AS 4 60

CO CL1Contig1 598 5 16 U
GGGTCAGAAAATAAAATAAAAGAGATCGGTCTGGGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGG
CAGCAACATTTGCAGCTCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCA
TCAAGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTC
TGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGA
GAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCTAGTATTCCGG
CGATAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTCGCTC
ACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGCTGATCACCTGGCACT
TAGGTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGGCAAATCGGGTTTAAGGGCAGGACCGAAGATT
ACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTGTTCCATCCGTACTTATTATCTTACATCTCTCTC
TCTTGGTTCTCCATGTAATATTATGATATCAAAACGAAGCCTTCTTTCGGTTTTCTAT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BA76TF U 58
AF RR2AD63JQ C 1
AF RR2E114JQ C 24
AF RR2E114TF U 24
AF RR2AD63TF U 1
BS 1 5 RR2AD63JQ
BS 6 23 RR2AD63TF
BS 24 41 RR2E114TF
BS 42 42 RR2AD63TF
BS 43 57 RR2E114TF
BS 58 219 RR2BA76TF
BS 220 222 RR2E114TF
BS 223 306 RR2BA76TF
BS 307 307 RR2E114TF
BS 308 460 RR2BA76TF
BS 461 551 RR2E114TF
BS 552 553 RR2AD63TF
BS 554 566 RR2E114TF
BS 567 567 RR2AD63TF
BS 568 575 RR2E114TF
BS 576 598 RR2AD63TF

RD RR2BA76TF 406 0 0
TGGCAGCAACATTTGCAGCTCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTC
CCATCAAGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACC
CTCTGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTC**AACAGAACTGGCTGA
GGAGAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCTAGTATTC
CGGCGATAAGCGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTCG
CTCACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGCTGATCACCTGGC
ACTTAGGTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGGCAAATCGGGTT
AAG

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2AD63JQ 598 0 0
GGGTCAGAAAATAAAATAAAAGAGATCGGTCTGGGTGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGG
CAGCAACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCA
TCAAGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTC
TGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGA
GAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGG
CGATAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTCGCTC
ACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACT
TAGGTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATCGGGTTTAAGGGCAGGACCGAAGATT
ACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTGTTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTC
**TTTGTTCTCCATGTAATATTATGATATCAAAACGAAGCCTTCTTTCGGTTTTCTAT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2E114JQ 566 0 0
GATCGGTCTGGGAGAAAGGAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCAACATTTGCAGCTCCATCG
ACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCAAGGCCAAAGCTCTCTCTTCA
TCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGA
GGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGTGGGGTTT
GGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCTAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAGCCTGTCG
GGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTCACTCACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTC
ACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGCTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGCCTCACC
TTCGGGCAAATCGGGTTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAATAAATCATCCAT
CTTGTTCCATCCGTACTTATTATCTTACATCTCTCTCTCTTGGTTCTCTGTGTAATATTA
TGA*ATCAAAACT
TTCTTTCTTTCGC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2E114TF 566 0 0
GATCGGTCTGGGAGAAAGGAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCAACATTTGCAGCTCCATCG
ACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCAAGGCCAAAGCTCTCTCTTCA
TCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGA
GGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGTGGGGTTT
GGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCTAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAGCCTGTCG
GGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTCACTCACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTC
ACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGCTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGCCTCACC
TTCGGGCAAATCGGGTTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAATAAATCATCCAT
CTTGTTCCATCCGTACTTATTATCTTACATCTCTCTCTCTTGGTTCTCTGTGTAATATTA
TGA*ATCAAAACT
TTCTTTCTTTCGC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2AD63TF 598 0 0
GGGTC
AGAAAATAAAATAAAAGAGATCGGTCTGGGTGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCA
ACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCAAG
GCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAA
GTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAGAT
CTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATA
AACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTC
CCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGT
CTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATCGGGTTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTC
AAGAAATAAATCATCCATCTTGTTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTC**TTT
GTTCTCCATGTAATATTATGATATCAAAACGAAGCCTTCTTTCGGTTTTCTAT

QA 6 598 6 598
DS 



CO CL1Contig2 700 23 15 U
GGAGAAAATAAAATAAAAGAGTCTGGTCTGGGAAAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAG
CAACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCA
AGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACCCTCTGA
AAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAG
ATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGA
TAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACT
TCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAG
GTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACT
TCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCTATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTG
GTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTCAGCTTTCTAT*GGTTTTCTATATTTG
ATGTTTCATTCAATGTTTTTAAACCAGATCGGACAGGTGATTGAACCGGATTCAACCATG
ATATTATTTTTAACCCAGTCGAACCCGATTGGGACGAACT


BQ
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 80 80 80 80 80 80 80 40 40 40 80 80 80 80 65 80 80 80 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 40 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 50 50 50 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 55 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 55 55 97 55 97 97 97 97 97 97 50 97 95 95 95 95 90 40 75 50 45 45 45 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM65TF U 127
AF RR2C788JQ C 245
AF RR2AO28JQ C 1
AF RR2FU65TF U 193
AF RR2AY35TFB U 1
AF RR2D504TF U 1
AF RR2C777TF U 14
AF RR2AO28TF U 1
AF RR2G856JQ C 327
AF RR2GM19JQ C 327
AF RR2GM19TF U 13
AF RR2G856TF U 13
AF RR2D504JQ C 1
AF RR2C788TF U 55
AF RR2GL93TF U 1
AF RR2GF89TF U 1
AF RR2DO20JQ C 1
AF RR2DO20TF U 1
AF RR2BW49TF U 1
AF RR2A127TF U 89
AF RR2DS18JQ C 33
AF RR2DS18TF U 1
AF RR2BW49JQ C 241
BS 1 194 RR2AY35TFB
BS 195 334 RR2FU65TF
BS 335 335 RR2AY35TFB
BS 336 352 RR2FU65TF
BS 353 353 RR2AY35TFB
BS 354 473 RR2FU65TF
BS 474 474 RR2AY35TFB
BS 475 507 RR2FU65TF
BS 508 508 RR2AY35TFB
BS 509 543 RR2FU65TF
BS 544 584 RR2AY35TFB
BS 585 585 RR2BW49TF
BS 586 592 RR2AO28TF
BS 593 632 RR2BW49TF
BS 633 700 RR2BW49JQ

RD RR2BM65TF 267 0 0
AAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCG
CCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGA
ACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACG
GGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACTTCCCAA
CTCCTCCTGCTC*CACTTCGCAGT
CTG

QA 1 264 1 264
DS 

RD RR2C788JQ 240 0 0
GAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCCAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAA
CGGGAAGAGCCTTTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACTTCCC
AACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGTACTTAGGTCT
CTTCATCTGCCTCCCCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAA

QA 1 240 1 240
DS 

RD RR2AO28JQ 592 0 0
GGAGAAAATAAAATAAAAGAGATCGGTCTGGGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAG
CAACATTTGCAGCTCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCA
AGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACAACAAGAGCAAAGAACCCTCTGA
AAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAG
ATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGA
TAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACT
TCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAG
GTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACT
TCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTG
GTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACGAAACTTTCTTTCGGTTTTC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2FU65TF 361 0 0
GC
TCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGTG
GGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAGC
CTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCT
GCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGC
CTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAAATTACTTCAAGAAATAAATC
ATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTGGTT
ACTTTCTGAT

QA 3 351 3 351
DS 

RD RR2AY35TFB 585 0 0
GGAGAAAATAAAATAAAAGAGTCTGGTCTGGGAAAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAG
CAACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCA
AGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACCCTCTGA
AAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAG
ATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGA
TAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACT
TCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAG
GTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACT
TCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCTATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTG
GTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTCAGCTTTCTATG

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2D504TF 551 0 0
GGAGAAAATAAAATAAAAGAGTCTGGTCTGGGAAAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAG
CAACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCA
AGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACCCTCTGA
AAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAG
ATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGA
TAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACT
TCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAG
GTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACT
TCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCTATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTG
GTTCTTCTCCG

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2C777TF 567 0 0
G
AAAAGAGTCTGGTCTGGGAAAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCAACATTTGCAGCT
CCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCAAGGCCAAAGCTCTC
TCTTCATCATTTATAAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGCA
TCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGTG
GGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAGC
CTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACTTCCCAACTCCTCCT
GCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGC
CTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAGGATTACTTCAAGAAATAAATC
ATCCATCTTATTCTATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTGGTTCTTCTCCGTGT
AATATTATGAATCAAAACTCAGCTTT

QA 2 567 2 567
DS 

RD RR2AO28TF 592 0 0
GGAGAAAATAAAATAAAAGAGATCGGTCTGGGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAG
CAACATTTGCAGCTCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCA
AGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACAACAAGAGCAAAGAACCCTCTGA
AAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAG
ATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGA
TAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACT
TCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAG
GTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACT
TCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTG
GTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACGAAACTTTCTTTCGGTTTTC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2G856JQ 266 0 0
TTT
TTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAG
TTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAA
ATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCTA
TCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTGGTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAA
AACTCAGCTTTCTAT*GGTTTCC

QA 4 266 4 266
DS 

RD RR2GM19JQ 266 0 0
TTT
TTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAG
TTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAA
ATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCTA
TCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTGGTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAA
AACTCAGCTTTCTAT*GGTTTCC

QA 4 266 4 266
DS 

RD RR2GM19TF 581 0 0
GG
AAAAGAGTCTGGTCTGGGAAAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCAACATTTGCAGCT
CCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCAAGGCCAAAGCTCTC
TCTTCATCATTTATAAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGCA
TCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAGCGTGGTG
GGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAGC
CTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACTTCCCAACTCCTCCT
GCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGC
CTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAATAAATC
ATCCATCTTATTCTATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTGGTTCTTCTCCGTGT
AATATTATGAATCAAAACTCAGCTTTCTAT*GGTTTCC
A

QA 3 580 3 580
DS 

RD RR2G856TF 580 0 0
GG
AAAAGAGTCTGGTCTGGGAAAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCAACATTTGCAGCT
CCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCAAGGCCAAAGCTCTC
TCTTCATCATTTATAAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGCA
TCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAGCGTGGTG
GGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAGC
CTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACTTCCCAACTCCTCCT
GCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGC
CTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAATAAATC
ATCCATCTTATTCTATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTGGTTCTTCTCCGTGT
AATATTATGAATCAAAACTCAGCTTTCTAT*GGTTTCC

QA 3 580 3 580
DS 

RD RR2D504JQ 593 0 0
GGAGAAAATAAAATAAAAGAGTCTGGTCTGGGAAAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAG
CAACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCA
AGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACCCTCTGA
AAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAG
ATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGA
TAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACT
TCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAG
GTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACT
TCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCTATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTG
GTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTCAGCTTTCTAT*GGTTTTCT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2C788TF 535 0 0
TGGCAGCAACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTC
CCATCAAGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACC
CTCTGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGA
GGAGAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCCAGCTCCGTCGAGTATTC
CGGCGATAAACGGGAAGAGCCTTTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGG
CTCACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGT
ACTTAGGTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAG
ATTACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCTATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCT
CTCTTGGTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTCAGCTTTCTAT*GGTT

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2GL93TF 592 0 0
GGAGAAAATAAAATAAAAGAGTCTGGTCCGGGAAAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAG
CAACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCA
AGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACCCTCTGA
AAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAG
ATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGGTCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGA
TAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACT
TCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCGCTTAG
GTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACT
TCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCTATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTG
GTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTCAGCTTTCTAT*GGTTTTC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2GF89TF 592 0 0
GGAGAAAATAAAATAAAAGAGTCTGGTCTGGGAAAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAG
CAACATTTGCAGCTCTATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCA
AGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACCCTCTGA
AAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAG
ATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGA
TAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACT
TCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAG
GTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACT
TCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCTATCTCTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTG
GTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTCAGCTTTCTAT*GGTTTTC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2DO20JQ 597 0 0
GGAGAAAATAAAATAAAAGAGTCTGGTCTGGGAAAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAG
CAACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCA
AGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACCCTCTGA
AAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAG
ATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGA
TAAACGGGAAGAGCCTGTCGCGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACT
TCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAG
GTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACT
TCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCTATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTG
GTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTCAGCTTTCTAT*GGTTTTCTATA
G

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2DO20TF 597 0 0
GGAGAAAATAAAATAAAAGAGTCTGGTCTGGGAAAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAG
CAACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCA
AGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACCCTCTGA
AAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAG
ATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGA
TAAACGGGAAGAGCCTGTCGCGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACT
TCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAG
GTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACT
TCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCTATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTG
GTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTCAGCTTTCTAT*GGTTTTCTATA
G

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2BW49TF 632 0 0
GGAGAAAATAAAATAAAAGAGTCTGGTCTGGGAAAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAG
CAACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCA
AGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACCCTCTGA
AAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAG
ATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGA
TAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACT
TCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTTATCACCTGGCACTTAG
GTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACT
TCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCTATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTG
GTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTCAGCTTTCTAT*GGTTTTCTATATTTG
ATGTTTCATTCAATGTTTTTAAACCAGATCGG

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2A127TF 518 0 0
AGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCAAGGCCAAAGCTCTCTCTCCATCATTTAT
AAAACCAACCTTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGT
CACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGAT
CGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTT
CTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACTTCCCAACTCCTCCT*CTCTCACTTCGCA
GTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACA
AATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCT
ATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTGGTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCA
AAACTCAGCTTTCTAT*GGTTTTCTATATTTGATGTTT

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2DS18JQ 579 0 0
AGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCAACATTTGCAGCTCCATCGACAGTGATAGGT
CTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCAAGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATCTATAAAA
CCAACAACAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACT
TGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGA
TGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTTTCTTCTTC
GAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTC
TGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGCCTCCCCTTCGGACAAATT
GGATTTAAGGGCAGGAACGAAGATTACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCCATCT
TTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTGGTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAAC
GAAACTTTCTTTCGGTTTTCTATATTTGATGTTTCATTC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2DS18TF 611 0 0
GGAGAAAATAAAATAAAAGAGATCGGTCTGGGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAG
CAACATTTGCAGCTCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCA
AGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATCTATAAAACCAACAACAAGAGCAAAGAACCCTCTGA
AAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAG
ATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGA
TAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACT
TCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAG
GTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGAACGAAGATTACT
TCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTG
GTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACGAAACTTTCTTTCGGTTTTCTATATTTG
ATGTTTCATTC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2BW49JQ 460 0 0
ATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGA
TAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGACAGCATAGGAACTGAGCTGGCTCACT
TCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTTATCACCTGGCACTTAG
GTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATTGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACT
TCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCTATCTTTACTTATTTTCTTACATCTCTCTCTTG
GTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTCAGCTTTCTAT*GGTTTTTTATATTTG
ATGTTTCATTCAATGTTTTTAAACCAGATCGGACAGGTGATTGAACCGGATTCAACCATG
ATATTATTTTTAACCCAGTCGAACCCGATTGGGACGAACT

QA 1 460 1 460
DS 



CO CL1Contig3 687 26 6 U
GGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGA
TGGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTC
GCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTT
TCGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGA
CGAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAG
ACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAG
GAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTC
TGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGAT
ACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGA
AGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAG
TTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTC
AGTGTGAAAATACTATCTTTGATCCAA


BQ
45 45 45 45 45 50 25 65 70 70 80 85 85 90 90 90 90 90 90 97 97 97 97 40 97 97 97 97 97 97 97 97 40 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 95 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 80 10 80 35 10 10 

AF RR2GY37TF U 9
AF RR2FY21TF U 18
AF RR2F742JQ C 1
AF RR2F742TF U 1
AF RR2DQ32JQ C 126
AF RR2F457TF U 4
AF RR2C084TF U 1
AF RR2DQ32TF U 1
AF RR2EW93JQ C 1
AF RR2FX49JQ C 95
AF RR2F172JQ C 62
AF RR2DU31TF U 44
AF RR2DU31JQ C 125
AF RR2DI56TF U 7
AF RR2CA83TF U 3
AF RR2F172TF U 12
AF RR2FY21JQ C 18
AF RR2CA83JQ C 90
AF RR2F457JQ C 4
AF RR2DX75TF U 4
AF RR2CH19JQ C 9
AF RR2DP72JQ C 165
AF RR2DX75JQ C 111
AF RR2CH19TF U 9
AF RR2FP25TF U 1
AF RR2EW93TF U 1
BS 1 452 RR2C084TF
BS 453 453 RR2DQ32TF
BS 454 681 RR2C084TF
BS 682 684 RR2DU31TF
BS 685 685 RR2F172TF
BS 686 687 RR2EW93TF

RD RR2GY37TF 565 0 0
GGG
GAAGAAGAAGACGAGAGTAGTTGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGATGGCGATGACA
GTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTCGCTTATCCGCC
GTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGCTGTTCCC
CTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAGCTTCT
TCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGAA
AAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGTA
GCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCTAAA
GTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTCTCTTC
AAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATCGCAGGG
ACCGAATAGATTCTTTCATAAA

QA 4 565 4 565
DS 

RD RR2FY21TF 528 0 0
GG
AGACAAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGATGGCGATGACAGTAGCAGC
TTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTCGCTTATCCGCCGTTCCTTA
CCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGCTGTTCCCCTGAAGCT
AGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAGCTTCTTCATCAGA
CGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGA
TGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGTAGCTGTTTG
GTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCTAAAGTTATGGA
GCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTCTCTTCAAGTCAAG
CAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATC

QA 3 528 3 528
DS 

RD RR2F742JQ 643 0 0
GGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGA
TGGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTC
GCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTT
TCGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGA
CGAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAG
ACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAG
GAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTC
TGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGAT
ACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGA
AGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAG
TTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2F742TF 643 0 0
GGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGA
TGGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTC
GCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTT
TCGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGA
CGAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAG
ACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAG
GAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTC
TGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGAT
ACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGA
AGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAG
TTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2DQ32JQ 505 0 0
TCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTTTTTAGGCCGATTTTTTTTCGCT
GTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGA
GCTTTTTCATCAGACAAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTG
AAGGAAAAGTGGGATGGTTTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATTTATGGAGGAGGAGCC
ATTGTAGCTGTTTGGTTATTTTCCATTTTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTTTGCTT
CCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTTTCGGGTACACAGGATGGTTTGTTTACAGATACCTT
TTTTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATC
GCAGGGACCGAATAGATTTTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTTTGGAGTTTTT
TTGTAATGTGATTATTATTATACAA

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR2F457TF 647 0 0
GGA
GAGAAGAAGAAGAAGACGAGAGTAGTTGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGATGGCGA
TGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTCGCTTAT
CCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGCTG
TTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAG
CTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGA
AGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCA
TTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTC
CTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTC
TCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATCG
CAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAGTTTT*C
TTTAATGTGATTATTAT*ATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATG

QA 4 647 4 647
DS 

RD RR2C084TF 681 0 0
GGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGA
TGGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTC
GCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTT
TCGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGA
CGAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAG
ACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAG
GAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTC
TGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCAGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGAT
ACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGA
AGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAG
TTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTC
AGTGTGAAAATACTATCTTTG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2DQ32TF 674 0 0
GGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGA
TGGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCC*CTC
GCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTT
TCGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGA
CGAGAGCTTCTTCATCAGACAAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAG
ACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAG
GAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTC
TGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGAT
ACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGA
AGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAG
TTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTC
AGTGTGAAAA
AAAA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2EW93JQ 685 0 0
GGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGA
TGGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTC
GCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTT
TCGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGA
CGAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAG
ACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAG
GAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTC
TGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGAT
ACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGA
AGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAG
TTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTC
AGTGTGAAAATACTATCTTTGATCC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2FX49JQ 591 0 0
AGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTCGCTTATCCGCCGTTCCTTATCTTCCTCCGCTGCC
TCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGG
TATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAGCTTTTTCATCAGGCGAGACCTCAACGTC
CATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAA
AACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCT
TGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGG
GTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTCTTTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGC
TGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAA
ATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAGTTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTC
TCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTCAGTGTGAAAATACTATCTTTGACC
C

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2F172JQ 624 0 0
GGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTCG
CTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTT
CGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGAC
GAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACTAACTCTTTACAGA
CTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGG
AGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCT
GCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATA
CCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAA
GATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAGT
TTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTCA
GTGTGAAAATACTATCTTTGATCC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2DU31TF 650 0 0
GG
GAAGAACCAGTTCGATGGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTC
CACGTGTCCCCGCTCGCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTT
TAGGCCGATCTTCTTTCGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGG
TTGAATTGATGAAGACGAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCA
ACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGG
TTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCA
TCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGAT
GGTTTGTCTACAGATACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTG
ATTCCTTGAAGAAGAAGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTT
TCTTTCTTTCTGGAGTTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAA
CAATGTACCTTCTTCAGTGTGAAAATACTATCTTTGATC
AAAAAAAAA

QA 3 641 3 641
DS 

RD RR2DU31JQ 560 0 0
ATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGC
TGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAG
AGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTT
GAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGC
CATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCT
TCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCT
TCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGAT
CGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAGTTTT
TCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTCAGTG
TGAAAATACTATCTTTGATC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2DI56TF 658 0 0
GG
GAAGAAGAAGAAGACAAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGATGGCGATG
ACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTCGCTTATCC
GCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGCTGTT
CCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAGCT
TCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGAAG
GAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCATT
GTGGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCT
AAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTCTC
TTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATCGCA
GGGACCGAATAGATTCTTTCATAGAAATAATAAACCTTCTTTCTTTCTGGAGTTTTTCTG
TAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTCAGTG

QA 3 658 3 658
DS 

RD RR2CA83TF 661 0 0
GGAG
GAGAAGAAGAAGAAGACGAGAGTAGTTGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGATGGCGA
TGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTCGCTTAT
CCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGCTG
TTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAG
CTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGA
AGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCA
TTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTC
CTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTC
TCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATCG
CAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAGTTTTTC
TGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTCAGT

QA 5 661 5 661
DS 

RD RR2F172TF 674 0 0
GG
AGAAGAAGACGAGAGTAGTTGCAGAAGTAGAAGAAGAACCAGTTCGATGGCGATGACAGT
AGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTCGCTTATCCGCCGT
TCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGCTGTTCCCCT
GAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAGCTTCTTC
ATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACTAACTCTTTACAGACTTGAAGGAAAA
GTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGTAGC
TGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCTAAAGT
TATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTCTCTTCAA
GTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATCGCAGGGAC
CGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAGTTTTTCTGTAATG
TGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTCAGTGTGAAAATAC
TATCTTTGATCC

QA 3 674 3 674
DS 

RD RR2FY21JQ 668 0 0
GG
AGACAAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGATGGCGATGACAGTAGCAGC
TTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTCGCTTATCCGCCGTTCCTTA
CCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGCTGTTCCCCTGAAGCT
AGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAGCTTTTTCATCAGA
CGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGA
TGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGTAGCTGTTTG
GTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCTAAAGTTATGGA
GCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTCTCTTCAAGTCAAG
CAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATCGCAGGGACCGAATA
GATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAGTTTTTCTGTAATGTGATTA
TTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTCAGTGTGAAAATACTATCTT
TGATCC

QA 3 668 3 668
DS 

RD RR2CA83JQ 577 0 0
GTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTCGCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCG
CTGCCTCCTCGCTTTTTAGGCCGATTTTCTTTCGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGG
AACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAGCTTTTTCATCAGACGAGACCTCA
ACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAG
AACAAAACAACTGTGGTTATTTATGGAGGAGGAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATTTTCC
ATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTTTGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGT
TTCGGGTACACAGGATGGTTTGTTTACAGATACCTTCTTTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAG
TTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCA
TAAAAATAATAAACTTTTTTTCTTTTTGGAGTTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACA
ATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTTTTCAGTGTG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2F457JQ 681 0 0
GGA
GAGAAGAAGAAGAAGACGAGAGTAGTTGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGATGGCGA
TGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTCGCTTAT
CCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGCTG
TTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAG
CTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGA
AGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCA
TTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTC
CTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTC
TCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATCG
CAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAGTTTTTC
TTTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTCAGTGTG
AAAATACTATCTTTGACC

QA 4 681 4 681
DS 

RD RR2DX75TF 673 0 0
GG
GAAGAAGAAGAAGAAGACAAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGATGGCG
ATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTCGCTTA
TCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGCT
GTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATATAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGA
GCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTG
AAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCC
ATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTT
CCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTT
CTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATC
GCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAGTTTTT
CTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTCAGTGT
GAAAATACTAT

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR2CH19JQ 676 0 0
GG
AGAAGAAGAAGACAAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGATGGCGATGAC
AGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTCGCTTATCCGC
CGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGCTGTTCC
CCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAGCTTC
TTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGA
AAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGT
AGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCTAA
AGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTCTCTT
CAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATCGCAGG
GACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAGTTTTTCTGTA
ATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTCAGTGTGAAAA
TACTATCTTTGACC

QA 3 676 3 676
DS 

RD RR2DP72JQ 520 0 0
TTAGGCCGATCTTCTTTCGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAG
GTTGAATCGATGAAGACGAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACC
AACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTG
GTTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGTTCCC
ATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGA
TGGTTTGTCTACAGATACCTTCTTTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATT
GATTCCTTGAAGAAGAAGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACT
TTCTTTCTTTCTGGAGTTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCA
ACAATGTCCCTTCTTCAGTGTGAAAATACTATCTTTGACC

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2DX75JQ 574 0 0
GTCCCCGCTCGCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGC
CGATCTTCTTTCGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATATAGAAGGTTGAA
TTGATGAAGACGAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAA
CTCTTTACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATC
TATGGAGGAGGAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAAC
TCTGTTCCTCTGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTT
GTCTACAGATACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCC
TTGAAGAAGAAGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTT
CTTTCTGGAGTTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATG
TACCTTCTTCAGTGTGAAAATACTATCTTTGACC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2CH19TF 676 0 0
GG
AGAAGAAGAAGACAAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGATGGCGATGAC
AGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTCGCTTATCCGC
CGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGCTGTTCC
CCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAGCTTC
TTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGA
AAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGT
AGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCTAA
AGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTCTCTT
CAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATCGCAGG
GACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAGTTTTTCTGTA
ATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTCAGTGTGAAAA
TACTATCTTTGACC

QA 3 676 3 676
DS 

RD RR2FP25TF 684 0 0
GGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGA
TGGCGATGACAGTAGCAGCCTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTC
GCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTT
TCGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAGCGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGA
CGAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAG
ACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAG
GAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTC
TGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGAT
ACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGA
AGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAG
TTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTC
AGTGTGAAAATACTATCTTTGATC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2EW93TF 687 0 0
GGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGA
TGGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCTC
GCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTT
TCGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGA
CGAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAG
ACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAG
GAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTC
TGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGAT
ACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGA
AGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAG
TTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTC
AGTGTGAAAATACTATCTTTGATCCAA

QA 1 687 1 687
DS 



CO CL1Contig4 1055 6 10 U
GACCAAACCCCGGCACGAAAAGTGTCAAGGAACATGCAACTAAACAGTCTGCTTTCGCCA
ACCCGGAAACGGTGTTTGTTTGGAAACAGTTCTGAAATGTAAAGTCTATAACGACTCTCG
GCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGT
GAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCTTCT
GGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTCCCCTC*ATCCTCTCGAGGAT
ATAGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGTTACCGCACGCGGTTGGCCAAAATCCGAGCTAA
GGATGCCAGGAGCGTCTTGACATGCGGTGGTGAATTAAATTCCTCGTCATATCGTCGGTC
GTTCCGGTCCAAAAGCTCTCGATGACCCAAAGTCCTCAACGCGACCCCAGGTCAGGCGGG
ATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCC
TTAGTAACGGCGAGCGAACCGGGAAGATCCCAGCTTGAAAATCGGACGTCTTCGGCGTTC
GAATTGTAGTCTGGAGAAGCATCCCCGCTCGCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGC
TGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGCTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGA
ACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAA
CGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGA
ACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCA
TTCTTGTTGTTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTCGGTC
TCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGT
TGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO57TF U 109
AF RR2GC46TF U 107
AF RR2AN35JQ C 107
AF RR2AN35TF U 107
AF RR2FF01TF U 1
AF RR2DP72TF U 459
BS 1 196 RR2FF01TF
BS 197 197 RR2AN35TF
BS 198 283 RR2FF01TF
BS 284 284 RR2AN35TF
BS 285 285 RR2FF01TF
BS 286 286 RR2AN35TF
BS 287 362 RR2FF01TF
BS 363 363 RR2AN35TF
BS 364 517 RR2FF01TF
BS 518 1055 RR2DP72TF

RD RR2CO57TF 172 0 0
G
AACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCG
ATACTTGGTGTGAATTGCAGATTCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCC
CCAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTC

QA 2 172 2 172
DS 

RD RR2GC46TF 174 0 0
G
ATAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATG
CGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG
CCCCAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTC

QA 2 174 2 174
DS 

RD RR2AN35JQ 283 0 0
G
ATAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATG
CGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG
CCCCAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTCCCCTC*A
TCCTCTCGAGGATATAGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGTTACCGCACGCGGTTGGCCA
AAATCCGAGCTAAGGATGCCAGGAGCGTCTTGACATGCGGTG

QA 2 283 2 283
DS 

RD RR2AN35TF 283 0 0
G
ATAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATG
CGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCG
CCCCAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTCCCCTC*A
TCCTCTCGAGGATATAGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGTTACCGCACGCGGTTGGCCA
AAATCCGAGCTAAGGATGCCAGGAGCGTCTTGACATGCGGTG

QA 2 283 2 283
DS 

RD RR2FF01TF 517 0 0
GACCAAACCCCGGCACGAAAAGTGTCAAGGAACATGCAACTAAACAGTCTGCTTTCGCCA
ACCCGGAAACGGTGTTTGTTTGGAAACAGTTCTGAAATGTAAAGTCTATAACGACTCTCG
GCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGT
GAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCTTCT
GGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTCCCCCCCATCCTCTCGAGGAT
ATAGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGTTACCGCACGCGGTTGGCCAAAATCCGAGCTAA
GGGTGCCAGGAGCGTCTTGACATGCGGTGGTGAATTAAATTCCTCGTCATATCGTCGGTC
GTTCCGGTCCAAAAGCTCTCGATGACCCAAAGTCCTCAACGCGACCCCAGGTCAGGCGGG
ATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAATAAGCGGAGG

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2DP72TF 597 0 0
GG
GCGACCCCAGGTCAGGCGGGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAA
AGAAACTAACAAGGATTCCCTTAGTAACGGCGAGCGAACCGGGAAGATCCCAGCTTGAAA
ATCGGACGTCTTCGGCGTTCGAATTGTAGTCTGGAGAAGCATCCCCGCTCGCTTATCCGC
CGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCGCTGTTCC
CCTGAAGCTAGTTTCAGGGAACGGTATACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAGCTTC
TTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGA
AAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGT
AGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGTTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCTAA
AGTTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTCTCTT
CAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATC

QA 3 597 3 597
DS 



AS 4 48

CO CL2Contig1 651 9 13 U
GGACATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAG
CAACCGCTCTCAAGCTCTCCTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCA
TCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGG
TCAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGCGACCATGCCCAGGACCATTTAG
GAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACT
TTGGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAG
TCATTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATG
AAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGG
GTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAG
AGCAACACAATAAAAATCATGCTTAAAGTTTCCGTCGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTA
CATCTATCTCAGCTTGTATCAGGGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTG


BQ
20 20 20 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 

AF RR2DZ27TF U 1
AF RR2BN93TF U 1
AF RR2FI25TF U 1
AF RR2FN57TF U 1
AF RR2CU18TF U 3
AF RR2DZ27JQ C 121
AF RR2BN93JQ C 83
AF RR2CU18JQ C 81
AF RR2FN57JQ C 100
BS 1 338 RR2BN93TF
BS 339 339 RR2FI25TF
BS 340 377 RR2BN93TF
BS 378 378 RR2FI25TF
BS 379 398 RR2BN93TF
BS 399 399 RR2FI25TF
BS 400 445 RR2BN93TF
BS 446 446 RR2FI25TF
BS 447 619 RR2BN93TF
BS 620 621 RR2FI25TF
BS 622 622 RR2CU18TF
BS 623 639 RR2FI25TF
BS 640 651 RR2FN57TF

RD RR2DZ27TF 540 0 0
GGG
CATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAGCAA
CCGCTCTCAAGCTCTCCTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGTTTTCTCCATCT
CCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTCA
AACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGCGACCATGCCCAGGACCATTTAGGAG
AAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCGAAGAAAAAAACTTTG
GAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCA
TTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAG
AAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTC
CAAAGGA*TACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGA
TTCAGA

QA 4 534 4 534
DS 

RD RR2BN93TF 619 0 0
GGACATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAG
CAACCGCTCTCAAGCTCTCCTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCA
TCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGG
TCAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGCGACCATGCCCAGGACCATTTAG
GAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACT
TTGGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTGTATCTCCAATCTCTGGTGAAG
TCATTGAGGTTAACACAGAGCTTGCCGATTCACCTGGTCTGATCAACTCAAGCCCTTATG
AAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAGCCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGG
GTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAG
AGCAACACAATAAAAATCATGCTTAAAGTTTCCGTCGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTA
CATCTATCTCAGCTTGTAT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2FI25TF 639 0 0
GGACATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAG
CACCCGCTCTCAAGCTCTCCTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCA
TCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGG
TCAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGCGACCATGCCCAGGACCATTTAG
GAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACT
TTGGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAG
TCATTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATG
AAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGG
GTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAG
AGCAACACAATAAAAATCATGCTTAAAGTTTCCGTCGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTA
CATCTATCTCAGCTTGTATCACGGGTGATACTAATGATC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2FN57TF 651 0 0
GGACATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAG
CAACCGCTCTCAAGCTCTCCTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCA
TCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGG
TCAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGCGACCATGCCCAGGACCATTTAG
GAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACT
TTGGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTGTATCTCCAATCTCTGGTGAAG
TCATTGAGGTTAACACAGAGCTTGCCGATTCACCTGGTCTGATCAACTCAAGCCCTTATG
AAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAGCCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGG
GTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAG
AGCAACACAATAAAAATCATGCTTAAAGTTTCCGTCGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTA
CATCTATCTCAGCTTGTATCA*GGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2CU18TF 649 0 0
GG
ATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACGTGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAGCAAC
CGCTCTCAAGCTCTCCTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTC
CAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTCAA
ACATGAAGGCTCAGTGGCTACTAATGGCATCAGCGACCATGCCCAGGACCATTTAGGAGA
AGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACTTTGG
AGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCAT
TGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGA
AGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCC
AAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAGAGCA
ACACAATAAAAATCATGCTTAAAGTTTCCGTCGTCTCACTTGTCAATGTTTCTTTACATC
TATCTCAGCTTGTATCAGGGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTG

QA 3 649 3 649
DS 

RD RR2DZ27JQ 531 0 0
TCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGG
TCAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGCGACCATGCCCAGGACCATTTAG
GAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACT
TTGGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAG
TCATTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATG
AAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGG
GTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAG
AGCAACACAATAAAAATCATGCTTAAAGTTTCCGTCGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTA
CATCTATCTCAGCTTGTATCAGGGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTG

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2BN93JQ 569 0 0
TTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGT
GTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTCAAACATGAAGGCTCAGTGGC
TACTATTGGCATCAGCGACCATGCCCAGGACCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCT
GCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTAAA
GGCCACAAGTGAGATTGTATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATTGAGGTTAACACAGAGCT
TGCCGATTCACCTGGTCTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGAAGGTTGGATGATAAAGGT
GAAGCCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAATACACCAAGTT
CTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAGAGCAACACAATAAAAATCATGC
TTAAAGTTTCCGTCGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTACATCTATCTCAGCTTGTATCAG
GGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTG

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2CU18JQ 571 0 0
TTTTT
TGCATCCAAATTTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTTTCCTCAGTGTT
GGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTCAAACATGAAGGCTCAGTGGCTAC
TAATGGCATCAGCGACCATGCCCAGGACCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCC
AGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGC
CACAAGTGAGATTATATCTCCAATTTTTGGTGAAGTCATTGAGGTTAACACAAAGCTTGC
CGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAA
ACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAATACACCAAGTTTTG
CGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAGAGCAACACAATAAAAATCATGCTTA
AAGTTTCCGTCGTCTCACTTGTCAATGTTTCTTTACATCTATTTCAGCTTGTATCAGGGG
TGATACTAATGATCAAGAGAAATTTG

QA 6 571 6 571
DS 

RD RR2FN57JQ 552 0 0
ATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGT
ATGCAAACTCACATGAGTGGGTCAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGCG
ACCATGCCCAGGACCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTT
CAGTGAGCAAAGAAAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTG
TATCTCCAATTTCTGGTGAAGTCATTGAGGTTAACACAGAGCTTGCCGATTCACCTGGTC
TGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAGCCAAGCAACCCGG
CAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACG
CTGCTCACTAGAGGAATTCAGAGCAACACAATAAAAATCATGCTTAAAGTTTCCGTCGTT
TCACTTGTCAATGTTTCTTTACATCTATTTCAGCTTGTATCAGGGGTGATACTAATGATC
AAGAGAAATTTG

QA 1 552 1 552
DS 



CO CL2Contig2 658 8 19 U
GGACATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAG
CAAACGCTCTCAAGCTCTCCTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCA
TCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGTAAACTCACATGAATGGG
TCAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGCGACCACGCCCAGGACCATTTAG
GAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACT
TTGGAGCGGTGGAGAGTGTAAAGGCCACCAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAG
TCATTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATG
AAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGG
GTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGCAACACAA
GAAAAAATCATGCTTAAAGTTTGCGTCGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTACATCTATCT
CAGCTTGTATCAGGGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTGATTTATTTTCGGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR2C364JQ C 1
AF RR2C364TF U 53
AF RR2CB40TF U 14
AF RR2CP68TF U 19
AF RR2FZ90JQ C 372
AF RR2DI75JQ C 283
AF RR2G492TF U 447
AF RR2DI75TF U 283
BS 1 14 RR2C364JQ
BS 15 52 RR2CB40TF
BS 53 297 RR2C364TF
BS 298 298 RR2CB40TF
BS 299 307 RR2C364TF
BS 308 308 RR2CB40TF
BS 309 328 RR2C364TF
BS 329 329 RR2CB40TF
BS 330 352 RR2C364TF
BS 353 353 RR2CB40TF
BS 354 474 RR2C364TF
BS 475 475 RR2CB40TF
BS 476 546 RR2C364TF
BS 547 547 RR2CB40TF
BS 548 612 RR2C364TF
BS 613 613 RR2CB40TF
BS 614 640 RR2C364TF
BS 641 655 RR2CB40TF
BS 656 658 RR2DI75JQ

RD RR2C364JQ 646 0 0
GGACATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGGATATGGGCTTCTTCCACAG
CAAACGCTCTCAAGCTCTCCTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCA
TCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGTAAACTCACATGAATGGG
TCAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGCGACCACGCCCAGGACCATTTAG
GAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAA*CT
TTGGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCCGGTGAAG
TCATTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATG
AAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTCGATGG
GTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGCAACACAA
GAAAAA*TCATGCTTAAAGTTTGCGTCGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTACATCTATCT
CAGCTTGTATCAGGGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTGATTT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2C364TF 588 0 0
TTCCACAGCAAACGCTCTCAAGCTCTCCTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGC
TTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACTCAAGTATGTAAACTCACA
TGAATGGGTCAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGCGACCACGCCCAGGA
CCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGA
AAAAA*CTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTC
CGGTGAAGTCATTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAG
CCCTTATGAAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATC
CTCGATGGGTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAG
CAACACAAGAAAAA*TCATGCTTAAAGTTTGCGTCGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTAC
ATCTATCTCAGCTTGTATCACGGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2CB40TF 642 0 0
G
GAAAACAAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAGCAAACGCTCTCAAG
CTCTCCTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATTTCCAGATGCTTC
TCCTCAGTATTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTTACATGAGTGGGTCAAACATGAAGGC
TCAGTGGCTACTATTGGCATCAGCGACCATGCCCAGGACCATTTAGGAGAAGTTGTGTTT
GTGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACTTTGGAGCGGTGGAG
AGTGTAAAGGCCACCAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATTGAGGTTAAC
ACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAGGCCCTTATGAAGAAGGTTGGATG
ATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAATAC
ACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGCAACACAAGAAAAAATCATGCT
TAAAGTTTGCGTCGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTACATCTATCTCAGCTTGTATCAGG
GGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTGATTTATTTTCGGT

QA 2 642 2 642
DS 

RD RR2CP68TF 631 0 0
GG
AAGAAAGACATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAGCAATCGCTCTCAAGCTCTCC
TCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATTTCCAGATGCTTCTCCTCA
GTGTTGGAAGGACTCAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTCAAACATGAAGGCTCAGTG
GCTACTATTGGCATCAGCGACCATGCCCAGGACCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAG
CTGCCAGAAGAGAAAAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAAACTTTGGAGCGGTGGAGAGTGTA
AAGGCCACCAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATTGAGGTTAACACAAAG
CTTGCCGATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGAAGGTTGGATGATAAAG
GTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAATACACCAAG
TTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGCAACACAAGAAAAAATCATGCTTAAAGT
TTGCGTCGTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTACATCTATCTCAGCTTGTATCAGGGGTGAT
ACTAATGATCAAGAGAAATTTGATTTATT

QA 3 631 3 631
DS 

RD RR2FZ90JQ 249 0 0
AACACAAAGCTTGCCAATTCACCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGAAGGTTGG
ATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAA
TACACCAAGTTTTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGCAACACAAGAAAAAATCAT
GCTTAAAGTTTGCGTCGTT*CACTTGTCAATGTTTCTTTACATCTATCTCAGCTTGTATC
AGGGGTGAT

QA 1 249 1 249
DS 

RD RR2DI75JQ 376 0 0
TGAGCAAAGAAAAAAACTTTGGAGCGGTGGAGAGTGTAAAGGCCACCAGTGAGATTATAT
CTCCAATTTCTGGTGAAGTCATTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGA
TCAACTCAAGCCCTTATGAAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAG
AGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAATACACCAAGTTTTGCGAAGATGAAGACGCTG
CTCACTAGAGCAACACAAGAAAAAATCATGCTTAAAGTTTGCGTCGTTTCACTTGTCAAT
GTTTCTTTACATCTATCTCAGCTTGCATCAGGGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTG
ATTTATTTTCGGTTAT

QA 1 376 1 376
DS 

RD RR2G492TF 210 0 0
G
CAAGCAACCCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCG
AAGATGAAGACGCTGCTCACTAGAGCAACACAAGAAAAAATCATGCTTAAAGTTTGCGTC
GTTTCACTTGTCAATGTTTCTTTACATCTATCTCAGCTTGTATCAGGGGTGATACTAATG
ATCAAGAGAAATTTGATTTATTTTCGGT
T

QA 2 209 2 209
DS 

RD RR2DI75TF 376 0 0
TGAGCAAAGAAAAAAACTTTGGAGCGGTGGAGAGTGTAAAGGCCACCAGTGAGATTATAT
CTCCAATCTCTGGTGAAGTCATTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCTGGTTTGA
TCAACTCAAGCCCTTATGAAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCGGCAG
AGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTG
CTCACTAGAGCAACACAAGAAAAAATCATGCTTAAAGTTTGCGTCGTTTCACTTGTCAAT
GTTTCTTTACATCTATCTCAGCTTGCATCAGGGGTGATACTAATGATCAAGAGAAATTTG
ATTTATTTTCGGT
TAT

QA 1 373 1 373
DS 



CO CL2Contig3 637 6 2 U
GAGTCTTATTTGAATGATATCATCTTTCAACCAAATTAGTATTACAGAGATACAAAGCTG
AGAGAGATAGGGTAAGGAACATTGACAAGTGAAGTCCCTCTAGTGAGCAGCGTCTTCCTC
TTCGCAGAACTTGGTGTATTCCTTTGAGCCCATCAAGGTTTCCAACTCTGCAGGGTTACT
TGGTTTCACCTTTATCATCCAACCATCTTCATAAGGGCTTGAGTTGATCAAACCAGGCGA
ATCGGTGAGCTTTGTGTTAACCTCAACGACTTCACCAGAGATTGGAGATAGAATCTCACT
TGTGGCCTTGACACTCTCCACAGCTCCAAAGTTCTTTTCTTTGCTCACTGAGCTTTTCTC
TTCTGGCAGCTCCACAAACACAACTTCTCCTAAATGATCCTGGGCATGGTCAGTGATGCC
TATGGTAGCCACTGAGCCATCATGTTTCACCCACTCATGTGAATTTGCATATTTAAGTCC
TTCCAACACTGAGGAGAAGCATCTAGAGATGGAGAAAGCCGGAAGGAGATGAGATTTGGA
GGCAGAAGAAGAGAGCTTGAGAGCGTTTGCTGTAGAGGAAGCCCACATTCTCAGTGCCAT
TTTGCTTTCTTTTCTCAAAGGAAAGTGGGGAAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA16JQ U 293
AF RR2E663JQ U 28
AF RR2EH77JQ U 1
AF RR2BM28TF C 14
AF RR2EH77TF C 185
AF RR2E663TF C 512
BS 1 631 RR2EH77JQ
BS 632 637 RR2E663TF

RD RR2CA16JQ 159 0 0
ATCTCACTTGTGGCCTTGACACTCTCCAAAGCTCCAAAGTTCTTTTCTTTGCTCACTGAG
CTTTTCTCTTCTGGAAGCTCCACAAACACAACTTCTCCTAAATGATCCTGGGCATGGTCA
GTGATGCCTATGGTAGCCACTGAGCCATCATGTTTCACC

QA 1 159 1 159
DS 

RD RR2E663JQ 475 0 0
CAACCAAATTAGTATTACAGAGATACAAAGCTGAGAGAGATAGGGTAAGGAACATTGACA
AGTGAAGTCCCTCTAGTGAGCAGCGTCTTCCTCTTCGCAGAACTTGGTGTATTCCTTTGA
GCCCATCAAGGTTTCCAACTCTGCAGGGTTACTTGGTTTCACCTTTATCATCCAACCATC
TTCATAAGGGCTTGAGTTGATCAAACCAGGCGAATCGGTGAGCTTTGTGTTAACCTCAAC
GACTTCACCAGAGATTGGAGATAGAATCTCACTTGTGGCCTTGACACTCTCCACAGCTCC
AAAGTTCTTTTCTTTGCTCACTGAGCTTTTCTCTTCTGGCAGCTCCACAAACACAACTTC
TCCTAAATGATCCTGGGCATGGTCAGTGATGCCTATGGTAGCCACTGAGCCATCATGTTT
CACCCACTCATGTGAATTTGCATATTTAAGTCCTTCCAACACTGAGGAGAAGCAT

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2EH77JQ 633 0 0
GAGTCTTATTTGAATGATATCATCTTTCAACCAAATTAGTATTACAGAGATACAAAGCTG
AGAGAGATAGGGTAAGGAACATTGACAAGTGAAGTCCCTCTAGTGAGCAGCGTCTTCCTC
TTCGCAGAACTTGGTGTATTCCTTTGAGCCCATCAAGGTTTCCAACTCTGCAGGGTTACT
TGGTTTCACCTTTATCATCCAACCATCTTCATAAGGGCTTGAGTTGATCAAACCAGGCGA
ATCGGTGAGCTTTGTGTTAACCTCAACGACTTCACCAGAGATTGGAGATAGAATCTCACT
TGTGGCCTTGACACTCTCCACAGCTCCAAAGTTCTTTTCTTTGCTCACTGAGCTTTTCTC
TTCTGGCAGCTCCACAAACACAACTTCTCCTAAATGATCCTGGGCATGGTCAGTGATGCC
TATGGTAGCCACTGAGCCATCATGTTTCACCCACTCATGTGAATTTGCATATTTAAGTCC
TTCCAACACTGAGGAGAAGCATCTAGAGATGGAGAAAGCCGGAAGGAGATGAGATTTGGA
GGCAGAAGAAGAGAGCTTGAGAGCGTTTGCTGTAGAGGAAGCCCACATTCTCAGTGCCAT
TTTGCTTTCTTTTCTCAAAGGAAAGTGGGGA
CC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2BM28TF 623 0 0
ATGATATCATCTTTCAACCAAATTAGTATTACAGAGATACAAGGCTGAAAGAGATAGGGT
AAGGAACGTTGACAAGTGAAGTCCCTCTAGTGAGCAGCGTCTTCCTCTTCGCAGAACTTG
GTGTATTCCTTTGAGCCCATCAAGGTTTCCAACTCTGCAGGGTTACTTGGTTTCACCTTT
ATCATCCAACCATCTTCATAAGGGCTTGAGTTGATCAAACCAGGCGAATCGGTGAGCTTT
GTGTTAACCTCAACGACTTCACCAGAGATTGGAGATAGAATCTCACTTGTGGCCTTGACA
CTCTCCACAGCTCCAAAGTTCTTTTCTTTGCTCACTGAGCTTTTCTCTTCTGGCAGCTCC
ACAAACACAACTTCTCCTAAATGATCCTGGGCATGGTCAGTGATGCCTATGGTAGCCACT
GAGCCATCATGTTTCACCCACTCATGTGAATTTGCATATTTAAGTCCTTCCAACACTGAG
GAGAAGCATCTAGAGATGGAGAAAGCCGGAAGGAGATGAGATTTGGAGGCAGAAGAAGAG
AGCTTGAGAGCGTTTGCTGTAGAGGAAGCCCACATTCTCAGTGCCATTTTGCTTTCTTTT
CTCAAAGGAAAGTGGGGA
AATCC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2EH77TF 449 0 0
TTCACCTTTATCATCCAACCATCTTCATAAGGGCTTGAGTTGATCAAACCAGGCGAATCG
GTGAGCTTTGTGTTAACCTCAACGACTTCACCAGAGATTGGAGATAGAATCTCACTTGTG
GCCTTGACACTCTCCACAGCTCCAAAGTTCTTTTCTTTGCTCACTGAGCTTTTCTCTTCT
GGCAGCTCCACAAACACAACTTCTCCTAAATGATCCTGGGCATGGTCAGTGATGCCTATG
GTAGCCACTGAGCCATCATGTTTCACCCACTCATGTGAATTTGCATATTTAAGTCCTTCC
AACACTGAGGAGAAGCATCTAGAGATGGAGAAAGCCGGAAGGAGATGAGATTTGGAGGCA
GAAGAAGAGAGCTTGAGAGCGTTTGCTGTAGAGGAAGCCCACATTCTCAGTGCCATTTTG
CTTTCTTTTCTCAAAGGAAAGTGGGGA
CC

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR2E663TF 126 0 0
GAGAAAGCCGGAAGGAGATGAGATTTGGAGGCAGAAGAAGAGAGCTTGAGAGCGTTTGCT
GTAGAGGAAGCCCACATTCTCAGTGCCATTTTGCTTTCTTTTCTCAAAGGAAAGTGGGGA
AAATCC

QA 1 126 1 126
DS 



CO CL2Contig4 763 25 19 U
GCTTTACAATTTTCGGACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAA**GAG
AGAAAGAAAACAGAAAAAAATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCT
CAAGCTCACTTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATG
CTTCTCCTCAGTATTGGAAGGACTTAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGA
AGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGT
GTTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAG
TGGAGAGTGTTAAGGCAACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGG
TTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTT*GATAAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGT
TGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACG
GAATACACCAAGTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCC
AGTATGTCCTAAA*CAAGAAAAAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTT
TT*CGCTACTTGTCAATGTTTCCT*TATCTTTTTTTATCAGATTTGTATTTCTATACT**
TTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTCCCAAGAGAGCTTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 25 25 25 10 10 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 85 
55 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 0 90 90 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 5 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 25 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 10 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 0 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 0 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 
97 97 97 97 97 55 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 35 15 97 15 97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 35 0 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E795TF U 15
AF RR2CB78TF U 6
AF RR2FL31TF U 93
AF RR2GS02TF U 1
AF RR2GZ63TF U 0
AF RR2FK16TF U 10
AF RR2B624TF U 15
AF RR2FA04TF U 13
AF RR2A401JQ C 15
AF RR2GS02JQB C 197
AF RR2BI76JQ C 133
AF RR2CB78JQ C 137
AF RR2DQ06TF U 15
AF RR2BJ88JQ C 80
AF RR2BJ88TF U 80
AF RR2BI76TF U 25
AF RR2DQ06JQ C 15
AF RR2A401TF U 15
AF RR2BO50TF U 25
AF RR2E755JQ C 224
AF RR2E795JQ C 31
AF RR2GZ63JQ C 69
AF RR2CI91TF U 61
AF RR2CI91JQ C 233
AF RR2FK16JQ C 189
BS 1 14 RR2GS02TF
BS 15 16 RR2B624TF
BS 17 638 RR2GS02TF
BS 639 639 RR2GZ63TF
BS 640 666 RR2GS02TF
BS 667 671 RR2GZ63TF
BS 672 672 RR2FK16TF
BS 673 685 RR2GZ63TF
BS 686 686 RR2FA04TF
BS 687 695 RR2GZ63TF
BS 696 696 RR2B624TF
BS 697 718 RR2GZ63TF
BS 719 720 RR2DQ06TF
BS 721 729 RR2FA04TF
BS 730 730 RR2DQ06TF
BS 731 744 RR2FA04TF
BS 745 747 RR2A401TF
BS 748 748 RR2BO50TF
BS 749 763 RR2FK16JQ

RD RR2E795TF 280 0 0
GGACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAA**GAGAGAAAGAAAACAGA
AAAAAATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCACTTCTT
CTGCATCCAAATCTCATCTC*TTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTAT
TGGAAGGACTTAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTA
CTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGA

QA 1 280 1 280
DS 

RD RR2CB78TF 508 0 0
GGA
ATTTTCCCACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAATCAAGAAAAAAAA**GAGAGAAAGAA
AACAGAAAAAAATGGCATTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCA
CTTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCT
CAGTATTGGAAGGACTTAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAG
TGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGG
AGCTGCCTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGT
GTTAAGGCAACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACA
AAGCTCGCTGATTCACCTGGCTTTGATAAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGAT
AAAGGTGAAACCAAGCAACCCC
CGC

QA 4 505 4 505
DS 

RD RR2FL31TF 420 0 0
G
GTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCTCTTCTTCTGCATCCAAATCTCATCT
CCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTGGAAGGACTTAAGTATGC
AAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAG*GACCA
TGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAA*GTTCAG
TGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAACAAGTGAGATTATAT
CTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTT*G
ATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGC

QA 2 420 2 420
DS 

RD RR2GS02TF 666 0 0
GCTTTACAATTTTCCCACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAA**GAG
AGAAAGAAAACAGAAAAAAATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCT
CAAGCTCACTTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATG
CTTCTCCTCAGTATTGGAAGGACTTAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGA
AGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGT
GTTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAG
TGGAGAGTGTTAAGGCAACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGG
TTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTT*GATAAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGT
TGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACG
GAATACACCAAGTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCC
AGTATGTCCTAAA*CAAGAAAAAAGCAAAACAAGAGAATCCATGCTACAGTTTCAATCTT
TT*CGC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2GZ63TF 721 0 0
GGCTTTACC
ATTTTCCCACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACATAACCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAAAGAA
AACAGAAAAATATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCT
CTTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATATCCAGATGCTTCTCCT
CAGTATTGGAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAG
TGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGG
AGCTGCCTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGT
GTTAAGGCAACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACA
AAGCTCGCTGATTCACCTGGCTT*GATCAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGAT
AAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACAC
CAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCAAGTATGTC
CTAAA*CAAGAAAAA*GCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTA
CTTCTCAATGTTTCCT**ATCTTTTTT*ATCAGATTTGTATTTCTATACTGT

QA 10 721 10 721
DS 

RD RR2FK16TF 684 0 0
GG
TTCCCACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAA**GAGAGAAAGAAAAC
AGAAAAAAATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCACTT
CTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAG
TATTGGAAGGACTTAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGG
CTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGC
TGCCTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTT
AAGGCAACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAG
CTCGCTGATTCACCTGGCTT*GATAAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGATAAA
GGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAA
GTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTCCTA
AA*CAAGAAAAA*GCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTACTT
GTCA*TGTTTCCT**ATCTTTT

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR2B624TF 686 0 0
GGACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAA**GAGAGAAAGAAAACAGA
AAAATATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCTCTTCTT
CTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTAT
TGGAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTA
CTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGC
CTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAG
GCAACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTC
GCTGATTCACCTGGCTT*GATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGT
GAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTT
CTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTCCTAAAA
CAAGAAAAA*GCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTAACGCTACTTGTC
AATGTTTCCT*TATCTTTTTTTATCA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2FA04TF 747 0 0
GG
CCACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAA**GAGAGAAAGAAAACAGA
AAAATATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCTCTTCTT
CTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTAT
TGGAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTA
CTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGC
CTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTGAG
GCAACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTC
GCTGATTCACCTGGCTT*GATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGT
GAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTT
CTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTCCTAAA*
CAAGAAAAA*GCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTAACGCTACTTGTC
AATGTTTCCT*TATCTTTTTT*ATCAGATTTGTATTTCTATACTGTTTTGGTTAA*GATC
ATTCGATGAG
TCTCAGAGAGCTTTA

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR2A401JQ 733 0 0
GGACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAAA*GAGAGGAAGAAAACAGA
AAAATATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGTAAACGCTCTCAAGCTCTCTTCTT
CTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATATCCAGATGCTTCTCCTCAGTAT
TGGAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTA
CTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGC
CTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAG
GCAACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTC
GCTGATTCACCTGGCTT*GATCAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGATAAAGGT
GAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTT
CTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCAAGTATGTCCTAAA*
CAAGAAAAA*GCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTACTTCTC
AATGTTTCCT**ATCTTTTTTTATCAGATTTGTATTTCTATACTGTTTTGGTTAAAGATC
ATTCGATGAGTCC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2GS02JQB 549 0 0
GAAGGACTTAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACT
ATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCT
GAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGC
AACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGC
TGATTCACCTGGCTT*GATAAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGA
AACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCT
GCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTCCTAAA*CA
AGAAAAAAGCAAAACAAGAGAATCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTACTTGTCAA
TGTTTCCTATCTTTTTTTTTATCAGATTTGTATTTCTATACT**TTTGGTTAAAGATCAT
TCGATGAGT

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2BI76JQ 614 0 0
TTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGT
ATTGGAAGGACTTAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGC
TACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCT
GCCTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTA
AGGCAACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGC
TCGCTGATTCACCTGGCTT*GATAAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGATAAAG
GTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAG
TTTTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTCCTAA
A*CAAGAAAAAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTACTTG
TCAATGTTTCCTATCTTTTTTTTTATCAGATTTGTATTTCTATACT**TTTGGTTAAAGA
TCATTCGATGAG
CG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2CB78JQ 609 0 0
GCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTG
GAAGGACTTAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACT
ATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCT
GAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGC
AACGAGTGAGATTATATCTCCAATTTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGC
TGATTCACCTGGCTT*GATAAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGA
AACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTTT
GCGAAGAGGAAAACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTCCTAAA*CA
AGAAAAAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTACTTGTCAA
TGTTTCCTATCTTTTTTTTTATCAGATTTGTATTTCTATACT**TTTGGTTAAAGATCAT
TCGATGAG
C

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2DQ06TF 738 0 0
GGACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAA**GAGAGAAAGAAAACAGA
AAAAAATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCACTTCTT
CTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTAT
TGGAAGGACTTAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTA
CTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGC
CTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAG
GCAACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTC
GCTGATTCACCTGGCTT*GATAAACTCAAGCCCTTATTAAGATGGTTGGATGATAAAGGT
GAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTT
CTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTCCTAAA*
CAAGAAAAAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTACTTGTC
AATGTTTCCT**ATCTTTTTTTATCAGATTTGTATTTCTATACT**TTTGGTTAAAGATC
ATTCGATGAG
AAAAAAAA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2BJ88JQ 665 0 0
GG
GGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCACTTCTTCTGCATC
CAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTGGAAGG
ACTTAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGGAGGCTCAGTGGCTACTATTGG
CATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGAAGA
AAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAACGA
GTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATT
CACCTGGCTT*GATAGACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCA
AGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGCGAA
GAGGAAGACGCTGCTCGCTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTCCTAAA*CAAGAAA
AAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTACTTGTCAATGTTT
CCTATCTTTTTTTTTATCAGATTTGTATTTCTATACT**TTTGGTTAAAGATCATTCGAT
GAG

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR2BJ88TF 665 0 0
GG
GGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCACTTCTTCTGCATC
CAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTGGAAGG
ACTTAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGGAGGCTCAGTGGCTACTATTGG
CATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGAAGA
AAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAACGA
GTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATT
CACCTGGCTT*GATAGACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCA
AGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGCGAA
GAGGAAGACGCTGCTCGCTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTCCTAAA*CAAGAAA
AAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTACTTGTCAATGTTT
CCTATCTTTTTTTTTATCAGATTTGTATTTCTATACT**TTTGGTTAAAGATCATTCGAT
GAG

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR2BI76TF 722 0 0
GG
GAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAA***GAGAGAAAGAAAACAGAAAAAAATGGCAC
TGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCACTTCTTCTGCATCCAAAT
CTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTGGAAGGACTTA
AGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCA
GTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAA
*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAACGAGTGAG
ATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCT
GGCTT*GATAAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAA
CCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGAGGA
AGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTCCTAAA*CAAGAAAAAAGC
AAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTACTTGTCAATGTTTCCTAT
CTTTTTTTTTATCAGATTTGTATTTCTATACT**TTTGGTTAAAGATCATTCGATGAG
CG

QA 3 720 3 720
DS 

RD RR2DQ06JQ 730 0 0
GGACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAA**GAGAGAAAGAAAACAGA
AAAAAATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCACTTCTT
CTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTAT
TGGAAGGACTTAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTA
CTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGC
CTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAG
GCAACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTC
GCTGATTCACCTGGCTT*GATAAACTCAAGCCCTTATTAAGATGGTTGGATGATAAAGGT
GAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTT
CTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTCCTAAA*
CAAGAAAAAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTACTTGTC
AATGTTTCCTATCTTTTTTTT*ATCAGATTTGTATTTCTATACT**TTTGGTTAAAGATC
ATTCGATGAG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2A401TF 733 0 0
GGACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAAA*GAGAGGAAGAAAACAGA
AAAATATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGTAAACGCTCTCAAGCTCTCTTCTT
CTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATATCCAGATGCTTCTCCTCAGTAT
TGGAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTA
CTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGC
CTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAG
GCAACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTC
GCTGATTCACCTGGCTT*GATCAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGATAAAGGT
GAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTT
CTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCAAGTATGTCCTAAA*
CAAGAAAAA*GCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTACTTCTC
AATGTTTCCT**ATCTTTTTTTATCAGATTTGTATTTCTATACTGTTTTGGTTAAAGATC
ATTCGATGAGTCC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2BO50TF 728 0 0
GG
GAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAA**GAGAGAAAGAAAACAGAAAAATATGGCAC
TGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCTCTTCTTCTGCATCCAAAT
CTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTGGAAGGACTTA
AGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCA
GTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAA
*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAACAAGTGAG
ATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCT
GGCTT*GATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAA
CCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGAGGA
AGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTCCTAAA*CAAGAAAAA*GC
AAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTAACGCTACTTGTCAATGTTTCCT*T
ATCTTTTTT*ATCAGATTTGTATTTCTATACTGTTTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTC
TC
AGAG

QA 3 724 3 724
DS 

RD RR2E755JQ 525 0 0
GAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGAT
CATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGA
GAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAACAAGTGAGATTATATCTCCAATTTC
TGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTT*GATCAACTCAA
GCCCTTATGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAGGCAACCCCGCAGAGTTGGAAT
CCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGG
GTTTCTTTGTCTTTCCAAGTATGTCCTAAA*CAAGAAAAA*GCAAAACAAGAGAACCCAT
GCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTACTTCTCAATGTTTCCT**ATCTTTTTTTATCAGAT
TTGTATTTCTATACTGTTTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTCTC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2E795JQ 715 0 0
AAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAA**GAGAGAAAGAAAACAGAAAAAAATGGCACTGAG
AATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCACTTCTTCTGCATCCAAATCTCA
TCTC*TTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTATTGGAAGGACTTAAGTA
TGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGA
CCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAA*GTT
CAGTGACCAAAGAGAGAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAACGAGTGAGATTA
TATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGCT
T*GATAAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCC
GCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGAGGAAGAC
GCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTCCTAAA*CAAGAAAAAAGCAAAA
CAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTT
TTTTTTATCAGATTTGTATTTCTATACT**TTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2GZ63JQ 680 0 0
AACAGAAAAATATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCT
CTTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATATCCAGATGCTTCTCCT
CAGTATTGGAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAG
TGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGG
AGCTGCCTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGT
GTTAAGGCAACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACA
AAGCTCGCTGATTCACCTGGCTT*GATCAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGAT
AAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACAC
CAAGTTCTGCGAAGATGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCAAGTATGTC
CTAAA*CAAGAAAAA*GCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTA
CTTCTCAATGTTTCCT**ATCTTTTTTTATCAGATTTGTATTTCTATACTGTTTTGGTTA
AAGATCATTCGATGAGTCTC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2CI91TF 689 0 0
G
GAAAGAAAACAGAAAAATATGGCACTGAGAATGTGGGCTTCCTCAACAGCAAACGCTCTC
AAGCTCTCTTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGC
TTCTCCTCAGTATTGGAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAA
GGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTT
TTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGT
GGAGAGTGTTAAGGCAACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGT
TAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTT*GATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTT
GGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATAGGTCCAACGG
AATACACCAAGTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCA
GTATGTCCTAAA*CAAGAAAAA*GCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTT
AACGCTACTTGTCAATGTTTCCT*TATCTTTTTTTATCAGATTTGTATTTCTATACTGTT
TTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTCC
CA

QA 2 687 2 687
DS 

RD RR2CI91JQ 516 0 0
AAC
CATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAA
GTTGTTTTTGTGGAGCTGCCTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGG
AGCAGTGGAGAGTGTTAAGGCAACAAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCAT
CGAGGTTAACACAAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTT*GATTAACTCGAGCCCTTACGAAG
ATGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATAGGTC
CAACGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCT
TTCCCAGTATGTCCTAAA*CAAGAAAAA*GCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCA
ATCTTTAACGCTACTTGTCAATGTTTCCT*TATCTTTTTTTATCAGATTTGTATTTCTAT
ACTGTTTTGGTTAAAGATCATTCGATGAGTCC
C

QA 4 515 4 515
DS 

RD RR2FK16JQ 575 0 0
CAGTATTGGAAGGACTTAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTCAG
TGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGG
AGCTGCCTGAAGAAAAAA*GTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGT
GTTAAGGCAACGAGTGAGATTATATCTCCAATTTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACA
AAGCTCGCTGATTCACCTGGCTT*GATAAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGAT
AAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACAC
CAAGTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTC
CTAAA*CAAGAAAAAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACAGTTTCAATCTTTT*CGCTA
CTTGTCAATGTTTCCTATCTTTTTTTTTATCAGATTTGTATTTCTATACT**TTTGGTTA
AAGATCATTCGATGAGTATCAAGAGAGCTTTAACC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 7 43

CO CL3Contig1 670 2 2 U
GGCCCCTCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAATCTCTAGATAGATTCGTGAGCGATTTA
AAACAAAAAACAAAAAAACAAATAAATCGACCATGTTGGTGTACACCGATCTTCTCACCG
GTGATGAGCTTCTGCCTGACTCTTTCCCGTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGG
AAGTTGAAGGAAAGTGGACTACCAAGGGATGCGTAGAGGTTAACATCGGCGCCAACCCAT
CTGCTGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACAGTGTTGAAAAAGTTGTTGACA
TTGTCGACACTTTCAGACTTCAGGAGCAGCCTACTTACGACAAGAAGGGCTTCATTGCCT
ATATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACTCCCAAGCTCACCCCTGAACAGCAAGAAGAGT
TCAAGAAGGGTATCGAGGGAGCTACCAAGTGCTGAGTGAGAGAAGCTCTTGTCGGGTTTT
ACTATGGTCGGGTCGCAGCGACTCTCTTTAAGTTTATGTGTCTTTTTATGTGTTCTGTGT
TTCGTCCGTCCCCCTGTTAAAATTGTCTACCAGTTTGGTCTTGTGTCTTGTGTTGTTTGG
AGATTGTTCAAGTTATATGATCCCGAATACAACGGTTTATCAATTACTAATAGTTGAATT
TTGATCGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2B507JQ C 1
AF RR2B507TF U 1
BS 1 669 RR2B507TF
BS 670 670 RR2B507JQ

RD RR2B507JQ 670 0 0
GGCCCCTCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAATCTCTAGATAGATTCGTGAGCGATTTA
AAACAAAAAACAAAAAAACAAATAAATCGACCATGTTGGTGTACACCGATCTTCTCACCG
GTGATGAGCTTCTGCCTGACTCTTTCCCGTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGG
AAGTTGAAGGAAAGTGGACTACCAAGGGATGCGTAGAGGTTAACATCGGCGCCAACCCAT
CTGCTGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACAGTGTTGAAAAAGTTGTTGACA
TTGTCGACACTTTCAGACTTCAGGAGCAGCCTACTTACGACAAGAAGGGCTTCATTGCCT
ATATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACTCCCAAGCTCACCCCTGAACAGCAAGAAGAGT
TCAAGAAGGGTATCGAGGGAGCTACCAAGTGCTGAGTGAGAGAAGCTCTTGTCGGGTTTT
ACTATGGTCGGGTCGCAGCGACTCTCTTTAAGTTTATGTGTCTTTTTATGTGTTCTGTGT
TTCGTCCGTCCCCCTGTTAAAATTGTCTACCAGTTTGGTCTTGTGTCTTGTGTTGTTTGG
AGATTGTTCAAGTTATATGATCCCGAATACAACGGTTTATCAATTACTAATAGTTGAATT
TTGATCGTCC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2B507TF 670 0 0
GGCCCCTCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAATCTCTAGATAGATTCGTGAGCGATTTA
AAACAAAAAACAAAAAAACAAATAAATCGACCATGTTGGTGTACACCGATCTTCTCACCG
GTGATGAGCTTCTGCCTGACTCTTTCCCGTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGG
AAGTTGAAGGAAAGTGGACTACCAAGGGATGCGTAGAGGTTAACATCGGCGCCAACCCAT
CTGCTGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACAGTGTTGAAAAAGTTGTTGACA
TTGTCGACACTTTCAGACTTCAGGAGCAGCCTACTTACGACAAGAAGGGCTTCATTGCCT
ATATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACTCCCAAGCTCACCCCTGAACAGCAAGAAGAGT
TCAAGAAGGGTATCGAGGGAGCTACCAAGTGCTGAGTGAGAGAAGCTCTTGTCGGGTTTT
ACTATGGTCGGGTCGCAGCGACTCTCTTTAAGTTTATGTGTCTTTTTATGTGTTCTGTGT
TTCGTCCGTCCCCCTGTTAAAATTGTCTACCAGTTTGGTCTTGTGTCTTGTGTTGTTTGG
AGATTGTTCAAGTTATATGATCCCGAATACAACGGTTTATCAATTACTAATAGTTGAATT
TTGATCGTC
C

QA 1 669 1 669
DS 



CO CL3Contig2 796 14 13 U
GGCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAACCTTACAGATTCGTTTTGTTCCCCATCGATCG
GAGAGAGAGATAATAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTCACCGG
TGATGAGCTTCTGTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTTTGGGA
AGTTGAAGGAAAGTGGACTACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACCCCTC
TGCCGAAGAAGGTGGTGAGGATGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTTGTTGACAT
TGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCCACTTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTA
TATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCTGAGTT
CAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTTCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTT
CTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGG
TGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGT
GAGACAAGCTCTCGTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATG
TTTCTTTATATTGTTCTGTGTTCCTTCGTCACCAGTTTGCTTTTCTTTCTACTTCACATC
TCTGTTGCAAGATTCTTAAGTTATTAATCCGAAAACAATGGTTTTTAGTTGAATTTTGGT
TCGTCCTTTACTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 30 30 30 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 5 65 70 70 70 70 
70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
50 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 45 45 45 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 
75 55 70 70 70 70 70 65 65 50 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E456TF U 1
AF RR2BK19TF U 1
AF RR2HA68TF U 6
AF RR2CP34TF U 1
AF RR2BK19JQ C 35
AF RR2G415TF U 14
AF RR2G415JQ C 310
AF RR2CP34JQ C 34
AF RR2E456JQ C 307
AF RR2HA68JQ C 177
AF RR2AG02TF U 14
AF RR2BD85JQ C 100
AF RR2BD85TF U 14
AF RR2AG02JQ C 46
BS 1 48 RR2BK19TF
BS 49 49 RR2HA68TF
BS 50 70 RR2BK19TF
BS 71 74 RR2HA68TF
BS 75 75 RR2BK19TF
BS 76 76 RR2HA68TF
BS 77 703 RR2BK19TF
BS 704 704 RR2HA68TF
BS 705 729 RR2BK19TF
BS 730 730 RR2AG02TF
BS 731 754 RR2BK19TF
BS 755 786 RR2AG02TF
BS 787 796 RR2AG02JQ

RD RR2E456TF 249 0 0
GGCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAACCTTACAGATTCGTTTTGTTCCCCATCGATCG
GAGAGAGAGATAATAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTCACCGG
TGATGAGCTTCTCTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGA
AGTCGAAGGAAAGTGGACTACCCAGGGATCTGTA*AGGT*AACATTGGTGCCAACCCCTC
TGCCGAAGA

QA 1 249 1 249
DS 

RD RR2BK19TF 758 0 0
GGCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAACCTTACAGATTCGTTTTGTTTCCCATCGATCG
GAGAGAGAGA****ATTTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTCACCGG
TGATGAGCTTCTGTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTTTGGGA
AGTTGAAGGAAAGTGGACTACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACCCCTC
TGCCGAAGAAGGTGGTGAGGATGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTTGTTGACAT
TGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCCACTTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTA
TATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCTGAGTT
CAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTTCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTT
CTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGG
TGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGT
GAGACAAGCTCTCGTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATG
TTTCTTTATATTGTTCTGTGTTCCTTCGTCACCAGTTTGCTTT*CTTTCTACTTCACATC
TCTGTTGCA*GATTCTTAAGTTATTAATCCGAAA
CATG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2HA68TF 722 0 0
GGG
GCTGCGTCTCTCTCCCGCAACCTTACAGATTCGTTTTGTTCCCCATCGATCGGAGAGAGA
GATAATAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTCACCGGTGATGAGC
TTCTGTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGCATTCTTTGGGAAGTTGAAG
GAAAGTGGACTACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACCCCTCTGCCGAAG
AAGGTGGTGAGGATGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTTGTTGACATTGTCGACA
CCTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCCACTTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTATATCAAGA
AGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAGCGAGGAACAGCAAGCAGAGTTCAAGAAGG
GTATTGAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTCCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTCTTTGTCG
GGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCTACTA
ACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAG
CTCTCGTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGTTTCTTTA
TATTGTTCTGTGTTC*TTCGTCACCAGTTTGCTTTTCTTTCTACTTCACATCTCTGTTG

QA 4 722 4 722
DS 

RD RR2CP34TF 721 0 0
GGCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAACCTTACAGATTCGTTTTGTTCCCCATCGATCG
GAGAGAGAGATAATAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTCACCGG
TGATGAGCTTCTCTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGA
AGTCGAAGGAAAGTGGACTACCCAGGGACCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACCCCTC
TGCCGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTTGTTGACAT
TGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCCACTTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTA
TATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCTGAGTT
CAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTTCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTT
CTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGG
TGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGT
GAGACAAGCTCTCGTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATG
TTTCTTTATATTGTTCCGTGTTCCTTCGTCACCAGTTTGCTTTTCTTTCTACTTCACATC
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2BK19JQ 737 0 0
CAGA
TCGTTTTGTTTCCCATCGATCGGAGAGAGAGA****ATTTCAATAAAGCGACCATGTTGG
TGTACACTGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTCTGTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGA
TTGAGAATGGTATTCTTTGGGAAGTTGAAGGAAAGTGGACTACCCAGGGATCTGTAGAGG
TTAACATTGGTGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAGGATGAGGGTGTTGACGACA
CTGTTCAGAAGGTTGTTGACATTGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCCACTTACG
ACAAGAAGGGGTTCATCGCCTATATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCA
ACGAGGAACAGCAAGCTGAGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTTC
CCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGG
TCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTT
TGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTCTCGTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCA
GCGACTCTATTTAAGTCTTATGTTTCTTTATATTGTTCTGTGTTCCTTCGTCACCAGTTT
GCTTTTCTTTCTACTTCACATCTCTGTTGCAAGATTCTTAAGTTATTAATCCGAAAACAA
TGGTTTTTAGTTG

QA 5 737 5 737
DS 

RD RR2G415TF 763 0 0
GTCTCTCTCCCGCAACCTTACAGATTCGTTTTGTTTCCCATCGATCGGAGAGAGAGAGAA
TAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACCGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTCTG
TCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTTTGGGAAGTTGAAGGAAAG
TGGACTACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAGGT
GGTGAGGATGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTTGTTGACATTGTCGACACCTTC
AGGCTCCAGGAGCAGCCCACTTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTATATCAAGAAGTAC
ATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCTGAGTTCAAGAAGGGTATT
GAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTTCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGGAG
AGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCTACTAACCCT
ACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTCTC
GTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGTTTCTTTATATTG
TTCTACGTTCCTTCGTCACCAGTTTGCTTTTCTTTCTACTTCACATCTCTGTTGCAAGAT
TCTTAAGTTATTAATCCGAAAACAATGGTTTTTAGTTGAA
AAA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2G415JQ 462 0 0
CTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCCACTTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTATATCAAGAA
GTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCTGAGTTCAAGAAGGG
TATTGAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTTCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTTTTTGTTGG
GGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCTACTAA
CCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAGC
TCTCGTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGTTTCTTTAT
ATTGTTTTACGTTCCTTCGTCACCAGTTTGCTTTTCTTTCTACTTCACATCTCTGTTGCA
AGATTCTTAAGTTATTAATCCGAAAACAATGGTTTTTAGTTG

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2CP34JQ 738 0 0
CAGATTCGTTTTGTTCCCCATCGATCGGAGAGAGAGATAATAATTCAATAAAGCGACCAT
GTTGGTGTACACTGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTCTCTCTGACTCTTTCCCTTACAA
GGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGAAGTCGAAGGAAAGTGGACTACCCAGGGATCTGT
AGAGGTTAACATTGGTGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGA
CGACACTGTTCAGAAGGTTGTTGACATTGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCCAC
TTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTATATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAA
GCTCAACGAGGAACAGCAAGCTGAGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTCTT
GCTTCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCAC
TGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACA
TGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTCTCGTTGGGGTTACTGTGGTCGG
TCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGTTTCTTTATATTGTTCCGTGTTCCTTCGTCACC
AGTTTGCTTTTCTTTCTACTTCACATCTCTGTTGCAAGATTCTTAAGTTATTAATCCGAA
AACAATGGTTTTTAGTTG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2E456JQ 465 0 0
CACCTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCCACTTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTATATCAA
GAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCTGAGTTCAAGAA
GGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTTCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTCTTTGT
TGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCTAC
TAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGAGACA
AGCTCTCGTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGTTTCTT
TATATTGTTCTGTGTTCCTTCGTCACCAGTTTGCTTTTCTTTCTACTTCACATCTCTGTT
GCAAGATTCTTAAGTTATTAATCCGAAAACAATGGTTTTTAGT
CG

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2HA68JQ 595 0 0
GGGAAGTTGAAGGAAAGTGGACTACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACC
CCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAGGATGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTTGTTG
ACATTGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCCACTTACGACAAGAAGGGGTTCATCG
CCTATATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAGCGAGGAACAGCAAGCAG
AGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTCCCCAAGCTCAAGGACTTCC
AGTTTTTTGTCGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTTTTTGCTTACTACAAGG
AGGGTGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTTGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCT
AAGTGAGACAAGCTCTCGTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAGGGACTCTATTTAAGTTT
TATGTTTCTTTATATTGTTCTGTGTTCCTTCGTCACCAGTTTGCTTTTCTTTTTACTTCA
CATTTTTGTTGCAAGATTTTTAAGTTATTAATCCGAAAACAATGGTTTTTAGTTG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2AG02TF 780 0 0
GTCTCTCTCCCGCAACCTTACAGATTCGTTTTGTTTCCCATCGATCGGAGAGAGAGAGAA
TAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTCTG
TCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTTTGGGAAGTTGAAGGAAAG
TGGACTACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAGGT
GGTGAGGATGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTTGTTGACATTGTCGACACCTTC
AGGCTCCAGGAGCAGCCCACTTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTATATCAAGAAGTAC
ATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCTGAGTTCAAGAAGGGTATT
GAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTTCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGGAG
AGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCTACTAACCCT
ACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTCTC
GTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGTTTCTTTATATTG
TTCTGTGTTCCTTCGTCACCAGTTTGCTTTTCTTTCTACTTCACATCTCTGTTGCAAGAT
TCTTAAGTTATTAATCCGAAAACAATGGTTTTTAGTTGAATTTTGGTTCGTCC
TTTACTT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2BD85JQ 689 0 0
GTACACTGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTCTCTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGAT
TGAGAATGGTATTCTCTGGGAAGTCGAAGGAAAGTGGACTACCCAGGGATCTGTAGAGGT
TAACATTGGTGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACAC
TGTTCAGAAGGTTGTTGACATTGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCCACTTACGA
CAAGAAGGGGTTCATCGCCTATATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAA
CGAGGAACAGCAAGCTGAGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTTCC
CAAGCTCAAGGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGT
CTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTT
GAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTCTCGTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAG
CGACTCTATTTAAGTCTTATGTTTCTTTATATTGTTCTGTGTTCCTTCGTCACCAGTTTG
CTTTTCTTTTTACTTCACATCTCTGTTGCAAGATTCTTAAGTTATTAATCCGAAAACAAT
GGTTTTTAGTTGAATTTTGGTTCGTCC
TT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2BD85TF 773 0 0
GTCTCTCTCCCGCAACCTTACAGATTCGTTTTGTTCCCCATCGATCGGAGAGAGAGATAA
TAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTCTC
TCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGAAGTCGAAGGAAAG
TGGACTACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAGGT
GGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTTGTTGACATTGTCGACACCTTC
AGGCTCCAGGAGCAGCCCACTTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTATATCAAGAAGTAC
ATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCTGAGTTCAAGAAGGGTATT
GAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTTCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGGAG
AGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCTACTAACCCT
ACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTCTC
GTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGTTTCTTTATATTG
TTCTGTGTTCCTTCGTCACCAGTTTGCTTTTCTTTCTACTTCACATCTCTGTTGCAAGAT
TCTTAAGTTATTAATCCGAAAACAATGGTTTTTAGTTGAATTTTGGTTCGTCC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2AG02JQ 751 0 0
GTTTCCCATCGATCGGAGAGAGAGAGAATAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACAC
TGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTCTGTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAA
TGGTATTCTTTGGGAAGTTGAAGGAAAGTGGACTACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACAT
TGGTGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAGGATGAGGGTGTTGACGACACTGTTCA
GAAGGTTGTTGACATTGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCCACTTACGACAAGAA
GGGGTTCATCGCCTATATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGA
ACAGCAAGCTGAGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTTCCCAAGCT
CAAGGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGC
TTACTACAAGGAGGGTGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGA
GGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTCTCGTTGGGGTTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTC
TATTTAAGTCTTATGTTTCTTTATATTGTTCTGTGTTCCTTCGTCACCAGTTTGCTTTTC
TTTCTACTTCACATCTCTGTTGCAAGATTCTTAAGTTATTAATCCGAAAACAATGGTTTT
TAGTTGAATTTTGGTTCGTCCTTTACTTTTT

QA 1 751 1 751
DS 



CO CL3Contig3 786 9 10 U
GGACGAACCAAAATTTAACTAAAAAACCATTGTTTTCCGATTAATAACTTAAGAATCTTG
CAACAGAGATGAGAAGTAGAAAGAAAAGTAATCAGGTAACGAAAAGACACAGAACAATAT
AAAGAAACATAAGACTTAAATAGAGTCGCTGCGACCGACCACAGTACCCCAACGAGAGCT
TGTCTCACTTAGCACTTGACCTCCTTCAAACCATGTCCGAAGTACAAAAATGTAGGGTTA
GTAGCACCCTCCTTGTAGTAAGCAAAGACCACAGTGCTGTCATCGTGCATGCTCTCCCCA
ACAAAGAACTGGAAGTCCTTGAGCTTAGGGAGCAAGAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCC
TTCTTGAACTCAGCTTGCTGTTCCTCGTTAAGCTTGGGGGTCAAAAGCTTGATGTACTTC
TTGATATAGGCGATGAACCCCTTCTTGTCGTAGGTGGGCTGCTCCTGGAGCCTGAAGGTG
TCGACAATGTCAACAACCTTCTGAACAGTGTCGTCAACACCCTCATCCTCACCACCTTCT
TCGGCAGAGGGGTTGGCACCAATGTTAACCTCTACAGATCCCTGGGTAGTCCACTTTCCT
TCAACTTCCCAGAGAATACCATTCTCAATCTCCTTGTAAGGGAAAGAGTCAGACAGAAGC
TCATCACCGGTGAGAAGATCAGTGTACACCAACATGGTCGCTTTATTGAATTATTATCTC
TCTCTCCGATCGATGGGGAACAAAACGAATCTGTAAGGTTGCGGGAGAGAGACGCAGCGA
CGAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 35 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 25 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2DS91JQ U 1
AF RR2DS91TF C 1
AF RR2ED68JQ U 31
AF RR2AD92JQ U 73
AF RR2BT01JQ U 31
AF RR2DC11JQ U 31
AF RR2BT01TF C 31
AF RR2DC11TF C 150
AF RR2ED68TF C 22
BS 1 452 RR2DS91JQ
BS 453 453 RR2BT01JQ
BS 454 481 RR2DS91JQ
BS 482 482 RR2BT01JQ
BS 483 483 RR2DS91JQ
BS 484 484 RR2BT01JQ
BS 485 492 RR2DS91JQ
BS 493 749 RR2BT01JQ
BS 750 754 RR2DC11JQ
BS 755 786 RR2BT01TF

RD RR2DS91JQ 493 0 0
GGACGAACCAAAATTTAACTAAAAAACCATTGTTTTCCGATTAATAACTTAAGAATCTTG
CAACAGAGATGAGAAGTAGAAAGAAAAGTAATCAGGTAACGAAAAGACACAGAACAATAT
AAAGAAACATAAGACTTAAATAGAGTCGCTGCGACCGACCACAGTACCCCAACGAGAGCT
TGTCTCACTTAGCACTTGACCTCCTTCAAACCATGTCCGAAGTACAAAAATGTAGGGTTA
GTAGCACCCTCCTTGTAGTAAGCAAAGACCACAGTGCTGTCATCGTGCATGCTCTCCCCA
ACAAAGAACTGGAAGTCCTTGAGCTTAGGGAGCAAGAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCC
TTCTTGAACTCAGCTTGCTGTTCCTCGTTAAGCTTGGGGGTCAAAAGCTTGATGTACTTC
TTGATATAGGCGATGAACCCCTTCTTGTCGTAAGTGGGCTGCTCCTGGAGCCTGAAGGTG
TTGGCAATGTCA
C

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR2DS91TF 493 0 0
GGACGAACCAAAATTTAACTAAAAAACCATTGTTTTCCGATTAATAACTTAAGAATCTTG
CAACAGAGATGAGAAGTAGAAAGAAAAGTAATCAGGTAACGAAAAGACACAGAACAATAT
AAAGAAACATAAGACTTAAATAGAGTCGCTGCGACCGACCACAGTACCCCAACGAGAGCT
TGTCTCACTTAGCACTTGACCTCCTTCAAACCATGTCCGAAGTACAAAAATGTAGGGTTA
GTAGCACCCTCCTTGTAGTAAGCAAAGACCACAGTGCTGTCATCGTGCATGCTCTCCCCA
ACAAAGAACTGGAAGTCCTTGAGCTTAGGGAGCAAGAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCC
TTCTTGAACTCAGCTTGCTGTTCCTCGTTAAGCTTGGGGGTCAAAAGCTTGATGTACTTC
TTGATATAGGCGATGAACCCCTTCTTGTCGTAAGTGGGCTGCTCCTGGAGCCTGAAGGTG
TTGGCAATGTCA
C

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR2ED68JQ 526 0 0
TGTTTTCCGATTAATAACTTAAGAATCTTGCAACAGAAATGAAAAGTAAAAAGAAAAGTA
ATCAGGTAACGAAAAGACACAGAACAATATAAAGAAACATAAGACTTAAATAGAGTCGCT
GCGACCGACCACAGTACCCCAACGAGAGCTTGTCTCACTTAGCACTTGACCTCCTTCAAA
CCATGTCCGAAGTACAAAAATGTAGGGTTAGTAGTACCCTCCTTGTAGTAAGCAAAGACC
ACAGTGCTGTCATCGTGCATGCTCTCCCCAACAAAAAACTGGAAGTCCTTGAGCTTAGGG
AGCAAGAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCAGCTTGCTGTTCCTCGTTA
AGCTTGGGGGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTGATATAGGCGATGAACCCCTTCTTGTCG
TAGGTGGGCTGCTCCTGGAGCCTGAAGGTGTCGACAATGTCAACAACCTTCTGAACAGTG
TCGTCAACACCCTCATCCTCACCACCTTCTTCGGCAGAGGGGTTGG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2AD92JQ 582 0 0
GAAGTATAAAGAAAAGTAATCAGGTAACGAAAAGACACAGAACAATATAAAGAAACATAA
GACTTAGATAGAGTCGCTGCGACCGACCACAGTACCCCAACGAGAGCTTGTCTCACTTAG
CACTTGACCTCCTTCAAACCATGTCCGAAGTACAAAAATGTAGGGTTAGTAGCACCCTCC
TTGTAGTAAGCAAAGACCACAGTGCTGTCATCGTGCATGCTCTCCCCAACAAAGAACTGG
AAGTCCTTGAGCTTAGGGAGCAAGAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCA
GCTTGCTGTTCCTCGTTAAGCTTGGGGGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTGATATAGGCG
ATGAACCCCTTCTTGTCGTAGGTGGGCTGCTCCTGGAGCCTGAAGGTGTCGACAATGTCA
ACAACCTTCTGAACAGTGTCGTCAACACCCTCATCCTCACCACCTTCTTCGGCAGAGGGG
TTGGCACCAATGTTAACCTCTACAGATCCCTGGGTAGTCCACTTTCCTTCAACTTCCCAG
AGAATACCATTCTCAATCTCCTTGTAAGGGAAAGAGTCAGAC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2BT01JQ 719 0 0
TGTTTTCCGATTAATAACTTAAGAATCTTGCAACAGAGATGAGAAGTAGAAAGAAAAGTA
ATCAGGTAACGAAAAGACACAGAACAATATAAAGAAACATAAGACTTAAATAGAGTCGCT
GCGACCGACCACAGTACCCCAACGAGAGCTTGTCTCACTTAGCACTTGACCTCCTTCAAA
CCATGTCCGAAGTACAAAAATGTAGGGTTAGTAGCACCCTCCCTGTAGTAAGCAAAGACC
ACAGTGCTGTCATCGTGCATGCTCTCCCCAACAAAGAACTGGAAGTCCTTGAGCTTAGGG
AGCAAGAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCAGCTTGCTGTTCCTCGTTA
AGCTTGGGGGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTGATATAGGCGATGAACCCCTTCTTGTCG
TAGGTGGGCTGCTCCTGGAGCCTGAAGGTGTCGACAATGTCAACAACCTTCTGAACAGTG
TCGTCAACACCCTCATCCTCACCACCTTCTTCGGCAGAGGGGTTGGCACCAATGTTAACC
TCTACAGATCCCTGGGTAGTCCACTTTCCTTCAACTTCCCAGAGAATACCATTCTCAATC
TCCTTGTAAGGGAAAGAGTCAGACAGAAGCTCATCACCGGTGAGAAGATCAGTGTACACC
AACATGGTCGCTTTATTGAATTATTATCTCTCTCTCCGATCGATGGGGAACAAAACGAA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2DC11JQ 724 0 0
TGTTTTCCGATTAATAACTTAAGAATCTTGCAACAGAGATGAGAAGTAGAAAGAAAAGTA
ATCAGGTAACGAAAAGACACAGAACAATATAAAGAAACATAAGACTTAAATAGAGTCGCT
GCGACCGACCACAGTACCCCAACGAGAGCTTGTCTCACTTAGCACTTGACCTCCTTCAAA
CCATGTCCGAAGTACAAAAATGTAGGGTTAGTAGCACCCTCCCTGTAGTAAGCAAAGACC
ACAGTGCTGTCATCGTGCATGCTCTCCCCAACAAAGAACTGGAAGTCCTTGAGCTTAGGG
AGCAAGAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCAGCTTGCTGTTCCTCGTTA
AGCTTGGGGGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTGATATAGGCGATGAACCCCTTCTTGTCG
TAGGTGGGCTGCTCCTGGAGCCTGAAGGTGTCGACAATGTCAACAACCTTCTGAACAGTG
TCATCAACACCCTCATCCTCACCACCTTCTTCGGCAGAGGGGTTGGCACCAATGTTAACC
TCTACAGATCCCTGGGTAGTCCACTTTCCTTCAACTTCCCAGAGAATACCATTCTCAATC
TCCTTGTAAGGGAAAGAGTCAGACAGAAGCTCATCACCGGTGAGAAGATCAGTGTACACC
AACATGGTCGCTTTATTGAATTATTATCTCTCTCTCCGATCGATGGGGAACAAAACGAAT
CTGT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2BT01TF 756 0 0
TT
TTTTCCGATTAATAACTTAAGAATCT*GCAACAGAGATGAGAAGTAGAAAGAAAAGTAAT
CAGGTAACGAAAAGACACAGAACAATATAAAGAAACATAAGACTTAAATAGAGTCGCTGC
GACCGACCACAGTACCCCAACGAGAGCTTGTCTCACTTAGCACTTGACCTCCTTCAAACC
ATGTCCGAAGTACAAAAATGTAGGGTTAGTAGCACCCTCCCTGTAGTAAGCAAAGACCAC
AGTGCTGTCATCGTGCATGCTCTCCCCAACAAAGAACTGGAAGTCCTTGAGCTTAGGGAG
CAAGAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCAGCTTGCTGTTCCTCGTTAAG
CTTGGGGGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTGATATAGGCGATGAACCCCTTCTTGTCGTA
GGTGGGCTGCTCCTGGAGCCTGAAGGTGTCGACAATGTCAACAACCTTCTGAACAGTGTC
GTCAACACCCTCATCCTCACCACCTTCTTCGGCAGAGGGGTTGGCACCAATGTTAACCTC
TACAGATCCCTGGGTAGTCCACTTTCCTTCAACTTCCCAGAGAATACCATTCTCAATCTC
CTTGTAAGGGAAAGAGTCAGACAGAAGCTCATCACCGGTGAGAAGATCAGTGTACACCAA
CATGGTCGCTTTATTGAATTATTATCTCTCTCTCCGATCGATGGGGAACAAAACGAATCT
GTAAGGTTGCGGGAGAGAGACGCAGCGACGAGCC

QA 3 756 3 756
DS 

RD RR2DC11TF 637 0 0
TGCGACCGACCACAGTACCCCAACGAGAGCTTGTCTCACTTAGCACTTGACCTCCTTCAA
ACCATGTCCGAAGTACAAAAATGTAGGGTTAGTAGCACCCTCCCTGTAGTAAGCAAAGAC
CACAGTGCTGTCATCGTGCATGCTCTCCCCAACAAAGAACTGGAAGTCCTTGAGCTTAGG
GAGCAAGAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCAGCTTGCTGTTCCTCGTT
AAGCTTGGGGGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTGATATAGGCGATGAACCCCTTCTTGTC
GTAGGTGGGCTGCTCCTGGAGCCTGAAGGTGTCGACAATGTCAACAACCTTCTGAACAGT
GTCATCAACACCCTCATCCTCACCACCTTCTTCGGCAGAGGGGTTGGCACCAATGTTAAC
CTCTACAGATCCCTGGGTAGTCCACTTTCCTTCAACTTCCCAGAGAATACCATTCTCAAT
CTCCTTGTAAGGGAAAGAGTCAGACAGAAGCTCATCACCGGTGAGAAGATCAGTGTACAC
CAACATGGTCGCTTTATTGAATTATTATCTCTCTCTCCGATCGATGGGGAACAAAACGAA
TCTGTAAGGTTGCGGGAGAGAGACGCAGCGACGAGCC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2ED68TF 765 0 0
CTAAAAACCATG
TTTCCGATTAATAACTTAAGAATCT*GCAACAGAGATGAGAAGTAGAAAGAAAAGTAATC
AGGTAACGAAA*GACACAGAACAATATAAAGAAACATAAGACTTAAATAGAGTCGCTGCG
ACCGACCACAGTACCCCAACGAGAGCTTGTCTCACTTAGCACTTGACCTCCTTCAAACCA
TGTCCGAAGTACAAAAATGTAGGGTTAGTAGTACCCTCCTTGTAGTAAGCAAAGACCACA
GTGCTGTCATCGTGCATGCTCTCCCCAACAAAGAACTGGAAGTCCTTGAGCTTAGGGAGC
AAGAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCAGCTTGCTGTTCCTCGTTAAGC
TTGGGGGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTGATATAGGCGATGAACCCCTTCTTGTCGTAG
GTGGGCTGCTCCTGGAGCCTGAAGGTGTCGACAATGTCAACAACCTTCTGAACAGTGTCG
TCAACACCCTCATCCTCACCACCTTCTTCGGCAGAGGGGTTGGCACCAATGTTAACCTCT
ACAGATCCCTGGGTAGTCCACTTTCCTTCAACTTCCCAGAGAATACCATTCTCAATCTCC
TTGTAAGGGAAAGAGTCAGACAGAAGCTCATCACCGGTGAGAAGATCAGTGTACACCAAC
ATGGTCGCTTTATTGAATTATTATCTCTCTCTCCGATCGATGGGGAACAAAACGAATCTG
TAAGGTTGCGGGAGAGAGACGCAGCGACGAGCC

QA 13 765 13 765
DS 



CO CL3Contig4 938 8 18 U
CTATGCGACGATGCTTATACTTTGCATTAAACGAGATCTAAAATCCAAGGCTTTGCCAAA
CAAGTGAGGTGAGTCGAGTAACAATGCTTAAATTAGCCGAACATGGATCAGATCTAAGAT
ACAAAAAGTAGACGATCAAAATTCAACTATTAGTAATTGATAAACCGTTGT*ATTCGGGA
TCATATAACTTGAACAATCTCCAAACAACACAAGACACA**AGAAAGACCAAACTGGTAG
ACAATTTTAATAGGGGGACGGACGAAACACAGAACACATAAAAAGACACA**AACTTAAA
GAGAGTCGCTGCGACCCGACCATAGTAAAACCCGACAAGAGCTTCTCTC**ACTCAGCAC
TTGACTTCCTTCAAACCATGTGCAAAGTACAAAAATGTTGGGTTAGTTGCACCCTCCTTG
TAGTAAGCAAAGACAATAGTGCTGTCATCGTGCATGCCCTCCCCAACAAAGAATTGGAAG
TCCTTGAGCTTGGGGAGCAAAAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCTTCT
TGCTGTTCCGGGGTGAGCTTGGGAGTCAAAAGCTTGATGTACTTTTTGATATAGGCAATG
AAGCCCTTCTTGTCGTAAGTAGGCTGCTCCTGAAGTCTGAAGGTGTCGACAATGTCAACA
ACCTTTTCAACAGAGTCGTCAACACCCTCGTCCTCACCACCTTCTTCAGCAGATGGGTTG
GCACCGATATTAACCTCTACACATCCCTTGGTAGTCCACTTTCCTTCAACTTCCCAGAGA
ATACCATTCTCAATCTCCTTGTAAGGGAAAGAGTCAGAGAGAAGCTCATCACCGGTGAGA
AGATCGGTGTACACCAACATGGTCGCTTTATTTGTTTTTTTTTTTTTTAATCGCTCACGA
ATCTATCTAGAGATTGCGGGAGAGAGACGCAGCGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 
40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 0 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2DX15JQ U 130
AF RR2DZ89JQ U 1
AF RR2FT83JQ U 152
AF RR2B672JQ U 121
AF RR2A217JQ U 121
AF RR2A217TF C 121
AF RR2DJ88TF C 156
AF RR2B672TF C 706
BS 1 219 RR2DZ89JQ
BS 220 221 RR2A217JQ
BS 222 349 RR2DZ89JQ
BS 350 351 RR2A217JQ
BS 352 627 RR2DZ89JQ
BS 628 628 RR2A217JQ
BS 629 633 RR2DZ89JQ
BS 634 728 RR2A217JQ
BS 729 729 RR2B672JQ
BS 730 784 RR2A217JQ
BS 785 785 RR2FT83JQ
BS 786 831 RR2A217JQ
BS 832 832 RR2FT83JQ
BS 833 865 RR2A217JQ
BS 866 866 RR2B672JQ
BS 867 919 RR2A217JQ
BS 920 936 RR2DJ88TF
BS 937 938 RR2B672TF

RD RR2DX15JQ 373 0 0
C
GACGATCAAAATTCAACTATTAGTAATTGATAAACCGTTGT*ATTCGGGATCATATAACT
TGAACAATCTCAAAACAACACAAGACACACAAGAAAGACCAAACTGGTAGACAATTTTAA
TAGGGGGACGGACGAAACACAGAACACATAAAAAGACACA**AACTTAAAGAGAGTCGCT
GCGACCCGACCATAGTAAAACCCGACAAGAGCTTCTCTCTCACTCAGCACTTGACTTCCT
TCAAACCATGTGCAAAGTACAAAAATGTTGGGTTAGTTGCACCCTCCTTGTAGTAAGCAA
AGACAATAGTGCTGTCATCGTGCATGCCCTCCCCAACAAAGAATTGGAAGTCCTTGAGCT
TGGGGAGCAAAA

QA 2 373 2 373
DS 

RD RR2DZ89JQ 633 0 0
CTATGCGACGATGCTTATACTTTGCATTAAACGAGATCTAAAATCCAAGGCTTTGCCAAA
CAAGTGAGGTGAGTCGAGTAACAATGCTTAAATTAGCCGAACATGGATCAGATCTAAGAT
ACAAAAAGTAGACGATCAAAATTCAACTATTAGTAATTGATAAACCGTTGT*ATTCGGGA
TCATATAACTTGAACAATCTCCAAACAACACAAGACACACAAGAAAGACCAAACTGGTAG
ACAATTTTAATAGGGGGACGGACGAAACACAGAACACATAAAAAGACACA**AACTTAAA
GAGAGTCGCTGCGACCCGACCATAGTAAAACCCGACAAGAGCTTCTCTCTCACTCAGCAC
TTGACTTCCTTCAAACCATGTGCAAAGTACAAAAATGTTGGGTTAGTTGCACCCTCCTTG
TAGTAAGCAAAGACAATAGTGCTGTCATCGTGCATGCCCTCCCCAACAAAGAATTGGAAG
TCCTTGAGCTTGGGGAGCAAAAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCTTCT
TGCTGTTCCGGGGTGAGCTTGGGAGTCAAAAGCTTGATGTACTTTTTGATATAGGCAATG
AAGCCCTTCTTGTCGTAAGTAGGCTGCCCCTGA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2FT83JQ 688 0 0
G
GTAATTGATAAACCGTTGT*ATTCGGGATCATATAACTTGAACAATCTCCAAACAACACA
AGACACACAAGAAAGACCAAACTGGTAGACAATTTTAATAGGGGGACGGACGAAACACAG
AACACATAAAAAGACACA**AACTTAAAGAGAGTCGCTGCGACCCGACCATAGTAAAACC
CGACAAGAGCTTCTCTCTCACTCAGCACTTGACTTCCTTCAAACCATGTGCAAAGTACAA
AAATGTTGGGTTAGTTGCACCCTCCTTGTAGTAAGCAAAGACAATAGTGCTGTCATCGTG
CATGCCCTCCCCAACAAAGAATTGGAAGTCCTTGAGCTTGGGGAGCAAAAACTTGGTAGC
TCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCTTCTTGCTGTTCCGGGGTGAGCTTGGGAGTCAAAAG
CTTGATGTACTTTTTGATATAGGCAATGAAGCCCTTCTTGTCGTAAGTAGGCTGCTCCTG
AAGTCTGAAGGTGTCGACAATGTCAACAACCTTTTCAACAGAGTCGTCAACACCCTCGTC
CTCACCACCTTCTTCAGCAGATGGGTTGGCACCGATGTTAACCTCTACACATCCCTTGGT
AGTCCACTTTCCTTCAACTTCCCAGAGAATACCATTCTCAATCTCCTTGTAAGGGAAAGA
GTCAGAGAGAAGCTCATCACCGGTGAG

QA 2 688 2 688
DS 

RD RR2B672JQ 763 0 0
A
CAAAAAGTAGACGATCAAAATTCAACTATTAGTAATTGATAAACCGTTGT*ATTCGGGAT
CATATAACTTGAACAATCTCCAAACAACACAAGACACA**AGAAAGACCAAACTGGTAGA
CAATTTTAATAGGGGGACG*ACGAAACACAGAACACATAAAAAGACACA**AACTTAAAG
AGAGTCGCTGCGACCCGACCATAGTAAAACCCGACAAGAGCTTCTCTC**ACTCAGCACT
TGACTTCCTTCAAACCATGTGCAAAGTACAAAAATGTTGGGTTAGTTGCACCCTCCTTGT
AGTAAGCAAAGACAATAGTGCTGTCATCGTGCATGCCCTCCCCAACAAAGAATTGGAAGT
CCTTGAGTTTGGGGAGCAAAAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCTTCTT
GCTGTTCAGGGGTGAGCTTGGGAGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTGATATAGGCAATGA
AGCCCTTCTTGTCGTAAGTAGGCTGCTCCTGAAGTCTGAAGGTGTCGACAACGTCAACAA
CCTTTTCAACAGAGTCGTCAACACCCTCGTCCTCACCACCTTCTTCAGCAGATGGGTTGG
CGCCGATATTAACCTCTACACATCCCTTGGTAGTCCACTTTCCTTCAACTTCCCAGAGAA
TACCATTCTCAATCTCCTTGTAAGGGAAAGAGTCAGAGAGAAGCTCATCACCGGTGAGAA
GATCGGTGTACACCAACATGGTCGCTTTATTCGTTTTTTTTT

QA 2 763 2 763
DS 

RD RR2A217JQ 801 0 0
G
CAAAAAGTAGACGATCAAAATTCAACTATTGGTAATTGATAAACCGTTGTTATTCGGGAT
CATATAACTTGAACAATCTCCAAACAACACAAGACACA**AGAAAGACCAAACTGGTAGA
CAATTTTAATAGGGGGACGGACGAAACACAGAACACATAAAAAGACACATAAACTTAAAG
AGAGTCGCTGCGACCCGACCATAGTAAAACCCGACAAGAGCTTCTCTC**ACTCAGCACT
TGACTTCCTTCAAACCATGTGCAAAGTACAAAAATGTTGGGTTAGTTGCACCCTCCTTGT
AGTAAGCAAAGACAATAGTGCTGTCATCGTGCATGCCCTCCCCAACAAAGAATTGGAAGT
CCTTGAGCTTGGGGAGCAAAAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCTTCTT
GCTGTTCCGGGGTGAGCTTGGGAGTCAAAAGCTTGATGAACTTTTTGATATAGGCAATGA
AGCCCTTCTTGTCGTAAGTAGGCTGCTCCTGAAGTCTGAAGGTGTCGACAATGTCAACAA
CCTTTTCAACAGAGTCGTCAACACCCTCGTCCTCACCACCTTCTTCAGCAGATGGGTTGG
CACCGATGTTAACCTCTACACATCCCTTGGTAGTCCACTTTCCTTCAACTTCCCAGAGAA
TACAATTCTCAATCTCCTTGTAAGGGAAAGAGTCAGAGAGAAGCTCATCATCGGTGAGAA
GATCGGTGTACACCAACATGGTCGATTTATTTGTTTTTTTTTTTTTTAATCGCTCACGAA
TCTATCTAGAGATTGCGG
CC

QA 2 799 2 799
DS 

RD RR2A217TF 801 0 0
G
CAAAAAGTAGACGATCAAAATTCAACTATTGGTAATTGATAAACCGTTGTTATTCGGGAT
CATATAACTTGAACAATCTCCAAACAACACAAGACACA**AGAAAGACCAAACTGGTAGA
CAATTTTAATAGGGGGACGGACGAAACACAGAACACATAAAAAGACACATAAACTTAAAG
AGAGTCGCTGCGACCCGACCATAGTAAAACCCGACAAGAGCTTCTCTC**ACTCAGCACT
TGACTTCCTTCAAACCATGTGCAAAGTACAAAAATGTTGGGTTAGTTGCACCCTCCTTGT
AGTAAGCAAAGACAATAGTGCTGTCATCGTGCATGCCCTCCCCAACAAAGAATTGGAAGT
CCTTGAGCTTGGGGAGCAAAAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCTTCTT
GCTGTTCCGGGGTGAGCTTGGGAGTCAAAAGCTTGATGAACTTTTTGATATAGGCAATGA
AGCCCTTCTTGTCGTAAGTAGGCTGCTCCTGAAGTCTGAAGGTGTCGACAATGTCAACAA
CCTTTTCAACAGAGTCGTCAACACCCTCGTCCTCACCACCTTCTTCAGCAGATGGGTTGG
CACCGATGTTAACCTCTACACATCCCTTGGTAGTCCACTTTCCTTCAACTTCCCAGAGAA
TACAATTCTCAATCTCCTTGTAAGGGAAAGAGTCAGAGAGAAGCTCATCATCGGTGAGAA
GATCGGTGTACACCAACATGGTCGATTTATTTGTTTTTTTTTTTTTTAATCGCTCACGAA
TCTATCTAGAGATTGCGG
CC

QA 2 799 2 799
DS 

RD RR2DJ88TF 783 0 0
ATTGATAAACCGTTGT*ATTCGGGATCATATAACTTGAACAATCTCCAAACAACACAAGA
CACA**AGAAAGACCAAACTGGTAGACAATTTTAATAGGGGGACG*ACGAAACACAGAAC
ACATAAAAAGACACA**AACTTAAAGAGAGTCGCTGCGACCCGACCATAGTAAAACCCGA
CAAGAGCTTCTCTC**GCTCAGCACTTGACTTCCTTCAAACCATGTGCAAAGTACAAAAA
TGTTGGGTTAGTTGCACCCTCCTTGTAGTAAGCAAAGACAATAGTGCTGTCATCGTGCAT
GCCCTCCCCAACAAAGAATTGGAAGTCCTTGAGTTTGGGGAGCAAAAACTTGGTAGCTCC
CTCAATACCCTTCTTGAACTCTTCTTGCTGTTCAGGGGTGAGCTTGGGAGTCAAAAGCTT
GATGTACTTCTTGATATAGGCAATGAAGCCCTTCTTGTCGTAAGTAGGCTGCTCCTGAAG
TCTGAAGGTGTCGACAATGTCAACAACCTTTTCAACAGAGTCGTCAACACCCTCGTCCTC
ACCACCTTCTTCAGCAGATGGGTTGGCGCCGATATTAACCTCTACACATCCCTTGGTAGT
CCACTTTCCTTCAACTTCCCAGAGAATACCATTCTCAATCTCCTTGTAAGGGAAAGAGTC
AGAGAGAAGTTCATCACCGGTGAGAAGATCGGTGTACACCAACATGGTCGCTTTATTTGT
TTTTTTTTTTA**AATCGCTCACGAATCTATCTAGAGATTGCGGGAGAGAGACGCAGCGA
C
CC

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2B672TF 233 0 0
TCAGCAGATGGGTTGGCGCCGATATTAACCTCTACACATCCCTTGGTAGTCCACTTTCCT
TCAACTTCCCAGAGAATACCATTCTCAATCTCCTTGTAAGGGAAAGAGTCAGAGAGAAGC
TCATCACCGGTGAGAAGATCGGTGTACACCAACATGGTCGCTTTATTCGTTTTTTTTTTA
***AATCGCTCACGAATCTATCTAGAGATTGCGGGAGAGAGACGCAGCGACCC

QA 1 233 1 233
DS 



CO CL3Contig5 709 4 9 U
GGCCCCTCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAATCTCTAGATAGATTCGTGAGCGATTAA
AAAAAAAAAAAAA*ACAAATAAATCGACCATGTTGGTGTACACCGATCTTCTCACCGGTG
ATGAGCTTCTCTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGAAG
TTGAAGGAAAGTGGACTACCAAGGGATGTGTAGAGGTTAACATCGGTGCCAACCCATCTG
CTGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACTCTGTTGAAAAGGTTGTTGACATTG
TCGACACCTTCAGACTTCAGGAGCAGCCTACTTACGACAAGAAGGGCTTCATTGCCTATA
TCAAAAAGTACATCAAGCTTTTGACTCCCAAGCTCACCCCGGAACAGCAAGAAGAGTTCA
AGAAGAGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTTTTGCTCCCCAAGCTCAAGGACTTCCAATTCT
TTGTTGGGGAGGGCATGCACGATGACAGCACTATTGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTG
CAACTAACCCAACATTTTTGTACTTTGCACATGGTTTGAAGGAAGTCAAGTGCTGAGTGA
GAGAGAAGCTCTTGTCGGGTTTTACTATGGTCGGGTCGCAGCGACTCTCTTTAAGTTTAT
GTGTCTTTTTATGTGTTCTGTGTCTCTCACTCTTCCTACTTGCTCCATA


BQ
15 15 15 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ89TF U 1
AF RR2DX15TF U 2
AF RR2FT83TF U 1
AF RR2AI42TF U 4
BS 1 71 RR2DZ89TF
BS 72 73 RR2FT83TF
BS 74 286 RR2DZ89TF
BS 287 425 RR2FT83TF
BS 426 426 RR2AI42TF
BS 427 657 RR2FT83TF
BS 658 659 RR2AI42TF
BS 660 683 RR2FT83TF
BS 684 709 RR2AI42TF

RD RR2DZ89TF 286 0 0
GGCCCCTCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAATCTCTAGATAGATTCGTGAGCGATTAA
AAAAAAAAAAA***ACAAATAAATCGACCATGTTGGTGTACACCGATCTTCTCACCGGTG
ATGAGCTTCTCTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGAAG
TTGAAGGAAAGTGGACTACCAAGGGATGTGTAGAGGTTAACATCGGTGCCAACCCATCTG
CTGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACTCTGTTGAAAA

QA 1 286 1 286
DS 

RD RR2DX15TF 287 0 0
GG
CCCTCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAATCTCTAGATAGATTCGTGAGCGATTAAAAA
AAAAAAAAAA*ACAAATAAATCGACCATGTTGGTGTACACCGATCTTCTCACCGGTGATG
AGCTTCTCTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGAAGTTG
AAGGAAAGTGGACTACCAAGGGATGTGTAGAGGTTAACATCGGTGCCAACCCATCTGCTG
AAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACTCTGTTGAAAAGG

QA 3 287 3 287
DS 

RD RR2FT83TF 684 0 0
GGCCCCTCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAATCTCTAGATAGATTCGTGAGCGATTAA
AAAAAAAAAAAAAAACAAATAAATCGACCATGTTGGTGTACACCGATCTTCTCACCGGTG
ATGAGCTTCTCTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGAAG
TTGAAGGAAAGTGGACTACCAAGGGATGTGTAGAGGTTAACATCGGTGCCAACCCATCTG
CTGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACTCTGTTGAAAAGGTTGTTGACATTG
TCGACACCTTCAGACTTCAGGAGCAGCCTACTTACGACAAGAAGGGCTTCATTGCCTATA
TCAAAAAGTACATCAAGCTTTTGACTCCCAAGCTCACCCCGGAACAGCAAGAAGAGTTCA
AGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTTTTGCTCCCCAAGCTCAAGGACTTCCAATTCT
TTGTTGGGGAGGGCATGCACGATGACAGCACTATTGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTG
CAACTAACCCAACATTTTTGTACTTTGCACATGGTTTGAAGGAAGTCAAGTGCTGAGTGA
GAGAGAAGCTCTTGTCGGGTTTTACTATGGTCGGGTCGCAGCGACTCTCTTTAAGTT**T
GTGTCTTTTTATGTGTTCTGTGTT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2AI42TF 706 0 0
GG
CTCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAATCTCTAGATAGATTCGTGAGCGATTAAAAAAA
AAAAAAA**ACAAATAAATCGACCATGTTGGTGTACACCGATCTTCTCACCGGTGATGAG
CTTCTCTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGAAGTTGAA
GGAAAGTGGACTACCAAGGGATGTGTAGAGGTTAACATCGGTGCCAACCCATCTACTGAA
GAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACTCTGTTGAAGAGGTTGTTGACATTGTCGAC
ACCTTCAGACTTCAGGAGCAGCCTACTTACGACAAGAAGGGCTTCATTGCCTATATCAAA
AAGTACATCAAGCTTTTGACTCCCAAGCTCACCCCGGAACAGCAAGAAGAGTTCAAGAAG
AGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTTTTGCTCCCCAAGCTCAAGGACTTCCAATTCTTTGTT
GGGGAGGGCATGCACGATGACAGCACTATTGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCAACT
AACCCAACATTTTTGTACTTTGCACATGGTTTGAAGGAAGTCAAGTGCTGAGTGAGAGA*
*AGCTCTTGTCGGGTTTTACTATGGTCGGGTCGCAGCGACTCTCTTTAAGTTTATGTGTC
TTTTTATGTGTTCTGTGTCTCTCACTCTTCCTACTTGCTCCATA

QA 3 706 3 706
DS 



CO CL3Contig6 861 2 6 U
TCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAATCTCTAGATAGATTCGTGAGCGATTAAAAAAAA
AAAAAACAAATAAATCGACCATGTTGGTGTACACCGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTC
TCTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGAAGTTGAAGGAA
AGGTCTGTTTTGTGCCTTCATTACTCTTATATTCATCATCAAGGTTTCATCCTTTGTTCT
GATTTTTTTAATTTTTATATTCAGTGGACTACCAAGGGATGTGTAGAGGTTAACATCGGT
GCCAACCCATCTGCTGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACTCTGTTGAAAAG
GTTGTTGACATTGTCGACACCTTCAGACTTCAGGAGCAGCCTACTTACGACAAGAATGGC
TTCATTGCCTATATCAAAAAGTACATCAAGCTTTTGACTCCCAAGCTCACCCCGGAACAG
CAAGAAGAGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTTTTGCTCCCCAAGCTCAAG
GACTTCCAATTCTTTGTTGGGGAGGGCATGCACGATGACAGCACTATTGTCTTTGCTTAC
TACAAGGAGGGTGCAACTAACCCAACATTTTTGTACTTTGCACATGGTTTGAAGGAAGTC
AAGTGCTGAGTGAGAGAGAAGCTCTTGTCGGGTTTTACTATGGTCGGGTCGCAGCGACTC
TCTTTAAGTTTGTGTCTTTTTATGTGTTCTGTGTTTCGTCCGTCCCCCTATTAAAATTGT
CTACCAGTTTGGTCTTTCTTGTGTGTCTTGTGTTGTTTGGAGATTGTTCAAGTTATATGA
TCCCGAATACAACGGTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F346TF U 1
AF RR2F346JQ C 185
BS 1 740 RR2F346TF
BS 741 741 RR2F346JQ
BS 742 767 RR2F346TF
BS 768 768 RR2F346JQ
BS 769 775 RR2F346TF
BS 776 861 RR2F346JQ

RD RR2F346TF 789 0 0
TCTCGTCGCTGCGTCTCTCTCCCGCAATCTCTAGATAGATTCGTGAGCGATTAAAAAAAA
AAAAAACAAATAAATCGACCATGTTGGTGTACACCGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTC
TCTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTCTGGGAAGTTGAAGGAA
AGGTCTGTTTTGTGCCTTCATTACTCTTATATTCATCATCAAGGTTTCATCCTTTGTTCT
GATTTTTTTAATTTTTATATTCAGTGGACTACCAAGGGATGTGTAGAGGTTAACATCGGT
GCCAACCCATCTGCTGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACTCTGTTGAAAAG
GTTGTTGACATTGTCGACACCTTCAGACTTCAGGAGCAGCCTACTTACGACAAGAATGGC
TTCATTGCCTATATCAAAAAGTACATCAAGCTTTTGACTCCCAAGCTCACCCCGGAACAG
CAAGAAGAGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTTTTGCTCCCCAAGCTCAAG
GACTTCCAATTCTTTGTTGGGGAGGGCATGCACGATGACAGCACTATTGTCTTTGCTTAC
TACAAGGAGGGTGCAACTAACCCAACATTTTTGTACTTTGCACATGGTTTGAAGGAAGTC
AAGTGCTGAGTGAGAGAGAAGCTCTTGTCGGGTTTTACTATGGTCGGGTCGCAGCGACTC
TCTTTAAGTTTGTGTCTTTT*ATGTGTTCTGTGTTTCGTCCGTCCCC*TATTAAA
TTGTCTACAGTTTG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2F346JQ 677 0 0
CTGTTTTGTGCCTTCATTACTCTTATATTCATCATCAAGGTTTCATCCTTTGTTCTGATT
TTTTTAATTTTTATATTCAGTGGACTACCAAGGGATGTGTAGAGGTTAACATCGGTGCCA
ACCCATCTGCTGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACTCTGTTGAAAAGGTTG
TTGACATTGTCGACACCTTCAGACTTCAGGAGCAGCCTACTTACGACAAGAATGGCTTCA
TTGCCTATATCAAAAAGTACATCAAGCTTTTGACTCCCAAGCTCACCCCGGAACAGCAAG
AAGAGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTTTTTGCTCCCCAAGCTCAAGGACT
TCCAATTCTTTGTTGGGGAGGGCATGCACGATGACAGCACTATTGTCTTTGCTTACTACA
AGGAGGGTGCAACTAACCCAACATTTTTGTACTTTGCACATGGTTTGAAGGAAGTCAAGT
GCTGAGTGAGAGAGAAGCTCTTGTCGGGTTTTACTATGGTCGGGTCGCAGCGACTCTCTT
TAAGTTTGTGTCTTTTTATGTGTTCTGTGTTTCGTCCGTCCCCCTATTAAAATTGTCTAC
CAGTTTGGTCTTTCTTGTGTGTCTTGTGTTGTTTGGAGATTGTTCAAGTTATATGATCCC
GAATACAACGGTTTATC

QA 1 677 1 677
DS 



CO CL3Contig7 811 4 2 U
GGACGATCAAAATTCAACTATTAGTAATTGATAAACCGTTGTATTCGGGATCATATAACT
TGAACAATCTCCAAACAACACAAGACACAAGACCAAACTGGTAGACAATTTTAATAGGGG
GACGGACGAAACACAGAACACATAAAAAGACACATAAACTTAAAGAGAGTCGCTGCGACC
CGACCATAGTAAAACCCGACAAGAGCTTCTCTCACTCAGCACTTGACTTCCTTCAAACCA
TGTGCAAAGTACAAAAATGTTGGGTTAGTTGCACCCTCCTTGTAGTAAGCAAAGACAATA
GTGCTGTCATCGTGCATGCCCTCCCCAACAAAGAATTGGAAGTCCTTGAGCTTGGGGAGC
AAAAACTTGGTAGCTCCCTCGATACCCTTCTTGAACTCTTCTTGCTGTTCAGGGGTGAGC
TTGGGAGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTGATATAGGCAATGAAGCCCTTCTTGTCGTAA
GTAGGCTGCTCCTGAAGTCTGAAAGTGTCGACAATGTCAACAACTTTTTCAACACTGTCG
TCAACACCCTCGTCCTCACCACCTTCTTCAGCAGATGGGTTGGCGCCGATGTTAACCTCT
GCGCATCCCTTGGTAGTCCACTTTCCTTCAACTTCCCAGAGAATACCATTCTCAATCTCC
TTGTACGGGAAAGAGTCAGACAGAAGCTCATCACCGGTGAGAAGATCGGTGTACACCAAC
ATGGTCGATTTATTTGTTTTTTTGTTTTTTGTTTTAAATCGCTCACGAATCTATCTAGAG
ATTGCGGGAGAGAGACGCAGCGACGAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB01JQ U 98
AF RR2H642JQB U 1
AF RR2H642TF C 32
AF RR2A185TF C 14
BS 1 736 RR2H642JQB
BS 737 811 RR2A185TF

RD RR2FB01JQ 408 0 0
CTGGTAGACAATTTTAATAGGGGGACGGACGAAACACCGAACACATAAAAAGACACATAA
ACTTAAAGAGAGTCGCTGCGACCCGACCATAGTAAAACCCGACAAGAGCTTCTCTCACTC
AGCACTTGACTTCCTTCAA*CCATGTGCAAAGTACAAAAATGTTGGGTTAGTTGCACCCT
CCTTGTAGTAAGCAAAGACAATAGTGCTGTCATCGTGCATGCCCTCCCCAACAAAGAATT
GGAAGTCCTTGAGTTTGGGGAGCAAAAACTTGGTAGCTCCCTCGATACCCTTCTTGAACT
CTTCTTGCTGTTCAGGGGTGAGCTTGGGAGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTGATAAAGG
CAATGAAGCCCTTCTTGTCCTAAGTAGGCTGCTCCTGAAGTCTGAAAG

QA 1 408 1 408
DS 

RD RR2H642JQB 737 0 0
GGACGATCAAAATTCAACTATTAGTAATTGATAAACCGTTGTATTCGGGATCATATAACT
TGAACAATCTCCAAACAACACAAGACACAAGACCAAACTGGTAGACAATTTTAATAGGGG
GACGGACGAAACACAGAACACATAAAAAGACACATAAACTTAAAGAGAGTCGCTGCGACC
CGACCATAGTAAAACCCGACAAGAGCTTCTCTCACTCAGCACTTGACTTCCTTCAAACCA
TGTGCAAAGTACAAAAATGTTGGGTTAGTTGCACCCTCCTTGTAGTAAGCAAAGACAATA
GTGCTGTCATCGTGCATGCCCTCCCCAACAAAGAATTGGAAGTCCTTGAGCTTGGGGAGC
AAAAACTTGGTAGCTCCCTCGATACCCTTCTTGAACTCTTCTTGCTGTTCAGGGGTGAGC
TTGGGAGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTGATATAGGCAATGAAGCCCTTCTTGTCGTAA
GTAGGCTGCTCCTGAAGTCTGAAAGTGTCGACAATGTCAACAACTTTTTCAACACTGTCG
TCAACACCCTCGTCCTCACCACCTTCTTCAGCAGATGGGTTGGCGCCGATGTTAACCTCT
GCGCATCCCTTGGTAGTCCACTTTCCTTCAACTTCCCAGAGAATACCATTCTCAATCTCC
TTGTACGGGAAAGAGTCAGACAGAAGCTCATCACCGGTGAGAAGATCGGTGTACACCAAC
ATGGTCGATTTATTTG
C

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2H642TF 706 0 0
ATAAA
CGTTGTATTCGGGATCATATAACTTGAACAATCTCCAAACAACACAAGACACAAGACCAA
ACTGGTAGACAATTTTAATAGGGG*ACGGACGAAACACAGAACACATAAAAAGACACATA
AACTTAAAGAGAGTCGCTGCGACCCGACCATAGTAAAACCCGACAAGAGCTTCTCTCACT
CAGCACTTGACTTCCTTCAAACCATGTGCAAAGTACAAAAATGTTGGGTTAGTTGCACCC
TCCTTGTAGTAAGCAAAGACAATAGTGCTGTCATCGTGCATGCCCTCCCCAACAAAGAAT
TGGAAGTCCTTGAGCTTGGGGAGCAAAAACTTGGTAGCTCCCTCGATACCCTTCTTGAAC
TCTTCTTGCTGTTCAGGGGTGAGCTTGGGAGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTGATATAG
GCAATGAAGCCCTTCTTGTCGTAAGTAGGCTGCTCCTGAAGTCTGAAAGTGTCGACAATG
TCAACAACTTTTTCAACACTGTCGTCAACACCCTCGTCCTCACCACCTTCTTCAGCAGAT
GGGTTGGCGCCGATGTTAACCTCTGCGCATCCCTTGGTAGTCCACTTTCCTTCAACTTCC
CAGAGAATACCATTCTCAATCTCCTTGTACGGGAAAGAGTCAGACAGAAGCTCATCACCG
GTGAGAAGATCGGTGTACACCAACATGGTCGATTTATTTG
C

QA 6 705 6 705
DS 

RD RR2A185TF 798 0 0
TCAACTATTAGTAATTGATAAACCGTTGTATTCGGGATCATATAACTTGAACAATCTCCA
AACAACACAAGACACAAGACCAAACTGGTAGACAATTTTAATAGGGGGACGGAAGAAACA
CAGAACACATAAAAAGACACATAAACTTAAAGAGAGTCGCTGCGACCCGACCATAGTAAA
ACCCGACAAGAGCTTCTCTCACTCAGCACTTGACTTCCTTCAAACCATGTGCAAAGTACA
AAAATGTTGGGTTAGTTGCACCCTCCTTGTAGTAAGCAAAGACAATAGTGCCGTCATCGT
GCATGCCCTCCCCAACAAAGAATTGGAAGTCCTTGAGCTTGGGGGGCAAAAACTTGGTAG
CTCCCTCGATACCCTTCTTGAACTCTTCTTGCTGTTCAGGGGTGAGCTTGGGAGTCAAAA
GCTTGATGTACTTCTTGATATAGGCAATGAAGCCCTTCTTGTCGTAAGTAGGCTGCTCCT
GAAGTCTGAAAGTGTCGACAATGACAACAACTTTTTCAACACTGTCGTCAACACCCTCGT
CCTCACCACCTTCTTCAGCAGATGGGTTGGCGCCGATGTTAACCTCTACGCATCCCTTGG
TAGTCCACTTTCCTTCAACTTCCCAGAGAATACCATTCTCAATCTCCTTGTACGGGAAAG
AGTCAGACAGAAGCTCATCACCGGTGAGAAGATCGGTGTACACCAACATGGTCGATTTAT
TTGTTTTTTTGTTTTTTGTTTTAAATCGCTCACGAATCTATCTAGAGATTGCGGGAGAGA
GACGCAGCGACGAGAGCC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 2 41

CO CL4Contig1 650 21 10 U
GGACCAATCAAAAAACTCTTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTAC
GCAATCTCTGGTGCTGGCTCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTT
GGTCAGAAGAAACAGACGTTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTT
GATGGGTCTAATGGAAGAAGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCT
GCTGCTGTGTCTGCTTCTGCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAG
GCCAACAAAGAACTGAACGATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGA
GCATTCACTGTCCAATTCGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGAT
CTCGCCAAGCAAAAGAAAGTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGC
AAAGACAAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTT
GTTTGTTATCCATTCTTATATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAA
GTTTTCATGTCCCATTTTGAATCTATCAAAGTTATCCTCTAATGAAGATC


BQ
45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 
90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 70 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 
97 80 80 97 60 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 60 55 45 40 30 30 30 10 10 10 

AF RR2A834TF U 1
AF RR2G869TF U 1
AF RR2B075TF U 1
AF RR2AJ10TF U 19
AF RR2C374JQ C 1
AF RR2DZ56TF U 1
AF RR2GK60TF U 1
AF RR2G869JQ C 1
AF RR2GK60JQ C 67
AF RR2DM16TF U 2
AF RR2AJ10JQ C 19
AF RR2AV64TF U 19
AF RR2CV91JQ C 19
AF RR2CV91TF U 19
AF RR2E518JQ C 19
AF RR2E518TF U 19
AF RR2C674JQ C 19
AF RR2C674TF U 19
AF RR2EN38JQ C 19
AF RR2AV64JQ C 243
AF RR2EN38TF U 19
BS 1 185 RR2A834TF
BS 186 239 RR2B075TF
BS 240 240 RR2DZ56TF
BS 241 491 RR2B075TF
BS 492 492 RR2DZ56TF
BS 493 590 RR2B075TF
BS 591 641 RR2DZ56TF
BS 642 643 RR2DM16TF
BS 644 647 RR2AV64TF
BS 648 650 RR2EN38JQ

RD RR2A834TF 185 0 0
GGACCAATCAAAAAACTCTTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTAC
GCAATCTCTGGTGCTGGCTCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTT
GGTCAGAAGAAACAGACGTTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTT
GATGG

QA 1 185 1 185
DS 

RD RR2G869TF 523 0 0
GGACCAATCAAAAAACTCTTAATGGCAGTCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTAC
GCAATCTCTGGTGCTGGCTCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTT
GGTCAGAAGAAACAGACGTTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTT
GATGGGTCTAATGGAAGAAGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCT
GCTGCTGTGTCTGCTTCTGCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAG
GCCAACAAAGAACTAAACGATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGA
GCATTCACTGTCCAATTCGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGAT
CTCGCCAAGCAAAAGAAAGTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGC
AAAGGCAAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGT

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2B075TF 590 0 0
GGACCAATCAAAAAACTCTTAATGGCAGCCATGGACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTAC
GCAATCTCTGGTGCTGGCTCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTT
GGTCAGAAGAAACAGACGTTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTT
GATGGGTCTAATGGAAGAAGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCC
GCTGCTGTGTCTGCTTCTGCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAG
GCCAACAAAGAACTGAACGATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGA
GCATTCACTGTCCAATTCGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGAT
CTCGCCAAGCAAAAGAAAGTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGC
AAAGACAAGTATAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTT
GTTTGTTATCCATTCTTATATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTT

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2AJ10TF 571 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAACTACGCAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGACGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTC
GGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAA
GTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAG*GACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATCCATTCTTA
TATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTT

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2C374JQ 641 0 0
GGACCAATCAAAAAACTCTTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTAC
GCAATCTCTGGTGCTGGCTCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTT
GGTCAGAAGAAACAGACGTTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTT
GATGGGTCTAATGGAAGAAGATCAGCCATGGTGTCCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCT
GCTGCTGTGTCTGCTTCTGCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAG
GCCAACAAAGAACTGAACGATGAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGA
GCATTCACTGTCCAATTCGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTCCACTGGTTGCCAAGAT
CTCGCCAAGCAAAAGAAAGTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGC
AAAGACAAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTT
GTTTGTTATCCATTCTTATATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAA
GTTTTCATGTCCCATTTTGAATCTATCAAAGTTATCCTCT
G

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2DZ56TF 643 0 0
GGACCAATCAAAAAACTCTTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTAC
GCAATCTCTGGTGCTGGCTCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTT
GGTCAGAAGAAACAGACGTTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTT
GATGGGTCTAATGGAAGAAGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCT
GCTGCTGTGTCTGCTTCTGCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAG
GCCAACAAAGAACTGAACGATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAAA
GCATTCACTGTCCAATTCGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGAT
CTCGCCAAGCAAAAGAAAGTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATACGAAGGC
AAAGACAAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTT
GTTTGTTATCCATTCTTATATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAA
GTTTTCATGTCCCATTTTGAATCTATCAAAGTTATCCTCTA
TG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2GK60TF 644 0 0
GGACCAATCAAAAAACTCTTAATGGCAGTCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTAC
GCAATCTCTGGTGCTGGCTCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTT
GGTCAGAAGAAACAGACGTTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTT
GATGGGTCTAATGGAAGAAGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCT
GCTGCTGTGTCTGCTTCTGCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAG
GCCAACAAAGAACTAAACGATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGA
GCATTCACTGTCCAATTCGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGAT
CTCGCCAAGCAAAAGAAAGTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGC
AAAGGCAAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTT
GTTTGTTATCCATTCTTATATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAA
GTTTTCATGTCCCATTTTGAATCTATCAAAGTTATCCTC
GAAAA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2G869JQ 640 0 0
GGACCAATCAAAAAACTCTTAATGGCAGTCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTAC
GCAATCTCTGGTGCTGGCTCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTT
GGTCAGAAGAAACAGACGTTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTT
GATGGGTCTAATGGAAGAAGATCAGCCATGGTGTTTTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCT
GCTGCTGTGTCTGCTTCTGCTAATGCTAGCGTTTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAG
GCCAACAAAGAACTAAACGATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGA
GCATTCACTGTCCAATTCGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGAT
CTCGCCAAGCAAAAGAAAGTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGC
AAAGGCAAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTT
GTTTGTTATCCATTCTTATATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAA
GTTTTCATGTCCCATTTTGAATCTATCAAAGTTATCCTC
G

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2GK60JQ 574 0 0
TCTGGTGCTGGCTCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAG
AAGAAACAGACGTTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGG
TTTAATGGAAGAAGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCT
GTGTCTGCTTCTGCTAATGCTAGCGTTTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAAC
AAAGAACTAAACGATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTC
ACTGTCCAATTCGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCC
AAGCAAAAGAAAGTCCCATTTATCTTTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGGC
AAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGT
TATCCATTCTTATATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAAGTTTTC
ATGTCCCATTTTGAATCTATCAAAGTTATCCTC
G

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2DM16TF 642 0 0
GACCAATCAAAAAACTCTTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACG
CAATCTCTGGTGCTGGCTCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTG
GTCAGAAGAAACAGACGTTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTG
ATGGGTCTAATGGAAGAAGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTG
CTGCTGTGTCTGCTTCTGCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAGG
CCAACAAAGAACTGAACGATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAG
CATTCACTGTCCAATTCGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATC
TCGCCAAGCAAAAGAAAGTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCA
AAGACAAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTG
TTTGTTATCCATTCTTATATAAACCCTCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAAG
TTTTCATGTCCCATTTTGAATCTATCAAAGTTATCCTCTAAT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2AJ10JQ 595 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAACTACGCAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGACGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTTTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTC
GGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAA
GTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAG*GACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATCCATTCTTA
TATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAAGTTTTCATGTCCC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2AV64TF 629 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACACAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTC
GGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAA
GTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATCCATTCTTA
TATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAAGTTTTCATGTCCCATTTT
GAATCTATCAAAGTTATCCTCTAATGAAG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2CV91JQ 595 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTC
GGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAA
GTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATCCATTCTTA
TATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAAGTTTTCATGTCCC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2CV91TF 595 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTC
GGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAA
GTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATCCATTCTTA
TATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAAGTTTTCATGTCCC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2E518JQ 626 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGTTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTC
GGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAA
GTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATCCATTCTTA
TATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAAGTTTTCATGTCCCATTTT
GAATCTATCAAAGTTATCCTCTAA
CG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2E518TF 626 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGTTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTC
GGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAA
GTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATCCATTCTTA
TATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAAGTTTTCATGTCCCATTTT
GAATCTATCAAAGTTATCCTCTAA
CG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2C674JQ 626 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTTTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTC
GGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAA
TTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATCCATTCTTA
TATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAAGTTTTCATGTCCCATTTT
GAATCTATCAAAGTTATCCTCTAATG

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2C674TF 626 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTC
GGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAA
TTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATCCATTCTTA
TATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAAGTTTTCATGTCCCATTTT
GAATCTATCAAAGTTATCCTCTAATG

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2EN38JQ 632 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGCCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTC
GGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAA
GTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATCCATTCTTA
TATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAAGTTTTCATGTCCCATTTT
GAATCTATCAAAGTTATCCTCTAATGAAGATC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2AV64JQ 405 0 0
TGCTGTGTCTGCTTCTGCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAGGC
CAACAAAGAACTGAACGATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGC
ATTCACTGTCCAATTCGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCT
CGCCAAGCAAAAGAAAGTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAA
AGACAAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGT
TTGTTATCCATTCTTATATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAAGT
TTTCATGTCCCATTTTGAATCTATCAAAGTTATCCTCTAATGAAG

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR2EN38TF 632 0 0
TTAATGGCAGCCATGAACTCAAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGTGCTGGC
TCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGAGTTCATCAGTCGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGACG
TTTCCTGTGATCAAAGCTCAACGAGCTGGTGGTGATGATGTTGATGGGTCTAATGGAAGA
AGATCAGCCATGGTGTTCTTAGCGGCTACACTCTTCTCCTCTGCTGCTGTGTCTGCTTCT
GCTAATGCTAGCGCCTTCGATGAGTATCTCGAGAAGAGCAAGGCCAACAAAGAACTGAAC
GATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAATTC
GGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTCGCCAAGCAAAAGAAA
GTCCCATTTATCTCTGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTACAAGTGT
GGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGAAGAAGTCTGTTTGTTGTTTGTTATCCATTCTTA
TATAAACCCCCAACAACAATGTATCTCCCTTTATTCATCAAAGTTTTCATGTCCCATTTT
GAATCTATCAAAGTTATCCTCTAATGAAG
ATC

QA 1 629 1 629
DS 



CO CL4Contig2 710 20 13 U
CAAAGTGATATATCTATGTGTGCATATATCTTTCATAATCCCTAATGAGAGGATAACTTT
GATAGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGG
GGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAA
AACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGA
GATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAA
CTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAA
TCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGAC
GCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGTGTAGCCGCTAAGAACAC
CATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTT
GATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCGACTGATGAACTCACTTTCTGGTT
TAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCAT
GGCTGCCATTGAGAGTTTTTTGATTGGTCCCTGAAGAAGGAAGAGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 35 35 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 45 60 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 
80 65 65 90 90 60 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 70 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 
97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 65 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 65 65 65 65 65 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE63JQ U 47
AF RR2GL76JQ U 129
AF RR2GK57TF C 47
AF RR2H648JQB U 34
AF RR2AY71JQ U 36
AF RR2GR24JQ U 47
AF RR2EN54JQ U 34
AF RR2CP65TF C 1
AF RR2AY71TFB C 416
AF RR2EN54TF C 67
AF RR2EI47JQ U 64
AF RR2EI47TF C 64
AF RR2BE63TF C 47
AF RR2FQ85JQ U 47
AF RR2BP86JQ U 18
AF RR2BP86TF C 60
AF RR2H648TF C 46
AF RR2E654JQ U 34
AF RR2GL76TF C 47
AF RR2GR24TF C 166
BS 1 27 RR2CP65TF
BS 28 46 RR2BP86JQ
BS 47 65 RR2BE63JQ
BS 66 66 RR2GR24JQ
BS 67 122 RR2BE63JQ
BS 123 123 RR2GR24JQ
BS 124 135 RR2BE63JQ
BS 136 136 RR2GR24JQ
BS 137 235 RR2BE63JQ
BS 236 621 RR2GR24JQ
BS 622 672 RR2EI47JQ
BS 673 690 RR2E654JQ
BS 691 710 RR2CP65TF

RD RR2BE63JQ 189 0 0
GAGAGGATAACTTTGATAGGTTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGAT
ACATTGTTGTTGGGGGGGGGTTTATATAAAAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTT
CACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAAC
GCCAAATCT

QA 1 189 1 189
DS 

RD RR2GL76JQ 334 0 0
TATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACATTGG
AACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATGAATG
GGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGC
TTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAATCTCTTCT
TATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGACGCTAGCAT
TAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAG

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR2GK57TF 453 0 0
GAGAGGATAACTTTGG*AGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGAT
ACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTT
CACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGTATTCCAAC
GCCAAATCTTCAGAGATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTG
AAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCT
CCACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGG
TATTCATCGAAGACGCTGGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGTGTA
GCCGCTAAGAACACCATGGCTGATCTTCTCCC
C

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2H648JQB 538 0 0
CATAATCCCTAATGAGAGGATAACTTTGATAGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATG
GATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAAC
AAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCC
TTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAAAGATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATC
TTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCT
CGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTT
GCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAAACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGA
GGAGAAGAGTGTAGCCGCTAAGAACACCATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAAC
ATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCA

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2AY71JQ 511 0 0
TAATCCCTAATGAGAGGATAACTTTGATAGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGA
TAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGGGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACGACAA
ACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTT
CGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTT
GGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCG
CAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGC
TCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGG
AGAAGAGTGTAGCCGCTAAGAACACCATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAACAT
CATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGATCAC

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2GR24JQ 575 0 0
GG
GAGGATAACTTTGATAGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGATAC
ATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCA
CCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGC
CAAATCTTCAGAGATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAA
ATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCC
ACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTA
TTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGTGTAGC
CGCTAAGAACACCATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGC
TCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCGACTGATGAACT
CACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACC

QA 3 575 3 575
DS 

RD RR2EN54JQ 584 0 0
CATAATCCCTAATGAGAGGATAACTTTGATAGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATG
GATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAAC
AAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCC
TTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATC
TTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCT
CGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTT
GCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGA
GGAGAAGAGTGTAGCCGCTAAGAACACCATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAAC
ATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAA
CCCGACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAG

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2CP65TF 710 0 0
CAAAGTGATATATCTATGTGTGCATATATCTTTCATA*TCCCTAATGAGAGGATAACTTT
GATAGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGG
GGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAA
AACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGA
GATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAA
CTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAA
TCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGAC
GCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGTGTAGCCGCTAAGAACAC
CATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTT
GATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCGACTGATGAACTCACTTTCTGGTT
TAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCAT
GGCTGCCATTGAGAGTTTTTTGATTGGTGACTGAAGAAGGAAGAGATTCC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2AY71TFB 275 0 0
AAGACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGTGTAGCCGCTAAG
AACACCATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGA
GCTTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCGACTGATGAACTCACTTTC
TGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACTAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAGAACACTTGAG
TTCATGGCTGCCATTGAGAGTTTTTTGATTGGTCC

QA 1 275 1 275
DS 

RD RR2EN54TF 606 0 0
TTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGTGGG
TTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACATT
GGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATGAA
TGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCA
GCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAATCTCTT
CTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGACGCTAGC
ATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGTGTAGCCGCTAAGAACACCATGGC
TGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGATCAC
AGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCGACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAGCTC
TACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAGAACACTCGAGTTCATGGCTGC
CATTGA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2EI47JQ 609 0 0
AGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGT
GGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAAC
ATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGAT
GAATGGGACTTTCCTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTT
GCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAATCT
CTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAAACGCT
AGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGTGTAGCCGCTAAGAACACCAT
GGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGAT
CACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCGACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAG
CTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCATGGC
TGCCATTGA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2EI47TF 609 0 0
AGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGT
GGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAAC
ATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGAT
GAATGGGACTTTCCTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTT
GCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAATCT
CTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGACGCT
AGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGTGTAGCCGCTAAGAACACCAT
GGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGAT
CACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCGACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAG
CTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCATGGC
TGCCATTGA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2BE63TF 626 0 0
GAGAGGATAACTTTGATAGGTTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGAT
ACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTT
CACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAAC
GCCAAATCTTCAGAGATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTG
AAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCT
CCACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGG
TATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGTGTA
GCCGCTAAGAACACCATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACCA
GCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAGCGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCGACTGATGAA
CTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAGA
ACACTTGAGTTCATGGCTGCCATTGA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2FQ85JQ 626 0 0
GG
GAGGATAACTTTGATAGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGATAC
ATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCA
CCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGC
CAAATCTTCAGAGATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAA
ATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCC
ACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTA
TTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGTGTAGT
CGCTAAGAACACCATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGC
TCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCGACTGATGAACT
CACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAGAAC
ACTTGAGTTCATGGCTGCCATTGA

QA 3 626 3 626
DS 

RD RR2BP86JQ 652 0 0
GTGCATAATA
ATCTTTCATAATCCCTAATGAGAGGATAACTTTGATAGATTCAAATGGGACATGAAAATT
TTAATGGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACA
AACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTC
TTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGC
GAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAA
TGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTATTTGTT
GGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGC
AGCAGAGGAGAAGAGTGTAGCCGCTAAGAACACCATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCC
ATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTG
ACCAAACCCGACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGAT
TGCGTAGCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCATGGCTGCC
CC

QA 11 650 11 650
DS 

RD RR2BP86TF 610 0 0
TGATAGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTAATGGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGG
GGGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGA
AAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAG
AGATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGA
ACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCA
ATCTCTTCTTATCGTTCAGTTACTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGA
CGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGTGTAGCCGCTAAGAACA
CCATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTT
TGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCGACTGATGAACTCACTTTCTGGT
TTAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCA
TGGCTGCC
CC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2H648TF 627 0 0
TGAGAGGATAACTTTGATAGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGA
TACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCT
TCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAA
CGCCAAATCTTCAGAGATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGT
GAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGC
TCCACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAG
GTATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGTGT
AGCCGCTAAGAACACCATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACC
AGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCGACTGATGA
ACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAG
AACACTTGAGTTCATGGCTGCCATTGA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2E654JQ 657 0 0
CATAATCCCTAATGAGAGGATAACTTTGATAGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATG
GATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAAC
AAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCC
TTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATC
TTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCT
CGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTT
GCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAAACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGA
GGAGAAGAGTGTAGCCGCTAAGAACACCATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAAC
ATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAA
CCCGACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTA
GCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCATGGCTGCCATTGAGAGTTTTTTGATTGGTCC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2GL76TF 644 0 0
GG
GAGGATAACTTTGATAGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGATAC
ATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCA
CCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGC
CAAATCTTCAGAGATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAA
ATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCC
ACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTA
TTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGTGTAGC
CGCTAAGAACACCATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGC
TCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCGACTGATGAACT
CACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAGAAC
GCTTGAGTTCATGGCTGCCATTGAGAGTTTTTTGATTGGTCC

QA 3 644 3 644
DS 

RD RR2GR24TF 525 0 0
TCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAA
CGCCAAATCTTCAGAGATGAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGT
GAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGC
TCCACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAG
GTATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGTGT
AGCCGCTAAGAACACCATGGCTGATCTTCTCCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACC
AGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCGACTGATGA
ACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAG
AACGCTTGAGTTCATGGCTGCCATTGAGAGTTTTTTGATTGGTCC

QA 1 525 1 525
DS 



AS 6 41

CO CL5Contig1 863 16 13 U
CTAAAATAAGCGCACGGCTGGGAAACAACTTTATCATCAAACCATTCAAGATCATCACAC
ATTGACAACCATATTTTATATGAAGATATTACAATGATTATATTTTCTAAAGCATTATCA
AGAAACCACTTGTTGCTATATATACATAGAAATAAAACTGTGTGAGATGTTATTCTTCAG
TCTGTCTCGTGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGC
AATCTTGTGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAATTCTTGTTGA
GATTTTGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCC
TCTCTAACCTCTAAACCATTCTTGGTTTTTCTTTCCTTCTCCATCGAAGCAATTCCATGT
ACACACCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTGCTTGCAAGATTAGATTCTCAACTTCCACC
TTTGGCTTCTCTTTCTCAAGGTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAA
TCATCACCTTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTCGGCTTTCTCTATTAAC
GGCGGATCTTGAAGAACACGATCGAACTGTCCGCGGCTGAAGAGCTCAAGCTTAGGAACG
TCTCTCGTGCTTGAACACCTGACCACCGGGAAACAAGACTTCGACGGTTGGACGAACTTA
GGCTTGCCGTGAAACTCTATAGGGAGAGGAAATGGACGAAGAGTAGTAGCCGACTTTATC
ATCTTCACTGAAAAGATATTATTATTAGCAAGTAGCAAGAGAGAAGGTTGGTTTTTAAAG
TTCGAGATTATGCAGAGGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 45 45 45 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 75 75 60 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 70 70 85 85 85 85 85 85 55 
70 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 65 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 60 90 90 90 60 90 90 60 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 
80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 65 50 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2D975JQ U 21
AF RR2EY28JQ U 21
AF RR2FG78JQ U 8
AF RR2DO61JQ U 21
AF RR2FI77JQ U 39
AF RR2CQ59JQ U 64
AF RR2CQ59TF C 64
AF RR2EY28TF C 35
AF RR2D975TF C 217
AF RR2DI35TF C 111
AF RR2AK76JQ U 2
AF RR2BR27JQ U 38
AF RR2AK76TF C 1
AF RR2BR27TF C 136
AF RR2FG78TF C 104
AF RR2BM11TF C 105
BS 1 7 RR2AK76TF
BS 8 19 RR2FG78JQ
BS 20 20 RR2AK76JQ
BS 21 450 RR2D975JQ
BS 451 451 RR2CQ59JQ
BS 452 489 RR2D975JQ
BS 490 490 RR2CQ59JQ
BS 491 610 RR2D975JQ
BS 611 655 RR2CQ59JQ
BS 656 656 RR2FG78JQ
BS 657 738 RR2CQ59JQ
BS 739 823 RR2AK76JQ
BS 824 863 RR2AK76TF

RD RR2D975JQ 590 0 0
GGAAACAACTTTATCATCAAACCATTCAAGATCATCACACATTGACAACCATATTTTATA
TGAAGATATTACAATGATTATATTTTCTAAAGCATTATCAAGAAACCACTTGTTGCTATA
TATACATAGAAATAAAACTGTGTGAGATGTTATTCTTCAGTCTGTCTCGTGGTCCGGAGG
GTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATCTTGTGAAAGCAGAATC
TGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAATTCTTGTTGAGATTTTGGTAAACCATCAGG
AACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCTAACCTCTAAACCATT
CTTGGTTTTTCTTTCCTTCTCCATCGAAGCAATTCCATGTACACACCCGATTAGCGATTT
CACACCGCCTACTTGCAAGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGGCTTCCCTTTCTCAAG
GTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAATCATCACCTTCGAGTTTACA
ACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTCGGCTTTCTCTATTAACGGCGGATCTT

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2EY28JQ 602 0 0
GGAAACAACTTTATCATCAAACCATTCAAGATCATCACACATTGACAACCATATTTTATA
TGAAGATATTACAATGATTATATTTTCTAAAGCATTATCAAGAAACCACTTGTTGCTATA
TATACATAGAAATAAAACTGTGTGAGATGTTATTCTTCAGTCTGTCTCGTGGTCCGGAGG
GTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATCTTGTGAAAGCAGAATC
TGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAATTCTTGTTGAGATTTTGGTAAACCATCAGG
AACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCTAACCTCTAA*CCATT
CTTGGTTTTTCTTTCCTTCTCCATCGAAGCAATTCCATGTACACACCCGATTAGCGATTT
CACACCGCCTGCTTGCAAGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGGCTTCTCTTTCTCAAG
GTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAATCATCACCTTCGAGTTTACA
ACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTCGGCTTTCTCTATTAACGGCGGATCTTGAAGAACACG
AT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2FG78JQ 691 0 0
AAGCGCACGGCTTGGAAACAACTTTATCATCAAACCATTCAAGATCATCACACATTGACA
ACCATATTTTATATGAAGATATTACAATGATTATATTTTCTAAAGCATTATCAAGAAACC
ACTTGTTGCTATATATACATAGAAATAAAACTGTGTGAGATGTTATTCTTCAGTCTGTCT
CGTGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATCTTG
TGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAATTCTTGTTGAGATTTTG
GTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCTAA
CCTCTAAACCATTCTTGGTTTTTCTTTCCTTCTCCATCGAAGCAATTCCATGTACACACC
CGATTAGCGATTTCACACCGCCTGCTTGCAAGATTAAATTCTCAACTTCCACCTTTGGCT
TCTCTTTCTCAAGGTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAATCACCAC
CTTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTCGGCTTTCTCTATTAACGGCGGAT
CTTGAAGAACACGATCGAACTGTCCGCGGCTGAAGAGCTCAAGCTTAGGAACGTCTCTCG
TGCTTGAACACCTGACCACCGGGAAACAAGA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2DO61JQ 696 0 0
GGAAACAACTTTATCATCAAACCATTCAAGATCATCACACATTGACAACCATATTTTATA
TGAAGATATTACAATGATTATATTTTCTAAAGCATTATCAAGAAACCACTTGTTGCTATA
TATACATAGAAATAAAACTGTGTGAGATGTTATTCTTCAGTCTGTCTCGTGGTCCGGAGG
GTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATCTTGTGAAAGCAGAATC
TGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAATTCTTGTTGAGATTTTGGTAAACCATCAGG
AACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCTAACCTCTAAACCATT
CTTGGTTTTTCTTTCCTTCTCCATCGAAGCAATTCCATGTACACACCCGATTAGCGATTT
CACACCGCCTGCTTGCAAGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGGCTTCTCTTTCTCAAG
GTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAATCATCACCTTCGAGTTTACA
ACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTCGGCTTTCTCTATTAACGGCGGATCTTGAAGAACACG
ATCGAACTGTCCGCGGCTGAAGAGCTCAAGCTTAGGAACGTCTCTCGTGCTTGAACACCT
GACCACCGGGAAACAAGACTTCGACGGTTGGACGAA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2FI77JQ 674 0 0
AAACCATTCAAGATCATCACACATTGACAACCATATTTTATATGAAGATATTACAATGAT
TATATTTTCTAAAGCATTATCAAGAAACCACTTGTTGCTATATATACATAGAAATAAAAC
TGTGTGAGATGTTATTCTTCAGCCTGTCTCGTGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAGCAGG
GATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATCTTGTGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTCTC
TTCTTCTTCCAATTCTTGTTGAGATTTTGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTT
CATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCTAACCTCTAAACCATTCTTGGTTTTTCTTTCCTT
CTCCATCGAAGCAATTCCATGTACACACCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTGCTTGCAA
GATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGGCTTCTCTTTCTCAAGGTCCTTGAGTTCGAAGTA
AGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAATCATCACCTTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGAGTTC
GGTCTCGGCTTTCTCTATTAACGGCGGATCTTGAAGAACACGATCGAACTGTCCGCGGCT
GAAGAGCTCAAGCTTAGGAACGTCTCTCGTGCTTGAACACCTGACCACCGGGAAACAAGA
CTTCGACGGTTGGA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2CQ59JQ 675 0 0
GG
CAACCATATTTTATATGAAGATATTACAATGATTATATTTTCTAAAGCATTATCAAGAAA
CCACTTGTTGCTATATATACATAGAAATAAAACTGTGTGAGATGTTATTCTTCAGTCTGT
CTCGTGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATCT
TGTGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAATTCTTGTTGAGATTT
TGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCT
AACCTCTAAACCATTCTTGGTTTTTCTTTCCTTCTCCATCGAAGCAATTCCATGTACACA
CCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTGCTTGCAAGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGG
CTTCTCTTTCTCAAGGTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAATCATC
ACCTTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTCGGCTTTCTCTATTAACGGCGG
ATCTTGAAGAACACGATCGAACTGTCCGCGGCTGAAGAGCTCAAGCTTAGTAACGTCTCT
CGTGCTTGAACACCTGACCACCGGGAAACAAGACTTCGACGGTTGGACGAACTTAGGCTT
GCCGTGAAACTCT

QA 3 675 3 675
DS 

RD RR2CQ59TF 727 0 0
GG
CAACCATATTTTATATGA*GATAT*ACAATGATTATATTTTCTAAAGCATTATCAAGAAA
CCACTTGTTGCTATATATACATAGAAATAAAACTGTGTGAGATGTTATTCTTCAGTCTGT
CTCGTGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATCT
TGTGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAATTCTTGTTGAGATTT
TGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCT
AACCTCTAAACCATTCTTGGTTTTTCTTTCCTTCTCCATCGAAGCAATTCCATGTACACA
CCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTGCTTGCAAGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGG
CTTCTCTTTCTCAAGGTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAATCATC
ACCTTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTCGGCTTTCTCTATTAACGGCGG
ATCTTGAAGAACACGATCGAACTGTCCGCGGCTGAAGAGCTCAAGCTTAGTAACGTCTCT
CGTGCTTGAACACCTGACCACCGGGAAACAAGACTTCGACGGTTGGACGAACTTAGGCTT
GCCGTGAAACTCTATAGGGAGAGGAAATGGACGAAGAGTAGTAGCCGACTTTATCATCTT
CACT
C

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR2EY28TF 763 0 0
CATCAAACCATTCAAGATCATCACACAT*GACAACCATATTT*ATATGAAGATATTACAA
TGATTATATTTTGTAAAGCATTATCAAGAAACCACTTGTTGCTATATATACATAGAAATA
AAACTGTGTGAGATGTTATTCTTCAGTCTGTCTCGTGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAG
CAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATCTTGTGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAAT
TCTCTTCTTCTTCCAATTCTTGTTGAGATTTTGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCA
GTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCTAACCTCTAA*CCATTCTTGGTTTTTCTTT
CCTTCTCCATGGAAGCAATTCCATGTACACACCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTGCTT
GCAAGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGGCTTCTCTTTCTCAAGGTCCTTGAGTTCGA
AGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAATCATCACCTTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGA
GTTCGGTCTCGGCTTTCTTTATTAACGGCGGATCTTGAAGAACACGATCGAACTGTCCGC
GGCTGAAGAGCTCAAGCTTAGGAACGTCTCACGTGCTTGAACACCTGACCACCGGGAAAC
AAGACTTCGACGGTTGGACGAACTTAGGCTTGCCGTGAAACTCTATAGGGAGAGGAAATG
GACGAAGAGTAGTAGCCGACTTTATCATCTTCACTGAAAAG
CC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2D975TF 597 0 0
GGGATGGTTC*TTTGGCTCTAAGCAATCTTGTGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTC
TCTTCTTCTTCCAATTCTTGTTGAGATTTTGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGT
TTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCTAACCTCTAAACCATTCTTGGTTTTTCTTTCC
TTCTCCATCGAAGCAATTCCATGTACACACCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTACTTGC
AAGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGGCTTCCCTTTCTCAAGGTCCTTGAGTTCGAAG
TAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAATCATCACCTTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGAGT
TCGGTCTCGGCTTTCTCTATTAACGGCGGATCTTGAAGAACACGATCGAACTGTCCGCGG
CTGAAGAGCTCAAGCTTAGGAACGTCTCTCGTGCTTGAACACCTGACCACCGGGAAACAA
GACTTCGACGGTTGGACGAACTTAGGCTTGCCGTGAAACTCTATAGGGAGAGGAAATGGA
CGAAGAGTAGTAGCCGACTTTATCATCTTCACTGAAAAGATATTATTATT
CCCCCCG

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2DI35TF 689 0 0
AGCATTATCAAGAAACCACTTGTTGCTATATATACATAGAAATAAAACTGTGTGAGATGT
TATTCTTCAGTCTGTCTCGTGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTT
GGCTCTAAGCAATCTTGTGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAA
TTCTTGTTGAGATTTTGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTTCACCTTATCTGA
ATCTGATCCCTCTCTAACCTCTAAACCATTCTTGGTTTTTCTTTCCTTCTCCATCGAAGC
AATTCCATGTACACACCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTGCTTGCAAGATTAGATTCTC
AACTTCCACCTTTGGCTTCTCTTTCTCAAGGTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCA
GCTGTAAGAATCATCACCTTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTCGGCTTT
CTCTATTAACGGCGGATCTTGAAGAACACGATCGAACTGTCCGCGGCTGAAGAGCTCAAG
CTTAGGAACGTCTCTCGTGCTTGAACACCTGACCACCGGGAAACAAGACTTCGACGGTTG
GACGAACTTAGGCTTGCCGTGAAACTCTATAGGGAGAGGAAATGGACGAAGAGTAGTAGC
CGACTTTATCATCTTCACTGAAAAGATA
C

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2AK76JQ 822 0 0
TAAAAT
AAGCGCACGGCTGGGAAACAACTTTATCATCAAACCATTCAAGATCATCACACATTGACA
ACCATATTTTATATGAAGATATTACAATGATTATATTTTCTAAAGCATTATCAAGAAACC
ACTTGTTGCTATATATACATAGAAATAAAACTGGGTGAGATGTTATTCTTCAGTCTGTCT
CGGGGTCCGGAGGGAGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATCTTG
TGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAATTCTTGTTGAGATTTTG
GTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCTAA
CCTCTAAACCATTCTTGGTTTTTCTTTCCTTCTCCATCGAAGCAATTCCATGTACACACC
CGATTAGCGATTTCACACTGCCTGCTTACAAGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGGCT
TCTCTTTCTCAAGGTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAATCATCAC
CTTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTCGGCTTTCTCTATTAACGGAGGAT
CTTGAAGAACACGATCGAACTGTCCGCGGCTGAAGAGCTCAAGCTTAGGAACGTCTCTCG
TGCTTGAACACCTGACCACCGGGAAACAAGACTTCGACGGTTGGACGAACTTAGGCTTGC
CGTGAAACTCTATAGGGAGAGGAAATGGACGAAGAGTAGTAGCCGACTTTATCATCTTCA
CTGAAAAGATATTATTATTAGCAAGTAGCAAGAGAG

QA 7 822 7 822
DS 

RD RR2BR27JQ 783 0 0
CAAACCATTCAAGATCATCACACATTGACAACCATATTTTATATGAAGATATTACAATGA
TTATATTTTCTAAAGCATTATCAAGAAACCACTTGTTGCTATATATACATAGAAATAAAA
CTGTGTGAGATGTTATTCTTCAATCTGTCTCGTGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAGCAG
GGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATCTTGTGAAAGCAGAATCTGGCATT**TGAATTCT
CTTCTTCTCCCAATTCTTGTTGAGATTTTGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTT
TCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCTAACCTCTAAACCATTCTTGGTTTTTCTTTCCT
TCTCCATCGAAGCAATTCCATGTACACACCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTGCTTGCA
GGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGGCTTCTCTTTCTCAAGGTCCTTGAGTTCGAAGT
AAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAATCATCACCTTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGAGTT
CGGTCTCGGCTTTCTCTATTAACGGCGGATCTTGAAGAACACGATCGAACTGTCCGCGGC
TGAAGAGCTCAAGCTTAGGAACGTCTCTCGTGCTTGAACACCTGACCACCGGGAAACAAG
ACTTCGACGGTTGGACGAACTTAGGCTTGCCGTGAAACTCTATAGGGAGAGGAAATGGAC
GAAGAGTAGTAGCCGACTTTATCATCTTCACTGAAAAGATATTATTATTAGCAAGTA
CAGAGA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2AK76TF 863 0 0
CTAAAATAAGCGCACGGCT*GGAAACA*CTTTATCATCAAACCATTCAAGATCATCACAC
AT*GACAACCATATTTTATATGAAGATATTACAATGATTATATTTTCTAAAGCATTATCA
AGAAACCACTTGTTGCTATATATACATAGAAATAAAACTGTGTGAGATGTTATTCTTCAG
TCTGTCTCGTGGTCCGGAGGGAGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGC
AATCTTGTGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAATTCTTGTTGA
GATTTTGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCC
TCTCTAACCTCTAAACCATTCTTGGTTTTTCTTTCCTTCTCCATCGAAGCAATTCCATGT
ACACACCCGATTAGCGATTTCACACTGCCTGCTTACAAGATTAGATTCTCAACTTCCACC
TTTGGCTTCTCTTTCTCAAGGTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAA
TCATCACCTTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTCGGCTTTCTCTATTAAC
GGAGGATCTTGAAGAACACGATCGAACTGTCCGCGGCTGAAGAGCTCAAGCTTAGGAACG
TCTCTCGTGCTTGAACACCTGACCACCGGGAAACAAGACTTCGACGGTTGGACGAACTTA
GGCTTGCCGTGAAACTCTATAGGGAGAGGAAATGGACGAAGAGTAGTAGCCGACTTTATC
ATCTTCACTGAAAAGATATTATTATTAGCAAGTAGCAAGAGAGAAGGTTGGTTTTTAAAG
TTCGAGATTATGCAGAGGAGTCC

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR2BR27TF 728 0 0
GCTA
ATATACATA*AAATAAAACTGTGTGAGATGTA**TCTTCAATCTGTCTCGTG*TCCGGAG
GGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTC*TTTGGCTCTAAGCAATCTTGTGAAAGCAGAAT
CTGGCATT**TGAATTCTCTTCTTCTCCCAATTCTTGTTGAGATTTTGGTAAACCATCAG
GAACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCTAACCTCTAAACCAT
TCTTGGTTTTTCTTTCCTTCTCCATCGAAGCAATTCCATGTACACACCCGATTAGCGATT
TCACACCGCCTGCTTGCAGGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGGCTTCTCTTTCTCAA
GGTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAATCATCACCTTCGAGTTTAC
AACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTCGGCTTTCTCTATTAACGGCGGATCTTGAAGAACAC
GATCGAACTGTCCGCGGCTGAAGAGCTCAAGCTTAGGAACGTCTCTCGTGCTTGAACACC
TGACCACCGGGAAACAAGACTTCGACGGTTGGACGAACTTAGGCTTGCCGTGAAACTCTA
TAGGGAGAGGAAATGGACGAAGAGTAGTAGCCGACTTTATCATCTTCACTGAAAAGATAT
TATTATTAGCAAGTAACAAGAGAGAAGGTTGGTTTTTAAAGTTCGAGATTATGCAGAGGA
GTCC

QA 5 728 5 728
DS 

RD RR2FG78TF 751 0 0
TTTCTAAAGCATTATCAAGAAACCACTTGTTGCTATATATACATAGAAATAAAACTGTGT
GAGATGTTATTCTTCAGTCTGTCTCGTGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGG
TTCCTTTGGCTCTAAGCAATCTTGTGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTCTCTTCTT
CTTCCAATTCTTGTTGAGATTTTGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTTCATCT
TATCTGAATCTGATCCCTCTCTAACCTCTAAACCATTCTTGGTTTTTCTTTCCTTCTCCA
TCGAAGCAATTCCATGTACACACCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTGCTTGCAAGATTA
GATTCTCAACTTCCACCTTTGGCTTCTCTTTCTCAAGGTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTC
TCCAGCAGCTGTAAGAATCACCACCTTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCT
CGGCTTTCTCTATTAACGGCGGATCTTGAAGAACACGATCGAACTGTCCGCGGCTGAAGA
GCTCAAGCTTAGGAACGTCTCTCGTGCTTGAACACCTGACCACCGGGAAACAAGACTTCG
ACGGTTGGACGAACCTAGGCTTGCCGTGAAACTCTGTAGGGAGAGGAAATGGACGAAGAG
TAGTAGCCGACTTTATCATCTTCACTGAAAAGATATTATTATTAGCAAGTAGCAAGAGAG
AAGGTTGGTTTTTAAAGTTCGAGATTATGC
C

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2BM11TF 751 0 0
TTCTAAAGCATTATCAAGAAACCACTTGTTGCTATATATACATAGAAATAAAACTGTGTG
AGATGTTATTCTTCAGTCTGTCTCGTGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGT
TCCTTTGGCTCTAAGCAATCTTGTGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTC
TTCCAATTCTTGTTGAGATTTTGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTTCATCTT
ATCTGAATCTGATCCCTCTCTAACCTCTAAACCATTCTTGGTTTTTCTTTCCTTCTCCAT
CGAAGCAATTCCATGTACACACCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTGCTTGCAAGATTAG
ATTCTCAACTTCCACCTTTGGCTTCTCTTTCTCAAGGTCCTCGAGTTCGAAGTAAGCTCT
CCAGCAGCTGTAAGAATCATCACCTTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTC
GGCTTTCTCTATTAACGGCGGATCTTGAAGAACACGATCGAACTGTCCGCGGCTGAAGAG
CTCAAGCTTAGGAACGTCTCTCGTGCTTGAACACCTGACCACCGGGAAACAAGACTTCGA
CGGTTGGACGAACTTAGGCTTGCCGTGAAACTCTATAGGGAGAGGAAATGGACGAAGAGT
AGTAGCCGACTTTGTCATCTTCACTGAAAAGATATTATTATTAGCAAGTAGCAAGAGAGA
AGGTTGGTTTTTAAAGTTCGAGATTATGC
CC

QA 1 749 1 749
DS 



CO CL5Contig2 828 10 18 U
GGACTCTTCTGCATAATCTCGAACTTTAAAAACCAACCTTCTCTCTTGCTACTTGCTAAT
AATAATATCTTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTC
CCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTG
GTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTC
GACCGTGTTCTTCAAGATCCGCCACTAATAGAAAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGATTAC
TGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAG
GACCTTGAAAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGT
GTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCAATGGAGAAGGAAAGCAAAACC
AAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGAAACTGGACGTTCAT
GTTCCTGATGGTTTACCAAAATCCCAACAAGAACTGGAAGAAGAAGAGAATTCAAGAATG
CCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCT
CACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACGGTTTTACTTCTATGTA
CATATAGCAACAAGTGGTTTCTTGATGATACTTTAGAAAATATAATCATTGTATTTAGTC
AAAAAAA**TATAATCATTGTAATATCTTCATATAAAATATGGTTGCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 45 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 25 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ31TF U 1
AF RR2BO38TF U 1
AF RR2G931TF U 9
AF RR2A150JQ C 92
AF RR2H492TF U 1
AF RR2BW36TF U 1
AF RR2CR72TF U 73
AF RR2BB81TF U 99
AF RR2BW36JQ C 117
AF RR2BB81JQ C 223
BS 1 30 RR2BO38TF
BS 31 31 RR2BW36TF
BS 32 243 RR2BO38TF
BS 244 244 RR2BW36TF
BS 245 389 RR2BO38TF
BS 390 390 RR2BW36TF
BS 391 410 RR2BO38TF
BS 411 411 RR2BW36TF
BS 412 672 RR2BO38TF
BS 673 673 RR2BW36TF
BS 674 690 RR2BO38TF
BS 691 759 RR2BW36TF
BS 760 760 RR2BB81TF
BS 761 775 RR2BW36TF
BS 776 776 RR2CR72TF
BS 777 787 RR2BW36TF
BS 788 823 RR2BB81TF
BS 824 828 RR2BB81JQ

RD RR2EZ31TF 561 0 0
GGACTCTTCTGCATAATCTCGAACTTTAAAAACCAACCTTCTCTCTTGCTACTTGCTAAT
AATAATATCTTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTC
CCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTG
GTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTC
GACCGTGTTCTTCAAGATCCGCCACTAATAGAAAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGATTAC
TGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAG
GACCTTGAAAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGT
GTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCAATGGAGAAGGAAAGCAAAACC
AAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGAAACTGGACGTTCAT
GTTCCTGATGGTTTACCAAAA

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2BO38TF 690 0 0
GGACTCTTCTGCATAATCTCGAACTTTAAATACCAACCTTCTCTCTTGCTACTTGCTAAT
AATAATATCTTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTC
CCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTG
GTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTC
GACTGTGTTCTTCAAGATCCGCCACTAATAGAAAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGATTAC
TGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAG
GACCTTGAAAAAGAGAAGCCAAAGGTGGA*GTTGAGAATCTAATCTTGCACGCAGGCGGT
GTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCAATGGAGAAGGAAAGCAAAACC
AAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGAAACTGGACGTTCAT
GTTCCTGATGGTTTACCAAAATCCCAACAAGAACTGGAAGAAGAAGAGAATTCAAGAATG
CCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCT
CACCCTCCGGAC*ACGAAACAGACTGAAGA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2G931TF 658 0 0
GG
GCATAATCTCGAACTTTAAAAACCAACTCTCTCTCTTGCTACTTGCTAATAATAATATCT
TTTCAGTGAAGATGATAAAGTCGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTCCCTATAGAGT
TTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTT
CAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTC
TTCAAGATCCGCCACTAATAGAAAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAGC
TCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAGGACCCTGAAA
AAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGC
TAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCAATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTT
TAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGAAACTGGACGTTCATGTTCCTGATG
GTTTACCAAAATCCCAACAAGAACTGGAAGAAGAAGAGAATTCAAGAATGTCAGATCCTG
CTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAG*AACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCT

QA 3 658 3 658
DS 

RD RR2A150JQ 597 0 0
CGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTCCCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCG
TCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTA
AGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCAAGATCCGCCACTAATAG
AAAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACA
GCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAGGACCTTGAAAAAGGGAAGCCAAAGGTGGAAG
TTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAA
TTGCTTCAATGGAGAAGGAAGGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAG
ATTCAGATAAGGTGAAACTGGACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCCCAACAAG
AACTGGAAGAAGAAGAGAATTCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAG
CCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCCCGAAACAGACTGAA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2H492TF 780 0 0
GGACTCTTCTGCATAATCTCGAACTTTAAAAACCAACCTTCTCTCTTGCTACTTGCTAAT
AATAATATCTTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTC
CCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTG
GTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTC
GACCGTGTTCTTCAAGATCCGCCACTAATAGAAAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGATTAC
TGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAG
GACCTTGAAAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGT
GTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCAATGGAGAAGGAAAGCAAAACC
AAGAATGGTTTAGAGGCTAGAGAGGGATCGGATTCAGATAAGATGAAACTGGACGTTCAT
GTTCCTGATGGTTTACCAAAATCCCAACAAGAACTGGAAGAAGAAGAGAATTCAAGAATG
CCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCT
CACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACG*TTTTACTTCTATGTA
CATATAGCAACAAGTGGTTTCTTGATGATACTTTAGAAA*TAAAATCATTGTATTTAGTC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2BW36TF 787 0 0
GGACTCTTCTGCATAATCTCGAACTTTAAAAACCAACCTTCTCTCTTGCTACTTGCTAAT
AATAATATCTTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTC
CCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTG
GTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTC
GACCGTGTTCTTCAAGATCCGCCACTAATAGAAAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGATTAC
TGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAG
GACCTTGAAAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGT
GTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCAATGGAGAAGGAAAGCAAAACC
AAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGAAACTGGACGTTCAT
GTTCCTGATGGTTTACCAAAATCCCAACAAGAACTGGAAGAAGAAGAGAATTCAAGAATG
CCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCGAAG*AACCATCCCTGCTTGGTTCTCT
CACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACGGTTTTACTTCTATGTA
CATATAGCAACAAGTGGTTTCTTGATGATACTTTAGAAA*TATAATCATTGTATT*AGTC
AAAAAAA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2CR72TF 714 0 0
TCAGTGAAGATGATAAAGTCGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTCCCTATAGAGTTT
CACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCA
AGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTT
CAAGATCCGCCGCTAATAGAAAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTC
GAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAGGATCTTGAAAAA
GAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTA
ATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCAATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTA
GAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGAAACTGGACGTTCATGTTCCTGATGGT
TTACCAAAATCCCAACAAGAACTGGAAGAAGAAGAGAATTCAAGAATGCCAGATTCTGCT
TTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGAC
CACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACGGTTTTACTTCTATGTACATATAGCAACA
AGTGGTTTCTTGATGATACTTTAGAAA*TATAATCATTGTATTTAGTCAAAAAA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2BB81TF 735 0 0
G
ACTCTTCGTCCATTTCCTCTCCCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCG
TCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAG
CTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCAAGATCCGCCACTAATAGAAAAAGCC
GAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGG
AGAGCTTACTTCGAACTCAAGGACCTTGAAAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAAT
CTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCA
ATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGAT
AAGATGAAACTGGACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCCCAACAAGAACTGGAA
GAAGAAGAGAATTCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGA
ACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCACCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTC
ACACGGTTTTACTTCTATGTACATATAGCAACAAGTGGTTTCTTGATGATACTTTAGAAA
ATATAATCATTGTATTTAGTCAAAAAAA**TATAATCATTGTAATATCTTCATATAAAAT
ATGG
GTTGCCAAAA

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR2BW36JQ 698 0 0
TCTCCCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCC
GGTGGTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACA
GTTCGACCGTGTTCTTCAAGATCCGCCACTAATAGAAAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGA
TTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACT
CAAGGACCTTGAAAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGG
CGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCAATGGAGAAGGAAAGCAA
AACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGAAACTGGACGT
TCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCCCAACAAGAACTGGAAGAAGAAGAGAATTCAAG
AATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCGAAGGAACCATCCCTGCTTGGTT
CTCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACGGTTTTACTTCTA
TGTACATATAGCAACAAGTGGTTTCTTGATGATACTTTAGAAAATATAATCATTGTATTT
AGTCAAAAAAAAATATAATCATTGTAATATCTTCAT
GT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2BB81JQ 606 0 0
TTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCAAGATCCGCCACTAATAGAAAAAGCCGAG
ACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGA
GCTTACTTCGAACTCAAGGACCTTGAAAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTA
ATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCAATG
GAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAG
ATGAAACTGGACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCCCAACAAGAACTGGAAGAA
GAAGAGAATTCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACC
ATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCACCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACA
CGGTTTTACTTCTATGTACATATAGCAACAAGTGGTTTCTTGATGATACTTTAGAAAATA
TAATCATTGTATTTAGTCAAAAAAA**TATAATCATTGTAATATCTTCATATAAAATATG
GTTGCC

QA 1 606 1 606
DS 



CO CL5Contig3 989 2 2 U
GGACTCCTCTGCATAATCGAACTTTAAAAACCAACCTTCTCTCTTGCTACTTGCTAATAA
TAATATCTTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTCCC
TATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGT
CAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGA
TCGTGTTCTTCAAGATCCGCCGTTAATAGAGAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGGTACATA
TTTTTTAATGAAACGTTTCTTGTTCTATTCTTGGATGTGTTACATATGAAGATGTCGTTG
AGAATATAATATGAAATGAAATATCTACTTGTGAATGTTATTAGATAATCGAGACATGTT
TTTTTTTTGGTTCGATTTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGATTCTTACAGCT
GCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTG
AGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTG
CTTCGATGGAGAAGGAAAGAAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATT
CAGATAAGATGAAACTGGACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAAT
TGGAAGAAGAAGAGAATTCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCA
AAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCACGAGACAGACTGAAGAATAA
CATCTCACACAGTCTTATTTCTATGTATATATAGCAACAAGTGGTTTCTTGATAATGCTT
TAGAAAATATAATCATTGTAATATCTTCATATAAAATATGGTTGTCAATGTGTGATGATC
TTGAATGGTTTGATGATAAAGTTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ75TF U 1
AF RR2BQ75JQ C 321
BS 1 614 RR2BQ75TF
BS 615 989 RR2BQ75JQ

RD RR2BQ75TF 627 0 0
GGACTCCTCTGCATAATCGAACTTTAAAAACCAACCTTCTCTCTTGCTACTTGCTAATAA
TAATATCTTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTCCC
TATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGT
CAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGA
TCGTGTTCTTCAAGATCCGCCGTTAATAGAGAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGGTACATA
TTTTTTAATGAAACGTTTCTTGTTCTATTCTTGGATGTGTTACATATGAAGATGTCGTTG
AGAATATAATATGAAATGAAATATCTACTTGTGAATGTTATTAGATAATCGAGACATGTT
TTTTTTTTGGTTCGATTTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGATTCTTACAGCT
GCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTG
AGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTG
CTTCGATGGAGAAG
AAAGAAAACCAAG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2BQ75JQ 669 0 0
TGTTCTATTCTTGGATGTGTTACATATGAAGATGTCGTTGAGAATATAATATGAAATGAA
ATATCTACTTGTGAATGTTATTAGATAATCGAGACATGTTTTTTTTTTGGTTCGATTTCA
GATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGATTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAA
CTCAAGGACCTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCA
GGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCGATGGAGAAGGAAAGA
AAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGAAACTGGAC
GTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAATTCA
AGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGG
TTCTCTCACCCTCCGGACCACGAGACAGACTGAAGAATAACATCTCACACAGTCTTATTT
CTATGTATATATAGCAACAAGTGGTTTCTTGATAATGCTTTAGAAAATATAATCATTGTA
ATATCTTCATATAAAATATGGTTGTCAATGTGTGATGATCTTGAATGGTTTGATGATAAA
GTTGTTTCC

QA 1 669 1 669
DS 



CO CL5Contig4 860 7 7 U
AGAAATCTCTCCGTAACCAAAACCAGATACTAAAATAAGCGCACGGCTTGGAAACAACTT
TATCATCAAACCATTCAAGATCATCACACATTGACAACCATATTTTATATGAAGATATTA
CAATGATTATATTTTTTTTGACTAAATACAATGATTATATTTTCTAAAGTATCATCAAGA
AACCACTTGTTGCTATATGTACATAGAAGTAAAACCGTGTGAGATGGATTCTTCAGTCTG
TTTCGTGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATC
TTGTGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAGTTCTTGTTGGGATT
TTGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTC
TAACCTCTAAACCATTCTTGGTTTTGCTTTCCTTCTCCATTGAAGCAATTCCATGTACAC
ACCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTGCTTGCAAGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTG
GCTTCTCTTTTTCAAGGTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAGTCAT
CACCTTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTCGGCTTTTTCTATTAGTGGCG
GATCTTGAAGAACACCTGACCACCGGGAAACAAGACTTCGACGGTTGGACGAACTTAGGC
TTGCCGTGAAACTCTATAGGGAGAGGAAATGGACGAAGAGTAGTAGCCGACTTTATCATC
TTCACTGAAAAGATATTATTATTAGCAAGTAGCAAGAGAGAAGGTTGGTTTTTAAAGTTC
GAGATTATGCAGAAGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A150TF C 64
AF RR2BO38JQ U 50
AF RR2CG30JQ U 1
AF RR2CG30TF C 388
AF RR2G931JQ U 62
AF RR2G121JQ U 15
AF RR2G121TF C 75
BS 1 335 RR2CG30JQ
BS 336 336 RR2BO38JQ
BS 337 603 RR2CG30JQ
BS 604 604 RR2G121JQ
BS 605 638 RR2CG30JQ
BS 639 786 RR2G121JQ
BS 787 860 RR2G121TF

RD RR2A150TF 401 0 0
CG
TCAAACCATTCAAGATCATCACACATTGACAACCATATTTTATATGAAGATATTACAATG
ATTATATTTTTT**GACTAGATACAATGATTATATTTTCTAAAGTATCATCAAGAAACCA
CTTGTTGCTATATGTACATAGAAGTAAAACCGTGTGAGATGGATTCTTCAGTCTGTTTCG
TGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATCTTGTG
AAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAGTTCTTGTTGGGATTTTGGT
AAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTTCACCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCTAACC
TCTAAACCATTCTTGGTTTTGCCTTCCTTCTCCATTGAA

QA 3 401 3 401
DS 

RD RR2BO38JQ 465 0 0
GGAAACAACTTTATCATCAAACCATTCAAGATCATCACACATTGACAACCATATTTTATA
TGAAGATATTACAATGATTATATTTTTTTTGACTAAATACAATGATTATATTTTCTAAAG
TATCATCAAGAAACCACTTGTTGCTATATGTACATAGAAGTAAAACCGTGTGAGATGGAT
TCTTCAGTCTGTTTCGTGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGC
TCTAAGCAATCTTGTGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAGTTC
TTGTTGGGATTTTGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATC
TGATCCCTCTCTAACCTCTAAACCATTCTTGGTTTTGCTTTCCTTCTCCATTGAAGCAAT
TCCATGTACACACCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTGCGTGCAA

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2CG30JQ 638 0 0
AGAAATCTCTCCGTAACCAAAACCAGATACTAAAATAAGCGCACGGCTTGGAAACAACTT
TATCATCAAACCATTCAAGATCATCACACATTGACAACCATATTTTATATGAAGATATTA
CAATGATTATATTTTTTTTGACTAAATACAATGATTATATTTTCTAAAGTATCATCAAGA
AACCACTTGTTGCTATATGTACATAGAAGTAAAACCGTGTGAGATGGATTCTTCAGTCTG
TTTCGTGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATC
TTGTGAAAGCAGAATCTGGCATTCTTGAATTCTCTCCTTCTTCCAGTTCTTGTTGGGATT
TTGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTC
TAACCTCTAAACCATTCTTGGTTTTGCTTTCCTTCTCCATTGAAGCAATTCCATGTACAC
ACCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTGCTTGCAAGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTG
GCTTCTCTTTTTCAAGGTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAGTCAT
CACATTCGAGTTTACAACAGTAATCTGAGAGTTCGGTC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2CG30TF 251 0 0
CCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCTA*CCTCTAAACCATTCTTGGTTTTGC
TTTCCTTCTCCATTGAAGCAATTCCATGTACACACCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTG
CTTGCAAGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGGCTTCTCTTTTTCAAGGTCCTTGAGTT
CGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAGTCATCACATTCGAGTTTACAACAGTAATCTG
AGAGTTCGGTC

QA 1 251 1 251
DS 

RD RR2G931JQ 552 0 0
ATCATCAAACCATTCAAGATCATCACACATTGACAACCATATTTTATATGAAGATATTAC
AATGATTATATTTTTTTTGACTAAATACAATGATTATATTTTCTAAAGTATCATCAAGAA
ACCACTTGTTGCTATATGTACATAGAAGTAAAACCGTGTGAGATGGATTCTTCAGTCTGT
TTCGTGGTCCGGAGGGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATCT
TGTGAAAGCAGGATCTGACATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAGTTCTTGTTGGGATTT
TGGTAAACCATCAGGAACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCT
AACCTCTAAACCATTCTTGGTTTTGCTTTCCTTCTCCATTGAAGCAATTCCATGTACACA
CCCGATTAGCGATTTCACACCGCCTGCTTGCAAGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGG
CTTCTCTTTTTCAGGGTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAGTCATC
ACCTTCGAG
CTT

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2G121JQ 772 0 0
G
ACCAAAACCAGATACTAAAATAAGCGCACGGCTTGGAAACAACTTTATCATCAAACCATT
CAAGATCATCACACATTGACAACCATATTTTATATGAAGATATTACAATGATTATATTTT
TTTTGACTAAATACAATGATTATATTTTCTAAAGTATCATCAAGAAACCACTTGTTGCTA
TATGTACATAGAAGTAAAACCGTGTGAGATGGATTCTTCAGTCTGTTTCGTGGTCCGGAG
GGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATCTTGTGAAAGCAGAAT
CTGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAGTTCTTGTTGGGATTTTGGTAAACCATCAG
GAACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCTAACCTCTAAACCAT
TCTTGGTTTTGCTTTCCTTCTCCATTGAAGCAATTCCACGTACACACCCGATTAGCGATT
TCACACCGCCTGCTTGCAAGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGGCTTCTCTTTTTCAA
GGTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAGTCATCACCTTCGAGTTTAC
AACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTCGGCTTTTTCTATTAGTGGCGGATCTTGAAGAACAC
CTGACCACCGGGAAACAAGACTTCGACGGTTGGACGAACTTAGGCTTGCCGTGAAACTCT
ATAGGGAGAGGAAATGGACGAAGAGTAGTAGCCGACTTTATCATCTTCACT

QA 2 772 2 772
DS 

RD RR2G121TF 786 0 0
TCAAGATCATCACACAT*GACAACCATATTTTATATGAAGATAT*ACAATGATTATATTT
TTTT*GACTAAATACAATGATTATATTT*CTAAAGTATCATCAAGAAACCACTTGTTGCT
ATATGTACATAGAAGTAAAACCGTGTGAGATGGATTCTTCAGTCTGTTTCGTGGTCCGGA
GGGTGAGAGAACCAAGCAGGGATGGTTCCTTTGGCTCTAAGCAATCTTGTGAAAGCAGAA
TCTGGCATTCTTGAATTCTCTTCTTCTTCCAGTTCTTGTTGGGATTTTGGTAAACCATCA
GGAACATGAACGTCCAGTTTCATCTTATCTGAATCTGATCCCTCTCTAACCTCTAAACCA
TTCTTGGTTTTGCTTTCCTTCTCCATTGAAGCAATTCCACGTACACACCCGATTAGCGAT
TTCACACCGCCTGCTTGCAAGATTAGATTCTCAACTTCCACCTTTGGCTTCTCTTTTTCA
AGGTCCTTGAGTTCGAAGTAAGCTCTCCAGCAGCTGTAAGAGTCATCACCTTCGAGTTTA
CAACAGTAATCTGAGAGTTCGGTCTCGGCTTTTTCTATTAGTGGCGGATCTTGAAGAACA
CCTGACCACCGGGAAACAAGACTTCGACGGTTGGACGAACTTAGGCTTGCCGTGAAACTC
TATAGGGAGAGGAAATGGACGAAGAGTAGTAGCCGACTTTATCATCTTCACTGAAAAGAT
ATTATTATTAGCAAGTAGCAAGAGAGAAGGTTGGTTTTTAAAGTTCGAGATTATGCAGAA
GAGTCC

QA 1 786 1 786
DS 



CO CL5Contig5 854 4 10 U
GGACTCTTCTGCATAATCTCGAACTTTAAAAACCAACCTTCTCTCTTGCTACTTGCTAAT
AATAATATCTTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTC
CCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTG
GTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTC
GACCGTGTTCTTCAAGATCCGCCGTTAATAGAAAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGATTAC
TGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTTCAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAG
GACCTTGAAAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGT
GTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCAATTGAGAAGGAAAGAAAAACC
AAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGAAACTGGACGTTCAT
GTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAAGAAGAATTGGAGGAAGAAGAGAAATCAAGAATG
CCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCT
CACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTA
CATATAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATAATGCCTATAAAATAT
AGTTGTCAATGTGTGATGATCTTGAATGGTTCGATGATAAAGTTGTTTCCAAGCCGTGTG
CTTATTTTAGTACC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ER40TF U 1
AF RR2ER40JQ C 2
AF RR2A422JQ C 407
AF RR2A422TF U 407
BS 1 748 RR2ER40TF
BS 749 749 RR2A422TF
BS 750 752 RR2ER40TF
BS 753 753 RR2A422TF
BS 754 769 RR2ER40TF
BS 770 770 RR2A422TF
BS 771 788 RR2ER40TF
BS 789 789 RR2A422TF
BS 790 798 RR2ER40TF
BS 799 854 RR2A422TF

RD RR2ER40TF 798 0 0
GGACTCTTCTGCATAATCTCGAACTTTAAAAACCAACCTTCTCTCTTGCTACTTGCTAAT
AATAATATCTTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTC
CCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTG
GTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTC
GACCGTGTTCTTCAAGATCCGCCGTTAATAGAAAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGATTAC
TGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTTCAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAG
GACCTTGAAAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGT
GTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCAATTGAGAAGGAAAGAAAAACC
AAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGAAACTGGACGTTCAT
GTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAAGAAGAATTGGAGGAAGAAGAGAAATCAAGAATG
CCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCT
CACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTA
CATATAATTATTGTAATATATCTGTTTT*GTA*TATATCTTCATAATGC*TATAAAATAT
AGTTGTCA*TGTGTGATG

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2ER40JQ 797 0 0
GACTCTTCTGCATAATCTCGAACTTTAAAAACCAAC*TTCTCTCTTGCTACTTGCTAATA
ATAATATCTTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTCC
CTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGG
TCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCG
ACCGTGTTCTTCAAGATCCGCCGTTAATAGAAAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGATTACT
GTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTTCAGCTGCTGGAGAGCTTACTTCGAACTCAAGG
ACCTTGAAAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTG
TGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCAATTGAGAAGGAAAGAAAAACCA
AGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGAAACTGGACGTTCATG
TTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAAGAAGAATTGGAGGAAGAAGAGAAATCAAGAATGC
CAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTC
ACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTAC
ATATAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATAATGCCTATAAAATATA
GTTGTCAATGTGTGATG

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2A422JQ 448 0 0
G
GCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCAATTGAGAA
GGAAAGAAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGAA
ACTGGACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAAGAAGAATTGGAGGAAGAAGA
GAAATCAAGAATGCCAGATTTTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCC
TGCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTT
TTACTTCTATGTACATATAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATAAT
GCCTATAAAATATAGTTGTCAATGTGTGATGATCTTGAATGGTTCGATGATAAAGTTGTT
TCCAAGCCGTGTGCTTATTTTAGTACC

QA 2 448 2 448
DS 

RD RR2A422TF 448 0 0
G
GCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTGTACATGGAATTGCTTCAATTGAGAA
GGAAAGAAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGAA
ACTGGACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAAGAAGAATTGGAGGAAGAAGA
GAAATCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCC
TGCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTT
TTACTTCTATGTACATATAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATAAT
GCCTATAAAATATAGTTGTCAATGTGTGATGATCTTGAATGGTTCGATGATAAAGTTGTT
TCCAAGCCGTGTGCTTATTTTAGTACC

QA 2 448 2 448
DS 



CO CL5Contig6 1063 2 2 U
GGACTCTTCTGCATAATCTCGAACTTTAAAAACCAACCTTCTCTCTTGCTACTTGCTAAT
AATAATATCTTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTC
CCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTG
GTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTC
GACCGTGCTCTTCAAGATCCGCCACTAATAGAAAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGGTACA
TATTTTTTTTTACCGACCAATAAATCTGTTCTTGGATGTGTTGTGTTACATATGAGAATA
ATATGAAGTGAAATATCTACTTGTGAATGTTATTAGATAATTGAGACGTTTTTTTTTTGT
TCGATTTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCT
TACTTCGAACTCAAGGACCTTGAAAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATC
TTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTTACATGGAATTGCTTCAATGGAGA
AGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGA
AACTGGACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCCCAACAAGAACTGGAAGAAGAAG
AGAATTCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCC
CTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACGGT
TTTACTTCTATGTACATATAGCAACAAGTGGTTTCTTGATGATACTTTAGAAAATATAAT
CATTGTATTTAGTCAAAAAAAATATAATCATTGTAATATCTTCATATAAAATATGGTTGT
CAATGTGTGATGATCTTGAATGGTTTGATGATAAAGTTGTTTCCAAGCCGTGCGCTTATT
TTAGTATCTGGTTTTGGTTACGGAGAGATTTCTATATTTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FI53TF U 1
AF RR2FI53JQ C 303
BS 1 573 RR2FI53TF
BS 574 1063 RR2FI53JQ

RD RR2FI53TF 573 0 0
GGACTCTTCTGCATAATCTCGAACTTTAAAAACCAACCTTCTCTCTTGCTACTTGCTAAT
AATAATATCTTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCGGCTACTACTCTTCGTCCATTTCCTCTC
CCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAACCGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTG
GTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTC
GACCGTGCTCTTCAAGATCCGCCACTAATAGAAAAAGCCGAGACCGAACTCTCAGGTACA
TATTTTTTTTTACCGACCAATAAATCTGTTCTTGGATGTGTTGTGTTACATATGAGAATA
ATATGAAGTGAAATATCTACTTGTGAATGTTATTAGATAATTGAGACGTTTTTTTTTTGT
TCGATTTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCT
TACTTCGAACTCAAGGACCTTGAAAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATC
TTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGG

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2FI53JQ 761 0 0
TTTTTTTTTACCGACCAATAAATCTGTTCTTGGATGTGTTGTGTTACATATGAGAATAAT
ATGAAGTGAAATATCTACTTGTGAATGTTATTAGATAATTGAGACGTTTTTTTTTTGTTC
GATTTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTA
CTTCGAACTCAAGGACCTTGAAAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTT
GCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTTACATGGAATTGCTTCAATGGAGAAG
GAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGGATCAGATTCAGATAAGATGAAA
CTGGACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCCCAACAAGAACTGGAAGAAGAAGAG
AATTCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCT
GCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACGGTTT
TACTTCTATGTACATATAGCAACAAGTGGTTTCTTGATGATACTTTAGAAAATATAATCA
TTGTATTTAGTCAAAAAAAATATAATCATTGTAATATCTTCATATAAAATATGGTTGTCA
ATGTGTGATGATCTTGAATGGTTTGATGATAAAGTTGTTTCCAAGCCGTGCGCTTATTTT
AGTATCTGGTTTTGGTTACGGAGAGATTTCTATATTTGATG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 2 40

CO CL6Contig1 816 2 4 U
GGATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTC
TTCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCT
GATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACC
TAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAA
GCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCTTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCA
ATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACCCATCCTGGTGCT
TCGGAGGTTCTTGTAGTCATACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAAC
AAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTCCCTCAAGGGCTTCTT
CATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAGGGCCCTGCTTTGGCCTTTGTCGCCTTTGGAAGCTCT
TCTCCAGGACTTCAGATTCTATCGTTTGCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTC
GTTGAAGCTACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAGCTTAAGGGTGTGCTTGGA
GGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTCAAAGTTTTCTTGTGTTTTTATCTCTTTAAAT
TCAAGTTCGTCTGCCATCCTGATTTTTATTTTAATGGTTATTTTGTGTTGTTATTGTTTT
TAGTGCTTCATTTATAATCACTTTGGCTTGAACTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER61TF U 1
AF RR2ER61JQ C 100
BS 1 707 RR2ER61TF
BS 708 708 RR2ER61JQ
BS 709 746 RR2ER61TF
BS 747 816 RR2ER61JQ

RD RR2ER61TF 747 0 0
GGATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTC
TTCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCT
GATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACC
TAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAA
GCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCTTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCA
ATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACCCATCCTGGTGCT
TCGGAGGTTCTTGTAGTCATACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAAC
AAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTCCCTCAAGGGCTTCTT
CATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAGGGCCCTGCTTTGGCCTTTGTCGCCTTTGGAAGCTCT
TCTCCAGGACTTCAGATTCTATCGTTTGCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTC
GTTGAAGCTACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAGCTTAAGGGTGTGCTTGGA
GGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTCAAAGTTTTCTTGTGTTTT*ATCTCTTTAAAT
TCAAGTTCGTCTGCCATCCTGATTTT
A

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2ER61JQ 717 0 0
GTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGC
AAGAACCCTGACCAGGTCACCTAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGA
AACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCTTTCGCAGGC
ACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCT
CTTCACACCCATCCTGGTGCTTCGGAGGTTCTTGTAGTCATACAAGGAACCATTTGCGCT
GGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATG
GTGTTCCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAGGGCCCTGCTTTGGCC
TTTGTCGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCAGGACTTCAGATTCTATCGTTTGCTTTGTTTGCA
AATGACTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCTACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAG
AAGCTTAAGGGTGTGCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTCAAAGTTTTCT
TGTGTTTTTATCTCTTTAAATTCAAGTTCGTCTGCCATCCTGATTTTTATTTTAATGGTT
ATTTTGTGTTGTTATTGTTTTTAGTGCTTCATTTATAATCACTTTGGCTTGAACTAT

QA 1 717 1 717
DS 



CO CL6Contig2 886 38 23 U
GGGATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTT
CTTCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGC
TGATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCAC
CGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAA
AGCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTC
AATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGC
TTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAA
CAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCT
TCATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTC
TTCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAAC
TCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GGGTGTTCTT
GGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTTTATCTCTTTA
AAAATTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTGTTATTTTGTGTTGTT
GTTTTCAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAACTATAATAAGGAATAAACATTCG
ATTGTAGACGTCTAAGATGGTTCTTAAATCTTAACTATCTTGAGAT


BQ
10 55 70 70 70 80 90 90 90 90 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 80 80 80 80 80 80 80 80 60 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 70 60 60 
60 60 55 40 40 30 15 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ56TF U 3
AF RR2GJ29TF U 1
AF RR2CC96TF U 3
AF RR2BY91TF U 2
AF RR2C805TF U 12
AF RR2BQ01TF U 4
AF RR2GD57TF U 2
AF RR2CT39TF U 2
AF RR2FZ44TF U 5
AF RR2GH23TF U 10
AF RR2DJ35TF U 2
AF RR2GN51TF U 2
AF RR2BO90TF U 3
AF RR2GB90TF U 2
AF RR2EL25TF U 2
AF RR2FQ21TF U 2
AF RR2ER69TF U 2
AF RR2FQ21JQ C 41
AF RR2BY91JQ C 4
AF RR2FZ44JQ C 97
AF RR2GH23JQB C 77
AF RR2C805JQ C 12
AF RR2BP53JQ C 589
AF RR2BP53TF U 589
AF RR2EQ56JQ C 246
AF RR2GN51JQ C 408
AF RR2CT39JQ C 115
AF RR2GJ29JQB C 101
AF RR2ER69JQ C 78
AF RR2BO90JQ C 101
AF RR2GB90JQ C 416
AF RR2DJ35JQ C 172
AF RR2EF45JQ C 173
AF RR2CC96JQ C 172
AF RR2EF45TF U 130
AF RR2FB71JQ C 101
AF RR2BQ01JQ C 115
AF RR2EL25JQ C 218
BS 1 247 RR2GJ29TF
BS 248 248 RR2BY91TF
BS 249 389 RR2GJ29TF
BS 390 390 RR2BY91TF
BS 391 489 RR2GJ29TF
BS 490 648 RR2BY91TF
BS 649 652 RR2DJ35TF
BS 653 653 RR2EL25TF
BS 654 661 RR2DJ35TF
BS 662 710 RR2EL25TF
BS 711 711 RR2FQ21TF
BS 712 723 RR2EL25TF
BS 724 724 RR2BP53TF
BS 725 748 RR2EL25TF
BS 749 751 RR2ER69TF
BS 752 752 RR2BP53TF
BS 753 756 RR2ER69TF
BS 757 818 RR2BP53TF
BS 819 827 RR2EF45TF
BS 828 828 RR2BY91JQ
BS 829 845 RR2EF45TF
BS 846 852 RR2ER69JQ
BS 853 886 RR2BQ01JQ

RD RR2EQ56TF 449 0 0
GATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTCT
TCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTGGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTG
ATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCG
AGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTGGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAG
CTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGTGTCTCAA
TGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACCCATCCCGGTGCTT
CGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACA
AAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGT

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2GJ29TF 489 0 0
GGGATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTT
CTTCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGC
TGATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCAC
CGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAA
AGCTGCA*TGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTC
AATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGC
TTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAATCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAA
CAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCT
TCATTTTCA

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2CC96TF 591 0 0
GATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTCT
TCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTG
ATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGTTCACCG
AGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAG
CTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAA
TGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTT
CGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACA
AAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTC
ATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTT
CTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2BY91TF 647 0 0
GGATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTC
TTCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCT
GATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACC
GAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAA
GCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCA
ATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCT
TCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAAC
AAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTT
CATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCT
TCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACT
CGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2C805TF 609 0 0
AAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTCTTCATCCTTT
CCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCAAAGG
GTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACT
TCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGA
CTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTC
TTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTC
TTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACT
TGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGC
TTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCGGGAC
TTCAGATTCTATCGTTTTGCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCC
ACTACGTTC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2BQ01TF 640 0 0
GG
AACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTCTTCA
TCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATC
CAAAGGGTCCCCAAGGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGA
ATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTG
CAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTGGGCGTCTCAATGG
CTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGG
AAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAG
TTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTCCATT
TTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTC
CGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTT
GAAGCCACTACGCTCCTTAGCGATGCAGAG
TTAAGAAA

QA 3 632 3 632
DS 

RD RR2GD57TF 632 0 0
GGATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTC
TTCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCT
GATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACC
GAGAGTGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAA
GCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCA
ATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCT
TCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAAC
AAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTT
CATTTTCAGCTTAATTCTGGGGAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCT
TCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACT
CGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAG

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2CT39TF 642 0 0
GGATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTC
TTCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCT
GATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACC
GAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAGAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAA
GCTGCAGTGACTCCAGCCTTTACTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCA
ATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCT
TCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAAC
AAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTT
CATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCT
TCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACT
CGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2FZ44TF 643 0 0
G
AACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTCTTCA
TCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATC
CAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGA
ATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTG
CAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGG
CTTGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGG
AAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAG
TTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATT
TTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTC
CGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTT
GAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTT

QA 2 643 2 643
DS 

RD RR2GH23TF 651 0 0
GG
AAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTCTTCATCCTTT
CCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCAAAGG
GTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACT
TCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGA
CTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTC
TTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTC
TTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACT
TGAAGACTCTCTAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGC
TTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCGGGAC
TTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCC
ACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GG*TGTTCTT

QA 3 651 3 651
DS 

RD RR2DJ35TF 660 0 0
GGATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTC
TTCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTACCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCT
GATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACC
GAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAA
GCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCA
ATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCT
TCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAAC
AAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTT
CATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCT
TCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACT
CGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GG*TGTTCTTG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2GN51TF 681 0 0
GGATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTC
TTCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCT
GATCCAAAGGGTTCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGGCCAGGTCACC
GAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAA
GCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCA*TGGACTTGGCGTCTCA
ATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCT
TCGGAAGTTCTTGTATTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAAC
AAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTT
CATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGAAAGCTCT
TCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACT
CGTTGAAGCCACTACGTTCCTTGGCGATGCAGAG*TTAAGAAACTTAA*GG*TGTTCTTG
GAGGAACTAATTAAGCT
CCTC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2BO90TF 671 0 0
GATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTCT
TCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTG
ACCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCG
AGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAG
CTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAA
TGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTT
CGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACA
AAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTC
ATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTT
CTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTC
GTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAG*TTAAGAAACTTAA*GG*TGTTCTTGG
AGGA
CTAATAA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2GB90TF 660 0 0
GGATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTC
TTCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCT
GATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACC
GAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAA
GCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCA
ATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCT
TCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAAC
AAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTT
CATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCT
TCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACT
CGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GGGTGTTCTTG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2EL25TF 747 0 0
GGATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTC
TTCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCT
GATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACC
GAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAA
GCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCA
ATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCT
TCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAAC
AAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTT
CATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCT
TCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACT
CGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GGGTGTTCTTG
GAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTT*ATCTCTTTAA
AA*TTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGAT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2FQ21TF 724 0 0
GGATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTC
TTCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCT
GATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACC
GAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAA
GCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCA
ATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCT
TCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAAC
AAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTT
CATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCT
TCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACT
CGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTA*GAAACTTAA*AGGTGTTCTTG
GAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTT*GTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTTTATCTCTTTAA
AA*T

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2ER69TF 772 0 0
GGATAACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTC
TTCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCT
GATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACC
GAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAA
GCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCA
ACGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCT
TCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCCGGATTTATCTCCTCTGCTAAC
AAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTT
CATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCT
TCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACT
CGTTGAAGCCGCTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAAAGGGTGTTCTTG
GAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTT*ATCTCTTTAA
AA*TTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTT*ATTTA
ATGGTTGCTATTTGTG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2FQ21JQ 700 0 0
AAAATGATAATCCATATTTTCTTCATCCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCA
GTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGC
AAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGA
AACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGC
ACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCT
CTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCT
GGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATG
GTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCA
TTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGC
AAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAG
GAAACTTAA*GGGTGTTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTT
CTTGTGTTTTTATCTCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCTGCC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2BY91JQ 838 0 0
GAT
ACTTCAAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTCTTCAT
CCTTTC*TTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCC
AAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAA
TGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTGC
AGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGC
TCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGA
AGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGT
TTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTT
TCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCC
GGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTTG
AAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GGGTGTTCTTGGAGGA
ACTAATTAAGCTTCTCTTTTGCTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTTTATCTCTTTAAAAATT
CAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTGTTATTTTGTGTTGTTGTTTTC
AGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAACTATAATAAGGAATAAACATTCG
T

QA 4 837 4 837
DS 

RD RR2FZ44JQ 723 0 0
CTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTC
TTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGC
TGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGC
AGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTTGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCAT
TCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTG
CGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTC
TATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTT
GGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGT
TTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGG
TTAAGAAACTTAA*GGGTGTTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAG
TTTTCTTGTGTTTTTATCTCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTT
TAATGGTTGTTATTTTGTGTTGTTGTTTTCAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGA
ACT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2GH23JQB 763 0 0
GTTTCATCCATATCTTT*GCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCAAAGGGTCCC
CAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACTTCGCA
TTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCA
GCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGAC
TTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTA
GTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAG
ACTCTCTAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAAT
TCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCGGGACTTCAG
ATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCACTAC
GTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GGGTGTTCTTGGAGGAACTAATTAAG
CTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTTTATCTCTTTAAAAATTCAAGTTCCTC
TGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTGTTATTTTGTGTTGTTGTTTTCAGTGCTTCAT
TTATAATCAATTTCGCTTGAACTATAATAAGGAATAAACATTC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2C805JQ 791 0 0
AAGACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATA*TCCATATTTTCTTCATCCTTT
CCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCAAAGG
GTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACT
TCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGA
CTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTC
TTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTC
TTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACT
TGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTTTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGC
TTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCGGGAC
TTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCC
ACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GGGTGTTCTTGGAGGAACTAA
TTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTTTATCTCTTTAAAAATTCAAGT
TCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTGTTATTTTGTGTTGTTGTTTTCAGTGC
TTCATTTATAA

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2BP53JQ 231 0 0
G
GCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGACGCAGAGGTTAAGAAACTTAA
*GGGTGTTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTT
TTATCTCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTGTTAT
TTTGTGTTGTTGTTTTCAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAAC
C

QA 2 230 2 230
DS 

RD RR2BP53TF 231 0 0
G
GCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGACGCAGAGGTTAAGAAACTTAA
*GGGTGTTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTT
TTATCTCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTGTTAT
TTTGTGTTGTTGTTTTCAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAAC
C

QA 2 230 2 230
DS 

RD RR2EQ56JQ 595 0 0
CAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGTGTCTCAATGG
CTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACCCATCCCGGTGCTTCGG
AAGTTTTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAG
TTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTTTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATT
TTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTTTC
CGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTT
GAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GGGTGTTCTTGGAGG
AACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTTTATCTCTTTAAAAAT
TCAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTGTTATTTTGTGTTGTTGTTTT
CAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAACTATAATAAGGAATAAACATTCG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2GN51JQ 412 0 0
TT
TCCTTTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTTTATGGTGTTTCCT
CAAGGGCTTTTTCATTTTCAGCTTAATTTTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCC
TTTGAAAGCTTTTTTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTT
GCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTGGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA
*GGGTGTTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTCCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTT
TTATCTCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCTGCCATTTTGATTTTTATTTTAATGGTTGTTAT
TTTGTGTTGTTGTTTTCAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAACT

QA 3 412 3 412
DS 

RD RR2CT39JQ 720 0 0
TGTAGCTGATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCA
GGTCACCGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAGAGCTGGAAACACTTCCAACAT
CATTAAAGCTGCAGTGACTCCAGCCTTTACTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGG
CGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCC
CGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTC
TGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGG
GCTTCTTCATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGG
AAGCTCTTCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTT
CAGAACTCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GGGT
GTTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTTTATC
TCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTGTTATTTTGT
GTTGTTGTTTTCAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAACTATAATAAGGAATAAA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2GJ29JQB 682 0 0
GTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGC
AAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGA
AACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCA*TGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGC
ACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCT
CTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAATCATTTGCGCT
GGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATG
GTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCA
TTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGC
AAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAA
GAAACTTAA*GGGTGTTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTT
CTTGTGTTTTTATCTCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAAT
AGTTGTTATTTTGTGTTGTTGT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2ER69JQ 775 0 0
TTTCATCCATATCTTT*GCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCAAAGGGTCCCC
AAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACTTCGCAT
TCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCAG
CCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAACGGCTCGTCTTGACT
TAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAG
TCGTACAAGGAACCATTTGCGCCGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGA
CTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAATT
CTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCGGGACTTCAGA
TTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCGCTACG
TTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GGGTGTTCTTGGAGGAACTAATTAAGC
TTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTTTATCTCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCT
GCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTGCTATTTTGTGTTGTTGTTTTCAGTGCTTCATT
TATAATCAATTTCGCTTGAACTATAATAAGGAATAAACATTCGATTGTAGACGTC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2BO90JQ 753 0 0
GTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGACCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGC
AAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGA
AACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGC
ACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCT
CTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCT
GGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATG
GTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCA
TTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGC
AAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAA
GAAACTTAA*GGGTGTTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTT
CTTGTGTTTTTATCTCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAAT
GGTTGTTATTTTGTGTTGTTGTTTTCAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAACTA
TAATAAGGAATAAACATTCGATTGTAGACGTC
C

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2GB90JQ 430 0 0
GCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGG
CTTCTTCATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGA
AGCTTTTTTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTC
AGAACTCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GGGTG
TTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTTTATCT
CTTTAAAAATTCAAGTTTTTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTGTTATTTTGTG
TTGTTGTTTTCAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAACTATAATAAGGAATAAAC
ATTCGATTG
G

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR2DJ35JQ 676 0 0
CCAGGTCACCGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAA
CATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACT
TGGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCA
TCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTC
CTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTTTATGGTGTTTCCTCA
AGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTT
TGGAAGCTCTTCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGC
CTTCAGAACTCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*G
GGTGTTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTTT
ATCTCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTGTTATTT
TGTGTTGTTGTTTTCAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAACTATAATAAGGAAT
AAACATTCGATTGTAG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2EF45JQ 673 0 0
CAGGTCACCGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAAC
ATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTT
GGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCAT
CCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCC
TCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAA
GGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTT
GGAAGCTCTTCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCC
TTCAGAACTCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GG
GTGTTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTTTA
TCTCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTGTTATTTT
GTGTTGTTGTTTTCAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAACTATAATAAGGAATA
AACATTCGATTGT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2CC96JQ 682 0 0
CCAGTTCACCGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAA
CATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACT
TGGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCA
TCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTC
CTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCA
AGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTT
TGGAAGCTCTTCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGC
CTTCAGAACTCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*G
GGTGTTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTTT
ATCTCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGACTTTTATTTTAATGGTTGTTATTT
TGTGTTGTTGTTTTCAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAACTATAATAAGGAAT
AAACATTCGATTGTAGACGTC
T

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2EF45TF 716 0 0
GGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGA
CTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGT
GACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCG
TCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGT
TCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTA
CTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCA
GCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCGGG
ACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAG
CCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GGGTGTTCTTGGAGGAACT
AATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTTTATCTCTTTAAAAATTCAA
GTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTGTTATTTTGTGTTGTTGTTTTCAGT
GCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAACTATAATAAG*AATAAACATTCGATTGT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2FB71JQ 747 0 0
GTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGC
AAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGA
AACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGC
ACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCT
CTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCT
GGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATG
GTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCA
TTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGC
AAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGTGGTTAA
GAAACTTAA*GGGTGTTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTT
CTTGTGTTTTTATCTCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAAT
AGTTGTTATTTTGTGTTGTTGTTTTCAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAACTA
TAATAAGGAATAAACATTCGATTGTAG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2BQ01JQ 772 0 0
TGTAGCTGATCCAAAGGGTCCCCAAGGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCA
GGTCACCGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCAAAGCTGGAAACACTTCCAACAT
CATTAAAGCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGG
CGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACACTCATCC
CGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTC
TGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTTTATGGTGTTTCCTCAAGG
GCTTCTCCATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTGGCATTTGTTGCCTTTGG
AAGCTCTTCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTT
CAGAACTCGTTGAAGCCACTACGCTCCTTAGCGATGCAGAGGTTAAGAAACTTAA*GGGT
GTTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGTTTTCTTGTGTTTTTATC
TCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATAGTTGTTATTTTGT
GTTGTTGTTTTCAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAACTATAATAAGGAATAAA
CATTCGATTGTAGAAGTCTAAGATGGTTCTTAAATCTTAACTATCTTGAGAT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2EL25JQ 638 0 0
GGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCAGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCA
GGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATT
CCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGC
GCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTTT
ATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAATTCTGGGAAGGGTCCTGCCTTG
GCATTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCGGGACTTCAGATTCTATCGTTT*GCTTTGTT
TGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCAGAGGT
TAAGAAACTTAA*GGGTGTTCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTAGAAGT
TTTCTTGTGTTTTTATCTCTTTAAAAATTCAAGTTCCTCTGCCATTCTGATTTTTATTTT
AATGGTTGTTATTTTGTGTTGTTGTTTTCAGTGCTTCATTTATAATCAATTTCGCTTGAA
CTATAATAAGGAATAAACATTCGATTGTAGACGTC
TAT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 3 34

CO CL7Contig1 840 30 32 U
GGCCGGGAGCCTAAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAG
AAGATGAAGACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAA
GTTAACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAG
CATCTCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAG
ATCGACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCAC
GTCGATAACCTCATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTAT
GCTCATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAAC
TTCCTTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGG
TCTGAGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGG
TCATGCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTT
GACGGTATCTACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCT
CGTTCATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAA
CTCGGCTTATCCCTTGTCTTTTTGTTCGAGATTTT*ATTTACTTTTGCAGAAGTTTTGGA
GACACAGTTTGCTTGTCTTTTTACCTATTTCACTCTTTTGAATGTCTTTTTTTCTTAAGC


BQ
10 10 10 10 50 50 65 65 65 65 70 75 90 90 90 90 90 95 95 95 95 75 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 95 65 65 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 90 90 80 90 75 90 90 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 55 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 90 60 90 90 90 90 75 85 85 85 85 85 45 85 85 80 25 80 80 80 
80 65 80 30 40 80 80 60 75 75 75 70 70 70 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 30 30 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D107TF U 5
AF RR2AO30TF U 1
AF RR2DL05TF U 5
AF RR2CY02TF U 5
AF RR2BR36TF U 11
AF RR2G079TF U 11
AF RR2A370JQ C 140
AF RR2CI18TF U 5
AF RR2AC74JQ C 380
AF RR2FV84TF U 5
AF RR2D449TF U 5
AF RR2A370TF U 5
AF RR2E908TF U 91
AF RR2AO30JQ C 6
AF RR2D449JQ C 9
AF RR2ET15TF U 4
AF RR2BR36JQ C 11
AF RR2DF50TF U 25
AF RR2H165JQ C 3
AF RR2FH56JQ C 239
AF RR2FH56TF U 239
AF RR2AC74TF U 39
AF RR2D107JQ C 13
AF RR2A865JQ C 5
AF RR2A865TF U 5
AF RR2AH26TF U 21
AF RR2ET15JQ C 62
AF RR2DL05JQ C 71
AF RR2AH26JQ C 80
AF RR2FV84JQ C 294
BS 1 4 RR2AO30TF
BS 5 6 RR2ET15TF
BS 7 28 RR2AO30TF
BS 29 37 RR2ET15TF
BS 38 51 RR2AO30TF
BS 52 52 RR2ET15TF
BS 53 163 RR2AO30TF
BS 164 164 RR2ET15TF
BS 165 218 RR2AO30TF
BS 219 219 RR2ET15TF
BS 220 305 RR2AO30TF
BS 306 306 RR2ET15TF
BS 307 326 RR2AO30TF
BS 327 327 RR2ET15TF
BS 328 587 RR2AO30TF
BS 588 657 RR2ET15TF
BS 658 658 RR2G079TF
BS 659 690 RR2ET15TF
BS 691 691 RR2FV84TF
BS 692 719 RR2ET15TF
BS 720 720 RR2FV84TF
BS 721 742 RR2ET15TF
BS 743 743 RR2DF50TF
BS 744 754 RR2ET15TF
BS 755 755 RR2A370TF
BS 756 776 RR2ET15TF
BS 777 777 RR2DF50TF
BS 778 804 RR2ET15TF
BS 805 805 RR2FH56TF
BS 806 818 RR2ET15TF
BS 819 820 RR2AH26TF
BS 821 840 RR2AH26JQ

RD RR2D107TF 531 0 0
GGGAGCCTAAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGA
TGAAGACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTA
ACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATC
TCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCG
ACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCCTAGCCACGTCG
ATAACCTCATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTC
ATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCC
TTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTG
AGAAAGTTAAAGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2AO30TF 587 0 0
GGCCCTGAGCCTAAAACAGAGCGAGAGCTTAGAGAGAGAGTTGAGCAAGAAAGTGAGGAG
AAGATGAAGACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAA
GTTAACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACCTGTTCGCGACTTCAAG
CATCTCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAAACCGGGAAGAAGAAGCTGAAG
ATCGACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCAC
GTCGACAACCTCATCACCGGTGTCACCAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTAT
GCTCATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAAC
TTCCTTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGG
TCTGAGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGG
TCATGCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATAT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2DL05TF 569 0 0
GGGAGCCTAAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGA
TGAAGACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTA
ACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATC
TCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCG
ACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCG
ATAACCTCATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTC
ATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCC
TTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTG
AGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCAT
GCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTG

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2CY02TF 583 0 0
GGGAGCCTAAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGA
TGAAGACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTA
ACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGTCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATC
TCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCG
ACTCGCGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCG
ATAACCTCATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTC
ATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCC
TTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTG
AGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCAT
GCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATAT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2BR36TF 635 0 0
GG
AAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGATGAAGACG
ATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTAACGCAAAG
GTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCAACCTC
GATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGTGG
TTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCGATAACCTC
ATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTCCC
ATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAG
AAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGTT
AAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTCTT
ATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTAC
GTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAA

QA 3 635 3 635
DS 

RD RR2G079TF 684 0 0
CTAAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGATGAAGA
CGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCTCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTAACGCAA
AGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCAACC
TCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGT
GGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCCCTTAGCCACGTCGATAACC
TCATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTC
CCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGG
AGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAG
TTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTC
TTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCT
ACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGA*TAGACAAATATGTCTCGTTCATCTT
TTGAATGTTTAGTTTGTTTT*CAG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2A370JQ 554 0 0
AAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCAACCTCGATTTCC
AGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGTGGTTCGGAT
CTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCGATAACCTCATCACCG
GTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTCCCATCAACG
CTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAAGG
TGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGTTAAGGATG
AGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTCTTATCAACC
AGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCCACGTTAGCG
AGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCGTTCTTCTTTTGAATGTT
TAGTTTGTTTTTCA

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2CI18TF 665 0 0
GGGAGCCTAAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGA
**AAGACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTA
ACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATC
TCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCG
ACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCG
ATAACCTCATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTC
ATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCC
TTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTG
AGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCAT
GCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACG
GTATCTACGTTAGCGAGA*GAGCAAGATCGTTGAAGAGGA*TAGACAAATATGTCTCGTT
CATCT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2AC74JQ 330 0 0
CTTCCATTGGCGGGGAAGGCAAGTTTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAAGG
TGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGGGTAACCATTGTTCGGTTTGAGAAAGTTAAGGATG
AGATT***TTTGATGGAAATTACATTGAGCTTGTTTCAAGGTCATGCGCTTTTATCAACC
AGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATTTACGTTAGCG
AGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTTTCGTTCATTTTTTGAATGTT
TAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATTTCACCG

QA 1 330 1 330
DS 

RD RR2FV84TF 719 0 0
GGGAGCCTAAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGA
TGAAGACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTA
ACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATC
TCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCG
ACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCG
ATAACCTCATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTC
ATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCC
TTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTG
AGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCAT
GCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACG
GTATCTACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCGCT
CATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAACTC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2D449TF 747 0 0
GGGAGCCTAAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGA
TGAAGACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGGCATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTA
ACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATC
TCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCG
ACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCG
ATAACCTCATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTC
ATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCC
TTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTG
AGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCAT
GCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACG
GTATCTACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCGTT
CATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAA*CTCG
GCTTATCCCTTGTCTTTT*GTTCGAGA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2A370TF 765 0 0
GGGAGCCTAAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGA
TGAAGACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTA
ACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATC
TCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCG
ACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCG
ATAACCTCATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTC
ATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCC
TTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTG
AGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCAT
GCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACG
GTATCCACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCGTT
CATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAA*TCTCACCGGTGTTGCAAAACTCG
GCTTATCCCTTGTCTTTT*GTTCGAGATTTT*ATTTACTTTTGCA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2E908TF 673 0 0
G
TGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTAACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGAC
CTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGG
ACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAA
GTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCGATAACCTCATCACCGGTGTCACGATAG
GGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCG
GTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAG
ATACGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTG
ATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACG
TGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTACGTTAGCGAAAAGAGCAAGA
TCGTTGAAGAGGAATATACAAATATGTCTCGTTCATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTT
CAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAACTCGGCTTATCCCTTGTCTTTTTGTTCGAGA
TTT**ATTTACT

QA 2 673 2 673
DS 

RD RR2AO30JQ 781 0 0
AACAGAGCGAGAGCTT
AGAGAGA*********GAGTTGAGCAAGAAAGTGAGGAGAAGATGAAGACGATCCTTTCT
TCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTAACGCAAAGGTGATCGAA
GTTGAAGGACCTCGCGGCAAACCTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCAACCTCGATTTCCAG
CTCATCAAGGACGCCGAAACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGTGGTTCGGATCT
CGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTTTTAGCCACGTCGACAACCTCATCACCGGT
GTCACCAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTCCCATCAACGCT
TCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAAGGTG
AGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGTTAAGGATGAG
ATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTCTTATCAACCAG
AAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTATGTTAGCGAG
AAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCCTTCATCTTTTGAATGTTTA
GTTTGTTTTTCAGACCA********CCGGTGTTGCAAAACTCGGCTTATCCCTTGTCTTT
TTGTTCGAGATTTTTATTTACTTTTGCAGAGGTTTT
TGGAGACAC

QA 17 772 17 772
DS 

RD RR2D449JQ 762 0 0
GCG
TAAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGATGAAGAC
GATCCTTTCTTCCGAGACGATGGGCATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTAACGCAAA
GGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCAACCT
CGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGTG
GTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCGATAACCT
CATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTCC
CATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGA
GAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGT
TAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTCT
TATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTA
CGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCGTTCATCTTT
TGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAACTCGGCTTATC
CCTTGTCTTTTTGTTCGAGATTTT*ATTTACTTTTGCAG

QA 4 762 4 762
DS 

RD RR2ET15TF 815 0 0
G
GGGAGCCTAAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGA
TGAAGACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTA
ACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTT*TTCGCGACTTCAAGCATC
TCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCG
ACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCG
ATAACCTCATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTC
ATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCC
TTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTG
AGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCAT
GCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACG
GTATCTACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGGCTCGTT
CATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTACAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAA*CTCG
GCTTATCCCTTGTCTTTT*GTTCGAGATTT**ATTTACTTTTGCAGAAGTTT*GGAGACA
CAGTTTGCTTGTCTTTTTAC*TATTTCACTCTTT

QA 2 815 2 815
DS 

RD RR2BR36JQ 806 0 0
GG
AAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGATGAAGACG
ATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTAACGCAAAG
GTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCAACCTC
GATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGTGG
TTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCGATAACCTC
ATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTCCC
ATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAG
AAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGTT
AAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTCTT
ATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTAC
GTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCGTTCATCTTTT
GAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAACTCGGCTTATCC
CTTGTCTTTTTGTTCGAGATTTT*ATTTACTTTTGCAGAAGTTTTGGAGACACAGTTTGC
TTGTCTTTTTACCTATTTCACTC
G

QA 3 805 3 805
DS 

RD RR2DF50TF 778 0 0
GAGA*********GAGTTGAGCAAGAAAGTGAGGAGAAGATGAAGACGATCCTTTCTTCC
GAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTAACGCAAAGGTGATCGAAGTT
GAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCAACCTCGATTTCCAGCTC
ATCAAGGACGCCGAAACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGTGGTTCGGATCTCGC
AAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCGACAACCTCATCACCGGTGTC
ACCAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTCCCATCAACGCTTCC
ATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAAGGTGAGG
AAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGTTAAGGATGAGATT
GTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTCTTATCAACCAGAAA
TGTCACGTGAAGAAGAAGGAT**CAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTATGTTAGCGAGAAG
AGCAAGATCGTTGAAGAGGA*TAGACAAATATGTCTCCTTCATCTTTTGAATGTTTAGTT
TGTTTT*CAGACCA********CCGGTGTTGCAAA*CTCGGCTTATCCCTTGTCTTTTTG
TTCGAGATTTT*ATT*ACTTTTGCAGA*GTTTTGGAGACACA*TTTGCTAGTCCTTT
A

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2H165JQ 813 0 0
ACAGAGCGAGAGCTT
AGAGAGAGAGA*********GAGTTGAGCAAGAAAGTGAGGAGAAGATGAAGACGATCCT
TTCTTCCGAGACGATGGATATCCCCGAGAGCATTACCATCAAAGTTAACGCTAAGGTGAT
CGAAGTCGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCAACCTTGATTT
CCAGCTCATCAAGGACGCCGAAACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGTGGTTCGG
ATCTCGCAAATCAAGTGCTTCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCGACAACCTCATCAC
AGGTGTCACCAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTCCCATCAA
CGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAA
GGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGTTAAGGA
TGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTTTCAAGGTCATGCGCTCTTATCAA
CCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTACGTTAG
CGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAACATGTCT***TCATCTTTTGAATG
TTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAACTCGGCTTATCCCTTGT
CTTTTTGTTCGAGATTTTTATTTACTTTTGCAGAAGTTTTGGAGAGACAATTTGCTA*TC
TTTTTACCTATTTCACTC

QA 16 813 16 813
DS 

RD RR2FH56JQ 568 0 0
GT
ATCGACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCTTCCATCAGAACCGCTCTTAGCCAC
GTCGACAACCTCATCACAGGTGTCACCAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTAT
GCTCATTTTCCCATCAACGCCTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAAC
TTCCTTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGG
TCTGAGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTTTCAAGG
TCATGCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTT
GACGGTATTTACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAACATTTCT
***TCATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAA
CTCGGCTTATCCCTTGTCTTTTTGTTCGAGATTTTTATTTACTTTTGCAGAAGTTTTGGA
GAGACAATTTGCTA*TCTTTTTACC
C

QA 3 567 3 567
DS 

RD RR2FH56TF 568 0 0
GT
ATCGACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCTTCCATCAGAACCGCTCTTAGCCAC
GTCGACAACCTCATCACAGGTGTCACCAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTAT
GCTCATTTTCCCATCAACGCCTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAAC
TTCCTTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGG
TCTGAGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTTTCAAGG
TCATGCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTT
GACGGTATCTACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAACATTTCT
***TCATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAA
CTCGGCTTATCCCTTGTCTTTTTGTTCGAGATTTTTATTTACTTTTGCAGAAGTTTTGGA
GAGACAATTTGCTA*TCTTTTTACC
C

QA 3 567 3 567
DS 

RD RR2AC74TF 759 0 0
AGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGATGAAGACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACAT
CCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTAACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGG
CAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGA
GACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGTGGTTCGGATGTCGCAAATCAAGTGCATC
CATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCGATAACCCCATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAG
GTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTCCCATCGACGCTTCCATCGGCGGTGAAGG
CAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTT
GGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGTTAAGGATGAGATT***CTTGATGGAAA
TTACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAA
GAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGA
AGAGGAATAGACAAATATGTCTCGTTCATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCA
AAATCTCACCGGTGTTGCAAAACTCGGCTTATCCCTTGTCTTTT*GTTCGAGATTTT*AT
TTACTTTTGCAGAAGTTTTGGAGACACAGTTTGCTTGTC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2D107JQ 794 0 0
AAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGATGAAGACG
ATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTAACGCAAAG
GTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCAACCTC
GATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGTGG
TTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCCTAGCCACGTCGATAACCTC
ATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTCCC
ATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAG
AAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGTT
AAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTCTT
ATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTAC
GTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCGTTCATCTTTT
GAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAACTCGGCTTATCC
CTTGTCTTTTTGTTCGAGATTTT*ATTTACTTTTGCAGAAGTTTTGGAGACACAGTTTGT
TTGTCTTTTTACC
C

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2A865JQ 801 0 0
GGGAGCCTAAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGA
TGAAGACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTA
ACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGTAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATC
TCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCG
ACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCG
ATAACCTCATCACCGGTGTCACGAGAGGTTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTC
ATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCC
TTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTAGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTG
ATAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCAT
GCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACG
GTATCTACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGCTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCGTT
CATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAACTCG
GCTTATCCCTTGTCTTTTTGTTCGAGATTT**ATTTACTTTTGCAGAAGTTTTGGAGACA
CAGTTTGCTTGTCTTTTTACC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2A865TF 801 0 0
GGGAGCCTAAAACAGAGCGAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGA
TGAAGACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTA
ACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGTAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATC
TCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCG
ACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCG
ATAACCTCATCACCGGTGTCACGAGAGGTTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTC
ATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCC
TTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTAGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTG
ATAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCAT
GCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACG
GTATCTACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGCTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCGTT
CATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAACTCG
GCTTATCCCTTGTCTTTTTGTTCGAGATTT**ATTTACTTTTGCAGAAGTTTTGGAGACA
CAGTTTGCTTGTCTTTTTACC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2AH26TF 800 0 0
GG
GAGAGC*********GAGTTGAGCAAGAACGTGAGGAGAAGATGAAGACGATCCTTTCTT
CCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTAACGCAAAGGTGATCGAAG
TTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCGACCTCGATTTCCAGC
TCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGTGGTTCGGATCTC
GCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCGATAACCTCATCACCGGTG
TCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTCCCATCAACGCTT
CCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAAGGTGA
GGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGTTAAGGATGAGA
TTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTCTTATCAACCAGA
AATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGCATCTACGTTAGCGAGA
AGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCGTTCATCTTTTGAATGTTTAG
TTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAACTCGGCTTATCCCTTGTCTTTT
TGTTCGAGATTTT*ATTTACTTTTGCAGAAGTTTTGGAGACACAGTTTGCTTGTCTTTTT
ACCTATTTCACTCTTTTG

QA 3 800 3 800
DS 

RD RR2ET15JQ 759 0 0
AGATGAAGACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATC*CCGAAAGCATTACCATCAAAG
TTAACGCAAAGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTT*TTCGCGACTTCAAGC
ATCTCAACCTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGA
TCGACTCGTGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACG
TCGATAACCTCATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATG
CTCATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACT
TCCTTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGT
CTGAGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGT
CATGCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTG
ACGGTATCTACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGGCTC
GTTCATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTACAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAAC
TCGGCTTATCCCTTGTCTTTTTGTTCGAGATTTT*ATTTACTTTTGCAGAAGTTTTGGAG
ACACAGTTTGCTTGTCTTTTTACCTATTTCACTCTTTTG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2DL05JQ 746 0 0
CGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTAACGCAA
AGGTGATCGAAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCAACC
TCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGT
GGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCGATAACC
TCATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTC
CCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGG
AGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAG
TTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTC
TTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCT
ACGTTAGCAAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCGTTCATCTT
TTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAACTCGGCTTAT
CCCTTGTCTTTTTGTTCGAGATTTT*ATTTACTTTTGCAGAAGTTTTGGAGACACAGTTT
GCTTGTCTTTTTACCTATTTCACTCT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2AH26JQ 761 0 0
CTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTAACGCAAAGGTGATCG
AAGTTGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCGACCTCGATTTCC
AGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGTGGTTCGGAT
CTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCGATAACCTCATCACCG
GTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTCCCATCAACG
CTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAAGG
TGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGTTAAGGATG
AGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCATGCGCTCTTATCAACC
AGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGCATTTACGTTAGCG
AGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCGTTCATCTTTTGAATGTT
TAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAACTCGGCTTATCCCTTGTCT
TTTTGTTCGAGATTTT*ATTTACTTTTGCAGAAGTTTTGGAGACACAGTTTGCTTGTCTT
TTTACCTATTTCACTCTTTTGAATGTCTTTTTTTCTTAAGC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2FV84JQ 492 0 0
TAGCCACGTCGATAACCTCATCACCGGTGTCACGAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTT
TGTGTATGCTCATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGAAGGCAAGTCTATTGAGAT
CCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCAT
TGTTCGGTCTGAGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGT
CTCAAGGTCATGCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAA
GTTCCTTGACGGTATTTACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAA
TATGTCTCGCTCATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAATCTCACCGGTGT
TGCAAAACTCGGCTTATCCCTTGTCTTTTTGTTCGAGATTTT*ATTTACTTTTGCAGAAG
TTTTGGAGACAC

QA 1 492 1 492
DS 



CO CL7Contig2 372 2 2 U
GGGACATTGAGCTTGTTTCAAGGTCATGCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGA
AGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTG
AAGAGGAATAGACAAACATGTCTTCATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAA
ATCTCACCGGTGGTGCAAAACTCGGCTTATCCCTTGTCTTTTTGTTCGAGATTTTTATTT
ACTTTTGCAGAAGTTTTGGAGAGACAATTTGCTATCTTTTTACCTATTTCACTCTTTTGA
ATGTCCTTTTTTCTTTTGGCTCATTCAACGTATGTTGTTCACTGTCGTAGATCTTACAAG
AAATCTGTACGT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AR45JQ C 1
AF RR2AR45TF U 1
BS 1 2 RR2AR45JQ
BS 3 372 RR2AR45TF

RD RR2AR45JQ 372 0 0
GGGACATTGAGCTTGTTTCAAGGTCATGCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGA
AGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATTTACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTG
AAGAGGAATAGACAAACATGTCTTCATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAA
ATCTCACCGGTGGTGCAAAACTCGGCTTATCCCTTGTCTTTTTGTTCGAGATTTTTATTT
ACTTTTGCAGAAGTTTTGGAGAGACAATTTGCTATCTTTTTACCTATTTCACTCTTTTGA
ATGTCCTTTTTTCTTTTGGCTCATTCAACGTATGTTGTTCACTGTCGTAGATCTTACAAG
AAATCTGTACGT

QA 1 372 1 372
DS 

RD RR2AR45TF 372 0 0
GG
GACATTGAGCTTGTTTCAAGGTCATGCGCTCTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAG
AAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTACGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAA
GAGGAATAGACAAACATGTCTTCATCTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAAT
CTCACCGGTGGTGCAAAACTCGGCTTATCCCTTGTCTTTTTGTTCGAGATTTTTATTTAC
TTTTGCAGAAGTTTTGGAGAGACAATTTGCTATCTTTTTACCTATTTCACTCTTTTGAAT
GTCCTTTTTTCTTTTGGCTCATTCAACGTATGTTGTTCACTGTCGTAGATCTTACAAGAA
ATCTGTACGT

QA 3 372 3 372
DS 



CO CL7Contig3 769 2 2 U
GGTTGGAAGACCTATACTATGTAGATTTCTTGCAAGATCTAAGAAGTGAACAATGTAACT
TGAAGTTGAGCCAAAAGAAAAAAAGAGGATTAAAAAAAGTGAAATAGGTAAAAGGACTAG
CAAATTGTGTCTCCAAAAACTTCTGCAAAAGTAAATAAAAATCTCGAACAAAAAGACAAG
GGATAAGCCGAGTTTTGCAACACCGGTGGTCTGAAAAACAAACTAAACATTCAAAAGATG
AAGGAGACATATTTGTCTATTCCTCTTCAACGATCTTGCTCTTCTCGCTAACATAGATAC
CGTCAAGGAACTTCCTGATATCCTTCTTCTTCACGTGACATTTCTGGTTGATAAGAGCGC
ATGACCTTGAGACAAGCTCAATGTCATTTCCATCAAGAACAATCTCATCCTTAACTTTCT
CAGACCGAACAATGGTTACACCATCCAACATATCTACCTTCCTCACCTTCTTCTCCCCAA
GGAAGTTACGGATCTCAATAGACTTGCCTTCACCGCCGATGGAAGCGTTGATGGGAAAAT
GAGCATACACAAACCTCATCTTGTACCTGAACCCTCTGGTGACACCGGTGATGAGGTTGT
CGACGTGGCTAAGAGCGGTTCTGATGGATGCACTTGATTTGCGAGATCCGAACCACGAGT
CGATCTTCAGCTTCTTCTTCCCGGTTTCGGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGAGGTTGA
GATGCTTGAAGTCGCGAACAAGTTTGCCGCGAGGTCCTTCAACTTCGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW28JQ U 1
AF RR2DF50JQ U 85
BS 1 621 RR2EW28JQ
BS 622 769 RR2DF50JQ

RD RR2EW28JQ 621 0 0
GGTTGGAAGACCTATACTATGTAGATTTCTTGCAAGATCTAAGAAGTGAACAATGTAACT
TGAAGTTGAGCCAAAAGAAAAAAAGAGGATTAAAAAAAGTGAAATAGGTAAAAGGACTAG
CAAATTGTGTCTCCAAAAACTTCTGCAAAAGTAAATAAAAATCTCGAACAAAAAGACAAG
GGATAAGCCGAGTTTTGCAACACCGGTGGTCTGAAAAACAAACTAAACATTCAAAAGATG
AAGGAGACATATTTGTCTATTCCTCTTCAACGATCTTGCTCTTCTCGCTAACATAGATAC
CGTCAAGGAACTTCCTGATATCCTTCTTCTTCACGTGACATTTCTGGTTGATAAGAGCGC
ATGACCTTGAGACAAGCTCAATGTCATTTCCATCAAGAACAATCTCATCCTTAACTTTCT
CAGACCGAACAATGGTTACACCATCCAACATATCTACCTTCCTCACCTTCTTCTCCCCAA
GGAAGTTACGGATCTCAATAGACTTGCCTTCACCGCCGATGGAAGCGTTGATGGGAAAAT
GAGCATACACAAACCTCATCTTGTACCTGAACCCTCTGGTGACACCGGTGATGAGGTTGT
CGACGTGGCTAAGAGCGGTTC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2DF50JQ 685 0 0
GAGGATTA
AAAAAAGTGAAATAGGTAAAAGGACTAGCAAATTGTGTCTCCAAAAACTTCTGCAAAAGT
AAATAAAAATCTCGAACAAAAAGACAAGGGATAAGCCGAGTTTTGCAACACCGGTGGTCT
GAAAAACAAACTAAACATTCAAAAGATGAAGGAGACATATTTGTCTATTCCTCTTCAACG
ATCTTGCTCTTCTCGCTAACATAGATACCGTCAAGGAACTTCCTGAT**CCTTCTTCTTC
ACGTGACATTTCTGGTTGATAAGAGCGCATGACCTTGAGACAAGCTCAATGTCATTTCCA
TCAAGAACAATCTCATCCTTAACTTTCTCAGACCGAACAATGGTTACACCATCCAACATA
TCTACCTTCCTCACCTTCTTCTCCCCAAGGAAGTTACGGATCTCAATAGACTTGCCTTCA
CCGCCGATGGAAGCGTTGATGGGAAAATGAGCATACACAAACCTCATCTTGTACCTGAAC
CCTCTGGTGACACCGGTGATGAGGTTGTCGACGTGGCTAAGAGCGGTTCTGATGGATGCA
CTTGATTTGCGAGATCCGAACCACGAGTCGATCTTCAGCTTCTTCTTCCCGGTTTCGGCG
TCCTTGATGAGCTGGAAATCGAGGTTGAGATGCTTGAAGTCGCGAACAAGTTTGCCGCGA
GGTCCTTCAACTTCGAT

QA 9 685 9 685
DS 



AS 1 34

CO CL8Contig1 1240 34 10 U
TTTTTCTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATA
TTGAGAGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGT
CTCTTGCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCT
TGTGGATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTG
CCTATTCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATT
TTCAAAATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATT
TGTCCACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTC
GGAGTCAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCG
TAGCCTTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAG
AATCAAATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACAT
ATTTTCCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCT
CAATCTTTCGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCA
GGATAGCTATAATGTCCTGAAGCTCCTTGTAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACTTGTTGCG
CAGTTTCATAATGTTCCTCGCCAACGATTCGAGGTTGTAGCATAGTTGACGTTGAATCTA
AAGGATCTACCGCTGGATAGATACCTTTAGCAGCTAATCCTCTTGATAGTACGGTAGTCG
CATCTAAATGTGCAAATGTGGTGGCAGGAGCAGGGTCAGTCAAATCGTCTGCAGGTACAT
AAACTGCTTGAATAGAGGTTATGAACCCTTTTTTCGTAGAAGTAATTCTTTCTTGTAAAG
TACCCATTTCGGTACTAAGGGTGGGTTGGTAACCCACAGCAGAAGGCATTCTACCCAATA
AAGCGGATACCTCGGATCCTGCTTGTACAAAACGGAAGATATTGTCGATAAATAGAAGTA
CGTCTTGCTTATTAACATCTCGGAAATATTCTGCCATAGTTAAGGCAGTCAGACCAACTC
TCATACGAGCTCCCGGCGGTTCATTCATCTGACCGTAGAC


BQ
10 10 10 10 10 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 5 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 70 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU59JQ U 6
AF RR2CU59TF C 6
AF RR2E812JQ U 40
AF RR2C325JQ U 6
AF RR2C325TF C 6
AF RR2EO60TF C 1
AF RR2FN93JQ U 8
AF RR2FN93TF C 8
AF RR2EO60JQ U 6
AF RR2GL52JQ U 6
AF RR2BS85JQ U 6
AF RR2BS85TF C 6
AF RR2EF25JQ U 6
AF RR2GL52TF C 6
AF RR2FP08TF C 6
AF RR2GW48JQ U 6
AF RR2FP08JQ U 6
AF RR2D453JQ U 6
AF RR2FZ45JQ U 6
AF RR2FF50JQ U 6
AF RR2AA49JQ U 6
AF RR2C648TF C 133
AF RR2F325JQ U 6
AF RR2AA49TF C 170
AF RR2BT38JQ U 30
AF RR2GZ15JQ U 8
AF RR2FZ45TF C 518
AF RR2E812TF C 309
AF RR2D453TF C 315
AF RR2EF25TF C 263
AF RR2GW48TF C 223
AF RR2GZ15TF C 189
AF RR2F325TF C 294
AF RR2BT38TF C 562
BS 1 5 RR2EO60TF
BS 6 181 RR2AA49JQ
BS 182 182 RR2CU59JQ
BS 183 749 RR2AA49JQ
BS 750 830 RR2GZ15JQ
BS 831 918 RR2GZ15TF
BS 919 983 RR2F325TF
BS 984 984 RR2BT38TF
BS 985 1071 RR2F325TF
BS 1072 1240 RR2BT38TF

RD RR2CU59JQ 223 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAAAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGT
C

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR2CU59TF 223 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGT
C

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR2E812JQ 450 0 0
TAGTTACAAAATCAAATCATATTGAGAGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAAAGCT
AGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTTGCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATT
TCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGGATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACT
AAAATAGTAATTTCATTATTGCCTATTCTAGCAAAACCGCCCATCAAAGCCATTGTTAAC
CATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAAATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCG
TGATTTGGTAATACGCCGATTTGTCCACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCT
GAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATT
TACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTTCG

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR2C325JQ 559 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAACTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAAAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGTAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATC
C

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2C325TF 564 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAACTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGTAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATC
CCCCCC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2EO60TF 602 0 0
TTTTTCTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATA
TTGAGAGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGT
CTCTTGCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCT
TGTGGATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTG
CCTATTCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATT
TTCAAAATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATT
TGTCCACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTC
GGAGTCAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCG
TAGCCTTCGCGGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAG
AATCAAATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACAT
C
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2FN93JQ 609 0 0
CTCGCTTTTG
TCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAGAGCCTCGACGCG
TGTCCGAGCTCGTCTGAAAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTTGCCTTCAGCTCT
TCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGGATCAATGTCACT
ATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTATTCTAGCAAAACC
GCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAAATACCTATATC
AACAGCTGTGACAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCCACTATTAGTAGA
TAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAA**ATTCGATTCGGAGTCAGTACACAAAG
ATTTAGGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTTCGCAGTAGCT
TCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAAATTCTCCGGAA
AGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCCGGAGAACC

QA 11 609 11 609
DS 

RD RR2FN93TF 609 0 0
CTCGCTTTTG
TCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAGAGCCTCGACGCG
TGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTTGCCTTCAGCTCT
TCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGGATCAATGTCACT
ATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTATTCTAGCAAAACC
GCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAAATACCTATATC
AACAGCTGTGACAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCCACTATTAGTAGA
TAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAA**ATTCGATTCGGAGTCAGTACACAAAG
ATTTAGGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTTCGCAGTAGCT
TCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAAATTCTCCGGAA
AGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCCGGAGAACC

QA 11 609 11 609
DS 

RD RR2EO60JQ 597 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAAAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCGGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATC
C

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2GL52JQ 596 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAAAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2BS85JQ 602 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATGCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTT
CC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2BS85TF 602 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATGCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTT
CC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2EF25JQ 633 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTT
CCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2GL52TF 596 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2FP08TF 611 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTT
CCCGGAGAACC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2GW48JQ 597 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAAAGCTAGATTTACCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTGGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATAT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2FP08JQ 611 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAAAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAAAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTT
CCCGGAGAACC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2D453JQ 675 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAAAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTT
CCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATC
TTTCGTGCTCTTGCG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2FZ45JQ 696 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGCCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTT
CCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATC
CTTCGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2FF50JQ 692 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAAAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTT
CTCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATC
TTTCGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2AA49JQ 744 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTATGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTT
CCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATC
TTTCGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATA
GCTATAATGTCCTGAAGCTCCTTG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2C648TF 618 0 0
GCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGGATCAATG
TCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTATTCTAGCA
AAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAAATACCT
ATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCCACTATTA
GTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCAGTACA
CAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTTCGCAG
TAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAAATTCTC
CGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCCGGAG
AACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATCTTTCGTG
CTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATAGCTATAA
TGTCCTGAAGCTCCTT
CC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2F325JQ 736 0 0
CTCGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAG
AGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAAAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTT
GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTT
CCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATC
TTTCGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGAATA
GCTATAATGTCCTGAA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2AA49TF 589 0 0
GCTGAGCTTCTTATGGATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAA
TTTCATTATTGCCTATTCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTAT
TAAGGCGTATTTTCAAAATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTA
ATACGCCAATTTGTCCACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAA
CAATTCGATTCGGAGTCAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCAT
TTCTAAGTTCGTAGCCTTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTG
TTCAGGAAGAGAATCAAATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGC
TAGACCAACATATTTTCCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGA
TAAGAAACGCTCAATCTTTCGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTC
GTCCAACCCCAGGATAGCTATAATGTCCTGAAGCTCCTTGTAACGTT
AC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2BT38JQ 738 0 0
ATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAGAGCCTCGACGCGTGTCCGAGCTCG
TCTGAAAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTTGCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGC
TTCTGCTATTTCAAGAGGTTGCTGAGCTTCTTGTGGATCAATGTCACTATTCTTCTCTGC
ATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTATTCTAGCAAAACCGCCCATCAAAGC
CATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAAATACCTATATCAACAGCTGTGGC
AATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCCACTATTAGTAAATAAAATGATTTC
TTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCAGTACACAAAGATTTAAGGTCAT
TTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTA
CCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAAATTCTCCGGAAAGGATCAATTTA
AACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCCGGAGAACCTGTAAATACTTCT
GCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATCTTTCGTGCTCTTGCGACGGTTAAG
CGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATAGCTATAATGTCCTGAAGCTCCTTG
TAACGTTGTAAAGTTTGC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2GZ15JQ 823 0 0
CGCTTTTGGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAGAG
CCTCGACGCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGCTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTTGC
CTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGGAT
CAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAATAATTTCATTATTGCCTATTC
TAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAAA
TACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCCAC
TATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCA
GTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTT
CGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAAA
TTCTCCGGAAAGGATCAGTTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCC
CGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATCTT
TCGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATAGC
TATAATGTCCTGAAGCTCCTTGTAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACTTGTTGCGCAGTTTC
ATAATGTTCCTCGCCAACGATTCGAGGTTGTAGCATAGTTGAC

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR2FZ45TF 364 0 0
GTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAA*CAAATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAA*CCCTCT
AATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAA
AAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATCCTTCGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTC
TTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATAGCTATAATGTCCTGAAGCTCCTTGTAACGTTG
TAAAGTTTGCTTAACTTGTTGCGCAGTTTCATAATGTTCCTCGCCAACGATTCGAGGTTG
TAGCATAGTTGACGTTGAATCTAAAGGATCTACCGCTAGATAGATACCTTTAGCAGCTAA
TCC
C

QA 1 363 1 363
DS 

RD RR2E812TF 573 0 0
ACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCGATTTGTCCACT
ATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCAG
TACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTTC
GCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAAAT
TCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCC
GGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATCTTT
CGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATAGCT
ATAATGCCCTGAAGCTCCTTGTAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACTTGTTGCGCAGTTTCA
TAATGTTCCTCGCCAACGATTCGAGGTTGTAGCATAGTTGACGTTGAATCTAAAGGATCT
ACCGCTGGATAGATACCTTTAGCAGCTAATCC
C

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2D453TF 566 0 0
ATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCCACTATTAGT
AGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCAGTACACA
AAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTTCGCAGTA
GCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAAATTCTCCG
GAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCCGGAGAA
CCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATCTTTCGTGCT
CTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATAGCTATAATG
TCCTGAAGCTCCTTGTAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACTTGTTGCGCAGTTTCATAATGT
TCCTCGCCAACGATTCGAGGTTGTAGCATAGTTGACGTTGAATCTAAAGGATCTACCGCT
GGATAGATACCTTTAGCAGCTAATCC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2EF25TF 618 0 0
TCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAAATACCTATATCAACAG
CTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCCACTATTAGTAGATAAAA
TGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCAGTACACAAAGATTTA
AGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTTCGCAGTAGCTTCATC
GATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAAATTCTCCGGAAAGGAT
CAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCCGGAGAACCTGTAAA
TACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATCTTTCGTGCTCTTGCGAC
GGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATAGCTATAATGTCCTGAAG
CTCCTTGTAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACTTGTTGCGCAGTTTCATAATGTTCCTCGCC
AACGATTCGAGGTTGTAGCATAGTTGACGTTGAATCTAAAGGATCTACCGCTGGATAGAT
ACCTTTAGCAGCTAATCC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2GW48TF 658 0 0
ATAGTAATTTCATTATTGCCTATTCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCAT
TGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAAATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGA
TTTGGTAATACGCCAATTTGTCCACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAA
TCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTAC
TCTCCATTTCTAAGTTCGTGGCCTTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAA
AGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAAATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTG
TTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAG
GTTGTGATAAGAAACGCTCAATCTTTCGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGG
ATAATTCGTCCAACCCCAGGATAGCTATAATGTCCTGAAGCTCCTTGTAACGTTGTAAAG
TTTGCTTAACTTGTTGCGCAGTTTCATAATGTTCCTCGCCAACGATTCGAGGTTGTAGCA
TAGTTGACGTTGAATCTAAAGGATCTACCGCTGGATAGATACCTTTAGCAGCTAATCC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2GZ15TF 731 0 0
AATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAATAATTTCATTATTGCCTATTCT
AGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAAAT
ACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCCACT
ATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCAG
TACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTTC
GCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAAAT
TCTCCGGAAAGGATCAGTTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCC
GGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATCTTT
CGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATAGCT
ATAATGTCCTGAAGCTCCTTGTAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACTTGTTGCGCAGTTTCA
TAATGTTCCTCGCCAACGATTCGAGGTTGTAGCATAGTTGACGTTGAATCTAAAGGATCT
ACCGCTGGATAGATACCTTTAGCAGCTAATCCTCTTGATAGTACGGTAGTCGCATCTAAA
TGTGCAAATG
C

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2F325TF 779 0 0
GCGTATTTTCAAAATAC*TATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATAC
GCCAATTTGTCCACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAAT
TCGATTCGGAGTCAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCT
AAGTTCGTAGCCTTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCA
GGAAGAGAATCAAATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGA
CCAACATATTTTCCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAG
AAACGCTCAATCTTTCGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCC
AACCCCAGAATAGCTATAATGTCCTGAAGCTCCTTGTAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACT
TGTTGCGCAGTTTCATAATGTTCCTCGCCAACGATTCGAGGTTGTAGCATAGTTGACGTT
GAATCTAAAGGATCTACCGCTGGATAGATACCTTTAGCAGCTAATCCTCTTGATAGTACG
GTAGTCGCATCTAAATGTGCAAATGTGGTGGCAGGAGCAGGGTCAGTCAAATCGTCTGCA
GGTACATAAACTGCTTGAATAGAGGTTATGGACCCTTTTTTCGTAGAAGTAATTCTTTCT
TGTAAAGTACCCATTTCGGTACTAAGGGTGGGTTGGTAACCCACAGCAGAAGGCATTC
C

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2BT38TF 679 0 0
TCAATTTAAACCCTCTAATTGTT*CCGCTAGACCAACATATTTTCCCGGAGAACCTGTAA
ATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATCTTTCGTGCTCTTGCGA
CGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATAGCTATAATGTCCTGAA
GCTCCTTGTAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACTTGTTGCGCAGTTTCATAATGTTCCTCGC
CAACGATTCGAGGTTGTAGCATAGTTGACGTTGAATCTAAAGGATCTACCGCTGGATAGA
TACCTTTAGCAGCTAATCCTCTTGATAGTACGGTAGTCGCATCTAAATGTGCAAATGTGG
TGGCAGGAGCAGGGTCAGTCAAATCGTCTGCAGGTACATAAACTGCTTGAATAGAGGTTA
TGAACCCTTTTTTCGTAGAAGTAATTCTTTCTTGTAAAGTACCCATTTCGGTACTAAGGG
TGGGTTGGTAACCCACAGCAGAAGGCATTCTACCCAATAAAGCGGATACCTCGGATCCTG
CTTGTACAAAACGGAAGATATTGTCGATAAATAGAAGTACGTCTTGCTTATTAACATCTC
GGAAATATTCTGCCATAGTTAAGGCAGTCAGACCAACTCTCATACGAGCTCCCGGCGGTT
CATTCATCTGACCGTAGAC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 3 37

CO CL9Contig1 714 8 11 U
GGGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTGGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCG
CAGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTACGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAGATTGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAAAAA
A*CGATTTATGATGATGTCTGCGACATGTTTTCAGCTTTCTTTCCAGTCTGTTATTTGTC
TTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACA
ATTTGATGTTCTCTCGTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCGGTTGTTTCTCTCCT


BQ
10 25 25 25 25 25 5 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 20 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D784JQ C 7
AF RR2D784TF U 7
AF RR2E356TF U 2
AF RR2E356JQ C 111
AF RR2AE06JQ C 1
AF RR2AT11JQ C 16
AF RR2AT11TF U 16
AF RR2AE06TF U 1
BS 1 1 RR2AE06JQ
BS 2 7 RR2AE06TF
BS 8 228 RR2D784TF
BS 229 229 RR2AT11TF
BS 230 464 RR2D784TF
BS 465 465 RR2AT11TF
BS 466 540 RR2D784TF
BS 541 541 RR2AE06TF
BS 542 659 RR2D784TF
BS 660 705 RR2AT11TF
BS 706 714 RR2AE06JQ

RD RR2D784JQ 653 0 0
GCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGATCAGC
TGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAG
ATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTGGGGCAAAACCCGA
CAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGCCGGGAACGGGACCATTG
ACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGAGGAAG
AGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCGCAGCTG
AGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTGATGAGA
TGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCGACTACGATGAGTTCGTCAAAG
TCATGATGGCTAAGTGAGATTGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAAAAA**CGAT
TTATGATGATGTTTGCGACATGTTTTCAGCTTTCTTTCCAGTCTGTTATTTGTCTTTTGC
TTTTGGTTAGTGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGAC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2D784TF 653 0 0
GCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGATCAGC
TGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAG
ATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTGGGGCAAAACCCGA
CAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGCCGGGAACGGGACCATTG
ACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGAGGAAG
AGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCGCAGCTG
AGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTGATGAGA
TGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCGACTACGATGAGTTCGTCAAAG
TCATGATGGCTAAGTGAGATTGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAAAAA**CGAT
TTATGATGATGTCTGCGACATGTTTTCAGCTTTCTTTCCAGTCTGTTATTTGTCTTTTGC
TTTTGGTTAGTGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGAC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2E356TF 656 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGA
TCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGA
TGGAGATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTGGGGCAAAA
CCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGACGGGAACGGGAC
CATTGACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGA
GGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCGC
AGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTGA
TGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTACGATGAGTTCGT
CAAAGTCATGATGGCTAAGTGAGATTGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAAAAAA
ACGATTTATGATGATGTCCGCGGCATGTTTTCAGCTTTCTTTCCAGTCTGTTATTTGTCT
TTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTA
AAAAAAA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2E356JQ 539 0 0
TTCGATAAGGATGGAGATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCT
CTGGGGCAAAACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGAC
GGGAACGGGACCATTGACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGAC
ACTGACTCGGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGT
TTCATCTCCGCAGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGAC
GAGGAGGTTGATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTAC
GATGAGTTCGTCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAGATTGAATCTTATTATCCCTTTTGAAA
CAAAAAAAAAAACGATTTATGATGATGTCCGCGGCATGTTTTCAGCTTTCTTTCCAGTCT
GTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATT

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2AE06JQ 714 0 0
GGGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTTTTTGGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGTAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCG
CAGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCTTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTACGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAGATTGAATCTTATTATCCCTTTTGAAACAAAAAAAAA
A*CGATTTATGATGATGTTTGCGACATGTTTTCAGCTTTCTTTCCAGTCTGTTATTTGTC
TTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACA
ATTTGATGTTCTCTCGTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCGGTTGTTTCTCTCCT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2AT11JQ 698 0 0
GCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGATCAGCTGACCGATG
ACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGTTGCA
TCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTTTCTGGGGCAAAACCCGACAGAAGCCG
AGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGACGGGAACGGGACCATTGACTTCCCTG
AGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGAGGAAGAGCTCAAGG
AAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCGCAGCTGAGCTTCGAC
ACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTGATGAGATGATCCGTG
AAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTACGATGAGTTCGTCAAAGTCATGATGG
CTAAGTGAGATTGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAAAAA**CGATTTATGATGA
TGTTTGCGACATGTTTTCAGCTTTCTTTCCAGTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTA
GTGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACAATTTGATGTTCTCTC
GTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCGGTTGTT
TCTCTCC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2AT11TF 690 0 0
GCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGATCAGCTGACCGATG
ACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGTTGCA
TCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTGGGGCAAAACCCGACAGAAGCCG
AGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGACGGGAACGGGACCATTGACTTCCCTG
AGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGAGGAAGAGCTCAAGG
AAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCGCAGCTGAGCTTCGAC
ACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTGATGAGATGATCCGTG
AAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTACGATGAGTTCGTCAAAGTCATGATGG
CTAAGTGAGATTGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAAAAA**CGATTTATGATGA
TGTCTGCGACATGTTTTCAGCTTTCTTTCCAGTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTA
GTGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACAATTTGATGTTCTCTC
GTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCGGTTGT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2AE06TF 705 0 0
G
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGA
TCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGA
TGGAGATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTGGGGCAAAA
CCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGACGGGAACGGGAC
CATTGACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGTAAGATGAAGGACACTGACTCGGA
GGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCGC
AGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTGA
TGAGATGATCCTTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTACGATGAGTTCGT
CAAAGTCATGATGGCTAAGTGAGATTGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAAAAAA
*CGATTTATGATGATGTCTGCGACATGTTTTCAGCTTTCTTTCCAGTCTGTTATTTGTCT
TTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACAA
TTTGATGTTCTCTCGTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCGGTTGT

QA 2 705 2 705
DS 



CO CL9Contig2 697 22 13 U
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCTC
GTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCTGTTGTTACTCTC


BQ
90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 90 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 
85 85 80 80 70 70 70 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 45 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A011JQ C 126
AF RR2AE84JQ C 1
AF RR2CG19JQ C 1
AF RR2CG19TF U 1
AF RR2AE84TF U 1
AF RR2B875TF U 45
AF RR2E207TF U 2
AF RR2AQ12JQ C 1
AF RR2G943JQ C 15
AF RR2G943TF U 15
AF RR2EV25JQ C 1
AF RR2EV25TF U 1
AF RR2CQ03TF U 1
AF RR2AQ12TF U 1
AF RR2AR18JQ C 1
AF RR2CQ03JQ C 1
AF RR2AR18TF U 1
AF RR2EW91TF U 1
AF RR2F532JQ C 1
AF RR2EW91JQ C 97
AF RR2F532TF U 1
AF RR2G303TF U 1
BS 1 331 RR2CG19TF
BS 332 332 RR2AE84TF
BS 333 538 RR2CG19TF
BS 539 539 RR2AE84TF
BS 540 629 RR2CG19TF
BS 630 641 RR2B875TF
BS 642 666 RR2G943TF
BS 667 669 RR2EV25TF
BS 670 683 RR2CQ03TF
BS 684 684 RR2AQ12TF
BS 685 685 RR2AR18TF
BS 686 691 RR2EW91TF
BS 692 697 RR2F532JQ

RD RR2A011JQ 237 0 0
GATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTTTAGGGCAAAACCCG
ACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGG***CATT
GACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGAGGAA
GAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTGCA

QA 1 237 1 237
DS 

RD RR2AE84JQ 645 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTTTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTTTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATTTTATTATCCCTTTTGAAACAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGAC
G

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2CG19JQ 629 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTTTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTTGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAAAC
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2CG19TF 629 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTTGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAAAC
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2AE84TF 629 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2B875TF 597 0 0
GAAAGAAAAATGGCGGATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTT
AGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATG
AGGTCTCTAGGGCAAAACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGAT
GCCGACGGGAACGGGACCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATG
AAGGACACTGACTCGGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAG
AACGGTTTCATCTCTGCAGCTGAGCTCCGACATGTGGTGACTAACCTTGGGGAGAAGCTG
ACCGATGAGGAGGTTGATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATC
AACTATGATGAGTTCGTCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCT
TCTGAAACAAAAAA*CGATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTC
TTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2E207TF 630 0 0
GAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGA
TCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGA
TGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAAA
TCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGAC
CATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGA
GGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTGC
AGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTGA
TGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGT
CAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAA*CG
ATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAGT
GTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2AQ12JQ 685 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCTC
GTTTTTATTATTTGTTTTCATCTC
C

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2G943JQ 652 0 0
GCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGATCAGCTGACCGAT
GACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGTTGC
ATCACCACGAAGGAACTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAAACCCGACAGAAGCC
GAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGACCATTGACTTCCCT
GAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGAGGAAGAGCTCAAG
GAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTGCAGCTGAGCTCCGA
CATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTGATGAGATGATCCGT
GAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTCAAAGTCATGATG
GCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCCTCTGAAACAAAAAA*CGATTTATGATGTCT
GTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGAAGTA
TGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCTCGTTTTT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2G943TF 652 0 0
GCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGATCAGCTGACCGAT
GACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGTTGC
ATCACCACGAAGGAACTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAAACCCGACAGAAGCC
GAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGACCATTGACTTCCCT
GAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGAGGAAGAGCTCAAG
GAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTGCAGCTGAGCTCCGA
CATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTGATGAGATGATCCGT
GAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTCAAAGTCATGATG
GCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCCTCTGAAACAAAAAA*CGATTTATGATGTCT
GTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGAAGTA
TGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCTCGTTTTT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2EV25JQ 669 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGTTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCTC
GTTTTTATT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2EV25TF 669 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGTTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCTC
GTTTTTATT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2CQ03TF 683 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAA
ATCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCTC
GTTTTTATTATTTGTTTTCATCT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2AQ12TF 685 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCTC
GTTTTTATTATTTGTTTTCATCTC
C

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2AR18JQ 685 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTTTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAGCAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCTC
GTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2CQ03JQ 685 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTTTAGGGCAAA
ATCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTTTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATTTCTG
CAGCTGAGTTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTTTGAAACAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCTC
GTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2AR18TF 685 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAGCAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCTC
GTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2EW91TF 691 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAATG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCCCTC
GTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCTGTTGTT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2F532JQ 697 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGC*GAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGCTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCTC
GTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCTGTTGTTACTCTC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2EW91JQ 595 0 0
AAGCCTTTAGCCTCTTCGATAATGATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGA
CCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAAACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACG
AAGTCGATGCCGACGGGAACGGGACCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGA
GGAAGATGAAGGACACTGACTCGGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATA
AAGACCAGAACGGTTTCATCTCTGCAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGG
AGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTGATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATG
GTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTA
TTATCCCTTCTGAAACAAAAAA*CGATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGT
TATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATC
CTTTTGACAATTTGATGTTCCCTCGTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCTGTTGTT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2F532TF 664 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGC*GAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTGTGACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGCTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCTC
GTTT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2G303TF 694 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAA*GCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGG
ATCAACTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACCACGAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAA
ACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGA
CCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CAGCTGAGCTCCGACATGTGATGACTAACCTTGGGGAGAAGCTGACCGATGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAAGACGGAATCTTATTATCCCTTCTGAAACAAAAAA*C
GATTTATGATGTCTG**ACATGTTTTCGCTTTCTGTTATTTGTCTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTTGACAATTTGATGTTCTCTC
GTTTTTATTATTTGTTTTCATCTCTGTTGTT
ACT

QA 1 691 1 691
DS 



CO CL9Contig3 673 7 6 U
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGA
TCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGA
TGGAGATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTGGGGCAAAA
CCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGACGGGAACGGGAC
CATTGACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGA
GGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCGC
AGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTGA
TGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGT
CAAAGTCATGATGGCTAAGTGAGACGGACTCTTATCAAAACGATTTATGATGTCTGTGAC
ATGTTTTCAGCTTTCTTTCCGTCTGTTATTTGTGTTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGA
AGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACAATTTGATATTCTCTCGTTTTTATTAT
TTGTTTTCATCTC


BQ
35 35 35 35 35 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 30 30 30 20 20 20 20 

AF RR2GN19TF U 1
AF RR2BE51JQ C 1
AF RR2F833JQ C 1
AF RR2F833TF U 1
AF RR2BE51TF U 1
AF RR2EA60JQ C 5
AF RR2EA60TF U 5
BS 1 165 RR2GN19TF
BS 166 166 RR2F833TF
BS 167 655 RR2GN19TF
BS 656 666 RR2F833TF
BS 667 669 RR2BE51TF
BS 670 673 RR2EA60TF

RD RR2GN19TF 655 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGA
TCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGA
TGGAGATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAG*TCTCTGGGGCAAAA
CCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGACGGGAACGGGAC
CATTGACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGA
GGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCGC
AGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTGA
TGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGT
CAAAGTCATGATGGCTAAGTGAGACGGACTCTTATCAAAACGATTTATGATGTCTGTGAC
ATGTTTTCAGCTTTCTTTCCGTCTGTTATTTGTGTTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGA
AGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACAATTTGATATTCTCTCGTTTTT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2BE51JQ 671 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGA
TCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGA
TGGAGATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTGGGGCAAAA
CCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGACGGGAACGGGAC
CATTGACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGA
GGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCGC
AGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTGA
TGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGT
CAAAGTCATGATGGCTAAGTGAGACGGACTCTTATCAAAACGATTTATGATGTCTGTGAC
ATGTTTTCAGCTTTCTTTCCGTCTGTTATTTGTGTTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGA
AGGATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACAATTTGATATTCTCTCGTTTTTATTAT
TTGTTTTCA
CC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2F833JQ 668 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGA
TCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGA
TGGAGATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTGGGGCAAAA
CCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGACGGGAACGGGAC
CATTGACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGA
GGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCGC
AGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTGA
TGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGT
CAAAGTCATGATGGCTAAGTGAGACGGACTCTTATCAAAACGATTTATGATGTCTGTGAC
ATGTTTTCAGCTTTCTTTCCGTCTGTTATTTGTGTTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGA
AGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACAATTTGATATTCTCTCGTTTTTATTAT
TTGTTT
CC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2F833TF 668 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGA
TCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGA
TGGAGATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTGGGGCAAAA
CCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGACGGGAACGGGAC
CATTGACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGA
GGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCGC
AGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTGA
TGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGT
CAAAGTCATGATGGCTAAGTGAGACGGACTCTTATCAAAACGATTTATGATGTCTGTGAC
ATGTTTTCAGCTTTCTTTCCGTCTGTTATTTGTGTTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGA
AGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACAATTTGATATTCTCTCGTTTTTATTAT
TTGTTT
CC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2BE51TF 671 0 0
GGAAATCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGA
TCAGCTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGA
TGGAGATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTGGGGCAAAA
CCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGACGGGAACGGGAC
CATTGACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGA
GGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCGC
AGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTGA
TGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGT
CAAAGTCATGATGGCTAAGTGAGACGGACTCTTATCAAAACGATTTATGATGTCTGTGAC
ATGTTTTCAGCTTTCTTTCCGTCTGTTATTTGTGTTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGA
AGGATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACAATTTGATATTCTCTCGTTTTTATTAT
TTGTTTTCA
CC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2EA60JQ 669 0 0
G
GCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGATCAGC
TGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAG
ATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAAACCCGA
CAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGACGGGAACGGGACCATTG
ACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGAGGAAG
AGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCGCAGCTG
AGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTGATGAGA
TGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTCAAAG
TCGTGATGGCTAAGTGAGACGGACTCTTATCAAAACGATTTATGATGTCTGTGACATGTT
TTCAGCTTTCTTTCCGTCTGTTATTTGTGTTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGAAGTAT
GAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACAATTTGATATTCTCTCGTTTTTATTATTTGTT
TTCATCTC

QA 2 669 2 669
DS 

RD RR2EA60TF 669 0 0
G
GCAGTAGAAGCAAAAGATCTCAAAAAAAAGCTTAGGAAGAAAGAAAAATGGCGGATCAGC
TGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAG
ATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTTGGGACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAAACCCGA
CAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCTGACGGGAACGGGACCATTG
ACTTCCCTGAGTTTCTCAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACACTGACTCGGAGGAAG
AGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGATAAAGACCAGAATGGTTTCATCTCCGCAGCTG
AGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACGAGGAGGTTGATGAGA
TGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTCAAAG
TCGTGATGGCTAAGTGAGACGGACTCTTATCAAAACGATTTATGATGTCTGTGACATGTT
TTCAGCTTTCTTTCCGTCTGTTATTTGTGTTTTGCTTTTGGTTAGTGTTATGTGAAGTAT
GAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACAATTTGATATTCTCTCGTTTTTATTATTTGTT
TTCATCTC

QA 2 669 2 669
DS 



AS 5 30

CO CL10Contig1 644 4 1 U
GGGTTGAAAGATGATTAAGCATCACGAAGATGGAAGCAGTATGAAGAAAGTGCTCAAAAC
ATCAATAAAAAAAAAAAACCAAGAGTTCCAAGAGCTAAACAAAAAAGGTCTATCAAGTTT
TACGACAAATCTCAGCAAAACAAATGACAGACAATAAGAAAAGATGCATCTTAGTTCATC
CTTTGGGCAGCCTCTTTTGCAAGAACCCTTTCCTTGGCCTTTGTCTTGGCCTGAGATTTG
GATCCCATGATGCCTCCTCCCCATTTCTTCCTGTACTCCTCGTACTTGTCGTTGAAGTTT
GCCTTGATGGCTTCAAGGATCTTGCTGAACTCTAGCTTGTCCTCGTTCTTGACAGTTGTC
AAACACAAGCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACGACCGTTCCAAGACGAGATTTGCCTTTA
ACAATGCAGTAAGGCACTTCCATCTTTCTGCAAAGAGCAGGCAACCAGACGACCAACTCG
ATGGGGTCAACATCGTGTGCAATGACGACAAGCTGTGCCTTGTTCTGCTCGATGAGGTAA
GTGACGTGGTTGAGACCGTACTTGACGACAATGGGCTTCTTGGATTCAGAAGGCTTTCCC
TCAGCCTCGGCTTGAGCCTTTTTGAGAAGACGATCCTTCTTGCT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AM37JQ U 150
AF RR2A593JQ U 1
AF RR2FJ42JQ U 406
AF RR2A593TF C 1
BS 1 644 RR2A593JQ

RD RR2AM37JQ 251 0 0
GACAATAAAAAAAAATGCATCTTAATTCATCCTTTGGGCAGCCTCTTTTGCAAGAACCCT
TTCCTTGGCCTTTGTCTTGGCCTGAAATTTGGATCCCATGATACCTCCTCCCCATTTCTT
CCTGTACTCCTCGTACTTGTCGTTGAAGTTTGCCTTGATGGCTTCAAGGATCTTGCTGAA
CTCTAGCTTGTCCTCGTTCTTGACAGTTGTCAAACACAAGCAAGCAGCAGTCTTCTGGTG
AACGACCGTTC

QA 1 251 1 251
DS 

RD RR2A593JQ 644 0 0
GGGTTGAAAGATGATTAAGCATCACGAAGATGGAAGCAGTATGAAGAAAGTGCTCAAAAC
ATCAATAAAAAAAAAAAACCAAGAGTTCCAAGAGCTAAACAAAAAAGGTCTATCAAGTTT
TACGACAAATCTCAGCAAAACAAATGACAGACAATAAGAAAAGATGCATCTTAGTTCATC
CTTTGGGCAGCCTCTTTTGCAAGAACCCTTTCCTTGGCCTTTGTCTTGGCCTGAGATTTG
GATCCCATGATGCCTCCTCCCCATTTCTTCCTGTACTCCTCGTACTTGTCGTTGAAGTTT
GCCTTGATGGCTTCAAGGATCTTGCTGAACTCTAGCTTGTCCTCGTTCTTGACAGTTGTC
AAACACAAGCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACGACCGTTCCAAGACGAGATTTGCCTTTA
ACAATGCAGTAAGGCACTTCCATCTTTCTGCAAAGAGCAGGCAACCAGACGACCAACTCG
ATGGGGTCAACATCGTGTGCAATGACGACAAGCTGTGCCTTGTTCTGCTCGATGAGGTAA
GTGACGTGGTTGAGACCGTACTTGACGACAATGGGCTTCTTGGATTCAGAAGGCTTTCCC
TCAGCCTCGGCTTGAGCCTTTTTGAGAAGACGATCCTTCTTGCT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2FJ42JQ 224 0 0
CGAA
ATTTGCCTTTAACAATGCAGTAAGGCACTTCCATCTTTCTGCAAAGAGCAGGCAACCAGA
CGACCAACTCGATGGGGTCAACATCGTGTGCAATGACGACAAGCTGTGCCTTGTTCTGCT
CGATGAGGTAAGTGACGTGGTTGAAACCGTACTTGACGACAATGGGCTTCTTGGATTCAG
AAGGCTTTCCCTCAGCCTCGGCTTGAGCCTTTTTGAGAAG

QA 5 224 5 224
DS 

RD RR2A593TF 644 0 0
GGGT
TGAAAGATGATTAAGCATCACGAAGATGGAAGCAGTATGAAGAAAGTGCTCAAAACATCA
ATAAAAAAAAAAAACCAAGAGTTCCAAGAGCTAAACAAAAAAGGTCTATCAAGTTTTACG
ACAAATCTCAGCAAAACAAATGACAGACAATAAGAAAAGATGCATCTTAGTTCATCCTTT
GGGCAGCCTCTTTTGCAAGAACCCTTTCCTTGGCCTTTGTCTTGGCCTGAGATTTGGATC
CCATGATGCCTCCTCCCCATTTCTTCCTGTACTCCTCGTACTTGTCGTTGAAGTTTGCCT
TGATGGCTTCAAGGATCTTGCTGAACTCTAGCTTGTCCTCGTTCTTGACAGTTGTCAAAC
ACAAGCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACGACCGTTCCAAGACGAGATTTGCCTTTAACAA
TGCAGTAAGGCACTTCCATCTTTCTGCAAAGAGCAGGCAACCAGACGACCAACTCGATGG
GGTCAACATCGTGTGCAATGACGACAAGCTGTGCCTTGTTCTGCTCGATGAGGTAAGTGA
CGTGGTTGAGACCGTACTTGACGACAATGGGCTTCTTGGATTCAGAAGGCTTTCCCTCAG
CCTCGGCTTGAGCCTTTTTGAGAAGACGATCCTTCTTG
CT

QA 5 642 5 642
DS 



CO CL10Contig2 514 5 14 U
ACTTTCAACTTCGAAAACATGATTTTAATCTGCATACAAAGATCAAAAAATAAACGTGAA
AGCTGAAAGTAAAACAAAACTGCCATATTATCCTCAAGTGTGCAAACATAGATGGTAAGA
GAGCATAGAGTTTTAAAACATTCCATGAAATCGTTAAACAAAACATTCACTATCTTCATG
GTGTGCCCCTCTGCTTAGTTCATTCTCTGGGCAGCCTCCTTGGCAAGAACTCTCTCCTTA
GCTTTGGTCTTGGCTTGAGACTTGGATCCCATTATCCCTCCTCCCCACTTCTTCCTGTAC
TCCTCGTACTTATCGTTGAAGTTTGCCTTGATGGCTTCAAGGATTTTGCTGAACTCGAGC
TTGTCCTCGTTCTTGACAGTAGTCAAGCACAAGCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACGACC
GTTCCAAGACGAGATTTTCCTTTGACAATGCAGTAAGGAACTTCCATCTTTCTGCACAGT
GCAGGTAACCAGACAACCAGCTCGATGGGGTCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2A622TF C 1
AF RR2A622JQ U 138
AF RR2ED38JQ U 1
AF RR2EX50JQ U 64
AF RR2EX50TF C 64
BS 1 110 RR2ED38JQ
BS 111 111 RR2EX50JQ
BS 112 127 RR2ED38JQ
BS 128 128 RR2EX50JQ
BS 129 137 RR2ED38JQ
BS 138 181 RR2A622JQ
BS 182 182 RR2ED38JQ
BS 183 183 RR2A622JQ
BS 184 184 RR2ED38JQ
BS 185 226 RR2A622JQ
BS 227 227 RR2ED38JQ
BS 228 426 RR2A622JQ
BS 427 427 RR2ED38JQ
BS 428 514 RR2EX50JQ

RD RR2A622TF 451 0 0
ACTTTCAACTTCGAAAACATGATTTTAATCTGCATACAAAGATCAAAAAATAAACGTGAA
AGCTGAAAGTAAAACAAAACTGCCATATTGTCCTCAAGTGTGCAAACATAGATGGTAAGA
GAGCATAGAGTTTTAAAACATTCCATGAAATCGTTAAACAAAACATTCACTATCTTCATG
GTGTGCCCCTCTGCTTAGTTCATTCTCTGGGCAGCCTCCTTGGCAAGAACTCTCTCCTTA
GCTTTGGTCTTGGCTTGAGACTTGGATCCCATTATCCCTCCTCCCCACTTCTTCCTGTAC
TCCTCGTACTTATCGTTGAAGTTTGCCTTGATGGCTTCAAGGATTTTGCTGAACTCGAGC
TTGTCCTCGTTCTTGACAGTAGTCAAGCACAAGCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACGACC
GTTCCAAGACGAGATTTTCCTTTGAC
GATCC

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR2A622JQ 289 0 0
ACATTCCATGAAATCGTTAAACAAAACATTCACTATCTTCATGGGGGGCCCCTCTGCTTA
GTTCATTCTCTGGGCAGCCTCCTTGGCAAAAACTCTCTCCTTAGCTTTGGTCTTGGCTTG
AGACTTGGATCCCATTATCCCTCCTCCCCACTTCTTCCTGTACTCCTCGTACTTATCGTT
GAAGTTTGCCTTGATGGCTTCAAGGATTTTGCTGAACTCGAGCTTGTCCTCGTTCTTGAC
AGTAGTCAAGCACAAGCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACGACCGTTCCA

QA 1 289 1 289
DS 

RD RR2ED38JQ 427 0 0
ACTTTCAACTTCGAAAACATGATTTTAATCTGCATACAAAGATCAAAAAATAAACGTGAA
AGCTGAAAGTAAAACAAAACTGCCATATTATCCTCAAGTGTGCAAACATAAATGGTAAGA
GAGCATAAAGTTTTAAAACATTCCATGAAATCGTTAAACAAAACATTCACTATCTTCATG
GTGTGCCCCTCTGCTTAGTTCATTCTCTGGGCAGCCTCCTTGGCAAGAACTCTCTCCTTA
GCTTTGGTCTTGGCTTGAGACTTGGATCCCATTATCCCTCCTCCCCACTTCTTCCTGTAC
TCCTCGTACTTATCGTTGAAGTTTGCCTTGATGGCTTCAAGGATTTTGCTGAACTCGAGC
TTGTCCTCGTTCTTGACAGTAGTCAAGCACAAGCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACGACC
GTTCCAA

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR2EX50JQ 451 0 0
C
GAAAGTAAAACAAAACTGCCATATTATCCTCAAGTGTGCAAACATAGATGGTAAGAGAGC
ATAGAGTTTTAAAACATTCCATGAAATCGTTAAACAAAACATTCACTATCTTCATGGTGT
GCCCCTCTGCTTAGTTCATTCTCTGGGCAGCCTCCTTGGCAAGAACTCTCTCCTTAGCTT
TGGTCTTGGCTTGAGACTTGGATCCCATTATCCCTCCTCCCCACTTCTTCCTGTACTCCT
CGTACTTATCGTTGAAGTTTGCCTTGATGGCTTCAAGGATTTTGCTGAACTCGAGCTTGT
CCTCGTTCTTGACAGTAGTCAAGCACAAGCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACGACCGTTC
CAAGACGAGATTTTCCTTTGACAATGCAGTAAGGAACTTCCATCTTTCTGCACAGTGCAG
GTAACCAGACAACCAGCTCGATGGGGTCAC

QA 2 451 2 451
DS 

RD RR2EX50TF 451 0 0
C
GAAAGTAAAACAAAACTGCCATATTATCCTCAAGTGTGCAAACATAGATGGTAAGAGAGC
ATAGAGTTTTAAAACATTCCATGAAATCGTTAAACAAAACATTCACTATCTTCATGGTGT
GCCCCTCTGCTTAGTTCATTCTCTGGGCAGCCTCCTTGGCAAGAACTCTCTCCTTAGCTT
TGGTCTTGGCTTGAGACTTGGATCCCATTATCCCTCCTCCCCACTTCTTCCTGTACTCCT
CGTACTTATCGTTGAAGTTTGCCTTGATGGCTTCAAGGATTTTGCTGAACTCGAGCTTGT
CCTCGTTCTTGACAGTAGTCAAGCACAAGCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACGACCGTTC
CAAGACGAGATTTTCCTTTGACAATGCAGTAAGGAACTTCCATCTTTCTGCACAGTGCAG
GTAACCAGACAACCAGCTCGATGGGGTCA
C

QA 2 450 2 450
DS 



CO CL10Contig3 963 12 12 U
GGCCTTTTGACTCAGCCGTCCGTTTCACATCATTTGGAGTTGCAGCACAGGAGGACGACA
ATGGCCCCGAAGAAAGGAGTGAAGGTAGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACCAAC
CCTCTATTCGAGAGGAGGCCTAAGCAGTTTGGTATCGGAGGAGCTCTTCCTCCAAAGAAG
GATCTGACTCGCTACATCAAATGGCCCAAGTCAATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATC
CTTAAGCAGAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAG
AACCTTGCCACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCGCC
AAGAAGGATCGTCTTCTCAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCC
AAGAAGCCCATTGTCGTCAAGTACGGGCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAAC
AAGGCCCAGCTTGTCGTCATTGCACACGATGTTGATCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTG
CCTGCTCTTTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTT
GGAACGGTCGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAACGAG
GACAAGCTAGAGTTCAGCAAGATCCTTGAAGCCATCAA*GGCAAACTTCAACGACAAGTA
CGAGGAGTACAGGAAGAAATGGGGAGGAGGTATCATGGGATCCAAATCTCAGGCCAAGAC
AAAGGCCAAGGAAAGGGTTCTTGCAAAAGAGGCTGCCCAAAGAATGAACTAAGATGCATA
TCTTTTCTTATTGTCTGTTATTTGCTGAGATTTGTCGTAAAACTTGATAGACCTCTTTTT
TT*GTTTAGCTGTTGGAACTCTTGGTTTTTTTTTT**ATGAATGTTTTGAGCACTTTCTT
CAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 
45 45 45 45 45 0 45 45 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 25 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 60 60 60 
60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 50 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2EU39TF U 12
AF RR2AT13TF U 7
AF RR2H812TF U 7
AF RR2A055TF U 90
AF RR2A055JQ C 130
AF RR2FS50TF U 1
AF RR2FJ42TF U 11
AF RR2AD38TF U 1
AF RR2AM37TF U 7
AF RR2AD38JQ C 144
AF RR2FS50JQ C 411
AF RR2EU39JQ C 187
BS 1 51 RR2AD38TF
BS 52 52 RR2FS50TF
BS 53 84 RR2AD38TF
BS 85 85 RR2AM37TF
BS 86 128 RR2AD38TF
BS 129 129 RR2AM37TF
BS 130 782 RR2AD38TF
BS 783 784 RR2AM37TF
BS 785 795 RR2AD38JQ
BS 796 796 RR2FS50JQ
BS 797 961 RR2AD38JQ
BS 962 963 RR2EU39JQ

RD RR2EU39TF 645 0 0
GG
AGCCGTCCGTTTCACATCATTTGGAGTTGCAGCACAGGAGGACGACAATGGCCCCGAAGA
AAGGAGTGAAGCTAGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACCAACCCTCTATTTGAGA
GGAGGCCTAAGCAGTTTGGTATCGGAGGAGCTCTTCCTCCAAAGAAGGATCTGACTCGCT
ACATCAAATGGCCCAAGTCAATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCAGAGGC
TCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGCCACCC
AGCTTTTCGAGGTTCTTATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAGGATCGTC
TTCTCAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCCATTG
TCGTCAAGTACGGGCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCAGCTTG
TCGTCATTGCACACGATGTTGATCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTCTTTGCA
GAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGTCGTTC
ACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAA

QA 3 645 3 645
DS 

RD RR2AT13TF 651 0 0
GG
GACTCAGCCGTCCGTTTCACATCATTTGGAGTTGCAGCACAGGAGGACGACAATGGCCCC
GAAGAAAGGAGTGAAGGTAGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACGAACCCTCTGTT
CGAGAGGAGGCCTAAGCAGTTTGGTATTGGAGGAGCTCTTCCTCCAAAGAAGGATCTGAC
TCGCTACATCAAATGGCCTAAGTCAATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCA
GAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGC
CACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAGGA
TCGTCTTCTCAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCC
TATTGTCGTCAAGTACGGGCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCA
GCTTGTCGTCATTGCACACGATGTTGACCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTACCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTTCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGT
GGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAAC

QA 3 651 3 651
DS 

RD RR2H812TF 655 0 0
GG
GACTCAGCCGTCCGTTTCACATCATTTGGAGTTGCAGCACAGGAGGACGACAATGGTCCC
GAAGAAAGGAGTGAAGGTAGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACGAACCCTCTGTT
CGAGAGGAGGCCTAAGCAGTTTGGTATTGGAGGAGCTCTTCCTCCAAAGAAGGATCTGAC
TCGCTACATCAAATGGCCTAAGTCAATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCTTATCCTTAAGCA
GAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGC
CACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAGGA
TCGTCTTCTCAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCC
TATTGTCGTCAAGTACGGGCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCA
GCTTGTCGTCATTGCACACGATGTTGACCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTACCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTTCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGT
GGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAACGAGG

QA 3 655 3 655
DS 

RD RR2A055TF 680 0 0
G
GCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACCAACCCTCTATTTGAGAGGAGGCCTAAGCAGTTT
GGTATCGGAGGAGCTCTTCCTCCAAAGAAGGATCTGACTCGCTACATCAAATGGCCCAAG
TCAATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCAGAGACTCAAGGTCCCTCCTGCT
TTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGCCACCCAGCTTTTCAAGGTTCTT
ATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAGGATCGTCTTCTCAAAAAGGCTCAA
GCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCCATTGTCGTCAAGTACGGGCTC
AACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCAGCTTGTCGTCATTGCACACGAT
GTTGATCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTCTTTGCAGAAAGATGGAAGTGCCT
TACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGTCGTTCACCAGAAGACTGCTGCT
TGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAACGAGGACAAGCTAGAGTTCAGCAAGATCCTTGAA
GCCATCAA*GGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAGTACAGGAAGAAATGGGGAGGAGG
TATCATGGGATCCAAATCT

QA 2 680 2 680
DS 

RD RR2A055JQ 608 0 0
GAGAGGAGGCCTAAGCAGTTTGGTATCGGAGGAGCTCTTCCTCCAAAGAAGGATCTGACT
CGCTACATCAAATGGCCCAAGTCAATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCAG
AGACTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGCC
ACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAGGAT
CGTCTTCTCAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCC
ATTGTCGTCAAGTACGGGCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCAG
CTTGTCGTCATTGCACACGATGTTGATCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTCTT
TGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGTC
GTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAACGAGGACAAGCTA
GAGTTCAGCAAGATCCTTGAAGCCATCAA*GGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAGTA
CAGGAAGA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2FS50TF 729 0 0
GGCCTTTT
GACTCAGCCGTCCGTTTCACATCATTTGGAGTTGCAGCACAGGAGGACGACAATGGCCCC
GAAGAAAGGAGTGAAGCTAGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACCAACCCTCTATT
TGAGAGGAGGCCTAAGCAGTTTGGTATCGGAGGAGCTCTTCCTCCAAAGAAGGATCTGAC
TCGCTACATCAAATGGCCCAAGTCAATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCA
GAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGC
CACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAGGA
TCGTCTTCTCAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCC
CATTGTCGTCAAGTACGGGCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCA
GCTTGTCGTCATTGCACACGATGTTGATCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGT
CGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAACGAGGACAAGCT
AGAGTTCAGCAAGATCCTTGAAGCCATCAA*GGCAAACTTCAACGACA*GTACGAGGAGT
A

QA 9 729 9 729
DS 

RD RR2FJ42TF 718 0 0
GGG
AGCCGTCCGTTTCACTTCATTTGGAGTTGCAGCACAGGAGGACGACAATGGCCCCGAAGA
AAGGAGTGAAGGTAGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACGAACCCTCTGTTCGAGA
GGAGGCCTAAGCAGTTTGGTATTGGAGGAGCTCTTCCTCCAAAGAAGGATCTGACTCGCT
ACATCAAATGGCCCAAGTCAATCCGCCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCAGAGGC
TCAAGGTCCCCCCGGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGCCACCC
AGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAGGATCGTC
TTCTCAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCCATTG
TCGTCAAGTACGGTCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACAGCTTG
TCGTCATTGCACACGATGTTGACCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTCTTTGCA
GAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGTCGTTC
ACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAACGAGGACAAGCTAGAGT
*CAGCAAGATCCTTGAAGTCATCAA**GCAAACTTCA*CGACA*GTACGAG*AGT

QA 4 718 4 718
DS 

RD RR2AD38TF 782 0 0
GGCCTTTTGACTCAGCCGTCCGTTTCACATCATTTGGAGTTGCAGCACAGGGGGACGACA
ATGGCCCCGAAGAAAGGAGTGAAGCTAGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACCAAC
CCTCTATTTGAGAGGAGGCCTAAGCAGTTTGGTATCGGAGGAGCTCTTCCTCCAAAGAAG
GATCTGACTCGCTACATCAAATGGCCCAAGTCAATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATC
CTTAAGCAGAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAG
AACCTTGCCACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCGCC
AAGAAGGATCGTCTTCTCAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCC
AAGAAGCCCATTGTCGTCAAGTACGGGCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAAC
AAGGCCCAGCTTGTCGTCATTGCACACGATGTTGATCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTG
CCTGCTCTTTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTT
GGAACGGTCGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAACGAG
GACAAGCTAGAGTTCAGCAAGATCCTTGAAGCCATCAA*GGCAAACTTCAACGACAAGTA
CGAGGAGTACAGGAAGAAATGGGGAGGAGGTATCATGGGATCCAAATCTCAGGCCAAGAC
AA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2AM37TF 783 0 0
GG
GACTCAGTCGTCCGTTTCACATCATTTGGAGTTGCAGCACAGGAGGACGACAATGGCCCC
GAAGAAAGGAGTGAAGGTAGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACGAACCCTCTGTT
CGAGAGGAGGCCTAAGCAGTTTGGTATTGGAGGAGCTCTTCCTCCAAAGAAGGATCTGAC
TCGCTACATCAAATGGCCCAAGTCAATCCGCCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCA
GAGGCTCAAGGTCCCCCCGGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGC
CACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAGGA
TCGTCTTCTCAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCC
CATTGTCGTCAAGTACGGTCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACA
GCTTGTCGTCATTGCACACGATGTTGACCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGT
CGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAACGAGGACAAGCT
AGAGTTCAGCAAGATCCTTGAAGCCATCAAAGGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAGT
ACAGGAAGAAATGGGGGAGGAGTATCATGGGATCCAAATCTCAG*CCAAGACAAAG
CCAAG

QA 3 778 3 778
DS 

RD RR2AD38JQ 818 0 0
GCAGTTTGGTATCGGAGGAGCTCTTCCTCCAAAGAAGGATCTGACTCGCTACATCAAATG
GCCCAAGTCAATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCAGAGGCTCAAGGTCCC
TCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGCCACCCAGCTTTTCAA
GGTTCTTATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAGGATCGTCTTCTCAAAAA
GGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCCATTGTCGTCAAGTA
CGGGCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCAGCTTGTCGTCATTGC
ACACGATGTTGATCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTCTTTGCAGAAAGATGGA
AGTGCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGTCGTTCACCAGAAGAC
TGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAACGAGGACAAGCTAGAGTTCAGCAAGAT
CCTTGAAGCCATCAA*GGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAGTACAGGAAGAAATGGG
GAGGAGGTATCATGGGATCCAAATCTCAGGCCAAGACAAAGGCCAAGGAAAGAGTTCTTG
CAAAAGAGGCTGCCCAAAGAATGAACTAAGATGCATATCTTTTCTTATTGTCTGTTATTT
GCTGAGATTTGTCGTAAAACTTGATAGACCTCTTTTTTT*GTTTAGCTGTTGGAACTCTT
GGTTTTTTTTTT**ATGAATGTTTTGAGCACTTTCTTC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2FS50JQ 551 0 0
TTCTGAATCCAAGAAGCCCATTGTCGTCAAGTACGGGCTCAACCACGTCACTTACCTCAT
CGAGCAGAACAAGGCCCAGCTTGTCGTCATTGCACACGATGTTGATCCCATCGAGTTGGT
CGTCTGGTTGCCTGCTCTTTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAA
ATTTCGTCTTGGAACGGTCGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGT
CAAGAACGAGGACAAGCTAGAGTTCAGCAAGATCCTTGAAGCCATCAA*GGCAAACTTCA
ACGACAAGTACGAGGAGTACAGGAAGAAATGGGGAGGAGGTATCATGGGATCCAAATCTC
AGGCCAAGACAAAGGCCAAGGAAAGGGTTCTTGCAAAAGAGGCTGCCCAAAGAATGAACT
AAGATGCATATCTTTTCTTATTGTCTGTTATTTGCTGAGATTTGTCGTAAAATTTGATAG
ACCTCTTTTTTT*GTTTAGCTGTTGGAACTCTTGGTTTTTTTTTT**ATGAATGTTTTGA
GCACTTTCTTC

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2EU39JQ 777 0 0
ACTCGCTACATCAAATGGCCCAAGTCAATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTTAAG
CAGAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTT
GCCACCCAGCTTTTCGAGGTTCTTATGAAGTACAGACCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAG
GATCGTCTTCTCAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAG
CCCATTGTCGTCAAGTACGGGCTCAACCACGTCACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCC
CAGCTTGTCGTCATTGCACACGATGTTGATCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCT
CTTTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTTAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACG
GTCGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACAACTGTCAAGAACGAGGACAAG
CTAGAGTTCAGCAAGATCCTTGAAGCCATCAA*GGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGA
GTACAGGAAGAAATGGGGAGGAGGTATCATGGGATCCAAATCTCAGGCCAAGACAAAGGC
CAAGGAAAGGGTTCTTGCAAAAGAGGCTGCCCAAAGAATGAACTAAGATGCATATCTTTT
CTTATTGTCTGTTATTTGCTGAGATTTGTCGTAAAACTTGATAGACCTCTTTTTTTTGTT
TAGCTGTTGGAACTCTTGGTTTTTTTTTTTTATGAATGTTTTGAGCACTTTCTTCAG

QA 1 777 1 777
DS 



CO CL10Contig4 957 5 16 U
GGAAATAGAGTCGTCTTTCTTTGCCAGCTCCCCGCCGTCCCTCTGTAGCAAAATGGCACC
CAAAAAGGGAGTGAAAGTTGTTGCCAAGAAGAAAACGGAGAAGGTAACGAATCCATTGTT
TGAGAGAAGGCCAAAGCAATTCGGTATCGGTGGAGCTTTGCCTCCTAAGAAGGACTTGAC
TCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTCTCCAGAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCA
GAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGC
AACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCAAAGAAAGA
TCGTCTTTTGAAAAAGGCCCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCC
CATTGTCGTCAAGTATGGTCTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACA
GCTTGTCGTCATTGCTCATGATGTTGACCCCATCGAGCTGGTCGTCTGGTTACCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGT
TGTTCATCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCT
CGAGTTCAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAGGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAGTA
CAGGAAGAAGTGGGGAGGAGGGATTATGGGATCCAAGTCTCAAGCCAAGACCAAAGCTAA
GGAGAGGGTTCTTGCCAAGGAGGCTGCCCAGAGAATGAACTAAGCAGAAACTTTATTATG
ATTGTGGTTTTGTTTAGCGGTTCCATGAAATACTCTAAAACTTTATGCTCTTACTATCAA
TGTTGCACACCTGAGGATACTATGCAGTTTTGTTATACATTTTGCTTTCTACTTATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2AO35TF U 1
AF RR2CN46TF U 1
AF RR2BL49TF U 550
AF RR2CN46JQ C 175
AF RR2AO35JQ C 247
BS 1 692 RR2AO35TF
BS 693 693 RR2BL49TF
BS 694 701 RR2CN46TF
BS 702 702 RR2BL49TF
BS 703 707 RR2CN46TF
BS 708 708 RR2BL49TF
BS 709 715 RR2CN46TF
BS 716 716 RR2BL49TF
BS 717 725 RR2CN46TF
BS 726 728 RR2BL49TF
BS 729 753 RR2CN46TF
BS 754 754 RR2CN46JQ
BS 755 779 RR2BL49TF
BS 780 908 RR2CN46JQ
BS 909 909 RR2AO35JQ
BS 910 957 RR2CN46JQ

RD RR2AO35TF 692 0 0
GGAAATAGAGTCGTCTTTCTTTGCCAGCTCCCCGCCGTCCCTCTGTAGCAAAATGGCACC
CAAAAAGGGAGTGAAAGTTGTTGCCAAGAAGAAAACGGAGAAGGTAACGAATCCATTGTT
TGAGAGAAGGCCAAAGCAATTCGGTATCGGTGGAGCTTTGCCTCCTAAGAAGGACTTGAC
TCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTCTCCAGAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCA
GAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGC
AACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCAAAGAAAGA
TCGTCTTTTGAAAAAGGCCCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCC
CATTGTCGTCAAGTATGGTCTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACA
GCTTGTCGTCATTGCTCATGATGTTGACCCCATCGAGCTGGTCGTCTGGTTACCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGT
TGTTCATCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCT
CGAGTTCAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAGG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2CN46TF 763 0 0
GGAAATAGAGTCGTCTTTCTTTGCCAGCTCCCCGCCGTCCCTCTGTAGCAAAATGGCACC
CAAAAAGGGAGTGAAAGTTGTTGCCAAGAAGAAAACGGAGAAGGTAACGAATCCATTGTT
TGAGAGAAGGCCAAAGCAATTCGGTATCGGTGGAGCTTTGCCTCCTAAGAAGGACTTGAC
TCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTCTCCAGAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCA
GAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGC
AACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCAAAGAAAGA
TCGTCTTTTGAAAAAGGCCCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCC
CATTGTCGTCAAGTATGGTCTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACA
GCTTGTCGTCATTGCTCATGATGTTGACCCCATCGAGCTGGTCGTCTGGTTACCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGT
TGTTCATCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGTT
CGAGTTCAGCAAA*TCCTTGAAGCCATCAAGC*AAACTTCA*CGACA*GTACGAG*AGTA
CAGGA**GAGTGGGGAGGAGGGATTATGGGATC
AAGTCTCATC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2BL49TF 230 0 0
GATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGTTGTTCATCA
AAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTCAAGAACGAGGACAAGCTCGAGTTCAG
CAAAATCCTTGAAGCCATCAAGGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAGTACAGGAAGAA
GTGGGGAGGAGGGATAATGGGATCGAAGTCTCAAGCCAAGACCAAAGCTA

QA 1 230 1 230
DS 

RD RR2CN46JQ 783 0 0
CTTGACTCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTCTCCAGAGGCAGAAGCGTATCCT
TAAGCAGAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAA
CCTTGCAACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCAAA
GAAAGATCGTCTTTTGAAAAAGGCCCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAA
GAAGCCCATTGTCGTCAAGTATGGTCTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAA
GGCACAGCTTGTCGTCATTGCTCATGATGTTGACCCCATCGAGCTGGTCGTCTGGTTACC
TGCTCTTTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTTGG
AACGGTTGTTCATCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTCAAGAATGAGGA
CAAGTTCGAGTTCAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAGGCAAACTTCAACGACAAGTACGA
GGAGTACAGGAAGAAGTGGGGAGGAGGGATTATGGGATCCAAGTCTCAATCCAAGACCAA
AGCTAAGGAGAGGGTTCTTGCCAAGGAGGCTGCCCAGAGAATGAACTAAGCAGAAACTTT
ATTATGATTGTGGTTTTGTTTAGCGGTTCCATGAAATACTCTAAAACTTTATGCTCTTAC
TATCAATGTTGCACCCCTGAGGATACTATGCAGTTTTGTTATACATTTTGCTTTCTACTT
ATT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2AO35JQ 707 0 0
CAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGCAACCCA
GCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCAAAGAAAGATCGTCT
TTTGAAAAAGGCCCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCCATTGT
CGTCAAGTATGGTCTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACAGCTTGT
CGTCATTGCTCATGATGTTGACCCCATCGAGCTGGTCGTCTGGTTACCTGCTCTTTGCAG
AAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAACGGTTGTTCA
TCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCTCGAGTT
CAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAGGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAGTACAGGAA
GAAGTGGGGAGGAGGGATTAGGGGATCCAAGTCTCAAGCCAAGACCAAAGCTAAGGAGAG
GGTTCTTGCCAAGGAGGCTGCCCAGAGAATGAACTAAGCAGAAACTTTATTATGATTGTG
GTTTTGTTTAGCGGTTCCATGAAATACTCTAAAACTTTATGCTCTTACTATCAATGTTGC
ACACCTGAGGATACTATGCAGTTTTGTTATACATTTTGCTTTCTACT

QA 1 707 1 707
DS 



CO CL10Contig5 1361 4 35 U
GGACTACTGTCTTTGCCGCTCTCCGCCGTCTAACTCCAGAAATTGAACAACCATGGCACC
CAAAAGGGGAGTGAAAGCAGTTACGAAGAAGAAGACGGAGAAGGTTACGAATCCATTGTT
CGAGAGAAGGCCAAAGCAGTTCGGTATCGGAGGTGCTTTACCTCCAAAGAAGGACTTGAC
TCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTCAAGCA
GAGACTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTCGACAAGAACCTTGC
CACCCAGCTTTTCAAGGTTCTCATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAGGA
TCGTCTTTTGAAAAAGGCCCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCCGAGTCCAAGAAGCC
CATTGTCGTCAAGTACGGGCTCAACCACGTAACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCA
GCTTGTTGTCATTGCTCACGACGTTGACCCCATTGAGCTCGTTGTCTGGTTGCCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTCGGAACGGT
CGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCCTGACCACTGTCAAGAACGAGGACAAGCT
CGAGTTCAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAGGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAGTA
CAGGAAGAAGTGGGGAGAAAGCCTTCTGAGTCCAAGAAGCCCATTGTCGTTAAGTACGGT
CTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCAGCTTGTTGTCATTGCTCAC
GACGTTGACCCCATTGAGCTCGTTGTCTGGTTGCCTGCTCTTTGCAGAAAGATGGAAGTG
CCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTCTC
CAAAGGCAGAAGCGTATCCTCAAGCAGAGACTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTC
ACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGCCACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGG
CCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAGGATCGTCTTTTGAAAAAGGCCCAAGCCGAGGCTGAG
GGAAAGCCTTTTGAGTCCAAGTCTCAAGCCAAGACCAAAGCTAAGGAGAGGGTTCTTGCC
AAGGAGGCTGCCCAGAGGATGAACTAAGCAGAGAGCTTCTTCACAATGATGATGATTATG
GTTTTGTTTAGCTATTTCATGGAATGTTTCGAAACTTTTTGCTATTATTATCGATGTTGC
ACACTTCAGGATATCATTATTCAGTTTCTGTTAAGACATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK13TF U 1
AF RR2BV34TF U 16
AF RR2FS54TF U 480
AF RR2FS54JQ C 539
BS 1 159 RR2FK13TF
BS 160 160 RR2BV34TF
BS 161 243 RR2FK13TF
BS 244 244 RR2BV34TF
BS 245 351 RR2FK13TF
BS 352 352 RR2BV34TF
BS 353 435 RR2FK13TF
BS 436 436 RR2BV34TF
BS 437 501 RR2FK13TF
BS 502 502 RR2BV34TF
BS 503 513 RR2FK13TF
BS 514 514 RR2BV34TF
BS 515 519 RR2FK13TF
BS 520 520 RR2BV34TF
BS 521 522 RR2FK13TF
BS 523 523 RR2BV34TF
BS 524 531 RR2FK13TF
BS 532 532 RR2BV34TF
BS 533 600 RR2FK13TF
BS 601 601 RR2BV34TF
BS 602 631 RR2FK13TF
BS 632 632 RR2BV34TF
BS 633 672 RR2FK13TF
BS 673 673 RR2BV34TF
BS 674 690 RR2FK13TF
BS 691 691 RR2FS54TF
BS 692 699 RR2FK13TF
BS 700 700 RR2BV34TF
BS 701 707 RR2FK13TF
BS 708 708 RR2FS54TF
BS 709 715 RR2FK13TF
BS 716 716 RR2FS54TF
BS 717 719 RR2FK13TF
BS 720 1117 RR2FS54TF
BS 1118 1361 RR2FS54JQ

RD RR2FK13TF 719 0 0
GGACTACTGTCTTTGCCGCTCTCCGCCGTCTAACTCCAGAAATTGAACAACCATGGCACC
CAAAAGGGGAGTGAAAGCAGTTACGAAGAAGAAGACGGAGAAGGTTACGAATCCATTGTT
CGAGAGAAGGCCAAAGCAGTTCGGTATCGGAGGTGCTTTGCCTCCAAAGAAGGACTTGAC
TCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTCAAGCA
GAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTCGACAAGAACCTTGC
CACCCAGCTTTTCAAGGTTCTCATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCTAAGAAGGA
TCGTCTTTTGAAAAAGGCCCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCCGAGTCCAAGAAGCC
CATTGTCGTCAAGTATGGGCTCAACCACGTAACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCA
GCTTGTTGTCATTGCTCACGATGTTGACCCCATCGAGCTGGTCGTCTGGTTACCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTCGGAACGGT
GGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTCAAGAACGAGGACAAGCT
CGAGTTCAGCAAGATCCTTGAAGCCATCAA*GCAAACTTTAACGACA*GTACGAG*AGT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2BV34TF 704 0 0
GG
GCTCTCCGCCGTCTAACTCCAGAAATTGAACAACCATGGCACCCAAAAGGGGAGTGAAAG
CAGTTACGAAGAAGAAGACGGAGAAGGTTACGAATCCATTGTTCGAGAGAAGGCCAAAGC
AGTTCGGTATCGGTGGTGCTTTACCTCCTAAGAAGGACTTGACTCGTTACATCAAATGGC
CCAAGTCCATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTCAAGCAGAGACTCAAGGTCCCTC
CTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGCCACCCAGCTTTTCAAGG
TTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAGGATCGTCTTTTGAAAAAGG
CCCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAGTCCAAGAAGCCCATTGTCGTTAAGTACG
GTCTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCAGCTTGTTGTCATTGCTC
ACGACGTTGACCCCATTGAGCTCGTTGTCTGGTTGCCTGCTCTTTGCAGAAAGATGGAAG
TGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTCGGAACGGTCGTTCACCAGAAGACTG
CTGCTTGCTTGTGCCTGACCACTGTCAAGAACGAGGACAAGCTCGAGTTCAGCAAAATCC
TTGAAGCCATCAACGCAAACTTCAACGACA*GTACGAG*AGT

QA 3 704 3 704
DS 

RD RR2FS54TF 638 0 0
G
GCTTGTTGTCATTGCTCACGACGTTGACCCCATTGAGCTCGTTGTCTGGTTGCCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTCGGAACGGT
CGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCCTGACCACTGTCAAGAACGAGGACAAGCT
CGAGTTCAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAGGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAGTA
CAGGAAGAAGTGGGGAGAAAGCCTTCTGAGTCCAAGAAGCCCATTGTCGTTAAGTACGGT
CTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCAGCTTGTTGTCATTGCTCAC
GACGTTGACCCCATTGAGCTCGTTGTCTGGTTGCCTGCTCTTTGCAGAAAGATGGAAGTG
CCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTCTC
CAAAGGCAGAAGCGTATCCTCAAGCAGAGACTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTC
ACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGCCACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGG
CCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAGGATCGTCTTTTGA

QA 2 638 2 638
DS 

RD RR2FS54JQ 823 0 0
CTTTGCAGAAAGATGGAAGTGCCT*ACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTCGGAACG
GTCGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCCTGACCACTGTCAAGAACGAGGACAAG
CTCGAGTTCAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAGGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAG
TACAGGAAGAAGTGGGGAGAAAGCCTTCTGAGTCCAAGAAGCCCATTGTCGTTAAGTACG
GTCTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCAGCTTGTTGTCATTGCTC
ACGACGTTGACCCCATTGAGCTCGTTGTCTGGTTGCCTGCTCTTTGCAGAAAGATGGAAG
TGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTC
TCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTCAAGCAGAGACTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGT
TCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGCCACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACA
GGCCAGAGGACAAGGCCGCCAAGAAGGATCGTCTTTTGAAAAAGGCCCAAGCCGAGGCTG
AGGGAAAGCCTTTTGAGTCCAAGTCTCAAGCCAAGACCAAAGCTAAGGAGAGGGTTCTTG
CCAAGGAGGCTGCCCAGAGGATGAACTAAGCAGAGAGCTTCTTCACAATGATGATGATTA
TGGTTTTGTTTAGCTATTTCATGGAATGTTTCGAAACTTTTTGCTATTATTATCGATGTT
GCACACTTCAGGATATCATTATTCAGTTTCTGTTAAGACATTT

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 36

CO CL11Contig1 762 36 10 U
GGACGGACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCT
TAAAAGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAA
CTGGATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTA
GAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCG
ACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGT
TCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAA
CTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAG
GTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACA
GTGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGAT
CCATTTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGT
TTCAAGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTTTTT*TTTTTTTGAAAGCTGG
TTTTCTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGC
TTTTTGGTTAATAATACGGACTTATATATGCTTAAAAAAAAA


BQ
50 60 65 65 10 15 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 85 85 85 85 85 85 85 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 30 97 97 97 50 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 90 90 90 90 90 80 80 
80 75 75 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 55 55 50 50 50 50 50 50 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF93TF U 1
AF RR2DE07TF U 5
AF RR2FN42JQ C 390
AF RR2FN42TF U 1
AF RR2G143TF U 157
AF RR2C781JQ C 129
AF RR2GW43JQ C 165
AF RR2D342TF U 5
AF RR2D342JQ C 5
AF RR2AN80TF U 5
AF RR2GM09JQ C 44
AF RR2C781TF U 5
AF RR2CL66TF U 5
AF RR2GM09TF U 4
AF RR2B646TF U 0
AF RR2C128TF U 1
AF RR2GW43TF U 4
AF RR2FQ23TF U 5
AF RR2C128JQ C 169
AF RR2GM44TF U 2
AF RR2B255TF U 1
AF RR2A963TF U 4
AF RR2EI60JQ C 8
AF RR2EI60TF U 54
AF RR2BC83JQ C 1
AF RR2DF93JQ C 197
AF RR2DE07JQ C 5
AF RR2FC38TF U 5
AF RR2G143JQ C 2
AF RR2GM44JQ C 34
AF RR2CC05JQ C 5
AF RR2CC05TF U 5
AF RR2EP86JQ C 1
AF RR2BC83TF U 1
AF RR2EP86TF U 1
AF RR2B255JQ C 169
BS 1 4 RR2B255TF
BS 5 6 RR2A963TF
BS 7 521 RR2B255TF
BS 522 524 RR2FN42TF
BS 525 602 RR2B255TF
BS 603 603 RR2FN42TF
BS 604 639 RR2B255TF
BS 640 640 RR2C781TF
BS 641 753 RR2B255TF
BS 754 762 RR2EP86TF

RD RR2DF93TF 533 0 0
GGACTCACTCATAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCT
TAAAAGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAA
CTGGATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTA
GAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCG
ACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGT
TCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAA
CTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAG
GTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACA
GTGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTA

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2DE07TF 579 0 0
GGACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACTGG
ATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGT
TCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGACGA
AGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGA
CTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCT
GGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCA
TGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGT
TTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGATCCAT
TTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCA

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2FN42JQ 198 0 0
ATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCC
ACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGTTTCTTTTAAGTTTAATCCTTCCGAA
ACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGATCCATTTATTGTTTGGACCAATTCACCTCT
TTAGAGAGAATTCAAAAA

QA 1 198 1 198
DS 

RD RR2FN42TF 655 0 0
GGACCCACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCT
TAAAAGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAG
CTGGATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTA
GAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCG
ACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGT
TCGACTCTGGTTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAA
CTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAG
GTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACA
GTGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGAT
CCATTTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGT
TTCAAGAATAA**TTTGTTTT*CTGCTAAA*TTTGGTGT**TT*TTTTTTTGAAA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2G143TF 469 0 0
CGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCA
AAGGAGAATATAATAAACTGTTCGACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTC
CTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACG
CTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACAT
GCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTA
AAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCT
CCTGA***ATCGGTGTATATCGATCCATTTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGA
GAATTCAAAA*TCGAGTCTGTTGTTTCAAGAATAAA*TTTGTTTT*CTG

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR2C781JQ 497 0 0
GTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGTTCTC
AGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGACGAAGAA
ACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGACTCT
GGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTGGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCTGGAG
CCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCATGTT
TTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGTTTCT
CTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGTTCCATTTAT
TGTTTGGACCAATTCCCCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCAAGAA
TAAAATTTGTTTTTCTG

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2GW43JQ 541 0 0
TCTCCTGAACAATTTAGAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAA
TATAATAAACTGTTCGACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTAT
AAGTCCACCACCAAGTTCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCC
GGTGCCATTAAACAAACTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAA
TGTGATGGACATTTAGGTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAG
CGTCACTGCGTCAACAGTGTTTTTTTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***
ATCGGTGTATATCGATCCATTTATTGTTTGGACCAATCCACCTCTTTAGAGAGAATTCAA
AAATCGAGTCTGTTGTTTCAAGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTTTTT*
TTTTTTTGAAAGCTGGTTTTCTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGC
C

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR2D342TF 707 0 0
GGACTCAAAAATCAATTCTTCATTTTCTTAGAAATCAGACCATCTCTCTCTCGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTACCA********TGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACTGG
ATCTGTCCAGAAACCTGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGT
TCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGAGGA
AGGAACGTATGCGTGTGCCGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGA
CTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCCTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCT
GGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACCTTTAGGTCA
TGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGT
TTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGACACTTCCTCCTGATAAATCGATGTATATCGATCCAT
TTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCA
AGAATAA**TTTTTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTGTTT*CTTTTTTGAAAGCTGGTTTT
CTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTTCCGAG
AAA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2D342JQ 704 0 0
GGACTCAAAAATCAATTCTTCATTTTCTTAGAAATCAGACCATCTCTCTCTCGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTACCA********TGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACTGG
ATCTGTCCAGAAACCTGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGT
TCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGAGGA
AGGAACGTATGCGTGTGCCGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGA
CTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCCTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCT
GGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACCTTTAGGTCA
TGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGT
TTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGACACTTCCTCCTGATAAATCGATGTATATCGATCCAT
TTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCA
AGAATAA***TTTTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTGTTTCTTTTTTTGAAAGCTGGTTTT
CTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTTCCGAG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2AN80TF 703 0 0
GGACTCAAAAATCAATTCTTCATTTTCTTAGAAATCAGACCATCTCTCTCTCGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTACCA********TGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACTGG
ATCTGTCCAGAAACCTGATGATGAGTGGCGTGCAGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGT
TCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGAGGA
AGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGA
CTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCCTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCT
GGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCA
TGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGT
TTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGACACTTCCTCCTGATAAATCGATGTATATCGATCCAT
TTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCA
AGAATAA**TTTTTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTGTTTCTTTTTTTGAAAGCTGGTTTT
CTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTTCCGA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2GM09JQ 675 0 0
ACATCTCTCTGTCGCCTTAAAAGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAATGACAGCAAC
ATTGGCAGCTCCATTAACTGGATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCT
GTCTCCTGAACAATTTAGAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGA
ATATAATAAACTGTTCGACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTA
TAAGTCCACCACCAAGTTCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCC
CGGTGCCATTAAACAAACTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAA
ATGTGATGGACATTTAGGTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGA
GCGTCACTGCGTCAACAGTGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGATA
AATCGGTGTATATCGATCCATTTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCA
AAAATCGAGTCTGTTGTTTGAAGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTGTTT
*TTTTTTTGAAAGCTGGTTTTCTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTG
CCGAGTACTGATGAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2C781TF 706 0 0
GGACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACTGG
ATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGT
TCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGACGA
AGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGA
CTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCT
GGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCA
TGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGT
TTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGATCCAT
TTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCA
AGAATAAA*TTTGTTTT*CTGCTAAAATTTGGTGTTTTT**TTTTTTGAAAGCTGGTTTT
CTAAA*TTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCC
AAAAA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2CL66TF 660 0 0
GGACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACTGG
ATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGT
TCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGACGA
AGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGA
CTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCT
GGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCA
TGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGT
TTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGATCCAT
TTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCA
AGAATAAA*TTTGTTTT*CTGCTAAAATTTGGTGTTTTT**TTTTCTGAAAGCTGGTTT
C

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2GM09TF 715 0 0
G
GGACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAATGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACTGG
ATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGT
TCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGACGA
AGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGA
CTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCT
GGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCA
TGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGT
TTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGATAAATCGGTGTATATCGATCCAT
TTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTGA
AGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAA*TTTGGTGTGTTT*TTTTTTTGAAAGCTGGTTTT
CTAAA*TTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAA

QA 2 715 2 715
DS 

RD RR2B646TF 706 0 0
GGT
ACTCACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCTTA
AAAGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACT
GGATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGA
GTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGAC
GAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTC
GACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACT
CTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGT
CATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGT
GTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGATAAATCGGTGTATATCGATCC
ACTTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTT
GAAGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTGTTTTTTTTTTTGAAAGCTGGTT
TTCTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCC

QA 4 706 4 706
DS 

RD RR2C128TF 714 0 0
GGACTCACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCT
TAAAAGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAA
CTGGATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTA
GAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCG
ACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCATTATAAGTCCACCACCAAGT
TCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAA
CTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAG
GTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACA
GTGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGAT
CCATTTATTGTTTTGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGT
TTCAAGAATAAA*TTTGTTTT*CTGCTAAAATTTGGTGTTTTT*TTTTTTTGAAAGCTGG
TTTTCTAAA*TTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAG
CAAAAA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2GW43TF 702 0 0
G
GGACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGTAGCTCCATTAACTGG
ATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGT
TCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGACGA
AGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGA
CTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCT
GGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCA
TGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGT
TTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGATCCAT
TTATTGTTTGGACCAATCCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCA
AGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTTTTT*TTTTTTTGAAAGCTGGTTTT
CTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCC

QA 2 702 2 702
DS 

RD RR2FQ23TF 709 0 0
GGACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACTGG
ATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGT
TCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGACGA
AGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGA
CTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCT
GGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCA
TGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGT
TTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGATCCAT
TTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCA
AGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTTTTT**TTTTTTGAAAGCTGGTTTT
CTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTA
AAA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2C128JQ 541 0 0
CTGAACAATTTAGAGTTTTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATA
ATAAACTGTTCGACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCATTATAAGT
CCACCACCAAGTTCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTG
CCATTAAACAAACTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTG
ATGGACATTTAGGTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTC
ACTGCGTCAACAGTGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCG
GTGTATATCGATCCATTTATTGTTTTGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAAT
CGAGTCTGTTGTTTCAAGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTTTTTTTTTT
TTTGAAAGCTGGTTTTCTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAG
C

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2GM44TF 716 0 0
GACTCACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCT*TCTGTCGCCTT
AAAAGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACGGCAACATTGGCAGCTCCATTAAC
TGGATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAG
AGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGA
CGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTT
CGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAAC
TCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGG
TCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAG
TGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGATC
CATTTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTT
TCAAGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTTTTTTTTTTTTTGAAAGCTGGT
TTTCTAAA*TTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2B255TF 753 0 0
GGACTCACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCT
TAAAAGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAA
CTGGATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTA
GAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCG
ACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGT
TCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAA
CTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAG
GTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACA
GTGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGATAAATCGGTGTATATCGAT
CCATTTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGT
TTGAAGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTGTTT*TTTTTTTGAAAGCTGG
TTTTCTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGC
TTTTTGGTTAATAATACGGACTTATATATGCTT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2A963TF 742 0 0
T
GGACTCAAAAATCAATTCTTCATTTTCTTAGAAATCAGACCATCTCTCTCTCGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTACCA********TGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACTGG
ATCTGTCCAGAAACCTGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGT
TCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGAGGA
AGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCTA
CTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCCTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCT
GGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCA
TGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGT
TTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGACACTTCCTCCTGATAAATCGATGTATATCGATCCAT
TTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCA
AGAATAA***TTTTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTGTTTCTTTTTTTGAAAGCTGGTTTT
CTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTTCCGAGTACTGATGAAGCTTTT
TGGTTAATAATACGGACTTAT

QA 2 742 2 742
DS 

RD RR2EI60JQ 746 0 0
CTCAAAAATCAATTCTTCATTTTCTTAGAAATCAGACCATCTCTCTCTCGCCTTAAAAGC
CTCTTCTTACCA********TGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACTGGATC
TGTCCAGAAACCTGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGTTCT
CAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATGATAAACTGTTCGAGGAAGG
AACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGACTC
TGGCTGTGGCTGGCCTGCCTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCTGGA
GCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCATGT
TTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGTTTC
TCTTAAGTTTAATCCTTCCGACACTTCCTCCTGATAAATCGATGTATATCGATCCATTTA
TTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCAAGA
ATAA**TTTTTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTGTTTCTTTTTTTGAAAGCTGGTTTTCTA
AAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTTCCGAGTACTGATGAAGCTTTTTGG
TTAATAATACGGACTTATATATGCTT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2EI60TF 700 0 0
CTCGCCTTAAAAGCCTCTTCTTACCA********TGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCT
CCATTAACTGGATCTGTCCAGAAACCTGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAA
CAATTTAGAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATGATAAA
CTGTTCGAGGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACC
ACCAAGTTCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCCTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATT
AAACAAACTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGA
CATTTAGGTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGC
GTCAACAGTGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGACACTTCCTCCTGATAAATCGATGTA
TATCGATCCATTTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGT
CTGTTGTTTCAAGAATAA**TTTTTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTGTTTCTTTTTTTGA
AAGCTGGTTTTCTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTTCCGAGTACTG
ATGAAGCTTTTTGGTTAATAATACGGACTTATATATGCTT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2BC83JQ 753 0 0
GGACTCACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCT
TAAAAGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAA
CTGGATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTA
GAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCG
ACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGT
TCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAA
CTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAG
GTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACA
GTGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGAT
CCATTTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGT
TTCAAGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTTTTT*TTTTTTTGAAAGCTGG
TTTTCTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGC
TTTTTGGTTAATAATACGGACTTATATATGCTT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2DF93JQ 551 0 0
GGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGACGAAGGAACGTATGC
GTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGACTCTGGCTGTGG
CTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCTGGAGCCAGATGG
GAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCATGTTTTCAAAGG
AGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGTTTCTCTTAAGTT
TAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGATCCATTTATTGTTTGGA
CCAATTCACCTCTTTAGAGAGAGTTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCAAGAATAAA*TTT
GTTTTTTTGCTAAAATTTGGTGTTTTT***TTTTTGAAAGCTGGTTTTTTAAAATTTGGT
GTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGCTTTTTGGTTAATAATA
CGGACTTATAT

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2DE07JQ 725 0 0
GGACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACTGG
ATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGT
TCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGACGA
AGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGA
CTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCT
GGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCA
TGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGT
TTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGATCCAT
TTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCA
AGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTTTTT***TTTTTGAAAGCTGGTTTT
CTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGCTTTT
TGG
GG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2FC38TF 729 0 0
GGACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACTGG
ATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGT
TCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGACGA
AGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGA
CTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCT
GGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCA
TGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGT
TTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGATCCAT
TTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCA
AGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTTTTT**TTTTTTGAAAGCTGGTTTT
CTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCCTTGCCGAATACTGATGAAGCTTTT
GGCTAAAAA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2G143JQ 728 0 0
GACTCACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCT*TCTGTCGCCTT
AAAAGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACGGCAACATTGGCAGCTCCATTAAC
TGGATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAG
AGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGA
CGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTT
CGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAAC
TCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGG
TCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAG
TGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGATC
CATTTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTT
TCAAGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTTTTTTTTTTTTTGAAAGCTGGT
TTTCTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGCT
TTTTGGTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2GM44JQ 696 0 0
AGAAATCAGAACATCT*TCTGTCGCCTTAAAAGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAA
CGACGGCAACATTGGCAGCTCCATTAACTGGATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGC
GTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGAT
TCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAA
CTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCG
ACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCA
CATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGG
CTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTT
CCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGATCCATTTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAG
AGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCAAGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATT
TGGTGTTTTTTTTTTTTTGAAAGCTGGTTTTCTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAAT
TGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGCTTTTTGGTT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2CC05JQ 739 0 0
GGACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACCGG
ATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGT
TCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGACGA
AGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGA
CTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCT
GGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCA
TGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGT
TTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGATCCAT
TTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCA
AGAATAAA*TTTGTTTTTCCGCTAAAATTTGGTGTTTTTTTTTTTTTGAAAGCTGGTTTT
CTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGCTTTT
TGGTTAATAATACGGACTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2CC05TF 720 0 0
GGACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAACCGG
ATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGT
TCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCGACGA
AGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGA
CTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCT
GGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCA
TGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACAGTGT
TTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGATCCAT
TTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCA
AGAATAAA*TTTGTTTTTCCGCTAAAATTTGGTGTTTTT*TTTTTTTGAAAGCTGGTTTT
CTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGCTTTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2EP86JQ 753 0 0
GGACTCACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCT
TAAAAGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAA
CTGGATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCTTGAACAATTTA
GAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCG
ACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGT
TCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAA
CTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAG
GTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACA
GTGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGAT
CCATTTATTGTTTGGGCCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGT
TTCAAGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTTTTT**TTTTTTGAAAGCTGG
TTTTCTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGC
TTTTTGGTTAATAATACGGACTTATATATGCTT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2BC83TF 753 0 0
GGACTCACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCT
TAAAAGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAA
CTGGATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCCTGAACAATTTA
GAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCG
ACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGT
TCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAA
CTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAG
GTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACA
GTGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGAT
CCATTTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGT
TTCAAGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTTTTT*TTTTTTTGAAAGCTGG
TTTTCTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGC
TTTTTGGTTAATAATACGGACTTATATATGCTT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2EP86TF 762 0 0
GGACTCACTCAAAAATCAATTCTTCATTT*CTTAGAAATCAGAACATCTCTCTGTCGCCT
TAAAAGCCTCTTCTTATCAAGTTATCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATTAA
CTGGATCTGTCCAAAAACCAGATGATGAGTGGCGTGCGGTTCTGTCTCTTGAACAATTTA
GAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTTCG
ACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGT
TCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAA
CTCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAG
GTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTCAACA
GTGTTTCTCTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGA***ATCGGTGTATATCGAT
CCATTTATTGTTTGGGCCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGT
TTCAAGAATAAA*TTTGTTTTTCTGCTAAAATTTGGTGTTTTT**TTTTTTGAAAGCTGG
TTTTCTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGC
TTTTTGGTTAATAATACGGACTTATATATGCTTAAAAAAAAA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2B255JQ 585 0 0
CTGAACAATTTAGAGTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATA
ATAAACTGTTCGACGAAGGAACGTATGCGTGTGCTGGCTGTGCAACTCCTCTTTATAAGT
CCACCACCAAGTTCGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCTTTTTTTGACGCTATTCCCGGTG
CCATTAAACAAACTTTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTG
ATGGACATTTAGGTCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTC
ACTGCGTCAACAGTGTTTTTTTTAAGTTTAATCCTTCCGAAACTTCCTCCTGATAAATCG
GTGTATATCGATCCATTTATTGTTTGGACCAATTCACCTCTTTAGAGAGAATTCAAAAAT
CGAGTTTGTTGTTTGAAGAATAAA*TTTGTTTTTTTGCTAAAATTTGGTGTGTTT**TTT
TTTGAAAGCTGGTTTTTTAAAATTTGGTGTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAG
TACTGATGAAGCTTTTTGGTTAATAATACGGACTTATATATGCTT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 5 32

CO CL12Contig1 774 2 17 U
CGTAGAGCATAATTAACTGATGGGGTAGTTTATGAAATATCATTGCAAGCTAATCCAAAA
GCATCTCGGGTTCTCAGACAATAGTAAAAACTGAAACTCAAAACATGTTTGATGATAAAA
CAAAAAAAAAAAGTTTGAAAATAAAAAAGTGTAGCTTTTAAGCGGCACCCTTTCCCTTCT
TCTTCTGGATCTTCTTCTGGTAAAACTCTAGCTCTTTGCCTTCCAAAATGTATCCATCGG
CACGTCCACACTGGCCAGGCCTAAATGAAATGCAAGCCAACAAACGTCCGCTAGCGAATT
GATCCTCGATGTGGGAATCAAGGCTGCGTCCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAAA
CATGGTTACTCTTCTTGGTCTCCTCAGGAGCGGTAGCAGCTGGAGCAGCTTCATCACCTT
CCTCTCCGTCCTTCTTGGCGGCGACAGAAGCAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAA
CTCCGTAGTGCTGCAAGTACCACTGCTTGAAAGGAGCGGCATCGACCTGAACAATAGCAC
TCTTCACAAGAGTCTTGGTCCTGACGAGCTCGTTGTTGGAAGCGTTGTAGACGACATCAA
GAACCCTGGTCTTGCGTGTCACAGCTCCACTTCCCCACGAGTAGTTACCGGTGTCGAGCC
TCAACGCGCGCCACTTGACGTTACCTCCACGAACACGGATTCTCCTCACCGTCTTGTTGC
TTGACAACTTGGTGTTAGCTGGCTGCCTTCCCATCTCGTACTTTCGCTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B412JQ U 81
AF RR2A672JQ U 1
BS 1 118 RR2A672JQ
BS 119 119 RR2B412JQ
BS 120 145 RR2A672JQ
BS 146 146 RR2B412JQ
BS 147 202 RR2A672JQ
BS 203 203 RR2B412JQ
BS 204 225 RR2A672JQ
BS 226 226 RR2B412JQ
BS 227 263 RR2A672JQ
BS 264 264 RR2B412JQ
BS 265 268 RR2A672JQ
BS 269 269 RR2B412JQ
BS 270 282 RR2A672JQ
BS 283 283 RR2B412JQ
BS 284 358 RR2A672JQ
BS 359 359 RR2B412JQ
BS 360 774 RR2A672JQ

RD RR2B412JQ 427 0 0
ATAGTAAAAACTGAAACTCAAAACATGTTTGATGATAAAACAAAAAAAAAA*GTTTGAAA
GTAAAAAAGTGTAGCTTTTAAGCGGCACCCTTTCCCTTCTTCTTCTGGATCTTCTTCTGG
TAAAACTCTAGCTCTTTGCCTTCCAAAATGTATCCATCGGCACGTCCACACTGGCCAGGC
CTAAATGAAATGCAAGCCAACAAACGTCCGCTAGCGAATTGATCCTCGATGTGGGAATCA
AGGCTGCGTCCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAAACATGGTTACTCTTCTTGGTC
TCCTCAGGAGCGGTAGCAGCTGGAGCAGCTTCATCACCTTCCTCTCCGTCCTTCTTGGCG
GCGACAGAAGCAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACTCCGTAGTGCTGCAAGTAC
CACTGCT

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR2A672JQ 774 0 0
CGTAGAGCATAATTAACTGATGGGGTAGTTTATGAAATATCATTGCAAGCTAATCCAAAA
GCATCTCGGGTTCTCAGACAATAGTAAAAACTGAAACTCAAAACATGTTTGATGATAAGA
CAAAAAAAAAAAGTTTGAAAATAAAGAAGTGTAGCTTTTAAGCGGCACCCTTTCCCTTCT
TCTTCTGGATCTTCTTCTGGTAGAACTCTAGCTCTTTGCCTTCCAGAATGTATCCATCGG
CACGTCCACACTGGCCAGGCCTAGATGAGATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATT
GATCCTCGATGTGGGAATCAAGGCTGCGTCCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAGA
CATGGTTACTCTTCTTGGTCTCCTCAGGAGCGGTAGCAGCTGGAGCAGCTTCATCACCTT
CCTCTCCGTCCTTCTTGGCGGCGACAGAAGCAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAA
CTCCGTAGTGCTGCAAGTACCACTGCTTGAAAGGAGCGGCATCGACCTGAACAATAGCAC
TCTTCACAAGAGTCTTGGTCCTGACGAGCTCGTTGTTGGAAGCGTTGTAGACGACATCAA
GAACCCTGGTCTTGCGTGTCACAGCTCCACTTCCCCACGAGTAGTTACCGGTGTCGAGCC
TCAACGCGCGCCACTTGACGTTACCTCCACGAACACGGATTCTCCTCACCGTCTTGTTGC
TTGACAACTTGGTGTTAGCTGGCTGCCTTCCCATCTCGTACTTTCGCTTCTTCC

QA 1 774 1 774
DS 



CO CL12Contig2 852 15 24 U
TTTTTTAACAGAGAAACTCTAAAGAGACAACCATGGGTATATCTCGTGACTCAATCCACA
AGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTACGAGATGG
GAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGTTGTCAAGCAACAAGACTGTTAGAAGAATCCGTGTCC
GTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACTGGTAACTACTCTTGGGGAA
GTGAGGCTGTTACCCGCAAGACCAGAGTCCTTGATGTTGTCTACAATGCTTCCAACAACG
AGCTTGTACGTACAAAGACTCTAGTCAAGAGTGCCATTGTTCAGGTGGATGCTGCTCCTT
TCAAGCAGTGGTATCTCCAGCACTATGGTGTCGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGAATGCTG
CTTCCGCTGCCAAGAAGGAAGCTGAGGATGGTGAAGAAGCAGCTCCAGCTGCTGCTGCTG
CTGCTGCTCCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGAAAGATTGAGAGCCGTC
AAGAGGGACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCGAGCGGTCGTTTGTTGG
CTTGCATCTCATCAAGGCCCGGCCAGTGCGGACGTGCTGATGGATACATT*CTGGAAGGT
AAAGAGCTGGAATTCTACCAGAAGAAGATCCAGAAGAAGAA*GGGAAAGGGTGCTGCTTA
AAAGCTTGTTCTTTTGCCTGAAACCTTTTTGTTTTCTTTATACATGCTGTTTTGAGGTTT
CAGTTTGTAATACTGTGTGAGAACTTATGTTTTTGGATTAGCTTGATATCGTATTTCTTA
GTACTTCCATCG


BQ
25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 50 50 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 40 75 75 75 75 70 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 25 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 30 45 45 45 45 45 45 20 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW42JQ C 105
AF RR2GT05TF U 1
AF RR2CW42TF U 1
AF RR2EE76TF U 1
AF RR2GY77TF U 1
AF RR2AE79TF U 7
AF RR2DM28TF U 119
AF RR2E636TF U 136
AF RR2E636JQ C 285
AF RR2FY31JQ C 521
AF RR2BJ26TF U 7
AF RR2CP57TF U 430
AF RR2GY77JQ C 22
AF RR2EE76JQ C 142
AF RR2GT05JQB C 475
BS 1 39 RR2CW42TF
BS 40 40 RR2EE76TF
BS 41 612 RR2CW42TF
BS 613 613 RR2EE76TF
BS 614 615 RR2GY77TF
BS 616 616 RR2BJ26TF
BS 617 657 RR2GY77TF
BS 658 658 RR2DM28TF
BS 659 668 RR2GY77TF
BS 669 669 RR2AE79TF
BS 670 697 RR2GY77TF
BS 698 701 RR2BJ26TF
BS 702 702 RR2E636TF
BS 703 727 RR2BJ26TF
BS 728 728 RR2E636TF
BS 729 776 RR2BJ26TF
BS 777 777 RR2CP57TF
BS 778 802 RR2BJ26TF
BS 803 803 RR2CP57TF
BS 804 824 RR2BJ26TF
BS 825 825 RR2CP57TF
BS 826 840 RR2BJ26TF
BS 841 841 RR2GY77JQ
BS 842 852 RR2EE76JQ

RD RR2CW42JQ 131 0 0
CGAAAGTACGAGATGGGAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGTTGTCAAGCAACAAGACTGTT
AGAAGAATCCGTGTCCGTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACTGGT
AACTACTCTTG

QA 1 131 1 131
DS 

RD RR2GT05TF 582 0 0
TTTTTTAACAGAGAAACTCTAAAGAGACAACCATGGGTATATCTCGTGACTCAATCCACA
AGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTACGAGATGG
GAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGTTGTCAAGCAACAAGACTGTTAGAAGAATCCGTGTCC
GTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACTGGTAACTACTCTTGGGGAA
GTGAGGCTGTTACCCGCAAGACCAGAGTCCTTGATGTTGTCTACAATGCTTCCAACAACG
AGCTTGTACGTACAAAGACTCTAGTCAAGAGTGCCATTGTTCAGGTGGATGCTGCTCCTT
TCAAGCAGTGGTATCTCCAGCACTATGGTGTCGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGAATGCTG
CTTCCGCTGCCAAGAAGGAAGCTGAAGATGGTGAAGAAGCAGCTCCAGCTGCTGCTGCTG
CTGCTGCTCCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGAAAGATTGAGAGCGGTC
AAGAGGGACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTG

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2CW42TF 612 0 0
TTTTTTAACAGAGAAACTCTAAAGAGACAACCATGGGTACATCTCGTGACTCAATCCACA
AGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTACGAGATGG
GAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGTTGTCAAGCAACAAGACTGTTAGAAGAATCCGTGTCC
GTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACTGGTAACTACTCTTGGGGAA
GTGAGGCTGTTACCCGCAAGACCAGAGTCCTTGATGTTGTCTACAATGCTTCCAACAACG
AGCTTGTACGTACAAAGACTCTAGTCAAGAGTGCCATTGTTCAGGTGGATGCTGCTCCTT
TCAAGCAGTGGTATCTCCAGCACTATGGTGTCGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGAATGCTG
CTTCCGCTGCCAAGAAGGAAGCTGAGGATGGTGAAGAAGCAGCTCCAGCTGCTGCTGCTG
CTGCTGCTCCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGAAAGATTGAGAGCCGTC
AAGAGGGACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCGAGCGGTCGTTTGTTGG
CTTGCATCTCAT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2EE76TF 613 0 0
TTTTTTAACAGAGAAACTCTAAAGAGACAACCATGGGTATATCTCGTGACTCAATCCACA
AGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGTAGCGAAAGTACGAGATGG
GAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGTTGTCAAGCAACAAGACTGTTAGAAGAATCCGTGTCC
GTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACTGGTAACTACTCTTGGGGAA
GTGAGGCTGTTACCCGCAAGACCAGAGTCCTTGATGTTGTCTACAATGCTTCCAACAACG
AGCTTGTACGTACAAAGACTCTAGTCAAGAGTGCCATTGTTCAGGTGGATGCTGCTCCTT
TCAAGCAGTGGTATCTCCAGCACTATGGTGTCGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGAATGCTG
CTTCCGCTGCCAAGAAGGAAGCTGAGGATGGTGAAGAAGCAGCTCCAGCTGCTGCTGCTG
CTGCTGCTCCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGAAAGATTGAGAGCCGTC
AAGAGGGACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCGAGCGGTCGTTTGTTGG
CTTGCATCTCATC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2GY77TF 697 0 0
TTTTTTAACAGAGAAACTCTAAAGAGACAACCATGGGTATATCTCGTGACTCAATCCACA
AGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTACGAGATGG
GAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGTTGTCAAGCAACAAGACTGTTAGAAGAATCCGTGTCC
GTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACTGGTAACTACTCTTGGGGAA
GTGAGGCTGTTACCCGCAAGACCAGAGTCCTTGATGTTGTCTACAATGCTTCCAACAACG
AGCTTGTACGTACAAAGACTCTAGTCAAGAGTGCCATTGTTCAGGTGGATGCTGCTCCTT
TCAAGCAGTGGTATCTCCAGCACTATGGTGTCGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGAATGCTG
CTTCCGCTGCCAAGAAGGAAGCTGAGGATGGTGAAGAAGCAGCTCCAGCTGCTGCTGCTG
CTGCTGCTCCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGAAAGATTGAGAGCGGTC
AAGAGGGACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCGAGCGGTCGTTTGTTGG
CTTGCATCTCATCAA*GCCCGGCCAGTGCGGACGTGCTGATGGATACATT*CTGGAA*GT
AAAGAGCTTGAATTCTACCAGAAGAAGATCCAGAAGA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2AE79TF 686 0 0
AACAGAGAAACTCTAAAGAGACAACCATGGGTATATCTCGTGACTCAATCCACAAGAGGC
GTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTACGAGATGGGAAGCC
AGCCAGCCAACACCAAGTTGTCAAGCAACAAGACTGTTAGAAGAATCCGTGTCCGTGGAG
GCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACTGGTAACTACTCTTGGGGAAGTGAGG
CTGTTACCCGCAAGACCAGAGTCCTTGATGTTGTCTACAATGCTTCCAACAACGAGCTTG
TACGTACAAAGACTCTAGTCAAGAGTGCCATTGTTCAGGTGGATGCTGCTCCTTTCAAGC
AGTGGTATCTCCAGCACTATGGTGTCGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGAATGCTGCTTCCG
CTGCCAAGAAGGAAGCTGAGGATGGTGAAGAAGCAGCTCCAGCTGCTGCTGCTGCTGCTG
CTCCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGAAAGATTGAGAGCCGTCAAGAGG
GACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCGAGCGGTCGTTTGTTGGCTTGCA
TCTCATCAAAGCCCGGCCAGTGCGGACGTGCTGATGGATACATTTCTGGAAAGTAAAGAG
CTGGAATTCTACCAGAAGAAGATCCA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2DM28TF 582 0 0
GGGAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGTTGTCAAGCAACAAGACTGTTAGAAGAATCCGTGT
CCGTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACTGGTAACTACTCTTGGGG
AAGTGAGGCTGTTACCCGCAAGACCAGAGTCCTTGATGTTGTCTACAATGCTTCCAACAA
CGAGCTTGTACGTACAAAGACTCTAGTCAAGAGTGCCATTGTTCAGGTGGATGCTGCTCC
TTTCAAGCAGTGGTATCTCCAGCACTATGGTGTCGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGAATGC
TGCTTCCGCTGCCAAGAAGGAAGCTGAGGATGGTGAAGAAGCAGCTCCAGCTGCTGCTGC
TGCTGCTGCTCCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGAAAGATTGAGAGCCG
TCAAGAGGGACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCGAGCGGTCGTTTGTT
GGCTTGCATCTCATCAA*GCCCGGCCAGTGCGGACGTGCTGATGGATACATT*CTGGAAG
GTAAAGAGCTGGAATTCTACCAGAAGAAGATCCAGAAGAAGA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2E636TF 605 0 0
G
CACCAAGTTGTCAAGCAACAAGACTGTTAGAAGAATCCGTGTCCGTGGAGGCAACGTCAA
GTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACTGGTAACTACTCTTGGGGAAGTGAGGCTGTTACCCG
CAAGACCAGAGTCCTTGATGTTGTCTACAATGCTTCCAACAACGAGCTTGTACGTACAAA
GACTCTAGTCAAGAGTGCCATTGTTCAGGTGGATGCTGCTCCTTTCAAGCAGTGGTATCT
CCAGCACTATGGTGTCGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGAATGCTGCTTCCGCTGCCAAGAA
GGAAGCTGAGGATGGTGAAGAAGCAGCTCCAGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGAGGA
GGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGAAAGATTGAGAGCCGTCAAGAGGGACGAAGTCT
TGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCGAGCGGTCGTTTGTTGGCTTGCATCTCATCAAG
GCCCGGCCAGTGCGGACGTGCTGATGGATACATT*CTGGAAGGTAAAGAGCTGGAATTCT
ACCAGAAGAAGATCCAGAAGAAGAA*GGGAAAGGGTGCTGCTTAAAAGCTTGTTCTTTTG
CCTG

QA 2 605 2 605
DS 

RD RR2E636JQ 454 0 0
AATGCTTCCAACAACGAGCTTGTACGTACAAAGACTCTAGTCAAGAGTGCCATTGTTCAG
GTGGATGCTGCTCCTTTCAAGCAGTGGTATCTCCAGCACTATGGTGTCGAGGTTGGTCGC
AAGAAGAAGAATGCTGCTTCCGCTGCCAAGAAGGAAGCTGAGGATGGTGAAGAAGCAGCT
CCAGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGA
AAGATTGAGAGCCGTCAAGAGGGACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCG
AGCGGTCGTTTGTTGGCTTGCATTTCATCAAGGCCCGGCCAGTGCGGACGTGCTGATGGA
TACATT*CTGGAAGGTAAAGAGCTGGAATTCTACCAGAAGAAGATCCAGAAGAAGAA*GG
GAAAGGGTGCTGCTTAAAAGCTTGTTTTTTTGCC

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR2FY31JQ 213 0 0
GAGAAAGATTGAGAGCCGTCAAGAGGGACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTT
TGCGAGCGGTGGTTTGTTGGCTTGCATTTCATCAAGGCCCGGCCAGTGCGGACGTGTTGA
TGGATACATT*TTGGAAGGTAAAGAGCTGGAATTTTACCAGAAGAAGATCCAGAAGAAGA
A*GGGAAAGGGTGCTGTTTAAAAGCTTGTT
TTT

QA 1 210 1 210
DS 

RD RR2BJ26TF 834 0 0
AACAGAGAAACTCTAAAGAGACAACCATGGGTATATCTCGTGACTCAATCCACAAGAGGC
GTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTACGAGATGGGAAGGC
AGCCAGCCAACACCAAGTTGTCAAGCAACAAGACTGTTAGAAGAATCCGTGTCCGTGGAG
GCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACTGGTAACTACTCTTGGGGAAGTGAGG
CTGTTACCCGCAAGACCAGAGTCCTTGATGTTGTCTACAATGCTTCCAACAACGAGCTTG
TACGTACAAAGACTCTAGTCAAGAGTGCCATTGTTCAGGTGGATGCTGCTCCTTTCAAGC
AGTGGTATCTCCAGCACTATGGTGTCGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGAATGCTGCTTCCG
CTGCCAAGAAGGAAGCTGAGGATGGTGAAGAAGCAGCTCCAGCTGCTGCTGCTGCTGCT*
**CCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGAAAGATTGAGAGCCGTCAAGAGG
GACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCGAGCGGTCGTTTGTTGGCTTGCA
TCTCATCAAGGCCCGGCCAGTGCGGACGTGCTGATGGATACATT*CTGGAAAGTAAAGAG
CTGGAATTCTACCAGAAGAAGATCCAGAAGAAGAAAGGGAAAGGGTGCTGCTTAAAAGCT
TATTCTTTTGCCTGAAACCTTTTTGTTTTCTTTATACATGCTGTTTTGAG*TTTCAGTTT
GTAATACTGTGTGAGA*CTTATGTTTTTGGATTAGCTTAATATCGTATTTCTTA

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR2CP57TF 403 0 0
G
CAAGAAGGAAGCTGAGGATGGTGAAGAAGCAGCTCCAGCTGCTGCTGCTGCTGCT***CC
TGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGAAAGATTGAGAGCCGTCAAGAGGGACG
AAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCGAGCGGTCGTTTGTTGGCTTGCATCTC
ATCAAGGCCCGGCCAGTGCGGACGTGCTGATGGATACATT*CTGGAAGGTAAAGAGCTGG
AATTCTACCAGAAGAAGATCCAGAAGAAGAA*GGGAAAGGGTGCTGCTTAAAAGCTTGTT
CTTTTGCCTGAAACCTTTTTGTTTTCTTTATACATGCT***TTGAGGTTTCAGTTTGTAA
TACTGTGTGAGAACTTATGTTTTTGGATTAGCTTGATATCGT

QA 2 403 2 403
DS 

RD RR2GY77JQ 820 0 0
AAGAGACAACCATGGGTATATCTCGTGACTCAATCCACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCA
AGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTACGAGATGGGAAGGCAGCCAGCCAACACCA
AGTTGTCAAGCAACAAGACTGTTAGAAGAATCCGTGTCCGTGGAGGCAACGTCAAGTGGC
GTGCGTTGAGGCTCGATACTGGTAACTACTCTTGGGGAAGTGAGGCTGTTACCCGCAAGA
CCAGAGTCCTTGATGTTGTCTACAATGCTTCCAACAACGAGCTTGTACGTACAAAGACTC
TAGTCAAGAGTGCCATTGTTCAGGTGGATGCTGCTCCTTTCAAGCAGTGGTATCTCCAGC
ACTATGGTGTCGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGAATGCTGCTTCCGCTGCCAAGAAGGAAG
CTGAGGATGGTGAAGAAGCAGCTCCAGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGAGGAGGTGA
AGAAGAGCAACCACGTGCTGAGAAAGATTGAGAGCGGTCAAGAGGGACGAAGTCTTGATT
CCCACATTGAGGACCAGTTTGCGAGCGGTCGTTTGTTGGCTTGCATCTCATCAAGGCCCG
GCCAGTGCGGACGTGCTGATGGATACATT*CTGGAAGGTAAAGAGCTTGAATTCTACCAG
AAGAAGATCCAGAAGAAGAA*GGGAAAGGGTGCTGCTTAAAAGCTTGTTCTTTTGCATGA
AACCTTTTTGTTTTCTTTATACATGCTGTTTTGAGGTTTCAGTTTGTAATACTGTGTGAG
AACTTATGTTTTTGGATTAGCTTGATATCGTATTTCTTAG

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR2EE76JQ 711 0 0
AGTTGTCAAGCAACAAGACTGTTAGAAGAATCCGTGTCCGTGGAGGCAACGTCAAGTGGC
GTGCGTTGAGGCTCGATACTGGTAACTACTCTTGGGGAAGTGAGGCTGTTACCCGCAAGA
CCAGAGTCCTTGATGTTGTCTACAATGCTTCCAACAACGAGCTTGTACGTACAAAGACTC
TAGTCAAGAGTGCCATTGTTCAGGTGGATGCTGCTCCTTTCAAGCAGTGGTATCTCCAGC
ACTATGGTGTCGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGAATGCTGCTTCCGCTGCCAAGAAGGAAG
CTGAGGATGGTGAAGAAGCAGCTCCAGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGAGGAGGTGA
AGAAGAGCAACCACGTGCTGAGAAAGATTGAGAGCCGTCAAGAGGGACGAAGTCTTGATT
CCCACATTGAGGACCAGTTTGCGAGCGGTCGTTTGTTGGCTTGCATCTCATCAAGGCCCG
GCCAGTGCGGACGTGCTGATGGATACATT*CTGGAAGGTAAAGAGCTGGAATTCTACCAG
AAGAAGATCCAGAAGAAGAA*GGGAAAGGGTGCTGCTTAAAAGCTTGTTCTTTTGCCTGA
AACCTTTTTGTTTTCTTTATACATGCTGTTTTGAGGTTTCAGTTTGTAATACTGTGTGAG
AACTTATGTTTTTGGATTAGCTTGATATCGTATTTCTTAGTACTTCCATCG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2GT05JQB 367 0 0
CC
GCTGCTGCTGCTCCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGAAAGATTGAGAGC
GGTCAAGAGGGACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCGAGCGGTCGTTTG
TTGGCTTGCATTTCATCAAGGCCCGGCCAGTGCGGACGTGCTGATGGATACATT*TTGGA
AGGTAAAGAGCTTGAATTCTACCAGAAGAAGATCCAGAAGAAGAA*GGGAAAGGGTGCTG
CTTAAAAGCTTGTTCTTTTGCATGAAACCTTTTTGTTTTCTTTATACATGCTGTTTTGAG
GTTTCAGTTTGTAATACTGTGTGAGAACTTATGTTTTTGGATTAGCTTGATATCGTATTT
TTTAG

QA 3 367 3 367
DS 



CO CL12Contig3 1014 7 10 U
GGACTCCTTGTCCCCTTATAATAGCTCTCTCTCTCTCTCTTCGTTCTTCCAACTCCTACC
GGCGCAGCTGAGAAGTTTATCTCGCGGAAGAGGCAACCATGGGTATCTCTCGTGACTCCA
TCCACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTACG
AGATGGGAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGTTGTCAAGCAACAAGACGGTGAGAAGAATCA
GAGTCCGTGGAGGTAACGTCAAGTGGCGCGCGTTGAGGCTCGACACCGGTAACTACTCGT
GGGGAAGTGAAGCGGTGACACGCAAGACCAGGGTTCTTGATGTTGTCTACAACGCTTCCA
ACAATGAGCTCGTCAGGACCAAGACTCTTGTAAAGAGTGCTATTGTTCAGGTCGATGCTG
CTCCTTTCAAGCAGTGGTACTTGCAGCATTACGGAGTTGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGA
GTGCTGCTTCTGTTGCCGCCAAGAAGGACGGAGAGGATGGTGAAGAAGCTGCTCCAGCTG
CTGCCGCTCCTGAGGAGACCAAGAAGAGTAACCACGTCTTGAGGAAGATCGAGAGCCGTC
AAGAGGGTCGCAGCCTTGATTCCCACATCGAGGATCAATTCGCTAGCGGACGTCTGTTGG
CTTGCATCTCATCTAGGCCTGGCCAGTGTGGACGTGCCGATGGATACATTCTGGAAGGCA
AAGAGCTAGAGTTCTACCAGAAGAAGATCCAGAAGAAGAAGGGAAAGGGTGCCGCTTAAA
AGCTACACTTCTTTACTTTCAAACTTTTTTTTTGTCTTATCATCAAACATGTTTTGAGTT
TCATTTTCAGTTTCTACTATTGTCTGAGAACCCGAGATGCTTTTGGATTAGCTTACAATG
ATATTTCATAAACTACCCCATCAGTTAATTATGCTCTACAATGTCTGTCTCTTATTTTTT
TGTTTAATTTTGACATCTTTCATATGAATATGATATTACGAACTATGCACCTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 15 
45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 15 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 30 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI90TF U 1
AF RR2A672TF U 14
AF RR2DW60TF U 1
AF RR2GI90JQB C 106
AF RR2A814JQ C 239
AF RR2A814TF U 239
AF RR2FP06JQ C 176
BS 1 195 RR2DW60TF
BS 196 196 RR2GI90TF
BS 197 284 RR2DW60TF
BS 285 286 RR2GI90TF
BS 287 620 RR2DW60TF
BS 621 622 RR2A814TF
BS 623 655 RR2DW60TF
BS 656 914 RR2A814TF
BS 915 934 RR2GI90JQB
BS 935 1014 RR2FP06JQ

RD RR2GI90TF 597 0 0
GGACTCCTTGTCCCCTTATAATAGCTCTCTCTCTCTCT**TCGTTCTTCCAACTCCTACC
GGCGCAGCTGAGAAGTTTATCTCGCGGAAGAGGCAACCATGGGTATCTCTCGTGACTCCA
TCCACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTACG
AGATGGGAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGTTGTCAAGCAACAAGACGGTGAGAAGAATCA
GAGTCCGTGGAGGTAACGTCAAGTGGCGCGCGTTGAGGCTCGACACCGGTAACTACTCGT
GGGGAAGTGAAGCGGTGACACGCAAGACCAGGGTTCTTGATGTTGTCTACAACGCTTCCA
ACAATGAGCTCGTCAGGACCAAGACTCTTGTAAAGAGTGCTATTGTTCAGGTCGATGCTG
CTCCTTTCAAGCAGTGGTACTTGCAGCATTACGGAGTTGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGA
GTGCTGCTTCTGTTGCCGCCAAGAAGGACGGAGAGGATGGTGAAGAAGCTGCTCCAGCTG
CTGCCGCTCCTGAGGAGACCAAGAAGAGTAACCACGTCTTGAGGAAGATCGAGAGCC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2A672TF 566 0 0
GGATATAATAGCT
CTCTCTCTCTCTCTTCGTTCTTCCAACTCCTACCGGCGCAGCTGAGAAGTTTATCTCGCG
GAAGAGGCAACCATGGGTATCTCTCGTGACTCCATCCACAAGAGACGTGCCACTGGAGGC
AAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTACGAGATGGGAAGGCAGCCAGCTAACACC
AAGTTGTCAAGCAACAAGACGGTGAGGAGAATCCGTGTTCGTGGAGGTAACGTCAAGTGG
CGCGCGTTGAGGCTCGACACCGGTAACTACTCGTGGGGAAGTGGAGCTGTGACACGCAAG
ACCAGGGTTCTTGATGTCGTCTACAACGCTTCCAACAACGAGCTCGTCAGGACCAAGACT
CTTGTGAAGAGTGCTATTGTTCAGGTCGATGCCGCTCCTTTCAAGCAGTGGTACTTGCAG
CACTACGGAGTTGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGAGTGCTGCTTCTGTCGCCGCCAAGAAG
GACGGAGAGGAAGGTGATGAAGCTGCTCCAGCTGCTACCGCTCCTGAGGAGACCAAGAAG
AGTAACCATGTCT

QA 14 566 14 566
DS 

RD RR2DW60TF 655 0 0
GGACTCCTTGTCCCCTTATAATAGCTCTCTCTCTCTCTCTTCGTTCTTCCAACTCCTACC
GGCGCAGCTGAGAAGTTTATCTCGCGGAAGAGGCAACCATGGGTATCTCTCGTGACTCCA
TCCACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTACG
AGATGGGAAGGCAGC*AGCCAACACCAAGTTGTCAAGCAACAAGACGGTGAGAAGAATCA
GAGTCCGTGGAGGTAACGTCAAGTGGCGCGCGTTGAGGCTCGAC**CGGTAACTACTCGT
GGGGAAGTGAAGCGGTGACACGCAAGACCAGGGTTCTTGATGTTGTCTACAACGCTTCCA
ACAATGAGCTCGTCAGGACCAAGACTCTTGTAAAGAGTGCTATTGTTCAGGTCGATGCTG
CTCCTTTCAAGCAGTGGTACTTGCAGCATTACGGAGTTGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGA
GTGCTGCTTCTGTTGCCGCCAAGAAGGACGGAGAGGATGGTGAAGAAGCTGCTCCAGCTG
CTGCCGCTCCTGAGGAGACCAAGAAGAGTAACCACGTCTTGAGGAAGATCGAGAGCCGTC
AAGAGGGTCGCAGCCTTGAT**CCACATCGAGGATCAATTCGCTAGCGGACGTCT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2GI90JQB 831 0 0
TCTCTCGTGACTCCATCCACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGA
AGAAGCGAAAGTACGAGATGGGAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGTTGTCAAGCAACAAGA
CGGTGAGAAGAATCAGAGTCCGTGGAGGTAACGTCAAGTGGCGCGCGTTGAGGCTCGACA
CCGGTAACTACTCGTGGGGAAGTGAAGCGGTGACACGCAAGACCAGGGTTCTTGATGTTG
TCTACAACGCTTCCAACAATGAGCTCGTCAGGACCAAGACTCTTGTAAAGAGTGCTATTG
TTCAGGTCGATGCTGCTCCTTTCAAGCAGTGGTACTTGCAGCATTACGGAGTTGAGGTTG
GTCGCAAGAAGAAGAGTGCTGCTTCTGTTGCCGCCAAGAAGGACGGAGAGGATGGTGAAG
AAGCTGCTCCAGCTGCTGCCGCTCCTGAGGAGACCAAGAAGAGTAACCACGTCTTGAGGA
AGATCGAGAGCCGTCAAGAGGGTCGCAGCCTTGATTCCCACATCGAGGATCAATTCGCTA
GCGGACGTCTGTTGGCTTGCATCTCATCTAGGCCTGGCCAGTGTGGACGTGCCGATGGAT
ACATTCTGGAAGGCAAAGAGCTAGAGTTCTACCAGAAGAAGATCCAGAAGAAGAAGGGAA
AGGGTGCCGCTTAAAAGCTACACTTCTTTACTTTCAAACTTTTTTTT*GTCTTATCATCA
AACATGTTTTGAGTTTCAGTTTCAGTTTCTACTATTGTCTGAGAACCCGAGATGCTTTTG
GATTAGCTTGCAATGATATTTCATAAACTACCCCATCAGTTAATTATGC
TT

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2A814JQ 676 0 0
G
AGAGTCCGTGGAGGTAACGTCAAGTGGCGCGCGTTGAGGCTCGACACCGGTAACTACTCG
TGGGGAAGTGAAGCGGTGACACGCAAGACCAGGGTCCTTGATGTTGTCTACAACGCTTCC
AACAATGAGCTCGTCAGGACCAAGACTCTTGTAAAGAGTGCTATTGTTCAGGTCGATGCT
GCTCCTTTCAAGCAGTGGTACTTGCAGCATTACGGAGTTGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAG
AGTGCTGCTTCTGTTGCCGCCAAGAAGGACGGAGAGGATGGTGAAGAAGCTGCTCCAGCT
GCTGCCGCTCTTGAGGAGACCAAGAAGAGTAACCACGTCTTGAGGAAGATCGAGAGCCGT
CAAGAGGGTCGCAGCCTTGATTCCCACATCGAGGATCAATTCGCTAGCGGACGTCTGTTG
GCTTGCATCTCATCTAGGCCTGGCCAGTGTGGACGTGCCGATGGATACATTCTGGAAGGC
AAAGAGCTAGAGTTCTACCAGAAGAAGATCCAGAAGAAGAAGGGAAAGGGTGCCGCTTAA
AAGCTACACTTCTTTACTTTCAAACTTTTTTTTTGTCTTATCATCAAACATGTTTTGAGT
TTCATTTTCAGTTTCTACTATTGTCTGAGAACCCGAGATGCTTTTGGATTAGCTTACAAT
GATATTTCATAAACT

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR2A814TF 676 0 0
G
AGAGTCCGTGGAGGTAACGTCAAGTGGCGCGCGTTGAGGCTCGACACCGGTAACTACTCG
TGGGGAAGTGAAGCGGTGACACGCAAGACCAGGGTCCTTGATGTTGTCTACAACGCTTCC
AACAATGAGCTCGTCAGGACCAAGACTCTTGTAAAGAGTGCTATTGTTCAGGTCGATGCT
GCTCCTTTCAAGCAGTGGTACTTGCAGCATTACGGAGTTGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAG
AGTGCTGCTTCTGTTGCCGCCAAGAAGGACGGAGAGGATGGTGAAGAAGCTGCTCCAGCT
GCTGCCGCTCTTGAGGAGACCAAGAAGAGTAACCACGTCTTGAGGAAGATCGAGAGCCGT
CAAGAGGGTCGCAGCCTTGATTCCCACATCGAGGATCAATTCGCTAGCGGACGTCTGTTG
GCTTGCATCTCATCTAGGCCTGGCCAGTGTGGACGTGCCGATGGATACATTCTGGAAGGC
AAAGAGCTAGAGTTCTACCAGAAGAAGATCCAGAAGAAGAAGGGAAAGGGTGCCGCTTAA
AAGCTACACTTCTTTACTTTCAAACTTTTTTTTTGTCTTATCATCAAACATGTTTTGAGT
TTCATTTTCAGTTTCTACTATTGTCTGAGAACCCGAGATGCTTTTGGATTAGCTTACAAT
GATATTTCATAAACT

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR2FP06JQ 839 0 0
GTACGAGATGGGAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGTTGTCAAGCAACAAGACGGTGAGAAG
AATCCGAGTCCGTGGAGGTAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGACACCGGTAACTA
CTCGTGGGGAAGTGAAGCTGTTACCCGCAAGACCAGGGTTCTCGATGTTGTCTACAACGC
TTCCAACAACGAGCTTGTCAGGACCAAGACCCTTGTGAAGAGTGCTATTGTTCAGGTCGA
TGCCGCCCCTTTCAAGCAGTGGTACTTGCAGCACTACGGAGTTGAGGTTGGTCGCAAGAA
GAAGAGTGCTGCTTCTGTCGCCGCCAAGAAGGACGGAGAGGACGGTGAGGAAGCTCCTCC
AGCTGCTGCTGCTCCTGAGGAGACCAAGAAGAGTAACCACGTCTTGAGGAAGATCGAGAG
CCGTCAAGAGGGACGCAGCCTTGATTCCCACATCGAGGATCAATTCGCTAGCGGACGTCT
GTTGGCTTGCATCTCATTTAGGCCAGGCCAGTGTGGACGTGCCGATGGATACATTCTGGA
AGGCAAAGAGCTAGAGTTCTACCAGAAGAAGATCCAGAAGAAGAAGGGAAAGGGTGCCGC
TTAAAAGCTACACTTCTTTACTTTCAAACTTTTTTTTTGTCTTATCATCAAACATGTTTT
GAGTTTCA******GTTTCTACTATTGTCTGAGAACCCGAGATGCTTTTGGATTAGCTTG
CAATGATATTTCATAAACTACCCCATCAGTTAATTATGCTCTACAATGTCTGTCTCTTAT
TTTTTTGTTTAATTTTGACATCTTTCATATGAATATGATATTACGAACTATGCACCTAC

QA 1 839 1 839
DS 



CO CL12Contig4 724 2 3 U
TTTTTTTGATGGAAGTACTAAGAAATACGATATCAAGCTTAATCCAAAAACACAAGTTCT
CACACAGTATTACAAACCGAAACCTCAAAACAGCATGTATAAAGAAAACAAAAAGGTTTC
AGGCAAAGAACAAGCTTTAAGCAGCACCCTTTCCCTTCTTCTTCTGGATCTTCTTCTGGT
AGAATTCCAACTCTTTACCTTCCAGAATGTATCCATCAGCACGTCCGCACTGGCCGGGCC
TTGATGAAATGCAAGCCAACAAACGACCGCTCGCAAACTGGTCCTCAATGTGGGAATCAA
GACTTCGTCCCTCTCGACGGCTCTCAATCTTTCTCAGCACGTGGTTGCTCTTCTTCACCT
CCTCAGGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTGCTTCTTCACCATCCTCTGCTTCCTTCT
TGGCAGCGGAAGCAGCATTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCGACACCATAGTGCTGGAGAT
ACCACTGCTTGAATGGAGCAGCATCCACCTGAACAATAGCACTCTTGACTAGCGTCTTTG
TACGGACAAGCTCGTTGTTGGAGGCGTTGTAAACAACATCAAGAACTCTGGTCTTGCGGG
TAACTGCCTCACTTCCCCAAGAGTAGTTACCAGTATCGAGCCTCAACGCATGCCACTTGA
CGTTGCCTCCACGAACACGGATTCTTCTGACCGTCTTGTTGCTGGACAACTTGGTGTTCG
CTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2FT33JQ U 8
AF RR2FT33TF C 1
BS 1 7 RR2FT33TF
BS 8 659 RR2FT33JQ
BS 660 724 RR2FT33TF

RD RR2FT33JQ 652 0 0
GATGGAAGTACTAAGAAATACGATATCAAGCTTAATCCAAAAACACAAGTTCTCACACAG
TATTACAAACCGAAACCTCAAAACAGCATGTATAAAGAAAACAAAAAGGTTTCAGGCAAA
GAACAAGCTTTAAGCAGCACCCTTTCCCTTCTTCTTCTGGATCTTCTTCTGGTAGAATTC
CAACTCTTTACCTTCCAGAATGTATCCATCAGCACGTCCGCACTGGCCGGGCCTTGATGA
AATGCAAGCCAACAAACGACCGCTCGCAAACTGGTCCTCAATGTGGGAATCAAGACTTCG
TCCCTCTCGACGGCTCTCAATCTTTCTCAGCACGTGGTTGCTCTTCTTCACCTCCTCAGG
AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTGCTTCTTCACCATCCTCTGCTTCCTTCTTGGCAGC
GGAAGCAGCATTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCGACACCATAGTGCTGGAGATACCACTG
CTTGAATGGAGCAGCATCCACCTGAACAATAGCACTCTTGACTAGCGTCTTTGTACGGAC
AAGCTCGTTGTTGGAGGCGTTGTAAACAACATCAAGAACTCTGGTCTTGCGGGTAACTGC
CTCACTTCCCCAAGAGTAGTTACCAGTATCGAGCCTCAACGCATGCCACTTG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2FT33TF 724 0 0
TTTTTTTGATGGAAGTACTAAGAAATACGATATCAAGCTTAATCCAAAAACACAAGTTCT
CACACAGTATTACAAACCGAAACCTCAAAACAGCATGTATAAAGAAAACAAAAAGGTTTC
AGGCAAAGAACAAGCTTTAAGCAGCACCCTTTCCCTTCTTCTTCTGGATCTTCTTCTGGT
AGAATTCCAACTCTTTACCTTCCAGAATGTATCCATCAGCACGTCCGCACTGGCCGGGCC
TTGATGAGATGCAAGCCAACAAACGACCGCTCGCAAACTGGTCCTCAATGTGGGAATCAA
GACTTCGTCCCTCTCGACGGCTCTCAATCTTTCTCAGCACGTGGTTGCTCTTCTTCACCT
CCTCAGGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTGCTTCTTCACCATCCTCTGCTTCCTTCT
TGGCAGCGGAAGCAGCATTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCGACACCATAGTGCTGGAGAT
ACCACTGCTTGAATGGAGCAGCATCCACCTGAACAATAGCACTCTTGACTAGCGTCTTTG
TACGGACAAGCTCGTTGTTGGAGGCGTTGTAAACAACATCAAGAACTCTGGTCTTGCGGG
TAACTGCCTCACTTCCCCAAGAGTAGTTACCAGTATCGAGCCTCAACGCATGCCACTTGA
CGTTGCCTCCACGAACACGGATTCTTCTGACCGTCTTGTTGCTGGACAACTTGGTGTTCG
CTGC

QA 1 724 1 724
DS 



CO CL12Contig5 873 6 11 U
AACTGATGGGGTAGTTTATGAAATATCATTGCAAGCTAATCCAAAAGCATCACGGGTTCT
CAGACAATAGTAGAAACTGAAACTCAAAACATGTTTGATGATAAGACAAAAAAAA*GTTT
GAAAGTAAAAAAGTGAGGCTTTTAAGCGGCACCCTTTCCCTTCTTCT*CTGGATCTTCTT
CTGGTAGAACTCTAGCTCTTTGCCTTCCAGAATGTATCCATCGGCACGTCCACACTGGCC
TGGCCTAGATGAGATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATTGATCCTCGATGTGGCA
ATCAAGGCTGCGTCCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAGACGTGGTTACTCTTCTT
GGTCTCCTCAGGAGCAGCAGCAGCAGCTGGAGCAGCTTCATCACCTTCCTCTCCGTCCTT
CTTGGCGGCAGCAACAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACTCCGTAATGCTGCAA
GTACCACTGCTTGAAAGGAGCAGCATCCACCTGAACAATAGCACTCTTCACAAGGGTCTT
TGTACGCGCAAGCTCGTTGTTGGGGGCGTTGTAGACAACATCAAGAACCCTGGTCTTGCG
TGTCACTGCTTCACTTCCCCACGAGTAGTTACCGGTGTCGAGCCTCAACGCGCGCCACTT
GACGTTACCTCCACGGACTCTGATTCTCCTCACCGTCTTGTTGCTTGACAGCTTGGTGTT
GGCTGGCTGCCTTCCCATCTCGTACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCC
AGTGGCACGCCTCTTGTGGATGGAGTCACGAGAGATACCCATGGTTGCCTCTTCCGCGAG
ATAAACTTGTCAGCTGCGCCGGTAGGAGTTGCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 10 10 10 15 15 30 30 30 30 30 30 20 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 10 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 10 10 

AF RR2DB38JQ U 2
AF RR2H139JQ U 1
AF RR2C671JQ U 33
AF RR2DB38TF C 61
AF RR2H139TF C 172
AF RR2C671TF C 361
BS 1 167 RR2H139JQ
BS 168 168 RR2DB38JQ
BS 169 460 RR2H139JQ
BS 461 461 RR2DB38JQ
BS 462 697 RR2H139JQ
BS 698 816 RR2C671JQ
BS 817 844 RR2DB38TF
BS 845 845 RR2H139TF
BS 846 870 RR2DB38TF
BS 871 871 RR2H139TF
BS 872 873 RR2C671TF

RD RR2DB38JQ 621 0 0
G
CTGATGGGGTAGTTTATGAAATATCATTGCAAGCTAATCCAAAAGCATCACGGGTTCTCA
GACAATAGTAGAAACTGAAACTCAAAACATGTTTGATGATAAGACAAAAAAAA*GTTTGA
AAGTAAAAAAGTGAGGCTTTTAAGCGGCACCCTTTCCCTTCTTCT***GGATCTTCTTCT
GGTAGAACTCTAGCTCTTTGCCTTCCAGAATGTATCCATCGGCACGTCCACACTGGCCTG
GCCTAAATGAAATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATTGATCCTCGATGTGGGAAT
CAAGGCTGCGTCCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAGACGTGGTTACTCTTCTTGG
TCTCCTCAGGAGCAGCAGCAGCAGCTGGAGCAGCTTCATCACCTTCCTCTCCGTCCTTCT
TGGCGGCAGCAACAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACTCCGTAATGCTGCAAGT
ACCACTGCTTGAAAGGAGCAGCATCCACCTGAACAACAGCACTCTTCACAAGGGTCTTTG
TACGCACAAGCTCGTTGTTGGAGGCGTTGTAGACAACATCAAGAACCCTGGTCTTGCGTG
TCACTGCTTCACTTCCCCAC

QA 2 621 2 621
DS 

RD RR2H139JQ 697 0 0
AACTGATGGGGTAGTTTATGAAATATCATTGCAAGCTAATCCAAAAGCATCACGGGTTCT
CAGACAATAGTAGAAACTGAAACTCAAAACATGTTTGATGATAAGACAAAAAAAA*GTTT
GAAAGTAAAAAAGTGAGGCTTTTAAGCGGCACCCTTTCCCTTCTTCTTCTGGATCTTCTT
CTGGTAGAACTCTAGCTCTTTGCCTTCCAGAATGTATCCATCGGCACGTCCACACTGGCC
TGGCCTAGATGAGATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATTGATCCTCGATGTGGCA
ATCAAGGCTGCGTCCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAGACGTGGTTACTCTTCTT
GGTCTCCTCAGGAGCAGCAGCAGCAGCTGGAGCAGCTTCATCACCTTCCTCTCCGTCCTT
CTTGGCGGCAGCAACAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCCCAACTCCGTAATGCTGCAA
GTACCACTGCTTGAAAGGAGCAGCATCCACCTGAACAATAGCACTCTTCACAAGGGTCTT
TGTACGCGCAAGCTCGTTGTTGGGGGCGTTGTAGACAACATCAAGAACCCTGGTCTTGCG
TGTCACTGCTTCACTTCCCCACGAGTAGTTACCGGTGTCGAGCCTCAACGCGCGCCACTT
GACGTTACCTCCACGGACTCTGATTCTCCTCACCGTC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2C671JQ 784 0 0
AAGCTAATCCAAAAGCATCACGGGTTCTCAGACAATAGTAGAAACTGAAACTCAAAACAT
GTTTGATGATAAGACAAAAAAAAAGTTTGAAAGTAAAAAAGTGAGGCTTTTAAGCGGCAC
CCTTTCCCTTCTTCTTCTGGATCTTCTTCTGGTAGAACTCTAGCTCTTTGCCTTCCAGAA
TGTATCCATCGGCACGTCCACACTGGCCTGGCCTAAATGAGATGCAAGCCAACAGACGTC
CGCTAGCGAATTGATCCTCGATGTGGCAATCAAGGCTGCGTCCCTCTTGACGGCTCTCGA
TCTTCCTCAAGACGTGGTTACTCTTCTTGGTCTCCTCAGGAGCAGCAGCAGCAGCTGGAG
CAGCTTCATCACCTTCCTCTCCGTCCTTCTTGGCGGCAGCAACAGCACTCTTCTTCTTGC
GACCAACCTCAACTCCGTAATGCTGCAAGTACCACTGCTTGAAAGGAGCAGCATCCACCT
GAACAATAGCACTCTTCACAAGGGTCTTTGTACGCGCAAGCTCGTTGTTGGGGGCGTTGT
AGACAACATCAAGAACCCTGGTCTTGCGTGTCACTGCTTCACTTCCCCACGAGTAGTTAC
CGGTGTCGAGCCTCAACGCGCGCCACTTGACGTTACCTCCACGGACTCTGATTCTCCTCA
CCGTCTTGTTGCTTGACAGCTTGGTGTTGGCTGGCTGCCTTCCCATCTCGTACTTTCGCT
TCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCCAGTGGCACGCCTCTTGTGGATGGAGTCACGAG
AGAT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2DB38TF 812 0 0
CAGACAATAGTAGAAACTGAAACTCAAA*CATGTTTGATGATA*GACAAAAAAAG***TT
GAAAGTAAAAA*GTGAGGCTTT*AAGCGGCACCTTT**CCTTCT****CTGGATCT*CTT
CTG*TAGAACTCTAGCTCTTTGC*TTCCAGAATGTATCCATCGGCACGTCCACACTGGCC
TGGC*TAGATGAGATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATTGATCCTCGATGTGGGA
ATCAAGGCTGCGTCCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAGACGTGGTTACTCTTCTT
GGTCTCCTCAGGAGCAGCAGCAGCAGCTGGAGCAGCTTCATCACCTTCCTCTCCGTCCTT
CTTGGCGGCAGCAACAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACTCCGTAATGCTGCAA
GTACCACTGCTTGAAAGGAGCAGCATCCACCTGAACAACAGCACTCTTCACAAGGGTCTT
TGTACGCACAAGCTCGTTGTTGGAGGCGTTGTAGACAACATCAAGAACCCTGGTCTTGCG
TGTCACTGCTTCACTTCCCCACGAGTAGTTACCGGTGTCGAGCCTCAACGCGCGCCACTT
GACGTTACCTCCACGGACTCTGATTCTCCTCACCGTCTTGTTGCTTGACAGCTTGGTGTT
GGCTGGATGCCTTCCCATCTCGTACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCC
AGTGGCACGCCTCTTGTGGATGGAGTCACGAGAGATACCCATGGTTGCCTCTTCCGCGAG
ATAA*CTTGTCAGCTGCGCCGGTAGGAGTT
CC

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR2H139TF 702 0 0
GGATC
TCTTCTGGTAGAACTCTAGCTCTTTGC*TTCCAGAATGTATCCATCGGCACGTCCACACT
GGCCTGGCCTAGATGAGATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATTGATCCTCGATGT
GGCAATCAAGGCTGCGTCCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAGACGTGGTTACTCT
TCTTGGTCTCCTCAGGAGCAGCAGCAGCAGCTGGAGCAGCTTCATCACCTTCCTCTCCGT
CCTTCTTGGCGGCAGCAACAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCCCAACTCCGTAATGCT
GCAAGTACCACTGCTTGAAAGGAGCAGCATCCACCTGAACAATAGCACTCTTCACAAGGG
TCTTTGTACGCGCAAGCTCGTTGTTGGGGGCGTTGTAGACAACATCAAGAACCCTGGTCT
TGCGTGTCACTGCTTCACTTCCCCACGAGTAGTTACCGGTGTCGAGCCTCAACGCGCGCC
ACTTGACGTTACCTCCACGGACTCTGATTCTCCTCACCGTCTTGTTGCTTGACAGCTTGG
TGTTGGCTGGCTGCCTTCCCATCTCGTACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGC
CTCCAGTGGCACGCCTCTTGTGGATGGAGTCACGAGAGATACCCATGGTTGCCTCTTCCG
CGAGATAAACTTGTCAGCTGCGCCGGTAGGAGTTG
CC

QA 6 700 6 700
DS 

RD RR2C671TF 513 0 0
GGTCTCCTCAGGAGCAGCAGCAGCAGCTGGAGCAGCTTCATCACCTTCCTCTCCGTCCTT
CTTGGCGGCAGCAACAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACTCCGTAATGCTGCAA
GTACCACTGCTTGAAAGGAGCAGCATCCACCTGAACAATAGCACTCTTCACAAGGGTCTT
TGTACGCGCAAGCTCGTTGTTGGGGGCGTTGTAGACAACATCAAGAACCCTGGTCTTGCG
TGTCACTGCTTCACTTCCCCACGAGTAGTTACCGGTGTCGAGCCTCAACGCGCGCCACTT
GACGTTACCTCCACGGACTCTGATTCTCCTCACCGTCTTGTTGCTTGACAGCTTGGTGTT
GGCTGGCTGCCTTCCCATCTCGTACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCC
AGTGGCACGCCTCATGTGGATGGAGTCACGAGAGATACCCATGGTTGCCTCTTCCGCGAG
ATAAACTTGTCAGCTGCGCCGGTAGGAGTTGCC

QA 1 513 1 513
DS 



AS 6 31

CO CL13Contig1 849 13 8 U
GGAGGCGTCGCGCATCTCTCTGTCTATCTCTCTCTCCCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTG
AAGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGA
TGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCA
AGCTCGGAGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGT
ACAAGAACATCAGTTTCACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGT
GGAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGACAGCAATGACAGAG
ACCGTGTTGTTGAGGCTAGGGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTG
ATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTG
AGATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCA
CATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCG
CCGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAAATCTGGATG
CAGGGGCAAACATTATCTGATTTTTTCTTCTTTATTGTTCTCTCCTTTTTTTT*GTTTCG
GGTATGTGGATTTGATTTTGTGATCGTTGTTCTTATTTGTGCAAGGAGGAGTCTCTTGCA
CGTAAAACATAGAAACTACCTTTTTATATAGTTTGTAATCGAAGATTTATACTCTACTTC
TTTCTGCTT


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 40 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 55 55 55 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 
70 10 70 70 70 70 55 55 70 70 70 70 70 55 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
65 65 65 45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 10 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 45 45 60 60 45 45 0 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 40 55 5 55 55 55 55 5 55 55 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 30 30 30 30 30 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2E844TF U 9
AF RR2DO07TF U 1
AF RR2C693TF U 258
AF RR2CV77TF U 1
AF RR2B216TF U 1
AF RR2AZ19TFB U 18
AF RR2E844JQ C 9
AF RR2DO07JQ C 294
AF RR2BR05TF U 419
AF RR2DK34JQ C 212
AF RR2B216JQ C 2
AF RR2AZ19JQ C 19
AF RR2CV77JQ C 69
BS 1 671 RR2B216TF
BS 672 672 RR2AZ19TFB
BS 673 761 RR2B216TF
BS 762 762 RR2BR05TF
BS 763 763 RR2B216JQ
BS 764 839 RR2BR05TF
BS 840 847 RR2B216JQ
BS 848 849 RR2AZ19JQ

RD RR2E844TF 330 0 0
CGCGCATCTCTCTGTCTATCTCTCTCTCCCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTGAAGCAAGG
ATGGGTTTGTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATT
CTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAGGCTCAAGCTCGGA
GAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAAC
ATCAGTTTCACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCAT
TACTTCCA*AACACTCAAGGACTCATCTTT

QA 1 330 1 330
DS 

RD RR2DO07TF 600 0 0
G
GAGGCGTCGCGCATCTCTCTGTCTATCTCTCTCTCCCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTGA
AGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGAT
GAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAA
GCTCGGAGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTA
CAAGAACATCAGTTTCACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTG
GAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGACAGCAATGACAGAGA
CCGTGTTGTTGAGGCTAGGGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGA
TGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGA
GATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCAC
ATGTGCCACTTC*GGCGAGGGGCTTTACGAAAGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCG

QA 2 600 2 600
DS 

RD RR2C693TF 346 0 0
ACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCATTACTTCCAG
AACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGACAGCAATGACAGATACCGTGTTGTTGAGGCT
AGGGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTGCTCGTG
TTTGCTAACAATCAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATCACTGATAAGCTT
GGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCATAGCACATGTGCCACTTCAGGC
GAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCG

QA 1 346 1 346
DS 

RD RR2CV77TF 705 0 0
G
GAGGCGTCGCGCATCTCTCTGTCTATCTCTCTCTCCCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTGA
AGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGAT
GAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAA
GCTCGGAGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTA
CAAGAACATCAGTTTCACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTG
GAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGACAGCAATGACAGAGA
CCGTGTTGTTGAGGCTAGGGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGA
TGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGA
GATCACTGATAAGTTTGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCAC
ATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGC
CGGCAAGGCGTAGAGGAGTAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAAATCTGGATGC
AGGGCAAACT*TTATCTGATTTTT*CTTCTTTATTGT
CTCTCCT

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR2B216TF 761 0 0
GGAGGCGTCGCGCATCTCTCTGTCTATCTCTCTCTCCCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTG
AAGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGA
TGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCA
AGCTCGGAGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGT
ACAAGAACATCAGTTTCACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGT
GGAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGACAGCAATGACAGAG
ACCGTGTTGTTGAGGCTAGGGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTG
ATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTG
AGATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCA
CATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCG
CCGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAAATCTGGATG
CAGGGGCAAAC*TTATCTGATTTTTTCTTCTTTATTGTTCTCTCCTTTTTTTT*GTTTCG
GGTATGTGGATTTGATTTTGTGATCGTTGTTCTTATTTGTG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2AZ19TFB 744 0 0
GGCGTCGCGCA
TCTCTCTCTCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTGAAGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGGGAA
GCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGC
GGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGAGAGATTGTCACCACCATTCC
CACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAACATCAGTTTCACAGTGTGGGA
TGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGG
ACTCATCTTTGTGGTGGATAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAGATGAATT
GCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAA
ACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATCACTGATAAGCCTGGTCTCCACTC
TCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACTTGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTA
CGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTG
GTTGAGTTGATTTTGCCGCGCAAATCTGGATGCAGGGGCAAACATTATCTGATTTTTTCT
TCTTTATTGTTCTCTCCTTTTTTT**GTTTCGGGTATGTGGATTTGATTTTGTGATCGTT
ATTCTGATTTTTG

QA 12 744 12 744
DS 

RD RR2E844JQ 826 0 0
CGCGCATCTCTCTGTCTATCTCTCTCTCCCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTGAAGCAAGG
ATGGGTTTGTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATT
CTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAGGCTCAAGCTCGGA
GAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAAC
ATCAGTTTCACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCAT
TACTTCCAGAACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGACAGCAATGACAGAGACCGTGTT
GTTGAGGCTAGGGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTT
CTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATCACT
GATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCC
ACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGCAAG
GCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAAATCTGGATGCAGGGGCA
AACTTTATCTGATTTTTTCTTCTTTATTGTTCTCTCCTTTTTTTTTGTTTCGGGTATGTG
GATTTGATCTTGTGATCGTTGTTCTTATTTGTGCAAGGAGGAGTCTCTTGCACGTAAAAC
ATAGAAACTACCTTTTTATATAGTTTGTAATCGAAGATTTATACTC

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2DO07JQ 542 0 0
CCCTTGTGGAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGACAGCAAT
GACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGGGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAG
CTGCGTGATGCTGTTTTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATTTTCCAAATGCCATGAAC
GCAGCTGAGATCACTGATAAGCTTGGTTTCCACTTTTTCCGTCAGGGTCACTGGTACATC
CAGAGCACATGTGCCACTTCAGGGGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAAC
AACATCGCCGGCAAGGGGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAAAT
TTGGATGCAGGGGCAAACTTTATTTGATTTTTTTTTCTTTATTGTTCTCTCCTTTTTTTT
TGTTTCGGGTATGTGGATTTGATTTTGTGATCGTTGTTTTTATTTGTGCAAGGAGGAGTT
TTTTGCACGTAAAACATAGAAACTACCTTTTTATATAGTTTGTAATCGAAGATTTATACT
TT

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2BR05TF 421 0 0
TGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGC
TGAGATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCCCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAG
CACCTGTGCTACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACAT
CGCCGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGCGCAAATCTGGA
TGCAGGGGCAAACATTATCTGATTTTTTCTTCTTTATTGTTCTCTCCTTTTTTTTTGTTT
CGGGTATGTGGATTTGATTTTGTGATCGTTGTTCTGATTTTTGCGAGGAGGAGTCTCTTG
CACGTAAAACATAGAAACTACCTTTTTATATAGTTTGTAATCGAAGATTTATACTCTACT
T

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR2DK34JQ 624 0 0
TATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAACATCAGTTTCACAGTGTGGGATGT
CGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGGACT
CATCTTTGTGGTGGATAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAGATGAATTGCA
CAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACA
GGATCTTCCAAAGGCCATGAACGCAGCTGAGATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCT
CCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACCTGTGTCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGA
AGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGACAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTT
GAGTTGATTTTGCTGCGCAAATCTGGATGCAGGGGCAAACATTATCTGATTTTTTCTTCT
TTATTGTCCTCTCCTTTTTTTT*GTTTCGGGTATGTGGATTTGATTTTGTGATCGTTGTT
CTGATTTTTGCGAGGAGGAGTCTCTTGCACGTAAAACATAGAAACTACCTTTTTATATAG
TTTGTAATCGAAGATTTATACTC
C

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2B216JQ 846 0 0
GAGGCGTCGCGCATCTCTCTGTCTATCTCTCTCTCCCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTGA
AGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGAT
GAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAA
GCTCGGAGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTA
CAAGAACATCAGTTTCACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTG
GAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGACAGCAATGACAGAGA
CCGTGTTGTTGAGGCTAGGGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGA
TGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGA
GATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCAC
ATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGC
CGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAAATCTGGATGC
AGGGGCAAAC*TTATCTGATTTTTTCTTCTTTATTGTTCTCTCCTTTTTTTT*GTTTCGG
GTATGTGGATTTGATTTTGTGATCGTTGTTCTTATTTGTGCAAGGAGGAGTCTCTTGCAC
GTAAAACATAGAAACTACCTTTTTATATAGTTTGTAATCGAAGATTTATACTCTACTTCT
TTCTGC

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR2AZ19JQ 831 0 0
GCGTCGCGCA
TCTCTCTCTCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTGAAGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGGGAA
GCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGC
GGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGAGAGATTGTCACCACCATTCC
CACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAACATCAGTTTCACAGTGTGGGA
TGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGG
ACTCATCTTTGTGGTGGATAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAGATGAATT
GCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAA
ACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATCACTGATAAGCCTGGTCTCCACTC
TCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACTTGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTA
CGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTG
GTTGAGTTGATTTTGCCGCGCAAATCTGGATGCAGGGGCAAACATTATCTGATTTTTTCT
TCTTTATTGTTCTCTCCTTTTTTT**GTTTCGGGTATGTGGATTTGATTTTGTGATCGTT
ATTCTGATTTTTGCGAGGAGGAGTCTCTTGCACGTAAAACATAGAAACTACCTTTTTATA
TAGTTTGTAATCGAAGATTTATACTCTACTTCTTTCTGCTT

QA 11 831 11 831
DS 

RD RR2CV77JQ 781 0 0
ATGGGTTTGTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATT
CTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGA
GAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAAC
ATCAGTTTCACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCAT
TACTTCCAGAACACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGACAGCAATGACAGAGACCGTGTT
GTTGAGGCTAGGGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTT
CTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATCACT
GATAAGTTTGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCC
ACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGCAAG
GCGTAGAGGAGTAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAAATCTGGATGCAGGGGCA
AACTTTATCTGATTTTTTCTTCTTTATTGTTCTCTCCTTTTTTTTTGTTTCGGGTATGTG
GATTTGATTTTGTGATCGTTGTTCTTATTTGTGCAAGGAGGAGTCTCTTGCACGTAAAAC
ATAGAAACTACCTTTTTATATAGTTTGTAATCGAAGATTTATACTCTACTTCTTTCTGC
CC

QA 1 779 1 779
DS 



CO CL13Contig2 784 2 7 U
GGGAAGCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCGTTCAAACTCCGTCTCGTTGTTACGCCATCT
CTCAATCGATCAGATCATCTACACAGAGTGAAAGCAAGGATGGGATTGTCGTTCGCGAAG
CTATTTAGCAGGCTTTTTGCAAAGAAGGAGATGAGGATCCTCATGGTTGGTCTTGATGCT
GCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGATCGTCACCACCATCCCC
ACTATTGGGTTCAACGTTGAGACTGTGGAGTACAAGAACATCAGCTTCACTGTCTGGGAT
GTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCATTGTGGAGGCACTACCTCCAGAACACTCAAGGT
CTCATCTTTGTGGTGGACAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAGATGAATTG
CACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCGGTTTTGCTCGTGTTTGCTAACAAG
CAGGATCTTCCAAATGCTATGAACGCAGCTGAAATCACTGATAAGCTTGGTCTTCACTCT
CTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTCCAGGCGAGGGGCTTTAC
GAAGGTCTTGACTGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGCGTAGAGAGAAAGTTTGTGG
TTGAGTTGATTTTGCTCTGGATGGAGGGGCAAAACATTATCTGAGTTTTTTTTCGGTTTT
CTTATATTGTTTTTTTTTTTTTCGGGTATGTGAATTGATTTTGTGATCGTTGTTATAACT
TGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2BN04TF U 4
AF RR2BB76TF U 1
BS 1 120 RR2BB76TF
BS 121 121 RR2BN04TF
BS 122 224 RR2BB76TF
BS 225 225 RR2BN04TF
BS 226 582 RR2BB76TF
BS 583 583 RR2BN04TF
BS 584 784 RR2BB76TF

RD RR2BN04TF 663 0 0
GGGAAGCTTTCT
TCTCTCTCTCTCTCGTTCAAACTCCGTCTCGTTGTTACGCCATCTCTCAATCGATCAGAT
CATCTACACAGAGTGAA*GCAAGGATGGGATTGTCGTTCGCGAAGCTATTTAGCAGGCTT
TTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTCATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACC
ATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGATCGTCACCACCATCCCCACTATTGGGTTCAAT
GTTGAGACTGTGGAGTACAAGAACATCAGCTTCACTGTCTGGGATGTCGGGGGTCAAGAC
AAGATTCGTCCATTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAAGGTCTCATCTTTGTGGTG
GACAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAGATGAATTGCACAGAATGCTCAAT
GAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTTTGCTCGTGTTTGCTAACAAGCAGGATCTTCCAAAT
GCTATGAACGCAGCTGAAATCACTGATAAGCTTGGTCTTCACTCTCTCCGTCAGCGTCAC
TGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTCCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGG
CTGTCCA*CAACATTGCCGGCA*GGCGTAGAGAGGAAGTTTGTGGTTGAGT

QA 13 663 13 663
DS 

RD RR2BB76TF 784 0 0
GGGAAGCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCGTTCAAACTCCGTCTCGTTGTTACGCCATCT
CTCAATCGATCAGATCATCTACACAGAGTGAAAGCAAGGATGGGATTGTCGTTCGCGAAG
TTATTTAGCAGGCTTTTTGCAAAGAAGGAGATGAGGATCCTCATGGTTGGTCTTGATGCT
GCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCC
ACTATTGGGTTCAACGTTGAGACTGTGGAGTACAAGAACATCAGCTTCACTGTCTGGGAT
GTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCATTGTGGAGGCACTACCTCCAGAACACTCAAGGT
CTCATCTTTGTGGTGGACAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAGATGAATTG
CACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCGGTTTTGCTCGTGTTTGCTAACAAG
CAGGATCTTCCAAATGCTATGAACGCAGCTGAAATCACTGATAAGCTTGGTCTTCACTCT
CTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTAC
GAAGGTCTTGACTGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGCGTAGAGAGAAAGTTTGTGG
TTGAGTTGATTTTGCTCTGGATGGAGGGGCAAAACATTATCTGAGTTTTTTTTCGGTTTT
CTTATATTGTTTTTTTTTTTTTCGGGTATGTGAATTGATTTTGTGATCGTTGTTATAACT
TGAG

QA 1 784 1 784
DS 



CO CL13Contig3 955 6 11 U
GGGTTATAAAAAAAACAACCATCCCGCTAATCACACCCCCTCTCTATTCATCGTCGTCGC
GCATTTAGCGTTTCTCTTAAGCAGAGCTCAGTTTCTCTCCAGAGTTTAAAAAGCAGAAAA
GAGATGGGGTTGAGTTTCGCGAAGCTGTTCAGCAGGCTCTTTGCCAAGAAGGAGATGAGG
ATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACCATTCTCTACAAGCTCAAGCTC
GGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAG
AACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTCCTTTGTGGAGG
CACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTCATCTTTGTTGTTGACAGCAACGACAGAGACAGA
GTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTTCACAGGATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCT
GTGTTGCTTGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCAAATGCCATGAATGCAGCTGAAATC
ACAGATAAGCTTGGCCTTCACTCTCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTCAGAGCACATGT
GCCACCTCAGGTGAAGGACTTTACGAAGGTCTTGACTGGCTGTCCAACAACATCGCTGGC
AAGGCGTAATGAAGTAAAAACAGCATTGCATCGAGAGATGATTCTTCCTGCTGTGTGTTG
GTAAAGTTTCTGGATGCAAGAGAGAGATTATAAATATTATATAAACCTTTTTTGCTACTG
GCTTTATGAATGTTCTGAGATTGTGCAAGTA***GATTTGTACCTAAAAGCTTACTAGTA
CGAGCCCCTTTTAAATAGTTTTCGTGTTGTTATCACCTGGATTGATGATTGAATGTTATT
GTTTTCTTGTTATCGCCTATTTTCATTTGCAACATAATAAGATAAAGTTTTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 15 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 20 35 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D310TF U 1
AF RR2GQ61TF U 49
AF RR2FB45TF U 44
AF RR2D310JQ C 191
AF RR2EQ47TF U 508
AF RR2FI17JQ C 349
BS 1 378 RR2D310TF
BS 379 772 RR2FB45TF
BS 773 773 RR2EQ47TF
BS 774 789 RR2FB45TF
BS 790 790 RR2GQ61TF
BS 791 801 RR2FB45TF
BS 802 802 RR2EQ47TF
BS 803 847 RR2FB45TF
BS 848 910 RR2EQ47TF
BS 911 935 RR2D310JQ
BS 936 955 RR2FI17JQ

RD RR2D310TF 378 0 0
GGGTTATAAAAAAAACAACCATCCCGCTAATCACACCCCCTCTCTATTCATCGTCGTCGC
GCATTTAGCGTTTCTCTTAAGCAGAGCTCAGTTTCTCTCCAGAGTTTAAAAAGCAGAAAA
GAGATGGGGTTGAGTTTCGCGAAGCTGTTCAGCAGGCTCTTTGCCAAGAAGGAGATGAGG
ATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACCATTCTCTACAAGCTCAAGCTC
GGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAG
AACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTCCTTTGTGGAGG
CACTACTTCCAGAACACT

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR2GQ61TF 775 0 0
GAT
CGTCGTCGCGCATTTAGCGTTTCTCTTAAGCAGAGCTCAGTTTCTCTCCAGAGTTTAAAA
AGCAGAAAAGAGATGGGGTTGAGTTTCGCGAAGCTGTTCAGCAGGCTCTTTGCCAAGAAG
GAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACCATTCTCTACAAG
CTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTG
GAGTACAAGAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTCCT
TTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGACTGATCTTTGTCGTCGACAGCAACGAC
AGAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTTCACAGGATGCTCAATGAGGATGAGCTG
CGTGATGCTGTGTTGCTTGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCAAACGCCATGAATGCC
GCTGAAATCACGGATAAGCTTGGCCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTCAG
AGCACATGCGCCACTTCAGGTGAAGGACTCTACGAAGGTCTTGACTGGCTGTCCAACAAC
ATCGCTGGCAAGGCCTAATGAAGTAAAAACAGCATTGCATCGAGAGATGATTCTTCCTGC
TGTATGTTGGTAAAGTTTCTGGATGCAAGAGAGAGAT*ATAAATATTATATAAACCTTTT
T*GCTACTGGCTTTATGAATGTTCTG*GTT*GTGCAAGTAGTAGATATGTAC

QA 4 775 4 775
DS 

RD RR2FB45TF 807 0 0
GGATTCAC
CGTCGTCGCGCATTTAGCGTTTCTCTTAAGCAGAGCTCAGTTTCTCTCCAGAGTTTAAAA
AGCAGAAAAGAGATGGGGTTGAGTTTCGCGAAGCTGTTCAGCAGGCTCTTTGCCAAGAAG
GAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACCATTCTCTACAAG
CTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTG
GAGTACAAGAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTCCT
TTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTCATCTTTGTTGTTGACAGCAACGAC
AGAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTTCACAGGATGCTCAATGAGGATGAGCTG
CGTGATGCTGTGTTGCTTGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCAAATGCCATGAATGCA
GCTGAAATCACAGATAAGCTTGGCCTTCACTCTCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTCAG
AGCACATGTGCCACCTCAGGTGAAGGACTTTACGAAGGTCTTGACTGGCTGTCCAACAAC
ATCGCTGGCAAGGCGTAATGAAGTAAAAACAGCATTGCATCGAGAGATGATTCTTCCTGC
TGTGTGTTGGTAAAGTTTCTGGATGCAAGAGAGAGATTATAAATATTATATAAACCTTTT
T*GCTACTGGCTTTATGA*TGTTCTGAGAT*GTGCAAGTA***GATTTGTACCTAAAAGC
TTACTAGTACGAGCCC
TTT

QA 9 804 9 804
DS 

RD RR2D310JQ 745 0 0
TTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACCATTCTCTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGATTG
TCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATCAGTT
TCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTCCTTTGTGGAGGCACTACTTCC
AGAACACTCAGGGTCTCATCTTTGTTGTTGACAGCAACGACAGAGACAGAGTTGTTGAGG
CTAGAGATGAACTTCACAGGATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTGTTGCTTG
TGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCAAATGCCATGAATGCAGCTGAAATCACAGATAAGC
TTGGCCTTCACTCTCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTCAGAGCACATGTGCCACCTCAG
GTGAAGGACTTTACGAAGGTCTTGACTGGCTGTCCAACAACATCGCTGGCAAGGCGTAAT
GAAGTAAAAACAGCATTGCATCGAGAGATGATTCTTCCTGCTGTGTGTTGGTAAAGTTTC
TGTATGCAAGAGAGAGATTATAAATATTATATAAACCTTTTTTGCTACTGGCTTTATGAA
TGTTCTGAGATTGTGCAAGTA***GATTTGTACCTAAAAGCTTACTAGTACGAGCCCCTT
T*AAATAGTTTTCGTGTTGTTATCACCTGGATTGACGATTGAATGTTATTGTTTTCTTGT
TATCGCCTATTTTCATTTGCAACAT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2EQ47TF 403 0 0
GATCTTCCAAATGCCATGAATGCAGCTGAAATCACAGATAAGCTTGGCCTTCACTCTCTG
CGTCAGCGTCACTGGTACATTCAGAGCACATGTGCCACCTCAGGTGAAGGACTTTACGAA
GGTCTTGACTGGCTGTCCAACAACATCGCTGGCAAGGCGTAATGAAGTAAAAACAGCATT
GCATCGAGAGATGATTCTTCCTGCTGTGTGTTGGTAAAGTTTCTGGATGCAAGAGAGAGA
TTATAAATATTATATAAACCTTTTTTGCTACTGGCTTTATGAATGTTCTGAGATTGTGCA
AGTA***GATTTGTACCTAAAAGCTTACTAGTACGAGCCCCTTTTAAATAGTTTTCGTGT
TGTTATCACCTGGATTGATGATTGAATGTTATTGTTTTCTTGT

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2FI17JQ 607 0 0
CCTTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTTTCATTTTTGTTGTTGACAGCAAC
GACAGAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTTCACAGGATGCTCAATGAGGATGAG
CTGCGTGATGCTGTGTTGCTTGTGTTTGCCAACAAGCAAGATTTTCCAAATGCCATGAAT
GCAGCTGAAATCACAGATAAGCTTGGCCTTCACTTTTTGGGTCAGGGTCACTGGTACATT
CAGAGCACATGTGCCACCTCAGGTGAAGGACTTTACGAAGGTTTTGACTGGCTGTCCAAC
AACATCGCTGGCAAGGGGTAATGAAGTAAAAACAGCATTGCATCGAGAGATGATTTTTCC
TGCTGTGTGTTGGTAAAGTTTTTGGATGCAAGAGAGAGATTATAAATATTATATAAACCT
TTTTTGCTACTGGCTTTATGAATGTTTTGAGATTGTGCAAGTA***GATTTGTACCTAAA
AGCTTATTAGTACGAGCCCCTTTTAAATAGTTTTCGTGTTGTTATCACCTGGATTGATGA
TTGAATGTTATTGTTTTTTTGTTATCGCCTATTTTCATTTGCAACATAATAAGATAAAGT
TTTTGGT

QA 1 607 1 607
DS 



CO CL13Contig4 633 2 1 U
GGGCGTCGCGCATCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTGAAGCAAGGATGGGT
TTGTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATG
GTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGAGAGATT
GTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAACATCAGT
TTCACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCATTACATC
CAGAGCACCTGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAAC
AACATCGCCGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGCGCAAAT
CTGGATGCAGGGGCAAACATTATCTGATTTTTTCTTCTTTATTGTTCTCTCCTTTTTTTT
TGTTTCGGGTATGTGGATTTGATTTTGTGATCGTTGTTCTGATTTTTGCGAGGAGGAGTC
TCTTGCACGTAAAACATAGAAACTACCTTTTTATATAGTTTGTAATCGAAGATTTATACT
CTACTTCTTTCTGCTTCACGTTTTATTTTTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK34TF U 2
AF RR2DE76TF U 1
BS 1 633 RR2DE76TF

RD RR2DK34TF 182 0 0
GGGCGTCCGC
ATCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTGAAGCAAGGA**GGTTTGTCTTTCGG
GAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGA
TGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGAGAGATTGTC

QA 11 182 11 182
DS 

RD RR2DE76TF 633 0 0
GGGCGTCGCGCATCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTGAAGCAAGGATGGGT
TTGTCTTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATG
GTTGGTCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGAGAGATT
GTCACCACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAACATCAGT
TTCACAGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCATTACATC
CAGAGCACCTGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAAC
AACATCGCCGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGCGCAAAT
CTGGATGCAGGGGCAAACATTATCTGATTTTTTCTTCTTTATTGTTCTCTCCTTTTTTTT
TGTTTCGGGTATGTGGATTTGATTTTGTGATCGTTGTTCTGATTTTTGCGAGGAGGAGTC
TCTTGCACGTAAAACATAGAAACTACCTTTTTATATAGTTTGTAATCGAAGATTTATACT
CTACTTCTTTCTGCTTCACGTTTTATTTTTGAA

QA 1 633 1 633
DS 



CO CL13Contig5 869 5 15 U
GGGTTCTTAAGCTCTCTCTCTCTCCTTCTCTTTCAAATTCCATTCGTCGTCGTCTCTCTA
TCAGATATCAGCCGAAGAGTGAAGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGCGAAGCTGTTTAGCA
GGCTTTTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTCATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGA
CCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGTT
TCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATTAGTTTCACCGTGTGGGATGTCGGGGGTC
AAGACAAGATCCGTCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACCCAAGGTCTCATCTTTG
TGGTCGACAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCCAGAGATGAACTCCACAGAATGC
TTAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTCCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTC
CAAATGCCATGAACGCTGCTGAAATCACTGATAAGCTCGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGC
GTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTCTACGAAGGTCTTG
ACTGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGCATAGAGGGAAGATGCGTGGTTGAGTTGAT
TTTGCTGGGCAAATCTGGATGCAGTGGCAAACATTATCTGATATTTTTTTATGGTGTTCT
TATTGTTCTGTGTTTTCTTTGGAGTATGTGGATTTGATTTTGTGCTCGTTGTTCTGATTT
GTGTAAAGAGGGTTTCTCTTGTACGTAGAACATAGAAACTGCCTTTTACTATAGCTTGTA
ATATCGAATTATCTACTGCTTTCGTGGCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DZ26TF U 1
AF RR2CN44TF U 3
AF RR2FW96TF U 2
AF RR2CN44JQ C 152
AF RR2FW96JQ C 194
BS 1 146 RR2DZ26TF
BS 147 147 RR2FW96TF
BS 148 149 RR2DZ26TF
BS 150 150 RR2FW96TF
BS 151 160 RR2DZ26TF
BS 161 709 RR2FW96TF
BS 710 710 RR2CN44JQ
BS 711 735 RR2FW96TF
BS 736 736 RR2CN44JQ
BS 737 760 RR2FW96TF
BS 761 761 RR2CN44JQ
BS 762 779 RR2FW96TF
BS 780 780 RR2CN44JQ
BS 781 797 RR2FW96TF
BS 798 869 RR2CN44JQ

RD RR2DZ26TF 163 0 0
GGGTTCTTAAGCTCTCTCTCTCTCCTTCTCTTTCAAATTCCATTCGTCGTCGTCTCTCTA
TCAGATATCAGCCGAAGAGTGAAGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGCGAAGCTGTTTAGCA
GGCTTTTTGCCAAGAAGGAGATGAGG*TTATCATGGTTGG
CTT

QA 1 160 1 160
DS 

RD RR2CN44TF 689 0 0
GTTCTTAAGCTCTCTCTCTCTCCTTCTCTTTCAAATTCCATTCGTCGTCGTCTCTCTATC
AGATATCAGCCGAAGAGTGAAGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGCGAAGCTGTTTAGCAGG
CTTTTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTCATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACC
ACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGTTTC
AATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATTAGTTTCACCGTGTGGGATGTCGGGGGTCAA
GACAAGATCCGTCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACCCAAGGTCTCATCTTTGTG
GTCGACAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCCAGAGATGAACTCCACAGAATGCTT
AATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTCCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCA
AATGCCATGAACGCTGCTGAAATCACTGATAAGCTCGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGT
CACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTCTACGAAGGTCTTGAC
TGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGTATAGAGGGAAGATGCGTGGTTGAGTTGATTT
TGCTGGGCAAATCTGGATGCAGTGGCAAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2FW96TF 796 0 0
G
GTTCTTAAGCTCTCTCTCTCTCCTTCTCTTTCAAATTCCATTCGTCGTCGTCTCTCTATC
AGATATCAGCCGAAGAGTGAAGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGCGAAGCTGTTTAGCAGG
CTTTTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTCATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACC
ACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGTTTC
AATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATTAGTTTCACCGTGTGGGATGTCGGGGGTCAA
GACAAGATCCGTCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACCCAAGGTCTCATCTTTGTG
GTCGACAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCCAGAGATGAACTCCACAGAATGCTT
AATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTCCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCA
AATGCCATGAACGCTGCTGAAATCACTGATAAGCTCGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGT
CACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTCTACGAAGGTCTTGAC
TGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGCATAGAGGGAAGATGCGTGGTTGAGTTGATTT
TGCTGGGCAAATCTGGATGCAGTGGCAAACATTATCTGATATTTTTT*ATGGTGTTCTTA
TTGTTCTGTGTTT*CTTTGGAGTATGTGGATTTGATTT*GTGCTCGTTGTTCTGATT*GT
GTAAAGAGGGTTTCT

QA 2 796 2 796
DS 

RD RR2CN44JQ 718 0 0
CATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGA
GATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACAT
TAGTTTCACCGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATCCGTCCCTTGTGGAGGCACTA
CTTCCAGAACACCCAAGGTCTCATCTTTGTGGTCGACAGCAATGACAGAGACCGTGTTGT
TGAGGCCAGAGATGAACTCCACAGAATGCTTAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCT
CCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCTGCTGAAATCACTGA
TAAGCTCGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCAC
TTCAGGCGAGGGGCTCTACGAAGGTCTTGACTGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGT
ATAGAGGGAAGATGCGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAAATCTGGATGCAGTGGCAAA
CATTATCTGATATTTTTTTATGGTGTTCTTATTGTTCTGTGTTTTCTTTGGAGTATGTGG
ATTTGATTTTGTGCTCGTTGTTCTGATTTGTGTAAAGAGGGTTTCTCTTGTACGTAGAAC
ATAGAAACTGCCTTTTACTATAGCTTGTAATATCGAATTATCTACTGCTTTCGTGGCC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2FW96JQ 676 0 0
CAAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAAC
TGTGGAGTACAAGAACATTAGTTTCACCGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATCCG
TCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACCCAAGGTCTCATCTTTGTGGTCGACAGCAA
TGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCCAGAGATGAACTCCACAGAATGCTTAATGAGGATGA
GCTGCGTGATGCTGTTCTCCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAA
CGCTGCTGAAATCACTGATAAGCTCGGTCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACAT
CCAGAGCACATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTCTACGAAGGTCTTGACTGGCTGTCCAA
CAACATTGCCGGCAAGGCATAGAGGGAAGATGCGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAAA
TCTGGATGCAGTGGCAAACATTATCTGATATTTTTTTATGGTGTTCTTATTGTTCTGTGT
TTTCTTTGGAGTATGTGGATTTGATTTTGTGCTCGTTGTTCTGATTTGTGTAAAGAGGGT
TTCTCTTGTACGTAGAACATAGAAACTGCCTTTTACTATAGCTTGTAATATCGAATTATC
TACTGCTTTCGTGGCC

QA 1 676 1 676
DS 



CO CL13Contig6 805 3 7 U
GGGTCGTCGTCTCGCGTTTCTCTTAAGCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCAGATCTCTCGGTTACATTCTACAGAGTGAAAGATGGGGTTGAGTTTCGCA
AAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGAT
GCTGCTGGTAAGACCACTATCTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATC
CCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATTAGTTTCACTGTGTGG
GATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTCCCTTGTAGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAG
GGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAACGACAGAGACAGAGTTGTTGAAGCTAGAGATAAA
CTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAGCTGCGTGATGCTGTGTTGCTTGTGTTTGCCAAC
AAGCAAGATCTTCCAAATGCGATGAATGCAGCTGAAATCACCGATAAGCTTGGCCTTCAT
TCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTCAGAGCACATGCGCCACTTCAGGTGAAGGACTG
TACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAACAACATCGCTGGCAAGGCGTAATGAGGGTGAGTT
GCATTTGCATCGAGATGATTGTATCTGCTGTGATGCAAAGAAACGATTATAAATATTATC
TGAACCTTTTTTTGATATTTTGGGTATGTGAATGTTTTGATTGTGCAAGTAGATGTCTTG
TCTCTAAAACTTACTAGAAGAACCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE73TF U 1
AF RR2EU22TF U 1
AF RR2EU22JQ C 510
BS 1 417 RR2EE73TF
BS 418 418 RR2EU22TF
BS 419 621 RR2EE73TF
BS 622 642 RR2EU22TF
BS 643 643 RR2EU22JQ
BS 644 767 RR2EU22TF
BS 768 805 RR2EU22JQ

RD RR2EE73TF 621 0 0
GGGTCGTCGTCTCGCGTTTCTCTTAAGCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCAGATCTCTCGGTTACATTCTACAGAGTGAAAGATGGGGTTGAGTTTCGCA
AAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGAT
GCTGCTGGTAAGACCACTATCTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATC
CCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATTAGTTTCACTGTGTGG
GATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTCCCTTGTAGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAG
GGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAACGACAGAGACAGAGTTGTTGAAGCTAGAGATGAA
CTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAGCTGCGTGATGCTGTGTTGCTTGTGTTTGCCAAC
AAGCAAGATCTTCCAAATGCGATGAATGCAGCTGAAATCACCGATAAGCTTGGCCTTCAT
TCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTCAGAGCACATGCGCCACTTCAGGTGAAGGACTG
TACGAAGGTCTGGACTGGCTG

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2EU22TF 767 0 0
GGGTCGTCGTCTCGCGTTTCTCTTAAGCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTT****AGATCTCTCGGTTACATTCTACAGAGTGAAAGATGGGGTTGAGTTTCGCA
AAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGAT
GCTGCTGGTAAGACCACTATCTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATC
CCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATTAGTTTCACTGTGTGG
GATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAG
GGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAACGACAGAGACAGAGTTGTTGAAGCTAGAGATAAA
CTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAGCTGCGTGATGCTGTGTTGCTTGTGTTTGCCAAC
AAGCAAGATCTTCCAAATGCGATGAATGCAGCTGAAATCACCGATAAGCTTGGCCTTCAT
TCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTCAGAGCACATGCGCCACTTCAGGTGAAGGACTG
TACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAACAACATCGCTGGCAAG*CGTAATGAGGGTGAGTT
GCATTTGCATCGAGATGATTGTATCTGCTGTGATGCAAAGAAACGATTATAAATATTATC
TGAACCTTTTTTTGATATTTTGGGTATGTGAATGTTTTGATTGTGCA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2EU22JQ 296 0 0
AGCTGAAATCACCGATAAGCTTGGCCTTCATTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTCA
GAGCACATGCGCCACTTCAGGTGAAGGACTGTACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAACAA
CATCGCTGGCAAGGCGTAATGAGGGTGAGTTGCATTTGCATCGAGATGATTGTATCTGCT
GTGATGCAAAGAAACGATTATAAATATTATCTGAACCTTTTTTTGATATTTTGGGTATGT
GAATGTTTTGATTGTGCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAAACTTACTAGAAGAACCC

QA 1 296 1 296
DS 



AS 6 35

CO CL14Contig1 629 2 1 U
GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTAGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAG
AAAAAAATGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTTC
TCCATGTTTTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTACA
CAAAGGGCAACGCATATGCACAGATTGCAATAGGCACAGATGACGTGTACAAAAGCGGTG
AAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCACTAGAGAAGCCGGACCTC
TTCCTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAAACAGTTC
TGGTAGACAATGAAGATTTTCTGAAGGAACTGGAATGAAGAGAGAGAGGGATGATGATGG
TCAAGATCACAGCTAAAACGTAACCATAATAATTAAATATGTGAACTTATCAAAGTAGAG
AGAAGACTTAGTATTTGATCTAAATAAAGATGTGGTTGGTTCAGTTTGTGTGTCGTGTTC
TATCTGCTCGTGCCTTTTGTCTTTTGAGCTAAAACTCTGTTACGTTCCTGAATAAAATAT
ATACACCACCTGGTTTTGGTGTTTACCGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B967JQ C 1
AF RR2B967TF U 1
BS 1 629 RR2B967TF

RD RR2B967JQ 629 0 0
GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTAGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAG
AAAAAAATGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTTC
TCCATGTTTTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTACA
CAAAGGGCAACGCATATGCACAGATTGCAATAGGCACAGATGACGTGTACAAAAGCGGTG
AAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCACTAGAGAAGCCGGACCTC
TTCCTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAAACAGTTC
TGGTAGACAATGAAGATTTTCTGAAGGAACTGGAATGAAGAGAGAGAGGGATGATGATGG
TCAAGATCACAGCTAAAACGTAACCATAATAATTAAATATGTGAACTTATCAAAGTAGAG
AGAAGACTTAGTATTTGATCTAAATAAAGATGTGGTTGGTTCAGTTTGTGTGTCGTGTTC
TATCTGCTCGTGCCTTTTGTCTTTTGAGCTAAAACTCTGTTACGTTCCTGAATAAAATAT
ATACACCACCTGGTTTTGGTGTTTACCGG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2B967TF 629 0 0
GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTAGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAG
AAAAAAATGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTTC
TCCATGTTTTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTACA
CAAAGGGCAACGCATATGCACAGATTGCAATAGGCACAGATGACGTGTACAAAAGCGGTG
AAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCACTAGAGAAGCCGGACCTC
TTCCTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAAACAGTTC
TGGTAGACAATGAAGATTTTCTGAAGGAACTGGAATGAAGAGAGAGAGGGATGATGATGG
TCAAGATCACAGCTAAAACGTAACCATAATAATTAAATATGTGAACTTATCAAAGTAGAG
AGAAGACTTAGTATTTGATCTAAATAAAGATGTGGTTGGTTCAGTTTGTGTGTCGTGTTC
TATCTGCTCGTGCCTTTTGTCTTTTGAGCTAAAACTCTGTTACGTTCCTGAATAAAATAT
ATACACCACCTGGTTTTGGTGTTTACCGG

QA 1 629 1 629
DS 



CO CL14Contig2 1131 16 41 U
GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTA*GGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCA
GAAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTT
TCTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTG
CTTTGGCATGAAGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTACTCTAATGCTTT
CCTTGGTTTTGGTCCTGAGACATCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGT
TAGCTCCTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCTATTTCCACTCAAGATGTTGC
CAAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCAGGTCCTGT
CAAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCT
CATCCAGAGAGGTCCTACTCCTGAACCACTCTGTCAAGTCATGCTTCGCGTTGGTGATCT
TGACCGCGCCATCAAGTTCTATGAGAAGGTCCTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATTGA
GAGACCTGAATACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGAT
AGTTTTGGAGCTGACCTATAACTACGGCGTGACTGAGTACACAAAGGGCAACGCATATGC
ACAGATCGCAATAGGCACGGATGATGTGTACAAAAGCGGTGAAGTTGTGAAGATAATGAA
CCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCACTAGAGAAGCCGGACCTCTTCCTGGACTAGGCACCAA
GATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAAACAGTTCTGGTAGACAACGAAGATTT
TCTGAAGGAACTGGAATGAGGTGAGAGAGAGAGGGATGCTGATGGTCAAGAATAGATCAC
AGCTAAAACGTAACCATAATAATAAAATATGTGATCTTATCAAAGTAGAGAGAAGACTTA
GTATTTGATCTACTAAATAAGATGTTTGTTCAGTTTGTGTGTCGTCTGCTAAAACTCTGT
TACGTTCCTGAATAAAAATATATCCACCACCTGGTTTTGGTGTTTACCGGC


BQ
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 55 10 55 10 5 60 5 5 5 60 60 60 60 60 5 5 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 
55 55 40 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 35 60 60 60 70 70 5 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 60 75 75 75 75 75 20 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 20 75 75 75 75 75 0 75 75 20 
75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
50 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 25 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 85 85 85 85 85 85 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 15 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 65 80 80 80 65 80 80 15 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 5 45 45 45 15 35 35 35 15 35 35 35 15 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E757TF U 1
AF RR2AX16TFB U 288
AF RR2CW12TF U 1
AF RR2AU29TF U 2
AF RR2D544TF U 1
AF RR2EC11TF U 15
AF RR2CL52TF U 10
AF RR2CE33TF U 1
AF RR2FM80TF U 1
AF RR2E259TF U 5
AF RR2B004TF U 9
AF RR2ER73TF U 9
AF RR2FM80JQ C 545
AF RR2AU29JQ C 311
AF RR2FM79JQ C 505
AF RR2CE33JQ C 350
BS 1 186 RR2CE33TF
BS 187 187 RR2CW12TF
BS 188 207 RR2CE33TF
BS 208 208 RR2CW12TF
BS 209 228 RR2CE33TF
BS 229 229 RR2E259TF
BS 230 261 RR2CE33TF
BS 262 262 RR2E259TF
BS 263 312 RR2CE33TF
BS 313 313 RR2CW12TF
BS 314 489 RR2CE33TF
BS 490 490 RR2CW12TF
BS 491 506 RR2CE33TF
BS 507 507 RR2CW12TF
BS 508 587 RR2CE33TF
BS 588 588 RR2CW12TF
BS 589 683 RR2CE33TF
BS 684 700 RR2FM80TF
BS 701 726 RR2E259TF
BS 727 727 RR2AU29JQ
BS 728 730 RR2E259TF
BS 731 731 RR2AU29JQ
BS 732 734 RR2E259TF
BS 735 735 RR2AU29JQ
BS 736 738 RR2E259TF
BS 739 739 RR2AU29JQ
BS 740 744 RR2E259TF
BS 745 745 RR2AU29JQ
BS 746 754 RR2E259TF
BS 755 755 RR2AU29JQ
BS 756 775 RR2E259TF
BS 776 880 RR2AU29JQ
BS 881 881 RR2FM79JQ
BS 882 901 RR2AU29JQ
BS 902 902 RR2FM79JQ
BS 903 921 RR2AU29JQ
BS 922 922 RR2FM79JQ
BS 923 1105 RR2AU29JQ
BS 1106 1106 RR2FM79JQ
BS 1107 1122 RR2AU29JQ
BS 1123 1131 RR2CE33JQ

RD RR2E757TF 184 0 0
GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTA*GGTGTCAGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCA
GAAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTT
TCTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTG
TTTG

QA 1 180 1 180
DS 

RD RR2AX16TFB 264 0 0
ACAATTATGGTGTTAGCTCGTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTCCA
CTCAAGATGTTGCCAAGATGGTTTAAACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAG
AGCCAGGTCCAGTCAAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTT
ACACTTTTGAGCTCGTCCAGAGAGGTCCTACTCCTGAACCACTCTGTCAAGTCATGCTTC
GTGTTGGTGATCTTGACCGCGCCA

QA 1 264 1 264
DS 

RD RR2CW12TF 622 0 0
GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTA*GGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCA
GAAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTT
TCTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTG
CTTCGGCATGAAGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTATTCTAATGCTTT
CCTTGGTTTTGGTCCTGAGACCTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGT
TAGCTCGTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTCCACTCAAGATGTTGC
CAAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCAGGTCCAGT
CAAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCT
CGTCCAGAGAGGTCCTACTCCTGAACCACTCTGTCAAGTCATGCTTCGTGTTGGTGATCT
TGACCGCGCCATCAAGTTCTATGAAAAGGCCCTGGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATCGA
GAGACCTGAATACAAGTACACC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2AU29TF 621 0 0
GATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTA*GGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAG
AAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTT
CTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGC
TTTGGGATGAAGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTATTCTAATGCTTTC
CTTGGTTTTGGTCCTGAGACCTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTT
AGCTCCTATGAAATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCTATTTCCACTCAAGATGTTGCC
AAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCAGGTCCTGTC
AAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTC
ATCCAGAGAGGTCCTACTCCTGAACCACTCTGTCAAGTCATGCTTCGCGTTGGTGATCTT
GACCGCGCCATCAAGTTCTATGAGAAGGTCCTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATTGAG
AGACCTGAATACAAGTACACC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2D544TF 622 0 0
GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTA*GGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCA
GAAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTT
TCTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTG
CTTTGGGATGAAGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTATTCTAATGCTTT
CCTTGGTTTTGGTCCTGAGACCTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGT
TAGCTCCTATGAAATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCTATTTCCACTCAAGATGTTGC
CAAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCAGGTCCTGT
CAAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCT
CATCCAGAGAGGTCCTACTCCTGAACCACTCTGTCAAGTCATGCTTCGCGTTGGTGATCT
TGACCGCGCCATCAAGTTCTATGAGAAGGTCCTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATTGA
GAGACCTGAATACAAGTACACC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2EC11TF 608 0 0
GG
ATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAGAAAAAAATGGCAGAA
AAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTTCTCCATGTTGTCTAC
CGTGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGCTTTGGCATGAAGGTG
TTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTACTCTAATGCTTTCCTTGGTTTTGGTCCT
GAGACATCCAACTTTGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTTAGCTCCTATGACATT
GGGACTGGATTTGGGCATTTCGCTATTTCCACTCAAGATGTTGCCAAGATGGTTGAGACT
GTTCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCGGTGAAAGGTGGAAACAGT
GTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTCATCCAGAGAGGTCCT
ACTCCTGAACCACTCTGTCAAGTCATGCTTCGCGTTGGCGATCTTGACCGCGCCGTCAAG
TTCTATGAGAAGGCCCTAGGGATGAGACTCTTGAGAAG*ATCGAGAGACCTGAATACAAG
TACACC

QA 3 608 3 608
DS 

RD RR2CL52TF 623 0 0
GG
AAATTATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAGAAAAAAATGG
TAGAAAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTTCTCCATGTTG
TCTACCGTGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGCTTTGGCATGA
AGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTACTCTAATGCTTTCCTTGGTTTTG
GTCCTGAGACATCCAACTTTGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTTAGCTCCTATG
ACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCTATTTCCACTCAAGATGTTGCCAAGATGGTTG
AGACTGTTCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCGGTGAAAGGTGGAA
ACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTCATCCAGAGAG
GTCCTACTCCTGAACCACTCTGTCAAGTCATGCTTCGCGTTGGCGATCTTGACCGCGCCG
TCAAGTTCTATGAGAAGGCCCTAGGGATGAGACTCTTGACAAGGATCGAGAGACCTGAAT
ACAAGTACACCATATGCATGA

QA 3 623 3 623
DS 

RD RR2CE33TF 683 0 0
GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTA*GGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCA
GAAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTT
TCTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTG
CTTTGGGATGAAGGTGTTGAGGAAAAGGGATGTCCCTGAGGAGAAGTATTCTAATGCTTT
CCTTGGTTTTGGTCCTGAGACCTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGT
TAGCTCCTATGAAATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCTATTTCCACTCAAGATGTTGC
CAAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCAGGTCCTGT
CAAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCT
CATCCAGAGGGGTCCTACTCCTGAAC*ACTCTGTCAAGTCATGCTTCGCGTTGGTGATCT
TGACCGCGCCATCAAGTTCTATGAGAAGGTCCTAGGGATGAGACTCTCGAGAAGGATTGA
GAGACCTGAATACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGAT
AGTTTTGGAGCTGACCTATAACT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2FM80TF 700 0 0
GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTA*GGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCA
GAAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTT
TCTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTG
CTTTGGGATGAAGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTATTCTAATGCTTT
CCTTGGTTTTGGTCCTGAGACCTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGT
TAGCTCCTATGAAATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCTATTTCCACTCAAGATGTTGC
CAAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCAGGTCCTGT
CAAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCT
CATCCAGAGAGGTCCTACTCCTGAACCACTCTGTCAAGTCATGCTTCGCGTTGGTGATCT
TGACCGCGCCATCAAGTTCTATGAGAAGGTCCTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATTGA
GAGACCTGAATACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGAT
AGTTTTGGAGCTGACCTATAACTACGGCGTGACTGAGTAC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2E259TF 783 0 0
GGAATCC
AAATTATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAGAAAAAAATGG
CAGAAAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTTCTCCATGTTG
TCTACCGTGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTCACACTGAGTGCTTTGGCATGA
AGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTACTCTAATGCTTTCCTTGGTTTTG
GTCCTGAGACATCCAACTTTGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTTAGCTCCTATG
ACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCTATTTCCACTCAAGATGTTGCCAAGATGGTTG
AGACTGTTCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCGGTGACAGGTGGAA
ACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTCATCCAGAGAG
GTCCTACTCCTGAACCACTCTGTCAAGTCATGCTTCGCGTTGGCGATCTTGACCGCGCCG
TCAAGTTCTATGAGAAGGCCCTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATCGAGAGACCTGAAT
ACAAGTACACCATATGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGC
TGACCTATAACTACGGCGTGACTGAGTACACAAAGGGCAACGCATATGCACAGATTGCA*
TAG*CACAGATGACGTGTACAAA*GCGGTGAAGTTGTGAAGATA
TGAACAAGAGCT

QA 8 771 8 771
DS 

RD RR2B004TF 722 0 0
GGA
AAATTATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTGTGTCTGCTTCATCTTCGATCAGAAAAAAATGG
CAGAAAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTTCTCCATGTTG
TCTACCGTGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGCTTTGGCATGA
AGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTACTCTAATGCTTTCCTTGGTTTTG
GTCCTGAGACATCCAACTTTGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTTAGCTCCTATG
ACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCTATTTCCACTCAAGATGTTGCCAAGATGGTTG
AGACTGTTCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCAC*AGAGAGCCTGGTCCGGTGAAAGGTGGAA
ACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTCATCCAGAGAG
GTCCTACTCCTGAACCACTCTGTCAAGTCATGCTTCGCGTTGGCGATCTTGACCGCGCCG
TCAAGTTCTATGAGAAGGCCCTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATCGAGAGACCTGAAT
ACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGC
TGACCTATAACTACGGCGTGACTGAGTACACAAAGGGCAACGCATATGCACAGATTGCA

QA 4 722 4 722
DS 

RD RR2ER73TF 722 0 0
GGA
AAATTATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAGAAAAAAATGG
CAGAAAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTTCTCCATGTTG
TCTACCGTGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGCTTTGGCATGA
AGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTACTCTAATGCTTTCCTTGGTTTTG
GTCCTGAGACATCCAACTTTGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTTAGCTCCTATG
ACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCTATTTCCACTCAAGATGTTGCCAAGATGGTTG
AGACTGTTCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCGGTGAAAGGTGGAA
ACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTCATCCAGAGAG
GTCCTACTCCTGAACCACTCTGTCAAGTCATGCTTCGCGTTGGCGATCTTGACCGCGCCG
TCAAGTTCTATGAGAAGGCCCTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATCGAGAGACCTGAAT
ACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGC
TGACCTATAACTACG*CGTGACTGAGTACACAAAGGGCAACGCATATGCACAGATTGCA

QA 4 722 4 722
DS 

RD RR2FM80JQ 530 0 0
CGCGCCATCAAGTTCTATGAGAAGGTCCTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATTGAGAGA
CCTGAATACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAGTT
TTGGAGCTGACCTATAACTACGGCGTGACTGAGTACACAAAGGGCAACGCATATGCACAG
ATCGCAATAGGCACGGATGATGTGTACAAAAGCGGTGAAGTTGTGAAGATAATGAACCAA
GAGCTAGGAGGAAAGATCACTAGAGAAGCCGGACCTCTTCCTGGACTAGGCACCAAGATT
TTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAAACAGTTCTGGTAGACAACGAAGATTTTCTG
AAGGAACTGGAATGAGGTGAGAGAGAGAGGGATGCTGATGGTCAAGAATAGATCACAGCT
AAAACGTAACCATAATAATAAAATATGTGATCTTATCAAAGTAGAGAGAAGACTTAGTAT
TTGATCTACTAAATAAGATGTTTGTTCAGTTTGTGTGTCGTCTGCTAAAA

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2AU29JQ 812 0 0
GAAATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCTATTTCCACTCAAGATGTTGCCAAGATGGTT
GAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCAGGTCCTGTCAAAGGTGGA
AACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTCATCCAGAGA
GGTCCTACTCCTGAACCACTCTGTCAAGTCATGCTTCGCGTTGGTGATCTTGACCGCGCC
ATCAAGTTCTATGAGAAGGTCCTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATTGAGAGACCTGAA
TACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAG
CTGACCTATAACTACGGCGTGACTGAGTACACAAAGGGCAACGCATATGCACAGATCGCA
ATAGGCACGGATGATGTGTACAAAAGCGGTGAAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTA
GGAGGAAAGATCACTAGAGAAGCCGGACCTCTTCCTGGACTAGGCACCAAGATTGTCTCG
TTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAAACAGTTTTGGTAGACAACGAAGATTTTTTGAAGGAA
CTGGAATGAGGAGAGAGAGAGAGGGATGCTGATGGTCAAGAATAGATCACAGCTAAAACG
TAACCATAATAATAAAATATGTGATCTTATCAAAGTAGAGAGAAGACTTAGTATTTGATC
TACTAAATAAGATGTTTGTTCAGTTTGTGTGTCGTCTGCTAAAACTCTGTTACGTTCCTG
AATAAAAATATATCCCCCACCTGGTTTTGGTG

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR2FM79JQ 607 0 0
ACCACTCTGTCAAGTCATGCTTCGCGTTGGTGATCTTGACCGCGCCATCAAGTTCTATGA
GAAGGTCCTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATTGAGAGACCTGAATACAAGTACACCAT
AGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCTATAACTA
CGGCGTGACTGAGTACACAAAGGGCAACGCATATGCACAGATCGCAATAGGCACGGATGA
TGTGTACAAAAGCGGTGAAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCAC
TAGAGAAGCCGGACCTCTTCCTGGACTAGGCACCAAGATTTTCTCGTTCCTCGATCCTGA
TGGCTGGAAAACAGTTCTGGTAGACAACGAAGATTTTCTGAAGGAACTGGAATGAGGTGA
GAGAGAGAGGGATGCTGATGGTCAAGAATAGATCACAGCTAAAACGTAACCATAATAATA
AAATATGTGATCTTATCAAAGTAGAGAGAAGACTTAGTATTTGATCTACTAAATAAGATG
TTTGTTCAGTTTGTGTGTCGTCTGCTAAAACTCTGTTACGTTCCTGAATAAAAATATATC
CACCACC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2CE33JQ 782 0 0
TCAAGATG
TGCCAAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCAGGTCC
TGTCAAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGA
GCTCATCCAGAGGGGTCCTACTCCTGAAC*ACTCTGTCAAGTCATGCTTCGCGTTGGTGA
TCTTGACCGCGCCATCAAGTTCTATGAGAAGGTCCTAGGGATGAGACTCTCGAGAAGGAT
TGAGAGACCTGAATACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTC
GATAGTTTTGGAGCTGACCTATAACTACGGCGTGACTGAGTACACAAAGGGCAACGCATA
TGCACAGATCGCAATAGGCACGGATGATGTGTACAAAAGCGGTGAAGTTGTGAAGATAAT
GAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCACTAGAGAAGCCGGACCTCTTCCTGGACTAGGCAC
CAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAAACAGTTCTGGTAGACAACGAAGA
TTTTCTGAAGGAACTGGAATGAGG**AGAGAGAGAGGGATGCTGATGGTCAAGAATAGAT
CACAGCTAAAACGTAACCATAATAATAAAATATGTGATCTTATCAAAGTAGAGAGAAGAC
TTAGTATTTGATCTACTAAATAAGATGTTTGTTCAGTTTGTGTGTCGTCTGCTAAAACTC
TGTTACGTTCCTGAATAAAAATATATCCACCACCTGGTTTTGGTGTTTACCGGC

QA 9 782 9 782
DS 



CO CL14Contig3 802 11 11 U
AACCGGTAAACACCAAAACCAGGTGGTGTATATATTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTTT
TAGCTCAAAAGACAAAAGGCACGAGCAGATAGAACACGACACACAAACTGAACCAACCAC
ATCTTTATTTAGATCAAATACTAAGTCTTCTCTCTACTTTGATAAGTTCACATATTTAAT
TATTATGGTTACGTTTTAGCTGTGATCTTGACCATCATCATCCCTCTCTCTCTTCATTCC
AGTTCCTTCAGAAAATCTTCATTGTCTACCAGAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGG
AACGAGACAATCTTGGTGCCGAGTCCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCT
CCTAGCTCTTGGTTCATTATCTTCACAACTTCACCGCTTTTGTACACGTCATCTGTGCCT
ATTGCAATCTGTGCATATGCGTTGCCCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAGTTATAGGTC
AGCTCCAAAACTATCGACTCATGTTCCTCAGCATATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTG
TATTCAGGTCTCTCGATCCTTCTCAAGAGTCTCATCCCTAGGGCCTTCTCATAGAACTTG
ACGGCGCGGTCAAGATCGCCAACGCGAAGCATGACTTGACAGAGTGGTTCAGGAGTAGGA
CCTCTCTGGATGAGCTCAAAAGTGTAACCATCAGGGTCCTTCACAAAGGCAATGACACTG
TTTCCACCTTTCACCGGACCAGGCTCTCTGGTGACATTTCCACCCTTGGCACGAACAGTC
TCAACCATCTTGGCAACATCTT


BQ
10 30 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 50 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 20 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2G030TF C 6
AF RR2E259JQ U 1
AF RR2E602TF C 1
AF RR2E111JQ U 1
AF RR2CR18TF C 9
AF RR2EC11JQ U 109
AF RR2CL52JQ U 2
AF RR2FW47JQ U 25
AF RR2ER73JQ U 1
AF RR2B004JQ U 1
AF RR2FW47TF C 118
BS 1 250 RR2E111JQ
BS 251 251 RR2B004JQ
BS 252 271 RR2E111JQ
BS 272 272 RR2B004JQ
BS 273 578 RR2E111JQ
BS 579 579 RR2ER73JQ
BS 580 587 RR2E111JQ
BS 588 690 RR2ER73JQ
BS 691 750 RR2B004JQ
BS 751 751 RR2FW47TF
BS 752 802 RR2B004JQ

RD RR2G030TF 319 0 0
AAAACACCA
AAAACCAGGTGGTGTATATATTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTTTTAGCTCAAAAGACA
AAAGGCACGAGCAGATAGAACACGACACACAAACTGAACCAACTACATCTTTATTTAGAT
CAAATACTAAGTCTTCTCTCTACTTTGATAAGTTCACATATTTAATTATTATGGTTACGT
TTTAGCTGTGATCTTGACCATCATCATCCCTCTCTCTCTTCATTCCAGTTCCTTCAGAAA
ATCTTCATTGTCTACCAGAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGAAACGAGACAATCTT
GGTGCCGAGT

QA 10 319 10 319
DS 

RD RR2E259JQ 458 0 0
A
ACCGGTAAACACCAAAACCAGGTGGTGTATATATTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTTTT
AGCTCAAAAGACAAAAGGCACGAGCAGATAGAACACGACACACAAACTGAACCAACCACA
TCTTTATTTAGATAAAATACTAAGTCTTCTCTCTACTTTGATAAGTTCACATATTTAATT
ATTATGGTTACGTTTTAGCTGTGATCTTGACCATCATCATCCCTCTCTCTCTTCATTCCA
GTTCCTTCAAAAAATCTTCATTGTCTACCAAAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGGA
ACGAGACAATCTTGGTGCCGAGTCCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTAATCTTTCCTC
CTAGCTCTTGGTTCATTATCTTCACAACTTCACCGCTTTTGTACACGTCATCTGTGCCTA
TTGCAATCTGTGCATATGCGTTGCCCTTTGTGTACTC

QA 2 458 2 458
DS 

RD RR2E602TF 482 0 0
A
ACCGGTAAACACCAAAACCAGGTGGTGTATATATTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTTTT
AGCTCAAAAGACAAAAGGCACGAGCAGATAGAACACGACACACAAACTGAACCAACCACA
TCTTTATTTAGATCAAATACTAAGTCTTCTCTCTACTTTGATAAGTTCACATATTTAATT
ATTATGGTTACGTTTTAGCTGTGATCTTGACCATCATCATCCCTCTCTCTCTTCATTCCA
GTTCCTTCAGAAAATCTTCATTGTCTACCAGAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGGA
ACGAGACAATCTTGGTGCCGAGTCCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCTC
CTAGCTCTTGGTTCATTATCTTCACAACTTCACCGCTTTTGTACACGTCATCTGTGCCTA
TTGCAATCTGTGCATATGCGTTGCCCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAGTTATAGGTC
CC

QA 2 480 2 480
DS 

RD RR2E111JQ 587 0 0
AACCGGTAAACACCAAAACCAGGTGGTGTATATATTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTTT
TAGCTCAAAAGACAAAAGGCACGAGCAGATAGAACACGACACACAAACTGAACCAACCAC
ATCTTTATTTAGATCAAATACTAAGTCTTCTCTCTACTTTGATAAGTTCACATATTTAAT
TATTATGGTTACGTTTTAGCTGTGATCTTGACCATCATCATCCCTCTCTCTCTTCATTCC
AGTTCCTTCAAAAAATCTTCATTGTCTACCAAAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGG
AACGAGACAATCTTGGTGCCGAGTCCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCT
CCTAGCTCTTGGTTCATTATCTTCACAACTTCACCGCTTTTGTACACGTCATCTGTGCCT
ATTGCAATCTGTGCATATGCGTTGCCCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAGTTATAGGTC
AGCTCCAAAACTATCGACTCATGTTCCTCAGCATATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTG
TATTCAGGTCTCTCGATCCTTCTCAAGAGTCTCATCCCCAGGGCCTT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2CR18TF 546 0 0
AACACCAAAACCAGGTGGTGTATATATTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTTTTAGCTCAA
AAGACAAAAGGCACGAGCAGATAGAACACGACACACAAACTGAACCAACCACATCTTTAT
TTAGATCAAATACTAAGTCTTCTCTCTACTTTGATAAGTTCACATATTTAATTATTATGG
TTACGTTTTAGCTGTGATCTTGACCATCATCATCCCACTCTCTCTTCATTCCAGTTCCTT
CAGAAAATCTTCATTGTCTACCAGAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGGAACGAGAC
AATCTTGGTGCCGAGTCCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCTCCTAGCTC
TTGGTTCATTATCTTCACAACTTCACCGCTTTTGTACACGTCATCTGTGCCTATTGCAAT
CTGTGCATATGCGTCGCCCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAGTTATAGGTCAGCTCCAA
AACTATCGACTCATGTTCCTCAGCATATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTGTATTCAGG
TCTCTC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2EC11JQ 536 0 0
C
GAACCAACCACATCTTTATTTAGATCGAATACTAAGTCTTCTCTCTACTTTGATAAGTTC
ACATATTTAATTATTATGGTTACGTTTTAGCTGTGATCTTGACCATCATCATCCCTCTCT
CTCTTCATTCCAGTTCCTTCAGAAAATCTTCATTGTCTACCAAAACTGTTTTCCAGCCAT
CAGGATCGAGGAACGAGACAATCTTGGTGCCGAGTCCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAG
TGATCTTTCCTCCTAGCTCTTGGTTCATTATCTTCACAACTTCACCGCTTTTGTACACGT
CATCTGTGCCTATTGCAATCTGTGCATATGCGTTGCCCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGT
AGTTATAGGTCAGCTCCAAAACTATCGACTCATGTTCCTCAGCATATCCCATCATGCCTA
TGGTGTACTTGTATTCAGGTCTCTCGATCCTTCTCAAGAGTCTCATCCCTAGGGCCTTCT
CATAGAACTTGACGGCGCGGTCAAGATCGCCAACGCGAAGCATGACTTGACAGAG

QA 2 536 2 536
DS 

RD RR2CL52JQ 617 0 0
AT
CGGTAAACACCAAAGCCAGGTGGTGTATATATTTTATTCAGGAACGTAAAAGAGTTTTAG
CTCAAAAGACAAAAGGCACGAGCAGATAGAACACGACACACAAACTGAACCAACCACATC
TTTATTTAGATCAAATACTAAGTCTTCTCTCTACTTTGATAAGTTCACATATTTAATTAT
TATGGTTACGTTTTAGCTGTGATCTTGACCATCATCATCCCTCTCTCTCTTCATTCCAGT
TCCTTCAGAAAATCTTCATTGTCTACCAGAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGGAAC
GAGACAATCTTGGTGCCGAGTCCAGGAAGAGGTCCGGCTCCTCTAGTGATCTTTCCTCCT
AGCTCTTGGTTCATTATCTTCACAACTTCACCGCTTTTGTACACGTCATCTGTGCCTATT
GCAATCTGTGCATATGCGTTGCCCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAGTTATAGGTCAGC
TCCAAAACTATCGACTCATGTTCCTCAGCATATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTGTAT
TCAGGTCTCTCGATCCTTCTCAAGAGTCTCATCCCTAGGGCCTTCTCATAGAACTTGACG
GCGCGGTCAAGATCG

QA 3 617 3 617
DS 

RD RR2FW47JQ 629 0 0
GGTGTATATATTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTTTTAGCTCAAAAGACAAAAGGCACGA
GCAGATAGAACACGACACACAAACTGAACCAACCACATCTTTATTTAGATCAAATACTAA
GTCTTCTCTCTACTTTGATAAGTTCACATATTTAATTATTATGGTTACGTTTTAGCTGTG
ATCTTGACCATCATCATCCCTCTCTCTCTTCATTCCAGTTCCTTCAGAAAATCTTCATTG
TCTACCAGAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGGAACGAGACAATCTTGGTGCCGAGT
CCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCTCCTAGCTCTTGGTTCATTATCTTC
ACAACTTCACCGCTTTTGTACACGTCATCTGTGCCTATTGCAATCTGTGCATATGCGTTG
CCCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAATTATAGGTCAGCTCCAAAACTATCGACTCATGT
TCCTCAGCATATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTGTATTCAGGTCTCTCGATCCTTCTC
AAGAGTCTCATCCCTAGGGCCTTCTCATAGAACTTGACGGCGCGGTCAAGATCGCCAACG
CGAAGCATGACTTGACAGAGTGGTTCAGG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2ER73JQ 690 0 0
C
ACCGGTAAACACCAAAACCAGGTGGTGTATATATTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTTTT
AGCTCAAGAGACAAAAGGCACGAGCAGATAGAACACGACACACAAACTGAACCAACCACA
TCTTTATTTAGATCAAATACTAAGTCTTCTCTCTACTTTGATAAGTTCACATATTTAATT
ATTATGGTTACGTTTTAGCTGTGATCTTGACCATCATCATCCCTCTCTCTCTTCATTCCA
GTTCCTTCAAAAAATCTTCATTGTCTACCAAAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGGA
ACGAGACAATCTTGGTGCCGAGTCCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCTC
CTAGCTCTTGGTTCATTATCTTCACAACTTCACCGCTTTTGTACACGTCATCTGTGCCTA
TTGCAATCTGTGCATATGCGTTGCCCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAGTTATAGGTCA
GCTCCAAAACTATCGACTCATGTTCCTCAGCATATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTGT
ATTCAGGTCTCTCGATCCTTCTCAAGAGTCTCATCCCTAGGGCCTTCTCATAGAACTTGA
CGGCGCGGTCAAGATCGCCAACGCGAAGCATGACTTGACAGAGTGGTTCAGGAGTAGGAC
CTCTCTGGATGAGCTCAAAAGTGTAACCA

QA 2 690 2 690
DS 

RD RR2B004JQ 802 0 0
AG
CCGGTAAACACCAAAACCAGGTGGTGTATATATTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTTTTA
GCTCAAAAGACAAAAGGCACGAGCAGATAGAACACGACACACAAACTGAACCAACCACAT
CTTTATTTAGATCAAATACTAAGTCTTCTCTCTACTTTGATAAGTTCACATATTTAATTA
TTATGGTTACGTTTTAGCTGTGATCTTGACCATCATCATCCCTCTCTCTCTTCATTCCAG
TTCCTTCAGAAAATCTTCATTGTCTACCAGAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGGAA
CGAGACAATCTTGGTGCCGAGTCCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCTCC
TAGCTCTTGGTTCATTATCTTCACAACTTCACCGCTTTTGTACACGTCATCTGTGCCTAT
TGCAATCTGTGCATATGCGTTGCCCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAGTTATAGGTCAG
CTCCAAAACTATCGACTCATGTTCCTCAGCATATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTGTA
TTCAGGTCTCTCGATCCTTCTCAAGAGTCTCATCCCTAGGGCCTTCTCATAGAACTTGAC
GGCGCGGTCAAGATCGCCAACGCGAAGCATGACTTGACAGAGTGGTTCAGGAGTAGGACC
TCTCTGGATGAGCTCAAAAGTGTAACCATCAGGGTCCTTCACAAAGGCAATGACACTGTT
TCCACCTTTCACCGGACCAGGCTCTCTG*TGACATTTCCACCCTTGGCACGAACAGTCTC
AACCATCTTGGCAACATCTT

QA 3 802 3 802
DS 

RD RR2FW47TF 683 0 0
CACATCTTTATTTAGATCAAATACTAAGTCT*CTCTCTACTTTGATAAGTTCACATATTT
AATTATTATGGTTACGTTTTAGCTGTGATCTTGACCATCATCATCCCTCTCTCTCTTCAT
TCCAGTTC*TTCAGAAAATCTTCATTGTCTACCAGAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCG
AGGAACGAGACAATCTTGGTGCCGAGTCCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTT
CCTCCTAGCTCTTGGTTCATTATCTTCACAACTTCACCGCTTTTGTACACGTCATCTGTG
CCTATTGCAATCTGTGCATATGCGTTGCCCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAGTTATAG
GTCAGCTCCAAAACTATCGACTCATGTTCCTCAGCATATCCCATCATGCCTATGGTGTAC
TTGTATTCAGGTCTCTCGATCCTTCTCAAGAGTCTCATCCCTAGGGCCTTCTCATAGAAC
TTGACGGCGCGGTCAAGATCGCCAACGCGAAGCATGACTTGACAGAGTGGTTCAGGAGTA
GGACCTCTCTGGATGAGCTCAAAAGTGTAACCATCAGGGTCCTTCACAAAGGCAATGACA
CTGTTTCCACCTTTCACCGGACCAGGCTCTCTGGTGACATTTCCACCCTTGGCACGAACA
GTCTCAACCATCTTGGCAACATC

QA 1 683 1 683
DS 



CO CL14Contig4 1242 2 8 U
GGGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTAGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCA
GAAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTT
TCTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTCTCTCTCTCTCTC
TGTTACATTCATACAAACTATTGTTGTTATTTCATTCTATGGAATGAACAGGAGTTAAAG
TTTATTTACTATTTACAAGGTTTTACACTGAGTGCTTTGGCATAAAGGTGTTGAGGAAAA
GAGATGTCCCTGAGGAGAAGTATTCTAATGCTTTCCTTGGTTTTGGTCCTGAGACCTCCA
ACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTTAGCTCGTATGACATTGGGACTGGAT
TTGGGCATTTCGCCATTTCCACTCAAGATGTTGCCAAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCA
AGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCAGGTCCAGTCAAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCT
TTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTCGTCCAGAGAGGTCCTACTCCTGAAC
CACTCTGTCAAGTCATGCTTCGTGTTGGTGATCTTGACCGCGCCATCAAGTTCTATGAAA
AGGCCCTGGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATCGAGAGACCTGAATACAAGTACACCATAG
GCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCTATAACTACG
GCGTGACTGAGTACACAAAGGGCAACGCATATGCACAGATTGCAATAGGCACAGATGACG
TGTACAAAAGCGGTGAAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCACTA
GAGAAGCCGGACCTCTTCCTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATG
GCTGGAAAACAGTTCTGGTAGACAATGAAGATTTTTTGAAGGAACTGGAATGAAGAGAGA
GAGGGATGATGATGGTCAAGATCACAGCTAAAACGTAACCATAATAATTAAATATGTGAA
CTTATCAAAGTAGAGAGAAGACTTAGTATTTGATCTAAATAAAGATGTGGTTGGTTCAGT
TTGTGTGTCGTGTTCTATCTGCTCGTGCCTTTTGTCTTTTGAGCTAAAACTCTGTTACGT
TCCTGAATAAAATATATACCCCCCCTGGTTTTGGTGTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E111TF U 1
AF RR2CW12JQ C 559
BS 1 665 RR2E111TF
BS 666 666 RR2CW12JQ
BS 667 688 RR2E111TF
BS 689 689 RR2CW12JQ
BS 690 720 RR2E111TF
BS 721 721 RR2CW12JQ
BS 722 771 RR2E111TF
BS 772 1242 RR2CW12JQ

RD RR2E111TF 771 0 0
GGGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTAGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCA
GAAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTT
TCTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTCTCTCTCTCTCTC
TGTTACATTCATACAAACTATTGTTGTTATTTCATTCTATGGAATGAACAGGAGTTAAAG
TTTATTTACTATTTACAAGGTTTTACACTGAGTGCTTTGGCATAAAGGTGTTGAGGAAAA
GAGATGTCCCTGAGGAGAAGTATTCTAATGCTTTCCTTGGTTTTGGTCCTGAGACCTCCA
ACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTTAGCTCGTATGACATTGGGACTGGAT
TTGGGCATTTCGCCATTTCCACTCAAGATGTTGCCAAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCA
AGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCAGGTCCAGTCAAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCT
TTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTCGTCCAGAGAGGTCCTACTCCTGAAC
CACTCTGTCAAGTCATGCTTCGTGTTGGTGATCTTGACCGCGCCATCAAGTTCTATGAAA
AGGCC*TGGGGATGAGACTCTTGAGAAG*ATCGAGAGACCTGAATACAAGTACACCATAG
*CATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2CW12JQ 684 0 0
GTTACACTTTTGAGCTCGTCCAGAGAGGTCCTACTCCTGAACCACTCTGTCAAGTCATGC
TTCGTGTTGGTGATCTTGACCGCGCCATCAAGTTTTATGAAAAGGCCCTGGGGATGAGAC
TCTTGAGAAGGATCGAGAGACCTGAATACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCTG
AGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCTATAACTACGGCGTGACTGAGTACACAA
AGGGCAACGCATATGCACAGATTGCAATAGGCACAGATGACGTGTACAAAAGCGGTGAAG
TTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCACTAGAGAAGCCGGACCTCTTC
CTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAAACAGTTCTGG
TAGACAATGAAGATTTTTTGAAGGAACTGGAATGAAGAGAGAGAGGGATGATGATGGTCA
AGATCACAGCTAAAACGTAACCATAATAATTAAATATGTGAACTTATCAAAGTAGAGAGA
AGACTTAGTATTTGATCTAAATAAAGATGTGGTTGGTTCAGTTTGTGTGTCGTGTTCTAT
CTGCTCGTGCCTTTTGTCTTTTGAGCTAAAACTCTGTTACGTTCCTGAATAAAATATATA
CCCCCCCTGGTTTTGGTGTTTACC

QA 1 684 1 684
DS 



CO CL14Contig5 688 2 5 U
ACCGGTAAACACCAAAACCAGGTGGTGGATATATTTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTTT
TAGCAGACGACACACAAACTGAACAAACATCTTATTTAGTAAATCAAATACTAAGTCTTC
TCTCTACTTTGATAAAATCACATATTTTATTATTATGGTTACGTTTTAGCTGTGATCTAT
TCTTGACCATCAGCATCCCTCTCTCTCTCTCCTCATTCCAGTTCCTTCAAAAAATCTTCG
TTGTCTACCAAAACTGTTTTCCACCCATCAGGATCGAGGAACGAGACAATCTTGGTGCCT
AGTCCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCTCCTAGCTCTTGGTTCATTATC
TTCACAACTTCTCAAGAGTCTCATCCCTAGGACCTTCTCATAAAACTTGATGGCGCGGTC
AAGATCACCAACGCGAAGCATGACTTGACAGAGTGGTTCAGGAGTAGGACCTCTCTGGAT
GAGCTCAAAAGTGTAACCATCAGGGTCCTTCACAAAGGCAATGACACTGTTTCCACCTTT
GACAGGACCTGGCTCTCTGGTGACATTTCCACCCTTGGCACGGACAGTCTCAACCATCTT
GGCAACATCTTGAGTGGAAATAGCGAAATGCCCAAATCCAGTCCCAATTTCATAGGAGCT
AACACCATAATTGTATGTGAGCTCGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D544JQ U 73
AF RR2FJ06JQ U 1
BS 1 135 RR2FJ06JQ
BS 136 136 RR2D544JQ
BS 137 263 RR2FJ06JQ
BS 264 264 RR2D544JQ
BS 265 688 RR2FJ06JQ

RD RR2D544JQ 208 0 0
CACAAACTGAACAAACATCTTATTTAGTAAATCAAATACTAAGTCTTCTCTCTACTTTGA
TAAAATCACATATTTTATTATTATGGTTACTTTTTAGCTGTGATCTATTCTTGACCATCA
GCATCCCTCTCTCTCTCTCCTCATTCCGGTTCCTTCAAAAAATCTTCTTTGTCTACCAAA
ACTGTTTTCCACCCATCAGGATCGAGGA

QA 1 208 1 208
DS 

RD RR2FJ06JQ 688 0 0
ACCGGTAAACACCAAAACCAGGTGGTGGATATATTTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTTT
TAGCAGACGACACACAAACTGAACAAACATCTTATTTAGTAAATCAAATACTAAGTCTTC
TCTCTACTTTGATAAGATCACATATTTTATTATTATGGTTACGTTTTAGCTGTGATCTAT
TCTTGACCATCAGCATCCCTCTCTCTCTCTCCTCATTCCAGTTCCTTCAAAAAATCTTCG
TTGTCTACCAAAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGGAACGAGACAATCTTGGTGCCT
AGTCCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCTCCTAGCTCTTGGTTCATTATC
TTCACAACTTCTCAAGAGTCTCATCCCTAGGACCTTCTCATAAAACTTGATGGCGCGGTC
AAGATCACCAACGCGAAGCATGACTTGACAGAGTGGTTCAGGAGTAGGACCTCTCTGGAT
GAGCTCAAAAGTGTAACCATCAGGGTCCTTCACAAAGGCAATGACACTGTTTCCACCTTT
GACAGGACCTGGCTCTCTGGTGACATTTCCACCCTTGGCACGGACAGTCTCAACCATCTT
GGCAACATCTTGAGTGGAAATAGCGAAATGCCCAAATCCAGTCCCAATTTCATAGGAGCT
AACACCATAATTGTATGTGAGCTCGACG

QA 1 688 1 688
DS 



CO CL14Contig6 926 2 8 U
GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTAGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAG
AAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTT
CTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGC
TTTGGCATGAAGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTATTCTAATGCTTTC
CTTGGTTTTGGTCCTGAGACCTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTT
AGCTCGTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTCCACTCAAGATGTTGCC
AAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCAGGTCCAGTC
AAAGGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCTATAACTACGGCGTGACTGAGTA
CACAAAGGGCAACGCATATGCACAGATTGCAATAGGCACAGATGACGTGTACAAAAGCGG
TGAAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCACTAGAGAAGCCGGACC
TCTTCCTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAAACAGT
TCTGGTAGACAATGAAGATTTTCTGAAGGAACTGGAATGAAGAGAGAGAGGGATGATGAT
GGTCAAGATCACAGCTAAAACGTAACCATAATAATTAAATATGTGAACTTATCAAAGTAG
AGAGAAGACTTAGTATTTGATCTAAATAAAGATGTGGTTGGTTCAGTTTGTGTGTCGTGT
TCTATCTGCTCGTGCCTTTTGTCTTTTGAGCTAAAACTCTGTTACGTTCCTGAATAAAAT
ATATACACCACCTGGTTTTGGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK46TF U 1
AF RR2FK46JQ C 105
BS 1 655 RR2FK46TF
BS 656 656 RR2FK46JQ
BS 657 690 RR2FK46TF
BS 691 691 RR2FK46JQ
BS 692 725 RR2FK46TF
BS 726 726 RR2FK46JQ
BS 727 739 RR2FK46TF
BS 740 926 RR2FK46JQ

RD RR2FK46TF 744 0 0
GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTAGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAG
AAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAATGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTT
CTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGC
TTTGGCATGAAGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTATTCTAATGCTTTC
CTTGGTTTTGGTCCTGAGACCTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTT
AGCTCGTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTCCACTCAAGATGTTGCC
AAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCAGGTCCAGTC
AAAGGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCTATAACTACGGCGTGACTGAGTA
CACAAAGGGCAACGCATATGCACAGATTGCAATAGGCACAGATGACGTGTACAAAAGCGG
TGAAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCACTAGAGAAGCCGGACC
TCTTCCTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAA*CAGT
TCTGGTAGACAATGAAGATTTTCTGAAGGA*CTGGAATGAAGAGAGAGAGGGATGATGAT
GGTCA*GATCACAGCTAAA
CGTAA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2FK46JQ 822 0 0
GGATAAGCGTCGTTTTCTCCATGT*GTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCA
GTTTTACACTGAGTGCTTTGGCATGAAGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAA
GTATTCTAATGCTTTCCTTGGTTTTGGTCCTGAGACCTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCAC
ATACAATTATGGTGTTAGCTCGTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTC
CACTCAAGATGTTGCCAAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAG
AGAGCCAGGTCCAGTCAAAGGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCTATAACT
ACGGCGTGACTGAGTACACAAAGGGCAACGCATATGCACAGATTGCAATAGGCACAGATG
ACGTGTACAAAAGCGGTGAAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCA
CTAGAGAAGCCGGACCTCTTCCTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTG
ATGGCTGGAAAACAGTTTTGGTAGACAATGAAGATTTTCTGAAGGAACTGGAATGAAGAG
AGAGAGGGATGATGATGGTCAAGATCACAGCTAAAACGTAACCATAATAATTAAATATGT
GAACTTATCAAAGTAGAGAGAAGACTTAGTATTTGATCTAAATAAAGATGTGGTTGGTTC
AGTTTGTGTGTCGTGTTCTATCTGCTCGTGCCTTTTGTCTTTTGAGCTAAAACTCTGTTA
CGTTCCTGAATAAAATATATACACCACCTGGTTTTGGTGTTT

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 35

CO CL15Contig1 4281 35 56 U
CATCCTATCTCTTCTAAATTTGTGTATGTCTTTTTTTAAATAGAATCAAAGATCAATTTT
ATTTCGATTTATTTAAAAATAACGTAATATCATCATTACAAATGTAATTTTTGTTAGAGT
TAGAATATTATAACAAATCCTTATTTTATTTTTTTCATTGTTTTTTTCATCTTTTATTAC
TTTTTTTATTTGGAAAAAAACCAATTTTTCGCCGGCGAATATTTACCCTTTCAATATCTA
TTTAAGTTTGCTGTTTATACCCCGAGGTCTCAAAATCAAAATCAGAAATCAGAATAGATA
ATAAAGTTTCTGGTTTATTCCGCCATCCTGTCCAATGAATTACTAAAATTTCTTGTTCAC
TAAAATCCTATATATTCATGGGTTCCGTCGTTCCCATCGCTTCTTGATTAATCATTAGGC
CTGAATTCTACAATGGAGCTTTTACATGAAATTTTGAATTTCATTTTTTTTTTGAGGCAA
TTTTCTCAGTTTTTATTGGCTCAAGGCTCTTAATTTTTTGTTTTCGGAACAGATTTATCT
AATTATTATGAATGAATCTGTATTGATGCTTTATTACATTGCTTTTCTTACAGTGACCTC
ATAGATTTTCCAAATTGGAATCATATATCATTAATATTCAATTTTTTCGCTCTTTCTTTC
ATCCTTCCATTTATCCGCATACTTTTTGATTACCTTTCATAACTTAATAATCATCTTTCT
TTATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTCAGTTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATCATAT
CTTGACTAATTTTTT*GGATCCAGATAATGCGAAGCAATGAGTTGCTTAGGTTATTTATT
AATGCTGTAGTTATTAGTTGCTCTTATAGGTAAGTTCTTTTTTTTT**TATCGTAATCTA
ACCCTAAACCAACGAGTCACACACTAAGCATAGCAATTATATCAAAGGAGTTTTGATGGA
AATGTTTATTCAACCTTATAGAATTGCTTATTTTTTTTCTTAAACATAAAAAAGAAGACT
ACAAGTTTTTATTTTTATTTCTTTTTTT*ATTTCTTTATAGTGTTATACTATATAGTTTT
CGTTTTTTATCATTGGATAAAATGTAAAGACAAATAAAGTTTTTTTATTCTTCGTCTACG
AATATCCAAATTTTTATTCCTAAAACCCCATAAATAGTTCGAACTGTATAGGAACAATAA
TCAATTTTAGCTTCAATTGTTTGTAAAGGAACTCTGCCTTCTCTGATCCATTCAACACGT
GCAATTTCTTTTCCGTCGATACGTCCTGCAATTTGTACTTGAATTCCTTTTGTATTCGCC
TGTTCAGTTAATTCAATAGCTTTTTTCATTGCTTTTCGAAAAGAAACACGATTTTTTAAT
TGGCCAGCTATAAATTCTGCAAGAATATTAGGATGCCCATACGGATTGGAAATTCGGGTA
ATAGCAATGTTGAGTTTTCTATTGGCACAATTAAGTTCTTTTTGAACATTCATCTGTAAT
TCTTCGATTCTTCGGGGTTTATCTTCAATTAATAATTTAGGAAATCCCATATAGATTATG
ATCTGAACGAGATCGATTCTTTTTTGAATTTCGATACGTGCAATTCCCTCCATACCAGAG
GATATTCTTATATTTTTTTGGACATAATTTTTAATACAGTCTCGTATTTTTTTATCTTCT
TCTAAACCTTCAGAATACTTTTTT*GGTTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGT
TGTACC*AAGTCTGAAACCAAGTGGATTTATTTTTT*GTCCCATAGGCCTCCACTACTAT
ATGTATCGTAACATGTTAGATTTATGTTTTCATTGCTGCATCCAGGTTTTTT*AAAATAC
ATTAAATATTCTTCATATTGTTGATATAAGGATATATCTTCCAATACGATAGTTATATGA
CAAGTGGATCTTTTTATTGGGAAACTCCGTCCTCGTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACC
GTATTTCCTTGATTCACTTCAGCTTTACTAATGACTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTA
TTGTGACTAGCATTTGCTGCTGCAGAATAAACTAATTTAAAAATGGGATAACATCCTCGA
TACGGCATAAGTTCTAATATCATAAGTGCTTCTTCGTAGGAACGTCCACGG*ATCTGATC
AATAACTCTCCGTGCTTTGTGGGCAGACATAGATATATATTGCCCTAAAGCATATACGGA
AGTATATGATTTCTTCTTTTTCTTCTTTATCATAAGGTTTACCTCTCACTAAAAAAAATT
TATATTCATTATTCATTTTTTT*GAATTCATTTAATTAACGACGAGATCTATTATCATTT
TTCGCGTGTCCTCGAAAATTTATAGTAGGTGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCATA
AGGTCGATTATATAAACGGGTAAGTGTTCCCTTCCATTATGTATAGCGATAGTATGGCCA
ATCATTGTGGGTATAATAGTAGATGCCCGGGACCAAGTTATTATGATTTCTTTTTCCGCC
TTTGTATTAAGCTTCTCTATTTTTCTTAATAAATGCTTTGCCACAAAAGGATTTTTTTTT
AGTGAACGTGTCACAGTTAATTAACTCCTATTTTTTTTTAAGACGAAGAAAGAAATTCTA
TTTTCTCTCCTATTTACTACGGCGACGAAGAATCAAAGTCTCACTATATTTTTTCCTTTT
TCTAGTTCTTCTTCCAAGCGCAGGATAACCCCAGGGGGTTACGGGTTTTTTTCTACCAAT
TGGAGCCCTCCCTTCACCACCTCCATGGGGGTGGTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTCT
TACTACAGGACGTTTACCTAGCCAACATTTCGATCCGGCTCTACCCAAACTTTTCTGGTT
TACCCCAACATTTCCCACTTGTCCGACTGTTGCTGAGCAGTTTTTGGATATCAAACGGAC
CTCTCCAGAAGGTAATTTTAATGTGGCCGATTTCCCCTCTTTTGCAATCAGTTTCGCTAC
AGCACCCGCTGCTCTAGCTAATTGTCCACCCTTTCCAAGTGTGATTTCTATATTATGTAT
GGCCGTGCCTAAGGGCATATCGGTCAAAGGTAGGGCATTTCCCATTTTTATAGGAACTTC
TGTACCAAAAACAATGGTATCTCCAATTATAGCCCCTCTGGGATGTAAAATATATCTCTT
CTCACC*ATCCCCATAGTGTATGAGACAAATGTATGCATTTCGATTAGGGTCGTATTCTA
TGGTTACGATTCTACCATATATGTCTTTTGTATTTCGTCGAAAATCTATTTTACGGTATA
GACGCTTATGACCTCCCCCTCTATGCCTTACGGTAATGATTCCTCTGGCATTACGACCTT
TACCACAATGATGCTGCCCATAGATCAAATTATTTCGTGGATTGGATTTCACTTGACTGT
CTACGGCTCCATTGCGTGTGCTCGGGGTAGAAGTTTTGTATAAATGTATCGCCATGCTAT
TAAGTATTTTGATTTAAGTTCTTTTCTTTCTAAGAGGTGGAATAGAATAACCCGGTTGAA
GCGTAATGATCATACGTCTGTAATGCATTGTATGTCCCAGAATAGGTCCCATTCTTTTAA
CCTTTCCGGGGAGTCGATGACTATTCATAGCTATTACCTTGACACCAAAGAAGAGTTCGA
CCCAATGCTTTATTTCTGTCCTAGTTGATCCTGATTCGACATTAAAAGTATATTGATTTT
TCCCCAATAACCGAATACTTTTGTCTGTAAATACTGCATATTTGATTCCATCCATAAATC
GATTTTCTTCCCTATGAGTTCTAGTCTCAATAAGAATGCTAGTTCTTACTGTTCATATGT
TATGACATGAATATACCACACCAATTCGTTATGTATAGATGATGAGAAGATTCCATTGAT
AAAGAGCCAATTCCAATAGACTTATTGGAGGGTCCCATTGGCGTGCATCCAGTAGGAATT
GAACCTACGAATTCGCCAATTATGAGTTGGGCGCTTTAACCATTCAGCCATGGATGCTTA
GTGGGGACCCCCGTACAACATGAAGTGCAGATGGGTTCCTAACAATGGAGATGGAATGCT
AAGTAACTCGATGCAGGATAACAACTACTTTGGAGATGATTCCAGCATAATAGAAAACGA
CTCAGCTGTGAGGTCGCCTAATGTTGTCAAGTTTGAACTTCAGTTGTATAAAACTCGAGA
CGACAAGTATCTGTTGGATCTGCAGAGGGTACATGGTCCTCAGTTCTGTTCTTGGATCTC
TGTGCTGCCTTCCTTGCTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 70 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 45 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU01JQ U 1
AF RR2FB89JQ U 192
AF RR2FU01TF C 266
AF RR2FS69JQ U 744
AF RR2FS69TF C 744
AF RR2FP42JQ U 901
AF RR2FB89TF C 521
AF RR2EE56JQ U 744
AF RR2EE56TF C 744
AF RR2D179JQ U 744
AF RR2GD74JQ U 1058
AF RR2AD57JQ U 1640
AF RR2D179TF C 1357
AF RR2A407JQ U 1640
AF RR2A407TF C 1640
AF RR2BL68JQ U 1648
AF RR2BL68TF C 1640
AF RR2D585JQ U 1595
AF RR2G235JQ U 1640
AF RR2G235TF C 1640
AF RR2FU78JQ U 1640
AF RR2FU78TF C 1699
AF RR2BD43JQ U 1640
AF RR2AD57TF C 1706
AF RR2BD43TF C 1706
AF RR2C280JQ U 2249
AF RR2AB18TF C 2101
AF RR2GE01JQ U 2344
AF RR2C280TF C 2379
AF RR2DP03JQ U 2704
AF RR2GE01TF C 2783
AF RR2AM30JQ U 2753
AF RR2DP03TF C 3073
AF RR2AM30TF C 3123
AF RR2CV54TF U 3586
BS 1 226 RR2FU01JQ
BS 227 227 RR2FB89JQ
BS 228 291 RR2FU01JQ
BS 292 442 RR2FB89JQ
BS 443 443 RR2FU01TF
BS 444 470 RR2FB89JQ
BS 471 472 RR2FU01TF
BS 473 531 RR2FB89JQ
BS 532 532 RR2FU01TF
BS 533 776 RR2FB89JQ
BS 777 794 RR2FS69JQ
BS 795 795 RR2EE56JQ
BS 796 886 RR2FS69JQ
BS 887 888 RR2EE56JQ
BS 889 975 RR2FS69JQ
BS 976 1193 RR2EE56JQ
BS 1194 1350 RR2D179JQ
BS 1351 1743 RR2GD74JQ
BS 1744 1744 RR2AD57JQ
BS 1745 1818 RR2GD74JQ
BS 1819 1819 RR2A407JQ
BS 1820 1844 RR2GD74JQ
BS 1845 1852 RR2AD57JQ
BS 1853 1853 RR2A407JQ
BS 1854 1906 RR2AD57JQ
BS 1907 2078 RR2A407JQ
BS 2079 2142 RR2D585JQ
BS 2143 2143 RR2BL68JQ
BS 2144 2266 RR2D585JQ
BS 2267 2302 RR2BD43JQ
BS 2303 2303 RR2FU78JQ
BS 2304 2350 RR2BD43JQ
BS 2351 2351 RR2C280JQ
BS 2352 2369 RR2BD43JQ
BS 2370 2370 RR2C280JQ
BS 2371 2440 RR2BD43JQ
BS 2441 2450 RR2C280JQ
BS 2451 2451 RR2GE01JQ
BS 2452 2579 RR2C280JQ
BS 2580 2580 RR2GE01JQ
BS 2581 2627 RR2C280JQ
BS 2628 2628 RR2GE01JQ
BS 2629 2666 RR2C280JQ
BS 2667 2667 RR2GE01JQ
BS 2668 2719 RR2C280JQ
BS 2720 2720 RR2GE01JQ
BS 2721 2724 RR2C280JQ
BS 2725 2849 RR2GE01JQ
BS 2850 3313 RR2DP03JQ
BS 3314 3314 RR2AM30JQ
BS 3315 3511 RR2DP03JQ
BS 3512 3577 RR2AM30JQ
BS 3578 3585 RR2DP03TF
BS 3586 3901 RR2CV54TF
BS 3902 3902 RR2AM30TF
BS 3903 4281 RR2CV54TF

RD RR2FU01JQ 294 0 0
CATCCTATCTCTTCTAAATTTGTGTATGTCTTTTTTTAAATAGAATCAAAGATCAATTTT
ATTTCGATTTATTTAAAAATAACGTAATATCATCATTACAAATGTAATTTTTGTTAGAGT
TAGAATATTATAACAAATCCTTATTTTATTTTTTTCATTGTTTTTTTCATCTTTTATTAC
TTTTTTTATTTGGAAAAAAACCAATTTTTCGCCGGCGAATATTTACTCTTTCAATATCTA
TTTAAGTTTGCTGTTTATACCCCGAGGTCTCAAAATCAAAATCAGAAATCA
AAA

QA 1 291 1 291
DS 

RD RR2FB89JQ 585 0 0
GA
AAAAAAACCAATTTTTCGCCGGCGAATATTTACCCTTTCAATATCTATTTAAGTTTGCTG
TTTATACCCCGAGGTCTCAAAATCAAAATCAGAAATCAGAATAGATAATAAAGTTTCTGG
TTTATTCCGCCATCCTGTCCAATGAATTACTAAAATTTCTTGTTCACTAAAATCCTATAT
ATTCATGGGTTCCGTCGTTCCCATCGCTTCTTGATTAATCATTAGGCCTGAATTCTACAA
TGGAGCTTT*ACATGAAATTTTGAATTTCATTTTTTT**TGAGGCAATTTTCTCAGTTTT
TATTGGCTCAAGGCTCTTAATTTTTTGTTTTCGGAACAAATTTATCTAATTATTATGAAT
GAATCTGTATTGATGCTTTATTACATTGCTTTTCTTACAGTGACCTCATAGATTTTCCAA
ATTGGAATCATATATCATTAATATTCAATTTTTTCGCTCTTTCTTTCATCCTTCCATTTA
TCCGCATACTTTTTGATTACCTTTCATAACTTAATAATCATCTTTCTTTATTCTTTTTTT
TTTTTTTTTTAGTCAGTTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATC

QA 3 585 3 585
DS 

RD RR2FU01TF 745 0 0
GGTCTCAGAATCAAAATCAGAAATCAGAATAGATAATAAAGTTTCTGGTTTAT*CCGCCA
TCCTGTCCAATGAATTACTAAGATTTCTTGTTCACTAGAATCCTATATATTCGTGGGTTC
CGTCGTTCCCATCGCTTCTTGATTAATCATTAGGCCTGAATTCTACAATGGAGCTTTTAC
ATGAAATTTTGAATTTCATTTTTTTTTTGAGGCAATTTTCTCAGTTTTTATTGGCTCAAG
GCTCTTAATTTTTTGTTTTCGGAACAGATTTATCTAATTATTATGAATGAATCTGTATTG
ATGCTTTATTACATTGCTTTTCTTACAGTGACCTCATAGATTTTCCAAATTGGAATCATA
TATCATTAATATTCAATTTTTTCGCTCTTTCTTTCATCCTTCCATTTATCCGCATACTTT
TTGATTACCTTTCATAACTTAATAATCATCTTTCTTTATTCTTTTTTTTTTTTT****AG
TCAGTTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATCATATCTTGACTAATTTTTT*GGATCCAGA
TAATGCGAAGCAATGAGTTGCTTAGGTTATTTATTAATGCTGTAGTTATTAGTTGCTCTT
ATAGGTAAGTTCTTTTTTTTT**TATCGTAATCTAACCCTAAACCAACGAGTCACACACT
AAGCATAGCAATTATATCAAAGGAGTTTTGATGGAAATGTTTATTCAACCTTATAGAATT
GCTTATTTTTTTTCTTAAACATA
CC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2FS69JQ 233 0 0
AGTCAGTTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATCATATCTTGACTAATTTTT**GGATCCA
GATAATGCGAAGCAATGAGTTGCTTAGGTTATTTATTAATGCTGTAGTTATTAGTTGCTC
TTATAGGTAAGTTCTTTTTTTTTTTTATCGTAATCTAACCCTAAACCAACGAGTCACACA
CTAAGCATAGCAATTATATCAAAGGAGTTTTGATGGAAATGTTTATTCAACC
C

QA 1 232 1 232
DS 

RD RR2FS69TF 233 0 0
AGTCAGTTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATCATATCTTGACTAATTTTT**GGATCCA
GATAATGCGAAGCAATGAGTTGCTTAGGTTATTTATTAATGCTGTAGTTATTAGTTGCTC
TTATAGGTAAGTTCTTTTTTTTTTTTATCGTAATCTAACCCTAAACCAACGAGTCACACA
CTAAGCATAGCAATTATATCAAAGGAGTTTTGATGGAAATGTTTATTCAACC
C

QA 1 232 1 232
DS 

RD RR2FP42JQ 105 0 0
ACCCTAAACCAACGAGTCACACACTAAGCATAGCAATTATATCAAAGGAGTTTTGATGGA
AATGTTTATTCAACCTTATAGAATTGCTTATTTTTTTT
TCTTAAA

QA 1 98 1 98
DS 

RD RR2FB89TF 651 0 0
TTTTCGGAACAGATTTATCTAATTATTATGAATGAATCTGTATTGATGCTTTATTACATT
GCTTTTCTTACAGTGACCTCATAGATTTTCCAAATTGGAATCATATATCATTAATATTCA
ATTTTTTCGCTCTTTCTTTCATCCTTCCATTTATCCGCATACTTTTTGATTACCTTTCAT
AACTTAATAATCATCTTTCTTTATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTCAGTTGCTCCAATG
ATATGATCAGCCTATCATATCTTGACTAATTTTTTTGGATCCAGATAATGCGAAGCAATG
AGTTGCTTAGGTTATTTATTAATGCTGTAGTTATTAGTTGCTCTTATAGGTAAGTTCTTT
TTTTTT**TATCGTAATCTAACCCTAAACCAACGAGTCACACACTAAGCATAGCAATTAT
ATCAAAGGAGTTTTGATGGAAATGTTTATTCAACCTTATAGAATTGCTTATTTTTTTTCT
TAAACATAAAAAAGAAGACTACAAGTTTTTATTTTTATTTCTTTTTTTTATTTCTTTATA
GTGTTATACTATATAGTTTTCGTTTTTTATCATTGGATAAAATGTAAAGACAAATAAAGT
TTTTT*ATTCTTCGTCTACGAATATCCAAATTTTTATTCCTAAAACCCC
CC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2EE56JQ 451 0 0
AGTCAGTTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATCATATCTTGACTAATTTTTT*GGATCCA
GATAATGCGAAGCAATGAGTTGCTTAGGTTATTTATTAATGCTGTAGTTATTAGTTGCTC
TTATAGGTAAGTTCTTTTTTTTT***ATCGTAATCTAACCCTAAACCAACGAGTCACACA
CTAAGCATAGCAATTATATCAAAGGAGTTTTGATGGAAATGTTTATTCAACCTTATAGAA
TTGCTTATTTTTTTTCTTAAACATAAAAAAGAAGACTACAAGTTTTTATTTTTATTTCTT
TTTTT*ATTTCTTTATAGTGTTATACTATATAGTTTTCGTTTTTTATCATTGGATAAAAT
GTAAAGACAAATAAAGTTTTTTTATTCTTCGTCTACGAATATCCAAATTTTTATTCCTAA
AACCCCATAAATAGTTCGAACTGTATAGGA
C

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR2EE56TF 451 0 0
AGTCAGTTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATCATATCTTGACTAATTTTTT*GGATCCA
GATAATGCGAAGCAATGAGTTGCTTAGGTTATTTATTAATGCTGTAGTTATTAGTTGCTC
TTATAGGTAAGTTCTTTTTTTTT***ATCGTAATCTAACCCTAAACCAACGAGTCACACA
CTAAGCATAGCAATTATATCAAAGGAGTTTTGATGGAAATGTTTATTCAACCTTATAGAA
TTGCTTATTTTTTTTCTTAAACATAAAAAAGAAGACTACAAGTTTTTATTTTTATTTCTT
TTTTT*ATTTCTTTATAGTGTTATACTATATAGTTTTCGTTTTTTATCATTGGATAAAAT
GTAAAGACAAATAAAGTTTTTTTATTCTTCGTCTACGAATATCCAAATTTTTATTCCTAA
AACCCCATAAATAGTTCGAACTGTATAGGA
C

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR2D179JQ 607 0 0
G
GTCAGTTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATCATATCTTGACTAATTTTTT*GGATCCAG
ATAATGCGAAGCAATGAGTTGCTTAGGTTATTTATTAATGCTGTAGTTATTAGTTGCTCT
TATAGGTAAGTTCTTTTTTTTT**TATCGTAATCTAACCCTAAACCAACGAGTCACACAC
TAAGCATAGCAATTATATCAAAGGAGTTTTGATGGAAATGTTTATTCAACCTTATAGAAT
TGCTTATTTTTTTTCTTAAACATAAAAAAGAAGACTACAAGTTTTTATTTTTATTTCTTT
TTTT*ATTTCTTTATAGTGTTATACTATATAGTTTTCGTTTTTTATCATTGGATAAAATG
TAAAGACAAATAAAGTTTTTTTATTCTTCGTCTACGAATATCCAAATTTTTATTCCTAAA
ACCCCATAAATAGTTCGAACTGTATAGGAACAATAATCAATTTTAGCTTCAATTGTTTGT
AAAGGAACTCTGCCTTCTCTGATCCATTCAACACGTGCAATTTCTTTTCCGTCGATACGT
CCTGCAATTTGTACTTGAATTCCTTTTGTATTCGCCTGTTCAGTTAATTCAATAGCTTTT
TTCATT

QA 2 607 2 607
DS 

RD RR2GD74JQ 787 0 0
ATAGTGTTATACTATATAGTTTTCGTTTTT*ATCATTGGATAAAATGTAAAGACAAATAA
AGTTTTTTTATTCTTCGTCTACGAATATCCAAATTTTTATTCCTAAAACCCCATAAATAG
TTCGAACTGTATAGGAACAATAATCAATTTTAGCTTCAATTGTTTGTAAAGGAACTCTGC
CTTCTCTGATCCATTCAACACGTGCAATTTCTTTTCCGTCGATACGTCCTGCAATTTGTA
CTTGAATTCCTTTTGTATTCGCCTGTTCAGTTAATTCAATAGCTTTTTTCATTGCTTTTC
GAAAAGAAACACGATTTTTTAATTGGCCAGCTATAAATTCTGCAAGAATATTAGGATGCC
CATACGGATTGGAAATTCGGGTAATAGCAATGTTGAGTTTTCTATTGGCACAATTAAGTT
CTTTTTGAACATTCATCTGTAATTCTTCGATTCTTCGGGGTTTATCTTCAATTAATAATT
TAGGAAATCCCATATAGATTATGATCTGAACGAGATCGATTCTTTTTTGAATTTCGATAC
GTGCAATTCCCTCCATACCAGAGGATATTCTTATATTTTTTTGGACATAATTTTTAATAC
AGTCTCGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACTTTTTT*GGTTGTGCAAAC
CAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTGCC*AAGTCTGAAACCAAGTGGATTTATTTTTT*
GTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAAATTTATGTTTTCATTGCT
GCATCCA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2AD57JQ 267 0 0
GGACATAATTTTTAATACAGTCTCGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAAAATACT
TTTTT*GGTTGTGCAAACCAAATAAAATGATGACTTTGGGTTGTACC*AAGTCTGAAACC
AAGTGGATTTATTTTTT*GTCCCATAGGCCCCCACTACTATATGTATCGTAACATGCTAA
ATTTATGTTTTCATTGCTGCATCCAGGTTTTTTTAAAATACATTAAATATTCTTCATATT
GTTGATATAAGGATATATCTTCCAATA

QA 1 267 1 267
DS 

RD RR2D179TF 727 0 0
CGA
AAAGAAACACGATTTTT*AATTGGCCAGCTATAAATTCTGCAAGAATATTAGGATGCCCA
TACGGATTGGAAATTCGGGTAATAGCAATGTTGAGTTTTCTATTGGCACAATTAAGTTCT
TTTTGAACATTCATCTGTAATTCTTCGATTCTTCGGGGTTTATCTTCAATTAATAATTTA
GGAAATCCCATATAGATTATGATCTGAACGAGATCGATTCTTTTTTGAATTTCGATACGT
GCAATTCCCTCCATACCAGAGGATATTCTTATATTTTTTTGGACATAATTTTTAATACAG
TCTCGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACTTTTTT*GGTTGTGCAAACCA
AATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACC*AAGTCTGAAACCAAGTGGATTTATTTTTT*GT
CCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAGATTTATGTTTTCATTGCTGC
ATCCAGGTTTTTT*AAAATACATTAAATATTCTTCATATTGTTGATATAAGGATATATCT
TCCAATACGATAGTTATATGACAAGTGGATCTTTTTATTGGGAAACTCCGTCCTCGTGCC
CGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACTTCAGCTTTACTAATGACTAAA
TTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCTGCTGCAGAATAAACTAATTTA
AAAA

QA 4 727 4 727
DS 

RD RR2A407JQ 439 0 0
GGACATAATTTTTAATACAGTCTCGTATTTGTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACT
TTTTT*GGTTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACC*AAGTCTGAAACC
AAGTGGATTTATTTTTT*GTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAG
ATTTATGTTTTCATTGCTGCATCCAGGTTTTTT*AAAATACATTAAATATTCTTCATATT
GTTGATATAAGGATATATCTTCCAATACGATAGTTATATGACAAGTGGATCTTTTTATTG
GGAAACTCCGTCCTCGTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACTT
CAGCTTTACTAATGACTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCTG
CTGCAGAATAAACTAATTT

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2A407TF 439 0 0
GGACATAATTTTTAATACAGTCTCGTATTTGTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACT
TTTTT*GGTTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACC*AAGTCTGAAACC
AAGTGGATTTATTTTTT*GTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAG
ATTTATGTTTTCATTGCTGCATCCAGGTTTTTT*AAAATACATTAAATATTCTTCATATT
GTTGATATAAGGATATATCTTCCAATACGATAGTTATATGACAAGTGGATCTTTTTATTG
GGAAACTCCGTCCTCGTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACTT
CAGCTTTACTAATGACTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCTG
CTGCAGAATAAACTAATTT

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2BL68JQ 542 0 0
TTTTTAATACAGTCACGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACTTTTTT*GG
TTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACC*AAGTCTGAAACCAAGTGGAT
TTATTTTTT*GTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAGATTTATGT
TTTCATTGCTGCATTCAGGTTTTTT*AAAATACATTAAATATTCTTCATATTGTTGATAT
AAGGATATATCTTCCAATACGATAGTTATATGACAAGTGGATCTTTTTATTGGGAAACTC
CGTCCTCGTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACTTCAGCTTTA
CTAATGACTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCTGCTGCAGAA
TAAACTAATTTAAAAATGGGATAACATCCTCGATACGGCATAAGTTCTAATATCATAAGT
GCTTCTTCGTAGGAACGTCCACGG*ATCTGATCAATAACTCTCCGTGCTTTGTGGGCAGA
C
C

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR2BL68TF 550 0 0
GGACATAATTTTTAATACAGTCACGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACT
TTTTT*GGTTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACC*AAGTCTGAAACC
AAGTGGATTTATTTTTT*GTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAG
ATTTATGTTTTCATTGCTGCATTCAGGTTTTTT*AAAATACATTAAATATTCTTCATATT
GTTGATATAAGGATATATCTTCCAATACGATAGTTATATGACAAGTGGATCTTTTTATTG
GGAAACTCCGTCCTCGTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACTT
CAGCTTTACTAATGACTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCTG
CTGCAGAATAAACTAATTTAAAAATGGGATAACATCCTCGATACGGCATAAGTTCTAATA
TCATAAGTGCTTCTTCGTAGGAACGTCCACGG*ATCTGATCAATAACTCTCCGTGCTTTG
TGGGCAGAC
C

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2D585JQ 672 0 0
TACGTGCAATTCCCTCCATACCAGAGGATATTCTTATATTTTTTTGGACATAATTTTTAA
TACAGTCTCGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACTTTTTT*GGTTGTGCA
AACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACC*AAGTCTGAAACCAAGTGGATTTATTTT
TT*GTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAGATTTATGTTTTCATT
GCTGCATCCAGGTTTTTT*AAAATACATTAAATATTCTTCATATTGTTGATATAAGGATA
TATCTTCCAATACGATAGTTATATGACAAGTGGATCTTTTTATTGGGAAACTCCGTCCCC
GTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACTTCAGCTTTACTAATGA
CTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCTGCTGCAGAATAAACTA
ATTTAAAAATGGGATAACATCCTCGATACGGCATAAGTTCTAATATCATAAGTGCTTCTT
CGTAGGAATGTCCACGG*ATCTGATCAATAACTCTCCGTGCTTTGTGGGCAGACATAGAT
ATATATTGCCCTAAAGCATATACGGAAGTATATGATTTCTTCTTTTTCTTCTTTATCATA
AGGTTTACCTCT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2G235JQ 607 0 0
GGACATAATTTTTAATAAAGTCTCGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACT
TTTTTTGGTTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACC*AAGTCTGAAACC
AAGTGGATTTATTTTTTTGTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAG
ATTTATGTTTTCATTGCTGCATCCAGGTTTTTT*AAAATACATTAAATATTCTTCATATT
GTTGATATAAGGATATATCTTCCAATACGATAGTTATATGACAAGTGGATCTTTTTATTG
GGAAACTCCGTCCTCGTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACTT
CAGCTTTACTAATGACTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCTA
CTGCAGAATAAACTAATTTAAAAATGGGATAACATCCTCGATACGGCATAAGTTCTAATA
TCATAAGTGCTTCTTCGTAGGAACGTCCACGG*ATCTGATCAATAACTCTCCGTGCTTTG
TGGGCAGACATAGATATATATTGCCCTAAAGCATATACGGAAGTATATGATTTCTTCTTT
TTC
CCCT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2G235TF 607 0 0
GGACATAATTTTTAATAAAGTCTCGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACT
TTTTTTGGTTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACC*AAGTCTGAAACC
AAGTGGATTTATTTTTTTGTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAG
ATTTATGTTTTCATTGCTGCATCCAGGTTTTTT*AAAATACATTAAATATTCTTCATATT
GTTGATATAAGGATATATCTTCCAATACGATAGTTATATGACAAGTGGATCTTTTTATTG
GGAAACTCCGTCCTCGTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACTT
CAGCTTTACTAATGACTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCTA
CTGCAGAATAAACTAATTTAAAAATGGGATAACATCCTCGATACGGCATAAGTTCTAATA
TCATAAGTGCTTCTTCGTAGGAACGTCCACGG*ATCTGATCAATAACTCTCCGTGCTTTG
TGGGCAGACATAGATATATATTGCCCTAAAGCATATACGGAAGTATATGATTTCTTCTTT
TTC
CCCT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2FU78JQ 679 0 0
GGACATAATTTTTAATACAGTCTCGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACT
TTTTTTGGTTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACC*AAGTCTGAAACC
AAGTGGATTTATTTTTT*GTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAG
ATTTATGTTTTCATTGCTGCATCCAGGTTTTTT*AAAATACATTAAATATTCTTCATATT
GTTGATATAAGGATATATCTTCCAATACGATAGTTATATGATAAGTGGATCTTTTTATTG
GGAAACTCCGTCCTCGTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACTT
CAGCTTTACTAATGACTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCTG
CTGCAGAATAAACTAATTTAAAAATGGGATAACATCCTCGATACGGCATAAGTTCTAATA
TCATAAGTGCTTCTTCGTAGGAACGTCCACGG*ATCTGATCAATAACTCTCCGTGCTTTG
TGGGCAGACATAGATATATATTGCCCTAAAGCATATACGGAAGTATATGATTTCTTCTTT
TTCTTCTTTATCATAAGGTTTACCTCTCACTAAAAAAAATTTATATTCATTATTCATTTT
TTT*GAATTCATTTAATT
C

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2FU78TF 620 0 0
TTTTTTTGGTTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACC*AAGTCTGAAAC
CAAGTGGATTTATTTTTT*GTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTA
GATTTATGTTTTCATTGCTGCATCCAGGTTTTTT*AAAATACATTAAATATTCTTCATAT
TGTTGATATAAGGATATATCTTCCAATACGATAGTTATATGATAAGTGGATCTTTTTATT
GGGAAACTCCGTCCTCGTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACT
TCAGCTTTACTAATGACTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCT
GCTGCAGAATAAACTAATTTAAAAATGGGATAACATCCTCGATACGGCATAAGTTCTAAT
ATCATAAGTGCTTCTTCGTAGGAACGTCCACGG*ATCTGATCAATAACTCTCCGTGCTTT
GTGGGCAGACATAGATATATATTGCCCTAAAGCATATACGGAAGTATATGATTTCTTCTT
TTTCTTCTTTATCATAAGGTTTACCTCTCACTAAAAAAAATTTATATTCATTATTCATTT
TTTT*GAATTCATTTAATT
C

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2BD43JQ 802 0 0
GGACATAATTTTTAATACAGTCTCGTATTTTTTTATCTTCTTCTAAACCTTCAGAATACT
TTTTT*GGTTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACC*AAGTCTGAAACC
AAGTGGATTTGTTTTTT*GTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAG
ATTTATGTTTTCATTGCTGCATTCAGGTTTTTT*AAAATACATTAAATATTCTTCATATT
GTTGATATAAGGATATATCTTCCGATACGATAGTTATATGACAAATGGATCTTTTTATTG
GGAAACTCCGTCCTCGTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACTT
CAGCTTTACTAATGACTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCTG
CTGCAGAGTAAACTAATTTAAAAATGGGATAACATCCTCGATACGGCATAAGTTCTAATA
TCATAAGTGCTTCTTCGTAGGAACGTCCACGG*ATCTGATCAATAACTCTCCGTGCTTTG
TGGGCAGACATAGATATATATTGCCCTAAAGCATATACGGAAGTATATGATTTCTTCTTT
TTCTTCTTTATCATAAGGTTTACCTCTCACTAAAAAAAATTTATATTCATTATTCATTTT
TTTTGAATTCATTTAATTAACGACGAGATCTATTATCATTTTTCGCGTGTCATCGAAAAT
TTATAGTAGGGGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCATAAGGTCGATTATATAAACGG
GTAAGTGTTCCCTTCCATTAT
C

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2AD57TF 721 0 0
GGTTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACC*AAGTCTGAAACCAAGTGG
ATTTATTTTTT*GTCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGCTAGATTTAT
GTTTTCATTGCTGCATCCAGGTTTTTTTAAAATACATTAAATATTCTTCATATTGTTGAT
ATAAGGATATATCTTCCAATACGATAGTTATATGACAAGTGGATCTTTTTATTGGGAAAC
TCCGTCCTCGTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACTTCAGCTT
TACTAATGACTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCTGCTGCAG
AATAAACTAATTTAAAAATGGGATAACATCCTCGATACGGCATAAGTTCTAATATCATAA
GTGCTTCTTCGTAGGAACGTCCACGG*ATCTGATCAATAACTCTCCGTGCTTTGTGGGCA
GACATAGATATATATTGCCCTAAAGCATATACGGAAGTATATGATTTCTTCTTTTTCTTC
TTTATCATAAGGTTTACCTCTCACTAAAAAAAATTTATATTCATTATTCATTTTTTT*GA
ATTCATTTAATTAACGACGAGATCTATTATCATTTTTCGCGTGTCCTCGAAAATTTATAG
TAGGTGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCATAAGGTCGATTATATAAACGGGTAAGT
C

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2BD43TF 736 0 0
GGTTGTGCAAACCAAATAGAATGATGACTTTGGGTTGTACCCAAGTCTGAAACCAAGTGG
ATTTGTTTTTTGTCCCCATAGGCCTCCACTACTATATGTATCGTAACATGTTAGATTTAT
GTTTTCATTGCTGCATTCAGGTTTTTTAAAAATACATTAAATATTCTTCATATTGTTGAT
ATAAGGATATATCTTCCGATACGATAGTTATATGACAAATGGATCTTTTTATTGGGAAAC
TCCGTCCTCGTGCCCGAGGTTTTAATTTTTTCACCGTATTTCCTTGATTCACTTCAGCTT
TACTAATGACTAAATTGGTTTCTTTGAAACCCTTATTGTGACTAGCATTTGCTGCTGCAG
AGTAAACTAATTTAAAAATGGGATAACATCCTCGATACGGCATAAGTTCTAATATCATAA
GTGCTTCTTCGTAGGAACGTCCACGG*ATCTGATCAATAACTCTCCGTGCTTTGTGGGCA
GACATAGATATATATTGCCCTAAAGCATATACGGAAGTATATGATTTCTTCTTTTTCTTC
TTTATCATAAGGTTTACCTCTCACTAAAAAAAATTTATATTCATTATTCATTTTTTTTGA
ATTCATTTAATTAACGACGAGATCTATTATCATTTTTCGCGTGTCATCGAAAATTTATAG
TAGGTGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCATAAGGTCGATTATATAAACGGGTAAGT
GTTCCCTTCCATTAT
C

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2C280JQ 476 0 0
ATCATAAGGTTTACCTCTCACTAAAAAAAATTTATATTCATTATTCATTTTTTT*GAATT
CATTTAATTAACGACGAGATCTATTATCATTTTTCGCGTGTCCTCGAAAATTTATAGTAG
GTGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCATAAGGTCGATTATATAAACGGGTAAGTGTT
CCCTTCCATTATGTATAGCGATTGTATGGCCAATCATTGTGGGTATAATAGTAGATGCCC
GGGACCAAGTTATTATGATTTCTTTTTCCGCCTTTGTATTAAGCTTCTCTATTTTTCTTA
ATAAATGCTTTGCCACAAAAGGATTTTTTTT*AGTGAACGTGTCACAGTTAATTAACTCC
TATTTTTTTTTAAGACGAAAAAAGAAATTCTATTTTCTCTCCTATTTACTACGGCGACAA
AGAATCAAAGTCTCACTATATTTTTTCCTTTTTCTAGTTCTTCTTCCAAGCACAGG

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR2AB18TF 669 0 0
TACGGCATAAGTTCTAATATCATAAGTGCTTCTTCGTAGGAACGTCCACGGGATCTGATC
AATAACTCTCCGTGCTTTGTGGGCAGACATAGATATATATTGCCCTAAAGCATATACGGA
AGTATATGATTTCTTCTTTTTCTTCTTTATCATAAGGTTTACCTCTCACTAAAAAAAATT
TATATTCATTATTCATTTTTTT*GAATTCATTTAATTAACGACGAGATCTATTATCATTT
TTCGCGTGTCCTCGAAAATTTATAGTAGGTGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCATA
AGGTCGATTATATAAACGGGTAAGTGTTCCCTTCCATTATGTATAGCGATAGTATGGCCA
ATCATTGTGGGTATAATAGTAGATGCCCGGGACCAAGTTATTATGATTTCTTTTTCCGCC
TTTGTATTAAGCTTCTCTATTTTTCTTAATAAATGCTTTGCTACAAAAGGATTTTTTTTT
AGTGAACGTGTCACAGTTAATTAAATCCTATTTTTTTT*AAGACGAAGAAAGAAATTCTA
TTTTCTCTCCTATTTACTACGGCGACGAAGAATCAAAGTCTCACTATATTTTTCCCTTTT
TCTAGTTCTTCTTCCAAGCGCAGGATAACCCCAGGGGGTTACGGGTTTTTTTCTACCAAT
TGGAGCCC
A

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2GE01JQ 507 0 0
GCGTGTCCTCGAAAATTTATAGTAGGTGAAAATTCTCCCAATTTATGTCCTACCATAAGG
TCGATTATATAAACGGGTAAGTGTTCCCTTCCATTATGTATAGCGATAGTATGGCCAATC
ATTGTGGGTATAATAGTAGATGCCCGGGACCAAGTTATTATGATTTCTTTTTCCGCCTTT
GTATTAAGCTTCTCTATTTTTCTTAATAAATGCTTTGCTACAAAAGGATTTTTTTTTAGT
GAACGTGTCACAGTTAATTAACTCCTATTTTTTTTTAAGACGAAGAAAGAAATTCTATTT
TCTCTCCTATTTACTACGGCGACGAAAAATCAAAGTCTCACTATATTTTTTCCTTTTTCT
AGTTCTTCTTCCAAGCGCAGGATAACCCCAGGGGGTTACGGGTTTTTTTCTACCAATTGG
AGCCCTCCCTTCACCACCTCCATGGGGGTGGTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTCTTAC
TACAGGACGTTTACCTAGCCAACATT
T

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2C280TF 444 0 0
TCCCAATTTATGTCCTACCATAAGGTCGATTATATAAACGGGTAAGTGTTCCCTTCCATT
ATGTATAGCGATTGTATGGCCAATCATTGTGGGTATAATAGTAGATGCCCGGGACCAAGT
TATTATGATTTCTTTTTCCGCCTTTGTATTAAGCTTCTCTATTTTTCTTAATAAATGCTT
TGCCACAAAAGGATTTTTTTT*AGTGAACGTGTCACAGTTAATTAACTCCTATTTTTTTT
TAAGACGAAGAAAGAAATTCTATTTTCTCTCCTATTTACTACGGCGACGAAGAATCAAAG
TCTCACTATATTTTTTCCTTTTTCTAGTTCTTCTTCCAAGCACAGGATAAACCCAGGGGG
TTACGGGTTTTTTTCTACCAATTGGAGCCCTCCCTTCACCACCTCCATGGGGGTGGTCGA
CAGGGTTCATAACTACTCCTCTTA

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR2DP03JQ 808 0 0
AGTTCTTCTTCCAAGCGCAGGATAACCCCAGGGGGTTACGGGTTTTTTTCTACCAATTGG
AGCCCTCCCTTCACCACCTCCATGGGGGTGGTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTCTTAC
TACAGGACGTTTACCTAGCCAACATTTCGATCCGGCTCTACCCAAACTTTTCTGGTTTAC
CCCAACATTTCCCACTTGTCCGACTGTTGCTGAGCAGTTTTTGGATATCAAACGGACCTC
TCCAGAAGGTAATTTTAATGTGGCCGATTTCCCCTCTTTTGCAATCAGTTTCGCTACAGC
ACCCGCTGCTCTAGCTAATTGTCCACCCTTTCCAAGTGTGATTTCTATATTATGTATGGC
CGTGCCTAAGGGCATATCGGTCAAAGGTAGGGCATTTCCCATTTTTATAGGAACTTCTGT
ACCAAAAACAATGGTATCTCCAATTATAGCCCCTCTGGGATGTAAAATATATCTCTTCTC
ACC*ATCCCCATAGTGTATGAGACAAATGTATGCATTTCGATTAGGGTCGTATTCTATGG
TTACGATTCTACCATATATGTCTTTTGTATTTCGTCGAAAATCTATTTTACGGTATAGAC
GCTTATGACCCCCCCCTCTATGCCTTACGGTAATGATTCCTCTGGCATTACGACCTTTAC
CACAATGATGCTGCCCATAGATCAAATTATTTCGTGGATTGGATTTCACTTGACTGTCTA
CGGCTCCATTGCGTGTGCTCGGGGTAGAAGTTTTGTATAAATGTATCGCCATGCTATTAA
GTATTTTGATTTAAGTTCTTTTCTTTCT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2GE01TF 750 0 0
TCCAT
GGGGGGGTCGACAGGGTTCATAACTACTCCTCTTACTACAGGACGTT*ACCTAGCCAACA
TT*CGATCCGGCTCTACCCAAACTTTTCTGGTTTACCCCAACATTTCCCACTTGTCCGAC
TGTTGCTGAGCAGTTTTTGGATATCAAACGGACCTCTCCAGAAGGTAATTTTAATGTGGC
CGATTTCCCCTCTTTTGCAATCAGTTTCGCTACAGCACCCGCTGCTCTAGCTAATTGTCC
ACCCTTTCCAAGTGTGATTTCTATATTATGTATGGCCGTGCCTAAGGGCATATCGGTCAA
AGGTAGGGCATTTCCCATTTTTATAGGAACTTCTGTACCAGAAACAATGGTATCTCCAAT
TATAGCCCCTCTGGGATGTAAAATATATCTCTTCTCACC*ATCCCCATAGTGTATGAGAC
AAATGTATGCATTTCGATTAGGGTCGTATTCTATGGTTACGATTCTACCATATATGTCTT
TTGTATTTCGTCGAAAATCTATTTTACGGTATAGACGCTTATGACCTCCCCCTCTATGCC
TTACGGTAATGATTCCTCTGGCATTACGACCTTTACCACAATGATGCTGCCCATAGATCA
AATTATTTCGTGGATTGGATTTCACTTGACTGTCTACGGCTCCATTGCGTGTGATCGGGG
TAGAAGTTTTGTATAAATGTATCGCCATGCTATTAAGTATTTTGATTTAAGTTCTTTTCT
TTCTAAGAGGTGGAATAGAATAACC

QA 6 750 6 750
DS 

RD RR2AM30JQ 825 0 0
CTACCAATTGGAGCCCTCCCTTCACCACCTCCATGGGGGGGGTCGACAGGGTTCATAACT
ACTCCTCTTACTACAGGACGTTCACCTAGCCAACATTTCGATCCGGCTCTACCCAAACTT
TTCTGGTTTACCCCAACATTTCCCACTTGTCCGACTGTTGCTGAGCAGTTTTTGGATATC
AAACGGACCTCTCCAGAAGGTAATTTTAATGTGGCCGATTTCCCCTCTTTTGCAATCAGT
TTCGCTACAGCACCCGCTGCTCTAGCTAATTGTCCACCCTTTCCAAGTGTGATTTCTATA
TTATGTATGGCCGTGCCTAAGGGCATATCGGTCAAAGGTAGGGCATTTCCCATTTTTATA
GGAACTTCTGTACCAAAAACAATGGTATCTCCAATTATAGCCCCTCTGGGATGTAAAATA
TATCTCTTCTCACC*ATCCCCATAGTGTATGAGACAAATGTATGCATTTCGATTAGGGTC
GTATTCTATGGTTACGATTCTACCATATATGTCTTTTGTATTTCGTCGAAAATCTATTTT
ACGGTATAGACGCTTATGACCTCCCCCTCTATGCCTTACGGTAATGATTCCTCTGGCATT
ACGACCTTTACCACAATGATGCTGCCCATAGATCAAATTATTTCGTGGATTGGATTTCAC
TTGACTGTCTACGGCTCCATTGCGTGTGCTCGGGGTAGAAGTTTTGTATAAATGTATCGC
CATGCTATTAAGTATTTTGATTTAAGTTCTTTTCTTTCTAAGAGGTGGAATAGAATAACC
CGGTTGAAGCGTAATGATCATACGTCTGTAATGCATTGTATGTCC

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR2DP03TF 629 0 0
GGGCATATCGGTCAAAGGTAGGGCATTTCCCATTTTTATAGGAACTTCTGTACCAGAAAC
AATGGTATCTCCAATTATAGCCCCTCTGGGATGTAAAATATATCTCTTCTCACC*ATCCC
CATAGTGTATGAGACAAATGTATGCATTTCGATTAGGGTCGTATTCTATGGTTACGATTC
TACCATATATGTCTTTTGTATTTCGTCGAAAATCTATTTTACGGTATAGACGCTTATGAC
CCCCCCCTCTATGCCTTACGGTAATGATTCCTCTGGCATTACGACCTTTACCACAATGAT
GCTGCCCATAGATCAAATTATTTCGTGGATTGGATTTCACTTGACTGTCTACGGCTCCAT
TGCGTGTGCTCGGGGTAGAAGTTTTGTATAAATGTATCGCCATGCTATTAAGTATTTTGA
TTTAAGTTCTTTTCTTTCTAAGAGGTGGAATAGAATAACCCGGTTGAAGCGTAATGATCA
TACGTCTGTAATGCATTGTATGTCCCAGAATAGGTCCCATTCTTTTAACCTTTCCGGGGA
GTCGATGACTATTCATAGCTATTACCTTGACACCAAAGAAGAGTTCGACCCAATGCTTTA
TTTCTGTCCTAGTTGATCCTGATTCGAC
C

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2AM30TF 787 0 0
TACCCA
AAACAATGGTATCTCCAATTATAGCCCCTCTGGGATGTAAAATATATCTCTTCTCACCCA
TCCCCATAGTGTATGAGACAAATGTATGCATTTCGATTAGGGTCGTATTCTATGGTTACG
ATTCTACCATATATGTCTTTTGTATTTCGTCGAAAATCTATTTTACGGTATAGACGCTTA
TGACCTCCCCCTCTATGCCTTACGGTAATGATTCCTCTGGCATTACGACCTTTACCACAA
TGATGCTGCCCATAGATCAAATTATTTCGTGGATTGGATTTCACTTGACTGTCTACGGCT
CCATTGCGTGTGCTCGGGGTAGAAGTTTTGTATAAATGTATCGCCATGCTATTAAGTATT
TTGATTTAAGTTCTTTTCTTTCTAAGAGGTGGAATAGAATAACCCGGTTGAAGCGTAATG
ATCATACGTCTGTAATGCATTGTATGTCCCAGAATAGGTCCCATTCTTTTAACCTTTCCG
GGGAGTCGATGACTATTCATAGCTATTACCTTGACACCAAAGAAGAGTTCGACCCAATGC
TTTATTTCTGTCCTAGTTAATCCTGATTCGACATTAAAAGTATATTGATTTTTCCCCAAT
AACCGAATACTTTTGTCTGTAAATACTGCATATTTGATTCCATCCATAAATCGATTTTCT
TCCCTATGAGTTCTAGTCTCAATAAGAATGCTAGTTCTTACTGTTCATATGTTATGATAT
GAATATACCACACCAATTCGTTATGTATAGATGATGAGAAGATTCCATTGATAAAGAGCC
C

QA 7 786 7 786
DS 

RD RR2CV54TF 696 0 0
GTCCCATTCTTTTAACCTTTCCGGGGAGTCGATGACTATTCATAGCTATTACCTTGACAC
CAAAGAAGAGTTCGACCCAATGCTTTATTTCTGTCCTAGTTGATCCTGATTCGACATTAA
AAGTATATTGATTTTTCCCCAATAACCGAATACTTTTGTCTGTAAATACTGCATATTTGA
TTCCATCCATAAATCGATTTTCTTCCCTATGAGTTCTAGTCTCAATAAGAATGCTAGTTC
TTACTGTTCATATGTTATGACATGAATATACCACACCAATTCGTTATGTATAGATGATGA
GAAGATTCCATTGATACAGAGCCAATTCCAATAGACTTATTGGAGGGTCCCATTGGCGTG
CATCCAGTAGGAATTGAACCTACGAATTCGCCAATTATGAGTTGGGCGCTTTAACCATTC
AGCCATGGATGCTTAGTGGGGACCCCCGTACAACATGAAGTGCAGATGGGTTCCTAACAA
TGGAGATGGAATGCTAAGTAACTCGATGCAGGATAACAACTACTTTGGAGATGATTCCAG
CATAATAGAAAACGACTCAGCTGTGAGGTCGCCTAATGTTGTCAAGTTTGAACTTCAGTT
GTATAAAACTCGAGACGACAAGTATCTGTTGGATCTGCAGAGGGTACATGGTCCTCAGTT
CTGTTCTTGGATCTCTGTGCTGCCTTCCTTGCTCAG

QA 1 696 1 696
DS 



AS 5 30

CO CL16Contig1 738 10 10 U
GGGTTGCTCATCCATTCTCACAATCCAATCTCAATTCCAATCTCTCGCAACATGTCTGAC
GAAGAGCACCACTTCGAGTCCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCT
GGTAACATCCGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAG
GTTTCGACTTCGAAGACTGGCAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCGATTGAT
ATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCT
CATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTT
TTGACCGACAGTGGTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCAGC
GCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCG
ATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGA
AGTATTATCATTCTCTCTTTACACAGAGGATAAATCTTATTTACCCCAGTTGTTATAAGA
ACAAAAACATGTTTTTTTCTTCCTTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCT
TGTTGCAAGACGACCATATCTATTGGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAAC
AGTGAAACTTTCCTACCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 50 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 20 

AF RR2AI50TF U 1
AF RR2AI50JQ C 86
AF RR2H116TF U 4
AF RR2BG71JQ C 8
AF RR2BG71TF U 8
AF RR2AP44TF U 4
AF RR2FX29TF U 1
AF RR2CM66TF U 184
AF RR2FX29JQ C 193
AF RR2CM66JQ C 248
BS 1 40 RR2AI50TF
BS 41 41 RR2FX29TF
BS 42 663 RR2AI50TF
BS 664 664 RR2FX29TF
BS 665 670 RR2AI50TF
BS 671 671 RR2FX29TF
BS 672 720 RR2AI50TF
BS 721 721 RR2CM66TF
BS 722 734 RR2FX29TF
BS 735 738 RR2CM66TF

RD RR2AI50TF 720 0 0
GGGTTGCTCATCCATTCTCACAATCCAATCTCAATTCCAACCTCTCGCAACATGTCTGAC
GAAGAGCACCACTTCGAGTCCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCT
GGTAACATCCGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAG
GTTTCGACTTCGAAGACTGGCAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCGATTGAT
ATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCT
CATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTT
TTGACCGACAGTGGTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCAGC
GCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCG
ATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGA
AGTATTATCATTCTCTCTTTACACAGAGGATAAATCTTATTTACCCCAGTTGTTATAAGA
ACAAAAACATGTTTTTTTCTTCCTTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCT
TGTCGCAAGATGACCATATCTATTGGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAAC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2AI50JQ 635 0 0
ACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAAGGTGGTCACA
TCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCGAAGACTGGCAAGC
ACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCGATTGATATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGG
ATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTGAACCGTATTGATTACCAGT
TGATTGATATTTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACTAAGG
ACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATTTCAGCGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGG
AGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTTTTCGATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCG
TCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTATTATCATTCTCTCTTTACACA
GAGGATAAATCTTATTTACCCCAGTTGTTATAAGAACAAAAACATGTTTTTTTCTTCCTT
TTTTTTTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTCGCAAGATGACCATATCTATTG
GTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAAC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2H116TF 695 0 0
GG
GCTCATCCATTCTCACAATCCAATCTCAATTCCAATCTCTCGCAACATGTCTGACGAAGA
GCACCACTTCGAGTCCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAA
CATCCGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTC
GACTTCGAAGACTGGCAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCGATTGATATCTT
CACTGCTAAGAAGCTCGAGGACATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGT
GGACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGAC
CGACAGTGGTGGCACTAAGGACGAACTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCAGCGCTCT
GATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGG
AGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTAT
TATCATTCTCTCTTTACACAGAGGATAAATCTTATTTACCCCAGTTGTTATAAGAACAAA
AACATGTTTTTTTCTTCCTTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTG
CAAGACGACCATATCTATTGGTTTTGGATTGTT

QA 3 695 3 695
DS 

RD RR2BG71JQ 692 0 0
GG
ATCCATTCTCACAATCCAATCTCAATTCCAATCTCTCGCAACATGTCTGACGAAGAGCGC
CACTTCGAGTCCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATC
CGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACT
TCGAAGACTGGCAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCGATTGATATCTTCACT
GCTAAGAAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTGAAC
CGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCGAC
AGTGGTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCAGCGCTCTGATG
AAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGGAGAG
GAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTATTATC
ATTCTCTCTTTACACAGAGGATAAATCTTATTTACCCCAGTTGTTATAAGAACAAAAACA
TGTTTTTTTCTTCCTTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTGCAAG
ACGACCATATCTATTGGTTTTGGATTGTTG

QA 3 692 3 692
DS 

RD RR2BG71TF 692 0 0
GG
ATCCATTCTCACAATCCAATCTCAATTCCAATCTCTCGCAACATGTCTGACGAAGAGCGC
CACTTCGAGTCCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATC
CGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACT
TCGAAGACTGGCAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCGATTGATATCTTCACT
GCTAAGAAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTGAAC
CGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCGAC
AGTGGTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCAGCGCTCTGATG
AAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGGAGAG
GAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTATTATC
ATTCTCTCTTTACACAGAGGATAAATCTTATTTACCCCAGTTGTTATAAGAACAAAAACA
TGTTTTTTTCTTCCTTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTGCAAG
ACGACCATATCTATTGGTTTTGGATTGTTG

QA 3 692 3 692
DS 

RD RR2AP44TF 694 0 0
GG
GCTCATCCATTCTCACAATCCAATCTCAATTCCAATCTCTCGCAACATGTCTGACGAAGA
GCACCACTTCGAGTCCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAA
CATCCGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGACCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTC
GACTTCGAAGACTGGCAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCGATTGATATCTT
CACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGT
GAACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGAC
CGACAGTGGTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCAGCGCTCT
GATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGG
AGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTAT
TATCATTCTCTCTTTACACAGAGGATAAATCTTATTTACCCCAGTTGTTATAAGAACAAA
AACATGTTTTTTTCTTCCTTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTG
CAAGACGACCATATCTATTGGTTTTGGATTGT

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR2FX29TF 734 0 0
GGGTT
GCTCATCCATTCTCACAATCCAATCTCAATTCCAATCTCTCGCAACATGTCTGACGAAGA
GCACCACTTCGAGTCCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAA
CATCCGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTC
GACTTCGAAGACTGGCAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCGATTGATATCTT
CACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGT
GAACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGAC
CGACAGTGGTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCAGCGCTCT
GATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGG
AGAGGAGCAGATCTTTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTAT
TATCATTCTCTCTTTACACAGAGGATAAATCTTATTTACCCCAGTTGTTATAAGAACAAA
AACATGTTTTTTTCTTCCTTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTG
CAAGACGACCATATCTATTGGTTTTGGATTGTTGAA*TATTTGGTGCTTTAAACA*GTGA
AACTTTCCT

QA 6 734 6 734
DS 

RD RR2CM66TF 555 0 0
TCGACTTCGAAGACTGGCAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCGATTGATATC
TTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCAT
GTGAACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTG
ACCGACAGTGGTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCAGCGCT
CTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATG
GGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGT
ATTATCATTCTCTCTTTACACAGAGGATAAATCTTATTTACCCCAGTTGTTATAAGAACA
AAAACATGTTTTTTTCTTCCTTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGT
TGCAAGACGACCATATCTATTGGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAACAGT
GAAACTTTCCTACCC

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2FX29JQ 545 0 0
AAGACTGGCAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCGATTGATATCTTCACTGCT
AAGAAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTGAACCGT
ATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCGACAGT
GGTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATTTCAGCGCTCTGATGAAG
AGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGGAGAGGAG
CAGATCTTTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTATTATCATT
CTCTCTTTACACAGAGGATAAATCTTATTTACCCCAGTTGTTATAAGAACAAAAACATGT
TTTTTTCTTCCTTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTGCAAGACG
ACCATATCTATTGGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAACAGTGAAACTTTC
CTACC

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2CM66JQ 491 0 0
CTGCTAAGAAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTGA
ACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCG
ACAGTGGTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCAGCGCTCTGA
TGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGGAG
AGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTATTA
TCATTCTCTCTTTACACAGAGGATAAATCTTATTTACCCCAGTTGTTATAAGAACAAAAA
CATGTTTTTTTCTTCCTTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTGCA
AGACGACCATATCTATTGGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAACAGTGAAA
CTTTCCTACCC

QA 1 491 1 491
DS 



CO CL16Contig2 727 3 2 U
CTTCGCTGACTTCTGTCCCTCTCTTTAGGTTTTTTTTTTCATTCCCAATCAATCTCTCTT
TGTTCCTCAAAGCTTTGCAAAACATGTCGGACGAAGAGCACCACTTCGAGTCCAGCGACG
CCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAAGGTGGTCACATCG
TCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCGAAGACTGGCAAGCACG
GTCACGCTAAGTGTCACTTTGTTGCTATTGATATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGGTA
TTGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCCCATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTGA
TTGATATCTCTGAAGATGGCTTTGTCAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACCAAGGATG
ACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTGAGCGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGG
GAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCAATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCA
AGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAACAAATTATCATTCTCTCTACACGGAGGATAATCTTA
TTACCCCCAGTTGTTATAAGAACAAAACAAAAAAAACATGTTTTTCCTTTTTTCTAATTT
TAGACCATTTGTGTGTTTTTACTTGTTGCAAGAGACCACCATTATCTATTGGTTTTGGAT
TGTTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2H257TF U 31
AF RR2BI75TF U 1
AF RR2BI75JQ C 111
BS 1 723 RR2BI75TF
BS 724 727 RR2BI75JQ

RD RR2H257TF 599 0 0
TTTTTTTTTCATTCCCAATCAATCTCTCTTTGTTCCTCAAAGCTTTGCAAAACATGTCGG
ACGAAGAGCACCACTTCGAGTCCAGCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGG
CTGGTAACATCCGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTG
AGGTTTCGACTTCGAAGACTGGCAAGCACGGTCACGCTAAGTGTCACTTTGTTGCTATTG
ATATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATTGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTC
CCCATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAAGATGGCTTTGTCAGCC
TTTTGACCGACAGTGGTGGCACCAAGGATGACCTCAAGCTTCCCACCGATGGTAATCTGA
GCGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTT
CAATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAACAAATT
ATCATTCTCTCTACACGGAGGATAATCTTATTACCCCCAGTTGTTATAAGAACAAAACA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2BI75TF 723 0 0
CTTCGCTGACTTCTGTCCCTCTCTTTAGGTTTTTTTTTTCATTCCCAATCAATCTCTCTT
TGTTCCTCAAAGCTTTGCAAAACATGTCGGACGAAGAGCACCACTTCGAGTCCAGCGACG
CCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAAGGTGGTCACATCG
TCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCGAAGACTGGCAAGCACG
GTCACGCTAAGTGTCACTTTGTTGCTATTGATATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGGTA
TTGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCCCATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTGA
TTGATATCTCTGAAGATGGCTTTGTCAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACCAAGGATG
ACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTGAGCGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGG
GAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCAATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCA
AGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAACAAATTATCATTCTCTCTACACGGAGGATAATCTTA
TTACCCCCAGTTGTTATAAGAACAAAACAAAAAAAACATGTTTTTCCTTTTTTCTAATTT
TAGACCATTTGTGTGTTTTTACTTGTTGCAAGAGACCACCATTATCTATTGGTTTTGGAT
TGT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2BI75JQ 617 0 0
TCCAGAGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAAGGT
GGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCGAAGACT
GGCAAGCACGGTCACGGTAAGTGTCACTTTGTTGCTATTGATATCTTCACTGCTAAGAAG
CTCGAGGGTATTGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCCCATGTGAACCGTATTGAT
TACCAGTTGATTGATATCTCTGAAGATGGCTTTGTCAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGC
ACCAAGGATGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATTTGAGCGCTCTGATGAAGAGTGGA
TTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTTTTCAATGGGAGAGGAGCAGATC
TGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAACAAATTATCATTCTCTCTACACGGAG
GATAATCTTATTACCCCCAGTTGTTATAAGAACAAAACAAAAAAAACATGTTTTTCCTTT
TTTTTAATTTTAGACCATTTGTGTGTTTTTACTTGTTGCAAGAGACCACCATTATCTATT
GGTTTTGGATTGTTTAG

QA 1 617 1 617
DS 



CO CL16Contig3 819 2 2 U
GTCATCCATTCTCACAATCCAATCTCAATTCCAATCTCTCGCAACATGTCTGACGAAGAG
CACCACTTCGAGTCCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAAC
ATCCGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCG
ACTTCGAAGACTGGCAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCGATTGATATCTTC
ACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTG
AACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTACGTCACTTTTTC
TCTATTAATCACTTATGTTTTTGTTTTCCTCTTTGGACATGTTTGAAGAGTTGTAATTGT
TTTAACATTACAGGTTAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCT
TCCCACCGATGATAATCTCAGCGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGT
GGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGGAGAGGAGCGGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGG
TGGTGGCAAGTAAAGCCAAAGAAGTATTATCATTCTCTCTTTACACAGAGGATAAATCTT
ATTTACCCCAGTTGTTATAAGAACAAAAACATGTTTTTTTCTTCCTTTTTTTCTCTGATT
TAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTGCAAGACGACCATATCTATTGGTTTTGGATTGTT
GAAATATTTGGTGCTTTAAAACAGTGAAACTTTCCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ60TF U 1
AF RR2BJ60JQ C 26
BS 1 684 RR2BJ60TF
BS 685 819 RR2BJ60JQ

RD RR2BJ60TF 684 0 0
GTCATCCATTCTCACAATCCAATCTCAATTCCAATCTCTCGCAACATGTCTGACGAAGAG
CACCACTTCGAGTCCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAAC
ATCCGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCG
ACTTCGAAGACTGGCAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCGATTGATATCTTC
ACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTG
AACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTACGTCACTTTTTC
TCTATTAATCACTTATGTTTTTGTTTTCCTCTTTGGACATGTTTGAAGAGTTGTAATTGT
TTTAACATTACAGGTTAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCT
TCCCACCGATGATAATCTCAGCGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGT
GGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGGAGAGGAGCGGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGG
TGGTGGCAAGTAAAGCCAAAGAAGTATTATCATTCTCTCTTTACACAGAGGATAAATCTT
ATTTACCCCAGTTGTTATAAGAAC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2BJ60JQ 794 0 0
CAATTCCAATCTCTCGC
AACATGTCTGACGAAGAGCACCACTTCGAGTCCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTAC
CCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGC
AAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCGAAGACTGGCAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTC
GTTGCGATTGATATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAAT
TGTGATGTTCCTCATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGC
TTTGTACGTCACTTTTTCTCTATTAATCACTTATGTTTTTGTTTTCCTCTTTGGACATGT
TTGAAGAGTTGTAATTGTTTTAACATTACAGGTTAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCAC
TAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCAGCGCTCTGATGAAGAGTGGATT
CGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGGAGAGGAGCGGATCTG
TGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAGCCAAAGAAGTATTATCATTCTCTCTTT
ACACAGAGGATAAATCTTATTTACCCCAGTTGTTATAAGAACAAAAACATGTTTTTTTCT
TCCTTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTGCAAGACGACCATATC
TATTGGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAACAGTGAAACTTTCCTACC

QA 18 794 18 794
DS 



CO CL16Contig4 789 7 1 U
GGATCATCCCCGGACCGAACCTACATCTCTAGCTTCCAAATCGTTGAAACATGTCGGACG
AAGAGCACCACTTCGAGTCCAGCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTG
GTAACATCCGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTCGAGG
TTTCGACTTCAAAGACTGGGAAGCACGGTCACGCAAAGTGTCACTTTGTTGCCATTGACA
TCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATTGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCCC
ATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCCGAGGATGGCTTTGTCAGCCTTT
TGACCGACAGTGGTGGCACCAAGGATGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCAGCG
CTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTTGTGGTGTCTGTCATGTCTTCAA
TGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAACTCAG****
TATCA*TTCTCTTTACCCTGAGAGGATAATATTATTACCAGTGGTCAAATGTTATAAGAA
CCAAAAAACTTGT*TTTTTCCTTTTTCTAATTTAGATCATTTGTGTTGTGTTTCTTGTTG
CAAGACAACCATTATCTATTATTGGTTTTGGATTGCTTAAAAGTTTCGTGTTTTAAACGG
GGAATGTTTTCCTATGAGAAAGATTCTTAACCCTTTGCTTATTATTTGGATGCGCTTAGT
TATGTTAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 25 25 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2B784TF U 318
AF RR2EP52TF U 4
AF RR2EP52JQ C 87
AF RR2GT58TF U 152
AF RR2D484TF U 628
AF RR2FB92TF U 1
AF RR2FB92JQ C 25
BS 1 789 RR2FB92TF

RD RR2B784TF 381 0 0
G
ACCAGTTGATTGATATCTCCGAGGATGGCTTTGTCAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCA
CCAAGGATGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCGGCGCTCTGATGAAGAGTGGAT
TCGAGGAGGGAAAGGATGTTGTGGTGTCTGTCATGTCTTCAATGGGAGAGGAGCAGATCT
GTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAACTCAG****TATCA*TTCTCTTTACCC
TGAGAGGATAATATTATTACCAGTGGTCAAATGTTATAAGAACCAAAAAACTTGT*TTTT
TCCTTTTTCTAATTTAGATCATTTGTGTTGTGTTTCTTGTTGCAAGACAACCATTATCTA
TTATTGGTTTTGGATTG
TTT

QA 2 378 2 378
DS 

RD RR2EP52TF 677 0 0
GGA
TCCCCGGACCGAACCTACATCTCTAGCTTCCAAATCGTTGAAACATGTCGGACGAAGAGC
ACCACTTCGAGTCCAGCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACA
TCCGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTCGAGGTTTCGA
CTTCAAAGACTGGGAAGCACGGTCACGCAAAGTGTCACTTTGTTGCCATTGACATCTTCA
CTGCTAAGAAGCTCGAGGATATTGTTCCCTCTTCCCACAATTGCGATGTTCCCCATGTGA
ACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCCGAGGATGGCTTTGTCAGCCTTTTGACCG
ACAGTGGTGGCACCAAGGATGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCAGCGCTCTGA
TGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTTGTGGTGTCTGTCATGTCTTCAATGGGAG
AGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAACTCAG****TATCA*
TTCTCTTTACCCTGAGAGGATAATATTATTACCAGTGGTCAAATGTTATAAGAACCAAAA
AACTTGT*TTTTTCCTTTTTCTAATTTAGATCATTTGTGTTGTGTTTCTTGTTGCAAGAC
AACCATTATCTATT

QA 4 677 4 677
DS 

RD RR2EP52JQ 612 0 0
GCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAAGGTGGTCACATC
GTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTCGAGGTTTTGACTTCAAAGACTGGGAAGCAC
GGTCACGCAAAGTGTCACTTTGTTGCCATTGACATTTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGAT
ATTGTTCCCTCTTCCCACAATTGCGATGTTCCCCATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTG
ATTGATATTTCCGAGGATGGCTTTGTCAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACCAAGGAT
GACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATTTCAGCGCTTTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAG
GGAAAGGATGTTGTGGTGTTTGTCATGTTTTCAATGGGAGAGGAGCAGATTTGTGCCGTC
AAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAACTCAG****TATCA*TTTTCTTTACCCTGAGAGGA
TAATATTATTACCAGTGGTCAAATGTTATAAGAACCAAAAAACTTGT*TTTTTCCTTTTT
TTAATTTAGATCATTTGTGTTGTGTTTCTTGTTGCAAGACAACCATTATTTATTATTGGT
TTTGGATTGCTT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2GT58TF 581 0 0
G
AAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCAAAGACAGGGAAGCACGGTCAC
GCAAAGTGTCACTTTGTTGCCATTGATATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGGGGATATTGTT
CCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCCCATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTGATTGAT
ATCTCTGAGGATGGCTTTGTCAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACCAAGGATGACCTC
AAGCTTCCCACCGATGATAGTCTGAGCGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAG
GATGTTGTGGTGTCTGTCATGTCTTCAATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAA
GTTGGTGGTGGCAAGTAAACCCAGCCAGTATCAATTCTCTTTACCCTGAGAGGATAATAT
TATTACCAGTGGTCAAATGTTATAAGAACCAAAAA*CTTGTCTTTTTCCTTTTTCTAATT
TAGATCATTTGTGTTGTGTTTCTTGTTGCAAGACAACCATTATCTATTATTGGTTTTGGA
TTGCTTAAAAGTTTCGTGTTTTAAACGGGGAATGTTTTCC

QA 2 581 2 581
DS 

RD RR2D484TF 106 0 0
G
AATTTAGATCATTTGTGTTGTGTTTCTTGTTGCAAGACAACCATTATCTATTATTGGTTT
TGGATTGCTTAAAAGTTTCGTGTTTTAAACGGGGAATGTTTTCCT

QA 2 106 2 106
DS 

RD RR2FB92TF 789 0 0
GGATCATCCCCGGACCGAACCTACATCTCTAGCTTCCAAATCGTTGAAACATGTCGGACG
AAGAGCACCACTTCGAGTCCAGCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTG
GTAACATCCGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTCGAGG
TTTCGACTTCAAAGACTGGGAAGCACGGTCACGCAAAGTGTCACTTTGTTGCCATTGACA
TCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGATATTGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCCC
ATGTGAACCGTATTGATTACCAGTTGATTGATATCTCCGAGGATGGCTTTGTCAGCCTTT
TGACCGACAGTGGTGGCACCAAGGATGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCAGCG
CTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTTGTGGTGTCTGTCATGTCTTCAA
TGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAACTCAG****
TATCA*TTCTCTTTACCCTGAGAGGATAATATTATTACCAGTGGTCAAATGTTATAAGAA
CCAAAAAACTTGT*TTTTTCCTTTTTCTAATTTAGATCATTTGTGTTGTGTTTCTTGTTG
CAAGACAACCATTATCTATTATTGGTTTTGGATTGCTTAAAAGTTTCGTGTTTTAAACGG
GGAATGTTTTCCTATGAGAAAGATTCTTAACCCTTTGCTTATTATTTGGATGCGCTTAGT
TATGTTAGA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2FB92JQ 763 0 0
ATCTCTAGCTTCCAAATCGTTGAAACATGTCGGACGAAGAGCACCACTTCGAGTCCAGCG
ACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAAGGTGGTCACA
TCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTCGAGGTTTCGACTTCAAAGACTGGGAAGC
ACGGTCACGCAAAGTGTCACTTTGTTGCCATTGACATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGG
ATATTGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCCCATGTGAACCGTATTGATTACCAGT
TGATTGATATCTCCGAGGATGGCTTTGTCAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACCAAGG
ATGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTCAGCGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGG
AGGGAAAGGATGTTGTGGTGTCTGTCATGTCTTCAATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCG
TCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAACTCAG****TATCA*TTCTCTTTACCCTGAGAG
GATAATATTATTACCAGTGGTCAAATGTTATAAGAACCAAAAAACTTGT*TTTTTCCTTT
TTTTAATTTAGATCATTTGTGTTGTGTTTCTTGTTGCAAGACAACCATTATCTATTATTG
GTTTTGGATTGCTTAAAAGTTTCGTGTTTTAAACGGGGAATGTTTTCCTATGAGAAAGAT
TCTTAACCCTTTGCTTATTATTTGGATGCGCTTAGTTA
ATGTT

QA 1 758 1 758
DS 



CO CL16Contig5 735 8 5 U
GGGCTCATTCATTCTCACAATCCAATCTCTCTCACAACATGTCTGACGAAGAGCACCACT
TCGAGTCCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTA
AAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCGA
AGACTGGGAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCTATTGATATCTTCACTGCTA
AGAAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTGAACCGTA
TTGATTACCAGCTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCGACAGTG
GTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTGAGCGCTCTGATGAAGA
GTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGGAGAGGAGC
AGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTATTATCATTC
TCTTTACACAGAGGATAAAATCTTATTTACCCCAGCAGTTGTTATAAGAACAAAAACATG
TTTTTTTCTTCCTTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTGCAAGAC
GACGACCATATCTATTGGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAACAGTGAAAG
TTTCCTACCCTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR2EH44TF U 77
AF RR2EH44JQ C 63
AF RR2FO21TF U 1
AF RR2FO21JQ C 73
AF RR2AN68TF U 6
AF RR2G330TF U 480
AF RR2AN68JQ C 69
AF RR2G330JQ C 327
BS 1 618 RR2FO21TF
BS 619 619 RR2AN68TF
BS 620 706 RR2FO21TF
BS 707 733 RR2AN68TF
BS 734 735 RR2AN68JQ

RD RR2EH44TF 288 0 0
CGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAAGGTGGTCACATCGT
CATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCCACTTCCAAGACTGGGAAGCACGG
TCACGCGAAGTGTCACTTCCTTGCTATTGATATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGGATAT
CGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTGAACCGTATTGATTACCACCTGAT
TGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGG

QA 1 288 1 288
DS 

RD RR2EH44JQ 534 0 0
GAGTCCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAA
GGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCGAAG
ACTGGGAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCTATTGATATCTTCACTGCTAAG
AAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTGAACCGTATT
GATTACCAGCTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCGACAGTGGT
GGCACTAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTGAGCGCCCTGATGAAGAGT
GGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGGAGAGGAGCAG
ATTTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTATTATCATTCTC
TTTACACAGAGGATAAAATCTTATT*ACCCCAGCAGTTGTTATAAGAACAAAAA

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2FO21TF 706 0 0
GGGCTCATTCATTCTCACAATCCAATCTCTCTCACAACATGTCTGACGAAGAGCACCACT
TCGAGTCCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTA
AAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCGA
AGACTGGGAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCTATTGATATCTTCACTGCTA
AGAAGCTCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTGAACCGTA
TTGATTACCAGCTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCGACAGTG
GTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTGAGCGCTCTGATGAAGA
GTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGGAGAGGAGC
AGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTATTATCATTC
TCTTTACACAGAGGATAAAATCTTATTTACCCCAGCAGTTGTTATAAGAACAAAAACATG
TTTTTTTCTTCCTTTTTT*CTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTGCAAGAC
GACGACCATATCTATTGGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2FO21JQ 635 0 0
ACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAAGGTGGTCACA
TCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCGAAGACTGGGAAGC
ACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCTATTGATATCTTCACTGCTAAGAAGCTCGAGG
ATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTGAACCGTATTGATTACCAGC
TGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACTAAGG
ACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTGAGCGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGG
AGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCG
TCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTATTATCATTCTCTTTACACAGA
GGATAAAATCTTATTTACCCCAGCAGTTGTTATAAGAACAAAAACATGTTTTTTTCTTCC
TTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTGCAAGACGACGACCATATC
TATTGGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2AN68TF 730 0 0
G
ATTCATTCTCACAATCCAATCTCTCTCACAACATGTCTGACGAAGAGCACCACTTCGAGT
CCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAAGGTG
GTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCGAAGACTG
GGAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCTATTGATATCTTCACTGCTAAGAAGC
TCGAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTGAACCGTATTGATT
ACCAGCTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCA
CTAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTGAGCGCTCTGATGAAGAGTGGAT
TCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGGAGAGGAGCAGATCT
GTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTATTATCATTCTCTTTA
CACAGAGGATAAAATCTTATTTACCCCAGCAGTTGTTATAAGAACAAAAACATGTTTTTT
TCTTCCTTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTGCAAGACGACGAC
CATATCTATTGGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAACAGTGAAAGTTTCCT
ACCCTTC
TC

QA 2 728 2 728
DS 

RD RR2G330TF 255 0 0
CAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTATTATCATT
CTCTTTACACAGAGGATAAAATCTTATTTACCCCAGCAGTTGTTATAAGAACAAAAACAT
GTTTTTTTCTTCCTTTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTGCAAGA
CGACGACCATATCTATTGGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAACAGTGAAA
GTTTCCTACCCTTC
C

QA 1 254 1 254
DS 

RD RR2AN68JQ 667 0 0
TCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTAAAGGTGGT
CACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCGAAGACTGGG
AAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCTATTGATATCTTCACTGCTAAGAAGCTC
GAGGATATCGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTGAACCGTATTGATTAC
CAGCTGATTGATATTTTTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACT
AAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTGAGCGCTCTGATGAAGAGTGGATTC
GAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGGAGAGGAGCAGATCTGT
GCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTATTATCATTCTCTTTACA
CAGAGGATAAAATCTTATTTACCCCAGCAGTTGTTATAAGAACAAAAACATGTTTTTTTC
TTCCTTTTTTTTTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTGCAAGACGACGACCA
TATCTATTGGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAACAGTGAAAGTTTCCTAC
CCTTCTC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2G330JQ 408 0 0
GAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCGACAGTGGTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCTT
CCCACCGATGATAATTTGAGCGTTTTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTG
GTGGTGTCTGTCATGTTTTCGATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGT
GGTGGCAAGTAAAACCAAAGAAGTATTATCATTCTCTTTACACAGAGGATAAAATTTTAT
TTACCCCAGCAGTTGTTATAAGAACAAAAACATGTTTTTTTCTTCCTTTTTTTTTCTGAT
TTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTGTTGCAAGACGACGACCATATCTATTGGTTTTGGAT
TGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAACAGTGAAAGTTTCCTACCCTTC
C

QA 1 407 1 407
DS 



AS 4 31

CO CL17Contig1 1042 6 11 U
ATGCCCGGGCATTGAGAAGGAAGGACGCTTTCAGAGGCGAAAGGCCATGGGGAGATACCG
TCTGTGATCCATGGATCTCCGATCGGGAAACCGTATCCAAGCTCCGTGGCTAGTCTGCGC
TCTTTGGACTTTGAAAACTTAGCGAACTGAAACATCTAAGTAGCTAAAGGAAGGGAAATC
AACCGAGACCCCGTTAGTAGCGGCGAGCGAGAGCGGATTTGGGATTTGAAGAAAAAGAAA
GACGAAGCTTCGTTCCAAAGTGTTCACTTCTTTTTCGCCAGGTTTCATTCGATTTCTTGT
GGATTGGATGATGGAAAAACCAGCAAGCCCCTCTTCTTTCAGTCGAGTTACTTCGTACCT
CTTCTTTCAGATTCCTAAAGGGCGCTGTGAACTGTAATTGTGAAAAGGTTGGAAGATCTG
GCCAAAGAAGGTGATAGCCCTGTAGATTCGTTCCTATGGTTCGATCCTTCCCAGTAAAAC
GCGGCGTGTTCGAATTCTGATCGCTTTTACGCGAGAAAGGGGGACCACCCTCTAAGCCTA
AGTATTCCTCAATGACCGATAGCGTACAAGTACCGTGAGGGAAAGGTGAAAAGAACCCTA
TGACGGGAGTGCAATAGAGAACCTGAGATCCGATGCGAACAATCAGTCGAAAGAGTAGTC
AAGCGCACTCACTCTAACGGCGTACCTTTTGCATGATGGGTCAGCGAGGAAATGGGAAGA
GCGGCTTAAGCCATTAGGTGTAGGCGCTTTCCAAAGGTGGAATCTTCTAGTTCTTCCCAT
TTGACCCGAAACCGATCGATCTAGCCATGAGCAGGTTGAAGAGAGCTCTAACAGGCCTTG
GAGGACCGAACCCACGTATGTGGCAAAATACGGGGATGACTTGTGGCTAGGGGTGAAAGG
CCAACAAGATCGGATATAGCTGGTTTTCCGCGAAATCTATTTCAGTAGAGCGTATGATGT
CGATGGCCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTATATTTATATATAAGGGCTTCCATCATCT
CTATCAGTTTATTGTTGTCTAA


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA80JQ C 1
AF RR2EA80TF U 1
AF RR2BT43TF U 1
AF RR2FV78TF U 1
AF RR2FH67TF U 95
AF RR2D721TF U 309
BS 1 256 RR2BT43TF
BS 257 257 RR2EA80TF
BS 258 375 RR2BT43TF
BS 376 376 RR2EA80TF
BS 377 381 RR2BT43TF
BS 382 382 RR2EA80TF
BS 383 404 RR2BT43TF
BS 405 405 RR2EA80TF
BS 406 675 RR2BT43TF
BS 676 737 RR2FV78TF
BS 738 1042 RR2D721TF

RD RR2EA80JQ 459 0 0
ATGCCCGGGCATTGAGAAGGAAGGACGCTTTCAGAGGCGAAAGGCCATGGGGAGATACCG
TCTGTGATCCATGGATCTCCGATCGGGAAACCGTATCCAAGCTCCGTGGCTAGTCTGCGC
TCTTTGGACTTTGAAAACTTAGCGAACTGAAACATCTAAGTAGCTAAAGGAAGGGAAATC
AACCGAGACCCCGTTAGTAGCGGCGAGTGAGAGCGGATTTGGGATTTGAAGAAAAAGAAA
GACGAAGCTTCGTTCCAAAGTGTTCACTTCTTTTTCGCCAGGTTTCATTCGATTTCTTGT
GGATTGGATGATGGAAAAACCAGCAAGCCCCTCTTCTTTCAGTCGAGTTACTTCGTACCT
CTTCTTTCAGATTCCTAAAGGGCGCTGTGAACTGTAATTGTGAAAAGGTTGGAAGATCTG
GCCAAAGAAGGTGATAGCCCTGTAGATTCGTTCCTATGG

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR2EA80TF 459 0 0
ATGCCCGGGCATTGAGAAGGAAGGACGCTTTCAGAGGCGAAAGGCCATGGGGAGATACCG
TCTGTGATCCATGGATCTCCGATCGGGAAACCGTATCCAAGCTCCGTGGCTAGTCTGCGC
TCTTTGGACTTTGAAAACTTAGCGAACTGAAACATCTAAGTAGCTAAAGGAAGGGAAATC
AACCGAGACCCCGTTAGTAGCGGCGAGTGAGAGCGGATTTGGGATTTGAAGAAAAAGAAA
GACGAAGCTTCGTTCCAAAGTGTTCACTTCTTTTTCGCCAGGTTTCATTCGATTTCTTGT
GGATTGGATGATGGAAAAACCAGCAAGCCCCTCTTCTTTCAGTCGAGTTACTTCGTACCT
CTTCTTTCAGATTCCTAAAGGGCGCTGTGAACTGTAATTGTGAAAAGGTTGGAAGATCTG
GCCAAAGAAGGTGATAGCCCTGTAGATTCGTTCCTATGG

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR2BT43TF 675 0 0
ATGCCCGGGCATTGAGAAGGAAGGACGCTTTCAGAGGCGAAAGGCCATGGGGAGATACCG
TCTGTGATCCATGGATCTCCGATCGGGAAACCGTATCCAAGCTCCGTGGCTAGTCTGCGC
TCTTTGGACTTTGAAAACTTAGCGAACTGAAACATCTAAGTAGCTAAAGGAAGGGAAATC
AACCGAGACCCCGTTAGTAGCGGCGAGCGAGAGCGGATTTGGGATTTGAAGAAAAAGAAA
GACGAAGCTTCGTTCCGAAGTGTTCACTTCTTTTTCGCCAGGTTTCATTCGATTTCTTGT
GGATTGGATGATGGAAAAACCAGCAAGCCCCTCTTCTTTCAGTCGAGTTACTTCGTACCT
CTTCTTTCAGATTCCCAAAGGACGCTGTGAACTGTAATTGTGAAGAGGTTGGAAGATCTG
GCCAAAGAAGGTGATAGCCCTGTAGATTCGTTCCTATGGTTCGATCCTTCCCAGTAAAAC
GCGGCGTGTTCGAATTCTGATCGCTTTTACGCGAGAAAGGGGGACCACCCTCTAAGCCTA
AGTATTCCTCAATGACCGATAGCGTACAAGTACCGTGAGGGAAAGGTGAAAAGAACCCTA
TGACGGGAGTGCAATAGAGAACCTGAGATCCGATGCGAACAATCAGTCGAAAGAGTAGTC
AAGCGCACTCACTCT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2FV78TF 754 0 0
ATGCCCGGGCATTGAGAAGGAAGGACGCTTTCAGAGGCGAAAGGCCATGGGGAGATACCG
TCTGTGATCCATGGATCTCCGATCGGGAAACCGTATCCAAGCTCCGTGGCTAGTCTGCGC
TCTTTGGACTTTGAAAACTTAGCGAACTGAAACATCTAAGTAGCTAAAGGAAGGGAAATC
AACCGAGACCCCGTTAGTAGCGGCGAGCGAGAGCGGATTTGGGATTTGAAGAAGGAGAAA
GACGAAGCTTCGTTCCAAAGTGTTCACTTCTTTTTCGCCAGGTTTCATTCGATTTCTTGT
GGATTGGATGATGGAAAAACCAGCAAGCCCCTCTTCTTTCAGTCGAGTTACTTCGTACCT
CTTCTTTCAGATTCCTAAAGGGCGCTGTGAACTGTAATTGTGAAAAGGTTGGAAGATCTG
GCCAAAGAAGGTGATAGCCCTGTAGATTCGTTCCTATGGTTCGATCCTTCCCAGTAAAAC
GCGGCGTGTTCGAATTCTGATCGCTTTTACGCGAGAAAGGGGGACCACCCTCTAAGCCTA
AGTATTCCTCAATGACCGATAGCGTACAAGTACCGTGAGGGAAAGGTGAAAAGAACCCTA
TGACGGGAGTGCAATAGAGAACCTGAGATCCGATGCGAACAATCAGTCGAAAGAGTAGTC
AAGCGCACTCACTCTAACGGCGTACCTTTTGCATGATGGGTCAGCGAGGAAATGGGAAGA
GCGGCTTAAGCCATTAG
TGTAGCGCTTTCAAAGT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2FH67TF 645 0 0
G
TCCAAGCTCCGTGGCTAGTCTGTGCTCTTTGGACTTTGAAAACTTAGCGAACTGAAACAT
CTAAGTAGCTAAAGGAAGGGAAATCAACCGAGACCCCGTTAGTAGCGGCGAGCGAGAGCG
GATTTGGGATTTGAAGAAAAAGAAAGACGAAGCTTCGTTCCAAAGTGTTCACTTCTTTTT
CGCCAGGTTTCATTCGATTTCTTGTGGATTGGGTGATGGAAAAACCAGCAAGCCCCTCTT
CTTTCAGTCGAGTTACTTCGTACCTCTTCTTTCAGATTCCTAAAGGGCGCTGTGAACTGT
AATTGTGAAAAGGTTGGAAGATCTGGCCAAAGAAGGTGATAGCCCTGTATATTCGTTCCT
ATGGTTCGATCCTTCCCAGTAAAACGCGGCGTGTCCGAATTCTGATCGCTTTTACGCGAG
AAAGGGGGACCACCCTCTAAGCCTAAGTATTCCTCAATGACCGATAGCGTACAAGTACCG
TGAGGGAAAGGTGAAAAGAACCCTATGACGGGAGTGCAATAGAGAACCTGAGATCCGATG
CGAACAATCAGTCGAAGGAGTAGTCAAGCGCACTCACTCTAACGGCGTACCTTTTGCATG
ATGGGTCAGCGAGGAAATGGGAAGAGCGGCTTAAGCCATTA
TGT

QA 2 642 2 642
DS 

RD RR2D721TF 734 0 0
G
GATGGAAAAACCAGCAAGCCCCTCTTCTTTCAGTCGAGTTACTTCGTACCTCTTCTTTCA
GATTCCTAAAGGGCGCTGTGAACTGTAATTGTGAAAAGGTTGGAAGATCTGGCCAAAGAA
GGTGACAGCCCTGTAGATTCGTTCCTATGGTTCGATCCTTCCCAGTAAAACGCGGCGTGT
TCGAATTCTGATCGCTTTTACGCGAGAAAGGGGGACCACCCTCTAAGCCTAAGTATTCCT
CAATGACCGATAGCGTACAAGTACCGTGAGGGAAAGGTGAAAAGAACCCTATGACGGGAG
TGCAATAGAGAACCTGAGATCCGATGCGAACAATCAGTCGAAGGAGTAGTCAAGCGCACT
CACTCTAACGGCGTACCTTTTGCATGATGGGTCAGCGAGGAAATGGGAAGAGCGGCTTAA
GCCATTAGGTGTAGGCGCTTTCCAAAGGTGGAATCTTCTAGTTCTTCCCATTTGACCCGA
AACCGATCGATCTAGCCATGAGCAGGTTGAAGAGAGCTCTAACAGGCCTTGGAGGACCGA
ACCCACGTATGTGGCAAAATACGGGGATGACTTGTGGCTAGGGGTGAAAGGCCAACAAGA
TCGGATATAGCTGGTTTTCCGCGAAATCTATTTCAGTAGAGCGTATGATGTCGATGGCCA
CTCTGCGTTGATACCACTGCTTATATTTATATATAAGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTT
TATTGTTGTCTAA

QA 2 734 2 734
DS 



CO CL17Contig2 1624 9 11 U
GCACGAAAGTGACGAAGTTGCTTTGACTACAAAACCATCCCCCTCTCTTGGAGCGAATTG
GATGATCGGGACGACTCTCCTTTTAGTCGAGCGGAGGAACCCCTCACTCTCCTTTCCCTA
ATATGAACCTTGAGTCATCAAAGCCTTTCTGACTCGGCCTGGCACGGTCGACCTACGCTA
CTGGCGCTTCAAAAGGCCAAAGTCTCGTCGTAGTTTGGCGAACTTCAGTAGGGGCCTTTA
GTCTTTTGATTAGAGTAGGGGTCGCGAGAGAGCAGAGCGTACCGACCTGCCATAGTCACG
AGTCTGTTTATAGTCGCGACTCTTGTCATAGTCAAGAAGGTTGAAACTTCCAGGAAAAAA
CTTCGAATTGGGAGGGCGATCCTCCCGGTGAACTGACCGTACCCCAAACCGACACAGGTG
AACAAGTAGAGTATACTAGGGCGCTTGAGAGAACCATGTCGAAGGAACTCGGCAAAATGA
CCCCGTAACTTCGGGAGAAGGGGTGCTCTCCTATCTTTTGATTAGGAAAGCGGCACATAC
CAGGGGGTAGCGACTGTTTATTAAAAACACAGGACTCTGCTAAGTGGTAACACGATGTAT
AGAGTCTGACACCTGCCCGGTGCTGGAAAGTCAAAAGGAGAAGTGTTATAAGCTTTGAAT
GGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCAGTAACTCTAACTGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGT
CGCATAAGTAGCGACCTGCACGAATGGTGTAACGACTGCCCCGCTGTCTCCGACATGGAC
CCAGTGAAATTGAATTCTCCGTGAAGATGCGGAGTACCAACGGCTAGACGGTAAGACCCC
GTGCACCTTCACTATAGCTTCGCAGTGACAACCTTGATCGAATGTGTAGGATAGGTGGGA
GGTCCTCACATAGAAAGACCAATCCTGAAAGACCACTCTTTCGTCTAAGGGTGCCTAACC
GCCGCACCGAGAATTCGGGGGGAGGCGGGACACTGCGAGGTGGGTAGTTTATCTGGGGCG
GATGCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGTGTGCGAAGGTAGGCTCAAGCAAAGATTCTGCTCG
TGAGCGTAATGGTATAAGCCTGCCTGACTGTGAGACCGACTGGTCGAACAGAGACGAAAG
TCGGCCATAGTGATCCGGGAGTCCCGTGTGGAA*GGGCTCTCGCTCAACGGATCAAAGGT
ACGCCGGGGATAACAGGCTGATGACTCCCAAGAGCTCTTATCGACGGAGTCGTTTGGCAC
CTCGATGTCGACTCACCACATCCTGGGGTTGAAGAAGGTCCCAAGGGTTCGGTTGTTCGC
CGATTCAAGTGGTACGTGAGTTGGGTTTAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTTCCTATCTA
CCGTTGGTGTTAAAGCGAGAACTGCGAGGAGCCAACCCTAGTACGAGAGGACTGGGTTGG
GCCAACCTATGGTGTACCGGTTGTTATGACAATAGCAGCGCCGGGAAGCTAAGTTGGTAT
GGAAGAACTGCTGCTTAGCGGGAAATCCTTCTCTATACAAGTTCTCGGAACAGGTTTTAG
AACAGAACTTCGATAGGCGAGAGGTGGAAGCACCGCGAGGTGTGGAGCCATCTCGTATTA
AACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2E514JQ C 384
AF RR2E514TF U 384
AF RR2H805TF U 339
AF RR2CD55TF U 1
AF RR2EG81JQ C 626
AF RR2H056TF U 1049
AF RR2H056JQ C 978
AF RR2AE71TF U 519
AF RR2CD55JQ C 853
BS 1 578 RR2CD55TF
BS 579 579 RR2E514TF
BS 580 703 RR2CD55TF
BS 704 704 RR2AE71TF
BS 705 731 RR2CD55TF
BS 732 818 RR2AE71TF
BS 819 819 RR2EG81JQ
BS 820 1173 RR2AE71TF
BS 1174 1174 RR2H056TF
BS 1175 1290 RR2AE71TF
BS 1291 1624 RR2CD55JQ

RD RR2E514JQ 301 0 0
GG
CGGTGAACTGACCGTACCCCAAACCGACACAGGTGAACAAGTAGAGTATACTAGGGCGCT
TGAGAGAACCATGTCGAAGGAACTCGGCAAAATGACCCCGTAACTTCGGGAGAAGGGGTG
CTCTCCTATCTTTTGATTAGGAAAGCGGCACATACCAGGGGGTAGCGACTGTTTATTAAA
AACACAGGACTCTGCTAAGTGGTAACACGATGTATAGAGTCTGACACCTGCCCGGTGCTG
GAAAGTCAAAAGGAGAAGTGTTATAAGCTTTGAATGGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCAG

QA 3 301 3 301
DS 

RD RR2E514TF 301 0 0
GG
CGGTGAACTGACCGTACCCCAAACCGACACAGGTGAACAAGTAGAGTATACTAGGGCGCT
TGAGAGAACCATGTCGAAGGAACTCGGCAAAATGACCCCGTAACTTCGGGAGAAGGGGTG
CTCTCCTATCTTTTGATTAGGAAAGCGGCACATACCAGGGGGTAGCGACTGTTTATTAAA
AACACAGGACTCTGCTAAGTGGTAACACGATGTATAGAGTCTGACACCTGCCCGGTGCTG
GAAAGTCAAAAGGAGAAGTGTTATAAGCTTTGAATGGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCAG

QA 3 301 3 301
DS 

RD RR2H805TF 341 0 0
GGTTGAAACTTCCAGGAAAAAACTTCGAATTGGGAGGGCGATCCTCCCGGTGAACTGACC
GTACCCCAAACCGACACAGGTGAACAAGTAGAGTATACTAGGGCGCTTGAGAGAACCATG
TCGAAGGAACTCGGCAAAATGACCCCGTAACTTCGGGAGAAGGGGTGCTCTCCTATCTTT
TGATTAGGAAAGCGGCACATACCAGGGGGTAGCGACTGTTTATTAAAAACACAGGACTCT
GCTAAGTGGTAACACGATGTATAGAGTCTGACACCTGCCCGGTGCTGGAAAGTCAAAAGG
AGAAGTGTTATAAGCTTTGAATGGAAGCCCCGGTAAACGGC

QA 1 341 1 341
DS 

RD RR2CD55TF 731 0 0
GCACGAAAGTGACGAAGTTGCTTTGACTACAAAACCATCCCCCTCTCTTGGAGCGAATTG
GATGATCGGGACGACTCTCCTTTTAGTCGAGCGGAGGAACCCCTCACTCTCCTTTCCCTA
ATATGAACCTTGAGTCATCAAAGCCTTTCTGACTCGGCCTGGCACGGTCGACCTACGCTA
CTGGCGCTTCAAAAGGCCAAAGTCTCGTCGTAGTTTGGCGAACTTCAGTAGGGGCCTTTA
GTCTTTTGATTAGAGTAGGGGTCGCGAGAGAGCAGAGCGTACCGACCTGCCATAGTCACG
AGTCTGTTTATAGTCGCGACTCTTGTCATAGTCAAGAAGGTTGAAACTTCCAGGAAAAAA
CTTCGAATTGGGAGGGCGATCCTCCCGGTGAACTGACCGTACCCCAAACCGACACAGGTG
AACAAGTAGAGTATACTAGGGCGCTTGAGAGAACCATGTCGAAGGAACTCGGCAAAATGA
CCCCGTAACTTCGGGAGAAGGGGTGCTCTCCTATCTTTTGATTAGGAAAGCGGCACATAC
CAGGGGGTAGCGACTGTTTATTAAAAACACAGGACTCTACTAAGTGGTAACACGATGTAT
AGAGTCTGACACCTGCCCGGTGCTGGAAAGTCAAAAGGAGAAGTGTTATAAGCTTTGAAT
GGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCAGTAACTCTAACTGTCCTAAG*TAGCGAAATTCCTTGT
CGCATAAGTAG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2EG81JQ 278 0 0
GAAAGTCAAAAGGAGAAGTGTTATAAGCTTTGAATGGAAGCCCCGGTAAACGGGGGCAGT
AACTCTAACTGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTGGCATAAGTAGCGACCTGCACGAAT
GGTGTAACGACTGCCCCGCTGTTTCCGACATGGACCCAGTGAAATTGAATTCTCCGTGAA
GATGCGGAGTACCAACGGCTAGACGGTAAGACCCCGTGCACCTTCATTATAGCTTCGCAG
TGACAACCTTGATCGAATGTGTAGGATAGGTGGGAGGT

QA 1 278 1 278
DS 

RD RR2H056TF 177 0 0
GCGAAGGTAGGCTCAAGCAAAGATTCTGCTCGTGAGCGTAATGGTATAAGCCTGCCTGAC
TGTGAGACCGACTGGTCGAACAGAGACGAAAGTCGGCCATAGTGATCCGGGAGTCCCGTG
TGGAA*GGGCTCTCGCTCAACGGATCAAAGGTACGCCGGGGATAACAGGCTGATGAC

QA 1 177 1 177
DS 

RD RR2H056JQ 248 0 0
GGGGGAGGCGGGACACTGCGAGGTGGGTAGTTTATCTGGGGCGGATGCCTCCTAAAGAGT
AACGGAGGTGTGCGAAGGTAGGCTCAAGCAAAGATTCTGCTCGTGAGCGTAATGGTATAA
GCCTGCCTGACTGTGAGACCGACTGGTCGAACAGAGACGAAAGTCGGCCATAGTGATCCG
GGAGTCCCGTGTGGAA*GGGCTCTCGCTCAACGGATCAAAGGTACGCCGGGGATAACAGG
CTGATGAC

QA 1 248 1 248
DS 

RD RR2AE71TF 772 0 0
G
GATTAGGAAAGCGGCACATACCAGGGGGTAGCGACTGTTTATTAAAAACACAGGACTCTG
CTAAGTGGTAACACGATGTATAGAGTCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAAGTCAAAAGGA
GAAGTGTTATAAGCTTTGAATGGAAGCCCCGGTAAACGGCGGCAGTAACTCTAACTGTCC
TAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGCATAAGTAGCGACCTGCACGAATGGTGTAACGACTGC
CCCGCTGTCTCCGACATGGACCCAGTGAAATTGAATTCTCCGTGAAGATGCGGAGTACCG
ACGGCTAGACGGTAAGACCCCGTGCACCTTCACTATAGCTTCGCAGTGACAACCTTGATC
GAATGTGTAGGATAGGTGGGAGGTCCTCACATAGAAAGACCAATCCTGAAAGACCACTCT
TTCGTCTAAGGGTGCCTAACCGCCGCACCGAGAATTCGGGGGGAGGCGGGACACTGCGAG
GTGGGTAGTTTATCTGGGGCGGATGCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGTGTGCGAAGGTAGG
CTCAAGCAAAGATTCTGCTCGTGAGCGTAATGGTATAAGCCTGCCTGACTGTGAGACCGA
CTGGTCGAACAGAGACGAAAGTCGGCCATAGTGATCCGGGAGTCCCGTGTGGAAAGGGCT
CTCGCTCAACGGATCAAAGGTACGCCGGGGATAACAGGCTGATGACTCCCAAGAGCTCTT
ATCGACGGAGTCGTTTGGCACCTCGATGTCGACTCACCACATCCTGGGGTT

QA 2 772 2 772
DS 

RD RR2CD55JQ 772 0 0
TATAGCTTCGCAGTGACAAC*TTGATCGAATGTGTAGGATAGGTGGGAGGTCCTCACATA
GAAAGACCAATCCTGAAAGACCACTCTTTCGTCTAAGGGTGCCTAACCTCCGCACCGAGA
ATTCGGGGGGAGGCGGGACACTGCGAGGTGGGTAGTTTATCTGGGGCGGATGCCTCCTAA
AGAGTAACGGAGGTGTGCGAAGGTAGGCTCAAGCAAAGATTCTGCTCGTGAGCGTAATGG
TATAAGCCTGCCTGACTGTGAGACCGACTGGTCGAACAGAGACGAAAGTCGGCCATAGTG
ATCCGGGAGTCCCGTGTGGAA*GGGCTCTCGCTCAACGGATCAAAGGTACGCCGGGGATA
ACAGGCTGATGACTCCCAAGAGCTCTTATCGACGGAGTCGTTTGGCACCTCGATGTCGAC
TCATCACATCCTGGGGTTGAAGAAGGTCCCAAGGGTTCGGTTGTTCGCCGATTCAAGTGG
TACGTGAGTTGGGTTTAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTTCCTATCTACCGTTGGTGTTA
AAGCGAGAACTGCGAGGAGCCAACCCTAGTACGAGAGGACTGGGTTGGGCCAACCTATGG
TGTACCGGTTGTTATGACAATAGCAGCGCCGGGAAGCTAAGTTGGTATGGAAGAACTGCT
GCTTAGCGGGAAATCCTTCTCTATACAAGTTCTCGGAACAGGTTTTAGAACAGAACTTCG
ATAGGCGAGAGGTGGAAGCACCGCGAGGTGTGGAGCCATCTCGTATTAAACG

QA 1 772 1 772
DS 



CO CL17Contig3 1474 14 24 U
CCTGGAAGTTTCAACCTTCTTGACTATGACAAGAGTCGCGACTATAAACAGACTCGTGAC
TATGGCAGGTCGGTACGCTCTGCTCTCTCGCGACCCCTACTCTAATCAAAAGACTAAAGG
CCCCTACTGAAGTTCGCCAAACTACGACGAGACTTTGGCCTTTTGAAGCGCCAGTAGCGT
AGGTCGACCGTGCCAGGCCGAGTCAGAAAGGCTTTGATGACTCAAGGTTCATATTAGGGA
AAGGAGAGTGAGGGGTTCCTCCGCTCGACTAAAAGGAGAGTCGTCCCGATCATCCAATTC
GCTCCAAGAGAGAGGGATGGTTTTGTAGTCAAAGCAACTTCGTCACTTTCGTGTACCCAT
CGGACGGCAGCCCTTTCGGGGTTTCCTTAGGGACCGATTCACTCTGCGTAGATTGACTGA
ACGCAGAAAGCCTTCCACTGGCAGGCGATCTTGTTTTTCACAGGATTTTTCGTTACTCAT
GTCAGCATTCTCACTTCTGATATCTCCAGGTCTTGTCACCAAAAACCTTCTCCGATTGAC
AGAACGTTCCGCTACTGACACTTGAAAAGCAGCTTTGCAAGGTCTCGTCGCTTCGGTGAA
TCACTTGAGCCCTGATACATTTTCGGTGCCATGGAGCTAGACCAGTGAGCTATTACGCTT
TCTTCAAAGGATGGCTGCTTCCAAGCCCACCTCCTGGTTGTCATCGCTCGATCACTTCCT
TTTCCACTAAGTGATTGCTTAGGGACCTTAGCGTACGATCTGGGCTGTTTCCCTCTCGAC
TTTGGATCTTAGCACCCCAAAAGTCTGTCTGTACAAACGAAAACGGCCTGTATTCGGAGT
TTCCCTGGGGTTGGTAAGGCGAAATGGGGCCACCCTAGCCCATTGAGTGCTCTACCTCGG
GCCATCGACATCATACGCTCTACTGAAATAGATTTCGCGGAAAACCAGCTATATCCGATC
TTGGTTGGCCTTTCACCCCTAGCCACAAGTCATCCCCGTATTTTGCCACATACGTGGGTT
CGGTCCTCCAAGGCCTGTTAGAGCTCTCTTCAACCTGCTCATGGCTAGATCGATCGGTTT
CGGGTCAAATAGGAAGAACTAGAAGATTCCACCTTTGGAAAGCGCCTACACCTAATGGCT
TAAGCCGCTCTTCCCATTTCCTCGCTGACCCATCATGCAAAAGGTACGCCGTTAGAGTGA
GTGCGCTTGACTACTCCTTCGACTGATTGTTCGCATCGGATCTCAGGTTCTCTATTGCAC
TCCCGTCATAGGGTTCTTTTCACCTTTCCCTCACGGTACTTGTACGCTATCGGTCATTGA
GGAATACTTAGGCTTAGAGGGTGGTCCCCCTTTCTCGCGTAAAAGCGATCAGAATTCGAA
CACGCCGCGTTTTACTGGGAAGGATCGAACCATAGGAACGAATCTACAGGGCTATCACCT
TCTTTGGCCAGATCTTCCAACCTTTTCACAATTC


BQ
20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 65 65 65 65 50 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 40 40 40 40 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM61JQ U 1
AF RR2CM61TF C 20
AF RR2FH67JQ U 4
AF RR2GY23JQ U 1
AF RR2B878TF C 325
AF RR2CE57JQ U 1
AF RR2DA55JQ U 459
AF RR2GY23TF C 352
AF RR2AS75TF C 277
AF RR2G353JQ U 471
AF RR2FV78JQ U 475
AF RR2BT43JQ U 624
AF RR2CE57TF C 701
AF RR2DA55TF C 853
BS 1 81 RR2CE57JQ
BS 82 86 RR2CM61JQ
BS 87 205 RR2CE57JQ
BS 206 206 RR2FH67JQ
BS 207 243 RR2CE57JQ
BS 244 244 RR2CM61JQ
BS 245 410 RR2CE57JQ
BS 411 411 RR2CM61JQ
BS 412 425 RR2CE57JQ
BS 426 426 RR2FH67JQ
BS 427 589 RR2CE57JQ
BS 590 590 RR2CM61JQ
BS 591 793 RR2CE57JQ
BS 794 816 RR2DA55JQ
BS 817 942 RR2G353JQ
BS 943 943 RR2FV78JQ
BS 944 949 RR2G353JQ
BS 950 950 RR2FV78JQ
BS 951 1191 RR2G353JQ
BS 1192 1192 RR2FV78JQ
BS 1193 1246 RR2G353JQ
BS 1247 1360 RR2BT43JQ
BS 1361 1396 RR2CE57TF
BS 1397 1474 RR2DA55TF

RD RR2CM61JQ 616 0 0
CCTGGAAGTTTCAACCTTCTTGACTATGACAAGAGTCGCGACTATAAACAGACTCGTGAC
TATGGCAGGTCGGTACGCTCTGCTCTCTCGCGACCCCTACTCTAATCAAAAGACTAAAGG
CCCCTACTGAAGTTCGCCAAACTACGACGAGACTTTGGCCTTTTGAAGCGCCAGTAGCGT
AGGTCGACCGTGCCAGGCCGAGTCAAAAAGGCTTTGATGACTCAAGGTTCATATTAGGGA
AAGGAGAGTGAGGGGTTCCTCCGCTCGACTAAAAGGAGAGTCGTCCCGATCATCCAATTC
GCTCCAAGAGAGAGGGATGGTTTTGTAGTCAAAGCAACTTCGTCACTTTCGTGTACCCAT
CGGACGGCAGCCCTTTCGGGGTTTCCTTAGGGACCGATTCACTCTGCGTAGATTGACTGA
ACGCAAAAAGCCTTCCACTGGCAGGCGATCTTGTTTTTCACAGGATTTTTCGTTACTCAT
GTCAGCATTCTCACTTCTGATATCTCCAGGTCTTGTCACCAAAAACCTTCTCCGATTGAC
AGAACGTTCCGCTACTGACACTTGAAAAGCAGCTTTGCAAGGTCTCGTCGCTTCGGTGAA
TCACTTGAGCCCTGAT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2CM61TF 597 0 0
TTGACTATGACAAGAGTCGCGACTATAAACAGACTCGTGACTATGGCAGGTCGGTACGCT
CTGCTCTCTCGCGACCCCTACTCTAATCAAAAGACTAAAGGCCCCTACTGAAGTTCGCCA
AACTACGACGAGACTTTGGCCTTTTGAAGCGCCAGTAGCGTAGGTCGACCGTGCCAGGCC
GAGTCAGAAAGGCTTTGATGACTCAAGGTTCATATTAGGGAAAGGAGAGTGAGGGGTTCC
TCCGCTCGACTAAAAGGAGAGTCGTCCCGATCATCCAATTCGCTCCAAGAGAGAGGGATG
GTTTTGTAGTCAAAGCAACTTCGTCACTTTCGTGTACCCATCGGACGGCAGCCCTTTCGG
GGTTTCCTTAGGGACCGATTCACTCTGCGTAGATTGACTGAACGCAGAAAGCCTTCCACT
GGCAGGCGATCTTGTTTTTCACAGGATTTTTCGTTACTCATGTCAGCATTCTCACTTCTG
ATATCTCCAGGTCTTGTCACCAAAAACCTTCTCCGATTGACAGAACGTTCCGCTACTGAC
ACTTGAAAAGCAGCTTTGCAAGGTCTCGTCGCTTCGGTGAATCACTTGAGCCCTGAT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2FH67JQ 735 0 0
GGAAGTTTCAACCTTCTTGACTATGACAAGAGTCGCGACTATAAACAGACTCGTGACTAT
GGCAGGTCGGTACGCTCTGCTCTCTCGCGACCCCTACTCTAATCAAAAGACTAAAGGCCC
CTACTGAAGTTCGCCAAACTACGACGAGACTTTGGCCTTTTGAAGCGCCAGTAGCGTAGG
TCGACCGTGCCAGGCCGAGTCAGAAAGGCTTTGATGACTCAAGGTTCATATTAGGGAAAG
GAGAGTGAGGGGTTCCTCCGCTCGACTAAAAGGAGAGTCGTCCCGATCATCCAATTCGCT
CCAAGAGAGAGGGATGGTTTTGTAGTCAAAGCAACTTCGTCACTTTCGTGTACCCATCGG
ACGGCAGCCCTTTCGGGGTTTCCTTAGGGACCGATTCACTCTGCGTAGATTGACTGAACG
CAGAAAGCCTTCCACTGGCAGGCGATCTTGTTTTTCACAGGATTTTTCGTTACTCATGTC
AGCATTCTCACTTCTGATATCTCCAGGTCTTGTCACCAAAAACCTTCTCCGATTGACAGA
ACGTTCCGCTACTGACACTTGAAAAGCAGCTTTGCAAGGTCTCGTCCCTTCGGTGAATCA
CTTGAGCCCTGATACATTTTCGGTGCCATGGAGCTAGACCAGTGAGCTATTACGCTTTCT
TCAAAGGATGGCTGCTTCCAAGCCCACCTCCTGGTTGTCATCGCTCGATCACTTCCTTTT
CCACTAAGTGATTGC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2GY23JQ 738 0 0
CCTGGAAGCTTCAACCTTCTTGACTATGACAAGAGTCGCGACTATAAACAGACTCGTGAC
TATGGCAGGTCGGTACGCTCTGCTCTCTCGCGACCCCTACTCTAATCAAAAGACTAAAGG
CCCCTACTGAAGTTCGCCAAACTACGACGAGACTTTG*CCTTTTGAAGCGCCAGTAGCGT
AGGTCGACCGTGCCAGGCCGAGTCAGAAAGGCTTTGATGACTCAAGGTTCATATTAGGGA
AAGGAGAGTGAGGGGTTCCTCCGCTCGACTAAAAGGAGAGTCGTCCCGATCATCCAATTC
GCTCCAAGAGAGAGGGATGGTTTTGTAGTCAAAGCAACTTCGTCACTTTCGTGTACCCAT
CGGACGGCAGCCCTTTCGGGGTTTCCTTAGGGACCGATTCACTCTGCGTAGATTGACTGA
ACGCAGAAAGCCTTCCACTGGCAGGCGATCTTGTTTTTCACAGGATTTTTCGTTACTCAT
GTCAGCATTCTCACTTCTGATATCTCCAGGTCTTGTCACCAAAAACCTTCTCCGATTGAC
AGAACGTTCCGCTACTGACACTTGAAAAGCAGCTTTGCAAGGTCTCGTCGCTTCGGTGAA
TCACTTGAGCCCTGATACATTTTCGGTGCCATGGAGCTAGACCAGTGAGCTATTACGCTT
TCTTCAAAGGATGGCTGCTTCCAAGCCCACCTCCTGGTTGTCATCGCTCGATCACTTCCT
TTTCCACTAAGTGATTGC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2B878TF 439 0 0
GTAGTCAAAGCAACTTCGTCACTTTCGTGTACCCATCGGACGGCAGCCCTTTCGGGGTTT
CCTTAGGGACCGATTCACTCTGCGTAGATTGACTGAACGCAGAAAGCCTTCCACTGGCAG
GCGATCTTGTTTTTCACAGGATTTTTCGTTACTCGTGTCAGCATTCTCACTTCTGATATC
TCCAGGACTTGTCACCAAAAACCTTCTCCGATTGACAGAACGTTCCGCTACTGACACTTG
AAAAGCAGCTTTGCAAGGTCTCGTCGCTTCGGTGAATCACTTGAGCCCTGATACATTTTC
GGTGCCATGGAGCTAGACCAGTGAGCTATTACGCTTTCTTCAAAGGATGGCTGCTTCCAA
GCCCACCTCCTGGTTGTCATCGCTCGATCACTTCCTTTTCCACTAAGTGATTGCTTAGGG
ACCTTAGCGTACGATCTGG

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2CE57JQ 793 0 0
CCTGGAAGTTTCAACCTTCTTGACTATGACAAGAGTCGCGACTATAAACAGACTCGTGAC
TATGGCAGGTCGGTACGCTCT*****CTCGCGACCCCTACTCTAATCAAAAGACTAAAGG
CCCCTACTGAAGTTCGCCAAACTACGACGAGACTTTGGCCTTTTGAAGCGCCAGTAGCGT
AGGTCGACCGTGCCAGGCCGAGTCAAAAAGGCTTTGATGACTCAAGGTTCATATTAGGGA
AAGTAGAGTGAGGGGTTCCTCCGCTCGACTAAAAGGAGAGTCGTCCCGATCATCCAATTC
GCTCCAAGAGAGAGGGATGGTTTTGTAGTCAAAGCAACTTCGTCACTTTCGTGTACCCAT
CGGACGGCAGCCCTTTCGGGGTTTCCTTAGGGACCGATTCACTCTGCGTAAATTGACTGA
ACGCAAAAAGCCTTCCACTGGCAGGCGATCTTGTTTTTCACAGGATTTTTCGTTACTCAT
GTCAGCATTCTCACTTCTGATATCTCCAGGTCTTGTCACCAAAAACCTTCTCCGATTGAC
AGAACGTTCCGCTACTGACACTTGAAAAGCAGCTTTGCAAGGTCTCGTCCCTTCGGTGAA
TCACTTGAGCCCTGATACATTTTCGGTGCCATGGAGCTAGACCAGTGAGCTATTACGCTT
TCTTCAAAGGATGGCTGCTTCCAAGCCCACCTCCTGGTTGTCATCGCTCGATCACTTCCT
TTTCCACTAAGTGATTGCTTAGGGACCTTAGCGTACGATCTGGGCTGTTTCCCTCTCGAC
TTTGGATCTTAGC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2DA55JQ 358 0 0
CACAGGATTTTTCGTTACTCATGTCAGCATTCTCACTTCTGATATCTCCAGGTCTTGTCA
CCAAAAACCTTCTCCGATTGACAGAACGTTCCGCTACTGACACTTGAAAAGCAGCTTTGC
AAGGTCTCGTCCCTTCGGTGAATCACTTGAGCCCTGATACATTTTCGGTGCCATGGAGCT
AGACCAGTGAGCTATTACGCTTTCTTCAAAGGATGGCTGCTTCCAAGCCCACCTCCTGGT
CGTCATCGCTCGATCACTTCCTTTTCCACTAAGTGATTGCTTAGGGACCTTAGCGTACGA
TCTGGGCTGTTTCCCTCTCGACTTTGGATCTTAGCACCCCAAAAGTCTGTCTGTACAA

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR2GY23TF 575 0 0
TGTACCCATCGGACGGCAGCCCTTTCGGGGTTTCCTTAGGGACCGATTCACTCTGCGTAG
ATTGACTGAACGCAGAAAGCCTTCCACTGGCAGGCGATCTTGTTTTTCACAGGATTTTTC
GTTACTCATGTCAGCATTCTCACTTCTGATATCTCCAGGTCTTGTCACCAAAAACCTTCT
CCGATTGACAGAACGTTCCGCTACTGACACTTGAAAAGCAGCTTTGCAAGGTCTCGTCGC
TTCGGTGAATCACTTGAGCCCTGATACATTTTCGGTGCCATGGAGCTAGACCAGTGAGCT
ATTACGCTTTCTTCAAAGGATGGCTGCTTCCAAGCCCACCTCCTGGTTGTCATCGCTCGA
TCACTTCCTTTTCCACTAAGTGATTGCTTAGGGACCTTAGCGTACGATCTGGGCTGTTTC
CCTCTCGACTTTGGATCTTAGCACCCCAAAAGTCTGTCTGTACAAACGAGAACGGCCTGT
ATTCGGAGTTTCCCTGGGGTTGGTAAGGCGAAATGGGGCCACCCTAGCCCATTGAGTGCT
CTACCTCGGGCCATCGACATCATACGCTCTACTG
C

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2AS75TF 750 0 0
AGAGTCGTCCCGATCATCCAATTCGCTCCAAGAGAGAGGGATGGTTTTGTAGTCAAAGCA
ACTTCGTCACTTTCGTGTACCCATCGGACGGCAGCCCTTTCGGGGTTTCCTTAGGGACCG
ATTCACTCTGCGTAGATTGACTGAACGCAGAAAGCCTTCCACTGGCAGGCGATCTTGTTT
TTCACAGGATTTTTCGTTACTCATGTCAGCATTCTCACTTCTGATATCTCCAGGTCTTGT
CACCAAAAACCTTCTCCGATTGACAGAACGTTCCGCTACTGACACTTGAAAAGCAGCTTT
GCAAGGTCTCGTCGCTTCGGTGAATCACTTGAGCCCTGATACATTTTCGGTGCCATGGAG
CTAGACCAGTGAGCTATTACGCTTTCTTCAAAGGATGGCTGCTTCCAAGCCCACCTCCTG
GTTGTCATCGCTCGATCACTTCCTTTTCCACTAAGTGATTGCTTAGGGACCTTAGCGTAC
GATCTGGGCTGTTTCCCTCTCGACTTTGGATCTTAGCACCCCAAAAGTCTGTCTGTACAA
ACGAGAACGGCCTGTATTCGGAGTTTCCCTGGGGTTGGTAAGGCGAAATGGGGCCACCCT
AGCCCATTGAGTGCTCTACCTCGGGCCATCGACATCATACGCTCTACTGAAATAGATTTC
GCGGAAAACCAGCTATATCCGATCTTGGTTGGCCTTTCACCCCTAGCCACAAGTCATCCC
CGTATTTTGCCACATACGTGGGTTCGGTCC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2G353JQ 783 0 0
CGTTACTCATGTCAGCATTCTCACTTCTGATATCTCCAGGTCTTGTCACCAAAAACCTTC
TCCGATTGACAGAACGTTCCGCTACTGACACTTGAAAAGCAGCTTTGCAAGGTCTCGTCG
CTTCGGTGAATCACTTGAGCCCTGATA****TTCGGTGCCATGGAGCTAGACCGGTGAGC
TATTACGCTTTCTTCAAAGGATGGCTGCTTCCAAGCCCACCTCCTGGTTGTCATCGCTCG
ATCACTTCCTTTTCCACTAAGTGATTGCTTAGGGACCTTAGCGTACGATCTGGGCTGTTT
CCCTCTCGACTTTGGATCTTAGCACCCCAAAAGTCTGTCTGTACAAACGAAAACGGCCTG
TATTCGGAGTTTCCCTGGGGTTGGTAAGGCGAAATGGGGCCACCCTAGCCCATTGAGTGC
TCTACCTCGGGCCATCGACATCATACGCTCTACTGAAATAGATTTCGCGGAAGACCAGCG
ATATCCGATCTTGGTTGGCCTTTCACCCCTAGCCACAAGTCATCCCCGTATTTTGCCACA
TACGTGGGTTCGGTCCTCCAAGGCCTGTTAGAGCTCTCTTCAACCTGCTCATGGCTAGAT
CGATCGGTTTCGGGTCAAATAGGAAGAACTAGAAGATTCCACCTTTGGAAAGCGCCTACA
CCTAATGGCTTAAGCCGCTCTTCCCATTTCCTCGCTGACCCATCATGCAAAAGGTACGCC
GCTAGAGTGAGTGCGCTTGACTACTCCTTCGACTGATTGTTCGCATCGGATCTCAG
TTCTCTA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2FV78JQ 739 0 0
ACTCATGTCAGCATTCTCACTTCTGATATCTCCAGGTCTTGTCACCAAAAACCTTCTCCG
ATTGACAGAACGTTCCGCTACTGACACTTGAAAAGCAGCTTTGCAAGGTCTCGTCGCTTC
GGTGAATCACTTGAGCCCTGATACATTTTCGGTGCCATGGAGCTAGATCAGTGAGCTATT
ACGCTTTCTTCAAAGGATGGCTGCTTCCAAGCCCACCTCCTGGTTGTCATCGCTCGATCA
CTTCCTTTTCCACTAAGTGATTGCTTAGGGACCTTAGCGTACGATCTGGGCTGTTTCCCT
CTCGACTTTGGATCTTAGCACCCCAAAAGTCTGTCTGTACAAACGAAAACGGCCTGTATT
CGGAGTTTCCCTGGGGTTGGTAAGGCGAAATGGGGCCACCCTAGCCCATTGAGTGCTCTA
CCTCGGGCCATCGACATCATACGCTCTACTGAAATAGATTTCGCGGAAAACCAGCTATAT
CCGATCTTGGTTGGCCTTTCACCCCTAGCCACAAGTCATCCCCGTATTTTGCCACATACG
TGGGTTCGGTCCTCCAAGGCCTGTTAGAGCTCTCTTCAACCTGCTCATGGCTAGATCGAT
CGGTTTCGGGTCAAATAGGAAGAACTAGAAGATTCCACCTTTGGAAAGCGCCTACACCTA
ATGGCTTAAGCCGCTCTTCCCATTTCCTCGCTGACCCATCATGCAAAAGGTACGCCGTTA
GAGTGAGTGCGCTTGACTA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2BT43JQ 737 0 0
CGGTGCCATGGAGCTAGACCAGTGAGCTATTACGCTTTCTTCAAAGGATGGCTGCTTCCA
AGCCCACCTCCTGGTTGTCATCGCTCGATCACTTCCTTTTCCACTAAGTGATTGCTTAGG
GACCTTAGCGTACGATCTGGGCTGTTTCCCTCTCGACTTTGGATCTTAGCACCCCAAAAG
TCTGTCTGTACAAACGAAAACGGCCTGTATTCGGAGTTTCCCTGGGGTTGGTAAGGCGAA
ATGGGGCCACCCTAGCCCATTGAGTGCTCTACCTCGGGCCATCGACATCATACGCTCTAC
TGAAATAAATTTCGCGGAAAACCAGCTATATCCGATCTTGGTTGGCCTTTCACCCCTAGC
CACAAGTCATCCCCGTATTTTGCCACATACGTGGGTTCGGTCCTCCAAGGCCTGTTAAAG
CTCTCTTCAACCTGCTCATGGCTAGATCGATCGGTTTCGGGTCAAATAGGAAAAACTAGA
AAATTCCACCTTTGGAAAGCGCCTACACCTAATGGCTTAAGCCGCTCTTCCCATTTCCTC
GCTGACCCATCATGCAAAAGGTACGCCGTTAGAGTGAGTGCGCTTGACTACTCCTTCGAC
TGATTGTTCGCATCGGATCTCAGGTTCTCTATTGCACTCCCGTCATAGGGTTCTTTTCAC
CTTTCCCTCACGGTACTTGTACGCTATCGGTCATTGAGGAATACTTAGGCTTAGAGGGTG
GTCCCCCTTTCTCGCGT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2CE57TF 697 0 0
TCATCGCTCGATCACTTCCTTT*CCACTAAGTGATTGCTTAGGGACCTTAGCGTACGATC
TGGGCTGTTTCCCTCTCGACTTTGGATCTTAGCACCCCAAAAGTCTGTCTGTACAAACGA
GAACGGCCTGTATTCGGAGTTTCCCTGGGGTCGGTAAGGCGAAATGGGGCCACCCTAGCC
CATTGAGTGCTCTACCCCGGGCCATCGACATCATACGCTCTACTGAAATAGATTTCGCGG
AAAACCAGCTATATCCGATCTTGGTTGGCCTTTCACCCCTAGCCACAAGTCATCCCCGTA
TTTTGCCACATACGTGGGTTCGGTCCTCCAAGGCCTGTTAGAGCTCTCTTCAACCTGCTC
ATGGCTAGATCGATCGGTTTCGGGTCAAATAGGAAGAACTAGAAGATTCCACCTTTGGAA
AGCGCCTACACCTAATGGCTTAAGCCGCTCTTCACATTTCCTCGCTGACCCATCATGCAA
AAGGTACGCCGTTAGAGTGAGTGCGCTTGACTACTCCTTCGACTGATTGTTCGCATCGGA
TCTCAGGTTCTCTATTGCACTCCCGTCATAGGGTTCTTTTCACCTTTCCCTCACGGTACT
TGTACGCTATCGGTCATTGAGGAATACTTAGGCTTAGAGGGTGGTCCCCCTTTCTCGCGT
AAAAGCGATCAGAATTCGAACACGCCGCGTTTTACT
C

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2DA55TF 622 0 0
GGTGTA
GCGAAATGGGGCCACCCTAGCCCATTGAGTGCTCTACCTCGGGCCATCGACATCATACGC
TCTACTGAAATAGATTTCGCGGAAAACCAGCTATATCCGATCTTGGTTGGCCTTTCACCC
CTAGCCACAAGTCATCCCCGTATTTTGCCACATACGTGGGTTCGGTCCTCCAAGGCCTGT
TGGAGCTCTCTTCAACCTGCTCATGGCTAGATCGATCGGTTTCGGGTCAAATAGGAAGAA
CTAGAAGATTCCACCTTTGGAAAGCGCCTACACCTAATGGCTTAAGCCGCTCTTCCCATT
TCCTCGCTGACCCATCATGCAAAAGGTACGCCGTTAGAGTGAGTGCGCTTGACTACTCCT
TCGACTGATTGTTCGCATCGGATCTCAGGTTCTCTATTGCACTCCCGTCATAGGGTTCTT
TTCACCTTTCCCTCACGGTACTTGTACGCTATCGGTCATTGAGGAATACTTAGGCTTAGA
GGGTGGTCCCCCTTTCTCGCGTAAAAGCGATCAGAATTCGAACACGCCGCGTTTTACTGG
GAAGGATCGAACCATAGGAACGAATCTACAGGGCTATCACCTTCTTTGGCCAGATCTTCC
AACCTTTTCACAATTC

QA 7 622 7 622
DS 



CO CL17Contig4 575 2 2 U
GCATTAGGTGTAGGCGCTTTCCAAAGGTGGAATCTTCTAGTTCTTCCTATTTGACCCGAA
ACCGATCGATCTAGCCATGAGCAGGTTGAAGAGAGCTCTAACAGGCCTTGGAGGACCGAA
CCCACGTATGTGGCAAAATACGGGGATGACTTGTGGCTAGGGGTGAAAGGCCAACCAAGA
TCGGATATAGCTGGTTTTCCGCGAAATCTATTTCAGTAGAGCGTATGATGTCGATGGCCC
GAGGCAGAGCACTCAATGGGCTAGGGTGGCCCCATTTCGCCTTACCAACCCCAGGGAAAC
TCCCTAAGCAATCACTTAGTGGAAAAGGAAGTGATCGAGCGATGACAACCAGGAGGTGGG
CTTGGAAGCAGCCATCCTTTGAAGAAAGCGTAATAGCTCACTGGTCTAGCTCCATGGCAC
CGAAAATGTATCAGGGCTCAAGTGATTCACCGAAGCGACGAGACCTTGCAAAGCTGCTTT
TCAAGTGTCAGTAGCGGAACGTTCTGTCAATCGGAGAAGGTTTTTGGTGACAAGACCTGG
AGATATCAGAAGTGAGAATGCTGACATGAGTAACG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CK59JQ C 1
AF RR2CK59TF U 6
BS 1 5 RR2CK59JQ
BS 6 575 RR2CK59TF

RD RR2CK59JQ 575 0 0
GCATTAGGTGTAGGCGCTTTCCAAAGGTGGAATCTTCTAGTTCTTCCTATTTGACCCGAA
ACCGATCGATCTAGCCATGAGCAGGTTGAAGAGAGCTCTAACAGGCCTTGGAGGACCGAA
CCCACGTATGTGGCAAAATACGGGGATGACTTGTGGCTAGGGGTGAAAGGCCAACCAAGA
TCGGATATAGCTGGTTTTCCGCGAAATCTATTTCAGTAGAGCGTATGATGTCGATGGCCC
GAGGCAGAGCACTCAATGGGCTAGGGTGGCCCCATTTCGCCTTACCAACCCCAGGGAAAC
TCCCTAAGCAATCACTTAGTGGAAAAGGAAGTGATCGAGCGATGACAACCAGGAGGTGGG
CTTGGAAGCAGCCATCCTTTGAAGAAAGCGTAATAGCTCACTGGTCTAGCTCCATGGCAC
CGAAAATGTATCAGGGCTCAAGTGATTCACCGAAGCGACGAGACCTTGCAAAGCTGCTTT
TCAAGTGTCAGTAGCGGAACGTTCTGTCAATCGGAGAAGGTTTTTGGTGACAAGACCTGG
AGATATCAGAAGTGAGAATGCTGACATGAGTAACG

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2CK59TF 570 0 0
AGGTGTAGGCGCTTTCCAAAGGTGGAATCTTCTAGTTCTTCCTATTTGACCCGAAACCGA
TCGATCTAGCCATGAGCAGGTTGAAGAGAGCTCTAACAGGCCTTGGAGGACCGAACCCAC
GTATGTGGCAAAATACGGGGATGACTTGTGGCTAGGGGTGAAAGGCCAACCAAGATCGGA
TATAGCTGGTTTTCCGCGAAATCTATTTCAGTAGAGCGTATGATGTCGATGGCCCGAGGC
AGAGCACTCAATGGGCTAGGGTGGCCCCATTTCGCCTTACCAACCCCAGGGAAACTCCCT
AAGCAATCACTTAGTGGAAAAGGAAGTGATCGAGCGATGACAACCAGGAGGTGGGCTTGG
AAGCAGCCATCCTTTGAAGAAAGCGTAATAGCTCACTGGTCTAGCTCCATGGCACCGAAA
ATGTATCAGGGCTCAAGTGATTCACCGAAGCGACGAGACCTTGCAAAGCTGCTTTTCAAG
TGTCAGTAGCGGAACGTTCTGTCAATCGGAGAAGGTTTTTGGTGACAAGACCTGGAGATA
TCAGAAGTGAGAATGCTGACATGAGTAACG

QA 1 570 1 570
DS 



AS 2 34

CO CL18Contig1 1016 11 14 U
GGCTCTTATCTGAAACTAGAGACTGTTGTCAAAGCAAAACTAAAAGTCATCTTCTTCGTC
ACCAATCAATGGCGTCTTTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCAGATTGTTGTTA
AGTCGCAGTTAGTTTCAGCAAACCGAACATCTCAACCAGTTTGTGTCGGAGCTCGTTCCT
CTGGTTCTGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAAAAAT
TCTCCGGAGCTTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTG
CTGAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTG
ATGTGGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCG
TCCCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACA
AGGGTTCTTCTTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCG
AGGGAAATGGTACTGGAGGTATTAGTATCTACGGTGCCAAATTTGAAGACGAAAACTTCA
CATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAATG
GAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGGTTAGATAACAAGCATGTTGTGT
TCGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAGCTTGTGAGGACACTTGAATCTCAGGAGACACGCG
CCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGCAGAATCTATGCCTGCGGAGAGCTCCCGCTTGAAG
CTTGATAACCCCACACACACCATTTAAGACCAGTCCATTGTCATTGCCCATCTTTGTTTT
TGCTATTATGAGAGTTTCAAGTTATGATGGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACAT
ATGAGTTTGAAAGTACAATGAAAGGTTCCTCTTAATCACATGTAAGATTCTTATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 
40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2GS71TF U 10
AF RR2D177TF U 6
AF RR2CP40TF U 6
AF RR2H816TF U 6
AF RR2D614TF U 16
AF RR2D640TF U 1
AF RR2CP40JQ C 332
AF RR2D640JQ C 192
AF RR2H816JQ C 270
AF RR2D614JQ C 327
AF RR2GS71JQB C 337
BS 1 190 RR2D640TF
BS 191 191 RR2D177TF
BS 192 367 RR2D640TF
BS 368 368 RR2D177TF
BS 369 727 RR2D640TF
BS 728 728 RR2D640JQ
BS 729 738 RR2D640TF
BS 739 739 RR2D640JQ
BS 740 754 RR2D640TF
BS 755 755 RR2D640JQ
BS 756 770 RR2D640TF
BS 771 976 RR2D640JQ
BS 977 1015 RR2H816JQ
BS 1016 1016 RR2GS71JQB

RD RR2GS71TF 515 0 0
GG
GAAACTAGAGACTGTTGTCAAAGCAAAACTAAAAGTCATCTTCTTCGTCACCAATCAATG
GCGTCTTTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCAGATTGTTGTTAAGTCGCAGTTA
GTTTCAGCAAACCGAACATCTCAACCAGTTTGTGTCGGAGCTCGTTCCTCTGGTTCTGCA
TTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAAAAATTCTCCGGAGCT
TATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTGCTGAGGAAGAA
GAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTGGAGATT
GGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTCCCTAAAACC
GTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTCTTCT
TTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAA

QA 3 515 3 515
DS 

RD RR2D177TF 556 0 0
GG
ATCTGAAACTAGAGACTGTTGTCAAAGCAAAACTAAAAGTCATCTTCTTCGTCACCAATC
AATGGCGTCTTTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCAGATTGTTGTTAAGTCGCA
GTTAGTTTCAGCAAACCGAACATCTCAACCAGTTTGTGTCGGAGCTCGTTCCTCTGGTTC
TGCATTGTCTTCCAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAAAAATTCTCCGG
AGCTTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTGCTGAGGA
AGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTGGA
GATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTCCCTAA
AACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTC
TTCTTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAA
TGGTACTGGAGGTA

QA 3 556 3 556
DS 

RD RR2CP40TF 714 0 0
GG
ATCTGAAACTAGAGACTGTTGTCAAAGCAAAACTAAAAGTCATCTTCTTCGTCACCAATC
AATGGCGTCTTTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCAGATTGTT****AGTCGCA
GTTAGTTTCAGCAAACCGAACATCTCAACCAGTTTGTGTCGGAGCTCGTTCCTCTGGTTC
TGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAAAAATTCTCCGG
AGCTTATGCGACCATCAAGAACCGAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTGCTGAGGA
AGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTGGA
GATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTCCCTAA
AACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTC
TTCTTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAA
TGGTACTGGAGGTATTAGTATCTACGGTGCCAAATTTGAAGACGAAAACTTCACATTGAA
GCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAATGGAAGCCA
GTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGGTTAGATA*CAAGCATGTTGTG

QA 3 714 3 714
DS 

RD RR2H816TF 700 0 0
GG
ATCTGAAACTAGAGACTGTTGTCAAAGCAAAACTAAAAGTCATCTTCTTCGTCACCAATC
AATGGCGTCTTTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCAGATTGTTGTTAAGTCGCA
GTTAGTTTCAGCAAACCGAACATCTCAACCAGTTTGTGTCGGAGCTCGTTCCTCTGGTTC
TGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAAAAATTCTCCGG
AGCTTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTGCTGAGGA
AGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTGGA
GATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTCCCTAA
AACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTC
TTCTTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAA
TGGTACTGGAGGTATTAGTATCTACGGTGCCAAATTTGAAGACGAAAACTTCACATTGAA
GCATACTGGACCTGGGATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAATGGAAGCCA
GTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGGTTAGATA

QA 3 700 3 700
DS 

RD RR2D614TF 704 0 0
GG
AGAGACTGTTGTCAAAGCAAAACTAAAAGTCATCTTCTTCGTCACCAATCAATGGCGTCT
TTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCAGATTGTTGTTAAGTCGCAGTTAGTTTCA
GCAAACCGAACATCTCAACCAGTTTGTGTCGGAGCTCGTTCCTCTGGTTCTGCATTGTCT
TCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAAAAATTCTCCGGAGCTTATGCG
ACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTGCTGAGGAAGAAGAAGTG
CTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTGGAGATTGGTGGT
GAAGTCGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTCCCTAAAACCGTTGAA
AACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTCTTCTTTCCAT
CGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGA
GGTATTAGTATCTACGGTGCCAAATTTGAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGGA
CCTGGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAATGGAAGCCAGTTCTTCATT
TGCACTGTCCAAACTTCATGGTTAGATAACAAACATGTTGTG

QA 3 704 3 704
DS 

RD RR2D640TF 776 0 0
GGCTCTTATCTGAAACTAGAGACTGTTGTCAAAGCAAAACTAAAAGTCATCTTCTTCGTC
ACCAATCAATGGCGTCTTTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCAGATTGTTGTTA
AGTCGCAGTTAGTTTCAGCAAACCGAACATCTCAACCAGTTTGTGTCGGAGCTCGTTCCT
CTGGTTCTGCTTTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAAAAAT
TCTCCGGAGCTTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTG
CTGAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTG
ATGTGGATATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCG
TCCCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACA
AGGGTTCTTCTTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCG
AGGGAAATGGTACTGGAGGTATTAGTATCTACGGTGCCAAATTTGAAGACGAAAACTTCA
CATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAATG
GAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGGTTAGATAACAAGCATGTTGTGT
TCGGACA*GTCCTTGAAG*TATGAAGCTTGTGAG*ACACTTGAATCTCAG
AGACAC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2CP40JQ 596 0 0
GGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTGGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAG
GATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTCCCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTT
GTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTCTTCTTTCCATCGTATCATCAAAGA
TTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGAGGTATTAGTATTTA
CGGTGCCAAATTTGAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAG
CATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAATGGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAAC
TTCATGGTTAGATAACAAGCATGTTGTGTTCGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAGCTTGT
GAGGACACTTGAATCTCAGGAGACACGCGCCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGCAGAAT
CTATGCCTGCGGAGAGCTCCCGCTTGAAGCTTGATAACCCCACACACACCATTTAAGACC
AGTCCATTGTCATTGCCCATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAGTTTCAAGTTATGA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2D640JQ 785 0 0
TTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAAAAATTCTCCGGAGCT
TATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTGCTGAGGAAGAA
GAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTGGATATT
GGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTCCCTAAAACC
GTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTCTTCT
TTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGT
ACTGGAGGTATTAGTATCTACGGTGCCAAATTTGAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCAT
ACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAATGGAAGCCAGTTC
TTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGGTTAGATAACAAGCATGTTGTGTTCGGACAAGTC
CTTGAAGGTATGAAGCTTGTGAGGACACTTGAATCTCAGGAGACACGCGCCTTCAATGTT
CCCAAGAAAGGTTGCAGAATCTATGCCTGCGGAGAGCTCCCGCTTGAAGCTTGATAACCC
CACACACACCATTTAAGACCAGTCCATTGTCATTGCCCATCTTTGTTTTTGCTATTATGA
GAGTTTCAAGTTATGATGGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAA
AGTAC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2H816JQ 747 0 0
CAAAGAACAGCTTGTGTCAAATCAATGGCTGCTGAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCT
CAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTGGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGA
AGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTCCCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTC
TTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTCTTCTTTCCATCGTATCATCAAA
GATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGAGGTATTAGTATC
TACGGTGCCAAATTTGAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGGACCTGGGATCTTG
AGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAATGGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAA
ACTTCATGGTTAGATAACAAGCATGTTGTGTTCGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAGCTT
GTGAGGACACTTGAATCTCAGGAGACACGCGCCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGCAGA
ATCTATGCCTGCGGAGAGCTCCCGCTTGAAGCTTGATAACCCCACACACACCATTTAAGA
CCAGTCCATTGTCATTGCCCATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAGTTTCAAGTTATGATG
GTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAGTACAATGAAAGGTTCC
TCTTAATCACATGTAAGATTCTTATT
T

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2D614JQ 673 0 0
CT
TCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTGGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGG
AAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTCCCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGT
CTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTCTTCTTTCCATCGTATCATCAA
AGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGAGGTATTAGTAT
CTACGGTGCCAAATTTGAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTT
GAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAATGGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCA
AACTTCATGGTTAGATAACAAACATGTTGTGTTCGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAGCT
TGTGAGGACACTTGAATCTCAGGAGACACGCGCCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGCAG
AATCCATGCCTGCGGAGAGCTCCCGCTTGAAGCTTGATAACCCCACACACACCATTTAAG
ACCAGTCCATTGTCATTGCCCATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAGTTTCAAGTTATGAT
GGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAGTACAATGAAAGGTTC
CTCTTAATCAC

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR2GS71JQB 680 0 0
AAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTGGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTG
TGATGGGTCTGTTTGGTGATGTCGTCCCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTA
CTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTCTTCTTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCA
TGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGAGGTATTAGTATCTACGGTG
CCAAATTTGAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGG
CAAACGCTGGTGCTAATACTAATGGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCAT
GGTTAGATAACAAGCATGTTGTGTTCGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAGCTTGTGAGGA
CACTCGAATCTCAGGAGACACGCGCCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGCAGAATCTATG
CCTGCGGAGAGCTCCCGCTTGAAGCTTGATAACCCCACACACACCATTTAAGACCAGTCC
ATTGTCATTGCCCATCTTTGTTTTTGCTATTATTAGAGTTTCAAGTTATGATGGTCTTAT
GTTTTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAGTACAATGAAAGGTTCCTCTTAAT
CACATGTAAGATTCTTATTC

QA 1 680 1 680
DS 



CO CL18Contig2 1014 23 17 U
GGACTCTTATCTGAAACTAGAGACTGTTGTGAAAAGCAAAACTAAAGTCATCTTCTTCGT
CACCAATCAATGGCGTCTCTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCT
CAGATTGTTGTCAAATCGCAGTTAGTTTCAGCAAAGCAAACAACTCAATCAGTTTGTGTC
GGTTCTGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCC
GGAGC***TTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAGATCAATGGCTGCT
GAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGAT
GTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTCATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTG
CCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACAAG
GGTTCTTCCTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAG
GGAAATGGTACTGGAGG*TATTAGTATCTACGGTGCCAAATTT*GAAGACGAAAACTTCA
CATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAACG
GAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGG*TTAGATAACAAGCATGTTGTG
TTTGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAGCTTGTGAGGACACTTGAATCTCAGGAGACGCGC
GCCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGCAGAATCTATGCCTGCGGAGAGCTCCCACTTGAA
GCTTGAAGCCTTCAATGTTGTATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAGTTTCAAGTTATTAT
GGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAGTACAATGAAAGGTTC
CTCTTAATCACATGTAAGATTCTTATTTAAAAGTGTCTGTCTTTTAAGCTTGCC


BQ
35 35 35 35 35 35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 50 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 45 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 70 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 90 95 95 95 95 95 95 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 85 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 80 97 97 97 97 97 
97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 55 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 50 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 55 95 95 95 95 95 55 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 50 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 55 70 70 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 70 85 80 80 80 80 
80 80 65 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 50 65 50 65 65 45 65 65 65 65 40 65 65 65 65 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2F541TF U 1
AF RR2DW71TF U 1
AF RR2ET10TF U 1
AF RR2GF37TF U 119
AF RR2C458JQ C 334
AF RR2EE25TF U 1
AF RR2BM63TF U 7
AF RR2A970TF U 397
AF RR2F306TF U 1
AF RR2C947TF U 85
AF RR2AI39TF U 7
AF RR2C458TF U 317
AF RR2FS18TF U 1
AF RR2A970JQ C 49
AF RR2BM63JQ C 335
AF RR2C947JQ C 257
AF RR2F306JQ C 287
AF RR2F541JQ C 228
AF RR2AI39JQ C 261
AF RR2EE25JQ C 341
AF RR2DW71JQ C 669
AF RR2ET10JQ C 373
AF RR2GF37JQ C 376
BS 1 130 RR2DW71TF
BS 131 131 RR2EE25TF
BS 132 290 RR2DW71TF
BS 291 291 RR2EE25TF
BS 292 479 RR2DW71TF
BS 480 595 RR2EE25TF
BS 596 658 RR2F306TF
BS 659 659 RR2FS18TF
BS 660 739 RR2F306TF
BS 740 740 RR2A970JQ
BS 741 754 RR2F306TF
BS 755 771 RR2FS18TF
BS 772 772 RR2A970JQ
BS 773 781 RR2FS18TF
BS 782 945 RR2A970JQ
BS 946 1012 RR2F541JQ
BS 1013 1014 RR2EE25JQ

RD RR2F541TF 334 0 0
GGACTCTTATCTGAAACTAGAGACTGTTGTGAAAAGCAAAACTA**GTCATCTTCTTCGT
CACCAATCAATGGCGTCTCTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCT
CAGATTGTTGTCAAATCGCAGTTAGTTTCAGCAAAGCAAACAACTCAATCAGTTTGTGTC
GGTTCTGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCC
GGAGC***TTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAGATCAATGGCTGCT
GAGGAAGAAGAA*TG*TAGAACCTCCTCAGG
TAA

QA 1 331 1 331
DS 

RD RR2DW71TF 486 0 0
GGACTCTTATCTGAAACTAGAGACTGTTGTGAAAAGCAAAACTAAAGTCATCTTCTTCGT
CACCAATCAATGGCGTCTCTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCT
CAGATTGTTGCCAAATCGCAGTTAGTTTCAGCAAAGCAAACAACTCAATCAGTTTGTGTC
GGTTCTGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCC
GGAGC***TTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAGATCGATGGCTGCT
GAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGAT
GTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTCATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTG
CCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACAA
AGGGTTC

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR2ET10TF 475 0 0
GGACTCTTATCTGAAACTAGAGACTGTTGTGAAAAGCAAAACTAAAGTCATCTTCTTCGT
CACCAATCAATGGCGTCTCT*TCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCT
CAGATTGTTGTCAAATCGCAGTTAGTTTCAGCAAAGCAAACAACTCAATCAGTTTGTGTC
GGTTCTGCATTGTCTTCAAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCC
GGAGC***TTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAGATCAATGGCTGCT
GAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGAT
GTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTCATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTG
CCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGT

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2GF37TF 374 0 0
GG
CAGATTGTTGTCAAATCGCAGTTAGTTTCCGCAAAGCAAACAACTCAATCAATTTGTGTC
GGTTCTGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCC
GGAGCTTCTTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTTAAATCAATGGCTGCT
GAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACGCACAAGGTTTACTTTGAT
GTGGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTTATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTG
CCCAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACAAG
GGTTCTTCCTTC

QA 3 374 3 374
DS 

RD RR2C458JQ 181 0 0
AAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATT
GTCATGGGTCTGTTTGGTGAAGTTGTGCCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGT
ACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACAAGGGTTTTTCCTTCCATCGTATCATCAAAGATTTC
A

QA 1 181 1 181
DS 

RD RR2EE25TF 595 0 0
GGACTCTTATCTGAAACTAGAGACTGTTGTGAAAAGCAAAACTAAAGTCATCTTCTTCGT
CACCAATCAATGGCGTCTCTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCT
CAGATTGTTGTCAAATTGCAGTTAGTTTCAGCAAAGCAAACAACTCAATCAGTTTGTGTC
GGTTCTGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCC
GGAGC***TTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAGATCAATGGCTGCT
GAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGAT
GTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTCATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTG
CCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACAAG
GGTTCTTCCTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAG
GGAAATGGTACTGGAGG*TATTAGTATCTACGGTGCCAAATTT*GAAGACGAAAA

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2BM63TF 725 0 0
TTATCTGAAACTAGAGACTGTTGTGAAAAGCAAAACTAAAGTCATCTTCTTCGTCACCAA
TCAATGGCGTCTCTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCTCAGATT
GTTGTCAAATCGCAGTTAGTTTCAGCAAAGCAAACAACTCAATCAGTTTGTGTCGGTTCT
GCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCCGGAGC*
**TTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAGATCAATGGCTGCTGAGGAA
GAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTTGAG
ATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTCATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTGCCTAAA
ACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACAAGGGTTCT
TCCTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAAT
GGTACTGGAGG*TATTAGTATCTACGGTGCCAAATTT*GAAGACGAAAACTTCACATTGA
AGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAACGGAAGCC
AGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGG*TTAGATAC**AGCATGT
GTGTTGGACAGTCCT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2A970TF 313 0 0
ATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTGCCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACT
GGTGAGAAGAAGTATGGGTACAAGGGTTCTTCCTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATG
ATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGAGGGTATTAGTATCTACGGTGC
CAAATTTTGAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGG
CAAACGCTGGTGCTAATACTAACGGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCAT
GGGTTAGATAACA

QA 1 313 1 313
DS 

RD RR2F306TF 754 0 0
GGACTCTTATCTGAAACTAGAGACTGTTGTCAAA*GCAAAACTAAAGTCATCTTCTTCGT
CACCAATCAATGGCGTCTCTGTCTCCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCT
CAGATTGTTGTCAAATCGCAGTTAGTTTCTGCAAAGCAAACAACTCAATCAATTTGTGTC
GGTTCTGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCC
GGAGCTTCTTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTTAAATCAATGGCTGCT
GAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACGCACAAGGTTTACTTTGAT
GTGGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTTATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTG
CCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACAAG
GGTTCTTCCTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGTGGTGACTTCACCGAG
GGAAATGGTACTGGAGG*TATTAGTATCTACGGTGCCAAATTC*GAAGATGAAAACTTCA
CATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAATG
GAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGG*TTAGATAACAAGCATGTTGTG
TTTGGACAAGTCCTTGAAG*TATGAAGCTTGTGA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2C947TF 664 0 0
G
CAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCTCAGATTGTTGTCAAATCGCAGTTAG
TTTCAGCAAAGCAAACAACTCAATCAGTTTGTGTCGGTTCTGCATTGTCTTCGAGACTAC
ACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCCGGAGC***TTATGCGACCATCAAGA
ACCAAAGAACAGCTTGTGTCAGATCAATGGCTGCTGAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTC
CTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTG
GAAGGATTGTCATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTGCCTAAAACCGTTGAAAACTTTCGTG
TCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACCAGGGTTCTTCCTTCCATCGTATCATCA
AAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGAGG*TATTAGT
ATCTACGGTGCCAAATTT*GAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGGACCTGGAAT
CTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAACGGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGT
CCAAACTTCATGG*TTAGATAC**AGCATGTTGTGTTTGGACA*GTCCTTGAAG*TATGA
GCT

QA 2 661 2 661
DS 

RD RR2AI39TF 726 0 0
GG
ATCTGAAACTAGAGACTGTTGTGAAAAGCAAAACTAAAGTCATCTTCTTCGTCACCAATC
AATGGCGTCTCTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCTCAGATTGT
TGTCAAATCGCAGTTAGTTTCAGCAAAGCAAACAACTCAATCAGTTTGTGTCGGTTCTGC
ATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCCGGAGC***
TTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAGATCAATGGCTGCTGAGGAAGA
AGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTTGAGAT
TGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTCATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTGCCTAAAAC
CGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTCTTC
CTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGG
TACTGGAGG*TATTAGTATCTACGGTGCCAAATTT*GAAGACGAAAACTTCACATTGAAG
CATACTGGACCTGTAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAACGGAAGCCAG
TTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGG*TTAGATAACAAGCATGTTGTGTTTGGACA
AGTC

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR2C458TF 408 0 0
TAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTTGAGATTGGTGGTG
AAGTCGCTGGAAGGATTGTCATGGGTCTGTTTGGTGAAGTTGTGCCTAAAACCGTTGAAA
ACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACAAGGGTTCTTCCTTCCATC
GTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGAG
G*TATTAGTATCTACGGTGCCAAATTT*GAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGG
ACCTGGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAACGGAAGCCAGTTCTTCAT
TTGCACTGTCCAAACTTCATGG*TTAGATA*CAAGCATGTTGTGTT
GG

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR2FS18TF 781 0 0
GGACTCTTATCTGAAACTAGAGACTGCTGTGAAAAGCAAAACTAAAGTCATCTTCTTCGT
CACCAATCAATGGCGTCTCTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCT
CAGATTGTTGTCAAATCGCAGTTAGTTTCAGCAAAGCAAACAACTCAATCAGTTTGTCTC
GGTTCTGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTCTCC
GGAGC***TTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAGATCAATGGCTGCT
GAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGAT
GTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTCATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTG
CCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACAGGTGAGAAGAAGTATGGGTACAAG
GGTTCTTCCTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAG
GGAAATGGTACTGGAGG*TATTAGTATCTACGGTGCCAAATTT*GAAGACGAAAACTTCA
CATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAACG
GAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGG*TTAGATAACAAGCATGTTGTG
TTTGGACAAGTCCTTGAAG*TATGAAGCTTGTGAGGACACTTGAATCTCAG*AGACGCGC
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2A970JQ 897 0 0
TCATCTT
TTCGTCACCAATCAATGGCGTCTCTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTG
TTGCTCAGATTGTTGTCAAATCGCAGTTAGTTTCAGCAAAGCAAACAACTCAATCAGTTT
GTGTCGGTTCTGCATTGTCTTCGAGACTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAAT
TCTCCGGAGC***TTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAGATCAATGG
CTGCTGAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACT
TTGATGTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTCATGGGTCTGTTTGGTGAAG
TCGTGCCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGT
ACAAGGGTTCTTCCTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCA
CCGAGGGAAATGGTACTGGAGG*TATTAGTATCTACGGTGCCAAATTT*GAAGACGAAAA
CTTCACATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATAC
TAACGGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGG*TTAGATAACAAGCATG
TTGTGTTTGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAGCTTGTGTGGACACTTGAATCTCAGGAGA
CGCGCGCCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGCAGAATCTATGCCTGCGGAGAGCTCCCAC
TTGAAGCTTGAAGCCTTCAATGTTGTATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAGTTTCAAGTT
ATTATGGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAG

QA 8 897 8 897
DS 

RD RR2BM63JQ 611 0 0
AAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTG
TCATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTGCCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTA
CTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACAAGGGTTCTTCCTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCA
TGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGAGG*TATTAGTATCTACGGT
GCCAAATTT*GAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCAT
GGCAAACGCTGGTGCTAATACTAACGGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTC
ATGG*TTAGATAACAAGCATGTTGTGTTTGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAGCTTGTGA
GGACACTTGAATCTTAGGAGACGCGCGCCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGCAGAATCT
ATGCCTGCGGAGAGCTCCCACTTGAAGCTTGAAGCCTTCAATGTTGTATCTTTGTTTTTG
CTATTATGAGAGTTTCAAGTTTTTATGGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACATAT
GAGTTTGAAAG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2C947JQ 689 0 0
CCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAGATCAATGGCTGCTGAGGAAGAAGAAGTGC
TAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTTGAGATTGGTGGTG
AAGTCGCTGGAAGGATTGTCATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTGCCTAAAACCGTTGAAA
ACTTTCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACCAGGGTTCTTCCTTCCATC
GTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGAG
G*TATTAGTATTTACGGTGCCAAATTT*GAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGG
ACCTGGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAACGGAAGCCAGTTCTTCAT
TTGCACTGTCCAAACTTCATGG*TTAGATAACAAGCATGTTGTGTTTGGACAAGTCCTTG
AAGGTATGAAGCTTGTGAGGACACTTGAATCTCAGGAGACGCGCGCCTTCAATGTTCCCA
AGAAAGGTTGCAGAATCTATGCCTGCGGAGAGCTCCCACTTGAAGCTTGAAGCCTTCAAT
GTTGTATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAGTTTCAAGTTATTATGGTCTTATGTTTTTAT
TTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2F306JQ 660 0 0
AATCAATGGCTGCTGAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACGCACA
AGGTTTACTTTGATGTGGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTTATGGGTCTGT
TTGGTGAAGTCGTGCCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGA
AGTATGGGTACAAGGGTTCTTCCTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGTG
GTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGAGG*TATTAGTATCTACGGTGCCAAATTC*GA
AGATGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGG
TGCTAATACTAATGGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGG*TTAGATA
ACAAGCATGTTGTGTTTGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAGCTTGTGAGGACACTTGAGT
CTCAGGAGACACGCGCCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGCAGAATCTATGCCTGCGGAG
AGCTCCCACTTGAAGCTTGAAGCCTTCAATGTTGTATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAG
TTTCAAGTTATTATGGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAG
C

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2F541JQ 785 0 0
TAAGCAATTCTCCGGAGC***TTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAG
ATCAATGGCTGCTGAGGAAGAAGAAGTGCTAGAACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAA
GGTTTACTTTGATGTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTCATGGGTCTGTT
TGGTGAAGTCGTGCCTAAAATCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAA
GTATGGGTACAAGGGTTCTTCCTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGG
TGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGAGG*TATTAGTATTTACGGTGCCAAATTT*GAA
GACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGGACCTTGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGT
GCTAATACTAACGGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGG*TTAGATAA
CAAGCATGTTGTGCTTGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAGCTTGTGAGGACACTTGAATC
TCAGGAGACGCGCGCCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGCAGAATCTATGCCTGCGGAGA
GCTCCCACTTGAAGCTTGAAGCCTTCAATGTTGTATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAGT
TTCAAGTTATTATGGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAGTA
CAATGAAAGGTTCCTCTTAATCACATGTAAGATTCTTATTTAAAAGTGTCTGTCTTTTAA
GCTTG

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2AI39JQ 723 0 0
CAAGAACCAAAGAACAGCTTGTGTCAGATCAATGGCTGCTGAGGAAGAAGAAGTGCTAGA
ACCTCCTCAGGCTAAAGTGACACACAAGGTTTACTTTGATGTTGAGATTGGTGGTGAAGT
CGCTGGAAGGATTGTCATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTGCCTAAAACCGTTGAAAACTT
CCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTACAAGGGTTCTTCCTTCCATCGTAT
CATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGAGG*TA
TTAGTATTTACGGTGCCAAATTT*GAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGGACCT
GTAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAACGGAAGCCAGTTCTTCATTTGC
ACTGTCCAAACTTCATGG*TTAGATAACAAGCATGTTGTGTTTGGACAAGTCCTTGAAGG
TATGAAGCTTGTGAGGACACTTGAATCTCAGGAGACGCGCGCCTTCAATGTTCCCAAGAA
AGGTTGCAGAATCTATGCCTGCGGAGAGCTCCCACTTGAAGCTTGAAGCCTTCAATGTTG
TATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAGTTTCAAGTTATTATGGTCTTATGTTTTTATTTAT
TTATGATTACATATGAGTTTGAAAGTACAATGAAAGGTTCCTCTTAATCACATGTAAGAT
TCT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2EE25JQ 674 0 0
CACACAAGGTTTACTTTGATGTTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTCATGG
GTCTGTTTGGTGAAGTCGTGCCTAAAACCGTTGAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTG
AGAAGAAGTATGGGTACAAGGGTTCTTCCTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCC
AAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGAGG*TATTAGTATCTACGGTGCCAAA
TTT*GAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCAAA
CGCTGGTGCTAATACTAACGGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGG*T
TAGATAACAAGCATGTTGTGTTTGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAGCTTGTGAGGACAC
TTGAATCTCAGGAGACGCGCGCCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGCAGAATCTATGCCT
GCGGAGAGCTCCCACTTGAAGCTTGAAGCCTTCAATGTTGTATCTTTGTTTTTGCTATTA
TGAGAGTTTCAAGTTATTATGGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTT
GAAAGTACAATGAAAGGTTCCTCTTAATCACATGTAAGATTCTTATTTAAAAGTGTCTGT
CTTTTAAGCTTGCC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2DW71JQ 320 0 0
TTT
TTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGG*TTAGATAACAAGCATGTTGTGTTTGGACAAGT
CCTTGAAGGTATGAAGCTTGTGAGGACACTTGAATTTCAGGAGACGCGCGCCTTCAATGT
TCCCAAGAAAGGTTGCAGAATTTATGCCTGGGGAGAGCTCCCACTTGAAGCTTGGAGCCT
TCAATGTTGTATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAGTTTCAAGTTATTATGGTTTTATGTT
TTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAGTACAATGAAAGGTTCCTTTTAATCAC
ATGTAAGATTTTTATTT

QA 4 320 4 320
DS 

RD RR2ET10JQ 595 0 0
GGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTCATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTGCCTAAAACCGTT
GAAAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACAAGGGTTCTTCCTTC
CATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACT
GGAGG*TATTAGTATCTACGGTGCCAAATTT*GAAGACGAAAACTTCACATTGAAGCATA
CTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAACGGAAGCCAGTTCT
TCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGG*TTAGATAACAAGCATGTTGTGTTTGGACAAGTC
CTTGAAGGTATGAAGCTTGTGAGGACACTTGAATCTCAGGAGACGCGCGCCTTCAATGTT
CCCAAGAAAGGTTGCAGAATCTATGCCTGCGGAGAGCTCCCACTTGAAGCTTGAAGCCTT
CAATGTTGTATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAGTTTCAAGTTATTATGGTCTTATGTTT
TTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAGTACAATGAAAGGTTCCTCTTAA

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2GF37JQ 637 0 0
GAAGTCGCTGGAAGGATTGTTATGGGTCTGTTTGGTGAAGTCGTGCCCAAAACCGTTGAA
AACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACAAGGGTTCTTCCTTCCAT
CGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGTGGTGACTTCACCGAGGGAAATGGTACTGGA
GG*TATTAGTATTTACGGTGCCAAATTC*GAAGATGAAAACTTCACATTGAAGCATACTG
GACCTGGAATCTTGAGCGTGGCAAACGCTGGTGCTAATACTAATGGAAGCCAGTTCTTCA
TTTGCACTGTCCAAACTTCATGG*TTAGATAACAAGCATGTTGTGTTTGGACAAGTCCTT
GAAGGTATGAAGCTTGTGAGGACACTTGAGTCTCAGGAGACACGCGCCTTCAATGTTCCC
AAGAAAGGTTGCAGAATCTATGCCTGCGGAGAGCTCCCACTTTAAGCTTGAAGCCTTCAA
TGTTGTATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAGTTTCAAGTTATTATGGTCTTATGTTTTTA
TTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAGTACAATGAAAGGTTCCTCTTAATCACATGT
AAGATTCTTATTTAAAAGTGTCTGTCTTTTAAGCTTG

QA 1 637 1 637
DS 



AS 4 31

CO CL19Contig1 851 5 6 U
GGGAGAGTATTTTGTCACACAAAACAAAAAAACAAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAAG
CAGAGGAGCCCCAAGGTGAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGAGGTGTAGGCAAATACTCC
CGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGTGGCGTT
TTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCCCGTTGAGAAGCCTGCGAAGTTT
TATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAG
CTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGA
AAGAGAGTTGTGTTTCTTAAGCAACTTTCTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACAGGACCATTC
AAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACC
AAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTCGATGACAAGTACTTTGGAAAGGTT
GCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAG
AAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGATCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGATCAAA
GCAATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAA
GGAATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGATTTCATCTTATCTTTTTGTATCCCATCAT
CACTGTTCAACAACATTTGTTTTCCCCTGAGATTTTGCCCTTTTAAAAATTAAAAAAGAC
TATTTTCTATG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2B065TF U 25
AF RR2CK81TF U 1
AF RR2E313TF U 1
AF RR2CK81JQ C 85
AF RR2E313JQ C 238
BS 1 606 RR2CK81TF
BS 607 718 RR2E313TF
BS 719 722 RR2CK81JQ
BS 723 723 RR2E313JQ
BS 724 850 RR2CK81JQ
BS 851 851 RR2E313JQ

RD RR2B065TF 338 0 0
C
AAAAAAACAAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAAGCAGAGGAGCCCCAAGGTGAGCCGAA
ACCCTGATCTAGTCAGAGGTGTAGGCAAATACTCCCGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAG
GTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCA
AGGTCGAAGCTCCCGTTGAGAAGCCTGCGAAGTTTTATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGC
CGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAGCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAA
CTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAA

QA 2 338 2 338
DS 

RD RR2CK81TF 606 0 0
GGGAGAGTATTTTGTCACACAAAACAAAAAAACAAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAAG
CAGAGGAGCCCCAAGGTGAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGAGGTGTAGGCAAATACTCC
CGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGTGGCGTT
TTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCCCGTTGAGAAGCCTGCGAAGTTT
TATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAG
CTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGA
AAGAGAGTTGTGTTTCTTAAGCAACTTTCTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACAGGACCATTC
AAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACC
AAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTCGATGACAAGTACTTTGGAAAGGTT
GCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAG
AAAGAG

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2E313TF 718 0 0
GGGAGAGTATTTTGTCACACAAAACAAAAAAACAAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAAG
CAGAGGAGCCCCAAGGTGAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGAGGTGTAGGCAAATACTCC
CGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTT
TTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCCCGTTGAGAAGCCTGCGAAGTTT
TATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAG
CTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGA
AAGAGAGTTGTGTTTCTTAAGCAACTTTCTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACAGGACCATTC
AAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACC
AAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTCGATGACAAGTACTTTGGAAAGGTT
GCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAG
AAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGATCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGATCAAA
GCAATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2CK81JQ 766 0 0
AAA
CCTGATCTAATCAGAGGTGTAGGCAAATACTCCCGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGT
TTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGTGGCGTTTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAG
GTCGAAGCTCCCGTTGAGAAGCCTGCGAAGTTTTATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCG
CTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAGCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACT
GTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAGTTGTGTTTCTTAAGCAACTT
TCTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACAGGACCATTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGT
GTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATC
GAGAAGTTCGATGACAAGTACTTTGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAA
GGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAA
GATCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGATCAAAGCAATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAG
ACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGGATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTC
TAGATTTCATCTTATCTTTTTGTATCCCATCATCACTGTTCAACAACATTTGTTTTCCCC
TGAGATTTTGCCCTTTTAAAAATTAAAAAAGACTATTTTCTAT

QA 4 766 4 766
DS 

RD RR2E313JQ 614 0 0
TTTTATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACC
AAGCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAG
GGAAAGAGAGTTGTGTTTCTTAAGCAACTTTCTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACAGGACCA
TTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCC
ACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTCGATGACAAGTACTTTGGAAAG
GTTGCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTG
AAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGATCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGATC
AAAGCAATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCT
CAAGGAATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGATTTCATCTTATCTTTTTGTATCCCAT
CATCACTGTTCAACAACATTTGTTTTCCCCTGAGATTTTGCCCTTTTAAAAATTAAAAAA
GACTATTTTCTATG

QA 1 614 1 614
DS 



CO CL19Contig2 873 3 4 U
ATAAAAAGAGAAATAACGTTTTTATAAAAGATGACCAAAATCTCTCAAGGGGAAACACAG
ATATTGTTGAAACAAAAGGGATATGAAATCTAGAAAACAAGCTCATGGGGTTTCATTCCT
TGAGACAATGAGAACCTGGCGCCGAGGTAAGTCTTGAGCTCTGGCACTGCTTCAATGGCT
TTGATCAAAGCTGCGTCCACAGTTTTCTGGTCTTCTTTCTTCTCCTGTGGGATCTCTTTC
TTCACCTCTTTCTCTGCTTCAAAGAACTCGCCTTCTCCTTTCTTGCTCTTCTTTTCAGCA
ACCTTTCCGAAGTACTCGTCATCGAACTTCTCAACGTTGACTCCAGAAATGTCAACCTTT
GTGGAGGTTCCAATCACATAGGACTGGTTAACACGTCTCAGTGGAACACCATTGATCTTG
AACGGTCCAGTAACCAAAGGCAAACCAGAAGAGAGCTGCTTGAGGAATACAACTCTCTTG
CCCTTGAATCTACCGGCAAGAATGATCAACACAGTTCCTGGAGTAATGCTTGACTTGAGC
TTGGTAGGCTTAGGCTTGCGTCTGTTGGCGAGGGGCTTCTTAACGTCTTCAGCGGGGTAA
AACTTGGGTGGCTTCTCGAGGGAAGCTTGGACCTTGGACTTAGCGTCGTGGCGGGGGAAA
ACGCCGCCGTTTTTGGCCTTGATTGCCCACAAGCCTCTCTTGTGGTACATTTGGGAACGA
GAGTATTTGCCAACACCCCTTATCAGATCAGGGTTTCGGCTCACTTTCGGGGTCCTTTGC
TTCGCCGCCGGCATCTTTGTTTGATTCTCTTTCTCTCTCTCTGTTACAACAAGAACCTCT
CAGTGACGACGGAAGTAAACCAAACAACCCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ96JQB U 7
AF RR2CU08JQ U 1
AF RR2CU08TF C 81
BS 1 47 RR2CU08JQ
BS 48 48 RR2GJ96JQB
BS 49 747 RR2CU08JQ
BS 748 873 RR2CU08TF

RD RR2GJ96JQB 642 0 0
AA
AGAAATAACGTTTTTATAAAAGATGACCAAAATCTCTCAAGGGGAAACACAGATATTGTT
GAAACAAAAGGGATATGAAATCTAAAAAACAAGCTCATGGGGTTTCATTCCTTGAGACAA
TGAGAACCTGGCGCCGAGGTAAGTCTTGAGCTCTGGCACTGCTTCAATGGCTTTGATAAG
TGCTGCATCCACCGTCTTCTGGTCTTCTTTCTTTTCCTGTGGGATCTCTTTCTTCACCTC
TTTGTAAGCTTCAAAGAACTCGCCTTCTCCTTTCTTGCTCTTCTTCTCAGCAACCTTTCC
AAAGTACTTGTCATCGAACTTCTCAACGTTGACTCCAAAAATGTCAACCTTTGTGGAGGT
TCCAATCACATAAAACTGGTTAACACGTCTCAGTGGAACACCATTGATCTTGAACGGTCC
AGTCACCAAAAGCAAACCAAAAGAGAGCTGCTTGAGGAATACAACTCTCTTGCCCTTGAA
TCTACCGGCAAGAATGATCAACACAGTTCCTGGAGTAATGCTTGACTTGAGCTTGGTAGG
GTTAGGCTTGCGTCTGTTGGCGAGAGGCTTCTTAACGTCTTCAGCGGGGTAAAACTTGGG
TGGCTTCTCAACGGAAGATTGGACCTTGGACTTAGCG
CCG

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR2CU08JQ 747 0 0
ATAAAAAGAGAAATAACGTTTTTATAAAAGATGACCAAAATCTCTCAGGGGGAAACACAG
ATATTGTTGAAACAAAAGGGATATGAAATCTAGAAAACAAGCTCATGGGGTTTCATTCCT
TGAGACAATGAGAACCTGGCGCCGAGGTAAGTCTTGAGCTCTGGCACTGCTTCAATGGCT
TTGATCAAAGCTGCGTCCACAGTTTTCTGGTCTTCTTTCTTCTCCTGTGGGATCTCTTTC
TTCACCTCTTTCTCTGCTTCAAAGAACTCGCCTTCTCCTTTCTTGCTCTTCTTTTCAGCA
ACCTTTCCGAAGTACTCGTCATCGAACTTCTCAACGTTGACTCCAGAAATGTCAACCTTT
GTGGAGGTTCCAATCACATAGGACTGGTTAACACGTCTCAGTGGAACACCATTGATCTTG
AACGGTCCAGTAACCAAAGGCAAACCAGAAGAGAGCTGCTTGAGGAATACAACTCTCTTG
CCCTTGAATCTACCGGCAAGAATGATCAACACAGTTCCTGGAGTAATGCTTGACTTGAGC
TTGGTAGGCTTAGGCTTGCGTCTGTTGGCGAGGGGCTTCTTAACGTCTTCAGCGGGGTAA
AACTTGGGTGGCTTCTCGAGGGAAGCTTGGACCTTGGACTTAGCGTCGTGGCGGGGGAAA
ACGCCGCCGTTTTTGGCCTTGATTGCCCACAAGCCTCTCTTGTGGTACATTTGGGAACGA
GAGTATTTGCCAACACCCCTTATCAGA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2CU08TF 793 0 0
GATATG
AATCTAGAAAACAAGCTCATGGGGTT*CATTCCTTGAGACAATGAGAACCTGGCGCCGAG
GTAAGTCTTGAGCTCTGGCACTGCTTCAATGGCTTTGATCAAAGCTGCGTCCACAGTTTT
CTGGTCTTCTTTCTTCTCCTGTGGGATCTCTTTCTTCACCTCTTTCTCTGCTTCAAAGAA
CTCGCCTTCTCCTTTCTTGCTCTTCTTTTCAGCAACCTTTCCGAAGTACTCGTCATCGAA
CTTCTCAACGTTGACTCCAGAAATGTCAACCTTTGTGGAGGTTCCAATCACATAGGACTG
GTTAACACGTCTCAGTGGAACACCATTGATCTTGAACGGTCCAGTAACCAAAGGCAAACC
AGAAGAGAGCTGCTTGAGGAATACAACTCTCTTGCCCTTGAATCTACCGGCAAGAATGAT
CAACACAGTTCCTGGAGTAATGCTTGACTTGAGCTTGGTAGGCTTAGGCTTGCGTCTGTT
GGCGAGGGGCTTCTTAACGTCTTCAGCGGGGTAAAACTTGGGTGGCTTCTCGAGGGAAGC
TTGGACCTTGGACTTAGCGTCGTGGCGGGGGAAAACGCCGCCGTTTTTGGCCTTGATTGC
CCACAAGCCTCTCTTGTGGTACATTTGGGAACGAGAGTATTTGCCAACACCCCTTATCAG
ATCAGGGTTTCGGCTCACTTTCGGGGTCCTTTGCTTCGCCGCCGGCATCTTTGTTTGATT
CTCTTTCTCTCTCTCTGTTACAACAAGAACCTCTCAGTGACGACGGAAGTAAACCAAACA
ACCCCTC

QA 7 793 7 793
DS 



CO CL19Contig3 871 20 21 U
GCGGAGAGTATTTTGTCACAGAGAGAA*AAAAACAACACAAAAGAGAAAGATGGCGCCGG
CGAAGCAGAGGAGCCCCAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGCAAAT
ACTCCCGTTCACAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAGAACGGCG
GCGTTTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAAGTCGAAGCTCCCATTGAGAAGCCGGCTA
AGTTTTATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTA
CCAAGCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCA
AGGGAAAGAGAGTTGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTTTACTTTTGGTTACAGGAC
CATTCAAGATCAATGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCT
CCACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTGATGACAAGTACTTCGGCA
AGGTTGCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGG
TGAAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGA
TCAAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGT
CTCAAGGAATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGATTTCATCATATCTTTTTGTATCCC
ATCATCATCACTGTTCAACAACATTTGTTTTCCCCTGAGATTTTGCCCTTTTTAAAAATT
AAAAAAGACTATTTTCTATGATTTATATATC


BQ
10 10 30 30 30 40 40 45 45 30 45 45 45 45 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 65 50 65 65 65 65 10 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 10 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 85 85 25 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 30 90 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 35 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 40 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 30 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 50 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 55 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 55 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 55 97 97 97 90 97 55 97 97 97 97 97 97 97 97 97 55 90 97 97 70 97 97 97 97 97 97 55 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 55 97 97 97 97 97 
97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 50 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 75 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 15 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 20 70 70 55 70 55 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 55 55 70 70 70 45 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 45 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 35 35 35 35 30 30 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL39TF U 2
AF RR2G718TF U 4
AF RR2G526JQ C 11
AF RR2G526TF U 11
AF RR2DM26TF U 2
AF RR2C239TF U 4
AF RR2BW80TF U 3
AF RR2D247TF U 11
AF RR2D375TF U 1
AF RR2FS53TF U 1
AF RR2B345TF U 8
AF RR2A712TF U 166
AF RR2G718JQ C 98
AF RR2D375JQ C 254
AF RR2DM26JQ C 254
AF RR2B345JQ C 219
AF RR2A712JQ C 175
AF RR2D247JQ C 106
AF RR2BW80JQ C 129
AF RR2FS53JQ C 103
BS 1 259 RR2D375TF
BS 260 260 RR2FS53TF
BS 261 620 RR2D375TF
BS 621 621 RR2FS53TF
BS 622 662 RR2D375TF
BS 663 663 RR2FS53TF
BS 664 728 RR2D375TF
BS 729 729 RR2B345TF
BS 730 733 RR2D375TF
BS 734 734 RR2FS53TF
BS 735 745 RR2D375TF
BS 746 747 RR2FS53TF
BS 748 750 RR2D375TF
BS 751 751 RR2B345TF
BS 752 772 RR2D375TF
BS 773 773 RR2B345TF
BS 774 784 RR2D375TF
BS 785 810 RR2FS53TF
BS 811 811 RR2A712TF
BS 812 834 RR2B345TF
BS 835 871 RR2G718JQ

RD RR2GL39TF 280 0 0
G
GGAGAGTGTTTTGTCACAGAGAGAA*GAAAAAAACACAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCG
AAGCAGAGGAGCCCCAAAGTAAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGCAAATAC
TCCCGTTCTCAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGCGGC
GTTTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCCCGTTGAGAAGCCGGCTAAG
TTTTATCCTGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTTGCTAAC

QA 2 280 2 280
DS 

RD RR2G718TF 424 0 0
GG
GAGTATTTTGTCGCAGAGAGAA*AAAAACAACACAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAAG
CAGAGGAGCCCCAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGCAAATACTCC
CGTTCACAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAGAACGGCGGCGTT
TTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAAGTCGAAGCTCCCATTGAGAAGCCGGCTAAGTTT
TATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAG
CTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTGATCATCCTTGTTGGTCGATTCAAGGGA
AAGAGAGTTGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTTTACTTTTGGTTACAGGACCATTC
AA

QA 3 424 3 424
DS 

RD RR2G526JQ 550 0 0
GGGTCACGGAGAGAAG
A*AAAAAAAACACAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAAGCAGAGGAGCCCCAAAGTAAGC
CGAAACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGCAAATACTCCCGTTCTCAAATGTACCACAAG
AGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCACGTCACGACGCTAAG
TCCAAGGTCGAAGCTCCCGTTGAGAAGCCGGCTAAGTTTTATCCTGCGGAAGACGTTAAG
AAGCCGCTTGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAGCTCAAAGCGAGCATTACTCCA
GGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAGTTGTGTTTCTCAAG
CAACTTTCTTTTGGTTTGCTTTTGGTTACTGGACCATTCAAGATCAATGGTGTTCCACTG
AGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTC
AGCATCGAGAAGTTTGATGACAAGTACTTCGGCAAGGTTGCTGAGAAGAAGACT

QA 17 550 17 550
DS 

RD RR2G526TF 550 0 0
GGGTCACGGAGAGAAG
A*AAAAAAAACACAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAAGCAGAGGAGCCCCAAAGTAAGC
CGAAACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGCAAATACTCCCGTTCTCAAATGTACCACAAG
AGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCACGTCACGACGCTAAG
TCCAAGGTCGAAGCTCCCGTTGAGAAGCCGGCTAAGTTTTATCCTGCGGAAGACGTTAAG
AAGCCGCTTGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAGCTCAAAGCGAGCATTACTCCA
GGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAGTTGTGTTTCTCAAG
CAACTTTCTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACTGGACCATTCAAGATCAATGGTGTTCCACTG
AGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTC
AGCATCGAGAAGTTTGATGACAAGTACTTCGGCAAGGTTGCTGAGAAGAAGACT

QA 17 550 17 550
DS 

RD RR2DM26TF 610 0 0
G
GGAGAGTATTTTGTCACAGAGAGAA*AAAAACAACACAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCG
AAGCAGAGGAGCCCCAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGCAAATAC
TCCCGTTCACAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAGAACGGCGGC
GTTTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAAGTCGAAGCTCCCATTGAGAAGCCGGCTAAG
TTTTATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACC
AAGCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAG
GGAAAGAGAGTTGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTTTACTTTTGGTTACAGGACCA
TTCAAGATCAATGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCC
ACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTGATGACAAGTACTTCGGCAAG
GTTGCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAG*TG
AAGAAAGAG

QA 2 610 2 610
DS 

RD RR2C239TF 611 0 0
GG
GAGTATTTTGTCACAGAGAGAA*AAAAACAACACAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAAG
CAGAGGAGCCCCAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGCAAATACTCC
CGTTCACAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAGAACGGCGGCGTT
TTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAAGTCGAAGCTCCCATTGAGAAGCCGGCTAAGTTT
TATCCTGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAG
CTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGA
AAGAGAGTTGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTTTACTTTTGGTTACAGGACCATTC
AAGATCAATGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACC
AAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTGATGACAAGTACTTCGGCAAGGTT
GCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAG
AAAGAGATC

QA 3 611 3 611
DS 

RD RR2BW80TF 703 0 0
GGAGAGTATTTTGTCACAGAGAGAA*AAAAACAATACAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCG
AAGCAGAGGAGCCCCAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGCAAATAC
TCCCGTTCACAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAGAACGGCGGC
GTTTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAAGTCGAAGCTCCCATTGAGAAGCCGGCTAAG
TTTTATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACC
AAGCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAG
GGAAAGAGAGTTGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTTTACTTTTGGTTACAGGACCA
TTCAAGATCAATGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCC
ACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTGATGACAAGTACTTCGGCAAG
GTTGCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTG
AAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGATC
*AAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2D247TF 719 0 0
GGTG
GTCACAGAGAGAAGAAAAAAAACACAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAAGCAGAGGAGC
CCCAAAGTAAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGCAAATACTCCCGTTCTCAA
ATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCACGT
CACGACGCTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCCCGTTGAGAAGCCGGCTAAGTTTTATCCTGCG
GAAGACGTTAAGAAGCCGCTTGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAGCTCAAAGCG
AGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAGTT
GTGTTTCTCAAGCAACTTTCTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACTGGACCATTCAAGATCAAT
GGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACCAAGGTTGAC
ATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTGATGACAAGTACTTCGGCAAGGTTGCTGAGAAG
AAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAGAAAGAGATC
CCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGATCAAAGCCATTGAA
GCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAA

QA 5 719 5 719
DS 

RD RR2D375TF 784 0 0
GCGGAGAGTATTTTGTCACAGAGAGAA*AAAAACAACACAAAAGAGAAAGATGGCGCCGG
CGAAGCAGAGGAGCCCCAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGCAAAT
ACTCCCGTTCACAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAGAACGGCG
GCGTTTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAAGTCGAAGCTCCCATTGAGAAGCCGGCTA
AGTTTTATCCGGCGGAAGATGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTA
CCAAGCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCA
AGGGAAAGAGAGTTGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTTTACTTTTGGTTACAGGAC
CATTCAAGATCAATGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCT
CCACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTGATGACAAGTACTTCGGCA
AGGTTGCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGG
TGAAGAAAGAGATCCCACAG*AGAAGAAAGAAGACCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGA
TCGAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGT
CTCAAGGA*TGAA*CCCCATGAGCTGTTTT*CTAGATTTCATCATATCTTTT*GTATCCC
ATCA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2FS53TF 817 0 0
GT
GGAGAGTATTTTGTCACAGAGAGAA*AAAAACAACACAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCG
AAGCAGAGGAGCCCCAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGCAAATAC
TCCCGTTCACAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAGAACGGCGGC
GTTTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAAGTCGAAGCTCCCATTGAGAAGCCGGCTAAG
TTTTATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACC
AAGCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAG
GGAAAGAGAGTTGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTTTACTTTTGGTTACAGGACCA
TCCAAGATCAATGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCC
ACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTGATGACAAGTACTTCGGCAAG
GTTGCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTG
AAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGATC
AAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCT
CAAGGA*TGAAACCCCATGAGCTTGTTT*CTAGATTTCATCATATCTTTT*GTATCCCAT
CATCATCACTGTTCAACAACATTTGTTT
CCCTGAG

QA 3 810 3 810
DS 

RD RR2B345TF 827 0 0
GTATTTTGTCACAGAGAGAA*AAAAACAACACAAAAGAGAAAGATGGCGCCGGCGAAGCA
GAGGAGCCCCAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTAATCAGGGGTGTAGGCAAATACTCCCG
TTCACAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAGAACGGCGGCGTTTT
CCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAAGTCGAAGCTCCCATTGAGAAGCCGGCTAAGTTTTA
TCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAGCT
CAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAA
GAGAGTTGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTTTACTTTTGGTTACAGGACCATTCAA
GATCAATGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACCAA
GGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTGATGACAAGTACTTCGGCAAGGTTGC
TGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAGAA
AGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGATCAAAGC
CATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGG
AATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGATTTCATCATATCTTTTTGTATCCCATCATCA
TCACTGTTCAACAACATTTGTTT*CCCCTGAGATTTTGCCCTTTTTA

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2A712TF 664 0 0
G
GGCCAAGAACGGCGGCGTTTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAAGTCGAAGCTCCCAT
TGAGAAGCCGGCTAAGTTTTATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACG
CAAACCTAAGCTTACCAAGCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTGATCATCCT
TGCTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAGTTGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTTTACT
TTTGGTTACAGGACCATTCAAGATCAATGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAACCAGTCCTA
TGTGATTGGAACCTCCACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTGATGA
CAAGTACTTCGGCAAGGTTGCTGATAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGA
AGCTGAGAAGGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAACTGT
GGACGCAGCTTTGATCGAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGACGC
CAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAGTGAAACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGATTTCATCATA
TCTTTTTGTATCCCATCATCATCACTGTTCAACAACATTTGTTTTCCCCTGAGATTTTGC
CCT

QA 2 664 2 664
DS 

RD RR2G718JQ 774 0 0
TCTAATCAGGGGTGTAGGCAAATACTCCCGTTCACAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTG
GGCAATCAAGGCCAAGAACGGCGGCGTTTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAAGTCGA
AGCTCCCATTGAGAAGCCGGCTAAGTTTTATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGC
TAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAGCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTTTT
GATCATCCTTGTTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAGTTGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTC
TGGTTTACTTTTGGTTACAGGACCATTCAAGATCAATGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAA
CCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAA
GTTTGATGACAAGTACTTCGGCAAGGTTGCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGA
GTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCA
GAAAACTATGGACGCAGCTTTGATCAAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTA
CCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGAT
TTCATCATATCTTTTTGTATCCCATCATCATCACTGTTCAACAACATTTGTTTTCCCCTG
AGATTTTGCCCTTTTTAAAAATTAAAAAAGACTATTTTCTATGATTTATATATC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2D375JQ 615 0 0
GGAAGATGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACTTAAGCTTACCAAGCTCAAAGC
AAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAGT
TGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTTTACTTTTGGTTACAGGACCATTCAAGATCAA
TGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACCAAGGTTGA
CATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTGATGACAAGTACTTCGGCAAGGTTGCTGAGAA
GAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAGAAAGAGAT
CCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGATCGAAGCCATTGA
AGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAATGAA
ACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGATTTCATCATATCTTTTTGTATCCCATCATCATCACTG
TTCAACAACATTTGTTTTCCCCCGAGATTTTGCCCTTTTTAAAAATTAAAAAAGACTATT
TTCTATGATTT
ATAC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2DM26JQ 607 0 0
GGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAGCTCAAAGC
AAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAGT
TGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTTTACTTTTGGTTACAGGACCATTCAAGATCAA
TGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACCAAGGTTGA
CATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTGATGACAAGTACTTCGGCAAGGTTGCTGAGAA
GAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAGAAAGAGAT
CCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGATCAAAGCCATTGA
AGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAATGAA
ACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGATTTCATCATATCTTTTTGTATCCCATCATCATCACTG
TTCAACAACATTTGTTTTCCCCTGAGATTTTGCCCTTTTTAAAAATTAAAAAAGACTATT
TT
TTACG

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2B345JQ 646 0 0
GCTCCCATTGAGAAGCCGGCTAAGTTTTATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCT
AACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAGCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTG
ATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAGTTGTCTTTTTTAAGCAACTTGCTTTT
GGTTTACTTTTGGTTACAGGACCATTCAAGATCAATGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAAC
CAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACCAAGGTTGACATTTTTGGAGTCAGCATCGAGAAG
TTTGATGACAAGTACTTCGGCAAGGTTGCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAG
TTTTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAG
AAAACTGTGGACGCAGCTTTGATCAAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTAC
CTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTTTAGATT
TCATCATATCTTTTTGTATCCCATCATCATCACTGTTCAACAACATTTGTTTTCCCCTGA
GATTTTGCCCTTTTTAAAAATTAAAAAAGACTATTTTTTATGATTT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2A712JQ 690 0 0
ACGGCGGCGTTTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAAGTCGAAGCTCCCATTGAGAAGC
CGGCTAAGTTTTATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTA
AGCTTACCAAGCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTGATCATCCTTGCTGGTC
GATTCAAGGGAAAGAGAGTTGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTTTACTTTTGGTTA
CAGGACCATTCAAGATCAATGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTG
GAACCTCCACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTGATGACAAGTACT
TCGGCAAGGTTGCTGATAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGA
AGGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAACTGTGGACGCAG
CTTTGATCGAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGACGCCAGGTTCT
CATTGTCTCAAGGAGTGAAACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGATTTCATCATATCTTTTTG
TATCCCATCATCATCACTGTTCAACAACATTTGTTTTCCCCTGAGATTTTGCCCTTTTTA
AAAATTAAAAAAGACTATTTTCTATGATTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2D247JQ 755 0 0
GGGGTGTAGGCAAATACTCCCGTTCTCAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCA
AGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCCCG
TTGAGAAGCCGGCTAAGTTTTATCCTGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTTGCTAACAGAC
GCAAACCTAAGCTTACCAAGCTCAAAGCGAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCC
TTGCTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAGTTGTGTTTCTCAAGCAACTTTTTTCTGGTTTGC
TTTTGGTTACTGGACCATTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAGTCCT
ATGTGATTGGAACCTCCACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTGATG
ACAAGTACTTCGGCAAGGTTGCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTG
AAGCTGAGAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAACTG
TGGACGCAGCTTTGATCAAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCG
CCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAATGAAACCCCACGAGCTTGTTTTCTAGATTTCATCAT
ATCTTTTTGTATCCCATCATCATCACTGTTCAACAACATTTGTTTTCCCCTGAGATTTTG
CCCTTTTTAAAAATTAAAAAAGACTATTTTCTATG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2BW80JQ 736 0 0
TCACAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAGAACGGCGGCGTTTTC
CCACGTCACGACGCTAAGTCCAAAGTCGAAGCTCCCATTGAGAAGCCGGCTAAGTTTTAT
CCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACAGACGCAAACCTAAGCTTACCAAGCTC
AAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTGATCATCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAAG
AGAGTTGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTTTGGTTTACTTTTGGTTACAGGACCATTCAAG
ATCAATGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACCAAG
GTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTGATGACAAGTACTTCGGCAAGGTTGCT
GAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAGAAA
GAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAACTGTGGACGCAGCTTTGATCAAAGCC
ATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGA
ATGCAACCCCATGAGCTTGTTTTTTAGATTTCATCATATCTTTTTGTATCCCATCATCAT
CACTGTTCAACAACATTTGTTTTCCCCTGAGATTTTGCCCTTTTTAAAAATTAAAAAAGA
CTATTTTCTATGAT
CG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2FS53JQ 758 0 0
TCAGGGGTGTAGGCAAATACTCCCGTTCACAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAA
TCAAGGCCAAGAACGGCGGCGTTTTCCCACGTCACGACGCTAAGTCCAAAGTCGAAGCTC
CCATTGAGAAGCCGGCTAAGTTTTATCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCTAACA
GACGCAAACCTAAGCTTACCAAGCTCAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTTTTGATCA
TCCTTGCTGGTCGATTCAAGGGAAAGAGAGTTGTCTTTCTTAAGCAACTTGCTTCTGGTT
TACTTTTGGTTACAGGACCATCCAAGATCAATGGTGTTCCATTGAGACGTGTTAACCAGT
CCTATGTGATTGGAACCTCCACCAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAGCATCGAGAAGTTTG
ATGACAAGTACTTCGGCAAGGTTGCTGAGAAGAAGACTAAGAAAGGAGAAGGAGAGTTCT
TTGAAGCTGAGAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGACCAGAAAA
CTGTGGACGCAGCTTTGATCAAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAGACTTACCTCG
GCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGATTTCAT
CATATCTTTTTGTATCCCATCATCATCACTGTTCAACAACATTTGTTTTCCCCTGAGATT
TTGCCCTTTTTAAAAATTAAAAAAGACTATTTT
TTACG

QA 1 753 1 753
DS 



CO CL19Contig4 867 3 2 U
GGGGGGTTGTTTGGTTTACTTCCGTCGTCACTGAGAGGTTGTTGTAACACAGAGAGAGAG
AAAGAGAATCAAAGAAAGATGCCGGCGGCGAAGCAAAGGACCCCGAAAGTGAGCCGAAAC
CCTGATCTGATAAGGGGTGTTGGCAAATACTCTCGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGC
TTGTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCCGCCACGACGCTAAGTCCAAG
GTCCAATCTTCCGTTGAGAAGCCACCCAAGTTTTACCCCGCTGAAGACGTTAAGAAGCCT
CTCGCCAACAGACGCAAGCCTAACCCTACCAAGCTCAAGTCAAGCATTACTCCAGGAACT
GTGTTGATCATTCTTGCCGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTTGTATTCCTCAAGCAGCTC
TCTTCTGGTTTGCTTTTGGTGACTGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGT
GTTAACCAGTCTTATGTGATTGGAACCTCCACAAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAACGTT
GAGAAGTTCGATGACAAGTACTTTGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGAGCAAGAAAGGAGAA
GGCGAGTTCTTTGAAGCTGGCAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAAAAGAAAGAA
GACCAGAAGACGGTGGATGCAGCACTTATCAAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAG
ACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTC
TAGATTTCATATCCCTTTTGTTTCAACAATATCTGTGTTTCCCCTTGAGAGATTTTGGTC
ATCTTTTATAAAAACGTTATTTCTCTC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ96TF U 1
AF RR2F836TF U 1
AF RR2F836JQ C 421
BS 1 613 RR2F836TF
BS 614 867 RR2F836JQ

RD RR2GJ96TF 450 0 0
GG
GGGGTTGTTTGGTTTACTTCCGTCGTCACTGAGAGGTTGTTGTAACACAGAGAGAGAGAA
AGAGAATCAAAGAAAGATGCCGGCGGCGAAGCAAAGGACCCCGAAAGTGAGCCGAAACCC
TGATCTGATAAGGGGTGTTGGCAAATACTCTCGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGCTT
GTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCCGCCACGGCGCTAAGTCCAAGGT
CCAATCTTCCGTTGAGAAGCCACCCAAGTTTTACCCCGCTGAAGACGTTAAGAAGCCTCT
CGCCAACAGACGCAAGCCTAACCCTACCAAGCTCAAGTCAAGCATTACTCCAGGAACTGT
GTTGATCATTCTTGCCGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTTGTATTCCTCAAGCAGCTCTC
TTCTGGTTTGCTTTTGGTGACTGGACCG

QA 3 450 3 450
DS 

RD RR2F836TF 613 0 0
GGGGGGTTGTTTGGTTTACTTCCGTCGTCACTGAGAGGTTGTTGTAACACAGAGAGAGAG
AAAGAGAATCAAAGAAAGATGCCGGCGGCGAAGCAAAGGACCCCGAAAGTGAGCCGAAAC
CCTGATCTGATAAGGGGTGTTGGCAAATACTCTCGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGC
TTGTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCCGCCACGACGCTAAGTCCAAG
GTCCAATCTTCCGTTGAGAAGCCACCCAAGTTTTACCCCGCTGAAGACGTTAAGAAGCCT
CTCGCCAACAGACGCAAGCCTAACCCTACCAAGCTCAAGTCAAGCATTACTCCAGGAACT
GTGTTGATCATTCTTGCCGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTTGTATTCCTCAAGCAGCTC
TCTTCTGGTTTGCTTTTGGTGACTGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGT
GTTAACCAGTCTTATGTGATTGGAACCTCCACAAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAACGTT
GAGAAGTTCGATGACAAGTACTTTGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGAGCAAGAAAGGAGAA
GGCGAGTTCTTTG

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2F836JQ 447 0 0
TCTTCTGGTTTGCTTTTGGTGACTGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGT
GTTAACCAGTCTTATGTGATTGGAACCTCCACAAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAACGTT
GAGAAGTTCGATGACAAGTACTTTGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGAGCAAGAAAGGAGAA
GGCGAGTTCTTTGAAGCTGGCAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAAAAGAAAGAA
GACCAGAAGACGGTGGATGCAGCACTTATCAAAGCCATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCAAG
ACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTC
TAGATTTCATATCCCTTTTGTTTCAACAATATCTGTGTTTCCCCTTGAGAGATTTTGGTC
ATCTTTTATAAAAACGTTATTTCTCTC

QA 1 447 1 447
DS 



AS 4 29

CO CL20Contig1 833 10 57 U
GGGCCTCCTCCTCTGACCACGAAGCTCTGGAAA*GCAGGAAGCCGTAAACCTTTTTCTCC
ACCTTCTAGTGTTCTTCGTCGTCGTTTACTGAAACTGCCAAGATGTTCTCTGCTCAGAAC
AAGATCCACAAGGATAAGGGTGTTGCACCAACCGAGTTTGAGGAGCGAGTTGCTCAGGCT
TTCTTTGATCTGGAGAACACCAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATT
AACCAAGCTGTTTCGATGGATATTGCTGGCAACCGCAAGGCTGTTGTGATCTATGTTCCA
TTCAGACTGAGGAAAGCCTTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTCGAGAAG
AAGTTCAGTGGTAACGATGTTATCTTTGTTGCTACCAGAAGAATCATGCGTCCTCCTAAG
AAAGGCTCTGCTGTTCAGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCACGAAGCCATG
CTTGAGGATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGAT
GGCACCAAGATCATGAAGGTCTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAG
CTTGAGACTATGGTTGGTGTGTACAGGAAACTCACAGGGAAAGATGTAGTTTTCGAGTAC
CCAGTCGCTGAAGCTTGAGGAGATA*CAATGTTG*TTTTAATTCTTCTTTTTTGTCGGAT
AGTTTTGGTTCTGTTTGAGAGTAAAAAAAACTCTTTGGAAAGATTTTCTTGTTAAAGTTG
CTTCACACTCTTCCTGCTATTTCTGTTTAATAAGACCTTTCTTATGTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 30 30 30 30 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 5 40 40 40 40 5 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 
60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 25 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 20 30 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2G472TF U 9
AF RR2AM71TF U 1
AF RR2FB30TF U 4
AF RR2DK78TF U 1
AF RR2C509TF U 20
AF RR2BT85TF U 3
AF RR2AH91TF U 13
AF RR2AH91JQ C 184
AF RR2G472JQ C 199
AF RR2C509JQ C 432
BS 1 23 RR2AM71TF
BS 24 24 RR2FB30TF
BS 25 33 RR2AM71TF
BS 34 34 RR2BT85TF
BS 35 49 RR2AM71TF
BS 50 50 RR2BT85TF
BS 51 51 RR2AM71TF
BS 52 52 RR2BT85TF
BS 53 113 RR2AM71TF
BS 114 114 RR2BT85TF
BS 115 144 RR2AM71TF
BS 145 145 RR2BT85TF
BS 146 152 RR2AM71TF
BS 153 153 RR2BT85TF
BS 154 189 RR2AM71TF
BS 190 190 RR2BT85TF
BS 191 203 RR2AM71TF
BS 204 204 RR2BT85TF
BS 205 221 RR2AM71TF
BS 222 222 RR2FB30TF
BS 223 254 RR2AM71TF
BS 255 255 RR2BT85TF
BS 256 261 RR2AM71TF
BS 262 262 RR2FB30TF
BS 263 293 RR2AM71TF
BS 294 294 RR2BT85TF
BS 295 392 RR2AM71TF
BS 393 393 RR2BT85TF
BS 394 440 RR2AM71TF
BS 441 441 RR2FB30TF
BS 442 446 RR2AM71TF
BS 447 447 RR2BT85TF
BS 448 464 RR2AM71TF
BS 465 465 RR2BT85TF
BS 466 494 RR2AM71TF
BS 495 495 RR2FB30TF
BS 496 601 RR2AM71TF
BS 602 602 RR2FB30TF
BS 603 608 RR2AM71TF
BS 609 609 RR2BT85TF
BS 610 665 RR2AM71TF
BS 666 666 RR2BT85TF
BS 667 667 RR2FB30TF
BS 668 679 RR2AM71TF
BS 680 680 RR2BT85TF
BS 681 685 RR2AM71TF
BS 686 686 RR2FB30TF
BS 687 694 RR2AM71TF
BS 695 695 RR2BT85TF
BS 696 713 RR2AM71TF
BS 714 715 RR2AH91TF
BS 716 749 RR2BT85TF
BS 750 796 RR2AH91TF
BS 797 801 RR2AH91JQ
BS 802 802 RR2G472JQ
BS 803 829 RR2AH91JQ
BS 830 833 RR2C509JQ

RD RR2G472TF 515 0 0
GG
CTCTGACCACGAAGCTCTGGAAA*GCAGGAAGCCGTAAACCTTTTTTTCCACCTTCTAGT
GTTCTTCGTCGTCGTTTACTGAAACTGCCAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCACA
AGGATAAGGGTGTTGCACCAACCGAGTTTGAGGAGCGAGTTGCTCAGGCTTTCTTTGATC
TGGAGAACACCAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTG
TTTCGATGGATATTGCTGGCAACCGCAAGGCTGTTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGA
GGAAAGCCTTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTCAGTG
GTAACGATGTTATCTTTGTTGCTACCAGAAGAATCATGCGTCCTCCTAAGAAAGGCTCTG
CTGTTCAGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCACGAAGCCATGCTTGAGGATG
TCGCTTACCCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTA

QA 3 515 3 515
DS 

RD RR2AM71TF 719 0 0
GGGCCTCCTCCTCTGACCACGAATCTCTGGAAAAGCAGGAAGCCGTAAATCCTTTTCTCC
ACCTTCTAGTGTTCTTCGTCGTCGTTTACTGAAACTGCCAAGATGTTCTCTGCACAGAAC
AAGATCCACAAGGATAAGGGTGTTCCACCAACTGAGTTTGAGGAGCGAGTTGCTCAGGCT
TTCTTTGATTTGGAGAACACCAATCAGGAGTTGAAAAGTGATTTGAAAGATCTCTACATT
AACCAAGCTGTTTCAATGGATGTTGCTGGCAACCGCAAGGCTGTTGTGATCTACGTTCCA
TTCAGACTGAGGAAAGCCTTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTCGAGAAG
AAGTTCAGTGGTAACGATGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGTCCTCCTAAG
AAAGGCTCTGCTGTTCAGAGGCCACGTAACAGGACTCTCACTTCGGTCCACGAAGCCATG
CTTGAGGATGTCGCCTACCCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGAT
GGCACCAAGATCATGAAGGTCTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAG
CCTGAGACAATGGTTGGTGTGTACAGGAAACTCACAGGGAAAGATGTAGTTTTCGAGTAC
CCAGTTACTGAAGCTTGAG*AGATATCAATGTTGGTTTTAATTCTTCTTTTTT
TTTTTT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2FB30TF 712 0 0
GGG
CCTCCTCTGACCACGAAGCTCTGGAAAAGCAGGAAGCCGTAAATCCTTTTCTCCACCTTC
TAGTGTTCGTCATCGTCGTTTACTGAAACTGCCAAGATGTTCTCTGCACAGAACAAGATC
CACAAGGATAAGGGTGTTCCACCAACTGAGTTTGAGGAGCGAGTTGCTCAGGCTTTCTTT
GATTTGGAGAACACCAATCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAA
GCTGTTTCAATGGATATTGCTGGCAACCGCAAGGCTGTTGTGATCTACGTTCCATTCAGA
CTGAGGAAAGCTTTCCGCAAGATTCATTCTCGTCTTGTAAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTC
AGTGGTAACGATGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGTCCTCCTAAGAAAGGC
TCTGCTGTTCAGAGACCACGTAACAGGACTCTCACTTCGGTCCACGAAGCCATGCTTGAG
GATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACC
AAGATCATGAAGGTCTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAG
ACAATGGTTGGTGTGTACAGGAAACTTACAGGGAAAGATGTAGTTTTCGAGTACCCAGTT
GTTGAAGCTTGAG*AGATA*CAATGTTGTTTTTAATTCTTCTTTTTT
TG

QA 4 710 4 710
DS 

RD RR2DK78TF 713 0 0
GGGCCT
CCTCCTCTGACCACGAAGCTCTGGAAAAGCAGGAAGCCGTAAATCCTTTTCTCCACCTTC
TAGTGTTCTTCGTCGTCGTTTACTGAAACTGCCAAGATGTTCTCTGCACAGAACAAGATC
CACAGGGATAAGGGTGTTCCACCAACTGAGTTTGAGGAGCGATTTGCTCAGGCTTTCTTT
GATTTGGAGAACACCAATCAGGAGTTGAAAAGTGATTTGAAAGATCTCTACATTAACCAA
GCTGTTTCAATGGATATTGCTGGCAACCGCAAGGCTGTTGTGATCTACGTTCCATTCAGA
CTGAGGAAAGCCTTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTC
AGTGGTAACGATGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGTCCTCCTAAGAAAGGC
TCTGCTGTTCAGAGACCACGTAACAGGACTCTCACTTCGGTCCACGAAGCCATGCTTGAA
GATGTCGCCTACCCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACAGTGTTGATGGCACC
AAGATCATGAAGGTCTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAG
ACAATGGTTGGTGTGTACAGGAAACTCACAGGGAAAGATGTAGTTTTCGAGTACCCAGTT
ACTGAAGCTTGAG*AGATATCAATGTTGGTTTTAATTCTTCTTTTTT

QA 7 713 7 713
DS 

RD RR2C509TF 693 0 0
CGAAGCTCTGGAAA*GCAGGAAGCCGTAAACCTTTTTCTCCACCTTCTAGTGTTCTTCGT
CGTCGTTTACTGAAACTGCCAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCACAAGGATAAGG
GTGTTGCACCAACCGAGTTTGAGGAGCGAGTTGCTCAGGCTTTCTTTGATCTGGAGAACA
CCAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTTCGATGG
ATATTGCTGGCAACCGCAAGGCTGTTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAAGCCT
TCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTCAGTGGTAACGATG
TTATCTTTGTTGCTACCAGAAGAATCATGCGTCCTCCTAAGAAAGGCTCTGCTGTTCAGA
GACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCACGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTTACC
CTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAGG
TCTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGGGACTATGGTTGGTG
TGTACAGGAAACTCACAGGGAAAGATGTAGTTTTCGAGTACCCAGTCGCTGAAGCTTGAG
*AGATA*CAATGTTG*TTTTAATTCTTCTTTTT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2BT85TF 747 0 0
GGCT
CCTCCTCTGACCACGAAGCTCTGGAAA*GCAGGAAGCCGTAAACCTTTTTTTCCACCTTC
TAGTGTTCTTCGTCGTCGTTTACTGAAACTGCCAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATC
CACAAGGATAAGGGTGTTGCACCAACCGAGTTTGAGGAGCGAGTTGCTCAGGCTTTCTTT
GATCTGGAGAACACCAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAA
GCTGTTTCGATGGATATTGCTGGCAACCGCAAGGCTGTTGTGATCTATGTTCCATTCAGA
CTGAGGAAAGCCTTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTC
AGTGGTAACGATGTTATCTTTGTTGCTACCAGAAGAATCATGCGTCCTCCTAAGAAAGGC
TCTGCTGTTCAGAGACCACGCAACAGGGCTCTCACTTCCGTCCACGAAGCCATGCTTGAG
GATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACC
AAGATCATGAAGGTCTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATGACACTGAGTACAAGCTTGAG
ACTATGGTTGGTGTGTACAGGAAACTCACAGGGAAAGATGTAGTTTTCGAGTACCCAGTC
GCTGAAGCTTGAGGAGATA*CAATGTTG*TTTTAATTCTTCTTTTTGC*CGGATAGTTTT
GGTTCTGTTTGAGAGTAAAAAAA

QA 5 747 5 747
DS 

RD RR2AH91TF 784 0 0
GG
GACCACGAAGCTCTGGAAA*GCAGGAAGCCGTAAACCTTTTTTTCCACCTTCTAGTGTTC
TTCGTCGTCGTTTACTGAAACTGCCAAGATGTTCTCTGCTTAGAACAAGATCCACAAGGA
TAAGGGTGTTGCACCAACCGAGTTTGAGGAGCGAGTTGCTCAGGCTTTCTTTGATCTGGA
GAACACCAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTTC
GATGGATATTGCTGGCAACCGCAAGGCTGTTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAA
AGCCTTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTCAGTGGTAA
CGATGTTATCTTTGTTGCTACCAGAAGAATCATGCGTCCTCCTAAGAAAGGCTCTGCTGT
TCAGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCACGAAGCCGTGCTTGAGGATGTCGC
TTACCCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCAT
GAAGGTCTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAGACTATGGT
TGGTGTGTACAGGAAACTCACAGGGAAAGATGTAGTTTTCGAGTACCCAGTCGCTGAAGC
TTGAGGAGATA*CAATGTTG*TTTTAATTCTTCTTTTTTGTCGGATAGTTTTGGTTCTGT
TTGAGAGTAAAAAAAACTCTTTGGAAAGATTTTCTTGTTAAAGTTGCTTCACACTCTTCC
TG

QA 3 784 3 784
DS 

RD RR2AH91JQ 646 0 0
TTTGATCTGGAGAACACCAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAAC
CAAGCTGTTTCGATGGATATTGCTGGCAACCGCAAGGCTGTTGTGATCTATGTTCCATTC
AGACTGAGGAAAGCCTTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTCGAGAAGAAG
TTCAGTGGTAACGATGTTATCTTTGTTGCTACCAGAAGAATCATGCGTCCTCCTAAGAAA
GGCTTTGCTGTTCAGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCACGAAGCCGTGCTT
GAGGATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGC
ACCAAGATCATGAAGGTCTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTT
GAGACTATGGTTGGTGTGTACAGGAAACTCACAGGGAAAGATGTAGTTTTCGAGTACCCA
GTCGCTGAAGCTTGAGGAGATA*CAATGTTG*TTTTAATTCTTCTTTTTTGTCGGATAGT
TTTGGTTCTGTTTGAGAGTAAAAAAAACTCTTTGGAAAGATTTTCTTGTTAAAGTTGCTT
CACACTCTTCCTGCTATTCCTGTTTAATAAGACCTTTCTTATGTTG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2G472JQ 635 0 0
ACCAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTTCGATG
GATATTGCTGGCAACCGCAAGGCTGTTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAAGCC
TTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTCAGTGGTAACGAT
GTTATCTTTGTTGCTACCAGAAGAATCATGCGTCCTCCTAAGAAAGGCTCTGCTGTTCAG
AGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCACGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTTAC
CCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAG
GTCTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAGACTATGGTTGGT
GTGTACAGGAAACTCACAGGGAAAGATGTAGTTTTCGAGTACCCAGTCGCTGAAGCTTGA
GGAGATA*CAATGTTG*TTTTAATTCTTCTTTTTTGTCGGATAGTTTTGGTTCTGTTTGA
GAGTAAAAAAAACTCTTTGGAAAGATTTTCTTGTTAAAGTTGCTTCACACTCTTCCTGCT
ATTTCTGTTTAATAAGACCTTTCTTATGTTG
TTCC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2C509JQ 402 0 0
TGTTCAGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCACGAAGCCATGCTTGAGGATGT
CGCTTACCCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGAT
CATGAAGGTCTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGGGACTAT
GGTTGGTGTGTACAGGAAACTCACAGGGAAAGATGTAGTTTTCGAGTACCCAGTCGCTGA
AGCTTGAGGAGATA*CAATGTTG*TTTTAATTCTTCTTTTTTGTCGGATAGTTTTGGTTC
TGTTTGAGAGTAAAAAAAACTCTTTGGAAAGATTTTCTTGTTAAAGTTGCTTCCCACTCT
TCCTGCTATTTCTGTTTAATAAGCCCTTTCTTATGTTGTTCC

QA 1 402 1 402
DS 



CO CL20Contig2 850 11 15 U
GGGAACACGAAGCTCTAAACGCAAAGCGGGGTAACCTTTTCACCATCTTCTAGGGTTCTT
CGTCGTTGTCAACTGAATCTGCGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGATA
AGGGTGTGGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGACCTGGAGA
ACACAAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGA
TGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCAATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAGG
CCTTCCGCAAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAG
AAGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCACCAAAGAAAGGCTCTGCTGTTC
AGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTT
ACCCTGCTGAGATTGTTGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGA
AGGTGTATTTGGAGCCTAAAGAGAGGAACAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCG
GTGTCTACAGGAAGCTTACGGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCGATCGTAGAAGCTT
GAAGAGATGAATGTTTGATTCTTTTTTTTT*GTCAGGATAGAGAGCTTTTGATTCTGCTT
TTTGAGTAAAAACTCTTTGCAAAATATTTTCTTGTTTAAGTTTTTGCATCTCAGTCTTCC
TCAAAACCTGTGTTAAACAACAGCTTTCTTATTTTCTCCGAGCATTCACCTTTTCAAGAA
ACTTTTATAC


BQ
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 45 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 45 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 50 20 40 40 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 15 35 35 35 
15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN34TF U 131
AF RR2AV75TF U 1
AF RR2B696TF U 1
AF RR2FG75TF U 1
AF RR2EX10TF U 1
AF RR2BB67TF U 1
AF RR2DV67TF U -6
AF RR2AV75JQ C 68
AF RR2FG75JQ C 68
AF RR2BB67JQ C 325
AF RR2B696JQ C 139
BS 1 497 RR2AV75TF
BS 498 498 RR2B696TF
BS 499 579 RR2AV75TF
BS 580 580 RR2B696TF
BS 581 690 RR2AV75TF
BS 691 693 RR2BB67TF
BS 694 696 RR2DV67TF
BS 697 697 RR2AV75JQ
BS 698 717 RR2DV67TF
BS 718 718 RR2AV75JQ
BS 719 721 RR2DV67TF
BS 722 722 RR2AV75JQ
BS 723 731 RR2DV67TF
BS 732 834 RR2AV75JQ
BS 835 850 RR2B696JQ

RD RR2FN34TF 108 0 0
TCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGACCTGGAGAACACAAACCA
GGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCA

QA 1 108 1 108
DS 

RD RR2AV75TF 694 0 0
GGGAACACGAAGCTCTAAACGCAAAGCGGGGTAACCTTTTCACCATCTTCTAGGGTTCTT
CGTCGTTGTCAACTGAATCTGCGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGATA
AGGGTGTGGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGACCTGGAGA
ACACAAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGA
TGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCAATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAGG
CCTTCCGCAAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAG
AAGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCACCAAAGAAAGGCTCTGCTGTTC
AGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTT
ACCCTGCTGAGATTGTTTGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGA
AGGTGTATTTGGAGCCTAAAGAGAGGAACAACACTGAGTGCAAGCTTGAGACAATGGTCG
GTGTCTACAGGAAGCTTACGGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCGATCGTAGAAGCTT
GAAGAGATGAATGTTTGATTCTTTTTTTTT
TGTC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2B696TF 662 0 0
GGGAACACGAAGCTCTAAACGCAAAGCGGGGTAACCTTTTCACCATCTTCTAGGGTTCTT
CGTCGTTGTCAACTGAATCTGCGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGATA
AGGGTGTGGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGACCTGGAGA
ACACAAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGA
TGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCAATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAGG
CCTTCCGCAAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAG
AAGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCACCAAAGAAAGGCTCTGCTGTTC
AGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTT
ACCCTGCTGAGATTGTTGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGA
AGGTGTATTTGGAGCCTAAAGAGAGGAACAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCG
GTGTCTACAGGAAGCTTACGGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCGATCGTAGAAGCTT
GA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2FG75TF 690 0 0
GGGAACACGAAGCTCTAAACGCAAAGCGGGGTAACCTTTTCACCATCTTCTAGGGTTCTT
CGTCGTTGTCAACTGAATCTGCGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGATA
AGGGTGTGGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGACCTGGAGA
ACACAAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGA
TGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCAATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAGG
CCTTCCGCAAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAG
AAGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCACCAAAGAAAGGCTCTGCTGTTC
AGAGACCACGCAACGGGACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTT
ACCCTGCTGAGATTGTTGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGGTCATGA
AGGTGTATTTGGAGCCTAAAGAGAGGAACAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCG
GTGTCTACAGGAAGCTTACGGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCGATCGTAGAAGCTT
GAAGAGATGAATGTTTGATTCTTTTTTTTG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2EX10TF 689 0 0
GGGAACACGAAGCTCTAAACGCAAAGCGGGGTAACCTTTTCACCATCTTCTAGGGTTCTT
CGTCGTTGTCAACTGAATCTGCGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGATA
AGGGTGTGGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCATGCTTTCTTTGACCTGGAGA
ACACAAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGA
TGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCAATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAGG
CCTTCCGCAAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAG
AAGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCACCAAAGAAAGGCTCTGCTGTTC
AGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCAGGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTT
ACCCTGCTGAGATTGTTGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGA
AGGTGTATTTGGAGCCTAAAGAGAGGAACAACACTGAGTGCAAGCTTGAGACAATGGTCG
GTGTCTACAGGAAGCTTACGGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCGATCGTAGAAGCTT
GAAGAGATGAATGTTTGATTCTTTTTTT
G

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2BB67TF 693 0 0
GGGAACACGAAGCTCTAAACGCAAAGCGGGGTAACCTTTTCACCATCTTCTAGGGTTCTT
CGTCGTTGTCAACTGAATCTGCGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGATA
AGGGTGTGACTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGACCTGGAGA
ACACAAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGA
TGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCAATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAGG
CCTTCCGCAAGATTCATCCTTGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAG
AAGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCACCAAAGAAAGGCTCTGCTGTTC
AGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGTATGTCGCTT
ACCCTGCTGAGATTGTTGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGA
AGGTGTATTTGGAGCCTAAAGAGAGGAACAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCG
GTGTCTACAGGAAGCTTACGGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCGATCGTAGAAGCTT
GAAGAGATGAATGTTTGATTCTTTTTTTTT*GT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2DV67TF 740 0 0
GGGCCTCTT
GAACACGAATCTCTAAAAGCAAAGAGTG*TAACCTTTTCACCATCTTCTAGGGTTCTTCG
TCGTTGTCAACTGAAACTGCGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGATAAG
GGTGTGGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCTCAGGCTTTCTTTGATTTGGAGAAC
ACAAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGATG
GATGTTTCTGGCAACCGCGAGGCTATTGTGATCTATGTTCCATTCAGATTGAGGAAAGCC
TTCCGCAAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGAA
GTCATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCCCCTAAGAAGGGCTCTGCTGTCCAG
AGACCACGCAACAGAACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTTAC
CCTGCTGAGATTGTTGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAG
GTGTATTTGGAGCCTAAAGAGAGGAACAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCGGT
GTCTACAGGAAGCTTACGGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCAATCGTAGAAGCTTGA
AGAGATGAATGTTTGATTCTTTTTTTT**GTCAG*ATAGAGAGCTTTTGATTCTGTTTTC
TGAGTAAAA
CT

QA 10 738 10 738
DS 

RD RR2AV75JQ 771 0 0
GTCAACTGAATCTGCGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGATAAGGGTGT
GGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGACCTGGAGAACACAAA
CCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGATGGATGT
TTCTGGCAACCGCAAGGCAATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAGGCCTTCCG
CAAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGAAGTTAT
CTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCACCAAAGAAAGGCTTTGCTGTTCAGAGACC
ACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTTACCCTGC
TGAGATTGTTTGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAGGTGTA
TTTGGAGCCTAAAGAGAGGAACAACACTGAGTGCAAGCTTGAGACAATGGTCGGTGTCTA
CAGGAAGCTTACGGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCGATCGTAGAAGCTTGAAGAGA
TGAATGTTTGATTCTTTTTTTTTTGTCAGGATAGAGAGCTTTTGATTCTGCTTTTTGAGT
AAAAACTCTTTGCAAAATATTTTCTTGTTTAAGTTTTTGCATCTCAGTCTTCCTCAAAAC
CTGTGTTAAACAACAGCTTTCTTATTTTCTCCGAGCATTCACCTTTT
CAGG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2FG75JQ 743 0 0
GTCAACTGAATCTGCGAAGATGTTCTCTGCTCAGAACAAGATCCATAAGGATAAGGGTGT
GGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGACCTGGAGAACACAAA
CCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGATGGATGT
TTCTGGCAACCGCAAGGCAATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAGGCCTTCCG
CAAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGAAGTTAT
CTTTGTTGCCACCAGAAGAATCATGCGCCCACCAAAGAAAGGCTCTGCTGTTCAGAGACC
ACGCAACGGGACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTTACCCTGC
TGAGATTGTTGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGGTCATGAAGGTGTA
TTTGGAGCCTAAAGAGAGGAACAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCGGTGTCTA
CAGGAAGCTTACGGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCGATCGTAGAAGCTTGAAGAGA
TGAATGTTTGATTCTTTTTTTTT*GTCAGGATAGAGAGCTTTTGATTCTGCTTTTTGAGT
AAAAACTCTTTGCAAAATATTTTCTTGTTTAAGTTTTTGCGTCTCAGTCTTCCTCAAAAC
CTGTGTTAAACAACAGCTTT
CTT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2BB67JQ 510 0 0
TTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGAAGTTATTTTTGTTGCCCCCAGAA
GAATCATGCGCCCCCCAAAGAAAGGCTTTGCTGTTCAGAGACCACGCAACAGGACTTTCA
CTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGTATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTGTTGGAAAGC
GTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAGGTGTATTTGGAGCCTAAAGAGA
GGAACAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCGGTGTTTACAGGAAGCTTACGGGGA
GAGATGTTGTTTTCGAGTACCCGATCGTAGAAGCTTGAAGAGATGAATGTTTGATTTTTT
TTTTTT*GTCAGGATAGAGAGCTTTTGATTTTGCTTTTTGAGTAAAAACTCTTTGCAAAA
TATTTTTTTGTTTAAGTTTTTGCATTTCAGTTTTCCTCAAAACCTGTGTTAAACAACAGC
TTTTTTATTTTTTCCGAGCATTCCCCTTTT

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2B696JQ 712 0 0
ACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGACCTGGAGAACACAAACCAGGAGTTGA
AAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGATGGATGTTTCTGGCAACC
GCAAGGCAATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAGGCCTTCCGCAAGATTCATC
CTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGAAGTTATCTTTGTTGCCA
CCAGAAGAATCATGCGCCCACCAAAGAAAGGCTCTGCTGTTCAGAGACCACGCAACAGGA
CTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTGTTG
GAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAGGTGTATTTGGAGCCTA
AAGAGAGGAACAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCGGTGTCTACAGGAAGCTTA
CGGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCGATCGTAGAAGCTTGAAGAGATGAATGTTTGA
TTCTTTTTTTTT*GTCAGGATAGAGAGCTTTTGATTCTGCTTTTTGAGTAAAAACTCTTT
GCAAAATATTTTCTTGTTTAAGTTTTTGCATCTCAGTCTTCCTCAAAACCTGTGTTAAAC
AACAGCTTTCTTATTTTCTCCGAGCATTCACCTTTTCAAGAAACTTTTATAC

QA 1 712 1 712
DS 



CO CL20Contig3 517 2 8 U
AACAAAAAAAAGCTCTTGTTTAAACACAAGTTTTGACAAAAACTGAAATGCAACAACTTA
AACAATAAAATGCTATGCAAGGAGTTTTTACTCAAAAAACAAAATCAAAAGCTCTCTATC
CTGACAAAAAAAAAAAATCAAACATTCATCTCTTCAAGCTTCTACGATTGGGTACTCCAA
AACAACATCTCTCCCCGTAAGCTTCCTGTAAACACCGACCATTGTCTCAAGCTTGTACTC
AGTGTTGTTCCTCTCTTTAGGCTCCAAATACACCTTCATGATCTTGGTGCCATCAACACG
GTATCTGGTACGCTTTCCAACAATCTCAGCAGGGTAAGCGACATCCTCAAGCATGGCTTC
ATGGACGGAAGTGAGAGTTCTGTTGCGTGGTCTCTGGACAGCAAAACCCTTCTTAGGGGG
GCGCATGATTCTTCTGGTGGCAACAAAGATGACTTCTTTGCCACTGAACTTCTTCTCAAG
CTCTCTGACAAGACGAGGATGAATCTGAATGGAACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV67JQ U 1
AF RR2E888JQ U 49
BS 1 74 RR2DV67JQ
BS 75 75 RR2E888JQ
BS 76 136 RR2DV67JQ
BS 137 137 RR2E888JQ
BS 138 177 RR2DV67JQ
BS 178 178 RR2E888JQ
BS 179 324 RR2DV67JQ
BS 325 517 RR2E888JQ

RD RR2DV67JQ 324 0 0
AACAAAAAAAAGCTCTTGTTTAAACACAAGTTTTGACAAAAACTGAAATGCAACAACTTA
AACAATAAAATGCTTTGCAAGGAGTTTTTACTCAAAAAACAAAATCAAAAGCTCTCTATC
CTGACAAAAAAAAAAA*TCAAACATTCATCTCTTCAAGCTTCTACGATTGGGTACTCGAA
AACAACATCTCTCCCCGTAAGCTTCCTGTAAACACCGACCATTGTCTCAAGCTTGTACTC
AGTGTTGTTCCTCTCTTTAGGCTCCAAATACACCTTCATGATCTTGGTGCCATCAACACG
GTATCTGGTACGCTTTCCAACAAT

QA 1 324 1 324
DS 

RD RR2E888JQ 469 0 0
TGCAACAACTTAAACAATAAAATGCTATGCAAGGAGTTTTTACTCAAAAAACAAAATCAA
AAGCTCTCTATCCTGACAAAAAAAAAAAATCAAACATTCATCTCTTCAAGCTTCTACGAT
TGGGTACTCCAAAACAACATCTCTCCCCGTAAGCTTCCTGTAAACACCGACCATTGTCTC
AAGCTTGTACTCAGTGTTGTTCCTCTCTTTAGGCTCCAAATACACCTTCATGATCTTGGT
GCCATCAACACGGTATCTGGTACGCTTTCCAACAATCTCAGCAGGGTAAGCGACATCCTC
AAGCATGGCTTCATGGACGGAAGTGAGAGTTCTGTTGCGTGGTCTCTGGACAGCAAAACC
CTTCTTAGGGGGGCGCATGATTCTTCTGGTGGCAACAAAGATGACTTCTTTGCCACTGAA
CTTCTTCTCAAGCTCTCTGACAAGACGAGGATGAATCTGAATGGAACAT

QA 1 469 1 469
DS 



CO CL20Contig4 805 6 50 U
AATACTCATAGAACAACAGAAAGGTTTTGTTAAATAGAAATTTGAGGAAGACTGAAGTAA
CTTGTACTCGGAAACAAACCAGAATCAAAAGCTCTCTAGTCGACCAAAAAAA*CAAAGAA
TAGAACAATCATTCATCTCTTCAAGCTTCTGTGACTGGGTACTCGAAAACTACATCTCTC
CCTGTAAGTTTCCTGTACACACCGACC*ATTGTCTCAAGCTTGTACTCAGTGTTATTCCT
CTCCTTAGGCTCCAAAAACACCTTCATGATCTTGGTACCATCAACACGGTATCTGGTACG
TTTTCCGACAATCTCAGCAGGGTAAGCGACATCCTCAAGCATAGCTTCATGGACGGAAGT
GAGAGTCCTGTTGCGTGGTCTCTGAACAGCAGAGCCTTTCTTAGGGGGACGCATGATTCT
TCTGGTGGCAACAAAGATAACATCTTTGCCACTGAACTTTTTCTCGAGCTCTCTGACGAG
GCGGGGATGGATCTTGCGGAATGCTTTCCTCAATCTGAATGGAACGTAGATCACAATAGC
CTTGCGGCTGCCAGAAACATCCATCTGAACAGCTTGGTTAATGTAGAGATCTTTCAAGTC
ACTTTTCAACTCCTGGTTGGTGTTTTCCAAGTCAAAGAAAGCCTGAGCAACTTCCTGTTC
GAAATCAGTGGGTGCAACACCCTTATCCTTGTGGATCTTGTTCTGAGCAGAGAACATCTT
GGCAAGATACAGATAAACACGTCGAAGAACCCTAGAAGGTGGTGGTGGAAAGGTTTACGG
CTTGCTTTAAGAGCTTCGTGTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 
5 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF94TF C 1
AF RR2BK20JQ U 29
AF RR2GR40JQ U 14
AF RR2E916JQ U 15
AF RR2GR40TF C 145
AF RR2E916TF C 274
BS 1 14 RR2GF94TF
BS 15 28 RR2GR40JQ
BS 29 32 RR2BK20JQ
BS 33 33 RR2GR40JQ
BS 34 70 RR2BK20JQ
BS 71 71 RR2GR40JQ
BS 72 104 RR2BK20JQ
BS 105 105 RR2GR40JQ
BS 106 112 RR2BK20JQ
BS 113 113 RR2GR40JQ
BS 114 228 RR2BK20JQ
BS 229 229 RR2GR40JQ
BS 230 234 RR2BK20JQ
BS 235 235 RR2GR40JQ
BS 236 240 RR2BK20JQ
BS 241 241 RR2GR40JQ
BS 242 246 RR2BK20JQ
BS 247 247 RR2GR40JQ
BS 248 257 RR2BK20JQ
BS 258 258 RR2GR40JQ
BS 259 282 RR2BK20JQ
BS 283 283 RR2GR40JQ
BS 284 300 RR2BK20JQ
BS 301 301 RR2GR40JQ
BS 302 303 RR2BK20JQ
BS 304 304 RR2GR40JQ
BS 305 342 RR2BK20JQ
BS 343 343 RR2GR40JQ
BS 344 354 RR2BK20JQ
BS 355 355 RR2GR40JQ
BS 356 459 RR2BK20JQ
BS 460 460 RR2GR40JQ
BS 461 477 RR2BK20JQ
BS 478 478 RR2GR40JQ
BS 479 480 RR2BK20JQ
BS 481 481 RR2GR40JQ
BS 482 483 RR2BK20JQ
BS 484 484 RR2GR40JQ
BS 485 627 RR2BK20JQ
BS 628 628 RR2GR40JQ
BS 629 629 RR2BK20JQ
BS 630 630 RR2GR40JQ
BS 631 669 RR2BK20JQ
BS 670 670 RR2GR40JQ
BS 671 681 RR2BK20JQ
BS 682 682 RR2GR40JQ
BS 683 748 RR2BK20JQ
BS 749 760 RR2GF94TF
BS 761 787 RR2GR40TF
BS 788 805 RR2E916TF

RD RR2GF94TF 762 0 0
AATACTCATAGAACAACAGAAAGGTTTTGTTAAATAGAAATTTGAGGAAGACTGAAGTAA
CTTGTACTCGGAAACAAACCAGAATCAAAAGCTCTCTAGTCGACCAAAAAAA*CAAAGAA
TAGAACAATCATTCATCTCTTCAAGCTTCTGTGACTGGGTACTCGAAAACTACATCTCTC
CCTGTAAGTTTTCTGTACACACCGACC*ATTGTCTCAAGCTTGTACTCAGTGTTATTCCT
CTTCTTAGGCTCCAAAAACACCTTCATGATCTTGGTACCATCAACACGGTATCTGGTACG
TTTTCCGACAATCTCAGCAGGGTAAGCGACATCCTCAAGCATAGCTTCATGGACGGAAGT
GAGAGTCCTGTTGCGTGGTCTCTGAACAGCGGAGCCTTTCTTAGGGGGACGCATGATTCT
TCTGGTGGCAACAAAGATAACATCTTTGCCACTGAACTTTTTCTCGAGCTCTCTGACGAG
GCGGGGATGGATCTTGCGGAATGCTTTCCTCAAGCTGAATGGAACGTAGATCACAATAGC
CTTGCGGCTGCCAGAAACATCCATCTGAACAGCTTGGTTAATGTAGAGATCTTTCAAGTC
ACTTTTCAACTCCTGGTTGGTGTTTTCCAAGTCAAAGAAAGCCTGAGCAACTTCCTGTTC
GAAATCAGTGGGTGCAACACCCTTATCCTTGTGGATCTTGTTCTGAGCAGAGAACATCTT
GGCAAGATACAGATAAACACGTCGAAGAACCCTAGAAGGT
CC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2BK20JQ 724 0 0
GTTAGATAGAAATTTGAGGAAGACTGAAGTAACTTGTACTCGAAAACAAACCAGAATCAA
AAGCTCTCTAGTCGACAAAAAAAAACAAAGAATAGAACAATCATTCATCTCTTCAAGCTT
CTGTGACTGGGTACTCGAAAACTACATCTCTCCCTGTAAGTTTCCTGTACACACCGACC*
ATTGTCTCAAGCTTGTACTCCGTGTTGTTCCTTTCCTTGGGCTCCAAAA*CACCTTCATG
ATCTTGGTACCATCGACACGGTATCTGGTACGCTTCCCGACAATCTCAGCAGGGTAAGCG
ACATCCTCAAGCATGGCTTCATGGACAGAAGTGAGAGTCCTGTTGCGTGGTCTCTGAACA
GCAGAGCCTTTCTTAGGGGGACGCATGATTCTTCTGGTGGCAACAAAGATAACATCTTTG
CCACTGAACTTCTTCTCGAGCTCTCTGACAAGACGAGGATGGATCTTGCGGAATGCTTTC
CTCAATCTGAATGGAACGTAGATCACAATAGCCTTGCGGCTGCCAGAAACATCCATCTGA
ACAGCTTGGTTAATGTAGAGATCTTTCAAGTCACTTTTCAACTCCTGGTTGGTGTTTTCA
AGGTCAAAGAAAGCCTGAGCAACTTCCTGTTCGAAATCAGTTGGTGCAACACCTTTATCC
TTGTGGATCTTGTTCTGAGCAGAGAACATCTTGGCAAGATACAGATAAACACGTCGAAGA
CCCT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2GR40JQ 729 0 0
C
AACAGAAAGGTTTTGTTAAATAGAAATTTGAGGAAGACTGAAGTAACTTGTACTCGGAAA
CAAACCAGAATCAAAAGCTCTCTAGTCGACCAAAAAAA*CAAAGAATAGAACAATCATTC
ATCTCTTCAAGCTTCTGTGACTGGATACTCGAAAACTACATCTCTCCCTGTAAGTTTCCT
GTACACACCGACC*ATTGTCTCAAGCTTGTACTCAGTGTTATTCCTCTCCTTAGGC*CCA
AAAACACCTTCATGATCTTGGTACCATCAACACGGTATCTGGTACGTTTTCCGACAATCT
CAGCAGGGTAAGCGACATCCTCAAGCATAGCTTCATGGACGGAAGTGAGAGTCCTGTTGC
GTGGTCTCTGAACAGCAAAGCCTTTCTTAGGGGGACGCATGATTCTTCTGGTGGCAACAA
AGATAACATCTTTGCCACTGAACTTTTTCTCGAGCTCTCTGACGAGGCGGGGATGGATCT
TGCGGAATGCTTTCCTCAATCTGAATGGAACGTAAATCACAATAGCCTTGCGGCTGCCAA
AAACATCCATCTGAACAGCTTGGTTAATGTAGAGATCTTTCAAGTCACTTTTCAACTCCT
GGTTGGTGTTTTCCAAGTCAAAGAAAGCCTGAGCAACTTCCTGTTCGAAATCAGTGGGTG
CAACACCCTTATCCTTGTGGATCTTGTTCTGAGCAGAGAACATCTTGGCAAGATACAGAT
AAACACGT

QA 2 729 2 729
DS 

RD RR2E916JQ 731 0 0
AACAGAAAGGTTTTGTTAAATAGAAATTTGAGGAAGACTGAAGTAACTTGTACTCGGAAA
CAAACCAGAATCAAAAGCTCTCTAGTCGACCAAAAAAA*CAAAGAATAGAACAATCATTC
ATCTCTTCAAGCTTCTGTGACTGGGTACTCGAAAACTACATCTCTCCCTGTAAGTTTCCT
GTACACACCGACC*ATTGTCTCAAGCTTGTACTCAGTGTTATTCCTCTTCTTAGGCTCCA
AAAACACCTTCATGATCTTGGTACCATCAACACGGTATCTGGTACGTTTTCCGACAATCT
CAGCAGGGTAAGCGACATCCTCAAGCATAGCTTCATGGACGGAAGTGAGAGTCCTGTTGC
GTGGTCTCTGAACAGCAGAGCCTTTCTTAGGGGGACGCATGATTCTTCTGGTGGCAACAA
AGATAACATCTTTGCCACTGAACTTTTTCTCGAGCTCTCTGACGAGGCGGGGATGGATCT
TGCGGAATGCTTTCCTCAATCTGAATGGAACGTAGATCACAATAGCCTTGAGGCTGCCAG
AAACATCCATCTTAACAGCTTGGTTAATGTAGAGATCTTTCAAGTCACTTTTCAACTCCT
GGTTGGTGTTTTCCAAGTCAAAGAAAGCCTGAGCAACTTCCTGTTCGAAATCAGTGGGTG
CAACACCCTTATCCTTGTGGATCTTGTTCTGAGCAGAGAACATCTTGGCAAGATACAGAT
AAACACGTCGA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2GR40TF 661 0 0
GCTTCTGTGACTGGATACTCGAAAACTACATCTCTCCCTGTAAGTTTCCTGTACACACCG
ACCCATTGTCTCAAGCTTGTACTCAGTGTTATTCCTCTCCTTAGGC*CCAAAAACACCTT
CATGATCTTGGTACCATCAACACGGTATCTGGTACGTTTTCCGACAATCTCAGCAGGGTA
AGCGACATCCTCAAGCATAGCTTCATGGACGGAAGTGAGAGTCCTGTTGCGTGGTCTCTG
AACAGCAGAGCCTTTCTTAGGGGGACGCATGATTCTTCTGGTGGCAACAAAGATAACATC
TTTGCCACTGAACTTTTTCTCGAGCTCTCTGACGAGGCGGGGATGGATCTTGCGGAATGC
TTTCCTCAATCTGAATGGAACGTAGATCACAATAGCCTTGCGGCTGCCAGAAACATCCAT
CTGAACAGCTTGGTTAATGTAGAGATCTTTCAAGTCACTTTTCAACTCCTGGTTGGTGTT
TTCCAAGTCAAAGAAAGCCTGAGCAACTTCCTGTTCGAAATCAGTGGGTGCAACACCCTT
ATCCTTGTGGATCTTGTTCTGAGCAGAGAACATCTTGGCAAGATACAGATAAACACGTCG
AAGAACCCTAGAAGGTGGTGGTGGAAAGGTTTACGGCTTGCTT
TAAGAGCTTCGTGTTCCC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2E916TF 532 0 0
GGTACCATCAACACGGTATCTGGTACGTTTTCCGACAATCTCAGCAGGGTAAGCGACATC
CTCAAGCATAGCTTCATGGACGGAAGTGAGAGTCCTGTTGCGTGGTCTCTGAACAGCAGA
GCCTTTCTTAGGGGGACGCATGATTCTTCTGGTGGCAACAAAGATAACATCTTTGCCACT
GAACTTTTTCTCGAGCTCTCTGACGAGGCGGGGATGGATCTTGCGGAATGCTTTCCTCAA
TCTGAATGGAACGTAGATCACAATAGCCTTGAGGCTGCCAGAAACATCCATCTTAACAGC
TTGGTTAATGTAGAGATCTTTCAAGTCACTTTTCAACTCCTGGTTGGTGTTTTCCAAGTC
AAAGAAAGCCTGAGCAACTTCCTGTTCGAAATCAGTGGGTGCAACACCCTTATCCTTGTG
GATCTTGTTCTGAGCAGAGAACATCTTGGCAAGATACAGATAAACACGTCGAAGAACCCT
AGAAGGTGGTGGTGGAAAGGTTTACGGCTTGCTTTAAGAGCTTCGTGTTCCT

QA 1 532 1 532
DS 



AS 4 29

CO CL21Contig1 926 21 20 U
GGACCAAACAGCACAGCACAGAACAAGAACAACACCACAGAGAAAATCAACGCTCAAAAT
CTCAGAGAGAGCAA*TGGCATCAACATTCACAAGCTCAAGCAGTATTCTGAGCCCAACTC
CATTTCTTGGCCAGACCAAAGGCTCCACGTTCAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTTG
GAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACT
TGGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCATCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGCGACTATG
GTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTG
AGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACCCCTGAAGTTC
TTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAA
TCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCA
TTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCA
ACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACAATACTTTGACC
CGCTGGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAAGGAGATCAAGA
ATGGAAGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAA
AGGGTCCCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCTTGGG
CTTTCGCAACAAAGTTTGTACCTGGAGCTTGATTTGATGTAATCCTTTGAAATGATATGA
ACATAAACCTTCTCTCGTTCCTCTGC


BQ
10 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 15 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 50 50 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 20 65 65 
65 65 65 65 65 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 5 80 80 
80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 10 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 30 90 90 90 90 90 90 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 20 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 20 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 25 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 25 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 15 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 15 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 
97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 85 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 80 65 95 95 80 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 95 95 90 90 85 85 85 40 75 75 75 75 75 45 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 55 
70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 40 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 50 45 45 40 40 40 40 35 35 35 35 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E537TF U 19
AF RR2BB45TF U 0
AF RR2GN90TF U 33
AF RR2BM27TF U 1
AF RR2FK68TF U 1
AF RR2H604TF U 33
AF RR2DO38TF U 33
AF RR2FZ69TF U 33
AF RR2BH06TF U 2
AF RR2H902TF U 1
AF RR2AZ86TFB U 362
AF RR2BB45JQ C 0
AF RR2FZ69JQ C 690
AF RR2E537JQ C 166
AF RR2GN90JQ C 127
AF RR2CI48JQ C 462
AF RR2H604JQB C 256
AF RR2BM27JQ C 170
AF RR2GX56JQ C 185
AF RR2H902JQ C 427
AF RR2AZ86JQ C 299
BS 1 34 RR2BM27TF
BS 35 35 RR2FK68TF
BS 36 45 RR2BM27TF
BS 46 46 RR2FK68TF
BS 47 600 RR2BM27TF
BS 601 601 RR2FK68TF
BS 602 649 RR2BM27TF
BS 650 650 RR2FK68TF
BS 651 698 RR2BM27TF
BS 699 703 RR2H902TF
BS 704 704 RR2DO38TF
BS 705 710 RR2H902TF
BS 711 711 RR2AZ86TFB
BS 712 729 RR2H902TF
BS 730 730 RR2AZ86TFB
BS 731 740 RR2H902TF
BS 741 836 RR2AZ86TFB
BS 837 913 RR2BB45JQ
BS 914 915 RR2BM27JQ
BS 916 926 RR2AZ86JQ

RD RR2E537TF 445 0 0
CAGAACAAGAACAACACCACAGAGAAAATCAACGCTCAAAATCTCAGAAAGAGCAA*TGG
CATCAACATTCACAAGCTCAAGCAGTATCCTGAGCCCAACTCCATTTCTTGGCCAGACCA
AAGGCTCCACGTTCAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTTGGAACTCCCAAATACACTA
TGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTTCCGTCC
AAACCCCATCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGCGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTT
TATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGAT
GGGCAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACCCCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTG
TGGACTTCAAAGAGCCGGCCTGGTT

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR2BB45TF 587 0 0
GGAC
CCAAACAGCACAGCACAGAACAAGAACAACACCACAGAGAAAATCAACGCTCAAAATCTC
AGA**GAGCAA*TGGCATCAACATTCACAAGCTCAAGCAGTATTCTGAGCCCAACTCCAT
TTCTTGGCCAGACCAAAGGCTCCACGTTCAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTTGGAA
CTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTGG
GACCATTTTCCGTCCAAACCCCATCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGCGACTATGGTT
GGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGG
TGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACCCCTGAAGTTCTTC
AGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCT
TCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTT
TAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGA

QA 5 587 5 587
DS 

RD RR2GN90TF 598 0 0
CACCACAGAGAAAATCAACGCTCAAAATCTCAGAGAGAGCAAATGGCATCAACATTCACA
AGCTCA****GTATTCTGAGCCCAACACCATTTCTTGGCCAGACCAAAGGCTCCACGTTC
AACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTT
TGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTGGGGCCATTTTCCGTCCAAACCCCGTCTTAC
CTCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCT
GAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGA
GCATTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTTCGTGTGGACTTCAAGGAG
CCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGCGGTTTGGACTACTTAGGC
AACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTC
ATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATG

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2BM27TF 698 0 0
GGACCAAACAGCACAGCACAGAACAAGAACAACATCACAGAGAAA*TCAACGCTCAAAAT
CTCAGAGAGAGCAA*TGGCATCAACATTCACAAGCTCAAGCAGTATTCTGAGCCCAACTC
CATTTCTTGGCCAGACCAAAGGCTCCACGTTCAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTTG
GAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACT
TGGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCATCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGCGACTATG
GTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTG
AGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACCCCTGAAGTTC
TTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAA
TCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCA
TTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCA
*CGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACA*TACTTTGACC
CGCTGGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2FK68TF 696 0 0
G
GACCAAACAGCACAGCACAGAACAAGAACAACACCACAGAGAAAATCAACGCTCAAAATC
TCAGAGAGAGCAA*TGGCATCAACATTCACAAGCTCAAGCAGTATTCTGAGCCCAACTCC
ATTTCTTGGCCAGACCAAAGGCTCCACGTTCAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTTGG
AACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTT
GGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCATCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGCGACTATGG
TTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGA
GGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACCCCTGAAGTTCT
TCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAAT
CTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCAT
TTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAA
CGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACAATACTTTGACCC
GCTGGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTG

QA 2 696 2 696
DS 

RD RR2H604TF 688 0 0
CACCACAGAGAAAATCAACGCTCAAAATCTCAGAGAGAGCAAATGGCATCAACATTCACA
AGCTCAAGCAGTATTCTGAGCCCAACACCATTTCTTGGTCAGACCAAAGGCTCCACTTTC
AACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTT
TGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCGTCTTAC
CTCACCGGAGAGTTTCCCGGCGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCT
GAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGA
GCATTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTTCGTGTGGACTTCAAGGAG
CCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGCGGTTTGGACTACTTAGGC
AACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTC
ATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGAC
TTGTACCCGGGCGGGCAATATTTTGACCCGCTGGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTC
GCTGAGCTCAAAGTGAAG*AGATCAAGA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2DO38TF 674 0 0
CACCACAGAGAAAATCAACGCTCAAAATCTCAGAGAGAGCAAATGGCATCAACATTCACA
AGCTCAAGCAGTATTCTGAGCCCAACACCATTTCTTGGCCAGACCAAAGGCTCCACGTTC
AACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTT
TGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCGTCTTAC
CTCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCT
GAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGA
GCATTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTTCGTGTGGACTTCAAGGAG
CCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGCGGTTTGGACTACTTAGGC
AACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTC
ATGGGATCAGTTGAAG*TTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAG*CAATGAC
TTGTACCCGGGTGGACAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTC
GCTGAGCTCAAG
TG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2FZ69TF 668 0 0
CACCACAGAGAAAATCAACGCTCAAAATCTCAGAGAGAGCAAATGGCATCAACATTCACA
AGCTCAAGCAGTATTCTGAGCCCAACACCATTTCTTGGCCAGACCAAAGGCTCCACGTTC
AACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTT
TGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCGTCTTAC
CTCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCT
GAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGA
GCATTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTTCGTGTGGACTTCAAGGAG
CCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGCGGTTTGGACTACTTAGGC
AACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTC
ATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAAGCAATGAC
TTGTACCCGGGCGGACAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTC
GCTGAGCT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2BH06TF 706 0 0
GACCAAACAGCACAGCACAGAACAAGAACAACACCACAGAGAAAATCAACGCTCAAAATC
TCAGAGAGAGCAA*TGGCATCAACATTCACAAGCTCAAGCAGTATTCTGAGCCCAACTCC
ATTTCTTGGCCAGACCAAAGGCTCCACGTTCAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTTGG
AACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTT
GGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCATCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGCGACTATGG
TTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGA
GGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACCCCTGAAGTTCT
TCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAAT
CTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCAT
TTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAA
CGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACAATACTTTGACCC
GCTGGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAG
TGA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2H902TF 740 0 0
G
GACCAAACAGCACAGCACAGAACAAGAACAACACCACAGAGAAAATCAACGCTCAAAATC
TCAGAGAGAGCAA*TGGCATCAACATTCACAAGCTCAAGCAGTATTCTGAGCCCAACTCC
ATTTCTTGGCCAGACCAAAGGCTCCACGTTCAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTTGG
AACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTT
GGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCATCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGCGACTATGG
TTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGA
GGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACCCCTGAAGTTCT
TCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAAT
CTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCAT
TTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAA
CGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACAATACTTTGACCC
GCTGGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAA*GTGAAG*AGATCAAGAA
TGGAAGGT*GGCTATGTTC

QA 2 740 2 740
DS 

RD RR2AZ86TFB 475 0 0
GGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACCCCTGAAGTTCT
TCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAAT
CTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCAT
TTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAA
CGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACAATACTTTGACCC
GCTGGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAAAGAGATCAAGAA
TGGAAGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAAA
GGGTCCCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCT

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2BB45JQ 914 0 0
GGAC
CCAAACAGCACAGCACAGAACAAGAACAACACCACAGAGAAAATCAACGCTCAAAATCTC
AGA**GAGCAA*TGGCATCAACATTCACAAGCTCAAGCAGTATTCTGAGCCCAACTCCAT
TTCTTGGCCAGACCAAAGGCTCCACGTTCAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTTGGAA
CTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTGG
GACCATTTTCCGTCCAAACCCCATCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGCGACTATGGTT
GGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGG
TGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACCCCTGAAGTTCTTC
AGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCT
TCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTT
TAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACG
GTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACAATACTTTGACCCGC
TGGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAAGGAGATCAAGAATG
GAAGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAAAGG
GTCCCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCTTGGGCTT
TCGCAACAAAGTTTGTACCTGGAGCTTGATTTGATGTAATCCTTTGAAATGATATGAACA
TAAACCTTCT

QA 5 914 5 914
DS 

RD RR2FZ69JQ 215 0 0
TTCGCTGAGCTCAAGGTGAAGGAGATCAAGAATGGAAGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTT
GGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAAAGGGTCCCTTGGAGAATCTCCTTGACCAT
CTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCTTGGGCTTTCGCAACAAAGTTTGTACCTGGAGCT
TGATTTGATGTAATCCTTTGAAATGATATGAACA
C

QA 1 214 1 214
DS 

RD RR2E537JQ 737 0 0
ATGTTGTCTCTCTTGGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAG
ACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCATCTTACCTCACCGGAGAGT
TTCCCGGCGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCA
AGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCA
TAACCCCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGCCTGGTTCA
AAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAG
TCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTG
AAGGTTTCCGCATCAACGGTTTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCG
AACAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGG
TGAAGGAGATCAAGAATGGAAGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAG
CCATTGTTACTGGAAAGGGTCCCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTG
CTAACAATGCTTGGGCTTTCGCAACAAAGTTTGTACCTGGAGCTTGATTTGATGTAATCC
TTTGAAATGATATGAAC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2GN90JQ 787 0 0
TTGGCCAGACCAAAGGCTCCACGTTCAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTC
CCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTGGGGC
CATTTTCCGTCCAAACCCCGTCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGG
ACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGA
TCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCATTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGA
AATGGGTTCGTGTGGACTTCAAGGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCT
CAGAAGGCGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAG
CCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTC
TAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACAATACTTTGACCCGCTGG
GTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAAGGAGATCAAGAATGGAA
GGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAAAGGGTC
CCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCTTGGGCTTTCG
CAACAAAGTTTGTACCTGGAGCTTGATTTGATGTAATCCTTTGAAATGATATGAACATAA
ACCTTCT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2CI48JQ 444 0 0
TTCAAAGCCGGTTCACAAATTTTCTCAGAAGGCGGTTTGGACTATTTAGGCAACCCAAAC
CTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCATGGGATTA
GTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCG
GGCGGACAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTC
AAGGTGAAGGAGATCAAGAATGGAAGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTT
CAAGCCATTGTTACTGGAAAGGGTCCCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCT
GTTGCTAACAATGCTTGGGTTTTCGCAACAAAGTTTGTACCTGGAGCTTGATTTGATGTA
ATCCTTTGAAATGATATGAACATA

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR2H604JQB 655 0 0
TCCAAACCCCGTCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGCGACTATGGTTGGGACACCGCCG
GTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGA
GATGGGCAATGTTGGGAGCATTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTTC
GTGTGGACTTCAAGGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGCG
GTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTG
GCTTCCAAGTTATCCTCATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTG
TTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGGCAATATTTTGACCCGCTGGGTCTCGCGG
ATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAAGTGAAGGAGATCAAGAGTGGAAGGTTGGCTA
TGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAAAGGGTCCCTTGGAGA
ATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCTTGGGCTTTCGCAACAAAGT
TTGTACCTGGAGCTTGATTTGATGTAATCCTTTGAAATGATATGAACATAAACC
C

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2BM27JQ 747 0 0
TGTCTCTCT*GGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAG
AGTGAAGTACTTGGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCATCTTACCTCACCGGAGAGTTTCC
CGGCGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAA
CAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAAC
CCCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGC
CGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCA
TGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGAAGG
TTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACA
ATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAA
GGAGATCAAGAATGGAAGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCAT
TGTTACTGGAAAGGGTCCCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAA
CAATGCTTGGGCTTTCGCAACAA*GTTTGTACCTGGAGCTTGATTTGATGTAATCCTTTG
AAATGATATGAACATAAACCTTCTCT
C

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2GX56JQ 735 0 0
TCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTGGG
ACCATTTTCCGTCCAAACCCCGTCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTG
GGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGT
GATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCATTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCA
GAAATGGGTTCGTGTGGACTTCAAGGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTT
CTCAGAAGGCGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTT
AGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGG
TCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACAATACTTTGACCCGCT
GGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAAGGAGATCAAGAATGG
AAGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAAAGGG
TCCCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCTTGGACTTT
CGCAACAAAGTTTGTACCTGGAGCTTGATTTGATGTAATCCTTTGAAATGATATGAACAT
AAACCTTCTCT
TGTT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2H902JQ 493 0 0
AATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCT
CAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAG
CCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTC
TAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACAATACTTTGACCCGCTGG
GTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAAGGAGATCAAGAATGGAA
GGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAAAGGGTC
CCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCTTGGGCTTTCG
CAACAAAGTTTGTACCTGGAGCTTGATTTGATGTAATCCTTTGAAATGATATGAACATAA
ACCTTCTCT
TGTT

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2AZ86JQ 628 0 0
G
GGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTT
GAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACCCCTGAAGTT
CTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAA
ATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGC
ATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATC
AACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACAATACTTTGAC
CCGCTGGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAAAGAGATCAAG
AATGGAAGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGA
AAGGGTCCCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCTTGG
GCTTTCGCAACAAAGTTTGTACCTGGAGCTTGATTTGATGTAATCCTTTGAAATGATATG
AACATAAACCTTCTCTCGTTCCTCTGC

QA 2 628 2 628
DS 



CO CL21Contig2 610 2 7 U
GTGACCAAATAGCAACTAATAATAACAAGACCACAGAGAAACAAACACTCAATACAAGAG
AGAACAATGGCTTCAACATTCACGAGCTCAAGCAGTGTGTTGTGCCCAACAACATTCCTT
GGTCAGACTAAAAGCTCCAGCTTTAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGATCTCCC
AAATACACTATGGGGAATGACCTTTGGTATGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTAGGACCC
TTTTCCGTCCAAACTCCGTCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGAGACTATGGTTGGGAT
ACTGCCGGTTTATCTGCAGACCCTGAAGCCTTGGCCAAAAACAGAGTTCTTGAGGTGATC
CATGGGAGATGGGCAATGTTAGGAGCATTTGGTTGCATAACCCCTGAAGTTCTTCAGAAA
TGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCC
GAAGGCGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCACGCTCAGAGCATTTTAGCC
GTCCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTT
GAAGTGTTGG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR43TF U 2
AF RR2D066TF U 1
BS 1 200 RR2D066TF
BS 201 201 RR2DR43TF
BS 202 267 RR2D066TF
BS 268 268 RR2DR43TF
BS 269 580 RR2D066TF
BS 581 581 RR2DR43TF
BS 582 610 RR2D066TF

RD RR2DR43TF 597 0 0
G
GACCAAATAGCAACTAATAATAACAAGACCACAGAGAAACAAACACTCAATACAAGAGAG
AACAATGGCTTCAACATTCACGAGCTCAAGCAGTGTGTTGTGCCCAACAACATTCCTTGG
TCAGACTAAAAGCTCCAGCTTTAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGATCTCCCAA
ATACACTATGGGGAATGACCTTTGGTATGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTAGGACCCTT
TTCCGTCCAAACTCCGTCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGAGACTATGGTTGGGATAC
TGCCGGTTTATCTGCAGACCCTGAAGCCTTGGCCAAAAACAGAGTTCTTGAGGTGATCCA
TGGGAGATGGGCAATGTTAGGAGCATTTGGTTGCATAACCCCTGAAGTTCTTCAGAAATG
GGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCCGA
AGGCGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCACGCTCAGAGCATTTTAGCCGT
CCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTC

QA 2 597 2 597
DS 

RD RR2D066TF 610 0 0
GTGACCAAATAGCAACTAATAATAACAAGACCACAGAGAAACAAACACTCAATACAAGAG
AGAACAATGGCTTCAACATTCACGAGCTCAAGCAGTGTGTTGTGCCCAACAACATTCCTT
GGTCAGACTAAAAGCTCCAGCTTTAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGATCTCCC
AAATACACTATGGGGAATGATCTTTGGTATGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTAGGACCC
TTTTCCGTCCAAACTCCGTCTTACCTCGCCGGAGAGTTTCCCGGAGACTATGGTTGGGAT
ACTGCCGGTTTATCTGCAGACCCTGAAGCCTTGGCCAAAAACAGAGTTCTTGAGGTGATC
CATGGGAGATGGGCAATGTTAGGAGCATTTGGTTGCATAACCCCTGAAGTTCTTCAGAAA
TGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCC
GAAGGCGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCACGCTCAGAGCATTTTAGCC
GTCCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGAAG*TTTCCGCATCAACGGTCTT
GAAGTGTTGG

QA 1 610 1 610
DS 



CO CL21Contig3 867 4 11 U
ATAACAACAAAACCGCAGAGAAACAAACCGCTCAATCCAAGAGAGAAGAATGGCTTCAAC
ATTCACTAGCTCAAGCAGTGTTCTGTGCCCAACAACATTCCTTGGCCAGACTAAAAGCAC
CAGCTTTAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGCTCTCCCAAATACACTATGGGAAA
TGATCTTTGGTATGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTAGGACCCTTTTCCGTCCAAACTCC
GTCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGAGACTATGGTTGGGACACTGCCGGTTTATCTGC
AGACCCTGAAGCCTTTGCCAAAAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAAT
GTTGGGAGCATTTGGTTGCATAACCCCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTT
CAAAGAACCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCCGAAGGCGGTTTGGACTA
CTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCTCAGAGCATTTTAGCTGTCCTTGGCTTCCAAGT
TATCCTAATGGGACTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTTGATGGTGTTGGTGAAGG
CAATGACTTGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCAGATGATCCAGT
TACCTTTGCGGAGCTCAAGGTGAAAGAAATCAAGAATGGAAGGTTGGCTATGTTCTCAAT
GTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACCGGAAAAGGTCCTTTGGAGAATCTCCTTGA
CCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCATGGGCCTTCGCAACAAAGTTTGTACCCGG
AGCTTGATGAAATGATATGAAACATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV40TF U 171
AF RR2EI96TF U 1
AF RR2CV40JQ C 147
AF RR2D066JQ C 458
BS 1 662 RR2EI96TF
BS 663 669 RR2CV40JQ
BS 670 670 RR2D066JQ
BS 671 756 RR2CV40JQ
BS 757 757 RR2D066JQ
BS 758 819 RR2CV40JQ
BS 820 820 RR2D066JQ
BS 821 837 RR2CV40JQ
BS 838 838 RR2D066JQ
BS 839 847 RR2CV40JQ
BS 848 867 RR2D066JQ

RD RR2CV40TF 269 0 0
CTATGGGAAATGATCTTTGGTATGGACCACACAGAGTGAAGTACTTAGGACCCTTTTCCG
TCCAAACTCCGTCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGAGACTATGGTTGGGACACTGCCG
GTTTATCTGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAAAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGA
GATGGGCAATGTTGGGAGCATTTGGTTGCATAACCCCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCC
GTGTGGACTTCAAAGAACCGGTCTGGTTC

QA 1 269 1 269
DS 

RD RR2EI96TF 662 0 0
ATAACAACAAAACCGCAGAGAAACAAACCGCTCAATCCAAGAGAGAAGAATGGCTTCAAC
ATTCACTAGCTCAAGCAGTGTTCTGTGCCCAACAACATTCCTTGGCCAGACTAAAAGCAC
CAGCTTTAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGCTCTCCCAAATACACTATGGGAAA
TGATCTTTGGTATGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTAGGACCCTTTTCCGTCCAAACTCC
GTCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGAGACTATGGTTGGGACACTGCCGGTTTATCTGC
AGACCCTGAAGCCTTTGCCAAAAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAAT
GTTGGGAGCATTTGGTTGCATAACCCCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTT
CAAAGAACCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCCGAAGGCGGTTTGGACTA
CTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCTCAGAGCATTTTAGCTGTCCTTGGCTTCCAAGT
TATCCTAATGGGACTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTTGATGGTGTTGGTGAAGG
CAATGACTTGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCAGATGATCCAGT
TA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2CV40JQ 707 0 0
TCTCTCTCGGCTCTCCCAAATACACTATGGGAAATGATCTTTGGTATGGACCAGACAGAG
TGAAGTACTTAGGACCCTTTTCCGTCCAAACTCCGTCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCG
GAGACTATGGTTGGGACACTGCCGGTTTATCTGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAAAACA
GAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCATTTGGTTGCATAACCC
CTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAACCGGTCTGGTTCAAAGCCG
GTTCACAAATCTTTTCCGAAGGCGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATG
CTCAGAGCATTTTAGCTGTCCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGACTAGTTGAAGGTT
TCCGCATCAACGGTCTTGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGTGGGCAAT
ACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCAGATGATCCAGTTACCTTTGCTGAGCTCAAGGTGAAAG
AAATCAAGAATGGAAGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTG
TTACCGGAAAGGGTCCTTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACA
ATGCATGGGCCTTTGCAACAAAGTTTGTACCTGGAGCTTGA
GCTTGA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2D066JQ 410 0 0
TTT
TCCGAAGGCGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCACGCTCAGAGCATTTTA
GCCGTCCTTGGCTTCCAAGTTATCCTAATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGT
CTTGAAGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGGCAATACTTTGACCCGCTG
GGTCTTGCAGATGATCCAGTTACCTTTGCGGAGCTCAAGGTGAAAGAAATCAAGAATGGA
AGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACCGGGAAAGGT
CCTTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCTTGGGCTTTC
GCAACAAAGTTTGTACCCGGAGCTTGATGAAATGATATGAAACATAA

QA 4 410 4 410
DS 



CO CL21Contig4 793 2 2 U
GGTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGT
GTAAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTT
TGTTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACA
AACCCCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGCTCCACGTTCAACCCTCTT
CGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGA
CCAGACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTCCGTCCAAACCCCGTCTTACCTCACCGGAG
AGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCATTTT
AGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGG
TCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACAATACTTTGACCCGCT
GGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAAGGAGATCAAGAATGG
AAGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAAAGGG
TCCCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGCTGCTAACAATGCTTGGGCTTT
CGCAACAAAGTTTGTACCCGGAGCTTGATTTGATGTAATCCTTTGAAATGATATGAACAT
AAACCTTCTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ25TF U 1
AF RR2FZ25JQ C 259
BS 1 585 RR2FZ25TF
BS 586 793 RR2FZ25JQ

RD RR2FZ25TF 585 0 0
GGTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGT
GTAAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTT
TGTTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACA
AACCCCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGCTCCACGTTCAACCCTCTT
CGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGA
CCAGACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTCCGTCCAAACCCCGTCTTACCTCACCGGAG
AGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCATTTT
AGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGG
TCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACAATACTTTGACCCGCT
GGGTCTCGCGGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2FZ25JQ 535 0 0
GGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTAC
TTGGGACCATTTCCGTCCAAACCCCGTCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATG
GTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCATTTTAGCCGTTTTTGGCTTCCA
AGTTATCCTCATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGA
AGGCAATGACTTGTACCCGGGCGGACAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCGGATGATCC
AGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAAGGAGATCAAGAATGGAAGGTTGGCTATGTTCTC
AATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAAAGGGTCCCTTGGAGAATCTCCT
TGACCATCTTGATAACCCTGCTGCTAACAATGCTTGGGCTTTCGCAACAAAGTTTGTACC
CGGAGCTTGATTTGATGTAATCCTTTGAAATGATATGAACATAAACCTTCTCTTG

QA 1 535 1 535
DS 



AS 6 28

CO CL22Contig1 570 3 2 U
GGCTGTAGTACCAGTTTCAATCGAAGACGATGAAGTTCAACGTCGCAAATCCGACAACTG
GATGCCAGAAGAAGCTCGAGATCGATGACGACCAGAAGCTCCGTGCTTTTTACGACAAGA
GGCTTTCTCAGGAAGTTAGCGGAGATGCTTTGGGCGAGGAGTTCAAGGGGTACGTGTTCA
AGATCATGGGAGGATGCGACAAGCAAGGTTTCCCGATGAAACAGGGAGTTCTGACCCCTG
GTCGTGTCCGCCTCTTGCTTCACCGAGGTACTCCTTGCTTCAGAGGACATGGAAGGAGGA
CTGGAGAGAGGAGAAGGAAGTCTGTCCGTGGTTGCATTGTTAGCCAAGACCTTTCTGTGC
TTAACTTGGTCATTGTTAAGAAGGGTGAGAAGGATCTTCCCGGGCTTACCGATACCGAGA
AGCCAAGGATGAGGGGACCTAAGAGAGCTTCTAAGATCCGTAAACTGTTTAACCTCACTA
AGGATGATGATGTCAGGAAGTATGTCAACACTTACCGCCGCAAATTCACTAACAAGAAAG
GTAAGGAAGTGAGCAAAGCCCCCAAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A926TF U 3
AF RR2BL37TF U 1
AF RR2D510TF U 3
BS 1 439 RR2BL37TF
BS 440 570 RR2D510TF

RD RR2A926TF 108 0 0
GGGTAGTAC
CAGTTTCAATCGAAGACGATGAAGTTCAACGTCCCAAATCCGACAACTGGATGCCAGAAG
AAGCTCGAGATCGATGACGACCAGAAGCTCCGTGCTTTT

QA 10 108 10 108
DS 

RD RR2BL37TF 439 0 0
GGCTGTAGTACCAGTTTCAATCGAAGACGATGAAGTTCAACGTCGCAAATCCGACAACTG
GATGCCAGAAGAAGCTCGAGATCGATGACGACCAGAAGCTCCGTGCTTTTTACGACAAGA
GGCTTTCTCAGGAAGTTAGCGGAGATGCTTTGGGCGAGGAGTTCAAGGGGTACGTGTTCA
AGATCATGGGAGGATGCGACAAGCAAGGTTTCCCGATGAAACAGGGAGTTCTGACCCCTG
GTCGTGTCCGCCTCTTGCTTCACCGAGGTACTCCTTGCTTCAGAGGACATGGAAGGAGGA
CTGGAGAGAGGAGAAGGAAGTCTGTCCGTGGTTGCATTGTTAGCCAAGACCTTTCTGTGC
TTAACTTGGTCATTGTTAAGAAGGGTGAGAAGGATCTTCCCGGGCTTACCGATACCGAGA
AGCCAAGGATGAGGGGACC

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2D510TF 568 0 0
GGGTAGTACCAGC
TTCAATCGAAGACGATGAAGTTCAACGTCGCAAATCCGACAACTGGATGCCAGAAGAAGC
TCGAGATCGATGACGACCAGAAGCTCCGTGCTTTTTACGACAAGAGGCTTTCTCAGGAAG
TTAGCGGAGATGCTTTGGGCGAGGAGTTCAAGGGGTACGTGTTCAAGATCATGGGAGGAT
GCGACAAGCAAGGTTTCCCGATGAAACAGGGAGTTCTGACCCCTGGTCGTGTCCGCCTCT
TGCTTCACCGAGGTACTCCTTGCTTCAGAGGACATGGAAGGAGGACTGGAGAGAGGAGAA
GGAAGTCTGTCCGTGGTTGCATTGTTAGCCAAGACCTTTCTGTGCTTAACTTGGTCATTG
TTAAGAAGGGTGAGAAGGATCTTCCCGGGCTTACCGATACCGAGAAGCCAAGGATGAGGG
GACCTAAGAGAGCTTCTAAGATCCGTAAACTGTTTAACCTCACTAAGGATGATGATGTCA
GGAAGTATGTCAACACTTACCGCCGCAAATTCACTAACAAGAAAGGTAAGGAAGTGAGCA
AAGCCCCCAAGATCC

QA 14 568 14 568
DS 



CO CL22Contig2 701 2 8 U
GTAAGAACCGAAAAGTTGAATTTAAAATGGTCTTTTTAACTAAAGAGCACAAATCAAAAA
ACACAAGTCCAAAGTAGTGGTGTTTACACCCATGTAATGGATGTAACAACTGAAACAAGA
ACTCGAAGTAACTCTTTTTTTTTGGAATGCCGGAAAAGCAAAACAAAACTAGAACGGTGA
TTCTCAAGCAGTAACGGAAGGCTTGGCAGCAGCAGAAAAAAGTCTAGACCTCTTCTTTGC
CAAACTCTCACTCCTCTTGTCACGTTGTTCCTTCAACCTTGAGGCAAGAAGCTTCTGGTA
CTCAGCAGCATCAGAGTTAGCCCTAGCAATCCTCTTCTTCTTGTCTGCGATTCTAGCTCT
CTTCCTCTGAAGTGTCAAAGGAGTCACAAGCCTCTGGATCTTGGGGGCTTTGCTCACTTC
CTTACCTTTCTTGCTTGTGAACTTGCGGCGGTAAGTGTTGACGTACTTCCTGACATCATC
ATCCTTGGTGAGGTTGAACAGTTTACGGATCTTTGAAGCTCTCTTGGGTCCCCTCATTCT
TGGCTTCTCGGTATCGGTAAGCCCGGGAAGATCCTTCTCACCTTTCTTAACAATGACAAG
GTTAAGAACAGAGAGATCTTGGCTGACAATACAACCACGAACAGACTTTCTTCTCCTCTC
TCCAGTCCTCCTTCCGTGTCCTCTGAAGCAAGGAGTTCCTC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU81JQ U 1
AF RR2GS32JQB U 1
BS 1 239 RR2BU81JQ
BS 240 240 RR2GS32JQB
BS 241 322 RR2BU81JQ
BS 323 323 RR2GS32JQB
BS 324 433 RR2BU81JQ
BS 434 434 RR2GS32JQB
BS 435 610 RR2BU81JQ
BS 611 701 RR2GS32JQB

RD RR2BU81JQ 610 0 0
GTAAGAACCGAAAAGTTGAATTTAAAATGGTCTTTTTAACTAAAGAGCACAAATCAAAAA
ACACAAGTCCAAAGTAGTGGTGTTTACACCCATGTAATGGATGTAACAACTGAAACAAGA
ACTCGAAGTAACTCTTTTTTTTTGGAATGCCGGAAAAGCAAAACAAAACTAGAACGGTGA
TTCTCAAGCAGTAACGGAAGGCTTGGCAGCAGCAGAAAAAAGTCTAGACCTCTTCTTTGT
CAAACTCTCACTCCTCTTGTCACGTTGTTCCTTCAACCTTGAGGCAAGAAGCTTCTGGTA
CTCAGCAGCATCAGAGTTAGCCTTAGCAATCCTCTTCTTCTTGTCTGCGATTCTAGCTCT
CTTCCTCTGAAGTGTCAAAGGAGTCACAAGCCTCTGGATCTTGGGGGCTTTGCTCACTTC
CTTACCTTTCTTGTTTGTGAACTTGCGGCGGTAAGTGTTGACGTACTTCCTGACATCATC
ATCCTTGGTGAGGTTGAACAGTTTACGGATCTTTGAAGCTCTCTTGGGTCCCCTCATTCT
TGGCTTCTCGGTATCGGTAAGCCCGGGAAGATCCTTCTCACCTTTCTTAACAATGACAAG
GTTAAGAACA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2GS32JQB 701 0 0
GA
AAGAACCGAAAAGTTGAATTTAAAATGGTCTTTTTAACTAAAGAGCACAAATCAAAAAAC
ACAAGTCCAAAGTAGTGGTGTTTACACCCATGTAATGGATGTAACAACTGAAACAAGAAC
TCGAAGTAACTCTTTTTTTTTGGAATGCCGGAAAAGCAAAACAAAACTAGAACGGTGATT
CTCAAGCAGTAACGGAAGGCTTGGCAGCAGCAGAAGAAAGTCTAGACCTCTTCTTTGCCA
AACTCTCACTCCTCTTGTCACGTTGTTCCTTCAACCTTGAGGCAAGAAGCTTCTGGTACT
CAGCAGCATCGGAGTTAGCCCTAGCAATCCTCTTCTTCTTGTCTGCGATTCTAGCTCTCT
TCCTCTGAAGTGTCAAAGGAGTCACAAGCCTCTGGATCTTGGGGGCTTTGCTCACTTCCT
TACCTTTCTTGCTTGTGAACTTGCGGCGGTAAGTGTTGACGTACTTCCTGACATCATCAT
CCTTGGTGAGGTTGAACAGTTTACGGATCTTTGAAGCTCTCTTGGGTCCCCTCATTCTTG
GCTTCTCGGTATCGGTAAGCCCGGGAAGATCCTTCTCACCTTTCTTAACAATGACAAGGT
TAAGAACAGAGAGATCTTGGCTGACAATACAACCACGAACAGACTTTCTTCTCCTCTCTC
CAGTCCTCCTTCCGTGTCCTCTGAAGCAAGGAGTTCCTC

QA 3 701 3 701
DS 



CO CL22Contig3 1001 7 57 U
GGAAGCGTCGTCGATTGCCCAAAGCCGTCATTCTCTCGTGGCTCTAGTCGACCTGAGAAG
ATGAAGTTCAACGTCGCGAATCCAACCACTGGTTGCCAGAAGAAGCTCGAGATCGACGAT
GACCAGAAACTCCGTGCTTTTTATGATAAGAGACTCTCCCAAGAAGTCAGTGGTGATGCT
TTGGGCGAGGAGTTCAAGGGATACGTTTTCAAGATCATGGGTGGGTGTGACAAGCAAGGT
TTCCCAATGAAGCAGGGAGTTCTAACTCCTGGCCGTGTTCGCCTTTTGCTTCACAGAGGA
ACTCCTTGCTTCAGAGGACACGGAAGGAGGACTGGAGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTTCGT
GGTTGCATTGTCAGTCAAGATCTCTCTGTTCTCAACCTTGTCATTGTCAAGAAGGGTGAG
AAGGATCTTCCTGGGCTTACTGATACCGAGAAGCCAAGAATGAGGGGACCTAAGAGAGCT
TCTAAGATCCGTAAACTGTTCAACCTCACCAAGGATGATGATGTGAGGAAGTACGTCAAC
ACTTACCGCCGCAAGTTCACAAACAAGAAAGGTAAGGAAGTGAGCAAAGCCCCCAAGATC
CAGAGGCTTGTGACTCCTTTGACACTCCAGAGGAAGAGAGCTAGAATCGCCGACAAGAAG
AAGAGGATTGCCAAGGCTAACTCTGATGCTGCTGAGTACCAGAAGCTTCTTGCCTCAAGG
TTGAAGGAACAACGTGACAAGAGGAGTGAGAGTTTGGCAAAGAAGAGATCTAGACTCTCT
TCTGCTGCTGCCAAGCCTTCCGTTACTGCTTGAGAATCACCGTTCTAATTTTGTTTTGCT
TCTTCCGGCATTCAAAAAAAAAAAGAGTTACTTCGAGTTCTTGTTTCAGTTGTTACTACA
TCCATTACATGGGTGTAAACACCACTACTTTGGACTTGTGTTTTTTGATTTGTGCTCTTT
AGTTAAAAAGACCATTTTAAATTCAACTTTTCGGTTCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 30 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 5 45 45 30 45 45 45 45 15 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 5 35 35 35 10 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU81TF U 1
AF RR2C558TF U 17
AF RR2C507TF U 8
AF RR2CM83TF U 1
AF RR2C507JQ C 202
AF RR2CM83JQ C 138
AF RR2CE01TF U 301
BS 1 29 RR2BU81TF
BS 30 30 RR2CM83TF
BS 31 41 RR2BU81TF
BS 42 42 RR2CM83TF
BS 43 52 RR2BU81TF
BS 53 53 RR2CM83TF
BS 54 365 RR2BU81TF
BS 366 366 RR2CM83TF
BS 367 374 RR2BU81TF
BS 375 375 RR2CM83TF
BS 376 392 RR2BU81TF
BS 393 393 RR2CM83TF
BS 394 407 RR2BU81TF
BS 408 408 RR2CM83TF
BS 409 413 RR2BU81TF
BS 414 414 RR2CM83TF
BS 415 431 RR2BU81TF
BS 432 432 RR2CM83TF
BS 433 440 RR2BU81TF
BS 441 441 RR2CM83TF
BS 442 470 RR2BU81TF
BS 471 471 RR2CM83TF
BS 472 482 RR2BU81TF
BS 483 483 RR2CM83TF
BS 484 524 RR2BU81TF
BS 525 525 RR2C507TF
BS 526 626 RR2BU81TF
BS 627 627 RR2C558TF
BS 628 650 RR2BU81TF
BS 651 651 RR2CM83TF
BS 652 655 RR2BU81TF
BS 656 656 RR2C558TF
BS 657 671 RR2CM83TF
BS 672 672 RR2C507TF
BS 673 675 RR2CM83TF
BS 676 676 RR2CE01TF
BS 677 679 RR2CM83TF
BS 680 680 RR2C507TF
BS 681 699 RR2CM83TF
BS 700 700 RR2CE01TF
BS 701 721 RR2CM83TF
BS 722 722 RR2CE01TF
BS 723 726 RR2CM83TF
BS 727 727 RR2CE01TF
BS 728 739 RR2CM83TF
BS 740 740 RR2CE01TF
BS 741 743 RR2CM83TF
BS 744 744 RR2CE01TF
BS 745 760 RR2CM83TF
BS 761 763 RR2CE01TF
BS 764 793 RR2CM83TF
BS 794 843 RR2CE01TF
BS 844 844 RR2CM83JQ
BS 845 863 RR2CE01TF
BS 864 864 RR2CM83JQ
BS 865 967 RR2CE01TF
BS 968 1001 RR2CM83JQ

RD RR2BU81TF 660 0 0
GGAAGCGTCGTCGATTGCCCAAAGCCGTCTTTCTCTCGTGGTTCTAGTCGACTTGAGAAG
ATGAAGTTCAACGTCGCGAATCCAACCACTGGTTGCCAGAAGAAGCTCGAGATCGACGAT
GACCAGAAACTCCGTGCTTTTTATGATAAGAGACTCTCCCAAGAAGTCAGTGGTGATGCT
TTGGGCGAGGAGTTCAAGGGATACGTTTTCAAGATCATGGGTGGGTGTGACAAGCAAGGT
TTCCCAATGAAGCAGGGAGTTCTAACTCCTGGCCGTGTTCGCCTTTTGCTTCACAGAGGA
ACTCCTTGCTTCAGAGGACACGGAAGGAGGACTGGAGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTTCGT
GGTTGTATTGTCAGCCAAGATCTCTCTGTTCTTAACCTTGTCATTGTTAAGAAAGGTGAG
AAGGATCTTCCCGGGCTTACCGATACCGAGAAGCCAAGAATGAGGGGACCCAAGAGAGCT
TCAAAGATCCGTAAACTGTTCAACCTCACCAAGGATGATGATGTCAGGAAGTACGTCAAC
ACTTACCGCCGCAAGTTCACAAACAAGAAAGGTAAGGAAGTGAGCAAAGCCCCCAAGATC
CAGAGGCTTGTGACTCCTTTGACACTTCAGAGGAAGAGAGCTAGAATCGCAGACA
GAAGA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2C558TF 655 0 0
CA
CCAAAGCCGTCTTTCTCTCGTGGCTCTAGTCGACTTGAGAAGATGAAGTTTAACGTTGCG
AATCCAACCACTGGTTGCCAGAAGAAGCTCGAGATCGACGATGACCAGAAACTCCGTGCT
TTTTATGATAAGAGACTCTCCCAAGAAGTCAGTGGTGATGCTTTGGGCGAGGAGTTCAAG
GGATACGTTTTCAAGATCATGGGTGGGTGTGACAAGCAAGGTTTCCCAATGAAGCAGGGA
GTTCTAACTCCTGGCCGTGTTCGTCTTTTGCTTCACAGAGGAACTCCTTGCTTCAGAGGA
CACGGAAGGAGGACTGGAGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTTCGTGGTTGCATTGTCGGCCAA
GATCTCTCTGTTCTCAACCTTGTCATTGTCAAGAAGGGTGAGAAGGATCTTCCCGGGCTT
ACCGATACCGAGAAGCCAAGGATGAGGGGACCTAAGAGAGCTTCTAAGATCCGTAAACTG
TTCAACCTTACCAAGGATGATGATGTTAGGAAGTACGTCAACACTTACCGCCGCAAGTTC
ACAAACAAGAAAGGTAAGGAAGTGAGCAAAGCCCCCAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCCT
TTGACACTCCAGAGGAAGAGAGTTAGAATCGCCGACAAGAAGAAGAGGATTGC

QA 3 655 3 655
DS 

RD RR2C507TF 692 0 0
TCGTCGATTGCC*AAAGCCGTCATTCTCTTGTGGCTCTAGTCGACCTGAGAAGATGAAGT
TCAACGTCGCGAATCCAACCACTGGTTGCCAGAAGAAGCTCGAGATCGACGATGACCAGA
AACTCCGAGCTTTTTATGATAAGAGACTCTCCCAAGAAGTCAGTGGTGATGCTTTGGGCG
AGGAGTTCAAGGGATACGTTTTCAAGATCATGGGTGGGTGTGACAAGCAAGGTTTCCCAA
TGAAGCAGGGAGTTCTAACTCCTGGCCATGTTCGCCTTTTGCTTCACAGAGGAACTCCTT
GCTTCAGAGGACACGGAAGGAGGACTGGAGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTTCGTGGTTGCA
TTGTCAGTCAAGATCTCTCTGTTCTCAACCTTGTCATTGTCAAGAAGGGTGAGAAGGATC
TTCCTGGGCTTACTGATACCGAGAAGCCAAGAATGAGGGGACCTAAGAGAGCTTCTAAGA
TCCGTAAACTGTTCAACCTCACCAAGGATGATGATGTGAGGAAGTACGTCAACACTTACC
GTCGCAAGTTCACTAACAAGAAAGGTAAGGAAGTGAGCAAAGCCCCCAAGATCCAGAGGC
TTGTGACTCCTTTGACACTCCAGAGGAAGAGAGCTAGAATTGCCGACA*GAAGAAGAG*A
TTGCCAAG*CTAACTCTGATGCTGCTGAGTAC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2CM83TF 796 0 0
GGAAGCG
TCGTCGATTGCC*AAAGCCGTCATTCTCTTGTGGCTCTAATCGACCTGAGAAGATGAAGT
TCAACGTCGCGAATCCAACCACTGGTTGCCAGAAGAAGCTCGAGATCGACGATGACCAGA
AACTCCGTGCTTTTTATGATAAGAGACTCTCCCAAGAAGTCAGTGGTGATGCTTTGGGCG
AGGAGTTCAAGGGATACGTTTTCAAGATCATGGGTGGGTGTGACAAGCAAGGTTTCCCAA
TGAAGCAGGGAGTTCTAACTCCTGGCCGTGTTCGCCTTTTGCTTCACAGAGGAACTCCTT
GCTTCAGAGGACACGGAAGGAGGACTGGAGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTTCGTGGTTGCA
TTGTCAGTCAAGATCTCTCTGTTCTCAACCTTGTCATTGTCAAGAAGGGTGAGAAGGATC
TTCCTGGGCTTACTGATACCGAGAAGCCAAGGATGAGGGGACCTAAGAGAGCTTCTAAGA
TCCGTAAACTGTTCAACCTCACCAAGGATGATGATGTTAGGAAGTACGTCAACACTTACC
GCCGCAAGTTCACAAACAAGAAAGGTAAGGAAGTGAGCAAAGCTCCCAAGATCCAGAGGC
TTGTGACTCCTTTGACACTTCAGAGGAAGAGAGCTAGAATCGCCGACA*GAAGAAGAGGA
TTGCTAAG*CTACCTCTGATGCTGCTGAGTAC*AGAAGCTTCTTGCCTCAAGGT*GAAG*
AACAACGTGACA*GAG*AGTGAGAGTTTGGCAAG**AGAGATCTAGACTCTCTTCTGCTG
CTGCCA
GCC

QA 8 793 8 793
DS 

RD RR2C507JQ 652 0 0
ATACG
TTTCAAGATCATGGGTGGGTGTGACAAGCAAGGTTTCCCAATGAAGCAGGGAGTTCTAAC
TCCTGGCCATGTTCGCCTTTTGCTTCACAGAGGAACTCCTTGCTTCAGAGGACACGGAAG
GAGGACTGGAGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTTCGTGGTTGCATTGTCAGTCAAGATCTCTC
TGTTCTCAACCTTGTCATTGTCAAGAAGGGTGAGAAGGATCTTCCTGGGCTTACTGATAC
CGAGAAGCCAAGAATGAGGGGACCTAAGAGAGCTTCTAAGATCCGTAAACTGTTCAACCT
CACCAAGGATGATGATGTGAGGAAGTACGTCAACACTTACCGTCGCAAGTTCACTAACAA
GAAAGGTAAGGAAGTGAGCAAAGCCCCCAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCCTTTGACACT
CCAGAGGAAGAGAGCTAGAATTGCCGACAAGAAGAAGAGGATTGCCAAGGCTAACTCTGA
TGCTGCTGAGTACCAGAAGCTTCTTGCCTCAAGGTTGAAGGAACAGCGTGACAAGAGGAG
TGAGAGTTTGGCAAAGAAGAGATCTAGACTCTCTTCTGCTGCTGCCAAGCCTTCCGTTAC
TGCTTGAGAATCACCGTTCTAATTTTGTTTTGCTT*TTCCGGCATTC

QA 6 652 6 652
DS 

RD RR2CM83JQ 864 0 0
TTTTTATGATAAGAGACTCTCCCAAGAAGTCAGTGGTGATGCTTTGGGCGAGGAGT*CAA
GGGATACGTTTTCAAGATCATGGGTGGGTGTGACAAGCAAGGTTTCCCAATGAAGCAGGG
AGTTCTAACTCCTGGCCGTGTTCGCCTTTTGCTTCACAGAGGAACTCCTTGCTTCAGAGG
ACACGGAAGGAGGACTGGAGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTTCGTGGTTGCATTGTCAGTCA
AGATCTCTCTGTTCTCAACCTTGTCATTGTCAAGAAGGGTGAGAAGGATCTTCCTGGGCT
TACTGATACCGAGAAGCCAAGGATGAGGGGACCTAAGAGAGCTTCTAAGATCCGTAAACT
GTTCAACCTCACCAAGGATGATGATGTTAGGAAGTACGTCAACACTTACCGCCGCAAGTT
CACAAACAAGAAAGGTAAGGAAGTGAGCAAAGCTCCCAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCC
TTTGACACTTCAGAGGAAGAGAGCTAGAATCGCCGACAAGAAGAAGAGGATTGCTAAGGC
TACCTCTGATGCTGCTGAGTACCAGAAGCTTCTTGCCTCAAGGTTGAAGGAACAACGTGA
CAAGAGGAGTGAGAGTTTGGCAAAGAAGAGATCTAGACTCTCTTCTGCTGCTGCCAAGCC
TTCCGTTACTGCTTGAGAATCACATTTCTAGTTTTGTTTTGCTTCTTCCGGCATTCAAAA
AAAAAAAGAGTTACTTCGAGTTCTTGTTTCAGTTGTTACTACATCCATTACATGGGTGTA
AACACCACTACTTTGGACTTGTGTTTTTTGATTTGTGCTCTTTAGTTAAAAAGACCATTT
TAAATTCAACTTTTCGGTTCTTTC

QA 1 864 1 864
DS 

RD RR2CE01TF 667 0 0
G
CTCCTTGCTTCAGAGGACACGGAAGGAGGACTGGAGAGAGGATAAGAAAGTCTGTTCGTG
GTTGCATCGTCAGTCAAGATCTCTCTGTTCTCAACCTTGTCATTGTCAAGAAGGGTGAGA
AGGATCTTCCTGGGCTTACTGATACCGAGAAGCCAA**ATGAGGGGACCTAAGAGAGCTT
CTAAGATCCGTAAACTGTTCAACCTCACCAAGGATGATGATGTGAGGAAGTACGTCAACA
CTTACCGTCGCAAGTTCACTAACAAGAAAGGTAAGGAAGTGAGCAAAGCCCCCAAGATCC
AGAGGCTTGTGACTCCTTTGACACTCCAGAGGAAGAGAGCTAGAATTGCCGACAAGAAGA
AGAGGATTGCCAAGGCTAACTCTGATGCTGCTGAGTACCAGAAGCTTCTTGCCTCAAGGT
TGAAGGAACAGCGTGACAAGAGGAGTGAGAGTTTGGCAAAGAAGAGATCTAGACTCTCTT
CTGCTGCTGCCAAGCCTTCCGTTACTGCTTGAGAATCACCGTTCTAATTTTGTTTTGCTT
CT*CCGGCATTCAAAAAAAAAA*GAGTTACTTCGAGTTCTTGTTTCAGTTGTTACTACAT
CCATTACATGGGTGTAAACACCACTACTTTGGACTTGTGTTTTTTGATTTGTGCTCTTTA
GTTAAA

QA 2 667 2 667
DS 



CO CL22Contig4 979 4 3 U
GGTCTTCGAACTAAAAGAGAATAAATCAAGTAACACGAGTACAAGGCGATGTCATGGATG
GAACAACAGAAATATAAAACTCGAACTAACGTTTTTTTAATGCAAATGAAGCAACAAAAA
AAGAAAACAAAACAGAGAAATGGGATTCTCAGGATTTTTAAGCAGTAACGGAAGGCTTGG
CGGCAGCAGAAGAGAGTCTAGATCTCTTCTTTGCCAAACTCTCACTCCTCTTCTCACGTT
GTTCCTTGAGCCTTGAGGCAAGAAGCTTCTGGTACTCAGCGGCATCAGAGTTAGCCTTAG
CAATCCTCTTCTTCTTGTCAGCGATTCTAGCTCTCTTCCTCTGAAGGGTCAATGGAGTCA
CAAGCCTCTGGATCTTAGGGGCTTTGCTCACTTCCTTGCCTTTCTTGTTAGTGAACTTGC
GGCGGTAAGTGTTGACGTACTTCCTGACATCATCATCCTTGGTGAGGTTAAACAGTTTAC
GGATCTTGGAAGCTCTCTTGGGACCCCTCATCCTTGGCTTCTCGGTATCGGTAAGCCCGG
GAAGATCCTTCTCACCCTTCTTGACAATGACAAGGTTAAGAACGGAGAGGTCTTGGCTGA
CAATGCAACCACGAACAGACTTTCTTCTCCTCTCTCCAGTCCTCCTTCCATGTCCTCTGA
AGCAAGGAGTTCCTCTGTGAAGCAAAAGGCGAACACGGCCAGGAGTTAGAACTCCCTGCT
TCATGGGGAAACCTTGCTTGTCACAACCACCCATGATCTTGAAAACGTATCCCTTGAACT
CCTCGCCCAAAGCATCTCCACTGACTTCTTGGGAGAGTCTCTTATCATAAAACGCACGGA
GTTTCTGGTCATCGTCGATCTCGAGCTTCTTCTGGCAACCAGTGGTTGGATTGGCGACGT
TAAACTTCATCTTCTCTCAGGTCGAGACGATAGCCACGAACAAAGAGAGAGAACGGCTTT
GGCAATCGACGACGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO02JQ U 324
AF RR2DO87JQ U 1
AF RR2CT54TF C 186
AF RR2DO02TF C 404
BS 1 655 RR2DO87JQ
BS 656 872 RR2CT54TF
BS 873 979 RR2DO02TF

RD RR2DO02JQ 124 0 0
ATTCTAGCTCTCTTCCTCTGAAGGGTCAATGGAGTCACAAGCCTCTGGATCTTAGGGGCT
TTGCTCACTTCCTTGCCTTTCTTGTTAGTGAACTTGCGGCGGTAAGTGTTGACGTACTTC
CTGA

QA 1 124 1 124
DS 

RD RR2DO87JQ 655 0 0
GGTCTTCGAACTAAAAGAGAATAAATCAAGTAACACGAGTACAAGGCGATGTCATGGATG
GAACAACAGAAATATAAAACTCGAACTAACGTTTTTTTAATGCAAATGAAGCAACAAAAA
AAGAAAACAAAACAGAGAAATGGGATTCTCAGGATTTTTAAGCAGTAACGGAAGGCTTGG
CGGCAGCAGAAGAGAGTCTAGATCTCTTCTTTGCCAAACTCTCACTCCTCTTCTCACGTT
GTTCCTTGAGCCTTGAGGCAAGAAGCTTCTGGTACTCAGCGGCATCAGAGTTAGCCTTAG
CAATCCTCTTCTTCTTGTCAGCGATTCTAGCTCTCTTCCTCTGAAGGGTCAATGGAGTCA
CAAGCCTCTGGATCTTAGGGGCTTTGCTCACTTCCTTGCCTTTCTTGTTAGTGAACTTGC
GGCGGTAAGTGTTGACGTACTTCCTGACATCATCATCCTTGGTGAGGTTAAACAGTTTAC
GGATCTTGGAAGCTCTCTTGGGACCCCTCATCCTTGGCTTCTCGGTATCGGTAAGCCCGG
GAAGATCCTTCTCACCCTTCTTGACAATGACAAGGTTAAGAACGGAGAGGTCTTGGCTGA
CAATGCAACCACGAACAGACTTTCTTCTCCTCTCTCCAGTCCTCCTTCCATGTCC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2CT54TF 688 0 0
GCAGAAGAGAGTCTAGATCTCTTCTTTGCCAAACTCTCACTCCTCTTCTCACGTTGTTCC
TTGAGCCTTGAGGCAAGAAGCTTCTGGTACTCAGCGGCATCAGAGTTAGCCTTAGCAATC
CTCTTCTTCTTGTCAGCGATTCTAGCTCTCTTCCTCTGAAGGATCAATGGAGTCACAAGC
CTCTGGATCTTAGGGGCTTTGCTCACTTCCTTGCCTTTCTTGTTAGTGAACTTGCGGCGG
TAAGTGTTGACGTACTTCCTGACATCATCATCCTTGGTGAGGTTAAACAGTTTACGGATC
TTGGAAGCTCTCTTGGGACCCCTCATCCTTGGCTTCTCGGTATCGGTAAGCCCGGGAAGA
TCCTTCTCACCCTTCTTGACAATGACAAGGTTAAGAACGGAGAGGTCTTGGCTGACAATG
CAACCACGAACAGACTTTCTTCTCCTCTCTCCAGTCCTCCTTCCATGTCCTCTGAAGCAA
GGAGTTCCTCTGTGAAGCAAAAGGCGAACACGGCCAGGAGTTAGAACTCCCTGCTTCATG
GGGAAACCTTGCTTGTCACAACCACCCATGATCTTGAAAACGTATCCCTTGAACTCCTCG
CCCAAAGCATCTCCACTGACTTCTTGGGAGAGTCTCTTATCATAAAACGCACGGAGTTTC
TGGTCATCGTCGATCTCGAGCTTCTTC
C

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2DO02TF 576 0 0
CTTGTTAGTGAACTTGCGGCGGTAAGTGTTGACGTACTTCCTGACATCATCATCCTTGGT
GAGGTTAAACAGTTTACGGATCTTGGAAGCTCTCTTGGGACCCCTCATCCTTGGCTTCTC
GGTATCGGTAAGCCCGGGAAGATCCTTCTCACCCTTCTTGACAATGACAAGGTTAAGAAC
GGAGAGGTCTTGGCTGACAATGCAACCACGAACAGACTTTCTTCTCCTCTCTCCAGTCCT
CCTTCCATGTCCTCTGAAGCAAGGAGTTCCTCTGTGAAGCAAAAGGCGAACACGGCCAGG
AGTTAGAACTCCCTGCTTCATGGGGAAACCTTGCTTGTCACAACCACCCATGATCTTGAA
AACGTATCCCTTGAACTCCTCGCCCAAAGCATCTCCACTGACTTCTTGGGAGAGTCTCTT
ATCATAAAACGCACGGAGTTTCTGGTCATCGTCGATCTCGAGCTTCTTCTGGCAACCAGT
GGTTGGATTGGCGACGTTAAACTTCATCTTCTCTCAGGTCGAGACGATAGCCACGAACAA
AGAGAGAGAACGGCTTTGGCAATCGACGACGCTTCC

QA 1 576 1 576
DS 



CO CL22Contig5 1009 10 28 U
GGCTAGTACCACTGCCGAGTTGCGCCGCGAACATTTTATATATCTTTCATCTGCTCTCGC
AAGAAGCTGTTAGCGGCAGTTTCAATCGGAGAAGATGAAGTTCAACGTCGCGAATCCTAC
CACTGGTTGCCAGAAGAAGCTCGAGATCGACGATGACCAAAAGCTGCGTGCTTTTTACGA
CAAGAGGCTCTCTCAGGAAGTTAGCGGAGATGCTTTGGGCGAGGAATTCAAGGGGTACGT
CTTCAAGATCATGGGAGGTTGCGACAAGCAAGGTTTCCCAATGAAACAGGGAGTTCTCAC
CCCTGGTCGTGTCCGCCTTTTACTTCACCGAGGTACTCCTTGCTTCAGAGGACACGGAAG
AAGGACTGGAGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTCCGTGGTTGCATTGTCAGCCAAGACCTTTC
TGTTCTTAACTTGGTCATTGTCAAGAAGGGTGAGAAGGATCTCCCCGGGCTTACCGACAC
CGAGAAGCCAAGGATGAGAGGTCCCAAGAGGGCATCCAAGATCCGCAAGTTGTTCAACCT
CACTAAGGATGATGATGTTAGGAAGTATGTCAACACTTACCGCCGCAAATTCACTAACAA
GAAAGGTAAGGAAGTGAGCAAAGCCCCCAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCCTTTGACACT
TCAGAGGAAGAGAGCTAGAATTGCCGACAAGAAGAAGAGAATCGCCAAGGCTAACTCTGA
TGCTGCTGAGTACCAGAAGCTTCTCGCCTCCAGGCTTAAGGAGCAGCGTGATCGCCGTAG
TGAAAGTTTGGCCAAGAAGAGGTCTAGGCTCTCTTCCGCTGCCGCTAAGCCCGTTGCTGC
GTAAAACCTATTCCATCATCAAGACACTTCGTTCTCTCTCTTAGTCTGTTTCTGCGTTTT
ATTGGGACATGTAAACGCCGTTTTGAACGTCTCTCTTTTTTTTGGTTTCTGCTTTGTCTT
AGCTCTTAAACCTTTCTATTATATCAAAGTTTTTGAACTTGTTTGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 30 45 30 30 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2DX81TF U 294
AF RR2F613TF U 1
AF RR2BZ52TF U 15
AF RR2BZ52JQ C 627
AF RR2CV08TF U 132
AF RR2G338TF U 764
AF RR2CV08JQ C 273
AF RR2G338JQ C 310
AF RR2F613JQ C 378
AF RR2DX81JQ C 483
BS 1 353 RR2F613TF
BS 354 354 RR2BZ52TF
BS 355 609 RR2F613TF
BS 610 610 RR2BZ52TF
BS 611 686 RR2F613TF
BS 687 695 RR2BZ52TF
BS 696 696 RR2CV08TF
BS 697 700 RR2BZ52TF
BS 701 701 RR2CV08TF
BS 702 709 RR2BZ52TF
BS 710 710 RR2CV08TF
BS 711 713 RR2BZ52TF
BS 714 714 RR2CV08TF
BS 715 733 RR2BZ52TF
BS 734 734 RR2CV08TF
BS 735 747 RR2BZ52TF
BS 748 750 RR2CV08TF
BS 751 756 RR2BZ52TF
BS 757 757 RR2CV08TF
BS 758 758 RR2BZ52TF
BS 759 760 RR2CV08TF
BS 761 784 RR2BZ52TF
BS 785 919 RR2CV08TF
BS 920 926 RR2G338TF
BS 927 927 RR2CV08JQ
BS 928 937 RR2G338TF
BS 938 1006 RR2CV08JQ
BS 1007 1009 RR2DX81JQ

RD RR2DX81TF 285 0 0
G
TCTCACCCCTGGTCGTGTCCGCCTTTTACTTCACCGAGGTACTCCTTGCTTCAGAGGACA
CGGAAGAAGGACTGGAGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTCCGTGGTTGCATTGTCAGCCAAGA
CCTTTCTGTTCTTAACTTGGTCATTGTCAAGAAGGGTGAGAAGGATCTCCCCGGGCTTAC
CGACACCGAGAAGCCAAGGATGAGAGG*CCCAAGAGGGCATCCAAGATCCGCAAGTTGT*
CAACCTCACTAAGGATGATGATGTTAGGAAGTATGTCAACACTT

QA 2 285 2 285
DS 

RD RR2F613TF 686 0 0
GGCTAGTACCACTGCCGAGTTGCGCCGCGAACATTTTATATATCTTTCATCTGCTCTCGC
AAGAAGCTGTTAGCGGCAGTTTCAATCGGAGAAGATGAAGTTCAACGTCGCGAATCCTAC
CACTGGTTGCCAGAAGAAGCTCGAGATCGACGATGACCAAAAGCTGCGTGCTTTTTACGA
CAAGAGGCTCTCTCAGGAAGTTAGCGGAGATGCTTTGGGCGAGGAATTCAAGGGGTACGT
CTTCAAGATCATGGGAGGTTGCGACAAGCAAGGTTTCCCAATGAAACAGGGAGTTCTCAC
CCCTGGTCGTGTCCGCCTTTTACTTCACCGAGGTACTCCTTGCTTCAGAGGACGCGGAAG
AAGGACTGGAGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTCCGTGGTTGCATTGTCAGCCAAGACCTTTC
TGTTCTTAACTTGGTCATTGTCAAGAAGGGTGAGAAGGATCTCCCCGGGCTTACCGACAC
CGAGAAGCCAAGGATGAGAGGTCCCAAGAGGGCATCCAAGATCCGCAAGTTGTTCAACCT
CACTAAGGATGATGATGTTAGGAAGTATGTCAACACTTACCGCCGCAAATTCACTAACAA
GAAAGGTAAAGAAGTGAGCAAAGCCCCCAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCCTTTGACACT
TCAGAGGAAGAGAGCTAGAATTGCCG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2BZ52TF 772 0 0
CCGAGTTGCGCCGCGAACATTTTATATATCTTTCATCTGCTCTCGCAAGAAGCTGTTAGT
GGCAGTTTCAATCGGAGAAGATGAAGTTCAACGTCGCGAATCCTACCACTGGTTGCCAAA
AGAAGCTCGAGATCGACGATGACCAAAAGCTGCGTGCTTTTTACGACAAGAGGCTCTCTC
AGGAAGTTAGTGGAGATGCTTTGGGCGAGGAATTCAAGGGGTACGTCTTCAAGATCATGG
GAGGTTGCGACAAGCAAGGTTTCCCAATGAAACAGGGAGTTCTCACCCCTGGTCGTGTCC
GCCTTTTACTTCACCGAGGTACTCCTCGCTTCAGAGGACACGGAAGAAGGACTGGAGAGA
GGAGAAGAAAGTCTGTCCGTGGTTGCATTGTCAGCCAAGACCTTTCTGTTCTTAACTTGG
TCATTGTCAAGAAGGGTGAGAAGGATCTCCCCGGGCTTACCGACACCGAGAAGCCAAGGA
TGAGAGGTCCCAAGAGGGCATCCAAGATCCGCAAGTTGTTCAACCTCACTAAGGATGATG
ATGTTAGGAAGTATGTCAACACTTACCGCCGCAAATTCACTAACAAGAAAGGTAAGGAAG
TGAGCAAAGCCCCCAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCCTTTGACACTTCAGAGGAAGAGAG
CTAGAATTGCCGACAAGAAGA*GAGA*TCGCCAAG*CTA*CTCTGATGCTGCTGAGTAC*
AGAAGCTTCTCGC**TCAGGCTAA**GAGCAGCGTGATCGCCGTAGTGAA
GT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2BZ52JQ 210 0 0
CCAAGTTCCAGAGGCTTGTGACTCCTTTGACACTTCAGAGGAAGAGAGCTAGAATTGCCG
ACAAGAAGAAGAGAATCGCCAAGGCTAACTCTGATGCTGCTGAGTACCAGAAGCTTCTCG
CCTCCAGGCTTAAGGAGCAGCGTGTTCGCCGTAGTGAAAGTTTGGCCAAGAAGAGGTCTA
GGCTCTCTTCCGCTGCCGCTAAGCCCGTTG

QA 1 210 1 210
DS 

RD RR2CV08TF 788 0 0
G
GAAGAAGCTCGAGATCGACGATGACCAAAAGCTGCGTGCTTTTTACGACAAGGGGCTCTC
TCAGGAAGTTAGCGGAGATGCTTTGGGCGAGGAATTCAAGGGGTACGTCTCCAAGATCAT
GGGAGGTTGCGACAAGCAAGGTTTCCCAATGAAACAGGGAGTTCTCACCCCTGGTCGTGT
CCGCCTTTTACTTCACCGAGGTACTCCTTGCTTCAGAGGACACGGAAGAAGGACTGGAGA
GAGGAGAAGAAAGTCTGTCCGTGGTTGCATTGTCAGCCAAGACCTTTCTGTTCTTAACTT
GGTCATTGTCAAGAAGGGTGAGAAGGATCTCCCCGGGCTTACCGACACCGAGAAGCCAAG
GATGAGAGGTCCCAAGAGGGCATCCAAGATCCGCAAGTTGTTCAACCTCACTAAGGATGA
TGATGTTAGGAAGTATGTCAACACTTACCGCCGCAAATTCACTAACAAGAAAGGTAAGGA
AGTGAGCAAAGCCCCCAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCCTTTGACACTTCAGAGGAAGAG
AGCTAGAATTGCCGACAAGAAGAAGAGAATCGCCAAGGCTAACTCTGATGCTGCTGAGTA
CCAGAAGCTTCTCGCCTCCAGGCTTAAGGAGCAGCGTGATCGCCGTAGTGAAAGTTTGGC
CAAGAAGAGGTCTAGGCTCTCTTCCGCTGCCGCTAAGCCCGTTGCTGCGTAAAACCTATT
CCATCATCAAGACACTTCGTTCTCTCTCTTAGTCTGTTTCTGCGTTTTATTGGGACATGT
AAACGCC

QA 2 788 2 788
DS 

RD RR2G338TF 174 0 0
CAGCGTGATCGCCGTAGTGAAAGTTTGGCCAAGAAGAGGTCTAGGCTCTCTTCCGCTGCC
GCTAAGCCCGTTGCTGCGTAAAACCTATTCCATCATCAAGACACTTCGTTCTCTCTCTTA
GTCTGTTTCTGCGTTTTATTGGGACATGTAAACGCCGTTTTGA*CGTCTCTCTT

QA 1 174 1 174
DS 

RD RR2CV08JQ 734 0 0
GTTTCCCAATGAAACAGGGAGTTCTCACCCCTGGTCGTGTCCGCCTTTTACTTCACCGAG
GTACTCCTTGCTTCAGAGGACACGGAAGAAGGACTGGAGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTCC
GTGGTTGCATTGTCAGCCAAGACCTTTCTGTTCTTAACTTGGTCATTGTCAAGAAGGGTG
AGAAGGATCTCCCCGGGCTTACCGACACCGAGAAGCCAAGGATGAGAGGTCCCAAGAGGG
CATCCAAGATCCGCAAGTTGTTCAACCTCACTAAGGATGATGATGTTAGGAAGTATGTCA
ACACTTACCGCCGCAAATTCACTAACAAGAAAGGTAAGGAAGTGAGCAAAGCCCCCAAGA
TCCAGAGGCTTGTGACTCCTTTGACACTTCAGAGGAAGAGAGCTAGAATTGCCGACAAGA
AGAAGAGAATCGCCAAGGCTAACTCTGATGCTGCTGAGTACCAGAAGCTTCTCGCCTCCA
GGCTTAAGGAGCAGCGTGATCGCCGTAGTGAAAGTTTGGCCAAGAAGAGGTCTAGGCTCT
CTTCCGCTGCCGCTAAGCCCGTTGCTGCGTAAAACCTATTCCATCATCAAGACACTTCGT
TCTCTCTCTTAGTCTGTTTCTGCGTTTTATTGGGACATGTAAACGCCGTTTTGAACGTCT
CTCTTTTTTTTGGTTTCTGCTTTGTCTTAGCTCTTAAACCTTTCTATTATATCAAAGTTT
TTGAACTTGTTTGC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2G338JQ 699 0 0
TGTCCGCCTTTTACTTCACCGAGGTACTCCTTGCTTCAGAGGACACGGAAGAAGGACTGG
AGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTCCGTGGTTGCATTGTCAGCCAAGACCTTTCTGTTCTTAA
CTTGGTCATTGTCAAGAAGGGTGAGAAGGATCTCCCCGGGCTTACCGACACCGAGAAGCC
AAGGATGATAGGTCCCAAGAGGGCATCCAAGATCCGCAAGTTGTTCAACCTCACTAAGAA
TGATGATGTTAGGAAGTATGTCAACACTTACCGCCGCAAATTCACTAACAAGAAAGGTAA
GGAAGTGAGCAAAGCCCCCAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCCTTTGACACTTCAGAGGAA
GAGAGCTAGAATTGCCGACAAGAAGAAGAGAATCGCCAAGGCTAACTCTGATGCTGCTGA
GTACCAGAAGCTTCTCGCCTCCAGGCTTAAGGAGCAGCGTGATCGCCGTAGTGAAAGTTT
GGCCAAGAAGAGGTCTAGGCTTTCTTCCGCTGCCGCTAAGCCCGTTGCTGCGTAAAACCT
ATTCCATCATCAAGACACTTCGTTCTCTCTCTTAGTCTGTTTCTGCGTTTTATTGGGACA
TGTAAACGCCGTTTTGAACGTCTCTCTTTTTTTTGGTTTCTGCTTTGTCTTAGCTCTTAA
ACCTTTCTATTATATCAAAGTTTTTGAACTTGTTTGC
CC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2F613JQ 632 0 0
GAAGAAAGTCTGTCCGTGGTTGCATTGTCAGCCAAGACCTTTCTGTTCTTAACTTGGTCA
TTGTCAAGAAGGGTGAGAAGGATCTCCCCGGGCTTACCGACACCGAGAAGCCAAGGATGA
GAGGTCCCAAGAGGGCATCCAAGATCCGCAAGTTGTTCAACCTCACTAAGGATGATGATG
TTAGGAAGTATGTCAACACTTACCGCCGCAAATTCACTAACAAGAAAGGTAAGGAAGTGA
GCAAAGCCCCCAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCCTTTGACACTTCAGAGGAAGAGAGCTA
GAATTGCCGACAAGAAGAAGAGAATCGCCAAGGCTAACTCTGATGCTGCTGAGTACCAGA
AGCTTCTCGCCTCCAGGCTTAAGGAGCAGCGTGATCGCCGTAGTGAAAGTTTGGCCAAGA
AGAGGTCTAGGCTCTCTTCCGCTGCCGCTAAGCCCGTTGCTGCGTAAAACCTATTCCATC
ATCAAGACACTTCGTTCTCTCTCTTAGTCTGTTTCTGCGTTTTATTGGGACATGTAAACG
CCGTTTTGAACGTCTCTCTTTTTTTTGGTTTCTGCTTTGTCTTAGCTCTTAAACCTTTCT
ATTATATCAAAGTTTTTGAACTTGTTTGC
TCC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2DX81JQ 527 0 0
AGAAGCCAAGGATGAGAGGTCCCAAGAGGGCATCCAAGATCCGCAAGTTGTTCAACCTCA
CTAAGGATGATGATGTTAGGAAGTATGTCAACACTTACCGCCGCAAATTCACTAACAAGA
AAGGTAAGGAAGTGAGCAAAGCCCCCAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCCTTTGACACTTC
AGAGGAAGAGAGCTAGAATTGCCGACAAGAAGAAGAGAATCGCCAAGGCTAACTCTGATG
CTGCTGAGTACCAGAAGCTTCTCGCCTCCAGGCTTAAGGAGCAGCGTGATCGCCGTAGTG
AAAGTTTGGCCAAGAAGAGGTCTAGGCTCTCTTCCGCTGCCGCTAAGCCCGTTGCTGCGT
AAAACCTATTCCATCATCAAGACACTTCGTTCTCTCTCTTAGTCTGTTTCTGCGTTTTAT
TGGGACATGTAAACGCCGTTTTGAACGTCTCTCTTTTTTTTGGTTTCTGCTTTGTCTTAG
CTCTTAAACCTTTCTATTATATCAAAGTTTTTGAACTTGTTTGCTCC

QA 1 527 1 527
DS 



CO CL22Contig6 650 2 3 U
GGACGGAAGGGGGACTGGAGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTCCGTGGTTGTATTGTCAGCCA
GGACCTTTCTGTGCTTAACTTGGTCATTGTCAAGAAAGGTGAGAAGGATCTCCCCGGGCT
TACCGATACCGAGAAGCCAAGGATGAGGGGACCCAAGAGAGCTTCTAAGATCCGCAAGTT
GTTCAACCTCACTAAGGATGATGATGTCAGGAAGTATGTCAACACTTACCGCCGCAAATT
CACTAACAAGAAAGGTAGGGAAGTGAGCAAAGCCCCTAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCC
TTTGACACTTCAGAGGAAGAGAGCTAGAATTGCCGACAAGAAGAAGAGAATCGCCAAGGC
TAACTCTGATGCTGCTGAGTACCAGAAGCTTCTCGCCTCCAGGCTTAAGGAGCAGCGTGA
TCGCCGTAGTGAAAGTTTGGCCAAGAAGAGGTCTAGGCTCTCTTCCGCTGCCGCTAAGCC
CGTTGCTGCTTAAAATCCATTCCATCATCAAGACACTTCGTTCTCTCTCTTAGTCTGTTT
CTGCGTCGTATTGGACATGTAAACGCCGTTTTGAACGTCTCTTTTTTTTTGGTTTATGCT
TTGTCTTAGCTCTTAAACCTTTCTATTATATCAAAGTTTTTTTTTGAACT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F970JQ C 1
AF RR2F970TF U 1
BS 1 2 RR2F970JQ
BS 3 641 RR2F970TF
BS 642 650 RR2F970JQ

RD RR2F970JQ 650 0 0
GGACGGAAGGGGGACTGGAGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTCCGTGGTTGTATTGTCAGCCA
GGACCTTTCTGTGCTTAACTTGGTCATTGTCAAGAAAGGTGAGAAGGATCTCCCCGGGCT
TACCGATACCGAGAAGCCAAGGATGAGGGGACCCAAGAGAGCTTCTAAGATCCGCAAGTT
GTTCAACCTCACTAAGGATGATGATGTCAGGAAGTATGTCAACACTTACCGCCGCAAATT
CACTAACAAGAAAGGTAGGGAAGTGAGCAAAGCCCCTAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCC
TTTGACACTTCAGAGGAAGAGAGCTAGAATTGCCGACAAGAAGAAGAGAATCGCCAAGGC
TAACTCTGATGCTGCTGAGTACCAGAAGCTTCTCGCCTCCAGGCTTAAGGAGCAGCGTGA
TCGCCGTAGTGAAAGTTTGGCCAAGAAGAGGTCTAGGCTCTCTTCCGCTGCCGCTAAGCC
CGTTGCTGCTTAAAATCCATTCCATCATCAAGACACTTCGTTCTCTCTCTTAGTCTGTTT
TTGCGTCGTATTGGACATGTAAACGCCGTTTTGAACGTCTCTTTTTTTTTGGTTTATGCT
TTGTCTTAGCTCTTAAACCTTTCTATTATATCAAAGTTTTTTTTTGAACT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2F970TF 649 0 0
GG
ACGGAAGGGGGACTGGAGAGAGGAGAAGAAAGTCTGTCCGTGGTTGTATTGTCAGCCAGG
ACCTTTCTGTGCTTAACTTGGTCATTGTCAAGAAAGGTGAGAAGGATCTCCCCGGGCTTA
CCGATACCGAGAAGCCAAGGATGAGGGGACCCAAGAGAGCTTCTAAGATCCGCAAGTTGT
TCAACCTCACTAAGGATGATGATGTCAGGAAGTATGTCAACACTTACCGCCGCAAATTCA
CTAACAAGAAAGGTAGGGAAGTGAGCAAAGCCCCTAAGATCCAGAGGCTTGTGACTCCTT
TGACACTTCAGAGGAAGAGAGCTAGAATTGCCGACAAGAAGAAGAGAATCGCCAAGGCTA
ACTCTGATGCTGCTGAGTACCAGAAGCTTCTCGCCTCCAGGCTTAAGGAGCAGCGTGATC
GCCGTAGTGAAAGTTTGGCCAAGAAGAGGTCTAGGCTCTCTTCCGCTGCCGCTAAGCCCG
TTGCTGCTTAAAATCCATTCCATCATCAAGACACTTCGTTCTCTCTCTTAGTCTGTTTCT
GCGTCGTATTGGACATGTAAACGCCGTTTTGAACGTCTCTTTTTTTTTGGTTTATGCTTT
GTCTTAGCTCTTAAACCTTTCTATTATATCAAAGTTTTT
TTTGAACT

QA 3 641 3 641
DS 



AS 3 31

CO CL23Contig1 580 17 6 U
GGATTCTGTGATTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTT
CTTCGGTCTTTCTTAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGC
TGCAAGTGCGGCAACGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACACAGATTTGGGATTCTCCGGT
GAGATGACCGCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTAT
GAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAG
TGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAAGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAG
AGATTATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTAGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCT
GCAGCCTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTT*CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGAT
GTCTCTGCCATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGGAATGGAGTTGAATAAT
TCTCTGAATATAATACTAGTATTCCAATATAGAAGTTCCC


BQ
30 30 30 30 40 10 10 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 55 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 75 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 60 55 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 60 55 35 35 35 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F786TF U 1
AF RR2GE29JQ C 208
AF RR2BN12TF U 1
AF RR2AW38JQ C 1
AF RR2CY60TF U 1
AF RR2GE29TF U 34
AF RR2BC73JQ C 1
AF RR2AW38TFB U 70
AF RR2GO26TF U 336
AF RR2CY60JQ C 29
AF RR2H688JQB C 6
AF RR2H688TF U 6
AF RR2B467JQ C 6
AF RR2B467TF U 6
AF RR2B391JQ C 8
AF RR2B391TF U 8
AF RR2BC73TF U 1
BS 1 286 RR2F786TF
BS 287 534 RR2BN12TF
BS 535 565 RR2CY60TF
BS 566 568 RR2AW38TFB
BS 569 572 RR2B467TF
BS 573 580 RR2BC73TF

RD RR2F786TF 286 0 0
GGATTCTGTGATTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTT
CTTCGGTCTTTCTTAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGC
TGCAAGTGCGGCAACGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACACAGATTTGGGATTCTCCGGT
GAGATGACCGCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTAT
GAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTG

QA 1 286 1 286
DS 

RD RR2GE29JQ 264 0 0
TTTGGCGTTGCCCCGGAGATGAAGAACCAGTATGAGGCTTTTGGAGAGGGCAGCGCTGAG
AACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATA
AAGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTTTCAGAGATTATATTAAAGTAACCCAAATGAT
GTTTTAGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCTGCACCCTTTTGTTTTTTAGCCTGTAAT
GGTTTT*CGTTTATGTTGACGTGA

QA 1 264 1 264
DS 

RD RR2BN12TF 534 0 0
GGATTCTGTGATTAACTTTCTATAAATGATCAATCTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTT
CTTCGGTCTTTCTTAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGC
TGCAAGTGCGGCAACGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACACAGATTTGGGATTCTCCGGT
GAGATGACCGCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTAT
GAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAG
TGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAAGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAG
AGATTATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTAGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCT
GCAGCCTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTT*CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGAT
GTCTCTGCCATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGGAATGGAGTTG

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2AW38JQ 564 0 0
GGATTCTGTGATTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTT
CTTCGGTCTTTCTTAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGC
TGCAAGTGCGGCAACGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACACAGATTTGGGATTCTCCGGT
GAGATGACCGCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTAT
GAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAG
TGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAAGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAG
AGATTATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTAGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCT
GCAGCCTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTT*CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGAT
GTTTCTGCCATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGGAATGGAGTTGAATAAT
TCTCTGAATATAATACTAGTATTC

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2CY60TF 565 0 0
GGATTCTGTGATTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTT
CTTCGGTCTTTCTTAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGC
TGCAAGTGCGGCAACGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACACAGATTTGGGATTCTCCGGT
GAGATGACCGCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTAT
GAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAG
TGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAAGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAG
AGATTATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTAGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCT
GCAGCCTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTT*CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGAT
GTCTCTGCCATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGGAATGGAGTTGAATAAT
TCTCTGAATATAATACTAGTATTCC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2GE29TF 513 0 0
G
CTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTTCTTCGGTCTTTCTTAGAGAAAATGTCTTGCTGTG
GAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGCTGCAAGTGCGGCAACGGTTGCGGAGGTTGCAAAA
TGTACACAGATTTGGGATTCTCCGGTGAGATGACCGCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCG
TTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTATGAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATG
CATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAAGGAAC
CTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAGAGATTATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTAG
GTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCTGCAGCCTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTT*
CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGATGTCTCTGCCACGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGT
ACTTCTATGGAATGGAGTTGAATAATTCTCTG

QA 2 513 2 513
DS 

RD RR2BC73JQ 580 0 0
GGAC
TCTGTGATTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTTCTTC
GGTCTTTCTTAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGCTGCA
AGTGCGGCAACGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACACAGATTTGGGATTTTCCGGTGAGA
TGACCGCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTATGAGG
CTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGTG
ACCCATGCACTTGTAAATTAATAAAGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAGAGAT
TATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTAGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCTGCAG
CCTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTT*CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGATGTTT
CTGCCATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGGAATGGAGTTGAATAATTCTC
TGAATATAATACTAGTATTCCAATATAGAAGTTCCC

QA 5 580 5 580
DS 

RD RR2AW38TFB 499 0 0
TTCTTAGAGAAAATGTCTTGGTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGCTGCAAGTGC
GGCAACGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACACAGATTTGGGATTCTCCGGTGAGATGACC
GCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTATGAGGCTTCT
GGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGTGACCCA
TGCACTTGTAAATGAATAAAGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAGAGATTATAT
TAAAGTAACCCAAATGATGTTCTAGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCTGCAGCCTTT
TGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTT*CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGATGTCTCTGCC
ATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGGAATGGAGTTGAATAATTCTCTGAAT
ATAATACTAGTATTCCAAT

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR2GO26TF 212 0 0
TTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAGAGATTATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTAGG
TTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCTGCAGCCTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTTTC
GTTTATGTTGACGTGATATCTAGATGTCTCTGCCATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTA
CTTCTATGGAATGGAGTTGAATAATTCTCTGA

QA 1 212 1 212
DS 

RD RR2CY60JQ 537 0 0
ATCAATCTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTTCTTCGGTCTTTCTTAGAGAAAATGTCTT
GCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGCTGCAAGTGCGGCAACGGTTGCGGAGGTT
GCAAAATGTACACAGATTTGGGATTTTCCGGTGAGATGACCGCAGCTGAGACTTTCGTCT
TTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTATGAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGA
ACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAA
AGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAGAGATTATATTAAAGTAACCCAAATGATG
TTCTAGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCTGCAGCCTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATG
GTTTT*CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGATGTCTCTGCCATGTGTGACGGATGAGTCA
GTTTGTACTTCTATGGAATGGAGTTGAATAATTCTCTGAATATAATACTAGTATTCC

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2H688JQB 560 0 0
GGGTGATTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTTCTTCG
GTCTTTCTTAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGCTGCAA
GTGCGGCAACGGTTGTGGAGGTTGCAAAATGTACACAGATTTGGGATTCTCCAGTGAGAT
GACCGCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTATGAGGC
TTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGTGA
CCCATGCACTTGTAAATGAATAAAGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAGAGATT
ATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTAGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCTGCAGC
CTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTT*CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGATGTCTC
TGCCATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGGAATGGAGTTGAATAATTCTCT
GAATATAATACTAGTATT
TC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2H688TF 560 0 0
GGGTGATTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTTCTTCG
GTCTTTCTTAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGCTGCAA
GTGCGGCAACGGTTGTGGAGGTTGCAAAATGTACACAGATTTGGGATTCTCCAGTGAGAT
GACCGCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTATGAGGC
TTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGTGA
CCCATGCACTTGTAAATGAATAAAGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAGAGATT
ATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTAGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCTGCAGC
CTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTT*CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGATGTCTC
TGCCATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGGAATGGAGTTGAATAATTCTCT
GAATATAATACTAGTATT
TC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2B467JQ 567 0 0
GGGTGATTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTTCTTCG
GTCTTTCTTAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGCTGCAA
GTGCGGCAACGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACACAGATTTGGGATTCTCCGGTGAGAT
GACCGCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTATGAGGC
TTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGTGA
CCCATGCACTTGTAAATGAATAAAGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAGAGATT
ATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTGGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCTGCAGC
CTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTT*CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGATGTCCC
TGCCATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGGAATGGAGTTGAATAATTCTCT
GAATATAATACTAGTATTCCAATATAG

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2B467TF 567 0 0
GGGTGATTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTTCTTCG
GTCTTTCTTAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGCTGCAA
GTGCGGCAACGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACACAGATTTGGGATTCTCCGGTGAGAT
GACCGCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTATGAGGC
TTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGTGA
CCCATGCACTTGTAAATGAATAAAGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAGAGATT
ATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTGGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCTGCAGC
CTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTT*CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGATGTCCC
TGCCATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGGAATGGAGTTGAATAATTCTCT
GAATATAATACTAGTATTCCAATATAG

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2B391JQ 558 0 0
GG
GATTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTTCTTCGGTCT
TTCTTAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGCTGCAAGTGC
GGCAACGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACACAGATTTGGGATTCTCCGGTGAGATGACC
GCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTATGAGGCTTCT
GGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGTGACCCA
TGCACTTGTAAATGAATAAAGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAGAGATTATAT
TAAAGTAACCCAAACGATGTTCTAGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCTGCAGCCTTT
TGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTT*CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGATGTCTCTGCC
ATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGGAATGGAGTTGAATAATTCTCTGAAT
ATAATACTAGTATTCC

QA 3 558 3 558
DS 

RD RR2B391TF 558 0 0
GG
GATTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTTCTTCGGTCT
TTCTTAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGCTGCAAGTGC
GGCAACGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACACAGATTTGGGATTCTCCGGTGAGATGACC
GCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTATGAGGCTTCT
GGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGTGACCCA
TGCACTTGTAAATGAATAAAGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAGAGATTATAT
TAAAGTAACCCAAACGATGTTCTAGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCTGCAGCCTTT
TGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTT*CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGATGTCTCTGCC
ATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGGAATGGAGTTGAATAATTCTCTGAAT
ATAATACTAGTATTCC

QA 3 558 3 558
DS 

RD RR2BC73TF 580 0 0
GGAC
TCTGTGATTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTTAAAACGTTCTCTACTATTTCTTC
GGTCTTTCTTAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGCTGCA
AGTGCGGCAACGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACACAGATTTGGGATTCTCCGGTGAGA
TGACCGCAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGAGATGAAGAACCAGTATGAGG
CTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGTG
ACCCATGCACTTGTAAATTAATAAAGGAACCTTTTTAAGAAGGCAGAGATTATCAGAGAT
TATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTAGGTTTGGTTTATAGTGTAATAATGGCTGCAG
CCTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTT*CGTTTATGTTGACGTGATATCTAGATGTCT
CTGCCATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGGAATGGAGTTGAATAATTCTC
TGAATATAATACTAGTATTCCAATATAGAAGTTCCC

QA 5 580 5 580
DS 



CO CL23Contig2 556 12 5 U
GGATTCTGTGGTTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTAAAAAACGTTCTCTGCTATT
TCTTCGGTCTTTCTCGAGAGAAAATGTCCTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTG
GCTGCAAGTGCGGCAGCGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGATTTGGGCTTCTCTG
GTGAGACGACGACAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGCGATGAAGAACCAGT
ATGAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCA
AGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAGGAAACCTTTTTAAAAAGGCAGAGATTATC
AGACTTTATATTAAAGTACGTTCTAGGTTTGGTCTATGGTGTAATAATGGCTGCAGACTT
TAGTCTTTTAGCCGATAATGGTTTTCGTTTGTCATATCTAGATATCTCTGCCATGTGTTA
ACGGATGAGTCGGTTTGTACTTCTACGGAATTTGAGCTGAACGATTCTCTAAATATATAG
TTATGTTTTATTAATT


BQ
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 55 55 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 45 70 55 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 10 10 10 10 

AF RR2ES54JQ C 1
AF RR2E144TF U 1
AF RR2E144JQ C 52
AF RR2H581JQB C 1
AF RR2AC23JQ C 70
AF RR2H581TF U 1
AF RR2ES54TF U 1
AF RR2GQ94TF U 1
AF RR2B942TF U 126
AF RR2C854JQ C 49
AF RR2AC23TF U 15
AF RR2H273TF U 1
BS 1 362 RR2E144TF
BS 363 363 RR2ES54TF
BS 364 530 RR2E144TF
BS 531 551 RR2ES54TF
BS 552 556 RR2GQ94TF

RD RR2ES54JQ 218 0 0
GGATTCTGTGGTTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTAAAAAACGTTTTCTGCTATT
TCTTCGGTCTTTCTCGAGAGAAAATGTCCTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTG
GCTGCAAGTGCGGCAGCGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGATTTGGACTTCTCTG
GTGAGACGACGACAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTT

QA 1 218 1 218
DS 

RD RR2E144TF 530 0 0
GGATTCTGTGGTTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTAAAAAACGTTCTCTGCTATT
TCTTCGGTCTTTCTCGAGAGAAAATGTCCTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTG
GCTGCAAGTGCGGCAGCGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGATTTGGGCTTCTCTG
GTGAGACGACGACAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGCGATGAAGAACCAGT
ATGAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCA
AGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAGGAAACCTTTTTAAAAAGGCAGAGATTATC
AGCCTTTATATTAAAGTACGTTCTAGGTTTGGTCTATGGTGTAATAATGGCTGCAGACTT
TAGTCTTTTAGCCGATAATGGTTTTCGTTTGTCATATCTAGATATCTCTGCCATGTGTTA
ACGGATGAGTCGGTTTGTACTTCTACGGAATTTGAGCTGAACGATTCTCT

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2E144JQ 479 0 0
TCTGCTATTTCTTCGGTCTTTCTCGAGAGAAAATGTCCTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTT
GTGGATCTGGCTGCAAGTGCGGCAGCGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGATTTGG
GCTTCTCTGGTGAGACGACGACAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGCGATGA
AGAACCAGTATGAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGAT
CCGACTGCAAGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAGGAAACCTTTTTAAAAAGGCA
GAGATTATCAGCCTTTATATTAAAGTACGTTCTAGGTTTGGTCTATGGTGTAATAATGGC
TGCAGACTTTAGTCTTTTAGCCGATAATGGTTTTCGTTTGTCATATCTAGATATCTCTGC
CATGTGTTAACGGATGAGTCGGTTTGTACTTCTACGGAATTTGAGCTGAACGATTCTCT

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR2H581JQB 530 0 0
GGATTCTGTGGTTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTAAAAAACGTTTTCTGCTATT
TCTTCGGTCTTTCTCGAGAGAAAATGTCCTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTG
GCTGCAAGTGCGGCAGCGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGATTTGGGCTTTTCTG
GTGAGACGACGACAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCCCCGGCGATGAAGAACCAGT
ATGAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCA
AGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAGGAAACCTTTTTAAAAAGGCAGAGATTATC
AGACTTTATATTAAAGTACGTTCTAGGTTTGGTCTATGGTGTAATAATGGCTGCAGACTT
TAGTCTTTTAGCCGATAATGGTTTTCGTTTGTCATATCTAGATATTTCTGCCATGTGTTA
ACGGATGAGTCGGTTTGTACTTCTACGGAATTTGAGCTGAACGATTCTC
C

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2AC23JQ 451 0 0
TTTCTCGAGAGAAAATGTCCTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGCTGCAAGT
GCGGCAGCGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGATTTGGGCTTTTTTGGTGAGACGA
CGACAGCTGAGACTTTTGTTTTTGGCGTTGCCCCGGCGATGAAGAACCAGTATGAGGCTT
TTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGTGACC
CATGCACTTGTAAATGAATAAGGAAACCTTTTTAAAAAGGCAGAGATTATCAGACTTTAT
ATTAAAGTACGTTTTAGGTTTGGTTTATGGTGTAATAATGGCTGCAGACTTTAGTTTTTT
AGCCGATAATGGTTTTCGTTTGTCATATCTAGATATTTTTCCCATGTGTTAACGGATGAG
TCGGTTTGTACTTTTACGGAATTTGAGCTGA

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR2H581TF 530 0 0
GGATTCTGTGGTTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTAAAAAACGTTCTCTGCTATT
TCTTCGGTCTTTCTCGAGAGAAAATGTCCTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTG
GCTGCAAGTGCGGCAGCGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGATTTGGGCTTCTCTG
GTGAGACGACGACAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGCGATGAAGAACCAGT
ATGAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCA
AGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAGGAAACCTTTTTAAAAAGGCAGAGATTATC
AGACTTTATATTAAAGTACGTTCTAGGTTTGGTCTATGGTGTAATAATGGCTGCAGACTT
TAGTCTTTTAGCCGATAATGGTTTTCGTTTGTCATATCTAGATATCTCTGCCATGTGTTA
ACGGATGAGTCGGTTTGTACTTCTACGGAATTTGAGCTGAACGATTCTC
C

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2ES54TF 552 0 0
GGATTCTGTGGTTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTAAAAAACGTTCTCTGCTATT
TCTTCGGTCTTTCTCGAGAGAAAATGTCCTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTG
GCTGCAAGTGCGGCAGCGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGATTTGGACTTCTCTG
GTGAGACGACGACAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGCGATGAAGAACCAGT
ATGAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCA
AGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAGGAAACCTTTTTAAAAAGGCAGAGATTATC
AGACTTTATATTAAAGTACGTTCTAGGTTTGGTCTATGGTGTAATAATGGCTGCAGACTT
TAGTCTTTTAGCCGATAATGGTTTTCGTTTGTCATATCTAGATATCTCTGCCATGTGTTA
ACGGATGAGTCGGTTTGTACTTCTACGGAATTTGAGCTGAACGATTCTCTAAATATATAG
TTATGTTTTAT
C

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2GQ94TF 556 0 0
GGATTCTGTGGTTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTAAAAAACGTTCTCTGCTATT
TCTTCGGTCTTTCTCGAGAGAAAATGTCCTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTG
GCTGCAAGTGCGGCAGCGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGATTTGGGCTTCTCTG
GTGAGACGACGACAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGCGATGAAGAACCAGT
ATGAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCA
AGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAGGAAACCTTTTTAAAAAGGCAGAGATTATC
AGACTTTATATTAAAGTACGTTCTAGGTTTGGTCTATGGTGTAATAATGGCTGCAGACTT
TAGTCTTTTAGCCGATAATGGTTTTCGTTTGTCATATCTAGATATCTCTGCCATGTGTTA
ACGGATGAGTCGGTTTGTACTTCTACGGAATTTGAGCTGAACGATTCTCTAAATATATAG
TTATGTTTTATTAATT

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2B942TF 427 0 0
AAGTGCGGCAGCGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGATTTGGGCTTCTCTGGTGAG
ACGACGACAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCGCCGGCGATGAAGAACCAGTATGAG
GCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGT
GACCCATGCACTTGTAAATGAATAAGGAAACCTTTTTAAAAAGGCAGAGATTATCAGACT
TTATATTAAAGTACGTTCTAGGTTTGGTCTATGGTGTAATAATGGCTGCAGACTTTAGTC
TTTTAGCCGATAATGGTTTTCGTTTGTCATATCTAGATATCTCTGCCATGTGTTAACGGA
TGAGTCGGTTTGTACTTCTACGGAATTTGAGCTGAACGATTCTCTAAATATATAGTTATG
TTTTATT

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR2C854JQ 504 0 0
TTTTT
TGCTATTTCTTCGGTCTTTCTCGAGAGAAAATGTCCTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGT
GGTTCTGGCTGCAAGTGCGGCAGCGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGATTTGGGC
TTCTCTGGTGAGACGACGACAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGCGATGAAG
AACCAGTATGAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCC
GACTGCAAGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAGGAAACCTTTTTAAAAAGGCAGA
GATTATCAGACTTTATATTAAAGTACGTTCTAGGTTTGGTCTATGGTGTAATAATGGCTG
CAGACTTTAGTCTTTTAGCCGATAATGGTTTTCGTTTGTCATATCTAGATATTTCTGCCA
TGTGTTAACGGATGAGTCGGTTTGTACTTCTACGGAATTTGAGCTGAACGATTCTCTAAA
TATATAGTTATGTTTTATT

QA 6 504 6 504
DS 

RD RR2AC23TF 538 0 0
ACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTAAAAAACGTTCTCTGCTATTTCTTCGGTCTTTCT
CGAGAGAAAATGTCCTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGGCTGCAAGTGCGGC
AGCGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGATTTGGGCTTCTCTGGTGAGACGACGACA
GCTGAGACTTTTGTCTTTGGCGTTGCACCGGCGATGAAGAACCAGTATGAGGCTTCTGGA
GAGGGCAGCGCTGAGAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCAAGTGTGACCCATGC
ACTTGTAAATGAATAAGGAAACCTTTTTAAAAAGGCAGAGATTATCAGACTTTATATTAA
AGTACGTTCTAGGTTTGGTCTATGGTGTAATAATGGCTGCAGACTTTAGTCTTTTAGCCG
ATAATGGTTTTCGTTTGTCATATCTAGATATCTCTGCCATGTGTTAACGGATGAGTCGGT
TTGTACTTCTACGGAATTTGAGCTGAACGATTCTCTAAATATATAGTTATGTTTTATT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2H273TF 552 0 0
GGATTCTGTGGTTAACTTTCTATAAACGATCAATCTAATTAAAAAACGTTCTCTGCTATT
TCTTCGGTCTTTCTCGAGAGAAAATGTCCTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTG
GCTGCAAGTGCGGCAGCGGTTGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGATTTGGGCTTCTCTG
GTGAGACGACGACAGCTGAGACTTTCGTCTTTGGCGTTGCACCGGCGATGAAGAACCAGT
ATGAGGCTTCTGGAGAGGGCAGCGCTGAAAACGATGCATGCAAGTGTGGATCCGACTGCA
AGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAGGAAACCTTTTTAAAAAGGCAGAGATTATC
AGACTTTATATTAAAGTACGTTCTAGGTTCGGTCTATGGTGTAATAATGGCTGCAGACTT
TAGTCTTTTAGCCGATAATGGTTTTCGTTTGTCATATCTAGATATCTCTGCCATGTGTTA
ACGGATGAGTCGGTTTGTACTTCTACGGAATTTGAGCTGAACGATTCTCTAAATATATAG
TTATGTTTTATT

QA 1 552 1 552
DS 



CO CL23Contig3 680 2 2 U
GTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTG
TAAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTT
GTTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAA
ACCCCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGT
TGCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCA
TTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACG
GGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGATGCATGCAAGT
GTGGATCCGACTGCAAGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAAGGAACCTTTTTAAG
AAGGCAGAGATTATCAGAGATTATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTAGGCTTGGTTT
ATAGTGTAATAATGGCTGCAGCCTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTTCGTTTATGTT
GACGTGATATCTAGATGTCTCTGCCATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGG
AATGGAGTTGAATAATTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E424TF U 1
AF RR2E424JQ C 1
BS 1 575 RR2E424TF
BS 576 680 RR2E424JQ

RD RR2E424TF 575 0 0
GTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTG
TAAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTT
GTTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAA
ACCCCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGT
TGCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCA
TTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACG
GGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGATGCATGCAAGT
GTGGATCCGACTGCAAGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAAGGAACCTTTTTAAG
AAGGCAGAGATTATCAGAGATTATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTAGGCTTGGTTT
ATAGTGTAATAATGGCTGCAGCCTTTTGTCTTTTA

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2E424JQ 680 0 0
GTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTG
TAAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTT
GTTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAA
ACCCCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGT
TGCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCA
TTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACG
GGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGATGCATGCAAGT
GTGGATCCGACTGCAAGTGTGACCCATGCACTTGTAAATGAATAAAGGAACCTTTTTAAG
AAGGCAGAGATTATCAGAGATTATATTAAAGTAACCCAAATGATGTTCTAGGCTTGGTTT
ATAGTGTAATAATGGCTGCAGCCTTTTGTCTTTTAGCCTGTAATGGTTTTCGTTTATGTT
GACGTGATATCTAGATGTCTCTGCCATGTGTGACGGATGAGTCAGTTTGTACTTCTATGG
AATGGAGTTGAATAATTCTC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 4 29

CO CL24Contig1 830 2 2 U
GGGTCCAGGTAACATTCAAATCTCATCAACCAAATAAACTCAAGAAAAAAGATGAATCCT
ATGTTTTACTTCCTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGTCACCGCAAACGCCGGGCCA
GTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCCACGGCAGTTACTACGTTGTCCCCGTCATC
AGGGGTGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCTC
TTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTCTCAAACTGG
AGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCAAGATGGATGTCGAA
CCTACGTTCTGCGTTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTTCAGCCCCTAGTCACTGGAGA
TCGTCATTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGTTGGAGGAGAAGATTCGTCGAGGAGT
TTCTTTCAGATCAAGAAAATTAGTGCAAACCTTAACGCTTACAAGTTTGTGTATTGTAGG
GACGGTAACCATTGCACCGATGTCGGAAGAAACGAGGAAGGTGGCGTGCGGGGTTTGGTC
ATAGGCTCTACCCCCCCAATCGCTAGCCCATTCCAGGTTGTGTTCGTGAAAGCTAGTGAG
ACGGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTGATGAA
GAGGATAAGAGTTATAACTTACCTCTAATAATAAAACTCTATCCCTTTATGCTGTTTTCT
TTGTTCGTCAATCATCATCATTATCGTATCTGGAATAAAACATCTTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A137TF U 1
AF RR2A137JQ C 63
BS 1 774 RR2A137TF
BS 775 830 RR2A137JQ

RD RR2A137TF 774 0 0
GGGTCCAGGTAACATTCAAATCTCATCAACCAAATAAACTCAAGAAAAAAGATGAATCCT
ATGTTTTACTTCCTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGTCACCGCAAACGCCGGGCCA
GTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCCACGGCAGTTACTACGTTGTCCCCGTCATC
AGGGGTGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCTC
TTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTCTCAAACTGG
AGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCAAGATGGATGTCGAA
CCTACGTTCTGCGTTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTTCAGCCCCTAGTCACTGGAGA
TCGTCATTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGTTGGAGGAGAAGATTCGTCGAGGAGT
TTCTTTCAGATCAAGAAAATTAGTGCAAACCTTAACGCTTACAAGTTTGTGTATTGTAGG
GACGGTAACCATTGCACCGATGTCGGAAGAAACGAGGAAGGTGGCGTGCGGGGTTTGGTC
ATAGGCTCTACCCCCCCAATCGCTAGCCCATTCCAGGTTGTGTTCGTGAAAGCTAGTGAG
ACGGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTGATGAA
GAGGATAAGAGTTATAACTTACCTCTAATAATAAAACTCTATCCCTTTATGCTG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2A137JQ 768 0 0
GTTTTACTTCCTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGTCACCGCAAACGCCGGGCCAGT
TCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCCACGGCAGTTACTACGTTGTCCCCGTCATCAG
GGGTGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCTCTT
TATCGGACAGGAGCGTTCAGATTTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTCTCAAACTGGAG
GTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCAAGATGGATGTCGAACC
TACGTTTTGCGTTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTTCAGCCCCTAGTCACTGGAGATC
GTCATTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGTTGGAGGAGAAGATTCGTCGAGGAGTTT
CTTTCAGATCAAGAAAATTAGTGCAAACCTTAACGCTTACAAGTTTGTGTATTGTAGGGA
CGGTAACCATTGCACCGATGTCGGAAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGGTTTGGTCAT
AGGCTCTACCCCCCCAATCGCTAGCCCATTCCAGGTTGTGTTCGTGAAAGCTAGTGAGAC
GGAGACTTCATCCAAGATTATGTTTATTATTTGAGAGAAATAAAGACCACTTGATGAAGA
GGATAAGAGTTATAACTTACCTCTAATAATAAAACTCTATCCCTTTATGCTGTTTTCTTT
GTTCGTCAATCATCATCATTATCGTATCTGGAATAAAACATCTTTGCT

QA 1 768 1 768
DS 



CO CL24Contig2 846 21 26 U
GGATCCAGGTAACATTCAAATCTCATCAACTAAATAAACTCAAAAAAAAA*GATGAATCC
TATGTTTTACTTACTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACC
AGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCGGCGGCAGTTACTACGCTATCTCCGTCAT
CAGGGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCT
CTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAACTG
GAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGA
ACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAG
ATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCTTCGAGGAG
TTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAG
GGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTTGG
TTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAGTG
AGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTAATG
AAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACTCTTTCCCTTTATGCTTCTTT
CTTTGTTCGTCGATAATCATCATCATCGTATCTGGAATAAAAACAACTTTACTGTGTTTC
TTTGTT


BQ
45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 20 20 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 20 97 20 97 97 20 97 97 70 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 30 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 20 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 80 97 97 95 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 80 95 95 95 80 95 95 95 80 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 
75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 60 50 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 65 60 45 60 60 55 55 55 45 45 25 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 

AF RR2G145TF U 1
AF RR2GI80TF U 1
AF RR2FX48TF U 1
AF RR2GY22TF U 1
AF RR2BB94TF U 1
AF RR2C420TF U 5
AF RR2G503TF U 1
AF RR2FX48JQ C 137
AF RR2AK50TF U 1
AF RR2B727TF U 1
AF RR2AK50JQ C 62
AF RR2E328JQ C 486
AF RR2BB94JQ C 100
AF RR2G145JQ C 119
AF RR2GY22JQ C 100
AF RR2C420JQ C 100
AF RR2GM71JQ C 324
AF RR2GM71TF U 324
AF RR2DX18TF U 130
AF RR2GI80JQB C 100
AF RR2DX18JQ C 130
BS 1 25 RR2AK50TF
BS 26 26 RR2B727TF
BS 27 50 RR2AK50TF
BS 51 51 RR2GI80TF
BS 52 151 RR2AK50TF
BS 152 153 RR2BB94TF
BS 154 167 RR2AK50TF
BS 168 168 RR2BB94TF
BS 169 169 RR2AK50TF
BS 170 170 RR2BB94TF
BS 171 172 RR2AK50TF
BS 173 173 RR2BB94TF
BS 174 471 RR2AK50TF
BS 472 472 RR2BB94TF
BS 473 550 RR2AK50TF
BS 551 551 RR2BB94TF
BS 552 594 RR2AK50TF
BS 595 595 RR2B727TF
BS 596 766 RR2AK50TF
BS 767 767 RR2B727TF
BS 768 795 RR2AK50TF
BS 796 796 RR2B727TF
BS 797 825 RR2AK50TF
BS 826 837 RR2GM71TF
BS 838 844 RR2GI80JQB
BS 845 846 RR2DX18JQ

RD RR2G145TF 536 0 0
GGATCCAGGTAACATTCAAATCTCATCAACTAAATAAACTCAAAAAAAAA*GATGAATCC
TATGTTTTACTTCCTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACC
AGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCGGCGACAGTTACTACGCTATCTCCGTCAT
CAGGGGCGCTGGAGTTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCT
CTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAACTG
GAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGA
ACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAG
ATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCTTCGAGGAG
TTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2GI80TF 619 0 0
GGATCCAGGTAACATTCAAATCTCATCAACTAAATAAACTCAAAAAAAAA*GATGAATCC
TATGTTTTACTTACTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACC
AGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCCACGGCAGTTACTACGTTGTCCCCGTCAT
CAGGGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCT
CTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAACTG
GAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGA
ACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAG
ATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCGTCGAGGAG
TTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAG
GGACGGTAACCATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTTGG
TTATAGGCTCTACCCCACC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2FX48TF 619 0 0
GGATCCAGGTAACATTCAAATCTCATCAACTAAATAAACTCAAAAAAAAAAGATGAATCC
TATGTTTTACTTACTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACC
AGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCCACGGCAGTTACTACGTTGTCCCCATCAT
CAGGGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCT
CTTTATCGGACATGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAACTG
GAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGA
ACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAG
ATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCGTCGAGGAG
TTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAG
GGACGGTAACCATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTTGG
TTATAGGCTCTACCCCACC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2GY22TF 701 0 0
GGATCCAGGTAACATTCAAATCTCATCAACTAAATAAACTCAAAAAAAAA*GATGAATCC
TATGTTTTACTTCCTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACC
AGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCGGCGGCAGTTACTACGCTATCTCCGTCAT
CAGGGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCT
CTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAACTG
GAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGA
ACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAG
ATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCTTCGAGGAG
TTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAG
GGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTTGG
TTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAGTG
AGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAG
CG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2BB94TF 779 0 0
GGATCCAGGTAACATTCAAATCTCATCAACTAAATAAACTCAAAAAAAA**GATGAATCC
TATGTTTTACTTCCTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACC
AGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCGGCGGCAGTTACTACGCTATCTCCGTCAT
CAGGGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCT
CTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAACTG
GAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGA
ACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAG
ATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCTTCGAGGAG
TTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAG
GGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTTGG
TTATAGACTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAGTG
AGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTAATG
AAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACTCTTTCCCTTTATGCTTCTT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2C420TF 718 0 0
GG
AGGTAACATTCAAATCTCATCAACTAAATAAACTCAAAAAAAAA*GATGAATCCTATGTT
TTACTTCCTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACCAGTTCT
CGACGTGAATGGTGATATCATATTCGGCGGCAGTTACTACGCTATCTCCGTCATCAGGGG
CGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCTCTTTAT
CGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAACTGGAGGTC
TAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAATATCGAGATGGATGTCGAACCTAC
GTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGCCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAGATCGTT
GTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCTTCGAGGAGTTTCTT
CCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAGGGACGG
TAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTTGGTTATAG
GCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAGTGAGATAG
AGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAGAGAA*TAAAGACCACTTAATGA
G

QA 3 717 3 717
DS 

RD RR2G503TF 735 0 0
GGATCCAGGTAACATTCAAATCTCATCAACTAAATGAACTCAAAAAAAAA*GATGAATCC
TATGTTTTACTTCCTTCTTGCCCTAACGGCTGTTTTGGCTGCCATCGCAAACGCCGGACC
AGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCGGCGGCAGTTACTACGCTATCTCCGTCAT
CAGGGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCT
CTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCTTGAAATTTTCAAACTG
GAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGA
ACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAG
ATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCTTCGAGGAG
TTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAG
GGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGGGTTTGG
TTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAGTG
AGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGAC*ACTTAATG
AAGAGGATAAGAGTT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2FX48JQ 601 0 0
GGTGATATCATATTCCACGGCAGTTACTACGTTGTCCCCATCATCAGGGGCGCTGGAGGT
GGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCTCTTTATCGGACATGAG
CGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAACTGGAGGTCTAGAGTTGGG
TTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGAACCTACGTTCTGCGCT
GAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAGATCGTTGTTCATAGCG
GTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCGTCGAGGAGTTTCTTCCAGATCAAG
AAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAGGGACGGTAACCATTGC
ACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTTGGTTATAGGCTCTACCCC
ACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAGTGAGATAGAGACTTCATC
CAAGATTATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTAATGAAGAGGATAAGAGTTA
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2AK50TF 832 0 0
GGATCCAGGTAACATTCAAATCTCACCAACTAAATAAACTCAAAAAAAAAAGATGAATCC
TATGTTTTACTTACTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACC
AGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCCACGGCAGTTACTACGTTGTCCCCGTCAT
CAGGGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCT
CTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAACTG
GAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGA
ACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAG
ATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCGTCGAGGAG
TTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAG
GGACGGTAACCATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGGGTTTGG
TTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAGTG
AGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTAATG
AAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACTCTTTCC*TTTATGCTTCTTT
CTTTGTTCGTCGATA*TCATCATCATCGTATCTGGAATAAAAACA
CTTTACC

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR2B727TF 834 0 0
GGATCCAGGTAACATTCAAATCTCATCAACTAAATAAACTCAAAAAAAAAAGATGAATCC
TATGTTTTACTTACTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACC
AGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCCACGGCAGTTACTACGTTGTCCCCGTCAT
CAGGGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCT
CTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAACTG
GAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGA
ACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAG
ATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCGTCGAGGAG
TTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAG
GGACGGTAACCATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTTGG
TTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAGTG
AGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTAATG
AAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACTCTTTCCCTTTATGCTTCTTT
CTTTGTTCGTCGATAATCATCATCATCGTATCTGGA
TAAAACACTTTACTGTGT

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR2AK50JQ 772 0 0
ATGTTTTACTTACTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACCA
GTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCCACGGCAGTTACTACGTTGTCCCCGTCATC
AGGGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCTC
TTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAACTGG
AGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGAA
CCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAGA
TCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCGTCGAGGAGT
TTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAGG
GACGGTAACCATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTTGGT
TATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAGTGA
GATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTAATGA
AGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACTCTTTCCCTTTATGCTTCTTTC
TTTGTTCGTCGATAATCATCATCATCGTATCTGGAATAAAAACAACTTTAC
C

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2E328JQ 338 0 0
TCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAGGGACG
GTAACCATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTTGGTTATA
GGCTTTACCCCCCCATTCGCTAGCCCATTTGAGGTTATGTTTGTGAAAGCTAGTGAGATA
GAGACTTCATCCAAGATTATGTTTATTATTTGAGAGAAATAAAGACCACTTAATGAAGAG
GATAAGAGTTATAACTTACGTTTAATAATAAAACTCTTTCCCTTTATGCTTCTTTCTTTG
TTTGTCGATAATCATCATCATCGTATTTGGAAAAAAAA

QA 1 338 1 338
DS 

RD RR2BB94JQ 738 0 0
TGCCACCGCAAACGCCGGACCAGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCGGCGGCAG
TTACTACGCTATCTCCGTCATCAGGGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCG
TAATGGCAACCAGTGTCCCCTCTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCAT
TCCCGTGAAATTTTCAAACTGGAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCT
CAACATCGAGATGGATGTCGAACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCAC
TCCAGCCCCCAGTCCCTGGAGATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGG
AGGAGAAGATTCTTCGAGGAGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGC
TTACAAGTTTGCATATTGTAGGGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGA
AGGTGGCGTTCGGGG*TTTGGTTATAGACTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGG
TTATGTTCGTGAAAGCTAGTGAGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAG
AGAAATAAAGACCACTTAATGAAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAAC
TCTTTCCCTTTATGCTTCTTTCTTTGTTCGTCGATAATCATCATCATCGTATCTGGAATA
AAAACAACTTTACTGTG
C

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2G145JQ 702 0 0
CCAGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCGGCGACAGTTACTACGCTATCTCCGTC
ATCAGGGGCGCTGGAGTTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCC
CTCTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAAC
TGGAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTC
GAACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGG
AGATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCTTCGAGG
AGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGT
AGGGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTT
GGTTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAG
TGAGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATTTGAGAGAAATAAAGACCACTTAA
TGAAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACTCTTTCCCTTTATGCTTCT
TTCTTTGTTCGTCGATAATCATCATCATCGTATCTGGAATAA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2GY22JQ 701 0 0
TGCCACCGCAAACGCCGGACCAGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCGGCGGCAG
TTACTACGCTATCTCCGTCATCAGGGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCG
TAATGGCAACCAGTGTCCCCTCTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCAT
TCCCGTGAAATTTTCAAACTGGAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCT
CAACATCGAGATGGATGTCGAACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCAC
TCCAGCCCCCAGTCCCTGGAGATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGG
AGGAGAAGATTCTTCGAGGAGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGC
TTACAAGTTTGCATATTGTAGGGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGA
AGGTGGCGTTCGGGG*TTTGGTTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGG
TTATGTTCGTGAAAGCTAGTGAGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAG
CGAAATAAGGACCACTTAATGAAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAAC
TCTTTCCCTTTATGCTTCTTTCTTTGTTCGTCGATAATCAT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2C420JQ 724 0 0
TGCCACCGCAAACGCCGGACCAGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCGGCGGCAG
TTACTACGCTATCTCCGTCATCAGGGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCG
TAATGGCAACCAGTGTCCCCTCTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCAT
TCCCGTGAAATTTTCAAACTGGAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCT
CAATATCGAGATGGATGTCGAACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGCCAC
TCCAGCCCCCAGTCCCTGGAGATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGG
AGGAGAAGATTCTTCGAGGAGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGC
TTACAAGTTTGCATATTGTAGGGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGA
AGGTGGCGTTCGGGG*TTTGGTTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGG
TTATGTTCGTGAAAGCTAGTGAGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAG
AGAAATAAAGACCACTTAATGAAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAAC
TCTTTCCCTTTATGCTTCTTTCTTTGTTCGTCGATAATCATCATCATCGTATCTGGAATA
AAAA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2GM71JQ 514 0 0
GG
GAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGAACCTACGTTTTGCGCTGAGTCAACT
TATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAGATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCT
AAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTTTTCGAGGAGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGT
GAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAGGGACGGTAACGATTGCACCGATGTC
GGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTTGGTTATAGGCTCTACCCCACCATTCGC
TAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAGTGAGATAGAGACTTCATCCAAGATTAT
GTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTAATGAAGAGGATAAGAGTTATAACTTACG
TCTAATAATAAAACTCTTTCCCTTTATGCTTCTTTCTTTGTTCGTCGATAATCATCATCA
TCGTATCTGGAATAAAAACAACTTTACTGTGT

QA 3 514 3 514
DS 

RD RR2GM71TF 514 0 0
GG
GAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGAACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACT
TATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAGATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCT
AAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCTTCGAGGAGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGT
GAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAGGGACGGTAACGATTGCACCGATGTC
GGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTTGGTTATAGGCTCTACCCCACCATTCGC
TAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAGTGAGATAGAGACTTCATCCAAGATTAT
GTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTAATGAAGAGGATAAGAGTTATAACTTACG
TCTAATAATAAAACTCTTTCCCTTTATGCTTCTTTCTTTGTTCGTCGATAATCATCATCA
TCGTATCTGGAATAAAAACAACTTTACTGTGT

QA 3 514 3 514
DS 

RD RR2DX18TF 686 0 0
G
GTGAATGGTGATATCATATTCGGCGGCAGTTACTACGCTATCTCCGTCATCAGGGGCGCT
GGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCTCTTTATCGGA
CAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTTCCGTGAAATTTTCAAACTGGAGGTCTAGA
GTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGAACCTACGTTC
TGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAGATCGTTGTTC
ATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCTTCGAGGAGTTTCTTCCAG
ATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAGGGACGGTAAC
GATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTTGGTTATAGGCTC
TACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAGTGAGATAGAGAC
TTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTAATGAAGAGGATAA
GAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACTCTTTCCCTTTATGCTTCTTTCTTTGTTCGT
CGATA*TCATCATCATCGTATCTGG

QA 2 686 2 686
DS 

RD RR2GI80JQB 746 0 0
TGCCACCGCAAACGCCGGACCAGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCCACGGCAG
TTACTACGTTGTCCCCGTCATCAGGGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCG
TAATGGCAACCAGTGTCCCCTCTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCAT
TCCCGTGAAATTTTCAAACTGGAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCT
CAACATCGAGATGGATGTCGAACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCAC
TCCAGCCCCCAGTCCCTGGAGATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGG
AGGAGAAGATTCGTCGAGGAGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGC
TTACAAGTTTGCATATTGTAGGGACGGTAACCATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGA
AGGTGGCGTTCGGGG*TTTGGTTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGG
TTATGTTCGTGAAAGCTAGTGAGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAG
AGAAATAAAGACCACTTAATGAAGAGGATAATAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAAC
TCTTTCCCTTTATGCTTCTTTCTTTGTTCGTCGATGATCATCATCATCGTATCTGGAATA
AAAACAACTTTACTGTGTTTCTTTG
T

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2DX18JQ 717 0 0
G
GTGAATGGTGATATCATATTCGGCGGCAGTTACTACGCTATCTCCGTCATCAGGGGCGCT
GGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCTCTTTATCGGA
CAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTTCCGTGAAATTTTCAAACTGGAGGTCTAGA
GTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGAACCTACGTTC
TGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAGATCGTTGTTC
ATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCTTCGAGGAGTTTCTTCCAG
ATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAGGGACGGTAAC
GATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGG*TTTGGTTATAGGCTC
TACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAGTGAGATAGAGAC
TTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTAATGAAGAGGATAA
GAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACTCTTTCCCTTTATGCTTCTTTCTTTGTTCGT
CGATAATCATCATCATCGTATCTGGAATAAAAACAGCTTTACTGTGTTTCTTTGTT

QA 2 717 2 717
DS 



CO CL24Contig3 847 2 2 U
GGGTCCAGGTAACACTCAAATCCATCAACTAAATAAACACAAAAAAAAAGAAGAAGATGA
ATCCTATGTTTTACTTACTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCG
GGCCAGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCGGCGGCAGTTACTACGCTATCTCCG
TCATCAGTGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTC
CCCTCTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTTAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTCTCAA
ACTGGAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCAAGATGGATG
TCGAACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGCCCCT
GGAGATCGTATTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCGTCGA
GGAGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGCAAACCTTAACGCTTACAAGTTTGCATATT
GTAGGGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGGTT
TGGTTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTGTGTTCGTGAAAGCTA
GTGAGACAGGGGCTTCATCCGAGTTTATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTA
ATGAAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACTCTATCCCTTTATGCTGT
TTTCTTTGTTCGTCAATCACCATCATCATCGTATGTGGAATAAAACATCTTTACTTTGTT
TCTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2B617TF U 1
AF RR2B617JQ C 39
BS 1 846 RR2B617TF
BS 847 847 RR2B617JQ

RD RR2B617TF 847 0 0
GGGTCCAGGTAACACTCAAATCCATCAACTAAATAAACACAAAAAAAAAGAAGAAGATGA
ATCCTATGTTTTACTTACTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCG
GGCCAGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCGGCGGCAGTTACTACGCTATCTCCG
TCATCAGTGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTC
CCCTCTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTTAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTCTCAA
ACTGGAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCAAGATGGATG
TCGAACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGCCCCT
GGAGATCGTATTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCGTCGA
GGAGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGCAAACCTTAACGCTTACAAGTTTGCATATT
GTAGGGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGGTT
TGGTTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTGTGTTCGTGAAAGCTA
GTGAGACAGGGGCTTCATCCGAGTTTATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTA
ATGAAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACTCTATCCCTTTATGCTGT
TTTCTTTGTTCGTCAATCACCATCATCATCGTATGTGGAATAAAACATCTTTACTTTGTT
TCTTTG
C

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR2B617JQ 809 0 0
ACAAAAAAAAAGAAG
AAGATGAATC*TATGTTTTACTTACTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCA
AACGCCGGGCCAGTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCGGCGGCAGTTACTACGCT
ATCTCCGTCATCAGTGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAAC
CAGTGTCCCCTCTTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTTAGGAGGGGCATTCCCGTGAAA
TTCTCAAACTGGAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCAAG
ATGGATGTCGAACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCC
AGCCCCTGGAGATCGTATTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGAT
TCGTCGAGGAGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGCAAACCTTAACGCTTACAAGTTT
GCATATTGTAGGGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTT
CGGGGTTTGGTTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTGTGTTCGTG
AAAGCTAGTGAGACAGGGGCTTCATCCGAGTTTATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGA
CCACTTAATGAAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACTCTATCCCTTT
ATGCTGTTTTCTTTGTTCGTCAATCACCATCATCATCGTATGTGGAATAAAACATCTTTA
CTTTGTTTCTTTGC

QA 16 809 16 809
DS 



CO CL24Contig4 739 4 5 U
GGATCCAGGTAACATTCAAATCTCATCAACTAAATAAACTCAAAAAAAAAGATGAATCCT
ATGTTTTACTTCCTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACCA
GTTCTCGACGTGAATGGTGATATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCC
GTGAAATTTTCAAACTGGAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAAC
ATCGAGATGGATGTCGAACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCA
GCCCCCAGTCCCTGGAGATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGA
GAAGATTCTTCGAGGAGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTAC
AAGTTTGCATATTG*TAGGGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGG
TGGCGTTCGGGG***TTTGGTTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGT
TATGTTCGTGAAAGCTAGTGAGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAGA
GAAATAAAGACCACTTAATGAAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACT
CTTTCCCTTTATGCTTCTTTCTTTGTTCGTCGATAATCATCATCATCGTATCTGGAATAA
AAACAACTTTACTGTGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 

AF RR2B153TF U 164
AF RR2FJ26JQ C 1
AF RR2G503JQ C 249
AF RR2FJ26TF U 1
BS 1 695 RR2FJ26TF
BS 696 696 RR2FJ26JQ
BS 697 722 RR2FJ26TF
BS 723 723 RR2FJ26JQ
BS 724 739 RR2FJ26TF

RD RR2B153TF 485 0 0
TCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAACTGGAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCG
AATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGAACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTT
ATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAGATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTA
AGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCTTCGAGGAGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTG
AAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGGTAGGGACGGTAACGATTGCACCGATGTC
GGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTCGGGGGGTTTGGGTTATAGGCTCTACCCCACCATTC
CCTAGCCCATTCGAGGTTATGTTCGTGAAAGCTAGTGAGATAGAGACTTCATCCAAGATT
ATGTCTATTATCTGAGAGAAATAAAGACCACTTAATGA*GAGGATAAGAGTTATAACTTA
CGTCT

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2FJ26JQ 739 0 0
GGATCCAGGTAACATTCAAATCTCATCAACTAAATAAACTCAAAAAAAAAGATGAATCCT
ATGTTTTACTTCCTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACCA
GTTCTCGACGTGAATGGTGATATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCC
GTGAAATTTTCAAACTGGAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAAC
ATCGAGATGGATGTCGAACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCA
GCCCCCAGTCCCTGGAGATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGA
GAAGATTCTTCGAGGAGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTAC
AAGTTTGCATATTG*TAGGGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGG
TGGCGTTCGGGG***TTTGGTTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGT
TATGTTCGTGAAAGCTAGTGAGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATTTGAGA
GAAATAAAGACCACTTAATGAAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACT
CTTTCCCTTTATGCTTCTTTCTTTGTTCGTCGATAATCATCATCATCGTATCTGGAATAA
AAACAACTTTACTGTGTTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2G503JQ 488 0 0
GGATGTCGAACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAG
TCCCTGGAGATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTC
TTCGAGGAGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGC
ATATTG*TAGGGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGGTGGCGTTC
GGGG***TTTGGTTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTATGTTCG
TGAAAGCTAGTGAGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATTTGAGAGAAATAAA
GACCACTTAATGAAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACTCTTTCCCT
TTATGCTTCTTTCTTTGTTCGTCGATAATCATCATC***GTATCTGGAATAAAAACAACT
TTACTGTG

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2FJ26TF 739 0 0
GGATCCAGGTAACATTCAAATCTCATCAACTAAATAAACTCAAAAAAAAAGATGAATCCT
ATGTTTTACTTCCTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACCA
GTTCTCGACGTGAATGGTGATATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCC
GTGAAATTTTCAAACTGGAGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAAC
ATCGAGATGGATGTCGAACCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCA
GCCCCCAGTCCCTGGAGATCGTTGTTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGA
GAAGATTCTTCGAGGAGTTTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTAC
AAGTTTGCATATTG*TAGGGACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAGAAACGAGGAAGG
TGGCGTTCGGGG***TTTGGTTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGT
TATGTTCGTGAAAGCTAGTGAGATAGAGACTTCATCCAAGATTATGTCTATTATCTGAGA
GAAATAAAGACCACTTAATGAAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACT
CTTTCCCTTTATGCTTCTTTCTTTGTTCGTCGATA*TCATCATCATCGTATCTGGAATAA
AA*CAACTTTACTGTGTTT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 2 31

CO CL25Contig1 1079 5 6 U
GGACTAATCCAATCTTATTATTATCACAAACTTGATACAAAGCAACGGACTAAAATTTCA
AGAAGCCAATAAATTGATACAAAGCAACGGACTAAAATTTCAAGAAGCCAATAAACAACA
TTTTTTATCACATAAACTTATCTTAGTTAATATCTCACAAAACAAAACAAAGAACTTTAT
AACTTGCCGTATTATTGTCTTGGCTCTCTTAAATTCACATAACAACAAATTTAAATATAT
GAATAAATACGTTTTCAAGTCTTATCAATCACATTTAATTAAATCATGGGATGCCAATGA
TTGGTAAAAAAGGAAAGAAGCTAGCAGGGGGGAATCCAAAACCTCCTGTCCCCGGAAAGT
TAACAGTCTTCGAATCTCCGATCATATTTCCGACATTATCGACCGTTGGTTTGGGGCATG
AAAGAGAGAAGGAAAGTGGGTTTGAGGTAATAAGAACCTTGGTGTCGTGTTTGGACTTAA
CTAGTTCAGAGACCATGTTGTGTTTGTGAGCATAAAGTTGTTCAGGACCTCCC*AAGATC
TTTGCAAGACAGTTCATGGAGTGTTTTTT*GTCAGTGGTTGGAAGCACTGACCGGAAAGT
TCCGTCAGAAGCTGCCATTGCGGTTATTGGTTTCTTCTCTCCGTCGCACTTAAGGAGAAA
CTTAACGCCTGAAAAATAAATTACTCATATATAAACTACATTTTCTATGGTAGAAACAAA
AAACTAAGCTGAAAATATGAATTTATAAAAAAAAGTGCCAAGAAACTTATACAATATTTA
ACTCACCCTTCTAAAACGTTTAAGCAAAACTCTACGAAAAACATGAAATAAGATGCATTG
AAATCCAAGTGGTTAACTAGCAAAAAGAGTAGACCTGAGAAGTCGAAATCGCTGTGGCAG
TCAAGGCAAGAGACCTTGCCAATGACAAGGGTTGAAGCTGAGAGCTCGAAGTTGGAGAAG
ACAGCCAAAACGAAAAGGAAGAATGCTGCAACAGCTGCTTGATTTGCCATTGATGAACTT
CAAATTTAAAACAAGAGTTTATGGATTTGATGGCTTTAGACTTATTGTCTGAGTGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ58JQ U 215
AF RR2GO28TF C 530
AF RR2A770JQ U 105
AF RR2AJ42JQ U 1
AF RR2AJ42TF C 345
BS 1 211 RR2AJ42JQ
BS 212 212 RR2A770JQ
BS 213 307 RR2AJ42JQ
BS 308 308 RR2A770JQ
BS 309 816 RR2AJ42JQ
BS 817 1079 RR2AJ42TF

RD RR2AJ58JQ 150 0 0
TCACATAACAACAAATTTAAATATATGAATAAATACGTTTTCAAGTCTTATCAATCACAT
TTAATTAAATCATGGGATGCCAATGATTGGTAAAAAAGGAAAGAAGCTAGCAGGGGGGAA
TCCAAAACCTCCTGTCCCCGGAAAGTTAAC

QA 1 150 1 150
DS 

RD RR2GO28TF 103 0 0
TCCC*AAGATCTTTGCAAGACAGTTCATGGAGTGTTTTTTTGTCAGTGGTTGGAAGCACT
GACCGGAAAGTTCCGTCAGAAGCTGCCATTGCGGTTATTGGTT

QA 1 103 1 103
DS 

RD RR2A770JQ 568 0 0
AAGCCAATAAACAACATTTTTTATCACATAAACTTATCTTAGTTAATATCTCACAAAACA
AAACAAAGAACTTTATAACTTGCCGTATTATTGTCTTGGCTCTCTTAAATTCACATAACA
ACAAATTTAAATATATGAATAAATACGTTTTCAAGTCTTATCAATCACATTTAATTAAAT
CATGGGATGCCAATGATTGGTAAAAAGGGAAAGAAGCTAGCAGGGGGGAATCCAAAACCT
CCTGTCCCCGGAAAGTTAACAGTCTTCGAATCTCCGATCATATTTCCGACATTATCGACC
GTTGGTTTGGGGCATGAAAGAGAGAAGGAAAGTGGGTTTGAGGTAATAAGAACCTTGGTG
TCGTGTTTGGACTTAACTAGTTCAAAAACCATGTTGTGTTTGTGAGCATAAAGTTGTTCA
GGACCTCCC*AAGATCTTTGCAAGACAGTTCATGGAGTGTTTTTT*GTCAGTGGTTGGAA
GCACTGACCGGAAAGTTCCGTCAGAAGCTGCCATTGCGGTTATTGGTTTCTTCTCTCCGT
CGCACTTAAGGAGAAACTTAACGCCTGA

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2AJ42JQ 816 0 0
GGACTAATCCAATCTTATTATTATCACAAACTTGATACAAAGCAACGGACTAAAATTTCA
AGAAGCCAATAAATTGATACAAAGCAACGGACTAAAATTTCAAGAAGCCAATAAACAACA
TTTTTTATCACATAAACTTATCTTAGTTAATATCTCACAAAACAAAACAAAGAACTTTAT
AACTTGCCGTATTATTGTCTTGGCTCTCTTAGATTCACATAACAACAAATTTAAATATAT
GAATAAATACGTTTTCAAGTCTTATCAATCACATTTAATTAAATCATGGGATGCCAATGA
TTGGTAAGAAAGGAAAGAAGCTAGCAGGGGGGAATCCAAAACCTCCTGTCCCCGGAAAGT
TAACAGTCTTCGAATCTCCGATCATATTTCCGACATTATCGACCGTTGGTTTGGGGCATG
AAAGAGAGAAGGAAAGTGGGTTTGAGGTAATAAGAACCTTGGTGTCGTGTTTGGACTTAA
CTAGTTCAGAGACCATGTTGTGTTTGTGAGCATAAAGTTGTTCAGGACCTCCC*AAGATC
TTTGCAAGACAGTTCATGGAGTGTTTTTT*GTCAGTGGTTGGAAGCACTGACCGGAAAGT
TCCGTCAGAAGCTGCCATTGCGGTTATTGGTTTCTTCTCTCCGTCGCACTTAAGGAGAAA
CTTAACGCCTGAAAAATAAATTACTCATATATAAACTACATTTTCTATGGTAGAAACAAA
AAACTAAGCTGAAAATATGAATTTATAAAAAAAAGTGCCAAGAAACTTATACAATATTTA
ACTCACCCTTCTAAAACGTTTAAGCAAAACTCTACG

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR2AJ42TF 735 0 0
CCTGTCCCGGGAAAGTTAACAGTCTTCGAATCTCCGATCATATTTCCGACATTATCGACC
GTTGGTTTGGGGCATGAAAGAGAGAAGGAAAGTGGGTTTGAGGTAATAAGAACCTTGGTG
TCGTGTTTGGACTTAACTAGTTCAGAGACCATGTTGTGTTTGTGAGCATAAAGTTGTTCA
GGACCTCCCCAAGATCTTTGCAAGACAGTTCATGGAGTGTTTTTT*GTCAGTGGTTGGAA
GCACTGACCGGAAAGTTCCGTCAGAAGCTGCCATTGCGGTTATTGGTTTCTTCTCTCCGT
CGCACTTAAGGAGAAACTTAACGCCTGAAAAATAAATTACTCATATATAAACTACATTTT
CTATGGTAGAAACAAAAAACTAAGCTGAAAATATGAATTTATAAAAAAAAGTGCCAAGAA
ACTTATACAATATTTAACTCACCCTTCTAAAACGTTTAAGCAAAACTCTACGAAAAACAT
GAAATAAGATGCATTGAAATCCAAGTGGTTAACTAGCAAAAAGAGTAGACCTGAGAAGTC
GAAATCGCTGTGGCAGTCAAGGCAAGAGACCTTGCCAATGACAAGGGTTGAAGCTGAGAG
CTCGAAGTTGGAGAAGACAGCCAAAACGAAAAGGAAGAATGCTGCAACAGCTGCTTGATT
TGCCATTGATGAACTTCAAATTTAAAACAAGAGTTTATGGATTTGATGGCTTTAGACTTA
TTGTCTGAGTGACCC

QA 1 735 1 735
DS 



CO CL25Contig2 952 26 11 U
GGCATATATGGGTCACTCAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTT
TTAAATTTGAAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGT
TTTGGCTGTCTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTC
TTGCCTTGACTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGA
CGGAGAGAAGAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCT
TCCAACCACTGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGA
ACAACTTTATGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACAC
CAAGGTTCTTATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGT
CGATAATGTCGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAG
GTTTTGGATTCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGAT
TTAATTAAATGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTG
TTATGTGAATCTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTCTTTGTTTTG
TTTTGTGAGATATTAACTAAGATAAGTTTATGTGATAAAAAATGTTGTTTATTGGCTTCT
TGAAATTTTAGTCCGTTGCTTTGTATCAATTTATTGGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGTTG
CTTTGTATCAAGTTTGTGATAATAATAAGATTGGATTAGTCCAACAAAGTTGTAATTACG
ACTGAAATGTCATCTTTGTATGTAATTTAACGTAGGTTTAATCTACAAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 60 60 60 65 65 40 40 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 
97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 30 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ58TF U 24
AF RR2BX74TF U 10
AF RR2DW19TF U 13
AF RR2FH36TF U 9
AF RR2CQ18JQ C 10
AF RR2CQ18TF U 8
AF RR2DO96JQ C 63
AF RR2F440TF U 10
AF RR2H575TF U 15
AF RR2AO83TF U 10
AF RR2DW19JQ C 172
AF RR2GY53TF U 17
AF RR2B048TF U 1
AF RR2AO83JQ C 10
AF RR2H575JQB C 63
AF RR2GY53JQ C 212
AF RR2BF23TF U 17
AF RR2AD16JQ C 10
AF RR2FH36JQ C 227
AF RR2AD16TF U 10
AF RR2AB34JQ C 16
AF RR2AB34TF U 17
AF RR2BF23JQ C 137
AF RR2F440JQ C 234
AF RR2C971TF U 723
AF RR2BX74JQ C 453
BS 1 9 RR2B048TF
BS 10 11 RR2FH36TF
BS 12 241 RR2B048TF
BS 242 242 RR2FH36TF
BS 243 756 RR2B048TF
BS 757 848 RR2AD16TF
BS 849 850 RR2AB34TF
BS 851 851 RR2C971TF
BS 852 860 RR2AB34TF
BS 861 897 RR2C971TF
BS 898 952 RR2BX74JQ

RD RR2AJ58TF 397 0 0
ATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTGAAGTTCATCAATGG
CAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGTTGTCTTCTCCAACTTCG
AGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGACTGCCACAGCGATT
TCAACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAAGAAACCAATAACCG
CAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACCACTGACAAAAAACACT
CCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATGCTCACAAACACA
ACATGGTCTCTGAACTAATTAAGTCCAAACACGACAC

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR2BX74TF 544 0 0
GGGTCACTCAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTG
AAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGT
CTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGA
CTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAA
GAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACCAC
TGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTA
TGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCT
TATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCGACGGTCGATAATGT
CGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCCCGGGGACAGGAGGTTTTGGAT
TCCC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2DW19TF 623 0 0
GG
ACTCAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTGAAGTT
CATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGTCTTCT
CCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGACTGCC
ACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAAGAAAC
CAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACCACTGACA
AAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATGCCC
ACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCTTATTA
CCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCGATAATGTCGGAA
ATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCCA
CCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTGA
TTGATAAGACTTGAAAACGTA

QA 3 623 3 623
DS 

RD RR2FH36TF 683 0 0
G
GGGTCACTCAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTG
AAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCTTTTTGGCTGT
CTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGA
CTGCCTCAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAA
GAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACCAC
TGACAAAAAACGCTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGATCCTGAACAACTTTA
TGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCT
TATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCGATAATGT
CGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGAT
TCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAA
TGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAA
TCTAAGAGAGCCAAGACAATAA

QA 2 683 2 683
DS 

RD RR2CQ18JQ 701 0 0
ATGTCACTCAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCCCATAAACTCTTGTTTTAAATTTG
AAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGT
CTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGA
CTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAA
GAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACCAC
TGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTA
TGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCT
TATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCGATAATGT
CGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGAT
TCCCCCCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCACCCCATGATTTAATTAAA
TGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAA
TCTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2CQ18TF 703 0 0
GG
ATGTCACTCAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTG
AAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGT
CTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGA
CTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAA
GAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACCAC
TGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTA
TGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCT
TATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCGATAATGT
CGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGAT
TCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCACCCCATGATTTAATTAAA
TGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAA
TCTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTT

QA 3 703 3 703
DS 

RD RR2DO96JQ 651 0 0
AAATTTGAAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTT
TGGCTGTCTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTT
GCCTTGACTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACG
GAGAGAAGAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTC
CAACCACTGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAAC
AACTTTATGCTCACAAACACAACATGGTTTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCA
AGGTTCTTATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCG
ATAATGTCGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGT
TTTGGATTCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTT
AATTAAATGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTT
ATGTGAATCTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTC
CC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2F440TF 673 0 0
GGGTCACTCAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTG
AAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGT
CTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGA
CTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAA
GAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACCAC
TGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTA
TGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCT
TATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCGATAATGT
CGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*CGGGACAGGAGGTTTTGGAT
TCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAA
TGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAA
TCTAAGAGAGCCA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2H575TF 677 0 0
GG
TCAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTGAAGTTCA
TCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGTCTTCTCC
AACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGACTGCCAC
AGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAAGAAACCA
ATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACCACTGACAAA
AAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATGCTCAC
AAGCACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCTTATTACC
TCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCGATAATGTCGGAAAT
ATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCCACC
TGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTGATT
GATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAATCTAAGA
GAGCCAAGACAATAA

QA 3 677 3 677
DS 

RD RR2AO83TF 682 0 0
GGGTCACTCAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTG
AAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGT
CTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGA
CTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAA
GAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTACTTCCAACCAC
TGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTA
TGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCT
TATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCGATAATGT
CGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGAT
TCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAA
TGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAA
TCTAAGAGAGCCAAGACAATAA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2DW19JQ 533 0 0
CAAGGTCTCTTGCCTTGACTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCT
TAAGTGCGACGGAGAGAAGAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCG
GTCAGTGCTTCCAACCACTGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGG
AGGTCCTGAACAACTTTATGCCCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAA
ACACGACACCAAGGTTCTTATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAA
ACCAACGGTCGATAATGTCGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GG
GGACAGGAGGTTTTGGATTCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCA
TCCCATGATTTAATTAAATGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTA
AATTTGTTGTTATGTGAATCTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTAT

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2GY53TF 674 0 0
GGAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTGAAGTTCA
TCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGTCTTCTCC
AACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGACTGCCAC
AGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAAGAAACCA
ATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAATGCTTCCAACCACTGACAAA
AAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATGCTCAC
AAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCTTATTACC
TCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCGATAATGTCGGAAAT
ATGACCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCCACC
TGCTAGCTTCTTTCCTTTTTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTGATT
GATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAATCTAAGA
GAGCCAAGACA
TAA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2B048TF 756 0 0
GGCATATATATGTCACTCAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTT
TTAAATTTGAAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGT
TTTGGCTGTCTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTC
TTGCCTTGACTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGA
CTGAGAGAAGAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCT
TCCAACCACTGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGA
ACAACTTTATGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACAC
CAAGGTTCTTATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGT
CGATAATGTCGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAG
GTTTTGGATTCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGAT
TTAATTAAATGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTG
TTATGTGAATCTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTCTTTGTTTTG
TTTTGTGAGATATTAACTAAGATAAGTTTATGTGAT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2AO83JQ 768 0 0
GGGTCACTCAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTG
AAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGT
CTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGA
CTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAA
GAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTACTTCCAACCAC
TGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTA
TGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCT
TATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCGATAATGT
CGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGAT
TCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAA
TGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAA
TCTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTCTTTGTTTTGTTTTGTGAG
ATATTAACTAAGATAAGTTTATGTGATAAAAAATGTTGTTTATTGGC
G

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2H575JQB 693 0 0
AAATTTGAAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTT
TGGCTGTCTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTT
GCCTTGACTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACG
GAGAGAAGAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTC
CAACCACTGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAAC
AACTTTATGCTCACAAGCACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCA
AGGTTCTTATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCG
ATAATGTCGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGT
TTTGGATTCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTT
AATTAAATGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTT
ATGTGAATCTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTCTTTGTTTTGTT
TTGTGAGATATTAACTAAGATAAGTTTATGTGA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2GY53JQ 543 0 0
TCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAAGAAACCAATAACCGCAATGGCA
GCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAATGCTTCCAACCACTGACAAAAAACACTCCATGAAC
TGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATGCTCACAAACACAACATGGTC
TTTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCTTATTACCTCAAACCCACTTTCC
TTCTTTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCGATAATGTCGGAAATATGACCGGAGATTCG
AAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCCACCTGCTAGCTTCTTTCC
TTTTTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTGATTGATAAGACTTGAAAA
CGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAATCTAAGAGAGCCAAGACAATAA
TACGGCAAGTTATAAAGTTCTTTGTTTTGTTTTGTGAGATATTAACTAAGATAAGTTTAT
GTG

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2BF23TF 804 0 0
GGAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTGAAGTTCA
TCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGTCTTCTCC
AACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGACTGCCAC
AGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGGGAAGAAACCA
ATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACCACTGACAAA
AAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATGCTCAC
AAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCTTATTACC
TCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATCCCCCAAACCAACGGTCGATAATGTCGGAAAT
ATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCCACC
TGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTGATT
GATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAATCTAAGA
GAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTCTTTGTTTTGTTTTGTGAGATATTAA
CTAAGATAAGTTTATGTGATAAAAAATGTTGTTTATTGGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGT
TGCTTTGTATCAATTTATTGGCTT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2AD16JQ 888 0 0
GGGTCACTCAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTG
AAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGT
CTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGA
CTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAA
GAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCGGTGCTTCCAACCAC
TGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCGAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTA
TGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACAACACCAAGGTTCT
TATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCGATAATGT
CGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTGAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGAT
TCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAA
TGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAA
TCTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTCTTTGTTTTGTTTTGTGAG
ATATTAACTAAGATAAGTTTATGTGATAAAAAATGTTGTTTATTGGCTTCTTGAAATTTT
AGTCCGTTGCTTTGTATCAATTTATTGGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGTTGCTTTGTATC
AAGTTTGTGATAATAATAAGATTGGATTAGTCCAACAAAGTTGTAAT
C

QA 1 887 1 887
DS 

RD RR2FH36JQ 669 0 0
CTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAAGAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACT
TTCCGGTCAGTGCTTCCAACCACTGACAAAAAACGCTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATC
TTGGGAGATCCTGAACAACTTTATGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAG
TCCAAACACGACACCAAGGTTCTTATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGC
CCCAAACCAACGGTCGATAATGTCGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTT
CC*GGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCAT
TGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATAT
ATTTAAATTTGTTGTTATGTGAATCTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAA
AGTTCTTTGTTTTGTTTTGTGAGATATTAACTAAGATAAGTTTATGTGATAAAAAATGTT
GTTTATTGGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGTTGCTTTGTATCAATTTATTGGCTTCTTGAA
ATTTTAGTCCGTTGCTTTGTATCAAGTTTGTGATAATAATAAGATTGGATTAGTCCAACA
AAGTTGTA
G

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2AD16TF 839 0 0
GGGTCACTCAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTG
AAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGT
CTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGA
CTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAA
GAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCGGTGCTTCCAACCAC
TGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCGAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTA
TGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACAACACCAAGGTTCT
TATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCGATAATGT
CGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTGAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGAT
TCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAA
TGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAA
TCTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTCTTTGTTTTGTTTTGTGAG
ATATTAACTAAGATAAGTTTATGTGATAAAAAATGTTGTTTATTGGCTTCTTGAAATTTT
AGTCCGTTGCTTTGTATCAATTTATTGGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGTTGCTTTGTAT

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR2AB34JQ 878 0 0
G
GGAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTGAAGTTCA
TCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGTCTTCTCC
AACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGACTGCCAC
AGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAAGAAACCA
ATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACCACTGACAAA
AAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATTCTCAC
AAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCTTATTACC
TCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCGATAATGTCGGAAAT
ATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCCACC
TGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTGATT
GATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAATCTAAGA
GAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTCTTTGTTTTGTTTTGTGAGATATTAA
CTAAGATAAGTTTATGTGATAAAAAATGTTGTTTATTGGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGT
TGCTTTGTATCAATTTATTGGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGTTGCTTTGTATCAAGTTTG
TGATAATAATAAGATTGGATTAGTCCAACAAAGTTGT

QA 2 878 2 878
DS 

RD RR2AB34TF 844 0 0
GGAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCC*ATAAACTCTTGTTTTAAATTTGAAGTTCA
TCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGTCTTCTCC
AACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGACTGCCAC
AGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAAGAAACCA
ATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACCACTGACAAA
AAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATTCTCAC
AAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCTTATTACC
TCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGTCGATAATGTCGGAAAT
ATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCCACC
TGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTGATT
GATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAATCTAAGA
GAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTCTTTGTTTTGTTTTGTGAGATATTAA
CTAAGATAAGTTTATGTGATAAAAAATGTTGTTTATTGGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGT
TGCTTTGTATCAATTTATTGGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGTTGCTTTGTATCA*GTTTG
TGAT

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR2BF23JQ 764 0 0
AACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGACTGCCAC
AGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGGGAAGAAACCA
ATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACCACTGACAAA
AAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATGCTCAC
AAACACAACATGGTCTTTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCTTATTACC
TCAAACCCACTTTCCTTCTTTCTTTCATCCCCCAAACCAACGGTCGATAATGTCGGAAAT
ATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCCACC
TGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTGATT
GATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAATCTAAGA
GAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTCTTTGTTTTGTTTTGTGAGATATTAA
CTAAGATAAGTTTATGTGATAAAAAATGTTGTTTATTGGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGT
TGCTTTGTATCAATTTATTGGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGTTGCTTTGTATCAAGTTTG
TGATAATAATAAGATTGGATTAGTCCAACAAAGTTGTAATT
ACG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2F440JQ 664 0 0
AGTGCGACGGAGAGAAGAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGT
CAGTGCTTCCAACCACTGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAG
GTCCTGAACAACTTTATGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAAC
ACGACACCAAGGTTCTTATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAAC
CAACGGTCGATAATGTCGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCC*GGGG
ACAGGAGGTTTTGGATTCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATC
CCATGATTTAATTAAATGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAA
TTTGTTGTTATGTGAATCTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTCTT
TGTTTTGTTTTGTGAGATATTAACTAAGATAAGTTTATGTGATAAAAAATGTTGTTTATT
GGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGTTGCTTTGTATCAATTTATTGGCTTCTTGAAATTTTAG
TCCGTTGCTTTGTACCAAGTTTGTGATAATAATAAGATTGGATTAGTCCAACAAAGTTGT
AATT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2C971TF 182 0 0
G
TGTGAGATATTAACTAAGATAAGTTTATGTGATAAAAAATGTTGTTTATTGGCTTCTTGA
AATTTTAGTCCGTTACTTTGTATCAATTTATTGGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGTTGCTT
TGTATCAAGTTTGTGATAATAATAAGATTGGATTAGTCCAACAAAGTTGTAATT
ACGACTG

QA 2 175 2 175
DS 

RD RR2BX74JQ 500 0 0
TCTCTCTTTCATGCCCCAAACCGACGGTCGATAATGTCGGAAATATGTTCGGAGATTCGA
AGACTGTTAACTTTCC*GGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCCCCCTGCTAGCTTCTTTCCT
TTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTGATTGATAAGACTTGAAAAC
GTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAATCTAAGGGAGCCAAGACAATAAT
ACGGCAAGTTATAAAGTTCTTTGTTTTGTTTTGTGAGATATTAACTAAGATAAGTTTATG
TGATAAAAAATGTTGTTTATTGGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGTTGCTTTGTATCAATTT
ATTGGCTTCTTGAAATTTTAGTCCGTTGCTTTGTATCAAGTTTGTGATAATAACAAGATT
GGATTAGTCCAACAAAGTTGTAATTACGACTGAAATGTCATCTTTGTATGTAATTTAACG
TAGGTTTAATCTACAAATTT

QA 1 500 1 500
DS 



AS 4 29

CO CL26Contig1 817 4 7 U
GGACCTCACCAACAAAACACAATCACAAGAAACAAAAGATTCAAACAGAAACAAAAACAA
AAAATGTTGGCAATATTCCAGAAAGCATTCGCTCACCCACCGGAAGAGCTCAACAGTCCG
GCGTCTCACTCCTCCGGCAAATCCCCAAAACTCCCCGGAGAAACCCTCTCCGACTTCCTC
TCCCTCCACGAGGACACCGCTTTCTCCATGACCTTCGGCGACTCCTCCGCCGTCTTAGCC
TACTCACGCCCCGACGGCAACTCTCTTCGCAAGAGGCTGTTCTGCGGGATAGACGGGATC
TACTGTACCTTCCTCGGCACGTTAACCAACCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGGCTC
ACGGGGAAGAACACGAGCGAGGCGATGTTCGTGATCGAAGCTTACCGAACGCTGCGCGAC
CGTGGTCCTTACCCTGCTGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTTCGCCTTCGTG
GTGTACGATACTCAGACCTCCTCTGTTTTCTCGGCTCTGAGCTCCGATGGAGGGGAGAGC
CTTTACTGGGGGATCTCCGGTGATGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTATA
AAGCAAGGGTGTGCTAAATCGTTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAG
ACAGGGCTTAAGAGCTTTGAACATCCGAGAACGAGATGAAGCGATGCCGAGGATGATAGT
GAAGTGTGTTGTGTGGTGCTATTTCAAGTGGATGCTTGTGCTAAGTCATGGCATCCCTAG
AGAGGAGTGAGCTACTGGGCTCTTGCTACTCTCGTTA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY77TF U 1
AF RR2AL80TF U 1
AF RR2FI27TF U 1
AF RR2BX20TF U 31
BS 1 415 RR2AL80TF
BS 416 416 RR2FI27TF
BS 417 493 RR2AL80TF
BS 494 494 RR2FI27TF
BS 495 555 RR2AL80TF
BS 556 689 RR2FI27TF
BS 690 817 RR2BX20TF

RD RR2DY77TF 286 0 0
GGACCTCACCAACAAAACACAATCACAAGAAACAAAAGATTCAAACAGAAACAAAAACAA
AAAATGTTGGCAATATTCCAGAAAGCATTCGCTCACCCACCGGAAGAGCTCAACAGTCCG
GCGTCTCACTCCTCCGGCAAATCCCCAAAACTCCCCGGAGAAACCCTCTCCGACTTCCTC
TCCCTCCACGAGGACACCGCTTTCTCCATGACCTTCGGCGACTCCTCCGCCGTCTTAGCC
TACTCACGCCCCGACGGCAACTCTCTTCGCAAGAGGCTGTTCTGCG

QA 1 286 1 286
DS 

RD RR2AL80TF 555 0 0
GGACCTCACCAACAAAACACAATCACAAGAAACAAAAGATTCAAACAGAAACAAAAACAA
AAAATGTTGGCAATATTCCAGAAAGCATTCGCTCACCCACCGGAAGAGCTCAACAGTCCG
GCGTCTCACTCCTCCGGCAAATCCCCAAAACTCCCCGGAGAAACCCTCTCCGACTTCCTC
TCCCTCCACGAGGACACCGCTTTCTCCATGACCTTCGGCGACTCCTCCGCCGTCTTAGCC
TACTCACGCCCCGACGGCAACTCTCTTCGCAAGAGGCTGTTCTGCGGGATAGACGGGATC
TACTGTACCTTCCTCGGCACGTTAACCAACCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGGCTC
ACGGGGAAGAACACGAGCGAGGCGATGTTCGTGATCGAAGCTTACCGAACGCTGCACGAC
CGTGGTCCTTACCCTGCTGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTTCGCCTTCGTG
GTGTACGATACTCGGACCTCCTCTGTTTTCTCGGCTCTGAGCTCCGATGGAGGGGAGAGC
CTTTACTGGGGGATC

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2FI27TF 708 0 0
GGACCTCACCAACAAAACACAATCACAAGAAACAAAAGATTCAAACAGAAACAAAAACAA
AAAATGTTGGCAATATTCCAGAAAGCATTCGCTCACCCACCGGAAGAGCTCAACAGTCCG
GCGTCTCACTCCTCCGGCAAATCCCCAAAACTCCCCGGAGAAACCCTCTCCGACTTCCTC
TCCCTCCACGAGGACACCGCTTTCTCCATGACCTTCGGCGACTCCTCCGCCGTCTTAGCC
TACTCACGCCCCGACGGCAACTCTCTTCGCAAGAGGCTGTTCTGCGGGATAGACGGGATC
TACTGTACCTTCCTCGGCACGTTAACCAACCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGGCTC
ACGGGGAAGAACACGAGCGAGGCGATGTTCGTGATCGAAGCTTACCGAACGCTGCGCGAC
CGTGGTCCTTACCCTGCTGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTTCGCCTTCGTG
GTGTACGATACTCAGACCTCCTCTGTTTTCTCGGCTCTGAGCTCCGATGGAGGGGAGAGC
CTTTACTGGGGGATCTCCGGTGATGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTATA
AAGCAAGGGTGTGCTAAATCGTTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAG
ACAGGGCTTAAGAGCTTTGAACATCCGAG
ACGAGATGAAGCGATGCCG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2BX20TF 787 0 0
G
ACAAAAGATTCAAACAGAAACAAAAACAAAAAATGTTGGCAATATTCCAGAAAGCATTCG
CTCACCCACCGGAAGAGCTCAACAGTCCGGCGTCTCACTCCTCCGGCAAATCCCCAAAAC
TCCCCGGAGAAACCCTCTCCGACTTCCTCTCCCTCCACGAGGACACCGCTTTCTCCATGA
CCTTCGGCGACTCCTCCGCCGTCTTAGCCTACTCACGCCCCGACGGCAACTCTCTTCGCA
AGAGGCTGTTCTGCGGGATAGACGGGATCTACTGTACCTTCCTCGGCACGTTAACCAACC
TCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGGCTCACGGGGAAGAACACGAGCGAGGCGATGTTCG
TGATCGAAGCTTACCGAACGCTGTGCGACCGTGGTCCTTACCCTGCTGATCAAGTCCTCA
GAGGTTTAGAAGGAAGCTTCGCCTTCGTGGTGTACGATACTCAGACCTCCTCTGTTTTCT
CGGCTCTGAGCTCCGATGGAGGGGAGAGCCTTTACTGGGGGATCTCCGGTGATGGGTCTG
TTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTATAAAGCAAGGGTGTGCTAAATCGTTTGCTCCTT
TCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACAGGGCTTAAGAGCTTTGAACATCCGAGAA
CGAGATGAAGCGATGCCGAGGATGATAGTGAAGTGTGTTGTGTGGTGCTATTTCAAGTGG
ATGCTTGTGCTAAGTCATGGCATCCCTAGAGAGGAGTGAGCTACTGGGCTCTTGCTACTC
TCGTTA

QA 2 787 2 787
DS 



CO CL26Contig2 967 5 12 U
GGAGATGCAATTTAGTTTCTTTATTGATATGGCATCAAAGGTCTAATAATTACATAAAAC
AAAGCAGGTAAAAAGAAAGTCCAACAAGAGAGGAGGAGAACAACTCAA*GAGTTTTCAAT
TATAAGAAGAAAGTTAACGAGAGTTAGCAAGAGCCCAGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAG
GGATGCCATTGACCTTAGCACAAGCATCCACTTTGAAATTAGCACCACACAACACACCTT
CACTATCAATCCTCGGCATCGCCTTCATCTCGTTCCTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCC
CTGTCTCACTGTGGAACATACACCCAGTAGGGAAAGGAGCAAACGATTTAGCACACCCTT
GCTTTATGATCTTCACATCATCAGACATCACAACAGACCCATCACCGGAGATCCCCCAGT
AAAGACTCTCCCCTCCATCTGAGCTCAGAGCCGAGAAAACAGAGGACGTCTGAGTATCGT
ACACCACGAAGGCGAAGCTTCCTTCCAAACCTCTGAGGACTTGATCAGCAGGGTAAGGAC
CACGGTCGCGGAGAGTTCGGTACGCTTCGATCACGAACATCGCCTCGCTCGTGTTCTTCC
CCGCGAGTCCGTACTGCCGGTTCAGCGTGCAGAGGTTGGTTAACGTGCCGAGGAAGGTAC
AGTAGATCCCGTCTATCCCGCAGAACAGCCTCTTGCGAAGAGAGTTGCCGTCGGGGCGGG
AGTAGGCTAAGACGGCGGAGGAGGAGTCGCCGAAGGTCATCGAGAAAGCGGTGTCCTCGT
GGAGGGAGAGGAAGTCGGAGAGGGTTTCTCTCGGGAGTTTTGGGGATTTGCCGGAGGAGT
GAGACGCTGGACTGTTGAGCTCTTCCGGTGGGTGAGCGAATGCTTTCTGGAATATTGCCA
ACATTTTTGTTTTTGTTTCAATCTTTTGTTTCTTGTGTTTGTTTGTGGTTATGTTGTGTT
TGAGGTC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2FI27JQ U 91
AF RR2AL80JQ U 32
AF RR2BX20JQ U 1
AF RR2BL34JQ U 2
AF RR2BL34TF C 270
BS 1 313 RR2BX20JQ
BS 314 314 RR2BL34JQ
BS 315 367 RR2BX20JQ
BS 368 368 RR2BL34JQ
BS 369 424 RR2BX20JQ
BS 425 425 RR2BL34JQ
BS 426 439 RR2BX20JQ
BS 440 440 RR2BL34JQ
BS 441 447 RR2BX20JQ
BS 448 448 RR2BL34JQ
BS 449 453 RR2BX20JQ
BS 454 967 RR2BL34TF

RD RR2FI27JQ 103 0 0
AGGAGGAGAACAACTCAA*GAGTTTTCAATTATAAGAAGAAAGTTAACGAGAGTTAGCAA
GAGCCCAGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAGGGATGCCATTGAC

QA 1 103 1 103
DS 

RD RR2AL80JQ 377 0 0
GCATCAAAGGTCTAATAATTACATAAAACAAAGCAGGTAAAAAGAAAGTCCAACAAGAGA
GGAGGAGAACAACTCAA*GAGTTTTCAATTATAAGAAGAAAGTTAACGAGAGTTAGCAAG
AGCCCAGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAGGGATGCCATTGACCTTAGCACAAGCATCCAC
TTTGAAATTAGCACCACACAACACACCTTCACTATCAATCCTCGGCATCGCCTTCATTTC
GTTCCTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCCTGTCTCACTGTGAAACATACACCCAGTAGG
GAAAGGAGCAAACGATTTAGCACACCCTTGCTTTATAATCTTCACATCATCAGACATCAC
AACAGACCCATCACCGG

QA 1 377 1 377
DS 

RD RR2BX20JQ 453 0 0
GGAGATGCAATTTAGTTTCTTTATTGATATGGCATCAAAGGTCTAATAATTACATAAAAC
AAAGCAGGTAAAAAGAAAGTCCAACAAGAGAGGAGGAGAACAACTCAA*GAGTTTTCAAT
TATAAGAAGAAAGTTAACGAGAGTTAGCAAGAGCCCAGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAG
GGATGCCATTGACCTTAGCACAAGCATCCACTTTGAAATTAGCACCACACAACACACCTT
CACTATCAATCCTCGGCATCGCCTTCATCTCGTTCCTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCC
CTGTCTCACTGTGAAACATACACCCAGTAGGGAAAGGAGCAAACGATTTAGCACACCCTT
GCTTTATAATCTTCACATCATCAGACATCACAACAGACCCATCACCGGAGATCCCCCAGT
AAAGGCTCTCCCCTCCATCGGAGCTCAAAGCCG

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR2BL34JQ 451 0 0
A
AGATGCAATTTATTTTCTTTATTGATATGGCATCAAAGGTCTAATAATTACATAAAACAA
AGCAGGTCAAAA*AAAGTCCAACAAGAGAGGAGCAGAACAACTCAAAGAGTTTTCAATTA
TAAGAAGAAAATTAACGAGAGTTAGCAAGAGCCCAGTTAGCTTCCCTTCCTCTCCTAGGG
ATGCCATTGACCTTAGCACAAGCACCCACTTTGAAATTAGCACCACACAACACACCTTCA
CTATCAATCCTCGGCATCGCCTTCATCTCATTCCTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCCT
GTCTCACTGTGGAACATACACCCAGTAGGGAAAGGAGCAAACGATTTAGCACACCCTTGC
TTTATGATCTTCACATCATCAGACATCACAACAGACCCATCACCGGAGATCCCCCAGTAA
AGACTCTCCCCTCCATCTGAGCTCAGAGCC

QA 2 451 2 451
DS 

RD RR2BL34TF 698 0 0
CTCATT
CTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCCTGTCTCACTGTGGAACATACACCCAGTAGGGAAA
GGAGCAAACGATTTAGCACACCCTTGCTTTATGATCTTCACATCATCAGACATCACAACA
GACCCATCACCGGAGATCCCCCAGTAAAGACTCTCCCCTCCATCTGAGCTCAGAGCCGAG
AAAACAGAGGACGTCTGAGTATCGTACACCACGAAGGCGAAGCTTCCTTCCAAACCTCTG
AGGACTTGATCAGCAGGGTAAGGACCACGGTCGCGGAGAGTTCGGTACGCTTCGATCACG
AACATCGCCTCGCTCGTGTTCTTCCCCGCGAGTCCGTACTGCCGGTTCAGCGTGCAGAGG
TTGGTTAACGTGCCGAGGAAGGTACAGTAGATCCCGTCTATCCCGCAGAACAGCCTCTTG
CGAAGAGAGTTGCCGTCGGGGCGGGAGTAGGCTAAGACGGCGGAGGAGGAGTCGCCGAAG
GTCATCGAGAAAGCGGTGTCCTCGTGGAGGGAGAGGAAGTCGGAGAGGGTTTCTCTCGGG
AGTTTTGGGGATTTGCCGGAGGAGTGAGACGCTGGACTGTTGAGCTCTTCCGGTGGGTGA
GCGAATGCTTTCTGGAATATTGCCAACATTTTTGTTTTTGTTTCAATCTTTTGTTTCTTG
TGTTTGTTTGTGGTTATGTTGTGTTTGAGGTC

QA 7 698 7 698
DS 



CO CL26Contig3 981 18 12 U
GGAATTGATAAGAGTTCACTATTTGCAATATAAAAGTGCTTTTGCTTCTTCATTGATGTA
ACACTAAAGATGCTATTTACACAAAAGAAGTAGGTAAAAATAAAATGCAACAAAGACAAA
AGAACCAACTCAACAACTGAATAAAAAAA*GAAGAGATTAACTTGAATTAGCGAGAGCCC
AGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAGGGATGGCATTGACCTT*ACTACAAGCATCCACTTTG
AAGTTAGCTCCACATATCACACCTTCACTGTCAATCCTCTGCATCGCTTTCATCTTCTTC
TTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCCTGTCTCACTGTGAAACATACACCC*AGTAGGGAA
AGGAGCAAATGACTTAGCACATCCTTGCTTTATGATCTTCAAATCATCAGACATCAAAA*
CAGACCCGTCATCCCCGGAGATTCCCCAGTAAAGACTCTCTCCTCCATCAGAGCTCAAAG
CTGAGAAAACAGAGGAGGTTTGAGTATCGTAGACAACGAAGGCGTAGCTTCCTTCTAAAC
CTCTGAGGACTTGATCTGCAGGGTAAGGACCACGGTCACGGAGTGTTCGGTATGCTTCGA
TCACAAACATGGCCTCGTTCGTGTTCTTCCCCGTGAGTCCGTACTGTCGGTTCAACGTGC
AGAGATTGCTTAACCTCCCAAGAAACATACAGTAGACTCCGTCTATCCCACAGAACAACC
TCTGACGAAGAGAATTGTTGGGACGGGAGTAAGCTAAGACGGCGGAGTCACCGAAGTTCA
TGGAGAAAGCTGTGTCCTTGTGGAGGGAGAGGAAGTCGGAGAGAGTTTCTCTGGGAAGTT
TTGGGGTTTTGCCGGAGAAATGAGGCGCCGGGCTGTTGAGCTCCTCCGGTGGGTGAGCAA
ACGCTTTCTGAAATATTGCCAACATTTTGATCAAAGTTTGAATCTTTTGTTGTTGTTGGT
TTGTTGTTGTAATGTCCCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 35 65 65 70 70 70 70 70 70 55 70 
70 70 45 70 70 70 70 55 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 45 70 70 70 55 70 70 70 45 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 
70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 40 60 60 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 70 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 
65 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 65 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 35 35 10 10 10 10 

AF RR2FM92JQ U 25
AF RR2DH74JQ U 1
AF RR2EX13JQ U 30
AF RR2E077JQ U 30
AF RR2DZ64JQ U 30
AF RR2F236JQ U 25
AF RR2GX59JQ U 25
AF RR2BH12JQ U 38
AF RR2C909JQ U 45
AF RR2BH12TF C 171
AF RR2EX13TF C 153
AF RR2FM92TF C 174
AF RR2E077TF C 244
AF RR2A859TF C 266
AF RR2DZ64TF C 610
AF RR2C909TF C 290
AF RR2DH74TF C 315
AF RR2F236TF C 315
BS 1 264 RR2DH74JQ
BS 265 265 RR2F236JQ
BS 266 435 RR2DH74JQ
BS 436 436 RR2F236JQ
BS 437 520 RR2DH74JQ
BS 521 742 RR2F236JQ
BS 743 809 RR2BH12JQ
BS 810 834 RR2C909JQ
BS 835 973 RR2BH12TF
BS 974 975 RR2EX13TF
BS 976 977 RR2FM92TF
BS 978 981 RR2A859TF

RD RR2FM92JQ 413 0 0
GC
AATATAAAAGTGCTTTTGCTTCTTCATTGATGTAACACTAAAGATGCTATTTACACAAAA
GAAGTAGGTAAAAATAAAATGCAACAAAGACAAAAGAACCAACTCAACAACTGAATAAAA
AAA*GAAGAAATTAACTTGAATTAGCGAGAGCCCAGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAGGG
ATGGCATTGACCTT*ACTACAAGCATCCACTTTGAAGTTAGCTCCACATATCACACCTTC
ACTGTCAATCCTCTGCATCGCTTTCATCTTCTTCTTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCC
TGTCTCACTGTGAAACATACACCC*AGTAGGGAAAGGAGCAAATGACTTAGCACATCCTT
GCTTTATGATCTTCAAATCATCAGGCATCAAAA*CAGACCCGTCATCCCCG

QA 3 413 3 413
DS 

RD RR2DH74JQ 520 0 0
GGAATTGATAAGAGTTCACTATTTGCAATATAAAAGTGCTTTTGCTTCTTCATTGATGTA
ACACTAAAGATGCTATTTACACAAAAGAAGTAGGTAAAAATAAAATGCAACAAAGACAAA
AGAACCAACTCAACAACTGAATAAAAAAA*GAAGAGATTAACTTGAATTAGCGAGAGCCC
AGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAGGGATGGCATTGACCTT*ACTACAAGCATCCACTTTG
AAGTTAGCTCCACATATCACACCTCCACTGTCAATCCTCTGCATCGCTTTCATCTTCTTC
TTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCCTGTCTCACTGTGAAACATACACCC*AGTAGGGAA
AGGAGCAAATGACTTAGCACATCCTTGCTTTATGATCTTCAAATCATCAGACATCAAAA*
CAGACCCGTCATCCC*GGAGATTCCCCAGTAAAGACTCTCTCCTCCATCAGAGCTCAAAG
CTGAGAAAACAGAGGAGGTTTGAGTATCGTAGACAACGAA

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2EX13JQ 564 0 0
ATAAAAGTGCTTTTGCTTCTTCATTGATGTAACACTAAAGATGCTATTTACACAAAAGAA
GTAGGTAAAAATAAAATGCAACAAAGACAAAAGAACCAACTCAACAACTGAATAAAAAAA
AGAAGAGATTAACTTGAATTAACGAGAGCCCAGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAGGGATG
GCATTGACCTT*ACTACAAGCATCCACTTTGAAGTTAGCTCCACATATCACACCTTCACT
GTCAATCCTCTGCATCGCTTTCATCTTCTTCTTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCCTGT
CTCACTGTGAAACATACACCC*AGTAGGGAAAGGAGCAAATGACTTAGCACATCCTTGCT
TTATGATCTTCAAATCATCAGACATCAAAA*CAGACCCGTCATCCCCGGAGATTCCCCAG
TAAAGACTCTCTCCTCCATCAGAGCTCAAAGCTGAGAAAACAGAGGAGGTTTGAGTATCG
TAGACAACGAAGGCGTAGCTTCCTTCTAAACCTCTGAGGACTTGATCTGCAGGGTAAGGA
CCACGGTCACGGAGTGTTCGGTAT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2E077JQ 623 0 0
ATAAAAGTGCTTTTGCTTCTTCATTGATGTAACACTAAAGATGCTATTTACACAAAAGAA
GTAGGTAAAAATAAAATGCAACAAAGACAAAAGAACCAACTCAACAACTGAATAAAAAAA
*GAAGAGATTAACTTGAATTAGCGAGAGCCCAGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAGGGATG
GCATTGACCTT*ACTACAAGCATCCACTTTGAAGTTAGCTCCACATATCACACCTTCACT
GTCAATCCTCTGCATCGCTTTCATCTTCTTCTTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCCTGT
CTCACTGTGAAACATACACCC*AGTAGGGAAAGGAGCAAATGACTTAGCACATCCTTGCT
TTATGATCTTCAAATCATCAGACATCAAAA*CAGACCCGTCATCCCCGGAGATTCCCCAG
TAAAGACTCTCTCCTCCATCAGAGCTCAAAGCTTAAAAAACAGAGGAGGTTTGAGTATCG
TAGACAACGAAGGCGTAGCTTCCTTCTAAACCTCTGAGGACTTGATCTGCAGGGTAAGGA
CCATGGTCACGGAGTGTTCGGTATGCTTCGATCACAAACATGGCCTCGTTCGCGTTCTTC
CCCGTGAGTCCGTACTGTCGGTT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2DZ64JQ 639 0 0
ATAAAAGTGCTTTTGCTTCTTCATTGATGTAACACTAAAGATGTTATTTACACAAAAGAA
GTAGGTAAAAATAAAATGCAACAAAGACAAAAGAACCAACTCAACAACTGAATAAAAAAA
*GAAGAGATTAACTTGAATTAGCGAGAGCCCAGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAGGGATG
GCATTGACCTT*ACTACAAGCATCCACTTTGAAGTTAGCTCCACATATCACACCTTCACT
GTCAATCCTCTGCATCGCTTTCATCTTCTTCTTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCCTGT
CTCACTGTGAAACATACAACC*AGTAGGGAAAGGAGCAAATGACTTAGCACATCCTTGCT
TTATGATCTTCAAATCATCAGACATCAAAA*CAGACCCGTCATCCCCGGAGATTCCCCAG
TAAAGACTCTCTCCTCCATCAGAGCTCAAAGCTGAGAAAACAGAGGAGGTTTGAGTATCG
TAGACAACGAAGGCGTAGCTTCCTTCTAAACCTCTGAGGACTTGATCTGCAGGGTAAGGA
CCACGGTCACGGAGTGTTCGGTATGCTTCGATCACAAACACGGCCTCGTTCGTGTTCTTC
CCCGTGAGTCCGTACTGTCGGTTCAACGTGCAGAGATTG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2F236JQ 718 0 0
GC
AATATAAAAGTGCTTTTGCTTCTTCATTGATGTAACACTAAAGATGCTATTTACACAAAA
GAAGTAGGTAAAAATAAAATGCAACAAAGACAAAAGAACCAACTCAACAACTGAATAAAA
AAA*GAAGAGATTAACTTGAATTAGCGAGAGCC*AGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAGGG
ATGGCATTGACCTT*ACTACAAGCATCCACTTTGAAGTTAGCTCCACATATCACACCTTC
ACTGTCAATCCTCTGCATCGCTTTCATCTTCTTCTTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCC
TGTCTCACCGTGAAACATACACCC*AGTAGGGAAAGGAGCAAATGACTTAGCACATCCTT
GCTTTATGATCTTCAAATCATCAGACATCAAAA*CAGACCCGTCATCCCCGGAGATTCCC
CAGTAAAGACTCTCTCCTCCATCAGAGCTCAAAGCTGAGAAAACAGAGGAGGTTTGAGTA
TCGTAGACAACGAAGGCGTAGCTTCCTTCTAAACCTCTGAGGACTTGATCTGCAGGGTAA
GGACCACGGTCACGGAGTGTTCGGTATGCTTCGATCACAAACATGGCCTCGTTCGTGTTC
TTCCCCGTGAGTCCGTACTGTCGGTTCAACGTGCAGAGATTGCTTAACCTCCCAAGAAAC
ATACAGTAGACTCCGTCTATCCCACAGAACAACCTCTGACGAAGAGAATTGTTGGG

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR2GX59JQ 717 0 0
GT
AATATAAAAGTGCTTTTGCTTCTTCATTGATGTAACACTAAAGATGCTATTTACACAAAA
GAAGTAGGTAAAAATAAAATGCAACAAAGACAAAAGAACCAACTCAACAACTGAATAAAA
AAA*GAAGAGATTAACTTGAATTAGCGAGAGCCCAGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAGGG
ATGGCATTGACCTT*ACTACAAGCATCCACTTTGAAGTTAGCTCCACATATCACACCTTC
ACTGTCAATCCTCTGCATCGCTTTCATCTTCTTCTTCGGATGCTCAAAGCTCTTAAGCCC
TGTCTCACTGTGAAACATACACCC*AGTAGAGAAAGGAGCAAATGACTTAGCACATCCTT
GCTTTATGATCTTCAAATCATCAGACATCAAAA*CAGACCCGTCATCCCCGGAGATTCCC
CAGTAAAGACTCTCTCCTCCATCAGAGCTCAAAGCTGAGAAAACAGAGGAGGTTTGAGTA
TCGTAGACAACGAAGGCGTAGCTTCCTTCTAAACCTCTGAGGACTTGATCTGCAGGGTAA
GGACCACGGTCACGGAGTGTTCGGTATGCTTCGATCACAAACATGGCCTCGTTCGTGTTC
TTCCCCGTGAGTCCGTACTGTCGGTTCAACGTGCAGAGATTGCTTAACCTCCCAAGAAAC
ATACAGTAGACTCCGTCTATCCCACAGAACAACCTCTGACGAAGAGAATTGTTGG

QA 3 717 3 717
DS 

RD RR2BH12JQ 772 0 0
GCTTTTGCTTCTTCATTGATGTAACACTAAAGATGCTATTTACACAAAAGAAGTAGGTAA
AAATAAAATGCAACAAAGACAAAAGAACCAACTCAACAACTGAATAAAAAAA*GAAGAGA
TTAACTTGAATTAGCGAGAGCCCAGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAGGGATGGCATTGAC
CTT*ACTACAAGCATCCACTTTGAAGTTAGCTCCACATATCACACCTTCACTGTCAATCC
TCTGCATCGCTTTCATCTTCTTCTTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCCTGTCTCACTGT
GAAACATACACCC*AGTAGGGAAAGGAGCAAATGACTTAGCACATCCTTGCTTTATGATC
TTCAAATCATCAGACATCAAAA*CAGACCCGTCATCCCCGGAGATTCCCCAGTAAAGACT
CTCTCCTCCATCAGAGCTCAAAGCTGAGAAAACAGAGGAGGTTTGAGTATCGTAGACAAC
GAAGGCGTAGCTTCCTTCTAAACCTCTGAGGACTTGATCTGCAGGGTAAGGACCACGGTC
ACGGAGTGTTCGGTATGCTTCGATCACAAACATGGCCTCGTTCGTGTTCTTCCCCGTGAG
TCCGTACTGTCAGTTCAACGTGCAGAGATTGCTTAACCTCCCAAGAAACATACAGTAGAC
TCCGTCTATCCCACAGAACAACCTCTGACGAAGAGAATTGTTGGGACGGGAGTAAGCTAA
GACGGCGGAGTCACCGAAGTTCATGGAGAAAGCTGTGTCCTTGTGGAGGGAG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2C909JQ 790 0 0
CTTCTTCATTGATGTTACACTAAAGATGCTATTTACACAAAAGAAGTAGGTAAAAATAAA
ATGCAACAAAGACAAAAGAACCAACTCAACAACTGAATAAAAAAA*GAAGAAATTAACTT
GAATTAGCGAGAGCCCAGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAGGGATGGCATTGACCTT*ACT
ACAAGCATCCACTTTGAAGTTAGCTCCACATATCACACCTTCACTGTCAATCCTCTGCAT
CGCTTTCATCTTCTTCTTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCCTGTCTCACTGTGAAACAT
ACACCC*AGTAGGGAAAGGAGCAAATGACTTAGCACATCCTTGCTTTATGATCTTCAAAT
CATCAGACATCAAAA*CAGACCCGTCATCCCCGGAGATTCCCCAGTAAAGACTCTCTCCT
CCATCAGAGCTCAAAGCTGAAAAAACAGAGGAGGTTTGAGTATCGTAGACAACGAAGGCG
TAGCTTCCTTCTAAACCTCTGAGGACTTGATCTGCAGGGTAAGGACCACGGTCACGGAGT
GTTCGGTATGCTTCGATCACAAACATGGCCTCGTTCGTGTTCTTCCCCGTGAGTCCGTAC
TGTCGGTTCAACGTGCAGAGATTGCTTAACCTCCCAAGAAACATACAGTAGACTCCGTCT
ATCCCACAGAACAACCTCTGACGAAGAGAATTGTTGGGACGGGAGTAAGCTAAGACGGCG
GAGTCACCGAAGTTCATGGAGAAAGCTGTGTCCTTGTGGAGGGAGAGGAAGTCGGAGAGA
GTTTCTCTGG

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2BH12TF 805 0 0
GCGAGAGCCCAGTTAGCTTCACTTCCTCTCCTAGGGATGGCATTGACCTTTACTACAAGC
ATCCACTTTGAAGTTAGCTCCACATATCACACCTTCACTGTCAATCCTCTGCATCGCTTT
CATCTTCTTCTTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCCTGTCTCACTGTGAAACATACACCC
*AGTAGGGAAAGGAGCAAATGACTTAGCACATCCTTGCTTTATGATCTTCAAATCATCAG
ACATCAAAA*CAGACCCGTCATCCCCGGAGATTCCCCAGTAAAGACTCTCTCCTCCATCA
GAGCTCAAAGCTGAGAAAACAGAGGAGGTTTGAGTATCGTAGACAACGAAGGCGTAGCTT
CCTTCTAAACCTCTGAGGACTTGATCTGCAGGGTAAGGACCACGGTCACGGAGTGTTCGG
TATGCTTCGATCACAAACATGGCCTCGTTCGTGTTCTTCCCCGTGAGTCCGTACTGTCAG
TTCAACGTGCAGAGATTGCTTAACCTCCCAAGAAACATACAGTAGACTCCGTCTATCCCA
CAGAACAACCTCTGACGAAGAGAATTGTTGGGACGGGAGTAAGCTAAGACGGCGGAGTCA
CCGAAGTTCATGGAGAAAGCTGTGTCCTTGTGGAGGGAGAGGAAGTCGGAGAGAGTTTCT
CTGGGAAGTTTTGGGGTTTTGCCGGAGAAATGAGGCGCCGGGCTGTTGAGCTCCTCCGGT
GGGTGAGCAAACGCTTTCTGAAATATTGCCAACATTTTGATCAAAGTTTGAATCTTTTGT
TGTTGTTGGTTTGTTGTTGTAAT
CC

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2EX13TF 828 0 0
AGAAGAGATTACTG
ATTAACGAGAGCCCAGT*AGCTTCACT*CCTCTC*TAGG*ATGGCAT*GACCTT*ACTAC
AAGCATCCACTT*GAAGTTAGCTCCACATATCACAC*TTCACTGTCAATCCTCTGCATCG
CTTTCATCTTCTTCTTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCCTGTCTCACTGTGAAACATAC
ACCC*AGTAGGGAAAGGAGCAAATGACTTAGCACATCCTTGCTTTATGATCTTCAAATCA
TCAGACATCAAAA*CAGACCCGTCATCCCCGGAGATTCCCCAGTAAAGACTCTCTCCTCC
ATCAGAGCTCAAAGCTGAGAAAACAGAGGAGGTTTGAGTATCGTAGACAACGAAGGCGTA
GCTTCCTTCTAAACCTCTGAGGACTTGATCTGCAGGGTAAGGACCACGGTCACGGAGTGT
TCGGTATGCTTCGATCACAAACATGGCCTCGTTCGTGTTCTTCCCCGTGAGTCCGTACTG
TCGGTTCAACGTGCAGAGATTGCTTAACCTCCCAAGAAACATACAGTAGACTCCGTCTAT
CCCACAGAACAACCTCTGACGAAGAGAATTGTTGGGACGGGAGTAAGCTAAGACGGCGGA
GTCACCGAAGTTCATGGAGAAAGCCGTGTCCTTGTGGAGGGAGAGGAAGTCGGAGAGAGT
TTCTCTGGGAAGTTTTGGGGTTTTGCCGGAGAAATGAGGCGCCGGGCTGTTGAGCTCCTC
CGGTGGGTGAGCAAACGCTTTCTGAAATATTGCCAACATTTTGATCAAAGTTTGAATCTT
TTGTTGTTGTTGGTTTGTTGTTGTAATGT
GGAGC

QA 15 823 15 823
DS 

RD RR2FM92TF 804 0 0
AGAGCCCAGT*AGCT*CACT*CCTCTC*TAGG*ATG*CAT*GAC*TT*ACTACAAGCATC
CACTT*GAAGTTAGCTCCACATATCACAC**TCACTGTCAATC*TCTGCATCGCTTTCAT
CT*CTTCTTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCC*TGTCTCACTGTGAAACATACACCC*AG
TAGGGAAAGGAGCAAATGACTTAGCACATCCTTGCTTTATGATCTTCAAATCATCAGGCA
TCAAAA*CAGACCCGTCATCCCCGGAGATTCCCCAGTAAAGACTCTCTCCTCCATCAGAG
CTCAAAGCTGAGAAAACAGAGGAGGTTTGAGTATCGTAGACAACGAAGGCGTAGCTTCCT
TCTAAACCTCTGAGGACTTGATCTGCAGGGTAAGGACCACGGTCACGGAGTGTTCGGTAT
GCTTCGATCACAAACATGGCCTCGTTCGTGTTCTTCCCCGTGAGTCCGTACTGTCGGTTC
AACGTGCAGAGATTGCTTAACCTCCCAAGAAACATACAGTAGACTCCGTCTATCCCACAG
AACAACCTCTGACGAAGAGAATTGTTGGGACGG*AGTAAGCTAAGACGGCGGAGTCACCG
AAGTTCATGGAGAAAGCTGTGTCCTTGTGGAGGGAGAGGAAGTCGGAGAGAGTTTCTCTG
GGAAGTTTTGGGGTTTTGCCGGAGAAATGAGGCGCCGGGCTGTTGAGCTCCTCCGGTGGG
TGAGCAAACGCTTTCTGAAATATTGCCAACATTTTGATCAAAGTTTGAATCTTTTGTTGT
TGTTGGTTTGTTGTTGTAATGTCC

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2E077TF 734 0 0
G
TAGCTCCACATATCACAC*TTCACTGTCA*TCCTCTGCATCGCTTTCATCT*CTTCTTCG
GATGTTCAAAGCTCTTAAGCC*TGTCTCACTGTGAAACATACACCC*AGTAGGGAAAGGA
GCAAATGACTTAGCACATCCTTGCTTTATGATCTTCAAATCATCAGACATCAAAA*CAGA
CCCGTCATCCCCGGAGATTCCCCAGTAAAGACTCTCTCCTCCATCAGAGCTCAAAGCTTA
GAAAACAGAGGAGGTTTGAGTATCGTAGACAACGAAGGCGTAGCTTCCTTCTAAACCTCT
GAGGACTTGATCTGCAGGGTAAGGACCATGGTCACGGAGTGTTCGGTATGCTTCGATCAC
AAACATGGCCTCGTTCGCGTTCTTCCCCGTGAGTCCGTACTGTCGGTTCAACGTGCAGAG
ATTGCTTAACCTCCCAAGAAACATACAGTAGACTCCGTCTATCCCACAGAACAACCTCTG
ACGAAGAGAATTGTTGGGACGGGAGTAAGCTAAGACGGCGGAGTCACCGAAGTTCATGGA
GAAAGCTGTGTCCTTGTGGAGGGAGAGGAAGTCGGAGAGAGTTTCTCTGGGAAGTTTTGG
GGTTTTGCCGGAGAAATGAGGCGCCGGGCTGTTGAGCTCCTCCGGTGGGTGAGCAAACGC
TTTCTGAAATATTGCCAACATTTTGATCAAAGTTTGAATCTTTTGTTGTTGTTGGTTTGT
TGTTGTAATGTCC

QA 2 734 2 734
DS 

RD RR2A859TF 716 0 0
CACTGTCAATCCTCTGCATCGCTTTCATCTTCTTCTTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCC
CTGTCTCACTGTGAAACATACACCCCAGTAGGGAAAGGAGCAAATGACTTAGCACATCCT
TGCTTTATGATCTTCAAATCATCAGACATCAAAAACAGACCCGTCATCCCCGGAGATTCC
CCAGTAAAGACTCTCTCCTCCATCAGAGCTCAAAGCTGAGAAAACAGAGGAGGTTTGAGT
ATCGTAGACAACGAAGGCGTAGCTTCCTTCTAAACCTCTGAGGACTTGATCTGCAGGGTA
AGGACCACGGTCACGGAGTGTTCGGTATGCTTCGATCACAAACATGGCCTCGTTCGTGTT
CTTCCCCGTGAGTCCGTACTGTCGGTTCAACGTGCAGAGATTGCTTAACCTCCCAAGAAA
CATACAGTAGACTCCGTCTATCCCACAGAACAACCTCTGACGAAGAGAATTGTTGGGACG
GGAGTAAGCTAAGACGGCGGAGTCACCGAAGTTCATGGAGAAAGCTGTGTCCTTGTGGAG
GGAGAGGAAGTCGGAGAGAGTTTCTCTGGGAAGTTTTGGGGTTTTGCCGGAGAAATGAGG
CGCCGGGCTGTTGAGCTCCTCCGGTGGGTGAGCAAACGCTTTCTGAAATATTGCCAACAT
TTTGATCAAAGTTTGAATCTTTTGTTGTTGTTGGTTTGTTGTTGTAATGTCCCCCT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2DZ64TF 368 0 0
C
GGCCTCGTTCGTGTTCTTCCCCGTGAGTCCGTACTGTCGGTTCAACGTGCAGAGATTGCT
TA*CCTCCCAAGAAACATACAGTAGACTCCGTCTATCCCACAGAACAACCTCTGACGGAG
AGAATTGTTGGGACGGGAGTAAGCTAAGACGGCGGAGTCACCGAAGTTCATGGAGAAAGC
TGTGTCCTTGTGGAGGGAGAGGAAGTCGGAGAGAGTTTCTCTGGGAAGTTTTGGGGTTTT
GCCGGAGAAATGAGGCGCCGGGCTGTTGAGCTCCTCCGGTGGGTGAGCAAACGCTTTCTG
AAATATTGCCAACATTTTGATCAAAGTTTGAATCTTTTGTTGTTGTTGGTTTGTTGTTGT
AATGTCC

QA 2 368 2 368
DS 

RD RR2C909TF 688 0 0
TCATCTTCTTCTTCGGATGTTCAAAGCTCTTAAGCCCTGTCTCACTGTGAAACATACACC
C*AGTAGGGAAAGGAGCAAATGACTTAGCACATCCTTGCTTTATGATCTTCAAATCATCA
GACATCAAAA*CAGACCCGTCATCCCCGGAGATTCCCCAGTAAAGACTCTCTCCTCCATC
AGAGCTCAAAGCTGAGAAAACAGAGGAGGTTTGAGTATCGTAGACAACGAAGGCGTAGCT
TCCTTCTAAACCTCTGAGGACTTGATCTGCAGGGTAAGGACCACGGTCACGGAGTGTTCG
GTATGCTTCGATCACAAACATGGCCTCGTTCGTGTTCTTCCCCGTGAGTCCGTACTGTCG
GTTCAACGTGCAGAGATTGCTTAACCTCCCAAGAAACATACAGTAGACTCCGTCTATCCC
ACAGAACAACCTCTGACGAAGAGAATTGTTGGGACGGGAGTAAGCTAAGACGGCGGAGTC
ACCGAAGTTCATGGAGAAAGCTGTGTCCTTGTGGAGGGAGAGGAAGTCGGAGAGAGTTTC
TCTGGGAAGTTTTGGGGTTTTGCCGGAGAAATGAGGCGCCGGGCTGTTGAGCTCCTCCGG
TGGGTGAGCAAACGCTTTCTGAAATATTGCCAACATTTTGATCAAAGTTTGAATCTTTTG
TTGTTGTTGGTTTGTTGTTGTAATGTCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2DH74TF 663 0 0
GCTCTTAAGCCCTGTCTCACTGTGAAACATACACCC*AGTAGGGAAAGGAGCAAATGACT
TAGCACATCCTTGCTTTATGATCTTCAAATCATCAGACATCAAAA*CAGACCCGTCATCC
C*GGAGATTCCCCAGTAAAGACTCTCTCCTCCATCAGAGCTCAAAGCTGAGAAAACAGAG
GAGGTTTGAGTATCGTAGACAACGAAGGCGTAGCTTCCTTCTAAACCTCTGAGGACTTGA
TCTGCAGGGTAAGGACCACGGTCACGGAGTGTTCGGTATGCTTCGATCACAAACATGGCC
TCGTTCGTGTTCTTCCCCGTGAGTCCGTACTGTCGGTTCAACGTGCAGAGATTGCTTAAC
CTCCCAAGAAACATACAGTAGACTCCGTCTATCCCACAGAACAACCTCTGACGAAGAGAA
TTGTTGGGACGGGAGTAAGCTAAGACGGCGGAGTCACCGAAGTTCATGGAGAAAGCTGTG
TCCTTGTGGAGGGAGAGGAAGTCGGAGAGAGTTTCTCTGGGAAGTTTTGGGGTTTTGCCG
GAGAAATGAGGCGCCGGGCTGTTGAGCTCCTCCGGTGGGTGAGCAAACGCTTTCTGAAAT
ATTGCCAACATTTTGATCAAAGTTTGAATCTTTTGTTGTTGTTGGTTTGTTGTTGTAATG
TCC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2F236TF 661 0 0
GCTCTTAAGCCCTGTCTCACCGTGAAACATACACCC*AGTAGGGAAAGGAGCAAATGACT
TAGCACATCCTTGCTTTATGATCTTCAAATCATCAGACATCAAAA*CAGACCCGTCATCC
CCGGAGATTCCCCAGTAAAGACTCTCTCCTCCATCAGAGCTCAAAGCTGAGAAAACAGAG
GAGGTTTGAGTATCGTAGACAACGAAGGCGTAGCTTCCTTCTAAACCTCTGAGGACTTGA
TCTGCAGGGTAAGGACCACGGTCACGGAGTGTTCGGTATGCTTCGATCACAAACATGGCC
TCGTTCGTGTTCTTCCCCGTGAGTCCGTACTGTCGGTTCAACGTGCAGAGATTGCTTAAC
CTCCCAAGAAACATACAGTAGACTCCGTCTATCCCACAGAACAACCTCTGACGAAGAGAA
TTGTTGGGACGGGAGTAAGCTAAGACGGCGGAGTCACCGAAGTTCATGGAGAAAGCTGTG
TCCTTGTGGAGGGAGAGGAAGTCGGAGAGAGTTTCTCTGGGAAGTTTTGGGGTTTTGCCG
GAGAAATGAGGCGCCGGGCTGTTGAGCTCCTCCGGTGGGTGAGCAAACGCTTTCTGAAAT
ATTGCCAACATTTTGATCAAAGTTTGAATCTTTTGTTGTTGTTGGTTTGTTGTTGTAAT
CC

QA 1 659 1 659
DS 



CO CL26Contig4 747 2 3 U
TAAACAAAGCAGGTCAAAGAAAGTCCAACAAGAGAGGAGCAGAACAACTCAAAGAGTTTC
AATTATAAGAAGAAAATTAACGAGAGTTAGCAAGAGCCCAGTTAGCTTCACTTCCTCTCC
TAGGGATGCCATTGACCTTAGCACAAGCATCCACTTTGAAATTAGCACCACACAACACAC
CTTCACTATCAATCCTCGGCATCGCCTTCATCTCATTCCCCGGATGTTCAAAGCTCTTAA
GCCCTGTCTCATGTGGAATATACACCCAGTAGGGAAAGGAGCAAACGATTTAGCACACCC
TTGCTTTATGATCTTCACATCATCAGACATCACAACAGACCCATCACCGGAGATCCCCCA
GTAAAGACTCTCCCCTCCATCTGAGCTCGGAGCCGAGAAAACAGAGGACGTCTGAGTATC
GTACACCACGAAGGTACAGTAGATCCCGTCTATCCCGCAGAACAGCCTCTTGCGAAGAGA
GTTGCCGTCGGGGCGGGAGTAGGCTAAGACGGCGGAGGAGGAGTCGCCGAAGGTCATCGA
GAAAGAGGTGTCCTCGTGGAGGGAGAGGAAGTCGGAGAGGGTTTCTCTCGGGAGTTTTGG
GGATTTGCCGGAGGAGTGAGACGCTGGACTGTTGAGCTCTTCCGATGGGTGAGCGAATGC
TTTCTGGAATATTGCCAACATTTTTGTTTTTGTTTCAATCTTTTGTTTCTTGTGTTTGTT
TGTGGTTATGTTGTGTTTGAGGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F952JQ U 180
AF RR2F952TF C 1
BS 1 179 RR2F952TF
BS 180 325 RR2F952JQ
BS 326 747 RR2F952TF

RD RR2F952JQ 146 0 0
CCTTCACTATCAATCCTCGGCATCGCCTTCATCTCATTCCCCGGATGTTCAAAGCTCTTA
AGCCCTGTCTCATGTGGAATATACACCCAGTAGGGAAAGGAGCAAACGATTTAGCACACC
CTTGCTTTATGATCTTCACATCATCA

QA 1 146 1 146
DS 

RD RR2F952TF 747 0 0
TAAACAAAGCAGGTCAAAGAAAGTCCAACAAGAGAGGAGCAGAACAACTCAAAGAGTTTC
AATTATAAGAAGAAAATTAACGAGAGTTAGCAAGAGCCCAGTTAGCTTCACTTCCTCTCC
TAGGGATGCCATTGACCTTAGCACAAGCATCCACTTTGAAATTAGCACCACACAACACAC
CTTCACTATCAATCCTCGGCATCGCCTTCATCTCATTCCCCGGATGTTCAAAGCTCTTAA
GCCCTGTCTCATGTGGAATATACACCCAGTAGGGAAAGGAGCAAACGATTTAGCACACCC
TTGCTTTATGATCTTCACATCATCAGACATCACAACAGACCCATCACCGGAGATCCCCCA
GTAAAGACTCTCCCCTCCATCTGAGCTCGGAGCCGAGAAAACAGAGGACGTCTGAGTATC
GTACACCACGAAGGTACAGTAGATCCCGTCTATCCCGCAGAACAGCCTCTTGCGAAGAGA
GTTGCCGTCGGGGCGGGAGTAGGCTAAGACGGCGGAGGAGGAGTCGCCGAAGGTCATCGA
GAAAGAGGTGTCCTCGTGGAGGGAGAGGAAGTCGGAGAGGGTTTCTCTCGGGAGTTTTGG
GGATTTGCCGGAGGAGTGAGACGCTGGACTGTTGAGCTCTTCCGATGGGTGAGCGAATGC
TTTCTGGAATATTGCCAACATTTTTGTTTTTGTTTCAATCTTTTGTTTCTTGTGTTTGTT
TGTGGTTATGTTGTGTTTGAGGTGTCC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 30

CO CL27Contig1 460 30 1 U
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT


BQ
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 20 

AF RR2AX27TFB U 1
AF RR2DR77TF U 1
AF RR2AP60TF U 1
AF RR2GQ51JQ C 68
AF RR2G556JQ C 51
AF RR2G556TF U 51
AF RR2GQ51TF U 51
AF RR2AX27JQ C 1
AF RR2DU66TF U 1
AF RR2DU66JQ C 85
AF RR2F664TF U 1
AF RR2BM06JQ C 1
AF RR2GU60JQB C -1
AF RR2FZ47JQ C 1
AF RR2FZ47TF U 1
AF RR2GU60TF U -1
AF RR2BZ71TF U 1
AF RR2GU57TF U 1
AF RR2H681JQB C 1
AF RR2H681TF U 1
AF RR2AS52JQ C 1
AF RR2EY20JQ C 1
AF RR2AS52TF U 1
AF RR2EY20TF U 1
AF RR2F664JQ C 1
AF RR2DJ12TF U 1
AF RR2C206TF U 1
AF RR2C206JQ C 1
AF RR2BM06TF U 1
AF RR2DR77JQ C 1
BS 1 460 RR2AP60TF

RD RR2AX27TFB 277 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTACTATTTCCCATGTTAATCTACC

QA 1 277 1 277
DS 

RD RR2DR77TF 339 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
T*ACTTACCGTTTCTTGTGTG*TTATAATTTGCATTAAA

QA 1 339 1 339
DS 

RD RR2AP60TF 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2GQ51JQ 386 0 0
GCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGTAAGCAAAGTTGTGC
GAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAAGATTCAG
TGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGCTCACAAG
TGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGTTTACTTA
CCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGACCTCA
TGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTATGTTGATT
TGTCTTAATAAAATATAAACATTTGC

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR2G556JQ 403 0 0
TGGTCGCCCTTCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGG
TGTAAGCAAAGTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATA
ACGCATGCAAGATTCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATG
TGTTCCCTGCTCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGT
GCTTGTATGTTTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGT
CACTATGAGTGACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACG
AATATTCTATGTTGATTTGTCTTAATAAAATATAAACATTTGC

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2G556TF 403 0 0
TGGTCGCCCTTCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGG
TGTAAGCAAAGTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATA
ACGCATGCAAGATTCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATG
TGTTCCCTGCTCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGT
GCTTGTATGTTTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGT
CACTATGAGTGACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACG
AATATTCTATGTTGATTTGTCTTAATAAAATATAAACATTTGC

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2GQ51TF 403 0 0
TGGTCGCCCTTCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGG
TGTAAGCAAAGTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATA
ACGCATGCAAGATTCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATG
TGTTCCCTGCTCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGT
GCTTGTATGTTTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGT
CACTATGAGTGACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACG
AATATTCTATGTTGATTTGTCTTAATAAAATATAAACATTTGC

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2AX27JQ 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TTTTTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTACTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2DU66TF 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAG*GGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGG
AT

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2DU66JQ 366 0 0
TGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAAGTTGTGCGAGAGGTCAAG*GGAAC
ATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAAGAATCAGTGCATTCGACTTGAAGG
AGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGCTCACAAGTGTATTTGCTATTTCCC
ATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGTTTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTT
ATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGACCTCATGACATGTAGCAGATAT
GTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTATGTTGGTTTGTTTTAATAAAATATA
AACATT

QA 1 366 1 366
DS 

RD RR2F664TF 452 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTG

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2BM06JQ 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTTTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATTTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2GU60JQB 461 0 0
GGAC
ACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCTTC
TTTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAAGT
TGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAAGA
ATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGCTC
ACAAGTGTATTTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGTTT
ACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAACTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGA
CCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTATGT
TGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGG

QA 5 461 5 461
DS 

RD RR2FZ47JQ 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCACTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTGGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2FZ47TF 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCACTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTGGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2GU60TF 461 0 0
GGAC
ACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCTTC
TCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAAGT
TGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAAGA
ATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGCTC
ACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGTTT
ACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAACTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGA
CCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTATGT
TGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGG

QA 5 461 5 461
DS 

RD RR2BZ71TF 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCCTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2GU57TF 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGATCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2H681JQB 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGTATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2H681TF 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGTATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2AS52JQ 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2EY20JQ 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2AS52TF 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2EY20TF 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2F664JQ 459 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGG
C

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2DJ12TF 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2C206TF 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2C206JQ 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2BM06TF 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2DR77JQ 460 0 0
GGACACACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATGGTCGCCCT
TCTCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAA
GTTGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAA
GAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGC
TCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAACAATCGTTGGTGCTTGTATGT
TTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATAATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGT
GACCTCATGACATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTAT
GTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATTTGTCTTGGGT

QA 1 460 1 460
DS 



AS 4 27

CO CL28Contig1 808 3 9 U
GGAACAACATCTCATCTTTGCTTATTTCTCTCCTTTGTTTTTCTGTTTGGAGTTAAGATA
ACAAAAAAAGAATGGCTACATCAGCAATCCAACACTCCTCTTTCGCCGGTCAAACGGCTT
TGAAGCCCTATAACGATCTCCTCCGCAAAGTAGGTGCTTCCAACGGTGGTGGACGCGTCG
TCATGCGCCGTACCGTCAAGTCTACTCCTCAGAGCATCTGGTACGGACCAGACCGTCCCA
AGTACTTAGGACCATTCTCGGAGAACACACCATCATACCTAACCGGTGAGTACCCCGGAG
ACTACGGTTGGGACACCGCTGGTCTCTCCGCTGACCCAGAAACCTTTGCAAAGAACCGTG
AGCTCGAAGTAATCCACAGCAGATGGGCAATGTTAGGAGCTTTAGGCTGCACATTCCCAG
AGATTCTCTCCAAAAACGGTGTCAAATTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAGGTTCTC
AGATCTTCTCAGAAGGAGGGCTTGATTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCATGCGCAAA
GCATTTTAGCTATCTGGGCTTCTCAAGTTGTGCTTATGGGCTTAATCGAAGGGTACAGAA
TCGGAGGTGGACCTCTTGGTGAAGGTCTTGACCCGCTTTACCCGGG*TGGGGCGTTTGAC
CCGTTGAACTTAGCCGAGGACCCGGAGGCATTTTCAGAATTGAAAGCGAAGAGCTCAAGA
ATGGTCGTCTTGCATGTTCTCATGTTTGGATTCTTTGTGCAGCTATTGTTACTGGTAAAG
TCCATAGAGATCTGTTCGATCATGTTGC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO20TF U 1
AF RR2H655TF U 1
AF RR2BZ09TF U 2
BS 1 646 RR2BO20TF
BS 647 647 RR2H655TF
BS 648 684 RR2BO20TF
BS 685 687 RR2H655TF
BS 688 688 RR2BZ09TF
BS 689 706 RR2H655TF
BS 707 707 RR2BZ09TF
BS 708 708 RR2H655TF
BS 709 808 RR2BZ09TF

RD RR2BO20TF 684 0 0
GGAACAACATCTCATCTTTGCTTATTTCTCTCCTTTGTTTTTCTGTTTGGAGTTAAGATA
ACAAAAAAAGAATGGCTACATCAGCAATCCAACACTCCTCTTTCGCCGGTCAAACGGCTT
TGAAGCCCTATAACGATCTCCTCCGCAAAGTAGGTGCTTCCAACGGTGGTGGACGCGTCG
TCATGCGCCGTACCGTCAAGTCTACTCCTCAGAGCATCTGGTACGGACCAGACCGTCCCA
AGTACTTAGGACCATTCTCGGAGAACACACCATCATACCTAACCGGTGAGTACCCCGGAG
ACTACGGTTGGGACACCGCTGGTCTCTCCGCTGACCCAGAAACCTTTGCAAAGAACCGTG
AGCTCGAAGTAATCCACAGCAGATGGGCAATGTTAGGAGCTTTAGGCTGCACATTCCCAG
AGATTCTCTCCAAAAACGGTGTCAAATTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAGGTTCTC
AGATCTTCTCAGAAGGAGGGCTTGATTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCATGCGCAAA
GCATTTTAGCTATCTGGGCTTCTCAAGTTGTGCTTATGGGCTTAATCGAAGGGTACAGAA
TCGGAGGTGGACCTCTTGGTGAAGGTCTTGACCCGCTTTACCCGGGGTGGGGCGTTTGAC
CCGTTGAACTTAGCCGAGGACCCG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2H655TF 708 0 0
GGA
ACAACATCTCATCTTTGCTTATTTCTCTCCTTTGTTTTTCTGTTTGGAGTTAAGATAACA
AAAAAAGAATGGCTACATCAGCAATCCAACACTCCTCTTTCGCCGGTCAAACGGCTTTGA
AGCCCTATAACGATCTCCTCCGCAAAGTAGGTGCTTCCAACGGTGGTGGACGCGTCGTCA
TGCGCCGTACCGTCAAGTCTACTCCTCAGAGCATCTGGTACGGACCAGACCGTCCCAAGT
ACTTAGGACCATTCTCGGAGAACACACCATCATACCTAACCGGTGAGTACCCCGGAGACT
ACGGTTGGGACACCGCTGGTCTCTCCGCTGACCCAGAAACCTTTGCAAAGAACCGTGAGC
TCGAAGTAATCCACAGCAGATGGGCAATGTTAGGAGCTTTAGGCTGCACATTCCCAGAGA
TTCTCTCCAAAAACGGTGTCAAATTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAGGTTCTCAGA
TCTTCTCAGAAGGAGGGCTTGATTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCATGCGCAAAGCA
TTTTAGCTATCTGGGCTTCTCAAGTTGTGCTTATGGGCTTAATCGAAGGGTACAGAATCG
GAGGTGGACCTCTTGGTGAAGGTCTTGACCCGCTTTACCCGGG*TGGGGCGTTTGACCCG
TTGAACTTAGCCGAGGACCCGGAG*CATTTTCAGAATTGAAAGTG

QA 4 708 4 708
DS 

RD RR2BZ09TF 807 0 0
GG
ACAACATCTCATCTTTGCTTATTTCTCTCCTTTGTTTTTCTGTTTTGAGTTAAGATAACA
AAAAAAGAATGGCTACATCAGCAATCCAACACTCCTCTTTCGCCGGTCAAACGGCTTTGA
AGCCCTATAACGATCTCCTCCGCAAAGTAGGTGCTTCCAACGGTGGTGGACGCGTCGTCA
TGCGCCGTACCGTCAAGTCTACTCCTCAGAGCATCTGGTACGGACCAGACCGTCCCAAGT
ACTTAGGACCATTCTCGGAGAACACACCATCATACCTAACCGGTGAGTACCCCGGAGACT
ACGGTTGGGACACCGCTGGTCTCTCCGCTGACCCAGAAACCTTTGCAAAGAACTGTGAGC
TCGAAGTAATCCACAGCAGATGGGCAATGTTAGGAGCTTTAGGCTGCACATTCCCAGAGA
TTCTCTCCAAAAACGGTGTCAAATTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAGGTTCTCAGA
TCTTCTCAGAAGGAGGGCTTGATTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCATGTGCAAAGCA
TTTTAGCTATCTGGGCTTCTCAAGTTGTGCTTATGGGCTTAATCGAAGGGTACAGAATCG
GAGGTGGACCTCTTGGTGAAGGTCTTGACCCGCTTTACCCGGG*TGGGGCGTTTGACCCG
TTGAACTTAGCCGAGGACCCGGAGGCATTTTCAGAATTGAAAGCGAAGAGCTCAAGAATG
GTCGTCTTGCATGTTCTCATGTTTGGATTCTTTGTGCAGCTATTGTTACTGGTAAAGTCC
ATAGAGATCTGTTCGATCATGTTGC

QA 3 807 3 807
DS 



CO CL28Contig2 975 5 40 U
GGCTTACGATGATTTCTTTTATTAAGACGGAACATCAAATCAACCGACACATATTTCCCA
TACATTAATTGTTTTAAAAACATTACATTAGCTGATAATATTCTATTTTCCGGGGACGAA
GTTGGTGGCGTAAGCCCAGGCATTGTTAGCCACAGGGTCCGCAACATGGTCAAACAGATT
CTCAATTGGTCCTTTACCAGTGACAATGGCCTGGACAAAGAAACCAAACATGGAGAACAT
GGCAAGGCGACCGTTCTTAAGTTCCTTCACTTTCAATTCGGAAAACGCCTCAGGATCCTC
AGCTAAGTTCAACGGGTCAAACGCTCCACCCGGGTAAAGCGGGTCAAGCCCTTCACCAAG
AGGTCCACCACCGATTCTGTACCCTTCGATCAACCCCATCAGCACAACTTGAGAAGCCCA
GATAGCTAATATGCTCTGCGCGTGGATCAAGTTAGGGTTCCCGAGGTAATCAAGCCCTCC
TTCTGAGAAGATCTGAGACCCTGCCTTGAACCACACGGCTTCACCGAATTTAACTCCGTT
TTTGGAGAGGATCTCTGGGAATGTGCAACCTAAAGCGCCGAGCATTGCCCATCTGCTGTG
GATTACTTCCAGCTCACGGTTCTTTGCAAATGTTTCTGGGTCGGCCGAGAGACCAGCTGT
GTCCCAGCCGTAGTCTCCGGGGTACTCTCCGGTTAGGTATGACGGTGTGTTCTCCGAGAA
TGGTCCTAAGTACTTGGGACGGTCTGGCCCGTACCAGATGCTCTGAGGAGTAGACTTGAC
GGTACGGCGCATGACGACGCGACCAACACCGTTGGAAGCTCCGACTTTGCGGAGGAGATC
GTTGGAGGACTTCAGGGCCGTTTGGCCGGCAAAAGAGGAGTGTTGGATTGCTGATGTGGC
CATTTCTTGTATTTCTCTAACTCCCAAGCAATCACACAAATGAAGAGATGAATAAGCAAA
GAAGAGATGGCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT26JQ U 1
AF RR2DG20JQ U 6
AF RR2GL12JQ U 43
AF RR2DG20TF C 235
AF RR2GL12TF C 379
BS 1 97 RR2DT26JQ
BS 98 98 RR2DG20JQ
BS 99 183 RR2DT26JQ
BS 184 184 RR2DG20JQ
BS 185 240 RR2DT26JQ
BS 241 241 RR2DG20JQ
BS 242 246 RR2DT26JQ
BS 247 247 RR2DG20JQ
BS 248 261 RR2DT26JQ
BS 262 262 RR2DG20JQ
BS 263 279 RR2DT26JQ
BS 280 280 RR2DG20JQ
BS 281 312 RR2DT26JQ
BS 313 313 RR2DG20JQ
BS 314 324 RR2DT26JQ
BS 325 325 RR2DG20JQ
BS 326 330 RR2DT26JQ
BS 331 331 RR2DG20JQ
BS 332 369 RR2DT26JQ
BS 370 370 RR2DG20JQ
BS 371 390 RR2DT26JQ
BS 391 391 RR2DG20JQ
BS 392 393 RR2DT26JQ
BS 394 394 RR2DG20JQ
BS 395 429 RR2DT26JQ
BS 430 430 RR2DG20JQ
BS 431 435 RR2DT26JQ
BS 436 436 RR2DG20JQ
BS 437 491 RR2DT26JQ
BS 492 596 RR2GL12JQ
BS 597 714 RR2DG20TF
BS 715 715 RR2GL12TF
BS 716 747 RR2DG20TF
BS 748 748 RR2GL12TF
BS 749 802 RR2DG20TF
BS 803 803 RR2GL12TF
BS 804 805 RR2DG20TF
BS 806 806 RR2GL12TF
BS 807 968 RR2DG20TF
BS 969 975 RR2GL12TF

RD RR2DT26JQ 491 0 0
GGCTTACGATGATTTCTTTTATTAAGACGGAACATCAAATCAACCGACACATATTTCCCA
TACATTAATTGTTTTAAAAACATTACATTAGCTGATAGTATTCTATTTTCCGGGGACGAA
GTTGGTGGCGTAAGCCCAGGCATTGTTAGCCACAGGGTCCGCAACATGGTCAAACAGATT
CTCGATTGGTCCTTTACCAGTGACAATGGCCTGGACAAAGAAACCAAACATGGAGAACAT
AGCAAGCCGACCGTTCTTAAGCTCCTTCACTTTCAATTCTGAAAACGCCTCAGGATCCTC
AGCTAAGTTCAATGGGTCAAACGCCCCACCAGGGTAAAGCGGGTCAAGCCCTTCACCAAG
AGGTCCACCTCCGATTCTGTACCCTTCGATTAAACCCATCAGCACAACTTGAGAAGCCCA
GATAGCTAAAATGCTTTGCGCGTGGATCAAGTTAGGGTTCCCGAGGTAATCAAGCCCTCC
TTCTGAGAAGA

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2DG20JQ 483 0 0
ACGATGATTTCTTTTATTAAGACGGAACATCAAATCAACCGACACATATTTCCCATACAT
TAATTGTTTTAAAAACATTACATTAGCTGATAATATTCTATTTTCCGGGGACGAAGTTGG
TGGCGTAAGCCCAGGCATTGTTAGCCACAGGGTCCGCAACATGGTCAAACAGATTCTCAA
TTGGTCCTTTACCAGTGACAATGGCCTGGACAAAGAAACCAAACATGGAGAACATGGCAA
GGCGACCGTTCTTAAGTTCCTTCACTTTCAATTCGGAAAACGCCTCAGGATCCTCAGCTA
AGTTCAACGGGTCAAACGCTCCACCCGGGTAAAGCGGGTCAAGCCCTTCACCAAGAGGTC
CACCACCGATTCTGTACCCTTCGATCAACCCCATCAGCACAACTTGAGAAGCCCAGATAG
CTAATATGCTCTGCGCGTGGATCAAGTTAGGGTTCCCGAGGTAATCAAGCCCTCCTTCTG
AGA

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR2GL12JQ 554 0 0
ACCGACACATATTTCCCATACATTAATTGTTTTAAAAACATTACATTAGCTGATAATATT
CTATTTTCCGGGGACGAAGTTGGTGGCGTAAGCCCAGGCATTGTTAGCCACAGGGTCCGC
AACATGGTCAAACAGATTCTCAATTGGTCCTTTACCAGTGACAATGGCCTGGACAAAGAA
ACCAAACATGGAGAACATGGCAAGGCGACCGTTCTTAAGTTCCTTCACTTTCAATTCGGA
AAACGCCTCAGGATCCTCAGCTAAGTTCAACGGGTCAAACGCTCCACCCGGGTAAAGCGG
GTCAAGCCCTTCACCAAGAGGTCCACCACCGATTCTGTACCCTTCGATCAACCCCATCAG
CACAACTTGAGAAGCCCAGATAGCTAATATGCTCTGCGCGTGGATCAAGTTAGGGTTCCC
GAGGTAATCAAGCCCTCCTTCTGAGAAGATCTGAGACCCTGCCTTGAACCACACGGCTTC
ACCGAATTTAACTCCGTTTTTGGAGAGGATCTCTGGGAATGTGCAACCTAAAGCGCCGAG
CATTGCCCATCTGC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2DG20TF 736 0 0
GAACATGGCAAGGCGACCGTTCTTAAG*TCCTTCACTTTCAATTCGGAAAACGCCTCAGG
ATC*TCAGCTAAGTTCAACGGGTCAAACGCTCCACCCGGGTAAAGCGGGTCAAGCCCTTC
ACCAAGAGGTCCACCACCGATTCTGTACCCTTCGATCAACCCCATCAGCACAACTTGAGA
AGCCCAGATAGCTAATATGCTCTGCGCGTGGATCAAGTTAGGGTTCCCGAGGTAATCAAG
CCCTCCTTCTGAGAAGATCTGAGACCCTGCCTTGAACCACACGGCTTCACCGAATTTAAC
TCCGTTTTTGGAGAGGATCTCTGGGAATGTGCAACCTAAAGCGCCGAGCATTGCCCATCT
GCTGTGGATTACTTCCAGCTCACGGTTCTTTGCAAATGTTTCTGGGTCGGCCGAGAGACC
AGCTGTGTCCCAGCCGTAGTCTCCGGGGTACTCTCCGGTTAGGTATGACGGTGTGTTCTC
TGAGAATGGTCCTAAGTACTTGGGACGGTCTGGTCCGTACCAGATGCTCTGAGGAGTAGA
CTTGACGGTACGGCGCATGACGACGCGATCACCACCGTTGGAAGCTCCGACTTTGCGGAG
GAGATCGTTGGAGGACTTCAGGGCCGTTTGGCCGGCAAAAGAGGAGTGTTGGATTGCTGA
TGTGGCCATTTCTTGTATTTCTCTAACTCCCAAGCAATCACACAAATGAAGAGATGAATA
AGCAAAGAAGAGAT
CC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2GL12TF 597 0 0
GTACCTTTCGATCAACCCCATCAGCACAACTTGAGAAGCCCAGATAGCTAATATGCTCTG
CGCGTGGATCAAGTTAGGGTTCCCGAGGTAATCAAGCCCTCCTTCTGAGAAGATCTGAGA
CCCTGCCTTGAACCACACGGCTTCACCGAATTTAACTCCGTTTTTGGAGAGGATCTCTGG
GAATGTGCAACCTAAAGCGCCGAGCATTGCCCATCTGCTGTGGATTACTTCCAGCTCACG
GTTCTTTGCAAATGTTTCTGGGTCGGCCGAGAGACCAGCTGTGTCCCAGCCGTAGTCTCC
GGGGTACTCTCCGGTTAGGTATGACGGTGTGTTCTCCGAGAATGGTCCTAAGTACTTGGG
ACGGTCTGGCCCGTACCAGATGCTCTGAGGAGTAGACTTGACGGTACGGCGCATGACGAC
GCGACCAACACCGTTGGAAGCTCCGACTTTGCGGAGGAGATCGTTGGAGGACTTCAGGGC
CGTTTGGCCGGCAAAAGAGGAGTGTTGGATTGCTGATGTGGCCATTTCTTGTATTTCTCT
AACTCCCAAGCAATCACACAAATGAAGAGATGAATAAGCAAAGAAGAGATGGCTCCC

QA 1 597 1 597
DS 



CO CL28Contig3 1008 14 11 U
GCTCTAACACGGTTTAATTTTAATGGTTTATATATTTCTTTCACCAAGATGGCATTATCA
AATCAAGAGACTTAAATATTTTCCATGCATTAAATGTTGACAGATAAAAATAAGTTACAT
GAATTAATCCGATCAAACTCTATTTTCCGGGAACAAAGTTGGTGGCGTAAGCCCATGCAT
TGTTGGCCACAGGGTCCGCAACATGATCAAACAGGTTCTCAATTGGACCTTTACCGGTAA
CAATTGCTTGGACAAAGAATCCAAACATGGAGAACATCGCAAGCCGACCGTTCTTGAGCT
CCTTCACTTTCAATTCTGAGAATGCCTCAGGATCCTCAGCTAAGTTCAACGGGTCAAACG
CTCCACCCGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAGGCCCACCTCCGATTCTGTACC
CTTCGATTAAGCCCATTAGCACAACTTGAGAAGCCCATATAGCTAATATGCTTTGCGCGT
GGATCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGTCCTCCTTCTGAGAAGATCTGGGAACCTG
CCTTGAACCATACGGCTTCACCAAATTTGACTCCGTTTTTGGAGAGAATCTCTGGGAAGG
TGCAGCCTAAAGCTCCTAGCATTGCCCATCTGCTGTGGATTACTTCGAGCTCACGGTTCT
TTGCGAAGGTTTCTGGGTCGGCGGAGAGACCGGCAGTGTCCCAGCCGTAGTCTCCTGGGT
ATTCTCCGGTTAGGTATGATGGTGTGTTCTCTGAGAATGGACCTAAGTACTTGGGACGGT
CTGGTCCATACCAGATGCTCTGAGGAGTAGACTTGACGGTACGACGCATGACGACACGGC
CACCACCGTTGGAAGCTCCGACTTTGCGGAGGAGATCGTTGGAGGGCTTAAGTGCCGTTT
GGCCAGCAAAAGAGGAGTGTTGGATAGCTGAAGTAGCCATTCTTTTTTATCTCTAGCTCC
AAACAAGAACACAAATAAAGAGAAACAAGCCAAGATGAGATGAGATCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 45 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 45 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 40 25 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 

AF RR2GU73JQB U 1
AF RR2G575JQ U 22
AF RR2DY51JQ U 64
AF RR2GU73TF C 3
AF RR2B295JQ U 68
AF RR2GW51JQ U 118
AF RR2GW51TF C 118
AF RR2D713JQ U 59
AF RR2C262JQ U 68
AF RR2D713TF C 306
AF RR2DY51TF C 676
AF RR2G575TF C 425
AF RR2C262TF C 393
AF RR2B295TF C 340
BS 1 233 RR2GU73JQB
BS 234 234 RR2G575JQ
BS 235 319 RR2GU73JQB
BS 320 320 RR2DY51JQ
BS 321 500 RR2GU73JQB
BS 501 559 RR2DY51JQ
BS 560 858 RR2D713JQ
BS 859 859 RR2C262JQ
BS 860 875 RR2D713JQ
BS 876 1007 RR2D713TF
BS 1008 1008 RR2B295TF

RD RR2GU73JQB 500 0 0
GCTCTAACACGGTTTAATTTTAATGGTTTATATATTTCTTTCACCAAGATGGCATTATCA
AATCAAGAGACTTAAATATTTTCCATGCATTAAATGTTGACAGATAAAAATAAGTTACAT
GAATTAATCCGATCAAACTCTATTTTCCGGGAACAAAGTTGGTGGCGTAAGCCCATGCAT
TGTTGGCCACAGGGTCCGCAACATGATCAAACAGGTTCTCAATTGGACCTTTATCGGTAA
CAATTGCTTGGACAAAGAATCCAAACATGGAGAACATCGCAAGCCGACCGTTCTTGAGCT
CCTTCACTTTCAATTCTGAAAATGCCTCAGGATCCTCAGCTAAGTTCAACGGGTCAAACG
CTCCACCCGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAGGCCCACCTCCGATTCTGTACC
CTTCGATTAAGCCCATTAGCACAACTTGAGAAGCCCATATAGCTAATATGCTTTGCGCGT
GGATCAAGTTAGGGTTTCCG

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2G575JQ 477 0 0
AATGGTTTATATATTTCTTTCACCAAGATGGCATTATCAAATCAAGAGACTTAAATATTT
TCCATGCATTAAATGTTGACAGATAAAAATAAGTTACATGAATTAATCCGATCAAACTCT
ATTTTCCGGGAACAAAGTTGGTGGCGTAAGCCCATGCATTGTTGGCCACAGGGTCCGCAA
CATGATCAAACAGGTTCTCAATTGGACCTTTACCGGTAACAATTGCTTGGACAAAGAATC
CAAACATGGAGAACATCGCAAGCCGACCGTTCTTGAGCTCCTTCACTTTCAATTCTGAAA
ATGCCTCAGGATCCTCAGCTAAGTTCAACGGGTCAAACGCTCCACCCGGGTAAAGCGGGT
CAAGACCTTCACCAAGAGGCCCACCTCCGATTCTGTACCCTTCGATTAAGCCCATTAGCA
CAACTTGAGAAGCCCATATAGCTAATATGCTTTGCGCGTGGATCAAGTTAGGGTTTC

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2DY51JQ 496 0 0
CAAGAGACTTAAATATTTTCCATGCATTAAATGTTGACAGATAAAAATAAGTTACATGAA
TTAATCCGATCAAACTCTATTTTCCGGGAACAAAGTTGGTGGCGTAAGCCCATGCATTGT
TGGCCACAGGGTCCGCAACATGATCAAACAGGTTCTCAATTGGACCTTTACCGGTAACAA
TTGCTTGGACAAAGAATCCAAACATGGAGAACATCGCAAGCCGACCGTTCTTGAGCTCCT
TCACTTTCAATTCTGAGAATGCCTCAGGATCCTCAGCTAAGTTCAACGGGTCAAACGCTC
CACCCGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAGGCCCACCTCCGATTCTGTACCCTT
CGATTAAGCCCATTAGCACAACTTGAGAAGCCCATATAGCTAATATGCTTTGCGCGTGGA
TCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGTCCTCCTTCTGAGAAGATCTGGGAACCTGCCT
TGAACCATACGGCTTC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2GU73TF 632 0 0
TCTAACACGGTTTAATTTTAATGGTTTATATATTTCTTTCACCAAGATGGCATTATCAAA
TCAAGAGACTTAAATATTTTCCATGCATTAAATGTTGACAGATAAAAATAAGTTACATGA
ATTAATCCGATCAAACTCTATTTTCCGGGAACAAAGTTGGTGGCGTAAGCCCATGCATTG
TTGGCCACAGGGTCCGCAACATGATCAAACAGGTTCTCAATTGGACCTTTATCGGTAACA
ATTGCTTGGACAAAGAATCCAAACATGGAGAACATCGCAAGCCGACCGTTCTTGAGCTCC
TTCACTTTCAATTCTGAGAATGCCTCAGGATCCTCAGCTAAGTTCAACGGGTCAAACGCT
CCACCCGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAGGCCCACCTCCGATTCTGTACCCT
TCGATTAAGCCCATTAGCACAACTTGAGAAGCCCATATAGCTAATATGCTTTGCGCGTGG
ATCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGTCCTCCTTCTGAGAAGATCTGGGAACCTGCC
TTGAACCATACGGCTTCACCAAATTTGACTCCGTTTTTGGAGAGAATCTCTGGGAAGGTG
CAGCCTAAAGCTCCTAGCATTGCCCATCTGC
C

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2B295JQ 616 0 0
AGACTTAAATATTTTCCATGCATTAAATGTTGACAGATAAAAATAAGTTACATGAATTAA
TCCGATCAAACTCTATTTTCCGGGAACAAAGTTGGTGGCGTAAGCCCATGCATTGTTGGC
CACAGGGTCCGCAACATGATCAAACAGGTTCTCAATTGGACCTTTACCGGTAACAATTGC
TTGGACAAAGAATCCAAACATGGAGAACATCGCAAGCCGACCGTCCTTGAGCTCCTTCAC
TTTCAATTCTGAGAATGCCTCAGGATCCTCGGCTAAGTTCAACGGGTCAAACGCTCCACC
CGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAGGCCCACCTCCGATTCTGTACCCTTCGAT
TAAGCCCATTAGCACAACTTGAGAAGCCCATATAGCTAATATGCTTTGCGCGTGGATCAA
GTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGTCCTCCTTCTGAAAAGATCTGGGAACCTGCCTTGAA
CCATACGGCTTCACCAAATTTGACTCCGTTTTTGGAGAGAATCCCTGGGAAGGTGCAGCC
TAAAGCTCCTAGCATTGCCCATCTGCTGTGGATTACTTCGAGCTCACGGTTCTTTGCGAA
GGTTTCTGGGTCGGCG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2GW51JQ 634 0 0
CATGAATTAATCCGATCAAACTCTATTTTCCGGGAACAAAGTTGGTGGCGTAAGCCCATG
CATTGTTGGCCAAAGGGTCCGCAACATGATCAAACAGATTCTCAATTGGACCTTTACCGG
TAACAATTGCTTGGACAAAGAATCCAAACATGGAGAACATCGCAAGCCGACCGTTCTTGA
GCTCCTTCACTTTCAATTCTGAAAATGCCTCAGGATCCTCAGCTAAGTTCAACGGGTCAA
ACGCTCCACCCGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAGGACCACCTCCGATTCTGT
ACCCTTCGATTAAGCCCATTAGCACAACTTGAGAAGCCCATATAGCTAATATGCTTTGCG
*GTGGATCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGTCCTCCTTCTGAGAAGATCTGGGAAC
CTGCCTTGAACCATACGGCTTCACCAAATTTGACTCCGTTTTTGGAGAGAATCTCTGGGA
AGGTGCAGCCTAAAGCTCCTAGCATTGCCCATCTGCTGTGGATTACTTCGAGCTCACGGT
TCTTTGCGAAGGTTTCTGGGTCGGCGGAGAGACCGGCAGTGTCCCAGCCGTAGTCTCCTG
GGTATTCTCCGGTTAGGTATGATGGTGTGTTCTC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2GW51TF 678 0 0
CATGAATTAATCCGATCAAACTCTATTTTCCGGGAACAAAGTTGGTGGCGTAAGCCCATG
CATTGTTGGCCAAAGGGTCCGCAACATGATCAAACAGATTCTCAATTGGACCTTTACCGG
TAACAATTGCTTGGACAAAGAATCCAAACATGGAGAACATCGCAAGCCGACCGTTCTTGA
GCTCCTTCACTTTCAATTCTGAGAATGCCTCAGGATCCTCAGCTAAGTTCAACGGGTCAA
ACGCTCCACCCGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAGGACCACCTCCGATTCTGT
ACCCTTCGATTAAGCCCATTAGCACAACTTGAGAAGCCCATATAGCTAATATGCTTTGCG
*GTGGATCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGTCCTCCTTCTGAGAAGATCTGGGAAC
CTGCCTTGAACCATACGGCTTCACCAAATTTGACTCCGTTTTTGGAGAGAATCTCTGGGA
AGGTGCAGCCTAAAGCTCCTAGCATTGCCCATCTGCTGTGGATTACTTCGAGCTCACGGT
TCTTTGCGAAGGTTTCTGGGTCGGCGGAGAGACCGGCAGTGTCCCAGCCGTAGTCTCCTG
GGTATTCTCCGGTTAGGTATGATGGTGTGTTCTCTGAGAATGGACCTAAGTACTTGGGAC
GGTCTGGTCCATACCAG
C

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2D713JQ 817 0 0
CAAATCAAGAGACTTAAATACTTTCCATGCATTAAATGTTGACAGATAAAAATAAGTTAC
ATGAATTAATCCGATCAAACTCTATTTTCCGGGAACAAAGTTGGGGGCGTAAGCCCATGC
ATTGTTGGCCACAGGGTCCGCAACATGATCAAACAGGTTCTCAATTGGACCTTTACCGGT
AACAATTGCTTGGACAAAGAATCCAAACATGGAGAACATCGCAAGCCGACCGTTCTTGAG
CTCCTTCACTTTCAATTCTGAGAATGCCTCAGGATCCTCAGCTAAGTTCAACGGGTCAAA
CGCTCCACCCGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAGGCCCACCTCCGATTCTGTA
CCCTTCGATTAAGCCCATTAGCACAACTTGAGAAGCCCATATAGCTAATATGCTTTGCGC
GTGGATCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGTCCTCCTTCTGAGAAGATCTGGGAACC
TGCCTTGAACCATACGGCTTCACCAAATTTGACTCCGTTTTTGGAGAGAATCTCTGGGAA
GGTGCAGCCTAAAGCTCCTAGCATTGCCCATCTGCTGTGGATTACTTCGAGCTCACGGTT
CTTTGCGAAGGTTTCTGGGTCGGCGGAGAGACCGGCAGTGTCCCAGCCGTAGTCTCCTGG
GTATTCTCCGGTTAGGTATGATGGTGTGTTCTCTGAGAATGGACCTAAGTACTTGGGACG
GTCTGGTCCATACCAGATGCTCTGAGGAGTAGACTTGACGGTACGACGCATGACGACACG
GCCACCACCGTTGGAAGCTC*GACTTTGCGGAGGAGA

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2C262JQ 799 0 0
G
GACTTAAATATTTTCCATGCATTAAATGTTGACAGATAAAAATAAGTTACATGAATTAAT
CCGATCAAACTCTATTTTCCGGGAACAAAGTTGGTGGCGTAAGCCCATGCATTGTTGGCC
ACAGGGTCCGCAACATGATCAAACAGGTTCTCAATTGGACCTTTACCGGTAACAATTGCT
TGGACAAAGAATCCAAACATGGAGAACATCGCAAGCCGACCGTTCTTGAGCTCCTTCACT
TTCAATTCTGAGAATGCCTCAGGATCCTCAGCTAAGTTCAACGGGTCAAACGCTCCACCC
GGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAGGCCCACCTCCGATTCTGTACCCTTCGATT
AAGCCCATTAGCACAGCTTGAGAAGCCCATATAGCTAATATGTTTTGCGCGTGGATCAAG
TTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGTCCTCCTTCTGAGAAGATCTGGGAACCTGCCTTGAAC
CATACGGCTTCACCAAATTTGACTCCGTTTTTGGAGAGAATCTCTGGGAAGGTGCAGCCT
AAAGCTCCTAGTATTGCCCATCTGCTGTGGATTACTTCGAGCTCACGGTTCTTTGCGAAG
GTTTCTGGGTCGGCGGAGAGACCGGCAGTGTCCCAGCCGTAGTCTCCTGGGTATTCTCCG
GTTAGGTATGATGGTGTGTTCTCTGAGAATGGACCTAAGTACTTGGGACGGTCTGGTCCA
TACCAGATGCTCTGAGGAGTAGACTTGACGGTACGACGCATGACGACACGGCCACCACCG
TTGGAAGCTCCGACTTTG

QA 2 799 2 799
DS 

RD RR2D713TF 703 0 0
ACTTTCAATTCTGAGAATGCCTCAGGATC*TCAGCTAAGTTCAACGGGTCAAACGCTCCA
CCCGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAGGCCCACCTCCGATTCTGTACCCTTCG
ATTAAGCCCATTAGCACAACTTGAGAAGCCCATATAGCTAATATGCTTTGCGCGTGGATC
AAGTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGTCCTCCTTCTGAGAAGATCTGGGAACCTGCCTTG
AACCATACGGCTTCACCAAATTTGACTCCGTTTTTGGAGAGAATCTCTGGGAAGGTGCAG
CCTAAAGCTCCTAGCATTGCCCATCTGCTGTGGATTACTTCGAGCTCACGGTTCTTTGCG
AAGGTTTCTGGGTCGGCGGAGAGACCGGCAGTGTCCCAGCCGTAGTCTCCTGGGTATTCT
CCGGTTAGGTATGATGGTGTGTTCTCTGAGAATGGACCTAAGTACTTGGGACGGTCTGGT
CCATACCAGATGCTCTGAGGAGTAGACTTGACGGTACGACGCATGACGACACGGCCACCA
CCGTTGGAAGCTCCGACTTTGCGGAGGAGATCGTTGGAGGGCTTAAGTGCCGTTTGGCCA
GCAAAAGAGGAGTGTTGGATAGCTGAAGTAGCCATTCTTTTTTATCTCTAGCTCCAAACA
AGAACACAAATAAAGAGAAACAAGCCAAGATGAGATGAGATC
C

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2DY51TF 333 0 0
GGTCGGCGGAGAGACCGGCAGTGTCCCAGCCGTAGTCTCCTGGGTATTCTCCGGTTAGGT
AGGATGGTGTGTTCA*TGAGAATGGACCTAAGTACTTGGGACGGTCTGGTCCATACCAGA
TGCTCTGAGGAGTAGACTTGACGGTACGACGCATGACGACACGGCCACCACCGTTGGAAG
CTCCGACTTTGCGGAGGAGATCGTTGGAGGGCTTAAGTGCCGTTTGGCCAGCAAAAGAGG
AGTGTTGGATAGCTGAAGTAGTCATTCTTTTTTATCTCTAGCTCCAAACAAGAACACAAA
TAAAGAGAAACAAGCCAAGATGAGATGAGATC
C

QA 1 332 1 332
DS 

RD RR2G575TF 583 0 0
GATTAAGCCCATTAGCACAACTTGAGAAGCCCATATAGCTAATATGCTTTGCGCGTGGAT
CAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGTCCTCCTTCTGAGAAGATCTGGGAACCTGCCTT
GAACCATACGGCTTCACCAAATTTGACTCCGTTTTTGGAGAGAATCTCTGGGAAGGTGCG
GCCTAAAGCTCCTAGCATTGCCCATCTGCTGTGGATTACTTCGAGCTCACGGTTCTTTGC
GAAGGTTTCTGGGTCGGCGGAGAGACCGGCAGTGTCCCAGCCGTAGTCTCCTGGGTATTC
TCCGGTTAGGTATGATGGTGTGTTCTCTGAGAATGGACCTAAGTACTTGGGACGGTCTGG
TCCATACCAGATGCTCTGAGGAGTAGACTTGACGGTACGACGCATGACGACACGGCCACC
ACCGTTGGAAGCTCCGACTTTGCGGAGGAGATCGTTGGAGGGCTTAAGTGCCGTTTGGCC
AGCAAAAGAGGAGTGTTGGATAGCTGAAGTAGCCATTCTTTTTTATCTCTAGCTCCAAAC
AAGAACACAAATAAAGAGAAACAAGCCAAGATGAGATGAGATC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2C262TF 618 0 0
CCAAGAGGCCCACCTCCGATTCTGTACCCTTCGATTAAGCCCATTAGCACAGCTTGAGAA
GCCCATATAGCTAATATGTTTTGCGCGTGGATCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGT
CCTCCTTCTGAGAAGATCTGGGAACCTGCCTTGAACCATACGGCTTCACCAAATTTGACT
CCGTTTTTGGAGAGAATCTCTGGGAAGGTGCAGCCTAAAGCTCCTAGTATTGCCCATCTG
CTGTGGATTACTTCGAGCTCACGGTTCTTTGCGAAGGTTTCTGGGTCGGCGGAGAGACCG
GCAGTGTCCCAGCCGTAGTCTCCTGGGTATTCTCCGGTTAGGTATGATGGTGTGTTCTCT
GAGAATGGACCTAAGTACTTGGGACGGTCTGGTCCATACCAGATGCTCTGAGGAGTAGAC
TTGACGGTACGACGCATGACGACACGGCCACCACCGTTGGAAGCTCCGACTTTGCGGAGG
AGATCGTTGGAGGGCTTAAGTGCCGTTTGGCCAGCAAAAGAGGAGTGTTGGATAACTGAA
GTAGCCATTCTTTTTTATCTCTAGCTCCAAACAAGAACACAAATAAAGAGAAACAAGCCA
AGATGAGATGAGAT
GACC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2B295TF 669 0 0
CTAAGTTCAACGGGTCAAACGCTCCACCCGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAG
GCCCACCTCCGATTCTGTACCCTTCGATTAAGCCCATTAGCACAACTTGAGAAGCCCATA
TAGCTAATATGCTTTGCGCGTGGATCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGTCCTCCTT
CTGAGAAGATCTGGGAACCTGCCTTGAACCATACGGCTTCACCAAATTTGACTCCGTTTT
TGGAGAGAATCCCTGGGAAGGTGCAGCCTAAAGCTCCTAGCATTGCCCATCTGCTGTGGA
TTACTTCGAGCTCACGGTTCTTTGCGAAGGTTTCTGGGTCGGCGGAGAGACCGGCAGTGT
CCCAGCCGTAGTCTCCTGGGTATTCTCCAGTTAGGTATGATGGTGTGTTCTCTGAGAATG
GACCTAAGTACTTGGGACGGTCTGGTCCATACCAGATGCTCTGAGGAGTAGACTTGACGG
TACGACGCATGACGACACGGCCACCACCGTTGGAAGCTCCGATTTTGCAGAGGAGATCGT
TGGAGGGCTTAAGTGCCGTTTGGCCAGCAAAAGAGGAGTGTTGGATAGCTGAAGTAGCCA
TTCTTTTTTATCTCTAGCTCCAAACAAGAACACAAATAAAGAGAAACAAGCCAAGATGAG
ATGAGATCC

QA 1 669 1 669
DS 



CO CL28Contig4 970 5 10 U
GCAGTGAACGAACATATTTCTTGCTTAATGACACAACAGAAGACTTGGAGAATTTATTCC
ACCAAGCAACGAAATTACATTTTTTGTTTTTGTCGTCACAAAGAAATTACATATATTTAT
TCGAATCAATTCTATTTGCCGGGAACGAAGTTGGTGGCGTAAGCCCAAGCATTGTTAGCC
ACAGGGTCCGCAACATGATCGAACAGATTCTCTATTGGACCTTTACCAGTAACAATAGCT
TGCACAAAGAATCCAAACATTGAGAACATTGCAAGACGACCATTCTTGAGCTCCTTCACT
TTCAATTCTGAAAATGCCTCCGGGTCCTCGGCTAAGTTCAACGGGTCAAACGCCCCACCC
GGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAGGTCCACCTCCGATTCTGTACCCTTCGATT
AAGCCCATAAGCACAACTTGAGAAGCCCAGATAGCTAAAATGCTTTGCGCATGGATCAAG
TTAGGGTTTCCGAGGTAATCAAGCCCTCCTTCTGAGAAGATCTGAGAACCTGCCTTGAAC
CACACGGCTTCACCGAATTTGACACCGTTTTTGGAGAGAATCTCTGGGAATGTGCAGCCT
AAAGCTCCTAACATTGCCCATCTGCTGTGGATTACTTCGAGCTCACGGTTCTTTGCAAAG
GTTTCTGGGTCAGCGGAGAGACCAGCGGTGTCCCAACCGTAATCTCCGGGGTACTCACCG
GTTAGGTATGATGGTGTGTTCTCCGAGAATGGTCCTAAGTACTTGGGACGGTCTGGTCCG
TACCAGATGCTCTGAGGAGTAGACTTGACGGTACGGCGCATGACGACGCGTCCACCACCG
TTGGAAGCTCCTATTTTGCGGAGGAGATCGTTAGAGGGCTTCAAAGCCGTTTGACCAGCG
AAAGAGGAGTGCTGGATTGCTGATGTAGCCATTCTTTTTTTTTTTGTTATCTTAACTCCA
AACAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H655JQB U 1
AF RR2G959JQ U 5
AF RR2G959TF C 216
AF RR2BO20JQ U 30
AF RR2GO94TF C 278
BS 1 122 RR2H655JQB
BS 123 123 RR2G959JQ
BS 124 335 RR2H655JQB
BS 336 336 RR2G959JQ
BS 337 387 RR2H655JQB
BS 388 518 RR2G959JQ
BS 519 701 RR2BO20JQ
BS 702 702 RR2GO94TF
BS 703 806 RR2BO20JQ
BS 807 970 RR2GO94TF

RD RR2H655JQB 387 0 0
GCAGTGAACGAACATATTTCTTGCTTAATGACACAACAGAAGACTTGGAGAATTTATTCC
ACCAAGCAACGAAATTACATTTTTTGTTTTTGTCGTCACAAAGAAATTACATATATTTAT
TCCAATCAATTCTATTTGCCGGGAACGAAGTTGGTGGCGTAAGCCCAAGCATTGTTAGCC
ACAGGGTCCGCAACATGATCGAACAGATTCTCTATTGGACCTTTACCAGTAACAATAGCT
TGCACAAAGAATCCAAACATTGAGAACATTGCAAGACGACCATTCTTGAGCTCCTTCACT
TTCAATTCTGAAAATGCCTCCGGGTCCTCGGCTAAATTCAACGGGTCAAACGCCCCACCC
GGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCA

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR2G959JQ 514 0 0
C
GAACGAACATATTTCTTGCTTAATGACACAACAGAAGACTTGGAGAATTTATTCCACCAA
GCAACGAAATTACATTTTTTGTTTTTGTCGTCACAAAGAAATTACATATATTTATTCGAA
TCAATTCTATTTGCCGGGAACGAAGTTGGTGGCGTAAGCCCAAGCATTGTTAGCCACAGG
GTCCGCAACATGATCGAACAGATTCTCTATTGGACCTTTACCAGTAACAATAGCTTGCAC
AAAGAATCCAAACATTGAGAACATTGCAAGACGACCATTCTTGAGCTCCTTCACTTTCAA
TTCTGAAAATGCCTCCGGGTCCTCGGCTAAGTTCAACGGGTCAAACGCCCCACCCGGGTA
AAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAGGTCCACCTCCGATTCTGTACCCTTCGATTAAGCC
CATAAGCACAACTTGAGAAGCCCAGATAGCTAAAATGCTTTGCGCATGGATCAAGTTAGG
GTTTCCGAGGTAATCAAGCCCTCCTTCTGAGAA

QA 2 514 2 514
DS 

RD RR2G959TF 461 0 0
TGGACCTTTACCAGTAACAATAGCTTGCACAAAGAATCCAAACATTGAGAACATTGCAAG
ACGACCATTCTTGAGCTCCTTCACTTTCAATTCTGAAAATGCCTCCGGGTCCTCGGCTAA
GTTCAACGGGTCAAACGCCCCACCCGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAGGTCC
ACCTCCGATTCTGTACCCTTCGATTAAGCCCATAAGCACAACTTGAGAAGCCCAGATAGC
TAAAATGCTTTGCGCATGGATCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAATCAAGCCCTCCTTCTGA
GAAGATCTGAGAACCTGCCTTGAACCACACGGCTTCACCGAATTTGACACCGTTTTTGGA
GAGAATCTCTGGGAATGTGCAGCCTAAAGCTCCTAACATTGCCCATCTGCTGTGGATTAC
TTCGAGCTCACGGTTCTTTGCAAAGGTTTCTGGGTCAGCG
C

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2BO20JQ 777 0 0
GACACAACAGAAGACTTGGAGAATTTATTCCACTAAGCAACGAAATTACATTTTTTGTTT
TTGTCGTCACAAAGAAATTACATATATTTATTCGAATCAATTCTATTTGCCGGGAACGAA
GTTGGTGGCGTAAGCCCAAGCATTGTTAGCCACAGGGTCCGCAACATGATCGAACAGATT
CTCTATTGGACCTTTACCAGTAACAATAGCTTGCACAAAGAATCCAAACATTGAGAACAT
TGCAAGACGACCATTCTTGAGCTCCTTCACTTTCAATTCTGAAAATGCCTCCGGGTCCTC
GGCTAAGTTCAACGGGTCAAACGCCCCACCCGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAG
AGGTCCACCTCCGATTCTGTACCCTTCGATTAAGCCCATAAGCACAACTTGAGAAGCCCA
GATAGCTAAAATGCTTTGCGCATGGATCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAATCAAGCCCTCC
TTCTGAGAAGATCTGAGAACCTGCCTTGAACCACACGGCTTCACCGAATTTGACACCGTT
TTTGGAGAGAATCTCTGGGAATGTGCAGCCTAAAGCTCCTAACATTGCCCATCTGCTGTG
GATTACTTCGAGCTCACGGTTCTTTGCAAAGGTTTCTGGGTCAGCGGAGAGACCAGCGGT
GTCCCAACCGTAGTCTCCGGGGTACTCACCGGTTAGGTATGATGGTGTGTTCTCCGAGAA
TGGTCCTAAGTACTTGGGACGGTCTGGTCCGTACCAGATGCTCTGAGGAGTAGACTT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2GO94TF 693 0 0
GACCGTTCTTGAGCTC*TTCACTTTCAATTCTGAAAATGC*TCCGGGTCCTCGGCTAAGT
TCAACGGGTCAAACGCCCCACCCGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCAAGAGGTCCAC
CTCCGATTCTGTACCCTTCGATTAAGCCCATAAGCACAACTTGAGAAGCCCAGATAGCTA
AAATGCTTTGCGCATGGATCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAATCAAGCCCTCCTTCTGAGA
AGATCTGAGAGCCAGCCTTGAACCACACGGCTTCACCGAACTTGACACCGTTTTTGGAGA
GAATCTCTGGGAATGTGCAGCCTAAAGCTCCTAACATTGCCCATCTGCCGTGGATTACTT
CGAGCTCACGGTTCTTTGCAAAGGTTTCTGGGTCAGCGGAGAGACCAGCGGTGTCCCAAC
CGTAATCTCCGGGGTACTCACCGGTTAGGTATGATGGTGTGTTCTCCGAGAATGGTCCTA
AGTACTTGGGACGGTCTGGTCCGTACCAGATGCTCTGAGGAGTAGACTTGACGGTACGGC
GCATGACGACGCGTCCACCACCGTTGGAAGCTCCTATTTTGCGGAGGAGATCGTTAGAGG
GCTTCAAAGCCGTTTGACCAGCGAAAGAGGAGTGCTGGATTGCTGATGTAGCCATTCTTT
TTTTTTTTGTTATCTTAACTCCAAACAGAAAAA

QA 1 693 1 693
DS 



AS 2 27

CO CL29Contig1 858 11 11 U
GGATATACGAGAATCTAAACACTTGTTTGAGGAAACAAAATGAACTTAATGTTAGATATG
AGTAGGAAAAAAACATTGGTGTTAGCAATAACTTCCATTTATTTATTATCGACCGTAGCT
GCTGGTTCATTTCCTGCGCTTTTGGCTTTTGGAGATTCAATACTTGATACCGGTAACAAC
AATTTTCTCATGACTTTTATGAGAGCAAATATCTGGCCATATGGGAGAAGCTACACTATG
AAAATCCCGACGGGAAGATTCGGAAATGGAAGAGTTTTCTCCGATATAATTGCCGAGGGT
TTGGGGATTAAAAAAAATTTACCAGCTGCTCGTAAGCTTTTCATTGCTCCAAGCGACCTC
AAAACTGGTGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTGCAGGAGTCGACCCTGTTACATCTAGACTA
ATGAGAGTTTTAAAGCCAAGCGACCAAATAAGTGACTACAAAAAGTACATAATGAAGCTA
AGGGTCGTAGCACCTACGCAAGCGAGTTCAATCATTGCAAACGCAGTGTATCTTGTTTCT
CAAGGAAATAATGATCTTGGAATCTCGTTTTTTATGACTCGATCTGCATTCATGCGAGGA
TATGTGACGAGTGGTGCTTACACCACTAAACTAACTAGTTGGAACAAAAATTTTATGAAA
CAAATGTATGATCAAGGAGCCAGAAAATTCGCAGTGATGGGAGTGATACCGTTTGGATGT
TTGCCTATGACAAGAATCATGGGTAGGTGTAACTTATTCGGAA*TCTATTAGCTGAAAGT
ACAGCGGAAATTGAGAGTGGTGTTAAACTTGGCCAACGAGCCGGTTTCGTGGTGCAAATT
TGTCTTTGTCGACATGTC


BQ
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FE26TF U 1
AF RR2D112TF U 27
AF RR2H911TF U 1
AF RR2DU86TF U 1
AF RR2GZ73TF U 1
AF RR2CE29TF U 1
AF RR2FS24TF U 3
AF RR2G623TF U 1
AF RR2G252TF U 104
AF RR2G295TF U 104
AF RR2C515TF U 64
BS 1 676 RR2CE29TF
BS 677 677 RR2FS24TF
BS 678 679 RR2CE29TF
BS 680 680 RR2G623TF
BS 681 687 RR2CE29TF
BS 688 732 RR2G623TF
BS 733 734 RR2C515TF
BS 735 735 RR2G623TF
BS 736 736 RR2G252TF
BS 737 746 RR2G623TF
BS 747 858 RR2C515TF

RD RR2FE26TF 381 0 0
GGATATACGAGAATCTAAACATTTGTTTGAGGAAACAAAATGAACTTAATGTTAGATATG
AGTAGGAAAAAAACATTGGTGTTAGCAATAACTTCCATTTATATATTATCGACCGTAGCT
GCTGGTTCATTTCCTGCGCTTTTGGCTTTTGGAGATTCAATACTTGATACCGGTAACAAC
AATTTTCTCATGACTTTTATGAGAGCAAATATCTGGCCATATGGGAGAAGCTACACTATG
AAAATCCCGACGGGAAGATTCGGAAATGGAAGAGTTTTCTCCGATATAATCGCCGAGGGT
TTGGGGATTAAAAAAA*TTTACCAGCTGCTCGTAAGCTTTTCATTGCTCCAAGCGACCTC
AAAACTGGTGTTTGTTTCGCA

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR2D112TF 530 0 0
GG
GAGGAAACAAAATGAACTTAATGTTAGATATGAGTAGGAAAAAAACATTGGTGTTAGCAA
TAACTTCCATTTATTTATTATCGACCGTAGCTGCTGGTTCATTTCCTGCGCTTTTGGCTT
TTGGAGATTCAATACTTGATACCGGTAACAACAATTTTCTCATGACTTTTATGAGAGCAA
ATATCTGGCCATATGGGAGAAGCTACACTATGAAAATCCCGACGGGAAGATTCGGAAATG
GAAGAGTTTTCTCCGATATAATTGCCGAGGGTTTGGGGATTAAAAAAAATTTACCAGCTG
CTCGTAAGCTTTTCATTGCTCCAAGCGACCTCAAAACTGGTGTTTGTTTCGCATCAGGTG
GTGCAGGAGTCGACCCTGTTACATCTAGACTAATGAGAGTTTTAAAGCCAAGCGACCAAA
TAAGTGACTACAAAAAGTACATAATGAAGCTAAGGGTCGTAGCACCTACGCAAGCGAGTT
CAATCATTGCAAACGCAGTGTATCTTGTTTCTCAAGGAAATAATGATC

QA 3 530 3 530
DS 

RD RR2H911TF 595 0 0
GGATATACGAGAATCTAAACACTTGTTTGAGGAAACAAAATGAACTTAATGTTAGATATG
AGTAGGAAAAAAACATTGGTGTTAGCAATAACTTCCATTTATTTATTATCGACCGTAGCT
GCTGGTTCATTTCCTGCGCTTTTGGCTTTTGGAGATTCAATACTTGATACCGGTAACAAC
AATTTTCTCATGACTTTTATGAGAGCAAATATCTGGCCATATGGGAGAAGCTACACTATG
AAAATCCCGACGGGAAGATTCGGAAATGGAAGAGTTTTCTCCGATATAATTGCCGAGGGT
TTGGGGATTAAAAAAAATTTACCAGCTGCTCGTAAGCTTTTCATTGCTCCAAGCGACCTC
AAAACTGGTGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTGCAGGAGTCGACCCTGTTACATCTAGACTA
ATGAGAGTTTTAAAGCCAAGCGACCAAATAAGTGACTACAAAAAGTACATAATGAAGCTA
AGGGTCGTAGCACCTACGCAAGCGAGTTCAATCATTGCAAACGCAGTGTATCTTGTTTCT
CAAGGAAATAATGATCTTGGAATCTCGTTTTTTATGACTCGATCTGCATTCATGC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2DU86TF 631 0 0
GGATATACGAGAATCTAAACACTTGTTTGAGGAAACAAAATGAACTTAATGTTAGATATG
AGTAGGAAAAAAACATTGGTGTTAGCAATAACTTCCATTTATTTATTATCGACCGTAGCT
GCTGGTTCATTTCCTGCGCTTTTGGCTTTTGGAGATTCGATACTTGATACCGGTAACAAC
AATTTTCTCATGACTTTTATGAGAGCAAATATCTGGCCATATGGGAGAAGCTACACTATG
AAAATCCCGACGGGAAGATTCGGAAATGGAAGAGTTTTCTCCGATATAATTGCCGAGGGT
TTGGGGATTAAAAAAAATTTACCAGCTGCTCGTAAGCTTTTCATTGCTCCAAGCGACCTC
AAAACTGGTGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTGCAGGAGTCTACCCTGTTACATCTAGACTA
ATGAGAGTTTTAAAGCCAAGCGACCAAATAAGTGACTACAAAAAGTACATAATGAAGCTA
AGGGTCGTAGCACCTACGCAAGCGAGTTCAATCATTGCAAACGCAGTGTATCTTGTTTCT
CAAGGAAATAATGATCTTGGAATCTCGTTTTTTATGACTCGATCTGCATTCATGCGAGGA
TATGTGACGAGTGGTGCTTACACCACTAAAC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2GZ73TF 650 0 0
GGATATACGAGAATCTAAACACTTGTTTGAGGAAACAAAATGAACTTAATGTTAGATATG
AGTAGGAAAAAAACATTGGTGTTAGCAATAACTTCCATTTATTTATTATCGACCGTAGCT
GCTGGTTCATTTCCTGCGCTTTTGGCTTTTGGAGATTCAATACTTGATACCGGTAACAAC
AATTTTCTCATGACTTTTATGAGAGCAAATATCTGGCCATATGGGAGAAGCTACACTATG
AAAATCCCGACGGGAAGATTCGGAAATGGAAGAGTTTTCTCCGATATAATTGCCGAGGGT
TTGGGGATTAAAAAAAATTTACCAGCTGCTCGTAAGCTTTTCATTGCTCCAAGCGACCTC
AAAACTGGTGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTGCAGGAGTCGACCCTGTTACATCTAGACTA
ATGAGAGTTTTAAAGCCAAGCGACCAAATAAGTGACTACAAAAAGTACATAATGAAGCTA
AGGGTCGTAGCACCTACGCAAGCGAGTTCAATCATTGCAAACGCAGTGTATCTTGTTTCT
CAAGGAAATAATGATCTTGGAATCTCGTTTTTTATAACTCGATTTGCATTCATGCGAGGA
TATGTGACGAGTGGTGCTTACACCACTAAACTAACTAGTTGGAACAAAAA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2CE29TF 687 0 0
GGATATACGAGAATCTAAACACTTGTTTGAGGAAACAAAATGAACTTAATGTTAGATATG
AGTAGGAAAAAAACATTGGTGTTAGCAATAACTTCCATTTATTTATTATCGACCGTAGCT
GCTGGTTCATTTCCTGCGCTTTTGGCTTTTGGAGATTCAATACTTGATACCGGTAACAAC
AATTTTCTCATGACTTTTATGAGAGCAAATATCTGGCCATATGGGAGAAGCTACACTATG
AAAATCCCGACGGGAAGATTCGGAAATGGAAGAGTTTTCTCCGATATAATTGCCGAGGGT
TTGGGGATTAAAAAAAATTTACCAGCTGCTCGTAAGCTTTTCATTGCTCCAAGCGACCTC
AAAACTGGTGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTGCAGGAGTCGACCCTGTTACATCTAGACTA
ATGAGAGTTTTAAAGCCAAGCGACCAAATAAGTGACTACAAAAAGTACATAATGAAGCTA
AGGGTCGTAGCACCTACGCAAGCGAGTTCAATCATTGCAAACGCAGTGTATCTTGTTTCT
CAAGGAAATAATGATCTTGGAATCTCGTTTTTTATGACTCGATCTGCATTCATGCGAGGA
TATGTGACGAGTGGTGCTTACACCACTAAACTAACTAGTTGGAACAAAAATTTTATGAAA
CAAATGTATGATCAAG*AGTCAGAAAA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2FS24TF 704 0 0
GG
ATACGAGAATCTAAACACTTGTTTGAGGAAACAAAATGAACTTAATGTTAGATATGAGTA
GGAAAAAAACATTGGTGTTAGCAATAACTTCCATTTATTTATTATCGACCGTAGCTGCTG
GTTCATTTCCTGCGCTTTTGGCTTTTGGAGATTCAATACTTGATACCGGTAACAACAATT
TTCTCATGACTTTTATGAGAGCAAATATCTGGCCATATGGGAGAAGCTACACTATGAAAA
TCCCGACGGGAAGATTCGGAAATGGAAGAGTTTTCTCCGATATAATTGCCGAGGGTTTGG
GGATTAAAGAAAATTTACCAGCTGCTCGTAAGCTTTTCATTGCTCCAAGCGACCTCAAAA
CTGGTGCTTGTTTCGCATCAGGTGGTGCAGGAGTCGACCCTGTTACATCTAGACTAATGA
GAGTTTTAAAGCCAAGCGACCAAATAAGTGACTACAAAAAGTACATAATGAAGCTAGGGG
TCGTAGCACCTACGCAAGCGAGTTCAATCATTGCAAACGCAGTGTATCTTGTTTCTCAAG
GAAATAATGATCTTGGAATCTCGTTTTTTATGACTCGATCTGCATTCATGCGAGGATATG
TGACGAGGGGTGCTTACACCACTAAACTAACTAGTTGGAACAAAAATTTTATGAAACAAA
TGTATGATCAAGGAGCCAGAAAATTCGCAGTGATGGGAGTGA

QA 3 704 3 704
DS 

RD RR2G623TF 747 0 0
GGATATACGAGAATCTAAACACTTGTTTGAGGAAACAAAATGAACTTAATGTTAGATATG
AGTAGGAAAAAAACATTGGTGTTAGCAATAACTTCCATTTATTTATTATCGACCGTAGCT
GCTGGTTCATTTCCTGCGCTTTTGGCTTTTGGAGATTCAATACTTGATACCGGTAACAAC
AATTTTCTCATGACTTTTATGAGAGCAAATATCTGGCCATATGGGAGAAGCTACACTATG
AAAATCCCGACGGGAAGATTCGGAAATGGAAGAGTTTTCTCCGATATAATTGCCGAGGGT
TTGGGGATTAAAAAAAATTTACCAGCTGCTCGTAAGCTTTTCATTGCTCCAAGCGACCTC
AAAACTGGTGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTGCAGGAGTCGACCCTGTTACATCTAGACTA
ATGAGAGTTTTAAAGCCAAGCGACCAAATAAGTGACTACAAAAAGTACATAATGAAGCTA
AGGGTCGTAGCACCTACGCAAGCGAGTTCAATCATTGCAAACGCAGTGTATCTCGTTTCT
CAAGGAAATAATGATCTTGGAATCTCGTTTTTTATGACTCGATCTGCATTCATGCGAGGA
TATGTGACGAGTGGTGCTTACACCACTAAACTAACTAGTTGGAACAAAAATTTTATGAAA
CAAATGTATGATCAAG*AGCCAGAAAATTCGCAGTGATGGGAGTGATACCGTTTGGATGT
TTGCCTATGACAGAA*TCATGGGTAG
T

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2G252TF 679 0 0
G
ATTATCGACCGTAGCTGCTGGTTCATTTCCTGCGCTTTTGGCTTTTGGAGATTCAATACT
TGATACCGGTAACAACAATTTTCTCATGACTTTTATGAGAGCAAATATCTGGCCATATGG
GAGAAGCTACACTATGAAAATCCCGACGGGAAGATTCGGAAATGGAAGAGTTTTCTCCGA
TATAATTGCCGAGGGTTTGGGGATTAAAAAAAATTTACCAGCTGCTCGTAAGCTTTTCAT
TGCTCCAAGCGACCTCAAAACTGGTGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTGCAGGAGTCGACCC
TGTTACATCTAGACTAATGAGAGTTTTAAAGCCAAGCGACCAAATAAGTGACTACAAAAA
GTACATAATGAAGCTAAGGGTCGTAGCACCTACGCAAGCGAGTTCAATCATTGCAAACGC
AGTGTATCTTGTTTCTCAAGGAAATAATGATCTTGGAATCTCGTTTTTTATGACTCGATC
TGCATTCATGCGAGGATATGTGACGAGTGGTGCTTACACCACTAA*CTAACTAGTTGGAA
CAAAAATTTTATGAAACAAATGTATGATCAAGGAGCCAGAAAATTCGCAGTGATGGGAGT
GATACCGTTTGGATGTTTGCCTATGACAAGAATCATGGGTAGGTGTAACTTATTCGGAA*
TCTATTAGCTGAAAG
TAC

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR2G295TF 672 0 0
G
ATTATCGACCGTAGCTGCTGGTTCATTTCCTGCGCTTTTGGCTTTTGGAGATTCAATACT
TGATACCGGTAACAACAATTTTCTCATGACTTTTATGAGAGCAAATATCTGGCCATATGG
GAGAAGCTACACTATGAAAATCCCGACGGGAAGATTCGGAAATGGAAGAGTTTTCTCCGA
TATAATTGCCGAGGGTTTGGGGATTAAAAAAAATTTACCAGCTGCTCGTAAGCTTTTCAT
TGCTCCAAGCGACCTCAAAACTGGTGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTGCAGGAGTCGACCC
TGTTACATCTAGACTAATGAGAGTTTTAAAGCCAAGCGACCAAATAAGTGACTACAAAAA
GTACATAATGAAGCTAAGGGTCGTAGCACCTACGCAAGCGAGTTCAATCATTGCAAACGC
AGTGTATCTTGTTTCTCAAGGAAATAATGATCTTGGAATCTCGTTTTTTATGACTCGATC
TGCATTCATGCGAGGATATGTGACGAGTGGTGCTTACACCACTAA*CTAACTAGTTGGAA
CAAAAATTTTATGAAACAAATGTATGATCAAGGAGCCAGAAAATTCGCAGTGATGGGAGT
GATACCGTTTGGATGTTTGCCTATGACAAGAATCATGGGTAGGTGTAACTTATTCGGAAA
TCTATTAGCTG

QA 2 672 2 672
DS 

RD RR2C515TF 795 0 0
G
GGAAAAAAACATTGGTGTTAGCAATAACTTCCATTTATTTATTATCGACCGTAGCTGCTG
GTTCATTTCCTGCGCTTTTGGCTTTTGGAGATTCAATACTTGATACCGGTAACAACAATT
TTCTCATGACTTTTATGAGAGCAAATATCTGGCCATATGGGAGAAGCTACACTATGAAAA
TCCCGACGGGAAGATTCGGAAATGGAAGAGTTTTCTCCGATATAATTGCCGAGGGTTTGG
GGATTAAAAAAAATTTACCAGCTGCTCGTAAGCTTTTCATTGCTCCAAGCGACCTCAAAA
CTGGTGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTGCAGGAGTCGACCCTGTTACATCTAGACTAATGA
GAGTTTTAAAGCCAAGCGACCAAATAAGTGACTACAAAAAGTACATAATGAAGCTAAGGG
TCGTAGCACCTACGCAAGCGAGTTCAATCATTGCAAACGCAGTGTATCTTGTTTCTCAAG
GAAATAATGATCTTGGAATCTCGTTTTTTATGACTCGATCTGCATTCATGCGAGGATATG
TGACGAGTGGTGCTTACACCACTAAACTAACTAGTTGGAACAAAAATTTTATGAAACAAA
TGTATGATCAAAGAGCCAGAAAATTCGCAGTGATGGGAGTGATACCGTTTGGATGTTTGC
CTATGACAAGA*TCATGGGTAGGTGTAACTTATTCGGAA*TCTATTAGCTGAAAGTACAG
CGGAAATTGAGAGTGGTGTTAAACTTGGCCAACGAGCCGGTTTCGTGGTGCAAATTTGTC
TTTGTCGACATGTC

QA 2 795 2 795
DS 



CO CL29Contig2 935 16 7 U
AGCATAACACAACATATTTTATAAAAAATACACCCGCATAGGCGTGCGGGTCAAAATCTA
GTATATAATTAACTAACAATGTTTTTTTGTTTGGGTGTAACTAGTTAACGATGTTTTTTC
TTTTTGGAAAACTGATTAGTTAACGATGTTGGTTGTTTATTATAATTTATTTTGGTACGT
TGTTGGTTATTAAGATTACAACAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGCAAGGCCTCT
CTTGATATCCTGGACCAGCCTTTTGGAAATGGTTTTGTAGGCTTTTTCCGAGGGATGAAC
AAAGTCATAGAAGACGTGACTATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAGGCATACA
ACAACACCCATTATTGGCATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTTTATAACATCCAT
AAGAGTATTGAACATGTCGACATAGACAAATTTTGCACCACGAAAACCGGCTTCGTTTGG
CCAAGTTTTAACACCACTCCTCAATTTTCCGTTGTACCTTTCAGCTAATAGATTTCCGAA
TAAGTTACACCTACCCATGATTCTTGTCATAGGCAAACATCCAAACGGTATCACTCCCAT
CACTGCGAATTTTCTGGCTCCTTGATCATACATTTGTTTCATAAAATTTTTGTTCCAACT
AGTTAGTTTAGTGGTGTAAGCACCACTCGTCACATATCCTCGCATGAATGCAGATCGAGT
CATAAAAAACGAGATTCCAAGATCATTATTTCCTTGAGAAACAAGATACACTGCGTTTGC
AATGATTGAACTCGCTTGCGTAGGTGCTACGACCCTTAGCTTCATTATGTACTTTTTGTA
GTCACTTATTTGGTCGCTTGGCTTTAAAACTCTCATTAGTCTAGATGTAACGGGGTCGAC
TCCTGCACCACCTGATGCGAAACAAACACCAGTTT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 65 65 65 65 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 80 80 80 80 80 80 65 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 65 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 65 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 45 60 60 60 60 60 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR2FE26JQ U 1
AF RR2C515JQ U 229
AF RR2E390JQ U 138
AF RR2E390TF C 138
AF RR2D112JQ U 1
AF RR2G295JQ U 126
AF RR2G623JQ U 317
AF RR2GZ73JQ U 174
AF RR2CK85JQ U 134
AF RR2DU86JQ U 142
AF RR2FS24JQ U 138
AF RR2G252JQ U 126
AF RR2CE29JQ U 138
AF RR2A205JQ U 138
AF RR2AA74JQ U 138
AF RR2AA74TF C 174
BS 1 530 RR2D112JQ
BS 531 531 RR2G252JQ
BS 532 712 RR2D112JQ
BS 713 862 RR2G252JQ
BS 863 891 RR2A205JQ
BS 892 892 RR2AA74JQ
BS 893 935 RR2A205JQ

RD RR2FE26JQ 231 0 0
AA
CATAACACAACATATTTTATAAAAAATACACCCGCATAGGCGTGCGGGTCAAAATCTAGT
ATATAATTAACTAACAATGTTTTTTTGTTTGGGTGTAACTAGTTAACGATGTTTTTTCTT
TTTGGAAAACTGATTAGTTAACAATGTTGGTTGTTTATTATAATTTATTTTGGTACGTTG
TTGGTTATTAAGATTACAACAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGC

QA 3 231 3 231
DS 

RD RR2C515JQ 197 0 0
GGCAAGGCCCCTCTTGATATCCTGGACCACCCTTTTGGAAATGGTTTTGTAGGCTTTTTC
CGAGGGATGAACAAAGTCATAAAAAACGTGACTATGAGGATTTACCCAAGGGACTATCGC
TGTAGGCATACAACAACCCCCATTATTGGCATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTT
TATAACATCCATAA
AAA

QA 1 194 1 194
DS 

RD RR2E390JQ 484 0 0
AGTTAACGATGTTGGTTGTTTATTATAATTTATTTTGGTACGTTGTTGGTTATTAAGATT
ACAACAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGCAAGGCCTCTCTTGATATCCTGGACCA
GCCTTTTGGAAATGGTTTTGTAGGCTCTTTCCGAGGGATGAACAAAGTCATAGAAGACGT
GACTATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAGGCATACAACAACACCCATTATTGG
CATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTTTATAACATCCATAAGAGTATTGAACATGT
CGACATAGACAAATTTTGCACCACGAAAACCGGCTTCGTTTGGCCAAGTTTTAACACCAC
TCCTCAATTTTCCGTTATACCTTTCAGCTAATAGATTTCCGAATAAGTTACACCTACCCA
TGATTCTTGTCATAGGCAAACATCCAAACGGTATCACTCCCATCACTGCGAATTTTCTGG
CTCC

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2E390TF 484 0 0
AGTTAACGATGTTGGTTGTTTATTATAATTTATTTTGGTACGTTGTTGGTTATTAAGATT
ACAACAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGCAAGGCCTCTCTTGATATCCTGGACCA
GCCTTTTGGAAATGGTTTTGTAGGCTCTTTCCGAGGGATGAACAAAGTCATAGAAGACGT
GACTATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAGGCATACAACAACACCCATTATTGG
CATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTTTATAACATCCATAAGAGTATTGAACATGT
CGACATAGACAAATTTTGCACCACGAAAACCGGCTTCGTTTGGCCAAGTTTTAACACCAC
TCCTCAATTTTCCGTTATACCTTTCAGCTAATAGATTTCCGAATAAGTTACACCTACCCA
TGATTCTTGTCATAGGCAAACATCCAAACGGTATCACTCCCATCACTGCGAATTTTCTGG
CTCC

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2D112JQ 712 0 0
AGCATAACACAACATATTTTATAAAAAATACACCCGCATAGGCGTGCGGGTCAAAATCTA
GTATATAATTAACTAACAATGTTTTTTTGTTTGGGTGTAACTAGTTAACGATGTTTTTTC
TTTTTGGAAAACTGATTAGTTAACGATGTTGGTTGTTTATTATAATTTATTTTGGTACGT
TGTTGGTTATTAAGATTACAACAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGCAAGGCCTCT
CTTGATATCCTGGACCAGCCTTTTGGAAATGGTTTTGTAGGCTTTTTCCGAGGGATGAAC
AAAGTCATAGAAGACGTGACTATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAGGCATACA
ACAACACCCATTATTGGCATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTTTATAACATCCAT
AAGAGTATTGAACATGTCGACATAGACAAATTTTGCACCACGAAAACCGGCTTCGTTTGG
CCAAGTTTTAACACCACTCCTCAATTTTCCGTTGTACCTTTCAGCTAATAAATTTCCGAA
TAAGTTACACCTACCCATGATTCTTGTCATAGGCAAACATCCAAACGGTATCACTCCCAT
CACTGCGAATTTTCTGGCTCCTTGATCATACATTTGTTTCATAAAATTTTTGTTCCAACT
AGTTAGTTTAGTGGTGTAAGCACCACTCGTCACATATCCTCGCATGAATGCA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2G295JQ 585 0 0
GGAAAACTGATTAGTTAACGATGTTGGTTGTTTATTATAATTTATTTTGGTACGTTGTTG
GTTATTAAGATTACAACAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGCAAGGCCTCTCTTGA
TATCCTGGACCAGCCTTTTGGAAATGGTTTTGTAGGCTTTTTCCGAGGGATGAACAAAGT
CATAGAAGACGTGACTATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAGGCATACAACAAC
ACCCATTATTGGCATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTTTATAACATCCATAAGAG
TATTGAACATGTCGACATAGACAAATTTTGCACCACGAAAACCGGCTTCGTTTGGCCAAG
TTTTAACACCACTCCTCAATTTTCCGTTGTACCTTTCAGCTAATAGATTTCCGAATAAGT
TACACCTACCCATGATTCTTGTCATAGGCAAACATCCAAACGGTATCACTCCCATCACTG
CGAATTTTCTGGCTCCTTGATCATACATTTGTTTCATAAAATTTTTGTTCCAACTAGTTA
GTT*AGTGGTGTAAGCACCACTCGTCACATATCCTCGCATGAATG

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2G623JQ 402 0 0
TGACTATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAGGCATACAACAACACCCATTATTG
GCATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTT*ATAACATCCATAAAAGTATTGAACATG
TCGACATAAACAAATTTTGCACCACGAAAACCGGCTTCGTTTGGCCAAGTTTTAACACCA
CTCCTCAATTTTCCGTTGTACCTTTCAGCTAATAGATTTCCGAATAAGTTACACCTACCC
ATGATTCTTGTCATAGGCAAACATCCAAACGGTATCACTCCCATCACTGCGAATTTTCTG
GCTCCTTGATCATACATTTGTTTCATAAAATTTTTGTTCCAACTAGTTAGTTTAGTGGTG
TAAGCACCACTCGTCACATATCCTCGCATGAATGCAGATCGA

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR2GZ73JQ 590 0 0
GGTACGTTGTTGGTTATTAAGATTACAACAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGCAA
GGCCTCTCTTGATATCCTGGACCAGCCTTTTGGAAATGGTTTTGTAGGCTTTTTCCGAGG
GATGAACAAAGTCATAGAAGACGTGACTATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAG
GCATACAACAACGCCCATTATTGGCATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTTTATAA
CATCCATAAGAGTATTGAACATGTCGACATAGACAAATTTTGCACCACGAAAACCGGCTT
CGTTTGGCCAAGTTTTAACACCACTCCTCAATTTTCCGTTGTACCTTTCAGCTAATAGAT
TTCCGAATAAGTTACACCTACCCATGATTCTTGTCATAGGCAAACATCCAAACGGTATCA
CTCCCATCACTGCGAATTTTCTGGCTCCTTGATCATACATTTGTTTCATAAAATTTTTGT
TCCAACTAGTTAGTTTAGTGGTGTAAGCACCACTCGTCACATATCCTCGCATGAATGCAA
ATCGAGTTATAAAAAACGAGATTCCAAGATCATTATTTCCTTGAGAAACA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2CK85JQ 665 0 0
TT
TTAGTTAACGATGTTGGTTGTTTATTATAATTTATTTTGGTACGTTGTTGGTTATTAAGA
TTACAACAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGCAAGGCCTCTCTTGATATCCTGGAC
CAGCCTTTTGGAAATGGTTTTGTAGGCTTTTTCCGAGGGATGAACAAAGTCATAGAAGAC
GTGACTATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAGGCATACAACAACACCCATTATT
GGCATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTTTATAACATCCATAAGAGTATTGAACAT
GTCGACATAGACAAATTTTGCACCACGAAAACCGGCTTCGTTTGGCCAAGTTTTAACACC
ACTCCTCAATTTTCCGTTGTACCTTTCAGCTAATAGATTTCCGAATAAGTTACACCTACC
CATGATTCTTGTCATAGGCAAACATCCAAACGGTATCACTCCCATCACTGCGAATTTTCT
GGCTCCTTGATCATACATTTGTTTCATAAAATTTTTGTTCCAACTAGTTAGTTTAGTGGT
GTAAGCACCACTCGTCACATATCCTCGCATGAATGCAGATCGAGTCATAAAAAACGAGAT
TCCAAGATCATTATTTCCTTGAGAAATAAGATACACTGCGTTTGCAATGATTGAACTCGC
TTG

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR2DU86JQ 668 0 0
AACGATGTTGGTTGTTTATTATAATTTATTTTGGTACGTTGTTGGTTATTAAGATTACAA
CAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGCAAGGCCTCTCTTGATATCCTGGACCAGCCT
TTTGGAAATGGTTTTGTAGGCTTTTTCCGAGGGATGAACAAAGTCATAGAAGACGTGACT
ATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAGGCATACAACAACACCCATTATTGGCATT
ACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTTTATAACATCCATAAGAGTATTGAACATGTCGAC
ATAGACAAATTTTGCACCACGAAAACCGGCTTCGTTTGGCCAAGTTTTAACACCACTCCT
CAATTTTCCGTTGTACCTTTCAGCTAATAGATTTCCGAATAAGTTACACCTACCCATGAT
TCTTGTCATAGGCAAACATCCAAACGGTATCACTCCCATCACTGCGAATTTTCTGGCTCC
TTGATCATACATTTGTTTCATAAAAGTTTTGTTCCAACTAGTTAGTTTAGTGGTGTAAGC
ACCACTCGTCACATATCCTCGCATGAATGCAGATCGAGTCATAAAAAACGAGATTCCAAG
ATCATTATTTCCTTGAGAAACAAGATACACTGCGTTTGCAATGATTGAACTCGCTTGCGT
AGGTGCTA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2FS24JQ 693 0 0
AGTTAACAATGTTGGTTGTTTATTATAATTTATTTTGGTACGTTGTTGGTTATTAAGATT
ACAACAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGCAAGGCCTCTCTTGATATCCTGGACCA
GCCTTTTGGAAATGGTTTTGTAGGCTTTTTCCGAGGGATGAACAAAGTCATAGAAGACGT
GACTATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAGGCATACAACAACACCCATTATTGG
CATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTTTATAACATCCATAAGAGTACTGAACATGT
CGACATAGACAAATTTTGCACCACGAAAACCGGCTTCGTTTGGCCAAGTTTTAACACCAC
TCCTCAATTTTCCGTTGTACCTTTCAGCTAATAGATTTCCGAATAAGTTACACCTACCCA
TGATTCTTGTCATAGGCAAACATCCAAACGGTATCACTCCCATCACTGCGAATTTTCTGG
CTCCTTGATCATACATTTGTTTCATAAAATTTTTGTTCCAACTAGTTAGTTTAGTGGTGT
AAGCACCCCTCGTCACATATCCTCGCATGAATGCAGATCGAGTCATAAAAAACGAGATTC
CAAGATCATTATTTCCTTGAGAAACAAGATACACTGCGTTTGCAATGATTGAACTCGCTT
GCGTAGGTGCTACGACCCCTAGCTTCATTATGT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2G252JQ 737 0 0
GGAAAACTGATTAGTTAACGATGTTGGTTGTTTATTATAATTTATTTTGGTACGTTGTTG
GTTATTAAGATTACAACAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGCAAGGCCTCTCTTGA
TATCCTGGACCAGCCTTTTGGAAATGGTTTTGTAGGCTTTTTCCGAGGGATGAACAAAGT
CATAGAAGACGTGACTATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAGGCATACAACAAC
ACCCATTATTGGCATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTTTATAACATCCATAAGAG
TATTGAACATGTCGACATAGACAAATTTTGCACCACGAAAACCGGCTTCGTTTGGCCAAG
TTTTAACACCACTCCTCAATTTTCCGTTGTACCTTTCAGCTAATAGATTTCCGAATAAGT
TACACCTACCCATGATTCTTGTCATAGGCAAACATCCAAACGGTATCACTCCCATCACTG
CGAATTTTCTGGCTCCTTGATCATACATTTGTTTCATAAAATTTTTGTTCCAACTAGTTA
GTT*AGTGGTGTAAGCACCACTCGTCACATATCCTCGCATGAATGCAGATCGAGTCATAA
AAAACGAGATTCCAAGATCATTATTTCCTTGAGAAACAAGATACACTGCGTTTGCAATGA
TTGAACTCGCTTGCGTAGGTGCTACGACCCTTAGCTTCATTATGTACTTTTTGTAGTCAC
TTATTTGGTCGCTTGGC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2CE29JQ 752 0 0
AGTTAACGATGTTGGTTGTTTATTATAATTTATTTTGGTACGTTGTTGGTTATTAAGATT
ACAACAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGCAAGGCCTCTCTTGATATCCTGGACCA
GCCTTTTGGAAACGGTTTTGTAGGCTTTTTCCGAGGGATGAACAAAGTCATAGAAGACGT
GACTATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAGGCATACAACAACACCCATTATTGG
CATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTTTATAACATCCATAAGAGTATTGAACATGT
CGACATAGACAAATTTTGCACCACGAAAACCGGCTTCGTTTGGCCAAGTTTTAACGCCAC
TCCTCAATTTTCCGTTGTACCTTTCAGCTAATAGATTTCCGAATAAGTTACACCTACCCA
TGATTCTTGTCATAGGCAAACATCCAAACGGTATCACTCCCATCACTGCGAATTTTCTGA
CTCCTTGATCATACATTTGTTTCATAAAATTTTTGTTCCAACTAGTTAGTTTAGTGGTGT
AAGCACCACTCGTCACATATCCTCGCATGAATGCAGATCGAGTCATAAAAAACGAGATTC
CAAGATCATTATTTCCTTGAGAAACAAGATACACTGCGTTTGCAATGATTGAACTCGCTT
GCGTAGGTGCTACGACCCTTAGCTTCATTATGTACTTTTTGTAGTCACTTATTTGGTCGC
TTGGCTTTAAAACTCTCATTAGTCTAGATGTA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2A205JQ 798 0 0
AGTTAACGATGTTGGTTGTTTATTATAATTTATTTTGGTACGTTGTTGGTTATTAAGATT
ACAACAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGCAAGGCCTCTCTTGATATCCTGGACCA
GCCTTTTGGAAATGGTTTTGTAGGCTTTTTCCGAGGGATGAACAAAGTCATAGAAGACGT
GACTATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAGGCATACAACAACACCCATTATTGG
CATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTTTATAACATCCATAAGAGTATTGAACATGT
CGACATAGACAAATTTTGCACCACGAAAACTGGCTTCGTTTGGCCAAGTTTTAACACCAC
TCCTCAATTTTCCGTTGTACCTTTCAGCTAATAGATTTCCGAATAAGTTACACCTACCCA
TGATTCTTGTCATAGGCAGACATCCAAACGGTATCACTCCCATCACTGCGAATTTTCTGG
CTCCTTGATCATACATTTGTTTCATAAAATTTTTGTTCCAACTAGTTAGTTTAGTGGTGT
AAGCACCACTCGTCACATATCCTCGCATGAATGCAGATCGAGTCATAAAAAACGAGATTC
CAAGATCATTATTTCCTTGAGAAACAAGATACACTGCGTTTGCAATGATTGAACTCGCTT
GTGTAGGTGCTACGACCCTTAGCTTCATTATGTACTTTTTGTAGTCACTTATTTGGTCGC
TTGGCTTTAAAACTCTCATTAGTCTAGATGTAACAGGGTCGACTCCTGCACCACCTGATG
CGAAACAAACACCAGTTT

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2AA74JQ 793 0 0
AGTTAACGATGTTGGTTGTTTATTATAATTTATTTTGGTACGTTGTTGGTTATTAAGATT
ACAACAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGCAAGGCCTCTCTTGATATCCTGGACCA
GCCTTTTGGAAATGGTTTTGTAGGCTTTTTCCGAGGGATGAACAAAGTCATAGAAGACGT
GACTATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAGGCATACAACAACACCCATTATTGG
CATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTTTATAACATCCATAAGAGTATTGAACATGT
CGACATAGACAAATTTTGCACCACGAAAACCGGCTTCGTTTGGCCAAGTTTTAACACCAC
TCCTCAATTTTCCGTTGTACCTTTCAGATAATAGATTTCCGAATAAGTTACACCTACCCA
TGATTCTTGTCATAGGCAAACATCCAAACGGTATCACTCCCATCACTGCGAATTTTCTGG
CTCCTTGATCATACATTTGTTTCATAAAATTTTTGTTCCAACTAGTTAGTTTAGTGGTGT
AAGCACCACTCGTCACATATCCTCGCATGAATGCAGATCGAGTCATAAAAAACGAGATTC
CAAGATCATTATTTCCTTGAGAAACAAGATACACTGCGTTTGCAATGATTGAACTCGCTT
GCGTAGGTGCTACGACCCTTAGCTTCATTATGTACTTTTTGTAGTCACTTATTTGGTCGC
TTGGCTTTAAAACTCTCATTAGTCTAGATGTAACGGGGTCGACTCCTGCACCACCTGATG
CGAAACAAACACC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2AA74TF 757 0 0
GGTACGTTGTTGGTTATTAAGATTACAACAATATAGGATCGTAAGACTGAAACTAGGCAA
GGCCTCTCTTGATATCCTGGACCAGCGTTTTGGAAATGGTTTTGTAGGCTTTTTCCGAGG
GATGAACAAAGTCATAGAAGACGTGACTATGAGGATTTACGCAAGGTACTATCGCTGTAG
GCATACAACAACACCCATTATTGGCATTACTAAATCCGTATCTTCTATAATTTTTTATAA
CATCCATAAGAGTATTGAACATGTCGACATAGACAAATTTTGCACCACGAAAACCGGCTT
CGTTTGGCCAAGTTTTAACACCACTCCTCAATTTTCCGTTGTACCTTTCAGATAATAGAT
TTCCGAATAAGTTACACCTACCCATGATTCTTGTCATAGGCAAACATCCAAACGGTATCA
CTCCCATCACTGCGAATTTTCTGGCTCCTTGATCATACATTTGTTTCATAAAATTTTTGT
TCCAACTAGTTAGTTTAGTGGTGTAAGCACCACTCGTCACATATCCTCGCATGAATGCAG
ATCGAGTCATAAAAAACGAGATTCCAAGATCATTATTTCCTTGAGAAACAAGATACACTG
CGTTTGCAATGATTGAACTCGCTTGCGTAGGTGCTACGACCCTTAGCTTCATTATGTACT
TTTTGTAGTCACTTATTTGGTCGCTTGGCTTTAAAACTCTCATTAGTCTAGATGTAACGG
GGTCGACTCCTGCACCACCTGATGCGAAACAAACACC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 5 21

CO CL30Contig1 1060 4 17 U
GGACAACCTCCTTGTCCGATATATTTTAACAGCAAGAGAACTCAAAACAGTTTAATTTTC
TACAAAACTAGTCTTTTTGGGGTTTTAGTTGGTATCGTCGGAAGAGAGAAAAATGTTGGG
AATTTTCAGCGGAGCTATAGTATCTTTGCCAGAAGAGCTGGTGGCCGCAGGAAACCGAAC
TCCGTCGCCGAAGACAAGCGGATCGGTCCTTGTCAACAAATTCGTAGAGAAAAATCCCTC
CGCCGTGTCCGTACAGGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACCACAAAGAGAG
TCCTCTCCGGCCAAGGTCATTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTCCAAGGCTC
ACTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAACAACAATATGGGCTTGCAAAGAACGCAAACGAGGT
TCTCTTGGCCATCGAGGCTTATAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCGGCCAACCA
TGTCGTGTCTCACCTAAGCGGCGATTTTGCCTTCGTGGTCTTCGACAAATCAACCTCCAC
TCTGTTTGTAGCTTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTCCATTGTATTGGGGGATAACAGCTGA
TGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATATTGAGTTGCTAAAAGGTGCTTGTGGGAAATCTCT
TGCTTCCTTCCCTCAAGGCTGTTTTTACTCGACTGCGTTAGGTGGGCTTAGGAGCTTTGA
GAACCCTAAGAACAAGATCACTGCCATCCCTGCTAAAGAGGAAGAAATTTGGGGAGCCAC
CTTCAAGGTGGAAGGAGCAGCAGTTCTTGCACATGGAGATTGAGAAAAAAAAATCAAGCT
CCATCTCTCTTAATATCGAAACTCCAAAATAATGATGTAGAGAAAACAAGAAGCTGTTCT
ATGAGTTTTTCTTTAAGCTATCAAATGGTTGGGGATGATGTGTGTAGTGTTGTGATCTCT
GTTTTGTCTTTTGTTTCTCTGTACAGCTTGTGTTTGTCTCTTCTGGTGTTTCTAGTGTGT
TCGTCCCAATAAGTTATGTCTCATAGACTCTAAATCTACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP50TF U 1
AF RR2EJ44TF U 1
AF RR2F743TF U 1
AF RR2BP50JQ C 264
BS 1 49 RR2BP50TF
BS 50 50 RR2EJ44TF
BS 51 637 RR2BP50TF
BS 638 640 RR2F743TF
BS 641 641 RR2BP50JQ
BS 642 677 RR2F743TF
BS 678 678 RR2BP50JQ
BS 679 685 RR2F743TF
BS 686 686 RR2BP50JQ
BS 687 701 RR2F743TF
BS 702 702 RR2BP50JQ
BS 703 711 RR2F743TF
BS 712 712 RR2BP50JQ
BS 713 724 RR2F743TF
BS 725 725 RR2BP50JQ
BS 726 736 RR2F743TF
BS 737 1060 RR2BP50JQ

RD RR2BP50TF 637 0 0
GGACAACCTCCTTGTCCGATATATTTTAACAGCAAGAGAACTCAAAACATTTTAATTTTC
TACAAAACTAGTCTTTTTGGGGTTTTAGTTGGTATCGTCGGAAGAGAGAAAAATGTTGGG
AATTTTCAGCGGAGCTATAGTATCTTTGCCAGAAGAGCTGGTGGCCGCAGGAAACCGAAC
TCCGTCGCCGAAGACAAGCGGATCGGTCCTTGTCAACAAATTCGTAGAGAAAAATCCCTC
CGCCGTGTCCGTACAGGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACCACAAAGAGAG
TCCTCTCCGGCCAAGGTCATTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTCCAAGGCTC
ACTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAACAACAATATGGGCTTGCAAAGAACGCAAACGAGGT
TCTCTTGGCCATCGAGGCTTATAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCGGCCAACCA
TGTCGTGTCTCACCTAAGCGGCGATTTTGCCTTCGTGGTCTTCGACAAATCAACCTCCAC
TCTGTTTGTAGCTTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTCCATTGTATTGGGGGATAACAGCTGA
TGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATATTGAGTTGCTA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2EJ44TF 637 0 0
GGACAACCTCCTTGTCCGATATATTTTAACAGCAAGAGAACTCAAAACAGTTTAATTTTC
TACAAAACTAGTCTTTTTGGGGTTTTAGTTGGTATCGTCGGAAGAGAGAAAAATGTTGGG
AATTTTCAGCGGAGCTATAGTATCTTTGCCAGAAGAGCTGGTGGCCGCAGGAAACCGAAC
TCCGTCGCCGAAGACAAGCGGATCGGTCCTTGTCAACAAATTCGTAGAGAAAAATCCCTC
CGCCGTGTCCGTACAGGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACCACAAAGAGAG
TCCTCTCCGGCCAAGGTCATTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTCCAAGGCTC
ACTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAACAACAATATGGGCTTGCAAAGAACGCAAACGAGGT
TCTCTTGGTCATCGAGGCTTATAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCGGCCAACCA
TGTCGTGTCTCACCTAAGCGGCGATTTTGCCTTCGTGGTCTTCGACAAATCAACCTCCAC
TCTGTTTGTAGCTTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTCCATTGTATTGGGGGATAACAGCTGA
TGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATATTGAGTTGCTA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2F743TF 736 0 0
GGACAACCTCCTTGTCCGATATATTTTAACAGCAAGAGAACTCAAAACAGTTTAATTTTC
TACAAAACTAGTCTTTTTGGGGTTTTAGTTGGTATCGTCGGAAGAGAGAAAAATGTTGGG
AATTTTCAGCGGAGCTATAGTATCTTTGCCAGAAGAGCTGGTGGCCGCAGGAAACCGAAC
TCCGTCGCCGAAGACAAGCGGATCGGTCCTTGTCAACAAATTCGTAGAGAAAAATCCCTC
CGCCGTGTCCGTACAGGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACCACAAAGAGAG
TCCTCTCCGGCCAAGGTCATTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTCCAAGGCTC
ACTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAACAACAATATGGGCTTGCAAAGAACGCAAACGAGGT
TCTCTTGGTCATCGAGGCTTATAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCGGCCAACCA
TGTCGTGTCTCACCTAAGCGGCGATTTTGCCTTCGTGGTCTTCGACAAATCAACCTCCAC
TCTGTTTGTAGCTTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTCCATTGTATTGGGGGATAACAGCTGA
TGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATATTGAGTTGCTAAAATGTGCTTGTGGGAAATCTCT
TGCTTCCTTCCCTCAAG*CTGTTTT*ACTCGACTGCGTTAG*TGGGCTTAG*AGCTTTGA
GAACTCTAAGAACAAG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2BP50JQ 797 0 0
ACTATGTGCAGCT*GCTTACAGCCACCACAAAGAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCATTTG
GGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTCCAAGGCTCACTTGACAACCTAGGAAGCTTGA
AACAACAATATGGGCTTGCAAAGAACGCAAACGAGGTTCTCTTGGCCATCGAGGCTTATA
AGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCGGCCAACCATGTCGTGTCTCACCTAAGCGGCG
ATTTTGCCTTCGTGGTCTTCGACAAATCAACCTCCACTCTGTTTGTAGCTTCTGACCAAG
AAGGTAAGGTTCCATTGTATTGGGGGATAACAGCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATG
ATATTGAGTTGCTAAAAGGTGCTTGTGGGAAATCTCTTGCTTCCTTCCCTCAAGGCTGTT
TTTACTCGACTGCGTTAGGTGGGCTTAGGAGCTTTGAGAACCCTAAGAACAAGATCACTG
CCATCCCTGCTAAAGAGGAAGAAATTTGGGGAGCCACCTTCAAGGTGGAAGGAGCAGCAG
TTCTTGCACATGGAGATTGAGAAAAAAAAATCAAGCTCCATCTCTCTTAATATCGAAACT
CCAAAATAATGATGTAGAGAAAACAAGAAGCTGTTCTATGAGTTTTTCTTTAAGCTATCA
AATGGTTGGGGATGATGTGTGTAGTGTTGTGATCTCTGTTTTGTCTTTTGTTTCTCTGTA
CAGCTTGTGTTTGTCTCTTCTGGTGTTTCTAGTGTGTTCGTCCCAATAAGTTATGTCTCA
TAGACTCTAAATCTACC

QA 1 797 1 797
DS 



CO CL30Contig2 779 5 17 U
AGGGGACAACCTCCATGTCCGATATATTTTATTAGCAGCAAGAGAACTCTTAACAGTTTA
ATTTTCTAAATAACTAGTTTTTTTGGGGTTTTAGTTGCTATCGTCGGAAGAGAGATAAAA
ATGTTGGGAATTTTCAGCGGAGCTATAGTATCTTTGCCGGAAGAGCTGGTGGCCGCCGGG
AACCGAACTCCGTCGCCGAAGACAACTGGATCGGTCCTAGTCAACAAGTTCGTAGAGAAA
AATCCCTCCGCCGTGTCCGTACAGGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACCAC
AAAGAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCGTTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTC
CAAGGATCACTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAACAACAATATGGGCTTGCGAAGAACGCA
AACGAGGTTCTCTTGGTCATCGAGGCTTATAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCA
GCCAACCATGTCGTGTCTCACCTAAGCGGCGATTTCGCCTTCGTGGTCTTCGACAAATCA
ACCTCCACTCTGTTTGTAGCCTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTCCGTTGTATTGGGGAATA
ACAGCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATGTTGAGTTGCTAAAAAGTGCTTGTGGC
AAATCTCTTGCTTCCTTCCCTCAAGCTGTTTCTACTCGACTGCGTTAGTGGGCTTAGGAG
TTTTGAGAACCCTAAGAACAAGATCACTGCCATTCCTGCTAAAGAGGAGAATTGGGGAG


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E831TF U 3
AF RR2CZ09TF U 4
AF RR2GR47TF U 4
AF RR2BZ63TF U 1
AF RR2FG84TF U 4
BS 1 265 RR2BZ63TF
BS 266 266 RR2E831TF
BS 267 574 RR2BZ63TF
BS 575 575 RR2FG84TF
BS 576 621 RR2BZ63TF
BS 622 622 RR2CZ09TF
BS 623 717 RR2BZ63TF
BS 718 718 RR2FG84TF
BS 719 728 RR2BZ63TF
BS 729 729 RR2FG84TF
BS 730 738 RR2BZ63TF
BS 739 739 RR2FG84TF
BS 740 750 RR2BZ63TF
BS 751 751 RR2FG84TF
BS 752 755 RR2BZ63TF
BS 756 756 RR2FG84TF
BS 757 779 RR2BZ63TF

RD RR2E831TF 568 0 0
G
GGACAACCTCCATGTCCGATATATTTTATTAGCAGCAAGAGAACTCTTAACAGTTTAATT
TTCTAAATAACTAGTTTTTTTGGGGTTTTAGTTGCTATCGTCGGAAGGGAGATAAAAATG
TTGGGAATTTTCAGCGGAGCTATAGTATCTTTGCCGGAAGAGCTGGTGGCCGCCGGGAAC
CGAACTCCGTCGCCGAAGACAACTGGATCGGTCCTAGTCAACAAGTTCGTAGAGAAAAAT
CCCTCCGCCGTGTCCGTACAGGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACCACAAA
GAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCGTTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTCCAA
GGATCACTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAACAACAATATGGGCTTGCGAAGAACGCAAAC
GAGGTTCTCTTGGTCATCGAGGCTTATAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCAGCC
AACCATGTCGTGTCTCACCTAAGCGGCGATTTCGCCTTCGTGGTCTTCGACAAATCAACC
TCCACTCTGTTTGTAGCCTCTGACCAA

QA 2 568 2 568
DS 

RD RR2CZ09TF 646 0 0
GGACAACCTCCATGTCCGATATATTTTATTAACAGCAAGAGAACTCTTAACAGTTTAATT
TTCTAAATAACTAGTTTTTTTGGGGTTTTAGTTGCTATCGTCGGAAGAGAGATAAAAATG
TTGGGAATTTTCAGCGGAGCTATAGTATCTTTGCCGGAAGAGCTGGTGGCCGCCGGGAAC
CGAACTCCGTCGCCGAAGACAACTGGATCGGTCCTAGTCAACAAGTTCGT*GAGAAAAAT
CCCTCCGCCGTGTCCGTACAGGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACCACAAA
GAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCGTTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTCCAA
GGATCACTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAACAACAATATGGGCTTGCGAAGAACGCAAAC
GAGGTTCTCTTGGTCATCGAGGCTTATAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCAGCC
AACCATGTCGTGTCTCACCTAAGCGGCGATTTCGCCTTCGTGGTCTTCGACAAATCAACC
TCCACTCTGTTTGTAGCCTCTGACCAAGAAG*TAAGGTTCCGTTGTATTGGGGAATAACA
GCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATGTTGAGTTGCTAAAAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2GR47TF 709 0 0
GGACAACCTCCATGTCCGATATATTTTATTAGCAGCAAGAGAACTCTTAACAGTTTAATT
TTCTAAATAACTAGTTTTTTTGGGGTTTTAGTTGCTATCGTCGGAAGAGAGATAAAAATG
TTGGGAATTTTCAGCGGAGCTATAGTATCTTTGCCGGAAGAGCTGGTGGCCGCCGGGAAC
CGAACTCCGTCGCCGAAGACAACTGGATCGGTCCTAGTCAACAAGTTCGTAGAGAAAAAT
CCCTCCGCCGTGTCCGTACAGGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACCACAAA
GAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCGTTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTCCAA
GGATCACTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAACAACAATATGTGCTTGCGAAGAACGCAAAC
GAGGTTCTCTTGGTCATCGAGGCTTATAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCAGCC
AACCATGTCGTGTCTCACCTAAGCGGCGATTTCGCCTTCGTGGTCTTCGACAAATCAACC
TCCACTCTGTTTGTAGCCTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTCCGTTGTATTGGGGAATAACA
GCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATGTTGAGTTGCTAAAAAGTGTTTGTGGCAA*
TCTCTTGCTTCCTTCCCTCAAGCTGTTTCTACTCGACTGCGTTAGTGGG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2BZ63TF 779 0 0
AGGGGACAACCTCCATGTCCGATATATTTTATTAGCAGCAAGAGAACTCTTAACAGTTTA
ATTTTCTAAATAACTAGTTTTTTTGGGGTTTTAGTTGCTATCGTCGGAAGAGAGATAAAA
ATGTTGGGAATTTTCAGCGGAGCTATAGTATCTTTGCCGGAAGAGCTGGTGGCCGCCGGG
AACCGAACTCCGTCGCCGAAGACAACTGGATCGGTCCTAGTCAACAAGTTCGTAGAGAAA
AATCCCTCCGCCGTGTCCGTACAGGCCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACCAC
AAAGAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCGTTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTC
CAAGGATCACTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAACAACAATATGGGCTTGCGAAGAACGCA
AACGAGGTTCTCTTGGTCATCGAGGCTTATAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCA
GCCAACCATGTCGTGTCTCACCTAAGCGGCGATTTCGCCTTCGTGGTCTTCGACAAATCA
ACCTCCACTCTGTTTGTAGCCTCTGACCAAGAAG*TAAGGTTCCGTTGTATTGGGGAATA
ACAGCTGATGGGTATGTGGCACTTGCTGATGATGTTGAGTTGCTAAAAAGTGCTTGTGGC
AAATCTCTTGCTTCCTTCCCTCAAGCTGTTTCTACTCGACTGCGTTAGTGGGCTTAG*AG
TTTTGAGA*CCCTAAGAA*AAGATCACTGC*ATTC*TGCTAAAGAGGAGAATTGGGGAG

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2FG84TF 761 0 0
GGACAACCTCCATGTCCGATATATTTTATTAGCAGCAAGAGAACTCTTAACAGTTTAATT
TTCTAAATAACTAGTTTTTTTGGGGTTTTAGTTGCTATCGTCGGAAGAGAGATAAAAATG
TTGGGAATTTTCAGCGGAGCTATAGTATCTTTGCCGGAAGAGCTGGTGGCCGCCGGGAAC
CGAACTCCGTCGCCGAAGACAACTGGATCGGTCCTAGTCAACAAGTTCGTAGAGAAAAAT
CCCTCCGCCGTGTCCGTACAGGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACCACAAA
GAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCGTTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTCCAA
GGATCACTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAACAACAATATGGGCTTGCGAAGAACGCAAAC
GAGGTTCTCTTGGTCATCGAGGCTTATAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCAGCC
AACCATGTCGTGTCTCACCTAAGCGGCGATTTCGCCTTCGTGGTCTTCGACAAATCAACC
TCCACTCTGTTTGTAGCCTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTCCGTTGTATTGGGGAATAACA
GCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATGTTGAGTTGCTAAAAAGTGCTTGTGGCAAA
TCTCTTGCTTCCTTCCCTCAAGCTGTTTCTACTCGACTGCGTTAGTGGGCTTAGGAGTTT
TGAGAACCCTAAGAACAAGATCACTGCCATTCCTGCTAAAG

QA 1 761 1 761
DS 



CO CL30Contig3 1055 5 4 U
GGACCAACCTCCATGTCCGAATCCGATATATATCTAACAGAGAAGTAACTCAGAGCTTTA
AGTTTCTAGTAAACTATTTGGATATTGAGGTTCTAATTGTCTAGTAGCGGAAAAGAGAGA
AAATGTTGGGAATTTTTAGCGGAGCTATAGTATCGTTGCCGGAAGAGCTGGTGGCCGCCG
GCAGCCGAACTCCGTCTCCGAAGACAACCGGAGCGGCTCTAGTTAACAAGTTTATCAAGA
AAAACCCATCCGCCGTGTCCGTACAAGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACC
ACAAAGAGAGTCCTCTGCGTCCCAGGTCATTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGT
TCCAAGGCTCACTTGACAACCTAGGAAGTTTGAAGCAGCAATACGGGCTTGCAAAGAATG
CAAATGAGGTTCTCCTGGTCATCGAGGCTTACAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACC
CTGCCAACCACGTTGTAGCACACCTAAGTGGTGATTTCGCCTTTGTGGTTTTCGATAAAT
CAACCTCCACACTCTTTGTAGCTTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTCCATTGTATTGGGGGA
TAACAGCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATGTTGAGTTGCTAAAAGGTGCCTGTG
GCAAGTCTCTTGCTTCTTTCCCTCAAGGATGTTTCTACTCAACTACGTTAGGTGGGCTTA
GGAGCTTTGAGAACCCTAAGAACAAGATCACCGCCATTCCTGCTAAAGAGGAAGAAATTT
GGGGAGCCACCTTCAAGGTGGAAGGAGCAACAGTTCTTGCAGATTGAGAATGGAGAAAAG
AAATTCAAGACCCATCTTTTCTTAATCTCGGAACTCTTCAACAGCAAAATGAAAATAATC
ATGTAGAGAGAAACAAGGTGTTGTATGAGTTCTTTAAGCTATCATGGTGTGTTGTGTCGT
ATCTCTCTCTTTTGTCTCTTGCTTCTTTGTACAGCCCGTGTCTGTCTATTGTTCCAATAA
GTTACGCCTCAAACTCCCAAAAATTCTAACTTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR24TF U 1
AF RR2CS06TF U 1
AF RR2EE60TF U 1
AF RR2CR24JQ C 226
AF RR2EE60JQ C 537
BS 1 646 RR2CR24TF
BS 647 707 RR2CS06TF
BS 708 960 RR2CR24JQ
BS 961 1055 RR2EE60JQ

RD RR2CR24TF 646 0 0
GGACCAACCTCCATGTCCGAATCCGATATATATCTAACAGAGAAGTAACTCAGAGCTTTA
AGTTTCTAGTAAACTATTTGGATATTGAGGTTCTAATTGTCTAGTAGCGGAAAAGAGAGA
AAATGTTGGGAATTTTTAGCGGAGCTATAGTATCGTTGCCGGAAGAGCTGGTGGCCGCCG
GCAGCCGAACTCCGTCTCCGAAGACAACCGGAGCGGCTCTAGTTAACAAGTTTATCAAGA
AAAACCCATCCGCCGTGTCCGTACAAGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACC
ACAAAGAGAGTCCTCTGCGTCCCAGGTCATTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGT
TCCAAGGCTCACTTGACAACCTAGGAAGTTTGAAGCAGCAATACGGGCTTGCAAAGAATG
CAAATGAGGTTCTCCTGGTCATCGAGGCTTACAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACC
CTGCCAACCACGTTGTAGCACACCTAAGTGGTGATTTCGCCTTTGTGGTTTTCGATAAAT
CAACCTCCACACTCTTTGTAGCTTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTCCATTGTATTGGGGGA
TAACAGCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATGTTGAGTTGCT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2CS06TF 707 0 0
GGACCAACCTCCATGTCCGAATCCGATATATATCTAACAGAGAAGTAACTCAGAGCTTTA
AGTTTCTAGTAAACTATTTGGATATTGAGGTTCTAATTGTCTAGTAGCGGAAAAGAGAGA
AAATGTTGGGAATTTTTAGCGGAGCTATAGTATCGTTGCCGGAAGAGCTGGTGGCCGCCG
GCAGCCGAACTCCGTCTCCGAAGACAACCGGAGCGGCTCTAGTTAACAAGTTTATCAAGA
AAAACCCATCCGCCGTGTCCGTACAAGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACC
ACAAAGAGAGTCCTCTGCGTCCCAGGTCATTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGT
TCCAAGGCTCACTTGACAACCTAGGAAGTTTGAAGCAGCAATACGGGCTTGCAAAGAATG
CAAATGAGGTTCTCCTGGTCATCGAGGCTTACAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACC
CTGCCAACCACGTTGTAGCACACCTAAGTGGTGATTTCGCCTTTGTGGTTTTCGATAAAT
CAACCTCCACACTCTTTGTAGCTTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTCCATTGTATTGGGGGA
TAACAGCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATGTTGAGTTGCTAAAAGGTGCCTGTG
GCAAGTCTCTTGCTTCTTTCCCTCAAGGATGTTTCTACTCAACTACG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2EE60TF 683 0 0
GGACCAACCTCCATGTCCGAATCCGATATATATCTAACAGAGAAGTAACTCAGAGCTTTA
AGTTTCTAGTAAACTATTTGGATATTGAGGTTCTAATTGTCTAGTAGCGGAAAAGAGAGA
AAATGTTGGGAATTTTTAGCGGAGCTATAGTATCGTTGCCGGAAGAGCTGGTGGCCGCCG
GCAGCCGAACTCCGTCTCCGAAGACAACCGGAGCGGCTCTAGTTAACAAGTTTATCAAGA
AAAACCCATCCGCCGTGTCCGTACAAGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACC
ACAAAGAGAGTCCTCTGCGTCCCAGGTCATTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGT
TCCAAGGCTCACTTGACAACCTAGGAAGTTTGAAGCAGCAATACGGGCTTGCAAAGAATA
CAAATGAGGTTCTCCTGGTCATCGAGGCTTACAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACC
CTGCCAACCACGTTGTAGCACACCTAAGTGGTGATTTCGCCTTTGTGGTTTTCGATAAAT
CAACCTCCACACTCTTTGTAGCTTCTGACCAAGAAG*TAAGGTTCCATTGTATTGGGGGA
TAACAGCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATGTTGAGTTGCTAAAAGGTGCCTGTG
GCAAGTCTCTTGCTTCTTTCCCT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2CR24JQ 735 0 0
ACAAGTTTATCAAGAAAAACCCATCCGCCGTGTCCGTACAAGTCGGCGACTATGTGCAGC
TTGCTTACAGCCACCACAAAGAGAGTCCTCTGCGTCCCAGGTCATTTGGGGCTAAGGATG
AGATATTCTGCTTGTTCCAAGGCTCACTTGACAACCTAGGAAGTTTGAAGCAGCAATACG
GGCTTGCAAAGAATGCAAATGAGGTTCTCCTGGTCATCGAGGCTTACAAGACTCTCCGTG
ACAGAGCTCCTTACCCTGCCAACCACGTTGTAGCACACCTAAGTGGTGATTTCGCCTTTG
TGGTTTTCGATAAATCAACCTCCACACTCTTTGTAGCTTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTC
CATTGTATTGGGGGATAACAGCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATGTTGAGTTGC
TATAAGGTGCCTGTGGCAAGTCTCTTGCTTCTTTCCCTCAAGGATGTTTCTACTCAACTA
CGTTAGGTGGGCTTAGGAGCTTTGAGAACCCTAAGAACAAGATCACCGCCATTCCTGCTA
AAGAGGAAGAAATTTGGGGAGCCACCTTCAAGGTGGAAGGAGCAACAGTTCTTGCAGATT
GAGAATGGAGAAAAGAAATTCAAGACCCATCTTTTCTTAATCTCGGAACTCTTCAACAGC
AAAATGAAAATAATCATGTAGAGAGAAACAAGGTGTTGTATGAGTTCTTTAAGCTATCAT
GGTGTGTTGTGTCGT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2EE60JQ 519 0 0
AAATCAACCTCCACACTCTTTGTAGCTTCTGACCAAGAAGGTAAGGTTCCATTGTATTGG
GGGATAACAGCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATGTTGAGTTGCTAAAAGGTGCC
TGTGGCAAGTCTCTTGCTTCTTTCCCTCAAGGATGTTTCTACTCAACTACGTTGGGTGGG
CTTAGGAGCTTTGAGAACCCTAAGAACAAGATCACCGCCATTCCTGCTAAAGAGGAAGAA
ATTTGGGGAGCCACCTTCAAGGTGGAAGGAGCAACAGTTCTTGCAGATTGAGAATGGAGA
AAAGAAATTCAAGACCCATCTTTTCTTAATCTCGGAACTCTTCAACAGCAAAATGAAAAT
AATCATGTAGAGAGAAACAAGGTGTTGTATGAGTTCTTTAAGCTATCATGGTGTGTTGTG
TCGTATCTCTCTCTTTTGTCTCTTGCTTCTTTGTACAGCCCGTGTCTGTCTATTGTTCCA
ATAAGTTACGCCTCAAACTCCCAAAAATTCTAACTTCTC

QA 1 519 1 519
DS 



CO CL30Contig4 724 5 1 U
GAGTCATAACGATAAGGAGAAAGTAGATTTAGAGTCTTCTTTTTTTGGACAGAGTAGAAT
TAGAGTCTATGAGACATAACTTATTGGGACGAACACACTAGAAACGCCAGAAGAGACAAA
CACAAGCTGTACAGAGAAACAAAAGACAGAACAGAGATACAACACTACACACATCATCCC
CAACCATTGATAGCTTAAGGAAAAACTCATAGAACAGCTTCTTGTTTTCTCTACATCATT
ATTTTGTTTGCTGTTGGAGTTTCGATATTAAGAGGTCTCATTCTCCATGTGCAAGAACTG
TTGCTCCTTCCACCTTGAAGGTGGCTCCCCAAATTTCTTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAG
TGATCTTGTTCTTAGGGTTCTCAAAACTCCTAAGCCCACCTAACGCAGTCGAGTAGAAAC
AGCCTTGAGGGAAGGAAGCAAGAGATTTGCCACAAGCACTTTTTAGCAACTCAACATCAT
CAGCAAATGCCACATACCCATCAGCTGTTATTCCCCAATACAACGGAACCTTACCTTCTT
GGTCAGAGGCTACAAACAGAGTGGAGGTTGATTTGTCGAAGACCACGAAGGCGAAATCGC
CGCTTAGGTGAGACACGACATGGTTGGCTGGGTAAGGAGCTCTGTCACGGAGAGTCTTAT
AAGCCTCGATGACCAAGAGAACCTCGTTTGCGTTCTTCGCAAGCCCATATTGTTGTTTCA
AGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2GR47JQ U 79
AF RR2FY93JQ U 26
AF RR2FG84JQ U 47
AF RR2CZ09JQ U 9
AF RR2E831JQ U 1
BS 1 724 RR2E831JQ

RD RR2GR47JQ 341 0 0
ACTTATTGGGACGAACACACTAGAAACGCCAGAAGAGACAAACACAAGCTGTACAGAGAA
ACAAAAGACAGAACAGAGATACAACACTACACACATCATCCCCAACCATTGATAGCTTAA
GGAAAAACTCATAGAACAGCTTCTTGTTTTCTCTACATCATTATTTTGTTTGCTGTTGGA
GTTTCGATATTAAGAGGTCTCATTCTCCATGTGCAAGAACTGTTGCTCCTTCCACCTTGA
AGGTGGCTCCCCAAATTTCTTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAGTGATCTTGTTCTTAGGGT
TCTCAAAACTCCTAAGCCCACCTAACGCAGTCGAGTAAAAA

QA 1 341 1 341
DS 

RD RR2FY93JQ 381 0 0
GG
TTTAGAGTCTTCTTTTTTTGGACAGAGTAGAATTAGAGTCTATGAGACATAACTTATTGG
GACGAACACACTAGAAACGCCAGAAGAGACAAACACAAGCTGTACAGAGAAACAAAAGAC
AGAACAGAGATACAACACTACACACATCATCCCCAACCATTGATAGCTTAAGGAAAAACT
CATAGAACAGCTTCTTGTTTTCTCTACATCATTATTTTGTTTGCTGTTGGAGTTTCGATA
TTAAGAGGTCTCATTCTCCATGTGCAAGAACTGTTGCTCCTTCCACCTTGAAGGTGGCTC
CCCAAATTTCTTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAGTGATCTTGTTCTTAGGGTTCTCAAAAC
TCCTAAGCCCACCTAACGC

QA 3 381 3 381
DS 

RD RR2FG84JQ 534 0 0
GGACAGAGTAGAATTAGAGTCTATGAGACATAACTTATTGGGACGAACACACTAGAAACG
CCAAAAGAGACAAACACAAGCTGTACAGAGAAACAAAAGACAGAACAGAGATACAACACT
ACACACATCATCCCCAACCATTGATAGCTTAAGGAAAAACTCATAGGACAGCTTCTTGTT
TTCTCTACATCATTATTTTGTTTGCTGTTGGAGTTTCGATATTAAGAGGTCTCATTCTCC
ATGTGCAAGAACTGTTGCTCCTTCCACCTTGAAGGTGGCTCCCCAAATTTCTTCCTCTTT
AGCAGGAATGGCAGTGATCTTGTTCTTAGGGTTCTCAAAACTCCTAAGCCCACCTAACGC
AGTCGAGTAGAAACAGCCTTGAGGGAAGGAAGCAAGAGATTTGCCACAAGCACTTTTTAG
CAACTCAACATCATCAGCAAATGCCACATACCCATCAGCTGTTATTCCCCAATACAACGG
AACCTTACCTTCTTGGTCAGAGGCTACAAACAGAGTGGAGGTTGATTTGTCGAA

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2CZ09JQ 572 0 0
CG
GATAAGGAGAAAGTAGATTTAGAGTCTTCTTTTTTTGGACAGAGTAGAATTAGAGTCTAT
GAGACATAACTTATTGGGACGAGCACACTAGAAACGCCAGAAGAGACAAACACAAGCTGT
ACAGAGAAACAAAAGACAGAACAGAGATACAACACTACACACATCATCCCCAACCATTGA
TAGCTTAAGGAAAAACTCATAGAACAGCTTCTTGTTTTCTCTACATCATTATTTTGTTTG
CTGTTGGAGTTTCGATATTAAGAGGTCTCATTCTCCATGTGCAAGAACTGTTGCTCCTTC
CACCTTGAAGGTGGCTCCCCAAATTTCTTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAGTGATCTTGTT
CTTAGGGTTCTCAAAACTCCTAAGCCCACCTAACGCAGTCGAGTAGAAACAGCCTTGAGG
GAAGGAAGCAAGAGATTTGCCACAAGCACTTTTTAGCAACTCAACATCATCAGCAAATGC
CACATACCCATCAGCTGTTATTCCCCAATACAACGGAACCTTACCTTCTTGGTCAGAGGC
TACAAACAGAGTGGAGGTTGATTTGTCGAA

QA 3 572 3 572
DS 

RD RR2E831JQ 724 0 0
GAGTCATAACGATAAGGAGAAAGTAGATTTAGAGTCTTCTTTTTTTGGACAGAGTAGAAT
TAGAGTCTATGAGACATAACTTATTGGGACGAACACACTAGAAACGCCAGAAGAGACAAA
CACAAGCTGTACAGAGAAACAAAAGACAGAACAGAGATACAACACTACACACATCATCCC
CAACCATTGATAGCTTAAGGAAAAACTCATAGAACAGCTTCTTGTTTTCTCTACATCATT
ATTTTGTTTGCTGTTGGAGTTTCGATATTAAGAGGTCTCATTCTCCATGTGCAAGAACTG
TTGCTCCTTCCACCTTGAAGGTGGCTCCCCAAATTTCTTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAG
TGATCTTGTTCTTAGGGTTCTCAAAACTCCTAAGCCCACCTAACGCAGTCGAGTAGAAAC
AGCCTTGAGGGAAGGAAGCAAGAGATTTGCCACAAGCACTTTTTAGCAACTCAACATCAT
CAGCAAATGCCACATACCCATCAGCTGTTATTCCCCAATACAACGGAACCTTACCTTCTT
GGTCAGAGGCTACAAACAGAGTGGAGGTTGATTTGTCGAAGACCACGAAGGCGAAATCGC
CGCTTAGGTGAGACACGACATGGTTGGCTGGGTAAGGAGCTCTGTCACGGAGAGTCTTAT
AAGCCTCGATGACCAAGAGAACCTCGTTTGCGTTCTTCGCAAGCCCATATTGTTGTTTCA
AGCT

QA 1 724 1 724
DS 



CO CL30Contig5 875 2 2 U
GGACAACCTCCATGTCCGATATATTTTATTAGCAGCAAGAGAACTCTTAACAGTTTAATT
TTCTAAATAACTAGTTTTTTTGGGGTTTTAGTTGCTATCGTCGGAAGAGAGATAAAAATG
TTGGGAATTTTCAGCGGAGCTATAGTATCTTTGCCGGAAGAGCTGGTGGCCGCCGGGAAC
CGAACTCCGTCGCCGAAGACAACTGGATCGGTCCTAGTCAACAAGTTCGTAGAGAAAAAT
CCCTCCGCCGTGTCCGTACAGGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACCACAAA
GAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCGTTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTCCGT
TGTATTGGGGAATAACAGCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATGTTGAGTTGCTAA
AAAGTGCTTGTGGCAAATCTCTTGCTTCCTTCCCTCAAGGCTGTTTCTACTCGACTGCGT
TAGGTGGGCTTAGGAGTTTTGAGAACCCTAAGAACAAGATCACTGCCATTCCTGCTAAAG
AGGAAGAAATTTGGGGAGCCACCTTCAAGGTGGAAGGAGCAACAGTTCTTGCACATGGAG
AATGAGACCTCTTAATATCGAAACTCCAACAGCAAACAAAATAATGATGTAGAGAAAACA
AGAAGCTGTTCTATGAGTTTTTCCTTAAGCTATCAATGGTTGGGGATGATGTGTGTAGTG
TTGTATCTCTGTTCTGTCTTTTGTTTCTCTGTACAGCTTGTGTTTGTCTCTTCTGGCGTT
TCTAGTGTGTTCGTCCCAATAAGTTATGTCTCATAGACTCTAATTCTACTCTGTCCAAAA
AAAGAAGACTCTAAATCTACTTTCTCCTTATCGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS67TF U 1
AF RR2GS67JQB C 207
BS 1 656 RR2GS67TF
BS 657 875 RR2GS67JQB

RD RR2GS67TF 656 0 0
GGACAACCTCCATGTCCGATATATTTTATTAGCAGCAAGAGAACTCTTAACAGTTTAATT
TTCTAAATAACTAGTTTTTTTGGGGTTTTAGTTGCTATCGTCGGAAGAGAGATAAAAATG
TTGGGAATTTTCAGCGGAGCTATAGTATCTTTGCCGGAAGAGCTGGTGGCCGCCGGGAAC
CGAACTCCGTCGCCGAAGACAACTGGATCGGTCCTAGTCAACAAGTTCGTAGAGAAAAAT
CCCTCCGCCGTGTCCGTACAGGTCGGCGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACCACAAA
GAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCGTTTGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTCCGT
TGTATTGGGGAATAACAGCTGATGGGTATGTGGCATTTGCTGATGATGTTGAGTTGCTAA
AAAGTGCTTGTGGCAAATCTCTTGCTTCCTTCCCTCAAGGCTGTTTCTACTCGACTGCGT
TAGGTGGGCTTAGGAGTTTTGAGAACCCTAAGAACAAGATCACTGCCATTCCTGCTAAAG
AGGAAGAAATTTGGGGAGCCACCTTCAAGGTGGAAGGAGCAACAGTTCTTGCACATGGAG
AATGAGACCTCTTAATATCGAAACTCCAACAGCAAACAAAATAATGATGTAGAGAA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2GS67JQB 669 0 0
ATCGGTCCTAGTCAACAAGTTCGTAGAGAAAAATCCCTCCGCCGTGTCCGTACAGGTCGG
CGACTATGTGCAGCTTGCTTACAGCCACCACAAAGAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCGTT
TGGGGCTAAGGATGAGATATTCTGCTTGTTCCGTTGTATTGGGGAATAACAGCTGATGGG
TATGTGGCATTTGCTGATGATGTTGAGTTGCTAAAAAGTGCTTGTGGCAAATCTCTTGCT
TCCTTCCCTCAAGGCTGTTTCTACTCGACTGCGTTAGGTGGGCTTAGGAGTTTTGAGAAC
CCTAAGAACAAGATCACTGCCATTCCTGCTAAAGAGGAAGAAATTTGGGGAGCCACCTTC
AAGGTGGAAGGAGCAACAGTTCTTGCACATGGAGAATGAGACCTCTTAATATCGAAACTC
CAACAGCAAACAAAATAATGATGTAGAGAAAACAAGAAGCTGTTCTATGAGTTTTTCCTT
AAGCTATCAATGGTTGGGGATGATGTGTGTAGTGTTGTATCTCTGTTCTGTCTTTTGTTT
CTCTGTACAGCTTGTGTTTGTCTCTTCTGGCGTTTCTAGTGTGTTCGTCCCAATAAGTTA
TGTCTCATAGACTCTAATTCTACTCTGTCCAAAAAAAGAAGACTCTAAATCTACTTTCTC
CTTATCGTT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 4 26

CO CL31Contig1 750 4 9 U
GGACAAACACGTAGTACGATTCCTTTTGCTCTCTCCTCTCTCTCTACAAACCCTACGATC
TTCTTCGTCAAGATTCGAGTATGAAAGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCA
AGCTCTCTGTGGCCAAGAAGCCAGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGG
ATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTTCCGTC
AGACTTACAAGAAGGATCACCCCAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTA
GAGAAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCCCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATA
AGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTC
CAAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAGGATGATA
CCGATGATGGCAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTCAGAAGCTGGTAGCAT
AATAGGGGCGCTACAAGGATCTCTGGGATGTTTTTTTTCTTTTTTCTTCTTTCTTATTTA
CTGATGTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCGGATTCTACGTGTAA
TGGAAAAAGTGTGTAGACTGTTTGAATGAGAGATTTGCAGCTCTATGTAACAATTTAGCT
TTTCGTTCTAAAATATGTTATCATCCCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 

AF RR2BG13TF U 1
AF RR2H869JQ C 64
AF RR2H869TF U 12
AF RR2BG13JQ C 61
BS 1 252 RR2BG13TF
BS 253 253 RR2H869TF
BS 254 258 RR2BG13TF
BS 259 259 RR2H869TF
BS 260 360 RR2BG13TF
BS 361 361 RR2H869TF
BS 362 577 RR2BG13TF
BS 578 578 RR2H869TF
BS 579 750 RR2BG13TF

RD RR2BG13TF 750 0 0
GGACAAACACGTAGTACGATTCCTTTTGCTCTCTCCTCTCTCTCTACAAACCCTACGATC
TTCTTCGTCAAGATTCGAGTATGAAAGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCA
AGCTCTCTGTGGCCAAGAAGCCAGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGG
ATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTTCCGTC
AGACTTACAAGA*GGATCGCCCCAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTA
GAGAAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCCCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATA
GGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTC
CAAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAGGATGATA
CCGATGATGGCAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTCAGAAGCTGGTAGCAT
AATAGGGGCGCTACAAGGATCTCTGGGATGTTTTTTT*CTTTTTTCTTCTTTCTTATTTA
CTGATGTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCGGATTCTACGTGTAA
TGGAAAAAGTGTGTAGACTGTTTGAATGAGAGATTTGCAGCTCTATGTAACAATTTAGCT
TTTCGTTCTAAAATATGTTATCATCCCTTT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2H869JQ 688 0 0
TTCGTCAAGATTCGAGTATGAAAGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGC
TCTCTGTGGCCAAGAAGCCAGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGGATC
CTAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTTCCGTCAGA
CTTACAAGAAGGATCACCCCAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAG
AAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCCCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGC
GCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAA
AGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCG
ATGATGGCAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTCAGAAGCTGGTAGCATAAT
AGGGGCGCTACAAGGATCTCTGGGATGTTTTTTTTCTTTTTTCTTCTTTCTTATTTACTG
ATGTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCGGATTCTACGTGTAATGG
AAAAAGTGTGTAGACTGTTTGAATGAGAGATTTGCAGCTCTATGTAACAATTTAGCTTTT
CGTTCTAAAATATGTTATCATCCCTT
CC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2H869TF 740 0 0
GG
GTACGATTCCTTTTGCTCTCTCCTCTCTCTCTACAAACCCTACGATCTTCTTCGTCAAGA
TTCGAGTATGAAAGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGCTCTCTGTGGC
CAAGAAGCCAGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGGATCCTAACAAACC
AAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTTCCGTCAGACTTACAAGAA
GGATCACCCCAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAGAAAAGTGGAA
ATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCCCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGCGCAAGGTTGA
GTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAAGGAGGACGA
GGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCGATGATGGCAG
TGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTCAGAAGCTGGTAGCATAATAGGGGCGCTA
CAAGGATCTCTGGGATGTTTTTTTTCTTTTTTCTTCTTTCTTATTTACTGATGTTTCAAG
TTAGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCGGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGTGTG
TAGACTGTTTGAATGAGAGATTTGCAGCTCTATGTAACAATTTAGCTTTTCGTTCTAAAA
TATGTTATCATCCCTT
CC

QA 3 738 3 738
DS 

RD RR2BG13JQ 690 0 0
TTCTTCGTCAAGATTCGAGTATGAAAGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCA
AGCTCTCTGTGGCCAAGAAGCCAGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGG
ATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTTCCGTC
AGACTTACAAGA*GGATCGCCCCAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTA
GAGAAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCCCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATA
GGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTC
CAAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAGGATGATA
CCGATGATGGCAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTCAGAAGCTGGTAGCAT
AATAGGGGCGCTACAAGGATTTCTGGGATGTTTTTTT*CTTTTTTCTTCTTTCTTATTTA
CTGATGTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCGGATTCTACGTGTAA
TGGAAAAAGTGTGTAGACTGTTTGAATGAGAGATTTGCAGCTCTATGTAACAATTTAGCT
TTTCGTTCTAAAATATGTTATCATCCCTTT

QA 1 690 1 690
DS 



CO CL31Contig2 691 4 15 U
GGGAATCACAAACACGCAGTATTCCCTTTTACTCCTCCCCTAATTTCAAACCCTAGCTCT
TCCTCTTCCTCCTCGTCATCAAGAA*TCGAGAGA**CCATGAAAGGAGGTAATTCAAAGG
CCGACTCCAGAAACTCAAAGCTCTCTGTAAACAAGAAGCCTACGAAGGCGAGCAAAGGAG
CAGCTGCTGGTAAAGATCCTAACAAACCTAAGAGGCCTGCCAGTGCTTTCTTCGTTTTCA
TGGAGGACTTCCGTCAGACTTACAAGAAGGATCATCCCAACAACAAATCTGTTGCTGCTG
TTGGAAAAGCTGGTGGAGAGAAGTGGAAATCCTTATCAGACGCTGAGAAGGCTCCCTACG
TAGCTAAGGCTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAGGCCTACAACAAGA
AGCTGGAGGAAGGTCCAAAGGAGGACGAGGAATCTGATGATAAGTCAATGTCTGAGGTTA
GTGAAGAGGAGGATGCAGATGATAAGAGTGATGAGGAGGAAGACGATTGACTAACAAGTT
GAAGTTGGCAGCATTATATAAAGGATCTCTCTCTCATGTTTTTCTTTCTCTTAAAATGTT
AACGAGGCTGGTTTTATTTTTTCTCATGTTTCTGTTTAGTAAGCTATCACTATCTCCCAC
TGATTCTGATTCTGATTCTACGGGTAATAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 0 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ66JQ C 366
AF RR2BN03TF U 1
AF RR2EQ66TF U 6
AF RR2ES24TF U 67
BS 1 64 RR2BN03TF
BS 65 67 RR2EQ66TF
BS 68 295 RR2BN03TF
BS 296 296 RR2EQ66TF
BS 297 467 RR2BN03TF
BS 468 468 RR2EQ66TF
BS 469 469 RR2BN03TF
BS 470 470 RR2EQ66TF
BS 471 475 RR2BN03TF
BS 476 476 RR2EQ66TF
BS 477 595 RR2BN03TF
BS 596 596 RR2EQ66TF
BS 597 670 RR2BN03TF
BS 671 686 RR2EQ66TF
BS 687 691 RR2ES24TF

RD RR2EQ66JQ 241 0 0
AAGGCTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAGGCCTACAACAAGAAGTTG
GAGGAAGGTCCAAAGGAGGACGAGGAATCTGATGATAAGTCAATGTCTGAGGTTAGTGAA
GAGGAGGATGCAGATGATAAGAGTGATGAGGAGGAAGACGATTGACTAACAAGTTGAAGT
TGGCAGCATTATATAAAGGATCTCTCTCTCATGTTTTTCTTTCTCTTAAAATGTTAACGA
G

QA 1 241 1 241
DS 

RD RR2BN03TF 670 0 0
GGGAATCACAAACACGCAGTATTCCCTTTTACTCCTCCCCTAATTTCAAACCCTAGCTCT
TCCT***CCTCCTCGTCATCAAGAA*TCGAGAGA**CCATGAAAGGAGGTAATTCAAAGG
CCGACTCCAGAAACTCAAAGCTCTCTGTAAACAAGAAGCCTACGAAGGCGAGCAAAGGAG
CAGCTGCTGGTAAAGATCCTAACAAACCTAAGAGGCCTGCCAGTGCTTTCTTCGTTTTCA
TGGAGGACTTCCGTCAGACTTACAAGAAGGATCATCCCAACAACAAATCTGTTGCCGCTG
TTGGAAAAGCTGGTGGAGAGAAGTGGAAATCCTTATCAGACGCTGAGAAGGCTCCCTACG
TAGCTAAGGCTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAGGCCTACAACAAGA
AGCTGGAGGAAGGTCCAAAGGAGGACGAGGAATCTGATGATAAGTCAGTCTCTGACGTTA
GTGAAGAGGAGGATGCAGATGATAAGAGTGATGAGGAGGAAGACGATTGACTAACAAGTT
GAAGTTGGCAGCATTATATAAAGGATCTCTCTCTCATGTTTTTCTTTCTCTTAAA*TGTT
AACGAGGCTGGTTTTATTTTTTCTCATGTTTCTGTTTAGTAAGCTATCACTATCTCCCAC
TGATTCTGAT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2EQ66TF 683 0 0
GG
ACAAACACGCAGTATTCCCTTTTACTCCTCCCCTAATTTCAAACCCTAGCTCTTCCTCTT
CCTCCTCCTCATCAAGAAATCGAGAGAGACCATGAAAGGAGGTAATTCAAAGGCCGACTC
CAGAAACTCAAAGCTGTCTGTGAACAAGAAGCCTACGAAGGCGAGCAAAGCAGCTGCTGC
TGGTAAAGATCCTAACAAACCTAAGAGGCCTGCCAGTGCTTTCTTCGTTTTCATGGAAGA
CTTCCGTCAGACTTACAAGAAGGATCATCCCAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGAAA
AGCTGGTGGAGAGAAGTGGAAATCCTTATCAGACGCTGAGAAGGCTCCCTACGTAGCTAA
GGCTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAGGCCTACAACAAGAAGCTGGA
GGAAGGTCCAAAGGAGGACGAGGAATCTGATGATAAGTCAATGTCTGAGGTTAGTGAAGA
GGAGGATGCAGATGATAAGAGTGATGAGGAGGAAGACGATTGACTAACAAGTTGAAGTTG
GCAGCATTATATAAAGGATCTCTCTCTCATGTTTTTCTTTCTCTTAAAATGTTAACGAGG
CTGGTTTTATTTTTTCTCATGTTTCTGTTTAGTA*GCTATCACTATCTCCCACTGATTCT
GATTCTGATTCTACGGGTA
AT

QA 3 681 3 681
DS 

RD RR2ES24TF 625 0 0
GG
CTCCTCGTCATCAAGAA*TCGAGAGA**CCATGAAAGGAGGTAATTCAAAGGCCGACTCC
AGAAACTCAAAGCTCTCTGTAAACAAGAAGCCTACGAAGGCGAGCAAAGGAGCAGCTGCT
GGTAAAGATCCTAACAAACCTAAGAGGCCTGCCAGTGCTTTCTTCGTTTTCATGGAGGAC
TTCCGTCAGACTTACAAGAAGGATCATCCCAACAACAAACCTGTTGCTGCTGTTGGAAAA
GTTGGTGGAGAGAAGTGGAAATCCTTATCAGACGCTGAGAAGGCTCCCTACGTAGCTAAG
GCTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAGGCCTACAACAAGAAGCTGGAG
GAAGGTCCAAAGGAGGACGAGGAATCTGATGATAAGTCAGTCTCTGACGTTAGTGAAGAG
GAGGATGCAGATGATAAGAGTGATGAGGAGGAAGACGATTGACTAACAAGTTGAAGTTGG
CAGCATTATATAAAGGATCTCTCTCTCATGTTTTTCTTTCTCTTAAAATGTTAACGAGGC
TGGTTTTATTTTTTCTCATGTTTCTGTTTAGTAAGCTATCACTATCTCCCACTGATTCTG
ATTCTGATTCTACGGGTAATAGA

QA 3 625 3 625
DS 



CO CL31Contig3 762 4 11 U
TTTTTTTTTAGTGAAGAAAGGGATGATAACATATTTTAGAACGAAAAGCTAAATTTGTTA
CATAGAGCTGCAAATCTCTCATTCAAAGAGTCTACACACTTTTTCCATTACACGTAGAAT
CAGAATCAGTGAGAGATAGTGGCAAGCTTACTAACTTGAAACATCAGTAAATAAAAAAGA
AAAAAACATCCCAGAGATCTTTGTAGCGCCCCTATTATGCTACCAGCTTCAACTTCTTTA
GTCAACGTCTTCCTCCTCATCACTACCATCATCGGCATCATCCTCATCATTCACCTCAGA
CACGGACTTGTCAGATTCCTCCTCGTCCTCCTTTGGACCTTCCTCCAGCTTCTTGTTGTA
GGCTTTCATGGTCTTCTCATACTCAACCTTGCGCTTATCAGCCTTGGCTACAAAGGGAGC
TTTCTCAGAGTCAGACAAGGATTTCCACTTTTCTCCACCAGCTTTACCAACAGCAGCAAC
AGATTTGTTGTTGGGGTGATCCTTCTTGTAAGTCTGACGGAAGTCCTCCATGAACACGAA
GAAGGCACTAGCAGGCCTCTTTGGTTTGTTAGGATCCTTAGCCGCCGCTTTGCTACGACC
TGCTGCTTTAGCCGGCTTCTTCGCCACAGAGAGCTTGGAGCTCCTGGTTTCAGTCTTTGA
TTTACCTCCTTTCATACTCAAATCTTGACGAAGAAGATCGTAGGGTTTGTAGAGGGAGAG
AGGAGAGGAGAGAGCAAAAGGAATCGTACGTGTTTGTGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM42JQ U 7
AF RR2ES08JQ U 56
AF RR2ES08TF C 1
AF RR2BM42TF C 202
BS 1 12 RR2ES08TF
BS 13 165 RR2BM42JQ
BS 166 166 RR2ES08JQ
BS 167 497 RR2BM42JQ
BS 498 684 RR2ES08JQ
BS 685 714 RR2ES08TF
BS 715 716 RR2BM42TF
BS 717 723 RR2ES08TF
BS 724 724 RR2BM42TF
BS 725 751 RR2ES08TF
BS 752 762 RR2BM42TF

RD RR2BM42JQ 491 0 0
TTTGGT
GAAGAAAGGGATGATAACATATTTTAGAACGAAAAGCTAAATTTGTTACATAGAGCTGCA
AATCTCTCATTCAAAGAGTCTACACACTTTTTCCATTACACGTAGAATCAGAATCAGTGA
GAGATAGTGGCAAGCTTACTAACTTGAAACATCGGTAAATAAAAAAGAAAAAAACATCCC
AGAGATCTTTGTAGCGCCCCTATTATGCTACCAGCTTCAACTTCTTTAGTCAACGTCTTC
CTCCTCATCACTACCATCATCGGCATCATCCTCATCATTCACCTCAGACACGGACTTGTC
AGATTCCTCCTCGTCCTCCTTTGGACCTTCCTCCAGCTTCTTGTTGTAGGCTTTCATGGT
CTTCTCATACTCAACCTTGCGCTTATCAGCCTTGGCTACAAAGGGAGCTTTCTCAGAGTC
AGACAAGGATTTCCACTTTTCTCCACCAGCTTTACCAACAGCAGCAACAGATTTGTTGTT
GGGGT

QA 7 491 7 491
DS 

RD RR2ES08JQ 629 0 0
TGTTACATAGAGCTGCAAATCTCTCATTCAAAGAGTCTACACACTTTTTCCATTACACGT
AGAATCAGAATCAGTGAGAGATAGTGGCAAGCTTACTAACTTGAAACATCAGTAAATAAA
AAAGAAAAAAACATCCCAGAGATCTTTGTAGCGCCCCTATTATGCTACCAGCTTCAACTT
CTTTAGTCATCGTCTTCCTCCTCATCACTACCATCATCGGCATCATCCTCATCATTCACC
TCAGACACGGACTTGTCAGATTCCTCCTCGTCCTCCTTTGGACCTTCCTCCAGCTTCTTG
TTGTAGGCTTTCATGGTCTTCTCATACTCAACCTTGCGCTTATCAGCCTTGGCTACAAAG
GGAGCTTTCTCAGAGTCAGACAAGGATTTCCACTTTTCTCCACCAGCTTTACCAACAGCA
GCAACAGATTTGTTGTTGGGGTGATCCTTCTTGTAAGTCTGACGGAAGTCCTCCATGAAC
ACGAAGAAGGCACTAGCAGGCCTCTTTGGTTTGTTAGGATCCTTAGCCGCCGCTTTGCTA
CGACCTGCTGCTTTAGCCGGCTTCTTCGCCACAGAGAGCTTGGAGCTCCTGGTTTCAGTC
TTTGATTTACCTCCTTTCATACTCAAATC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2ES08TF 758 0 0
TTTTTTTTTAGTGAAGAAAGGGATGATAACATATTTTAGAACGAAAAGCTAAATT*GTTA
CATAGAGCTGCAAATCTCTCATTCAAAGAGTCTACACACTTTTTCCATTACACGTAGAAT
CAGAATCAGTGAGAGATAGTGGCAAGCTTACTAACTTGAAACATCAGTAAATAAAAAAGA
AAAAAACATCCCAGAGATCTTTGTAGCGCCCCTATTATGCTACCAGCTTCAACTTCTTTA
GTCATCGTCTTCCTCCTCATCACTACCATCATCGGCATCATCCTCATCATTCACCTCAGA
CACGGACTTGTCAGATTCCTCCTCGTCCTCCTTTGGACCTTCCTCCAGCTTCTTGTTGTA
GGCTTTCATGGTCTTCTCATACTCAACCTTGCGCTTATCAGCCTTGGCTACAAAGGGAGC
TTTCTCAGAGTCAGACAAGGATTTCCACTTTTCTCCACCAGCTTTACCAACAGCAGCAAC
AGATTTGTTGTTGGGGTGATCCTTCTTGTAAGTCTGACGGAAGTCCTCCATGAACACGAA
GAAGGCACTAGCAGGCCTCTTTGGTTTGTTAGGATCCTTAGCCGCCGCTTTGCTACGACC
TGCTGCTTTAGCCGGCTTCTTCGCCACAGAGAGCTTGGAGCTCCTGGTTTCAGTCTTTGA
TTTACCTCCTTTCATACTCAAATCTTGACGAAGAAGATCGTAGGGTTTGTAGAG**AGAG
AGGGGAGGAGAGAGCAAAAGGAATCGTACGT
GTTTTCC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2BM42TF 561 0 0
TGTAGCGCCCCTATTATGCTACCAGCTTCAACTTCTTTAGTCAACGTCTTCCTCCTCATC
ACTACCATCATCGGCATCATCCTCATCATTCACCTCAGACACGGACTTGTCAGATTCCTC
CTCGTCCTCCTTTGGACCTTCCTCCAGCTTCTTGTTGTAGGCTTTCATGGTCTTCTCATA
CTCAACCTTGCGCTTATCAGCCTTGGCTACAAAGGGAGCTTTCTCAGAGTCAGACAAGGA
TTTCCACTTTTCTCCACCAGCTTTACCAACAGCAGCAACAGATTTGTTGTTGGGGTGATC
CTTCTTGTAAGTCTGACGGAAGTCCTCCATGAACACGAAGAAGGCACTAGCAGGCCTCTT
TGGTTTGTTAGGATCCTTAGCCGCCGCTTTGCTACGACCTGCTGCTTTAGCTGGCTTCTT
CGCCACAGAGAGCTTGGAGTTCCTGGTTTCAGTCTTTGATTTACCTCCTTTCATACTCGA
ATCTTGACGAAGAAGATCGTAGGGTTTGTAGAGGGAGAGAGGAGAGGAGAGAGCAAAAGG
AATCGTACGTGTTTGTGAGCC

QA 1 561 1 561
DS 



CO CL31Contig4 803 14 11 U
GGACTAGCCCCTCTCTACATCTCTTGGCCTCTCACTTGAATCTCTCCGGACAAACACGTA
GTACGATTCCTTTTGCTCTCTC******TCTCTCTCTCTGCAAAACCTACGATCTTCTTC
GTCAAGTTTCGAGTATGAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGCTCT
CTGTGGCCAAGAAGCCCGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGGATCCTA
ACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTTCCGTCAGACTT
ATAAGAAGGACCACCCAAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAGAAA
AGTGGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGCGCA
AGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAAGG
AGGACGAAGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCGATG
ATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTCGAAGCTGGTAGCATAATAGGG
GCGCTACAAAGATCTCTGGGATGTTTTTTTCTTTTTTATTTACTGATGTTTCAAGTTAGT
AAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGTGTGTAGAC
TCTTTGAATGAGAGATTTGCAGCTCTATGTAACAATTTAGCTTTTCGTTCTAAAATATGT
TATCATCCCTCTCTTCACTATCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 50 40 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 20 20 45 45 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 35 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 75 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 65 65 65 65 50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 45 60 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 40 30 25 10 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G914TF U 1
AF RR2AX04TFB U 332
AF RR2G914JQ C 492
AF RR2GS74TF U 1
AF RR2GS74JQB C 391
AF RR2GQ10JQ C 293
AF RR2GQ10TF U 48
AF RR2AX04JQ C 33
AF RR2D416JQ C 48
AF RR2DH15TF U 57
AF RR2D416TF U 48
AF RR2BQ12TF U 56
AF RR2BQ12JQ C 70
AF RR2EY29TF U 48
BS 1 47 RR2G914TF
BS 48 49 RR2GQ10TF
BS 50 170 RR2G914TF
BS 171 676 RR2GS74TF
BS 677 723 RR2DH15TF
BS 724 724 RR2GQ10TF
BS 725 774 RR2DH15TF
BS 775 775 RR2D416TF
BS 776 787 RR2DH15TF
BS 788 796 RR2D416TF
BS 797 803 RR2EY29TF

RD RR2G914TF 170 0 0
GGACTAGCCCCTCTCTACATCTCTTGGCCTCTCACTTGAATCTCTCCTCACAAACACGTA
GTACGATTCCTTTTGCTCTCTC******TCTCTCTCTCTGCAAAACCTACGATCTTCTTC
GTCAAGTTTCGAGTATGAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGC

QA 1 170 1 170
DS 

RD RR2AX04TFB 161 0 0
TGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAGAAAAGTGGAAATCCTT**CTGACTCTGAGAAGGC
TCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTA
CAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAAGGAGGACGAAGAGG

QA 1 161 1 161
DS 

RD RR2G914JQ 118 0 0
GAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCGATGATGGTAGTGAT
GAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTCGAAGCTGGTAGCATAATAGGGGCGCTACAA

QA 1 118 1 118
DS 

RD RR2GS74TF 676 0 0
GGACTAGCCCCTCTCTACATCTCTTGGCCTCTCACTTGAATCTCTCCTCACAAACACGTA
GTACGATTCCTTTTGCTCTCTC******TCTCTCTCTCTGCAAAACCTACGATCTTCTTC
GTCAAGTTTCGAGTATGAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGCTCT
CTGTGGCCAAGAAGCCCGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGGATCCTA
ACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTTCCGTCAGACTT
ATAAGAAGGACCACCCAAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAGAAA
AGTGGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGCGCA
AGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAAGG
AGGACGAAGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCGATG
ATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTCGAAGCTGGTAGCATAATAGGG
GCGCTACAAAGATCTCTGGGATGTTTTTTTCTTTTTTATTTACTGATGTTTCAAGTTAGT
AAGCTTGCCACTATCT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2GS74JQB 373 0 0
CTCCCTTTGTAGCTAAGGGTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCT
ACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAAGGAGGACGAAGAGGAATTTGACAAGTCCGTGT
CCGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCGATGATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACT
AAAGAAGTCGAAGCTGGTAGCATAATAGGGGCGCTACAAAGATTTTTGGGATGTTTTTTT
TTTTTTTATTTACTGATGTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTTTGA
TTTTACGTGTAATGGAAAAAGTGTGTAGACTCTTTGAATGAGAGATTTGCAGCTTTATGT
AACAATTTAGCTT

QA 1 373 1 373
DS 

RD RR2GQ10JQ 454 0 0
TCAGACTTATAAGAAGGACCACCCAAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGG
TGGAGAAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAGGCTGA
TAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGG
TCCAAAGGAGGACGAAGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAGGATGA
TGCCGATGATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTCGAAGCTGGTAGCA
TAATAGGGGCGCTACAAAGATCTCTGGGATGTTTTTTTCTTTTTTATTTACTGATGTTTC
AAGTTAGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGT
GTGTAGACTCTTTGAATGAGAGATTTGCAGCTCT

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR2GQ10TF 703 0 0
GGACAAACACGTAGTACGATTCCTTTTGCTCTCTC******TCTCTCTCTCTGCAAAACC
TACGATCTTCTTCGTCAAGTTTCGAGTATGAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGG
AGCTCCAAGCTCTCTGTGGCCAAGAAGCCCGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCG
GCTAAGGATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGAC
TTCCGTCAGACTTATAAGAAGGACCACCCAAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAA
GCTGGTGGAGAAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAG
GCTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAG
GAAGGTCCAAAGGAGGACGAAGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAG
GATGATGCCGATGATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTCGAAGCTGG
TAGCATAATAGGGGCGCTACAAAGATCTCTGGGATGTTTTTTTCTTTTTTATTTACTGAT
GTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGGAA
AAAGTGTGTAGACTCTTTGAATGAGAGATTTGCAGCTCTA
AAA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2AX04JQ 757 0 0
CACTTGAATCTCTCCTCACAAACACGTAGTACGATTCCTTTTGCTCTCTC******TCTC
TCTCTCTGCAAAACCTACGATCTTCTTCGTCAAGTTTCGAGTATGAAGGGAGGTAAATCA
AAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGCTCTCTGTGGCCAAGAAGCCCGCTAAAGCAGCAGGT
CGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGGATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTC
GTTTTCATGGAGGACTTCCGTCAGACTTATAAGAAGGACCACCCAAACAACAAATCTGTT
GCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAGAAAAGTGGAAATCCTT**CTGACTCTGAGAAGGCT
CCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTAC
AACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAAGGAGGACGAAGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCC
GAGGTGAATGATGAGGATGATGCCGATGATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAA
AGAAGTCGAAGCTGGTAGCATAATAGGGGCGCTACAAAGATCTCTGGGATGTTTTTTTCT
TTTTTATTTACTGATGTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCTGATT
CTACGTGTAATGGAAAAAGTGTGTAGACTCTTTGAATGAGAGATTTGCAGCTCTATGTAA
CAATTTAGCTTTTCGTTCTAAAATATGTTATCATCCC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2D416JQ 749 0 0
GGACAAACACGTAGTACGATTCCTTTTGCTCTCTC******TCTCTCTCTCTGCAAAACC
TACGATCTTCTTCGTCAAGTTTCGAGTATGAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGG
AGCTCCAAGCTCTCTGTGGCCAAGAAGCCCGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCG
GCTAAGGATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGAC
TTCCGTCAGACTTATAAGAAGGACCACCCAAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAA
GCTGGTGGAGAAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAG
GCTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAG
GAAGGTCCAAAGGAGGACGAAGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAG
GATGATGCCGATGATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTCGAAGCTGG
TAGCATAATAGGGGCGCTACAAAGATCTCTGGGATGTTTTTTTCTTTTTTATTTACTGAT
GTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGGAA
AAAGTGTGTAGACTCTTTGAATGAGAGATTTGCAGCTCTATGTAACAATTTAGCTTTTCG
TTCTAAAATATGTTATCATCCCTCTCTTC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2DH15TF 731 0 0
GG
ACGTACGATTCCTTTTACTCTCTCCTCTCCTCTCTCTCTCTACAACCCCTACGATCTTCT
TCGTCAAGATTCGATTATGAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGCT
CTCTGTGGCCAAGAAGCCCGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGGATCC
TAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTTCCGTCAGAC
TTATAAGAAGGACCACCCAAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAGA
AAAGTGGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGCG
CAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAA
GGAGGACGAAGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCGA
TGATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTCGAAGCTGGTAGCATAATAG
GGGCGCTACAAAGATCTCTGGGATGTTTTTTTCTTTTTTATTTGCTGATGTTTCAAGTTA
GTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGTGTGTAG
ACTCTCTGAATGAGAGATTTGCAGCTCTATGTAACAATTTAGCTTTTCGTTCTAAA*TAT
GTTATCATC

QA 3 731 3 731
DS 

RD RR2D416TF 749 0 0
GGACAAACACGTAGTACGATTCCTTTTGCTCTCTC******TCTCTCTCTCTGCAAAACC
TACGATCTTCTTCGTCAAGTTTCGAGTATGAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGG
AGCTCCAAGCTCTCTGTGGCCAAGAAGCCCGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCG
GCTAAGGATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGAC
TTCCGTCAGACTTATAAGAAGGACCACCCAAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAA
GCTGGTGGAGAAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAG
GCTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAG
GAAGGTCCAAAGGAGGACGAAGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAG
GATGATGCCGATGATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTCGAAGCTGG
TAGCATAATAGGGGCGCTACAAAGATCTCTGGGATGTTTTTTTCTTTTTTATTTACTGAT
GTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGGAA
AAAGTGTGTAGACTCTTTGAATGAGAGATT*GCAGCTCTATGTAACAATTTAGCTTTTCG
TTCTAAAATATGTTATCATCCCTCTCTTC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2BQ12TF 743 0 0
GG
GTAGTACGATTCCTTTTGCTCTCTC********TCTCTCTCTGCAAAACCTACGATCTTC
TTCGTCAAGTTTCGAGTATGAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGC
TCTCTGTGGCCAAGAAGCCCGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGGATC
CTAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTTCCGCCAGA
CTTATAAGAAGGACCACCCAAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAG
AAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGC
GCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAA
AGGAGGACGAAGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCG
ATGATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGGCTAAAGAAGTCGAAGCTGGTAGCATAATA
GGGGCGCTACAAAGATCTCTGGGATGTTTTTTTCTTTTTTATTTACTGATGTTTCAAGTT
AGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGTGTGTA
GACTCTTTGAATGAGAGATT*GCAGCTCTATGTAACAATTTAGCTTTTCGTTCTAAA*TA
TGTTATCATCC
GAAAAAAAAA

QA 3 733 3 733
DS 

RD RR2BQ12JQ 720 0 0
CTTTTGCTCTCTC********TCTCTCTCTGCAAAACCTACGATCTTCTTCGTCAAGTTT
CGAGTATGAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGCTCTCTGTGGCCA
AGAAGCCCGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGGATCCTAACAAACCAA
AGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGACTTCCGCCAGACTTATAAGAAGG
ACCACCCAAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAGAAAAGTGGAAAT
CCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGCGCAAGGTTGAGT
ATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAAGGAGGACGAAG
AGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCGATGATGGTAGTG
ATGAGGAGGAAGACGATGGCTAAAGAAGTCGAAGCTGGTAGCATAATAGGGGCGCTACAA
AGATCTCTGGGATGTTTTTTTCTTTTTTATTTACTGATGTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCC
ACTATCTCTCACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGTGTGTAGACTCTTTGAAT
GAGAGATTTGCAGCTCTATGTAACAATTTAGCTTTTCGTTCTAAAATATGTTATCATCC
G

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2EY29TF 756 0 0
GGACAAACACGTAGTACGATTCCTTTTGCTCTCTC**********TCTCTCTGCAAAACC
TACGATCTTCTTCGTCAAGTTTCGAGTATGAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGG
AGCTTCAAGCTCTCTGTGGCCAAGAAGCCCGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCG
GCTAAGGATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGAC
TTCCGTCAGACTTATAAGGAGGACCACCCAAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAA
GCTGGTGGAGAAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAG
GCTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAG
GAAGGTCCAAAGGAGGACGAAGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCCGAGGTGAATGATGAG
GATGATGCCGATGATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTCGAAGCTGG
TAGCATAATAGGGGCGCTACAAAGATCTCTGGGATGTTTTTTTCTTTTTTATTTACTGAT
GTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGGAA
AAAGTGTGTAGACTCTTTGAATGAGAGATTTGCAGCTCTATGTAACAATTTAGCTTTTCG
TTCTAAA*TATGTTATCATCCCTTTCTTCACTATCT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 26

CO CL32Contig1 699 26 15 U
GGAAGAAAATAGGTGAAGTAGTTGGAGAACAAAAGGTCCAAAGAGAAAAA*TATCTCAAA
CACACAAAGAAAGA*********GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGT
TAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGGCAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACCGT
CGATGGTTTCCTCAAGATCGGAGCTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTA
CAAAGCCATCGACAAAGGGAGTGTTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGAT
GTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGGGATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGG
AATCGAACGTATCCGTGGCACTAGGGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCGGCGAC
AGGAGCGGTGATCTCTGCCGCTACTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAAT
CATGGGTGGCGCTCTTGCAACTGCGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGT
TTTCAATCTTCTTATCAGGACCAA*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGT
GGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATAAAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTA
TTAATATGAACGTTCAAAAATGGTCTGTGGTCTGTTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 80 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 0 97 97 97 97 97 97 97 97 5 97 97 97 97 97 55 97 97 97 45 97 97 97 97 50 
97 50 50 50 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 15 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 5 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 15 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 15 97 97 97 
97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 65 97 55 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 50 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
95 90 75 75 75 75 60 65 65 65 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 10 10 10 10 

AF RR2F641TF U 56
AF RR2B548JQ C 23
AF RR2B548TF U 23
AF RR2B422JQ C 1
AF RR2GR21JQ C 24
AF RR2DI78TF U 145
AF RR2CJ81JQ C 24
AF RR2DZ43JQ C 379
AF RR2C726TF U 30
AF RR2CA19TF U 23
AF RR2FH90JQ C 24
AF RR2FH90TF U 24
AF RR2CJ81TF U 24
AF RR2E661TF U 24
AF RR2BZ44TF U 25
AF RR2GR21TF U 24
AF RR2BB40JQ C 24
AF RR2BB40TF U 24
AF RR2EN37JQ C 24
AF RR2EN37TF U 24
AF RR2FS94TF U 23
AF RR2C209TF U 24
AF RR2BZ06JQ C 24
AF RR2BZ06TF U 24
AF RR2C209JQ C 24
AF RR2B422TF U 1
BS 1 23 RR2B422TF
BS 24 35 RR2B548TF
BS 36 36 RR2BB40TF
BS 37 211 RR2B548TF
BS 212 212 RR2F641TF
BS 213 469 RR2B548TF
BS 470 470 RR2C726TF
BS 471 471 RR2B548TF
BS 472 472 RR2C726TF
BS 473 648 RR2B548TF
BS 649 662 RR2DI78TF
BS 663 675 RR2C726TF
BS 676 680 RR2CJ81TF
BS 681 695 RR2GR21TF
BS 696 699 RR2B422JQ

RD RR2F641TF 253 0 0
G
CAAACACACAAAGAAAGA*********GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAA
CTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGGCAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCA
CCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAGCTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACA
CTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTGTT*CCAAGAGCACTATTGTGCATGCGCTTAAGA
AGATGTGCAAAG

QA 2 253 2 253
DS 

RD RR2B548JQ 626 0 0
G
GGAGAACAAAAGCTCCAAAGAGAAAAA*TATCTCAAACACACAAAGAAAGA*********
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAATCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GGGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCGGCGACAGGAGCGGTGATCTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGCTCGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATG

QA 2 626 2 626
DS 

RD RR2B548TF 626 0 0
G
GGAGAACAAAAGCTCCAAAGAGAAAAA*TATCTCAAACACACAAAGAAAGA*********
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAATCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GGGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCGGCGACAGGAGCGGTGATCTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGCTCGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATG

QA 2 626 2 626
DS 

RD RR2B422JQ 699 0 0
GGAAGAAAATAGGTGAAGTAGTTTCAGAACAAAAGGTCCAAAGATAAAAA*TATCTCAAA
CACACAAAGAAAGAAAAGAAAGAGGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGT
TAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGGCAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACTGT
CGATGGTTTCCTCAAGATCGGAGCTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTA
CAAAGCCATCGACAAAGGGAGTGTTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGAT
GTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGGGATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGG
AATCGAACGTATCCGTGGCACTAGAGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCTGCGAC
AGGAGCTGTGATCTCTGCCGCTACTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAAT
CACGGGTGGCGCTCTTGCAACTGCGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGT
TTTCAATCTTCTTATCAGGACCAA*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGT
GGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATAAAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTA
TTAATATGAACGTTCAAAAATGGTCTGTGGTCTGTTCTC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2GR21JQ 673 0 0
GGAGAACAAAAGCTCCAAAGAGAAAAAATATCTCAAACACACAAAGAAAGA*********
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GGGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCGGCGACAGGAGCGGTGATCTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGCTCGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTTCAAAAATGG
TCTGTGGTCTGT
T

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2DI78TF 518 0 0
AGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAGC
TGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTGT
TTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGGG
ATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTAG
GGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCGGCGACAGGAGCGGTGATCTCTGCCGCTAC
TAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGCTCGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTGC
GTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCAA
*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATAA
AAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATT

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2CJ81JQ 662 0 0
GGAGAACAAAAGATCCAAAGAGAAAAA*CATC*CAAAGA***AAAGAAAGA*********
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTTTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCCCTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GGGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCGGCGACAGGAGCGGTGATTTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGATCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTTCAAAAATGG
AC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2DZ43JQ 297 0 0
CACTAGGGATTGGAAAAACGCAATGTTGACAGGAGCGGCGACAGGAGCGGTGATTTCTGC
CGCTACTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGC
AACTGCGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAG
GACCAA*GTTTGTTATATCCAAAATTGATCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTC
CAATAAAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGT
AC

QA 1 295 1 295
DS 

RD RR2C726TF 646 0 0
CAAAAGATCCAAGGAGAAAAA*CATC*CAAAGA***AAAGAAAGA*********GGAA**
AGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGGCAGTGG
ACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAGCTGTTG
GAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTGTTTCCA
AGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGGGATCTG
TGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTAGGGATT
GGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCGGCGACAGGAGCGGTGATCTCTGCCGCTACTAACA
AAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATTGGTGGCGCTCTTGCAACTGCGTCTC
AGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCAA*GTTT
GTTATATCCAAAATTG*TCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATAAAA**G
ATGTAGTACTTTT*GTATGA*TTGCATTTTAT*AATATGAACGTTC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2CA19TF 653 0 0
GGC
AGAACAAAAGATCCAAAGAGAAAAA*TATC*CAAAGA***AAAGAAAGA*********GG
AAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGGCA
GTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAGCT
GTTGGAGTCATTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTGTT
TCCAAGAGCACTCTTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGGGA
TCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTAGA
GATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCGGCGACAGGAGCGGTGATCTCTGCCGCTACT
AACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTCGATGCAATTATGGGTGGCGCTCTTGCAACTGCG
TCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCAAA
GTTTGTTATATCCAAATTTGG*CCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATAAA
AA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATAAATATGAACGTTC

QA 4 653 4 653
DS 

RD RR2FH90JQ 652 0 0
GGAGAACAAAAGATCCAAAGAGAAAAA*CATC*CAAAGA***AAAGAAAGA*********
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAGCTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGCTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GGGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCGGCGACAGGAGCGGTGATCTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
G*GTTTGTTATATCCAAAATTGATCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGT
CC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2FH90TF 652 0 0
GGAGAACAAAAGATCCAAAGAGAAAAA*CATC*CAAAGA***AAAGAAAGA*********
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAGCTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGCTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GGGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCGGCGACAGGAGCGGTGATCTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
G*GTTTGTTATATCCAAAATTGATCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGT
CC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2CJ81TF 657 0 0
GGAGAACAAAAGATCCAAAGAGAAAAA*CATC*CAAAGA***AAAGAAAGA*********
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCCCTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GGGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCGGCGACAGGAGCGGTGATCTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGATCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTTCAAAAA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2E661TF 651 0 0
GGAGAACAAAAGATCCAAAGAGAAAAA*CATC*CAAAGA***AAAGAAAGA*********
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GGGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCGGCGACAGGAGCGGTGATCTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGATCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2BZ44TF 645 0 0
GAGAACAAAAGCTCCAAAGAGAAAAA*TATCTCAAACACACAAAGAAAGA*********G
GAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGGC
AGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAGC
TGTTGGAGCCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTGT
TTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGGG
ATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTAG
GGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGAAGCGGCGACAGGAGCGGTGATCTCTGCCGCTAC
TAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGCTCGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTGC
GTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCAA
*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATAA
AAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAA
AAAAA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2GR21TF 672 0 0
GGAGAACAAAAGCTCCAAAGAGAAAAA*TATCTCAAACACACAAAGAAAGA*********
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACCGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GGGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCGGCGACAGGAGCGGTGATCTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGCTCGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGG*CCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTTCAAAA*TGG
TCTGTGGTCTGT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2BB40JQ 652 0 0
GGAGAACAAAAGGTCCAAAGATAAAAA*TATCTCAAACACACAAAGAAAAAAA*GAAAGA
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACTGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCCGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GAGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCTGCGACAGGAGCTGTGATTTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTTTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTTC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2BB40TF 661 0 0
GGAGAACAAAAGGTCCAAAGATAAAAA*TATCTCAAACACACAAAGAAAAAAA*GAAAGA
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACTGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCCGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GAGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCTGCGACAGGAGCTGTGATCTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAAAGATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTTCAAAAATGG
C

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2EN37JQ 662 0 0
GGAGAACAAAAGGTCCAAAGATAAAAA*TATCTCAAACACACAAAGAAAGAAAAGAAAGA
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACTGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGTG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GAGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCTGCGACAGGAGCTGTGATTTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTTTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTTTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTTCAAAAATGG
CC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2EN37TF 662 0 0
GGAGAACAAAAGGTCCAAAGATAAAAA*TATCTCAAACACACAAAGAAAGAAAAGAAAGA
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACTGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGTG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GAGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCTGCGACAGGAGCTGTGATCTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTTCAAAAATGG
CC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2FS94TF 658 0 0
G
GGAGAACAAAAGGTCCAAAGATAAAAA*TATCTCAAACACACAAAGAAAGAAAAGAAAGA
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACTGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GAGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCTGCGACAGGAGCTGTGATCTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTTCAAAAA

QA 2 658 2 658
DS 

RD RR2C209TF 647 0 0
GGAGAACAAAAGGTCCAAAGATAAAAA*TATCTCAAACACACAAAGAAAGAAAAGAAAGA
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACTGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GAGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCTGCGACAGGAGCTGTGATCTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2BZ06JQ 670 0 0
GGAGAACAAAAGGTCCAAAGATAAAAA*TATCTCAAACACACAAAGAAAGAAAAGAAAGA
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTTTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTTTCAACCTCACTGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GAGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCTGCGACAGGAGCTGTGATTTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGTCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTTTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTTCAAAAATGG
TCTGTGGTCT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2BZ06TF 670 0 0
GGAGAACAAAAGGTCCAAAGATAAAAA*TATCTCAAACACACAAAGAAAGAAAAGAAAGA
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACTGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GAGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCTGCGACAGGAGCTGTGATCTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGTCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTTCAAAAATGG
TCTGTGGTCT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2C209JQ 663 0 0
GGAGAACAAAAGGTCCAAAGATAAAAA*TATCTCAAACACACAAAGAAAGAAAAGAAAGA
GGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGTTAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGG
CAGTGGACATGGGCAACCCTTTTTTCAACCTCACTGTCGATGGTTTCCTCAAGATCGGAG
CTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTACAAAGCCATCGACAAAGGGAGTG
TTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGATGTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGG
GATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGGAATCGAACGTATCCGTGGCACTA
GAGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCTGCGACAGGAGCTGTGATCTCTGCCGCTA
CTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAATCATGGGTGGCGCTCTTGCAACTG
CGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGTTTTCAATCTTCTTATCAGGACCA
A*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGTGGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATA
AAAA*GATGTAGTACTTTT*GTATGAATTGCATTTTATTAATATGAACGTTCAAAAATGG
TC
G

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2B422TF 699 0 0
GGAAGAAAATAGGTGAAGTAGTTTCAGAACAAAAGGTCCAAAGATAAAAA*TATCTCAAA
CACACAAAGAAAGAAAAGAAAGAGGAAGAAGATGCCTTCAAGCACATTCTCTGGAACTGT
TAGCTCACCGAAGCTGTCGGTGGCAGTGGACATGGGCAACCCTTTTCTCAACCTCACTGT
CGATGGTTTCCTCAAGATCGGAGCTGTTGGAGTCACTAAATCTCTTGTGGAAGACACTTA
CAAAGCCATCGACAAAGGGAGTGTTTCCAAGAGCACTATTGAGCATGCGCTTAAGAAGAT
GTGCAAAGAAGGTGTTTACTGGGGATCTGTGGCTGGAGTTTACGTTGGAACAGAGTATGG
AATCGAACGTATCCGTGGCACTAGAGATTGGAAAAACGCAATGTTGGCAGGAGCTGCGAC
AGGAGCTGTGATCTCTGCCGCTACTAACAAAGGCAAAGACAAGGTGGTGGTGGATGCAAT
CACGGGTGGCGCTCTTGCAACTGCGTCTCAGTTCCTTAACAATCATTATTTCTACTGAGT
TTTCAATCTTCTTATCAGGACCAA*GTTTGTTATATCCAAAATTGGTCCTTATGGTGTGT
GGTTTCTTTGTTTGTTTCCAATAAAAA*GATGTAGTACTTTTTGTATGAATTGCATTTTA
TTAATATGAACGTTCAAAAATGGTCTGTGGTCTGT
TCTC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 2 28

CO CL33Contig1 1787 24 23 U
CGCACGTGTTCCTAAGAAAAGGGAATTTGTTAATTTTTCGGGGTCTTAAAGGGGCGTGGA
AACACATAAGAACTCTTGAATGGAAATGGAAAAGAGATGTAACTCCAGTTCCTTTGGAAA
TAGGAAGATCTTTGGCGCAAGAATAAAGGATTAATCCGTATCATCTTGACTTGGTTCTGA
TTTCTCTATTTTTTT*AAGTTTAAGAAAAGAATACCGTTTCTCCTACCCGTATCGAATAG
AACATGCTGAGTAAAATCTTCTTCATGTAAAACCGGCTTGATTTAGATCGGGAGAATCGT
ACGGTTTTATGAAACCATGTGCTATGGCTCGAATCCGTAGTCAATCCTATTTCCGATAGG
AGTAGTTGACAATTGAATCCAACTTTTTCCATTATTTTCATTTCATACCCGTAATAGTGC
GAAAGGAAAGCCCGGCTCCAATCCAAGTTGTTCAAGAATAGTGGCCTTGAGTTTCTCGAC
CCTTTGACTTAGGATTAGTCAGTTCTATTTCTTGATGGGGGAAGGGATATAACTCAGCGG
TAGAGTGTCACCTTGACGTGGTGGAAGTCATCAGTTCGAGCCTGATTATCCCTAAACCCA
ATGAATGTGAGTTTTTCTATTTTGACTTGCTCCCTCGCTGTGATCGAATAAGAATGGATA
AGAGGCTCGTGGGATTGACGTGAGGGGGTAGGGGTAGCTATATTTCTGGGAGCGAACTCC
ATGCGAATATGAAGCGCATGGATACAAGTTATGACTTGGAATGAAAGACAATTTCGAATC
AGCTTTGTCTACGAAGAAGGAAGCTATAAGTAATGCAACTATGAATCTCATGGAGAGTTC
GATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACACGCAAGTCGGACGGGAAGT
GGTGTTTCCAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAAGAACCTGCCCTTGGGAGGGGAACA
ACAGCTGGAAACGGCTGCTAATACCCCGTAGGCTGAGGAGCAAAAGGAGGAATCCGCCCG
AGGAGGGGCTCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGCAATAGCTTACCAAGACGATGATC
CTTGGCTAAATCATTTTAAAGACTTATCAGAAGAAAAAAATCAGGTAAAATCAAAAATAA
GAAGACTGGTTGCAGAAGAAAATATAAGTTTTTTTTTTGCTTTCACGTAAGAGTCAAAGA
AAATGGCGAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGCTAGCAAGA
TCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGTCGCAAGGGAAATG
GAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACGT
CGACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAACAGGAAGG
CGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACTGGTGACCCAGCCG
GGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAG
TTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTTTATTTGTATTCTGTCA
ACTTGTAGATTTAAAAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGAGAGGAGATCTAGTCAATGT
TTATAATCTTTGTATCGCATTGTATTCCTCTTTAAAACAATTAGAACGACCGCATCTTCA
AGTATGTAACGTGAACCGAAGGCATTGTTCCCTTGATGGAAAACACG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 85 85 85 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
70 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 65 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 
97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D231JQ U 1
AF RR2DO76JQ U 1
AF RR2D231TF C 517
AF RR2AP85JQ U 1
AF RR2DO76TF C 339
AF RR2AP85TF C 232
AF RR2BZ49TF U 825
AF RR2BU54TF U 1179
AF RR2BD67JQ C 1092
AF RR2EH09JQ C 1304
AF RR2H160JQ C 1179
AF RR2H160TF U 1179
AF RR2BZ49JQ C 1111
AF RR2BD67TF U 1092
AF RR2EH09TF U 1179
AF RR2AG07JQ C 1096
AF RR2CO83JQ C 1179
AF RR2CO83TF U 1179
AF RR2E688TF U 1179
AF RR2E688JQ C 1179
AF RR2FQ01JQ C 1179
AF RR2BA65TF U 1150
AF RR2FQ01TF U 1150
AF RR2AG07TF U 1096
BS 1 566 RR2AP85JQ
BS 567 567 RR2D231JQ
BS 568 798 RR2AP85JQ
BS 799 799 RR2AP85TF
BS 800 853 RR2AP85JQ
BS 854 854 RR2BZ49TF
BS 855 891 RR2AP85JQ
BS 892 1177 RR2BZ49TF
BS 1178 1178 RR2BD67TF
BS 1179 1281 RR2BZ49TF
BS 1282 1282 RR2H160TF
BS 1283 1400 RR2BZ49TF
BS 1401 1401 RR2H160TF
BS 1402 1459 RR2BZ49TF
BS 1460 1667 RR2H160TF
BS 1668 1668 RR2BD67TF
BS 1669 1698 RR2H160TF
BS 1699 1722 RR2CO83TF
BS 1723 1723 RR2E688TF
BS 1724 1742 RR2CO83TF
BS 1743 1743 RR2BA65TF
BS 1744 1757 RR2FQ01TF
BS 1758 1787 RR2AG07TF

RD RR2D231JQ 628 0 0
GG
CACGTGTTCCTAAGAAAAGGGAATTTGTTAATTTTTCGGGGTCTTAAAGGGGCGTGGAAA
CACATAAGAACTCTTGAATGGAAATGGAAAAGAGATGTAACTCCAGTTCCTTTGGAAATA
GGAAGATCTTTGGCGCAAGAATAAAGGATTAATCCGTATCATCTTGACTTGGTTCTGATT
TCTCTATTTTTTT*AAGTTTAAGAAAAGAATACCGTTTCTCCTACCCGTATCGAATAGAA
CATGCTGAGTAAAATCTTCTTCATGTAAAACCGGCTTGATTTAGATCGGGAGAATCGTAC
GGTTTTATGAAACCATGTGCTATGGCTCGAATCCGTAGTCAATCCTATTTCCGATAGGAG
TAGTTGACAATTGAATCCAACTTTTTCCATTATTTTCATTTCATACCCGTAATAGTGCGA
AAGGAAAGCCCGGCTCCAATCCAAGTTGTTCAAGAATAGTGGCCTTGAGTTTCTCGACCC
TTTGACTTAGGATTAGTCAGTTCTATTTCTTGATGGGGGAAGGGATATAACTCAGCGGTA
GAGTGTCACCTTGACGTGGTGGAAGTCATCAGTTCGAGCCTGATTATCCCTAAACCCAAT
GAATGTGAGTTTTTCTATTTTGACTT

QA 3 628 3 628
DS 

RD RR2DO76JQ 660 0 0
CT
CACGTGTTCCTAAGAAAAGGGAATTTGTTAATTTTTCGGGGTCTTAAAGGGGCGTGGAAA
CACATAAGAACTCTTGAATGGAAATGGAAAAGAGATGTAACTCCAGTTCCTTTGGAAATA
GGAAGATCTTTGGCGCAAGAATAAAGGATTAATCCGTATCATCTTGACTTGGTTCTGATT
TCTCTATTTTTTTTAAGTTTAAGAAAAGAATACCGTTTCTCCTACCCGTATCGAATAGAA
CATGCTGAGTAAAATCTTCTTCATGTAAAACCGGCTTGATTTAGATCGGGAGAATCGTAC
GGTTTTATGAAACCATGTGCTATGGCTCGAATCCGTAGTCAATCCTATTTCCGATAGGAG
TAGTTGACAATTGAATCCAACTTTTTCCATTATTTTCATTTCATACCCGTAATAGTGCGA
AAGGAAAGCCCGGCTCCAATCCAAGTTGTTCAAGAATAGTGGCCTTGAGTTTCTCGACCC
TTTGACTTAGGATTAGTCAGTTCTATTTCTTGATGGGGGAAGGGATATAACTCAGCGGTA
GAGTGTCACCTTGACGTGGTGGAAGTCATCAGTTCGAGCCTGATTATCCCTAAACCCAAT
GAATGTGAGTTTTTCTATTTTGACTTGCTCCCTCGCTGTGATCGAATAAGAATGGATA

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR2D231TF 290 0 0
GGGGGAAGGGATATAACTCAGCGGTAGAGTGTCACCTTGACGTGGTGGAAGTCATCAGTT
CGAGCCTGATTATCCCTAAACCCAATGAATGTGAGTTTTTCTATTTTGACTTGCTCCCTC
GCTGTGATCGAATAAGAATGGATAAGAGGCTCGTGGGATTGACGTGAGGGGGTAGGGGTA
GCTATATTTCTGGGAGCGAACTCCATGCGAATATGAAGCGCATGGATACAAGTTATGACT
TGGAATGAAAGACAATTTCGAATCAGCTTTGTCTACGAAGAAGGAAGC
CC

QA 1 288 1 288
DS 

RD RR2AP85JQ 891 0 0
CGCACGTGTTCCTAAGAAAAGGGAATTTGTTAATTTTTCGGGGTCTTAAAGGGGCGTGGA
AACACATAAGAACTCTTGAATGGAAATGGAAAAGAGATGTAACTCCAGTTCCTTTGGAAA
TAGGAAGATCTTTGGCGCAAGAATAAAGGATTAATCCGTATCATCTTGACTTGGTTCTGA
TTTCTCTATTTTTTT*AAGTTTAAGAAAAGAATACCGTTTCTCCTACCCGTATCGAATAG
AACATGCTGAGTAAAATCTTCTTCATGTAAAACCGGCTTGATTTAGATCGGGAGAATCGT
ACGGTTTTATGAAACCATGTGCTATGGCTCGAATCCGTAGTCAATCCTATTTCCGATAGG
AGTAGTTGACAATTGAATCCAACTTTTTCCATTATTTTCATTTCATACCCGTAATAGTGC
GAAAGGAAAGCCCGGCTCCAATCCAAGTTGTTCAAGAATAGTGGCCTTGAGTTTCTCGAC
CCTTTGACTTAGGATTAGTCAGTTCTATTTCTTGATGGGGGAAGGGATATAACTCAGCGG
TAGAGTGTCACCTTGACGTGGTGGAAATCATCAGTTCGAGCCTGATTATCCCTAAACCCA
ATGAATGTGAGTTTTTCTATTTTGACTTGCTCCCTCGCTGTGATCGAATAAGAATGGATA
AGAGGCTCGTGGGATTGACGTGAGGGGGTAGGGGTAGCTATATTTCTGGGAGCGAACTCC
ATGCGAATATGAAGCGCATGGATACAAGTTATGACTTGGAATGAAAGACAATTTCGAATC
AGCTTTGTCTACGAAGAAAGAAGCTATAAGTAATGCAACTATGAATCTCATGGAGAGTTC
GATCCTGGCTCAG*ATGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACACGCAAGTCGG

QA 1 891 1 891
DS 

RD RR2DO76TF 582 0 0
AGTCAATCCTATTTCCGATAGGAGTAGTTGACAATTGAATCCAACTTTTTCCATTATTTT
CATTTCATACCCGTAATAGTGCGAAAGGAAAGCCCGGCTCCAATCCAAGTTGTTCAAGAA
TAGTGGCCTTGAGTTTCTCGACCCTTTGACTTAGGATTAGTCAGTTCTATTTCTTGATGG
GGGAAGGGATATAACTCAGCGGTAGAGTGTCACCTTGACGTGGTGGAAGTCATCAGTTCG
AGCCTGATTATCCCTAAACCCAATGAATGTGAGTTTTTCTATTTTGACTTGCTCCCTCGC
TGTGATCGAATAAGAATGGATAAGAGGCTCGTGGGATTGACGTGAGGGGGTAGGGGTAGC
TATATTTCTGGGAGCGAACTCCATGCGAATATGAAGCGCATGGATACAAGTTATGACTTG
GAATGAAAGACAATTTCGAATCAGCTTTGTCTACGAAGAAGGAAGCTATAAGTAATGCAA
CTATGAATCTCATGGAGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCATGCTTAAC
ACATGCAAGTCGGACGGGAAGTGGTGTTTCCAGTGGCGGAC
C

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2AP85TF 731 0 0
ATCGAATAGAACATGCTGAGTAAAATCTTCTTCATGTAAAACCGGCTTGATTTAGATCGG
GAGAATCGTACGGTTTTATGAAACCATGTGCTATGGCTCGAATCCGTAGTCAATCCTATT
TCCGATAGGAGTAGTTGACAATTGAATCCAACTTTTTCCATTATTTTCATTTCATACCCG
TAATAGTGCGAAAGGAAAGCCCGGCTCCAATCCAAGTTGTTCAAGAATAGTGGCCTTGAG
TTTCTCGACCCTTTGACTTAGGATTAGTCAGTTCTATTTCTTGATGGGGGAAGGGATATA
ACTCAGCGGTAGAGTGTCACCTTGACGTGGTGGAAATCATCAGTTCGAGCCTGATTATCC
CTAAACCCAATGAATGTGAGTTTTTCTATTTTGACTTGCTCCCTCGCTGTGATCGAATAA
GAATGGATAAGAGGCTCGTGGGATTGACGTGAGGGGGTAGGGGTAGCTATATTTCTGGGA
GCGAACTCCATGCGAATATGAAGCGCATGGATACAAGTTATGACTTGGAATGAAAGACAA
TTTCGAATCAGCTTTGTCTACGAAGAAGGAAGCTATAAGTAATGCAACTATGAATCTCAT
GGAGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACACGCAAGTCGG
ACGGGAAGTGGTGTTTCCAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAAGAACCTGCCCTTGGG
AGGGGAACAAC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2BZ49TF 635 0 0
G
TCTCATGGAGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACGTGCA
AGTCGGACGGGAAGTGGTGTTTCCAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAAGAACCTGCC
CTTGGGAGGGGAACAACAGCTGGAAACGGCTGCTAATACCCCGTAGGCTGAGGAGCAAAA
GGAGGAATCCGCCCGAGGAGGGGCTCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGCAATAGCTT
ACCAAGACGATGATCCTTGGCTAAATCATTTTAAAGACTTATCAGAAGAAAAAAATCAGG
TAAAATCAAAAATAAGAAGACTGGTTGCAGAAGAAAATATAAGTTTTTTTTT*GCTTTCA
CGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTC
TTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGACCTGGCAACTGTTGTGCCCATGA
GTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATC
TGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCACTGGGAGATTCGGACTAGCACCAT
CAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTT

QA 2 635 2 635
DS 

RD RR2BU54TF 420 0 0
GCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTC
AATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTG
CCCATGAATCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCTTTGGTTCATCA
ACAAATCTGATAATGGTAACGTCCACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTA
GCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGT
CTACAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTTTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTT
GGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAA

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR2BD67JQ 607 0 0
GATTTT
AAAGACTTATCAGAAGAAAAAAATCAGGTAAAATCAAAAATAAGAAGACTGGTTGCAGAA
GAAAATATAAGTTTTTTTTTTGCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTG
ATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATTTCTGCAGCTCCAGTG
CAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAG
TGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTG
TTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAG
TTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGAC
ACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAA
AACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAA
AAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGAGAGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATCTTTGTATCG
C

QA 7 607 7 607
DS 

RD RR2EH09JQ 382 0 0
GAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAA
TCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACC
ATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACA
AACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCA
TATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGT
TTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGAGA
GGAGATCTAGTCAATGTTTAT
G

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR2H160JQ 520 0 0
GCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTC
AATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTG
CCCATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCA
ACAAATCTGATGATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTA
GCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGT
CTACAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTT
GGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAA
CATGTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACC
CGAGAGGAGTTCTAGTCAATGTTTATAATCTTTGTATCGC

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2H160TF 520 0 0
GCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTC
AATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTG
CCCATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCA
ACAAATCTGATGATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTA
GCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGT
CTACAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTT
GGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAA
CATGTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACC
CGAGAGGAGTTCTAGTCAATGTTTATAATCTTTGTATCGC

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2BZ49JQ 574 0 0
AAGAAAAAAATCAGGTAAAATCAAAAATAAGAAGACTGGTTGCAGAAGAAAATATAAGTT
TTTTTTT*GCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATGACTACACTGC
CTCAGTTCAATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATTTCTGCAGCTCCAGTGCAAGACCTGGCAA
CTGTTGTGCCCATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTG
GTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCACTGGGAGAT
TCGGACTAGCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTG
ACTCGGGTCTACAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTG
GTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGAAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTA
TTTAAAAACATGTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAAAACAAAGTTCT
CAAGAACCCGAGAGGAGATCTAGTCAATGTTTAT

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2BD67TF 607 0 0
GATTTT
AAAGACTTATCAGAAGAAAAAAATCAGGTAAAATCAAAAATAAGAAGACTGGTTGCAGAA
GAAAATATAAGTTTTTTTTTTGCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTG
ATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTG
CAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAG
TGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTG
TTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAG
TTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGAC
ACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAA
AACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAA
AAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGAGAGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATCTTTGTATCG
C

QA 7 607 7 607
DS 

RD RR2EH09TF 507 0 0
GCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATGCCTACACTGCCTCAGTTC
AATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTG
CCCATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCA
ACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTA
GCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGT
CTACAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTT
GGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAA
CATGTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACC
CGAGAGGAGATCTAGTCAATGTTTAT
G

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2AG07JQ 692 0 0
GG
AAAGACTTATCAGAAGAAAAAAATCAGGTAAAATCAAAAATAAGAAGACTGGTTGCAGAA
GAAAATATAAGTTTTTTTTTTGCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTG
ATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTG
CAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAG
TGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTG
TTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAG
TTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGAC
ACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAA
AACATTGGTGCTGTTTAAAAACATGTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAA
AAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGAGAGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATCTTTGTATCG
CATTGTATTCCTCTTTAAAACAATTAGAACGACCGCATCTTCAAGTATGTAACGTGAACC
GAAGGCATTGTTCCCTTGATGGAAAACACG

QA 3 692 3 692
DS 

RD RR2CO83JQ 565 0 0
GCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTC
AATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTTTAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTG
CCCATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCA
ACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTA
GCACCATCAGCCAACAGGACGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGT
CTACAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTT
GGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAA
CATGTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACC
CGAGAGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATCTTTGTATCGCATTGTATTCCTCTTTAAAAC
AATTGGAACGACCGCATCTTCAAGC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2CO83TF 570 0 0
GCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTC
AATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCTAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTG
CCCATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCA
ACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTA
GCACCATCAGCCAACAGGACGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGT
CTACAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTT
GGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAA
CATGTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACC
CGAGAGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATCTTTGTATCGCATTGTATTCCTCTTTAAAAC
AATTGGAACGACCGCATCTTCAAGC
AAAAA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2E688TF 571 0 0
GCC
TTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAAT
GGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCC
ATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACA
AATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCA
CCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTA
CAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGT
CATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACAT
GTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGA
GAGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATCTTTGTATCGCATTGTATTCCTCTTTAAAACAAT
TAGAACGACCGCATCTTCAAGC
AAAAAA

QA 4 565 4 565
DS 

RD RR2E688JQ 565 0 0
GCC
TTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAAT
GGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCC
ATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACA
AATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCA
CCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTA
CAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGT
CATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACAT
GTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGA
GAGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATCTTTGTATCGCATTGTATTCCTCTTTAAAACAAT
TAGAACGACCGCATCTTCAAGC

QA 4 565 4 565
DS 

RD RR2FQ01JQ 581 0 0
GCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTC
AATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTG
CCCATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCA
ACAAATCTGATAACGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTA
GCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGT
CTACAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTT
GGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTTTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAA
CATGTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAAA*CAAAGTTCTCAAGAACC
CGAGAGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATCTTTGTATCGCATTGTATTCCTCTTTAAAAC
AATTAGAACGACCGCATCTTCAAGTATGTAACGTGAACC
GA

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2BA65TF 594 0 0
TTGCAGAAGGAAATATAAGTTTTTTTTTTGCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGA
GCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAG
CTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGG
GTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCGTCAACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTC
TGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGGCAGCTG
GACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTC
TCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTG
GTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGA
TTTAAAAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGAGAGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATCT
TTGTATCGCATTGTATTCCTCTTTAAAACAATTAGAACGACCGCATCTTCAAGT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2FQ01TF 608 0 0
TTGCAGAAGAAAATATAAGTTTTTTTTTTGCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGA
GCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAG
CTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGG
GTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAACGGTAACGTCGACGACTC
TGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTG
GACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTC
TCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTG
GTTTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGA
TTTAAAAAAAA*CAAAGTTCTCAAGAACCCGAGAGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATCT
TTGTATCGCATTGTATTCCTCTTTAAAACAATTAGAACGACCGCATCTTCAAGTATGTAA
CGTGAACC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2AG07TF 692 0 0
GG
AAAGACTTATCAGAAGAAAAAAATCAGGTAAAATCAAAAATAAGAAGACTGGTTGCAGAA
GAAAATATAAGTTTTTTTTTTGCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTG
ATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTG
CAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGTCGCAAGGGAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAG
TGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTG
TTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAG
TTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACTGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGAC
ACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAA
AACATTGGTGCTGTTTAAAAACATGTTTATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAA
AAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGAGAGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATCTTTGTATCG
CATTGTATTCCTCTTTAAAACAATTAGAACGACCGCATCTTCAAGTATGTAACGTGAACC
GAAGGCATTGTTCCCTTGATGGAAAACACG

QA 3 692 3 692
DS 



CO CL33Contig2 576 4 16 U
GGAGGTAGAATAAAAAATAAGAAGGCTGGTTGCAGAAGAAAATATAAGTTTTTTTTGCTT
TCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATAACTACACTGCCTCAGTTCAATG
GTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGTAACTGTTGTACCCA
CGAGACGCAAGGGGAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACAA
ATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGCTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCAC
CATCAGCCAACAGGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTAC
AAACGGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTC
ATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATG
TTCATTCGTATTTTGTCAACTTGTAGATTTTTAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGAGG
GGAGATCTAGTCAATGTTTATAATGTTTGTATCGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2A948JQ C 5
AF RR2DG63TF U 1
AF RR2A948TF U 5
AF RR2DG63JQ C 261
BS 1 165 RR2DG63TF
BS 166 166 RR2A948TF
BS 167 169 RR2DG63TF
BS 170 170 RR2A948TF
BS 171 175 RR2DG63TF
BS 176 176 RR2A948TF
BS 177 180 RR2DG63TF
BS 181 181 RR2A948TF
BS 182 272 RR2DG63TF
BS 273 273 RR2A948TF
BS 274 310 RR2DG63TF
BS 311 311 RR2A948TF
BS 312 328 RR2DG63TF
BS 329 329 RR2A948TF
BS 330 573 RR2DG63TF
BS 574 576 RR2A948TF

RD RR2A948JQ 397 0 0
GGAGAATA
AAAAATAAGAAGGCTGGTTGCAGAAGAAAATATAAGTTTTTTTTGCTTTCACGTAAGAGT
CAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATAACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGCTA
GCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGTAACTGTTGTACCCACGAGACGCAAGG
GGAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGG
TAACGTCGACGACTCTGATGCTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAACA
GGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGACC
CAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTG

QA 9 397 9 397
DS 

RD RR2DG63TF 575 0 0
GGAGGTAGAATAAAAAATAAGAAGGCTGGTTGCAGAAGAAAATATAAGTTTTTTTTGCTT
TCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATAACTACACTGCCTCAGTTCAATG
GTCTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACCGTTGTGCCCA
TGAGACGCAAGGGGAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACAA
ATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCAC
CATCAGCCAATAGGAAGGCGACAGCTGGGCTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTAC
AAACGGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTC
ATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATG
TTCATTCGTATTTTGTCAACTTGTAGATTTTTAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGAGG
GGAGATCTAGTCAATGTTTATAATGTTTGTATC
AC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2A948TF 572 0 0
GGAGAATA
AAAAATAAGAAGGCTGGTTGCAGAAGAAAATATAAGTTTTTTTTGCTTTCACGTAAGAGT
CAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATAACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGCTA
GCAAGATCTCTGCAGCTCCAGTGCAAGGCCTGGTAACTGTTGTACCCACGAGACGCAAGG
GGAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGG
TAACGTCGACGACTCTGATGCTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAACA
GGAAGGCGACAGCTGGACTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGACC
CAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCG
TCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTTCATTTGTATT
CTGTCAACTTGTAGATTTTTAAAAA*CAAAGTTCTCAAGAACCCGAGGGGAGATCTAGTC
AATGTTTATAATCTTTGTATCGCG

QA 9 572 9 572
DS 

RD RR2DG63JQ 315 0 0
ACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAATAGGAAGGCG
ACAGCTGGGCTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGACCCAGCCGGG
TTCACTTTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTT
GTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTTCATTCGTATTTTGTCAAC
TTGTAGATTTTTAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGAGGGGAGATCTAGTCAATGTTTA
TAATGTTTGTATC
AC

QA 1 313 1 313
DS 



AS 6 27

CO CL34Contig1 772 2 6 U
GGAAACCAAACTTATTTTATAAACGAACTGAAACATCATTCACAGCCCACATTAATGTCT
CTCCTTGCTTCTCTATTTTTACAAACATTCGGCAAAACATAATAATAATTGAATAAGGTA
TTACATACAGGAAAATATAAGTTGTTCTACAGGGACCAAGCCCTAGACAAAAAGAAGCCA
CACACACACAAGCAATTTCACTTATTACATAACACTTGTCGAGTTAAAAGCAAAAGAGAC
TTGAGAACAATGAGCAATGCGGAGAGAGACTTACGAGGAGGAGGAGGAAGGTGCAGTCGA
AGGGTTAAACGGTTTCTGCTCGGCGCAGCTGAGCTCCTCGTTAGGCCCTGCGTCTTCTCT
TCCAATACCCAAAAGATCAAGGAAGTACAAGTAGTGAGAGACAATGTTGTTCATCGGCTA
AATGTCACCTTGACCGCACGTGTACTCTCCGTACAAGACGTTCATGGTGGTACCAAAAGT
CGGTCCACGTTTGGACAGAGTATCGTTCTTCGTCGGTTTCCAGTTTCCAACGAAGATGTC
GTGAGCTGAAGGCTGAGCTTTCTTGATCGGTGTCATCCATCTCCAGATTGCAGCTTGGAA
GGCAAGCGTGGCGTTCTGCTCGATGTACTCAGGGTGGTTCAAGAGATCAGCTTTTAGTGC
TTCCCCTGCTGCACCGTAGTTGAAGTTCCAGTAAATGGGTAAAGCACCACGTCCGTAGTA
TTCAGCTCCAGGGCTGCAAGGGTACTTATACTTCCAGGTCTCGTCACAGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL60JQ U 1
AF RR2CL46JQ U 78
BS 1 347 RR2CL60JQ
BS 348 348 RR2CL46JQ
BS 349 455 RR2CL60JQ
BS 456 456 RR2CL46JQ
BS 457 709 RR2CL60JQ
BS 710 772 RR2CL46JQ

RD RR2CL60JQ 709 0 0
GGAAACCAAACTTATTTTATAAACGAACTGAAACATCATTCACAGCCCACATTAATGTCT
CTCCTTGCTTCTCTATTTTTACAAACATTCGGCAAAACATAATAATAATTGAATAAGGTA
TTACATACAGGAAAATATAAGTTGTTCTACAGGGACCAAGCCCTAGACAAAAAGAAGCCA
CACACACACAAGCAATTTCACTTATTACATAACACTTGTCGAGTTAAAAGCAAAAGAGAC
TTGAGAACAATGAGCAATGCGGAGAGAGACTTACGAGGAGGAGGAGGAAGGTGCAGTCGA
AGGGTTAAACGGTTTCTGCTCGGCGCAGCTGAGCTCCTCGTTAGGCCTTGCGTCTTCTCT
TCCAATACCCAAAAGATCAAGGAAGTACAAGTAGTGAGAGACAATGTTGTTCATCGGCTA
AATGTCACCTTGACCGCACGTGTACTCTCCGTACAGGACGTTCATGGTGGTACCAAAAGT
CGGTCCACGTTTGGACAGAGTATCGTTCTTCGTCGGTTTCCAGTTTCCAACGAAGATGTC
GTGAGCTGAAGGCTGAGCTTTCTTGATCGGTGTCATCCATCTCCAGATTGCAGCTTGGAA
GGCAAGCGTGGCGTTCTGCTCGATGTACTCAGGGTGGTTCAAGAGATCAGCTTTTAGTGC
TTCCCCTGCTGCACCGTAGTTGAAGTTCCAGTAAATGGGTAAAGCACCA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2CL46JQ 695 0 0
TTTG
CAAACATTCGGCAAAATATAATAATAATTGAATAAGGTATTACATACAGGAAAATATAAG
TTGTTCTACAGGGACCAAGCCCTAGACAAAAAGAAGCCACACACACACAAGCAATTTCAC
TTATTACATAACACTTGTCGAGTTAAAAGCAAAAGAGACTTGAGAACAATGAGCAATGCG
GAGAGAGACTTACGAGGAGGAGGAGGAAGGTGCAGTCGAAGGGTTAAACGGTTTCTGCTC
GGCGCAGCTGAGCTCCTCGTTAGGCCCTGCGTCTTCTCTTCCAATACCCAAAAGATCAAG
GAAGTACAAGTAGTGAGAGACAATGTTGTTCATCGGCTCAATGTCACCTTGACCGCACGT
GTACTCTCCGTACAAGACGTTCATGGTGGTACCAAAAGTCGGTCCACGTTTGGACAGAGT
ATCGTTCTTCGTCGGTTTCCAGTTTCCAACGAAGATGTCGTGAGCTGAAGGCTGAGCTTT
CTTGATCGGTGTCATCCATCTCCAGATTGCAGCTTGGAAGGCAAGCGTGGCGTTCTGCTC
GATGTACTCAGGGTGGTTCAAGAGATCAGCTTTTAGTGCTTCCCCTGCTGCACCGTAGTT
GAAGTTCCAGTAAATGGGTAAAGCACCACGTCCGTAGTATTCAGCTCCAGGGCTGCAAGG
GTACTTATACTTCCAGGTCTCGTCACAGTAA

QA 5 695 5 695
DS 



CO CL34Contig2 1322 7 19 U
GGAGAATCTCTTAATTGTTCGGCAACGAAGCAAAACAAAAGAAAAAAAAGAAAGTTTTTT
CTCAATCTCTCTCTGGATCTAGCTGAGCAGCATTACAGCCGTGTATAAGCTATGGTGACA
ATCCGGAGCGTTTCGGTGTTTATCCTTGTTCTGCTGGCTGTATCATCCCTAGCTTTGTTT
GCAAACGGGGAAGACAAGACGATCAAAGTGAAGAAAGTGAAGGGAAAGAAAGTGTGCACG
CAAGGGTGGGAATGCGTCTGGTGGTCCGAGTACTGCTGTAACCAGACGATATCAGATTAC
TTTCAGGTTTACCAGTTCGAGCAGCTCTTCGCCAAAAGAAACACTCCCATAGCTCATGCC
GTTGGTTTCTGGGACTACCAGTCCTTCATCACCGCCGCTGCTCTCTTTGAGCCTCTCGGG
TTTGGTACCACCGGTGGAAAACTCATGGGACAGAAAGAAATGGCTGCCTTTCTCGGTCAT
GTCGCCAGCAAAACCTCCTGTGGTTATGGAGTCGCAACAGGAGGGCCTTTAGCTTGGGGA
CTTTGCTATAACAGGGAGATGAGTCCAATGCAATCTTACTGTGACGAGACCTGGAAATAC
AAGTACCCTTGCAGCCCTGGAGCTGAGTACTACGGACGTGGTGCTTTACCCATTTACTGG
AACTTCAACTACGGTGCAGCTGGGGAAGCCTTAAAGGCCGATCTCTTGAACCACCCTGAG
TACATCGAGCAGAACGCCACACTCGCCTTCCAAGCTGCTATCTGGAGATGGATGACGCCG
ATCAAGAAAGCTCAGCCCTCTGCTCACGACATCTTTGTTGGTAACTGGAAACCAACGAAG
AATGATACTTTGTCCAAACGTGGACCGACTTTTGGTACCACCATGAACGTTCTGTACGGA
GAGTACACATGTGGTCAAGGTGACATTGAGCCGATGAACAATATAGTCTCGCACTACTTG
TACTTCCTGGACCTCTTGGGTATCGGAAGAGAAGACGCGGGTCCAAACGAGGAGCTCAGT
TGCGCTGAGCAGAAAGCATTCAACCCTGCAACTGCACCTTCTACGTCCACTTCGTAAGGC
TCTCTCTCCTCCATATTCCAGTTGTTTGTCAAGTTCCTCTGCTTCTTCACTCGACAAGTG
TTTACTTAATAAGTGTGCTATTTTTCTTTAGGGGTTGTCCTCCCTGACTCCCTGTAGAAC
TTATACAAACGAAATTTTATATCTGTATGTATGTCGTATTGAATGAATTGTTGTATTTGC
AGAGTGTGTAAAAGTAACTGAAAGCATGTAAACATTGATGTGTGTTGCAAAATGATGTTT
CT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2E692TF U 55
AF RR2GC84TF U 15
AF RR2DR45TF U 1
AF RR2EO23TF U 2
AF RR2E234TF U 255
AF RR2E692JQ C 531
AF RR2DR45JQ C 612
BS 1 40 RR2DR45TF
BS 41 41 RR2GC84TF
BS 42 630 RR2DR45TF
BS 631 669 RR2EO23TF
BS 670 690 RR2E234TF
BS 691 691 RR2E692JQ
BS 692 695 RR2E234TF
BS 696 696 RR2E692JQ
BS 697 716 RR2E234TF
BS 717 717 RR2E692JQ
BS 718 743 RR2E234TF
BS 744 744 RR2E692JQ
BS 745 776 RR2E234TF
BS 777 777 RR2E692JQ
BS 778 894 RR2E234TF
BS 895 1097 RR2E692JQ
BS 1098 1098 RR2DR45JQ
BS 1099 1262 RR2E692JQ
BS 1263 1322 RR2DR45JQ

RD RR2E692TF 254 0 0
TTTTTTCTCAATCTCTCTCTGGATCTAGCTGAGCAGCATTACAGCCGTGTATAAGCTATG
GTGACAATCCGGAGCGTTTCGGTGTTTATCCTTGTTCTGCTGGCTGTATCATCCCTAGCT
TTGTTTGCAAACGGGGAAGACAAGACGATCAAAGTGAAGAAAGTGAAGGGAAAGAAAGTG
TGCACGCAAGGGTGTGAATGCGTCTGGTGGTCCGAGTACTGCTGTAACCAGACGATATCA
GATTACTTTCAGGT

QA 1 254 1 254
DS 

RD RR2GC84TF 536 0 0
GG
GTTCGGCAACGAAGCAAAACAAAAGAAAAAAAAGAAAGTTTTTTCTCAATCTCTCTCTGG
ATCTAGCTGAGCAGCATTACAGCCGTGTATAAGCTATGGTGACAATCCGGAGCGTTTCGG
TGTTTATCCTTGTTCTGCTGGCTGTATCATCCCTAGCTTTGTTTGCAAACGGGGAAGACA
AGACGATCAAAGTGAAGAAAGTGAAGGGAAAGAAAGTGTGCACGCAAGGGTGGGAATGCG
TCTGGTGGTCCGAGTACTGCTGTAACCAGACGATATCAGATTACTTTCAGGTTTACCAGT
TCGAGCAGCTCTTCGCCAAAAGAAACACTCCCATAGCTCATGCCGTTGGTTTCTGGGACT
ACCAGTCCTTCATCACCGCCGCTGCTCTCTTTGAGCCTCTCGGGTTTGGTACCACCGGTG
GAAAACTCATGGGACAGAAAGAAATGGCTGCCTTTCTCGGTCATGTCGCCAGCAAAACCT
CCTGTGGTTATGGAGTCGCAACAGGAGGGCCTTTAGCTTGGGGACTTTGCTATA

QA 3 536 3 536
DS 

RD RR2DR45TF 630 0 0
GGAGAATCTCTTAATTGTTCGGCAACGAAGCAAAACAAAACAAAAAAAAGAAAGTTTTTT
CTCAATCTCTCTCTGGATCTAGCTGAGCAGCATTACAGCCGTGTATAAGCTATGGTGACA
ATCCGGAGCGTTTCGGTGTTTATCCTTGTTCTGCTGGCTGTATCATCCCTAGCTTTGTTT
GCAAACGGGGAAGACAAGACGATCAAAGTGAAGAAAGTGAAGGGAAAGAAAGTGTGCACG
CAAGGGTGGGAATGCGTCTGGTGGTCCGAGTACTGCTGTAACCAGACGATATCAGATTAC
TTTCAGGTTTACCAGTTCGAGCAGCTCTTCGCCAAAAGAAACACTCCCATAGCTCATGCC
GTTGGTTTCTGGGACTACCAGTCCTTCATCACCGCCGCTGCTCTCTTTGAGCCTCTCGGG
TTTGGTACCACCGGTGGAAAACTCATGGGACAGAAAGAAATGGCTGCCTTTCTCGGTCAT
GTCGCCAGCAAAACCTCCTGTGGTTATGGAGTCGCAACAGGAGGGCCTTTAGCTTGGGGA
CTTTGCTATAACAGGGAGATGAGTCCAATGCAATCTTACTGTGACGAGACCTGGAAATAC
AAGTACCCTTGCAGCCCTGGAGCTGAGTAC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2EO23TF 668 0 0
GG
GAATCTCTTAATTGTTCGGCAACGAAGCAAAACAAAAGAAAAAAAAGAAAGTTTTTTCTC
AATCTCTCTCTGGATCTAGCTGAGCAGCATTACAGCCGTGTATAAGCTATGGTGACAATC
CGGAGCGTTTCGGTGTTTATCCTTGTTCTGCTGGCTGTATCATCCCTAGCTTTGTTTGCA
AACGGGGAAGACAAGACGATCAAAGTGAAGAAAGTGAAGGGAAAGAAAGTGTGCACGCAA
GGGTGGGAATGCGTCTGGTGGTCCGAGTACTGCTGTAACCAGACGATATCAGATTACTTT
CAGGTTTACCAGTTCGAGCAGCTCTTCGCCAAAAGAAACACTCCCATAGCTCATGCCGTT
GGTTTCTGG*ACTACCAGTCCTTCATCACCGCCGCTGCTCTCTTTGAGCCTCTCGGGTTT
GGTACCACCGGTGAAAAACTCATGGGACAGAAAGAAGTGGCTGCCTTTCTCGGTCATGTC
GCCAGCAAAACCTCCTGTGGTTATGGAGTCGCAACAGGAGGGCCTTTAGCTTGGGGACTT
TGCTATAACAGGGAGATGAGTCCAATGCAATCTTACTGTGACTAGACCTGGAAATACAAG
TACCCTTGCAGCCCTGGAGCTGAGTACTACGGACGTGGTGCTTTACCCATTTACTGGAAC
TTCAAC

QA 3 668 3 668
DS 

RD RR2E234TF 640 0 0
CGTCTGGTGGTCCGAATACTGCTGTAACCAGACGATATCAGATTACTTTCAGGTTTACCA
GTTTGAGCAGCTCTTCGCCAAAAGAAACACTCCCATAGCTCATGCCGTTGGTTTCTGGGA
CTACCAGTCTTTCATTACCGCCGCTGCTCTCTTTGAGCCTCTCGGGTTTGGTACCACCGG
TGGAAAGCTCATGGGACAGAAAGAAATGGCTGCCTTTCTCGGTCATGTCGCCAGCAAAAC
CTCCTGTGGTTATGGAGTCGCAACGGGAGGGCCTTTAGCTTGGGGTCTGTGCTATAACAG
GGAGATGAGTCCTATGCAATCTTACTGTGACGAGACGTGGAAATACAAGTACCCTTGCAG
CCCTGGAGCTGAGTACTACGGACGTGGTGCTTTACCCATTTACTGGAACTTCAACTACGG
TGCAGCTGGGGAAGCCCTAAAAGCCGATCTCTTGAACCACCCGGAGTACATCGAGCAGAA
CGCCACACTTGCCTTCCAAGCTGCTATCTGGAGATGGATGACACCGATCAAGAAAGCTCA
GCCCTCTGCTCACGACATCTTTGTTGGTAACTGGAAACCAACGAAGAATGATACTTTGTC
CAAACGTGGACCGACTTTTGGTACCACCATGAACGTTCTG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2E692JQ 732 0 0
AGCTTGGGGACTTTGCTATAACAGGGAGATGAGTCCAATGCAATCTTACTGTGACGAGAC
CTGGAAATACAAGTACCCTTGCAGCCCTGGAGCTGAGTACTACGGACGTGGTGCTTTACC
CATTTACTGGAACTTCAACTACGGTGCAGCTGGGGAAGCCTTAAAGGCCGATCTCTTGAA
CCACCCTGAGTACATCGAGCAGAACGCCACACTCGCCTTCCAAGCTGCTATCTGGAGATG
GATGACGCCGATCAAGAAAGCTCAGCCCTCTGCTCACGACATCTTTGTTGGTAACTGGAA
ACCAACGAAGAATGATACTTTGTCCAAACGTGGACCGACTTTTGGTACCACCATGAACGT
TCTGTACGGAGAGTACACATGTGGTCAAGGTGACATTGAGCCGATGAACAATATAGTCTC
GCACTACTTGTACTTCCTGGACCTCTTGGGTATCGGAAGAGAAGACGCGGGTCCAAACGA
GGAGCTCAGTTGCGCTGAGCAGAAAGCATTCAACCCTGCAACTGCACCTTCTACGTCCAC
TTCGTAAGGCTCTCTCTCCTCCATATTGCAGTTGTTTGTCAAGTTCCTCTGCTTCTTCAC
TCGACAAGTGTTTACTTAATAAGTGTGCTATTTTTCTTTAGGGGTTGTCCTCCCTGACTC
CCTGTAGAACTTATACAAACGAAATTTTATATCTGTATGTATGTCGTATTGAATGAATTG
TTGTATTTGCAG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2DR45JQ 711 0 0
CAGCCCTGGAGCTGAGTACTACGGACGTGGTGCTTTACCCATTTACTGGAACTTCAACTA
CGGTGCAGCTGGGGAAGCCTTAAAGGCCGATCTCTTGAACCACCCTGAGTACATCGAGCA
GAACGCCACACTCGCCTTCCAAGCTGCTATCTGGAGATGGATGACGCCGATCAAGAAAGC
TCAGCCCTCTGCTCACGACATCTTTGTTGGTAACTGGAAACCAACGAAGAATGATACTTT
GTCCAAACGTGGACCGACTTTTGGTACCACCATTAACGTTCTGTACGGAGAGTACACATG
TGGTCAAGGTGACATTGAGCCGATGAACAATATAGTCTCGCACTACTTGTACTTCCTGGA
CCTCTTGGGTATCGGAAGAGAAGACGCGGGTCCAAACGAGGAGCTCAGTTGCGCTGAGCA
GAAAGCATTCAACCCTGCAACTGCACCTTCTACGTCCACTTCGTAAGGCTCTCTCTCCTC
CATATTCCAGTTGTTTGTCAAGTTCCTCTGCTTCTTCACTCGACAAGTGTTTACTTAATA
AGTGTGCTATTTTTCTTTAGGGGTTGTCCTCCCTGACTCCCTGTAGAACTTATACAAACG
AAATTTTATATCTGTATGTATGTCGTATTGAATGAATTGTTGTATTTGCAGAGTGTGTAA
AAGTAACTGAAAGCATGTAAACATTGATGTGTGTTGCAAAATGATGTTTCT

QA 1 711 1 711
DS 



CO CL34Contig3 724 3 14 U
GAACAAAACTTAAAATTATATAATAAAAATGAATAGAAACATCATTTGCAAACACACATT
AATGGTTTACATGCTTTCAGTTACTTTTACACACTCTGCAAATACAACAATTCATTCAAT
ACGACATACATACAGATATAAAATTTCGTTT*GTATAAGTTCTACAGGGAGTCAGGGAGG
ACAACCCCTAAAGAAAAATAGCACACTTATTACGTAAACACTTGTCGAGTGAAGAAGCAA
AGGATCTTGAGAACAACCGCAAATACGGAGGAGAGAGACTTACGAAGTGGAAGAAGTAGG
TGCAGTTGCAGGGTTGAATGCTTTCTGCTCAGCGCAACTGAGCTCCTCGTTTGGACCCGC
GTCTTCTCTTCCAATACCCAAGAGGTCCAGGAAGTACAAGTAGTGCGAGACTATATTGTT
CATCGGCTCAATGTCACCTTGACCACATGTGTACTCTCCGTACAGAACGTTCATGGTGGT
ACCAAAAGTCGGTCCACGTTTGGACAAAGTATCATTCTTCGTTGGTTTCCAGTTACCAAC
AAAGATGTCGTGAGCAGAGGGCTGAGCTTTCTTGATCGGCGTCATCCATCTCCAGATAGC
AGCTTGGAAGGCAAGTGTGGCGTTCTGCTCGATGTACTCAGGGTGGTTCAAGAGATCGGC
CTTTAAGGCTTCCCCAGCTGCACCGTAGTTGAAGTTCCAGTAAATGGGTAAAGCACCACG
TCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2D829JQ U 40
AF RR2E234JQ U 1
AF RR2EO23JQ U 114
BS 1 151 RR2E234JQ
BS 152 152 RR2D829JQ
BS 153 241 RR2E234JQ
BS 242 242 RR2D829JQ
BS 243 443 RR2E234JQ
BS 444 444 RR2D829JQ
BS 445 579 RR2E234JQ
BS 580 580 RR2D829JQ
BS 581 639 RR2E234JQ
BS 640 640 RR2EO23JQ
BS 641 660 RR2E234JQ
BS 661 661 RR2EO23JQ
BS 662 662 RR2E234JQ
BS 663 724 RR2EO23JQ

RD RR2D829JQ 555 0 0
CATCATTTGCA
AACACACATTAATGGTTTACATGCTTTCAGTTACTTTTACACACTCTGCAAATACAACAA
TTCATTCAATACGACATACATACGGATATAAAATTTCGTTT*GTATAAGTTCTACAGGGA
GTCAGGGAGGACAACCCCTAAAGAAAAATAGCACACTTATTACGTAAACACTTGTCGAGT
GAAAAAGCAAAGGATCTTGAAAACAACCGCAAATACGGAGGAAAGAGACTTACAAAGTGG
AAAAAGTAGGTGCAGTTGCAGGGTTGAATGCTTTCTGCTCAGCGCAGCTGAGCTCCTCGT
TTGGACCCGCGTCTTCTCTTCCAATACCCAAAAGGTCCAGGAAGTACAAGTAGTGCGAGA
CTATATTGTTCATAGGCTCAATGTCACCTTGACCACATGTGTACTCTCCGTACAAAACGT
TCATGGTGGTACCAAAAGTCGGTCCACGTTTGGACAAAGTATCATTCTTCGTTGGTTTCC
AGTTACCAACAAAGATGTCGTGAGCAGAGGGCTGAGCTTTCTTGATCGGCGTCATCCATC
TCCA

QA 12 555 12 555
DS 

RD RR2E234JQ 662 0 0
GAACAAAACTTAAAATTATATAATAAAAATGAATAGAAACATCATTTGCAAACACACATT
AATGGTTTACATGCTTTCAGTTACTTTTACACACTCTGCAAATACAACAATTCATTCAAT
ACGACATACATACAGATATAAAATTTCGTTTTGTATAAGTTCTACAGGGAGTCAGGGAGG
ACAACCCCTAAAGAAAAATAGCACACTTATTACGTAAACACTTGTCGAGTGAAGAAGCAA
ACGATCTTGAGAACAACCGCAAATACGGAGGAGAGAGACTTACGAAGTGGAAGAAGTAGG
TGCAGTTGCAGGGTTGAATGCTTTCTGCTCAGCGCAACTGAGCTCCTCGTTTGGACCCGC
GTCTTCTCTTCCAATACCCAAGAGGTCCAGGAAGTACAAGTAGTGCGAGACTATATTGTT
CATCGGCTCAATGTCACCTTGACAACATGTGTACTCTCCGTACAGAACGTTCATGGTGGT
ACCAAAAGTCGGTCCACGTTTGGACAAAGTATCATTCTTCGTTGGTTTCCAGTTACCAAC
AAAGATGTCGTGAGCAGAGGGCTGAGCTTTCTTGATCGGTGTCATCCATCTCCAGATAGC
AGCTTGGAAGGCAAGTGTGGCGTTCTGCTCGATGTACTCCGGGTGGTTCAAGAGATCGGC
TT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2EO23JQ 611 0 0
ATTCAATACGACATACATACAGATATAAAATTTCGTTT*GTATAAGTTCTACAGGGAGTC
AGGGAGGACAACCCCTAAAGAAAAATAGCACACTTATTACGTAAACACTTGTCGAGTGAA
GAAGCAAAGGATCTTGAGAACAACCGCAAATACGGAGGAGAGAGACTTACGAAGTGGAAG
AAGTAGGTGCAGTTGCAGGGTTGAATGCTTTCTGCTCAGCGCAACTGAGCTCCTCGTTTG
GACCCGCGTCTTCTCTTCCAATACCCAAGAGGTCCAGGAAGTACAAGTAGTGCGAGACTA
TATTGTTCATCGGCTCAATGTCACCTTGACCACATGTGTACTCTCCGTACAGAACGTTCA
TGGTGGTACCAAAAGTCGGTCCACGTTTGGACAAAGTATCATTCTTCGTTGGTTTCCAGT
TACCAACAAAGATGTCGTGAGCAGAGGGCTGAGCTTTCTTGATCGGCGTCATCCATCTCC
AGATAGCAGCTTGGAAGGCGAGTGTGGCGTTCTGCTCGATGTACTCAGGGTGGTTCAAGA
GATCGGCCTTTAAGGCTTCCCCAGCTGCACCGTAGTTGAAGTTCCAGTAAATGGGTAAAG
CACCACGTCCG

QA 1 611 1 611
DS 



CO CL34Contig4 1250 9 12 U
CAAAAAAGAAAGTAGTTTTTGTTCCCCGTTGAAGTTTTCTCGATCTAGCTTATCGGCATT
GCAGTTGATAATACTTTACTCCATAGTTGTAAAGCTATGGTGACGATCCGGAGCGCTTCA
GTCTTTATTCTGGTTCTGCTCGCTGTCTCATGCCTTGCTTTGGTTGCAAATGGGGAAGAC
AAAACGATTAAAGTGAAGAAAGTGAAGGGAAAGAAGGTGTGCACTCAGGGATGGGAATGC
GTCTGGTGGTCTCAGTACTGCTGTAACGAGACGATCTCTGATTACTTCCAGGTGTATCAG
TTTGAGCAGCTCTTCGCCAAAAGAAACACTCCCATTGCTCACGCTGTTGGTTTCTGGGAC
TACCAGTCTTTCATCACCGCCGCTGCTCTCTACGAGCCTCTTGGATTCGGTACCACTGGT
GGAAAGCTCATGGGACAGAAAGAAATGGCTGCCTTCCTCGGCCATGTCGCCAGCAAAACG
TCCTGTGGCTATGGAGTTGCAACAGGAGGGCCTTTAGCTTGGGGTCTGTGCTACAACAGG
GAGATGAGCCCAATGCAGTCTTACTGTGACGAGACCTGGAAGTATAAGTACCCTTGCAGC
CCTGGAGCTGAATACTACGGACGTGGTGCTTTACCCATTTACTGGAACTTCAACTACGGT
GCAGCAGGGGAAGCACTAAAAGCTGATCTCTTGAACCACCCTGAGTACATCGAGCAGAAC
GCCACGCTTGCATTCCAAGCAGCGATCTGGAGATGGATGACACCGATCAAGAAAGCTCAG
CCTTCAGCTCACGACATCTTCGTTGGAAACTGGAAACCGACGAAGAACGATACTCTGTCC
AAACGTGGACCGACTTTTGGCACCACCATGAACGTCTTGTACGGAGAGTACACGTGCGGT
CAAGGTGACATTGAGCCGATGAACAACATTGTCTCTCACTACTTGTACTTCCCTGATCTC
TTGGGTATTGGAAGAGAAGACGCGGGGCCTAACGAGGAGCTCAGCTGCGCTGAGCAGAAA
CCGTTTAACCCTTCGACTGCACCTTCCTCCTCCTCCTCGTAAGTATCTCCGCATTGCTCG
TTGTTCTCAAGTCTCTTTTGCTTTTAACTCGACAAGTGTTATGTAATAAGTGAAATTGCT
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCGCCTTTTTGTCTAGGGCTTGGTCCCTGTAGAACAACTT
ATATTTTCCTGTATGTAATACCTTATTCAATTATTATTATGTTTTGCCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 0 0 0 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2EB33TF U 16
AF RR2E405TF U 1
AF RR2CL60TF U 17
AF RR2FO05TF U 16
AF RR2AD65TF U 42
AF RR2AL69TF U 371
AF RR2E405JQ C 694
AF RR2AL69JQ C 424
AF RR2EB33JQ C 629
BS 1 533 RR2E405TF
BS 534 669 RR2FO05TF
BS 670 670 RR2AD65TF
BS 671 733 RR2FO05TF
BS 734 734 RR2AL69TF
BS 735 748 RR2FO05TF
BS 749 1158 RR2AL69TF
BS 1159 1160 RR2E405JQ
BS 1161 1161 RR2AL69JQ
BS 1162 1162 RR2EB33JQ
BS 1163 1164 RR2E405JQ
BS 1165 1250 RR2AL69JQ

RD RR2EB33TF 156 0 0
TTTTTGTTC
CCCGTTGAAGTTTTCTCGATCTAGCTTATCGGCATTGCAGTTGATAATACTTTACTCCAT
A*TTGTAAAGCTATGGTGACGATCCGGAGCGCTTCA*TCTTCATTCTGGTTCTGCTCGCT
GTCTCATGCCTTGCTTTGGTTGCAA
TG

QA 10 154 10 154
DS 

RD RR2E405TF 533 0 0
CAAAAAAGAAAGTAGTTTTTGTTCCCCGTTGAAGTTTTCTCGATCTAGCTTATCGGCATT
GCAGTTGATAATACTTTACTCCATAGTTGTAAAGCTATGGTGACGATCCGGAGCGCTTCA
GTCTTTATTCTGGTTCTGCTCGCTGTCTCATGCCTTGCTTTGGTTGCAAATGGGGAAGAC
AAAACGATTAAAGTGAAGAAAGTGAAGGGAAAGAAGGTGTGCACTCAGGGATGGGAATGC
GTCTGGTGGTCTCAGTACTGCTGTAACGAGACGATCTCTGATTACTTCCAGGTGTATCAG
TTTGAGCAGCTCTTCGCCAAAAGAAACACTCCCATTGCTCACGCTGTTGGTTTCTGGGAC
TACCAGTCTTTCATCACCGCCGCTGCTCTCTACGAGCCTCTTGGATTCGGTACCACTGGT
GGAAAGCTCATGGGACAGAAAGAAATGGCTGCCTTCCTCGGCCATGTCGCCAGCAAAACG
TCCTGTGGCTATGGAGTTGCAACAGGAGGGCCTTTAGCTTGGGGTCTGTGCTA

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2CL60TF 706 0 0
TTTTTGTT
CCCGTTGAAGTTTTCTCGATCTAGCTTATCGGCATTGCAGTTGATAATACTTTACTCCAT
AGTTGTAAAGCTATGGTGACGATCCGGAGCGCTTCAGTCTTTATTCTGGTTCTGCTCGCT
GTCTCATGCCTTGCTTTGGTTGCAAATGGGGAAGACAAAACGATTAAAGTGAAGAAGGTG
AAGGGGAAGAAAGTGTGCACGCAGGGATGGAAATGCGTCTGGTGGTCTCAGTACTGCTGT
AACGAGACCATCTCTGATTACTTCCAGGTGTATCAGTTCGAGCAGCTCTTCGCCAAAAGA
AACACCCCCATTGCTCATGCTGTTGGTTTCTGGGACTACCAGTCTTTCATCACCGCCGCT
GCTCTCTACGAGCCTCTTGGGTTCGGTACCACTGGTTGAAAGCCCATGGGACAGAAAGAA
ATGGCTGCTTTCCTCGGCCATGTCGCCAGCAAAACGTCCTGTGGCTATGGAGTTGCAACA
GGAGGGCCTTTAGCTTGGGGTCTGTGCTACAACAGGGAGATGAGCCCAATGCAATCTTAC
TGTGACGAGACCTGGAAGTATAAGTACCCTTGCAGCCCTGGAGCTGAATACTACGGACGT
GGTGCTTTACCCATTTACTGGAACTTCAACTACGGTGCAGCAGGG*AAGCACTAAAAGCT
GATCTCTTGAACCACCCTGAGTACATCGAGCAGA
CGCC

QA 9 702 9 702
DS 

RD RR2FO05TF 733 0 0
TTTTTGTTC
CCCGTTGAAGTTTTCTCGATCTAGCTTATCGGCATTGCAGTTGATAATACTTTACTCCAT
AGTTGTAGAGCTATGGTGACGATCCGGAGCGCTTCAGTCTTTATTCTGGTTCTGCCCGCT
GTCTCATGCCTTGCTTTGGTTGCAAATGGGGAAGACAAAACGATTAAAGTGAAGAAAGTG
AAGGGAAAGAAGGTGTGCACTCAGGGATGGGAATGCGTCTGGTGGTCTCAGTACTGCTGT
AACGAGACGATCTCTGATTACTTCCAGGTGTATCAGTTTGAGCAGCTCTTCGCCAAAAGA
AACACTCCCATTGCTCACGCTGTTGGTTTCTGGGACTACCAGTCTTTCATCACCGCCGCT
GCTCTCTACGAGCCTCTTGGATTCGGTACCACTGGTGGAAAGCTCATGGGACAGAAAGAA
ATGGCTGCCTTCCTCGGCCATGTCGCCAGCAAAACGTCCTGTGGCTATGGAGTTGCAACA
GGAGGGCCTTTAGCTTGGGGTCTGTGCTACAACAGGGAGATGAGCCCAATGCAGTCTTAC
TGTGACGAGACCTGGAAGTATAAGTACCCTTGCAGCCCTGGAGCTGAATACTACGGACGT
GGTGCTTTACCCATTTACTGGAACTTCAACTACGGTGCAGCAGGG*AAGCACTAAAAGCT
GATCTCTTGAACCACCCTGAGTACATCGAGCAGAACGCCACGCTTGCAT*CCAAGCAGCG
ATCT

QA 10 733 10 733
DS 

RD RR2AD65TF 681 0 0
GATCTAGCTTATCGGCATTGCAGTTGATAATACTTTACTCCATAGTTGTAAAGCTATGGT
GACGATCCGGAGCGCTTCAGTCTTTATTCTGGTTCTGCTCGCTGTCTCATGCCTTGCTTT
GGTTGCAAATGGGGAAGACAAAACGATTAAAGTGAAGAAAGTGAAGGGAAAGAAGGTGTG
CACTCAGGGATGGGAATGCGTCTGGTGGTCTCAGTACTGCTGTAACGAGACGATCTCTGA
TTACTTCCAGGTGTATCAGTTTGAGCAGCTCTTCGCCAAAAGAAACACTCCCATTGCTCC
CGCTGTTGGTTTCTGGGACTACCAGTCTTTCATCACCGCCGCTGCTCTCTACGAGCCTCT
TGGATTCGGTACCACTGGTGGAAAGCTCATGGGACAGAAAGAAATGGCTGCCTTCCTCGG
CCATGTCGCCAGCAAAACGTCCTGTGGCTATGGAGTTGCAACAGGAGGGCCTTTAGCTTG
GGGTCTGTGCTACAACAGGGAGATGAGCCCAATGCAGTCTTACTGTGACGAGACCTGGAA
GTATAAGTACCCTTGCAGCCCTGGAGCTGAATACTACGGACGTGGTGCTTTACCCATTTA
CTGGAACTTCAACTACGGTGCAGCAGGGGAAGCACTAAAAGCTGATCTCTTGAACCACCC
TGAGTACATCGAGCAGAACGC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2AL69TF 791 0 0
G
CATCACCGCCGCTGCTCTCTACGAGCCTCTTGGATTCGGTACCACTGGTGGAAAGCTCAT
GGGACAGAAAGAAATGGCTGCCTTCCTCGGCCATGTCGCCAGCAAAACGTCCTGTGGCTA
TGGAGTTGCAACAGGAGGGCCTTTAGCTTGGGGTCTGTGCTACAACAGGGAGATGAGCCC
AATGCAGTCTTACTGTGACGAGACCTGGAAGTATAAGTACCCTTGCAGCCCTGGAGCTGA
ATACTACGGACGTGGTGCTTTACCCATTTACTGGAACTTCAACTACGGTGCAGCAGGGGA
AGCACTAAAAGCTGATCTCTTGAACCACCCTGAGTACATCGAGCAGAACGCCACGCTTGC
ATTCCAAGCAGCGATCTGGAGATGGATGACACCGATCAAGAAAGCTCAGCCTTCAGCTCA
CGACATCTTCGTTGGAAACTGGAAACCGACGAAGAACGATACTCTGTCCAAACGTGGACC
GACTTTTGGCACCACCATGAACGTCTTGTACGGAGAGTACACGTGCGGTCAAGGTGACAT
TGAGCCGATGAACAACATTGTCTCTCACTACTTGTACTTCCCTGATCTCTTGGGTATTGG
AAGAGAAGACGCGGGGCCTAACGAGGAGCTCAGCTGCGCTGAGCAGAAACCGTTTAACCC
TTCGACTGCACCTTCCTCCTCCTCCTCGTAAGTATCTCCGCATTGCTCGTTGTTCTCAAG
TCTCTTTTGCTTTTAACTCGACAAGTGTTATGTAATAAGTGAAATTGCTTGTGTGTGTGT
GTGTGTG
GCT

QA 2 788 2 788
DS 

RD RR2E405JQ 507 0 0
AACCACCCTGAGTACATCGAGCAGAACGCCACGCTTGCATTCCAAGCAGCGATCTGGAGA
TGGATGACACCGATCAAGAAAGCTCAGCCTTCAGCTCACGACATCTTCGTTGGAAACTGG
AAACCGACGAAGAACGATACTCTGTCCAAACGTGGACCGACTTTTGGCACCACCATGAAC
GTCTTGTACGGAGAGTACACGTGCGGTCAAGGTGACATTGAGCCGATGAACAACATTGTC
TCTCACTACTTGTACTTCCTTGATCTCTTGGGTATTGGAAGAGAAGACGCGGGGCCTAAC
GAGGAGCTCAGCTGCGCTGAGCAGAAACCGTTTAACCCTTCGACTGCACCTTCCTCCTCC
TCCTCGTAAGTATCTCCGCATTGCTCGTTGTTCTCAAGTCTCTTTTGCTTTTAACTCGAC
AAGTGTTATGTAATAAGTGAAATTGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCTTTTTTGTC
TAGGGCTTGGTCCCTGTAGAACAACTT

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2AL69JQ 827 0 0
AAGCTCATGGGACAGAAAGAAATGGCTGCCTTCCTCGGCCATGTCGCCAGCAAAACGTCC
TGTGGCTATGGAGTTGCAACAGGAGGGCCTTTAGCTTGGGGTCTGTGCTACAACAGGGAG
ATGAGCCCAATGCAGTCTTACTGTGACGAGACCTGGAAGTATAAGTACCCTTGCAGCCCT
GGAGCTGAATACTACGGACGTGGTGCTTTACCCATTTACTGGAACTTCAACTACGGTGCA
GCAGGGGAAGCACTAAAAGCTGATCTCTTGAACCACCCTGAGTACATCGAGCAGAACGCC
ACGCTTGCATTCCAAGCAGCGATCTGGAGATGGATGACACCGATCAAGAAAGCTCAGCCT
TCAGCTCACGACATTTTCGTTGGAAACTGGAAACCGACGAAGAACGATACTCTGTCCAAA
CGTGGACCGACTTTTGGCACCACCATGAACGTCTTGTACGGAGAGTACACGTGCGGTCAA
GGTGACATTGAGCCGATGAACAACATTGTCTCTCACTACTTGTACTTCCCTGATCTCTTG
GGTATTGGAAGAGAAGACGCGGGGCCTAACGAGGAGCTCAGCTGCGCTGAGCAGAAACCG
TTTAACCCTTCGACTGCACCTTCCTCCTCCTCCTCGTAAGTATCTCCGCATTGCTCGTTG
TTCTCAAGTCTCTTTTGCTTTTAACTCGACAAGTGTTATGTAATAAGTGAAATTGCTTGT
GTGTGTGTGTGTGTGGCTT**CTTTTTGTCTAGGGCTTGGTCCCTGTAGAACAACTTATA
TTTTCCTGTATGTAATACCTTATTCAATTATTATTATGTTTTGCCGG

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2EB33JQ 620 0 0
CTTTACCCATTTACTGGAACTTCAATTACGGTGCGGCAGGGGAAGCACTAAAAGCTGATC
TCTTGAACCACCCTGAGTACATCGAGCAGAACGCCACGCTTGCATTCCAAGCAGCGATCT
GGAGATGGACGACACCGATCAAGAAAGCTCAGCCTTCAGCTCACGACATCTTCGTTGGAA
ACTGGAAACCGAGGAAGAACGATACTCTGTCCAAACGTGGACCGACTTTTGGCACCACCA
TGAACGTCTTGTACGGAGAGTACACGTGCGGTCAAGGTGACACTGAGCCGATGAACAACG
TTGTCTCTCACTACTTGTACTTCCTTGATCTCTTGGGTATTGGAAGAGAAGACGCGGGGC
CTAACGAGGAGCTCAGCTGCGTTGAGCAGAAACCGTTTAACCCTTCGACTGCACCTTCCT
CCTCCTCCTGGTAAGTATCTCCGCATTGCTCGTTGTTCTCAAGTTTCTTTTGCTTTTAAC
TCGACAAGTGTTATGTAATAAGTGAAATTGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCTTCTTT
TTGTCTAGGGCTTGGTCCCTGTAGAACAACTTATATTTTCCTGTATGTAATACCTTATTC
AATTATTATTATGTTTTGCC

QA 1 620 1 620
DS 



CO CL34Contig5 1289 2 2 U
GTGACGACAACGAAGCAAAAAAAGAAAGTAGTTTTTGTTCCCCGTTGAAGCTCAACTAGT
TTTCTCGATCTCTCTAGATCTAGCTTATCGGCATTGCAGTTGATACTTTACTCCATAGTT
GTAAAGCTATGGTGACGATCCGTAGCGCTTCAGTCTTTATTCTAGTTCTGCTCGCTGTCT
CATGCCTGGCGTTGGTTGCAAACGGGGAAGACAAAACGATTAAAGTGAAGAAGGTGAAGG
GAAAGAAGGTGTGCACGCAGGGATGGGAATGCGTCTGGTGGTCTCAGTACTGCTGTAACG
AGACGATCTCTGATTACTTCCAGGTGTATCAGTTTGAGCAGCTCTTCGCCAAAAGAAACA
CTCCAATTGCTCACGCTGTTGGTTTCTGGGACTACCAGTCTTTCATCACCGCCGCTGCTC
TCTATGAGCCTCTTGGGTTCGGTACCACTGGTGGAAAGCTCATGGGACAGAAAGAAATGG
CTGCCTTCCTCGGCCATGTCGCCAGCAAAACGTCCTGTGGCTATGGAGTTGCAACAGGAG
GGCCTTTAGCTTGGGGTCTGTGCTATAACAGGGAGATGAGTCCAATGCAATCTTACTGTG
ACGAGACCTGGAAGTACAAGTACCCTTGCAGCCCTGGAGCTGAATACTACGGACGTGGTG
CTTTACCCATTTACTGGAACTTCAACTACGGTGCAGCAGGGGAAGCACTAAAAGCTGATC
TCTTGAACCACCCTGAGTACATCGAGCAGAACGCCACGCTTGCATTCCAAGCAGCGATCT
GGAGATGGATGGCACCGATCAAGAAAGCTCAGCCGTCAGCTCACGATATCTTCGTTGGGA
ACTGGAAACCGACGAAGAACGATACTCTGTCCAAACGTGGACCGACTTTTGGTACCACCA
TGAACGTCTTGTATGGAGAGTACACGTGCGGTCAAGGTGACATTGAGCCGATGAACAACA
TTGTCTCTCACTATTTGTACTTCCTTGATCTCTTGGGTATTGGAAGAGAAGACGCGGGGC
CTAACGAGGAGCTCAGCTGCGCTGAGCAGAAACCATTTAACCCTTTTACTGCACCTTCCT
CCTCCTCCTCGTAAGTCTCTCCGCATTGCCTCCTCCTGGTAAGTCTCTCCGCATTGCTCA
TTGTTCTCAAGTCTCTTTTGCTTTTAACTCGACAAGTGTTATGTAATAAGTGAAATTGCT
TGTGTGTGTGTGTGGCTTCTTTTTGTCTAGGGCTTGGTCCCTGTAGAACAACTTATATTT
TCCTGTATGTAATACCTTATTCAATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO92TF U 1
AF RR2FO92JQ C 547
BS 1 607 RR2FO92TF
BS 608 1289 RR2FO92JQ

RD RR2FO92TF 607 0 0
GTGACGACAACGAAGCAAAAAAAGAAAGTAGTTTTTGTTCCCCGTTGAAGCTCAACTAGT
TTTCTCGATCTCTCTAGATCTAGCTTATCGGCATTGCAGTTGATACTTTACTCCATAGTT
GTAAAGCTATGGTGACGATCCGTAGCGCTTCAGTCTTTATTCTAGTTCTGCTCGCTGTCT
CATGCCTGGCGTTGGTTGCAAACGGGGAAGACAAAACGATTAAAGTGAAGAAGGTGAAGG
GAAAGAAGGTGTGCACGCAGGGATGGGAATGCGTCTGGTGGTCTCAGTACTGCTGTAACG
AGACGATCTCTGATTACTTCCAGGTGTATCAGTTTGAGCAGCTCTTCGCCAAAAGAAACA
CTCCAATTGCTCACGCTGTTGGTTTCTGGGACTACCAGTCTTTCATCACCGCCGCTGCTC
TCTATGAGCCTCTTGGGTTCGGTACCACTGGTGGAAAGCTCATGGGACAGAAAGAAATGG
CTGCCTTCCTCGGCCATGTCGCCAGCAAAACGTCCTGTGGCTATGGAGTTGCAACAGGAG
GGCCTTTAGCTTGGGGTCTGTGCTATAACAGGGAGATGAGTCCAATGCAATCTTACTGTG
ACGAGAC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2FO92JQ 743 0 0
TAGCTTGGGGTCTGTGCTATAACAGGGAGATGAGTCCAATGCAATCTTACTGTGACGAGA
CCTGGAAGTACAAGTACCCTTGCAGCCCTGGAGCTGAATACTACGGACGTGGTGCTTTAC
CCATTTACTGGAACTTCAACTACGGTGCAGCAGGGGAAGCACTAAAAGCTGATCTCTTGA
ACCACCCTGAGTACATCGAGCAGAACGCCACGCTTGCATTCCAAGCAGCGATCTGGAGAT
GGATGGCACCGATCAAGAAAGCTCAGCCGTCAGCTCACGATATCTTCGTTGGGAACTGGA
AACCGACGAAGAACGATACTCTGTCCAAACGTGGACCGACTTTTGGTACCACCATGAACG
TCTTGTATGGAGAGTACACGTGCGGTCAAGGTGACATTGAGCCGATGAACAACATTGTCT
CTCACTATTTGTACTTCCTTGATCTCTTGGGTATTGGAAGAGAAGACGCGGGGCCTAACG
AGGAGCTCAGCTGCGCTGAGCAGAAACCATTTAACCCTTTTACTGCACCTTCCTCCTCCT
CCTCGTAAGTCTCTCCGCATTGCCTCCTCCTGGTAAGTCTCTCCGCATTGCTCATTGTTC
TCAAGTCTCTTTTGCTTTTAACTCGACAAGTGTTATGTAATAAGTGAAATTGCTTGTGTG
TGTGTGTGGCTTCTTTTTGTCTAGGGCTTGGTCCCTGTAGAACAACTTATATTTTCCTGT
ATGTAATACCTTATTCAATTATT

QA 1 743 1 743
DS 



CO CL34Contig6 1352 4 12 U
GGTGACGACAACGAAGCAAAAAAAAAGAAAGTAGTTTTTGTTCCCCGTTGAAGCTCAACT
AGGTTTCTCTCGACCTCTCTAGATCTAGCTTATCGGCATTGCAGCTGAATACTTTACTCC
ATAGTTGTAAAGCTATGGTGACGATCCGGAGCGCTTCGGTCTTTATTCTACTTCTGCTGG
CTGTCTCATGCCTTGCTTTGGTTGCAAACGGGGAAGACAAAACGATTAAAGTGAAGAAAG
TGAAGGGAAAGAAGGTGTGCACGCAGGGATGGGAATGCGTCTGGTGGTCTCAGTACTGCT
GCAACGAGACGATCTCTGATTACTTCCAGGTGTATCAGTTTGAGCAGCTCTTCGCCAAAA
GAAACACCCCCATTGCTCATGCTGTCGGTTTCTGGGACTACCAGTCTTTCATCACCGCGG
CTGCTCTCTACGAGCCTCTTGGGTTTGGTACCACTGGTGGAAAGCTCATGGGACAGAAAG
AAATGGCTGCCTTCCTCGGCCATGTCGCCAGCAAAACGTCATGTGGCTATGGAGTTGCAA
CAGGAGGGCCTTTAGCTTGGGGTCTGTGCTACAACAGGGAGATGAGCCCAATGCAATCTT
ACTGTGACGAGACCTGGAAGTACAAGTACCCTTGCAGCCCTGGAGCTGAGTACTACGGAC
GTGGTGCCTTACCCATTTACTGGAACTTCAACTACGGTGCGGCTGGAGAAGCACTAAAAG
CCGATCTCTTGAACCACCCGGAGTACATCGAGCAGAACGCCACGCTTGCCTTCCAAGCTG
CAATCTGGAGATGGATGACACCGATCAAGAAAGCTCAGCCTTCAGCTCACGATATCTTTG
TTGGAAACTGGAAACCGACGAAGAACGATACTCTGTCCAAACGTGGACCGACTTTTGGTA
CCACCATGAACGTCTTGTACGGAGAGTACACGTGCGGTCAAGGTGACATTGAGCCGATGA
ACAACATTGTCTCTCACTACTTGTACTTCCTTGATCTCTTGGGTATTGGAAGAGAAGACG
CGGGGCCTAACGAGGAGCTCAGCCGCGCTGAGCAGAAACCATTTAACCCTTCAACTGCAC
CTTCCTCCTCCTCCTCGTAAGTCTCTCTCCGCATTGCTCATCGTTCTCAAGTCTCTTTTG
CTTTTAACTCAACAATTATGTAATAAGTGAAATTGCTTGTGTGTGTGTGGCTTCTTTTTG
TCCATGTAGAACTTATATTTTCCTGTATGTAATACCTTATTCAATTATTATTATGTTTTG
CCGAATGTTTGTAAAAATAGAGAAGCAAGGAGAGACATTAATGTGGGCTGTGAATGATGT
TTCAGTTCGTTTATAAAATAAGTTTGGTTTCT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP11TF U 1
AF RR2DJ76TF U 2
AF RR2DJ76JQ C 634
AF RR2GP11JQ C 872
BS 1 730 RR2GP11TF
BS 731 756 RR2DJ76TF
BS 757 757 RR2DJ76JQ
BS 758 773 RR2DJ76TF
BS 774 774 RR2DJ76JQ
BS 775 801 RR2DJ76TF
BS 802 908 RR2DJ76JQ
BS 909 909 RR2GP11JQ
BS 910 1121 RR2DJ76JQ
BS 1122 1122 RR2GP11JQ
BS 1123 1272 RR2DJ76JQ
BS 1273 1352 RR2GP11JQ

RD RR2GP11TF 730 0 0
GGTGACGACAACGAAGCAAAAAAAAAGAAAGTAGTTTTTGTTCCCCGTTGAAGCTCAACT
AGGTTTCTCTCGACCTCTCTAGATCTAGCTTATCGGCATTGCAGCTGAATACTTTACTCC
ATAGTTGTAAAGCTATGGTGACGATCCGGAGCGCTTCGGTCTTTATTCTACTTCTGCTGG
CTGTCTCATGCCTTGCTTTGGTTGCAAACGGGGAAGACAAAACGATTAAAGTGAAGAAAG
TGAAGGGAAAGAAGGTGTGCACGCAGGGATGGGAATGCGTCTGGTGGTCTCAGTACTGCT
GCAACGAGACGATCTCTGATTACTTCCAGGTGTATCAGTTTGAGCAGCTCTTCGCCAAAA
GAAACACCCCCATTGCTCATGCTGTCGGTTTCTGGGACTACCAGTCTTTCATCACCGCGG
CTGCTCTCTACGAGCCTCTTGGGTTTGGTACCACTGGTGGAAAGCTCATGGGACAGAAAG
AAATGGCTGCCTTCCTCGGCCATGTCGCCAGCAAAACGTCATGTGGCTATGGAGTTGCAA
CAGGAGGGCCTTTAGCTTGGGGTCTGTGCTACAACAGGGAGATGAGCCCAATGCAATCTT
ACTGTGACGAGACCTGGAAGTACAAGTACCCTTGCAGCCCTGGAGCTGAGTACTACGGAC
GTGGTGCCTTACCCATTTACTGGAACTTCAACTACGGTGCGGCTGGAGAAGCACTAAAAG
CCGATCTCTT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2DJ76TF 800 0 0
GG
GACGACAACGAAGCAAAAAAA**GAAAGTAGTTTTTGTTCCCCGTTGAAGCTCAACTAGG
TTTCTCTCGACCTCTCTAGATCTAGCTTATCGGCATTGCAGCTGAATACTTTACTCCATA
GTTGTAAAGCTATGGTGACGATCCGGAGCGCTTCGGTCTTTATTCTACTTCTGCTGGCTG
TCTCATGCCTTGCTTTGGTTGCAAACGGGGAAGACAAAACGATTAAAGTGAAGAAAGTGA
AGGGAAAGAAGGTGTGCACGCAGGGATGGGAATGCGTCTGGTGGTCTCAGTACTGCTGCA
ACGAGACGATCTCTGATTACTTCCAGGTGTATCAGTTTGAGCAGCTCTTCGCCAAAAGAA
ACACCCCCATTGCTCATGCTGTCGGTTTCTGGGACTACCAGTCTTTCATCACCGCGGCTG
CTCTCTACGAGCCTCTTGGGTTTGGTACCACTGGTGGAAAGCTCATGGGACAGAAAGAAA
TGGCTGCCTTCCTCGGCCATGTCGCCAGCAACACGTCATGTGGCTATGGAGTTGCAACAG
GAGGGCCTTTAGCTTGGGGTCTGTGCTACAACAGGGAGATGAGCCCAATGCAATCTTACT
GTGACGAGACCTGGAAGTACAAGTACCCTTGCAGCCCTGGAGCTGAGTACTACGGACGTG
GTGCCTTACCCATTTACTGGAACTTCAACTACG*TGCGGCTGGAGAAGCACTAAAAGCCG
ATCTCTTGAACCACCCGGAGTACATCGAGCAGA*CGCCACGCTTGCCTTC*AAGCTGCAA
TCTGGAGATGGATGACAC

QA 3 800 3 800
DS 

RD RR2DJ76JQ 639 0 0
GCAGCCCTGGAGCTGAGTACTACGGACGTGGTGCCTTACCCATTTACTGGAACTTCAACT
ACGGTGCGGCTGGAGAAGCACTAAAAGCCGATCTCTTGAACCACCCGGAGTACATCGAGC
AGAACGCCACGCTTGCCTTCCAAGCTGCAATCTGGAGATGGATGACACCGATCAAGAAAG
CTCAGCCTTCAGCTCACGATATCTTTGTTGGAAACTGGAAACCGACGAAGAACGATACTC
TGTCCAAACGTGGACCGACTTTTGGTACCACCATGTACGTCTTGTACGGAGAGTACACGT
GCGGTCAAGGTGACATTGAGCCGATGAACAACATTGTCTCTCACTACTTGTACTTCCTTG
ATCTCTTGGGTATTGGAAGAGAAGACGCGGGGCCTAACGAGGAGCTCAGCCGCGCTGAGC
AGAAACCATTTAACCCTTCAACTGCACCTTCCTCCTCCTCCTCGTAAGTCTCTCTCCGCA
TTGCTCATTGTTCTCAAGTCTCTTTTGCTTTTAACTCAACAATTATGTAATAAGTGAAAT
TGCTTGTGTGTGTGTGGCTTCTTTTTGTCCATGTAGAACTTATATTTTCCTGTATGTAAT
ACCTTATTCAATTATTATTATGTTTTGCCGAATGTTTGT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2GP11JQ 481 0 0
TCTGTCCAAACGTGGACCGACTTTTGGTACCACCATGAACGTCTTGTACGGAGAGTACAC
GTGCGGTCAAGGTGGCATTGAGCCGATGAACAACATTGTCTCTCACTACTTGTACTTCCT
TGATCTCTTGGGTATTGGAAGAGAAGACGCGGGGCCTAACGAGGAGCTCAGCTGCGCTGA
GCAGAAACCATTTAACCCTTCAACTGCACCTTCCTCCTCCTCCTCGTAAGTCTCTCTCCG
CATTGCTCATCGTTCTCAAGTCTCTTTTGCTTTTAACTCAACAATTATGTAATAAGTGAA
ATTGCTTGTGTGTGTGTGGCTTCTTTTTGTCCATGTAGAACTTATATTTTCCTGTATGTA
ATACCTTATTCAATTATTATTATGTTTTGCCGAATGTTTGTAAAAATAGAGAAGCAAGGA
GAGACATTAATGTGGGCTGTGAATGATGTTTCAGTTCGTTTATAAAATAAGTTTGGTTTC
T

QA 1 481 1 481
DS 



AS 3 29

CO CL35Contig1 762 14 11 U
GGACGAACAAAAGCTCACAAAGCAGAGAAAAGAGAAAGAGAGAGAGA**AGAAACAATCT
AGCCGGAGAAGACGAAAAGAGAAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCT
GTGCGATGTGGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGT
CTGGGCCCAAAGCTCCAATTTTCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAA
AGACTTTGAGGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGAGAAAAGTA
CATGGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGG*ACCTGGTGG*A
GTCACTATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGAGCCAATGACT
GGCGGTCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTC
TAAGTTTACACTTTTCAAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCT
TTTACTACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATC
AAAAACAAAAACCAAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTG
TTTTTGTTTTGGAGTCTCTCTATTGTTCTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCT
CTGGCTTTCGATTTCGATAATAAAGTAACTCCTGTTTGGTAG


BQ
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 30 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 25 80 80 65 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 
80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 65 65 65 50 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 10 10 10 

AF RR2A384TF U 333
AF RR2DL50JQ C 115
AF RR2E262TF U 1
AF RR2DL50TF U -1
AF RR2AH61TF U 1
AF RR2C138JQ C 1
AF RR2C138TF U 1
AF RR2G328JQ C 1
AF RR2G328TF U 318
AF RR2B656JQ C 16
AF RR2B656TF U 16
AF RR2E262JQ C 63
AF RR2GO15TF U 326
AF RR2AH61JQ C 163
BS 1 506 RR2AH61TF
BS 507 507 RR2E262TF
BS 508 585 RR2AH61TF
BS 586 586 RR2E262TF
BS 587 673 RR2AH61TF
BS 674 674 RR2E262TF
BS 675 738 RR2AH61TF
BS 739 752 RR2G328TF
BS 753 758 RR2B656TF
BS 759 759 RR2G328JQ
BS 760 762 RR2E262JQ

RD RR2A384TF 155 0 0
TCAGAGGCAAAAAGGG*ACCTGGTGG*AGTCACTATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGT
CTTTGGCGTCTATGATGAGCCAATGACTGGCGGTCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCT
CGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGTTT

QA 1 155 1 155
DS 

RD RR2DL50JQ 566 0 0
TCTCCTGTGCGATGTGGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCGAGACGG
CAGTGTCTGGGCCCAAAGCTCCAATTTTCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAAT
CAGGAAAGACTTTGAGGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGAGA
AAAGTACATGGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGG*ACCTG
GTGG*AGTCACTATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTTTACGATGAGCCA
ATGACTGGCGGTCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCT
GATCTCTAAGTTTACACTTTTCAAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGT
TCTTCTTTTACTACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCG
TGCATCAAAAACAAAAACCAAAACTATACTCTTGAAAATGATTTAAGAAACAAATCACCC
TTTGTGTTTTTGTTTTGGAGTCTCTC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2E262TF 719 0 0
GGACGAACAAAAGCTCACAAAGCAGAGAAAAGAGAAAGAGAGAGAGA**AGAAACAATCT
AGCCGGAGAAGACGAAAAGAGAAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCT
GCGCGATGTGGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGT
CTGGGCCCAAAGCTCCAATTTTCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAA
AGACTTTGAGGAACCTGGGCATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGAGAAAAGTA
CATGGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGG*ACCTGGTGG*A
GTCACTATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGAGCCAATGACT
GGCGGTCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTC
TAAGTTTACACTTTTCAAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCT
TTTACTACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATC
AAAAACAAAAACCAAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTG
TTTTTGTTTTGGAGTCTCTCTATTGTTCTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2DL50TF 682 0 0
GGCC
ACGAACAAAAGCTCACAAAGCAGAGAAAAGAGAAAGAGAGAGAGA**AGAAACAATCTAG
CCGGAGAAGACTAAAAGAGAAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCTGT
GCGATGTGGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCGAGACGGCAGTGTCT
GGGCCCAAAGCTCCAATTTTCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAAG
ACTTTGAGGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGAGAAAAGTACA
TGGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGG*ACCTGGTGG*AGT
CACTATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGAGCCAATGACTGG
CGGTCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTA
AGTTTACACTTTTCAAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCTTT
TACTACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATCAA
AAACAAAAACCAAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTT
TTTGTTTTGGAGTCTCTC

QA 5 682 5 682
DS 

RD RR2AH61TF 738 0 0
GGACGAACAAAAGCTCACAAAGCAGAGAAAAGAGAAAGAGAGAGAGA**AGAAACAATCT
AGCCGGAGAAGACGAAAAGAGAAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCT
GTGCGATGTGGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGT
CTGGGCCCAAAGCTCCAATTTTCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAA
AGACTTTGAGGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGAGAAAAGTA
CATGGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGG*ACCTGGTGG*A
GTCACTATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGAGCCAATGACT
GGCGGTCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTC
TAAGTTTACACTTTTCAAAAAAAGTGTTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCT
TTTACTACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGACTGTGGTCGTGCATC
AAAAACAAAAACCAAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTG
TTTTTGTTTTGGAATCTCTCTATTGTTCTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCT
CTGGCTTTCGATTTCGAT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2C138JQ 749 0 0
GGACGAACAAAAGCTCACAAAGCAGAGAAAAGAGAAAGAGAGAGAGA**AGAAACAATCT
AGCCGGAGAAGACGAAAAGAGAAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCT
GTGCGATGTGGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGT
CTGGGCCCAAAGCTCCAATTTTCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAA
AGACTTTGAGGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGAGAAAAGTA
CATGGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGG*ACCTGGTGG*A
GTCACTATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTTTACGATGAGCCAATGACT
GGCGGTCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTC
TAAGTTTACACTTTTCAAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCT
TTTACTACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATC
AAAAACAAAAACCAAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTG
TTTTTGTTTTGGAGTCTCTCTATTATTCTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCT
CTGGCTTTCGATTTCGATAATAAAGTAAC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2C138TF 738 0 0
GGACGAACAAAAGCTCACAAAGCAGAGAAAAGAGAAAGAGAGAGAGA**AGAAACAATCT
AGCCGGAGAAGACGAAAAGAGAAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCT
GTGCGATGTGGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGT
CTGGGCCCAAAGCTCCAATTTTCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAA
AGACTTTGAGGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGAGAAAAGTA
CATGGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGG*ACCTGGTGG*A
GTCACTATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGAGCCAATGACT
GGCGGTCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTC
TAAGTTTACACTTTTCAAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCT
TTTACTACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATC
AAAAACAAAAACCAAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTG
TTTTTGTTTTGGAGTCTCTCTAT*ATTCTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCT
CTGGCTTTCGATTTCGAT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2G328JQ 760 0 0
GGACGAACAAAAGTTCACAAAGCAGAGAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAACAATCT
AGCCGGAGAAGACGAAAAGAGAAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCT
GTGCGATGTGGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGT
CTGGGCCCAAAGCTCCAATTTTCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAA
AGACTTTGAGGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGA*AAAAGTA
CATGGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGG*ACCTGGTGG*A
GTCACTATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTTTACGATGAGCCAATGACT
GGCGGTCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTC
TAAGTTTACACTTTTCAAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCT
TTTACTACATAAAACACTCTTCTGCCGTTGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATC
AAAAACAAAAACCAAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTG
TTTTTGTTTTGGAGTCTCTCTATTGTTCTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCT
CTGGCTTTCGATTTCGATAATAAAGTAACTCCTGTTTGG
G

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2G328TF 435 0 0
AAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGGGACCTGGTGGGAGTCACTATCAAGAAGAC
CAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGAGCCAATGACTGGCGGTCAATGCAACTT
GGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGTTTACACTTTTCA
AAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCTTTTACTACATAAAACAC
TCTTCTGCCGTTGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATCAAAAACAAAAACCAAAA
CTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTTTTTGTTTTGGAGTCT
CTCTATTGTTCTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCTCTGGCTTTCGATTTCGA
TAATAAAGTAACTCC

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR2B656JQ 745 0 0
CACAAAGCAGAGAAAAGAGAAAGAGAGAGAGA**AGAAACAATCTAGCCGGAGAAGACGA
AAAGAGAAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCTGTGCGATGTGGAAGG
CAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTGGGCCCAAAGCTC
CAATTTTCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAAGACTTTGAGGAACC
TGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGAGAAAAGTACATGGTTATCCAAGG
TGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGG*ACCTGGTGG*AGTCACTATCAAGAAG
ACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGGGCCAATGACTGGCGGTCAATGCAAC
TTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGTTTACACTTTT
CAAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCTTTTACTACATAAAAC
ACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATCAAAAACAGAAACCAA
AACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTTTTTGTTTTGGAGT
CTCTCTATTGTTCTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCTCTGGCTTTCGATTTC
GATAATAAAGTAACTCCTGTTTG
AC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2B656TF 745 0 0
CACAAAGCAGAGAAAAGAGAAAGAGAGAGAGA**AGAAACAATCTAGCCGGAGAAGACGA
AAAGAGAAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCTGTGCGATGTGGAAGG
CAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTGGGCCCAAAGCTC
CAATTTTCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAAGACTTTGAGGAACC
TGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGAGAAAAGTACATGGTTATCCAAGG
TGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGG*ACCTGGTGG*AGTCACTATCAAGAAG
ACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGGGCCAATGACTGGCGGTCAATGCAAC
TTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGTTTACACTTTT
CAAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCTTTTACTACATAAAAC
ACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATCAAAAACAGAAACCAA
AACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTTTTTGTTTTGGAGT
CTCTCTATTGTTCTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCTCTGGCTTTCGATTTC
GATAATAAAGTAACTCCTGTTTG
AC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2E262JQ 700 0 0
CCGGAGAAGACGAAAAGAGAAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCTGC
GCGATGTGGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCT
GGGCCCAAAGCTCCAATTTTCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAAG
ACTTTGAGGAACCTGGGCATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGAGAAAAGTACA
TGGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGG*ACCTGGTGG*AGT
CACTATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTTTACGATGAGCCAATGACTGG
CGGTCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTA
AGTTTACACTTTTCAAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCTTT
TACTACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATCAA
AAACAAAAACCAAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTT
TTTGTTTTGGAGTCTCTCTATTGTTCTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCTCT
GGCTTTCGATTTCGATAATAAAGTAACTCCTGTTTGGTAG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2GO15TF 424 0 0
GCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGG*ACCTGGTGG*AGTCACTATCAAGAAGACCAACCAAG
CCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGAGCCAATGACTGGCGGTCAATGCAACTTGGTGGTGG
AGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGTTTACACTTTTCAAAAAAAGT
GCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCTTTTACTACATAAAACACTCTTCTGC
CGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATCAAAAACAAAAACCAAAACTATACTC
TTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTTTTTGTTTTGGAGTCTCTCTATTG
TTCTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCTCTGGCTTTCGATTTCGATAATAAAG
TAAC

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR2AH61JQ 598 0 0
CGGCCAAGACGGCAGTGTCTGGGCCCAAAGCTCCAATTTTCCTCAGTTGAAGACTACTGA
GATAGATGGAATCAGGAAAGACTTTGAGGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTCTT
CCTTGGCGGAGAAAAGTACATGGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAA
AAAGGG*ACCTGGTGG*AGTCACTATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTT
TACGATGAGCCAATGACTGGCGGTCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTAC
CTTATCGAGTCTGATCTTTAAGTTTACACTTTTCAAAAAAAGTGTTTCAAACCAAAATTT
CAACTTTAAGGTTCTTCTTTTACTACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATT
TGACTGTGGTCGTGCATCAAAAACAAAAACCAAAACTATACTCTTGAAAATGATTTAAGA
AACAAATCACCCTTTGTGTTTTTGTTTTGGAATCTCTCTATTGTTCTCTTCTTGTGTTGT
ATTTCTTAATGTATCTTTCTGGCTTTCGATTTCGATAATAAAGTAACTCCTGTTTGG
C

QA 1 597 1 597
DS 



CO CL35Contig2 744 7 14 U
GGACGAACAAAAGCTCACAAAGAAGAGAAAACACAAAGAGAGAGAGAAGAAACAATCCAG
CCAGAGAAGACGAAAAGAGAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCTGTG
CGATGTTGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTG
GGCCCAAAGCTCGAACTTCCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAAGA
CTTTGAAGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTGTTCCTTGGCGGAGAAAAGTACAT
GGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGGACCTGGTGGAGTCAC
TATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGAACCAATGACTGGAGG
TCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTTGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGT
TTACACTTTTCAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCTTTTACT
ACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATCAAAACA
AAAAACCTAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTTTTTG
TTTTGGAGTCTCTCTATTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCTCTGGTTTTCGATTTTAA
TAATAAAAGTAACTCCTGTTTGGC


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 

AF RR2E314TF U 1
AF RR2CU25TF U 1
AF RR2BC55JQ C 1
AF RR2AY32TFB U 159
AF RR2C307TF U 1
AF RR2E314JQ C 1
AF RR2BC55TF U 1
BS 1 158 RR2CU25TF
BS 159 380 RR2AY32TFB
BS 381 381 RR2CU25TF
BS 382 483 RR2AY32TFB
BS 484 484 RR2CU25TF
BS 485 558 RR2AY32TFB
BS 559 559 RR2CU25TF
BS 560 598 RR2AY32TFB
BS 599 599 RR2CU25TF
BS 600 646 RR2AY32TFB
BS 647 647 RR2CU25TF
BS 648 740 RR2AY32TFB
BS 741 743 RR2C307TF
BS 744 744 RR2BC55JQ

RD RR2E314TF 592 0 0
GGACGAACAAAAGCTCACAAAGAAGAGAAAACACAAAGAGAGAGAGAAGAAACAATCCAG
CCAGAGAAGACGAAAAGAGAAGATGTCGTGGCATTCATACGTCGATGACCATCTCCTGTG
CTATGTTGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCTTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTG
GGCCCAAAGCTCGAACTTCCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAAGA
CTTTGAAGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTGTTCCTTGGCGGAGAAAAGTACAT
GGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGGACCTGGTGGAGTCAC
TATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGAACCAATGACTGGAGG
TCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTTGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGT
TTACACTTTTCAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCTTTTACT
ACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCA

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2CU25TF 726 0 0
GGACGAACAAAAGCTCACAAAGAAGAGAAAACACAAAGAGAGAGAGAAGAAACAATCCAG
CCAGAGAAGACGAAAAGAGAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCTGTG
CGATGTTGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTG
GGCCCAAAGCTCGAACTTCCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAAGA
CTTTGAAGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTGTTCCTTGGCGGAGAAAAGTACAT
GGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGGACCTGGTGGAGTCAC
TATCAAGAAGGCCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGAACCAATGACTGGAGG
TCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTTGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGT
TTACACTTTTCAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTCTAAGGTTCTTCTTTTACT
ACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATCAAAACA
AAAAACCTAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTTTTTG
TTTTGGAGTCTCTCTATTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCTCTGGTTTTCGATTTTA
TATAAAG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2BC55JQ 744 0 0
GGACGAACAAAAGCTCACAAAGAAGAGAAAACACAAAGAGAGAGAGAAGAAACAATCCAG
CCAGAGAAGACGAAAAGAGAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCTGTG
CGATGTTGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTG
GGCCCAAAGCTCGAACTTCCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAAGA
CTTTGAAGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTGTTCCTTGGCGGAGAAAAGTACAT
GGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGGACCTGGTGGAGTCAC
TATCAAGAAGACCCACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGAACCAATGACTGGAGG
TCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTTGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGT
TTACACTTTTCAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCTTTTACT
ACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATCAAAACA
AAAAACCTAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTTTTTG
TTTTGGAGTCTCTCTATTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCTCTGGTTTTCGATTTTAA
TAATAAAAGTAACTCCTGTTTGGC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2AY32TFB 582 0 0
TCGGCCAAGACGGCAGTGTCTGGGCCCAAAGCTCGAACTTCCCTCAGTTGAAGACTACTG
AGATAGATGGAATCAGGAAAGACTTTGAAGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTGT
TCCTTGGCGGAGAAAAGTACATGGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCA
AAAAGGGACCTGGTGGAGTCACTATCAAGAAGACCAACCAAGTCTTTGTCTTTGGCGTCT
ACGATGAACCAATGACTGGAGGTCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTTGGCGATTACC
TTATCGAGTCTGATCTCTAAGTTTATACTTTTCAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCA
ACTTTAAGGTTCTTCTTTTACTACATAAAACACTCTTCTGTCGTGGTGTATTATGATTTG
ATTGTGGTCGTGCATCAAAATAAAAAACCTAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAA
CAAATCACTCTTTGTGTTTTTGTTTTGGAGTCTCTCTATTGTGTTGTATTTCTTAATGTA
TCTCTCTGGTTTTCGATTTTAATAATAAAAGTAACTCCTGTT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2C307TF 744 0 0
GGACGAACAAAAGCTCACAAAGAAGAGAAAACACAAAGAGAGAGAGAAGAAACAATCCAG
CCAGAGAAGACGAAAAGAGAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCTGTG
CGATGTTGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTG
GGCCCAAAGCTCGAACTTCCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAAGA
CTTTGAAGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTGTTCCTTGGCGGAGAAAAGTACAT
GGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGGACCTGGTGGAGTCAC
TATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGAACCAATGACTGGAGG
TCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTTGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGT
TTACACTTTTCAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCTTTTACT
ACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATCAAAACA
AAAAACCTAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTTTTTG
TTTTGGAGTCTCTCTATTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCTCTGGTTT*CGATTT*AA
TAATAAAAGTAACTCCTGTTTGG
T

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2E314JQ 744 0 0
GGACGAACAAAAGCTCACAAAGAAGAGAAAACACAAAGAGAGAGAGAAGAAACAATCCAG
CCAGAGAAGACGAAAAGAGAAGATGTCGTGGCATTCATACGTCGATGACCATCTCCTGTG
CTATGTTGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCTTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTG
GGCCCAAAGCTCGAACTTCCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAAGA
CTTTGAAGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTGTTCCTTGGCGGAGAAAAGTACAT
GGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGGACCTGGTGGAGTCAC
TATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTTTACGATGAACCAATGACTGGAGG
TCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTTGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGT
TTACACTTTTCAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCTTTTACT
ACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATCAAAACA
AAAAACCTAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTTTTTG
TTTTGGAGTCTCTCTATTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCTCTGGTTTTCGATTTTAA
TAATAAAAGTAACTCCTGTTTGG
T

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2BC55TF 744 0 0
GGACGAACAAAAGCTCACAAAGAAGAGAAAACACAAAGAGAGAGAGAAGAAACAATCCAG
CCAGAGAAGACGAAAAGAGAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCTGTG
CGATGTTGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTG
GGCCCAAAGCTCGAACTTCCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAAGA
CTTTGAAGAACCTGGACATCTTGCCCCAACAGGGCTGTTCCTTGGCGGAGAAAAGTACAT
GGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGGACCTGGTGGAGTCAC
TATCAAGAAGACCCACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGAACCAATGACTGGAGG
TCAATGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTTGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGT
TTACACTTTTCAAAAAAGTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTTTAAGGTTCTTCTTTTACT
ACATAAAACACTCTTCTGCCGTGGTGTATTATGATTTGATTGTGGTCGTGCATCAAAACA
AAAAACCTAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTTTTTG
TTTTGGAGTCTCTCTATTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCTCTGGTTTTCGATTTTAA
TAATAAAAGTAACTCCTGTTTGG
C

QA 1 743 1 743
DS 



CO CL35Contig3 752 8 8 U
ACCAAACAGGAGTTACTTTATTATTAAAATCGAAAACCAGAGAGATACATTAAGAAATAC
AACACAAGAAGAACAATAGAGAGAGACTCCAAAACAAAAACACAAAGGTGATTTGTTTCT
TAGATCATTTTCAAGAGTATAGTTTAGGTTTTTTGTTTTGATGCACGACCACAATCAAAT
CATAATACACCACGGCAGAAGAGTGTTTTATGTAGTAAAAGAAGAACCTTAAAGTTGAAA
TTTTGGTTTGAAGCACTCTTTTTGAAAAGTGTGAAACTTAGAGATCAGACTCGATAAGGT
AATCGCCGAGCCTCTCCACCACCAAGTTGCATTGACCTCCAGTCATTGGTTCATCGTAGA
TGCCAAAGACAAAGGCTTGGTTGGTCTTCTTGATAGTGACTCCCCCAGGTCCCTTTTTGC
CTCTGATGACAGCTCCGGCTTCACCTTGGATAACCATGTACTTCTCTCCGCCAAGGAATA
GTCCTGTTGGGGCAAGATGTCCAGGTTCCTCAAAGTCTTTCCTGATTCCATCTATCTCAG
TAGTCTTCAACTGAGGAAAATTCGAGCTTTGGGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGAGGA
TGGCGGCGGATGTAAGGCGGCTGCCTTCCACATCGCACAGGAGATGGTCATCGACGTATG
ATTGCCACGACATCTTTTCGTCTTCTCCGGCTAGATTGTTTCTTCTCTCTCTCTTTGGTG
TTTTCTCTGCTTTGTGAGCTTTTGTTCGTCCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 15 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 25 10 10 

AF RR2DC61JQ U 1
AF RR2FF28TF C -5
AF RR2BF32JQ U 12
AF RR2C601TF C 10
AF RR2C601JQ U 12
AF RR2BF32TF C 12
AF RR2DC61TF C 36
AF RR2FF28JQ U 12
BS 1 251 RR2DC61JQ
BS 252 252 RR2BF32JQ
BS 253 627 RR2DC61JQ
BS 628 664 RR2BF32JQ
BS 665 665 RR2C601JQ
BS 666 743 RR2BF32JQ
BS 744 750 RR2FF28JQ
BS 751 752 RR2BF32TF

RD RR2DC61JQ 627 0 0
ACCAAACAGGAGTTACTTTATTATTAAAATCGAAAACCAGAGAGATACATTAAGAAATAC
AACACAAGAAGAACAATAGAGAGAGACTCCAAAACAAAAACACAAAGGTGATTTGTTTCT
TAGATCATTTTCAAGAGTATAGTTTAGGTTTTTTGTTTTGATGCACGACCACAATCAAAT
CATAATACACCACGGCAGAAGAGTGTTTTATGTAGTAAAAGAAGAACCTTAAAGTTGAAA
TTTTGGTTTGAGGCACTCTTTTTGAAAAGTGTGAAACTTAGAGATCAGACTCGATAAGGT
AATCGCCGAGCCTCTCCACCACCAAGTTGCATTGACCTCCAGTCATTGGTTCATCGTAGA
TGCCAAAGACAAAGGCTTGGTTGGTCTTCTTGATAGTGACTCCCCCAGGTCCCTTTTTGC
CTCTGATGACAGCTCCGGCTTCACCTTGGATAACCATGTACTTCTCTCCGCCAAGGAATA
GTCCTGTTGGGGCAAGATGTCCAGGTTCCTCAAAGTCTTTCCTGATTCCATCTATCTCAG
TAGTCTTCAACTGAGGAAAATTCGAGCTTTGGGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGAGGA
TGGCGGCGGATGTAAGGCGGCTGCCTT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2FF28TF 756 0 0
TTGTATA
CCAAACAGGAGTTACTTTATTATTAAA*TCGAAAACCAGAGAGATACATTAAGAAATACA
ACACAAGAAGAACAATAGAGAGAGACTCCAAAACAAAAACACAAAGGTGATTTGTTTCTT
AGACCATTTTCAAGAGTATAGTTTAGGTTTTTTGTTTTGATGCACGACCACAATCAAATC
ATAATACACCACGGCAGAAGAGTGTTTTATGTAGTAAAAGAAGAACCTTAAAGTTGAAAT
TTTGGTTTGAAGCACTCTTTTTGAAAAGTGTGAAACTTAGAGATCAGACTCGATAAGGTA
ATCGCCGAGCCTCTCCACCACCAAGTTGCATTGACCTCCAGTCATTGGTTCATCGTAGAT
GCCAAAGACAAAGGCTTGGTTGGTCTTCTTGATAGTGACTCCCCCAGGTCCCTTTTTGCC
TCTGATGACAGCTCCGGCTTCACCTTGGATAACCATGTACTTCTCTCCGCCAAGGAATAG
TCCTGTTGGGGCAAGATGTCCAGGTTCCTCAAAGTCTTTCCTGATTCCATCTATCTCAGT
AGTCTTCAACTGAGGAAAATTCGAGCTTTGGGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGAGGAT
GGCGGCGGATGTAAGGCGGCTGCCTTCCATACCGCACAGGAGATGGTCATCGACGTATGA
TTGCCACGACATCTTTTCGTCTTCTCCGGCTAGATTGTTTCTTCTCTCTCTCTTTGGTGT
TTTCTCTGCTTTGTGAGCTTTTGTTCGTC

QA 8 756 8 756
DS 

RD RR2BF32JQ 742 0 0
GTTACTTTATTATTAAAATCGAAAACCAGAGAGATACATTAAGAAATACAACACAAGAAG
AACAATAGAGAGAGACTCCAAAACAAAAACACAAAGGTGATTTGTTTCTTAGATCATTTT
CAAGAGTATAGTTTAGGTTTTTTGTTTTGATGCACGACCACAATCAAATCATAATACACC
ACGGCAGAAGAGTGTTTTATGTAGTAAAAGAAGAACCTTAAAGTTGAAATTTTGGTTTGA
AGCACTCTTTTTGAAAAGTGTGAAACTTAGAGATCAGACTCGATAAGGTAATCGCCGAGC
CTCTCCACCACCAAGTTGCATTGACCTCCAGTCATTGGTTCATCGTAAATGCCAAAGACA
AAGGCTTGGTTGGTCTTCTTGATAGTGGCTCCCCCAGGTCCCTTTTTGCCTCTGATGACA
GCTCCGGCTTCACCTTGGATAACCATGTACTTCTCTCCGCCAAGGAATAGTCCTGTTGGG
GCAAGATGTCCAGGTTCCTCAAAGTCTTTCCTGATTCCATCTATCTCAGTAGTCTTCAAC
TGAGGAAAATTCGAGCTTTGGGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGAGGATGGCGGCGGAT
GTAAGGCGGCTGCCTTCCACATCGCACAGGAGATGGTCATCGACGTATGATTGTCACGAC
ATCTTTTCGTCTTCTCCGGCTAGATTGTTTCTTCTCTCTCTCTTTGGTGTTTTCTCTGCT
TTGTGAGCTTTT
TGTTCGTCCC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2C601TF 743 0 0
GAGTTACTTTATTATTAAA*TCGAAAACCAGAGAGATACATTAAGAAATACGACACAAGA
AGAACAATAGAGAGAGACTCCAAAACAAAAACACAAAGGTGATTTGTTTCTTAGATCATT
TTCAAGAGTATAGTTTAGGTTTTTTGTTTTGATGCACGACCACAATCAAATCATAATACA
CCACGGCAGAAGAGTGTTTTATGTAGTAAAAGAAGAACCTTAAAGTTGAAATTTTGGTTT
GAAGCACTCTTTTTGAAAAGTGTGAAACTTAGAGATCAGACTCGATAAGGTAATCGCCGA
GCCTCTCCACCACCAAGTTGCATTGACCTCCAGTCATTGGTTCATCGTAGATGCCAAAGA
CAAAGGCTTGGTTGGTCTTCTTGATAGTGACTCCCCCAGGTCCCTTTTTGCCTCTGATGA
CAGCTACGGCTTCACCTTGGATAACCATGTACTTCTCTCCGCCAAGGAATAGTCCTGTTG
GGGCAAGATGTCCAGGTTCCTCAAAGTCTTTCCTGATTCCATCTATCTCAGTAGTCTTCA
ACTGAGGAAAATTCGAGCTTTGGGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGAGGATGGCGGCGG
ATGTAAGGCGGCTGCCTTCCACATCGCACAGGAGATGGTCATCGACGTATGATTGCCACG
ACATCTTTTCGTCTTCTCCGGCTAGATTGTTTCTTCTCTCTCTCTTTGGTGTTTTCTCTG
CTTTGTGAGCTTTTGTTCGT
GCC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2C601JQ 731 0 0
GTTACTTTATTATTAAAATCGAAAACCAGAGAGATACATTAAGAAATACGACACAAGAAG
AACAATAGAGAGAGACTCCAAAACAAAAACACAAAGGTGATTTGTTTCTTAGATCATTTT
CAAGAGTATAGTTTAGGTTTTTTGTTTTGATGCACGACCACAATCAAATCATAATACACC
ACGGCAGAAGAGTGTTTTATGTAGTAAAAGAAGAACCTTAAAGTTGAAATTTTGGTTTGA
AGCACTCTTTTTGAAAAGTGTGAAACTTAGAGATCAGACTCGATAAGGTAATCGCCGAGC
CTCTCCACCACCAAGTTGCATTGACCTCCAGTCATTGGTTCATCGTAAATGCCAAAGACA
AAGGCTTGGTTGGTCTTCTTGATAGTGACTCCCCCAGGTCCCTTTTTGCCTCTGATGACA
GCTACGGCTTCACCTTGGATAACCATGTACTTCTCTCCGCCAAGGAATAGTCCTGTTGGG
GCAAGATGTCCAGGTTCCTCAAAGTCTTTCCTGATTCCATCTATCTCAGTAGTCTTCAAC
TGAGGAAAATTCGAGCTTTGGGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGAGGATGGCGGCGGAT
GTAAGGCGGCTGCCTTCCACATCGCACAGGAGATGGTCATCGACGTATGATTGCCACGAC
ATCTTTTCGTCTTCTCCGGCTAGATTGTTTCTTCTCTCTCTCTTTGGTGTTTTCTCTGCT
TTGTGAGCTTT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2BF32TF 741 0 0
GTTACTTTATTATTAAAATCGAAAACCAGAGAGATACATTAAGAAATACAACACAAGAAG
AACAATAGAGAGAGACTCCAAAACAAAAACACAAAGGTGATTTGTTTCTTAGATCATTTT
CAAGAGTATAGTTTAGGTTTTTTGTTTTGATGCACGACCACAATCAAATCATAATACACC
ACGGCAGAAGAGTGTTTTATGTAGTAAAAGAAGAACCTTAAAGTTGAAATTTTGGTTTGA
AGCACTCTTTTTGAAAAGTGTGAAACTTAGAGATCAGACTCGATAAGGTAATCGCCGAGC
CTCTCCACCACCAAGTTGCATTGACCTCCAGTCATTGGTTCATCGTAGATGCCAAAGACA
AAGGCTTGGTTGGTCTTCTTGATAGTGGCTCCCCCAGGTCCCTTTTTGCCTCTGATGACA
GCTCCGGCTTCACCTTGGATAACCATGTACTTCTCTCCGCCAAGGAATAGTCCTGTTGGG
GCAAGATGTCCAGGTTCCTCAAAGTCTTTCCTGATTCCATCTATCTCAGTAGTCTTCAAC
TGAGGAAAATTCGAGCTTTGGGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGAGGATGGCGGCGGAT
GTAAGGCGGCTGCCTTCCACATCGCACAGGAGATGGTCATCGACGTATGATTGTCACGAC
ATCTTTTCGTCTTCTCCGGCTAGATTGTTTCTTCTCTCTCTCTTTGGTGTTTTCTCTGCT
TTGTGAGCTTTTGTTCGTCCC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2DC61TF 701 0 0
ACCAGAGAGATACATTAAGAAATACAACACAAGAAGAACAATAGAGAGAGACTCCAAAAC
AAAAACACAAAGGTGATTTGTTTCTTAGATCATTTTCAAGAGTATAGTTTAGGTTTTTTG
TTTTGATGCACGACCACAATCAAATCATAATACACCACGGCAGAAGAGTGTTTTATGTAG
TAAAAGAAGAACCTTAAAGTTGAAATTTTGGTTTGAGGCACTCTTTTTGAAAAGTGTGAA
ACTTAGAGATCAGACTCGATAAGGTAATCGCCGAGCCTCTCCACCACCAAGTTGCATTGA
CCTCCAGTCATTGGTTCATCGTAGATGCCAAAGACAAAGGCTTGGTTGGTCTTCTTGATA
GTGACTCCCCCAGGTCCCTTTTTGCCTCTGATGACAGCTCCGGCTTCACCTTGGATAACC
ATGTACTTCTCTCCGCCAAGGAATAGTCCTGTTGGGGCAAGATGTCCAGGTTCCTCAAAG
TCTTTCCTGATTCCATCTATCTCAGTAGTCTTCAACTGAGGAAAATTCGAGCTTTGGGCC
CAGACACTGCCGTCTTGGCCGAGGATGGCGGCGGATGTAAGGCGGCTGCCTTCCACATCG
CACAGGAGATGGTCATCGACGTATGATTGCCACGACATCTTTTCGTCTTCTCCGGCTAGA
TTGTTTCTTCTCTCTCTCTTTGGTGTTTTCTCTGCTTTGTG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2FF28JQ 739 0 0
GTTACTTTATTATTAAAATCGAAAACCAGAGAGATACATTAAGAAATACAACACAAGAAG
AACAATAGAGAGAGACTCCAAAACAAAAACACAAAGGTGATTTGTTTCTTAGACCATTTT
CAAGAGTATAGTTTAGGTTTTTTGTTTTGATGCACGACCACAATCAAATCATAATACACC
ACGGCAGAAGAGTGTTTTATGTAGTAAAAGAAGAACCTTAAAGTTGAAATTTTGGTTTGA
AGCACTCTTTTTGAAAAGTGTGAAACTTAGAGATCAGACTCGATAAGGTAATCGCCGAGC
CTCTCCACCACCAAGTTGCATTGACCTCCAGTCATTGGTTCATCGTAAATGCCAAAGACA
AAGGCTTGGTTGGTCTTCTTGATAGTGACTCCCCCAGGTCCCTTTTTGCCTCTGATGACA
GCTCCGGCTTCACCTTGGATAACCATGTACTTCTCTCCGCCAAGGAATAGTCCTGTTGGG
GCAAGATGTCCAGGTTCCTCAAAGTCTTTCCTGATTCCATCTATCTCAGTAGTCTTCAAC
TGAGGAAAATTCGAGCTTTGGGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGAGGATGGCGGCGGAT
GTAAGGCGGCTGCCTTCCATACCGCACAGGAGATGGTCATCGACGTATGATTGCCACGAC
ATCTTTTCGTCTTCTCCGGCTAGATTGTTTCTTCTCTCTCTCTTTGGTGTTTTCTCTGCT
TTGTGAGCTTTTGTTCGTC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 28

CO CL36Contig1 663 28 14 U
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
GAAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
TGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGA
TCTATATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACACCCCAGTTTCTATTTTAAAGAAATGTG
ACAAATTAATGTTCCAGTGGTTTATCGTTATATAACAATGG*ATGAAGTTATCTGTAGTT
CGT


BQ
80 85 90 90 55 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 10 10 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
10 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 85 85 85 85 85 85 85 70 80 50 50 45 45 45 45 45 15 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU80JQ C 8
AF RR2A023JQ C 1
AF RR2BW52TF U 5
AF RR2AH32JQ C 1
AF RR2AH32TF U 1
AF RR2BW52JQ C 1
AF RR2A023TF U 1
AF RR2AE80TF U 1
AF RR2CM33TF U 242
AF RR2HA79TF U 0
AF RR2CB58TF U 1
AF RR2CD72JQ C 5
AF RR2CD72TF U 5
AF RR2DY88TF U 1
AF RR2BJ74JQ C 1
AF RR2BJ74TF U 1
AF RR2FM15JQ C 5
AF RR2FM15TF U 5
AF RR2CM33JQ C 1
AF RR2H711TF U 1
AF RR2G958TF U 4
AF RR2GO39TF U 5
AF RR2DM87TF U 1
AF RR2EW80JQ C 198
AF RR2EW80TF U 2
AF RR2DM87JQ C 143
AF RR2BU80TF U 56
AF RR2GO39JQ C 1
BS 1 4 RR2AH32TF
BS 5 267 RR2BW52TF
BS 268 269 RR2AE80TF
BS 270 360 RR2BW52TF
BS 361 361 RR2AE80TF
BS 362 559 RR2BW52TF
BS 560 560 RR2AH32TF
BS 561 563 RR2BW52TF
BS 564 574 RR2AH32TF
BS 575 586 RR2AE80TF
BS 587 641 RR2DM87TF
BS 642 642 RR2BU80TF
BS 643 656 RR2DM87TF
BS 657 663 RR2GO39JQ

RD RR2BU80JQ 453 0 0
AAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGAATCATCA
ATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGAGAAAGCT
GAGCAGTGGACTGAGTTTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGACTGCAGAT
GCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGCAAGTCT
GCAGATGCATCTCATTCCTCAAACGCATTTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACCACTGGT
TTTTTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGACGGTGTT
AAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACTTCTCAAA
TAACTATTTATATATCCATGGCTATTTTTGGTT

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR2A023JQ 574 0 0
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
GAAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACAAACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
CGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGA
TCTATATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACAC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2BW52TF 560 0 0
TCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGAATCA
TCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGAGAAA
GCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGACTGCA
GATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGCAAG
TCTGCAGATGCATCTCATTCCACAAACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACCACT
GGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGACGGT
GTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACTTCTC
AAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCTCTAA
ATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATCTA
TATATAATAATTT**TGGGG

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2AH32JQ 574 0 0
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
GA**GCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACAAACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
CGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGA
TCTATATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACAC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2AH32TF 574 0 0
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
GA**GCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACAAACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
CGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGA
TCTATATATAATAATTTTGGGGGTGGTATTACAC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2BW52JQ 575 0 0
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
GAAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACAAACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
CGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGA
TCTATATATAATAATTT**GGGGTGGTATTAC
CCC

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2A023TF 574 0 0
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
GAAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACAAACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
CGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGA
TCTATATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACAC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2AE80TF 586 0 0
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
GAAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
TGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGA
TCTATATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACACCCCAGTTTCTAT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2CM33TF 343 0 0
AAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACC
ACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGAT
GGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACTT
CTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCTC
TAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGAT
CTATATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACACCCCAGTTTCT

QA 1 343 1 343
DS 

RD RR2HA79TF 551 0 0
GGC
AATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGAAT
CATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGAGA
AAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGACTG
CAGATTCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGCA
AGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAGCCA
CTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAGTCTGTGAAGAACATGGTTCAGGATGCTTTCGATG
GTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACTTC
TCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCTCT
AAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATC
TATATATA

QA 4 551 4 551
DS 

RD RR2CB58TF 551 0 0
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
GAAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
TGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGACA
TCTATATATAA

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2CD72JQ 570 0 0
GGAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGAATCA
TCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGAGAAA
GCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGACTGCA
GATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGCAAG
TCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACCACT
GGTTTTCTCGGTCAGGCCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGATGGT
GTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTATTTCTC
AAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCTCTAA
ATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATCTA
TATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACAC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2CD72TF 570 0 0
GGAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGAATCA
TCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGAGAAA
GCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGACTGCA
GATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGCAAG
TCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACCACT
GGTTTTCTCGGTCAGGCCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGATGGT
GTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTATTTCTC
AAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCTCTAA
ATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATCTA
TATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACAC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2DY88TF 583 0 0
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
GAAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
TGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTTTGAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGA
TCTATATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACACCCCAGTTTC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2BJ74JQ 584 0 0
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCTATGCTCAAGA
GAAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGGTGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
TGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGA
TCTATATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACACCCCAGTTTCT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2BJ74TF 584 0 0
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCTATGCTCAAGA
GAAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGGTGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
TGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGA
TCTATATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACACCCCAGTTTCT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2FM15JQ 580 0 0
GGAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGAATCA
TCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGAGAAA
GCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGACTGCA
GATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGCAAG
TCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACCACT
GGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGATGGT
GTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACTTCTC
AAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCTCTAA
ATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATCTA
TATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACACCCCAGTTTCT

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2FM15TF 580 0 0
GGAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGAATCA
TCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGAGAAA
GCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGACTGCA
GATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGCAAG
TCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACCACT
GGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGATGGT
GTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACTTCTC
AAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCTCTAA
ATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATCTA
TATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACACCCCAGTTTCT

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2CM33JQ 584 0 0
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
GAAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTTTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
TGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGA
TCTATATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACACCCCAGTTTCT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2H711TF 574 0 0
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCACAGGCCATGCTCAAGA
GAAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACAAACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
CGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGA
TCTATATATAATAATTT*GGGGGTGGTATTACAC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2G958TF 590 0 0
GGA
AAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGAATCATC
AATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGAGAAAGC
TGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGACTGCAGA
TGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGCAAGTC
TGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACCACTGG
TTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGATGGTGT
TAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACTTCTCAA
ATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCTCTAAAT
TATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATCTATA
TATAATAATTT**GGGGTGGTATTACACCCCAGTTTCTATTTTAAAG

QA 4 590 4 590
DS 

RD RR2GO39TF 541 0 0
TCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGAATCA
TCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATACTCAAGAGAAA
GCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGACTGCA
GATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGCAAG
TCTGCAGATGCATCTCATTCCACAAACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACCACT
GGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGACCATGGCTCAGGGTGCTTTCGACGGT
GTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACTTCTC
AAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCTCTAA
ATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATCTA
T

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR2DM87TF 656 0 0
GGAACCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
GAAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACAAACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
CGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGA
TCTATATATAATAATTT*GGGGGTGGTATTACACCCCAGTTTCTATTTTAAAGAAATGTG
ACAAATTAATGTTCCAGTGGTTTATCGTTATATAACAATGGGATGAAGTTATCTGT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2EW80JQ 415 0 0
CAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGCAAGTTTGCAGATGCAT
CTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACCATTGGTTTTTTCGGTC
AGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGATGGTGTTAAAAACAGCC
TTGGCATGAAACGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACTTCTCAAATAACTATTTA
TATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCTTTAAATTATGTTTGTAA
TAAAAATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATCTATATATAATAATTT
**GGGGTGGTATTACACCCCAGTTTCTATTTTAATGAAATGTGACAAATTAATGT

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR2EW80TF 611 0 0
GAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGAA
TCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGAG
AAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGACT
GCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGC
AAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACC
ACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGAT
GGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAAACGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACTT
CTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCTC
TAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGAT
CTATATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACACCCCAGTTTCTATTTTAATGAAATGTGA
CAAATTAATGT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2DM87JQ 514 0 0
TCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGACTGCAGATGCAGCACTATCAGCA
CGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGCAAGTTTGCAGATGCATTTCAT
TCCACAAACGCATTTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACCACTGGTTTTTTCGGTCAGACC
GGTGAATTTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTTGACGGTGTTAAAAACAGCCTTGGC
ATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACTTTTCAAATAACTATTTATATAT
CCATGGCTATTTTTGGTTTTTAGTAATTTTTTATTTTTTTAAATTATGTTTGTAATAAAT
ATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATCTATATATAATAATTT**GGG
GGGGTATTACACCCCAGTTTTTATTTTAAAGAAATGTGACAAATTAATGTTCCAGTGGTT
TATCGTTATATAACAATGG*AAGAAGTTATCTGT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2BU80TF 601 0 0
TTTGAATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCT
CAAGAGAAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGAC
AAGACTGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACA
CATAGCAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCTCAAACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAA
CAAACCACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCT
TTCGACGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTC
GTACTTCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTA
TTTCTCTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATA
TGAGATCTATATATAATAATTTTGGGGGGGGTATTACACCCCAGTTTCTATTTTAAAGAA
ATGTGACAAATTAATGTTCCAGTGGTTTATCGTTATATAACAATGG*ATGAAGTTATCTG
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2GO39JQ 663 0 0
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTCGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATACTCAAGA
GAAAGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACAAACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTTTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGACCATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
CGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAA*CGAGAAGAAATGAGGAAATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATCCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGTAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT*GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGA
TCTATATATAATAATTT**GGGGTGGTATTACACCCCAGTTTCTATTTTAAAGAAATGTG
ACAAATTAATGTTCCAGTGGTTTATCGTTATATAACAATGG*ATGAAGTTATCTGTAGTT
CGT

QA 1 663 1 663
DS 



AS 5 27

CO CL37Contig1 790 4 6 U
GGCCTCCACTCCTAAATTGCGAGAAGAAAAAAAAGAGGCGAAAAGCTCGCCAGATCGGGA
GTCCGCGAAACCGAAGAGAGATCGTAGGTTTTGGAAATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAG
GAGTTGAAGGATCTGCAGAAGGATCCACCCACTTCATGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAA
GACATGTTTCATTGGCAGGCAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCCTACGCTGGTGGT
GTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCGGATTACCCTTTCAAGCCTCCTAAGGTTGCC
TTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACATCAACAGCAATGGAAGCATCTGCCTCGACATC
TTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCTGTCGATCTGTTCT
TTGTTAACCGATCCAAACCCGGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAG
ACTGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCCATGGGC
TGAAAAGAAAAGGGATCCCAAATCCACTAAACGATCTCTTTTTATGCGAAAATCTACCGT
GATTTCTATGTATTCAATAGACGATCTCTTTCTGTACTCGTTTGAAATTTCTGAAGACAG
GACCAATGAAGTAGGTCTTGTTTGTTTGGAAAAAAAAACATCTTTGTGAAACTAGAAACT
GGAAATCTTCCTGGTGTTGTTTGGTCCTTGTCTTGCAATTACGATTTGATGTTTTTACGG
TGGGATTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO21TF U 1
AF RR2AP20TF U 19
AF RR2AP20JQ C 19
AF RR2AO21JQ C 423
BS 1 649 RR2AO21TF
BS 650 652 RR2AP20TF
BS 653 676 RR2AP20JQ
BS 677 677 RR2AO21JQ
BS 678 777 RR2AP20JQ
BS 778 790 RR2AO21JQ

RD RR2AO21TF 652 0 0
GGCCTCCACTCCTAAATTGCGAGAAGAAAAAAAAGAGGCGAAAAGCTCGCCAGATCGGGA
GTCCGCGAAACCGAAGAGAGATCGTAGGTTTTGGAAATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAG
GAGTTGAAGGATCTGCAGAAGGATCCACCCACTTCATGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAA
GACATGTTTCATTGGCAGGCAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCCTACGCTGGTGGT
GTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCGGATTACCCTTTCAAGCCTCCTAAGGTTGCC
TTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACATCAACAGCAATGGAAGCATCTGCCTCGACATC
TTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCTGTCGATCTGTTCT
TTGTTAACCGATCCAAACCCGGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAG
ACTGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCCATGGGC
TGAAAAGAAAAGGGATCCCAAATCCACTAAACGATCTCTTTTTATGCGAAAATCTACCGT
GATTTCTATGTATTCAATAGACGATCTCTTTCTGTACTCGTTTGAAATT
CCT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2AP20TF 634 0 0
GG
GAGAAGAAAAAAAAGAGGCGAAAAGCTCGCCAGATCGGGAGTCCGCGAAACCGAAGAGAG
ATCGTAGGTTTTGGAAATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGGAGTTGAAGGATCTGCAGAA
GGATCCACCCACTTCATGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGC
AACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCCTACGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCA
TTTCCCTCCGGATTACCCTTTCAAGCCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCA
TCCCAACATCAACAGCAATGGAAGCATCTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCC
TGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCTGTCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCC
GGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTATGA
GTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCCATGGGCTGAAAAGAAAAGGGATCCCA
AATCCACTAAACGATCTCTTTTTATGCGAAAATCTACCGTGATTTCTATGTATTCAATAG
ACTATCTCTTTCTGTACTCGTTTGAAATTTCT

QA 3 634 3 634
DS 

RD RR2AP20JQ 762 0 0
GG
GAGAAGAAAAAAAAGAGGCGAAAAGCTCGCCAGATCGGGAGTCCGCGAAACCGAAGAGAG
ATCGTAGGTTTTGGAAATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGGAGTTGAAGGATCTGCAGAA
GGATCCACCCACTTCATGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGC
AACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCCTACGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCA
TTTCCCTCCGGATTACCCTTTCAAGCCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCA
TCCCAACATCAACAGCAATGGAAGCATTTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCC
TGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCTGTCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCC
GGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTATGA
GTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCCATGGGCTGAAAAGAAAAGGGATCCCA
AATCCACTAAACGATCTCTTTTTATGCGAAAATCTACCGTGATTTCTATGTATTCAATAG
ACTATCTCTTTCTGTACTCGTTTGAAATTTTTGAAGACAGGACCAATGAAGTAGGTTTTG
TTTGTTTGGAAAAAAAAACATCTTTGTGAAACTAGAAACTGGAAATCTTCCTGGTGTTGT
TTGGTCCTTGTCTTGCAATTACGATTTGATGTTTTTA
AAG

QA 3 759 3 759
DS 

RD RR2AO21JQ 368 0 0
GTTAACCGATCCAAACCCGGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGAC
TGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCCATGGGCTG
AAAAGAAAAGGGATCCCAAATCCACTAAACGATTTCTTTTTATGGGAAAATCTACCGTGA
TTTCTATGTATTCAATAGACGATCTCTTTCTGTACTCGTTTGAAATTCCTGAAGACAGGA
CCAATGAAGTAGGTCTTGTTTGTTTGGAAAAAAAAACATCTTTGTGAAACTAGAAACTGG
AAATTTTCCTGGTGTTGTTTGGTCCTTGTCTTGCAATTAGGATTTGATGTTTTTACGGTG
GGATTGAT

QA 1 368 1 368
DS 



CO CL37Contig2 771 4 5 U
GGGTCCTTCATCTCTCCTAAAAAAACCACGAGAAGAAAAAGGCGAGAACCTCGCCAAATC
GGAGATACGCGAGAAACCAAAAAGAGATCTCGTAAGGTTTTTGGATTCATGGCGTCGAAG
CGGATCTTGAAGGAACTCAAGGATCTCCAGAAGGATCCACCCACCCCTTGTAGCGCAGGA
CCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGCAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCT
TACGCGGGAGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACCT
CCTAAGGTGGCCTTTAGGACCAAGGTGTTCCATCCCAACATTAACAGCAACGGAAGCATT
TGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCTA
TCAATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCGGATGATCCTTTGGTACCTGAGATTGCT
CATATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAG
TATGCCATGGGATGAAAAAGAAGACCCCCAAAATCTTCTAAAACTATCTCTTTTTAATGG
AAAAAAAAATATGCCGTAATTTCTATGTATGATTCAATAGACATCTCTTTGTGTTCTTTT
TAAATTTCTGAAAGACAAGACCAAATGAAGTGGGTCTTGTTTAAAACCAAACATCTTCGT
GAAAACAAGAAACTGAGAATCTTTCCCGTGTTGTCTTGTGTTGCAATTATG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO65TF U 65
AF RR2AQ68TF U 1
AF RR2BJ77TF U 1
AF RR2AQ68JQ C 103
BS 1 82 RR2AQ68TF
BS 83 83 RR2BJ77TF
BS 84 727 RR2AQ68TF
BS 728 751 RR2BJ77TF
BS 752 771 RR2AQ68JQ

RD RR2DO65TF 495 0 0
GGACGCGAGAAACCA
AAAAGAGATCTCGTAAGGTTTTTGGATTCATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGGAACTCA
AGGATCTCCAGAAGGATCCACCCACCTCTTGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGT
TTCATTGGCAGGCAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCTTACGCTGGAGGTGTTTTCC
TTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACCTCCTAAGGTGGCCTTTAGGA
CCAAGGTCTTCCATCCCAACATTAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTCGACATCTTGAAGG
AACAATGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCTATCAATCTGTTCTTTGTTAA
CCGATCCAAACCCGGATGATCCTTTGGTACCTGAGATTGCTCATATGTACAAGACTGACA
AGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCCATGGGATGAAAAA

QA 16 495 16 495
DS 

RD RR2AQ68TF 727 0 0
GGGTCCTTCATCTCTCCTAAAAAAACCACGAGAAGAAAAAGGCGAGAACCTCGCCAAATC
GGAGATACGCGAGAAACCAAAA*GAGATCTCGTAAGGTTTTTGGATTCATGGCGTCGAAG
CGGATCTTGAAGGAACTCAAGGATCTCCAGAAGGATCCACCCACCCCTTGTAGCGCAGGA
CCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGCAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCT
TACGCGGGAGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACCT
CCTAAGGTGGCCTTTAGGACCAAGGTGTTCCATCCCAACATTAACAGCAACGGAAGCATT
TGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCTA
TCAATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCGGATGATCCTTTGGTACCTGAGATTGCT
CATATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAG
TATGCCATGGGATGAAAAAGAAGACCCCCAAAATCTTCTAAAACTATCTCTTTTTAATGG
AAAAAAAAATATGCCGTAATTTCTATGTATGATTCAATAGACATCTCTTTGTGTTCTTTT
TAAATTTCTGAAAGACAAGACCAAATGAAGTGGGTCTTGTTTAAAACCAAACATCTTCGT
GAAAACA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2BJ77TF 759 0 0
GG
GTCCTTCATCTCTCCTAAAAAA*CCACGAGAAGAAAAAGGCGAGAACCTCGCCAAATCGG
AGATACGCGAGAAACCAAAAAGAGATCTCGTAAGGTTTTTGGATTCATGGCGTCGAAGCG
GATCTTGAAGGAACTCAAGGATCTCCAGAAGGATCCACCCACCTCTTGTAGCGCAGGACC
TGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGCAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCTTA
CGCTGGAGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACCTCC
TAAGGTGGCCTTTAGGACCAAGGTCTTCCATCCCAACATTAACAGCAACGGAAGCATTTG
CCTCGACATCTTGAAGGAACAATGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCTATC
AATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCGGATGATCCTTTGGTACCTGAGATTGCTCA
TATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTA
TGCCATGGGATGAAAAAGAAGACCCCCAAAATCTTCTAAAACTATCTCTTTTTAATGGAA
AAAAAA*TATGCCGTAATTTCTATGTATGATTCAATAGACATCTCTTTGTGTTCTTTTTA
AATTTCTGAAAGACAAGACCAAATGAAGTGGGTCTTGTTTAAAACCAAACATCTTTGTGA
AAACAAGAAACTGAGAATCTTTCCCGTGT
GTCTGTGT

QA 3 751 3 751
DS 

RD RR2AQ68JQ 669 0 0
GGATTCATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGGAACTCAAGGATCTCCAGAAGGATCCACCC
ACCCCTTGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGCAACGATAATG
GGTCCTTCAGACAGTCCTTACGCGGGAGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCA
GATTACCCTTTCAAACCTCCTAAGGTGGCCTTTAGGACCAAGGTGTTCCATCCCAACATT
AACAGCAACGGAAGCATTTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCCCTCACC
ATTTCCAAGGTGCTGCTATCAATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCGGATGATCCT
TTGGTACCTGAGATTGCTCATATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCA
CGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCCATGGGATGAAAAAGAAGACCCCCAAAATCTTCTAAA
ACTATCTCTTTTTAATGGAAAAAAAAATATGCCGTAATTTCTATGTATGATTCAATAGAC
ATCTCTTTGTGTTCTTTTTAAATTTTTGAAAGACAAGACCAAATGAAGTGGGTCTTGTTT
AAAACCAAACATCTTCGTGAAAACAAGAAACTGAGAATCTTTCCGGTGTTGTCTTGTGTT
GCAATTATG

QA 1 669 1 669
DS 



CO CL37Contig3 790 9 15 U
GGGGGTTCTTCTTCTTCTCCGCCTCTCCTAATTACGCGAAGAAGAAGGCGAAAACCTCGC
CAAGTCTGATACACGCAAAACCGAAGAGATCGCATCGTAGGTTTTGGATATGGCGTCGAA
GCGGATCTTGAAGGAACTCAAGGATCTTCAGAAGGATCCACCCACCTCATGTAGCGCAGG
ACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGCAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCC
CTACGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACC
TCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACATCAACAGCAATGGAAGTAT
TTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCACTCACCATCTCCAAGGTGTTGTT
ATCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCTGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGC
TCATATGTACAAGACCGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAA
GTATGCTATGGGCTGAAATGGAAACCCCCAATCTACAAAACTATCTCCTTATGAAGAAAA
AAAAAGTATTTCCCTAAGTTCTATGTATGATTCAGTAGACAAATCTCTCGTGTCCTTTTT
AAAATTTCTGAAAACTGGACCAAATGATGTGGGTCTTGTTTAAAAGAAAACATCATCTTT
GTGAAACTAGAAACTGGTGTTTGGTCTTGTGGGTGAATTGTGATTTGATGTTTTATCTTT
CTTAAAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H560TF U 17
AF RR2GA84TF U 341
AF RR2EL79JQ C 1
AF RR2EL79TF U 1
AF RR2H560JQB C 443
AF RR2FV82TF U 32
AF RR2FV82JQ C 134
AF RR2H741JQB C 446
AF RR2H741TF U 168
BS 1 18 RR2EL79TF
BS 19 120 RR2H560TF
BS 121 240 RR2EL79TF
BS 241 241 RR2FV82TF
BS 242 300 RR2EL79TF
BS 301 301 RR2FV82TF
BS 302 370 RR2EL79TF
BS 371 371 RR2FV82TF
BS 372 587 RR2EL79TF
BS 588 588 RR2FV82TF
BS 589 595 RR2EL79TF
BS 596 709 RR2FV82TF
BS 710 710 RR2H741TF
BS 711 780 RR2FV82TF
BS 781 790 RR2H741TF

RD RR2H560TF 104 0 0
GG
CCGCCTCTCCTAATTACGCGAAGAAGAAGGCGAAAACCTCGCCAAGTCTGATACACGCAA
AACCGAAGAGATCGCATCGTAGGTTTTGGATATGGCGTCGAA

QA 3 104 3 104
DS 

RD RR2GA84TF 193 0 0
ATCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCACTC
ACCATCTCCAAGGTGTTGTTATCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCTGATGAT
CCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACCGACAAGAACAAGTATGAGTCCACT
GCACGGAGCTGGA

QA 1 193 1 193
DS 

RD RR2EL79JQ 575 0 0
GGGGGTTCTTCTTCTTCTCCGCCTCTCCTAATTACGCGAAGAAGAAGGCGAAAACCTCGC
CAAGTCTGATACACGCAAAACCGAAGAGATCGCATCGTAGGTTTTGGATATGGCGTCGAA
GCGGATCTTGAAGGAACTCAAGGATCTTCAGAAGGATCCACCCACCTCATGTAGCGCAGG
ACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGCAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCC
GTACGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACC
ACCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACATCAACAGCAATGGAAGTAT
TTGCCTCGACGTCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCACTCACCATCTCCAAGGTGTTGTT
ATCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCTGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGC
TCATATGTACAAGACCGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAA
GTATGCTATGGGCTGAAATGGAAACCCCCAATCTA

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2EL79TF 599 0 0
GGGGGTTCTTCTTCTTCTCCGCCTCTCCTAATTACGCGAAGAAGAAGGCGAAAACCTCGC
CAAGTCTGATACACGCAAAACCGAAGAGATCGCATCGTAGGTTTTGGATATGGCGTCGAA
GCGGATCTTGAAGGAACTCAAGGATCTTCAGAAGGATCCACCCACCTCATGTAGCGCAGG
ACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGCAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCC
GTACGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACC
ACCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACATCAACAGCAATGGAAGTAT
TTGCCTCGACGTCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCACTCACCATCTCCAAGGTGTTGTT
ATCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCTGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGC
TCATATGTACAAGACCGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAA
GTATGCTATGGGCTGAAATGGAAACCCCCAATCTACAAAACTATCTCTTTATGAA
AAAA

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2H560JQB 201 0 0
GATCCAAACCCTGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACCGACAAG
AACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCTATGGGCTGAAATGGA
AACCCCCAATTTACAAAACTATCTCCTTATGAAGAAAAAAAAAGTATTTCCCTAAGTTTT
ATGTATGATTCAGTAGACAAA

QA 1 201 1 201
DS 

RD RR2FV82TF 749 0 0
GG
ACGCGAAGAAGAAGGCGAAAACCTCGCCAAGTCTGATACACGCAAAACCGAAGAGATCGC
ATCGTAGGTTTTGGATATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGGAACTCAAGGATCTTCAGAA
GGATCCACCCACCTCATGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGC
AACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCCTACGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCA
TTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCA
TCCCAACATCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCC
TGCACTCACCATCTCCAAGGTGTTGTTATCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCC
TGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGAC*GACAAGAACAGGTATGA
GTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCTATGGGCTGAAATGGAAACCCCCAATC
TACAAAACTATCTCCTTATGAAGAAAAAAAAAGTATTTCCCTAAGTTCTATGTATGATTC
AGTAGACAAATCTCTCGTGTCCTTTTTAAAATTTCTGAAAACTGGACCAAATGATGTGGG
TCTTGTTTAAAAGAAA*CATCATCTTTGTGAAACTAGAAACTGGTGTTTGGTCTTGTGGG
TGAATTGTGATTTGATGTTTTATCTTT

QA 3 749 3 749
DS 

RD RR2FV82JQ 650 0 0
GAACTCAAGGATCTTCAGAAGGATCCACCCACCTCATGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAA
GACATGTTTCATTGGCAGGCAACGATAATGGGTCCTTCAGACAGTCCCTACGCTGGTGGT
GTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTACCCTTTCAAACCTCCTAAGGTTGCC
TTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACATCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTCGACATC
TTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCACTCACCATCTCCAAGGTGTTGTTATCGATCTGTTCT
TTGTTAACCGATCCAAACCCTGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAG
AC*GACAAGAACAGGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCTATGGGC
TGAAATGGAAACCCCCAATCTACAAAACTATCTCCTTATGAAGAAAAAAAAAGTATTTCC
CTAAGTTCTATGTATGATTCAGTAGACAAATCTCTCGTGTCCTTTTTAAAATTTCTGAAA
ACTGGACCAAATGATGTGGGTCTTGTTTAAAAGAAAACATCATCTTTGTGAAACTAGAAA
CTGGTGTTTGGTCTTGTGGGTGAATTGTGATTTGATGTTTTATCTTT
CCC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2H741JQB 338 0 0
CCAACCCCTGATGATCCTTTGGTGCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACCGACAAGAAC
AAGTATGAGTCCACTGCACGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCTATGGGCTGAAATGGAAAC
CCCCAATTTACAAAACTATCTCCTTATGAAGAAAAAAAAAGTATTTCCCTAAGTTTTATG
TATGATTCAGTAGACAAATCTTTCGTGTCCTTTTTAAAATTTTTGAAAACTGGACCAAAT
GATGTGGGTCTTGTTTAAAAGAAAACATCATCTTTGTGAAACTAGAAACTGGTGTTTGGT
CTTGTGGGTGAATTGTGATTTGATGTTTTATCTTT
CTT

QA 1 335 1 335
DS 

RD RR2H741TF 623 0 0
G
ATGTAGCGCAGGACCTGTTGCTGAAGACATGTTTCATTGGCAGGCAACGATAATGGGTCC
TTCAGACAGTCCCTACGCTGGTGGTGTTTTCCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCAGATTA
CCCTTTCAAACCTCCTAAGGTTGCCTTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCCAACATCAACAG
CAATGGAAGTATTTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAATGGAGTCCTGCACTCACCATCTC
CAAGGTGTTGTTATCGATCTGTTCTTTGTTAACCGATCCAAACCCTGATGATCCTTTGGT
GCCTGAGATAGCTCATATGTACAAGACCGACAAGAACAAGTATGAGTCCACTGCACGGAG
CTGGACTCAGAAGTATGCTATGGGCTGAAATGGAAACCCCCAATCTACAAAACTATCTCC
TTATGAAGAAAAAAAAAGTATTTCCCTAAGTTCTATGTATGATTCAGTAGACAAATCTCT
CGTGTCCTTTTTAAAATTTCTGAAAACTGGACCAAATGATGTGGGTCTTGTTTAAAAGAA
AACATCATCTTTGTGAAACTAGAAACTGGTGTTTGGTCTTGTGGGTGAATTGTGATTTGA
TGTTTTATCTTTCTTAAAAAAA

QA 2 623 2 623
DS 



CO CL37Contig4 752 4 10 U
ACACCGGAAAGATTCTTAGTTTCTTGTTTTCACAAAGATGTTTGGTTTTAAACAAGACCC
ACTTCATTTGGTCTTGTCTTTCAGAATATTTAAAAGAACACAAAGAGATTGTCTATTGAA
TCATACATAGAAATAACGGCATATTTTGTTTTCATTAAAAAGAGATAGATTTTGGGGTCC
TCCTTTTCATCCCATGGCATACTTCTGAGTCCAGCTCCGTGCAGTGGACTCATACTTGTT
CCTGTCCGTCTTGTACATATGAGCAATCTCAGGTACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATC
GGTTAACAAAGAACAGATCGATAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCATTG
CTCCTTCAAGATGTCGAGGCAAATGCTTCCGTTGCTGTTAATGTTGGGATGGAACACCTT
GGTCCTAAAGGCGACCTTAGGAGGCTTGAAAGGGTAATCTGGAGGGAAATGAATGGTAAC
AAGGAAAACACCACCAGCGTAAGGACTGTCTGAAGGACCCATTATCGTTGCCTGCCAATG
AAACATGTCTTCAGCAACAGGTCCTGCGCTACAAGAGGTGGGTGGATCCTTCTGGAGATC
CTTGAGTTCCTTCAAGATCCGCTTCGACGCCATGAATCCAAAAACCTTACGAGATCTCTT
TTGGTTTTCGCGTATCTCCGATTTGGCGAGGTTCTCGCCTTTTTCTTCTCGTGGTTTTTA
GGAGAGATGAAGGACGAAGAAGAGAAGACTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FH52JQ U 1
AF RR2FH52TF C 44
AF RR2AF15JQ U 4
AF RR2AF15TF C 9
BS 1 83 RR2FH52JQ
BS 84 84 RR2AF15JQ
BS 85 95 RR2FH52JQ
BS 96 96 RR2AF15JQ
BS 97 179 RR2FH52JQ
BS 180 180 RR2AF15JQ
BS 181 241 RR2FH52JQ
BS 242 242 RR2AF15JQ
BS 243 717 RR2FH52JQ
BS 718 752 RR2AF15JQ

RD RR2FH52JQ 717 0 0
ACACCGGAAAGATTCTTAGTTTCTTGTTTTCACAAAGATGTTTGGTTTTAAACAAGACCC
ACTTCATTTGGTCTTGTCTTTCAAAATATTTAAAAAAACACAAAGAGATTGTCTATTGAA
TCATACATAGAAATAACGGCATATTTTGTTTTCATTAAAAAGAGATAGATTTTGGGGTCT
TCCTTTTCATCCCATGGCATACTTCTGAGTCCAGCTCCGTGCAGTGGACTCATACTTGTT
CTTGTCCGTCTTGTACATATGAGCAATCTCAGGTACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATC
GGTTAACAAAGAACAGATCGATAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCATTG
CTCCTTCAAGATGTCGAGGCAAATGCTTCCGTTGCTGTTAATGTTGGGATGGAACACCTT
GGTCCTAAAGGCGACCTTAGGAGGCTTGAAAGGGTAATCTGGAGGGAAATGAATGGTAAC
AAGGAAAACACCACCAGCGTAAGGACTGTCTGAAGGACCCATTATCGTTGCCTGCCAATG
AAACATGTCTTCAGCAACAGGTCCTGCGCTACAAGAGGTGGGTGGATCCTTCTGGAGATC
CTTGAGTTCCTTCAAGATCCGCTTCGACGCCATGAATCCAAAAACCTTACGAGATCTCTT
TTGGTTTTCGCGTATCTCCGATTTGGCGAGGTTCTCGCCTTTTTCTTCTCGTGGTTT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2FH52TF 645 0 0
TGG
TTTAAACAAGACCCACTTCATTTGGTCTTGTCTTTCAGAATATTTAAAAGAACACAAAGA
GATTGTCTATTGAATCATACATAGAAATAACGGCATATTTTGTTTTCATTAAAAAGAGAT
AGATTTTGGGGTCTTCCTTTTCATCCCATGGCATACTTCTGAGTCCAGCTCCGTGCAGTG
GACTCATACTTGTTCTTGTCCGTCTTGTACATATGAGCAATCTCAGGTACCAAAGGATCA
TCCGGGTTTGGATCGGTTAACAAAGAACAGATCGATAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGG
GCAGGACTCCATTGCTCCTTCAAGATGTCGAGGCAAATGCTTCCGTTGCTGTTAATGTTG
GGATGGAACACCTTGGTCCTAAAGGCGACCTTAGGAGGCTTGAAAGGGTAATCTGGAGGG
AAATGAATGGTAACAAGGAAAACACCACCAGCGTAAGGACTGTCTGAAGGACCCATTATC
GTTGCCTGCCAATGAAACATGTCTTCAGCAACAGGTCCTGCGCTACAAGAGGTGGGTGGA
TCCTTCTGGAGATCCTTGAGTTCCTTCAAGATCCGCTTCGACGCCATGAATCCAAAAACC
TTACGAGATCTCTTTTGGTTTTCGCGTATCTCCGATTTGGCG

QA 4 645 4 645
DS 

RD RR2AF15JQ 749 0 0
CCGGAAAGATTCTTAGTTTCTTGTTTTCACAAAGATGTTTGGTTTTAAGCAAGACCCACT
TCATTTGGTCTTGTCTTTCAGAATATTTAAAAGAACACAAAGAGATTGTCTATTGAATCA
TACATAGAAATAACGGCATATTTTGTTTTCATTAAAAAGAGATAGATTTTGGGGTCCTCC
TTTTCATCCCATGGCATACTTCTGAGTCCAGCTCCGTGCAGTGGACTCATACTTGTTCCT
GTCCGTCTTGTACATATGAGCAATCTCAGGTACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATCGGT
TAACAAAGAACAGATCGATAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCATTGCTC
CTTCAAGATGTCGAGGCAAATGCTTCCGTTGCTGTTAATGTTGGGATGGAACACCTTGGT
CCTAAAGGCGACCTTAGGAGGCTTGAAAGGGTAATCTGGAGGGAAATGAATGGTAACAAG
GAAAACACCACCAGCGTAAGGACTGTCTGAAGGACCCATTATCGTTGCCTGCCAATGAAA
CATGTCTTCAGCAACAGGTCCTGCGCTACAAGAGGTGGGTGGATCCTTCTGGAGATCCTT
GAGTTCCTTCAAGATCCGCTTCGACGTCATGAATCCAAAAACCTTACGAGATCTCTTTTG
GTTTTCGCGTATCTCCGATTTGGCGAGGTTCTCGCCTTTTTCTTCTCGTGGTTTTTAGGA
GAGATGAAGGACGAAGAAGAGAAGACTCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2AF15TF 744 0 0
AAGATTCTTAGTTTCTTGTTTTCACAAAGATGTTTGGTTTTAAGCAAGACCCACTTCATT
TGGTCTTGTCTTTCAGAATATTTAAAAGAACACAAAGAGATTGTCTATTGAATCATACAT
AGAAATAACGGCATATTTTGTTTTCATTAAAAAGAGATAGATTTTGGGGTCCTCCTTTTC
ATCCCATGGCATACTTCTGAGTCCAGCTCCGTGCAGTGGACTCATACTTGTTCCTGTCCG
TCTTGTACATATGAGCAATCTCAGGTACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATCGGTTAACA
AAGAACAGATCGATAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCATTGCTCCTTCA
AGATGTCGAGGCAAATGCTTCCGTTGCTGTTAATGTTGGGATGGAACACCTTGGTCCTAA
AGGCGACCTTAGGAGGCTTGAAAGGGTAATCTGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGGAAAA
CACCACCAGCGTAAGGACTGTCTGAAGGACCCATTATCGTTGCCTGCCAATGAAACATGT
CTTCAGCAACAGGTCCTGCGCTACAAGAGGTGGGTGGATCCTTCTGGAGATCCTTGAGTT
CCTTCAAGATCCGCTTCGACGTCATGAATCCAAAAACCTTACGAGATCTCTTTTGGTTTT
CGCGTATCTCCGATTTGGCGAGGTTCTCGCCTTTTTCTTCTCGTGGTTTTTAGGAGAGAT
GAAGGACGAAGAAGAGAAGACTCC

QA 1 744 1 744
DS 



CO CL37Contig5 816 6 4 U
GGTGAATCATCTTATCAGTTATCAATCACACCGTAAAAACATCAAATCATAATTGCAAGA
CAAGACCAAACAACACCAGGAAGATTTCCAGTTTCTAGTTTCACAAAGATGTTTTTTTTT
TCCAAACAAACAAGACCTACTTCATTGGTCCTGTCTTCAGAAATTTCAAACGAGTACAGA
AAGAGATCGTCTATTGAATCATACATAGAAATCACGGTAGATTTTCGCATAAAAAGAGAT
CGTTTAGTGGATTTGGGATCCCTTATCCTTTTCAGCCCATGGCATACTTCTGAGTCCAGC
TCCGTGCAGTGGACTCATACTTGTTCTTGTCAGTCTTGTACATATGAGCTATCTCAGGCA
CCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATCGGTTAACAAAGAACAGATCGACAAGAGCACCTTGG
AAATGGTGAGGGCAGGACTCCATTGCTCCTTCAAGATGTCGAGGCAGATGCTTCCATTGC
TGTTGATGTTGGGATGGAACACCTTCGTCCTAAAGGCAACCTTAGGAGGCTTGAAAGGGT
AATCCGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGGAAAACACCTCCAGCGTAAGGACTGTCTGAAG
GACCCATTATCGTTGCCTGCCAATGAAACATGTCTTCAGCAACAGGTCATGCGCTACATG
AGGTGGGTGGATCCTTCTGCAGATCCTTCAACTCCTTCAAGATCCGCTTCGACGCCATTT
CCAAAACCTACGATCTCTCTTCGGTTTCGCGGACCCCCGATCTGGCGAGCTTTTCGCCTT
TTTTTTTCTTCTCGCAATTTAGGAGTGGAGGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2GN83JQ U 66
AF RR2GQ24JQ U 1
AF RR2AF16JQ U 28
AF RR2GQ24TF C 154
AF RR2GN83TF C 155
AF RR2AF16TF C 159
BS 1 366 RR2GQ24JQ
BS 367 367 RR2GN83JQ
BS 368 623 RR2GQ24JQ
BS 624 816 RR2AF16JQ

RD RR2GN83JQ 497 0 0
CCAAACAACACCAGGAAGATTTCCAGTTTCTAGTTTCACAAAGATGTTTTTTTTTTCCAA
ACAAACAAGACCTACTTCATTGGTCCTGTCTTCAAAAATTTCAAACGAGTACAGAAAGAG
ATCGTCTATTGAATCATACATAGAAATCACGGTAAATTTTCGCATAAAAAGAGATCGTTT
AGTGGATTTGGGATCCCTTATCCTTTTCAGCCCATGGCATACTTCTGAGTCCAGCTCCGA
GCAGTGGACTCATACTTGTTCTTGTCAGTCTTGTACATATGAGCTATCTCAGGCACCAAA
GGATCATCCGGGTTTGGATCGGTTAACAAAAAACAGATCGACAAGAGCACCTTGGAAATG
GTGAGGGCAGGACTCCATTGCTCCTTCAAGATGTCGAGGCAAATGCTTCCATTGCTGTTG
ATGTTGGGATGGAACACCTTCGTCCTAAAGGCAACCTTAGGAGGCTTGAAAGGGTAATCC
GGAGGGAAATGAATGGT

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2GQ24JQ 623 0 0
GGTGAATCATCTTATCAGTTATCAATCACACCGTAAAAACATCAAATCATAATTGCAAGA
CAAGACCAAACAACACCAGGAAGATTTCCAGTTTCTAGTTTCACAAAGATGTTTTTTTTT
TCCAAACAAACAAGACCTACTTCATTGGTCCTGTCTTCAGAAATTTCAAACGAGTACAGA
AAGAGATCGTCTATTGAATCATACATAGAAATCACGGTAGATTTTCGCATAAAAAGAGAT
CGTTTAGTGGATTTGGGATCCCTTATCCTTTTCAGCCCATGGCATACTTCTGAGTCCAGC
TCCGTGCAGTGGACTCATACTTGTTCTTGTCAGTCTTGTACATATGAGCTATCTCAGGCA
CCAAAGAATCATCCGGGTTTGGATCGGTTAACAAAGAACAGATCGACAAGAGCACCTTGG
AAATGGTGAGGGCAGGACTCCATTGCTCCTTCAAGATGTCGAGGCAGATGCTTCCATTGC
TGTTGATGTTGGGATGGAACACCTTCGTCCTAAAGGCAACCTTAGGAGGCTTGAAAGGGT
AATCCGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGGAAAACACCTCCAGCGTAAGGACTGTCTGAAG
GACCCATTATCGTTGCCTGCCAA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2AF16JQ 789 0 0
CCACCG
TAAAAACATCAAATCATAATTGCAAGACAAGACCAAACAACACCAGGAAGATTTCCAGTT
TCTAGTTTCACAAAGATGTTTTTTT***CCAAACAAACAAGACCTACTTCATTGGTCCTG
TCTTCAGAAATTTCAAACGAGTACAGAAAGAGATCGTCTATTGAATCATACATAGAAATC
ACGGTAGATTTTCGCATAAAAAGAGATCGTTTAGTGGATTTGGGATCCCTTATCCTTTTC
AGCCCATGGCATACTTCTGAGTCCAGCTCCGTGCAGTGGACTCATACTTGTTCTTGTCAG
TCTTGTACATATGAGCTATCTCAGGCACCAAAGGATCATCCGGGTTCGGATCGGTTAACA
AAGAACAGATCGACAAGAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCATTGCTCCTTCA
AGATGTCGAGGCAGATGCTTCCATTGCTGTTGATGTTGGGATGGAACACCTTCGTCCTAA
AGGCAACCTTAGGAGGCTTGAAAGGGTAATCCGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGGAAAA
CACCTCCAGCGTAAGGACTGTCTGAAGGACCCATTATCGTTGCCTGCCAATGAAACATGT
CTTCAGCAACAGGTCATGCGCTACATGAGGTGGGTGGATCCTTCTGCAGATCCTTCAACT
CCTTCAAGATCCGCTTCGACGCCATTTCCAAAACCTACGATCTCTCTTCGGTTTCGCGGA
CCCCCGATCTGGCGAGCTTTTCGCCTTTTTTTTTCTTCTCGCAATTTAGGAGTGGAGGAA
CCC

QA 7 789 7 789
DS 

RD RR2GQ24TF 655 0 0
TCTTCAGAAATTTCAAACGAGTACAGAAAGAGATCGTCTATTGAATCATACATAGAAATC
ACGGTAGATTTTCGCATAAAAAGAGATCGTTTAGTGGATTTGGGATCCCTTATCCTTTTC
AGCCCATGGCATACTTCTGAGTCCAGCTCCGTGCAGTGGACTCATACTTGTTCTTGTCAG
TCTTGTACATATGAGCTATCTCAGGCACCAAAGAATCATCCGGGTTTGGATCGGTTAACA
AAGAACAGATCGACAAGAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCATTGCTCCTTCA
AGATGTCGAGGCAGATGCTTCCATTGCTGTTGATGTTGGGATGGAACACCTTCGTCCTAA
AGGCAACCTTAGGAGGCTTGAAAGGGTAATCCGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGGAAAA
CACCTCCAGCGTAAGGACTGTCTGAAGGACCCATTATCGTTGCCTGCCAATGAAACATGT
CTTCAGCAACAGGTCCTGCGCTACATGAGGTGGGTGGATCCTTCTGCAGATCCTTCAACT
CCTTCAAGATCCGCTTCGACGCCATTTCCAAAACCTACGATCTCTCTTCGGTTTCGCGGA
CTCCCGATCTGGCGAGCTTTTCGCCTTTTTTTTTCTTCTCGCAATTTAGGAGT
CC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2GN83TF 654 0 0
CTTCAGAAATTTCAAACGAGTACAGAAAGAGATCGTCTATTGAATCATACATAGAAATCA
CGGTAGATTTTCGCATAAAAAGAGATCGTTTAGTGGATTTGGGATCCCTTATCCTTTTCA
GCCCATGGCATACTTCTGAGTCCAGCTCCGAGCAGTGGACTCATACTTGTTCTTGTCAGT
CTTGTACATATGAGCTATCTCAGGCACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATCGGTTAACAA
AGAACAGATCGACAAGAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCATTGCTCCTTCAA
GATGTCGAGGCAGATGCTTCCATTGCTGTTGATGTTGGGATGGAACACCTTCGTCCTAAA
GGCAACCTTAGGAGGCTTGAAAGGGTAATCCGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGGAAAAC
ACCTCCAGCGTAAGGACTGTCTGAAGGACCCATTATCGTTGCCTGCCAATGAAACATGTC
TTCAGCAACAGGTCCTGCGCTACATGAGGTGGGTGGATCCTTCTGCAGATCCTTCAACTC
CTCCAAGATCCGCTTCGACGCCATTTCCAAAACCTACGATCTCTCTTCGGTTTCGCGGAC
TCCCGATCTGGCGAGCTTTTCGCCTTTTTTTTTCTTCTCGCAATTTAGGAGT
CC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2AF16TF 658 0 0
AGAAATTTCAAACGAGTACAGAAAGAGATCGTCTATTGAATCATACATAGAAATCACGGT
AGATTTTCGCATAAAAAGAGATCGTTTAGTGGATTTGGGATCCCTTATCCTTTTCAGCCC
ATGGCATACTTCTGAGTCCAGCTCCGTGCAGTGGACTCATACTTGTTCTTGTCAGTCTTG
TACATATGAGCTATCTCAGGCACCAAAGGATCATCCGGGTTCGGATCGGTTAACAAAGAA
CAGATCGACAAGAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCATTGCTCCTTCAAGATG
TCGAGGCAGATGCTTCCATTGCTGTTGATGTTGGGATGGAACACCTTCGTCCTAAAGGCA
ACCTTAGGAGGCTTGAAAGGGTAATCCGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGGAAAACACCT
CCAGCGTAAGGACTGTCTGAAGGACCCATTATCGTTGCCTGCCAATGAAACATGTCTTCA
GCAACAGGTCATGCGCTACATGAGGTGGGTGGATCCTTCTGCAGATCCTTCAACTCCTTC
AAGATCCGCTTCGACGCCATTTCCAAAACCTACGATCTCTCTTCGGTTTCGCGGACCCCC
GATCTGGCGAGCTTTTCGCCTTTTTTTTTCTTCTCGCAATTTAGGAGTGGAGG
AACCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 2 28

CO CL38Contig1 1302 24 14 U
CCCAAAAGCCCATAGGCCCAAAATGTATACATTAAACAAAGACTTTCTTTATTACAGACA
GCAAGGTCACATATGGCGTCATTGTCATGATTCAAAAGAAACATTTCTACCGTAAACAAA
AAGTTTGTAGAAACTTATGGATCAAGAAACACATGCTTGATAATATCAACGACTATATAC
TGTCTTTCTCGCTTTATTTAACCATTATTTTGCCCAAGTGATCGGCTTCATTATTGGATA
CACACTAGTAGTTTAATTAGTTGTAGCAACAAAGTAGTTTCTTTTTATAAAGGCCATAAA
AACGGCACGATGTTTTTACTCTGTTGTTGTACATAACTTGTTGAAGAAGGAGAGAATCTC
CTCCGAGACTTGTTTAGCCTTCTCTTGCTGGATAAAATGATGACCATCCTCAATTACAAC
AACCTCAACATTTGGTACATGACTCTTGAACATCTCTCCCTTCACATACCCCATCGTTTC
ATTTGCTCCTATATCTTTGTCTCCGGCAATAAACTTTGTCGGAACAAGGATCTTGGAGCC
TTCCCACGGCGCCAATATCTCCCAGTTCAGATCCATGGCTCTGTAGTAATTCAACGGGCC
AGTGAATCCAGATCTCTGAAACTTGTCTGCATAAACCTGAATCTCCTCTTCTGTTATCCA
CTCTGGAATCTTCGACGGAATCTCGAGATCATCGATGATCTCTGTACCAGGAGGAGCCAC
CATGAAATCTGTTCTCGTCGTTAGCAAGAACTTCTTCATAACCGTCTTGCAATCATGCTT
GGCAAATGCAGCTTCAGCTCTTCCAGGTTTTTGAAACTGAGTGATGTATAGCCCATCTCC
AAAGGTTTTGGAAAACTCTGAAGGTTTGAGGTTTGGATCTCTTGGAGAATATGGAACAGA
GAGACTTATGAAACCTTTGACTCTGTCTGGTCTAAACAAGCATAGAGACCAACCTATAAC
TGATCCCCAGTCATGTCCAGCCACAAATGCCTGAGCAGTGCCGTAGTGATCAAGCAAACC
GATGGCATCAGCGACAAGGTGGCTCACAGTGTAAGACTCGTAACTCGGAAGAAACTCGGA
GTCGCCGTAGCCTCTGAGGTCTGGAGCGACCACGTGGTAGCCATGGCTCGACAAGAAATC
GATCTGGTGACGCCACGAGAACCATGTCTCGGGGAAGCCATGGAGTAACAGAACCAAAGG
TCCTCGTTCTTCTCCTTTCTCAGCAACGTTTAACCAAATCCCGTTGGTCTTGATCTTCTT
CTCTCTCACTAAGCTTGTTGTCATGATTCTTGATCCTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 40 40 45 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 
60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 55 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 
80 80 80 35 80 80 80 80 80 35 80 80 35 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 35 80 80 80 80 80 80 80 80 35 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 60 90 90 90 90 45 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 50 85 85 
85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 55 90 90 90 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 90 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 65 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 85 85 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 80 95 95 95 95 95 95 45 95 95 60 95 95 95 95 80 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 65 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 75 60 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 70 70 70 65 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 

AF RR2DO40JQ U 162
AF RR2BS86JQ U 361
AF RR2G230JQ U 168
AF RR2D370TF C 141
AF RR2F009JQ U 159
AF RR2BY83JQ U 1
AF RR2ET85JQ U 184
AF RR2GP87JQ U 162
AF RR2AE15JQ U 155
AF RR2AU86JQ U 287
AF RR2GI35JQB U 162
AF RR2F684JQ U 259
AF RR2F481JQ U 165
AF RR2B721JQ U 180
AF RR2ET85TF C 382
AF RR2AE15TF C 510
AF RR2AU86TF C 1099
AF RR2GI35TF C 628
AF RR2E785TF C 641
AF RR2DO40TF C 642
AF RR2BS86TF C 650
AF RR2F009TF C 560
AF RR2B721TF C 541
AF RR2BY83TF C 1017
BS 1 569 RR2BY83JQ
BS 570 570 RR2F009JQ
BS 571 797 RR2BY83JQ
BS 798 798 RR2ET85JQ
BS 799 833 RR2BY83JQ
BS 834 899 RR2AE15JQ
BS 900 935 RR2F481JQ
BS 936 936 RR2B721JQ
BS 937 963 RR2F481JQ
BS 964 1010 RR2B721JQ
BS 1011 1067 RR2ET85TF
BS 1068 1191 RR2AE15TF
BS 1192 1192 RR2AU86TF
BS 1193 1302 RR2AE15TF

RD RR2DO40JQ 195 0 0
AATATCAACGACTATATACTGTCTTTCTCGCTTTATTTAACCATTATTTTGCCCAAGTGA
TCGGCTTCATTATTGGATACACACTAATAGTTTAATTAGTTGTAGCAACAAAGTAGTTTC
TTTTTATAAAGGCCATAAAAACGGCACGATGTTTTTACTCTGTTGTTGTACATAACTTGT
TGAAAAAGGA
AAAAA

QA 1 190 1 190
DS 

RD RR2BS86JQ 236 0 0
CCCCAAA
ACTTGTTTAGCCTTCTCTTGCTGGATAAAATGATGACCATCCTCAATTACAACAACCTCA
ACATTTGGTACATGACTCTTGAACATCTCTCCCTTCACATACCCCATCGTTTCATTTGCT
CCTATATCTTTGTCTCCGGCAATAAACTTTGTCGGAACAAGGATCTTGGAGCCTTCCCAC
GGCGCCAATATCTCCCAGTTCAAATCCATGGCTCTGTAGTAATTCAACG

QA 8 236 8 236
DS 

RD RR2G230JQ 401 0 0
GG
CGACTATATACTGTCTTTCTCGCTTTGTTTAACCATTATTTTGCCCAAGTGATCGGCTTC
ATCATTGGATACACACTAGTAGTTTAATTAGTTGTAGCAGCAAAGTAGTTTCTTTTTATA
AAGGCCATAAAAACGGCACGATGTTTTTACTCTGTTGTTGTACATAACTTGTTGAAGAAG
GAGAGAATCTCCTCCGAGACTTGTTTAGCCTTCTCTTGCTGGATAAAATGATGACCATCC
TCAATTACAACAACTTCAACGTTAGGTACATGAATCTTGAACATCTCTCCCTTCACATAC
CCCATCGTTTCATTTGCTCCGATATCTTTATCTCCGGCAATAAACTTTGTCGGAACAAGG
ATCTTGGAGCCTTCCCACGGCGCCAATATCTCCCA
TTTC

QA 3 397 3 397
DS 

RD RR2D370TF 625 0 0
ATCAAGAAACACATGCTTGATAATATCAACGACTATATACTGTCTTTCTCGCTTTATTTA
ACCATTATTTTGCCCAAGTGATCGGCTTCATTATTGGATACACACTAGTAGTTTAATTAG
TTGTAGCAACAAAGTAGTTTCTTTTTATAAAGGCCATAAAAACGGCACGATGTTTTTACT
CTGTTGTTGTACATAACTTGTTGAAGAAGGAGAGAATCTCCTCCGAGACTTGTTTAGCCT
TCTCTTGCTGGATAAAATGATGACCATCCTCAATTACAACAACCTCAACATTTGGTACAT
GACTCTTGAACATCTCTCCCTTCACATACCCCATCGTTTCATTTGCTCCTATATCTTTGT
CTCCGGCAATAAACTTTGTCGGAACAAGGATCTTGGAGCCTTCCCACGGCGCCAATATCT
CCCAGTTCAGATCCATGGCTCTGTAGTAATTCAACGGGCCAGTGAATCCAGATCTCTGAA
ACTTGTCTGCATAAACCTGAATCTCCTCTTCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGACGGAA
TCTCGAGATCATCGATGATCTCTGTACCAGGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTCTCGCCG
TTAGCAAGAACTTCTTCATAACCG
C

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2F009JQ 574 0 0
GATAATATCAACGACTATATACTGTCTTTCTCGCTTTATTTAACCATTATTTTGCCCAAG
TGATCGGCTTCATTATTGGATACACACTAGTAGTTTAATTAGTTGTAGCAACAAAGTAGT
TTCTTTTTATAAAGGCCATAAAAACGGCACGATGTTTTTACTCTGTTGTTGTACGTAACT
TGTTGAAGAAGGAGAGAATCTCCTCCGAGACTTGTTTAGCCTTCTCTTGCTGGATAAAAT
GATGACCATCCTCAATTACAACAACCTCAACATTTGGTACATGACTCTTGAACATCTCTC
CCTTCACATACCCCATCGTTTCATTTGCTCCTATATCTTTGTCTCCGGCAATAAACTTTG
TCGGAACAAGGATCTTGGAGCCTTCCCACGGCGCCAATATCTCCCAATTCAGATCCATGG
CTCTGTAGTAATTCAACGGGCCAGTGAATCCAGATCTCTGAAACTTGTCTGCATAAACCT
GAATCTCCTCTTCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGACGGAATCTCGAGATCATCGATGA
TCTCTGTACCAGGAGGAGCCACCATGAAATCTGT

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2BY83JQ 849 0 0
CCCAAAAGCCCATAGGCCCAAAATGTATACATTAAACAAAGACTTTCTTTATTACAGACA
GCAAGGTCACATATGGCGTCATTGTCATGATTCAAAAGAAACATTTCTACCGTAAACAAA
AAGTTTGTAGAAACTTATGGATCAAGAAACACATGCTTGATAATATCAACGACTATATAC
TGTCTTTCTCGCTTTATTTAACCATTATTTTGCCCAAGTGATCGGCTTCATTATTGGATA
CACACTAGTAGTTTAATTAGTTGTAGCAACAAAGTAGTTTCTTTTTATAAAGGCCATAAA
AACGGCACGATGTTTTTACTCTGTTGTTGTACATAACTTGTTGAAGAAGGAGAGAATCTC
CTCCGAGACTTGTTTAGCCTTCTCTTGCTGGATAAAATGATGACCATCCTCAATTACAAC
AACCTCAACATTTGGTACATGACTCTTGAACATCTCTCCCTTCACATACCCCATCGTTTC
ATTTGCTCCTATATCTTTGTCTCCGGCAATAAACTTTGTCGGAACAAGGATCTTGGAGCC
TTCCCACGGCGCCAATATCTCCCAGTTCAAATCCATGGCTCTGTAGTAATTCAACGGGCC
AGTGAATCCAGATCTCTGAAACTTGTCTGCATAAACCTGAATCTCCTCTTCTGTTATCCA
CTCTGGAATCTTCGACGGAATCTCGAGATCATCGATGATCTCTGTACCAGGAGGAGCCAC
CATGAAATCTGTTCTCGTCGTTAGCAAGAACTTCTTCATAACCGTCTTGCAATCATGCTT
GGCAAATGCAGCTTCAGTTCTTCCAGGTTTTTGAAACTGAGTGATGTATAGCC
ATCTCAAAGTTTTGGA

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2ET85JQ 642 0 0
CTTTCTCGCTTTATTTAACCATTATTTTGCCCAAGTGATCGGCTTCATTATTGGATACAC
ACTAGTAGTTTAATTAGTTGTAGCAACAAAGTAGTTTCTTTTTATAAAGGCCATAAAAAC
GGCACGATGTTTTTACTCTGTTGTTGTACATAACTTGTTGAAAAAGGAGAGAATCTCCTC
CGAAACTTGTTTAGCCTTCTCTTGCTGGATAAAATGATGACCATCCTCAATTACAACAAC
CTCAACATTTGGTACATGACTCTTGAACATCTCTCCCTTCACATACCCCATCGTTTCATT
TGCTCCTATATCTTTGTCTCCGGCAATAAACTTTGTCGGAACAAGGATCTTGGAGCCTTC
CCACGACGCCAATATCTCCCAGTTCAAATCCATGGCTCTGTAGTAATTCAACGGGCCAGT
GAATCCAGATCTCTGAAACTTGTCTGCATAAACCTGAATCTCCTCTTCTGTTATCCACTC
TGGAATCTTCGACGGAATCTCGAGATCATCGATGATCTCTGTACCAGGAGGAGCCACCAT
GAAATCTGTTCTCGTCGTTAGCAAGAACTTCTTCATAACCGTCTTGCAATCATGCTTGGC
AAATGCAGCTTCAGCTCTTCCAGGTTTTTGAAACTGAGTGAT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2GP87JQ 640 0 0
GC
TATCAACGACTATATACTGTCTTTCTCGCTTTGTTTAACCATTATTTTGCCCAAGTGATC
GGCTTCATTATTGGATGCACACTAGTAGTTTAATTAGTTGTAGCAACAAAGTAGTTTCTT
TTTATAAAGGCCATAAAAACGGCACGATGTTTTTACTCTGTTGTTGTACATAACTTGTTG
AAGAAGGAGAGAATCTCCTCCGAGACTTGTTTAGCCTTCTCTTGCTGGATAAAATGATGA
CCATCCTCAATTACAACAACTTCAACGTTAGGTACATGACTCTTGAACATCTCTCCCTTC
ACATACCCCATCGTTTCATTTGCTCCGATATCTTTATCTCCGGCAATAAACTTTGTCGGA
ACAAGGATCTTGGAGCCTTCCCACGGCGCCAATATCTCCCAGTTCAGATCCATGGCTCTG
TAGTAATTCAACGGACCAGTGAATCCAGATCTCTGAAACTTGTCTGCATAAACCTGAATC
TCCTCTTCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGGTGGAATCTCGAGATCATCGATGATCTCT
GTACCGGGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTCTCGTTGTTAGCAAGAACTTCTTCATAACC
GTCTTGCAATCATGCTTGGCAAATGCGGCCTCAGCTCT

QA 3 640 3 640
DS 

RD RR2AE15JQ 745 0 0
GCTT
GATAATATCAACGACTATATACTGTCTTTCTCGCTTTATTTAACCATTATTTTGCCCAAG
TGATCGGCTTCATTATTGGATACACACTAGTAGTTTAATTAGTTGTAGCAACAAAGTAGT
TTCTTTTTATAAAGGCCATAAAAACGGCACGATGTTTTTACTCTGTTGTTGTACATAACT
CGTTGAAGAAGGAGAGAATCTCCTCCGAGACTTGTTTAGCCTTCTCTTGCTGGATAAAAT
GATGACCATCCTCAATTACGACAACCTCAACATTTGGTACATGACTCTTGAACATCTCTC
CCTTCACATACCCCATCGTTTCATTTGCTCCTATATCTTTGTCTCCGGCAATAAACTTTG
TCGGAACAAGGATCTTGGAGCCTTCCCACGGCGCCAATATCTCCCAGTTCAGATCCATGG
CTCTGTAGTAATTCAACGGGCCAGTGAATCCAGATCTCTGAAACTTGTCTGCATAAACCT
GAATCTCCTCTTCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGACGGAATCTCGAGATCATCGATGA
TCTCTGTACCAGGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTCTCGTCGTTAGCAAGAACTTCTTCA
TAACCGTCTTGCAATCATGCTTGGCAAATGCAGCTTCAGCTCTTCCAGGTTTTTGAAACT
GAGTGATGTATAGCCCATCTCCAAAGGTTTTGGAAAACTCTGAAGGTTTGAGGTTTGGAT
CTCTTGGAGAATATGGAACAG

QA 5 745 5 745
DS 

RD RR2AU86JQ 610 0 0
ATAAAGGCCATAAAAACGGCACGATGTTTTTACTCTGTTGTTGTACATAACTTGTTGAAG
AAGGAGAGAATCTCCTCCGAGACTTGCTTAGCCTTCTCTTGCTGGATAAAATGATGACCA
TCCTCAATTACGACAACCTCAACATTTGGTACATGACTCTTGAACATCTCTCCCTTCACA
TACCCCATCGTTTCATTTGCTCCTATATCTTTGTCTCCGGCAATAAACTTTGTCGGAACA
AGGATCTTGGAGCCTTCCCACGGCGCCAATATCTCCCAGTTCAAATCCATGGCTCTGTAG
TAATTCAACGGGCCAGTGAATCCAGATCTCTGAAACTTGTCTGCATAAACCTGAATCTCC
TCTTCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGACGGAATCTCGAGATCATCGATGATCTCTGTA
CCAGGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTCTCGTCGTTAGCAAGAACTTCTTCATATCCGTC
TTGCAATCATGCTTGGCAAATGCAGCTTCAGCTCTTCCAGGTTTTTGAAACTGAGTGATG
TATAGCCCATCTCCAAAGGTTTTGGAAAACTCTGAAGGTTTGAGGTTTGGATCTCTTGGA
GAATATGGAA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2GI35JQB 687 0 0
AATATCAACGACTATATACTGTCTTTCTCGCTTTATTTAACCATTATTTTGCCCAAGTGA
TCGGCTTCATTATTGGATACACACTAGTAGTTTAATTAGTTGTAGCAACAAAGTAGTTTC
TTTTTATAAAGGCCATAAAAACGGCACGATGTTTTTACTCTGTTGTTGTACATAACTTGT
TGAAGAAGGAGAGAATCTCCTCCGAGACTTGTTTAGCCTTCTCTTGCTGGATAAAATGAT
GACCATCCTCAATTACAACAACCTCAACATTTGGTACATGACTCTTGAACATCTCTCCCT
TCACATACCCCATCGTTTCATTTGCTCCTATATCTTTGTCTCCGGCAATAAACTTTGTCG
GAACAAGGATCTTGGAGCCTTCCCACGGCGCCAATATCTCCCAGTTCAGATCCATGGCTC
TGTAGTAATTCAACGGGCCAGTGAATCCAGATCTCTGAAACTTGTCTGCATAAACCTGAA
TCTCCTCTTCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGACGGAATCTCGAGATCATCGATGATCT
CTGTACCAGGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTCTCGTCGTTAGCAAGAACTTCTTCATAA
CCGTCTTGCAATCATGCTTGGCAAATGCAGCTTCAGCTCTTCCAGGTTTTTGAAACTGAG
TGATGTATAGCCCATCTCCAAAGGTTT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2F684JQ 642 0 0
AGTTGTAGCAACAAAGTAGTTTCTTTTTATAAAGGCCATAAAAACGGCACGATGTTTTTA
CTCTGTTGTTGTACATAACTTGTTGAAGAAGGAGAGAATCTCCTCCGAGACTTGTTTAGC
CTTCTCTTGCTGGATAAAATGATGACCATCCTCAATTACAACAACTTCAACGTTAGGTAC
ATGACTCTTGAACATCTCTCCCTTCACATACCCCATCGTTTCATTTGCTCCGATATCTTT
ATCTCCGGCAATAAACTTTGTCGGAACAAGGATCTTGGAGCCTTCCCACGGCGCCAATAT
CTCCCAGTTCAGATCCATGGCTCTGTAGTAATTCAACGGACCAGTGAATCCAGATCTCTG
AAACTTGTCTGCATAAACCTGAATCTCCTCTTCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGGTGG
AATCTCGAGATCATCGATGATCTCTGTACCGGGAGGAGCCGCCATGAAATCTGTTCTCGT
TGTTAGCAAGAACTTCTTCATAACCGTCTTGCAATCATGCTTGGCAAATGCGGCCTCAGC
TCTTCCAGGTTTCTGAAACTGAGTGATGTATAGCCCATCTCCAAAGGTTTTGGAAAACTC
TGAAGGTTTGAGGTTTGGATCTCTTGGGGAATATGGAACAGA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2F481JQ 799 0 0
ATCAACGACTATATACTGTCTTTCTCGCTTTGTTTAACCATTATTTTGCCCAAGTGATCG
GCTTCATTATTGGATACACACTAGTAGTTTAATTAGTTGTAGCAACAAAGTAGTTTCTTT
TTATAAAGGCCATAAAAACGGCACGATGTTTTTACTCTGTTGTTGTACATAACTTGTTGA
AGAAGGAGAGAATCTCCTCCGAGACTTGTTTAGCCTTCTCTTGCTGGATAAAATGATGAC
CATCCTCAATTACAACAACTTCAACGTTAGGTACATGACTCTTGAACATCTCTCCCTTCA
CATACCCCATCGTTTCATTTGCTCCGATATCTTTATCTCTGGCAATAAACTTTGTCGGAA
CAAGGATCTTGGAGCCTTCCCACGGCGCCAATATCTCCCAGTTCAGATCCATGGCTCTGT
AGTAATTCAACGGACCAGTGAATCCAGATCTCTGAAACTTGTCTGCATAAACCTGAATCT
CCTCTTCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGGTGGAATCTCGAGATCATCGATGATCTCTG
TACCGGGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTCTCGTTGTTAGCAAGAACTTCTTCATAACCG
TCTTGCAATCATGCTTGGCAAATGCGGCCTCAGCTCTTCCAGGTTTCTGAAACTGAGTGA
TGTATAGCCCATCTCCAAAGGTTTTAGAAAACTCTGAAGGTTTGAGGTCTGGATCTCTTG
GAGAATATGGAACAGAGAGACTTATGAAACCTTTGACTCTGTCTGGTCTAA*CAAGCATA
GAGACCAACCTATAACTGA

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2B721JQ 831 0 0
CTGTCTTTCTCGCTTTATTTAACCATTATTTTGCCCAAGTGATCGGCTTCATTATTGGAT
ACACACTAGTAGTTTAATTAGTTGTAGCAACAAAGTAGTTTCTTTTTATAAAGGCCATAA
AAACGGCACGATGTTTTTACTCTGTTGTTGTACATAACTTGTTGAAGAAGGAGAGAATCT
CCTCCGAGACTTGTTTAGCCTTCTCTTGCTGGATAAAATGATGACCATCCTCAATTACAA
CAACCTCAACATTTGGTACATGACTCTTGAACATCTCTCCCTTCACATACCCCATCGTTT
CATTTGCTCCTATATCTTTGTCTCCGGCAATAAACTTTGTCGGAACAAGGATCTTGGAGC
CTTCCCACGGCGCCAATATCTCCCAGTTCAGATCCATGGCTCTGTAGTAATTCAACGGGC
CAGTGAATCCAGATCTCTGAAACTTGTCTGCATAAACCTGAATCTCCTCTTCTGTTATCC
ACTCTGGAATCTTCGACGGAATCTCGAGATCATCGATGATCCCTGTACCAGGAGGAGCCA
CCATGAAATCTGTTCTCGTCGTTAGCAAGAACTTCTTCATAACCGTCTTGCAATCATGCT
TGGCAAATGCAGCTTCAGCTCTTCCAGGTTTTTGAAACTGAGTGATGTATAGCCCATCTC
CAAAGGTTTTGGAAGACTCTGAAGGTTTGAGGTTTGGATCTCTTGGAGAATATGGAACAG
AGAGACTTATGAAACCTTTGACTCTGTCTGGTCTAAACAAGCATAGAGACCAACCTATAA
CTGATCCCCAGTCATGTCCAGCCACAAATGCCTGAGCAGTGCCGTAGTGAT

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR2ET85TF 687 0 0
CTCTTGCTGGATAAAATGATGACCATCCTCAATTACAACAACCTCAACATTTGGTACATG
ACTCTTGAACATCTCTCCCTTCACATACCCCATCGTTTCATTTGCTCCTATATCTTTGTC
TCCGGCAATAAACTTTGTCGGAACAAGGATCTTGGAGCCTTCCCACGACGCCAATATCTC
CCAGTTCAGATCCATGGCTCTGTAGTAATTCAACGGGCCAGTGAATCCAGATCTCTGAAA
CTTGTCTGCATAAACCTGAATCTCCTCTTCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGACGGAAT
CTCGAGATCATCGATGATCTCTGTACCAGGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTCTCGTCGT
TAGCAAGAACTTCTTCATAACCGTCTTGCAATCATGCTTGGCAAATGCAGCTTCAGCTCT
TCCAGGTTTTTGAAACTGAGTGATGTATAGCCCATCTCCAAAGGTTTTGGAAAACTCTGA
AGGTTTGAGGTTTGGATCTCTTGGAGAATATGGAACAGAGAGACTTATGAAACCTTTGAC
TCTGTCTGGTCTAAACAAGCATAGAGACCAACCTATAACTGATCCCCAGTCATGTCCAGC
CACAAATGCCTGAGCAGTGCCGTAGTGATCAAGCAAACCGATGGCATCAGCGACAAGGTG
GCTCACAGTGTAAGACTCGTAACTCG
C

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2AE15TF 793 0 0
TAAACTTTGTCGGAACAAGGATCTTGGAGCCTTCCCACGGCGCCAATATCTCCCAGTTCA
GATCCATGGCTCTGTAGTAATTCAACGGGCCAGTGAATCCAGATCTCTGAAACTTGTCTG
CATAAACCTGAATCTCCTCTTCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGACGGAATCTCGAGAT
CATCGATGATCTCTGTACCAGGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTCTCGTCGTTAGCAAGA
ACTTCTTCATAACCGTCTTGCAATCATGCTTGGCAAATGCAGCTTCAGCTCTTCCAGGTT
TTTGAAACTGAGTGATGTATAGCCCATCTCCAAAGGTTTTGGAAAACTCTGAAGGTTTGA
GGTTTGGATCTCTTGGAGAATATGGAACAGAGAGACTTATGAAACCTTTGACTCTGTCTG
GTCTAAACAAGCATAGAGACCAACCTATAACTGATCCCCAGTCATGTCCAGCCACAAATG
CCTGAGCAGTGCCGTAGTGATCAAGCAAACCGATGGCATCAGCGACAAGGTGGCTCACAG
TGTAAGACTCGTAACTCGGAAGAAACTCGGAGTCGCCGTAGCCTCTGAGGTCTGGAGCGA
CCACGTGGTAGCCATGGCTCGACAAGAAATCGATCTGGTGACGCCACGAGAACCATGTCT
CGGGGAAGCCATGGAGTAACAGGACCAAAGGTCCTCGTTCTTCTCCTTTCTCAGCAACGT
TTAACCAAATCCCGTTGGTCTTGATCTTCTTCTCTCTCACTAAGCTTGTTGTCATGATTC
TTGATCCTGATCC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2AU86TF 204 0 0
GTCTGGAGCGACCACGTGGTAGCCATGGCTCGACAAGAAATCAATCTGGTGACGCCACGA
GAACCATGTCTCGGGGAAGCCATGGAGTAACAGAACCAAAGGTCCTCGTTCTTCTCCTTT
CTCAGCAACGTTTAACCAAATCCCGTTGGTCTTGATCTTCTTCTCTCTCACTAAGCTTGT
TGTCATGATTCTTGATCCTGATCC

QA 1 204 1 204
DS 

RD RR2GI35TF 640 0 0
TGCATAAACGTGAATCTCCTCTTCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGACGGAATCTCGAG
ATCATCGATGATCTCTGTACCAGGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTCTCGTCGTTAGCAA
GAACTTCTTCATAACCGTCTTGCAATCATGCTTGGCAAATGCAGCTTCAGCTCTTCCAGG
TTTTTGAAACTGAGTGATGTATAGCCCATCTCCAAAGGTTTTGGAAAACTCTGAAGGTTT
GAGGTTTGGATCTCTTGGAGAATGTGGAACAGAGAGACTTATGAAACCTTTGACTCTGTC
TGGTCTAAACAAGCATAGAGACCAACCTATAACTGATCCCCAGTCATGTCCAGCCACAAA
TGCCTGAGCAGTGCCGTAGTGATCAAGCAAACCGATGGCATCAGCGACAAGGTGGCTCAC
AGTGTAAGACTCGTAACTCGGAAGAAACTCGGAGTCGCCGTAGCCTCTGAGGTCTGGAGC
GACCACGTGGTAGCCATGGCTCGACAAGAAATCGATCTGGTGACGCCACGAGAACCATGT
CTCGGGGAAGCCATGGAGTAACAGAACCAAAGGTCCTCGTTCTTCTCCTTTCTCAGCAAC
GTTTAACCAAATCCCGTTGGTCTTGATCTTCTTCTCTCTC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2E785TF 662 0 0
ATCTCCTCTTCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGACGGAATCTCGAGATCATCGATGATC
TCTGTACCAGGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTCTCGTCGTTAGCAAGAACTTCTTCATA
ACCGTCTTGCAATCATGCTTGGAAAATGCAGCTTCAGCTCTTCCAGGTTTTTGAAACTGA
GTGATGTATAGCCCATCTCCAAAGGTTTTGGAAAACTCTGAAGGTTTGAGGTTTGGATCT
CTTGGAGAATATGGAACAGAGAGACTTATGAAACCTTTGACTCTGTCTGGTCTAAACAAG
CATAGAGACCAACCTATAACTGATCCCCAGTCATGTCCAGCCACAAATGCCTGAGCAGTG
CCGTAGTGATCAAGCAAACCGATGGCATCAGCGACAAGGTGGCTCACAGTGTAAGACTCG
TAACTCGGAAGAAACTCGGAGTCGCCGTAGCCTCTGAGGTCTGGAGCGACCACGTGGTAG
CCATGGCTCGACAAGAAATCGATCTGGTGACGCCACGAGAACCATGTCTCGGGGAAGCCA
TGGAGTAACAGAACCAAAGGTCCTCGTTCTTCCCCTTTCTCAGCAACGTTTAACCAAATC
CCGTTGGTCTTGATCTTCTTCTCTCTCACTAAGCTTGTTGTCATGATTCTTGATCCTGAT
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2DO40TF 661 0 0
ATCT
CTCTTCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGACGGAATCTCGAGATCATCGATGATCTCTGT
ACCAGGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTCTCGTCGTTAGCAAGAACTTCTTCATAACCGT
CTTGCAATCATGCTTGGCAAATGCAGCTTCAGCTCTTCCAGGTTTTTGAAACTGAGTGAT
GTATAGCCCATCTCCAAAGGTTTTGGAAAACTCTGAAGGTTTGAGGTTTGGATCTCTTGG
AGAATATGGAACAGAGAGACTTATGAAACCTTTGACTCTGTCTGGTCTAAACAAGCATAG
AGACCAACCTATAACTGATCCCCAGTCATGTCCAGCCACAAATGCCTGAGCAGTGCCGTA
GTGATCAAGCAAACCGATGGCATCAGCGACAAGGTGGCTCACAGTGTAAGACTCGTAACT
CGGAAGAAACTCGGAGTCGCCGTAGCCTCTGAGGTCTGGAGCGACCACGTGGTAGCCATG
GCTCGACAAGAAATCGATCTGGTGACGCCACGAGAACCATGTCTCGGGGAAGCCATGGAG
TAACAGAACCAAAGGTCCTCGTTCTTCTCCTTTCTCAGCAACGTTTAACCAAATCCCGTT
GGTCTTGATCTTCTTCTCTCTCACTAAGCTTGTTGTCATGATTCTTGATCCTGATCC

QA 5 661 5 661
DS 

RD RR2BS86TF 650 0 0
TCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGACGGAATCTCGAGATCATCGATGATCTCTGTACTA
GGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTCTCGTCGTTAGCAAGAACTTCTTCATAACCGTCTTG
CAATCATGCTTGGCAAATGCAGCTTCAGCTCTTCCAGGTTTTTGAAACTGAGTGATGTAT
AGCCCATCTCCAAAGGTTTTGGAAAACTCTGAAGGTTTGAGGTTTGGATCTCTTGGAGAA
TATGGAACAGAGAGACTTATGAAACCTTTGACTCTGTCTGGTCTAAACAAGCATAGAGAC
CAACCTATAACTGATCCCCAGTCATGTCCAGCCACAAATGCCTGAGCAGTGCCGTAGTGA
TCAAGCAAACCGATGGCATCAGCGACAAGGTGGCTCACAGTGTAAGACTCGTAACTCGGA
AGAAACTCGGAGTCGCCGTAGCCTCTGAGGTCTGGAGCGACCACGTGGTAGCCATGGCTC
GACAAGAAATCGATCTGGTGACGCCACGAGAACCATGTCTCGGGGAAGCCATGGAGTAAC
AGAACCAAAGGTCCTCGTTCTTCTCCTTTCTCAGCAACGTTTAACCAAATCCCGTTGGTC
TTGATCTTCTTCTCTCTCACTAAGCTTGTTGTCATGATTCTCGATCCT
CC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2F009TF 740 0 0
TCCCAATTCAGATCCATGGCTCTGTAGTAATTCAACGGGCCAGTGA*TCCAGATCTCTGA
AACTTGTCTGCATAAACGTGAATCTCCTCTTCTGTTATCCACTCTGGAATCTTCGACGGA
ATCTCGAGATCATCGATGATCTCTGTACCAGGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTCTCGTC
GTTAGCAAGAACTTCTTCA**ACCGTCTTGCAATCATGCTTGGCAAATGCGGCTTCAGCT
CTTCCAGGTTTTTGAAACTGAGTGATGTATAGCCCATCTCCAAAGGTTTTGGAAAACTCT
GAAGGTTTGAGGTTTGGATCTCTTGGAGAATATGGAACAGAGAGACTTATGAAACCTTTG
ACTCTGTCTGGTCTAAACAAGCATAGAGACCAACCTATAACTGATCCCCAGTCATGTCCA
GCCACAAATGCCTGAGCAGTACCGTAGTGATCAAGCAAACCGATGGCATCAGCGACAAGG
TGGCTCACAGTGTAAGACTCGTAACTCGGAAGAAACTCGGAGTCGCCGTAGCCTCTGAGG
TCTGGAGCGACCACGTGGTAGCCATGGCTCGACAAGAAATCGATCTGGTGACGCCACGAG
AACCATGTCTCGGGGAAGCCATGGAGTAACAGAACCAAAGGTCCTCGTTCTTCTCCTTTC
TCAGCAACGTTTAACCAAATCCCGTTGGTCTTGATCTTCTTCTCTCTCACTAAGCTTGTT
GTCATGATTCTTGATCCT
CC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2B721TF 762 0 0
TTCCCACGGCGCCAATATCTCCCAGTTCAGATCCATGGCTCTGTAGTAATTCAACGGGCC
AGTGAATCCAGATCTCTGAAACTTGTCTGCATAAACGTGAATCTCCTCTTCTGTTATCCA
CTCTGGAATCTTCGACGGAATCTCGAGATCATCGATGATCCCTGTACCAGGAGGAGCCAC
CATGAAATCTGTTCTCGTCGTTAGCAAGAACTTCTTCATAACCGTCTTGCAATCATGCTT
GGCAAATGCAGCTTCAGCTCTTCCAGGTTTTTGAAACTGAGTGATGTATAGCCCATCTCC
AAAGGTTTTGGAAGACTCTGAAGGTTTGAGGTTTGGATCTCTTGGAGAATATGGAACAGA
GAGACTTATGAAACCTTTGACTCTGTCTGGTCTAAACAAGCATAGAGACCAACCTATAAC
TGATCCCCAGTCATGTCCAGCCACAAATGCCTGAGCAGTGCCGTAGTGATCAAGCAAACC
GATGGCATCAGCGACAAGGTGGCTCACAGTGTAAGACTCGTAACTCGGAAGAAACTCGGA
GTCGCCGTAGCCTCTGAGGTCTGGAGCGACCACGTGGTAGCCATGGCTCGACAAGAAATC
GATCTGGTGACGCCACGAGAACCATGTCTCGGGGAAGCCATGGAGTAACAGAACCAAAGG
TCCTCGTTCTTCTCCTTTCTCAGCAACGTTTAACCAAATCCCGTTGGTCTTGATCTTCTT
CTCTCTCACTAAGCTTGTTGTCATGATTCTTGATCCTGATCC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2BY83TF 286 0 0
AACCGATGGCATCAGCGGCAAGGTGGCTCACAGTGTAAGACTCGTAACTCGGAAGAAACT
CGGAGTCGCCGTAGCCTCTGAGGTCTGGAGCGACCACGTGGTAGCCATGGCTCGACAAGA
AATCGATCTGGTGACGCCACGAGAACCATGTCTCGGGGAAGCCATGGAGTAACAGAACCA
AAGGTCCTCGTTCTTCTCCTTTCTCAGCAACGTTTAACCAAATCCCGTTGGTCTTGATCT
TCTTCTCTCTCACTAAGCTTGTTGTCATGATTCTTGATCCTGATCC

QA 1 286 1 286
DS 



CO CL38Contig2 791 4 11 U
GGCTCTCACATCAGGATCAAGAATCATGACAACAAGCTTAGTGAGAGAGAAGAAGATCAA
GACCAACGGGATTTGGTTAAACGTTGCTGAGAAAGGAGACGAAGGAGGACCTTTGGTTCT
GTTACTCCACGGCTTCCCCGAGACATGGTTCTCGTGGCGTCACCAGATCGATTACTTGTC
GAGCAATGGCTACCACGTGGTCGCTCCAGACCTCAGAGGCTACGGTGACTCTGAGTTTCT
TCCGAGCTACGAGTCTTACACTGTGAGCCACCTTGTCGCTGATGTCATCGGTTTGCTTGA
TCACTACGGCACTGCTCAGGCTTTTGTGGCTGGACATGACTGGGGATCAGTTATAGGTTG
GTCTCTATGCTTGTTTAGACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCATAAGTCTCTCTGTTCCATA
TTCTCCAAGAGATCCAAACCTCAAACCTTCAGAGTTTTCCAAAACCTTTGGAGATGGGCT
ATACATCACTCAGTTTCAGAAACCTGGAAGAGCTGAGGCCGCATTTGCCAAGCATGATTG
CAAGACGGTTATGAAGAAGTTCTTGCTAACAACGAGAACAGATTTCATGGTGGCTCCTCC
CGGTACAGAGATCATCGATGATCTCGAGATTCCACCGAAGATTCCAGAGTGGATAACAGA
AGAGGAGATTCAGTTTATGCAGACAAGTTTCAGAGATCTGGATCACTGGTCCGTTGATTA
CTACAGAGCATGGATCTGACTGGGAGATTTGGCGCCGTGGGAAGCTCCAGATCTTGTTCC
GACAAAGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW63TF U 6
AF RR2CY27TF U 76
AF RR2F684TF U 6
AF RR2F481TF U 1
BS 1 185 RR2F481TF
BS 186 186 RR2CY27TF
BS 187 243 RR2F481TF
BS 244 244 RR2CY27TF
BS 245 436 RR2F481TF
BS 437 437 RR2CY27TF
BS 438 459 RR2F481TF
BS 460 460 RR2CY27TF
BS 461 664 RR2F481TF
BS 665 665 RR2CY27TF
BS 666 791 RR2F481TF

RD RR2BW63TF 625 0 0
GGAC
ATCAGGATCAAGAATCATGACAACAAGCTTAGTGAGAGAGAAGAAGATCAAGACCAATGG
GATTTGGTTAAACGTTGCTGAGAAAGGAGACGAAGGAGGACCTTTGGTTCTGTTACTCCA
CGGCTTCCCCGAGACATGGTTCTCGTGGCGTCACCAGATCGATTACTTGTCGAGCAATGG
CTACCACGTGGTCGCTCCAGACCTCAGAGGCTACGGTGACTCTGAGTTTCTTCCGAGCTA
CGAGTCTTACACTGTGAGCCACCTTGTCGCTGATGTCATCGGTTTGCTTGATCACTACGG
CACTGCTCAGGCTTTTGTGGCTGGACATGACTGGGGATCAGTTATAGGTTGGTCTCTATG
CTTGTTTAGACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCATAAGTCTCTCTGTTCCATATTCTCCAAG
AGATCCAAACCTCAAACCTTCAGAGTTTTCCAAAACCTTTGGAGATGGGCTATACATCAC
TCAGTTTCAGAAACCTGGAAGAGCTGAGGCCGCATTTGCCAAGCATGATTGCAAGACGGT
TATGAAGAAGTTCTTGCTAACAACGAGAACAGATTTCATGGTGGCTCCTCCCGGTACAGA
GATCATCGATGATCTCGAGAT

QA 5 625 5 625
DS 

RD RR2CY27TF 594 0 0
GTTAAACGTTGCTGAGAAAGGAGACGAAGGAGGACCTTTGGTTCTGTTACTCCACGGCTT
CCCCGAGACATGGTTCTCGTGGCGTCACCAGATCGATTACTTGTCGAGCAATGGCTACCA
CGTGGTCGCTCCAGACCTCAGAGGCTACGGTGACTCTGAGTTTCTTCCGAGCTACGAGTC
TTACACTGTGAGCCACCTTGTCGCTGATGTCATCGGTTTGCTTGATCACTACGGCACTGC
TCAGGCTTTTGTGGCTGGACATGACTGGGGATCAGTTATAGGTTGGTCTCTATGCTTGTT
TAGACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCATAAGTCTCTCTGTTCCATATTCTCCAAGAGATCC
AAACCTCAAACCTTCAGAGTTTTCCAAAACCTTTGGAGATGGGCTATACATCACTCAGTT
TCAGAAACCTGGAAGAGCTGAGGCCGCATTTGCCAAGCATGATTGCAAGACGGTTATGAA
GAAGTTCTTGCTAACAACGAGAACAGATTTCATGGTGGCTCCTCCCGGTACAGAGATCAT
CGATGATCTCGAGATTCCACCGAAGATTCCAGAGTGGATAACAGAAGAGGAGAT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2F684TF 664 0 0
GGAC
ATCAGGATCAAGAATCATGACAACAAGCTTAGTGAGAGAGAAGAAGATCAAGACCAACGG
GATTTGGTTAAACGTTGCTGAGAAAGGAGACGAAGGAGGACCTTTGGTTCTGTTACTCCA
CGGCTTCCCCGAGACATGGTTCTCGTGGCGTCACCAGATCGATTACTTGTCGAGCAATGG
CTACCACGTGGTCGCTCCAGACCTCAGAGGCTACGGTGACTCTGAGTTTCTTCCGAGCTA
CGAGTCTTACACTGTGAGCCACCTTGTCGCTGATGTCATCGGTTTGCTTGATCACTACAG
CACTGCTCAGGCTTTTGTGGCTGGACATGACTGGGGATCAGTTATAGGTTGGTCTCTATG
CTTGTTTAGACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCATAAGTCTCTCTGTTCCATATTCCCCAAG
AGATCCAAACCTCAAACCTTCAGAGTTTTCCAAAACCTTTGGAGATGGGCTATACATCAC
TCAGTTTCAGAAACCTGGAAGAGCTGAGGCCGCATTTGCCAAGCATGATTGCAAGACGGT
TATGAAGAAGTTCTTGCTAACAACGAGAACAGATTTCATGGCGGCTCCTCCCGGTACAGA
GATCATCGATGATCTCGAGATTCCACCGAAGATTCCAGAGTGGATAACAGAAGAGGAGAT

QA 5 664 5 664
DS 

RD RR2F481TF 791 0 0
GGCTCTCACATCAGGATCAAGAATCATGACAACAAGCTTAGTGAGAGAGAAGAAGATCAA
GACCAACGGGATTTGGTTAAACGTTGCTGAGAAAGGAGACGAAGGAGGACCTTTGGTTCT
GTTACTCCACGGCTTCCCCGAGACATGGTTCTCGTGGCGTCACCAGATCGATTACTTGTC
GAGCA*TGGCTACCACGTGGTCGCTCCAGACCTCAGAGGCTACGGTGACTCTGAGTTTCT
TCCTAGCTACGAGTCTTACACTGTGAGCCACCTTGTCGCTGATGTCATCGGTTTGCTTGA
TCACTACGGCACTGCTCAGGCTTTTGTGGCTGGACATGACTGGGGATCAGTTATAGGTTG
GTCTCTATGCTTGTTTAGACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCATAAGTCTCTCTGTTCCATA
TTCTCCAAGAGATCCAGACCTCAAACCTTCAGAGTTTTCTAAAACCTTTGGAGATGGGCT
ATACATCACTCAGTTTCAGAAACCTGGAAGAGCTGAGGCCGCATTTGCCAAGCATGATTG
CAAGACGGTTATGAAGAAGTTCTTGCTAACAACGAGAACAGATTTCATGGTGGCTCCTCC
CGGTACAGAGATCATCGATGATCTCGAGATTCCACCGAAGATTCCAGAGTGGATAACAGA
AGAG*AGATTCAGTTTATGCAGACAAGTTTCAGAGATCTGGATCACTGGTCCGTTGATTA
CTACAGAGCATGGATCTGACTGGGAGATTTGGCGCCGTGGGAAGCTCCAGATCTTGTTCC
GACAAAGTTAT

QA 1 791 1 791
DS 



AS 3 23

CO CL39Contig1 915 9 11 U
GGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTTTAGAGAAACTC
AAGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAA
TCTGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACGGAGACTGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAAC
TATGACCC*GCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCG
CCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGAT
GGGACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGT
TAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTTTTGGCTTCTGAGTCGGTCATCAAGCAGAT
TCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTTCCAACACTGGTGAGTCA
CCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACAGTGAAGTTCCAGTTGAA
GAAGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTT
TCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAAA
CGTAAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAGTTCT
CTACTCCTGTTATCTTGGAACTTTTGCTTTGTGGGTTTTGTTTTGTTTCAGAGATCTTGA
GTTATGGTTTTGTTTGATATTAGCAGAACTGAGGTGTTAGTTTGCTTTTTGTTAAGACAT
TATAATATGCAATGTTGGATTATACAATATCGACTCTCCAATTCAGTTTTATCTTATGAA
ATGCTTTCTAGTCCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN38TF U 1
AF RR2DD85TF U 1
AF RR2C010TF U 1
AF RR2CY09TF U 1
AF RR2B978TF U 1
AF RR2GN38JQ C 175
AF RR2FE07JQ C 23
AF RR2DD85JQ C 175
AF RR2C010JQ C 192
BS 1 149 RR2B978TF
BS 150 150 RR2GN38TF
BS 151 662 RR2B978TF
BS 663 709 RR2FE07JQ
BS 710 710 RR2DD85JQ
BS 711 814 RR2FE07JQ
BS 815 815 RR2DD85JQ
BS 816 861 RR2FE07JQ
BS 862 862 RR2C010JQ
BS 863 894 RR2FE07JQ
BS 895 915 RR2C010JQ

RD RR2GN38TF 635 0 0
GGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCATGTTCAGAGATTCGTCAACTTTAGAGAAACTC
AAGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAA
TCTGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACGGAGACTGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAAC
TATGACCC*GCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCG
CCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGAT
GGGACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGT
TAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTTTTGGCTTCTGAGTCGGTCATCAAGCAGAT
TCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTTCCAACACTGGTGAGTCA
CCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACAGTGAAGTTCCAGTTGAA
GAAGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTT
TCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2DD85TF 654 0 0
GGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTTTAGAGAAACTC
AAGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCTTCAAGGGCAAA
TCTGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACGGAGACTGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAAC
TATGACCC*GCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCCGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCG
CCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGAT
GGGACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGT
TAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTTTTGGCTTCTGAGTCGGTCATCAAGCAGAT
TCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTTCCAACACTGGTGAGTCA
CCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACAGTGAAGTTCCAGTTGAA
GAAGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGAAAGAGAAGCAGCTCTT
TCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGA
GATTGGC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2C010TF 645 0 0
GGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTTTAGAGAAACTC
AAGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAA
TCTGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACGGAGACTGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAAC
TATGACCC*GCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCG
CCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGAT
GGGACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGT
TAAGAAGCTTGTCAAGAAGTACCATGCTTTTTTGGCTTCTGAGTCGGTCATCAAGCAGAT
TCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTTCCAACACTGGTGAGTCA
CCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACAGTGAAGTTCCAGTTGAA
GAAGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTT
TCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2CY09TF 659 0 0
GGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTTTAGAGAAACTC
AAGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAA
TCTGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACGGAGACTGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAAC
TATGACCC*GCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCG
CCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGAT
GGGACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGT
TAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTTTTGGCTTCTGAGTCGGTCATCAAGCAGAT
TCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTTCCAACACTGGTGAGTCA
CCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGATAGTGAAGTTCCAGTTGAA
GAAGGTTCTTTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTT
TCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2B978TF 662 0 0
GGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTTTAGAGAAACTC
AAGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAA
TCTGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACGGATACTGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAAC
TATGACCC*GCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCG
CCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGAT
GGGACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGT
TAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTTTTGGCTTCTGAGTCGGTCATCAAGCAGAT
TCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTTCCAACACTGGTGAGTCA
CCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACAGTGAAGTTCCAGTTGAA
GAAGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTT
TCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAAA
CG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2GN38JQ 633 0 0
AAGAACTATGACCCCGCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACAT
TCCTCGCCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGA
GAAGATGGGACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAA
GCTTGTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTTTTGGCTTCTGAGTCGGTCATCAA
GCAGATTCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTTCCAACACTGGT
GAGTCACCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACAGTGAAGTTCCA
GTTGAAGAAGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCA
GCTCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTG
GCAAAACGTAAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTG
AGTTCTCTACTCCTGTTATCTTGGAACTTTTGCTTTGTGGGTTTTGTTTTGTTTCAGAGA
TCTTGAGTTATGGTTTTGTTTGATATTAGCAGA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2FE07JQ 872 0 0
CTTTCAGGTTCAGAGAT*CGTCAACTT*AGAGAAACTCAAGATGAGTAAGCTTCAGAGCG
AGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAATCTGAGGAGAAGAAGCGTAACT
TTACGGAGACTGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAACTATGACCC*GCAAAAGGACAAG
CGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCGCCCTAAGATGAAGGTCTGCATG
CTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGGTGGGACTAGACTCTATGGATGTT
GAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTAC
CATGCTTTTTTGGCTTCTGAGTCGGTCATCAAGCAGATACCCCGTCTTCTTGGTCCTGGT
CTTAACAAAGCAGGAAAGTTTCCAACACTGGTGAGTCACCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAG
GTGAACGAGACCAAAGCGACAGTGAAGTTCCAGTTGAAGAAGGTTCTGTGTATGGGTGTT
GCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCATC
GACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAAACTTAAGGTGTTTGTACTTGAAG
AGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCCTTTGAGTTCTCTACTCCTGTTATCTTGGAACT
TTTGCTTTGTGGGTTTTGTTTTGTTTCAGAGATCTTGAGTTATGGTTTTGTTTGATATTA
GCAGAACTGAGGCGTTAGTTTGCTTTTTGTTAAGACATTATAATATGCAATGTTGGATTC
TACAATATCGACTCTCCAATTCAGTTTTATCT

QA 1 872 1 872
DS 

RD RR2DD85JQ 691 0 0
AAGAACTATGACCC*GCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCCGTCAAGCTCCCGCACAT
TCCTCGCCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGA
GAAGATGGGACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAA
GCTTGTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTTTTGGCTTCTGAGTCGGTCATCAA
GCAGATTCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTTCCAACACTGGT
GAGTCACCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACAGTGAAGTTCCA
GTTGAAGAAGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGAAAGAGAAGCA
GCTCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTG
GCAAAACGTAAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTG
AGTTCTCTACTCCTGTTATCTTGGAACTTTTGCTTTGTGGGTTTTGTTTTGTTTCAGAGA
TCTTGAGTTATGGTTTTGTTTGATATTAGCAGAACTGAGGTGTTAGTTTGCTTTTTGTTA
AGACATTATAATATGCAATGTTGGATT
CTAC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2C010JQ 724 0 0
AAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCTGTCAAGCTCCCGCACATTCCTCGCCCTAAGATGA
AGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGATGGGACTAGACT
CTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTTG
TCAAGAAGTACCATGCTTTTTTGGCTTCTGAGTCGGTCATCAAGCAGATTCCCCGTCTTC
TTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTTCCAACACTGGTGAGTCACCAAGAGTCGT
TGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACAGTGAAGTTCCAGTTGAAGAAGGTTCTGT
GTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTTTCAGAATGTTC
AGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAAACGTAAGGTGTT
TGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAGTTCTCTACTCCTGTT
ATCTTGGAACTTTTGCTTTGTGGGTTTTGTTTTGTTTCAGAGATCTTGAGTTATGGTTTT
GTTTGATATTAGCAGAACTGAGGTGTTAGTTTGCTTTTTGTTAAGACATTATAATATGCA
ATGTTGGATTATACAATATCGACTCTCCAATTCAGTTTTATCTTATGAAATGCTTTCTAG
TCCC

QA 1 724 1 724
DS 



CO CL39Contig2 869 10 19 U
GGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTGAGAGAAACTCA
AGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAAT
CCGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACTGAGACTATTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAACT
ATGACCCACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCCGTCAAGCTCCCTCACATTCCTCGTC
CTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGATGG
GACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGTTA
AGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCCGTCATCAAGCAGATTC
CCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCACC
AAGAGTCCTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAGGCTACGGTGAAGTTCCAGCTGAAGA
AGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTTCC
AGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAAACG
TGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAGTTCTCG
ACTCTTGTCATCTTGGAACTTTTGCTTTGTGGTTTTTGTTTGCTTCAGAGATCTTGAGTT
ATGGTTTTGTTTGATATTAGCAGAACTGAGGTGTTAGTTTGCTTTTTGTTAAGACATTAT
AATATGCAATGTTGGATTTTACAATATCG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 15 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C444TF U 216
AF RR2FO30TF U 1
AF RR2E208TF U 1
AF RR2CJ71TF U 1
AF RR2GW63TF U 1
AF RR2FO30JQ C 442
AF RR2FA29TF U 1
AF RR2FA29JQ C 681
AF RR2GW63JQ C 53
AF RR2CJ71JQ C 174
BS 1 70 RR2CJ71TF
BS 71 71 RR2E208TF
BS 72 564 RR2CJ71TF
BS 565 565 RR2E208TF
BS 566 657 RR2CJ71TF
BS 658 658 RR2GW63TF
BS 659 693 RR2CJ71TF
BS 694 694 RR2FA29TF
BS 695 704 RR2CJ71TF
BS 705 715 RR2FA29TF
BS 716 716 RR2GW63JQ
BS 717 737 RR2FA29TF
BS 738 738 RR2GW63JQ
BS 739 756 RR2FA29TF
BS 757 759 RR2GW63JQ
BS 760 783 RR2FA29TF
BS 784 821 RR2GW63JQ
BS 822 822 RR2CJ71JQ
BS 823 869 RR2GW63JQ

RD RR2C444TF 165 0 0
GTCC
AGCTCCCTCACATTCCTCGTCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGGGATGCTCAGCCTG
TTGAGGAGGCTGAGAAGATGGGACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCA
GCAAGAACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTAC

QA 5 165 5 165
DS 

RD RR2FO30TF 511 0 0
GGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTGAGAGAAACTCA
AGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAAT
CCGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACTGAGACTATTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAACT
ATGACCCACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCCGTCAAGCTCCCTCACATTCCTCGTC
CTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGATGG
GACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGTTA
AGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCCGTCATCAAGCAGATTC
CCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCACC
AAGAGTCCTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGAC

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2E208TF 652 0 0
GGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTGAGAGAAACTCA
AGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAAT
CCGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACTGAGACTATTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAACT
ATGACCCACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCCGTCAAGCTCCCTCACATTCCTCGTC
CTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGATGG
GACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGTTA
AGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCCGTCATCAAGCAGATTC
CCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCACC
AAGAGTCCTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAGGCTACGGTGAAGTTTCAGCTGAAGA
AGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTTCC
AGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2CJ71TF 704 0 0
GGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTGAGAGAAACTCA
AGATGAGTAATCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAAT
CCGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACTGAGACTATTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAACT
ATGACCCACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCCGTCAAGCTCCCTCACATTCCTCGTC
CTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGATGG
GACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGTTA
AGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCCGTCATCAAGCAGATTC
CCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCACC
AAGAGTCCTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAGGCTACGGTGAAGTTCCAGCTGAAGA
AGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGCTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTTCC
AGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAA*CG
TGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGAC*ACCACAGAGA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2GW63TF 714 0 0
GGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTGAGAGAAACTCA
AGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAAT
CCGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACTGAGACTATTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAACT
ATGACCCACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCCGTCAAGCTCCCTCACATTCCTCGTC
CTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGATGG
GACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTCTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGTTA
AGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCCGTCATCAAGCAGATTC
CCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCACC
AAGAGTCCTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAGGCTACGGTGAAGTTCCAGCTGAAGA
AGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTTCC
AGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAAACG
TGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2FO30JQ 274 0 0
TTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCACCAAGAGTCCTTGGAAGGGAAGG
TGAACGAGACCAAGGTTACGGTGAAGTTCCAGCTGAAGAAGGTTCTGTGTATGGGTGTTG
CTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGTTTTTCCAGAATGTTCAGATGAGCATCA
ACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGA
GCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAGT

QA 1 274 1 274
DS 

RD RR2FA29TF 783 0 0
GGAAGGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTGAGAGAAACTCA
AGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGCAAAT
CCGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACTGAGACTATTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAGAACT
ATGACCCACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGTATCCGTCAAGCTCCCTCACATTCCTCGTC
CTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCGGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGATGG
GACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGTTA
AGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCCGTCATCAAGCAGATTC
CCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGTCACC
AAGAGTCCTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAGGCTACGGTGAAGTTCCAGCTGAAGA
AGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTTCC
AGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAAA*CG
TGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAGT*CTCG
ACTCTTGTCATCTTGGA*CTTTTGCTTTGTGGTTTTG**TTGCTTCAGAGATCTTGAGTT
ATG

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2FA29JQ 115 0 0
AGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAGTTCTCGACTCTTGTCATCTTGGAACT
TTTGCTTTGTGGTTTTTGTTTGCTTCAGAGATCTTGAGTTATGGTTTTGTTTG
CT

QA 1 113 1 113
DS 

RD RR2GW63JQ 817 0 0
AG
AACTCAAGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGG
GCAAATCCGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACTGAGACTATTGAGCTTCAGATTGGTCTGA
AGAACTATGACCCACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCCGTCAAGCTCCCTCACATTC
CTCGTCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGA
AGATGGGACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTCTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGC
TTGTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCCGTCATCAAGC
AGATTCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGA
GTCACCAAGAGTCCTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAGGCTACGGTGAAGTTCCAGC
TGAAGAAGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGC
TCTTCCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGC
AAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAG
TTCTCGACTCTTGTCATCTTGGAACTTTTGCTTTGTGGTTTTTGTTTGCTTCAGAGATCT
TGAGTTATGGTTTTGTTTGATATTAGCAGAACTGAGGTGTTAGTTTGTTTTTTGTTAAGA
CATTATAATATGCAATGTTGGATTTTACAATATCG

QA 3 817 3 817
DS 

RD RR2CJ71JQ 689 0 0
AAGAACTATGACCCACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCCGTCAAGCTCCCTCACATT
CCTCGTCCTAAGATGAAGGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAG
AAGATGGGACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAG
CTTGTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCCGTCATCAAG
CAGATTCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTG
AGTCACCAAGAGTCCTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAGGCTACGGTGAAGTTCCAG
CTGAAGAAGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGCTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAG
CTCTTCCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGG
CAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGA
GTTCTCGACTCTTGTCATCTTGGAACTTTTGCTTTGTGGTTTTTGTTTGCTTCAGAGATC
TTGAGTTATGGTTTTGTTTGATATTAGCAGAACTGAGGTGTTAGTTTGCTTTTTGTTAAG
ACATTATAATATGCAATGTTGGATT
TTAC

QA 1 685 1 685
DS 



CO CL39Contig3 684 4 13 U
GGAAGCCGCCTTGAAGCAGGTCGAGTGCTTCTTCCTCTGTTTCACCCTCTCAGACACAAA
GATTCGTCAATTCAGAGAAACTCAAGATGAGTAAGCTACAAAGTGAGGTACTTAGAGAAG
GAATCGCAGCTGTTAAGAGCAAAGCTGATGAGAAAAAACGCAACTTTGTTGAGACAGTTG
AGCTCCAGATTGGTCTCAAGAACTATGACCCACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGTTCTG
TCAAGCTCCCTCACATTCCTCGCCCTAAAATGAAGATCTGTATGCTCGGAGATGCCCAGC
ATGTCGAGGAGGCTGAGAAGATTGGACTAGACTATATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGC
TCAACAAGAACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCCTGGCTT
CTGAGTCCGTCATTAAGCAGATCCCTCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAGGCAGGAA
AGTTCCCTACACTAGTGAGTCACCAGGAGTCGTTGGAAGGAAAGGTGAATGAAACCAAAG
CGACAGTGAAGTTCCAGTTGAAGAAGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTT
CCATGGAAGAGAAGCAGCTCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCGTTAACTTCCTTGTCTCGC
TCTTGAAGAAGATTGGCAAACGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 0 0 0 25 25 0 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 0 25 25 25 25 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD63TF U 1
AF RR2H692TF U 7
AF RR2DH11TF U 29
AF RR2E253TF U 29
BS 1 22 RR2GD63TF
BS 23 23 RR2H692TF
BS 24 69 RR2GD63TF
BS 70 70 RR2H692TF
BS 71 72 RR2GD63TF
BS 73 73 RR2H692TF
BS 74 442 RR2GD63TF
BS 443 443 RR2H692TF
BS 444 661 RR2GD63TF
BS 662 662 RR2H692TF
BS 663 666 RR2GD63TF
BS 667 667 RR2DH11TF
BS 668 684 RR2E253TF

RD RR2GD63TF 669 0 0
GGAAGCCGCCTTGAAGCAGGTCTAGTGCTTCTTCCTCTGTTTCACCCTCTCAGACACAAA
GATTCGTCAGTTGAGAGAAACTCAAGATGAGTAAGCTACAAAGTGAGGTACTTAGAGAAG
GAATCGCAGCTGTTAAGAGCAAAGCTGATGAGAAAAAACGCAACTTTGTTGAGACAGTTG
AGCTCCAGATTGGTCTCAAGAACTATGACCCACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGTTCTG
TCAAGCTCCCTCACATTCCTCGCCCTAAAATGAAGATCTGTATGCTCGGAGATGCCCAGC
ATGTCGAGGAGGCTGAGAAGATTGGACTAGACTATATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGC
TCAACAAGAACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCCTGGCTT
CTGAGTCCGTCATTAAGCAGATTCCTCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAGGCAGGAA
AGTTCCCTACACTAGTGAGTCACCAGGAGTCGTTGGAAGGAAAGGTGAATGAAACCAAAG
CGACAGTGAAGTTCCAGTTGAAGAAGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTT
CCATGGAAGAGAAGCAGCTCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCGTTAACTTCCTTGTCTCGC
TGTTGA
GAG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2H692TF 660 0 0
G
GCCTTGAAGCAGG*CGAGTGGTTCTTCCTCTGTTTCTCCCTCTCAGGTTCAGAGATTCGT
CAATTCAGAGAAACTCAAGATGAGTAAGCTTCAAAGTGAGGTACTTAGAGAAGGAATCGC
AGCTGTTAAGGGCAAAGCTGATGAGAAGAAACGCAACTTTGTCGAGACAGTTGAGCTTCA
GATTGGTCTCAAGAACTATGACCCACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGTTCTGTCAAGCT
CCCTCACATTCCTCGCCCTAAAATGAAGATCTGTATGCTCGGAGATGCTCAGCATGTTGA
GGAGGCTGAGAAGATTGGACTAGACTATATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAA
GAACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCCTGGCTTCTGAATC
CGTCATTAAGCAGATCCCTCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAGGCAGGCAAGTTCCC
TACTCTAGTGAGTCACCAGGAGTCGTTGGAAGGAAAGGTGAATGAGACCAAAGCGACAGT
GAGGTTCCAGTTGAAGAAG*TTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGA
AGAGAAGCAGCTCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCGTTAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGA

QA 2 660 2 660
DS 

RD RR2DH11TF 639 0 0
TTT
TTCCTCTGTTTCACCCTCTTAGGTTCAGAGATTCGTTAATTCAGAGAAACTCAAGATGAG
TAAGCTACAAAGTGAGGTACTTAGAGAAGGAATCGCAGCTGTTAAGGGCAAAGCTGATGA
GAAAAAACGCAACTTTGTTGAGACAGTTGAGCTTCAGATTGGTCTCAAGAACTATGACCC
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGTTCCGTCAAGCTCCCTCACATTCCTCGCCCTAAAAT
GAAGATCTGTATGCTCGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAGATTGGACTAGA
CTATATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCT
TGCCAAGAAGTACCATGCTTTCCTGGCTTCTGAGTCCGTCATTAAGCAGATCCCTCGTCT
TCTTGGTCCTGGTCTTAATAAGGCAGGAAGGTTCCCTACACTAGTGAGTCACCAGGAGTC
GTTGGAAGGAAAGGTGAATGAGACCAAAGCGACAGTGAAGTTCCAGTTGAAGAAGGTTCT
GTGCATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTTTCAGAATGT
TCAGATGAGCGTTAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAA

QA 4 639 4 639
DS 

RD RR2E253TF 656 0 0
GGT
TTCCTCTGTTTCACCCTCTCAGACACAAAGATTCGTCAGTTGAGAGAAACTCAAGATGAG
TAAGCTACAAAGTGAGGTACTTAGAGAAGGAATCGCAGCTGTTAAGAGCAAAGCTGATGA
GAAAAAACGCAACTTTGTTGAGACAGTTGAGCTCCAGATTGGTCTCAAGAACTATGACCC
ACAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGTTCTGTCAAGCTCCCTCACATTCCTCGCCCTAAAAT
GAAGATCTGTATGCTCGGAGATGCCCAGCATGTCGAGGAGGCTGAGAAGATTGGACTAGA
CTATATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCT
TGCCAAGAAGTACCATGCTTTCCTGGCTTCTGAGTCCGTCATTAAGCAGATTCCTCGTCT
TCTTGGTCCTGGTCTTAACAAGGCAGGAAAGTTCCCTACACTAGTGAGTCACCAGGAGTC
GTTGGAAGGAAAGGTGAATGAAACCAAAGCGACAGTGAAGTTCCAGTTGAAGAAGGTTCT
GTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTCTTTCAGAATGT
TCAGATGAGCGTTAACTTCCTTGTCTCGCTGTTGAAGAAGATTGGCAAACGTG

QA 4 656 4 656
DS 



AS 5 27

CO CL40Contig1 666 2 12 U
GTGACCTAGAGTTTCAGCTGCTTCACCTCACCAGATTTTGAGCGGAAAGGAATCGTTCAG
AGCAATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACGACGAAGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTT
GAAGGCTGCAAAGGCAGTGAAGTCAGGCCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAG
GACTAAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCTAGAGATCCCAAGTACCC
GAGGATCAGCGCTACACCGAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACT
CACCACTGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGA
CATTCGTGCTGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAGATGTATGACATCCAGAC
CAAGAAGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTAC
ACCGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTAT
CTCTGCTATTATAAAAACAGACTTGTGTTTTTGTTTCTTTGGTAGTTTCTGTTTTTACAA
TACATTCTTGTTTCTCTGGTTTTGATTCTATCTTACAACAAAACACTCTTGTGAACTTCC
AAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ79TF U 1
AF RR2F464TF U 20
BS 1 45 RR2BQ79TF
BS 46 46 RR2F464TF
BS 47 105 RR2BQ79TF
BS 106 106 RR2F464TF
BS 107 215 RR2BQ79TF
BS 216 216 RR2F464TF
BS 217 556 RR2BQ79TF
BS 557 557 RR2F464TF
BS 558 637 RR2BQ79TF
BS 638 640 RR2F464TF
BS 641 658 RR2BQ79TF
BS 659 666 RR2F464TF

RD RR2BQ79TF 658 0 0
GTGACCTAGAGTTTCAGCTGCTTCACCTCACCAGATTTTGAGCGGGAAGGAATCGTTCAG
AGCAATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACGACGAAGAAGGCTGACCCTAAAGCCAAGGCCTT
GAAGGCTGCAAAGGCAGTGAAGTCAGGCCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAG
GACTAAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGATCAAGGCTAGAGATCCCAAGTACCC
GAGGATCAGCGCTACACCGAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACT
CACCACTGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGA
CATTCGTGCTGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAGATGTATGACATCCAGAC
CAAGAAGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTAC
ACCGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTAT
CTCTGCTATTATAAAA*CAGACTTGTGTTTTTGTTTCTTTGGTAGTTTCTGTTTTTACAA
TACATTCTTGTTTCTCTGGTTTTGATTCTATCTTACAC**AAACACTCTTGTGAACTT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2F464TF 647 0 0
GCTTCACCTCACCAGATTTTGAGCGGAAAGGAATCGTTCAGAGCAATGTCTCCGGCTAAA
GTTGATACGACGAAGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCTGCAAAGGCAGTG
AAGTCAGGCCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTAAGGTCACCTTCCAC
AGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCTAGAGATCCCAAGTACCCGAGGATCAGCGCTACACCG
AGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCTGCAATG
AAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACATTCGTGCTGACAAGAAG
AAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAGATGTATGACATCCAGACCAAGAAGGTCAACACCCTC
ATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTTG
GATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCTGCTATTATAAAAACA
GACTTGTGTTTTTGTTTCTTTGGTAGTTTCTGTTTTTACAATACATTCTTGTTTCTCTGG
TTTTGATTCTATCTTACAACAAAACACTCTTGTGAACTTCCAAAATG

QA 1 647 1 647
DS 



CO CL40Contig2 682 8 10 U
GGAGAGTTTCAGCTGCTTCACCTCACCAGATTTTGAGCGGGAAGGAATCGTTTCAGAGAA
ATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACGACGAAGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAG
GCTGCAAAGGCAGTGAAGTCTGGGCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACT
AAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCCAGAGATCCCAAGTACCCGAGG
ATCAGCGCTACTCCGAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACC
ACTGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATCGTTGACATT
CGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAG
AAGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCG
GACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCT
GCTATTATAAAAACAGACATGTGGTTTTGTTTCTCTGGTAGTTTCTGTTTTTTTTACAAA
ACATTCTTGTTACATGTTGAATTCAAGTTCTCCGTTTTTGAATTTGCTTCTCGACAATCT
TACAACAAAACACTCTTATAGG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2FP01JQ C 348
AF RR2AO78JQ C 15
AF RR2AO78TF U 15
AF RR2B568JQ C 15
AF RR2B568TF U 15
AF RR2BU39JQ C 1
AF RR2FP01TF U 1
AF RR2BU39TF U 1
BS 1 14 RR2FP01TF
BS 15 381 RR2AO78TF
BS 382 382 RR2B568TF
BS 383 640 RR2AO78TF
BS 641 648 RR2B568TF
BS 649 666 RR2FP01TF
BS 667 669 RR2BU39TF
BS 670 670 RR2BU39JQ
BS 671 681 RR2BU39TF
BS 682 682 RR2BU39JQ

RD RR2FP01JQ 171 0 0
CATCGTTGACATTCGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGA
CATCCAGACCAAGAAGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAAAGAAGAAGGCTTACGT
TAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCAT

QA 1 171 1 171
DS 

RD RR2AO78JQ 626 0 0
GCTTCACCTCACCAGATTTTGAGCGGGAAGGAATCGTTTCAGAGAAATGTCTCCGGCTAA
AGTTGATACGACGAAGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCTGCAAAGGCAGT
GAAGTCTGGGCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTAAGGTCACCTTCCA
CAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCCAGAGATCCCAAGTACCCGAGGATCAGCGCTACTCC
GAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTTTGCAAT
GAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATCGTTGACATTCGTGCCGACAAGAA
GAAGATCGAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGAAGGTCAACACCCT
CATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTT
GGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCTGCTATTATAAAAAC
AGACATGTGGTTTTGTTTCTCTGGTAGTTTCTGTTTTTTTTACAAAACATTCTTGTTACA
TGTTGAATTCAAGTTCTCCGTTTTTG

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2AO78TF 626 0 0
GCTTCACCTCACCAGATTTTGAGCGGGAAGGAATCGTTTCAGAGAAATGTCTCCGGCTAA
AGTTGATACGACGAAGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCTGCAAAGGCAGT
GAAGTCTGGGCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTAAGGTCACCTTCCA
CAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCCAGAGATCCCAAGTACCCGAGGATCAGCGCTACTCC
GAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCTGCAAT
GAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATCGTTGACATTCGTGCCGACAAGAA
GAAGATCGAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGAAGGTCAACACCCT
CATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTT
GGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCTGCTATTATAAAAAC
AGACATGTGGTTTTGTTTCTCTGGTAGTTTCTGTTTTTTTTACAAAACATTCTTGTTACA
TGTTGAATTCAAGTTCTCCGTTTTTG

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2B568JQ 634 0 0
GCTTCACCTCACCAGATTTTGAGCGGGAAGGAATCGTTTCAGAGAAATGTCTCCGGCTAA
AGTTGATACGACGAAGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCTGCAAAGGCAGT
GAAGTCTGGGCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTAAGGTCACCTTCCA
CAGGCCAAAGACTTTGAC*AAGGCCAGAGATCCCAAGTACCCGAGGATCAGCGCTACTCC
GAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCTGCAAT
GAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATCGTTGACATTCGTGCCGACAAGAA
GAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGAAGGTCAACACCCT
CATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTT
GGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCCATCTCTGCTATTATAAAAAC
AGACATGTGGTTTTGTTTCTCTGGTAGTTTCTGTTTTTTTTACAAAACATTCTTGTTACA
TGTTGAATTCAAGTTCTCCGTTTTTGAATTTGCT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2B568TF 634 0 0
GCTTCACCTCACCAGATTTTGAGCGGGAAGGAATCGTTTCAGAGAAATGTCTCCGGCTAA
AGTTGATACGACGAAGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCTGCAAAGGCAGT
GAAGTCTGGGCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTAAGGTCACCTTCCA
CAGGCCAAAGACTTTGAC*AAGGCCAGAGATCCCAAGTACCCGAGGATCAGCGCTACTCC
GAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCTGCAAT
GAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATCGTTGACATTCGTGCCGACAAGAA
GAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGAAGGTCAACACCCT
CATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTT
GGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCCATCTCTGCTATTATAAAAAC
AGACATGTGGTTTTGTTTCTCTGGTAGTTTCTGTTTTTTTTACAAAACATTCTTGTTACA
TGTTGAATTCAAGTTCTCCGTTTTTGAATTTGCT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2BU39JQ 682 0 0
GGAGAGTTTCAGCTGCTTCACCTCACCAGATTTTGAGCGGGAAGGAATCGTTTCAGAGAA
ATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACGACGAAGAAGGCTGGCCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAG
GCTGCAAAGGCAGTGAAGTCTGGGCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACT
AAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCCAGAGATCCCAAGTACCCGAGG
ATCAGCGCTACTCCGAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACC
ACTGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATCGTTGACATT
CGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAG
AAGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCG
GACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCT
GCTATTATAAAAACAGACATGTGGTTTTGTTTCTCTGGTAGTTTCTGTTTTTTTTACAAA
ACATTCTTGTTACATGTTGAATTCAAGTTCTCCGTTTTTGAATTTGCTTCTCGACAATCT
TACAACAAAACACTCTTATAGG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2FP01TF 666 0 0
GGAGAGTTTCAGCTGCTTCACCTCACCAGATTTTGAGCGGGAAGGAATCGTTTCAGAGAA
ATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACGACGAAGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAG
GCTGCAAAGGCAGTGAAGTCTGGGCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACT
AAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCCAGAGATCCCAAGTACCCGAGG
ATCAGCGCTACTCCGAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACC
ACCGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATCGTTGACATT
CGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAG
AAGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCG
GACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCT
GCTATTATAAAAACAGACATGTGGTTTTGTTTCTCTGGTAGTTTCTGTTTTTTTTACAAA
ACATTCTTGTTACATGTTGAATTCAAGTTCTCCGTTTTTGAATTTGCTTCTCGACAATCT
TACAAC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2BU39TF 681 0 0
GGAGAGTTTCAGCTGCTTCACCTCACCAGATTTTGAGCGGGAAGGAATCGTTTCAGAGAA
ATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACGACGAAGAAGGCTGGCCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAG
GCTGCAAAGGCAGTGAAGTCTGGGCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACT
AAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCCAGAGATCCCAAGTACCCGAGG
ATCAGCGCTACTCCGAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACC
ACTGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATCGTTGACATT
CGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAG
AAGGGCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCG
GACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCT
GCTATTATAAAAACAGACATGTGGTTTTGTTTCTCTGGTAGTTTCTGTTTTTTTTACAAA
ACATTCTTGTTACATGTTGAATTCAAGTTCTCCGTTTTTGAATTTGCTTCTCGACAATCT
TACAACAAA*CACTCTTATAG

QA 1 681 1 681
DS 



CO CL40Contig3 684 7 2 U
GGAGAGTTTCAGCTGCTTCACCTTCACCAGATTTCGAGCGGGAAGGAATCGTTCAAAGCA
ATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACGACGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCT
GCAAAGGCAGTGAAGTCTGGCCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTAAG
GTCACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCTAGAGATCCCAAGTACCCGAGGATC
AGTGCTACTCCGAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACT
GAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACATTCGT
GCTGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGAAG
GTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGAC
TATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCTGCT
ATTATAAAAACAGATTTGTGGTTTTGTTTCGCTGGTAGTTTCTGTTTTTAAAATACATTC
TTGTTTCTCTGGTTTTGATTCTATCTTACAACAAAACACTCTTGTGAACTTCCAAAATGA
AACTATTCTGTCAATGGACGAGCT


BQ
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2C292JQ C 1
AF RR2C292TF U 1
AF RR2DF11TF U 1
AF RR2CO89JQ C 31
AF RR2F070JQ C 26
AF RR2CO89TF U -5
AF RR2F070TF U 15
BS 1 640 RR2C292TF
BS 641 684 RR2DF11TF

RD RR2C292JQ 602 0 0
GGAGAGTTTCAGCTGCTTCACCTTCACCAGATTTCGAGCGGGAAGGAATCGTTCAAAGCA
ATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACGACGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCT
GCAAAGGCAGTGAAGTCTGGCCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTAAG
GTCACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCTAGAGATCCCAAGTACCCGAGGATC
AGTGCTACTCCGAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACT
GAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACATTCGT
GCTGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGAAG
GTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGAC
TATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCTGCT
ATTATAAAAACAGATTTGTGGTTTTGTTTCGCTGGTAGTTTCTGTTTTTAAAATACATTC
TT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2C292TF 647 0 0
GGAGAGTTTCAGCTGCTTCACCTTCACCAGATTTCGAGCGGGAAGGAATCGTTCAAAGCA
ATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACGACGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCT
GCAAAGGCAGTGAAGTCTGGCCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTAAG
GTCACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCTAGAGATCCCAAGTACCCGAGGATC
AGTGCTACTCCGAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACT
GAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACATTCGT
GCTGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGAAG
GTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGAC
TATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCTGCT
ATTATAAAAACAGATTTGTGGTTTTGTTTCGCTGGTAGTTTCTGTTTTTAAAATACATTC
TTGTTTCTCTGGTTTTGATTCTATCTTACAACAAAACACT
AAAAAAA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2DF11TF 684 0 0
GGAGAGTTTCAGCTGCTTCACCTTCACCAGATTTCGAGCGGGAAGGAATCGTTCAAAGCA
ATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACGACGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCT
GCAAAGGCAGTGAAGTCTGGCCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTAAG
GTCACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCTAGAGATCCCAAGTACCCGAGGATC
AGTGCTACTCCG**GAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACT
GAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGCCTTCATTGTTGACATTCGT
GCTGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGAAG
GTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGAC
TATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCTGCT
ATTATAAAAACAGATTTGTGGTTTTGTTTCGCTGGTAGTTTCTGTTTTTAAAATACATTC
TTGTTTCTCTGGTTTTGATTCTATCTTACAACAAAACACTCTTGTGAACTTCCAAAATGA
AACTATTCTGTCAATGGACGAGCT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2CO89JQ 653 0 0
ATTTCGAGCGGGAAGGAATCGTTCAAAGCAATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACGACGAAG
GCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCTGCAAAGGCAGTGGAGTCTGGCCAAGCTTTC
AAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTAAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACC
AAGGCTAGAGATCCCAAGTACCCGAGGATCAGTGCTACTCCGAGGAACAAGTTGGACCAT
TACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAAC
AACACTCTTGTTTTCATTGTTGACATTCGTGCTGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTT
AAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGAAGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACG
AAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATC
GGCATCATTTAAGTTTTATCTATTTCTGCTATTATAAAAACAGATTTGTGGTTTTGTTTC
GCTGGTAGTTTCTGTTTTTAAAATACATTCTTGTTTCTCTGGTTTTGATTCTATCTTACA
ACAAAACACTCTTGTGAACTTCCAAAATGAAACTATTCTGTCAATGGACGAGC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2F070JQ 647 0 0
ACCAGATTTCGAGCGGGAAGGAATCGTTCAAAGCAATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACGA
CGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCTGCAAAGGCAGTGAAGTCTGGCCAAG
CTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTAAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACTT
TGACCAAGGCTAGAGATCCCAAGTACCCGAGGATCAGTGCTACTCCGAGGAACAAGTTGG
ACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAG
ACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACATTCGTGCTGACAAGAAGAAGATCAAGGATG
CTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGAAGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATG
GAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACA
AGATCGGCATCATTTAAGTTTTATCTATTTCTGCTATTATAAAAACAGATTTGTGGTTTT
GTTTCGCTGGTAGTTTCTGTTTTTAAAATACATTCTTGTTTCTCTGGTTTTGATTCTATC
TTACAACAAAACACTCTTGTGAACTTCCAAAATGAAACTATTCTGTC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2CO89TF 689 0 0
GGGACCTT
AGAGTTTCAGCTGCTTCACCTTCACCAGATTTCGAGCGGGAAGGAATCGTTCAAAGCAAT
GTCTCCGGCTAAAGTTGATACGACGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCTGC
AAAGGCAGTGGAGTCTGGCCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTAAGGT
CACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCTAGAGATCCCAAGTACCCGAGGATCAG
TGCTACTCCGAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGA
GTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACATTCGTGC
TGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGAAGGT
CAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTA
TGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCTGCTAT
TATAAAAACAGATTTGTGGTTTTGTTTCGCTGGTAGTTTCTGTTTTTAAAATACATTCTT
GTTTCTCTGGTTTTGATTCTATCTTACAACAAAACACTCTTGTGAACTTCCAAA*TGAAA
CTATTCTGTCAATGGACGAGC

QA 9 689 9 689
DS 

RD RR2F070TF 658 0 0
GCTTCACCTTCACCAGATTTCGAGCGGGAAGGAATCGTTCAAAGCAATGTCTCCGGCTAA
AGTTGATACGACGAAGGCTGACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCTGCAAAGGCAGTGAA
GTCTGGCCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTAAGGTCACCTTCCACAG
GCCAAAGACTTTGACCAAGGCTAGAGATCCCAAGTACCCGAGGATCAGTGCTACTCCGAG
GAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCTGCAATGAA
GAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACATTCGTGCTGACAAGAAGAA
GATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGAAGGTCAACACCCTCAT
CAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTTGGA
TGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCTGCTATTATAAAAACAGA
TTTGTGGTTTTGTTTCGCTGGTAGTTTCTGTTTTTAAAATACATTCTTGTTTCTCTGGTT
TTGATTCTATCTTACAACAAAACACTCTTGTGAACTTCCAAAATGAAACTATTCTGTC

QA 1 658 1 658
DS 



CO CL40Contig4 678 8 2 U
GGAGGGTTTCAGCTGCTTCAACCTCTCTCCAGATTTAGTGTCGGAAGGATCGTTCAGAAG
CAATGTCTCCGGCTAAAGTTGATGCCACGAAGAAGGCCGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGA
AGGCTGCGAAGGCAGTGAAGTCTGGCCAAGCCTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGA
CAAAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACCTTGACCAAGGCCAGAGACCCCAAGTACCCAA
GGATCAGTGCTACTCCCAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCA
CCACTGAGTCTGCGATGAAGAAGATTGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACA
TTCGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAAAAGATGTATGACATTCAGACCA
AGAAGGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
CGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCATTATCTAAGTTTTATCTACCT
CTACTATTGTTAAACCAGTGTTTTTGTCACTTGCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATTGAGA
TATTATTATCTACCATCATCGTTTAATGTTGAATTCAAGTTCTCTGTTTCTTTTGCTTCT
TAACAATCTTATCCTTAT


BQ
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR2GH32TF U 1
AF RR2GD11JQ C 259
AF RR2GD11TF U 2
AF RR2CS68JQ C 1
AF RR2G747JQ C 341
AF RR2CS68TF U 1
AF RR2GH32JQB C 1
AF RR2G747TF U 1
BS 1 674 RR2CS68TF
BS 675 678 RR2CS68JQ

RD RR2GH32TF 438 0 0
GGAGGGTTTCAGCTGCTTCAACCTCTCTCCAGATTTAGTGTCGGAAGGATCGTTCAGAAG
CAATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACCACTAAGAAGGCCGACCCAAAGGCCAAGGCTTTGA
AGGCTGCGAAGGCAGTTAAGTCTGGCCAGGCCTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGA
CAAAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACATTGACCAAGGCCAGAGACCCCAAGTACCCGA
GAATCAGTGCTACTCCCAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCA
CCACTGAGTCTGCCATGAAGAAGATTGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACA
TTCGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAAAAGATGTACGACATTCAGACCA
AGAAGGTTAACACCCTCA

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR2GD11JQ 298 0 0
GGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCTGCGATGA
AGAAGATTGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACATTCGTGCCGACAAGAAGA
AGATCAAAGATGCTGTTAAAAAGATGTATGACATTCAGACCAAGAAGGTTAACACCCTCA
TCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTTGG
ATGTTGCTAACAAGATTGGCATTATCTAAGTTTTAGCTACCTCTACTATTGTTAAACC

QA 1 298 1 298
DS 

RD RR2GD11TF 616 0 0
GG
GGGTTTCAGCTGCTTCAACCTCTCTCCAGATTTAGTGTCGGAAGGATCGTTCAGAAGCAA
TGTCTCCGGCTAAAGTTGATGCCACGAAGAAGGCCGACCCAAAGGCCGAGGCCTTGAAGG
CTGCGAAGGCAGTGAAGTCTGGCCAAGCCTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACAA
AGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACCTTGACCAAGGCCAGAGACCCCAAGTACCCAAGGA
TCAGTGCTACTCCCAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCA
CTGAGTCTGCGATGAAGAAGATTGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACATTC
GTGCCGACAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAAAAGATGTATGACATTCAGACCAAGA
AGGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGG
ACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCATTATCTAAGTTTTAGCTACCTCTA
CTATTGTTAAACCAGTGTTTTTGTCACTTGCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATTGAGATAT
TATTATCTACCATC

QA 3 616 3 616
DS 

RD RR2CS68JQ 678 0 0
GGAGGGTTTCAGCTGCTTCAACCTCTCTCCAGATTTAGTGTCGGAAGGATCGTTCAGAAG
CAATGTCTCCGGCTAAAGTTGATGCCACGAAGAAGGCCGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGA
AGGCTGCGAAGGCAGTGAAGTCTGGCCAAGCCTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGA
CAAAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACCTTGACCAAGGCCAGAGACCCCAAGTACCCAA
GGATCAGTGCTACTCCCAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCA
CCACTGAGTTTGCGATGAAGAAGATTGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACA
TTCGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAAAAGATGTATGACATTCAGACCA
AGAAGGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
CGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCATTATCTAAGTTTTATCTACCT
CTACTATTGTTAAACCAGTGTTTTTGTCACTTGCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATTGAGA
TATTATTATCTACCATCATCGTTTAATGTTGAATTCAAGTTCTCTGTTTCTTTTGCTTCT
TAACAATCTTATCCTTAT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2G747JQ 334 0 0
TCTTGTCTTCATTGTTGACATTCGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAAAA
GATGTATGACATTCAGACCAAGAAGGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAA
GGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCAT
TATTTAAGTTTTATCTACCTCTACTATTGTTAAACCAGTGTTTTTGTCATTTGCTTGTAG
ACTCCAGTTTTGCATTGAGATATTATTATCTACCATCATCGTTTAATGTTGAATTCAAGT
TTTCTGTTTCTTTTGCTTCTTAACAATCTTATCC

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR2CS68TF 678 0 0
GGAGGGTTTCAGCTGCTTCAACCTCTCTCCAGATTTAGTGTCGGAAGGATCGTTCAGAAG
CAATGTCTCCGGCTAAAGTTGATGCCACGAAGAAGGCCGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGA
AGGCTGCGAAGGCAGTGAAGTCTGGCCAAGCCTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGA
CAAAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACCTTGACCAAGGCCAGAGACCCCAAGTACCCAA
GGATCAGTGCTACTCCCAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCA
CCACTGAGTCTGCGATGAAGAAGATTGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACA
TTCGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAAAAGATGTATGACATTCAGACCA
AGAAGGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
CGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCATTATCTAAGTTTTATCTACCT
CTACTATTGTTAAACCAGTGTTTTTGTCACTTGCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATTGAGA
TATTATTATCTACCATCATCGTTTAATGTTGAATTCAAGTTCTCTGTTTCTTTTGCTTCT
TAACAATCTTATCC
TTAT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2GH32JQB 670 0 0
GGAGGGTTTCAGCTGCTTCAACCTCTCTCCAGATTTAGTGTCGGAAGGATCGTTCAGAAG
CAATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACCACTAAGAAGGCCGACCCAAAGGCCAAGGCTTTGA
AGGCTGCGAAGGCAGTTAAGTCTGGCCAGGCCTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGA
CAAAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACATTGACCAAGGCCAGAGACCCCAAGTACCCGA
GAATCAGTGCTACTCCCAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCA
CCACTGAGTCTGCCATGAAGAAGATTGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACA
TTCGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAAAAGATGTACGACATTCAGACCA
AGAAGGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
CGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCATCATTTAAGTTTTATCTACCT
CTACTATTGTGAAACCAGTGTTTT*GTCACTTGCCTGTAGACTCCAGTTTTGCATTGAGA
TATTATTATCTACCATCATCGTTTAATGTTGAATTCAAGTTCTATATTTCTTTTGCTTCT
TAACAATCT
C

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2G747TF 674 0 0
GGAGGGTTTCAGCTGCTTCAACCTCTCTCCAGATTTAGTGTCGGAAGGATCGTTCAGAAG
CAATGTCTCCGGCTAAAGTTGATGCCACGAAGAAGGCCGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGA
AGGCTGCGAAGGCAGTGAAGTCTGGCCAAGCCTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGA
CAAAGGTCACCTTCCACAGGCCAAAGACCTTGACCAAGGCCAGAGACCCCAAGTACCCAA
GGATCAATGCTACTCCCAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCA
CCACTGAGTCTGCGATGAAGAAGATTGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACA
TTCGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAAAAGATGTATGACATTCAGACCA
AGAAGGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
CGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCATTATCTAAGTTTTATCTACCT
CTACTATTGTTAAACCAGTGTTTTTGTCATTTGCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATTGAGA
TATTATTATCTACCATCATCGTTTAATGTTGAATTCAAGTTCTCTGTTTCTTTTGCTTCT
TAACAATCTTATCC

QA 1 674 1 674
DS 



CO CL40Contig5 676 2 3 U
TTGGCAGAATAGTTTGCATTTTGGAAGTTCACAAGAGTGTTTTGTTGTAAGATAGAAAAC
AAAACCAGGGAAACAAGAATGTATTAAAAACAAAAACTACCAGAGAAACAAAACCACAAA
TCTGTTTTTATAATAGCAGAAATAGATAAAACTTAGATGATGCCGATCTTGTTAGCAACA
TCCAGAGCATCATAGTCTGGTGTAAGCCTAACGTAAGCCTTCTTCGTTCCATCAGGCCTG
ATGAGGGTGTTGACCTTCTTGGTCTGGATGTCATACATTTTCTTAACAGCATCCTTGATC
TTCTTCTTGTCAGCACGAATGTCAACAATGAAGACAAGAGTGTTGTTGTCTTCAATCTTC
TTCATTGCAGACTCAGTGGTGAGTGGGTACTTGAGGATACCGTAATGGTCCAACTTGTTC
CTCGGAGTAGCGCTGATCCTCGGGTACTTGGGATCTCTGGCCTTGGTCAAAGTCCTTGGC
CTGTGGAAGGTGACCTTAGTCCTGATCTTCTTGTCCTTCTTCTTGAAAGCTTGGCCTGAC
TTCACTGCCTTTGCAGCCTTCAAGGCCTTGGCTTTCGGGTCAGCCTTCTTCGTCGTATCA
ACTTTAGCCGGAGACATTGCTATGAACGATTCCTTCCCGCTCAAAATCTGGTGAGGTGAA
GCAGCTGAAACTCTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FV60JQ U 3
AF RR2FV60TF C 1
BS 1 4 RR2FV60TF
BS 5 659 RR2FV60JQ
BS 660 676 RR2FV60TF

RD RR2FV60JQ 657 0 0
GG
CAGAATAGTTTGCATTTTGGAAGTTCACAAGAGTGTTTTGTTGTAAGATAGAAAACAAAA
CCAGGGAAACAAGAATGTATTAAAAACAAAAACTACCAGAGAAACAAAACCACAAATCTG
TTTTTATAATAGCAGAAATAGATAAAACTTAGATGATGCCGATCTTGTTAGCAACATCCA
GAGCATCATAGTCTGGTGTAAGCCTAACGTAAGCCTTCTTCGTTCCATCAGGCCTGATGA
GGGTGTTGACCTTCTTGGTCTGGATGTCATACATTTTCTTAACAGCATCCTTGATCTTCT
TCTTGTCAGCACGAATGTCAACAATGAAGACAAGAGTGTTGTTGTCTTCAATCTTCTTCA
TTGCAGACTCAGTGGTGAGTGGGTACTTGAGGATACCGTAATGGTCCAACTTGTTCCTCG
GAGTAGCGCTGATCCTCGGGTACTTGGGATCTCTGGCCTTGGTCAAAGTCCTTGGCCTGT
GGAAGGTGACCTTAGTCCTGATCTTCTTGTCCTTCTTCTTGAAAGCTTGGCCTGACTTCA
CTGCCTTTGCAGCCTTCAAGGCCTTGGCTTTCGGGTCAGCCTTCTTCGTCGTATCAACTT
TAGCCGGAGACATTGCTATGAACGATTCCTTCCCGCTCAAAATCTGGTGAGGTGA

QA 3 657 3 657
DS 

RD RR2FV60TF 676 0 0
TTGGCAGAATAGTTTGCATTTTGGAAGTTCACAAGAGTGTTTTGTTGTAAGATAGAAAAC
AAAACCAGGGAAACAAGAATGTATTAAAAACAAAAACTACCAGAGAAACAAAACCACAAA
TCTGTTTTTATAATAGCAGAAATAGATAAAACTTAGATGATGCCGATCTTGTTAGCAACA
TCCAGAGCATCATAGTCTGGTGTAAGCCTAACGTAAGCCTTCTTCGTTCCATCAGGCCTG
ATGAGGGTGTTGACCTTCTTGGTCTGGATGTCATACATTTTCTTAACAGCATCCTTGATC
TTCTTCTTGTCAGCACGAATGTCAACAATGAAGACAAGAGTGTTGTTGTCTTCAATCTTC
TTCATTGCAGACTCAGTGGTGAGTGGGTACTTGAGGATACCGTAATGGTCCAACTTGTTC
CTCGGAGTAGCGCTGATCCTCGGGTACTTGGGATCTCTGGCCTTGGTCAAAGTCCTTGGC
CTGTGGAAGGTGACCTTAGTCCTGATCTTCTTGTCCTTCTTCTTGAAAGCTTGGCCTGAC
TTCACTGCCTTTGCAGCCTTCAAGGCCTTGGCTTTCGGGTCAGCCTTCTTCGTCGTATCA
ACTTTAGCCGGAGACATTGCTATGAACGATTCCTTCCCGCTCAAAATCTGGTGAGGTGAA
GCAGCTGAAACTCTCC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 4 23

CO CL41Contig1 769 6 6 U
GGGAGATTACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTCGAATTCTCAG
AGAAAGCGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTAC
CGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAAC
CACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAAT
CCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTTCCATTCCAGAGGCTTGT
TCGTGAGATTGCTCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGC
ACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTGTGGGACTCTTCGAGGACACCAACCTTTGCGC
CATTCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAG
AGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGG
TTTGTTGCTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTCAAGAAGG
CTTTTGGTATTAGCAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTTTTTTTCTTATTTT
CGGTTTTATGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGT
TTGAATTCTAAAACAATTAGT*ATGTTGAAGTTGACCGTCTCTTTTCAT


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EV20TF U 1
AF RR2AE72TF U 1
AF RR2AK82TF U 1
AF RR2CI83JQ C 1
AF RR2CI83TF U 1
AF RR2AK82JQ C 78
BS 1 115 RR2AE72TF
BS 116 116 RR2AK82TF
BS 117 651 RR2AE72TF
BS 652 741 RR2AK82TF
BS 742 742 RR2CI83TF
BS 743 769 RR2AK82TF

RD RR2EV20TF 251 0 0
GGGAGATTACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTCGAATTCTCAG
AGAAAGCGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTAC
CGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAAC
CACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAAT
CCGTAAGTACC

QA 1 251 1 251
DS 

RD RR2AE72TF 657 0 0
GGGAGATTACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTCGAATTCTCAG
AGAAAGCGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGCCTAC
CGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAAC
CACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAAT
CCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTTCCATTCCAGAGGCTTGT
TCGTGAGATTGCTCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGC
ACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTGTGGGACTCTTCGAGGACACCAACCTTTGCGC
CATTCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAG
AGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGG
TTTGTTGCTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTCAAGAAGG
CTTTTGGTATTAGCAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTTTTTT
CTTATT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2AK82TF 769 0 0
GGGAGATTACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTCGAATTCTCAG
AGAAAGCGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTAC
CGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAAC
CACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAAT
CCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTTCCATTCCAGAGGCTTGT
TCGTGAGATTGCTCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGC
ACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTGTGGGACTCTTCGAGGACACCAACCTTTGCGC
CATTCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAG
AGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGG
TTTGTTGCTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTCAAGAAGG
CTTTTGGTATTAGCAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTTTTTTTCTTATTTT
CGGTTTTATGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGT
TTGAATTCTAAAACAATTAGTTATGTTGAAGTTGACCGTCTCTTTTCAT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2CI83JQ 754 0 0
GGGAGATTACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTCGAATTCTCAG
AGAAAGCGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTAC
CGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAAC
CACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAAT
CCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTTCCATTCCAGAGGCTTGT
TCGTGAGATTGCTCAGGATTTCCAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGC
ACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTGTGGGACTCTTCGAGGACACCAACCTTTGCGC
CATTCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAG
AGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGG
TTTGTTGCTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTCAAGAAGG
CTTTTGGTATTAGCAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTTTTTTTCTTATTTT
CGGTTTTATGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGT
TTGAATTCTAAAACAATTAGT*ATGTTGAAGT
CG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2CI83TF 751 0 0
GGGAGATTACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTCGAATTCTCAG
AGAAAGCGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTAC
CGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAAC
CACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAAT
CCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTTCCATTCCAGAGGCTTGT
TCGTGAGATTGCTCAGGATTTCCAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGC
ACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTGTGGGACTCTTCGAGGACACCAACCTTTGCGC
CATTCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAG
AGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGG
TTTGTTGCTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTCAAGAAGG
CTTTTGGTATTAGCAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTTTTTT*CTTATTTT
CG*TTTTATGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGT
TTGAATTCTAAA*CAATTAGT*ATGTTGAAG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2AK82JQ 692 0 0
GAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGGAAAGGCCCCTA
GGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGA
AGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGA
GTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTTCCATTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCTCAGG
ATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAG
AAGCGTACCTTGTGGGACTCTTCGAGGACACCAACCTTTGCGCCATTCATGCCAAGCGTG
TCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAG
TCTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAA
TAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTCAAGAAGGCTTTTGGTATTAGCAGA
CTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTTTTTTTCTTATTTTCGGTTTTATGATTTGCT
TTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGTTTGAATTCTAAAACAAT
TAGT*ATGTTGAAGTTGACCGTCTCTTTTCAT

QA 1 692 1 692
DS 



CO CL41Contig2 777 6 11 U
GGAGAGGACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAGATCGGAGCACTAATTTGAATTCTCAGA
GAAAGCGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACC
GGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCTGCACGAAAGTCTGCACCAACC
ACCGGTGGAGTGAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATC
CGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTT
CGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGCA
CTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTGTGGGACTCTTTGAGGACACCAACCTGTGCGCC
ATTCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGA
GGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTTTGTGAATGTTGGGGTTTG
CTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTAAGAAGGCTTT
TGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGAATGATGGTTTGTTGGTTTTTTTCTTATT
TTCTGTCCCAGTCGGTTCTATGATTTGCTTTTGTGTATTTGCAGCTACGTGTTTTGTGAA
CCTCCCGCTGTTTGAATTCTAAAACAATCAGTATGTTGAAGTTGACTGACTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D128TF U 315
AF RR2C571TF U 6
AF RR2B580TF U 1
AF RR2C571JQ C 32
AF RR2H922TF U 6
AF RR2D128JQ C 336
BS 1 5 RR2B580TF
BS 6 7 RR2C571TF
BS 8 309 RR2B580TF
BS 310 310 RR2C571TF
BS 311 327 RR2B580TF
BS 328 328 RR2C571TF
BS 329 333 RR2B580TF
BS 334 335 RR2C571TF
BS 336 743 RR2B580TF
BS 744 747 RR2H922TF
BS 748 777 RR2D128JQ

RD RR2D128TF 151 0 0
GGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGC
AGAAGCGTACCTTGTGGGACTCTTTGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCCAAGCG
TGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTC

QA 1 151 1 151
DS 

RD RR2C571TF 587 0 0
GGACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAGATCGGAGCACTAATTTGAATTCTCAGAGAAAG
CGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGG
AAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCTGCACGAAAGTCTGCACCAACCACCGG
TGGAGTGAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAA
GTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGA
GATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGCACTCCA
GGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTGTGGGACTCTTTGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCA
TGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGA
GCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTTTGTGAATGTTGGGGTTTGCTGTT
TCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTAAG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2B580TF 746 0 0
GGAGATTACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAGATCGGAGCACTAATTTGAATTCTCAGA
GAAAGCGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACC
GGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCTGCACGAAAGTCTGCACCAACC
ACCGGTGGAGTGAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATC
CGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTT
CGTGAGATTACCCAGGATTTCAAGACTAACCTGT*TTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGCA
CTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTGTGGGACTCTTTGAGGACACCAACCTGTGCGCC
ATTCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGA
GGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTTTGTGAATGTTGGGGTTTG
CTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTAAGAAGGCTTT
TGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGAATGATGGTTTGTTGGTTTTTTTCTTATT
TTCTGTCCCAGTCGGTTCTATGATTTGCTTTTGTGTATTTGCAGCTACGTGTTTTGTGAA
CCTCCCGCTGTTTGAATTCTAAA
CAA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2C571JQ 701 0 0
AGATCGGAGCACTAATTTGAATTCTCAGAGAAAGCGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTC
GTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTA
CTAAGGCTGCACGAAAGTTTGCACCAACCACCGGTGGAGTGAAGAAGCCACATCGTTACA
GACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCA
TCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACC
TGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTGTGG
GACTCTTTGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCA
AAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGCTCG
GGGTCCTATTTTGTGAATGTTGGGGTTTGCTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTT
TAGATAATATGGTCTTTTAAGAAGGCTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATG
AATGATGGTTTGTTGGTTTTTTTCTTATTTTCTGTCCCAGTCGGTTCTATGATTTGCTTT
CGTGTATTTGCAGCTACGTGTTTTGTGAACCTCCCGCTGTT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2H922TF 742 0 0
GGACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAGATCGGGGCACTAATTTGAATTCTCAGAGAAAG
CGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGG
AAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCTGCACGAAAGTCTGCACCAACCACCGG
TGGAGTGAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAA
GTACCAGAAGAGTACCGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGA
GATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGCACTCCA
GGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTGTGGGACTCTTTGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCA
TGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGA
GCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTTTGTGAATGTTGGGGTTTGCTGTT
TCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTAAGAAGGCTTTTGGTA
TTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGAATGATGGTTCGTTGGTTTTTTTCTTATTTTCTG
TCCCAGTCG*TTCTATGATTTGCTTTTGTGTATT*GCAGCTACGTGTTTTGTGA*CCTCC
CGCTGTTTGAATTCTAAAACAA

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2D128JQ 442 0 0
TTC
CCAGAGCCATGCTGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTGTGGGACTCTT
TGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACAT
CCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCT
ATTTTGTGAATGTTGGGGTTTGCTGTTTCTCCAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAA
TATGGTCTTTTAAGAAGGCTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGAATGATG
GTTTGTTGGTTTTTTTCTTATTTTCTGTCCCAGTCGGTTCTATGATTTGCTTTTGTGTAT
TTGCAGCTACGTGTTTTGTGAACCTCCCGCTGTTTGAATTCTAAAACAATCAGTATGTTG
AAGTTGACTGACTCTTTCC

QA 4 442 4 442
DS 



CO CL41Contig3 753 7 8 U
GGACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAGATCGGAGCACTAATTTGAATTCTCAGAGAAAG
CGAAAGCGATAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGG
AAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCTGCACGTAAGTCTGCGCCAACCACCGG
TGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAA
GTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGA
GATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCA
GGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGGGACTCTTTGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCA
TGCCAAGCGTGTTACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGA
GCGTGCTTGAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTATGTGAATGTGGGGTTTGCTGTTT
CTGCTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTAAGAAGGC
TTTTGGTATTTGTAGGCTCTCTAAAACAATGATGAATGGTGGTTTGTTGGTTTTTTTCTT
ATTTTCTGTCCCAGCCGGTTCTATGATTTGCTTTTGTGTATTTGCAGCTACGTGTTTTGT
GAACCTTTGAATTCTAAAACAATTAGTATGTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2GF84TF U 8
AF RR2BM88TF U 1
AF RR2EU57TF U 1
AF RR2EU57JQ C 480
AF RR2BO33JQ C 177
AF RR2GF84JQ C 228
AF RR2BO33TF U 177
BS 1 598 RR2BM88TF
BS 599 599 RR2EU57TF
BS 600 613 RR2BM88TF
BS 614 649 RR2EU57TF
BS 650 650 RR2BO33TF
BS 651 672 RR2EU57TF
BS 673 751 RR2BO33TF
BS 752 753 RR2BO33JQ

RD RR2GF84TF 557 0 0
GG
ATTATCTTCTGTTTTCGAGATCGGAGCACTAATTTGAATTCTCAGAGAAAGCGAAAGCGA
TAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGGAAAGGCCCC
TAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCTGCACGTAAGTCTGCGCCAACCACCGGTGGAGTCAA
GAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAA
GAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCCCA
GGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGC
AGAAGCATACCTTGTGGGACTCTTTGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCCAAGCG
TGTTACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTG
AGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTATGTGAATGTGGGGTTTGCTGTTTCTGCTGTTT
CTCTAAATAGACGTA

QA 3 557 3 557
DS 

RD RR2BM88TF 613 0 0
GGACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAGATCGGAGCACTAATTTGAATTCTCAGAGAAAG
CGAAAGCGATAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGG
AAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCTGCACGTAAGTCTGCGCCAACCACCGG
TGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAA
GTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGA
GATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCA
GGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGGGACTCTTTGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCA
TGCCAAGCGTGTTACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGA
GCGTGCTTGAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTATGTGAATGTGGGGTTTGCTGTTT
CTGCTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTAAGAAG*C
TTTTGGTATTTGT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2EU57TF 672 0 0
GGACTTTTCATTATCTTCT***TTCGAGATCGGAGCACTAATTTGAATTCTCAGAGAAAG
CGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGG
AAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCTGCACGAAAGTCTGCACCAACCACCGG
TGGAGTGAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAA
GTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGACTTGTTCGTGA
GATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACTCCA
GGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGGGACTCTTTGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCA
TGCCAAGCGTGTTACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGA
GCGTGCTTGAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTATGTGAATGTGGGGTTTACTGTTT
CTGCTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTAAGAAGGC
TTTTGGTATTTGTAGGCTCTCTAAAACAATGATGAATGGTGGTTTGTTGTTTTTTTTCTT
ATTTTCTGTCCC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2EU57JQ 237 0 0
AGCGTGCTTGAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTATGTGAATGTGGGGTTTACTGTT
TCTGCTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTAAGAAGG
CTTTTGGTATTTGTAGGCTCTCTAAAACAATGATGAATGGTGGTTTGTTGTTTTTTTTCT
TATTTTCTGTCCCAGTCGGTTTTATGATTTGCTTTTGTGTATTTGCAGCTACGTGTT

QA 1 237 1 237
DS 

RD RR2BO33JQ 577 0 0
G
CGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCG
TAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCG
TGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACT
CCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGGGACTCTTTGAGGACACCAACCTGTGCGCCAT
TCATGCCAAGCGTGTTACCATCATGCCCAAAGACATCTAACTCGCTCGCAGGATCAGAGG
AGAGCGTGCTTGAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTATGTGAATGTGGGGTTTGCTG
TTTCTGCTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCGGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTAAGAA
GGCTTTTGGTATTTGTAGGCTCTCTAAAACAATGATGAATGGTGGTTTGTTGGTTTTTTT
CTTATTTTCTGTCCCAGCCGGTTCTATGATTTGCTTTTGTGTATTTGCAGCTACGTGTTT
TGTGAACCTTTGAATTCTAAAACAATTAGTATGTTG

QA 2 577 2 577
DS 

RD RR2GF84JQ 526 0 0
GTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCAGA
GGCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCGG
TGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGGGACTCTTTGAGGACACCAACC
TGTGCGCCATTCATGCCAAGCGTGTTACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCA
GGATCAGAGGAGAGCGTGCTTGAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTATGTGAATGTG
GGGTTTGCTGTTTCTGCTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGT
CTTTTAAGAAGGCTTTTGGTATTTGTAGGCTCTCTAAAACAATGATGAATGGTGGTTTGT
TGGTTTTTTTCTTATTTTCTGTCCCAGTCGGTTTTATGATTTGCTTTTGTGTATTTGCAG
CTACGTGTTTTGTGAACCTTTGAATTCTAAAACAATTAGTATGT
GG

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2BO33TF 577 0 0
G
CGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCG
TAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCG
TGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCGGTGCTAGCACT
CCAGGAGGCAGCAGAAGCATACCTTGTGGGACTCTTTGAGGACACCAACCTGTGCGCCAT
TCATGCCAAGCGTGTTACCATCATGCCCAAAGACATCTAACTCGCTCGCAGGATCAGAGG
AGAGCGTGCTTGAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTATGTGAATGTGGGGTTTGCTG
TTTCTGCTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCGGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTAAGAA
GGCTTTTGGTATTTGTAGGCTCTCTAAAACAATGATGAATGGTGGTTTGTTGGTTTTTTT
CTTATTTTCTGTCCCAGCCGGTTCTATGATTTGCTTTTGTGTATTTGCAGCTACGTGTTT
TGTGAACCTTTGAATTCTAAAACAATTAGTATGT
TG

QA 2 575 2 575
DS 



CO CL41Contig4 750 4 20 U
GGGAGATTACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTCGAATTCTCAG
AGAAAGCGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTAC
CGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAAC
CACCGATGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAAT
CCGTAAGTACCAGAAGAGAACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTTCCATTCCAGAGGCTTGT
TCGTGAGATTGCTCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGC
ACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTGTGGGACTCTTCGAGGACACCAACCTTTGCGC
CATTCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAG
AGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGG
TTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTTTGGTAT
TAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTTGCTTGCTTTTTTTCTTATTTTCG
GTTTTATGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGTTT
GAATTCTAATACAATTAGTATGTTGAAGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
5 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2GX83TF U 17
AF RR2HA66JQ C 1
AF RR2GX83JQ C 17
AF RR2HA66TF U 1
BS 1 18 RR2HA66TF
BS 19 129 RR2GX83TF
BS 130 130 RR2HA66TF
BS 131 185 RR2GX83TF
BS 186 186 RR2HA66TF
BS 187 258 RR2GX83TF
BS 259 259 RR2HA66TF
BS 260 649 RR2GX83TF
BS 650 650 RR2HA66TF
BS 651 689 RR2GX83TF
BS 690 700 RR2HA66TF
BS 701 701 RR2HA66JQ
BS 702 706 RR2HA66TF
BS 707 707 RR2HA66JQ
BS 708 719 RR2HA66TF
BS 720 722 RR2HA66JQ
BS 723 728 RR2HA66TF
BS 729 729 RR2HA66JQ
BS 730 748 RR2HA66TF
BS 749 750 RR2HA66JQ

RD RR2GX83TF 673 0 0
GG
ATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTCGAATTCTCAGAGAAAGCGAAAGCGACAG
AGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGGAAATGCCCCTAG
GAAGCAGCTTGCTACTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAA
GCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAG
TACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTTCCATTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCTCAGGA
TTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGA
AGCGTACCTTGTGGGACTCTTCGAGGACACCAACCTTTGCGCCATTCATGCCAAGCGTGT
CACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGT
CTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAAT
AGAAGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAAC
AATGATGGTTTGTTGGTTTGCTTGCTTTTTT*CTTATTTTCGGTTTTATGATTTGCTTTT
GTGTACTTGCA

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR2HA66JQ 750 0 0
GGGAGATTACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTCGAATTCTCAG
AGAAAGCGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTAC
CGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAAC
CACCGATGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAAT
CCGTAAGTACCAGAAGAGAACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTTCCATTCCAGAGGCTTGT
TCGTGAGATTGCTCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGC
ACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTGTGGGACTCTTCGAGGACACCAACCTTTGCGC
CATTCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAG
AGGAGGGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGG
TTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTTTGGTAT
TAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTTGCTTGTTTTTTTTCTTATTTTCG
GTTTTATGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGTTT
GAATTCTAATACAATTAGTATGTTGAAGTT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2GX83JQ 723 0 0
GG
ATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTCGAATTCTCAGAGAAAGCGAAAGCGACAG
AGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGGAAATGCCCCTAG
GAAGCAGCTTGCTACTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAA
GCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAG
TACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTTCCATTCCAGAGGCTTGTTCGTGAGATTGCTCAGGA
TTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGCACTCCAGGAGGCAGCAGA
AGCGTACCTTGTGGGACTCTTCGAGGACACCAACCTTTGCGCCATTCATGCCAAGCGTGT
CACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGT
CTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGTTGCTTCTCTAAAT
AGAAGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAAC
AATGATGGTTTGTTGGTTTGCTTGCTTTTTT*CTTATTTTCGGTTTTATGATTTGCTTTT
GTGTACTTGCATCTACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGTTTGAATTCTAATACAATTAG
C

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR2HA66TF 750 0 0
GGGAGATTACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAAATCGGAGCACTAATTCGAATTCTCAG
AGAAAGCGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTAC
CGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCGGCACGTAAGTCTGCACCAAC
CACCGATGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGACCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAAT
CCGTAAGTACCAGAAGAGAACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTTCCATTCCAGAGGCTTGT
TCGTGAGATTGCTCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGC
ACTCCAGGAGGCAGCAGAAGCGTACCTTGTGGGACTCTTCGAGGACACCAACCTTTGCGC
CATTCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAACTCGCTCGCAGGATCAG
AGGAGGGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGGGTTTGGGTCTCGTATTATGTGAATGTTGGGG
TTTGTTGCTTCTCTAAATAGAAGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTTTGGTAT
TAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTTGCTTGTTTTTTTTCTTATTTTCG
*TTTTATGATTTGCTTTTGTGTACTTGCATCTACGTGTTT*GTTAA*CCTTTCGTTGTTG
**ATTCTA*TACAATTAGTATGTTGAAG
TT

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 25

CO CL42Contig1 2670 25 32 U
CTAAAATGCCTAATATCCTTTTTACATCTTCTATGTGAAAATGTTCCATTTTGATAAGGT
CTTCTTGACTGTTATTCAAAAGATTCAATAATGTATGTATATTGGACTTTTTGAGACAAT
TATAGATTCTGGGAGGCAATTCTAATTGGTCAATAAAAATATATTGAAATCCTAGTTCTT
TTTTTTTTTTTTTCTTAGGTTAACTAATCTATTATGAAAAGGAAAAAGGGGTAAAGTAAC
TTGATGTTGATTGTTCTCTAAATAGAACGTTTCTTCTTCTACATGTAGAAAAGGAATAAA
TAAATTAATCAAATTCCGGGAGGCTTCATGAAGTGCTTCTTTAGGAGTTAAACTTCCATT
TGTCCATATTTCTAGAAAAAGAATCTCTTGTTTTTCATTCCCATT*CCCATAAGAATGAA
TACTATGATTCGCATTTTGAACAGGCATGAATACAGCATCTATAGGATAACTTCGGTCTT
CAAAGTTATTTGACATTTTTAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATAC
ACAAATTTATTGGTTCCGTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAACGATTTCCACAG
AGGGCGGTAAAACTATGTCTCGAGCAGTTATATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCG
CGTTGCGCGTTCCATATAGATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAATTCATTAAAATTT
CATGTACTGATTCTTGAATACCGACTATGTTAGAATAGTCATGTGGTATGTTCTCAAATT
TTGCACGTGTAATACATGTTCCTTCTATTTCGCCAAGTAAAGCTCTTCGCATCGCAATGC
CTATTGTGTCGGCTTGACCTTTCATAAGTGGAGACAGAATAAAGCGTCCATAATAAAGAC
GCTTACTGTCTCTTCTTGATTCAACACACTTCCACTGTAGTGTCCGAGTAGATACTTTGA
CTTTCTCTCGAACCATAGTAATTTTATTTGATCAGATCATTGAATCATTTATTTCTCTTG
AAACCCTTTCAGCCTTTATTTAGTTCTATACACGTCGTTTTTTAGGGGGTCTACAACCAT
TATGTGGCATAGGGGTTACATCTCGTACGAAACTTAAAAGTATACCGCTTCTACGAATAG
CTCGTAATGCTGCATCTCTTCCCAGTCCAGGGCCTTTTATCCTTACTTCAGCTCGTTGCA
TACCTTGATCCACTACCGCTCGAATAGCATTTCCTGCTGCGGTTTGAGCAGCAAAAGGTG
TTCCTCTTCTTGTACCCCTGAATCCACAAGTACCCGCGGAGGACCAAGAAATCACCCGAC
CCCGTACATCTGTAACGGTCACAATGGTATTGTTGAAACTTGCTTGAACATGAATAACTC
CCTTTGGTATTCTACGTACATTTTTACGTGAACCACTACGGGTATTTTTACGTGAACCAA
TTCTTAATATAGGTTTTGCCATATTTTTTCATTTCACAAGAAATATATGGATATATCCAT
TTCATGTCAAAACGGACCTTTTTTTTTACTAGCTCCTTGGAAGTGCCTTTTCCTTTATTT
CCTTTAGTAAGATTATCCTTGTCTTTGTTTATGCCTCGGGTTGGAACAAATTACTATAAT
TCGTCCCCTCCTACGGATTAGCCGACACTTTTCACAAATTTTACGAACGGAAGCCCTTAT
TTTCATAGTTGTTATTCCTTAATTCTCTTAATATACTTATTCTTGGACGAAAAAAA*GGT
TTCTTGATATTTTTGAATCTTGAATTGTATCTTCGTGAAAGGAATGTTGAATTTCAAAAA
ACCACTGACTTATTTGAATCCTTGTTATGGAGTCTAGAAAGTGGCTGTTCCCCGATTAAC
TTAATACCTAAGAACTTACTAAAATTTTTAACTTTTTCTCCTATAGGTATACCTATACAA
AAATATGTCGAATCCTTTCAGAAGCATGACCTAAAATAAAAAAAATCTTTAGTATCTAAA
CAAAATCGAACCATGCCGTTCGGAAGTGATTCATAAAGAAAACTTTCATTAATTCATTTT
TTCTTTAATTTCATTTGGGGTAAAACATTCTAAACTTTTTTAGCAGGGGTGGTATTACAC
AACCCCCC*TTTTTTTTTCACAAATGGTAAGTTCCGGATATCCAATTTTGATATTAGAAG
GATTACCATATATAACACAAAATTTCTCCGCCGATTCTTTTTAGTCGAGCTTCTCGATCT
GTCATTATACCTTGAGAAGTCGAAAGGATTACAATTCCTATTCCGCCTAAAATTCGTGGA
ATTCGTTGAGAGTTAGAATAGATTCGTAGACCCGGTCGGCTTATTCTCTTTAAATTTAAA
ATAGTTTTATAGGATTCTTTCTTATTTCGTCTATGTCTTAGGGTTAAAATCAAAAAATAT
TGATTGTTTTCGCGATGTTTCCTTACGTTTTCGATAAAACCCTCTCGTAAAAGTATTTTA
ACAATGCTTTCGGTGATGTTAGTCGATCCTATCCGAACTGTTCCTTTTCTATTCATGTCA
GCATTTCGTATAGAGGTTATTATATCAGCAATAGTGTCTTTCCCCATGATAAGTTAAAAT
TCCTTAATTGTTCTATAATTTTGATATAATCAACATGTTATTTTTCTTTTATTTTTATAA
AAATAGAGACGAATTATATATTAATATATG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 30 30 30 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 60 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC53JQ U 1
AF RR2FB22JQ U 1
AF RR2DZ37JQ U 197
AF RR2EC53TF C 15
AF RR2DJ44JQ U 197
AF RR2DJ44TF C 197
AF RR2EV08JQ U 244
AF RR2GG08JQB U 197
AF RR2BY86JQ U 198
AF RR2C849JQ U 197
AF RR2B329JQ U 194
AF RR2C892JQ U 197
AF RR2C632JQ U 408
AF RR2B329TF C 216
AF RR2C632TF C 366
AF RR2BY86TF C 482
AF RR2GG08TF C 1004
AF RR2C849TF C 1099
AF RR2C662JQ U 1563
AF RR2C662TF C 1567
AF RR2GZ94JQ U 1567
AF RR2GZ94TF C 1567
AF RR2EV08TF C 1523
AF RR2DZ37TF C 1750
AF RR2C892TF C 2043
BS 1 264 RR2EC53JQ
BS 265 265 RR2B329JQ
BS 266 287 RR2EC53JQ
BS 288 288 RR2B329JQ
BS 289 379 RR2EC53JQ
BS 380 413 RR2FB22JQ
BS 414 414 RR2B329JQ
BS 415 589 RR2FB22JQ
BS 590 911 RR2B329JQ
BS 912 912 RR2BY86JQ
BS 913 975 RR2B329JQ
BS 976 980 RR2C632JQ
BS 981 981 RR2B329TF
BS 982 1003 RR2C632JQ
BS 1004 1012 RR2B329TF
BS 1013 1013 RR2C632TF
BS 1014 1027 RR2B329TF
BS 1028 1028 RR2C632TF
BS 1029 1074 RR2B329TF
BS 1075 1129 RR2C632TF
BS 1130 1172 RR2BY86TF
BS 1173 1475 RR2GG08TF
BS 1476 1566 RR2C849TF
BS 1567 1801 RR2C662JQ
BS 1802 1802 RR2GZ94JQ
BS 1803 2108 RR2C662JQ
BS 2109 2109 RR2GZ94JQ
BS 2110 2143 RR2C662JQ
BS 2144 2258 RR2GZ94JQ
BS 2259 2296 RR2EV08TF
BS 2297 2362 RR2DZ37TF
BS 2363 2670 RR2C892TF

RD RR2EC53JQ 379 0 0
CTAAAATGCCTAATATCCTTTTTACATCTTCTATGTGAAAATGTTCCATTTTGATAAGGT
CTTCTTGACTGTTATTCAAAAGATTCAATAATGTATGTATATTGGACTTTTTGAGACAAT
TATAGATTCTGGGAGGCAATTCTAATTGGTCAATAAAAATATATTGAAATCCTAGTTCTT
TTTTTTTTTTTTTCTTAGGTTAACTAATCTATTATGAAAAGGAAAAAGGGGTAAAGTAAC
TTGATGTTGATTGTTCTCTAAATAAAACGTTTCTTCTTCTACATGTAAAAAAGGAATAAA
TAAATTAATCAAATTCCGGGAGGCTTCATGAAGTGCTTCTTTAGGAGTTAAACTTCCATT
TGTCCATATTTCTAGAAAA

QA 1 379 1 379
DS 

RD RR2FB22JQ 589 0 0
CTAAAATGTCTAATATC*TTTTTACATCTTCTATGTGAAAATGTTCCATTTTGATAAGGT
CTTCTTGACTGTTATTCAAAAGATCCAATAATGTATGTATATTGGACTTTTTGAGACAAT
TATAGATTCTGGGAGGCAATTCTAATTGGTCAATAAAAATATATTGAAATCCTAGTTCTT
TTTTTTTTTT***CTTAGGTTAACTAATCTATTATGAAAAGGAAAAAGGGGTAAAGTAAC
TTGATGTTGATTGTTCTCTAAATAAAACGTTTCTTCTTCTACATGTAAAAAAGGAATAAA
TAAATTAATCAAATTCCGGGAGGCTTCATGAAGTGCTTCTTTAGGAGTTAAACTTTCATT
TGTCCATATTTCTAGAAAAAGAATCTCTTGTTTTTCATTCCCATT*CCCATAAAAATGAA
TACTATGATTCGCATTTTGAACAGGCATGAATACAGCATCTATAGGATAACTTCGGTCTT
CAAAGTTATTTGACATTTTTAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATAC
ACAAATTTATTGGTTCCGTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAAC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2DZ37JQ 479 0 0
AGGTTAACTAATCTATTATGAAAAGGAAAAAGGGGTAAAGTAACTTGATGTTGATTGTTC
TCTAAATAGAACGTTTCTTCTTCTACATGTAGAAAAGGAATAAATAAATTAATCAAATTC
CGGGAGGCTTCATGAAGTGCTTCTTTAGGAGTTAAACTTCCATTTGTCCATATTTCTAGA
AAAAGAATCTCTTGTTTTTCATTCCCATT*CCCATAAGAATGAATACTATGATTCGCATT
TTGAACAGGCATGAATACAGCATCTATAGGATAACTTCGGTCTTCAAAGTTATTTGACAT
TTTTAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATACACAAATTTATTGGTTC
CGTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAACGATTTCCACAGAGGGCGGTAAAACTAT
GTCTCGAGCAGTTATATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCGCGTTGCGCGTTCCAT

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR2EC53TF 743 0 0
TATCC
TTTTACATCT*CTATGTGAAAATGTTCCATTT*GATAAGGTCT*CTTGACTGTTATTCAA
AAGATTCAATAATGTATGTATATTGGACTTTTTGAGACAATTATAGATTCTGGGAGGCAA
TTCTAATTGGTCAATAAAAATATATTGAAATCCTAGTTCTTTTTTTTTTTTTTTCTTAGG
TTAACTAATCTATTATGAAAAGGAAAAAGGGGTAAAGTAACTTGATGTTGATTGTTCTCT
AAATAGAACGTTTCTTCTTCTACATGTAGAAAAGGAATAAATAAATTAATCAAATTCCGG
GAGGCTTCATGAAGTGCTTCTTTAGGAGTTAAACTTCCATTTGTCCATATTTCTAGAAAA
AGAATCTCTTGTTTTTCATTCCCATT*CCCATAAGAATGAATACTATGATTCGCATTTTG
AACAGGCATGAATACAGCATCTATAGGATAACTTCGGTCTTCAAAGTTATTTGACATTTT
TAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATACACAAATTTATTGGTTCCGT
TAAGGTAGCTATATGCTGCGTATTATCAACGATTTCCACAGAGGGCGGTAAAACTATGTC
TCGAGCAGTTATATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCGCGTTGCGCGTTCCATATAG
ATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAATTCATTAAAATTTCATGTACTGATTCTTGAAT
ACCGACTATGTTAGAAT
C

QA 6 742 6 742
DS 

RD RR2DJ44JQ 553 0 0
AGGTTAACTAATCTATTATGAAAAGGAAAAAGGGGTAAAGTAACTTGATGTTGATTGTTC
TCTAAATAGAACGTTTCTTCTTCTACATGTAGAAAAGGAATAAATAAATTAATCAAATTC
CGGGAGGCTTCATGAAGTGCTTCTTTAGGAGTTAAACTTCCATTTGTCCATATTTCTAGA
AAAAGAATCTCTTGTTTTTCATTCCCATT*CCCATAAGAATGAATACTATGATTCGCATT
TTGAACAGGCATGGATACAGCATCTATAGGATAACTTCGGTCTTCAAAGTTATTTGACAT
TTTTAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATACACAAATTTATTGGTTC
CGTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAACGATTTCCACAGAGGGCGGTAAAACTAT
GTCTCGAGCAGTTATATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCGCGTTGCGCGTTCCATA
TAGATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAATTCATTAAAATTTCATGTACTGATTCTTG
AATACCGACTAT
C

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2DJ44TF 553 0 0
AGGTTAACTAATCTATTATGAAAAGGAAAAAGGGGTAAAGTAACTTGATGTTGATTGTTC
TCTAAATAGAACGTTTCTTCTTCTACATGTAGAAAAGGAATAAATAAATTAATCAAATTC
CGGGAGGCTTCATGAAGTGCTTCTTTAGGAGTTAAACTTCCATTTGTCCATATTTCTAGA
AAAAGAATCTCTTGTTTTTCATTCCCATT*CCCATAAGAATGAATACTATGATTCGCATT
TTGAACAGGCATGGATACAGCATCTATAGGATAACTTCGGTCTTCAAAGTTATTTGACAT
TTTTAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATACACAAATTTATTGGTTC
CGTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAACGATTTCCACAGAGGGCGGTAAAACTAT
GTCTCGAGCAGTTATATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCGCGTTGCGCGTTCCATA
TAGATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAATTCATTAAAATTTCATGTACTGATTCTTG
AATACCGACTAT
C

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2EV08JQ 589 0 0
ATGTTGATTGTTCTCTAAATAGAACGTTTCTTCTTCTACATGTAGAAAAGGAATAAATAA
ATTAATCAAATTCCGGGAGGCTTCATGAAGTGCTTCTTTAGGAGTTAAACTTCCATTTGT
CCATATTTCTAGAAAAAGAATCTCTTGTTTTTCATTCCCATT*CCCATAAGAATGAATAC
TATGATTCGCATTTTGAACAGGCATGAATACAGCATCTATAGGATAACTTCGGTCTTCAA
AGTTATTTGACATTTTTAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATACACA
AATTTATTGGTTCCGTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAACGATTTCCACAGAGG
GCGGTAAAACTATGTCTCGAGCAGTTATATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCGCGT
TGCGCGTTCCATATAGATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAATTCATTAAAATTTCAT
GTACTGATTCTTGAATACCGACTATGTTAGAATAGTCATGTGGTATGTTCTCAAATTTTG
CACGTGTAATACATGTTCCTTCTATTTCGCCAAGTAAAGCTCTTCGCAT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2GG08JQB 667 0 0
AGGTTAACTAATCTATTATGAAAAGGAAAAAGGGGTAAAGTAACTTGATGTTGATTGTTC
TCTAAATAGAACGTTTCTTCTTCTACATGTAGAAAAGGAATAAATAAATTAATCAAATTC
CGGGAGGCTTCATGAAGTGCTTCTTTAGGAGTTAAACTTCCATTTGTCCATATTTCTAGA
AAAAGAATCTCTTGTTTTTCATTCCCATT*CCCATAAGAATGAATACTATGATTCGCATT
TTGAACAGGCATGAATACAGCATCTATAGGATAACTTCGGTCTTCAAAGTTATTTGACAT
TTTTAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATACACAAATTTATTGGTTC
CGTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAACGATTTCCACAGAGGGCGGTAAAACTAT
GTCTCGAGCAGTTATATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCGCGTTGCGCGTTCCATA
TAGATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAATTCATTAAAATTTCATGTACCGATTCTTG
AATACCGACTATGTTAGAATAGTCATGTGGTATGTTCTCAAATTTTGCACGTGTAATACA
TGTTCCTTCTATTTCGCCAAGTAAAGCTCTTCGCATCGCAATGCCTATTGTGTCGGCTTG
ACCTTTC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2BY86JQ 731 0 0
GGTTAACTAATCTATTATGAAAAGGAAAAAGGGGTAAAGTAACTTGATGTTGATTGTTCT
CTAAATAGAACGTTTCTTCTTCTACATGTAGAAAAGGAATAAATAAATTAATCAAATTAC
GGGAGGGTTCATGAAGTGCTTCTTTAGGAGTTAAACTTCCATTTGTCCATATTTCTAGAA
AAAGAATCTCTTGTTTTTCATTCCCATT*CCCATAAGAATGAATACTATGATTCGCATTT
TGAACAGGCATGAATACGGCATCTATAGGATAACTTCGGTCTTCAAAGTTATTTGACATT
TTTAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATACACAAATTTATTGGTTCC
GTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAACGATTTCCACAGAGGGCGGTAAAACTATG
TCTCGAGCAGTTACATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCGCGTTGCGCGTTCCATAT
AGATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAATTCATTAAAATTTCATGTACTGATTCTTGA
ATACCGACTATGTTAGAATAGTCATGTGGTATGTTCTCAAATTTTGCACGTGTAATACAT
GTTCCTTCTATTTCGCCAAGTAAAGCTCTTCGCATCGCAATGCCTATTGTGTCGGCTTGA
CCCTTCATAAGTGGAGACAGAATAAAGCGTCCATAATAAAGACGCTTACTGTCTCTTCTT
GATTCAACACA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2C849JQ 721 0 0
AGGTTAACTAATCTATTATGAAAAGGAAAAAGGGGTAAAGTAACTTGATGTTGATTGTTC
TCTAAATAGAACGTTTCTTCTTCTACATGTAGAAAAGGAATAAATAAATTAATCAAATTC
CGGGAGGCTTCATGAAGTGCTTCTTTAGGAGTTAAACTTCCATTTGTCCATATTTCTAGA
AAAAGAATCTCTTGTTTTTCATTCCCATT*CCCATAAAAATGAATACTATGATTCGCATT
TTGAACAGGCATGAATACAGCATCTATAGGATAACTTCGGTCTTCAAAGTTATTTGACAT
TTTTAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATACACAAATTTATTGGTTC
CGTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAACGATTTCCACAGAGGGCGGTAAAACTAT
GTCTCGAGCAGTTATATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCGCGTTGCGCGTTCCATA
TAGATTACTTTTTAATACATTCTCGTTCAAATTCATTAAAATTTCATGTACTGATTCTTG
AATACCGACTATGTTAGAATAGTCATGTGGTATGTTCTCAAATTTTGCACGTGTAATACA
TGTTCCTTCTATTTCGCCAAGTAAAGCTCTTCGCATCGCAATGCCTATTGTGTCGGCTTG
ACCTTTCATAAGTGGAGACAGAATAAAGCGTCCATAATAAAGACGCTTACTGTCTCTTCT
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2B329JQ 782 0 0
CTTAGGTTAACTAATCTATTATGAAAAGGAAAAAGGGGTAAAGTAACTTGATGTTGATTG
TTCTCTAAATAGAACGTTTCTTCTTCTACATGTAGAAAAGGAATAAATAAATTAATCAAA
TTCCGGGAGGCTTCATGAAGTGCTTCTTTAGGAGTTAAACTTCCATTTGTCCATATTTCT
AGAAAAAGAATCTCTTGTTTTTCATTCCCATT*CCCATAAGAATGAATACTATGATTCGC
ATTTTGAACAGGCATGAATACAGCATCTATAGGATAACTTCGGTCTTCAAAGTTATTTGA
CATTTTTAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATACACAAATTTATTGG
TTCCGCTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAACGATTTCCACAGAGGGCGGTAAAAC
TATGTCTCGAGCAGTTATATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCGCGTTGCGCGTTCC
ATATAGATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAATTCATTAAAATTTCATGTACTGATTC
TTGAATACCGACTATGTTAGAATAGTCATGTGGTATGTTCTCAAATTTTGCACGTGTAAT
ACATGTTCCTTCTATTTCGCCAAGTAAAGCTCTTCGCATCGCAATGCCTATTGTGTCGGC
TTGACCTTTCATAAGTGGAGACAGAATAAAGCGTCCATAATAAAGACGCTTACTGTCTAT
TCTTGATTCAACACACTTCCACTGTAGTGTCCGAGTAGATACTTTGACTTTCTCTCGAAC
CA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2C892JQ 793 0 0
AGGTTAACTAATCTATTATGAAAAGGAAAAAGGGGTAAAGTAACTTGATGTTGATTGTTC
TCTAAATAGAACGTTTCTTCTTCTACATGTAGAAAAGGAATAAATAAATTAATCAAATTC
CGGGAGGCTTCATGAAGTGCTTCTTTAGGAGTTAAACTTCCATTTGTCCATATTTCTAGA
AAAAGAATCTCTTGTTTTTCATTCCCATT*CCCATAAGAATGAATACTATGATTCGCATT
TTGAACAGGCATGAATACAGCATCTATAGGATAACTTCGGTCTTCAAAGTTATTTGACAT
TTTTAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATACACAAATTTATTGGTTC
CGTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAACGATTTCCACAGAGGGCGGTAAAACTAT
GTCTCGAGCAGTTATATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCGCGTTGCGCGTTCCATA
TAGATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAATTCATTAAAATTTCATGTACTGATTCTTG
AATACCGACTATGTTAGAATAGTCATGTGGTATGTTCTCAGATTTTGCACGTGTAATACA
TGTTCCTTCTATTTCGCCAAGTAAAGCTCTTCGCATCGCAATGCCTATTGTGTCGGCTTG
ACCTTTCATAAATGGAGACAGAATAAAGCGTCCATAATAAAGACGCTTACTGTCTCTTCT
TGATTCA*CACACTTCCACTGTAGTGTCCGAGTAGATACTTTGACTTTCTCTCGAAC
ATAGTATTTTATTTGA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2C632JQ 596 0 0
CCATAAGAATGAATACTATGATTCGCATTTTGAACAGGCATGAATACAGCATCTATAGGA
TAACTTCGGTCTTCAAAGTTATTTGACATTTTTAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATT
TTTAATCCAATACACAAATTTATTGGTTCCGTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCA
ACGATTTCCACAGAGGGCGGTAAAACTATGTCTCGAGCAGTTATATATCCGGGACCTTGG
ACACAAATAAGCGCGTTGCGCGTTCCATATAGATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAA
TTCATTAAAATTTCATGTACTGATTCTTGAATACCGACTATGTTAGAATAGTCATGTGGT
ATGTTCTCAAATTTTGCACGTGTAATACATGTTCCTTCTATTTCGCCAAGTAAAGCTCTT
CGCATCGCAATGCCTATTGTGTCGGCTTGACCTTTCATAAGTGGAGACAGAATAAAGCGT
CCATAATAAAGACGCTTACTGTCTCTTCTTGATTCAACACACTTCCACTGTAGTGTCCGA
GTAGATACTTTGACTTTCTCTCGAACCATAGTA*TTTTATTTGATCAGATCATTGA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2B329TF 859 0 0
TGAAAA
GAAAAAGGGGTAAAGTAACTTGATGTTGATTGTTCTCTAAATAGAACGTTTCTTCTTCTA
CATGTAGAAAAGGAATAAATAAATTAATCAAATTCCGGGAGGCTTCATGAAGTGCTTCTT
TAGGAGTTAAACTTCCATTTGTCCATATTTCTAGAAAAAGAATCTCTTGTTTTTCATTCC
CATTTCCCATAAGAATGAATACTATGATTCGCATTTTGAACAGGCATGAATACAGCATCT
ATAGGATAACTTCGGTCTTCAAAGTTATTTGACATTTTTAGACTATATCCGCGATTCCTC
TCGATTTTTAATCCAATACACAAATTTATTGGTTCCGCTAAGGTAGCTATATGCTGTGTA
TTATCAACGATTTCCACAGAGGGCGGTAAAACTATGTCTCGAGCAGTTATATATCCGGGA
CCTTGGACACAAATAAGCGCGTTGCGCGTTCCATATAGATTACTTTTTAATACAATCTCG
TTCAAATTCATTAAAATTTCATGTACTGATTCTTGAATACCGACTATGTTAGAATAGTCA
TGTGGTATGTTCTCAAATTTTGCACGTGTAATACATGTTCCTTCTATTTCGCCAAGTAAA
GCTCTTCGCATCGCAATGCCTATTGTGTCGGCTTGACCTTTCATAAGTGGAGACAGAATA
AAGCGTCCATAATAAAGACGCTTACTGTCTATTCTTGATTCAACACACTTCCACTGTAGT
GTCCGAGTAGATACTTTGACTTTCTCTCGAACCATAGTAATTTTATTTGATCAGATCATT
GAATCATTTATCTCTCTTGAAACCCTCTCAGCCTTTATTTAGTTCTATACACGTCGTTTT
TTAGGGGGTCTAC

QA 7 859 7 859
DS 

RD RR2C632TF 765 0 0
CATA
TTCTAGAAAAAGAATCTCTG**TTTTCATTCCCATT*CCCATAAGAATGAATACTATGAT
TCGCATTT*GAACAGGCATGAATACAGCATCTATAGGATAACTTCGGTCTTCAAAGTTAT
TTGACATTTTTAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATACACAAATTTA
TTGGTTCCGTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAACGATTTCCACAGAGGGCGGTA
AAACTATGTCTCGAGCAGTTATATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCGCGTTGCGCG
TTCCATATAGATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAATTCATTAAAATTTCATGTACTG
ATTCTTGAATACCGACTATGTTAGAATAGTCATGTGGTATGTTCTCAAATTTTGCACGTG
TAATACATGTTCCTTCTATTTCGCCAAGTAAAGCTCTTCGCATCGCAATGCCTATTGTGT
CGGCTTGACCTTTCATAAGTGGAGACAGAATAAAGCGTCCATAATAAAGACGCTTACTGT
CTCTTCTTGATTCAACACACTTCCACTGTAGTGTCCGAGTAGATACTTTGACTTTCTCTC
GAACCATAGTAATTTTATTTGATCAGATCATTGAATAATTTATTTCTCTTGAAACCCTTT
CAGCCTTTATTTAGTTCTATACACGTCGTTTTTTAGGGGGTCTACAACCATTATGTGGCA
TAGGGGTTACATCTCGTACGAAACTTAAAAGTATACCGCT
C

QA 5 764 5 764
DS 

RD RR2BY86TF 691 0 0
AAAGTTATTTGACATTTT*AGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATACA
CAAATTTATTGGTTCCGTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAACGATTTCCACAGA
GGGCGGTAAAACTATGTCTCGAGCAGTTACATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCGC
GTTGCGCGTTCCATATAGATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAATTCATTAAAATTTC
ATGTACTGATTCTTGAATACCGACTATGTTAGAATAGTCATGTGGTATGTTCTCAAATTT
TGCACGTGTAATACATGTTCCTTCTATTTCGCCAAGTAAAGCTCTTCGCATCGCAATGCC
TATTGTGTCGGCTTGACCCTTCATAAGTGGAGACAGAATAAAGCGTCCATAATAAAGACG
CTTACTGTCTCTTCTTGATTCAACACACTTCCACTGTAGTGTCCGAGTAGATACTTTGAC
TTTCTCTCGAACCATAGTAATTTTATTTGATCAGATCATTGAATCATTTATTTCTCTTGA
AACCCTTTCAGCCTTTATTTAGTTCTATACACGTCGTTTTTTAGGGGGTCTACAACCATT
ATGTGGCATAGGGGTTACATCTCGTACGAAACTTAAAAGTATACCGCTTCTACGAATAGC
TCGTAATGCTGCATCTCTTCCCAGTCCAGGG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2GG08TF 473 0 0
ATCATTTATTTCTCTTGAAACCCTTTCAGCCTTTATTTAGTTCTATACACGTCGTTTTTT
AGGGGGTCTACAACCATTATGTGGCATAGGGGTTACATCTCGTACGAAACTTAAAAGTAT
ACCGCTTCTACGAATAGCTCGTAATGCTGCATCTCTTCCCAGTCCAGGGCCTTTTATCCT
TACTTCAGCTCGTTGCATACCTTGATCCACTACCGCTCGAATAGCATTTCCTGCTGCGGT
TTGAGCAGCAAAAGGTGTTCCTCTTCTTGTACCCCTGAATCCACAAGTACCCGCGGAGGA
CCAAGAAATCACCCGACCCCGTACATCTGTAACGGTCACAATGGTATTGTTGAAACTTGC
TTGAACATGAATAACTCCCTTTGGTATTCTACGTACATTTTTACGTGAACCACTACGGGT
ATTTTTACGTGAACCAATTCTTAATATAGGTTTTGCCATATTTTTTCATTTC
C

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2C849TF 595 0 0
CATCTCGTACGAAACTAAAAAGTATACCGCTTCTACGAATAGCTCGTAATGCTGCATCTC
TTCCCAGTCCAGGGCCTTTTATCCTTACTTCAGCTCGTTGCATACCTTGATCCACTACCG
CTCGAATAGCATTTCCTGCTGCGGTTTGAGCAGCAAAAGGTGTTCCTCTTCTTGTACCCC
TGAATCCACAAGTACCCGCGGAGGACCAAGAAATCACCCGACCCCGTACATCTGTAACGG
TCACAATGGTATTGTTGAAACTTGCTTGAACATGAATAACTCCCTTTGGTATTCTACGTA
CATTTTTACGTGAACCACTACGGGTATTTTTACGTGAACCAATTCTTAATATAGGTTTTG
CCATATTTTTTCATTTCACAAGAAATATATGGATATATCCATTTCATGTCAAAACGGACC
TTTTTTTTTACTAGCTCCTTGGAAGTGCCTTTTCCTTTATTTCCTTTAGTAAGATTATCC
TTGTCTTTGTTTATGCCTCGGGTTGGAACAAATTACTATAATTCGTCCCCTCCTACGGAT
TAGCCGACACTTTTCACAAATTTTACGAACGGAAGCCCTTATTTTCATAGTTGTT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2C662JQ 582 0 0
TTTT
GTAAGATTATCCTTGTCTTTGTTTATGCCTCGGGTTGGAACAAATTACTATAATTCGTCC
CCTCCTACGGATTAGCCGACACTTTTCACAAATTTTACGAACGGAAGCCCTTATTTTCAT
AGTTGTTATTCCTTAATTCTCTTAATATACTTATTCTTGGACGAAAAAAA*GGTTTCTTG
ATATTTTTGAATCTTGAATTGTATCTTCGTGAAAGGAATGTTGAATTTCAAAAAAACACT
GACTTATTTGAATCCTTGTTATGGAGTCTAGAAAGTGGCTGTTCCCCGATTAACTTAATA
CCTAAGAACTTACTAAAATTTTTAACTTTTTCTCCTATAGGTATACCTATACAAAAATAT
GTCGAATCCTTTCAGAAGCATGACCTAAAATAAAAAAAATCTTTAGTATCTAAACAAAAT
CGAACCATGCCGTTCGGAAGTGATTCATAAAGAAAACTTTCATTAATTCATTTTTTCTTT
AATTTCATTTGGGGTAAAACATTCTAAACTTTTTTAGCAGGGGTGGTATTACACAACCCC
CCCTTTTTTTTTCACAAATGGTAAGTTCCGGATATCC
C

QA 5 581 5 581
DS 

RD RR2C662TF 578 0 0
GTAAGATTATCCTTGTCTTTGTTTATGCCTCGGGTTGGAACAAATTACTATAATTCGTCC
CCTCCTACGGATTAGCCGACACTTTTCACAAATTTTACGAACGGAAGCCCTTATTTTCAT
AGTTGTTATTCCTTAATTCTCTTAATATACTTATTCTTGGACGAAAAAAA*GGTTTCTTG
ATATTTTTGAATCTTGAATTGTATCTTCGTGAAAGGAATGTTGAATTTCAAAAAAACACT
GACTTATTTGAATCCTTGTTATGGAGTCTAGAAAGTGGCTGTTCCCCGATTAACTTAATA
CCTAAGAACTTACTAAAATTTTTAACTTTTTCTCCTATAGGTATACCTATACAAAAATAT
GTCGAATCCTTTCAGAAGCATGACCTAAAATAAAAAAAATCTTTAGTATCTAAACAAAAT
CGAACCATGCCGTTCGGAAGTGATTCATAAAGAAAACTTTCATTAATTCATTTTTTCTTT
AATTTCATTTGGGGTAAAACATTCTAAACTTTTTTAGCAGGGGTGGTATTACACAACCCC
CCTTTTTTTTTTCACAAATGGTAAGTTCCGGATATCC
C

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2GZ94JQ 692 0 0
GTAAGATTATCCTTGTCTTTGTTTATGCCTCGGGTTGGAACAAATTACTATAATTCGTCC
CCTCCTACGGATTAGCCGACACTTTTCACAAATTTTACGAACGGAAGCCCTTATTTTCAT
AGTTGTTATTCCTTAATTCTCTTAATATACTTATTCTTGGACGAAAAAAA*GGTTTCTTG
ATATTTTTGAATCTTGAATTGTATCTTCGTGAAAGGAATGTTGAATTTCAAAAAACCACT
GACTTATTTGAATCCTTGTTATGGAGTCTAGAAAGTGGCTGTTCCCCGATTAACTTAATA
CCTAAGAACTTACTAAAATTTTTAACTTTTTCTCCTATAGGTATACCTATACAAAAATAT
GTCGAATCCTTTCAGAAGCATGACCTAAAATAAAAAAAATCTTTAGTATCTAAACAAAAT
CGAACCATGCCGTTCGGAAGTGATTCATAAAGAAAACTTTCATTAATTCATTTTTTCTTT
AATTTCATTTGGGGTAAAACATTCTAAACTTTTTTAGCAGGGGTGGTATTACACAACCCC
CC*TTTTTTTTTCACAAATGGTAAGTTCCGGATATCCAATTTTGATATTAGAAGGATTAC
CATATATAACACAAAATTTCTCCGCCGATTCTTTTTAGTCGAGCTTCTCGATCTGTCATT
ATACCTTGAGAAGTCGAAAGGATTACAATTCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2GZ94TF 692 0 0
GTAAGATTATCCTTGTCTTTGTTTATGCCTCGGGTTGGAACAAATTACTATAATTCGTCC
CCTCCTACGGATTAGCCGACACTTTTCACAAATTTTACGAACGGAAGCCCTTATTTTCAT
AGTTGTTATTCCTTAATTCTCTTAATATACTTATTCTTGGACGAAAAAAA*GGTTTCTTG
ATATTTTTGAATCTTGAATTGTATCTTCGTGAAAGGAATGTTGAATTTCAAAAAACCACT
GACTTATTTGAATCCTTGTTATGGAGTCTAGAAAGTGGCTGTTCCCCGATTAACTTAATA
CCTAAGAACTTACTAAAATTTTTAACTTTTTCTCCTATAGGTATACCTATACAAAAATAT
GTCGAATCCTTTCAGAAGCATGACCTAAAATAAAAAAAATCTTTAGTATCTAAACAAAAT
CGAACCATGCCGTTCGGAAGTGATTCATAAAGAAAACTTTCATTAATTCATTTTTTCTTT
AATTTCATTTGGGGTAAAACATTCTAAACTTTTTTAGCAGGGGTGGTATTACACAACCCC
CC*TTTTTTTTTCACAAATGGTAAGTTCCGGATATCCAATTTTGATATTAGAAGGATTAC
CATATATAACACAAAATTTCTCCGCCGATTCTTTTTAGTCGAGCTTCTCGATCTGTCATT
ATACCTTGAGAAGTCGAAAGGATTACAATTCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2EV08TF 774 0 0
TTTTTACTAGCTCCTTGGAAGTGC*TTTTCCTTTATTTCCTTTAGTAAGATTATC*TTGT
CTTTGTTTATGCCTCGGGTTGGAACAAATTACTATAATTCGTCCCCTC*TACGGATTAGC
CGACACTTTTCACAAATTTTACGAACGGAAGCCCTTATTTTCATAGTTGTTATTCCTTAA
TTCTCTTAATATACTTATTCTTGGACGAAAAAAAAGGTTTCTTGATATTTTTGAATCTTG
AATTGTATCTTCGTGAAAGGAATGTTGAATTTCAAAAAACCACTGACTTATTTGAAGCCT
TGTTATGGAGTCTAGAAAGTGGCTGTTCCCCGATTAACTTAATACCTAAGAACTTACTAA
AATTTTTAACTTTTTCTCCTATAGGTATACCTATACAAAAATATGTCGAATCCTTTCAGA
AGCATGACCTAAAATAAAAAAAATCTTTAGTATCTAAACAAAATCGAACCATGCCGTTCG
GAAGTGATTCATAAAGAAAACTTTCATTAATTCATTTTTTCTTTAATTTCATTTGGGGTA
AAACATTCTAAACTTTTTTAGCAGGGGTGGTATTACACAACCCCCCTTTTTTTTTTCACA
AATGGTAAGTTCCGGATATCCAATTTTGATATTAGAAGGATTACCATATATAACACAAAA
TTTCTCCGCCGATTCTTTTTAGTCGAGCTTCTCGATCTGTCATTATACCTTGAGAAGTCG
AAAGGATTACAATTCCTATTCCGCCTAAAATTCGTGGAATTCGTTGAGAGTTAG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2DZ37TF 614 0 0
TTTTTGAATCTTGAATTGTATCTTCGTGAAAGGAATGTTGAATTTCAAAAAACCACTGAC
TTATTTGAATCCTTGTTATGGAGTCTAGAAAGTGGCTGTTCCCCGATTAACTTAATACCT
AAGAACTTACTAAAATTTTTAACTTTTTCTCCTATAGGTATACCTATACAAAAATATGTC
GAATCCTTTCAGAAGCATGACCTAAAATAAAAAAAATCTTTAGTATCTAAACAAAATCGA
ACCATGCCGTTCGGAAGTGATTCATAAAGAAAACTTTCATTAATTCATTTTTTCTTTAAT
TTCATTTGGGGTAAAACATTCTAA*CTTTTTTAGCAGGGGTGGTATTACACAACCCCCC*
TTTTTTTTTCACAAATGGTAAGTTCCGGATATCCAATTTTGATATTAGAAGGATTACCAT
ATATAACACAAAATTTCTCCGCCGATTCTTTTTAGTCGAGCTTCTCGATCTGTCATTATA
CCTTGAGAAGTCGAAAGGATTACAATTCCTATTCCGCCTAAAATTCGTGGAATTCGTTGA
GAGTTAGAATAGATTCGTAGACCCGGTCGGCTTATTCTCTTTAAATTTAAAATAGTTTTA
TAGGATTCTTTCT
C

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2C892TF 628 0 0
CTTTAATTTCATTTGGGGTAAAACATTCTAAACTTTTT*AGCAGGGGTGGTATTACACAA
CCCCCC*TTTTTTTTTCACAAATGGTAAGTTCCGGATATCCAATTTTGATATTAGAAGGA
TTACCATATATAACACAAAATTTCTCCGCCGATTCTTTTTAGTCGAGCTTCTCGATCTGT
CATTATACCTTGAGAAGTCGAAAGGATTACAATTCCTATTCCGCCTAAAATTCGTGGAAT
TCGTTGAGAGTTAGAATAGATTCGTAGACCCGGTCGGCTTATTCTCTTTAAATTTAAAAT
AGTTTTATAGGATTCTTTCTTATTTCGTCTATGTCTTAGGGTTAAAATCAAAAAATATTG
ATTGTTTTCGCGATGTTTCCTTACGTTTTCGATAAAACCCTCTCGTAAAAGTATTTTAAC
AATGCTTTCGGTGATGTTAGTCGATCCTATCCGAACTGTTCCTTTTCTATTCATGTCAGC
ATTTCGTATAGAGGTTATTATATCAGCAATAGTGTCTTTCCCCATGATAAGTTAAAATTC
CTTAATTGTTCTATAATTTTGATATAATCAACATGTTATTTTTCTTTTATTTTTATAAAA
ATAGAGACGAATTATATATTAATATATG

QA 1 628 1 628
DS 



AS 3 25

CO CL43Contig1 667 5 9 U
GGGAAGCTCTCTAGCCGTCGCTGCCTACATCCTTGCCTCAAAGCTTTCACGGGAGCAGAA
CAGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTCCTAAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCA
GCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGAGACCTGGAAAGGGTGGAAACAGATTCGTGAAGA
ACATTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCATTCAAGGAACCTACATCGACAGTA
AATGTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATCAGAGGTCGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACT
CTGCTAAAATGCAGAGGACCATTATCGTCCGAAGGAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGT
ATCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTG
TCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATGCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGT
TCAATGTGTTGAAGGTGATTCCAGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCAAAGAAGGCTTTCACTG
GAGCCTAAAGAGTGTTTTTTATGCTAGTTTGTGTTTCTTGATAGTTTTGCTGAACTCTGT
TGTTATCTTTTTCAAGAAAAGAGGGATTTTACATTGAAGTTTCAGATTTTAAGTTTTATG
CACTGAT


BQ
20 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D054TF U 2
AF RR2C418JQ C 1
AF RR2CQ31JQ C 30
AF RR2CQ31TF U -1
AF RR2C418TF U 1
BS 1 167 RR2C418TF
BS 168 168 RR2D054TF
BS 169 294 RR2C418TF
BS 295 295 RR2D054TF
BS 296 605 RR2C418TF
BS 606 606 RR2CQ31TF
BS 607 623 RR2C418TF
BS 624 624 RR2CQ31TF
BS 625 667 RR2C418TF

RD RR2D054TF 453 0 0
GGAAGCTCTCTAGCCGTCGCTGCCTACATCCTTGCCTCAAAGCTTTCACGGGAGCAGAAC
AGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTCCTAAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCAG
CTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGAGACCTGGAAAGGGTGGAAACAGATTCGTGAAGAA
CATTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCATTCAAGGAACCTACATCGACAGTAA
ATGTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATCAGAGGTCGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACTC
TGCTAAAATGCAGAGGACCATTATCGTCCGAAGGAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGTA
TCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTGT
CAAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATG

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR2C418JQ 590 0 0
GGGAAGCTCTCTAGCCGTCGCTGCCTACATCCTTGCCTCAAAGCTTTCACGGGAGCAGAA
CAGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTCCTAAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCA
GCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGAGACCTGGAAAGGGTGGAAACGGATTCGTGAAGA
ACATTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCATTCAAGGAACCTACATCGACAGTA
AATGTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATCAGAGGTCGTATCTTAGCTGGTACTTACCACT
CTGCTAAAATGCAGAGGACCATTATCGTCCGAAGGAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGT
ATCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTG
TCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATGCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGT
TCAATGTGTTGAAGGTGATTCCAGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCAAAGAAGGCTTTCACTG
GAGCCTAAAGAGTGTTTTTTATGCTAGTTTGTGTTTCTTGATAGTTTTGC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2CQ31JQ 607 0 0
TCCTTGCCTCAAAGCTTTCACGGGAGCAGAACAGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAA
GCTTTCCTAAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCAGCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGAGA
CCTGGAAAGGGTGGAAACAGATTCGTGAAGAACATTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGT
GATGCCATTCAAGGAACCTACATCGACAGTAAATGTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATC
AGAGGTCGTATTTTAGCTGGTACTTGCCACTCTGCTAAAATGCAGAGGACCATTATCGTC
CGAAGGAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGTATCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAAC
ATCCCTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGA
CAATGCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATTCCAGCTGGT
GCTTCTGCTTTCGCAAAGAAGGCTTTCACTGGAGCCTAAAGAGTGTTTTTTATGCTAGTT
TGTGTTTCTTGATAGTTTTGCTGAACTCTGTTGTTATCTTTTTCAAGAAAAGAGGGATTT
TACATTG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2CQ31TF 638 0 0
GGGT
GAAGCTCTCTAGCCGTCGCTGCCTACATCCTTGCCTCAAAGCTTTCACGGGAGCAGAACA
GCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTCCTAAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCAGC
TCGAAGTTATCTGGAAAGGGAAAGAGACCTGGAAAGGGTGGAAACAGATTCGTGAAGAAC
ATTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCATTCAAGGAACCTACATCGACAGTAAA
TGTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATCAGAGGTCGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACTCT
GCTAAAATGCAGAGGACCATTATCGTCCGAAGGAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGTAT
CAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTGTC
AAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATGCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGTTC
AATGTGTTGAAGGTGATTCCAGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCAAAGAAGGCTTTCACTGGA
GCCTAAAGAGTGTTTTTTATGCTAGTTTGTGTTTCTTGATAGTTTTGCTGAACTCTGTTG
TTATCTTTTTCAAGAAAAGAGGGATTTTACATTG

QA 5 638 5 638
DS 

RD RR2C418TF 667 0 0
GGGAAGCTCTCTAGCCGTCGCTGCCTACATCCTTGCCTCAAAGCTTTCACGGGAGCAGAA
CAGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTCCTAAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCA
GCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGAGACCTGGAAAGGGTGGAAACGGATTCGTGAAGA
ACATTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCATTCAAGGAACCTACATCGACAGTA
AATGTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATCAGAGGTCGTATCTTAGCTGGTACTTACCACT
CTGCTAAAATGCAGAGGACCATTATCGTCCGAAGGAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGT
ATCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTG
TCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATGCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGT
TCAATGTGTTGAAGGTGATTCCAGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCAAAGAAGGCTTTCACTG
GAGCCTAAAGAGTGTTTTTTATGCTAGTTTGTGTTTCTTGATAGTTTTGCTGAACTCTGT
TGTTACCTTTTTCAAGAAAAGAGAGATTTTACATTGAAGTTTCAGATTTTAAGTTTTATG
CACTGAT

QA 1 667 1 667
DS 



CO CL43Contig2 688 6 2 U
GGGAAGCTCTCTAGCCGTCGCTGCCTACATCCTTGCCTCAAAGCTTTCACGGGAGCAGAA
CAGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTCCTAAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCA
GCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGAGACCTGGAAAGGGTGGAAACAGATTCGTGAAGA
ACATTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCATTCAAGGAACCTACATCGACAGTA
AATGTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATTAGAGGTCGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACT
CTGCCAAAATGCAGAGGACCATTATCGTCCGAAGGAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGT
ATCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTG
TCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATGCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGT
TCAATGTGTTGAAGGTGATACCAGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCAAAGAAGGCTTTCACTG
GCGCTTAAGAGTGCTTTTTTATGTTAGTTTATGTTTCTTGATAGACCTAAACTCTGTTGT
TACCTTTTTATTTTATGGAGATTTTTACCTTGAAGTTTCAGATTTTAATGCACTGATTTT
GTTTACTCTTCTATAGTATTTTCGTCCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2FG21JQ C 1
AF RR2FG21TF U 1
AF RR2CU83JQ C 1
AF RR2FX20TF U 334
AF RR2G214TF U 334
AF RR2CU83TF U 1
BS 1 333 RR2FG21TF
BS 334 688 RR2FX20TF

RD RR2FG21JQ 632 0 0
GGGAAGCTCTCTAGCCGTCGCTGCCTACATCCTTGCCTCAAAGCTTTCACGGGAGCAGAA
CAGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTCCTAAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCA
GCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGAGACCTGGAAAGGGTGGAAACAGATTCGTGAAGA
ACATTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCATTCAAGGAACCTACATCGACAGTA
AATGTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATTAGAGGTCGTATTTTAGCTGGTACTTGCCACT
CTGCCAAAATGCAGAGGACCATTATCGTCCGAAGGAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGT
ATCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTG
TCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATGCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGT
TCAATGTGTTGAAGGTGATACCAGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCAAAGAAGGCTTTCACTG
GCGCTTAAGAGTGCTTTTTTATGTTAGTTTATGTTTCTTGATAGACCTAAACTCTGTTGT
TACCTTTTTATTTTATGGAGATTTTTACCT
CG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2FG21TF 632 0 0
GGGAAGCTCTCTAGCCGTCGCTGCCTACATCCTTGCCTCAAAGCTTTCACGGGAGCAGAA
CAGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTCCTAAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCA
GCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGAGACCTGGAAAGGGTGGAAACAGATTCGTGAAGA
ACATTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCATTCAAGGAACCTACATCGACAGTA
AATGTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATTAGAGGTCGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACT
CTGCCAAAATGCAGAGGACCATTATCGTCCGAAGGAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGT
ATCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTG
TCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATGCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGT
TCAATGTGTTGAAGGTGATACCAGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCAAAGAAGGCTTTCACTG
GCGCTTAAGAGTGCTTTTTTATGTTAGTTTATGTTTCTTGATAGACCTAAACTCTGTTGT
TACCTTTTTATTTTATGGAGATTTTTACCT
CG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2CU83JQ 688 0 0
GGGAAGCTCTCTAGCCGTCGCTGCCTACATCCTTGCCTCAAAGCTTTCACGGGAGCAGAA
CAGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTCCTAAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCA
GCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGAGACCTGGAAAGGGTGGAAACAGATTCGTGAAGA
ACATTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCATTCAAGGAACCTACATCGACAGTA
AATGTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATTAGAGGTCGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACT
CTGCCAAAATGCAGAGGACCATTATCGTCCGAAGGAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGT
ATCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTG
TCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATGCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGT
TCAATGTGTTGAAGGTGATACCAGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCAAAGAAGGCTTTCACTG
GCGCTTAAGAGTGCTTTTTTATGTTAGTTTATGTTTCTTGATAGACCTAAACTCTGTTGT
TACCTTTTTATTTTATGGAGATTTTTACCTTGAAGTTTCAGATTTTAATGCACTGATTTT
GTTTACTCTTCTATAGTATTTTCGTCCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2FX20TF 355 0 0
GGAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGTATCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCC
CTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAAT
GCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATACCAGCTGGTGCTT
CTGCTTTCGCAAAGAAGGCTTTCACTGGCGCTTAAGAGTGCTTTTTTATGTTAGTTTATG
TTTCTTGATAGACCTAAACTCTGTTGTTACCTTTTTATTTTATGGAGATTTTTACCTTGA
AGTTTCAGATTTTAATGCACTGATTTTGTTTACTCTTCTATAGTATTTTCGTCCC

QA 1 355 1 355
DS 

RD RR2G214TF 355 0 0
GGAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGTATCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCC
CTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAAT
GCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATACCAGCTGGTGCTT
CTGCTTTCGCAAAGAAGGCTTTCACTGGCGCTTAAGAGTGCTTTTTTATGTTAGTTTATG
TTTCTTGATAGACCTAAACTCTGTTGTTACCTTTTTATTTTATGGAGATTTTTACCTTGA
AGTTTCAGATTTTAATGCACTGATTTTGTTTACTCTTCTATAGTATTTTCGTCCC

QA 1 355 1 355
DS 

RD RR2CU83TF 688 0 0
GGGAAGCTCTCTAGCCGTCGCTGCCTACATCCTTGCCTCAAAGCTTTCACGGGAGCAGAA
CAGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTCCTAAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCA
GCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGAGACCTGGAAAGGGTGGAAACAGATTCGTGAAGA
ACATTGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGATGCCATTCAAGGAACCTACATCGACAGTA
AATGTCCCTTCACTGGAACTGTTTCGATTAGAGGTCGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACT
CTGCCAAAATGCAGAGGACCATTATCGTCCGAAGGAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGT
ATCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTG
TCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATTGGACAATGCAGGCCTTTGTCCAAGACTGTGAGGT
TCAATGTGTTGAAGGTGATACCAGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCAAAGAAGGCTTTCACTG
GCGCTTAAGAGTGCTTTTTTATGTTAGTTTATGTTTCTTGATAGACCTAAACTCTGTTGT
TACCTTTTTATTTTATGGAGATTTTTACCTTGAAGTTTCAGATTTTAATGCACTGATTTT
GTTTACTCTTCTATAGTATTTTCGTCCC

QA 1 688 1 688
DS 



CO CL43Contig3 726 14 18 U
ACTTAAAACGAGATTTTGGAAATGGGATGAAAGTGGTATAGCAAAATAAACAAAATCGAT
GCATTAAAACATTAATATCTGAACACTCAAATGTAAAATTCTTCCATAGATAAAAGGGAT
AAAAGCATCCAAAAACATAAACTAAGCTGAAAAGCTCCCTTCTTACATTCCAGTAAAAGC
CTTCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAATCACCTTCAATACATTGAACCTCACAGT
CTTGGACAATGGCCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAGCA
TGGTGAGACATGAGCAGGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTCGTACCTCTGATACTTCTTGAC
AAAGTGGAGATAGTTCCTTCTCACAATGATGGTCCTCTGCATCTTGGCGCTGTGGCAAGT
ACCAGCTAAGATACGGCCTCTGATGGAAACAGTTCCGGTGAAGGGACATTTTCTGTCAAT
GTAAGTTCCTTGAATAGCTTCACGAGGAGTCTTGAAGCCCAAACCGATGTTCTTGGAGAA
ACGGTTTCCACCCTTCCCAGGTCGCTTTCCCTTTCCAGATATCTTCGAGCTAAGGAAGAC
CTTAGGTTGCTTTAGAAAAGCCTTCTCAGTCTGTTCCGCCATGGCTGCTGTTTTGTGAAA
GCTTGAGGCGAGGATGTAGGAGACGATATGATAGGAGAGGCAGAGACGGCTAAAGCTTCG
AGAGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 45 30 45 45 45 
45 45 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 50 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 15 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 20 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 5 75 45 75 75 75 40 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 55 70 70 
70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 10 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
35 35 10 10 10 10 

AF RR2C655JQ U 105
AF RR2CP48JQ U 199
AF RR2C655TF C 40
AF RR2FD57JQ U 63
AF RR2DK01JQ U 40
AF RR2DK01TF C 40
AF RR2A289JQ U 56
AF RR2A289TF C 56
AF RR2FD57TF C 147
AF RR2EP63JQ U 1
AF RR2EP63TF C 1
AF RR2A480JQ U 63
AF RR2CP48TF C 57
AF RR2A480TF C 63
BS 1 145 RR2EP63JQ
BS 146 147 RR2DK01JQ
BS 148 213 RR2EP63JQ
BS 214 214 RR2DK01JQ
BS 215 339 RR2EP63JQ
BS 340 340 RR2DK01JQ
BS 341 423 RR2EP63JQ
BS 424 424 RR2DK01JQ
BS 425 447 RR2EP63JQ
BS 448 448 RR2DK01JQ
BS 449 456 RR2EP63JQ
BS 457 457 RR2DK01JQ
BS 458 552 RR2EP63JQ
BS 553 553 RR2DK01JQ
BS 554 588 RR2EP63JQ
BS 589 589 RR2DK01JQ
BS 590 722 RR2EP63JQ
BS 723 726 RR2A480JQ

RD RR2C655JQ 177 0 0
CATAGATAAAAGGGATAAAAGCATCCAAAAACATAAACTAAGCTGAAAAGCCCCGTTCTT
ACATTCCAGTAAAAGCCTTCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAATCACCTTCAATA
CATTGAACCTCACAGTCTTGGACAATGGCCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTCTC

QA 1 177 1 177
DS 

RD RR2CP48JQ 338 0 0
AA
CACCAGCTGGAATCACCTTCAATACATTGAACCTCACAGTCTTGGACAATGGCCTGCATT
GGCCGATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAGCATGGTGAGACATGAGCAGGGA
TGTTCGAGTGCCTCTTCTCGTACCTCTGATACTTCTTGACAAAGTGGAAATAGTTCCTTC
TCACAATGATGGTCCTCTGCATCTTGGCGCTGTGGCAAGTACCGGCTAAAATACGGCCTC
TGATGGAGACAGTTCCAGTGAAGGGACATTTTCTGTCAATGTAAGTTCCTTGAATAGCTT
CACGAGGAGTCTTGAAGCCCAAACCGATGTTCTTGG

QA 3 338 3 338
DS 

RD RR2C655TF 503 0 0
CCAATGAATTAAT
AAATTGATGCATTAAAACATTAATATCTGAACACTCGAATGTAGAATTCTTCCATAGATA
AAAGGGATAAAAGCATCCAAAAACATAAACTAAGCTGAAAAGCCCCGTTCTTACATTCCA
GTAAAAGCCTTCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAATCACCTTCAATACATTGACC
CTCACAGTCTTGGACAATGGCCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACA
CGGAAGCATGGTGAGACATGAGCAGGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTCGTACCTCTGATAC
TTCTTGACAAAGTGGAGATAGTTCCTTCTCACGATGATGGTCCTCTGCATCTTGGCGCTG
TGGCAAGTACCAGCTAAGATACGGCCTCTGATGGAAACAGTTCCGGTGAAGGGACATTTT
CTGTCAATGTAAGTTCCTTGAATGGCTTCACGAGGAGTCTTGAAGCCCAAACCGATGTTC
TTGGAGAAAC

QA 14 503 14 503
DS 

RD RR2FD57JQ 529 0 0
ATTAAAACATTAATATCTGAACACTCGAATGTAGAATTCTTCCATAGATAAAAGGGATAA
AAGCATCCAAAAACATAAACTAAGCTGAAAAGCCCCGTTCTTACATTCCAGTAAAAGCCT
TCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAATCACCTTCAATACATTGAACCTCACAGTCT
TGGACAATGGCCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAGCATG
GTGAGACATGAGCAGGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTCGTACCTCTGATACTTCTTGACAA
AGTGGAGATAGTTCCTTCTCACGATGATGGCCCTCTGCATCTTGGCGCTGTGGCAAGTAC
CAGATAAGATACGGCCTCTGATGGAAACAGTTCCGGTGAAGGGACATTTTCTGTCAATGT
AAGTTCCTTGAATGGCTTCACGAGGAGTCTTGAAGCCCAAACCGATGTTCTTGGAGAAAC
GGTTTCCACCCTTTCCAGGTCGCTTTCCCTTTCCAGATATCTTCGAGCT

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2DK01JQ 568 0 0
AGCAAAATAAACAAAATCGATGCATTAAAACATTAATATCTGAACACTCGAATGTAGAAT
TCTTCCATAGATAAAAGGGATAAAAGCATCCAAAAACATAAACTAAGCTGAAAAGCCCCG
TTCTTACATTCCAGTAAAAGCCTTCTTCGCGAAAGCAAAAGCACCAGCTGGAATCACCTT
CAATACATTGAACCTCACAGTCTTGGACAATGGCCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTC
TCCTTCCTTGACACGGAAGCATGGTGAGACATGAGCAGGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTC
GTACCTCTGATACTTCTTGACAAAGTGGAAATAGTTCCTTCTCACGATGATGGTCCTCTG
CATCTTGGCGCTGTGGCAAGTACCAGCTAAAATACGGCCTCTGATGGAAACAGTTCCGGT
GAAGGGACATTTTCTGTCAATGTAAGTTCCTTGAATGGCTTCACGAGGAGTCTTGAAGCC
CAAACCGATGTTCTTGGAGAAACGGTTTCCACCCTTTCCAGGTCGCTTTCCCTTTCCAGA
TATCTTCGAGCTAAGGAAGACCTTAGG
C

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2DK01TF 568 0 0
AGCAAAATAAACAAAATCGATGCATTAAAACATTAATATCTGAACACTCGAATGTAGAAT
TCTTCCATAGATAAAAGGGATAAAAGCATCCAAAAACATAAACTAAGCTGAAAAGCCCCG
TTCTTACATTCCAGTAAAAGCCTTCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAATCACCTT
CAATACATTGAACCTCACAGTCTTGGACAATGGCCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTC
TCCTTCCTTGACACGGAAGCATGGTGAGACATGAGCAGGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTC
GTACCTCTGATACTTCTTGACAAAGTGGAGATAGTTCCTTCTCACGATGATGGTCCTCTG
CATCTTGGCGCTGTGGCAAGTACCAGCTAAGATACGGCCTCTGATGGAAACAGTTCCGGT
GAAGGGACATTTTCTGTCAATGTAAGTTCCTTGAATGGCTTCACGAGGAGTCTTGAAGCC
CAAACCGATGTTCTTGGAGAAACGGTTTCCACCCTTTCCAGGTCGCTTTCCCTTTCCAGA
TATCTTCGAGCTAAGGAAGACCTTAGG
C

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2A289JQ 666 0 0
TCGATGCATTAAAACATTAATATCTTAACACTCAAATGTAAAATTCTTCCATAGATAAA*
GGGATAAAAGCATCCAAAAACATAAACTAAGCTGAAAAGCTCCCTTCTTACATTCCAGTA
AAAGCCTTCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAATAACCTTCAACACATTGAACCTC
ACAGTCTTGGACAATGGCCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGG
AAGCATGGTGAGACATGAGCAGGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTCGTACCTCTGATACTTC
TTGACAAAGTGGAGATAGTTCCTTCTCACAATGATGGTCCTCTGCATCTTGGCGCTGTGG
CAAGTACCAGCTAAAATACGGCCTCTGATGGAAACAGTTCCGGTGAAGGGACATTTTCTG
TCAATGTAAGTTCCTTGAATAGCTTCACGAGGAGTCTTGAAGCCCAAACCGATGTTCTTG
GAAAAACGGTTTCCACCCTTCCCAGGTCGCTTTCCCTTTCCAAATATCTTCGAGCTAAGG
AAGACCTTAGGTTGCTTTAGAAAAGCCTTCTCAGTCTGTTCCGCCATGGCTGCTGTTTTG
TGAAAGCTTGAGGCAAGGATGTAGGAGACGATATGATAGGAGAGGCAGAGACGGCTAAAG
CTTC
CC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2A289TF 666 0 0
TCGATGCATTAAAACATTAATATCTTAACACTCAAATGTAAAATTCTTCCATAGATAAA*
GGGATAAAAGCATCCAAAAACATAAACTAAGCTGAAAAGCTCCCTTCTTACATTCCAGTA
AAAGCCTTCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAATAACCTTCAACACATTGAACCTC
ACAGTCTTGGACAATGGCCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGG
AAGCATGGTGAGACATGAGCAGGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTCGTACCTCTGATACTTC
TTGACAAAGTGGAGATAGTTCCTTCTCACAATGATGGTCCTCTGCATCTTGGCGCTGTGG
CAAGTACCAGCTAAGATACGGCCTCTGATGGAAACAGTTCCGGTGAAGGGACATTTTCTG
TCAATGTAAGTTCCTTGAATAGCTTCACGAGGAGTCTTGAAGCCCAAACCGATGTTCTTG
GAGAAACGGTTTCCACCCTTCCCAGGTCGCTTTCCCTTTCCAGATATCTTCGAGCTAAGG
AAGACCTTAGGTTGCTTTAGAAAAGCCTTCTCAGTCTGTTCCGCCATGGCTGCTGTTTTG
TGAAAGCTTGAGGCAAGGATGTAGGAGACGATATGATAGGAGAGGCAGAGACGGCTAAAG
CTTC
CC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2FD57TF 575 0 0
CTGAAAAGCCCCGTTCTTACATTCCAGTAAAAGCCTTCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAG
CTGGAATCACCTTCAATACATTGAACCTCACAGTCTTGGACAATGGCCTGCATTGGCCGA
TGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAGCATGGTGAGACATGAGCAGGGATGTTCG
AGTGCCTCTTCTCGTACCTCTGATACTTCTTGACAAAGTGGAGATAGTTCCTTCTCACGA
TGATGGCCCTCTGCATCTTGGCGCTGTGGCAAGTACCAGATAAGATACGGCCTCTGATGG
AAACAGTTCCGGTGAAGGGACATTTTCTGTCAATGTAAGTTCCTTGAATGGCTTCACGAG
GAGTCTTGAAGCCCAAACCGATGTTCTTGGAGAAACGGTTTCCACCCTTTCCAGGTCGCT
TTCCCTTTCCAGATATCTTCGAGCTAAGGAAGACCTTAGGTTGCTTTAGAAAAGCCTTCT
CAGTCTGTTCCGCCATGGTTGCTGTTTTGTGAAAGCTTGAGGAAAGAACGTAGGAGACGA
TA*****GGAGAGGCAGAGACGGCTAAAGCTTC
CC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2EP63JQ 724 0 0
ACTTAAAACGAGATTTTGGAAATGGGATGAAAGTGGTATAGCAAAATAAACAAAATCGAT
GCATTAAAACATTAATATCTGAACACTCAAATGTAAAATTCTTCCATAGATAAAAGGGAT
AAAAGCATCCAAAAACATAAACTAAAATGAAAAGCTCCCTTCTTACATTCCAGTAAAAGC
CTTCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAATTACCTTCAATACATTGAACCTCACAGT
CTTGGACAATGGCCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAGCA
TGGTGAGACATGAGCAGGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTCATACCTCTGATACTTCTTGAC
AAAGTGGAGATAGTTCCTTCTCACAATGATGGTCCTCTGCATCTTGGCGCTGTGGCAAGT
ACCGGCTAAGATACGGCCTCTGATGGAGACAGTTCCAGTGAAGGGACATTTTCTGTCAAT
GTAAGTTCCTTGAATAGCTTCACGAGGAGTCTTGAAGCCCAAACCGATGTTCTTGGAGAA
ACGGTTTCCACCTTTCCCAGGTCGCTTTCCCTTTCCAGATATCTTCGAACTAAGGAAGAC
CTTAGGTTGCTTTAGAAAAGCCTTCTCAGTCTGTTCCGCCATGGCTGCTGTTTTGTGAAA
GCTTGAGGCGAGGATGTAGGAGACGATATGATAGGAGAGGCAGAGACGGCTAAAGCTTCG
AG
CC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2EP63TF 724 0 0
ACTTAAAACGAGATTT*GGAAATGGGATGAAAGTGGTATAGCAAAATAAACAAAATCGAT
GCATTAAAACATTAATATCTGAACACTCAAATGTAAAATTCTTCCATAGATAAAAGGGAT
AAAAGCATCCAAAAACATAAACTAAAATGAAAAGCTCCCTTCTTACATTCCAGTAAAAGC
CTTCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAATTACCTTCAATACATTGAACCTCACAGT
CTTGGACAATGGCCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAGCA
TGGTGAGACATGAGCAGGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTCATACCTCTGATACTTCTTGAC
AAAGTGGAGATAGTTCCTTCTCACAATGATGGTCCTCTGCATCTTGGCGCTGTGGCAAGT
ACCGGCTAAGATACGGCCTCTGATGGAGACAGTTCCAGTGAAGGGACATTTTCTGTCAAT
GTAAGTTCCTTGAATAGCTTCACGAGGAGTCTTGAAGCCCAAACCGATGTTCTTGGAGAA
ACGGTTTCCACCTTTCCCAGGTCGCTTTCCCTTTCCAGATATCTTCGAACTAAGGAAGAC
CTTAGGTTGCTTTAGAAAAGCCTTCTCAGTCTGTTCCGCCATGGCTGCTGTTTTGTGAAA
GCTTGAGGCGAGGATGTAGGAGACGATATGATAGGAGAGGCAGAGACGGCTAAAGCTTCG
AG
CC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2A480JQ 664 0 0
ATTAAAACATTAATATCTGAACACTCAAATGTAAAATTCTTCCATAGATAAAAGGGATAA
AAGCATCCAAAAACATAAACTAAAATGAAAAGCTCCCTTCTTACATTCCAGTAAAAGCCT
TCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAATCACCTTCAATACATTGAACCTCACAGTCT
TGGACAATGGCCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAGCATG
GTGAGACATGAGCAGGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTCGTACCTCTGATACTTCTTGACAA
AGTGGAGATAGTTCCTTCTCACAATGATGGTCCTCTGCATCTTGGCGCTGTGGCAAGTAC
CGGCTAAGATACGGCCTATGATGGAGACAGTTCCAGTGAAGGGACATTTTCTGTCAATGT
AAGTTCCTTGAATAGCTTCACGAGGAGTCTTGAAGCCCAAACCGATGTTCTTGGAGAAAC
GGTTTCCACCTTTCCCAGGTCGCTTTCCCTTTCCAGATATCTTCGAACTAAGGAAGACCT
TAGGTTGCTTTAGAAAAGCCTTCTCAGTCTGTTCCGCCATGGCTGCTGTTTTGTGAAAGC
TTGAGGCGAGGATGTAGGCGACGATATGATAGGAGAGGCAGAGACGGCTAAAGCTTCGAG
AGTC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2CP48TF 668 0 0
TCGATGCA
TAAAACATTAATATCTGAACACTCAAATGTAAAATTCCTCCATAGATAAAAGGGATAAAA
GCATCCAAAAACATAAACTAAAATGAAAAGCTCCCTTCTTACATTCCAGTAAAAGCCTTC
TTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAATCACCTTCAATACATTGAACCTCACAGTCTTG
GACAATGGCCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAGCATGGT
GAGACATGAGCAGGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTCGTACCTCTGATACTTCTTGACAAAG
TGGAGATAGTTCCTTCTCACAATGATGGTCCTCTGCATCTTGGCGCTGTGGCAAGTACCG
GCTAAGATACGGCCTCTGATGGAGACAGTTCCAGTGAAGGGACATTTTCTGTCAATGTAA
GTTCCTTGAATAGCTTCACGAGGAGTCTTGAAGCCCAAACCGATGTTCTTGGAGAAACGG
TTTCCACCTTTCCCAGGTCGCTTTCCCTTTCCAGATATCTTCGAACTAAGGAAGACCTTA
GGTTGCTTTAGAAAAGCCTTCTCAGTCTGTTCCGCCATGGCTGCTGTTTTGTGAAAGCTT
GAGGCGAGGATGTAGGAGACGATATGATAGGAGAGGCAGAGACGGCTAAAGCTTCGAG
CC

QA 9 666 9 666
DS 

RD RR2A480TF 664 0 0
ATTAAAACATTAATATCTGAACACTCAAATGTAAAATTCTTCCATAGATAAAAGGGATAA
AAGCATCCAAAAACATAAACTAAAATGAAAAGCTCCCTTCTTACATTCCAGTAAAAGCCT
TCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAATCACCTTCAATACATTGAACCTCACAGTCT
TGGACAATGGCCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAGCATG
GTGAGACATGAGCAGGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTCGTACCTCTGATACTTCTTGACAA
AGTGGAGATAGTTCCTTCTCACAATGATGGTCCTCTGCATCTTGGCGCTGTGGCAAGTAC
CGGCTAAGATACGGCCTATGATGGAGACAGTTCCAGTGAAGGGACATTTTCTGTCAATGT
AAGTTCCTTGAATAGCTTCACGAGGAGTCTTGAAGCCCAAACCGATGTTCTTGGAGAAAC
GGTTTCCACCTTTCCCAGGTCGCTTTCCCTTTCCAGATATCTTCGAACTAAGGAAGACCT
TAGGTTGCTTTAGAAAAGCCTTCTCAGTCTGTTCCGCCATGGCTGCTGTTTTGTGAAAGC
TTGAGGCGAGGATGTAGGCGACGATATGATAGGAGAGGCAGAGACGGCTAAAGCTTCGAG
AGTC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 4 24

CO CL44Contig1 777 7 4 U
TTTACGCTTAGGGATTAGGAAAGATCTCTCGTCGCTTCTCTCTCCATCTCTCATACCCAT
GGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGCCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAACCGC
ATCCTCACCATCCGCTTCACTCTCCGCTCGGCGAATCTTCACCGTGTCACCCGACTCAGC
AGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGGCTCCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACC
ACGAAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAAGAAACCACTACAGACATAGTTACGATAGT
CAACGACACAACATGGGACTCTCTAGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTT
TTGGGCACCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCGCTCGTGAACGAGCTAGCAAG
AGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCC
AAGCAAGTACAATGTCAGAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAA
GGATGCGATCATAGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTT
GCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTGTCTCCCCCCCCCCCCCTTCT
TGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTATTTGCTTCTTCCATTGTATCTTT
TCTTCATCACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATATGATGTCATGTTTTTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 

AF RR2G639TF U 29
AF RR2G639JQ C 371
AF RR2GC64TF U 29
AF RR2AI92JQ C 1
AF RR2BK75JQ C 40
AF RR2AI92TF U 4
AF RR2BK75TF U 15
BS 1 8 RR2AI92JQ
BS 9 246 RR2AI92TF
BS 247 247 RR2GC64TF
BS 248 777 RR2AI92TF

RD RR2G639TF 609 0 0
GGGTCGCTTCTCTCTCCATCTCTCATACCCATGGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGCCCT
CCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAACCGCATCCTCACCATCCGCTTCACTCTCCGCT
CGGCGAATCTTCACCGTGTCACCCGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGGCT
CCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACCACGAAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCT
CAAGAAACCACTACAGACATAGTTACGATAGTCAACGACACAACATGGGACTCTCTAGTT
CTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCTTGCAAA
ATGATTGACCCGCTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTAC
AAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAATGTCAGAAGCATCCCA
ACGATCATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATTCGATCATAGGTGCAGTGCCTAGA
TCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGA
GATCTGTGT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2G639JQ 248 0 0
TGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCGCTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACACC
GGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTAC
AATGTCAGAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATTCGATC
ATAGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTTTTGCAATGAGAC
TACACTGT

QA 1 248 1 248
DS 

RD RR2GC64TF 686 0 0
GGGTCGCTTCTCTCTCCATCTCTCATACCCATGGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGCCCT
CCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAACCGCATCCTCACCATCCGCTTCACTCTCCGCT
CGGCGAATCTTCACCGTGTCACCCGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGGCT
CCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACCACGAAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCT
CAAGAAACCACTACAGACATAGTTACGATAGTCGACGACACAACATGGGACTCTCTAGTT
CTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCTTGCAAA
ATGATTGACCCGCTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTAC
AAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAATGTCAGAAGCATCCCA
ACGATCATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATGCGATCATAGGTGCAGTGCCTAGA
TCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGGGTCTGTGA
GATCTGTGTCTGTCTCCCCCCCCCCCCCTTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAAT
TTGTAGCTATTTGCTTCTTC
ATTGTA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2AI92JQ 777 0 0
TTTACGCTTAGGGATTAGGAAAGATCTCTCGTCGCTTCTCTCTCCATCTCTCATACCCAT
GGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGCCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAACCGC
ATCCTCACCATCCGCTTCACTCTCCGCTCGGCGAATCTTCACCGTGTCACCCGACTCAGC
AGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGGCTCCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACC
ACGAAGGAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAAGAAACCACTACAGACATAGTTACGATAGT
CAACGACACAACATGGGACTCTCTAGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTT
TTGGGCACCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCGCTCGTGAACGAGCTAGCAAG
AGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTTTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCC
AAGCAAGTACAATGTCAGAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAA
GGATGCGATCATAGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTT
GCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTGTCTCCCCCCCCCCCCCTTCT
TGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTATTTGCTTCTTCCATTGTATCTTT
TCTTCATCACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATATGATGTCATGTTTTTGTGTT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2BK75JQ 738 0 0
CTCTCCATCTCTCATACCCATGGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGCCCTCCCGTTTCCCT
CCGTTCGGAGGCAAGAACCGCATCCTCACCATCCGCTTCACTCTCCGCTCGGCGAATCTT
CACCGTGTCACCCGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGGCTCCACCTTCGTT
GACCTCGAAGGTTCCTCGACCACGAAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAAGAAACCAC
TACAGACATAGTTACGATAGTCAACGACACAACATGGGACTCTCTAGTTCTCAAGGCGGA
CGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCC
GCTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTTTACAAACTGAACAC
GGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAATGTCAGAAGCATCCCAACGATCATGAT
CTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATGCGATCATAGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCAC
ATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTGTGTCT
GTCTCCCCCCCCCCCCCTTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTATT
TGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTCATCACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATATG
ATGTCATGTTTTTGTGTT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2AI92TF 774 0 0
ACGCT
TAGGGATTAGGAAAGATCTCTCGTCGCTTCTCTCTCCATCTCTCATACCCATGGCTGCTT
TCACTTGTACCTCTCGCCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAACCGCATCCTCAC
CATCCGCTTCACTCTCCGCTCGGCGAATCTTCACCGTGTCACCCGACTCAGCAGGATTGA
GAATCCGTCTTTCCCAGGCTCCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACCACGAAGGA
GAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAAGAAACCACTACAGACATAGTTACGATAGTCAACGACA
CAACATGGGACTCTCTAGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCAC
CATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCGCTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACA
CCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGT
ACAATGTCAGAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATGCGA
TCATAGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAG
ACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTGTCTCCCCCCCCCCCCCTTCTTGTCTTGT
GTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTATTTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTCATC
ACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATATGATGTCATGTTTTTGTGTT

QA 6 774 6 774
DS 

RD RR2BK75TF 769 0 0
GG
AGGAAAGATCTCTCGTCGCTTCTCTCTCCATCTCTCATACCCATGGCTGCTTTCACTTGT
ACCTCTCGCCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAACCGCATCCTCACCATCCGCT
TCACTCTCCGCTCGGCGAATCTTCACCGTGTCACCCGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGT
CTTTCCCAGGCTCCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACCACGAAGAAGAGGTGTC
GTCTGTGAAGCTCAAGAAACCACTACAGACATAGTTACGATAGTCAACGACACAACATGG
GACTCTCTAGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCACCATGGTGT
GGACCTTGCAAAATGATTGACCCGCTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAG
GTCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAATGTC
AGAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATGCGATCATAGGT
GCAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACT
GTGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTGTCTCCCCCCCCCCCC*TTCTTGTCTTGTGTTCTCAT
TCTCTCTGTAATTTGTAGCTATTTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTCATCACTGAACA
TCTAGACATGGATAA*TAATATGATGTCATGTTTT
GTGTAAAAAAAA

QA 3 757 3 757
DS 



CO CL44Contig2 777 4 30 U
TTTTTACGCTAGGGATTAAGAAAGATCTCTCGTTTGCTTCTCTCTCCATCTCTCATAGCC
ATGGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCTTCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGTCAAGAATC
GCATCCTCACCATCCGCTTCACTCTCCGCTAAGCGAATCTTCGCCGTCTCGCCTGACTCA
GCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCAGCTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGA
CCACGTAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAGGAAACCACTACAGACATAGTTACAATA
GTCAACGACACGACATGGGACTCTCTAGTTCCCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGAC
TTTTGGGCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCA
AGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCGACC
CCAAGCAAGTACAATGTCAGAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGCGAGAAG
AAAGATGCTATCATAGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACTTCTAGCATTGACAAGTTC
TTGCAATGAGACTACACTGTGATTCTGTGAGACCTGTGTCTTGTTGTCTCCCCCCCTCTT
GTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTATCTGCTTCTTCCATTGTATCTTTT
CTTTCATCACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATATGATGTCATGTTTTTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DF90TF U 1
AF RR2DI32TF U 17
AF RR2AD34TF U 6
AF RR2AD34JQ C 161
BS 1 5 RR2DF90TF
BS 6 6 RR2AD34TF
BS 7 18 RR2DF90TF
BS 19 19 RR2AD34TF
BS 20 34 RR2DF90TF
BS 35 35 RR2AD34TF
BS 36 85 RR2DF90TF
BS 86 86 RR2AD34TF
BS 87 214 RR2DF90TF
BS 215 215 RR2AD34TF
BS 216 308 RR2DF90TF
BS 309 309 RR2AD34TF
BS 310 311 RR2DF90TF
BS 312 312 RR2AD34TF
BS 313 326 RR2DF90TF
BS 327 327 RR2AD34TF
BS 328 331 RR2DF90TF
BS 332 332 RR2AD34TF
BS 333 476 RR2DF90TF
BS 477 477 RR2AD34TF
BS 478 509 RR2DF90TF
BS 510 510 RR2AD34TF
BS 511 554 RR2DF90TF
BS 555 555 RR2AD34TF
BS 556 622 RR2DF90TF
BS 623 623 RR2AD34TF
BS 624 632 RR2DF90TF
BS 633 633 RR2AD34TF
BS 634 635 RR2DF90TF
BS 636 777 RR2AD34TF

RD RR2DF90TF 635 0 0
TTTTTGCGCTAGGGATTAGGAAAGATCTCTCGTT*GCTTCTCTCTCCATCTCTCATAGCC
ATGGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGTCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGTCAAGAATC
GCATCCTCACCATCCGCTTCACTCTCCGCTAAGCGAATCTTCGCCGTCTCGCCTGACTCA
GCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCAGTTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGA
CCACGTAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAGGAAACCACTACAGACATAGTTACAATA
GTCAACGATACCACATGGGACTCTCTTGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGAC
TTTTGGGCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCA
AGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACC
CCAAGCAAGTACAATGTCAGAAGCATCCCGACGATCATGATCTTTGTCAATGGCGAGAAG
AAAGATGCTATCATTGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACTTCTAGCATTGACAAGTTC
TTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2DI32TF 640 0 0
GAA
GAAAGATCTCTCGTTTGCTTCTCTCTCCATCTCTCATAGCCATGGCTGCTTTCACTTGTA
CCTCTCTTCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGTCAAGAATCGCATCCTCACCATCCGCTT
CACTCTCCGCTAAGCGAATCTTCGCCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTC
TTTCCCAGTCTCCAGCTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACCACGTAGAAGAGGTGTCG
TCTGTGAAGCTCAGGAAACCACTACAGACATAGTTACAATAGTCAACGACACGACATGGG
ACTCTCTAGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTG
GACCTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAGG
TCAAGTTCTACAAACTGAGCACGGACGACTCTCCTTCGACCCCAAGCAAGTACAATGTCA
GAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGCGAGAAGAAAGATGCTATCATAGGTG
CAGTGCCTAGATCCACACTCACTTCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTG
TGAGTCTGTGAGACCTGTGTCTTGT
TGTCTCCCCCCC

QA 4 628 4 628
DS 

RD RR2AD34TF 772 0 0
ACGCTAGGGATTAAGAAAGATCTCTCGTTTGCTTCTCTCTCCATCTCTCATAGCCATGGC
TGCTTTCACTTGCACCTCTCTTCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGTCAAGAATCGCATC
CTCACCATCCGCTTCACTCTCCGCTAAGCGAATCTTCGCCGTCTCGCCTGACTCAGCAGG
ATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCAGCTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACCACG
TAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAGGAAACCACTACAGACATAGTTACAATAGTCAA
CGACACGACATGGGACTCTCTAGTTCCCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTG
GGCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGA
GTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCGACCCCAAG
CAAGTACAATGTCAGAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGCGAGAAGAAAGA
TGCTATCATAGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACTTCTAGCATTGACAAGTTCTTGCA
ATGAGACTACACTGTGATTCTGTGAGACCTGTGTCTTGTTGTCTCCCCCCCTCTTGTCTT
GTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTATCTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTTC
ATCACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATATGATGTCATGTTTTTGTGTT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2AD34JQ 617 0 0
TCGCCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCAGCTTCGT
TGACCTCGAAGGTTCCTCGACCACGTAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAGGAAACCA
CTACAGACATAGTTACAATAGTCAACGACACGACATGGGACTCTCTAGTTCCCAAGGCGG
ACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACC
CACTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTGAACA
CGGACGACTCTCCTTCGACCCCAAGCAAGTACAATGTCAGAAGCATCCCAACGATCATGA
TCTTTGTCAATGGCGAGAAGAAAGATGCTATCATAGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCA
CTTCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGATTCTGTGAGACCTGTGTC
TTGTTGTCTCCCCCCCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTATCTG
CTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTTCATCACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATATGA
TGTCATGTTTTTGTGTT

QA 1 617 1 617
DS 



CO CL44Contig3 816 11 9 U
GGACACCTTCTCTTCCACAGTTTCGTTATCTAGTCTAGATATTATTTTACGCTAGGGATT
AGGAAGATCTCTCGTTGCTTCTCTCTCCATCTCTCATACCCATGGCTGCTTTCACTTGTA
CCTCTCGCCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAATCGTATCCTCACCTTCCGCTT
CACTCTCCGCTCGGCGAATCTTCACCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTC
TTTCCCAGTCTCCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTTCTCAACCACGAAGAAGAGGTGTTG
TCTGCGAAGCTCAAGAAACCACTACAGATATAGTTACAATAGTCAACGACACAACATGGG
ACTCTCTTGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTG
GACCTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCGAGAGAGTACACCGGGAAGG
TCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAACGTCA
GGAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATGCGATCATAGGTG
CAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTG
TGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTTGTCTCCCCCCCCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTC
TGTAATTTGTAGCTATCTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTTCATCACTGAACATCTAG
ACATGGATAAATAATATGATGTCATGTTTTTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 5 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 30 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 15 10 

AF RR2DQ57TF U 72
AF RR2G743TF U 72
AF RR2GD95TF U 1
AF RR2D473TF U 14
AF RR2CX07TF U 63
AF RR2D715JQ C 75
AF RR2D715TF U 75
AF RR2D473JQ C 93
AF RR2DQ57JQ C 199
AF RR2GD95JQ C 304
AF RR2G743JQ C 307
BS 1 694 RR2GD95TF
BS 695 695 RR2CX07TF
BS 696 759 RR2GD95TF
BS 760 772 RR2D473TF
BS 773 773 RR2CX07TF
BS 774 788 RR2D473TF
BS 789 810 RR2D715TF
BS 811 814 RR2D715JQ
BS 815 816 RR2GD95JQ

RD RR2DQ57TF 402 0 0
GGGTTGCTTCTCTCTCCATCTCTCATACCCATGGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGCCCT
CCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAATCGTATCCTCACCTTCCGCTTCACTCTCCGCT
CGGCGAATCTTCACCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCT
CCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTTCTCAACCACGAAGAAGAGGTGTTGTCTGCGAAGCT
CAAGAAACCACTACAGATATAGTTACAATAGTCAACGACACAACATGGGACTCTCTTGTT
CTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAA
ATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAACGAGAGAGTACACC

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR2G743TF 616 0 0
GGGTTGCTTCTCTCTCCATCTCTCATACCCATGGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGCCCT
CCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAATCGTATCCTCACCTTCCGCTTCACTCTCCGCT
CGGCGAATCTTCACCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCT
CCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTTCTCAACCACGAAGAAGAGGTGTTGTCTGCGAAGCT
CAAGAAACCACTACAGATATAGTTACAATAGTCAACGACACAACATGGGACTCTCTTGTT
CTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAA
ATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCGAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTAC
AAACTGAACGCGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAACGTCAGGAGCATCCCA
ACGATCATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATGCGATCATAGGTGCAGTGCCTAGA
TCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGA
GATCTGTGTCTTGTCT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2GD95TF 759 0 0
GGACACCTTCTCTTCCACAGTTTCGTTATCTAGTCTAGATATTATTTTACGCTAGGGATT
AGGAAGATCTCTCGTTGCTTCTCTCTCCATCTCTCATACCCATGGCTGCTTTCACTTGTA
CCTCTCGCCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAATCGTATCCTCACCTTCCGCTT
CACTCTCCGCTCGGCGAATCTTCACCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTC
TTTCCCAGTCTCCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTTCTCAACCACGAAGAAGAGGTGTTG
TCTGCGAAGCTCAAGAAACCACTACAGATATAGTTACAATAGTCAACGACACAACATGGG
ACTCTCTTGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTG
GACCTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCGAGAGAGTACACCGGGAAGG
TCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAACGTCA
GGAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATGCGATCATAGGTG
CAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTG
TGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTTGTCTCCCCCCC*TCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTC
TGTAATTTGTAGCTATCTGCTTCTTCCATTGTATCTTTT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2D473TF 775 0 0
GGG
ACAGTTTCGTTATCTAGTCTAGATATTATTTTACGCTAGGGATTAGGAAGATCTCTCGTT
GCTTCTCTCTCCATCTCTCATACCCATGGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGCCCTCCCGT
TTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAATCGTATCCTCACCTTCCGCTTCACTCTCCGCTCGGCG
AATCTTCACCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCACC
TTCGTTGACCTCGAAGGTTTCTCAACCACGAAGAAGAGGTGTTGTCTGCGAAGCTCAAGA
AACCACTACAGATATAGTTACAATAGTCAACGACACAACATGGGACTCTCTTGTTCTCAA
GGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTCGGGCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGAT
TGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCGAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACT
GAGCACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTAC***GTCAGGAGCATCCCAACGAT
CATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATGCGATCATAGGTGCAGTGCCTAGATCCAC
ACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCT
GTGTCTTGTCTCCCCCCC*TCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTAT
CTGCTTCTTC*ATTGTATCTTTTCTTTCATCACTGAGCATCTAGACATGGAT

QA 4 775 4 775
DS 

RD RR2CX07TF 721 0 0
GG
AGATCTCTCGTTGCTTCTCTCTCCATCTCTCATACCCATGGCTGCTTTCACTTGTACCTC
TCGCCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAATCGTATCCTCACCTTCCGCTTCACT
CTCCGCTCGGCGAATCTTCACCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTC
CCAGTCTCCACCTTCGTTGACCTCGAAGGTTTCTCAACCACGAAGAAGAGGTGTTGTCTG
CGAAGCTCAAGAAACCACTACAGATATAGTTACAATAGTCAACGACACAACATGGGACTC
TCTTGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTGGACC
TTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCGAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAA
GTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAACGTCAGGAG
CATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATGCGATCATAGGTGCAGT
GCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAG
TCTGTGAGATCTGTGTCTTGTCTCCCCCCCCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTA
ATTTGTAGCTATCTACTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTTCATCACTGAACATCTAGACA

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR2D715JQ 741 0 0
GG
GCTTCTCTCTCCATCTCTCATACCCATGGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGCCCTCCCGT
TTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAATCGTATCCTCACCTTCCGCTTCACTCTCCGCTCGGCG
AATCTTCACCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCACC
TTCGTTGACCTCGAAGGTTTCTCAACCACGAAGAAGAGGTGTTGTCTGCGAAGCTCAAGA
AACCACTACAGATATAGTTACAATAGTCAACGACACAACATGGGACTCTCTTGTTCTCAA
GGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGAT
TGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCGAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACT
GAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAACGTCAGGAGCATCCCAACGAT
CATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATGCGATCATAGGTGCAGTGCCTAGATCCAC
ACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCT
GTGTCTTGTCTCCCCCCCCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTAT
CTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTTCATCACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATA
TGATGTCATGTTTTTGTG
C

QA 3 740 3 740
DS 

RD RR2D715TF 739 0 0
GG
GCTTCTCTCTCCATCTCTCATACCCATGGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGCCCTCCCGT
TTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAATCGTATCCTCACCTTCCGCTTCACTCTCCGCTCGGCG
AATCTTCACCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCACC
TTCGTTGACCTCGAAGGTTTCTCAACCACGAAGAAGAGGTGTTGTCTGCGAAGCTCAAGA
AACCACTACAGATATAGTTACAATAGTCAACGACACAACATGGGACTCTCTTGTTCTCAA
GGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGAT
TGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCGAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACT
GAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAACGTCAGGAGCATCCCAACGAT
CATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATGCGATCATAGGTGCAGTGCCTAGATCCAC
ACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCT
GTGTCTTGTCTCCCCCCC*TCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTAT
CTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTTCATCACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATA
TGATGTCATGTTTT
GTG

QA 3 736 3 736
DS 

RD RR2D473JQ 725 0 0
CTCATACCCATGGCTGCTTTCACTTGTACCTCTCGCCCTCCCGTTTCCCTCCGTTCGGAG
GCAAGAATCGTATCCTCACCTTCCGCTTCACTCTCCGCTCGGCGAATCTTCACCGTCTCG
CCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCACCTTCGTTGACCTCGAAG
GTTTCTCAACCACGAAGAAGAGGTGTTGTCTGCGAAGCTCAAGAAACCACTACAGATATA
GTTACAATAGTCAACGACACAACATGGGACTCTCTTGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTA
TTGGTTGACTTTCGGGCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAAC
GAGCTAGCGAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTGAGCACGGACGACTCT
CCTTCAACCCCAAGCAAGTAC***GTCAGGAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAAT
GGAGAGAAGAAGGATGCGATCATAGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATT
GACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTTGTCTCCCCC
CCCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTATCTGCTTCTTCCATTGT
ATCTTTTCTTTCATCACTGAGCATCTAGACATGGATAAATAATATGATGTCATGTTTTTG
TG
CAG

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2DQ57JQ 618 0 0
TCTTCACCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCACCTT
CGTTGACCTCGAAGGTTTCTCAACCACGAAGAAGAGGTGTTGTCTGCGAAGCTCAAGAAA
CCACTACAGATATAGTTACAATAGTCAACGACACAACATGGGACTCTCTTGTTCTCAAGG
CGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTG
ACCCACTCGTGAACGAGCTAGCGAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTGA
ACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAACGTCAGGAGCATCCCAACGATCA
TGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATGCGATCATAGGTGCAGTGCCTAGATCCACAC
TCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTGT
GTCTTGTCTCCCCCCCCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTATCT
GCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTTCATCACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATATG
ATGTCATGTTTTTGTG
AC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2GD95JQ 513 0 0
GCGAAGCTCAAGAAACCACTACAGATATAGTTACAATAGTCAACGACACAACATGGGACT
CTCTTGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTGGAC
CTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCGAGAGAGTACACCGGGAAGGTCA
AGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAACGTCAGGA
GCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATGCGATCATAGGTGCAG
TGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGA
GTCTGTGAGATCTGTGTCTTGTCTCCCCCCCCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGT
AATTTGTAGCTATCTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTTCATCACTGAACATCTAGACA
TGGATAAATAATATGATGTCATGTTTTTGTGTT

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2G743JQ 510 0 0
AAGCTCAAGAAACCACTACAGATATAGTTACAATAGTCAACGACACAACATGGGACTCTC
TTGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTGGACCTT
GCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCGAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGT
TCTACAAACTGAACGCGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAACGTCAGGAGCA
TCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGAGAGAAGAAGGATGCGATCATAGGTGCAGTGC
CTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTC
TGTGAGATCTGTGTCTTGTCTCCCCCCCCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAAT
TTGTAGCTATCTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTTCATCACTGAACATCTAGACATGG
ATAAATAATATGATGTCATGTTTTTGTGT
C

QA 1 509 1 509
DS 



CO CL44Contig4 629 2 2 U
GTAAGCGAATCTTCGCCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGT
CTCCAGTTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACCACGTAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAG
CTCAGGAAACCACTACAGACATAGTTACAATAGTCAACGATACCACATGGGACTCTCTTG
TTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTGGACCTTGCA
AAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCT
ACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAATGTCAGAAGCATCC
CGACGATCATGATCTTTGTCAATGGCGAGAAGAAAGATGCTATCATTGGTGCAGTGCCTA
GATCCACACTCACTTCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGT
GAGATCTGTGTCTTGTCTCCCCCCCCCCCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCGCTCTGTAAT
TTGTAGCTATCTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTCATCACTGAACATCTAGACATGGA
TAAATAATATGATGTCATGTTTTTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2GS69TF U 1
AF RR2DF90JQ C 8
BS 1 627 RR2GS69TF
BS 628 629 RR2DF90JQ

RD RR2GS69TF 627 0 0
GTAAGCGAATCTTCGCCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGT
CTCCAGTTTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACCACGTAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAG
CTCAGGAAACCACTACAGACATAGTTACAATAGTCAACGATACCACATGGGACTCTCTTG
TTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTGGACCTTGCA
AAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCT
ACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAATGTCAGAAGCATCC
CGACGATCATGATCTTTGTCAATGGCGAGAAGAAAGATGCTATCATTGGTGCAGTGCCTA
GATCCACACTCACTTCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGT
GAGATCTGTGTCTTGTCTCCCCCCCCCCCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCGCTCTGTAAT
TTGTAGCTATCTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTCATCACTGAACATCTAGACATGGA
TAAATAATATGATGTCATGTTTTTGTG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2DF90JQ 622 0 0
AATCTTCGCCGTCTCGCCTGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCAGT
TTCGTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACCACGTAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAGGA
AACCACTACAGACATAGTTACAATAGTCAACGATACCACATGGGACTTTCTTGTTCTCAA
GGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGAT
TGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTTTACAAACT
GAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAATGTCAGAAGCATCCCGACGAT
CATGATCTTTGTCAATGGCGAGAAGAAAGATGCTATCATTGGTGCAGTGCCTAGATCCAC
ACTCACTTCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCT
GTGTCTTGTCTCCCCCCCCCC*TCTTGTCTTGTGTTTTCATTCGCTCTGTAATTTGTAGC
TATCTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTCATCACTGAACATCTAGACATGGATAAATAA
TATGATGTCATGTTTTTGTGTT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 4 23

CO CL45Contig1 1056 7 44 U
AATTTTAAATTCAACAAAATCAATAGATAATTGATTATTTATACATAAAACAGAATCAT*
*CAAAGAGCTACAACATGTTCTCTTTGATCAAAACAACTTCATGACTAAGTTAAAACACA
AAGATCGACTTTTAAGACTACAAATGGCGATGGTGTTGGCACTCAAGAGGAGTAACAGGA
AACCTCGCAGCATCAAAACAATAATCATAAATTATATGGTTAGCTCGAACCCAAATAAGC
TGATGATTCTGATGAAGACTCAACTCAAACACAGTTGGCTCATCCCACCAAAATCTCTGG
TCTTCTCCATTACACTTGCTTAAATCAGTTGTCGTCGGAACCTCACAAGCATCAATCTTG
AAATCTTTGTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAGACCTCCT
TGTGTTGCCCAGTCATCTGCATTCCAAATCGAACTGTACACTCCCATTGCTTGATCTTTA
GCAAATGGGATGCCTTTATCTTCAAGATTCTTGTGGACACGAATAGGAGTCTCATCTACC
ATAAACACAACACTGCGTTTACTCCAGAGGATAGAGTAAGTGTGAAACTCAGTGGTGGGA
TCGAACCAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCAACTCCGTTCACATAGACGTTTGTC
TGGACTATGTACGGCTCACCCGTTGTGTTACCTAAGAACTCGAAGTCAAACTCATTGTGG
TTCGAACCTTCTGAAGACATGTAGAAAGCAGTGACGGTTCCTGCTGAGTCACCCTCGACG
AGCTTAATCTGGATAGAGACTTTACCAAACAAGTACTTGCTTCTCGATTCAAACCCAGCT
CCGGAGGAGTTGTCAAGCTTGAGTTTTGTGACTTCTCCATCGTTGATACAATGATCCATA
GCCCAGCTTGAGCGGTAAAGTTCCTCGAACTTAGCTCCTGGAGCAGCTTCGCCACAAGAA
ACCACACACACCACAATCATCATACATATGTACCAACCCATTCCCACCATTTTTTTAAAT
CTTCACTCTACAGTCTCACACACTTTGACTCAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 10 35 35 
10 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 10 35 10 35 35 35 35 10 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 10 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 30 45 45 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
0 35 35 0 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F406JQ U 116
AF RR2AC95JQ U 1
AF RR2AT14JQ U 2
AF RR2DA60JQ U 48
AF RR2FZ89JQ U 41
AF RR2HB46JQ U 7
AF RR2D146TF C 424
BS 1 25 RR2AC95JQ
BS 26 26 RR2AT14JQ
BS 27 52 RR2AC95JQ
BS 53 53 RR2AT14JQ
BS 54 59 RR2AC95JQ
BS 60 61 RR2AT14JQ
BS 62 109 RR2AC95JQ
BS 110 110 RR2AT14JQ
BS 111 135 RR2AC95JQ
BS 136 136 RR2F406JQ
BS 137 166 RR2AC95JQ
BS 167 167 RR2AT14JQ
BS 168 186 RR2AC95JQ
BS 187 187 RR2AT14JQ
BS 188 239 RR2AC95JQ
BS 240 240 RR2AT14JQ
BS 241 256 RR2AC95JQ
BS 257 257 RR2F406JQ
BS 258 269 RR2AC95JQ
BS 270 270 RR2AT14JQ
BS 271 372 RR2AC95JQ
BS 373 373 RR2F406JQ
BS 374 412 RR2AC95JQ
BS 413 413 RR2F406JQ
BS 414 422 RR2AC95JQ
BS 423 423 RR2AT14JQ
BS 424 458 RR2AC95JQ
BS 459 459 RR2AT14JQ
BS 460 473 RR2AC95JQ
BS 474 474 RR2AT14JQ
BS 475 505 RR2AC95JQ
BS 506 506 RR2AT14JQ
BS 507 517 RR2AC95JQ
BS 518 519 RR2AT14JQ
BS 520 520 RR2HB46JQ
BS 521 536 RR2AT14JQ
BS 537 537 RR2HB46JQ
BS 538 548 RR2AT14JQ
BS 549 549 RR2DA60JQ
BS 550 565 RR2AT14JQ
BS 566 733 RR2HB46JQ
BS 734 734 RR2D146TF
BS 735 743 RR2HB46JQ
BS 744 1056 RR2D146TF

RD RR2F406JQ 364 0 0
ACACAAAGATCGACTTTTAAGACTACAAATGGCGATGGTGTTGGCACTCAAGAGGAGTAA
CAGGAAACCTCGCAGCATCAAAACAATAATCATAAATTATATGGTTAGCTCGAACCCAAA
TCAGCTGGTGACTCTGATGAAGACTCAACTCAGACACAGTTGGCTCATCCCACCAGAATC
TCTGGTCTTCTCCATTGCACTTGCTTAGATCGGTTGTCGTCCGAACCTCACAAGCATCAA
TCTTGAAATCTTTGTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAGAC
CTCCTTGTGTTGCCCAGTCATCTGCATTCCAAATCGAACTGTACACTCCCATTGCTTGAT
CTTT

QA 1 364 1 364
DS 

RD RR2AC95JQ 517 0 0
AATTTTAAATTCAACAAAATCAATAAATAATTGATTATTTATACATAAAACAAAATCATA
TCAAAGAGCTACAACATGTTCTCTTTGATCAAAACAACTTCATGACTAAATTAAAACACA
AAGATCGACTTTTAAAACTACAAATGGCGATGGTGTTGGCACTCAAAAGGAGTAACAGGA
AACCTCCCAGCATCAAAACAATAATCATAAATTATATGGTTAGCTCGAACCCAAATAAGT
TGATGATTCTGATGAAAACTCAACTCAAATACAGTTGGCTCATCCCACCAAAATCTCTGG
TCTTCTCCATTACACTTGCTTAAATCAGTTGTCGTCGGAACCTCACAAGCATCAATCTTG
AAATCTTTGTAAAAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAAACCTCCT
TGGGTTGCCCAGTCATCTGCATTCCAAATCGAACTGTAAACTCCCATTGCTTGGTCTTTA
GCAAATGGGATGCCTTTATCTTCAAAATTCTTGTGGA

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2AT14JQ 564 0 0
ATTTT
AAATTCAACAAAATCAATAGATAATTGATTATTTATACATAAAACAGAATCAT**CAAAG
AGCTACAACATGTTCTCTTTGATCACAACAACTTCATGACTAAGTTAAAACACAAAGATC
GACTTTTAAAACTACAAATGGCGATGGTGTTGGCACTCAAGAGGAGTAACAGGAAACCTC
GCAGCATCAAAACAATAATCATAAATTATATGGTTAGCTCGAACCCAAATCAGCTGGTGA
CTCTGATGAAAACTCAACTCAAACACAGTTGGCTCATCCCACCAAAATCTCTGGTCTTCT
CCATTGCACTTGCTTAAATCGGTTGTCGTCGGAACCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCT
TTGTAAAAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAAACCTCCTTGTGTT
GCCCAGTCATCCGCATTCCAAATCGAACTGTACACTCCCATTGCTTGATCTTTAGCAAAT
GGGATGCCTTTATCTTCAAGATTCTTGTGGACA*GAATAGGAGTCTCATCCACCATAAAC
ACGACACTGCGTTTACTCC

QA 6 564 6 564
DS 

RD RR2DA60JQ 524 0 0
AAACAGAATCAT
ATCAAAGAGCTACAACATGTTCTCTTTGATCAAAACAACTTCATGACTAAGTTAAAACAC
AAAGATCGACTTTTAAGACTACAAATGGCGATGGTGTTGGCACTCAAGAGGAGTAACAGG
AAACCTCGCAGCATCAAAACAATAATCATAAATTATATGGTTAGCTCGAACCCAAATAAG
TTGATGATTCTGATGAAGACTCAACTCAGATACAGTTGGCTCATCCCACCAGAATCTCTG
GTCTTCTCCATTACACTTGCTTAGATCAGTTGTCGTCGGAACCTCACAAGCATCAATCTT
GAAATCTTTGTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAGACCTCC
TTGGGTTGCCCAGTCATCTGCATTCCAAATCGAACTGTAGACTCCCATTGCTTGGTATTT
AGCAAATGGGATGCCTTTATCTTCAAGATTCTTGTGGACACGAATAGGAGTCTCATCTAC
CATGAATACAACACTGCGTTTACTCCAGAGGA

QA 13 524 13 524
DS 

RD RR2FZ89JQ 617 0 0
ATACATAAAACAGAATCAT**CAAAGAGCTACAACATGTTCTCTTTGATCAAAACAACTT
CATGACTAAGTTAAAACACAAAGATCGACTTTTAAGACTACAAATGGCGATGGTGTTGGC
ACTCAAGAGGAGTAACAGGAAACCTCGCAGCATCAAAACAATAATCATAAATTATATGGT
TAGCTCGAACCCAAATAAGCTGATGATTCTGATGAAGGCTTAGCTCAAACACAGTTGGCT
CATCCCACCAGAATCTCTGGTCTTCTCCATTACACTTGCTTAGATCAGTTGTTGTAGGAA
CCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAAT
CTGTTTTCACAAGACCTCCTTGTGTTGCCCAGTCATCTGCATTCCAAATCGAACTGTACA
CTCCCATTGCTTGATCTTTAGCAAATGGGATGCCTTTATCTTCAAGATTCTTGTGGACAC
GAATAGGAGCCTCATCTACCATAAACACGACACTGCGTTTACTCCAGAGGATAGAGTAAG
TGTGAAACTCAGTGGTGGGATCGAACCAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCAACTC
CGTTCACATAGACGTTT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2HB46JQ 738 0 0
AAATTCAACAAAATCAATAGATAATTGATTATTTATACATAAAACAGAATCAT**CAAAG
AGCTACAACATGTTCTCTTTGATCAAAACAACTTCATGACTAAGTTAAAACACAAAGATC
GACTTTTAAGACTACAAATGGCGATGGTGTTGGCACTCAAGAGGAGTAACGGGAAACCTC
GCAGCATCAAAACAATAATCATAAATTATATGGTTAGCTCGAACCCAAATAAGCTGATGA
TTCTGATGAAGGCTTAGCTCAAACACAGTTGGCTCATCCCACCAAAATCTCTGGTCTTCT
CCATTACACTTGCTTAAATCAGTTGTTGTAGGAACCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCT
TTGTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAGACCTCCTTGTGTT
GCCCAGTCATCTGCATTCCAAATCGAACTGTACACTCCCATTGCTTGATCTTTAGCAAAT
GGGATGCCTTTATCTTCAAGATTCTTGTGGACACGAATAGGAGTCTCATCTACCATAAAC
ACGACACTGCGTTTACTCCAGAGGATAGAGTAAGTGTGAAACTCAGTGGTGGGATCGAAC
CAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCAACTCCGTTCACATAGACGTTTGTCTGGACT
ATGTACGGCTCACCCGTTGTGTTACCTAAGAACTCGAAGTCAAACTCATTGTGGTTCGAA
CCTTCTGGAGACATGTA
A

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2D146TF 633 0 0
GTTGCCCAGTCATCTGCATTCCAAATCGAACTGTAGACTCCCATTGCTTGGTCTTTAGCA
AATGGGATGCCTTTATCTTCAAGATTCTTGTGGACACGAATAGGAGTCTCATCTACCATG
AATACAACACTGCGTTTACTCCAGAGGATAGAGTAAGTGTGAAACTCAGTGGTGGGATCG
AACCAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCAACTCCGTTCACATAGACGTTTGTCTGG
ACTATGTACGGCTCACCCGTTGTGTTACCTAAGAACTCGAAGTCAAACTCATTGTGGTTC
GAACCTTCTGAAGACATGTAGAAAGCAGTGACGGTTCCTGCTGAGTCACCCTCGACGAGC
TTAATCTGGATAGAGACTTTACCAAACAAGTACTTGCTTCTCGATTCAAACCCAGCTCCG
GAGGAGTTGTCAAGCTTGAGTTTTGTGACTTCTCCATCGTTGATACAATGATCCATAGCC
CAGCTTGAGCGGTAAAGTTCCTCGAACTTAGCTCCTGGAGCAGCTTCGCCACAAGAAACC
ACACACACCACAATCATCATACATATGTACCAACCCATTCCCACCATTTTTTTAAATCTT
CACTCTACAGTCTCACACACTTTGACTCAATCC

QA 1 633 1 633
DS 



CO CL45Contig2 855 3 11 U
GGACATTGAGTCAAAGTGTGTGAGACTGTAGAGTGAATATTTAAA*AAAATGGTGGGAAT
GGGTTGGTTCATGTGTATGATGATTGTGGTGTGTGTGGTTTCTTGTGGCGAAGCTGCTCC
AGGAGCTAAGTTCGAGGAACTTTACCGCTCAAGCTGGGCTATGGATCATTGTATCAACGA
TGGGGAAGTCACAAAACTCAAGCTTGACAACTCCTCTGGAGCTGGGTTCGAGTCGAGAAG
CAAGTACTTGTTTGGTAAAGTCTCTATCCAGATTAAGCTCGTCGAGGGTGACTCAGCAGG
AACCGTCACTGCTTTCTACATGTCTTCGGAAGGTTCAAACCACAACGAGTTTGACTTCGA
GTTCTTAGGCAACACAACGGGTGAGCCTTACATAGTCCAGACAAACGTCTATGTGAATGG
AGTTGGAAACAGAGAGCAAAGACTCAACCTTTGGTTCGATCCCACCACTGAGTTCCACAC
CTACTCTATCCTCTGGAGTAAACGCAGTGTCGTGTTTATGGTGGATGAGACTCCTATTCG
TGTCCACAAGAATCTTGAAGATAAAGGCATCCCATTTGCTAAAGATCAAGCAATGGGAGT
GTACAGTTCGATTTGGAATGCAGATGACTGGGCAACACAAGGAGGTCTTGTGAAAACAGA
TTGGAGTCACGCTCCTTTCATTGCTTCTTACAAAGATTTCAAGATTGATGCTTGTGAGGT
TCCGACGACAACCGATCTAAGCAAGTGCAATGGAGA*GAC*AGAGATTCTGGTGGGATGA
GCCA*CTGTGTCTGAGTTGAGTCTTCATCAGAGTCACCAGCTGATTTGGGTTCGAGCTAA
CCATATAATTTATGA


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 
20 20 5 20 20 5 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F406TF U 1
AF RR2FZ89TF U 3
AF RR2AT14TF U 1
BS 1 539 RR2AT14TF
BS 540 540 RR2F406TF
BS 541 621 RR2AT14TF
BS 622 622 RR2F406TF
BS 623 756 RR2AT14TF
BS 757 757 RR2F406TF
BS 758 760 RR2AT14TF
BS 761 761 RR2F406TF
BS 762 784 RR2AT14TF
BS 785 785 RR2F406TF
BS 786 855 RR2AT14TF

RD RR2F406TF 813 0 0
GGAC
ATTGAGTCAAAGTGTGAGAGACTGTAGAGTGAATATTTAAA*AAAATGGTGGGAATGGGT
TGGTTCATGTGTATGATGATTGTGGTGTGTGTGGTTTCTTGTGGCGAAGCTGCTCCAGGA
GCTAAGTTCGAGGAACTTTACCGCTCAAGCTGGGCTATGGATCATTGTATCAACGATGGG
GAAGTCACAAAACTCAAGCTTGACAACTCCTCTGGAGCTGGGTTCGAGTCGAGAAGCAAG
TACTTGTTTGGTAAAGTCTCTATCCAGATTAAGCTCGTCGAGGGTGACTCAGCAGGAACC
GTCACTGCTTTCTACATGTCTTCGGAAGGTTCAGACCACAACGAGTTTGACTTCGAGTTC
TTAGGCAACACAACTGGTGAGCCTTACATAGTCCAGACAAACGTCTATGTGAATGGAGTT
GGAAACAGAGAGCAAAGACTCAACCTTTGGTTCGATCCCACCACTGAGTTCCACACCTAC
TCTATCCTCTGGAGTAAACGCAGTGTCGTGTTTATGGTGGATGAGACTCCTATTCGTGTC
CACAAGAATCTTGAAGATAAAGGCATCCCATTTGCTAAAGATCAAGCAATGGGAGTGTAC
AGTTCGATTTGGAATGCAGATGACTGGGCAACACAAGGAGGTCTTGTGAAAACAGATTGG
AGTCACGCTCCTTTCATTGCTTCTTACAAAGATTTCA*GATTGATGCTTGTGAGGT*CCG
ACGACA*CCGATCTA*GCAAGTGCAATGGAGA*GAC*AGAGATTCTGGTGGGATGAGCCA
*CTGTGTCTGAGT*GAGTCTTCATCAGAG

QA 5 813 5 813
DS 

RD RR2FZ89TF 793 0 0
GG
ATTGAGTCAAAGTGTGTGAGACTGTAGAGTGAAGATTTAAACAAAATGGTGGGAATGGGT
TGGTTCATGTGTATGATGATTGTGGTGTGTGTGGTTTCTTGTGGCCAAGCTGCTCCAGGA
GCTAAGTTCGAGGAACTTTACCGCTCTAGCTGGGCTATGGATCATTGTGTCAACGATGGA
GAAGTCACAAAACTCAAGCTTGACAACTCCTCTGGAGCTGGGTTTGAATCGAGAAGCAAG
TACTTGTTCGGTAAAGTCTCTATCCAGATTAAGCTCGTCGAGGGTGACTCAGCAGGAACC
GTCACTGCTTTTTACATGTCTTCAGAAGGTTCGAACCACAATGAGTTTGACTTCGAGTTC
TTAGGTAACACAACGGGTGAGCCGTACATAGTCCAGACAAACGTCTATGTGAACGGAGTT
GGAAACAGAGAGCAAAGACTCAACCTTTGGTTCGATCCCACCACTGAGTTTCACACTTAC
TCTATCCTCTGGAGTAAACGCAGTGTCGTGTTTATGGTAGATGAGGCTCCTATTCGTGTC
CACAAGAATCTTGAAGATAAAGGCATCCCATTTGCTAAAGATCAAGCAATGGGAGTGTAC
AGTTCGATTTGGAATGCAGATGACTGGGCAACACAAAGAGGTCTTGTGAAA*CAGATTGG
AGTCACGCTCCTTTCATTGCTTCTTACAAAGATTTCAAGATTGATGCTTGTGAG*TTCCT
AC*ACAACTGATCTAAGCAAGTGTA*TGGAGA*GAC*AGAGAT*CTGG*GGGATGAGCCA
*CTGTGTCTGA

QA 3 793 3 793
DS 

RD RR2AT14TF 855 0 0
GGACATTGAGTCAAAGTGTGTGAGACTGTAGAGTGAATATTTAAA*AAAATGGTGGGAAT
GGGTTGGTTCATGTGTATGATGATTGTGGTGTGTGTGGTTTCTTGTGGCGAAGCTGCTCC
AGGAGCTAAGTTCGAGGAACTTTACCGCTCAAGCTGGGCTATGGATCATTGTATCAACGA
TGGGGAAGTCACAAAACTCAAGCTTGACAACTCCTCTGGAGCTGGGTTCGAGTCGAGAAG
CAAGTACTTGTTTGGTAAAGTCTCTATCCAGATTAAGCTCGTCGAGGGTGACTCAGCAGG
AACCGTCACTGCTTTCTACATGTCTTCGGAAGGTTCAAACCACAACGAGTTTGACTTCGA
GTTCTTAGGCAACACAACGGGTGAGCCTTACATAGTCCAGACAAACGTCTATGTGAATGG
AGTTGGAAACAGAGAGCAAAGACTCAACCTTTGGTTCGATCCCACCACTGAGTTCCACAC
CTACTCTATCCTCTGGAGTAAACGCAGTGTCGTGTTTATGGTGGATGAGACTCCTATTC*
TGTCCACAAGAATCTTGAAGATAAAGGCATCCCATTTGCTAAAGATCAAGCAATGGGAGT
GTACAGTTCGATTTGGAATGCGGATGACTGGGCAACACAAGGAGGTCTTGTGAAAACAGA
TTGGAGTCACGCTCCTTTCATTGCTTCTTACAAAGATTTCAAGATTGATGCTTGTGAGGT
TCCGACGACAACCGATCTAAGCAAGTGCAATGGAGAAGACCAGAGATTCTGGTGGGATGA
GCCAACTGTGTCTGAGTTGAGTCTTCATCAGAGTCACCAGCTGATTTGGGTTCGAGCTAA
CCATATAATTTATGA

QA 1 855 1 855
DS 



CO CL45Contig3 1058 4 19 U
AAATTCAACAAAATCAATAGATAATTGATTATTTATACATAAAACAGAATCATCAAAGAG
CTACAACATGTTCTCTTGGATCACAACAACTTCATGACTAAGTTAAAACACAAAGATCGA
CTTTTAAGACTACAAATGGCGATGGTGTTGGCACTCAAGAGGAGTAACAGGAAACCTCGC
AGCATCAAAACAATAATCATAAATTATATGGTTAGCTCGAACCCAAATAAGCTGATGATT
CTGATGAAAACTCAACTCCGACACAGTTGGCTCATCCCACCAAAACCTCTGGTCTTCTCC
ATTACACTTGCTTAAATCAGTTGTTGTAGGAACCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTT
GTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAGACCTCCTTGGGTTGC
CCAGTCATCTGCGTTCCAAATCGAACTGTACACTCCCATGGCTTGGTCTTTAGCAAATGG
GATGCCTTTATCTTCAAGATTCTTGTGAACACGGATTGGTGTCTCATCTACCATGAATAC
AACACTGCGTCTACTCCAGAGGATAGAGTAAGTGTGGAACTCAGTGGCGGGATCGAACCA
AAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCAATTCCGTTCACATAGACGTTTGTCTGGACTAT
GTACGGCTCACCGGTTGTGTTACCTAAGAACTCGAAGTCAAACACGTTGTGGTTCGACCC
TTCTGAAGACATATAGAAAGCAGTGACGGTTCCGGCTGAGTCACCCTCGACGAGCTTAAT
CTGGACGGAGACTTTACCGAACAAGTACTTGCTCTTAGATTCAAATCCAGCTCCAGAGGA
GTTGTCAAGCTTGAGTTTTGTAACTTCTCCATCGTTGACACAATGATCCATAGCCCAGCT
AGAACGGTACAGTTCCTCGAACTTAGCTCCTGGAGCAGCTTCGCAACAAGAAACCACACA
CATAATTGCTATCAAAGACACGAACCAACCCATACCCACCATTTTTTTACTCTCTTAATT
AAACTTCACTCTACAGTCTCACACACTTGACTCAGTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2B296JQ U 1
AF RR2AZ35JQ U 2
AF RR2AZ35TFB C 339
AF RR2B296TF C 504
BS 1 11 RR2B296JQ
BS 12 12 RR2AZ35JQ
BS 13 77 RR2B296JQ
BS 78 78 RR2AZ35JQ
BS 79 359 RR2B296JQ
BS 360 360 RR2AZ35JQ
BS 361 497 RR2B296JQ
BS 498 498 RR2AZ35JQ
BS 499 566 RR2B296JQ
BS 567 567 RR2AZ35JQ
BS 568 587 RR2B296JQ
BS 588 588 RR2AZ35JQ
BS 589 703 RR2B296JQ
BS 704 704 RR2AZ35JQ
BS 705 718 RR2B296JQ
BS 719 724 RR2AZ35JQ
BS 725 785 RR2AZ35TFB
BS 786 786 RR2B296TF
BS 787 1058 RR2AZ35TFB

RD RR2B296JQ 718 0 0
AAATTCAACAAGATCAATAGATAATTGATTATTTATACATAAAACAGAATCATCAAAGAG
CTACAACATGTTCTCTTTGATCACAACAACTTCATGACTAAGTTAAAACACAAAGATCGA
CTTTTAAGACTACAAATGGCGATGGTGTTGGCACTCAAGAGGAGTAACAGGAAACCTCGC
AGCATCAAAACAATAATCATAAATTATATGGTTAGCTCGAACCCAAATAAGCTGATGATT
CTGATGAAAACTCAACTCCGACACAGTTGGCTCATCCCACCAAAACCTCTGGTCTTCTCC
ATTACACTTGCTTAAATCAGTTGTTGTAGGAACCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTC
GTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAGACCTCCTTGGGTTGC
CCAGTCATCTGCGTTCCAAATCGAACTGTACACTCCCATGGCTTGGTCTTTAGCAAATGG
GATGCCTTTATCTTCAAAATTCTTGTGAACACGGATTGGTGTCTCATCTACCATGAATAC
AACACTGCGTCTACTCCAGAGGATAGGGTAAGTGTGGAACTCAGTGGTGGGATCGAACCA
AAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCAATTCCGTTCACATAGACGTTTGTCTGGACTAT
GTACGGCTCACCGGTTGTGTTACCTAAGAACTCGAAGTCAAACTCGTTGTGGTTCGAC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2AZ35JQ 723 0 0
GG
TTCAACAAAATCAATAGATAATTGATTATTTATACATAAAACAGAATCATCAAAGAGCTA
CAACATGTTCTCTTGGATCACAACAACTTCATGACTAAGTTAAAACACAAAGATCGACTT
TTAAGACTACAAATGGCGATGGTGTTGGCACTCAAGAGGAGTAACAGGAAACCTCGCAGC
ATCAAAACAATAATCATAAATTATATGGTTAGCTCGAACCCAAATAAGCTGATGATTCTG
ATGAAGACTCAACTCCGACACAGTTGGCTCATCCCACCAGAACCTCTGGTCTTCTCCATT
ACACTTGCTTAAATCAGTTGTTGTAGGAACCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTA
AGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAGACCTCCTTGGGTTGCCCA
GTCATCTGCGTTCCAAATCGAACTGTACACTCCCATGGCTTGGTCTTTAGCAAATGGGAT
GCCTTTATCTTCAAGATTCTTGTGAACACGGATTGGTGTCTCATCTACCATGAATACAAC
ACTGCGTCTACTCCAGAGGATAGAGTAAGTGTGGAACTCAGTGGCGGGATCGAACCAAAG
GTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCAATTCCGTTCACATAGACGTTTGTCTGGACTATGTA
CGGCTCACCGGTTGTGTTACCTAAGAACTCGAAGTCAAACACGTTGTGGTTCGACCCTTC
T

QA 3 723 3 723
DS 

RD RR2AZ35TFB 720 0 0
AAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAATCTGTTT
TCACAAGACCTCCTTGGGTTGCCCAGTCATCTGCGTTCCAAATCGAACTGTACACTCCCA
TGGCTTGGTCTTTAGCAAATGGGATGCCTTTATCTTCAAGATTCTTGTGAACACGGATTG
GTGTCTCATCTACCATGAATACAACACTGCGTCTACTCCAGAGGATAGAGTAAGTGTGGA
ACTCAGTGGCGGGATCGAACCAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCAATTCCGTTCA
CATAGACGTTTGTCTGGACTATGTACGGCTCACCGGTTGTGTTACCTAAGAACTCGAAGT
CAAACACGTTGTGGTTCGACCCTTCTGAAGACATATAGAAAGCAGTGACGGTTCCGGCTG
AGTCACCCTCGACGAGCTTAATCTGGATGGAGACTTTACCGAACAAGTACTTGCTCTTAG
ATTCAAATCCAGCTCCAGAGGAGTTGTCAAGCTTGAGTTTTGTAACTTCTCCATCGTTGA
CACAATGATCCATAGCCCAGCTAGAACGGTACAGTTCCTCGAACTTAGCTCCTGGAGCAG
CTTCGCAACAAGAAACCACACACATAATTGCTATCAAAGACACGAACCAACCCATACCCA
CCATTTTTTTACTCTCTTAATTAAACTTCACTCTACAGTCTCACACACTTGACTCAGTCC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2B296TF 555 0 0
TGTGAACACGGATTGGTGTCTCATCTACCATGAATACAACACTGCGTCTACTCCAGAGGA
TAGGGTAAGTGTGGAACTCAGTGGTGGGATCGAACCAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGT
TTCCAATTCCGTTCACATAGACGTTTGTCTGGACTATGTACGGCTCACCGGTTGTGTTAC
CTAAGAACTCGAAGTCAAACTCGTTGTGGTTCGACCCTTCTGAAGACATATAGAAAGCAG
TGACGGTTCCGGCTGAGTCACCCTCGACGAGCTTAATCTGGACGGAGACTTTACCGAACA
AGTACTTGCTCTTAGATTCAAATCCAGCTCCAGAGGAGTTGTCAAGCTTGAGTTTTGTAA
CTTCTCCATCGTTGACACAATGATCCATAGCCCAGCTAGAACGGTACAGTTCCTCGAACT
TAGCTCCTGGAGCAGCTTCGCAACAAGAAACCACACACATAATTGCTATCAAAGACACGA
ACCAACCCATAGCCACCATTTTTTTACTCTCTTAATTAAACTTCACTCTACAGTCTCACA
CACTTGACTCAGTCC

QA 1 555 1 555
DS 



CO CL45Contig4 1087 9 5 U
CCACAAAATATCGCATTTTCTATTTGAAACCAAAACTAAATTCAACAAAATCAATAGATA
ATTTGATTATTTATACATAAACAGAATCATCAAGGAGCCACATGTACTCTTGACAACAAC
AACTTGTTGCCCAAGTTAAACAGAAGATCAACTTTGGACTACAAATGGCGATGGTGTTTG
CACTCAAGAGGAGTAACAGGAAACCTCGCAGCATCATAGCAATAATCATAGATCATATGG
TTAGCTCGGACCCAAATAAGCTGATGATTCTGATGAAGGCTAAGCTCAGACACAGTCGGC
TCATCCCACCAGAATCTCTGATCCCCATTACACTTGCTTAGGTCAGTTGTTGTCGGAACC
TCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAATCT
GTTTTCACAAGACCTCCTTGTGTAGCCCAATCATCTGCATTCCAAATGGAGCTGTAGACT
CCCATCGCTTGATCTTTAGCAAATGGGATGCCTTTATCCTCAAGGTTCTTGTGGACACGA
ATAGGAGTCTCATCTACCATAAACACAACACTGCGTTTACTCCAGAGGATAGAGTAAGTG
TGGAACTCAGTGGTGGGATCAAACCAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCAACTCCG
TTCACATAGACGTTTGTTTGGACTATGTAAGGCTCACCGGTTGTGTTGCCTAGGAACTCG
AAATCAAACTCGTTGTGGTTCGAACCTTCTGAAGACATGTAGAAAGCAGTGACGGTTCCT
GCTGAATCACCCTCCACGAGCTTGATCTGAATAGAGACTTTACCGAACAAGTACTTGCTC
CTCGACTCGAACCCAGCTCCAGAGAAATTGTCAAGCTTGAGTTTCGTGACTTCTCCATCG
TTGACACAATGATCCATAGCCCAGCTTGAACGGTAAAGATCCTCGAACTTAGCTCCTGGA
GCTGCTTCACCACAAGAAATCACACACACCATCATCATCATACACATGAACAAACCCATA
CCCATCATTTTTGTTTTGTAAAGATTCTTTTTTTTACTCTACAGTCTCAGACACTAGACT
CAGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 50 50 50 25 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN94JQ U 43
AF RR2G824JQ U 56
AF RR2ET60JQ U 1
AF RR2A435JQ U 43
AF RR2AQ96JQ U 43
AF RR2GN94TF C 260
AF RR2A435TF C 357
AF RR2ET60TF C 529
AF RR2AQ96TF C 285
BS 1 556 RR2ET60JQ
BS 557 557 RR2A435JQ
BS 558 749 RR2ET60JQ
BS 750 771 RR2AQ96JQ
BS 772 1087 RR2GN94TF

RD RR2GN94JQ 541 0 0
CAACAAAATCAATAGATAATTTGATTATTTATACATAAACAGAATCATCAAGGAGCCACA
TGTACTCTTGACAACAACAACTTGTTGCCCAAGTTAAACAGAAAATCAACTTTGGACTAC
AAATGGCGATGGTGTTTGCACTCAAGAGGAGTAACAGGAAACCTCGCAGCATCATAGCAA
TAATCATAGATCATATGGTTAGCTCGGACCCAAATAAGCTGATGATTCTGATGAAGGCTA
AGCTCAAACACAGTCGGCTCATCCCACCAAAATCTCTGATCCCCATTACACTTGCTTAGG
TCAGTTGTTGTCGGAACCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTAAAAAGCAATGAAA
GGAGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAGACCTCCTTGTGTAGCCCAATCATCTGCATTC
CAAATGGAGCTGTAGACTCCCATCGCTTGATCTTTAGCAAATGGGATGCCTTT**CCTCA
AGGTTCTTGTGGACACGAATAGGAGTCTCATCTACCATAAACACAACACTGCGTTTACTC
C

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR2G824JQ 527 0 0
AGATAATTTGATTATTTATACATAAACAGAATCATCAAGGAGCCACATGTACTCTTGACA
ACAACAACTTGTTGCCCAAGTTAAACAGAAGATCAACTTTGGACTACAAATGGCGATGGT
GTTTGCACTCAAGAGGAGTAACAGGAAACCTCGCAGCATCATAGCAATAATCATAGATCA
TATGGTTAGCTCGGACCCAAATAAGCTGATGATTCTGATGAAGGCTAAGCTCAGACACAG
TCGGCTCATCCCACCAGAATCTCTGATCCCCATTACACTTGCTTAGGTCAGTTGTTGTCG
GAACCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCC
AATCTGGTTTCACAAGACCTCCTTGTGTAGCCCAATCATCTGCATTCCAAATGGAGCTGT
AGACTCCCATCGCTTGATCTTTAGCAAATGGGATGCCTTTATCCTCAAGGTTCTTGTGGA
CACGAATAGGAGTCTCATCTACCATAAACACAACACTGCGTTTACTC

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2ET60JQ 749 0 0
CCACAAAATATCGCATTTTCTATTTGAAACCAAAACTAAATTCAACAAAATCAATAGATA
ATTTGATTATTTATACATAAACAGAATCATCAAGGAGCCACATGTACTCTTGACAACAAC
AACTTGTTGCCCAAGTTAAACAGAAGATCAACTTTGGACTACAAATGGCGATGGTGTTTG
CACTCAAGAGGAGTAACAGGAAACCTCGCAGCATCATAGCAATAATCATAGATCATATGG
TTAGCTCGGACCCAAATAAGCTGATGATTCTGATGAAGGCTAAGCTCAGACACAGTCGGC
TCATCCCACCAGAATCTCTGATCCCCATTACACTTGCTTAGGTCAGTTGTTGTCGGAACC
TCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAATCT
GTTTTCACAAGACCTCCTTGTGTAGCCCAATCATCTGCATTCCAAATGGAGCTGTAGACT
CCCATCGCTTGATCTTTAGCAAATGGGATGCCTTTATCCTCAAGGTTCTTGTGGACACGA
ATAGGAGTCTCATCTAACATAAACACAACACTGCGTTTACTCCAGAGGATAGAGTAAGTG
TGGAACTCAGTGGTGGGATCAAACCAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCAACTCCG
TTCACATAGACGTTTGTTTGGACTATGTAAGGCTCACCGGTTGTGTTGCCTAGGAACTCG
AAATCAAACTCGTTGTGGTTCGAACCTTC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2A435JQ 680 0 0
CAACAAAATCAATAGATAATTTGATTATTTATACATAAACAGAATCATCAAGGAGCCACA
TGTACTCTTGACAACAACAACTTGTTGCCCAAGTTAAACAGAAGATCAACTTTGGACTAC
AAATGGCGATGGTGTTTGCACTCAAGAGGAGTAACAGGAAACCTCGCAGCATCATAGCAA
TAATCATAGATCATATGGTTAGCTCGGACCCAAATAAGCTGATGATTCTGATGAAGGCTA
AGCTCAGACACAGTCGGCTCATCCCACCAGAATCTCTGATCCCCATTACACTTGCTTAGG
TCAGTTGTTGTCGGAACCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTAAGAAGCAATGAAA
GGAGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAGACCTCCTTGTGTAGCCCAATCATCTGCATTC
CAAATGGAGCTGTAGACTCCCATCGCTTGATCTTTAGCAAATGGGATGCCTTTATCCTCA
AGGTTCTTGTGGACACGAATAGGAGTCTCATCTACCATAAACACAACACTGCGTTTACTC
CAGAGGATAGAGTAAGTGTGGAACTCAGTGGTGGGATCAAACCAAAGGTTGAGTCTTTGC
TCTCTGTTTCCAACTCCGTTCACATAGACGTTTGTTTGGACTATGTAAGGCTCACCGGTT
GTGTTGCCTAGGAACTCGAA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2AQ96JQ 729 0 0
CAACAAAATCAATAGATAATTTGATTATTTATACATAAACAGAATCATCAAGGAGCCACA
TGTACTCTTGACAACAACAACTTGTTGCCCAAGTTGAACAGAAGATCAACTTTGGACTAC
AAATGGCGATGGTGTTTGCACTCAAGAGGAGTGACGGGAAACCTCGCAGCATCATAGCAA
TAATCATAGATCATATGGTTAGCTCGGACCCAAATAAGCTGATGATTCTGATGAAGGCTA
AGCTCAGACACAGTCGGCTCATCCCACCAGAATCTCTGATCCCCATTACACTTGCTTAGG
TCAGTTGTTGTCGGAACCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTAAGAAGCAATGAAA
GGAGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAGACCTCCTTGTGTAGCCCAATCATCTGCATTC
CAAATGGAGCTGTAGACTACCATCGCTTGATCTTTAGCAAATGGGATGCCTTTATCCTCA
AGGTTCTTGTGGACACGAATAGGAGTCTCATCTACCATAAACACAACACTGCGTTTACTC
CAGAGGATAGAGTAAGTGTGGAACTCAGTGGTGGGATCAAACCAAAGGTTGAGTCTCTGC
TCTCTGTTTCCAACTCCGTTCACATAGACGTTTGTTTGGACTATGTAAGGCTCACCGGTT
GTGTTGCCTAGGAACTCGAAATCAAACTCGTTGTGGTTCGAACCTTCTGAAGACATGTAG
AAAGCAGTG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2GN94TF 828 0 0
GCTGATGATTCTGATGAAGGCTAAGCTCAGACACAGTCGGCTCATCCCACCAGA*TCTCT
GATCCCCATTACACTTGCTTAGGTCAGTG**TGTCGGAAC*TCACAAGCATCAATCTTGA
A*TCTTTGTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCAATCTG*TTTCACAAGACCTCTTT
GTGTAGCCCAATCATCTGCATTCCAAATGGAGCTGTAGACTCCCATCGCTTGATCTTTAG
CAAATGGGATGCCTTT**CCTCAAGGTTCTTGTGGACACGAATAGGAGTCTCATCTACCA
TAAACACAACACTGCGTTTACTCCAGAGGATAGAGTAAGTGTGGAACTCAGTGGTGGGAT
CAAACCAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCAACTCCGTTCACATAGACGTTTGTTT
GGACTATGTAAGGTTCACCGGTTGTGTTGCCTAGGAACTCGAAATCAAACTCGTTGTGGT
TCGAACCTTCTGAAGACATGTAGAAAGCAGTGACGGTTCCTGCTGAATCACCCTCCACGA
GCTTGATCTGAATAGAGACTTTACCGAACAAGTACTTGCTCCTCGACTCGAACCCAGCTC
CAGAGAAATTGTCAAGCTTGAGTTTCGTGACTTCTCCATCGTTGACACAATGATCCATAG
CCCAGCTTGAACGGTAAAGATCCTCGAACTTAGCTCCTGGAGCTGCTTCACCACAAGAAA
TCACACACACCATCATCATCATACACATGAACAAACCCATACCCATCATTTTTGTTTTGT
AAAGATTCTTTTTTTTACTCTACAGTCTCAGACACTAGACTCAGTGCC

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2A435TF 730 0 0
AACCTCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTAAGAAGCAATGAAAGGAGCGTGACTCCA
ATCTGTTTTCACAAGACCTCCTTGTGTAGCCCAATCATCTGCATTCCAAATGGAGCTGTA
GACTCCCATCGCTTGATCTTTAGCAAATGGGATGCCTTTATCCTCAAGGTTCTTGTGGAC
ACGAATAGGAGTCTCATCTACCATAAACACAACACTGCGTTTACTCCAGAGGATAGAGTA
AGTGTGGAACTCAGTGGTGGGATCAAACCAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTGTTTCCAAC
TCCGTTCACATAGACGTTTGTTTGGACTATGTAAGGCTCACCGGTTGTGTTGCCTAGGAA
CTCGAAATCAAACTCGTTGAGGTTCGAACCTTCTGAAGACATGTAGAAAGCAGTGACGGT
TCCTGCTGAATCACCCTCCACGAGCTTGATCTGAATAGAGACTTTACCGAACAAGTACTT
GCTCCTCGACTCGAACCCAGCTCCAGAGAAATTGTCAAGCTTGAGTTTCGTGACTTCTCC
ATCGTTGACACAATGATCCATAGCCCAGCTTGAACGGTAAAGATCCTCGAACTTAGCTCC
TGGAGCTGCTTCACCACAAGAAATCACACACACCATCATCATCATACACATGAACAAACC
CATACCCATCATTTTTGTTTTGTAAAGATTCTTTTTTTTACTCTACAGTCTCAGACACTA
GACTC
AGTCC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2ET60TF 555 0 0
TTGTGGACACGAATAGGAGTCTCATCTAACATAAACACAACACTGCGTTTACTCCAGAGG
ATAGAGTAAGTGTGGAACTCAGTGGTGGGATCAAACCAAAGGTTGAGTCTTTGCTCTCTG
TTTCCAACTCCGTTCACATAGACGTTTGTTTGGACTATGTAAGGCTCACCGGTTGTGTTG
CCTAGGAACTCGAAATCAAACTCGTTGTGGTTCGAACCTTCTGAAGACATGTAGAAAGCA
GTGACGGTTCCTGCTGAATCACCCTCCACGAGCTTGATCTGAATAGAGACTTTACCGAAC
AAGTACTTGCTCCTCGACTCGAACCCAGCTCCAGAGAAATTGTCAAGCTTGAGTTTCGTG
ACTTCTCCATCGTTGACACAATGATCCATAGCCCAGCTTGAACGGTAAAGATCCTCGAAC
TTAGCTCCTGGAGCTGCTTCACCACAAGAAATCACACACACCATCATCATCATACACATG
AACAAACCCATACCCATCATTTTTGTTTTGTAAAGATTCTTTTTTTTACTCTACAGTCTC
GGACACTAGACTC
CC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2AQ96TF 802 0 0
CTCAGACACAGTCGGCTCATCCCACCAGAATCTCTGATCCCCATTACACTTGCTTAGGTC
AGTTGTTGTCGGAAC*TCACAAGCATCAATCTTGAAATCTTTGTAAGAAGCAATGAAAGG
AGCGTGACTCCAATCTGTTTTCACAAGACCTCCTTGTGTAGCCCAATCATCTGCATTCCA
AATGGAGCTGTAGACTACCATCGCTTGATCTTTAGCAAATGGGATGCCTTTATCCTCAAG
GTTCTTGTGGACACGAATAGGAGTCTCATCTACCATAAACACAACACTGCGTTTACTCCA
GAGGATAGAGTAAGTGTGGAACTCAGTGGTGGGATCAAACCAAAGGTTGAGTCTCTGCTC
TCTGTTTCCAACTCCGTTCACATAGACGTTTGTTTGGACTATGTAAGGCTCACCGGTTGT
GTTGCCTAGGAACTCGAAATCAAACTCGTTGTGGTTCGAACCTTCTGAAGACATGTAGAA
AGCAGTGACGGTTCCTGCTGAATCACCCTCCACGAGCTTGATCTGAATAGAGACTTTACC
GAACAAGTACTTGCTCCTCGACTCGAACCCAGCTCCAGAGAAATTGTCAAGCTTGAGTTT
CGTGACTTCTCCATCGTTGACACAATGATCCATAGCCCAGCTTGAACGGTAAAGATCCTC
GAACTTAGCTCCTGGAGCTGCTTCACCACAAGAAATCACACACACCATCATCATCATACA
CATGAACAAACCCATACCCATCATTTTTGTTTTGTAAAGATTCTTTTTTTTACTCTACAG
TCTCAGACACTAGACTC
AGTCC

QA 1 797 1 797
DS 



AS 3 24

CO CL46Contig1 644 7 6 U
GGGGGTAGCAGCCAGCTAAGGAGGAGCAAGAAGAAGAGCAGCAAACATGGTTCTCAAGAC
GGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAAATTTACCCAGGAAGAGGAATCAGATTTATCCG
ATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCACAATAA
GCTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGC
AGCTCAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCCACTAAGAAGCCATACTCAAGGTCTAT
TGTTGGTGCTACTTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCAGAAGTTCGTGA
TGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGATGA
GAAAAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCTAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGATCCC
CAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCCAAGTTGGGTGGT**GGTGGTGGCAAACGCTGATTA
AGCTCAAACCATCTATTGTCCAGTTTGACAACTTTTTAATGTTGATTTCAGAATATTCTG
CAGAATTCTTATATTATCTTACGTTTTTTGGTGCCTACGAACCT


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A267TF U 1
AF RR2GF62JQ C 273
AF RR2BK38TF U 1
AF RR2A267JQ C 125
AF RR2GF62TF U 1
AF RR2BZ54JQ C 1
AF RR2BZ54TF U 1
BS 1 12 RR2A267TF
BS 13 13 RR2BK38TF
BS 14 468 RR2A267TF
BS 469 516 RR2BK38TF
BS 517 519 RR2GF62TF
BS 520 644 RR2BK38TF

RD RR2A267TF 468 0 0
GGGGGTAGCAGCTAGCTAAGGAGGAGCAAGAAGAAGAGCAGCAAACATGGTTCTCAAGAC
GGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAAATTTACCCAGGAAGAGGAATCAGATTTATCCG
ATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCACAATAA
GCTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGC
AGCTCAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCCACTAAGAAGCCATACTCAAGGTCTAT
TGTTGGTGCTACTTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCAGAAGTTCGTGA
TGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGATGA
GAAAAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCTAAGCAACAGAAGATTCA

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR2GF62JQ 317 0 0
CCACTAAGAAGCCATACTCAAGGTCTATTGTTGGTGCTACTTTGGAAGTGATTCAGAAGA
AGGGAGCTGAGAAGCCAGAAGTTCGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGAAATCA
AGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGATGAGAAAAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCTA
AGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGATCCCCAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCCAAGTTGG
GTGGT**GGTGGTGGCAAACGCTGATTAAGCTCAAACCATCTATTGTCCAGTTTGACAAC
TTTTTAATGTTGATTTC

QA 1 317 1 317
DS 

RD RR2BK38TF 644 0 0
GGGGGTAGTAGCCAGCTAAGGAGGAGCAAGAAGAAGAGCAGCAAACATGGTTCTCAAGAC
GGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAAATTTACCCAGGAAGAGGAATCAGATTTATCCG
ATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCACAATAA
GCTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGC
AGCTCAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCCACTAAGAAGCCATACTCAAGGTCTAT
TGTTGGTGCTACTTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCAGAAGTTCGTGA
TGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGATGA
GAAGAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCTAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGATCCC
CAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCCAAGTTGGGTGGGTGGGTGGTGGCAAACGCTGATTA
AGCTCAAACCATCTATTGTCCAGTTTGACAACTTTTTAATGTTGATTTCAGAATATTCTG
CAGAATTCTTATATTATCTTACGTTTTTTGGTGCCTACGAACCT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2A267JQ 519 0 0
GACTTTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCACAATAAGCTG
AAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGCAGCT
CAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCCACTAAGAAGCCATACTCAAGGTCTATTGTT
GGTGCTACTTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCAGAAGTTCGTGATGCC
GCAAGAGAAGCTGCTTTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGATGAGAAA
AAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTTTAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGATCCCCAAG
GCTGCTGCCAAGGGAGGTCCCAAGTTGGGTGGT**GGTGGTGGCAAACGCTGATTAAGCT
CAAACCATCTATTGTCCAGTTTGACAACTTTTTAATGTTGATTTCAGAATATTCTGCAGA
ATTCTTATATTATCTTACGTTTTTTGGTGC
CTACGAACC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2GF62TF 636 0 0
GGGGGTAGCAGCCAGCTAAGGAGGAGCAAGAAGAAGAGCAGCAAACATGGTTCTCAAGAC
GGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAAATTTACCCAGGAAGAGGAATCAGATTTATCCG
ATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCACAATAA
GCTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGC
AGCTCAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCCACTAAGAAGCCATACTCAAGGTCTAT
TGTTGGTGCTACTTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGGGAGCTGAGAAGCCAGAAGTTCGTGA
TGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGAAATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGATGA
GAAAAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCTAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGATCCC
CAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCCAAGTTGGGTGGT**GGTGGTGGCAAACGCTGATTA
AGCTCAAACCATCTATTGTCCAGTTTGACAACTTTTTAATGTTGATTTCAGAATATTCTG
CAGAATTCTTAGATTATCTTACGTTTTTTGGTGC
AA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2BZ54JQ 634 0 0
GGGGGTAGCAGCCAGCTAAGGAGGAGCAAGAAGAAGAGCAGCAAACATGGTTCTCAAGAC
GGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAAATTTACCCAGGAAGAGGAATCAGATTTATCCG
ATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCACAATAA
GCTGAAGCCTTCCACGCTTGCATGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGC
AGCTCAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCCACTAAGAAGCCATACTCAAGGTCTAT
TGTTGGTGCTACTTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCAGAAGTTCGTGA
TGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGATGA
GAAAAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCTAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGATCCC
CAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCCAAGTTGGGTGGT**GGTGGTGGCAAACGCTGATTA
AGCTCAAACCATCTATTGTCCAGTTTGACAACTTTTTAATGTTGATTTCAGAATATTCTG
CAGAATTCTTATATTATCTTACGTTTTTTGGTGC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2BZ54TF 634 0 0
GGGGGTAGCAGCCAGCTAAGGAGGAGCAAGAAGAAGAGCAGCAAACATGGTTCTCAAGAC
GGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAAATTTACCCAGGAAGAGGAATCAGATTTATCCG
ATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCACAATAA
GCTGAAGCCTTCCACGCTTGCATGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGC
AGCTCAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCCACTAAGAAGCCATACTCAAGGTCTAT
TGTTGGTGCTACTTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCAGAAGTTCGTGA
TGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAAGATGA
GAAAAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCTAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGATCCC
CAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCCAAGTTGGGTGGGT*GGTGGTGGCAAACGCTGATTA
AGCTCAAACCATCTATTGTCCAGTTTGACAACTTTTTAATGTTGATTTCAGAATATTCTG
CAGAATTCTTATATTATCTTACGTTTTTTGGTGC

QA 1 634 1 634
DS 



CO CL46Contig2 769 11 8 U
GGGAGTAGTAGTAACAGGAGGAAGCAGAGGAGCATCACCAGCAGCCAG****CAACCATG
GTTCTCAAGACGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATC
AGATTCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCACTAC
TTTCATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCAC
AAGAAGGATGCAGCTCAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGCGCTACCAAGAAGCCCTAC
TCAAGGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCT
GAAGTCCGTGATGCTGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAG
ACAAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAGATTCAG
GCTAAGATCCCCAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAA
CGCTGAAGAACCCTTGCCAAAACCATCTCTTTTCACTCTTGTGTTTCTCTGCTAGTGTGC
TACTTTTTTTAGTTTATGTTGATTTCAGAATATCCCGCAGAACGTAAACCTTTTGTTATT
GGCGTTTGTCTCTTACTTTTAAGCAGCTGTTATAATCTCAGACTTGAGAATTTTGTTTTC
CTATGAGCTTCATTTCATTTTAACTCTTGGCTCAACGACCTTATCACAA


BQ
25 25 25 25 30 30 30 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 15 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2GG17TF U 1
AF RR2EX70TF U 24
AF RR2C357JQ C 133
AF RR2EX70JQ C 24
AF RR2GU84TF U 500
AF RR2D420JQ C 1
AF RR2D420TF U 1
AF RR2D382TF U 3
AF RR2D382JQ C 392
AF RR2CK96TF U 8
AF RR2CK96JQ C 8
BS 1 48 RR2GG17TF
BS 49 52 RR2EX70TF
BS 53 340 RR2GG17TF
BS 341 721 RR2D420TF
BS 722 722 RR2CK96TF
BS 723 754 RR2D382TF
BS 755 755 RR2D382JQ
BS 756 769 RR2D382TF

RD RR2GG17TF 340 0 0
GGGAGTAGTAGTAACAGGAGGAAGCAGAGGAGCATCACCAGCAGCCAGCCAGCAACCATG
GTTCTCAAGACGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATC
AGATTCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCACTAC
TTTCATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCAC
AAGAAGGATGCAGCTCAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGCGCTACCAAGAAGCCCTAC
TCAAGGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATTCAGA

QA 1 340 1 340
DS 

RD RR2EX70TF 311 0 0
GG
AGAGGAGCATCACCAGCAGCCAG****CAACCATGGTTCTCAAGACGGAGCTTTGTCGTT
TCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATCAGATTCATCCGATCTGACTCTCAGG
TGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCACTACTTTCATAACAAACTGAAGCCTTCCA
AGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGCAGCTCAAGAGGCCG
TCAAGAAGAGGAGACGCGCTACCAAGAAGCCCTACTCAAGGTCTATTGTTGGTGCTACCT
TGGAAGTGA

QA 3 311 3 311
DS 

RD RR2C357JQ 454 0 0
TCC
GACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCACTACTTTCATAACAAACTG
AAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGCAGCT
CAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGCGCTACCAAGAAGCCCTACTCAAGGTTTATTGTT
GGTGCTCCCTTGGAAGTGATTCAGAAGGAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTCCGTGATGCT
GCAAGAGAAGCTGTTTTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACAAAGGATGAGAAG
AAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGATCCCCAAG
GCTGCTGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGCTGAAGAACCCTT
GCCAAAACCATCTCTTTTCACTCTTGTGTTT

QA 4 454 4 454
DS 

RD RR2EX70JQ 683 0 0
GG
AGAGGAGCATCACCAGCAGCCAG****CAACCATGGTTCTCAAGACGGAGCTTTGTCGTT
TCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATCAGATTCATCCGATCTGACTCTCAGG
TGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCACTACTTTCATAACAAACTGAAGCCTTCCA
AGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGCAGCTCAAGAGGCCG
TCAAGAAGAGGAGACGCGCTACCAAGAAGCCCTACTCAAGGTCTATTGTTGGTGCTACCT
TGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTCCGTGATGCTGCAAGAGTAG
CTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACAAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGA
AGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGATCCCCAAGGCTGCTGCCA
AGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAA*CGCTGAAGAACCCTTGCCAAAACCA
TCTCTTTTCACTCTTGTGTTTCTCTGCTAGTGTGCTACTTTTTTTAGTTTATGTTGATTT
CAGAATATCCCGCAGAACGTAAACCTTTTGTTATTGGCGTTTGTCTCTTACTTTTAAGCA
GCTGTTATAATCTCAGACTTG

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2GU84TF 209 0 0
G
TGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGTTGAAGAACCCTTGCCAA
AACCATCTCTTTTCACTCTTGTGTTTCTCTGCTAGTGTGCTACTTTTTT*AGTTTATGTT
GATTTCAGAATATCCCGCAGAACGTAAACCTTTTGTTATTGGCGTTTGTCTCTTACTTTT
AAGCAGCTGTTATAATTTCAGACTTGAG

QA 2 209 2 209
DS 

RD RR2D420JQ 721 0 0
GGGAGTAGTAGTAACAGGAGGAAGCAGAGGGGCATCACCAGCAGCCAG****CAACCATG
GTTCTCAAGACGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATC
AGATTCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGT*TAAGCACTAC
TTTCATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCAC
AAGAAGGATGCAGCTCAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGCGCTACCAAGAAGCCCTAC
TCAAGGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCT
GAAGTCCGTGATGCTGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAG
ACAAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAGATTCAG
GCTAAGATCCCCAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAA
CGCTGAAGAACCCTTGCCAAAACCATCTCTTTTCACTCTTGTGTTTCTCTGCTAGTGTGC
TACTTTTTTTAGTTTATGTTGATTTCAGAATATCCCGCAGAACGTAAACCTTTTGTTATT
GGCGTTTGTCTCTTACTTTTAAGCAGCTGTTATAATCTCAGACTTGAGAATTTTGTTTTC
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2D420TF 722 0 0
GGGAGTAGTAGTAACAGGAGGAAGCAGAGGGGCATCACCAGCAGCCAG****CAACCATG
GTTCTCAAGACGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATC
AGATTCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGT*TAAGCACTAC
TTTCATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCAC
AAGAAGGATGCAGCTCAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGCGCTACCAAGAAGCCCTAC
TCAAGGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCT
GAAGTCCGTGATGCTGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAG
ACAAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAGATTCAG
GCTAAGATCCCCAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAA
CGCTGAAGAACCCTTGCCAAAACCATCTCTTTTCACTCTTGTGTTTCTCTGCTAGTGTGC
TACTTTTTTTAGTTTATGTTGATTTCAGAATATCCCGCAGAACGTAAACCTTTTGTTATT
GGCGTTTGTCTCTTACTTTTAAGCAGCTGTTATAATCTCAGACTTGAGAATTTTGTTTTC
C
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2D382TF 767 0 0
GG
GTAGTAGTAACAGGAGGAAGCAGAGGAGCATCACCAGCAGCCAG****CAACCATGGTTC
CCAAGACGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATCAGAT
TCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCACTACTTTC
ATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGA
AGGATGCAGCTCAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGCGCTACCAAGAAGCCCTACTCAA
GGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAG
TCCGTGATGCTGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAGTCAAGAAGACAA
AGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAGATTCAGGCTA
AGATCCCCAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGCT
GAAGAACCCTTGCCAAAACCATCTCTTTTCACTCTTGTGTTTCTCTGCTAGTGTGCTACT
TTTTTTAGTTTATGTTGATTTCAGA*TATCCCGCAGAACGTAAACCTTTTGTTATTGGCG
TTTGTCTCTTACTTTTAAGCAGCTGTTATAATCTCAGACTTGAGA*TTTTGTTTCCT*AT
GAGCTTCATTTCATTTTAACTCTTGGCTCA*CGACCTTATCACAA

QA 3 767 3 767
DS 

RD RR2D382JQ 374 0 0
TTCGTGATATCAAGGAGAGAGTCAAGAAGACAAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCTG
AATTTGCTTCAAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGATCCCCAAGGCTGCTGCCAAGGGAG
GTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGCTGAAGAACCCTTGCCAAAACCATCTCTT
TTCACTCTTGTGTTTCTCTGCTAGTGTGCTACTTTTTTTAGTTTATGTTGATTTCAGAAT
ATCCCGCAGAACGTAAACCTTTTGTTATTGGCGTTTGTCTCTTACTTTTAAGCAGCTGTT
ATAATCTCAGACTTGAGAATTTTGTTTTCCTATGAGCTTCATTTCATTTTAACTCTTGGC
TCAACGACCTTATC

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR2CK96TF 743 0 0
GGAGTAACAGGAGGAAGCAGAGGAGCATCACCAGCAGCCAGCCAGCAACCATGGTTCTCA
AGACGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATCAGATTCA
TCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCACTACTTTCATA
ACAAACTGAAGCCCTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGG
ATACAGCTCAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGCGCTACCAAGAAGCCCTACTCAAGGT
CTATTGTTGGTGCTACCTCGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTTC
GTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACGAAGG
ATGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGA
TCCCCAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGTTGAA
GAACCCTTGCCAAAACCATCTCTTTTCACTCTTGTGTTTCTCTGCTAGTGTGCTACTTTT
TT*AGTTTATGTTGATTTCAGAATATCCCGCAGAACGTAAACCTTTTGTTATTGGCGTTT
GTCTCTTACTTTTAAGCAGCTATTATAATTTCAGACTTGAGA*TTTTGTTTTCCTATGAG
CTTCATTTCATT
ACACCAAAAAA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2CK96JQ 737 0 0
GGAGTAACAGGAGGAAGCAGAGGAGCATCACCAGCAGCCAGCCAGCAACCATGGTTCTCA
AGACGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATCAGATTCA
TCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCACTACTTTCATA
ACAAACTGAAGCCCTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGG
ATACAGCTCAAGAGGCTGTCAAGAAGAGGAGACGCGCTACCAAGAAGCCCTACTCAAGGT
CTATTGTTGGTGCTACCTCGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTTC
GTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACGAAGG
ATGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGA
TCCCCAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGTTGAA
GAACCCTTGCCAAAACCATCTCTTTTCACTCTTGTGTTTCTCTGCTAGTGTGCTACTTTT
TT*AGTTTATGTTGATTTCAGAATATCCCGCAGAACGTAAACCTTTTGTTATTGGCGTTT
GTCTCTTACTTTTAAGCAGCTATTATAATTTCAGACTTGAGAATTTTGTTTTCCTATGAG
CTTCATTTCATT
ACACC

QA 1 732 1 732
DS 



CO CL46Contig3 668 6 7 U
GGGAGTTGGAGTAACAGGAGGAAGCAGAGGAGCATCACCAGCAGCCAGCAACCATGGTTC
TCAAGACGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATCAGAT
TCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCGAAGTGTAAGCATTACTTTC
ATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGA
AGGATGCAGCTCAAGAGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCCTACTCGA
GGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAG
TTCGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACAA
AGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAAATTCAGGCTA
AGATCCCCAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGTT
GAAGAGAGCCCAAACCATTTCACTTTGTCTTTCTTGCTTTCTTCAGTTAATGTTGATTTC
AGATTACTCGGCAAGAACGTTTTTTGGCGTTTGTCTCTTTACTTTTGCAGCTCTTTTAAT
CTCAGACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 30 0 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 

AF RR2E631JQ C 1
AF RR2EJ60JQ C 8
AF RR2F330JQ C 14
AF RR2F330TF U 14
AF RR2EJ60TF U 8
AF RR2E631TF U 1
BS 1 7 RR2E631TF
BS 8 15 RR2EJ60TF
BS 16 239 RR2F330TF
BS 240 240 RR2EJ60TF
BS 241 405 RR2F330TF
BS 406 406 RR2EJ60TF
BS 407 668 RR2F330TF

RD RR2E631JQ 668 0 0
GGGAGTTGTAGTAACAGGAGGAAGCAGAGGAGCATCACCAGCAGCCAGCAACCATGGTTC
TCAAGACGGAGCTTTTTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATCGGAT
TCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCGAAGTGTAAGCATTACTTTC
ATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGA
AGGATGCAGCTCAAGAGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCCTACTCGA
GGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAG
TTCGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACAA
AGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAAATTCAGGCTA
AGATCCCCAAGGCTGCCGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGTT
GAAGAGAGCCCAAACCATTTCACTTTGTCTTTCTTGCTCTCTTCAGTTAATGTTGATTTC
AGATTACTCGGCAAGAACGTTTTTTGGCGTTTGTCTCTTTACTTTTGCAGCTCTTTTAAT
CTCAGACT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2EJ60JQ 661 0 0
GGAGTAACAGGAGGAAGCAGAGGAGCATCACCAGCAGCCAGCAACCATGGTTCTCAAGAC
GGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAGGGGGAATCAGATTCATCCG
ATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCGAAGTGTAAGCATTACTTTCATAACAA
ACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGC
AGCTCAAGAGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCCTACTCGAGGTCTAT
TGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTTCGTGA
TGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACAAAGGATGA
GAAGAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAAATTCAGGCTAAGATCCC
CAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGTTGAAGAGA
GCCCAAACCATTTCACTTTGTCTTTCTTGCTTTCTTCAGTTAATGTTGATTTCAGACTAC
TCGGCAAGAACGTTTTTTGGCGTTTGTCTCTTTACTTTTGCAGCTCTTTTAATCTCAGAC
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2F330JQ 655 0 0
GG
AGGAGGAAGCAGAGGAGCATCACCAGCAGCCAGCAACCATGGTTCTCAAGACGGAGCTTT
GTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATCAGATTCATCCGATCTGACT
CTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCGAAGTGTAAGCATTACTTTCATAACAAACTGAAGC
CTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGCAGGATGCAGCTCAAG
AGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCCTACTCGAGGTCTATTGTTGGTG
CTACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGCCGCAA
GAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGATAATCAAGAAGACAAAGGATGAGAAGAAGG
CAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAAATTCAGGCTAAGATCCCCAAGGCTG
CTGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGTTGAAGAGAGCCCAAAC
CATTTCACTTTGTCTTTCTTGCTTTCTTCAGTTAATGTTGATTTCAGATTACTCGGCAAG
AACGTTTTTTGGCGTTTGTCTCTTTACTTTTGCAGCTCTTTTAATCTCAGACT

QA 3 655 3 655
DS 

RD RR2F330TF 655 0 0
GG
AGGAGGAAGCAGAGGAGCATCACCAGCAGCCAGCAACCATGGTTCTCAAGACGGAGCTTT
GTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATCAGATTCATCCGATCTGACT
CTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCGAAGTGTAAGCATTACTTTCATAACAAACTGAAGC
CTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGCAGGATGCAGCTCAAG
AGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCCTACTCGAGGTCTATTGTTGGTG
CTACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGCCGCAA
GAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGATAATCAAGAAGACAAAGGATGAGAAGAAGG
CAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAAATTCAGGCTAAGATCCCCAAGGCTG
CTGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGTTGAAGAGAGCCCAAAC
CATTTCACTTTGTCTTTCTTGCTTTCTTCAGTTAATGTTGATTTCAGATTACTCGGCAAG
AACGTTTTTTGGCGTTTGTCTCTTTACTTTTGCAGCTCTTTTAATCTCAGACT

QA 3 655 3 655
DS 

RD RR2EJ60TF 661 0 0
GGAGTAACAGGAGGAAGCAGAGGAGCATCACCAGCAGCCAGCAACCATGGTTCTCAAGAC
GGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAGGGGGAATCAGATTCATCCG
ATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCGAAGTGTAAGCATTACTTTCATAACAA
ACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGC
AGCTCAAGAGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCCTACTCGAGGTCTAT
TGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTTCGTGA
TGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACAAAGGATGA
GAAGAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAAATTCAGGCTAAGATCCC
CAAGGCTGCTGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGTTGAAGAGA
GCCCAAACCATTTCACTTTGTCTTTCTTGCTTTCTTCAGTTAATGTTGATTTCAGACTAC
TCGGCAAGAACGTTTTTTGGCGTTTGTCTCTTTACTTTTGCAGCTCTTTTAATCTCAGAC
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2E631TF 668 0 0
GGGAGTTGTAGTAACAGGAGGAAGCAGAGGAGCATCACCAGCAGCCAGCAACCATGGTTC
TCAAGACGGAGCTTTTTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGAATCGGAT
TCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCGAAGTGTAAGCATTACTTTC
ATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGA
AGGATGCAGCTCAAGAGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCCTACTCGA
GGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATTCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAG
TTCGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTTCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACAA
AGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCTTCAAAGCAACAGAAAATTCAGGCTA
AGATCCCCAAGGCTGCCGCCAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGTT
GAAGAGAGCCCAAACCATTTCACTTTGTCTTTCTTGCTCTCTTCAGTTAATGTTGATTTC
AGATTACTCGGCAAGAACGTTTTTTGGCGTTTGTCTCTTTACTTTTGCAGCTCTTTTAAT
CTCAGACT

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 26

CO CL47Contig1 1140 26 16 U
GCGGATTCAATAAAAAAAAAGACATAAACTCTCCCTTTTTTTTTTTCTGGGCAAGGGGAT
CAAAATGGTTTCGGTTATCTTTTTGTTTTATTTTTCTTTTTTCATCAAGCAAAAGAAAGG
GGTATTTCTGTAGCACCAATTTAAAGACATATGTAAATTAGTATAATTATAATTATTGAG
AGCATTCACCACTTCAAGAACGAGATACTGTATGGGGTTTCCTCTTTTTGTCAATTAATC
TCCC*ATTAACTCGTGTAGGAAAATGAAATAGGATAGCGTATAATACGTTTGCC*AAGAG
TACCTATATATACTTTTGTTTCTATGAAGTCAAGGAAGTTAAAA*TAGTTCGAATCCAAC
CAAGTAAAGAGGATATTTAAAAAATAAAGATCAATTTAGTCTTCCCTAATGAATATGCTC
TTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTTAATTTTTTG
GAATATTGTAGTTTTTTTT*ATCGGGACTCGTCTTTATCACATTTCCTTTGTTTTACAAA
AAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTACTTGTTTTC
TCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTAAACAATCGA
AGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAAGGAAAGTAATAGGTTG
TAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAAGAATCATAAATAAATAGTTTTTTATTGGATCAGGAATC
TCATTATGTATTCGGTGTGGATAAAAGATCTTCCTATGTTATACTATTAAATTCTTGACG
ATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCGATATCAT
CGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTATGGGATTA
AATCCCGAGATATTCCAAAGAAAAAAAAATAAATAATAAACTATTTAATTATGGAAGTCA
ATATTCTTGCATTTATTGCTACTGCACTCTTCATTCTCGTTCCTACTGCTTTTTTGCTTA
TAATTTACGTAAAAACGGTTAGTCAAAATAATTAATTTGAATACAATTTGACTATCAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 20 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 45 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 35 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 

AF RR2B831TF U 1
AF RR2GO65TF U 39
AF RR2CB89TF U 177
AF RR2EL18TF U 177
AF RR2CB89JQ C 193
AF RR2GO65JQ C 222
AF RR2B831JQ C 230
AF RR2G810JQ C 443
AF RR2D482JQ C 292
AF RR2D482TF U 292
AF RR2G810TF U 291
AF RR2H271JQ C 292
AF RR2H271TF U 292
AF RR2EL18JQ C 252
AF RR2HA16TF U 325
AF RR2BP14TF U 474
AF RR2G116JQ C 421
AF RR2HA16JQ C 421
AF RR2BR81JQ C 836
AF RR2GY71JQ C 836
AF RR2H882JQ C 836
AF RR2GY71TF U 836
AF RR2H882TF U 836
AF RR2BR81TF U 836
AF RR2A758JQ C 837
AF RR2A758TF U 837
BS 1 332 RR2B831TF
BS 333 333 RR2GO65TF
BS 334 499 RR2B831TF
BS 500 500 RR2GO65TF
BS 501 704 RR2B831TF
BS 705 742 RR2CB89TF
BS 743 851 RR2EL18TF
BS 852 976 RR2D482TF
BS 977 988 RR2HA16TF
BS 989 989 RR2BP14TF
BS 990 1005 RR2HA16TF
BS 1006 1006 RR2BP14TF
BS 1007 1020 RR2HA16TF
BS 1021 1021 RR2BP14TF
BS 1022 1047 RR2HA16TF
BS 1048 1140 RR2GY71TF

RD RR2B831TF 713 0 0
GCGGATTCAATAAAAAAAAAGACATAAACTCTCCCTTTTTTTTTTTCTGGGCAAGGGGAT
CAAAATGGTTTCGGTTATCTTTTTGTTTTATTTTTCTTTTTTCATCAAGCAAAAGAAAGG
GGTATTTCTGTAGCACCAATTTAAAGACATATGTAAATTAGTATAATTATAATTATTGAG
AGCATTCACCACTTCAAGAACGAGATACTGTATGGGGTTTCCTCTTTTTGTCAATTAATC
TCCC*ATTAACTCGTGTAGGAAAATGAAATAGGATAGCGTATAATACGTTTGCC*AAGAG
TACCTATATATACTTTTGTTTCTATGAAGTCAGGGAAGTTAAAA*TAGTTCGAATCCAAC
CAAGTAAAGAGGATATTTAAAAAATAAAGATCAATTTAGTCTTCCCTAATGAATATGCTC
TTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTTAATTTTTTG
GAATATTGTAGTTTTTTTTTATCGGGACTCGTCTTTATCACATTTCCTTTGTTTTACAAA
AAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTACTTGTTTTC
TCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTAAACAATCGA
AGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAA
AGGAAAGTA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2GO65TF 627 0 0
TTTTTTTTCTGGGCAAGGGGATCAAAATGGTTTCGGTTATCTTTTTGTTTTATTTTTCTT
TTTTCATCAAGCAAAAGAAAGGGGTATTTCTGTAGCACCAATTTAAAGACATATGTAAAT
TAGTATAATTATAATTATTGAGAGCATTCACCACTTCAAGAACGAGATACTGTATGGGGT
TTCCTCTTTTTGTCAATTAATCTCCC*ATTAACTCGTGTAGGAAAATGAAATAGGATAGC
GTATAATACGTTTGCC*AAGAGTACCTATATATACTTTTGTTTCTATGAAGTCAAGGAAG
TTAAAA*TAGTTCGAATCCAACCAAGTAAAGAGGATATTTAAAAAATAAAGACCAATTTA
GTCTTCCCTAATGAATATGCTCTTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAA
AATTTAAAGAGTTAATTTTTTGGAATATTGTAGTTTTTTTT*ATCGGGACTCGTCTTTAT
CACATTTCCTTTGTTTTACAAAAAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAAT
TTGAAATTTCGTACTTGTTTTCTCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAAGTTCTTTAGA
AACTCTTTTTGTAAACAATCGAAGTAG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2CB89TF 566 0 0
G
GAGAGCATTCACCACTTCAAGAACGAGATACTGTATGGGGTTTCCTCTTTTTGTCAATTA
ATCTCCC*ATTAACTCGTGTAGGAAAATGAAATAGGATAGCGTATAATACGTTTGCC*AA
GAGTACCTATATATACTTTTGTTTCTATGAAGTCAAGGAAGTTAAAA*TAGTTCGAATCC
AACCAAGTAAAGAGGATATTTAAAAAATAAAGATCAATTTAGTCTTCCCTAATGAATATG
CTCTTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTTAATTTT
TTGGAATATTGTAGTTTTTTT**ATCGGGACTCGTCTTTATCACATTTCCTTTGTTTTAC
AAAAAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTACTTGTT
TTCTCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTAAACAAT
CGAAGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAAGGAAAGTAATAGG
TTGTAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAA

QA 2 566 2 566
DS 

RD RR2EL18TF 675 0 0
G
GAGAGCATTCACCACTTCAAGAACGAGATACTGTATGGGGTTTCCTCTTTTTGTCAATTA
ATCTCCC*ATTAACTCGTGTAGGAAAATGAAATAGGATAGCGTATAATACGTTTGCC*AA
GAGTACCTATATATACTTTTGTTTCTATGAAGTCAAGGAAGTTAAAA*TAGTTCGAATCC
AACCAAGTAAAGAGGATATTTAAAAAATAAAGATCAATTTAGTCTTCCCTAATGAATATG
CTCTTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTTAATTTT
TTGGAATATTGTAGTTTTTTTT*ATCGGGACTCGTCTTTATCACATTTCCTTTGTTTTAC
AAAAAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTACTTGTT
TTCTCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTAAACAAT
CGAAGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAAGGAAAGTAATAGG
TTGTAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAAGAATCATAAATAAATAGTTTTTTATTGGATCAGGA
ATCTCATTATGTATTCGGTGTGGATAAAAGATCTTCCTATGTTATACTATTAAATTCTTG
ACGATGAATCGATT

QA 2 675 2 675
DS 

RD RR2CB89JQ 750 0 0
TTCAAGAACGAGATACTGTATGGGGTTTCCTCTTTTTGTCAATTAATCTCCC*ATTAACT
CGTGTAGGAAAATGAAATAGGATAGCGTATAATACGTTTGCC*AAGAGTACCTATATATA
CTTTTGTTTCTATGAAGTCAAGGAAGTTAAAA*TAGTTCGAATCCAACCAAGTAAAGAGG
ATATTTAAAAAATAAAGATCAATTTAGTCTTCCCTAATGAATATGCTCTTTTTAAAAAGT
TGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTTAATTTTTTGGAATATTGTAGT
TTTTTT**ATCGGGACTCGTCTTTATCACATTTCCTTTGTTTTACAAAAAGATCATAGAC
CCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTACTTGTTTTCTCTATTTGATTT
CTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTAAACAATCGAAGTAGAAAAGGT
TTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAAGGAAAGTAATAGGTTGTAGAAAAGAAAG
CGGTGAAAAAGAATCATAAATAAATAGTTTTTTATTGGATCAGGAATCTCATTATGTATT
CGGTGTGGATAAAAGATCTTCCTATGTTATACTATTAAATTCTTGACGATGAATCGATTT
TATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCTATATCATCGAAATCTAATT
CTTCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2GO65JQ 755 0 0
CCTC
TTTTGTCAATTAATCTCCC*ATTAACTCGTGTAGGAAAATGAAATAGGATAGCGTATAAT
ACGTTTGCC*AAGAGTACCTATATATACTTTTGTTTCTATGAAGTCAAGGAAGTTAAAA*
TAGTTCGAATCCAACCAAGTAAAGAGGATATTTAAAAAATAAAGATCAATTTAGTCTTCC
CTAATGAATATGCTCTTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAA
AGAGTTAATTTTTTGGAATATTGTAGTTTTTTTT*ATCGGGACTCGTCTTTATCACATTT
CCTTTGTTTTACAAAAAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAAT
TTCGTACTTGTTTTCTCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTT
TTTGTAAACAATCGAAGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAAG
GAAAGTAATAGGTTGTAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAAGAATCATAAATAAATAGTTTTTT
ATTGGATCAGGAATCTCATTATGTATTCGGTGTGGATAAAAGATCTTCCTATGTTATACT
ATTAAATTCTTGACGATGAATCGATTT*ATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCT
TTCATTCGATATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTC
ATCTCTATGGGATTAAATCCCGAGATATTCC

QA 5 755 5 755
DS 

RD RR2B831JQ 747 0 0
GTCAATTAATCTCCCCATTAACTCGTGTAGGAAAATGAAATAGGATAGCGTATAATACGT
TTGCCCAAGAGTACCTATATATACTTTTGTTTCTATGAAGTCAGGGAAGTTAAAA*TAGT
TCGAATCCAACCAAGTAAAGAGGATATTTAAAAAATAAAGATCAATTTAGTCTTCCCTAA
TGAATATGCTCTTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAG
TTAATTTTTTGGAATATTGTAGTTTTTTTTTATCGGGACTCGTCTTTATCACATTTCCTT
TGTTTTACAAAAAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCG
TACTTGTTTTCTCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTG
TAAACAATCGAAGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAAGGAAA
GTAATAGGTTGTAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAAGAATCATAAATAAATAGTTTTTTATTG
GATCAGGAATCTCATTATGTATTCGGTGTGGATAAAAGATCTTCCTATGTTATACTATTA
AATTCTTGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCA
TTCGATATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCT
CTATGGGATTAAATCCCGAGATATTCC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2G810JQ 534 0 0
GAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTTAATTTTTTGGAATATTGTAGTCTTTTTT*AT
CGGGACTCGTCTTTATCACATTTCCTTTGTTTTACAAAAAGATCATAGACCCTTACAAAA
TTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTACTTGTTTTCTCTATTTGATTTCTATTGTTTA
TTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTAAACAATCGAAGTAGAAAAGGTTTTTTATGAT
ATTTCATCAGATGATTGTACAAGGAAAGTAATAGGTTGTAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAA
GAATCATAAATAAATAGTTTTTTATTGGATCAGGAATCTCATTATGTATTCGGTGTGGAT
AAAAGATCTTCCTATGTTATACTATTAAATTCTTGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCG
ATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCGATATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTG
AGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTATGGGATTAAATCCCGAGATATTCC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2D482JQ 685 0 0
GGCCAAGAGTACCTATATATACTTTTGTTTCTATGAAGTCAAGGAAGTTAAAA*TAGTTC
GAATCCAACCAAGTAAAGAGGATATTTAAAAAATAAAGATCAATTTAGTCTTCCCTAATG
AATATGCTCTTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTT
AATTTTTTGGAATATTGTAGTTTTTTT**ATCGGGACTCGTCTT*ATCACATTTCCTTTG
TTTTACAAAAAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTA
CTTGTTTTCTCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTA
ACCAATCGAAGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAAGGAAAGT
AATAGGTTGTAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAAGAATCATAAATAAATAGTTTTTTATTGGA
TCGGGAATCTCATTATGTATTCGGTGTGGATAAAAGATCTTCCTATGTTATACTATTAAA
TTCTTGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATT
CGATATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCT
ATGGGATTAAATCCCGAGATATTCC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2D482TF 685 0 0
GGCCAAGAGTACCTATATATACTTTTGTTTCTATGAAGTCAAGGAAGTTAAAA*TAGTTC
GAATCCAACCAAGTAAAGAGGATATTTAAAAAATAAAGATCAATTTAGTCTTCCCTAATG
AATATGCTCTTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTT
AATTTTTTGGAATATTGTAGTTTTTTT**ATCGGGACTCGTCTT*ATCACATTTCCTTTG
TTTTACAAAAAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTA
CTTGTTTTCTCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTA
AACAATCGAAGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAAGGAAAGT
AATAGGTTGTAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAAGAATCATAAATAAATAGTTTTTTATTGGA
TCGGGAATCTCATTATGTATTCGGTGTGGATAAAAGATCTTCCTATGTTATACTATTAAA
TTCTTGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATT
CGATATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCT
ATGGGATTAAATCCCGAGATATTCC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2G810TF 686 0 0
G
GGCCAAGAGTACCTATATATACTTTTGTTTCTATGAAGTCAAGGAAGTTAAAA*TAGTTC
GAATCCAACCAAGTAAAGAGGATATTTAAAAAATAAAGATCAATTTAGTCTTCCCTAATG
AATATGCTCTTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTT
AATTTTTTGGAATATTGTAGTCTTTTTT*ATCGGGACTCGTCTTTATCACATTTCCTTTG
TTTTACAAAAAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTA
CTTGTTTTCTCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTA
AACAATCGAAGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAAGGAAAGT
AATAGGTTGTAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAAGAATCATAAATAAATAGTTTTTTATTGGA
TCAGGAATCTCATTATGTATTCGGTGTGGATAAAAGATCTTCCTATGTTATACTATTAAA
TTCTTGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATT
CGATATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCT
ATGGGATTAAATCCCGAGATATTCC

QA 2 686 2 686
DS 

RD RR2H271JQ 685 0 0
GGCCAAGAGTACCTATATATACTTTTGTTTCTATGAAGTCAAGGAAGTTAAAA*TAGTTC
GAATCCAACCAAGTAAAGAGGATATTTAAAAAATAAAGATCAATTTAGTCTTCCCTAATG
AATATGCTCTTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTT
AATTTTTTGGAATATTGTAGTTTTTTT**ATCGGGACTCGTCTTTATCACATTTCCTTTG
TTTTACAAAAAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTA
CTTGTTTTCTCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTA
AACAATCGAAGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAAGGAAAGT
AATAGGTTGTAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAAGAATCATAAATAAATAGTTTTTTATTGGA
TTAGGAATCTCATTATGTATTCGGTGTGAATAAAAGATCTTCCTATGTTATACTATTAAA
TTCTTGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATT
CGATATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCT
ATGGGATTAAATCCCGAGATATTCC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2H271TF 685 0 0
GGCCAAGAGTACCTATATATACTTTTGTTTCTATGAAGTCAAGGAAGTTAAAA*TAGTTC
GAATCCAACCAAGTAAAGAGGATATTTAAAAAATAAAGATCAATTTAGTCTTCCCTAATG
AATATGCTCTTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTT
AATTTTTTGGAATATTGTAGTTTTTTT**ATCGGGACTCGTCTTTATCACATTTCCTTTG
TTTTACAAAAAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTA
CTTGTTTTCTCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTA
AACAATCGAAGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAAGGAAAGT
AATAGGTTGTAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAAGAATCATAAATAAATAGTTTTTTATTGGA
TTAGGAATCTCATTATGTATTCGGTGTGAATAAAAGATCTTCCTATGTTATACTATTAAA
TTCTTGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATT
CGATATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCT
ATGGGATTAAATCCCGAGATATTCC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2EL18JQ 725 0 0
TCGTGTAGGAAAATGAAATAGGATAGCGTATAATACGTTTGCC*AAGAGTACCTATATAT
ACTTTTGTTTCTATGAAGTCAAGGAAGTTAAAAATAGTTCGAATCCAACCAAGTAAAGAG
GATATTTAAAAAATAAAGATCAATTTAGTCTTCCCTAATGAATATGCTCTTTTTAAAAAG
TTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTTAATTTTTTGGAATATTGTAG
TTTTTTTT*ATCGGGACTCGTCTTTATCACATTTCCTTTGTTTTACAAAAAGATCATAGA
CCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTACTTGTTTTCTCTATTTGATT
TCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTAAACAATCGAAGTAGAAAAGG
TTTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAAGGAAAGTAATAGGTTGTAGAAAAGAAA
GCGGTGAAAAAGAATCATAAATAAATAGTTTTTTATTGGATCAGGAATCTCATTATGTAT
TCGGTGTGGATAAAAGATCTTCCTATGTTATACTATTAAATTCTTGACGATGAATCGATT
TTATGGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCCTTCATTCGATATCATCGAAATCTAAT
TCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTATGGGATTAAATCCCGAGAT
ATTCC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2HA16TF 723 0 0
G
GAAGTCAAGGAAGTTAAAA*TAGTTCGAATCCAACTAAGTAAAGAGGATATTTAAAAAAT
AAAGATCAATTTAGTCTTCCCTAATGAATATGCTCTTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAA
AAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTTAATTTTTTGGAATATTGTAGTTTTTTTT*ATCGG
GACTCGTCTTTATCACATTTCCTTTGTTTTACAAAAAGATCATAGACCCTTACAAAATTT
TTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTACTTGTTTTCTCTATTTGATTTCTATTGTTTATTT
AAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTAAACAATCGAAGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATT
TCATCAGATGACTGTACAAGGAAAGTAATAGGTTGTAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAAGAA
TCATAAATAAATAGTTTTTTATTGGATCAGGAATCTCATTATGTATTCGGTGTGGATAAA
AGATCTTCCTATGTTATACTATTAAATTCTTGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATA
TTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCGATATCATCGAAATCTAATTCTTCTGAGTGAGT
TTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTATGGGATTAAATCCCGAGATATTCCAAAGAAAAA
AAA*TAAATAATAAACTATTAAATTATGGAAGTCA*TATTCTTGCATTTATTGCTACTGC
AC

QA 2 723 2 723
DS 

RD RR2BP14TF 566 0 0
TTTTTTGGAATATTGTAGTTTTTTTT*ATCGGGACTCGTCTTTATCACATTTCCTTTGTT
TTACAAAAAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTACT
TGTTTTCTCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTAAA
CAGTCGAAGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAAGGAAAGTAA
TAGGTTGTAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAAGAATCATAAATAAATAGTTTTTTATTGGATC
AGGAATCTCATTATGTATTCGGTGTGGATAAAAGATCTTCCTATGTTATACTATTAAATT
CTTGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCG
ATATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTAT
GGGATTAAATCCCGAGATATTCCAAAGAAAAAAAAATAAATAATAAACTATTTAATTATG
GAAGTCAATATTCTTGCATTTATTGC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2G116JQ 720 0 0
TTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTTAATTTTTTG
GAATATTGTAGTTTTTTT**ATCGGGACTCGTCTTTATCACATTTCCTTTGTTTTACAAA
AAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTACTTGTTTTC
TCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTAAACAATCGA
AGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATTTCATCAGATGATTGTACAAGGAAAGTAATAGGTTG
TAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAAGAATCATAAATAAATAGTTTTTTATTGGATCAGGAATC
TCATTATGTATTCGGTGTGGATAAAAGATCTTCCTATGTTATACTATTAAATTCTTGACG
ATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCGATATCAT
CGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTATGGGATTA
AATCCCGAGATATTCCAAAGAAAAAAAAATAAATAATAAACTATTTAATTATGGAAGTCA
ATATTCTTGCATTTATTGCTACTGCACTCTTCATTCTCGTTCCTACTGCTTTTTTGCTTA
TAATTTACGTAAAAACGGTTAGTCAAAATAATTAATTTGAATACAATTTGACTATCAATG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2HA16JQ 720 0 0
TTTTTAAAAAGTTGATGTCGAAGAAAAACTCGTAAGAAAATTTAAAGAGTTAATTTTTTG
GAATATTGTAGTTTTTTTT*ATCGGGACTCGTCTTTATCACATTTCCTTTGTTTTACAAA
AAGATCATAGACCCTTACAAAATTTTTTAAATTTCAATTTGAAATTTCGTACTTGTTTTC
TCTATTTGATTTCTATTGTTTATTTAAGGTTCTTTAGAAACTCTTTTTGTAAACAATCGA
AGTAGAAAAGGTTTTTTATGATATTTCATCAGATGACTGTACAAGGAAAGTAATAGGTTG
TAGAAAAGAAAGCGGTGAAAAAGAATCATAAATAAATAGTTTTTTATTGGATCAGGAATC
TCATTATGTATTCGGTGTGGATAAAAGATCTTCCTATGTTATACTATTAAATTCTTGACG
ATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCGATATCAT
CGAAATCTAATTCTTCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTATGGGATTA
AATCCCGAGATATTCCAAAGAAAAAAAAATAAATAATAAACTATTTAATTATGGAAGTCA
ATATTCTTGCATTTATTGCTACTGCACTCTTCATTCTCGTTCCTACTGCTTTTTTGCTTA
TAATTTACGTAAAAACGGTTAGTCAAAATAATTAATTTGAATACAATTTGACTATCAATG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2BR81JQ 305 0 0
GGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCGAT
ATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTATGG
GATTAAATCCCGAGATATTCCAAAGAAAAAAAAATAAATAATAAACTATTTAATTATGGA
AGTCAATATTCTTGCATTTATTGCTACTGCGCTCTTCATTCTCGTTCCTACTGCTTTTTT
GCTTATAATTTACGTAAAAACGGTTAGTCAAAATAATTAATTTGAATACAATTTGACTAT
CAATG

QA 1 305 1 305
DS 

RD RR2GY71JQ 305 0 0
GGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCGAT
ATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTATGG
GATTAAATCCCGAGATATTCCAAAGAAAAAAAAATAAATAATAAACTATTTAATTATGGA
AGTCAATATTCTTGCATTTATTGCTACTGCACTCTTCATTCTCGTTCCTACTGCTTTTTT
GCTTATAATTTACGTAAAAACGGTTAGTCAAAATAATTAATTTGAATACAATTTGACTAT
CAATG

QA 1 305 1 305
DS 

RD RR2H882JQ 305 0 0
GGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCGAT
ATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTATGG
GATTAAATCCCGAGATATTCCAAAGAAAAAAAAATAAATAATAAACTATTTAATTATGGA
AGTCAATATTCTTGCATTTATTGCTACTGCACTCTTCATTCTCGTTCCTACTGCTTTTTT
GCTTATAATTTACGTAAAAACGGTTAGTCAAAATAATTAATTTGAATACAATTTGACTAT
CAATG

QA 1 305 1 305
DS 

RD RR2GY71TF 305 0 0
GGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCGAT
ATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTATGG
GATTAAATCCCGAGATATTCCAAAGAAAAAAAAATAAATAATAAACTATTTAATTATGGA
AGTCAATATTCTTGCATTTATTGCTACTGCACTCTTCATTCTCGTTCCTACTGCTTTTTT
GCTTATAATTTACGTAAAAACGGTTAGTCAAAATAATTAATTTGAATACAATTTGACTAT
CAATG

QA 1 305 1 305
DS 

RD RR2H882TF 305 0 0
GGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCGAT
ATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTATGG
GATTAAATCCCGAGATATTCCAAAGAAAAAAAAATAAATAATAAACTATTTAATTATGGA
AGTCAATATTCTTGCATTTATTGCTACTGCACTCTTCATTCTCGTTCCTACTGCTTTTTT
GCTTATAATTTACGTAAAAACGGTTAGTCAAAATAATTAATTTGAATACAATTTGACTAT
CAATG

QA 1 305 1 305
DS 

RD RR2BR81TF 305 0 0
GGACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCGAT
ATCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTATGG
GATTAAATCCCGAGATATTCCAAAGAAAAAAAAATAAATAATAAACTATTTAATTATGGA
AGTCAATATTCTTGCATTTATTGCTACTGCGCTCTTCATTCTCGTTCCTACTGCTTTTTT
GCTTATAATTTACGTAAAAACGGTTAGTCAAAATAATTAATTTGAATACAATTTGACTAT
CAATG

QA 1 305 1 305
DS 

RD RR2A758JQ 304 0 0
GACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCGATA
TCATCGAAATCTAATTCATTTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTATGGG
ATTAAATCCCGAGATATTCCAAAGAAAAAAAAATAAATAATAAACTATTTAATTATGGAA
GTCAATATTCTTGCATTTATTGCTACTGCACTCTTCATTCTCGTTCCCACTGCTTTTTTG
CTTATAATTTACGTAAAAACGGTTAGTCAAAATAATTAATTTGAATACAATTTGACTATC
AATG

QA 1 304 1 304
DS 

RD RR2A758TF 304 0 0
GACGATGAATCGATTTTATAGCTCCGATATTGTTATTCATGATATTTCTTTCATTCGATA
TCATCGAAATCTAATTCATCTGAGTGAGTTTACAAGCGAAAGATTTCTCATCTCTATGGG
ATTAAATCCCGAGATATTCCAAAGAAAAAAAAATAAATAATAAACTATTTAATTATGGAA
GTCAATATTCTTGCATTTATTGCTACTGCACTCTTCATTCTCGTTCCCACTGCTTTTTTG
CTTATAATTTACGTAAAAACGGTTAGTCAAAATAATTAATTTGAATACAATTTGACTATC
AATG

QA 1 304 1 304
DS 



AS 4 23

CO CL48Contig1 1003 9 9 U
ATAAACAAAGTCTTTCGTCTCTTTATTTATTTCTATAGCCAATGATAACACTCGGGCATG
AGGAAAAAATACAGATGCATAAACAAAGAGTTCGATGGGTTTTATGGCATGAAAGAGAAC
ATAAAAGAATCACAACAAATAGAAATCTTTCCCAGATGGGTAAAAAACCAAACACAAACC
GGTCTGAATCACTTCTCTGTCTCTTTTCATTCATTAGGCAGCAACTTGGCCGAACAACGA
CCTGCGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAATGCCACATCAAGACGCGCATCGAGTGTGTT
CTCGCACACGATTTTCCCATCCCGAGAAGCCAACACAACACCTCCAGAGCAGTGGAGACC
ATGAGAATCACTAGAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAAGATGGTTGTGTCCACGGCAACCTC
AGGAGCGTGAACATTTGCTTTACCAGCATACTCCTCCTTTGCGTCATCAAGAATAGATTC
AACTAAACCCAAATCCTCTTCACGGCAACGCAACAACACAGAAGGCTCTTTCAACCTTAG
CAAACACTGGACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCATCCTCATCGCCGCTGAC
GTTGAGAAGATCCTTTGCTGCTTGGTCTTTCATAGCATTGACAATATCATCCTGCGCTTG
AAGAACTTTGATCCTTGACGCATTTAGCTGCATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGAACATC
GGCTTGCTTCTCCTTCTTCTCATAGTCTTGCCTGATCTTCTTCTTCTCCGCCTCAACTAA
CTGCAGCTTCTCGATGTTGAATTCTTCTTCAGCGGAGACGGAGATCTCGTTTGCCTTCTC
CTCCGCCTCTTGGCGGATGAATCTCACCATCTGCTGGATCTGAATCGACACATCGGCGTC
GTTCATCTTTGCCGCAGATCGTTGACGATCGGAGGTTTGGAGAGATTCCGAGAAATCTGT
GGAGAGAGAGAGAGACGACGTAGATCGGGTTTTCGCTACGTCC


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 
0 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 20 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 
45 45 45 30 45 30 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
5 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E857JQ U 3
AF RR2GO21JQ U 2
AF RR2FZ43JQ U 3
AF RR2BS69JQ U 1
AF RR2DD61JQ U 2
AF RR2BD28TF C 185
AF RR2GO21TF C 551
AF RR2GJ68TF C 191
AF RR2BS69TF C 205
BS 1 68 RR2BS69JQ
BS 69 69 RR2GO21JQ
BS 70 110 RR2BS69JQ
BS 111 123 RR2DD61JQ
BS 124 752 RR2BS69JQ
BS 753 753 RR2DD61JQ
BS 754 810 RR2BS69JQ
BS 811 865 RR2DD61JQ
BS 866 1003 RR2BD28TF

RD RR2E857JQ 109 0 0
AAACAAAGTCTTTCCTCTCTTTATTTATTTCTATAGCCAATGATAACACTCGGGCATGAG
GAAAAAATACAGATGCATAAAAAAAGAGTTCGATGGGTTTTATGGCAT
G

QA 1 108 1 108
DS 

RD RR2GO21JQ 709 0 0
A
AAACAAAGTCTTTCGTCTCTTTATTTATTTCTATAGCCAATGATAACACTCGGGCATGAG
GAAAAAATACAGATGCATAAACAAAGAGTTCGATGGGTTTTATGGCAT************
TAAAGAATCACAACAAATAGAAACCTTTCCCAGATGGGTAAAAAACCAAACACAAACCGG
TCTGAATCACTTCTCCGTCTCTTTTCATTCATTAGGCAGCAACTTGGCCGAACAACGACC
TGCGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAATGCCACATCAAGACGCGCATCGAGTGTGTTCT
CGCACACGATTTTCCCATCCCGAGAAGCCAACACAACACCTCCAGAGCAGTGGAGACCAT
GAGAATCACTAGAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAAGATGGTTGTGTCCACGGCAACCTCAG
GAGCGTGAACATTTGCTTTACCAGCGTACTCCTCCTTTGCGTCATCAAGAATAGATTCAA
CTAAACCCAAATCCTCTTCACGGCAACGCAACAACACAGAAGGCTCCTTCAACCTTAGCA
AACACTGGACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCGTCCTCATCGCCGCTGACGT
TGAGAAGATCCTTTGCTGCTTGGTCTTTCATAGCATTGACAATATCATCCTGCGCTTGAA
GAACTTTGATCCTTGACGCATTTAGCTGCATCGAGTAATCAATCTTCT

QA 2 709 2 709
DS 

RD RR2FZ43JQ 742 0 0
AAACAAAGTCTTTCGTCTCTTTATTTATTTCTATAGCCAATGATAACACTCGGGCATGAG
GAAAAAATACAGATGCATAAAGAAAGAGTTCGATGGGTTTTATGGCATGAAAGAGAACAT
AAAAGAATCACAACAAATAGAAATCTTTCCCAGATGGGTAAAAAACCAAACACAAACCGG
TCTGAATCACTTCTCTGTCTCTTTTCATTCATTAGGCAGCAACTTGGCCGAACAACGACC
TGCGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAATGCCACATCAAGACGCGCATCGAGAGTGTTCT
CGCACACAATTTTCCCATCCCGAGAAGCCAACACAACACCTCCAGAGCAGTGGAGACCAT
GAGAATCACTAGAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAAGATGGTTGTGTCCACGGCAACCTCTG
GAGCATGAACATTTGCTTTACCAGCATACTCCTCCTTTGCATCATCAAGAATAGATTCAA
CTAAACCCAAATCCTCTTCGCGGTAACGCAACAACACAGAAGGCTCTTTCAACCTTAGCA
AACACTGGACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCATCCTCATCGCCGCTGACGT
TGAGAAGATCCTTTGCTGCTTGATCTTTCATAGCATTCACAATATCATCCTGCGCTTGAA
GAACTTTGATCCTCGAAGCATTTAACTGCATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGAACATCGG
CTTGCTTCTCCTTCTTCTCATA

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2BS69JQ 810 0 0
ATAAACAAAGTCTTTCGTCTCTTTATTTATTTCTATAGCCAATGATAACACTCGGGCATG
AGGAAAAA*TACAGATGCATAAACAAAGAGTTCGATGGGTTTTATGGCAT**********
**TAAAGAATCACAACAAATAGAAATCTTTCCCAGATGGGTAAAAAACCAAACACAAACC
GGTCTGAATCACTTCTCTGTCTCTTTTCATTCATTAGGCAGCAACTTGGCCGAACAACGA
CCTGCGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAATGCCACATCAAGACGCGCATCGAGTGTGTT
CTCGCACACGATTTTCCCATCCCGAGAAGCCAACACAACACCTCCAGAGCAGTGGAGACC
ATGAGAATCACTAGAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAAGATGGTTGTGTCCACGGCAACCTC
AGGAGCGTGAACATTTGCTTTACCAGCATACTCCTCCTTTGCGTCATCAAGAATAGATTC
AACTAAACCCAAATCCTCTTCACGGCAACGCAACAACACAGAAGGCTCTTTCAACCTTAG
CAAACACTGGACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCATCCTCATCGCCGCTGAC
GTTGAGAAGATCCTTTGCTGCTTGGTCTTTCATAGCATTGACAATATCATCCTGCGCTTG
AAGAACTTTGATCCTTGACGCATTTAGCTGCATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGAACATC
GGCTTGCTTCTCCTTCTTCTCATAGTCTTGCCCGATCTTCTTCTTCTCCGCCTCAACTAA
CTGCAGCTTCTCGATGTTGAATTCTTCTTC

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR2DD61JQ 864 0 0
A
AAACAAAGTCTTTCGTCTCTTTATTTATTTCTATAGCCAATGATAACATTCGGGCATGAG
GAAAAAATACAGATGCATAAACAAAGAGTTCGATGGGTTTTATGGCATGAAAGAGAACAT
AAAAGAATCACAACAAATAGAAATCTTTCCCAGATGGGTAAAAAACCAAACACAAACCGG
TCTGAATCACTTCTCTGTCTCTTTTCATTCATTAGGCAGCAACTTGGCCGAACAACGACC
TGCGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAATGCCACATCAAGACGTGCATCGAGTGTGTTCT
CACACACAATTTTCCCATCCCGAGAAGCCAACACAACACCTCCAGAGCAGTGAAGACCAT
GAGAATCACTAGAAGTAGGAGG***GGGAAGGAAGATGGTTGTGTCCACGGCAACCTCTG
GAGCATGAACATTTGCTTTACCAGCATACTCCTCCTTTGCGTCATCAAGAATAGATTCAA
CTAAACCTAAATCCTCTTCGCGGCAACGCAACAACACAGAAGGCTCTTTCAACCTTAGCA
AACACTGGACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCATCCTCATCGCCGCTGACGT
TGAGAAGATCCTTTGCTGCTTGGTCTTTCATAGCATTGACAATATCATCCTGCGCTTGAA
GAACTTTGATCCTTGACGCATTTAGCTGCATAGAGTAATCAATCTTCTTGCGAACATCGG
CTTGCTTCTCCTTCTTCTCATAGTCTTGCCTGATCTTCTTCTTCTCCGCCTCAACTAACT
GCAGCTTCTCGATGTTGAATTCTTCTTCAGCGGAGACGGAGATCTCGTTTGCCTTCTCCT
CCGCCTCTTGGCGGATGAATCTC

QA 2 864 2 864
DS 

RD RR2BD28TF 819 0 0
TGAATCACTTATCTGTCTCTTT*CATTCATTAGGCAGCAACTTGGCCGAACAACGACCTC
CGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAATGCCACATCAAGACGTGCATCGAGTGTGTTCTCG
CACACGATTTTCCCATCCCGAGAAGCCAACACAACACCTCCAGAGCAGTGGAGACCATGA
GAATCACTAGAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAAGATGGTTGTGTCCACGGCAACCTCTGGA
GCATGAACATTTGCTTTACCAGCATACTCCTCCTTTGCGTCATCAAGAATAGATTCAACT
AAACCCAAATCCTCTTCGCGGCAACGCAACAACACAGAAGGCTCTTTCAACCTTAGCAAA
CACTGGACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCATCCTCATCGCCGCTGACGTTG
AGAAGATCCTTTGCTGCTTGGTCTTTCATAGCATTGACAATATCGTCCTGCGCCTGAAGA
ACTTTGATCCTTGACGCATTTAGCTGCATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGAACATCGGCT
TGCTTCTCCTTCTTCTCATAGTCTTGCCTGATCTTCTTCTTCTCCGCCTCAACTAACTGC
AGCTTCTCGATGTTGAATTCTTCTTCAGCGGAGACGGAGATCTCGTTTGCCTTCTCCTCC
GCCTCTTGGCGGATGAATCTCACCATCTGCTGGATCTGAATCGACACATCGGCGTCGTTC
ATCTTTGCCGCAGATCGTTGACGATCGGAGGTTTGGAGAGATTCCGAGAAATCTGTGGAG
AGAGAGAGAGACGACGTAGATCGGGTTTTCGCTACGTCC

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2GO21TF 451 0 0
ACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCGTCCTCATCGCCGCTGACGTTGAGAAGA
TCCTTTGCTGCTTGGTCTTTCATAGCATTGACAATATCATCCTGCGCTTGAAGAACTTTG
ATCCTTGACGCATTTAGCTGCATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGAACATCGGCTTGCTTC
TCCTTCTTCTCATAGTCTTGCCTGATCTTCTTCTTCTCCGCCTCAACTAACTGCAGCTTC
TCGATGTTGAATTCTTCTTCAGCGGAGACGGAGATCTCGTTTGCCTTCTCCTCCGCCTCT
TGGCGGATGAATCTCACCATCTGCTGGATCTGAATCGACACATCGGCGTCGTTCATCTTT
GCCGCAGATCGTTGACGATCGGAGGTTTGGAGAGATTCCGAGAAATCTGTGGAGAGAGAG
AGA**CGACGTAGATCGGGTTTTCGC
AACCC

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR2GJ68TF 796 0 0
CACTCTCTG
TCTCTTT*CAT*CATTAGGCAGCAACTTG*CCGAACAACGAC*TGCGGATCACTGGAAGT
TTCATACGGAATGCCACATCAAGACGCGCATCGAGTGTGTTCTCGCGCACGATTTTCCCA
TCCCGAGAAGCCAACACAACAC*TCCAGAGCAGTGGAGACCATGAGAATCACTAGAAGTA
GGAGGAGGGGGAAGGAAGATGGTTGTGTCCACGGCAACCTCAGGAGCGTGAACATTTGCT
TTACCAGCATACTCCTCCTTTGCGTCATCAAGAATAGATTCAACTAAACCCAAATCCTCT
TCAGGGCAACGCAACAACACAGAAGGCTCTTTCAACCTTAGCAAACACTGGACAATGAGA
TCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCATCCTCATCGCCGCTGACGTTGAGAAGATCCTTTGCT
GCTTGGTCTTTCATAGCATTGACAATATCATC*TGCGCTTGAAGAACTTTGATCCTTGAC
GCATTTAGCTGCATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGAACATCGGCTTGCTTCTCCTTCTTC
TCATAGTCTTGCCTGATCTTCTTCTTCTCCGCCTCAACTAACTGCAGCTTCTCGATGTTG
AATTCTTCTTCAGCGGAGACGGAGATCTCGTTTGCCTTCTCCTCCGCCTCTTGGCGGATG
AATCTCACCATCTGCTGGATCTGAATCGACACATCGGCGTCGTTCATCTTTGCCGCAGAT
CGTTGACGATCGGAGGTTTGGAGAGATTCCGAGAAATCTGTGGAGAGAGAGAGA
CGACGTAGATCCC

QA 10 783 10 783
DS 

RD RR2BS69TF 777 0 0
TCTTTCATCA
TAGGCAGCAACTTG*CCGAACAACGAC*TGCGGATCACTGGAAGTTTCATACGGA*TGCC
ACATCAAGACGCGCATCGAGTGTGT*CTCGCACACGATTTTCCCATCCCGAGAAGCCAAC
ACAACACCTCCAGAGCAGTGGAGACCATGAGAATCACTAGAAGTAGGAGGAGGGGGAAGG
AAGATGGTTGTGTCCACGGCAACCTCAGGAGCGTGAACATTTGCTTTACCAGCATACTCC
TCCTTTGCGTCATCAAGAATAGATTCAACTAAACCCAAATCCTCTTCACGGCAACGCAAC
AACACAGAAGGCTCTTTCAACCTTAGCAAACACTGGACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGT
TTGTAGGCATCCTCATCGCCGCTGACGTTGAGAAGATCCTTTGCTGCTTGGTCTTTCATA
GCATTGACAATATCATCCTGCGCTTGAAGAACTTTGATCCTTGACGCATTTAGCTGCATC
GAGTAATCAATCTTCTTGCGAACATCGGCTTGCTTCTCCTTCTTCTCATAGTCTTGCCCG
ATCTTCTTCTTCTCCGCCTCAACTAACTGCAGCTTCTCGATGTTGAATTCTTCTTCAGCG
GAGGCGGAGATCTCGTTTGCCTTCTCCTCCGCCTCTTGGCGGATGAATCTCACCATCTGC
TGGATCTGAATCGACACATCGGCGTCGTTCATCTTTGCCGCAGATCGTTGACGATCGGAG
GTTTGGAGAGATTCCGAGAAATCTGTGGAGAGAGAGAGA
CGACGTCC

QA 11 769 11 769
DS 



CO CL48Contig2 789 4 7 U
GGCCACGTAGCGAGAACCCGATCTACGTCGTCTCCCTCTCTCTCCAATCTCCCTCTGCGC
CACAGATTTCTCGAAATCTCTCCAAACCTCCGATCGTCAACGATCTCCGGCAAAGATGAA
CGATGCCGATGTGTCGAGTCAGATCCAGCAGATGGTGAGATTCATCCGCCAAGAGGCTGA
GGAGAAGGCAAACGAGATCTCCGTCTCCGCTGAAGAAGAATTCAACATCGAGAAGCTGCA
GTTAGTAGAGGCGGAGAAGAAGAAGATCAGGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGC
CGATGTTCGCAAGAAGATTGATTACTCGATGCAGTTAAATGCTTCGAGGATCAAAGTTCT
TCAAGCGCAGGATGATATTGTGAATGCTATGAAAGATCAAGCAGCAAAGGATCTTCTCAA
CGTCAGCGGCGATGAGGATGCCTACAAACAGCTTCTTAAGGATCTCATTGTCCAGTGTTT
GCTAAGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGTTGTTGCGTTGCCGCGAAGAGGATTTGGGTTTAGT
TGAATCTATTCTTGATGATGCAAAGGAGGAGTATGCTGGTAAAGCAAATGTTCATGCTCC
AGAGGTTGCCGTGGACACAACCATCTTCCTTCCCCCTCCTCCTACTTCTAGTGATTCTCA
TGGTCTCCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGTTGGCTTCTCGGGATGGGAAAATTGTGTGCGA
GAACACACTCGATGCGCGTCTTGATGTGGCATTCCGTATGAAACTTCAGTGATCCGCAGT
CGTGTCGGC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E857TF U 1
AF RR2GI53TF U 3
AF RR2EX93TF U 2
AF RR2FZ43TF U 13
BS 1 219 RR2E857TF
BS 220 220 RR2EX93TF
BS 221 238 RR2E857TF
BS 239 420 RR2EX93TF
BS 421 421 RR2GI53TF
BS 422 760 RR2EX93TF
BS 761 789 RR2FZ43TF

RD RR2E857TF 238 0 0
GGCCACGTAGCGAGAACCCGATCTACGTCGTCTCCCTCTCTCTCCAATCTCCCTCTGCGC
CACAGATTTCTCGAAATCTCTCCAAACCTCCGATCGTCAACGATCTCCGGCAAAGATGAA
CGATGCCGATGTGTCGAGTCAGATCCAGCAGATGGTGAGATTCATCCGCCAAGAGGCTGA
GGAGAAGGCAAACGAGATCTCCGTCTCCGCTGAAGAAGA*TTCAACATCGAGAAGCTG

QA 1 238 1 238
DS 

RD RR2GI53TF 522 0 0
GG
ACGTAGCGAGAACCCGATCTACGTCGTCTCCCTCTCTCTCCAATCTCCCTCTGCGCCACA
GATTTCTCGAAATCTCTCCAAACCTCCGATCGTCAACGATCTCCGGCAAAGATGAACGAT
GCCGATGTGTCGAGTCAGATCCAGCAGATGGTGAGATTCATCCGCCAAGAGGCTGAGGAG
AAGGCAAACGAGATCTCCGTCTCCGCTGAAGAAGAATTCAACATCGAGAAGCTGCAGTTA
GTAGAGGCGGAGAAGAAGAAGATCAGGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCCGAT
GTTCGCAAGAAGATTGATTACTCGATGCAGTTAAATGCTTCGAGGATCAAAGTTCTTCAA
GCGCAGGATGATATTGTGAATGCTATGAAAGATCAAGCAGCAAAGGATCTTCTCAACGTC
AGCGGCGATGAGGATGCCTACAAACAGCTTCTTAAGGATCTCATTGTCCAGTGTTTGCTA
AGGTTGAAAGAGCCTTCTGCGTTGTTGCGTTGCCGCGAAG

QA 3 522 3 522
DS 

RD RR2EX93TF 759 0 0
AGG
ACGTAGCGAGAACCCGATCTACGTCGTCTCCCTCTCTCTCCAATCTCCCTCTGCGCCACA
GATTTCTCGAAATCTCTCCAAACCTCCGATCGTCAACGATCTCCGGCAAAGATGAACGAT
GCCGATGTGTCGAGTCAGATCCAGCAGATGGTGAGATTCATCCGCCAAGAGGCTGAGGAG
AAGGCAAACGAGATCTCCGTCTCCGCTGAAGAAGAATTCAACATCGAGAAGCTGCAGTTA
GTAGAGGCGGAGAAGAAGAAGATCAGGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCCGAT
GTTCGCAAGAAGATTGATTACTCGATGCAGTTAAATGCTTCGAGGATCAAAGTTCTTCAA
GCGCAGGATGATATTGTGAATGCTATGAAAGATCAAGCAGCAAAGGATCTTCTCAATGTC
AGCGGCGATGAGGATGCCTACAAACAGCTTCTTAAGGATCTCATTGTCCAGTGTTTGCTA
AGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGTTGTTGCGTTGCCGCGAAGAGGATTTGGGTTTAGTTGAA
TCTATTCTTGATGATGCAAAGGAGGAGTATGCTGGTAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAG
GTTGCCGTGGACACAACCATCTTCCTTCCCCCTCCTCCTACTTCTAGTGATTCTCATGGT
CTCCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGTTGGCTTCTCGGGATGGGAAAATTGTGTGCGAGAAC
ACACTCGATGCGCGTCTTGATGTGGCATTCCGTATG

QA 4 759 4 759
DS 

RD RR2FZ43TF 777 0 0
G
GAACCCGATCTACGTCGTCTCCCTCTCTCTCCAATCTCCCTCTGCGCCACAGATTTCTCG
AAATCTCTCCAAACCTCCGATCGTCAACGATCTCCGGCAAAGATGAACGATGCCGATGTG
TCGAGTCAGATCCAGCAGATGGTGAGATTCATCCGCCAAGAGGCTGAGGAGAAGGCAAAC
GAGATCTCCGTCTCCGCTGAAGAAGAATTCAACATCGAGAAGCTGCAGTTAGTAGAGGCG
GAGAAGAAGAAGATCAGGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCCGATGTTCGCAAG
AAGATTGATTACTCGATGCAGTTAAATGCTTCGAGGATCAAAGTTCTTCAAGCGCAGGAT
GATATTGTGAATGCTATGAAAGATCAAGCAGCAAAGGATCTTCTCAACGTCAGCGGCGAT
GAGGATGCCTACAAACAGCTTCTTAAGGATCTCATTGTCCAGTGTTTGCTAAGGTTGAAA
GAGCCTTCTGTGTTGTTGCGTTACCGCGAAGAGGATTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTT
GATGATGCAAAGGAGGAGTATGCTGGTAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTG
GACACAACCATCTTCCTTCCCCCTCCTCCTACTTCTAGTGATTCTCATGGTCTCCACTGC
TCTGGAGGTGTTGTGTTGGCTTCTCGGGATGGGAAAATTGTGTGCGAGA*CACTCTCGAT
GCGCGTCTTGATGTGGCAT*CCGTATGAAACTTCAGTGATCCGCAGTCGTGTCGGC

QA 2 777 2 777
DS 



CO CL48Contig3 1015 8 23 U
AGGGGGATCTCTCCCCAATCTTCCTGCGCCACATAAATCTCAGTATTTTCTCCAAATCTC
CCGATCGTTAACGGCGACCAAACTCTTTTACCGGTAAAGATGAACGACTTAGATGTGTCG
AAGCAGATCCAGCAGATGGTGAGATTCATTCGCCAAGAGGCTGAGGAGAAGGCAAACGAG
ATCTCCGTCTCCGCTGAAGAAGAATTCAACATCGAGAAACTGCAGCTAGTTGAGGCGGAA
AAGAAGAAGATCAGGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCTGATGTACGCAAGAAG
ATTGATTACTCGATGCAGCTGAATGCGTCAAGGATCAAAGTTCTTCAAGCTCAGGATGAT
ATTGTCAATGCCATGAAAGACCAAGCAGCTCAAGATCTTCTCAACGTCAGTGCCGATGAG
GATGCCTACAAACAGCTTCTCAAGGATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTCGGTTGAAAGAG
CCTTCTGTGTTGTTGCGTTGTCGTGAAGAGGACTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGAG
GATGCAAAGGAGGAGTATGCTGGCAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGAC
ACAACCATATTCCTTCCCCCTCCTCCTACTTCTAGTGATTCTCATGGTCTTCACTGCTCT
GGAGGTGTTGTGCTAGCTTCTCGTGATGGGAAAATCGTGTGCGAGAACACCCTCGATGCG
CGTCTTGATGTGGCATTCCGTATGAAACTTCCAGTGATCCGTAGGTCATTGTTTGGCCAA
GTTGCTGCCTAATGAATGAAAGAGATGTGATTCATACTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTAC
CCATTTGGG*AAAGATTTATCTTTGTTGTGATTCTTTGTTTCTGCAGAATTTTACTTTGA
TGCCCAAAAGAACCCATCGAACTCTTCGTTTACTCGTGTATTTTTTCCTCCTTCCTGAAT
GTTATCATTGGCTATAAAAATAAATAAAGGAATGAAAGACTTTTGTTAAAAAAAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP42TF U 4
AF RR2CC21TF U 26
AF RR2EE39TF U 1
AF RR2G128TF U 251
AF RR2CC21JQ C 190
AF RR2G128JQ C 624
AF RR2EE39JQ C 614
AF RR2DP42JQ C 467
BS 1 221 RR2EE39TF
BS 222 222 RR2DP42TF
BS 223 406 RR2EE39TF
BS 407 407 RR2DP42TF
BS 408 664 RR2EE39TF
BS 665 665 RR2G128TF
BS 666 693 RR2EE39TF
BS 694 694 RR2G128TF
BS 695 706 RR2EE39TF
BS 707 707 RR2G128TF
BS 708 736 RR2EE39TF
BS 737 737 RR2G128TF
BS 738 764 RR2EE39TF
BS 765 765 RR2G128TF
BS 766 773 RR2EE39TF
BS 774 774 RR2G128TF
BS 775 779 RR2EE39TF
BS 780 780 RR2G128TF
BS 781 788 RR2EE39TF
BS 789 849 RR2G128TF
BS 850 850 RR2CC21JQ
BS 851 945 RR2G128TF
BS 946 1015 RR2CC21JQ

RD RR2DP42TF 597 0 0
GGGATCTCTCCCCAATCTTCCTGCGCCACATAAATCTCAGTATTTTCTCCAAATCTCCCG
ATCGTTAACGGCGACCAAACTCTTTTACCGGTAAAGATGAACGACTTAGATGTGTCGAAG
CAGATCCAGCAGATGGTGAGATTCATTCGCCAAGAGGCTGAGGAGAAGGCAAACGAGATC
TCCGTCTCCGCTGAAGAAGAATTCAACATCGAGAAACTGCAGCTAGTTGAGGCGGAAAAG
AAGAAGATCAGGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCTGATGTACGCAAGAAGATT
GATTACTCGATGCAGCTGAATGCGTCAAGGATCAAAGTTCTTCAAGCTCAGGATGATATT
GTCAATGCCATGAAAGACCAAGCAGCTCAAGATCTTCTCAACGTCAGTGCCGATGAGGAT
GCCTACAAACAGCTTCTCAAGGATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTCGGTTGAAAGAGCCT
TCTGTGTTGTTGCGTTGTCGTGAAGAGGACTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGAGGAT
GCAAAGGAGGAGTATGCTGGCAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAG*TTGCCGTGGAC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2CC21TF 634 0 0
GCGCCACATAAATCTCAGTATTTTCTCCAAATCTCCCGATCGTTAACGGCGACCAAACTC
TTTTACCGGTAAAGATGAACGACTTAGATGTGTCGAAGCAGATCCAGCAGATGGTGAGAT
TCATTCGCCAAGAGGCTGAGGAGAAGGCAAACGAGATCTCCGTCTCCGCTGAAGAAGAAT
TCAACATCGAGAAACTGCAGCTAGTTGAGGCGGAAAAGAAGAAGATCAGGCAAGACTATG
AGAAGAAGGAGAAGCAAGCTGATGTACGCAAGAAGATTGATTACTCGATGCAGCTGAATG
CGTCAAGGATCAAAGTTCTTCAAGCTCAGGATGATATTGTCAATGCCATGAAAGACCAAG
CAGCTCAAGATCTTCTCAACGTCAGTGCCGATGAGGATGCCTACAAACAGCTTCTCAAGG
ATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTCGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGTTGTTGCGTTGTCGTG
AAGAGGACTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGAGGATGCAAAGGAGGAGTATGCTGGCA
AAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGACACAACCATATTCCTTCCCCCTCCTC
CTACTTCTAGTGATTCTCATGGTCTTCACTGCTC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2EE39TF 789 0 0
AGGGGGATCTCTCCCCAATCTTCCTGCGCCACATAAATCTCAGTATTTTCTCCAAATCTC
CCGATCGTTAACGGCGACCAAACTCTTTTACCGGTAAAGATGAACGACTTAGATGTGTCG
AAGCAGATCCAGCAGATGGTGAGATTCATTCGCCAAGAGGCTGAGGAGAAGGCAAACGAG
ATCTCCGTCTCCGCTGAAGAAGAATTCAACATCGAGAAACT*CAGCTAGTTGAGGCGGAA
AAGAAGAAGATCAGGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCTGATGTACGCAAGAAG
ATTGATTACTCGATGCAGCTGAATGCGTCAAGGATCAAAGTTCTTCAAGCTCAGGATGAT
ATTGTCAATGCCATGAAAGACCAAGCAGCTCAAGATCTTCTCAACGGCAGTGCCGATGAG
GATGCCTACAAACAGCTTCTCAAGGATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTCGGTTGAAAGAG
CCTTCTGTGTTGTTGCGTTGTCGTGAAGAGGACTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGAG
GATGCAAAGGAGGAGTATGCTGGCAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGAC
ACAACCATATTCCTTCCCCCTCCTCCTACTTCTAGTGATTCTCATGGTCTTCACTGCTCT
GGAG*TGTTGTGCTAGCTTCTCGTGATGGGAAA*TCGTGTGCGAGA*CACCCTCGATGCG
CGTCTTGATGTGGCAT*CCGTATGAAACTTCCAGTGATCCGTAG*TCATTGTT*GGCCA*
GTTGCTGC
T

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2G128TF 695 0 0
GG
AGGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCTGATGTACGCAAGAAGATTGATTACTCG
ATGCAGCTGAATGCGTCAAGGATCAAAGTTCTTCAAGCTCAGGATGATATTGTCAATGCC
ATGAAAGACCAAGCAGCTCAAGATCTTCTCAACGTCAGTGCCGATGAGGATGCCTACAAA
CAGCTTCTCAAGGATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTCGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGTTG
TTGCGTTGTCGTGAAGAGGACTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGAGGATGCAAAGGAG
GAGTATGCTGGCAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGACACAACCATATTC
CTTCCCCCTCCTCCTACTTCTAGTGATTCTCATGGTCTTCACTGCTCTGGAGGTGTTGTG
CTAGCTTCTCGTGATGGGAAAATCGTGTGCGAGAACACCCTCGATGCGCGTCTTGATGTG
GCATTCCGTATGAAACTTCCAGTGATCCGTAGGTCATTGTTTGGCCAAGTTGCTGCCTAA
TGAATGAAAGAGATGTGATTCATACTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCCATTTGGGGAA
AGATTTATCTTTGTTGTGATTCTTTGTTTCTGCAGAATTTTACTTTGATGCCCAAAAGAA
CCCATCGAACTCTTCGTTTACTCGTGTATTTTT

QA 3 695 3 695
DS 

RD RR2CC21JQ 826 0 0
TCCGCTGAAGAAGAATTCAACATCGAGAAACTGCAGCTAGTTGAGGCGGAAAAGAAGAAG
ATCAGGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCTGATGTACGCAAGAAGATTGATTAC
TCGATGCAGCTGAATGCGTCAAGGATCAAAGTTCTTCAAGCTCAGGATGATATTGTCAAT
GCCATGAAAGACCAAGCAGCTCAAGATCTTCTCAACGTCAGTGCCGATGAGGATGCCTAC
AAACAGCTTCTCAAGGATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTCGGTTGAAAGAGCCTTCTGTG
TTGTTGCGTTGTCGTGAAGAGGACTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGAGGATGCAAAG
GAGGAGTATGCTGGCAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGACACAACCATA
TTCCTTCCCCCTCCTCCTACTTCTAGTGATTCTCATGGTCTTCACTGCTCTGGAGGTGTT
GTGCTAGCTTCTCGTGATGGGAAAATCGTGTGCGAGAACACCCTCGATGCGCGTCTTGAT
GTGGCATTCCGTATGAAACTTCCAGTGATCCGTAGGTCATTGTTTGGCCAAGTTGCTGCC
TAATGAATGAAAGAGATGTGATTCATACTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCCATTTGGG
*AAAGATTTATCTTTGTTGTGATTCTTTGTTTCTGCAGAATTTTACTTTGATGCCCAAAA
GAACCCATCGAACTCTTCGTTTACTCGTGTATTTTTTCCTCCTTCCTGAATGTTATCATT
GGCTATAAAAATAAATAAAGGAATGAAAGACTTTTGTTAAAAAAAA

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2G128JQ 384 0 0
TCCTACTTCTAGTGATTCTCATGGTCTTCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGCTAGCTTCTCG
TGATGGGAAAATCGTGTGCGAGAACACCCTCGATGCGCGTCTTGATGTGGCATTCCGTAT
GAAACTTCCAGTGATCCGTAGGTCATTGTTTGGCCAAGTTGCTGCCTAATGAATGAAAGA
GATGTGATTCATACTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCCATTTGGG*AAAGATTTATCTT
TGTTGTGATTCTTTGTTTCTGCAGAATTTTACTTTGATGCCCAAAAGAACCCATCGAACT
CTTCGTTTACTCGTGTATTTTTTCCTCCTTCCTGAATGTTATCATTGGCTATAAAAATAA
ATAAAGGAATGAAAGACTTTTGTT

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR2EE39JQ 394 0 0
TTCCCCCTCCTCCTACTTCTAGTGATTCTCATGGTCTTCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGC
TAGCTTCTCGTGATGGGAAAATCGTGTGCGAGAACACCCTCGATGCGCGTCTTGATGTGG
CATTCCGTATGAAACTTCCAGTGATCCGTAGGTCATTGTTTGGCCAAGTTGCTGCCTAAT
GAATGAAAGAGATGTGATTCATACTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCCATTTGGG*AAA
GATTTATCTTTGTTGTGATTCTTTGTTTCTGCAGAATTTTACTTTGATGCCCAAAAGAAC
CCATCGAACTCTTCGTTTACTCGTGTATTTTTTCCTCCTTCCTGAATGTTATCATTGGCT
ATAAAAATAAATAAAGGAATGAAAGACTTTTGTT

QA 1 394 1 394
DS 

RD RR2DP42JQ 541 0 0
TTCGGTTGAAAGAGCCTTTTGTGTTGTTGCGTTGTCGTGAAGAGGACTTGGGTTTAGTTG
AATTTATTTTTGAGGATGCAAAGGAGGAGTATGCTGGCAAAGCAAATGTTCATGCTCCAG
AGGTTGCCGTGGACACAACCATATTCCTTCCCCCTCCTCCTACTTTTAGTGATTTTCATG
GTTTTCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGCTAGCTTTTCGTGATGGGAAAATTGTGTGCGAGA
ACCCCCTCGATGCGGGTCTTGATGTGGCATTCCGTATGAAACTTCCAGTGATCCGTAGGT
CATTGTTTGGCCAAGTTGCTGCCTAATGAATGAAAGAGATGTGATTCATACTGGTTTGTG
TGTTTGTTTGTTACCCATTTGGG*AAAGATTTTTTTTTGTTGTGATTTTTTGTTTTTGCA
GAATTTTACTTTGATGCCCAAAAGAACCCATCGAACTTTTTGTTTACTCGTGTATTTTTT
CCTCCTTCCTGAATGTTATCATTGGCTATAAAAATAAACAAAGGAATGAAAGACTTTTGT
T

QA 1 541 1 541
DS 



CO CL48Contig4 996 2 12 U
AACAAAAGTCTTTCATCCCTTTATTTATTTTTATGGCCAGTGATAACATTCAGGAAGGAG
GAAAAAAATACACGAGTAAACGACGAGTTCGATGGGTTCTTTTGGACTTCAAAGTAAAAT
TCTGCAGAAACAAAGAATCACAACAAAGATAGATCTTTTCCCAAATGGGTAACAAACAAA
CACACAAACCGGTCGGAATCACATCTCTTTCATTCATTAGGCAGCAACTTGGCCAAACAA
TGACCTACGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAATGCCACATCAAGACGAGCATCGAGGGT
GTTCTCGCACACGATTTTCCCATCACGAGAAGCTAGCACAACACCTCCAGAGCAGTGAAG
ACCATGAGAATCACTAGAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAATATGGTCGTGTCCACGGCAAC
CTCTGGGGCGTGAACATTTGCTTTACCAGCGTACTCCTCCTTTGCATCCTCAAGAATAGA
TTCAACTAAACCCAAGTCCTCTTCACGACAACGCAACAACACAGAAGACTCTTTCAACCG
AAGCAAACACTGAACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCATCCTCATCGGCACT
GACGTTGAGAAGATCTTTAGCTGCTTGGTCTTTCATGGCATTGACAATATCATCCTGAGC
TTGAAGAACTTTGATCCTTGACGCATTCAGCTGCATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGTAC
ATCAGCTTGTTTCTCCTTCTTCTCATAGTCTTGCCTGATCTTCTTCTTTTCCGCCTCAAC
TAGCTGCAGCTTCTCGATGTTGAATTCTTCTTCAGCAGAGACGGAGATCTCGTTTGCCTT
CTCCTCAGCCTCTTGGCGAATGAATCTCACCATCTGCTGGATCTGCTTCGACACATCTAA
GTCGTTCATCTTTAAGTTTGTTCGCCGTTAACGACCGATCGGGAGTTGCAGAGATTTGGA
GAAAATACTGAGATTTATGTGGCGCAGGAAGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI34JQB U 1
AF RR2EN45TF C 349
BS 1 405 RR2GI34JQB
BS 406 406 RR2EN45TF
BS 407 527 RR2GI34JQB
BS 528 528 RR2EN45TF
BS 529 839 RR2GI34JQB
BS 840 840 RR2EN45TF
BS 841 859 RR2GI34JQB
BS 860 860 RR2EN45TF
BS 861 863 RR2GI34JQB
BS 864 864 RR2EN45TF
BS 865 897 RR2GI34JQB
BS 898 996 RR2EN45TF

RD RR2GI34JQB 897 0 0
AACAAAAGTCTTTCATCCCTTTATTTATTTTTATGGCCAGTGATAACATTCAGGAAGGAG
GAAAAAAATACACGAGTAAACGACGAGTTCGATGGGTTCTTTTGGACTTCAAAGTAAAAT
TCTGCAGAAACAAAGAATCACAACAAAGATAGATCTTTTCCCAAATGGGTAACAAACAAA
CACACAAACCGGTCGGAATCACATCTCTTTCATTCATTAGGCAGCAACTTGGCCAAACAA
TGACCTACGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAATGCCACATCAAGACGAGCATCGAGGGT
GTTCTCGCACACGATTTTCCCATCACGAGAAGCTAGCACAACACCTCCAGAGCAGTGAAG
ACCATGAGAATCACTAGAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAATATGGTTGTGTCCACGGCAAC
CTCTGGGGCGTGAACATTTGCTTTACCAGCGTACTCCTCCTTTGCATCCTCAAGAATAGA
TTCAACTAAACCCAAGTCCTCTTCACGACAACGCAACAACACAGAAGGCTCTTTCAACCG
AAGCAAACACTGAACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCATCCTCATCGGCACT
GACGTTGAGAAGATCTTTAGCTGCTTGGTCTTTCATGGCATTGACAATATCATCCTGAGC
TTGAAGAACTTTGATCCTTGACGCATTCAGCTGCATCGAGTAATCAATCTTCTTGCGTAC
ATCAGCTTGTTTCTCCTTCTTCTCATAGTCTTGCCTGATCTTCTTCTTTTCCGCCTCAAC
TAGCTGCAGCTTCTCGATGTTGAATTCTTCTTCAGCAGAGACGGAGATCTCGTTTGCCT*
CTCCTCAGCCTCTTGGCGA*TGA*TCTCACCATCTGCTGGATCTGCTTCGACACATC

QA 1 897 1 897
DS 

RD RR2EN45TF 648 0 0
AGAGCAGTGAAGACCATGAGAATCACTAGAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAATATGGTCGT
GTCCACGGCAACCTCTGGGGCGTGAACATTTGCTTTACCAGCGTACTCCTCCTTTGCATC
CTCAAGAATAGATTCAACTAAACCCAAGTCCTCTTCACGACAACGCAACAACACAGAAGA
CTCTTTCAACCGAAGCAAACACTGAACAATGAGATCCTTAAGAAGCTGTTTGTAGGCATC
CTCATCGGCACTGACGTTGAGAAGATCTTTAGCTGCTTGGTCTTTCATGGCATTGACAAT
ATCATCCTGAGCTTGAAGAACTTTGATCCTTGACGCATTCAGCTGCATCGAGTAATCAAT
CTTCTTGCGTACATCAGCTTGTTTCTCCTTCTTCTCATAGTCTTGCCTGATCTTCTTCTT
TTCCGCCTCAACTAGCTGCAGCTTCTCGATGTTGAATTCTTCTTCAGCAGAGACGGAGAT
CTCGTTTGCCTTCTCCTCAGCCTCTTGGCGAATGAATCTCACCATCTGCTGGATCTGCTT
CGACACATCTAAGTCGTTCATCTTTAAGTTTGTTCGCCGTTAACGACCGATCGGGAGTTG
CAGAGATTTGGAGAAAATACTGAGATTTATGTGGCGCAGGAAGATTCC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 25

CO CL49Contig1 920 25 18 U
GGAACTCAACTCAAAAGGAAACAAAGAAAAAACCTACCAAACCCTAAAACACACAAATAT
CAATCACAATGATGTCCTCGTTCCCACTGGTCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCTG
CAGCTGTATGCACCCACGGAGGACAGGAACACGTGCTGGACACCTCCGAAGATCCAGTTC
TAACGACTGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTC
TTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTA
CAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATG
TTAACGAAGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGG
CCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAG
GAGCCTGCGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAG
AGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATC
GGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCG
AAGACCTTCCTCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGATGATACTACTTCTACTTCAAGTCTG
TAGAAGTTAGGTCTAAGGATGTTCCCATTCTAGTAGTCAACAAGCCAAAATCACGTAATG
TAAAGCCTGTGACTCGTCCATGGCCTAAAATAATGGGTTGAGATAATACCCTCATTGCCT
GTACCTGAATTTCCATAAATATATCAAGTTATGTTTGCCAACATTTTAATTATAAGACAG
AACTATACATTAAAACTTTC


BQ
35 35 40 40 40 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 45 60 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 90 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 75 75 75 97 95 70 90 90 85 85 60 85 85 85 70 85 85 70 85 85 85 85 60 85 85 50 85 85 85 85 85 85 30 80 80 80 65 80 80 80 80 80 65 80 80 80 65 80 80 80 65 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 45 80 80 55 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 40 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 60 60 60 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY30TF U 1
AF RR2DZ49TF U 5
AF RR2DF96TF U 6
AF RR2CV61TF U 5
AF RR2D996TF U 1
AF RR2EJ21TF U 1
AF RR2GY73TF U 1
AF RR2CS71TF U 1
AF RR2F389TF U 1
AF RR2BD47TF U 6
AF RR2G152TF U 238
AF RR2DJ31TF U -1
AF RR2G152JQ C 190
AF RR2DF96JQ C 281
AF RR2DJ31JQ C 263
AF RR2CS71JQ C 249
AF RR2F389JQ C 487
AF RR2CV61JQ C 249
AF RR2DY30JQ C 491
AF RR2EJ21JQ C 216
AF RR2DA45JQ C 212
AF RR2D996JQ C 191
AF RR2DA45TF U 248
AF RR2BD47JQ C 414
AF RR2GY73JQ C 333
BS 1 40 RR2CS71TF
BS 41 41 RR2DY30TF
BS 42 86 RR2CS71TF
BS 87 87 RR2DY30TF
BS 88 677 RR2CS71TF
BS 678 678 RR2F389TF
BS 679 735 RR2CS71TF
BS 736 737 RR2DJ31TF
BS 738 738 RR2DA45TF
BS 739 759 RR2DJ31TF
BS 760 760 RR2G152JQ
BS 761 769 RR2DJ31TF
BS 770 770 RR2DA45TF
BS 771 798 RR2DJ31TF
BS 799 858 RR2DA45TF
BS 859 859 RR2G152JQ
BS 860 880 RR2DA45TF
BS 881 920 RR2GY73JQ

RD RR2DY30TF 509 0 0
GGAACTCAACTCAAAAGGAAACAAAGAAAAAACCTACCAAACCCTAAAACACACAAATAT
CAATCACAATGATGTCCTCGTTCCCACTGGTCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCTG
CAGCTGTATGCACCCACGGAGGACAGGAACACGTGCTGGACACCTCCGAAGATCCAGTTC
TAACGACTGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTC
TTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTA
CAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATG
TTAACGAAGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGG
CCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAG
GAGCCTGCGATTCTCATTGGTGGTAAGAA

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2DZ49TF 533 0 0
GGG
AACTCAAAAGGAAACAAAGAAAAAACCTACCAAGCCCTAAAACACACAAATATCAATCAC
AATGATGTCCTCGTTCCCATTGGTCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCTGCAGCTGT
ATGCACCCACGGAGGACAGGAACACGTGCTGGACACCTCCGAAGATCCAGTTCTAACGAC
TGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTCTTCCCGT
CCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTT
ACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGA
AGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGAT
GCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTG
CGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATT

QA 4 533 4 533
DS 

RD RR2DF96TF 489 0 0
GG
AACTCAAAAGGAAACAAAGAAAAAACCTACCAAACCCTAAAACACACAAATATCAATCAC
AATGATGTCCTCGTTCCCACTGGTCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCTGCAGCTGT
ATGTACCCACGGAGGACAGGAACACGTACTGGACACCTCCGAAGATCCAGTTCTAACGAC
TGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTCTTCCCGT
CCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTT
ACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGA
AGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGAT
GCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTG
CGATTCT

QA 3 489 3 489
DS 

RD RR2CV61TF 677 0 0
G
TCAACTCAAAAGGAAACAAAGAAAAAACCTACCAAACCCTAAAACACACAAATATCAATC
ACAATGATGTCCTCGTTCCCACTGGTCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCTGCAGCT
GTATGCACCCACGGAGGACAGGAACACGTGCTTGACACCTCCGAAGATCCAGTTCTAACG
ACTGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTCTTCCC
GTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCC
TTACCAGGCCTACCGGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAAC
GAAGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGG
ATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAGGAGCC
TGCGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAA
AGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATCGGAAC
CGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCGAAGAC
CTTCCTCGTGAA
TTCC

QA 2 673 2 673
DS 

RD RR2D996TF 675 0 0
GGAACTCAACTCAAAAGGAAACAAAGAAAAAACCTACCAAACCCTAAAACACACAAATAT
CAATCACAATGATGTCCTCGTTCCCACTGGTCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCTG
CAGCTGTATGCACCCACGGAGGACAGGAACACGTGCTGGACACCTCCGAAGATCCAGTTC
TAACGACTGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTC
TTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTA
CAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATG
TTAACGAATGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGG
CCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCGTCGGCTTCCGAG
GAGCCTGCGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAG
AGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATC
GGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCG
AAGACCTTCCTCGTG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2EJ21TF 677 0 0
GGAACTCAACTCAAAAGGAAACAAAGAAAAAACCTACCAAGCCCTAAAACACACAAATAT
CAATCACAATGAT**CCTCGTTCCCATTGGTCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCTG
CAGCTGTATGCACCCACGGAGGACAGGAACACGTGCTGGACACCTCCGAAGATCCAGTTC
TAACGACTGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTC
TTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTA
CAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATG
TTAACGAAGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGG
CCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAG
GAGCCTGCGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAG
AGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATC
GGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCG
AAGACCTTCCTCGTGAA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2GY73TF 683 0 0
GGAACTCAACTCAAAAGGAAACAAAGAAAAAACCTACCAAACCCTAAAACACACAAATAT
CAATCACAATGATGTCCTCGTTCCCACTGGTCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCTG
CAGCTGTATGCACCCACGGAGGACAGGAACACGTGCTGGACACCTCCGAAGATCCAGTTC
TAACGACTGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTC
TTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTA
CAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATG
TTAATGAAGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGG
CCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAG
GAGCCTGCGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAG
AGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATC
GGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCG
AAGACCTTCCTCGTGAA
TTCCAT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2CS71TF 735 0 0
GGAACTCAACTCAAAAGGAAACAAAGAAAAAACCTACCAAGCCCTAAAACACACAAATAT
CAATCACAATGATGTCCTCGTTCCCATTGGTCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCTG
CAGCTGTATGCACCCACGGAGGACAGGAACACGTGCTGGACACCTCCGAAGATCCAGTTC
TAACGACTGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTC
TTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTA
CAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATG
TTAACGAAGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGG
CCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAG
GAGCCTGCGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAG
AGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATC
GGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCG
AAGACCTTCCTCGTGAA*TTCCATAGGGTTCATGATGATACTACTTCTACTTCAAGTCTG
TAGAAGTTAGGTCTA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2F389TF 733 0 0
GGAACTCAACTCAAAAGGAAACAAAGAAAAAACCTACCAAGCCCTAAAACACACAAATAT
CAATCACAATGATGTCCTCGTTCCCATTGGTCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCTG
CAGCTGTATGCACCCACGGAGGACAGGAACACGTGCTGGACACCTCCGAAGATCCAGTTC
TAACGACCGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTC
TTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTA
CAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATG
TTAACGAAGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGG
CCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAG
GAGCCTGCGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAG
AGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATC
GGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCG
AAGACCTTCCTCGTGAAATTCCATACGGTTCATGATGATACTACTTCTACTTCAAGTCTG
TAGAAGTTAGGTC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2BD47TF 726 0 0
GG
AACTCAAAAGGAAACAAAGAAAAAACCTACCAAACCCTAAAACACACAAATATCAATCAC
AATGATGTCCTCGTTCCCACTGGTCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCTGCAGCTGT
ATGCACCCACGGAGGACAGGAACACGTGCTGGACACCTCCGAAGATCCAGTTCTAACGAC
TGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTCTTCCCGT
CCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTT
ACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGA
AGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGAT
GCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTG
CGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAAAG
AAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATCGGAACCG
TCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCGAAGACCT
TCCTCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGATGATACTACTTCTACTTCAAGTCTGTAGAAGT
TAGG

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR2G152TF 535 0 0
TTCTTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGG
TTACAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCT
ATGTTAACGAAGGGGCAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCA
TGGCCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCC
GAGGAGCCTGCGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATT
GAGAGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACA
ATCGGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACT
GCGAAGACCTTCCTCGTGAAATTCCATAGGGT*CATGATGATACTACTTCTACTTCA*GT
CTGTAGAAGTA**GTCTAAG*ATGTTCTCATTCTAGTAGTCA
CAGCCAAATCACG

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2DJ31TF 809 0 0
GGAC
AACTCAACTCAAAAGGAAACAAAGAAAAAACCTACCAAACCCTAAAACACACAAATATCA
ATCACAATGATGTCCTCGTTCCCACTGGTCTCCTTTCTCATCACTCTCATGTTGGCTGCA
GCTGTATGCACCCACGGAGGACAGGAACACGTGCTGGACACCTCCGAAGATCCAGTTCTA
ACGACTGCACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTCTT
CCCGTCCCCGTTAAACTACTCCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACA
GCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTT
AACGAAGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCC
GGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAGGA
GCCTGCGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAG
AAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATCGG
AACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCGAA
GACCTTCCTCGTGAAATTCCATAGGGT*CATGATGATACTACTTCTACTTCA*GTCTGTA
GAAGTA**GTCTAAG*ATGTTCCCATTCTAGTAGTCA*CAAGCCAAA*TCACGTAATGTA
AAGCCTGTGACTCGTC
ATGGCTAAA

QA 5 800 5 800
DS 

RD RR2G152JQ 693 0 0
CACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGT*TTCTTCCCGTCC
CCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTTAC
CAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGAAG
GG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGATGC
GAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTGCG
ATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAAAGAA
AAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATCGGAACCGTC
CCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCGAAGACCTTC
CTCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGATGATACTACTTCTACTTCAAGTCTGTAGAAGTTA
GGTCTAAGGATGTTCCCATTCTAGTAGTCAACAAGCCAAAATCACGTAATGTAAAGCCTG
TGACTCGTCCATGGCCTAAAATAATGGGTTGAGATAATACCCTCATTGCCTGTACCTGAA
TTTCCATAAATATATCAAGTTATGTTTGCCA
GC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2DF96JQ 600 0 0
CATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATA
CGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGAAGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCG
ACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATG
AATCCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTGCGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAA
ACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGA
CCACCTTAACCGGAACAATCGGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAG
TTATCACCAATGATACTGCGAAGACCTTCCTCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGATGATA
CTACTTCTACTTCAAGTCTGTAGAAGTTAGGTCTAAGGATGTTCCCATTCTAGTAGTCAA
CAAGCCAAAATCACGTAATGTAAAGCCTGTGACTCGTCCATGGCCTAAAATAATGGGTTG
AGATAATACCCTCATTGCCTGTACCTGAATTTCCATAAATATATCAAGTTATGTTTGCC
T

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2DJ31JQ 617 0 0
C
CCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTTACCAGGCCTACCAGTT
AGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGAAGGG*CAAGCTGTAAA
TATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAA
GTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTGCGATTCTCATTGGTGG
TAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGG
AGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATCGGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGA
AAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCGAAGACCTTCCTCGTGAAATTCCA
TAGGGTTCATGATGATACTACTTCTACTTCAAGTCTGTAGAAGTTAGGTCTAAGGATGTT
CCCATTCTAGTAGTCAACAAGCCAAAATCACGTAATGTAAAGCCTGTGACTCGTCCATGG
CCTAAAATAATGGGTTGAGATAATACCCTCATTGCCTGTACCTGAATTTCCATAAATATA
TCAAGTTATGTTT
ACC

QA 2 614 2 614
DS 

RD RR2CS71JQ 631 0 0
CCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTTA
CCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGAA
GGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGATG
CGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTGC
GATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAAAGA
AAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATCGGAACCGT
CCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCGAAGACCTT
CCTCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGATGATACTACTTCTACTTCAAGTCTGTAGAAGTT
AGGTCTAAGGATGTTCCCATTCTACTAGTCAACAAGCCAAAATCACGTAATGTAAAGCCT
GCGACTCGTCCATGGCCTAAAATAATGGGTTGAGATAATACCCTCATTGCCTGTACCTGA
ATTTCCATAAATATATCAAGTTATGTTTGCC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2F389JQ 386 0 0
GCGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAAA
GAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATCGGAACC
GTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCGAAGACC
TTCCTCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGATGATACTACTTCTACTTCAAGTCTGTAGAAG
TTAGGTTTAAGGATGTTCCCATTTTACTAGTCAACAATCCAAAATCATGTAATGTAAAGC
CTGCGACTCGTCCATGGCCTAAAATAATGGGTTGAGATAATACCCTCATTGCCTGTACCT
GAATTTCCATAAATATATCAAGTTAT

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR2CV61JQ 631 0 0
CCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTTA
CCAGGCCTACCGGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGAA
GGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGATG
CGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTGC
GATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAAAGA
AAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATCGGAACCGT
CCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCGAAGACCTT
CCTCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGATGATACTACTTCTACTTCAAGTCTGTAGAAGTT
AGGTCTAAGGATGTTCCCATTCTAGTAGTCAACAAGCCAAAATCACGTAATGTAAAGCCT
GTGACTCGTCCATGGCCTAAAATAATGGGTTGAGATAATACCCTCATTGCCTGTACCTGA
ATTTCCATAAATATATCAAGTTATGTTTGCC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2DY30JQ 389 0 0
TTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAAAGAAA
AATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATCGGAACCGTCC
CAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGGGAAGACCTTCC
TCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGATGATACTACTTTTACTTCAAGTCTGTAGAAGTTAG
GTTTAAGGATGTTCCCATTTTAGTAGTCAACAAGCCAAAATCACGTAGTGTAAAGCCTGT
GATTCGTCCATGGCCTAAAATAATGGGTTGAGATAATACCCTCATTGCCTGTACCTGAAT
TTCCATAAATATATCAAGTTATGTTTGCC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2EJ21JQ 664 0 0
CGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTCTTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCA
CTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATAT
CCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGAAGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAG
GTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGT
AGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTGCGATTTTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGA
ACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAA
GTTGACCACCTTAACCGGAACAATCGGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACA
ACTAGTTATCACCAATGATACTGGGAAGACCTTCCTCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGA
TGATACTACTTCTACTTCAAGTCTGTAGAAGTTAGGTCTAAGGATGCTCCCATTCTACTA
GTCAACAAGCCAAAATCACGTAATGTAAAGCCTGCGACTCGTCCATGGCCTAAAATAATG
GGTTGAGATAATACCCTCATTGCCTGTACCTGAATTTCCATAAATATATCAAGTTATGTT
TGCC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2DA45JQ 668 0 0
CTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTCTTCCCGTCCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTG
TCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTTACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTC
ATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGAAGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGT
TTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGG
AAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTGCGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGC
AGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAAAGAAAAATTTGT*GGAGGAGTTGCTT
ACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATCGGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCAC
CACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCGAAGACCTTCCTCGTGAAATTCCATAGGGTTC
ATGATGATACTACTTCTACTTCAAGTCTGTAGAAGTTAGGTCTAAGGATGTTCCCATTCT
AGTAGTCAGCAAGCCAAAATCACGTAATGTAAAGCCTGTGACTCGTCCATGGCCTAAAAT
AATGGGTTGAGATAATACCCTCATTGCCTGTACCTGAATTTCCATAACTATATCAAGTTA
TGTTTGCC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2D996JQ 686 0 0
ACGATACTTGATCCAGCCGTACTCCCGGAGTAGTAACGGAGGTGGTCTTCTTCCCGTCCC
CGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTTACC
AGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGAATG
G*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGATGCG
AGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCGTCGGCTTCCGAGGAGCCTGCGA
TTTTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAAAGAAA
AATTTGTTGGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATCGGAACCGTCC
CAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCGAAGACCTTCC
TCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGATGATACTACTTTTACTTCAAGTCTGTAGAAGTTAG
GTCTAAGGATGTTCCCATTCTAGTAGTCAACAAGCCAAAATCACGTAATGTAAAGCCTGT
GACTCGTCCATGGCCTAAAATAATGGGTTGAGATAATACCCTCATTGCCTGTACCTGAAT
TTCCATAAATATATCAAGTTATGTTT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2DA45TF 636 0 0
CCCCGTTAAACTACTTCCCCTTTGTCCACTTGGCATCAGCCAATCCTCGGTTACAGCCTT
ACCAGGCCTACCAGTTAGCTTCTCATATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAACGA
AGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTTTAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGAT
GCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTG
CGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAAAG
AAAAATTTGT*GGAGGAGTTGCTTACAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATCGGAACCG
TCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCGAAGACCT
TCCTCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGATGATACTACTTCTACTTCAAGTCTGTAGAAGT
TAGGTCTAAGGATGTTCCCATTCTAGTAGTCAGCAAGCCAAAATCACGTAATGTAAAGCC
TGTGACTCGTCCATGGCCTAAAATAATGGGTTGAGATAATACCCTCATTGCCTGTACCTG
AATTTCCATAACTATATCAAGTTATGTTTGCCA
CAA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2BD47JQ 469 0 0
AGCATGGCCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGAAGTAGATGAATCCTCATCGGC
TTCGGAGGAGCCTGCGATTTTCATTGGTGGTAAGAAGCAGGAACGAAACAGCTGGTTTAA
AATTGAGAGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGTTTACAAGTTGACCACCTTAACCGG
AACAATCGGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACCACAACTAGTTATCACCAATGA
TACTGCGAAGACCTTCCTCGTGAAATTCCATAGGGTTCATGATGATACTACTTCTACTTC
AAGTCTGTAGAAGTTAGGTCTAAGGATGTTCCCATTCTAGTAGTCAACAAGCCAAAATCA
CGTAATGTAAAGCCTGTGATTCGTCCATGGCCTAAAATAATGGGTTGAGATAATACCCTC
ATTGCCTGTACCTGAATTTCCATAAATATATCAAGTTATGTTTGCCA
AC

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2GY73JQ 588 0 0
TATCCATACGCGCTCATGGACACCTATGTTAATGAAGGG*CAAGCTGTAAATATCGAGTT
TAGGTCCGACTTTAGGTCGGAAGCATGGCCGGGATGCGAGGAGTTTTCCAAGTACTGGGA
AGTAGATGAATCCTCATCGGCTTCCGAGGAGCCTGCGATTCTCATTGGTGGTAAGAAGCA
GGAACGAAACAGCTGGTTTAAAATTGAGAGAAAAGAAAAATTTGTTGGAGGAGTTGCTTA
CAAGTTGACCACCTTAACCGGAACAATCGGAACCGTCCCAGGGCCTTGGGAAAATGCACC
ACAACTAGTTATCACCAATGATACTGCGAAGACCTTCCTCGTGAAATTCCATAGGGTTCA
TGATGATACTACTTCTACTTCAAGTCTGTAGAAGTTAGGTCTAAGGATGTTCCCATTCTA
GTAGTCAACAAGCCAAAATCACGTAATGTAAAGCCTGTGACTCGTCCATGGCCTAAAATA
ATGGGTTGAGATAATACCCTCATTGCCTGTACCTGAATTTCCATAAATATATCAAGTTAT
GTTTGCCAACATTTTAATTATAAGACAGAACTATACATTAAAACTTTC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 4 16

CO CL50Contig1 823 6 44 U
GGACCAAAAACCACAATCGTCAACCTCAGCAAAAA*GAAAACACATACAGAGAGAGAGAG
AGATGGCGACGACAACAGCAGAGGCAACGAAGACATCTACTAATAATGGAGAAGACAAGC
AATCTCAGAATCTCCGACATCAAGAAGTTGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGATC
TCTACCAGTATATTCTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAAC
TCAGGGAAGTGACAGCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCAGCAGATGAAGGAC
AGTTTCTGAACATGCTCATCAAGCTCGTTAACGCCAAGAACACAATGGAGATCGGTGTTT
ACACTGGCTACTCTCTCCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCCGAAGACGGCAAAATTCTTG
CTATGGATGTTAACAGAGAGAATTACGAATTGGGTTTGCCGATCATCGAAAAAGCCGGCG
TTGCTCACAAGATTGATTT*CAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCCGTTCTTGATCAACTCGTT
GCTGACGAGAAGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAGGACAAC
TATATCAACTACCATAAGCGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGTGGAGTGATTGGCTAT
GACAACACTTTGTGGAACGGTTCTGTCGTTGCTCCTCCTGATGCACCAATGAGGAAGTAT
GTTCGTTATTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTAACAAGCTCTTGCTGCTGACCTAGATGA
GATCTGCATGCTCCTGTTGGTGATGGATCACTATCTGCCGTCG


BQ
10 15 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 0 0 
0 0 35 35 20 20 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C577TF U 2
AF RR2C256TF U 1
AF RR2AZ22TFB U 0
AF RR2BK06TF U 0
AF RR2H670TF U 2
AF RR2E263TF U 1
BS 1 23 RR2C256TF
BS 24 24 RR2E263TF
BS 25 34 RR2C256TF
BS 35 35 RR2E263TF
BS 36 43 RR2C256TF
BS 44 44 RR2E263TF
BS 45 53 RR2C256TF
BS 54 54 RR2E263TF
BS 55 59 RR2C256TF
BS 60 63 RR2E263TF
BS 64 65 RR2C256TF
BS 66 66 RR2E263TF
BS 67 139 RR2C256TF
BS 140 140 RR2E263TF
BS 141 220 RR2C256TF
BS 221 221 RR2E263TF
BS 222 274 RR2C256TF
BS 275 275 RR2E263TF
BS 276 280 RR2C256TF
BS 281 281 RR2E263TF
BS 282 307 RR2C256TF
BS 308 308 RR2E263TF
BS 309 352 RR2C256TF
BS 353 353 RR2E263TF
BS 354 358 RR2C256TF
BS 359 359 RR2E263TF
BS 360 385 RR2C256TF
BS 386 386 RR2E263TF
BS 387 400 RR2C256TF
BS 401 401 RR2E263TF
BS 402 469 RR2C256TF
BS 470 470 RR2E263TF
BS 471 493 RR2C256TF
BS 494 494 RR2E263TF
BS 495 539 RR2C256TF
BS 540 540 RR2E263TF
BS 541 686 RR2C256TF
BS 687 687 RR2E263TF
BS 688 689 RR2C256TF
BS 690 690 RR2E263TF
BS 691 706 RR2C256TF
BS 707 713 RR2E263TF
BS 714 714 RR2H670TF
BS 715 823 RR2E263TF

RD RR2C577TF 355 0 0
GGACCAAAAACCA
AATCGTCAATCTCAGCAAAAAAGAAAACATATACAGAGAGAGAGA****TGGCGACGACA
ACAGCAGAGGCAACGAAGACATCTACTAATAACGGAGAAGACAAGCAATCTCAGAACCTC
CGACATCAAGAAGTTGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGATCTCTACCAGTATATT
CTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAACTCAGGGAAGTGACA
GCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCAGCAGATGAAGGACAGTTTCTGAACATG
CTCATCAAGCTCGTTAACGCCAAGAACACAATGGAGAACGGT

QA 14 355 14 355
DS 

RD RR2C256TF 708 0 0
GGACCAAAAACCACAATCGTCAATCTCAGCAAAAG*GAAAACAAATACAGAGAAAGAGA*
***TGTCGACGACAACAGCAGAGGCAACGAAGACATCTACTAATAATGGAGAAGACAAGC
AATCTCAGAATCTCCGACACCAAGAAGTTGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGATC
TCTACCAGTATATTCTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAGCCAGAATCAATGAAAGAAC
TCAGGGAAGTGACAGCAAAACACCCTTGGAACATTATGACGACATCAGCAGATGAAGGAC
AGTTTCTCAACATGCTCATCAAGCTCGTTAACGCCAAGAACACAATGGAGATTGGTGTCT
ACACTGGCTACTCTCTCCTCGCCACCGCTCTTGCTCTCCCAGAAGACGGCAAAATTCTTG
CTATGGATGTTAACAGAGAGAATTACGAATTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCCGGCG
TTGCTCACAAGATCGATTT*CAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCCGTTCTTGATCAACTCGTC
GCTGACGAGAAGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAGGACAAC
TATATCAACTACCATAAGCGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGTGGAGTGATTGGCTAT
GACAACACTTTGTGGAACGGTTCTGTAGTGGCTCCTCCTGATGCAC
AA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2AZ22TFB 710 0 0
GGACCA
AAAAACCACAATCGTCAATCTCAGCAAAAG*GAAAACAAATACAGAGAAAGAGA****TG
GGCACCACAACAGCAGAGGCAACGAAGACATCTACTAATAATGGAGAAGACAAGCAATCT
CAGAATCTCAGACATCAAGAAGTCGGTCACAAGAGTCTTTTACAGAGCGATGATCTCTAC
CAGTATATTCTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAGCCAGAATCAATGAAAGAACTCAGA
GAAGTGACAGCAGAACACCCTTGGAACATAATGACGACATCAGCAGATGAAGGACAGTTT
CTCAACATGCTCATCAAGCTCGTTAACGCCAAGAACACAATGGAGATCGGTGTTTACACT
GGATACTCTCTCCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCCGAAGACGGCAAAATTCTTGCTATG
GATGTTAACAGAGAGAATTACGAATTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCCGGCGTTGCT
CACAAGATCGATTT*CAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCCGTTCTTGATCAACTCGTTGCTGA
CGAGAAGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAGGACAACTATAT
CAACTACCATAAGCGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGTGGAGTGATTGGCTATGACAA
CACTCTGTGGAACGGTTCTGTCGTTGCTCCTCCTGATGCACCAA

QA 7 710 7 710
DS 

RD RR2BK06TF 704 0 0
GGC
ACCAAAAACCACAATCGTCAACCTCAGCAAAAA*GAAAACACATACAGAGAGAGAGAGAG
ATGGCGACGACAACAGCAGAGGCAACGAAGACATCTACTAATAATGGAGAAGACAAGCAA
TCTCAGAATCTCCGACATCAAGAAGTTGGCCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGATCTC
TACCAGTATATTCTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAACTC
AGGGAAGTGACAGCGAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCAGCAGATGAAGGACAG
TTTCTGAACATGCTCATCAAGCTTGTTAACGCCAAGAACACAATGGAGATCGGTGTTTAC
ACTGGCTACTCTCTCCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCCGAAGACGGCAAAATTCTTGCT
ATGGATGTTAACAGAGAGAATTACGAATTGGGTTTGCCGATCATCGAAAAAGCCGGCGTT
GCTCACAAGATTGATTTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCCGTTCTTGATCAACTCGTTGC
TGACGAGAAGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAGGACAACTA
TATCAACTACCATAAGCGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGTGGAGTGATTGGCTATGA
CAACACTTTGTGGAACGGTTCTGTCGTTGCTCCTCCTGATG

QA 4 704 4 704
DS 

RD RR2H670TF 749 0 0
G
ACCAAAAACCACAATCGTCAACCTCAGCAAAAA*GAAAACACATACAGAGAGAGAGAGAG
ATGGCGACGACAACAGCAGAGGCAACGAAGACATCTACTAATAATGGAGAAGACAAGCAA
TCTCAGAATCTCCGACATCAAGAAGTTGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGATCTC
TACCAGTATATTCTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAACTC
AGGGAAGTGACAGCGAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCAGCAGATGAAGGACAG
TTTCTGAACATGCTCATCAAGCTTGTTAACGCCAAGAACACAATGGAGATCGGTGTTTAC
ACTGGCTACTCTCTCCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCCGAAGACGGCAAAATTCTTGCT
ATGGATGTTAACAGAGAGAATTACGAATTGGGTTTGCCGATCATCGAAAAAGCCGGCGTT
GCTCACAAGATTGATTT*CAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCCGTTCTTGATCGACTCGTTGC
TGACGAGAAGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAGGACAACTA
TATCAACTACCATAAGCGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGTGGAGTGATTGGCTATGA
CAACACTTTGTGGAACGGTTCTGTCGTTGCTCCTCCTGATGCACCAATGAGGAAGTATGT
TCGTTATTACAGAGACTTTGTTCTTGAG

QA 2 749 2 749
DS 

RD RR2E263TF 823 0 0
G
GACCAAAAACCACAATCGTCAACCTCAGCAAAAA*GAAAACACATACAGAGAGAGAGAGA
GATGGCGACGACAACAGCAGAGGCAACGAAGACATCTACTAATAATGGAGAAGACAAGCA
ATCTCAGAATCTCCGACATCAAGAAGTTGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGATCT
CTACCAGTATATTCTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAACT
CAGGGAAGTGACAGCGAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCAGCAGATGAAGGACA
GTTTCTGAACATGCTCATCAAGCTTGTTAACGCCAAGAACACAATGGAGATCGGTGTTTA
CACTGGCTACTCTCTCCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCCGAAGACGGCAAAATTCTTGC
TATGGATGTTAACAGAGAGAATTACGAATTGGGTTTGCCGATCATCGAAAAAGCCGGCGT
TGCTCACAAGATTGATTT*CAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCCGTTCTTGATCAACTCGTTG
CTGACGAGAAGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAGGACAACT
ATATCAACTACCATAAGCGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGTGGAGTGATTGGCTATG
ACAACACTTTGTGGAACGGTTCTGTCGTTGCTCCTCCTGATGCACCAATGAG*AAGTATG
TTCGTTATTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTAACAAGCTCTTGCTGCTGACCTAGATGAG
ATCTGCATGCTCCTGTTGGTGATGGATCACTATCTGCCGTCG

QA 2 823 2 823
DS 



CO CL50Contig2 911 2 14 U
GACACCAAGAAGTCGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGATCTCTACCAGTATATTC
TGGAGACGAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAACCAATGAAAGAACTCAGGGAAGTCACGG
CAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCAGCAGACGAAGGACAGTTTCTCAACATGC
TCATCAAGCTCGTTAACGCCAAGAACACAATGGAGATCGGTGTTTACACTGGCTACTCTC
TCCTCGCCACCGCTCTTGCTCTCCCCGAAGACGGCAAAATTCTTGCTATGGACGTTAACA
GAGAGAACTACGAGTTGGGTTTTGCCGATCATAGAGAAAGCTAGCGTTGCTCACAAGATC
GACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATCAACTCGTTGCGGACGAGAAGAAC
CATGGAACGTATGATTTCATATTCGTTGATGCTGACAAAGACAACTACATCAACTACCAT
AAACGTTTGATCGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGACAACACTCTGTGG
AACGGTTCCGTCGTGGCTCCTCCTGATGCGCCGATGAGGAAGTACGTTCGTTACTACAGA
GACTTTGTTATTGAGCTTAACAAGGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGATCGAGATCTGCATG
CTCCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGCCGCCGGATCAATTGATTGATACCCACTTTT
GAGTGTGGGTTTGATTACTTTGATCATTTCTCTGTACCTTTCATTTACCAACCATTTTAT
GTATTATGTTAAGTATTATCTCTATTATTCTTCCTTTGCTTAATACTTTATGAACAAAGA
AATGATGTATCCTACCTTTTGTTTGTTTTTCATTTATATATGATAAACTTCTAAAAGAAG
ATACCAGTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL50TF U 1
AF RR2A140JQ C 12
BS 1 92 RR2CL50TF
BS 93 93 RR2A140JQ
BS 94 208 RR2CL50TF
BS 209 209 RR2A140JQ
BS 210 268 RR2CL50TF
BS 269 269 RR2A140JQ
BS 270 407 RR2CL50TF
BS 408 408 RR2A140JQ
BS 409 433 RR2CL50TF
BS 434 434 RR2A140JQ
BS 435 437 RR2CL50TF
BS 438 438 RR2A140JQ
BS 439 567 RR2CL50TF
BS 568 911 RR2A140JQ

RD RR2CL50TF 567 0 0
GACACCAAGAAGTCGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGATCTCTACCAGTATATTC
TGGAGACGAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAACTCAGGGAAGTCACGG
CAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCAGCAGACGAAGGACAGTTTCTCAACATGC
TCATCAAGCTCGTTAACGCCAAGAACACCATGGAGATCGGTGTTTACACTGGCTACTCTC
TCCTCGCCACCGCTCTTGCTCTCCCCGATGACGGCAAAATTCTTGCTATGGACGTTAACA
GAGAGAACTACGAGTTGGGTTTTGCCGATCATAGAGAAAGCTAGCGTTGCTCACAAGATC
GACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATCAACTCGTTGCTGACGAGAAGAAC
CATGGAACGTATGGTTTTATATTCGTTGATGCTGACAAAGACAACTACATCAACTACCAT
AAACGTTTGATCGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGACAACACTCTGTGG
AACGGTTCCGTCGTGGCTCCTCCTGAT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2A140JQ 900 0 0
GTCGGTCACAAGAGTCTCTTGCAGAGCGACGATCTTTACCAGTATATTCTGGAGACGAGT
GTGTATCCAAGAGAACCAGAACCAATGAAAGAACTCAGGGAAGTCACGGCAAAACACCCT
TGGAACATAATGACAACATCAGCAGACGAAGGACAGTTTCTCAACATGCTCATCAAGCTC
GTTAACGCCAAGAACACAATGGAGATCGGTGTTTACACTGGCTACTCTCTCCTTGCCACC
GCTCTTGCTCTCCCTGAAGACGGCAAAATTCTTGCTATGGACGTTAACAGAGAGAACTAC
GAGTTGGGTTT*GCCGATCATCGAGAAAGCTGGCGTTGCTCACAAGATCGACTTCAGGGA
AGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATCAACTCGTTGCGGACGAGAAGAACCATGGGACGTA
TGATTTCATATTCGTTGATGCTGACAAAGACAACTACATCAACTACCATAAACGTTTGAT
CGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGACAACACTCTGTGGAACGGTTCGGT
CGTGGCTCCTCCTGATGCGCCGATGAGGAAGTACGTTCGTTACTACAGAGACTTTGTTAT
TGAGCTTAACAAGGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGATCGAGATCTGCATGCTCCCTGTTGG
TGATGGAATCACTATCTGCCGCCGGATCAATTGATTGATACCCACTTTTGAGTGTGGGTT
TGATTACTTTGATCATTTCTCTGTACCTTTCATTTACCAACCATTTTATGTATTATGTTA
AGTATTATCTCTATTATTCTTCCTTTGCTTAATACTTTATGAACAAAGAAATGATGTATC
CTACCTTTTGTTTGTTTTTCATTTATATATGATAAACTTCTAAAAGAAGATACCAGTCAT

QA 1 900 1 900
DS 



CO CL50Contig3 1153 6 30 U
GGATCACCCAAAAACACTTTAACATATAAGTTGTTCAAAAAAAAACATATACAGAGAGAG
AGATGGCGACGACAACAGCAGAGACAACGAAGACATCTCCTACAAATGGAGAAGACAAGC
AATCTCAGAATCTCCGACACCAAGAAGTCGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGAAC
TCTACCAGTATATTCTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAAC
TTAGGGAAGTCACAGCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCGGCAGATGAAGGTC
AGTTTCTCAACATGCTCATCAAGCTCGTTAATGCCAAGAACACTATGGAGATCGGCGTTT
ACACTGGCTACTCTCTTCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCTGAAGACGGAAAAATTCTGG
CTATGGATGTTAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGGCTACCGATCATCGAGAAAGCTGGGG
TTGCTCACAAGATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATGAACTCGTTG
CTGACGAGAAGAACCATGGAACGTATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAAGACAACT
ACATCAACTACCATAAACGTTTGATCGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACG
ACAACACTCTTTGGAACGGCTCCGTTGTGGCCCCTCCTGATGCACCGATGAGGAAGTACG
TTCGTTACTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAATAAGGCTCTCGCAACTGACCCTAGGA
TCGAGATTTGCATGCTCCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGTCGTCGGGTCAATTGAT
TGATATCACACTTTTGAGTGTGGGTGGATTAACTTACCTCCCTCTGTTTTTCAAATCGCT
CTTATCACTACCATTCACCAACCAACCAAAATGGACCGCTTTTATGCATTTTGTTTAGTA
ATATCTCCACAAAAAAAAAATATCTCCACATTGTCATTTGTGTTTTGCTTTCTTTGTGAA
GAGATAAATAATGTTCTCAACCTTTTTTCACTATGTATATGATAAAACATTTGAAACGAA
ATATCACTCATCAAGTTTTCTAGAGAAACTTGAACATATGCATAGACAATTGTCCATAAT
ATTTTTCCAAGAG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR04TF U 4
AF RR2A336TF U 250
AF RR2FK30TF U 1
AF RR2CZ10TF U 243
AF RR2DR04JQ C 375
AF RR2FK30JQ C 417
BS 1 57 RR2FK30TF
BS 58 58 RR2DR04TF
BS 59 675 RR2FK30TF
BS 676 676 RR2A336TF
BS 677 714 RR2FK30TF
BS 715 715 RR2CZ10TF
BS 716 753 RR2FK30TF
BS 754 754 RR2CZ10TF
BS 755 756 RR2FK30TF
BS 757 758 RR2CZ10TF
BS 759 767 RR2FK30TF
BS 768 768 RR2CZ10TF
BS 769 774 RR2FK30TF
BS 775 775 RR2CZ10TF
BS 776 778 RR2FK30TF
BS 779 779 RR2CZ10TF
BS 780 798 RR2FK30TF
BS 799 799 RR2CZ10TF
BS 800 812 RR2FK30TF
BS 813 813 RR2CZ10TF
BS 814 825 RR2FK30TF
BS 826 894 RR2CZ10TF
BS 895 895 RR2DR04JQ
BS 896 942 RR2CZ10TF
BS 943 943 RR2DR04JQ
BS 944 969 RR2CZ10TF
BS 970 977 RR2DR04JQ
BS 978 979 RR2FK30JQ
BS 980 1103 RR2DR04JQ
BS 1104 1153 RR2FK30JQ

RD RR2DR04TF 556 0 0
GG
ACCCAAAAACACTTTAACATATAAGTTGTTCAAAAAAAAACATATACAGAGAGAGAGATG
GCGACGACAACAGCAGAGACAACGAAGACATCTCCTACAAATGGAGAAGACAAGCAATCT
CAGAATCTCCGACACCAAGAAGTCGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGAACTCTAC
CAGTATATTCTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAACTTAGG
GAAGTCACAGCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCGGCAGATGAAGGTCAGTTT
CTCAACATGCTCATCAAGCTCGTTAATGCCAAGAACACTATGGAGATCGGCGTTTACACT
GGCTACTCTCTTCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCTGAAGACGGAAAAATTCTGGCTATG
GATGTTAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGGCTACCGATCATCGAGAAAGCCGGGGTTGCT
CACAAGATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATGAACTCGTTGCTGAC
GAGAAGAACCATGG

QA 3 556 3 556
DS 

RD RR2A336TF 452 0 0
TCACAGCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCGGCAGATGAAGGTCAGTTTCTCA
ACATGCTCATCAAGCTCGTTAATGCCAAGAACACTATGGAGATCGGCGTTTACACTGGCT
ACTCTCTTCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCTGAAGACGGAAAAATTCTGGCTATGGATG
TTAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGGCTACCGATCATCGAGAAAGCTGGGGTTGCTCACA
AGATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATGAACTCGTTGCTGACGAGA
AGAACCATGGAACGTATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAAGACAACTACATCAACT
ACCATAAACGTTTGATCGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGGCAACACTC
TTTGGAACGGCTCCGTTGTGGCCCCTCCTGAT

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2FK30TF 825 0 0
GGATCACCCAAAAACACTTTAACATATAAGTTGTTCAAAAAAAAACATATACAGAGATAG
AGATGGCGACGACAACAGCAGAGACAACGAAGACATCTCCTACAAATGGAGAAGACAAGC
AATCTCAGAATCTCCGACACCAAGAAGTCGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGAAC
TCTACCAGTATATTCTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAAC
TTAGGGAAGTCACAGCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCGGCAGATGAAGGTC
AGTTTCTCAACATGCTCATCAAGCTCGTTAATGCCAAGAACACTATGGAGATCGGCGTTT
ACACTGGCTACTCTCTTCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCTGAAGACGGAAAAATTCTGG
CTATGGATGTTAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGGCTACCGATCATCGAGAAAGCTGGGG
TTGCTCACAAGATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATGAACTCGTTG
CTGACGAGAAGAACCATGGAACGTATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAAGACAACT
ACATCAACTACCATAAACGTTTGATCGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACG
ACAACACTCTTTGGAGCGGCTCCGTTGTGGCCCCTCCTGATGCACCGATGAGGA*GTACG
TTCGTTACTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTA*TA**GCTCTCGCA*CTGACC*TAG*A
TCGAGATTTGCATGCTCC*TGTTGGTGATGGA*TCACTATCTGTC

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR2CZ10TF 727 0 0
G
GGGAAGTCACAGCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCGGCAGATGAAGGTCAGT
TTCTCAACATGCTCATCAAGCTCGTTAATGCCAAGAACACTATGGAGATCGGCGTTTACA
CTGGCTACTCTCTTCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCTGAAGACGGAAAAATTCTGGCTA
TGGATGTTAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGGCTACCGATCATCGAGAAAGCTGGGGTTG
CTCACAAGATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGTTGAACTCGTTGCTG
ACGAGAAGAACCATGGAACGTATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAAGGCAACTACA
TCAACTACCATAAACGTTTGATCTATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGACA
ACACTCTTTGGAACGGCTCCGTTGTGGCCCCTCCTGATGCACCGATGAGGAAGTACGTTC
GTTACTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAATAAGGCTCTCGCAACTGACCCTAGGATCG
AGATTTGCATGCTCCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGTCGTCGGGTCAATTGATTGA
TATCACACTTTTGAGTGTGGGTGGATTAACTTACCTCCCTCTGTTTTTCAA*TCGCTCTT
ATCACTACCATTCACCAACCAACCAAAATGGACCGCTTT*ATGCATTTTGTTTAGTAATA
TCTCCA

QA 2 727 2 727
DS 

RD RR2DR04JQ 729 0 0
CTTCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCTGAAGACGGAAAAATTCTGGCTATGGATGTTAAC
AGAGAGAACTACGAGTTGGGGCTACCGATCATCGAGAAAGCCGGGGTTGCTCACAAGATC
GACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATGAACTCGTTGCTGACGAGAAGAAC
CATGGAACGTATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAAGACAACTACATCAACTGCCAT
AAACGTATGATCGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGACAACACTCTTTTG
AACGGCTCCGTTGTGGCCCCTCCTGATGCACCGATGAGGAAGTACGTTCGTTACTACAGA
GACTTTGTTCTTGAGCTTAATAAGGCTCTCGCAACTGACCCTAGGATCGAGATTTGCATG
CTCCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGTCGTCGGGTCAATTGATTGATATCACACTTT
TGAGTGTGGGTGGATTAACTTACCTCCCTCTGTTTTTCAAATCGCTCTTATCACTACCAT
TCACCAACCAACCAAAATGGACCGCTTTTATGCATTGTGTTTAGTAATATCTCCACAAAA
AAA**ATATCTCCACATTGTCATTTGTGTTTTGCTTTCTTTGTGAAGAGATAAATAATGT
TCTCAACCTTTTTTCACTATGTATATGATAAAACATTTGAAACGAAATATCACTCATCAA
GTTTTCTAG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2FK30JQ 737 0 0
CTGGCTATGGATGTTAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGGCTACCGATCATCGAGAAAGCT
GGGGTTGCTCACAAGATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATGAACTC
GTTGCTGACGAGAAGAACCATGGAACGTATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAAGAC
AACTACATCAACTACCATAAACGTTTGATCGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGC
TACGACAACACTCTTTGGAGCGGCTCCGTTGTGGCCCCTCCTGATGCACCGATGAGGAAG
TACGTTCGTTACTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAATAAGGCTCTCGCAACTGACCCT
AGGATCGAGATTTGCATGCTCCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGTCGTCGGGTCAAT
TGATTGATATCACACTTTTGAGTGTGGGTGGATTAACTTACCTCCCTCTGTTTTTCAAAT
CGCTCTTATCACTACCATTCACCAACCAACCAAAATGGACCGCTTTTATGCATTTTGTTT
AGTAATATCTCCACAAAAAAAAAATATCTCCACATTGTCATTTGTGTTTTGCTTTCTTTG
TGAAGAGATAAATAATGTTTTCAGCCTTTTTTCACTATGTATATGATAAAACATTTGAAA
CGAAATATCACTCATCAAGTTTTCTAGAGAAACTTGAACATATGCATAGACAATTGTCCA
TAATATTTTTCCAAGAG

QA 1 737 1 737
DS 



CO CL50Contig4 785 2 8 U
GGAATCTCCGACACCAAGAAGTCGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGAACTCTACC
AGTATATTCTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAACTTAGGG
AAGTCACAGCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCGGCAGATGAAGGTCAGTTTC
TCAACATGCTCATCAAGCTCGTTAATGCCAAGAACACTATGGAGATCGGCGTTTACACTG
GCTACTCTCTTCTCGCCACTGCTCTTCCTGTTCTTGATGAACTCGTTGCTGACGAGAAGA
ACCATGGAACGTATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAAGACAACTACATCAACTACC
ATAAACGTTTGATCGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGACAACACTCTTT
GGAACGGCTCCGTTGTGGCCCCTCCTGATGCACCGATGAGGAAGTACGTTCGTTACTACA
GAGACTTTGTTCTTGAGCTTAATAAGGCTCTCGCAACTGACCCTAGGATCGAGATTTGCA
TGCTCCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGTCGTCGGGTCAATTGATTGATATCACACT
TTTGAGTGTGGGGTGGATTAACTTACCTCCCTCTGTTTTTCAAATCGCTCTTATCACTAC
CATTCACCAACCAACCAAAATGGACCGCTTTTATGCATTTTGTTTAGTAATATCTCCACA
AAAAAAATATCTCCACATTGTCATTTGTGTTTTGCTTTCTTTGTGAAGAGATAAATAATG
TTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2H716TF U 1
AF RR2H716JQB C 145
BS 1 709 RR2H716TF
BS 710 710 RR2H716JQB
BS 711 726 RR2H716TF
BS 727 727 RR2H716JQB
BS 728 733 RR2H716TF
BS 734 734 RR2H716JQB
BS 735 752 RR2H716TF
BS 753 785 RR2H716JQB

RD RR2H716TF 766 0 0
GGAATCTCCGACACCAAGAAGTCGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGAACTCTACC
AGTATATTCTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAACTTAGGG
AAGTCACAGCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCGGCAGATGAAGGTCAGTTTC
TCAACATGCTCATCAAGCTCGTTAATGCCAAGAACACTATGGAGATCGGCGTTTACACTG
GCTACTCTCTTCTCGCCACTGCTCTTCCTGTTCTTGATGAACTCGTTGCTGACGAGAAGA
ACCATGGAACGTATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAAGACAACTACATCAACTACC
ATAAACGTTTGATCGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGACAACACTCTTT
GGAACGGCTCCGTTGTGGCCCCTCCTGATGCACCGATGAGGAAGTACGTTCGTTACTACA
GAGACTTTGTTCTTGAGCTTAATAAGGCTCTCGCAACTGACCCTAGGATCGAGATTTGCA
TGCTCCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGTCGTCGGGTCAATTGATTGATATCACACT
TTTGAGTGTGGGGTGGATTAACTTACCTCCCTCTGTTTTTCAAATCGCTCTTATCACTAC
CATTCACCAACCAACCAAAATGGACCGCTTTTATGCATTTTGTTTAGTA*TATCTCCACA
AAAAAA*TATCTC*ACATTGTCATTTGTGTTT
GCTTCTTGTGAGAG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2H716JQB 641 0 0
ACATAATGACAACATCGGCAGATGAAGGTCAGTTTCTCAACATGCTCATCAAGCTCGTTA
ATGCCAAGAACACTATGGAGATCGGCGTTTACACTGGCTACTCTCTTCTCGCCACTGCTC
TTCCTGTTCTTGATGAACTCGTTGCTGACGAGAAGAACCATGGAACGTATGACTTTATAT
TCGTTGATGCTGACAAAGACAACTACATCAACTACCATAAACGTTTGATCGATCTTGTGA
AAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGACAACACTCTTTGGAACGGCTCCGTTGTGGCCCCTC
CTGATGCACCGATGAGGAAGTACGTTCGTTACTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAATA
AGGCTCTCGCAACTGACCCTAGGATCGAGATTTGCATGCTCCCTGTTGGTGATGGAATCA
CTATCTGTCGTCGGGTCAATTGATTGATATCACACTTTTGAGTGTGGG*TGGATTAACTT
ACCTCCCTCTGTTTTTCAAATCGCTCTTATCACTACCATTCACCAACCAACCAAAATGGA
CCGCTTTTATGCATTTTGTTTAGTAATATCTCCACAAAAAAAATATCTCCACATTGTCAT
TTGTGTTTTGCTTTCTTTGTGAAGAGATAAATAATGTTCTC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 3 22

CO CL51Contig1 1036 12 13 U
GGGACACGCAAATCGCATAATCGATTTCTTCAACAAAAAAGTGTGAGAAAAAAGGGGGAA
ACGAAAACCCTAAATTCACTCTTAACTCAATTCCCTTTCCCATTAGCTCAAACATGGCGT
CCAGAAACTTTCAGTGGGAGTTACTCGCAGCGTCGCTAACTCTAACATTAGCTCTGATTC
ACCTCGTCGAAGCAAACTCCGAGGGAGATGCTCTTTACGCTCTACGACGGAGCTTATCGG
ACCCAGACCATGTTCTCCAGAGCTGGGATCCCACTCTTGTTAACCCCTGTACCTGGTTCC
ACGTCACCTGTAACCAAGACAACCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTT
CTGGACATCTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAACATCTACAGTACTTGGAGCTGTACA
AGAACAACATCCAAGGAACTATACCTTCTGAACTTGCAAACCTGAAGAGCCTCATCAGCT
TGGATCTCTATAACAACAATCTTACTGGGAAGATTCCTACTTCTCTGGGGAAACTCAAGT
CTCTGGTCTTTCTACGACTCAATGACAACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCA
CGAAAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCC
CAACAGGAGGACCTTTTGAACACATTCCTTTGCAGAACTTTGAGAACAATTCGCGACTGG
AGGGGCCGGAACTAATTGGTCTTGCAAGCTACGACACCAACTGCAACTAAAACAACATCT
GAAATAA**CAAGAAATGGGGGGTGACCTTTGTAAGAAGAACACTTCACCGTTTTTTATC
AAATATCACAACTATTATTATGTAATAAGTATATATATGTCCTAGTTGCCAAAAAAAGAG
AGTCAAAATCTGTAATCCATCTGTCTCAGTTGAGACTGACCGCCCAAAGACTGAGGTTAC
TGTAATGATCGTGTGTGTGACACTGAGATGTAACATTGGTTTTGGTATCAAGTTCCTTTG
CCTTGTTTGCATTAGC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 30 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2C323TF U 1
AF RR2D529TF U 13
AF RR2CV64TF U 15
AF RR2AT96TF U 3
AF RR2ES76TF U 39
AF RR2EN75TF U 103
AF RR2EU60JQ C 173
AF RR2BG30TF U 46
AF RR2EN75JQ C 542
AF RR2D529JQ C 569
AF RR2C323JQ C 540
AF RR2AT96JQ C 567
BS 1 662 RR2C323TF
BS 663 716 RR2AT96TF
BS 717 746 RR2ES76TF
BS 747 747 RR2BG30TF
BS 748 759 RR2ES76TF
BS 760 842 RR2BG30TF
BS 843 843 RR2EU60JQ
BS 844 896 RR2BG30TF
BS 897 897 RR2EN75JQ
BS 898 907 RR2BG30TF
BS 908 908 RR2EN75JQ
BS 909 941 RR2BG30TF
BS 942 1036 RR2EN75JQ

RD RR2C323TF 662 0 0
GGGACACGCAAATCGCATAATCGATTTCTTCAACAAAAAAGTGTGAGAAAAAAGGGGGAA
ACGAAAACCCTAAATTCACTCTTAACTCAATTCCCTTTCCCATTAGCTCAAACATGGCGT
CCAGAAACTTTCAGTGGGAGTTACTCGCAGCGTCGCTAACTCTAACATTAGCTCTGATTC
ACCTCGTCGAAGCAAACTCCGAGGGAGATGCTCTTTACGCTCTACGACGGAGCTTATCGG
ACCCAGACCATGTTCTCCAGAGCTGGGATCCCACTCTTGTTAACCCCTGTACCTGGTTCC
ACGTCACCTGTAACCAAGACAACCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTT
CTGGACATCTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAACATCTACAGTACTTGGAGCTGTACA
AGAACAACATCCAAGGAACTATACCTTCTGAACTTGCAAACCTGAAGAGCCTCATCAGCT
TGGATCTCTATAACAACAATCTTACTGGGAAGATTCCTACTTCTCTGGGGAAACTCAAGT
CTCTGGTCTTTCTACGACTCAATGACAACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCA
CGAAAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCC
CA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2D529TF 650 0 0
GG
GCATAATCGATTTCTTCAACAAAAAAGTGTGAGAAAAAAGGGGGAAACGAAAACCCTAAA
TTCACTCTTAACTCAATTCCCTTTCCCATTAGCTCAAACATGGCGTCCAGAAACTTTCAG
TGGGAGTTACTCGCAGCGTCGCTAACTCTAACATTAGCTCTGATTCACCTCGTCGAAGCA
AACTCCGAGGGAGATGCTCTTTACGCTCTACGACGGAGCTTATCGGACCCAGACCATGTT
CTCCATAGCTGGGATCCCACTCTTGTTAACCCCTGTACCTGGTTCCACGTCACCTGTAAC
CAAGACAACCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTTCTGGACATCTTGCA
CCTGAGCTTGGGAAGCTCGAACATCTACAGTACTTGGAGCTGTACAAGAACAACATCCAA
GGAACTATACCTTCTGAACTTGCAAACCTGAAGAGCCTCATCAGCTTGGATCTCTATAAC
AACAATCTTACTGGGAAGATTCCTACTTCTCTGGGGAAACTCAAGTCTCTGGTCTTTCTA
CGACTCAATGACAACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAATCCCAAGC
CTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCCCA

QA 3 650 3 650
DS 

RD RR2CV64TF 648 0 0
GG
ATAATCGATTTCTTCAACAAAAAAGTGTGAGAAAAAAGGGGGAAACGAAAACCCTAAATT
CACTCTTAACTCAATTCCCTTTCCCATTAGCTCAAACATGGCGTCCAGAAACTTTCAGTG
GGAGTTACTCGCAGCGTCGCTAACTCTAACATTAGCTCTGATTCACCTCGTCGAAGCAAA
CTCCGAGGGAGATGCTCTTTACGCTCTACGACGGAGCTTATCGGACCCAGACCATGTTCT
CCAGAGCTGGGATCCCACTCTTGTTAACCCCTGTACCTGGTTCCACGTCACCTGTAACCA
AGACAACCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTTCTGGACATCTTGCACC
TGAGCTTGGGAAGCTCGAACATCTACAGTACTTGGAGCTGTACAAGAACAACATCCAAGG
AACTATACCTTCTGAACTTGCAAACCTGAAGAGCCTCATCAGCTTGGATCTCTATAACAA
CAATCTTACTGGGAAGATTCCTACTTCTCTGGGGAAACTCAAGTCTCTGGTCTTTCTACG
ACTCAATGACAACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCT
CAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCCCA

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR2AT96TF 714 0 0
GACACGCAAATCGCATAATCGATTTCTTCAACAAAAAAGTGTGAGAAAAAAGGGGGAAAC
GAAAACCCTAAATTCACTCTTAACTCAATTCCCTTTCCCATTAGCTCAAACATGGCGTCC
AGAAACTTTCAGTGGGAGTTACTCGCAGCGTCGCTAACTCTAACATTAGCTCTGATTCAC
CTCGTCGAAGCAAACTCCGAGGGAGATGCTCTTTACGCTCTACGACGGAGCTTATCGGAC
CCAGACCATGTTCTCCAGAGCTGGGATCCCACTCTTGTTAACCCCTGTACCTGGTTCCAC
GTCACCTGTAACCAAGACAACCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTTCT
GGACATCTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAACATCTACAGTACTTGAAGCTGTACAAG
AACAACATCCAAGGAACTATACCTTCTGAACTTGCAAACCTGAAGAGCCTCATCAGCTTG
GATCTCTATAACAACAATCTTACTGGGAAGATTCCTACTTCTCTGGGGAAACTCAAGTCT
CTGGTCTTTCTACGACTCAATGACGACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCACG
AAAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCCCA
ACAGGAGGACCTTTTGAACACATTCCTTTGCAGAACTTTGAGAACAATTCGCGA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2ES76TF 728 0 0
GGA
TGTGAGAAAAAAGGGGGAAACGAAAACCCTAAATTCACTCTTAACTCAATTCCCTTTCCC
ATTAGCTCAAACATGGCGTCCAGAAACTTTCAGTGGGAGTTACTCGCAGCGTCGCTAACT
CTAACATTAGCTCTGATTCACCTCGTCGAAGCAAACTCCGAAGGAGATGCTCTTTACGCT
CTACGACGGAGCTTATCGGACCCAGACCATGTTCTCCAGAGCTGGGATCCCACTCTTGTT
AACCCCTGTACCTGGTTCCACGTCACCTGTAACCAAGACAACCGCGTCACTCGTGTGGAT
TTGGGTAATTCAAACCTTTCTGGACATCTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAACATCTA
CAGTACTTGGAGCTGTACAAGAACAACATCCAAGGAACTATACCTTCTGAACTTGCAAAC
CTGAAGAGCCTCATCAGCTTGGATCTCTATAACAACAATCTTACTGGGAAGATTCCTACT
TCTCTGGGAAAACTCAAGTCTCTGGTCTTTCTACGACTCAATGACAACCAATTGACTGGT
CCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAAT
GATTTGTGTGGAACCATCCCAACAGGAGGACCTTTTGAACACATTCCTTTGCAGAACTTT
GAGAACAATTCGCGACTGGAGGGGCCGGAACTAATTGGTCTTGCA*GCTACGACACCA
CTGCACT

QA 4 721 4 721
DS 

RD RR2EN75TF 623 0 0
GG
AGCTCAAACATGGCGTCCAGAAACTTTCAGTGGGAGTTACTCGCAGCGTCGCTAACTCTA
ACATTAGCTCTGATTCACCTCGTCGAAGCAAACTCCGAGGGAGATGCTCTTTACGCTCTA
CGACGGAGCTTATCGGACCCAGACCATGTTCTCCAGAGCTGGGATCCCACTCTTGTTAAC
CCCTGTACCTGGTTCCACGTCACCTGTAACCAAGACAACCGCGTCACTCGTGTGGATTTG
GGTAATTCAAACCTTTCTGGACATCTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAACATCTACAG
TACTTGGAGCTGTACAAGAACAACATCCAAGGAACTATACCTTCTGAACTTGCAAACCTG
AAGAGCCTCATCAGCTTGGATCTCTATAACAACAATCTTACTGGGAAGATTCCTACTTCT
CTGGGGAAACTCAAGTCTCTGGTCTTTCTACGACTCAATGACAACCAATTGACTGGTCCA
ATCCCTAGAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGAT
TTGTGTGGAACCATCCCAACAGGAGGACCTTTTGAACACATTCCTTTGCAGAACTTTGAG
AACAATTCGCGACTGGAGGGG

QA 3 623 3 623
DS 

RD RR2EU60JQ 716 0 0
TTTGATTCACCTCGTGGAGGCAAACTCCGAGGGAGATGCTCTTTACGCTCTACGACGGAG
CTTATCGGACCCAGACCATGTTCTCCAGAGCTGGGATCCAACTCTTGTTAACCCCTGTAC
CTGGTTCCATGTCACCTGTAACCAAGACAACCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAATTC
AAACCTTTCTGGACATCTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAACATCTACAGTACTTGGA
GCTGTACAAGAACAACATCCAAGGAACTATACCTTCTGAACTTGCAAACCTGAAGAGCCT
CATCAGCTTGGATCTCTATAACAACAATCTTACTGGGAAGATTCCTACTTCTCTGGGGAA
ACTCAAGTCTCTGGTCTTTCTACGACTCAATGACAACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAG
AGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGTGG
AACCATCCCAACAGGAGGACCTTTTGAACACATTCCTTTGCAGAACTTTGAGAACAATTC
GCGATTGGAGGGGCCGGAACTAATTGGTCTTGCAAGCTACGACACCAACTGCAACTAAAA
CAACATCTGAAAAAAAACAAGAACTGGGGGGTGAGCTTTGTAAGAAGAACACTTCACCAC
TTTTTATCAAATATCACAACTATTATTATGTACTGAGTATATATAT
ATGTCCTAGT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2BG30TF 896 0 0
GA
AAAAAAGGGGGAAACGAAAACCCTAAATTCACTCTTAACTCAATTCCCTTTCCCATTAGC
TCAAACATGGCGTCCAGAAACTTTCAGTGGGAGTTACTCGCAGCGTCGCTAACTCTAACA
TTAGCTCTGATTCACCTCGTCGAAGCAAACTCCGAGGGAGATGCTCTTTACGCTCTACGA
CGGAGCTTATCGGACCCAGACCATGTTCTCCAGAGCTGGGATCCCACTCTTGTTAACCCC
TGTACCTGGTTCCACGTCACCTGTAACCAAGACAACCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGT
AATTCAAACCTTTCTGGACATCTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAACATCTACAGTAC
TTGGAGCTGTACAAGAACAACATCCAAGGAACTATACCTTCTGAACTTGCAAACCTGAAG
AGCCTCATCAGCTTGGATCTCTATAACAACAATCTTACTGGGAAGATTCCTACTTCTCTG
GGGAAACTCAAGTCTCTGGTCTTTCTACGACTCAATGACAACCAATTGACTGGTCCAATC
CCTAGAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTG
TGTGGAACCATCCCAACAGGAGGACCTTTTGAACACATTCCTTTGCAGAACTTTGAGAAC
AATTCGCGACTGGAGGGGCCGGAACTAATTGGTCTTGCAAGCTACGACACCAACTGCAAC
TAAAACAACATCTGAAATAA**CAAGAAATGGGGGGTGACCTTTGTAAGAAGAACACTTC
ACCGTTTTTTATCAA*TATCACAACTATTATTATGTAATAAGTATATATATGTCCTAGTT
GCCAAAAAA*GAGAGTCAAA*TCTGTAATCCATCTGTCTCAGTTGAGACTGACC

QA 3 896 3 896
DS 

RD RR2EN75JQ 495 0 0
TCTGGTCTTTCTACGACTCAATGACAACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCAC
GAAAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCCC
AACAGGAGGACCTTTTGAACACATTCCTTTGCAGAACTTTGAGAACAATTCGCGACTGGA
GGGGCCGGAACTAATTGGTCTTGCAAGCTACGACACCAACTGCAACTAAAACAACATCTG
AAATAA**CAAGAAATGGGGGGTGACCTTTGTAAGAAGAACACTTCACCGTTTTTTATCA
AATATCACAACTATTATTATGTAATAAGTATATATATGTCCTAGTTGCCAAAAAAAGAGA
GTCAAAATCTGTAATCCATCTGTCTCAGTTGAGACTGACCGCCCAAAGACTGAGGTTACT
GTAATGATCGTGTGTGTGACACTGAGATGTAACATTGGTTTTGGTATCAAGTTCCTTTGC
CTTGTTTGCATTAGC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR2D529JQ 465 0 0
CCAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTGA
TGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCCCAACAGGAGGACCTTTTGAACACATTCC
TTTGCAGAACTTTGAGAACAATTCGCGACTGGAGGGGCCGGAACTAATTGGTCTTGCAAG
CTACGACACCAACTGCAACTAAAACAACATCTGAAATAA**CAAGAAATGGGGGGTGACC
TTTGTAAGAAGAACACTTCACCGTTTTTTATCAAATATCACAACTATTATTATGTAATAA
GTATATATATGTCCTAGTTGCCAAAAAAAGAGAGTCAAAATCTGTAATCCATCTGTCTCA
GTTGAGACTGACCGCCCAAAGACTGAGGTTACTGTAATGATCGTGTGTGTGACACTGAGA
TGTAACATTGGTTTTGGTATCAAGTTCCTTTGTCTTGTTTGCATT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2C323JQ 494 0 0
TTTT
TGGTCTTTTTACGACTCAATGACAACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCACGA
AAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCCCAA
CAGGAGGACCTTTTGAACACATTCCTTTGCAGAACTTTGAGAACAATTCGCGACTGGAGG
GGCCGGAACTAATTGGTCTTGCAAGTTACGACACCAACTGCAACTAAAACAACATCTGAA
ATAA**CAAGAAATGGGGGGTGACCTTTGTAAGAAGAACACTTCACCGTTTTTTATCAAA
TATCACAACTATTATTATGTAATAAGTATATATATGTCCTAGTTGCCAAAAAAAGAGGGT
CAAAATCTGTAATCCATCTGTCTCAGTTGAGACTGACCGCCCAAAGACTGAGGTTACTGT
AATGATCGTGTGTGTGACACTGAGATGTAACATTGGTTTTGGTATCAAGTTCCTTTGCCT
TGTTTGCATT

QA 5 494 5 494
DS 

RD RR2AT96JQ 457 0 0
G
ACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTG
ATGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCCCAACAGGAGGACCTTTTGAACACATTC
CTTTGCAGAACTTTGAGAACAATTCGCGACTGGAGGGGCCGGAACTAATTGGTCTTGCAA
GTTACGACACCAACTGCAACTAAAACAACATCTGAAATAA**CAAGAAGTGGGGGGTGAC
CTTTGTAAGGAGAACACTTCACCGTTTTTTATCAAATATCACAACTATTATTATGTAATA
AGTATATATATGTCCTAGTTGCCAAAAAAAGAGAGTCAAAATCTGTAATCCATCTGTCTC
AGTTGAGACTGACCGCCCAAAGACTGAGGTTACTGTAATGATCGTGTGTGTGACACTGAG
ATGTAACATTGGTTTTGGTATCAAGTTCCTTTGCC
C

QA 2 456 2 456
DS 



CO CL51Contig2 941 4 14 U
GGGCATAATCGATTTCTCTTCAACAAAAAGTGTGAGAAAAAAAGGGGGAAACGAAAACCC
TAAATTCACTCTTTAACTCAATTCCCTTTCCCCATTAGCTCAAACATGGCGTCCAGAAAC
TTTCAGTGGGAGCTCCTCGCAGCATCTCTAACTCTAACCTTAGCTTTGATTCACCTCGTG
GAGGCAAACTCCGAGGGAGATGCTCTTTACGCTCTACGACGGAGCTTATCGGACCCAGAC
CATGTTCTCCAGAGCTGGGATCCAACTCTTGTTAACCCCTGTACCTGGTTCCATGTCACC
TGTAACCAAGACAACCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTTCTGGACAT
CTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAACATCTACAGTACTTGGAGCTGTACAAGAACAAC
ATCCAAGGAACTATACCTTCTGAACTTGCAAACCTGAAGAGCCTCATCAGCTTGGATCTC
TATAACAACAATCTTACTGGGAAGATTCCTACTTCTCTGGGGAAACTCAAGTCTCTGGTC
TTTCTACGACTCAATGACAACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAATC
CCAAGCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCCCAACAGGA
GGACCTTTTGAACACATTCCTTTGCAGAACTTTGAGAACAACTCGCGATTGGAGGGGCCG
GAACTAATTGGTCTTGCAAGCTACGACACCAACTGCAACTGAAATAACATCTGAAAAAAC
AAGAAATGGGAAGAACACTTCACCAGTTTTTATCAAATATCACAACTATTATTATGTAAT
AAGTATATATATGTCCTAGTTGCCAAAAAAAGAGAGTCAGAATCTGTAATCCATCTGTCT
CAGTTGAGACTGACCGCCCAAAGACTGAGGTTACTGTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV09TF U 1
AF RR2EU60TF U 43
AF RR2ET69TF U 62
AF RR2ET69JQ C 561
BS 1 242 RR2GV09TF
BS 243 243 RR2EU60TF
BS 244 472 RR2GV09TF
BS 473 473 RR2EU60TF
BS 474 474 RR2GV09TF
BS 475 475 RR2EU60TF
BS 476 655 RR2GV09TF
BS 656 679 RR2EU60TF
BS 680 778 RR2ET69TF
BS 779 781 RR2ET69JQ
BS 782 794 RR2ET69TF
BS 795 795 RR2ET69JQ
BS 796 807 RR2ET69TF
BS 808 941 RR2ET69JQ

RD RR2GV09TF 655 0 0
GGGCATAATCGATTTCTCTTCAACAAAAAGTGTGAGAAAAAAAGGGGGAAACGAAAACCC
TAAATTCACTCTTTAACTCAATTCCCTTTCCCCATTAGCTCAAACATGGCGTCCAGAAAC
TTTCAGTGGGAGCTCCTCGCAGCATCTCTAACTCTAACCTTAGCTTTGATTCACCTCGTG
GAGGCAAACTCCGAGGGAGATGCTCTTTACGCTCTACGACGGAGCTTATCGGACCCAGAC
CACGTTCTCCAGAGCTGGGATCCAACTCTTGTTAACCCCTGTACCTGGTTCCATGTCACC
TGTAACCAAGACAACCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTTCTGGACAT
CTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAACATCTACAGTACTTGGAGCTGTACAAGAACAAC
ATCCAAGGAACTATACCTTCTGAACTTGCAAACCTGAAGAGCCTCATCAGCTCG*ATCTC
TATAACAACAATCTTACTGGGAAGATTCCTACTTCTCTGGGGAAACTCAAGTCTCTGGTC
TTTCTACGACTCAATGACAACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAATC
CCAAGCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCCCAA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2EU60TF 637 0 0
G
GGGGGAAACGAAAACCCTAAATTCACTCTTTAACTCAATTCCCTTTCCCCATTAGCTCAA
ACATGGCGTCCAGAAACTTTCAGTGGGAGCTCCTCGCAGCATCTCTAACTCTAACCTTAG
CTTTGATTCACCTCGTGGAGGCAAACTCCGAGGGAGATGCTCTTTACGCTCTACGACGGA
GCTTATCGGACCCAGACCATGTTCTCCAGAGCTGGGATCCAACTCTTGTTAACCCCTGTA
CCTGGTTCCATGTCACCTGTAACCAAGACAACCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAATT
CAAACCTTTCTGGACATCTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAACATCTACAGTACTTGG
AGCTGTACAAGAACAACATCCAAGGAACTATACCTTCTGAACTTGCAAACCTGAAGAGCC
TCATCAGCTTGGATCTCTATAACAACAATCTTACTGGGAAGATTCCTACTTCTCTGGGGA
AACTCAAGTCTCTGGTCTTTCTACGACTCAATGACAACCAATTGACTGGTCCAATCCCTA
GAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGTG
GAACCATCCCAACAGGAGGACCTTTTGAACACATTC

QA 2 637 2 637
DS 

RD RR2ET69TF 746 0 0
TGGGGACTCTAA
TAACTCAATTCCCCTTCCC*ATTAGCTCAAACATGGCGTCCAGAAACTTTCAGTGGGAGC
TCCTCGCAGCATCTCTAACTCTAACCTTAGCTTTGATTCACCTCGTGGAAGCAAACTCCG
AGGGAGATGCTCTTTACGCTCTACGAAGGAGCTTATCGGACCCAGACCATGTTCTCCAGA
GCTGGGATCCAACTCTTGTTAACCCCTGTACCTGGTTCCATGTCACCTGTAACCAAGACA
ACCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTTCTGGACATCTTGCACCTGAGC
TTGGGAAGCTCGAACATCTACAGTACTTGGAGCTGTACAAGAACGACATCCAAGGAACTA
TACCTTCTGAACTTGCAAACCTGAAGAGCCTCATCAGCTTGGATCTCTATAACAACAATC
TTACTGGGAAGATTCCTACTTCTCTTGGGAAACTCAAGTCTCTGGTCTTTCTACGACTCA
ATGACAACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTCAAAG
TTGTTGATGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCCCAACAGGAGGACCTTTTGAAC
ACATTCCTTTGCAGAACTTTGAGAACAACTCGCGATTGGAGGGGCCGGAACTAATTGGTC
TTGCAAGCTACGACACCAACTGCAACTGAAATAACATCTGAAAAAC**AGAAATGGGAAG
A*CACTTCACCAGT

QA 13 746 13 746
DS 

RD RR2ET69JQ 381 0 0
CCAATTGACTGGTCCAATCCCTAGAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTCAAAGTTGTTGA
TGTATCGAGCAATGATTTGTGTGGAACCATCCCAACAGGAGGACCTTTTGAACACATTCC
TTTGCAGAACTTTGAGAACAACTCGCGATTGGAGGGGCCGGAACTAATTGGTCTTGCAAG
CTACGACACCAACTGCAACTGAAATAACATCTGAAAAAACAAGAAATGGGAAGAACACTT
CACCAGTTTTTATCAAATATCACAACTATTATTATGTAATAAGTATATATATGTCCTAGT
TGCCAAAAAAAGAGAGTCAGAATCTGTAATCCATCTGTCTCAGTTGAGACTGACCGCCCA
AAGACTGAGGTTACTGTAATG

QA 1 381 1 381
DS 



CO CL51Contig3 1095 6 19 U
GGAGGAAGTAGGAGAAGTCTATCTTCTCTCCGTCGTTCCCAACACCAATCGCATAATCAA
TCAATT*GAACTTCAACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAAACCCTAA
TTTCTCTGATCGTAAAAAA*GAGAGAAAACTAACTTTACTCAATTCCCTTTTTTTTGCGA
TTAGCTAACATGGCGTTCGGAAACTGTCGGTGGGAGCTCCTCGCGGCTTCTCTAGCCCTG
ACTTTAGCTCTGATTCACCACCCGGTGGATGCGAACTCGGAAGGAGATGCTCTTTACGCG
CTTCGCAGGAGCTTATCGGATCCAGACCACGTGCTCCAGAGCTGGGATCCAACTCTTGTT
AACCCTTGTACCTGGTTCCATGTCACCTGTAACCAAGACAGCCGCGTCACTCGTGTGGAT
TTGGGTAATTCAAACCTTTCAGGACATCTTGCACCTGAGCTTGGCAAGCTCGAGCATTTA
CAGTATTTGGAGCTGTACAAAAACAAAATAGAAGGGACTATACCTTCTGAACTTGAAAAT
CTGAAGAACCTCATCAGCTTGGATCTGTACAACAACAATCTTACTGGGAAAATCCCTTCT
TCTTTGGGAAAATTGAAGTCTCTCGTCTTTCTACGACTCAACGACAACCAATTGACTGGT
CCAATCCCTAAAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTTAAAGTCGTTGATGTATCGAACAAT
GATTTGTGTGGAACTATCCCAACAGAAAGACCTTTCGGACACATTCCTCTGCAGAACTTT
GAGAACAACTCGAGATTGGAGGGGCCGGAACTAATCGGTCTTGCAAGCTACGACACCAAC
TGCAACTGAAACAACTGGCCAAACGACCTGAAAAAAACAAGAAATGAGGGGGTGACCTTA
GAAGAACACTTCACCACTTTATCAAAATATCACATCTATTATGTAACAAGTATATATATG
TATGTTCGTTGTGTGACACACTGAGATGTAACATTTGTTGTATTGGTAGCAAGTTCTTTA
TCTTGTCTGCATTAACATTTGTGTGTATGATCTGTCATATTAATACAAAAACTACGGATT
TGAGTGCTTTATTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 
40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H528TF U 1
AF RR2H884TF U 1
AF RR2BO35TF U 49
AF RR2AK11TF U 80
AF RR2AT46TF U 78
AF RR2AK11JQ C 286
BS 1 107 RR2H528TF
BS 108 109 RR2H884TF
BS 110 299 RR2H528TF
BS 300 300 RR2AT46TF
BS 301 306 RR2H528TF
BS 307 307 RR2AT46TF
BS 308 331 RR2H528TF
BS 332 332 RR2H884TF
BS 333 350 RR2H528TF
BS 351 351 RR2AT46TF
BS 352 464 RR2H528TF
BS 465 465 RR2AT46TF
BS 466 594 RR2H528TF
BS 595 623 RR2H884TF
BS 624 624 RR2AT46TF
BS 625 720 RR2H884TF
BS 721 735 RR2BO35TF
BS 736 855 RR2AT46TF
BS 856 1095 RR2AK11JQ

RD RR2H528TF 594 0 0
GGAGGAAGTAGGAGAAGTCTATCTTCTCTCCGTCGTTCCCAACACCAATCGCATAATCAA
TCAATT*GAACTTCAACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG**CGAAACCCTAA
TTTCTCTGATCGTAAAAAA*GAGAGAAAACTAACTTTACTCAATTCCCTTTTTTTTGCGA
TTAGCTAACATGGCGTTCGGAAACTGTCGGTGGGAGCTCCTCGCGGCTTCTCTAGCCCTG
ACTTTAGCTCTGATTCACCACCCGGTGGATGCGAACTCGGAAGGAGATGCTCTTTACGCT
CTTCGCCGGAGCTTATCGGATCCAGACCACGCGCTCCAGAGCTGGGATCCGACTCTTGTT
AACCCTTGTACCTGGTTCCATGTCACCTGTAACCAAGACAGCCGCGTCACTCGTGTGGAT
TTGGGTAATTCAAACCTTTCAGGACATCTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAGCATTTA
CAGTATTTGGAGCTGTACAAAAACAAAATAGAAGGGACTATACCTTCTGAACTTGAAAAT
CTGAAGAACCTCATCAGCTTGGATCTGTACAACAACAATCTTACTGGGAAAATC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2H884TF 720 0 0
GGAGGAAGTAGGAGAAGTCTATCTTCTCTCCGTCGTTCCCAACACCAATCGCATAATCAA
TCAATT*GAACTTCAACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAAACCCTAA
TTTCTCTGATCGTAAAAAA*GAGAGAAAACTAACTTTACTCAATTCCCTTTTTTTTGCGA
TTAGCTAACATGGCGTTCGGAAACTGTCGGTGGGAGCTCCTCGCGGCTTCTCTAGCCCTG
ACTTTAGCTCTGATTCACCACCCGGTGGATGCGAACTCGGAAGGAGATGCTCTTTACGCT
CTTCGCCGGAGCTTATCGGATCCAGACCACGTGCTCCAGAGCTGGGATCCGACTCTTGTT
AACCCTTGTACCTGGATCCATGTCACCTGTAACCAAGACAGCCGCGTCACTCGTGTGGAT
TTGGGTAATTCAAACCTTTCAGGACATCTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCTCGAGCATTTA
CAGTATTTGGAGCTGTACAAAAACAAAATAGAAGGGACTATACCTTCTGAACTTGAAAAT
CTGAAGAACCTCATCAGCTTGGATCTGTACAACAACAATCTTACTGGGAAAATCCCTTCT
TCTTTGGGAAAATTGAAGTCTCTGGTCTTTCTACGACTCAACGACAACCAATTGACTGGT
CCAATCCCTAAAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTTAAAGTCGTTGATGTATCGAACAAT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2BO35TF 687 0 0
GG
GCATAATCAATCAATTCGAACTTCAACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGC
GAAACCCTAATTTCTCCGATCGTAAAAAA*GAGAGAAAACTAACTTTACTCAATTCCCTT
TTTTTTGCGATTAGCTAACATGGCGTTCGGAAACTGTCGGTGGGAGCTCCTCGCGGCTTC
TCTAGCCCTGACTTTAGCTCTGATTCACCACCCGGTGGATGCGAACTCGGAAGGAGATGC
TCTTTACGCTCTTCGCCGGAGCTTATCGGATCCAGACCACGTGCTCCAGAGCTGGGATCC
GACTCTTGTTAACCCTTGTACCTGGTTCCATGTCACCTGTAACCAAGACAGCCGCGTCAC
TCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTTCAGGACATCTTGCACCTGAGCTTGGGAAGCT
CGAGCATTTACAGTATTTGGAGCTGTACAAAAACAAAATAGAAGGGACTATACCTTCTGA
ACTTGAAAATCTGAAGAACCTCATCAGCTTGGATCTGTACAACAACAATCTTACTGGGAA
AATCCCTTCTTCTTTGGGAAAATTGAAGTCTCTGGTCTTTCTACGACTCAACGACAACCA
ATTGACTGGTCCAATCCCTAAAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTTAAAGTCGTTGATGT
ATCGAACAATGATTTGTGTGGAACT

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR2AK11TF 703 0 0
ACTTCAAC
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAAACCCTAATTTCTCTGATCGTAAAAAAAGAGAGAA
AACTAACTTTACTCAATTCCTTTTTTTTTGCGATTAGCTAACATGGCGTTCGGAAACTGT
CGGTGGGAGCTCCTCGCGGCTTCTCTAGCCCTGACTTTAGCTCTGATTCACCACCTGGTG
GATGCGAACTCGGAAGGAGATGCTCTTTACGCGCTTCGCAGGAGCTTATCGGATCCAGAC
CACGTGCTCCAGAGCTGGGATCCAACTCTTGTTAACCCTTGTACCTGGTTCCATGTCACC
TGTAACCAAGACAGCCGCGTCACCCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTTCAGGACAT
CTTGCACCTGAGCTTGGCAAGCTCGAGCATTTACAGTATTTGGAGCTGTACAAAAACAAA
ATAGAAGGGACTATACCTTCTGAACTTGAAAATCTGAAGAACCTCATCAGCTTGGATCTG
TACAACAACAATCTTACTGGGAAAATCCCTTCTTCTTTGGGAAAATTGAAGTCTCTCGTC
TTTCTACGACTCAACGACAACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAAAGAACTCACGAAAATC
CCAAGCCTTAAAGTCGTTGATGTATCGAACAATGATTTGTGTGGAACTATCCCAACAGAA
AGACCTTTCGGACACATTCCTCTGCAGAACTTTGA

QA 9 703 9 703
DS 

RD RR2AT46TF 795 0 0
ACTTCAAC
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAAACCCTAATTTCTCTGATCGTAAAAAAAGAGAG
AAAACTAACTT*ACTCAATTCCTTTTTTTTTGCGATTAGCTAACATGGCGTTCGGAAACT
GTCGGTGGGAGCTCCTCGCGGCTTCTCTAGCCCTGACTTTAGCTCTGATTCACCACCTGG
TGGATGCGAACTCGGAAGGAGATGCTCTTTACGCGCTTCGCAGGAGCTTATCGGATCCAG
ACCACGTGCTCCAGAGCTGGGATCCAACTCTTGTTAACCCTTGTACCTGGTTCCATGTCA
CCCGTAACCAAGACAGCCGCGTCACTCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTTCAGGAC
ATCTTGCACCTGAGCTTGGCAAGCTCGGGCATTTACAGTATTTGGAGCTGTACAAAAACA
AAATAGAAGGGACTATACCTTCTGAACTTGAAAATCTGAAGAACCTCATCAGCTTGGATC
TGTACAACAACAATCTTACTGGGAAAATCCCTTCTTCTTTGGGAAAATTGAAGTCTCTCG
TCTTTCTACGACTCAACGACAACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAAAGAACTCACGAAAA
TCCCAAGCCTTAAAGTCGTTGATGTATCGAACAATGATTTGTGTGGAACTATCCCAACAG
AAAGACCTTTCGGACACATTCCTCTGCAGAACTTTGAGAACAACTCGAGATTGGAGGGGC
CGGAACTAATCGGTCTTGCAAGCTACGACACCAACTGCAACTGAAACAAC
TGGCCAAACGACCTGAA

QA 9 778 9 778
DS 

RD RR2AK11JQ 810 0 0
GATGCTCTTTACGCGCTTCGCAGGAGCTTATCGGATCCAGACCACGTGCTCCAGAGCTGG
GATCCAACTCTTGTTAACCCTTGTACCTGGTTCCATGTCACCTGTAACCAAGACAGCCGC
GTCACCCGTGTGGATTTGGGTAATTCAAACCTTTCAGGACATCTTGCACCTGAGCTTGGC
AAGCTCGAGCATTTACAGTATTTGGAGCTGTACAAAAACAAAATAGAAGGGACTATACCT
TCTGAACTTGAAAATCTGAAGAACCTCATCAGCTTGGATCTGTACAACAACAATCTTACT
GGGAAAATCCCTTCTTCTTTGGGAAAATTGAAGTCTCTCGTCTTTTTACGACTCAACGAC
AACCAATTGACTGGTCCAATCCCTAAAGAACTCACGAAAATCCCAAGCCTTAAAGTCGTT
GATGTATCGAACAATGATTTGTGTGGAACTATCCCAACAGAAGGACCTTTCGGACACATT
CCTCTGCAGAACTTTGAGAACAACTCGAGATTGGAGGGGCCGGAACTAATCGGTCTTGCA
AGCTACGACACCAACTGCAACTGAAACAACTGGCCAAACGACCTGAAAAAAACAAGAAAT
GAGGGGGTGACCTTAGAAGAACACTTCACCACTTTATCAAAATATCACATCTATTATGTA
ACAAGTATATATATGTATGTTCGTTGTGTGACACACTGAGATGTAACATTTGTTGTATTG
GTAGCAAGTTCTTTATCTTGTCTGCATTAACATTTGTGTGTATGATCTGTCATATTAATA
CAAAAACTACGGATTTGAGTGCTTTATTTT

QA 1 810 1 810
DS 



AS 4 24

CO CL52Contig1 1090 7 21 U
GGACAATACTCATCACAGCTCTACATAATCAATCACCTTTAAAGCTCTCATATTTTTCTG
TTTATCACATCTCGTTTAACTGTTCAGGCGACAACTATCACTATGGCGGAAGAATACAAG
AACACTTCGGAGGAGTTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCC
GCGACGACGACGGGAGAGGTTAAGGATCGTGGATTGTTTGACTTCCTCAAGAAAAAAGAG
GAAGTGAAACCTCAAGAGACGACGACCCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAGGCTCAGGTC
TCGGAACCGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAGCATAAGCCT
ACTCTCCTAGAAAAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAAGAAGAAGAGAACAAACCTAGTCTC
CTCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAAGAAGAAGGTGAA
GACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGATGAGAAAATA
AAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAACAAAG
ACAGAGGATGATACTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAATGGTGGAGCAT
CCGGAGGAGAAGAAAGGATTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCTGGTCACAGCGAG
AAACCAGAGGATTCTCAAGTGGTCGACACGGGGGCTGCGGTACCGGTGACTGAGGAACCG
GCTGAGCATCCGGAAGAGAAGAAAGGGATTCTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGT
TATCATGCCAAGGGTACTGAAGAGGAGGAGAAGAAGAAAGAAAAGGAGTCCGATGATTAA
GAAAATAATGATGTTGGAGTGGGACATTTGCTGTGTTTCTTTGATGATTTTCTCTTTAAT
CTTTATGATGTTCGGTAAGGTTTGTGTTTTTCATTGATTTGCATTTGCTACTTTATATTG
TAATTTCACTATCTCTTTTATAAAGTTTGTGTTGTGTTTCTAAGTAACGCTTATGTGTGT
ATACATTATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM54TF U 1
AF RR2BV33TF U 1
AF RR2AO67TF U 110
AF RR2BV33JQ C 251
AF RR2BM54JQ C 363
AF RR2AO67JQ C 271
AF RR2FK84TF U 471
BS 1 275 RR2BM54TF
BS 276 276 RR2BV33TF
BS 277 640 RR2BM54TF
BS 641 641 RR2BV33TF
BS 642 642 RR2AO67TF
BS 643 677 RR2BV33TF
BS 678 678 RR2AO67TF
BS 679 696 RR2BV33TF
BS 697 697 RR2AO67TF
BS 698 724 RR2BV33TF
BS 725 725 RR2AO67TF
BS 726 732 RR2BV33TF
BS 733 733 RR2AO67TF
BS 734 737 RR2BV33TF
BS 738 738 RR2AO67TF
BS 739 753 RR2BV33TF
BS 754 754 RR2AO67TF
BS 755 774 RR2BV33TF
BS 775 775 RR2FK84TF
BS 776 834 RR2AO67TF
BS 835 1090 RR2FK84TF

RD RR2BM54TF 640 0 0
GGACAATACTCATCACAGCTCTACATAATCAATCACCTTTAAAGCTCTCATATTTTTCTG
TTTATCACATCTCGTTTAACTGTTCAGGCGACAACTATCACTATGGCGGAAGAATACAAG
AACACTTCGGAGGAGTTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCC
GCGACGACGACGGGAGAGGTTAAGGATCGTGGATTGTTTGACTTCCTCAAGAAAAAAGAG
GAAGTGAAACCTCAAGAGACGACGACCCTGGAGTCGGAGTTCGAGCACAAGGCTCAGGTC
TCGGAACCGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAGCATAAGCCT
ACTCTCCTAGAAAAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAAGAAGAAGAGAACAAACCTAGTCTC
CTCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAAGAAGAAGGTGAA
GACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGATGAGAAAATA
AAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAACAAAG
ACAGAGGATGATACTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2BV33TF 776 0 0
GGACAATACTCATCACAGCTCTACATAATCAATCACCTTTAAAGCTCTCATATTTTTCTG
TTTATCACATCTCGTTTAACTGTTCAGGCGACAACTATCACTATGGCGGAAGAATACAAG
AACACTTCGGAGGAGTTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCC
GCGACGACGACGGGAGAGGTTAAGGATCGTGGATTGTTTGACTTCCTCAAGAAAAAAGAG
GAAGTGAAACCTCAAGAGACGACGACCCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAGGCTCAGGTC
TCGGAACCGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAGCATAAGCCT
ACTCTCCTAGAAAAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAAGAAGAAGAGAACAAACCTAGTCTC
CTCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAAGAAGAAGGTGAA
GACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGATGAGAAAATA
AAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAA**AAG
ACAGAGGATGATACTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAAGAGGAAATGGTGGAGCAT
CCGGAGGAGAAGAAAGG*TTGATGGAGAAGATCAAG*AGAAGCTTCCTGGTCACAGCGAG
AAAC*AGAGGAT*CTCA*GTGGTCGACACGGGG*CTGCGGTACCGGTGACTGAG
AC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2AO67TF 725 0 0
AAGAATACAAGAACACTTCGGAGGAGTTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCG
AGGAATCATCCGCGACGACGACGGGAGAGGTTAAGGATCGTGGATTGTTTGACTTCCTCA
AGAAAAAAGAGGAAGTGAAACCTCAAGAGACGACGACCCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACA
AGGCTCAGGTCTCGGAACCGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGG
AGCATAAGCCTACTCTCCTAGAAAAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAAGAAGAAGAGAACA
AACCTAGTCTCCTCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAAG
AAGAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAG
ATGAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCAC
ACGGAACAAAGACAGAGGATGATACTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAA
TGGTGGAGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGATTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCTG
GTCACATCGAGAAACCAGAGGATTCTCAAGTGGTCGACACGGGGGCTGCGGTACCGGTGA
CTGAG*AACCGGCTGAGCATCCGGAAGAGAAGAAAGGGATTCTTGAAAAGATCAAAGAGA
AGCTT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2BV33JQ 815 0 0
CTCAAGAGACGACGACCCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAGGCTCAGGTCTCGGAACCGC
CGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAGCATAAGCCTACTCTCCTAG
AAAAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAAGAAGAAGAGAACAAACCTAGTCTCCTCCAAAAGC
TTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAAGAAGAAGGTGAAGACGGTGAGA
AGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGATGAGAAAATAAAGGAAGATA
GAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAA**AAGACAGAGGATG
ATACTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAATGGTGGAGCATCCGGAGGAGA
AGAAAGGATTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCTGGTCACAGCGAGAAACCAGAGG
ATTCTCAAGTGGTCGACACGGGGGCTGCGGTACCGGTGACTGAGGAACCGGCTGAGCATC
CGGAAGAGAAGAAAGGGATTCTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCATGCCA
AGGGTACTGAAGAGGAGGAGAAGAAGAAAGAAAAGGAGTCCGATGATTAAGAAAATAATG
ATGTTGGAGTGGGACATTTGCTGTGTTTCTTTGATGATTTTCTCTTTAATCTTTATGATG
TTCGGTAAGGTTTGTGTTTTTCATTGATTTGCATTTGCTACTTTATATTGTAATTTCACT
ATCTCTTTTATAAAGTTTGTGTTGTGTTTCT
AAGT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2BM54JQ 701 0 0
TCTCCTAGAAAAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAAGAAGAAGAGAACAAACCTAGTCTCCT
CCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAAGAAGAAGGTGAAGA
CGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGATGAGAAAATAAA
GGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAACAAAGAC
AGAGGATGATACTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAATGGTGGAGCATCC
GGAGGAGAAGAAAGGATTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCTGGTCACAGCGAGAA
ACCAGAGGATTCTCAAGTGGTCGACACGGGGGCTGCGGTACCGGTGACTGAGGAACCGGC
TGAGCATCCGGAAGAGAAGAAAGGGATTCTTGAAAAGA**AAAGAGAAGCTTCCAGGTTA
TCATGCCAAGGGTACTGAAGAGGAGGAGAAGAAGAAAGAAAAGGAGTCCGATGATTAAGA
AAATAATGATGTTGGAGTGGGACATTTGCTGTGTTTCTTTGATGATTTTCTCTTTAATCT
TTATGATGTTCGGTAAGGTTTGTGTTTTTCATTGATTTGCATTTGCTACTTTATATTGTA
ATTTCACTATCTCTTTTATAAAGTTTGTGTTGTGTTTC
AGC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2AO67JQ 790 0 0
GAGTCAGAGTTCGAGCACAAGGCTCAGGTCTCGGAACCGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCAC
GAAGAAGAGGAAGAGAAGGAGCATAAGCCTACTCTCCTAGAAAAGCTTCACCAGAAGCAC
GAGGAAGAAGAAGAGAACAAACCTAGTCTCCTCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCT
TCTTCCTCTTCAAGCGAAGAAGAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAG
AAGAAGATGGCCGAAGAAGATGAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAG
ATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAACAAAGACAGAGGATGATACTCCAGTCATCGCCACC
CTGCCGGTGAAGGAGGAAATGGTGGAGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGATTGATGGAGAAG
ATCAAGGAGAAGCTTCCTGGTCACATCGAGAAACCAGAGGATTCTCAAGTGGTCGACACG
GGGGCTGCGGTACCGGTGACTGAGGAACCGGCTGAGCATCCGGAAGAGAAGAAAGGGATT
CTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCATGCCAAGGGTACTGAAGAGGAGGAG
AAGAAGAAAGAAAAGGAGTCCGATGATTAAGAAAATAATGATGTTGGAGTGGGACATTTG
CTGTGTTTCTTTGATGATTTTCTCTTTAATCTTTATGATGTTCGGTAAGGTTTGTGTTTT
TCATTGATTTGCATTTGCTACTTTATATTGTAATTTCACTATCTCTTTTATAAAGTTTGT
GTTGTGTTTC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2FK84TF 620 0 0
G
GAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGAT
GAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACAC
GGAACAAAGACAGAGGATGATACTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAATG
GTGGAGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGATTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCTGGT
CACAGCGAGAAACCAGAGGATTCTCAAGTGGTCGACACGGGGGCTGCGGTACCGGTGACT
GAGGAACCGGCTGAGCATCCGGAAGAGAAGAAAGGGATTCTTGAAAAGATCAAAGAGAAG
CTTCCAGGTTATCATGCCAAGGGTACTGAAGAGGAGGAGAAGAAGAAAGAAAAGGAGTCC
GATGATTAAGAAAATAATGATGTTGGAGTGGGACATTTGCTGTGTTTCTTTGATGATTTT
CTCTTTAATCTTTATGATGTTCGGTAAGGTTTGTGTTTTTCATTGATTTGCATTTGCTAC
TTTATATTGTAATTTCACTATCTCTTTTATAAAGTTTGTGTTGTGTTTCTAAGTAACGCT
TATGTGTGTATACATTATC

QA 2 620 2 620
DS 



CO CL52Contig2 1074 9 22 U
GGACAATACTCATCACAGCTCTACATAATCAATCACCTTTAAAGCTCTCATATTTTTCTG
TTTATCACATCTCGTTTAACTGTTCAGGCGACAACTATCACTATGGCGGAAGAATACAAG
AACGCTTCGGAGGAGTTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCT
GCGACGACGACGGGAGAGGTAAAGGATCGTGGATTGTTCGACTTCCTCAAGAAAAAAGAG
GAAGTGAAGCCTCAAGAAACGTCGACGCCGCCGCCGCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAG
GCTCAGGTCTCGGAACAGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAG
CATAAGCCTACTCTCCTCGAGAAGCTCCACCAGAAGCACGAAGAAGAAGAAGAGAACAAA
CCTAGTCTCATCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAA
GAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGAT
GAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACAC
GGAACAAAGACAGATGACGACACTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAACG
GTAGAGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGACTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGT
CACAGCGAGAAACCAGAGGATTCTCAAGTGGTCGACACGGGGGCTGTGGTACCAGTGACT
GAGGAAACGGCTGAGCATCCGGAAGAGAAGAAAGGGCTTCTTGAAAAAATCAAAGAGAAG
CTTCCAGGTTATCACGCCAAGGGTACTGAAGAGGAGGAGAAGAAGAAAGAAAAGGAGTCC
GATGATTAAGAAAATAATGATGCTGGAGTGGGACATTTGCTGTGTTTCTTTGATGGTTTT
CTCTTTAATCTTTGTGATGTTCTGTAAGGTTTGTGTCTTTCGTTGATTTGCATTTGCTAC
TTTATATTGTAATTTCACTATCTTTTTTATAAAGTTTGTGTTGTGTTTCTAAGT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 25 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 15 10 10 10 10 

AF RR2DC60TF U 1
AF RR2GH79TF U 1
AF RR2FQ32TF U 1
AF RR2F240TF U 1
AF RR2CM77TF U 1
AF RR2F240JQ C 250
AF RR2CM77JQ C 274
AF RR2DC60JQ C 425
AF RR2GH79JQB C 466
BS 1 245 RR2CM77TF
BS 246 246 RR2DC60TF
BS 247 527 RR2CM77TF
BS 528 528 RR2DC60TF
BS 529 531 RR2CM77TF
BS 532 532 RR2DC60TF
BS 533 733 RR2CM77TF
BS 734 734 RR2F240JQ
BS 735 741 RR2CM77TF
BS 742 742 RR2F240JQ
BS 743 746 RR2CM77TF
BS 747 747 RR2F240JQ
BS 748 762 RR2CM77TF
BS 763 763 RR2F240JQ
BS 764 772 RR2CM77TF
BS 773 773 RR2F240JQ
BS 774 783 RR2CM77TF
BS 784 897 RR2F240JQ
BS 898 898 RR2CM77JQ
BS 899 1068 RR2F240JQ
BS 1069 1070 RR2CM77JQ
BS 1071 1074 RR2DC60JQ

RD RR2DC60TF 640 0 0
GGACAATACTCATCACAGCTCTACATAATCAATCACCTTTAAAGCTCTCATATTTTTCTG
TTTATCACATCTCGTTTAACTGTTCAGGCGACAACTATCACTATGGCGGAAGAATACAAG
AACGCTTCGGAGGAGTTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCT
GCGACGACGACGGGAGAGGTAAAGGATCGTA*ATTGTTCGACTTCCTCAAGAAAAAAGAG
GAAGTGAAGCCTCAAGAAACGTCGACGCCGCCGCCGCTGGAGTCAGAGTTCAAGCACAAG
GCTCAGGTCTCGGAATAGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAG
CATAAGCCTACTCTCCTCGAGAAGCTCCACCAGAAGCACGAAGAAGAAGAAGAGAACAAA
CCTAGTCTCATCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAA
GAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGAT
GAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACAC
GGAACAAAGACAGATGACGACACTCCAGTCATCGCCACCC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2GH79TF 640 0 0
GGACAATACTCATCACAGCTCTACATAATCAATCACCTTTAAAGCTCTCATATTTTTCTG
TTTATCACATCTCGTTTAACTGTTCAGGCGACAACTATCACTATGGCGGAAGAATACAAG
AACGCTTCGGAGGAGTTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCT
GCGACGACGACGGGAGAGGTAAAGGATCGTGGATTGTTCGACTTCCTCAAGAAAAAAGAG
GAAGTGAAGCCTCAAGAAACGTCGACGCCGCCGCCGCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAG
GCTCAGGTCTCGGAACAGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAG
CATAAGCCTACTCTCCTCGAGAAGCTCCACCAGAAGCACGAAGAAGAAGAAGAGAACAAA
CCTAGTCTCATCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAA
GAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGACGAAGATGGCCGATGAAGAT
GAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCACGGAGAAGTTTCCACAC
GGAACAAAGACAGATGACGACACTCCAGTCATCGCCACCC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2FQ32TF 648 0 0
GGACAATACTCATCACAGCTCTACATAATCAATCACCTTTAAAGCTCTCATATTTTTCTG
TTTATCACATCTCGTTTAACTGTTCAGGCGACAACTATCACTATGGCGGAAGAATACAAG
AACGCTTCGGAGGAGTTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCT
GCGACGACGACGGGAGAGGTAAAGGATCGTGGATTGTTCGACTTCCTCAAGAAAAAAGAG
GAAGTGAAGCCTCAAGAAACGTCGACGCCGCCGCCGCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAG
GCTCAGGTCTCGGAACAGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAG
CATAAGCCTACTCTCCTCGAGAAGCTCCACCAGAAGCACGAAGAAGAAGAAGAGAACAAA
CCTAGTCTCATCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAA
GAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGAT
GAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACAC
GGAACAAAGACAGGTGACGACACTCCAGTCATCGCCACCCTGCC
CGTG

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2F240TF 727 0 0
GGACAATACTCATCACAGCTCTACATAATCAATCACCTTTAAAGCTCTCATATTTTTCTG
TTTATCACATCTCGTTTAACTGTTCAGGCGACAACTATCACTATGGCGGAAGAATACAAG
AACGCTTCGGAGGAGTTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCT
GCGACGACGACGAGAGAGGTAAAGGATCGTGGATTGTTCGACTTCCTCAAGAAAAAAGAG
GAAGTGAAGCCTCAAGAAACGTCGACGCCGCCGCCGCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAG
GCTCAGGTCTCGGAACAGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAG
CATAAGCCTACTCTCCTCGAGAAGCTCCACCAGAAGCACGAAGAAGAAGAAGAGAACAAA
CCTAGTCTCATCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAA
GAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGAT
GAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACAC
GGAACAAAGACAGATGACGACACTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAACG
GTAGAGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGACTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGT
CACAGCG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2CM77TF 794 0 0
GGACAATACTCATCACAGCTCTACATAATCAATCACCTTTAAAGCTCTCATATTTTTCTG
TTTATCACATCTCGTTTAACTGTTCAGGCGACAACTATCACTATGGCGGAAGAATACAAG
AACGCTTCGGAGGAGTTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCT
GCGACGACGACGGGAGAGGTAAAGGATCGTGGATTGTTCGACTTCCTCAAGAAAAAAGAG
GAAGTTAAGCCTCAAGAAACGTCGACGCCGCCGCCGCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAG
GCTCAGGTCTCGGAACAGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAG
CATAAGCCTACTCTCCTCGAGAAGCTCCACCAGAAGCACGAAGAAGAAGAAGAGAACAAA
CCTAGTCTCATCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAA
GAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATTGCCTAAGAAGAT
GAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACAC
GGAACAAAGACAGATGACGACACTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAACG
GTAGAGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGACTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGT
CACAGCGAGAAAC*AGAGGAT*CTCA*GTGGTCGACACGGGG*CTGTGGTAC*AGTGACT
GAG
AACGGCTGAGC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2F240JQ 821 0 0
CCTCAAGAAACGTCGACGCCGCCGCCGCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAGGCTCAGGTC
TCGGAACAGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAGCATAAGCCT
ACTCTCCTCGAGAAGCTCCACCAGAAGCACGAAGAAGAAGAAGAGAACAAACCTAGTCTC
ATCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAA
GACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGATGAGAAAATA
AAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAACAAAG
ACAGATGACGACACTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAACGGTAGAGCAT
CCGGAGGAGAAGAAAGGACTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGCGAG
AAACCAGAGGATTCTCAAGTGGTCGACACGGGGGCTGTGGTACCAGTGACTGAGGAAACG
GCTGAGCATCCGGAAGAGAAGAAAGGGCTTCTTGAAAAAATCAAAGAGAAGCTTCCAGGT
TATCACGCCAAGGGTACTGAAGAGGAGGAGAAGAAGAAAGAAAAGGAGCCCGATGATTAA
GAAAATAATGATGCTGGAGTGGGACATTTGCTGTGTTTCTTTGATGGTTTTCTCTTTAAT
CTTTGTGATGTTCTGTAAGGTTTGTGTCTTTCGTTGATTTGCATTTGCTACTTTATATTG
TAATTTCACTATCTTTTTTATAAAGTTTGTGTTGTGTTT
TT

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2CM77JQ 797 0 0
CCGCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAGGCTCAGGTCTCGGAACAGCCGGCGTTTGTGGCG
AAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAGCATAAGCCTACTCTCCTCGAGAAGCTCCACCAG
AAGCACGAAGAAGAAGAAGAGAACAAACCTAGTCTCATCCAAAAGCTTCACCGATCCAAC
AGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAA
AAGAAGAAGAAGATTGCCTAAGAAGATGAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATG
GAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAACAAAGACAGATGACGACACTCCAGTCATC
GCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAACGGTAGAGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGACTGATG
GAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGCGAGAAACCAGAGGATTCTCAAGTGGTC
GACACGGGGGCTGTGGTACCAGTGACTGAGGAAACGGCTGAGCATCCGGAAGAGAAGAAA
GGGCTTCTTGAAAAAATCGAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCCAAGGGTACTGAAGAG
GAGGAGAAGAAGAAAGAAAAGGAGTCCGATGATTAAGAAAATAATGATGCTGGAGTGGGA
CATTTGCTGTGTTTCTTTGATGGTTTTCTCTTTAATCTTTGTGATGTTCTGTAAGGTTTG
TGTCTTTCGTTGATTTGCATTTGCTACTTTATATTGTAATTTCACTATCTTTTTTATAAA
GTTTGTGTTGTGTTTCT

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2DC60JQ 650 0 0
GTCTCATCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAG
GTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGATGAGA
AAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAA
CAAAGACAGATGACGACACTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAACGGTAG
AGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGACTGGTGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACA
GCGAGAAACCAGAGGATTCTCAAGTGGTCGACACGGGGGCTGTGGTACCAGTGACTGAGG
AAACGGCTGAGCATCCGGAAGAGAAGAAAGGGCTTCTTGAAAAAATCAAAGAGAAGCTTC
CAGGTTATCACGCCAAGGGTACTGAAGAGGAGGAGAAGAAGAAAGAAAAGGAGTCCGATG
ATTAAGAAAATAATGATGCTGGAGTGGGACATTTGCTGTGTTTCTTTGATGGTTTTCTCT
TTAATCTTTGTGATGTTCTGTAAGGTTTGTGTCTTTCGTTGATTTGCATTTGCTACTTTA
TATTGTAATTTCACTATCTTTTTTATAAAGTTTGTGTTGTGTTTCTAAGT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2GH79JQB 604 0 0
TCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAG
ATGGCCGAAGAAGATGAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGG
GAGAAGTTTCCACACGGAACAAAGACAGATGACGACACTCCAGTCATCGCCACCCTGCCG
GTGAAGGAGGAAACGGTAGAGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGACTGATGGAGAAGATCA*G
GAGAAGCTTCCAGGTCACAGCGAGAAACCAGAGGATTCTCAAGTGGTCGACACGGGGGCT
GTGGTACCAGTGACTGAGGAAACGGCTGAGCATCCGGAAGAGAAGAAAGGGCTTCTTGAA
AAAATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCCAAGGGCACTGAAGAGGAGGAGAAGAAG
AAAGAAAAGGAGTCCGATGATTAAGAAAATAATGATGCTGGAGTGGGACATTTGCTGTGT
TTCTTTGATGGTTTTCTCTTTAATCTTTGTGATGTTCTGTAAGGTTTGTGTCTTTCGTTG
ATTTGCATTTGCTACTTTATATTGTAATTTCACTATCTTTTTTATAAAGTTTGTGTTGTG
TTTC

QA 1 604 1 604
DS 



CO CL52Contig3 1249 5 6 U
CCTATTATATATGTCATCATTTGAAACTCTTGTCGATACTAGGTGACCATGTGGTTACAG
TAGCAACCAAATGCAGACGAGGAGTTTTATGGAGATAATGTATACACACATAAGCGTTAC
TTAGAAACACAACACAAACTTTATAAAAAGAGATAATGAAATTATTACATAATATAAAGA
TGCAAATGCAAATCAACGAAAGACACAATCTTACAAGAACATCATCAAGTTAAAAAGAGA
AAACCATCAAAGAAACACAGCAAATATCCCACTCCAACATCATTATTTTCTTTTATTTTT
TTTTCTTAATCATCAGACTCCTTTTCTTTCTTCTTCTCCTCCTCTTCAGTACCCTTGGCG
TGATAACCTGGAAGCTTCTCTTTGATCTTTTCAAGAAGCCCTTTCTTCTCTTCCGGATGC
TCAGCCGTTTCCTCAGTCACTGGTACCGCAGCCCCCGTGTCGACCACTTGAGAATCCTCT
GGTTTCTCGCTGTGACCTGGAAGCTTCTCCTTGATCTTCTCCATCAGTCCTTTCTTCTCC
TCCGGATGCTCTACCGTTTCCTCCTTCACCGGCAGGGTGGCGATGACTGGAGTATCATCC
TCTGTCTTTGTTCCGTGTGGAAACTTCTCACTGATCTGCTCCATTACATCCTTTCTATCT
TCCTTTATTTTCTCATCTTCTTCGGCCATCTTCTTCTTCTTTTCCTTCTTCCTCTTCTCA
CCGTCCTCACCTTCTTCCTCGCTTGACTGAATAAATTACTTAAAACATATTATAAAACTA
AATCTAAGTTTTAAATAAATAACTGTTACGTGTGGATTGAATAAGTTACTTACAGAGGAA
GAAGAGCTGTTGGATCGGTGAAGCTTTTGGATGAGACTAGGTTTGTTCTCTTCTTCTTCT
TCGTGCTTCTGGTGAAGCTTCTCGAGGAGAGTAGGCTTATGCTCCTTCTCTTCCTCTTCT
TCGTGCTTCGCCACAAACGCCGGCGGTTCCGAGACCTGAGCCTTGTGCTCGAACTCTGAC
TCCAGGGTCGTCGTCTCTTGAGGTTTCACTTCCTCTTTTTTCTTGAGGAAGTCAAACAAT
CCACGATCCTTAACCTCTCCCGTCGTCGTCGCAGATGATTCCTCGGTGGTGGCAACCTTT
GGGGTCTCGTTCTTGAACTCCTCCGACGCGTTTTTGTACTCTTCCGCCATAGTGATAGAT
GTGATAAACAGAAAATATGAGAGCTTTACTCTGCTTTAAAGGTGATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E387JQ U 119
AF RR2G840JQ U 148
AF RR2DG71JQ U 124
AF RR2FE86JQ U 1
AF RR2FE86TF C 572
BS 1 260 RR2FE86JQ
BS 261 261 RR2E387JQ
BS 262 303 RR2FE86JQ
BS 304 304 RR2E387JQ
BS 305 815 RR2FE86JQ
BS 816 1249 RR2FE86TF

RD RR2E387JQ 424 0 0
GCTTA
GAAACACAACACAAACTTTATAAAAAGAGATAATGAAATTATTACATAATATAAAGATGC
AAATGCAAATCAACGAAAGACACAATCTTACAAGAACATCATCAAGTTAAAAAGAGAAAA
CCATCAAAGAAACACAGCAAATATCCCACTCCAACATCATTATTTTCTTTTATTTTTTTT
TCTTAATCATCAGACTCCTTTTCTTTCTTCTTCTCCTCCTCTTCAGTACCCTTGGCGTGA
TAACCTGGAAGCTTCTCTTTGATCTTTTCAAGAAGCCCTTTCTTCTCTTCCGGATGCTCA
GCCGTTTCCTCAGTCACTGGTACCGCAGCCCCCGTGTCGACCACTTGAGAATCCTCTGGT
TTCTCGCTGTGACCTGGAAGCTTCTACTTGATCTTCTCCATCAGTCCTTTCTTCTCCTC

QA 6 424 6 424
DS 

RD RR2G840JQ 601 0 0
G
AGAGATAATGAAATTATTACATAATATAAAGATGCAAATGCAAATCAACGAAAGACACAA
TCTTACAAGAACATCATCAAGTTAAAAAGAGAAAACCATCAAAGAAACACAGCAAATATC
CCACTCCAACATCATTATTTTCTTTTATTTTTTTTTCTTAATCATCAGACTCCTTTTCTT
TCTTCTTCTCCTCCTCTTCAGTACCCTTGGCGTGATAACCTGGAAGCTTATCTTTGATCT
TTTCAAGAAGCCCTTTCTTCTCTTCCGGATGCTCAGCCGTTTCCTCAGTCACTGGTACCG
CAGCCCCCGTGTCGACCACTTGAGAATCCTCTGGTTTCTCGCTGTGACCTGGAAGCTTCT
CCTTGATCTTCTCCATCAGTCCTTTCTTCTCCTCCGGATGCTCTACCGTTTCCTCCTTCA
CCGGCAGGGTGGCGATGACTGGAGTATCATCCTCTGTCTTTGTTCCGTGTGGAAACTTCT
CCCTGATCTGCTCCATTACATCCTTTCTATCTTCCTTTATTTTCTCATCTTCTTCGGCCA
TCTTCTTCTTCTTTTCCTTCTTCCTCTTCTCACCGTCCTCACCTTCTTCCTCGCTTGAAG

QA 2 601 2 601
DS 

RD RR2DG71JQ 609 0 0
GAAACACAACACAAACTTTATAAAAAGAGATAATGAAATTATTACATAATATAAAGATGC
AAATGCAAATCAACGAAAGACACAATCTTACAAGAACATCATCAAGTTAAAAAGAAAAAA
CCATCAAAGAAACACAGCAAATATCCCACTCCAACATCATTATTTTCTTTTATTTTTTTT
TCTTAATCATCAAACTCCTTTTCTTTCTTCTTCTCCTCCTCTTCAGTACCCTTGGCGTGA
TAACCTGGAAGCTTCTCTTTGATCTTTTCAAGAAGCCCTTTCTTCTCTTCCGGATGCTCA
GCCGTTTCCTCAGTCACTGGTACCGCAGCCCCCGTGTCGACCGCTTGAAAATCCTCTGGT
TTCTCGCTGTGACCTGGAAGCTTCTCCTTGATCTTCTCCATCAGTCCTTTCTTCTCCTCC
GGATGCTCTACCGTTTCCTCCTTCACCGGCAGGGTGGCGATGACTGGAGTATCATCCTCT
GTCTTTGTTCCGTGTGGAAACTTCTCCCTGATCTGCTCCATTACATCCTTTCTATCTTCC
TTTATTTTCTCATCTTCTTCGGCCATCTTCTTCTTCTTTTCCTTCTTCCTCTTCTCACCG
TCCTCACCT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2FE86JQ 815 0 0
CCTATTATATATGTCATCATTTGAAACTCTTGTCGATACTAGGTGACCATGTGGTTACAG
TAGCAACCAAATGCAGACGAGGAGTTTTATGGAGATAATGTATACACACATAAGCGTTAC
TTAGAAACACAACACAAACTTTATAAAAAGAGATAATGAAATTATTACATAATATAAAGA
TGCAAATGCAAATCAACGAAAGACACAATCTTACAAGAACATCATCAAGTTAAAAAGAGA
AAACCATCAAAGAAACACAGAAAATATCCCACTCCAACATCATTATTTTCTTTTATTTTT
TTT*CTTAATCATCAGACTCCTTTTCTTTCTTCTTCTCCTCCTCTTCAGTACCCTTGGCG
TGATAACCTGGAAGCTTCTCTTTGATCTTTTCAAGAAGCCCTTTCTTCTCTTCCGGATGC
TCAGCCGTTTCCTCAGTCACTGGTACCGCAGCCCCCGTGTCGACCACTTGAGAATCCTCT
GGTTTCTCGCTGTGACCTGGAAGCTTCTCCTTGATCTTCTCCATCAGTCCTTTCTTCTCC
TCCGGATGCTCTACCGTTTCCTCCTTCACCGGCAGGGTGGCGATGACTGGAGTATCATCC
TCTGTCTTTGTTCCGTGTGGAAACTTCTCACTGATCTGCTCCATTACATCCTTTCTATCT
TCCTTTATTTTCTCATCTTCTTCGGCCATCTTCTTCTTCTTTTCCTTCTTCCTCTTCTCA
CCGTCCTCACCTTCTTCCTCGCTTGACTGAATAAATTACTTAAAACATATTATAAAACTA
AATCTAAGTTTTAAATAAATAACTGTTACGTGTGG

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR2FE86TF 678 0 0
GCAGGGTGGCGATGACTGGAGTATCATCCTCTGTCTTTGTTCCGTGTGGAAACTTCTCAC
TGATCTGCTCCATTACATCCTTTCTATCTTCCTTTATTTTCTCATCTTCTTCGGCCATCT
TCTTCTTCTTTTCCTTCTTCCTCTTCTCACCGTCCTCACCTTCTTCCTCGCTTGACTGAA
TAAATTACTTAAAACATATTATAAAACTAAATCTAAGTTTTAAATAAATAACTGTTACGT
GTGGATTGAATAAGTTACTTACAGAGGAAGAAGAGCTGTTGGATCGGTGAAGCTTTTGGA
TGAGACTAGGTTTGTTCTCTTCTTCTTCTTCGTGCTTCTGGTGAAGCTTCTCGAGGAGAG
TAGGCTTATGCTCCTTCTCTTCCTCTTCTTCGTGCTTCGCCACAAACGCCGGCGGTTCCG
AGACCTGAGCCTTGTGCTCGAACTCTGACTCCAGGGTCGTCGTCTCTTGAGGTTTCACTT
CCTCTTTTTTCTTGAGGAAGTCAAACAATCCACGATCCTTAACCTCTCCCGTCGTCGTCG
CAGATGATTCCTCGGTGGTGGCAACCTTTGGGGTCTCGTTCTTGAACTCCTCCGACGCGT
TTTTGTACTCTTCCGCCATAGTGATAGATGTGATAAACAGAAAATATGAGAGCTTTACTC
TGCTTTAAAGGTGATTGC

QA 1 678 1 678
DS 



CO CL52Contig4 955 3 12 U
GGACAATACTCATCACAGCTCTACTTTATCAATCACCTTTAAAGCAAAGTAAAGCTCTCA
TATTTTCTGTTTATCACATCTATCACTATGGCGGAAGAGTACAAAAACGCGCCGGAGGAG
TTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCTGCGACGACGACGGGA
GAGGTTAAGGATCGTGGATTGTTTGACTTCCTCAAGAAAAAAGAGGAAGTGAAACCTCAA
GAGACGACGACCCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAGGCTCAGGTCTCGGAACCGCCGGCG
TTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAGCATAAGCCTACTCTCCTCGAGAAG
CTTCACCAGAAGCACGAAGAAGAAGAAGAGAACAAACCTAGTCTCATCCAAAAGCTTCAC
CGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAGGACGGTGAGAAGAGG
AAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGATGAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAG
GATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAACAAAGACAGAGGATGATACT
CCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAACGGTAGAGCATCCGGAGGAGAAGAAA
GGACTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGCGAGAAACCAGAGGATTCT
CAAGTGGTCGACACGGGGGCTGCGGTACCAGTGACTGAGGAAACGGCTGAGCATCCGGAA
GAGAAGAAAGGGCTTCTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCCAAGGGT
ACTGAAGAGGAGGAGAAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTGATGATTAAGAAAAAAAATAAAAG
AAAATAATGATGTTGGAGTGGGATATTTGCTGTGTTTCTTTGATGGTTTTCTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG71TF U 11
AF RR2G840TF U 1
AF RR2EF13TF U 255
BS 1 681 RR2G840TF
BS 682 682 RR2DG71TF
BS 683 717 RR2G840TF
BS 718 718 RR2DG71TF
BS 719 722 RR2G840TF
BS 723 723 RR2DG71TF
BS 724 748 RR2G840TF
BS 749 749 RR2EF13TF
BS 750 759 RR2G840TF
BS 760 760 RR2EF13TF
BS 761 784 RR2G840TF
BS 785 955 RR2EF13TF

RD RR2DG71TF 732 0 0
G
ATCACAGCTCTACTTTATCAATCACCTTTAAAGCAAAGTAAAGCTCTCATATTTTCTGTT
TATCACATCTATCACTATGGCGGAAGAGTACAAAAACGCGTCGGAGGAGTTCAAGAACGA
GACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCTGCGACGACGACGGGAGAGGTTAAGGA
TCGTGGATTGTTTGACTTCCTCAAGAAAAAAGAGGAAGTGAAACCTCAAGAGACGACGAC
CCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAGGCTCAGGTCTCGGAACCGCCGGCGTTTGTGGCGAA
GCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAGCATAAGCCTACTCTCCTCGAGAAGCTTCACCAGAA
GCACGAAGAAGAAGAAGAGAACAAACCTAGTCTCATCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAG
CTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAGGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAA
GAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGATGAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGA
GCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAACAAAGACAGAGGATGATACTCCAGTCATCGC
CACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAACGGTAGAGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGACTGATGGA
GAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGCGAGAAACCAGAGGATTCTCAAGCGGTCGA
CACGGGGGCTG

QA 2 732 2 732
DS 

RD RR2G840TF 784 0 0
GGACAATACTCATCACAGCTCTACTTTATCAATCACCTTTAAAGCAAAGTAAAGCTCTCA
TATTTTCTGTTTATCACATCTATCACTATGGCGGAAGAGTACAAAAACGCGCCGGAGGAG
TTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCTGCGACGACGACGGGA
GAGGTTAAGGATCGTGGATTGTTTGACTTCCTCAAGAAAAAAGAGGAAGTGAAACCTCAA
GAGACGACGACCCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAGGCTCAGGTCTCGGAACCGCCGGCG
TTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAGCATAAGCCTACTCTCCTCGAGAAG
CTTCACCAGAAGCACGAAGAAGAAGAAGAGAACAAACCTAGTCTCATCCAAAAGCTTCAC
CGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAGGACGGTGAGAAGAGG
AAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGATGAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAG
GATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAACAAAGACAGAGGATGATACT
CCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAACGGTAGAGCATCCGGAGGAGAAGAAA
GGACTGATGGAGAAGATCAAG*AGAAGCTTCCAGGTCACAGCGAGAAACCAGAGGAT*CT
CA*GTGGTCGACACGGGGGCTGCGGTAC*AGTGACTGAG*AAACGGCTGAGCATCCGGAA
GAGA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2EF13TF 701 0 0
GGAGTCAGAGTTCGAGCACAAGGCTCAGGTCTCGGAACCGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCA
CGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAGCATAAGCCTACTCTCCTCGAGAAGCTTCACCAGAAGCA
CGAAGAAGAAGAAGAGAACAAACCTAGTCTCATCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTC
TTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAGGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAA
GAAGAAGATGGCCGAAGAAGATGAGAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCA
GATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAACAAAGACAGAGGATGATACTCCAGTCATCGCCAC
CCTGCCGGTGAAGGAGGAAACGGTAGAGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGACTGATGGAGAG
GATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGCGAGAAACCAGAGGATTCTCAAGTGGTCGACAC
GGGGGCTGCGGTACCAGTGACTGAGGAAACGGCTGAGCATCCGGAAGAGAAGAAAGGGCT
TCTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCCAAGGGTACTGAAGAGGAGGA
GAAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTGATGATTAAGAAAAAAAATAAAAGAAAATAATGATGTT
GGAGTGGGATATTTGCTGTGTTTCTTTGATGGTTTTCTCTT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 3 22

CO CL53Contig1 838 8 7 U
ATCAAATTACGTGCCTTCATAGTTAAAGGGAAAAATAACACAGCAGAATCGAACCAATAA
TCACACACTTTGCGTTTTTTC*ACATTCAACCGGTCTCGATCGGATGGTACAAACAAAAC
CCACAAAAACATAATTCTTTGAATCAATCGAGTTTTGATACAAATTAGTAAGTGACACGC
ACGCCTGAGTACCGGAGAATCTCTCCAATGAGTTCTCCTTTACCGGAACCAACATACCGC
CCACAAATATCGCCTTGTCTGATGAACAAGAAAGTTGGTACTTCGATAACATTCATGTCC
TTTAGAAACTCCATACAGCTATCGTTCTCGTCCCCATTCATTCTAGCGAACACGACAGAC
TCGGACATCGACCGGGACAGTTTCAGCACCGTCGGATAAACCTTCACGCATGGTCCACAG
TGTTTCAGACCGACATCCAGCACAATCAGCTTGCCTCCAGTACGGTTCTCGTCAATCAGC
TTCTCCACGTCAGCTCGTCCATGCAGCTGCACAACCGCCGAGTGGCTGTCTCCATAATAT
AGCACGTCCCCCATTAACTGGTCCGGTCCGATACCTTCTTCCTCGTGTATTTTCTCCATG
CTCTTATAAAAGCTAAAGTGAGGAACTTTCTCGATCTTCTCTCTCCGACAAAGCTCTCTA
GTCTTTTCGGACTCATCACCCATGACGAGCAAGAAGTCGACGTCGTTACATGTCCTGCTC
AGCTCCACCATAAAAGGATATATCTTACTACTCTGATCACTCTTACTCGTGGCAAACTCA
ACAACCACAAGCTTGTTCTTGGCCTTCTTAAGCGCTTCGTCAACTCCTCTCCGCTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 30 30 30 35 5 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 15 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H226TF C 44
AF RR2E557JQ U 59
AF RR2F726JQ U 50
AF RR2F546JQ U 41
AF RR2A950TF C 21
AF RR2CH20JQ U 1
AF RR2AB86JQ U 119
AF RR2AB86TF C 193
BS 1 96 RR2CH20JQ
BS 97 97 RR2F546JQ
BS 98 366 RR2CH20JQ
BS 367 367 RR2F546JQ
BS 368 775 RR2CH20JQ
BS 776 776 RR2AB86JQ
BS 777 838 RR2CH20JQ

RD RR2H226TF 161 0 0
CAA
AATCAAACCAATAATCACACACTTTGCGTTTTTTCCATATTCAACCGGTCTCGATCGGAT
GGTACAAACAAAACTCAGAAAAACATA*TTCTTTTAATCAATCGAGTTTTGATACAAATT
AGTAAGTGACACGAACGCCTGAGTACCGGAGAATCTC
C

QA 4 160 4 160
DS 

RD RR2E557JQ 335 0 0
AATCACACACTTTGCGTTTTTTC*ACATTCAACCGGTCTCGATCGGATGGTACAAACAAA
ACCCACAAAAACATAATTCTTTGAATCAATCGAGTTTTGATACAAATTAATAAGTGACAC
GCACGCCTGAGTACCGGAAAATCTCTCCAATGAGTTCTCCTTTACCGGAACCAACATACC
GCCCACAAATATCGCCTTGTCTGATGAACAAAAAAGTTGGTACTTCGATAACATTCATGT
CCTTTAAAAACTCCATACAGCTATCGTTCTCGTCCCCATTCATTCTAGCGAACACGACAG
ACTCGGACATCGACCGGGACAGTTTCAGCACCGTC

QA 1 335 1 335
DS 

RD RR2F726JQ 642 0 0
CGAACCAATAATCACACACTTTGCGTTTTTTC*ACATTCAACCGGTCTCGATCGGATGGT
ACAAACAAAACCCACAAAAACATAATTCTTTGAATCAATCGAGTTTTGATACAAATTAGT
AAGTGACACGCACGCCTGAGTACCGGAAAATCTCTCCAATGAGTTCTCCTTTACCGGAAC
CAACATACCGCCCACAAATATCGCCTTGTCTGATGAACAAAAAAGTTGGTACTTCGATAA
CATTCATGTCCTTTAAAAACTCCATACAGCTATCGTTCTCGTCCCCATTCATTCTAGCGA
ACACGACAGACTCGGACATCGACCGGGACAGTTTCAGCACCGTCGGATAAACCTTCACGC
ATGGTCCACAGTGTTTCAAACCGACATCCAGCACAATCAGCTTGCCTCCAGTACGGTTCT
CGTCAATCAGCTTCTCCACGTCAGCTCGTCCATGCAGCTGCACAACCGCCGAGTGGCTGT
CTCCATAATATAGCACGTCCCCCATTAACTGGTCCGGTCCGATACCTTCTTCCTCGTGTA
TTTTCTCCATGCTCTTATAAAAGCTAAAGTGAGGAACTTTCTCGATCTTCTCTCTCCGAC
AAAGCTCTCTAGTCTTTTCGGACTCATCACCCATGACGAGCA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2F546JQ 691 0 0
A
AGCAAAATCAAACCAATAATCACACACTTTGCGTTTTTTCCATATTCAACCGGTCTCGAT
CGGATGGTACAAACAAAACTCAGAAAAACATA*TTCTTTTAATCAATCGAGTTTTGATAC
AAATTAGTAAGTGACACGAACGCCTGAGTACCGGAGAATCTCTCCAATGAGTTCTCCTTT
ACCGGAACCAACATACCGCCCACAAATATCGCCTTGTCTGATGAACAAGAAAGTTGGTAC
TTCGATAACATTCATGTCCTTTAGAAACTCCATACAGCTATCGTTCTCGTCCCCGTTCAT
TCTAGCGAACACGACAGACTCGGACATCGACCGGGACAGTTTCAGCACTGTCGGATAAAC
CTTCACGCATGGTCCACAGTGTTTCAGACCGACATCCAGCACAATCAGCTTGCCTCCAGT
ACGGTTCTCGTCAATCAACTTCTCCACGTCAGCTCGTCCATGCAGCTGCACAACCGCCGA
GTGGCTGTCCCCGTAATATAGCACGTCCCCCATTAGCTGGTCCGGTCCAATACCTTCTTC
CTCGTGTATTTTCTCCATGCTCTTATAGAAGCTAAAGTGAGGAACTTTCTCGATCTTCTC
CCTCCGACAAAGCTCTCTAGTCTTTTCGGACTCATCACCCATGACGAGCAAGAAGTCGAC
GTCGTTACATGTCCTGCTCAGCTCAACCAT

QA 2 691 2 691
DS 

RD RR2A950TF 746 0 0
AGTT
AAAGGGAAAAATAACACAGCAGAATCGAACCAATAATCACACACTTTGCGTTTTTTC*AC
ATTCAACCGGTCTCGATCGGATGGTACAAACAAAACCCACAAAAACATAATTCTTTGAAT
CAATCGAGTTTTGATACAAATTAGTAAGTGACACGCACGGCTGAGTACCGGAGAATCTCT
CAAATGAGTTCTCCTTTACCGGAACCAACATACCGCCCACAAATATCGCCTTGTCTGATG
AACAAGAAAGTTGGTACTTCGATAACATTCATGTCCTTTAGAAACTCCATACAGCTATCG
TTCTCGTCCCCATTCATTCTAGCGAACACGACAGACTCGGACATCGACCGGGACAGTTTC
AGCACCGTCGGATAAACCTTCACGCATGGTCCACAGTGTTTCAGACCGACATCCAGCACA
ATCAGCTTGCCTCCAGTACGGTTCTCGTCAATCAGCTTCTCCACATCAGCTCGTCCATGC
AGCTGCACAACCGCCGAGTGGCTGTCTCCATAATATAGCACGTCCCCCATTAACTGGTCC
GGTCCGATACCTTCTTCCTCGTGTATTTTCTCCATGCTCTTATAAAAGCTAAAGTGAGGA
ACTTTCTCGATCTTCTCTCTCCGACAAAGCTCTCTAGTCTTTTCGGACTCATCACCCATG
ACGAGCAAGAAGTCGACGTCGTTACATGTCCTGCTCAGCTCCACCATAAAAGGATATATC
TTACTACTCTGATCACTCTTAC

QA 5 746 5 746
DS 

RD RR2CH20JQ 838 0 0
ATCAAATTACGTGCCTTCATAGTTAAAGGGAAAAATAACACAGCAGAATCGAACCAATAA
TCACACACTTTGCGTTTTTTC*ACATTCAACCGGTCCCGATCGGATGGTACAAACAAAAC
CCACAAAAACATAATTCTTTGAATCAATCGAGTTTTGATACAAATTAGTAAGTGACACGC
ACGCCTGAGTACCGGAGAATCTCTCCAATGAGTTCTCCTTTACCGGAACCAACATACCGC
CCACAAATATCGCCTTGTCTGATGAACAAGAAAGTTGGTACTTCGATAACATTCATGTCC
TTTAGAAACTCCATACAGCTATCGTTCTCGTCCCCATTCATTCTAGCGAACACGACAGAC
TCGGACGTCGACCGGGACAGTTTCAGCACCGTCGGATAAACCTTCACGCATGGTCCACAG
TGTTTCAGACCGACATCCAGCACAATCAGCTTGCCTCCAGTACGGTTCTCGTCAATCAGC
TTCTCCACGTCAGCTCGTCCATGCAGCTGCACAACCGCCGAGTGGCTGTCTCCATAATAT
AGCACGTCCCCCATTAACTGGTCCGGTCCGATACCTTCTTCCTCGTGTATTTTCTCCATG
CTCTTATAAAAGCTAAAGTGAGGAACTTTCTCGATCTTCTCTCTCCGACAAAGCTCTCTA
GTCTTTTCGGACTCATCACCCATGACGAGCAAGAAGTCGACGTCGTTACATGTCCTGCTC
AGCTCCACCATAAAAGGATATATCTTACTACTCTGATCACTCTTACTCGTGGCAA*CTCA
ACAACCACAAGCTTGTTCTTGGCCTTCTTAAGCGCTTCGTCAACTCCTCTCCGCTGTG

QA 1 838 1 838
DS 

RD RR2AB86JQ 693 0 0
ACCCACAAAAACATAATTCTTTGAATCAATCGAGTTTTGATACAAATTAGTAAGTGACAC
GCACGCCTGAGTACCGGAGAATCTCTCCAATGAGTTCTCCTTTACCGGAACCAACATACC
GCCCACAAATATCGCCTTGTCTGATGAACAAGAAAGTTGGTACTTCGATAACATTCATGT
CCTTTAAAAACTCCATACAGCTATCGTTCTCGTCCCCATTCATTCTAGCGAACACGACAG
ACTCGGACATCGACCGGGACAGTTTCAGCACCGTCGGATAAACCTTCACGCATGGTCCAC
AGTGTTTCAAACCGACATCCAGCACAATCAGCTTGCCTACAGTACGGTTCTCGTCAATCA
GCTTCTCCACGTCAGCTCGTCCATGCAGCTGCACAACCGCCGAGTGGCTGTCTCCATAAT
ATAGCACGTCCCCCATTAACTGGTCCGGTCCGATACCTTCTTCCTCGTGTATTTTCTCCA
TGCTCTTATAAAAGCTAAAGTGAGGAACTTTCTCGATCTTCTCTCTCCGACAAAGCTCTC
TAGTCTTTTCGGACTCATCACCCATGACGAGCAAGAAGTCGACGTCGTTACATGTCCTGC
TCAGCTCCACCATAAAAGGATATATCTTACTACTCTGATCACTCTTACTCGTGGCAAACT
CAACAACCACAAGCTTGTTCTTGGCCTTCTTA
C

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2AB86TF 619 0 0
CGGAGAATCTCTCCAATGAGTTCTCCTTTACCGGAACCAACATACCGCCCACAAATATCG
CCTTGTCTGATGAACAAGAAAGTTGGTACTTCGATAACATTCATGTCCTTTAGAAACTCC
ATACAGCTATCGTTCTCGTCCCCATTCATTCTAGCGAACACGACAGACTCGGACATCGAC
CGGGACAGTTTCAGCACCGTCGGATAAACCTTCACGCATGGTCCACAGTGTTTCAGACCG
ACATCCAGCACAATCAGCTTGCCTACAGTACGGTTCTCGTCAATCAGCTTCTCCACGTCA
GCTCGTCCATGCAGCTGCACAACCGCCGAGTGGCTGTCTCCATAATATAGCACGTCCCCC
ATTAACTGGTCCGGTCCGATACCTTCTTCCTCGTGTATTTTCTCCATGCTCTTATAAAAG
CTAAAGTGAGGAACTTTCTCGATCTTCTCTCTCCGACAAAGCTCTCTAGTCTTTTCGGAC
TCATCACCCATGACGAGCAAGAAGTCGACGTCGTTACATGTCCTGCTCAGCTCCACCATA
AAAGGATATATCTTACTACTCTGATCACTCTTACTCGTGGCAAACTCAACAACCACAAGC
TTGTTCTTGGCCTTCTTA
C

QA 1 618 1 618
DS 



CO CL53Contig2 1116 11 19 U
GGATAGTACCATTCACCAATCTCTAGCCAATAGTCACACACA****CTCACAATGGCCAC
C***GTCGCTAACTTCTCAGCCAAACCAATCACCACCGTGATTCCACGGCTGTCATCCGC
CGTTGCCTCCACCTCCTCCTTCGTATTCATCGACCCCAAACCCAACTCACTGATCCTAAA
ACAGAGCTGGGTTAAAAATCCCTCGAAAAGAAGATTCTCAGCCGTGAAGGTCAAGGCCAG
TGCGGCTTCACCAGGGAAGGTGGGTACACCGGCGGCGAAGGACGAGAAGGTGCAAAAGAT
TCACAGCGGAGAGGAGTTTGACGAAGCGCTTAAGAAGGCCAAGAACAAGCTTGTGGTTGT
TGAGTTTGCCACGAGTAAGAGTGATCAGAGTAGTAAGATATATCCTTTTATGGTTGAGCT
GAGCAGGACATGTAACGACGTCGACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGAC
TAGAGAGCTTTGTCGGAGGGAGAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTCTATAAGAG
CATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTATTGGACCGGACCAGCTAATGGGGG*ACGTGC
TATATTACGGGGACAGCCACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCATGGACGAGCTGACGTGGAGA
AGTTGATTGACGAGAACCGTACTGGAGGCAAGCTGATTGTGCTGGATGTCGGTCTGAAAC
ACTGTGGACCATGCGTGAAG*TTTATCCGACAGTGCTGAAACTGTCCCGGTCGATGTCCG
AGTCTGTCGTGTTCGCTAGAATGAACGGGGACGAGAACGATAGCTGTATGGAGTTTCTAA
AGGACATGAATGTTATCGAAGTACCAACTTTCTTGTTCATCAGACAAGGCGATATTTGTG
GGCGGTATGTTGGTTCCGGTAAAGGAGAACTCATTGGAGAGATTTTCCGGTACTCAGGCG
TTCGTGTCACTTAATAATTTGTATCAAAACTCGATTGATTAAAAGAATATGTTTTTTTGA
GTTTTGTTTGTACCATCCGATCGAGACCGGTTGAATATGGAAAAAACGCAAAGTGTGTGA
TTATTGGTTTGATTTTGCTTTGTTTTTTTTCCCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 
55 55 30 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 0 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ18TF U 1
AF RR2GM72TF U 34
AF RR2DK29TF U 1
AF RR2CE66TF U 8
AF RR2CH20TF U 16
AF RR2E557TF U 27
AF RR2EH94TF U 211
AF RR2GL94TF U 34
AF RR2F546TF U 16
AF RR2GL94JQ C 504
AF RR2GJ18JQB C 536
BS 1 26 RR2DK29TF
BS 27 27 RR2GJ18TF
BS 28 79 RR2DK29TF
BS 80 80 RR2GJ18TF
BS 81 307 RR2DK29TF
BS 308 308 RR2CE66TF
BS 309 424 RR2DK29TF
BS 425 425 RR2CE66TF
BS 426 736 RR2DK29TF
BS 737 763 RR2CE66TF
BS 764 774 RR2CH20TF
BS 775 800 RR2F546TF
BS 801 801 RR2GL94TF
BS 802 827 RR2F546TF
BS 828 828 RR2GL94JQ
BS 829 845 RR2F546TF
BS 846 973 RR2GL94JQ
BS 974 974 RR2GJ18JQB
BS 975 1116 RR2GL94JQ

RD RR2GJ18TF 198 0 0
GGATAGTAC
CATTCACCAATCTCTAGCCAATAGTCACACACA****CTCACAATGGCCACC***GTCGC
TAACTTCTCAGCCAAACCAATCACCACCGTGATTCCACGGCTGTCATCCGCCGTTGCCTC
CACCTCCTCCTTCGTATTCATCGACCCCAAACCCAACTCACTGATCCTAAAACAGAGCTG
GGTTAAAAA

QA 10 198 10 198
DS 

RD RR2GM72TF 524 0 0
GG
ACACACA****CTCACAATGGCCACC***GTCGCTAACTTCTCAGCCAAACCAGTCACCA
CCGTGATTCCACGGCTGTCATCCGCCGTTGCCTCCACCTCCTCCTTCGTATTCATCGACC
CCAAACCCAACTCACTGATCCTAAAACAGAGCTGGGTTAAAAATCCCTCGAAAAGAAGAT
TCTCAGCCGTGAAGGTCAAGGCCAGTGCGGCTTCACCAGGGAAGGTGGGTACACCGGCGG
CGAAGGACGAGAAGGTGCAAAAGATTCACAGCGGAGAGGAGTTTGACGAAGCGCTTAAGA
AGGCCAAGAACAAGCTTGTGGTTGTTGAGTTTGCCACGAGTAAGAGTGATCAGAGTAGTA
AGATATATCCTTTTATGGTTGAGCTGAGCAGGACATGTAACGACGTCGACTTCTTGCTCG
TCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGACTAGAGAGCTTTGTCGGAGGGAGAAGATCGAGAAAG
TTCCTCACTTTAGCTTCTATAAGAGCATGGAGAAAATACACG

QA 3 524 3 524
DS 

RD RR2DK29TF 736 0 0
GGATAGTACCATTCACCAATCTCTAGTCAATAGTCACACACA****CTCACAATGGCCAC
C***GTCGCTAACTTCTCAACCAAACCAATCACCACCGTGATTCCACGGCTGTCATCCGC
CGTTGCCTCCACCTCCTCCTTCGTATTCATCGACCCCAAACCCAACTCACTGATCCTAAA
ACAGAGCTGGGTTAAAAATCCCTCGAAAAGAAGATTCTCAGCCGTGAAGGTCAAGGCCAG
TGCGGCTTCACCAGGGAAGGTGGGTACACCGGCGGCGAAGGACGAGAAGGTGCAAAAGAT
TCACAGCAGAGAGGAGTTTGACGAAGCGCTTAAGAAGGCCAAGAACAAGCTTGTGGTTGT
TGAGTTTGCCACGAGTAAGAGTGATCAGAGTAGTAAGATATATCCTTTTATGGTTGAGCT
GAGCGGGACATGTAACGACGTCGACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGAC
TAGAGAGCTTTGTCGGAGGGAGAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTCTATAAGAG
CATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTATTGGACCGGACCAGCTAATGGGGG*ACGTGC
TATATTACGGGGACAGCCACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCATGGACGAGCTGACGTGGAGA
AGTTGATTGACGAGAACCGTACTGGAGGCAAGCTGATTGTGCTGGATGTCGGTCTGAAAC
ACTGTGGACCATGCGT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2CE66TF 756 0 0
GGG
ATTCACCAATCTCTAGCCAATAGTCACACACA****CTCACAATGGCCACC***GTCGCT
AACTTCTCAGCCAAACCAATCACCACCGTGATTCCACGGCTGTCATCCGCCGTTGCCTCC
ACCTCCTCCTTCGTATTCATCGACCCCAAACCCAACTCACTGATCCTAAAACAGAGCTGG
GTTAAAAATCCCTCGAAAAGAAGATTCTCAGCCGTGAAGGTCAAGGCCAGTGCGGCTTCA
CCAGGGAAGGTGGGTACACCGGCGGCGAAGGACGAGAAGGTGCAAAAGATTCACAGCGGA
GAGGAGTTTGACGAAGCACTTAAGAAGGCCAAGAACAAGCTTGTGGTTGTTGAGTTTGTC
ACGAGTAAGAGTGATCAGAGTAGTAAGATATATCCTTTTATGGTTGAGCTGAGCAGGACA
TGTAACGACGTCGACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGACTAGAGAGCTT
TGTCGGAGGGAGAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTCTATAAGAGCATGGAGAAA
ATACACGAGGAAGAAGGTATTGGACCGGACCAGCTAATGGGGGGACGTGCTATATTACGG
GGACAGCCACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCATGGACGAGCTGACGTGGAGAAGTTGATTGA
CGAGAACCGTACTGGAG*CAAGCTGAT*GTGCTGGATGTCG*TCTGAAACACTGTGGAC*
ATGCGTGAAG*TTTATCCGACAGTGCTGAAACT

QA 4 756 4 756
DS 

RD RR2CH20TF 763 0 0
GG
AATCTCTAGCCAATAGTCACACACACACACTCACAATGGCCACCGCCGTCGCTAACTTCT
CAGCCAAACCAATCACCACCGTGATTCCACGGCTGTCATCCGCCGTTGCCTCCACCTCCT
CCTTCGTATTCTTCGACCCCAAACCCAACTCACTGATCCTAAAACAGAGCTGGGTTAAAA
CTCCCTCGAAAAGAAGATTCTCAGCCGTGAAGGTCAAGGCCAGTGCGGCTTCACCAGGGA
AGGTGGGTACACCGGCGGCCAAGGACGAGAAGGTGCAAAAGATTCACAGCGGAGAGGAGT
TTGACGAAGCGCTTAAGAAGGCCAAGAACAAGCTTGTGGTTGTTGAGTTTGCCACGAGTA
AGAGTGATCAGAGTAGTAAGATATATCCTTTTATGGTGGAGCTGAGCAGGACATGTAACG
ACGTCGACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGACTAGAGAGCTTTGTCGGA
GAGAGAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTTTATAAGAGCATGGAGAAAATACACG
AGGAAGAAGGTATCGGACCGGACCAGTTAATGGGGGGACGTGCTATATTATGGAGACAGC
CACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCATGGACGAGCTGACGTGGAGAAGCTGATTGACGAGAAC
CGTACTGGAG*CAAGCTGATTGTGCTGGATGTCG*TCTGAAACACTGTGGAC*ATGCGTG
AAG*TTTATCCGAC*GTGCTGAAACTGTCCCGGTCGA
CGTC

QA 3 759 3 759
DS 

RD RR2E557TF 739 0 0
GGGTCACA
CACACACA****CTCACAATGGCCACCGCCGTCGCTAACTTCTCAGCCAAACCAATCACC
ACCGTGATTCCACGGCTGTCATCCGCCGTTGCCTCCACCTCCTCCTTCGTATTCTTCGAC
CCCAAACCCAACTCACTGATCCTAAAACAGAGCTGGGTTAAAACTCCCTCGAAAAGAAGA
TTCTCAGCCGTGAAGGTCAAGGCCAGTGCGGCTTCACCAGGGAAGGTGGGTACACCGGCG
GCCAAGGACGAGAAGGTGCAAAAGATTCACAGCGGAGAGGAGTTTGACGAAGCGCTTAAG
AAGGCCAAGAACAAGCTTGTGGTTGTTGAGTTTGCCACGAGTAAGAGTGATCAGAGTAGT
AAGATATATCCTTTTATGGTGGAGCTGAGCAGGACATGTAACGACGTCGACTTCTTGCTC
GTCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGACTAGAGAGCTTTGTCGGAGAGAGAAGATCGAGAAA
GTTCCTCACTTTAGCTTTTATAAGAGCATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAG*TATCGGA
CCGGACCAGTTAATGGGGG*ACGTGCTATATTATGGAGACAGCCACTCGGCGGTTGTGCA
GCTGCATGGACGAGCTGACGTGGAGAAGCTGATTGACGAGAACCGTACTGGAG*CAAGCT
GATTGTGCTGGATGTCG*TCTGAAACACTGTGGACCATGCGTGAAG*TTTATCCGACG
TGCTGAACTGTCC

QA 9 726 9 726
DS 

RD RR2EH94TF 555 0 0
AAGATTCTCAGCCGTGAAGGTCAAGGCCAGTGCGGCTTCACCAGGGAAGGTGGGTACACC
GGCGGCGAAGGACGAGAAGGTGCAAAAGATTCACAGCGGAGAGGAGTTTGACGAAGCGCT
TAAGAAGGCCAAGAACAAGCTTGTGGTTGTTGAGTTTGCCACGAGTAAGAGTGATCAGAG
TAGTAAGATATATCCTTTTATGGTTGAGCTGAGCAGGACATGTAACGACGTCGACTTCTT
GCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGACTAGAGAGCTTTGTCGGAGGGAGAAGATCGA
GAAAGTTCCTCACTTTAGCTTCTATAAGAGCATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTAT
TGGACCGGACCAGCTAATGGGGG*ACGTGCTATATTACGGGGACAGCCACTCGGCGGTTG
TGCAGCTGCAGGGACGAGCTGACGTGGAGAAGTTGATTGACGAGAACCGTACTGGAG*CA
AGCTGATTGTGCTGGATGTCGGTCTGAAACACTGTGGAC*ATGCGTGAAG*TTTATCCGA
CAGTGCTGAAACTGT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2GL94TF 774 0 0
GG
ACACACA****CTCACAATGGCCACC***GTCGCTAACTTCTCAGCCAAACCAATCACCA
CCGTGATTCCACGGCTGTCATCCGCCGTTGCCTCCACCTCCTCCTTCGTATTCATCGACC
CCAAACCCAACTCACTGATCCTAAAACAGAGCTGGGTTAAAAATCCCTCGAAAAGAAGAT
TCTCAGCCGTGAAGGTCAAGGCCAGTGCGGCTTCACCAGGGAAGGTGGGTACACCGGCGG
CGAAGGACGAGAAGGTGCAAAAGATTCACAGCGGAGAGGAGTTTGACGAAGCGCTTAAGC
AGGCCAAGAACAAGCTTGTGGTTGTTGAGTTTGCCACGAGTAAGAGTGATCAGAGTAGTA
AGATATATCCTTTTATGGTTGAGCTGAGCAGGACATGTAACGACGTCGACTTCTTGCTCG
TCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGACTAGAGAGCTTTGTCGGAGGGAGAAGATCGAGAAAG
TTCCTCACTTTAGCTTCTATAAGAGCATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTATTGGAC
CGGACCAGCTAATGGGGG*ACGTGCTATATTACGGGGATAGCCACTCGGCGGTTGTGCAG
CTGCATGGACGAGCTGACGTGGAGAAGTTGATTGACGAGAACCGTACTGGAGGCAAGCTG
ATTGTGCTGGATGTCGGTCTGAAACACTGTGGAC*ATGCGTGAAG*TTTATCCGACAGTG
CTGAAACTGTCCCGGTCGATGTCCGAGTCTGTCGTGTTCGCTAGAATGAA
GG

QA 3 772 3 772
DS 

RD RR2F546TF 830 0 0
GG
AATCTCTAGCCAATAGTCACACACA****CTCACAATGGCCACC***GTCGCTAACTTCT
CAGCCAAACCAATCACCACCGTGATTCCACGGCTGTCATCCGCCGTTGCCTCCACCTCCT
CCTTCGTATTCATCGACCCCAAACCCAACTCACTGATCCTAAAACAGAGCTGGGTTAAAA
ATCCCTCGAAAAGAAGATTCTCAGCCGTGAAGGTCAAGGCCAGTGCGGCTTCACCAGGGA
AGGTGGGTACACCGGCGGCGAAGGACGAGAAGGTGCAAAAGATTCACAGCGGAGAGGAGT
TTGACGAAGCGCTTAAGAAGGCCAAGAACAAGCTTGTGGTTGTTGAGTTTGCCACGAGTA
AGAGTGATCAGAGTAGTAAGATATATCCTTTTATGGTTGAGCTGAGCAGGACATGTAACG
ACGTCGACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGACTAGAGAGCTTTGTCGGA
GGGAGAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTCTATAAGAGCATGGAGAAAATACACG
AGGAAGAAGGTATTGGACCGGACCAGCTAATGGGGG*ACGTGCTATATTACGGGGACAGC
CACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCATGGACGAGCTGACGTGGAGAAGTTGATTGACGAGAAC
CGTACTGGAGGCAAGCTGATTGTGCTGGATGTCGGTCTGAAACACTGTGGAC*ATGCGTG
AAG*GTTATCCGACAGTGCTGAAACTGTCCCGGTCGATGTCCGAGTCTGTCGTGTTCGCT
AGA*TGAACGGGGACGAGAACGATAGCTGTTTGGAGTTTCTAAAGGAC

QA 3 830 3 830
DS 

RD RR2GL94JQ 613 0 0
AGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTCTATAAGAGCATGGAGAAAATACACGAGGAAG
AAGGTATTGGACCGGACCAGCTAATGGGGG*ACGTGCTATATTACGGGGATAGCCACTCG
GCGGTTGTGCAGCTGCATGGACGAGCTGACGTGGAGAAGTTGATTGACGAGAACCGTACT
GGAGGCAAGCTGATTGTGCTGGATGTCGGTTTGAAACACTGTGGACCATGCGTGAAGGTT
TATCCGACAGTGCTGAAACTGTCCCGGTCGATGTCCGAGTCTGTCGTGTTCGCTAGAATG
AAGGGGGACGAGAACGATAGCTGTATGGAGTTTCTAAAGGACATGAATGTTATCGAAGTA
CCAACTTTCTTGTTCATCAGACAAGGCGATATTTGTGGGCGGTATGTTGGTTCCGGTAAA
GGAGAACTCATTGGAGAGATTTTCCGGTACTCAGGCGTTCGTGTCACTTACTAATTTGTA
TCAAAACTCGATTGATTAAAAGAATATGTTTTTTTGAGTTTTGTTTGTACCATCCGATCG
AGACCGGTTGAATATGGAAAAAACGCAAAGTGTGTGATTATTGGTTTGATTTTGCTTTGT
TTTTTTTCCCTTT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2GJ18JQB 556 0 0
AAGAGCATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTATTGGACCGGACCAGCTAATGGGGG*A
CGTGCTATATTACGGGGACAGCCACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCATGGACGAGCTGACGT
GGAGAAGTTGATTGACGAGAACCGTACTGGAGGCAAGCTGATTGTGCTGGATGTCGGTTT
GAAACACTGTGGACCATGCGTGAAGGTTTATCCGACAGTGCTGAAACTGTCCCGGTCGAT
GTCCGAGTTTGTCGTGTTCGCTAGAATGAACGGGGACGTGAACGATAGCTGTATGGAGTT
TTTAAAGGGCATGAATGTTATCGAAGTACCAACTTTTTTGTTCATCAGACAAGGCGATAT
TTGTGGGCGGTATGTTGGTTCCGGTAAAGGAGAACTCATTGGAGAGATTTTCCGGTACTC
AGGCGTTCGTGTCACTTAATAATTTGTATCAAAACTCGATTGATTAAAAGAATATGTTTT
TTTGAGTTTTGTTTGTACCATCCGATCGAGACCGGTTGAATATGGAAAAAACGCAAAGTG
TGTGATTATTGGTTTG

QA 1 556 1 556
DS 



CO CL53Contig3 1063 3 9 U
GGATACCATTCACCAATCTCTAGCCAATAGTCACACACATTCACAATGGCCACCGTCGCA
AACTTCTCAGCCAAACCAATCACCACCGTGATTCCACGGCTGTCATCCGCCGTTGCCTCC
ACCTCCTCCTTCGTATTCTTCGACCCCAAACCCAACTCACTGATCCTAAAACAGAGCTGG
GTTAAAAATCCCTCGAAAAGAAGATTCTCAGCCGTGAAGGTCAAGGCCAGTGCGGCGTCA
CCAGGGAAGGTGGGTACACCGGCGGCCAAGGACGAGAAGGTGCAAAAGATTCACAGCGGA
GAGGAGTTTGACGAAGCGCTTAAGAAGGCCAAGAACAAGCTTGTGGTTGTTGAGTTTGCC
ACGAGTAAGAGTGATCAGAGTAGTAAGATATATCCTTTTATGGTGGAGCTGAGCAGGACA
TGTAACGACGTCAACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGACTAGAGAGCTT
TGTCGGAGAGAGAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTTTATAAGAGCATGGAGAAA
ATACACGAGGAAGAAGGTATTGGACCGGACCAGCTAATGGGGGACGTGCTATATTACGGG
GACAGCCACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCACGGGCGAGCTGACGTGGAGAAGCTGATTGAC
GAGAACCGTACTGGAGGCAAGTTGATTGTGTTGGATGTCGGTCTGAAACACTGTGGACCA
TGCGTGAAGGTTTATCCGACGGTGCTGAAACTGTCCCGGTCGATGTCCGCGAGTGTCGTG
TTCGCTAGAATGAATGGGGACGAGAACGATAGCTGTATGGAGTTTCTAAAGGACATGAAT
GTTATCGAAGTACCAACTTTCTTGTTCATCAGAGACGGCGATATTCGTGGGCGGTATGTT
GGTTCCGGTAAAGGAGAACTCATTGGAGAGATTCTCCGGTACTCAGGCGTTCGTGTCACT
TACTAAAAGAATATGTTTTTGTGAGTTTTGATTGTACCATCCGATCGAGACCGGTTGAAT
ATGAAAAAAACGCAAAGTGTGTGATTATTGGTTCGATTCTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FV41TF U 1
AF RR2EN26TF U 6
AF RR2EN26JQ C 317
BS 1 624 RR2FV41TF
BS 625 625 RR2EN26TF
BS 626 690 RR2FV41TF
BS 691 691 RR2EN26TF
BS 692 707 RR2FV41TF
BS 708 708 RR2EN26TF
BS 709 727 RR2FV41TF
BS 728 737 RR2EN26TF
BS 738 1063 RR2EN26JQ

RD RR2FV41TF 727 0 0
GGATACCATTCACCAATCTCTAGCCAATAGTCACACACATTCACAATGGCCACCGTCGCA
AACTTCTCAGCCAAACCAATCACCACCGTGATTCCACGGCTGTCATCCGCCGTTGCCTCC
ACCTCCTCCTTCGTATTCTTCGACCCCAAACCCAACTCACTGATCCTAAAACAGAGCTGG
GTTAAAAATCCCTCGAAAAGAAGATTCTCAGCCGTGAAGGTCAAGGCCAGTGCGGCGTCA
CCAGGGAAGGTGGGTACACCGGCGGCCAAGGACGAGAAGGTGCAAAAGATTCACAGCGGA
GAGGAGTTTGACGAAGCGCTTAAGAAGGCCAAGAACAAGCTTGTGGTTGTTGAGTTTGCC
ACGAGTAAGAGTGATCAGAGTAGTAAGATATATCCTTTTATGGTGGAGCTGAGCAGGACA
TGTAACGACGTCAACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGACTAGAGAGCTT
TGTCGGAGAGAGAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTTTATAAGAGCATGGAGAAA
ATACACGAGGAAGAAGGTATTGGACCGGACCAGCTAATGGGGGACGTGCTATATTACGGG
GACAGCCACTCGGCGGTTGTGCAGTTGCACGGGCGAGCTGACGTGGAGAAGCTGATTGAC
GAGAACCGTACTGGAGGCAAGTTGATTGTGCTGGATGTCGGTCTGAA*CACTGTGGACCA
TGCGTGA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2EN26TF 732 0 0
GG
ATTCACCAATCTCTAGCCAATAGTCACACACATTCACAATGGCCACCGTCGCAAACTTCT
CAGCCAAACCAATCACCACCGTGATTCCACGGCTGTCATCCGCCGTTGCCTCCACCTCCT
CCTTCGTATTCTTCGACCCCAAACCCAACTCACTGATCCTAAAACAGAGCTGGGTTAAAA
ATCCCTCGAAAAGAAGATTCTCAGCCGTGAAGGTCAAGGCCAGTGCGGCGTCACCAGGGA
AGGTGGGTACACCGGCGGCCAAGGACGAGAAGGTGCAAAAGATTCACAGCGGAGAGGAGT
TTGACGAAGCGCTTAAGAAGGCCAAGAACAAGCTTGTGGTTGTTGAGTTTGCCACGAGTA
AGAGTGATCAGAGTAGTAAGATATATCCTTTTATGGTGGAGCTGAGCAGGACATGTAACG
ACGTCAACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGACTAGAGAGCTTTGTCGGA
GAGAGAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTTTATAAGAGCATGGAGAAAATACACG
AGGAAGAAGGTATTGGACCGGACCAGCTAATGGGGGACGTGCTATATTACGGGGACAGCC
ACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCACGGGCGAGCTGACGTGGAGAAGCTGATTGACGAGAACC
GTACTGGAGGCAAGTTGATTGTGTTGGATGTCGGTCTGAAACACTGTGGACCATGCGTGA
AGGTTTATCC

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR2EN26JQ 747 0 0
CGCTTAAGAAGGCCAAGAACAAGCTTGTGGTTGTTGAGTTTGCCACGAGTAAGAGTGATC
AGAGTAGTAAGATATATCCTTTTATGGTGGAGCTGAGCAGGACATGTAACGACGTCAACT
TCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGACTAGAGAGCTTTGTCGGAGAGAGAAGA
TCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTTTATAAGAGCATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAG
GTATTGGACCGGACCAGCTAATGGGGGACGTGCTATATTACGGGGACAGCCACTCGGCGG
TTGTGCAGCTGCACGGGCGAGCTGACGTGGAGAAGCTGATTGACGAGAACCGTACTGGAG
GCAAGTTGATTGTGTTGGATGTCGGTCTGAAACACTGTGGACCATGCGTGAAGGTTTATC
CGACGGTGCTGAAACTGTCCCGGTCGATGTCCGCGAGTGTCGTGTTCGCTAGAATGAATG
GGGACGAGAACGATAGCTGTATGGAGTTTCTAAAGGACATGAATGTTATCGAAGTACCAA
CTTTCTTGTTCATCAGAGACGGCGATATTCGTGGGCGGTATGTTGGTTCCGGTAAAGGAG
AACTCATTGGAGAGATTCTCCGGTACTCAGGCGTTCGTGTCACTTACTAAAAGAATATGT
TTTTGTGAGTTTTGATTGTACCATCCGATCGAGACCGGTTGAATATGAAAAAAACGCAAA
GTGTGTGATTATTGGTTCGATTCTGCT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 6 21

CO CL54Contig1 743 2 19 U
AATGAGCATGAGTACAAGTCTGATCTCAACATTGTTTCCAACGCTAGCTGCACCACTAAC
CGCCTTGCGCCACTTGCCAAGGTTATCAACGACAGGTTTGGAATCGTTGAGGGACTCATG
ACTACCGTCCACTCGATCACTGCTACCCAGAAGACTGTTGATGGTCCATCAATGAAGGAC
TGGAGAGGTGGAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATTCCAAGCAGCACCGGAGCTGCCAAG
GCTGTCGGAAAGGTGCTTCCACAGCTCAACGGAAAATTGACCGGAATGTCCTTCCGCGTT
CCCACCGTTGATGTTTCAGTTGTTGACCTCACGGTCAGACTCGAGAAAGCTGCAACCTAC
GACGAGATCAAGAAGGCTATCAAGGAGGAATCTGAAGGAAAACTGAAGGGAATCCTTGGT
TACACCGAGGATGATGCTGTCTCAACTGACTTCGTTGGTGACAACAGGTCTAGCATTTTT
GATGCAGAGGCTGGAATTGCATCGAGTGACAACTTCGTGAAACTGGTGTCATGGTATGAC
AACGAATGGGGTTACAGCACCCGTGTTGTCGACTTGATCATTCACATGTCCAAAGCCTAG
AGCGCCCAAGGGAAGCACAAGATTTCAAATGGTGTAATGGTGTCTGTCGGTTTTTTCGAA
TAAATTTTCTCAGAGATCTAAAAACTCATCTTTTTCTTTTTGGTTTTAGCGATTCTCCTT
CACGTGACGTGATAGGAAGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B621TF U 46
AF RR2C646JQ C 1
BS 1 45 RR2C646JQ
BS 46 47 RR2B621TF
BS 48 48 RR2C646JQ
BS 49 60 RR2B621TF
BS 61 61 RR2C646JQ
BS 62 68 RR2B621TF
BS 69 69 RR2C646JQ
BS 70 90 RR2B621TF
BS 91 91 RR2C646JQ
BS 92 317 RR2B621TF
BS 318 318 RR2C646JQ
BS 319 397 RR2B621TF
BS 398 398 RR2C646JQ
BS 399 436 RR2B621TF
BS 437 437 RR2C646JQ
BS 438 486 RR2B621TF
BS 487 487 RR2C646JQ
BS 488 604 RR2B621TF
BS 605 743 RR2C646JQ

RD RR2B621TF 559 0 0
AGTTGCACCACTAACTGCCTTGCTCCACTTGCCAAGGTTATCAACTACAGGTTTGGAATC
GTTGAGGGACTCATGACTACCGTCCACTCGATCACTGCTACCCAGAAGACTGTTGATGGT
CCATCAATGAAGGACTGGAGAGGTGGAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATTCCAAGCAGC
ACCGGAGCTGCCAAGGCTGTCGGAAAGGTGCTTCCACAGCTCAACGGAAAATTGACCGGA
ATGTCCTTCCGCGTTCCCACCGTTGATGTTTCGGTTGTTGACCTCACGGTCAGACTCGAG
AAAGCTGCAACCTACGACGAGATCAAGAAGGCTATCAAGGAGGAATCTGAAGTAAAACTG
AAGGGAATCCTTGGTTACACCGAGGATGATGTTGTCTCAACTGACTTCGTTGGTGACAAC
AGGTCTAGCATTTTTGATGCA*AGGCTGGAATTGCATCGAGTGACAACTTCGTGAAACTG
GTGTCATGGTATGACAACGAATGGGGTTACAGCACCCGTGTTGTCGACTTGATCATTCAC
ATGTCCAAAGCCTAGAGCG

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2C646JQ 743 0 0
AATGAGCATGAGTACAAGTCTGATCTCAACATTGTTTCCAACGCTAGCTGCACCACTAAC
CGCCTTGCGCCACTTGCCAAGGTTATCAACGACAGGTTTGGAATCGTTGAGGGACTCATG
ACTACCGTCCA**CGATCACTGCTACCCAGAATACTGTTGATGGTCCATCAATGAAGGAC
TGGAGAGGTGGAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATTCCAAGCAGCACCGGAGCTGCCAAG
GCTGTCGGAAAGGTGCTTCCACAGCTCAACGGAAAATTGACCGGAATGTCCTTCCGTGTT
CCCACCGTTGATGTTTCAGTTGTTGACCTCACGGTCAGACTCGAGAAAGCTGCAACCTAC
GACGAGATCAAGAAGGCTATCAAGGAGGAATTTGAAGGAAAACTGAAGGGAATCCTTGGT
TACACCGAGGATGATGCTGTCTCAACTGACTTCGTTGGTGACAACAGGTCTAGCATTTTT
GATGCAGAGGCTGGAATTGCATTGAGTGACAACTTCGTGAAACTGGTGTCATGGTGTGAC
AACGAATGGGGTTACAGCACCCGTGTTGTCGACTTGATCATTCACATGTCCAAAGCCTAG
AGCGCCCAAGGGAAGCACAAGATTTCAAATGGTGTAATGGTGTCTGTCGGTTTTTTCGAA
TAAATTTTCTCAGAGATCTAAAAACTCATCTTTTTCTTTTTGGTTTTAGCGATTCTCCTT
CACGTGACGTGATAGGAAGTTTG

QA 1 743 1 743
DS 



CO CL54Contig2 627 5 15 U
GGATTGCAATAAAAGTAAACTTGTATCAAAGGGTTTCCAGTGTAGAAATAAAACAAGGTT
TACAAACTTCCTATCACGTCACGTGAAGGAGACTCGCTAAAACCAAAAAGAAAAAGAGTT
TTTAGATCTCGAGAAAATTTATTCGAAAAAAACTGACAGACACCATTACATCGTTTGAGA
TCTCTTGTTTCCCTTGGGCGCTCTAGGCTTTGGACATGTGAACGATCAAGTCGACAACAC
GGGTGCTGTAACCCCATTCGTTGTCATACCATGACACCAGTTTCACGAAGTTGTCACTCA
ATGCAATTCCAGCCTTTGCATCAAAAATGCTAGACCTGTTGTCACCAACGAAGTCAGTTG
AGACAACATCATCCTCGGTGTAACCAAGGATTCCCTTCAGTTTTCCTTCAGATTCCTCCT
TGATAGCCTTCTTGATCTCGTCGTAGGTTGCAGCTTTCTCGAGTCTGACCGTGAGGTCAA
CAACTGAAAAATCAACGGTGGGAACACGGAAGGACATTCCGGTCAATTTTCCGTTGAGCT
GTGGAAGCACCTTTCCGACAGCCTTGGCAGCTCCGGTGCTGCTGGGAATGATGTTGAAGG
AAGCAGCTCTTCCACCTCTCCAGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2H757JQB U 38
AF RR2DB02JQ U 1
AF RR2G373JQ U 38
AF RR2BQ57TF C 4
AF RR2BQ57JQ U 6
BS 1 44 RR2DB02JQ
BS 45 45 RR2G373JQ
BS 46 138 RR2DB02JQ
BS 139 139 RR2G373JQ
BS 140 153 RR2DB02JQ
BS 154 154 RR2G373JQ
BS 155 222 RR2DB02JQ
BS 223 223 RR2BQ57JQ
BS 224 361 RR2DB02JQ
BS 362 362 RR2G373JQ
BS 363 445 RR2DB02JQ
BS 446 489 RR2G373JQ
BS 490 490 RR2BQ57JQ
BS 491 514 RR2G373JQ
BS 515 627 RR2BQ57JQ

RD RR2H757JQB 350 0 0
CAGTGTAGAAATAAAGCAAGGTTTACAAACTTCCTATCACGTCACGTGAAGGAGACTCGC
TAAAACCAAAAAGAAAAAGAGTTTTTAGATCTCGAGAAAATTTATTCGAAAAAAACTGAC
AGACACCATTACATCGTTTGAGATCTCTTGTTTCCCTTGGGCGCTCTAGGCTTTGGACAT
GTGAATGATCAAGTCGACAACACGGGTGCTGTAACCCCATTCGTTGTCATACCATGACAC
CAGTTTCACGAAGTTGTCACTCAATGCAAATCCAGCCTTTGCATCAAAAATGCTAGACCT
GTTGTCACCAACGAAGTCAGTTGAGACAACATCATCCTCGGTGTAACCAA

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR2DB02JQ 445 0 0
GGATTGCAATAAAAGTAAACTTGTATCAAAGGGTTTCCAGTGTAAAAATAAAACAAGGTT
TACAAACTTCCTATCACGTCACGTGAAGGAGACTCGCTAAAACCAAAAAGAAAAAGAGTT
TTTAGATCTCGAGAAAATCTATTCGAAAAAAACCGACAGACACCATTACATCGTTTGAGA
TCTCTTGTTTCCCTTGGGCGCTCTAGGCTTTGGACATGTGAATGATCAAGTCGACAACAC
GGGTGCTGTAACCCCATTCGTTGTCATACCATGACACCAGTTTCACGAAGTTGTCACTCA
ATGCAATTCCAGCCTTTGCATCAAAAATGCTAGACCTGTTGTCACCAACGAAGTCAGTTG
AAACAACATCATCCTCGGTGTAACCAAGGATTCCCTTCAGTTTTCCTTCAGATTCCTCCT
TGATAGCCTTCTTGATCTCGTCGTA

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR2G373JQ 477 0 0
CAGTGTAGAAATAAAGCAAGGTTTACAAACTTCCTATCACGTCACGTGAAGGAGACTCGC
TAAAACCAAAAAGAAAAAGAGTTTTTAGATCTCGAGAAAATTTATTCGAAAAAAACTGAC
AGACACCATTACATCGTTTGAGATCTCTTGTTTCCCTTGGGCGCTCTAGGCTTTGGACAT
GTGAATGATCAAGTCGACAACACGGGTGCTGTAACCCCATTCGTTGTCATACCATGACAC
CAGTTTCACGAAGTTGTCACTCAATGCAAATCCAGCCTTTGCATCAAAAATGCTAGACCT
GTTGTCACCAACGAAGTCAGTTGAGACAACATCATCCTCGGTGTAACCAAGGATTCCCTT
CAGTTTTCCTTCAGATTCCTCCTTGATAGCCTTCTTGATCTCGTCGTAGGTTGCAGCTTT
CTCGAGTCTGACCGTGAGGTCAACAACTGAAACATCAACGGTGGGAACACGGAAGGA

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2BQ57TF 624 0 0
TT
GCAATAAAAGTAAACTTGTATCAAAGGGTTTCCAGTGTAGAAATAAAACAAGGTTTACAA
ACTTCCTATCACGTCACGTGAAGGAGACTCGCTAAAACCAAAAAGAAAAAGAGTTTTTAG
ATCTCGAGAAAATTTATTCGAAAAAAACTGACAGACACCATTACATCGTTTGAGATCTCT
TGTTTCCCTTGGGCGCTCTAGGCTTTGGACATGTGAACGATCAAGTCGACAACACGGGTG
CTGTAACCCCATTCGTTGTCATACCATGACACCAGTTTCACGAAGTTGTCACTCAATGCA
ATTCCAGCCTTTGCATCAAAAATGCTAGACCTGTTGTCACCAACGAAGTCAGTTGAGACA
ACATCATCCTCGGTGTAACCAAGGATTCCCTTCAGTTTTCCTTCAGATTCCTCCTTGATA
GCCTTCTTGATCTCGTCGTAGGTTGCAGCTTTCTCGAGTCTGACCGTGAGGTCAACAACT
GAAAAATCAACGGTGGGAACACGGAAGGACATTCCGGTCAATTTTCCGTTGAGCTGTGGA
AGCACCTTTCCGACAGCCTTGGCAGCTCCGGTGCTGCTGGGAATGATGTTGAAGGAAGCA
GCTCTTCCACCTCTCCAGTCC
C

QA 3 623 3 623
DS 

RD RR2BQ57JQ 622 0 0
GCAATAAAAGTAAACTTGTATCAAAGGGTTTCCAGTGTAAAAATAAAACAAGGTTTACAA
ACTTCCTATCACGTCACGTGAAGGAGACTCGCTAAAACCAAAAAGAAAAAGAGTTTTTAG
ATCTCGAGAAAATTTATTCGAAAAAAACTGACAGACACCATTACATCGTTTGAGATCTCT
TGTTTCCCTTGGGCGCTCTAGGCTTTGGACATGTGAACGATCAAGTCGACAACACGGGTG
CTGTAACCCCATTCGTTGTCATACCATGACACCAGTTTCACGAAGTTGTCACTCAATGCA
ATTCCAGCCTTTGCATCAAAAATGCTAGACCTGTTGTCACCAACGAAGTCAGTTGAGACA
ACATCATCCTCGGTGTAACCAAGGATTCCCTTCAGTTTTCCTTCAGATTCCTCCTTGATA
GCCTTCTTGATCTCGTCGTAGGTTGCAGCTTTCTCGAGTCTGACCGTGAGGTCAACAACT
GAAAAATCAACGGTGGGAACACGGAAGGACATTCCGGTCAATTTTCCGTTGAGCTGTGGA
AGCACCTTTCCGACAGCCTTGGCAGCTCCGGTGCTGCTGGGAATGATGTTGAAGGAAGCA
GCTCTTCCACCTCTCCAGTCCC

QA 1 622 1 622
DS 



CO CL54Contig3 904 6 16 U
GGACTCACTTGACTATTCTCACATTCAGAACTTTGCTATCTCTCTCTCTCGACCACATCG
CCATGGCTGACAAGAAGATTAAGATCGGAATCAACGGTTTCGGAAGAATCGGTCGTTTGG
TGGCGAGAGTGATCCTTCAGAGGAACGATGTTGAGCTCGTCGCTGTTAACGATCCTTTCA
TCACCACCGAGTACATGACATACATGTTTAAGTACGACAGTGTTCACGGACAGTGGAAGC
ACAATGAACTTAAGATAAAGGATGAGAAAACCCTTCTCTTTGGTGAGAAGCCAGTCACAG
TTTTCGGCATCAGGAACCCTGAGGATATCCCATGGGGTGAGGCCGGAGCTGACTTTGTTG
TCGAGTCTACTGGTGTCTTCACTGACAAGGACAAGGCCGCTGCTCACTTGAAGGGTGGTG
CCAAGAAAGTTGTCATCTCTGCCCCAAGCAAAGATGCTCCCATGTTTGTTGTTGGTGTCA
ATGAGCATGAGTACAAGTCTGATCTCAACATTGTTTCCAACGCTAGTTGCACCACTAACT
GCCTTGCTCCACTTGCCAAGGTTATCAACGACAGGTTTGGAATCGTTGAGGGACTCATGA
CTACCGTCCACTCGATCACTGCTACCCAGAAGACTGTTGATGGTCCATCAATGAAG*ACT
GGAGAGGTGGAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATTCCAAGCAGCACCGGAGCTGCCAAG*
CTGTCGGAAAGGTGCTTCCACAGCTCAACGGAAAAATTGACCGGGAATGTCCTTCCGCGT
TCCCACCGTTGATGTTTCGGTTGTTGACCTCACGGTCAGACTCGAGAAAGCTGCAACCTA
CGACGAGATCAAGAAGGCTATCAAAGGAGAATCTGAAGAAAACTGAAGGAATCCTTGGTT
ACAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 10 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2DB02TF U 1
AF RR2G373TF U 1
AF RR2BY58TF U 13
AF RR2H757TF U 1
AF RR2C646TF U 20
AF RR2AP70TF U 79
BS 1 91 RR2DB02TF
BS 92 92 RR2BY58TF
BS 93 328 RR2DB02TF
BS 329 329 RR2BY58TF
BS 330 532 RR2DB02TF
BS 533 533 RR2BY58TF
BS 534 568 RR2DB02TF
BS 569 569 RR2BY58TF
BS 570 572 RR2DB02TF
BS 573 573 RR2G373TF
BS 574 582 RR2DB02TF
BS 583 651 RR2G373TF
BS 652 697 RR2H757TF
BS 698 698 RR2C646TF
BS 699 731 RR2H757TF
BS 732 904 RR2AP70TF

RD RR2DB02TF 582 0 0
GGACTCACTTGACTATTCTCACATTCAGAACTTTGCTATCTCTCTCTCTCGACCACATCG
CCATGGCTGACAAGAAGATTAAGATCGGAATTAACGGTTTCGGAAGAATCGGTCGTTTGG
TGGCGAGAGTGATCCTTCAGAGGAACGATGTTGAGCTCGTCGCTGTTAACGATCCTTTCA
TCACCACCGAGTACATGACATACATGTTTAAGTACGACAGTGTTCACGGACAGTGGAAGC
ACAATGAACTTAAGATAAAGGATGAGAAAACCCTTCTCTTTGGTGAGAAGCCAGTCACAG
TTTTCGGCATCAGGAACCCTGAGGATATTCCATGGGGTGAGGCCGGAGCTGACTTTGTTG
TCGAGTCTACTGGTGTCTTCACTGACAAGGACAAGGCCGCTGCTCACTTGAAGGGTGGTG
CCAAGAAAGTTGTCATCTCTGCCCCAAGCAAAGATGCTCCCATGTTTGTTGTTGGTGTCA
ATGAGCATGAGTACAAGTCTGATCTCAACATTGTTTCCAACGCTAGTTGCACTACTAACT
GCCTTGCTCCACTTGCCAAGGTTATCAATGACGGGTTTGGAA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2G373TF 651 0 0
GGACTCACTTGACTATTCTCACATTCAGAACTTTGCTATCTCTCTCTCTCGACCACATCG
CCATGGCTGACAAGAAGATTAAGATCGGAATTAACGGTTTCGTAAGAATCGGTCGTTTGG
TGGCGAGAGTGATCCTTCAGAGGAACGATGTTGAGCTCGTCGCTGTTAACGATCCTTTCA
TCACCGCCGAGTACATGACATACATGTTTAAGTACGACAGTGTTCACGGACAGTGGAAGC
ACAATGAACTTAAGATAAAGGATGAGAAAACCCTTCT*TTTGGTGAGAAGCCAGTCACAG
TTTTCGGCATCAGGAACCCTGAGGATATTCCATGGGGTGAGGCCGGAGCTGACTTTGTTG
TCGAGTCTACTGGTGTCTTCACTGACAAGGACAAGGCCGCTGCTCACTTGAAGGGTGGTG
CCAAGAAAGTTGTCATCTCTGCCCCAAGCAAAGATGCTCCCATGTTTGTTGTTGGTGTCA
ATGAGCATGAGTACAAGTCTGATCTCAACATTGTTTCCAACGCTAGTTGCACTACTAACT
GCCTTGCTCCACTTGCCAAGGTTATCAATGACAGGTTTGGAATCGTTGAGGGACTCATGA
CTACCGTCCACTCGATCACTGCTACCCAGAAGACTGTTGATGGTCCATCAA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2BY58TF 613 0 0
GG
ATTCTCACATTCAGAACTTTGCTTTCTCTCTCTC**GACCACATCGCCATGGCTGACAAG
AAGATTAAGATCGGAATCAACGGTTTCGGAAGAATCGGTCGTTTGGTGGCGAGAGTTATC
CTTCATAGGAACGATGTTGAGCTCGTCGCTGTTAACGATCCTTTCATCACCACCGAGTAC
ATGACATACATGTTTAAGTACGACAGTGTTCACGGACAGTGGAAGCACAATGAGCTTAAG
ATAAAGGATGAGAAAACCCTTCTCTTCGGCGAGAAGCCAGTCACTGTTTTCGGCATCAGG
AACCCTGAGGATATCCCATGGGGTGAGGCCGGAGCTGACTTTGTTGTTGAGTCTACTGGT
GTCTTCACTGACAAGGACAAGGCCGCTGCTCACTTGAAGGGTGGTGCCAAGAAAGTTGTC
ATCTCTGCCCCAAGCAAAGATGCTCCCATGTTTGTTGTTGGTGTCAATGAGCATGAATAC
AAGTCTGATCTTAACATTGTTTCCAACGCTAGTTGCACCACTAACTGCCTTGCTCCACTT
GCCAAGGTTATCAACGACAGGTTTGGAATCGTTGAGGGACTCATGACTACCGTCCACTCG
ATCACTGCTAC

QA 3 613 3 613
DS 

RD RR2H757TF 731 0 0
GGACTCACTTGACTATTCTCACATTCAGAACTTTGCTATCTCTCTCTCTCGACCACATCG
CCATGGCTGACAAGAAGATTAAGATCGGAATTAACGGTTTCGTAAGAATCGGTCGTTTGG
TGGCGAGAGTGATCCTTCAGAGGAACGATGTTGAGCTCGTCGCTGTTAACGATCCTTTCA
TCACCGCCGAGTACATGACATACATGTTTAAGTACGACAGTGTTCACGGACAGTGGAAGC
ACAATGAACTTAAGATAAAGGATGAGAAAACCCTTCT*TTTGGTGAGAAGCCAGTCACAG
TTTTCGGCATCAGGAACCCTGAGGATATTCCATGGGGTGAGGCCGGAGCTGACTTTGTTG
TCGAGTCTACTGGTGTCTTCACTGACAAGGACAAGGCCGCTGCTCACTTGAAGGGTGGTG
CCAAGAAAGTTGTCATCTCTGCCCCAAGCAAAGATGCTCCCATGTTTGTTGTTGGTGTCA
ATGAGCATGAGTACAAGTCTGATCTCAACATTGTTTCCAACGCTAGTTGCACTACTAACT
GCCTTGCTCCACTTGCCAAGGTTATCAATGACAGGTTTGGAATCGTTGAGGGACTCATGA
CTACCGTCCACTCGATCACTGCTACCCAGAAGACTGTTGATGGTCCATCAATGAAG*ACT
GGAGAGGTGGAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATTCCCAGCAGCACCGGAGCTGCCAAG*
CTGTCGGAAAG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2C646TF 724 0 0
CACATTCAGAACTTTGCTTTCTCTCTCTC**GACCACATCGCCATGGCTGACAAGAAGAT
CAAGATCGGAATCAACGGTTTCGGAAGAATCGGTCGTTTGGTGGCGAGAGTTATCCTTCA
GAGGAACGATGTTGAGCTCGTCGCTGTTAACGATCCTTTCATCACCACCGAGTACATGAC
ATACATGTTTAAGTACGACAGTGTTCACGGACAGTGGAAGCACAATGAACTTAGGATAAA
GGATGAGAAGACCCTTCTCTTTGGTGAGAAGCCAGTCACAGTTTTCGGCATCAGGAACCC
TGAGGATATCCCATGGGGTGAGGCCGGAGCTGACTTTGTTGTTGAGTCTACTGGTGTCTT
CACTGACAAGGACAAGGCCGCTGCTCACTTGAAGGGTGGTGCCAAGAAAGTTGTCATCTC
TGCCCCAAGCAAAGATGCTCCCATGTTTGTTGTTGGTGTTAATGAGCATGAGTACAAGTC
TGATCTCAACATTGTTTCCAACGCTAGCTGCACCACTAACCGCCTTGCGCCACTTGCCAA
GGTTATCAACGACAGGTTTGGAATCGTTGAGGGACTCATGACTACCGTCCAC**GATCAC
TGCTACCCAGAATACTGTTGATGGTCCATCAATGAAG*ACTGGAGAGGTGGAAGAGCTGC
TTCCTTCAACATCATTCCAAGCAGCACCG*AGCTGCCAAG*CTGTCGGAAAG
TGCTTCACAGCT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2AP70TF 826 0 0
G
TAAGATCGGAATCAACGGTTTCGGAAGAATCGGTCGTTTGGTGGCGAGAGTTATCCTTCA
GAGGAGCGATGTTGAGCTCGTCGCTGTTAACGATCCTTTCATCACCACCGAGTACATGAC
ATACATGTTTAAGTACGACAGTGTTCACGGACAGTGGAAGCACAATGAGCTTAAGATAAA
GGATGAGAAAACCCTTCTCTTCGGCGAGAAGCCAGTCACTGTTTTCGGCATCAGGAACCC
TGAGGATATCCCATGGGGTGAGGCCGGAGCTGACTTTGTTGTTGAGTCTACTGGTGTCTT
CACTGACAAGGACAAGGCCGCTGCTCACTTGAAGGGTGGTGCCAAGAAAGTTGTCATCTC
TGCCCCAAGCAAAGATGCTCCCATGTTTGTTGTTGGTGTCAATGAGCATGAATACAAGTC
TGATCTTAACATTGTTTCCAACGCTAGTTGCACCACTAACTGCCTTGCTCCACTTGCCAA
GGTTATCAACGACAGGTTTGGAATCGTTGAGGGACTCATGACTACCGTCCACTCGATCAC
TGCTACCCAGAAGACTGTTGATGGTCCATCAATGAAGTACTGGAGAGGTGGAAGAGCTGC
TTCCTTCAACATCATTCCAAGCAGCGCCGGAGCTGCCAAGGCTGTCGGAAAGGTGCTTCC
ACAGCTCAACGGAAAAATTGACCGGGAATGTCCTTCCGCGTTCCCACCGTTGATGTTTCG
GTTGTTGACCTCACGGTCAGACTCGAGAAAGCTGCAACCTACGACGAGATCAAGAAGGCT
ATCAAAGGAGAATCTGAAGAAAACTGAAGGAATCCTTGGTTACAC

QA 2 826 2 826
DS 



CO CL54Contig4 1196 2 2 U
GGACTCACTCCACCATCCTCACTGTAATTTTCTCTCTAAACCTCTCTTTCTCGCGTATTT
GATTCGTAATGGCTAACGGTAAGATCAAGATCGGAATCAACGGATTCGGAAGAATCGGTC
GTTTGGTAGCTAGAGTTGTTCTTCAGAGGGACGATGTTGAGCTCGTCGCCGTCAACGATC
CTTTCATCACCACTGAGTACATGACGTACATGTTCAAGTACGACAGTGTTCACGGTCAAT
GGAAACACCATGAACTCAAGGTCAAGGATGAGAAGACTCTTCTCTTCGGTGAGAAGCCAG
CCACCGTCTTCGGCATCAGGAACCCTGAGGATATCCCATGGGCTGAGGCTGGTGCTGACT
TCGTTGTTGAGTCTACCGGTGTTTGTCGTTGGTGTCAACGAGCACGAGTACAAGTCCGAC
CTTGACATTGTCTCCAACGCTAGTTGCACCACTAACTGCCTTGCTCCCCTTGCCAAGGTT
ATTAACGACAGGTTCGGCATTGTTGAGGGTCTTATGACCACCGTCCACTCCATCACTGCT
ACTCCGAAGACTGTTGATGGACCATCAATGAAGGACTGGAGAGGTGGAAGAGCTGCTTCG
TTCAACATCATTCCCAGCAGCACCGGAGCTGCCAAGGCTGTCGGAAAGGTGCTTCCTCAG
CTCAATGGAAAGTTGACCGGCATGTCCTTCCGTGTTCCCACCGTCGATGTCTCAGTTGTT
GACCTCACGGTTAGACTCCAGAAAGCTGCAACCTACGACGAGATCAAGAAGGCTATCAAG
GAGGAATCTGAGGGCAAGCTAAAGGGAATCCTTGGATACACCGAGGATGATGTTGTTTCA
ACTGACTTCGTTGGTGACAGCAGGTCGAGCATTTTTGACGCCAAGGCTGGAATCGCATTG
AGTGACAACTTCGTGAAGCTGGTGTCGTGGTATGACAACGAATGGGGTTACAGTACCCGT
GTGGTCGACTTGATCGTCCACATGTCAAAGTGCTAAATCTGAGGAGATGATCTGGAATGA
TGTTTTGGAGGAAGTTTGAATCTGTTGTTTTTGAATAAATTTTCTTGGGGTTTTTAAAAC
TCTTTGTTGGGTCTTGGCTAATCTCCCTCACTTGAACTCTTGAGTCTGTAGCACGGTTGT
TTTACTGAGAAGCCCTTTACATTTGGCTTTTGATATATTTGAGTTATGGTTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA71TF U 1
AF RR2EA71JQ C 438
BS 1 636 RR2EA71TF
BS 637 1196 RR2EA71JQ

RD RR2EA71TF 638 0 0
GGACTCACTCCACCATCCTCACTGTAATTTTCTCTCTAAACCTCTCTTTCTCGCGTATTT
GATTCGTAATGGCTAACGGTAAGATCAAGATCGGAATCAACGGATTCGGAAGAATCGGTC
GTTTGGTAGCTAGAGTTGTTCTTCAGAGGGACGATGTTGAGCTCGTCGCCGTCAACGATC
CTTTCATCACCACTGAGTACATGACGTACATGTTCAAGTACGACAGTGTTCACGGTCAAT
GGAAACACCATGAACTCAAGGTCAAGGATGAGAAGACTCTTCTCTTCGGTGAGAAGCCAG
CCACCGTCTTCGGCATCAGGAACCCTGAGGATATCCCATGGGCTGAGGCTGGTGCTGACT
TCGTTGTTGAGTCTACCGGTGTTTGTCGTTGGTGTCAACGAGCACGAGTACAAGTCCGAC
CTTGACATTGTCTCCAACGCTAGTTGCACCACTAACTGCCTTGCTCCCCTTGCCAAGGTT
ATTAACGACAGGTTCGGCATTGTTGAGGGTCTTATGACCACCGTCCACTCCATCACTGCT
ACTCCGAAGACTGTTGATGGACCATCAATGAAGGACTGGAGAGGTGGAAGAGCTGCTTCG
TTCAACATCATTCCCAGCAGCACCGGAGCTGCCAAG
CT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2EA71JQ 759 0 0
CGCTAGTTGCACCACTAACTGCCTTGCTCCCCTTGCCAAGGTTATTAACGACAGGTTCGG
CATTGTTGAGGGTCTTATGACCCCCGTCCACTCCATCACTGCTACTCCGAAGACTGTTGA
TGGACCATCAATGAAGGACTGGAGAGGTGGAAGAGCTGCTTCGTTCAACATCATTCCCAG
CAGCACCGGAGCTGCCAAGGCTGTCGGAAAGGTGCTTCCTCAGCTCAATGGAAAGTTGAC
CGGCATGTCCTTCCGTGTTCCCACCGTCGATGTCTCAGTTGTTGACCTCACGGTTAGACT
CCAGAAAGCTGCAACCTACGACGAGATCAAGAAGGCTATCAAGGAGGAATCTGAGGGCAA
GCTAAAGGGAATCCTTGGATACACCGAGGATGATGTTGTTTCAACTGACTTCGTTGGTGA
CAGCAGGTCGAGCATTTTTGACGCCAAGGCTGGAATCGCATTGAGTGACAACTTCGTGAA
GCTGGTGTCGTGGTATGACAACGAATGGGGTTACAGTACCCGTGTGGTCGACTTGATCGT
CCACATGTCAAAGTGCTAAATCTGAGGAGATGATCTGGAATGATGTTTTGGAGGAAGTTT
GAATCTGTTGTTTTTGAATAAATTTTCTTGGGGTTTTTAAAACTCTTTGTTGGGTCTTGG
CTAATCTCCCTCACTTGAACTCTTGAGTCTGTAGCACGGTTGTTTTACTGAGAAGCCCTT
TACATTTGGCTTTTGATATATTTGAGTTATGGTTTTATC

QA 1 759 1 759
DS 



CO CL54Contig5 810 2 8 U
GGACTCCACCATACTCACTCTAATTTTCTCTCTAAATCTCTCTTTCTCGCGTATTTTGAT
TCGTAATGGCTGGCGGTAAGATCAAGATCGGAATCAACGGATTCGGAAGAATCGGTCGTT
TGGTAGCTAGGGTTGTTCTTCAGAGGGACGATGTTGAGCTCGTCGCCGTCAACGATCCTT
TCATCACCACTGAGTACATGACGTACATGTTCAAGTACGACAGTGTTCACGGTCAATGGA
AACACCATGAACTCAAGGTTAAGGATGAGAAGACTCTTCTCTTCGGTGAGAAGCCAGTCA
CCGTCTTCGGCATCAGGAACCCTGAGGATATCCCATGGGCTGAGGCTGGTGCTGACTTCG
TTGTTGAGTCTACTGGTGTTTTCACTGACAAGGACAAAGCTGCTGCTCACTTGAAGGGTG
GTGCCAAGAAGGTTGTCATCTCTGCCCCTAGCAAGGACGCTCCCATGTTTGTCGTTGGTG
TCAACGAGCATTTTTGACGCCAAGGCTGGAATTGCATTGAGTGACAACTTCGTGAAGCTG
GTGTCGTGGTATGACAACGAATGGGGTTACAGTACCCGTGTGGTCGACTTGATCGTCCAC
ATGTCAAAGTGCTAAATCTGAGAAGATGATCTGGAATGATGTTTGGAGGAAGTTTGAATC
TGTTGTTTTTGAATAAATTTTCTTGGGGGTTTTAAAACTCTATGTTGGGTTTTGGCTAAT
CTCCCTCACTTGAACTATGAGTCTGTAGCTGTTTAACTGAGAAGACCCCTTTACGTTTGG
CTTTTGATATATTTGAGTTATGGTTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G485TF U 1
AF RR2G485JQ C 199
BS 1 676 RR2G485TF
BS 677 677 RR2G485JQ
BS 678 696 RR2G485TF
BS 697 697 RR2G485JQ
BS 698 765 RR2G485TF
BS 766 766 RR2G485JQ
BS 767 777 RR2G485TF
BS 778 810 RR2G485JQ

RD RR2G485TF 777 0 0
GGACTCCACCATACTCACTCTAATTTTCTCTCTAAATCTCTCTTTCTCGCGTATTTTGAT
TCGTAATGGCTGGCGGTAAGATCAAGATCGGAATCAACGGATTCGGAAGAATCGGTCGTT
TGGTAGCTAGGGTTGTTCTTCAGAGGGACGATGTTGAGCTCGTCGCCGTCAACGATCCTT
TCATCACCACTGAGTACATGACGTACATGTTCAAGTACGACAGTGTTCACGGTCAATGGA
AACACCATGAACTCAAGGTTAAGGATGAGAAGACTCTTCTCTTCGGTGAGAAGCCAGTCA
CCGTCTTCGGCATCAGGAACCCTGAGGATATCCCATGGGCTGAGGCTGGTGCTGACTTCG
TTGTTGAGTCTACTGGTGTTTTCACTGACAAGGACAAAGCTGCTGCTCACTTGAAGGGTG
GTGCCAAGAAGGTTGTCATCTCTGCCCCTAGCAAGGACGCTCCCATGTTTGTCGTTGGTG
TCAACGAGCATTTTTGACGCCAAGGCTGGAATTGCATTGAGTGACAACTTCGTGAAGCTG
GTGTCGTGGTATGACAACGAATGGGGTTACAGTACCCGTGTGGTCGACTTGATCGTCCAC
ATGTCAAAGTGCTAAATCTGAGAAGATGATCTGGAATGATGTTTGGAGGAAGTTTGAATC
TGTTGTTTTTGAATAA*TTTTCTTGGGGGTTTTAAA*CTCTATGTTGGGTTTTGGCTAAT
CTCCCTCACTTGAACTATGAGTCTGTAGCTGTTTAACTGAGAAGAGCCCTTTACGTT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2G485JQ 612 0 0
TGACGTACATGTTCAAGTACGACAGTGTTCACGGTCAATGGAAACACCATGAACTCAAGG
TTAAGGATGAGAAGACTCTTCTCTTCGGTGAGAAGCCAGTCACCGTCTTCGGCATCAGGA
ACCCTGAGGATATCCCATGGGCTGAGGCTGGTGCTGACTTCGTTGTTGAGTCTACTGGTG
TTTTCACTGACAAGGACAAAGCTGCTGCTCACTTGAAGGGTGGTGCCAAGAAGGTTGTCA
TCTCTGCCCCTAGCAAGGACGCTCCCATGTTTGTCGTTGGTGTCAACGAGCATTTTTGAC
GCCAAGGCTGGAATTGCATTGAGTGACAACTTCGTGAAGCTGGTGTCGTGGTATGACAAC
GAATGGGGTTACAGTACCCGTGTGGTCGACTTGATCGTCCACATGTCAAAGTGCTAAATC
TGAGAAGATGATCTGGAATGATGTTTGGAGGAAGTTTGAATCTGTTGTTTTTGAATAAAT
TTTCTTGGGGGTTTTAAAACTCTATGTTGGGTTTTGGCTAATCTCCCTCACTTGAACTAT
GAGTCTGTAGCTGTTTAACTGAGAAGACCCCTTTACGTTTGGCTTTTGATATATTTGAGT
TATGGTTTTATC

QA 1 612 1 612
DS 



CO CL54Contig6 1196 4 4 U
GGCTAGAGTTGTTCTCCAGAGGGACGATGTCGAGCTCGTCGCCGTCAACGATCCTTTCAT
CACCACTGAGTACACGACCTACATGTTCAAGTACGACAGTGTTCACGGTCAATGGAAACA
CCATGAGCTTAAGGTTAAGGATGAGAAGACTCTTCTCTTCGGTGAGAAGCCTGTCACCGT
CTTCGGCATCAGGAACCCTGAGGATATCCCATGGGCTTCGGCTGGAGCCGATTTCGTTGT
TGAGTCCACCGGTGTGTTCACTGACAAGGACAAAGCTGCTGCTCACTTGAAGGGTGGTGC
CAAGAAGGTTGTCATCTCTGCCCCAAGCAAGGACGCTCCCATGTTTGTCGTTGGTGTCAA
CGAGCACGAGTACAAGTCCGACCTTGACATTGTCTCCAATGCTAGTTGCACCACTAACTG
CCTTGCTCCTCTTGCCAAGGTTATCAACGACAGGTTCGGAATTGTTGAGGGTCTTATGAC
TACCGTCCACTCCATCACCGCTACTCAGAAGACCGTTGATGGACCATCAATGAAGGACTG
GAGAGGTGGAAGAGCCGCTTCATTCAACATCATTCCCAGCAGCACCGGAGCTGCCAAGGC
TGTCGGAAAGGTGCTTCCACAGCTCAACGGAAAGCTAACCGGAATGTCCTTCCGTGTTCC
CACCGTTGATGTCTCAGTTGTTGACCTCACTGTTAGACTCGAGAAAGCTGCAACCTACGA
CGATATCAAGAAGGCTATCAAGGAGGAATCTGAAGGCAAGCTTAAGGGAATCCTTGGATA
CACTGAGGATGATGTCGTCTCAACTGACTTCATTGGTGACAGCAGGTCAAGCATCTTCGA
CGCAAAGGCTGGAATCGCTTTGAGTGACAACTTCGTGAAGCTGGTGTCGTGGTATGACAA
CGAATGGGGTTACAGCACCCGTGTGGTCGACTTGATCGTCCACATGTCCAAGTGTTAAAT
CTGAGAAGGTCTGGAATGGTGTTTGGAGGAAGAAGTCCTGTGTTTCGTTTCTGCTAATGG
TTTAAATTTGTCGTTTTTGAATAAAATTTCTTGGGATTTCAATCTCCTTTCAGTTTTTAA
GCGAATCTCCCTCAGAGTTTGTGAAGAGGATCTTTTATGTTTGGCTTTTGATATATTGAG
CTGTGTTTTCTCAGGATTCTAAGTTTCGTATAACAAATTACAATGTTTTATACAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GW91TF U 1
AF RR2GW91JQ C 421
AF RR2CE87JQ C 511
AF RR2CE87TF U 511
BS 1 689 RR2GW91TF
BS 690 1154 RR2CE87TF
BS 1155 1155 RR2CE87JQ
BS 1156 1196 RR2CE87TF

RD RR2GW91TF 689 0 0
GGCTAGAGTTGTTCTCCAGAGGGACGATGTCGAGCTCGTCGCCGTCAACGATCCTTTCAT
CACCACTGAGTACACGACCTACATGTTCAAGTACGACAGTGTTCACGGTCAATGGAAACA
CCATGAGCTTAAGGTTAAGGATGAGAAGACTCTTCTCTTCGGTGAGAAGCCTGTCACCGT
CTTCGGCATCAGGAACCCTGAGGATATCCCATGGGCTTCGGCTGGAGCCGATTTCGTTGT
TGAGTCCACCGGTGTGTTCACTGACAAGGACAAAGCTGCTGCTCACTTGAAGGGTGGTGC
CAAGAAGGTTGTCATCTCTGCCCCAAGCAAGGACGCTCCCATGTTTGTCGTTGGTGTCAA
CGAGCACGAGTACAAGTCCGACCTTGACATTGTCTCCAATGCTAGTTGCACCACTAACTG
CCTTGCTCCTCTTGCCAAGGTTATCAACGACAGGTTCGGAATTGTTGAGGGTCTTATGAC
TACCGTCCACTCCATCACCGCTACTCAGAAGACCGTTGATGGACCATCAATGAAGGACTG
GAGAGGTGGAAGAGCCGCTTCATTCAACATCATTCCCAGCAGCACCGGAGCTGCCAAGGC
TGTCGGAAAGGTGCTTCCACAGCTCAACGGAAAGCTAACCGGAATGTCCTTCCGTGTTCC
CACCGTTGATGTCTCAGTTGTTGACCTCA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2GW91JQ 736 0 0
CCTTGCTCCTCTTGCCAAGGTTATCAACGACAGGTTCGGAATTGTTGAGGGTCTTATGAC
TACCGTCCACTCCATCACCGCTACTCAGAAGACCGTTGATGGACCATCAATGAAGGACTG
GAGAGGTGGAAGAGCCGCTTCATTCAACATCATTCCCAGCAGCACCGGAGCTGCCAAGGC
TGTCGGAAAGGTGCTTCCACAGCTCAACGGAAAGCTAACCGGAATGTCCTTCCGTGTTCC
CACCGTTGATGTCTCAGTTGTTGACCTCACTGTTAGACTCGAGAAAGCTGCAACCTACGA
CGATATCAAGAAGGCTATCAAGGAGGAATCTGAAGGCAAGCTTAAGGGAATCCTTGGATA
CACTGAGGATGATGTCGTCTCAACTGACTTCATTGGTGACAGCAGGTCAAGCATTTTCGA
CGCAAAGGCTGGAATCGCTTTGAGTGACAACTTCGTGAAGCTGGTGTCGTGGTATGACAA
CGAATGGGGTTACAGCACCCGTGTGGTCGACTTGATCGTCCACATGTCCAAGTGCTAAAT
CTGAGAAGGTCTGGAATGGTGTTTGGAGGAAGAAGTCCTGTGTTTCGTTTCTGCTAATGG
TTTAAATTTGTCGTTTTTGAATAAAATTTCTTGGGACTTCAATCTCCTTTCAGTTTTTAA
GCGAATCTCCCTCAGAGTTTGTGAAGAGGATCTTTTATGTTTGGCTTTTGATATATTGAG
CTGTGTTTTCTCAG
GA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2CE87JQ 686 0 0
GACCGTTGATGGACCATCAATGAAGGACTGGAGAGGTGGAAGAGCCGCTTCATTCAACAT
CATTCCCAGCAGCACCGGAGCTGCCAAGGCTGTCGGAAAGGTGCTTCCACAGCTCAACGG
AAAGCTAACCGGAATGTCCTTCCGTGTTCCCACCGTTGATGTCTCAGTTGTTGACCTCAC
TGTTAGACTCGAGAAAGCTGCAACCTACGACGATATCAAGAAGGCTATCAAGGAGGAATC
TGAAGGCAAGCTTAAGGGAATCCTTGGATACACTGAGGATGATGTCGTCTCAACTGACTT
CATTGGTGACAGCAGGTCAAGCATCTTCGACGCAAAGGCTGGAATCGCTTTGAGTGACAA
CTTCGTGAAGCTGGTGTCGTGGTATGACAACGAATGGGGTTACAGCACCCGTGTGGTCGA
CTTGATCGTCCACATGTCCAAGTGTTAAATCTGAGAAGGTCTGGAATGGTGTTTGGAGGA
AGAAGTCCTGTGTTTCGTTTCTGCTAATGGTTTAAATTTGTCGTTTTTGAATAAAATTTC
TTGGGATTTCAATCTCCTTTCAGTTTTTAAGCGAATCTCCCTCAGAGTTTGTGAAGAGGA
TCTTTTATGTTTGGCTTTTGATATATTGAGCTGTGTTTTCTCAGGATTCTAAGTTTCGTA
TAACAAATTACAATGTTTTATACAGC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2CE87TF 686 0 0
GACCGTTGATGGACCATCAATGAAGGACTGGAGAGGTGGAAGAGCCGCTTCATTCAACAT
CATTCCCAGCAGCACCGGAGCTGCCAAGGCTGTCGGAAAGGTGCTTCCACAGCTCAACGG
AAAGCTAACCGGAATGTCCTTCCGTGTTCCCACCGTTGATGTCTCAGTTGTTGACCTCAC
TGTTAGACTCGAGAAAGCTGCAACCTACGACGATATCAAGAAGGCTATCAAGGAGGAATC
TGAAGGCAAGCTTAAGGGAATCCTTGGATACACTGAGGATGATGTCGTCTCAACTGACTT
CATTGGTGACAGCAGGTCAAGCATCTTCGACGCAAAGGCTGGAATCGCTTTGAGTGACAA
CTTCGTGAAGCTGGTGTCGTGGTATGACAACGAATGGGGTTACAGCACCCGTGTGGTCGA
CTTGATCGTCCACATGTCCAAGTGTTAAATCTGAGAAGGTCTGGAATGGTGTTTGGAGGA
AGAAGTCCTGTGTTTCGTTTCTGCTAATGGTTTAAATTTGTCGTTTTTGAATAAAATTTC
TTGGGATTTCAATCTCCTTTCAGTTTTTAAGCGAATCTCCCTCAGAGTTTGTGAAGAGGA
TCTTTTATGTTTGGCTTTTGATATATTGAGCTGTGTTTTCTCAG*ATTCTAAGTTTCGTA
TAACAAATTACAATGTTTTATACAGC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 2 21

CO CL55Contig1 1309 5 13 U
GTCTGTAATGTCCCTTCATTCAAAAACCCATAGAAGAGTACGTTTAAGAGGGGCCACAGA
GTTGCACAAACTGATAAAAGGAAATTTACAAAGCTGTAGGAAGAAGCACAAAGGACACAC
AGGCATCTTGATGAGTAAGTATAGTACATGATCATATATAGGATTTAACCAAGACCATCT
TTTATTGTCTCTCTGACTGATTGGATATATTCTCTCAACTATCATTTCCTGATGAAGTCG
ACACCTTTCTGAATACTCCCTGCTAATTCTTCTTTTGCTTTCTCCAAACCAACCCTTTCG
TATTCGTTCAAGGGCCCAAGCGGATACACTTCCTCTGCTCCTGTACGTCCAAGACGAACT
TTGGTTGCAAAGAATGGTAACTCTGTCACCTGAGAAGCTACAAAAGAGCATTCAACGACA
TTCGCATCTCCTCTTAACCCTCGAAGGCAAGCATCTGCAAACTTGGCTGCAGCATATGCC
ATTGAAAGTGTTGCTGATCCAGCTCCAGCTTTTGCCTCCACTACTTCAGTTCCACCGTTT
TGAATCCGGTTAGTGAGGTACTCTATTTCTGAAGGTGTAAAACTACTAGGAGGTTTCACC
TGTGACAACAGTGGCAAAATTGTGACTCCGGCGTGTCCACCAACGACTGGTACATTGACT
TCTCTCGGATCAAGTCCAAGAACTTCAGCCACAAATGTGTTGGCACGAGCAACATCGAGT
GTAGTAACTCCAAGGAGCTTCTTAGGGTCATAAGTTCCAGCTTTCTTGAAAACCTCAGCG
GCAATTGCCACAGTAGAGTTCACAGGGTTACTGATCAAGTTGACTATAGCATTAGGACAA
CATTTTGCCACGCCTTCGCATAGTGTCTTAACAATCCCAGCATTGATTTTAAATAGATCG
TCGCGTGTCATCCCTGGTTTCCTCGGCACACCAGCTGGTATGATCACAAGATCCATACCC
GTTAGAGCGTCCTCAAGCTGCTTGGCTCCCAAGAATCCTTTAACAACCGCTCCAGTGTCC
ATATGGCTAACATCAGCAGTGACTCCGGGAGCATTGACAACATCGTAGAGATGAAGTAAA
GAGACGAGAGGGTTCATCTTCATTAACAAGGATAGAGATTGTCCTACTCCACCTGCAGCT
CCGAGAATTGCTACTTTGAATCCTGCGTTCCCACCTTTCCCTCTGCAGTTTTCTCTTCCC
ATTACAGTGTTCTTGGCCTCCGTCTGAGAAGCGAAAGAAGGTTGAAGATGAGCTGATATC
CTAGCAATCCTCTGGTTGGCATCTCCACGAAACTCCATTCTCGTCTTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ07JQ U 3
AF RR2B407JQ U 5
AF RR2AR85JQ U 1
AF RR2AR85TF C 544
AF RR2CQ07TF C 604
BS 1 219 RR2AR85JQ
BS 220 220 RR2CQ07JQ
BS 221 234 RR2AR85JQ
BS 235 235 RR2CQ07JQ
BS 236 285 RR2AR85JQ
BS 286 286 RR2CQ07JQ
BS 287 832 RR2AR85JQ
BS 833 1216 RR2AR85TF
BS 1217 1217 RR2CQ07TF
BS 1218 1231 RR2AR85TF
BS 1232 1232 RR2CQ07TF
BS 1233 1288 RR2AR85TF
BS 1289 1309 RR2CQ07TF

RD RR2CQ07JQ 737 0 0
CT
GTAATGTCCCTTCATTCAAAAACCCATAGAAGAGTACGTTTAAGAGGGGCCACAGAGTTG
CACAAACTGATAAAAGGAAATTTACAAAGCTGTAGGAAGAAGCACAAAGGACACACAGGC
ATCTTGATGAGTAAGTATAGTACATGATCATATATAGGATTTAACCAAGACCATCTTTTA
TTGTCTCTCTGACTGATTGGATATATTCTCTCAACTATCATTTCCTGATGAAGTCGACAC
CTTTCTGAATACTCCCTGCTAATTCTTCTTTTGCTTTCTCCAAACCAACCCTTTCGTATT
CGTTCAAGGGCCCAAGCGGATACACTTCCTCTGCTCCTGTACGTCCAAGACGAACTTTGG
TTGCAAAGAATGGTAACTCTGTCACCTGAGAAGCTACAAAAGAGCATTCAACGACATTCG
CATCTCCTCTTAACCCTCGAAGGCAAGCATCTGCAAACTTGGCTGCAGCATATGCCATTG
AAAGTGTTGCTGATCCAGCTCCAGCTTTTGCCTCCACTACTTCAGTTCCACCGTTTTGAA
TCCGGTTCGTGAGGTACTCTATTTCTGAAGGTGTAAAACTACTAGGAGGTTTCACCTGTG
ACAACAGCGGCAAAATTGTGACTCCGGCGTGTCCACCAACGACTGGTACATTGACTTCTC
TCGGATCAAGTCCAAGAACTTCAGCCACAAATGTGTTGGCACGAGCAACATCGAGTGTAG
TAACTCCAAGGAGCT

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR2B407JQ 763 0 0
GTAATGTCCCTTCATTCAAAAACCCATAGAAGAGTACGTTTAAGAGGGGCCACAGAGTTG
CACAAACTGATAAAAGGAAATTTACAAAGCTGTAGGAAGAAGCACAAAGGACACACAGGC
ATCTTGATGAGTAAGTATAGTACATGATCATATATAGGATTTAACCAAGACCATCTTTTA
TTGTCTCTCTGACTGATTGGATATATTCTCTCAACTATCATTTCCTGATGAAGTCGACAC
CTTTCTGAATACTCCCTGCTAATTCTTCTTTTGCTTTCTCCAAACCAACCCTTTCGTATT
CGTTCAAGGGCCCAAGCGGATACACTTCCTCTGCTCCTGTACGTCCAAGACGAACTTTGG
TTGCAAAGAATGGTAACTCTGTCACCTGAGAAGCTACAAAAGAGCATTCAACGACATTCG
CATCTCCTCTTAACCCTCGAAGGCAAGCATCTGCAAACTTGGCTGCAGCATATGCCATTG
AAAGTGTTGCTGATCCAGCTCCAGCTTTTGCCTCCACTACTTCAGTTCCACCGTTTTGAA
TCCGGTTCGTGAGGTACTCTATTTCTGAAGGTGTAAAACTACTAGGAGGTTTCACCTGTG
ACAACAGTGGCAAAATTGTGACTCCGGCGTGTCCACCAACGACTGGTACATTGACTTCTC
TCGGATCAAGTCCAAGAACTTCAGCCACAAATGTGTTGGCACGAGCAACATCGAGTGTAG
TAACTCCAAGGAGCTTCTTAGGGTCATAAGTTCCAGCTTTCTT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2AR85JQ 832 0 0
GTCTGTAATGTCCCTTCATTCAAAAACCCATAGAAGAGTACGTTTAAGAGGGGCCACAGA
GTTGCACAAACTGATAAAAGGAAATTTACAAAGCTGTAGGAAGAAGCACAAAGGACACAC
AGGCATCTTGATGAGTAAGTATAGTACATGATCATATATAGGATTTAACCAAGACCATCT
TTTATTGTCTCTCTGACTGATTGGATATATTCTCTCAACCATCATTTCCTGATGGAGTCG
ACACCTTTCTGAATACTCCCTGCTAATTCTTCTTTTGCTTTCTCCGAACCAACCCTTTCG
TATTCGTTCAAGGGCCCAAGCGGATACACTTCCTCTGCTCCTGTACGTCCAAGACGAACT
TTGGTTGCAAAGAATGGTAACTCTGTCACCTGAGAAGCTACAAAAGAGCATTCAACGACA
TTCGCATCTCCTCTTAACCCTCGAAGGCAAGCATCTGCAAACTTGGCTGCAGCATATGCC
ATTGAAAGTGTTGCTGATCCAGCTCCAGCTTTTGCCTCCACTACTTCAGTTCCACCGTTT
TGAATCCGGTTAGTGAGGTACTCTATTTCTGAAGGTGTAAAACTACTAGGAGGTTTCACC
TGTGACAACAGTGGCAAAATTGTGACTCCGGCGTGTCCACCAACGACTGGTACATTGACT
TCTCTCGGATCAAGTCCAAGAACTTCAGCCACAAATGTGTTGGCACGAGCAACATCGAGT
GTAGTAACTCCAAGGAGCTTCTTAGGGTCATAAGTTCCAGCTTTCTTGAAAACCTCAGCG
GCAATTGCCACAGTAGAGTTCACAGGGTTACTGATCAAGTTGACTATAGCAT

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR2AR85TF 749 0 0
ATCCGGTTAGTGAGGTACTCTATT*CTGAAGGTGTAAAACTACTAGGAGGTTTCACCTGT
GACAACAGTGGCAAAATTGTGACTCCGGCGTGTCCACCAACGACTGGTACATTGACTTCT
CTCGGATCAAGTCCAAGAACTTCAGCCACAAATGTGTTGGCACGAGCAACATCGAGTGTA
GTAACTCCAAGGAGCTTCTTAGGGTCATAAGTTCCAGCTTTCTTGAAAACCTCAGCGGCA
ATTGCCACAGTAGAGTTCACAGGGTTACTGATCAAGTTGACTATAGCATTAGGACAACAT
TTTGCCACGCCTTCGCATAGTGTCTTAACAATCCCAGCATTGATTTTAAATAGATCGTCG
CGTGTCATCCCTGGTTTCCTCGGCACACCAGCTGGTATGATCACAAGATCCATACCCGTT
AGAGCGTCCTCAAGCTGCTTGGCTCCCAAGAATCCTTTAACAACCGCTCCAGTGTCCATA
TGGCTAACATCAGCAGTGACTCCGGGAGCATTGACAACATCGTAGAGATGAAGTAAAGAG
ACGAGAGGGTTCATCTTCATTAACAAGGATAGAGATTGTCCTACTCCACCTGCAGCTCCG
AGAATTGCTACTTTGAATCCTGCGTTCCCACCTTTCCCTCTGCAGTTTTCTCTTCCCATT
ACAGTGTTCTTGGTCTCCGTCTGAGAAGTGAAAGAAGGTTGAAGATGAGCTGATATCCTA
GCAATCCTCTGGTTGGCATCTCCAC
CCCT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2CQ07TF 706 0 0
GACAACAGCGGCAAAAT*GTGACTC*GGCGTGTCCACCAACGACTGGTACAT*GACTTCT
CTCGGATCAAGTCCAAGAACTTCAGCCACAAATGTGTTGGCACGAGCAACATCGAGTGTA
GTAACTCCAAGGAGCTTCTTAGGGTCATAAGTTCCAGCTTTCTTGAAAACCTCAGCGGCA
ATTGCCACAGTAGAGTTCACAGGGTTACTGATCAAGTTGACTATAGCATTAGGACAACAT
TTTGCCACGCCTTCGCATAGTGTCTTAACAATCCCAGCATTGATTTTAAATAGATCGTCG
CGTGTCATCCCTGGTTTCCTCGGCACACCAGCTGGTATGATCACAAGATCCATACCCGTT
AGAGCGTCCTCAAGCTGCTTGGCTCCCAAGAATCCTTTAACAACCGCTCCAGTGTCCATA
TGGCTAACATCAGCAGTGACTCCGGGAGCATTGACAACATCGTAGAGATGAAGTAAAGAG
ACGAGAGGGTTCATCTTCATTAACAAGGATAGAGATTGTCCTATTCCACCTGCAGCTCCG
AGAATTGCTACTTTGAATCCTGCGTTCCCACCTTTCCCTCTGCAGTTTTCTCTTCCCATT
ACAGTGTTCTTGGCCTCCGTCTGAGAAGCGAAAGAAGGTTGAAGATGAGCTGATATCCTA
GCAATCCTCTGGTTGGCATCTCCACGAAACTCCATTCTCGTCTTCC

QA 1 706 1 706
DS 



CO CL55Contig2 1323 16 45 U
GGGAAATCAAAACTCTTTAGCAGCGCTCTAAAGAAAGTAAACAAAGAGAAGCAAGAATGG
AGTTTCGTGGAGATGCCAACCAGAGGATTGCTATGATATCAGCTCATCTTCAACCTTCTT
TCACTCCTCAGATGGAGGCCAAGAACTCTGTAGTGGGACGAGAAAACTGCAGAGCGAAAG
GTGGGAATCCAGGATTCAAAGTAGCCATTCTTGGAGCTGCAGGTGGGATAGGACAGTCTC
TATCCTTGTTAATGAAGATGAACCCTCTCGTCTCTTTACTTCATCTCTACGATGTTGTCA
ATGCTCCTGGAGTCACCGCTGACGTTAGCCACATGGACACTGGAGCTGTTGTTAGAGGAT
TCTTGGGAGCCAAGCATCTTGAGGACGCGTTAACTGGTATGGATCTTGTGATCATACCAG
CTGGTGTGCCGAGGAAACCAGGGATGACACGTGATGATCTCTTTAAAATCAATGCTGGGA
TTGTTAAGACACTATGTGAAGGAGTAGCCAAATGCTGTCCTAATGCTATTGTCAACTTGA
TTAGTAACCCTGTGAACTCTACTGTTGCTATTGCTGCTGAAGTTTTCAAGAAAGCTGGGA
CTTATGATCCTAAGAAGCTCCTTGGTGTTACTACACTCGATGTTGCTCGTGCCAATACAT
TTGTGGCTGAAGTTCTTGGCCTTGATCCAAGAGAAGTTGATGTACCAGTGGTTGGAGGAC
ACGCTGGAGTCACAATCTTGCCACTGTTGTCACAGGTTAAACCTCCTAGCAGCTTCACAC
AATCAGAGATTGAGTACCTCACGAACCGGATTCAAAATGGTGGAACTGAAGTTGTGGAGG
CAAAAGCTGGAGCTGGATCTGCAACACTTTCAATGGCATATGCTGCAGCAAAGTTTGCAG
ATGCTTGCCTTCGCGGGTTGAGAGGAGATGCGAATGTCATTGAGTGCTCTTTTGTTGCTT
CACAGGTGACAGAGTTAGCTTTCTTTGCAACCAAAGTGCGTCTTGGACGTACAGGAGCAG
AGGAAGTGTTTCAGCTTGGGCCCTTGAACGAATACGAAAGGGTTGGTCTGGAGAAAGCAA
AAGAAGAACTAGCTGGAAGTATTCAGAAAGGTGTCGACTTCATCAGGAAATGAAATTAAG
AA*AATCACAGAGAGAGAACAATAAGATCTTCTTCCTTCCTAAAATCATA**TGATCATG
TACTACTACTACTCACTCATCATGCCTATGTCCTGCTTTCTTCTTCTTCTTCAACTTTGT
AAAAAAAATGTTTGTATAACTCTGTCCCTTCTCTTAAACGCACTTCTCTATGGGTTTATG
ATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 45 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 30 70 70 70 70 70 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 15 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2D216TF U 1
AF RR2BP02TF U 266
AF RR2F662TF U 35
AF RR2BQ78TF U 37
AF RR2DQ43TF U 25
AF RR2A383TF U 37
AF RR2GF83TF U 57
AF RR2AR63TF U 37
AF RR2C815TF U 182
AF RR2F741JQ C 862
AF RR2C815JQ C 554
AF RR2CL56TF U 617
AF RR2F662JQ C 625
AF RR2BQ78JQ C 558
AF RR2AR63JQ C 490
AF RR2A383JQ C 551
BS 1 226 RR2D216TF
BS 227 227 RR2DQ43TF
BS 228 376 RR2D216TF
BS 377 377 RR2DQ43TF
BS 378 382 RR2D216TF
BS 383 383 RR2DQ43TF
BS 384 389 RR2D216TF
BS 390 390 RR2DQ43TF
BS 391 460 RR2D216TF
BS 461 461 RR2DQ43TF
BS 462 490 RR2D216TF
BS 491 491 RR2DQ43TF
BS 492 598 RR2D216TF
BS 599 599 RR2DQ43TF
BS 600 613 RR2D216TF
BS 614 755 RR2DQ43TF
BS 756 756 RR2A383TF
BS 757 790 RR2DQ43TF
BS 791 791 RR2A383TF
BS 792 804 RR2DQ43TF
BS 805 812 RR2A383TF
BS 813 816 RR2AR63TF
BS 817 817 RR2C815TF
BS 818 827 RR2AR63TF
BS 828 844 RR2C815TF
BS 845 845 RR2CL56TF
BS 846 904 RR2C815TF
BS 905 1067 RR2CL56TF
BS 1068 1068 RR2AR63JQ
BS 1069 1069 RR2CL56TF
BS 1070 1070 RR2AR63JQ
BS 1071 1142 RR2CL56TF
BS 1143 1143 RR2AR63JQ
BS 1144 1148 RR2CL56TF
BS 1149 1149 RR2AR63JQ
BS 1150 1159 RR2CL56TF
BS 1160 1160 RR2AR63JQ
BS 1161 1190 RR2CL56TF
BS 1191 1192 RR2AR63JQ
BS 1193 1207 RR2CL56TF
BS 1208 1209 RR2AR63JQ
BS 1210 1244 RR2CL56TF
BS 1245 1245 RR2AR63JQ
BS 1246 1249 RR2CL56TF
BS 1250 1323 RR2AR63JQ

RD RR2D216TF 613 0 0
GGGAAATCAAAACTCTTTAGCAGCGCTCTAAAGAAAGTAAACAAAGAGAAGCAAGAATGG
AGTTTCGTGGAGATGCCAACCAGAGGATTGCTATGATATCAGCTCATCTTCAACCTTCTT
TCACTCCTCAGATGGAGGCCAAGAACTCTGTAGTGGGACGAGAAAACTGCAGAGCGAAAG
GTGGGAATCCAGGATTCAAAGTAGCCATTCTTGGAGCTGCAGGTGGAATAGGACAGTCTC
TATCCTTGTTAATGAAGATGAACCCTCTCGTCTCTTTACTTCATCTCTACGATGTTGTCA
ATGCTCCTGGAGTCACCGCTGACGTTAGCCACATGGACACTGGAGCTGTTGTTAGAGGAT
TCTTGGGAGCCAAGCAACTTGAAGACGCGCTAACTGGTATGGATCTTGTGATCATACCAG
CTGGTGTGCCGAGGAAACCAGGGATGACACGTGATGATCTTTTTAAAATCAATGCTGGGA
TTGTTAAGACGCTATGTGAAGGAGTAGCCAAATGCTGTCCTAATGCTATTGTCAACTTGA
TTAGTAACCCTGTGAACTCTACTGTTGCTATTGCTGCTGAAGTTTTCAAGAAAGCTGGAA
CTTATGATCCTAA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2BP02TF 373 0 0
TCTCGTCTCTTTACTTCATCTCTACGATGTTGTCAATGCTCCTGGAGTCACTGCTGACGT
TAGCCATATGGACACTGGAGCTGTTGTTAGAGGATTCTTGGGAGCCAAGCAACTTGAAGA
CGCGTTAACTGGTATGGATCTTGTGATCATACCAGCTGGTGTGCCGAGGAAACCAGGGAT
GACACGTGATGATCTCTTTAAAATCAATGCTGGGATTGTTAAGACACTATGTGAAGGAGT
AGCCAAATGCTGTCCTAATGCTATTGTCAACTTGATTAGTAACCCTGTGAACTCTACTGT
TGCTATTGCTGCTGAAGTTTTCAAGAAAGCTGGAACTTATGATCCTAAGAAGCTCCTTGG
TGTTACTACACTC

QA 1 373 1 373
DS 

RD RR2F662TF 635 0 0
GG
GTAAACAAAGAGAAGCAAGAATGGAGTTTCGTGGAGATGCCAACCAGAGGATTGCTATGA
TATCGGCTCATCTTCAACCTTCTTTCACTCCTCAGATGGAGGCCAAGAACTCTGTAGTGG
GACGAGAAAACTGCAGAGCGAAAGGTGGGAATCCAGGATTCAAAGTAGCCATTCTTGGAG
CTGCAGGTGGGATAGGACAGTCTCTATCCTTGTTAATGAAGATGAACCCTCTCGTCTCTT
TACTTCATCTCTACGATGTTGTCAATGCTCCTGGAGTCACCGCTGACGTTAGCCACATGG
ACACTGGAGCTGTTGTTAGAGGATTCTTGGGAGCCAAGCATCTTGAGGACGCGTTAACTG
GTATGGATCTTGTGATCATACCAGCTGGTGTGCCGAGGAAACCAGGGATGACACGTGATG
ATCTCTTTAAAATCAATGCTGGGATTGTTAAGACACTATGTGAAGGAGTAGCCAAATGCT
GTCCTAATGCTATTGTCAACTTGATTAGTAACCCTGTGAACTCTACTGTTGCTATTGCTG
CTGAAGTTTTCAAGAAAGCTGGGACTTATGATCCTAAGAAGCTCCTTGGTGTTACTACAC
TCGATGTTGCTCGTGCCAATACATTTGTGGCTG

QA 3 635 3 635
DS 

RD RR2BQ78TF 715 0 0
GG
AAACAAAGAGAAGCAAGAATGGAGTTTCGTGGAGATGCCAACCAGAGGATTGCTATGATA
TCAGCTCATCTTCAACCTTCTTTCACTCCTCAGATGGAGGCCAAGAACTCTGTAGTGGGA
CGAGAAAACTGCAGAGCGAAAGGTGGGAATCCAGGATTCAAAGTAGCCATTCTTGGAGCT
GCAGGTGGGATAGGACAGTCTCTATCCTTGTTAATGAAGATGAACCCTCTCGTCTCTTTA
CTTCATCTCTACGATGTTGTCAATGCTCCTGGAGTCACCGCTGACGTTAGCCACATGGAC
ACTGGAGCTGTTGTTAGAGGATTCTTGGGAGCCAAGCATCTTGAGGACGCGTTAACTGGT
ATGGATCTTGTGATCATACCAGCTGGTGTGCCGAGGAAACCAGGGATGACACGTGATGAT
CTCTTTAAAATCAATGCTGGGATTGTTAAGACACTATGTGAAGGAGTAGCCAAATGCTGT
CCTAATGCTATTGTCAACTTGATTAGTAACCCTGTGAACTCTACTGTTGCTATTGCTGCT
GAAGTTTTCAAGAAAGCTGGGACTTATGATCCTAAGAAGCTCCTTGGTGTTACTACACTC
GATGTTGCTCGTGCCAATACATTTATGGCTGAAGTTCTTGGCCTTGATCCAAGAGAAGTT
GATGTACCAGTGGTTGGAGGACACGCTGGAGTCACAATCTTGC*ACTGTTGTC

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR2DQ43TF 787 0 0
GGAAA
AAAGAAAGTAAACAAAGAGAAGCAAGAATGGAGTTTCGTGGAGATGCCAACCAGAGGATT
GCTATGATATCAGCTCATCTTCAACCTTCTTTCACTCCTCAGATGGAGGCCAAGAACTCT
GTAGTGGGACGAGAAAACTGCAGAGCGAAAGGTGGGAATCCAGGATTCAAAGTAGCCATT
CTTGGAGCTGCAGGTGGGATAGGACAGTCTCTATCCTTGTTAATGAAGATGAACCCTCTC
GTCTCTTTACTTCATCTCTACGATGTTGTCAATGCTCCTGGAGTCACCGCTGACGTTAGC
CACATGGACACTGGAGCTGTTGTTAGAGGATTCTTGGGAGCCAAGCATCTTGAGGACGCG
TTAACTGGTATGGATCTTGTGATCATACCAGCTGGTGTGCCGAGGAAACCAGGGATGACA
CGTGATGATCTCTTTAAAATCAATGCTGGGATTGTTAAGACACTATGTGAAGGAGTAGCC
AAATGCTGTCCTAATGCTATTGTCAACTTGATTAGTAACCCTGTGAACTCTACTGTTGCT
ATTGCTGCTGAAGTTTTCAAGAAAGCTGGGACTTATGATCCTAAGAAGCTCCTTGGTGTT
ACTACACTCGATGTTGCTCGTGCCAATACATTTGTGGCTGAAGTTCTTGGCCTTGATCCA
AGAGAAGTTGATGTACCAGTGGTTGGAGGACACGCTGGAGTCACAATCTTGCCACTGTTG
TCACAG*TTAAACCTCCTAGCAGCTTCACACAATCAGAGAT*GAGTACCTCACGA
CCGGATT

QA 6 780 6 780
DS 

RD RR2A383TF 776 0 0
GG
AAACAAAGAGAAGCAAGAATGGAGTTTCGTGGAGATGCCAACCAGAGGATTGCTATGATA
TCAGCTCATCTTCAACCTTCTTTCACTCCTCAGATGGAGGCCAAGAACTCTGTAGTGGGA
CGAGAAAACTGCAGAGCGAAAGGTGGGAATCCAGGATTCAAAGTAGCCATTCTTGGAGCT
GCAGGTGGGATAGGACAGTCTCTATCCTTGTTAATGAAGATGAACCCTCTCGTCTCTTTA
CTTCATCTCTACGATGTTGTCAATGCTCCTGGAGTCGCCGCTGACGTTAGCCACATGGAC
ACTGGAGCTGTTGTTAGAGGATTCTTGGGAGCCAAGCATCTTGAGGACGCGTTAACTGGT
ATGGATCTTGTGATCATACCAGCTGGTGTGCCGAGGAAACCAGGGATGACACGTGATGAT
CTCTTTAAAATCAATGCTGGGATTGTTAAGACACTATGTGAAGGAGTAGCCAAATGCTGT
CCTAATGCTATTGTCAACTTGATTAGTAACCCTGTGAACTCTACTGTTGCTATTGCTGCT
GAAGTTTTCAAGAAAGCTGGGACTTATGATCCTAAGAAGCTCCTTGGTGTTACTACACTC
GATGTTGCTCGTGCCAATACATTTGTGGCTGAAGTTCTTGGCCTTGATCCAAGAGAAGTT
GATGTACCAGTGGTTGGAGGACACGCTGGAGTCACAATCTTGCCACTGTTGTCACAGGTT
AAACCTCCTAGCAGCTTCACACAATCAGAGATTGAGTACCTCACGAACCGGATT

QA 3 776 3 776
DS 

RD RR2GF83TF 737 0 0
GG
GGAGTTTCGTGGAGATGCCAACCAGAGGATTGCTATGATATCAGCTCATCTTCAACCTTC
TTTCACTCCTCAGATGGAGGCCAAGAACTCTGTAGTGGGACGAGAAAACTGCAGAGCGAA
AGGTGGGAATCCAGGATTCAAAGTAGCCATTCTTGGAGCTGCAGGTGGGATAGGACAGTC
TCTATCCTTGTTAATGAAGATGAACCCTCTCTTCTCTTTACTTCATCTCTACGATGTTGT
CAATGCTCCTGGAGTCACCGCTGACGTTAGCCACATGGACACTGGAGCTGTTGTTAGAGG
ATTCTTGGGAGCCAAGCATCTTGAGGACGCGTTAACTGGTATGGATCTTGTGATCATACC
AGCTGGTGTGCCGAGGAAACCAGGGATGACACGTGATGATCTCTTTAAAATCAATGCTGG
GATTGTTAAGACACTATGTGAAGGAGTAGCCGAATGCTGTCCTAATGCTATTGCCAACTT
GATTAGTAACCCTGTGAACTCTACTGTTGCTATTGCTGCTGAAGTTTTCAAGAAAGCTGG
GACTTATGATCCTAAGAAGCTCCTTGGTGTTACTACACTCGATGTTGCTCGTGCCAATAC
ATTTGTGGCTGAAGTTCTTGGCCTTGATCCAAGAGAAGTTGATGTACCAGTGGTTGGAGG
ACACGCTGGAGTCACAATCTTGCCACTGTTGTCACAG*TTAAACCTCCTAGCAGCTTCAC
ACAATCAGAGATTGA

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR2AR63TF 791 0 0
GG
AAACAAAGAGAAGCAAGAATGGAGTTTCGTGGAGATGCCAACCAGAGGATTGCTATGATA
TCAGCTCATCTTCAACCTTCTTTCACTCCTCAGATGGAGGCCAAGAACTCTGTAGTGGGA
CGAGAAAACTGCAGAGCGAAAGGTGGGAATCCAGGATTCAAAGTAGCCATTCTTGGAGCT
GCAGGTGGGATAGGACAGTCTCTATCCTTGTTAATGAAGATGAACCCTCTCGTCTCTTTA
CTTCATCTCTACGATGTTGTCAATGCTCCTGGAGTCGCCGCTGACGTTAGCCACATGGAC
ACTGGAGCTGTTGTTAGAGGATTCTTGGGAGCCAAGCATCTTGAGGACGCGTTAACTGGT
ATGGATCTTGTGATCATACCAGCTGGTGTGCCGAGGAAACCAGGGATGACACGTGATGAT
CTCTTTAAAATCAATGCTGGGATTGTTAAGACACTATGTGAAGGAGTAGCCAAATGCTGT
CCTAATGCTATTGTCAACTTGATTAGTAACCCTGTGAACTCTACTGTTGCTATTGCTGCT
GAAGTTTTCAAGAAAGCTGGGACTTATGATCCTAAGAAGCTCCTTGGTGTTACTACACTC
GATGTTGCTCGTGCCAATACATTTGTGGCTGAAGTTCTTGGCCTTGATCCAAGAGAAGTT
GATGTACCAGTGGTTGGAGGACACGCTGGAGTCACAATCTTGCCACTGTTGTCACAGGTT
AAACCTCCTAGCAGCTTCACACAATCAGAGATTGAGTACCTCACGAACCGGATTCAAA*T
GGTGGAACT

QA 3 791 3 791
DS 

RD RR2C815TF 723 0 0
G
GGGAATCCAGGATTCAAAGTAGCCATTCTTGGAGCTGCAGGTGGAATAGGACAGTCTCTA
TCCTTGTTAATGAAGA*GAACCCTCTCGTCTCTTTACTTCATCTCTACGATGTTGTCAAT
ACTCCTGGAGTCACCGCTGACGTTAGCCACATGGACACTGGAGCTGTTGTTAGAGGATTC
TTGGGAGCCAAGCAACTTGAAGACGCGTTAACTGGTATGGATCTTGTGATCATACCGGCT
GGTGTGCCTAGGAAACCAGGGATGACACGTGATGATCTCTTTAAAATCAATGCTGGGATT
GTTAAGACGCTATGTGAAGGAGTAGCCAAATGCTGTCCTAATGCTGTTGTCAACTTGATT
AGTAACCCTGTGAACTCTACTGTTGCTATTGCTGCTGAAGTTTTCAAGAAAGCTGGAACT
TATGATCCTAAGAAGCTCCTTGGTTTTACTACACTCGATGTTGCTCGTGCCAATACATTT
GTGGCTGAAGTTCTTGGCCTTGATCCAAGAGAAGTTGATGTACCAGTGGTTGGAGGACAC
GCTGGAGTCACAATCTTGCCACTATTGTCACAGGTTAAACCTCCTAGCAGCTTCACACAA
TCAGAGATTGAGTACCTCACGAACCGGATTCAAAATGGTGGAACTGAAGTTGTGGAGGCA
AA*GCTGGAGCTGGATCTGCAACACTTTCAATGGCATATGCTGCAGCAAAGTTTGCAGAT
GC

QA 2 723 2 723
DS 

RD RR2F741JQ 283 0 0
CAACACTTTCAATGGCATATGCTGCAGCAAAGTTTGCAGATGCTTGCCTTCGCGGGTTGA
GAGGAGATGCGAATGTCATTGAGTGCTCTTTTGTTGCTTCACAGGTGACAGAGTTAGCTT
TCTTTGCAACCAAAGTGCGTTTTGGACGTACAGGAGCAGAGGAAGTGTTTCAGCTTGGGC
CCTTGAACGAATACGAAAGGGTTGGTTTGGAGAAAGCAAAAGAAGAACTAGCTGGAAGTA
TTCAGAAAGGTGTCGACTTCATCAGGAAATGAAATTAAGAA*A

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR2C815JQ 607 0 0
GAACTCTACTGTTGCTAT*GCTGCTGAAGTTT*CAAGAAAGCTGGAACTTATGATCCTAA
GAAGCTCCTTGGTTTTACTACACTCGATGTTGCTCGTGCCAATACATTTGTGGCTGAAGT
TCTTGGCCTTGATCCAAGAGAAGTTGATGTACCAGTGGTTGGAGGACACGCTGGAGTCAC
AATCTTGCCACTATTGTCACAGGTTAAACCTCCTAGCAGCTTCACACAATCAGAGATTGA
GTACCTCACGAACCGGATTCAAAATGGTGGAACTGAAGTTGTGGAGGCAAAAGCTGGAGC
TGGATCTGCAACACTTTCAATGGCATATGCTGCAGCAAAGTTTGCAGATGCTTGCCTTCG
CGGGTTGAGAGGAGATGCGAATGTCATTGAGTGCTCTTTTGTTGCTTCACAGGTGACAGA
GTTAGCTTTCTTTGCAACCAAAGTGCGTCTTGGACGTACGGGAGCAGAAGAAGTATTTCA
GCTTGGGCCCTTGAACGAATACGAAAGGGTTGGTCTAGAGAAAGCAAAAGAAGAACTAGC
TGGAAGTATTCAGAAAGGTGTCGACTTCATCAGGAAATGAAATTAAGAATAATCAGAGAG
AGA
AAAA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2CL56TF 641 0 0
GCTCCTTGGTGTTACTACACTCGATGTTGCTCGTGCCAATACATTTGTGGCTGAAGTTCT
TGGCCTTGATCCAAGAGAAGTTGATGTACCAGTGGTTGGAGGACACGCTGGAGTCACAAT
CTTGCCACTATTGTCACAGGTTAAACCTCCTAGCAGCTTCACACAATCAGAGATTGATTA
CCTCACGAACCGGATTCAAAATGGTGGAACTGAAGTTGTGGGGGCAAAAGCTGGAGCTGG
ATCTGCAACACTTTCAATGGCATATGCTGCAGCAAAGTTTGCAGATGCTTGCCTTCGCGG
GTTGAGAGGAGATGCGAATGTCATTGAGTGCTCTTTTGTTGCTTCACAGGTGACAGAGTT
AGCTTTCTTTGCAACCAAAGTGCGTCTTGGACGTACAGGAGCAGAGGAAGTGTTTCAGCT
TGGGCCCTTGAACGAATACGAAAGGGTTGGTTTAGAGAAAGCAAAAGAAGAACTAGCTGG
AAGTATTCAGAAAGGTGTCGACTTCATCAGGAAATGAAATTAAGAATAATCAGAGAGAGA
GAAAAATAAGATCTTCTTCCTTCCTAAAATCATATATGATCATGTACTACT**TACTCAC
TCATCATGCCTATGTCCTGCTTTCTTCTCCTTC
AACTTTGT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2F662JQ 671 0 0
GTGTTACTACACTCGATGTTGCTCGTGCCAATACATTTGTGGCTGAAGTTCTTGGCCTTG
ATCCAAGAGAAGTTGATGTACCAGTGGTTGGAGGACACGCTGGAGTCACAATCTTGCCAC
TGTTGTCACAGGTTAAACCTCCTAGCAGCTTCACACAATCAGAGATTGAGTACCTCACGA
ACCGGATTCAAAATGGTGGAACTGAAGTTGTGGAGGCAAAAGCTGGAGCTGGATCTGCAA
CACTTTCAATGGCATATGCTGCAGCAAAGTTTGCAGATGCTTGCCTTCGCGGGTTGAGAG
GAGATGCGAATGTCATTGAGTGCTCTTTTGTTGCTTCACAGGTGACAGAGTTAGCTTTCT
TTGCAACCAAAGTGCGTCTTGGACGTACAGGAGCAGAGGAAGTGTTTCAGCTTGGGCCCT
TGAACGAATACGAAAGGGTTGGTCTGGAGAAAGCAAAAGAAGAACTAGCTGGAAGTATTC
AGAAAGGTGTCGACTTCATCAGGAAATGAAATTAAGAA*AATCACAGAGAGAGAACAATA
AGATCTTCTTCCTTCCTAAAATCATA**TGATCATGTACTACTACTACTCACTCATCATG
CCTATGTCCTGCTTTCT*CTTCTTCTTCAACTTTGTAAAAAAAATGTTTGTATAACTCTG
TCCCTTCTCTT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2BQ78JQ 738 0 0
TCTACTGTTGCTATTGCTGCTGAAGTTTTCAAGAAAGCTGGGACTTATGATCCTAAGAAG
CTCCTTGGTGTTACTACACTCGATGTTGCTCGTGCCAATACATTTATGGCTGAAGTTCTT
GGCCTTGATCCAAGAGAAGTTGATGTACCAGTGGTTGGAGGACACGCTGGAGTCACAATC
TTGCCACTGTTGTCACAGGTTAAACCTCCTAGCAGCTTCACACAATCAGAGATTGAGTAC
CTCACGAACCGGATTCAAAATGGTGGAACTGAAGTTGTGGAGGCAAAAGCTGGAGCTGGA
TCTGCAACACTTTCAATGGCATATGCTGCAGCAAAGTTTGCAGATGCTTGCCTTCGCGGG
TTGAGAGGAGATGCGAATGTCATTGAGTGCTCTTTTGTTGCTTCACAGGTGACAGAGTTA
GCTTTCTTTGCAACCAAAGTGCGTCTTGGACGTACAGGAGCAGAGGAAGTGTTTCAGCTT
GGGCCCTTGAACGAATACGAAAGGGTTGGTCTGGAGAAAGCAAAAGAAGAACTAGCTGGA
AGTATTCAGAAAGGTGTCGACTTCATCAGGAAATGAAATTAAGAA*AATCACAGAGAGAG
AACAATAAGATCTTCTTCCTTCCTAAAATCATA**TGATCATGTACTACTACTACTCACT
CATCATGCCTATGTCCTGCTTTCTTCTTCTTCTTCAACTTTGTAAAAAAAATGTTTGTAT
AACTCTGTCCCTTTTCTT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2AR63JQ 834 0 0
CACTATGTGAAGGAGTAGCCAAATGCTGTCCTAATGCTATTGTCAACTTGATTAGTAACC
CTGTGAACTCTACTGTTGCTATTGCTGCTGAAGTTTTCAAGAAAGCTGGGACTTATGATC
CTAAGAAGCTCCTTGGTGTTACTACACTCGATGTTGCTCGTGCCAATACATTTGTGGCTG
AAGTTCTTGGCCTTGATCCAAGAGAAGTTGATGTACCAGTGGTTGGAGGACACGCTGGAG
TCACAATCTTGCCACTGTTGTCACAGGTTAAACCTCCTAGCAGCTTCACACAATCAGAGA
TTGAGTACCTCACGAACCGGATTCAAAATGGTGGAACTGAAGTTGTGGAGGCAAAAGCTG
GAGCTGGATCTGCAACACTTTCAATGGCATATGCTGCAGCAAAGTTTGCAGATGCTTGCC
TTCGCGGGTTGAGAGGAGATGCGAATGTCATTGAGTGCTCTTTTGTTGCTTCACAGGTGA
CAGAGTTAGCTTTCTTTGCAACCAAAGTGCGTCTTGGACGTACAGGAGCAGAGGAAGTGT
TTCAGCTTGGGCCCTTGAACGAATACGAAAGGGTTGGTCTGGAGAAAGCAAAAGAAGAAC
TAGCTGGAAGTATTCAGAAAGGTGTCGACTTCATCAGGAAATGAAATTAAGAA*AATCAC
AGAGAGAGAACAATAAGATCTTCTTCCTTCCTAAAATCATA**TGATCATGTACTACTAC
TACTCACTCATCATGCCTATGTCCTGCTTTCTTCTTCTTCTTCAACTTTGTAAAAAAAAT
GTTTGTATAACTCTGTCCCTTCTCTTAAACGCACTTCTCTATGGGTTTATGATG

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR2A383JQ 773 0 0
TGTGAACTCTACTGTTGCTATTGCTGCTGAAGTTTTCAAGAAAGCTGGGACTTATGATCC
TAAGAAGCTCCTTGGTGTTACTACACTCGATGTTGCTCGTGCCAATACATTTGTGGCTGA
AGTTCTTGGCCTTGATCCAAGAGAAGTTGATGTACCAGTGGTTGGAGGACACGCTGGAGT
CACAATCTTGCCACTGTTGTCACAGGTTAAACCTCCTAGCAGCTTCACACAATCAGAGAT
TGAGTACCTCACGAACCGGATTCAAAATGGTGGAACTGAAGTTGTGGAGGCAAAAGCTGG
AGCTGGATCTGCAACACTTTCAATGGCATATGCTGCAGCAAAGTTTGCAGATGCTTGCCT
TCGCGGGTTGAGAGGAGATGCGAATGTCATTGAGTGCTCTTTTGTTGCTTCACAGGTGAC
AGAGTTAGCTTTCTTTGCAACCAAAGTGCGTCTTGGACGTACAGGAGCAGAGGAAGTGTT
TCAGCTTGGGCCCTTGAACGAATACGAAAGGGTTGGTCTGGAGAAAGCAAAAGAAGAACT
AGCTGGAAGTATTCAGAAAGGTGTCGACTTCATCAGGAAATGAAATTAAGAA*AATCACA
GAGAGAGAACAATAAGATCTTCTTCCTTCCTAAAATCATA**TGATCATGTACTACTACT
ACTCACTCATCATGCCTATGTCCTGCTTTCTTCTTCTTCTTCAACTTTGTAAAAAAAATG
TTTGTATAACTCTGTCCCTTCTCTTAAACGCACTTCTCTATGGGTTTATGATG

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 24

CO CL56Contig1 852 24 24 U
GGAAAATCTCTTCTAACAAGGATTTTCAAAGCAGCAACAGAAAAAAA*TGGCTCAAGCAA
TGACTTCGATGGCTGGTCTACGTGGTGCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACC
GTCTGAACATCTCTAGAGTCACCGTTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTC
AGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTG
GTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAG
TTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAA
GAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAG
CTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACA
AAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGAACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTAC
GATCTTAACACCGTTATCTCCGCTAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTC
ACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGC
CCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAG
ATCGGCTAAGGAAGAAAGATTTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGT
ACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCTTTCTGATCAAATCGGTTATATTTAATTTCAGTTT
CAAGTTTTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 40 45 45 45 45 55 65 65 65 65 65 60 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 70 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 60 90 90 90 90 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 45 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 5 97 97 97 15 97 97 97 97 90 97 70 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 90 97 90 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 95 95 95 90 85 85 85 85 80 80 80 75 75 70 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 40 35 35 35 30 

AF RR2D357TF U 16
AF RR2GI21TF U 1
AF RR2BY82TF U 20
AF RR2FK35TF U 508
AF RR2AZ07TFB U 31
AF RR2AT24TF U 20
AF RR2G072TF U 20
AF RR2D756JQ C 20
AF RR2D756TF U 20
AF RR2FO49TF U 353
AF RR2DW48TF U 373
AF RR2DV45TF U 266
AF RR2FH58TF U 25
AF RR2GG82TF U 31
AF RR2DG83TF U 26
AF RR2D357JQ C 284
AF RR2E012TF U 57
AF RR2B720JQ C 27
AF RR2GI21JQB C 405
AF RR2GG82JQB C 288
AF RR2G841JQ C 276
AF RR2AZ07JQ C 38
AF RR2DG83JQ C 155
AF RR2B720TF U 27
BS 1 19 RR2GI21TF
BS 20 21 RR2AT24TF
BS 22 32 RR2GI21TF
BS 33 33 RR2AT24TF
BS 34 255 RR2GI21TF
BS 256 256 RR2AT24TF
BS 257 431 RR2GI21TF
BS 432 432 RR2AT24TF
BS 433 506 RR2GI21TF
BS 507 507 RR2AT24TF
BS 508 567 RR2GI21TF
BS 568 568 RR2AT24TF
BS 569 703 RR2GI21TF
BS 704 704 RR2AT24TF
BS 705 715 RR2GI21TF
BS 716 725 RR2AT24TF
BS 726 726 RR2G072TF
BS 727 729 RR2AT24TF
BS 730 730 RR2FO49TF
BS 731 798 RR2AT24TF
BS 799 818 RR2FO49TF
BS 819 829 RR2DW48TF
BS 830 834 RR2DV45TF
BS 835 852 RR2B720TF

RD RR2D357TF 623 0 0
GGAATT
ATTTTCAAAGCAGCAACAGAAAAAAA*TGGCTCAAGCAATGACTTCGATGGCTGGTCTAC
GTGGTGCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTGAACATCTCTAGAGTCA
CCGTTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGG
AAAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCG
TTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTT
CCGGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGA
AAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAAT
CTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAAGCGTGGCCTTACGTT
CAGAATGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCC
GCTAAGCCTAAG*AAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACC
ATCGACAACCTGGACTA

QA 7 623 7 623
DS 

RD RR2GI21TF 715 0 0
GGAAAATCTCTTCTAACAATTATTTTCAAAGCGGCAACAGAAAAAAA*TGGCTCAAGCAA
TGACTTCGATGGCTGGTCTACGTGGTGCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACC
GTCTGAACATCTCTAGAGTCACCGTTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTC
AGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTG
GTTTAGTCGGTGGTTTGTTCGTTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAG
TTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAA
GAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAG
CTGCAGCTAGGACCAAAGAATCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACA
AAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGAATGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTAC
GATCTTAACACCGTTATCTCCGCTAAGTCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTC
ACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGC
CCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGA*CAATGTTCTTG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2BY82TF 698 0 0
TTT
TTTTCAAAGCAGCAACAGAAAAAAA*TGGCTCAAGCAATGACTTCGATGGCTGGTCTACG
TGGTGCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTGAACATCTCTAGAGTCAC
CGTTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGA
AAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGT
TAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTC
CGGCGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAA
AGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATC
TGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTC
AGAATGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCG
CTAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCA
TCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTAT*ACT
CAGAAACTGTCTCGAGTTTGAACA
TGTCCTGCCAG

QA 4 687 4 687
DS 

RD RR2FK35TF 175 0 0
GATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCTAAG
CCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGAC
AACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACT

QA 1 175 1 175
DS 

RD RR2AZ07TFB 695 0 0
GG
AGCAACAGAAAAAAA*TGGCTCAAGCAATGACTTCGATGGGTGGTCTACGTGGTGGATCT
CAGGGTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTGAACATCTCTAGAGTCACCGTTGGGTCT
AAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGTAGTCGC
CGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCC
TTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTA
CCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTT
TACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCTGCTAAAGAG
ATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGAACGATCT
CCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCTAAGCCTAA
GGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCT
GGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGT
CTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGG

QA 3 695 3 695
DS 

RD RR2AT24TF 779 0 0
GGATTTTCAAAGCAGCAACAGAAAAAAA*TGGCTCAAGCAATGACTTCGATGGCTGGTCT
ACGTGGTGCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTGAACATCTCTAGAGT
CACCGTTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCC
GGAAAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTT
CGTTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCC
TTCCGGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACT
GAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGA
GCCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACG
TTCAGAACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCT
CCGCCAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAA
CCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATT
ACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGTTAAAGAAGAAAGA
TTTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2G072TF 774 0 0
GGATTTTCAAAGCAGCAACAGAAAAAAAATGGCTCAAGCAATGACTTCGATGGCTGGTCT
ACGTGGTTCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTGAACATCTCTAGAGT
CACCGTTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCC
GGAAAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTT
CGTTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCC
TTCCGGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACT
GAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGA
ATCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACG
TTCAGAACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCT
CCGCTAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAA
CCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATT
ACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGCTAA*GAAGAAAGA
TTTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCCA*GTACTATTGTCTT
AA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2D756JQ 781 0 0
GGATTTTCAAAGCAGCAACAGAAAAAAA*TGGCTCAAGCAATGACTTCGATGGCTGGTCT
ACGTGGTGCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTGAACATCTCTAGAGT
CACCGTTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCC
GGAAAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTT
CGTTAAGTCTTCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCC
TTCCGGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACT
GAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGA
ATCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGAT**ACAAAAAA*GCGTGGCCTTACG
TTCAGAACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATTT
CCGCTAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAA
CCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATT
ACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGCTAAGGAAGAAAGA
TTTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCC
T

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2D756TF 768 0 0
GGATTTTCAAAGCAGCAACAGAAAAAAA*TGGCTCAAGCAATGACTTCGATGGCTGGTCT
ACGTGGTGCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTGAACATCTCTAGAGT
CACCGTTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCC
GGAAAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTT
CGTTAAGTCTTCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCC
TTCCGGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACT
GAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGA
ATCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGAT**ACAAAAAA*GCGTGGCCTTACG
TTCAGAACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCT
CCGCTAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAA
CCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATT
ACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGCTAA*GAAGAA*GA
TTTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGCTAT*ACTATC*AAGTACTATTG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2FO49TF 466 0 0
CCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACC
AACACAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAGTCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTT
GATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAAAACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACC
TCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCCAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCA
AAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAA
AGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTC
TTGCCAAGATCGGTTAAGGAAGAAAGATTTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGCTATTACT
ATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCTTTCTGATCAAAT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR2DW48TF 458 0 0
G
GAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGC
CAAAGAATCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGC
CTTACGTTCAGAACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCG
TTATCTCCGCTAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCT
TCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGA
AGTATTACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGCTAAGGAA
GAAAGATTTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTC
TCCTCCTCTTCCTTTCTGATCAAATCGGTTATATTT
T

QA 2 457 2 457
DS 

RD RR2DV45TF 569 0 0
GTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGG
TGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGA
CAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCTGC
TAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGA
ATGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCTA
AGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCG
ACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAG
AAACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGTTAAGGAAGAAAGATCTGCT
CTGTAATGTATTGCTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCC
TTTCTGATCAAATCGGTTATATTTAATTT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2FH58TF 790 0 0
GGA
AAAGCAGCAACAGAAAAAAA*CGGCTCAAGCAATGACTTCGATGGCTGGTCTACGTGGTG
CATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTGAACATCTCTAGAGTCACCGTTG
GGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGTA
GTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGT
CTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTG
GTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACA
GGTTTTACTTACAGCCATTGTCGCCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAGTCTGCTA
AAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGAAC
GATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCCAAG
CCTAAGGAATAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGAC
AACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAA
ACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGTTAA*GAAGAA*GATTTGCTCT
GTAATGTATTGTTGTTGCTAT*ACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTC
TCTCTTCTTTCTGATCAAT

QA 4 771 4 771
DS 

RD RR2GG82TF 771 0 0
GG
AGCAACAGAAAAAAA*TGGCTCAAGCAATGACTTCGATGGCTGGTCTACGTGGTGCATCT
CAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTGAACATCTCTAGAGTCACCGTTGGGTCT
AAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGTAGTCGC
CGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCCGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCC
TTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTA
CCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTT
TACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAGTCTGCTAAAGAG
AACATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGAACGATCT
CCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCCAAGCCTAA
GGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCT
GGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGT
CTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGTTAA*GAAGAA*GATTTGCTCTGTAAT
GTATTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTC

QA 3 771 3 771
DS 

RD RR2DG83TF 761 0 0
GG
AAAGCAGCAACAGAAAAAAA*TGGCTCAAGCAATGACTTCGATGGCTGGTCTACGTGGTG
CATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTGAACATCTCTAGAGTCACCGTTG
GGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGTA
GTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCATTAAGT
CTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTG
GTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACA
GGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCTGCTA
AAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGAAC
GATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCTAAG
CCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGAC
AACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAA
ACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGCTAA*GAAGAAAGATTTGCTCT
GTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATT

QA 3 761 3 761
DS 

RD RR2D357JQ 508 0 0
AGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACAGA
TAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCC
ATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATTTGCTAAAGAGATCATTAACGT
TAAGTCTTTGATCGACAAAAAAAGCGTGGCCTTACGTTCAGAATGATCTCCGTTTAAGAG
CATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATTTCCGCTAAGCCTAAGGAAGAGAAAC
AGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGTTTTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGG
GGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGA
ACAATGTTCTTGCCAAGATCGGTTAAGGAAGAAAGATTTGCTCTGTAATGTATTGTTGTT
GCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCT
C

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2E012TF 762 0 0
GCAATGACTTCGATGGCTGGTCTACGTGGTGCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCA
AACCGTCTGAACATCTCTAGAGTCACCGTTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGG
GCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCG
GCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATT
AAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAA
GCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACA
GAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATC
GACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGAACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCG
TTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCTAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGA
ACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAGCCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAG
CAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGC
CAAGATCGGCTAA*GAAGAAAGATTTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCC
AAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCTTTCTGATCAAAT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2B720JQ 826 0 0
CAAAGCAGCAACAGAAAAAAA*TGGCTCAAGCAATGACTTCGATGGCTGGTCTACGTGGT
GCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCCGAACATCTCTAGAGTCACCGTT
GGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGT
AGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAG
TCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGT
GGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGAC
AGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCTGCT
AAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGAA
CGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCTAA
GCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGA
CAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTTTTACTCAGA
AACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGCTAAGGAAGAAAGATTTGCTC
TGTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCT
TTCTGATCAAATCGGTTATATTTAATTTCAGTTTCAAGTTTTAGCC

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2GI21JQB 448 0 0
TTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGACCAAAGAATCTGCTAAAGAGATCATTAACGTT
AAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGAATGATCTCCGTTTAAGAGC
ATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATTTCCGCTAAGTCTAAGGAAGAGAAACA
GAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGTTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGC
GAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGAA
CAATGTTCTTGCCAAGATCGGTTAAGGAAGAAAGATTTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTG
CTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCTTTCTGATCAAATCGGTTA
TATTTAATTTCAGTTTCAGGTTTTAGCC

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR2GG82JQB 565 0 0
CTTGGGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACAGATAAT
TCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTG
TCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAGTCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAG
TCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGAACGATTTCCGTTTAAGAGCATC
GTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATTTCCGCCAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAG
CCTCAAAGAACTCACCGGCAAGTTTTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAG
GTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTATTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGAACAA
TGTTCTTGCCAAGATCGGTTAAGGAAGAAAGATTTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGCTA
TTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCTTTCTGATCAAATCGGTTATAT
TTAATTTCAGTTTCAAGTTTTAGCC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2G841JQ 576 0 0
GCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCT
GGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTAC
TTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCTGCTAAAGAGATC
ATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGAATGATCTCCG
TTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCTTTATCTCCGCTAAGCCTAAGGA
AGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGA
CTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTC
GAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGTTAAGGAAGGAAGATTTGCTCTGTAATGTA
TTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCTTTCTGATCA
AATCGGTTATATTTAATTTCAGTTTCAAGTTTTAGC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2AZ07JQ 811 0 0
CAGAAAAAAA*TGGCTCAAGCAATGACTTCGATGGCTGGTCTACGTGGTGCATCTCAGGC
TCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTGAACATCTCTAGAGTCACCGTTGGGTCTAAGAG
AACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGTAGTCGCCGGTC
TGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCCTTCGC
CACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGG
AACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTT
ACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATTTGCTAAAGAGATCAT
TAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGAACGATCTCCGTT
TAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATTTCCGCTAAGCCTAAGGAAG
AGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACT
ATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTCGA
GTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGCTAAGGAAGAAAGATTTGCTCTGTAATGTATT
GTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCTTTCTGATCAAA
TCGGTTATATTTAATTTCAGTTTCAAGTTTT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2DG83JQ 693 0 0
GAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGTAGTCGCCG
GTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCATTAAGTCTGCCTT
CGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACC
TGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTA
CTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCTGCTAAAGAGAT
CATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGAACGATCTCC
GTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATTTCCGCTAAGCCTAAGG
AAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCTGG
ACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCT
CGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGCTAAGGAAGAAAGATTTGCTCTGTAATGT
ATTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCCTTCTGATC
AAATCGGTTATATTTAATTTCAGTTTCAAGTTT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2B720TF 826 0 0
CAAAGCAGCAACAGAAAAAAA*TGGCTCAAGCAATGACTTCGATGGCTGGTCTACGTGGT
GCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCCGAACATCTCTAGAGTCACCGTT
GGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGT
AGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAG
TCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGT
GGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGAC
AGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCTGCT
AAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAA*GCGTGGCCTTACGTTCAGAA
CGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCTAA
GCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGA
CAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTTTTACTCAGA
AACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGCTAAAGAAGAAAGATTTGCTC
TGTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCT
TTCTGATCAAATCGGTTATATTTAATTTCAGTTTCAAGTTTTAGCC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 3 25

CO CL57Contig1 650 4 4 U
GAGACCGCCATAGCGTCTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAG
GTTAAACACGAGGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCAC
CGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGG
AAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTACTGAAGGAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAG
GAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAG
CCTGAAGATGCTCCACCGGCACCGGTTGTCGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCG
GAGAAGAAGGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACT
GTGGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAAATCATGATGTGTTCT
TGTGTTGAATGATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGT
TGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTGTTGTATATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATG
ATTATTTTCATTTTCCCTTAAAACATTGATTTAGGTGTCCCAATATATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B637JQ C 1
AF RR2B637TF U 1
AF RR2B636JQ C 94
AF RR2B636TF U 94
BS 1 406 RR2B637TF
BS 407 407 RR2B636TF
BS 408 601 RR2B637TF
BS 602 650 RR2B636TF

RD RR2B637JQ 601 0 0
GAGACCGCCATAGCGTCTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAG
GTTAAACACGAGGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCAC
CGCAGCGACAGCTTTTCAAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGG
AAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTACTGAAGGAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAG
GAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAG
CCTGAAGATGCTCCACCGGCACCGGTTGTCGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCG
GAGAAGAAGGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGCTGCCATCCCAAGACT
GTGGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAAATCATGATGTGTTCT
TGTGTTGAATGATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGT
TGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTGTTGTATATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATG
A

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2B637TF 601 0 0
GAGACCGCCATAGCGTCTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAG
GTTAAACACGAGGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCAC
CGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGG
AAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTACTGAAGGAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAG
GAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAG
CCTGAAGATGCTCCACCGGCACCGGTTGTCGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCG
GAGAAGAAGGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGCTGCCATCCCAAGACT
GTGGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAAATCATGATGTGTTCT
TGTGTTGAATGATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGT
TGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTGTTGTATATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATG
A

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2B636JQ 557 0 0
G
ATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTCAAGCGAGG
AAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGTAGGTAACTACTG
AAGGAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGT
AGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCGGCACCGGTTGTCGCTC
CTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGA
AGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTGGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATT
AAAGATATGAAATCATGATGTGTTCTTGTGTTGAATGATGATCATCTTTTGCTTTTGTGT
TGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTGTTGTATAT
GATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATGATTATTTTCATTTTCCCTTAAAACATTGATTTAG
GTGTCCCAATATATCC

QA 2 557 2 557
DS 

RD RR2B636TF 557 0 0
G
ATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTCAAGCGAGG
AAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGTAGGTAACTACTG
AAGGAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGT
AGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCGGCACCGGTTGTCGCTC
CTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGA
AGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTGGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATT
AAAGATATGAAATCATGATGTGTTCTTGTGTTGAATGATGATCATCTTTTGCTTTTGTGT
TGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTGTTGTATAT
GATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATGATTATTTTCATTTTCCCTTAAAACATTGATTTAG
GTGTCCCAATATATCC

QA 2 557 2 557
DS 



CO CL57Contig2 837 3 4 U
GGATCATTCGTCTCTTACAAATCATCTTAAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCATCA
GCAGAGCAAACAAAACTTTTTTCTCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGG
TGCCAAAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTTACAGATCGCGGAC
TGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGT
CTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAG
AAGAAGAGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAA
GCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGA
AGAAGGTAACTACCGAAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGG
ATAAGTTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCTACTCCAGCCG
CACCGGTTGTCGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCCGCGGAGAAGAAGGGGATCTTGG
AGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGG
ATAAGGATGATCATTAAAGATATGAAATCATGATGTGTTCTTTGTGTTGAATGATGATCA
TCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGGAAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTC
AGCTTTTCCTTGTTATGTGTTGTATATGATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATGA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK69TF U -1
AF RR2DN27TF U 1
AF RR2DN27JQ C 357
BS 1 175 RR2DN27TF
BS 176 176 RR2GK69TF
BS 177 587 RR2DN27TF
BS 588 837 RR2DN27JQ

RD RR2GK69TF 303 0 0
GGAT
ATCATTCGTCTCTTACAAATCATCTTAAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGC
AGAGCAAACAAAACTTTTTTCTCGATATCTT**GCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTG
CCAAAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTTACAGATCGCGGACTG
TTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAGG*TGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCT
GA*TTTGAGCAAAAGGT*CACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAGGT*AAACACGAGGAAGA

QA 5 303 5 303
DS 

RD RR2DN27TF 587 0 0
GGATCATTCGTCTCTTACAAATCATCTTAAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCATCA
GCAGAGCAAACAAAACTTTTTTCTCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGG
TGCCAAAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTTACAGATCGTGGAC
TGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGT
CTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAG
AAGAAGAGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAA
GCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGA
AGAAGGTAACTACCGAAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGG
ATAAGTTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCTACTCCAGCCG
CACCGGTTGTCGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCCGCGGAGAAG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2DN27JQ 481 0 0
TCAAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGAC
AAGAAGAAGGTAACTACCGAAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTT
ATGGATAAGTTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCTACTCCA
GCCGCACCGGTTGTCGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAGGGGATC
TTGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAG
AAGGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAAATCATGATGTGTTCTTTGTGTTGAATGATG
ATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGGAAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGA
TTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTGTTGTATATGATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATG
A

QA 1 481 1 481
DS 



CO CL57Contig3 854 18 14 U
GGATCATTCGTCTCTTACAAATCATCTTAAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCATCA
GCAGAGCAAACAAAACTTTTTTCTCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGG
TGCCAAAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGAC
TGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGT
CTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCAGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAG
AAGAAGAAGAGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTT
CAAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACA
AGAAGAAGGTAACTAGTGAAGGAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGT
TTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCT***C
CACCCGCACCGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAA*GGGG
ATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAA
AAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAAATCATGATGTGTTCTT*GTGTTGAATG
ATATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGGAAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTT
GTTGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTGTTGTATATGATGATTTCAAAGGTGTTTTAATG
GTATGATTATTTTC


BQ
20 20 25 25 25 40 40 40 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 55 55 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 45 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 75 75 75 75 60 75 75 75 75 60 75 75 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 35 45 85 85 85 85 85 85 85 45 45 45 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 45 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 45 
70 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 75 90 90 90 90 90 75 90 
90 90 75 90 90 90 90 90 85 85 45 85 85 50 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 70 80 65 75 75 75 75 75 75 75 75 70 65 65 
65 35 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 25 65 
65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG28TF U 4
AF RR2FW79TF U 8
AF RR2FI22TF U 1
AF RR2FZ67TF U 1
AF RR2G467TF U -1
AF RR2G732TF U 1
AF RR2EF65TF U 5
AF RR2BA24TF U 8
AF RR2B806TF U 4
AF RR2FC47TF U 26
AF RR2BA24JQ C 9
AF RR2FI22JQ C 329
AF RR2C233JQ C 327
AF RR2EF65JQ C 563
AF RR2C233TF U 327
AF RR2FC47JQ C 270
AF RR2GK69JQ C 294
AF RR2FW79JQ C 96
BS 1 273 RR2FI22TF
BS 274 274 RR2FZ67TF
BS 275 378 RR2FI22TF
BS 379 379 RR2FZ67TF
BS 380 382 RR2FI22TF
BS 383 383 RR2FZ67TF
BS 384 405 RR2FI22TF
BS 406 406 RR2FZ67TF
BS 407 612 RR2FI22TF
BS 613 653 RR2FZ67TF
BS 654 662 RR2G732TF
BS 663 825 RR2B806TF
BS 826 846 RR2C233TF
BS 847 854 RR2BA24JQ

RD RR2GG28TF 312 0 0
GG
ATTCGTCTCTTACAAATCATCTTAAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCAGA
GCAAACAAAACTTTTTTCTCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCA
AAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTC
GATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAG
TTTGAGCAAAAGGT*CACGTCTCAGAGCCGGCGCCTGAGGT*AAACACGAGGAAGAAGAA
GAAGAGAAGA

QA 3 312 3 312
DS 

RD RR2FW79TF 375 0 0
GG
GTCTCTTACAAATCATCTTAAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCAGAGCAA
ACAAAACTTTTTTCTCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCAAAGG
TAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTCGATT
TCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAGTTTG
AGCAAAAGGTTCACGTCTCAGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAGAAGAAGAAG
AGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCA*GCTCCT
CAAGCGAGGAAGA

QA 3 375 3 375
DS 

RD RR2FI22TF 612 0 0
GGATCATTCGTCTCTTACAAATCATCTTAAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCATCA
GCAGAGCAAACAAAACTTTTTTCTCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGG
TGCCAAAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGAC
TGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGT
CTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCAGAGCTGGCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAG
AAGAAGAAGAGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTT
CAAGCTCCTCAAGCGAGGTAGATGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAGGAAGAAGAAGGACA
AGAAGAAGGTAACTAGTGAAGGAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGT
TTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCT***C
CACCCGCACCGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAA*GGGG
ATCTTGGAGAAG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2FZ67TF 653 0 0
GGATCATTCGTCTCTTACAAATCATCTTAAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCATCA
GCAGAGCAAACAAAACTTTTTTCTCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGG
TGCCAAAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGAC
TGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGGTGAAACAAAACCAGAG***ACCGCCATAGCGT
CTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCAGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAG
AAGAAGAAGAGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTT
CAAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACA
AGAAGAAGGTAACTAGTGAAGGAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGT
TTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCT***C
CACCCGCACCGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAA*GGGG
ATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2G467TF 653 0 0
GGAT
ATCATTCGTCTCTTACAAATCATCTTAAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCTTCAGC
AGAGCAAACAAAACTTTTTTCTCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTG
CCAAAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTG
TTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCT
GAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCGGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAGAA
GAAGAAGAGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCA
AGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAG
AAGAAGGTAACTACTGAAGGAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGTAGAAGAAAGGGTTT
ATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCT***CCA
CCGGCACCGGTTGTCGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAA*GGGGAT
CTTG*AGAAGATTAAAGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTG

QA 5 653 5 653
DS 

RD RR2G732TF 662 0 0
GGATCATTCGTCTCTTACAAATCATCTTAAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCATCA
GCAGAGCAAACAATACTTTTTTCTCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGG
TGCCAAAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCGGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGAC
TGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGT
CTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCAGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAG
AAGAAGAAGAGAAGAAGCACCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTT
CAAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGGAGAGGAAGAAGAAGAAGGACA
AGAAGAAGGTAACTAGTGAAGGAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGT
TTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCT***C
CACTCGCACCGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAA*GGGG
ATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAA
AA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2EF65TF 657 0 0
G
ATTCGTCTCTTACAAATCATCTTAAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCAGA
GCAAACAAAACTTTTTTCTTGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCA
AAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTC
GATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCAGAGCGTCTGAG
TTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCAGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAGAAGAA
GAAGAGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGC
TCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAG
AAGGTAACTAGTGAAGGAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATG
GATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCT***CCACCC
GCACCGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAA*AGGGATCTT
GGAGAAGATTAAAGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACCGTAGAGGAGGAAA

QA 2 657 2 657
DS 

RD RR2BA24TF 761 0 0
GG
GTCTCTTACAAATCATCTTAAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCAGAGCAA
ACAAAACTTTTTTCTCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCAAAGG
TAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTCGATT
TCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAGTTTG
AGCAAAAGGTTCACGTCTCAGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAGAAGAAGAAG
AGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCT
CAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGG
TAACTAGTGAAGGAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATA
AGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCT***CCACCCGCAC
CGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAAGGGGATCTTGGAG
AAGATTAAAGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAATGAT
AAG*ATGATCATTAAAGATATGAAATCATGATGTGTTCTT*GTGTTGAATGATATGATCA
TCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGTAAGTTTGTTGGCTTTTT

QA 3 761 3 761
DS 

RD RR2B806TF 822 0 0
GG
ATTCGTCTCTTACAAATCATCTTAAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCAGA
GCAAACAAAACTTTTTTCTCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCA
AAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTC
GATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAG
TTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCAGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAGAAGAA
GAAGAGGAGAAGCATCATAATCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGC
TCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAG
AAGGTAACTAGTGAAGGAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATG
GATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCT***CCACCC
GCACCGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAA*GGGGATCTT
GGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAA
GGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAAATCATGATGTGTTCTT*GTGTTGAATGATATG
ATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGGAAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGA
TTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTGTTGTATATGATGATTTC

QA 3 822 3 822
DS 

RD RR2FC47TF 800 0 0
GGG
AAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCAGAGCAAACAAAACTTTTTTCTCGAT
AACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCAAAGGTAGAGTCGGAGGAATCATC
AGCAGCGGCCACAGAGGTTACAGATCGTGGACTGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGA
TGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTC
GGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAGCATCATAGTCT
CCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGA
AGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTACCGAAGGAG***A
GGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGTTGAAGGAGAAGCTTCC
TGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCTACTCCAGCCGCACCGGTTGTCGCTCCTCCGGT
GGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAA*GGGGATCTTGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTC
CAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAAGATAAGGATGATCATTAAAGAT
ATGAAATCATGATGTGTTCTTTGTGTTGAATGAT**GATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGT
TGGAAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTG
TTGTATATGATGATTTC

QA 4 800 4 800
DS 

RD RR2BA24JQ 846 0 0
G
GTCTCTTACAAATCATCTTAAGTATACTTTGATCGTTTCGTATTCTCATCAGCAGAGCAA
ACAAAACTTTTTTCTCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCAAAGG
TAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCGGCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTCGATT
TCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACAAAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAGTTTG
AGCAAAAGGTTCACGTCTCAGAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAGAAGAAGAAG
AGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCT
CAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGG
TAACTAGTGAAGGAGGAGAGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATA
AGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCT***CCACCCGCAC
CGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAA*GGGGATCTTGGAG
AAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGAT
AAGGATGATCATTAAAGATATGAAATCATGATGTGTTCTT*GTGTTGAATGATATGATCA
TCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGTAAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTC
AGCTTTTCCTTGTTATGTGTTGTATATGATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATGATTA
TTTTC

QA 2 846 2 846
DS 

RD RR2FI22JQ 518 0 0
CCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTCAAGCGAGGTAGATGGCGA
AGATGGTGTGAAGAGGAGGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTAGTGAAGGAGGAGA
GGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCC
TGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCT***CCACCCGCACCGGTTGTTGCTCCTCCGGT
GGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAA*GGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTC
CAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGAT
ATGAAATCATGATGTGTTCTT*GTGTTGAATGATATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGT
TGGAAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTG
TTGTATATGATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATGA

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2C233JQ 520 0 0
G
TCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCAACAGCTCTTCAAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCG
AAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTAGTGAAGGAGGAG
AGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTC
CTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCT***CCACCCGCACCGGTTGTTGCTCCTCCGG
TGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAA*GGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTT
CCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGA
TATGAAATCATGATGTGTTCTT*GTGTTGAATGATATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTG
TTGGAAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGT
GTTGTATATGATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATGA

QA 2 520 2 520
DS 

RD RR2EF65JQ 284 0 0
TCCGGTGGAGGAAGGGCATCCGGCGGAGAAGAA*GGGGATTTTGGAGAAGATTAAGGAGA
AGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACCGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATT
AAAGATATGAAATCATGATGTGTTTTT*GTGTTGAATGATATGATCATTTTTTGCTTTTG
TGTTGTTGGAAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCCGCTTTTCCTTGT
TATGTGTTGTATATGATGATTTCAAAGGGGTTTTAATGGTATGA

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2C233TF 520 0 0
G
TCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCAACAGCTCTTCAAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCG
AAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTAGTGAAGGAGGAG
AGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTC
CTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCT***CCACCCGCACCGGTTGTTGCTCCTCCGG
TGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAA*GGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTT
CCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGA
TATGAAATCATGATGTGTTCTT*GTGTTGAATGATATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTG
TTGGAAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGT
GTTGTATATGATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATGA

QA 2 520 2 520
DS 

RD RR2FC47JQ 577 0 0
GAGCCGGCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAGCATCATAGTCTC
CTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAA
GATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTACCGAAGGAG***AG
GTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGTTGAAGGAGAAGCTTCCT
GGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCTACTCCAGCCGCACCGGTTGTCGCTCCTCCGGTG
GAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAA*GGGGATCTTGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCC
AGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATA
TGAAATCATGATGTGTTCTTTGTGTTGAATGAT**GATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTT
GGAAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTGT
TGTATATGATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATGA

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2GK69JQ 553 0 0
GAGGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGCAGCGAC
AGCTCTTCAAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAG
AAGGACAAGAAGAAGGTAACTACCGAAGGAG***AGGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAG
AAAGGGTTTATGGATAAGTTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGAT
GCTACTCCAGCCGCACCGGTTGTCGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAG
AA*GGGGATCTTGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAG*
GGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAAATCATGATGTGTTCTTTGTG
TTGAATGAT**GATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGGAAGTTTGTTGGCTTTTTATTAT
TTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTGTTGTATATGATGATTTCAAAGGTGT
TTTAATGGTATGA

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2FW79JQ 751 0 0
GCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGGTGCCAAAGGTAGAGTCGGAGGAATCATCAGCAGCG
GCCACAGAGGTCACAGATCGTGGACTGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAAGATGAAACA
AAACCAGAGGAGACCGCCATAGCGTCTGAGTTTGAGCAAAAGGTTCACGTCTCAGAGCCG
GCGCCTGAGGTTAAACACGAGGAAGAAGAAGAAGAGAAGAAGCATCATAGTCTCCTCGAG
AAGCTTCACCGCAGCGACAGCTCTTCAAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGCGAAGATGGT
GTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGGTGACTAGTGAAGGAGGAGAGGTGAAG
ACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACAC
GGGAAGAAGCCTGAAGATGCT***CCACCCGCACCGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAA
GCGCATCCGGCGGAGAAGA**GGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGCTA
CCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAAAT
CATGATGTGTTCTT*GTGTTGAATGATATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGGAAGT
TTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTGTTGTATA
TGATGATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATGA

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 25

CO CL58Contig1 700 25 7 U
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATG
GTCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCC
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACA
AGGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTA
GCAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGT
GGCTCAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGA
GCTTCACTACTATGAATCTACTTTTTAACTTTTGCTCAAA


BQ
75 90 90 90 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 45 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 95 97 97 
97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 65 90 90 90 90 97 90 90 75 
97 90 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 75 75 75 75 70 70 60 60 55 50 50 50 50 50 40 40 40 40 30 10 10 10 10 

AF RR2C927TF U 7
AF RR2DK63TF U 1
AF RR2G316JQ C 207
AF RR2ET28JQ C 238
AF RR2C627TF U 1
AF RR2EC23JQ C 207
AF RR2DK63JQ C 64
AF RR2EC23TF U 1
AF RR2AI22TF U 1
AF RR2AP74TF U 1
AF RR2BS68JQ C 1
AF RR2FO42JQ C 185
AF RR2BF28JQ C 75
AF RR2G316TF U 1
AF RR2C803JQ C 1
AF RR2DO37JQ C 1
AF RR2DO37TF U 1
AF RR2C927JQ C 7
AF RR2C803TF U 1
AF RR2DC40TF U 1
AF RR2FO42TF U 2
AF RR2BS68TF U 1
AF RR2H932TF U 2
AF RR2BF28TF U 2
AF RR2ET28TF U 3
BS 1 424 RR2AI22TF
BS 425 425 RR2AP74TF
BS 426 437 RR2AI22TF
BS 438 440 RR2AP74TF
BS 441 691 RR2AI22TF
BS 692 696 RR2BS68TF
BS 697 700 RR2ET28TF

RD RR2C927TF 227 0 0
G
CAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACTACGAAAC
ACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTTAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATGGTCAGAA
CCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCCCGACTCT
GAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGT

QA 2 227 2 227
DS 

RD RR2DK63TF 335 0 0
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATG
GTCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCC
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTCCCTTG***GGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAAGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCAC

QA 1 335 1 335
DS 

RD RR2G316JQ 322 0 0
GGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGCCCAAAAGGGTCAGAACGGCTTAGGG
ACGTTTTTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACAAGGGCCATGGACATGGTAAGTTTTTA
GGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACAAAGGTGATTACGGCCTAGGAACTTTC
ATTAACAATGGAGAGAAGAACCATAAGAAGCAAAATGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAG
GATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTAGCAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTG
AAATGATTTCATAAAGCCTGAT

QA 1 322 1 322
DS 

RD RR2ET28JQ 283 0 0
ATGCCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTTTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTA
ACAAGGGCCATGGACATGGTAAGCTTTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAA
GCAAGGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGGGAGAAGAAACATAAGAAGC
AAAATGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAA
GTAGCAGCGGTAGCGACAGGGACTAACTGAAATGATTTCATAA

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR2C627TF 612 0 0
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATG
GTCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCC
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACA
AGGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTA
GCAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGT
GGCTCAATGCTT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2EC23JQ 422 0 0
GGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGCCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGG
ACGTTTTTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACAAGGGCCATGGACATGGTAAGCTTTTA
GGACAGCCCCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACAAGGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTC
TTTAACAATGGGGAGAAGAAACATAAGAAGCAAAATGGGCACAAGAAGAAGAAGAACAAG
GATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGGGGAAGTAGCAGCGGTAGGGACAGCGACTAACTG
AAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAAAAAGACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATA
CTTAGAATAAAGAGAGACTTATATATTACGATGGGGCTCAATGCTTAGAATAAAACCACT
TA

QA 1 422 1 422
DS 

RD RR2DK63JQ 579 0 0
AAACACGTGGAAAAGAATATTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATGGTC
AGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCCCGA
CTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTCCCTTG***GGCTGTTCAAGGGTAAAAATGCCC
AAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACAAGG
GCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACAAGG
GTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAAATG
AGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTAGCA
GCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAGACT
GTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGTGGC
TCAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2EC23TF 650 0 0
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATG
GTCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCC
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACA
AGGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTA
GCAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGT
GGCTCAATGCTTAGAATAAA*CCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCCGCATG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2AI22TF 691 0 0
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATG
GTCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCC
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACA
AGGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGATCACAAGAAGAAG***AACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTA
GCAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGT
GGCTCAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGA
GCTTCACTACTATGAATCTACTTTTTAACTT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2AP74TF 677 0 0
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATG
GTCGGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGACCCGCCCAGTATATGGGAAAAGCC
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACA
AAGGTGATTACGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAACCATAAGAAGCAAA
ATGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTA
GCAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATAAAGTAAGTA
GACTAAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGA
GCTTCACTACTATGAAT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2BS68JQ 697 0 0
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATATTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATG
GTCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCC
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTTTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGTTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACA
AGGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTA
GCAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGT
GGCTCAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGA
GCTTCACTACTATGAATCTACTTTTTAACTTTTGCT
C

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2FO42JQ 499 0 0
TCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGCCCA
AAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTTTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACGAGGG
CCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCGGAAGAAAGCTCATGAGACAAACAAGGG
TGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAAATGA
GCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTAGCAG
CGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAGACTG
TATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATATTACGATGTGGCT
CAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGAGCTT
CACTACTATGAATCTACTT

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR2BF28JQ 623 0 0
AAAGCATATTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATGGTCAGAACCACCAC
CAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCCCGACTCTGAATTAC
CGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGCCCAAAAGGATCAG
AACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACAAGGGCCATGGACAT
GGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGGCAAACAAGGGTGATTATGGC
CTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAAATGAGCACAAGAAG
AAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTAGCAGCGGTAGCGAC
AGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAGACTGTATAAAGTAA
GTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGTGGCTCAATGCTTAG
AATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGAGCTTCACTACTATG
AATCTACTTTTTAACTTTTGC
AC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2G316TF 681 0 0
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAGTG
GTCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGACCCGCCCAGTATATGGGAAAAGCC
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGGTCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACA
AAGGTGATTACGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAACCATAAGAAGCAAA
ATGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTA
GCAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATAAAGTAAGTA
GACTAAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGA
GCTTCACTACTATGAATCTAC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2C803JQ 663 0 0
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTC*CCAGGCTAATG
GTCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCT
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTTTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACA
AGGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTA
GCAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGT
GGCTCAATGCTTAGAATAAAACCGCTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGA
GCT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2DO37JQ 674 0 0
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAATACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATG
GTCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCC
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTTTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACA
AGGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTA
GCAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGT
GGCTCAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGA
GCTTCACTACTATG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2DO37TF 662 0 0
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAATACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATG
GTCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCC
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACA
AGGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTA
GCAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGT
GGCTCAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGA
GC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2C927JQ 685 0 0
G
CAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACTACGAAAC
ACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTTAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATGGTCAGAA
CCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCCCGACTCT
GAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGCCCAAAA
GGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTTTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACAAGGGCCA
TGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCGTGAGACAAACAAGGGTGA
TTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAAATGAGCA
CAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTAGCAGCGG
TAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAGACTGTAT
AAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGTGGCTCAA
TGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGAGCTTCAC
TACTATGAATCTACTTTTTAACTT

QA 2 685 2 685
DS 

RD RR2C803TF 686 0 0
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTC*CCAGGCTAATG
GTCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCT
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACA
AGGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTA
GCAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGT
GGCTCAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGA
GCTTCACTACTATGAATCTACTTTTT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2DC40TF 687 0 0
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATG
GTCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCC
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACA
AGGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAGCACAAGAAGAAGGAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTA
GCAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGT
GGCTCAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGA
GCTTCACTACTATGAATCTACTTTT
AA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2FO42TF 682 0 0
GACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACTA
CGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGACGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGTCTAATGG
TCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCCC
GACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGC
CCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACGA
GGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCGGAAGAAAGCTCATGAGACAAACAA
GGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAAA
TGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTAG
CAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAGA
CTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGTG
GCTCAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGAG
CTTCACTACTATGAATCTACTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2BS68TF 697 0 0
GGACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACT
ACGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATG
GTCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCC
CGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATG
CCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGTTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACA
AGGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTA
GCAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGT
GGCTCAATGCTTAGAATAAA*CCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGA
GCTTCACTACTATGAATCTACTTTTTAACTTTTGCT
C

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2H932TF 695 0 0
GACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACTA
CGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATGG
TCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCCC
GACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGC
CCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACAA
GGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAACAA
GGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAATAAACATAAGAAGCAAAA
TGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTAG
CAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAGA
CTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGTG
GCTCAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGAG
CTTCACTACTATGAATCTACTTTTTAACTTTTGCT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2BF28TF 696 0 0
GACACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACTA
CGAAACACGTGGAAAAGCATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATGG
TCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCCC
GACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGC
CCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACAA
GGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGGCAAACAA
GGGTGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAAA
TGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTAG
CAGCGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAGA
CTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGTG
GCTCAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGAG
CTTCACTACTATGAATCTACTTTTTAACTTTTGC
AC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2ET28TF 698 0 0
GG
ACACAGCACAAATTGAAAACATAAAACTCACCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACTACGA
AACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATGGTCA
GAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGAACCGCCCAGTATATGGGAAAAGCCCGAC
TCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTCCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGCCCA
AAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACAAGGG
CCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAGCTCATGAGACAAGCAAGGG
TGATTATGGCCTAGGAACTTTCATTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAAATGA
GCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGCGGAAGTAGCAG
CGGTAGCGACAGCGACTAACTGAAATGATTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAGACTG
TATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAGACTTATATACTACGATGTGGCT
CAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGAGCTT
CACTACTATGAATCTACTTTTTAACTTTTGCTCAAA

QA 3 698 3 698
DS 



AS 4 23

CO CL59Contig1 1064 2 2 U
GGGAAGACATATCGACGAGTTCCAAGAGAATGACCATGGATAAGTTGGAAGAGGAGCCAC
GAGCTTCCGTCGAAGGTGGATGCGGTTTCGGCGGCGATAAGGTCACTGTACATGGTTCCA
TCGCCGGATCTGTCGCCGGAGAAAGTGCTGAGAAACCAATTCAGGAAGCTAGGTGCATGG
AAGTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTTCAACCATCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCT
TTGGTGGGAAAGTTCGCGTCTTTGATGGAATCCCAGCAGACAAGGTTTGGTCCACTAGAC
CACATTCTACTTTCATGTTTTTTCTGTAGAACTCAAAGACTTCAAGTTCTCATTCACTGT
GAACCATTTTCTTTACAGATTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAA
TCCATCGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGA
GCTCTTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCCCCAGCTGCTCAGTCATTCCCCGTT
CACCCTATTTCCTTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTGCCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTT
CAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGGTATGTATAACTGAGAGGGACTTTGTAAAGA
CATATTGATCGTACTCTTGACCTTGAGGTATTTGTATTTGACAGCAACGTTCACAATCTT
TTTTTCTTTTTGCAGATTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCGGACAAGAAGACAGA
TGTCCCAAGCGACAATGTCTCTATTAAGGAGGAGTATCCCACTGCTTAGCAGAAGATCAA
CCAACCTTCAAGGCTGTAATAAAGTTTAACGAATTTATCATTCCTACTAAGTGAAATGTT
ATGAACTTATGATAATGTAATCGTCTATGCTCTGCTTCTGTGTTGTATGATAGTGTATGT
ACAGGTTTGTTAGGCCTGTTTTATCATTTTACGTTTTTCTCCAAGGATTGTTGCAGTGTC
CATCTTATCTAATGTCTCTTGATGTTATGTTATTGAACTTGTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL29TF U 1
AF RR2AL29JQ C 576
BS 1 802 RR2AL29TF
BS 803 1064 RR2AL29JQ

RD RR2AL29TF 802 0 0
GGGAAGACATATCGACGAGTTCCAAGAGAATGACCATGGATAAGTTGGAAGAGGAGCCAC
GAGCTTCCGTCGAAGGTGGATGCGGTTTCGGCGGCGATAAGGTCACTGTACATGGTTCCA
TCGCCGGATCTGTCGCCGGAGAAAGTGCTGAGAAACCAATTCAGGAAGCTAGGTGCATGG
AAGTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTTCAACCATCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCT
TTGGTGGGAAAGTTCGCGTCTTTGATGGAATCCCAGCAGACAAGGTTTGGTCCACTAGAC
CACATTCTACTTTCATGTTTTTTCTGTAGAACTCAAAGACTTCAAGTTCTCATTCACTGT
GAACCATTTTCTTTACAGATTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAA
TCCATCGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGA
GCTCTTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCCCCAGCTGCTCAGTCATTCCCCGTT
CACCCTATTTCCTTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTGCCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTT
CAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGGTATGTATAACTGAGAGGGACTTTGTAAAGA
CATATTGATCGTACTCTTGACCTTGAGGTATTTGTATTTGACAGCAACGTTCACAATCTT
TTTTTCTTTTTGCAGATTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCGGACAAGAAGACAGA
TGTCCCAAGCGACAATGTCTCT

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2AL29JQ 489 0 0
GCA
AATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGGTATGTATA
ACTGAGAGGGACTTTGTAAAGACATATTGATCGTACTCTTGACCTTGAGGTATTTGTATT
TGACAGCAACGTTCACAATCTTTTTTTCTTTTTGCAGATTGGTCAGCAAGAATCCTTACC
CTGCTTCGGACAAGAAGACAGATGTCCCAAGCGACAATGTCTCTATTAAGGAGGAGTATC
CCACTGCTTAGCAGAAGATCAACCAACCTTCAAGGCTGTAATAAAGTTTAACGAATTTAT
CATTCCTACTAAGTGAAATGTTATGAACTTATGATAATGTAATCGTCTATGCTCTGCTTC
TGTGTTGTATGATAGTGTATGTACAGGTTTGTTAGGCCTGTTTTATCATTTTACGTTTTT
CTCCAAGGATTGTTGCAGTGTCCATCTTATCTAATGTCTCTTGATGTTATGTTATTGAAC
TTGTTA

QA 4 489 4 489
DS 



CO CL59Contig2 889 9 18 U
GGAAAGACGAAGAAAGCAAATCGAAACTGGAGAAGACAAATCGACGAGTTCCAAGAGAAT
GACCATGGATAAGGTGGAAGACGAGCCACGAGCTCCCGTCGAAGGTGGTGGATGCGGTTT
CGGCGGCGATAAGGTCACTGTACATGGTTCCATCGCCGGATCTGTCGCCGGAGAAGGTGC
TGAGAAACCAATTCAGGAAGCTAGGTGCATGGAAGTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTTC
AACCATCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTTGGTGGGAAAGTTCGCGTCTTTGATGG
AATCCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATC
CATCGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGC
TCTTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCCCCAGCTGCTCAGTCATTCCCCGTTCA
CCCTATTTCCTTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTGCCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCA
ACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCGGA
CAAGAAGACAGATGTCCCAAGCGACAATGTCTCTATTAAGGAGGAGTATCCCACTGCTTA
GCAGAAGATCAACCAACCTTCAAGGCTGTAATAAAGTTTAACGAATTTATCATTCCTACT
AAGTGAAATGTTATGAACTTATGATAATGTAATCGTCTATGCTCTGCTTCTGTGTTGTAT
GATAGTGTATGTACAGGTTTGTTAGACCTGTTTTATCATTTTACGTTTTTCTCCAAGGAT
TGTTGCAGTGTCCATCTTATCTAATGTCTCTTGATGTTATGTTATTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 25 25 25 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV60TF U 35
AF RR2CE35TF U 88
AF RR2AX02TFB U 561
AF RR2FA20TF U 1
AF RR2CI62TF U 31
AF RR2CE35JQ C 34
AF RR2FA20JQ C 242
AF RR2DV60JQ C 538
AF RR2FU69JQ C 301
BS 1 120 RR2FA20TF
BS 121 121 RR2CI62TF
BS 122 459 RR2FA20TF
BS 460 460 RR2CE35TF
BS 461 684 RR2FA20TF
BS 685 685 RR2CE35JQ
BS 686 727 RR2FA20TF
BS 728 728 RR2CE35JQ
BS 729 736 RR2FA20TF
BS 737 737 RR2CI62TF
BS 738 797 RR2FA20TF
BS 798 799 RR2CI62TF
BS 800 800 RR2CE35JQ
BS 801 807 RR2CI62TF
BS 808 808 RR2CE35JQ
BS 809 821 RR2CI62TF
BS 822 883 RR2FA20JQ
BS 884 889 RR2FU69JQ

RD RR2DV60TF 597 0 0
GGG
ATATCGACGAGTTCCAAGAGAATGACCATGGATAAGTTGGAAGAGGAGCCACGAGCTTCC
GTCGAAGGTGG***ATGCGGTTTCGGCGGCGATAAGGTCACTGTACATGGTTCCATCGCC
GGATCTGTCGCCGGAGAAAGTGCTGAGAAACCAATTCAGGAAGCTAGGTGCATGGAAGTC
CCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTTCAACCATCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTTGGT
GGGAAAGTTCGCGTCTTTGATGGAATCCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGTATT
GCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCCATCGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGTCCTGTC
GCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCTTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCCCCA
GCTGCTCAGTCATTCCCCGTTCACCCTATTTCCTTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTGCCA
ATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTCAGC
AAGAATCCTTACCCTGCTTCGGACAAGAAGACAGATGTCCCAAGCGACAATGTC

QA 4 597 4 597
DS 

RD RR2CE35TF 593 0 0
ACGAGCTCCCGTCGAAGGTGGTGGATGCGGTTTTGGCGGCGATAAGGTCACTGTACATGG
TTCCATCGCCGGATCTGTCGCCGGAGAAGGTGCTGAGAAACCAATTCAGGAAGCTAGGTG
CATGGAAGTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTTCAACCATCCGTCCTAATCAACTTACTAT
CTTCTTTGGTGGGAAAGTTCGCGTCTTTGATGGAATCCCAGCAGACAAGATTCAAGAAAT
CATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCCATCGAGACAAAGAACTCCACGAACAC
CAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCTTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGC
AGCTTCCCCAGCTGCTCAGTCATTCCCCGTTCACCCTATTTCCTTCTGCAGATCTGCTGC
TGATCTGCCAATTGCAAGGAGGCGTTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAG
ATTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCGGACAAGAAGACAGATGTCCCAAGCGACAA
TGTCTCTATTAAGGAGGAGTATCCCACTGCTTAGCAGAAGATCAACCAACCTT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2AX02TFB 117 0 0
GGGACAGATTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCGGACAAGAAGACAGATGTCCCAA
GCGACAATGTCTCTATTAAGGAGGAGTATCCCACTGCTTAGCAGAAGATCAACCAAC

QA 1 117 1 117
DS 

RD RR2FA20TF 797 0 0
GGAAAGACGAAGAAAGCAAATCGAAACTGGAGAAGACAAATCGACGAGTTCCAAGAGAAT
GACCATGGATAAGGTGGAAGACGAGCCACGAGCTCCCGTCGAAGGTGGTGGATGCGGTTT
TGGCGGCGATAAGGTCACTGTACATGGTTCCATCGCCGGATCTGTCGCCGGAGAAGGTGC
TGAGAAACCAATTCAGGAAGCTAGGTGCATGGAAGTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTTC
AACCATCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTTGGTGGGAAAGTTCGCGTCTTTGATGG
AATCCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATC
CATCGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGC
TCTTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCCCCAGCCGCTCAGTCATTCCCCGTTCA
CCCTATTTCCTTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTGCCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCA
ACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCGGA
CAAGAAGACAGATGTCCCAAGCGACAATGTCTCTATTAAGGAGGAGTATCCCACTGCTTA
GCAGAAGATCAACCAACCTTCAAG*CTGTAATAAAGTTTAACGAATTTATCATTCCTACT
AAGTGAA*TGTTATGA*CTTATGATAATGTAATCGTCTATGCTCTGCTTCTGTGTTGTAT
GATAGTGTATGTACAGG

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2CI62TF 800 0 0
G
GAAGACATATCGACGAGTTCCAAGAGAATGACCATGGATAAGTTGGAAGAGGAGCCACGA
GCTTCCGTCGAAGGTGG***ATGCGGTTTCGGCGGCGATAAGGTCACTGTACATGGTTCC
ATCGCCGGATCTGTCGCCGGAGAAAGTGCTGAGAAACCAATTCAGGAAGCTAGGTGCATG
GAAGTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTTCAACCATCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTC
TTTGGTGGGAAAGTTCGCGTCTTTGATGGAATCCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATC
CGTATTACTGCTGCTACTGCTGCTAAATCCATCGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGT
CCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCTTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCT
TCCCCAGCTGCTCAGTCATTCCCCGTTCACCCTATTTCCTTCTGCAGATCTGCTGCTGAT
CTGCCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTG
GTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCGGACAAGAAGACAGATGTCCCAAGCGACAATGTC
TCTATTAAGGAGGAGTATCCCACTGCTTAGCAGAAGATCAACCAACCTTCAAG*CTGTAA
TAAAGTTTAACGACTTTATCATTCCTACTAAGTGAA*TGTTATGAACTTATGATAATGTA
ATCGTCTATGCTCTGCTTCTGTGT*GTATGATAGTGTATGTACAGGTT*GTTAGAC*TGT
TTTATCATTT
ACGTTTTCT

QA 2 791 2 791
DS 

RD RR2CE35JQ 780 0 0
G
GACAAATCGACGAGTTCCAAGAGAATGACCATGGATAAGGTGGAAGACGAGCCACGAGCT
CCCGTCGAAGGTGGTGGATGCGGTTT*GGCGGCGATAAGGTCACTGTACATGGTTCCATC
GCCGGATCTGTCGCCGGAGAAGGTGCTGAGAAACCAATTCAGGAAGCTAGGTGCATGGAA
GTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTTCAACCATCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTT
GGTGGGAAAGTTCGCGTCTTTGATGGAATCCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGT
ATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCCATCGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGTCCT
GTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCTTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCC
CCAGCTGCTCAGTCATTCCCCGTTCACCCTATTTCCTTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTG
CCAATTGCAAGGAGGCGTTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTC
AGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCGGACAAGAAGACAGATGTCCCAAGCGACAATGTCTCT
ATTAAGGAGGAGTATCCCACTGCTTAGCAGAAGATCAACCAACCTTCAAGGCTGTAATAA
AGTTTAACGAATTTATCATTCCTACTAAGTGAAATGTTATGAACTTATGATAATGTAATC
GTCTATGCTCTGCTTCTGTGTTGTATGATGGTGTATGTACAGGTTTGTTAGACCTGTTT

QA 2 780 2 780
DS 

RD RR2FA20JQ 642 0 0
ACCATCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTTGGTGGGAAAGTTCGCGTCTTTGATGGA
ATCCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCC
ATCGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCT
CTTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCCCCAGCCGCTCAGTCATTCCCCGTTCAC
CCTATTTCCTTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTGCCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCAA
CGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCGGAC
AAGAAGACAGATGTCCCAAGCGACAATGTCTCTATTAAGGAGGAGTATCCCACTGCTTAG
CAGAAGATCAACCAACCTTCAAGGCTGTAATAAAGTTTAACGAATTTATCATTCCTACTA
AGTGAAATGTTATGAACTTATGATAATGTAATCGTCTATGCTCTGCTTCTGTGTTGTATG
ATAGTGTATGTACAGGTTTGTTAGACCTGTTTTATCATTTTACGTTTTTCTCCAAGGATT
GTTGCAGTGTCCATCTTATCTAATGTCTCTTGATGTTATGTT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2DV60JQ 322 0 0
TCAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTC
GGACAAGAAGACAGATGTCCCAAGCGACAATGTCTCTATTAAGGAGGAGTATCCCACTGC
TTAGCAGAAGATCAACCAACCTTCAAGGCTGTAATAAAGTTTAACGAATTTATCATTCCT
ACTAAGTGAAATGTTATGAACTTATGATAATGTAATCGTCTATGCTCTGCTTCTGTGTTG
TATGATAGTGTATGTACAGGTTTGTTAGACCTGTTTTATCATTTTACGTTTTTCTCCAAG
GATTGTTGCAGTGTCCAT
ATTA

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR2FU69JQ 589 0 0
AATCCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATC
CATCGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGC
TCTTTCTCTTTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCCCCAGCTGCTCAGTCATTCCCCGTTCA
CCCTATTTCCTTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTGCCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCA
ACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTCAGCAAGAATTCTTACCCTGCTTCGGA
CAAGAAGACAGATGTCCCAAGCGACAATGTCTCTATTAAGGAGGAGTATCCCACTGCATA
GCAGAAGATCAACCAACCTTCAAGGCTGTAATAAAGTTTAACGAATTTATCATTCCTACT
AAGTGAAATGTTATGAACTTATGATAATGTAATCGTCTATGCTCTGCTTCTGTGTTGTAT
GATAGTGTATGTACAGGTTTGTTAGACCTGTTTTATCATTTTACGTTTTTCTCCAAGGAT
TGTTGCAGTGTCCATCTTATCTAATGTCTCTTGATGTTATGTTATTGAA

QA 1 589 1 589
DS 



CO CL59Contig3 985 5 32 U
GGAGACAAAACACGACTTTAAAGACGAAGAAAGCAAATCGAAACTGGAGAAGACATATCG
ACGAGTTCCAAGAGAATGACCATGGATAAGGTGGAAGAGGAGCCACGAGCTCCCGTCGAA
GGTGGTGGATGCGGTTTTGGCGGCGATAAGGTCACTGTACATGGTTCCATCGCCGGATCT
GTCGCCGGAGAAAGTGCTGAGAAACCAATTCAGGAAGCTAGGTGCATGGAAGTCCCTTCC
TCTGAGCCAGAAGCTTCAACCATCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTTGGTGGGAAA
GTTCGCGTATTTGATGGGATTCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCT
GCTACTGCTGCTAAATCCATTGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGTCCTGTCGCTTCT
CCAGCACTGAACAGAGCTCCTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCCCCAACTGCG
CAGTCATTCCCCGTTCACCCTATTTCCTTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTACCAATTGCA
AGGAGGCATTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTTAGCAAGAAT
CCTTACCGTGCTTCAGACAAGAAGACAGATGTCCCAAGAGACGATGTCTCTGCTAAGGAG
GAGTATCCCACTGCTTAGCAGAAGATCAACCAACCTTCAAGGCTGTAATAAAGTTTAACA
AATATATCATTCCTACTAAGTGAAACGTTATGAACTTATGATAATGTAATCGTATATGCT
CTGCTTCTGTGTTGTATGATAGTGTCTGTACAGGTTTGTTAGACCTGTTTTTATCATTTT
ACGTTTTTCTCCAAGGATTATTGTTGCAGTGTCCTAAGAGTCTATCTTAACTAATGTCTC
TTGATGTCATGTTATTGAACTTGTTATATCTTCCAGATACAAATTTGTGTGCAATATTTT
AATGGAATCTAAATGTTATTGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 10 5 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS52TF U 1
AF RR2FS52JQ C 421
AF RR2BS63TF U 32
AF RR2D178TF U 258
AF RR2BS63JQ C 537
BS 1 541 RR2FS52TF
BS 542 620 RR2BS63TF
BS 621 621 RR2D178TF
BS 622 701 RR2BS63TF
BS 702 702 RR2D178TF
BS 703 744 RR2BS63TF
BS 745 745 RR2D178TF
BS 746 748 RR2BS63TF
BS 749 749 RR2D178TF
BS 750 753 RR2BS63TF
BS 754 754 RR2D178TF
BS 755 763 RR2BS63TF
BS 764 764 RR2D178TF
BS 765 768 RR2BS63TF
BS 769 769 RR2D178TF
BS 770 792 RR2BS63TF
BS 793 793 RR2D178TF
BS 794 813 RR2BS63TF
BS 814 815 RR2D178TF
BS 816 819 RR2BS63TF
BS 820 820 RR2D178TF
BS 821 824 RR2BS63TF
BS 825 825 RR2D178TF
BS 826 831 RR2BS63TF
BS 832 832 RR2D178TF
BS 833 839 RR2BS63TF
BS 840 840 RR2D178TF
BS 841 847 RR2BS63TF
BS 848 848 RR2D178TF
BS 849 850 RR2BS63TF
BS 851 930 RR2D178TF
BS 931 985 RR2BS63JQ

RD RR2FS52TF 541 0 0
GGAGACAAAACACGACTTTAAAGACGAAGAAAGCAAATCGAAACTGGAGAAGACATATCG
ACGAGTTCCAAGAGAATGACCATGGATAAGGTGGAAGAGGAGCCACGAGCTCCCGTCGAA
GGTGGTGGATGCGGTTTTGGCGGCGATAAGGTCACTGTACATGGTTCCATCGCCGGATCT
GTCGCCGGAGAAAGTGCTGAGAAACCAATTCAGGAAGCTAGGTGCATGGAAGTCCCTTCC
TCTGAGCCAGAAGCTTCAACCATCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTTGGTGGGAAA
GTTCGCGTATTTGATGGGATTCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCT
GCTACTGCTGCTAAATCCATTGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGTCCTGTCGCTTCT
CCAGCACTGAACAGAGCTCCTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCCCCAACTGCG
CAGTCATTCCCCGTTCACCCTATTTCCTTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTACCAATTGCA
A

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR2FS52JQ 357 0 0
CCAGCACTGAACAGAGCTCCTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCCCCAACTGCG
CAGTCATTCCCCGTTCACCCTATTTCCTTTTGCAGATCTGCTGCTGATCTACCAATTGCA
AGGAGGCATTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTTAGCAAGAAT
CCTTACCGTGCTTCAGACAAGAAGACAGATGTCCCAAGAGACGATGTCTCTGTTAAGGAG
GAGTATCCCACTGCTTAGCAGAAGATCAACCAACCTTCAAGGCTGTAATAAAGTTTAACG
AATATATCATTCCTAATAAGTGAAACGTTATGAACTTATGATAATGTAATCGT
ATAT

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR2BS63TF 819 0 0
GGA
AAATCGAAACTGGAGAAGACATATCGACGAGTTCCAAGAGAATGACCATGGATAAGGTGG
AAGAGGAGCCACGAGCTCCCGTCGAAGGTGGTGGATGCGGTTTTGGCGGCGATAAGGTCA
CTGTACATGGTTCCATCGCCGGATCTGTCGCCGGAGAAAGTGCTGAGAAACCAATTCAGG
AAGCTAGGTGCATGGAAGTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTTCAACCATCCGTCCTAATC
AACTTACTATCTTCTTTGGTGGGAAAGTTCGCGTATTTGATGGGATTCCAGCAGACAAGA
TTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCTATTGAGACAAAGAACT
CCACGAACACCAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCCTTCTCTCTCAAGCA
CCTCCAACGCAGCTTCCCCAGCTGCGCAGTCATTCCCCGTTCACCCTATTTCCTTCTGCA
GATCTGCTGCTGATCTACCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGA
GACGGGACAGATTGGTTAGCAAGAATCCTTACCGTGCTTCAGACAA*AAGACAGATGTCC
CAAGAGACGATGTCTCTGCTAAGGAGGAGTATCCCACTGCTTAGCAGAAGATCAACCAAC
CTTCAAG*CTGTAATAAAGTTTAACAAATATATCATTCCTACTAAGTGAA*CGT*ATGA*
CTTATGATA*TGTA*TCGTATATGCTCTGCTTCTGTGT*GTATGATAGTGTCTGTACAG*
*TTGT*AGAC*TGTTTT*ATCATTT*ACGTTTT*CT

QA 4 819 4 819
DS 

RD RR2D178TF 673 0 0
G
ACCATCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTTGGTGGGAAAGTTCGCGTATTTGATGGG
ATTCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCC
ATTGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCT
CCTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCCCCAGCTGCGCAGTCATTCCCCGTTCAC
CCTATTTCCTTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTGCCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCAA
CGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTTAGCAAGGATCCTTACCGTGCTTCAGAC
AAGAAGACAGATGTCCCAAGAGACGATGTCTCTGTTAAGGAGGAGTATCCCACTGCTTAG
CAGGAGATCAACCAACCTTCAAGGCTGTAATAAAGTTTAACGAATATATCATTCCTACTA
AGTGAAACGTTATGAACTTATGATAATGTAATCGTATATGCTCTGCTTCTGTGTTGTATG
ATAGTGTCTGTACAGGTTTGTTAGACCTGTTTTTATCATTTTACGTTTTTCTCCAAGGAT
TATTGTTGCAGTGTCCTAAGAGTCTATCTTAACTAATGTCTCTTGATGTCATGTTATTGA
ACTTGTTATATC

QA 2 673 2 673
DS 

RD RR2BS63JQ 449 0 0
TGCAAGGAGGCATTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTTAGCAA
GAATCCTTACCGTGCTTCAGACAA*AAGACAGATGTCCCAAGAGACGATGTTTTTGCTAA
GGAGGAGTATCCCACTGCTTAGCAGAAGATCAACCAACCTTCAAGGCTGTAATAAAGTTT
AACAAATATATCATTCCTACTAAGTGAAACGTTATGAACTTATGATAATGTAATCGTATA
TGCTCTGCTTCTGTGTTGTATGATAGTGTCTGTACAGGTTTGTTAGACCTGTTTTTATCA
TTTTACGTTTTTTTCCAAGGATTATTGTTGCAGTGTCCTAAGAGTCTATCTTAACTAATG
TCTCTTGATGTTATGTTATTGAACTTGTTATATCTTCCAGATACAAATTTGTGTGCAATA
TTTTAATGGAATCTAAATGTTATTGTTGT

QA 1 449 1 449
DS 



CO CL59Contig4 996 7 10 U
GGGGTTCCAGACAGAACACGACTTTAAAGACGAAGAAAGCAAATCGAAACTGGAGAAGAC
ATATCGACGAGTTCCAAGAGAATGACCATGGATAAGGTGGAAGAGGAGGCACGAGCTCCC
GTCGAAGGTGGTGGATGCGGTTTTGGCGGCGATAAGGTCACTGCACATGGTTCCATCGCC
GGATCTGTCGCCGGAGAAGGTGCTGAGAAACCAATTAAGGAAGCTAGGTGCATGGAAGTC
CCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTTCAACCGTCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTTGGT
GGGAAAGTTCGTGTCTTTGATGGGATTCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGTATT
GCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCCATTGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGTCCTGTC
GCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCCTTCTCTCTCAAGCACCTCAAATGCAGCTTCCCCA
GCTGCTCAGTCATTCCCCGTTCACCCTATTTCATTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTGCCA
ATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTCAGC
AAGAATCCTTACCCTGCTTCAGACAAGAAGACAGATGTCCCAAGAGACAATGCCTCTGTT
AAGGAGGAGTATCCCACTGCTTAGCAGAAGATCAACCAACCTTCAAGGCTGTAATAAAGT
TTAACGAATAATATATCATTCCTACTAAGTGAAACGTTATGAACTTATGATAATGTAATC
GTCTATGCTGCGTCTGTGTTGTATGATAGTGTCTGTACAGGTTTGTTAGACCTGTTTTTA
TCATTTTAAGTTTTTCTCCAAGGATTATTGCAGTGTCCTAAGAGTCTATCTTATGTCTTA
ACTAATGTCTCATGATGTTATGTTATTGAACTTGTTATATCTTCCAGATACAAATTTGTG
TGCAATATTTTAATGGAATTTAAGTGTTATTGTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS15TF U 79
AF RR2GA31TF U 1
AF RR2DN08TF U 25
AF RR2EN88TF U 55
AF RR2EN88JQ C 342
AF RR2BB25TF U 39
AF RR2GA31JQ C 292
BS 1 33 RR2GA31TF
BS 34 34 RR2DN08TF
BS 35 547 RR2GA31TF
BS 548 548 RR2DN08TF
BS 549 625 RR2GA31TF
BS 626 659 RR2DN08TF
BS 660 693 RR2BB25TF
BS 694 694 RR2GA31JQ
BS 695 857 RR2BB25TF
BS 858 996 RR2GA31JQ

RD RR2AS15TF 102 0 0
AGAATGACCATGGATAAGGTGGAAGAGGAGGCTCGAGCTCCCGTCGAAGGTGGTGGATGC
GGTTTTGGCGGCGATAAGGTCACTGCACATGGTTCCATCGCC

QA 1 102 1 102
DS 

RD RR2GA31TF 642 0 0
GGGGTTCCAGACAGAACACGACTTTAAAGACGAGGAAAGCAAATCGAAACTGGAGAAGAC
ATATCGACGAGTTCCAAGAGAATGACCATGGATAAGGTGGAAGAGGAGGCACGAGCTCCC
GTCGAAGGTGGTGGATGCGGTTTTGGCGGCGATAAGGTCACTGCACATGGTTCCATCGCC
GGATCTGTCGCCGGAGAAGGTGCTGAGAAACCAATTAAGGAAGCTAGGTGCATGGAAGTC
CCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTTCAACCGTCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTTGGT
GGGAAAGTTCGTGTCTTTGATGGGATTCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGTATT
GCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCCATTGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGTCCTGTC
GCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCCTTCTCTCTCAAGCACCTCAAATGCAGCTTCCCCA
GCTGCTCAGTCATTCCCCGTTCACCCTATTTCATTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTGCCA
ATTGCAAAGAGGCATTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTCAGC
AAGAATCCTTACCCTGCTTCAGACA
GAGACAGATGTCCCAGA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2DN08TF 635 0 0
AGGG
GACGAAGAAAGCAAATCGAAACTGGAGAAGACATATCGACGAGTTCCAAGAGAATGACCA
TGGATAAGGTGGAAGAGGAGGCACGAGCTCCCGTCGAAGGTGGTGGATGCGGTTTTGGCG
GCGATAAGGTCACTGCACATGGTTCCATCGCCGGATCTGTCGCCGGAGAAGGTGCTGAGA
AACCAATTAAGGAAGCTAGGTGCATGGAAGTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTTCAACCG
TCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTTGGTGGGAAAGTTCGTGTCTTTGATGGGATTC
CAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCCATTG
AGACAAAGGACTCCACGAACACCAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCCTT
CTCTCTCAAGCACCTCAAATGCAGCTTCCCCAGCTGCTCAGTCATTCCCCGTTCACCCTA
TTTCATTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTGCCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCAACGAT
TCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCAGACAAGA
AGACAGATGTCCCAAGAGACAATGCCTCTGT

QA 5 635 5 635
DS 

RD RR2EN88TF 624 0 0
GG
AGACATATCGACGAGTTCCAAGAGAATGACCATGGATAAGGTGGAAGAGGAGGCACGAGC
TCCCGTCGAAGGTGGTGGATGCGGTTTTGGCGGCGATAAGGTCACTGCACATGGTTCCAT
CGCCGGATCTGTCGCCGGAGAAGGTGCTGAGAAACCAATTAAGGAAGCTAGGTGCATGGA
AGTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTTCAACCGTCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTT
TGGTGGGAAAGTTCGTGTCTTTGATGGGATTCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCG
TATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCCATTGAGACAAAGAACTCCACGAACACCAGTCC
TGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCCTTCTCTCTCAAGCACCTCAAATGCAGCTTC
CCCAGCTGCTCAGTCATTCCCCGTTCACCCTATTTCATTCTGCAGATCTGCTGCTGATCT
GCCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGT
CAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCAGACAAGAAGACAGATGTCCCAAGAGACAATGCCTC
TGTTAAGGAGGAGTATCCCACT

QA 3 624 3 624
DS 

RD RR2EN88JQ 449 0 0
TCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCCATTGAGACAAAGAACTC
CACGAACACCAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCCTTCTCTCTCAAGCAC
CTCAAATGCAGCTTCCCCAGCTGCTCAGTCATTCCCCGTTCACCCTATTTCATTCTGCAG
ATCTGCTGCTGATCTGCCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGAG
ACGGGACAGATTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCAGACAAGAAGACAGATGTCCC
AAGAGACAATGCCTTTGTTAAGGAGGAGTATCCCACTGCTTAGCAGAAGATCAACCAACC
TTCAAGGCTGTAATAAAGTTTAACGAATAATATATCATTCCTACTAAGTGAAACGTTATG
AACTTATGATAATGTAATCGTCTATGCT
G

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR2BB25TF 819 0 0
GG
AAATCGAAACTGGAGAAGACATATCGACGAGTTCCAAGAGAATGACCATGGATAAGGTGG
AAGAGGAGGCACGAGCTCCCGTCGAAGGTGGTGGATGCGGTTTTGGCGGCGATAAGGTCA
CTGCACATGGTTCCATCGCCGGATCTGTCGCCGGAGAAGGTGCTGAGAAACCAATTAAGG
AAGCTAGGTGCATGGAAGTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTTCAACCGTCCGTCCTAATC
AACTTACTATCTTCTTTGGTGGGAAAGTTCGTGTCTTTGATGGGATACCAGCAGACAAGA
TTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCCATTGAGACAAAGAACT
CCACGAACACCAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCCTTCTCTCTCAAGCA
CCTCAAATGCAGCTTCCCCAGCTGCTCAGTCATTCCCCGTTCACCCTATTTCATTCTGCA
GATCTGCTGCTGATCTGCCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGA
GACGGGACAGATTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCAGACAAGAAGACAGATGTCC
CAAGAGACAATGCCTCTGTTAAGGAGGAGTATCCCACTGCTTAGCAGAAGATCGACCAAC
CTTCAAGGCTGTAATAAAGTTTAACGAATAATATATCATTCCTACTAAGTGAAACGTTAT
GAACTTATGATAATGTAATCGTCTATGCTGCGTCTGTGTTGTATGATAGTGTCTGTACAG
GTTTGTTAGACCTGTTTTTATCATTTTAAGTTTTTCT

QA 3 819 3 819
DS 

RD RR2GA31JQ 705 0 0
TTCTTTGGTGGGAAAGTTCGTGTCTTTGATGGGATTCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATC
ATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCCATTGAGACAAAGAACTCCACGAACACC
AGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCCTTCTCTCTCAAGCACCTCAAATGCA
GCTTCCCCAGCTGCTCAGTCATTCCCCGTTCACCCTATTTCATTCTGCAGATCTGCTGCT
GATCTGCCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGA
TTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCAGACAAGAAGACAGATGTCCCAAGAGACAAT
GCCTCTGTTAAGGAGGAGTATCCCACTGCTTAGCAGAAGATCAACCAACCTTCAAGGCTG
TAATAAAGTTTAACGAATAATATATCATTCCTACTAAGTGAAACGTTATGAACTTATGAT
AATGTAATCGTCTATGCTGCGTCTGTGTTGTATGATAGTGTCTGTACAGGTTTGTTAGAC
CTGTTTTTATCATTTTAAGTTTTTCTCCAAGGATTATTGCAGTGTCCTAAGAGTCTATCT
TATGTCTTAACTAATGTCTCATGATGTTATGTTATTGAACTTGTTATATCTTCCAGATAC
AAATTTGTGTGCAATATTTTAATGGAATTTAAGTGTTATTGTTGG

QA 1 705 1 705
DS 



AS 3 22

CO CL60Contig1 648 8 5 U
GGGTCTACTCAACTAAAAAGAAAAAAACGCCGCTCGTCTCTTCAGAGAGTGTTCCACTTT
CCAGGATTTGCTCAAGAGAAAAAAAATGAGTAGAGGAAGTGCAGCCGTTGCCAAGGGAAA
GAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATTGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGA
GATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGC
ACTCGGTGATTCCGTCACGATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACCGTCACTTCCGATGG
TCAATTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGT
GAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTA
CTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAAGAGCTATTACTTCTG
TTTCCGGTTTTTGTTTTATGTTCGTTGTTACTCAAATACAATTTGTCATCGCCCTTGTGT
TCTTCTTTATCGTCGACACATCTTATTTTAGTTTTGTTCAAGTTACCTCTTGGTTCAGAC
TATTGTTTAAGAAAAATATTTTGGTAATGATTCAAGAATCTTTTAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2C622JQ C 239
AF RR2CE42JQ C 42
AF RR2CE42TF U 1
AF RR2DA84JQ C 7
AF RR2DA84TF U 7
AF RR2EC68TF U 5
AF RR2AV19JQ C 9
AF RR2AV19TF U 9
BS 1 497 RR2CE42TF
BS 498 498 RR2DA84TF
BS 499 611 RR2CE42TF
BS 612 646 RR2AV19TF
BS 647 648 RR2AV19JQ

RD RR2C622JQ 201 0 0
GCTT
TCGGGGATTCCGTCACGATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACCGTCACTTCCGATGGTC
AATTTTCCAAGAGGTATTTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGTGA
GGGATTGGCTCAGAGGGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTTTACGAGTTGAGGTACT
TCAACATTGCTGGGAAC

QA 5 201 5 201
DS 

RD RR2CE42JQ 493 0 0
TCAGAGAGTGTTCCACTTTCCAGGATTTGCTCAAGAGAAAAAAAATGAGTAGAGGAAGTG
CAGCCGTTGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGAGTTTCCTTTTCCATTGACTGCTCCAAGCCTG
TCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAG
TCGGTGGCAAAGCCGGTGCACTCGGTGATTCCGTCACGATCACCCGTGAGAAGAACAAGA
TCACCGTCACTTCCGATGGTCAATTTTCCAAGAGGTATTTCAAGTACTTGACGAAGAAGT
ACTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTA
ACCTTTACGAGTTGAGGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGA
AGAAGAGCTATTACTTCTGTTTCCGGTTTTTGTTTTGTGTTCGTTGTTACTCAAATACAA
TTTGTCATCGCCC

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR2CE42TF 611 0 0
GGGTCTACTCAACTAAAAAGAAAAAAACGCCGCTCGTCTCTTCAGAGAGTGTTCCACTTT
CCAGGATTTGCTCAAGAGAAAAAAAATGAGTAGAGGAAGTGCAGCCGTTGCCAAGGGAAA
GAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATTGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGA
GATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGC
ACTCGGTGATTCCGTCACGATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACCGTCACTTCCGATGG
TCAATTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGT
GAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTA
CTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAAGAGCTATTACTTCTG
TTTCCGGTTTTTGTTTTGTGTTCGTTGTTACTCAAATACAATTTGTCATCGCCCTTGTGT
TCTTCTTTATCGTCGACACATCTTATTTTAGTTTTGTTCAAGTTACCTCTTGGTTCAGAC
TATTGTTTAAG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2DA84JQ 602 0 0
GG
TCAACTAAAAAGAAAAAAACGCCGCTCGTCTCTTCAGAGAGTGTTCCACTTTCCAGGATT
TGCTCAAGAGAAAAAAAATGAGTAGAGGAAGTGCAGCCGTTGCCAAGGGAAAGAAGAAGG
GAGTCTCCTTCTCCATTGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCCT
CCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCACTCGGTG
ATTCCGTCACGATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACCGTCACTTCCGATGGTCAATTCT
CCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGATT
GGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACA
TCGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAAGAGCTATTACTTCTGTTTCCGGT
TTTTGTTTTATGTTCGTTGTTACTCAAATACAATTTGTCATCGCCCTTGTGTTCTTCTTT
ATCGTCGACACATCTTATTTTAGTTTTGTTCAAGTTACCTCTTGGTTCAGACTATTGTTT

QA 3 602 3 602
DS 

RD RR2DA84TF 602 0 0
GG
TCAACTAAAAAGAAAAAAACGCCGCTCGTCTCTTCAGAGAGTGTTCCACTTTCCAGGATT
TGCTCAAGAGAAAAAAAATGAGTAGAGGAAGTGCAGCCGTTGCCAAGGGAAAGAAGAAGG
GAGTCTCCTTCTCCATTGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCCT
CCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCACTCGGTG
ATTCCGTCACGATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACCGTCACTTCCGATGGTCAATTCT
CCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGATT
GGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACA
TCGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAAGAGCTATTACTTCTGTTTCCGGT
TTTTGTTTTATGTTCGTTGTTACTCAAATACAATTTGTCATCGCCCTTGTGTTCTTCTTT
ATCGTCGACACATCTTATTTTAGTTTTGTTCAAGTTACCTCTTGGTTCAGACTATTGTTT

QA 3 602 3 602
DS 

RD RR2EC68TF 612 0 0
GG
ACTCAACTAAAAAGAAAAAAACGCCGCTCGTCTCTTCAGAGAGTGTTCCACTTTCCAGGA
TTTGCTCAAGAGAAAAAAAATGAGTAGAGGAAGTGCGGCCGTTGCCAAGGGAAAGAAGAA
GGGAGTCTCCTTCTCCATTGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGC
TTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCACTCGG
TGATTCCGTCACGATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACCGTCACTTCCGATGGTCAATT
CTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGA
TTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAA
CATCGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAAGAGCTATTACTTCTGTTTCCG
GTTTTTGTTTTATGTTCGTTGTTACTCAAATACAATTTGTCATCGCCCTTGTGTTCTTCT
TTATCGTCGACACATCTTATTTTAGTTTTGTTCAAGTTACCTCTTGGTTCAGACTATTGT
TTAAG
AAAAA

QA 3 607 3 607
DS 

RD RR2AV19JQ 640 0 0
GG
AACTAAAAAGAAAAAAACGCCGCTCGTCTCTTCAGAGAGTGTTCCACTTTCCAGGATTTG
CTCAAGAGAAAAAAAATGAGTAGAGGAAGTGCAGCCGTTGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGA
GTCTCCTTCTCCATTGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCC
CTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCACTCGGTGAT
TCCGTCACGATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACCGTCACTTCCGATGGTCAATTCTCC
AAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGATTGG
CTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACAAGTTGAGGTACTTCAACATC
GCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAAGAGCTATTACTTCTGTTTCCGTTTT
TTGTTTTATGTTCGTTGTTACTCAAATACAATTTGTCATCGCCCTTGTGTTCTTCTTTAT
CGTCGACACATCTTATTTTAGTTTTGTTCAAGTTACCTCTTGGTTCAGACTATTGTTTAA
GAAAAATATTTTGGTAATGATTCAAGAATCTTTTAACT

QA 3 640 3 640
DS 

RD RR2AV19TF 640 0 0
GG
AACTAAAAAGAAAAAAACGCCGCTCGTCTCTTCAGAGAGTGTTCCACTTTCCAGGATTTG
CTCAAGAGAAAAAAAATGAGTAGAGGAAGTGCAGCCGTTGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGA
GTCTCCTTCTCCATTGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCC
CTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCACTCGGTGAT
TCCGTCACGATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACCGTCACTTCCGATGGTCAATTCTCC
AAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGATTGG
CTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACAAGTTGAGGTACTTCAACATC
GCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAAGAGCTATTACTTCTGTTTCCGTTTT
TTGTTTTATGTTCGTTGTTACTCAAATACAATTTGTCATCGCCCTTGTGTTCTTCTTTAT
CGTCGACACATCTTATTTTAGTTTTGTTCAAGTTACCTCTTGGTTCAGACTATTGTTTAA
GAAAAATATTTTGGTAATGATTCAAGAATCTTTTAA
CT

QA 3 638 3 638
DS 



CO CL60Contig2 645 7 4 U
GGCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCCTCTTCAGACAAGTTCCACCTTCTAGG
ATCTGATCAAGAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTTGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGAG
TCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCAC
TCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCCCTCGGTGACT
CTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTCTCCA
AGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGATTGGC
TCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATCG
CTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACTTCTGTTTCGTGTTTCTGT
TGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCCCATTACAATTTATCTTGGTACTTCTATTGTTTTT
TTGACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAA****CGTGTTTCAGACACTT**GTTTG
AGAAAAATTTAAAGATCTTTATGATCCAATCCCGAAACTAAAAAA


BQ
30 30 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D344TF U 1
AF RR2F730JQ C 1
AF RR2F730TF U 1
AF RR2GX62TF U 1
AF RR2GF55JQ C -3
AF RR2GF55TF U -3
AF RR2E320TF U -1
BS 1 330 RR2D344TF
BS 331 331 RR2F730TF
BS 332 607 RR2D344TF
BS 608 645 RR2F730TF

RD RR2D344TF 607 0 0
GGCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCCTCTTCAGACAAGTTCCACCTTCTAGG
ATCTGATCAAGAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTTGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGAG
TCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCAC
TCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCCCTCGGTGACT
CTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTCTCCA
AGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTGCTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGATTGGC
TCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATCG
CTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACTTCTGTTTCGTGTTTCTGT
TGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCCCATTACAATTTATCTTGGTACTTCTATTGTTTTT
TTGACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAA****CGTGTTTCAGACACTT**GTTTG
AGAAAAA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2F730JQ 639 0 0
GGCCGTCTCCTCAGCTTAAAGACGCCGCTCGTC*TCTTCAGACAAGTTCCACCTTCTAGG
ATTTGTTCAAGAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGAG
TCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCC
TCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATAAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCGCTCGGTGACT
CTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTCTCCA
AGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGAGGGATTGGC
TCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATCG
CTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACTTCTGTTTCGTGTTTCTGT
TGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCCCATTACAGTTTATCTTGGTACTTCTATTGTTTTT
TTGACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAA***CTTGTTTCAGACACTT**GTTTG
AGAAAAATTTAAAGATCTTTATGATCCAATCCCG
AAACT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2F730TF 645 0 0
GGCCGTCTCCTCAGCTTAAAGACGCCGCTCGTC*TCTTCAGACAAGTTCCACCTTCTAGG
ATTTGTTCAAGAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGAG
TCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCC
TCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATAAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCGCTCGGTGACT
CTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTCTCCA
AGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGAGGGATTGGC
TCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATCG
CTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACTTCTGTTTCGTGTTTCTGT
TGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCCCATTACAGTTTATCTTGGTACTTCTATTGTTTTT
TTGACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAA***CTTGTTTCAGACACTT**GTTTG
AGAAAAATTTAAAGATCTTTATGATCCAATCCCGAAACTAAAAAA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2GX62TF 644 0 0
GGCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCCTCTTCAGACAAGTTCCACCTTCTAGG
ATCTGATCAAGAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTTGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGAG
TCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCAC
TCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCCCTCGGTGACT
CTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTCTCCA
AGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGATTGGC
TCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATCG
CTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACTTCTGTTTCGTGTTTCTGT
TGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCCCATTACAATTTATCTTGGTACTTCTATTGTTTTT
TTGACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAA****CGTGTTTCAGACACTT**GTTTG
AGAAAAATTTAAAGATCTTTATGATCCAATCCCGAAACT
ACAGA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2GF55JQ 638 0 0
GGGGTT
CCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCCTCTTCAGACAAGTTCCACCTTCTAGGAT
CTGATCAAGAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTTGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGAGTC
TCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCACTC
GAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCCCTCGGTGACTCT
GTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTCTCCAAG
AGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGATTGGCTC
AGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTTTACGAGTTGAGGTACTTCAACATCGCT
GAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACTTCTGTTTCGTGTTTCTGTTG
TTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCCCATTACAATTTATCTTGGTACTTCTATTGTTTTTTT
GACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAA****CGTGTTTCAGACACTT**GTTTGAG
AAAAATTTAAAGATCTTTATGATCCAATCCCG

QA 7 638 7 638
DS 

RD RR2GF55TF 638 0 0
GGGGTT
CCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCCTCTTCAGACAAGTTCCACCTTCTAGGAT
CTGATCAAGAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTTGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGAGTC
TCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCACTC
GAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCCCTCGGTGACTCT
GTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTCTCCAAG
AGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGATTGGCTC
AGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATCGCT
GAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACTTCTGTTTCGTGTTTCTGTTG
TTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCCCATTACAATTTATCTTGGTACTTCTATTGTTTTTTT
GACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAA****CGTGTTTCAGACACTT**GTTTGAG
AAAAATTTAAAGATCTTTATGATCCAATCCCG

QA 7 638 7 638
DS 

RD RR2E320TF 607 0 0
GGCCGTC
TCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCCTCTTCAGACAAGTTCCACCTTCTAGGATCTG
ATCAAGAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTTGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGAGTCTCC
TTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAG
AAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCCCTCGGTGACTCTGTC
ACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGTCAGTTCTCCAAGAGG
TATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGTGAGGGATTGGCTCAGA
GTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATCGCTGAG
AACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACTTCTGTTTCGTGTTTCTGTTGTTT
TGGTTTCTGCTCGTTGCTGCCCATTACAATTTATCTTGGTACTTCTATTGTTTTTTTGAC
AGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAAACTCTTGTTTCAGACACTTTTGTTTGAGAAA

QA 8 607 8 607
DS 



CO CL60Contig3 661 7 11 U
AATCCACATTAACAGATTATTGAATCATTACCAAAATACTTTTCTTAAACAATGGTCTTA
AACAAAAGTTAACTTCAACAAAACTAAAATAGGATGCGTTGATAAAGAACACAAGGGAAA
TGATAAAATTGTATTGAGCAACAACGAACATAAAACAAAAAA*GCGGAAA*CAGAAGTTC
TAGTTTTTCTTCTTCTAGTCTTCTTCCTCTCCCTCGTTCTCAGCGATGTTGAAGTACCTC
AACTCGTAGAGGTTACGGTCCTTGTTGGCTGCAATCACTCTGAGCCAATCCCTCACATTG
TGCTTCTTCAAGTACTTCTTCGTCAAGTACTTCAAATACCTCTTGGAGAATTGACCATCG
GAAGTGACAGTGATCTTGTTCTTCTCACGGGTGATAGTGACGGAATCACCGAGTGCACCG
GCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCTCCTGAAGAAACTTCTCGAGGGAAGCAATCTCCATG
ATCTTGTCATCGACAGGCTTGGAGCAGTCAATGGAGAAGGAGACTCCCTTCTTCTTTCCC
TTTGCAACGGCTGCACTTCCTCTACTCATTTTTTTTTCTTGAGCAAATCCTGGAAAGTGG
AACACTCTCTGAAGAGACGAGCGGCGTTCTTTTTTCTTTTTAGTTGAGTAGACGAAAACC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS45JQ U 1
AF RR2AP51JQ U 26
AF RR2AP51TF C 26
AF RR2AH23JQ U 73
AF RR2FB60TF C 103
AF RR2DS45TF C 45
AF RR2FB60JQ U 26
BS 1 162 RR2DS45JQ
BS 163 163 RR2AP51JQ
BS 164 170 RR2DS45JQ
BS 171 171 RR2AP51JQ
BS 172 357 RR2DS45JQ
BS 358 358 RR2AP51JQ
BS 359 550 RR2DS45JQ
BS 551 576 RR2AP51JQ
BS 577 577 RR2FB60JQ
BS 578 653 RR2AP51JQ
BS 654 661 RR2FB60JQ

RD RR2DS45JQ 550 0 0
AATCCACATTAACAGATTATTGAATCATTACCAAAATACTTTTCTTAAACAATGGTCTTA
AACAAAAGTTAACTTCAACAAAACTAAAATAGGATGCGTTGATAAAGAACACAAGGGAAA
TGATAAAATTGTATTGAGCAACAACGAACATAAAACAAAAAAAGCGGAAAACAGAAGTTC
TAGTTTTTCTTCTTCTAGTCTTCTTCCTCTCCCTCGTTCTCAGCGATGTTGAAGTACCTC
AACTCGTAGAGGTTACGGTCCTTGTTGGCTGCAATCACTCTGAGCCAATCCCTCACATTG
TGCTTCTTCAAGTACTTCTTCGTCAAGTACTTCAAATACCTCTTGGAGAATTGACCACCG
GAAGTGACAGTGATCTTGTTCTTCTCACGGGTGATAGTGACGGAATCACCGAGTGCACCG
GCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCTCCTGAAGAAACTTCTCGAGGGAAGCAATCTCCATG
ATCTTGTCATCGACAGGCTTGGAGCAGTCAATGGAGAAGGAGACTCCCTTCTTCTTTCCC
TTTGCAACGG

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2AP51JQ 630 0 0
CG
TTACCAAAATACTTTTCTTAAACAATGGTCTTAAACAAAAGTTAACTTCAACAAAACTAA
AATAGGATGCGTTGATAAAGAACACAAGGGAAATGATAAAATTGTATTGAGCAACAACGA
ACATAAAACAAAAAA*GCGGAAA*CAGAAGTTCTAGTTTTTCTTCTTCTAGTCTTCTTCC
TCTCCCTCGTTCTCAGCGATGTTGAAGTACCTCAACTCGTAGAGGTTACGGTCCTTGTTG
GCTGCAATCACTCTGAGCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTACTTCTTCGTCAAG
TACTTCAAATACCTCTTGGAGAATTGACCATCGGAAGTGACAGTGATCTTGTTCTTCTCA
CGGGTGATAGTGACGGAATCACCGAGTGCAC*GGCTTTGCCACCGACCTTGATCCTCTCC
TGAAGAAACTTCTCGAGGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACAGGCTTGGAGCAG
TCGATGGAGAAGGAGACTCCCTTCTTCTTTCCCTATGCAACGGCTGCACTTCCTCTACTC
ATTTTTTTT*CTTGAGCAAATCCTGGAAAGTGGAACACTCTCTGAAGAGACGAGCGGCGT
TCTTTTTTCTTTTTAGTTGAGTAGAC
CC

QA 3 628 3 628
DS 

RD RR2AP51TF 630 0 0
CG
TTACCAAAATACTTTTCTTAAACAATGGTCTTAAACAAAAGTTAACTTCAACAAAACTAA
AATAGGATGCGTTGATAAAGAACACAAGGGAAATGATAAAATTGTATTGAGCAACAACGA
ACATAAAACAAAAAA*GCGGAAA*CAGAAGTTCTAGTTTTTCTTCTTCTAGTCTTCTTCC
TCTCCCTCGTTCTCAGCGATGTTGAAGTACCTCAACTCGTAGAGGTTACGGTCCTTGTTG
GCTGCAATCACTCTGAGCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTACTTCTTCGTCAAG
TACTTCAAATACCTCTTGGAGAATTGACCATCGGAAGTGACAGTGATCTTGTTCTTCTCA
CGGGTGATAGTGACGGAATCACCGAGTGCAC*GGCTTTGCCACCGACCTTGATCCTCTCC
TGAAGAAACTTCTCGAGGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACAGGCTTGGAGCAG
TCGATGGAGAAGGAGACTCCCTTCTTCTTTCCCTATGCAACGGCTGCACTTCCTCTACTC
ATTTTTTTT*CTTGAGCAAATCCTGGAAAGTGGAACACTCTCTGAAGAGACGAGCGGCGT
TCTTTTTTCTTTTTAGTTGAGTAGAC
CC

QA 3 628 3 628
DS 

RD RR2AH23JQ 543 0 0
CTTCAACAAAACTAAAATAGGATGCGTTGATAAAGAACACAAGGGAAATGATAAAATTGT
ATTGAGCAACAACGAACATAAAACAAAAAA*GCGGAAA*CAGAAGTTCTAGTTTTTCTTC
TTCTAGTCTTCTTCCTCTCCCTCGTTCTCAGCGATGTTGAAGTACCTCAACTCGTAAAGG
TTACGGTCCTTGTTGGCCGCAATCACTCTGAGCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAG
TACTTCTTCGTCAAGTACTTCAAATACCTCTTGGAGAATTGACCATCGGAAGTGACGGTG
ATCTTGTTCTTCTCACGGGTGATAGTGACGGAATCACCGAGTGCACCGGCTTTGCCACCG
ACTTTGATCCTCTCCTGAAAAAACTTCTCGAGGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCG
ACAGGCTCGGAGCAGTCAATGGAGAAGGAGACTCCCTTCTTCTTTCCCTTTGCAACGGCT
GCACTTCCTCTACTCATTTTTTTTTCTTGAGCAAATCCTGGAAAGTGGAACACTCTCTGA
AGA

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2FB60TF 559 0 0
TAAAGAACACAAGGGAAATGATAAAATTGTATTGAGCAACAACGAACATAAAACAAAAAA
*GCGGAAA*CAGAAGTTCTAGTTTTTCTTCTTCTAGTCTTCTTCCTCTCCCTCGTTCTCA
GCGATGTTGAAGTACCTCAACTCGTAGAGGTTACGGTCCTTGTTGGCTGCAATCACTCTG
AGCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTACTTCTTCGTCAAGTACTTCAAATACCTC
TTGGAGAATTGACCATCGGAAGTGACAGTGATCTTGTTCTTCTCACGGGTGATAGTGACG
GAATCACCGAGTGCACCGGCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCTCCTGAAGAAACTTCTCG
AGGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACAGGCTTGGAGCAGTCAATGGAGAAGGAG
ACTCCCTTCTTCTTTCCCTTTGCAACGGCTGCACTTCCTCTACTCATTTTTTTTTCTTGA
GCAAATCCTGGAAAGTGGAACACTCTCTGAAGAGACGAGCGGCGTTCTTTTTTCTTTTTA
GTTGAGTAGAC
GAAAACCC

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2DS45TF 603 0 0
TTAAACAATGGTCTTAAACAAAAGTTAACTTCAACAAAACTAAAATAGGATGCGTTGATA
AAGAACACAAGGGAAATGATAAAATTGTATTGAGCAACAACGAACATAAAACAAAAAAAG
CGGAAAACAGAAGTTCTAGTTTTTCTTCTTCTAGTCTTCTTCCTCTCCCTCGTTCTCAGC
GATGTTGAAGTACCTCAACTCGTAGAGGTTACGGTCCTTGTTGGCTGCAATCACTCTGAG
CCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTACTTCTTCGTCAAGTACTTCAAATACCTCTT
GGAGAATTGACCACCGGAAGTGACAGTGATCTTGTTCTTCTCACGGGTGATAGTGACGGA
ATCACCGAGTGCACCGGCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCTCCTGAAGAAACTTCTCGAG
GGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACAGGCTTGGAGCAGTCAATGGAGAAGGAGAC
TCCCTTCTTCTTTCCCTTTGCAACGGCTGCACTTCCTCTACTCATTTTTTTTTCTTGAGC
AAATCCTGGAAAGTGGAACACTCTCTGAAGAGACGAGCGGCGTTCTTTTTTCTTTTTAGT
T
CC

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2FB60JQ 636 0 0
CG
TTACCAAAATACTTTTCTTAAACAATGGTCTTAAACAAAAGTTAACTTCAACAAAACTAA
AATAGGATGCGTTGATAAAGAACACAAGGGAAATGATAAAATTGTATTGAGCAACAACGA
ACATAAAACAAAAAA*GCGGAAA*CAGAAGTTCTAGTTTTTCTTCTTCTAGTCTTCTTCC
TCTCCCTCGTTCTCAGCGATGTTGAAGTACCTCAACTCGTAGAGGTTACGGTCCTTGTTG
GCTGCAATCACTCTGAGCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTACTTCTTCGTCAAG
TACTTCAAATACCTCTTGGAGAATTGACCATCGGAAGTGACAGTGATCTTGTTCTTCTCA
CGGGTGATAGTGACGGAATCACCGAGTGCACCGGCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCTCC
TGAAGAAACTTCTCGAGGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACAGGCTTGGAGCAG
TCAATGGAGAAGGAGACTCCCTTCTTCTTTCCCTTTGCAACGGCTGCACTTCCTCTACTC
ATTTTTTTTTCTTGAGCAAATCCTGGAAAGTGGAACACTCTCTGAAGAGACGAGCGGCGT
TCTTTTTTCTTTTTAGTTGAGTAGACGAAAACCC

QA 3 636 3 636
DS 



AS 2 23

CO CL61Contig1 996 18 38 U
GGACCACAACACTTGACTGATCTTTTCTCTCATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGC
AACACACACAAAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATT
TCTTGAGGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAA
ACTCACCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATCGTTGGTTCCTCTCGCTATCTTCAAAC
CCAAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTA
TCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTG
TTGCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGCTGACTGGGAAAGGGATAT
TAGCACAGCTGAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCGGAGCCGTT*GCTTCTC
TTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTC
GTCGACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCGC
TCTGCCCTCGGTCTGAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTG
TTCGTAGGAAGATTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACC
GGGAAAGGAGCATTGGCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAA
CCACTCGTCCTCTTAAACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGA
AAGTTCATTACTGATGATGGTGAAGAGAGCTAAACTCTTTATATGTACTTTCGAGTTAGT
AGTTTGGGAGACCATTATCATGTTGAGACAAAAGGAAATGGACAATTTAAACTATTGTAA
TACTTGAATCCTTTTGTTTTAACTTGCTTTTTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 65 
65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 55 40 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 15 85 85 85 70 85 85 70 85 70 85 
85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 70 85 85 70 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 65 80 20 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 30 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 60 65 65 65 50 20 50 65 40 15 50 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 15 15 

AF RR2FP69JQ C 200
AF RR2GF68TF U 1
AF RR2E439TF U 6
AF RR2D429TF U 30
AF RR2F456TF U 1
AF RR2CT62TF U 4
AF RR2CY53TF U 24
AF RR2G048TF U 60
AF RR2E704TF U 4
AF RR2FY65TF U 4
AF RR2HB09TF U 54
AF RR2DA58JQ C 180
AF RR2CY53JQ C 316
AF RR2E829TF U 282
AF RR2G048JQ C 220
AF RR2CT62JQ C 256
AF RR2E704JQ C 859
AF RR2FY65JQ C 241
BS 1 68 RR2F456TF
BS 69 69 RR2CT62TF
BS 70 219 RR2F456TF
BS 220 220 RR2CT62TF
BS 221 387 RR2F456TF
BS 388 388 RR2GF68TF
BS 389 400 RR2F456TF
BS 401 401 RR2CT62TF
BS 402 463 RR2F456TF
BS 464 464 RR2CT62TF
BS 465 469 RR2F456TF
BS 470 470 RR2CT62TF
BS 471 521 RR2F456TF
BS 522 522 RR2CT62TF
BS 523 536 RR2F456TF
BS 537 537 RR2E439TF
BS 538 614 RR2F456TF
BS 615 615 RR2CT62TF
BS 616 647 RR2F456TF
BS 648 648 RR2HB09TF
BS 649 663 RR2F456TF
BS 664 667 RR2E704TF
BS 668 668 RR2HB09TF
BS 669 670 RR2E704TF
BS 671 672 RR2FY65TF
BS 673 673 RR2CY53TF
BS 674 721 RR2E704TF
BS 722 727 RR2FY65TF
BS 728 728 RR2HB09TF
BS 729 740 RR2FY65TF
BS 741 741 RR2HB09TF
BS 742 745 RR2FY65TF
BS 746 746 RR2HB09TF
BS 747 761 RR2FY65TF
BS 762 795 RR2HB09TF
BS 796 918 RR2E829TF
BS 919 953 RR2DA58JQ
BS 954 996 RR2G048JQ

RD RR2FP69JQ 184 0 0
ATCTCGAAGACCATCGTTGGCTCCTCTCGCTATCTTCAAACCCAAAACCAAAGCTGCTCC
CAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATTTTCGGAACGTTTGGTGG
GATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTTTCGC
CGCA

QA 1 184 1 184
DS 

RD RR2GF68TF 429 0 0
GGACC
ACAACACTTGACTGATCTTTTCTCTCATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGCAACAC
ACA*AAAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATTTCTTG
AGGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAAACTCA
CCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATCGTTGACTCCTCTCGCTATCTTCAAACCCAAA
ACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTC
GGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCT
ATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCCCTGACTGGGAAAGGGATATTAGCA
CAGC

QA 6 429 6 429
DS 

RD RR2E439TF 583 0 0
GG
AACACTTGACTGATCTTTTCTCTCATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGCAACACAC
A*AAAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATTTCTTGAG
GAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAAACTCACC
GGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATCGTTGGCTCCTCTCGCTATCTTCAAACCCAAAAC
CAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGG
AACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTAT
GATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCCCTGACTGGGAAAGGGATATTAGCACA
GCTGAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATT*GCTTCTCTTCCTCA
TATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTCGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACG
ATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGC

QA 3 583 3 583
DS 

RD RR2D429TF 592 0 0
GG
ATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGCAACACACA*AAAAAATGGCTCAAACCATGCT
GCTTACTTCCGGCATCTCTGCTACCCATTTCTTGAGGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCC
CAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAAACTCACCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACC
ATCGTTGGCTCCTCTCGCTATCTTCAAACCCAAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGA
GAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCAC
GAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCT
AGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATATTAGCACAGCTGAACTTGGAGACAGGAATACC
GATTTACGAAGCGGAGCCATT*GCTTCTCTTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCA
TTGTAGCTCTTGGAGACAGAGGTAAATTCGTCGACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAG
CCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCGCTCTGCCCTCGGTCTCAAAGAA

QA 3 592 3 592
DS 

RD RR2F456TF 663 0 0
GGACCACAACACTTGACTGATCTTTTCTCTCATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGC
AACACACA*AAAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATT
TCTTGAGGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAA
ACTCACCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATCGTTGGCTCCTCTCGCTATCTTCAAAC
CCAAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTA
TCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTG
TTGCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTCGCTAGGTGAGGCCCTGACTGGGAAAGGGATAT
TAGCACAGCTGAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATT*GCTTCTC
TTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTCGGAGACAGAGGAAA*TTC
GTCGACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCGC
TCTGCCCTCGGTCTCAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAAGCGAACGAGTTG
TTC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2CT62TF 660 0 0
GG
ACAACACTTGACTGATCTTTTCTCTCATCCCCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGCAACAC
ACACAAAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATTTCTTG
AGGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCCCTCCGGAAACTCA
CCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATCGTTGGTTCCTCTCGCTATCTTCAAACCCAAA
ACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTC
GGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCT
ATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGCTGACTGGGAAAGGGATATTAGCA
CAGCTGAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCGGAGCCGTT*GCTTCTCTTCTT
CATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGA
CGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCGCTCTGC
CCTCGGTCTGAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAA*GCGAACGAGTTGTTC

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR2CY53TF 689 0 0
C
TTCTCTCATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGCAACACACA*AAAAAATGGCTCAAA
CCATTCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATTTCTTGAGGAACAAGAACCCTCTGG
CTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTTTCCGGAAACTCTCCGGTTACTCTACCATCTC
GAAGACCATCGTTGGTTCCTCTCGCTATCTTCAAACCCAAAACCGAAGCTGCTCCCAAAA
AGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAG
GATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTTTCGCCGCAT
CGTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATATTAGCACAGCTGAACTTGGAGACAG
GAATACCGATTTACGAAGCGGAGCCATTTGCTTCTCTTCTTCATATTGTTCACTCTGTTG
GGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCCACCGGACTC
GAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCGCTCTGTCCTCGGTCTCAAAGAACAA
G*TCCATTGTTTGGGTTCACGAA*GCGAACGAGTTGTTCGTAA*GAAGTTGGCACAGTTG
GGAATAGCATTT*CACTGATTGGGGAGA

QA 2 689 2 689
DS 

RD RR2G048TF 645 0 0
CAACACACACAAAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCAT
TTCTTGAGGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCGTCTCTTCCTCTCCGGA
AACTCACCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATCGTTGGTTCCTCTCGCTATCTTCAAA
CCCAAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGT
ATCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGT
GTTGCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGCTGACTGGGAAAGGGATA
TTAGCACAGCTGAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCGGAGCCGTT*GCTTCT
CTTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATT
CGTCGACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCG
CTCTGCCCTCGGTCTGAAAGAACAAG*TCCATTGTTTGGGTTCACGAA*GCGAACGAGTT
GTTCGTAG*AAGATTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGAT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2E704TF 718 0 0
GG
ACAACACTTGACTGATCTTTTCTCTCATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGCAACAC
ACACAAAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATTTCTTG
AGGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAAACTCA
CCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATCGTTGGTTCCTCTCGCTATCTTCAAACCCAAA
ACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTC
GGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCT
ATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGCTGACTGGGAAAGGGATATTAGCA
CAGCTGAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCGGAGCCGTT*GCTTCTCTTCTT
CATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGA
CGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCGCTCTGC
CCTCGGTCTGAAAGAACAAG*TCCATTGTTTGGGTTCACGAA*GCGAACGAGTTGTTCGT
AG*AAAGATGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACCG

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR2FY65TF 760 0 0
GG
ACAACACTTGACTGATCTTTTCTCTCATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGCAACAC
ACACAAAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATTTCTTG
AGGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCGTCTCTTCCTCTCCGGAAACTCA
CCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATCGTTGGTTCCTCTCGCTATCTTCAAACCCAAA
ACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTC
GGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCT
ATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGCTGACTGGGAAAGGGATATTAGCA
CAGCTGAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCGGAGCCGTT*GCTTCTCTTCTT
CATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGA
CGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCGCTCTGC
CCTCGGTCTGAAAGAACAAG*TCCATTGTTTGGGTTCACGAA*GCGAACGAGTTGTTCGT
AG*AAGATTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGAT*ATTACCGGGAA
AG*AGCATTGGCTCA*CTCA*CATTGAGACTGGTAT
CC

QA 3 758 3 758
DS 

RD RR2HB09TF 742 0 0
GG
GTTGCAACACACACAAAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAA
CCATTTCTTGAGGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTC
CGGAAACTCACCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATCGTTGGTTCCTCTCGCTATCTT
CAAACCCAAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGA
CGGTATCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGG
TCGTGTTGCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGCTGACTGGGAAAGG
GATATTAGCACAGCTGAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCGGAGCCGTT*GC
TTCTCTTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAA
AATTCGTCGACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCG
TTCGCTCTGCCCTCGGTCTGAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACG
AGTTGTTCGTAGGAAGATTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTA
TTACCGGGAAAGGAGCATTGGCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATA
TCGAACCACTCGTCCTCTTA

QA 3 742 3 742
DS 

RD RR2DA58JQ 774 0 0
AACTCACCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATCGTTGGCTCCTCTCGCTATCTTCAAA
CCCAAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGT
ATCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGT
GTTGCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATA
TTAGCACAGCTGAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCGGAGCCATT*GCTTCT
CTTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGTAAATT
CGTCGACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCG
CTCTGCCCTCGGTCTCAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTT
GTTTGTAGGAAGGTTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTAC
CGGGAAAGGAGCATTGGCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGA
ACCACTCGTCCTCTTGAACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGG
AAAGTTCATTACTGATGATGGTGAAGAGAGCTAAACTCTTTA**TGTACTTTCGAGTTAG
TAGTTTGGGAGACCATTATCATGTTGAGACAAAAGGAAATGGACAATTTAAACT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2CY53JQ 625 0 0
GTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTT
TCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATATTAGCACAGCTGAACT
TGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCGGAGCCATT*GCTTTTTTTCTTCATATTGTTC
ACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCC
CCCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCGCTCTGTCCTCGGTCTC
AAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTCGTAGGAAGGTTG
GCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACCGGGAAAGGAGCATTG
GCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCACTCGTCCTCTTG
AACGTTGCTTTTTTTTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGAAAGTTCATTACTGAT
GATGGTGAAGAAGGCTAAACTCTTTA**TGTACTTTCGAGTTAGTAGTTTGGGAGACCAT
TATCATGTTGAGACAAAAGGAAATG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2E829TF 637 0 0
G
CAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACG
AGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGC
TGACTGGGAAAGGGATATTAGCACAGCTGAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAG
CGGAGCCGTT*GTTTCTCTTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTT
GGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCT
CCCGGCAAAGGCGTTCGCTCTGCCCTCGGTCTGAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTC
ACGAAGGCGAACGAGTTGTTCGTAGGAAGATTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTG
ATTGGGGAGATTATTACCGGGAAAGGAGCATTGGCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATT
CCAATTCAAGATATCGAACCACTCGTCCTCTTAAACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCTGCC
ATTAATCCTGGTAATGGAAAGTTCATTACTGATGATGGTGAAGAGAGCTAAACTCTTTAT
ATGTACTTTCGAGTTAGTAGTTTGGGAGACCATTAT

QA 2 637 2 637
DS 

RD RR2G048JQ 777 0 0
TTCCTCTCGCTATCTTCAAACCCAAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGA
AGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGA
ACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGG
CGCTGACTGGGAAAGGGATATTAGCACAGCTGAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACG
AAGCGGAGCCGTT*GCTTCTCTTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCT
CTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATT
CCTCCCGGCAAAGGCGTTCGCTCTGCCCTCGGTCTGAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGG
TTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTCGTAGGAAGATTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCA
CTGATTGGGGAGATTATTACCGGGAAAGGAGCATTGGCTCAACTCAACATTGAGACTGGT
ATTCCAATTCAAGATATCGAACCACTCGTCCTCTTAAACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCT
GCCATTAATCCTGGTAATGGAAAGCTCATTACTGATGATGGTGAAGAGAGCTAAACTCTT
TATATGTACTTTCGAGTTAGTAGTTTGGGAGACCATTATCATGTTGAGACAAAAGGAAAT
GGACAATTTAAACTATTGTAATACTTGAATCCTTTTGTTTTAACTTGCTTTTTTCTG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2CT62JQ 740 0 0
CTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACGTCTG
GTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTT
TCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGCTGACTGGGAAAGGGATATTAGCACAGCTGAACT
TGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCGGAGCCGTT*GCTTCTCTTCTTCATATTGTTC
ACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCC
ACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCGCTCTGCCCTCGGTCTG
AAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTCGTAGGAAGATTG
GCGCAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACCGGGAAAGGAGCATTG
GCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCACTCGTCCTCTTA
AACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGAAAGTTCATTACTGAT
GATGGTGAAGAGAGCTAAACTCTTTATATGTACTTTCGAGTTAGTAGTTTGGGAGACCAT
TATCATGTTGAGACAAAAGGAAATGGACAATTTAAACTATTGTAATACTTGAATCCTTTT
GTTTTAACTTGCTTTTTTC
A

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2E704JQ 141 0 0
GGG
GAAGAGAGCTAAACTCTTTATATGTACTTTCGAGTTAGTAGTTTGGGAGACCATTATCAT
GTTGAGACAAAAGGAAATGGACAATTTAAACTATTGTAATACTTGAATCCTTTTGTTTTA
ACTTGCTTTTTT
TGGGTT

QA 4 135 4 135
DS 

RD RR2FY65JQ 756 0 0
CCAAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTA
TCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTG
TTGCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGCTGACTGGGAAAGGGATAT
TAGCACAGCTGAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCGGAGCCGTT*GCTTCTC
TTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTT
GTCGACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCGC
TCTGCCCTCGGTTTGAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTG
TTCGTAGGAAGATTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACC
GGGAAAGGAGCATTGGCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAA
CCACTCGTCCTCTTAAACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGA
AAGCTCATTACTGATGATGGTGAAGAGAGCTAAACTCTTTATATGTACTTTCGAGTTAGT
AGTTTGGGAGACCATTATCATGTTGAGACAAAAGGAAATGGACAATTTAAACTATTGTAA
TACTTGAATCCTTTTGTTTTAACTTGCTTTTTTCTG

QA 1 756 1 756
DS 



CO CL61Contig2 803 5 3 U
AGGTGTAAAGGAACTAGGGATATAATCAGAAAAAAGCAAGTTAAAACAAAAGGATTTAAG
TATTACAATAGTTTAAATTGTCCATTTCCTTTTGTCTCAACATGATAATGGTCTCCCAAA
CTACTAATAACTCGAAAGTACATAAAGAGTTTAGCTTTCTTCACCATCATCAGTAATGAA
CTTTCCATTACCAGGATTAATGGCAGCAAAGAAGAAGAAAGCAACGTTCAAGAGGACGAG
TGGTTCGATATCTTGAATTGGAATACCAGTCTCAATGTTGAGTTGAGCCAATGCTCCTTT
CCCGGTAATAATCTCCCCAATCAGTGAAAATGCTATTCCCAACTGTGCCAACCTTCCTAC
GAACAACTCGTTCGCCTTCGTGAACCCAAACAATGGACCTTGTTCTTTGAGACCGAGGGC
AGAGCGAACGCCTTTGCCGGGAGGAATGACGGCTTTCTCGAGTCCGGTGGGAGGATCGTC
GACGAATTTTCCTCTGTCTCCGAGAGCTCCAATGGCACCCAACAGAGTGAACAATATGAA
GAAGAGAAGCAATGGCTCTGCTTCGTAAATCGGTATTCCCGTCTCCAAGTTCAGCTGTGC
TAATATCCCTTTCCCAGTCAGGGCCTCACCTAGCAACGATGCGGCGAAACCGATCATAGC
AACACGACCCACAAAGAGCTCGTTCTGCTTCGTGAATCCTATCCCACCAGACGTTCCGAA
GATACCGTCTTCAACCTTTGGCTTCACTTTCTCAACCTTTTGGGAGCAGCTTTGGTTTTG
GGTTTGAAGATAGCGAGAGGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F456JQ U 108
AF RR2D429JQ U 5
AF RR2E439JQ U 44
AF RR2DN52JQ U 26
AF RR2GF68JQ U 1
BS 1 302 RR2GF68JQ
BS 303 303 RR2F456JQ
BS 304 803 RR2GF68JQ

RD RR2F456JQ 372 0 0
ATGGTCCCCCAAACTACTAATAACTCGAAAGTACATAAAGAGTTTAGCTTTCTTCACCAT
CATCAGTAATGAACTTTCCATTACCAGGATTAATGGCAGCAAAAAAAAAAAAAGCAACGT
TCAAAAGGACGAGTGGTTCGATATCTTGAATTGGAATACCAGTCTCAATGTTGAGTTGAG
CCAATGCTCCTTTCCCGGTAATAATCCCCCCAATCAGTGAAAATGCTATTCCCAACTGTG
CCAACCTTCCTACAAACAACTCGTTCGCCTTCGTGAACCCAAACAATGGACCTTGTTCTT
TGAAACCGAGGGCAAAGCGAACGCCTTTGCCGGGAGGAATGACGGCTTTCTCGAGTCCGG
GGGGAGGATCGT

QA 1 372 1 372
DS 

RD RR2D429JQ 475 0 0
GC
AAAGGAACTAGGGATATAATCAGAAAAA*GCAAGTTAAAACAAAAGGATTCAAGTATTAC
AATAGTTTAAATTGTCCATTTCCTTTTGTCTCAACATGATAATGGTCTCCCAAACTACTA
A***CTCGAAAGTACATAAAGAGTTTAGCTCTCTTCACCATCATCAGTAATGAACTTTCC
ATTACCAGGATTAATGGCAGCAAAGAAGAAGAAAGCAACGTTCAAGAGGA*GAGTGGTTC
GATATCTTGAATTGGAATACCAGTCTCAATGTTGAGTTGAGCCAATGCTCCTTTCCCGGT
AATAATCTACCCAATCAGTGAAAATGCTATTCCCAACTGTGCCAACCTTCCTACAAACAA
CTCGTTCGCCTTCGTGAACCCAAACAATGGACCTTGTTCTTTGAGACCGAGGGCAGAGCG
AACGCCTTTGCCGGGAGGAATGACGGCTTTCTCGAGTCCGGTGGGAGGATCGT

QA 3 475 3 475
DS 

RD RR2E439JQ 430 0 0
AAACAAAAGGATTTAAGTATTACAATAGTTTAAATTGTCCATTTCCTTTTGTCTCAACAT
GATAATGGTCTCCCAAACTACTAATAACTCGAAAGTACATAAAGAGTTTAGCTTTCTTCA
CCATCATCAGTAATGAACTTTCCATTACCAGGATTAATGGCAGCAAAGAAAAAAAAAGCA
ACGTTCAAGAGGACGAGTGGTTCGATATCTTGAATTGGAATACCAGTCTCAATGTTGAGT
TGAGCCAATGCTCCTTTCCCGGTAATAATCTCCCCAATCAGTGAAAATGCTATTCCCAAC
TGTGCCAACCTTCCTACGAACAACTCGTTCGCCTTCGTGAACCCAAACAATGGACCTTGT
TCTTTGAGACCGAGGGCAGAGCGAACGCCTTTGCCGGGAGGAATGACGGCTTTCTCGAGT
CCGGGGGGAG

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2DN52JQ 523 0 0
G
CAGAAAAAAGCAAGTTAAAACAAAAGGATTTAAGTATTACAATAGTTTAAATTGTCCATT
TCCTTTTGTCTCAACATGATAATGGTCTCCCAAACTACTAATAACTCGAAAGTACATAAA
GAGTTTAGCTTTCTTCACCATCATCAGTAATGAACTTTCCATTACCAGGATTAATGGCAG
CAAAGAAGAAGAAAGCAACGTTCAAGAGGACGAGTGGTTCGATATCTTGAATTGGAATAC
CAGTCTCAATGTTGAGTTGAGCCAATGCTCCTTTCCCGGTAATAATCTCCCCAATCAGTG
AAAATGCTATTCCCAACTGTGCCAACCTTCCTACGAACAACTCGTTCGCCTTCGTGAACC
CAAACAATGGACCTTGTTCTTTGAGACCGAGGGCAGAGCGAACGCCTTTGCCGGGAGGAA
TGACGGCTTTCTCGAGTCCGGTGGGAGGATCGTCGACGAATTTTCCTCTGTCTCCGAGAG
CTCCAATGGCACCCAACAGAGTGAACAATATGAAGAAGAGAA

QA 2 523 2 523
DS 

RD RR2GF68JQ 803 0 0
AGGTGTAAAGGAACTAGGGATATAATCAGAAAAAAGCAAGTTAAAACAAAAGGATTTAAG
TATTACAATAGTTTAAATTGTCCATTTCCTTTTGTCTCAACATGATAATGGTCTCCCAAA
CTACTAATAACTCGAAAGTACATAAAGAGTTTAGCTTTCTTCACCATCATCAGTAATGAA
CTTTCCATTACCAGGATTAATGGCAGCAAAGAAGAAGAAAGCAACGTTCAAGAGGACGAG
TGGTTCGATATCTTGAATTGGAATACCAGTCTCAATGTTGAGTTGAGCCAATGCTCCTTT
CCTGGTAATAATCTCCCCAATCAGTGAAAATGCTATTCCCAACTGTGCCAACCTTCCTAC
GAACAACTCGTTCGCCTTCGTGAACCCAAACAATGGACCTTGTTCTTTGAGACCGAGGGC
AGAGCGAACGCCTTTGCCGGGAGGAATGACGGCTTTCTCGAGTCCGGTGGGAGGATCGTC
GACGAATTTTCCTCTGTCTCCGAGAGCTCCAATGGCACCCAACAGAGTGAACAATATGAA
GAAGAGAAGCAATGGCTCTGCTTCGTAAATCGGTATTCCCGTCTCCAAGTTCAGCTGTGC
TAATATCCCTTTCCCAGTCAGGGCCTCACCTAGCAACGATGCGGCGAAACCGATCATAGC
AACACGACCCACAAAGAGCTCGTTCTGCTTCGTGAATCCTATCCCACCAGACGTTCCGAA
GATACCGTCTTCAACCTTTGGCTTCACTTTCTCAACCTTTTGGGAGCAGCTTTGGTTTTG
GGTTTGAAGATAGCGAGAGGAGT

QA 1 803 1 803
DS 



AS 3 23

CO CL62Contig1 616 6 6 U
GGGAAAGGTTGTCTAGTTGTGTAAGCAAAAAAGAGAGATAGAGAGAAATGGCTAGCTTCA
CTGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCG
CCGTCTCTGCTCCCGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAGAT
GCTCGATGGAGACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGAGCTGGAGTTTCTGCGGCGG
CTACAGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGA
TGTCAACGGAGGGAACCGGATTGCCCTTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTC
TTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTCGACG
AGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAACTCTAGATATGTCCTTCATCAGTG
TTCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATGAATCATGAACGATCTTCTGGTTTCTTGTAATTTT
AAGTAAACACCCAAAAAACTATTTTCATGTGTACATCCTAAGACATATAAATTTTCATGA
ATAATAGAGTAACTCT


BQ
10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C160TF U 334
AF RR2BV85TF U 2
AF RR2B965JQ C 2
AF RR2B965TF U 2
AF RR2AO06JQ C 1
AF RR2AO06TF U 1
BS 1 1 RR2AO06JQ
BS 2 334 RR2BV85TF
BS 335 476 RR2C160TF
BS 477 529 RR2BV85TF
BS 530 572 RR2B965TF
BS 573 616 RR2AO06TF

RD RR2C160TF 143 0 0
G
GAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTA
CTTCACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCACTCTGAACATG
AACTCTAGATATGTCCTTCATC

QA 2 143 2 143
DS 

RD RR2BV85TF 531 0 0
GGAAAGGTTGTCTAGTTGTGTAAGCAAAAAAGAGAGATAGAGAGAAATGGCTAGCTTCAC
TGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCGC
CGTCTCTGCTCCCGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAGATG
CTCGATGGAGACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGAGCTGGAGTTTCTGCGGCGGC
TACAGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGAT
GTCAACGGAGGGAACCGGATTGCCCTTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCT
TTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTCGACGA
GGATGAAGAGTCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAACTCTAGATATGTCCTTCATCAGTGT
TCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATGAATCATGAACGATCTTCTGGTTT
AAA

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2B965JQ 571 0 0
GGAAAGGTTGTCTAGTTGTGTAAGCAAAAAAGAGAGATAGAGAGAAATGGCTAGCTTCAC
TGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCGC
CGTCTCTGCTCCCGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAGATG
CTCGATGGAGACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGAGCTGGAGTTTCTGCGGCGGC
TACAGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGAT
GTCAACGGAGGGAACCGGATTGCCCTTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCT
TTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTCGACGA
GGATGAAGAGTCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAACTCTAGATATGTCCTTCATCAGTGT
TCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATGAATCATGAACGATCTTCTGGTTTCTTGTAATTTTA
AGTAAACCCCCAAAAAACTATTTTCATGTGT

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2B965TF 571 0 0
GGAAAGGTTGTCTAGTTGTGTAAGCAAAAAAGAGAGATAGAGAGAAATGGCTAGCTTCAC
TGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCGC
CGTCTCTGCTCCCGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAGATG
CTCGATGGAGACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGAGCTGGAGTTTCTGCGGCGGC
TACAGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGAT
GTCAACGGAGGGAACCGGATTGCCCTTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCT
TTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTCGACGA
GGATGAAGAGTCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAACTCTAGATATGTCCTTCATCAGTGT
TCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATGAATCATGAACGATCTTCTGGTTTCTTGTAATTTTA
AGTAAACACCCAAAAAACTATTTTCATGTGT

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2AO06JQ 616 0 0
GGGAAAGGTTGTCTAGTTGTGTAAGCAAAAAAGAGAGATAGAGAGAAATGGCTAGCTTCA
CTGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCG
CCGTCTCTGCTCCCGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAGAT
GCTCGATGGAGACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGAGCTGGAGTTTCTGCGGCGG
CTACAGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGA
TGTCAACGGAGGGAACCGGATTGCCCTTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTC
TTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTCGACG
AGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAACTCTAGATATGTCCTTCATCAGTG
TTCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATGAATCATGAACGATCTTCTGGTTTCTTGTAATTTT
AAGTAAACACCCAAAAAACTATTTTCATGTGTACATCCTAAGACATATAAATTTTCATGA
ATAATAGAGTAACTCT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2AO06TF 616 0 0
G
GGAAAGGTTGTCTAGTTGTGTAAGCAAAAAAGAGAGATAGAGAGAAATGGCTAGCTTCAC
TGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCGC
CGTCTCTGCTCCCGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAGATG
CTCGATGGAGACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGAGCTGGAGTTTCTGCGGCGGC
TACAGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGAT
GTCAACGGAGGGAACCGGATTGCCCTTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCT
TTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTCGACGA
GGATGAAGAGTCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAACTCTAGATATGTCCTTCATCAGTGT
TCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATGAATCATGAACGATCTTCTGGTTTCTTGTAATTTTA
AGTAAACACCCAAAAAACTATTTTCATGTGTACATCCTAAGACATATAAATTTTCATGAA
TAATAGAGTAACTCT

QA 2 616 2 616
DS 



CO CL62Contig2 661 14 20 U
GGGTTGTGTTGTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGA
GTTTGTACTTGTGTTGGAGCAAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCG
TGTCTGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCTGCTCCTGTTC
TTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGC
AAGGAAACGTCTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGG
CTGTGATGAGCAACCCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAG
GATTACCATTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTT
TGATCTGGACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTC
TTTCTCTCTGAATATGTACTACTACTATATGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCT
CTCTCGTTTTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTCCTGGTTTCTTGT
TTTTAAATGAACACAAAAAAAATCATGTGTATATCTTATTTAAATGTTTCATGTTAATCA
C


BQ
30 35 35 40 40 40 40 40 10 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 55 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 60 60 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 40 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 15 75 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 
60 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
10 

AF RR2D113TF U 87
AF RR2BV83JQ C 65
AF RR2BV83TF U 65
AF RR2D113JQ C 9
AF RR2B758JQ C 1
AF RR2FB16JQ C 1
AF RR2FB16TF U 1
AF RR2B758TF U 1
AF RR2FW81TF U -2
AF RR2CF96TF U 9
AF RR2GA18TF U 4
AF RR2DC06JQ C 9
AF RR2DC06TF U 9
AF RR2FW81JQ C 174
BS 1 64 RR2FB16TF
BS 65 86 RR2BV83TF
BS 87 124 RR2D113TF
BS 125 125 RR2BV83TF
BS 126 132 RR2D113TF
BS 133 133 RR2BV83TF
BS 134 237 RR2D113TF
BS 238 325 RR2BV83TF
BS 326 326 RR2B758TF
BS 327 514 RR2BV83TF
BS 515 515 RR2B758TF
BS 516 587 RR2BV83TF
BS 588 588 RR2B758TF
BS 589 589 RR2BV83TF
BS 590 601 RR2FB16TF
BS 602 621 RR2FW81TF
BS 622 622 RR2CF96TF
BS 623 623 RR2DC06TF
BS 624 659 RR2FW81TF
BS 660 661 RR2FW81JQ

RD RR2D113TF 151 0 0
AAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTGTCCGTCGCTCATCCTGCTCTCCTT
CTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCTGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGG
AAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAA

QA 1 151 1 151
DS 

RD RR2BV83JQ 525 0 0
GTACTTGTGTTGGAGCAAAAAGAAAATGGTTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTGTC
TGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCTGCTCCTGTTCTTGG
TTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGTGGAGTGAAATGCTCCATGGAGTCAAAGCAAGG
AAACGTCTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGT
GATGAGCAACCCGGCCATGGCGTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATT
ACCATTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGAT
CTGGACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTC
TCTCTGAATATGTACTACTACTATATGTCTTTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCT
CGTTTTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTTC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2BV83TF 525 0 0
GTACTTGTGTTGGAGCAAAAAGAAAATGGTTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTGTC
TGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCTGCTCCTGTTCTTGG
TTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGTGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGG
AAACGTCTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGT
GATGAGCAACCCGGCCATGGCGTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATT
ACCATTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGAT
CTGGACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTC
TCTCTGAATATGTACTACTACTATATGTCTTTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCT
CGTTTTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTTC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2D113JQ 585 0 0
GGGTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGAGTTTGTAC
TTGTGTTGGAGCAAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTGTCTGTC
GCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTTTTTGCTCCTGTTCTTGGTTTG
CCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAAC
GTTTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATG
AGCAACCCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCA
TTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGG
ACTTTTTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTC
TGAATATGTACTACTACTATATGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCGTT
TTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTCCTGGT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2B758JQ 601 0 0
GGGTTGTGTTGTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAGACAAAAATCTCAGATTGAAGAGA
GTTTGTACTTGTGTTGGAGCAAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCG
TGTCTGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCTGCTCCTGTTC
TTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGC
AAGGAAACGTCTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGG
CTGTGATGAGCAACCCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAG
GATTACCATTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTT
TGATCTGGACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTC
TTTCTCTCTGAATATGTACTACTACTATATGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCT
CTCTCGTTTTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTCCTGGTTTCTTGT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2FB16JQ 601 0 0
GGGTTGTGTTGTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGA
GTTTGTACTTGTGTTGGAGCAAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCG
TGTCTGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTTTCTGCTCCTGTTC
TTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGTGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGC
AAGGAAACGTTTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGG
CTGTGATGAGCAACCCGGCCATGGCGTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAG
GATTACCATTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTT
TGATCTGGACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTC
TTTCTCTCTGAATATGTACTACTACTATATGTCTTTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCT
CTCTCGTTTTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTTCTGGTTTCTTGT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2FB16TF 601 0 0
GGGTTGTGTTGTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGA
GTTTGTACTTGTGTTGGAGCAAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCG
TGTCTGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCTGCTCCTGTTC
TTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGTGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGC
AAGGAAACGTCTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGG
CTGTGATGAGCAACCCGGCCATGGCGTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAG
GATTACCATTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTT
TGATCTGGACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTC
TTTCTCTCTGAATATGTACTACTACTATATGTCTTTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCT
CTCTCGTTTTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTTCTGGTTTCTTGT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2B758TF 601 0 0
GGGTTGTGTTGTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAGACAAAAATCTCAGATTGAAGAGA
GTTTGTACTTGTGTTGGAGCAAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCG
TGTCTGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCTGCTCCTGTTC
TTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGC
AAGGAAACGTCTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGG
CTGTGATGAGCAACCCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAG
GATTACCATTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTT
TGATCTGGACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTC
TTTCTCTCTGAATATGTACTACTACTATATGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCT
CTCTCGTTTTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTCCTGGTTTCTTGT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2FW81TF 664 0 0
GAAA
GGTTGTGTTGTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGAG
TTTGTACTTGTGTTGGAGCAAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGT
GTCTGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCTGCTCCTGTTCT
TGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCA
AGGAAACGTCTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGC
TGTGATGAGCAACCCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGG
ATTACCATTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTT
GATCTGGACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTCT
TTCTCTCTGAATATGTACTACTACTATATGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTC
TCTCGTTTTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTCCTGGTTTCTTGTT
TTTAAATGAACACAAAAAAAT*CATGTGTATATCTTATTTAAATGTTTCATGTTAATC
AC

QA 5 662 5 662
DS 

RD RR2CF96TF 614 0 0
GGGTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGAGTTTGTAC
TTGTGTTGGAGCAAAAC*AAAATGGCTAGCTTCACTACCTCTGCTTCCACCGTGTCTGTC
GCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCAGCTCCTGTTCTTGGTTTG
CCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAAC
GTCTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCAGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATG
AGCAACCCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCA
TTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGG
ACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTC
TGAATATGTACTACTACTATATGTCTCTTTTAGCCTTCATC**********TCTCTCGTT
TTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATCTTCTGGTTTCTTGTTTTTAAAT
AAATACAAAAAAAA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2GA18TF 618 0 0
TTGTGTTGTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGAGTT
TGTACTTGTGTTGGAGCAAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTGT
CTGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCTGCTCCTGTTCTTG
GTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAG
GAAACGTCTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTG
TGATGAGCAACCCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGAT
*ACCATTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGA
TCTGGACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTT
CTCTCTGAATATGTACTACTACTATATGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTC
TCGTTTTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTCCTGGTTTCTTGTTTT
TAAATGAACACAAAAAAA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2DC06JQ 651 0 0
GGGTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGAGTTTGTAC
TTGTGTTGGAGCAAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTGTCTGTC
GCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCTGCTCCTGTTCTTGGTTTG
CCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAAC
GTTTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATG
AGCAACCCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCA
TTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGG
ACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTC
TGAATATGTACTACTACTATATGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCGTT
TTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTCCTGGTTTCTTGTTTTTAAAT
GAACACAAAAAAAATCATGTGTATATCTTATTTAAATGTTTCATGTTAATC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2DC06TF 651 0 0
GGGTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGAGTTTGTAC
TTGTGTTGGAGCAAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTGTCTGTC
GCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCTCCCTCTCTGCTCCTGTTCTTGGTTTG
CCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAAC
GTCTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATG
AGCAACCCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATTACCA
TTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGG
ACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTC
TGAATATGTACTACTACTATATGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCGTT
TTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTCCTGGTTTCTTGTTTTTAAAT
GAACACAAAAAAAATCATGTGTATATCTTATTTAAATGTTTCATGTTAATC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2FW81JQ 488 0 0
CCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAG
TCAAAGCAAGGAAACGTCTCAGCCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCT
TTGACGGCTGTGATGAGCAACCCGGCCATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAA
GGAACAGGATTACCATTTGGGCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTG
TTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAG
TCTGGTCTTTCTCTCTGAATATGTACTACTACTATATGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTG
TTCATCTCTCTCGTTTTCATTCTCATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTTCCTGGT
TTCTTGTTTTTAAATGAACACAAAAAAAATCATGTGTATATCTTATTTAAATGTTTCATG
TTAATCAC

QA 1 488 1 488
DS 



CO CL62Contig3 580 3 2 U
ACACATGAAAATAGTTTTTTTAGGTGTTTACTTAAAATTACAAGAAACCAAAAGCTCGTT
CATGATTCATGTCCTCAAACGAAAATGGAAAAGGAAAAAGAAAGAAAACACTGATGAAGG
ACATATCTAGAGTTCATGTTCAGAGTGAAAGACCAAATTCTTCATCCTCGTCGAGAGATG
AAGTGTAGGTGAAGTAAAAAGTCCAGATCAAACCAAACACTCCTAAAAAAATCCAACCCA
AGAGGTTGTTGCTCAGCCCAAAGGGCAAGCCGGTTCCCTCCGTTGACATCCTGTCATCCA
CCAAAGCCATAGCCGGGCTGCTCATCACAGCCGTCAAAGCTGCTGTAGCCCCCGCAAAAA
CTCCAGCTCCCACGGCTGACACGCTTCCTTGCTTGGTCTCCATCGAGCACTTCACTCCTC
CCTTCCTCTTACTCATTGGAGGCAAACCAAGAACGGGAGCAGAGACCGCGACGGTGGGCT
TGAGAAGGAGAGCAGGACGAGCGACGGAGACGGTGGAAGCGGAGGCAGTGAAGCTAGCCA
TTTCACTCAATCTCTCTTTTTTGCTTACACAACTAGACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK08JQ U 1
AF RR2CD47JQ U 181
AF RR2EK08TF C 1
BS 1 461 RR2EK08JQ
BS 462 580 RR2EK08TF

RD RR2EK08JQ 465 0 0
ACACATGAAAATAGTTTTTTTAGGTGTTTACTTAAAATTACAAGAAACCAAAAGCTCGTT
CATGATTCATGTCCTCAAACGAAAATGGAAAAGGAAAAAGAAAGAAAACACTGATGAAGG
ACATATCTAGAGTTCATGTTCAGAGTGAAAGACCAAATTCTTCATCCTCGTCGAGAGATG
AAGTGTAGGTGAAGTAAAAAGTCCAGATCAAACCAAACACTCCTAAAAAAATCCAACCCA
AGAGGTTGTTGCTCAGCCCAAAGGGCAAGCCGGTTCCCTCCGTTGACATCCTGTCATCCA
CCAAAGCCATAGCCGGGCTGCTCATCACAGCCGTCAAAGCTGCTGTAGCCCCCGCAAAAA
CTCCAGCTCCCACGGCTGACACGCTTCCTTGCTTGGTCTCCATCGAGCACTTCACTCCTC
CCTTCCTCTTACTCATTGGAGGCAAACCAAGAACGGGAGCA
AAAA

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR2CD47JQ 285 0 0
AAGTGTAGGTGAAGTAAAAAGTCCAAATCAAACCAAACACTCCTAAAAAAATCCAACCCA
AGAGGTTGTTGCTCAGCCCAAAGGGCAAGCCGGTTCCCTCCGTTGACATCCTGTCATCCA
CCAAAGCCATAGCCGGGCTGCTCATCACAGCCGTCAAAGCTGCTGTAGCCCCCCCAAAAA
CTCCAGCTCCCACGGCTGACACGCTTCCTTGCTTGGTCTCCATCGAGCACTTCACTCCTC
CCTTCCTCTTACTCATTGGAGGCAAACCAAAAACGGGAGCA
AAAA

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR2EK08TF 580 0 0
ACACATGAAAATAGTTTTTTTAGGTGTTTACTTAAAATTACAAGAAACCAGAAGCTCGTT
CATGATTCATGTCCTCAAACGAAAATGGAAAAGGAGAAAGAGAGAGAACACTGATGAAGG
ACATATCTAGAGTTCATGTTCAGAGTGAAAGACCAGATTCTTCATCCTCGTCGAGAGATG
AAGTGTAGGTGAAGTAGAAAGTCCAGATCAAACCAAACACTCCTAAAAGAATCCAACCCA
AGAGGTTGTTGCTCAGCCCAAAGGGCAAGCCGGTTCCCTCCGTTGACATCCTGTCATCCA
CCAAAGCCATAGCCGGGCTGCTCATCACAGCCGTCAAAGCTGCTGTAGCCGCCGCAGAAA
CTCCAGCTCCCACGGCTGACACGCTTCCTTGCTTGGTCTCCATCGAGCACTTCACTCCTC
CCTTCCTCTTACTCATTGGAGGCAAACCAAGAACGGGAGCAGAGACCGCGACGGTGGGCT
TGAGAAGGAGAGCAGGACGAGCGACGGAGACGGTGGAAGCGGAGGCAGTGAAGCTAGCCA
TTTCACTCAATCTCTCTTTTTTGCTTACACAACTAGACCC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 4 15

CO CL63Contig1 1040 3 5 U
CTGATCAGATATGTTCTTGTTTTCAGCATTGATATGAAAAAATGCAAATGATATATTCAT
ACAAAAGGGACTGTAAAGAAATTGATTTGATACATTTTGCGGAAGGATATTGATCAGAGT
AAAAGAAAAGAAGAAAAATAAAAACTCTGCTCACATTTCACATATAACAAAGGTTGTAGC
TTATTCTAAATAGCTGAGAAGTACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTCAGGTTTCATTGACTTC
TCACCCGGTTGCCATCCTGCAGGGCAGACTTCATCAGGGTTCTCCTGGATGTACTGTAAC
GCCTGGAGGGTTCTCATAGTCTCATCGACGCTTCGGCCAATACCAAGATTGTTGATGGTG
GAATGTTGGATCACTCCTTCCTTGTCGATTATGAAAAGCCCTCTCAGTGCTATTCCCTGA
TCATGGATGAGCACTCCAAAAGACTTTGAGATGGATTTAGTTACATCTGAAACAAGGGGG
TAGTTCAGATCACCAAGCCCTCCAGATTGTCTGTCTGTCCGGACCCACGCAAGGTGGGAG
AACACACTATCAACAGAGACACCTAACACTTCTGTGTTCAACTTCTCAAACTCTGCGTAC
CGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTTGGGCAGACGAAAGTGAAGTCCAAAGGGTAGAAA
AAGAGAATCACATACTTCTTCCCAATGTACTCAGAAAGCTTAACCTTGATGAACTCCTGA
TCAAACACAGCCTCAGCCTCAAAATCAGGCGCCTTGTTTCCAACCAATGGAAGATCATCG
GCATGGGCCTTGACAGAAAAGCTACGGCGTGAAGTGGAGCTGAGGGAAGAGCGGAGAGGA
GAGGGTATGATGGTTGGAAGGAAAGAGAGGGAGGAGGGAGATGGAAGCGAAGACTTTGTT
GGAGAAACTCGAGTGGAGGAGGAGATGAGAGTGGTCGAAGAAGCTATGGAGGCAGCCATT
GTTAACACTTTTGCGACTCTCTCCTCTCTGTTTTACTCAGAGCTACAAAACACTTATCTC
TGTGTGTGTTGTGTGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK85JQ U 1
AF RR2B225JQ U 88
AF RR2AK85TF C 160
BS 1 744 RR2AK85JQ
BS 745 785 RR2B225JQ
BS 786 786 RR2AK85TF
BS 787 820 RR2B225JQ
BS 821 1040 RR2AK85TF

RD RR2AK85JQ 744 0 0
CTGATCAGATATGTTCTTGTTTTCAGCATTGATATGAAAAAATGCAAATGATATATTCAT
ACAAAAGGGACTGTAAAGAAATTGATTTGATACATTTTGCGGAAGGATATTGATCAGAGT
AAAAGAAAAGAAGAAAAATAAAAACTCTGCTCACATTTCACATATAACAAAGGTTGTAGC
TTATTCTAAATAGCTGAGAAGTACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTCAGGTTTCATTGACTTC
TCACCCGGTTGCCATCCTGCAGGGCAGACTTCATCAGGGTTCTCCTGGATGTACTGTAAC
GCCTGGAGGGTTCTCATAGTCTCATCGACGCTTCGGCCAATACCAAGATTGTTGATGGTG
GAATGTTGGATCACTCCTTCCTTGTCGATTATGAAAAGCCCTCTCAGTGCTATTCCCTGA
TCATGGATGAGCACTCCAAAAGACTTTGAGATGGATTTAGTTACATCTGAAACAAGGGGG
TAGTTCAGATCACCAAGCCCTCCAGATTGTCTGTCTGTCCGGACCCACGCAAGGTGGGAG
AACACACTATCAACAGAGACACCTAACACTTCTGTGTTCAACTTCTCAAACTCTGCGTAC
CGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTTGGGCAGACGAAAGTGAAGTCCAAAGGGTAGAAA
AAGAGAATCACATACTTCTTCCCAATGTACTCAGAAAGCTTAACCTTGATGAACTCCTGA
TCAAACACAGCCTCAGCCTCAAAA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2B225JQ 733 0 0
TGATACATTTTGCGGAAGGATATTGTTCAGCGTAAAAGAAAAGAAGAACAA*AAAAACTC
TGCTCACATTTCACATATAACAAAGGTTGTAGCC*ATTCTAAATAGCTGAGAAGTACTCT
TTGCTGAGCTTGGGGTCAGGTTTCATTGACTTCTCACCCGGTTGCCATCCTGCAGGGCAG
ACTTCATCAGGGTTCTCCTGGATGTACTGTAAGGCCTGGAGGGTTCTCATAGTCTCATCG
ACGCTTCGGCCAATACCAAGATTGTTGATGGTGGAATGTTGGATCACTCCTTCCTTGTCG
ATTATGAAAAGCCCTCTCAGTGCTATTCCCTGATCATGGATGAGCACTCCAAAAGACTTT
GAGATTGATTTAGTTACATCTGAAACAAGGGGGTAGTTCAGATCACCAAGCCCTC*AGAT
T*TCTGTCTGTCTGGACCCACGCAAGGTGGGAGAACACACTATCAACAGAGACACCCAAC
ACTTCTGTGTTCAACTTCTCAAAATCTGCGTACCGATCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTT
GGGCAGACGAAAGTGAAGTCCAAAGGGTAGAAAAAGAGAATCACATACTTCTTCCCAATG
TACTCAGAAAGCTTAACCTTGATGAACTCCTGATCAAACACAGCCTCAGCCTCAAAATCA
GGCGCCTTGTTTCCAACCAATGGAAGATCATCGGCATGTGCCTTGACAGAAAAGCTACGG
CGTGAAGTGGAGC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2AK85TF 881 0 0
ACATATAA
CAAAGGTTGTAGCTTAT*CTAAATAGCTGAGAAGTACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTCAGG
TTTCATTGACT*CTCACCCGGTTGCCATC*TGCAGGGCAGACTTCATCAGGGTTCTCCTG
GATGTACTGTAACGCCTGGAGGGTTCTCATAGTCTCATCGACGCTTCGGCCAATACCAAG
ATTGTTGATGGTGGAATGTTGGATCACTCCTTCCTTGTCGATTATGAAAAGCCCTCTCAG
TGCTATTCCCTGATCATGGATGAGCACTCCAAAAGACTTTGAGATGGATTTAGTTACATC
TGAAACAAGGGGGTAGTTCAGATCACCAAGCCCTCCAGATTGTCTGTCTGTCCGGACCCA
CGCAAGGTGGGAGAACACACTATCAACAGAGACACCTAACACTTCTGTGTTCAACTTCTC
AAACTCTGCGTACCGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTTGGGCAGACGAAAGTGAAGTC
CAAAGGGTAGAAAAAGAGAATCACATACTTCTTCCCAATGTACTCAGAAAGCTTAACCTT
GATGAACTCCTGATCAAACACAGCCTCAGCCTCAAAATCAGGCGCCTTGTTTCCAACCAA
TGGAAGATCATCGGCCTGGGCCTTGACAGCAAAGCTCCGGCGTGAGGTGGAGTTGAGGGA
AGAGCGGAGAGGAGAGGGTATGATGGTTGGAAGGAAAGAGAGGGAGGAGGGAGATGGAAG
CGAAGACTTTGTTGGAGAAACTCGAGTGGAGGAGGAGATGAGAGTGGTCGAAGAAGCTAT
GGAGGCAGCCATTGTTAACACTTTTGCGACTCTCTCCTCTCTGTTTTACTCAGAGCTACA
AAACACTTATCTCTGTGTGTGTTGTGTGTCTCC

QA 9 881 9 881
DS 



CO CL63Contig2 1041 3 10 U
GGGACACACAACACACACAGAGATAAGTGTTTTGTAGAGAGGAGAGTCGCAAAGTGTTAT
CAAATGGCGTCGTCTACTATAGCTTCTTCGACCACTCTCATCTCCTCCTCCACTCGAGTT
TCTCCACCAAAGTCTTCGCTTCCATCTCCCTCCTCCGTCTCTTTCCTTCCAACCATCATA
CCCTCTCCTCTCCGCTCTGGTTTTTCTCTCCGCTCTTCCCTCAGCTCCACTTCACGCCGT
AGCTTTTCTGTCAAGGCACATGCCGATGATCTTCCATTGGTTGGAAACAAGGCGCCTGAT
TTTGAGGCTGAGGCTGTGTTTGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTTTCTGAGTACATT
GGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTCGTCTGCCCAACA
GAGATTACTGCCTTCAGTGATCGGTACGCAGAGTTTGAGAAGTTGAACACAGAAGTGTTA
GGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCGTGGGTCCAGACAGACAGACAATCT
GGAGGGCTTGGTGATCTGAACTACCCCCTTGTTTCAGATGTAACTAAATCAATCTCAAAG
TCTTTTGGAGTGCTCATCCATGATCAGGGAATAGCACTGAGAGGGCTTTTCATAATCGAC
AAGGAAGGAGTGATCCAACATTCCACCATCAACAATCTTGGTATTGGCCGAAGCGTCGAT
GAGACTATGAGAACCCTCCAGGCCTTACAGTACATCCAGGAGAACCCTGATGAAGTCTGC
CCCGCAGGATGGCAACCGGGTGAGAAGTCAACGAAACCTGACCCCAAGCTCAGCAAAGAG
TACTTCTCAGCTATTTAGAATAAGCTACAACCTTTGCATATGTGAAATATGAGCAGAGTT
TTTATTTTTCTTCTTCTTTTCTTTTACTCTGAACAATCCTTCCGCAAAATGTATCAAATC
AATTTCTTTTGCCGTCCCTTTTGTATGAATATGTCATTTGTATTTTTCATATCAATGCTG
AAAACAAGAACATATCTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G374TF U 8
AF RR2B225TF U 1
AF RR2GN72JQ C 545
BS 1 452 RR2B225TF
BS 453 453 RR2G374TF
BS 454 479 RR2B225TF
BS 480 480 RR2G374TF
BS 481 534 RR2B225TF
BS 535 535 RR2G374TF
BS 536 541 RR2B225TF
BS 542 542 RR2G374TF
BS 543 761 RR2B225TF
BS 762 1041 RR2GN72JQ

RD RR2G374TF 694 0 0
GG
AACACACACAGAGATAAGTGTTTTGTAGAGAGGAGAGTCGCAAAGTGTTATCAAATGGCG
TCGTCTACTATAGCTTCTTCGACCACTCTCATCTCCTCCTCCACTCGAGTTTCTCCACCA
AAGTCTTCGCTTCCATCTCCCTCCTCCGTCTCTTTCCTTCCAACCATCATACCCTCTCCT
CTCCGCTCTGGTTTTTCTCTCCGCTCTTCCCTCAGCTCCACTTCACGCCGTAGCTTTTCT
GTCAAGGCACATGCCGATGATCTTCCATTGGTTGGAAGCAAGGCGCCTGATTTTGAGGCT
GAGGCTGTGTTTGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTTTCTGAGTACATTGGGAAGAAG
TATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTCGTCTGCCCAACAGAGATTACT
GCCTTCAGTGATCGGTACGCAGAGTTTGAGAAGTTGAACACAGAAGTGTTAGGTGTCTCT
GTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCGTGGGTCCAGACAGACAGACAATCTGGAGGGCTT
GGTGATCTGAACTACCCCCTTTTTTCAGATGTAACTAAATCAATCTCAAAGTCTTTTGGA
GTGCTCATCCATGATCAGGGAATAGCACTGAGAGGGCTTTTCATAATCGACAGGGAAG*A
GTGATCCAACATTCCACCATCA*CAATCTTGG

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR2B225TF 761 0 0
GGGACACACAACACACACAGAGATAAGTGTTTTGTAGAGAGGAGAGTCGCAAAGTGTTAT
CAAATGGCGTCGTCTACTATAGCTTCTTCGACCACTCTCATCTCCTCCTCCACTCGAGTT
TCTCCACCAAAGTCTTCGCTTCCATCTCCCTCCTCCGTCTCTTTCCTTCCAACCATCATA
CCCTCTCCTCTCCGCTCTGGTTTTTCTCTCCGCTCTTCCCTCAGCTCCACTTCACGCCGT
AGCTTTTCTGTCAAGGCACATGCCGATGATCTTCCATTGGTTGGAAACAAGGCGCCTGAT
TTTGAGGCTGAGGCTGTGTTTGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTTTCTGAGTACATT
GGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTCGTCTGCCCAACA
GAGATTACTGCCTTCAGTGATCGGTACGCAGATTTTGAGAAGTTGAACACAGAAGTGTTG
GGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCGTGGGTCCAGACAGACAGA*AATCT
G*AGGGCTTGGTGATCTGAACTACCCCCTTGTTTCAGATGTAACTAAATCAATCTCAAAG
TCTTTTGGAGTGCTCATCCATGATCAGGGAATAGCACTGAGAGGGCTTTTCATAATCGAC
AAGGAAGGAGTGATCCAACATTCCACCATCAACAATCTTGGTATTGGCCGAAGCGTCGAT
GAGACTATGAGAACCCTCCAGGCCTTACAGTACATCCAGGA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2GN72JQ 497 0 0
GGCTTGGTGATCTGAACTACCCCCTTGTTTCAGATGTTACTAAATCAATCTCAAAGTCTT
TCGGAGTGCTCATCCATGATCAGGGAATAGCACTGAGAGGGCTTTTCATAATCGACAAGG
AAGGAGTGATCCAACATTCCACCATTAACAATCTTGGTATTGGCCGAAGCGTCGATGAGG
CTATGAGAACCCTCCAGGCGTTACAGTACATCCAGGAGAACCCTGATGAAGTCTGCCCCG
CAGGATGGCAACCGGGTGAGAAGTCAACGAAACCTGACCCCAAGCTCAGCAAAGAGTACT
TCTCAGCTATTTAGAATAAGCTACAACCTTTGCATATGTGAAATATGAGCAGAGTTTTTA
TTTTTCTTCTTCTTTTCTTTTACTCTGAACAATCCTTCCGCAAAATGTATCAAATCAATT
TCTTTTGCCGTCCCTTTTGTATGAATATGTCATTTGTATTTTTCATATCAATGCTGAAAA
CAAGAACATATCTGATC

QA 1 497 1 497
DS 



CO CL63Contig3 925 6 9 U
GGACGCAGATAAGTCTCAATGGCGTCTGTAGCTTCTTCAACCACTCTCATCTCCTCCTCC
ACCAGAGCTCTCCCAGCCAAGTCTCCGCTTTCATCTCCCTCCATCTCTTTCCTTCCAACC
CTCTCTTCTCCTCTCCGCTCTGGCTTTGCTCAACGCTCTTCCCTCACTTCAATCCGCTCC
ACTTCTCGCCCGAGCTTCGTTGTCAAGGCTCAAACCGATGATCTTCCACTGGTTGGAAAC
AAGGCGCCTGATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTC
TCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTTTTTTTCTACCCTTTGGACTTTACCTTC
GTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATTTGAGAAGTTGAAC
ACAGAGGTGTTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCTTGGGTTCAAACA
GACAGAAAATCTGGAGGACTTGGTGATCTCAACTACCCCCTTGTATCAGATGTCACTAAA
TCAATCTCAAAATCTTTTGGAGTGCTCATCCCTGACCAGGGGATAGCGTTGAGAGGGCTT
TTCATAATAGACAAGGAAGGTGTGATCCAACATTCAACCATCAACAATCTTGGTATTGGC
CGAAGTGTTGATGAGACAATGAGAACCCTTCGGGCATTACAGTACATCCAGGAGAACCCT
GATGAAGTCTGCCCTGCAGGATGGAAACCAGGGGAGAAGTCAATGAAACCTGACCCCAAG
CTCAGCAAAGAGTATTTTTCAGCTATTTAGTAATATCTACAAAACCATTGTTATATATGA
GCTGAGTTTTTTTTTTTTAAAGCCGCTGAACAATCCTTTGTTTGAATCTCCACTTTGTCC
CCCAGAATCCTTAAAACTTACATTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 20 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 5 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN93TF U 1
AF RR2G124TF U 1
AF RR2B464TF U 1
AF RR2EU56TF U 12
AF RR2DB69TF U 1
AF RR2C522JQ C 252
BS 1 690 RR2B464TF
BS 691 693 RR2DB69TF
BS 694 694 RR2EU56TF
BS 695 715 RR2DB69TF
BS 716 716 RR2EU56TF
BS 717 718 RR2DB69TF
BS 719 719 RR2C522JQ
BS 720 735 RR2DB69TF
BS 736 925 RR2C522JQ

RD RR2GN93TF 479 0 0
GGACGCAGATAAGTCTCAATGGCGTCTGTAGCTTCTTCAACCACTCTCATCTCCTCCTTC
ACCAGAGCTCTCCCAGCCAAGTCTCCGCTTTCATCTCCCTCCATCTCTTTCCTTCCAACC
CTCTCTTCTCCTCTCCGCTCTGGCTTTGCTCAACGCTCTTCCCTCACTTCAATCCGCTCC
ACTTCTCGCCCGAGCTTCGTTGTCAAGGCTCAAACCGATGATCTTCCACTGGTTGGAAAC
AAGGCGCCTGATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTC
TCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTTTTTTTCTACCCTTTGGACTTTACCTTC
GTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATTTGAGAAGTTGAAC
ACAGAGGTGTTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCTTGGGTTCAAAC

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR2G124TF 611 0 0
GGACGCAGATAAGTCTCAATGGCGTCTGTAGCTTCTTCAACCACTCTCATCTCCTCCTCC
ACCAGAGCTCTCCCAGCCAAGTCTCCGCTTCCATCTCCCTCCATCTCTTTCCTTCCAACC
CTCTCTTCTCCTCTCCGCTCTGGCTTTGCTCAACGCTCTTCCCTCACCTCAATCCGCTCC
ACTTCTCGTCGGAGCTTCGTTGTCAAGGCTCAAACCGATGATCTTCCACTGGTTGGAAAC
AAGGCGCCTGATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTC
TCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTTTTTTTCTACCCTTTGGACTTTACCTTC
GTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATTTGAGAAGTTAAAC
ACAGAGGTGTTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGCGTTCTCCCACCTTGCGTGGGTTCAAACA
GACAGAAAATCTGGAGGACTTGGTGATCTCAACTATCCACTTATATCAGATGTCACTAAA
TCAATCTCAAAACCTTTTGGAGTGTTCATCCCTGACCAGGGAATAGCGTTGAGAGGGCTT
TTCATAATAGA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2B464TF 690 0 0
GGACGCAGATAAGTCTCAATGGCGTCTGTAGCTTCTTCAACCACTCTCATCTCCTCCTCC
ACCAGAGCTCTCCCAGCCAAGTCTCCGCTTTCATCTCCCTCCATCTCTTTCCTTCCAACC
CTCTCTTCTCCTCTCCGCTCTGGCTTTGCTCAACGCTCTTCCCTCACTTCAATCCGCTCC
ACTTCTCGCCCGAGCTTCGTTGTCAAGGCTCAAACCGATGATCTTCCACTGGTTGGAAAC
AAGGCGCCTGATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTC
TCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTTTTTTTCTACCCTTTGGACTTTACCTTC
GTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATTTGAGAAGTTGAAC
ACAGAGGTGTTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCTTGGGTTCAAACA
GACAGAAAATCTGGAGGACTTGGTGATCTCAACTACCCCCTTGTATCAGATGTCACTAAA
TCAATCTCAAAATCTTTTGGAGTGCTCATCCCTGACCAGGGGATAGCGTTGAGAGGGCTT
TTCATAATAGACAAGGAAGGTGTGATCCAACATTCAACCATCAACAATCTTGGTATTGGC
CGAAGTGTTGATGAGACAATGAGAACCCTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2EU56TF 706 0 0
AGTCTCAATGGCGTCCGTAGCTTCTTCAACCACTCTCATCTCCTCCTCCACCAGAGCTCT
CCCAGCCAAGTCTCCGCTTTCATCTCCCTCCATCTCTTTCCTTCCAACCCTCTCTTCTCC
TCTCCGCTCTGGCTTTGCTCAACGCTCTTCCCTCACTTCAATCCGCTCCACTTCTCGCCC
GAGCTTCGTTGTCAAGGCTCAAACCGATGATCTTCCACTGGTTGGAAACAAGGCGCCTGA
TTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTCTCTGAGTACAT
TGGGAAGAAGTATGTGATTCTTTTTTTCTACCCTTTGGACTTTACCTTCGTCTGCCCAAC
AGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATTTGAGAAGTTGAACACAGAGGTGTT
AGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCTTGGGTTCAAACAGACAGAAAATC
TGGAGGACTTGGTGATCTCAACTACCCCCTTGTATCAGATGTCACTAAATCAATCTCAAA
ATCTTTTGGAGTGCTCATCCCTGACCAGGGGATAGCGTTGAGAGGGCTTTTCATAATAGA
CAAGGAAGGTGTGATCCAACATTCAACCATCAACAATCTTGGTATTGGCCGAAGTGTTGA
TGAGACAATGAGAACCCTTCGGGCATTACAGTACATCCAGGAGAAC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2DB69TF 735 0 0
GGACGCAGATAAGTCTCAATGGCGTCTGTAGCTTCTTCAACCACTCTCATCTCCTCCTCC
ACCAGAGCTCTCCCAGCCAAGTCTCCGCTTTCATCTCCCTCCATCTCTTTCCTTCCAACC
CTCTCTTCTCCTCTCCGCTCTGGCTTTGCTCAACGCTCTTCCCTCACTTCAATCCGCTCC
ACTTCTCGCCCGAGCTTCGTTGTCAAGGCTCAAACCGATGATCTTCCACTGGTTGGAAAC
AAGGCGCCTGATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTC
TCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTTTTTTTCTACCCTTTGGACTTTACCTTC
GTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATTTGAGAAGTTGAAC
ACAGAGGTGTTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCTTGGGTTCAAACA
GACAGAAAATCTGGAGGACTTGGTGATCTCAACTACCCCCTTGTATCAGATGTCACTAAA
TCAATCTCAAAATCTTTTGGAGTGCTCATCCCTGACCAGGGGATAGCGTTGAGAGGGCTT
TTCATAATAGACAAGGAAGGTGTGATCCAACATTCAACCATCAACAATCTTGGTATTGGC
CGAAGTGTTGATGAGACAATGAGAACCCTTCGG*CATTACAGTACATCCAGGAGACCC*T
GATGAAGTCTGCCCT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2C522JQ 674 0 0
TTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTCTCTGAGTACAT
TGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTCGTCTGCCCAAC
AGAGATCACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATTTGAGAAGTTGAACACAGAGGTGTT
AGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCTTGGGTTCAAACAGACAGAAAATT
TGGAGGACTTGGTGATTTCAACTACCCCCTTGTATCAGATGTCACTAAATCAATCTCAAA
ATCTTTTGGAGTGCTCATCCCTGACCAGGGTATAGCGTTGAGAGGGCTTTTCATAATAGA
CAAGGAAGGTGTGATCCAACATTCCACCATCAACAATCTTGGTATTGGCCGAAGTGTTGA
TGAGACAATGAGAACCCTCCAGGCACTACAGTACATCCAGGAGAACCCTGATGAAGTTTG
CCCTGCAGGATGGAAACCAGGGGAGAAGTCAATGAAACCTGACCCCAAGCTCAGCAAAGA
GTATTTTTCAGCTATTTAGTAATATCTACAAAACCATTGTTATATATGAGCTGAGTTTTT
TTTTTTTAAAGCCGCTGAACAATCCTTTGTTTGAATCTCCACTTTGTCCCCCAGAATCCT
TAAAACTTACATTT

QA 1 674 1 674
DS 



CO CL63Contig4 899 3 5 U
GGGAACAAAAGTGTGTGTTATCAATGGCGTCGGTTACTTCTTCAACCACTCTCATCTCCT
CCACAAGGGCTTTCCCAGCCAAGTCTTCTTCCCTTCCTTCTCCCTCCCTCTCTTTCCTTC
GAACCGTATCCTCTCCTCCCGCATCCGCTTCTCTCCGCTCTAGCTTTGCCCAACGCTCTT
CCCTCAGCTCCAGTTCTCGCCGGAGCTTCGCTGTCAAGGCTCAGGCCGATGATCTTCCAC
TGGTTGGAAACAAGGCGCCTGATTTCGAGGCTGAGGCTGTGTTTGATCAGGAGTTCATCA
AGGTTAAGCTCTCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGG
ACTTCACTTTCGTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAGTTTG
AGAAGTTGAACACAGAAGTACTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCGT
GGGTCCAGACAGACAGAAAATCTGGAGGGCTTGGTGATCTGAACTATCCTCTTATCTCAG
ATGTAACTAAATCAATCTCAAAGTCCTTCGGAGTGCTCATCCATGACCAGGGAATAGCAC
TAAGGGGGCTTTTCATCATAGACAAAGAAGGAGTGATCCAACATTCCACCATCAACAATC
TTGGTATTGGCCGAAGCGTTGACGAGACAATGAGAACCCTCCAGGCCTTACAGTACATTC
AGGAGAACCCTGATGAAGTCTGCCCAGCAGGGTGGAAACCAGGTGAGAAGTCAATGAAAC
CTGACCCAAAGCTCAGCAAAGAGTACTTTTCAGCTATTTAGAATAGCTCAAAGGTACCAA
ACCCTTTGTTGTAAGTGAGCAGCGTGTTTTTTTTTCTTTTTCATTTGTGCTAAACAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR53TF U 1
AF RR2GL59TF U 13
AF RR2GL59JQ C 287
BS 1 149 RR2DR53TF
BS 150 150 RR2GL59TF
BS 151 470 RR2DR53TF
BS 471 601 RR2GL59TF
BS 602 899 RR2GL59JQ

RD RR2DR53TF 470 0 0
GGGAACAAAAGTGTGTGTTATCAATGGCGTCGGTTACTTCTTCAACCACTCTCATCTCCT
CCACAAGGGCTTTCCCAGCCAAGTCTTCTTCCCTTCCTTCTCCCTCCCTCTCTTTCCTTC
GAACCGTATCCTCTCCTCCCGCATCCGCT*CTCTCCGCTCTAGCTTTGCCCAACGCTCTT
CCCTCAGCTCCAGTTCTCGCCGGAGCTTCGCTGTCAAGGCTCAGGCCGATGATCTTCCAC
TGGTTGGAAACAAGGCGCCTGATTTCGAGGCTGAGGCTGTGTTTGATCAGGAGTTCATCA
AGGTTAAGCTCTCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGG
ACTTCACTTTCGTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAGTTTG
AGAAGTTGAACACAGAAGTACTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCC

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR2GL59TF 600 0 0
GGGTG
TTATCAATGGCGTCGGTTACTTCTTCAACCACTCTCATCTCCTCCACAAGGGCTTTCCCA
GCCAAGTCTTCTTCCCTTCCTTCTCCCTCCCTCTCTTTCCTTCGAACCGTATCCTCTCCT
CCCGCATCCGCTTCTCTCCGCTCTAGCTTTGCCCAACGCTCTTCCCTCAGCTCCAGTTCT
CGCCGGAGCTTCGCTGTCAAGGCTCAGGCCGATGATCTTCCACTGGTTGGAAACAAGGCG
CCTGATTTCGAGGCTGAGGCTGTGTTTGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTCTCTGAG
TACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTCGTCTGC
CCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAGTTTGAGAAGTTGAACACAGAA
GTACTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCGTGGGTCCAGACAGACAGA
AAATCTGGAGGGCTTGGTGATCTGAACTATCCTCTTATCTCAGATGTAACTAAATCAATC
TCAAAGTCCTTCGGAGTGCTCATCCATGACCAGGGAATAGCACT
AAAGGGGCTTT

QA 6 589 6 589
DS 

RD RR2GL59JQ 613 0 0
TCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTCTCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTT
TTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTCGTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCG
GTATGCAGAGTTTGAGAAGTTGAACACAGAAGTACTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTT
CTCCCACCTTGCGTGGGTCCAGACAGACAGAAAATCTGGAGGGCTTGGTGATCTGAACTA
TCCTCTTATCTCAGATGTAACTAAATCAATCTCAAAGTCCTTCGGAGTGCTCATCCATGA
CCAGGGAATAGCACTAAGGGGGCTTTTCATCATAGACAAAGAAGGAGTGATCCAACATTC
CACCATCAACAATCTTGGTATTGGCCGAAGCGTTGACGAGACAATGAGAACCCTCCAGGC
CTTACAGTACATTCAGGAGAACCCTGATGAAGTCTGCCCAGCAGGGTGGAAACCAGGTGA
GAAGTCAATGAAACCTGACCCAAAGCTCAGCAAAGAGTACTTTTCAGCTATTTAGAATAG
CTCAAAGGTACCAAACCCTTTGTTGTAAGTGAGCAGCGTGTTTTTTTTTCTTTTTCATTT
GTGCTAAACAATC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 2 23

CO CL64Contig1 473 21 26 U
GGAAGGGATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCG
GCATCCAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGT
GCCAGCCTAGAAAAAAAA*CCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTG
TTGCAGCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTG
GTAGCACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAA
CAAAGCATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGT
ATTGTTCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCA
TCCAATCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATACTATTCATCT


BQ
10 10 10 10 25 80 40 80 80 80 80 80 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 75 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 30 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 80 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 95 95 95 65 95 95 95 90 90 90 60 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 10 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AZ70TFB U 21
AF RR2AT91TF U 1
AF RR2GK58JQ C 11
AF RR2GK58TF U 11
AF RR2H449TF U 113
AF RR2B977JQ C 4
AF RR2GR06JQ C 132
AF RR2F587JQ C 37
AF RR2F587TF U 37
AF RR2G982JQ C 6
AF RR2GK82JQ C 6
AF RR2G982TF U 6
AF RR2GK82TF U 6
AF RR2GC39JQ C 6
AF RR2GC39TF U 6
AF RR2GR06TF U 6
AF RR2B977TF U 4
AF RR2AU33JQ C 6
AF RR2AZ69JQ C 6
AF RR2AZ69TFB U 6
AF RR2AU33TF U 6
BS 1 6 RR2AT91TF
BS 7 7 RR2G982TF
BS 8 99 RR2AT91TF
BS 100 100 RR2GK58TF
BS 101 128 RR2AT91TF
BS 129 129 RR2GK58TF
BS 130 195 RR2AT91TF
BS 196 196 RR2GK58TF
BS 197 211 RR2AT91TF
BS 212 212 RR2GK58TF
BS 213 261 RR2AT91TF
BS 262 262 RR2GK58TF
BS 263 290 RR2AT91TF
BS 291 292 RR2GK58TF
BS 293 322 RR2AT91TF
BS 323 323 RR2GK58TF
BS 324 337 RR2AT91TF
BS 338 338 RR2GK58TF
BS 339 385 RR2AT91TF
BS 386 386 RR2GK58TF
BS 387 411 RR2AT91TF
BS 412 412 RR2F587TF
BS 413 419 RR2AT91TF
BS 420 464 RR2F587TF
BS 465 465 RR2GC39TF
BS 466 473 RR2AU33TF

RD RR2AZ70TFB 252 0 0
CACACAAAACATTTATTTGGAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTTGCTTTATT
TTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCTGGAAAAAAAA*C
CCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCAGCTCCAATACACACT
GCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACCTGGGGCCGCTGA
ATTTACAAAACA

QA 1 252 1 252
DS 

RD RR2AT91TF 419 0 0
GGAAGGCATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCG
GCATCCAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTTTTGCTAGTCTTCATGAATGT
GCCAGCCTGGAAAAAAAA*CCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTG
TTGCAGCTCCAATACCCACTGCCGACAAACCAAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTG
GTAGCACCTGGGGCCGCTGAACTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATATACAATAAAA
CAAAGCATTTATTTACAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTTACTATATTTTGT
ATTGTTCTGGTTTGTTTTGCTAGTTCTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTCACGGTCC

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR2GK58JQ 402 0 0
GG
ACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTT
GCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCTAGAA
AAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCAGCTCCAA
TACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACCTGGG
GCCGCTGAATTTACAAAACATATAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAGCATTTAT
TTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTGGTT
TGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCT
C

QA 3 401 3 401
DS 

RD RR2GK58TF 402 0 0
GG
ACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTT
GCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCTAGAA
AAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCAGCTCCAA
TACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACCTGGG
GCCGCTGAATTTACAAAACATATAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAGCATTTAT
TTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTGGTT
TGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCT
C

QA 3 401 3 401
DS 

RD RR2H449TF 268 0 0
TAATAG
GTGCCAGCCTGGAAAAAAAA**ACAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGG
TGTTGCAGCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATC
TGGTAGCACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAA
AACAAAGCATTTATTTACAGTGAAGAGTTGCAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTT
GTATTGTTCTGGTTTGTTTTGC

QA 7 268 7 268
DS 

RD RR2B977JQ 462 0 0
G
GGCATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCAT
CCAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCA
GCCTAGAAAAAAAA*CCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGC
AGCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAG
CACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATTTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAA
GCATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGTATTG
TTCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCA
ATCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATACC

QA 2 462 2 462
DS 

RD RR2GR06JQ 334 0 0
AAAAAAA*CCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCAGCTCCA
ATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACCTGG
GGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAGCATTTA
TTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTGGT
TTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAATCCTTT
AGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATACT

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR2F587JQ 428 0 0
GG
GCAGTGAAAAGCTACAATGTCGGCATCCAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTG
TCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCTAGAAAAAAAA*CCCAAAGGAACCTGCTCTA
AAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCAGCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGT
TATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAG
TTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAGCATTTATCTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGA
ATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAA
GTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAATCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATATTA
TTATAC

QA 3 428 3 428
DS 

RD RR2F587TF 428 0 0
GG
GCAGTGAAAAGCTACAATGTCGGCATCCAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTG
TCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCTAGAAAAAAAA*CCCAAAGGAACCTGCTCTA
AAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCAGCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGT
TATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAG
TTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAGCATTTATCTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGA
ATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAA
GTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAATCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATATTA
TTATAC

QA 3 428 3 428
DS 

RD RR2G982JQ 432 0 0
GGATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATC
CAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCTAGAAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCA
GCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGC
ACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAG
CATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGT
TCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAA
TCCTTTAGCATC

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR2GK82JQ 432 0 0
GGATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATC
CAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCTAGAAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCA
GCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGC
ACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAG
CATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGT
TCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAA
TCCTTTAGCATC

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR2G982TF 432 0 0
GGATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATC
CAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCTAGAAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCA
GCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGC
ACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAG
CATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGT
TCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAA
TCCTTTAGCATC

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR2GK82TF 432 0 0
GGATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATC
CAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCTAGAAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCA
GCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGC
ACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAG
CATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGT
TCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAA
TCCTTTAGCATC

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR2GC39JQ 460 0 0
GGATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATC
CAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCTAGAAAAAAAA*CCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCA
GCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGC
ACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAG
CATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGT
TCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAA
TCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATACT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2GC39TF 460 0 0
GGATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATC
CAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCTAGAAAAAAAA*CCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCA
GCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGC
ACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAG
CATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGT
TCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAA
TCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATACT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2GR06TF 460 0 0
GGATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATC
CAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCTAGAAAAAAAA*CCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCA
GCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGC
ACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAG
CATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGT
TCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAA
TCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATACT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2B977TF 462 0 0
G
GGCATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCAT
CCAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCA
GCCTAGAAAAAAAA*CCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGC
AGCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAG
CACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAA
GCATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGTATTG
TTCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCA
ATCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATACC

QA 2 462 2 462
DS 

RD RR2AU33JQ 468 0 0
GGATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAATTTACAATGTCGGCATC
CAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCTGGAAAAAAAA*CCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCA
GCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGC
ACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAG
CATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTTGGCATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGT
TCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAA
TCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATACTATTCATCT

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR2AZ69JQ 460 0 0
GGATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATC
CAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCTGGAAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCA
GCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGC
ACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAG
CATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGT
TCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGATCCATCAAA
TCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATACC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2AZ69TFB 460 0 0
GGATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATC
CAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCTGGAAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCA
GCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGC
ACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAG
CATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGAATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGT
TCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGATCCATCAAA
TCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATACC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2AU33TF 468 0 0
GGATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAATTTACAATGTCGGCATC
CAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCTGGAAAAAAAA*CCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCA
GCTCCAATACACACTGCCGACAAACCCAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGC
ACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATA**CAATAAAACAAAG
CATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTTGGCATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGT
TCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAA
TCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATATGATTATACTATTCATCT

QA 1 468 1 468
DS 



CO CL64Contig2 393 2 2 U
GGAAGGCATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCG
GCATCCAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGT
GCCAGCCTGGAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGT
TGCAGCTCCAATACACATTGCCGACAAACCGAAGCGTTGTGTGAGAAGATATGTATTTGG
TAGCACCTGGGGCCGCCGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACAA
AGCATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGCATCTAAATTTACTATATTTTGTATT
TTTCTGGTTTGTTTTACTAGTTTTCATGAATGT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G136JQ C 1
AF RR2G136TF U 1
BS 1 4 RR2G136JQ
BS 5 393 RR2G136TF

RD RR2G136JQ 393 0 0
GGAAGGCATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCG
GCATCCAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTTTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGT
GCCAGCCTGGAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTTTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGT
TGCAGCTCCAATACACATTGCCGACAAACCGAAGCGTTGTGTGAGAAGATATGTATTTGG
TAGCACCTGGGGCCGCCGAATTTACAAAACATTTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACAA
AGCATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGCATTTAAATTTACTATATTTTGTATT
TTTTTGGTTTGTTTTACTAGTTTTCATGAATGT

QA 1 393 1 393
DS 

RD RR2G136TF 393 0 0
GGAA
GGCATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCAT
CCAAATTTGCTTTATTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCA
GCCTGGAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCA
GCTCCAATACACATTGCCGACAAACCGAAGCGTTGTGTGAGAAGATATGTATTTGGTAGC
ACCTGGGGCCGCCGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACAAAGCA
TTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGCATCTAAATTTACTATATTTTGTATTTTTC
TGGTTTGTTTTACTAGTTTTCATGAATGT

QA 5 393 5 393
DS 



AS 3 24

CO CL65Contig1 620 4 4 U
GATCAAAGCAATTAACAACCATAAAGAGATATTTAAATTAGAAAAAAAGAAAGAGATCAG
AGATGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGAGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGG
AAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGC
ACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGACAAAATCAAAGACAAGATCCACGGTG
GAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACA
AGAAGGAGAAGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCG
ATTAAGGTGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCA
CTCCTGTCAGAGAGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTTCCTTTGTTATCTA
ATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATA
AACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTTCTAATGTAAGAAGTTTATA
TTTAACTTTGAAATTTGTTT


BQ
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EC62JQ C 1
AF RR2EC62TF U 1
AF RR2BC36JQ C 3
AF RR2BC36TF U 3
BS 1 194 RR2EC62TF
BS 195 195 RR2BC36TF
BS 196 580 RR2EC62TF
BS 581 620 RR2BC36TF

RD RR2EC62JQ 484 0 0
GATCAAAGCAATTAACAACCATAAAGAGATATTTAAATTAGAAAAAAAGAAAGAGATCAG
AGATGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGAGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGG
AAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGC
ACAAGAGTGGTGAGTACAAAGAAGGTATCGTTGACAAAATCAAAGACAAGATCCACGGTG
GAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACA
AGAAGGAGAAGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCG
ATTAAGGTGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCA
CTCCTGTCAGAGAGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTTCCTTTGTTATTTA
ATTT

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2EC62TF 583 0 0
GATCAAAGCAATTAACAACCATAAAGAGATATTTAAATTAGAAAAAAAGAAAGAGATCAG
AGATGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGAGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGG
AAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGC
ACAAGAGTGGTGAGTACAAAGAAGGTATCGTTGACAAAATCAAAGACAAGATCCACGGTG
GAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACA
AGAAGGAGAAGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCG
ATTAAGGTGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCA
CTCCTGTCAGAGAGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTTCCTTTGTTATCTA
ATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATA
AACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTT
TCC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2BC36JQ 618 0 0
GG
AAAGCAATTAACAACCATAAAGAGATATTTAAATTAGAAAAAAAGAAAGAGATCAGAGAT
GGCAGGAATCATCAACAAGATTGGAGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGA
TGAGCACGAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGCACAA
GAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGA
AGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAA
GGAGAAGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTA
AGGTGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCACTCC
TGTCAGAGAGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTTCCTTTGTTATCTAATTT
TCTTTTAACTGTCATTTTCACCTTTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATAAACC
TCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTTCTAATGTAAGAAGTTTATATTTA
ACTTTGAAATTTGTTT

QA 3 618 3 618
DS 

RD RR2BC36TF 618 0 0
GG
AAAGCAATTAACAACCATAAAGAGATATTTAAATTAGAAAAAAAGAAAGAGATCAGAGAT
GGCAGGAATCATCAACAAGATCGGAGATGCTCTCTATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGA
TGAGCACGAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGCACAA
GAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGA
AGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAA
GGAGAAGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTA
AGGTGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCACTCC
TGTCAGAGAGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTTCCTTTGTTATCTAATTT
TCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATAAACC
TCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTTCTAATGTAAGAAGTTTATATTTA
ACTTTGAAATTTGTTT

QA 3 618 3 618
DS 



CO CL65Contig2 595 18 7 U
GGGATCAAAGCAATTAACAACCACAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAAAGAAAGAGAGA
TCAGAGATGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGCGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCAC
AAGGAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCAGAC
GAGCACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCAC
GGTGGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACATGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAG
GACAAGAAGGAGAAGAAACACCATGATGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGAC
AGCGATTAAGGTAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTAT
CATCTCGCTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCCGTCTTCCTTTG
TTATCTAATTTCCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGA
AAAAATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTACCTG


BQ
10 10 25 35 35 35 35 15 45 45 45 45 45 45 95 95 95 95 65 95 95 95 95 35 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 70 97 70 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 70 97 30 40 
70 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 30 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 70 97 97 97 97 97 97 97 40 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 40 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 40 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 40 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 65 95 65 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 35 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 35 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 55 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
80 95 95 95 55 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 75 50 50 50 30 10 

AF RR2A021JQ C 6
AF RR2EH20TF U 1
AF RR2CE48JQ C 2
AF RR2A341TF U 15
AF RR2BA28JQ C 15
AF RR2BA28TF U 15
AF RR2A983JQ C 15
AF RR2A983TF U 15
AF RR2B789JQ C 15
AF RR2B789TF U 15
AF RR2A021TF U 6
AF RR2CE48TF U 2
AF RR2BJ65JQ C -1
AF RR2E275JQ C 39
AF RR2E275TF U 15
AF RR2EW83JQ C 15
AF RR2EW83TF U 15
AF RR2BJ65TF U -1
BS 1 460 RR2EH20TF
BS 461 461 RR2A341TF
BS 462 587 RR2EH20TF
BS 588 590 RR2A341TF
BS 591 593 RR2CE48TF
BS 594 594 RR2E275TF
BS 595 595 RR2BJ65JQ

RD RR2A021JQ 446 0 0
GG
AAGCAATTAACAACCACAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAAAGAAAGAGAGATCAGAGA
TGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGCGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAGG
ATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAATAAACACGCAGACGAGCACA
AGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAG
AAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACATGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGA
AGGAGAGGAAACACCATGATGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATT
AAGGTAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCG
CTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGG

QA 3 446 3 446
DS 

RD RR2EH20TF 587 0 0
GGGATCAAAGCAATTAACAACCACAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAAAGAAAGAGAGA
TCAGAGATGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGCGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCAC
AAGGAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCAGAC
GAGCACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCAC
GGTGGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACATGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAG
GACAAGAAGGAGAAGAAACACCATGATGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGAC
AGCGATTAAGGTAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTAT
CATCTCGCTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGGGTGCATCCGTCTTCCTTTG
TTATCTAATTTCCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGA
AAAAATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2CE48JQ 592 0 0
G
GATCAAAGCAATTAACGACCACAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAAAGAAAGAGAGATC
AGAGATGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGCGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAA
GGAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCAGACGA
GCACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCACGG
TGGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACATGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGA
CAAGAAGGAGAAGAAACACCATGATGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAG
CGATTAAGGTAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCA
TCTCGCTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCCGTCTTCCTTTGTT
ATCTAATTTCCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAA
AAATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTACC

QA 2 592 2 592
DS 

RD RR2A341TF 576 0 0
TAACAACCATAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAAAGAAAGAGA**TCAGAGATGGCAGG
AATCATCAACAAGATCGGGGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAGCA
CAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGCACAAGAGTGG
TGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGCCA
CAGCAGCGGAGACCACAAACACGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAGAA
GAAACACCATGGTGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTAAGGTAA
GGAGGATGCGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCACTCCTGA
CAAAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTTCT
TTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTCTATGTTATCTTGTCAGAAAAA*TAAACCTCA
TGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2BA28JQ 576 0 0
TAACAACCATAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAA*GAAAGAAAC*CAAGAGATGGCAGG
AATCATCAACAAGATCGGAGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAGCA
CAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGCACAAGAGTGG
TGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGCCA
CAGCAGCGGAGACCACAAACACGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAGAA
GAAACACCATGGTGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTAAGGTAA
GGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCACTCCTGA
CAGAGAGGGGTGAACGGGAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTTCT
TTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATAAACCTCA
TGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2BA28TF 576 0 0
TAACAACCATAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAA*GAAAGAAAC*CAAGAGATGGCAGG
AATCATCAACAAGATCGGAGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAGCA
CAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGCACAAGAGTGG
TGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGCCA
CAGCAGCGGAGACCACAAACACGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAGAA
GAAACACCATGGTGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTAAGGTAA
GGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCACTCCTGA
CAGAGAGGGGTGAACGGGAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTTCT
TTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATAAACCTCA
TGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2A983JQ 576 0 0
TAACAACCATAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAAAGAAAGAGA**TCAGAGATGGCAGG
AATCATCAACAAGATCGGGGGTGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAGCA
CAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGCACAAGAGTGG
TGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGCCA
CAGCAGCGGAGACCACAAACACGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAGAA
GAAACACCATGGTGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTAAGGTAA
GGAGGATGCGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCACTCCTGA
CAAAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTTCT
TTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTCTATGTTATCTTGTCAGAAAAA*TAAACCTCA
TGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCC
G

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2A983TF 576 0 0
TAACAACCATAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAAAGAAAGAGA**TCAGAGATGGCAGG
AATCATCAACAAGATCGGGGGTGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAGCA
CAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGCACAAGAGTGG
TGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGCCA
CAGCAGCGGAGACCACAAACACGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAGAA
GAAACACCATGGTGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTAAGGTAA
GGAGGATGCGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCACTCCTGA
CAAAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTTCT
TTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTCTATGTTATCTTGTCAGAAAAA*TAAACCTCA
TGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCC
G

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2B789JQ 576 0 0
TAACAACCACAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAAAGAAAGAGAGATCAGAGATGGCAGG
AATCATCAACAAGATCGGCGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAGCA
CAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCAGACGAGCACAAGAGTGG
TGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGCCA
CAGCAGCGGAGACCACAAACATGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAGAA
GAAACACCATGATGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTAAGGTAA
GGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCCGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCGCTCCTGA
CAGAGAGGGGTGAATGGAAGAAGAAGAGTGCATCCGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTCCT
TTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATAAACCTCA
TGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2B789TF 576 0 0
TAACAACCACAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAAAGAAAGAGAGATCAGAGATGGCAGG
AATCATCAACAAGATCGGCGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAGCA
CAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCAGACGAGCACAAGAGTGG
TGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGCCA
CAGCAGCGGAGACCACAAACATGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAGAA
GAAACACCATGATGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTAAGGTAA
GGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCCGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCGCTCCTGA
CAGAGAGGGGTGAATGGAAGAAGAAGAGTGCATCCGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTCCT
TTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATAAACCTCA
TGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2A021TF 585 0 0
GG
AAGCAATTAACAACCACAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAAAGAAAGAGAGATCAGAGA
TGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGCGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAGG
ATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAATAAACACGCAGACGAGCACA
AGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAG
AAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACATGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGA
AGGAGAGGAAACACCATGATGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATT
AAGGTAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCG
CTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCCGTCTTCCTTTGTTATCTA
ATTTCCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATA
AACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCC
C

QA 3 584 3 584
DS 

RD RR2CE48TF 592 0 0
G
GATCAAAGCAATTAACGACCACAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAAAGAAAGAGAGATC
AGAGATGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGCGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAA
GGAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCAGACGA
GCACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCACGG
TGGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACATGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGA
CAAGAAGGAGAAGAAACACCATGATGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAG
CGATTAAGGTAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCA
TCTCGCTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCCGTCTTCCTTTGTT
ATCTAATTTCCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAA
AAATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTACC

QA 2 592 2 592
DS 

RD RR2BJ65JQ 597 0 0
GGATC
ATCAGAGCAATTAACAACCACAAAGAGAGATTTAATTTTA*AAAAAAGAAAGAGAGATCA
GAGATGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGCGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAG
GAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGTAACACGCAGACGAG
CACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCACGGT
GGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACATGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGAC
AAGAAGGAGAAGAAACACCATGATGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGC
GATTAAGGTAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCAT
CTCGCTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCCGTCTTCCTTTGTTA
TCTAATTTCCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAA
AATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTACCTG

QA 6 597 6 597
DS 

RD RR2E275JQ 557 0 0
TTTAATAAAAAAGAAAGAGAGATCAGAGATGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGCGATGC
TCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAGTACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGA
GGAACACAAGAAACACGCAGACGAGCACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGA
TAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACATGA
CGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAGAAGAAACACCATGATGATGGTCACCA
CAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTAAGGTAAGGAGGATGTGAGGAGGATTATAAA
TGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCGCTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGA
AGAGTGCATCCGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTCCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTA
TGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATAAACCCCATGTATCGTAATCTATATTAATAAA
ATCGAGTTTCCTACCT
C

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2E275TF 581 0 0
TAACAACCACAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAAAGAAAGAGAGATCAGAGATGGCAGG
AATCATCAACAAGATCGGCGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAGTA
CAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCAGACGAGCACAAGAGTGG
TGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGCCA
CAGCAGCGGAGACCACAAACATGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAGAA
GAAACACCATGATGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTAAGGTAA
GGAGGATGTGAGGAGGATTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCGCTCCTGA
CAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCCGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTCCT
TTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATAAACCCCA
TGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTACCT
C

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2EW83JQ 580 0 0
TAACAACCACAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAAAGAAAGAGAGATCAGAGATGGCAGG
GATCATCAACAAGATCGGCGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAGCA
CAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCAGACGAGCACAAGAGTGG
TGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGCCA
CAGCAGCGGAGACCACAAACATGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAGAA
GAAACACCATGATGATGGTCACCACAGCAGCAGCGGTGACAGCGACAGCGATTAAGGTAA
GGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCGCTCCTGA
CAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCCGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTCCT
TTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAATAAACCTCA
TGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTACC
G

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2EW83TF 580 0 0
TAACAACCACAAAGAGAGATTTAATTTAATAAAAAAGAAAGAGAGATCAGAGATGGCAGG
GATCATCAACAAGATCGGCGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAGCA
CAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCAGACGAGCACAAGAGTGG
TGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGCCA
CAGCAGCGGAGACCACAAACATGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAGAA
GAAACACCATGATGATGGTCACCACAGCAGCAGCGGTGACAGCGACAGCGATTAAGGTAA
GGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCGCTCCTGA
CAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCCGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTCCT
TTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGACAAAATAAACCTCA
TGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTACC
G

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2BJ65TF 597 0 0
GGATC
ATCAGAGCAATTAACAACCACAAAGAGAGATTTAATTTTA*AAAAAAGAAAGAGAGATCA
GAGATGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGCGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAG
GAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGTAACACGCAGACGAG
CACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGATAAGATCAAAGACAAGATCCACGGT
GGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACATGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGAC
AAGAAGGAGAAGAAACACCATGATGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGC
GATTAAGGTAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCAT
CTCGCTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCCGTCTTCCTTTGTTA
TCTAATTTCCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAA
AATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTACCT
G

QA 6 596 6 596
DS 



CO CL65Contig3 740 2 2 U
GGTAATACAATAAAGAAGAAAGAAGGAGGATTTCAAATGCGAGATCTAAAAACATATCTT
TCCGTAGCACCGGTACTAAGTACTCTATGGTTCGTTTCGTTAGCAGGTTTATTAATAGAG
ATTAATCGTTTATTTCCAGATGCATTAACATTTCCCTTTTTTTAATTCTAGTTATTAACA
TCAGAAAGGATAAAAAAAAAAAGAAAGAGATCAGAGATGGCAGGAATCATCAACAAGATC
GGGGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCAC
AGGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGCACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGT
ATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCAC
AAACACGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAGAAGAAACACCATGGTGAT
GGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTAAGGTAAGGAGGATGCGAGGAGG
ACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCACTCCTGACAAAGAGGGGTGAATG
GAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTC
ACCTCTTATGTTCTATGTTATCTTGTCAGAAAAATAAACCTCATGTATCGTAATCTATAT
TAATAAAATCGAGTTTCCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC30TF U 1
AF RR2FC30JQ C 43
BS 1 693 RR2FC30TF
BS 694 740 RR2FC30JQ

RD RR2FC30TF 693 0 0
GGTAATACAATAAAGAAGAAAGAAGGAGGATTTCAAATGCGAGATCTAAAAACATATCTT
TCCGTAGCACCGGTACTAAGTACTCTATGGTTCGTTTCGTTAGCAGGTTTATTAATAGAG
ATTAATCGTTTATTTCCAGATGCATTAACATTTCCCTTTTTTTAATTCTAGTTATTAACA
TCAGAAAGGATAAAAAAAAAAAGAAAGAGATCAGAGATGGCAGGAATCATCAACAAGATC
GGGGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCAC
AGGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGCACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGT
ATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCAC
AAACACGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAGAAGAAACACCATGGTGAT
GGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTAAGGTAAGGAGGATGCGAGGAGG
ACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCACTCCTGACAAAGAGGGGTGAATG
GAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTC
ACCTCTTATGTTCTATGTTATCTTGTCAGAAAA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2FC30JQ 698 0 0
GATCTAAAAACATATCTTTCCGTAGCACCGGTACTAAGTACTCTATGGTTCGTTTCGTTA
GCAGGTTTATTAATAGAGATTAATCGTTTATTTCCAGATGCATTAACATTTCCCTTTTTT
TAATTCTAGTTATTAACATCAGAAAGGATAAAAAAAAAAAGAAAGAGATCAGAGATGGCA
GGAATCATCAACAAGATCGGGGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAG
CACAAGAAAGAGGAGCACAGGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGCACAAGAGT
GGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGC
CACAGCAGCGGAGACCACAAACACGACGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAG
AAGAAACACCATGGTGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTAAGGT
AAGGAGGATGCGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCACTCCT
GACAAAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTT
CTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTCTATGTTATCTTGTCAGAAAAATAAACCTC
ATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTG

QA 1 698 1 698
DS 



AS 3 13

CO CL66Contig1 899 5 15 U
GGAGTGGCTCAGGTTATAGTGTACGTTCTCAAGCAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCC
TAACTCACTAAAGCAGCAGCTAGCTACAATGGCGGTTACCTTTTCAGATCTACACACAGA
GCAGGGTATCAAATCCGTTGAGGAGCACCTCGTCGGAAAAACCTACATCTCCGGAGATCA
ATTGTCTGTAGATGATGTGAAGGTATACGCTGCCGTTGTTGAGAAACCAAGCGAGAGTTT
CCCTAATGCTAGCAAGTGGTACGACTGTGTAGCCTCTCACCTTGCTAAAAGTTTCCCTGG
TAAAGCCGTAGGAGTTTCAATCGGTGGCTCTGTTGCTGCTCCTGCTCAAGCCGAGGCACA
TGCAGTAGCTGCAGCTGATGATGATGATGACATGGATCTGTTTGGTGACGAGACTGAGGA
GGAAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCTAAGAAGGACACCAAGAAGCCCAAAGA
GAGTGGAAAGTCATCCGTGCTCATGGAAGTGAAACCATGGGATGACGAGACAGATATGAA
GAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTCTATGGGGAGCTTCAAA
ACTGGTTCCAGTTGGTTACGGGATCAAGAAGCTCACGATCATGCTCACAATCGTTGATGA
CCTCGTGTCCCCAGACAACCTCATTGAGGACTATCTCACCTCTGAACCTAACAACGAGTA
CATCCAGAGTGTTGACATCGTCGCATTCAACAAGATCTAGAGACTTTAGATCTCTCCTTG
CCAAAAAGATATTTGATTTCCTTCCAAGTTTTTGTTTCTTTGTGTTGTTTGCTTTGGGAT
GTTTATTTTCTAGTTGCAAGACCTCTTACATCTGCAATGAAACAGAAACTATCAATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2EG80TF U 47
AF RR2BB61TF U 1
AF RR2BS66TF U 49
AF RR2EG80JQ C 156
AF RR2BS66JQ C 233
BS 1 113 RR2BB61TF
BS 114 114 RR2EG80TF
BS 115 239 RR2BB61TF
BS 240 240 RR2BS66TF
BS 241 303 RR2BB61TF
BS 304 304 RR2BS66TF
BS 305 537 RR2BB61TF
BS 538 538 RR2BS66TF
BS 539 625 RR2BB61TF
BS 626 626 RR2BS66TF
BS 627 720 RR2BB61TF
BS 721 752 RR2BS66TF
BS 753 753 RR2EG80JQ
BS 754 779 RR2BS66TF
BS 780 899 RR2EG80JQ

RD RR2EG80TF 179 0 0
GG
CTCTCTCTCTCCTAACTCACTAAAGCAGCAGCTAGCTACAATGGCGGTTACCTTTTCAGA
TCTACACACAGAGCAGGGTATCAAATCCGTTGAGGAGCACCTCGTCGGAAAAACCTACAT
CTCCGGAGATCAATTGTCTGTAGATGATGTGAAGGTATACGCTGCCGTTGTTGAGAA

QA 3 179 3 179
DS 

RD RR2BB61TF 720 0 0
GGAGTGGCTCAGGTTATAGTGTACGTTCTCAAGCAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCC
TAACTCACTAAAGCAGCAGCTAGCTACAATGGCGGTTACCTTTTCAGATCTACGCACAGA
GCAGGGTATCAAATCCGTTGAGGAGCACCTCGTCGGAAAAACCTACATCTCCGGAGATCA
ATTGTCTGTAGATGATGTGAAGGTATACGCTGCCGTTGTTGAGAAACCAAGCGAGAGTTC
CCCTAATGCTAGCAAGTGGTACGACTGTGTAGCCTCTCACCTTGCTAAAAGTTTCCCTGG
TAAGGCCGTAGGAGTTTCAATCGGTGGCTCTGTTGCTGCTCCTGCTCAAGCCGAGGCACA
TGCAGTAGCTGCAGCTGATGATGATGATGACATGGATCTGTTTGGTGACGAGACTGAGGA
GGAAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCTAAGAAGGACACCAAGAAGCCCAAAGA
GAGTGGAAAGTCATCCGTGCTCATGGAAGTGAAACCATGGGATGACGAGACAGATATTAA
GAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTCTATGGGGAGCTTCAAA
ACTGGTTCCAGTTGGTTACGGGATCGAGAAGCTCACGATCATGCTCACAATCGTTGATGA
CCTCGTGTCCCCAGACAACCTCATTGAGGACTATCTCACCTCTGAACCTAACAACGAGTA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2BS66TF 731 0 0
GG
CTCTCTCTTCTAACTCACTAAAGTAGCAGCTAGCTACAATGGCGGTTACCTCTTCAGATC
TACACACAGAGCAGGGTATCAAATCCGTTGAGGAGCACCTCGCCGGAAAAACCTACATCT
CCGGAGATCAATTGTCTGTAGATGATGTGAAGGTATACGCTGCCGTTGTTGAGAAACCAA
GCGAGAGTTTCCCTAATGCTAGCAAGTGGTACGACTGTGTAGCCTCTCACCTTGCTAAAA
GTTTCCCTGGTAAAGCCGTAGGAGTTTCAATCGGTGGCTCTGTTGCTGCTCCTGCTCAAG
CCGAGGCACATGCAGTAGCTGCAGCTGATGATGATGATGACATGGATCTGTTTGGTGACG
AGACTGAGGAGGAAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCTAAGAAGGACACCAAGA
AGCCCAAAGAGAGTGGAAAGTCATCCGTGCTCATGGAAGTGAAACCATGGGATGACGAGA
CAGATATGAAGAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTCTATGGG
GAGCTTCAAAACTGGTTCCAGTTGGTTACGGGATCAAGAAGCTCACGATCATGCTCACAA
TCGTTGATGACCTCGTGTCCCCAGACAACCTCATTGAGGACTATCTCACCTCTGAACCTA
ACAACGAGTACATCCAGAGTGTTGACATCGTCGCATTCAACA*GATCTAGAGACTTTAGA
TCTCTCCTT

QA 3 731 3 731
DS 

RD RR2EG80JQ 744 0 0
GAAAAACCTACATCTCCGGAGATCAATTGTCTGTAGATGATGTGAAGGTATACGCTGCCG
TTGTTGAGAAACCAAGCGAGAGTTTCCCTAATGCTAGCAAGTGGTACGACTGTGTAGCCT
CTCACCTTGCTAAAAGTTTCCCTGGTAAAGCCGTAGGAGTTTCAATCGGTGGCTCTGTTG
CTGCTCCTGCTCAAGCCGAGGCACATGCAGTAGCTGCAGCTGATGATGATGATGACATGG
ATCTGTTTGGTGACGAGACTGAGGAGGAAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCTA
AGAAGGACACCAAGAAGCCCAAAGAGAGTGGAAAGTCATCCGTGCTCATGGAAGTGAAAC
CATGGGATGACGAGACAGATATGAAGAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGC
CTGGTCTTCTATGGGGAGCTTCAAAACTGGTTCCAGTTGGTTACGGGATCAAGAAGCTCA
CGATCATGCTCACAATCGTTGATGACCTCGTGTCCCCAGACAACCTCATTGAGGACTATC
TCACCTCTGAACCTAACAACGAGTACATCCAGAGTGTTGACATCGTCGCATTCAACAAGA
TCTAGAGACTTTAGATCTCTCCTTGCCAAAAAGATATTTGATTTCCTTCCAAGTTTTTGT
TTCTTTGTGTTGTTTGCTTTGGGATGTTTATTTTCTAGTTGCAAGACCTCTTACATCTGC
AATGAAACAGAAACTATCAATGCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2BS66JQ 667 0 0
GAGAGTTTCCCTAATGCTAGCAAGTGGTACGACTGTGTAGCCTCTCACCTTGCTAAAAGT
TTCCCTGGTAAAGCCGTAGGAGTTTCAATCGGTGGCTCTGTTGCTGCTCCTGCTCAAGCC
GAGGCACATGCAGTAGCTGCAGCTGATGATGATGATGACATGGATCTGTTTGGTGACGAG
ACTGAGGAGGAAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCTAAGAAGGACACCAAGAAG
CCCAAAGAGAGTGGAAAGTCATCCGTGCTCATGGAAGTGAAACCATGGGATGACGAGACA
GATATGAAGAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTCTATGGGGA
GCTTCAAAACTGGTTCCAGTTGGTTACGGGATCAAGAAGCTCACGATCATGCTCACAATC
GTTGATGACCTCGTGTCCCCAGACAACCTCATTGAGGACTATCTCACCTCTGAACCTAAC
AACGAGTACATCCAGAGTGTTGACATCGTCGCATTCAACAAGATCTAGAGACTTTAGATC
TCTCCTTGCCAAAAAGATATTTGATTTCCTTCCAAGTTTTTGTTTCTTTGTGTTGTTTGC
TTTGGGATGTTTATTTTCTAGTTGCAAGACCTCTTACATCTGCAATGAAACAGAAACTAT
CAATGCC

QA 1 667 1 667
DS 



CO CL66Contig2 851 2 2 U
GGCTCTCTCTCTCTCTCACCTAACTCACTAAAGCAGCTAGCTAAAATGGCGGTTACCTTT
TCAGATCTACACACAGAGCAGGGTCTCAAATCCGTAGAGGAGCACCTCGTCGGAAAAACC
TACATCTCCGGAGATCAATTGTCTGTAGATGATGTGAAGGTATACGCTGCCGTTGTTGAG
AAACCAAGCGAGAGTTTCCCCAATGCTAGCAAGTGGTACGACTGTGTTGCCTCCCACCTT
GCTAAAAGTTTCCCTGGTAAAGCCGTAGGAGTTTCAATCGGTGGTTCTGTTGCTGCTCCT
GCCCAAGCTGAGGCACCTGCAGCTGATGATGATGATGACATGGATCTGTTTGGTGACGAG
ACAGAGGAGGAAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCTAAGAAGGACACCAAGAAG
CCCAAAGAGAGTGGAAAGTCATCTGTGCTCATGGAAGTGAAACCATGGGATGACGAGACA
GATATGAAGAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTCTATGGGGA
GCTTCAAAACTGGTTCCAGTTGGTTACGGGATCAAGAAGCTCACGATCATGCTCACAATC
GTTGATGACCTCGTGTCCCCAGACAACCTCATTGAAGACTATCTCACCTCTGAACCTAAC
AACGAGTACATCCAGAGTGTTGACATCGTCGCATTCAACAAGATCTAGAGACTTTTAGAT
CTCTCCTTGCCAAAAAGATATTTGATTTCCTTCCATGTTTTCGTTTCTTTTTGTGTTGTT
TGCTTTGGGATGTTTATTTTCTAGTTGCAAGACCTCTTACATGTTGCAATGAAACATAAA
CTATCAATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY94TF U 1
AF RR2DY94JQ C 210
BS 1 564 RR2DY94TF
BS 565 851 RR2DY94JQ

RD RR2DY94TF 564 0 0
GGCTCTCTCTCTCTCTCACCTAACTCACTAAAGCAGCTAGCTAAAATGGCGGTTACCTTT
TCAGATCTACACACAGAGCAGGGTCTCAAATCCGTAGAGGAGCACCTCGTCGGAAAAACC
TACATCTCCGGAGATCAATTGTCTGTAGATGATGTGAAGGTATACGCTGCCGTTGTTGAG
AAACCAAGCGAGAGTTTCCCCAATGCTAGCAAGTGGTACGACTGTGTTGCCTCCCACCTT
GCTAAAAGTTTCCCTGGTAAAGCCGTAGGAGTTTCAATCGGTGGTTCTGTTGCTGCTCCT
GCCCAAGCTGAGGCACCTGCAGCTGATGATGATGATGACATGGATCTGTTTGGTGACGAG
ACAGAGGAGGAAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCTAAGAAGGACACCAAGAAG
CCCAAAGAGAGTGGAAAGTCATCTGTGCTCATGGAAGTGAAACCATGGGATGACGAGACA
GATATGAAGAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTCTATGGGGA
GCTTCAAAACTGGTTCCAGTTGGT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2DY94JQ 642 0 0
CAAGTGGTACGACTGTGTTGCCTCCCACCTTGCTAAAAGTTTCCCTGGTAAAGCCGTAGG
AGTTTCAATCGGTGGTTCTGTTGCTGCTCCTGCCCAAGCTGAGGCACCTGCAGCTGATGA
TGATGATGACATGGATCTGTTTGGTGACGAGACAGAGGAGGAAAAGAAAGCTGCAGAGGA
GAGGGAGGCTGCTAAGAAGGACACCAAGAAGCCCAAAGAGAGTGGAAAGTCATCTGTGCT
CATGGAAGTGAAACCATGGGATGACGAGACAGATATGAAGAAACTTGAGGAGTGTGTTCG
TGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTCTATGGGGAGCTTCAAAACTGGTTCCAGTTGGTTACGG
GATCAAGAAGCTCACGATCATGCTCACAATCGTTGATGACCTCGTGTCCCCAGACAACCT
CATTGAAGACTATCTCACCTCTGAACCTAACAACGAGTACATCCAGAGTGTTGACATCGT
CGCATTCAACAAGATCTAGAGACTTTTAGATCTCTCCTTGCCAAAAAGATATTTGATTTC
CTTCCATGTTTTCGTTTCTTTTTGTGTTGTTTGCTTTGGGATGTTTATTTTCTAGTTGCA
AGACCTCTTACATGTTGCAATGAAACATAAACTATCAATGCC

QA 1 642 1 642
DS 



CO CL66Contig3 862 6 12 U
GAACCTCTTCCACTCCCTCCTAAACCAGAGCATCAAATGGCGCTTACCTTCTCAGATCTA
CACACAGAGCAGGGTGTCAAATCCGTGGAGGAGCACCTCGCCGGAAAAACCTACATCTCC
GGAGATCAGTTGTCTGTGGATGATGTGAAGGTATACGCTGCCGTTTCGGGGAAACCCAGC
GATGCTTTCCCCAATGCTAGCAGGTGGTACGATTGCGTCGCTTCCCACCTTGCTAAAAGC
TTCCCTGGAAAAGCCGTTGGAGTGAGTATCGGTGACTCTGCTGTTGCTGCTCCCGCTCAA
GCTGAGGCACCTGCATCAGCTGTAGCTGAGGATGATGATGATGACATGGATCTGTTCGGT
GATGAGACCGAGGAGGAAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCTAAGAAGGACACC
AAGAAGCCTAAAGAGAGTGGAAAGTCCTCTGTGCTCATGGAAATGAAACCATGGGATGAT
GAGACAGATATGAAGAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTCTA
TGGGGAGCTTCAAAATTGGTTCCAGTTGGTTACGGTATCAAGAAGCTCACGATCATGCTC
ACAATTGTTGATGACCTCGTCTCCCCTGACAACCTCATTGAAGACTATCTCACCAGTGAA
CCTAACAACGAGTACATCCAGAGTGTTGACATCGTTGCATTCAACAAGATCTAAGAGACT
TTAAAACCTCTCCCTACCCCC*ACAAACAATACATTTGATTTCCTTCCAAGTTTTGTTCT
TTTCTGCTGTTTGCTTGTTTTCTAGTTGCAAGACCTAGTTCATGTTACTAGAAACATAAA
CTATCAATACTTTTTTATCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 15 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS33TF U 1
AF RR2H842TF U 1
AF RR2GP84JQ C 617
AF RR2BG83TF U 202
AF RR2E872TF U 433
AF RR2E872JQ C 622
BS 1 574 RR2GS33TF
BS 575 575 RR2H842TF
BS 576 599 RR2GS33TF
BS 600 703 RR2H842TF
BS 704 741 RR2BG83TF
BS 742 742 RR2E872TF
BS 743 823 RR2BG83TF
BS 824 824 RR2E872TF
BS 825 846 RR2BG83TF
BS 847 847 RR2E872TF
BS 848 856 RR2BG83TF
BS 857 862 RR2E872TF

RD RR2GS33TF 599 0 0
GAACCTCTTCCACTCCCTCCTAAACCAGAGCATCAAATGGCGCTTACCTTCTCAGATCTA
CACACAGAGCAGGGTGTCAAATCCGTGGAGGAGCACCTCGCCGGAAAAACCTACATCTCC
GGAGATCAGTTGTCTGTGGATGATGTGAAGGTATACGCTGCCGTTTCGGGGAAACCCAGC
GATGCTTTCCCCAATGCTAGCAGGTGGTACGATTGCGTCGCTTCCCACCTTGCTAAAAGC
TTCCCTGGAAAAGCCGTTGGAGTGAGTATCGGTGACTCTGCTGTTGCTGCTCCCGCTCAA
GCTGAGGCACCTGCATCAGCTGTAGCTGAGGATGATGATGATGACATGGATCTGTTCGGT
GATGAGACCGAGGAGGAAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCTAAGAAGGACACC
AAGAAGCCTAAAGAGAGTGGAAAGTCCTCTGTGCTCATGGAAATGAAACCATGGGATGAT
GAGACAGATATGAAGAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTCTA
TGGGGAGCTTCAAAATTGGTTCCAGTTGGTTACG*TATCAAGAAGCTCACGATCATGCT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2H842TF 714 0 0
GAACCTCTTCCACTC
CCTCCTAAACCAGAGCATCAAATGGCGCTTACCTTCTCAGATCTACACACAGAGCAGGGT
GTCAAATCCGTGGAGGAGCACCTCGCCGGAAAAACCTACATCTCCGGAGATCAGTTGTCT
GTGGATGATGTGAAGGTATACGCTGCCGTTTCGGGGAAACCCAGCGATGCTTTCCCCAAT
GCTAGCAGGTGGTACGATTGCGTCGCTTCCCACCTTGCTAAAAGCTTCCCTGGAAAAGCC
GTTGGAGTGAGTATCGGTGACTCTGCTGTTGCTGCTCCCGCTCAAGCTGAGGCACCTGCA
TCAGCTGTAGCTGAGGATGATGATGATGACATGGATCTGTTCGGTGATGAGACCGAGGAG
GAAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCTAAGAAGGACACCAAGAAGCCTAAAGAG
AGTGGAAAGTCCTCTGTGCTCATGGAAATGAAACCATGGGATGATGAGACAGATATGAAG
AAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTCTATGGGGAGCTTCAAAA
TTGGTTCCAGTTGGTTACGGTATCAAGAAGCTCACGATCATGCTCACAATTGTTGATGAC
CTCGTCTCCCCTGACAACCTCATTGAAGACTATCTCACCAGTGAACCTAACAACGAGTAC
ATCCAGAGTGTTGACATCGTTGCATTCA
CAGATCTAGAG

QA 16 703 16 703
DS 

RD RR2GP84JQ 193 0 0
TCGTCTCCCCTGACAACCTCATTGAAGACTATCTCACCAGTGAACCTAACAACGAGTACA
TCCAGAGTGTTGACATCGTTGCATTCAACAAGATCTAAGAGACTTTAAAACCTCTCCCTA
CCCCC*ACAAACAATACATTTGATTTCCTTCCAAGTTTTGTTCTTTTCTGCTGTTTGCTT
GTTTTCTAGTTGC

QA 1 193 1 193
DS 

RD RR2BG83TF 656 0 0
G
GGTGGTACGATTGCGTCGCTTCCCACCTTGCTAAAAGTTTCCCTGGAAAAGCCGTTGGAG
TGAGTATCTGTGGCTCTGCTGTTGCTGCTCCTGCTCAAGCTGAGGCACCTGCAGCAGCTG
TAGCTGAGGATGATGATGATGACATGGATCTGTTTGGTGATGAGACCGAGGAGGAGAAGA
AAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCTAAGAAGGACACCAAGAAGCCTAAAGAGAGTGGAA
AGTCCTCTGTGCTCATGGAAGTGAAGCCATGGGATGATGAGACAGATATGAAGAAACTTG
AGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTCTATGGGGAGCTTCGAAACTGGTTC
CAGTTGGTTACGGTATCAAGAAGCTCACAATCATGCTCACAATCGTTGATGACCTTGTGT
CCCCTGACAACCTCATTGAAGACTATCTCACCAGTGAACCTAACAACGAGTACATCCAGA
GTGTTGACATCGTTGCATTCAACAAGATCTAAGAGACTTTAAAACCTCTCCCTACCCCCC
ACAAACAATACATTTGATTTCCTTCCAAGTTTTGTTCTTTTCTGCTGTTTGCTTGTTTTC
TAGTTGCAAGACCTAGTTCATTTTACTAGAAACATAAACTATCA*TACTTTTTT
T

QA 2 655 2 655
DS 

RD RR2E872TF 430 0 0
GAGAGTGGAAAGTCCTCTGTGCTCATGGAAGTGAAACCGTGGGATGATGAGACAGATATG
AAGAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTCTATGGGGAGCTTCA
AAATTGGTTCCAGTTGGTTACGGTATCAAGAAGCTCACGATCATGCTCACAATTGTTGAT
GACCTCGTCTCCCCTGACAACCTCATTGAAGACTATCTCACCAGTGAACCTAACAACGAG
TACATCCAGAGTGTTGACATCGTTGCATTCAACAAGATCTA*GAGACTTTAAAACCTCTC
CCTGCCCCC*ACAAACAATACATTTGATTTCCTTCCAAGTTTTGTTCTTTTCTGCTGTTT
GCTTGTTTTCTAGTTGCAAGACCTAGTTCATGTTACTAGAAACATAAACTATCAATACTT
TTTTATCCCT

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2E872JQ 225 0 0
TCCCCTGACAACCTCATTGAAGACTATTTCACCAGTGAACCTAACAACGAGTACATCCAG
AGTGTTGACATCGTTGCATTCAACAAGATTTA*GAGACTTTAAAACCTCTCCCTGCCCCC
*ACAAACAATACATTTGATTTCCTTCCAAGTTTTGTTTTTTTTTGCTGTTTGCTTGTTTT
TTAGTTGCAAGACCTAGTTCATGTTACTAGAAACATAAACT
TTCA

QA 1 221 1 221
DS 



AS 4 11

CO CL67Contig1 699 2 11 U
GGACTTCCAATCAATCGGCGAACTTTCAAACATGGCGACACAAATCAGCAAGAAGAGAAA
GTTTGTAGCGGACGGTGTGTTCTACGCCGAGTTGAACGAGGTTCTAACCAGAGAGCTTGC
GGAAGATGGTTACTCAGGCGTGGAGGTTAGGGTTACTCCGATGAGGACTGAGATTATCAT
CAGGGCCACACGTACCCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGGAGGAGGATCAGAGAGTTGAC
ATCTCTTGTCCAGAAGAGATTCAGGCTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCAGAGAA
GGTTACCAACAGAGGTCTCTGCGCTATTGCCCAGGCTGAGTCTCTTCGTTACAAGCTCCT
CGGTGGACTTGCTGCCCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAGAGTGG
TGCTAAGGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTGCGTGCAGCACGTGCCAAGTCCAT
GAAATTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCTGGTCAACCTACCAAAGATTACATCGACTC
TGCTGTCAGACATGTTCTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATCAAGGTGAAGGTCATGCT
TGACTGGGACCCTAAAGGAGTAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCAT
CCATGCTCCCAAAGAGGAAGATGTCAACTCTGCACCTGT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ25TF U 1
AF RR2BC51TF U 1
BS 1 265 RR2BC51TF
BS 266 266 RR2DZ25TF
BS 267 294 RR2BC51TF
BS 295 295 RR2DZ25TF
BS 296 330 RR2BC51TF
BS 331 331 RR2DZ25TF
BS 332 525 RR2BC51TF
BS 526 526 RR2DZ25TF
BS 527 615 RR2BC51TF
BS 616 616 RR2DZ25TF
BS 617 699 RR2BC51TF

RD RR2DZ25TF 638 0 0
GG
ACTTCCAATCAATCGGCGAACTTTCAAACATGGCGACACAAATCAGCAAGGAGAGAAAGT
TTGTAGCGGACGGTGTGTTCTACGCCGAGTTGAACGAGGTTCTAACCAGAGAGCTTGCGG
AAGATGGTTACTCAGGCGTGGAGGTTAGGGTTACTCCGATGAGGACTGAGATTATCATCA
GGGCCACACGTACCCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGGAGGAGGATCAGAGAGTTGACAT
CTCTTGTCCAGAAGAGATTCAGGCTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCAGAGAAGG
TTACCAACAGAGGTCTCTGCGCTATTGCCCAGGCTGAGTCTCTTCGTTACAAGCTCCTCG
GTGGACTTGCTGTCCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAGAGTGGTG
CTAAGGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTGCGTGCAGCACGTGCCAAGTCCATGA
AATTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCTGGTCAACCTACCAAAGATTACATCGACTCTG
CTGTCAGACATGTTCTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATCAAGGTGAAGGTCATGCTTG
ACTGGGACCCTAAAGGAGTAAATGGACCAAAGACAC

QA 3 638 3 638
DS 

RD RR2BC51TF 699 0 0
GGACTTCCAATCAATCGGCGAACTTTCAAACATGGCGACACAAATCAGCAAGAAGAGAAA
GTTTGTAGCGGACGGTGTGTTCTACGCCGAGTTGAACGAGGTTCTAACCAGAGAGCTTGC
GGAAGATGGTTACTCAGGCGTGGAGGTTAGGGTTACTCCGATGAGGACTGAGATTATCAT
CAGGGCCACACGTACCCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGGAGGAGGATCAGAGAGTTGAC
ATCTCTTGTCCAGAAGAGATTCAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAGAA
GGTTACCAACAGAGGTCTCTGCGCTATTGCTCAGGCTGAGTCTCTTCGTTACAAGCTCCT
CGGTGGACTTGCTGCCCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAGAGTGG
TGCTAAGGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTGCGTGCAGCACGTGCCAAGTCCAT
GAAATTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCTGGTCAACCTACCAAGGATTACATCGACTC
TGCTGTCAGACATGTTCTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATCAAGGTGAAGGTCATGCT
TGACTGGGACCCTAAGGGAGTAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCAT
CCATGCTCCCAAAGAGGAAGATGTCAACTCTGCACCTGT

QA 1 699 1 699
DS 



CO CL67Contig2 900 3 8 U
TTTTTAGCGATCGGCAGCCTTCTTTCTACCTCTTATTTCTAAAACATGGCGACGCAAATC
AGCAAGAAGAGAAAGTTTGTGGCGGACGGTGTGTTCTACGCCGAATTGAACGAGGTTTTG
ACTAGGGAGCTGGCGGAGGATGGATACTCAGGTGTGGAGGTTAGGGTTACTCCAATGAGG
ACTGAGATTATCATCAGTGCCACCCGTACTCAAAATGTTCTCGGTGAGAAAGGGAGGAGG
ATCAGGGAGCTGACATCACTTGTACAGAAGAGATTTAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAG
CTTTACGCCGAGAAGGTTGCCAACAGAGGTCTCTGTGCCATTGCTCAGGCTGAGCCTCTC
CGTTACAAGCTCCTCGGTGGTCTTGCTGTTCGCAGGGCTTGCTATGGTGTATTGAGATTC
GTCATGGAGAGCGGAGCTAAGGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTCCGTGCTGCG
CGTGCCAAGTCCATGAAGTTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCCGGTCAACCTACCAAG
GAGTACATCGACTCTGCTGTCAGACATGTTCTCCTTAGACAGGGAGTGCTCGGAATCAAG
GTTAAGGTTATGCTTGACTGGGACCCTAAGGGAGTAACGGGACCAAAGACACCATTGCCT
GATGTTGTGATCATCCATACTCCCAAGGAAGAAGAAGTGAACTCTACATCTACCCAAGTT
GTTGCTCCGGCTGCTGCTCTTGTACCCGAAGCTCCCCTCACAGCTGTAGATTACCCTGAG
ATGATCCCAGTTGCCTAGAAAGAAAAAACCCTGTTTTACTACTATTTCATTTGATTTTGT
TCCTTTTTTTTTGTTCTTGGAATCAGACACCTTTTGAAATCTTATTTCTAAAATTATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CP61TF U 1
AF RR2CP61JQ C 227
AF RR2BE46TF U 430
BS 1 689 RR2CP61TF
BS 690 690 RR2BE46TF
BS 691 729 RR2CP61TF
BS 730 735 RR2BE46TF
BS 736 738 RR2CP61JQ
BS 739 746 RR2BE46TF
BS 747 747 RR2CP61JQ
BS 748 900 RR2BE46TF

RD RR2CP61TF 739 0 0
TTTTTAGCGATCGGCAGCCTTCTTTCTACCTCTTATTTCTAAAACATGGCGACGCAAATC
AGCAAGAAGAGAAAGTTTGTGGCGGACGGTGTGTTCTACGCCGAATTGAACGAGGTTTTG
ACTAGGGAGCTGGCGGAGGATGGATACTCAGGTGTGGAGGTTAGGGTTACTCCAATGAGG
ACTGAGATTATCATCAGTGCCACCCGTACTCAAAATGTTCTCGGTGAGAAAGGGAGGAGG
ATCAGGGAGCTGACATCACTTGTACAGAAGAGATTTAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAG
CTTTACGCCGAGAAGGTTGCCAACAGAGGTCTCTGTGCCATTGCTCAGGCTGAGCCTCTC
CGTTACAAGCTCCTCGGTGGTCTTGCTGTTCGCAGGGCTTGCTATGGTGTATTGAGATTC
GTCATGGAGAGCGGAGCTAAGGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTCCGTGCTGCG
CGTGCCAAGTCCATGAAGTTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCCGGTCAACCTACCAAG
GAGTACATCGACTCTGCTGTCAGACATGTTCTCCTTAGACAGGGAGTGCTCGGAATCAAG
GTTAAGGTTATGCTTGACTGGGACCCTAAGGGAGTAACGGGACCAAAGACACCATTGCCT
GATGTTGTGATCATCCATACTCCCAAGGA*GAAGAAGTGAACTCTACATCTACCCAAGTT
GTTGCTCCG
CTGCTGCTCT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2CP61JQ 674 0 0
AGAAAGGGAGGAGGATCAGGGAGCTGACATCACTTGTACAGAAGAGATTTAGGTTTCCTC
AAGACAGTGTTGAGCTTTACGCCGAGAAGGTTGCCAACAGAGGTCTCTGTGCCATTGCTC
AGGCTGAGCCTCTCCGTTACAAGCTCCTCGGTGGTCTTGCTGTTCGCAGGGCTTGCTATG
GTGTATTGAGATTCGTCATGGAGAGCGGAGCTAAGGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAA
AGCTCCGTGCTGCGCGTGCCAAGTCCATGAAGTTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCCG
GTCAACCTACCAAGGAGTACATCGACTCTGCTGTCAGACATGTTCTCCTTAGACAGGGAG
TGCTCGGAATCAAGGTTAAGGTTATGCTTGACTGGGACCCTAAGGGAGTAACGGGACCAA
AGACACCATTGCCTGATGTTGTGATCATCCATACTCCCAAGGAAGAAGAAGTGAACTCTA
CATCTACCCAAGTTGTTGCTCCGGCTGCTGCTCTTGTACCCGAAGCTCCCCTCACAGCTG
TAGATTACCCTGAGATGATCCCAGTTGCCTAGAAAGAAAAAACCCTGTTTTACTACTATT
TCATTTGATTTTGTTCCTTTTTTTTTGTTCTTGGAATCAGACACCTTTTGAAATCTTATT
TCTAAAATTATATC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2BE46TF 471 0 0
G
GCGGAGCTAAGGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTCCGTGCAGCACGTGCCAAGT
CCATGAAATTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCTGGTCAACCTACCAAGGAGTACATCG
ACTCTGCTGTCAGACATGTTCTCCTTAGACAGGGAGTGCTCGGAATCAAGGTTAAGGTTA
TGCTTGACTGGGACCCTAAGGGAGTAACGGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTGA
TCATCCATACTCCCAAAGAAGAAGAAGTGAACTCTACATCTACCCAAGTTGTTGCTCCAG
CTGCT***CTTGTACCTGAAGCTCCCCTCACAGCTGTAGATTACCCTGAGATGATCCCAG
TTGCCTAGAAAGAAAAAACCCTGTTTTACTACTATTTCATTTGATTTTGTTCCTTTTTTT
TTGTTCTTGGAATCAGACACCTTTTGAAATCTTATTTCTAAAATTATATC

QA 2 471 2 471
DS 



CO CL67Contig3 638 2 8 U
AAGACCAAAAATTCAATTGAACATAAGCATCCAGTCTAAAAAATACTTTGACATAAGTTT
GTAACCATGAAAAAAAAAACTTGTCAAATTGGAGGATATAGAAAAACAACTAGTGAGTAT
CAAGAGACACAGAAAAGTTATAACAAAAACAGAAGTACCCCATGGTAAGAGTAACCAAAG
GGTTTCTTCTAAGCGACTGGGATCATCTCAGGGTAATCTACAGCTGTGAGGGGAGCTTCC
GGTGCAAGGGCAGCCGGAGCAGTAACCTGAGCAGGTGCAGAGTTGACATCATCCTCCTTG
GGGGTATGGATGATGACAACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCATTTATTCCCTTAGGG
TCCCAGTCAAGCATGACCTTCACCTTGATTCCGAAAACACCCTGTCTAAGCAGAACATGT
CTGACAGCAGAGTCGATGTAATCCTTGGTTGGCTGACCAGAGGAAACCATGTAACCGTCC
TTGAATTTCATGGACTTGGCACGTGCTGCACGCAGCTTTCCACTCACAATCACCTCACAT
CCCTTAGCACCACTTTCCATGACGAATCTCAAGACACCATAGCAAGCCCTGCGAACAGCA
AGTCCACCGAGGAGCTTGTAACGGAGAGACTCAGTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ63JQ U 1
AF RR2CX18JQ U 22
BS 1 70 RR2DZ63JQ
BS 71 71 RR2CX18JQ
BS 72 78 RR2DZ63JQ
BS 79 79 RR2CX18JQ
BS 80 394 RR2DZ63JQ
BS 395 395 RR2CX18JQ
BS 396 538 RR2DZ63JQ
BS 539 638 RR2CX18JQ

RD RR2DZ63JQ 538 0 0
AAGACCAAAAATTCAATTGAACATAAGCATCCAGTCTAAAAAATACTTTGACATAAGTTT
GTAACCATGAGAAAAAAA*CTTGTCAAATTGGAGGATATAGAAAAACAACTAGTGAGTAT
CAAGAGACACAGAAAAGTTATAACAAAAACAGAAGTACCCCATGGTAAGAGTAACCAAAG
GGTTTCTTCTAAGCGACTGGGATCATCTCAGGGTAATCTACAGCTGTGAGGGGAGCTTCC
GGTGCAAGGGCAGCCGGAGCAGTAACCTGAGCAGGTGCAGAGTTGACATCATCCTCCTTG
GGGGTATGGATGATGACAACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCATTTATTCCCTTAGGG
TCCCAGTCAAGCATGACCTTCACCTTGATTCCGAGAACACCCTGTCTAAGCAGAACATGT
CTGACAGCAGAGTCGATGTAATCCTTGGTTGGCTGACCAGAGGAAACCATGTAACCGTCC
TTGAATTTCATGGACTTGGCACGTGCTGCACGCAGCTTTCCACTCACAATCACCTCAC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2CX18JQ 617 0 0
CATAAGCATCCAGTCTAAAAAATACTTTGACATAAGTTTGTAACCATGAAAAAAAAAACT
TGTCAAATTGGAGGATATAGAAAAACAACTAGTGAGTATCAAGAGACACAGAAAAGTTAT
AACAAAAACAGAAGTACCCCATGGTAAGAGTAACCAAAGGGTTTCTTCTAAGCGACTGGG
ATCATCTCAGGGTAATCTACAGCTGTGAGGGGAGCTTCCGGTGCAAGGGCAGCCGGAGCA
GTAACCTGAGCAGGTGCAGAGTTGACATCATCCTCCTTGGGGGTATGGATGATGACAACA
TCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCATTTATTCCCTTAGGGTCCCAGTCAAGCATGACCTTC
ACCTTGATTCCGAAAACACCCTGTCTAAGCAGAACATGTCTGACAGCAGAGTCGATGTAA
TCCTTGGTTGGCTGACCAGAGGAAACCATGTAACCGTCCTTGAATTTCATGGACTTGGCA
CGTGCTGCACGCAGCTTTCCACTCACAATCACCTCACATCCCTTAGCACCACTTTCCATG
ACGAATCTCAAGACACCATAGCAAGCCCTGCGAACAGCAAGTCCACCGAGGAGCTTGTAA
CGGAGAGACTCAGTCTG

QA 1 617 1 617
DS 



CO CL67Contig4 1036 4 33 U
GGGCAGCGCTTTCACCATCATCTCGAGATTACTTCAGGACTTTAGGGTTTCAGCGATCCA
CAGCTGCACACATCAAACATGGCGACTCAAATGAGCAAGAAGAGAAAGTTTGTAGCTGAC
GGCGTGCTCTACGCCGAGTTGAACGAGGTTTTAACCAGAGAGCTTGCTGAAGATGGTTAC
TCTGGTGTGGAGGTTAGGGTTACTCCAATGAGGACTGAGATTATCATCAGAGCCACACGT
ACTCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGAAGGAGAATCAGAGAGTTGACATCTCTTGTTCAG
AAGAGATTCAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAGAAGGTGACCAACAGA
GGTCTCTGCGCTATTGCTCAGGCTGAGTCTCTTC*GTTACAAGCTCCTCGGTGGACTTGC
TGTTCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAAAGTGGTGCTAAAGGATG
TGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCACGTGCCAAGTCCATGAAATTCAAGGA
CGGTTACATGGTTTCCTCTGGTCAACCAACCAAGGATTACATCGACTCTGCTGTCAGACA
TGTTCTGCTTAGACAGGGTGTTCTCGGAATCAAGGTGAAGGTCATGCTTGACTGGGACCC
TAAGGGAATAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGCCATCATCCATACCCCCAA
GGAGGATGATGTCAACTCTGCTCCTGCTCAGGTTACTGCTCCGGCTGCCCTTGCACCTGA
AGCTCCCCTCACAGCAGTAGATTACCCTGAGATGATCCCAGTCGCTTAGAAGAAATCCTT
TGGTTACTCTTACCATGGGATACTTCTGTTTTTGTTATAACTATTCTGTCTCTTGATACT
CGGTAGTTGTTTTTCTATATCCTCCAATTAGACAAGTTTTTTTTCTCATGGTTCCAAACT
TATGTCAATTATTTTTTAGACTGGATGCTTATGTTCAATGGAATTTTTGGTCTTAATAAG
AACAAAAATTACTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ63TF U 1
AF RR2CX18TF U 280
AF RR2BA69TF U -2
AF RR2FD50JQ C 298
BS 1 92 RR2DZ63TF
BS 93 93 RR2BA69TF
BS 94 122 RR2DZ63TF
BS 123 123 RR2BA69TF
BS 124 126 RR2DZ63TF
BS 127 127 RR2BA69TF
BS 128 230 RR2DZ63TF
BS 231 231 RR2BA69TF
BS 232 266 RR2DZ63TF
BS 267 267 RR2BA69TF
BS 268 272 RR2DZ63TF
BS 273 273 RR2BA69TF
BS 274 288 RR2DZ63TF
BS 289 289 RR2BA69TF
BS 290 350 RR2DZ63TF
BS 351 351 RR2BA69TF
BS 352 359 RR2DZ63TF
BS 360 360 RR2BA69TF
BS 361 392 RR2DZ63TF
BS 393 393 RR2BA69TF
BS 394 474 RR2DZ63TF
BS 475 475 RR2BA69TF
BS 476 504 RR2DZ63TF
BS 505 505 RR2BA69TF
BS 506 535 RR2DZ63TF
BS 536 567 RR2BA69TF
BS 568 568 RR2CX18TF
BS 569 576 RR2BA69TF
BS 577 577 RR2CX18TF
BS 578 701 RR2BA69TF
BS 702 702 RR2FD50JQ
BS 703 734 RR2BA69TF
BS 735 1036 RR2FD50JQ

RD RR2DZ63TF 535 0 0
GGGCAGCGCTTTCACCATCATCTCGAGATTACTTCAGGACTTTAGGGTTTCAGCGATCCA
CAGCTGCACACATCAAACATGGCGACTCAAATTAGCAAGAAGAGAAAGTTTGTAGCTGAC
GGTGTGTTCTACGCCGAGTTGAACGAGGTTTTAACCAGAGAGCTTGCTGAAGATGGTTAC
TCTGGTGTGGAGGTTAGGGTTACTCCAATGAGGACTGAGATTATCATCAGGGCCACACGT
ACTCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGGAGGAGGATCAGAGAGTTGACAGCTCTTGTTCAG
AAGAGATTCAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAGAAGGTTACCAACAGG
GGTCTCTGCGCTATTGCTCAGGCTGAGTCTCTCC*GTTACAAGCTCCTCGGTGGACTTGC
TGTTCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAAAGTGGTGCTAAGGGATG
TGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTGCGTGCAGCACGTGCCAAGTCCATGAAATTC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2CX18TF 353 0 0
GAGTTGACATCTCTTGTTCAGAAGAGATTCAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTAC
GCTGAGAAGGTTACCAACAGGGGTCTCTGCGCTATTGCTCAGACTGAGTCTCTCCCGTTA
CAAGCTCCTCGGTGGACTTGCTGTTCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCAT
GGAAAGTGGTGCTAAGGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTGCGTGCAGCACGTGC
CAAGTCCATGAAATTCAAGGACGGTTACATGGTTTCCTCTGGTCAGCCAACCAAGGATTA
CATCGACTCTGCTGTCAGACATGTTCTGCTTAGACAGGGTGTTCTCGGA
TCAA

QA 1 349 1 349
DS 

RD RR2BA69TF 737 0 0
GGATCTCAGCGCT
TTCACCATCATCTCGAGATTACTTCAGGACTTTAGGGTTTCAGTGATCCGCAGCTGCACA
CATCAAACATGGCGACTCAAATGAGCAAGAAGAGAAAGTTTGTAGCTGACGGCGTGCTCT
ACGCCGAGTTGAACGAGGTTTTAACCAGAGAGCTTGCTGAAGATGGTTACTCTGGTGTGG
AGGTTAGGGTTACTCCAATGAGGACTGAGATTATCATCAGAGCCACACGTACTCAAAATG
TTCTCGGTGAGAAGGGAAGGAGAATCAGAGAGTTGACATCTCTTGTTCAGAAGAGATTCA
GGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAGAAGGTGACCAACAGAGGTCTCTGCG
CTATTGCTCAGGCTGAGTCTCTTC*GTTACAAGCTCCTCGGTGGACTTGCTGTTCGCAGG
GCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAAAGTGGTGCTAAAGGATGTGAGGTGATT
GTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCACGTGCCAAGTCCATGAAATTCAAGGACGGTTACATG
GTTTCCTCTGGTCAACCTACCAAGGACTACATCGACTCTGCTGTCAGACATGTTCTGCTT
AGACAGGGTGTTCTCGGAATCAAGGTGAAGGTCATGCTTGACTGGGACCCTAAGGGAATA
AATGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCATCCATACCCCCAAGGAGGATGAT
GTCA

QA 14 737 14 737
DS 

RD RR2FD50JQ 739 0 0
CAGAAGAGATTCAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAGAAGGTGACCAAC
AGAGGTCTCTGCGCCATTGCTCAGGCTGAGTCTCTTC*GTTACAAGCTTCTCGGTGGACT
TGCTGTCCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTCATGGAAAGTGGTGCTAAAGG
ATGTGAGGTCATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCACGTGCCAAGTCCATGAAATTCAA
GGACGGTTACATGGTTTCGTCTGGTCAACCAACCAAAGATTACATCGACTCTGCTGTCAG
ACATGTTCTGCTTAGACAGGGTGTTCTCGGAATCAAGGTGAAGGTCATGCTTGACTGGGA
CCCTAAGGGAATAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGCCATCATCCATACCCC
CAAGGAGGATGATGTCAACTCTGCTCCTGCTCAGGTTACTGCTCCGGCTGCCCTTGCACC
TGAAGCTCCCCTCACAGCAGTAGATTACCCTGAGATGATCCCAGTCGCTTAGAAGAAATC
CTTTGGTTACTCTTACCATGGGATACTTCTGTTTTTGTTATAACTATTCTGTCTCTTGAT
ACTCGGTAGTTGTTTTTCTATATCCTCCAATTAGACAAGTTTTTTTTCTCATGGTTCCAA
ACTTATGTCAATTATTTTTTAGACTGGATGCTTATGTTCAATGGAATTTTTGGTCTTAAT
AAGAACAAAAATTACTACG

QA 1 739 1 739
DS 



AS 5 22

CO CL68Contig1 651 7 4 U
GGGTTCGCTGACGACGGCACACAATCTTCACCCGAGAGAGAGATCAGATTAGCGAAAATG
GTGAACATTCCAAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCACACA
TTGCACAAGGTTACCCAATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCCGCTCAAGGGAAACGT
CGTTATGACCGTAAGCAATCTGGCTACGGTGGTCAGACCAAGCCTGTTTTCCACAAGAAG
GCTAAGACTACCAAGAAGATCGTTCTCAGGCTTCAGTGCCAAACTTGCAAGCACTTTTCG
CAGCACTCAATCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGAAAGGGA
ACATCTCTTTTCTAAGCTGTTGTCATCTTATTTTGTTACAAGTTTTCTATTTCGTTGGAT
CTTTGATTCCATCTGTTTTAGCACTCGTATAAGATTGTCCTCACCCCCAACTCTATATTT
TGAATCATCTAGATATGATTTTGCTGTTTTCTATGCACCTAAAATGGTTACTTTTGACTT
TCGAGATATAGTTTGTACGAAACTCACGAGGCTCTGTTTTCTCGAGCAGAAAGTATTGAT
CTTTCATGTGAAAGCCTCTTGAAATTAAGCAATAACAAGTGTTGATCTTTT


BQ
30 30 30 30 30 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG03JQ C 1
AF RR2BM03JQ C 185
AF RR2AG03TF U 1
AF RR2BM03TF U 185
AF RR2EI41JQ C 1
AF RR2EI41TF U 1
AF RR2FM26TF U 5
BS 1 142 RR2AG03TF
BS 143 143 RR2EI41TF
BS 144 506 RR2AG03TF
BS 507 651 RR2FM26TF

RD RR2AG03JQ 506 0 0
GGGTTCGCTGACGACGGCACACAATCTTCACCCGAGAGAGAGATCAGATTAGCGAAAATG
GTGAACATTCCAAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCACACA
TTGCACAAGGTTACCCAATACAGGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCCGCTCAAGGGAAACGT
CGTTATGACCGTAAGCAATCTGGCTACGGTGGTCAGACCAAGCCTGTTTTCCACAAGAAG
GCTAAGACTACCAAGAAGATCGTTCTCAGGCTTCAGTGCCAAACTTGCAAGCACTTTTCG
CAGCACTCAATCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGAAAGGGA
ACATCTCTTTTTTAAGCTGTTGTCATCTTATTTTGTTACAAGTTTTCTATTTCGTTGGAT
CTTTGATTCCATCTGTTTTAGCACTCGTATAAGATTGTCCTCACCCCCAACTCTATATTT
TGAATCATCTAGATATGATTTTGCTG

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2BM03JQ 311 0 0
G
TGACCGTAAGCAATCTGGCTACGGTGGTCAGACCAAGCCTGTTTTCCACAAGAAGGCTAA
GACTACCAAGAAGATCGTTCTCAGGCTTCAGTGCCAAACTTGCAAGCACTTTTCGCAGCA
CTCAATCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGAAAGGGAACATC
TCTTTTTTAAGCTGTTGTCATCTTATTTTGTTACAAGTTTTCTATTTCGTTGGATCTTTG
ATTCCATCTGTTTTAGCACTCGTATAAGATTGTCCTCACCCCCAACTCTATATTTTGAAT
CATCTAGATA

QA 2 311 2 311
DS 

RD RR2AG03TF 506 0 0
GGGTTCGCTGACGACGGCACACAATCTTCACCCGAGAGAGAGATCAGATTAGCGAAAATG
GTGAACATTCCAAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCACACA
TTGCACAAGGTTACCCAATACAGGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCCGCTCAAGGGAAACGT
CGTTATGACCGTAAGCAATCTGGCTACGGTGGTCAGACCAAGCCTGTTTTCCACAAGAAG
GCTAAGACTACCAAGAAGATCGTTCTCAGGCTTCAGTGCCAAACTTGCAAGCACTTTTCG
CAGCACTCAATCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGAAAGGGA
ACATCTCTTTTCTAAGCTGTTGTCATCTTATTTTGTTACAAGTTTTCTATTTCGTTGGAT
CTTTGATTCCATCTGTTTTAGCACTCGTATAAGATTGTCCTCACCCCCAACTCTATATTT
TGAATCATCTAGATATGATTTTGCTG

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2BM03TF 311 0 0
G
TGACCGTAAGCAATCTGGCTACGGTGGTCAGACCAAGCCTGTTTTCCACAAGAAGGCTAA
GACTACCAAGAAGATCGTTCTCAGGCTTCAGTGCCAAACTTGCAAGCACTTTTCGCAGCA
CTCAATCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGAAAGGGAACATC
TCTTTTCTAAGCTGTTGTCATCTTATTTTGTTACAAGTTTTCTATTTCGTTGGATCTTTG
ATTCCATCTGTTTTAGCACTCGTATAAGATTGTCCTCACCCCCAACTCTATATTTTGAAT
CATCTAGATA

QA 2 311 2 311
DS 

RD RR2EI41JQ 506 0 0
GGGTTCGCTGACGACGGCACACAATCTTCACCCGAGAGAGAGATCAGATTAGCGAAAATG
GTGAACATTCCAAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCACACA
TTGCACAAGGTTACCCAATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCCGCTCAAGGGAAACGT
CGTTATGACCGTAAGCAATCTGGCTACGGTGGTCAGACCAAGCCTGTTTTCCACAAGAAG
GCTAAGACTACCAAGAAGATCGTTCTCAGGCTTCAGTGCCAAACTTGCAAGCACTTTTCG
CAGCACTCAATCAAGAGGTGCGAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGAAAGGGA
ACATCTCTTTTCTAAGCTGTTGTCATCTTATTTTGTTACAAGTTTTCTATTTCGTTGGAT
CTTTGATTCCATCTGTTTTAGCACTCGTATAAGATTGTCCTCACCCCCAACTCTATATTT
TGAATCATCTAGATATGATTTTGCTG

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2EI41TF 494 0 0
GGGTTCGCTGACGACGGCACACAATCTTCACCCGAGAGAGAGATCAGATTAGCGAAAATG
GTGAACATTCCAAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCACACA
TTGCACAAGGTTACCCAATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCCGCTCAAGGGAAACGT
CGTTATGACCGTAAGCAATCTGGCTACGGTGGTCAGACCAAGCCTGTTTTCCACAAGAAG
GCTAAGACTACCAAGAAGATCGTTCTCAGGCTTCAGTGCCAAACTTGCAAGCACTTTTCG
CAGCACTCAATCAAGAGGTGCGAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGAAAGGGA
ACATCTCTTTTCTAAGCTGTTGTCATCTTATTTTGTTACAAGTTTTCTATTTCGTTGGAT
CTTTGATTCCATCTGTTTTAGCACTCGTATAAGATTGTCCTCACCCCCAACTCTATATTT
TGAATCATCTAGAT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2FM26TF 647 0 0
G
GGCTGACGACGGCACACAATCTTCACCCGAGAGAGAGATCAGATTAGCGAAAATGGTGAA
CATTCCAAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCACACATTGCA
CAAGGTTACCCAATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCCGCTCAAGGGAAACGTCGTTA
TGACCGTAAGCAATCTGGCTACGGTGGTCAGACCAAGCCTGTTTTCCACAAGAAGGCTAA
GACTACCAAGAAGATCGTTCTCAGGCTTCAGTGCCAAACTTGCAAGCACTTTTCGCAGCA
CTCAATCAAGAGGTGCAAGCATTTTAAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGAAAGGGAACATC
TCTTTTCTAAGCTGTTGTCATCTTATTTTGTTACAAGTTTTCTATTTCGTTGGATCTTTG
ATTCCACCTGTTTTAGCACTCGTATAAGATTGTCCTCACCCCCAACTCTATATTTTGAAT
CATCTAGATATGATTTTGCTGTTTTCTATGCACCTAAAATGGTTACTTTTGACTTTCGAG
ATATAGTTTGTACGAAACTCACGAGGCTCTGTTTTCTCGAGCAGAAAGTATTGATCTTTC
ATGTGAAAGCCTCTTGAAATTAAGCAATAACAAGTGTTGATCTTTT

QA 2 647 2 647
DS 



CO CL68Contig2 529 4 11 U
GGGACGACGACGGCACAAGCTTCCCTCAAGGTCAGACGAGCGAAAATGGTGAACATTCCA
AAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGTAAGAAGCATACGTTGCACAAGGTG
ACCCAATACAAGAAAGGTAAAGACATTCTCGCTGCTCAAGGAAAGCGTCGTTACGACCGT
AAGCAATCTGGTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACCACG
AAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGCAAACACTTTTCTCAGCACTCGATC
AAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGCCAAGAAGGGGAAGGGAACATCGCTTTTC
TAAGTTGGTCTTGTCTTAACTTTTTTTTTTGCAAGGTTTTGTTACTTGTGTCGGATCATG
ATCCCCATCTGTTTTAGAATCTTCCATTGCCCAAATTTAAAATTTCAAACTATGCATGTA
AAAGTGAAATACTTTTTCAGATGTTCTTTGCTCTATGATGTCATTGTTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2GO77TF U 34
AF RR2CP64TF U 1
AF RR2DH81JQ C 1
AF RR2DH81TF U 1
BS 1 145 RR2CP64TF
BS 146 146 RR2DH81TF
BS 147 312 RR2CP64TF
BS 313 313 RR2GO77TF
BS 314 331 RR2CP64TF
BS 332 332 RR2DH81TF
BS 333 387 RR2CP64TF
BS 388 389 RR2DH81TF
BS 390 505 RR2CP64TF
BS 506 525 RR2DH81TF
BS 526 529 RR2DH81JQ

RD RR2GO77TF 310 0 0
AGACGAGCGAAAATGGTGAACATTCCAAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAA
TGCAAGAAGCATACATTGCACAAGGTGACCCAATACAAGAAAGGTAAAGACAGTCTCGCT
GCTCAAGGAAAGCGTCGTTATGACCGTAAGCAATCTGGTTATGGTGGTCAGACTAAGCCT
GTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACCACGAAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCATTGCCAAACC
TGCAAACATTTTTCTCAGCACTCAATCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGAC
AAGAAGGGGA

QA 1 310 1 310
DS 

RD RR2CP64TF 514 0 0
GGGACGACGACGGCACAAGCTTCCCTCAAGGTCAGACGAGCGAAAATGGTGAACATTCCA
AAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGTAAGAAGCATACGTTGCACAAGGTG
ACCCAATACAAGAAAGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCAAGGAAAGCGTCGTTACGACCGT
AAGCAATCTGGTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACCACG
AAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGCAAACACTTTTCTCAGCACTCGATC
AAGAGGTGCAAGTATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGGAAGGGAACATCGCTTTTC
TAAGTTGGTCTTGTCTTAACTTTTTTT**TGCAAGGTTTTGTTACTTGTGTCGGATCATG
ATCCCCATCTGTTTTAGAATCTTCCATTGCCCAAATTTAAAATTTCAAACTATGCATGTA
AAAGTGAAATACTTTTTCAGATGTT
CTTTGCTCC

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR2DH81JQ 529 0 0
GGGACGACGACGGCACAAGCTTCCCTCAAGGTCAGACGAGCGAAAATGGTGAACATTCCA
AAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGTAAGAAGCATACGTTGCACAAGGTG
ACCCAATACAAGAAAGGTAAAGACATTCTCGCTGCTCAAGGAAAGCGTCGTTACGACCGT
AAGCAATCTGGTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACCACG
AAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGCAAACACTTTTCTCAGCACTCGATC
AAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGCCAAGAAGGGGAAGGGAACATCGCTTTTC
TAAGTTGGTCTTGTCTTAACTTTTTTTTTTGCAAGGTTTTGTTACTTGTGTCGGATCATG
ATCCCCATCTGTTTTAGAATCTTCCATTGCCCAAATTTAAAATTTCAAACTATGCATGTA
AAAGTGAAATACTTTTTCAGATGTTCTTTGCTCTATGATGTCATTGTTT

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2DH81TF 529 0 0
GGGACGACGACGGCACAAGCTTCCCTCAAGGTCAGACGAGCGAAAATGGTGAACATTCCA
AAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGTAAGAAGCATACGTTGCACAAGGTG
ACCCAATACAAGAAAGGTAAAGACATTCTCGCTGCTCAAGGAAAGCGTCGTTACGACCGT
AAGCAATCTGGTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACCACG
AAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGCAAACACTTTTCTCAGCACTCGATC
AAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGCCAAGAAGGGGAAGGGAACATCGCTTTTC
TAAGTTGGTCTTGTCTTAACTTTTTTTTTTGCAAGGTTTTGTTACTTGTGTCGGATCATG
ATCCCCATCTGTTTTAGAATCTTCCATTGCCCAAATTTAAAATTTCAAACTATGCATGTA
AAAGTGAAATACTTTTTCAGATGTTCTTTGCTCTATGATGTCATT
GTTT

QA 1 525 1 525
DS 



CO CL68Contig3 510 2 2 U
GGAGCAGAAGACGACGGCACACAAGCTTCACCGGAGATAGATCAGAGGAGCGAAAATGGT
GAACATTCCGAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAGTGCAAGAAGCATACTTT
GCACAAGGTTACCCAATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCGAGGGAAGCGTCG
TTATGACCGCAAGCAATCCGTTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGC
TAAGACCACTAAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGCAAGCACTTTTCTCA
GCACTCAATCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAAC
ATCACTTTTCTAAGCTGGTCTCGTCTTGAGCTTTACAAGTTTTGTACTTCGTTGGATCTT
TGATTTCATCTGTTTTAGCTCTCGTATAAGATTGTTTCTCATCTTTGCCTGTTAACTCTT
ATGTTTTTGTATCTCAAGATGTGTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CW17JQ C 1
AF RR2CW17TF U 1
BS 1 9 RR2CW17JQ
BS 10 510 RR2CW17TF

RD RR2CW17JQ 510 0 0
GGAGCAGAAGACGACGGCACACAAGCTTCACCGGAGATAGATCAGAGGAGCGAAAATGGT
GAACATTCCGAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAGTGCAAGAAGCATACTTT
GCACAAGGTTACCCAATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCGAGGGAAGCGTCG
TTATGACCGCAAGCAATCCGTTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGC
TAAGACCACTAAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGCAAGCACTTTTCTCA
GCACTCAATCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAAC
ATCACTTTTCTAAGCTGGTCTCGTCTTGAGCTTTACAAGTTTTGTACTTCGTTGGATCTT
TGATTTCATCTGTTTTAGCTCTCGTATAAGATTGTTTCTCATCTTTGCCTGTTAACTCTT
ATGTTTTTGTATCTCAAGATGTGTTTTTCC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2CW17TF 510 0 0
GGAGCAGAA
GACGACGGCACACAAGCTTCACCGGAGATAGATCAGAGGAGCGAAAATGGTGAACATTCC
GAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAGTGCAAGAAGCATACTTTGCACAAGGT
TACCCAATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCGAGGGAAGCGTCGTTATGACCG
CAAGCAATCCGTTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACCAC
TAAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGCAAGCACTTTTCTCAGCACTCAAT
CAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAACATCACTTTT
CTAAGCTGGTCTCGTCTTGAGCTTTACAAGTTTTGTACTTCGTTGGATCTTTGATTTCAT
CTGTTTTAGCTCTCGTATAAGATTGTTTCTCATCTTTGCCTGTTAACTCTTATGTTTTTG
TATCTCAAGATGTGTTTTTCC

QA 10 510 10 510
DS 



CO CL68Contig4 540 2 2 U
GGAGACAAGCTTCACCGGAGATAGATCAGGGGAGCGAAAATGGTGAACATTCCGAAGACA
AAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACATTGCACAAGGTTACCCAA
TACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCAAGGGAAGCGTCGTTATGACCGTAAGCAA
TCCGGTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACCACTAAGAAG
ATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGCAAGCACTTTTCTCAGCACTCCATCAAGAGG
TGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAACATCACTTTTCTAAGCT
GGTCTCGTCTTTACGCTTTACAAGTTTTGTATTTCGTTGGATCTTTGATTTCATCTCTTT
TAGCTCTCATATAAGATTGTTTCTCATCTTTGCTTGTTAACTCTGTCTTTGTATCATCAA
GATGTGTTTTTCAGTTTATCAGTCACTACAATCGAAGTGTGTGTTTTACAATCCAGTTTT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FE20JQ C 1
AF RR2FE20TF U 1
BS 1 4 RR2FE20JQ
BS 5 540 RR2FE20TF

RD RR2FE20JQ 540 0 0
GGAGACAAGCTTCACCGGAGATAGATCAGGGGAGCGAAAATGGTGAACATTCCGAAGACA
AAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACATTGCACAAGGTTACCCAA
TACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCAAGGGAAGCGTCGTTATGACCGTAAGCAA
TCCGGTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTTTTCCACAAGAAGGCTAAGACCACTAAGAAG
ATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGCAAGCACTTTTTTCAGCACTCCATCAAGAGG
TGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAACATCACTTTTTTAAGCT
GGTTTCGTCTTTACGCTTTACAAGTTTTGTATTTCGTTGGATCTTTGATTTCATCTCTTT
TAGCTCTCATATAAGATTGTTTTTCATCTTTGCTTGTTAACTCTGTCTTTGTATCATCAA
GATGTGTTTTTCAGTTTATCAGTCACTACAATCGAAGTGTGTGTTTTACAATCCAGTTTT

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2FE20TF 540 0 0
GGAG
ACAAGCTTCACCGGAGATAGATCAGGGGAGCGAAAATGGTGAACATTCCGAAGACAAAGA
AGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACATTGCACAAGGTTACCCAATACA
AGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCAAGGGAAGCGTCGTTATGACCGTAAGCAATCCG
GTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACCACTAAGAAGATTG
TCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGCAAGCACTTTTCTCAGCACTCCATCAAGAGGTGCA
AGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAACATCACTTTTCTAAGCTGGTC
TCGTCTTTACGCTTTACAAGTTTTGTATTTCGTTGGATCTTTGATTTCATCTCTTTTAGC
TCTCATATAAGATTGTTTCTCATCTTTGCTTGTTAACTCTGTCTTTGTATCATCAAGATG
TGTTTTTCAGTTTATCAGTCACTACAATCGAAGTGTGTGTTTTACAATCCAGTTTT

QA 5 540 5 540
DS 



CO CL68Contig5 553 7 6 U
CGTACAAACTATTTCTCAAAAGTAACCATTTCAAGTGCATAGAAAAACAGCAAAATCATA
TCTAGATGATTCAAAATATAGAGTTGGAGGGCGAGGGGACAAATCTTATACGAGGGCTAA
AACAGATGGAATCACAGATCCAACGAAATAGAAAACTTGTAACAAAATAAGATGACAACA
GCTTAAAAAAGAGATGTTCCCTTGCCCTTCTTGTCTCCACCGATCTCAAAATGCTTGCAC
CTCTTGATTGAGTGCTGAGAAAAGTGCTTGCAAGTTTGGCACTGAAGCCTGAGGACGATC
TTCTTCGTGGTCTTAGCCTTCTTGTGGAAGACAGGCTTGGTCTGACCACCATAGCCAGAT
TGCTTACGGTCATAACGACGCTTCCCTTGAGCGGCGAGACTGTCTTTACCCTTCTTGTAT
TGGGTAACCTTGTGCAATGTGTGCTTCTTGCATTCCTTGTTCTTGCAGTATGTCTTCTTT
GTCTTTGGAATGTTCACCATTTTCGCTAATCTGATCTCTCTCTCGGGTGAAGATTGTGTG
CCGTCGTCAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 10 

AF RR2G160JQ U 1
AF RR2G160TF C 1
AF RR2GY50JQ U 4
AF RR2FG42JQ U 18
AF RR2B265JQ U 48
AF RR2B265TF C 48
AF RR2FG42TF C 18
BS 1 93 RR2G160JQ
BS 94 94 RR2FG42JQ
BS 95 523 RR2G160JQ
BS 524 524 RR2FG42JQ
BS 525 550 RR2G160JQ
BS 551 553 RR2FG42JQ

RD RR2G160JQ 553 0 0
CGTACAAACTATTTCTCAAAAGTAACCATTTCAAGTGCATAGAAAAACAGCAAAATCATA
TCTAGATGATTCAAAATATAGAGTTGGAGGGCGTGGGGACAAATCTTATACGAGGGCTAA
AACAGATGGAATCACAGATCCAACGAAATAGAAAACTTGTAACAAAATAAGATGACAACA
GCTTAAAAAAGAGATGTTCCCTTGCCCTTCTTGTCTCCACCGATCTCAAAATGCTTGCAC
CTCTTGATTGAGTGCTGAGAAAAGTGCTTGCAAGTTTGGCACTGAAGCCTGAGGACGATC
TTCTTCGTGGTCTTAGCCTTCTTGTGGAAGACAGGCTTGGTCTGACCACCATAGCCAGAT
TGCTTACGGTCATAACGACGCTTCCCTTGAGCGGCGAGACTGTCTTTACCCTTCTTGTAT
TGGGTAACCTTGTGCAATGTGTGCTTCTTGCATTCCTTGTTCTTGCAGTATGTCTTCTTT
GTCTTTGGAATGTTCACCATTTTCGCTAATCTGATCTCTCTCT*GGGTGAAGATTGTGTG
CCGTCGTCAG
TCC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2G160TF 553 0 0
CGTACAAACTATTTC
TCAAAAGTAACCATTTCAAGTGCATAGAAAAACAGCAAAATCATATCTAGATGATTCAAA
ATATAGAGTTGGAGGGCGTGGGGACAAATCTTATACGAGGGCTAAAACAGATGGAATCAC
AGATCCAACGAAATAGAAAACTTGTAACAAAATAAGATGACAACAGCTTAGAAAAGAGAT
GTTCCCTTGCCCTTCTTGTCTCCACCGATCTCAAAATGCTTGCACCTCTTGATTGAGTGC
TGAGAAAAGTGCTTGCAAGTTTGGCACTGAAGCCTGAGGACGATCTTCTTCGTGGTCTTA
GCCTTCTTGTGGAAGACAGGCTTGGTCTGACCACCATAGCCAGATTGCTTACGGTCATAA
CGACGCTTCCCTTGAGCGGCGAGACTGTCTTTACCCTTCTTGTATTGGGTAACCTTGTGC
AATGTGTGCTTCTTGCATTCCTTGTTCTTGCAGTATGTCTTCTTTGTCTTTGGAATGTTC
ACCATTTTCGCTAATCTGATCTCTCTCT*GGGTGAAGATTGTGTGCCGTCGTCAG
TCC

QA 16 550 16 550
DS 

RD RR2GY50JQ 550 0 0
ACAAACTATTTC
TCAAAAGTAACCATTTCAAGTGCATAGAAAAACAGCAAAATCATATCTAGATGATTCAAA
ATATAGAGTTGGAGGGCGTGGGGACAAATCTTATACGAGGGCTAAAACAGATGGAATCAC
AGATCCAACGAAATAGAAAACTTGTAACAAAATAAGATGACAACAGCTTAAAAAAGAGAT
GTTCCCTTGCCCTTCTTGTCTCCACCGATCTCAAAATGCTTGCACCTCTTGATTGAGTGC
TGAGAAAAGTGCTTGCAAGTTTGGCACTGAAGCCTGAGGACGATCTTCTTCGTGGTCTTA
GCCTTCTTGTGGAAGACAGGCTTGGTCTGACCACCATAGCCAGATTGCTTACGGTCATAA
CGACGCTTCCCTTGAGCGGCGAGACTGTCTTTACCCTTCTTGTATTGGGTAACCTTGTGC
AATGTGTGCTTCTTGCATTCCTTGTTCTTGCAGTATGTCTTCTTTGTCTTTGGAATGTTC
ACCATTTTCGCTAATCTGATCTCTCTCT*GGGTGAAGATTGTGTGCCGTCGTCAG
TCC

QA 13 547 13 547
DS 

RD RR2FG42JQ 536 0 0
G
AAAGTAACCATTTCAAGTGCATAGAAAAACAGCAAAATCATATCTAGATGATTCAAAATA
TAGAGTTGGAGGGCGAGGGGACAAATCTTATACGAGGGCTAAAACAGATGGAATCACAGA
TCCAACGAAATAGAAAACTTGTAACAAAATAAGATGACAACAGCTTAAAAAAGAGATGTT
CCCTTGCCCTTCTTGTCTCCACCGATCTCAAAATGCTTGCACCTCTTGATTGAGTGCTGA
AAAAAGTGCTTGCAAGTTTGGCACTGAAGCCTGAGGACGATCTTCTTCGTGGCCTTAGCC
TTCTTGTGGAAGACAGGCTTGGTCTGACCACCATAGCCAGATTGCTTACGGTCATAACGA
CGCTTCCCTTGAGCGGCGAGACTGTCTTTACCCTTCTTGTATTGGGTAACCTTGTGCAAT
GTGTGCTTCTTGCATTCCTTGTCCTTGCAGTATGTCTTCTTTGTCTTTGGAATGTTCACC
ATTTTCGCTAATCTGATCTCTCTCTCGGGTGAAGATTGTGTGCCGTCGTCAGCCC

QA 2 536 2 536
DS 

RD RR2B265JQ 505 0 0
CG
GCAAAATCATATCTAGATGATTCAAAATATAGAGTTGGAGGGCGAGGGGACAAATCTTAT
ACGAGGGCTAAAACAGATGGAATCACAGATCCAACGAAATAGAAAACTTGTAACAAAATA
AGATGACAACAGCTTAAAAAAGAGATGTTCCCTTGCCCTTCTTGTCTCCACCGATCTCAA
AATGCTTGCACCTCTTGATTGAGTGCTGAGAAAAGTGCTTGCAAGTTTGGCACTGAAGCC
TGAGGACGATCTTCTTCGTGGTCTTAGCCTTCTTGTGGAAGACAGGCTTGGTCTGACCAC
CATAGCCAGATTGCTTACGGTCATAACGACGCTTCCCTTGAGCGGCGAGGCTGTCTTTAC
CCTTCTTGTATTGGGTAACCTTGTGCAATGTGTGCTTCTTGCATTACTTGTTCTTGCAGT
ATGCCTTCTTTGTCTTTGGAATGTTCACCATTTTCGCTAATCTGATCTCTCTCTCGGGTG
AAGATTGTGTGCCGTCGTCAGCC

QA 3 505 3 505
DS 

RD RR2B265TF 505 0 0
CG
GCAAAATCATATCTAGATGATTCAAAATATAGAGTTGGAGGGCGAGGGGACAAATCTTAT
ACGAGGGCTAAAACAGATGGAATCACAGATCCAACGAAATAGAAAACTTGTAACAAAATA
AGATGACAACAGCTTAGAAAAGAGATGTTCCCTTGCCCTTCTTGTCTCCACCGATCTCAA
AATGCTTGCACCTCTTGATTGAGTGCTGAGAAAAGTGCTTGCAAGTTTGGCACTGAAGCC
TGAGGACGATCTTCTTCGTGGTCTTAGCCTTCTTGTGGAAGACAGGCTTGGTCTGACCAC
CATAGCCAGATTGCTTACGGTCATAACGACGCTTCCCTTGAGCGGCGAGGCTGTCTTTAC
CCTTCTTGTATTGGGTAACCTTGTGCAATGTGTGCTTCTTGCATTACTTGTTCTTGCAGT
ATGCCTTCTTTGTCTTTGGAATGTTCACCATTTTCGCTAATCTGATCTCTCTCTCGGGTG
AAGATTGTGTGCCGTCGTCAGCC

QA 3 505 3 505
DS 

RD RR2FG42TF 536 0 0
G
AAAGTAACCATTTCAAGTGCATAGAAAAACAGCAAAATCATATCTAGATGATTCAAAATA
TAGAGTTGGAGGGCGAGGGGACAAATCTTATACGAGGGCTAAAACAGATGGAATCACAGA
TCCAACGAAATAGAAAACTTGTAACAAAATAAGATGACAACAGCTTAGAAAAGAGATGTT
CCCTTGCCCTTCTTGTCTCCACCGATCTCAAAATGCTTGCACCTCTTGATTGAGTGCTGA
GAAAAGTGCTTGCAAGTTTGGCACTGAAGCCTGAGGACGATCTTCTTCGTGGCCTTAGCC
TTCTTGTGGAAGACAGGCTTGGTCTGACCACCATAGCCAGATTGCTTACGGTCATAACGA
CGCTTCCCTTGAGCGGCGAGACTGTCTTTACCCTTCTTGTATTGGGTAACCTTGTGCAAT
GTGTGCTTCTTGCATTCCTTGTCCTTGCAGTATGTCTTCTTTGTCTTTGGAATGTTCACC
ATTTTCGCTAATCTGATCTCTCTCTCGGGTGAAGATTGTGTGCCGTCGTCAGCC
C

QA 2 535 2 535
DS 



AS 2 23

CO CL69Contig1 786 19 9 U
GGGATCAAAGAAAAGGACACATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGA
GATGAGGAACATTACTTCTAAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAAC
GGTGATTGCGTATCATGAGGGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGC
ACCATGTTTATCTTATCTAAGATCTGGAGGAAACCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCT
TAGCAGTCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTT
GAAGAGTGTGTCTAACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTC
TAAATGTAATGTTGATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAA
CTGAAAAGAGGACTATGTATCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAA
AGAGCAAACGCATTATGAACAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTA
TACTTTATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAATGTGAAAATTCCCACATTTA
TATATTCCTCAATCTCCTAGAACGCAGCATCAAAAAGATTCTGGTATCAGTCACACATTA
CAAGAATATGTTCAAAGATTCATGACGTTTCACAGAGTTGTAGTCATATTGAGCAAACAT
CAAATCCAAGGAGAACATATTTTATTTATATGTGGTAAATTTTAGTATCAGTATAGGATG
AGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 50 50 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 90 75 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 75 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 65 90 90 90 90 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 70 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 95 95 65 95 95 70 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 70 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 65 60 50 40 25 25 25 25 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2C929JQ C 20
AF RR2DK27TF U 20
AF RR2A244JQ C 20
AF RR2A170JQ C 82
AF RR2AN74TF U 1
AF RR2AW19JQ C 4
AF RR2AW19TFB U 4
AF RR2CN72JQ C 15
AF RR2FX60TF U 15
AF RR2CS64TF U 15
AF RR2HA17TF U 15
AF RR2CN72TF U 15
AF RR2A244TF U 20
AF RR2A170TF U 69
AF RR2FW75TF U 372
AF RR2D879TF U 243
AF RR2DK27JQ C 20
AF RR2C929TF U 20
AF RR2HA17JQ C 220
BS 1 14 RR2AN74TF
BS 15 16 RR2FX60TF
BS 17 435 RR2AN74TF
BS 436 436 RR2AW19TFB
BS 437 592 RR2AN74TF
BS 593 594 RR2AW19TFB
BS 595 596 RR2CS64TF
BS 597 600 RR2A244TF
BS 601 786 RR2HA17JQ

RD RR2C929JQ 177 0 0
CATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAGGAACATTACTTCT
AAACCAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTATCATGAG
GGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTATCTTAT

QA 1 177 1 177
DS 

RD RR2DK27TF 456 0 0
CATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAGGAACATTACTTCT
AAAACAGGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGTGTATCATGAG
GGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTATCTTATCTA
AGATCTGGAGGAAACCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAGCCGCT
GCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTAACACA
ATCCCTGGAATCAACGATGACAGTTCCAAACAATTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCTG
GGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTA
TCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTC

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR2A244JQ 469 0 0
CATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAGGAACATTACTTTT
AAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTATCATGAG
GGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTATTTTATTTA
AGATCTGGAGGAAACCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAGTTTAAAAGCCGCT
GCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTAACACA
ATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCTG
GGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTA
TCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAA

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR2A170JQ 418 0 0
AACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTATCATGAGGG
AGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTTTTAGCACCATGTTTATTTTATTTAAG
ATCTGGAGGAAACCCGTTTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAGTTTAAAAGCCGCTGC
GCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTAACACAAT
CCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCTGGG
TGTCCCTTTCTTTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTATC
AACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAA

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR2AN74TF 592 0 0
GGGATCAAAGAAAAACACACATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGA
GATGAGGAACATTACTTCTAAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAAC
GGTGATTGCGTATCATGAGGGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGC
ACCATGTTTATCTTATCTAAGATCTGGAGGAAACCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCT
TAGCAGTCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTT
GAAGAGTGTGTCTAACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTC
TAAATGTAATGTTGATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAA
CTGAAAAGAGGACTACGTATCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAA
AGAGCAAACGCATTATGAACAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTA
TACTTTATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAATGTGAAAATTCC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2AW19JQ 592 0 0
GGA
AAAGAAAAACACACATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAG
GAACATTACTTCTAAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGAT
TGCGTATCATGAGGGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATG
TTTATCTTATCTAAGATCTGGAGGAAACCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAG
TCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAG
TGTGTCTAACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTCTAAATG
TAATGTTGATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAA
AGAGGACTATGTATCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCA
AACGCATTATGAACAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTTT
ATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAATGTGAAAATTCCCA
T

QA 4 591 4 591
DS 

RD RR2AW19TFB 591 0 0
GGG
AAAGAAAAACACACATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAG
GAACATTACTTCTAAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGAT
TGCGTATCATGAGGGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATG
TTTATCTTATCTAAGATCTGGAGGAAACCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAG
TCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAG
TGTGTCTAACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTCTAAATG
TAATGTTGATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAA
AGAGGACTATGTATCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCA
AACGCATTATGAACAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTTT
ATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAATGTGAAAATTCCCA

QA 4 591 4 591
DS 

RD RR2CN72JQ 584 0 0
GGACACATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAGGAACATTA
CTTCTAAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTATC
ATGAGGGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTATCTT
ATCTAAGATCTGGAGGAAACCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAG
CCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTA
ACACAATCCCTGAAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTCTAAATGTAATGTTG
ATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGATT
ATGTATCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATT
ATGAACAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGT
AATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAATGTGAAAATTCCCACA
GT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2FX60TF 573 0 0
GGACACATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAGGAACATTA
CTTCTAAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGACTGCGTATC
ATGAGGGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTATCTT
ATCTAAGATCTGGAGGAAACCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAG
CCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTA
ACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTCTAAATGTAATGTTG
ATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACT
ATGTATCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATT
ATGAACAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGT
AATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAATGTGAAA

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2CS64TF 582 0 0
GGACACATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAGGAACATTA
CTTCTAAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTATC
ATGAGGGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAGCATGTTCTTAGCACCATGTTTATCTT
ATCTAAGATCTGGAGGAAACCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAG
CCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTA
ACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTCTAAATGTAATGTTG
ATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACT
ATGTATCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATT
ATGAACAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGT
AATCATATAGTTCTTGGCAAATAAA*TGTGAAAATTCCCACA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2HA17TF 555 0 0
GGACACATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAGGAACATTA
CTTCTAAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTATC
ATGAGGGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTATCTT
ATCTAAGATCTGGAGGAAGCCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCGGTCTAAAAG
CCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTA
ACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTCTAAATGTAATGTTG
ATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAA*GAGGACT
ATGTATCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATT
ATGAACAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGT
AATCATATAGTTCTT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2CN72TF 584 0 0
GGACACATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAGGAACATTA
CTTCTAAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTATC
ATGAGGGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTATCTT
ATCTAAGATCTGGAGGAAACCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAG
CCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTA
ACACAATCCCTGAAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTCTAAATGTAATGTTG
ATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGATT
ATGTATCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATT
ATGAACAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGT
AATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAATGTGAAAATTCCCACA
GT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2A244TF 584 0 0
CATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAGGAACATTACTTCT
AAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTATCATGAG
GGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTATCTTATCTA
AGATCTGGAGGAAACCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAGCCGCT
GCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTAACACA
ATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCTG
GGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTA
TCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAA
CAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATCA
TATAGTTCTTGGCAAATAAAATGTGAAAATTCCCACATTTA
TAT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2A170TF 533 0 0
G
CATTACTTCTAAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGC
GTATCATGAGGGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTT
ATCTTATCTAAGATCTGGAGGAAACCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAGTCT
AAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGT
GTCTAACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTCTAAATGTAA
TGTTGATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGA
GGACTATGTATCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAAC
GCATTATGAACAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATA
CATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAATGTGAAAATTCCCACATTTA
T

QA 2 532 2 532
DS 

RD RR2FW75TF 224 0 0
GG
GATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGAC
TATGTATCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCAT
TATGAACAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTT*ATACATG
TAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAATGTGAAAATTCCCAC

QA 3 224 3 224
DS 

RD RR2D879TF 353 0 0
GCAGTCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGA
AGAGTGTGTCTAACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTCTA
AATGTAATGTTGATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACT
GAAAAGAGGACTATGTATCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAG
AGCAAACGCATTATGAACAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTATA
CTTTATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAATGTGAAAATTCCCAC

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR2DK27JQ 562 0 0
CATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAGGAACATTACTTCT
AAAACAGGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGTGTATCATGAG
GGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTATCTTATCTA
AGATCTGGAGGAAACCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAGCCGCT
GCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTAACACA
ATCCCTGGAATCAACGATGACAGTTCCAAACAATTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCTG
GGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTA
TCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAA
CAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATCA
TATAGTTCTTGGCAAATAAAAT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2C929TF 574 0 0
CATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAGGAACATTACTTCT
AAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTATCATGAG
GGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTATCTTATCTA
AGATCTGGAGGAAACCCGTCTCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAGCCGCT
GCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTAACACA
ATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAATTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCTG
GGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTA
TCAACGGTCATGGAGCTATAAGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAA
CAAATCAATTGGATGATTCTAATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATCA
TATAGTTCTTGGCAAATAAAATGTGAAAATTCCC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2HA17JQ 567 0 0
TCAGCAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCGGTCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAG
GCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTTTAACACAATCCCTGGAATCAACGATGA
CAATTCCAAACAATTACCTTTTAAATGTAATGTTGATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAG
CGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAA*GAGGACTATGTATCAACGGTCATGGAGCTATA
AGAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAACAAATCAATTGGATGATTCT
AATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAA
ATGTGAAAATTCCCACATTTATATATTCCTCAATCTCCTAGAACGCAGCATCAAAAAGAT
TCTGGTATCAGTCACACATTACAAGAATATGTTCAAAGATTCATGACGTTTCACAGAGTT
GTAGTCATATTGAGCAAACATCAAATCCAAGGAGAACATATTTTATTTATATGTGGTAAA
TTTTAGTATCAGTATAGGATGAGGCCC

QA 1 567 1 567
DS 



CO CL69Contig2 573 4 7 U
GGATCAAAAACACACAAAGTTTTCAAGTAAAAGATGAGGAACATTGCTTCTAAAACACGG
AACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTACCATGAGGGAGAAGCT
ATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTGTCTTATCTAAGATCTGGA
GGAAACCCCTCTCAACAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGG
AAGCCAGATAGACAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTATCTAACACAATCCCTGGA
ATCAACGATGACAATTCCAAACAGCTACCTTCTAAATGTGGTGTTGATCTAGGTGTCCCT
TTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTATCAACGGTC
ATGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAACAAATCAAT
TGGATAATTCCAATATTAATCTTCTGATAATATATACTTTATACATGTAATCATATAGTT
CTTGGTAAATAAAGTGAAAATTCCCACTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 10 

AF RR2E810TF U 1
AF RR2F496JQ C 20
AF RR2F496TF U 20
AF RR2EN48TF U 295
BS 1 143 RR2E810TF
BS 144 144 RR2F496TF
BS 145 438 RR2E810TF
BS 439 439 RR2F496TF
BS 440 546 RR2E810TF
BS 547 572 RR2F496TF
BS 573 573 RR2F496JQ

RD RR2E810TF 546 0 0
GGATCAAAAACACACAAAGTTTTCAAGTAAAAGATGAGGAACATTGCTTCTAAAACACGG
AACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTACCATGAGGGAGAAGCT
ATATCATGTTCGCAGGTAAACATTTTCTTAGCACCATGTTTGTCTTATCTAAGATCTGGA
GGAAACCCCTCTCAACAGTGCTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGG
AAGCCAGATAGACAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTATCTAACACAATCCCTGGA
ATCAACGATGACAATTCCAAACAGCTACCTTCTAAATGTGGTGTTGATCTAGGTGTCCCT
TTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTATCAACGGTC
ATGCAGCTATAATAATAATTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAACAAATCAAT
TGGATAATTCCAATATTAATCTTCTGATAATATATACTTTATACATGTAATCATATAGTT
CTTGGT

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2F496JQ 554 0 0
TTTTCAAGTAAAAGATGAGGAACATTGCTTCTAAAACACGGAACATGTTAATGTTTGTCG
TCATACTTTTAACGGTGATTGCGTACCATGAGGGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAA
ACATGTTCTTAGCACCATGTTTGTTTTATTTAAGATCTGGAGGAAACCCCTCTCAACAGT
GCTGTGGCGGGCTTAGCAGTTTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAGCCAGATAGACAAACAG
CTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTATCTAACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCA
AACAGCTACCTTCTAAATGTGGTGTTGATTTAGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACT
GTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTATCAACGGTCATGCAGCTATAATAATAAG
TGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAACAAATCAATTGGATAATTCCAATATTAA
TCTTCTGATAATATATACTTTATACATGTAATCATATAGTTCTTGGTAAATAAAGTGAAA
ATTCCCACTTTTAC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2F496TF 554 0 0
TTTTCAAGTAAAAGATGAGGAACATTGCTTCTAAAACACGGAACATGTTAATGTTTGTCG
TCATACTTTTAACGGTGATTGCGTACCATGAGGGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAA
ACATGTTCTTAGCACCATGTTTGTCTTATCTAAGATCTGGAGGAAACCCCTCTCAACAGT
GCTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAGCCAGATAGACAAACAG
CTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTATCTAACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCA
AACAGCTACCTTCTAAATGTGGTGTTGATCTAGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACT
GTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTATCAACGGTCATGCAGCTATAATAATAAG
TGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAACAAATCAATTGGATAATTCCAATATTAA
TCTTCTGATAATATATACTTTATACATGTAATCATATAGTTCTTGGTAAATAAAGTGAAA
ATTCCCACTTTTA
C

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2EN48TF 274 0 0
G
CTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAGCTACCTTCTAAATGTGGTGTTGATCTAGGTG
TCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTATCAA
CGGTCATGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAACAAA
TCAATTGGATAATTCCAATATTAATCTTCTGATAATATATACTTTATACATGTAATCATA
TAGTTCTTGGTAAATAAAGTGAAAATTCCCAC
T

QA 2 273 2 273
DS 



AS 1 21

CO CL70Contig1 885 21 21 U
GGACAACCATCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATA
GTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATC
TTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCC
CTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCG
CTTCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGC
GGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAG
GAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCG
CACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATA
GTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAA
CATAAAAAAATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCA
AAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTA
TGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTAC
TCTCTAAATATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCTAA
TAGTATGTCATTTTGAAAACGAAATAATGTCATTGATTCTTACCTTTAGACCAATATTTT
GAACTTTTAGCGCAAATGTAGTTATCCAACTTTTGGCAACATATC


BQ
45 50 60 60 70 70 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 70 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 85 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 85 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 80 80 80 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 80 80 95 80 95 70 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 80 75 75 75 75 75 60 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 10 65 60 60 60 45 60 60 60 45 60 45 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 40 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS37TF U 1
AF RR2H583TF U 19
AF RR2EU78TF U 3
AF RR2C433JQ C 336
AF RR2DC58TF U 1
AF RR2CE68JQ C 1
AF RR2CE68TF U 1
AF RR2CZ72TF U -3
AF RR2DC58JQ C 341
AF RR2CZ72JQ C 58
AF RR2C433TF U 1
AF RR2DI79TF U 1
AF RR2CI71TF U -2
AF RR2GU38TF U 1
AF RR2AT59TF U 2
AF RR2D734TF U 7
AF RR2EU78JQ C 4
AF RR2AS37JQ C 55
AF RR2GU38JQB C 426
AF RR2CI71JQ C 86
AF RR2AT59JQ C 10
BS 1 248 RR2AS37TF
BS 249 674 RR2C433TF
BS 675 676 RR2DC58TF
BS 677 677 RR2C433TF
BS 678 678 RR2DC58TF
BS 679 679 RR2C433TF
BS 680 680 RR2CE68TF
BS 681 710 RR2C433TF
BS 711 711 RR2DI79TF
BS 712 727 RR2C433TF
BS 728 728 RR2AT59TF
BS 729 729 RR2C433TF
BS 730 754 RR2DI79TF
BS 755 755 RR2GU38TF
BS 756 759 RR2DI79TF
BS 760 760 RR2AT59TF
BS 761 779 RR2GU38TF
BS 780 780 RR2AT59TF
BS 781 793 RR2GU38TF
BS 794 795 RR2EU78JQ
BS 796 885 RR2AT59JQ

RD RR2AS37TF 248 0 0
GGACAACCATCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATA
GTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATC
TTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCC
CTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCG
CTTCTCGT

QA 1 248 1 248
DS 

RD RR2H583TF 521 0 0
GG
AGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATAGTGAGAATGGGGTTGTTGAA
AAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATCTTGACGGCCATTTTAGCTAC
CATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCCCTCGCTGGCACAGCCGTGGC
ATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGCTTCTCGTACCAGCGGGTAT
TACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCGGCTCCGGTTTGACGGCCCT
CAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGGAGCTGTCAAAAATTTCGGG
TTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCGCACTGAATAAATGAAAAGAA
GGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATAGTTGTTATTATAATTTCACA
AATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAA

QA 3 521 3 521
DS 

RD RR2EU78TF 597 0 0
GG
AACCATCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATAGTGA
GAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATCTTGA
CGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCCCTCG
CTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGCTTC
TCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCGGCT
CCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGGAGC
TGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCGCACT
GAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATAGTTG
TTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACATA
AAAAAATCTAGTTAAACCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTC

QA 3 597 3 597
DS 

RD RR2C433JQ 257 0 0
GCTT
TACAAGAAATTAACGGTTAAGGAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTTGTCAGAGGT
TTTCCAGGCGGCCGTTGGTCGCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGAT
GATATGAAAAATTGATATATAGTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATTTAGTTAACCC
GAACGACCTTTTGTGGTCAAACATAAAAAAATTTAGTTAA*CCCGACTTTTTTTAGTAGT
AATTATTACGTGG

QA 5 257 5 257
DS 

RD RR2DC58TF 694 0 0
GGACAACCATCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATA
GTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATC
TTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCC
CTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCG
CTTCTTGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGC
GGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAG
GAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCG
CACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATA
GTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAA
CATAAAAAAATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCA
AAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAA*TAGCATCTA**TAGTGTA
TGTCGTG*TACACAATAAT*ATAAATGTATGCGT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2CE68JQ 704 0 0
GGACAACCATCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATA
GTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATC
TTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCC
CTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCG
CTTCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGC
GGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAG
GAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCG
CACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATA
GTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAA
CATAAAAAA*TCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCA
AAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTA
TGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2CE68TF 704 0 0
GGACAACCATCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATA
GTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATC
TTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCC
CTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCG
CTTCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGC
GGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAG
GAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCG
CACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATA
GTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAA
CATAAAAAA*TCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCA
AAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTA
TGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2CZ72TF 717 0 0
GGTCCC
ACAACCATCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTC**GCCATTCAAAATAGT
GAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATCTT
GACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCCCT
CGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGCT
TCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCGG
CTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGGA
GCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCGCA
CTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATAGT
TGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACA
TAAAAAAATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAA
ATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTATG
TCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCA
A

QA 7 716 7 716
DS 

RD RR2DC58JQ 365 0 0
ACAAGAAATTAACGGTTAAGGAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTT
CTCCAGGCGGCCGTTGGTCGCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATG
ATATGAAAAATTGATATATAGTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCG
AACGACCTTTTGTGGTCAAACATAAAAAAATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTA
ATTATTACGTGGCATTTTCAAAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCA
AATAGCATCTTATTAGTGTATGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGT
TATCT

QA 1 365 1 365
DS 

RD RR2CZ72JQ 654 0 0
ATAGTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGT
ATCTTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTA
TCCCTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGT
CCGCTTCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCG
GGCGGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTT
AAGGAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGG
TCGCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATAT
ATAGTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTC
AAACATAAAAAAATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTT
TCAAAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGT
GTATGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2C433TF 729 0 0
GGACAACCATCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATA
GTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATC
TTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCC
CTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCG
CTTCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGC
GGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAG
GAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCG
CACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATA
GTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAA
CATAAAAAAATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCA
AAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTA
TGTCGTGGTACACATAATT*ATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGC*ATACTCTAC
TCTCTAA*T

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2DI79TF 759 0 0
GGACAACCATCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATA
GTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATC
TTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGATGCTCGCCGGTTTATCC
CTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCG
CTTCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGC
GGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAG
GAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCG
CACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATAATATGAAAAATTGATATATA
GTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAA
CATAAAAAAATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCA
AAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTA
TGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTAC
TCTCTAA*TATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTTCAAA

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2CI71TF 754 0 0
GGCCC
ACAACCATCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATAGT
GAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATCTT
GACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCCCT
CGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGCT
TCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCGG
CTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGGA
GCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCGCA
CTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATAGT
TGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACA
TAAAAAAATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAA
ATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTATG
TCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTACTC
TCTAA*TATAAAAGTGTCGTATATGGTTT

QA 6 754 6 754
DS 

RD RR2GU38TF 804 0 0
GGACAACCATCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATA
GTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATC
TTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCC
CTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCG
CTTCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGC
GGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCACCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAG
GAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCG
CACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATA
GTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAA
CATAAAAAAATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCA
AAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTA
TGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTAC
TCTCTAA*TATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAA*GTATTGTATATGATATCTA*
TAGTATGTCATTT
GAAACGAAAAA

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2AT59TF 789 0 0
GACAACCATCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATAG
TGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATCT
TGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCCC
TCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGC
TTCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCG
GCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGG
AGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCGC
ACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATAG
TTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAAC
ATAAAAAAATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAA
AATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTAT
GTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTACT
CTCTAAATATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCTAAT
AGTATGTCA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2D734TF 783 0 0
CCATCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATAGTGAGA
ATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTACCTTGACG
GCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGTTCGCCGATTTATCCCTCGCT
GGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATT*GTCGTATTCAGTCCGCTTCTC
GTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCGGCTCC
GGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGGAGCTG
TCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCGCACTGA
ATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATAGTTGTT
ATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACATAAA
AAAATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAAATAA
TAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTATGTCGT
GGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTACTCTCTA
A*TATACAAGCGTTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCTAATAGTAT
GTC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2EU78JQ 792 0 0
G
AACCATCGGGTATCAA*GAAGCAGGT*CTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATAGTGA
GAATGGGGTTGTTGAAAAA*CACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATCTTGA
CGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCCCTCG
CTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGCTTC
TCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCGGCT
CCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGGAGC
TGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCGCACT
GAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATAGTTG
TTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACATA
AAAAAATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAAAT
AATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTATGTC
GTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTACTCTC
TAAATATACAAGTGCTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCTAATAGT
ATGTCATTTTG

QA 2 792 2 792
DS 

RD RR2AS37JQ 767 0 0
AAAATAGTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAG
GGTATCTTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGT
TTATCCCTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTC
AGTCCGCTTCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCC
TCGGGCGGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACG
GTTAAGGAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGT
TGGTCGCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGA
TATATAGTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTG
GTCAAACATAAAAAAATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCA
TTTTCAAAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATT
AGTGTATGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATA
CTCTACTCTCTAAATATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGAT
ATCTAATAGTATGTCATTTTGAAAACGAAATAATGTCATTGATTCT
T

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2GU38JQB 395 0 0
AATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATAGTTGT
TATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACATAA
AAAAATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAAATA
ATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTATGTCG
TGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTACTCTCT
AAATATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCTAATAGTA
TGTCATTTTGAAAACGAAATAATGTCATTGATTCT

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR2CI71JQ 710 0 0
ACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATCTTGACGGCCATTTTAGCTACCATAG
CCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCCCTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTA
TTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGCTTCTCGTACCAGCGGGTATTACCA
CTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCGGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCA
TCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGGAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAA
CGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCGCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGG
CATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATAGTTGTTATTATAATTTCACAAATTA
AATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACATAAAAAAATCTAGTTAA*CCCGA
CTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAAATAATAATTATTACTTGGGGATG
GAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTATGTCGTGGTACACAATAATTATAAA
TGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTACTCTCTAAATATACAAGTGTCGTATA
TGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCTAATAGTATGTCATTTTG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2AT59JQ 876 0 0
TCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATAGTGAGAATG
GGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATCTTGACGGCC
ATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCCCTCGCTGGC
ACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGCTTCTCGTA
CCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCGGCTCCGGT
TTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGGAGCTGTCA
AAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCGCACTGAATA
AATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGATATATAGTTGTTATT
ATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACATAAAAAA
ATCTAGTTAA*CCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAAATAATAA
TTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTATGTCGTGGT
ACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTACTCTCTAAAT
ATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCTAATAGTATGTC
ATTTTGAAAACGAAATAATGTCATTGATTCTTACCTTTAGACCAATATTTTGAACTTTTA
GCGCAAATGTAGTTATCCAACTTTTGGCAACATATC

QA 1 876 1 876
DS 



AS 1 23

CO CL71Contig1 1674 23 13 U
GGATATTGACTAGGTATATAAGTTAAAGATCCATATAATCTGCCCCACTACTTTTGTGAA
TTTCTATTTAGATAACGATTCAATTATAAGTTCTTACTTTTTATCTGTGAATTGGCTGAA
AAAAACGATCAAAAAAAGAACGAAGAATTAAAAGAAAAGAATGGTTCACAAAAAAGAAAC
GACATAAAAAAGTCGTATATATATATATATTATGCATTTTTCAAAATCCCGTGGATAGGA
ACTAATATCAAAGTAATTCTTATCAAGTTTTTGGTTATTTTGGCTGGATGAATCTTAGCG
ATGACTTAATTATAATTAAGTCCTAAGTCATTGGATGATTGTATCATTAACTATTTCTTT
ATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGTTTCTGCTGCTTCGGTTATTGCTGC
TGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGGGGTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGG
TCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGCAGAAGGAAAAATACGAGGTACTTT
ATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAATTTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGC
GCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAAATAAGAAAATTATGAATTTTTT*T
TT*CGTAGTTTTTTTTT*ATTCTATCAAGATTTAACTCCTACAATTATTCATTGAGACAA
CAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAATTAACACATCGATTCGCTTTCTTCC
TTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTTTTT*AAGGAGTGTTGCGCAAAAAG
GAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGGTCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAA
TTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTTTTGGAAAATAAATTTGTAAATAGA
ATAGGTTTTT*GATTCTGTTTATAAATATCCAAATAGGTAAATTAAATTATAAATTATTA
AACGAAATTTTCTTTTTATTGAAAAAAATAAAGAATAAAAAAAAAAAAAGGACAGAGTTC
TTTTTTTTATAGTTTAGCTAGAAGAGGAGATTCTATGAAAAATTTAACCGATTCTTTCGT
TTACTTGGGTCACTGGCCATCCGCCGGGAGTTTCGGGTTTAATACCGATATTTTAGCAAC
AAATCTAATAAATCTAAGTGTAGTCTTCGGTGTATTGATCTTTTTTGGAAAGGGAGTGTG
TGTGAGTTGTTCATTTCAAGAATAGGCTGGATTCGCCCAGTGGCACTATAACTAGCAAAG
AGTGCCTAATCCCGCGAATTACTTCTGAATACAAAATTCAATAAAAAATCATACTTTAGA
ACCATAGCATTTCGTTATTCTTTGGTAAGTCTACTTGACTTTGATTCTCTATCAACCAAA
AATTTGGGACCATTAATTAACATGGTTAAAACTAAACCGTTTGAAGTTCAGATGCAACAT
GGTACTCTTTCTACCATATGTAGTCTAATTAAAAAATGAATAAGATTTTCAAAAAGAATA
GTTCGGCTTTTTTCGATATAAAACACTCATGTCGATAAAAAATTTTGAGTCTTTTTGTAT
AATGCAGAATTGATAACCTACGTATAAAGTAATAAAAATTCTTTGGATTTCAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 65 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 65 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 70 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 90 90 90 90 90 
90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 75 75 75 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL02TF U 337
AF RR2A601TF U 1
AF RR2A958TF U 432
AF RR2EG47JQ C 591
AF RR2B865JQ C 337
AF RR2C804JQ C 337
AF RR2EG47TF U 619
AF RR2C804TF U 337
AF RR2FU20JQ C 337
AF RR2CA87JQ C 337
AF RR2DG70JQ C 515
AF RR2DL02JQ C 366
AF RR2DG70TF U 337
AF RR2CA87TF U 337
AF RR2B865TF U 337
AF RR2FU20TF U 337
AF RR2BD93JQ C 336
AF RR2BD93TF U 336
AF RR2F130TF C 679
AF RR2F130JQ U 682
AF RR2DV44JQ C 1100
AF RR2DV44TF U 1100
AF RR2A601JQ C 1092
BS 1 581 RR2A601TF
BS 582 582 RR2C804TF
BS 583 685 RR2A601TF
BS 686 819 RR2EG47TF
BS 820 820 RR2C804TF
BS 821 890 RR2EG47TF
BS 891 891 RR2C804TF
BS 892 1041 RR2EG47TF
BS 1042 1205 RR2F130JQ
BS 1206 1206 RR2DV44TF
BS 1207 1358 RR2F130JQ
BS 1359 1447 RR2DV44TF
BS 1448 1674 RR2A601JQ

RD RR2DL02TF 125 0 0
GATTGTATCATTAACTATTTCTTTATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGT
TTCTGCTGCTTCGGTTATTGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGG
GGTTG

QA 1 125 1 125
DS 

RD RR2A601TF 685 0 0
GGATATTGACTAGGTATATAAGTTAAAGATCCATATAATCTGCCCCACTACTTTTGTGAA
TTTCTATTTAGATAACGATTCAATTATAAGTTCTTACTTTTTATCTGTGAATTGGCTGAA
AAAAACGATCAAAAAAAGAACGAAGAATTAAAAGAAAAGAATGGTTCACAAAAAAGAAAC
GACATAAAAAAGTCGTATATATATATATATTATGCATTTTTCAAAATCCCGTGGATAGGA
ACTAATATCAAAGTAATTCTTATCAAGTTTTTGGTTATTTTGGCTGGATGAATCTTAGCG
ATGACTTAATTATAATTAAGTCCTAAGTCATTGGATGATTGTATCATTAACTATTTCTTT
ATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGTTTCTGCTGCTTCGGTTATTGCTGC
TGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGGGGTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGG
TCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGCAGAAGGAAAAATACGAGGTACTTT
ATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAATTTATGACCTGGTTGTAGCATTAGC
GCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAAATAAGAAAATTATGAATTTTTT*T
TT*CGTAGTTTTTTTTT*ATTCTAT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2A958TF 403 0 0
TTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGGGGTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCG
AAGGTATCGCGAGACGACCCGAGGCAGAAGGAAAAATACGAGGTTCTTTATTGCTTAGTT
TGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAATTTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTG
CGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAAATAAGAAAATTATGAATTTTTTCTTTTCGTAGTTT
TTTTTTTATTCTATCAAGATTTAACTCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGG
AAGGACTAATTTGAGGATGGGGAATTAACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATT
CTTTTTAGTTTAAGGGAAACTTTTTTTT*AAGGAGTGTTGCGC

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2EG47JQ 430 0 0
G
AGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAAATAAGAAAATTATGA
ATTTTTT*TTT*CGTAGTTTTTTTTT*ATTCTATCAAGATTTAACTCCTACAATTATTCA
TTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAATTAACACATCGATTCG
CTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTTTTTTAAGGAGTGTTG
CGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGGTCTCAAATTCTAGCC
TAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTTTTGGAAAATAAATTT
GTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTGTTTATAAATATCCAAATAGGTAAATTAAATTAT
AAATTATTA

QA 2 430 2 430
DS 

RD RR2B865JQ 705 0 0
GATTGTATCAGTAACTATTTCTTTATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGT
TTCTGCTTCTTCGGTTATTGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGG
GGTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGC
AGAAGGAAAA*TACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAAT
TTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAA
ATAAGAAAATTATGAATTTTTT*TTT*CGTAGTTTTTTTTT*ATTCTATCAAGATTTAAC
TCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAAT
TAACGCATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTT
TTT*AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGG
TCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTT
TTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTGTTTATAAATATCCAAATA
GGTAAATTAAATTATAAATTATCAAACGAAATTTTCTTTTTATTG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2C804JQ 705 0 0
GATTGTATCATTAACTATTTCTTTATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGT
TTCTGCTGCTTCGGTTATTGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGG
GGTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGC
AGAAGGAAAAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATAGAAGCTTTAACAAT
TTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAA
ATAAGAAAATTATGAATTTTTT*TTT*CGTAGTTTTTTTTT*ATTCTATCAAGATTTAAC
TCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAAT
TAACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTT
TTT*AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATACAAAACTTGG
TCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTT
TTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTGTTTATAAATATCCAAATA
GGTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTTATTG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2EG47TF 423 0 0
TTTTGTTTAATCCTAGAAATAAGAAAATTATGAATTTTTT*TTT*CGTAGTTTTTTTTT*
ATTCTATCAAGATTTAACTCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACT
AATTTGAGGATGGGGAATTAACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTA
GTTTAATGGAAACTTTTTTTTTAAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAA
AATTTATATAAAACTTGGTCTCAAATTCTAGCCTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATT
ATTGAAAATTCAAAATTTTTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTG
TTTATAAATATCCAAATAGGTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTTA
TTG

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR2C804TF 701 0 0
GATTGTATCATTAACTATTTCTTTATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGT
TTCTGCTGCTTCGGTTATTGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGG
GGTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGC
AGAAGGAAAAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATAGAAGCTTTAACAAT
TTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAA
ATAAGAAAATTATGAATTTTTT*TTT*CGTAGTTTTTTTTT*ATTCTATCAAGATTTAAC
TCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAAT
TAACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTT
TTT*AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATACAAAACTTGG
TCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTT
TTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTGTTTATAAATATCCAAATA
G*TAAATTAA*TTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2FU20JQ 705 0 0
GATTGTATCATTAACTATTTCTTTATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGT
TTCTGCTGCTTCGGTTATTGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGG
GGTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCTAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGC
AGAAGGAAAAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAAT
TTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAA
ATAAGAAAATTATGAATTTTTT*TTT*CGTAGTTTTTTTTT*ATTCTATCAAGATTTAAC
TCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAAT
TAACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTT
TT**AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGG
TCTCAAATTCTGGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTT
TTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTGTTTATAAATATCCAAATA
GGTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTTATTG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2CA87JQ 705 0 0
GATTGTATCATTAACTATTTCTTTATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGT
TTCTGCTGCTTCGGTTATTGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGG
GGTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGC
AGAAGGAAAAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAAT
TTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAA
ATAAGAAAATTATGAATTTTTT*TTT*CGTAGTTTTTTTTT*ATTCTATCAAGATTTAAC
TCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAAT
TAACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTT
TTT*AAGGAGTGTTGCGCACAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGG
TCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTT
TTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTGTTTATAAATATCCAAATA
GGTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTTATTG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2DG70JQ 527 0 0
GCAGAAGGAAAAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACA
ATTTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAG
AAATAAGAAAATTATGAATTTTTT*TTT*CGTAGTTTTTTTTTTATTCTATCTAGATTTA
ACTCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGA
ATTAACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTT
TTTTT*AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTT
GGTCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAAT
TTTTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTGTTTATAAATATCCAAA
TAGGTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTTATTG

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2DL02JQ 676 0 0
GGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGTTTCTGCTGCTTCGGTTATTGCTGCTGGGT
TGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGGGGTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAG
CTGTCGAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGCAGAAGGAAAAATACGAGGTACTTTATTGC
TTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAATTTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTT
TATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAAATAAGAAAATTATGAATTTTTT*TTTTCG
TAGTTTTTTTTT*ATTCTATCAAGATTTAACTCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACC
CTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAATTAACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCC
CTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTTTTT*AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGT
TTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGGTCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAG
TCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTTTTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGG
TTTTT*GATTCTGTTTATAAATATCCAAATAGGTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGA
AATTTTCTTTTTATTG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2DG70TF 690 0 0
GATTGTATCATTAACTATTTCTTTATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGT
TTCTGCTGCTTCGGTTATTGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGG
GGTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGC
AGAAGGAAAAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAAT
TTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAA
ATAAGAAAATTATGAATTTTTT*TTT*CGTAGTTTTTTTTTTATTCTATCTAGATTTAAC
TCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAAT
TAACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTT
TTT*AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGG
TCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTT
TTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTGTTTATAAATATCCAAATA
G*TAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2CA87TF 702 0 0
GATTGTATCATTAACTATTTCTTTATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGT
TTCTGCTGCTTCGGTTATTGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGG
GGTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGC
AGAAGGAAAAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAAT
TTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAA
ATAAGAAAATTATGAATTTTTT*TTT*CGTAGTTTTTTTTT*ATTCTATCAAGATTTAAC
TCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAAT
TAACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTT
TTT*AAGGAGTGTTGCGCACAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGG
TCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTT
TTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTGTTTATAAATATCCAAATA
GGTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTTA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2B865TF 705 0 0
GATTGTATCAGTAACTATTTCTTTATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGT
TTCTGCTTCTTCGGTTATTGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGG
GGTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGC
AGAAGGAAAA*TACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAAT
TTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAA
ATAAGAAAATTATGAATTTTTT*TTT*CGTAGTTTTTTTTT*ATTCTATCAAGATTTAAC
TCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAAT
TAACGCATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTT
TTT*AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGG
TCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTT
TTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTTTGATTCTGTTTATAAATATCCAAATA
GGTAAATTAAATTATAAATTATCAAACGAAATTTTCTTTTTATTG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2FU20TF 711 0 0
GATTGTATCATTAACTATTTCTTTATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGT
TTCTGCTGCTTCGGTTATTGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGG
GGTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCTAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGC
AGAAGGAAAAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAAT
TTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAA
ATAAGAAAATTATGAATTTTTT*TTT*CGTAGTTTTTTTTT*ATTCTATCAAGATTTAAC
TCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAAT
TAACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTT
TT**AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGG
TCTCAAATTCTGGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTT
TTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTGTTTATAAATATCCAAATA
GGTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTTATTG
AAAAAA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2BD93JQ 706 0 0
GT
ATTGTATCATTAACTATTTCTTTATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGTT
TCTGCTGCTTCGGTTATTGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGGG
GTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGATAACCCGAGGCA
GAAGGAAAAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAATT
TATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAAA
TAAGAAAATTATGAATTTTTT*TTT*CGTAGTTTTTTTT**ATTCTATCAAGATTTAACT
CCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAATT
AACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTTT
TT*AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGGT
CTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTTT
TGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTGTTTATAAATATCCAAATAG
GTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTTATTG

QA 3 706 3 706
DS 

RD RR2BD93TF 706 0 0
GT
ATTGTATCATTAACTATTTCTTTATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGTT
TCTGCTGCTTCGGTTATTGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGGG
GTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGATAACCCGAGGCA
GAAGGAAAAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAATT
TATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAAA
TAAGAAAATTATGAATTTTTT*TTT*CGTAGTTTTTTTT**ATTCTATCAAGATTTAACT
CCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAATT
AACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTTT
TT*AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGGT
CTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTTT
TGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTGTTTATAAATATCCAAATAG
GTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTTATTG

QA 3 706 3 706
DS 

RD RR2F130TF 680 0 0
ATTCTATCAAGATTTAACTCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACT
AATTTGAGGATGGGGAATTAACACATCGATTCGCTTCCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTA
GTTTAATGGAAACTTTTTTTT*AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAA
AATTTATATAAAACTTGGTCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATT
ATTGAAAATTCAAAATTTTTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTG
TTTATAAATATCCAAATAGGTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTTA
TTGAAAAAAATAAAGAATAAAAAAAAAAAAAGGACAGAGTTCTTTTTTTTATAGTTTAGC
TAGAAGAGGAGATTCTATGAAAAATTTAACCGATTCTTTCGTTTACTTGGGTCACTGGCC
ATCCGCCGGGAGTTTCGGGTTTAATACCGATATTTTAGCAACAAATCCAATAAATCTAAG
TGTAGTCTTCGGTGTATTGATCTTTTTTGGAAAGGGAGTGTGTGTGAGTTGTTCATTTCA
AGAATAGGCTGGATTCGCCCAGTGGCACTATAACTAGCAAAGAGTGCCTAATCCCGCGAA
TTACTTCTGAATACAAAATT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2F130JQ 677 0 0
CTATCAAGATTTAACTCCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAAT
TTGAGGATGGGGAATTAACACATCGATTCGCTTCCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTT
TAATGGAAACTTTTTTTT*AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAAT
TTATATAAAACTTGGTCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATT
GAAAATTCAAAATTTTTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT*GATTCTGTTT
ATAAATATCCAAATAGGTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTTATTG
AAAAAAATAAAGAATAAAAAAAAAAAAAGGACAGAGTTCTTTTTTTTATAGTTTAGCTAG
AAGAGGAGATTCTATGAAAAATTTAACCGATTCTTTCGTTTACTTGGGTCACTGGCCATC
CGCCGGGAGTTTCGGGTTTAATACCGATATTTTAGCAACAAATCCAATAAATCTAAGTGT
AGTCTTCGGTGTATTGATCTTTTTTGGAAAGGGAGTGTGTGTGAGTTGTTCATTTCAAGA
ATAGGCTGGATTCGCCCAGTGGCACTATAACTAGCAAAGAGTGCCTAATCCCGCGAATTA
CTTCTGAATACAAAATT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2DV44JQ 349 0 0
G
GAAGAGGAGATTCTATGAAAAATTTAACCGATTCTTTCGTTTACTTGGGTCACTGGCCAT
CCGCCGGGAGTTTCGGGTTTAATACCGATATTTTAGCAACAAATCTAATAAATCTAAGTG
TAGTCTTCGGTGTATTGATCTTTTTTGGAAAGGGAGTGTGTGTGAGTTGTTCATTTCAAG
AATAGGCTGGATTCGCCCAGTGGCACTATAACTAGCAAAGAGTGCCTAATCCCGCGAATT
ACTTCTGAATACAAAATTCAATAAAAAATCATACTTTAGAACCATAGCATTTCGTTATTC
TTTGGTAAGTCTACTTGACTTTGATTCTCTATCAACCAAAAATTTGG
C

QA 2 348 2 348
DS 

RD RR2DV44TF 349 0 0
G
GAAGAGGAGATTCTATGAAAAATTTAACCGATTCTTTCGTTTACTTGGGTCACTGGCCAT
CCGCCGGGAGTTTCGGGTTTAATACCGATATTTTAGCAACAAATCTAATAAATCTAAGTG
TAGTCTTCGGTGTATTGATCTTTTTTGGAAAGGGAGTGTGTGTGAGTTGTTCATTTCAAG
AATAGGCTGGATTCGCCCAGTGGCACTATAACTAGCAAAGAGTGCCTAATCCCGCGAATT
ACTTCTGAATACAAAATTCAATAAAAAATCATACTTTAGAACCATAGCATTTCGTTATTC
TTTGGTAAGTCTACTTGACTTTGATTCTCTATCAACCAAAAATTTGG
C

QA 2 348 2 348
DS 

RD RR2A601JQ 583 0 0
GTTTAGCTAGAAGAGGAGATTCTATGAAAAATTTAACCGATTCTTTCGTTTACTTGGGTC
ACTGGCCATCCGCCGGGAGTTTCGGGTTTAATACCGATATTTTAGCAACAAATCTAATAA
ATTTAAGTGTAGTCTTCGGTGTATTGATCTTTTTTGGAAAGGGAGTGTGTGTGAGTTGTT
CATTTCAAGAATAGGCTGGATTCGCCCAGTGGCACTATAACTAGCAAAGAGTGCCTAATC
CCGCGAATTACTTCTGAATACAAAATTCAATAAAAAATCATATTTTAGAACCATAGCATT
TCGTTATTCTTTGGTAAGTCTACTTGACTTTGATTCTCTATCAACCAAAAATTTGGGACC
ATTAATTAACATGGTTAAAACTAAACCGTTTGAAGTTCAGATGCAACATGGTACTCTTTC
TACCATATGTAGTCTAATTAAAAAATGAATAAGATTTTCAAAAAGAATAGTTCGGCTTTT
TTCGATATAAAACACTCATGTCGATAAAAAATTTTGAGTCTTTTTGTATAATGCAGAATT
GATAACCTACGTATAAAGTAATAAAAATTCTTTGGATTTCAAG

QA 1 583 1 583
DS 



AS 3 19

CO CL72Contig1 1052 8 36 U
GGCTGCGTGAGTCATAGCCCCACTCAAACACACTCGATCTATCTTCAAAACCCACTCGAA
CAATCCAAACCTTTTGCATCCTCGTGATCATCGTAGAGAAAATATGGCAAGAAAGTTCTT
CGTCGGAGGCAACTGGAAATGCAACGGAACTGCTGAGGAGGTGAAGAAGATTGTCAACAC
ACTTAACGAAGCTCAAGTTCCTCCCCAGGATGTCGTTGAGGTGGTGGTTAGCCCTCCATA
TGTGTTCCTTCCTCTGGTGAAGAGCATATTAAGGCCTGACTTCCATGTTGCGGCACAAAA
CTGCTGGGTCAAGAAAGGAGGTGCCTTCACTGGTGAAGTTAGTGCTGAGATGCTTGTGAA
CTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTCTGAAAGGAGAGCACTCCTCAATGAAAC
AAACGAGTTTGTTGGAGATAAGGTTGCCTATGCTCTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATTGC
TTGTGTTGGCGAGACTCTTGAGCAGCGTGAGGCTGGGTCGACCATGGATGTTGTAGCTGC
CCAGACTAAAGCTATTGCTGACCGGGTGTCGAACTGGCCAAATGTTGTCATAGCCTATGA
ACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCCCAAGCTCAAGAAGTACA
TGATGAGTTGAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGAGCGCTGATGTCGCTGCTACAACCCG
CATCATTTATGGAGGATCCGTTAATGGTGGTAACTGCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGA
TGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGCCCGAGTTTATCGACATCATCAA
GGCTGCTGAGGTGAAGAAAAGCGCTTAGTGGCTTCACGAAACAATCTCAAATCCTTTTGC
TTCTTCAGTCTCAACTCTGATCGGAAAAAAATGAATAAGTTGATACAGTGTTATTGTGAT
ACTCTTTTGCTTCAGTTGTATGTTGTCTTGAGGAGGCAACACACTTTTTCTTGGCCGTTT
TGTTTAGCTCTGAAATCACAAAATCTCACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 25 0 0 0 25 25 0 0 0 
0 0 0 25 25 0 25 25 0 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 0 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 15 15 10 

AF RR2CE34TF U 1
AF RR2DA33TF U 20
AF RR2EO28TF U 45
AF RR2BO37TF U 46
AF RR2DA33JQ C 411
AF RR2F515JQ C 647
AF RR2EB48TF U 575
AF RR2EO28JQ C 456
BS 1 47 RR2CE34TF
BS 48 51 RR2EO28TF
BS 52 52 RR2CE34TF
BS 53 55 RR2EO28TF
BS 56 57 RR2CE34TF
BS 58 59 RR2EO28TF
BS 60 60 RR2CE34TF
BS 61 61 RR2EO28TF
BS 62 62 RR2CE34TF
BS 63 63 RR2EO28TF
BS 64 65 RR2CE34TF
BS 66 66 RR2EO28TF
BS 67 68 RR2CE34TF
BS 69 69 RR2EO28TF
BS 70 94 RR2CE34TF
BS 95 95 RR2EO28TF
BS 96 101 RR2CE34TF
BS 102 103 RR2EO28TF
BS 104 108 RR2CE34TF
BS 109 109 RR2EO28TF
BS 110 152 RR2CE34TF
BS 153 153 RR2EO28TF
BS 154 202 RR2CE34TF
BS 203 203 RR2EO28TF
BS 204 534 RR2CE34TF
BS 535 535 RR2EO28TF
BS 536 689 RR2CE34TF
BS 690 690 RR2EO28TF
BS 691 715 RR2CE34TF
BS 716 729 RR2EO28TF
BS 730 839 RR2EB48TF
BS 840 840 RR2DA33JQ
BS 841 849 RR2EB48TF
BS 850 850 RR2DA33JQ
BS 851 1049 RR2EB48TF
BS 1050 1052 RR2DA33JQ

RD RR2CE34TF 723 0 0
GGCTGCGTGAGTCATAGCCCCACTCAAACACACTCGATCTATCTTCATCGTCGTTTCTGA
GACTCTAAGCCTTTTGCATCCTCGTGATCATCGTTGAGAAAG*ATGGCCAGAAAGTTCTT
CGTCGGAGGCAACTGGAAATGCAACGGAACTGGTGAGGAGGTGAAGAAGATTGTCAACAC
ACTTAACGAAGCTCAAGTTCCTTCCCAGGATGTCGTTGAGGTGGTGGTTAGCCCTCCATA
TGTGTTCCTTCCTCTGGTGAAGAGCATATTAAGGCCTGACTTCCATGTTGCGGCACAAAA
CTGCTGGGTCAAGAAAGGAGGTGCCTTCACTGGTGAAGTTAGTGCTGAGATGCTTGTGAA
CTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTCTGAAAGGAGAGCACTCCTCAATGAAAC
AAACGAGTTTGTTGGAGATAAGGTTGCCTATGCTCTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATTGC
TTGTGTTGGCGAGACTCTTGAGCAGCGTGAGGCTGGGTCGACCATGGATGTTGTGGCTGC
CCAGACTAAAGCTATTGCTGACCGGGTGTCGAACTGGCCAAATGTTGTCATAGCCTATGA
ACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCCCAAGCTCAAGAAGTACA
TGATGAGTTGAGGAAATGGCTTGCAAAGA*CGTGAGCGCTGATGTCGCTGCTACA
CCCGCATC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2DA33TF 663 0 0
GG
ACTCAAACACACTCGATCTATCTTCATCGTCGTTTCTGAGACTCTAAGCCTTTTGCATCC
TCGTGATCATCGTTGAGAAAG*ATGGCCAGAAAGTTCTTCGTCGGAGGCAACTGGAAATG
CAACGGAACTGGTGAGGAGGTGAAGAAGATTGTCAACACACTTAACGAAGCTCAAGTTCC
TTCCCAGGATGTCGTTGAGGTGGTGGTTAGCCCTCCATATGTGTTCCTTCCTCTGGTGAA
GAGCATATTAAGGCCTGACTTCCATGTTGCGGCACAAAACTGCTGGGTCAAGAAAGGAGG
TGCCTTCACTGGTGAAGTTAGTGCTGAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTAT
CCTTGGTCACTCTGAAAGGAGAGCACTCCTCAATGAAACAAACGAGTTTGTTGGAGATAA
GGTTGCCTATGCTCTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATTGCTTGTGTTGGCGAGACTCTTGA
GCAGCGTGAGGCTGGTTCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGA
CCGGGTGTCGAACTGGCCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAAC
CGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCCCAAGCTCAAGAAGTACATGATGAGTTGAGGAAATGGCT
T

QA 3 663 3 663
DS 

RD RR2EO28TF 685 0 0
GGA
AAACCCACTCGATCTATCCAAACCTTT**CATCCTCGTGATCATCGTAGAGAAAATATGG
CAAGAAAGTTCTTCGTCGGAGGCAACTGGAAATGCAACGGAACTGCTGAGGAGGTGAAGA
AGATTGTCAACACTCTTAACGAAGCTCAAGTTCCTCCCCTGGATGTCGTTGAGGTGGTGG
TTAGCCCTCCATATGTGTTCCTTCCTCTGGTGAAGAGCATATTGAGGCCTGACTTCCATG
TTGCGGCACAAAACTGCTGGGTCAAGAAAGGAGGTGCCTTCACTGGTGAAGTTAGTGCTG
AGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTCTGAAAGGAGAGCAC
TCCTCAATGAAACAAACGAGTTTGTTGGAGACAAGGTTGCATATGCTCTTGCTCAAGGTT
TGAAAGTGATTGCTTGTGTTGGCGAGACTCTTGAGCAGCGTGAGGCTGGGTCGACCATGG
ATGTTGTAGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGACCGGGTGTCGAACTGGCCAAATGTTG
TCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCCCAAG
CTCAAGAAGTACATGATGAGCTGAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGAGCGCTGATGTCG
CTGCTACAACCCGCATCATTTA

QA 4 685 4 685
DS 

RD RR2BO37TF 682 0 0
GG
AAACCCACTCGATCTATCCAAACCTTT**CATCCTCGTGATCATCGTAGAGAAAATATGG
CAA**AAGTTCTTCGTCGGAGGCAACTGGAAATGCAACGGAACTGCTGAGGAGGTGAAGA
AGATTGTCAACACTCTTAACGAAGCTCAAGTTCCTCCCCAGGATGTCGTTGAGGTGGTGG
TTAGCCCTCCATATGTGTTCCTTCCTCTGGTGAAGAGCATATTGAGGCCTGACTTCCATG
TTGCGGCACAAAACTGCTGGGTCAAGAAAGGAGGTGCCTTCACTGGTGAAGTTAGTGCTG
AGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTCTGAAAGGAGAGCAC
TCCTCAATGAAACAAACGAGTTTGTTGGAGACAAGGTTGCATATACTCTTGCTCAAGGTT
TGAAAGTGATTGCTTGTGTTGGCGAGACTCTTGAGCAGCGTGAGGCTGGGTCGACCATGG
ATGTTGTAGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGACCGGGTGTCGAACTGGCCAAATGTTG
TCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCCCAAG
CTCAAGAAGTACATGATGAGCTGAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGAGCGCTGATGTCG
CTGCTACAACCCGCATCATT

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR2DA33JQ 642 0 0
TCAATGAAACAAACGAGTTTGTTGGAGATAAGGTTGCCTATGCTCTTGCTCAAGGTTTGA
AAGTGATTGCTTGTGTTGGCGAGACTCTTGAGCAGCGTGAGGCTGGTTCGACCATGGATG
TTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGACCGGGTGTCGAACTGGCCAAATGTTGTCA
TAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCCCAAGCTC
AAGAAGTACATGATGAGTTGAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGAGCGCTGATGTCGCTG
CTACAACCCGCATCATTTATGGAGGATCCGTTAATGGTGGTAACTGCAAGGAGCTAGGTG
GTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGCCCGAGTTTATCG
ACATCATCAAGGCTGCTGAGGTGAAGAAAAGCGCTTAGTGGCTTCACGAAACAATCTCAA
ATCCTTTTGCTTCTTCAGTTTCAACTCTGATCGGAAAAAAATGAATAAGTTGATACAGTG
TTATTGTGATACTCTTTTGCTTCAGTTGTATGTTGTCTTGAGGAGGCAACACACTTTTTC
TTGGCCGTTTTGTTTAGCTCTGAAATCACAAAATCTCACCCC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2F515JQ 408 0 0
GCTCAAGAAGTACATGATGAGTTGAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGAGCGCTGATGTC
GCTGCTACAACCCGCATCATTTATGGAGGATCCGTTAATGGTGGTACCTGCAAGGAGCTA
GGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGCCCGAGTTT
ATCGACATCATCAAGGCTGCTGAGGTGAAGAAAAGCGCTTAGTGGCTTCACGAAACAATC
TCAAATCCTTTTGCTTCTTCAGTCTCAACTCTGATCGGAAAAAAATGAAAAAGTTGATAC
AGTGTTATTGTGATACTCTTTTGCTTCAGTTGTATGTTGTCTTGAGGAGGCAACACACTT
TTTTTTGGCCGTTTTGTTTAGCTCTGAAATCACAAAATCTC
CCCCTTT

QA 1 401 1 401
DS 

RD RR2EB48TF 475 0 0
G
GGCCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTA
GCCCAGCCCAAGCTCAAGAAGTACATGATGAGTTGAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGA
GCGCTGATGTCGCTGCTACAACCCGCATCATTTATGGAGGATCCGTTAATGGTGGTAACT
GCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAA
AGCCCGAGTTTATCGACATCATCAGGGCTGCTGAAGTGAAGAAAAGCGCTTAGTGGCTTC
ACGAAACAATCTCAAATCCTTTTGCTTCTTCAGTCTCAACTCTGATCGGAAAAAAATGAA
TAAGTTGATACAGTGTTATTGTGATACTCTTTTGCTTCAGTTGTATGTTGTCTTGAGGAG
GCAACACACTTTTTCTTGGCCGTTTTGTTTAGCTCTGAAATCACAAAATCTCAC

QA 2 475 2 475
DS 

RD RR2EO28JQ 596 0 0
TTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATTGCTTGTGTTGGCGAGACTCTTGAGCAGCGTGAGGCTG
GGTCGACCATGGATGTTGTAGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGACCGGGTGTCGAACT
GGCCAAATGTTGTCATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTA
GCCCAGCCCAAGCTCAAGAAGTACATGATGAGCTGAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGA
GCGCTGATGTCGCTGCTACAACCCGCATCATTTACGGAGGATCCGTCAATGGTGGTAACT
GCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAA
AGCCTGAGTTTATCGACATCATCAAGGCTGCTGAGGTGAAGAAAAGCGCTTAGTGGCTTC
ACGAAACAATCTCAAATCCTTTTGCTTTTTCAGTTTCAGCTCTGATCG*AAAAAAATGAA
TAAGTTGATACAGTGTTATTGTGATACTCTTTTGCTTCAGTTGTATGTTGTCTTGAGGAG
GCAACACACTTTTTCTTGGCCGTTTTGTTTAGCTCTGAAATCACAAAATCTCACCC

QA 1 596 1 596
DS 



CO CL72Contig2 987 5 6 U
GGACTGAACACTCTCTCCTCTCGATCTATATCTTTCTAAGCTCTCTACATCGTCGTTTTC
TCGTGATCATCGTTGATAAAAGATGGCCAGAAAGTTCTTCGTTGGAGGCAACTGGAAATG
CAACGGAACGAGTGAGGAGGTGAAGAAGATTGTGAACACTCTTAACGAAGCTAAAGTACC
TTCCCAGGATGTCGTTGAGGTTGTGCTTAGCCCTCCATATGTGTTTCTTCCTCTTGTTAA
GAGCATATTGAGGCCTGACTTCCATGTTGCTGCCCAAAACTGCTGGGTTAAGAAAGGAGG
TGCCTTCACTGGTGAAGTCAGTGCGGAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTAT
CCTTGGTCACTCTGAAAGGAGGGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAA
GGTTGCCTATGCACTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGA
GCAGCGAGAGGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGA
TCGTGTGTCGAACTGGCCAAATGTTGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAAC
CGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCTCAGGCTCAGGAAGTACACGATGAGCTTAGGAAATGGCT
TGCAAAGAACGTGAGTGATGATGTTGCCGCTACAACCCGCATCATATACGGAGGATCCGT
CAATGGTGGTAACTGCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGG
TGGTGCTTCTCTAAAGCCCGAGTTTATCGACATCATCAAGGCTGCCGAGGTGAAGAAGAG
TGCTTAATGAGTTTCACTAAACTTCCTTTTACTTTTTCCAGTCTCAACTCTGATTTTAAA
AATGAATAAGTTGATACAGTATTATTGTGATACTCTTTGGTTCATGTGTATGTTTCCTTG
AGAAGGCAAACAATCATTTTCTTCACC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2ED50TF U 1
AF RR2BS18TF U 2
AF RR2A594TF U 5
AF RR2E949JQ C 368
AF RR2DJ89JQ C 499
BS 1 621 RR2ED50TF
BS 622 625 RR2BS18TF
BS 626 629 RR2A594TF
BS 630 744 RR2E949JQ
BS 745 745 RR2DJ89JQ
BS 746 987 RR2E949JQ

RD RR2ED50TF 621 0 0
GGACTGAACACTCTCTCCTCTCGATCTATATCTTTCTAAGCTCTCTACATCGTCGTTTTC
TCGTGATCATCGTTGATAAAAGATGGCCAGAAAGTTCTTCGTTGGAGGCAACTGGAAATG
CAACGGAACGAGTGAGGAGGTGAAGAAGATTGTGAACACTCTTAACGAAGCTAAAGTACC
TTCCCAGGATGTCGTTGAGGTTGTGCTTAGCCCTCCATATGTGTTTCTTCCTCTTGTTAA
GAGCATATTGAGGCCTGACTTCCATGTTGCTGCCCAAAACTGCTGGGTTAAGAAAGGAGG
TGCCTTCACTGGTGAAGTCAGTGCGGAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTAT
CCTTGGTCACTCTGAAAGGAGGGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAA
GGTTGCCTATGCACTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGA
GCAGCGAGAGGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGA
TCGTGTGTCGAACTGGCCAAATGTTGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAAC
CGGAAAGGTCGCTAGCCCAGC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2BS18TF 625 0 0
GACT
GAACACTCTCTCCTCTCGATCTATATCTTTCTAAGCTCTCTACATCGTCGTTTTCTCGTG
ATCATCGTTGATAAAAGATGGCCAGAAAGTTCTTCGTTGGAGGCAACTGGAAATGCAACG
GAACGAGTGAGGAGGTGAAGAAGATTGTGAACACTCTTAACGAAGCTAAAGTACCTTCCC
AGGATGTCGTTGAGGTTGTGCTTAGCCCTCCATATGTGTTTCTTCCTCTTGTTAAGAGCA
TATTGAGGCCTGACTTCCATGTTGCTGCCCAAAACTGCTGGGTTAAGAAAGGAGGTGCCT
TCACTGGTGAAGTCAGTGCGGAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTG
GTCACTCTGAAAGGAGGGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAAGGTTG
CCTATGCACTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGC
GGGAGGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGTG
TGTCGAACTGGCCAAATGTTGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAA
AGGTCGCTAGCCCAGCTCAG
C

QA 5 624 5 624
DS 

RD RR2A594TF 625 0 0
G
GAACACTCTCTCCTCTCGATCTATATCTTTCTAAGCTCTCTACATCGTCGTTTTCTCGTG
ATCATCGTTGATAAAAGATGGCCAGAAAGTTCTTCGTTGGAGGCAACTGGAAATGCAACG
GAACGAGTGAGGAGGTGAAGAAGATTGTGAACACTCTTAACGAAGCTAAAGTACCTTCCC
AGGATGTCGTTGAGGTTGTGCTTAGCCCTCCATATGTGTTTCTTCCTCTTGTTAAGAGCA
TATTGAGGCCTGACTTCCATGTTGCTGCCCAAAACTGCTGGGTTAAGAAAGGAGGTGCCT
TCACTGGTGAAGTCAGTGCGGAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTG
GTCACTCTGAAAGGAGGGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAAGGTTG
CCTATGCACTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGC
GAGAGGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGTG
TGTCGAACTGGCCAAATGTTGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAA
AGGTCGCTAGCCCAGCTCACGCTC

QA 2 625 2 625
DS 

RD RR2E949JQ 620 0 0
CACTCTGAAAGGAGGGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAAGGTTGCC
TATGCACTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGCGA
GAGGCTGGGTCAACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGTGTG
TCGAACTGGCCAAATGTTGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATAGGAACCGGAAAG
GTCGCTAGCCCAGCTCAGGCTCAGGAAGTACACGATGAGCTTAGGAAATGGCTTGCAAAG
AACGTGAGTGATGATGTTGCCGCTACAACCCGCATCATATACGGAGGATCCGTCAATGGT
GGTAACTGCAAGGAGCTGGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCT
TCTCTAAAGCCCGAGTTTATCGACATCATCAAGGCTGCCGAGGTGAAGAAGAGTGCTTAA
TGAGTTTCACTAAACTTCCTTTTACTTTTTCCAGTCTCAACTCTGATTTTAAAAATGAAT
AAGTTGATACAGTATTATTGTGATACTCTTTGGTTCATGTGTATGTTTCCTTGAGAAGGC
AAACAATCATTTTCTTCACC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2DJ89JQ 489 0 0
AC
CCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGTGTGTCGAACTGGCCAA
ATGTTGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATAGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAG
CTCAGGCTCAGGAAGTACACGATGAGCTTAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGAGTGATG
ATGTTGCCGCTACAACCCGCATCATATACGGAGGATCCGTCAATGGTGGTAACTGCAAGG
AGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGCCCG
AGTTTATCGACATCATCAAGGCTGCCGAGGTGAAGAAGAGTGCTTAATGAGTTTCACTAA
ACTTCCTTTTACTTTTTCCAGTCTCAACTCTGATTTTAAAAATGAATAAGTTGATACAGT
ATTATTGTGATACTCTTTGGTTCATGTGTATGTTTCCTTGAGAAGGCAAACAATCATTTT
CTTCACC

QA 3 489 3 489
DS 



CO CL72Contig3 1113 6 39 U
GGGGACTGAACACTCTCTCTCGATCTATCTTCCTAA*GCTCTCTCTCTCGTGATCATCGT
T*ATAAAAAGATGGCCAGAAAGTTCTTCGTCGGAGGCAACTGGAAATGCAACGGAACTGT
TGAGGAGGTGAAGAAGATTGTGAACACTCTTAACGAAGCTCAAGTACCTTCCCAGGATGT
CGTTGAGGTCGTGCTTAGCCCTCCATATGTGTTTCTTCCTCTTGTTAAGAGCATTTTGAG
GTCTGACTTCCATGTTGCTGCCCAAAACTGCTGGGTTAAGAAAGGAGGTGCCTTCACTGG
TGAAGTGAGTGCTGAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTC
TGAAAGGAGGGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAAGGTTGCCTATGC
ACTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGCGAGAGGC
TGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGTGTGTCGAA
CTGGCCAAATGTTGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGC
TAGCCCAGCTCAAGCTCAGGAAGTACATGATGAGCTTAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGT
GAGTGATGATGTTGCCGCTACAACCCGCATCATATACGGAGGATCCGTCAATGGTGGTAA
CTGCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCT
AAAGCCCGAGTTTATCGACATCATCAAGGCTGCCGAGGTGAAGAAGAGTGCTTAATGAGT
TTCACTAAGCGACATAGCTTCCTTTTACTTTTTCCAGTCTCAACTCTGATTTTAAAAAAA
TGAATAAGTTGATACAGTATTATTGTGATACTCTTTGGTTCATGTGTATGTTTCCTTGAG
AAGGCAAACAATCATTTTCTTCACCATTTGCATTTAGCTGTGAGCTTACAAAAAATCTCT
CCCTTTGATGCTCTGTCCGTGTTCTTAACTTCCGGGCTTTTTAATTAAAAGGAAATTAAG
TTATATACAGCCCGATCGAGGAAGTGTTTTTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 15 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E949TF U 3
AF RR2EF02TF U 1
AF RR2DJ89TF U 3
AF RR2EF02JQ C 256
AF RR2FI84JQ C 359
AF RR2ED50JQ C 463
BS 1 36 RR2EF02TF
BS 37 37 RR2DJ89TF
BS 38 61 RR2EF02TF
BS 62 62 RR2DJ89TF
BS 63 118 RR2EF02TF
BS 119 120 RR2DJ89TF
BS 121 141 RR2EF02TF
BS 142 142 RR2DJ89TF
BS 143 189 RR2EF02TF
BS 190 190 RR2DJ89TF
BS 191 225 RR2EF02TF
BS 226 226 RR2DJ89TF
BS 227 241 RR2EF02TF
BS 242 242 RR2DJ89TF
BS 243 369 RR2EF02TF
BS 370 370 RR2DJ89TF
BS 371 531 RR2EF02TF
BS 532 532 RR2DJ89TF
BS 533 544 RR2EF02TF
BS 545 545 RR2DJ89TF
BS 546 619 RR2EF02TF
BS 620 620 RR2DJ89TF
BS 621 639 RR2EF02TF
BS 640 640 RR2DJ89TF
BS 641 648 RR2EF02TF
BS 649 649 RR2DJ89TF
BS 650 682 RR2EF02TF
BS 683 683 RR2DJ89TF
BS 684 694 RR2EF02TF
BS 695 724 RR2DJ89TF
BS 725 866 RR2EF02JQ
BS 867 867 RR2FI84JQ
BS 868 893 RR2EF02JQ
BS 894 895 RR2FI84JQ
BS 896 968 RR2EF02JQ
BS 969 969 RR2FI84JQ
BS 970 980 RR2EF02JQ
BS 981 985 RR2FI84JQ
BS 986 1113 RR2ED50JQ

RD RR2E949TF 506 0 0
GGACTGAACACTCTCTCTCGATCTATCTTCCTAA*GCTCTCTCTCTCGTGATCATCGTT*
ATAAAAAGATGGCCAGAAAGTTCTTCGTCGGAGGCAACTGGAAATGCAACGGAACTGTTG
AGGAGGTGAAGAAGATTGTGAACACTCTTAACGAAGCTCAAGTACCTTCCCAGGATGTCG
TTGAGGTCGTGCTTAGCCCTCCATATGTGTTTCTTCCTCTTGTTAAGAGCATTTTGAGGT
CTGACTTCCATGTTGCTGCCCAAAACTGCTGGGCTAAAAAAGGAGGTGCCTTCACTGGTG
AAGTGAGTGCTGAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTCTG
AAAGGAGGGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAAGGTTGCCTATGCAC
TTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGCGAGAGGCTG
GGTCAACCATGGATGTTGTGGCTGCC

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2EF02TF 694 0 0
GGGGACTGAACACTCTCTCTCGATCTATCTTCCTAAAGCTCTCTCTCTCGTGATCATCGT
TGATAAAAAGATGGCCAGAAAGTTCTTCGTCGGAGGCAACTGGAAATGCAACGGAACTAG
TGAGGAGGTGAAGAAGATTGTTAACACTCTTAACGAAGCTCAAGTACCTTCCCAGGATGT
CGTTGAGGTTGTGCTTAGCCCTCCATATGTGTTTCTTCCTCTTGTCAAGAGCATTTTGAG
GCCTGACTTCCATGTTGCTGCCCAAAACTGCTGGGTTAAGAAAGGAGGTGCCTTCACTGG
TGAAGTGAGTGCTGAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTC
TGAAAGGAGTGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAAGGTTGCCTATGC
ACTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGCGAGAGGC
TGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGAGTGTCGAA
CTGGTCAAATGTTGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGC
TAGCCCAGCTCAAGCTCAG*AAGTACATGATGAGCTTAG*AAATGGCTCGCAAAGAACGT
GAGTGATGATGTTGCCGCTACA*CCCGCATCATA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2DJ89TF 722 0 0
GGACTGAACACTCTCTCTCGATCTATCTTCCTAA*GCTCTCTCTCTCGTGATCATCGTT*
ATAAAAAGATGGCCAGAAAGTTCTTCGTCGGAGGCAACTGGAAATGCAACGGAACTGTTG
AGGAGGTGAAGAAGATTGTGAACACTCTTAACGAAGCTCAAGTACCTTCCCAGGATGTCG
TTAAGGTCGTGCTTAGCCCTCCATATGTGTTTCTTCCTCTTGTTAAGAGCATTTTGAGGT
CTGACTTCCATGTTGCTGCCCAAAACTGCTGGGTTAAGAAAGGAGGTGCCTTCACTGGTG
AAGTGAGTGCTGAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTCTG
AAAGGAGGGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAAGGTTGCCTATGCAC
TTGCTCAAGGTTTGAAAGTTATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGCGAGAGGCTG
GGTCAACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGTGTGTCGAACT
GGCCAAATGTTGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATAGGAACCGGAAAGGTCGCTA
GCCCAGCTCACGCTCAGGAAGTACACGATGAGCTTAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGA
GTGATGATGTTGCCGCTACAACCCGCATCATATACGGAGGATCCGTCAATGGTGGTAACT
GC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2EF02JQ 727 0 0
TGCTGCCCAAAACTGCTGGGTTAAGAAAGGAGGTGCCTTCACTGGTGAAGTGAGTGCTGA
GATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTCTGAAAGGAGTGCACT
CCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAAGGTTGCCTATGCACTTGCTCAAGGTTT
GAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGCGAGAGGCTGGATCGACCATGGA
TGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGAGTGTCGAACTGGTCAAATGTTGT
TATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCTCAAGC
TCAGGAAGTACATGATGAGCTTAGGAAATGGCTCGCAAAGAACGTGAGTGATGATGTTGC
CGCTACAACCCGCATCATATACGGAGGATCCGTCAATGGTGGTAACTGCAAGGAGCTAGG
TGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGCCCGAGTTTAT
CGACATCATCAAGGCTGCCGAGGTGAAGAAGAGTGCTTAATGAGTTTCACTAAGCGACAT
AGCTTCCTTTTGCTTTTTCCAGTCTCAACTCTGATTTTTTAAAAATGAATAAGTTGATAC
AGTATTATTGTGATACTCTTTGGTTCATGTGTATGTTTCCTTGAGAAGGCAAAAAATCAT
TTTCT
CC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2FI84JQ 627 0 0
TCTGAAAGGAGGGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAAGGTTGCCTAT
GCACTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGCGAGAG
GCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGTGTGTCG
AACTGGCCAAATGTTGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTC
GCTAGTCCAGCTCAGGCTCAGGAAGTACATGATGAGCTTAGGAAATGGCTTGCAAAGAAC
GTGAGTGATGATGTTGCCGCTACAACCCGCATCATGTACGGAGGATCCGTCAATGGTGGT
AACTGCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCT
CTAAAGCCCGAGTTTATCGACATCATCAAGGCTGCCGAGGTGAAGAAGAGTGCTTAATGA
GTTTCACTAAGCGACATAGCTTCCTTTTACTTTTTCCAGTCTCAACTCTGATTTTAAAAA
AATGAATAAGTTGATACAGTATTATTGTGATACTCTTTGGTTCATGTGTATGTTTCCTTG
AGAAGGCAAACAATCATTTTCTTCACC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2ED50JQ 651 0 0
TCTTGAGCAGCGAGAGGCTGGATCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTAT
TGCTGATCGTGTGTCGAACTGGCCAAATGTTGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCAT
TGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCTCAGGCTCAGGAAGTACATGATGAGCTTAGGAA
ATGGCTTGCAAAGAACGTGAGTGATGATGTTGCCGCTACAACCCGCATCATATACGGAGG
ATCCGTCAATGGTGGTAACTGCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTT
GGTCGGTAGTGCTTCTCTAAAGCCCGAGTTTATCGACATCATCAAGGCTGCCGAGGTGAA
GAAGAGTGCTTAATGAGTTTCACTAAGCGACATAGCTTCCTTTTACTTTTTCCAGTCTCA
ACTCTGATTTTAAAAAAATGAATAAGTTGATACAGTATTATTGTGATACTCTTTGGTTCA
TGTGTATGTTTCCTTGAGAAGGCAAACAATCATTTTCTTCACCATTTGCATTTAGCTGTG
AGCTTACAAAAAATCTCTCCCTTTGATGCTCTGTCCGTGTTCTTAACTTCCGGGCTTTTT
AATTAAAAGGAAATTAAGTTATATACAGCCCGATCGAGGAAGTGTTTTTCC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 4 23

CO CL73Contig1 683 6 4 U
GGATTCTCTCTTGCACTGAAACTCTCCAAGGAAGAAGAAGAAGATAATATGGCGACGACA
AGCGCATCTGCTTTGCTCTCACCCACAACAACCTTCTCCAAAGCAATCTCCCAGAAAAAT
CCAAACTCCATCTCATTCCACGGCCTCCGTCCTCTCCGTCTCGGTGGCTCCTCCTCCGCC
TTACCCAAGCTATCCACCACCTACGGAAGGAGATCATCCTCCTCTGCTGTCGTGAGAGCC
GAGCTCAGCCCATCGGTCGTCATAAGCCTCAGCACCGGTCTCTCCCTCTTCCTAGGACGG
TTCGTCTTCTTCAACTTCCAGAGAGAGAACGTTGCCAAGCAGGTGCCGGAGCAGAACGGG
AAAACCCACTTCGAAGCCGGAGATGATCGTGCTAAGGAGTATGTAAGCCTCCTAAAGTCG
AACGATCCAGTTGGATTCAACATTGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCACATC
GTTGCTTACTATGTCTTGGCCACTTCTAGCAATGGCTATGACCCCAGCTTCTTTGGCTGA
TTCATTTCCATTTTCTGTCTCGTTATATGTATATGTTTGACTTGTATGGCAAGTTACCTC
TTCTCTTGTTATTTGTCTTTTGGCTTCCCTCTTTCGTTTGCAACATTTTTATATTTCGTG
ATCTACAAGAGCGGTTTGCAGCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 0 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B712JQ C 1
AF RR2B712TF U 1
AF RR2CB56JQ C 317
AF RR2BF18TF U 16
AF RR2AG46TF U 16
AF RR2CB56TF U 16
BS 1 319 RR2B712TF
BS 320 320 RR2AG46TF
BS 321 649 RR2B712TF
BS 650 683 RR2AG46TF

RD RR2B712JQ 649 0 0
GGATTCTCTCTTGCACTGAAACTCTCCAAGGAAGAAGAAGAAGATAATATGGCGACGACA
AGCGCATCTGCTTTGCTCTCACCCACAACAACCTTCTCCAAAGCAATCTCCCAGAAAAAT
CCAAACTCCATCTCATTCCACGGCCTCCGTCCTCTCCGTCTCGGTGGCTCCTCCTCCGCC
TTACCCAAGCTATCCACCACCTACGGAAGGAGATCATCCTCCTCTGCTGTCGTGAGAGCC
GAGCTCAGCCCATCGGTCGTCATAAGCCTCAGCACCGGTCTCTCCCTCTTCCTAGGACGG
TTCGTCTTCTTCAACTTCCTGAGAGAGAACGTTGCCAAGCAGGTGCCGGAGCAGAACGGG
AAAACCCACTTCGAAGCCGGAGATGATCGTGCTAAGGAGTATGTAAGCCTCCTAAAGTCG
AACGATCCAGTTGGATTCAACATTGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCACATC
GTTGCTTACTATGTCTTGGCCACTTCTAGCAATGGCTATGACCCCAGCTTCTTTGGCTGA
TTCATTTCCATTTTCTGTCTCGTTATATGTATATGTTTGACTTGTATGGCAAGTTACCTC
TTCTCTTGTTATTTGTCTTTTGGCTTCCCTCTTTCGTTTGCAACATTTT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2B712TF 649 0 0
GGATTCTCTCTTGCACTGAAACTCTCCAAGGAAGAAGAAGAAGATAATATGGCGACGACA
AGCGCATCTGCTTTGCTCTCACCCACAACAACCTTCTCCAAAGCAATCTCCCAGAAAAAT
CCAAACTCCATCTCATTCCACGGCCTCCGTCCTCTCCGTCTCGGTGGCTCCTCCTCCGCC
TTACCCAAGCTATCCACCACCTACGGAAGGAGATCATCCTCCTCTGCTGTCGTGAGAGCC
GAGCTCAGCCCATCGGTCGTCATAAGCCTCAGCACCGGTCTCTCCCTCTTCCTAGGACGG
TTCGTCTTCTTCAACTTCCTGAGAGAGAACGTTGCCAAGCAGGTGCCGGAGCAGAACGGG
AAAACCCACTTCGAAGCCGGAGATGATCGTGCTAAGGAGTATGTAAGCCTCCTAAAGTCG
AACGATCCAGTTGGATTCAACATTGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCACATC
GTTGCTTACTATGTCTTGGCCACTTCTAGCAATGGCTATGACCCCAGCTTCTTTGGCTGA
TTCATTTCCATTTTCTGTCTCGTTATATGTATATGTTTGACTTGTATGGCAAGTTACCTC
TTCTCTTGTTATTTGTCTTTTGGCTTCCCTCTTTCGTTTGCAACATTTT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2CB56JQ 309 0 0
TCCAGAGAGAGAACGTTGCCAAGCAGGTGCCGGAGCAGAACGGGAAAACCCACTTCGAAG
CCGGAGATGATCGTGCTAAGGAGTATGTAAGCCTCCTAAAGTCGAACGGTCCAGTTGGAT
TCAACATTGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCACATCGTTGCTTACTATGTCT
TGGCCACTTCTAGCAATGGCTATGACCCCAGCTTCTTTGGCTGATTCATTTCCATTTTCT
GTCTCGTTATATGTATATGTTTGACTTGTATGGCAAGTTACCTCTTCTCTTGTTATTTGT
CTTTTGGCT

QA 1 309 1 309
DS 

RD RR2BF18TF 615 0 0
GG
GAAACTCTCCAAGGAAGAAGAAGAAGATAATATGGCGACGACAAGCGCATCTGCTTTGCT
CTCACCCACAACAACCTTCTCCAAAGCAATCTCCCAGAAAAATCCAAACTCCATCTCATT
CCACGGCCTCCGTCCTCTCCGTCTCGGTGGCTCCTCCTCCGCCTTACCCAAGCTATCCAC
CACCTACGGAAGGAGATCATCCTCCTCTGCTGTCGTGAGAGCCGAGCTCAGCCCATCGGT
CGTCATAAGCCTCAGCACCGGTCTCTCCCTCTTCCTAGGACGGTTCGTCTTCTTCAACTT
CCAGAGAGAGAACGTTGCCAAGCAGGTGCCGGAGCAGAACGGGAAAACCCACTTCGAAGC
CGGAGATGATCGTGCTAAGGAGTATGTAAGCCTCCTAAAGTCGAACGATCCAGTTGGATT
CAACATTGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCACATCGTTGCTTACTATGTCTT
GGCCACTTCTAGCAATGGCTATGACCCCAGCTTCTTTGGCTGATTCATTTCCATTTTCTG
TCTCGTTATATGTATATGTTTGACTTGTATGGCAAGTTACCTCTTCTCTTGTTATTTGTC
TTTTGGCTTCTCT

QA 3 615 3 615
DS 

RD RR2AG46TF 668 0 0
GG
GAAACTCTCCAAGGAAGAAGAAGAAGATAATATGGCGACGACAAGCGCATCTGCTTTACT
CTCACCCACAACAACCTTCTCCAAAGCAATCTCCCAGAAAAATCCAAACTCCATCTCATT
CCACGGCCTCCGTCCTCTCCGTCTCGGTGGCTCCTCCTCCGCCTTACCCAAGCTATCCAC
CACCTACGGAAGGAGGTCATCCTCCTCTGCTGTCGTGAGAGCCGAGCTCAGCCCATCGGT
CGTCATAAGCCTCAGCACCGGTCTCTCCCTCTTCCTAGGACGGTTCGTCTTCTTCAACTT
CCAGAGAGAGAACGTTGCCAAGCAGGTGCCGGAGCAGAACGGGAAAACCCACTTCGAAGC
CGGAGATGATCGTGCTAAGGAGTATGTAAGCCTCCTAAAGTCGAACGATCCAGTTGGATT
CAACATTGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCACATCGTTGCTTACTATGTCTT
GGCCACTTCTAGCAATGGCTATGACCCCAGCTTCTTTGGCTGATTCATTTCCATTTTCTG
TCTCGTTATATGTATATGTTTGACTTGTATGGCAAGTTACCTCTTCTCTTGTTATTTGTC
TTTTGGCTTCTCTCTTTCGTTTGCAACATTTTTATATTTCGTGATCTACAAGAGCGGTTT
GCAGCG

QA 3 668 3 668
DS 

RD RR2CB56TF 654 0 0
GG
GAAACTCTCCAAGGAAGAAGAAGAAGATAATATGGCGACGACAAGCGCATCTGCTTTGCT
CTCACCCACAACAACCTTCTCCAAAGCAATCTCCCAGAAAAATCCAAACTCCATCTCATT
CCACGACCTCCGTCCTCTCCGTCTCGGTGGCTCCTCCTCCGCCTTACCCAAGCTATCCAC
CACCTACGGAAGGAGATCATCCTCCTCTGCTGTCGTGAGAGCCGAGCTCAGCCCATCGGT
CGTCATAAGCCTCAGCACCGGTCTCTCCCTCTTCCTAGGACGGTTCGTCTTCTTCAACTT
CCAGAGAGAGAACGTTGCCAAGCAGGTGCCGGAGCAGAACGGGAAAACCCACTTCGAAGC
CGGAGATGATCGTGCTAAGGAGTATGTAAGCCTCCTAAAGTCGAACGATCCAGTTGGATT
CAACATTGTGGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCACATCGTTGCTTACTATGTCTT
GGCCACTTCTAGCAATGGCTATGACCCCAGCTTCTTTGGCTGATTCATTTCCATTTTCTG
TCTCGTTATATGTATATGTTTGACTTGTATGGCAAGTTACCTCTTCTCTTGTTATTTGTC
TTTTGGCTTCTCTCTTTCGTTTGCAACATTTTTATATTTCGTGATCTACAA
G

QA 3 653 3 653
DS 



CO CL73Contig2 703 10 4 U
GGAGAAGAAAAAAAGAAAGAACTATCCGAAAGAAGAAGAAGAAAACATGGCGACAAGCGC
ATCTGCTTTGCTCACACCCACAACAACCTTCTCCACTACAATCTCCCAGAAAAACCCGAA
CTCCATCTCATTTCACGGCCTCCGTTCTCT*CCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCTCCGCCT
TACCCAAGCTATCCACCACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCTGCTTTGGTGAGAGCCGAGC
TCAGTCCATCCGTCGTTATAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCG
TCTTCTTCAACTTCCAGAGAGAGAATGTGGCGAAACAGGTGCCGGAGCAGAACGGCAAAA
CCCACTTCGAAGCCGGAGACGATCGTGCCAAGGAGTACGTTAGCCTCTTGAAATCGAACG
ACCCTGTTGGATTCAACATCGTTGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGCCACATCGTTG
CTTACTATGTCTTGGCCACTTCTAGCAATGGCTACGATCCTAGCTTCTTTGGCTGATTCT
TTTCTGTCTCTCTGTTCCTTGTTCATGTATATGTTTGACTTGTATCTCAAGTTGCCTAAT
GTATTCTCTTATCTATGTTTCTTCCACCTCTATTATTATTGTCTAGGGCATAAATCTCTC
TTTCGTTTGCAACACTTAAATATATTTCATGATCCAAAAAAAA


BQ
10 10 10 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 45 45 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY23TF U 78
AF RR2BU44JQ C 18
AF RR2BU44TF U 18
AF RR2FI67JQ C 1
AF RR2FI67TF U 1
AF RR2G758JQ C -3
AF RR2CF87TF U 1
AF RR2BQ23JQ C 3
AF RR2BQ23TF U 3
AF RR2CF87JQ C 30
BS 1 446 RR2CF87TF
BS 447 447 RR2BU44TF
BS 448 692 RR2CF87TF
BS 693 703 RR2BQ23TF

RD RR2BY23TF 279 0 0
CCACAACAACCTTCTCCACTACAATCTCCCAGAAAAACCCGAACTCCATCTCATTTCACG
GCCTCCGTTCTCT*CCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCTCCGCCTTACCCAAGCTATCCACC
ACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCTGCTTTGGTGAGAGCCGAGCTCAGTCCATCCGTCGTT
ATAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCGTCTTCTTCAACTTCCAG
AGAGAGAATGTGGCGAAACAGGTGCCGGAGCAGAACGGC

QA 1 279 1 279
DS 

RD RR2BU44JQ 632 0 0
G
GAACTATCCGAAAGAAGAAGAAGAAAACATGGCGACAAGCGCATCTGCTTTGCTCACACC
CACAACAACCTTCTCCACTACAATCTCCCAGAAAAACCCGAACTCCATCTCATTTCACGG
CCTCCGTTCTTT*CCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCTCCGCCTTACCCAAGCTATCCACCA
CCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCTGCTTTGGTGAGAGCCGAGCTCAGTCCATCCGTCGTTA
TAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCGTCTTCTTCAACTTCCAGA
GAGAGAATGTGGCGAAACAGGTGCCGGAGCAGAACGGCAAAACCCACTTCGAAGCCGGAG
ACGATCGTGCCAAGGAGTACGTTAGCCTCTTGAAATCGAACGACCCTGTTGGATTCAACA
TCGTTGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGCCACATCGTTGTTTACTATGTCTTGGCCA
CTTCTAGCAATGGCTACGATCCTAGCTTCTTTGGCTGATTCTTTTCTGTCTCTCTGTTCC
TTGTTCATGTATATGTTTGACTTGTATCTCAAGTTGCCTAATGTATTCTCTTATCTATGT
TTCTTCCACCTCTATTATTATTGTCTAGGG
T

QA 2 631 2 631
DS 

RD RR2BU44TF 632 0 0
G
GAACTATCCGAAAGAAGAAGAAGAAAACATGGCGACAAGCGCATCTGCTTTGCTCACACC
CACAACAACCTTCTCCACTACAATCTCCCAGAAAAACCCGAACTCCATCTCATTTCACGG
CCTCCGTTCTCT*CCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCTCCGCCTTACCCAAGCTATCCACCA
CCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCTGCTTTGGTGAGAGCCGAGCTCAGTCCATCCGTCGTTA
TAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCGTCTTCTTCAACTTCCAGA
GAGAGAATGTGGCGAAACAGGTGCCGGAGCAGAACGGCAAAACCCACTTCGAAGCCGGAG
ACGATCGTGCCAAGGAGTACGTTAGCCTCTTGAAATCGAACGACCCTGTTGGATTCAACA
TCGTTGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGCCACATCGTTGTTTACTATGTCTTGGCCA
CTTCTAGCAATGGCTACGATCCTAGCTTCTTTGGCTGATTCTTTTCTGTCTCTCTGTTCC
TTGTTCATGTATATGTTTGACTTGTATCTCAAGTTGCCTAATGTATTCTCTTATCTATGT
TTCTTCCACCTCTATTATTATTGTCTAGGG
T

QA 2 631 2 631
DS 

RD RR2FI67JQ 651 0 0
GGA
GAAGAAAAAAAGAAAGAACTATCCGAAAGAAGAAGAAGAAAACATGGCGACAAGCGCATC
TGCTTTGCTCACACCCACAACAACCTTCTCCACTACAATCTCCCAGAAAAACCCGAACTC
CATCTCATTTCACGGCCTCCGTTCTCT*CCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCTCCGCCTTAC
CCAAGCTATCCACC***TCCGGGAGAAGATCTTCCTCTGCTTTGGTGAGAGCCGAGCTCA
GTCCATCCGTCGTTATAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCGTCT
TCTTCAACTTCCAGAGAGAGAATGTGGCGAAACAGGTGCCGGAGCAGAACGGCAAAACCC
ACTTCGAAGCCGGAGACGATCGTGCCAAGGAGTACGTTAGCCTCTTGAAATCGAACGACC
CTGTTGGATTCAACATCGTTGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGCCACATCGTTGCTT
ACTATGTCTTGGCCACTTCTAGCAATGGCTACGATCCTAGCTTCTTTGGCTGATTCCTTT
CTGTCTCTCTGTTCCTTGTTCATGTATATGTTTGACTTGTATCTCAAGTTGCCTAATGTA
TTCTCTTATCTATGTTTCTTCCACCTCTATTATTATTGTCTAGGGCA
C

QA 4 650 4 650
DS 

RD RR2FI67TF 651 0 0
GGA
GAAGAAAAAAAGAAAGAACTATCCGAAAGAAGAAGAAGAAAACATGGCGACAAGCGCATC
TGCTTTGCTCACACCCACAACAACCTTCTCCACTACAATCTCCCAGAAAAACCCGAACTC
CATCTCATTTCACGGCCTCCGTTCTCT*CCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCTCCGCCTTAC
CCAAGCTATCCACC***TCCGGGAGAAGATCTTCCTCTGCTTTGGTGAGAGCCGAGCTCA
GTCCATCCGTCGTTATAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCGTCT
TCTTCAACTTCCAGAGAGAGAATGTGGCGAAACAGGTGCCGGAGCAGAACGGCAAAACCC
ACTTCGAAGCCGGAGACGATCGTGCCAAGGAGTACGTTAGCCTCTTGAAATCGAACGACC
CTGTTGGATTCAACATCGTTGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGCCACATCGTTGCTT
ACTATGTCTTGGCCACTTCTAGCAATGGCTACGATCCTAGCTTCTTTGGCTGATTCCTTT
CTGTCTCTCTGTTCCTTGTTCATGTATATGTTTGACTTGTATCTCAAGTTGCCTAATGTA
TTCTCTTATCTATGTTTCTTCCACCTCTATTATTATTGTCTAGGGCA
C

QA 4 650 4 650
DS 

RD RR2G758JQ 655 0 0
TCCTGCGCTAAG
AAAAAAGAAAGAACTATCCGAAAGAAGAAGAAGAAAACATGGCGACAAGCGCATTTGCTT
TGCTCACACCCACAACAACCTTTTCCACTACAATCTCCCAGAAAAACCCGAACTCCATCT
CATTTCACGGCCTCCGTTCTTT*CCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCTCCGCCTTACCCAAG
CTATCCACCACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTTTGCTTTGGTGAGAGCCGAGCTCAGTCCA
TCCGTCGTTATAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCGTTTTTTTC
AACTTCCAGAGAGAGAATGTGGCGAAACAGGTGCCGGAGCAGAACGGCAAAACCCACTTC
GAAGCCGGAGACGATCGTGCCAAGGAGTACGTTAGCCTCTTGAAATCGAACGACCCTGTT
GGATTCAACATCGTTGATGTTCTTGCTTGGGGTTTTATTGGCCACATCGTTGCTTACTAT
GTCTTGGCCACTTCTAGCAATGGCTACGATCCTAGCTTCTTTGGCTGATTCTTTTCTGTC
TCTCTGTTCCTTGTTCATGTATATGTTTGACTTGTATCTCAAGTTGCCTAATGTATTCTC
TTATCTATGTTTCTTCCACCTCTATTATTATTGTTTAGGGCAT

QA 13 655 13 655
DS 

RD RR2CF87TF 692 0 0
GGAGAAGAAAAAAAGAAAGAACTATCCGAAAGAAGAAGAAGAAAACATGGCGACAAGCGC
ATCTGCTTTGCTCACACCCACAACAACCTTCTCCACTACAATCTCCCAGAAAAACCCGAA
CTCCATCTCATTTCACGGCCTCCGTTCTCT*CCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCTCCGCCT
TACCCAAGCTATCCACCACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCTGCTTTGGTGAGAGCCGAGC
TCAGTCCATCCGTCGTTATAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCG
TCTTCTTCAACTTCCAGAGAGAGAATGTGGCGAAACAGGTGCCGGAGCAGAACGGCAAAA
CCCACTTCGAAGCCGGAGACGATCGTGCCAAGGAGTACGTTAGCCTCTTGAAATCGAACG
ACCCTGTTGGATTCAACATCGTTGATTTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGCCACATCGTTG
CTTACTATGTCTTGGCCACTTCTAGCAATGGCTACGATCCTAGCTTCTTTGGCTGATTCT
TTTCTGTCTCTCTGTTCCTTGTTCATGTATATGTTTGACTTGTATCTCAAGTTGCCTAAT
GTATTCTCTTATCTATGTTTCTTCCACCTCTATTATTATTGTCTAGGGCATAAATCTCTC
TTTCGTTTGCAACACTTAAATATATTTCATGA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2BQ23JQ 693 0 0
G
GAAGAAAAAAAGAAAGAACTATCCGAAAGAAGAAGAAGAAAACATGGCGACAAGCGCATC
TGCTTTGCTCACACCCACAACAACCTTCTCCACTACAATCTCCCAGAAAAACCCGAACTC
CATCTCATTTCACGGCCTCCGTTCTCTTCCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCTCCGCCTTAC
CCAAGCTATCCACCACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCTGCTTTGGTGAGAGCCGAGCTCA
GTCCATCCGTCGTTATAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCGTCT
TCTTCAACTTCCAGAGAGAGAATGTGGCGAAACAGGTGCCGGAGCAGAACGGCAAAACCC
ACTTCGAAGCCGGAGACGATCGTGCCAAGGAGTACGTTAGCCTCTTGAAATCGAACGACC
CTGTTGGATTCAACATCGTTGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGCCACATCGTTGCTT
ACTATGTCTTGGCCACTTCTAGCAATGGCTACGATCCTAGCTTCTTTGGCTGATTCTTTT
CTGTCTCTCTGTTCCTTGTTCATGTATATGTTTGACTTGTATCTCAAGTTGCCTAATGTA
TTCTCTTATCTATGTTTCTTCCACCTCTATTATTATTGTTTAGGGCATAAATCTCTCTTT
CGTTTGCAACACTTAAATATATTTCATGA
TCC

QA 2 690 2 690
DS 

RD RR2BQ23TF 701 0 0
G
GAAGAAAAAAAGAAAGAACTATCCGAAAGAAGAAGAAGAAAACATGGCGACAAGCGCATC
TGCTTTGCTCACACCCACAACAACCTTCTCCACTACAATCTCCCAGAAAAACCCGAACTC
CATCTCATTTCACGGCCTCCGTTCTCTTCCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCTCCGCCTTAC
CCAAGCTATCCACCACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCTGCTTTGGTGAGAGCCGAGCTCA
GTCCATCCGTCGTTATAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCGTCT
TCTTCAACTTCCAGAGAGAGAATGTGGCGAAACAGGTGCCGGAGCAGAACGGCAAAACCC
ACTTCGAAGCCGGAGACGATCGTGCCAAGGAGTACGTTAGCCTCTTGAAATCGAACGACC
CTGTTGGATTCAACATCGTTGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGCCACATCGTTGCTT
ACTATGTCTTGGCCACTTCTAGCAATGGCTACGATCCTAGCTTCTTTGGCTGATTCTTTT
CTGTCTCTCTGTTCCTTGTTCATGTATATGTTTGACTTGTATCTCAAGTTGCCTAATGTA
TTCTCTTATCTATGTTTCTTCCACCTCTATTATTATTGTTTAGGGCATAAATCTCTCTTT
CGTTTGCAACACTTAAATATATTTCATGATCCAAAAAAAA

QA 2 701 2 701
DS 

RD RR2CF87JQ 667 0 0
AAGAAGAAGAAGAAAACATGGCGACAAGCGCATCTGCTTTGCTCACACCCACAACAACCT
TCTCCACTACAATCTCCCAGAAAAACCCGAACTCCATCTCATTTCACGGCCTCCGTTCTC
T*CCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCTCCGCCTTACCCAAGCTATCCACCACCTCCGGGAGA
AGATCTTCCTCTGCTTTGGTGAGAGCCGAGCTCAGTCCATCCGTCGTTATAAGCCTCAGC
ACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCGTCTTCTTCAACTTCCAGAGAGAGAATGTG
GCGAAACAGGTGCCGGAGCAGAACGGCAAAACCCACTTCGAAGCCGGAGACGATCGTGCC
AAGGAGTACGTTAGCCTCTTGAAATCGAACGACCCTGTTGGATTCAACATCGTTGATTTT
CTTGCTTGGGGTTCTATTGGCCACATCGTTGCTTACTATGTCTTGGCCACTTCTAGCAAT
GGCTACGATCCTAGCTTCTTTGGCTGATTCTTTTCTGTCTCTCTGTTCCTTGTTCATGTA
TATGTTTGACTTGTATCTCAAGTTGCCTAATGTATTCTCTTATCTATGTTTCTTCCACCT
CTATTATTATTGTCTAGGGCATAAATCTCTCTTTCGTTTGCAACACTTAAATATATTTCA
TGA
TCCT

QA 1 663 1 663
DS 



CO CL73Contig3 736 4 4 U
GAGCATCTAAAAGTCATCTTTGTATGTATCTATTATGTATGTTCTTCTTATTAAGTATTA
CCGCTGCAAACCGCTCTTTGTAGATCACGAAATATAAAAATGTTGCAAACGAAAGAGAGA
AGCCAATAGACAAACAACAAGAGAGGAGGTAACTTGCCATACAAGTCAAAGATATACATA
TAACGAGACAGAATATGGAAATGAATCAGCCAAAGAAGCTGGGGTCATAGCCATTGCTAG
AAGTGGCTAAGACATAGTAAGCAACGATGTGACCAATGGAACCCCAAGCAAGAACATCCA
CAATGTTGAATCCAACTGGATCGTTCGACTTCAAGAGGCTAACATACTCCTTAGCACGAT
CATCTCCGGCTTCGAAGTGGGTTTTCCCGTTCTGCTCCGGCACCTGTTTCGCCACGTTCT
CTCTCTGGAAGTTGAAGAAGTCGAACCGTCCTAGGAAGAGGGAGAGACCGGTGCTGAGGC
TTATGACGACCGATGGGCTGAGCTCGGCTCTCACGACGGCGGAGGAGGAAGATCTTCTTC
CGGAGGTGGTGGATAGCTTGGGTAAGGAAGAGGAGGAGCCACCGAGTCGGAGAGGACGGA
GGCCGTGGAATGAGATGGAGTTTGGGGTTTTCTGAGAGATTGCTTTGGAGAAGGTTGTTG
TGGGTGAGAGCAAAGCAGATGCGCTTGTCGTCGCCATATTATCTTCTTCTGAGAGTTTTA
GTGCAAGAGAGAATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F032JQ U 1
AF RR2F032TF C 1
AF RR2CP83JQ U 80
AF RR2CP83TF C 80
BS 1 439 RR2F032JQ
BS 440 591 RR2CP83JQ
BS 592 592 RR2F032TF
BS 593 736 RR2CP83JQ

RD RR2F032JQ 439 0 0
GAGCATCTAAAAGTCATCTTTGTATGTATCTATTATGTATGTTCTTCTTATTAAGTATTA
CCGCTGCAAACCGCTCTTTGTAGATCACGAAATATAAAAATGTTGCAAACGAAAGAGAGA
AGCCAATAGACAAACAACAAGAGAGGAGGTAACTTGCCATACAAGTCAAAGATATACATA
TAACGAGACAGAATATGGAAATGAATCAGCCAAAGAAGCTGGGGTCATAGCCATTGCTAG
AAGTGGCTAAGACATAGTAAGCAACGATGTGACCAATGGAACCCCAAGCAAGAACATCCA
CAATGTTGAATCCAACTGGATCGTTCGACTTCAAGAGGCTAACATACTCCTTAGCACGAT
CATCTCCGGCTTCGAAGTGGGTTTTCCCGTTCTGCTCCGGCACCTGTTTCGCCACGTTCT
CTCTCTGGAAGTTGAAGAA

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2F032TF 724 0 0
GAGCATCTAAAAGTCATCTTTGTATGTATCTATTATGTATGTTCTTCTTATTAAGTATTA
CCGCTGCAAACCGCTCTTTGTAGATCACGAAATATAAAAATGTTGCAAACGAAAGAGAGA
AGCCAATAGACAAACAACAAGAGAGGAGGTAACTTGCCATACAAGTCAAAGATATACATA
TAACGAGACAGAATATGGAAATGAATCAGCCAAAGAAGCTGGGGTCATAGCCATTGCTAG
AAGTGGCTAAGACATAGTAAGCAACGATGTGACCAATGGAACCCCAAGCAAGAACATCCA
CAATGTTGAATCCAACTGGATCGTTCGACTTCAAGAGGCTAACATACTCCTTAGCACGAT
CATCTCCGGCTTCGAAGTGGGTTTTCCCGTTCTGCTCCGGCACCTGTTTCGCCACGTTCT
CTCTCTGGAAGTTGAAGAAGACGAACCGTCCTAGGAAGAGGGAGAGACCGGTGCTGAGGC
TTATGACGACCGATGGGCTGAGCTCGGCTCTCACGACGGCGGAGGAGGAAGATCTTCTTC
CGGAGGTGGTGGATAGCTTGGGTAAGGAAGAGGAGGAGCCACCGAGTCGGAGAGGACGGA
GGCCGTGGAATGAGATGGAGTTTGGGGTTTTCTGAGAGATTGCTTTGGAGAAGGTTGTTG
TGGGTGAGAGCAAAGCAGATGCGCTTGTCGTCGCCATATTATCTTCTTCT
GAGAGTTTTAGTCC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2CP83JQ 657 0 0
GTAGATCACGAAATATAAAAATGTTGCAAACGAAAGAGAGAAGCCAATAGACAAACAACA
AGAGAGGAGGTAACTTGCCATACAAGTCAAAGATATACGTATAACGAGACAGAATATGGA
AATGAATCAGCCAAAGAAGCTGGGGTCATAGCCATTGCTAGAAGTGGCTAAGACATAGTA
AGCAACGATGTGACCAATGGAACCCCAAGCAAGAACATCCACAATGTTGAATCCAACTGG
ATCGTTCGACTTCAAGAGGCTAACATACTCCTTAGCACGATCATCTCCGGCTTCGAAGTG
GGTTTTCCCGTTCTGCTCCGGCACCTGTTTCGCCACGTTCTCTCTCTGGAAGTTGAAGAA
GTCGAACCGTCCTAGGAAGAGGGAGAGACCGGTGCTGAGGCTTATGACGACCGATGGGCT
GAGCTCGGCTCTCACGACGGCGGAGGAGGAAGATCTTCTTCCGGAGGTGGTGGATAGCTT
GGGTAAGGAAGAGGAGGAGCCACCGAGTCGGAAAGGACGGAGGCCGTGGAATGAGATGGA
GTTTGGGGTTTTCTGAGAGATTGCTTTGGAGAAGGTTGTTGTGGGTGAGAGCAAAGCAGA
TGCGCTTGTCGTCGCCATATTATCTTCTTCTGAGAGTTTTAGTGCAAGAGAGAATCC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2CP83TF 657 0 0
GTAGATCACGAAATATAAAAATGTTGCAAACGAAAGAGAGAAGCCAATAGACAAACAACA
AGAGAGGAGGTAACTTGCCATACAAGTCAAAGATATACGTATAACGAGACAGAATATGGA
AATGAATCAGCCAAAGAAGCTGGGGTCATAGCCATTGCTAGAAGTGGCTAAGACATAGTA
AGCAACGATGTGACCAATGGAACCCCAAGCAAGAACATCCACAATGTTGAATCCAACTGG
ATCGTTCGACTTCAAGAGGCTAACATACTCCTTAGCACGATCATCTCCGGCTTCGAAGTG
GGTTTTCCCGTTCTGCTCCGGCACCTGTTTCGCCACGTTCTCTCTCTGGAAGTTGAAGAA
GTCGAACCGTCCTAGGAAGAGGGAGAGACCGGTGCTGAGGCTTATGACGACCGATGGGCT
GAGCTCGGCTCTCACGACGGCGGAGGAGGAAGATCTTCTTCCGGAGGTGGTGGATAGCTT
GGGTAAGGAAGAGGAGGAGCCACCGAGTCGGAGAGGACGGAGGCCGTGGAATGAGATGGA
GTTTGGGGTTTTCTGAGAGATTGCTTTGGAGAAGGTTGTTGTGGGTGAGAGCAAAGCAGA
TGCGCTTGTCGTCGCCATATTATCTTCTTCTGAGAGTTTTAGTGCAAGAGAGAATCC

QA 1 657 1 657
DS 



CO CL73Contig4 608 3 6 U
GGAGAAGAAAAAAAAGAAAGAACTCTCCGAAAGAAGAAGAAGAAGAAAACATGGCGACAA
GCGCATCTGCTTTGCTCACACCCACAACAACCTTCTCCACTACAATCTCCCAGAAAAACC
CCAACTCCATCTCATTCCACGGCCTCCGTTCTCTCCGCCTCGGTGGTTCCTCCTCCTTAC
CCAAGCTATCCACCACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCCGCCGTCGTGAGAGCCGAGCTCA
GCCCATCCGTCGTTATAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCGTCT
TCTTCAACTTCCAGAGAGAGAATGTAGCGAAGCAGGTGCCGGAGCAGAACGGCAAAACCC
ACTTCGAAGCCGGAGACGATCGTGCCAAGGAGTACGTAAACCTCTTGAAATCGAACGACC
CTGTTGGATTCAACATCGTTGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCACATCGTTGCTT
ACTATGTCTTGGCCACTTCTAGCAATGGCTACGATCCTAGCTTTCTTGGCTGATTCTTTT
CTGTCTCTCTGTTCCTTGTTCATGTATATGTTTGACTTGTATCTCAAGTTGCCTAATGTA
TTCTCTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F716TF U 1
AF RR2F716JQ C 303
AF RR2AS58TF U 3
BS 1 343 RR2F716TF
BS 344 344 RR2AS58TF
BS 345 364 RR2F716TF
BS 365 399 RR2AS58TF
BS 400 400 RR2F716JQ
BS 401 608 RR2AS58TF

RD RR2F716TF 364 0 0
GGAGAAGAAAAAAAAGAAAGAACTCTCCGAAAGAAGAAGAAGAAGAAAACATGGCGACAA
GCGCATCTGCTTTGCTCACACCCACAACAACCTTCTCCACTACAATCTCCCAGAAAAACC
CCAACTCCATCTCATTCCACGGCCTCCGTTCTCTCCGCCTCGGTGGTTCCTCCTCCTTAC
CCAAGCTATCCACCACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCCGCCGTCGTGAGAGCCGAGCTCA
GCCCATCCGTCGTTATAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCGTCT
TCTTCAACTTCCAGAGAGAGAATGTAGCGAAGCAGGTGCCGGAACAGAACGGCAAAACCC
ACTT

QA 1 364 1 364
DS 

RD RR2F716JQ 202 0 0
TTCAACTTCCAGAGAGAGAATGTAGCGAAGCAGGTGCCGGAGCAGAACGGCAAAACCCAC
TTCGAAGCCGGAGACGATCGTGCCAAGGAGTACGTAAACCTCTTGAAATCGAACGACCCT
GTTGGATTCAACATCTTTGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCACATCGTTGCTTAC
TATGTCTTGGCCACTTCTAGCA

QA 1 202 1 202
DS 

RD RR2AS58TF 606 0 0
GGAAGA
AAAAAAAGAAAGAACTCTCCGAAAGAAGAAGAAGAAGAAAACATGGCGACAAGCGCATCT
GCTTTGCTCACACCCACAACAACCTTCTCCACTGCAATCTCCCAGAAAAACCCCAACTCC
ATCTCATTCCACGGCCTCCGTTCTCTCCGCCTCGGTGGTTCCTCCTCCTTACCCAAGCTA
TCCACCACCTCCGGGAGAAGATCTTCCTCCGCCGTCGTGAGAGCCGAGCTCAGCCCATCC
GTCGTTATAAGCCTCAGCACTGGTCTCTCCCTCTTCCTTGGCCGGTTCGTCTTCTTCAAC
TTCCAGAGAGAGAATGTGGCGAAGCAGGTGCCGGAGCAGAACGGCAAAACCCACTTCGAA
GCCGGAGACGATCGTGCCAAGGAGTACGTAAGCCTCTTGAAATCGAACGACCCTGTTGGA
TTCAACATCGTTGATGTTCTTGCTTGGGGTTCTATTGGTCACATCGTTGCTTACTATGTC
TTGGCCACTTCTAGCAATGGCTACGATCCTAGCTTTCTTGGCTGATTCTTTTCTGTCTCT
CTGTTCCTTGTTCATGTATATGTTTGACTTGTATCTCAAGTTGCCTAATGTATTCTCTTA

QA 7 606 7 606
DS 



AS 2 21

CO CL74Contig1 468 12 4 U
GGGACAAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACAAGAAAAGAACTCGAAAACGCTTTTTT
TTT*CAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTG
CGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTGGACGTCGTCGAGACTCAAGAGAGCTACAAGGA
AGCCATTGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTAG
CTGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAGAAATAAGGCTCCTAAAATACA
CATTTAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAAT
AAAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGT
AATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCCATG


BQ
10 55 60 60 60 60 60 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 10 10 10 

AF RR2CD35TF U 1
AF RR2EV93JQ C 2
AF RR2EV93TF U 2
AF RR2EI14JQ C 2
AF RR2AW46TFB U 2
AF RR2EX69JQ C 2
AF RR2EX69TF U 2
AF RR2FM40JQ C 2
AF RR2FM40TF U 2
AF RR2EI14TF U 2
AF RR2CV67TF U 8
AF RR2CA21TF U 313
BS 1 235 RR2CD35TF
BS 236 236 RR2EV93TF
BS 237 465 RR2CD35TF
BS 466 468 RR2CV67TF

RD RR2CD35TF 465 0 0
GGGACAAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACAAGAAAAGAACTCGAAAACGCTTTTTT
TTT*CAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTG
CGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTGGACGTCGTCGAGACTCAAGAGAGCTACAAGGA
AGCCATTGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCCCTAG
CTGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAGAAATAAGGCTCCTAAAATACA
CATTTAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAAT
AAAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGT
AATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCC

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2EV93JQ 464 0 0
GGACAAAGCGAAACAACAAAAAACACACACACAAGAAAAGAACTCGAAAACGCTTTTTTT
TTTCAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTGC
GTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTGGACGTCGTCGAGACTCAAGAGAGCTACAAGGAA
GCCATTGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTAGC
TGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAGAAATAAGGCTCCTAAAATACAC
ATTTAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATA
AAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGTA
ATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2EV93TF 464 0 0
GGACAAAGCGAAACAACAAAAAACACACACACAAGAAAAGAACTCGAAAACGCTTTTTTT
TTTCAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTGC
GTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTGGACGTCGTCGAGACTCAAGAGAGCTACAAGGAA
GCCATTGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTAGC
TGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAGAAATAAGGCTCCTAAAATACAC
ATTTAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATA
AAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGTA
ATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2EI14JQ 464 0 0
GGACAAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACAAGAAAAGAACTCGAAAACGCTTTTTTT
TT*CAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTGC
GTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTGGACGTCGTCGAGACTCAAGAGAGCTACAAGGAA
GCCATTGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTAGC
TGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAGAAATAAGGCTCCTAAAATACAC
ATTTAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATA
AAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGTA
ATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2AW46TFB 461 0 0
A
GACAAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACAAGAAAAGAACTCGAAAACGCTTTTTTTT
T*CAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCCGACAAGACCCAGTGCG
TGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTGGACGTCGTCGAGACTCAAGAGAGCTACAAGGAAG
CCATTGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGACTCTAGCT
GCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAGAAATAAGGCTCCTAAAATACACA
TTTAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATAA
AAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGTAA
TGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATC

QA 2 461 2 461
DS 

RD RR2EX69JQ 464 0 0
GGACAAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACAAGAAAAGAACTCGAAAACGCTTTTTTT
TT*CAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTGC
GTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTGGACATCGTCGAGACTCAAGAGAGCTACAAGGAA
GCCATTGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTAGC
TGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAGAAATAAGGCTCCTAAAATACAC
ATTTAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATA
AAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGTA
ATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2EX69TF 464 0 0
GGACAAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACAAGAAAAGAACTCGAAAACGCTTTTTTT
TT*CAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTGC
GTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTGGACATCGTCGAGACTCAAGAGAGCTACAAGGAA
GCCATTGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTAGC
TGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAGAAATAAGGCTCCTAAAATACAC
ATTTAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATA
AAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGTA
ATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2FM40JQ 464 0 0
GGACAAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACAAGAAAAGAACTCGAAAACCCTTTTTTT
TT*CAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTGC
GTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTGGACGTCGTCGAGACTCAAGAGAGCTACAAGGAA
GCCATTGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTAGC
TGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAGAAATAAGGCTCCTAAAATACAC
ATTTAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATA
AAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGTA
ATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2FM40TF 464 0 0
GGACAAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACAAGAAAAGAACTCGAAAACCCTTTTTTT
TT*CAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTGC
GTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTGGACGTCGTCGAGACTCAAGAGAGCTACAAGGAA
GCCATTGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTAGC
TGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAGAAATAAGGCTCCTAAAATACAC
ATTTAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATA
AAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGTA
ATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2EI14TF 464 0 0
GGACAAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACAAGAAAAGAACTCGAAAACGCTTTTTTT
TT*CAAGATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTGC
GTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTGGACGTCGTCGAGACTCAAGAGAGCTACAAGGAA
GCCATTGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTAGC
TGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAGAAATAAGGCTCCTAAAATACAC
ATTTAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATA
AAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGTA
ATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2CV67TF 461 0 0
AGCAAAACAACAAAAAACACACACACAAGAAAAGAACTCGAAAACGCTTTTTTTT**CAA
GATCAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTGCGTGAAG
AAGGGAACCAGCCACACCTTGGACGTCGTCGAGACTCAAGAGAGCTACAAGGAAGCCATT
GTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTAGCTGCAGC
TGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAGAAATAAGGCTCCTAAAATACACATTTAA
AAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATAAAAGTT
GATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGTAATGGTT
CTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCCATG

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR2CA21TF 153 0 0
GACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGCAATATGAATAAAAGTTGATGT
GAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGTGATGGTTCTATG
TCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCC

QA 1 153 1 153
DS 



CO CL74Contig2 476 9 5 U
GGACAAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACGCAAGAAAAGAACTCGAAAACCGTTCAA
GTTTTTTTTT*CAAGAACAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGA
CCCAGTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAGACTCAGGAGAGCT
ACAAGGAAGCCATGGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTG
GCTCTAGCTGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAAAAATAAGGCTCCTA
AAATACACATTTAAAAGGGGCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATA
TGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGT
GTGATGTAATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCCATAT


BQ
30 30 30 30 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 15 15 10 10 

AF RR2DO95TF U 1
AF RR2DO95JQ C 1
AF RR2DT60JQ C 30
AF RR2DT60TF U 3
AF RR2FH76JQ C 1
AF RR2FH76TF U 1
AF RR2EM77TF U 2
AF RR2D189TF U 8
AF RR2D189JQ C 261
BS 1 360 RR2DO95TF
BS 361 471 RR2DT60TF
BS 472 472 RR2FH76TF
BS 473 474 RR2EM77TF
BS 475 476 RR2D189TF

RD RR2DO95TF 360 0 0
GGACAAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACGCAAGAAAAGAACTCGAAAACCGTTCAA
GTTTTTTTTT*CAAGAACAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGA
CCCAGTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAGACTCAGGAGAGCT
ACAAGGAAGCCATGGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTG
GCTCTAGCTGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAAAAATAAGGCTCCTA
AAATACACATTTAAAAGGGGCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATA

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR2DO95JQ 472 0 0
GGACAAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACGCAAGAAAAGAACTCGAAAACCGTTCAA
GTTTTTTTTT*CAAGAACAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGA
CCCAGTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAGACTCAGGAGAGCT
ACAAGGAAGCCATGGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTG
GCTCTAGCTGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAAAAATAAGGCTCCTA
AAATACACATTTAAAAGGGGCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATA
TGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGT
GTGATGTAATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2DT60JQ 443 0 0
CACGCAAGAAAAGAACTCGAAAACCGTTCAAGTTTTTTTTTTCAAGAACAAATCATGTCT
TCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTAC
ACCTTCGACATCGTCGAGACTCAGGAGAGCTACAAGGAAGCCATGGTCATGGACGTTGGT
GCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTAGCTGCAGCTGCGTCAACTGCACT
TGCTGCCCCAACTAAAAAAATAAGGCTCCTAAAATACACATTTAAAAGGGGCATGTCTCT
CTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATAT
CTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGTAATGGTTCTATGTCCCCTTATC
CTCTAATACATCATATTATCTCC

QA 1 443 1 443
DS 

RD RR2DT60TF 469 0 0
GG
AAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACGCAAGAAAAGAACTCGAAAACCGTTCAAGTTT
TTTTTTTCAAGAACAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCA
GTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAGACTCAGGAGAGCTACAA
GGAAGCCATGGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTC
TAGCTGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAAAAATAAGGCTCCTAAAAT
ACACATTTAAAAGGGGCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAA
TAAAAGTTGATGTGAGCTCATATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGA
TGTAATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTC

QA 3 469 3 469
DS 

RD RR2FH76JQ 472 0 0
GGACAAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACGCAAGAAAAGAACTCGAAAACCGTTCAA
GTTTTTTTTT*CAAGAACAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGA
CCCAGTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAGACTCAGGAGAGCT
ACAAGGAAGCCATGGTCACGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTG
GCTCTAGCTGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAAAAATAAGGCTCCTA
AAATACACATTTAAAAGGGGCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATA
TGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGT
GTGATGTAATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2FH76TF 472 0 0
GGACAAAGCAAAACAACAAAAAACACACACACGCAAGAAAAGAACTCGAAAACCGTTCAA
GTTTTTTTTT*CAAGAACAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGA
CCCAGTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAGACTCAGGAGAGCT
ACAAGGAAGCCATGGTCACGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTG
GCTCTAGCTGCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAAAAATAAGGCTCCTA
AAATACACATTTAAAAGGGGCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATA
TGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGT
GTGATGTAATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2EM77TF 473 0 0
GGA
AAAGCAAAACAACAAAGAACACACACACGCAAGAAAAGAACTCGAAAACCGTTCAAGTTT
TTTTTT*CAAGAACAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCA
GTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAGACTCAGGAGAGCTACAA
GGAAGCCATGGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTC
TAGCTGCAGCTGCGTCAACTGTACTTGCTGCCCCAACTAAAAAAATAAGGCTCCTAAAAT
ACGCATTTAAAAGGGGCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAA
TAAAAGTTGATGTGAGCTCATATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGA
TGTAATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCCAT

QA 4 473 4 473
DS 

RD RR2D189TF 469 0 0
GG
AAAACAACAAAAAACACACACACGCAAGAAAAGAACTCGAAAACCGTTCAAGTTTTTTTT
TTCAAGAACAAATCATGTCTTCGTGCGGAAACTGCGACTGTGCTGACAAGACCCAGTGCG
TGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATC*TCGAGACTCAGGAGAGCTACAAGGAAG
CCATGGTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGGTGCCAATGCAAGTGTGGCTCTAGCT
GCAGCTGCGTCAACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAAAAATAAGGCTCCTAAAATACACA
TTTAAAAGGGGCATGTCTTTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGAATAAAA
GTTTATGTGAGCTCATATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGTAA
TGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATATTATCTCCATAT

QA 3 469 3 469
DS 

RD RR2D189JQ 173 0 0
AACTGCACTTGCTGCCCCAACTAAAAAAATAAGGCTCCTAAAATACACATTTAAAAGGGG
CATGTCTTTCTTTTTTCCTCCTTTTAAATAAAATGTAATATGAATAAAAGTTTATGTGAG
CTCATATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTGTGATGTAATGGT

QA 1 173 1 173
DS 



AS 3 22

CO CL75Contig1 636 9 5 U
GGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAAAGTCTCCTTATCTTCTTA
TCACAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCCTCGGCTCTGAAGTTCTTCACATGCCTTGTTT
TGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACAGTGGGGAGTA
GCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGTGGGGCGGTGCCAGCTCCATGCTGCT
CCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCGAAAACCACACCTGACCGCCAACAAGCATGTA
AATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTTCCTGGAA
AGTGCGGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACACCGTCAAGT
GAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAATAAAAGC
GGGTCTATCTACGCTGACCTCAGCATGTCCTAGTTTGTCTTGTTTTTATTTTGTAGTTGA
AAAGTTTGTCATGTTACTTTGTAATACTTTGCTTTATATTGTGTCTTAATTATGTTTGAG
ATATGATAATATTATCTTATTAATCATCTTTTCTCT


BQ
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 35 35 35 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA48TF U 3
AF RR2BA39JQ C 1
AF RR2BA39TF U 1
AF RR2BD41JQ C 1
AF RR2GA48JQ C 243
AF RR2BD41TF U 1
AF RR2BU49TF U 1
AF RR2D830JQ C 1
AF RR2D830TF U 1
BS 1 107 RR2BA39TF
BS 108 108 RR2BD41TF
BS 109 619 RR2BA39TF
BS 620 630 RR2BD41TF
BS 631 636 RR2BD41JQ

RD RR2GA48TF 188 0 0
GG
ATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAAAGTCTCCTTATCTTCTTATCAC
AAAAAAAAAGCAAAAGACAATGGCCTCGGCTCTGAAGTTCTTCACATGCCTTGTTTTGAC
GGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACAGTGGGGAGTAGCTT
GGCTCC

QA 3 188 3 188
DS 

RD RR2BA39JQ 621 0 0
GGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAAAGTCTCCTTATCTTCTTA
TCACAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCCTCGGCTCTGAAGTTCTTCGCATGCCTTGTTT
TGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACAGTGGGGAGTA
GCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGTGGGGCGGTGCCAGCTCCATGCTGCT
CCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCGAAAACCACACCTGACCGCCAACAAGCATGTA
AATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTTCCTGGAA
AGTGCGGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACACCGTCAAGT
GAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAATAAAAGC
GGGTCTATCTACGCTGACCTCAGCATGTCCTAGTTTGTCTTGTTTTTATTTTGTAGTTGA
AAAGTTTGTCATGTTACTTTGTAATACTTTGCTTTATATTGTGTCTTAATTATGTTTGAG
ATATGATAATATTATCTTA
CT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2BA39TF 621 0 0
GGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAAAGTCTCCTTATCTTCTTA
TCACAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCCTCGGCTCTGAAGTTCTTCGCATGCCTTGTTT
TGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACAGTGGGGAGTA
GCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGTGGGGCGGTGCCAGCTCCATGCTGCT
CCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCGAAAACCACACCTGACCGCCAACAAGCATGTA
AATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTTCCTGGAA
AGTGCGGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACACCGTCAAGT
GAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAATAAAAGC
GGGTCTATCTACGCTGACCTCAGCATGTCCTAGTTTGTCTTGTTTTTATTTTGTAGTTGA
AAAGTTTGTCATGTTACTTTGTAATACTTTGCTTTATATTGTGTCTTAATTATGTTTGAG
ATATGATAATATTATCTTA
CT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2BD41JQ 636 0 0
GGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAAAGTCTCCTTATCTTCTTA
TCACAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCCTCGGCTTTGAAGTTCTTCACATGCCTTGTTT
TGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATTTCATGTGGCACAGTGGGGAGTA
GCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGTGGGGCGGTGCCAGCTCCATGCTGCT
CCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCGAAAACCACACCTGACCGCCAACAAGCATGTA
AATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTTCCTGGAA
AGTGCGGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGGGACACCGTCAAGT
GAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAATAAAAGC
GGGTCTATCTACGCTGACCTCAGCATGTCCTAGTTTGTCTTGTTTTTATTTTGTAGTTGA
AAAGTTTGTCATGTTACTTTGTAATACTTTGCTTTATATTGTGTCTTAATTATGTTTGAG
ATATGATAATATTATCTTATTAATCATCTTTTCTCT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2GA48JQ 383 0 0
GGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCGAAAACCACACCTGACCGCCAACAAGCATGTAA*
TGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTTTAGCCTCTAGCCTTCCTGGAAAG
TGCGGTGTTAGCATTCCCTATCCCATTTCCATGAACACTAACTGGGACACCGTCAAGTGA
AGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTTTAGCATAAATAAAAGCGG
GTCTATTTACGCTGACCTTAGCATGTCCTAGTTTGTCTTGTTTTTATTTTGTAGTTGAAA
AGTTTGTCATGTTACTTTGTAATACTTTGCTTTATATTGTGTCTTAATTATGTTTGAGAT
ATGATAATATTATCTTATTAATC

QA 1 383 1 383
DS 

RD RR2BD41TF 635 0 0
GGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAAAGTCTCCTTATCTTCTTA
TCACAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCCTCGGCTCTGAAGTTCTTCACATGCCTTGTTT
TGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACAGTGGGGAGTA
GCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGTGGGGCGGTGCCAGCTCCATGCTGCT
CCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCGAAAACCACACCTGACCGCCAACAAGCATGTA
AATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTTCCTGGAA
AGTGCGGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACACCGTCAAGT
GAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAATAAAAGC
GGGTCTATCTACGCTGACCTCAGCATGTCCTAGTTTGTCTTGTTTTTATTTTGTAGTTGA
AAAGTTTGTCATGTTACTTTGTAATACTTTGCTTTATATTGTGTCTTAATTATGTTTGAG
ATATGATAATATTATCTTATTAATCATCTT
TTCTC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2BU49TF 622 0 0
GGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAAAGTCTCCTTATCTTCTTA
TCACAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCCTCGGCTCTGAAGTTCTTCACATGCCTTGTTT
TGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCGGCAATCTCATGTGGCACAGTGGGGAGTA
GCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGTGGGGCGGTGCCAGCTCCATGCTGCT
CCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCGAAAACCACACCTGACCGCCAACAAGCATGTA
AATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTTCCTGGAA
AGTGCGGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACACCGTCAAGT
GAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAATAAAAGC
GGGTCTATCTACGCTGACCTCAGCATGTCCTAGTTTGTCTTGTTTTTATTTTGTAGTTGA
AAAGTTTGTCATGTTACTTTGTAATACTTTGCTTTATATTGTGTCTTAATTATGTTTGAG
ATATGATAATATTATCTTATTA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2D830JQ 625 0 0
GGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAAAGTCTCCTTATCTTCTTA
TCACAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCCTCGGCTCTGAAGTTCTTCACATGCCTTGTTT
TGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACAGTGGGGAGTA
GCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGTGGGGCGGTGCCAGCTCCATGCTGCT
CCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCGAAAACCACACCTGACCGCCAACAAGCATGTA
AATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTTCCTGGAA
AGTGCGGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACACCGTCAAGT
GAAGTGGGAACTCACATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAATAAAAGC
GGGTCTATCTACGCTGACCTCAGCATGTCCTAGTTTGTCTTGTTTTTATTTTGTAGTTGA
AAAGTTTGTCATGTTACTTTGTAATACTTTGCTTTATATTGTGTCTTAATTATGTTTGAG
ATATGATAATATTATCTTATTAATC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2D830TF 625 0 0
GGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAAAGTCTCCTTATCTTCTTA
TCACAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCCTCGGCTCTGAAGTTCTTCACATGCCTTGTTT
TGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACAGTGGGGAGTA
GCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGTGGGGCGGTGCCAGCTCCATGCTGCT
CCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCGAAAACCACACCTGACCGCCAACAAGCATGTA
AATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTTCCTGGAA
AGTGCGGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACACCGTCAAGT
GAAGTGGGAACTCACATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAATAAAAGC
GGGTCTATCTACGCTGACCTCAGCATGTCCTAGTTTGTCTTGTTTTTATTTTGTAGTTGA
AAAGTTTGTCATGTTACTTTGTAATACTTTGCTTTATATTGTGTCTTAATTATGTTTGAG
ATATGATAATATTATCTTATTAATC

QA 1 625 1 625
DS 



CO CL75Contig2 695 7 6 U
GGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAACTAAAGTCTCCTTCTTAT
CTTCTTCTCACAAAAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACA
TGCCTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACA
GTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCT
CCATGCTGTGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGCCAA
CAAGCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGC
CTTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGAC
ACCGTCAAGTGAAGTGGGAACTTGAAAGCCCAAGTTACAAAAAAAAAAAAAA*GTGAAGT
GGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAATAAAAGAGGGTC
TATCTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTATTTGGTCGTTGAAAAGT
TTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTATTGTGTCTTAGTTATGTTTAAGATATG
ATAATATTATCTTATTAATCATCTTCTCTTTATGT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C518JQ C 170
AF RR2DP53TF U 1
AF RR2BZ74TF U 1
AF RR2C518TF U 1
AF RR2GS92TF U 1
AF RR2GS92JQB C 110
AF RR2GP49JQ C 101
BS 1 458 RR2BZ74TF
BS 459 472 RR2C518TF
BS 473 473 RR2GS92TF
BS 474 676 RR2C518TF
BS 677 678 RR2GS92TF
BS 679 695 RR2GP49JQ

RD RR2C518JQ 110 0 0
CATGTGGCACAGTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGGGGGG
GGGTGCCAGCTCCATGCTGTGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCT

QA 1 110 1 110
DS 

RD RR2DP53TF 365 0 0
GGACATCCAACA*CAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAACTAAAGTCCCCTTCTTAT
CTTCTTCTCACAAAAAAAAAAAAGCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACA
TGCCTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACA
GTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCT
CCATGCTGTGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGCCAA
CAAGCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTA
CCTTCCT

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR2BZ74TF 458 0 0
GGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAACTAAAGTCTCCTTCTTAT
CTTCTTCTCACAAAAAAAAAAA*GCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACA
TGCCTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACA
GTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCT
CCATGCTGTGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGCCAA
CAAGCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGC
CTTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGAC
ACCGTCAAGTGAAGTGGGAACTTGAAAGCCCAAGTTAC

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2C518TF 676 0 0
GGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAACTAAAGTCTCCTTCTTAT
CTTCTTCTCACAAAAAAAAAA**GCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACA
TGCCTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGTAGCAATCTCATGTGGCACA
GTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCT
CCATGCTGTGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGCCAA
CAAGCATGTAAATGCCTAAAGGTCGCAGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGC
CTTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGAC
ACCGTCAAGTGAAGTGGGAACTTGAAAGCCCAAGTTACAAAAAAAAAAAAAAAGTGAAGT
GGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAATAAAAGAGGGTC
TATCTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTATTTGGTCGTTGAAAAGT
TTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTATTGTGTCTTAGTTATGTTTAAGATATG
ATAATATTATCTTATT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2GS92TF 689 0 0
GGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAACTAAAGTCTCCTTCTTAT
CTTCTTCTCACAAAAAAAAAA**GCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACA
TGCCTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACA
GTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCT
CCATGCTGTGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGCCAA
CAAGCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGC
CTTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACGCTAACTGCGAC
ACCGTCAAGTGAAGTGGGAACTTGAAAGCCCAAGTTACAAAAAAAAAAAAAA*GTGAAGT
GGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAATAAAAGAGGGTT
TATCTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTATTTGGTCGTTGAAAAGT
TTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTATTGTGTCTTAGTTATGTTTAAGATATG
ATAATATTATCTTATTAA
GCAAAAAAAAA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2GS92JQB 571 0 0
AGTTCTTCACATGCCTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCT
CATGTGGCACAGTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGG
CGGTGCCAGCTCCATGCTGTGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACAC
CGGACCGCCAACAAGCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTT
TAGCCTCTAGCCTTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACG
CTAACTGCGACACCGTCAAGTGAAGTGGGAACTTGAAAGCCCAAGTTACAAAAAAAAAAA
AAA*GTGAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAAT
AAAAGAGGGTTTATTTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTATTTGGT
CGTTGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTATTGTGTCTTAGTTATG
TTTAAGATATGATAATATTATCTTATT
AAGC

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2GP49JQ 595 0 0
CGGCTCTGAAGTTCTTCACATGCCTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATG
CAGCAATCTCATGTGGCACAGTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGA
ACGGCGGGGCGGTGCCAGCTCCATGCTGTGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTA
AAACCACACCGGACCGCCAACAAGCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCA
ATCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCT
CCATGAACACTAACTGCGACACCGTCAAGTGAAGTGGGAACTTGAAAGCCCAAGTTACAA
AAAAAAAAAAA**GTGAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCT
AGCATAAATAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTT
TTATTTGGTCGTTGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTATTGTGTC
TTAGTTATGTTTAAGATATGATAATATTGTCTTATTAATCATCTTCTCTTTATGT

QA 1 595 1 595
DS 



CO CL75Contig3 650 6 6 U
GGGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAACTAAAGTCTCCTTCTTA
TCTTCTTCTCACAAAAAAAAA*GAAGCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCA
CATGCCTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCGGCAATCTCATGTGGCA
CAGTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAG
CTCCATGCTGCGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGCC
AACAAGCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTA
GCCTTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCG
ACACTGTCAAGTGAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGC
ATAAATAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCACCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTA
TTTTGTCGATGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTACTGTGTCTTA
GTTATGTTTAAGATATGATAATATTATCTTATTAATCATCTTCTCTTTAT


BQ
10 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA87TF U 1
AF RR2GB56TF U 1
AF RR2DA87JQ C 50
AF RR2GB56JQ C 64
AF RR2BB88JQ C 4
AF RR2BB88TF U 4
BS 1 81 RR2DA87TF
BS 82 82 RR2GB56TF
BS 83 620 RR2DA87TF
BS 621 637 RR2GB56TF
BS 638 642 RR2BB88TF
BS 643 650 RR2BB88JQ

RD RR2DA87TF 620 0 0
GGGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAACTAAAGTCTCCTTCTTA
TCTTCTTCTCACAAAAAAAAAAGAAGCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCA
CATGCCTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCGGCAATCTCATGTGGCA
CAGTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAG
CTCCATGCTGCGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGCC
AACAAGCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTA
GCCTTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCG
ACACTGTCAAGTGAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGC
ATAAATAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCACCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTA
TTTTGTCGATGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTACTGTGTCTTA
GTTATGTTTAAGATATGATA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2GB56TF 641 0 0
G
GGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAACTAAAGTCTCCTTCTTAT
CTTCTTCTCACAAAAAAAAA*GAAGCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCAC
ATGCCTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCGGCAATCTCATGTGGCAC
AGTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGC
TCCATGCTGCGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGCCA
ACAAGCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAG
CCTTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGA
CACTGTCAAGTGAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCA
TAAATAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCACC*TGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTAT
TTTGTCGATGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTACTGTGTCTTAG
TTATGTTTAAGATATGATAATATTATCTTATTAATC
CAAA

QA 2 637 2 637
DS 

RD RR2DA87JQ 571 0 0
TCTCCTTCTTATCTTCTTCTCACAAAAAAAAAAGAAGCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCT
GAAGTTCTTCACATGCCTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCGGCAAT
CTCATGTGGCACAGTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGG
GGCGGTGCCAGCTCCATGCTGCGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCAC
ACCGGACCGCCAACAAGCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAG
TCTAGCCTCTAGCCTTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAA
CACTAACTGCGACACTGTCAAGTGAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAG
TATGGTCTAGCATAAATAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCACCGTGTCCTAGTTTG
TCTGGTTTTTATTTTGTCGATGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTT
ACTGTGTCTTAGTTATGTTTAAGATATGATA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2GB56JQ 575 0 0
TCTTCTCACAAAAAAAAA*GAAGCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACAT
GCCTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCGGCAATCTCATGTGGCACAG
TGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCTC
CATGCTGCGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGCCAAC
AAGCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCC
TTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACA
CTGTCAAGTGAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATA
AATAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCACC*TGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTATTT
TGTCGATGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTACTGTGTCTTAGTT
ATGTTTAAGATATGATAATATTATCTTATTAATC
C

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2BB88JQ 647 0 0
GG
ATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAACTAAAGTCTCCTTCTTATCTTC
TCCTCACAAAAAAAAA*GAAGCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACATGC
CTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCGGCAATCTCATGTGGCACAGTG
GGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCTCCA
TGCTGCGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGCCAACAA
GCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTT
CCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACACT
GTCAAGTGAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAA
TAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCACCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTATTTTG
TCGATGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTACTGTGTCTTAGTTAT
GTTTAAGATATGATAATATTATCTTATTAATCATCTTCTCTTTAT

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR2BB88TF 647 0 0
GG
ATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAACTAAAGTCTCCTTCTTATCTTC
TCCTCACAAAAAAAAA*GAAGCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACATGC
CTTGTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCGGCAATCTCATGTGGCACAGTG
GGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCTCCA
TGCTGCGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGCCAACAA
GCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTT
CCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACACT
GTCAAGTGAAGTGGGAACTCATATATCATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAA
TAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCACCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTATTTTG
TCGATGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTACTGTGTCTTAGTTAT
GTTTAAGATATGATAATATTATCTTATTAATCATCTT
CTCTTTAT

QA 3 639 3 639
DS 



AS 2 21

CO CL76Contig1 857 10 17 U
GGAACGTAGCTAGTGAAAGGAGAGCCTCCCAGAAAAAAAAA*GTATAACAATGGCTTCGC
TCTCAATAGGAATCGCCTTCGCGAACACCGTCCGTAAAGTCCCGAGAATTAATACACGAA
GGAACAAAATCTCCTGCGAATGGGATCCCAAAGGTATATTAGGACCAGCACAAACTGGCC
ATATCGCTCGTCTTGAGTTCAAACGCAGGATAGAGAGAGACTCCGAGGCTAAAGAAGCTT
TTCAGAAACAACTCCGTGAAGAGAGAGAGCGTCGTCAAGCTCTTAGAGAGTCTAGAGTTG
TACCAGATACTTCCGCTGAGCTGATTGAGTTCTTTCTTGACACGGAAGCTCAGGAGATTG
AATTCGAAATCGCTAGGCTTCGTGGAAGGTTAAACGACGAATTTTTTGCGCAAATTCGAC
TTGAAATCGGGCAAATCCGGTTTGCTGTTACAAAAACCGCGGAAGATGAAGACAGATTGA
TTGAGCTTGAATCACTTCAGAAAGCCTTAGAAGAAGGAATTGAGGCTTATGACAAAATGC
AAAAGGAGCTTATGACGGCTACAAATAGCTTAACCAAGATCTTAACCTCAACCGATATCA
AAGCAACATTGTTGGATATGGTGGAGAAAAACGAGATCAACAGATCTCTGTTGACTCTTC
TTGATGAAAACATAGCTAATGCATACAGAGGGAACCAGAAAGAAGCA*GAGATTACATGG
AGAAGGTACGTGCTTCGGTTCTAAAGTACTTGACGGTTTAGAATCATATGAGGGATTGAG
TCTACAAAGATTTCTCATCTTTGGAATGTTTACTATGTTCAGTAAATGTATTTATATTTA
TTTGTGAGTAAATGTAT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 45 10 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 
55 55 0 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 20 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 5 20 20 20 
20 20 5 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV19TF U 19
AF RR2A646TF U 1
AF RR2B956TF U 1
AF RR2B726TF U 19
AF RR2FV59TF U 19
AF RR2FS74TF U 20
AF RR2E296TF U 19
AF RR2AJ46TF U 13
AF RR2ER64TF U 20
AF RR2AC81TF U 14
BS 1 19 RR2A646TF
BS 20 20 RR2B726TF
BS 21 123 RR2A646TF
BS 124 124 RR2AJ46TF
BS 125 158 RR2A646TF
BS 159 159 RR2AJ46TF
BS 160 175 RR2A646TF
BS 176 176 RR2AJ46TF
BS 177 227 RR2A646TF
BS 228 228 RR2B956TF
BS 229 241 RR2A646TF
BS 242 242 RR2AJ46TF
BS 243 524 RR2A646TF
BS 525 525 RR2B956TF
BS 526 704 RR2A646TF
BS 705 769 RR2AJ46TF
BS 770 857 RR2AC81TF

RD RR2GV19TF 523 0 0
GGAGAGCCTCCCAGAAAAAAAAA*GTATAACAATGGCTTCGCTCTCAATAGGAATCGCCT
TCGCGAACACCGTCCGTAAAGTCCCGAGAATTAATACACGAAGGAACAAAGTCTCCTGCG
AATGGGATCCGAAAGGTATATTAGGACCAGCACAAACTGGCCATATCGCTCGTCTTGAGT
TCAAACGCAGGATAGAGAGAGACTCCGAGGCTAAAGAAGCTTTTCAGAAACAACTCCGTG
AAGAGAGAGAGCGTCGTCAAGCTCTTAGAGAGTCTAGAGTTGTACCAGATACTTCCGCTG
AGCTGATTGAGTTCTTTCTTGACACGGAAGCTCAGGAGATTGAATTTGAAATCGCTAGGC
TTCGTGGAAGGTTAAACGACGAATTTTTTGCGCAAATTCGACTTGAAATCGGCCAAATCC
GGTTTGCTGTTACAAAAACCGCGGAAGATGAAGACAGATTGATTGAGCTTGAATCACTTC
AGAAAGCCTTAGAAGAAGGAATTGAGGCTTATGACAAAATGCA

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2A646TF 704 0 0
GGAACGTAGCTAGTGAAAGCAGAGCCTCCCAGAAAAAAAAA*GTATAACAATGGCTTCGC
TCTCAATAGGAATCGCCTTCGCGAACACCGTCCGTAAAGTCCCGAGAATTAATACACGAA
GGAGCAAAATCTCCTGCGAATGGGATCCCAAAGGTATACTAGGACCAGCACAAACCGGCC
ATATCGCTCGTCTTGAGTTCAAACGCAGGATAGAGAGAGACTCCGAGACTAAAGAAGCTT
TCCAGAAACAACTCCGTGAAGAGAGAGAGCGTCGTCAAGCTCTTAGAGAGTCTAGAGTTG
TACCAGATACTTCCGCTGAGCTGATTGAGTTCTTTCTTGACACGGAAGCTCAGGAGATTG
AATTCGAAATCGCTAGGCTTCGTGGAAGGTTAAACGACGAATTTTTTGCGCAAATTCGAC
TTGAAATCGGGCAAATCCGGTTTGCTGTTACAAAAACCGCGGAAGATGAAGACAGATTGA
TTGAGCTTGAATCACTTCAGAAAGCCTTAGAAGAAGGAATTGAGACTTATGACAAAATGC
AAAAGGAGCTTATGACGGCTACAAATAGCTTAACCAAGATCTTAACCTCAACCGATATCA
AAGCAACATTGTTGGATATGGTGGAGAAAAACGAGATCAACAGATCTCTGTTGACTCTTC
TTGATGAAAACATAGCTAATGCATACAGAGGGAACCAGAAAGAA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2B956TF 704 0 0
GG
AACGTAGCTAGTGAAAGCAGAGCCTCCCAGAAAAAAAAAAGTATAACAATGGCTTCGCTC
TCAATAGGAATCGCCTTCGCGAACACCGTCCGTAAAGTCCCGAGAATTAATACACGAAGG
AGCAAAATCTCCTGCGAATGGGATCCCAAAGGTATACTAGGACCAGCACAAACCGGCCAT
ATCGCTCGTCTTGAGTTCAAACGCAGGATAGAGAGAGACCCCGAGGCTAAAGAAGCTTTC
CAGAAACAACTCCGTGAAGAGAGAGAGCGTCGTCAAGCTCTTAGAGAGTCTAGAGTTGTA
CCAGATACTTCCGCTGAGCTGATTGAGTTCTTTCTTGACACGGAAGCTCAGGAGATTGAA
TTCGAAATCGCTAGGCTTCGTGGAAGGTTAAACGACGAATTTTTTGCGCAAATTCGACTT
GAAATCGGGCAAATCCGGTTTGCTGTTACAAAAACCGCGGAAGATTAAGACAGATTGATT
GAGCTTGAATCACTTCAGAAAGCCTTAGAAGAAGGAATTGAGGCTTATGACAAAATGCAA
AAGGAGCTTATGACGGCTACAAATAGCTTAACCAAGATCTTAACCTCAACCGATATCAAA
GCAACATTGTTGGAT**GGTGGAGAAAAACGAGATCAACAGATCTCTGTTGACTCTTCTT
GATGAAAACATAGCTAATGCATACAGAGGGAACCAGAAAGAA

QA 3 704 3 704
DS 

RD RR2B726TF 688 0 0
GGAGAGCCTCCCAGAAAAAAAAA*GTATAACAATGGCTTCGCTCTCAATAGGAATCGCCT
TCGCGAACACCGTCCGTAAAGTCCCGAGAATTAATACACGAAGGAGCAAAATCTCCTGCG
AATGGGATCCCAAAGGTATACTAGGACCAGCACAAACCGGCCATATCGCTCGTCTTGAGT
TCAAACGCAGGATAGAGAGAGACTCCGAGGCTAAAGAAGCTTTCCAGAAACAACTCCGTG
AAGAGAGAGAGCGTCGTCAAGCTCTTAGAGAGTCTAGAGTTGTACCAGATACTTCCGCTG
AGCTGATTGAGTTCTTTCTTGACACGGAAGCTCAGGAGATTGAATTCGAAATCGCTAGGC
TTCGTGGAAGGTTAAACGACGAATTTTTTGCGCAAATTCGACTTGAAATCGGGCAAATCC
GGTTTGCTGTTACAAAAACCGCGGAAGATGAAGACAGATTGATTGAGCTTGAATCACTTC
AGAAAGCCTTAGAAGAAGGAATTGAGGCTTATGCCAAAATGCAAAAGGAGCTTATGACGG
CTACAAATAGCTTAACCAAGATCTTAACCTCAACCGATATCAAAGCAACATTGTTGGATA
TGGTGGAGAAAAACGAGATCAACAGATCTCTGTTGACTCTTCTTGATGAAAACATAGCTA
ATGCATACAGAGGGAACCAGAAAGAAGC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2FV59TF 703 0 0
GGAGAGCCTCCCAGAAAAAAAAA*GTATAACAATGGCTTCGCTCTCAATAGGAATCGCCT
TCGCGAACACCGTCCGTAAAGTCCCGAGAATTAATACACGAAGGAGCAAAATCTCCTGCG
AATGGGATCCCAAAGGTATATTAGGACCAGCACAAACTGGCCATATCGCTCGTCTTGAGT
TCAAACGCAGGATAGAGAGAGACTCCGAGGCTAAAGAAGCTTTTCAGAAACAACTCCGTG
AAGAGAGAGAGCGTCGTCAAGCTCTTAGAGAGTCTAGAGTTGTACCAGATACTTCCGCTG
AGCTGATTGAGTTCTTTCTTGACACTGAAGCTCAGGAGATTGAATTCGAAATCGCTAGGC
TTCGTGGAAGGTTAAACGACGAGTTTTTTGCGCAAATTCGACTTGAAATCGGGCAAATCC
GGTTTGCTGTTACAAAAACCGCGGAAGATGAAGACAGATTGATTGAGCTTGAATCACTTC
AGAAAGCCTTAGAAGAAGGAACTGAGGCTTATGACAAAATGCAAAAGGAGCTTATGACGG
CTACAAATAGCTTAACCAAGATCTTAACCTCAACCGATATCAAAGCAACATTGTTGGATA
TGGTGGAGAAAAACGAGATCAACAGATCTCTGTTGACTCTTCTTGATGAAAACATAGCTA
ATGCATACAGAGGGAACCAGAAAGAAGCA*GAGATTACAT
TGA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2FS74TF 685 0 0
GAGAGCCTCCCAGAAAAAAAAA*GTATAACAATGGCTTCGCTCTCAATAGGAATCGCCTT
CGCGAACACCGTCCGTAAAGTCCCGAGAATTAATACACGAAGGAGCAAAATCTCCTGCGA
ATGGGATCCCAAAGGTATATTAGGACCAGCACAAACTGGCCATATCGCTCGTCTTGAGTT
CAAACGCAGGATAGAGAGAGACTCCGAGGCTAAAGAAGCTTTTCAGAAACAACTCCGTGA
AGAGAGAGAGCGTCGTCAAGCTCTTAGAGAGTCTAGAGTTGTACCAGATACTTCCGCTGA
GCTGATTGAGTTCTTTCTTGACACTGAAGCTCAGGAGATTGAATTCGAAATCGCTAGGCT
TCGTGGAAGGTTAAACGACGAGTTTTTTGCGCAAATTCGACTTGAAATCGGGCAAATCCG
GTTTGCTGTTACAAAAACCGCGGAAGATGAAGACAGATTGATTGAGCTTGAATCACTTCA
GAAAGCCTTAGAAGAAGGAACTGAGGCTAATGACAAAATGCAAAAGGAGCTTATGACGGC
TACAAATAGCTTAACCAAGATCTTAACCTCAACCGATATCAAAGCAACATTGTTGGATAT
GGTGGAGAAAAACGAGATCAACAGATCTCTGTTGACTCTTCTTGATGAAAACATAGCTAA
TGCATACAGAGGGAACCAGAAAGAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2E296TF 700 0 0
GGAGAGCCTCCCAGAAAAAAAAA*GTATAACAATGGCTTCGCTCTCAATAGGAATCGCCT
TCGCGAACACCGTCCGTAAAGTCCCGAGAATTAATACACGAAGGAACAAAATCTCCTGCG
AATGGGATCCGAAAGGTATATTAGGACCAGCACAAACTGGCCATATCGCTCGTCTTGAGT
TCAAACGCAGGATAGAGAGAGACTCCGAGGCTAAAGAAGCTTTTCAGAAACAACTCCGTG
AAGAGAGAGAGCGTCGTCAAGCTCTTAGAGAGTCTAGAGTTGTACCAGATACTTCCGCTG
AGCTGATTGAGTTCTTTCTTGACACGGAAGCTCAGGAGATTGAATTCGAAATCGCTAGGC
TTCGTGGAAGGTTAAACGACGAATTTTTTGCGCAAATTCGACTTGAAATCGGGCAAATCC
GGTTTGCTGTTACAAAAACCGCGGAAGATGAAGACAGATTGATTGAGCTTGAATCACTTC
AGAAAGCCTTAGAAGAAGGAATTGAGGCTTATGACAAAATGCAAAAGGAGCTTATGACGG
CTACAAATAGCTTAACCAAGATCTTAACCTCAACCGATATCAAAGCAACATTGTTGGATA
TGGTGGAGAAAAACGAGATCAACAGATCTCTGTTGACTCTTCTTGATGAAAACATAGCTA
ATGCATACAGAGGGAACCAGAAAGAAGCA*GAGAT
ACATG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2AJ46TF 757 0 0
GG
GAAAGCAGAGCCTCCCAGAAAAAAAAAAGTATAACAATGGCTTCGCTCTCAATAGGAATC
GCCTTCGCGAACACCGTCCGTAAAGTCCCGAGAATTAATACACGAAGGAACAAAATCTCC
TGCGAATGGGATCCGAAAGGTATATTAGGACCAGCACAAACTGGCCATATCGCTCGTCTT
GAGTTCAAACGCAGGATAGAGAGAGACTCCGAGGCTAAAGAAGCTTTTCAGAAACAACTC
CGTGAAGAGAGAGAGCGTCGTCAAGCTCTTAGAGAGTCTAGAGTTGTACCAGATACTTCC
GCTGAGCTGATTGAGTTCTTTCTTGACACGGAAGCTCAGGAGATTGAATTCGAAATCGCT
AGGCTTCGTGGAAGGTTAAACGACGAATTTTTTGCGCAAATTCGACTTGAAATCGGGCAA
ATCCGGTTTGCTGTTACAAAAACCGCGGAAGATGAAGACAGATTGATTGAGCTTGAATCA
CTTCAGAAAGCCTTAGAAGAAGGAATTGAGGCTTATGACAAAATGCAAAAGGAGCTTATG
ACGGCTACAAATAGCTTAACCAAGATCTTAACCTCAACCGATATCAAAGCAACATTGTTG
GATATGGTGGAGAAAAACGAGATCAACAGATCTCTGTTGACTCTTCTTGATGAAAACATA
GCTAATGCATACAGAGGGAACCAGAAAGAAGCA*GAGATTACATGGAGAAGGTACGTGCT
TCGGTTCTAAAGTACTTGACGGTTTAGAATCATAT

QA 3 757 3 757
DS 

RD RR2ER64TF 712 0 0
GAGAGCCTCCCAGAAAAAAAAA*GTATAACAATGGCTTCGCTCTCAATAGGAATCGCCTT
CGCGAACACCGTCCGTAAAGTCCCGATAATTAATACACAAAGGAACAAAATCTCCTGCGA
ATGGGATCCGAAAGGTATATTAGGACCAGCACAAACTGGCCATATCGCTCGTCTTGAGTT
CAAACGCAGGATAGAGAGAGACTCCGAGGCTAAAGAAGCTTTTCAGAAACAACTCCGTGA
AGGGAGAGAGCGTCGTCAAGCTCTTAGAGAGTCTAGAGTTGTACCAGATACTTCCGCTGA
GCTGATTGAGTTCTTTCTTGACACGGAAGCTCAGGAGATTGAATTCGAAATCGCTAGGCT
TCGTGGAAGGTTAAACGACGAATTTTTTGCGCAAATTCGACTTGAAATCGGGCAAATCCG
GTTTGCCGTTACAAAAACCGCGGAAGATGAAGACAGATTGATTGAGCTTGAATCACTTCA
GAAAGCCTTAGAAGAAGGAATTGAGGCTTATGACAAAATGCAAAAGGAGCTTATGACGGC
TACAAATAGCTTAACCAAGATCTTAACCTCAACCGATATCAAAGCAACATTGTTGGATAT
GGTGGAGAAAAACGAGATCAACAGATCTCTGTTGACTCTTCTTGATGAAAACATAGCTAA
TGCATACAGAGGGAACCAGAAAGAAGCA*GAGAT*ACATGGAGAAG
TACGTG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2AC81TF 844 0 0
G
GAAAGCAGAGCCTCCCAGAAAAAAAAA*GTATAACAATGGCTTCGCTCTCAATAGGAATC
GCCTTCGCGAACACCGTCCGTAAAGTCCCGAGAATTAATACACGAAGGAACAAAATCTCC
TTCGAATGGGATCCGAAAGGTATATTAGGACCAGCACAAACTGGCCATATCGCTCGTCTT
GAGTTCAAACGCAGGATAGAGAGAGACTCCGAGGCTAAAGAAGCTTTTCAGAAACAACTC
CGTGAAGAGAGAGAGCGTCGTCAAGCTCTTAGAGAGTCTAGAGCTGTACCAGATACTTCC
GCTGAGCTGATTGAGTTCTTTCTTGACACGGAAGCTCAGGAGATTGAATTCGAAATCGCT
AGGCTTCGTGGAAGGTTAAACGACGAATTTTTTGCGCAAATTCGACTTGAAATCGGGCAA
ATCCGGTTTGCTGTTACAAAAACCGCGGAAGATGAAGACAGATTGATTGAGCTTGAATCA
CTTCAGAAAGCCTTAGAAGAAGGAATTGAGGCTTATGACAAAATGCAAAAGGAGCTTATG
ACGGCTACAAATAGCTTAACCAAGATCTTAACCTCAACCGATATCAAAGCAACATTGTTG
GATATGGTGGAGAAAAACGAGATCAACAGATCTCTGTTGACTCTTCTTGATGAAAACATA
GCTAATGCATACAGAGGGAATCAGAAAGAAGTATGAGATTACATAGAGAAAGTACGTGCT
TCGGTTCTAAAGTACTTGACGGTTTAGAATCATATGAGGGATTGAGTCTACAAAGATTTC
TCATCTTTGGAATGTTTACTATGTTCAGTAAATGTATTTATATTTATTTGTGAGTAAATG
TAT

QA 2 844 2 844
DS 



CO CL76Contig2 855 11 19 U
GGACGAAAAAGGGCTCAGCTTATGAAAGTCGATATTTCGAGACATGGTACATGTTAAAAT
GCGGAATTTTATATAAAATATGACCTTAAAGATATAAAACATTCGTTCAGGAAAAAGAAA
TACATTTTACTCAACAAAATAAATATAAATACATTTTACCTGAACATAGTAAACATTCCA
AAGATTGAGAAATCTTTGTAGACTCAATCCCTCATATGATTCTAAACCGTCAAGTACTTT
AGAACCGAAGCACGTACCTTCTCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCCCTCTGTAT
GCATTAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTCAACAGAGATCTGTTGATCTCGTTTTTCTCC
ACCATATCCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTAAGCTATTT
GTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAATTCCTTCTTCTAAGGCT
TTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGTTTTTGTAACAGCA
AACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAAAAATTCGTCGTTTAACCTTCCA
CGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAGAAAGAACTCAATC
AGCTCAGCGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACTCTCTAAGAGCTTGACGACGCTCTCTC
TCTTCACGGAGTTGTTTCTGAAAAGCTTCTTTAGCCTCGGAGTCTCTCTCTATCCTGCGT
TTGAACTCAAGACGAGCGATATGGCCAGTTTGTGCTGGTCCTAATATACCTTTCGGATCC
CATTCGCAGGAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV19JQB U 56
AF RR2E296JQ U 56
AF RR2FV59JQ U 71
AF RR2B956JQ U 53
AF RR2FS74JQ U 1
AF RR2AJ46JQ U 22
AF RR2A646JQ U 53
AF RR2EH52JQ U 56
AF RR2ER64JQ U 71
AF RR2AC81JQ U 53
AF RR2B726JQ U 107
BS 1 55 RR2FS74JQ
BS 56 56 RR2AJ46JQ
BS 57 195 RR2FS74JQ
BS 196 196 RR2AJ46JQ
BS 197 209 RR2FS74JQ
BS 210 210 RR2AJ46JQ
BS 211 454 RR2FS74JQ
BS 455 455 RR2FV59JQ
BS 456 462 RR2FS74JQ
BS 463 463 RR2AJ46JQ
BS 464 581 RR2FS74JQ
BS 582 582 RR2AJ46JQ
BS 583 638 RR2FS74JQ
BS 639 639 RR2AJ46JQ
BS 640 730 RR2FS74JQ
BS 731 757 RR2AJ46JQ
BS 758 806 RR2A646JQ
BS 807 844 RR2AC81JQ
BS 845 855 RR2B726JQ

RD RR2GV19JQB 366 0 0
AAAATGCGGAATTTTATATAAAATATGACCTTAAAGATATAAAACATTCGTTCAGGAAAA
AGAAATACATTTTACTCAACAAAATAAATATAAATACATTTTACCTGAACATAGTAAACA
TTCCAAAGATTGAGAAATCTTTGTAGACTCAATCCCTCATATGATTCTAAACCGTCAAGT
ACTTTAGAACCGAAGCACGTACCTTCTCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCCCTC
TGTATGCATTAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTCAACAGAGATCTGTTGATCT*GTTTT
TCTCCACCATATCCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGACCTTGGTTAAGC
TATTTG

QA 1 366 1 366
DS 

RD RR2E296JQ 526 0 0
AAAATGCGGAATTTTATATAAAATATGACCTTAAAGATATAAAACATTCGTTCAGGAAAA
AGAAATACGTTTTACTCAACAAAATAAATATAAATACATTTTACCTGAACATAGTAAACA
TTCCAAAGATTGAGAAATCTTTGTAGACTCAATCCCTCATATGATTCTAAACCGTCAAGT
ACTTTAGAACCGAAGCACGTACCTTCTCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCCCTC
TGTATGCATTAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTCAACAGAGATCTGTTGATCTCGTTTT
TCTCCACCATATCCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTAAGC
TATTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAATTCCTTCTTCTA
AGGCTTTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGTTTTTGTAA
CAGCAAACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAAAAA

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2FV59JQ 610 0 0
G
TATAAAATATGACCTTAAAGATATAAAACATTCGCTCAGGAAAAAGAAATACATTTTACT
CAACAAAATAAATATAAATACATTTTACCTGAACATAGTAAACATTCCAAAGATTGAGAA
ATCTCTGTAGACTCAATCACTCATATGATTCTAAACCGTCAAGTACTTTAGAACCGAAGC
ACGTACCTTCTCAATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCCCTCTGTATGCATTAGCTAT
GTTTTCATCAAGAAGAGTCAACAGAGATCTGTTGATCTCGTTTTTCTCCACCATATCCAA
CAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTAAGCTATTTGTAGCCGTCAT
AAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAGTTCCTTCTTCTAAGGGTTTCTGAAGTGA
TTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGTTTTTGTAACAGCAAACCGGATTTG
CCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAAAAACTCGTCGTTTAACCTTCCACGAAGCCTAGC
GATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTCAGTGTCAAGAAAGAACTCAATCAGCTCAGCGGA
AGTATCTGG

QA 2 610 2 610
DS 

RD RR2B956JQ 612 0 0
GTTAAAATGCGGAATTTTATATAAAATATGACCTTAAAGATATAAAACATTCGTTCAGGA
AAAAGAAATACATTTTACTCAACAAAATAAATATAAATACATTTTACCTGAACATAGTAA
ACATTCCAAAGATTGAGAAATCTTTGTAGACTCAATCACTCATATGATTCTAAACCGTCA
AGTACTTTAGAACCGAAGCACGTACCTTCTCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCC
CTCTGTATGCATTAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTCAACAGAGATCTGTTGATCTCGT
TTTTCTCCACCAT**CCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTA
AGCTATTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAATTCCTTCTT
CTAAGGCTTTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTAATCTTCCGCGGTTTTTG
TAACAGCAAACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAAAAATTCGTCGTTTA
ACCTTCCACGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAGAAAGA
ACTCAATCAGCT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2FS74JQ 730 0 0
GGACGAAAAAGGGCTCAGCTTATGAAAGTCGATATTTCGAGACATGGTACATGTTGAAAT
GCGGAATTTTATATAAAATATGACCTTAAAGATATAAAACATTCGTTCAGGAAAAAGAAA
TACATTTTACTCAACAAAATAAATATAAATACATTTTACCTGAACATAGTAAACATTCCA
AAGATTGAGAAATCTCTGTAGACTCAATCACTCATATGATTCTAAACCGTCAAGTACTTT
AGAACCGAAGCACGTACCTTCTCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCCCTCTGTAT
GCATTAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTCAACAGAGATCTGTTGATCTCGTTTTTCTCC
ACCATATCCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTAAGCTATTT
GTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATTAGCCTCAGTTCCTTCTTCTAAGGCT
TTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGTTTTTGTAACAGCA
AACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAAAAACTCGTCGTTTAACCTTCCA
CGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTCAGTGTCAAGAAAGAACTCAATC
AGCTCAGCGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACTCTCTAAGAGCTTGACGACGCTCTCTC
TCTTCACGGA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2AJ46JQ 736 0 0
ATGAAAGTCGATATTTCGAGACATGGTACATGTTAAAATGCGGAATTTTATATAAAATAT
GACCTTAAAGATATAAAACATTCGTTCAGGAAAAAGAAATACATTTTACTCAACAAAATA
AATATAAATACATTTTACCTGAACATAGTAAACATTCCAAAGATTGAGAAATCTTTGTAG
ACTCAATCCCTCATATGATTCTAAACCGTCAAGTACTTTAGAACCGAAGCACGTACCTTC
TCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCCCTCTGTATGCATTAGCTATGTTTTCATCA
AGAAGAGTCAACAGAGATCTGTTGATCTCGTTTTTCTCCACCATATCCAACAATGTTGCT
TTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTAAGCTATTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTT
TGCATTTTGTCATAAGCCTCAATTCCTTCTTCTAAGGCTTTCTGAAGTGATTCAAGCTCA
ATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGTTTTTGTAACAGCAAACCGGATTTGCCCGATTTCA
AGTCGAATTTGCGCAAAAAATTCGTCGTTTAACCTTCCACGAAGCCTAGCGATTTCGAAT
TCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAGAAAGAACTCAATCAGCTCAGCGGAAGTATCTGGT
ACAACTCTAGACTCTCTAAGAGCTTGACGACGCTCTCTCTCTTCACGGAGTTGTTTCTGA
AAAGCTTCTTTAGCCT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2A646JQ 754 0 0
GTTAAAATGCGGAATTTTATATAAAATATGACCTTAAAGATATAAAACATTCGTTCAGGA
AAAAGAAATACATTTTACTCAACAAAATAAATATAAATACATTTTACCTGAACATAGTAA
ACATTCCAAAGATTGAGAAATCTTTGTAGACTCAATCACTCATATGATTCTAAACCGTCA
AGTACTTTAGAACCGAAGCACGTACCTTCTCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCC
CTCTGTATGCATTAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTCAACAGAGATCTGTTGATCTCGT
TTTTCTCCACCATATCCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTA
AGCTATTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGTCTCAATTCCTTCTT
CTAAGGCTTTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGTTTTTG
TAACAGCAAACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAAAAATTCGTCGTTTA
ACCTTCCACGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAGAAAGA
ACTCAATCAGCTCAGCGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACTCTCTAAGAGCTTGACGAC
GCTCTCTCTCTTCACGGAGTTGTTTCTGGAAAGCTTCTTTAGTCTCGGAGTCTCTCTCTA
TCCTGCGTTTGAACTCAAGACGAGCGATATGGCC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2EH52JQ 761 0 0
AAAATGCGGAATTTTGTATAAAATATGACCTTAAAGATATAAAACATTCGTTCAGGAAAA
AGAAATACATTTTACTCAACAAAATAAATATAAATACATTTTACCTGAACATAGTAAACA
TTCCAAAGATTGAGAAATCTTTGTAGACTCAATCCCTCATATGATTCTAAACCGTCAAGT
ACTTTAGAACCGAAGCACGTACCTTCTCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCCCTC
TGTATGCATTAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTCAACAGAGATCTGTTGATCTCGTTTT
TCTCCACCATATCCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTAAGC
TATTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAATTCCTTCTTCTA
AGGCTTTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGTTTTTGTAA
CAGCAAACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAAAAATTCGTCGTTTAACC
TTCCACGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAGAAAGAACT
CAATCAGCTCAGCGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACTCTCTAAGAGCCTGACGACGCT
CTCTCTCTTCACGGAGTTGTTTCTGAAAAGCTTCTTTAGCCTCGGAGTCTCTCTCTATCC
TGCGTTTGAACTCAAGACGAGCGATATGGCCAGTTTGTGCT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2ER64JQ 724 0 0
G
TATAAAATATGACCTTAAAGATATAAAACATTCGTTCAGGAAAAAGAAATACATTTTACT
CAACAAAATAAATATAAATACATTTTACCTGAACATAGTAAACATTCCAAAGATTGAGAA
ATCTTTGTAGACTCAATCCCTCATATGATTCTAAACCGTCAAGTACTTTAGAACCGAAGC
ACGTACCTTCTCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCCCTCTGTATGCATTAGCTAT
GTTTTCATCAAGAAGAGTCAACAGAGATCTGTTGATCTCGTTTTTCTCCACCATATCCAA
CAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTAAGCTATTTGTAGCCGTCAT
AAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAATTCCTTCTTCTAAGGCTTTCTGAAGTGA
TTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGTTTTTGTAACGGCAAACCGGATTTG
CCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAAAAATTCGTCGTTTAACCTTCCACGAAGCCTAGC
GATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAGAAAGAACTCAATCAGCTCAGCGGA
AGTATCTGGTACAACTCTAGACTCTCTAAGAGCTTGACGACGCTCTCTCCCTTCACGGAG
TTGTTTCTGAAAAGCTTCTTTAGCCTCGGAGTCTCTCTCTATCCTGCGTTTGAACTCAAG
ACG

QA 2 724 2 724
DS 

RD RR2AC81JQ 792 0 0
GTTAAAATGCGGAATTTTATATAAAATATGACCTTAAAGATATAAAACATTCGTTCAGGA
AAAAGAAATACATTTTACTCAACAAAATAAATATAAATACATTTTACCTGAACATAGTAA
ACATTCCAAAGATTGAGAAATCTTTGTAGACTCAATCCCTCATATGATTCTAAACCGTCA
AGTACTTTAGAACCGAAGCACGTACCTTCTCTATGTAATCTCCTACTTCTTTCTGATTCC
CTCTGTATGCATTAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTCAACAGAGATCTGTTGATCTCGT
TTTTCTCCACCATATCCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTA
AGCTATTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAATTCCTTCTT
CTAAGGCTTTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGTTTTTG
TAACAGCAAACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAAAAATTCGTCGTTTA
ACCTTCCACGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAGAAAGA
ACTCAATCAGCTCAGCGGAAGTATCTGGTACAGCTCTAGACTCTCTAAGAGCTTGACGAC
GCTCTCTCTCTTCACGGAGTTGTTTCTGAAAAGCTTCTTTAGCCTCGGAGTCTCTCTCTA
TCCTGCGTTTGAACTCAAGACGAGCGATATGGCCAGTTTGTGCTGGTCCTAATATACCTT
TCGGATCCCATT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2B726JQ 749 0 0
C
CAGGAAAAAGAAATACATTTTACTCAACAAAATAAATATAAATACATTTTACCTGAACAT
AGTAAACATTCCAAAGATTGAGAAATCTTTGTAGACTCAATCACTCATATGATTCTAAAC
CGTCAAGTACTTTAGAACCGAAGCACGTACCTTCTCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTG
GTTCCCTCTGTATGCATTAGCTATGTTTTCATCAAGAAGAGTCAACAGAGATCTGTTGAT
CTCGTTTTTCTCCACCATATCCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTT
GGTTAAGCTATTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGGCATAAGCCTCAATTCC
TTCTTCTAAGGCTTTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGT
TTTTGTAACAGCAAACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAAAAATTCGTC
GTTTAACCTTCCACGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAG
AAAGAACTCAATCAGCTCAGCGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACTCTCTAAGAGCTTG
ACGACGCTCTCTCTCTTCACGGAGTTGTTTCTGGAAAGCTTCTTTAGCCTCGGAGTCTCT
CTCTATCCTGCGTTTGAACTCAAGACGAGCGATATGGCCGGTTTGTGCTGGTCCTAGTAT
ACCTTTGGGATCCCATTCGCAGGAGATT

QA 2 749 2 749
DS 



AS 1 22

CO CL77Contig1 534 22 7 U
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCTATG


BQ
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 
95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 90 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 
97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 80 95 95 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 50 30 30 30 

AF RR2AM50JQ C 1
AF RR2DN24JQ C 286
AF RR2DN24TF U 286
AF RR2CC38JQ C 48
AF RR2CZ33JQ C 1
AF RR2CZ33TF U 1
AF RR2F752TF U 2
AF RR2E326TF U 1
AF RR2DH18TF U 1
AF RR2CQ71JQ C 1
AF RR2GA80JQ C 1
AF RR2GA80TF U 1
AF RR2CQ71TF U 1
AF RR2C762JQ C 1
AF RR2H310TF U 1
AF RR2CC38TF U 1
AF RR2GQ73TF U 1
AF RR2GX55JQ C 1
AF RR2GX55TF U 1
AF RR2GQ73JQ C 1
AF RR2C762TF U 1
AF RR2AM50TF U 1
BS 1 160 RR2CZ33TF
BS 161 161 RR2F752TF
BS 162 286 RR2CZ33TF
BS 287 350 RR2DN24TF
BS 351 352 RR2CZ33TF
BS 353 520 RR2DN24TF
BS 521 534 RR2E326TF

RD RR2AM50JQ 534 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCCCCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATCCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCTATG

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2DN24JQ 235 0 0
G
AAGCAACCTCAACAATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAG
GATCCACCCTTCCACCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGA
AGCTACTACTACTACTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATG
TTGATCAGTTGATGTATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATT

QA 2 235 2 235
DS 

RD RR2DN24TF 235 0 0
G
AAGCAACCTCAACAATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAG
GATCCACCCTTCCACCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGA
AGCTACTACTACTACTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATG
TTGATCAGTTGATGTATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATT

QA 2 235 2 235
DS 

RD RR2CC38JQ 484 0 0
TTT
TTACTAGCCTTGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAAC
AACGTGGTTAGTGATCTCTACCCTTGCCTTTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCC
CCAGCTAACTGCTGCAGCGGTGTCAGAT*GCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTTTGTGGAC
CGTCGGAGGGTGTGCCGTTGCATCAAAAATGGGATTGGAGGAGCCTTTTACTTTTCAAGC
AACCTCAACAATGCTCTGTTTTTGCCTTCCAAGTGGGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATC
AGCCCTTCCCCCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTTTAAAGGAAGCT
ACTACTACTACTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGA
TCAGTTGATGTATCTTCACGTCTATTTTTTTCAAAGTTTTAATAAAAATTATCAACATGC
T

QA 4 484 4 484
DS 

RD RR2CZ33JQ 511 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGGAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
CATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTA

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2CZ33TF 511 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGGAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAAACATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
CATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTA

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2F752TF 517 0 0
GACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCTT
GTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTAG
TGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCTCCAGCTAACTG
CTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCGC
GTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACAA
TGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCAC
CAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTAC
TATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATGT
ATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAA

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2E326TF 534 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCT***TGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATGAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCTATG

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2DH18TF 518 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGTAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAA

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2CQ71JQ 529 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTTTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTTTTCAAAGTTTTAATAAAATTTATCAACATG

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2GA80JQ 531 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTTTTACTTTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTTTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGACTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACTTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGC
G

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2GA80TF 538 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGACTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACTTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGC
GAAAAAAA

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2CQ71TF 534 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAATTTATCAACATGCTATG

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2C762JQ 531 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2H310TF 518 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAA

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2CC38TF 531 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAT*GCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2GQ73TF 530 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTCTTCAGAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGC

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2GX55JQ 531 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATG
TC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2GX55TF 531 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATG
TC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2GQ73JQ 530 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGC

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2C762TF 531 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATGCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2AM50TF 534 0 0
GGACCAAAAACACAACCAAAAAAACAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTA
GTGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGAGGAAAAGTCCCACCAGCTAACT
GCTGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCG
TGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCTTCAAGCAACCTCAACA
ATCCTCTGTCTTTGCCTTCCAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCA
CCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATTCTAAAGGAAGCTACTACTACTA
CTATTACTACAAGAACTTAAAA*CATATGGCTTGGTAGTAACTATGTTGATCAGTTGATG
TATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCTATG

QA 1 534 1 534
DS 



AS 3 22

CO CL78Contig1 615 5 5 U
GGATCTAAAAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGACAACTATAGCTG
CTACTAGTCTTAACTTTGGAACCCAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGATCAGTTC
GTCTCGCAGGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACC
GGATGGTGGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGG
AGAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCCGCGAGCGGAGAGTGTG
TAGCTGCGTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGA
AGAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCCGAGACTAACGAGTGTC
GTACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATTCCGTCCTTGTATTACA
TAAAAATCATTTGTTCCGATCTATTTGGTGTTGTGATATGAATACTGTCTTTGAGACTCA
AGCAGGTTATATACTTTGTAATTTTGCAAGATTCATATAATATAAAAAGCAACACAAAGC
TCGAATTTCATTAAG


BQ
20 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2BY63JQ C 68
AF RR2BX82TF U -1
AF RR2BY63TF U -1
AF RR2AO10JQ C 1
AF RR2AO10TF U 1
BS 1 1 RR2AO10TF
BS 2 2 RR2BY63TF
BS 3 574 RR2BX82TF
BS 575 612 RR2AO10TF
BS 613 615 RR2AO10JQ

RD RR2BY63JQ 529 0 0
TCTTAACTTTGGAACCCAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGATCAGTTCGTCTCGC
AGGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACCGGATGGT
GGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGAGAAGAG
CATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCCGCGAGCGGAGAGTGTGTAGCTGC
GTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAAGAAAGA
CTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCCGAGACTAACGAGTGTCGTACTTA
CGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATTCCGCCCTTGTATTACATAAAAAT
CATTTGTTCCGATCTATTTGGTGTTGTGATATGAATACTGTCTTTGAGACTCAAGCAGGT
TATATACTTTGTAATTTTGCAAGATTCATATAATATAAAAA
GCAACACA

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2BX82TF 576 0 0
GGAT
ATCTAAAAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGACAACTATAGCTGCT
ACTAGTCTTAACTTTGGAACCCAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGATCAGTTCGT
CTCGCAGGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACCGG
ATGGTGGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGAG
AAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCCGCGAGCGGAGAGTGTGTA
GCTGCGTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAAG
AAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCCGAGACTAACGAGTGTCGT
ACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATTCCGTCCTTGTATTACATA
AAAATCATTTGTTCCGATCTATTTGGTGTTGTGATATGAATACTGTCTTTGAGACTCAAG
CAGGTTATATACTTTGTAATTTTGCAAGATTC

QA 5 576 5 576
DS 

RD RR2BY63TF 576 0 0
GGA
GATCTAAAAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGACAACTATAGCTGC
TACTAGTCTTAACTTTGGAACCCAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGATCAGTTCG
TCTCGCAGGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACCG
GATGGTGGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGA
GAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCCGCGAGCGGAGAGTGTGT
AGCTGCGTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAA
GAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCCGAGACTAACGAGTGTCG
TACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATTCCGTCCTTGTATTACAT
AAAAATCATTTGTTCCGATCTATTTGGTGTTGTGATATGAATACTGTCTTTGAGACTCAA
GCAGGTTATATACTTTGTAATTTTGCAAGATTC

QA 4 576 4 576
DS 

RD RR2AO10JQ 615 0 0
GGATCTAAAAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGACAACTATAGCTG
CTACTAGTCTTAACTTTGGAACCCAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGATCAGTTC
GTCTCGCAGGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACC
GGATGGTGGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGG
AGAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCCGCGAGCGGAGAGTGTG
TAGTTGCGTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGA
AGAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCCGAGACTAACGAGTGTC
GTACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATTCCGTCCTTGTATTACA
TAAAAATCATTTGTTCCGATCTATTTGGTGTTGTGATATGAATACTGTCTTTGAGACTCA
AGCAGGTTATATACTTTGTAATTTTGCAAGATTCATATAATATAAAAAGCAACACAAAGC
TCGAATTTCATTAAG

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2AO10TF 615 0 0
GGATCTAAAAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGACAACTATAGCTG
CTACTAGTCTTAACTTTGGAACCCAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGATCAGTTC
GTCTCGCAGGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACC
GGATGGTGGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGG
AGAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCCGCGAGCGGAGAGTGTG
TAGTTGCGTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGA
AGAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCCGAGACTAACGAGTGTC
GTACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATTCCGTCCTTGTATTACA
TAAAAATCATTTGTTCCGATCTATTTGGTGTTGTGATATGAATACTGTCTTTGAGACTCA
AGCAGGTTATATACTTTGTAATTTTGCAAGATTCATATAATATAAAAAGCAACACAAAGC
TCGAATTTCATT
AAG

QA 1 612 1 612
DS 



CO CL78Contig2 614 4 8 U
GGATCTAAAAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATACCTG
CTACTACTCTTAACTTTGGAACCCAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGATCAGTTC
GTCTCGCAGGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACC
GGATGGTGGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGG
AGAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCCGCGAGCGGAGAGTGTG
TAGCTGCGTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGA
AGAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTC
GAACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATCCCGTCCTTGTATTACA
TAAAAATCATTTGTTCGATCTATTTGGTGTTGTGATATAAATACTGTCTTTGAGACTCGA
GCAGGTTATATACTTTGTAATTTTTGTAAGATTCATATAATATAAAAAAAGCAACACAAA
GCTCGAATTTCATT


BQ
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2E745TF U 1
AF RR2E745JQ C 1
AF RR2D718JQ C -1
AF RR2D718TF U -1
BS 1 66 RR2E745TF
BS 67 67 RR2D718TF
BS 68 476 RR2E745TF
BS 477 477 RR2D718TF
BS 478 543 RR2E745TF
BS 544 544 RR2D718TF
BS 545 590 RR2E745TF
BS 591 614 RR2D718TF

RD RR2E745TF 590 0 0
GGATCTAAAAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATACCTG
CTACTAGTCTTAACTTTGGAACCCAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGATCAGTTC
GTCTCGCAGGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACC
GGATGGTGGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGG
AGAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCCGCGAGCGGAGAGTGTG
TAGCTGCGTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGA
AGAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTC
GAACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATCCCGTCCTTGTAT*ACA
TAAAAATCATTTGTTCGATCTATTTGGTGTTGTGATATAAATACTGTCTTTGAGACTCGA
GCATGTTATATACTTTGTAATTTTTGTAAGATTCATATAATATAAAAAAA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2E745JQ 614 0 0
GGATCTAAAAAACAAAACATTCAAAGCCTTTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATACCTG
CTACTAGTCTTAACTTTGGAACCCAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGATCAGTTC
GTCTCGCAGGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACC
GGATGGTGGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGG
AGAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCCGCGAGCGGAGAGTGTG
TAGCTGCGTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGA
AGAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTC
GAACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATCCCGTCCTTGTAT*ACA
TAAAAATCATTTGTTCGATCTATTTGGTGTTGTGATATAAATACTGTCTTTGAGACTCGA
GCAGGTTATATACTTTGTAATTTTTGTAAGATTCATATAATATAAAAAAAGCAACACAAA
GCTCGAATTTCATT

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2D718JQ 616 0 0
GGAT
ATCTAAAAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATAGCTGCT
ACTACTCTTAACTTTGGAACCCAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGATCAGTTCGT
CTCGCAGGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAAGCGG
ATGGTGGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGAG
AAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCCGCGAGCGGAGAGTGTGTA
GCTGCGTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAAG
AAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTCGA
ACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATCCCGTCCTTGTATTACATA
AAAATCATTTGTTCGATCTATTTGGTGTTGTGATATGAATACTGTCTTTGAGACTCGAGC
AGGTTATATACTTTGTAATTTTTGTAAGATTCATATAATATAAAAAAAGCAACACAAAGC
TCGAATTTCATT

QA 5 616 5 616
DS 

RD RR2D718TF 616 0 0
GGAT
ATCTAAAAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATAGCTGCT
ACTACTCTTAACTTTGGAACCCAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGATCAGTTCGT
CTCGCAGGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAAGCGG
ATGGTGGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGAG
AAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCCGCGAGCGGAGAGTGTGTA
GCTGCGTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAAG
AAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTCGA
ACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATCCCGTCCTTGTATTACATA
AAAATCATTTGTTCGATCTATTTGGTGTTGTGATATGAATACTGTCTTTGAGACTCGAGC
AGGTTATATACTTTGTAATTTTTGTAAGATTCATATAATATAAAAAAAGCAACACAAAGC
TCGAATTTCATT

QA 5 616 5 616
DS 



CO CL78Contig3 570 13 10 U
GGGATCTATAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATAGCTG
CTACTAGTCTTAACTTTGGAACCAAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGTCCAGTTC
GTCTCGCAGGTCCTGTCCGTTTAAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACC
GGATGGTTGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGG
AGAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCTGCGAGCGGAGAGTGTG
TAGCTGCTTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGA
AGAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTC
GTACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTCCTTATATTACATAAAAATCATTTG
TTTCGGTCAATTTGGTGTTATGATATGAATACCGTCTTTGAGACTCAAGCAGGTTATATA
ATTTGTAATCTCGCAAGATTTATATAATAT


BQ
10 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 40 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2FN10JQ C 1
AF RR2FN10TF U 1
AF RR2EG79TF U 2
AF RR2EG79JQ C 71
AF RR2G880TF U 1
AF RR2BA34JQ C 2
AF RR2G880JQ C 35
AF RR2BA34TF U 2
AF RR2DA09TF U 2
AF RR2G687JQ C 68
AF RR2DG18TF U 7
AF RR2G687TF U 2
AF RR2DA09JQ C 424
BS 1 1 RR2FN10JQ
BS 2 96 RR2FN10TF
BS 97 97 RR2G880TF
BS 98 297 RR2FN10TF
BS 298 298 RR2G880TF
BS 299 397 RR2FN10TF
BS 398 398 RR2G880TF
BS 399 525 RR2FN10TF
BS 526 559 RR2G880TF
BS 560 570 RR2DA09TF

RD RR2FN10JQ 473 0 0
GGGATCTATAAACAAAACATTCAAAGCCTTTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATAGCTG
CTACTAGTCTTAACTTTGGAACCAAACGAGCCGTCACCACCAGCGAGGCTCGTCCAGTTC
GTCTCGCAGGTCCTGTCCGTTTAAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACC
GGATGGTTGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGG
AGAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCTGCGAGCGGAGAGTATG
TAGCTGCTTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGA
AGAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGATAATCCAGAGACTAACGAGTGTC
GTACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTCCTTATATTACATAAAAA

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2FN10TF 525 0 0
G
GGATCTATAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATAGCTGC
TACTAGTCTTAACTTTGGAACCAAACGAGCCGTCACCACCAGCGAGGCTCGTCCAGTTCG
TCTCGCAGGTCCTGTCCGTTTAAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACCG
GATGGTTGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGA
GAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCTGCGAGCGGAGAGTATGT
AGCTGCTTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAA
GAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGATAATCCAGAGACTAACGAGTGTCG
TACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTCCTTATATTACATAAAAATCATTTGT
TTCGGTCAATTTGGTGTTATGATATGAATACCGTCTTTGAGACT

QA 2 525 2 525
DS 

RD RR2EG79TF 522 0 0
GGATCTATAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATAGCTGC
TACTAGTCTTAACTTTGGAACCAAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGTCCAGTTCG
TCTCGCAGGTCCTGTCCGTTTAAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACCG
GATGGTTGCAGTTAGGGCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGA
GAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCTGCGAGCGGAGAGTGTGT
AGCTGCTTGGGACGAGGTTGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAA
GAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTCG
TACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTCCTTATACTACATAAAAATCATTTGT
TTCGGTCAATTTGGTGTTATGATATGAATACCGTCTTTGAGA

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2EG79JQ 456 0 0
TAACTTTGGAACCAAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGTTCGTCCAGTTCGTCTCGCAGG
TCCTGTCCGTTTAAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACCGGATGGTTGC
AGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGAGAAGAGCAT
CAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCTGCGAGCGGAGAGTGTGTAGCTGCTTG
GGACGAGGTTGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAAGAAAGACTC
CGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTCGTACTTACGA
CAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTCCTTATACTACATAAAAATCATTTGTTTCGGTCAA
TTTGGTGTTATGATATGAATACCGTCTTTGAGACTC

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR2G880TF 559 0 0
G
GGATCTATAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATAGCTGC
TACTAGTCTTAACTTTGGAACCAAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGTCCAGTTCG
TCTCGCAGGTCCTGTCCGTTTAAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACCG
GATGGTTGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGA
GAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCTGCGAGCGGAGAGTGTGT
AGCTGCTTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAA
GAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTCG
TACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTCCTTATATTACATAAAAATCATTTGT
TTCGGTCAATTTGGTGTTATGATATGAATACCGTCTTTGAGACTCAAGCAGGTTATATAA
TTTGTAATCTCGCAAGAT

QA 2 559 2 559
DS 

RD RR2BA34JQ 558 0 0
GGATCTATAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTACGGCAACTATAGCTGC
TACTAGTCTTAACTTTGGAACCAAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGTCCAGTTCG
TCTCGCAGGTCCTGTCCGTTTAAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACCG
GATGGTTGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGA
GAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGGCTTGTGCTGGCGACCCTGCGAGCGGAGAGTGTGT
AGCTGCTTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAA
GAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTCG
TACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTCCTTATATTACATAAAAATCATTTGT
TTCGGTCAATTTGGTGTTATGATATGAATACCGTCTTTGAGACTCAAGCAGGTTATATAA
TTTGTAATCTCGCAAGAT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2G880JQ 525 0 0
TCATCCAACTATGGCAACTATAGCTGCTACTAGTCTTAACTTTGGAACCAAACGAGCCGT
CATCACCAGCGAGGTTCGTCCAGTTCGTCTCGCAGGTCCTGTCCGTTTAAACAATCCGTG
GAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACCGGATGGTTGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCC
AGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGAGAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGC
TGGCGACCCTGCGAGCGGAGAGTGTGTAGCTGCTTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGC
AGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAAGAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAA
AGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTCGTACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATG
TCCTTATATTACATAAAAATCATTTGTTTCGGTCAATTTGGTGTTATGATATGAATACCG
TCTTTGAGACTCAAGCAGGTTATATAATTTGTAATCTCGCAAGAT

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2BA34TF 558 0 0
GGATCTATAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTACGGCAACTATAGCTGC
TACTAGTCTTAACTTTGGAACCAAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGTCCAGTTCG
TCTCGCAGGTCCTGTCCGTTTAAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACCG
GATGGTTGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGA
GAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGGCTTGTGCTGGCGACCCTGCGAGCGGAGAGTGTGT
AGCTGCTTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAA
GAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTCG
TACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTCCTTATATTACATAAAAATCATTTGT
TTCGGTCAATTTGGTGTTATGATATGAATACCGTCTTTGAGACTCAAGCAGGTTATATAA
TTTGTAATCTCGCAAGAT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2DA09TF 569 0 0
GGATCTATAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATAGCTGC
TACTAGTCTTAACTTTGGAACCAAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGTCCAGTTCG
TCTCGCAGGTCCTGTCCGTTTAAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACCG
GATGGTTGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGA
GAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCTGCGAGCGGAGAGTGTGT
AGCTGCTTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAA
GAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACGATCCAGAGACTAACGAGTGTCG
TACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTCCTTATATTACATAAAAATCATTTGT
TTCGGTCAATTTGGTGTTATGATATGAATACCGTCTTTGAGACTCAAGCAGGTTATATAA
TTTGTAATCTCGCAAGATTTATATAATAT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2G687JQ 503 0 0
TCTTAACTTTGGAACCAAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGTCCAGTTCGTCTCGC
AGGTCCTGTCCGTTTAAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAATCGGATGGT
TGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGAGAAGAG
CATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCTGCGAGCGGGGAGTGTGTAGCTGC
TTGGGACGAGGTCGAAGGGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAAGAAAGA
CTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTCGTACTTA
CGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTCCTTATATTACATAAAAATCATTTGTTTCGGT
CAATTTGGTGTTATGATATGAATACCGTCTTTGAGACTCAAGCAGGTTATATAATTTGTA
ATCTCGCAAGATTTATATAATAT

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2DG18TF 553 0 0
TATAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATAGCTGCTACTA
GTCTTAACTTTGGAACCAAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGTCCAGTTCGTCTCG
CAGGTCCTGTCCGTTTAAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAACCGGATGG
TTGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGAGAAGA
GCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCTGCGAGCGGAGAGTGTGTAGCTG
CTTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAAGAAAG
ACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTCGTACTT
ACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTCCTTATATTACATAAAAATCATTTGTTTCGG
TCAATTTGGTGTTATGATATGAATACCGTCTTTGAGACTCAAGCAGGTTATATAATTTGT
AATCTCGCAAGAT

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2G687TF 569 0 0
GGATCTATAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATAGCTGC
TACTAGTCTTAACTTTGGAACCAAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGTCCAGTTCG
TCTCGCAGGTCCTGTCCGTTTAAACAATCCGTGGAATCTTGGTTCAAGAACAACGAATCG
GATGGTTGCAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGA
GAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCTGCGAGCGGGGAGTGTGT
AGCTGCTTGGGACGAGGTCGAAGGGCTTAGCGCAGCAGCCAGCCACGCTAGAGACAAGAA
GAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCAGAGACTAACGAGTGTCG
TACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTCCTTATATTACATAAAAATCATTTGT
TTCGGTCAATTTGGTGTTATGATATGAATACCGTCTTTGAGACTCAAGCAGGTTATATAA
TTTGTAATCTCGCAAGATTTATATAATAT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2DA09JQ 147 0 0
CTTACGACAACTGAAATTGAGCTCCATCATGTCCTTATATTACATAAAAATCATTTGTTT
CGGTCAATTTGGTGTTATGATATGAATCCCGTCTTTGAGACTCAAGCAGGTTATATAATT
TGTAATCTCGCAAGATTTATATAATAT

QA 1 147 1 147
DS 



AS 5 18

CO CL79Contig1 942 2 4 U
GGGGGAACTCCCCCGAGACAAGACACGACTGAGTTAGTGCTCAAATGGAGGTGAGTATGT
CTCAACGCGTTGTCTCGGCTTCCACTGAAGAAGCCTACAGGAAGACTGGAAGAGGTCGGT
TTAGCGAGACACTCTCTGCTGAGAACACCGAAACAACGGCGGCGGATGGTGTTCGTGGTG
GAGGCGAAAGGGAAGAAAGGAATGGCGGCTCGACAGTATCAACGGACGCCTCCTCCTATG
CCTAAGATTGAAGACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATCCGTATGGCCAATGTG
TATCTTTGGTATCCGCTTAGTATAATAGCTGGTGGTACAACGGCCAAGATCATGGTTGCT
GCTAAAGACAACCTCTTGGGGAAGTATATCTACAAAGACACCATTGCTAGAAACATTGCT
GCTGTTATTTACAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACTGCGATTAAGCAGCATCGTGTC
TTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAACGGGAACATGAGA
GCTGCACTTAGTGCCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACTCAGGACCAGCTAAAAACAGTG
TTGGACAAAGTGAAAGACTTTTTCGGCGATGCAAAAGAGTCGTTCGGGAAGATATCATCG
TTGAATCCTGGGGCAGATGAAGAAATCCCTGACGAGAAAACCAAGCAAGTATAGACAGGG
TCCATCCAAGGCTGGAGAATTGACACTTGATGGCCTAATTCCAATCTCAACCGTCTTGAT
ATGGGATCCAGAAGGTCCACTGGATACCATGACGAGATTCCCCCGCTATTTTGTGCACAT
TTTTTTCTTTTATACACCTCTCAGAGAGAAACAGTTTCTCTTAAAAATCTCTTGTAAACT
TTTAGTCTGTAGATTTGTTGAAAGAAAGAGCTGTTTGGTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE82TF U 1
AF RR2AE82JQ C 187
BS 1 730 RR2AE82TF
BS 731 731 RR2AE82JQ
BS 732 757 RR2AE82TF
BS 758 942 RR2AE82JQ

RD RR2AE82TF 757 0 0
GGGGGAACTCCCCCGAGACAAGACACGACTGAGTTAGTGCTCAAATGGAGGTGAGTATGT
CTCAACGCGTTGTCTCGGCTTCCACTGAAGAAGCCTACAGGAAGACTGGAAGAGGTCGGT
TTAGCGAGACACTCTCTGCTGAGAACACCGAAACAACGGCGGCGGATGGTGTTCGTGGTG
GAGGCGAAAGGGAAGAAAGGAATGGCGGCTCGACAGTATCAACGGACGCCTCCTCCTATG
CCTAAGATTGAAGACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATCCGTATGGCCAATGTG
TATCTTTGGTATCCGCTTAGTATAATAGCTGGTGGTACAACGGCCAAGATCATGGTTGCT
GCTAAAGACAACCTCTTGGGGAAGTATATCTACAAAGACACCATTGCTAGAAACATTGCT
GCTGTTATTTACAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACTGCGATTAAGCAGCATCGTGTC
TTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAACGGGAACATGAGA
GCTGCACTTAGTGCCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACTCAGGACCAGCTAAAAACAGTG
TTGGACAAAGTGAAAGACTTTTTCGGCGATGCAAAAGAGTCGTTCGGGAAGATATCATCG
TTGAATCCTGGGGCAGATGAAGAAATCCCTGACGAGAAAACCAAGCAAGTATAGACAGGG
TCCATCCAAG*CTGGAGAATTGACACTTGATGGCCTA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2AE82JQ 756 0 0
AAAGGGAAGAAAGGAATGGCGGCTCGACAGTATCAACGGACGCCTCCTCCTATGCCTAAG
ATTGAAGACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATCCGTATGGCCAATGTGTATCTT
TGGTATCCGCTTAGTATAATAGCTGGTGGTACAACGGCCAAGATCATGGTTGCTGCTAAA
GACAACCTCTTGGGGAAGTATATCTACAAAGACACCATTGCTAGAAACATTGCTGCTGTT
ATTTACAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACTGCGATTAAGCAGCATCGTGTCTTGCGG
ACTGCCACTGAGTTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAACGGGAACATGAGAGCTGCA
CTTAGTGCCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACTCAGGACCAGCTAAAAACAGTGTTGGAC
AAAGTGAAAGACTTTTTCGGCGATGCAAAAGAGTCGTTCGGGAAGATATCATCGTTGAAT
CCTGGGGCAGATGAAGAAATCCCTGACGAGAAAACCAAGCAAGTATAGACAGGGTCCATC
CAAGGCTGGAGAATTGACACTTGATGGCCTAATTCCAATCTCAACCGTCTTGATATGGGA
TCCAGAAGGTCCACTGGATACCATGACGAGATTCCCCCGCTATTTTGTGCACATTTTTTT
CTTTTATACACCTCTCAGAGAGAAACAGTTTCTCTTAAAAATCTCTTGTAAACTTTTAGT
CTGTAGATTTGTTGAAAGAAAGAGCTGTTTGGTGGC

QA 1 756 1 756
DS 



CO CL79Contig2 1032 3 20 U
AGAATTCTAACCAACAGGTGTTTCTTTCTAAGTAAAGTTGAACTCGCAAGTTGTTATCAA
CAGCTCTTCCTTTCAACAAATCTACAGACAATATAAGTTTACAAGAGATTTTTAAGAGAA
ACTGTTTCTCTCTGAGAGGTGTATAAAAGAAAAATAATGTGCACAAAATAGCGGGCATCT
CGTCATGATATCCCTTTGGACCTTCTGGATCCCGTATCAACACGGTTGAGATAGGAATGA
GCCCATCAAGTGTCAGTTGTGCAGCCTTGGACCCTGTCTATACTTGCTTGGCTTTCTCAT
CAGGGCTTTCTTCATCTGCCCCAGGATTCAACGATGATATCTTCCCGAATGAATCTTTAG
CATCCCCAAAAAAGTCTTTCACTTTGTCCAGCACTGTTTTTAGCTGGTCCTGAGTTGGGA
GCTCGATGACATCAGAGGTACTAAGTGCAGCTCTCATGTTTCCGTTTTCAACAAGTTTGT
AGCCATAACGAAACTCAGTGGCAGTCCGCAAGACACGATGCTGCTTAATCGCAGTCTTTT
GTATCTCCTTCTCATCTCTGTAAATAACAGCAGCAATGTTTCTAGCAATGGTGTCTTTGT
AGATATACTTCCCCAAGAGGTTATCTTTAGCAGCAACCATGATCTTGGCCGTTGTACCAC
CGGCTATTATACTAAGCGGATACCAAAGATACACATTGGCCATACGGATGAAGATAACGA
ATCTAGGGTTTCCGTCGTCTTCAATCTTAGGCATAGGAGGAGGCGTCCGTTGATACTGTC
GAGCCGCCATTCCTTTCTTCCCTTTCGCCTCCACCACGAACACCATCCGCCGTCGTTGTT
TCGGTGTTCTCACCAGAGAGTGTCTCGCTAAACCGACCTCTTCGAGTCTTGCTGTATTCT
TCTTCAGTGGAAGCCGAGACAAGGCGTTGAGAGACATACTCACCTCCATTTGAGCACTAC
TCAGTCGTGTCTTGTTGTCTCGGGGGAGTTCTGGGGACGATGATTTCGTTGGATCGTTAC
CTTATCCATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN28JQ U 53
AF RR2BG16JQ U 1
AF RR2FN28TF C 238
BS 1 68 RR2BG16JQ
BS 69 69 RR2FN28JQ
BS 70 153 RR2BG16JQ
BS 154 154 RR2FN28JQ
BS 155 260 RR2BG16JQ
BS 261 261 RR2FN28JQ
BS 262 367 RR2BG16JQ
BS 368 368 RR2FN28JQ
BS 369 390 RR2BG16JQ
BS 391 391 RR2FN28JQ
BS 392 433 RR2BG16JQ
BS 434 434 RR2FN28JQ
BS 435 766 RR2BG16JQ
BS 767 767 RR2FN28TF
BS 768 814 RR2BG16JQ
BS 815 815 RR2FN28TF
BS 816 842 RR2BG16JQ
BS 843 843 RR2FN28TF
BS 844 890 RR2BG16JQ
BS 891 1032 RR2FN28TF

RD RR2FN28JQ 694 0 0
GCTATC
AACAGCTCTTCCTTTCAACAAATCTACAGACAATATAAGTTTACAAGAGATTTTTAAGAG
AAACTGTTTCTCTCTGAGAGGTGTATAAAAGAAAAATAATGTGCACAAAATAGCGGGCAT
CTCGTCATGATATCCCTTTGGACCTTCTGGATCCCGTATCAACACGGTTGAGATAGGAAT
GAGCCCATCAAGTGTCAGTTGTGCAGCCTTGGACCCTGTCTATACTTGCTTGGCTTTCTC
ATCAGGGCTTTCTTCATCTGCCCCAGGATTCAACGATGATATCTTCCCGAATGAATCTTT
AGCATCCCCAAAAAAGTCTTTCACTTTGTCCAGCACTGTTTTTAGCTGGTCCTGAGTTGG
GAGCTCGATGACATCAGAGGTACTAAGTGCAGCTCTCATGTTTCCGTTTTCAACAAGTTT
GTAGCCATAACGAAACTCAGTGGCAGTCCGCAAGACACGATGCTGCTTAATCGCAGTCTT
TTGTATCTCCTTCTCATCTCTGTAAATAACAGCAGCAATGTTTCTAGCAATGGTGTCTTT
GTAGATATACTTCCCCAAGAGGTTATCTTTAGCAGCAACCATGATCTTGGCCGTTGTACC
ACCGGCTATTATACTAAGCGGATACCAAAGATACACATTGGCCATACGGATGAAGATAAC
GAATCTAGGGTTTCCGTCGTCTTCAATC

QA 7 694 7 694
DS 

RD RR2BG16JQ 894 0 0
AGAATTCTAACCAACAGGTGTTTCTTTCTAAGTAAAGTTGAACTCGCAAGTTGTTATCAA
CAGCTCTTTCTTTCAACAAATCTACAGACAATATAAGTTTACAAGAGATTTTTAAGAGAA
ACTGTTTCTCTCTGAGAGGTGTATAAAAGAAAA*TAATGTGCACAAAATAGCGGGCATCT
CGTCATGATATCCCTTTGGACCTTCTGGATCCCGTATCAACACGGTTGAGATAGGAATGA
GCCCATCAAGTGTCAGTTGTCCAGCCTTGGACCCTGTCTATACTTGCTTGGCTTTCTCAT
CAGGGCTTTCTTCATCTGCCCCAGGATTCAACGATGATATCTTCCCGAATGAATCTTTAG
CATCCCCGAAAAAGTCTTTCACTTTGTCCAACACTGTTTTTAGCTGGTCCTGAGTTGGGA
GCTCGATGACATCTGAGGTACTAAGTGCAGCTCTCATGTTTCCGTTTTCAACAAGTTTGT
AGCCATAACGAAACTCAGTGGCAGTCCGCAAGACACGATGCTGCTTAATCGCAGTCTTTT
GTATCTCCTTCTCATCTCTGTAAATAACAGCAGCAATGTTTCTAGCAATGGTGTCTTTGT
AGATATACTTCCCCAAGAGGTTATCTTTAGCAGCAACCATGATCTTGGCCGTTGTACCAC
CGGCTATTATACTAAGCGGATACCAAAGATACACATTGGCCATACGGATGAAGATAACGA
ATCTAGGGTTTCCGTCGTCTTCAATCTTAGGCATAGGAGGAGGCGTGCGTTGATACTGTC
GAGCCGCCATTCCTTTCTTCCCTTTCGCCTCCACTACGAACACCATCCGCCGTCGTTGTT
TCTGTGTTCTCACCAGAGAGTGTCTCGCTAAACCGACCTCTTCGAGTCTT
GCTG

QA 1 890 1 890
DS 

RD RR2FN28TF 795 0 0
TGAGCCCATCAAGTGTCAGTTGTGCAGC**TGGACCCTGTCTATACTTGCTTG*CTTTCT
CATCAGG*CTTTCTTCATCTGCCCCAGGAT*CAACGATGATATCTTCCCGAATGA*TCTT
TAGCATCCCCAAAAAAGTCTTTCACTTTGTCCAGCACTGTTTTTAGCTGGTC*TGAGTTG
GGAGCTCGATGACATCAGAGGTACTAAGTGCAGCTCTCATGTTTCCGTTTTCAACAAGTT
TGTAGCCATAACGAAACTCAGTGGCAGTCCGCAAGACACGATGCTGCTTAATCGCAGTCT
TTTGTATCTCCTTCTCATCTCTGTAAATAACAGCAGCAATGTTTCTAGCAATGGTGTCTT
TGTAGATATACTTCCCCAAGAGGTTATCTTTAGCAGCAACCATGATCTTGGCCGTTGTAC
CACCGGCTATTATACTAAGCGGATACCAAAGATACACATTGGCCATACGGATGAAGATAA
CGAATCTAGGGTTTCCGTCGTCTTCAATCTTAGGCATAGGAGGAGGCGTCCGTTGATACT
GTCGAGCCGCCATTCCTTTCTTCCCTTTCGCCTCCACCACGAACACCATCCGCCGTCGTT
GTTTCGGTGTTCTCACCAGAGAGTGTCTCGCTAAACCGACCTCTTCGAGTCTTGCTGTAT
TCTTCTTCAGTGGAAGCCGAGACAAGGCGTTGAGAGACATACTCACCTCCATTTGAGCAC
TACTCAGTCGTGTCTTGTTGTCTCGGGGGAGTTCTGGGGACGATGATTTCGTTGGATCGT
TACCTTATCCATTCC

QA 1 795 1 795
DS 



CO CL79Contig3 908 4 11 U
GGGCTCAAAATGGAGGTAAGTATGTCTCTCAACGCGTTAACTCGGCTTCCACTGAAGAAC
ACGGGAAGACTTGAAGAGTTCGGGTTAGCTAGACATTCTCTGTTCACCTCGAGAACATCA
TGCCTAGAGACGGCGCAGCGGAGGAGGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGGAAGAAAGGT
ATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAAGACGACGGA
TACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTATGGCCAATGTGTATCTTTGGTATCCACTTAGT
ATAATAGCAGGTGGTACAACTGCTAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACCTCTTGGGG
AAGTATATCTATAAAGACACCATTGCAAGAAACATAGCTGCTGTTATTTACAGGGATGAG
AAGGAGATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCACCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTT
CGATATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTGAGTACTTCAGAT
GTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTGGACAAAGTGAAAGACTTT
TTTGGGGATGCAAAAGAGTCATTCGGAAAACTATCATCACTGAATCCTGGGACAGATGAA
GAAACCGAAGGAAGCACTGATGAGAAAGCCAAGGTCCAAGGCTGAACGATCGACACATGA
TGGGCTGATTCCAAATGTCTCAACCGTCTTGATATGGAATGCAGAAGTTCACTGGATAGG
ACGAGATTGTCCACTACTTTGTGCACATTTTTCTTTATACACCTCTGAGAGAAACAGTTT
CTCCTAAATCTCTTGTAACATATAACTTATTGTGTCTGTAGATTTGTTGAAAGAAAGAGC
TGTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ34TF U 1
AF RR2BZ27TF U 11
AF RR2E359JQ C 524
AF RR2BJ34JQ C 141
BS 1 669 RR2BJ34TF
BS 670 670 RR2BJ34JQ
BS 671 684 RR2BJ34TF
BS 685 693 RR2BZ27TF
BS 694 744 RR2BJ34JQ
BS 745 745 RR2E359JQ
BS 746 791 RR2BJ34JQ
BS 792 792 RR2E359JQ
BS 793 819 RR2BJ34JQ
BS 820 820 RR2E359JQ
BS 821 908 RR2BJ34JQ

RD RR2BJ34TF 684 0 0
GGGCTCAAAATGGAGGTAAGTATGTCTCTCAACGCGTTAACTCGGCTTCCACTGAAGAAC
ACGGGAAGACTTGAAGAGTTCGGGTTAGCTAGACATTCTCTGTTCACCTCGAGAACATCA
TGCCTAGAGACGGCGCAGCGGAGGAGGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGGAAGAAAGGT
ATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAAGACGACGGA
TACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTATGGCCAATGTGTATCTTTGGTATCCACTTAGT
ATAATAGCAGGTGGTACAACTGCTAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACCTCTTGGGG
AAGTATATCTATAAAGACACCATTGCAAGAAACATAGCTGCTGTTATTTACAGGGATGAG
AAGGAGATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCACCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTT
CGATATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTGAGTACTTCAGAT
GTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTGGACAAAGTGAAAGACTTT
TTTGGGGATGCAAAAGAGTCATTCGGAAAACTATCATCACTGAATCCTGGGACAGATGAA
GAAACCGAAAGAAGCACTGATGAG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2BZ27TF 699 0 0
G
GGAGGTAAGTATGTCTCTCAACGCGTTAACTCGGCTTCCACTGAAGAACACGGGAAGACT
TGAAGAGTTCGGGTTAGCTAGACATTCTCTGTTCACCTCGAGAACATCATGCCTAGAGAC
GGCGCAGCGGAGGAGGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGGAAGAAAGGTATGGCGGCGCG
TCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAAGACGACGGAAACCCTAGATT
CGTTATCTTCATTCGTATGGCCAATGTGTATCTTTGGTATCCACTTAGTATAATAGCAGG
TGGTACAACTGCTAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACCTCTTGGGGAAGTATATCTA
TAAAGACACCATTGCAAGAAACATAGCTGCTGTTATTTACAGGGATGAGAAGGAGATACA
AAAGACAGCAATAAAGCAGCACCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGATATGGCTA
CAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTGAGTACTTCAGATGTCATCGAGCT
CCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTGGACAAAGTGAAAGACTTTTTTGGGGATGC
AAAAGAGTCATTCGGAAAACTATCATCACTGAATCCTGGGACAGATGAAGAAACCGAA*G
AAGCACTGATGAGAAAGCCAAG
TAAGTATACAGTGTAG

QA 2 683 2 683
DS 

RD RR2E359JQ 351 0 0
CACTGAGTACTTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTGG
GCAAAGTGAAAGACTTTTTTGGGGATGCAAAAGAGTCATTCGGAAAGATATCATCACTAA
ACCCTGGTACAGATGAAGAAACCGAAGGAAGCACTGATGAGAAAGCCAAGGTCCAAGGCT
GAACGATTGACACATGATGGGCTGATTCCTAATGTCTCAACCGTCTTGATATGGAATGCA
GAAGTTCACTGGATAGGACGAGATTGTCCACTACTTTGTGCACATTTTTCTTTATACACC
TCTGAGA*AAACAGTTTCTCCTAAATCTCTTGTAACATATAACTTATTGTG

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR2BJ34JQ 768 0 0
GAGGAGGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGGAAGAAAGGTATGGCGGCGCGTCAGTATCA
ACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAAGACGACGGATACCCTAGATTCGTTATCTT
CATTCGTATGGCCAATGTGTATCTTTGGTATCCACTTAGTATAATAGCAGGTGGTACAAC
TGCTAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACCTCTTGGGGAAGTATATCTATAAAGACAC
CATTGCAAGAAACATAGCTGCTGTTATTTACAGGGATGAGAAGGAGATACAAAAGACAGC
AATAAAGCAGCACCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGATATGGCTACAAACTTGT
TGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTGAGTACTTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACCCA
GGACCAGCTTAAAACAGTATTGGACAAAGTGAAAGACTTTTTTGGGGATGCAAAAGAGTC
ATTCGGAAAACTATCATCACTGAATCCTGGGACAGATGAAGAAACCGAAGGAAGCACTGA
TGAGAAAGCCAAGGTCCAAGGCTGAACGATCGACACATGATGGGCTGATTCCAAATGTCT
CAACTGTCTTGATATGGAATGCAGAAGTTCACTGGATAGGACGAGATTGTC*ACTACTTT
GTGCACATTTTTCTTTATATACCTCTGAGAGAAACAGTTTCTCCTAAATCTCTTGTAACA
TATAACTTATTGTGTCTGTAGATTTGTTGAAAGAAAGAGCTGTTTGGC

QA 1 768 1 768
DS 



CO CL79Contig4 694 3 1 U
GAACTCGCAAAGTAAACAGCTCTTTCTTTCAACAAATATACAGACACAATAAGTTATATG
TTACAATAGATTTAGGAGAAACTGTTTCTCTCAGAGGTGTATAAAGAAAAATGTTCACAA
AGTAGTGGGCATCTTGTCGTATCCAGTGAACTTCTACATCCGATATCAAGACGGTTGAGA
CATTAGGAATCAGCCCATCATGTGTCAATCGGTTCAGCCTTGGACCTTGGCTTTCTCATC
AGTGCTTCCTTCGGTTTCTTCATCTGTCCCAGGATTCAGTGATGATAGTTTTCCGAATGA
CTCTTTTGCATCCCCAAAAAAGTCTTTCACTTTGTCCAATACTGTTTTAAGCTGGTCCTG
GGTTGGGAGCTCGATGACATCTGAAGTACTCAGTGCAGCTCTCATATTTCCATTTTCAAC
AAGTTTGTAGCCATATCGAAACTCAGTGGCAGTCCGCAAGACACGATGCTGCTTTATTGC
TGTCTTTTGTATCTCCTTCTCATCTCTGTAAATAACAGCAGCTATGTTTCTTGCAATGGT
GTCTTTGTAGATATACTTCCCCAAGAGGTTGTCTTTAGCAGCAACCATGATTTTGGCAGT
TGTACCTCCAGCTATTATACTGAGAGGGTACCAAAGATACACATTGGCCATGCGAATGAA
GATAACGAATCTAGGGTTTCCGTAGTCTTCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU48JQB U 1
AF RR2H703JQB U 1
AF RR2FX74JQ U 1
BS 1 694 RR2FX74JQ

RD RR2GU48JQB 420 0 0
GGACTCGCAAAGT
AAACAGCTCTTTCTTTCAACAAATATACAGACACAATAAGTTATATGTTACAATAGATTT
AGGAGAAACTGTTTCTCTCAGAGGTGTATAAAGAAAAATGTTCACAAAGTAGTGGGCATC
TTGTCGTATCCAGTGAACTTCTACATCCGATATCAAGACGGTTGAAACATTAGGAATCAG
CCCATCATGTGTCAATCGGTTCAGCCTTGGACCTTGGCTTTCTCATCAGTGCTTCCTTCG
GTTTCTTCATCTGTCCCAGGATTCAGTGATGATAGTTTTCCGAATGACTCTTTTGCATCC
CCAAAAAAGTCTTTCACTTTGTCCAATACTGTTTTAAGCTGGTCCTGGGTTGGGAGCTCG
ATGACATCTGAAGTACTCAGTGCAGCTCTCATATTTCCATTTTCAAC

QA 14 420 14 420
DS 

RD RR2H703JQB 562 0 0
GAACTCGCAAAGT
AAACAGCTCTTTCTTTCAACAAATATACAGACACAATAAGTTATATGTTACAATAGATTT
AGGAGAAACTGTTTCTCTCAGAGGTGTATAAAGAAAAATGTTCACAAAGTAGTGGGCATC
TTGTCGTATCCAGTGAACTTCTACATCCGATATCAAGACGGTTGAGACATTAGGAATCAG
CCCATCATGTGTCAATCGGTTCAGCCTTGGACCTTGGCTTTCTCATCAGTGCTTCCTTCG
GTTTCTTCATCTGTCCCAGGATTCAGTGATGATAGTTTTCCGAATGACTCTTTTGCATCC
CCAAAAAAGTCTTTCACTTTGTCCAATACTGTTTTAAGCTGGTCCTGGGTTGGGAGCTCG
ATGACATCTGAAGTACTCAGTGCAGCTCTCATATTTCCATTTTCAACAAGTTTGTAGCCA
TATCGAAACTCAGTGGCAGTCCGCAAGACACGATGCTGCTTTATTGCTGTCTTTTGTATC
TCCTTCTCATCTCTGTAAATAACAGCAGCTATGTTTCTTGCAATGGTGTCTTTGTAGATA
TACTTCCCC

QA 14 562 14 562
DS 

RD RR2FX74JQ 694 0 0
GAACTCGCAAAGTAAACAGCTCTTTCTTTCAACAAATATACAGACACAATAAGTTATATG
TTACAATAGATTTAGGAGAAACTGTTTCTCTCAGAGGTGTATAAAGAAAAATGTTCACAA
AGTAGTGGGCATCTTGTCGTATCCAGTGAACTTCTACATCCGATATCAAGACGGTTGAGA
CATTAGGAATCAGCCCATCATGTGTCAATCGGTTCAGCCTTGGACCTTGGCTTTCTCATC
AGTGCTTCCTTCGGTTTCTTCATCTGTCCCAGGATTCAGTGATGATAGTTTTCCGAATGA
CTCTTTTGCATCCCCAAAAAAGTCTTTCACTTTGTCCAATACTGTTTTAAGCTGGTCCTG
GGTTGGGAGCTCGATGACATCTGAAGTACTCAGTGCAGCTCTCATATTTCCATTTTCAAC
AAGTTTGTAGCCATATCGAAACTCAGTGGCAGTCCGCAAGACACGATGCTGCTTTATTGC
TGTCTTTTGTATCTCCTTCTCATCTCTGTAAATAACAGCAGCTATGTTTCTTGCAATGGT
GTCTTTGTAGATATACTTCCCCAAGAGGTTGTCTTTAGCAGCAACCATGATTTTGGCAGT
TGTACCTCCAGCTATTATACTGAGAGGGTACCAAAGATACACATTGGCCATGCGAATGAA
GATAACGAATCTAGGGTTTCCGTAGTCTTCAATC

QA 1 694 1 694
DS 



CO CL79Contig5 955 6 45 U
GGATCCCCCAAAACTCCAGTTGCTCAAATGGAGGCAAGTATGTCCCTCAACGCGTTAACT
CGGCTTCCACTGAAGAACACGGGAAGACTCGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTG
TTCACCTCCTCGAGAACGCCATGCCAAGAGAAGGCGCAGC***GGAGGAGGGTTTTAGTG
GTGGAGGCGAAGGGGAAGAAAGGTATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCT
ATGCCTAAGATTGAAGACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGCATGGCCAAT
GTGTATCTTTGGTACCCTCTCAGTATAATAGCTGGAGGTACAACTGCCAAAATCATGGTT
GCTGCTAAAGACAACCTCTTGGGGAAGTATATCTACAAAGACACCATTGCAAGAAACATA
GCTGCTGTTATTTACAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCATCGT
GTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGATATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATG
AGAGCTGCACTGAGTACTTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACA
GTATTGGACAAAGTGAAAGACTTTTTTGGGGATGCAAAAGAGTCATTCGGAAAACTATCA
TCACTGAATCCTGGGACAGATGAAGAAACCGAAG*AAGCACTGATGAGAAAGCCAAGTAA
GTATACAGTGTAGACAGGGTCCAAGGCTGAACGATCGACACATGATGGGCTGATTCCAAA
TGTCTCAACTGTCTTGATATGGAATGCAGAAGTTCACTGGATAGGACGAGATTGTCACTA
CTTTGTGCACATTTTTCTTTATATACCTCTGAGAGAAACAGTTTCTCCTAAATCTCTTGT
AACATATAACTTATTGTGTCTGTAGATTTGTTGAAAGAAAGAGCTGTTTGGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 0 15 0 15 15 15 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 20 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 20 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG09TF U 1
AF RR2FX74TF U 28
AF RR2H703TF U 28
AF RR2GU48TF U 2
AF RR2E330TF U 30
AF RR2BZ27JQ C 189
BS 1 22 RR2GG09TF
BS 23 23 RR2GU48TF
BS 24 24 RR2GG09TF
BS 25 25 RR2GU48TF
BS 26 34 RR2GG09TF
BS 35 35 RR2GU48TF
BS 36 44 RR2GG09TF
BS 45 45 RR2GU48TF
BS 46 160 RR2GG09TF
BS 161 163 RR2GU48TF
BS 164 209 RR2GG09TF
BS 210 210 RR2GU48TF
BS 211 230 RR2GG09TF
BS 231 231 RR2GU48TF
BS 232 290 RR2GG09TF
BS 291 291 RR2GU48TF
BS 292 299 RR2GG09TF
BS 300 300 RR2GU48TF
BS 301 314 RR2GG09TF
BS 315 315 RR2GU48TF
BS 316 350 RR2GG09TF
BS 351 351 RR2GU48TF
BS 352 363 RR2GG09TF
BS 364 364 RR2GU48TF
BS 365 395 RR2GG09TF
BS 396 396 RR2GU48TF
BS 397 410 RR2GG09TF
BS 411 411 RR2GU48TF
BS 412 416 RR2GG09TF
BS 417 417 RR2GU48TF
BS 418 419 RR2GG09TF
BS 420 420 RR2GU48TF
BS 421 467 RR2GG09TF
BS 468 468 RR2GU48TF
BS 469 491 RR2GG09TF
BS 492 492 RR2GU48TF
BS 493 551 RR2GG09TF
BS 552 552 RR2GU48TF
BS 553 557 RR2GG09TF
BS 558 558 RR2GU48TF
BS 559 626 RR2GG09TF
BS 627 627 RR2GU48TF
BS 628 644 RR2GG09TF
BS 645 717 RR2GU48TF
BS 718 955 RR2BZ27JQ

RD RR2GG09TF 645 0 0
GGATCCCCCAAAACTCCAGTTGGTGAAATGGAGGTAAGTATGTCTCTCAACGCGTTAACT
CGGCTTCCACTGAAGAACACGGGAAGACTCGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTG
TTCACCTCCTCGAGAACGCCATGCCAAGAGAAGGCGCAGCAGCGGAGGAGGGTTTTAGTG
GTGGAGGCGAAGGGGAAGAAAGGTATGGCAGCGCGTCAGTATCAACGTACGCCTCCCCCT
ATGCCTAAGATTGAAGACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTATGGCCAAC
GTGTATCTTTGGTATCCTCTCAGTATAATAGCTGGAGGTACAACTGCCAAGATCATGGTT
GCTACTAAAGACAACCTCTTGGGGAAGTATATCTATAAAGACACCATTGCTAGAAATATT
GCTGCTGTTATTTACAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACAGCAATTAAGCAGCATCGT
GTCTTGCGGACAGCCACTGAGTTTCGATATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATG
AGAGCTGCACTTAGTACCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACA
GTATTGGACAAAGTGAAAGACTTTTT*GGGGATGCAAAAGAGTC
C

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2FX74TF 619 0 0
GG
GGAGGCAAGTATGTCCCTCAACGCGTTAACTCGGCTTCCACTGAAGAACACGGGAAGACT
CGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGTTCACCTCCTCGAGAACGCCATGCCAAGA
GAAGGCGCAGC***GGAGGAGGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGGAAGAAAGGTATGGC
GGCGCGTCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAAGACTACGGAAACCC
TAGATTCGTTATCTTCATTCGCATGGCCAATGTGTATCTTTGGTACCCTCTCAGTATAAT
AGCTGGAGGTACAACTGCCAAAATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACCTCTTGGGGAAGTA
TATCTACAAAGACACCATTGCAAGAAACATAGCTGCTGTTATTTACAGAGATGAGAAGGA
GATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGATA
TGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTGAGTACTTCAGATGTCAT
CGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTGGACAAAGTGAAAGACTTTTTTGG
GGATGCAAAAGAGTCAT

QA 3 619 3 619
DS 

RD RR2H703TF 579 0 0
GG
GGAGGCAAGTATGTCCCTCAACGCGTTAACTCGGCTTCCACTGAAGAACACGGGAAGACT
CGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGTTCACCTCCTCGAGAACGCCATGCCAAGA
GAAGGCGCAGC***GGAGGAGGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGGAAGAAAGGTATGGC
GGCGCGTCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAAGACTACGGAAACCC
TAGATTCGTTATCTTCATTCGCATGGCCAATGTGTATCTTTGGTACCCTCTCAGTATAAT
AGCTGGAGGTACAACTGCCAAAATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACCTCTTGGGGAAGTA
TATCTACAAAGACACCATTGCAAGAAACATAGCTGCTGTTATTTACAGAGATGAGAAGGA
GATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGATA
TGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTGAGTACTTCAGATGTCAT
CGAGCTCCCAACCCAG*ACCAGCTTAAAACAGTATTG

QA 3 579 3 579
DS 

RD RR2GU48TF 718 0 0
GGATCCCAAAAACTCCAGT
TGCTCAAATGGAGGCAAGTATGTCCCTCAACGCGTTAACTCGGCTTCCACTGAAGAACAC
GGGAAGACTCGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGTTCACCTCCTCGAGAACGCC
ATGCCAAGAGAAGGCGCAGC***GGAGGAGGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGGAAGAA
AGGTATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAAGACGA
CGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGCATGGCCAATGTGTATCTTTGGTACCCTCT
CAGTATAATAGCTGGAGGTACAACTGCCAAAATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACCTCTT
GGGGAAGTATATCTACAAAGACACCATTGCAAGAAACATAGCTGCTGTTATTTACAGAGA
TGAGAAGGAGATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGA
GTTTCGATATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTGAGTACTTC
AGATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTGGACAAAGTGAAAGA
CTTTTTTGGGGATGCAAAAGAGTCATTCGGAAAACTATCATCACTGAATCCTGGGACAGA
TGAAGAAACCGAAG*AAGCACTGATGAGAAAGCCAAG
TC

QA 20 716 20 716
DS 

RD RR2E330TF 688 0 0
GGAGGCAAGTATGTCCCTCAACGCGTTAACTCGGCTTCCACTGAAGAACACGGGAAGACT
CGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGTTCACCTCCTCGAGAACGCCATGCCAAGA
GAAGGCGCAGC***GGAGGAGGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGGAAGAAAGGTATGGC
GGCGCGTCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAAGACGACGGAAACCC
TAGATTCGTTATCTTCATTCGCATGGCCAATGTGTATCTTTGGTACCCTCTCAGTATAAT
AGCTGGAGGTACAACTGCCAAAATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACCTCTTGGGGAAGTA
TATCTACAAAGACACCATTGCAAGAAACATAGCTGCTGTTATTTACAGAGATGAGAAGGA
GATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGTATCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGATA
TGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTGAGTACTTCAGATGTCAT
CGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTGGACAAAGTGAAAGACTTTTTTGG
GGATGCAAAAGAGTCATTCGGAAAACTATCATCACTGAATCCTGGGACAGATGAAGAAAC
CGAAG*AAGCACTGATGAGAAAGCCAAG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2BZ27JQ 767 0 0
GAAGGGGAAGAAAGGTATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACTCCTCCCCCTATGCCTAA
GATTGAAGACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTATGGCCAATGTGTATCT
TTGGTATCCACTTAGTATAATAGCAGGTGGTACAACTGCTAAGATCATGGTTGCTGCTAA
AGACAACCTCTTGGGGAAGTATATCTATAAAGACACCATTGCAAGAAACATAGCTGCTGT
TATTTACAGGGATGAGAAGGAGATACAAAAGACAGCAATAAAGCAGCACCGTGTCTTGCG
GACTGCCACTGAGTTTCGATATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGC
ACTGAGTACTTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTGGA
CAAAGTGAAAGACTTTTTTGGGGATGCAAAAGAGTCATTCGGAAAACTATCATCACTGAA
TCCTGGGACAGATGAAGAAACCGAAGGAAGCACTGATGAGAAAGCCAAGTAAGTATACAG
TGTAGACAGGGTCCAAGGCTGAACGATCGACACATGATGGGCTGATTCCAAATGTCTCAA
CTGTCTTGATATGGAATGCAGAAGTTCACTGGATAGGACGAGATTGTCACTACTTTGTGC
ACATTTTTCTTTATATACCTCTGAGAGAAACAGTTTCTCCTAAATCTCTTGTAACATATA
ACTTATTGTGTCTGTAGATTTGTTGAAAGAAAGAGCTGTTTGGTTAC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 2 18

CO CL80Contig1 1377 16 25 U
GGACAAAGCTACAAAGGTCCGAATAAATTTATGTCCTTAAGTTTAACATGGATGCATTAT
AAAGTTGATCGTCTGTAGTTTATGCATCATTTTGTACATATGAACAGACCTTATGTTACA
ACAAGCATAAACAAACACTATGCACTCCCAAGTGACTTTCAAGTAATGTCTTAATCCAAT
ATATATGGGGAACATGATCGTAATCAGATCACTGAGAGACGACATTCGCTGATCATCTTA
GGCCACAACCGGGTACGATGCACATGCCGCAATACCACACATGTTCTTCCCCATCTCCAT
CTTGAAGTAACCTTTGTCACCCCAATCTGCTCCCCACGAGTTTTTGATAAGCCAATATGG
AACACCGTCTTCAATTCCATAACCAACCGCCAAAACAGCATGGTTCACGTCCATTGGAGT
CTTTCCACAGTGACTATCGCTGTAAACTCCGCTCCTGTAAAGCCGGAACGAGTGTATAAC
CTCAAATCCTATGCTTACTGGTCGTACCAATCCAACCGCATGCTTCAGTTCATCTTCAGC
ACCCAGAGTAATGTTGACAGAGTCAAGGACTTGTACACCGACGTTCTCAGCTGAATATTT
GCAGGTTCCATCTTCACCGGTGTAAGGATAAGCTTCCTCTGTGTCAAGGCCACCGTTGGA
TTTGATGTACTCAAAGGCTTGGGAAGGAAGGCCACCATTACAGCCATAGTTGTTGAAAGC
TCCGGCACAATCCACAAGCTGTTGCTCAGAGAGAGATATTCCTTTTCCAAATGCTTGATG
GTAAGCTGCTTCAAGCGCTCCAGTCGTGCTGAATGTCCAGCAAGAACCACAACCTCCCTG
GTCTTTGACTGGGCTAACAATACCATCCTCTCTCCAGTCTTTGGTTTCCGGAAGAGCTTC
TCCTTTGAGTTTGTGGGTCCCCTTTAAAGCGGCAGAGCAGTTTTGAGCAGCACCAAGCCT
GGTCCTTTGAAACTCTTGCCACGTCATATCAGCAAACTGATTGACACCGAGTTTGTAAGA
CAAGCCTTTCTTATTGGTGGATCTGATCAAATCCAGATTCTCCTTGAATATCGAGAACCT
GAGCTTCATCTCCTCCGCGTTCTCGTACCTTTTCCCGTACCGGTGAGTGAACCGAGCGAA
GGAGAGAGCGTGGCGGGTTTGTCCTAAGATCTCGACAACGGTTTGCTCTACTTCTCGTAG
ACGGTCGGAGACCATACGGATCGGGTTTGACTCGTCGAATCCGATACTCTCCGTCGCAGA
TACGGCTATGAGGATTAGTAGAACCACCGATGATAGGATTGTTCTCACAGTCAGAGTCAT
CATTGTCTTTTTTTTT*CCTCGACCAACGCGTCTGCTTTTGCTTCAGTGGTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 0 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 10 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 0 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 50 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 65 65 65 65 65 65 10 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 0 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 10 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 0 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 0 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2H649JQB U 222
AF RR2DS26JQ U 11
AF RR2DX49JQ U 5
AF RR2E345JQ U 7
AF RR2FB03JQ U 1
AF RR2D222JQ U 67
AF RR2DB56JQ U 69
AF RR2EO83JQ U 84
AF RR2CT93JQ U 16
AF RR2CE36JQ U 16
AF RR2EO83TF C 243
AF RR2DB56TF C 916
AF RR2E345TF C 528
AF RR2CE36TF C 667
AF RR2FB03TF C 798
AF RR2DX49TF C 909
BS 1 294 RR2FB03JQ
BS 295 295 RR2DB56JQ
BS 296 317 RR2FB03JQ
BS 318 318 RR2D222JQ
BS 319 336 RR2FB03JQ
BS 337 337 RR2DB56JQ
BS 338 438 RR2FB03JQ
BS 439 439 RR2D222JQ
BS 440 454 RR2FB03JQ
BS 455 455 RR2DB56JQ
BS 456 468 RR2FB03JQ
BS 469 469 RR2D222JQ
BS 470 483 RR2FB03JQ
BS 484 484 RR2DB56JQ
BS 485 645 RR2FB03JQ
BS 646 646 RR2D222JQ
BS 647 669 RR2FB03JQ
BS 670 670 RR2D222JQ
BS 671 766 RR2FB03JQ
BS 767 815 RR2CE36JQ
BS 816 821 RR2EO83TF
BS 822 1230 RR2E345TF
BS 1231 1231 RR2CE36TF
BS 1232 1374 RR2E345TF
BS 1375 1377 RR2DX49TF

RD RR2H649JQB 296 0 0
ACATTCGCTGATCATCTTAGGCCACAACCGGGTACGAAGCACATGCCGCAATACCACACA
TGTTCTTCCCCATCTCCATCTTGAAGTAACCTTTGTCACCCCAATCTGCTCCCCACGAGT
TTTTGATAAGCCAATATGGAACACCGTCTTCAATTCCATAACCAACCGCCAAAACAGCAT
GGTTCACGTCCATTGGAGTCTTTCCACAGTGACTATCGCTGTAAACTCCGCTCCTGTAAA
GCCGGAACGAGTGTATAACCTCAAATCCTATGCTTACTGGTCGTACCAATCCAACC

QA 1 296 1 296
DS 

RD RR2DS26JQ 592 0 0
ACAAAGGTCCGAATAAATTTATGTCCTTAAGTTTAACATGGATGCATTATAAAGTTGATC
GTCTGTAGTTTATGCATCATTTTGTACATATGAACAGACCTTATGTTACAACAAGCATAA
ACAAACACTATGCACTCCCAAGTGACTTTCAAGTAATGTCTTAATCCAATATATATGGGG
AACATGATCGTAATCAGATCACTGAGAGACGACATTCGCTGATCATCTTAGGCCACAACC
GGGTACGATGCACATGCCGCAATACCACACATGTTCTTCCCCATTTCCATCTTGAAGTAA
CCTTTGTTACCCCAATCTGCTCCCCATGAGTTTTTGATAAGCCAATATGGAACACCGTCT
TCAATTCCATAACCAACCGCCAAAACAGCATGGTTCACGTCCATTGGAGTCTTTCCACAG
TGACTATCACTGTAAACTCCGCTCTTGTAAAGCCGGAATGAGTGTATAACCTCGAATCCT
ATGCTTACTGGTCGTACCAATCCAACCGCATGCTTCAGTTCATCTTCAGCACCCAGAGTA
ATGTTGACAGAGTCAAGGACTTGTACACCGACGTTCTCAGCTGAATATTTGC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2DX49JQ 604 0 0
AAAGCT
ACAAAGGTCCGAATAAATTTATGTCCTTAAGTTTAACATGGATGCATTATAAAGTTGATC
GTCTGTAGTTTATGCATCATTTTGTACATATGAACAGACCTTATGTTACAACAAGCATAA
ACAAACACTATGCACTCCCAAGTGACTTTCAAGTAATGTCTTAATCCAATATATATGGGG
AACATGATCGTAATCAGATCACTGAGAGACGACATTCGCTGATCATCTTAGGCCACAACC
GGGTACGATGCACATGCCGCAATACCACACATGTTCTTCCCCATTTCCATCTTGAAGTAA
CCTTTGTTACCCCAATCTGCTCCCCATGAGTTTTTGATAAGCCAATATGGAACACCGTAT
TCAATTCCATAACCAACCGCCAAAACAGCATGGTTCACGTCCATTGGAGTCTTTCCACAG
TGACTATCACTGTAAACTCCGCTCTTGTAAAGCCGGAATGAGTGTATAACCTCGAATCCT
ATGCTTACTGGTCGTACCAATCCAACCGCATGCTTCAGTTCATCTTCAGCACCCAGAGTA
ATGTTGACAGAGTCAAGGACTTGTACACCGACGTTCTCAGCTGAATATTTGCAGGTTC

QA 7 604 7 604
DS 

RD RR2E345JQ 664 0 0
GGCT
ACAAAGGTCCGAATAAATTTATGTCCTTAAGTTTAACATGGATGCATTATAAAGTTGATC
GTCTGTAGTTTATGCATCATTTTGTACATATGAACAGACCTTATGTTACAACAAGCATAA
ACAAACACTATGCACTCCCAAGTGACTTTCAAGTAATGTCTTAATCCAATATATATGGGG
AACATGATCGTAATCAGATCACTGAGAGACGACATTCGCTGATCATCTTAGGCCACAACC
GGGTACGATGCACATGCCGCAATACCACACATGTTCTTCCCCATTTCCATCTTGAAGTAA
CCTTTGTTACCCCAATCTGCTCCCCATGAGTTTTTGATAAGCCAATATGGAACATCGTCT
TCAATTCCATAACCAACCGCCAAAACAGCATGGTTCACGTCCATTGGAGTCTTTCCACAG
TGACTATCACTGTAAACTCCGCTCTTGTAAAGCCGGAATGAGTGTATAACCTCGAATCCT
ATGCTTACTGGTCGTACCAATCCAACCGCATGCTTCAGTTCATCTTCAGCACCCAGAGTA
ATGTTGACAGAGTCAAGGACTTGTACACCGACGTTCTCAGCTGAATATTTGCAGGTTCCA
TCTTCACCGGTGTAAAGATAAGCTTCCTCTGTGTCGAGGCCACCGTTGGATTTGATGTAT

QA 5 664 5 664
DS 

RD RR2FB03JQ 766 0 0
GGACAAAGCTACAAAGGTCCGAATAAATTTATGTCCTTAAGTTTAACATGGATGCATTAT
AAAGTTGATCGTCTGTAGTTTATGCATCATTTTGTACATATGAACAGACCTTATGTTACA
ACAAGCATAAACAAACACTATGCACTCCCAAGTGACTTTCAAGTAATGTCTTAATCCAAT
ATATATGGGGAACATGATCGTAATCAGATCACTGAGAGACGACATTCGCTGATCATCTTA
GGCCACAACCGGGTACGATGCACATGCCGCAATACCACACATGTTCTTCCCCATTTCCAT
CTTGAAGTAACCTTTGTTACCCCAATCTGCTCCCCATGAGTTTTTGATAAGCCAATATGG
AACACCGTCTTCAATTCCATAACCAACCGCCAAAACAGCATGGTTCACGTCCATTGGAGT
CTTTCCACAGTGACTATCACTGTAAACTCCGCTCTTGTAAAGCCGGAATGAGTGTATAAC
CTCGAATCCTATGCTTACTGGTCGTACCAATCCAACCGCATGCTTCAGTTCATCTTCAGC
ACCCAGAGTAATGTTGACAGAGTCAAGGACTTGTACACCGACGTTCTCAGCTGAATATTT
GCAGGTTCCATCTTCACCGGTGTAAGGATAAGCTTCCTCTGTGTCGAGGCCACCGTTGGA
TTTGATGTATTCAAAGGCTTGGGAAGGAAGGCCACCATTACAGCCATAGTTGTTGAAAGC
TCCGGCACAATCCACAAGCTGTTGCTCAGAGAGAGATATTCCTTTT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2D222JQ 689 0 0
GATCGTCTGTAGTTTATGCATCATTTTGTACATATGAACAGACCTTATGTTACAACAAGC
ATAAACAAACACTATGCACTCCCAAGTGACTTTCAAGTAATGTCTTAATCCAATATATAT
GGGGAACATGATTGTAATCAGATCACTGAGAGACGACATTCGCTGATCATCTTAGGCCAC
AACCGGGTACGATGCACATGCCGCAATACCACACGTGTTCTTGCCCATTTCCATCTTGAA
GTAACCTTTGTCACCCCAATCTGCTCCCCATGAGTTTTTTATAAGCCAATATGGAACACC
GTCTTCAATTCCATAACCAACCGCCAAAACAGCATGGTTCACGTCCATTGGAGTCTTTCC
ACAGTGACTATCGCTGTAAACTCCGCTCTTGTAAAGCCGGAACGAGTGTATAACCTCGAA
TCCTATGCTTACTGGTCGTACCAATCCAACCGCATGCTTCAGTTCATCTTCAGCACCCAA
AGTAATGTTGACAGAGTCAAGGACTTGTACACCGACGTTCTCAGCTGAATATTTGCAGGT
TCCATCTTCACCGGTGTAAGGATAAGCTTCCTCTGTGTCAAGGCCACCGTTGGATTTGAT
GTACTCAAAGGCTTGGGAAGGAAGGCCACCATTACAGCCATAGTTGTTGAAAGCTCCGGC
ACAATCCACAAGCTGTTGCTCAGAGAGAG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2DB56JQ 706 0 0
TCGTCTGTAGTTTATGCATCATTTTGTACATATCAACAGACCTTATGTTACAACAAGCAT
AAACAAACACTATGCACTCCCAAGTGACTTTCAAGTGATGTCTTACTCCAATATATATGG
GGAACATGATTGTAATCAGATAGCTGAGAGACGACATTCGCTGATCATCTTAGGCCACAA
CCGGGTACGATGCACATGCCGCAATACCACACATGTTCTTCCCCATCTCCATCTTGAAGT
AACCTTTGTCACCCCAATCTGCTCCCCACGAGTTTTTGATAAGCCAATATGGAACACCGT
CTTCAATTCCATAACCAACCGCCAAAACAGCATGGTTCACGTCCATTGGAGTCTTTCCAC
AGTGACTATCGCTGTAAACTCCGCTCCTGTAAAGCCGGAACGAGTGTATAACCTCAAATC
CTATGCTTACTGGTCGTACCAATCCAACCGCATGCTTCAGTTCATCTTCAGCACCCATAG
TAATGTTGACAGAGTCAAGGACTTGTACACCGACGTTCTCAGCTGAATATTTGCAGGTTC
CATCTTCACCGGTGTAAGGATAAGCTTCCTCTGTGTCAAGGCCACCGTTGGATTTGATGT
ACTCAAAGGCTTGGGAAGGAAGGCCACCATTACAGCCATAGTTGTTGAAAGCTCCGGCAC
AGTCCACAAGCTGTTGCTCAGAGAGAGATATTCCTTTTCCAAATGC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2EO83JQ 685 0 0
GCATCATTTTGTACATATCAACAGACCTTATGTTACAACAAGCATAAACAAACACTATGC
ACTCCCAAGTGACTTTCAAGTGATGTCTTACTCCAATATATATGGGGAACATGATTGTAA
TCAGATAACTGAGAGACGACATTCGCTGATCATCTTAGGCCACAACCGGGTACGATGCAC
ATGCCGCAATACCACACATGTTCTTCCCCATCTCCATCTTGAAGTAACCTTTGTCACCCC
AATCTGCTCCCCACGAGTTTTTGATAAGCCAATATGGAACACCGTCTTCAATTCCATAAC
CAACCGCCAAAACAGCATGGTTCACGTCCATTGGAGTCTTTCCACAGCGACTATCGCTGT
AAACTCCGCTCCTGTAAAGCCGGAACGAGTGTATAACCTCAAATCCTATGCTTACTGGTC
GTACCAATCCAACCGCATGCTTCAGTTCATCTTCAGCACCCATAGTAATGTTGACAGAGT
CAAGGACTTGTACACCGACGTTCTCAGCTGAATATTTGCAGGTTCCATCTTCACCGGTGT
AAGGATAAGCTTCCTCTGTGTCAAGGCCACCGTTGGATTTGATGTACTCAAAGGCTTGGG
AAGGAAGGCCACCATTACAGCCATAGTTGTTGAAAGCTCCGGCACAGTCCACAAGCTGTT
GCTCAGAGAGAGATATTCCTTTTCC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2CT93JQ 713 0 0
GGTCCAAATAAATGTATGTCCTTAAATTTAACATGGATACATTATAAAGTTGATCGTCTG
TAGTTTATGCATCATTTTGTACATATCAACAGACCTTATGTTACAACAAGCATAAACAAA
CACTATGCACTCCCAAGTGACTTTCAAGTGATGTCTTACTCCAATATATATGGGGAACAT
GATTGTAATCAGATAACTGAGAGACGACATTCGCTGATCATCTTAGGCCACAACCGGGTA
CGATGCACATGCCGCAATACCACACATGTTCTTCCCCATCTCCATCTTGAAGTAACCTTC
GTCACCCCAATCTGCTCCCCACGAGTTTTTGATAAGCCAATATGGAACACCGTCTTCAAT
TCCATAACCAACAGCCAAAACAGCATGGTTCACGTCCATTGGAGTCTTTCCACAGTGACT
ATCGCTGTAAACTCCGCTCCTGTAAAGCCGGAACGAGTGTATAACCTCAAATCCTATGCT
TACTGGTCGTACCAATCCAACCGCATGCTTCAGTTCATCTTCAGCACCCATAGTAATGTT
GACAGAGTCAAGGACTTGTACACCGACGTTCTCAGCTGAATATTTGCAGGTTCCATCTTC
ACCGGTGTAAGGATAAGCTTCCTCTGTGTCAAGGCCACCGTTGGATTTGATGTACTCAAA
GGCTTGGGAAGGAAGGCCACCATTACAGCCATAGTTGTTGAAAGCTCCGG
TAC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2CE36JQ 800 0 0
GGTCCGAATAAATTTATGTCCTTAAGTTTAACATGGATGCATTATAAAGTTGATCGTCTG
TAGTTTATGCATCATTTTGTACATATGAACAGACCTTATGTTACAACAAGCATAAACAAA
CACTATGCACTCCCAAGTGACTTTCAAGTAATGTCTTAATCCAATATATATGGGGAACAT
GATCGTAATCAGATCACTGAGAGACGACATTCGCTGATCATCTTAGGCCACAACCGGGTA
CGATGCACATGCCGCAATACCACACATGTTCTTCCCCATTTCCATCTTGAAGTAACCTTT
GTTACCCCAATCTGCTCCCCATGAGTTTTTGATAAGCCAATATGGAACACCGTCTTCAAT
TCCATAACCAACCGCCAAAACAGCATGGTTCACGTCCACTGGAGTCTTTCCACAGTGACT
ATCACTGTAAACTCCGCTCTTGTAAGGCCGGAATGAGTGTATAACCTCGAATCCTATGCT
TACTGGTCGTACCAATCCAACCGCATGCTTCAGTTCATCTTCAGCACCCAGAGTAATGTT
GACAGAGTCAAGGACTTGTACACCGACGTTCTCAGCTGAATATT*GCAGGTTCCATCTTC
ACCGGTGTAAGGATAAGCTTCCTCTGTGTCGAGGCCACCGTTGGATTTGATGTATTCAAA
GGCTTGGGAAGGAAGGCCACCATTACAGCCATAGTTGTTGAAAGCTCCGGCACAATCCAC
AAGCTGTTGCTCAGAGAGAGATATTCCTTTTCCAAATGCTTGATGGTAAGCTGCTTCAAG
CGCTCCAGTCGTGCTGAATG

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2EO83TF 579 0 0
CCACAACCGGGTACGATGCACATGCCGCAATACCACACATGTTCTTCCCCATCTCCATCT
TGAAGTAACCTTTGTCACCCCAATCTGCTCCCCACGAGTTTTTGATAAGCCAATATGGAA
CACCGTCTTCAATTCCATAACCAACCGCCAAAACAGCATGGTTCACGTCCATTGGAGTCT
TTCCACAGCGACTATCGCTGTAAACTCCGCTCCTGTAAAGCCGGAACGAGTGTATAACCT
CAAATCCTATGCTTACTGGTCGTACCAATCCAACCGCATGCTTCAGTTCATCTTCAGCAC
CCATAGTAATGTTGACAGAGTCAAGGACTTGTACACCGACGTTCTCAGCTGAATATTTGC
AGGTTCCATCTTCACCGGTGTAAGGATAAGCTTCCTCTGTGTCAAGGCCACCGTTGGATT
TGATGTACTCAAAGGCTTGGGAAGGAAGGCCACCATTACAGCCATAGTTGTTGAAAGCTC
CGGCACAGTCCACAAGCTGTTGCTCAGAGAGAGATATTCCTTTTCCAAATGCTTGATGGT
AAGCTGCTTCAAGCGCTCCAGTCGTGCTGAATGTCCAGC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2DB56TF 220 0 0
GGTCCCCTTTAAAGCGGCAGAGCAGTTTTGAGCGGCACCAAGCCTGGTCCTTTGAAACTC
TTGCCACGTCATATCAGCAAACTGATTGACACCGAGTTTGTAAGACAAGCCTTTCTTATT
GGTGGATCTGATCAAATCCAGATTCTCCTTGAATATCGAGAATCTGAGCTTCATCTCCTC
CGCGTTCTCTACTCTTTTCCCGTACCGGTGAGTGAA
TCGC

QA 1 216 1 216
DS 

RD RR2E345TF 849 0 0
AG
TCATCTTCAGCACCCAGAGTA*TGTTGACAGAGTCAAGGACTTGTACAC*GACGTTCTCA
GCTGAATATTTGCAGGTTCCATCTTCACCGGTGTAAGGATAAGCTTCCTCTGTGTCGAGG
CCACCGTTGGATTTGATGTATTCAAAGGCTTGGGAAGGAAGGCCACCATTACAGCCATAG
TTGTTGAAAGCTCCGGCACAATCCACAGGCTGTTGCTCAGAGAGAGATATTCCTTTTCCA
AATGCTTGATGGTAAGCTGCTTCAAGCGCTCCAGTCGTGCTGAATGTCCAGCAAGAACCA
CAACCTCCCTGGTCTTTGACTGGGCTAACAATACCATCCTCTCTCCAGTCTTTGGTTTCC
GGAAGAGCTTCTCCTTTGAGTTTGTGGGTCCCCTTTAAAGCGGCAGAGCAGTTTTGAGCA
GCACCAAGCCTGGTCCTTTGAAACTCTTGCCACGTCATATCAGCAAACTGATTGACACCG
AGTTTGTAAGACAAGCCTTTCTTATTGGTGGATCTGATCAAATCCAGATTCTCCTTGAAT
ATCGAGAACCTGAGCTTCATCTCCTCCGCGTTCTCGTACCTTTTCCCGTACCGGTGAGTG
AACCGAGCGAAGGAGAGAGCGTGGCGGGTTTGTCCTAAGATCTCGACAACGGTTTGCTCT
ACTTCTCGTAGACGGTCGGAGACCATACGGATCGGGTTTGAATCGTCGAATCCGATACTC
TCCGTCGCAGATACGGCTATGAGGATTAGTAGAACCACCGATGATAGGATTGTTCTCACA
GTCAGAGTCATCATTGTCTTTTTTTTT*CCTCGACCAACGCGTCTGCTTTTGCTTCAGTG
GTTTT
CC

QA 3 847 3 847
DS 

RD RR2CE36TF 710 0 0
ATGTATCAAAGGC
TGGGAAGGAAGGCCACCATTACAGCCATAGTTGTTGAAAGCTCCGGCACAATCCACAAGC
TGTTGCTCAGAGAGAGATATTCCTTTTCCAAATGCTTGATGGTAAGCTGCTTCAAGCGCT
CCAGTCGTGCTGAATGTCCAGCAAGAACCACAACCTCCCTGGTCTTTGACTGGGCTAACA
ATACCATCCTCTCTCCAGTCTTTGGTTTCCGGAAGAGCTTCTCCTTTGAGTTTGTGGGTC
CCCTTTAAAGCGGCAGAGCAGTTTTGAGCAGCACCAAGCCTGGTCCTTTGAAACTCTTGC
CACGACATATCAGCAAACTGATTGACACCGAGTTTGTAAGACAAGCCTTTCTTATTGGTG
GATCTGATCAAATCCAGATTCTCCTTGAATATCGAGAACCTGAGCTTCATCTCCTCCGCG
TTCTCGTACCTTTTCCCGTACCGGTGAGTGAACCGAGCGAAGGAGAGAGCGTGGCGGGTT
TGTCCTAAGATCTCGACAACGGTTTGCTCTACTTCTCGTAGACGGTCGGAGACCATACGG
ATCGGGTTTGACTCGTCGAATCCGATACTCTCCGTCGCAGATACGGCTATGAGGATTAGT
AGAACCACCGATGATAGGATTGTTCTCACAGTCAGAGTCATCATTGTCTTTTTTTTT*CC
TCGACCAACGCGTCTGCTTTTGCTTCAGTGGTTTT
CC

QA 14 708 14 708
DS 

RD RR2FB03TF 549 0 0
CTCCAGTCGTGCTGAATGTCCAGCAAGAACCACAACCTCCCTGGTCTTTGACTGGGCTAA
CAATACCATCCTCTCTCCAGTCTTTGGTTTCCGGAAGAGCTTCTCCTTTGAGTTTGTGGG
TCCCCTTTAA*GCGGCAGAGCAGTTTTGAGCAGCACCAAGCCTGGTCCTTTGAAACTCTT
GCCACGTCATATCAGCAAACTGATTGACACCGAGTTTGTAAGACAAGCCTTTCTTATTGG
TGGATCTGATCAAATCCAGATTCTCCTTGAATATCGAGAACCTGAGCTTCATCTCCTCCG
CGTTCTCGTACCTTTTCCCGTACCGGTGAGTGAACCGAGCGAAGGAGAGAGCGTGGCGGG
TTTGTCCTAAGATCTCGACAACGGTTTGCTCTACTTCTCGTAGACGGTCGGAGACCATAC
GGATCGGGTTTGACTCGTCGAATCCGATACTCTCCGTCGCAGATACGGCTATGAGGATTA
GTAGAACCACCGATGATAGGATTGTTCTCACAGTCAGAGTCATCATTGTCTTTTTTTTTT
CCTCGACCA

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2DX49TF 469 0 0
GTTTGTGGGTCCCCTTTAAAGCGGCAGAGCAGTTTTGAGCAGCACCAAGCCTGGTCCTTT
GAAACTCTTGCCACGTCATATCAGCAAACTGATTGACACCGAGTTTGTAAGACAAGCCTT
TCTTATTGGTGGATCTGATCAAATCCAGATTCTCCTTGAATATCGAGAACCTGAGCTTCA
TCTCCTCCGCGTTCTCGTACCTTTTCCCGTACCGGTGAGTGAACCGAGCGAAGGAGAGAG
CGTGGCGGGTTTGTCCTAAGATCTCGACAACGGTTTGCTCTACTTCTCGTAGACGGTCGG
AGACCATACGGATCGGGTTTGACTCGTCGAATCCGATACTCTCCGTCGCAGATACGGCTA
TGAGGATTAGTAGAACCACCGATGATAGGATTGTTCTCACAGTCAGAGTCATCATTGTCT
TTTTTT***CCTCGACCAACGCGTCTGCTTTTGCTTCAGTGGTTTTTCC

QA 1 469 1 469
DS 



CO CL80Contig2 758 2 5 U
GGAACGCGGAGGAGATGAAGCTCAGATTCTCGATATTCAAGGAGAATCTGGATTTGATCA
GATCCACCAATAAGAAAGGCTTGTCTTACAAACTCGGTGTCAATCAGTTTGCCGATATGA
CGTGGCAAGAGTTTCAAAGGACCAGGCTTGGTGCCGCTCAAAACTGCTCTGCCGCTTTAA
AGGGAACCCACAAACTCACGGAAGCAGCTCTTCCAGAAACCAAAGACTGGAGAGAAGATG
GTATTGTTAGCCCAGTCAAAGACCAGGGAGGTTGTGGTTCTTGCTGGACATTCAGCACGA
CTGGAGCGCTTGAAGCAGCTTACCATCAAGCATTTGGAAAAGGAATATCTCTCTCTGAGC
AACAGCTTGTGGACTGTACCGGAGCTTTCAACAACTATGGCTGTAATGGTGGCCTTCCTT
CCCAAGCCTTTGAGTACATCAAATCCAACGGTGGCCTTGACACAGAGGAAGCTTATCCTT
ACACCGGTGAAGATGGAACCTGCAAATATTCAGCTGAGAACGTCGGTGTACAAGTCCTTG
ACTCTGTCAACATTACTATGGGTGCTGAAGATGAACTGAAGCATGCGGTTGGATTGGTAC
GACCAGTAAGCATAGGATTTGAGGTTATACACTCGTTCCGGCTTTACAGGAGCGGAGTTT
ACAGCGATAGTCACTGTGGAAAGACTCCAATGGACGTGAACCATGCTGTTTTGGCGGTTG
GTTATGGAATTGAAGACGTGTTCCATATTGGCTTATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT93TF U 66
AF RR2H649TF U 1
BS 1 112 RR2H649TF
BS 113 113 RR2CT93TF
BS 114 371 RR2H649TF
BS 372 378 RR2CT93TF
BS 379 758 RR2H649TF

RD RR2CT93TF 350 0 0
ACCAATAAGAAAGGCTTGTCTTACAAACTCGGTGTCAATCAGTTTGCCGATATGACGTGG
CAAGAGTTTCAAAGGACCAGGCTTGGTGCCGCTCAAAACTGCTCTGCCGCTTTAAAGGGA
ACCCACAAACTCACGGAAGCAGCTCTTCCAGAAACCAAAGACTGGAGAGAAGATGGTATT
GTTAGCCCAGTCAAAGACCAGGGAGGTTGTGGTTCTTGCTGGACATTCAGCACGACTGGA
GCGCTTGAAGCAGCTTACCATCAAGCATTTGGAAAAGGAATATCTCTCTCTGAGCAACAG
CTTGTGGACTGTACCGGAGCTTTCAACAACTATGGCTGTAATGGTGGCCT

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR2H649TF 758 0 0
GGAACGCGGAGGAGATGAAGCTCAGATTCTCGATATTCAAGGAGAATCTGGATTTGATCA
GATCCACCAATAAGAAAGGCTTGTCTTACAAACTCGGTGTCAATCAGTTTGCTGATATGA
CGTGGCAAGAGTTTCAAAGGACCAGGCTTGGTGCCGCTCAAAACTGCTCTGCCGCTTTAA
AGGGAACCCACAAACTCACGGAAGCAGCTCTTCCAGAAACCAAAGACTGGAGAGAAGATG
GTATTGTTAGCCCAGTCAAAGACCAGGGAGGTTGTGGTTCTTGCTGGACATTCAGCACGA
CTGGAGCGCTTGAAGCAGCTTACCATCAAGCATTTGGAAAAGGAATATCTCTCTCTGAGC
AACAGCTTGTG*******CCGGAGCTTTCAACAACTATGGCTGTAATGGTGGCCTTCCTT
CCCAAGCCTTTGAGTACATCAAATCCAACGGTGGCCTTGACACAGAGGAAGCTTATCCTT
ACACCGGTGAAGATGGAACCTGCAAATATTCAGCTGAGAACGTCGGTGTACAAGTCCTTG
ACTCTGTCAACATTACTATGGGTGCTGAAGATGAACTGAAGCATGCGGTTGGATTGGTAC
GACCAGTAAGCATAGGATTTGAGGTTATACACTCGTTCCGGCTTTACAGGAGCGGAGTTT
ACAGCGATAGTCACTGTGGAAAGACTCCAATGGACGTGAACCATGCTGTTTTGGCGGTTG
GTTATGGAATTGAAGACGTGTTCCATATTGGCTTATCA

QA 1 758 1 758
DS 



AS 2 19

CO CL81Contig1 1067 16 19 U
GGGATCCAAACAAACACAAGAAAATGCTAGATAATCTCCTTTTCTGAGCATTCTCTCTCT
AGAAAATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCGTTCTCTATCTCCTCCTCTCATTCCCAAAGTAT
CATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTACATCTTCTTCTTTGGCTCTCTCGAATCCCACCG
TCTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAACAG
ACGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTG
GCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTACG
TTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGT
CTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTA
GTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAA*TGGTATCCTTCAATT
GAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATT
ACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCG
GAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCA
AAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAA*GGA
TAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAGTT
CAGTCTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGTACTA
TGCTTATGTATCCAAAAAGTAGTGTATTGGTTCACTCTCGTATATACCAAACTGAGCCAG
GTCATAACATTGCTATCAAACCGGTTTAATAATGATTTGTTTTTGTTACGGTTTCTTGGT
ACATTGGTTTATTTGAGAAATATAGCTATATAAGTACACAATATGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 25 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 
60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 40 55 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 65 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 70 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 65 65 65 50 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA62TF U 32
AF RR2G188TF U 61
AF RR2AV09TF U 1
AF RR2E580TF U 131
AF RR2E083TF U 59
AF RR2FY18TF U 57
AF RR2FU34TF U 58
AF RR2AB04TF U 59
AF RR2AV09JQ C 468
AF RR2AB04JQ C 410
AF RR2G188JQ C 207
AF RR2CS10TF U 466
AF RR2FU34JQ C 299
AF RR2E013JQ C 366
AF RR2E083JQ C 653
AF RR2E580JQ C 722
BS 1 138 RR2AV09TF
BS 139 139 RR2GA62TF
BS 140 241 RR2AV09TF
BS 242 242 RR2GA62TF
BS 243 400 RR2AV09TF
BS 401 401 RR2GA62TF
BS 402 725 RR2AV09TF
BS 726 726 RR2FY18TF
BS 727 775 RR2AV09TF
BS 776 779 RR2FY18TF
BS 780 780 RR2FU34TF
BS 781 792 RR2FY18TF
BS 793 793 RR2AB04TF
BS 794 805 RR2FY18TF
BS 806 810 RR2AB04TF
BS 811 1005 RR2CS10TF
BS 1006 1006 RR2G188JQ
BS 1007 1013 RR2FU34JQ
BS 1014 1067 RR2E580JQ

RD RR2GA62TF 652 0 0
G
AATCTCCTTTTCTGAGCATTCTCTCTCTAGAAAATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCGTTCT
CTATCTCCTCCTCTCATTCCCAAAGTATCATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTACGTCT
TCTTCTTTGGCTCTCTCGAATCCCACCGTCTCTGGCCCGAAGCACCTTTCCACCCGGTTT
AGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAACAGACGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTA
TCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTGGCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTC
AACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTACGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTT
ACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGTCTGATCTTGAATACAGGAAGAAACTCCGACTC
AATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAG
GTTTTGGAGAAA*TGGTATCATTCAATTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTT
GATTACTAGCCAGAAGGATGGGGCCATTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGG
TGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCAC

QA 2 652 2 652
DS 

RD RR2G188TF 633 0 0
G
GAAAATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCGTTCTCTATCTCCTCCTCTCATTCCCAAAGTATC
ATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTACATCTTCTTCTTTGGCTCTCTCGAATCCCACCGT
CTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAACAGA
CGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTGG
CACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTACGT
TGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGTC
TGATCTCGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTAG
TAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAA*TGGTATCCTTCAATTG
AAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTA
CTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGG
AAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAA

QA 2 633 2 633
DS 

RD RR2AV09TF 775 0 0
GGGATCCAAACAAACACAAGAAAATGCTAGATAATCTCCTTTTCTGAGCATTCTCTCTCT
AGAAAATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCGTTCTCTATCTCCTCCTCTCATTCCCAAAGTAT
CATCTTCTCATCAATCCATACTCGCTACATCTTCTTCTTTGGCTCTCTCGAATCCCACCG
TCTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAACAG
ATGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTG
GCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTACG
TTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCGGATCTGAAGAAACTCTTGT
CTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTA
GTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAA*TGGTATCCTTCAATT
GAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATT
ACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCG
GAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCA
AAACGTTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2E580TF 645 0 0
GG
AATCCAAACTCGCTACATCTTCTTCTTTGGCTCTCTCGAATCCCACCGTCTCTGGCCCGA
AACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAACAGACGCAAAGCAAG
GACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTGGCACTACCTTAG
CCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTACGTTGTAGACGACG
CTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGTCTGATCTTGAAT
ACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTAGTAAAGCAGATG
CGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAAATGGTATCCTTCAATTGAAGAAGGCAAC
AATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTACTGGTGGTCCT
GCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGGAAAATCTTCCC
GTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCAAAACGGTTGGTT
GCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGA

QA 3 645 3 645
DS 

RD RR2E083TF 683 0 0
GG
AGAAAATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCGTTCTCTATCTCCTCCTCTCATTCCCAAAGTAT
CATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTACATCTTCTTCTTTGGCTCTCTCGAATCCCACCG
TCTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAACAG
ACGCAAAGCAAGGACTATCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTG
GCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTACG
TTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGT
CTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTA
GTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAA*TGGTATCCTTCAATT
GAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATT
ACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCG
GAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCA
AAACGGTTGGTTGCAGCAATT

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2FY18TF 766 0 0
GG
CTAGAAAATGGAGACCCTTCCCTCTCCTCGTTCTCTATCTCCTCCTCTCATTCCCAAAGT
ATCATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTACATCTTCTTCTTTGGCTCTCTTGAATCCCAC
CGTCTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAAC
AGACGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGT
TGGCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTA
CGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTT
GTCTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCAC
TAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAA*TGGTATCCTTCAA
TTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCA
TTACTGGTGGTCTTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCT
CGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTG
CAAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACG*TCTCC*AGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAA*G
G*TAACAAGAGAGA*TCAAATTTCAAA
CCAAGAGAACAGAGAGA

QA 3 749 3 749
DS 

RD RR2FU34TF 736 0 0
GG
TAGAAAATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCGTTCTCTATCTCCTCCTCTCATTCCCAAAGTA
TCATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTACATCTTCTTCTTTGGCTCTCTCGAATCCCACC
GTCTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAACA
GATGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTT
GGCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTAC
GTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTG
TCTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACT
AGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAA*TGGTATCCTTCAAT
TGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCAT
TACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTC
GGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGC
AAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAA*GG
ATAACAAGAGAGA
T

QA 3 735 3 735
DS 

RD RR2AB04TF 752 0 0
GG
AGAAAATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCGTTCTCTATCTCCTCCTCTCATTCCCAAAGTAT
CATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTACATCTTCTTCTTTGGCTCTCTCGAATCCCACCG
TCTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAACAG
ACGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTG
GCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTACG
TTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGT
CTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTA
GTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAA*TGGTATCCTTCAATT
GAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATT
ACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCG
GAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCA
AAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAAAGGA
TAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAA

QA 3 752 3 752
DS 

RD RR2AV09JQ 366 0 0
CGGAAGCTCACTAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAA*TG
GTATCCTTCAATTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAA
GGAAGGGGCCATTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTTTTGA
TGCTACTGTTTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCCCAGACGAAAAATACAATGAGGCAAT
ATACAGCAGTGCAAAACGTTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCC
AGAAGTGAA*GGATAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGA
AG
GGGG

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR2AB04JQ 531 0 0
GAAACTCTTGTCTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCG
GAAGCTCACTAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAA*TGGT
ATCCTTCAATTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGG
AAGGGGCCATTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATG
CTACTGTCTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATAT
ACAGCAGTGCAAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAG
AAGTGAA*GGATAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAG
AGAGGACAGTTCAGTCTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCCCATG
GCTCAGTACTATGCTTATGTATCCAAAAAGTAGTGTATTGGTTCACTCTCG

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2G188JQ 801 0 0
CCGG
TTAGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAACAGACGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTC
TATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTGGCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTC
TCAACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTACGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAG
TTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGTCTGATCTCGAATACAGAAAGAAACTCCGAC
TCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACC
AGGTTTTGGAGAAA*TGGTATCCTTCAATTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTT
TTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTT
GGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAA
AAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCAAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTC
CCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAA*GGATAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAA
AGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAGTTCAGTCTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAAT
TGCCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGTACTATGCTTATGTATCCAAAAAGTAGTGTATTGG
TTCACTCTCGTATATACCAAACTGAGCCAGGTCATAACATTGCTATCAAACCGGTTTAAT
AATGATTTGTTTTTGT
C

QA 5 800 5 800
DS 

RD RR2CS10TF 540 0 0
G
CCGGAAGCTCACTAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAA*T
GGTATCCTTCAATTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGA
AGGAAGGGGCCATTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTG
ATGCTACTGTCTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAA
TATACAGCAGTGCAAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTC
CAGAAGTGAA*GGATAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAG
AAGAGAGGACAGTTCAGTCTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCCC
ATGGCTCAGTACTATGCTTATGTATCCAAAAAGTAGTGTATTGGTTCACTCTCGTATATA
CCAAACTGAGCCAGGTCATAACATTGCTATCAAACCGGTTTAATAATGATTTGTTTTTG

QA 2 540 2 540
DS 

RD RR2FU34JQ 716 0 0
TGGCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAACTTA
CGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTT
GTCTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCAC
TAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAA*TGGTATCCTTCAA
TTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCA
TTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCT
CGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTG
CAAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAA*G
GATAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAG
TTCAGTCTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGTAC
TATGCTTATGTATCCAAGAAGTAGTGTATTGGTTCACTCTCGTATATACCAAACTGAGCC
AGGTCATAACATTGCTATCAAACCGGTTTAATAATGATTTGTTTTTGTTACGGTT
T

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2E013JQ 649 0 0
GACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGTCTGAT
CTTTAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTAGTAAA
GCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAA*TGGTATCCTTTAATTGAAGA
AGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTACTGG
TGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGGAAAA
TCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCAAAACG
GTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAA*GGATAACA
AGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAAGACAGTTCAGTC
TTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGTACTATGCTT
ATGTATCCAAAAAGTAGTGTATTGGTTCACTCTCGTATATACCAAACTGAGCCAGGTCAT
AACATTGCTATCAAACCGGTTTAATAATGATTTGTTTTTGTTACGGTT
T

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2E083JQ 362 0 0
CTGTCTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGAGGAAAAATACAATGAGGCAATATACA
GCAGTGCAAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAG
TGAA*GGATAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGA
GGACAGTTCAGTCTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCCCATGGCT
CAGTACTATGCTTATGTATCCAAAAAGTAGTGTATTGGTTCACTCTCGTATATACCAAAC
TGAGCCAGGTCATAACATTGCTATCAAACCGGTTTAATAATGATTTGTTTTTGTTACGGT
T
C

QA 1 361 1 361
DS 

RD RR2E580JQ 346 0 0
AACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAA*GGAT
AACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAGTTC
AGTCTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGTACTAT
GCTTATGTATCCAAAAAGTAGTGTATCGGTTCACTCTCGTATATACCAAACTGAGCCAGG
TCATAACATTGCTATCAAACCGGTTTAATGATGATTTGTTTTTGTTACGGTTTCTTGGTA
CATTGGTTTATTTGAGAAATATAGCTATATAAGTACACAATATGGC

QA 1 346 1 346
DS 



CO CL81Contig2 1143 3 5 U
AACAAAAACAAATCATTATTACCGGTTTGATAGCAATGTCATGACCTGGCTCAGTTTGGT
ATATACAAAAGTGAACCAATACACTACTTTTTGGATACATAACCATAGTACTGAGCCATG
GGAACAACAAAGGCAATTACAAGCAAACCTCCAACGAAAAGACTGAGCTGTCCTCTCTTC
TCTTCTGTTTCTTCTTTGGTTTTGAAATTTGATTCTCTCTTGTTATCCTTCACTTCTGGA
CCCCCGGGATCGGGGAGACCGTCAATTGCTGCAACCAACCGTTTTGCACTGCTGTATATT
GCCTCATTGTATTTTTCGTCTGTGGCTAATACTGCACCATCATAAATTCAAACAGTCATC
ACGTCCAATACAAACCACCGAGACTAAAAATACTAGGTTCTATTTTGATTACTATTATTT
CTAAACCCAATCAAAATCAAGATTAAAGACACTTGGTTTCAGCCTCTCTCTGTACTGAAA
TTCTAAGAGTGCTGTATAATCTATACCAGACTGAGAGGAAAACGTACCGGGAAGATTTTC
CGAGACAGTAGCATCAAGAATCTTTTCACCAACAGCTTCAATGAAAGCAGGACCACCAGT
AATGGCCCCTTCCTTCTGGCTAGTAATCAAAACAACAATACCCTTATTGTTGCCTTCTTC
AATTGAAGGATACCATTTCTCCAAAACCTGGTCTGCATACTCGAACGCATCTGCTTTACT
AGTGAGCTTCCGGACAGTGATGAAATTGAGTCGGAGTTTCTTTCTGTATTCAAGATCAGA
CAAGAGTTTCTTCAGATCTGATCTCGTAACTCGACTAAGAGCACCAGCGTCGTCTACAAC
GTAAGTTTCTTTGGGTGGACCATCGTTGAGAATATTGAACTCAGAGGCTAAGGCAGTGCC
AACAGGTGAGAAAGTAAGGGCCAGAGATAGAGATAGAGCAGCTAGTCCTTGCTTTGCGTC
TGTTAACCACGATTCTGGTTTAGCACTAAACCGGGTGGAAAGGTGTTTCGGGCCAGAGAC
GGTGGGATTCGAGAGAGCCAAAGAAGAAGATGTAGCGAGTTTGGATTGATGAGAAGATGA
TACTTTGGGAATGAGAGGAGGAGATAGAGAACGAGGAGAGAGAAGGGTCTCCATTTTCTA
GCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2GA62JQ U 1
AF RR2F388JQ U 58
AF RR2F388TF C 366
BS 1 154 RR2GA62JQ
BS 155 513 RR2F388JQ
BS 514 514 RR2F388TF
BS 515 882 RR2F388JQ
BS 883 1143 RR2F388TF

RD RR2GA62JQ 154 0 0
AACAAAAACAAATCATTATTACCGGTTTGATAGCAATGTCATGACCTGGCTCAGTTTGGT
ATATACAAAAGTGAACCAATACACTACTTTTTGGATACATAACCATAGTACTGAGCCATG
GGAACAACAAAGGCAATTACAAGCAAACCTCCAA

QA 1 154 1 154
DS 

RD RR2F388JQ 825 0 0
GGTATATACGAGAGTGAACCAATACACTACTTTTTGGATACATAAGCATAGTACTGAGCC
ATGGGAACAACAAAGGCAATTACAAGCAAACCTCCAACGAAAAGACTGAGCTGTCCTCTC
TTCTCTTCTGTTTCTTCTTTGGTTTTGAAATTTGATTCTCTCTTGTTATCCTTCACTTCT
GGACCCCCGGGATCGGGGAGACCGTCAATTGCTGCAACCAACCGTTTTGCACTGCTGTAT
ATTGCCTCATTGTATTTTTCGTCTGTGGCTAATACTGCACCATCATAAATTCAAACAGTC
ATCACGTCCAATACAAACCACCGAGACTAAAAATACTAGGTTCTATTTTGATTACTATTA
TTTCTAAACCCAATCAAAATCAAGATTAAAGACACTTGGTTTCAGCCTCTCTCTGTACTG
AAATTCTAAGAGTGCTGTATAATCTATACCAGACTGGGAGGAAAACGTACCGGGAAGATT
TTCCGAGACAGTAGCATCAAGAATCTTTTCACCAACAGCTTCAATGAAAGCAGGACCACC
AGTAATGGCCCCTTCCTTCTGGCTAGTAATCAAAACAACAATACCCTTATTGTTGCCTTC
TTCAATTGAAGGATACCATTTCTCCAAAACCTGGTCTGCATACTCGAACGCATCTGCTTT
ACTAGTGAGCTTCCGGACAGTGATGAAATTGAGTCGGAGTTTCTTTCTGTATTCAAGATC
AGACAAGAGTTTCTTCAGATCTGATCTCGTAACTCGACTAAGAGCACCAGCGTCGTCTAC
AACGTAAGTTTCTTTGGGTGGACCATCGTTGAGAATATTGAACTC

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR2F388TF 778 0 0
CAATACAAACCAC*GAGACTAAAAATACTAGGTTCTATTT*GATTACTATTATTTCTAAA
CCCAATCAAAATCAAGATTAAAGACACTTGGTTTCAGCCTCTCTCTGTACTGAAATTCTA
AGAGTGCTGTATAATCTATACCAGACTGAGAGGAAAACGTACCGGGAAGATTTTCCGAGA
CAGTAGCATCAAGAATCTTTTCACCAACAGCTTCAATGAAAGCAGGACCACCAGTAATGG
CCCCTTCCTTCTGGCTAGTAATCAAAACAACAATACCCTTATTGTTGCCTTCTTCAATTG
AAGGATACCATTTCTCCAAAACCTGGTCTGCATACTCGAACGCATCTGCTTTACTAGTGA
GCTTCCGGACAGTGATGAAATTGAGTCGGAGTTTCTTTCTGTATTCAAGATCAGACAAGA
GTTTCTTCAGATCTGATCTCGTAACTCGACTAAGAGCACCAGCGTCGTCTACAACGTAAG
TTTCTTTGGGTGGACCATCGTTGAGAATATTGAACTCAGAGGCTAAGGCAGTGCCAACAG
GTGAGAAAGTAAGGGCCAGAGATAGAGATAGAGCAGCTAGTCCTTGCTTTGCGTCTGTTA
ACCACGATTCTGGTTTAGCACTAAACCGGGTGGAAAGGTGTTTCGGGCCAGAGACGGTGG
GATTCGAGAGAGCCAAAGAAGAAGATGTAGCGAGTTTGGATTGATGAGAAGATGATACTT
TGGGAATGAGAGGAGGAGATAGAGAACGAGGAGAGAGAAGGGTCTCCATTTTCTAGCC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 2 21

CO CL82Contig1 570 4 6 U
ATGCTATCAGAGCTTATTTTAAAATTATTTCAACACGTACAGAGCGGTTACAGTCTATCT
TTACTTTACTTAATAGGTCGATCCATAGATCTATATATGATTGGCCTATACCAACCTTGG
TTTTATTTCAACCCAACAAAAAAAAATCTCTAAATTATTATTAGCTAGCCTTGAATAATA
TTATATATGTGTAGTGGCAAAATGAATGTAGTAAATAAGCAGCCTCTGAAAGAGAGAGCT
CAAGGTAGCTTGACTTTGTCTACACCAACTGTAGTATTTGAAGCAGCCTCGGTCTGGATA
GCAGTCTCCACGAACTGAGTCGTCACTGTTTCCCATCTGGTGATTGTTTGTTTGATCTCT
GTTTTTTGCTCTGCTGTCACTGCCACTGACCCCTCTACCTTTCCTTGGTTTGCTTCAATG
ATTTTCTTGTGGATGGCTTCTAACTCTTGCAGTGACTTGGCCACCTCTTGTTGGTAGGTC
TCCATGGATTTTTTGACCTCTGCTGACTTGCCAGTAAATTTTGAACCAATGAAAGACACC
GCATCAGATATTTTTCCAGCTGCAGCAGAA


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2DE49JQ U 1
AF RR2DM64JQ U 1
AF RR2D366JQ U 3
AF RR2GA94JQ U 34
BS 1 229 RR2DE49JQ
BS 230 230 RR2DM64JQ
BS 231 473 RR2DE49JQ
BS 474 474 RR2DM64JQ
BS 475 565 RR2DE49JQ
BS 566 570 RR2D366JQ

RD RR2DE49JQ 565 0 0
ATGCTATCAGAGCTTATTTTAAAATTATTTCAACACGTACAGAGCGGTTACAGTCTATCT
TTACTTTACTTAATAGGTCGATCCATAGATCTATATATGATTGGCCTATACCAACCTTGG
TTTTATTTCAACCCAACAAAAAAAAATCTCTAAATTATTATTAGCTAGCCTTGAATAATA
TTATATATGTGTAGTGGCAAAATGAATGTAGTAAATAAGCAGCCTCTGAGAGAGAGAGCT
CAAGGTAGCTTGACTTTGTCTACACCAACTGTAGTATTTGAAGCAGCCTCGGTCTGGATA
GCAGTCTCCACGAACTGAGTCGTCACTGTTTCCCATCTGGTGATTGTTTGTTTGATCTCT
GTTTTTTGCTCTGCTGTCACTGCCACTGACCCCTCTACCTTTCCTTGGTTTGCTTCAATG
ATTTTCTTGTGGATGGCTTCTAACTCTTGCAGTGACTTGGCCACCTCTTGTTG*TAGGTC
TCCATGGATTTTTTGACCTCTGCTGACTTGCCAGTAAATTTTGAACCAATGAAAGACACC
GCATCAGATATTTTTCCAGCTGCAG

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2DM64JQ 543 0 0
AT
GCTATCAGAGCTTGTTTTAAAATTATTTCAACACGTACAGAGCGGTTACAGTCTATCTTT
ACTTTACTTAATAGGTCGATCCATAGATCTATATATGATTGGCCTATACCAACCTTGGTT
TTATTTCAACCCAACAAAAAAAAATCTCTAAATTATTATTAGCTAGCCTTGAATAATATT
ATATATGTGTAGTGGCAAAATGAATGTGGTAGATAAGCAGCCTCTGAAAGAGAGAGCTCA
AGGTAGCTTGACTTTGTCTACACCAACTGTAGTATTTGAAGCAGCCTCGGTCTGGATAGC
AGTCTCCACGAACTGAGTCGTCACTGTTTCCCATCTGGTGATTGTTTGTTTGATCTCTGT
TTTTTGCTCTGCTGTCACTGCCACTGACCCCTCTACCTTTCCTTGGTTTGCTTCAATGAT
TTTCTTGTGGATGGCTTCTAACTCTTGCAGTGACTTGGCCACCTCTTGTTGGTAGGTCTC
CATGGATTTTTTGACCTCTGCTGACCTGCCAGTAAATTTTGAACCAATGAAAGACACCGC
A

QA 3 543 3 543
DS 

RD RR2D366JQ 568 0 0
GCTATCAGAGCTTATTTTAAAATTATTTCAACACGTACAGAGCGGTTACAGTCTATCTTT
ACTTTACTTAATAGGTCGATCCATAGATCTATATATGATTGGCCTATACCAACCTTGGTT
TTATTTCAACCCAACAAAAAAAAATCTCTAAATTATTATTAGCTAGCCTTGAATAATATT
ATATATGTGTGGTGGCAAAATGAATGTAGTAAATAAGCAGCCTCTGAAAGAGAG**CTCA
AGGTAGCTTGACTTTGTCTACACCAACTGTAGTATTTGAAGCAGCCTCGGTCTGGATAGC
AGTCTCCACGAACTGAGTCGTCACTGTTTCCCATCTGGTGATTGTTTGTTTGATCTCTGT
TTTTTGCTCTGCTGTCACTGCCACTGACCCCTCTACCTTTCCTTGGTTTGCTTCAATGAT
TTTCTTGTGGATGGCTTCTAACTCTTGCAGTGACTTGGCCACCTCTTGTTGGTAGGTCTC
CATGGATTTTTTGACCTCTGCTGACTTGCCAGTAAATTTTGAACCAATGAAAGACACCGC
ATCAGATATTTTTCCAGCTGCAGCAGAA

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2GA94JQ 510 0 0
CACGTACAGAGCGGTTACAGTCTATCTTTACTTTACTTAATAGGTCGATCCATAGATCTA
TATATGATTGGCCTATACCAACCTTGGTTTTATTTCAACCCAACAAAAAAAAATCTCTAA
ATTATTATTAGCTAGCCTTGAATAATATTATATATGTGTAGTGGCAAAATGAATGTAGTA
GATAAGCAGCCTCTGAGAGAGAG**CTCAAGGTAGCTTGACTTTGTCTACACCAACTGTA
GTATTTGAAGCAGCCTCGGTCTGGATAGCAGTCTCCACGAACTGAGTCGTCACTGTTTCC
CATCTGGTGATTGTTTGTTTGATCTCTGTTTTTTGCTCTGCTGTCACTGCCACTGACCCC
TCTACCTTTCCTTGGTTTGCTTCAATGATTTTCTTGTGGATGGCTTCTAACTCTTGCAGT
GACTTGGCCACCTCTTGTTGGTAGGTCTCCATGGATTTTTTGACCTCTGCTGACTTGCCA
GTAAATTTTGAACCAATGAAAGACACCGCA

QA 1 510 1 510
DS 



CO CL82Contig2 980 17 17 U
TTTTTAAAACCAAAACAAAACAAAACAAAAAATTACAAAACATAAAA*AGAAAAACATAA
AA*TAATGGCAAGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTTTCTCCTTGCATCAGTGACCT
TTATGGAACATGTTTCAAGTGCCACCACCGCCGCCAGCTCTAGCTCAACCACAACAGTGG
CACAGCTCGAGACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAGTTCATAATGAAGCTGGAGAAGA
AGTGTCCACCAAAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGCACCATGGTAG
CCTCCACAAAGGTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGCAAAA
TATCTGATGCGGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCTGAGGTCAAAA
AA*TCCATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCAAGAGTTAGAAGCCATC
CACAAGAAAATCATTGAAGCAAACCAAGGGAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCA
GAACAAAAAACAGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTGACGACTCAATTC
GTGGAGACAGCTATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACAAAGTC
AAGCTACCTTGAGCTCTCTCTC**AGAGGCTGCTTATCTACTACATTCATTTTGCCACTA
CACATAAAATATTTTATTCAAGGCTAGCTAATAATAATTTAGAGATTCTTTTTTTTTGTT
GGGTTGAAATAAAACCAAGGTTGGTATAGGCCAATCATATATAGATCTATGGATCGACCT
ATTAAGTAAGTAAAGATAGACTGTAACCGCGCTCTGTACGTGTTGAAATAATTTTAAAAT
AAGCTCTGATAGCATAAGATGAGAAGATTGTCTAAATCTTTTTTTTTCACTCTGAAAATG
TAGACTAGATCCTTGACTGC


BQ
10 10 10 10 10 45 45 45 45 45 45 15 15 15 0 15 70 70 70 15 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 25 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 15 70 70 70 55 55 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 5 5 5 45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 5 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 15 70 70 70 70 70 70 70 70 15 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 35 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 
50 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 
70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 25 60 60 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 40 40 55 35 35 50 50 50 50 45 45 45 40 5 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH19JQ C 6
AF RR2AH19TF U 6
AF RR2DE49TF U 12
AF RR2DM64TF U 12
AF RR2FD78JQ C 349
AF RR2GA94TF U 12
AF RR2FX61TF U 1
AF RR2D366TF U 12
AF RR2FH34TF U 1
AF RR2G746TF U 1
AF RR2FD78TF U 12
AF RR2CA24TF U 6
AF RR2A678TF U 6
AF RR2A678JQ C 698
AF RR2FX61JQ C 681
AF RR2CA24JQ C 366
AF RR2FH34JQ C 202
BS 1 53 RR2FH34TF
BS 54 55 RR2FX61TF
BS 56 197 RR2FH34TF
BS 198 198 RR2FX61TF
BS 199 217 RR2FH34TF
BS 218 218 RR2FX61TF
BS 219 483 RR2FH34TF
BS 484 484 RR2FX61TF
BS 485 556 RR2FH34TF
BS 557 557 RR2FX61TF
BS 558 688 RR2FH34TF
BS 689 689 RR2A678TF
BS 690 740 RR2FH34TF
BS 741 741 RR2A678TF
BS 742 742 RR2FH34JQ
BS 743 799 RR2A678TF
BS 800 980 RR2FH34JQ

RD RR2AH19JQ 114 0 0
AAAACCAAAACAAAACAAAACAAAAAATTACAAAACATAAAA*AGAAAAACATAAAA*TA
ATGGCAAGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTTTCTCCTTGCATCAGTGACC

QA 1 114 1 114
DS 

RD RR2AH19TF 479 0 0
AAAACCAAAACAAAACAAAACAAAAAATTACAAAACATAAAA*AGAAAAACATAAAA*TA
ATGGCAAGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTTTCTCCTTGCATCAGTGACCTTTATG
GAACATGTTTCAAGTGCCACCACCGCCGCCAGCTCTAGCTCAACCACAACAGTGGCACAG
CTCGAGACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAGTTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGTGT
CCACCAGAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGCACCATGGTAGCCTCC
ACAAAGGTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGCAAAATATCT
GATGCGGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCTGAGGTCAAAAAA*TC
CATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCACGAGTTAGAAGCCATCCACA

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR2DE49TF 509 0 0
TTTTTAAACCAAAACAAAAAAGTACAAAACATAAAACAAAAAAACATAAAAATAATGGCA
AGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTTTCTCCTTGCATCAGTGACCTTTATGGAACAT
GTTTCAAGTGCCACCACCGCC***TGCTCTGGCTCAACCACAACAGTGGCACAACTTGAG
ACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAGTTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGTGTCCACCA
AAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGTACCATGGTGGCCTCCACAAAG
GTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGAAAAATATCTGATGCG
GTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCAGAGGTCAAAAAA*TCCATGGA
GACCTAC*AACAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCAAGAGTTAGAAGCCATCCACAAGAAAAT
CATTGAAGCAAACCAAGGAAAGGTAGAGG

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2DM64TF 539 0 0
TTTTTAAACCAAAACAAAAAAGTACAAAACATAAAACAAAAAAACATAAAAATAATGGCA
AGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTTTCTCCTTGCATCAGTGACCTTTATGGAACAT
GTTTCAAGTGCCACCACCGCC***AGCTCTAGCTCAACCACAACAGTGGCACAACTTGAG
ACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAGTTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGTGTCCACCA
AAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGTACCATGGTGGCCTCCACAAAG
GTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGAAAAATATCTGATGCG
GTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAGGTCAGCAGAGGTCAAAAAA*TCCATGGA
GACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCAAGAGTTAGAAGCCATCCACAAGAAAAT
CATTGAAGCAAACCAAGGAAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCAGAGCAAAAAA

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2FD78JQ 276 0 0
CAGCTGGAAAAATATCTGATGCGGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAG
CAGAGGTCAAAAAA*TCCATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCAGGAG
TTAGAAGCCGTCCACAAGAAAATCATTGAAGCAAACCAAGGAAAGGTAGAGGGGTCAGTG
GCAGTGACAGCAGAGCAAAAAACAGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTG
ACGACTCAGTTCGTGGAGACTGCTATCCAGACCGAG

QA 1 276 1 276
DS 

RD RR2GA94TF 645 0 0
TTTTTAAACCAAAACAAAAAAGTACAAAACATAAAACAAAAAAACATAAAAATAATGGCA
AGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTTTCTCCTTGCATCAGTGACCTTTATGGAACAT
GTTTCAAGTGCCACCACCGCC***AGCTCTAGCTCAACCACAACAGTGGCACAACTTGAG
ACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAGTTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGTGTCCACCA
AAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGTACCATGGTGGCCTCCACAAAG
GTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGAAAAATATCTGATGCG
GTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCAGAGGTCAAAAAA*TCCATGGA
GACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCAAGAGTTAGAAGCCATCCACAAGAAA*T
CATTGAAGCAAACCAAGGAAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCAGAGCAAAAAAC
AGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTGACGACTCAGTTCGTGGAGACTGC
TATCCAGACCGAG*CTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACAA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2FX61TF 716 0 0
TTTTT
AAAACCAAAACAAAACAAAACAAAAAATTACAAAACATAAAA*AGAAAAACATAAAA*TA
ATGGCAAGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTTTCTCCTTGCATCAGTGACCTTTATG
GAACATGTTTCAAGTGCCACCACCGCCGCCAGCTCTAGCTCAACCACAACAGTGGCACAG
CTCGAGACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAGTTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGTGT
CCACCAAAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGCACCATGGTAGCCTCC
ACAAAGATTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGCAAAATATCT
GATGCGGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCTGAGGTCAAAAAA*TC
CATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCAAGAGTTAGAAGCCATCCACAA
GAAAATCATTGAAGCAAACCAAGGGAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCAGAACA
AAAAACAGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAA*CAGTGACGACTCAATTCGTGGA
GACAGCTATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACAAAGTCAAGCT
ACCTTGAGCTCTCTCTC**AGAG*CTGCTTATCTACTACATTCATTTTGCC

QA 6 716 6 716
DS 

RD RR2D366TF 671 0 0
TTTTTAAACCAAAACAAAAAAGTACAAAACATAAAACAAAAAAACATAAAAATAATGGCA
AGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTTTCTCCTTGCATCAGTGACCTTTATGGAACAT
GTTTCAAGTGCCACCACCGCC***AGCTCTAGCTCAACCACAACAGTGGCACAACTTGAG
ACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAGTTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGTGTCCACCA
AAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGTACCATGGTGGCCTCCACAAAG
GTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGAAAAATATCTGATGCG
GTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCAGAGGTCAAAAAA*TCCATGGA
GACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCAAGAGTTAGAAGCCATCCACAAGAAAAT
CATTGAAGCAAACCAAGGAAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCAGAGCAAAAAAC
AGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTGACGACTCAGTTCGTGGAGACTGC
TATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACAAAGTCAAGCTACCTTG
AGCTCTCTCTC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2FH34TF 756 0 0
TTTTTAAAACCAAAACAAAACAAAACAAAAAATTACAAAACATAAAA*AGAAA**CATAA
AA*TAATGGCAAGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTTTCTCCTTGCATCAGTGACCT
TTATGGAACATGTTTCAAGTGCCACCACCGCCGCCAGCTCTAGCTCAACCACAACAGTGG
CACAGCTCGAGACTGAGGCATCCAAAGAAGTCATGGATTTCATAATGAAGCTGGAGAAGA
AGTGTCCACCAAAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGCACCATGGTAG
CCTCCACAAAGGTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGCAAAA
TATCTGATGCGGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCTGAGGTCAAAA
AA*TCCATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCAAGAGTTAGAAGCCATC
CACGAGAAAATCATTGAAGCAAACCAAGGGAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCA
GAACAAAAAACAGAGACCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTGACGACTCAATTC
GTGGAGACAGCTATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACAAAGTC
AAGCTACCTTGAGCTCTCTCTC**AGAG*CTGCTTATCTACTACATTCATTTTGCCACTA
CACATAAAATATTTTATTCA
GCTAGCTATATAATTT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2G746TF 737 0 0
TTTTT
AAAACCAAACCAAAACAAAACAAAAAATTACAAAACATAAAA*AGAAAAACATAAAA*TA
ATGGCAAGAGTTCAGTTATTATTATGTTTTACCTTTCTCCTTGCATCAGTGACCTTTATG
GAACATGTTTCAAGTGCCACCACCGCCGCCAGCTCTAGCTCAACCACAACAGTGGCACAG
CTCGAGACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAGTTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGTGT
CCACCAAAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGCACCATGGTAGCCTCC
ACAAAGGTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGCAAAATATCT
GATGCGGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCTGAGGTCAAAAAA*TC
CATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCAAGAGTTAGGAGCCATCCACAA
GAAAATCATTGAAGCAAACCAAGGGAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCAGAACA
AAAAACAGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTGACGACTCAATTCGTGGA
GACAGCTATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACATAGTCAAGCT
ACCTTGAGCTCTCTCTC**AGAG*CTGCTTATCTACTACATTCATTTTGCCACTACACAT
AAAATATTTTAT

QA 6 737 6 737
DS 

RD RR2FD78TF 745 0 0
TTTTTAAACCAAAACAAAAAGT*ACAAAACATAAAACAAAAAAACATAAAAATAATGGCA
AGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTTTCTCCTTGCATCAGTGACCTTTATGGAACAT
GTTTCAAGTGCCACCACCGCC***AGCTCTAGCTCAACCACAACAGTGGCACAACTTGAG
ACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAGTTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGTGTCCACCA
AAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGTACCATGGTGGCCTCCACAAAG
GTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGAAAAATATCTGATGCG
GTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCAGAGGTCAAAAAA*TCCATGGA
GACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCAGGAGTTAGAAGCCGTCCACAAGAAAAT
CATTGAAGCAAACCAAGGAAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCAGAGCAAAAAAC
AGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTGACGACTCAGTTCGTGGAGACTGC
TATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACAAAGTCAAGCTACCTTG
AGCTCTCTCTCTCAGAGGCTGCTTATCTACTACATTCATTTTGCCACTACACATATATAA
TATTATTCAA*GCTAGCTAATAATA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2CA24TF 726 0 0
AAAACCAAAACAAAACAAAACAAAAAATTACAAAACATAAAA*AGAAAAACATAAAA*TA
ATGGCAAGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTTTCTCCTTGCATCAGTGACCTTTATG
GAACATGTTTCAAGTGCCACCACCGCCGCCAGCTCTAGCTCAACCACAACAGTGGCACAG
CTCGAGACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAGTTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGTGT
CCACCAAAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGCACCATGGTAGCCTCC
ACAAAGGTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGCAAAATATCT
GATGCGGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCTGAGGTCAAAAAA*TC
CATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCGAGAGTTAGAAGCCATCCACAA
GAAAATCATTGAAGCAAACCAAGGGAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCAGAACA
AAAAACAGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTGACGACTCAATTCGTGGA
GACAGCTATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACAAAGTCAAGCT
ACCTTGAGCTCTCTCTC**AGAGGCTGCTTATCTACTACATTCATTTTGCCACTACACAT
AAAATA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2A678TF 795 0 0
AAAACCAAAACAAAACAAAACAAAAAATTACAAAACATAAAA*AGAAAAACATAAAA*TA
ATGGCAAGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTTTCTCCTTGCATCAGTGACCTTTATG
GAACATGTTTCAAGTGCCACCACCGCCGCCAGCTCTAGCTCAACCACAACAGTGGCACAG
CTCGAGACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAGTTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGTGT
CCACCAAAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGCACCATGGTAGCCTCC
ACAAAGGTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGCAAAATATCT
GATGCGGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCTGAGGTCAAAAAAATC
CATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCAAGAGTTAGAAGCCATCCACAA
GAAAATCATTGAAGCAAACCAAGGGAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCAGAACA
AAAAACAGAGATCAAACAAACAATCAC*AGATGGGAAACAGTGACGACTCAATTCGTGGA
GACAGCTATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACAAAGTCAAGCT
ACCTTGAGCTCTCTCTC**AGAGGCTGCTTATCTACTACATTCATTTTGCCGCTACACAT
AAAATATTTTATTCAAAGCTAGCTAATAATAATTTAGAGATTCTTTTTTTTTGTTGGGTT
GAAATAAAACCAAG
T

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2A678JQ 186 0 0
TTACTACATTCATTTTGCCGCTACACATAAAATATTTTATTCAAGGCTAGTTAATAATAA
TTTAGAGATTTTTTTTTTTTGTTGGGTTGAAATAAAACCAAGGTTGGTATAGGCCAATCA
TATATAGATTTATGGATCGACCTATTAAGTAAGTAAAGATAGACTGTAACCGCGCTCTGT
ACGTGT

QA 1 186 1 186
DS 

RD RR2FX61JQ 233 0 0
TC**AGAGGCTGCTTATTTACTACATTCATTTTGCCACTACACATAAAATATTTTATTCA
AGGCTAGCTAATAATAATTTAGAGATTCTTTTTTTTTGTTGGGTTGAAATAAAACCAAGG
TTGGTATAGGCCAATCATATATAGATTTATGGATCGACCTATTAAGTAAGTAAAGATAGA
CTGTAACCGCGCTCTGTACGTGTTGAAATAATTTTAAAATAAGCTCTGATAGC

QA 1 233 1 233
DS 

RD RR2CA24JQ 548 0 0
GATGCGGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCTGAGGTCAAAAAA*TC
CATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCGAGAGTTAGAAGCCATCCACAA
GAAAATCATTGAAGCAAACCAAGGGAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCAGAACA
AAAAACAGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTGACGACTCAATTCGTGGA
GACAGCTATCCAGACCGAGGCTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACAAAGTCAAGCT
CCCTTGAGCTCTTTTTC**AGAGGCTGCTTATTTACTACATTCATTTTGCCACTACACAT
AAAATAGTTTATTCAAGGCTAGTTAATAATAATTTAGAGATTCTTTTTTTTTGTTGGGTT
GAAATAAAACCAAGGTTGGTATAGGCCAATCATATATAGATCTATGGATCGACCTATTAA
GTAAGTAAAGATAGACTGTAACCGCGCTCTGTACGTGTTGAAATAATTTTAAAATAAGCT
CTGATAGC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2FH34JQ 779 0 0
CCAAAGAAGTCATGGATTTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGTGTCCACCAAAGGAGGAAT
ACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGCACCATGGTAGCCTCCACAAAGGTTACTACCG
AAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGCAAAATATCTGATGCGGTGTCTTTCA
TTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCTGAGGTCAAAAAA*TCCATGGAGACCTACCAA
CAAGAGGTGGCCAAGTCACTGCAAGAGTTAGAAGCCATCCACGAGAAAATCATTGAAGCA
AACCAAGGGAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCAGAACAAAAAACAGAGACCAAA
CAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTGACGACTCAATTCGTGGAGACAGCTATCCAGACC
GAGGCTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACAAAGTCAAGCTACCTTGAGCTCTCTTT
C**AGAGGCTGCTTATTTACTACATTCATTTTGCCACTACACATAAAATATTTTATTCAA
GGCTAGCTAATAATAATTTAGAGATTCTTTTTTTTTGTTGGGTTGAAATAAAACCAAGGT
TGGTATAGGCCAATCATATATAGATCTATGGATCGACCTATTAAGTAAGTAAAGATAGAC
TGTAACCGCGCTCTGTACGTGTTGAAATAATTTTAAAATAAGCTCTGATAGCATAAGATG
AGAAGATTGTCTAAATCTTTTTTTTTCACTCTGAAAATGTAGACTAGATCCTTGACTGC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 3 21

CO CL83Contig1 825 4 3 U
CAGTAACGTATCTGTTTCATTGTTAAATGGAAAACACAATATTTTACTTTATAATCTAAA
TGCATCGTAGTAATGTATCACATATCTGCTATGATGGCATTACACAATATTGAAACTTCA
CCAATTTCTAAACCAAACTAAAAAA*TTACAAAGAAATAGAAAGAAAACTAACTACACTT
CACATTTACCAAAAACATCATATTGTTAGACAGTTTAAGATAACAGTAAACAGCAGACAA
ACTTGATTTACTGCTGCTTCCATAGTAATAAGTTGCCACACTGCCATTTTTTTCATTTCT
GTCTTGAAATCATCATCACTACTATTATTATTGTAAAATAACTGAAACAGCTGAAGAAGA
TTCATCTCCTCTCATCGGTCTCTATGATAAGATACACCTTCAAGCTTTAACGCAGCAGTT
GAAGCAGCTGAAGATTCCTCTCCTCGCAGATGGAGAAAGTGGCTGGTGATGAGAGAACTC
ATTATGGGTTTTGTTGTTGTCACTGTGAACGGTGGTGAGCTTAGGCTTAGCATTATCAAC
CGAAGTAGGTTGATTATGAAAAGGATTAACGAGTTCTTCATCGTTGCCAAGACTGGCGCG
AGAAGGATCTCTCTTGTTCTGTTTCCGCATCTCTCTGATCTTAGAGAAATCCATAGAGTA
ATCAGGAATGGTTCCTCCTTTCTGATCCCAATCTCCAAACTGTGGTACTGATAGCCATGG
CGAGTTCTTGTTCTCCTTTGGATCTTCCATATGATCAAGTCTGTAGAGAGTAGTAGTAAA
GAATCCTCCTTTTTCAATCAAAAGAAGAAGAAGATGATCTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2E764JQ U 102
AF RR2A016TF C 1
AF RR2E764TF C 133
AF RR2A016JQ U 611
BS 1 102 RR2A016TF
BS 103 663 RR2E764JQ
BS 664 825 RR2A016JQ

RD RR2E764JQ 562 0 0
G
CACAATATTGAAACTTCACCAATTTCTAAACCAAACTAAAAAA*TTACAAAGAAATAGAA
AGAAAACTAACTACACTTCACATTTACCAAAAACATCATATTGTTAGACAGTTTAAGATA
ACAGTAAACAGCAGACAAACTTGATTTACTGCTGCTTCCATAGTAATAAGTTGCCACACT
GCCATTTTTTTCATTTCTGTCTTGAAATCATCATCACTACTATTATTATTGTAAAATAAC
TGAAACAGCTGAAGAAGATTCATCTCCTCTCATCGGTCTCTATGATAAGATACACCTTCA
AGCTTTAACGCAGCAGTTGAAGCAGCTGAAGATTCCTCTCCTCGCAGATGGAGAAAGTGG
CTGGTGATGAGAGAACTCATTATGGGTTTTGTTGTTGTCACTGTGAACGGTGGTGAGCTT
AGGCTTAGCATTATCAACCGAAGTAGGTTGATTATGAAAAGGATTAACGAGTTCTTCATC
GTTGCCAAGACTGGCGCGAGAAGGATCTCTCTTGTTCTGTTTCCGCATCTCTCTGATCTT
AGAGAAATCCATAGAGTAATC

QA 2 562 2 562
DS 

RD RR2A016TF 750 0 0
CAGTAACGTATCTGTTTCATTGTTAAATGGAAAACACAATATTTTACTTTATAATCTAAA
TGCATCGTAGTAATGTATCACATATCTGCTATGATGGCATTACACAATATTGAAACTTCA
CCAATTTCTAAACCAAACTAAAAAAATTACAAAGAAATAGAAAGAAAACTAACTACACTT
CACATTTACCAAAAACATCATATTGTTAGACAGTTTAAGATAACAGTAAACAGCAGACAA
ACTTGATTTACTGCTGCTTCCGTAGTAATAAGTTGCCACACTGCCATTTTTTTCATTTCT
GTCTTGAAATCATCATCACTACTATTATTATTGTAAAATAACTGAAACAGCTGAAGAAGA
TTCATCTCCTCTCATCGGTCTCTATGATAAGATACACCTTCAAGCTTTAACGCAGCAGTT
GAAGCAGCTGAAGATTCCTCTCCTCGCAGACGGAGAAAGTGGCTGGTGATGAGAGAACTC
ATTATGGGTTTTGTTGTTGTCACTGTGAACGGTGGTGAGCTTAGGCTTAGCATTATCAAC
CGAAGTAGGTTGATTATGAAAAGGATTAACGAGTTCTTCATCGTTGCCAAGACTGGCGCG
AGAAGGATCTCTCTTGTTCTGTTTCCGCATCTCTCTGATCTTAGAGAAATCCATAGAGTA
ATCAGGAATGGTTCCTCCTTTCTGATCCCAATCTCCAAACTGTGGTACTGATAGCCATGG
CGAGTTCTTGTTCTCCTTTGG
CCTTCCATA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2E764TF 691 0 0
CCAAACTAAAAAA**TACAAAGAAATAGAAAGAAAACTAACTACACTTCACATTTACCAA
AAACATCATATTGTTAGACAGTTTAAGATAACAGTAAACAGCAGACAAACTTGATTTACT
GCTGCTTCCATAGTAATAAGTTGCCACACTGCCATTTTTTTCATTTCTGTCTTGAAATCA
TCATCACTACTATTATTATTGTAAAATAACTGAAACAGCTGAAGAAGATTCATCTCCTCT
CATCGGTCTCTATGATAAGATACACCTTCAAGCTTTAACGCAGCAGTTGAAGCAGCTGAA
GATTCCTCTCCTCGCAGATGGAGAAAGTGGCTGGTGATGAGAGAACTCATTATGGGTTTT
GTTGTTGTCACTGTGAACGGTGGTGAGCTTAGGCTTAGCATTATCAACCGAAGTAGGTTG
ATTATGAAAAGGATTAACGAGTTCTTCATCGTTGCCAAGACTGGCGCGAGAAGGATCTCT
CTTGTTCTGTTTCCGCATCTCTCTGATCTTAGAGAAATCCATAGAGTAATCAGGAATGGT
TCCTCCTTTCTGATCCCAATCTCCAAACTGCGGTACTGATAGCCATGGCGAGTTCTTGTT
CTCCTTTGGATCTTCCATATGATCAAGTCTGTAGAGAGTAGTAGTAAAGAATCCTCCTTT
TTCAATCAAAAGAAGAAGAAGATGATCTT
CC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2A016JQ 215 0 0
CTCTTGTTCTGTTTCCGCATCTCTCTGATCTTAGAGAAATCCATAGAGTAATCAGGAATG
GTTCCTCCTTTCTGATCCCAATCTCCAAACTGTGGTACTGATAGCCATGGCGAGTTCTTG
TTCTCCTTTGGATCTTCCATATGATCAAGTCTGTAGAGAGTAGTAGTAAAGAATCCTCCT
TTTTCAATCAAAAGAAGAAGAAGATGATCTTATCC

QA 1 215 1 215
DS 



CO CL83Contig2 827 11 9 U
GGACCATAAGATCATCATCTTCTTCTTCTTTTGATTGAAAAAGTTAATTCAGAAAAGGAG
GATTCTTTACTACTACTCTCTACAGATTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAG***AACA
AGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCA
TTCCTGATTACTCTATGGATTTCTCTAAGATCAGAGAGATGCGGAAACAGAACAAGAGAG
ATCCTTCTCGTGCCAGTCTTGGCAACGAGGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAAC
CTACTTCGGTTGATAATGCTAAGCCTAAGCTCACCACTGTTCACGGTGACAACAACAACA
ACAAC***AAAACCCACAATGACTTCTCTCATCACCAGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGA
GAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGA
GACCGATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGT
AGTGATGATGATTTCAAGACAGAAATGAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGG
AAGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTAAACTGTCTAACAATAT
GATGTTTTTGGTAAATGTGAAGTGTAGTTAGTTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTA
GTTTGGTTTAGAAATTGGTGAAGTTTCAATATTGTGTAATGCCATCGTAGCAGATATGTG
ATACATTACTACGATGCATTTAGATTATAAAAGTAAAATATTGTGTT


BQ
10 30 30 30 30 40 40 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 35 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 45 45 45 45 15 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 
45 50 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 
50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ49TF U 6
AF RR2FI34TF U 35
AF RR2CB82TF U 4
AF RR2FN35TF U 5
AF RR2CB82JQ C 29
AF RR2B031JQ C 1
AF RR2EX61JQ C 365
AF RR2FZ49JQ C 315
AF RR2CV57JQ C 2
AF RR2CV57TF U 2
AF RR2B031TF U 1
BS 1 1 RR2B031JQ
BS 2 212 RR2CV57TF
BS 213 213 RR2FZ49TF
BS 214 380 RR2CV57TF
BS 381 381 RR2FZ49TF
BS 382 678 RR2CV57TF
BS 679 679 RR2CB82TF
BS 680 781 RR2CV57TF
BS 782 827 RR2B031TF

RD RR2FZ49TF 670 0 0
GG
AAGATCATCATCTTCTTCTTCTTTTGATTGAAAAAGTTAATTCAGAAAAGGAGGATTCTT
TACTACTACTCTCTACAGATTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAG***AACAAGAACTC
GCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGA
TTACTCTATGGATTTCTCTAAGATCAGAGAGATGCGGAAACAGAACAAGAGAGATCCTTC
TCGTGCCAGTCTTGGCAACGAGGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAACCTACTTC
GGTTGATAATGCTAAGCCTAAGCTCACCACTGTTCACGGTGACAACAACAACAACAACAA
CAAAACCCACAATGACTTCTCTCATCACCAGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGAGAGGAAT
CTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGAGACCGAT
GAGAGGAGATGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTAGTGATG
ATGATTTCAAGACAGAAATGAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACAGAAGCAGC
AGTAAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTAAACTGTCTAACAATATGATGTTT
TTGGTAAA

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR2FI34TF 664 0 0
GG
GAAAAAGTTAATTCAGAAAAGGAGGATTCTTTACTACTACTCTCTACAGATTTGATCATA
TGGAAGATCCAAAGGAG***AACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAG
ATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGATTACTCTATGGATTTCTCTAAGATCAGAG
AGATGCGGAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGTGCCAGTCTTGGCAACGAGGAAGAAC
TCGTTAATCCTTTTCATAATCAACCTACTTCGGTTGATAATGCTAAGCCTAAGCTCACCA
CTGTTCACGGTGACAACAACAACAACAAC***AAAACCCACAATGACTTCTCTCATCACC
AGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAG
CTTGAAGGTGTATCTTATCATAGAGACCGATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCAGCTGTTT
CAGTTATTTTACGATAATAATAGTAGTGATGATGATTTCAAGACAGAAATGAAAAAATGG
CAGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTG
TTATCTTAAACTGTCTAACAATATGATGTTTTTGGTAAATGTGAAGTGTAGTTAGTTTTC
TT

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR2CB82TF 743 0 0
GG
ATAAGATCGTCATCTTCTTCTTCTTTTGATTGAAAAAGTTAATTCAGAAAAGGAGGATTC
TTTACTACTACTCTCTACAGATTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAG***AACAAGAAC
TCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCT
GATTACTCTATGGATTTCTCTAAGATCAGAGAGATGCGGAAACAGAACAAGAGAGATCCT
TCTCGTGCCAGTCTTGGCAACGAGGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAACCTACT
TCGGTTGATAATGCTGAGCCTAAGCTCACCACTGTTCACGGTGACAACAACAACAACAAC
***AAAACCCACAACGACTTCTCTCATCACCAGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGAGAGGA
ATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGATACCG
ATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTAGTGA
TGATGATTTCAAGACAGAAATGAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGCA
GCAGTAAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTAAACTGTCTAACAATATGATGT
TTTTGGTAAATGTGAAGTGTAGTTAGTTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTAGTTTG
GTTTAGAAATTGGTGAAGTTT

QA 3 743 3 743
DS 

RD RR2FN35TF 719 0 0
G
ATAAGATCATCATCTTCTTCTTCTTTTGATTGAAAAAGTTAATTCAGAAAAGGAGGATTC
TTTACTACTACTCTCTACAGATTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAG***AACAAGAAC
TCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCT
GATTACTCTATGGATTTCTCTAAGATCAGAGAGATGAGGAAACAGAACAAGAGAGATCCT
TCTCGTGCCAGTCTTGGCAACGAGGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAACCTACT
TCGGTTGATAA******GCCTAAGCTCACCACTGTTCACAGTGACAACAACAACAA****
*****AACCCACAATGACTTCTCTCATCACCAACCACTTTCTCCATCTGCGAGGAGAGGA
ATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGAGACCG
ATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTAGTGA
TGATGATTTCAAGACAGAAATGAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGCA
GCAGTAAATCAAGTCTGTCTGCTGTTTACCGTTATCTTAAACTGTCTAACAATATGATGT
TTTTGGTAAATGTGAAGTGTAGTTAGCTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTAGTT

QA 2 719 2 719
DS 

RD RR2CB82JQ 701 0 0
TTTTGATTGAAAAAGTTAATTCAGAAAAGGAGGATTCTTTACTACTACTCTCTACAGATT
TGATCATATGGAAGATCCAAAGGAG***AACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACA
GTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGATTACTCTATGGATTTCTCTAA
GATCAGAGAGATGCGGAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGTGCCAGTCTTGGCAACGA
GGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAACCTACTTCGGTTGATAATGCTGAGCCTAA
GCTCACCACTGTTCACGGTGACAACAACAACAACAAC***AAAACCCACAACGACTTCTC
TCATCACCAGCCACTTTCTCCATTTGCGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTG
CGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGATACCGATGAGAGGAGATGAATCTTCTTC
AGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTAGTGATGATGATTTCAAGACAGAAATGA
AAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTTTGCT
GTTTACTGTTATCTTAAACTGTCTAACAATATGATGTTTTTGGTAAATGTGAAGTGTAGT
TAGTTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTAGTTTGGTTT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2B031JQ 818 0 0
GGACCATAAGATCATCATCTTCTTCTTCTTTTGATTGAAAAAGTTAATTCAGAAAAGGAG
GATTCTTTACTACTACTCTCTACAGATTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAGCAGAACA
AGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCA
TTCCTGATTAGTCTATGGATTTCTCTAAGATCAGAGAGATGCGGAAACAGAACAAGAGAG
ATCCTTCTCGTGCCTGTCTTGGCAACGAGGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAAC
CTACTTCGGTTGATAATGCTAAGCCTAAGCTCACCACTGTTCACGGTGACAACAACAACA
ACAAC***AAAACCCACAATGACTTCTCTCATCACCAGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGA
GAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGA
GACCGATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGT
AGTGATGATGATTTCAAGACAGAAATGAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGG
AAGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTAAACTGTCTAACAATAT
GATGTTTTTGGTAAATGTGAAGTGTAGTTAGTTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTA
GTTTGGTTTAGAAATTGGTGAAGTTTCAATATTGTGTAATGCCATCGTAGCAGATATGTG
ATACATTACTACGATGCATTTAGATTATAAA
AGTAAAA

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2EX61JQ 434 0 0
C***AAAACCCACAATGACTTCTCTCATCACCAGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGAGAGG
AATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGAGACC
GATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTAGTG
ATGATGATTTCAAGACAGAAATGAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGC
AGCAGTAAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTAAACTGTCTAACAATATGATG
TTTTTGGTAAATGTGAAGTGTAGTTAGTTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTAGTTT
GGTTTAGAAATTGGTGAAGTTTCAATATTGTGTAATGCCATCGTAGCAGATATGTGATAC
ATTACTACGATGCA

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR2FZ49JQ 471 0 0
AATGCTAAGCCTAAGCTCACCACTGTTCACGGTGACAACAACAACAACAACAACAAAACC
CACAATGACTTCTCTCATCACCAGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGAGAGGAATCTTCAGC
TGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGAGACCGATGAGAGGA
GATGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTAGTGATGATGATTT
CAAGACAGAAATGAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGCAGCAGTAAAT
CAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTAAACTGTCTAACAATATGATGTTTTTGGTAA
ATGTGAAGTGTAGTTAGTTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTAGTTTGGTTTAGAAA
TTGGTGAAGTTTCAATATTGTGTAATGCCATCGTAGCAGATATGTGATACA

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR2CV57JQ 781 0 0
GACCATAAGATCATCATCTTCTTCTTCTTT*GATTGAAAAAGTTAATTCAGAAAAGGAGG
ATTCTTTACTACTACTCTCTACAGATTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAG***AACAA
GAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCAT
TCCTGATTACTCTATGGATTTCTCTAAGATCGGAGAGATGCGGAAACAGAACAAGAGAGA
TCCTTCTCGTGCCAGTCTTGGCAACGAGGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAACC
TACTTCGGTTGATAATGCTAAGCCTAAGCTCACCACTGTTCACGGTGACAACAACAACAA
CAAC***AAAACCCACAATAACTTCTCTCATCACCAGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGAG
AGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGAG
ACCGATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTA
GTGATGATGATTTCAAGACAGAAATGAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGA
AGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTAAACTGTCTAACAATATG
ATGTTTTTGGTAAATGTTAAGTGTAGTTAGTTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTAG
TTTGGTTTAGAAATTGGTGAAGTTTCAATATTGTGTAATGCCATCGTAGCAGATATGTGA
T

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2CV57TF 780 0 0
GACCATAAGATCATCATCTTCTTCTTCTTTTGATTGAAAAAGTTAATTCAGAAAAGGAGG
ATTCTTTACTACTACTCTCTACAGATTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAG***AACAA
GAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCAT
TCCTGATTACTCTATGGATTTCTCTAAGATCGGAGAGATGCGGAAACAGAACAAGAGAGA
TCCTTCTCGTGCCAGTCTTGGCAACGAGGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAACC
TACTTCGGTTGATAATGCTAAGCCTAAGCTCACCACTGTTCACGGTGACAACAACAACAA
CAAC***AAAACCCACAATAACTTCTCTCATCACCAGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGAG
AGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGAG
ACCGATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTA
GTGATGATGATTTCAAGACAGAAATGAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGA
AGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTAAACTGTCTAACAATATG
ATGTTTTTGGTAAATGTTAAGTGTAGTTAGTTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTAG
TTTGGTTTAGAAATTGGTGAAGTTTCAATATTGTGTAATGCCATCGTAGCAGATATGTGA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2B031TF 827 0 0
G
GACCATAAGATCATCATCTTCTTCTTCTTTTGATTGAAAAAGTTAATTCAGAAAAGGAGG
ATTCTTTACTACTACTCTCTACAGATTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAGCAGAACAA
GAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCAT
TCCTGATTAGTCTATGGATTTCTCTAAGATCAGAGAGATGCGGAAACAGAACAAGAGAGA
TCCTTCTCGTGCCTGTCTTGGCAACGAGGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAACC
TACTTCGGTTGATAATGCTAAGCCTAAGCTCACCACTGTTCACGGTGACAACAACAACAA
CAAC***AAAACCCACAATGACTTCTCTCATCACCAGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGAG
AGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGAG
ACCGATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTA
GTGATGATGATTTCAAGACAGAAATGAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGA
AGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTAAACTGTCTAACAATATG
ATGTTTTTGGTAAATGTGAAGTGTAGTTAGTTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTAG
TTTGGTTTAGAAATTGGTGAAGTTTCAATATTGTGTAATGCCATCGTAGCAGATATGTGA
TACATTACTACGATGCATTTAGATTATAAAAGTAAAATATTGTGTT

QA 2 827 2 827
DS 



CO CL83Contig3 730 6 3 U
TTTTTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGA
TGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGA
TCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAG
GAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAA
CCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCA
TAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTTCATCTAC
GAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAAT
AGAGACGATGAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTTGGATGTTTCGGAAAAAAAAATGAAAT
GAGAAATGGTAGTGTGACACCATCACACTTATATTTTTCTGCGGAAGCAGTAAAGTGTTA
ATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTTAACTATGTTTTT*GGTATT
AATTCGAAGTGTAGTTTTAACTTTTAAGTCTCTCCTTTCTATTTTGTTGTAATTTTCGTT
TTGTTTGGAGATTGATAAGTTTTCAGTATTGTGTAATGCAGAGTAGACTACTGTGCTTAT
CTCAAGGATT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM15TF U 1
AF RR2EV35TF U 1
AF RR2AF68JQ C 36
AF RR2AF68TF U 6
AF RR2EV35JQ C 83
AF RR2BM15JQ C 4
BS 1 603 RR2BM15TF
BS 604 718 RR2EV35TF
BS 719 730 RR2BM15JQ

RD RR2BM15TF 603 0 0
TTTTTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGA
TGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGA
TCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAG
GAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAA
CCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCA
TAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTTCATCTAC
GAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAAT
AGAGACGATGAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTTGGATGTTTCGGAAAAAAAAATGAAAT
GAGAAATGGTAGTGTGACACCATCACACTTATATTTTTCTGCGGAAGCAGTAAAGTGTTA
ATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTTAACTATGTTTTT*GGTATT
AAT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2EV35TF 721 0 0
TTTTT
CAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGATGATC
CAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAGA
AAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAAAC
AGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCCTT
TTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCATAGCG
ACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTTCATCTACGAGGA
GAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAATAGAGA
CGATGAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTTGGATGTTTCGGAAAAAAAAATGAAATGAGAA
ATGGTAGTGTGACACCATCACACTTATATTTTTCTGCGGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAA
GTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTTAACTATGTTTTT*GGTATTAATTC
GAAGTGTAGTTTTAACTTTTAAGTCTCTCCTTTCTATTTTGTTGTAATTTTCGTTTTGTT
TGGAGATTGATAAGTTTTCAGTATTGTGTAATGCAGAGTAGACTACTGTGCTT
ATC

QA 6 718 6 718
DS 

RD RR2AF68JQ 683 0 0
CTCACTACAGCTTTGATCATATGGATGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTAT
CAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGG
ATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTC
TTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATA
CTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCATAGGGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTC
ACCCCCAGCCACTTTTTTCATTTACGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCG
TTAAAGCTTGAATATTTTTTATAATAGAGACGATGAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTTG
GATGTTTCGGAAAAAAAAATGAAATGAGAAATGGTAGTGTGACACCATCACACTTATATT
TTTTTGCGGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTCGTTTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAA
TGTCTTAACTATGTTTTT*GGTATTAATTCGAAGTGTAGTTTTAACTTTTAAGTCTCTCC
TTTTTATTTTGTTGTAATTTTCGTTTTGTTTGGAGATTGATAAGTTTTCAGTATTGTGTA
ATGCAGAGTAGACTACTGTGCTT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2AF68TF 700 0 0
CAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGATGATC
CAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAGA
AAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAAAC
AGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCCTT
TTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCATAGCG
ACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTTCATCTACGAGGA
GAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAATAGAGA
CGATGAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTTGGATGTTTCGGAAAAAAAAATGAAATGAGAA
ATGGTAGTGTGACACCATCACACTTATATTTTTCTGCGGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAA
GTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTTAACTATGTTTTTTGGTATTAATTC
GAAGTGTAGTTTTAACTTTTAAGTCTCTCCTTTCTATTTTGTTGTAATTTTCGTTTTGTT
TGGAGATTGATAAGTTTTCAGTATTGTGTAATGCAGAGTA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2EV35JQ 641 0 0
TCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCT
GACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAAACAGAACAAGAGAGATCCT
TCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCCTTTTCATAACCAACCTACT
TCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCATAGCGACAACAACAGAACCAAC
ACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTTCATCTACGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGC
TTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAATAGAGACGATGAGGAATCTCCAT
GAGGTGTTCTTTGGATGTTTCGGAAAAAAAAATGAAATGAGAAATGGTAGTGTGACACCA
TCACACTTATATTTTTCTGCGGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTCGTCTGCTGTTTAC
TGTTATCTTCTAATGTCTTAACTATGTTTTT*GGTATTAATTCGAAGTGTAGTTTTAACT
TTTAAGTCTCTCCTTTCTATTTTGTTGTAATTTTCGTTTTGTTTGGAGATTGATAAGTTT
TCAGTATTGTGTAATGCAGAGTAGACTACTGTGCTT
ATCTC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2BM15JQ 727 0 0
TT
CAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGATGATC
CAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAGA
AAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAAAC
AGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCCTT
TTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCATAGCG
ACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTTCATCTACGAGGA
GAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAATAGAGA
CGATGAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTTGGATGTTTCGGAAAAAAAAATGAAATGAGAA
ATGGTAGTGTGACACCATCACACTTATATTTTTCTGCGGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAA
GTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTTAACTATGTTTTT*GGTATTAATTC
GAAGTGTGGTTTTAACTTTTAAGTCTCTCCTTTCTATTTTGTTGTAATTTTCGTTTTGTT
TGGAGATTGATAAGTTTTCAGTATTGTGTAATGCAGAGTAGACTACTGTGCTTATCTCAA
GGATT

QA 3 727 3 727
DS 



AS 2 21

CO CL84Contig1 637 7 2 U
GGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTTTCACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACCACAAAAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGCTCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAGCACAGAAGAAACCGGTGAGAACCAGAACCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGTGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAAGCGACCAAGGAAACAGCT
CCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGTT
GCAGCAGCAACTGAGAAAGTTGAGGACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTT
GCGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTT
TGATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGAT
TTGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTCT
TCTTTTATTAATTTAAATATAAATCAGTCTTGCTTCG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 20 20 20 20 10 

AF RR2GO22JQ C 393
AF RR2CK88JQ C 110
AF RR2CX13TF U 8
AF RR2CK88TF U 1
AF RR2B038JQ C 1
AF RR2B038TF U 1
AF RR2F228TF U 1
BS 1 636 RR2B038TF
BS 637 637 RR2B038JQ

RD RR2GO22JQ 186 0 0
GGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAA
GGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGGGTTAAAAATGTGAAAATATTTTGAA
CGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTG
GTTGTT

QA 1 186 1 186
DS 

RD RR2CK88JQ 469 0 0
GTGCGAGTAGACCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGCTTTGTTCCTAAGCCTGTGT
TTGAAGACGTAGTAGCCAAGGAGATCAGCACAGAAGAAACCGGTGAGAACCAGAACCAGA
CGGAGACCACTGAAACAACTCCTGTGGAAGTTAAGGAGACATCTGAGGTCGAAGCGACCA
AGGAAACAGCTCCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATTTTTTG
CTGGTGAGGTTGCAGCAGCAACTGAGAAAGTTGAGGACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACT
TTGAGGCGGTTGCGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTG
TTGTCACCGTTTGATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCCC
CTTGATTTGATTTGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTT

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR2CX13TF 569 0 0
GG
GGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTTTCACACTCCACAGCCTAAACCCA
ACCCTAAACCACAAAAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGACCCAAGAAG
TCAGACATGAACAACGAAGGCTCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTAGTAGCCAAG
GAGATCAGCACAGAAGAAACCGGTGAGAACCAGAACCAGACGGAGACCACTGAAACAACT
CCTGTGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAAGCGACCAGGGAAACAGCTCCTACTGCT
GAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGTTGCAGCAGCA
ACTGAGAAAGTTGAGGACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAAA
GAGGTTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGGAT
TAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTACTA
CATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTG

QA 3 569 3 569
DS 

RD RR2CK88TF 578 0 0
GGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTTTCACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACCACAAAAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGCTCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAGCACAGAAGAAACCGGTGAGAACCAGAACCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGTGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAAGCGACCAAGGAAACAGCT
CCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGTT
GCAGCAGCAACTGAGAAAGTTGAGGACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACTTTGAGGCGGTT
GCGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTT
TGATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGAT
TTGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTT

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2B038JQ 637 0 0
GGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTTTCACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACCACAAAAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGCTCTGTTCCTAAGCCTGTGTTTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAGCACAGAAGAAACCGGTGAGAACCAGAACCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGTGGAAGCTAAGGAGACATTTGAGGTCGAAGCGACCAAGGAAACAGCT
CCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATTTTTTGCTGGTGAGGTT
GCAGCAGCAACTGAGAAAGTTGAGGACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTT
GCGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTT
TGATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGAT
TTGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTCT
TCTTTTATTAATTTAAATATAAATCAGTCTTGCTTCG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2B038TF 637 0 0
GGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTTTCACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACCACAAAAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGCTCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAGCACAGAAGAAACCGGTGAGAACCAGAACCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGTGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAAGCGACCAAGGAAACAGCT
CCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGTT
GCAGCAGCAACTGAGAAAGTTGAGGACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTT
GCGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTT
TGATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGAT
TTGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTCT
TCTTTTATTAATTTAAATATAAATCAGTCTTGCTTC
G

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2F228TF 632 0 0
GGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTTTCACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACCACAAAAACAATAAATAAATAATGGGTGGTTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGCTCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAGCACAGAAGAAACCGGTGAGAACCAGAACCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGTGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAAGCGACCAAGGAAACAGCT
CCTACTGCTGAAGCAGAGATTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGTT
GCAGCAGCAACTGAGAAAGTTGAGGACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTT
GCGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTT
TGATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGAT
TTGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTCT
TCTTTTATTAATTTAAATATAAATCAGTTTTG

QA 1 632 1 632
DS 



CO CL84Contig2 632 14 10 U
AGGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTCTTACACTCCACAG
CCTAAACCCAACCCTAAACCACAACAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAG
ACCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGATCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGT
AGTAGCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCAC
TGAAACAACTCCTGAGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGC
TCCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGG*TGAGG
TTGCAGCAGCAACTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGA
AAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGG
ATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTAC
TACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTATTCTTTTA
TTAATTTAAATATAAATCAGTTTTGCTTCATT


BQ
10 55 55 55 60 60 60 60 65 65 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 
80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 50 10 10 10 

AF RR2AS92TF U 2
AF RR2E782TF U 2
AF RR2GO22TF U 9
AF RR2FY20JQ C 1
AF RR2H502JQB C 152
AF RR2FP85JQ C 9
AF RR2FP85TF U 9
AF RR2B217JQ C 2
AF RR2GR54TF U 2
AF RR2H459TF U 2
AF RR2DX61TF U 2
AF RR2H502TF U 3
AF RR2B217TF U 2
AF RR2FY20TF U 1
BS 1 1 RR2FY20JQ
BS 2 14 RR2AS92TF
BS 15 15 RR2FP85TF
BS 16 489 RR2AS92TF
BS 490 490 RR2FP85TF
BS 491 491 RR2AS92TF
BS 492 492 RR2FP85TF
BS 493 580 RR2AS92TF
BS 581 629 RR2FP85TF
BS 630 632 RR2FY20JQ

RD RR2AS92TF 579 0 0
GGAATCCTCGGGTTGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTCTTACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACCACAACAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGATCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGAGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCT
CCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGG*TGAGGT
TGCAGCAGCAACTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAA
AGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGGA
TTAAAAATATAAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTACT
ACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTG

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2E782TF 568 0 0
GGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTCTTACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACCACAACAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGATCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGAGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCT
CCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGG*TGAGGT
TGCAGCAGCAACTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAA
AGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGGA
TTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTACT
ACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTG

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2GO22TF 561 0 0
TCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTCTTACACTCCACAGCCTAAACC
CAACCCTAAACCACAACAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGACCCAAGG
AGTCAGACATGAACAACGAAGGATCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTAGTAGCCA
AGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCACTGAAACAA
CTCCTGAGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCTCCTACTG
CTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGGTGAGGTTGCAGCA
GCAACTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAAAGAGGCT
GAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGGGTTAAAAA
TGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTACTACATGAT
TTAATTAATTGGCTTTGGT
GT

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2FY20JQ 632 0 0
AGGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTCTTACACTCCACAG
CCTAAACCCAACCCTAAACCACAACAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAG
ACCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGATCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGT
AGTAGCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCAC
TGAAACAACTCCTGAGGAAGCTAAGGAGACATTTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGC
TCCCACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGG*TGAGG
TTGCAGCAGCAACTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGA
AAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAATTTGTTGTCACCGTTTGATTGG
ATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTAC
TACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTATTCTTTTA
TTAATTTAAATATAAATCAGTTTTGCTTCATT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2H502JQB 478 0 0
TCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTAGTAGCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACC
GGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCACTGAAACAACTCCTGAGGAAGCTAAGGAGACA
TCTGAGGTCTAACCGACCAAGGAAACAGCTCCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCC
GTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGG*TGAGGTTGCAGCAGCAACTGAGAACGTCGTGGCTGC
AACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGA
GAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGC
TGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTT
CTTTGTGTGTCATAATGATTATTCTTTTATTAATTTAAATATAAATCAGTTTTGCTTC

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2FP85JQ 621 0 0
GG
GGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTCTTACACTCCACAGCCTAAACCCA
ACCCTAAACCACAACAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGACCCAAGGAG
TCAGACATGAACAACGAAGGATCTGTTCCTAAGCCTGTGTTTGAAGACGTAGTAGCCAAG
GAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCACTGAAACAACT
CCTGAGGAAGCTAAGGAGACATTTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCTCCTACTGCT
GAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATTTTTTGCTGG*TGAGGTTGCAGCAGC
AACTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAAAGAGGCTGA
GGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGGATTAAAAATG
TGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTACTACATGATTT
AATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTATTCTTTTATTAATTTAAA
TATAAATCAGTTTTGCTTC

QA 3 621 3 621
DS 

RD RR2FP85TF 621 0 0
GG
GGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTCTTACACTCCACAGCCTAAACCCA
ACCCTAAACCACAACAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGACCCAAGGAG
TCAGACATGAACAACGAAGGATCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTAGTAGCCAAG
GAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCACTGAAACAACT
CCTGAGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCTCCTACTGCT
GAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGG*TGAGGTTGCAGCAGC
AACTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAAAGAGGCTGA
GGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGGATTAAAAATG
TGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTACTACATGATTT
AATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTATTCTTTTATTAATTTAAA
TATAAATCAGTTTTGCTTC

QA 3 621 3 621
DS 

RD RR2B217JQ 628 0 0
GGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTCTTACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACCACAACAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGATCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGAGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCT
CCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGG*TGAGGT
TGCAGCAGCAACTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAA
AGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGGA
TTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACTACCTTGATTTGATTTGCTACT
ACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTATTCTTTTAT
TAATTTAAATATAAATCAGTTTTGCTTC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2GR54TF 627 0 0
GGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCGAAGCAAAATAATTTCTTACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACCACAACAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGATCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGAGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCT
CCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGG*TGAGGT
TGCAGCAGCAACTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAA
AGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGGA
TTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTACT
ACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCGTAATGATTATTCTTTTAT
TAATTTAAATATAAATCAGTTTTGCTT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2H459TF 625 0 0
GGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCGAAGCAAAATAATTTCTTACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACCACAACAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGATCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGAGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCT
CCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGG*TGAGGT
TGCAGCAGCAACTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAA
AGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGGA
TTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTACT
ACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCGTAATGATTATTCTTTTAT
TAATTTAAATATAAATCAGTTTTGC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2DX61TF 625 0 0
GGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTCTTACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACCACAACAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGATCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGAGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCT
CCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGCGGAAGAGTCATCTTCTGCTGG*TGAGGT
TGCAGCAGCAACTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAA
AGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGGA
TTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTACT
ACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTATTCTTTTAT
TAATTTAAATATAAATCAGTTTTGC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2H502TF 627 0 0
GG
ATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTCTTACACTCCACAGCCTA
AACCCAACCCTAAACCACAACAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGACCC
AAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGATCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTAGTA
GCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCACTGAA
ACAACTCCTGAGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCTAACCGACCAAGGAAACAGCTCCT
ACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGG*TGAGGTTGC
AGCAGCAACTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAAAGA
GGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGGATTA
AAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTACTACA
TGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTATTCTTTTATTAA
TTTAAATATAAATCAGTTTTGCTTC

QA 3 627 3 627
DS 

RD RR2B217TF 628 0 0
GGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTCTTACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACCACAACAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGATCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGAGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCT
CCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGG*TGAGGT
TGCAGCAGCAACTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAA
AGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTTTGATTGGA
TTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACTACCTTGATTTGATTTGCTACT
ACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTATTCTTTTAT
TAATTTAAATATAAATCAGTTTTGCTTC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2FY20TF 632 0 0
A
GGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTCTTACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACCACAACAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGATCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAATCAGAACCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGAGGAAGCTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCT
CCCACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGG*TGAGGT
TGCAGCAGCAACTGAGAACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTTGCGGTGAA
AGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAATTTGTTGTCACCGTTTGATTGGA
TTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGATTTGCTACT
ACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAATGATTATTCTTTTAT
TAATTTAAATATAAATCAGTTTTGCTTC
ATT

QA 2 629 2 629
DS 



AS 3 21

CO CL85Contig1 687 9 11 U
GGATTCATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGAGA**AAGAAAGAAAGA
ACAGAGAAAAATGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCA
CACCGTCGCTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGT
GATTGACTTCACAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGA
GTTGGCTAAGAAGCACCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTC
TGTTGCTAAGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGA
GAAGGTCGACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCA
CTCTCAAGTTGCTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTGCCTAGTA
GTATGTTTGGTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAGTC
ATCTTTCCCTTTGTGTTGGTTTGGTGTGGTGCCTCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAA
TGTTTGCAGACTTTATAACTCGCAGCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACTCTTGAGGT
TATTGTGTTACGTCAGATTTCAGTTTT


BQ
30 30 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 25 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 40 55 40 55 55 55 40 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR49JQ C 437
AF RR2BR49TF U 1
AF RR2EN57TF U 1
AF RR2C404JQ C 1
AF RR2C404TF U 1
AF RR2AA63TF U -3
AF RR2A921JQ C 5
AF RR2A921TF U 5
AF RR2CQ30TF U 5
BS 1 46 RR2BR49TF
BS 47 48 RR2EN57TF
BS 49 537 RR2BR49TF
BS 538 538 RR2EN57TF
BS 539 655 RR2BR49TF
BS 656 658 RR2C404TF
BS 659 659 RR2AA63TF
BS 660 669 RR2C404TF
BS 670 670 RR2AA63TF
BS 671 681 RR2C404TF
BS 682 687 RR2A921JQ

RD RR2BR49JQ 163 0 0
GCTTGATTTGGTTTATCGTTCTTTTCATAACTATTTGCCTAGTAGTATGTTTGGTGTTTT
TAATAAAAATCCTCTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACCTGATTCATCTTTCCCTCTGTGT
TGGTTTGGTGTGGTGCCTCTACATCCCTCGGGGGTGTGAATAA

QA 1 163 1 163
DS 

RD RR2BR49TF 655 0 0
GGATTCATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGA
ACAGAGAAAAATGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCA
CACCGTCGCTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGT
GATTGACTTCACAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGA
GTTGGCTAAGAAGCACCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTC
TGTTGCTAAGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGA
GAAGGTCGACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCA
CTCTCAAGTTGCTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTGCCTAGTA
GTATGTTTGGTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGATTC
ATCTTTCCCTTTGTGTTGGTTTGGTGTGGTGCCTCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAA
TGTTTGCAGACTTTATAACTCGCAGCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACTCTT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2EN57TF 645 0 0
GGATTCATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGAGA**AAGAAAGAAAGA
ACAGAGAAAAATGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCA
CACCGTCGCTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGT
GATTGACTTCACAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGA
GTTGGCTAAGAAGCACCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTC
TGTTGCTAAGGATTTCGAAGTTGAGGCCGTGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGA
GAAGGTCGACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCA
CTCTCAAGTTGCTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTGCCTAGTA
GTATGTTTGGTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAGTC
ATCTTTCCCTTTGTGTTGGTTTGGTGTGGTGCCTCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAA
TGTTTGCAGACTTTATAACTCGCAGCTATGCTAAATTTTCATGT
A

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2C404JQ 681 0 0
GGATTCATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGA****AAGAAAGAAAGA
ACAGAGAAAAATGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCA
CACCGTCGCTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGT
GATTGACTTCACAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGA
GTTGGCTAAGAAGCACCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTC
TGTTGCTAAGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGA
GAAGGTCGACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCA
CTCTCAAGTTGCTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTGCCTAGTA
GTATGTTTGGTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAGTC
ATCTTTCCCTTTGTGTTGGTTTGGTGTGGTGCCTCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAA
TGTTTGCAGACTTTATAACTCGCAGCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACTCTTGAGGT
TATTGTGTTGCGTCAGATTTC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2C404TF 681 0 0
GGATTCATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGA****AAGAAAGAAAGA
ACAGAGAAAAATGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCA
CACCGTCGCTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGT
GATTGACTTCACAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGA
GTTGGCTAAGAAGCACCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTC
TGTTGCTAAGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGA
GAAGGTCGACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCA
CTCTCAAGTTGCTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTGCCTAGTA
GTATGTTTGGTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAGTC
ATCTTTCCCTTTGTGTTGGTTTGGTGTGGTGCCTCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAA
TGTTTGCAGACTTTATAACTCGCAGCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACTCTTGAG*T
TATTGTGTTGCGTCAGATTTC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2AA63TF 689 0 0
GGAATT
ATTCATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGAGA**AAGAAAGAAAGAAC
AGAGAAAAATGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACA
CCGTCGCTGACTGGAACGAGAAGTCCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGA
TTGACTTCACAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGT
TGGCTAAGAAGCACCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTG
TTGCTAAGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGA
AGGTCGACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGACGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACT
CTCAAGTTGCTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTGCCTAGTAGT
ATGTTTGGTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCAT
CTTTCCCTTTGTGTTGGTTTGGTGTGGTGCCTCT***TGCCTTGGGTGTGTGAATAAATG
TTTGCAGACTTTATAACTCGCAGCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACTCTTGAGGTTA
TTGTGTTACGTCAGATTTC
AGTT

QA 7 685 7 685
DS 

RD RR2A921JQ 683 0 0
GG
ATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGAGA**AAGAAAGAAAGAACAGAG
AAAAATGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGT
CGCTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATTGA
CTTCACAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATTTTCGTCGAGTTGGC
TAAGAAGCACCTTGATGTCGTTTTTTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGC
TAAGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTTTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGT
CGACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCA
AGTTGCTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTGCCTAGTAGTAT*T
TTGGTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCATCTTT
CCCTTTGTGTTGGTTTGGTGTGGTGCCTCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAATGTTTG
CAGACTTTATAACTCGCAGCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACTCTTGAGGTTATTGT
GTTACGTCAGATTTCAGTTTT

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2A921TF 681 0 0
GG
ATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGAGA**AAGAAAGAAAGAACAGAG
AAAAATGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGT
CGCTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATTGA
CTTCACAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGC
TAAGAAGCACCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGC
TAAGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGT
CGACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCA
AGTTGCTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTGCCTAGTAGTAT*T
TTGGTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCATCTTT
CCCTTTGTGTTGGTTTGGTGTGGTGCCTCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAATGTTTG
CAGACTTTATAACTCGCAGCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACTCTTGAGGTTATTGT
GTTACGTCAGATTTC
AGTT

QA 3 677 3 677
DS 

RD RR2CQ30TF 664 0 0
GG
ATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGAGA**AAGAAAGAAAGAACAGAG
AAAAATGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGT
CGCTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGT*ATTGA
CTTCACAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGC
TAAGAAGCACCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGC
TAAGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGT
CGACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCA
AGTTGCTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTGCCTAGTAGTATGT
TTGGTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCATCTTT
CCCTTTGTGTTGGTTTGATGTGGTGCCTCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAATGTTTG
CAGACTTTATAACTCGCAGCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACTCTTGAGGTTATTGT
GT

QA 3 664 3 664
DS 



CO CL85Contig2 666 5 13 U
GGATTCACCTAAAACAAAATCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGAGAAATAAAGAACAGAG
AAAAATGGCCGCACCAGCAGAATCGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGT
CGCTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATAGA
CTTCACAGCAACGTGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGC
TAAGAAGCATCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGC
TAAGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGT
CGACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCA
AGTTGCTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTATGT
TTGGTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCATCTTC
CGTTGGTGTGGTGCCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAATGTCTGCAGACTTTATAACT
CGCACGCAGCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACTCATGAGGTTATTGTGTTTACTTCA
GATTTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN96JQ C 131
AF RR2DN96TF U 6
AF RR2GK56TF U 1
AF RR2BY27TF U 1
AF RR2BY27JQ C 1
BS 1 7 RR2GK56TF
BS 8 8 RR2BY27TF
BS 9 48 RR2DN96TF
BS 49 49 RR2BY27TF
BS 50 83 RR2DN96TF
BS 84 84 RR2BY27TF
BS 85 95 RR2DN96TF
BS 96 96 RR2GK56TF
BS 97 591 RR2DN96TF
BS 592 592 RR2GK56TF
BS 593 636 RR2DN96TF
BS 637 653 RR2BY27TF
BS 654 666 RR2BY27JQ

RD RR2DN96JQ 506 0 0
AACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATAGACTTCACAGCA
ACGTGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGCTAAGAAGCAT
CTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGCTAAGGATTTC
GAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTCGACAAGGTG
GTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCAAGTTGCTTCG
GCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTATGTTTGGTGTTTT
TAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCATCTTCCGTTGGTGTG
GTGCCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAATGTCTGCAGACCTTATAACTCGCACGCAGC
TATGCTAAATTTTCATGTTATTAACT

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2DN96TF 631 0 0
GGT
CTAAAACAAAATCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAACAGAGAAAAATGG
CCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGTAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGTCGCTGACT
GGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATAGACTTCACAG
CAACGTGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGCTAAGAAGC
ATCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGCTAAGGATT
TCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTCGACAAGG
TGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCAAGTTGCTT
CGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTATGTTTGGTGTT
TTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCATCTTCCGTTGGTG
TGGTGCCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAATGTCTGCAGACCTTATAACTCGCACGCA
GCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACT

QA 4 631 4 631
DS 

RD RR2GK56TF 633 0 0
GGATTCATCTAAAACAAAATCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAACAGAG
AAAAATGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGT
CGCTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATAGA
CTTCACAGCAACGTGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCACCTTCGTCGAGTTGGC
TAAGAAGCATCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGC
TAAGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGT
CGACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCA
AGTTGCTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTATGT
TTGGTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCATCTTC
CGTTGGTGTGGTGCCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAATGTCTGCAGACTTTATAACT
CGCACGCAGCTATGCTAAATTTTCATGTTATTA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2BY27TF 666 0 0
GGATTCACCTAAAACAAAATCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGAGAAATAAAGAACAGAG
AAAAATGGCCGCACCAGCAGAATCGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGT
CGCTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATAGA
CTTCACAGCAACGTGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGC
TAAGAAGCATCTTGATGTCGCCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGC
TAAGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGT
CGACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCA
AGTTGCTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTATGT
TTGGTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCATCTTC
CGTTGGTGTGGTGCCTACATGCCTTGAGTGTGTGAATAAATGTCTGCAGACTTTATAACT
CGCACGCAGCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACTCATGAGGTTATTGTGTT
TACTTCAGATTTC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2BY27JQ 666 0 0
GGATTCACCTAAAACAAAATCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGAGAAATAAAGAACAGAG
AAAAATGGCCGCACCAGCAGAATCGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGT
CGCTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATAGA
CTTCACAGCAACGTGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGC
TAAGAAGCATCTTGATGTCGCCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGC
TAAGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGT
CGACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCA
AGTTGCTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTATGT
TTGGTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCATCTTC
CGTTGGTGTGGTGCCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAATGTCTGCAGACTTTATAACT
CGCACGCAGCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACTCATGAGGTTATTGTGTTTACTTCA
GATTTC

QA 1 666 1 666
DS 



CO CL85Contig3 644 7 32 U
GGATTCATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGA*************GAA
AAATGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGTCG
CTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATAGACT
TCACAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGCTA
AGAAGCACCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGCTA
AGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACATTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTCG
ACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCAAG
TT*GCTT*CGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTATGT
TTGGTGTTTTTAATAAAAATCCGTTGTTGCGTTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCATCTT
TCCCTTTGTGTTGGTTTGGTGCCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAATGTCTGCAGACT
TTATAACTCGCACGCAGCTATGCTAAATTTACATGTTATTAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E564JQ C 1
AF RR2E564TF U 1
AF RR2C381JQ C 1
AF RR2FP33TF U 1
AF RR2AP61TF U 5
AF RR2C381TF U 398
AF RR2EL05JQ C 5
BS 1 40 RR2E564TF
BS 41 41 RR2FP33TF
BS 42 44 RR2E564TF
BS 45 57 RR2FP33TF
BS 58 118 RR2E564TF
BS 119 119 RR2FP33TF
BS 120 175 RR2E564TF
BS 176 176 RR2FP33TF
BS 177 328 RR2E564TF
BS 329 329 RR2FP33TF
BS 330 358 RR2E564TF
BS 359 359 RR2FP33TF
BS 360 438 RR2E564TF
BS 439 439 RR2FP33TF
BS 440 441 RR2E564TF
BS 442 442 RR2FP33TF
BS 443 483 RR2E564TF
BS 484 484 RR2FP33TF
BS 485 502 RR2E564TF
BS 503 503 RR2FP33TF
BS 504 513 RR2E564TF
BS 514 514 RR2FP33TF
BS 515 519 RR2E564TF
BS 520 520 RR2FP33TF
BS 521 575 RR2E564TF
BS 576 576 RR2FP33TF
BS 577 607 RR2E564TF
BS 608 608 RR2FP33TF
BS 609 625 RR2E564TF
BS 626 635 RR2FP33TF
BS 636 638 RR2AP61TF
BS 639 644 RR2EL05JQ

RD RR2E564JQ 624 0 0
GGATTCATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAACAGAGAA
AAATGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGTTG
CTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATTGACT
TCACAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATTTTCGTCGAGTTGGCTA
AGAAGCCCCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGCTA
AGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTTG
ACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCAAG
TT*GCTT*CGGCTTGATTCGGCTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTATGT
TTGTTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTT*ATTGTTACTTTCACTTGAGTCATCTT
TCCCTTTGTGTTGGTTTGGTGCCTACATGCCTTGG*TGTGTGAATAAATGTCTGCAGACT
TTATAACACGCACGCAGCTATGCT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2E564TF 625 0 0
GGATTCATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAACAGAGAA
AAATGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGTTG
CTGACTGGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATTGACT
TCACAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGCTA
AGAAGCACCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGCTA
AGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTTG
ACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCAAG
TT*GCTT*CGGCTTGATTCGGCTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTATGT
TTGTTGTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTT*ATTGTTACTTTCACTTGAGTCATCTT
TCCCTTTGTGTTGGTTTGGTGCCTACATGCCTTGG*TGTGTGAATAAATGTCTGCAGACT
TTATAACACGCACGCAGCTATGCTA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2C381JQ 611 0 0
GGATTC
ATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGA*************GAAAAATGG
CCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGTCGCTGACT
GGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATGGACTTCACAG
CAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGCTAAGAAGC
ACCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGCTAAGGATT
TCGAAGTTGAGGCCATGCCGACATTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTCGACAAGG
TGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCACGCTTGAGAAGCACTCTCAAGTT*GCT
T*CGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTATGTTTGGTG
TTTTTAATAAAAATCCGTTGTTGCGTTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCATCTTTCCCTT
TGTGTTGGTTTGGTGCCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAATGTCTGCAGACTTTATAA
CTC
AC

QA 7 609 7 609
DS 

RD RR2FP33TF 635 0 0
GGATTC
ATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGA*************GAAAAATGG
CCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGTCGCTGACT
GGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATAGACTTCACAG
CAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGCTAAGAAGC
ACCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGCTAAGGATT
TCGAAGTTGAGGCCATGCCGACATTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTCGACAAGG
TGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCAAGTT*GCT
T*CGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTATGTTTGGTG
TTTTTAATAAAAATCCGTTGTTGCGTTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCATCTTTCCCTT
TGTGTTGGTTTGGTGCCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAATGTCTGCAGACTTTATAA
CTCGCACGCAGCTATGCTAAATTTACATG

QA 7 635 7 635
DS 

RD RR2AP61TF 634 0 0
GG
ATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGA***************AAAATGG
CCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCTCTTGCCACACCGTCGCTGACT
GGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATAGACTTCACAG
CAACGTGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGCTAAGAAGC
ACCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTAGCTAAGGATT
TCGAAGTTGAGGCCATGCCGACATTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTCGACAAGG
TGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCAAGTT*GCT
T*CGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTATGTTTGGTG
TTTTTAATAAAAATCCGTTGTTGCGTTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCATCTTTCCCTT
TGTGTTGGTTTGGTGCCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAATGTCTGCAGACTTTATAA
CTCGCACGCAGCTATGCTAAATTTACATGTTA

QA 3 634 3 634
DS 

RD RR2C381TF 218 0 0
CAC
GCTTGAGAAGCACTCTCAAGTTTGCTTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAA
CTATTTACCTAGTAGTATGTTTGGTGTTTTTAATAAAAATCCGTTGTTGCGTTTATTGTC
ACTTTCACTTGAGTCATCTTTCCCTTTGTGTTGGTTTGGTGCCTACATGCCTTGGGTGTG
TGAATAAATGTCTGCAGACTTTATAACTC
ACAAAA

QA 4 212 4 212
DS 

RD RR2EL05JQ 640 0 0
GG
ATCAAAAACAAATCCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAGA*************GAAAAATGG
CCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGTCGCTGACT
GGAACGAGAAGTTCAAGGCCGCCAAAGACTCCAACAAACTGATTGTGATAGACTTCACAG
CAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATTTTCGTCGAGTTGGCTAAGAAGC
ACCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGCTAAGGATT
TCGAAGTTGAGGCCATGCCGACATTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTCGACAAGG
TGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCAAGTT*GCT
T*CGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCCCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTATGTTTGGTG
TTTTTAATAAAAATCCGTTGTTGCGTTTATTGTCACTTTCACTTGAGTCATCTTTCCCTT
TGTGTTGGTTTGGTGCCTACATGCCTTGGGTGTGTGAATAAATGTCTGCAGACTTTATAA
CTCGCACGCAGCTATGCTAAATTTACATGTTATTAACT

QA 3 640 3 640
DS 



AS 2 21

CO CL86Contig1 732 8 6 U
GGAAACACAAACCATTAAACTCAAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACGAGAAAAA
AA*CATGAAACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTAGCGGTGATGTCCAA
TGCTTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTA
CATCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGT
CAGGTCTTCTGGTGAGTGTTTATGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGAT
CAATTTTAATCAAACACAGGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCC
AGTTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTC
AGAACATGGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCTCATGG
GAGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCGACTTCCTACATCAC
AATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTT
TTTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAA
AATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTG
CTTTATGAATAA


BQ
30 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 

AF RR2DP45TF U -1
AF RR2C628TF U 1
AF RR2B489JQ C 1
AF RR2BF24JQ C 2
AF RR2BF24TF U 2
AF RR2C628JQ C 1
AF RR2DP45JQ C 1
AF RR2B489TF U 1
BS 1 2 RR2C628TF
BS 3 62 RR2DP45TF
BS 63 63 RR2C628TF
BS 64 218 RR2DP45TF
BS 219 681 RR2C628TF
BS 682 732 RR2BF24TF

RD RR2DP45TF 220 0 0
GGCC
AAACACAAACCATTAAACTCAAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACGAGAAAAAAA
ACATGAAACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTAGCGGTGATGTCCAATG
CTTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTACA
TCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCT

QA 5 220 5 220
DS 

RD RR2C628TF 681 0 0
GGAAACACAAACCATTAAACTCAAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACGAGAAAAA
AA*CATGAAACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTAGCGGTGGTGTCCAA
TGCTTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTA
CATCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGT
CAGGTCTTCTGGTGAGTGTTTATGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGAT
CAATTTTAATCAAACACAGGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCC
AGTTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTC
AGAACATGGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCTCATGG
GAGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCGACTTCCTACATCAC
AATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTT
TTTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAA
AATCCCTACTTCCGGGGTGAT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2B489JQ 732 0 0
GGAAACACAAACCATTAAACTCAAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACGAGAAAAA
AA*CATGAAACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTAGCGGTGATGTCCAA
TGCTTCTGCTCAATCGAACTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTA
CATCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGT
CAGGTCTTCTGGTGAGTGTTTATGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGAT
CAATTTTAATCAAACACAGGCTTTTGCTTTGCCTAAA*CTTGTAATGTTCAAACTCCTCC
AGTTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTC
AGAACATGGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCTCATGG
GAGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCGACTTCCTACATCAC
AATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTT
TTTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAA
AATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTG
CTTTATGAATAA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2BF24JQ 731 0 0
GAAACACAAACCATTAAACTCAAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACGAGAAAAAA
A*CATGAAACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTAGCGGTGATGTCCAAT
GCTTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTAC
ATCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTC
AGGTCTTCTGGTGAGTGTTTATGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATC
AATTTTAATCAAACACAGGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCA
GTTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCA
GAACATGGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCTCATGGG
AGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCGACTTCCTACATCACA
ATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTT
TTATTTCTTCTGAATCTCAGCGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAA
ATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTGC
TTTATGAATAA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2BF24TF 731 0 0
GAAACACAAACCATTAAACTCAAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACGAGAAAAAA
A*CATGAAACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTAGCGGTGATGTCCAAT
GCTTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTAC
ATCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTC
AGGTCTTCTGGTGAGTGTTTATGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATC
AATTTTAATCAAACACAGGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCA
GTTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCA
GAACATGGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCTCATGGG
AGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCGACTTCCTACATCACA
ATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTT
TTATTTCTTCTGAATCTCAGCGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAA
ATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTGC
TTTATGAATAA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2C628JQ 732 0 0
GGAAACACAAACCATTAAACTCAAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACGAGAAAAA
AAACATGAAACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTAGCGGTGGTGTCCAA
TGCTTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTA
CATCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGT
CAGGTCTTTTGGTGAGTGTTTATGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGAT
CAATTTTAATCAAACACAGGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCC
AGTTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTC
AGAACATGGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCTCATGG
GAGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTTTGCGACTTCCTACATCAC
AATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTT
TTTATTTTTTTTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAA
AATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTG
CTTTATGAATAA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2DP45JQ 732 0 0
CC
AAACACAAACCATTAAACTCAAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACGAGAAAAAAA
ACATGAAACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTAGCGGTGATGTCCAATG
CTTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTACA
TCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCA
GGTCTTCTGGTGAGTGTTTATGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCA
ATTTTAATCAAACACAGGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAG
TTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAG
AACATGGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCTCATGGGA
GTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTTTGCGACTTCCTACATCACAA
TACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTT
TATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAAA
TCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTGCT
TTATGAATAA

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR2B489TF 732 0 0
GGAAACACAAACCATTAAACTCAAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACGAGAAAAA
AA*CATGAAACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTAGCGGTGATGTCCAA
TGCTTCTGCTCAATCGAACTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTA
CATCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGT
CAGGTCTTCTGGTGAGTGTTTATGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGAT
CAATTTTAATCAAACACAGGCTTTTGCTTTGCCTAAA*CTTGTAATGTTCAAACTCCTCC
AGTTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTC
AGAACATGGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCTCATGG
GAGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCGACTTCCTACATCAC
AATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTT
TTTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAA
AATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTG
CTTTATGAATAA

QA 1 732 1 732
DS 



CO CL86Contig2 762 13 13 U
GGAAACACAAACCATTAAACTCAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACAAGAAATAA
CATGAAACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTGGCGCTGATGTCCTATGT
TTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTACAT
CACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCAG
GTCTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAA
TTTTAATCAAACACAAGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGT
TAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCAGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGA
ACATGGAAATGGGTCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCA
TGGGAGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACAT
CACAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCT
TTTTTTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTA
TAAAATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGT
TTACTTTATGAATAAGTATTGCTCTCCATGATATTATTCTAC


BQ
15 15 25 25 25 25 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 40 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 25 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 
70 70 70 70 50 65 65 65 65 65 65 60 60 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G871TF U 1
AF RR2FH60TF U 1
AF RR2E069TF U 0
AF RR2CK65TF U 10
AF RR2EC56TF U 0
AF RR2D456TF U 5
AF RR2AY80JQ C 206
AF RR2EC56JQ C 77
AF RR2D456JQ C 205
AF RR2CK65JQ C 200
AF RR2AY80TFB U 206
AF RR2G871JQ C 193
AF RR2E069JQ C 333
BS 1 40 RR2FH60TF
BS 41 41 RR2G871TF
BS 42 622 RR2FH60TF
BS 623 623 RR2E069TF
BS 624 671 RR2FH60TF
BS 672 673 RR2E069TF
BS 674 676 RR2EC56TF
BS 677 677 RR2AY80TFB
BS 678 721 RR2EC56TF
BS 722 722 RR2AY80TFB
BS 723 746 RR2EC56TF
BS 747 748 RR2D456TF
BS 749 762 RR2G871JQ

RD RR2G871TF 610 0 0
GGAAACACAAACCATTAAACTCAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACAAGAAATAA
CATGAAACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTGGCGCTGATGTCCTATGC
TTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTACAT
CACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCAG
GTCTTCCGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAA
TTTTAATCAAACACAAGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGT
TAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCAGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGA
ACATGGAAATGGGTCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCA
TGGGAGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACAT
CACAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCT
TTTTTTATTT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2FH60TF 671 0 0
GGAAACACAAACCATTAAACTCAAACACCCAATTAAACAAGCTTTTGACACAAGAAATAA
CATGAAACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTGGCGCTGATGTCCTATGT
TTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTACAT
CACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCAG
GTCTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAA
TTTTAATCAAACACAAGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGT
TAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCAGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGA
ACATGGAAATGGGTCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCA
TGGGAGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACAT
CACAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCT
TTTTTTATTTCTTCTGAATCTCGGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTA
TAAAATCCCTA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2E069TF 674 0 0
GGA
AAACACAAACCATTAAACTCAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACAAGAAATAACA
TGAAACCTTGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTGGCGCTGATGTCCTATGTTT
CTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTACATCA
CTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGT
CTTCCGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATT
TTAATCAAACACAAGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTA
GTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCAGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAAC
ATGGAAATGGGTCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATG
GGAGTACTATCAAGTTCTCATTCCCCCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACATCA
CAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTT
TTTTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATA
AAATCCCTACT

QA 4 674 4 674
DS 

RD RR2CK65TF 661 0 0
AACCATTAAACTCAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACAAGAAATAACATGAAACC
TGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTGGCGCTGATGTCCTATGTTTCTGCTCA
ATCGAGCTGCACTGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTACATCACTGGAAA
CTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGTCT*CTGG
TGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTTTAATCA
AACACAAGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTAGTAGCTG
CAACGGTGGTTCTTCAGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACATGGAAA
TGGGTCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATGGGAGTAC
TATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACATCACAATACT
GACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTTTATT
TCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAA
TCCCTA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2EC56TF 750 0 0
GGC
AAACACAAACCATTAAACTCAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACAAGAAATAACA
TGAAACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTGGCGCTGATGTCCTATGTTT
CTGCTCAGTCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTACATCA
CTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGT
CTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATT
TTAATCAAACACAAGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTA
GTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCAGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAAC
ATGGAAATGGGTCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATG
GGAGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACATCA
CAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTT
TTTTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATA
AAATCCCTACTTCC*GGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTT*
ACTTTATGAATAAGTATTGCTCTC
ATG

QA 4 747 4 747
DS 

RD RR2D456TF 749 0 0
GG
ACAAACCATTAAACTCAAACACCCAATTAAACAAACTTTTGACACAAGAAATAACATGAA
ACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTGGCGCTGATGTCCTATGTTTCTGC
TCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTACATCACTGG
AAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGGTGTCAGGTCTTC
TGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTTTAA
TCAAACACAAGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTAGTAG
CTGCAACGGTGGTTCTTCAGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACATGG
AAATGGGCCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATGGGAG
TACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACATCACAAT
ACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTTT
ATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAA*T
CCCTACTTCCCGGGTGATATCGGTT*GTAGCTACAA*TAGTGTCTTGTATCTGTT*ACTT
TATGAATAAGTATTGCTCTCCA
AAAAA

QA 3 744 3 744
DS 

RD RR2AY80JQ 541 0 0
G
AACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGTCTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAAC
TTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTTTAATCAAACCCAAGCTTTTGCTT
TGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCAG
TTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACATGGAAATGGGTCAAAACCAGATC
CAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATGGGAGTACTATCAAGTTCTCATTCC
CTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACATCACAATACTGACTTCTTAAAATCCAT
AAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTTTATTTCTTCTGAATCTCTGTG
TAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAAATCCCTACTTCCGGGGTGATAT
CGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTACTTTATGAATAAGTATTGCTCTC

QA 2 541 2 541
DS 

RD RR2EC56JQ 674 0 0
TATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTGGCGCTGATGTCCTATGTTTCTGCTCAGTCGAGC
TGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTCGGCTACATCACTGGAAACTCTTCT
TCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGTCTTCTGGTGAGTGT
TTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTTTAATCAAACACAA
GCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTAGTAGCTGCAACGGT
GGTTCTTCAGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACATGGAAATGGGTCA
AAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATGGGAGTACTATCAAG
TTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACATCACAATACTGACTTCT
TAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTTTATTTCTTCTG
AATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAAATCCCTACTTCC
GGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTACTTTATGAATAAG
TATTGCTCTCCA
TG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2D456JQ 543 0 0
TCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGGTGTCAGGTCTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGA
ACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTTTAATCAAACACAAGCTTTTGC
TTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTC
AGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACATGGAAATGGGCCAAAACCAGA
TCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATGGGAGTACTATCAAGTTCTCATT
CCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACATCACAATACTGACTTCTTAAAATCC
ATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTTTATTTCTTCTGAATCTCAG
TGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAAATCCCTACTTCCGGGGTGAT
ATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTACTTTATGAATAAGTATTGCTC
TCC

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2CK65JQ 548 0 0
CCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGTCT*CTGGTGAGTGTTTG
TGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTTTAATCAAACACAAGCT
TTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTAGTAGCTGCAACGGTGGT
TCTTCAGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACATGGAAATGGGTCAAAA
CCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATGGGAGTACTATCAAGTTC
TCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACATCACAATACTGACTTCTTAA
AATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTTTATTTCTTCTGAAT
CTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAAATCCCTACTTCCGGG
GTGATATCGGTTTGTAGCTACACATAGTGTCTTGTATCTGTTTACTTTATGAATAAGTAT
TGCTCTCC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2AY80TFB 542 0 0
G
AACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGTCTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAAC
TTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTTTAATCAAACACAAGCTTTTGCTT
TGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCAG
TTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACATGGAAATGGGTCAAAACCAGATC
CAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATGGGAGTACTATCAAGTTCTCATTCC
CTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACATCACAATACTGACTTCTTAAAATCCAT
AAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTTTATTTCTTCTGAATCTCTGTG
TAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAAATCCCTACTTCCGGGGTGATAT
CGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTACTTTATGAATAAGTATTGCTCTC
C

QA 2 542 2 542
DS 

RD RR2G871JQ 570 0 0
TTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGTCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGTCTTCCGGTGA
GTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTTTAATCAAAC
ACAAGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTAGTAGCTGCAA
CGGTGGTTCTTCAGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACATGGAAATGG
GTCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATGGGAGTACTAT
CAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACATCACAATACTGAC
TTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTTTATTTCT
TTTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCCCTATAAAATCCCTAC
TTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTACTTTATGAA
TAAGTATTGCTCTCCATGATATTATTCTAC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2E069JQ 425 0 0
AAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCAGTTAATT
CGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACATGGAAATGGGTCAAAACCAGATCCAGGAC
ATAGATCATCATCATCATCATCATTTCATGGGAGTACTATCAAGTTCTCATTCCCCCTTC
TTGCTATCCTTTCTGCAACTTCCTACATCACAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGAT
TATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTTTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGT
GGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAAATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTT
GTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTACTTTATGAATAAGTATTGCTCTCCA
TGATATTAT

QA 1 416 1 416
DS 



AS 5 17

CO CL87Contig1 744 2 2 U
CTATTAAAGAGCCAAGACTAACAAAACAACTCGAAGTTCGAAACATATTCAAACTAGAAA
GACAATAGCATAAATCTGAAGTGGACAAAATCAAGAAGACAGAAACCATCATACTACAAA
CGAAACAGTACTTAAAGCAACGACAAAAAGGTGAACTCGGGGGGAGATATAACAATGGAT
ATCTATTCATCACCGAACATATCGAAACCACCGTAGTCTTCTTCATCCGATTCCTCAACG
ACTTCCTTCTTCTCCTCTACCTTGGCAGCTCCAGCCGAAGCCCCACCACCTGCATCGGCA
GATACAGCCGCTGCAGCAACAGCGAACTTGCTAGGATCCTTCAAGTACTCCTTGACCTTC
TCTGCTTGTGGGAAAGTGTACTCGGTGGCAACTGAGATAGCCAATGTGTTCTTGTACGCA
TTGATGAACATATGTGGAGCAGCAACAAGGGTAGGGTAAGAGATACCAGTGTTCTCAGCG
TGAATCTTAACGGAACGTTTCATCATAGTGTTCTTCCCCATGAGAACCACTGAGTCACCA
CGAAGACCTTTCCTGATGTTCTGGAGCGGAGTCGATCCGACGTTGTCGGCTGCAACGACC
AAGATCTGGGTGAACTCGTCGATGAGCTGACATAGCTTCGCGTCGTAAGCGATCTTCTTC
TCAGCCTTTGTTGCCTTCACCATTGTTGCTGCTCACGGGGATGAGACTCGTTTTTTCCTC
TTTGTCTGTGCAGAAGAGTGACCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT16TF C 1
AF RR2BT16JQ U 2
BS 1 2 RR2BT16TF
BS 3 744 RR2BT16JQ

RD RR2BT16TF 449 0 0
CTATTAAAGAGCCAAGACTAACAAAACAACTCGAAGTTCGAAACATATTCAAACTAGAAA
GACAATAGCATAAATCTGAAGTGGACAAAATCAAGAAGACAGAAACCATCATACTACAAA
CGAAACAGTACTTAAAGCAACGACAAAAAGGTGAACTCGGGGGGAGATATAACAATGGAT
ATCTATTCATCACCGAACATATCGAAACCACCGTAGTCTTCTTCATCCGATTCCTCAACG
ACTTCCTTCTTCTCCTCTACCTTGGCAGCTCCAGCCGAAGCCCCACCACCTGCATCGGCA
GATACAGCCGCTGCAGCAACAGCGAACTTGCTAGGATCCTTCAAGTACTCCTTGACCTTC
TCTGCTTGTGGGAAAGTGTACTCGGTGGCAACTGAGATAGCCAATGTGTTCTTGTACGCA
TTGATGAACATATGTGGAGCAGCAACAAG

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2BT16JQ 743 0 0
A
ATTAAAGAGCCAAGACTAACAAAACAACTCGAAGTTCGAAACATATTCAAACTAGAAAGA
CAATAGCATAAATCTGAAGTGGACAAAATCAAGAAGACAGAAACCATCATACTACAAACG
AAACAGTACTTAAAGCAACGACAAAAAGGTGAACTCGGGGGGAGATATAACAATGGATAT
CTATTCATCACCGAACATATCGAAACCACCGTAGTCTTCTTCATCCGATTCCTCAACGAC
TTCCTTCTTCTCCTCTACCTTGGCAGCTCCAGCCGAAGCCCCACCACCTGCATCGGCAGA
TACAGCCGCTGCAGCAACAGCGAACTTGCTAGGATCCTTCAAGTACTCCTTGACCTTCTC
TGCTTGTGGGAAAGTGTACTCGGTGGCAACTGAGATAGCCAATGTGTTCTTGTACGCATT
GATGAACATATGTGGAGCAGCAACAAGGGTAGGGTAAGAGATACCAGTGTTCTCAGCGTG
AATCTTAACGGAACGTTTCATCATAGTGTTCTTCCCCATGAGAACCACTGAGTCACCACG
AAGACCTTTCCTGATGTTCTGGAGCGGAGTCGATCCGACGTTGTCGGCTGCAACGACCAA
GATCTGGGTGAACTCGTCGATGAGCTGACATAGCTTCGCGTCGTAAGCGATCTTCTTCTC
AGCCTTTGTTGCCTTCACCATTGTTGCTGCTCACGGGGATGAGACTCGTTTTTTCCTCTT
TGTCTGTGCAGAAGAGTGACCC

QA 2 743 2 743
DS 



CO CL87Contig2 745 2 3 U
GGCTATATAAAAAGAGTGATATAACACTTGGGAAATTAAAGAGCCAAGACTAACAAACAA
CTCAAAGTTCGAAACATATTCAAACTAGAAAGACAATAGCATAAATCTGAAGTGGCCAAA
ATCAAGAAAACAGAAATCATCATACTACAAACGAAGCAGTACTTATAGCAACGACAAAAA
GGTGAACTCGGGAGAGATATAACAACAATGGATCTACTCATCACCGAACATATCGAAACC
ACCGTAGTCTTCTTCATCTGACTCCTCAACCACTTCCTTCTCCTCCTCTACCTTGGCAGC
TCCAGCCGAAGCCCCACCACCTGCATCGGCAGATACAGCCGCTGCAGCAACAGCGAACTT
GCTAGGATCCTTCAAGTACTCCTTGACCTTCTCTGCTTGTGGGAAAGTGTACTCGGTGGC
AACTGAGATAGCCAATGCGTTCTTGTACGCATTGATGAACATATGCGGAGCAGCAGCAAG
GGTAGGGTAAGAGATAGCTAGCGCCAAGGAAGTGACCATGGAGATACCAGCGGCAAACTT
CTGGACAAGGTCATCTTCCGTAAGATCGAGAACCTCTGGGCTGAAGACAGAGCCATTGTC
GTAAACAGACTGGACAACAAGACCGTAAGAGAACGGCCTGATGCCGAGCTTGGCTAGAAG
GGCGGCCTCAGAAGAACCGACCTTGTCGCCTTGCTTGATGAGCTCAACAGGGGTGATGAT
TTCGACTGTCCCCTTGTTAATCTTA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX35JQ U 1
AF RR2A994JQ U 2
BS 1 281 RR2BX35JQ
BS 282 282 RR2A994JQ
BS 283 745 RR2BX35JQ

RD RR2BX35JQ 745 0 0
GGCTATATAAAAAGAGTGATATAACACTTGGGAAATTAAAGAGCCAAGACTAACAAACAA
CTCAAAGTTCGAAACATATTCAAACTAGAAAGACAATAGCATAAATCTGAAGTGGCCAAA
ATCAAGAAAACAGAAATCATCATACTACAAACGAAGCAGTACTTATAGCAACGACAAAAA
GGTGAACTCGGGAGAGATATAACAACAATGGATCTACTCATCACCGAACATATCGAAACC
ACCGTAGTCTTCTTCATCTGACTCCTCAACCACTTCCTTCTTCTCCTCTACCTTGGCAGC
TCCAGCCGAAGCCCCACCACCTGCATCGGCAGATACAGCCGCTGCAGCAACAGCGAACTT
GCTAGGATCCTTCAAGTACTCCTTGACCTTCTCTGCTTGTGGGAAAGTGTACTCGGTGGC
AACTGAGATAGCCAATGCGTTCTTGTACGCATTGATGAACATATGCGGAGCAGCAGCAAG
GGTAGGGTAAGAGATAGCTAGCGCCAAGGAAGTGACCATGGAGATACCAGCGGCAAACTT
CTGGACAAGGTCATCTTCCGTAAGATCGAGAACCTCTGGGCTGAAGACAGAGCCATTGTC
GTAAACAGACTGGACAACAAGACCGTAAGAGAACGGCCTGATGCCGAGCTTGGCTAGAAG
GGCGGCCTCAGAAGAACCGACCTTGTCGCCTTGCTTGATGAGCTCAACAGGGGTGATGAT
TTCGACTGTCCCCTTGTTAATCTTA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2A994JQ 721 0 0
GCTATATAAAAAGAGTGATATAACACTTGGGAAATTAAAGAGCCAAGACTAACAAACAAC
TCAAAGTTCGAAACATATTCAAACTAGAAAGACAATAGCATAAATCTGAAGTGGCCAAAA
TCAAGAAAACAGAAATCATCATACTACAAACGAAGCAGTACTTATAGCAACGACAAAAAG
GTGAACTCGGGAGAGATATAACAACAATGGATCTACTCATCACCGAACATATCGAAACCA
CCGTAGTCTTCTTCATCTGACTCCTCAACCACTTCCTTCTCCTCCTCTACCTTGGCAGCT
CCAGCCGAAGCCCCACCACCTGCATCGGCAGATACAGCCGCTGCAGCAACAGCGAACTTG
CTAGGATCCTTCAAGTACTCCTTGACCTTCTCTGCTTGTGGGAAAGTGTACTCGGTGGCA
ACTGAGATAGCCAATGCGTTCTTGTACGCATTGATGAACATATGCGGAGCAGCAGCAAGG
GTAGGGTAAGAGATAGCTAGCGCCAAGGAAGTGACCATGGAGATACCAGCGGCAAACTTC
TGGACAAGGTCATCTTCCGTAAGATCGAGAACCTCTGGGCTGAAGACAGAGCCATTGTCG
TAAGCAGACTGGACAACAAGACCGTAAGAGAACGGCCTGATGCCGAGCTTGGCTAGAAGG
GCGGCCTCAGAAGAACCGACCTTGTCGCCTTGCTTGATGAGCTTAACAGGGGTGATGATT
T

QA 1 721 1 721
DS 



CO CL87Contig3 1186 4 20 U
GAATCTCCGTCACTCTTCTGCACAGACAAAGAGGAAAAAAACGAGTCTCATCCCCGTGAG
CAACAACAATGGTGAAGGCAACAAAGGCTGAGAAGAAGATCGCTTACGACGCGAAGCTAT
GTCAGCTCATCGACGAGTTCACCCAGATCTTGGTCGTTGCAGCCGACAACGTCGGATCGA
CTCAGCTCCAGAACATCAGGAAAGGTCTTCGTGGTGACTCAGTGGTTCTCATGGGGAAGA
ACACTATGATGAAACGTTCCGTTAAGATTCACGCTGAGAACACTGGAAACACTGGTATCC
TCAATCTCATGCCCCTCCTTCAGGGAAATGTTGGTTTGATCTTTACCAAGGGTGACCTCA
AGGAAGTGAGTGAGGAAGTTGCCAAGTACAAGGTTGGTGCTCCTGCTCGTGTTGGTTTGG
TTGCGCCAATTGATGTGGTTGTCCAACCTGGTAACACTGGTCTCGATCCATCTCAGACAT
CTTTCTTCCAGGTTCTTAACATCCCAACTAAGATTAACAAGGGAACAGTCGAAATCATCA
CCCCTGTTGAGCTCATCAAGCAAGGTGACAAGGTCGGTTCTTCTGAGGCTGCCCTTCTAG
CCAAGCTCGGCATCAGGCCGTTCTCGTACGGTCTTGTTGTCCAGTCTGTTTACGACAATG
GCTCTGTCTTCAGCCCAGAGGTTCTCGATCTTACGGAAGATGACCTTGTCCAGAAGTTTG
CCGCTGGTATCTCCATGGTCACTTCCTTGGCGCTAGCTATCTCTTACCCTACCCTTGCTG
CTGCTCCACATATGTTCATCAATGCGTACAAGAACGCATTGGCTATCTCAGTTGCCACCG
AGTACACTTTCCCACAAGCAGAGAAAGGTCAAGGAGTACTTGAAAGATCCTAGCAAGTTC
GCTGTTGCTGCAGCGGCTGTATCTGCCGATGCAAGGTGGTGGGGCTTCGGCTGGAGCTGC
CAAGGTAGAGGAGAAGAAGGAAGTCGTTGAGGAATCGGATGAAGAAGACTACGGTGGTTT
CGATATGTTCGATGATGAATAGATATCCATTGTTATATCTCCCCCCGAGTTCACCTTTTT
GTCGTTGCTTTAAGTACTGTTTCGTTTGTAGTATGATGGTTTCTGTCTTCTTGATTTTGT
CCACTTCAGATCTATGCTATTGTCTTTCTAGTTTGAATATGTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ07TF U 1
AF RR2GZ17TF U 143
AF RR2A994TF U 218
AF RR2BZ07JQ C 407
BS 1 408 RR2BZ07TF
BS 409 409 RR2GZ17TF
BS 410 682 RR2BZ07TF
BS 683 683 RR2GZ17TF
BS 684 695 RR2BZ07TF
BS 696 696 RR2GZ17TF
BS 697 704 RR2BZ07TF
BS 705 705 RR2GZ17TF
BS 706 710 RR2BZ07TF
BS 711 711 RR2GZ17TF
BS 712 764 RR2BZ07TF
BS 765 765 RR2GZ17TF
BS 766 773 RR2BZ07TF
BS 774 774 RR2GZ17TF
BS 775 786 RR2BZ07TF
BS 787 789 RR2GZ17TF
BS 790 790 RR2A994TF
BS 791 865 RR2GZ17TF
BS 866 969 RR2A994TF
BS 970 1186 RR2BZ07JQ

RD RR2BZ07TF 791 0 0
GAATCTCCGTCACTCTTCTGCACAGACAAAGAGGAAAAAAACGAGTCTCATCCCCGTGAG
CAACAACAATGGTGAAGGCAACAAAGGCTGAGAAGAAGATCGCTTACGACGCGAAGCTAT
GTCAGCTCATCGACGAGTTCACCCAGATCTTGGTCGTTGCAGCCGACAACGTCGGATCGA
CTCAGCTCCAGAACATCAGGAAAGGTCTTCGTGGTGACTCAGTGGTTCTCATGGGGAAGA
ACACTATGATGAAACGTTCCGTTAAGATTCACGCTGAGAACACTGGAAACACTGGTATCC
TCAATCTCATGCCCCTCCTTCAGGGAAATGTTGGTTTGATCTTTACCAAGGGTGACCTCA
AGGAAGTGAGTGAGGAAGTTGCCAAGTACAAGGTTGGTGCTCCTGCTCTTGTTGGTTTGG
TTGCGCCAATTGATGTGGTTGTCCAACCTGGTAACACTGGTCTCGATCCATCTCAGACAT
CTTTCTTCCAGGTTCTTAACATCCCAACTAAGATTAACAAGGGAACAGTCGAAATCATCA
CCCCTGTTGAGCTCATCAAGCAAGGTGACAAGGTCGGTTCTTCTGAGGCTGCCCTTCTAG
CCAAGCTCGGCATCAGGCCGTTCTCGTACGGTCTTGTTGTCCAGTCTGTTTACGACAATG
GCTCTGTCTTCAGCCCAGAGGT*CTCGATCTTACG*AAGATGAC*TTGTC*AGAAGTTTG
CCGCTGGTATCTCCATGGTCACTTCCTTGGCGCTAGCTATCTCT*ACCCTACC*TTGCTG
CTGCTC
ACATA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2GZ17TF 724 0 0
G
CAGATCTTGGTCGTTGCAGCCGACAACGTCGGATCGACTCAGCTCCAGAACATCAGGAAA
GGTCTTCGTGGTGACTCAGTGGTTCTCATGGAGAAGAACACTATGATGAAACGTTCCGTT
AAGATTCACGCTGAGAACACTGGAAACACTGGTATCCTCAATCTCATGCCCCTCCTTCAG
GGAAATGTT**TTTGATCTTTACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGTGAGGAAGTTGCC
AAGTACAAGGTTGGTGCTCCTGCTCGTGTTGGTTTGGTTGCGCCAATTGATGTGGTTGTC
CAACCTGGTAACACTGGTCTCGATCCATCTCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTTAACATC
CCAACTAAGATTAACAAGGGAACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTCATCAAGCAA
GGTGACAAGGTCGGTTCTTCTGAGGCTGCCCTTCTAGCCAAGCTCGGCATCAGGCCGTTC
TCGTACGGTCTTGTTGTCCAGTCTGTTTACGACAATGGCTCTGTCTTCAGCCCAGAGGTT
CTCGATCTTACGGAAGATGACCTTGTCCAGAAGTTTGCCGCTGGTATCTCCATGGTCACT
TCCTTGGCGCTAGCTATCTCTTACCCTACCCTTGCTGCTGCTCCACGTATGTTCATCAAT
GCGTACAAGAACGCATTGGCTATCTCAGTTGCCACCGAGTACACTTTCCCACAAGCAGAG
AAG

QA 2 724 2 724
DS 

RD RR2A994TF 752 0 0
GG
CAGTGGTTCTCATGGGGAAGAACACTATGATGAAGCGTTCCGTTAAGATTCACGCTGAGA
ACACTGGAAACACTGGTATCCTAAATCTCATGCCCCTCCTTCAGGGAAATGTTGGTTTGA
TCTTTACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGTGAGGAAGTTGCCAAGTACAAGGTTGGTG
CTCCTGCTCGTGTGGGTTTGGTTGCCCCAATTGATGTGGTTGTCCAACCTGGTAACACTG
GTCTCGATCCATCTCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTTAACATCCCAACTAAGATTAACA
AGGGAACAGTCGAAATCATCACCCCTGTTAAGCTCATCAAGCAAGGCGACAAGGTCGGTT
CTTCTGAGGCCGCCCTTCTAGCCAAGCTCGGCATCAGGCCGTTCTCTTACGGTCTTGTTG
TCCAGTCTGCTTACGACAATGGCTCTGTCTTCAGCCCAGAGGTTCTCGATCTTACGGAAG
ATGACCTTGTCCAGAAGTTTGCCGCTGGTATCTCCATGGTCACTTCCTTGGCGCTAGCTA
TCTCTTACCCTACCCTTGCTGCTGCTCCGCATATGTTCATCAATGCGTACAAGAACGCAT
TGGCTATCTCAGTTGCCACCGAGTACACTTTCCCACAAGCAGAGAAAGGTCAAGGAGTAC
TTGAAAGATCCTAGCAAGTTCGCTGTTGCTGCAGCGGCTGTATCTGCCGATGCAAGGTGG
TGGGGCTTCGGCTGGAGCTGCCAAGGTAGA

QA 3 752 3 752
DS 

RD RR2BZ07JQ 780 0 0
TCT
TGTTGGTTTGGT*GCGCCAATTGATGTGGTTGTCCAACCTGGTAACACTGGTCTCGATCC
ATCTCAGACATCTTTCTTCCAGGTTCTTAACATCCCAACTAAGATTAACAAGGGAACAGT
CGAAATCATCACCCCTGTTGAGCTCATCAAGCAAGGTGACAAGGTCGGTTCTTCTGAGGC
TGCCCTTCTAGCCAAGCTCGGCATCAGGCCGTTTTCGTACGGTCTTGTTGTCCAGTCTGT
TTACGACAATGGCTCTGTCTTCAGCCCAGAGGTTCTCGATCTTACGGAAGATGACCTTGT
CCAGAAGTTTGCCGCTGGTATCTCCATGGTCACTTCCTTGGCGCTAGCTATCTCTTACCC
TACCCTTGCTGCTGCTCCACATATGTTCATCAATGCGTACAAGAACGCATTGGCTATCTC
AGTTGCCACCGAGTACACTTTCCCACAAGCAGAGAA*GGTCAAGGAGTACTTGAAGGATC
CTAGCAAGTTCGCTGTTGCTGCAGCGGCTGTATCTGCCGATGCA*GGTGGTGGGGCTTCG
GCTGGAGCTGCCAAGGTAGAGGAGAAGAAGGAAGTCGTTGAGGAATCGGATGAAGAAGAC
TACGGTGGTTTCGATATGTTCGATGATGAATAGATATCCATTGTTATATCTCCCCCCGAG
TTCACCTTTTTGTCGTTGCTTTAAGTACTGTTTCGTTTGTAGTATGATGGTTTCTGTCTT
CTTGATTTTGTCCACTTCAGATCTATGCTATTGTCTTTCTAGTTTGAATATGTTTCG

QA 4 780 4 780
DS 



CO CL87Contig4 763 2 3 U
TTTTTATAGACAAAGAGGGGAAGCAGAAGAAGCCTTATCCTGTGAGCAACAATGGTGAAG
GCAACAAAGGCGGAGAAGAAGATCGCTTACGATGCGAAGCTATGTCAGCTCATCGACGAG
TTCACTCAGATCCTTGTCGTCGCCGCCGACAACGTCGGATCAACTCAGCTGCAGAACATC
AGGAAGGGTCTTCGTGGTGACTCAGTGGTTCTCATGGGAAAGAACACTATGATGAAGCGT
TCTGTTAAGATTCACGCTGAGAATACCGGAAACACTGGAATCCTCAATCTCATGCCCCTC
CTTCAGGGAAATGTTGGTTTGATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAGGAA
GTAGCCAAGTACAAGGTTGGTGCTCCTGCTCGTGTTGGTTTGGTTGCCCCAATTGATGTG
GTTGTCCAGCCTGGAAACACTGGTTTAGATCCATCCCAGACTTCTTTCTTCCAGGTTCTT
AACATCCCAACTAAGATTAACAAGGGTACAGTCGAAATCATCACCCCTGTCGAGCTCATC
AAGCAAGGCGACAAGGTCGGTTCTTCTGAGGCCGCCCTTCTAGCCAAGCTTGGCATCAGG
CCGTTTTCATACGGTCTTGTTGTCCAGTCTGTTTACGACAATGGCTCAGTCTTCAGCCCA
GAGGTTCTTGATCTCACGGAAGACGACCTTGTCCAGAAGTTTGCTGCTGGTATCTCCATG
GTCACTTCCTTGGCTCTAGCCATCTCTTACCCTACACTCGCTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H615TF U 1
AF RR2FM70TF U 1
BS 1 162 RR2FM70TF
BS 163 163 RR2H615TF
BS 164 763 RR2FM70TF

RD RR2H615TF 581 0 0
TTTTTATAGACAAAGAGGGGAAGCAGAAGAAGCCTTATCCTGTGAGCAACAATGGTGAAG
GCAACAAAGGCGGAGAAGAAGATCGCTTACGATGCGAAGCTATGTCAGCTCATCGACGAG
TTCACTCAGATCCTTGTCGTCGCCGCCGACAACGTCGGATCAACTCAGCTGCAGAACATC
AGGAAGGGTCTTCGTGGTGACTCAGTGGTTCTCATGGGAAAGAACACTATGATGAAGCGT
TCTGTTAAGATTCACGCTGAGAATACCGGAAACACTGGAATCCTCAATCTCATGCCCCTC
CTTCAGGGAAATGTTGGTTTGATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAGGAA
GTAGCCAAGTACAAGGTTGGTGCTCCTGCTCGTGTTGGTTTGGTTGCCCCAATTGATGTG
GTTGTCCAGCCTGGAAACACTGGTTTAGATCCATCCCAGACTTCTTTCTTCCAGGTTCTT
AACATCCCAACTAAGATTAACAAGGGTACAGTCGAAATCATCACCCCTGTCGAGCTCATC
AAGCAAGGCGACAAGGTCGGTTCTTCTGAGGCCGCCCTTCT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2FM70TF 763 0 0
TTTTTATAGACAAAGAGGGGAAGCAGAAGAAGCCTTATCCTGTGAGCAACAATGGTGAAG
GCAACAAAGGCGGAGAAGAAGATCGCTTACGATGCGAAGCTATGTCAGCTCATCGACGAG
TTCACTCAGATCCTTGTCGTCGCCGCCGACAACGTCGGATCAGCTCAGCTGCAGAACATC
AGGAAGGGTCTTCGTGGTGACTCAGTGGTTCTCATGGGAAAGAACACTATGATGAAGCGT
TCTGTTAAGATTCACGCTGAGAATACCGGAAACACTGGAATCCTCAATCTCATGCCCCTC
CTTCAGGGAAATGTTGGTTTGATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAGGAA
GTAGCCAAGTACAAGGTTGGTGCTCCTGCTCGTGTTGGTTTGGTTGCCCCAATTGATGTG
GTTGTCCAGCCTGGAAACACTGGTTTAGATCCATCCCAGACTTCTTTCTTCCAGGTTCTT
AACATCCCAACTAAGATTAACAAGGGTACAGTCGAAATCATCACCCCTGTCGAGCTCATC
AAGCAAGGCGACAAGGTCGGTTCTTCTGAGGCCGCCCTTCTAGCCAAGCTTGGCATCAGG
CCGTTTTCATACGGTCTTGTTGTCCAGTCTGTTTACGACAATGGCTCAGTCTTCAGCCCA
GAGGTTCTTGATCTCACGGAAGACGACCTTGTCCAGAAGTTTGCTGCTGGTATCTCCATG
GTCACTTCCTTGGCTCTAGCCATCTCTTACCCTACACTCGCTG

QA 1 763 1 763
DS 



CO CL87Contig5 1144 7 33 U
CTTCTTCAAACTAAAAAGACAATAACATAAATCTGAATTTGTCAAAATCAAGAACATTAA
AAACATCGTCTGTAAGAAGCAACACTTGTAGCATTGACAAAAACGTAACCTCCTCGATAG
ATTTATTAATCTATTCATCACCGAACATATCGAAACCACCGTAGTCTTCTTCATCTGATT
CCTCAACAACTTCCTTCTTCTCCTCGACCTTGGCAGCTCCACCTGAAGCACCACCACCTG
CATCTGCAGACACCGCCGCTACAGCAACAGCGAACTTGCTAGGATCCTTCAAGTACTCCT
TAACCTTCTCCGCTTGTGGGAAAGTGTACTCAGTGGCAACAGAGATCGCCAATGCGTTCT
TGTAGGCATTGATGAACATATGCGGGGCGGCAGCGAGTGTAGGGTACGAGATGGCTAGAG
CCAAGGAAGTGACCATGGAGATACCAGCAGCAAACTTCTGGACAAGGTCGTCTTCCGTGA
GATCAAGAACCTCTGGGCTGAAGACTGAGCCATTGTCGTAAACAGACTGGACAACAAGAC
CGTATGAAAACGGCCTGATGCCTAGCTTGGCTAGAAGGGCGGCCTCAGAAGAGCCGACCT
TGTCGCCTTGCTTGATGAGCTCAACAGGGGTGATGATTTCGACTGTACCCTTGTTAATCT
TAGTTGGGATGTTAAGAACCTGGA*GAAAGATGTCTGGGATGGATCTAAACCGGTGTTTC
CAGGCTGGACAACCACATCAATTGGGGCAACCAAACCCACACGAGCAGGAGCACCAACCT
TGTACTTGGCAACTTCCTCGCTCACTTCCTTGAGGTCACCCTTGGTGAAGATCAAACCAA
CATTTCCCTGAAGGAGGAGCATGAGGTTGAGGATTCCAGTGTTTCCGGTATTCTCAGCGT
GAATCTTAACAGAACGCTTCATCATAGTGTTCTTTCCCATGAGAACCACTGAGTCACCAC
GAAGACCCTTCCTGATGTCCTGTAGCTGAGTCGATACGACGTTGTCGGCGGCGACGACCA
GGATCTGAGTGAACTCGTCGATGAGCTGGCATAGCTTCGCGTCGTAAGCGATCTTCTTCT
CCGCCTTTGTTGCCTTCACCATTGTCGCTCACAGGATAAGGCTCTCTGTTTCCTCTTTGT
CTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 25 25 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 

AF RR2AJ35JQ U 47
AF RR2FC90JQ U 7
AF RR2FC90TF C 7
AF RR2H615JQB U 1
AF RR2BF83JQ U 2
AF RR2B394TF C 321
AF RR2BF83TF C 557
BS 1 69 RR2H615JQB
BS 70 70 RR2BF83JQ
BS 71 108 RR2H615JQB
BS 109 110 RR2BF83JQ
BS 111 205 RR2H615JQB
BS 206 206 RR2BF83JQ
BS 207 221 RR2H615JQB
BS 222 222 RR2BF83JQ
BS 223 223 RR2H615JQB
BS 224 224 RR2BF83JQ
BS 225 244 RR2H615JQB
BS 245 245 RR2BF83JQ
BS 246 260 RR2H615JQB
BS 261 261 RR2BF83JQ
BS 262 271 RR2H615JQB
BS 272 272 RR2BF83JQ
BS 273 301 RR2H615JQB
BS 302 302 RR2FC90JQ
BS 303 336 RR2H615JQB
BS 337 337 RR2AJ35JQ
BS 338 346 RR2H615JQB
BS 347 347 RR2BF83JQ
BS 348 364 RR2H615JQB
BS 365 365 RR2AJ35JQ
BS 366 406 RR2H615JQB
BS 407 407 RR2BF83JQ
BS 408 562 RR2H615JQB
BS 563 563 RR2BF83JQ
BS 564 592 RR2H615JQB
BS 593 593 RR2BF83JQ
BS 594 603 RR2H615JQB
BS 604 764 RR2BF83JQ
BS 765 1144 RR2B394TF

RD RR2AJ35JQ 438 0 0
ATCAAGAACATTAAAAACATCGTTTGTAAGAAGCAACACTTGTAGCATTGACAAAAACGT
AAATTCCTCGATAGATTTATTAATCTATTCATCACCGGACATATCGAAACCACCGTAGTC
TTCTTCATCTGATTCCTCAACAACTTCCTTCTTCTCCTCTACCTTGGCAGCTCCAGCCGA
AGCACCACCACCTGCATCCGCAGACACCGCCGCTGCAGCAACAGCAAACTTGCTAGGATC
CTTCAAGTACTCCTTGACCTTCTCCGCTTGTGGGAAAGTGTACTCAGTGGCAACAGAGAT
AGCCAATGCATTCTTGTAGGCATTGATGAACATATGCGGGGCGGCAGCGAGTGTAGGGTA
AGAGATGGCTAGAGCCAAGGAAGTGACCATGGATATACCAACAGCAAACTTCTGGACAAG
GTCGTCTTCTGTGAGATC

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR2FC90JQ 590 0 0
CAAACTAAAAAGACAATAACATAAATCTGAATTTGTCAAAATCAAGAACATTAAAAACAT
CGTCTGTAAGAAGCAACACTTGTAGCATTGACAAAAACGTAACCTCCTCGATAGATTTAT
TAATCTATTCATCACCGAACATATCGAAACCACCGTAGTCTTCTTCATCTGATTCCTCAA
CAACTTCC**CTTCTCCTCGACCTTGGCAGCTCCACCTGAAGCACCACCACCTGCATCTG
CAGACACCGCCGCTACAGCAACAGCGAACTTGCTAGGATCCTTCAAGTACTCCTTAACCT
TCTCCGCTTGTGGGAAAGTGTACTCAGTGGCAACAGAGATCGCCAATGCGTTCTTGTAGG
CATTGATGAACATATGCGGGGCGGCAGCGAGTGTAGGGTACGAGATGGCTAGAGCCAAGG
AAGTGACCATGGAGATACCAGCAGCAAACTTCTGGACAAGGTCGTCTTCCGTGAGATCAA
GAACCTCTGGGCTGAAGACTGAGCCATTGTCGTAAACAGACTGGACAACAAGACCGTATG
AAAACGGCCTGATGCCTAGCTTGGCTAGAAGGGCGGCCTCAGAAGAGCCG

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2FC90TF 590 0 0
CAAACTAAAAAGACAATAACATAAATCTGAATTTGTCAAAATCAAGAACATTAAAAACAT
CGTCTGTAAGAAGCAACACTTGTAGCATTGACAAAAACGTAACCTCCTCGATAGATTTAT
TAATCTATTCATCACCGAACATATCGAAACCACCGTAGTCTTCTTCATCTGATTCCTCAA
CAACTTCC**CTTCTCCTCGACCTTGGCAGCTCCACCTGAAGCACCACCACCTGCATCTG
CAGACACCGCCGCTACAGCAACAGCGAACTTGCTAGGATCCTTCAAGTACTCCTTAACCT
TCTCCGCTTGTGGGAAAGTGTACTCAGTGGCAACAGAGATCGCCAATGCGTTCTTGTAGG
CATTGATGAACATATGCGGGGCGGCAGCGAGTGTAGGGTACGAGATGGCTAGAGCCAAGG
AAGTGACCATGGAGATACCAGCAGCAAACTTCTGGACAAGGTCGTCTTCCGTGAGATCAA
GAACCTCTGGGCTGAAGACTGAGCCATTGTCGTAAACAGACTGGACAACAAGACCGTATG
AAAACGGCCTGATGCCTAGCTTGGCTAGAAGGGCGGCCTCAGAAGAGCCG

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2H615JQB 603 0 0
CTTCTTCAAACTAAAAAGACAATAACATAAATCTGAATTTGTCAAAATCAAGAACATTAA
AAACATCGTTTGTAAGAAGCAACACTTGTAGCATTGACAAAAACGTAAATTCCTCGATAG
ATTTATTAATCTATTCATCACCGAACATATCGAAACCACCGTAGTCTTCTTCATCTGATT
CCTCAACAACTTCCTTCTTCTCCTCTACCTTGGCAGCTCCAGCCGAAGCACCACCACCTG
CATCCGCAGACACCGCCGCTGCAGCAACAGCAAACTTGCTAGGATCCTTCAAGTACTCCT
TGACCTTCTCCGCTTGTGGGAAAGTGTACTCAGTGGTAACAGAGATAGCCAATGCGTTCT
TGTATGCATTGATGAACATATGCGGGGCGGCAGCGAGTGTAGGGTAAGAGATGGCTAGAG
CCAAGGAAGTGACCATGGAGATACCAGCAGCAAACTTCTGGACAAGGTCGTCTTCCGTGA
GATCAAGAACCTCTGGGCTGAAGACTGAGCCATTGTCGTAAACAGACTGGACAACAAGAC
CGTATGAAAACGGCCTGATGCCAAGCTTGGCTAGAAGGGCGGCCTCAGAAGAACCGACCT
TGT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2BF83JQ 763 0 0
ATCTT
CAAACTAAAAAGACAATAACATAAATCTGAATTTGTCAAAATCAAGAACATTAAAAACAT
CGTCTGTAAGAAGCAACACTTGTAGCATTGACAACAACGTAACCTCCTCGATAGATTTAT
TAATCTATTCATCACCGAACATATCGAAACCACCGTAGTCTTCTTCATCTGATTCCTCAA
CAACTTCCTTCTTCTCCTCGACCTTGGCAGCTCCACCTGAAGCACCACCACCTGCATCTG
CAGACACCGCCGCTACAGTAACAGCGAACTTGCTAGGATCCTTCAAGTACTCCTTGACCT
TCTCCGCTTGTGGGAAAGTGTACTCAGTGGCAACAGAGATCGCCAATGCGTTCTTGTAGG
CATTGATGAACATATGCGGGGCGGCAGCGAGTGTAGGGTACGAGATGGCTAGAGCCAAGG
AAGTGACCATGGAGATACCAGCAGCAAACTTCTGGACAAGGTCGTCTTCCGTGAGATCAA
GAACCTCTGGGCTGAAGACTGAGCCATTGTCGTAAACAGACTGGACAACAAGACCGTATG
AAAACGGCCTGATGCCTAGCTTGGCTAGAAGGGCGGCCTCAGAAGAGCCGACCTTGTCGC
CTTGCTTGATGAGCTCAACAGGGGTGATGATTTCGACTGTACCCTTGTTAATCTTAGTTG
GGATGTTAAGAACCTGGA*GAAAGATGTCTGGGATGGATCTAAACCGGTGTTTCCAGGCT
GGACAACCACATCAATTGGGGCAACCAAACCCACACGA

QA 6 763 6 763
DS 

RD RR2B394TF 824 0 0
AAAGTGTACTCAGTGGCAACAGAGATCGCCAATGCGTC**TGTAGGCATTGATGAACATA
TGCGGGGCGGCAGCGAGTGTAGGGTACGAGATGACTAGAGCCAAGGAAGTGACCATGGAG
ATACCAGCAGCAAACTTCTGGACAAGGTCGTCTTCCGTGAGATCAAGAACCTCTGGGCTG
AAGACTGAGCCATTGTCGTAAACAGACTGGACAACAAGACCGTATGAAAACGGCCTGATG
CCTAGCTTGGCTAGAAGGGCGGCCTCAGAAGAGCCGACCTTGTCGCCTTGCTTGATGAGC
TCAACAGGGGTGATGATTTCGACTGTACCCTTGTTAATCTTAGTTGGGATGTTAAGAACC
TGGAAGAAAGATGTCTGGGATGGATCTAAACCGGTGTTTCCAGGCTGGACAACCACATCA
ATTGGGGCAACCAAACCCACACGAGCAGGAGCACCAACCTTGTACTTGGCAACTTCCTCG
CTCACTTCCTTGAGGTCACCCTTGGTGAAGATCAAACCAACATTTCCCTGAAGGAGGAGC
ATGAGGTTGAGGATTCCAGTGTTTCCGGTATTCTCAGCGTGAATCTTAACAGAACGCTTC
ATCATAGTGTTCTTTCCCATGAGAACCACTGAGTCACCACGAAGACCCTTCCTGATGTCC
TGTAGCTGAGTCGATACGACGTTGTCGGCGGCGACGACCAGGATCTGAGTGAACTCGTCG
ATGAGCTGGCATAGCTTCGCGTCGTAAGCGATCTTCTTCTCCGCCTTTGTTGCCTTCACC
ATTGTCGCTCACAGGATAAGGCTCTCTGTTTCCTCTTTGTCTAT

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2BF83TF 588 0 0
GATGCCTAGCTTGGCTAGAAGGGCGGCCTCAGAAGAGCCGACCTTGTCGCCTTGCTTGAT
GAGCTCAACAGGGGTGATGATTTCGACTGTACCCTTGTTAATCTTAGTTGGGATGTTAAG
AACCTGGA*GAAAGATGTCTGGGATGGATCTAAACCGGTGTTTCCAGGCTGGACAACCAC
ATCAATTGGGGCAACCAAACCCACACGAGCAGGAGCACCAACCTTGTACTTGGCAACTTC
CTCGCTCACTTCCTTGAGGTCACCCTTGGTGAAGATCAAACCAACATTTCCCTGAAGGAG
GGGCATGAGGTTGAGGATTCCAGTGTTTCCGGTATTCTCAGCGTGAATCTTAACAGAACG
CTTCATCATAGTGTTCTTTCCCATGAGAACCACTGAGTCACCACGAAGACCCTTCCTGAT
GTTCTGTAGCTGAGTCGATCCGACGTTGTCGGCGGCGACGACCAGGATCTGAGTGAACTC
GTCGATGAGCTGGCATAGCTTCGCGTCGTAAGCGATCTTCTTCTCCGCCTTTGTTGCCTT
CACCATTGTCGCTCACAGGATAAGGCTCTCTGTTTC*TCTTTGTCTAT

QA 1 588 1 588
DS 



AS 2 19

CO CL88Contig1 1093 17 22 U
GGAAAATCATCCAATTCATTCCTCACAAAAAA*TATATAATTTCCTTATAAAAAAATCAA
AAAGAAAAGAATAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTTCTATTTGCATC
TGTAACCCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTTGCCTCAGAT
TGAAGATCCGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGTGATGGTATT
TGTGGGGGACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAA
ACTCAGAGGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGC
CGACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAA
GATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAA
ATCCCTGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACT
AACAGCTGAACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGT
TAAGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTAC
TACTGGAGGCTCTGAATCTACCACTGGAGGCTCTTCGGGTCCTAATGCTGGAAGGTCTAC
TGGAAGTCCATCAAACAAACCAGAAGCTGGTTCAAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTCTGA
GGATACAAACAATGAATCCGAAGATACCACGAACACTGCTTCTAATGCAACTGAAACTGG
AGGCTCTAAGGGTCCCAACTCCGGAAGCTCTACTGGAAGTCCATCAAACAAACCTTAGAT
GAAGAATAAGATGTGGTCATCACTTTACGCAGTTTTTAGATGTACACGGAAAAATGAGTA
TGCATAGTTAACAAAATAAGTTAATGTCCATTTTATCGTAGAATAAGTAGGAGGCTGCCG
CTTCTTTGACAAATAATAGAGTGTTTGGCTTCTTAAAATGTGATATCCACAATTGAATTT
AAGTTTCTAGACT


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 65 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 45 80 80 55 80 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 40 75 75 50 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 15 55 55 30 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 15 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 35 50 50 50 50 35 5 50 50 35 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 20 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H324TF U 1
AF RR2A474TF U 1
AF RR2EV60TF U 1
AF RR2C308TF U 12
AF RR2CJ87TF U 1
AF RR2GX38TF U 1
AF RR2DA73TF U 7
AF RR2G634TF U 49
AF RR2A233TF U 9
AF RR2AL16TF U 1
AF RR2A233JQ C 272
AF RR2GX38JQ C 691
AF RR2H324JQ C 412
AF RR2DK02JQ C 933
AF RR2G634JQ C 431
AF RR2C308JQ C 299
AF RR2A474JQ C 363
BS 1 707 RR2A474TF
BS 708 713 RR2AL16TF
BS 714 714 RR2A233JQ
BS 715 781 RR2AL16TF
BS 782 782 RR2A233JQ
BS 783 791 RR2AL16TF
BS 792 792 RR2A233TF
BS 793 801 RR2AL16TF
BS 802 802 RR2A233JQ
BS 803 812 RR2AL16TF
BS 813 813 RR2A233TF
BS 814 820 RR2AL16TF
BS 821 821 RR2A233TF
BS 822 824 RR2AL16TF
BS 825 825 RR2A233TF
BS 826 842 RR2AL16TF
BS 843 918 RR2A233JQ
BS 919 924 RR2C308JQ
BS 925 925 RR2A474JQ
BS 926 1016 RR2C308JQ
BS 1017 1017 RR2H324JQ
BS 1018 1093 RR2C308JQ

RD RR2H324TF 549 0 0
GGAAAATCATCCAATTCATTCCTCACAAAAAAATATATAATTTCCTTATAAGAAAATCAA
AAAGAAAAGAATAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTTCTATTTGCATC
TGTAACCCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTTGCCTCAGAT
TGAAGATCCGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGTGATGGTATT
TGTGGGGGACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAA
ACTCAGATGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGC
CGACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAA
GATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAA
ATCCCTGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACT
AACAGCTGA

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2A474TF 707 0 0
GGAAAATCATCCAATTCATTCCTCACAAAAAA*TATATAATTTCCTTATAAAAAAATCAA
AAAGAAAAGAATAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTTCTATTTGCATC
TGTAACCCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTTGCCTCAGAT
TGAAGATCCGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGTGATGGTATT
TGTGGGGGACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAA
ACTCAGAGGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGC
CGACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAA
GATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAA
ATCCCTGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACT
AACAGCTGAACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGT
TAAGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTAC
TACTGGAGGCTCTGAATCTACCACTGGAGGCTCTTCGGGTCCTAATG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2EV60TF 673 0 0
GGAAAATCATCCAATTCATCCCTCACAAAAAAATATATAATTTCCTTATAAGAAAATCAA
AAAGAAAAGAATAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTTCTATTTGCATC
TGTAACCCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTTGCCTCAGAT
TGAAGGTCTGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGTGATGGTATT
TGTGGGGGACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAA
ACTCAGAGGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGC
CGACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAA
GATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAA
ATCCCTGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACT
AACAGCTGAACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGT
TAAGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTAC
TACTGGAGGCTCT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2C308TF 683 0 0
CAATTCATTCCTCACAAAAAA*TATATAATTTCCTTATAAAAAAATCAAAAAGAAAAGAA
TAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTTCTATTTGCATCTGTAACCCTTT
TTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTTGCCTCAGATTGAAGATCCGA
AGACGGTGAGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGTGATGGTATTTGTGGGGGACC
TCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAAACTCAGAGGAT
TTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGCCGACATGAAGG
CCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAAGATAAAGAGGG
AAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAAATCCCTGGCTG
GTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACTAACAGCTGAAC
AGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGTTAAGATCACAA
ACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTACTACTGGAGGCT
CTGAATCTACCACTGGAGGCTCT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2CJ87TF 693 0 0
GGAAAATCATCCAATTCATTCCTCACAAAAAA*TATATAATTTCCTTATAAAAAAATCAA
AAAGAAAAGAATAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTTCTATTTGCATC
TGTAACCCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTTGCCTCAGAT
TGAAGATCCGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGTGATAGTATT
TGTGGGGGACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAA
ACTCAGAGGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGC
CGACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAA
GATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAA
ATCCCTGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACT
AACAGCTGAACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGT
TAAGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTAC
TACTGGAG*CTCTGAATCTACCACTGGAGGCTC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2GX38TF 694 0 0
GGAAAATCATCCAATTCATTCCTCACAAAAAAATATATAATTTCCTTATAAGAAAATCAA
AAAGAAAAGAATAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTTCTATTTGCATC
TGTAACCCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTTGCCTCAGAT
TGAGGATCCGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGTGATGGTATT
TGTGGGGGACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAA
ACTCAGAGGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGC
CGACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTCGCTATTGGAAA
GATAAAGGGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAA
ATCCCTGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACT
AACAGCTGAACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGT
TAAGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTAC
TACTGGAG*CTCTGAATCTACCACTGGAG*CTC
T

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2DA73TF 687 0 0
GG
ATCCAATTCATTCCTCACAAAAAAATATATAATTTCCTTATAAGAAAATCAAAA*GAAAA
GAATAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTTCTATTTGCATCTGTAACCC
TTTTTGGCGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTTGCCTCAGATTGAAGATC
CGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGTGATGGTATTTGTGGGGG
ACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAACTCAAAGCGTTCTTCGACAAACTCAGAG
GATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGCCGACATGA
AGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAAGATAAAGA
GGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAAATCCCTGG
CTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACTAACAGCTG
AACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGTTAAGATCA
CAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTACTACTGGAG
GCTCTGAATCTACCACTGGAG*CTC

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR2G634TF 728 0 0
G
AAGAAAATCAAAAAGAAAAGAATAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTT
CTATTTGCATCTGTAACCCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCT
TTGCCTCAGATTGAAGATCCGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTA
GTGATGGTATTTGTGGGGGACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCG
TTCTTCGACAAACTCAGAGGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAA
AAAGATGATGCCGACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTT
GCTATTGGAAAGATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTT
AAGTTTATGAAATCCCTGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCA
ACCACGGCACTAACAGCTGAACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAG
ACTACGATTGTTAAGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCT
GAAACTACTACTACTGGAGGCTCTGAATCTACCACTGGAGGCTCTTCGGGTCCTAATGCT
GGAAAGTCTACTGGAAGTCTATCAAACAAACCAGAAGCTGGTTCAA*CCCTGGAGCTGGA
CTCCCTC

QA 2 721 2 721
DS 

RD RR2A233TF 823 0 0
ATCCAATTCATTCCTCACAAAAAA*TATATAATTTCCTTATAAAAAAATCAAAAAGAAAA
GAATAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTTCTATTTGCATCTGTAACCC
TTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTTGCCTCAGATTGAAGATC
CGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGTGATGGTATTTGTGGGGG
ACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAAACTCAGAG
GATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGCCGACATGA
AGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAAGATAAAGA
GGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAAATCCCTGG
CGGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACTAACAGCTG
AACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGTTAAGATCA
CAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTACTACTGGAG
GCTCTGAATCTACCACTGGAGGCTCTTCGGGTCCTAATGCTGGAAAGTCTACTGGAAGTC
CATCAAACAAACCAGAAGCTGGTTCAAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTCTGAG*ATACAA
ACAATGAATCCGA*GATACCACGAACACTGCTTCTAATGCAAC

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR2AL16TF 847 0 0
GGAAAATCATCCAATTCATTCCTCACAAAAAA*TATATAATTTCCTTATAAAAAAATCAA
AAAGAAAAGAATAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTTCTATTTGCATC
TGTAACCCTTTTTGACGTGGCTCCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTTGCCTCAGAT
TGAAGATCCGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCTAGTAGTGATGGTATT
TGTGGGGGACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAA
ACTCAGAGGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGC
CGACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAA
GATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAA
ATCCCTGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACT
AACAGCTGAACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGT
TAAGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTAC
TACTGGAG*CTCTGAATCTACCACTGGAG*CTCTTCGGGTCCTAATGCTGGAAAGTCTAC
TGGAAGTCCATCAAACAAACCAGAAGCTGGTTCAAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTCTGA
G*ATACAAACA*TGAATCCGA*GATACCACGA*CACTGCT*CTA*TGCAACTGAAACTGG
AG
CTCTA

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR2A233JQ 647 0 0
ACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAAACTCAGAGGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCA
CTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGCCGACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTC
AAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAAGATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAG
GAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAAATCCCTGGCGGGTAGAATTTTGGGTGGCCGC
AAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACTAACAGCTGAACAGCTGAAAGAAATCAAAGAT
GGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGTTAAGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACC
TCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTACTACTGGAGGCTCTGAATCTACCACTGGAGGC
TCTTCGGGTCCTAATGCTGGAAGGTCTACTGGAAGTCCATCAAACAAACCAGAAGCTGGT
TCAAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTCTGAGGATACAAACAATGAATCCGAAGATACCACG
AACACTGCTTTTAATGCAACTGAAACTGGAGGCTCTAAGGGTCCCAACTCCGGAAGCTCT
ACTGGAAGTCCATCAAACAAACCTTAGATGAAGAATAAGATGTGGTC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2GX38JQ 303 0 0
TTT
TTCGGGTCCTAATGCTGGAAGGTTTACTGGAAGTCCATCAAACAAACCAGAAGGTGGTTC
AAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTTTGGGGATACAAACAATGAATCCAAAGATACCACGAA
CACTGCTTTTAATGCAACTGAAACTGGGGGCTTTAAGGGTCCCAACTCCGGAAGCTTTAC
TGGAAGTCCATCAAACAAACCTTAGATGGGGAATAAGATGTGGTCATCACTTTACGCAGT
TTTTAGATGTACACGGAAAAATGAGTATGCATAGTTAACAAAATAAGTTAATGTCCATTT

QA 4 303 4 303
DS 

RD RR2H324JQ 643 0 0
TATTGGAAAGATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAA
GTTTATGAAATCCCTGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAAC
CACGGCACTAACAGCTGAACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGAC
TACGATTGTTAAGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGA
AACTACTACTACTGGAGGCTCTGAATCTACCACTGGAGGCTCTTCGGGTCCTAATGCTGG
AAGGTCTACTGGAAGTCCATCAAACAAACCAGAAGCTGGTTCAAACCCTGGAGCTGGAAC
TCCCTCTGAGGATACAAACAATGAATCCAAAGATACCACGAACT*TGCTTCTAATGCAAC
TGAAACTGGAGGCTCTAAGGGTCCCAACTCCGGAAGCTCTACTGGAAGTCCCTCAAACAA
ACCTTAGATGAAGAATAAGATGTGGTCATCACTCTACGCAGTTTTTAGATGTACACGGAA
AAATGAGTATGCATAGTTAACAAAATAAGTTAATGTCCATTTTATCGTAGAATAAGTAGG
AGGCTGCCGCTTCTTTGACAAATAATAGAGTGTTTGGCTTCT
C

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2DK02JQ 145 0 0
TTTTTAGATGTACACGGAAAAATGAGTATGCATAGTTAACAAAATAAGTTAATGTCCATT
TTATCGTAGAATAAGTAGGAGGCTGCCGCTTCTTTGACAAATAATAGAGTGTTTGACTTC
TTAAAATGTGATATCCACAATTGAA

QA 1 145 1 145
DS 

RD RR2G634JQ 624 0 0
GAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAAATCCCTGGCT
GGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACTAACAGCTGAA
CAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGTTAAGATCACA
AACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTACTACTGGAGGC
TTTGAATTTACCACTGGAGGCTTTTCGGGTCCTAATGCTGGAAGGTTTACTGGAAGTCTA
TCAAACAAACCAGAAGCTGGTTCAAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTCTGAGGATACAAAC
AATGAATCCAAAGATACCACGAACACTGCTTTTAATGCAACTGAAACTGGAGGCTTTAAG
GGTCCCAACTCCGGAAGCTTTACTGGAAGTCCATCAAACAAACCTTAGATGAAGAATAAG
ATGTGGTCATCACTTTACGCAGTTTTTAGATGTACACGGAAAAATGAGTATGCATAGTTA
ACAAAATAAGTTAATGTCCATTTTATCGTAGAATAAGTAGGAGGCTGCCGCTTCTTTGAC
AAATAATAGAGTGTTTGGCTT
TTT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2C308JQ 795 0 0
AAACTCAGAGGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGAT
GCCGACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGA
AAGATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATG
AAATCCCTGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCA
CTAACAGCTGAACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATT
GTTAAGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACT
ACTACTGGAGGCTCTGAATCTACCACTGGAGGCTCTTCGGGTCCTAATGCTGGAAGGTCT
ACTGGAAGTCCATCAAACAAACCAGAAGCTGGTTCAAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTCT
GAGGATACAAACAATGAATCCGAAGATACCACGAACACTGCTTCTAATGCAACTGAAACT
GGAGTCTCTAAGGGTCCCAACTCCGGAAGCTCTACTGGAAGTCCATCAAACAAACCTTAG
ATGAAGAATAAGATGTGGTCATCACTCTACGCAGTTTTTAGATGTACACGGAAAAATGAG
TATGCATAGTTAACAAAATAAGTTAATGTCCATTTTATCGTAGAATAAGTAGGAGGCTAC
CGCTTCTTTGACAAATAATAGAGTGTTTGGCTTCTTAAAATGTGATATCCACAATTGAAT
TTAAGTTTCTAGACT

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2A474JQ 726 0 0
ACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAAGA
TAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAAAT
CCCTGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACTAA
CAGCTGAACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGTTA
AGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTTTGAAACTACTACTA
CTGGAGGCTTTGAATCTACCACTGGAGGCTTTTCGGGTCCTAATGCTGGAAGGTCTACTG
GAAGTCCATCAAACAAACCAGAAGCTGGTTCAAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTCTGAGG
ATACAAACAATGAATCCGAAGATACCACGAACACTGCTTTTAATGCAACTGAAACTGGAG
GCTCTAAGGGTCCCAACTCCGGAAGCTCTACTGGAAGTCCATCAAACAAACCTTAGATGA
AGAATAAGATGTGGTCATCACTTTACGCAGTTTTTAGATGTACACGGAAAAATGAGTATG
CATAGTTAACAAAATAAGTTAATGTCCATTTTATCGTAGAATAAGTAGGAGGCTACCGCT
TCTTTGACAAATAATAGAGTGTTTGGCTTCTTAAAATGTGATATCCACAATTGAATTTAA
GTTTC
G

QA 1 725 1 725
DS 



CO CL88Contig2 869 2 4 U
GGAAAATCATCCAATTCATTCCTCACAAAAAATATATAATTTCCTTATAAAAAATCAAAA
AGAAAAGAATAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTTTCTATTTGCATCT
GTAACCCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTTGCCTCAGATT
GAAGATCCGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGTGATGGTATTT
GTGGGGGACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAAA
CTCAGAGGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGCC
GACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAAG
ATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGCAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAAAT
CCCCGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGGGAAAGCAACCACGGCACTAA
CAGCTGAACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGTTA
AGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTACTA
CTGGAGGCTCTGAAACTGGAGGCTCTAAGGGTCCCAACTCCGGAAGCTCTACTGGAAGTC
CATCAAACAAACCTTAGATGAAGAATAAGATGTGGTCATCACTCTATGCAGTTTTTAGAT
GTACACGGAAAAATGAGTATGCATAGTTAACAAAATAAGTTAATGTCCATTTTATCGTAG
AATAAGTAGGAGGCTACCGCTTCTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B105TF U 1
AF RR2B105JQ C 61
BS 1 107 RR2B105TF
BS 108 108 RR2B105JQ
BS 109 832 RR2B105TF
BS 833 869 RR2B105JQ

RD RR2B105TF 839 0 0
GGAAAATCATCCAATTCATTCCTCACAAAAAATATATAATTTCCTTATAAAAAATCAAAA
AGAAAAGAATAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTT*CTATTTGCATCT
GTAACCCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTTGCCTCAGATT
GAAGATCCGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGTGATGGTATTT
GTGGGGGACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAAA
CTCAGAGGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGCC
GACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAAG
ATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGCAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAAAT
CCCCGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGGGAAAGCAACCACGGCACTAA
CAGCTGAACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGTTA
AGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTACTA
CTGGAGGCTCTGAAACTGGAGGCTCTAAGGGTCCCAACTCCGGAAGCTCTACTGGAAGTC
CATCAAACAAACCTTAGATGAAGAATAAGATGTGGTCATCACTCTATGCAGTTTTTAGAT
GTACACGGAAAAATGAGTATGCATAGTTAACAAAATAAGTTAATGTCCATTT
TATCGTA

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR2B105JQ 809 0 0
AGAAAAGAATAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTTTCTATTTGCATCT
GTAACCCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTTGCCTCAGATT
GAAGATCCGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGTGATGGTATTT
GTGGGGGACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAAA
CTCAGAGGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGCC
GACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAAG
ATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGCAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAAAT
CCCCGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGGGAAAGCAACCACGGCACTAA
CAGCTGAACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGTTA
AGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTACTA
CTGGAGGCTCTGAAACTGGAGGCTCTAAGGGTCCCAACTCCGGAAGCTCTACTGGAAGTC
CATCAAACAAACCTTAGATGAAGAATAAGATGTGGTCATCACTCTATGCAGTTTTTAGAT
GTACACGGAAAAATGAGTATGCATAGTTAACAAAATAAGTTAATGTCCATTTTATCGTAG
AATAAGTAGGAGGCTACCGCTTCTTTGAC

QA 1 809 1 809
DS 



AS 3 21

CO CL89Contig1 810 7 16 U
GGAACGCAGAAGAAAGGAGAAAAGAGAAGGAAAAAAACATCTGTCGTCTTCTCTCCGTCA
CCTTTCACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGC
TTCGGGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTTGAACTCAAGGCGAAAAG
AACGCACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAA
AGTTGGTGAGCCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATG
CCGTTACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGAT
TTTCTTCATTGCTTGGTGTCCGGATGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAG
CTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGA
TCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAAAAGAATTAAGCTT
CTTTGGCTCATTTTCTATGATATCTACTATTCCTAAATGGTGTTTTATTTTCTCTTATAC
AGTTTCTTCTTGCAACTGTGATAAAAAAAACCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGT
CTCTCTTCTGTGTCTTTGTTACCATACAGTGTTTCCTACATCTTATATTGAGAATTGTCC
CAAGGGTTTGCATCCTTTTGTGTAAACTGTGATGATTCCTTTAAGCGTTTTGTTATCTTT
GCTACAGTATTGATGAACAATGCAAACTTC


BQ
10 10 10 15 15 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 25 25 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D061TF U 1
AF RR2BO96TF U 1
AF RR2C229TF U 6
AF RR2F291TF U 6
AF RR2C229JQ C 43
AF RR2D061JQ C 87
AF RR2BO96JQ C 78
BS 1 576 RR2BO96TF
BS 577 577 RR2C229TF
BS 578 582 RR2BO96TF
BS 583 583 RR2C229TF
BS 584 622 RR2BO96TF
BS 623 629 RR2C229TF
BS 630 630 RR2F291TF
BS 631 664 RR2C229TF
BS 665 665 RR2F291TF
BS 666 679 RR2C229TF
BS 680 680 RR2F291TF
BS 681 713 RR2C229TF
BS 714 714 RR2F291TF
BS 715 723 RR2C229TF
BS 724 729 RR2F291TF
BS 730 810 RR2BO96JQ

RD RR2D061TF 456 0 0
GGG
ACGCAGAAGAAAGGAGAAAAGAGAAGGAAAAAAACATCTGTCGTCTTCTCTCCGTCACCT
TTCACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTC
GGGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTTGAACTCAAGGCGAAAAGAAC
GCACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAAGT
TGGTGAGCCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAACAATGCCG
TTACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTT
CTTCATTGCTTGGTGTCCGGATGTAACAAAAGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTC
CAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGGGAT

QA 4 456 4 456
DS 

RD RR2BO96TF 622 0 0
GGAACGCAGAAGAAAGGAGAAAAGAGAAGGAAAAAAACATCTGTCGTCTTCTCTCCGTCA
CCTTTCACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGC
TTCGGGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTTGAACTCAAGGCGAAAAG
AACGCACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAA
AGTTGGTGAGCCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATG
CCGTTACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGAT
TTTCTTCATTGCTTGGTGTCCGGATGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAG
CTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGA
TCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAAAAGAATTAAGCTT
CTTTGGCTCATTTTCTATGATATCTACTATTCCTAA*TGGTGCTTTATTTTCTCTTATAC
AGTTTCTTCTTGCAACTGTGAT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2C229TF 725 0 0
GGAGAAGAAAGGAGAAAAGAGAAGGAAAAAAACATCTGTCGTCTTCTCTCCGTCACCTTT
CACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTCGG
GGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTTGAACTCAAGGCGAAAAGAACGC
ACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAAGTTG
GTGAGCCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTT
ACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCT
TCATTGCTTGGTGTCCGGATGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCCA
AGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCAA
CCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAAAAGAATTAAGCTTCTTTG
GCTCATTTTCTATGATATCTACTATTCCTAAATGGTGTTTTATTTTCTCTTATACAGTTT
CTTCTTGCAACTGTGATAAAAAAA*CCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCTCTT
TTCTGTGTCTTTGT*ACCATACAGTGTTTCCTACATCTTATATTGAGA*TTGTCCCAA
AAAAAAA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2F291TF 724 0 0
GGAGAAGAAAGGAGAAAAGAGAAGGAAAAAAACATCTGTCGTCTTCTCTCCGTCACCTTT
CACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTCGG
GGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTTGAACTCAAGGCGAAAAGAGCGC
ACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAATTGGCTGTTGAGAAAGTTG
GTGAGCCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTT
ACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCT
TCATTTCTTGGTGTCCGGATGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCCA
AGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCAA
CCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCGACTAAAAAGAATTAAGCTTCTTTG
GCTCATTTTCTATGATATCTACTATTCCTAAATGGTGTTTTATTTTCTCTTATACAGTTT
CTTCTTGCAACTGTGATAAAAAAAACCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCTCTC
TTCTGTGTCTTTGTTACCGTACAGTGTTTCCTACATCTTATATTGAGAATTGTCCCAAGG
GTTT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2C229JQ 679 0 0
GTCGTCTTCTCTCCGTCACCTTTCACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATTCAGC
AACCATGGCTAACGCGGCTTCGGGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCT
TGAACTCAAGGGGAAAAGAACGCACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAA
GCAAGTGGTTGTTGAGAAAGTTGGTGAGCCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCTGCTAG
CCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTTACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTTGAGAA
CTGCCAGAAGAGCAAGATTTTTTTCATTGCTTGGTGTCCGGATGTAGCAAAGGTGAGAAG
CAAGATGATCTACGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGT
GGAGCTTCAGGCAACTGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAA
CTAAAAAGAATTAAGCTTCTTTGGCTCATTTTCTATGATATCTACTATTCCTAAATGGTG
TTTTATTTTTTCTTATACAGTTTCTTCTTGCAACTGTGATAAAAAAAACCTAACTCCCCG
TCACTCTATCCATCTGGTCTCTTTTCTGTGTCTTTGTTACCATACAGTGTTTCCTACATC
TTATATTGAGAATTGTCCC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2D061JQ 635 0 0
AGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTCGGGGATGGCAGTCCATGATGACT
GCAAGCTCAGGTTTCTTGAACTCAAGGCGAAAAGAACGCACCGTTTCATTGTCTACAAGA
TCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAAGTTGGTGAGCCTATTCTATCCTACG
AGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTTACGCCATTTATGATTTCGACT
TTGTCACTGTTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCTTGGTGTCCGGATG
TAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAGC
TTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTT
TCAAAAGCCGCGTCAACTAAAAAGAATTAAGCTTCTTTGGCTCATTTTCTATGATATCTA
CTATTCCTAAATGGTGTTTTATTTTCTCTTATACAGTTTCTTCTTGCAACTGTGATAAAA
AAAACCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCTCTCTTCTGTGTCTTTGTTACCATA
CAGTGTTTCCTACATCTTATATTGAGAATTGTCCC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2BO96JQ 733 0 0
TCTCTTGACAGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTCGGGGATGGCAGTCC
ATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTTGAACTCAAGGCGAAAAGAACGCACCGTTTCATTG
TCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAAGTTGGTGAGCCTATTC
TATCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTTACGCCATTTATG
ATTTCGACTTTGTCACTGTTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCTTGGT
GTCCGGATGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCA
AGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCAACCGAGATGGATC
TCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAAAAGAATTAAGCTTCTTTGGCTCATTTTCTA
TGATATCTACTATTCCTAA*TGGTGCTTTATTTTCTCTTATACAGTTTCTTCTTGCAACT
GTGATAAAAAAAACCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCTCTCTTCTGTGTCTTT
GTTACCATACAGTGTTTCCTACATCTTATATTGAGAATTGTCCCAAGGGTTTGCATCCTT
TTGTGTAAACTGTGATGATTCCTTTAAGCGTTTTGTTATCTTTGCTACAGTATTGATGAA
CAATGCAAACTTC

QA 1 733 1 733
DS 



CO CL89Contig2 814 7 8 U
GGAACGCAGAAGAAAGG**AAAAGAGAAGAAAAAAAACATCTGTCTTCTTCTCTCCGTCA
CCTTTCCACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATCCAGCAACCATGGCTAACGCGG
CTTCGGGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAAA
GGACGCACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTTGTTGTTGAGA
AAGTTGGCGAACCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCCGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAAT
GCCGTTACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACCGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGA
TTTTCTTCATTGCTTGGTGTCCGGATGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCTA
GCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTG
ATCCAACTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAAAAGAATTAAGCT
TCTTTGGCTCGTATTCTATCTA****TCTACTATTCCTAAATGGTGTTTTCTTTTCTCTT
ATACAGTTTCTTCTTGCAACTGTGATAAAAATACCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCT
GGTCTCTCTTCTGTGTCTTTGTTACCATACAGTGTTTCCTACATCTTATATTGAGAATTG
TCCCAAGGGTTTGCATCCTTTTGTGTAAACTGTGATGATTCCTTTAAGCGTTTTGTTATC
TTTGTTACAATGTTGATGAACAAATGCAAACTTC


BQ
10 25 25 25 25 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 5 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX70TF U 1
AF RR2CE21TF U 2
AF RR2CR54TF U 6
AF RR2CE21JQ C 2
AF RR2BX70JQ C 38
AF RR2EG82TF U 4
AF RR2EG82JQ C 97
BS 1 623 RR2BX70TF
BS 624 624 RR2CE21TF
BS 625 716 RR2BX70TF
BS 717 731 RR2EG82TF
BS 732 732 RR2CE21JQ
BS 733 733 RR2EG82JQ
BS 734 748 RR2EG82TF
BS 749 814 RR2EG82JQ

RD RR2BX70TF 723 0 0
GGAACGCAGAAGAAAGG**AAAAGAGAAGAAAAAAAACATCTGTCTTCTTCTCTCCGTCA
CCTTTCCACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATCCAGCAACCATGGCTAACGCGG
CTTCGGGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAAA
GGACGCACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTTGTTGTTGAGA
AAGTTGGCGAACCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCCGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAAT
GCCGTTACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACCGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGA
TTTTCTTCATTGCTTGGTGTCCGGATGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCTA
GCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTG
ATCCAACTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAAAAGAATTAAGCT
TCTTTGGCTCGTATTCTATCTA****TCTACTATTCCTAAATGGTGTTTTCTTTTCTCTT
ATACAGTTTCTTCTTGCAACTGTTATAAAAATACCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCT
GGTCTCTCTTCTGTGTCTTTGTTACCATACAGTGTTTCCTACATCTTATATTGAGA
TTGTCCC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2CE21TF 711 0 0
GAACGCAGAAGAAAGG**AAAAGAGAAGAAAAAAAACATCTGTCTTCTTCTCTCCGTCAC
CTTTCCACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATCCAGCAACCATGGCTAACGCGGC
TTCGGGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTCGAACTCAATGCCAAAAG
GACGCACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTTGTTGTTGAGAA
AGTTGGCGAACCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCCGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATG
CCGTTACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACCGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGAT
TTTCTTCATTGCTTGGTGTCCGGATGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCTAG
CTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGA
CCCAACTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAAAAGAATTAAGCTT
CTTTGGCTCGTATTCTATCTA****TCTACTATTCCTAAATGGTGTTTTCTTTTCTCTTA
TACAGTTTCTTCTTGCAACTGTGATAAAAATACCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTG
GTCTCCCTTCTGTGTCTTTGTTACCATACAGTGTTTCCTACATCTTATATT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2CR54TF 693 0 0
GGAGAAGAAAGGAGAAAAGAGAAGAAAAAAAACATCTGTCGTCTTCTCTCCGTCACCTTT
C*ACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTCG
GGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTTGAACTCAAGGCCAAAAGGACA
CACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAGGCAGAAGCAAGTTGTTGTTGAGAAAGTT
GGTGAACCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCCGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGT
TACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTC
TTCATTGCTTGGTGTCCGGATGTAGCGAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCTAGCTCC
AAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCA
ACTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAAAAGAATTAAGCTTCTTT
GGCTCGTATTCTATCTATATATCTACTATTCCTAAATGGTGTTTTCTTTTCTCTTATACA
GTTTCTTCTTGCAAATGTGATAAAA*TACCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCT
CTCTTCTGTGTCTTTGTTACCATGCAGTGTTTC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2CE21JQ 733 0 0
GAACGCAGAAGAAAGG**AAAAGAGAAGAAAAAAAACATCTGTCTTCTTCTCTCCGTCAC
CTTTCCACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATCCAGCAACCATGGCTAACGCGGC
TTCGGGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTCGAACTCAATGCCAAAAG
GACGCACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTTGTTGTTGAGAA
AGTTGGCGAACCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCCGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATG
CCGTTACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACCGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGAT
TTTCTTCATTGCTTGGTGTCCGGATGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCTAG
CTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGA
CCCAACTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAAAAGAATTAAGCTT
CTTTGGCTCGTATTCTATCTA****TCTACTATTCCTAAATGGTGTTTTCTTTTCTCTTA
TACAGTTTCTTCTTGCAACTGTGATAAAAATACCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTG
GTCTCCCTTCTGTGTCTTTGTTACCATACAGTGTTTCCTACATCTTATATTGAGAATTGT
CCCAAGGGTTT
AC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2BX70JQ 687 0 0
CATCTGTCTTCTTCTCTCCGTCACCTTTCCACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGA
TCCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTCGGGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAG
GTTTCTCGAACTCAAGGCCAAAAGGACGCACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAA
GCAGAAGCAAGTTGTTGTTGAGAAAGTTGGCGAACCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGC
CGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTTACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACCGT
CGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCTTGGTGTCCGGATGTAGCAAAGGT
GAGAAGCAAGATGATCTACGCTAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGAT
TCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCAACTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCG
CGTCAACTAAAAAGAATTAAGCTTCTTTGGCTCGTATTCTATCTA****TCTACTATTCC
TAAATGGTGTTTTCTTTTCTCTTATACAGTTTCTTCTTGCAACTGTTATAAAAATACCTA
ACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCTCTCTTCTGTGTCTTTGTTACCATACAGTGTTT
CCTACATCTTATATTGAGAATTGTCCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2EG82TF 753 0 0
GG
GCAGAAGAAAGGAGAAAAGAGAAGAAAAAAAACATCTGTCGTCTTCTCTCCGTCACCTTT
C*ACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTCG
GGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTTGAACTCAAGGCCAAAAGGACA
CACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTTGTTGTTGAGAAAGTT
GGTGAACCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCCGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGT
TACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTC
TTCATTGCTTGGTGTCCGGATGTAGCGAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCTAGCTCC
AAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCA
ACTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAAAGGAATTAAGCTTCTTT
GGCTCGTATTCTATCTATATATCTACTATTCCTAAATGGTGTTTTCTTTTCTCTTATACA
GTTTCTTCTTGCAAATGTGATAAAAATACCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCT
CTCTTCTGTGTCTTTGTTACCATGCAGTGTTTCCTACATCTTATATTGAGAATTGTCCCA
AGGGTTG*CATCCTTTTGTGTAA
CTGTGATG

QA 3 745 3 745
DS 

RD RR2EG82JQ 718 0 0
ATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTCGGGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCA
GGTTTCTTGAACTCAAGGCCAAAAGGACACACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGA
AGCAGAAGCAAGTTGTTGTTGAGAAAGTTGGTGAACCTATTCTATCCTACGAGGATTTCG
CCGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTTACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTG
TTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCTTGGTGTCCGGATGTAGCGAAGG
TGAGAAGCAAGATGATTTACGCTAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGA
TTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCAACTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCC
GCGTCAACTAAAAGGAATTAAGCTTCTTTGGCTCGTATTCTATCTATATATCTACTATTC
CTAAATGGTGTTTTCTTTTCTCTTATACAGTTTCTTCTTGCAAATGTGATAAAAATACCT
AACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCTCTCTTCTGTGTCTTTGTTACCATGCAGTGTT
TCCTACATCTTATATTGAGAATTGTCCCAAGGGTTTGCATCCTTTTGTGTAAACTGTGAT
GATTCCTTTAAGCGTTTTGTTATCTTTGTTACAATGTTGATGAACAAATGCAAACTTC

QA 1 718 1 718
DS 



CO CL89Contig3 731 7 9 U
GGGGAGAAGAAAGGAGAAAAGAGAAGAAAAAAAACATCTATCGTCTTCTCTCCGTCACCT
TTCACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTC
GGGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTCGAACTCAAGGCGAAAAGGAC
GCACCGTTTCATTGTCTACAAAATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAAGT
TGGCGAACCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCG
TTACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTT
CTTCATTGCTTGGTGTCCGGACGTAGCGAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCTAGCTC
CAAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCC
AACTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAATGAATTAAGCTTCTTT
GGCCCGTGTTCTATCTATCTACTATTCCTAAATTGTGTTTTCTTTTCTCTTATACAGTTT
CTTCTTGCAACTGTGATAAAAAAAACCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCTCTC
TTCTGTGTCTTTGTTACCATGCAGTGTTTTCTACATCTTATATTGAGAATTGTCCCAAGG
GTTTGCATCGG


BQ
10 10 30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2DU25TF U 1
AF RR2C913TF U 3
AF RR2AV10TF U 3
AF RR2EA30TF U 5
AF RR2AV10JQ C 146
AF RR2C913JQ C 3
AF RR2EA30JQ C 260
BS 1 3 RR2DU25TF
BS 4 4 RR2AV10TF
BS 5 39 RR2DU25TF
BS 40 40 RR2C913TF
BS 41 129 RR2DU25TF
BS 130 130 RR2AV10TF
BS 131 571 RR2DU25TF
BS 572 715 RR2AV10TF
BS 716 731 RR2C913JQ

RD RR2DU25TF 571 0 0
GGGCAGAAGAAAGGAGAAAAGAGAAGAAAAAAAACATCTGTCGTCTTCTCTCCGTCACCT
TTCACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTC
GGGGATGGCGGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTCGAACTCAAGGCGAAAAGGAC
GCACCGTTTCATTGTCTACAAAATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAAGT
TGGCGAACCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCG
TTACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTT
CTTCATTGCTTGGTGTCCGGACGTAGCGAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCTAGCTC
CAAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCC
AACTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAATGAATTAAGCTTCTTT
GGCCCGTGTTCTATCTATCTACTATTCCTAA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2C913TF 594 0 0
GGAGAAGAAAGGAGAAAAGAGAAGAAAAAAAACATCTATCGTCTTCTCTCCGTCACCTTT
CACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTCGG
GGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTCGAACTCAAGGCGAAAAGGACGC
ACCGTTTCATTGTCTACAAAATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAAGTTG
GCGAACCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTT
ACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCT
TCATTGCTTGGTGTCCGGACGTAGCGAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCTAGCTCCA
AGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCAA
CTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAATGAATTAAGCTTCTTTGG
CCCGTGTTCTATCTATCTACTATTCCTAAATTGTGTTTTCTTTTCTCTTATACA

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2AV10TF 713 0 0
GGAGAAGAAAGGAGAAAAGAGAAGAAAAAAAACATCTGTCGTCTTCTCTCCGTCACCTTT
CACCCGAAATTGTCTCTCGACAGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTCGG
GGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTCGAACTCAAGGCGAAAAGGACGC
ACCGTTTCATTGTCTACAAAATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAAGTTG
GCGAACCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTT
ACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCT
TCATTGCTTGGTGTCCGGACGTAGCGAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCTAGCTCCA
AGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCAA
CTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAATGAATTAAGCTTCTTTGG
CCCGTGTTCTATCTATCTACTATTCCTAAATTGTGTTTTCTTTTCTCTTATACAGTTTCT
TCTTGCAACTGTGATAAAAAAAACCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCTCTCTT
CTGTGTCTTTGTTACCATGCAGTGTTTTCTACATCTTATATTGAGAATTGTCC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2EA30TF 710 0 0
G
GAAGAAAGGAGAAAAGAGAAGAAAAAAAACATCTGTCGTCTTCTCTCCGTCACCTTTCAC
CCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTCGGGGA
TGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTCGAACTCAAGGCGAAAAGGACGCACC
GTTTCATTGTCTACAAAATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAAGTTGGCG
AACCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTTACG
CCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCA
TTGCTTGGTGTCCGGACGTAGCGAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCTAGCTCCAAGG
ACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCAACTG
AGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAATGAATTAAGCTTCTTTGGCCC
GTGTTCTATCTATCTACTATTCCTAAATTGTGTTTTCTTTTCTCTTATACAGTTTCTTCT
TGCAACTGTGATAAAAAAA*CCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCTCTCTTCTG
TGTCTTTGTTACCATGCAGTGTTT*CTACATCTTATATTGAGA
TTGTCC

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR2AV10JQ 571 0 0
AAGCTCAGGTTTCTCGAACTCAAGGCGAAAAGGACGCACCGTTTCATTGTCTACAAAATC
GAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAAGTTGGCGAACCTATTCTATCCTACGAG
GATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTTACGCCATTTATGATTTCGACTTT
GTCACTGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCTTGGTGTCCGGACGTA
GCGAAGGTGAGAAGCAAGATGATTTACGCTAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTT
GATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCAACTGAGATGGATCTCGATGTTTTC
AAAAGCCGCGTCAACTAAATGAATTAAGCTTCTTTGGCCCGTGTTCTATCTATCTACTAT
TCCTAAATTGTGTTTTCTTTTCTCTTATACAGTTTCTTCTTGCAACTGTGATAAAAAAAA
CCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCTCTCTTCTGTGTCTTTGTTACCATGCAGT
GTTTTCTACATCTTATATTGAGAATTGTCCC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2C913JQ 729 0 0
GGAGAAGAAAGGAGAAAAGAGAAGAAAAAAAACATCTATCGTCTTCTCTCCGTCACCTTT
CACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATTCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTCGG
GGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTCGAACTCAAGGCGAAAAGGACGC
ACCGTTTCATTGTCTACAAAATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAAGTTG
GCGAACCTATTCTATCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTT
ACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCT
TCATTGCTTGGTGTCCGGACGTAGCGAAGGTGAGAAGCAAGATGATTTACGCTAGCTCCA
AGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCAA
CTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAATGAATTAAGCTTCTTTGG
CCCGTGTTCTATCTATCTACTATTCCTAAATTGTGTTTTCTTTTCTCTTATACAGTTTCT
TCTTGCAACTGTGATAAAAAAAACCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCTCTCTT
CTGTGTCTTTGTTACCATGCAGTGTTTCCTACATCTTATATTGAGAATTGTCCCAAGGGT
TTGCATCGG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2EA30JQ 467 0 0
TACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTTACGCCATTTATGATTTC
GACTTTGTCACTGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTTTTCATTGCTTGGTGTCCG
GACGTAGCGAAGGTGAGAAGCAAGATGATTTACGCTAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGT
GAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCAACTGAGATGGATCTCGAT
GTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAATGAATTAAGCTTCTTTGGCCCGTGTTCTATCTATT
TACTATTCCTAAATTGTGTTTTCTTTTTTCTTATACAGTTTCTTCTTGCAACTGTGATAA
AAAAAACCTAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCTCTCTTCTGTGTCTTTGTTACCA
TGCAGTGTTTCCTACATCTTATATTGAGAATTGTCCCAAGGGTTTGC

QA 1 467 1 467
DS 



AS 5 16

CO CL90Contig1 261 2 2 U
AGTTCTCAAAAGCTAAGTTTTTCATTTTCCATTTTTTTTACAAGAGCAAATGAAGATAAC
AAGCAAGCAGAGCATATAGTTGTGCTTTACACACTAGTTTAGAGAGTGACACGTAGCGCT
GGGATGATAAGGAAGGGGATGATCTCCCCCCGGCGGAGGAGGCTAGTGCGCTTTGATGTA
GGAAACACGCGCTGCTGTACGCCATCTTCTCTCTCTCTTAAACGATCTGTGTTTGGTTGA
AGTTATGATGAAAGTGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AO95TF C 1
AF RR2AO95JQ U 130
BS 1 129 RR2AO95TF
BS 130 261 RR2AO95JQ

RD RR2AO95TF 261 0 0
AGTTCTCAAAAGCTAAGTTTTTCATTTTCCATTTTTTTTACAAGAGCAAATGAAGATAAC
AAGCAAGCAGAGCATATAGTTGTGCTTTACACACTAGTTTAGAGAGTGACACGTAGCGCT
GGGATGATAAGGAAGGTGATGATCTCGCCGCGGCGGAGGAGGCTAGTGCGCTTTGATGTA
GGAAACACGCGCTGCTGTACGCCATCTTCTCTCTCTCTTAAACGATCTGTGTTTGGTTGA
AGTTATGATGAAAGTGTGTCC

QA 1 261 1 261
DS 

RD RR2AO95JQ 132 0 0
AGGAAGGGGATGATCTCCCCCCGGCGGAGGAGGCTAGTGCGCTTTGATGTAGGAAACACG
CGCTGCTGTACGCCATCTTCTCTCTCTCTTAAACGATCTGTGTTTGGTTGAAGTTATGAT
GAAAGTGTGTCC

QA 1 132 1 132
DS 



CO CL90Contig2 970 6 22 U
GGACACACCTTTCATCGTAACTTCAACCAAACACAGAGCTAAAGAGACAGAGACAGAGAA
GATGGCGTACAGCAGCGCGTGTTTCCTACATCAAAGCGCACTAGCCTCCTCCGCCGCCGC
GAGATCATCACCTTCCTCATCATCCCAGCGCTACGTGTCACTCTCTAAACTAGTGTGTAA
AGCACAACAGACTCACGAAGACGATACCTCCGCCGTCTCTCGCCGTCTCGCTCTCACACT
CCTCGTCGGCGCCGCTGCGGTTGGTTCCAAAGTGTCTCCAGCCGATGCTGCCTACGGTGA
AGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGCAAAACACAGACTTCACGGCGTACAGTGGAGA
CGGATTCCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAGTGGAACCCAAGCAGAGAGGTTGAGTATCCAGG
ACAAGTCCTTCGGTATGAAGACAACTTTGACGCTACTAGCAATCTCAATGTCATGGTCAC
TCCTACTGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGTTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGT
CAATTACCTTCTAGGGAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGA
CAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACATCCTGGAGACGAATATTCAGGACGTTGGAGGGAA
ACCATACTATTACTTGTCTGTGTTGACGAGAACAGCCGATGGAGACGAAGGTGGTAAGCA
TCAGCTGATCACAGCCACCGTGAATGGAGGCAAGCTTTATATCTGCAAAGCACAAGCTGG
AGACAAGAGGTGGTTCAAGGGAGCCAATAAATTCGTCGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAG
TGTTGCTTGATTTTAAAAGCAGCACAGCTATATGCTCTGCTTGCTTGTTATCTCCATTTG
TCTCTTGTAAAAAAAAA**TGGAAAAATGAAAACTTAGCTTTTGAGAATTATCAAGATGG
TGTTTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DB63TF U 1
AF RR2F621TF U 3
AF RR2BC86TF U 5
AF RR2GV31JQB C 324
AF RR2BC86JQ C 257
AF RR2F621JQ C 301
BS 1 117 RR2DB63TF
BS 118 120 RR2F621TF
BS 121 186 RR2DB63TF
BS 187 187 RR2F621TF
BS 188 204 RR2DB63TF
BS 205 205 RR2F621TF
BS 206 430 RR2DB63TF
BS 431 431 RR2F621TF
BS 432 447 RR2DB63TF
BS 448 448 RR2F621TF
BS 449 544 RR2DB63TF
BS 545 545 RR2F621TF
BS 546 594 RR2DB63TF
BS 595 595 RR2F621TF
BS 596 601 RR2DB63TF
BS 602 619 RR2F621TF
BS 620 709 RR2BC86TF
BS 710 710 RR2BC86JQ
BS 711 789 RR2BC86TF
BS 790 790 RR2BC86JQ
BS 791 884 RR2BC86TF
BS 885 970 RR2BC86JQ

RD RR2DB63TF 601 0 0
GGACACACCTTTCATCGTAACTTCAACCAAACACAGAGCTAAAGAGACAGAGACAGAGAA
GATGGCGTACAGCAGCGCGTGTTTCCTACATCAAAGCGCACTAGCCTCCTCCGCCGC***
GAGATCATCACCTTCCTCATCATCCCAGCGCTACGTGTCACTCTCTAAACTAGTGTGTAA
AGCACAGCAGACTCACGAAGACGACACCTCCGCCGTCTCTCGCCGTCTCGCTCTCACACT
CCTCGTCGGCGCCGCTGCGGTTGGTTCCAAAGTGTCTCCAGCCGATGCTGCCTACGGTGA
AGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGCAAAACACAGACTTCACGGCGTACAGTGGAGA
CGGATTCCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAGTGGAACCCAAGCAGAGAGGTTGAGTATCCAGG
ACAAGTCCTTAGGTATGAAGACAACTTCGACGCTACTAGCAATCTCAATGTCATGGTCAC
TCCTACTGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGTTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGT
CAATCACCTTCTAGGGAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGGTTTGA
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2F621TF 617 0 0
GGAC
ACCTTTCATCGTAACTTCAACCAAACACAGAGCTAAAGAGACAGAGACAGAGAAGATGGC
GTACAGCAGCGCGTGTTTCCTACATCAAAGCGCACTAGCCTCCTCCGCCGCCGCGAGATC
ATCACCTTCCTCATCATCCCAGCGCTACGTGTCACTCTCTAAACTAGTGTGTAAAGCACA
ACAGACTCACGAAGACGATACCTCCGCCGTCTCTCGCCGTCTCGCTCTCACACTCCTCGT
CGGCGCCGCTGCGGTTGGTTCCAAAGTGTCTCCAGCCGATGCTGCCTACGGTGAAGCTGC
AAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGCAAAACACAGACTTCACGGCGTACAGTGGAGACGGATT
CCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAGTGGAACCCAAGCAGAGAGGTTGAGTATCCAGGACAAGT
CCTTCGGTATGAAGACAACTTTGACGCTACTAGCAATCTCAATGTCATGGTCACTCCTAC
TGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGTTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAATTA
CCTTCTAGGGAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACAACAA
TGCAGTGGCAACA

QA 5 617 5 617
DS 

RD RR2BC86TF 880 0 0
GG
ACCTTTCATCGTAACTTCAACCAAACACAGAGCTAAAGAGACAGAGACAGAGAAGATGGC
GTACAGCAGCGCGTGTTTCCTACATCAAAGCGCACTAGCCTCCTCCGCCGCCGCGAGATC
ATCACCTTCCTCATCATCCCAGCGCTACGTGTCACTCTCTAAACTAGTGTGTAAAGCACA
ACAGACTCACGAAGACGATACCTCCGCCGTCTCTCGCCGTCTCGCTCTCACACTCCTCGT
CGGCGCCGCTGCGGTTGGTTCCAAAGTGTCTCCAGCCGATGCTGCCTACGGTGAAGCTGC
AAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGCAAAACACAGACTTCACGGCGTACAGTGGAGACGGATT
CCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAGTG*AACCCAAGCAGAGAGGTTGAGTATCCAGGACAAGT
CCTTCGGTATGAAGACAACTTTGACGCTACTAGCAATCTCAATGTCATGGTCACTCCTAC
TGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGTTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAATTA
CCTCCTAGGGAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACAACAA
TGCAGTGGCAACAGCAAACATCCTGGAGACGAATATTCAGGACGTTGGAGGGAAACCATA
CTATTACTTGTCTGTGTTGACGAGAACAGCCGATGGAGACGAAAGTGGTAAGCATCAGCT
GATCACAGCCACCGTGAATGGAGGCAAGCTTTATATCTGCAAAGCACAAGCTGGAGACAA
GAG*TGGTTCAAGGGAGCCAATAAATTCGTCGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTGC
TTGATTTTAAAAGCAGCACAGCTATATGCTCTGCTTGC

QA 3 880 3 880
DS 

RD RR2GV31JQB 627 0 0
CAAG
GCAAAACACAGACTTCACGGCGTACAGTGGAGACGGATTCCAAGTGCAGGTGCCGGCTAA
GTGGAACCCAAGCGGAGAGGTTGAGTATCCAGGACAAGTCCTTAGGTATGAAGACAACTT
TGACGCTACTAGCAATCTCAATGTCATGGTCACTCCTACCGACAAGAAGTCCATCACTGA
TTACGGTTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAATTACCTTCTAGGGAAACAAGCTTA
CTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGGTTTGACAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACAT
TCTGGAGACAAATATTCAGGACGTTGGTGGGAAGCCATACTATTACTTGTCTGTGTTGAC
GAGAACAGCCGATGGAGACGAAGGTGGTAAGCATCAGCTGATCACAGCCACCGTGAATGG
AGGCAAGCTTTATATCTGCAAAGCACAAGCTGGAGACAAGAGGTGGTTCAAGGGAGCCAA
TAAATTCGTCGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTGCTTGATTTTAAAAGCAGCACAA
CTATATGCTCTGCTTGCTTGTTATCTTCATTTG*CTCTTGTAAAAAAAA***TGGAAAAT
GAAAAACTTAGCTTTTGAGAA
CC

QA 5 625 5 625
DS 

RD RR2BC86JQ 714 0 0
GCGGTTGGTTCCAAAGTGTCTCCAGCCGATGCTGCCTACGGTGAAGCTGCAAATGTGTTT
GGGAAGCCAAAGCAAAACACAGACTTCACGGCGTACAGTGGAGACGGATTCCAAGTGCAG
GTGCCAGCTAAGTG*AACCCAAGCAGAGAGGTTGAGTATCCAGGACAAGTCCTTCGGTAT
GAAGACAACTTTGACGCTACTAGCAATCTCAATGTCATGGTCACTCCTACTGACAAGAAG
TCCATCACTGATTACGGTTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAATTACCTCCTAGGG
AAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACAACAATGCAGTGGCA
ACAGCAAACATCCTGGAGACGAATATTCAGGACGTTGGAGGGAAACCATACTATTACTTG
TCTGTGTTGACGAGAACAGCCGATGGAGACGAAGGTGGTAAGCATCAGCTGATCACAGCC
ACCGTGAATGGAGGCAAGCTTTATATCTGCAAAGCACAAGCTGGAGACAAGAGGTGGTTC
AAGGGAGCCAATAAATTCGTCGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTGCTTGATTTTAA
AAGCAGCACAGCTATATGCTCTGCTTGCTTGTTATCTCCATTTGTCTCTTGTAAAAAAAA
A**TGGAAAAATGAAAACTTAGCTTTTGAGAATTATCAAGATGGTGTTTTTACC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2F621JQ 670 0 0
AGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGCAAAACACAGACTTCACGGCGTACAGTGGAGA
CGGATTCCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAGTGGAACCCAAGCAGAGAGGTTGAGTATCCAGG
ACAAGTCCTTCGGTATGAAGACAACTTTGACGCTACTAGCAATCTCAATGTCATGGTCAC
TCCTACTGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGTTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGT
CAATTACCTTCTAGGGAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGA
CAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACATCCTGGAGACGAATATTCAGGACGTTGGAGTGAA
ACCATACTATTACTTGTCTGTGTTGACGAGAACAGCCGATGGAGACGAAGGTGGTAAGCA
TCAGCTGATCACAGCCACCGTGAATGGAGGCAAGCTTTATATCTGCAAAGCACAAGCTGG
AGACAAGAGGTGGTTCAAGGGAGCCAATAAATTCGTCGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAG
TGTTGCTTGATTTTAAAAGCAGCACAGCTATATGCTCTGCTTGCTTGTTATCTCCATTTG
TCTCTTGTAAAAAAAAAAATGGAAAAATGAAAACTTAGCTTTTGAGAATTATCAAGATGG
TGTTTTTACC

QA 1 670 1 670
DS 



CO CL90Contig3 912 4 14 U
GTCAAAGTTTATAAGAGTTTCCATTTTGGTGACAGACAGATAACAAAGACTTTTGACTAT
TAATTAATAATATCATTATTGCAAATGAGTTCTGTTATCACAGGTACACAAGTGAAGCTT
CCTAGGTAGCATCATTATCTAGATAGTTCTCAAAAGCTTAGTTTCAAAAGAAAAGCAGAG
GACT*CTTCTGTTGTGTTGCTTTTCAATTTAAGCAACACTGAAAGAAGTGGCTGCTTTCT
CAACAAACTTATTGGCTCCCTTGAACCACCTCTTGTCTCCAGCTTGCGCTTTGCAGATAT
ATAGCTTCCCTCCATTCACGGTGGCTGTGATCAGCTGATGCTTACCACCTTCATCTCCAT
CTGCGGTTCTTGTCAACACTGACAAGTAATAGTATGGCTTCCCACCAACGTCCTGAATGT
TTGTGTCCAGAATGTTTGCTGTCGCCACTGCATTGTTGTCAAAACCTCCCTCAGAGGCAG
TCTCACCAAAGTAAGCTTGTTTACCTAGGAGATAGTTGACCTGAGAGAGGAACTCTTCAG
GGGAACCGTAGTCAGTGATAGACTTCTTGTCAGTAGGAGTGACCATGACATTGAGATTGC
TAGTGGCGTCAAAGTTGTCTTCGTACCTAAGGACTTGTCCTGGATACTCTACCTCTCTGC
TTGGGTTCCATTTAGCTGGCACCTGCACAATGAATCCATCTCCACTGTATGCAGTGAAGT
CTGTGTTCTTCTTTGGCTTCCCAAACACATTAGCAGCTTCACCGTAGGCTGCATCAGCGG
GAGACACTTTGGAACCGACGGCGGCGGCGCCAACGAGGAGTGTGAGAGCTAGACGGCGAG
AGACATTGGAGTTATCCTCTTCATGGTGTTGTTGGGCTTTACAGACTATCTGGACGGGTC
TGGAGAGTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT84JQ U 1
AF RR2A603JQ U 55
AF RR2DB58TF C 85
AF RR2BP90TF C 266
BS 1 99 RR2DT84JQ
BS 100 100 RR2A603JQ
BS 101 184 RR2DT84JQ
BS 185 185 RR2A603JQ
BS 186 497 RR2DT84JQ
BS 498 559 RR2A603JQ
BS 560 560 RR2DB58TF
BS 561 622 RR2A603JQ
BS 623 623 RR2DB58TF
BS 624 735 RR2A603JQ
BS 736 748 RR2DB58TF
BS 749 749 RR2BP90TF
BS 750 770 RR2DB58TF
BS 771 912 RR2BP90TF

RD RR2DT84JQ 497 0 0
GTCAAAGTTTATAAGAGTTTCCATTTTGGTGACAGACAGATAACAAAGACTTTTGACTAT
TAATTAATAATATCATTATTGCAAATGAGTTCTGTTATCTCAGGTACACAAGTGAAGCTT
CCTAGGTAGCATCATTATCTAGATAGTTCTCAAAAGCTTAGTTTCAAAAGAAAAGCAGAG
GACTTCTTCTGTTGTGTTGCTTTTCAATTTAAGCAACACTGAAAGAAGTGGCTGCTTTCT
CAACAAACTTATTGGCTCCCTTGAACCACCTCTTGTCTCCAGCTTGCGCTTTGCAGATAT
ATAGCTTCCCTCCATTCACGGTGGCTGTGATCAGCTGATGCTTACCACCTTCATCTCCAT
CTGCGGTTCTTGTCAACACTGACAAGTAATAGTATGGCTTCCCACCAACGTCCTGAATGT
TTGTGTCCAGAATGTTTGCTGTCGCCACTGCATTGTTGTCAAAACCTCCCTCAGAGGCAG
TCTCACCAAAGTAAGCT

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2A603JQ 681 0 0
GACTATTAATTAATAATATCATTATTGCAAATGAGT*CTGTTATCACAGGTACACAAGTG
AAGCTTCCTAGGTAGCATCATTATCTAGATAGTTCTCAAAAGCTTAGTTTCAAAAGAAAA
GCAGAGGACT*CTTCTGTTGTGTTGCTTTTCAATTTAAGCAACACTGAAAGAAGTGGCTG
CTTTCTCAACAAACTTATTGGCTCCCTTGAACCACCTCTTGTCTCCAGCTTGCGCTTTGC
AGATATATAGCTTCCCTCCATTCACGGTGGCTGTGATCAGCTGATGCTTTCCACCTTCGT
CCCCATCTGCTGTTCTTGTCAACACTGACAAGTAATAGTATGGCTTCCCACCAACGTCCT
GAATGTTTGTGTCCAGAATGTTTGCTGTTGCCACTGCATTGTTATCAAAGCCTCCCTCAG
AGGCAGTCTCACCAAAGTAAGCTTGTTTACCTAGGAGATAGTTGACCTGAGAGAGGAACT
CTTCAGGGGAACCGTAGTCAGTGATGGACTTCTTGTCAGTAGGAGTGACCATGACATTGA
GATTGCTAGTGGCGTCAAAGTTGTCTTCATACCTAAGGACTTGTCCTGGATACTCTACCT
CTCTGCTTGGGTTCCATTTAGCTGGCACCTGCACAATGAATCCATCTCCACTGTATGCAG
TGAAGTCTGTGTTCTTCTTTG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2DB58TF 686 0 0
AAATGAGTCTG
TATCACAGGTACACAAGTGAAGCT**CTAGGTAGCATCAT*ATCTAGATAGT*CTCAAAA
GCTTAGTTTCAAAAGAAAAGCTGAGGACT*CTTCTGTTGT*TTGCTTTTCAATTTAAGCA
ACACTGAAAGAAGTGGCTGCTTTCTCAACAAACTTATTGGCTCCCTTGAACCACCTCTTG
TCTCCAGCCTGCGCTTTGCAGATATATAGCTTCCCTCCATTCACGGTGGCTGTGATCAGC
TGATGCTTACCACCTTCGTCTCCATCTGCTGTTCTTGTCAACACTGACAAGTAATAGTAT
GGTTTCCCACCAACGTCCTGAATGTTTGTGTCCAGAATGTTTGCTGTTGCCACTGCATTG
TTGTCAAAACCTCCCTCAGAGGCAGTCTCACCAAAGTAAGCTTGTTTACCAAGGAGATAG
TTGACCTGAGAGAGGAACTCTTCAGGGGAACCGTAGTCAGTGATAGACTTCTTGTCAGTA
GGAGTGACCATGACATTGAGATTGCTAGTGGCGTCAAAGTTGTCTTCGTACCTAAGGACT
TGTCCTGGATACTCTACCTCTCTGCTTGGGTTCCATTTAGCCGGCACCTGCACAATGAAT
CCATCTCCACTGTATGCAGTGAAGTCTGTGTTCTTCTTTGGCTTCCCAAACACGTTAGCA
GCTTCACCGTAGGCT

QA 12 686 12 686
DS 

RD RR2BP90TF 647 0 0
ACCA
CTCTTGTCTCCAGCTTGCGCTTTGCAGATGTATAGCTTCCCTCCATTCACGGTGGCTGTG
ATCAGCTGATGCTTACCACCTTCATCTCCATCTGCGGTTCTTGTCAACACTGACAAGTAA
TAGTATGGCTTCCCACCAACGTCCTGAATGTTTGTGTCCAGAATGTTTGCTGTCGCCACT
GCATTGTTGTCAAAACCTCCCTCAGAGGCAGTCTCACCAAAGTAAGCTTGTTTACCTAGG
AGATAGTTGACCTGAGAGAGGAACTCTTCAGGGGAACCGTAGTCAGTGATAGACTTCTTG
TCAGTAGGAGTGACCATGACATTGAGATTGCTAGTGGCGTCAAAGTTGTCTTCGTACCTA
AGGACTTGTCCTGGATACTCTACCTCTCTGCTTGGGTTCCATTTAGCTGGCACCTGCACA
ATGAATCCATCTCCGCTGTATGCAGTGAAGTCTGTGTTCTTCTTTGGCTTCCCAAACACA
TTCGCAGCTTCACCGTAGGCTGCATCAGCGGGAGACACTTTGGAACCGACGGCGGCGGCG
CCAACGAGGAGTGTGAGAGCTAGACGGCGAGAGACATTGGAGTTATCCTCTTCATGGTGT
TGTTGGGCTTTACAGACTATCTGGACGGGTCTGGAGAGTGACC

QA 5 647 5 647
DS 



CO CL90Contig4 747 2 14 U
GGAAGAGAGAGAGAGATAAAATGGCGTACAGCGCGTGTTTCCTACACCAGAGCGCACTAG
CCTCCTCAGCCGCACGATCATCGTCTCCCAACTCATCCCAGCGCCACTTGTCACTCTCCA
GACCCGTCCAGATAGTCTGTAAAGCACAACAACACCATGAAGAGGATAACTCCAATGTCT
CTCGCCGTCTAGCTCTCACACTCCTCGTTGGCGCCGCCGCCGTCAGTTCCAAAGTGTCTC
CCGCTGATGCAGCCTACGGTGAAGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGAAGAACACAG
ACTTCACTGCATACAGTGGAGATGGATTCATTGTGCAGGCGCCAGCTAAATGGAACCCAA
GCAGAGAGGTAGAGTATCCAGGACAAGTCCTTAGGTACGAAGACAACTTTGACGCCACTA
GCAATCTCAATGTCATGGTCACTCCTACTGACAAGAAGTCCATCACTGACTACGGTTCCC
CTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAACTATCTCCTAGGTAAACAAGCTTACTTTGGTGAGA
CTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGACACAA
ACATTCAGGACGTTGGTGGGAAGCCATACTATTACTTGTCAGTGTTGACAAGAACAGCAG
ATGGGGACGAAGGTGGAAAGCATCAGCTGATCACAGCCACCGTGAATGGAGGGAAGCTAT
ATATCTGCAAAGCGCAAGCTGGAGACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT84TF U 1
AF RR2A603TF U 14
BS 1 145 RR2DT84TF
BS 146 146 RR2A603TF
BS 147 224 RR2DT84TF
BS 225 225 RR2A603TF
BS 226 268 RR2DT84TF
BS 269 269 RR2A603TF
BS 270 460 RR2DT84TF
BS 461 461 RR2A603TF
BS 462 556 RR2DT84TF
BS 557 557 RR2A603TF
BS 558 577 RR2DT84TF
BS 578 578 RR2A603TF
BS 579 599 RR2DT84TF
BS 600 747 RR2A603TF

RD RR2DT84TF 599 0 0
GGAAGAGAGAGAGAGATAAAATGGCGTACAGCGCGTGTTTCCTACACCAGAGCGCACTAG
CCTCCTCAGCCGCACGATCATCGTCTCCCAACTCATCCCAGCGCCACTTGTCACTCTCCA
GACCCGTCCAGATAGTCTGTAAAGCCCAACAACACCATGAAGAGGATAACTCCAATGTCT
CTCGCCGTCTAGCTCTCACACTCCTCGTTGGCGCCGCCGCCGTCGGTTCCAAAGTGTCTC
CCGCTGATGCAGCCTACGGTGAAGCTGCGAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGAAGAACACAG
ACTTCACTGCATACAGTGGAGATGGATTCATTGTGCAGGCGCCAGCTAAATGGAACCCAA
GCAGAGAGGTAGAGTATCCAGGACAAGTCCTTAGGTACGAAGACAACTTTGACGCCACTA
GCAATCTCAATGTCATGGTCACTCCTACTGACAAGAAGTCTATCACTGACTACGGTTCCC
CTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAACTATCTCCTAGGTAAACAAGCTTACTTTGGTGAGA
CTGCCTCTGAGGGAGGTTTTGACAACAATGCAGTGGCGACAGCAAACATTCTGGACACA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2A603TF 734 0 0
AGATAAA
ATGGCGTACAGCGCGTGTTTCCTACACCAGAGCGCATTAGCCTCCTCAGCCGCACGATCA
TCGTCTCCCAACTCATCCCAGCGCCACTTGTCACTCTCCAGACCCGTCCAGATAGTCTGT
AAAGCACGACAGCACCATGAAGAGGATAACTCCGCTGTCTCTCGCCGTCTAGTTCTCACA
CTCCTCGTTGGCGCCGCCGCCGTCAGTTCCAAAGTGTCTCCCGCTGATGCAGCCTACGGT
GAAGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGAAGAACACAGACTTCACTGCATACAGTGGA
GATGGATTCATTGTGCAGGTGCCAGCTAAATGGAACCCAAGCAGAGAGGTAGAGTATCCA
GGACAAGTCCTTAGGTATGAAGACAACTTTGACGCCACTAGCAATCTCAATGTCATGGTC
ACTCCTACTGACAAGAAGTCCATCACTGACTACGGTTCCCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAG
GTCAACTATCTCCTAGGTAAACAAGCTTACTTTGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTT
GATAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGACACAAACATTCAGGACGTTGGTGGG
AAGCCATACTATTACTTGTCAGTGTTGACAAGAACAGCAGATGGGGACGAAGGTGGAAAG
CATCAGCTGATCACAGCCACCGTGAATGGAGGGAAGCTATATATCTGCAAAGCGCAAGCT
GGAGACA

QA 8 734 8 734
DS 



CO CL90Contig5 816 2 2 U
GGTTTCTCAAAACCTTAGTTTCATTATCCTTTTTTTACAAAGAGACAAAAGAAGAAAGAA
AGCAAAGCATTGTTCTGTTCTGTTTGAGTTGCTTTTACATTCAAGCAACACTGAAAGATG
TGGCTGCTTTCTCGACAAATTTGTTGGCTCCCTTGAACCACCTCTTGTCTCCAGCTTGTG
CTTTGCAGATGTAAAGCTTGCCTCCATTCACGGTGGCGGTGATCAGCTGATGCTTACCTC
CTTCATCTCCATCGGCCGTTCTTGTCAACACGGACAAGTAATAGTATGGTTTCCCACCAA
CGTCCTGAACATTAGTCTCCAGAATGTTTGCTGTTGCCACTGCATTGTTGTCAAAGCCTC
CCTGAAAGAGGAACTCTTCAGGAGAGCCGTAATCAGTGATGGACTTCTTGTCGGTAGGGG
TGACCATGACATTGAGATTGCTAGTAGCATCGAAGTTGTCTTCGTACCTAAGGACTTGTC
CTGGATACTCTACCTCTCTGCTTGGGTTCCATTTAGCTGGCACCTGCACTTGGAACCCAT
CTCCACTGTATGCTGTGAAGTCTGTGTTCTTCTTTGGCTTCCCAAACACATTAGCAGCTT
CACCGTAGGCAGCATCGGCGGGAGACACCTTGGAACCAACTGCAGCGGCGCCGACGAGGA
GTGTGAGAGCGAGACGGCGAGAGACGGCAGAGTTATCGTCTTCATGAGCCTGTTGGGCTT
TGCACACTACCTGGACGGGTTCGGAGAGTGAAACGTAACGCTGGGATGAGGAGGAAGATG
ATGATCGTGTGGCGGCAGAGGCCAGTGCGCTCTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FV95JQ U 1
AF RR2FK82TF C 363
BS 1 599 RR2FV95JQ
BS 600 816 RR2FK82TF

RD RR2FV95JQ 599 0 0
GGTTTCTCAAAACCTTAGTTTCATTATCCTTTTTTTACAAAGAGACAAAAGAAGAAAGAA
AGCAAAGCATTGTTCTGTTCTGTTTGAGTTGCTTTTACATTCAAGCAACACTGAAAGATG
TGGCTGCTTTCTCGACAAATTTGTTGGCTCCCTTGAACCACCTCTTGTCTCCAGCTTGTG
CTTTGCAGATGTAAAGCTTGCCTCCATTCACGGTGGCGGTGATCAGCTGATGCTTACCTC
CTTCATCTCCATCGGCCGTTCTTGTCAACACGGACAAGTAATAGTATGGTTTCCCACCAA
CGTCCTGAACATTAGTCTCCAGAATGTTTGCTGTTGCCACTGCATTGTTGTCAAAGCCTC
CCTGAAAGAGGAACTCTTCAGGAGAGCCGTAATCAGTGATGGACTTCTTGTCGGTAGGGG
TGACCATGACATTGAGATTGCTAGTAGCATCGAAGTTGTCTTCGTACCTAAGGACTTGTC
CTGGATACTCTACCTCTCTGCTTGGGTTCCATTTAGCTGGCACCTGCACTTGGAACCCAT
CTCCACTGTATGCTGTGAAGTCTGTGTTCTTCTTTGGCTTCCCAAACACATTAGCAGCT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2FK82TF 454 0 0
TGAGAGAGGAACTCTTCAGGAGAGCCGTAATCAGTGATGGACTTCTTGTCGGTAGGGGTG
ACCATGACATTGAGATTGCTAGTAGCATCGAAGTTGTCTTCGTACCTAAGGACTTGTCCT
GGATACTCTACCTCTCTGCTTGGGTTCCATTTAGCTGGCACCTGCACTTGGAACCCATCT
CCACTGTATGCTGTGAAGTCTGTGTTCTTCTTTGGCTTCCCAAACACATTAGCAGCTTCA
CCGTAGGCAGCATCGGCGGGAGACACCTTGGAACCAACTGCAGCGGCGCCGACGAGGAGT
GTGAGAGCGAGACGGCGAGAGACGGCAGAGTTATCGTCTTCATGAGCCTGTTGGGCTTTG
CACACTACCTGGACGGGTTCGGAGAGTGAAACGTAACGCTGGGATGAGGAGGAAGATGAT
GATCGTGTGGCGGCAGAGGCCAGTGCGCTCTGAT

QA 1 454 1 454
DS 



AS 3 18

CO CL91Contig1 745 5 10 U
CAACGTTCTGGGAAATTCAGATTATACCATGCTGATGTCAACAAAGGTTTTAGTACAACA
AAAAATTCTTTAACATCCAGAAAGTCGTAAAGACTGAAACTTGAAATAAAACTAAAATAA
ACAAAAATCAATAAAGATTGAAGTTTGGTTTAGCCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGG
ATAACTCCTTCATACTTGACTTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTGGTCACTCTGTGT
TGGATACCAACACGAGCCTTACACCTACGACGACGAGCCACACGGTATCCTGGACGTTCG
AGAACAACATAGAAGTCCATTCCGTAGATACCAGTAGATGGATCATACTTGATACCAAGA
TCAATGTGCTCTTGGATACCGAATCCAAAGCAACCAGTGTCACTAAAGTTCCTTCTAAGA
AGCTCATACTCCTTAACTTTCAAACCACTCTCAAGAAGCTGCATAGCCTTGTCGCCTCTC
ACAGTGACATAGCAAGCAATCTTTTCGTTACGCCTGATACCAAAAGACCTCACAGTGTAT
CTCGCCTTGGAGAAAACAGGGGATTGTCCACTGAGCTGTTCTAAAACCTTGGAGGCACGA
GTGAGACGATCACCACTCTCACCCACAGAGATGTTGAGAACAAGTTTCTGGACCTTAATG
TCCCTCATGGGGTTCGACAGCTTCTTCTCCGACGCCATTGTAAAGAGATCAGAGTCGAGG
TAGAAGAGAAGAAGTAAAGAGAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER96JQ U 1
AF RR2DE16JQ U 8
AF RR2DE16TF C 8
AF RR2E546JQ U 10
AF RR2E546TF C 11
BS 1 93 RR2ER96JQ
BS 94 94 RR2DE16JQ
BS 95 110 RR2ER96JQ
BS 111 111 RR2DE16JQ
BS 112 269 RR2ER96JQ
BS 270 270 RR2DE16JQ
BS 271 317 RR2ER96JQ
BS 318 509 RR2DE16JQ
BS 510 696 RR2E546JQ
BS 697 745 RR2E546TF

RD RR2ER96JQ 317 0 0
CAACGTTCTGGGAAATTCAGATTATACCATGCTGATGTCAACAAAGGTTTTAGTACAACA
AAAAATTCTTTAACATCCAGAAAGTCGTAAAGATTGAAACTTGAAATAAAGCTAAAATAA
ACAAAAATCAATAAAGATTGAAGTTTGGTTTAGCCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGG
ATAACTCCTTCATACTTGACTTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTGGTCACTCTGTGT
TGGATACCAACACGAGCCTTACACCTACGGCGACGAGCCACACGGTATCCTGGACGTTCG
AGAACAACATAGAAGTC

QA 1 317 1 317
DS 

RD RR2DE16JQ 502 0 0
CT
GGGAAATTCAGATTATACCATGCTGATGTCAACAAAGGTTTTAGTACAACAAAAAATTCT
TTAACATCCAGAAAGTCGTAAAGACTGAAACTTGAAATAAAACTAAAATAAACAAAAATC
AATAAAGATTGAAGTTTGGTTTAGCCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGGATAACTCCT
TCATACTTGACTTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTGGTCACTCTGTGTTGGATACCA
ACACGAGCCTTACACCTACGACGACGAGCCACACGGTATCCTGGACGTTCGAGAACAACA
TAAAAGTCCATTCCGTAGATACCAGTAGATGGATCATACTTGATACCAAGATCAATGTGC
TCTTGGATACCGAATCCAAAGCAACCAGTGTCACTAAAGTTCCTTCTAAGAAGCTCATAC
TCCTTAACTTTCAAACCACTCTCAAGAAGCTGCATAGCCTTGTCGCCTCTCACAGTGACA
TAGCAAGCAATCTTTTCGTT

QA 3 502 3 502
DS 

RD RR2DE16TF 575 0 0
CT
GGGAAATTCAGATTATACCATGCTGATGTCAACAAAGGTTTTAGTACAACAAAAAATTCT
TTAACATCCAGAAAGTCGTAAAGACTGAAACTTGAAATAAAACTAAAATAAACAAAAATC
AATAAAGATTGAAGTTTGGTTTAGCCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGGATAACTCCT
TCATACTTGACTTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTGGTCACTCTGTGTTGGATACCA
ACACGAGCCTTACACCTACGACGACGAGCCACACGGTATCCTGGACGTTCGAGAACAACA
TAGAAGTCCATTCCGTAGATACCAGTAGATGGATCATACTTGATACCAAGATCAATGTGC
TCTTGGATACCGAATCCAAAGCAACCAGTGTCACTAAAGTTCCTTCTAAGAAGCTCATAC
TCCTTAACTTTCAAACCACTCTCAAGAAGCTGCATAGCCTTGTCGCCTCTCACAGTGACA
TAGCAAGCAATCTTTTCGTTACGCCTGATACCAAAAGACCTCACAGTGTATCTCGCCTTG
GAGAAAACAGGGGATTGTCCACTGAGCTGTTCC

QA 3 575 3 575
DS 

RD RR2E546JQ 687 0 0
GGGAAATTCAGATTATACCATGCTGATGTCAACAAAGGTTTTAGTACAACAAAAAATTCT
TTAACATCCAGAAAGTCGTAAAGACTGAAACTTGAAATAAAACTAAAATAAACAAAAATC
AATAAAGATTGAAGTTTGGTTTAGCCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGGATAGCTCCT
TCATACTTGACTTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTGGTCACTCTGTGTTGGATACCA
ACACGAGCCTTACACCTACGACGACGAGCCACACGGTATCCTGGACGTTCGAGAACAACA
TAGAAGTCCATTCCGTAGATACCAGTAGATGGATCATACTTGATACCAAGATCAATGTGC
TCTTGGATACCGAATCCAAAGCAACCAGTGTCACTAAAGTTCCTTCTAAGAAGCTCATAC
TCCTTAACTTTCAAACCACTCTCAAGAAGCTGCATAGCCTTGTCGCCTCTCACAGTGACA
TAGCAAGCAATCTTTTCGTTACGCCTGATACCAAAAGACCTCACAGTGTATCTCGCCTTG
GAGAAAACAGGGGATTGTCCACTGAGCTGTTCTAAAACCTTGGAGGCACGAGTGAGACGA
TCACCACTCTCACCCACAGAGATGTTGAGAACAAGTTTCTGGACCTTAATGTCCCTCATG
GGGTTCGACAGCTTCTTCTCCGACGCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2E546TF 735 0 0
GGGAAA
TCAGATTATACCATGCTGATGTCAACAAAGGTTTTAGTACAACAAAAAATTCTTTAACAT
CCAGAAAGTCGTAAAGACTGAAACTTGAAATAAAACTAAAATAAACAAAAATCAATAAAG
ATTGAAGTTTGGTTTAGCCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGGATAGCTCCTTCATACT
TGACTTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTGGTCACTCTGTGTTGGATACCAACACGAG
CCTTACACCTACGACGACGAGCCACACGGTATCCTGGACGTTCGAGAACAACATAGAAGT
CCATTCCGTAGATACCAGTAGATGGATCATACTTGATACCAAGATCAATGTGCTCTTGGA
TACCGAATCCAAAGCAACCAGTGTCACTAAAGTTCCTTCTAAGAAGCTCATACTCCTTAA
CTTTCAAACCACTCTCAAGAAGCTGCATAGCCTTGTCGCCTCTCACAGTGACATAGCAAG
CAATCTTTTCGTTACGCCTGATACCAAAAGACCTCACAGTGTATCTCGCCTTGGAGAAAA
CAGGGGATTGTCCACTGAGCTGTTCTAAAACCTTGGAGGCACGAGTGAGACGATCACCAC
TCTCACCCACAGAGATGTTGAGAACAAGTTTCTGGACCTTAATGTCCCTCATGGGGTTCG
ACAGCTTCTTCTCCGACGCCATTGTAAAGAGATCAGAGTCGAGGTAGAAGAGAAGAAGTA
AAGAGAGTT

QA 7 735 7 735
DS 



CO CL91Contig2 786 6 25 U
CTTGGAAATTTAAATGGCATAGATGGTAAACATAAAAGAAGGGTCTGGAAATTTAATTTC
TACCACACTGACGTCAAAAAGAGGTTTTACTAGAACAAGCGATTCTTAAATATCCAGAAA
TCGTAAAGATGACAACTTAAAAAAA*CAAAAACTAGAATCAACAAAAAATCTATGAAGAC
TCAAGTTTTAGTTTAGCCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGAATAACTCCTTCATACTT
AACTTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTAGTCACTCTGTGTTGGATACCAACACGAGC
CTTGCACCTGCGTCGACGAGCCACACGGTATCCTGGACGTTCAAGAACTACATAGAAGTC
CATTCCGTAGATACCCGTAGAAGGATCATACTTGATACCAAGATCAATGTGCTCTTGGAT
ACCGAATCCAAAGCAACCAGTGTCACTAAAGTTCCTCCTGAGAAGCTCATACTCCTTAAC
TTTCAAACCACTCTCAAGAAGCTGCATTGCCTTGTCACCTCTCACAGTAACATAGCACGC
AATCTTTTCGTTACGCCTGATACCAAAAGACCTCACAGTGTACCTTGCCTTTGAGAAAAC
AGGGGTTTGTCCACTGAGCTGTTCCAAAACCTTGGAGGCACGAGTGAGACGATCACCACT
CTCACCAACGGAGATGTTAAGAACAAGTTTTTGGACCTTAATGTCCCTCATGGGGTTCGA
CAGCTTCTTCTCCGACGCCATTTGAAGGAGATCAACAATCGAAGTAACAGAGAGTTGCGG
AAACCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 0 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2E116JQ U 47
AF RR2FT57JQ U 4
AF RR2FT57TF C 1
AF RR2FG90JQ U 47
AF RR2EA44TF C 47
AF RR2E116TF C 38
BS 1 3 RR2FT57TF
BS 4 49 RR2FT57JQ
BS 50 62 RR2FG90JQ
BS 63 63 RR2FT57JQ
BS 64 64 RR2FG90JQ
BS 65 65 RR2E116JQ
BS 66 151 RR2FG90JQ
BS 152 152 RR2E116JQ
BS 153 179 RR2FG90JQ
BS 180 180 RR2E116JQ
BS 181 222 RR2FG90JQ
BS 223 223 RR2E116JQ
BS 224 312 RR2FG90JQ
BS 313 313 RR2FT57JQ
BS 314 355 RR2FG90JQ
BS 356 356 RR2FT57JQ
BS 357 381 RR2FG90JQ
BS 382 382 RR2FT57JQ
BS 383 450 RR2FG90JQ
BS 451 451 RR2FT57JQ
BS 452 678 RR2FG90JQ
BS 679 679 RR2FT57JQ
BS 680 758 RR2FG90JQ
BS 759 761 RR2FT57TF
BS 762 786 RR2E116TF

RD RR2E116JQ 576 0 0
GGAAATTTAATTTCTACCACACTGACGTCAAAAAGAGGTTTTACTAGAACAAGCGATTCT
TAAATATCCAGAAATCGTAAAGATGACAACTTAAAAAA**CAAAAACTAGAATCAACAAA
AAATCTATGAAGACTCAAGTTTTAGTTTAGCCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGAATA
ACTCCTTCATACTTAACTTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTAGTCACCCTGTGTTGG
ATACCAACACGAGCCTTGCACCTGCGTCGACGAGCCACACGGTATCCTGGACGTTCAAGA
ACTACATAGAAGTCCATTCCGTAGATACCCGTAGAAGGATCATACTTGATGCCAAGATCA
ATGTGCTCTTGGATACCGAATCCAAAGCAACCAGTGTCACTGAAGTTCCTCCTGAGAAGC
TCATACTCCTTAACTTTCAAACCACTCTCAAGAAGCTGCATTGCCTTGTCACCTCTCACA
GTAACATAGCAGGCGATCTTTTCGTTACGCCTGATACCAAAAGATCTCACAGTGTACCTT
GCCTTTGAGAAAACAGGGGTTTGTCCACTGAGCTGT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2FT57JQ 706 0 0
GGAAATTTAAATGGCATAGATGGTAAACATAAAAGAAGGGTCTGGAAATTTAATTTCTAC
CCCACTGACGTCAAAAAGAGGTTTTACTAGAACAAGCGATTCTTAAACATCCAGATATCG
TAAAGATGACAACTTAAAAAAAACAAAAGCTAGAATCAACAAAAAATCTATGAAGATTCA
AGTTTTAGTTTAGCCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGGATAACTCCTTCATACTTAAC
TTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTAGTCACTCTGTGTTGGATACCAACACGAGCCTT
GCACCTGCGTCGACGAGCCACACGGTATCCTGGACGTTCAAGAACTACATAGAAGTCCAT
TCCGTAGATACCCGTAGAAGGATCATACTTGATACCAAGATCAATGTGCTCTTGGATACC
GAATCCAAAGCAACCAGTGTCACTAAAGTTCCTCCTGAGAAGCTCATACTCCTTAACTTT
CAAACCACTCTCAAGAAGCTGCATTGCCTTGTCACCTCTAACAGTAACATAGCACGCAAT
CTTTTCGTTACGCCTGATACCAAAAGACCTCACAGTGTACCTTGCCTTTGGGAAAACAGG
GGTTTGTCCACTGAGCTGTTCCAAAACCTTGGAGGCACGAGTCAGACGATCACCACTCTC
ACCAACGGAGATGTTAAGAACAAGTTTTTGGACCTTAATGTCCCTC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2FT57TF 762 0 0
CTTGGAAATTTAAATGGCATAGATGGTAAACATAAAAGAAGGGTCTGGAAATTTAATTTC
TACCCCACTGACGTCAAAAAGAGGTTTTACTAGAACAAGCGATTCTTAAACATCCAGATA
TCGTAAAGATGACAACTTAAAAAAAACAAAAGCTAGAATCAACAAAAAATCTATGAAGAT
TCAAGTTTTAGTTTAGCCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGGATAACTCCTTCATACTT
AACTTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTAGTCACTCTGTGTTGGATACCAACACGAGC
CTTGCACCTGCGTCGACGAGCCACACGGTATCCTGGACGTTCAAGAACTACATAGAAGTC
CATTCCGTAGATACCCGTAGAAGGATCATACTTGATACCAAGATCAATGTGCTCTTGGAT
ACCGAATCCAAAGCAACCAGTGTCACTAAAGTTCCTCCTGAGAAGCTCATACTCCTTAAC
TTTCAAACCACTCTCAAGAAGCTGCATTGCCTTGTCACCTCTAACAGTAACATAGCACGC
AATCTTTTCGTTACGCCTGATACCAAAAGACCTCACAGTGTACCTTGCCTTTGGGAAAAC
AGGGGTTTGTCCACTGAGCTGTTCCAAAACCTTGGAGGCACGAGTCAGACGATCACCACT
CTCACCAACGGAGATGTTAAGAACAAGTTTTTGGACCTTAATGTCCCTCATAGGGTTCGA
CAGCTTCTTCTCCGACGCCATTTGAAGGAGATCAACAATCG
C

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2FG90JQ 712 0 0
GGC
AATTTAATTTCTAACCCACTGACGTCAAAAAGAGGTTTTACTAGAACAAGCGATTCTTAA
ATATCCAGAAATCGTAAAGATGACAACTTAAAAAAA*CAAAAGCTAGAATCAACAAAAAA
TCTATGAAGATTCAAGTTTTAGTTTAGCCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGGATAACT
CCTTCATACTTAACTTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTAGTCACTCTGTGTTGGATA
CCAACACGAGCCTTGCACCTGCGGCGACGAGCCACACGGTATCCTGGACGTTCAAGAACT
ACATAGGAGTCCATTCCGTAGATACCCGTAGAGGGATCATACTTGATACCAAGATCAATG
TGCTCTTGGATACCGAATCCAAAGCAACCAGTGTCACTAAAATTCCTCCTGAGAAGCTCA
TACTCCTTAACTTTCAAACCACTCTCAAGAAGCTGCATTGCCTTGTCACCTCTCACAGTA
ACATAGCACGCAATCTTTTCGTTACGCCTGATACCAAAAGACCTCACAGTGTACCTTGCC
TTTGAGAAAACAGGGGTTTGTCCACTGAGCTGTTCCAAAACCTTGGAGGCACGAGTGAGA
CGATCACCACTCTCACCAACGGAGATGTTGAGAACAAGTTTTTGGACCTTAATGTCCCTC
ATGGGGTTCGACAGCTTCTTCTCCGACGCCATTTGAAGGAGATCAACAA

QA 4 712 4 712
DS 

RD RR2EA44TF 736 0 0
GGAAATTTAATTTCTACCACACTGACGTCAAAAAGAGGTTT*ACTAGAACAAGCGATTCT
TAAATATCCAGAAATCGTAAAGATGACAACTTAAAAAA**CAAAAACTAGAATCAACAAA
AAATCTATGAAGACTCAAGTTTTAGTTTAGCCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGAATA
ACTCCTTCATACTTAACTTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTAGTCACTCTGTGTTGG
ATACCAACACGAGCCTTGCACCTGCGTCGACGAGCCACACGGTATCCTGGACGTTCAAGA
ACTACATAGAAGTCCATTCCGTAGATACCCGTAGAAGGATCATACTTGATACCAAGATCA
ATGTGCTCTTGGATACCGAATCCAAAGCAACCAGTGTCACTGAAGTTCCTCCTGAGAAGC
TCATACTCCTTAACTTTCAAACCACTCTCAAGAAGTTGCATTGCCTTGTCACCTCTCACA
GTAACATAGCAGGCGATCTTTTCGTTACGCCTGATACCAAAAGATCTCACAGTGTACCTT
GCCTTTGAGAAAACAGGGGTTTGTCCACTGAGCTGTTCCAAAACCTTGGAGGCACGAGTG
AGACGATCACCACTCTCACCAACGGAGATGTTAAGAACAAGTTTTTGGACCTTAATGTCC
CTCATGGGGTTCGACAGCTTCTTCTCCGACGCCATTTGAAGGAGATCAACAATCGAAGTA
ACAGAGAGTTGCGG
CC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2E116TF 749 0 0
TTTTTTTT
TGGAAATTTAATTTCTACCACACTGACGTCAAAA*GAGGTTT*ACTAGAACAAGCGATTC
TTAAATATCCAGAAATCGTAAAGATGACAACTTAAAAAA**CAAAAACTAGAATCAACAA
AAAATCTATGAAGACTCAAGTTTTAGTTTAGCCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGAAT
AACTCCTTCATACTTAACTTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTAGTCACCCTGTGTTG
GATACCAACACGAGCCTTGCACCTGCGTCGACGAGCCACACGGTATCCTGGACGTTCAAG
AACTACATAGAAGTCCATTCCGTAGATACCCGTAGAAGGATCATACTTGATGCCAAGATC
AATGTGCTCTTGGATACCGAATCCAAAGCAACCAGTGTCACTGAAGTTCCTCCTGAGAAG
CTCATACTCCTTAACTTTCAAACCACTCTCAAGAAGCTGCATTGCCTTGTCACCTCTCAC
AGTAACATAGCAGGCGATCTTTTCGTTACGCCTGATACCAAAAGATCTCACAGTGTACCT
TGCCTTTGAGAAAACAGGGGTTTGTCCACTGAGCTGTTCCAAAACCTTGGAGGCACGAGT
GAGACGATCACCACTCTCACCAACGGAGATGTTAAGAACAAGTTTTTGGACCTTAATGTC
CCTCATGGGGTTCGACAGCTTCTTCTCCGACGCCATTTGAAGGAGATCAACAATCGAAGT
AACAGAGAGTTGCGGAAACCC

QA 9 749 9 749
DS 



CO CL91Contig3 733 7 8 U
GGCTCCTCGACGCAGTCTTGTCTCCGCAACTCTCTTATAGCTCCTTGAAATGGCGTCAGA
GAAGAAGCTGTCGAACCCCATGAGGGACATTAAGGTCCAGAAGCTTGTTCTCAACATCTC
CGTTGGTGAAAGTGGTGATCGTCTCACCCGTGCCTCAAAGGTTTTGGAACAGCTCAGTGG
ACAAACCCCTGTTTTCTCAAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTTGGTATCAGGCGTAA
CGAAAAGATTGCGTGCTACGTCACTGTTAGAGGTGACAAGGCAATGCAGCTTCTCGAGAG
TGGCTTGAAAGTTAAGGAGTATGAGCTTCTTAGGAGGAACTTTAGTGACACTGGTTGCTT
TGGATTCGGTATCCAAGAGCACATTGATCTCGGAATCAAGTATGATCCATCTACTGGTAT
CTACGGAATGGATTTCTATGTTGTTCTTGAACGTCCAGGATACCGTGTGGCACGTAGACG
TAGATGCAAGGCCCGTGTTGGTATCCAACACAGAGTGACTAAGGATGATGCAATGAAATG
GTTCCAAGTCAAGTATGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTCACAGAACATCACCGGTTAAAA
AAAAAT*CTTGTTGATTTTAGCCTTGTTTCGTGGTCTTTTATCTTTT*ATGATTTCTGGA
TGTTAAAGAATTTCTTGTTGTAGTAAAACCTTTTTTTGACATGTGGTAGAATCTAAAATC
TTCCAAGAACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A227JQ C 26
AF RR2GN85TF U 1
AF RR2B565TF U 7
AF RR2CC27TF U 7
AF RR2CC27JQ C 7
AF RR2A227TF U 102
AF RR2GN85JQ C 181
BS 1 177 RR2GN85TF
BS 178 178 RR2B565TF
BS 179 605 RR2GN85TF
BS 606 687 RR2B565TF
BS 688 688 RR2A227TF
BS 689 713 RR2B565TF
BS 714 724 RR2A227TF
BS 725 733 RR2GN85JQ

RD RR2A227JQ 378 0 0
GCAACTCTCTTATAGCTCCTTGAAATGGCGTCAGAGAAGAAGCTGTCGAACCCCATGAGG
GACATTAAGGTCCAGAAGCTTGTTCTCAACATCTCCGTTGGTGAAAGTGGTGATCGTCTC
ACTCGTGCCTCAAAGGTTTTGGAACAGCTCAGTGGACAAACCCCTGTTTTCTCAAAGGCG
AGGTACACTGCGAGGTCTTTTGGTATCAGGCGTAACGAAAAGATTGCGTGCTACGTCACT
GTTAGAGGTGACAAGGCAATGCAGCTTCTCGAGAGTGGCTTGAAAGTTAAGGAGTATGAG
CTTCTTAGGAGGAACTTTAGTGACACTGGTTGCTTTGGATTCGGTATCCAAGAGCACATT
GTTCTCGGAATCAAGTAT

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR2GN85TF 605 0 0
GGCTCCTCGACGCAGTCTTGTCTCCGCAACTCTCTTATAGCTCCTTGAAATGGCGTCAGA
GAAGAAGCTGTCGAACCCCATGAGGGACATTAAGGTCCAGAAGCTTGTTCTCAACATCTC
CGTTGGTGAAAGTGGTGATCGTCTCACCCGTGCCTCAAAGGTTTTGGAACAGCTCAGCGG
ACAAACCCCTGTTTTCTCAAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTTGGTATCAGGCGTAA
CGAAAAGATTGCGTGCTACGTCACTGTTAGAGGTGACAAGGCAATGCAGCTTCTCGAGAG
TGGCTTGAAAGTTAAGGAGTATGAGCTTCTTAGGAGGAACTTTAGTGACACTGGTTGCTT
TGGATTCGGTATCCAAGAGCACATTGATCTCGGAATCAAGTATGATCCATCTACTGGTAT
CTACGGAATGGATTTCTATGTTGTTCTTGAACGTCCAGGATACCGTGTGGCACGTAGACG
TAGATGCAAGGCCCGTGTTGGTATCCAACACAGAGTGACTAAGGATGATGCAATGAAATG
GTTCCAAGTCAAGTATGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTCACAGAACATCACCGGTTAAAA
AAAAA

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2B565TF 707 0 0
GG
GACGCAGTCTTGTCTCCGCAACTCTCTTATAGCTCCTTGAAATGGCGTCAGAGAAGAAGC
TGTCGAACCCCATGAGGGACATTAAGGTCCAGAAGCTTGTTCTCAACATCTCCGTTGGTG
AAAGTGGTGATCGTCTCACCCGTGCCTCAAAGGTTTTGGAACAGCTCAGTGGACAAACTC
CTGTTTTCTCAAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTTGGTATCAGGCGTAACGAAAAGA
TTGCGTGCTACGTCACTGTTAGAGGTGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGCTTGA
AAGTTAAGGAGTATGAGCTTCTTAGGAGGAACTTTAGTGACACTGGTTGCTTTGGATTCG
GTATCCAAGAGCACATTGATCTCGGAATCAAGTATGATCCATCTACTGGTATCTACGGAA
TGGATTTCTATGTTGTTCTTGAACGTCCAGGATACCGTGTGGCACGTCGACGTAGATGCA
AGGCCCGTGTTGGTATCCAACACAGAGTGCCTAAGGATGATGCAATGAAATGGTTCCAAG
TCAAGTATGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTCACAGAACATCACCGGTTAAAAAAAAAT*C
TTGTTGATTTTAGCCTTGTTTCGTGGTCTTTTATCTTTT*ATGATTTCTGGATGTTAAAG
AATTTCTTGTTGTAGTAAAGCCTTTTTTTGACATGTGGTAGAATC

QA 3 707 3 707
DS 

RD RR2CC27TF 683 0 0
GG
GACGCAGTCTTGTCTCCGCAACTCTCTTATAGCTCCTTGAAATGGCGTCAGAGAAGAAGC
TGTCGAACCCCATGAGGGACATTAAGGTCCAGAAGCTTGTTCTCAACATCTCCGTTGGTG
AAAGTGGTGATCGTCTCACCCGTGCCTCAAAGGTTTTGGAACAGCTCAGTGGACAAACTC
CTGTTTTCTCAAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTTGGTATCAGGCGTAACGAAAAGA
TTGCGTGCTACGTCACTGTTAGAGGTGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGCTTGA
GAGTTAAGGAGTATGAGCTTCTTAGGAGGAACTTTAGTGACACTGGTTGCTTTGGATTCG
GTATCCAAGAGCACATTGATCTCGGAATCAAGTATGATCCATCTACTGGTATCTACGGAA
TGGATTTCTATGTTGTTCTTGAACGTCCAGGATACCGTGTGGCACGTCGACGTAGATGCA
AGGCCCGTGTTGGTATCCAACACAGAGTGACTAAGGATGATGCAATGAAATGGTTCCAAG
TCAAGTATGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTCACAGAACATCACCGGTTAAAAAAAAT**C
TTGTTGATTTTAGCCTTGTTTCGTAGTCTTTTATCTTTTTATGATTTCTGGATGTTAA*G
AATTTCTTGTTGTAGTAAAAC

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2CC27JQ 725 0 0
GG
GACGCAGTCTTGTCTCCGCAACTCTCTTATAGCTCCTTGAAATGGCGTCAGAGAAGAAGC
TGTCGAACCCCATGAGGGACATTAAGGTCCAGAAGCTTGTTCTCAACATCTCCGTTGGTG
AAAGTGGTGATCGTCTCACCCGTGCCTCAAAGGTTTTGGAACAGCTCAGTGGACAAACTC
CTGTTTTCTCAAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTTGGTATCAGGCGTAACGAAAAGA
TTGCGTGCTACGTCACTGTTAGAGGTGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGCTTGA
GAGTTAAGGAGTATGAGCTTCTTAGGAGGAACTTTAGTGACACTGGTTGCTTTGGATTCG
GTATCCAAGAGCACATTGATCTCGGAATCAAGTATGATCCATCTACTGGTATCTACGGAA
TGGATTTCTATGTTGTTCTTGAACGTCCAGGATACCGTGTGGCACGTCGACGTAGATGCA
AGGCCCGTGTTGGTATCCAACACAGAGTGACTAAGGATGATGCAATGAAATGGTTCCAAG
TCAAGTATGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTCACAGAACATCACCGGTTAAAAAAAAAT*C
TTGTTGATTTTAGCCTTGTTTCGTAGTCTTTTATCTTTTTATGATTTCTGGATGTTAAAG
AATTTCTTGTTGTAGTAAAACCTTTTTTTGACATGTGGTAGAATCTAAAATCTTCC
AAGAACT

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR2A227TF 623 0 0
AGCTTGTTCTCAACATCTCCGTTGGTGAAAGTGGTGAACGTCTCACTCGTGCCTCAAAGG
TTTTGGAACAGCTCAGTGGACAAACCCCTGTTTTCTCAAAGGCGAGGTACACTGCGAGGT
CTTTTGGTATCAGGCGTAACGAAAAGATTGCGTGCTACGTCACTGTTAGAGGTGACAAGG
CAATGCAGCTTCTCGAGAGTGGCTTGAAAGTTAAGGAGTATGAGCTTCTTAGGAGGAACT
TTAGTGACACTGGTTGCTTTGGATTCGGTATCCAAGAGCACATTGATCTCGGAATCAAGT
ATGATCCATCTACTGGTATCTACGGAATGGATTTCTATGTTGTTCTTGAACGTCCAGGAT
ACCGTGTGGCACGTAGACGTGGATGCAAGGCCCGTGTTGGTATCCAACACAGAGTGACTA
AGGATGATGCAATGAAAT**TTCCAAGTCAAGTATGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTCAC
AGAACATCACCGGTTAAAAAAAAATTCTTGTTGATTTTAGCTTTGTTTCGTGTTCTTTTA
TCTTTT*ATGATTTCTGGATGTTAAAGAATTTCTTGTTGTAGTAAAACCTTTTTTTGACA
TGTGGTAGAATCTAAAATCTTCC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2GN85JQ 553 0 0
ACAAACCCCTGTTTTCTCAAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTTGGTATCAGGCGTAA
CGAAAAGATTGCGTGCTACGTCACTGTTAGAGGTGACAAGGCAATGCAGCTTCTCGAGAG
TGGCTTGAAAGTTAAGGAGTATGAGCTTCTTAGGAGGAACTTTAGTGACACTGGTTGCTT
TGGATTCGGTATCCAAGAGCACATTGATCTCGGAATCAAGTATGATCCATCTACTGGTAT
CTACGGAATGGATTTCTATGTTGTTCTTGAACGTCCAGGATACCGTGTGGCACGTAGACG
TAGATGCAAGGCCCGTGTTGGTATCCAACACAGAGTGACTAAGGATGATGCAATGAAATG
GTTCCAAGTCAAGTATGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTCACAGAACATCACCGGTTAAAA
AAAAATTCTTGTTGATTTTAGCTTTGTTTCGTGTTCTTTTATCTTTT*ATGATTTCTGGA
TGTTAAAGAATTTCTTGTTGTAGTAAAACCTTTTTTTGACATGTGGTAGAATCTAAAATC
TTCCAAGAACTTT

QA 1 553 1 553
DS 



AS 3 20

CO CL92Contig1 840 7 11 U
GGGTCTCGATCAAAACACACTCAGTTCAGAAAATGTGGAGCGTCACCGGAGCTTTGGGCG
TGGCGGTGCCAACCGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGTTACTCTTCTCCTCTACTCTTC
TTCCCAAGCAGACAAATAAGCTCCATCTCTCTCCTCAGCAGCAGCAGCCTCTGTCTCTAT
CCTCACATTTCTCCTCCTCCTCTTTCATAACAGCTGCCACCTCCGTTGAACAACAGTCTG
ATAATAAGGGAGAGAGCAGCAGCAAGTACTACTTCCTGGTTGCGAACGCAAAGTTCATGC
TTGACGAAGAGGAACACTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGA
ATGAAAAGGAGCTAGACTTCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCA
ACATCACTCAAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGA
TCACGTTCATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTC
TTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTACTACTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGG
TGGCGCCCTACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAAC
AAGAATCTCTAGCATAGTAGTACTCTTTTTTTTTGTCATTGTTTGTCCGAATCCAACAGC
CTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTTGTATTACTGAGCTTCTTGTATTTCCTGTGTAC
TTGCAACTCAGTTGAGTCTAGTGACCAGAATCGATCAAAATCTGTTTCTACTTGGCAAAG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP19TF U 1
AF RR2BI96TF U -9
AF RR2E004TF U 1
AF RR2CP19JQ C 93
AF RR2BI96JQ C 163
AF RR2D584TF U 305
AF RR2E004JQ C 440
BS 1 658 RR2CP19TF
BS 659 659 RR2E004TF
BS 660 670 RR2CP19TF
BS 671 671 RR2E004TF
BS 672 692 RR2CP19TF
BS 693 693 RR2E004TF
BS 694 694 RR2BI96TF
BS 695 735 RR2E004TF
BS 736 813 RR2D584TF
BS 814 814 RR2CP19JQ
BS 815 840 RR2D584TF

RD RR2CP19TF 693 0 0
GGGTCTCGATCAAAACACACTCAGTTCAGAAAATGTGGAGCGTCACCGGAGCTTTGGGCG
TGGCGGTGCCAACCGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGTTACTCTTCTCCTCTACTCTTC
TTCCCAAGCAGACAAATAAGCTCCATCTCTCTCCTCAGCAGCAGCAGCCTCTGTCTCTAT
CCTCACATTTCTCCTCCTCCTCTTTCATAACAGCTGCCACCTCCGTTGAACAACAGTCTG
ATAATAAGGGAGAGAGCAGCAGCAAGTACTACTTCCTGGTTGCGAACGCAAAGTTCATGC
TTGACGAAGAGGAACACTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGA
ATGAAAAGGAGCTAGACTTCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCA
ACATCACTCAAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGA
TCACGTTCATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTC
TTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTACTACTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGG
TGGCGCCCTACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAA*C
AAGAATCTCTGGCATAGTAGTACTCTTTTTTT
G

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2BI96TF 719 0 0
CCAGATTCCTCTGCCTC
GATCAAAACACACTCATTTCAGAAAATGTGGAGCGTCACCGGAGCTTTGGGCGTGGCGGT
GCCAACCGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGTTACTCTTCTCCTCTACTCTTCTTCCCAA
GCAGACAAATAAGCTCCATCTCTCTCCTCAGCAGCAGCAGCCTCTGTCTCTATCCTCACA
TTTCTCCTCCTCCTCTTTCATAACAGCTGCCACCTCCGTTGAACAACAGTCTGATAATAA
GGGAGAGAGCAGCAGCAAGTACTACTTCCTGGTTGCGAACGCAAAGTTCATGCTTGACGA
AGAGGAACACTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAA
GGAGCTAGACTTCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAACATCAC
TCAAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTCGATCACGTT
CATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGA
AGCCTTGGCCTTCACTCCTACTACTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCC
CTACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATC
TCTAGCATAGTAGTACTCTTTTTTTTTGTCATTGTTTGTCCG

QA 18 719 18 719
DS 

RD RR2E004TF 735 0 0
GAGC
CTCGATCAAAACACACTCAGTTCAGAAAATGTGGAGCGTCACCGGAGCTTTGGGCGTGGC
GGTGCCAACCGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGTTACTCTTCTCCTCTACTCTTCTTCC
CAAGCAGACAAATAAGCTCCATCTCTCTCCTCAGCAGCAGCAGCCTCTGTCTCTATCCTC
ACATTTCTCCTCCTCCTCTTTCATAACAGCTGCCACCTCCGTTGAACAACAGTCTGATAA
TAAGGGAGAGAGCAGCAGCAAGTACTACTTCCTGGTTGCGAACGCAAAGTTCATGCTTGA
CGAAGAGGAACACTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGA
AAAGGAGCTAGACTTCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAACAT
CACTCAAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCAC
GTTCATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGA
TGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTACTACTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGC
GCCCTACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGA
ATCTCTAGCATAGTAGTACTCTTTTTTTT*GTCATTGTTTGTCCGAATCCAACAGCCTTT
GTCTTAGAGTG

QA 5 735 5 735
DS 

RD RR2CP19JQ 744 0 0
AAACCGTTACTCTTCTCCTCTACTCTTCTTCCCAAGCAGACAAATAAGCTCCATCTCTCT
CCTCAGCAGCAGCAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATTTCTCCTCCTCCTCTTTCATAACA
GCTGCCACCTCCGTTGAACAACAGTCTGATAATAAGGGAGAGAGCAGCAGCAAGTACTAC
TTCCTGGTTGCGAACGCAAAGTTCATGCTTGACGAAGAGGAACACTTTCAGGAGCAATTG
TTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAGACTTCTGGCTCGTCATC
GAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAACATCACTCAAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTC
GCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTT
CTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTACTACT
TTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCCTACCCCAAGTATGAACCGGGATGG
TGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATTTCTGGCATAGTAGTACTCTTTTTTT
T*GTCATTGTTTGTCCGAATCCAACAGCCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTTGTAT
TACTGAGCTTCTTGTATTTCCTGTGTACTTGCAACTCAGTTGAGTCTAGTGACCAGAATC
GATCAAAATCTGTTTC
TACTTGGC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2BI96JQ 654 0 0
AGCAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATTTCTCCTCCTCCTCTTTCATAACAGCTGCCACCT
CCGTTGAACAACAGTCTGATAATAAGGGAGAGAGCAGCAGCAAGTACTACTTCCTGGTTG
CGAACGCAAAGTTCATGCTTGACGAAGAGGAACACTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTC
TTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAGACTTTTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGT
TCCTCGACAAGTTCCCCAACATCACTCAAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCT
CCACCAATGGTCCCTCGATCACGTTCATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATT
CCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTACTACTTTAGAGTTCG
ACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCCTACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCT
TCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATCTCTAGCATAGTAGTACTCTTTTTTTTTGTCATTGT
TTGTCCGAATCCAACAGCCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTTGTATTACTGAGCTT
CTTGTATTTCCTGTGTACTTGCAACTCAGTTGAGTCTAGTGACCAGAATCG
ATC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2D584TF 536 0 0
CGAAGAGGAATACTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGA
AAAGGAGCTAGACTTCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAACAT
CACTCAAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCAC
GTTCATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGA
TGAAGTCTTGGCCTTCACTCCTACTACTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGC
GCCCTACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGA
ATCTCTAGCATAGTAGTACTCTTTTTTTTTGTCATTGTTTGTCCGAATCCAACAGCCTTT
GTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTTGTATTACTGAGCTTCTTGTATTTCCTGTGTACTTGC
AACTCAGTTGAGTCTAGTGACCAGAATCGCTCAAAATCTGTTTCTACTTGGCAAAG

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2E004JQ 390 0 0
TCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAAG
GTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTT
CACTCCTACTACTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCCTACCCCAAGTA
TGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATCTCTAGCATAGTA
GTACTCTTTTTTTTTGTCATTGTTTGTCCGAATCCAACAGCCTTTGTCTTAGAGTGCTTT
TCTTGTTTTGTATTACTGAGCTTCTTGTATTTCCTGTGTACTTGCAACTCAGTTGAGCCT
AGTGACCAGAATCGATCAAAATCTGTTTC
C

QA 1 389 1 389
DS 



CO CL92Contig2 984 3 7 U
TTTTTCCAGGTTTCTCTGCCTCGATCAAAACACACTCAGTTCAGAAAATGTGGAGCGTCA
CCGGAGCATTTGGCGTGGTAACGGTGCCAACGGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGTTAC
TCGTCTCCTCTACTCCTCTTCCCAAGCAGACAAATAAGCTCCATCTCTCTCCTCAGCAGC
AGCAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATTTCTCCTCCTCCTCTTTCATAACCGCTGCCACCT
CCGTTGAACAACAGTCTGATAATAAGGGAGAGAGCAGTAAGTACTACTTCCTGGTAGCGA
ACGCCAAGTTCATGCTTGACGAAGAGGAACACTTCCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTC
GTTACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAGACTTCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCC
TCGACAAGTTCCCCAAGATCACTCAGAGGCTCCGTCGTCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCA
CCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCT
TTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTACTACTTTAGAGTTCGACA
AGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCGTACCCCAAGTACGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCT
TGCCCAAAGCAAAACAAGAATCTGTAGCATAGTAGTACTTTTTTGTCATTGTCCGGATCC
AACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTTGTATTACTGAGCTTCTTGTTTTTCCTG
TGTACTACAATTATGTTGCAACTCAGTTGAGTCTAGTGACCAGAATCGATCAAAATCTGT
TTTTACTTGGCAAAAGTGCACATGTTTTTGATCAATCAAGAGTTCTGATTTCTTCCTCTT
GATCAGAGTTTTTGTATCAGTGCTGTGTGTGTCCCATCAATTTTAATCATTTATTTGTGG
GTGGAAATTATACTTTAGCTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB68TF U 1
AF RR2FP63TF U 21
AF RR2FP63JQ C 397
BS 1 325 RR2GB68TF
BS 326 326 RR2FP63TF
BS 327 373 RR2GB68TF
BS 374 374 RR2FP63TF
BS 375 634 RR2GB68TF
BS 635 752 RR2FP63TF
BS 753 984 RR2FP63JQ

RD RR2GB68TF 634 0 0
TTTTTCCAGGTTTCTCTGCCTCGATCAAAACACACTCAGTTCAGAAAATGTGGAGCGTCA
CCGGAGCATTTGGCGTGGTAACGGTGCCAACGGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGTTAC
TCGTCTCCTCTACTCCTCTTCCCAAGCAGACAAATAAGCTCCATCTCTCTCCTCAGCAGC
AGCAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATTTCTCCTCCTCCTCTTTCATAACCGCTGCCACCT
CCGTTGAACAACAGTCTGATAATAAGGGAGAGAGCAGTAAGTACTACTTCCTGGTAGCGA
ACGCCAAGTTCATGCTTGACGAAGATGAACACTTCCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTC
GTTACTACGGAGATAATGAAAAGGAGCTAGACTTCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCC
TCGACAAGTTCCCCAAGATCACTCAGAGGCTCCGTCGTCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCA
CCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCT
TTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTACTACTTTAGAGTTCGACA
AGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCGTACCCCAAGTA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2FP63TF 748 0 0
GG
GATCAAAACACACTCAGTTCAGAAAATGTGGAGCGTCACCGGAGCATTTGGCGTGGTAAC
GGTGCCAACGGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGTTACTCGTCTCCTCTACTCTTCTTCC
CAAGCAGACAAATAAGCTCCATCTCTCTCCTCAGCAGCAGCAGCCTCTGTCTCTATCCTC
ACATTTCTCCTCCTCCTCTTTCATAACCGCTGCCACCTCCGTTGAACAACAGTCTGATAA
TAAGGGAGAGAGCAGTAAGTACTACTTCCTGGTAGCGAACGCCAAGTTCATGCTTGACGA
AGAGGAACACTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAA
GGAGCTAGACTTCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAAGATCAC
TCAGAGGCTCCGTCGTCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTT
CATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGA
AGCCTTGGCCTTCACTCCTACTACTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCC
GTACCCCAAGTACGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATC
TGTAGCATAGTAGTACTTTTTTGTCATTGTCCGGATCCAACAGCTTTGTCTTAGAGTGCT
TTTCTTGTTT
GTATACTGAGCTTCTT

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR2FP63JQ 588 0 0
GGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAAGATCACTCAGAGGCTCCGTC
GTCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAAGGT
TGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTCA
CTCCTACTACTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCGTACCCCAAGTACG
AACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATCTGTAGCATAGTAGT
ACTTTTTTGTCATTGTCCGGATCCAACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTTGTA
TTACTGAGCTTCTTGTTTTTCCTGTGTACTACAATTATGTTGCAACTCAGTTGAGTCTAG
TGACCAGAATCGATCAAAATCTGTTTTTACTTGGCAAAAGTGCACATGTTTTTGATCAAT
CAAGAGTTCTGATTTCTTCCTCTTGATCAGAGTTTTTGTATCAGTGCTGTGTGTGTCCCA
TCAATTTTAATCATTTATTTGTGGGTGGAAATTATACTTTAGCTACTC

QA 1 588 1 588
DS 



CO CL92Contig3 922 10 12 U
TTTTTTCAGATTCCTCCGAGTCTATTTGTTGCATACAAGCTGCTTTGGTCTCACTCCTAG
ATCAAAACACACTAAGTTCAGAAAATGTGGAGCGTCACCGGAGCATTGGGCGTGGCGGTG
CCAACCGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGTTACTCGTCTCCTCTACTCTTCTTCCCAAG
CAGACGAATAAGCTCCATCTCTCTCCGCAGCAGCAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATCTC
TCCTCTTTCATAACCGCTGCCACCTCCGTTGAACAACAGTCTGATAATAAGGGAGAGAGC
AGTAAGTACTACTTCCTGGTTGCGAACGCCAAGTTCATGCTTGACGAAGAGGAACACTTT
CAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAGACTTC
TGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAACATCACTCAAAGGCTCCGT
CGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAAGG
TTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTC
ACTCCTACTTCTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCGTACCCCAAGTAT
GAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATCTCTAGCATAGTAG
TACTTTTTTTT*GTCATTGTTGTCCGAATCCAACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCTTG
TTTTGTATTACTGAGCTTCTTGTATTTCCTGTGTACTACAAAATATGTTGCAACTCAGTT
GTGACCAGAATCGATCAAAATCTGTTTCTACTTGGCAAAGTGCACATGTTTTTGATTAAT
CAAGAGTTGTGATTTCTTCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 55 55 55 55 
55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 45 60 45 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 10 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2GI25TF U 1
AF RR2GU92TF U 16
AF RR2H393TF U 26
AF RR2C595TF U 56
AF RR2A093TF U 56
AF RR2B763TF U 57
AF RR2H393JQ C 188
AF RR2GU92JQB C 542
AF RR2D413JQ C 355
AF RR2D413TF U 355
BS 1 611 RR2GI25TF
BS 612 698 RR2GU92TF
BS 699 699 RR2A093TF
BS 700 729 RR2H393TF
BS 730 731 RR2A093TF
BS 732 747 RR2H393TF
BS 748 748 RR2A093TF
BS 749 775 RR2H393TF
BS 776 848 RR2A093TF
BS 849 850 RR2B763TF
BS 851 920 RR2D413TF
BS 921 922 RR2D413JQ

RD RR2GI25TF 611 0 0
TTTTTTCAGATTCCTCCGAGTCTATTTGTTGCATACAAGCTGCTTTGGTCTCACTCCTAG
ATCAAAACACACTAAGTTCAGAAAATGTGGAGCGTCACCGGAGCATTGGGCGTGGCGGTG
CCAACCGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGTTACTCGTCTCCTCTACTCTTCTTCCCAAG
CAGACGAATAAGCTCCATCTCTCTCCGCAGCAGCAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATCTC
TCCTCTTTCATAACCGCTGCCACCTCCGTTGAACAACAGTCTGATAATAAGGGAGAGAGC
AGTAAGTACTACTTCCTGGTTGCGAACGCCAAGTTCATGCTTGACGAAGAGGAACACTTT
CAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAGACTTC
TGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAACATCACTCAAAGGCTCCGT
CGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAAGG
TTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTC
ACTCCTACTTC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2GU92TF 683 0 0
GG
GAGTCTATTTGTTGCATACAAGCTGCTTTGGTCTCACTCCTAGATCAAAACACACTAAGT
TCAGAAAATGTGGAGCGTCACCGGAGCATTGGGCGTGGCGGTGCCAACCGCCGCCGCTTG
CCGTACGAAACCGTTACTCGTCTCCTCTACTCTTCTTCCCAAGCAGACGAATAAGCTCCA
TCTCTCTCCGCAGCAGCAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATCTCTCCTCTTTCATAACCGC
TGCCACCTCCGTTGAACAACAGTCTGATAATAAGGGAGAGAGCAGTAAGTACTACTTCCT
GGTTGCGAACGCCAAGTTCATGCTTGACGAAGAGGAACACTTTCAGGAGCAATTGTTCGA
GCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAGACTTCTGGCTCGTCATCGAGCC
TAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAACATCACTCAAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCT
TGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGC
TGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTACTTCTTTAGA
GTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCGTACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGA
AACCTTCTTGCCCAAAGCAAA

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2H393TF 756 0 0
GG
GTTGCATACAAGCTGCTTTGGTCTCACTCCTAGATCAAAACACACTAAGTTCAGAAAATG
TGGAGCGTCACCGGAGCATTGGGCGTGGCGGTGCCAACCGCCGCCGCTTGCCGTACGAAA
CCGTTACTCGTCTCCTCTACTCTTCTTCCCAAGCAGACGAATAAGCTCCATCTCTCTCCG
CAGCAGCAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATCTCTCCTCTTTCATAACCGCTGCCACCTCC
GTTGAACAACAGTCTGATAATAAGGGAGAGAGCAGTAAGTACTACTTCCTGGTTGCGAAC
GCCAAGTTCATGCTTGACGAAGAGGAACACTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGT
TACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAGACTTCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTC
GACAAGTTCCCCAACATCACTCAAAGGCTCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACC
AATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTT
GAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTACTTCTTTAGAGTTCGACAAG
CCTAAGAATTGGGTGGCGCCGTACCCCAAGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTG
CCCAAAGCAAA*CAAGAATCTCTAGCATAGTAGTACTTTTTT***GTCATTGTTGTCCGA
*TCCAACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTT
CTTGTT

QA 3 750 3 750
DS 

RD RR2C595TF 780 0 0
GGG
AGATCAAAACACACTAAGTTCAGAAAATGTGGAGCGTCACCGGAGCATTGGGCGTGGCGG
TGCCAACCGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGTTACTCGTCTCCTCTACTCTTCTTCCCA
AGCAGACGAATAAGCTCCATCTCTCTCCGCAGCAGCAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATC
TCTCCTCTTTCATAACCGCTGCCACCTCCGTTGAACAACAGTCTGATAATAAGGGAGAGA
GCAGTAAGTACTACTTCCTGGTTGCGAACGCCAAGTTCATGCTTGACGAAGAGGAACACT
TTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAGACT
TCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAACATCACTCAAAGGCTCC
GTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAA
GGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCT
TCACTCCTACTACTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCGTACCCCAAGT
ATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATCTCTAGCATAGT
AGTACTTTTTTT**GTCATTGTTGTCCGAATCCAACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCT
TGTTTTGTAT*ACTGAGCTTCTTGTATTTCCTGTGTACTACAAA*TATGTTGCAACT

QA 4 780 4 780
DS 

RD RR2A093TF 793 0 0
G
CTAGATCAAAAGACACTAAGTTCAGAAAATGTGGAGCGTCACCGGAGCATTGGGCGTGGC
GGTGCCAACCGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGTTACTCGTCTCCTCTACTCTTCTTCC
CAAGCAGACGAATAAGCTCCATCTCTCTCCGCAGCAGCAGCCTCTGTCTCTATCCTCACA
TCTCTCCTCTTTCATAACCGCTGCCACCTCCGTTGAACAACAGTCTGATAATAAGGGAGA
GAGCAGTAAGTACTACTTCCTGGTTGCGAACGCCAAGTTCATGCTTGACGAAGAGGAACG
CTTTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAGA
CTTCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAACATCACTCAAAGGCT
CCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTT
AAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGC
CTTCACTCCTACTTCTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCGTACCCCAA
GTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATCTCTAGCATA
GTAGTACTTTTTTTT*GTCATTGTTGTCCGAATCCAACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTT
CTTGTTTTGTATTACTGAGCTTCTTGTATTTCCTGTGTACTACAAAATATGTTGCAACTC
AGTTGTGACCAG

QA 2 793 2 793
DS 

RD RR2B763TF 794 0 0
GG
AGATCAAAACACACTAAGTTCAGAAAATGTGGAGCGTCACCGGAGCATTGGGCGTGGCGG
TGCCAACCGCCGCCGCTTGCCGTACGAAACCGTTACTCGTCTCCTCTACTCTTCTTCCCA
AGCAGACGAATAAGCTCCATCTCTCTCAGCAGCAGCAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATC
TCTCCTCTTTCATAACCGCTGCCACCTCCGTTGAACAACAGTCTGATAATAAGGGAGAAA
GCAGTAAGTACTACTTCCTGGTTGCGAACGCCAAGTTCATGCTTGACGAAGAGGAACACT
TTCAGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAGACT
TCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAACATCACTCAAAGGCTCC
GTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAA
GGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCT
TCACTCCTATTTCTTTAGAGTTCGACAAGCCTAGGAATTGGGTGGCGCTGTACCCCAAGT
ATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGTCCAAAGCAAAACAAGAATCTCTAGCATAGT
AGTACTTTTTTTTTGTCATTGTTGTCCGAATCCAACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCT
TGTTTTGTATTACTGAGCTTCTTGTATTTCCTGTGTACTACAAAATATGTTGCAACTCAG
TTGTGACCAGAA

QA 3 794 3 794
DS 

RD RR2H393JQ 689 0 0
ATAAGCTCCATCTCTCTCCGCAGCAGCAGCCTCTGTCTCTATCCTCACATCTCTCCTCTT
TCATAACCGCTGCCACCTCCGTTGAACAACAGTCTGATAATAAGGGAGAGAGCAGTAAGT
ACTACTTCCTGGTTGCGAACGCCAAGTTCATGCTTGACGAAGAGGAACACTTTCAGGAGC
AATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAGACTTCTGGCTCG
TCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAACATCACTCAAAGGCTCCGTCGCCCTG
CCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGTTAAGGTTGGATC
GAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTCACTCCTA
CTTCTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCGTACCCCAAGTATGAACCGG
GATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATCTCTAGCATAGTAGTACTTTT
TTT**GTCATTGTTGTCCGAATCCAACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGTTTTGTA
TTACTGAGCTTCTTGTATTTCCTGTGTACTACAAAATATGTTGCAACTCAGTTGTGACCA
GAATCGATCAAAATCTGTTTCTACTTGG
T

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2GU92JQB 352 0 0
TGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGGCCTTCA
CTCCTACTTCTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCGTACCCCAAGTATG
AACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATCTCTAGCATAGTAGT
ACTTTTTTTT*GTCATTGTTGTCCGAATCCAACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTTTCTTGT
TTTGTATTACTGAGCTTCTTGTATTTCCTGTGTACTACAAAATATGTTGCAACTCAGTTG
TGACCAGAATCGATCAAAATCTGTTTTTACTTGGCAAAGTGCACATGTTTTT

QA 1 352 1 352
DS 

RD RR2D413JQ 568 0 0
A
ACTTTCGGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAG
ACTTCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAACATCACTCAAAGGC
TCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGT
TAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGG
CCTTCACTCCTACTTCTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCGTACCCCA
AGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATCTCTAGCAT
AGTAGTACTTTTTTTT*GTCATTGTCGTCCGAATCCAACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTT
TCTTGTTTTGTATTACTGAGCTTCTTGTATTTCCTGTGTACTACAAAATATGTTGCAACT
CAGTTGTGACCAGAATCGATCAAAATCTGTTTCTACTTGGCAAAGTGCACATGTTTTTGA
TTAATCAAGAGTTGTGATTTCTTCCCG

QA 2 568 2 568
DS 

RD RR2D413TF 568 0 0
A
ACTTTCGGGAGCAATTGTTCGAGCGTCTTCGTTACTACGGAGAGAATGAAAAGGAGCTAG
ACTTCTGGCTCGTCATCGAGCCTAAGTTCCTCGACAAGTTCCCCAACATCACTCAAAGGC
TCCGTCGCCCTGCCGTCGCTCTTGTCTCCACCAATGGTCCCTGGATCACGTTCATGAAGT
TAAGGTTGGATCGAGTTCTAGCTGATTCCTTTGAAGCTACCTCTCTTGATGAAGCCTTGG
CCTTCACTCCTACTTCTTTAGAGTTCGACAAGCCTAAGAATTGGGTGGCGCCGTACCCCA
AGTATGAACCGGGATGGTGGGAAACCTTCTTGCCCAAAGCAAAACAAGAATCTCTAGCAT
AGTAGTACTTTTTTTT*GTCATTGTCGTCCGAATCCAACAGCTTTGTCTTAGAGTGCTTT
TCTTGTTTTGTATTACTGAGCTTCTTGTATTTCCTGTGTACTACAAAATATGTTGCAACT
CAGTTGTGACCAGAATCGATCAAAATCTGTTTCTACTTGGCAAAGTGCACATGTTTTTGA
TTAATCAAGAGTTGTGATTTCTTCC
CG

QA 2 566 2 566
DS 



AS 3 20

CO CL93Contig1 1061 9 6 U
GCTTAAAAACCAAGATAGTTTCATTTCAATTGATAACAAAGTACACAACAAAACACGAAG
AACATAAATGAAGATTACATCACAAGCATTGACAACTTCATCTTATTACAAACTCATTAC
ACGCCTCTCTTTATTCATAGAGTTTGTTTGATCCATGACAAAACAAGTTATAGATCATTA
AACAGAGACGATGTTGGTCACAGAGACCTTAACCATTTCAGCTTCAAAGATAATAGCATC
ATTCACCAAATACCCTTTGGATGCATCGTTTAAATCTGCTAACAATATGATATTGTTTAC
TCCCACACCATAATCGCTTCGAATAGGGTACCAAGCTGCAGAATATATTTGTCTATGGTT
GGTGCTTCGCTGATTCTTTAACCGCAGATTAACCGCTCCCCAAGTGTTTGTAGCGACTGC
GTTTGGTCCATGGCCTTGAGCAAATAAGAAGATTGGAAGTGCATATGGTCTTCCTCCTCC
GTCTCCTTTCGGATTAAACCCTAATCTCCAGTATCTGTCTCCAACGAGAAAATCGGCAGA
ATAGTAGAATTTATCTTCCAAGTTGGAGAAATGAAGTATCTTCCAAGTAAACACATTGTC
TGGAGGGTTTGATATGAATGTGACTTTCTCTTGTACCAGGGCCGGTTTAACGATGAGAAT
TTCTGCACCGAAAGAACAAGTGTCTTGCACAATGTATCCTTCGTTGGTGTTCTCGAATGT
TGAAAGAGCAATCAATTGTCCGAATCCCCACTCTTTTTTCCCAGCGTTGTATCCCTTCAC
CGCTCCATCTGTGACGATCAAGTACTTGTTCAGCTTTGGATTGTGGACAAAGAGTTTGAG
ATCAACATTGACTTCCCAGCCACTGGGAAGAGATTCAGTCTCTTCGATTCTCGCGTAACC
AGCAGCTTCGAAAACAGAGGACTCGTAGGGCTCGCCTCTTCCCTTAATCACGTACAAGAT
TAATCTCCATTCGTAACCAGCAGAAGAGCAAGTGATGAATAGAAAAGCTAGAGAAATGAA
AGCTAAGCTCTTTTGTTGACTACCCATTTTCTGTGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 15 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H767JQB U 14
AF RR2BT47JQ U 14
AF RR2FZ93JQ U 14
AF RR2C369JQ U 8
AF RR2FK22JQ U 14
AF RR2E884JQ U 14
AF RR2BE94JQ U 14
AF RR2B947JQ U 1
AF RR2E884TF C 440
BS 1 124 RR2B947JQ
BS 125 125 RR2BT47JQ
BS 126 250 RR2B947JQ
BS 251 251 RR2BT47JQ
BS 252 843 RR2B947JQ
BS 844 1061 RR2E884TF

RD RR2H767JQB 170 0 0
GATAGTTTCATTTCAATTGATAACAAAGTACACAACAAAACACGAAAAACATAAATGAAG
ATTACATCACAAGCATTGACAACTTCATCTTATTACAAACTCATTACACGCTTCTCTTTA
TTCATAAAGTTTGTTTGATCCATGACAAAACAAGTTATAGATCATTAAAC

QA 1 170 1 170
DS 

RD RR2BT47JQ 528 0 0
GATAGTTTCATTTCAATTGATAACAAAGTACACAACAACGCACGAAGAACATAAATGAAG
ATTACATCACAAGCATTGACAACTTCATCTTATTACAAACTCATTACACGCCTCTCTTTA
TTCATAGAGTTTGTTTGATCCATGACAAAACAAGTTATAGATCATTAAACAGAGACGATG
TTGGTCACAGAGACCTTAACCATTTCAGCTTCAAAGATAATAGCATCATTCACCAAATAC
CCTTTGGATGCATCGTTTAAATCTGCTAACAATATGATATTGTTTACTCCCACACCATAA
TCGCTTCGAATAGGGTACCAAGCTGCAAAATATATTTGTCTATGGTTGGTGCTTCGCTGA
TTCTTTAACCGCAAATTAACCGCTCCCCAAGTGTTTGTAGCGACTGCGTTTGGTCCATGG
CCTTGAGCAAATAAAAAGATTGGAAGTGCATATGGTCTTCCTCCTCCGTCTCCTTTCGGA
TTAAACCCTAATCTCCAGTATCTGTCTCCAACGAGAAAATCGGCAGAA

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2FZ93JQ 615 0 0
GATAGTTTCATTTCAATTGATAACAAAGTACACAACAAAACACGAAGAACATAAATGAAG
ATTACATCACAAGCATTGACAACTTCATCTTATTACAAACTCATTACACGCCTCTCTTTA
TTCATAGAGTTTGTTTGATCCATGACAGAACAAGTTATAGATCATTAAACAGAGACGATG
TTGGTCACAGAGACCTTAACCATTTCAGCTTCAAAGATAATAGCATCATTCACCAAATAC
CCTTTGGATGCATCGTTTAAATCTGCTAACAATATGATATTGTTTACCCCCACACCATAA
TCGCTTAGAATAGGGTACCAAGCTGCAGAATATATTTGTCTATGGTTGGTGCTTCCCTGA
TTCTTTAACCGCAGATTAACCGCTCCCCAAGTGTTTGTAGCGACTGCGTTTGGTCCATGG
CCTTGAGCAAATAAGAAGATTGGAAGTGCATATGGTCTTCCTCCTCCGTCTCCTTTCGGA
TTAAACCCTAATCTCCAGTATCTGTCTCCAACGAGAAAATCGGCAGAATAGTAGAATTTA
TCTTCCAAGTTGGAGAAATGAAGTATCTTCCAAGTAAACACATTGTCTGGAGGGTTTGAT
ATGAATGTGACTTTC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2C369JQ 746 0 0
GACCAA
GATAGTTTCATTTCAATTGATAACAAAGTACACAACAAAACACGAAGAACATAAATGAAG
ATTACATCACAAGCATTGACAACTTCATCTTATTACAAACTCATTACACGCCTCTCTTTA
TTCATAGAGTTTGTTTGATCCATGACAAAACAAGTTATAGATCATTAAACAGAGACGATG
TTGGTCACAGAGACCTTAACCATTTCAGCTTAAAAGATAATAGCATCATTCACCAAATAC
CCTTTGGATGCATCGTTTAAATCTGCTAACAATATGATATTGTTTACCCCCACACCATAA
TCGCTTCGAATAGGGTACCAAGCTGCAGAATATATTTGTCTATGGTTGGTGCTTCGCTGA
TTCTTTAACCGCAGATTAACCGCTCCCCAAGTGTTTGTAGCGACTGCGTTTGGTCCATGG
CCTTGAGCAAATAAGAAGATTGGAAGTGCATATGGTCTTCCTCCTCCGTCTCCTTTCGGA
TTAAACCCTAATCTCCAGTATCTGTCTCCAACGAGAAAATCGGCAGAATAGTAGAATTTA
TCTTCCAAGTTGGAGAAATGAAGTATCTTCCAAGTAAACACATTGTCTGGAGGGTTTGAT
ATGAATGTGACTTTCTCTTGTACCAGGGCCGGTTTAACGATGAGAATTTCTGCACCGAAA
GAACAAGTGTCTTGCACAATGTATCCTTCGTTGGTGTTCTCGAATGTTGAAAGAGCAATC
AATTGTCCGAATCCCCACTC

QA 7 746 7 746
DS 

RD RR2FK22JQ 731 0 0
GATAGTTTCATTTCAATTGATAACAAAGTACACAACAAAACACGAAGAACATAAATGAAG
ATTACATCACAAGCATTGACAACTTCATCTTATTACAAACTCATTACACGCCTCTCTTTA
TTCATAGAGTTTGTTTGATCCATGACAAAACAAGTTATAGATCATTAAACAGAGACGATG
TTGGTCACAGAGACCTTAACCATTTCAGCTTCAAAGATAATAGCATCATTCACCAAATAC
CCTTTGGATGCATCGTTTAAATCTGCTAACAATATGATATTGTTTACTCCCACACCATAA
TCGCTTCGAATAGGGTACCAAGCTGCAGAATATATTTGTCTATGGTTGGTGCTTCGCTGA
TTCTTTAACCGCAAATTAACCGCTCCCCAAGTGTTTGTAGCGACTGCGTTTGGTCCATGG
CCTTGAGCAAATAAAAAGATTGGAAGTGCATATGGTCTTCCTCCTCCGTCTCCTTTCGGA
TTAAACCCTAATCTCCAGTATCAGTCTCCAACGAGAAAATCGGCAGAATAGTAGAATTTA
TCTTCCAAGTTGGAGAAATGAAGTATCTTCCAAGTAAACACATTGTCTGGAGGGTTTGAT
ATGAATGTGACTTTCTCTTGTACCAGGGCCGGTTTAACGATGAGAATTTCTGCACCGAAA
GAACAAGTGTCTTGCACAATGCATCCTTCGTTGGTGTTCTCGAATGTTGAAAGAGCAATC
AATTGTCCGAA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2E884JQ 722 0 0
GATAGTTTCATTTCAATTGATAACAAAGTACACAACAAAACACGAAGAACATAAATGAAG
ATTACATCACAAGCATTGACAACTTCATCTTATTACAAACTCATTACACGCCTCTCTTTA
TTCATAGAGTTTGTTTGATCCATGACAAAACAAGTTATAGATCATTAAACAGAGACGATG
TTGGTCACAGAGACCTTAACCATTTCAGCTTCAAAGATAATAGCATCATTCACCAAATAC
CCTTTGGATGCATCGTTTAAATCTGCTAACAATATGATATTGTTTACCCCCACACCATAA
TCGCTTCGAATAGGGTACCAAGCTGCAGAATATATTTGTCTATGGTTGGTGCTTCGCTGA
TTCTTTAACCGCAGATTAACCGCTCCCCAAGTGTTTGTAGCGACTGCGTTTGGTCCATGG
CCTTGAGCAAATAAGAAGATTGGAAGTGCATATGGTCTTCCTCCGTCGTCTCCTTTCGGA
TTAAACCCTAATCTCCAGTATCTGTCTCCAACGAGAAAATCGGCAGAATAGTAGAATTTA
TCTTCCAAGTTGGAGAAATGAAGTATCTTCCAAGTAAACACATTGTCTGGAGGGTTTGAT
ATGAATGTGACTTTCTCTTGTACCAGGGCCGGTTTAACGATGAGAATTTCTGCACCGAAA
GAACAAGTGTCTTGCACAATGTATCCTTCGTTGGTGTTCTCGAATGTTGAAAGAGCAATC
AA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2BE94JQ 810 0 0
GATAGTTTCATTTCAATTGATAACAAAGTACACAACAAAACACGAAGAACATAAATGAAG
ATTACATCACAAGCATTGACAACTTCATCTTATTACAAACTCATTACACGCTTCTCTTTA
TTCATAGAGTTTGTTTGATCCATGACAAAACAAGTTATAGATCATTAAACAGAGACGATG
TTGGTCACAGAGACCTTAACCATTTCAGCTTCAAAGATAATAGCATCATTCACCAAATAC
CCTTTGGATGCATCGTTTAAATCTGCTAACAATATGATATTGTTTACTCCCACACCATAA
TCGCTTCGAATAGGGTACCAAGCTGCAGAATATATTTGTCTATGGTTGGTGCTTCGCTGA
TTCTTTAACCGCAAATTAACCGCTCCCAAAGTGTTTGTAGCGACTGCGTTTGGTCCATGG
CCTTGAGCAAATAAGAAGATTGGAAGTGCATATGGTCTTCCTCCTCCGTCTCCTTTCGGA
TTAAACCCTAATCTCCAGTATCTGTCTCCAACGAGAAAATCGGCAGAA*AGTAGAATTTA
TCTTCCAAGTTGGAGAAATGAAGTATCTTCCAAGTAAACACATTGTCTGGAGGGTTTGAT
ATGAATGTGACTTTCTCTTGTACCAGGGCCGGTTTAACGATGAGAATTTCTGCACCGAAA
GAACAAGTGTCTTGCACAATGTATCCTTCGTTGGTGTTCTCGAATGTTGAAAGAGCAATC
AATTGTCCGAATCCCCACTCTTTTTTCCCAGCGTTGTATCCCTTCACCGCTCCATCTGTG
ACGATCAAGTACTTGTTCAGCTTTGGATTG

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR2B947JQ 843 0 0
GCTTAAAAACCAAGATAGTTTCATTTCAATTGATAACAAAGTACACAACAAAACACGAAG
AACATAAATGAAGATTACATCACAAGCATTGACAACTTCATCTTATTACAAACTCATTAC
ACGCTTCTCTTTATTCATAGAGTTTGTTTGATCCATGACAAAACAAGTTATAGATCATTA
AACAGAGACGATGTTGGTCACAGAGACCTTAACCATTTCAGCTTCAAAGATAATAGCATC
ATTCACCAAA*ACCCTTTGGATGCATCGTTTAAATCTGCTAACAATATGATATTGTTTAC
TCCCACACCATAATCGCTTCGAATAGGGTACCAAGCTGCAGAATATATTTGTCTATGGTT
GGTGCTTCGCTGATTCTTTAACCGCAGATTAACCGCTCCCCAAGTGTTTGTAGCGACTGC
GTTTGGTCCATGGCCTTGAGCAAATAAGAAGATTGGAAGTGCATATGGTCTTCCTCCTCC
GTCTCCTTTCGGATTAAACCCTAATCTCCAGTATCTGTCTCCAACGAGAAAATCGGCAGA
ATAGTAGAATTTATCTTCCAAGTTGGAGAAATGAAGTATCTTCCAAGTAAACACATTGTC
TGGAGGGTTTGATATGAATGTGACTTTCTCTTGTACCAGGGCCGGTTTAACGATGAGAAT
TTCTGCACCGAAAGAACAAGTGTCTTGCACAATGTATCCTTCGTTGGTGTTCTCGAATGT
TGAAAGAGCAATCAATTGTCCGAATCCCCACTCTTTTTTCCCAGCGTTGTATCCCTTCAC
CGCTCCATCTGTGACGATCAAGTACTTGTTCAGCTTTGGATTGTGGACAAAGAGTTTGAG
ATC

QA 1 843 1 843
DS 

RD RR2E884TF 622 0 0
GCAAATAAGAAGATTGGAAGTGCATATGGTCTTCCTCCGTCGTCTCCTTTCGGATTAAAC
CCTAATCTCCAGTATCTGTCTCCAACGAGAAAATCGGCAGAATAGTAGAATTTATCTTCC
AAGTTGGAGAAATGAAGTATCTTCCAAGTAAACACATTGTCTGGAGGGTTTGATATGAAT
GTGACTTTCTCTTGTACCAGGGCCGGTTTAACGATGAGAATTTCTGCACCGAAAGAACAA
GTGTCTTGCACAATGTATCCTTCGTTGGTGTTCTCGAATGTTGAAAGAGCAATCAATTGT
CCGAATCCCCACTCTTTTTTCCCAGCGTTGTATCGCTTCACCGCTCCATCTGTGACGATC
AAGTACTTGTTCAGCTTTGGATTGTGGACAAAGAGTTTGAGATCAACATTGACTTCCCAG
CCACTGGGAAGAGATTCAGTCTCTTCGATTCTCGCGTAACCAGCAGCTTCGAAAACAGAG
GACTCGTAGGGCTCGCCTCTTCCCTTAATCACGTACAAGATTAATCTCCATTCGTAACCA
GCAGAAGAGCAAGTGATGAATAGAAAAGCTAGAGAAATGAAAGCTAAGCTCTTTTGTTGA
CTACCCATTTTCTGTGATCTCC

QA 1 622 1 622
DS 



CO CL93Contig2 762 9 13 U
GGGAGATCACAGAAAATGGGTAGTCAACAAAAGAGTTTAGCTTTCATTTCTCTAGCTTTT
CTATTCATCACTTGCTCTTCTGCTGAGTTCCTGATTCAACAGGTCACGCAAGGGACAGGG
ACTGAGAACAACAGTTCTTACAGTCTCGAAGCAAATCTTGGAGTGACAAGAGTGTTGAGA
GACGAGCGACCATCGAGTAAGATAGTGACAATAGCCGGCTACTCCGTGATTAAGGGAAGA
GGCGAGCCCTACGAGTCCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTCTTG
TACGTGGTTGGTAATGCTAACGATGGTGGAGCTGGCTATATATCCCTTTACGCGAGAATC
GAAGAGACTGAATCTCTTCCCAGTGGCTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTC
CACAATCCAAAGCTGAACAAGTACTTGATCGTCACAGATGGAGCGGTGAAGCGATACAAC
GCTGGGAAAAAAGAGTGGGGATTCGGACAATTGATTGCTCTTTCAACATTCGAGAACACC
AACGAAGGATACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTCGGTGCAGAAATTCTCATCGTTAAA
CCGGCCCTGGTACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAGACAATGTGTTTACT
TGGAAGATACTTCATTTCTCCAACTTGGAAGATAAATTCTACTATTCTGCCGATTTTCTC
GTTGGAGACAGATACTGGAGATTAGGGTTTAATCCGAAAGGA


BQ
10 40 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ93TF U 2
AF RR2CF75TF U 9
AF RR2C369TF U 2
AF RR2FK22TF U 2
AF RR2BE94TF U 1
AF RR2BT47TF U 2
AF RR2F254TF U 2
AF RR2H767TF U 3
AF RR2B947TF U 2
BS 1 71 RR2BE94TF
BS 72 72 RR2BT47TF
BS 73 89 RR2BE94TF
BS 90 90 RR2BT47TF
BS 91 262 RR2BE94TF
BS 263 263 RR2BT47TF
BS 264 352 RR2BE94TF
BS 353 353 RR2BT47TF
BS 354 471 RR2BE94TF
BS 472 472 RR2BT47TF
BS 473 703 RR2BE94TF
BS 704 704 RR2BT47TF
BS 705 762 RR2BE94TF

RD RR2FZ93TF 552 0 0
GGAGATCACAGAAAATGGGTAGTCAACAAAAGAGTTTAGCTTTCATTTCTCTAGCTTTTC
TATTCATCACTTGCTCTTCTGCTGAGTTCCTGATTCAACAGGTCACGCAAGGGACAGGGA
CTGAGAACAACAGTTCTTACAGTCTCGAAGCAAATCTTGGAGTGACAAGAGTGTTGAGAG
ACGAGCGACCATCGAGTAAGATAGTGACAATAGCCGGCTACTCCGTGATTAAGGGAAGAG
GCGAGCCCTACGAGTCCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTCTTGT
ACGTGGTTGGTAATGCTAACGATGGTGGAGCTGGCTATATATCCCTTTACGCGAGAATCG
AAGAGACTGAATCTCTTCCCAGTGGCTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCC
ACAATCCAAAGCTGAACAAGTACTTGATCGTCACAGATGGAGCGGTGAAGCGATACAACG
CTGGGAAAAAAGAGTGGGGATTCGGACAATTGATTGCTCTTTCAGCATTCGAGAACACCA
ACGAAGGATACA

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2CF75TF 671 0 0
GG
AGAAAATGGGTAGTCAACAAAAGAGTTTAGCTTTCATTTCTCTAGCTTTTCTATTCATCA
CTTGCTCTTCTGCTGAGTTCCTGATTCAACAGGTCACGCAAGGGACAGGGACTGAGAACA
ACAGTTCTTACAGTCTCGAAGCAAATCTTGGAGTGACAAGAGTGTTGAGAGACGAGCGAC
CATCGAGTAAGATAGTGACAATAGCCGGCTACTCCGTGATTAAGGGAAGAGGCGAGCCCT
ACGAGTCCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTCTTGTACGTGGTTG
GTAATGCTAACGATGGTGGAGCTGGCTATATATCCCTTTACGCGAGAATCGAAGAGACTG
AATCTCTTCCCAGTGGCTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCCACAATCCAA
AGCTGAACAAGTACTTGATCGTCACAGATGGAGCGGTGAAGCGATACAACGCTGGGAAAA
AAGAGTGGGGATTCGGACAATTGATTGCTCTTTCAACATTCGAGAACACCAACGAAGGAT
ACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTCGGTGCAGAAATTCTCATCGTTAAACCGGCCCTGG
TACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAA*CCCTCCAGACA*TGTGTTTACTTGGAAGATAC
TTCATTTCT

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR2C369TF 708 0 0
GGAGATCACAGAAAATGGGTAGTCAACAAAAGAGTTTAGCTTTCATTTCTCTAGCTTTTC
TATTCATCACTTGCTCTTCTGCTGAGTTCCTGATTCAACAGGTCACGCAAGGGACAGGGA
CTGAGAACAACAGTTCTTACAGTCTCGAAGCAAATCTTGGAGTGACAAGAGTGTTGAGAG
ACGAGCGACCATCGAGTAAGATAGTGACAATAGCCGGCTACTCCGTGATTAAGGGAAGAG
GCGAGCCCTACGAGTCCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTCTTGT
ACGTGGTTGGTAATGCTAACGATGGTGGAGCTGGCTATATATCCCTTTACGCGAGAATCG
AAGAGACTGAATCTCTTCCCAGTGGCTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCC
ACAATCCAAAGCTGAACAATTACTTGATCGTCACAGATGGAGCGGTGAAGCGATACAACG
CTGGGAAAAAAGAGTGGGGATTCGGACAATTGATTGCTCTTTCAACATTCGAGAACACCA
ACGAAGGATACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTCGGTGCAGAAATTCTCATCGTTAAAC
CGGCCCTGGTACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAGACAATGTGTTTACTT
GGAAGATACTTCATTTCTCCAACTTGGAAGATAAATTCTACTATTCTG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2FK22TF 678 0 0
GGAGATCACAGAAAATGGGTAGTCAACAAAAGAGTTTAGCTTTCATTTCTCTAGCTTTTC
TATTCATCACTTGCTCTTCTGCTGAGTTCCTGATTCAACAGGTCACGCAAGGGACAGGGA
CTGAGAACAACAGTTCTTACAGTCTCGAAGCAAATCTTGGAGTGACAAGAGTGTTGAGAG
ACGAGCGACCATCGAGTAAGATAGTGACAATAGCCGGCTACTCCGTGATTAAGGGAAGAG
GCGAGCCCTACGAGTCCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTCTTGT
ACGTGGTTGGTAATGCTAACGATGGTGGAGCTGGCTATATATCTCTTTACGCGAGAATCG
AAGAGACTGAATCTCTTCCCAGTGGCTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCC
ACAATCCAAAGCTGAACAAGTACTTGATCGTCACAGATGGAGCGGTGAAGCGATACAACG
CCGGGAAAAAAGAGTGGGGATTCGGACAATTGATTGCTCTTTCAACATTCGAGAACACCA
ACGAAGGATGCATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTCGGTGCAGAAATTCTCATCGTTAAAC
CGGCCCTGGTACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAGACAATGTGTTTACTT
GGAAGATACTTCATTTCT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2BE94TF 762 0 0
GGGAGATCACAGAAAATGGGTAGTCAACAAAAGAGTTTAGCTTTCATTTCTCTAGCTTTT
CTATTCATCACATGCTCTTCTGCTGAGTTTCTGATTCAACAGGTCACGCAAGGGACAGGG
ACTGAGAACAACAGTTCTTACAGTCTCGAAGCAAATCTTGGAGTGACAAGAGTGTTGAGA
GACGAGCGACCATCGAGTAAGATAGTGACAATAGCCGGCTACTCCGTGATTAAGGGAAGA
GGCGAGCCCTACGAGTCCTCTGCTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTCTTG
TACGTGGTTGGTAATGCTAACGATGGTGGAGCTGGCTATATATCCCTTTACGAGAGAATC
GAAGAGACTGAATCTCTTCCCAGTGGCTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTC
CACAATCCAAAGCTGAACAAGTACTTGATCGTCACAGATGGAGCGGTGAAGGGATACAAC
GCTGGGAAAAAAGAGTGGGGATTCGGACAATTGATTGCTCTTTCAACATTCGAGAACACC
AACGAAGGATACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTCGGTGCAGAAATTCTCATCGTTAAA
CCGGCCCTGGTACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAGACAATGTGTTTACT
TGGAAGATACTTCATTTCTCCAACTTGGAAGATAAATTCTACT*TTCTGCCGATTTTCTC
GTTGGAGACAGATACTGGAGATTAGGGTTTAATCCGAAAGGA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2BT47TF 738 0 0
GGAGATCACAGAAAATGGGTAGTCAACAAAAGAGTTTAGCTTTCATTTCTCTAGCTTTTC
TATTCATCACTTGCTCTTCTGCTGAGTTCCTGATTCAACAGGTCACGCAAGGGACAGGGA
CTGAGAACAACAGTTCTTACAGTCTCGAAGCAAATCTTGGAGTGACAAGAGTGTTGAGAG
ACGAGCGACCATCGAGTAAGATAGTGACAATAGCCGGCTACTCCGTGATTAAGGGAAGAG
GCGAGCCCTACGAGTCCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTCTTGT
ACGTGGTTGGTAATGCTAACGATGGTGGAGCTGGCTATATATCTCTTTACGCGAGAATCG
AAGAGACTGAATCTCTTCCCAGTGGCTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCC
ACAATCCAAAGCTGAACAAGTACTTGATCGTCACAGATGGAGCGGTGAAGCGATACAACG
CTGGGAAAAAAGAGTGGGGATTCGGACAATTGATTGCTCTTTCAACATTCGAGAACACCA
ACGAAGGATACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTCGTTGCAGAAATTCTCATCGTTAAAC
CGGCCCTGGTACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAGACA*TGCGTTTACTT
GGAAGATACTTCATTTCTCCAACTTGGAAGATAAATTCTACTATTCTGCCGATTTTCTCG
TTGGAGACAGATACTGGA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2F254TF 754 0 0
GGAGATCACAGAAAATGGGTAGTCAACAAAAGAGTTTAGCTTTCATTTCTCTAGCTTTTC
TATTCATCACTTGCTCTTCTGCCGAGTTCCTGATTCAACAGGTCACGCAAGGGACAGGGA
CTGAGAACAACAGTTCTTACAGTCTCGAAGCAAATCTTGGAGTGACAAGAGTGTTGAGAG
ACGAGCGACCATCGAGTAAGATAGTGACAATAGCCGGCTACTCCGTGATTAAGGGAAGAG
GCGAGCCCTACGAGTCCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTCTTGT
ACGTGGTTGGTAATGCTAACGATGGTGGAGCTGGCTATATATCCCTTTACGCGAGAATCG
AAGAGACTGAATCTCTTCCCAGTGGCTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCC
ACAATCCAAAGCTGAACAAGTACTTGATCGTCACAGATGGAGCGGTGAAGCGATACAACA
CTGGGAAAAAAGAGTGGGGATTCGGACAATTGATTGCTCTTTCAACATTCGAGAACACCA
ACGAAGGATACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTCGGTGCAGAAATTCTCATTGTTAAAC
CGGCCCTGGTACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAGACAATGTGTTTACTT
GGAAGATACTTCATTTCTCCAACTTGGAAGATAAATTCTACTATTCTGCCGATTTTCTCG
TTGGAGACAGATACTGGAGATTAGGGTT
AATCCG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2H767TF 751 0 0
GAGATCACAGAAAATGGGTAGTCAACAAAAGAGTTTAGCTTTCATTTCTCTAGCTTTTCT
ATTCATCACTTGCTCTTCTGCTGAGTTTCTGATTCAACAGGTCACGCAAGGGACAGGGAC
TGAGAACAACAGTTCTTACAGTCTCGAAGCAAATCTTGGAGTGACAAGAGTGTTGAGAGA
CGAGCGACCATCGAGTAAGATAGTGACAATAGCCGGCTACTCCGTGATTAAGGGAAGAGG
CGAGCCCTACGAGTCCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTCTTGTA
CGTGGTTGGTAATGCTAACGATGGTGGAGCTGGCTATATATCCCTTTACGCGAGAATCGA
AGAGACTGAATCTCTTCCCAGTGGCTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCCA
CAATCCAAAGCTGAACAAGTACTTGATCGTCACAGATGGAGCGGTGAAGGGATACAACGC
TGGGAAAAAAGAGTGGGGATTCGGACAATTGATTGCTCTTTCAACATTCGAGAACACCAA
CGAAGGATACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTCGGTGCAGAAATTCTCATCGTTAAACC
GGCCCTGGTACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAGACAATGTGTTTACTTG
GAAGATACTTCATTTCTCCAACTTGGAAGATAAATTCTACTATTCTGCCGATTTTCTCGT
TGGAGACAGATACTGGAGATTAGG
TTTAATC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2B947TF 737 0 0
GGAGATCACAGAAAATGGGTAGTCAACAAAAGAGTTTAGCTTTCATTTCTCTAGCTTTTC
TATTCATCACTTGCTCTTCTGCTGAGTTTCTGATTCAACAGGTCACGCAAGGGACAGGGA
CTGAGAACAACAGTTCTTACAGTCTCGAAGCAAATCTTGGAGTGACAAGAGTGTTGAGAG
ACGAGCGACCATCGAGTAAGATAGTGACAATAGCCGGCTACTCCGTGATTAAGGGAAGAG
GCGAGCCCTACGAGTCCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTCTTGT
ACGTGGTTGGTAATGCTAACGATGGTGGAGCTGGCTATATATCCCTTTACGCGAGAATCG
AAGAGACTGAATCTCTTCCCAGTGGCTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCC
ACAATCCAAAGCTGAACAAGTACTTGATCGTCACAGATGGAGCGGTGAAGGGATACAACG
CTGGGAAAAAAGAGTGGGGATTCGGACAATTGATTGCTCTTTCAACATTCGAGAACACCA
ACGAAGGATACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTCGGTGCAGAAATTCTCATCGTTAAAC
CGGCCCTGGTACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAGACAATGTGTTTACTT
GGAAGATACTTCATTTCTCCAACTTGGAAGATAAATTCTACTATTCTGCCGATTTTCTCG
TTGGAGACAGATACTGG

QA 1 737 1 737
DS 



CO CL93Contig3 771 2 4 U
GGAGATCACAGAAAATGGGTAGTCAACAAAAGAGTTTAGCTTTCATTTCTCTAGCTTTTC
TATTCATCACTTGCTCTTCTGCTGAGTTCCTGATTCAACAGGTCACGCAAGGGACAGGGA
CTGAGAACAACAGTTCTTACAGTCTCGAAGCAAATCTTGGAGTGACAAGAGTGTTGAGAG
ACGAGCGACCATCGAGTAAGATAGTGACAATAGCCGGCTACTCCGTGATTAAGGGAAGAG
GCGAGCCCTACGAGTCCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTCTTGT
ACGTGGTTGGTAATGCTAACGATGGTGGAGCTGGCTATATATCCCTTTACGCAAGGGTTT
AATCCGAAAGGAGACGGAGGAGGAAGACCATATGCACTTCCAATCTTCTTATTTGCTCAA
GGCCATGGACCAAACGCAGTCGCTACAAACACTTGGGGAGCGGTTAATCTGCGGTTAAAG
AATCAGCGAAGCACCAACCATAGACAAATATATTCTGCAGCTTGGTACCCTATTCGAAGC
GATTATGGTGTGGGGGTAAACAATATCATATTGTTAGCAGATTTAAACGATGCATCCAAA
GGGTATTTGGTGAATGATGCTATTATCTTTGAAGCTGAAATGGTTAAAGTCTCTGTGACC
AACATCGTCTCTGTTTAATGATCTATAACTTGTTTTGTCATGGATCAAACAAACTCTATG
AATAAAGAGAGGCGTGTAATGAGTTTGTAATAAGATGAAGTTGTCAATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2H843TF U 1
AF RR2H843JQ C 45
BS 1 677 RR2H843TF
BS 678 678 RR2H843JQ
BS 679 766 RR2H843TF
BS 767 771 RR2H843JQ

RD RR2H843TF 770 0 0
GGAGATCACAGAAAATGGGTAGTCAACAAAAGAGTTTAGCTTTCATTTCTCTAGCTTTTC
TATTCATCACTTGCTCTTCTGCTGAGTTCCTGATTCAACAGGTCACGCAAGGGACAGGGA
CTGAGAACAACAGTTCTTACAGTCTCGAAGCAAATCTTGGAGTGACAAGAGTGTTGAGAG
ACGAGCGACCATCGAGTAAGATAGTGACAATAGCCGGCTACTCCGTGATTAAGGGAAGAG
GCGAGCCCTACGAGTCCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTCTTGT
ACGTGGTTGGTAATGCTAACGATGGTGGAGCTGGCTATATATCCCTTTACGCAAGGGTTT
AATCCGAAAGGAGACGGAGGAGGAAGACCATATGCACTTCCAATCTTCTTATTTGCTCAA
GGCCATGGACCAAACGCAGTCGCTACAAACACTTGGGGAGCGGTTAATCTGCGGTTAAAG
AATCAGCGAAGCACCAACCATAGACAAATATATTCTGCAGCTTGGTACCCTATTCGAAGC
GATTATGGTGTGGGGGTAAACAATATCATATTGTTAGCAGATTTAAACGATGCATCCAAA
GGGTATTTGGTGAATGATGCTATTATCTTTGAAGCTGAAATGGTTAAAGTCTCTGTGACC
AACATCGTCTCTGTTTA*TGATCTATAACTTGTTTTGTCATGGATCAAACAAACTCTATG
AATAAAGAGAGGCGTGTAATGAGTTTGTAATAAGATGAAGTTGTCA
TGCT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2H843JQ 727 0 0
ATTTCTCTAGCTTTTCTATTCATCACTTGCTCTTCTGCTGAGTTCCTGATTCAACAGGTC
ACGCAAGGGACAGGGACTGAGAACAACAGTTCTTACAGTCTCGAAGCAAATCTTGGAGTG
ACAAGAGTGTTGAGAGACGAGCGACCATCGAGTAAGATAGTGACAATAGCCGGCTACTCC
GTGATTAAGGGAAGAGGCGAGCCCTACGAGTCCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAA
TGGAGATTAGTCTTGTACGTGGTTGGTAATGCTAACGATGGTGGAGCTGGCTATATATCC
CTTTACGCAAGGGTTTAATCCGAAAGGAGACGGAGGAGGAAGACCATATGCACTTCCAAT
CTTTTTATTTGCTCAAGGCCATGGACCAAACGCAGTCGCTACAAACACTTGGGGAGCGGT
TAATCTGCGGTTAAAGAATCAGCGAAGCACCAACCATAGACAAATATATTCTGCAGCTTG
GTACCCTATTCGAAGCGATTATGGTGTGGGGGTAAACAATATCATATTGTTAGCAGATTT
AAACGATGCATCCAAAGGGTATTTGGTGAATGATGCTATTATCTTTGAAGCTGAAATGGT
TAAGGTCTCTGTGACCAACATCGTCTCTGTTTAATGATCTATAACTTGTTTTGTCATGGA
TCAAACAAACTCTATGAATAAAGAGAGGCGTGTAATGAGTTTGTAATAAGATGAAGTTGT
CAATGCT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 21

CO CL94Contig1 766 21 23 U
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATA
TGTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTGTTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*
ATGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAG
TTAATAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCC
TATGAAAATAAATCAATTATATTTTATGTTATACGTTAAAAAAAAA


BQ
85 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 10 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 45 97 97 45 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 45 97 97 97 97 
97 97 97 97 45 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 50 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 55 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 55 55 55 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 50 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 50 97 97 97 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 85 50 70 70 85 85 85 85 85 60 60 60 60 60 55 50 50 50 45 45 45 45 45 40 35 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E575TF U 1
AF RR2E575JQ C 1
AF RR2EX04JQ C 187
AF RR2CC59TF U 1
AF RR2EX04TF U 1
AF RR2A846JQ C 1
AF RR2CC59JQ C 1
AF RR2CR46JQ C 14
AF RR2CR46TF U 1
AF RR2CU57JQ C 1
AF RR2EO71JQ C 1
AF RR2FI24TF U 12
AF RR2GX28JQ C 2
AF RR2F772TF U 1
AF RR2EO71TF U 1
AF RR2CU57TF U 1
AF RR2GX28TF U 2
AF RR2FK78TF U 1
AF RR2A846TF U 1
AF RR2FK78JQ C 1
AF RR2F772JQ C 3
BS 1 46 RR2E575TF
BS 47 47 RR2CC59TF
BS 48 89 RR2E575TF
BS 90 90 RR2CC59TF
BS 91 270 RR2E575TF
BS 271 271 RR2CC59TF
BS 272 273 RR2E575TF
BS 274 274 RR2CC59TF
BS 275 475 RR2E575TF
BS 476 476 RR2CC59TF
BS 477 484 RR2E575TF
BS 485 485 RR2CC59TF
BS 486 530 RR2E575TF
BS 531 649 RR2CC59TF
BS 650 650 RR2CR46TF
BS 651 668 RR2CC59TF
BS 669 726 RR2CR46TF
BS 727 735 RR2FI24TF
BS 736 741 RR2F772TF
BS 742 749 RR2EO71TF
BS 750 751 RR2GX28TF
BS 752 752 RR2A846TF
BS 753 766 RR2FK78JQ

RD RR2E575TF 530 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTGAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAGCCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTTGACTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTATCATA
TGTACTTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGA

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2E575JQ 563 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTGAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAGCCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTTGACTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTATCATA
TGTACTTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTATTTACTCTTATTATTGTGTC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2EX04JQ 442 0 0
ACCCCC
CCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGGTGTCTGCGCCAA
TGTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCATCGGTCAAGCCATGCTGTAG
CCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCACCGCTCTTAAGGC
TAACGTTCTTGGAATCGACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCTCCTCAATGTTTG
CAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATATGTAATTTCAGT
ACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATTCTGTTTACTCTT
ATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*ATGGGG*TTCAT
TGGAGCCAAATTGTGT

QA 7 442 7 442
DS 

RD RR2CC59TF 668 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATTGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTTATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATA
TGTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTGTTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*
ATGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACTATTCTTGAAG
TTAATAGT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2EX04TF 680 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCC**CCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCATCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCGACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATA
TGTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTGTTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*
ATGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAG
TTAATAGTTCCA
AAAAAAAA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2A846JQ 752 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTGAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTTGACTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTATCATA
TGTACTTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTATTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTACATTTGTGTTCTTATTAC***CTTCTTGTT*
ATGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGAT*CTTGAAG
TTAACAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCC
TATGAAAATAAATCAATTATATTTTATGTTAT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2CC59JQ 735 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATTGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTTATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATA
TGTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTGTTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*
ATGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACTATTCTTGAAG
TTAATAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCC
TATGAAAATAAATCA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2CR46JQ 722 0 0
ACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATGGCTTCAAGCTCCATAGCC
CTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATGCGGTAGCTGCACT
CCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAAACCAACCCCAAGC
CCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTACCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGGTGTTTGCGCCAAT
GTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAAGCCATGCTGTAGC
CTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCACCGCTCTTAAGGCT
AACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCTCCTCAATGTTTGC
AGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATATGTAATTTCAGTA
CACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAGGGTGATTCTGTTTACTCTTA
TTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*ATGGGG*TTCATT
GGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAGTTAATAGTTCCAT
TATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCCTATGAAAATAAAT
CA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2CR46TF 726 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTACCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATA
TGTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAGGGTGATT
CTGTTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*
ATGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAG
TTAATAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCC
TATGAA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2CU57JQ 751 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGTGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATA
TGTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTGTTTACTCTTATTATTGTGTCTCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*
ATGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAG
TTAATAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCC
TATGAAAATAAATCAATTATATTTTATGTT
G

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2EO71JQ 735 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATGGCTTC
AAGCCCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATA
TGTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTGTTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*
ATGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAG
TTAATAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCC
TATGAAAATAAATCA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2FI24TF 724 0 0
GG
ACCCACAACATATCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATGGCTTCAAGCTCCATAGCC
CTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTCCACAACAATCTCCGCATGCGGTAGCTGCACT
CCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAAACCAACCCCAAGC
CCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGGTGTCTGCGCCAAT
GTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAAGCCATGCTGTAGC
CTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCACCGCTCTTAAGGCT
AACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCTCCTCAATGTTTGC
AGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATATGTAATTTCAGTA
CACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATTCTGTTTACTCTTA
TTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*ATGGGG*TTCATT
GGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAGTTAATAGTTCCAT
TATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCCTATGAAAATAAAT
CA

QA 3 724 3 724
DS 

RD RR2GX28JQ 734 0 0
GACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCT*AAAAAATGGCTTCA
AGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATGC
GGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAAA
CCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGGT
GTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAAG
CCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTTTGCACC
GCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCTC
CTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATAT
GTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTCCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATTC
TGTTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*A
TGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAGT
TAATAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCCT
ATGAAAATAAATCA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2F772TF 741 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCACCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAAT*AACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATA
TGTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTGTTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*
ATGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAG
TTAATAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCC
TATGAAAATAAATCAATTATA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2EO71TF 751 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATGGCTTC
AAGCCCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATA
TGTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTGTTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*
ATGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAG
TTAATAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCC
TATGAAA*TAAATCAATTATATTTTATGT
AA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2CU57TF 740 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGTGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATA
TGTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTGTTTACTCTTATTATTGTGTCTCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*
ATGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAG
TTAATAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCC
TATGAAAATAAATCAATTAT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2GX28TF 753 0 0
GACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCT*AAAAAATGGCTTCA
AGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATGC
GGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAAA
CCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGGT
GTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAAG
CCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCACC
GCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCTC
CTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATAT
GTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTCCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATTC
TGTTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*A
TGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAGT
TAATAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCCT
ATGAAA**TAATCAATTATATTTTATGTTA
AAT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2FK78TF 762 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTGAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTTGACTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTATCATA
TGTACTTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTATTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTACATTTGTGTTCTTATTAC***CTTCTTGTT*
ATGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGAT*CTTGAAG
TTAACAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCC
TATGAAA*TAAATCAATTATATTT
ATGTATACGTTAAAAAAA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2A846TF 752 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTGAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTTGACTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTATCATA
TGTACTTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTATTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTACATTTGTGTTCTTATTAC***CTTCTTGTTT
ATGGGGGTTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGAT*CTTGAAG
TTAACAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCC
TATGAAAATAAATCAATTATATTTTATGTTAT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2FK78JQ 766 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTGAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTTGACTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTATCATA
TGTACTTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTATTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTACATTTGTGTTCTTATTAC***CTTCTTGTT*
ATGGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGAT*CTTGAAG
TTAACAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCC
TATGAAAATAAATCAATTATATTTTATGTTATACGTTAAAAAAAAA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2F772JQ 756 0 0
ACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATGGCTTCAA
GCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCACCGCATGCG
GTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAAAC
CAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGGTG
TCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTCGATTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAAGC
CATGCTGTAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCACCG
CTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAAT*AACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCTCC
TCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATATG
TAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATTCT
GTTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTT*AT
GGGG*TTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAGTT
AATAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCCTA
TGAAAATAAATCAATTATATTTTATGTTAT
ACGTCT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 3 17

CO CL95Contig1 1088 9 10 U
GAAACATCTTCGTTAACAATATCGACGCTTATAATTGATTCTCTCTCTCTCAGGAAGCAA
AAGAAAACAAAAAA*GGCCATATGGATTCGTTCTCGTCCTTCTTCGATTCACAACCAGGT
AGCAGAAGCTGGAGCTATGATTCCCTCAAGAACCTCCATCAGATCTCTCCCTCCGTCCAG
AATCACCTCAAGCGGGTTTATCTCACTCTGTGCTGTGCCCTTGTTGCGTCTGCCTTTGGA
GCTTACCTCCACGTGCTCTGGAACATCGGTGGTCTTCTCACAACCATTGCATGCTGTGGA
AGCATGATCTGGCTCCTCTCCTGCCCTCCTCATGAACAACAAAAGAGGCTCTCGCTTCTG
TTCCTGTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCTATTGGCCCCTTGATCAAAGTGGCTGTTGAT
TTCGACCCAAGCATCCTTATCACTGCGTTCGTCGGAACTGCGATAGCGTTTGTCTGTTTC
TCAGGAGCGGCGATGCTGGCAAGGCGCAGAGAGTATCTCTACCTCGGAGGCCTTCTCTCA
TCTGGCTTGTCTATGCTGATGTGGCTTCAGTTTGCCTCTTCGATCTTTGGTGGCTCTGCC
TCTATCTTTAAGTTCGAGCTATACTTTGGACTCTTGATCTTTGTGGGATACATGGTGGTG
GACACCCAAGAGATTATTGAGAAAGCTCACCTCGGAGACATGGACTATGTGAAACATGCG
TTGACCCTCTTCACCGATTTTGTTGCTGTGTTTGTCCGTATTCTCATCATAATGCTGAAG
AACTCGGCAGATAAAGAGGAGAAGAAGAAGAAGAGGAGAAACTGAGAGACTTAAAAGTGA
CAAGGAAATCGAATAAGAGTTGGGGTGTTACAAACACGTGAAAGCTTTGGTGTTTTTATG
ATTAGGACGTACTTTGGTTTGCGTATTCCTCTTATTGCACAAGATTGTAAATGGATCAGA
TAGTTTTCGCTTTTATCCTTACTCTCGTTCAATTTCGTGATGTTCATGATTTTTCTTCTA
CTGTTTAAATCACTTGAAGACGAGGATTAGCAGGATAATAATGAAGTACTAGAACCATTC
TTCTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2A918TF U 1
AF RR2FL66TF U 1
AF RR2FP76TF U 1
AF RR2D568TF U 4
AF RR2EZ81TF U 94
AF RR2A918JQ C 238
AF RR2EZ81JQ C 411
AF RR2FP76JQ C 595
AF RR2FL66JQ C 526
BS 1 648 RR2A918TF
BS 649 740 RR2FL66TF
BS 741 747 RR2FP76TF
BS 748 761 RR2D568TF
BS 762 762 RR2A918JQ
BS 763 778 RR2D568TF
BS 779 966 RR2A918JQ
BS 967 967 RR2EZ81JQ
BS 968 1008 RR2A918JQ
BS 1009 1088 RR2EZ81JQ

RD RR2A918TF 648 0 0
GAAACATCTTCGTTAACAATATCGACGCTTATAATTGATTCTCTCTCTCTCAGGAAGCAA
AAGAAAACAAAAAA*GGCCATATGGATTCGTTCTCGTCCTTCTTCGATTCACAACCAGGT
AGCAGAAGCTGGAGCTATGATTCCCTCAAGAACCTCCATCAGATCTCTCCCTCCGTCCAG
AATCACCTCAAGCGGGTTTATCTCACTCTGTGCTGTGCCCTTGTTGCGTCTGCCTTTGGA
GCTTACCTCCACGTGCTCTGGAACATCGGTGGTCTTCTCACAACCATTGCATGCTGTGGA
AGCATGATCTGGCTCCTCTCCTGCCCTCCTCATGAACAACAAAAGAGGCTCTCGCTTCTG
TTCCTGTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCTATTGGCCCCTTGATCAAAGTGGCTGTTGAT
TTCGACCCAAGCATCCTTATCACTGCGTTCGTCGGAACTGCGATAGCGTTTGTCTGTTTC
TCAGGAGCGGCGATGCTGGCAAGGCGCAGAGAGTATCTCTACCTCGGAGGCCTTCTCTCA
TCTGGCTTGTCTATGCTGATGTGGCTTCAGTTTGCCTCTTCGATCTTTGGTGGCTCTGCC
TCTATCTTTAAGTTCGAGCTATACTTTGGACTCTTGATCTTTGTGGGA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2FL66TF 752 0 0
GGAAT
ATCTTCGTTAACAATATCGACGCTTATAATTGATTCTCTCTCTCTCGGGAAGCAAAAGAA
AACAAAAAAAGGCCATATGGATTCGTTCTCGTCCTTCTTCGATTCACAACCAGGTAGCAG
AAGCTGGAGCTATGATTCTCTCAAGAACCTCCATCAGATCTCTCCCTCCGTCCAGAATCA
CCTCAAGCGGGTTTATCTCACTTTGTGCTGTGCTCTTGTTGCGTCTGCCTTTGGAGCTTA
CCTCCACGTGCTCTGGAACATCGGTGGTCTTCTCACAACCATTGCATGCTGTGGAAGCAT
GATCTGGCTCCTCTCGTGCCCTCCTCATGAACAACAAAAGAGGCTCTCGCTTCTATTCCT
GTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCTGTTGGCCCCTTGATCAAAGTGGCTGTTGATTTCGA
CCCAAGCATCCTTATCACTGCGTTCGTCGGAACTGCGATAGCGTTTGTCTGTTTCTCGGG
AGCGGCGATGCTGGCAAGGCGCAGAGAGTATCTCTACCTCGGAGGCCTTCTCTCATCTGG
CTTGTCTATGCTGATGTGGCTTCAGTTTGCCTCTTCGATCTTTGGTGGCTCTGCCTCTAT
CTTTAAGTTCGAGCTATACTTTGGACTCTTGATCTTTGTGGGATACATGGTGGTGGACAC
CCAAGAGATTATTGAGAAAGCTCACCTCGGAGACATGGACTATGTGAAACATGCGTTGAC
CCTCTTCACCGATTT
GTGCTGTGTTGT

QA 6 740 6 740
DS 

RD RR2FP76TF 747 0 0
GGAAT
ATCTTCGTTAACAATATCGACGCTTATAATTGATTCTCTCTCTCTCAGGAAGCAAAAGAA
AACAAAAAA*GGCCATATGGATTCGTTCTCGTCCTTCTTCGATTCACAACCAGGTAGCAG
AAGCTGGAGCTATGATTCTCTCAAGAACCTCCATCAGATCTCTCCCTCCGTCCAGAATCA
CCTCAAGCGGGTTTATCTCACTTTGTGCTGTGCTCTTGTTGCGTCTGCCTTTGGAGCTTA
CCTCCACGTGCTCTGGAACATCGGTGGTCTTCTCACAACCATTGCATGCTGTGGAAGCAT
GATCTGGCTCCTCTCGTGCCCTCCTCATGAACAACAAAAGAGGCTCTCGCTTCTATTCCT
GTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCTGTTGGCCCCTTGATCAAAGTGGCTGTTGATTTCGA
CCCAAGCATCCTTATCACTGCGTTCGTCGGAACTGCGATAGCGTTTGTCTGTTTCTCGGG
AGCGGCGATGCTGGCAAGGCGCAGAGAGTATCTCTACCTCGGAGGCCTTCTCTCATCTGG
CTTGTCTATGCTGATGTGGCTTCAGTTTGCCTCTTCGATCTTTGGTGGCTCTGCCTCTAT
CTTTAAGTTCGAGCTATACTTTGGACTCTTGATCTTTGTGGGATACATGGTGGTGGACAC
CCAAGAGATTATTGAGAAAGCTCACCTCGGAGACATGGACTATGTGAAACATGCGTTGAC
C*TCTTCACCGATTTTGTTGCT

QA 6 747 6 747
DS 

RD RR2D568TF 777 0 0
GG
ATCTTCGTTAACAATATCGACGCTTATAATTGATTCTCTCTCTCTCAGGAAGCAAAAGAA
AACAAAAAA*GGCCATATGGATTCGTTCTCGTCCTTCTTCGATTCACAACCAGGTAGCAG
AAGCTGGAGCTATGATTCCCTCAAGAACCTCCATCAGATCTCTCCCTCCGTCCAGAATCA
CCTCAAGCGGGTTTATCTCACTCTGTGCTGTGCCCTTGTTGCGTCTGCCTTTGGAGCTTA
CCTCCACGTGCTCTGGAACATCGGTGGTCTTCTCACAACCATTGCATGCTGTGGAAGCAT
GATCTGGCTCCTCTCCTGCCCTCCTCATGAACAACAAAAGAGGCTCTCGCTTCTGTTCCT
GTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCTATTGGCCCCTTGATCAAAGTGGCTGTTGATTTCGA
CCCAAGCATCCTTATCACTGCGTTCGTCGGAACTGCGATAGCGTTTGTCTGTTTCTCAGG
AGCGGCGATGCTGGCAAGGCGCAGAGAGTATCTCTACCTCGGAGGCCTTCTCTCATCTGG
CTTGTCTATGCTGATGTGGCTTCAGTTTGCCTCTTCGATCTTTGGTGGCTCTGCCTCTAT
CTTTAAGTTCGAGCTATACTTTGGACTCTTGATCTTTGTGGGATACATGGTGGTGGACAC
CCAAGAGATTATTGAGAAAGCTCACCTCGGAGACATGGACTATGTGAAACATGCGTTGAC
C*TCTTCACCGATTTTGTTGCTGTGTTTGTCCGTAT*CTCATCATAATGCTGA
GA

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR2EZ81TF 643 0 0
TCGTCCTTCTTCGATTCACAACCAGGTAGCAGAAGCTGGAGCTATGATTCCCTCAAGAAC
CTCCATCAGATCTCTCCCTCCGTCCAGAATCACCTCAAGCGGGTTTATCTCACTCTGTGC
CGTGCCCTTGTTGCGTCTGCCTTTGGAGCTTACCTCCACGTGCTCTGGAACATCGGTGGT
CTTCTCACAACCATTGCATGCTGTGGAAGCATGATCTGGCTCCTCTCCTGCCCTCCTCAT
GAACAACAAAAGAGGCTCTCGCTTCTGTTCCTGTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCTATT
GGCCCCTTGATCAAAGTGGCTGTTGATTTCGACCCAAGCATCCTTATCACTGCGTTCGTC
GGAACTGCGATAGCGTTTGTCTGTTTCTCAGGAGCGGCGATGCTGGCAAGGCGCAGAGAG
TATCTCTACCTCGGAGGCCTTCTCTCATCTGGCTTGTCTATGCTGATGTGGCTTCAGTTT
GCCTCTTCGATCTTTGGTGGCTCTGCCTCTATCTTTAAGTTCGAGCTATACTTTGGACTC
TTGATCTTTGTGGGATACATGGTGGTGGACACCCAAGAGATTATTGAGAAAGCTCACCTC
GGAGACATGGACTATGTGAAACATGCGTTGACCCTCTTCACCG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2A918JQ 771 0 0
GGAGCTTACCTCCACGTGCTCTGGAACATCGGTGGTCTTCTCACAACCATTGCATGCTGT
GGAAGCATGATCTGGCTCCTCTCCTGCCCTCCTCATGAACAACAAAAGAGGCTCTCGCTT
CTGTTCCTGTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCTATTGGCCCCTTGATCAAAGTGGCTGTT
GATTTCGACCCAAGCATCCTTATCACTGCGTTCGTCGGAACTGCGATAGCGTTTGTCTGT
TTCTCAGGAGCGGCGATGCTGGCAAGGCGCAGAGAGTATCTCTACCTCGGAGGCCTTCTC
TCATCTGGCTTGTCTATGCTGATGTGGCTTCAGTTTGCCTCTTCGATCTTTGGTGGCTCT
GCCTCTATCTTTAAGTTCGAGCTATACTTTGGACTCTTGATCTTTGTGGGATACATGGTG
GTGGACACCCAAGAGATTATTGAGAAAGCTCACCTCGGAGACATGGACTATGTGAAACAT
GCGTTGACCCTCTTCACCGATTTTGTTGCTGTGTTTGTCCGTATTCTCATCATAATGCTG
AAGAACTCGGCAGATAAAGAGGAGAAGAAGAAGAAGAGGAGAAACTGAGAGACTTAAAAG
TGACAAGGAAATCGAATAAGAGTTGGGGTGTTACAAACACGTGAAAGCTTTGGTGTTTTT
ATGATTAGGACGTACTTTGGTTTGCGTATTCCTCTTATTGCACAAGATTGTAAATGGATC
AGATAGTTTCCGCTTTTATCCTTACTCTCGTTCAATTTCGTGATGTTCATG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2EZ81JQ 678 0 0
GGCTGTTGATTTCGACCCAAGCATCCTTATCACTGCGTTCGTCGGAACTGCGATAGCGTT
TGTCTGTTTCTCAGGAGCGGCGATGCTGGCAAGGCGCAGAGAGTATCTCTACCTCGGAGG
CCTTCTCTCATCTGGCTTGTCTATGCTGATGTGGCTTCAGTTTGCCTCTTCGATCTTTGG
TGGCTCTGCCTCTATCTTTAAGTTCGAGCTATACTTTGGACTCTTGATCTTTGTGGGATA
CATGGTGGTGGACACCCAAGAGATTATTGAGAAAGCTCACCTCGGAGACATGGACTATGT
GAAACATGCGTTGACCCTCTTCACCGATTTTGTTGCTGTGTTTGTCCGTATTCTCATCAT
AATGCTGAAGAACTCGGCAGATAAAGAGGAGAAGAAGAAGAAGAGGAGAAACTGAGAGAC
TTAAAAGTGACAAGGAAATCGAATAAGAGTTGGGGTGTTACAAACACGTGAAAGCTTTGG
TGTTTTTATGATTAGGACGTACTTTGGTTTGCGTATTCCTCTTATTGCACAAGATTGTAA
ATGGATCAGATAGTTTTCGCTTTTATCCTTACTCTCGTTCAATTTCGTGATGTTCATGAT
TTTTCTTCTACTGTTTAAATCACTTGAAGACGAGGATTAGCAGGATAATAATGAAGTACT
AGAACCATTCTTCTTGAG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2FP76JQ 490 0 0
TCTGCCTCTATCTTTAAGTTCGAGCTATACTTTGGACTCTTAATCTTTGTGGGATACATG
GTGGTGGACACCCAAGAGATTATTGAGAAAGCTCACCTCGGAGACATGGACTATGTGAAA
CATGCGTTGACCCTCTTCACCGATTTTGTTGCTGTGTTTGTCCGTATTCTCATCATAATG
CTGAAGAACTCGGCAGATAAAGAGGAGAAGAAGAAGAAGAGGAGAAACTGAGAGACTTAA
AAGTGACAAGGAAATCGAATAAGAGTTGGGGTGTTACAAACACGTGAAAGCTTTGGTGTT
TTTATGATTAGGACGTACTTTGGTTTGCGTATTCCTCTTGTTGCACAAGATTGTAAATGG
ATCAGATAGTTTTCGCTTTTATCCTTACTCTCGTTCAATTTCGTGATGTTCATGATTTTT
CTTCTACTGTTTAAATCACTTGAAGACGAGGATTAGCAGGATAATAATGAAGTACTAGAA
CCATTCTTC
C

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2FL66JQ 563 0 0
GGAGGCCTTCTCTCATCTGGCTTGTCTATGCTGATGTGGCTTCAGTTTGCCTCTTCGATC
TTTGGTGGCTCTGCCTCTATCTTTAAGTTCGAGCTATACTTTGGACTCTTGATCTTTGTG
GGATACATGGTGGTGGACACCCAAGAGATTATTGAGAAAGCTCACCTCGGAGACATGGAC
TATGTGAAACATGCGTTGACCCTCTTCACCGATTTTGTTGCTGTGTTTGTCCGTATTCTC
ATCATAATGCTGAAGAACTCGGCAGATAAAGAGGAGAAGAAGAAGAAGAGGAGAAACTGA
GAGACTTAAAAGTGACAAGGAAATCGAATAAGAGTTGGGGTGTTACAAACACGTGAAAGC
TTTGGTGTTTTTATGATTAGGACGTACTTTGGTTTGCGTATTCCTCTTATTGCACAAGAT
TGTAAATGGATCAGATAGTTTTCGCTTTTATCCTTACTCTCGTTCAATTTCGTGATGTTC
ATGATTTTTCTTCTACTGTTTAAATCACTTGAAGACGAGGATTAGCAGGATAATAATGAA
GTACTAGAACCATTCTTC
TTGAC

QA 1 558 1 558
DS 



CO CL95Contig2 775 3 7 U
TTTTCTCTTGGCAACCAGACGCGAAACTACACCAAAAAAAAAACGTAGAATCCCCAACTA
ATATTCTTTTAGACAGACTAAGATAATGAACGAAAATGGAGCACCACTAGATCCATTTAC
AATCGGGAGCGACTTAGAGGAATACACAAATAAGGTAACATGTGTTTTTAGCAAAACCGT
CTCAAACAAGTAAAAACACCAAAGCTTTCATGTACTTTTATCACCCACTCTCCATTAAGC
TTTCTTTCTCACTTTGAATCTCAGTTCCTCCTCTTCTTCTTTTTCTCTTCTTTATCTGCC
GAGTTCTTCAGCATTATGATGAGGATACGAACAAACACAGCTACAAAATCGGTGAAAAGG
ATCAAGGAATGTTTCACGTAGTCCATGTCACCGTGGTGGGCCTTCTCTATAATATCTTGA
GTGTCCACCACCATGTATCCCACAAAGATCAAGAGTCCAAAGTAGAGCTCGAACTTAAAG
ATAGATGCAGAGCCACCGAAGATGGAAGAGGCGAACTGAAGCCACATAAGCATGGACAAG
CCAGATGAAAGAAGTCCTCCGAGGTAGAGATACTCTCTGCGTCTTGCCAGCATCGCTGCT
CCCGAGAAACAGATAAAGGCTATCGCAGTTCCCACAAACGCAGTGATAAGGATGCTTGGG
TCAAAATCAACTGCCACTTTGATCAAGGGACCAACTGAAGCACCTTTCAAGAACAGCAGA
CAGAAACAGAAGTGAGAGCCTCTTTTTGTTGTTCATAAGGAGGAGACGAGAGCAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY79JQ U 1
AF RR2G731JQ U 48
AF RR2BG33JQ U 1
BS 1 15 RR2BG33JQ
BS 16 16 RR2DY79JQ
BS 17 35 RR2BG33JQ
BS 36 36 RR2DY79JQ
BS 37 476 RR2BG33JQ
BS 477 477 RR2G731JQ
BS 478 775 RR2BG33JQ

RD RR2DY79JQ 352 0 0
TTTTCTCTTGGCAACCAGACGCGAAACTACACCAAAAAAAAAACGTAGAATCCCCAACTA
ATATTCTTTTAGACAGACTAAGATAATGAACGAAAATGGAGCACCACTAGATCCATTTAC
AATCGGGAGCGACTTAAAGGAATACACAAATAAGGTAACATGTGTTTTTAGCAAAACCGT
CTCAAACAAGTAAAAACACCAAAGCTTTCATGTACTTTTATCACCCACTCTCCATTAAGC
TTTCTTTCTCACTTTGAATCTCAGTTCCTCCTCTTCTTCTTTTTCTCTTCTTTATCTGCC
GAGTTCTTCAGCATTATGATGAGGATACGAACAAACACAGCTACAAAATCGG

QA 1 352 1 352
DS 

RD RR2G731JQ 446 0 0
GAAT
CCCCAACTAATATTCTTTTAGACAGACTAAGATAATGAACGAAAATGGAGCACCACTAGA
TCCATTTACAATCGGGAGCGACTTAGAGGAATACACAAATAAGGTAACATGTGTTTTTAG
CAAAACCGTCTCAAACAAGTAAAAACACCAAAGCTTTCATGTACTTTTATCACCCACTCT
CCATTAAGCTTTCTTTCTCACTTTGAATCTCAGTTCCTCCTCTTCTTCTTTTTCTCTTCT
TTATCTGCCGAGTTCTTCAGCATTATGATGAGGATACGAACAAACACAGCTACAAAATCG
GTGAAAAGGGTCAAGGAATGTTTCACGTAGTCCATGTCACCGTGGTGGGCCTTCTCTATA
ATATCTTGAGTGTCCACCACCATGTATCCCACAAAGATCAAGAGTCCAAAGTAGAGCTCG
AACTTAAAGATAGATGCAGAGC

QA 5 446 5 446
DS 

RD RR2BG33JQ 775 0 0
TTTTCTCTTGGCAAC*AGACGCGAAACTACACCAACAAAAAAACGTAGAATCCCCAACTA
ATATTCTTTTAGACAGACTAAGATAATGAACGAAAATGGAGCACCACTAGATCCATTTAC
AATCGGGAGCGACTTAGAGGAATACACAAATAAGGTAACATGTGTTTTTAGCAAAACCGT
CTCAAACAAGTAAAAACACCAAAGCTTTCATGTACTTTTATCACCCACTCTCCATTAAGC
TTTCTTTCTCACTTTGAATCTCAGTTCCTCCTCTTCTTCTTTTTCTCTTCTTTATCTGCC
GAGTTCTTCAGCATTATGATGAGGATACGAACAAACACAGCTACAAAATCGGTGAAAAGG
ATCAAGGAATGTTTCACGTAGTCCATGTCACCGTGGTGGGCCTTCTCTATAATATCTTGA
GTGTCCACCACCATGTATCCCACAAAGATCAAGAGTCCAAAGTAGAGCTCGAACTTGAAG
ATAGATGCAGAGCCACCGAAGATGGAAGAGGCGAACTGAAGCCACATAAGCATGGACAAG
CCAGATGAAAGAAGTCCTCCGAGGTAGAGATACTCTCTGCGTCTTGCCAGCATCGCTGCT
CCCGAGAAACAGATAAAGGCTATCGCAGTTCCCACAAACGCAGTGATAAGGATGCTTGGG
TCAAAATCAACTGCCACTTTGATCAAGGGACCAACTGAAGCACCTTTCAAGAACAGCAGA
CAGAAACAGAAGTGAGAGCCTCTTTTTGTTGTTCATAAGGAGGAGACGAGAGCAG

QA 1 775 1 775
DS 



CO CL95Contig3 999 5 3 U
GGGACATTTTAATCATCTCAAAGCAAGCAAAAGAATACAAAAAAGTTATGGAATCATTCT
CGTCCTTCTTCGATTCTCAAACTGGTAGCAGAAGCTGGAGCTATGATTCTCTCAAGAACC
TCCGTCAGATTTCCCCGGCTGTCCAGAATCATCTTAAGCGGGTTTATCTTACTCTGTGTT
GTGCTCTTGTTGCGTCTGCGTTTGGGGCTTACCTTCATATGCTCTGGAACATTGGTGGTA
TTCTCACTACTATGGGATGCTTTGGAAGCATGATTTGGCTGCTCTCCTGTCCTCCTTATC
AACAACAAAAGAGGCTTTCACTTCTCTTTCTCTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCTGTTG
GTCCCTT*GATCAAAGTGGCAGTTGATTTTGACCCAAGCATCCTTATCACTGCATTCGTC
GGGACTGCGATAGCCTTTATCTGTTTCTCGGGAGCAGCGATGCTGGCAAGACGCAGAGAG
TATCTCTACCTCGGAGGACTCCTTTCATCTGGCTTGTCCATGCTTATGTGGCTTCAGTTC
GCCTCTTCGATCTTTGGTGGCTCTGCATCTATCTTTAAGTTCGAGCTCTACTTTGGACTC
TTGATCTTTGTGGGATACATGGTGGTGGACACTCAAGATATTATAGAGAAGGCCCACCAC
GGTGACATGGACTACGTGAAACATTCCTTGACCCTTTTCACCGATTTTGTAGCTGTGTTT
GTTCGTATCCTCATCATAATGCTGAAGAACTCGGCAGATAAAGAAGAGAAAAAGAAGAAG
AGGAGGAACTGAGGTTCAAAGTGAGAAAGAAAGCTTAATGGAGAGTGGGTGATAAAAGTA
CATGAAAGCTTTGGTGTTTTTACTTGTTTGAGACGGTTTTGCTAAAAACATGTTACCTTA
TTTGTGTATTCCTCTAAGTCGCTCCCGATTGTAAATGGATCTAGTGGTGCTCCATTTTCG
TTCATTATCTTAGTCTGTCTAAAAGAATATTAGTTGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY79TF U 1
AF RR2G731TF U 23
AF RR2AO07TF U 2
AF RR2AM45TF U 9
AF RR2AO07JQ C 170
BS 1 282 RR2DY79TF
BS 283 768 RR2AO07TF
BS 769 999 RR2AO07JQ

RD RR2DY79TF 282 0 0
GGGACATTTTAATCATCTCAAAGCAAGCAAAAGAATACAAAAAAGTTATGGAATCATTCT
CGTCCTTCTTCGATTCTCAAACTGGTAGCAGAAGCTGGAGCTATGATTCTCTCAAGAACC
TCCGTCAGATTTCCCCGGCTGTCCAGAATCATCTTAAGCGGGTTTATCTTACTCTGTGTT
GTGCTCTTGTTGCGTCTGCGTTTGGGGCTTACCTTCATATGCTCTGGAACATTGGTGGTA
TTCTCACTACTATGGGATGCTTTGGAAGCATGATTTGGCTGC

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR2G731TF 623 0 0
GG
AAGCAAAAGAATACAAAAAAGTTATGGAATCATTCTCGTCCTTCTTCGATTCTCAAACTG
GTAGCAGAAGCTGGAGCTATGATTCTCTCAAGAACCCCCGTCAGATTTCCCCGGCTGTCC
AGAATCATCTTAAGCGGGTTTATCTTACTCTGTGTTGTGCTCTTGTTGCGTCTGCGTTTG
GGGCTTACCTTCATATGCTCTGGAACATTGGTGGTATTCTCACTACTATGGGATGCTTTG
GAAGCATGATTTGGCTGCTCTCCTGTCCTCCTTATCAACAACAAAAGAGGCTTTCACTTC
TCTTTCTCTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCTGTTGGCCCCTT*GATCAAAGTGGCAGTT
GATTTTGACCCAAGCATCCTTATCACTGCATTCGTCGGGACTGCGATAGCCTTTATCTGT
TTCTCGGGAGCAGCGATGCTGGCAAGACGCAGAGAGTATCTCTACCTCGGAGGACTCCTT
TCATCTGGCTTGTCCATGCTTATGTGGCTTCAGTTCGCCTCTTCGATCTTTGGTGGCTCT
GCATCTATCTTTAAGTTCGAGCTCTACTTTGGACTCTTGATCTTTGTGGGATACATGGTG
GTGGACACTCAAGATATTATA

QA 3 623 3 623
DS 

RD RR2AO07TF 767 0 0
GGACATTTT
AATCATCTCAAAGCAAGCAAAAGAATACAAAAAAGTTATGGAATCATTCTCGTCCTTCTT
CGATTCTCAAACTGGTAGCAGAAGCTGGAGCTATGATTCTCTCAAGAACCTCCGTCAGAT
TTCCCCGGCTGTCCAGAATCATCTTAAGCGGGTTTATCTTACTCTGTGTTGTGCTCTTGT
TGCGTCTGCGTTTGGGGCTTACCTTCATATGCTCTGGAACATTGGTGGTATTCTCACTAC
TATGGGATGCTTTGGAAGCATGATTTGGCTGCTCTCCTGTCCTCCTTATCAACAACAAAA
GAGGCTTTCACTTCTCTTTCTCTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCTGTTGGTCCCTT*GA
TCAAAGTGGCAGTTGATTTTGACCCAAGCATCCTTATCACTGCATTCGTCGGGACTGCGA
TAGCCTTTATCTGTTTCTCGGGAGCAGCGATGCTGGCAAGACGCAGAGAGTATCTCTACC
TCGGAGGACTCCTTTCATCTGGCTTGTCCATGCTTATGTGGCTTCAGTTCGCCTCTTCGA
TCTTTGGTGGCTCTGCATCTATCTTTAAGTTCGAGCTCTACTTTGGACTCTTGATCTTTG
TGGGATACATGGTGGTGGACACTCAAGATATTATAGAGAAGGCCCACCACGGTGACATGG
ACTACGTGAAACATTCCTTGACCCTTTTCACCGATTTTGTAGCTGTGTTTGTTCGTATCC
TCATCATAATGCTGAAGAACTCGGCAGATAAAGAAGAG

QA 10 767 10 767
DS 

RD RR2AM45TF 751 0 0
GG
AATCATCTCAAAGCAAGCAAAAGAATACAAAAAAGTTATGGAATCATTCTCGTCCTTCTT
CGATTCTCAAACTGGTAGCAGAAGCTGGAGCTATGATTCTCTCAAGAACCTCCGTCAGAT
TTCCCCAGCTGTCCAGAATCATCTTAAGCGGGTTTATCTTACTCTGTGTTGTGCTCTTGT
TGCGTCTGCGTTTGGGGCTTACCTTCATATGCTCTGGAACATTGGTGGTATTCTCACTAC
TATGGGATGCTTTGGAAGCATGATTTGGCTGCTCTCCTGTCCTCCTTATCAACAACAAAA
GAGGCTTTCACTTCTCTTTCTCTCTGCCGTTCTTGAAGGTGCTTCTGTTGGTCCCTTTGA
TCAAAGTGGCAGTTGATTTTGACCCAAGCATCCTTATCACTGCATTCGTCGGGACTGCGA
TAGCCTTTATCTGTTTCTCGGGAGCAGCGATGCTGGCAAGACGCAGAGAGTATCTCTACC
TCGGAGGACTCCTTTCATCTGGCTTGTCCATGCTTATGTGGCTTCAGTTCGCCTCTTCGA
TCTTTGGTGGCTCTGCATCTATCTTTAAGTTCGAGCTCTACTTTGGACTCTTGATCTTTG
TGGGATACATGGTGGTGGACACTCAAGATATTATAGAGAAAGCCCACCACGGTGACATGG
ACTACGTGAAACATTCCTTGACCCTTTTCACCGATTTTGTAGCTGTGTTTGTTCGTATCC
TCATCATAATGCTGAAGAACTCGGCAGAT

QA 3 751 3 751
DS 

RD RR2AO07JQ 830 0 0
TACTCTGTGTTGTGCTCTTGTTGCGTCTGCGTTTGGGGCTTACCTTCATATGCTCTGGAA
CATTGGTGGTATTCTCACTACTATGGGATGCTTTGGAAGCATGATTTGGCTGCTCTCCTG
TCCTCCTTATCAACAACAAAAGAGGCTTTCACTTCTCTTTCTCTCTGCCGTTCTTGAAGG
TGCTTCTGTTGGTCCCTT*GATCAAAGTGGCAGTTGATTTTGACCCAAGCATCCTTATCA
CTGCATTCGTCGGGACTGCGATAGCCTTTATCTGTTTCTCGGGAGCAGCGATGCTGGCAA
GACGCAGAGAGTATCTCTACCTCGGAGGACTCCTTTCATCTGGCTTGTCCATGCTTATGT
GGCTTCAGTTCGCCTCTTCGATCTTTGGTGGCTCTGCATCTATCTTTAAGTTCGAGCTCT
ACTTTGGACTCTTGATCTTTGTGGGATACATGGTGGTGGACACTCAAGATATTATAGAGA
AGGCCCACCACGGTGACATGGACTACGTGAAACATTCCTTGACCCTTTTCACCGATTTTG
TAGCTGTGTTTGTTCGTATCCTCATCATAATGCTGAAGAACTCGGCAGATAAAGAAGAGA
AAAAGAAGAAGAGGAGGAACTGAGGTTCAAAGTGAGAAAGAAAGCTTAATGGAGAGTGGG
TGATAAAAGTACATGAAAGCTTTGGTGTTTTTACTTGTTTGAGACGGTTTTGCTAAAAAC
ATGTTACCTTATTTGTGTATTCCTCTAAGTCGCTCCCGATTGTAAATGGATCTAGTGGTG
CTCCATTTTCGTTCATTATCTTAGTCTGTCTAAAAGAATATTAGTTGGGG

QA 1 830 1 830
DS 



AS 2 20

CO CL96Contig1 711 6 16 U
GGGGATCGCCGACGAGTAACAGCATTAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCA
TCATGATCAAGCCTGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCG
AGCAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTG
AGAAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAA
TCTCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGA
AGATCATTGGAGCAACTAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTG
CAATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAGG
AATGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGA
TCTACGAATGATTCCATCATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTTATTTCTGT
TGCTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACAAGACTTTGTTTTT
TTTTGTGTGGGGGTTTCTTTTACTCTTCTTATATTATTTTCTCTTTCTCCTCGAGCAAGA
AAGCTCATCGGTTTTCATGCGCTAGTTATATTAACTTTCTTGCATTCCAAA


BQ
10 10 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2BE83TF U 1
AF RR2FW73TF U 2
AF RR2G279TF U 101
AF RR2AJ77TF U 3
AF RR2BW44JQ C 3
AF RR2BW44TF U 3
BS 1 3 RR2BE83TF
BS 4 4 RR2FW73TF
BS 5 37 RR2BE83TF
BS 38 38 RR2FW73TF
BS 39 155 RR2BE83TF
BS 156 156 RR2FW73TF
BS 157 162 RR2BE83TF
BS 163 164 RR2FW73TF
BS 165 337 RR2BE83TF
BS 338 338 RR2FW73TF
BS 339 601 RR2BE83TF
BS 602 604 RR2FW73TF
BS 605 605 RR2AJ77TF
BS 606 609 RR2FW73TF
BS 610 658 RR2AJ77TF
BS 659 711 RR2BW44TF

RD RR2BE83TF 601 0 0
GGGTATCGCCGACGAGTAACAGCATTAAAAAAAAAGAGTCGACAATGGAGCAAACTTTCA
TCATGATCAAGCCTGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCG
AGCAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGTTGCTCACTG**GACCGTCCTTTTGCTG
AGAAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAA
TCTCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGA
AGATCATTGGAGCAACTAACCCTGCAGCTTCTGAACCTGGAACCATCCGTGGGGATTTTG
CAATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAGG
AATGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGA
TCTACGAATGATTCCATCATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTTATTTCTGT
TGCTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACAAGACTTTGTTTTT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2FW73TF 608 0 0
A
GGATCGCCGACGAGTAACAGCATTAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCTGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAG
CAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAATTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAG
AAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATC
TCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCAACTAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCA
ATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAGGAA
TGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATC
TACGAATGATTCCATCATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTTATTTCTGTTG
CTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACAAGACTTTGTTTTTTT
TTTTGTG

QA 2 608 2 608
DS 

RD RR2G279TF 501 0 0
TCAAATCATCTGCAGGTTCGAGCAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAATTTGATCAC
TGTGGACCGTCCTTTTGCTGAGAAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAG
TGGCCTTGTTGATTACATAATCTCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAA
CGTTGTGTTGACGGGAAGGAAGATCATTGGAGCAACTAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGG
AACCATCCGTGGGGATTTTGCAATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTC
TGTTGATAGCGCTAACAAGGAATGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCA
GAGCAGCCTCCACTCTTGGATCTACGAATGATTCCATCATTCAAAACATGTTTCTCCACT
GTTATTGCTGTTATTTCTGTTGCTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCT
TAAAACAAGACTTTGTTTTTT

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR2AJ77TF 656 0 0
GGATCGCCGACGAGTAACAGCATTAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCTGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAG
CAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAG
AAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATC
TCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCAACTAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCA
ATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAGGAA
TGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATC
TACGAATGATTCCATCATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTTATTTCTGTTG
CTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACAAGACTTTGTTTTTTT
TTGTGTGGGGGTTTCTTTTACTCTTCTTATATTATTTTCTCTTTCTCCTCGAGCAA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2BW44JQ 706 0 0
GGATCGCCGACGAGTAACAGCGTTAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCTGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAG
CAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAG
AAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATT
TCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCAACTAACCCTGCAGCTTTTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCA
ATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAGGAA
TGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATC
TACGAATGATTCCATCATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTTATTTCTGTTG
CTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACTAGACTTTGTTTTTTT
TTGTGTGGGGGTTTCTTTTACTCTTCTTATATTATTTTCTCTTTCTCCTCGAGCAAGAAA
GCTCATCGGTTTTCATGCGCTAGTTATATTAACTTTCTTGCATTCC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2BW44TF 709 0 0
GGATCGCCGACGAGTAACAGCGTTAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCTGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAG
CAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAG
AAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATC
TCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCAACTAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCA
ATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAGGAA
TGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATC
TACGAATGATTCCATCATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTTATTTCTGTTG
CTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAA*CTAGACTTTGTTTTTTT
TTGTGTGGGGGTTTCTTTTACTCTTCTTATATTATTTTCTCTTTCTCCTCGAGCAAGAAA
GCTCATCGGTTTTCATGCGCTAGTTATATTAACTTTCTTGCATTCCAAA

QA 1 709 1 709
DS 



CO CL96Contig2 684 14 32 U
GGAGGGATCGCCGACGAGTAACAGCA*CAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTT
CATCATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTT
CGAGCAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGC
TGAGAAGCACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACAT
AATCTCTGGTCCAGTCGTTGCGATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAG
GAAGATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTT
CGCAATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCAGTGGATAGCGCTAACAA
GGAATGTGCCTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTG
GATCTACGAATGATTCCATCGTTTTT*GTGATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGC
TGTTATCTCTGTCGCTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACAT
GACTTTGTTTTTTTTGTGTGTGGTTTCTTTTACTCGTCTTATTATATTCTCTTTCTCCTA
GAGCAAGAAAGATCATCGTTGTTC


BQ
30 30 30 35 65 5 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 25 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 50 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 55 80 55 80 80 80 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 65 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 25 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 10 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 
80 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 60 60 60 60 
60 20 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV01TF U 1
AF RR2BV41JQ C 1
AF RR2BV41TF U 1
AF RR2A207JQ C 5
AF RR2CD63JQ C 1
AF RR2G435TF U 2
AF RR2A207TF U 5
AF RR2G435JQ C 16
AF RR2D537JQ C 5
AF RR2D537TF U 5
AF RR2CD63TF U 34
AF RR2FC09TF U 5
AF RR2GL32TF U 5
AF RR2GL32JQ C 7
BS 1 5 RR2BV41TF
BS 6 6 RR2A207TF
BS 7 26 RR2BV41TF
BS 27 27 RR2GV01TF
BS 28 29 RR2BV41TF
BS 30 30 RR2GV01TF
BS 31 144 RR2BV41TF
BS 145 145 RR2GV01TF
BS 146 186 RR2BV41TF
BS 187 187 RR2G435TF
BS 188 249 RR2BV41TF
BS 250 250 RR2G435TF
BS 251 261 RR2BV41TF
BS 262 262 RR2G435TF
BS 263 320 RR2BV41TF
BS 321 321 RR2GV01TF
BS 322 360 RR2BV41TF
BS 361 361 RR2G435TF
BS 362 402 RR2BV41TF
BS 403 403 RR2G435TF
BS 404 405 RR2BV41TF
BS 406 406 RR2G435TF
BS 407 429 RR2BV41TF
BS 430 430 RR2G435TF
BS 431 506 RR2BV41TF
BS 507 507 RR2G435TF
BS 508 552 RR2BV41TF
BS 553 553 RR2G435TF
BS 554 598 RR2BV41TF
BS 599 638 RR2G435TF
BS 639 678 RR2GL32TF
BS 679 684 RR2GL32JQ

RD RR2GV01TF 482 0 0
GGAGGTATCGCCGACGAGTAACAGCA*CAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTT
CATCATGATCAAGCCCGACGGCGCCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTT
CGAGCAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGC
TGAGAAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACAT
AATCTCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAG
GAAGATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTT
TGCAATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAA
GGAATGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTG
GA

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR2BV41JQ 598 0 0
GGAGGTATCGCCGACGAGTAACAGCATCAGAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTT
CATCATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGTTTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTT
CGAGCAGAAGGGTTTCACTTTGAAGGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGC
TGAGAAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACAT
AATTTCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAG
GAAGATCATTGGAGCAACCAGCCCTGCAGCTTTTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTT
TGCAATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAA
GGAATGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTG
GATCTACGAATGATTCCATCGTTTTTTGTGATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGC
TGTTATCTCTGTTGCTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAAC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2BV41TF 598 0 0
GGAGGTATCGCCGACGAGTAACAGCATCAGAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTT
CATCATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTT
CGAGCAGAAGGGTTTCACTTTGAAGGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGC
TGAGAAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACAT
AATCTCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAG
GAAGATCATTGGAGCAACCAGCCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTT
TGCAATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAA
GGAATGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTG
GATCTACGAATGATTCCATCGTTTTTTGTGATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGC
TGTTATCTCTGTTGCTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAAC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2A207JQ 579 0 0
GGATCGCCGACGAGTAACAGCA*CAAAAAAAAAGAATCGACAATGTAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGTTTGGTCGGTCAAATCATTTGCAGGTTCGAG
CAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGCCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAG
AAGCACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTTTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATC
TTTGGTCCAGTCGTTGCGATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTTTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTCGCA
ATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCAGTGGATAGCGCTAACAAGGAA
TGTGCCTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCCCTCTTGGATC
TACGAATGATTCCATCGTTTTC*GTGATTCAAAACATGTTTTTCCACTGTTATTGCTGTT
ATTTCTGTCGCTTTCCCCCTTTGCATCTTTGTTTTGAAG

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2CD63JQ 640 0 0
GGAGGTATCGCCGACGAGTAACAGCATCAGAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTT
CATCATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTT
CGAGCAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGC
TGAGAAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACAT
AATTTCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAG
GAAGATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTTTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTT
TGCAATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAA
GGAATGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTG
GATCTACGAATGATTCCATCGTTTTTTGTGATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGC
TGTTATCTCTGTTGCTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACAT
GACCTTGTTTTTTTTGTGTGGGGTTTCTTTTGCTCGTCTT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2G435TF 641 0 0
GG
GGTATCGCCGACGAGTAACAGCA*CAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCAT
CATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGA
GCAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGA
GAAGCACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAAT
CTCTGGTCCAGTCGTTGCGATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAA
GATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTCGC
AATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCAGTGGATAGCGCTAACAAGGA
ATGTGCCTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGAT
CTACGAATGATTCCATCGTTTTT*GTGATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGT
TATCTCTGTCGCTTTCCACCTTTGTATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACATGAC
TTTGTTTTTTTTGTGTGTGGTTTCTTTTACTCGTC
GAAA

QA 3 637 3 637
DS 

RD RR2A207TF 612 0 0
GGATCGCCGACGAGTAACAGCA*CAAAAAAAAAGAATCGACAATGTAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAG
CAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGCCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAG
AAGCACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATC
TCTGGTCCAGTCGTTGCGATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTCGCA
ATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCAGTGGATAGCGCTAACAAGGAA
TGTGCCTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATC
TACGAATGATTCCATCGTTTTC*GTGATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTT
ATCTCTGTCGCTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACATGACT
TTGTTTT
AAAAG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2G435JQ 624 0 0
GAGTAACAGCA*CAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCATCATGATCAAGCC
CGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAGCAGAAGGGTTT
CACTTTGAAAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAGAAGCACTACCA
AGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATCTTTGGTCCAGT
CGTTGCGATGATTTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAGATCATTGGAGC
AACCAACCCTGCAGCTTTTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTCGCAATTGACATTGG
CAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCAGTGGATAGCGCTAACAAGGAATGTGCCTTGTG
GTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATTTACGAATGATT
CCATCGTTTTT*GTGATTCAAAACATGTTTTTCCACTGTTATTGCTGTTATTTCTGTCGC
TTTCCACCTTTGTATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACATGACTTTGTTTTTTTT
GTGTGTGGTTTCTTTTACTCGTC
G

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2D537JQ 610 0 0
GGATCGCCGACGAGTAACAGCA*CAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAG
CAGAAGGGTTTCACTTCGAAAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAG
AAGCACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATC
TCTGGTCCAGTCGTTGCGATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTCGCA
ATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCAGTGGATAGCGCTAACAAGGAA
TGTGCCTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATC
TACGAATGATTCCATCGTTTTT*GTGATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTT
ATCTCTGTCGCTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACATGACT
TTGTTTTTTT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2D537TF 610 0 0
GGATCGCCGACGAGTAACAGCA*CAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAG
CAGAAGGGTTTCACTTCGAAAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAG
AAGCACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATC
TCTGGTCCAGTCGTTGCGATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTCGCA
ATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCAGTGGATAGCGCTAACAAGGAA
TGTGCCTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATC
TACGAATGATTCCATCGTTTTT*GTGATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTT
ATCTCTGTCGCTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACATGACT
TTGTTTTTTT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2CD63TF 616 0 0
AAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCATCATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGG
TCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAGCAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAA
GTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAGAAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCC
CTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATCTCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGA
GGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAGATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTC
TGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCAATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGG
GAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAGGAATGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGT
GAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATCTACGAATGATTCCATCGTTTTTTGTGATT
CAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTTATCTCTGTTGCTTTCCACCTTTGCATCTT
TGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACATGACCTTGTTTTTTT*GTGTGGGGTTTCTTTTGC
TCGTC
TTAAAAAAAAA

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2FC09TF 610 0 0
GGATCGCCGACGAGTAACAGCATCAGAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAG
CAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAG
AAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATC
TCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCA
ATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTAATAGCGCTAACAAGGAA
TGTGCGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATC
TACGAATGATTCCATCGTTTTTTGTGATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTACTGCTGTT
ATCTCTGTTGCTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACATGACC
TTGTTTTTTT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2GL32TF 680 0 0
GGATCGCCGACGAGTAACAGCA*CAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAG
CAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAG
AAGCACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATC
TCTGGTCCAGTCGTTGCGATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTCGCA
ATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCAGTGGATAGCGCTAACAAGGAA
TGTGCCTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATC
TACGAATGATTCCATCGTTTTT*GTTATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTT
ATCTCTGTCGCTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACATGACT
TTGTTTTTTTTGTGTGTGGTTTCTTTTACTCGTCTTATTATATTCTCTTTCTCCTAGAGC
AAGAAAGATCATCG
TTGTTC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2GL32JQ 678 0 0
ATCGCCGACGAGTAACAGCACAAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTTCATCAT
GATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAGCA
GAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAGAA
GCACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATCTC
TGGTCCAGTCGTTGCGATGATCTGGAAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAGAT
CATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTTTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTCGCAAT
TGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCAGTGGATAGCGCTAACAAGGAATG
TGCCTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATCTA
CGAATGATTCCATCGTTTTT*GTTATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTTAT
CTCTGTCGCTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACATGACTTT
GTTTTTTTTGTGTGTGGTTTCTTTTACTCGTCTTATTATATTCTCTTTCTCCTAGAGCAA
GAAAGATCATCGTTGTTC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 2 19

CO CL97Contig1 881 5 8 U
CATCACGAAGGAGAGAAGGAAGCATTTCATCATCTATCAACAATGGCGATTCGTTCTGTA
GCGAGTAGAAGAACCCTAGCCGGCTTAAAGGAGACGTCTTCGAGGCTTGTGGGATTGAGA
GGGATCCAGACTTTCTCGCTTCCTGATCTTCCATATGATTACAGCGCGCTGGAGCCGGCG
ATTAGCGGCGAGATTATGCAGATTCATCACCAGAAGCATCACCAGACGTACGTCACTAAT
TACAACAATGCCCTCGAGCAGCTTGATCAGGCCGTTAACAAGGGAGACGCTTCCACTGTC
GTCAAGCTCCATAGCGCCATCAAGTTCAACGGCGGAGGTCATGTGAACCACTCGATTTTC
TGGAAGAATCTTGCTCCTGTCAACCAAGGTGGTGGAGAGCCACCGAAGGGAGCACTTGGT
GGAGCTATTGAAACTCACTTTGGCTCTCTTGAAGGTTTGGTGAAAAAGATGAGTGCTGAA
GGTGCTGCTCTGCAAGGCTCAGGATGGGTGTGGCTCGGTTTAGACAAAGAACTTAAGAAG
CTTGTGGTTGACACCACCGCCAATCAGGATCCACTTGTGACAAAAGGAGGAAGCTTGGTT
CCTCTGGTTGGTATTGATGTTTGGGAGCACGCCTACTACTTGCAGTACAAGAATGTGAGG
CCTGATTATCTGAAGAACGTCTGGAAGGTTATCAACTGGAACTACGCAAACGAAGTTTAT
GAGAAGGAATGCTAGTGAGTTCGTTACAAATAATAACATAAAAGAGAGGACCCAGTTCCC
AGCTCGGCTTTGTTTTTTATAAGTTTGTCTGAAACAAACTTACACTGTCTCTGTTTGTAG
CTCAAGTGAACCTGTGTGGTTGCAATAATACACTTTTAAAG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2CC85TF U 1
AF RR2G006TF U 392
AF RR2AN19TF U 1
AF RR2AN19JQ C 126
AF RR2CC85JQ C 281
BS 1 649 RR2AN19TF
BS 650 650 RR2G006TF
BS 651 687 RR2AN19TF
BS 688 688 RR2AN19JQ
BS 689 725 RR2AN19TF
BS 726 726 RR2AN19JQ
BS 727 795 RR2AN19TF
BS 796 881 RR2AN19JQ

RD RR2CC85TF 289 0 0
G
ATCACGAAGGAGAGAAGGAAGCATTTCATCATCTATCAACAATGGCGATTCGTTCTGTAG
CGAGTAGAAGAACCCTAGCCGGCTTAAAGGAGACGTCTTCGGGGCTTGTGGGATTGAGAG
GGATCCAGACTTTCTCGCTTCCTGATCTTCCATATGATTACAGCGCGCTGGAGCCGGCGA
TTAGCGGCGAGATTATGCAGATTCATCACCAGAAGCATCACCAGACGTACGTCACTAATT
ACAACAATGCCCTCGAGCAGCTTGATCAGGCCGATAACAAGGGAGACG

QA 2 289 2 289
DS 

RD RR2G006TF 333 0 0
GTGGAGAGCCACCGAAGGGAGCTCTTGGTGGAGCTATTGAAACTCACTTTGGCTCTCTTG
AAGGTCTGGTGAAAAAGATGAGTGCTGAAGGTGCTGCTCTGCAAGGCTCAGGATGGGTGT
GGCTCGGTTTAGACAAAGAACTTAAGAAGCTTGTGGTTGACACCACCGCCAATCAGGATC
CACTTGTGACAAAAGGAGGAAGCTTGGTTCCTCTGGTGGGTATTGATGTTTGGGAGCACG
CCTACTACTTGCAGTACAAGAATGTGAGGCCTGATTATCTGAAGA*CGTCTGGAAG*TTA
TCAACTGGAACTACGCAAACGAAGTTTATGAGA

QA 1 333 1 333
DS 

RD RR2AN19TF 795 0 0
CATCACGAAGGAGAGAAGGAAGCATTTCATCATCTATCAACAATGGCGATTCGTTCTGTA
GCGAGTAGAAGAACCCTAGCCGGCTTAAAGGAGACGTCTTCGAGGCTTGTGGGATTGAGA
GGGATCCAGACTTTCTCGCTTCCTGATCTTCCATATGATTACAGCGCGCTGGAGCCGGCG
ATTAGCGGCGAGATTATGCAGATTCATCACCAGAAGCATCACCAGACGTACGTCACTAAT
TACAACAATGCCCTCGAGCAGCTTGATCAGGCCGTTAACAAGGGAGACGCTTCCACTGTC
GTCAAGCTCCATAGCGCCATCAAGTTCAACGGCGGAGGTCATGTGAACCACTCGATTTTC
TGGAAGAATCTTGCTCCTGTCAACCAAGGTGGTGGAGAGCCACCGAAGGGAGCACTTGGT
GGAGCTATTGAAACTCACTTTGGCTCTCTTGAAGGTTTGGTGAAAAAGATGAGTGCTGAA
GGTGCTGCTCTGCAAGGCTCAGGATGGGTGTGGCTCGGTTTAGACAAAGAACTTAAGAAG
CTTGTGGTTGACACCACCGCCAATCAGGATCCACTTGTGACAAAAGGAGGAAGCTTGGTT
CCTCTGGTTGGTATTGATGTTTGGGAGCACGCCTACTACTTGCAGTACAGGAATGTGAGG
CCTGATTATCTGAAGAACGTCTGGAAG*TTATCAACTGGAACTACGCAAACGAAGTTTAT
GAGAAAGAATGCTAGTGAGTTCGTTACAAATAATAACATAAAAGAGAGGACCCAGTTCCC
AGCTCGGCTTTGTTT

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2AN19JQ 756 0 0
CCAGACTTTCTCGCTTCCTGATCTTCCATATGATTACAGCGCGCTGGAGCCGGCGATTAG
CGGCGAGATTATGCAGATTCATCACCAGAAGCATCACCAGACGTACGTCACTAATTACAA
CAATGCCCTCGAGCAGCTTGATCAGGCCGTTAACAAGGGAGACGCTTCCACTGTCGTCAA
GCTCCATAGCGCCATCAAGTTCAACGGCGGAGGTCATGTGAACCACTCGATTTTCTGGAA
GAATCTTGCTCCTGTCAACCAAGGTGGTGGAGAGCCACCGAAGGGAGCACTTGGTGGAGC
TATTGAAACTCACTTTGGCTCTCTTGAAGGTTTGGTGAAAAAGATGAGTGCTGAAGGTGC
TGCTCTGCAAGGCTCAGGATGGGTGTGGCTCGGTTTAGACAAAGAACTTAAGAAGCTTGT
GGTTGACACCACCGCCAATCAGGATCCACTTGTGACAAAAGGAGGAAGCTTGGTTCCTCT
GGTTGGTATTGATGTTTGGGAGCACGCCTACTACTTGCAGTACAGGAATGTGAGGCCTGA
TTATCTGAAGAACGTCTGGAAGGTTATCAACTGGAACTACGCAAACGAAGTTTATGAGAA
GGAATGCTAGTGAGTTCGTTACAAATAATAACATAAAAGAGAGGACCCAGTTCCCAGCTC
GGCTTTGTTTTTTATAAGTTTGTCTGAAACAAACTTACACTGTCTCTGTTTGTAGCTCAA
GTGAACCTGTGTGGTTGCAATAATACACTTTTAAAG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2CC85JQ 597 0 0
AGGGAGACGCTTCCACTGTCGTCAAGCTCCATAGCGCCATCAAGTTCAACGGCGGAGGTC
ATGTGAACCACTCTATTTTCTGGAAGAATCTTGCTCCTGTCAACCAAGGTGGTGGAGAGC
CACCGAAGGGAGCACTTGGTAGAGCTATTGAAACTCACTCTGGCTCTCTTGAAGGTTTGG
TGAAAAAGATGAGTGCTGAAGGTGCTGCTCTGCAAGGCTCAGGATGGGTGTGGCTCGGTT
TAGACAAAGAACTTAAGAAGCTTGTGGTTGACACCACCGCCAATCAGGATCCACTTGTGA
CAAAAGGAGGAAGCTTGGTTCCTCTGGTTGGTATTGATGTTTGGGAGCACGCCTACTACT
TGCAGTACAAGAATGTGAGGCCTGATTATCTGAAGAACGTCTGGAAGGTTATCAACTGGA
ACT*CGCAAACGAAGTTTATGAGAAGGAATGCTAGTGAGTTCGTTACAAATAATAACATA
AAAGAGAGGACCCAGTTCCCAGCTCGGCTTTGTTTTTTATAAGTTTGTCTGAAACAAACT
TACACTGTCTCTGTTTGTAGCTCAAGTGAACCTGTGTGGTTGCAATAATACACTTTT

QA 1 597 1 597
DS 



CO CL97Contig2 939 14 7 U
GGATGAAGTAAAATTTTATTATTGGAAAATGTTTTGTAAAACGTGTATTATTGCAA*CCA
TACATGTTCATTTTGAAGGTAACTCAAAGACCAAAGAGACATTGTACGTTTGTTTCAGAC
AAACTTATAAAAACAAAGCCGAGCTGGGAACTGGTTCCTCTCTTTATGTTTGTTATCATG
TAAAGACCTCATCACTTGCATTCCTTCTCATAAACTTCGCTTGCATATTTCCAGTTGATG
ACTTTCCACACGTTCTTCAGATACTCCGGCCTCACATTCTTGTACTGCAAGTAGTAGGCG
TGCTCCCAAACATCTATACCCACCAGAGGAACCAAGCTTCCTCCTTTCGTCACAAGTGGA
TCCTGATTTGCGGTTGTGTCAACCACAAGCTTCTTAAGCTCTTTGTCTAAACCGAGCCAC
ACCCATCCTGAGCCTTGCACAGCAGCACCTTCAGCACTCATCTTCTTCACCAAACCTTCG
AGAGAGCCAAAATGAGTATCAATAGCTCCACCAAGAGATCCCTTCGGTGGCTCTCCACCA
CCTTCCTTGACAGGAGCAAGATTCTTCCAGAAAATCGAGTGGTTCACATGACCTCCGCCG
TTGAACTTGATGGCGCTCTGCAGCTTAACGACAGCGGAAGCGTCTCCCTTGTTGACGGCC
TGATCGAGCTGCTCGAGGGCATTGTTGTAATTAGTGACGTAAGCCTGGTGATGCTTCTGG
*TGATGGATCTGCATGATCTCGCCGCTGATCGCCGGCTCCAACGCGCTGTAATCATAGGG
GAGATCAGGAAGCGTGAAGGTCTGGATTCCTCGGAAACCAAGAAGCCTCGAAGATGTCTC
CTTTAGGCCCGCTAGGGTTCTTCTGCTGGCTACGGAACGAATCGCCATTGTTGATAGATA
GATAGACGATGAGATACACAGTGAGAGTCTCTCCTTCCC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 10 25 25 25 25 25 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2DS93JQ U 101
AF RR2AC80JQ U 5
AF RR2DZ04JQ U 36
AF RR2FV49JQ U 5
AF RR2BX89JQ U 5
AF RR2FU08JQ U 1
AF RR2CW04JQ U 1
AF RR2BE93JQ U 1
AF RR2BE93TF C 82
AF RR2BX89TF C 160
AF RR2AC80TF C 192
AF RR2DZ04TF C 481
AF RR2FV49TF C 407
AF RR2FU08TF C 275
BS 1 654 RR2BE93JQ
BS 655 655 RR2BX89JQ
BS 656 784 RR2BE93JQ
BS 785 792 RR2BE93TF
BS 793 793 RR2BX89TF
BS 794 915 RR2BE93TF
BS 916 939 RR2AC80TF

RD RR2DS93JQ 232 0 0
ATTGTACGTTTGTTTCGGACAAACTTATAAAAACAAAGCCGAGCTGGGAACTGGTTCCTC
TCTTTATGTTTGTTATCATGTAAAGACCTCATCACTTGCATTCCTTCTCATAAACTTCGC
TTGCATATTTCCAGTTGATGACTTTCCACACTTTCTTCAGATACTCCGGCCTCACATTCT
TGTATTGCAAGTAGTAGGCGTGCTCCCAAACATCTATACCCACCAGAGGAAC

QA 1 232 1 232
DS 

RD RR2AC80JQ 512 0 0
GTAGCAG
AATTTTATTATTGGAAAATGTTTTGTACAACGTGTATTATTGCAA*CCATACATGTTCAT
TTTGAAGGTAACTCAAAGACCAAAGAGACATTGTACGTTTGTTTCAGACAAACTTATAAA
AACAACGCCGAGCTGGGAACTGGTTCCTCTCTTTATGTTTGTTATCATGTAAAGACCTCA
TCACTTGCATTCCTTCTCATAAACTTCGCTTGCATATTTCCAGTTGATGACTTTCCACAC
GTTCTTCAGATACTCCGGCCTCACATTCTTGTACTGCAAGTAGTAGGCGTGCTCCCAAAC
ATCTATACCCACCAGAGGAACCAAGCTTCCTCCATTCGTCACAAGTGGATCCTGATTGGC
GGTTGTGTCAACCACAAGCTTCTTAAGCTCTTTGTCTAAACCGAGCCACACCCATCCTGA
GCCTTGCAGAGCAGCACCTTCAGCACTCATCTTCTTCACCAAACCTTCGAGAGAGCCAAA
ATGAGTATCAATAACTCCACCAAGA

QA 8 512 8 512
DS 

RD RR2DZ04JQ 604 0 0
GTAAAACGTGTATTATTGCAA*CCATACATGTTCATTTTGAAGGTAACTCAAAGACCAAA
GAGACATTGTACGTTTGTTTCAGACAAACTTATAAAAACAACGCCGAGCTGGGAACTGGT
TCCTCTCTTTATGTTTGTTATCATGTAAAGACCTCATCACTTGCATTCCTTCTCATAAAC
TTCGCTTGCATATTTCCAGTTGATGACTTTCCACACGTTCTTCAGATACTCCGGCCTCAC
ATTCTTGTACTGCAAGTAGTAGGCGTGCTCCCAAACATCTATACCCACCAGAGGAACCAA
GCTTCCTCCATTCGTCACAAGTGGATCCTGATTGGCGGTTGTGTCAACCAAAAGCTTCTT
AAGCTCTTTGTCTAAACCGAGCCACACCCATCCTGAGCCTTGCAGAGCAGCACCTTCAGC
ACTCATCTTCTTCACCAAACCTTCGAGAGAGCCAAAATGAGTATCAATAGCTCCACCAAG
AGATCCCTTCGGTGGCTCTCCACCACCTTCCTTTACAGGAGCAAGGTTCTTCCAGAAAAT
CGAGTGGTTCACATGACCTCCGCCGTTGAACTTGATGGCGCTCTGCAGCTTAACGACAGC
GGAA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2FV49JQ 609 0 0
GTAGC
AAAATTTTATTATTGGAAAATGTTTTGTAAAACGTGTATTATTACAAACCATACATGTTC
ATTTTGAAGGTAACTCAAAGACCAAAGAGACATTGTACGTTTGTTTCAGACAAACTTATA
AAAACAACGCCGAGCTGGGAACTGGTTCCTCTCTTTATGTTTGTTATCATGTAAAGACCT
CATCACTTGCATTCCTTCTCATAAACTTCGCTTGCATATTTCCAGTTGATGACTTTCCAC
ACGTTCTTCAGATACTCCGGCCTCACATTCTTGTACTGCAAGTAGTAGGCGTGCTCCCAA
ACATCTATACCCACCAGAGGAACCAAGCTTCCTCCTTTCGTCACAAGTGGATCCTGATTT
GCGGTTGTGTCAACCACAAGCTTCTTAAGCTCTTTGTCTAAACCGAGCCACACCCATCCT
GAGCCTTGCACAGCAGCACCTTCAGCACTCATCTTCTTCACCAAACCTTCGAGAGAGCCA
AAATGAGTATCAATAGCTCCACCAAGAGATCCCTTCGGTGGCTCTCCACCACCTTCCTTT
ACAGGAGCAAGGTTCTTCCAGAAAATCGAGTGGTTCACATGACCTCCGCCGTTGAACTTG
ATGG

QA 6 609 6 609
DS 

RD RR2BX89JQ 744 0 0
GAAGTAAAATTTTATTATTGGAAAATGTTTTGTAAAACGTGTATTATTGCAA*CCATACA
TGTTCATTTTGAAGGTGACTCAAAGACCAAAGAGACATTGTACGTTTGTTTCAGACAAAC
TTATAAAAACAAAGCCGAGCTGGGAACTGGTTCCTCTCTTTATGTTTGTTATCATGTAAA
GACCTCATCACTTGCATTCCTTCTCATAAACTTCGCTTGCATATTTCCAGTTGATGACTT
TCCACACGTTCTTCGGATACTCCGGCCTCACATTCTTGTACTGCAAGTAGTAGGCGTGCT
CCCAAACATCTATACCCACCAGAGGAACCAAGCTTCCTCCTTTCGTCACAAGTGGATCCT
GATTTGCGGTTGTGTCAACCACAAGCTTCTTAAGCTCTTTGTCTAAACCGAGCCACACCC
ATCCTGAGCCTTGCACAGCAGCACCTTCAGCACTCATCTTCTTCACCAAACCTTCGAGAG
AGCCAAAATGAGTATCAATAGCTCCACCAAGAGATCCCTTCGGTGGCTCTCCACCACCTT
CCTTGACAGGAGCAAGATTCTTCCAGAAAATCGAGTGGTTCACATGACCTCCGCCGTTGA
ACTTGATGGCGCTCTGCAGCTTAACGACAGCGGAAGCGTCTCCCTTGTTGACGGCCTGAT
CGAGCTGCTCGAGGGCATTGTTGTAATTAGTGACGTAAGCCTGGTGATGCTTCTGGGTGA
TGGATCTGCATGATCTCGCCGCTG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2FU08JQ 749 0 0
GTAT
GAAGTAAAATTTTATTATTGGAAAATGTTTTGTAAAACGTGTATTATTGCAA*CCATACA
TGTTCATTTTGAAGGTAACTCAAAGACCAAAGAGACATTGTACGTTTGTTTCAGACAAAC
TTATAAAAACAAAGCCGAGCTGAGAACTGGTTCCTCTCTTTATGTTTGTTATCATGTAAA
GACCTCATCACTTGCATTCCTTCTCATAAACTTCGCTTGCATATTTCCAGTTGATGACTT
TCCACACGTTCTTCAGATACTCCGGCCTCACATTCTTGTACTGCAAGTAGTAGGCGTGCT
CCCAAACATCTATACCCACCAGAGGAACCAAGCTTCCTCCTTTCGTCACAAGTGGATCCT
GATTTGCGGTTGTGTCAACCACAAGCTTCTTAAGCTCTTTGTCTAAACCGAGCCACACCC
ATCCTGAGCCTTGCACAGCAGCACCTTCAGCACTCATCTTCTTCACCAAACCTTCGAGAG
AGCCAAAATGAGTATCAATAGCTCCACCAAGAGATCCCTTCGGTGGCTCTCCACCACCTT
CCTTGACAGGAGCAAGATTCTTCCAGAAAATCGAGTGGTTCACATGACCTCCGCCGTTGA
ACTTGATGGCGCTCTGCAGCTTAACGGCAGCGGAAGCGTCTCCCTTGTTGACGGCCTGAT
CGAGCTGCTCGAGGGCATTGTTGTAATTAGTGACGTAAGCCTGGTGATGCTTCTGG*TGA
TGGATCTGCATGATCTCGCCGCTGA

QA 5 749 5 749
DS 

RD RR2CW04JQ 750 0 0
GAAT
GAAGTAAAATTTTATTATTGGAAAATGTTTTGTAAAACGTGTATTATTGCAA*CCATACA
TGTTCATTTTGAAAGTAACTCAAAGACCAAAGAGACATTGTACGTTTGTTTCAGACAAAC
TTATAAAAACAAAGCCGAGCTGGGAACTGGTTCCTCTCTTTATGTTTGTTATCATGTAAA
GACCTCATCACTTGCATTCCTTCTCATAAACTTCGCTTGCATATTTCCAGTTGATGACTT
TCCACACGTTCTTCAGATACTCCGGCCTCACATTCTTGTACTGCAAGTAGTAGGCGTGCT
CCCAAACATCTATACCCACCAGCGGAACCAAGCTTCCTCCTTTCGTCACAAGTGGATCCT
GATTTGCGGTTGTGTCAACCACAAGCTTCTTAAGCTCTTTGTCTAAACCGAGCCACACCC
ATCCTGAGCCTTGCACAGCAGCACCTTCAGCACTCATCTTCTTCACCAAACCTTCGAGAG
AGCCAAAATGAGTATCAATAGCTCCACCAAGAGATCCCTTCGGTGGCTCTCCACCACCTT
CCTTGACAGGAGCAAGATTCTTCCAGAAAATCGAGTGGTTCACATGACCTCCGCCGTTGA
ACTTGATGGCGCTCTGCAGCTTAACGACAGCGGAAGCGTCTCCCTTGTTGACGGCCTGAT
CGAGCTGCTCGAGGGCATTGTTGTAATTAGTGACGTAAGCCTGGTGATGCTTCTGG*TGA
TGGATCTGCATGATCTCGCCGCTGAT

QA 5 750 5 750
DS 

RD RR2BE93JQ 784 0 0
GGATGAAGTAAAATTTTATTATTGGAAAATGTTTTGTAAAACGTGTATTATTGCAA*CCA
TACATGTTCATTTTGAAGGTAACTCAAAGACCAAAGAGACATTGTACGTTTGTTTCAGAC
AAACTTATAAAAACAAAGCCGAGCTGGGAACTGGTTCCTCTCTTTATGTTTGTTATCATG
TAAAGACCTCATCACTTGCATTCCTTCTCATAAACTTCGCTTGCATATTTCCAGTTGATG
ACTTTCCACACGTTCTTCAGATACTCCGGCCTCACATTCTTGTACTGCAAGTAGTAGGCG
TGCTCCCAAACATCTATACCCACCAGAGGAACCAAGCTTCCTCCTTTCGTCACAAGTGGA
TCCTGATTTGCGGTTGTGTCAACCACAAGCTTCTTAAGCTCTTTGTCTAAACCGAGCCAC
ACCCATCCTGAGCCTTGCACAGCAGCACCTTCAGCACTCATCTTCTTCACCAAACCTTCG
AGAGAGCCAAAATGAGTATCAATAGCTCCACCAAGAGATCCCTTCGGTGGCTCTCCACCA
CCTTCCTTGACAGGAGCAAGATTCTTCCAGAAAATCGAGTGGTTCACATGACCTCCGCCG
TTGAACTTGATGGCGCTCTGCAGCTTAACGACAGCGGAAGCGTCTCCCTTGTTGGCGGCC
TGATCGAGCTGCTCGAGGGCATTGTTGTAATTAGTGACGTAAGCCTGGTGATGCTTCTGG
*TGATGGATCTGCATGATCTCGCCGCTGATCGCCGGCTCCAACGCGCTGTAATCATAGGG
GAGA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2BE93TF 836 0 0
ACTCAAAGACCAAAGAGACATTGTACGTTTGTTTCAGACAAACTTATAAAAACAAAGCCG
AGCTGGGAACTGGTTCCTCTCTTTATGTTTGTTATCATGTAAAGACCTCATCACTTGCAT
*CCTTCTCATAAACTTCGCTTGCATATTTCCAGTTGATGACTTTCCACACGTTCTTCAGA
TACTCCGGCCTCACATTCTTGTACTGCAAGTAGTAGGCGTGCTCCCAAACATCTATACCC
ACCAGAGGAACCAAGCTTCCTCCTTTCGTCACAAGTGGATCCTGATTTGCGGTTGTGTCA
ACCACAAGCTTCTTAAGCTCTTTGTCTAAACCGAGCCACACCCATCCTGAGCCTTGCACA
GCAGCACCTTCAGCACTCATCTTCTTCACCAAACCTTCGAGAGAGCCAAAATGAGTATCA
ATAGCTCCACCAAGAGATCCCTTCGGTGGCTCTCCACCACCTTCCTTGACAGGAGCAAGA
TTCTTCCAGAAAATCGAGTGGTTCACATGACCTCCGCCGTTGAACTTGATGGCGCTCTGC
AGCTTAACGACAGCGGAAGCGTCTCCCTTGTTGGCGGCCTGATCGAGCTGCTCGAGGGCA
TTGTTGTAATTAGTGACGTAAGCCTGGTGATGCTTCTGG*TGATGGATCTGCATGATCTC
GCCGCTGATCGCCGGCTCCAACGCGCTGTAATCATAGGGGAGATCAGGAAGAGTGAAGGT
CTGGATTCCTCGGAAACCAAGAAGCCTCGAAGATGTCTCCTTTAGGCCCGCTAGGGTTCT
TCTGCTGGCTACGGAACGAATCGCCATTGTTGATAGATAGATAGACGATGAGAT
CC

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR2BX89TF 758 0 0
CTCTTTATGTT*GTTATCATGTAAAGAC*TCATCACTTGCAT*CCTTCTCATAAACTTCG
CTTGCATATT*CCAGTTGATGACTTTCCACACGTTCTTCGGATACTCCGGCCTCACATTC
TTGTACTGCAAGTAGTAGGCGTGCTCCCAAACATCTATACCCACCAGAGGAACCAAGCTT
CCTCCTTTCGTCACAAGTGGATCCTGATTTGCGGTTGTGTCAACCACAAGCTTCTTAAGC
TCTTTGTCTAAACCGAGCCACACCCATCCTGAGCCTTGCACAGCAGCACCTTCAGCACTC
ATCTTCTTCACCAAACCTTCGAGAGAGCCAAAATGAGTATCAATAGCTCCACCAAGAGAT
CCCTTCGGTGGCTCTCCACCACCTTCCTTGACAGGAGCAAGATTCTTCCAGAAAATCGAG
TGGTTCACATGACCTCCGCCGTTGAACTTGATGGCGCTCTGCAGCTTAACGACAGCGGAA
GCGTCTCCCTTGTTGACGGCCTGATCGAGCTGCTCGAGGGCATTGTTGTAATTAGTGACG
TAAGCCTGGTGATGCTTCTGG*TGATGGATCTGCATGATCTCGCCGCTGATCGCCGGCTC
CAACGCGCTGTAATCATAGGGGAGATCAGGAAGCGTGAAGGTCTGGATTCCTCGGAAACC
AAGAAGCCTCGAAGATGTCTCCTTTAGGCCCGCTAGGGTTTTTCTGCTGGCTACGGAACG
AATCGCCATTGTTGATAGATAGATAGATGAA
GAGATCC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2AC80TF 748 0 0
TCACTTGCAT*CCTTCTCATAAACTTCGCTTGCATATTTCCAGTTGATGACTTTCCACAC
GTTCTTCAGATACTCCGGCCTCACATTCTTGTACTGCAAGTAGTAGGCGTGCTCCCAAAC
ATCTATACCCACCAGAGGAACCAAGCTTCCTCCATTCGTCACAAGTGGATCCTGATTGGC
GGTTGTGTCAACCACAAGCTTCTTAAGCTCTTTGTCTAAACCGAGCCACACCCATCCTGA
GCCTTGCAGAGCAGCACCTTCAGCACTCATCTTCTTCACCAAACCTTCGAGAGAGCCAAA
ATGAGTATCAATAACTCCACCAAGAGATCCCTTCGGTGGCTCTCCACCACCTTCCTTTAC
AGGAGCAAGGTTCTTCCAGAAAATCGAGTGGTTCACATGACCTCCGCCGTTGAACTTGAT
GGCGCTCTGCAGCTTAACGACAGCGGAAGCGTCTCCCTTGTTGACGGCCTGATCGAGCTG
CTCGAGGGCATTGTTGTAATTAGTGACGTAAGCCTGGTGATGCTTCTGG*TGATGGATCT
GCATGATCTCGCCGCTGATCGCCGGCTCCAACGCGCTGTAATCATAGGGGAGATCAGGAA
GCGTGAAGGTCTGGATTCCTCGGAAACCAAGAAGCCTCGAAGATGTCTCCTTTAGGCCCG
CTAGGGTTCTTCTGCTGGCTACGGAACGAATCGCCATTGTTGATAGATAGATAGACGATG
AGATACACAGTGAGAGTCTCTCCTTCCC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2DZ04TF 459 0 0
AGAGAGCCAAAATGAGTATCAATAGCTCCACCAAGAGATCCCTTCGGTGGCTCTCCACCA
CCTTCCTTTACAGGAGCAAGGTTCTTCCAGAAAATCGAGTGGTTCACATGACCTCCGCCG
TTGAACTTGATGGCGCTCTGCAGCTTAACGACAGCGGAAGCGTCTCCCTTGTTGACGGCC
TGATCGAGCTGCTCGAGGGCATTGTTGTAATTAGTGACGTAAGCCTGGTGATGCTTCTGG
*TGATGGATCTGCATGATCTCGCCGCTGATCGCCGGCTCCAACGCGCTGTAATCATAGGG
GAGATCAGGAAGCGTGAAGGTCTGGATTCCTCGGAAACCAAGAAGCCTCGAAGATGTCTC
CTTTAGGCCCGCTAGGGTTCTTCTGCTGGCTACGGAACGAATCGCCATTGTTGATAGATA
GATAGACGATGAGATACACAGTGAGAGTCTCTCCTT
TCC

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR2FV49TF 505 0 0
CTAAACCGAGCCACACCCATCTTGAGCCTTGCACAGCAGCACCTTCAGCACTCATCTTCT
TCACCAAACCTTCGAGAGAGCCAAAATGAGTATCAATAGCTCCACCAAGAGATCCCTTCG
GTGGCTCTCCACCACCTTCCTTTACAGGAGCAAGGTTCTTCCAGAAAATCGAGTGGTTCA
CATGACCTCCGCCGTTGAACTTGATGGCGCTCTGCAGCTTAACGACAGCGGAAGCGTCTC
CCTTGTTGACGGCCTGATCGAGCTGCTCGAGGGCATTGTTGTAATTAGTGACGTAAGCCT
GGTGATGCTTCTGG*TGATGGATCTGCATGATCTCGCCGCTGATCGCCGGCTCCAACGCG
CTGTAATCATAGGGGAGATCAGGAAGCGTGAAGGTCTGGATTCCTCGGAAACCAAGAAGC
CTCGAAGATGCCTCCTTTAGGCCCGCTAGGGTTCTTATGCTGGCTACGGAACGAATCGCC
ATTGTTGATAGATAGATAGACGAT
C

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2FU08TF 653 0 0
CATTCTTGTACTGCAAGTAGTAGGCGTGCTCCCAAACATCTATACCCACCAGAGGAACCA
AGCTTCCTCCTTTCGTCACAAGTGGATCCTGATTTGCGGTTGTGTCAACCACAAGCTTCT
TAAGCTCTTTGTCTAAACCGAGCCACACCCATCCTGAGCCTTGCACAGCAGCACCTTCAG
CACTCATCTTCTTCACCAAACCTTCGAGAGAGCCAAAATGAGTATCAATAGCTCCACCAA
GAGATCCCTTCGGTGGCTCTCCACCACCTTCCTTGACAGGAGCAAGATTCTTCCAGAAAA
TCGAGTGGTTCACATGACCTCCGCCGTTGAACTTGATGGCGCTCTGCAGCTTAACGGCAG
CGGAAGCGTCTCCCTTGTTGACGGCCTGATCGAGCTGCTCGAGGGCATTGTTGTAATTAG
TGACGTAAGCCTGGTGATGCTTCTGG*TGATGGATCTGCATGATCTCGCCGCTGATCGCC
GGCTCCAACGCGCTGTAATCATAGGGGAGATCAGGAAGCGTGAAGGTCTGGATTCCTCGG
AAACCAAGAAGCCTCGAAGATGTCTCCTTTAGGCCCGCTAGGGTTTTTCTGCTGGCTACG
GAACGAATCGCCATTGTTGATAGATAGATAGATGAAGAGATACCCAGTGAG
CC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 3 18

CO CL98Contig1 667 2 2 U
TTTATAATAATAGTTTTAACTTCATTTTGTGAATAGAAGGATGACAAGGGAGGTGGTTCA
AACAAAACTTTTAGCTGTTCAGGAATACTCTTTAACCTACAAACACTGTCTGAAACTCTC
AAAACGAGCTTATTTAAAAGAAAGATATTCATTCAATGGCGGATTCTTCAAGCCTGTCTG
TTCCTCCTCTTGGGGCCAGACTTGGCGACTCTGGGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTA
GCAAGCGCTGCCTTCTTCAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACA
GCTTTGGCCATCCTCGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGC
TTGTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTTGTTCCAAGTACCACACCTTGATCTTTGTCAGCTGGC
TGAATGGTCACGGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAG
AGGTTGTTGCCCTCTTTGCTGAACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACC
AAGAAACAGTTGTTTCTCTTCACGATCTCCCACACCAGCTGTCCTGGAACTGTTGTCATT
TCGATCTCCTTGCAAATTGAATAACTAGACAACGGCGGAATAGAGAGAATGAGACTTGTG
CCGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AQ93TF C 1
AF RR2AQ93JQ U 22
BS 1 25 RR2AQ93TF
BS 26 667 RR2AQ93JQ

RD RR2AQ93TF 667 0 0
TTTATAATAATAGTTTTAACTTCATTTTGTGAATAGAAGGATGACAAGGGAGGTGGTTCA
AACATAACTTTTAGCTGTTCAGGAATACTCTTTAACCTACAAACACTGTCTGAAACTCTC
AAAACGAGCTTATTTAAAAGAAAGATATTCATTCAATGGCGGATTCTTCAAGCCTGTCTG
TTCCTCCTCTTGGGGCCAGACTTGGCGACTCTGGGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTA
GCAAGCGCTGCCTTCTTCAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACA
GCTTTGGCCATCCTCGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGC
TTGTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTTGTTCCAAGTACCACACCTTGATCTTTGTCAGCTGGC
TGAATGGTCACGGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAG
AGGTTGTTGCCCTCTTTGCTGAACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACC
AAGAAACAGTTGTTTCTCTTCACGATCTCCCACACCAGCTGTCCTGGAACTGTTGTCATT
TCGATCTCCTTGCAAATTGAATAACTAGACAACGGCGGAATAGAGAGAATGAGACTTGTG
CCGGCCC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2AQ93JQ 646 0 0
TCAT
TTTGTGAATAGAAGGATGACAAGGGAGGTGGTTCAAACAAAACTTTTAGCTGTTCAGGAA
TACTCTTTAACCTACAAACACTGTCTGAAACTCTCAAAACGAGCTTATTTAAAAGAAAGA
TATTCATTCAATGGCGGATTCTTCAAGCCTGTCTGTTCCTCCTCTTGGGGCCAGACTTGG
CGACTCTGGGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGCGCTGCCTTCTTCAAATCAG
GCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGCCATCCTCGGGAACTCCT
TCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTTGTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTTG
TTCCAAGTACCACACCTTGATCTTTGTCAGCTGGCTGAATGGTCACGGTCTTCTTGTTTG
CCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAGAGGTTGTTGCCCTCTTTGCTGAACT
GAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACCAAGAAACAGTTGTTTCTCTTCACGA
TCTCCCACACCAGCTGTCCTGGAACTGTTGTCATTTCGATCTCCTTGCAAATTGAATAAC
TAGACAACGGCGGAATAGAGAGAATGAGACTTGTGCCGGCCC

QA 5 646 5 646
DS 



CO CL98Contig2 686 12 2 U
GGGCCGGCACAAGTCTCATTCTCTCTATTCCGCCGCTGTCTAGTTATTAAATTTGCTAGG
AGATCGAAATGACAACAGTTCCAGGACAGCTGGTGTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACT
GTTTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCA
ACAACCTCTGCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGA
CCATTCAGCCAGCAGACAAGGATCAAGGTGTGGTGCTTGGAACAACCAAAACCAAGAAGC
AAAACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCAAGGATGG
CCAAAGCTGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAG
CGCTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCAGAGTCGCCAAGTCTGGCCCCAAGA
GGAGGAACAGACAGGCTTGAAGAATCCTCCGCCATTGAATGAATATCTTTCTTCTAAATA
AGCTCGTTTTGAGAGTTTCAGACTGTGTTTGTAGGCTAAAGATTATTCCTGAACAGCTAA
AAGTTTTGTTTGAACCACCAACCTTGTCATCCTTCTATTCACAAATGAAGTTAAAACTAT
TATTATACTGCCATCGTTTTAACCGC


BQ
30 40 45 45 45 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 40 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI62TF U 2
AF RR2D973TF U -2
AF RR2DP73TF U 9
AF RR2C882TF U 1
AF RR2EY17JQ C 217
AF RR2DP73JQ C 9
AF RR2AG70TF U 4
AF RR2A012TF U 2
AF RR2EY14JQ C 1
AF RR2EY14TF U 1
AF RR2EY17TF U 1
AF RR2D973JQ C 131
BS 1 648 RR2C882TF
BS 649 686 RR2D973JQ

RD RR2EI62TF 432 0 0
GGCCGGCACAAGTCTCATTCTCTCTATTCCGCCGCGGTCTAGTTATTAAATTTGCTAGGA
GATCGAAATGACAACAGTTCCAGGACAGCTGGTGTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACTG
TTTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCAA
CAACCTCTGCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGAC
CATTCAGCCAGCAGACAAGGATCAAGGTGTGGTGCTTGGAACAACCAAAACCAAGAAGCA
AAACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCAAGGATGGC
CAAAGCTGTTGCCAACCAGGTTTTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAGC
GCTTGCTAGGCT

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR2D973TF 575 0 0
GGAAC
GCCGGCACAAGTCTCATTCTCTCTATTCCGCCGCTGTCTAGTTATTAAATTTGCTAGGAG
ATCGAAATGACAACAGTTCCAGGACAGCTGGTGTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACTGT
TTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCAAC
AACCTCTGCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGACC
ATTCAGCCAGCAGACAAGGATCAAGGTGTGGTGCTTGGAACAACCAAAACCAAGAAGCAA
AACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCAAGGATGGCC
AAAGCTGTTGCCAACCAGGTTGTGGGCAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAGCT
CTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCAGAGTCGCCAAGTCTGGCCCCAAGAGG
AGGAACAGACAGGCTTGAAGAATCCTCCGCCATTGAATGAATATCTTTCTTCTAAATAAG
CTCGTTTTGAGAGTTTCAGACTGTGTTTGT

QA 6 575 6 575
DS 

RD RR2DP73TF 575 0 0
G
CAAGTCTCATTCTCTCTATTCCGCCGCGGTCTAGTTATTAAATTTGCTAGGAGATCGAAA
TGACAACAGTTCCAGGACAGCTGGTGTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACTGTTTCTTGG
TGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCAACAACCTCT
GCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGACCATTCAGC
CAGCAGACAAGGATCAAGGTGTGGTGCTTGGAACAACCAAAACCAAGAAGCAAAACAAGC
CAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCAAGGATGGCCAAAGCTG
TTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAGCGCTTGCTA
GGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCAGAGTCGCCAAGTCTGTCCCCAAGAGGAGGAACA
GACAGACTTGAAGAATCCTCCGCCATTGAATGAATATCTTTCTTCTAAATAAGCTCGTTT
TGAGAGTTTCAGACTGTGTTTGTAGGCTAAAGAT

QA 2 575 2 575
DS 

RD RR2C882TF 653 0 0
GGGCCGGCACAAGTCTCATTCTCTCTATTCCGCCGCTGTCTAGTTATTAAATTTGCTAGG
AGATCGAAATGACAACAGTTCCAGGACAGCTGGTGTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACT
GTTTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCA
ACAACCTCTGCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGA
CCATTCAGCCAGCAGACAAGGATCAAGGTGTGGTGCTTGGAACAACCAAAACCAAGAAGC
AAAACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCAAGGATGG
CCAAAGCTGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAG
CGCTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCAGAGTCGCCAAGTCTGGCCCCAAGA
GGAGGAACAGACAGGCTTGAAGAATCCTCCGCCATTGAATGAATATCTTTCTTCTAAATA
AGCTCGTTTTGAGAGTTTCAGACTGTGTTTGTAGGCTAAAGATTATTCCTGAACAGCTAA
AAGTTTTGTTTGAACCACCAACCTTGTCATCCTTCTATTCACAAATGA
AGTTA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2EY17JQ 432 0 0
GTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGACCATTCAGCCAGCAGACAAGGATCAAGGTGTGGTGC
TTGGAACAACCAAAACCAAGAAGCAAAACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCC
TCAAGAAGGAGTTCCCAAGGATGGCCAAAGCTGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACT
ACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAGCGCTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCA
GAGTCGCCAAGTCTGGCCCCAAGAGGAGGAACAGACAGGCTTGAAGAATCCTCCGCCATT
GAATGAATATCTTTTTTCTAAATAAGCTCGTTTTGAGAGTTTCAGACTGTGTTTGTAGGC
TAAAGATTATTCCTGAACAGCTAAAAGTTTTGTTTGAACCACCAACCTTGTCATCCTTCT
ATTCACAAATGA

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR2DP73JQ 640 0 0
G
CAAGTCTCATTCTCTCTATTCCGCCGCGGTCTAGTTATTAAATTTGCTAGGAGATCGAAA
TGACAACAGTTCCAGGACAGCTGGTGTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACTGTTTCTTGG
TGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCAACAACCTCT
GCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGACCATTCAGC
CAGCAGACAAGGATCAAGGTGTGGTGCTTGGAACAACCAAAACCAAGAAGCAAAACAAGC
CAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCAAGGATGGCCAAAGCTG
TTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAGCGCTTGCTA
GGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCAGAGTCGCCAAGTCTGTCCCCAAGAGGAGGAACA
GACAGACTTGAAGAATCCTCCGCCATTGAATGAATATCTTTCTTCTAAATAAGCTCGTTT
TGAGAGTTTCAGACTGTGTTTGTAGGCTAAAGATTATTCCTGAACAGCTAAAAGTTTTGT
TTGAACCACCAACCTTGTCATCCTTCTATTCACAAATGA

QA 2 640 2 640
DS 

RD RR2AG70TF 645 0 0
GG
GGCACAAGTCTCATTCTCTCTATTCCGCCGCTGTCTAGTTATTAAATTTGCTAGGAGATC
GAAATGACAACAGTTCCAGGACAGCTGGTGTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACTGTTTC
TTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCAACAAC
CTCTGCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGACCATT
CAGCCAGCAGACAAGGATCAAGGTGTGGTGCTTGGAACAACCAAAACCAAGAAGCAAAAC
AAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCAAGGATGGCCAAA
GCTGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAGCGCTT
GCTCGGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCAGAGTCGCCAAGTCTGGCCCCAAGAGGAGG
AACAGACAGGCTTGAAGAATCCTCCGCCATTGAATGAATATCTTTCTTCTAAATAAGCTC
GTTTTGAGAGTTTCAGACTGTGTTTGTAGGCTAAAGATTATTCCTGAACAGCTAAAAGTT
TTGTTTGAACCACCAACCTTGTCATCCTTCTATTCACAAATGA

QA 3 645 3 645
DS 

RD RR2A012TF 651 0 0
GGCCGGCACAAGTCTCATTCTCTCTATTCCGCCGCTGTCTAGTTATTAAATTTGCTAGGA
GATCGAAATGACAACAGTTCCAGGACAGCTGGTGTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACTG
TTTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCAA
CAACCTCTGCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGGCCGTGAC
CATTCAGCCAGCAGACAAGGATCAAGGTGTGGTGCTTGGAACAACCAAAACCAAGAAGCA
AAACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCAAGGATGGC
CAAAGCTGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAGC
GCTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCAGAGTCGCCAAGTCTGGCCCCAAGAG
GAGGAACAGACAGGCTTGAAGAATCCTCCGCCATTGAATGAATATCTTTCTTCTAAATAA
GCTCGTTTTGAGAGTTTCAGACTGTGTTTGTAGGCTAAAGATTATTCCTGAACAGCTAAA
AGTTTTGTTTGAACCACCAACCTTGTCATCCTTCTATTCACAAATGA
AGTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2EY14JQ 648 0 0
GGGCCGGCACAAGTCTCATTCTCTCTATTCCGCCGCTGTCTAGTTATTAAATTTGCTAGG
AGATCGAAATGACAACAGTTCCAGGACAGCTGGTGTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACT
GTTTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCA
ACAACCTCTGCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGA
CCATTCAGCCAGCAGACAAGGATCAAGGTGTGGTGCTTGGAACAACCAAAACCAAGAAGC
AAAACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCAAGGATGG
CCAAAGCTGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAG
CGCTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCAGAGTCGCCAAGTCTGTCCCCAAGA
GGAGGAACAGACAGGCTTGAAGAATCCTCCGCCATTGAATGAATATCTTTCTTCTAAATA
AGCTCGTTTTGAGAGTTTCAGACTGTGTTTGTAGGCTAAAGATTATTCCTGAACAGCTAA
AAGTTTTGTTTGAACCACCAACCTTGTCATCCTTCTATTCACAAATGA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2EY14TF 648 0 0
GGGCCGGCACAAGTCTCATTCTCTCTATTCCGCCGCTGTCTAGTTATTAAATTTGCTAGG
AGATCGAAATGACAACAGTTCCAGGACAGCTGGTGTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACT
GTTTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCA
ACAACCTCTGCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGA
CCATTCAGCCAGCAGACAAGGATCAAGGTGTGGTGCTTGGAACAACCAAAACCAAGAAGC
AAAACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCAAGGATGG
CCAAAGCTGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAG
CGCTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCAGAGTCGCCAAGTCTGTCCCCAAGA
GGAGGAACAGACAGGCTTGAAGAATCCTCCGCCATTGAATGAATATCTTTCTTCTAAATA
AGCTCGTTTTGAGAGTTTCAGACTGTGTTTGTAGGCTAAAGATTATTCCTGAACAGCTAA
AAGTTTTGTTTGAACCACCAACCTTGTCATCCTTCTATTCACAAATGA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2EY17TF 648 0 0
GGGCCGGCACAAGTCTCATTCTCTCTATTCCGCCGCGGTCTAGTTATTAAATTTGCTAGG
AGATCGAAATGACAACAGTTCCAGGACAGCTGGTGTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACT
GTTTCTTGGTGAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCA
ACAACCTCTGCAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGA
CCATTCAGCCAGCAGACAAGGATCAAGGTGTGGTGCTTGGAACAACCAAAACCAAGAAGC
AAAACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCAAGGATGG
CCAAAGCTGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAG
CGCTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCAGAGTCGCCAAGTCTGGCCCCAAGA
GGAGGAACAGACAGGCTTGAAGAATCCTCCGCCATTGAATGAATATCTTTCTTCTAAATA
AGCTCGTTTTGAGAGTTTCAGACTGTGTTTGTAGGCTAAAGATTATTCCTGAACAGCTAA
AAGTTTTGTTTGAACCACCAACCTTGTCATCCTTCTATTCACAAATGA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2D973JQ 556 0 0
GAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAGGAGAGCAACAACCTCTG
CAACCTCAACTCTTACAAGCACTCTGGTTTGGCAAACAAGAAGACCGTGACCATTCAGCC
AGCAGACAAGGATCAAGGTGTGGTGCTTGGAACAACCAAAACCAAGAAGCAAAACAAGCC
AAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCAAGGATGGCCAAAGCTGT
TGCCAACCAGGTTGTGGGCAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAGCTCTTGCTAG
GCTCAGCGTGATCAGCAAAGGCCTCAGAGTCGCCAAGTCTGGCCCCAAGAGGAGGAACAG
ACAGGCTTGAAGAATCCTCCGCCATTGAATGAATATCTTTCTTCTAAATAAGCTCGTTTT
GAGAGTTTCAGACTGTGTTTGTAGGCTAAAGATTATTCCTGAACAGCTAAAAGTTTTGTT
TGAACCACCAACCTTGTCATCCTTCTATTCACAAATGAAGTTAAAACTATTATTATACTG
CCATCGTTTTAACCGC

QA 1 556 1 556
DS 



CO CL98Contig3 641 4 24 U
AACCATACTAAATAATTTTTGATATCGTTTTTGTGAAAAAAGGATGACAAAGGAGGTCGT
TCAAACAAAACTTTCAGCTGTTCAGGAGAAATCATTAAACCTACAAGCATTGTCTGAAGC
ACTCAAAACAAGCTTTTATAAGAAGTAAAATATTTCATTCAATGGCGGATTCTTCAGGCC
TGTCTGTTTCTCCTCTTGGGACCAGACTTGGCGACTCTAAGACCTTTGCTGATCACGCTG
AGCCTAGCAAGTGCTGCCTTCTTCAGATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTG
GCAACAGCTTTGGCCATCCTGGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGC
TTAGGCTTGTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGCTCCTTGTCA
GCTGGCTGGATGGTCACTGTCTTTTTGTTTGCCAAACCAGAGTGTTTGTAGGAGTTGAGG
TTGCAGAGGTTGTTGGTCTCCTTGCTGAACTGGACCTTGGCATTGCCTCTACCGAACTGT
TTGACCAAGAAACAGTTGTTTCTCTTCACTATCTCCCACACCAACTGTCCTGGTACTGTT
GCCATTTCGACGATCTCCTAATGAAATGTCAAGCTCACGAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 5 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB17JQ U 1
AF RR2A314TF C 22
AF RR2GB17TF C 1
AF RR2G427JQ U 97
BS 1 87 RR2GB17JQ
BS 88 88 RR2GB17TF
BS 89 141 RR2GB17JQ
BS 142 142 RR2G427JQ
BS 143 220 RR2GB17JQ
BS 221 221 RR2G427JQ
BS 222 265 RR2GB17JQ
BS 266 266 RR2G427JQ
BS 267 356 RR2GB17JQ
BS 357 395 RR2G427JQ
BS 396 396 RR2GB17TF
BS 397 423 RR2G427JQ
BS 424 426 RR2GB17TF
BS 427 428 RR2G427JQ
BS 429 429 RR2GB17TF
BS 430 455 RR2G427JQ
BS 456 456 RR2GB17TF
BS 457 485 RR2G427JQ
BS 486 486 RR2GB17TF
BS 487 512 RR2G427JQ
BS 513 513 RR2GB17TF
BS 514 601 RR2G427JQ
BS 602 602 RR2GB17TF
BS 603 641 RR2G427JQ

RD RR2GB17JQ 356 0 0
AACCATACTAAATAATTTTTGATATCGTTTTTGTGAAAAAAGGATGACAAAGGAGGTCGT
TCAAACAAAACTTTCAGCTGTTCAGGAAAAATCATTAAACCTACAAGCATTGTCTGAAGC
ACTCAAAACAAGCTTTTATAAAAAGTAAAATATTTCATTCAATGGCGGATTCTTCAGGCC
TGTCTGTTTCTCCTCTTGGGACCAGACTTGGCGACTCTAAAACCTTTGCTGATCACGCTG
AGCCTAGCAAGTGCTGCCTTCTTCAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTG
GCAACAGCTTTGGCCATCCTGGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGA

QA 1 356 1 356
DS 

RD RR2A314TF 555 0 0
ATATCATTTTTGTGAAAAAAGGATGACAAAGGAGGTCGTTCAGACAAAACTTTCAGCTGT
TCAGGAGAAATCATTAAACCTACAAGCATTGTCTGAAGCACTCAAAACAAGCTTTTATAA
GAAGTAAAATATTTCATTCAATGGCGGATTCTTCAGGCCTGTCTGTTTCTCCTCTTGGGA
CCAGACTTGGCGACTCTAAGACCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGTGCTGCCTTC
TTCAGATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGCCATCCTG
GGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTAGGCTTGTTTTGCTTCTTG
GTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGCTCCTTGTCAGCTGGCTGGATGGTCACTGTC
TTTTTGTTTACCAAACCAGAGTGTTTGTAGGAGTTGAGGTTGCAGAGGTTGTTGGTCTCC
TTGCTGAACTGGACCTTGGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTGACCAAGAAACAGTTGTTT
CTCTTCACTATCTCC

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2GB17TF 620 0 0
AACCATACTAAATAATTTT*GATATCGTTTTTGTGAAAAAAGGATGACAAAGGAGGTCGT
TCAAACAAAACTTTCAGCTGTTCAGGAGAAATCATTAAACCTACAAGCATTGTCTGAAGC
ACTCAAAACAAGCTTTTATAAGAAGTAAAATATTTCATTCAATGGCGGATTCTTCAGGCC
TGTCTGTTTCTCCTCTTGGGACCAGACTTGGCGACTCTAAGACCTTTGCTGATCACGCTG
AGCCTAGCAAGTGCTGCCTTCTTCAGATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTG
GCAACAGCTTTGGCCATCCTGGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGC
TTAGGCTTGTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGCTCCTTGTCA
GCTGGCTGGATGGTCACTGTCTTTTTGTTTGCCAAACCAGAGTGTTTGTAGGAGTTGAGG
TTGCAGAGGTTGTTGGTCTCCTTGCTGAACTGGACCTTGGCATTGCCTCTACCGAACTGT
TTGACCAAGAAACAGTTGTTTCTCTTCACTATCTCCCACACCAACTGTCCTGGTACTGTT
GCCATTTCGATGATCTC
TCC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2G427JQ 545 0 0
AAACCTACAAGCATTGTCTGAAGCACTCAAAACAAGCTTTTATAAGAAGTAAAATATTTC
ATTCAATGGCGGATTCTTCAGGCC*GTCTGTTTCTCCTCTTGGGACCAGACTTTGCGACT
CTAAGACCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGTGCTGCCTTCTTCAGATCAGGCCTG
TAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGCCATCCTGGGGAACTCCTTCTTG
AGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTAGGCTTGTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCG
AGTACCACACCTTGCTCCTTGTCAGCTACTTGAATGGTCACTGTCTTTTTGTTTGCCAAG
CCAGAGTGTTTGTAGGAGTTGAGGTTGCAAAGGTTGTTGGTCTCCTTGCTGAACTGAACC
TTGGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTGACCAAGAAACAGTTGTTTCTCTTCACTATCTCC
CACACCAACTGTCCTGGTACTGTTGTCATTTCGACGATCTCCTAATGAAATGTCAAGCTC
ACGAA

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 20

CO CL99Contig1 904 20 36 U
GGCTCTCGAGCTTCTTTTGTCTCAGTTCTGAGCTTAAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAAACA
TGGCTTCTCCCTCAGCGGCGCTTTCTCTGTGCTCTGCTTTCTCTGCTCATTGCAGTATCG
CTCCACCGCGCTCCCTCTCTAAGCCTTCGTTGAGTCTGGCAAAACCAACGATTGGGTTTC
TTTCTACTTCCGCTGCTGCGTCTACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCT
CCGAATCAGCCGTCGTGGCTGAACCCGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTGGTCTCAG
AGGAGGATAAGCCTAAACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGCCAGT
ACATTGTTTTCCCAGGGAGATATCTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATG
ACCAGATTGTTTTGAACAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCA
AACCGGTTGTTACCAATGCCACTGTGCATGCTGTTGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATA
AAGTGGTGGTCTTCAAGTACAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGAC
AGCCAAATACGAGGATTAGGATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCAGCGTCTC
CCAACGTTGCTGTTTAAATGTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAAAA*TTATGCTT
CTTGAATGTTCAATTTTCTGATCTTTTCTATGTACTTCTGAAAGACCAGACCA*****TT
TCATTTCTGTTGAGAATCTTAAGATGCAGTATATTAATATGTACTCACTCTTGCCATTTC
TTATCCCCATGTTTCAAGTCTCCATCCATCCATCTAGACGTATTGATATATATCATAGAG
TGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 30 45 45 45 45 55 60 60 60 60 60 65 65 50 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 45 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 65 30 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 40 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 5 70 70 45 70 45 70 70 70 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 20 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 25 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 55 97 97 15 97 90 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 10 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 30 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 30 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 80 95 95 95 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 5 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 0 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 50 75 75 75 60 75 15 60 75 75 75 15 35 75 75 75 75 15 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 65 65 65 65 15 65 65 65 50 40 65 65 65 65 65 40 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D624TF U 17
AF RR2GM24TF U 17
AF RR2H960TF U 22
AF RR2CZ23TF U 5
AF RR2GX61TF U 22
AF RR2CW60TF U 28
AF RR2GE78TF U 1
AF RR2H543TF U 7
AF RR2CY31TF U 22
AF RR2FM96TF U 17
AF RR2GE78JQ C 13
AF RR2FM96JQ C 132
AF RR2CW60JQ C 330
AF RR2H543JQB C 230
AF RR2GM24JQ C 234
AF RR2CZ23JQ C 246
AF RR2AC61JQ C 239
AF RR2AC61TF U 239
AF RR2CY31JQ C 195
AF RR2GF34TF U 166
BS 1 100 RR2GE78TF
BS 101 101 RR2D624TF
BS 102 157 RR2GE78TF
BS 158 158 RR2CZ23TF
BS 159 239 RR2GE78TF
BS 240 240 RR2CZ23TF
BS 241 265 RR2GE78TF
BS 266 266 RR2CZ23TF
BS 267 391 RR2GE78TF
BS 392 392 RR2CZ23TF
BS 393 517 RR2GE78TF
BS 518 518 RR2CZ23TF
BS 519 561 RR2GE78TF
BS 562 562 RR2CZ23TF
BS 563 640 RR2GE78TF
BS 641 641 RR2FM96TF
BS 642 677 RR2GE78TF
BS 678 678 RR2FM96TF
BS 679 690 RR2GE78TF
BS 691 709 RR2FM96TF
BS 710 710 RR2H543TF
BS 711 711 RR2CY31TF
BS 712 731 RR2FM96TF
BS 732 732 RR2H543TF
BS 733 736 RR2FM96TF
BS 737 737 RR2H543TF
BS 738 742 RR2FM96TF
BS 743 743 RR2H543TF
BS 744 773 RR2FM96TF
BS 774 778 RR2GF34TF
BS 779 797 RR2FM96TF
BS 798 820 RR2GF34TF
BS 821 821 RR2AC61TF
BS 822 829 RR2GF34TF
BS 830 830 RR2H543JQB
BS 831 904 RR2GF34TF

RD RR2D624TF 515 0 0
GG
GTCTCAGTTCTGAGCTTAAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAAACATGGCTTCTCCCTCAGCGG
CGCTTTCTCTGTGCTCTGCTTTCTCTGCTCATTGCAGTATCGCTCCACCGCGCTCCCTCT
CTAAGCCTTCGTTGAGTCTAGCAAAACCAACGATTGGGTTTCTTTCTACTTCCGCTGCTG
CGTCTACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCGCCGAATCAGCCGTCGTGG
CTGAACCAGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTGGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAAC
GAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGCCAGTACATTGTTTTCCCAGGGA
GATATCTCTACACCCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACA
AAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCGGTTGTTACCAATG
CCACTGTGCATGCTGTTGTCGAAAATCAAGGTC

QA 3 515 3 515
DS 

RD RR2GM24TF 508 0 0
GG
GTCTCAGTTCTGAGCTTTAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAAACATGGCTTCTCCCTCAGCGG
CGCTGTCTCTGTGCTCTGCTTTCTCTGCTCATTGCAGTATCGCTCCACCGCGTTCTCTCT
CTAAGCCTTCGTTGAGTCCGGCAAAACCAGCGATTGGGTTTCTTTCTACTTCCGCTGCTG
CGTCTACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCTGCTCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTCGTGG
CTGAACCCGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTCGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAAC
GAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGCCAGTACATTGTTTTCCCAGGGA
GATATCTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACA
AAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATTGGCAAACCGGTTGTTACCAATG
CCACTGTGCATGCTGTTGTGGAAAAT

QA 3 508 3 508
DS 

RD RR2H960TF 530 0 0
GG
AGTTCTGAGCTTAAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAAACATGGCTTCTCCCTCAGCGGCGCTT
TCTCTGTGCTCTGCCTTCTCTGCTCATTGCAGTATCGCTCCACCGCGCTCCCTCTCTAAG
CCTTCGTTGAGTCTGGCAAAACCAACGATTGGGTTTCTTTCTACTTCCGCTGCTGCGTCT
ACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTCGTGGCTGAA
CCCGAGACTACCGATATTGAAGCTGTTGTGGCCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAACGAGAA
GAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGGCAGTACATTGTTTTCCCAGGGAGATAT
CTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACAAAGTG
TTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCGGTTGTTACCAATGCCACT
GTGCATGCTGTTGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTC

QA 3 530 3 530
DS 

RD RR2CZ23TF 605 0 0
GGGAGCATTCT
TTTGTCTCAGTTCTGAGCTTAAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAAACATGGCTTCTCCCTCAG
CGGCGCTTTCTCTGTGCTCTGCTTTCTCCGCTCATTGCAGTATCGCTCCACCGCGCTCCC
TCTCTAAGCCTTCGTTGAGTCTGGCTAGACCAACGATTGGGTTTCTTTCTACTTCCGCTG
CTGCGTCTACGTCTCGTCCCTCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTCG
TGGCTGAACCCGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTCGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTA
AACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGCGGACGGCAGTACATTGTTTTCCCAG
GGAGATATCTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGA
ACAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCGGTTGTTACCA
ATGCCACTGTACATGCTGTTGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCTTCA
AGTACAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCAAATA

QA 12 605 12 605
DS 

RD RR2GX61TF 588 0 0
GG
AGTTCTGAACTTAAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAAACATGGCTTCTCCCTCAGCGGCGCTT
TCTCTGTGCTCTGCTTTCTCCGCTCATTGCAGTATCGCTCCACCGCGCTCCCTCTCTAAG
CCTTCGTTGAGTCTGGCTAGACCAACGATTGGGTTTCTTTCTACTTCCGCTGCTGCGTCT
ACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTCGTGGCTGAA
CCCGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTCGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAACGAGAA
GAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGGCAGTACATTGTTTTCCCAGGGAGATAT
CTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCGGATTGTTTTGAACAAAGTG
TTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCGGTTGTTACCAATGCCACT
GTACATGCTGTTGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCTTCAAGTACAAG
CCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCAAATA

QA 3 588 3 588
DS 

RD RR2CW60TF 605 0 0
GG
GAGCTTAAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAAACATGGCTTCTCCCTCAGCGGCGCTTTCTCTG
TGCTCTGCCTTCTCTGCTCATTGCAGTATCGCTCCACCGCGCTCCCTCTCTAAGCCTTCG
TTGAGTCTGGCAAAACCAACGATTGGGTTTCTTTCTACTTCCGCTGCTGCGTCTACGTCT
CGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTCGTGGCTGAACCCGAG
ACTACCGATATTGAAGCTGTTGTGGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAACGAGAAGAGATC
TTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGGCAGTACATTGTTTTCCCAGGGAGATATCTCTAC
ACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACAAAGTGTTGCTT
GTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCGGTTGTTACCAATGCCACTGTGCAT
GCTGTTGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCTTCAAGTACAAGCCAAAG
AAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCAAATACGAGGATTAGGATTACAGG
GATC

QA 3 601 3 601
DS 

RD RR2GE78TF 690 0 0
GGCTCTCGAGCTTCTTTTGTCTCAGTTCTGAGCTTAAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAAACA
TGGCTTCTCCCTCAGCGGCGCTTTCTCTGTGCTCTGCTTT*TCTGCTCATTGCAGTATCG
CTCCACCGCGCTCCCTCTCTAAGCCTTCGTTGAGTCTAGCAAAACCAACGATTGGGTTTC
TTTCTACTTCCGCTGCTGCGTCTACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCG
CCGAATCAGCCGTCGTGGCTGAACCAGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTGGTCTCAG
AGGAGGATAAGCCTAAACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGCCAGT
ACATTGTTTTCCCAGGGAGATATCTCTACACCCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATG
ACCAGATTGTTTTGAACAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCA
AACCGGTTGTTACCAATGCCACTGTGCATGCTGTTGTCGAAAATCAAGGTCTGAATGATA
AAGTGGTGGTCTTCAAGTACAGGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGAC
AGCCAAATACGAGGATTAGGATTACAGGAATCTCAGGGTATGAAGAGTATCCAGCGTCTC
CCAACGTTGCTGTTTAA*TGTCTAGAGAAG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2H543TF 769 0 0
GGAGCTTCCTTTG
TCTCAGTTCTGAGCTTTAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAAACATGGCTTCTCCCTCAGCGGC
GCTGTCTCTGTGCTCTGCTTTCTCTGCTCATTGCAGTATCGCTCCACCGTGTTCTCTCTC
TAAGCCTTCGTTGAGTCTGGCAAAACCAGCGATTGGGTTTCTTTCTACTTCCGCTGCTGC
GTCTACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCTGCTCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTCGTGGC
TGAACCCGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTCGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAACG
AGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGCCAGTACATTGTTTTCCCAGGGAG
ATATCTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACAA
AGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATTGGCAAACCGGTTGTTACCAATGC
CACTGTGCATGCTGTTGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCTTCAAGTA
CAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCAAATACGAGGATTAG
GATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCAGCGTCTCC*AACGTTGCTGTTTAA*T
GTCTAGAGAAGTATAG*ATCTTTGGAAAAAA**TTATGCTTCTTGA*TGT*CAATTTTAT
GATCTTT*CTATGTACTTCTGAA
GACAGATTTTTCG

QA 14 756 14 756
DS 

RD RR2CY31TF 751 0 0
GGT
GTTCTGAGCTTAAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAAACATGGCTTCTCCCTCAGCGGCGCTTT
CTCTGTGCTCTGCCTTCTCTGCTCATTGCAGTATCGCTCCACCGCGCTCCCTCTCTAAGC
CTTCGTTGAGTCTGGCAAAACCAACGATTGGGTTTCTTTCTACTTCCGCTGCTGCGTCTA
CGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTCGTGGCTGAAC
CCGAGACTACCGATATTGAAGCTGTTGTGGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAACGAGAAG
AGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGGCAGTACATTGTTTTCCCAGGGAGATATC
TCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACAAAGTGT
TGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCGGTTGTTACCAATGCCACTG
TGCATGCTGTTGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCTTCAAGTACAAGC
CAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCAAATACGAGGATTAGGATTA
CAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCAGCGTCTCCTAACGTTGCTGTTTAAATGTCTA
GAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAAAA*TTATGCTTCTTGA*TGTTCAATTTTCTGATCT
TTTCTATGTACTTCTGAA
GACAGACATT

QA 4 741 4 741
DS 

RD RR2FM96TF 781 0 0
GG
GTCTCAGTTCTGAGCTTAAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAAACATGGCTTCTCCCTCAGCGG
CGCTTTCTCTGTGCTCTGCTTTCTCTGCTCATTGCAGTATCGCTCCACCGCGCTCCCTCT
CTAAGCCTTCGTTGAGTCTAGCAAAACCAACGATTGGGTTTCTTTCTACTTCCGCTGCTG
CGTCTACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCGCCGAATCAGCCGTCGTGG
CTGAACCAGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTGGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAAC
GAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGCCAGTACATTGTTTTCCCAGGGA
GATATCTCTACACCCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACA
AAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCGGTTGTTACCAATG
CCACTGTGCATGCTGTTGTCGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCTTCAAGT
ACAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCAAATACGAGGATTA
GGATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCAGCGTCTCCCAACGTTGCTGTTTAAA
TGTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAAT**TTATGCTTCTTGAATGTTCGATTTCC
TGATATTTTCTATGTACTTCTGAAAGACCAGACCAGTCCATTTCATTTCTGTTGAGAAT

QA 3 781 3 781
DS 

RD RR2GE78JQ 809 0 0
TTTTTTT
TCTCAGTTCTGAGCTTAAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAA*CATGGCTTCTCCCTCAGCGGC
GCTTTCTCTGTGCTCTGCTTT*TCTGCTCATTGCAGTATCGCTCCACCGCGCTCCCTCTC
TAAGCCTTCGTTGAGTCTAGCAAAACCAACGATTGGGTTTCTTTCTACTTCCGCTGCTGC
GTCTACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCGCCGAATCAGCCGTCGTGGC
TGAACCAGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTGGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAACG
AGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGCCAGTACATTGTTTTCCCAGGGAG
ATATCTCTACACCCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACAA
AGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCGGTTGTTACCAATGC
CACTGTGCATGCTGTTGTCGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCTTCAAGTA
CAGGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCAAATACGAGGATTAG
GATTACAGGAATCTCAGGGTATGAAGAGTATCCAGCGTCTCCCAACGTTGCTGTTTAAAT
GTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAAAT*TTATGCTTCTTGAATGTTCGATTTCCT
GATATTTTCTATGTACTTCTGAAAGACCAGACCAGTCCATTTCATTTCTGTTGAGAATCT
TAAGATGCAGTATATTAATATG

QA 8 809 8 809
DS 

RD RR2FM96JQ 690 0 0
TCCCTCTCTAAGCCTTCGTTGAGTCTAGCAAAACCAACGATTGGGTTTCTTTCTACTTCC
GCTGCTGCGTCTACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCGCCGAATCAGCC
GTCGTGGCTGAACCAGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTGGTCTCAGAGGAGGATAAG
CCTAAACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGCCAGTACATTGTTTTC
CCAGGGAGATATCTCTACACCCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTT
TTGAACAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCGGTTGTT
ACCAATGCCACTGTGCATGCTGTTGTCGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTC
TTCAAGTACAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCAAATACG
AGGATTAGGATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCAGCGTCTCCCAACGTTGCT
GTTTAAATGTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAAAT*TTATGCTTCTTGAATGTTC
GATTTCCTGATATTTTCTATGTACTTCTGAAAGACCAGACCAGTCCATTTCATTTCTGTT
GAGAATCTTAAGATGCAGTATATTAATATG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2CW60JQ 491 0 0
TTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGGCAGTACATTGTTTTCCCAGGGAGATATCTCTAC
ACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACAAAGTGTTGCTT
GTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCGGTTGTTACCAATGCCACTGTGCAT
GCTGTTGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCTTCAAGTACAAGCCAAAG
AAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCAAATACGAGGATTAGGATTACAGGG
ATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCAGCGTCTCCTAACGTTGCTGTTTAAATGTCTAGAGAA
GTATAGGATCTTTGGAAAAAA**TTATGCTTCTTGAATGTTCAGTTTTCTGATCTTTTCT
ATGTACTTCTGAAAGACAAGACCA*****TTTCATTTCTGTTGAGAATCTTAAGATGCAG
TATATTAATAT

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2H543JQB 605 0 0
TCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTCGTGGCTGAACCCGAGACTACCGATATTGAAGCTGT
GGTCGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGG
TGGACGCCAGTACATTGTTTTCCCAGGGAGATATCTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGC
GAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATAC
TTACATTGGCAAACCGGTTGTTACCAATGCCACTGTGCATGCTGTTGTGGAAAATCAAGG
TCTGAATGATAAAGTGGTGGTCTTCAAGTACAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATAT
CGGTCACCGACAGCCAAATACGAGGATTAGGATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTA
TCCAGCGTCTCCCAACGTTGCTGTTTAAATGTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAA
AA*TTATGCTTCTTGAATGTTCAATTTTATGATCTTTTCTATGTACTTCTGAAAGACCAG
ATTA*****TTTCGTTTCTGTTGAGAATCTTAAGATTCAGTATATTAATATATACTCACT
CTTGC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2GM24JQ 601 0 0
AAATTCTCCGAATCAGCCGTCGTGGCTGAACCCGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTC
GTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGA
CGCCAGTACATTGTTTTCCCAGGGAGATATCTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAAT
GTTGATGACCAGATTGTTTTGAACAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTAC
ATTGGCAAACCGGTTGTTACCAATGCCACTGTGCATGCTGTTGTGGAAAATCAAGGTCTG
AATGATAAAGTGGTGGTCTTCAAGTACAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGT
CACCGACAGCCAGATACGATGATTAGGATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCA
GCGTCTCCCAACGTTGCTGTTTAAATGTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAAAA*T
TATGCTTCTTGAATGTTCAATTTTATGATCTTTTCTATGTACTTCTGAAAGACCAGACTA
*****TTTCGTTTCTGTTGAGAATCTTAAGATTCAGTATATTAATATATACTCACTCTTG
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2CZ23JQ 575 0 0
TCAGCCGTCGTGGCTGAACCCGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTCGTCTCAGAGGAG
GATAAGCCTAAACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGCGGACGGCAGTACATT
GTTTTCCCAGGGAGATATCTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAG
ATTGTTTTGAACAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCG
GTTGTTACCAATGCCACTGTACATGCTGTTGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTG
GTGGTCTTCAAGTACAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCA
AATACGAGGATTAGGATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCAGCGTCTCCTAAC
GTTGCTGTTTAAATGTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAAAA*TTATGCTTCTTGA
ATGTTCAATTTTCTGATCTTTTCTATGTACTTCTGAAAGACAAGACCA*****TTTCATT
TCTGTTGAGAATCTTAAGATGCAGTATATTAATAT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2AC61JQ 583 0 0
G
GCCGAATCAGCCGTCGTGGCTGAACCAGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTGGTCTCA
GAGGAGGATAAGCCTAAACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGCCAG
TACATTGTTTTCCCAGGGAGATATCTCTACACCCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGAT
GACCAGATTGTTTTGAACAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGC
AAACCGGTTGTTACCAATGCCACTGTGCATGCTGTTGTCGAAAATCAAGGTCTGAATGAT
AAAGTGGTGGTCTTCAAGTACAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGA
CAGCCAAATACGAGGATTAGGATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCAGCGTCT
CCCAACGTTGC*GTTTAAATGTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAAAT*TTATGCT
TCTTGAATGTTCGATTTCCTGATATTTTCTATGTACTTCTGAAAGACCAGACCAGTCCAT
TTCATTTCTGTTGAGAATCTTAAGATGCAGTATATTAATATG

QA 2 583 2 583
DS 

RD RR2AC61TF 583 0 0
G
GCCGAATCAGCCGTCGTGGCTGAACCAGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTGGTCTCA
GAGGAGGATAAGCCTAAACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGCCAG
TACATTGTTTTCCCAGGGAGATATCTCTACACCCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGAT
GACCAGATTGTTTTGAACAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGC
AAACCGGTTGTTACCAATGCCACTGTGCATGCTGTTGTCGAAAATCAAGGTCTGAATGAT
AAAGTGGTGGTCTTCAAGTACAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGA
CAGCCAAATACGAGGATTAGGATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCAGCGTCT
CCCAACGTTGC*GTTTAAATGTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAAAT*TTATGCT
TCTTGAATGTTCGATTTCCTGATATTTTCTATGTACTTCTGAAAGACCAGACCAGTCCAT
TTCATTTCTGTTGAGAATCTTAAGATGCAGTATATTAATATG

QA 2 583 2 583
DS 

RD RR2CY31JQ 626 0 0
GCTGCGTCTACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTC
GTGGCTGAACCCGAGACTACCGATATTGAAGCTGTTGTGGTCTCAGAGGAGGATAAGCCT
AAACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGGCAGTACATTGTTTTCCCA
GGGAGATATCTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTG
AACAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCGGTTGTTACC
AATGCCACTGTGCATGCTGTTGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCTTC
AAGTACAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCAAATACGAGG
ATTAGGATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCAGCGTCTCCTAACGTTGCTGTT
TAAATGTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAAAAATTATGCTTCTTGAATGTTCAAT
TTTCTGATCTTTTCTATGTACTTCTGAAAGACAAGACCA*****TTTCATTTCTGTTGAG
AATCTTAAGATGCAGTATATTAATAT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2GF34TF 739 0 0
G
AACGATTGGGTTTCTTTCTACTTCCGCTGCTGCGTCTACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGC
CGCTCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTCGTGGCTGAACCCGAGACTACCGATATTGAAGC
TGTGGTCGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGT
TGGTGGACGGCAGTACATTGTTTTCCCAGGGAGATATCTCTACACTCAGCGGCTCAAAGA
TGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACA
TACTTACATCGGCAAACCGGTTGTTACCAATGCCACTGTACATGCTGTTGTGGAAAATCA
AGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCTTCAAGTACGAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAA
TATCGGTCACCGACAGCCAAATACGAGGATTAGGATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGA
GTATCCAGCGTCTCCTAACGTTGCTGTTTAAATGTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAA
AAAAA*TTATGCTTCTTGAATGTTCAATTTTCTGATCTTTTCTATGTACTTCTGAAAGAC
AAGACCA*****TTTCATTTCTGTTGAGAATCTTAAGATGCAGTATATTAATATATACTC
ACTTTTGCCATTTCTTATCCCCATGTTTCAAGTCTCCATCCATCCATCTAGACGTATTGA
TATATATCATAGAGTGTG

QA 2 739 2 739
DS 



AS 3 16

CO CL100Contig1 701 3 7 U
GCGACAAAAAAAAACTAATTATATGACGAACCAAACATATAACATAATTGCTTTGAAAGT
TTTGTTTGGAGTACAACACAAGCACAAATCATTACATCTCTCTATACGTAAAAGAAAGAC
AAGCTGTGAAATAATACCATGTAACTGATACATAAATAAACCCGAATAAAATCACAAAAT
AGAGAAAGAATCTATTATTATAAAAAAAAAAAACAGAACCAAACCAGTCTTGTTTTCTTT
TTCTTATTGATATGTATTTTTTTTCAATTTCAAAAAGCTCTAAGCAGAAGTAGAGCCCTT
GAGCTTCTTGGTGATGGTAGCAATGTACTTGCCTTGGTGAAGCGCTTGCTGTAACTCCAG
CTCCGTTGGCTGCCTCGACCCATCTCCTGCAAATGTTCCAGCTCCATAAGGGCTACCTCC
TTTCACACTCTCCATCTCGAACATTCCCGCCCCGAAAGTGTAACCGATGGGGACAAACAC
CATCCCGTGGTGAACCAGCTGAGTTATCGCAGTCAATGCGGTGGTTTCTTGGCCACCACC
TTGAGAGCCAGTGCTGTAGAAGATACCAGCTGGTTTGCCAGCGAGCGACTGAGTCCTCCA
GAGTCCACCGGTCGCGTCCAAGAAGGCCTTGAACTGAGCAGCCATCATACCGAACCTTGT
AGGGAATCCGAAGACGAAGCCATCAGCTTCGGTTAGCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR44JQ U 1
AF RR2GB20JQ U 25
AF RR2GB20TF C 25
BS 1 341 RR2DR44JQ
BS 342 342 RR2GB20JQ
BS 343 510 RR2DR44JQ
BS 511 511 RR2GB20JQ
BS 512 556 RR2DR44JQ
BS 557 557 RR2GB20JQ
BS 558 701 RR2GB20TF

RD RR2DR44JQ 556 0 0
GCGACAAAAAAAAACTAATTATATGACGAACCAAACATATAACATAATTGCTTTGAAAGT
TTTGTTTGGAGTACAACACAAGCACAAATCATTACATCTCTCTATACGTAAAAGAAAGAC
AAGCTGTGAAATAATACCATGTAACTGATACATAAATAAACCCGAATAAAATCACAAAAT
AGAGAAAGAATCTATTATTATAAAAAAAAAAAACAGAACCAAACCAGTCTTGTTTTCTTT
TTCTTATTGATATGTATTTTTTTTCAATTTCAAAAAGCTCTAAGCAGAAGTAGAGCCCTT
GAGCTTCTTGGTGATGGTAGCAATGTACTTGCCTTGGTGAAACGCTTGCTGTAACTCCAG
CTCCGTTGGCTGCCTCGACCCATCTCCTGCAAATGTTCCAGCTCCATAAGGGCTACCTCC
TTTCACACTCTCCATCTCGAACATTCCCGCCCCGAAAGTGTAACCGATGGGGACAAACAC
CATCCCGTGGTGAACCAGCTGAGTTATCGCCGTCAATGCGGTGGTTTCTTGGCCACCACC
TTGAGAGCCAGTGCTG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2GB20JQ 533 0 0
GACGAACCAAACATATAACATAATTGCTTTGAAAGTTTTGTTTGGAGTACAACACAAGCA
CAAATCATTACATCTCTCTATACGTAAAAGAAAGACAAGCTGTGAAATAATACCATGTAA
CTGATACATAAATAAACCCGAATAAAATCACAAAATAGAGAAAGAATCTATTATTATAAA
AAAAAAAAACAGAACCAAACCAGTCTTGTTTTCTTTTTCTTATTGATATGTATTTTTTTT
CAATTTCAAAAAGCTCTAAGCAGAAGTAGAGCCCTTGAGCTTCTTGGTGATGGTAGCAAT
GTACTTGCCTTGGTGAAGCGCTTGCTGTAACTCCAGCTCCGTTGGCTGCCTCGACCCATC
TCCTGCAAATGTTCCAGCTCCATAAGGGCTACCTCCTTTCACACTCTCCATCTCGAACAT
TCCCGCCCCGAAAGTGTAACCGATGGGGACAAACACCATCCCGTGGTGAACCAGCTGAGT
TATCGCAGTCAATGCGGTGGTTTCTTGGCCACCACCTTGAGAGCCAGTGCTGT

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2GB20TF 677 0 0
GACGAACCAAACATATAACATAATTGCTTTGAAAGTTTTGTTTGGAGTACAACACAAGCA
CAAATCATTACATCTCTCTATACGTAAAAGAAAGACAAGCTGTGAAATAATACCATGTAA
CTGATACATAAATAAACCCGAATAAAATCACAAAATAGAGAAAGAATCTATTATTATAAA
AAAAAAAAACAGAACCAAACCAGTCTTGTTTTCTTTTTCTTATTGATATGTATTTTTTTT
CAATTTCAAAAAGCTCTAAGCAGAAGTAGAGCCCTTGAGCTTCTTGGTGATGGTAGCAAT
GTACTTGCCTTGGTGAAGCGCTTGCTGTAACTCCAGCTCCGTTGGCTGCCTCGACCCATC
TCCTGCAAATGTTCCAGCTCCATAAGGGCTACCTCCTTTCACACTCTCCATCTCGAACAT
TCCCGCCCCGAAAGTGTAACCGATGGGGACAAACACCATCCCGTGGTGAACCAGCTGAGT
TATCGCAGTCAATGCGGTGGTTTCTTGGCCACCACCTTGAGAGCCAGTGCTGTAGAAGAT
ACCAGCTGGTTTGCCAGCGAGCGACTGAGTCCTCCAGAGTCCACCGGTCGCGTCCAAGAA
GGCCTTGAACTGAGCAGCCATCATACCGAACCTTGTAGGGAATCCGAAGACGAAGCCATC
AGCTTCGGTTAGCTCCC

QA 1 677 1 677
DS 



CO CL100Contig2 797 7 49 U
AGGGGGAACATCCAATCAATAAAGCTTCAGAGATTCTTCTACTGCAGAGACAACTATTTT
TCGATATGGCGACCAAAGTGTATATCGTGTACTACTCAATGTACGGTCATGTTGAGAAAT
TGGCTGAAGAGATAAGGAAAGGTGCTGCTTCTGTTGAAGGTGTTGAAGCCAAACTCTGGC
AGGTACCTGAGACACTTCCGGAAGAAGTACTCTCTAAGATGAGCGCACCACCGAAGAGTG
AATCACCAATCATCACACCCAACGAGCTAACCGAAGCTGATGGCTTCCTCTTCGGATTCC
CAACAAGGTTCGGTATGATGGCTGCTCAGTTCAAGGCCTTCTTGGACGCTACCGGTGGAC
TCTGGAGGACTCAGTCGCTCGCTGGCAAACCAGCTGGTATCTTCTACAGCACTGGCTCCC
AAGGTGGTGGCCAAGAAACCACCGCATTGACTGCGATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGA
TGGTGTTTGTGCCCATCGGTTACACTTTCGGTGCGGGAATGTTCGAGATGGAGAATGTGA
AAGGAGGTAGCCCTTATGGAGCTGGAACATTTGCAGGAGATGGGTCGAGGCAGCCAACGG
AGCTGGAGCTACAGCAAGCGTTTCACCAAGGCAAGTACATTGCTACCATCACCAAGAAGC
TCAAGGGCTCTACTTCTGCTTAGAGCTTTTTGAAAAA****AAAAAAATACATATCAATA
AGAAAAAAAAAACAAGACTGGTTTGGTTCTGTTTTTTTATTACAAAAATAGATTCTTTCT
CTATTTTGTGATTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 0 30 45 
45 45 45 45 5 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 20 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 30 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 20 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 0 0 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 5 10 25 10 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR44TF U 1
AF RR2EU16TF U 4
AF RR2BZ61TF U 26
AF RR2E209TF U 4
AF RR2F061TF U 4
AF RR2A602TF U 2
AF RR2F061JQ C 57
BS 1 36 RR2DR44TF
BS 37 39 RR2E209TF
BS 40 57 RR2DR44TF
BS 58 58 RR2F061TF
BS 59 64 RR2DR44TF
BS 65 65 RR2F061TF
BS 66 106 RR2DR44TF
BS 107 107 RR2E209TF
BS 108 142 RR2DR44TF
BS 143 143 RR2E209TF
BS 144 187 RR2DR44TF
BS 188 188 RR2F061TF
BS 189 287 RR2DR44TF
BS 288 288 RR2E209TF
BS 289 301 RR2DR44TF
BS 302 302 RR2E209TF
BS 303 349 RR2DR44TF
BS 350 350 RR2F061TF
BS 351 418 RR2DR44TF
BS 419 419 RR2E209TF
BS 420 451 RR2DR44TF
BS 452 452 RR2E209TF
BS 453 490 RR2DR44TF
BS 491 491 RR2E209TF
BS 492 511 RR2DR44TF
BS 512 512 RR2E209TF
BS 513 534 RR2DR44TF
BS 535 535 RR2E209TF
BS 536 608 RR2DR44TF
BS 609 609 RR2F061TF
BS 610 629 RR2DR44TF
BS 630 630 RR2F061TF
BS 631 686 RR2DR44TF
BS 687 695 RR2EU16TF
BS 696 696 RR2E209TF
BS 697 697 RR2A602TF
BS 698 700 RR2EU16TF
BS 701 701 RR2E209TF
BS 702 702 RR2A602TF
BS 703 708 RR2EU16TF
BS 709 727 RR2E209TF
BS 728 728 RR2F061JQ
BS 729 730 RR2A602TF
BS 731 760 RR2E209TF
BS 761 761 RR2A602TF
BS 762 765 RR2E209TF
BS 766 766 RR2F061JQ
BS 767 777 RR2E209TF
BS 778 797 RR2A602TF

RD RR2DR44TF 686 0 0
AGGGGGAACATCCAATCAATAAAGCTTCAGAGATTC***TACTGCAGAGACAACTATATT
TCGAGATGGCGACCAAAGTGTATATCGTGTACTACTCAATGTACGGACATGTTGAGAAAT
TGGCTGAAGAGATAAGGAAAGGAGCTGCTTCTGTTGAAGGTGTTGAAGCCAAACTCTGGC
AGGTACCAGAGACACTTCCGGAAGAAGTACTCTCTAAGATGAGCGCACCACCGAAGAGTG
AATCACCAATCATCACACCCAACGAGCTAACCGAAGCTGATGGCTTCGTCTTCGGATTCC
CTACAAGGTTCGGTATGATGGCTGCTCAGTTCAAGGCCTTCTTGGACGCGACCGGTGGAC
TCTGGAGGACTCAGTCGCTCGCTGGCAAACCAGCTGGTATCTTCTACAGCACTGGCTCTC
AAGGTGGTGGCCAAGAAACCACCGCATTGACGGCGATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGA
TGGTGTTTGTCCCCATCGGTTACACTTTCGGGGCGGGAATGTTCGAGATGGAGAGTGTGA
AAGGAGGTAGCCCTTATGGAGCTGGAACATTTGCAGGAGATGGGTCGAGGCAGCCAACGG
AGCTGGAGTTACAGCAAGCGTTTCACCAAAGCAAGTACATTGCTACCATCACCAAGAAGC
TCAAGGGCTCTACTTCTGCTTAGAGC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2EU16TF 705 0 0
GGG
AACATCCAATCAATAAAGCTTCAGAGATTC***TACTGCAGAGGCAACTATATTTCGAGA
TGGCGACCAAAGTGTATATCGTGTACTACTCAATGTACGGACATGTTGAGAAATTGGCTG
AAGAGATAAGGAAAGGAGCTGCTTCTGTTGAAGGTGTTGAAGCCAAACTCTGGCAGGTAC
CAGAGACACTTCCGGAAGAAGTACTCTCTAAGATGAGCGCACCACCGAAGAGTGAATCAC
CAATCATCACACCCAACGAGCTAACCGAAGCTGATGGCTTCGTCTTCGGATTCCCTACAA
GGTTCGGTATGATGGCTGCTCAGTTCAAGGCCTTCTTGGACGCGACCGGTGGACTCTGGA
GGACTCAGTCGCTCGCTGGCAAACCAGCTGGTATCTTCTACAGCACTGGCTCTCAAGGTG
GTGGCCAAGAAACCACCGCATTGACGGCGATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGATGGTGT
TTGTCCCCATCGGTTACACTTTCGGGGCGGGAATGTTCGAGATGGATAGTGTGAAAGGAG
GTAGCCCTTATGGAGCTGGAACATTTGCAGGAGATGGGTCGAGGCAGCCAACGGAGCTGG
AGTTACAGCAAGCGTTTCACCAA*GCAAGTACATTGCTACCATCACCAAGAAGCTCAAGG
GCTCTACTTCTGCTTAGAGCTTTTTGAAAT****TGAAAAAA

QA 4 705 4 705
DS 

RD RR2BZ61TF 655 0 0
TTCAGAGATTCTTCTACTGCAGAGACAACTATTTTTCGATATGGCGACCAAAGTGTATAT
CGTGTACTACTCAATGTACGGTCATGTTGAGAAATTGGCTGAAGAGATAAGGAAAGGTGC
TGCTTCTGTTGAAGGTGTTGAAGCCAAACTCTGGCAGGTACCTGAGACACTTCCGGAAGA
AGTACTCTCTAAGATGAGCGCACCACCGAAGAGTGAATCACCAATCATCACACCCAACGA
GCTAACCGAAGCTGATGGCTTCCTCTTCGGATTCCCAACAAGGTTCGGTATGATGGCTAC
TCAGTTCAAGGCCTTCTTGGACGCTACCGGTGGACTCTGGAGGACTCAGTCGCTCGCTGG
CAAACCAGCTGGTATCTTCTACAGCACTGGCTCCCAAGGTGGTGGCCAAGAAACCACCGC
ATTGACTGCGATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGATGGTGTTTGTGCCCATCGGTTACAC
TTTCGGTGCGGGAATGTTCGAGATGGAGAATGTGAAAGGAGGTAGCCCTTATGGAGCTGG
AACATTTGCTGGAGATGGGTCGAGGCAGCCAACGGAGCTGGAGCTACAGCAAGCGTTTCA
CCAA*GCAAGTACATTGCTACCATCACCAAGAAGCTCAAGGGCTCTACTTCTGCT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2E209TF 778 0 0
GGAAACA
TCCAATCAAAAAAGCTTCAGAGATTCTTCTACTGCAGAGACAACTAT**TTCGA**TGGC
GACCAAAGTGTATATCGTGTACTACTCAATGTACGGTCATGTTGAGAAATTGGCTGAAGA
GATAAGGAAAGGTGCTGCTTCTGTTGAAGGTGTTGAAGCCAAACTCTGGCAGGTACCAGA
GACACTTCCGGAAGAAGTACTCTCTAAGATGAGCGCACCACCGAAGAGTGAATCACCAAT
CATCACACCCAACGAGCTAACCGAAGCTGATGGCTTCCTCTTCGGATTCCCAACAAGGTT
CGGTATGATGGCTGCTCAGTTCAAGGCCTTCTTGGACGCGACCGGTGGACTCTGGAGGAC
TCAGTCGCTCGCTGGCAAACCAGCTGGTATCTTCTACAGCACTGGCTCCCAAGGTGGTGG
CCAAGAAACCACCGCATTGACTGCGATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGATGGTGTTTGT
GCCCATCGGTTACACCTTCAGTGCGGGAATGTTCGAGATGGAGAATGTGAAAGGAGGAAG
CCCTTATGGAGCTGGAACATTTGCAGGAGATGGGTCGAGGCAGCCAACGGAGCTGGAGTT
ACAGCAAGCGTTTCACCAAAGCAAGTACATTGCTACCATCACCAAGAAGCTCAAGGGCTC
TACTTCTGCTTAGAGCTTTTTGAAAA*****GAAAAAATACATATCAATAAGAAAAA***
AACAAGACTGGTTTGGTTCTGTTTTTTTAT*ACAA*AATAGATTCTT
CTTT

QA 8 774 8 774
DS 

RD RR2F061TF 724 0 0
GGGAACC
TCCAATCAATAAAGCTTCAGAGATTCTTCTACTGCAGAGACAACTATTTTTCGATATGGC
GACCAAAGTGTATATCGTGTACTACTCAATGTACGGTCATGTTGAGAAATTGGCTGAAGA
GATAAGGAAAGGTGCTGCTTCTGTTGAAGGTGTTGAAGCCAAACTCTGGCAGGTACCTGA
GACACTTCCGGAAGAAGTACTCTCTAAGATGAGCGCACCACCGAAGAGTGAATCACCAAT
CATCACACCCAACGAGCTAACCGAAGCTGATGGCTTCCTCTTCGGATTCCCAACAAGGTT
CGGTATGATGGCTGCTCAGTTCAAGGCCTTCTTGGACGCTACCGGTGGACTCTGGAGGAC
TCAGTCGCTCGCTGGCAAACCAGCTGGTATCTTCTACAGCACTGGCTCCCAAGGTGGTGG
CCAAGAAACCACCGCATTGACTGCGATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGATGGTGTTTGT
GCCCATCGGTTACACTTTCGGTGCGGGAATGTTCGAGATGGAGAATGTGAAAGGAGGTAG
CCCTTATGGAGCTGGAACATTTGCTGGAGATGGGTCGAGGCAGCCAACGGAGCTGGAGCT
ACAGCAAGCGTTTCACCAAGGCAAGTACATTGCTACCATCACCAAGAAGCTCAAGGGCTC
TACTTCTGCTTAGAGCTTTTTGAAAA*****GAAAAAATACATATCAATAAGAAAAA

QA 8 724 8 724
DS 

RD RR2A602TF 796 0 0
GGGAACATTTAATCAAAAA
AAAGCTTCAGAGATTCTTCTACTGCAGAGACAACTAT*TTTCGATATGGCGACCAAAGTG
TATATCGTGTACTACTCAATGTACGGTCATGTTGAGAAATTGGCTGAGGAGATAAGGAAA
GGAGCTGCTTCTGTTGAAGGTGTTGAAGCCAAACTCTGGCAGGTACCTGAGACACTTCCG
GAAGAAGTACTCTCTAAGATGAGCGCACCACCCAAGAGTGAATCACCAATCATCACACCC
AACGAGCTAACCGAAGCTGATGGCTTCCTCTTCGGATTCCCAGCAAGGTTCGGTATGATG
GCTGCTCAGTTCAAGGCCTTCTTGGACGCTACCGGTGGACTCTGGAGGACTCAGTCGCTC
GCTGGCAAACCAGCTGGTATCTTCTACAGCACTGGCTCTCAAGGTGGTGGCCAAGAAACC
ACAGCATTGACTGCGATAACTCAGCTTGTTCACCACGGGATGGTGTTTGTGCCCATCGGT
TACACTTTTGGTGCGGGAATGTTCGAGATGGAGAATGTGAAAGGAGGTAGCCCTTATGGA
GCTGGAACATTTGCAGGAGATGGGTCGAGGCAGCCAACGGAGCTGGAGCTACAGCAAGCG
TTTCACCAAGGCAAGTACATTGCAACCATCACCAAGAAGCTCAAGGGCTCTACTTCTGCT
TAGAGCTTTTTGAAAAAAGAAAAAAAAATACATATCAATAAGAAAAAGAAAACAAGACTG
GTTTGGTTCTGTTTTTTTTTTATAATAATAGATTCTTTCTCTATTTTGTGATTTTAT

QA 20 796 20 796
DS 

RD RR2F061JQ 726 0 0
T
TTTTCGATATGGCGACCAAAGTGTATATCGTGTACTACTCAATGTACGGTCATGTTGAGA
AATTGGCTGAAGAGATAAGGAAAGGTGCTGCTTCTGTTGAAGGTGTTGAAGCCAAACTCT
GGCAGGTACCTGAGACACTTCCGGAAGAAGTACTCTCTAAGATGAGCGCACCACCGAAGA
GTGAATCACCAATCATCACACCCAACGAGCTAACCGAAGCTGATGGCTTCCTTTTCGGAT
TCCCAACAAGGTTCGGTATGATGGCTGCTCAGTTCAAGGCCTTCTTGGACGCTACCGGTG
GACTTTGGAGGACTCAGTCGCTCGCTGGCAAACCAGCTGGTATTTTTTACAGCACTGGCT
CCCAAGGTGGTGGCCAAGAAACCACCGCATTGACTGCGATAACTCAGCTGGTTCACCACG
GGATGGTGTTTGTGCCCATCGGTTACACTTTCGGTGCGGGAATGTTCGAGATGGAGAATG
TGAAAGGAGGTAGCCCTTATGGAGCTGGAACATTTGCTGGAGATGGGTCGAGGCAGCCAA
CGGAGCTGGAGCTACAGCAAGCGTTTCACCAAGGCAAGTACATTGCTACCATCACCAAGA
AGCTCAAGGGCTCTACTTCTGCTTAGAGCTTTTTGAAAAA***GAAAAAAATACATATCA
ATAAGAAAAAAAAAACAAGACTGGTTTGGTTCTGTTTTTTTAATACAAAAATAGATTCTT
TCTC
G

QA 2 725 2 725
DS 



CO CL100Contig3 911 6 23 U
GGGAACCATTCCTATATCATCATCCACAAAGAGTTTTTTTTTTCGAGAAACACTTAACAA
AGTAGTTAAGCTTCAGAAAAACTAAGAAACGATCCCCATGGCGACCAAAGTATATATCGT
GTACTACTCAATGTACGGTCATGTGCAGAAATTGGCTGAAGAAATAAGGAAAGGAGCTGC
TTCTGTTGAAGGTGTTGAAGTCAAACTATGGCAGGTACCAGAGACGCTTCCAGAAGAAGC
ACTCCTTAAGATGAGCGCACCACCAAAGAGTGGATCACCAATTATCACACCCAACGACCT
AACTGAAGCTGATGGCTTTGTCTTTGGTTTCCCAACGAGGTTTGGTATGATGGCTGCTCA
GTTCAAAGCCTTCTTGGACGCAACCGGTGGACTCTGGAGGACTCAGGCACTCGCCGGTAA
ACCAGCTGGTATCTTCTACAGCACTGGCTCTCAAGGCGGTGGCCAAGAAACCACCGCATT
GACGGCGATAACTCAGCTGGTCCACCACGGGATGATATTTGTCCCAATCGGTTACACATT
TGGTGCTGGAATGTTCGAGATGGAGAAAGTTAAAGGTGGGAGTCCTTATGGAGCTGGAAC
ATTCGCAGGAGATGGTTCTAGGCAGCCAACACAGCTGGAGCTAGAGCAAGCCTTTCACCA
AGGCAAATACGTTGCAACCATCACCAAGAAGCTTAAGGGATCTACTGCTTAATGCTTTCT
AATGATTCGGTATCGATAAGAACAAAAAAACATTACCGGTTTTGTTCTGCTTTTATTAAT
AATATAAGTTCTTTCACTTTAATATTATTTCACAGCAATTAAATTCTTGTCTTTGTTCTT
ACGTATAGATATGTAATGATTTGTGCTTGTGCTTCACTCCAAACATGAATGAGATTTTTT
ACTGTCAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2GF23TF U 1
AF RR2GY49TF U 43
AF RR2GF33TF U 44
AF RR2CI69TF U 43
AF RR2GF23JQ C 211
AF RR2GF33JQ C 438
BS 1 49 RR2GF23TF
BS 50 50 RR2CI69TF
BS 51 111 RR2GF23TF
BS 112 112 RR2CI69TF
BS 113 131 RR2GF23TF
BS 132 132 RR2CI69TF
BS 133 337 RR2GF23TF
BS 338 338 RR2CI69TF
BS 339 462 RR2GF23TF
BS 463 463 RR2CI69TF
BS 464 508 RR2GF23TF
BS 509 525 RR2CI69TF
BS 526 526 RR2GY49TF
BS 527 618 RR2CI69TF
BS 619 619 RR2GF23JQ
BS 620 662 RR2CI69TF
BS 663 663 RR2GF23JQ
BS 664 698 RR2CI69TF
BS 699 699 RR2GF23JQ
BS 700 713 RR2CI69TF
BS 714 871 RR2GF23JQ
BS 872 872 RR2GF33JQ
BS 873 911 RR2GF23JQ

RD RR2GF23TF 508 0 0
GGGAACCATTCCTATATCATCATCCACAAAGAGTTTTTTTTTTCGAGAAGCACTTAACAA
AGTAGTTAAGCTTCAGAAAAACTAAGAAACGATCCCCATGGCGACCAAAGTGTATATCGT
GTACTACTCAAGGTACGGTCATGTGCAGAAATTGGCTGAAGAAATAAGGAAAGGAGCTGC
TTCTGTTGAAGGTGTTGAAGTCAAACTATGGCAGGTACCAGAGACGCTTCCAGAAGAAGC
ACTCCTTAAGATGAGCGCACCACCAAAGAGTGGATCACCAATTATCACACCCAACGACCT
AACTGAAGCTGATGGCTTTGTCTTTGGTTTCCCAACGGGGTTTGGTATGATGGCTGCTCA
GTTCAAAGCCTTCTTGGACGCAACCGGTGGACTCTGGAGGACTCAGGCACTCGCCGGTAA
ACCAGCTGGTATCTTCTACAGCACTGGCTCTCAAGGCGGTGGTCAAGAAACCACCGCATT
GACGGCGATAACTCAGCTGGTCCACCAC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2GY49TF 554 0 0
GG
GAGAAACACTTAACAAAGTAGTTAAGCTTCAGAAAAACTAAGAAACGATCCCCATGGCGA
CCAAAGTATATATCGTGTACTACTCAATGTACGGTCATGTGCAGAAATTGGCTGAAGAAA
TAAGGAAAGGAGCTGCTTCTGTTGAAGGTGTTGAAGTCAAACTATGGC**GTACCAGAGA
CGCTTCCAGAAGAAGCACTCCTTAAGATGAGCGCACCACCAAAGAGTGGATCACCAATCA
TCACCCCCAACGACCTAACTGAAGCTGATGGATTTGTTTTTGGTTTCCCAACGAGGTTCG
GTATGATGGCTGCTCAGTTCAAAGCCTTCTTGGACGCAACCGGTGGACTCTGGAGGACTC
AGGCACTCGCCGGTAAACCAGCTGGTATCTTCTACAGCACTGGCTCTCAAGGTGGTG*CC
AAGAAACCACCGCATTGACGGCGATAACTCAGCTGGTCCACCACGGGATGATATTTGTCC
CAATCGGTTACACATTTGGTGCTGGAATGTTCGAGATGGAGAAAGTTAAAGGTGGGAGTC
CTTATGGAGCTG

QA 3 554 3 554
DS 

RD RR2GF33TF 561 0 0
G
GAGAAGCACTTAACAAAGTAGTTAAGCTTCAGAAAAACTAAGAAACGATCCCCATGGCGA
CCAAAGTGTATATCGTGTACTACTCAATGTACGGTCATGTGCAGAAATTGGCTGAAGAAA
TAAGGAAAGGAGCTGCTTCTGTTGAAGGTGTTGAAGTCAAACTATGGCAGGTACCAGAGA
CGCTTCCAGAAGAAGCACTCCTTAAGATGAGCGCACCACCAAAGAGTGGATCACCAATTA
TCACACCCAACGACCTAACTGAAGCTGATGGCTTTGTCTTTGGTTTCCCAACGAGGTTTG
GTATGATGGCTGCTCAGTTCAAAGCCTTCTTGGACGCAACCGGTGGACTCTGGAGGACTC
AGGCACTCGCCGGTAAACCAGCTGGTATCTTCTACAGCACTGTCTCTCAAGGCGGTGGCC
AAGAAACCACCGCATTGACGGCGATAACTCAGCTGGTCCACCACGGGATGATATTTGTCC
CAATCGGTTACACATTTGGTGCTGGAATGTTCGAGATGGAGAAAGTTAAAGGTGGGAGTC
CTTATGGAGCTGGAACATTC

QA 2 561 2 561
DS 

RD RR2CI69TF 671 0 0
GG
GAGAAACACTTAACAAAGTAGTTAAGCTTCAGAGAAACTAAGAAACGATTCCCATGGCGA
CCAAAGTATATATCGTGTACTACTCAATGTACGGTCATGTGCAGAAATTGGCTGAAGAAA
TAAGGAAAGGAGCTGCTTCTGTTGAAGGTGTTGAAGTCAAACTATGGCAGGTACCAGAGA
CGCTTCCAGAAGAAGCACTCCTTAAGATGAGCGCACCACCAAAGAGTGGATCACCAATCA
TCACCCCCAACGACCTAACTGAAGCTGATGGCTTTGTCTTTGGTTTCCCAACGAGGTTCG
GTATGATGGCTGCTCAGTTCAAATCCTTCTTGGACGCAACCGGTGGACTCTGGAGGACTC
AGGCACTCGCCGGTAAACCAGCTGGTATCTTCTACAGCACTGGCTCTCAAGGTGGTGGCC
AAGAAACCACCGCATTGACGGCGATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGATGATATTTGTCC
CGATCGGTTACACATTTGGTGCTGGAATGTTCGAGATGGAGAAAGTTAAAGGTGGGAGTC
CTTATGGAGCTGGAACATTCGCAGGAGATGGTTCAAGGCAGCCAACACAGCTGGAGCTAG
AGCAAGCCTTTCACCAAG*CAAATACGTTGCAACCATCACCAAGAAGCTTAAGG*ATCTA
CTGCTTAAT

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR2GF23JQ 701 0 0
GCAGGTACCAGAGACGCTTCCAGAAGAAGCACTCCTTAAGATGAGCGCACCACCAAAGAG
TGGATCACCAATTATCACACCCAACGACCTAACTGAAGCTGATGGCTTTGTCTTTGGTTT
CCCAACGGGGTTTGGTATGATGGCTGCTCAGTTCAAAGCCTTCTTGGACGCAACCGGTGG
ACTCTGGAGGACTCAGGCACTCGCCGGTAAACCAGCTGGTATCTTCTACAGCACTGGCTC
TCAAGGCGGTGGTCAAGAAACCACCGCATTGACGGCGATAACTCAGCTGGTCCACCACGG
GATGATATTTGTCCCAATCGGTTACACATTTGGTACTGGAATGTTCGAGATGGAGAAAGT
TAAAGGTGGGAGTCCTTATGGAGCTGGAACATTCGCAGGAGATGGTTTTAGGCAGCCAAC
ACAGCTGGAGCTAGAGCAAGCCTTTCACCAAGGCAAATACGTTGCAACCATCACCAAGAA
GCTTAAGGGATCTACTGCTTAATGCTTTCTAATGATTCGGTATCGATAAGAACAAAAAAA
CATTACCGGTTTTGTTCTGCTTTTATTAATAATATAAGTTCTTTCACTTTAATATTATTT
CACAGCAATTAAATTCTTGTCTTTGTTCTTACGTATAGATATGTAATGATTTGTGCTTGT
GTTTCACTCCAAACATGAATGAGATTTTTTACTGTCAAATT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2GF33JQ 469 0 0
ACAGCACTGTCTCTCAAGGCGGTGGCCAAGAAACCACCGCATTGACGGCGATAACTCAGC
TGGTCCACCACGGGATGATATTTGTCCCAATCGGTTACACATTTGGTGCTGGAATGTTCG
AGATGGAGAAAGTTAAAGGTGGGAGTCCTTATGGAGCTGGAACATTCGCAGGAGATGGTT
CTAGGCAGCCAACACAGCTGGAGCTAGAGCAAGCCATTCACCAAGGCAAATACGTTGCAA
CCATCACCAAGAAGCTTAAGGGATCTACTGCTTAATGCTTTCTAATGATTCGGTATCGAT
AAGAACAAAAAAACATTACCGGTTTTGTTCTGCTTTTATTAATAATATAAGTTCTTTCAC
TTTAATATTATTTCACAGCAATTAAATTCTTGTCTTTGTTCTTACGTATAGATATGTAAT
GATTTGTGCTTGTGCTTCACTCCAAACATGAATGAGATTTTTTACTGTC

QA 1 469 1 469
DS 



AS 1 20

CO CL101Contig1 724 20 26 U
TTTTTTTCTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTC
CTCCATGGCTCCTATTGCTGTTGGTAATTCTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGA
CGAGAATGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCATTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCAT
TCTCTTTGGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTT
CATTGAGAAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCA
TGAATGATCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCA
AGTTTGTCTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTA
AGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGG
TAACTGTCGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGCGCCGATGATATCC
TCAAGGCTCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTTAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAA
TAAGAAGTTGCCATAATTAATTGGTTTAATATTATTTATTTCTTTTCTTTTATTATAATA
ATGTACTTGGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTGATTTATGAAGAGTTCAAGTGGTTCAC
CTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 25 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 25 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 35 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 50 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 70 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 80 80 45 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 45 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 65 80 50 80 80 80 80 80 80 45 45 80 45 75 75 75 75 75 50 70 70 70 70 70 70 55 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 55 55 55 50 45 45 45 45 15 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 

AF RR2CB53TF U 133
AF RR2DT83TF U 8
AF RR2BK27JQ C 1
AF RR2A934JQ C 8
AF RR2CB53JQ C 336
AF RR2A934TF U 8
AF RR2BK27TF U 60
AF RR2B396TF U 8
AF RR2C028TF U 8
AF RR2AD02JQ C 8
AF RR2BV23TF U 8
AF RR2EC04TF U 8
AF RR2AD02TF U 8
AF RR2DM49TF U 8
AF RR2FL74TF U 8
AF RR2B910TF U 8
AF RR2B910JQ C 8
AF RR2C028JQ C 215
AF RR2BV23JQ C 161
AF RR2EC04JQ C 149
BS 1 7 RR2BK27JQ
BS 8 88 RR2A934TF
BS 89 89 RR2BK27TF
BS 90 126 RR2A934TF
BS 127 127 RR2BK27TF
BS 128 137 RR2A934TF
BS 138 138 RR2DT83TF
BS 139 153 RR2A934TF
BS 154 154 RR2CB53TF
BS 155 526 RR2A934TF
BS 527 527 RR2BK27TF
BS 528 604 RR2A934TF
BS 605 605 RR2BK27TF
BS 606 617 RR2A934TF
BS 618 618 RR2BK27TF
BS 619 641 RR2A934TF
BS 642 643 RR2BK27TF
BS 644 644 RR2A934TF
BS 645 645 RR2BK27TF
BS 646 658 RR2A934TF
BS 659 675 RR2BV23TF
BS 676 697 RR2EC04TF
BS 698 702 RR2DM49TF
BS 703 703 RR2AD02JQ
BS 704 714 RR2DM49TF
BS 715 724 RR2B910JQ

RD RR2CB53TF 107 0 0
GCTCCAGACTGTCTCTGTTCATTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTTGGTGT
CCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTT

QA 1 107 1 107
DS 

RD RR2DT83TF 514 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTATGACGAGAAC
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGA
TCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGT
CTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTGGAGCTTGACCTTAAGGACAA
GGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGT
CGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2BK27JQ 562 0 0
TTTTTTTCTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTC
CTCCATGGCTCCTATTGCTGTTGGTAATTCTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGA
CGAGAATGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCATTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCAT
TCTCTTTGGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTT
CATTGAGAAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCA
TGAATGATCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCA
AGTTTGTCTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTA
AGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGG
TAACTGTCGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGCGCCGATGATATCC
TCAAGGCTCTCTAAGAAATTAC

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2A934JQ 546 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAC
GATCAGCTCCTGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGA
TCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGT
CTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAA
GGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGT
CGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGTGCCGATGATATCCTCAAGGC
TCTCTA

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2CB53JQ 239 0 0
ACATTCCCAGAAAACAAGCATGTCAAGTTTGTTTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAG
CTTTTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTT
GCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGTCGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTC
ACGGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGCTCTTTAAGAAATTACCATCTGAATT
AG

QA 1 237 1 237
DS 

RD RR2A934TF 659 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAC
GATCAGCTCCTGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGA
TCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGT
CTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAA
GGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGT
CGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGTGCCGATGATATCCTCAAGGC
TCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTTAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGTAG
TTGCCATAATAAATTGGTTTAATATTATTTATTTTCTCTCTTTTATTATAA
AATGTACT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2BK27TF 592 0 0
CCTCCATGGCTCCTATTGCTGTTGGTAATTCTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTG
ACGAGAATGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCATTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCA
TTCTCTTTGGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTT
TCATTGAGAAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGC
ATGAATGATCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTC
AAGTTTGTCTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTT
AAGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAG
GTAACTGTCGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGCGCCGATGATATC
CTCAAGGCTCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTTAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGA
ATAAGAAGTTGCCATAATTAATTGGTTTA*TATTATTTATTTCTTTTCTTTT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2B396TF 595 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTTGGTAATTCTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAT
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCATTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGA
TCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGT
CTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAA
GGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGT
CGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGC
TCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTTAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATA

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2C028TF 643 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTTGGTAATTCTCTACCAGACGGAAAAATTCTCCTCTTTGACGAGAAT
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCATTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGA
TCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGT
CTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAA
GGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGT
CGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGC
TCTCTAAGAAATTACCATCTGATTTTAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAG
TTGCCATAATTAAT*GGTTTA*TAT*ATTTATTTCTTT
CTTTA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2AD02JQ 697 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTTGGTAATTCTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAT
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCATTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGA
TCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGT
CTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAA
GGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGT
CGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGC
TCTCCAAGAAATTACCATCTGAATTTAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAG
TTGCCATAATTAATTGGTTTAATATTATTTATTTCTTTTCTTTTATTATAATAATGTACT
TGGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTGATTTATGAAG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2BV23TF 668 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTTGGTAATTCTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAT
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCATTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGA
TCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAACACATTCC*AGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGT
CTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAA
GGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGT
CGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGC
TCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTTAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAG
TTGCCATAATTAATTGGTTTAATATTACTTATTTCTTTTCTTTTATTATAATAATGTACT
TGGTTTGG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2EC04TF 690 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTCGGTAATTCTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAT
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCATTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGA
TCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGT
CTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAA
GGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGT
CGCCAACATTGAAACAGGAGGCGAGTTCACGGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGC
TCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTTAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAG
TTGCCATAATTAATTGGTTTAATATTATTTATTTCTTTTCTTTTATTATAATAATGTACT
TGGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTGATT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2AD02TF 687 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTTGGTAATTCTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAT
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCATTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGA
TCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGT
CTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAA
GGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGT
CGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGC
TCTCCAAGAAATTACCATCTGAATTTAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAG
TTGCCATAATTAATTGGTTTAATATTATTTATTTCTTTTCTTTTATTATAATAATGTACT
TGGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2DM49TF 707 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAC
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACTTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAG*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGA
TCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGT
CTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAA
GGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGT
CGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGTGCCGATGATATCCTCAAGGC
TCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTTAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGTAG
TTGCCATAATAAATTGGTTTAATATTATTTATTTTCTCTCTTTTATTATAATAATGTACT
TGGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTGATTTATGA*GAGTTCAAGTG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2FL74TF 707 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCT*CCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAC
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTGGTTATGGCATGAATGA
TCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGT
CTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAA
GGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGT
CGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGTGCCGATGATATCCTCAAGGC
TCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTTAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGTAG
TTGCCATAATAAATTGGTTTAATATTATTTATTTTCTCTCTTT*ATTATAATAATGTACT
TGGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTT*GATTTATGA*GAGTTCAAGTG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2B910TF 691 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTTGGTAATTCTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAT
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCATTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTTCAGCATGTACCTACTTTCATTGAG
AAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGA
TCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGT
CTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAA
GGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGT
CGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCATCGCCGATGATATCCTCAAGGC
TCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTTAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAG
TTGCCATAATTAATTGGTTTAATATTATTTATTTCTTTTCTTT*ATTATA*TAATGTACT
TGGTTTGGGTTGTTT*CTTTAAGTTTGATTT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2B910JQ 717 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTTGGTAATTCTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAT
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCATTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTTCAGCATGTACCTACTTTCATTGAG
AAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGA
TCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGT
CTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAA
GGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGT
CGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCATCGCCGATGATATCCTCAAGGC
TCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTTAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAG
TTGCCATAATTAATTGGTTTAATATTATTTATTTCTTTTCTTTTATTATAATAATGTACT
TGGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTGATTTATGAAGAGTTCAAGTGGTTCACCTTT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2C028JQ 510 0 0
TGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAGAAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGG
TGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGATCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAA
TACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGTTTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAA
GCTTTTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATT
TGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGTCGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTT
CACGGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGCTCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTTA
GAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAGTTGCCATAATTAATTGGTTTAATATTA
TTTATTTCTTTTCTTTTATTATAATAATGTACTTGGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTG
ATTTATGAAGAGTTCAAGTGGTTCCCCTTT

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2BV23JQ 564 0 0
TTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTTGGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGC
TTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAGAAA*GCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAA
TGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGATCCGTATGTGATGAAAGCATGGGGAAACACATT
CC*AGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGTTTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTTT
CGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTAT
GTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGTCGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGT
TTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGCTCTTTAAGAAATTACCATCTGAATTTAGAGGAT
CTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAGTTGCCATAATTAATTGGTTTAATATTACTTATT
TCTTTTCTTTTATTATAATAATGTACTTGGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTGATTTAT
GAAGAGTTCAAGTGGTTCACCTTT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2EC04JQ 576 0 0
GTTCATTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTTGGTGTCCCCGGTGCTTTCACT
TCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAGAAA*GCGGAACAGCTGAAAGC
GAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGATCCGTATGTGATGAAAGCATG
GGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGTCTCAGACGGCTCAGGAGAATA
CACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGACAAA
GAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACTGTCGCCAACATTGAAACAGGAGG
CGAGTTCACGGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGCTCTCTAAGAAATTACCATCTG
AATTTAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAGTTGCCATAATTAATTGGTTTA
ATATTATTTATTTCTTTTCTTTTATTATAATAATGTACTTGGTTTGGGTTGTTTTCTTTA
AGTTTGATTTATGAAGAGTTCAAGTGGTTCACCTTT

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 20

CO CL102Contig1 635 20 7 U
GGGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAA
GATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAAT
AATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCA
ATCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCT
ATGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTAT
TCCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAA
ACTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAAT
CCGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTA
TCCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTT
CGTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTC
TTAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTACAATAACAAT


BQ
10 85 85 85 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 40 40 40 30 30 30 30 30 30 

AF RR2H296TF U 2
AF RR2G864TF U 2
AF RR2C891TF U 2
AF RR2CS08TF U 2
AF RR2AP41JQ C 1
AF RR2E827JQ C 94
AF RR2E827TF U 94
AF RR2C891JQ C 2
AF RR2B277JQ C 2
AF RR2B277TF U 2
AF RR2CS08JQ C 2
AF RR2E977JQ C 2
AF RR2D639TF U 2
AF RR2D639JQ C 2
AF RR2BF56JQ C 2
AF RR2H296JQ C 37
AF RR2G864JQ C 2
AF RR2E977TF U 2
AF RR2BF56TF U 2
AF RR2AP41TF U 1
BS 1 1 RR2AP41JQ
BS 2 94 RR2C891TF
BS 95 281 RR2E827TF
BS 282 282 RR2C891TF
BS 283 626 RR2E827TF
BS 627 629 RR2B277TF
BS 630 635 RR2BF56TF

RD RR2H296TF 406 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAA
TCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTA
TGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATT
CCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAA
CTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGT

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR2G864TF 506 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAA
TCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGG*TATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTA
TGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATT
CCTGTTTTGGCATTCCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAA
CTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATC
CGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTAT
CCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACT

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2C891TF 577 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAA
TCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTA
TGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATT
CCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAA
CTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATC
CGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTAT
CCGTGGGCAATGGGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTC
GTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2CS08TF 563 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAC
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAA
TCCACTCCGATTGGAATTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTA
TGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATT
CCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAA
CTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATC
CGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTAT
CCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTC
GTGCTTATCCTAATTCTTGGTTT

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2AP41JQ 635 0 0
GGGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAA
GATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAAT
AATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCA
ACCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCT
ATGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTAT
TCCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAA
ACTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAAT
CCGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTA
TCCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTT
CGTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTC
TCAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTACAATAACAAT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2E827JQ 533 0 0
G
ACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATAATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGA
AGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAATCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATT
TTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTATGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGG
CATTTTTTAATAATATCAAGTGCTATTCCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTA
TCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAACTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATC
GGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATCCGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTT
TTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTATCCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTA
TCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTCGTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCA
TGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCTTAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTAC

QA 2 533 2 533
DS 

RD RR2E827TF 533 0 0
G
ACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATAATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGA
AGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAATCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATT
TTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTATGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGG
CATTTTTTAATAATATCAAGTGCTATTCCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTA
TCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAACTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATC
GGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATCCGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTT
TTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTATCCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTA
TCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTCGTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCA
TGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCTTAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTAC

QA 2 533 2 533
DS 

RD RR2C891JQ 612 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTTTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAA
TCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTA
TGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATT
CCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAA
CTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATC
CGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTAT
CCGTGGGCAATGGGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTC
GTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCT
TAGTTCGTTTCC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2B277JQ 628 0 0
GGT
GAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAGATT
ACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATAATT
CGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTCTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAATCC
ACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTATGT
TTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATTCCT
GTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAACTT
TCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATCCGT
TATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTATCCG
TGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTCGTG
CTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCTTAG
TTCGTTTCCTGAATACTTGTACAAT

QA 4 628 4 628
DS 

RD RR2B277TF 628 0 0
GGT
GAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAGATT
ACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATAATT
CGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTCTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAATCC
ACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTATGT
TTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATTCCT
GTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAACTT
TCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATCCGT
TATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTATCCG
TGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTCGTG
CTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCTTAG
TTCGTTTCCTGAATACTTGTACAAT

QA 4 628 4 628
DS 

RD RR2CS08JQ 625 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAA
TCCACTCCGATTGGAATTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTA
TGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATT
CCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAA
CTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATC
CGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTAT
CCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTC
GTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCT
TAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTAC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2E977JQ 625 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAA
TCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTA
TGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATT
CCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAA
CTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATC
CGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTAT
CCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTC
GTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCT
TAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTAC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2D639TF 625 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAA
TCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTA
TGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATT
CCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAA
CTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATC
CGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTAT
CCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTC
GTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCT
TAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTAC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2D639JQ 625 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAA
TCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTA
TGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATT
CCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAA
CTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATC
CGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTAT
CCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTC
GTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCT
TAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTAC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2BF56JQ 634 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAA
TCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTA
TGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATT
CCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAA
CTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATC
CGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTAT
CCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTC
GTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCT
TAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTACAATAACAAT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2H296JQ 590 0 0
AAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAGATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTAC
CACAGCAACCAAACAAAAATAAATAATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAG
CAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAATCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTT
TTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTATGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCA
TTTTT*AATAATATCAAGTGCTATTCCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATC
TCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAACTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGG
GGATGCTTGGTTACAATTTAGAATCCGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTT
TGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTATCCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATC
CGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTCGTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATG
GCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCTTAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTAC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2G864JQ 625 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAA
TCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGG*TATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTA
TGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATT
CCTGTTTTGGCATTCCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAA
CTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATC
CGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTAT
CCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTC
GTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCT
TAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTAC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2E977TF 625 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAA
TCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTA
TGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATT
CCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAA
CTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATC
CGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTAT
CCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTC
GTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCT
TAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTAC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2BF56TF 634 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAA
TCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTA
TGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATT
CCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAA
CTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATC
CGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTAT
CCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTC
GTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCT
TAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTACAATAACAAT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2AP41TF 635 0 0
G
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGACGTCTACCACAGCAACCAAACAAAAATAAATA
ATTCGATTAACCTTAATTTTGGTTTGGTTTTGAAGCAAGAGTTATATATCCCTTGCCCAA
CCCACTCCGATTGGAAGTGACTAAGCGGGTATTTTTTCCACATTCATAGGAGTTCGTCTA
TGTTTCTGCTTTACGAATATGATATTTTCTGGGCATTTTT*AATAATATCAAGTGCTATT
CCTGTTTTGGCATTTCTAATTTCCGGGGTTTTATCTCCAATTACGAAGGGGCCGGAGAAA
CTTTCTAGTTATGAATCAGGTATAGAACCGATCGGGGATGCTTGGTTACAATTTAGAATC
CGTTATTATATGTTTGCTCTAGTTTTTGTTGTTTTTGATGTTGAAACCGTTTTTCTGTAT
CCGTGGGCAATGAGTTTCGATGTACTAGGGGTATCCGCTTTTATAGAAGCTTTCATTTTC
GTGCTTATCCTAATTCTTGGTTTAGTTTATGCATGGCGAAAAGGAGCGTTGGAATGGTCT
CAGTTCGTTTCCTGAATACTTGTACAATAACAAT

QA 2 635 2 635
DS 



AS 2 19

CO CL103Contig1 741 5 6 U
GGGACCTTTACTTTACTTCCTTCTCACTTCGATCCATACTCTCTCTCTAACTCTCTCTCT
CTCGAAAATGGCGAAACTAGTGATCTTGATGGTTCTTTGCATCTTGCCGGCGATAGCCAT
GGCGGCGAGGAAGCAGCCACGCATCGGAAAGAACACTCTGGTCGTTCAAGGCATCACTTA
CTGCGACACATGCAAGTTCGGTTTCGAGACTGCCGAATCCTCCTACGTACTCCCCGGCGC
GACGGTGAAGCTTTCTTGCAAAGACAGGAAGACGATGGAAGAGATCTACAGTGACGTGGC
CGTGTCGAACCGTCACGGGAAGTACATGTTCGTCGTCCACGAGGACCATAAGGACGAGAT
GTGCGATGTGATGCTCGTGAAGAGCTCGGACAAGGGTTGTTCGAAAATCTCAAAGGGGCG
TGAGCAGTCGCGCGTGATATTGAACCATTACAATGGTATCGCGGAGCAGATTAGGCATGC
TAACAACATGGGGTTCGAGAAGGATGTTAGTGATGTGTTTTGCTCTGAGTTGATTAAGAA
GTATCAGGTTGATGAAGATGAGATTTGAGATTGGTAGATCTGTTTTCTTGTCAATGTTGT
GATCTGATGTTTTTTTTT*AATATATTTATTTGTCTTGGATGATGATCGGAACTCTGGTT
GTGTAAGCTTTCTTTATATTTGATGATGTGTTACTTCCCTGCTTGGGAAGTGTCTTTAAT
ATTTGATTATTTCGTTACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GM23TF U 2
AF RR2AM09TF U 1
AF RR2D955TF U 31
AF RR2HA91TF U 24
AF RR2HA91JQ C 252
BS 1 618 RR2AM09TF
BS 619 619 RR2HA91TF
BS 620 714 RR2AM09TF
BS 715 718 RR2HA91TF
BS 719 719 RR2HA91JQ
BS 720 741 RR2HA91TF

RD RR2GM23TF 544 0 0
GGACCTTTACTTTACT
TCCTTCTCACTTCGATCCATACTCTCTCTCTAACTCTCTCTCTCTCGAAAATGGCGAAAC
TAGTGATCTTGATGGTTCTTTGCATCTTGCCGGCGATAGCCATGGCGGCGAGGAAGCAGC
CACGCATCGGAAAGAACACTCTGGTCGTTCAAGGCATCACTTACTGCGACACATGCAAGT
TCGGTTTCGAGACTGCCGAATCCTCCTACGTACTCCCCGGCGCGACGGTGAAGCTTTCTT
GCAAAGACAGGAAGACGATGGAAGAGATCTACAGTGACGTGGCCGTGTCGAACCGTCACG
GGAAGTACATGTTCGTCGTCCACGAGGACCATAAGGACGAGATGTGCGATGTGATGCTCG
TGAAGAGCCCGGACAAGGGTTGTTCGAAAATCTCAAAGGGGCGTGAGCAGTCGCGCGTGA
TATTGAACCATTACAATGGTATCGCGGAGCAGATTAGGCATGCTAACAACATGGGGTTCG
AGAAGGATGTTAGTGATGTGTTTTGCTCTGAGTTGATTAAGAAGTATC

QA 17 544 17 544
DS 

RD RR2AM09TF 714 0 0
GGGACCTTTACTTTACTTCCTTCTCACTTCGATCCATACTCTCTCTCTAACTCTCTCTCT
CTCGAAAATGGCGAAACTAGTGATCTTGATGGTTCTTTGCATCTTGCCGGCGATAGCCAT
GGCGGCGAGGAAGCAGCCACGCATCGGAAAGAACACTCTGGTCGTTCAAGGCATCACTTA
CTGCGACACATGCAAGTTCGGTTTCGAGACTGCCGAATCCTCCTACGTACTCCCCGGCGC
GACGGTGAAGCTTTCTTGCAAAGACAGGAAGACGATGGAAGAGATCTACAGTGACGTGGC
CGTGTCGAACCGTCACGGGAAGTACATGTTCGTCGTCCACGAGGACCATAAGGACGAGAT
GTGCGATGTGATGCTCGTGAAGAGCTCGGACAAGGGTTGTTCGAAAATCTCAAAGGGGCG
TGAGCAGTCGCGCGTGATATTGAACCATTACAATGGTATCGCGGAGCAGATTAGGCATGC
TAACAACATGGGGTTCGAGAAGGATGTTAGTGATGTGTTTTGCTCTGAGTTGATTAAGAA
GTATCAGGTTGATGAAGATGAGATTTGAGATTGGTAGATCTGTTTTCTTGTCAATGTTGT
GATCTGATGTTTTTTTTTTAATATATTTATTTGTCTTGGATGATGATCGGAACTCTGGTT
GTGTAAGCTTTCTTTATATTTGATGATGTGTTACTTCCCTGCTTGGGAAGTGTC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2D955TF 686 0 0
G
ATCCATACTCTCTCTCTAACTCTCTCTCTCTCGAAAATGGCGAAACTAGTGATCTTGATG
GTTCTTTGCATCTTGCCGGCGATAGCCATGGCGGCGAGGAAGCAGCCACGCATCGGAAAG
AACACTCTGGTCGTTCAAGGCATCACTTACTGCGACACATGCAAGTTCGGTTTCGAGACT
GCCGAATCCTCCTACGTACTCCCCGGCGCGACGGTGAAGCTTTCTTGCAAAGACAGGAAG
ACGATGGAAGAGATCTACAGTGACGTGGCCGTGTCGAACCGTCACGGGAAGTACATGTTC
GTCGTCCACGAGGACCATAAGGACGAGATGTGCGATGTGATGCTCGTGAAGAGCTCGGAC
AAGGGTTGTTCGAAAATCTCAAAGGGGCGTGAGCAGTCGCGCGTGATATTGAACCATTAC
AATGGTATCGCGGAGCAGATTAGGCATGCTAACAACATGGGGTTCGAGAAGGATGTTAGT
GATGTGTTTTGCTCTGAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAGATTTGAGAT
TGGTAGATCTGTTTTCTTGTCAATGTTGTGATCTGATGTTTTTTTTT*AATATATTTATT
TGTCTTGGATGATGATCGGAACTCTGGTTGTGTAAGCTTTCTTTATATTTGATGATGTGT
TACTTCCCTGCTTGGGAAGTGTCTT

QA 2 686 2 686
DS 

RD RR2HA91TF 718 0 0
GG
ACTTCGATCCATACTCTCTCTCTAACTCTCTCTC****GAAAATGGCGAAACTAGTGATC
TTGATGGTTCTTTGCATCTTGCCGGCGATAGCCATGGCGGCGAGGAAGCAGCCACACATC
GGAAAGAACACTCTGGTCGTTCAAGGCATCACTTACTGCGACACATGCAAGTTCGGTTTC
GAGACTGCCGAATCCTCCTACGTACTCCCCGGCGCGACGGTGAAGCTTTCTTGCAAAGAC
AGGAAGACGATGGAAGAGATCTACAGTGACGTGGCCGTGTCGAACCGTCACGGGAAGTAC
ATGTTCGTCGTCCACGAGGACCATAAGGACGAGATGTGCGATGTGATGCTCGTGAAGAGC
TCGGACAAGGGTTGTTCGAAAATCTCAAAGGGGCGTGAGCAGTCGCGCGTGATATTGAAC
CATTACAATGGTATCGCGGAGCAGATTAGGCATGCTAACAACATGGGGTTCGAGAAGGAT
GTTAGTGATGTGTTTTGCTCTGAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAGATT
TGAGATTGGTAGATCTGTTTTCTTGTCAATGTTGTGATCTGATGTTTTTTTTT*AATATA
TTTATTTGTCTTGGATGATGATCGGAACTCTGGTTGTGTAAGCTTTCTTTATATTTGATG
ATGTGTTACTTCCCTGCTTGGGAAGTGTCTTTA*TATTTGATTATTTCGTTACTTC

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR2HA91JQ 490 0 0
TTTCTTGCAAAGACAGGAAGACGATGGAAGAGATCTACAGTGACGTGGCCGTGTCGAACC
GTCACGGGAAGTACATGTTCGTCGTCCACGAGGACCATAAGGACGAGATGTGCGATGTGA
TGCTCGTGAAGAGCTCGGACAAGGGTTGTTCGAAAATCTCAAAGGGGCGTGAGCAGTCGC
GCGTGATATTGAACCATTACAATGGTATCGCGGAGCAGATTAGGCATGCTAACAACATGG
GGTTCGAGAAGGATGTTAGTGATGTGTTTTGCTCTGAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTG
ATGAAGATGAGATTTGAGATTGGTAGATCTGTTTTCTTGTCAATGTTGTGATCTGATGTT
TTTTTTT*AATATATTTATTTGTCTTGGATGATGATCGGAACTCTGGTTGTGTAAGCTTT
CTTTATATTTGATGATGTGTTACTTCCCTGCTTGGGAAGTGTCTTTAATATTTGATTATT
TCGTTACTTC

QA 1 490 1 490
DS 



CO CL103Contig2 714 14 2 U
CGAATATTAAAGACACTTCCCAAGCAGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCT
TACACAACCAGAGTTCCAATCATCATCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAA*C
ATCAGATCACAACATCGACAAGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAAC
CTGATACTTCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCACTAACATCCTTCTCGAACCCCAT
GTTGTTAGCATGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGA
CTGCTCACGCCCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCATCAC
ATCGCACATCTCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTT
CGACACGGCCACGTCACTGTAGATCTCCTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCTT
CACCGTCGCGCCGGGGAGGACGTAGGAGGATTCGGCAGTCTCGAAACCGAACTTGCATGT
GTCGCAGTAAGTGATGCCTTGCACGACAAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCT
CCCCGCCATGGCTATCGCGGGTAAGATGCAGAGGACCATCAAGATCACTAGTTTCGCCAT
TTTCGAGGAGAGAGAGTTAGAGAGAGAGTATCCATTGAAGTGAGAAGGAGATCC


BQ
10 10 10 10 25 50 50 55 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 
75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 50 50 25 25 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A737JQ U 6
AF RR2BV30JQ U 9
AF RR2GQ44JQ U 9
AF RR2G815JQ U 1
AF RR2FF03TF C 8
AF RR2FF03JQ U 9
AF RR2G815TF C 1
AF RR2AJ47TF C 4
AF RR2A737TF C 6
AF RR2A962JQ U 6
AF RR2AJ47JQ U 6
AF RR2A962TF C 6
AF RR2BV30TF C 11
AF RR2CC09TF C 25
BS 1 693 RR2G815JQ
BS 694 714 RR2A737TF

RD RR2A737JQ 156 0 0
ATTAAAGACACTTCCCAAGCCGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCTTACAC
AACCAGAGTTCCAATCATCATCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAA*CATCAG
ATCACACCATCGACAAGAAACAGATCTACTAATCTC

QA 1 156 1 156
DS 

RD RR2BV30JQ 479 0 0
AAAGACACTTCCCAAGCAGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCTTACACAAC
CAGAGTTCCAATCATCATCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAA*CATCAGATC
ACAACATCGACAAGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGATACT
TCTTAATCAACTCAAAGCAAAACACATCACTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTGTTAG
CATGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGACTGCTCAC
GCCCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCATCACATCGCACA
TCTCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTTCGACACGG
CCACGTCACTGTAAATCTCCTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCTTCACCGTC

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR2GQ44JQ 624 0 0
AAAGACACTTCCCAAGCAGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCTTACACAAC
CAGAGTTCCAATCATCATCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAA*CATCAGATC
ACAACATCGACAAGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGATACT
TCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCACTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTGTTAG
CATGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGACTGCTCAC
GCCCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCATCACATCGCACA
TCTCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTTCGACACGC
CCACGTCACTGTAGATCTCCTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCTTCACCGTCG
CGCCGGGGAGGACGTAGGAGGATTCGGCAGTCTCGAAACCGAACTTGCATGTGTCGCAGT
AAGTGATGCCTTGCACGACAAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCTCCCCGCCA
TGGCTATCGCGGGTAAGATGCAGA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2G815JQ 693 0 0
CGAATATTAAAGACACTTCCCAAGCAGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCT
TACACAACCAGAGTTCCAATCATCATCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAA*C
ATCAGATCACAACATCGACAAGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAAC
CTGATACTTCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCACTAACATCCTTCTCGAACCCCAT
GTTGTTAGCATGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGA
CTGCTCACGCCCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCATCAC
ATCGCACATCTCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTT
CGACACGGCCACGTCACTGTAGATCTCCTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCTT
CACCGTCGCGCCGGGGAGGACGTAGGAGGATTCGGCAGTCTCGAAACCGAACTTGCATGT
GTCGCAGTAAGTGATGCCTTGCACGACAAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCT
CCCCGCCATGGCTATCGCGGGTAAGATGCAGAGGACCATCAAGATCACTAGTTTCGCCAT
TTTCGAGGAGAGAGAGTTAGAGAGAGAGTATCC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2FF03TF 686 0 0
TAAAGACACTTCCCAAGCAGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCTTACACAA
CCAGAGTTCCAATCATCACCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAA*CATCAGAT
CACAACATCGACAAGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGATAC
TTCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCACTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTGTTA
GCATGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGACTGCTCA
CGCCCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCATCACATCGCAC
ATCTCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTTCGACACG
GCCACGTCACTGTAGATCTCCTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCTTCACCGTC
GCGCCGGGGAGGACGTAGGAGGATTCGGCAGTCTCGAAACCGAACTTGCATGTGTCGCAG
TAAGTGATGCCTCGCACGACAAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCTCCCCGCC
ATGGCTATCGCGGGTAAGATGCGGAGGACCATCAAGATCACTAGTTTCGCCATTTTCGAG
GAGAGAGAGTTAGAGAGAGAGT
CCCT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2FF03JQ 654 0 0
AAAGACACTTCCCAAGCAGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCTTACACAAC
CAGAGTTCCAATCATCACCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAA*CATCAGATC
ACAACATCGACAAGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGATACT
TCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCACTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTGTTAG
CATGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGACTGCTCAC
GCCCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCATCACATCGCACA
TCTCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTTCGACACGG
CCACGTCACTGTAGATCTCCTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCTTCACCGTCG
CGCCGGGGAGGACGTAGGAGGATTCGGCAGTCTCGAAACCGAACTTGCATGTGTCGCAGT
AAGTGATGCCTCGCACGACAAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCTCCCCGCCA
TGGCTATCGCGGGTAAGATGCGGAGGACCATCAAGATCACTAGTTTCGCCATTT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2G815TF 693 0 0
CGAA
TATTAAAGACACTTCCCAAGCAGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCTTACA
CAACCAGAGTTCCAATCATCATCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAA*CATCA
GATCACAACATCGACAAGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGA
TACTTCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCACTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTG
TTAGCATGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGACTGC
TCACGCCCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCATCACATCG
CACATCTCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTTCGAC
ACGGCCACGTCACTGTAGATCTCCTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCTTCACC
GTCGCGCCGGGGAGGACGTAGGAGGATTCGGCAGTCTCGAAACCGAACTTGCATGTGTCG
CAGTAAGTGATGCCTTGCACGACAAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCTCCCC
GCCATGGCTATCGCGGGTAAGATGCAGAGGACCATCAAGATCACTAGTTTCGCCATTTTC
GAGGAGAGAGAGTTAGAGAGAGAGTATCC

QA 5 693 5 693
DS 

RD RR2AJ47TF 690 0 0
T
TATTAAAGACACTTCCCAAGCAGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCTTACA
CAACCAGAGTTCCAATCATCATCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAA*CATCA
GATCACAACATCGACAAGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGA
TACTTCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCACTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTG
TTAGCATGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGACTGC
TCACGCCCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCAAGAGCATCACATCG
CACATCTCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTTCGAC
ACGGCCACGTCACTGTAGATCTCCTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCTTCACC
GTCGCGCCGGGGAGGACGTAGGAGGATTCGGCAGTCTCGAAACCGAACTTGAATGTGTCG
CAGTAAGTGATGCCTTGCACGACAAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCTCCCC
GCCATGGCTATCGCGGGTAAGATGCAGAGGACCATCAAGATCACTAGTTTCGCCATTTTC
GAGGAGAGAGAGTTAGAGAGAGAGTATCC

QA 2 690 2 690
DS 

RD RR2A737TF 709 0 0
ATTAAAGACACTTCCCAAGCAGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCTTACAC
AACCAGAGTTCCAATCATCATCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAA*CATCAG
ATCACAACATCGACAAGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGAT
ACTTCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCACTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTGT
TAGCATGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGACTGCT
CACGCCCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCATCACATCGC
ACATCTCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTTCGACA
CGGCCACGTCACTGTAGATCTCCTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCTTCACCG
TCGCGCCGGGGAGGACGTAGGAGGATTCGGCAGTCTCGAAACCGAACTTGCATGTGTCGC
AGTAAGTGATGCCTTGCAAGACAAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCTCCCCG
CCATGGCTATCGCGGGTAAGATGCAGAGGACCATCAAGATCACTAGTTTCGCCATTTTCG
AGGAGAGAGAGTTAGAGAGAGAGTATGGATTGAAGTGAGAAGGAGATCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2A962JQ 688 0 0
ATTAAAGACACTTCCCAAGCAGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCTTACAC
AACCAGAGTTCCAATCATCATCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAA*CATCAG
ATCACAACATCGACAAGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGAT
ACTTCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCACTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTGT
TAGCATGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGACTGCT
CACGCCCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCATCACATCGC
ACATCTCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTTCGACA
CGGCCACGTCACTGTAGATCTCCTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCCTCACCG
TCGCGCCGGGGAGGACGTAGGAGGATTCGGCAGTCTCGAAACCGAACTTGCATGTGTCGC
AGTAAGTGATGCCTTGCACGACAAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCTCCCCG
CCATGGCTATCGCGGGTAAGATGCAGAGGACCATCAAGATCACTAGTTTCGCCATTTTCG
AGGAGAGAGAGTTAGAGAGAGAGTATCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2AJ47JQ 688 0 0
ATTAAAGACACTTCCCAAGCAGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCTTACAC
AACCAGAGTTCCAATCATCATCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAA*CATCAG
ATCACAACATCGACAAGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGAT
ACTTCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCACTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTGT
TAGCATGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGACTGCT
CACGCCCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCAAGAGCATCACATCGC
ACATCTCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTTCGACA
CGGCCACGTCACTGTAGATCTCCTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCTTCACCG
TCGCGCCGGGGAGGACGTAGGAGGATTCGGCAGTCTCGAAACCGAACTTGAATGTGTCGC
AGTAAGTGATGCCTTGCACGACAAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCTCCCCG
CCATGGCTATCGCGGGTAAGATGCAGAGGACCATCAAGATCACTAGTTTCGCCATTTTCG
AGGAGAGAGAGTTAGAGAGAGAGTATCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2A962TF 688 0 0
ATTAAAGACACTTCCCAAGCAGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCTTACAC
AACCAGAGTTCCAATCATCATCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAA*CATCAG
ATCACAACATCGACAAGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGAT
ACTTCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCACTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTGT
TAGCATGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGACTGCT
CACGCCCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCATCACATCGC
ACATCTCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTTCGACA
CGGCCACGTCACTGTAGATCTCCTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCCTCACCG
TCGCGCCGGGGAGGACGTAGGAGGATTCGGCAGTCTCGAAACCGAACTTGCATGTGTCGC
AGTAAGTGATGCCTTGCACGACAAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCTCCCCG
CCATGGCTATCGCGGGTAAGATGCAGAGGACCATCAAGATCACTAGTTTCGCCATTTTCG
AGGAGAGAGAGTTAGAGAGAGAGTATCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2BV30TF 686 0 0
AGACACTTCCCAAGCAGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCTTACACAACCA
GAGTTCCAATCATCATCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAA*CATCAGATCAC
AACATCGACAAGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGATACTTC
TTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCACTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTGTTAGCA
TGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGACTGCTCACGC
CCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCATCACATCGCACATC
TCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTTCGACACGGCC
ACGTCACTGTAGATCTCCTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCTTCACCGTCGCG
CCGGGGAGGACGTAGGAGGATTCGGCAGTCTCGAAACCGAACTTGCATGTGTCGCAGTAA
GTGATGCCTTGCACGACAAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCTCCCCGCCATG
GCTATCGCGGGTAAGATGCAGAGGACCATCAAGATCACTAGTTTCGCCATTTTCGAGGAG
AGAGAGTTAGAGAGAGAGTATGGAT
T

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2CC09TF 667 0 0
CAGGGAAGTAACACATCATCAAATATAAAGAAAGCTTACACAACCAGAGTTCCAATCATC
ATCATCCAAGACAAATAAATATATTTAAAAAAAAACATCAGATCACAACATCGACAAGAA
ACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGATACTTCTTAATCAACTCAGA
GCAAAACACATCACTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTGTTAGCATGCCTAATCTGCTC
AGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCAACTGCTCACGCCCCTTTGAGATTTT
AGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCATCACATCGCACATCTCGTCTTTGTGGTC
CTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTTCGACACGGCCACGTCACTGTAGAT
CTCCTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCTTCACCGTCGCGCCGGGGAGGACGTA
GGAGGATTCGGCAGTCTCGAAACCGAACTTGCATGTGTCGCAGTAAGTGATGCCTTGCAC
GACAAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCTCCCCGCCATGGCTATCGCGGGTAA
GATGCAGAGGACCATCAAGATCACTAGTTTCGCCATTTTCGAGGAGAGAGAGTTAGAGAG
A
AGTATC

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 20

CO CL104Contig1 729 20 36 U
GGGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCCGACAATCA
GACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACCCGTGA
AACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAATGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAA
GAAATCAGCAGCTTAAA*GCTTTCTCTATTTTTTCT*****AGTCTCTCCTTTTTGTGTT
GTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTT*CTCCATCTTTGCAAGACTAGAGATATATTTTCTT
GGATCTTTTGTTCAACGTTGCTGTTTGATGATGTCTAGTATTATTCATCCTATCTTTACT
AGTTCCGCC


BQ
70 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 25 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 15 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 
97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 10 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 30 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 
55 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 75 75 97 97 97 75 97 97 97 97 25 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 55 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 90 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 25 97 97 97 97 97 55 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 70 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 50 97 50 97 97 97 97 97 97 30 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 50 97 45 95 95 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 80 80 80 80 65 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 

AF RR2GH53TF U 1
AF RR2H839TF U 1
AF RR2BG86JQ C 1
AF RR2BG86TF U 1
AF RR2H436TF U 1
AF RR2CH33JQ C 1
AF RR2CH33TF U 1
AF RR2DC73JQ C 1
AF RR2H436JQB C 221
AF RR2EY31TF U 1
AF RR2DC73TF U 1
AF RR2FG14TF U 1
AF RR2FG14JQ C 170
AF RR2CA91TF U 2
AF RR2H839JQ C 60
AF RR2GW09TF U 1
AF RR2GW09JQ C 88
AF RR2FM61TF U 0
AF RR2EY31JQ C 109
AF RR2GH53JQB C 167
BS 1 36 RR2BG86TF
BS 37 37 RR2CH33TF
BS 38 69 RR2BG86TF
BS 70 70 RR2EY31TF
BS 71 114 RR2BG86TF
BS 115 115 RR2EY31TF
BS 116 507 RR2BG86TF
BS 508 508 RR2EY31TF
BS 509 557 RR2BG86TF
BS 558 558 RR2EY31TF
BS 559 565 RR2BG86TF
BS 566 566 RR2EY31TF
BS 567 567 RR2BG86TF
BS 568 568 RR2EY31TF
BS 569 574 RR2BG86TF
BS 575 575 RR2EY31TF
BS 576 576 RR2BG86TF
BS 577 578 RR2EY31TF
BS 579 580 RR2CH33TF
BS 581 581 RR2EY31TF
BS 582 625 RR2BG86TF
BS 626 626 RR2EY31TF
BS 627 643 RR2BG86TF
BS 644 644 RR2EY31TF
BS 645 645 RR2BG86TF
BS 646 646 RR2EY31TF
BS 647 648 RR2BG86TF
BS 649 658 RR2CH33TF
BS 659 659 RR2EY31TF
BS 660 665 RR2CH33TF
BS 666 685 RR2DC73TF
BS 686 687 RR2FG14TF
BS 688 702 RR2DC73TF
BS 703 714 RR2FG14TF
BS 715 718 RR2GW09TF
BS 719 729 RR2EY31JQ

RD RR2GH53TF 346 0 0
GGGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCCGACAATCA
GACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACCCGTGA
AACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGGGGTGAAA

QA 1 346 1 346
DS 

RD RR2H839TF 539 0 0
GGGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCCGACAATCA
GACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACCCGTGA
AACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
CGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCTGAGAAAGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAA

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2BG86JQ 648 0 0
GGGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAATTACTCGCAAGAACCCGACAATCA
GACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACGCGTGA
AACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCTAAGAACAGGCACTTTAATGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAGGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAA
GAAATCAGCAGCTTAAAAGCTTTCTTTGTTTTTTTTTTTTAAGTCTCTCCTTTTTGTGTT
GTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTTTCTCCATCTTTGCAAGACAATAG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2BG86TF 648 0 0
GGGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAATTACTCGCAAGAACCCGACAATCA
GACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACGCGTGA
AACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAATGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAGGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAA
GAAATCAGCAGCTTAAAAGCTTTCTTTGTTTTTTTTTTTTAAGTCTCTCCTTTTTGTGTT
GTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTTTCTCCATCTTTGCAAGACAATAG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2H436TF 645 0 0
GGGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCCGACAATCA
GACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACCCGTGA
AACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAATGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTCGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCTAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAA
GAAATCAGTAGCTTAAA*GCTTTCTCTATTTTTTCT*****AGTCTCTCCTTTTTGTGTT
GTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTT*CTCCATCTTTGCAAGACTA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2CH33JQ 665 0 0
GGGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCCGACAATCA
GACCAAGTC**GCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACGCGTGA
AACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAATGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTT**CAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAGGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAA
GAAATCAGCAGCCTAAAAGCTTTCTTTGTTTTTTTTTT**AAGTCTCTCCTTTTTGTGTT
GTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTTTCTCCATCTTTGCAAGACAATAGATATATTTTCAT
GGATC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2CH33TF 669 0 0
GGGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCCGACAATCA
GACCAAGTC**GCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACGCGTGA
AACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAATGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTT**CAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAGGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAA
GAAATCAGCAGCCTAAAAGCTTTCTTTGTTTTTTTTTT**AAGTCTCTCCTTTTTGTGTT
GTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTTTCTCCATCTTTGCAAGACAATAGATATATTTTCAT
GGATC
AAAA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2DC73JQ 702 0 0
GGGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCCGACAATCA
GACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACCCGTGA
AACAGCTCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAATGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTCGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCTAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAA
GAAATCAGCAGCTTAAA*GCTTTCTCTATTTTTTCT*****AGTCTCTCCTTTTTGTGTT
GTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTT*CTCCATCTTTGCAAGACTAGAGATATATTTTCTT
GGATCTTTTGTTCAACGTTGCTGTT**ATGATGTCTAGTATT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2H436JQB 446 0 0
AGAGGTGTTGGAAGGACTGCCCAAGCTAAGAACAGGCACTTTAATGGTCAGGGACGTTGG
CCTGCGAAATCTGCTCAGTTCGTTCTCGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAG
GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCT
AAGCAAAGGAGAAGGACTTACCGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCA
TGCCACATTGAGTTGATTTTGTTTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACG
CAGTTGGCAGCCAAGTCAAAGAAATCAGTAGCTTAAA*GCTTTCTCTATTTTTTCT****
*AGTCTCTCCTTTTTGTGTTGTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTT*CTCCATCTTTGCAA
GACTAGAGATATATTTTCTTGGATC
G

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR2EY31TF 661 0 0
GGGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCCGACAATCA
GACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACCCGTGA
AACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAATGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTCGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCTAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAA
GAAATCAGCAGCTTAAA*GCTTTCTCTATTTTTTCT*****AGTCTCTCCTTTTTGTGTT
GTTGAAAGAG*TTTTGTTACATTTT*CTCTATCTTTGCA*GACTAGAGATATATTTTCTT
G

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2DC73TF 702 0 0
GGGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCCGACAATCA
GACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACCCGTGA
AACAGCTCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAATGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTCGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCTAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAA
GAAATCAGCAGCTTAAA*GCTTTCTCTATTTTTTCT*****AGTCTCTCCTTTTTGTGTT
GTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTT*CTCCATCTTTGCAAGACTAGAGATATATTTTCTT
GGATCTTTTGTTCAACGTTGCTGTT**ATGATGTCTAGTATT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2FG14TF 721 0 0
GGGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCCGACAATCA
GACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACGCGTGA
AACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGGCTGC
CCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAAGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAATCCTTACATATCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAA
GAAATCAGCAGCTTAAA*GCTTTCTCTATTTTTTTT*****AGTCTCTCCTTTTTGTGTT
GTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTT*CTCCATCTTTGCAAGACTAGAGATATATTTTCTT
GGATCTTTTGTTCAACGTTGCTGTTTGATGATGTCTAGTATTATTCATCCTATC
AAAAAAA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2FG14JQ 545 0 0
CTTGAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTT
GGAAGGGCTGCCCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAAGGACGTTGGCCTGCGAAA
TCTGCTCAGTTCGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGT
TTGGATGTTGATGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGG
AGAAGGACTTACCGTGCCCACGGAAGAATCAATCCTTACATATCCAACCCATGCCACATT
GAGTTGATTTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCA
GCCAAGTCAAAGAAATCAGCAGCTTAAA*GCTTTCTCTATTTTTTTT*****AGTCTCTC
CTTTTTGTGTTGTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTT*CTCCATCTTTGCAAGACTAGAGA
TATATTTTCTTGGATCTTTTGTTCAACGTTGCTGTTTGATGATGTCTAGTATTATTCATC
CTATC

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2CA91TF 687 0 0
GGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCCGACAATCAG
ACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACCCGTGAA
ACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGTG
ATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGCC
CAAGCTAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTTC
GTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGAC
GCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTTAC
CGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTTG
TCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAAG
AAATCAGCAGCTTAAA*GCTTTCTCTATTTTTTCT*****AGTCTCTCCTTTTTGTGTTG
TTGAAAGAGATTTTGTTACATTTT*CTCCATCTTTGCAAGACTAGAGATATATTTTCTTG
GATCTTTTGTTCAACGTTGCTGTTTGA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2H839JQ 607 0 0
AGACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACCCGTG
AAACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGGGAAGAGATACCTTGAAGATG
TGATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTG
CCCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGT
TCGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTG
ACGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTT
ACCGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTT
TGTCTGAGAAAGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAA
AGAAATCAGCAGCTTAAA*GCTTTCTCTATTTTTTCT*****AGTCTCTCCTTTTTGTGT
TGTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTT*CTCCATCTTTGCAAGACTAGAGATATATTTTCT
TGGATCT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2GW09TF 725 0 0
GGGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCCGACAATCA
GACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACGCGTGA
AACAGCGCACTCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAAGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGTCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAATCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAA
GAAATCAGCAGCTTAAA*TCTTTCTCTATTTTTTCT*****AGTCTCTCCTTTTTGTGTT
GTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTT*CTCCATCTTTGCAAGACTAGAGATATATTTTCTT
GGATCTTTTGTTCAACGTTGCTGTTTGATGATGTCTAGTATTATTCATCCTATCTTTA
CTAGTTC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2GW09JQ 606 0 0
CGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACGCGTGAAACAGCGCACTCCATCAGGAAGCTACC
ATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTT
CACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGCCCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAACGG
TCAAGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTTCGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGA
GAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGT
TAACCAGTCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTTACCGTGCCCACGGAAGAATCAATCCTTA
CATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAA
AGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAAGAAATCAGCAGCTTAAA*TCTTTCTCT
ATTTTTTCT*****AGTCTCTCCTTTTTGTGTTGTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTT*C
TCCATCTTTGCAAGACTAGAGATATATTTTCTTGGATCTTTTGTTCAACGTTGCTGTTTG
ATGATG

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2FM61TF 719 0 0
GA
GGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCCGACAATCAG
ACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACCCGTGAA
ACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGTG
ATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGCC
CGAGCTAAGAACAGGCACTCTAATGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTTC
GTTCTCGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTCGAT
GCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCTAAGCAAAGGAGAAGGACTTAC
CGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTTG
TCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAAG
AAATCAGCAGCTTAAA*GCTTTCTCTATTTTTTCT*****AGTCTCTCCTTTTTGTGTTG
TTGAAAGAGATTTTGTTACATTTT*CTCCATCTTTGCAAGACTAGAGATATATTTTCTTG
GATCTTTTGTTCAACGTTGCTGTTTGATGATGTCTAGTATTATTCATCCTATCTTTA

QA 3 719 3 719
DS 

RD RR2EY31JQ 621 0 0
GAACACCCGTGAAACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATA
CCTTGAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGT
TGGAAGGACTGCCCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAATGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAA
ATCTGCTCAGTTCGTTCTCGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGG
TTTGGATGTTGATGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCTAAGCAAAG
GAGAAGGACTTACCGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACAT
TGAGTTGATTTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGC
AGCCAAGTCAAAGAAATCAGCAGCTTAAA*GCTTTCTCTATTTTTTCT*****AGTCTCT
CCTTTTTGTGTTGTTGAAAGAGGTTTTGTTACATTTT*CTCTATCTTTGCAAGACTAGAG
ATATATTTTCTTGGATCTTTTGTTCAACGTTGCTGTTTGATGATGTCTAGTATTATTCAT
CCTATCTTTACTAGTTCCGCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2GH53JQB 563 0 0
TACCTTGAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGT
GTTGGAAGGACTGCCCAAGCTAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAGGGACGTTGGCCTGCG
AAATCTGCTCAGTTCGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGGGGTGAAA
GGTTTGGATGTTGACACACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAA
AGGAGAAGGACTTACCGTGCCCACGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCAC
ATTGAGTTGATTTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTG
GCAGCCAAGTCAAAGAAATCAGCAGCTTAAA*GCTTTCTCTATTTTTTCT*****AGTCT
CTCCTTTTTGTGTTGTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTT*CTCCATCTTTGCAAGACTAG
AGATATATTTTCTTGGATCTTTTGTTCAACGTTGCTGTTTGATGATGTCTAGTATTATTC
ATCCTATCTTTACTAGTTC
CGCT

QA 1 559 1 559
DS 



AS 5 20

CO CL105Contig1 915 2 4 U
GGGAAGTAGCCTATATATTACATATACAAAGTCTTATTACTATATTGTAAAATACATCTC
ACTCTCACTAACTTCTCTTCACCCGAAAATGTCGACCGCTCCTCTCTCCGGCTTCTTCCT
CACCTCTCTTTCTCCTTCTCAACCTTCACTCCAAAAACTCTCTCTTCGTTCCTCTCCCGC
CGTTGCTTGCCTTCCCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCCCCTCTCGTTCCGT
TCCAACACTTATCCGTAACGAGCCCGTTTTTGCCGCTCCTGCTCCTATCATCACCCCTTA
TTGGAGCGAAGAGATGGGTAGCGAAGCATACGAAGAGGCCATTGAAGCTCTCAAGAAGCT
TATTATCGAGAAGGAGGAGCTAAAGACTGTTGCGGCCGCTAAGGTGGAGCAGTTCACGGC
AGCACTTCAGACAGGTACTTCCTCCGACAAGAAAGCTTTCGACCCCGTCGAAAACATTAA
GCAAGGCTTCATCACTTTCAAGAAGGAGAAATACGAAACCAACCCTGCTTTGTACGGTGA
GCTCGCCAAGGGTCAGAGTCCTAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCCGACTCGCGTGTGTG
TCCATCGCACGTTCTCAACATTCAGCCAGGAGAGGCCTTCGTTGTCCGTAACATAGCCAA
CATGGTTCCTCCTTTTGACAAGGTCAAATACGGTGGAGTAGGAGCAGCCAAGTCAAAAGT
AATATCAGAACTTGGGGAGTCAGCCTTTGAGGACCAGTGTGGCCGATGTGAAAGGGAGGC
AGTGAATGTTTCACTAGCAAACTTGTTGACTTATCCATTCGTGAGAGAAGGACTTGTGAA
AGGAACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTACTATGATTTTATAAAGGGTGCTTTTGAGCTTTG
GGGACTTGAGTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AI15TF U 1
AF RR2AI15JQ C 449
BS 1 681 RR2AI15TF
BS 682 682 RR2AI15JQ
BS 683 770 RR2AI15TF
BS 771 915 RR2AI15JQ

RD RR2AI15TF 770 0 0
GGGAAGTAGCCTATATATTACATATACAAAGTCTTATTACTATATTGTAAAATACATCTC
ACTCTCACTAACTTCTCTTCACCCGAAAATGTCGACCGCTCCTCTCTCCGGCTTCTTCCT
CACCTCTCTTTCTCCTTCTCAACCTTCACTCCAAAAACTCTCTCTTCGTTCCTCTCCCGC
CGTTGCTTGCCTTCCCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCCCCTCTCGTTCCGT
TCCAACACTTATCCGTAACGAGCCCGTTTTTGCCGCTCCTGCTCCTATCATCACCCCTTA
TTGGAGCGAAGAGATGGGTAGCGAAGCATACGAAGAGGCCATTGAAGCTCTCAAGAAGCT
TATTATCGAGAAGGAGGAGCTAAAGACTGTTGCGGCCGCTAAGGTGGAGCAGTTCACGGC
AGCACTTCAGACAGGTACTTCCTCCGACAAGAAAGCTTTCGACCCCGTCGAAAACATTAA
GCAAGGCTTCATCACTTTCAAGAAGGAGAAATACGAAACCAACCCTGCTTTGTACGGTGA
GCTCGCCAAGGGTCAGAGTCCTAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCCGACTCGCGTGTGTG
TCCATCGCACGTTCTCAACATTCAGCCAGGAGAGGCCTTCGTTGTCCGTAACATAGCCAA
CATGGTTCCTCCTTTTGACAATGTCAAATACGGTGGAGTAGGAGCAGCCAAGTCAAAAGT
AATATCAGAACTTGGGGAGTCAGCCTTTGAGGACCAGTGTGGCCGATGTG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2AI15JQ 467 0 0
AAGAAAGCTTTCGACCCCGTCGAAAACATTAAGCAAGGCTTCATCACTTTCAAGAAGGAG
AAATACGAAACCAACCCTGCTTTGTACGGTGAGCTCGCCAAGGGTCAGAGTCCTAAGTAC
ATGGTGTTTGCTTGTTCCGACTCGCGTGTGTGTCCATCGCACGTTCTCAACATTCAGCCA
GGAGAGGCCTTCGTTGTCCGTAACATAGCCAACATGGTTCCTCCTTTTGACAAGGTCAAA
TACGGTGGAGTAGGAGCAGCCAAGTCAAAAGTAATATCAGAACTTGGGGAGTCAGCCTTT
GAGGACCAGTGTGGCCGATGTGAAAGGGAGGCAGTGAATGTTTCACTAGCAAACTTGTTG
ACTTATCCATTCGTGAGAGAAGGACTTGTGAAAGGAACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTAC
TATGATTTTATAAAGGGTGCTTTTGAGCTTTGGGGACTTGAGTTTGG

QA 1 467 1 467
DS 



CO CL105Contig2 795 3 7 U
GGACTGAAGTAGCCTATATATTACATATACAAAGTCTTATTACTATATTGTAAAATACAT
CTCACTCTCACTAACTTCTCTTCACCCGAAAATGTCGACCGCTCCTCTCTCCGGCTTCTT
CCTCACCTCTCTTTCTCCTTCTCAACCTTCACTCCAAAAACTCTCTCTTCGTTCCTCTCC
CGCCGTTGCTTGCCTTCCCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCCCCTCTCG
TTCCGTTCCAACACTTATCCGTAACGAGCCCGTTTTTGCCGCTCCTGCTCCTATCATCAC
CCCTTATTGGAGCGAAGAGATGGGTAGCGAAGCATACGAAGAGGCCATTGAAGCTCTCAA
GAAGCTTATTATCGAGAAGGAGGAGCTAAAGACTGTTGCGGCCGCTAAGGTGGAGCAGTT
CACGGCAGCACTTCAGACAGGTACTTCCTCCGACAAGAAAGCTTTCGACCCCGTCGAAAA
CATTAAGCAAGGCTTCATCACTTTCAAGAAGGAGAAATACGAAACCAACCCTGCTTTGTA
CGGTGAGCTCGCCAAGGGTCAGAGTCCTAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCCGACTCGCG
TGTGTGTCCATCGCACGTTCTCAACTTTCAGCCAGGAGAGGCCCTCGTTGTCCGTAACAT
AGCCAACATGGTTCCTCCTTTTGACAAGTCAAATACGGTGGAGTAGAGCAGCCATCGAAT
ACGCTGTTTGCACCTTAAGTGAGAACATTGTGGTGATAGACACAGCGCTTGTGGTGGGAT
CAAGGACTCATGTCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU11TF U 1
AF RR2C776TF U 59
AF RR2C473TF U 1
BS 1 249 RR2C473TF
BS 250 250 RR2GU11TF
BS 251 403 RR2C473TF
BS 404 404 RR2GU11TF
BS 405 697 RR2C473TF
BS 698 698 RR2C776TF
BS 699 795 RR2C473TF

RD RR2GU11TF 628 0 0
GGACT
GAAGTAGCCTATATATTACATATACAAAGTCTTATTACTATATTGTAAAATACATCTCAC
TCTCACTAACTTCTCTTCACCCGAAAATGTCGACCGCTCCTCTCTCCGGCTTCTTCCTCA
CCTCTCTTTCTCCTTCTCAACCTTCACTCCAAAAACTCTCTCTTCGTTCCTCTCCCGCCG
TTGCTTGCCTTCCCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCCCCTCTCGTTCCG
TTCCAACACTTATCCGTAACGAGCCCGTTTTTGCCGCTCCTGCTCCTATCATCACCTCTT
ATTGGAGCGAAGAGATGGGTAGCGAAGCATACGAAGAGGCCATTGAAGCTCTCAAGAAGC
TTATTATCGAGAAGGAGGAGCTAAAGACTGTTGCGGCCGCTAAGGTGGAGCAGTTCACGG
CAGCACTTCAGACAGGTACTTCCTCCGACAAGAAAGCTTTCGACCCCGTCGAAAACATTA
AGCAAGGCTTCATCACTTTCAAGAAGGAGAAATACGAAACCAACCCTGCTTTGTACGGTG
AGCTCGCCAAGGGTCAGAGTCCTAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCCGACTCGCGTGTGT
GTCCATCGCACGTTCTCAACTTT

QA 6 628 6 628
DS 

RD RR2C776TF 646 0 0
ATCTCACTCTCACTAACTTCTCTTCACCCGAAAATGTCGACCGCTCCTCTCTCCGGCTTC
TTCCTCACCTCTCTTTCTCCTTCTCAACCTTCACTCCAAAAACTCTCTCTTCGTTCCTCT
CCCGCCGTTGCTTGCCTTCCCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCCCCTCT
CGTTCCGTTCCAACACTTATCCGTAACGAGCCCGTTTTTGCCGCTCCTGCTCCTATCATC
GCCCCTTATTGGAGCGAAGAGATGGGTAGCGAAGCATACGAAGAGGCCATTGAAGCTCTC
AAGAAGCTTATTATCGAGAAGGAGGAGCTAAAGACTGTTGCGGCCGCTAAGGTGGAGCAG
TTCACGGCAGCACTTCAGACAGGTACTTCCTCCGACAAGAAAGCTTTCGACCCCGTCGAA
AACATTAAGCAAGGCTTCATCACTTTCAAGAAGGAGAAATACGAAACCAACCCTGCTTTG
TACGGTGAGCTCGCCAAGGGTCAGAGTCCTAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCCGACTCG
CGTGTGTGTCCATCGCACGTTCTCAACTTTCAGCCAGGAGAGGCCTTCGTTGTCCGTAAC
ATAGCCAACATGGTTCCTCCTTTTGACAAGTCAAATACGGTGGAGT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2C473TF 795 0 0
GGACTGAAGTAGCCTATATATTACATATACAAAGTCTTATTACTATATTGTAAAATACAT
CTCACTCTCACTAACTTCTCTTCACCCGAAAATGTCGACCGCTCCTCTCTCCGGCTTCTT
CCTCACCTCTCTTTCTCCTTCTCAACCTTCACTCCAAAAACTCTCTCTTCGTTCCTCTCC
CGCCGTTGCTTGCCTTCCCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCCCCTCTCG
TTCCGTTCCGACACTTATCCGTAACGAGCCCGTTTTTGCCGCTCCTGCTCCTATCATCAC
CCCTTATTGGAGCGAAGAGATGGGTAGCGAAGCATACGAAGAGGCCATTGAAGCTCTCAA
GAAGCTTATTATCGAGAAGGAGGAGCTAAAGACTGTTGCGGCCACTAAGGTGGAGCAGTT
CACGGCAGCACTTCAGACAGGTACTTCCTCCGACAAGAAAGCTTTCGACCCCGTCGAAAA
CATTAAGCAAGGCTTCATCACTTTCAAGAAGGAGAAATACGAAACCAACCCTGCTTTGTA
CGGTGAGCTCGCCAAGGGTCAGAGTCCTAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCCGACTCGCG
TGTGTGTCCATCGCACGTTCTCAACTTTCAGCCAGGAGAGGCCCTCGTTGTCCGTAACAT
AGCCAACATGGTTCCTCCTTTTGACAAGTCAAATACG*TGGAGTAGAGCAGCCATCGAAT
ACGCTGTTTGCACCTTAAGTGAGAACATTGTGGTGATAGACACAGCGCTTGTGGTGGGAT
CAAGGACTCATGTCT

QA 1 795 1 795
DS 



CO CL105Contig3 1152 4 15 U
GATCTCACTCTCACTAACTTCTCTTCACCCGAAAATGTCGACCGCTCCTCTCTCCGGCTT
CTTCCTCACCTCTCTTTCTCCTTCTCAACCTTCTCTCCAAAAACTCTCTCTTCGTTCTTC
TCCCGCCGTTGCTTGCCTTCCCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCCTC
CTCCTCCTCCTCCTCTCGTTCCATTCCAACACTTATCCGTAACGAGCCCGTTTTTGCCGC
TCCTGCTCCTATCATCACCCCTTATTGGAGCGAAGAGATGGGTAGCGAAGCATACGAAGA
GGCCATTGAAGCTCTCAAGAAGCTTATTATCGAAAAGGAGGAGCTAAAGACTGTTGCGGC
CGCTAAGGTGGAGCAGGCCACGGCAGCACTTCAGACAGGTACTTCCTCCGACAAGAAAGC
TTTCGACCCCGTCGAAAACATTAAGCAAGGCTTCATCACTTTCAAGAAGGAGAAATACGA
AACCAACCCTGCTTTGTACGGTGAGCTCGCCAAGGGTCAGAGTCCTAAGTACATGGTGTT
TGCTTGTTCCGACTCGCGTGTGTGTCCATCGCACGTTCTCAACTTTCAGCCAGGAGAGGC
CTTCGTTGTCCGTAACATAGCCAACATGGTTCCTCCTTTTGACAAGGTCAAATACGGTGG
AGTAGGAGCAGCCATCGAATACGCTGTTTTGCACCTTAAGGTGGAGAACATTGTGGTGAT
AGGACACAGCGCTTGTGGTGGGATCAAAGGACTCATGTCTTTTCCTTTGGATGGAAACAA
CTCCACTGATTTCATAGAGGACTGGGTCAAAATCTGTTTACCAGCCAAGTCAAAAGTAAT
ATCAGAACTTGGAGAGTCAGCCTTTGAGGACCAGTGTGGCCGATGTGAAAGGGAGGCAGT
GAATGTTTCACTAGCAAACTTGTTGACTTATCCATTCGTGAGAGAAGGACTTGTGAAAGG
AACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTACTATGATTTTATAAAGGGTGCTTTTGAGCTTTGGGG
ACTTGAGTTTGGCCTCTCCGAAACTAGCTCAGTAAAAGATGTGGCCACCATACTACATTG
GAAGCTGTAGGAAATCTTTCAAGCTTTTATCCCGTTCACATTTTTAATTCAGCCACACTT
GTTGTTTCAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ30TF U 82
AF RR2F266TF U 1
AF RR2F418TF U 424
AF RR2C473JQ C 438
BS 1 165 RR2F266TF
BS 166 166 RR2GQ30TF
BS 167 696 RR2F266TF
BS 697 753 RR2F418TF
BS 754 754 RR2C473JQ
BS 755 837 RR2F418TF
BS 838 838 RR2C473JQ
BS 839 855 RR2F418TF
BS 856 856 RR2C473JQ
BS 857 1042 RR2F418TF
BS 1043 1043 RR2C473JQ
BS 1044 1054 RR2F418TF
BS 1055 1056 RR2C473JQ
BS 1057 1057 RR2F418TF
BS 1058 1152 RR2C473JQ

RD RR2GQ30TF 293 0 0
TTCTCAACCTTCTCTCCAAAAACTCTCTCTTCGTTCTTCTCCCGCCGTTGCTTGCCTTCC
CTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTCGTTC
CGTTCCAACACTTATCCGTAACGAGCCCGTTTTTGCCGCTCCTGCTCCTATCATCACCCC
TTATTGGAGCGAAGAGATGGGTAGCGAAGCATACGAAGAGGCCATTGAAGCTCTCAAGAA
GCTTATTATCGAAAAGGAGGAGCTAAAGACTGTTGCGGCCGCTAAGGTGGAGC

QA 1 293 1 293
DS 

RD RR2F266TF 696 0 0
GATCTCACTCTCACTAACTTCTCTTCACCCGAAAATGTCGACCGCTCCTCTCTCCGGCTT
CTTCCTCACCTCTCTTTCTCCTTCTCAACCTTCTCTCCAAAAACTCTCTCTTCGTTCTTC
TCCCGCCGTTGCTTGCCTTCCCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTC
CTCCTCCTCCTCCTCTCGTTCCATTCCAACACTTATCCGTAACGAGCCCGTTTTTGCCGC
TCCTGCTCCTATCATCACCCCTTATTGGAGCGAAGAGATGGGTAGCGAAGCATACGAAGA
GGCCATTGAAGCTCTCAAGAAGCTTATTATCGAAAAGGAGGAGCTAAAGACTGTTGCGGC
CGCTAAGGTGGAGCAGGCCACGGCAGCACTTCAGACAGGTACTTCCTCCGACAAGAAAGC
TTTCGACCCCGTCGAAAACATTAAGCAAGGCTTCATCACTTTCAAGAAGGAGAAATACGA
AACCAACCCTGCTTTGTACGGTGAGCTCGCCAAGGGTCAGAGTCCTAAGTACATGGTGTT
TGCTTGTTCCGACTCGCGTGTGTGTCCATCGCACGTTCTCAACTTTCAGCCAGGAGAGGC
CTTCGTTGTCCGTAACATAGCCAACATGGTTCCTCCTTTTGACAAGGTCAAATACGGTGG
AGTAGGAGCAGCCATCGAATACGCTGTTTTGCACCT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2F418TF 638 0 0
G
GACCCCGTCGAAAACATTAAGCAAGGCTTCATCACTTTCAAGAAGGAGAAATACGAAACC
AACCCTGCTTTGTACGGTGAGCTCGCCAAGGGTCAGAGTCCTAAGTACATGGTGTTTGCT
TGTTCCGACTCGCGTGTGTGTCCATCGCACGTTCTCAACTTTCAGCCAGGAGAGGCCTTC
GTTGTCCGTAACATAGCCAACATGGTTCCTCCTTTTGACAAGGTCAAATACGGTGGAGTA
GGAGCAGCCATCGAATACGCTGTTTCGCACCTTAAGGTGGAGAACATTGTGGTGATAGGA
CACAGCGCTTGTGGTGGGATCAAAGGACTTATGTCTTTTCCTTTGGATGGAAACAACTCC
ACTGATTTCATAGAGGACTGGGTCAAAATCTGTTTACCAGCCAAGTCAAAAGTCATATCA
GAACTTGGAGATTCAGCCTTTGAGGACCAGTGTGGCCGATGTGAAAGGGAGGCAGTGAAT
GTTTCACTAGCAAACTTGTTGACTTATCCATTCGTGAGAGAAGGACTTGTGAAAGGAACA
CTTGCTTTGAAGGGAGGCTACTATGATTTTATAAAGGGTGCTTTTGAGCTTTGGGGACTT
GAGTTTGGCCTCTCCGAA*CTAGCTCAGTATGA
CATC

QA 2 634 2 634
DS 

RD RR2C473JQ 715 0 0
ACATTAAGCAAGGCTTCATCACTTTCAAGAAGGAGAAATACGAAACCAACCCTGCTTTGT
ACGGTGAGCTCGCCAAGGGTCAGAGTCCTAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCCGACTCGC
GTGTGTGTCCATCGCACGTTCTCAACTTTCAGCCAGGAGAGGCCCTCGTTGTCCGTAACA
TAGCCAACATGGTTCCTCCTTTTGACAAGGTCAAATACGGTGGAGTAGGAGCAGCCATCG
AATACGCTGTTTTGCACCTTAAGGTGGAGAACATTGTGGTGATAGGACACAGCGCTTGTG
GTGGGATCAAGGGACTCATGTCTTTTCCTTTGGATGGAAACAACTCCACTGATTTCATAG
AGGACTGGGTCAAAATTTGTTTGCCAGCCAAGTCAAAAGTAATATCAGAACTTGGGGAGT
CAGCCTTTGAGGACCAGTGTGGCCGATGTGAAAGGGAGGCAGTGAATGTTTCACTAGCAA
ACTTGTTGACTTATCCATTCGTGAGAGAAGGACTTGTGAAAGGAACACTTGCTTTGAAGG
GAGGCTACTATGATTTTATAAAGGGTGCTTTTGAGCTTTGGGGACTTGAGTTTGGCCTCT
CCGAAACTAGCTCAGTTAAAGATGTGGCCACCATACTACATTGGAAGCTGTAGGAAATCT
TTCAAGCTTTTATCCCGTTCACATTTTTAATTCAGCCACACTTGTTGTTTCAAAA

QA 1 715 1 715
DS 



CO CL105Contig4 710 9 13 U
ATATATCATCTGAGTTTTCTTTTTTTATTTATATGAAAGTTGAATACCATGAAGATTGGA
AAACAACTCAGCACATTACAAATTACATATGTAAATGAGATATATGATGATGATGGATGC
TCATGATGATGATGGTGGATTGGTTCATACTGAGCTAGTTTCGGAGAGGCCAAACTCAAG
TCCCCAAAGCTCAAAAGCACCCTTTATAAAATCATAGTAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGT
TCCTTTCACAAGTCCTTCTCTCACGAATGGATAAGTCAACAAGTTTGCTAGTGAAACATT
CACTGCCTCCCTTTCACATCGGCCACACTGGTCCTCAAAGGCTGACTCCCCAAGTTCTGA
TATTACTTTTGACTTGGCTGGTAAACAGATTTTGACCCAGTCCTCTATGAAATCAGTGGA
GTT*GTTTCCATCCAAAGGAAAAGACATAAGTCCTTTGATCCCACCACAAGCGCTGTGTC
CTATCACCACAATGTTCTCCACCTTAAGGTGCAAAACAGCGTATTCGATGGCTGCTCCTA
CTCCACCGTATTTGACCTTGTCAAAAGGAGGAACCATGTTGGCTATGTTACGGACAACGA
AGGCCTCTCCTGGCTGAAAGTTGAGAACGTGCGATGGACACACACGCGAGTCGGAACAAG
CAAACACCATGTACTTAGGACTCTGACCCTTGGCGAGCTCACCGTACAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 5 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 5 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2GT83JQB U 7
AF RR2GT83TF C 7
AF RR2C776JQ U 145
AF RR2DV05JQ U 5
AF RR2DV05TF C 53
AF RR2F418JQ U 1
AF RR2F266JQ U 31
AF RR2FB10TF C 20
AF RR2GQ30JQ U 5
BS 1 12 RR2F418JQ
BS 13 13 RR2GT83JQB
BS 14 56 RR2F418JQ
BS 57 57 RR2GT83JQB
BS 58 345 RR2F418JQ
BS 346 346 RR2GT83JQB
BS 347 348 RR2F418JQ
BS 349 349 RR2GT83JQB
BS 350 363 RR2F418JQ
BS 364 364 RR2GT83JQB
BS 365 512 RR2F418JQ
BS 513 513 RR2DV05JQ
BS 514 710 RR2F418JQ

RD RR2GT83JQB 375 0 0
CATCTGAGTTTTCTTTTTT*ATTTATATGAAAGTTGAATACCATGAAGATTGGAAAACAA
CTCAGCACATTACAAATTACATATGTAAATGAGATATATGATGATGATGGATGCTCATGA
TGATGATGGTGGATTGGTTCATACTGAGCTAGTTTCGGAGAGGCCAAACTCAAGTCCCCA
AAGCTCAAAAGCACCCTTTATAAAATCATAGTAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTCT
CACAAGTCCTTCTCTCACGAATGGATAAGTCAACAAGTTTGCTAGTGAAACATTCACTGC
CTCCCTTTCACATCGGCCACACTGGTCCTCAAAGGCTGACTCCCCAAGTTCTGATATTAC
TTTTGACTTGGCTGC

QA 1 375 1 375
DS 

RD RR2GT83TF 375 0 0
CATCTGAGTTTTCTTTTTT*ATTTATATGAAAGTTGAATACCATGAAGATTGGAAAACAA
CTCAGCACATTACAAATTACATATGTAAATGAGATATATGATGATGATGGATGCTCATGA
TGATGATGGTGGATTGGTTCATACTGAGCTAGTTTCGGAGAGGCCAAACTCAAGTCCCCA
AAGCTCAAAAGCACCCTTTATAAAATCATAGTAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTCT
CACAAGTCCTTCTCTCACGAATGGATAAGTCAACAAGTTTGCTAGTGAAACATTCACTGC
CTCCCTTTCACATCGGCCACACTGGTCCTCAAAGGCTGACTCCCCAAGTTCTGATATTAC
TTTTGACTTGGCTGC

QA 1 375 1 375
DS 

RD RR2C776JQ 312 0 0
TCATACTGAGCTAGTTTCGGAAAGGCCAAACTCAAGTCCCCAAAGCTCAAAAGCACCCTT
TATAAAACCATAGTAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTCACAAGTCCTTCTCTCAC
GAATGGATAAGTCAACAAGTTTGCTAGTGAAACATTCACTGCCTCCCTTTCACATCGGCC
ACACTGGTCCTCAAAGGCTGACTCCCCAAGTTCTGATATTACTTTTGACTTGGCTGGCAA
AAAGATTTTGACCCAGTCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTTGTTTCCATCCAAAGGAAAAG
ACATGAGTCCCT

QA 1 312 1 312
DS 

RD RR2DV05JQ 587 0 0
AT
CATCTGAGTTTTCTTTTTT*ATTTATATGAAAGTTGAATACCATGAAGATTGGAAAACAA
CTCAGCACATTACAAATTACATATGTAAATGAGATATATGATGATGATGGATGCTCATGA
TGATGATGGTGGATTGGTTCATACTGAGCTAGTTTCGGAGAGGCCAAACTCAAGTCCCCA
AAGCTCAAAAGCACCCTTTATAAAATCATAGTAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTT
CACAAGTCCTTCTCTCACGAATGGATAAGTCAACAAGTTTGCTAGTGAAACATTCACTGC
CTCCCTTTCACATCGGCCACACTGGTCCTCAAAGGCTGACTCCCCAAGTTCTGATATTAC
TTTTGACTTGGCTGGCAAACAGATTTTGACCCAGTCCTCTATGAAATCAGTGGAGTT*GT
TTCCATCCAAAGGAAAAGACATGAGTCCCTTGATCCCACCACAAGCGCTGTGTCCTATCA
CCACAATGTTCTCCACCTTAAGGTGCAAAACAGCGTATTCGATGGCTGTTCCTACTCCAC
CGTATTTGACCTTGTCAAAAGGAGGAACCATGTTGGCTATGTTAC

QA 3 587 3 587
DS 

RD RR2DV05TF 563 0 0
AGATTGGAAAACAACTCAGCACATTACAAATTACATATGTAAATGAGATATATGATGATG
ATGGATGCTCATGATGATGATGGTGGATTGGTTCATACTGAGCTAGTTTCGGAGAGGCCA
AACTCAAGTCCCCAAAGCTCAAAAGCACCCTTTATAAAATCATAGTAGCCTCCCTTCAAA
GCAAGTGTTCCTTTCACAAGTCCTTCTCTCACGAATGGATAAGTCAACAAGTTTGCTAGT
GAAACATTCACTGCCTCCCTTTCACATCGGCCACACTGGTCCTCAAAGGCTGACTCCCCA
AGTTCTGATATTACTTTTGACTTGGCTGGCAAACAGATTTTGACCCAGTCCTCTATGAAA
TCAGTGGAGTT*GTTTCCATCCAAAGGAAAAGACATGAGTCCCTTGATCCCACCACAAGC
GCTGTGTCCTATCACCACAATGTTCTCCACCTTAAGGTGCAAAACAGCGTATTCGATGGC
TGTTCCTACTCCACCGTATTTGACCTTGTCAAAAGGAGGAACCATGTTGGCTATGTTACG
GACAACGAAGGCCTCTCCTGGC
C

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2F418JQ 710 0 0
ATATATCATCTGGGTTTTCTTTTTTTATTTATATGAAAGTTGAATACCATGAAGATCGGA
AAACAACTCAGCACATTACAAATTACATATGTAAATGAGATATATGATGATGATGGATGC
TCATGATGATGATGGTGGATTGGTTCATACTGAGCTAGTTTCGGAGAGGCCAAACTCAAG
TCCCCAAAGCTCAAAAGCACCCTTTATAAAATCATAGTAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGT
TCCTTTCACAAGTCCTTCTCTCACGAATGGATAAGTCAACAAGTTTGCTAGTGAAACATT
CACTGCCTCCCTTTCACATCGGCCACACTGGTCCTCAAAGGCTGAATCTCCAAGTTCTGA
TATGACTTTTGACTTGGCTGGTAAACAGATTTTGACCCAGTCCTCTATGAAATCAGTGGA
GTT*GTTTCCATCCAAAGGAAAAGACATAAGTCCTTTGATCCCACCACAAGCGCTGTGTC
CTATCACCACAATGTTCTCCACCTTAAGGTGCGAAACAGCGTATTCGATGGCTGCTCCTA
CTCCACCGTATTTGACCTTGTCAAAAGGAGGAACCATGTTGGCTATGTTACGGACAACGA
AGGCCTCTCCTGGCTGAAAGTTGAGAACGTGCGATGGACACACACGCGAGTCGGAACAAG
CAAACACCATGTACTTAGGACTCTGACCCTTGGCGAGCTCACCGTACAAA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2F266JQ 657 0 0
ATATGAAAGTTGAATACCATGAAGATTGGAAAACAACTCAGCACATTACAAATTACATAT
GTAAATGAGATATATGGTGATGATGGATGCTCATGATGATGATGGTGGATTGGTTCATAC
TGAGCTAGTTTCGGAGAGGCCAAACTCAAGTCCCCAAAGTTCAAAAGCACCCTTTATAAA
ATCATAGTAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTCACAAGTCCTTCTCTCACGAATGG
ATAAGTCAACAAGTTTGCTAGTGAAACATTCACTGCCTCCCTTTCACATCGGCCACACTG
GTCCTCAAAGGCTGAATCTCCAAGTTCTGATATGACTTTTGACTTGGCTGGTAAACAGAT
TTTGACCCAGTCCTCTATGAAATCAGTGGAGTT*GTTTCCATCCAAAGGAAAAGACATAA
GTCCTTTGATCCCACCACAAGCGCTGTGTCCTATCACCACAATGTTCTCCACCTTAAGGT
GCAAAACAGCGTATTCGATGGCTGCTCCTACTCCACCGTATTTGACCTTGTCAAAAGGAG
GAACCATGTTGGCTATGTTACGGACAACGAAGGCCTCTCCTGGCTGAAAGTTGAGAACGT
GCGATGGACACACACGCGAGTCGGAACAAGCAAACACCATGTACTTAGGACTCTGAC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2FB10TF 662 0 0
T
TTTTTTATTTATATGAAAGTTGAATACCATGAAGATTGGAAAACAACTCAGCACATTACA
AATTACATATGTAAATGAGATATATGATGATGATGGATGCTCATGATGATGATGGTGGAT
TGGTTCATACTGAGCTAGTTTCGGAGAGGCCAAACTCAAGTCCCCAAAGCTCAAAAGCAC
CCTTTATAAAATCATAGTAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTCACAAGTCCTTCTC
TCACGAATGGATAAGTCAACAAGTTTGCTAGTGAAACATTCACTGCCTCCCTTTCACATC
GGCCACACTGGTCCTCAAAGGCTGAATCTCCAAGTTCTGATATGACTTTTGACTTGGCTG
GTAGACAGATTTTGACCCAGTCCTCTATGAAATCAGTGGAGTT*GTTTCCATCCAAAGGA
AAAGACATAAGTCCTTTGATCCCACCACAAGCGCTGTGTCCTATCACCACAATGTTCTCC
ACCTTAAGGTGCAAAACAGCGTATTCGATGGCTGCTCCTACTCCACCGTATTTGACCTTG
TCAAAAGGAGGAACCATGTTGGCTATGTTACGGACAACGAAGGCCTCTCCTGGCTGAAAG
TTGAGAACCTGCGATGGACACACACGCGAGTCGGAACAAGCAAACACCATGTACTTAGGA
C

QA 2 662 2 662
DS 

RD RR2GQ30JQ 705 0 0
GT
CATCTGGGTTTTCTTTTTTTATTTATATGAAAGTTGAATACCATGAAGATTGGAAAACAA
CTCAGCACATTACAAATTACATATGTAAATGAGATATATG***ATGATGGATGCTCATGA
TGATGATGGTGGATTGGTTCATACTGAGCTAGTTTCGGAGAGGCCAAACTCAAGTCCCCA
AAGCTCAAAAGCACCCTTTATAAAATCATAGTAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTT
CACAAGTCCTTCTCTCACGAATGGATAAGTCAACAAGTTTGCTAGTGAAACATTCACTGC
CTCCCTTTCACATCGGCCACACTGGTCCTCAAAGGCTGAATCTCCAAGTTCTGATATGAC
TTTTGACTTGGCTGGTAAACAGATTTTGACCCAGTCCTCTATGAAATCAGTGGAGTT*GT
TTCCATCCAAAGGAAAAGACATAAGTCCTTTGATCCCACCACAAGCGCTGTGTCCTATCA
CCACAATGTTCTCCACCTTAAGGTGCAAAACAGCGTATTCGATGGCTGCTCCTACTCCAC
CGTATTTGACCTTGTCAAAAGGAGGAACCATGTTGGCTATGTTACGGACAACGAAGGCCT
CTCCTGGCTGAAAGTTGAGAACGTGCGATGGACACACACGCGAGTCGGAACAAGCAAACA
CCATGTACTTAGGACTCTGACCCTTGGCGAGCTCACCGTACAA

QA 3 705 3 705
DS 



CO CL105Contig5 695 2 3 U
TTTTTTTTCTAGAAATCTCTTCAATTATATCTTTCATTTTTTTTCTTTTTTAATTCTTGT
CCCTCCAAGATTTAGCTTTCAAAAGACCATCTGTATGCATTCTTCATGTTTGATTATTAA
ATAGAATGCAAAGGGTTTTCTGATGAGCTACATGGAAACAACAAGTGTGGCTGAATTAAA
AATGTGAACGGGATAAAAGCTTGAAAGATTTCCTACAGCTTCCAATGTAGTATGGTGGCC
ACATCTTTAACTGAGCTAGTTTCGGAAAGGCCAAACTCAAGTCCCCAAAGCTCAAAAGCA
CCCTTTATAAAATCATAGTAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTCACAAGTCCTTCT
CTCACGAATGGATAAGTCAACAAGTTTGCTAGTGAAACATTCACTGCCTCCCTTTCACAT
CGGCCACACTGGTCCTCAAAGGCTGACTCCCCAAGTTCTGATATTACTTTTGACTTGGCT
GGCAAACAGATTTTGACCCAGTCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCATCCAAAGGA
AAAGACATGAGTCCCTTGATCCCACCACAAGCAAACACCATGTACTTAGGACTCTGACCC
TTGGCGAGCTCACCGTACAAAGCAGGGTTGGTTTCGTATTTCTCCTTCTTGAAAGTGATG
AAGCCTTGCTTAATGTTTTCGACGGGGTCGAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL27TF C 1
AF RR2FL27JQ U 52
BS 1 51 RR2FL27TF
BS 52 679 RR2FL27JQ
BS 680 695 RR2FL27TF

RD RR2FL27TF 695 0 0
TTTTTTTTCTAGAAATCTCTTCAATTATATCTTTCATTTTTTTTCTTTTTTAATTCTTGT
CCCTCCAAGATTTAGCTTTCAAAAGACCATCTGTATGCATTCTTCATGTTTGATTATTAA
ATAGAATGCAAAGGGTTTTCTGATGAGCTACATGGAAACAACAAGTGTGGCTGAATTAAA
AATGTGAACGGGATAAAAGCTTGAAAGATTTCCTACAGCTTCCAATGTAGTATGGTGGCC
ACATCTTTAACTGAGCTAGTTTCGGAGAGGCCAAACTCAAGTCCCCAAAGCTCAAAAGCA
CCCTTTATAAAATCATAGTAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTCACAAGTCCTTCT
CTCACGAATGGATAAGTCAACAAGTTTGCTAGTGAAACATTCACTGCCTCCCTTTCACAT
CGGCCACACTGGTCCTCAAAGGCTGACTCCCCAAGTTCTGATATTACTTTTGACTTGGCT
GGCAAACAGATTTTGACCCAGTCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCATCCAAAGGA
AAAGACATGAGTCCCTTGATCCCACCACAAGCAAACACCATGTACTTAGGACTCTGACCC
TTGGCGAGCTCACCGTACAAAGCAGGGTTGGTTTCGTATTTCTCCTTCTTGAAAGTGATG
AAGCCTTGCTTAATGTTTTCGACGGGGTCGAAAGC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2FL27JQ 628 0 0
AATTCTTGTCCCTCCAAGATTTAGCTTTCAAAAGACCATCTGTATGCATTCTTCATGTTT
GATTATTAAATAGAATGCAAAGGGTTTTCTGATGAGCTACATGGAAACAACAAGTGTGGC
TGAATTAAAAATGTGAACGGGATAAAAGCTTGAAAGATTTCCTACAGCTTCCAATGTAGT
ATGGTGGCCACATCTTTAACTGAGCTAGTTTCGGAAAGGCCAAACTCAAGTCCCCAAAGC
TCAAAAGCACCCTTTATAAAATCATAGTAGCCTCCCTTCAAAGCAAGTGTTCCTTTCACA
AGTCCTTCTCTCACGAATGGATAAGTCAACAAGTTTGCTAGTGAAACATTCACTGCCTCC
CTTTCACATCGGCCACACTGGTCCTCAAAGGCTGACTCCCCAAGTTCTGATATTACTTTT
GACTTGGCTGGCAAACAGATTTTGACCCAGTCCTCTATGAAATCAGTGGAGTTGTTTCCA
TCCAAAGGAAAAGACATGAGTCCCTTGATCCCACCACAAGCAAACACCATGTACTTAGGA
CTCTGACCCTTGGCGAGCTCACCGTACAAAGCAGGGTTGGTTTCGTATTTCTCCTTCTTG
AAAGTGATGAAGCCTTGCTTAATGTTTT

QA 1 628 1 628
DS 



AS 4 19

CO CL106Contig1 927 4 4 U
GGAGAGAGAGAAAATCAAATCTCATATCATGGCTCCGCTTCCTGTCCACTTCTCCAGGAA
TCATCTCTCTTCCCCCAATTTCTCCGGCAGATTCCGACGTTCCACCGAGACGACCAGATC
TTTTGTAGCTCTTGTACATTGCTCCGCTAGAGACGATGATCAAGGAATCAAGAAGACTTT
GTTTCCTGTGAAGGAGCTTGGATGTTTCGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCAC
AATGGCCTCTCCTGTCATTGCTGCTAACCAGAGGCTTCCTCCGCCTTCAACAGATCCAAC
CCGGTGTGAACAAGCTTTTGTAGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAA
GCCACTCGACCTCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGAC
TCTCTCTGCTGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTTGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGT
TATGTCTAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGGGTGAATTTCTCGAATGCCGT
TATCGATCGGGTGAACTTCGGGAAGTCAGATCTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGT
GTTGTCAGGTTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTGATCTTTGAGGACACCAT
CATTGGTTACATAGACCTTCAGAAGATTTGTAGGAACGTGACAATAAACGAAGAAGGAAG
ACTCGTCTTGGGTTGCAGATAAAGAGACAAAAGGGTTTTGTATTTGGTGTGTGTGTGTAA
GAATTTGAGAGTTGACACAAAAGAATGTATGAACAAATAAGTACGTTCAAGTGTTGAAGG
ATATTAGGACTCAGAAGAGTGTTATGAGGTTTGTATAATCAAATTCCTGTAAAGTTTGTT
ATCAGACAAAAGGGTCTGTTATTCGTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ08TF U 1
AF RR2B985TF U 1
AF RR2EZ08JQ C 246
AF RR2B985JQ C 132
BS 1 715 RR2B985TF
BS 716 716 RR2B985JQ
BS 717 778 RR2B985TF
BS 779 927 RR2B985JQ

RD RR2EZ08TF 686 0 0
GGAGA
GAGAGAAAATCAAATCTCATATCATGGCTTCGCTTCCTGTCCACTTCTCCAGGAATCATC
TCTCTTCCCCCAATTTCTCCGGCAGATTCCGACGTTCCACCGAGACGACCAGATCTTTTG
TAGCTCTTGTACATTGCTCCGCTAGAGACGATGATCAAGGAATCAAGAAGACTTTGTTTC
CTGTGAAGGAGCTTGGATGTTTCGCTTGCACCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAATGG
CCTCTCCTGTCATTGCTGCTAACCAGAGGCTTCCTCCGCTTTCAACAGATCCAACCCGGT
GTGAACAAGCTTTTGTAGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAAGCCAC
TCGACCTCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTCTCT
CTGCTGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTTGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTATGT
CTAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGGGTGAATTTCTCGAATGCCGTTATCG
ATCGGGTGAACTTCGGGAAGTCGGATCTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGTGTTGT
CAGGTTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTGGTCTTTGAGGACACCATCATTG
GTTACATAGACCTTCAGAAGA

QA 6 686 6 686
DS 

RD RR2B985TF 778 0 0
GGAGAGAGAGAAAATCAAATCTCATATCATGGCTCCGCTTCCTGTCCACTTCTCCAGGAA
TCATCTCTCTTCCCCCAATTTCTCCGGCAGATTCCGACGTTCCACCGAGACGACCAGATC
TTTTGTAGCTCTTGTACATTGCTCCGCTAGAGACGATGATCAAGGAATCAAGAAGACTTT
GTTTCCTGTGAAGGAGCTTGGATGTTTCGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCAC
AATGGCCTCTCCTGTCATTGCTGCTAACCAGAGGCTTCCTCCGCCTTCAACAGATCCAAC
CCGGTGTGAACAAGCTTTTGTAGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAA
GCCACTCGACCTCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGAC
TCTCTCTGCTGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTTGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGT
TATGTCTAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGGGTGAATTTCTCGAATGCCGT
TATCGATCGGGTGAACTTCGGGAAGTCAGATCTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGT
GTTGTCAGGTTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTGATCTTTGAGGACACCAT
CATTGGTTACATAGACCTTCAGAAGATTTGTAGGAACGTGACAATAAACGAAGAAAGAAG
ACTCGTCTTGGGTTGCAGATAAAGAGACAAAAGGGTTTTGTATTTGGTGTGTGTGTGT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2EZ08JQ 571 0 0
CCTCTCCTGTCATTGCTGCTAACCAGAGGCTTCCTCCGCTTTCAACAGATCCAACCCGGT
GTGAACAAGCTTTTGTAGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAAGCCAC
TCGACCTCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTCTCT
CTGCTGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTTGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTATGT
CTAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGGGTGAATTTCTCGAATGCCGTTATCG
ATCGGGTGAACTTCGGGAAGTCGGATCTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGTGTTGT
CAGGTTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTGGTCTTTGAGGACACCATCATTG
GTTACATAGACCTTCAGAAGATTTGTAGGAACGTGACAATAAACGAAGAAGGAAGACTCG
TCTTGGGTTGCAGATAAAGAGACAAAAGGGTTTTGTATTTGGTGTGTGTGTGTAAGAATT
TGAGAGTTGACACAAAAGAATGTATGAACAA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2B985JQ 796 0 0
TTGTACATTGCTCCGCTAGAGACGATGATCAAGGAATCAAGAAGACTTTGTTTCCTGTGA
AGGAGCTTGGATGTTTCGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAATGGCCTCTC
CTGTCATTGCTGCTAACCAGAGGCTTCCTCCGCCTTCAACAGATCCAACCCGGTGTGAAC
AAGCTTTTGTAGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAAGCCACTCGACC
TCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTCTCTCTGCTG
CCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTTGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTATGTCTAAAG
CTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGGGTGAATTTCTCGAATGCCGTTATCGATCGGG
TGAACTTCGGGAAGTCAGATCTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGTGTTGTCAGGTT
CCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTGATCTTTGAGGACACCATCATTGGTTACA
TAGACCTTCAGAAGATTTGTAGGAACGTGACAATAAACGAAGAAGGAAGACTCGTCTTGG
GTTGCAGATAAAGAGACAAAAGGGTTTTGTATTTGGTGTGTGTGTGTAAGAATTTGAGAG
TTGACACAAAAGAATGTATGAACAAATAAGTACGTTCAAGTGTTGAAGGATATTAGGACT
CAGAAGAGTGTTATGAGGTTTGTATAATCAAATTCCTGTAAAGTTTGTTATCAGACAAAA
GGGTCTGTTATTCGTT

QA 1 796 1 796
DS 



CO CL106Contig2 532 4 8 U
GTGAATAACAAAGAAAAACCCTTTTGTCTGATTACAAACTTTACAGGAATTGATTATACA
AACCTCACAACACTTCTGAGTCCTAATATCCTTCAACACTGAAACGTACTTATTTGTTCA
TACATTCTTTTGCCTCAACTCTCAAATTCTTACACACACCAAATACAAAACCCTTTGGTC
TCTTCATCTCTTATCTGCAACCCAAGACGAGTCTTCCTTCTTCGTTTATTGTCACGTTCC
TACAAATCTTCTGAAGGTCTATGTAACCAATGATGGTGTCCTCAAAGACCACATCCTCCA
GGTTTGCCTCCTCGAATGTGGAACCTGACAAAACCGTGTTCTTGAACACAGCTCCTTTTA
GATCCGACTTCCCGAAGTTCACCCGATCGATAACGGCATTCGAGAAATTCACCCCCTTGA
AGCTAGCTCCAACGGCGTAAGCATTAGACATAACGACTTCAGACATGTCAGCACCATCAA
ACTTGGCACCTGACATCAAGGCAGCAGAGAGAGTCTTGCCTTTGAGATTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR48JQ U 93
AF RR2DR48TF C 93
AF RR2GI45JQB U 1
AF RR2FR79TF C 79
BS 1 132 RR2GI45JQB
BS 133 133 RR2DR48JQ
BS 134 140 RR2GI45JQB
BS 141 141 RR2DR48JQ
BS 142 442 RR2GI45JQB
BS 443 443 RR2FR79TF
BS 444 503 RR2GI45JQB
BS 504 532 RR2FR79TF

RD RR2DR48JQ 266 0 0
A
CAACACTGAAACGTACTTATTTGTTCATACATTCTTTTGCCTCAACTCTCAAATTCTTAC
ACACACCAAATACAAAACCCTTTGGTCTCTTCATCTCTTATCTGCAACCCAAGACGAGTC
TTCCTTCTTCGTTTATTGTCACGTTCCTACAAATCTTCTGAAGGTCTATGTAACCAATGA
TGGTGTCCTCAAAGACCACATCCTCCAGGTTTGCCTCCTCGAATGTGGAACCTGACAAAA
CCGTGTTCTTGAACACAGCTCCTT
C

QA 2 265 2 265
DS 

RD RR2DR48TF 266 0 0
A
CAACACTGAAACGTACTTATTTGTTCATACATTCTTTTGCCTCAACTCTCAAATTCTTAC
ACACACCAAATACAAAACCCTTTGGTCTCTTCATCTCTTATCTGCAACCCAAGACGAGTC
TTCCTTCTTCGTTTATTGTCACGTTCCTACAAATCTTCTGAAGGTCTATGTAACCAATGA
TGGTGTCCTCAAAGACCACATCCTCCAGGTTTGCCTCCTCGAATGTGGAACCTGACAAAA
CCGTGTTCTTGAACACAGCTCCTT
C

QA 2 265 2 265
DS 

RD RR2GI45JQB 503 0 0
GTGAATAACAAAGAAAAACCCTTTTGTCTGATTACAAACTTTACAGGAATTGATTATACA
AACCTCACAACACTTCTGAGTCCTAATATCCTTCAACACTGAAACGTACTTATTTGTTCA
TACATTCTTTTGTCTCAACTATCAAATTCTTACACACACCAAATACAAAACCCTTTGGTC
TCTTCATCTCTTATCTGCAACCCAAGACGAGTCTTCCTTCTTCGTTTATTGTCACGTTCC
TACAAATCTTCTGAAGGTCTATGTAACCAATGATGGTGTCCTCAAAGACCACATCCTCCA
GGTTTGCCTCCTCGAATGTGGAACCTGACAAAACCGTGTTCTTGAACACAGCTCCTTTTA
GATCCGACTTCCCGAAGTTCACCCGATCGATAACGGCATTCGAGAAATTCACCCCCTTGA
AGCTAGCTCCAACGGCGTAAGCTTTAGACATAACGACTTCAGACATGTCAGCACCATCAA
ACTTGGCACCTGACATCAAGGCA

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2FR79TF 454 0 0
AGTCCTAATATCCTTCAACACTGAAACATACTTATTTGTTCATACATTCTTTTGTCTCAA
CTCTCAAATTCTTACACACACCAAGTACAAAACCCTTTGGTCTCTTCATCTCTTATCTGC
AACCCAAGACGAGTCTTCCTTCTTCGTTTATTGTCACGTTCCTACAAATCTTCTGAAGGT
CTATGTAACCAATGATGGTGTCCTCAAAGACCACATCCTCCAGGTTTGCCTCCTCGAATG
TGGAACCTGACAAAACCGTGTTCTTGAACACAGCTCCTTTTAGATCCGACTTCCCGAAGT
TCACCCGATCGATAACGGCATTCGAGAAATTCACCCCCTTGAAGCTAGCTCCAACGGCGT
AAGCATTAGACATAACGACTTCAGACATGTCAGCACCATCAAACTTGGCACCTGACATCA
AGGCAGCAGAGAGAGTCTTGCCTTTGAGATTAGC

QA 1 454 1 454
DS 



CO CL106Contig3 947 9 28 U
GAGAGAGAGAAAATAAAATCTCATATCATGGCTTCGCTTCCTGTCCACTTCTCCAGGAAT
CATCTCTCTTCGCCCAATTTCTCCGACAGATTCCGCCGTTCCGCGGAGCGGAGATCTTTC
GTAGCTCTTGTACACTGCTCTGCTAGAGAAAATGATCAAGGAATCAAGAAGACTTTGTTT
CCTGTGAAGGAGCTTGGATGTTTAGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAATG
GCCTCTCCTGTCATTGCTGCTAACCAGAGACTTCCTCCGCTTTCAACAGATCCAGCTCGG
TGTGAACAAGCTTTTGTTGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAAGCCA
CTCGATCTCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTCTC
TCTGCTGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTCGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTATG
TCTAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGAGTGAATTTCTCGAATGCCGTTATC
GATCGGGTGAACTTCGGGAAGTCGGATCTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGTGTTG
TCAGGTTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTGGTCTTTGAGGACACCATCATT
GGTTACATAGACCTTCAGAAGATATGCAGGAACGTGACAATAAACGAAGAAGGAAGACTC
GTCTTGGGTTGCAGATAAAGAGATGAAGAGACTAAAGGGTTTTGGATTTGGTGTGTGTGT
GTGTGTAAGAATTTGAGAGTTGACACAAAAGAATGTATGAACAAATAAGCGTACGTTTAA
GTGTTGAAGGATATTAGGACTCAGAAGAGTGTTATGAGGTTTGTATAATCAAATTCCTGT
AAAGTTTGTAATCAGACAAAAGGGTTTTTCTCTGTTATTCGTTAATT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
45 45 15 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI45TF U 1
AF RR2CF60TF U 3
AF RR2D003TF U 9
AF RR2CM43TF U 13
AF RR2BP16TF U 185
AF RR2D003JQ C 186
AF RR2CM43JQ C 220
AF RR2BP16JQ C 419
AF RR2CF60JQ C 279
BS 1 29 RR2GI45TF
BS 30 30 RR2CF60TF
BS 31 165 RR2GI45TF
BS 166 166 RR2CF60TF
BS 167 185 RR2GI45TF
BS 186 186 RR2CF60TF
BS 187 287 RR2GI45TF
BS 288 288 RR2CF60TF
BS 289 294 RR2GI45TF
BS 295 295 RR2CF60TF
BS 296 317 RR2GI45TF
BS 318 318 RR2CF60TF
BS 319 449 RR2GI45TF
BS 450 450 RR2CF60TF
BS 451 509 RR2GI45TF
BS 510 600 RR2CF60TF
BS 601 604 RR2D003TF
BS 605 605 RR2CM43TF
BS 606 648 RR2D003TF
BS 649 649 RR2BP16TF
BS 650 664 RR2D003TF
BS 665 689 RR2CM43TF
BS 690 690 RR2BP16TF
BS 691 700 RR2CM43TF
BS 701 753 RR2BP16TF
BS 754 931 RR2D003JQ
BS 932 934 RR2CM43JQ
BS 935 947 RR2CF60JQ

RD RR2GI45TF 509 0 0
GAGAGAGAGAAAATAAAATCTCATATCATCGCTTCGCTTCCTGTCCACTTCTCCAGGAAT
CATCTCTCTTCGCCCAATTTCTCCGACAGATTCCGCCGTTCCGCGGAGCGGAGATCTTTC
GTAGCTCTTGTACACTGCTCTGCTAGAGAAAATGATCAAGGAATCTAGAAGACTTTGTTT
CCTGTAAAGGAGCTTGGATGTTTAGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAATG
GCCTCTCCTGTCATTGCTGCTAACCAGAGACTTCCTCCGCTTTCAACGGATCCAACTCGG
TGTGAACAAGCTTTTGTCGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAAGCCA
CTCGATCTCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTCTC
TCTGCTGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTTGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTATG
TCTAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTT

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2CF60TF 598 0 0
GG
GAGAGAAAATAAAATCTCATATCATGGCTTCGCTTCCTGTCCACTTCTCCAGGAATCATC
TCTCTTCGCCCAATTTCTCCGACAGATTCCGCCGTTCCGCGGAGCGGAGATCTTTCGTAG
CTCTTGTACACTGCTCTGCTAGAGAAAATGATCAAGGAATCAAGAAGACTTTGTTTCCTG
TGAAGGAGCTTGGATGTTTAGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAATGGCCT
CTCCTGTCATTGCTGCTAACCAGAGACTTCCTCCGCTTTCAACAGATCCAGCTCGGTGTG
AACAAGCTTTTGTTGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAAGCCACTCG
ATCTCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCGGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTCTCTCTG
CTGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTCGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTATGTCTA
AAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGAGTGAATTTCTCGAATGCCGTTATCGATC
GGGTGAACTTCGGGAAGTCGGATCTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGTGTTG

QA 3 598 3 598
DS 

RD RR2D003TF 658 0 0
GAAAATAAAATCTCATATCATGGCTTCGCTTCCTGTCCACTTCTCCAGGAATCATCTCTC
TTCGCCCAATTTCTCCGACAGATTCCGCCGTTCCGCGGAGCGGAGATCTTTCGTAGCTCT
TGTACACTGCTCTGCTAGAGAAAATGATCAAGGAATCAAGAAGACTTTGTTTCCTGTGAA
GGAGCTTGGATGTGTAGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAATGGCCTCTCC
TGTCATTGCTGCTAACCAGAGACTTCCTCCGCTTTCAACAGATCCAGCTCGGTGTGAACA
AGCTTTTGTTGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAAGCCACTCGATCT
CAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTCTCTCTGCTGC
CTTGATGTCAGGTGCCAAGTTCGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTATGTCTAAAGC
TTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGAGTGAATTTCTCGAATGCCGTTATCGATCGGGT
GAACTTCGGGAGGTCGGATCTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGTGTTGTCAG*TTC
CACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTGGTCTTTGAG*ACACCATCATTGGTT
GC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2CM43TF 691 0 0
ATAAAATCTCATATCATGGCTTCGCTTCCTGTCCACTTCTCCAGGAATCATCTCTCTTCG
CCCAATTTCTCCGACAGATTCCGCCGTTCCGCGGAGCGGAGATCTTTCGTAGCTCTTGTA
CACTGCTCTGCTAGAGAAAATGATCAAGGAATCAAGAAGACTTTGTTTCCTGTGAAGGAG
CTTGGATGTTTAGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAATGGCCTCTCCTGTC
ATTGCTGCTAACCAGAGACTTCCTCCGCTTTCAACAGATCCAGCTCGGTGTGAACAAGCT
TTTGTTGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAAGCCACTCGATCTCAGG
TTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTCTCTCTGCTGCCTTG
ATGTCAGGTGCCAAGTTCGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTATGTCTAAAGCTTAC
GCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGAGTGAATTTCTCGAATGCCGTTATCGATCGGGTGAAC
TTCGGGAAGTCGGATCTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGTGTTGTCAGGTTCCACA
TTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTGGTCTTTGAG*ACACCATCATTGGTTACATAGAC
CTTCAGAAGATATGCAG*AACGTGACAA
AAA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2BP16TF 569 0 0
TGAAGGAGCTTGGATGTTTAGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAATGGCCT
CTCCCGTCATTGCTGCTAACCAGAGACT*CCTCCGCTTTCAACAGATCCAGCTCGGTGTG
AACAAGCTTTTGTTGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAAGCCACTCG
ACCTCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTCTCTCTG
CTGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTCGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTATGTCTA
AAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGAGTGAATTTCTCGAATGCCGTTATCGATC
GGGTGAACTTCGGGAAGTCGGATCTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGTGTTGTCGG
GTTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTGGTCTTTGAGGACACCATCATTGGTT
ACATAGACCTTCAGAAGATATGCAGGAACGTGACAATAAACGAAGAAGGAAGACTCGTCT
TGGGTTGCAGATAAAGAGATGAAGAGACT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2D003JQ 751 0 0
GAAGGAGCTTGGATGTGTAGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAATGGCCTC
TCCTGTCATTGCTGCTAACCAGAGACTTCCTCCGCTTTCAACAGATCCAGCTCGGTGTGA
ACAAGCTTTTGTTGGTAACACGATAGGTCAAGCAAACGGGGTCTATGACAAGCCACTCGA
TCTCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTCTAATCTCAAAGGCAAGACTCTCTCTGC
TGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTCGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTATGTCTAA
AGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGAGTGAATTTCTCGAATGCCGTTATCGATCG
GGTGAACTTCGGGAGGTCGGATCTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGTGTTGTCAGG
TTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTGGTCTTTGAGGACACCATCATTGGTTG
CATAGACCTTCAGAAGATATGCAGGAACGTGACAATAAACGAAGAAGGAAGACTCGTCTT
GGGTTGCAGATAAAGAGATGAAGAGACTAAAGGGTTTTGGATTTGGTGTGTGTGTGTGTG
TAAGAATTTGAGAGTTGACACAAAAGAATGTATGAACAAATAAGCGTACGTTTAAGTGTT
GAAGGATATTAGGACTCAGAAGAGTGTTATGAGGTTTGTATAATCAAATTCCTGTAAAGT
TTGTAATCAGACAAAAGGGTTTTTCT
CTGCT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2CM43JQ 717 0 0
TCTGCTTTCACTCTCACAATGGCCTCTCCTGTCATTGCTGCTAACCAGAGACTTCCTCCG
CTTTCAACAGATCCAGCTCGGTGTGAACAAGCTTTTGTTGGTAACACGATAGGTCAAGCA
AACGGGGTCTATGACAAGCCACTCGATCTCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCAGTTT
AATCTCAAAGGCAAGACTCTTTTTGCTGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTCGATGGTGCT
GACATGTCTGAAGTCGTTATGTCTAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGAGTG
AATTTCTCGAATGCCGTTATCGATCGGGTGAACTTCGGGAAGTCGGATCTAAAAGGAGCT
GTGTTCAAGAACACGGTGTTGTCAGGTTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTG
GTCTTTGAGGACACCATCATTGGTTACATAGACCTTCAGAAGATATGCAGGAACGTGACA
ATAAACGAAGAAGGAAGACTCGTCTTGGGTTGCAGATAAAGAGATGAAGAGACTAAAGGG
TTTTGGATTTGGTGTGTGTGTGTGTGTAAGAATTTGAGAGTTGACACAAAAGAATGTATG
AACAAATAAGCGTACGTTTAAGTGTTGAAGGATATTAGGACTCAGAAGAGTGTTATGAGG
TTTGTATAATCAAATTCCTGTAAAGTTTGTAATCAGACAAAAGGGTTTTTTTCTG
TT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2BP16JQ 518 0 0
TTTT
TGCTGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTCGATGGTGCTGACATGTCTGAAGTCGTTATGTT
TAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGAGTGAATTTCTCGAATGCCGTTATCGA
TCGGGTGAACTTCGGGAAGTCGGATTTAAAAGGAGCTGTGTTCAAGAACACGGTGTTGTC
GGGTTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGTGGTCTTTGAGGACACCATCATTGG
TTACATAGACCTTCAGAAGATATGCAGGAACGTGACAATAAACGAAGAAGGAAGACTCGT
CTTGGGTTGCAGATAAAGAGATGAAGAGACTAAAGGGTTTTGGATTTGGTGTGTGTGTGT
GCGTAAGAATTTGAGAGTTGACACAAAAGAATGTATGAACAAATAAGCGTACGTTTAAGT
GTTGAAGGATATTAGGACTCAGAAGAGTGTTATGAGGTTTGTATAATCAAATTCCTGTAA
AGTTTGTAATCAGACAAAAGGGTTTTT
TTTTGTT

QA 5 511 5 511
DS 

RD RR2CF60JQ 669 0 0
GCTTTCAACAGATCCAGCTCGGTGTGAACAAGCTTTTGTTGGTAACACGATAGGTCAAGC
AAACGGGGTCTATGACAAGCCACTCGATCTCAGGTTCTGCGACTACACCAACGATCGGTC
TAATCTCAAAGGCAAGACTCTCTCTGCTGCCTTGATGTCAGGTGCCAAGTTCGATGGTGC
TGACATGTCTGAAGTCGTTATGTCTAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGAGT
GAATTTCTCGAATGCCGTTATCGATCGGGTGAACTTCGGGAAGTCGGATCTAAAAGGAGC
TGTGTTCAAGAACACGGTGTTGTCAGGTTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATGT
GGTCTTTGAGGACACCATCATTGGTTACATAGACCTTCAGAAGATATGCAGAAACGTGAC
AATAAACGAAGAAGGAAGACTCGTCTTGGGTTGCAGATAAAGAGATGAAGAGACTAAAGG
GTTTTGGATTTGGTGTGTGTGTGTG**TAAGAATTTGAGAGTTGACACAAAAGAATGTAT
GAACAAATAAGCGTACGTTTAAGTGTTGAAGGATATTAGGACTCAGAAGAGTGTTATGAG
GTTTGTATAATCAAATTCCTGTAAAGTTTGTAATCAGACAAAAGGGTTTTTCTCTGTTAT
TCGTTAATT

QA 1 669 1 669
DS 



CO CL106Contig4 598 2 2 U
CTCATATCATGGCTTCGCTTCCTGTCCACTTCTCCAGGAATCATCTCTCTTCGCCCAATT
TCTCCGACAGATTCCGCCGTTCCGCGGAGCGGAGATCTTTCGTAGCTCTTGTACACTGCT
CTGCTAGAGAAAATGATCGAGGAATCAAGAAGACTTTGTTTCCTGTGAAGGAGCTTGGAT
GTTTAGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAATGGCCTCTCCTGTCATTGCTG
CTGACGTGTCTGAAGTCGTTATGTCTAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGAG
TGAATTTCTCGAATGCCGTTATCGATCGGGTGAACTTCGGGAAGTCGGATCTAAAAGGGG
CTGTGTTCAAGAACACGGTGTTGTCAGGTTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATG
TGGTCTTTGAGGACACCATCATTGGTTACATAGACCTTCAGAAGATATGCAGGAACGTGA
CAATAAACGAAGAAGGAAGACTCGTCTTGGGTTGCAGATAAAGAGATGAAGAGACTAAAG
GGTTTTGGATTTGGTGTGTGTGTGTAAGAATTTGAGAGTTGACACAAAAGAATGTGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW24TF U 1
AF RR2GW24JQ C 1
BS 1 536 RR2GW24TF
BS 537 598 RR2GW24JQ

RD RR2GW24TF 536 0 0
CTCATATCATGGCTTCGCTTCCTGTCCACTTCTCCAGGAATCATCTCTCTTCGCCCAATT
TCTCCGACAGATTCCGCCGTTCCGCGGAGCGGAGATCTTTCGTAGCTCTTGTACACTGCT
CTGCTAGAGAAAATGATCGAGGAATCAAGAAGACTTTGTTTCCTGTGAAGGAGCTTGGAT
GTTTAGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAATGGCCTCTCCTGTCATTGCTG
CTGACGTGTCTGAAGTCGTTATGTCTAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGAG
TGAATTTCTCGAATGCCGTTATCGATCGGGTGAACTTCGGGAAGTCGGATCTAAAAGGGG
CTGTGTTCAAGAACACGGTGTTGTCAGGTTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATG
TGGTCTTTGAGGACACCATCATTGGTTACATAGACCTTCAGAAGATATGCAGGAACGTGA
CAATAAACGAAGAAGGAAGACTCGTCTTGGGTTGCAGATAAAGAGATGAAGAGACT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2GW24JQ 598 0 0
CTCATATCATGGCTTCGCTTCCTGTCCACTTCTCCAGGAATCATCTCTCTTCGCCCAATT
TCTCCGACAGATTCCGCCGTTCCGCGGAGCGGAGATCTTTCGTAGCTCTTGTACACTGCT
CTGCTAGAGAAAATGATCGAGGAATCAAGAAGACTTTGTTTCCTGTGAAGGAGCTTGGAT
GTTTAGCTTGCGCCGCTCTTTCTGCTTTCACTCTCACAATGGCCTCTCCTGTCATTGCTG
CTGACGTGTCTGAAGTCGTTATGTCTAAAGCTTACGCCGTTGGAGCTAGCTTCAAGGGAG
TGAATTTCTCGAATGCCGTTATCGATCGGGTGAACTTCGGGAAGTCGGATCTAAAAGGGG
CTGTGTTCAAGAACACGGTGTTGTCAGGTTCCACATTCGAGGAGGCAAACCTGGAGGATG
TGGTCTTTGAGGACACCATCATTGGTTACATAGACCTTCAGAAGATATGCAGGAACGTGA
CAATAAACGAAGAAGGAAGACTCGTCTTGGGTTGCAGATAAAGAGATGAAGAGACTAAAG
GGTTTTGGATTTGGTGTGTGTGTGTAAGAATTTGAGAGTTGACACAAAAGAATGTGTG

QA 1 598 1 598
DS 



AS 3 20

CO CL107Contig1 826 2 3 U
CATATAAACAAGATCTTATTAGCATTAGGAAAACCATTGCAGTAGAGGCATTTTCACTAC
CAAAATCCAACGAGATAATGAAGATTCAACTGTCACTTGCAAGTTTTTTTTGGTTCAAAC
CCGTCACTTGCAAGTTACAACTACCACACAAAGGAAACTTGCAAAACACAGCCCAAAATG
GAACGTTAACAACGTGACAACTTATTGCATAGGTAGAAGACAGTTATGTACACAAGCAAA
ACAAACACGTGAACTCGTGAAGGTAGATCTAGACACTATATTTACATCACCCACTTGTGT
CACTCCCTCTGACTCGCTTTTAACGGTGCTGACTCCTTGACTCGCCGCTGTACAACCATA
TATGCACAATAAAGGAAGGTGGTTGATATGGTAAAACAAAGTAATGTTTTATTGTTTTTC
ATTTAATCCACGCGCCCACTAAACACAGAGCCACGTGTTCCTTCCTTTGAGCTTCGTTAT
CATCCCAGTCGTAAACGGATGGAGAATTTGGGTGGGTTGGTTTATCAAAGATGTTGGAGC
CGATGGCTCTTGTGGCGAGGTTGCTTCCAGGATTAAAGACGCTCCTCCACACGTTATCCT
TGTGTGGCGTTGTCGGAGTGGTCGGAGTAGTTGGAGTACCGGGGCTCACTACCGTCGGCA
TAGTCAACGACCTAAGCATCATCTTGTTGCTTCCTTCTCCTCTGATATTAATGGGTTGGG
TAGTGATCTTCCGGAGGCGGGCAAGGCCACGGTCAGGTTGAGGTCCGGCCACAACATCAT
CCCAGAGCTTGTCTAGCAGAACCATCTTATTTTTGTCTGATTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC62JQ U 43
AF RR2A350TF C 1
BS 1 42 RR2A350TF
BS 43 538 RR2GC62JQ
BS 539 826 RR2A350TF

RD RR2GC62JQ 496 0 0
TAGAGGCATTTTCACTACCAAAATCCAACGAGATAATGAAGATTCAACTGTCACTTGCAA
GTTTTTTTTGGTTCAAACCCGTCACTTGCAAGTTACAACTACCACACAAAGGAAACTTGC
AAAACACAGCCCAAAATGGAACGTTAACAACGTGACAACTTATTGCATAGGTAGAAGACA
GTTATGTACACAAGCAAAACAAACACGTGAACTCGTGAAGGTAGATCTAGACACTATATT
TACATCACCCACTTGTGTCACTCCCTCTGACTCGCTTTTAACGGTGCTGACTCCTTGACT
CGCCGCTGTACAACCATATATGCACAATAAAGGAAGGTGGTTGATATGGTAAAACAAAGT
AATGTTTTATTGTTTTTCATTTAATCCACGCGCCCACTAAACACAGAGCCACGTGTTCCT
TCCTTTGAGCTTCGTTATCATCCCAGTCGTAAACGGATGGAGAATTTGGGTGGGTTGGTT
TATCAAAGATGTTGGA

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2A350TF 826 0 0
CATATAAACAAGATCTTATTAGCATTAGGAAAACCATTGCAGTAGAGGCATTTTCACTAC
CAAAATCCAACGAGATAGTGAAGATTCAACTGTCACTTGCAAGTTTTTTTTGGTTCAAAC
CCGTCACTTGCAAGTTACAACTACCACACAAAGGAAACTTGCAAAACACAGCCCAAAATG
GAACGTTAACAACGTGACAACTTATTGCATAGGTGGAAGACAGTTATGTACACAAGCAAA
ACAGACACGTGAACTCGTGAAGGTAGATCTAGACACTATATTTACATCACCCACTTGTGT
CACTCCCTCTGACTCGCTTTTAACGGTGCTGACTCCTTGACTCGCCGCTGTACAACCATA
TATGCACAATAAAGGAAGGTGGTTGATATGGTAAAACAGAGTAATGTTTTATTGTTTTTC
ATTTAATCCACGCGCCCACTAAACACAGAGCCACGTGTTCCTTCCTTTGAGCTTCGTTAT
CATCGCAGTCGTAGACGGATGGAGAATTTGGGTGGGTTGGTTTATCAAAGATGTTGGAGC
CGATGGCTCTTGTGGCGAGGTTGCTTCCAGGATTAAAGACGCTCCTCCACACGTTATCCT
TGTGTGGCGTTGTCGGAGTGGTCGGAGTAGTTGGAGTACCGGGGCTCACTACCGTCGGCA
TAGTCAACGACCTAAGCATCATCTTGTTGCTTCCTTCTCCTCTGATATTAATGGGTTGGG
TAGTGATCTTCCGGAGGCGGGCAAGGCCACGGTCAGGTTGAGGTCCGGCCACAACATCAT
CCCAGAGCTTGTCTAGCAGAACCATCTTATTTTTGTCTGATTTCCC

QA 1 826 1 826
DS 



CO CL107Contig2 765 8 15 U
GGACTCCACCCTCGCTACAAAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACA
AAAATAAGATGGTTCTGCTAGACAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCTG
ACCGTGGCCTTGCCCGCCTCCGGAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAG
GAAGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTC
CAACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTA
ATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCC
ACCCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCAGCACC
GTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATGTAAATATAGTGTCTAGATCT
ACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAA
TAAGTTGTCACGTTGTTAACGTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTCCTTTGTGTG
GTAGTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAACTTGCAAGTGACAGTTGAA
TCTTCACTATCTCGTTGGATTTTGGTAGTGAAAATGCCTCTACTGTAATGGTTTTCCTAA
TGCTAATAAGATCTTGTTTATATAAAATGTTGGTGGTTCTATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC62TF U 1
AF RR2AY75JQ C 1
AF RR2AY75TFB U 286
AF RR2FY25TF U 6
AF RR2BR20TF U 7
AF RR2BR20JQ C 7
AF RR2FY25JQ C 141
AF RR2FG25TF U 53
BS 1 7 RR2AY75JQ
BS 8 172 RR2GC62TF
BS 173 174 RR2FY25TF
BS 175 207 RR2GC62TF
BS 208 208 RR2FY25TF
BS 209 298 RR2GC62TF
BS 299 299 RR2AY75TFB
BS 300 311 RR2GC62TF
BS 312 493 RR2AY75TFB
BS 494 495 RR2FY25TF
BS 496 640 RR2AY75TFB
BS 641 641 RR2FY25TF
BS 642 745 RR2AY75TFB
BS 746 747 RR2FY25TF
BS 748 765 RR2AY75JQ

RD RR2GC62TF 311 0 0
GGACTCC
ACCCTCGCTACAAAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACAAAAATAA
GATGGTTCTGCTAGACAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCTGACCGTGG
CCTTGCCCGCCTCCGGAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAG**GAGAAGGAAGCAA
CAAGATGATGCTTAGGTCGT*GACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAACTAC
TCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTT*AATCCTGG
AAGC

QA 8 311 8 311
DS 

RD RR2AY75JQ 765 0 0
GGACTCCACCCTCGCTACAAAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACA
AAAATAAGATGGTTCTGCTAGACAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCTG
ACCGTGGCCTTGCCCGCCTCCGGAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAG
GAAGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTC
CAACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTA
ATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCC
ACCCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCAGCACC
GTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATGTAAATATAGTGTCTAGATCT
ACCTTCACGAGTTT*CGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAA
TAAGTTGTCACGTTGTTAACGTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTCCTTTGTGTG
GTAGTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAA*CTTGCAAGTGACAGTTGAA
TCTTCACTATCTCGTTGGATTTTGGTAGTGAAAATGCCTCTACTGTAATGGTTTTCCTAA
TGCTAATAAGATCTTGTTTATATAAAATGTTGGTGGTTCTATGCT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2AY75TFB 460 0 0
GGAGGAGCGTCTTTAATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCT
TTGATAAACCAACCCACCCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGT
CAAGGAGTCAGCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATGTAAAT
ATAGTGTCTAGATCTACCTTCACGAGTTT*CGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGT
CTTCCACCTATGCAATAAGTTGTCACGTTGTTAACGTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCA
AGTTTCCTTTGTGTGGTAGTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAA*CTTG
CAAGTGACAGTTGAATCTTCACTATCTCGTTGGATTTTGGTAGTGAAAATGCCTCTACTG
TAATGGTTTTCCTAATGCTAATAAGATCTTGTTTATATAA

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2FY25TF 747 0 0
GG
ACCCTCGCTACAAAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACAAAAATAA
GATGGTTCTGCTAGACAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCTGACCGTGG
CCTTGCCCGCCTCCGGAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAAGCAA
CAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAACTAC
TCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAATCCTGG
AAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCCACCCAAA
TTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCAGCACCGTTAAAA
GCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATGTAAATATAGTGTCTAGATCTACCTTCA
CGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTTG
TCACGTTGTTAACGTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTCCTTTGTGTGGTAGTTG
TAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAACTTGCAAGCGACAGTTGAATCTTCAC
TATCTCGTTGGATTTTGGTAGTGAAA*TGCCTCTACTGTAATGGTTTTCCTAATGCTAAT
AAGATCTTGTTTATATAAAA
AAAAA

QA 3 742 3 742
DS 

RD RR2BR20TF 732 0 0
G
ACCCTCGCTACAAAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACAAAAATAA
GATGGTTCTGCTAGACAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCTGACCGTGG
CCTTGCCCGCCTCCGGAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAAGCAA
CAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAACTAC
TCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAATCCTGG
AAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCCACCCAAA
TTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCAGCACCGTTAAAA
GCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATGTAAATATAGTGTCTAGATCTACCTTCA
CGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTTG
TCACGTTGTTAACGTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTCCTTTGTGTGGTAGTTG
TAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAA*CTTGCAAGTGACAGTTGAATCTTCAC
TATCTCGTTGGATTTTGGTAGTGAAA*TGCCTCTACTGTAATGGTTTTCCTA*TGCTAAT
AAGATCTTGTT

QA 2 732 2 732
DS 

RD RR2BR20JQ 737 0 0
G
ACCCTCGCTACAAAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACAAAAATAA
GATGGTTCTGCTAGACAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCTGACCGTGG
CCTTGCCCGCCTCCGGAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAAGCAA
CAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAACTAC
TCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAATCCTGG
AAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCCACCCAAA
TTCTCCATCCGTTTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCAGCACCGTTAAAA
GCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATGTAAATATAGTGTCTAGATCTACCTTCA
CGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTTG
TCACGTTGTTAACGTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTCCTTTGTGTGGTAGTTG
TAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAACTTGCAAGTGACAGTTGAATCTTCAC
TATCTCGTTGGATTTTGGTAGTGAAAATGCCTCTACTGTAATGGTTTTCCTAATGCTAAT
AAGATCTTGTTTATAT

QA 2 737 2 737
DS 

RD RR2FY25JQ 603 0 0
CGGAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAAGCAACAAGATGATGCTT
AGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAACTACTCCGACCACTCCG
ACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAATCCTGGAAGCAACCTCGCC
ACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCCACCCAAATTCTCCATCCGTC
TACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCAGCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGG
AGTGACACAAGTGGGTGATGTAAATATAGTGTCTAGATCTACCTTCACGAGTTCACGTGT
CTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTTGTCACGTTGTTAAC
GTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTCCTTTGTGTGGTAGTTGTAACTTGCAAGTG
ACGGGTTTGAACCAAAAAAAACTTGCAAGCGACAGTTGAATCTTCACTATCTCGTTGGAT
TTTGGTAGTGAAAATGCCTCTACTGTAATGGTTTTCCTAATGCTAATAAGATCTTGTTTA
TAT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2FG25TF 692 0 0
GGG
AAACAAAAATAAGATGGTTCTGCTAGACAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCA
ACCTGACCGTGGCCTTGCCCGCCTCCGGAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGG
AGAAGGAAGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGG
TACTCCAACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGT
CTTTAATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGGGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACC
AACCCACCCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGGCGAGTCAAGGAGTCA
GCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATGTAAATATAGTGTCTA
GATCTACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTA
TGCAATAAGTTGTCACGTTGTTAACGTTCCATTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTCCTTT
GTGTGGTAGTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAACTTGCAAGTGACAG
TTGAATCTTCACTATCTCGTTGGATTTTGGTAGTGAAAATGCCTCTACTGTAATGGTTTT
CCTAATGCTAATAAGATCTTGTTTATA
CA

QA 4 690 4 690
DS 



CO CL107Contig3 782 10 7 U
ACCATAGAACCACCAACATTTTATATAAACAAGCTCTTATTAGCATTAAGAAAACCATTA
CAGTAGAGGCATTTTCACTACCAAAATCCAACGAGATAGTGAATATTCAACCGTCACTTG
CAAGTTTTTTTTT*GGTTCAAACCCGTCACTTGCAAGTTACAACTAACAAAAGCAAACAC
ACAAAGGAAACTTGCAAAACACAGCCCAAAATGGAACGTTAACAACGTGACAACTTATTG
CATAGGTGGAAGACAGTTATGTACACAAGCAAACAGACACGTGAACTCGTGAAGGTAGAT
CTAGACACCACCATATTTACATCACCCACTTGTGTCACTCCCTCTGACTCGCTTTTAACG
GTGCTGACTCCTTGACTCGCCGCTGTACAACCAGTCGTAGACGGATGGAGAATTTGGGTG
GGTTGGTTTATCAAAGATGTTGGAGCCGATGGCTCTTGTGGCGAGGTTGCTTCCAGGATT
AAAGACGCTCCTCCACACGTTATCCTTGTGTGGCGTTGTCGGAGTGGTCGGAGTAGTTGG
AGTACCGGGGCTCACTACCGTCGGCATAGTCAACGACCTAAGCATCATCTTGTTGCTTCC
TTCTCCTCTGATATTAATGGGTTGAGTAGTGATCTTCCGGAGGCGGGCAAGGCCACGGTC
AGGTTGAGGTCCGGCCACAACATCATCCCAGAGCTTGTCTAGCAGAACCATCTTATTTTT
GTTTGATTTCGCTTTTTCTTTTGTTGCTTGAGTGACTTTTTGTAGAGAGGGATGTGGAGT
CC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 40 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2F942JQ U 23
AF RR2AE14JQ U 23
AF RR2AE14TF C 23
AF RR2AE38JQ U 23
AF RR2BR08JQ U 1
AF RR2CF94JQ U 1
AF RR2CF94TF C 45
AF RR2BR08TF C 24
AF RR2F942TF C 32
AF RR2AE38TF C 24
BS 1 133 RR2BR08JQ
BS 134 134 RR2F942JQ
BS 135 399 RR2BR08JQ
BS 400 400 RR2CF94JQ
BS 401 730 RR2BR08JQ
BS 731 775 RR2CF94JQ
BS 776 782 RR2AE38TF

RD RR2F942JQ 508 0 0
ATATAAACAAGCTCTTATTAGCATTAAGAAAACCATTACAGTAGAGGCATTTTCACTACC
AAAATCCAACGAGATAGTGAATATTCAACCGTCACTTGCAAGTTTTTTTTT*GGTTCAAA
CCCGTCACTTGCAAGTTACAACTAACAAAAGCAAACACACAAAGGAAACTTGCAAAACAC
AGCCCAAAATGGAACGTTAACAACGTGACAACTTATTGCATAGGTGGAAAACAGTTATGT
ACACAAGCAAACAGACACGTGAACTCGTGAAGGTAGATCTAGACACCACCATATTTACAT
CACCCACTTGTGTCACTCCCTCTGACTCGCTTTTAACGGTGCTGACTCCTTGACTCGCCG
CTGTACAACCAGTCGTAAACGGATGGAGAATTTGGGTGGGTTGGTTTATCAAAGATGTTG
GAGCCGATGGCTCTTGTGGCGAGGTTGCTTCCAGGATTAAAGACGCTCCTCCACACGTTA
TCCTTGTGTGGCGTTGTCGGAGTGGTCG

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2AE14JQ 691 0 0
ATATAAACAAGCTCTTATTAGCATTAAGAAAACCATTACAGTAGAGGCATTTTCACTACC
AAAATCCAACGAGATAGTGAATATTCAACCGTCACTTGCAAGTTTTTTTTTTGGTTCAAA
CCCGTCACTTGCAAGTTACAACTAACAAAAGCAAACACACAAAGGAAACTTGCAAAACAC
AGCCCAAAATGGAACGTTAACAACGTGACAACTTATTGCATAGGTGGAAGACAGTTATGT
ACACAAGCAAACAGACACGTGAACTCGTGAAGGTAGATCTAGACACCACCATATTTACAT
CACCCACTTGTGTCACTCCCTCTGACTCGCTTTTAACGGTGCTGACTCCTTGACTCGCCG
CTGTACAACCAGTCGTAAACGGATGGAGAATTTGGGTGGGTTGGTTTATCAAAGATGTTG
GAGCCGATGGCTCTTGTGGCGAGGTTGCTTCCAGGATTAAAGACGCTCCTCCACACGTTA
TCCTTGTGTGGCGTTGTCGGAGTGGTCGGAGTAGTTGGAGTACCGGGGCTCACTACCGTC
GGCATAGTCAACGACCTAAGCATCATCTTGTTGCTTCCTTCTCC*CTGATATTAATGGGT
TGAGTAGTGATCTTCCGGAGGCGGGCAAGGCCACGGTCAGGTTGAGGTCCGGCCACAACA
TCATCCCAGAGCTTGTCTAGCAGAACCATC
C

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2AE14TF 691 0 0
ATATAAACAAGCTCTTATTAGCATTAAGAAAACCATTACAGTAGAGGCATTTTCACTACC
AAAATCCAACGAGATAGTGAATATTCAACCGTCACTTGCAAGTTTTTTTTTTGGTTCAAA
CCCGTCACTTGCAAGTTACAACTAACAAAAGCAAACACACAAAGGAAACTTGCAAAACAC
AGCCCAAAATGGAACGTTAACAACGTGACAACTTATTGCATAGGTGGAAGACAGTTATGT
ACACAAGCAAACAGACACGTGAACTCGTGAAGGTAGATCTAGACACCACCATATTTACAT
CACCCACTTGTGTCACTCCCTCTGACTCGCTTTTAACGGTGCTGACTCCTTGACTCGCCG
CTGTACAACCAGTCGTAGACGGATGGAGAATTTGGGTGGGTTGGTTTATCAAAGATGTTG
GAGCCGATGGCTCTTGTGGCGAGGTTGCTTCCAGGATTAAAGACGCTCCTCCACACGTTA
TCCTTGTGTGGCGTTGTCGGAGTGGTCGGAGTAGTTGGAGTACCGGGGCTCACTACCGTC
GGCATAGTCAACGACCTAAGCATCATCTTGTTGCTTCCTTCTCC*CTGATATTAATGGGT
TGAGTAGTGATCTTCCGGAGGCGGGCAAGGCCACGGTCAGGTTGAGGTCCGGCCACAACA
TCATCCCAGAGCTTGTCTAGCAGAACCATC
C

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2AE38JQ 680 0 0
ATATAAACAAGCTCTTATTAGCATTAAAAAAACCATTACAGTAAAGGCATTTTCACTACC
AAAATCCAACGAGATAGTGAATATTCAACCGTCACTTGCAAGTTTTTTTT**GGTTCAAA
CCCGTCACTTGCAAGTTACAACTAACAAAAGCAAACACACAAAGGAAACTTGCAAAACAC
AGCCCAAAATGGAACGTTAACAACGTGACAACTTATTGCATAGGTGGAAAACAGTTATGT
ACACAAGCAAACAGACACGTGAACTCGTGAAGGTAGATCTAGACACCACCATATTTACAT
CACCCACTTGTGTCACTCCCTCTGACTCGCTTTTAACGGTGCTGACTCCTTGACTCGCCG
CTGTACAACCAGTCGTAAACGGATGGAGAATTTGGGTGGGTTGGTTTATCAAAGATGTTG
GAGCCGATGGCTCTTGTGGCGAGGTTGCTTCCAGGATTAAAGACCCTCCTCCACACGTTA
TCCTTGTGTGGCGTTGTCGGAGTGGTCGGAGTAGTTGGAGTACCGGGGCTCACTACCGTC
GGCATAGTCAACGACCTAAGCATCATCTTGTTGCTTCCTTCTCCTCTGATATTAATGGGT
TGAGTAGTGATCTTCCGGAGGCGGGCAAGGCCACGGTCAGGTTGAGGTCCGGCCACAACA
TCATCCCAGAGCTTGTCTAG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2BR08JQ 732 0 0
ACCATAGAACCACCAACATTTTATATAAACAAGCTCTTATTAGCATTAAGAAAACCATTA
CAGTAGAGGCATTTTCACTACCAAAATCCAACGAGATAGTGAATATTCAACCGTCACTTG
CAAGTTTTTTTTTTGGTTCAAACCCGTCACTTGCAAGTTACAACTAACAAAAGCAAACAC
ACAAAGGAAACTTGCAAAACACAGCCCAAAATGGAACGTTAACAACGTGACAACTTATTG
CATAGGTGGAAGACAGTTATGTACACAAGCAAACAGACACGTGAACTCGTGAAGGTAGAT
CTAGACACCACCATATTTACATCACCCACTTGTGTCACTCCCTCTGACTCGCTTTTAACG
GTGCTGACTCCTTGACTCGCCGCTGTACAACCAGTCGTAAACGGATGGAGAATTTGGGTG
GGTTGGTTTATCAAAGATGTTGGAGCCGATGGCTCTTGTGGCGAGGTTGCTTCCAGGATT
AAAGACGCTCCTCCACACGTTATCCTTGTGTGGCGTTGTCGGAGTGGTCGGAGTAGTTGG
AGTACCGGGGCTCACTACCGTCGGCATAGTCAACGACCTAAGCATCATCTTGTTGCTTCC
TTCTCCTCTGATATTAATGGGTTGAGTAGTGATCTTCCGGAGGCGGGCAAGGCCACGGTC
AGGTTGAGGTCCGGCCACAACATCATCCCAGAGCTTGTCTAGCAGAACCATCTTATTTTT
GTTTGATTTC
CC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2CF94JQ 777 0 0
CC
CATAGAACCACCAACATTTTATATAAACAAGCTCTTATTAGCATTAAGAAAACCATTACA
GTAGAGGCATTTTCACTACCAAAATCCAACGAGATAGTGAATATTCAACCGTCACTTGCA
AGTTTTTTTTTTGGTTCAAACCCGTCACTTGCAAGTTACAACTAACAAAAGCAAACACAC
AAAGGAAACTTGCAAAACACAGCCCAAAATGGAACGTTAACAACGTGACAACTTATTGCA
TAGGTGGAAGACAGTTATGTACACAAGCAAACAGACACGTGAACTCGTGAAGGTAGATCT
AGACACCACCATATTTACATCACCCACTTGTGTCACTCCCTCTGACTCGCTTTTAACGGT
GCTGACTCCTTGACTCGCCGCTGTACAACCAGTCGTAGACGGATGGAGAATTTGGGTGGG
TTGGTTTATCAAAGATGTTGGAGCCGATGGCTCTTGTGGCGAGGTTGCTTCCAGGATTAA
AGACGCTCCTCCACACGTTATCCTTGTGTGGCGTTGTCGGAGTGGTCGGAGTAGTTGGAG
TACCGGGGCTCACTACCGTCGGCATAGTCAACGACCTAAGCATCATCTTGTTGCTTCCTT
CTCCTCTGATATTAATGGGTTGAGTAGTGATCTTCCGGAGGCGGGCAAGGCCACGGTCGG
GTTGAGGTCCGGCCACAACATCATCCCAGAGCTTGTCTAGCAGAACCATCTTATTTTTGT
TTGATTTCGCTTTTTCTTTTGTTGCTTGAGTGACTTTTTGTAGAGAGGGATGT
CC

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR2CF94TF 733 0 0
ATTAAGAAAACCATTACAGTAGAG*CATTT*CACTACCAAAATCCAACGAGATAGTGAAT
ATTCAACCGTCACTTGCAAGTTTTTTTTT*GGTTCAAACCCGTCACTTGCAAGTTACAAC
TAACAAAAGCAAACACACAAAGGAAACTTGCAAAACACAGCCCAAAATGGAACGTTAACA
ACGTGACAACTTATTGCATAGGTGGAAGACAGTTATGTACACAAGCAAACAGACACGTGA
ACTCGTGAAGGTAGATCTAGACACCACCATATTTACATCACCCACTTGTGTCACTCCCTC
TGACTCGCTTTTAACGGTGCTGACTCCTTGACTCGCCGCTGTACAACCAGTCGTAGACGG
ATGGAGAATTTGGGTGGGTTGGTTTATCAAAGATGTTGGAGCCGATGGCTCTTGTGGCGA
GGTTGCTTCCAGGATTAAAGACCCTCCTCCACACGTTATCCTTGTGTGGCGTTGTCGGAG
TGGTCGGAGTAGTTGGAGTACCGGGGCTCACTACCGTCGGCATAGTCAACGACCTAAGCA
TCATCTTGTTGCTTCCTTCTCCTCTGATATTAATGGGTTGAGTAGTGATCTTCCGGAGGC
GGGCAAGGCCACGGTCGGGTTGAGGTCCGGCCACAACATCATCCCAGAGCTTGTCTAGCA
GAACCATCTTATTTTTGTTTGATTTCGCTTTTTCTTTTGTTGCTTGAGTGACTTTTTGTA
GAGAGGGATGT
CC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2BR08TF 709 0 0
TATAAACAAGCTCTTATTAGCATTAAGAAAACCATTACAGTAGAGGCATTTTCACTACCA
AAATCCAACGAGATAGTGAATATTCAACCGTCACTTGCAAGTTTTTTTTT*GGTTCAAAC
CCGTCACTTGCAAGTTACAACTAACAAAAGCAAACACACAAAGGAAACTTGCAAAACACA
GCCCAAAATGGAACGTTAACAACGTGACAACTTATTGCATAGGTGGAAGACAGTTATGTA
CACAAGCAAACAGACACGTGAACTCGTGAAGGTAGATCTAGACACCACCATATTTACATC
ACCCACTTGTGTCACTCCCTCTGACTCGCTTTTAACGGTGCTGACTCCTTGACTCGCCGC
TGTACAACCAGTCGTAGACGGATGGAGAATTTGGGTGGGTTGGTTTATCAAAGATGTTGG
AGCCGATGGCTCTTGTGGCGAGGTTGCTTCCAGGATTAAAGACGCTCCTCCACACGTTAT
CCTTGTGTGGCGTTGTCGGAGTGGTCGGAGTAGTTGGAGTACCGGGGCTCACTACCGTCG
GCATAGTCAACGACCTAAGCATCATCTTGTTGCTTCCTTCTCCTCTGATATTAATGGGTT
GAGTAGTGATCTTCCGGAGGCGGGCAAGGCCACGGTCAGGTTGAGGTCCGGCCACAACAT
CATCCCAGAGCTTGTCTAGCAGAACCATCTTATTTTTGTTTGATTTC
CC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2F942TF 751 0 0
AGCTCTTATTAGCAT*AAGAAAACCATTACAGTAGAGGCATTT*CACTACCAAAATCCAA
CGAGATAGTGA*TATTCAACCGTCACTTGCAAGTTTTTTTT**GGTTCAAACCCGTCACT
TGCAAGTTACAACTAACAAAAGCAAACACACAAAGGAAACTTGCAAAACACAGCCCAAAA
TGGAACGTTAACAACGTGACAACTTATTGCATAGGTGGAAGACAGTTATGTACACAAGCA
AACAGACACGTGAACTCGTGAAGGTAGATCTAGACACCACCATATTTACATCACCCACTT
GTGTCACTCCCTCTGACTCGCTTTTAACGGTGCTGACTCCTTGACTCGCCGCTGTACAAC
CAGTCGTAGACGGATGGAGAATTTGGGTGGGTTGGTTTATCAAAGATGTTGGAGCCGATG
GCTCTTGTGGCGAGGTTGCTTCCAGGATTAAAGACGCTCCTCCACACGTTATCCTTGTGT
GGCGTTGTCGGAGTGGTCGGAGTAGTTGGAGTACCGGGGTTCACTACCGTCGGCATAGTC
AACGACCTAAGCATCATCTTGTTGCTTCCTTCTCCTCTGATATTAATGGGTTGAGTAGTG
ATCTTCCGGAGGCGGGCAAGGCCACGGTCAGGTTGAGGTCCGGCCACAACATCATCCCAG
AGCTTGTCTAGCAGAACCATCTTATTTTTGTTTGATTTCGCTTTTTCTTTTGTTGCTTGA
GTGACTTTTTGTAGAGAGGGATGT
GGAGTCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2AE38TF 759 0 0
TATAAACAAGCTCTTATTAGCATTAAGAAAACCATTACAGTAGAGGCATTTTCACTACCA
AAATCCAACGAGATAGTGAATATTCAACCGTCACTTGCAAGTTTTTTTT**GGTTCAAAC
CCGTCACTTGCAAGTTACAACTAACAAAAGCAAACACACAAAGGAAACTTGCAAAACACA
GCCCAAAATGGAACGTTAACAACGTGACAACTTATTGCATAGGTGGAAGACAGTTATGTA
CACAAGCAAACAGACACGTGAACTCGTGAAGGTAGATCTAGACACCACCATATTTACATC
ACCCACTTGTGTCACTCCCTCTGACTCGCTTTTAACGGTGCTGACTCCTTGACTCGCCGC
TGTACAACCAGTCGTAGACGGATGGAGAATTTGGGTGGGTTGGTTTATCAAAGATGTTGG
AGCCGATGGCTCTTGTGGCGAGGTTGCTTCCAGGATTAAAGACGCTCCTCCACACGTTAT
CCTTGTGTGGCGTTGTCGGAGTGGTCGGAGTAGTTGGAGTACCGGGGCTCACTACCGTCG
GCATAGTCAACGACCTAAGCATCATCTTGTTGCTTCCTTCTCCTCTGATATTAATGGGTT
GAGTAGTGATCTTCCGGAGGCGGGCAAGGCCACGGTCAGGTTGAGGTCCGGCCACAACAT
CATCCCAGAGCTTGTCTAGCAGAACCATCTTATTTTTGTTTGATTTCGCTTTTTCTTTTG
TTGCTTGAGTGACTTTTTGTAGAGAGGGATGTGGAGTCC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 3 18

CO CL108Contig1 960 4 3 U
GTATCCAAAGTATTATTAACCGAATAGAACCGAACATATATTATGAAACTCAACCTGAAA
ACCTGGTCATAACCGGGACACCCTGGCCTAGTTTTCAGTCTTCAGAAAAACGAACAAACT
TCACCGGAAATCAAACTCAGGTTGATACAAGTAAACAATTCAATTACACAGCACAAAGCT
GGAATACAAAAGAGGAGTTTTCAAACGCATAAGATGTCATATTTTATTCTAACAGAAGCA
ACCGAAAAACGTTTTCTCGGGGAATAACTTGAAGCAAAAAGACTGTTGTTAGAATGTTTT
CTAACGGTAGAGACTCTCTGATTTAAGATTCTCAGCAATCTCAGTCTCCCATCGATCTCC
ATTCTCAAGAAGCTTTTCTTTGTCATATAGAAGTTCCTCGTGTGTCTCGGTTGCGAATTC
AAAGTTCGGTCCTTCCACAATTGCATCAACGGGGCAAGCTTCTTGGCAGAAACCACAGTA
AATGCATTTTGTCATGTCGATGTCATACCTAGTGGTTCTCCGGCTTCCATCTTCCCGCTC
TTCTGCTTCTATTGTGATTGCTTGAGCTGGACACACAGCTTCACAGAGTTTGCAGGCAAT
GCAGCGCTCTTCCCCAGTGGGATAACGACGAAGAGCATGTTCACCACGGAAACGAGGGCT
CAGTGGACCCTTCTCAAATGGATAATTGATAGTAACTTTGCGATCAAAGAAGTACTTGAG
AGTCAACGACAAACCACGCACCATTTCAGTGAGAAATAGTGTGTTTATACTCCGTTCAAA
CACAGTATTCCAGTCCTTGGAGATCTCCTTAGCAAGTTGCTCCTCTTCTTCATCATCTTT
CTTGGAGCCGTAAGAAATAGCACGGGACTGCAGTCCAGAAAGATGAGATCCCTGCAAAGC
TTGCCCTGACAAAACGAGATGGCGAGCACGGAGTGTATTCAGTGACCTGCGAGCCAGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA40TF C 15
AF RR2DH08JQ U 1
AF RR2DH08TF C 132
AF RR2B591JQ U 108
BS 1 700 RR2DH08JQ
BS 701 701 RR2DH08TF
BS 702 960 RR2B591JQ

RD RR2BA40TF 539 0 0
ATTAACCGAATAGAACCGAACATATATTATGAAACTCAACCTGAAAACCTGGTCATAACC
GGGACACCCTGGCCTAGTTTTCAGTCTTCAGAAAAACGAACAAACTTCACCGGAAATCAA
ACTCAGGTTGATACAAGTAAACAATTCAATTACACAGCACAAAGCTGGAATACAAAAGAG
GAGTTTTCAAACGCATAAGATGTCATATTTTATTCTAACAGAAGCAACCGAAAAACGTTT
TCTCGGGGAATAACTTGAAGCAAAAAGACTGTTGTTAGAATGTTTTCTAACGGTAGAGAC
TCTCTGATTTAAGATTCTCAGCAATCTCAGTCTCCCATCGATCTCCATTCTCAAGAAGCT
TTTCTTTGTCATATAGAAGTTCCTCGTGTGTCTCGGTTGCGAATTCAAAGTTCGGTCCTT
CCACAATTGCATCAACGGGGCAAGCTTCTTGGCAGAAACCACAGTAAATGCATTTTGTCA
TGTCGATGTCATACCTAGTGGTTCTCCGGCTTCCATCTTCCCGCTCTTCTGCTTCTATT

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2DH08JQ 703 0 0
GTATCCAAAGTATTATTAACCGAATAGAACCGAACATATATTATGAAACTCAACCTGAAA
ACCTGGTCATAACCGGGACACCCTGGCCTAGTTTTCAGTCTTCAGAAAAACGAACAAACT
TCACCGGAAATCAAACTCAGGTTGATACAAGTAAACAATTCAATTACACAGCACAAAGCT
GGAATACAAAAGAGGAGTTTTCAAACGCATAAGATGTCATATTTTATTCTAACAGAAGCA
ACCGAAAAACGTTTTCTCGGGGAATAACTTGAAGCAAAAAGACTGTTGTTAGAATGTTTT
CTAACGGTAGAGACTCTCTGATTTAAGATTCTCAGCAATCTCAGTCTCCCATCGATCTCC
ATTCTCAAGAAGCTTTTCTTTGTCATATAGAAGTTCCTCGTGTGTCTCGGTTGCGAATTC
AAAGTTCGGTCCTTCCACAATTGCATCAACGGGGCAAGCTTCTTGGCAGAAACCACAGTA
AATGCATTTTGTCATGTCGATGTCATACCTAGTGGTTCTCCGGCTTCCATCTTCCCGCTC
TTCTGCTTCTATTGTGATTGCTTGAGCTGGACACACAGCTTCACAGAGTTTGCAGGCAAT
GCAGCGCTCTTCCCCAGTGGGATAACGACGAAGAGCATGTTCACCACGGAAACGAGGGCT
CAGTGGACCCTTCTCAAATGGATAATTGATAGTAACTTTG
CGA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2DH08TF 760 0 0
CAAACTCAGGTTGATACAAGTAAACAATTCAATTACACAGCACAAAGCTGGAATACAAAA
GAGGAGTTTTCAAACGCATAAGATGTCATATTTTATTCTAACAGAAGCAACCGAAAAACG
TTTTCTCGGGGAATAACTTGAAGCAAAAAGACTGTTGTTAGAATGTTTTCTAACGGTAGA
GACTCTCTGATTTAAGATTCTCAGCAATCTCAGTCTCCCATCGATCTCCATTCTCAAGAA
GCTTTTCTTTGTCATATAGAAGTTCCTCGTGTGTCTCGGTTGCGAATTCAAAGTTCGGTC
CTTCCACAATTGCATCAACGGGGCAAGCTTCTTGGCAGAAACCACAGTAAATGCATTTTG
TCATGTCGATGTCATACCTAGTGGTTCTCCGGCTTCCATCTTCCCGCTCTTCTGCTTCTA
TTGTGATTGCTTGAGCTGGACACACAGCTTCACAGAGTTTGCAGGCAATGCAGCGCTCTT
CCCCAGTGGGATAACGACGAAGAGCATGTTCACCACGGAAACGAGGGCTCAGTGGACCCT
TCTCAAATGGATAATTGATAGTAACTTTGCGATCAAAGAAGTACTTGAGAGTCAACGACA
AACCACGCACCATTTCAGTGAGAAATAGTGTGTTTATACTCCGTTCAAACACAGTATTCC
AGTCCTTGGAGATCTCCTTAGCAAGTTGCTCCTCTTCTTCATCATCTTTCTTGGAGCCGT
AAGAAATAGCACGGGACTGCAGTCCAGAAAGATGAG
ATCC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2B591JQ 853 0 0
AAACGAACAAACTTCACCGGAAATCAAACTCAGGTTGATACAAGTAAACAATTCAATTAC
ACAGCACAAAGCTGGAATACAAAAGAGGAGTTTTCAAACGCATAAGATGTCATATTTTAT
TCTAACAGAAGCAACCGAAAAACGTTTTCTCGGGGAATAACTTGAAGCAAAAAGACTGTT
GTTAGAATGTTTTCTAACGGTAGAGACTCTCTGATTTAAGATTCTCAGCAATCTCAGTCT
CCCATCGATCTCCATTCTCAAGAAGCTTTTCTTTGTCATATAGAAGTTCCTCGTGTGTCT
CGGTTGCGAATTCAAAGTTCGGTCCTTCCACAATTGCATCAACGGGGCAAGCTTCTTGGC
AGAAACCACAGTAAATGCATTTTGTCATGTCGATGTCATACCTAGTGGTTCTCCGGCTTC
CATCTTCCCGCTCTTCTGCTTCTATTGTGATTGCTTGAGCTGGACACACAGCTTCACAGA
GTTTGCAGGCAATGCAGCGCTCTTCCCCAGTGGGATAACGACGAAGAGCATGTTCACCAC
GGAAACGAGGGCTCAGTGGGCCCTTCTCAAATGGATAATTGATAGTAACTTTGGGATCAA
AGAAGTACTTGAGAGTCAACGACAAACCACGCACCATTTCAGTGAGAAATAGTGTGTTTA
TACTCCGTTCAAACACAGTATTCCAGTCCTTGGAGATCTCCTTAGCAAGTTGCTCCTCTT
CTTCATCATCTTTCTTGGAGCCGTAAGAAATAGCACGGGACTGCAGTCCAGAAAGATGAG
ATCCCTGCAAAGCTTGCCCTGACAAAACGAGATGGCGAGCACGGAGTGTATTCAGTGACC
TGCGAGCCAGCAT

QA 1 853 1 853
DS 



CO CL108Contig2 891 5 15 U
GGACCGAAATCGAATTAGGGGAGATTCGTCAATGGCGTCGATGCTTGCTCGCAGGTCTCT
GGATACTCTCCGTGCTCGACATCTCGTTTTGTCAGGGAAAGCTTTGCAAGGAACTCATCT
TTCTCCACCGCAGTCGCGTGGTATTTCTTATGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAGGA
GCAACTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCATAAACAC
CCTGTTTCTCACTGAAATGGTCCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCC
CAAAGTTACCATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGCTTCCGTGGTGA
ACATGCTCTTCGAAGGTATCCTACTGGGGAAGAACGTTGCATTGCCTGCAGACTCTGTGA
AGCTGTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATGGAAGCCG
CAGAACCACAAGGTATGACATCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGA
AGCTTGCCCCGTTGATGCAATCGTCGAAAGACCTAACTTTGAATTCGCAACTGAGACACA
CGAGGAGCTTCTGTATGACAAGGAAAAACTGCTCGAGAATGGAGATCGATGGGAGACAGA
GATCGCTGAGAATCTGAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTGAGAGCACTCTTTTTTTGTTTG
CTTCATTGTTTAGAAATAAAAAGACGAGTGCTTTATGCGTTTGAAAAAAAAAAAACTCCT
TTTGTTGTACCTACACCAGCTTTGGGGCTGTGTAATTGAATTGTCTATTGTAAACCAGTT
CGGTTCCGGTTCACGAATTCCGGTTTAATTGAATTATCCCATTCAGACATG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A001TF U 10
AF RR2DW24TF U 1
AF RR2H891TF U 4
AF RR2H891JQ C 369
AF RR2DW24JQ C 688
BS 1 96 RR2DW24TF
BS 97 97 RR2H891TF
BS 98 310 RR2DW24TF
BS 311 311 RR2H891TF
BS 312 410 RR2DW24TF
BS 411 411 RR2H891TF
BS 412 547 RR2DW24TF
BS 548 604 RR2H891TF
BS 605 605 RR2H891JQ
BS 606 694 RR2H891TF
BS 695 773 RR2H891JQ
BS 774 775 RR2DW24JQ
BS 776 804 RR2H891JQ
BS 805 805 RR2DW24JQ
BS 806 891 RR2H891JQ

RD RR2A001TF 117 0 0
GG
GAATTAGGGGAGATTCGTCAATGGCGTCGATGCTTGCTCGCAGGTCTCTGGATACTCTCC
GTGCTCGACATCTTGTTTTGTCAGGGAAAGCTTTGCAAGGAACTCATCTTTCTCC

QA 3 117 3 117
DS 

RD RR2DW24TF 547 0 0
GGACCGAAATCGAATTAGGGGAGATTCGTCAATGGCGTCGATGCTTGCTCGCAGGTCTCT
GGATACTCTCCGTGCTCGACATCTCGTTTTGTCAGG*AAAGCTTTGCAAGGAACTCATCT
TTCTCCACCGCAGTCGCGTGGTATTTCTTATGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAGGA
GCAACTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCATAAACAC
CCTGTTTCTCACTGAAATGGTCCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCC
CAAAGTTACCGTCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGCTTCCGTGGTGA
ACATGCTCTTCGAAGGTATCCTACTGGGGAAGAACGTTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGA
AGCTGTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATGGAAGCCG
CAGAACCACAAGGTATGACATCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGA
AGCTTGC

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2H891TF 702 0 0
GG
GAAATCGAATTAGGGGAGATTCGTCAATGGCGTCGATGCTTGCTCGCAGGTCTCTGGATA
CTCTCCGTGCTCGACATCTCGTTTTGTCAGGGAAAGCCTTGCAAGGAACTCATCTTTCTC
CACCGCAGTCGCGTGGTATTTCTTATGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAAC
TTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCATAAACACCCTGT
TTCTCACTGAAATGGTCCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAAG
TTACCATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGCTTCCGTGGTGAACATG
CTCTTCGAAGGTATCCTACTGGGGAAGAACGTTGCATTGCCTGCAGACTCTGTGAAGCTG
TGTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATGGAAGCCGCAGAA
CCACAAGGTATGACATCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGAAGCTT
GCCCCGTTGATGCAATCGTCGAAAGACCTAACTTTGAATTCGCAACTGAGACACACGAG*
AGCTTCTGTATGACAAGGAAAAACTGCTCGAGAATGGAGATCGATGGGAGACAGAGATCG
CTGAGAATCTGAAATCAGAGAGTCTCTAC
GTGAGAGCACT

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR2H891JQ 523 0 0
TTCGAAGGTATCCTACTGGGGAAGAACGTTGCATTGCCTGCAGACTCTGTGAAGCTGTGT
GTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATGGAAGCCGCAGAACCA
CAAGGTATGACATCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGTTTTTGCCAAGAAGCTTGCC
CCGTTGATGCAATCGTCGAAGGACCTAACTTTGAATTCGCAACTGAGACACACGAGGAGC
TTTTGTATGACAAGGAAAAACTGCTCGAGAATGGAGATCGATGGGAGACAGAGATCGCTG
AGAATTTGAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTGAGAGCACTCTTTTTTTGTTTGCTTCATTG
TTTAGAAATAAAAAGACGAGTGCTTTATGCGTTTGAAAAAAAAAA**CTCCTTTTGTTGT
ACCTACACCAGCTTTGTGGCTGTGTAATTGAATTGTCTATTGTAAACCAGTTCGGTTCCG
GTTCACGAATTCCGGTTTAATTGAATTATCCCATTCAGACATG

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2DW24JQ 201 0 0
TTTT
TACCGTTGAGAGCACTTTTTTTTTGTTTGCTTCATTGTTTAGAAATAAAAAGACGAGTGC
TTTATGCGTTTGAAAAAAAAAAAACTCCTTTTGTTGTACCTACACCAGCTTTGGGGCTGT
GTAATTGAATTGTTTATTGTAAACCAGTTCGGTTCCGGTTCACGAATTCCGGTTTAATTG
AATTATCCCATTC
GGAC

QA 5 197 5 197
DS 



CO CL108Contig3 892 9 15 U
GGGAAGAAGACCGAAATCGAATTTGGGGAGATTCGTCAATGGCGTCGATGCTTGCTCGCA
GGTCTCTGGATACTCTCCGTGCTCGACATCTCGTTTTGTCAGGGAAAGCTTTGCAGGGAA
CTCATCTTTCTCCACTGCAGTCCCGTGGCATTTCTTATGGCTCCAAGAAAGATGATGAAG
AAGAGGAGCAACTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCA
TAAACACGCTGTTTCTCACTGAAATGGTCCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCT
TTGATCCCAAAGTTACCATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGCTTCC
GTGGTGAACATGCTCTTCGACGGTATCCCACTGGGGAGGAACGCTGCATTGCCTGCAAAC
TCTGTGAAGCTGTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATG
GAAGCCGCAGAACCACAAGGTATGACATCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGCTTCT
GCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATCGTCGAAGGACCTAACTTCGAATTCGCAACTG
AGACACACGAGGAGCTTCTGTATGACAAAGAAAAGCTGCTAGAGAATGGAGATCGATGGG
AGACGGAGATCGCTGAGAATCTGAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTGAGAGCACTCTTTTT
TTTTTT*GCTTCATTGTTTAGAAATAAAAAGACGAGTGCTTTATGCGTTTGCAGAAAAAA
*CTCCTCTGTTGTACACCAGCTTTGTGGCTGTGTAATTGAATTGTCTATTGTAAACCAGT
TCGGTTCCGGTTCACGAATTCCGGTTTAATTGAATTATCGCATTCAGACATG


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 25 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2DB78TF U 3
AF RR2EH08TF U 1
AF RR2CZ22TF U 23
AF RR2FP88TF U 2
AF RR2DM72TF U 4
AF RR2CZ22JQ C 62
AF RR2FP88JQ C 99
AF RR2DB78JQ C 208
AF RR2EH08JQ C 170
BS 1 595 RR2EH08TF
BS 596 596 RR2CZ22TF
BS 597 725 RR2EH08TF
BS 726 726 RR2FP88TF
BS 727 744 RR2EH08TF
BS 745 745 RR2DM72TF
BS 746 749 RR2FP88TF
BS 750 750 RR2DM72TF
BS 751 751 RR2CZ22JQ
BS 752 779 RR2FP88TF
BS 780 795 RR2CZ22JQ
BS 796 796 RR2FP88JQ
BS 797 871 RR2CZ22JQ
BS 872 889 RR2FP88JQ
BS 890 892 RR2EH08JQ

RD RR2DB78TF 659 0 0
GGA
GAAGACCGAAATCGAATTTGGGGAGATTCGTCAATGGCGTCGATGCTTGCTCGCAGGTCT
CTGGATACTCTCCGTGCTCGACATCTCGTTTTGTCAGGGAAAGCTTTGCAGGGAACTCAT
CTTTCTCCACTGCAGTCCCGTGGCATTTCTTATGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAG
GAGCAACTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCATAAAC
ACGCTGTTTCTCACTGAAATGGTCCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGAT
CCCAAAGTTACCATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGCTTCCGTGGT
GAACATGCTCTTCGACGGTATCCCACTGGGGAGGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGT
GAAGCTGTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATGGAAGC
CGCAGAACCACAAGGTATGACATCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGCTTCTGCCAA
GAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATCGTCGA*GGACCTAACTTCGAATTCGCAACTGAGACA
CACGAG*AGCTTCTGTATGACAAAGAAAAGCTGCTAGAGAATGGAGATCGATGGGA

QA 4 659 4 659
DS 

RD RR2EH08TF 746 0 0
GGGAAGAAGACCGAAATCGAATTTGGGGAGATTCGTCAATGGCGTCGATGCTTGCTCGCA
GGTCTCTGGATACTCTCCGTGCTCGACATCTCGTTTTGTCAGGGAAAGCTTTGCAGGGAA
CTCATCTTTCTCCACTGCAGTCCCGTGGCATTTCTTATGGCTCCAAGAAAGATGATGAAG
AAGAGGAGCAACTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCA
TAAACACGCTGTTTCTCACTGAAATGGTCCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCT
TTGATCCCAAAGTTACCATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGCTTCC
GTGGTGAACATGCTCTTCGACGGTATCCCACTGGGGAGGAACGCTGCATTGCCTGCAAAC
TCTGTGAAGCTGTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATG
GAAGCCGCAGAACCACAAGGTATGACATCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGCTTCT
GCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATCGTCGAAGGACCTAACTTCGAATTCGCGACTG
AGACACACGAGGAGCTTCTGTATGACAAAGAAAAGCTGCTAGAGAATGGAGATCGATGGG
AGACGGAGATCGCTGAGAATCTGAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTGAGAGCACTCTTTTT
TTTTT**GCTTCATTGTTTAGAAA
AA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2CZ22TF 706 0 0
GG
GGGGAGATTCGTCAATGGCGTCGATGCTTGCTCGCAGGTCTCTGGATACTCTCCGTGCTC
GACATCTCGTTTTGTCAGGGAAAGCTTTGCAGGGAACTCACCTTTCTCCACTGCAGTCCC
GTGGCATTTCTTATGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCTAAGGAAA
TCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCATAAACACGCTGTTTCTCACTGAAA
TGGTCCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACCATCAATT
ATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGCTTCCGTGGTGAACATGCTCTTCGACGGT
ATCCCACTGGGGAGGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTGTGTCCAGCTC
AAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATGGAAGCCGCAGAACCACAAGGTATG
ACATCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGCTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATG
CAATCGTCGAAGGACCTAACTTCGAATTCGCAACTGAGACACACGAGGAGCTTCTGTATG
ACAAAGAAA*GCTGCTAGAGAATGGAGATCGATGGGAGACGGAGATCGCTGAGAATCTGA
AATCAGAGAGTCTCTACCGTTGAGAGCACTCTTTTTTTTTT
GCT

QA 3 703 3 703
DS 

RD RR2FP88TF 778 0 0
GGAA
GAAGACCGAAATCGAATTTGGGGAGATTCGTCAATGGCGTCGATGCTTGCTCGCAGGTCT
CTGGATACTCTCCGTGCTCGACATCTCGTTTTGTCAGGGAAAGCTTTGCAGGGAACTCAT
CTTTCTCCACTGCAGTCCCGTGGCATTTCTTATGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAG
GAGCAACTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCATAAAC
ACGCTGTTTCTCACTGAAATGGTCCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGAT
CCCAAAGTTACCATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGCTTCCGTGGT
GAACATGCTCTTCGACGGTATCCCACTGGGGAGGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGT
GAAGCTGTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATGGAAGC
CGCAGAACCACAAGGTATGACATCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGCTTCTGCCAA
GAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATCGTCGAAGGACCTAACTTCGAATTCGCAACTGAGACA
CACGAGGAGCTTCTGTATGACAAAGAAAAGCTGCTAGAGAATGGAGATCGATGGGAGACG
GAGATCGCTGAGAATCTGAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTGAGAGTACTCTTTTTTTTTT
T*GCTTCATTGTTTAGAAAAAAAAG*ACGAGTGCTTTATGCGTTTGCAGAAAAA

QA 5 778 5 778
DS 

RD RR2DM72TF 747 0 0
GG
GAAGACCGAAATCGAATTTGGGGAGATTCGTCAATGGCGTCGATTCTTGCTCGCAGGTCT
CTGGATACTCTCCGTGCTCGACATCTCGTTTTGTCAGGGAAAGCTTTGCAGGGAACTCAT
CTTTCTCCACTGCAGTCCCGTGGCATTTCTTATGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAG
GAGCAACTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCATAAAC
ACGCTGTTTCTCACTGAAATGGTCCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGAT
CCCAAAGTTACCATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGCTTCCGTGGT
GAACATGCTCTTCGACGGTATCCCACTGGGGAGGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGT
GAAGCTGTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAATCAGAAGAGCGAGGAGATGGAAGC
CGCAGAACCACAAGGTATGACATCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGCTTCTGCCAA
GAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATCGTCGAAGGACCTAACTTCGAATTCGCAACTGAGACA
CACGAGGAGCTTCTGTATGACAAAGAAAAGCTGCTAGAGAATGGAGATCGATGGGAGACG
GAGATCGCTGAGAATCTGAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTGAGAGCACTCTTTTTTTTTT
**GCTTCATTGTTTAGAAATAAAAA

QA 3 747 3 747
DS 

RD RR2CZ22JQ 810 0 0
GTCTCTGGATACTCTCCGTGCTCGACATCTCGTTTTGTCAGGGAAAGCTTTGCAGGGAAC
TCACCTTTCTCCACTGCAGTCCCGTGGCATTTCTTATGGCTCCAAGAAAGATGATGAAGA
AGAGGAGCAACTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCAT
AAACACGCTGTTTCTCACTGAAATGGTCCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTT
TGATCCCAAAGTTACCATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGCTTCCG
TGGTGAACATGCTTTTCGACGGTATCCCACTGGGGAGGAACGCTGCATTGCCTGCAAACT
CTGTGAAGCTGTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATGG
AAGCCGCAGAACCACAAGGTATGACATCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGCTTCTG
CCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATCGTCGAAGGACCTAACTTCGAATTCGCAACTGA
GACACACGAGGAGCTTCTGTATGACAAAGAAAAGCTGCTAGAGAATGGAGATCGATGGGA
GACGGAGATCGCTGAGAATTTGAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTGAGAGCACTCTTTTTT
TTTTT*GCTTCATTGTTTAGAAATAAAAAGACGAGTGCTTTATGCGTTTGCAGAAAAAA*
CTCCTCTGTTGTACCCCAGCTTTGTGGCTGTGTAATTGAATTGTCTATTGTAAACCAGTT
CGGTTCCGGTTCACGAATTCCGGTTTAATT

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR2FP88JQ 794 0 0
TCAGGGAAAGCTTTGCAGGGAACTCATCTTTCTCCACTGCAGTCCCGTGGCATTTCTTAT
GGCTCCAAGAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGG
AATACTGTCTTTGAACGGAGCATAAACACGCTGTTTCTCACTGAAATGGTCCGTGGTTTG
TCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACCATCAATTATCCATTTGAGAAG
GGTCCACTGAGCCCTCGCTTCCGTGGTGAACATGCTCTTCGACGGTATCCCACTGGGGAG
GAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATA
GAAGCAGAAGAGCGAGAAGATGGAAGCCGCAGAACCACAAGGTATGACATCGACATGACG
AAATGCATTTACTGTGGCTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATCGTCGAAGGA
CCTAACTTCGAATTCGCAACTGAGACACACGAGGAGCTTCTGTATGACAAAGAAAAGCTG
CTAGAGAATGGAGATCGATGGGAGACGGAGATCGCTGAGAATCTGAAATCAGAGAGTCTC
TACCGTTGAGAGTACTCTTTTTTTTTTTTGCTTCATTGTTTAGAAATAAAAAGACGAGTG
CTTTATGCGTTTGCAGAAAAAA*CTCCTCTGTTGTACACCAGCTTTGTGGCTGTGTAATT
GAATTGTCTATTGTAAACCAGTTCGGTTCCGGTTCACGAATTCCGGTTTAATTGAATTAT
CGCATTCAGAC
AGG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2DB78JQ 682 0 0
CCAAGGACTGGAATACTGTCTTTGAACGGAGCATAAACACGCTGTTTCTCACTGAAATGG
TCCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACCATCAATTATC
CATTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGCTTCCGTGGTGAACATGCTCTTCGACGGTATC
CCACTGGGGAGGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTGTGTCCAGCTCAAG
CAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGAGAAGATGGAAGCCGCAGAACCACAAGGTATGACA
TCGACATGACGAAATGCATTTACTGTGGCTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAA
TCGTCGAAGGACCTAACTTCGAATTCGCAACTGAGACACACGAGGAGCTTCTGTATGACA
AAGAAAAGCTGCTAGAGAATGGAGATCGATGGGAGACGGAGATCGCTGAGAATCTGAAAT
CAGAGAGTCTCTACCGTTGAGAGCACTCTTTTTTTTTTTTGCTTCATTGTTTAGAAATAA
AAAGACGAGTGCTTTATGCGTTTGCAGAAAAAA*CTCCTCTGTTGTACACCAGCTTTGTG
GCTGTGTAATTGAATTGTCTATTGTAAACCAGTTCGGTTCCGGTTCACGAATTCCGGTTT
AATTGAATTATCGCATTCAGAC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2EH08JQ 723 0 0
AGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCTAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTCTT
TGAACGGAGCATAAACACGCTGTTTCTCACTGAAATGGTCCGTGGTTTGTCGTTGACCCT
CAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACCATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAG
CCCTCGCTTCCGTGGTGAACATGCTCTTCGACGGTATCCCACTGGGGAGGAACGCTGCAT
TGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGA
GCGAGAAGATGGAAGCCGCAGAACCACAAGGTATGACATCGACATGACGAAATGCATTTA
CTGTGGCTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATCGTCGAAGGACCTAACTTCGA
ATTCGCGACTGAGACACACGAGGAGCTTCTGTATGACAAAGAAAAGCTGCTAGAGAATGG
AGATCGATGGGAGACGGAGATCGCTGAGAATTTGAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTGAGA
GCACTCTTTTTTTTTTT*GCTTCATTGTTTAGAAATAAAAAGACGAGTGCTTTATGCGTT
TGCAGAAAAAAACTCCTCTGTTGTACACCAGCTTTGTGGCTGTGTAATTGAATTGTCTAT
TGTAAACCAGTTCGGTTCCGGTTCACGAATTCCGGTTTAATTGAATTATCGCATTCAGAC
ATG

QA 1 723 1 723
DS 



AS 3 16

CO CL109Contig1 786 3 2 U
GGGAAGAAGAAGAAACAAGTGTAAGCGCTCCACTTCGCAGCGGAAGTTGGAGAAGCGAGA
CCAAAGTTGAAGAAATGGCGACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCATTCACTTCTCTTTCTA
TATCCTCCAACTCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCCTCG
CTTCTCCGGTCAAGCTCACTGGGAATCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGG
AACGGAAGAAATGCAAACCAAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCG
GAGATACGGTCAAAGTTATCTCTGGACGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGA
TCTTTACCCACAACAGCACCGTTGTCATCAAAGATGTCAACCTCAAGACCAAACACATGA
AGAGCCGTGAAGAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCGCCGATCCACAGCT
CAAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTGGTAAGCAGGGTGGGTCACAAGGTCC
TTGAAGATGGACAGAAAGTAAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATTG
AGAAGTGGAAGCAACTTAAGGAGGCTAAGGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCGT
CTTCATCTTAACGTCCCCACTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTGCTTCC
TTAAGCTATGCTTAGAATGGTACTTAGACTTGTGTTTTATTCTGAAGATACATTTTTTAC
AAAGTT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2F176TF U 1
AF RR2DE65TF U 1
AF RR2DE65JQ C 2
BS 1 617 RR2DE65TF
BS 618 786 RR2DE65JQ

RD RR2F176TF 509 0 0
G
GGAAGAAGAAGAAACAAGTGTAAGCGCTCCACTTCGCAGTGGAAGTTGGAGAAGCGAGAC
CAAAGTTGAAGAAATGGCGACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCATTCACTTCTCTTTCTAT
ATCCTCCAACTCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCCTCGC
TTCTCCGGTCAAGCTCACTGGGAATCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGA
ACGGAAGAAATGCAAACCAAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGG
AGATACGGTCAAAGTTATCTCTGGACGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGAT
CTTTACCCACAACAGCACCGTTGTCATCAAAGATGTCAACCTCAAGACCAAACACATGAA
GAGCCGTGAAGAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCGCCGATCCACAGCTC
AAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAG

QA 2 509 2 509
DS 

RD RR2DE65TF 617 0 0
GGGAAGAAGAAGAAACAAGTGTAAGCGCTCCACTTCGCAGCGGAAGTTGGAGAAGCGAGA
CCAAAGTTGAAGAAATGGCGACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCATTCACTTCTCTTTCTA
TATCCTCCAACTCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCCTCG
CTTCTCCGGTCAAGCTCACTGGGAATCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGG
AACGGAAGAAATGCAAACCAAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCG
GAGATACGGTCAAAGTTATCTCTGGACGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGA
TCTTTACCCACAACAGCACCGTTGTCATCAAAGATGTCAACCTCAAGACCAAACACATGA
AGAGCCGTGAAGAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCGCCGATCCACAGCT
CAAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTGGTAAGCAGGGTGGGTCACAAGGTCC
TTGAAGATGGACAGAAAGTAAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATTG
AGAAGTGGAAGCAACTT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2DE65JQ 785 0 0
GGAAGAAGAAGAAACAAGTGTAAGCGCTCCACTTCGCAGCGGAAGTTGGAGAAGCGAGAC
CAAAGTTGAAGAAATGGCGACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCATTCACTTCTCTTTCTAT
ATCCTCCAACTCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCCTCGC
TTCTCCGGTCAAGCTCACTGGGAATCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGA
ACGGAAGAAATGCAAACCAAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGG
AGATACGGTCAAAGTTATCTCTGGACGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGAT
CTTTACCCACAACAGCACCGTTGTCATCAAAGATGTCAACCTCAAGACCAAACACATGAA
GAGCCGTGAAGAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCGCCGATCCACAGCTC
AAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTGGTAAGCAGGGTGGGTCACAAGGTCCT
TGAAGATGGACAGAAAGTAAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATTGA
GAAGTGGAAGCAACTTAAGGAGGCTAAGGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCGTC
TTCATCTTAACGTCCCCACTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTGCTTCCT
TAAGCTATGCTTAGAATGGTACTTAGACTTGTGTTTTATTCTGAAGATACATTTTTTACA
AAGTT

QA 1 785 1 785
DS 



CO CL109Contig2 803 6 15 U
GTCCGTGCAGAAGGTGTTCTTTATCTGGTATAAATTTTACACTTTACCTTGAAAGGGATT
CAATTTATCCATCAAATACATAGATAGGTCTCCTTAGCCTACAAACAAAAGTGCAATGAA
GAAGAAATAGGTGACATGCTAAGATGTGGAGGCAACTGTAACTGCAGATGTTTCTTTATC
CTTTGCCTCCTTAAGTTGCTTCCACTTCTCAACGGTGTCGATAAGTTCCCCAGTTTTGAT
CAGATACCTTACCTTCTGTCCATCTTCAAGGACCTTGTGACCCACCCGGCTTACCACCTC
CTTTTCTTTCGAATACAGCATCACATTTGAGCTGTGTATCGGTGCTTCAATCTTGACAAT
TTGACCAGGCTCCCCCTCTTCCCGGCTCTTCATGTGTTTGGTCTTGAGGTTGACATCGTT
GATGACAATGGTGCTGTTGTGGGTAAAGATCTTAGTGACTTCTCCAATCTTACCCTTGTC
TCGTCCAGAGATAACTTTGACAGTATCTCCAAACTTGACATGCATTTTGTGCAGAATTGG
AAGACTGTTTGGTTTACATTTCTTCCGTTCCCAACGCTTAAGCTTTGCAAAAACAAGACA
TGGGTTACGGGCGGGCTTGACCGGAGAAGCGGCGGAGAGGGAAATCGGGGAAAGGAGACG
CTGGCCGAGGAAGGAGGAAGGGGATGAGGATATCGAAAGAGATGTAAACGAGCTCTGAAG
AGAAGTCATTGTCGCCATTTTTAACAGTTCAGACTCTGCAACTCCCGCTGCTGCTGCCAA
GGTGGTGCTAACAGTTCATATCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 15 30 30 15 30 15 30 30 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FV71JQ U 1
AF RR2FV71TF C 1
AF RR2FX91JQ U 46
AF RR2A520JQ U 3
AF RR2A520TF C 96
AF RR2FX91TF C 305
BS 1 120 RR2FV71JQ
BS 121 121 RR2A520JQ
BS 122 123 RR2FV71JQ
BS 124 124 RR2A520JQ
BS 125 239 RR2FV71JQ
BS 240 426 RR2A520JQ
BS 427 427 RR2FX91JQ
BS 428 555 RR2A520JQ
BS 556 556 RR2FX91JQ
BS 557 588 RR2A520JQ
BS 589 589 RR2FX91JQ
BS 590 607 RR2A520JQ
BS 608 608 RR2FX91JQ
BS 609 777 RR2A520JQ
BS 778 803 RR2A520TF

RD RR2FV71JQ 239 0 0
GTCCGTGCAGAAGGTGTTCTTTATCTGGTATAAATTTTACACTTTACCTTGAAAGGGATT
CAATTTATCCATCAAATACATAGATAGGTCTCCTTAGCCTACAAACAAAAGTGCAATGAA
AAAAAAATAGGTGACATGCTAAGATGTGGAGGCAACTGTAACTGCAGATGTTTCTTTATC
CTTTGCCTCCTTAAGTTGCTTCCACTTCTCAACGGTGTCGATAAGTTCCCCAGTTTTGA

QA 1 239 1 239
DS 

RD RR2FV71TF 408 0 0
GT
CCGTGCAGAAGGTGTTCTTTATCTGGTATAAATTTTACACTTTACCTTGAAAGGGATTCA
ATTTATCCATCAAATACATAGATAGGTCTCCTTAGCCTACAAACAAAAGTGCAATGAAGA
AGAAATAGGTGACATGCTAAGATGTGGAGGCAACTGTAACTGCAGATGTTTCTTTATCCT
TTGCCTCCTTAAGTTGCTTCCACTTCTCAACGGTGTCGATAAGTTCCCCAGTTTTGATCA
GATACCTTACCTTCTGTCCATCTTCAAGGACCTTGTGACCCACCCGGCTTACCACCTCCT
TTTCTTTCGAATACAGCATCACATTTGAGCTGTGTATCGGTGCTTCAATCTTGACAATTT
GACCAGGCTCCCCCTCTTCCCGGCTCTTCATGTGTTTGGTCTTGA
C

QA 3 407 3 407
DS 

RD RR2FX91JQ 655 0 0
G
CCTTGAAAGGGATTCAATTTATCCATCAAATACATA**TAGATC*CATTAGTCTACAAAC
AAAAGTGCAATGAAGAAGAAATAGGTGACATGCTAAGATGTGGAGGCAACTGTAACTGCA
GATGTTTCTTTATCCTTTGCCTCCTTAAGTTGCTTCCACTTCTCAACCGTGTCGATAAGT
TCCCCAGTTTTGATCAGATACCTAACCTTCTGTCCATCCTCAAGGACCTTGTGACCCACC
CGGCTTACCACCTCCTTTTCTTTCGAATACAGCATCACATTTGAGCTGTGTATCGGTGCT
TCGATCTTGACAATTTGACCAGGCTCCCCCTCTTCCCGGCTCTTCATGTGTTTGGTCTTG
AGGTTGACATCGTTGATGACAATGGTGCTGTTGTGGGTAAAGATCTTAGTGACTTCTCCA
ATCTTACCCTTGTCTCGTCCAGAGATAACTTTGACAGTATCTCCAAACTTGACATGCATT
TTGTGCAGAATTGGAAGACTGTTTGGTTTACATTTCTTCCGTTCCCAACGCTTAAGCTTT
GCAAAAACAAGGCATGGGTTTCGGGCGGGCTTGACCGGAGAAGCGGCGGAGAGGGAAATT
GGGGAAAGGAGACGCTGGCCGAGGAAGGAGGAAGGGGATGAGGATATCGAAAGA

QA 2 655 2 655
DS 

RD RR2A520JQ 775 0 0
CCGTGCAGAAGGTGTTCTTTATCTGGTATAAATTTTACACTTTACCTTGAAAGGGATTCA
ATTTATCCATCAAATACATAGATAGGTCTCCTTAGCCTACAAACAAAAGTGCAATGAAGA
AGAAATAGGTGACATGCTAAGATGTGGAGGCAACTGTAACTGCAGATGTTTCTTTATCCT
TTGCCTCCTTAAGTTGCTTCCACTTCTCAACGGTGTCGATAAGTTCCCCAGTTTTGATCA
GATACCTTACCTTCTGTCCATCTTCAAGGACCTTGTGACCCACCCGGCTTACCACCTCCT
TTTCTTTCGAATACAGCATCACATTTGAGCTGTGTATCGGTGCTTCAATCTTGACAATTT
GACCAGGCTCCCCCTCTTCCCGGCTCTTCATGTGTTTGGTCTTGAGGTTGACATCGTTGA
TGACGATGGTGCTGTTGTGGGTAAAGATCTTAGTGACTTCTCCAATCTTACCCTTGTCTC
GTCCAGAGATAACTTTGACAGTATCTCCAAACTTGACATGCATTTTGTGCAGAATTGGAA
GACTGTTTGGTTTGCATTTCTTCCGTTCCCAACGCTTAAGCTTTGCGAAAACAAGACATG
GGTTATGGGCGGGCTTGACCGGAGAAGCGGCGGAGAGGGAAATCGGGGAAAGGAGACGCT
GGCCGAGGAAGGAGGAAGGGGATGAGGATATCGAAAGAGATGTAAACGAGCTCTGAAGAG
AAGTCATTGTCGCCATTTTTAACAGTTCAGACTCTGCAACTCCCGCTGCTGCTGC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2A520TF 708 0 0
AGCCTACAAACAAAAGTGCAATGAAGAAGAAATAGGTGACATGCTAAGATGTGGAGGCAA
CTGTAACTGCAGATGTTTCTTTATCCTTTGCCTCCTTAAGTTGCTTCCACTTCTCAACGG
TGTCGATAAGTTCCCCAGTTTTGATCAGATACCTTACCTTCTGTCCATCTTCAAGGACCT
TGTGACCCACCCGGCTTACCACCTCCTTTTCTTTCGAATACAGCATCACATTTGAGCTGT
GTATCGGTGCTTCAATCTTGACAATTTGACCAGGCTCCCCCTCTTCCCGGCTCTTCATGT
GTTTGGTCTTGAGGTTGACATCGTTGATGACGATGGTGCTGTTGTGGGTAAAGATCTTAG
TGACTTCTCCAATCTTACCCTTGTCTCGTCCAGAGATAACTTTGACAGTATCTCCAAACT
TGACATGCATTTTGTGCAGAATTGGAAGACTGTTTGGTTTGCATTTCTTCCGTTCCCAAC
GCTTAAGCTTTGCGAAAACAAGACATGGGTTATGGGCGGGCTTGACCGGAGAAGCGGCGG
AGAGGGAAATCGGGGAAAGGAGACGCTGGCCGAGGAAGGAGGAAGGGGATGAGGATATCG
AAAGAGATGTAAACGAGCTCTGAAGAGAAGTCATTGTCGCCATTTTTAACAGTTCAGACT
CTGCAACTCCCGCTGCTGCTGCCAAGGTGGTGCTAACAGTTCATATCC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2FX91TF 493 0 0
TCTTTCGAATACAGCATCACATTTGAGCTGTGTATCGGTGCTTCGATCTTGACAATTTGA
CCAGGCTCCCCCTCTTCCCGGCTCTTCATGTGTTTGGTCTTGAGGTTGACATCGTTGATG
ACAATGGTGCTGTTGTGGGTAAAGATCTTAGTGACTTCTCCAATCTTACCCTTGTCTCGT
CCAGAGATAACTTTGACAGTATCTCCAAACTTGACATGCATTTTGTGCAGAATTGGAAGA
CTGTTTGGTTTACATTTCTTCCGTTCCCAACGCTTAAGCTTTGCAAAAACAAGGCATGGG
TTCCGGGCGGGCTTGACCGGAGAAGCGGCGGAGAGGGAAATTGGGGAAAGGAGACGCTGG
CCGAGGAAGGAGGAAGGGGATGAGGATATCGAAAGAGATGTAAACGAGCTCTGAAGAGAA
GTCATTGTCGCCATTTTTAACAGTTCAGACTCTGCAACTCCCGCTGCTGCTGCCAAGGTG
GTGCT
GCTAACCC

QA 1 485 1 485
DS 



CO CL109Contig3 941 7 16 U
GGGAAGTTATTCGCGGCCGTGATTCCAAAACGCTGTCGTTCCAGAGTCTAGCGTTATCCA
CGTTTTATCGCCTTCAGTCGAACGGATAGGACGAAGAAGAAGAAGAAGAAACTAGTGTTA
GCGCTCCACTTGGAGAGGCGAGACCAAGGTTGAAAAAATGGCGACCATGTCTGCTCTTCA
GAGCTCATTTACATCTCTTTCAATAACCTCCAACTCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCCT
TTCCCCTATTCCCCTCTCCGTCGCTTCTCCGGTCAAACTCGTTAAGAACCCATGTCTTGT
CTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACCAAACAGTCTTCCCATTCT
TCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTCAAAGTTATATCTGGACGCGACAAGGG
TAAGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACAGCACCGTTGTCATCAAAGATGT
CAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAA
GATCGAAGCGCCGATCCACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTGGT
AAGCAGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAAGTAAGGTATCTGATCAAAAC
TGGGGAACTTATCGACACCATTGAGAAGTGGAAGCAACTTAAGGAGGCTAAAGATAAAGA
AAATACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAACGTCTCCACTTTTGATATATTTGTCT
GATGAATGTATTAAGTTGCTTCCTTAAGTTATGCTTAGAATGGTACTTAAACTTGTGTTT
TATTCTAAACATACATTTTTTACAAAGTTTTTGCAAAGCTGTGGAACGTATGTTTATATC
GACCAACATTTTACATTAAAAAAAAAACAATTCAAATGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX90TF U 1
AF RR2GK13TF U 81
AF RR2AT36TF U 95
AF RR2AO45JQ C 91
AF RR2AO45TF U 91
AF RR2D774TF U 118
AF RR2D774JQ C 228
BS 1 618 RR2GX90TF
BS 619 619 RR2GK13TF
BS 620 645 RR2GX90TF
BS 646 646 RR2GK13TF
BS 647 666 RR2GX90TF
BS 667 667 RR2GK13TF
BS 668 676 RR2GX90TF
BS 677 708 RR2GK13TF
BS 709 787 RR2AT36TF
BS 788 863 RR2AO45TF
BS 864 871 RR2D774TF
BS 872 872 RR2D774JQ
BS 873 876 RR2D774TF
BS 877 877 RR2D774JQ
BS 878 911 RR2D774TF
BS 912 941 RR2D774JQ

RD RR2GX90TF 676 0 0
GGGAAGTTATTCGCGGCCGTGATTCCAAAACGCTGTCGTTCCAGAGTCTAGCGTTATCCA
CGTTTTATCGCCTTCAGTCGAACGGATAGGACGAAGAAGAAGAAGAAGAAACTAGTGTTA
GCGCTCCACTTGGAGAGGCGAGACCAAGGTTGAAAAAATGGCGACCATGTCTGCTCTTCA
GAGCTCATTTACATCTCTTTCAATAACCTCCAACTCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCCT
TTCCCCTATTCCCCTCTCCGTCGCTTCTCCGGTCAAACTCGTTAAGAACCCATGTCTTGT
CTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACCAAACAGTCTTCCCATTCT
TCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTCAAAGTTATATCTGGACGCGACAAGGG
TAAGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACAGCACCGTTGTCATCAAAGATGT
CAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAA
GATCGAAGCGCCGATCCACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTGGT
AAGCAGGGTGGGTCACAAAGTCCTTGAAGATGGACAGAAAGTAAG*TATCTGATCAAAAC
TGGGGA*CTTATCGAC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2GK13TF 628 0 0
GAGGACGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGGAACAAGTGTTAGCGCTCCACTTGGAGAGGCGAGAACAAAGTTA
AAGAAATGGCGACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCATTTACATCTCTTTCAATAACCTCCA
ACTCCTCTTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCGTCGCTTCTCCGG
TCAAACTCGTTAAGAACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGA
AATGTAAACCAAACAGTCTTCCAATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGG
TCAAAGTTATATCTGGACGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCC
ACAACAGCACCATTGTCATCAAAGATGTCAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTG
AAGAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCGCCGATCCACAGCTCAAATGTGA
TGCTGTATTCGAAAGAAA*GGAGGTGGTAAGCAGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATG
GACAGAAAGTAAGGTATTTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATTGAGAAGTGGA
AGCAACTTAAGGAGGC

QA 13 628 13 628
DS 

RD RR2AT36TF 693 0 0
G
GAAGAAGAAGAAGAAACTAGTGTTAGCGCTCCACTTGGAGAGGCGAGACCAAGGTTGAAA
AAATGGCGACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCATTTACATCTCTTTCAATAACCTCCAACT
CCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCTATTCCCCTCTCCGTCGCTTCTCCGGTCA
AACTCGTTAAAAACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGAAAT
GCAAACCAGACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTCA
AAGTTATATCTGGACGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCCACA
ACAGCACCGTTGTCATCAAAGATGTCAACCTCAAGACCAGACACATGAAGAGCCGTGAAG
AGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCGCCGATCCACAGCTCAGATGTGATGC
TGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTGGTAAGCAGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGAC
AGAAAGTAAGGTATCTGATCAGAACTGGGGAACTTATCGACACCATTGAGAAGTGGAAGC
AACTTAAGGAGGCTAAAGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAAC
GTCTCCACTTTTGATATATTTGTCTGATGAAT

QA 2 693 2 693
DS 

RD RR2AO45JQ 773 0 0
GG
GAAGAAGAAGAAGAAGAAACTAGTGTTGGCGCTCCACTTGGAGAGGCGAGACCAAGGTTG
AAAAAATGGCGACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCATTTACATCTCTTTCAATAACCTCCA
ACTCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCTATTCCCCTCTCCGTCGCTTCTCCGG
TCAAACTCGTTAAGAACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGA
AATGCAAACCAAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGG
TCAAAGTTATATCTGGACGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCC
ACAACAGCACCGTTGTCATCAAAGATGTCAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTG
AAGAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCGCCGATCCACAGCTCAAATGTGA
TGCTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTGGTAAGCAGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATG
GACAGAAAGTAAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATTGAGAAGTGGA
AGCAACTTAAGGAGGCTAAAGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTT
AACGTCTCCACTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTGCTTCCTTAAGTTAT
GCTTAGAATGGTACTTAAACTTGTGTTTTATTCTAAACATACATTTTTTAC

QA 3 773 3 773
DS 

RD RR2AO45TF 773 0 0
GG
GAAGAAGAAGAAGAAGAAACTAGTGTTGGCGCTCCACTTGGAGAGGCGAGACCAAGGTTG
AAAAAATGGCGACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCATTTACATCTCTTTCAATAACCTCCA
ACTCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCTATTCCCCTCTCCGTCGCTTCTCCGG
TCAAACTCGTTAAGAACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGA
AATGCAAACCAAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGG
TCAAAGTTATATCTGGACGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCC
ACAACAGCACCGTTGTCATCAAAGATGTCAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTG
AAGAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCGCCGATCCACAGCTCAAATGTGA
TGCTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTGGTAAGCAGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATG
GACAGAAAGTAAGGTATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATTGAGAAGTGGA
AGCAACTTAAGGAGGCTAAAGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTT
AACGTCTCCACTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTGCTTCCTTAAGTTAT
GCTTAGAATGGTACTTAAACTTGTGTTTTATTCTAAACATACATTTTTTAC

QA 3 773 3 773
DS 

RD RR2D774TF 796 0 0
GG
AGCGCTCCACTTGGAGAGGCGAGACCAAGGTTGAAAAAATGGCGACCATGTCTGCTCTTC
AGAGCTCATTTACATCTCTTTCAATAACCTCCAACTCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCC
TTTCCCCTATTCCCCTCTCCGTCGCTTCTCCGGTCAAACTCGTTAAGAACCCATGTCTTG
TCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACCAAACAGTCTTCCCATTC
TTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTCAAAGTTATATCTGGACGCGACAAGG
GTAAGATTGGAGAAGTCACTGAGATCTTTACCCACAACAGCACCGTTGTCATCAAAGATG
TCAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCA
AGATCGAAGCGCCGATCCACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTGG
TAAGCAGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAAGTAAGGTATCTGATCAAAA
CTGGGGAACTTATCGACACCATTGAGAAGTGGAAGCAACTTAAGGAGGCTAAAGATAAAG
AAAATACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAACGTCTCCACTTTTGATATATTTGTC
TGATGAATGTAT*AAGTTGCTTCCTTAAGT*ATGCTTAGA*TGGTACTTAAACTTGTGTT
T*ATTCTAAACATACATTTTTTACAAAGTTTT*GCAA*GCTGTGGAACGTATGTTTATAT
CGACCAACATTT
AC

QA 3 794 3 794
DS 

RD RR2D774JQ 714 0 0
GCCAGCGTCTCCTTTCCCCTATTCCCCTCTCCGTCGCTTCTCCGGTCAAACTCGTTAAGA
ACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACCAAACA
GTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTCAAAGTTATATCTG
GACGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTGAGATCTTTACCCACAACAGCACCGTTG
TCATCAAAGATGTCAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGAGCCTG
GCCAAATTGTCAAGATCGAAGCGCCGATCCACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTCGAAAG
AAAAGGAGGTGGTAAGCAGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGACAGAAAGTAAGGT
ATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATTGAGAAGTGGAAGCAACTTAAGGAGG
CTAAAGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAACGTCTCCACTTTT
GATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTGCTTCCTTAAGTTATGCTTAGAATGGTACT
TAAACTTGTGTTTTATTCTAAACATACATTTTTTACAAAGTTTTTGCAAAGCTGTGGAAC
GTATGTTTATATCGACCAACATTTTACATTAAAAAAAAAACAATTCAAATGGCT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 2 18

CO CL110Contig1 770 3 17 U
GGACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAAGCGAGTTGCAGATATTTTTCTCAGGCCT
CCAAGATCTAAAGATTCAGAGTTATACAAAACAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTT
CTACGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTTCGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATT
TCTCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCA
GCCAGCACCAGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAG
CTGATCTTCTCCCCGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCGAACCTGAGT
TTGATCATCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGACATTGGTT
TAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATCG
TTGAACCGGCCAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCAC
GAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATC
TTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCT
GTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCTCAAAAAAAATGT
AAAAAACATAAAAAATTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAATTTACGCAC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG72TF U 1
AF RR2CM25TF U 1
AF RR2CM25JQ C 128
BS 1 188 RR2AG72TF
BS 189 189 RR2CM25TF
BS 190 369 RR2AG72TF
BS 370 370 RR2CM25TF
BS 371 413 RR2AG72TF
BS 414 414 RR2CM25TF
BS 415 505 RR2AG72TF
BS 506 506 RR2CM25TF
BS 507 709 RR2AG72TF
BS 710 716 RR2CM25TF
BS 717 717 RR2CM25JQ
BS 718 725 RR2CM25TF
BS 726 726 RR2CM25JQ
BS 727 734 RR2CM25TF
BS 735 735 RR2CM25JQ
BS 736 748 RR2CM25TF
BS 749 770 RR2CM25JQ

RD RR2AG72TF 709 0 0
GGACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAAGCGAGTTGCAGATATTTTTCTCAGGCCT
CCAAGATCTAAAGATTCAGAGTTATACAAAACAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTT
CTACGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTTCGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATT
TCTCTCCGTAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCA
GCCAGCACCAGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAG
CTGATCTTCTCCCCGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCGAACCTGAGT
TTGATCATCGTCAAGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGACTTTGGTT
TAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATCG
TTGAACCGGCCAAGTATGCAGAGAATCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCAC
GAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATC
TTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCT
GTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCTC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2CM25TF 767 0 0
GG
ACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAAGCGAGTTGCAGATATTTTTCTCAGGCCTCC
AAGATCTAAAGATTCAGAGTTATACAAAACAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTTCT
ACGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTTCGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATTTC
TCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCAGC
CAGCACCAGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCT
GATCTTCTCCCCGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCGAACCTGAGTTT
GATCATCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGACATTGGTTTA
GGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATCGTT
GAACCGGCCAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGA
AACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTT
TAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGT
AACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAA*CTTGTTATCTCAAAAAAA*TGTAA
AAA*CATAAAAA*TTGTATAATTTGA
GAGTATGAGATTTACGCAC

QA 3 748 3 748
DS 

RD RR2CM25JQ 643 0 0
AAACCCCAACGCACCTCTCTTCGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATTTCTCTCC
GGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCAGCCAGCA
CCAGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTGATCT
TCTCCCCGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCGAACCTGAGTTTGATCA
TCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGACATTGGTTTAGGGAA
GAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATCGTTGAACC
GGCCAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAACAT
CCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTAGCC
ACCTGTACCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGTAACTT
CTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCTCAAAAAAAATGTAAAAAAC
ATAAAAAATTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAATTTACGCAC

QA 1 643 1 643
DS 



CO CL110Contig2 777 15 32 U
GGGTCACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAGCGAGTTGCAGATATTTTCTCAGGCC
TCCAAGATCTAATATTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTT
CTACGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTTCGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATT
TCTCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCA
GCCAGCACCAGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAG
CTGATCTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATGGAAGATGTCTTCCAAGCTGAGT
TTGATCATCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGACTTTGGTT
TAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGCGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTG
TTGAACCGGCGAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCAC
GAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATC
TTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTT*AGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGC
TGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCTCAAAAAAAATG
TAAAAAACATAAAAA*TTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAATAGCGTTACGCACAT


BQ
35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 15 50 80 80 80 80 20 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 20 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 20 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 20 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 20 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 10 80 80 40 80 80 80 80 80 20 10 10 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 20 20 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 20 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 40 80 80 80 20 80 80 80 80 80 80 80 20 80 65 35 85 85 85 85 85 85 35 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 15 85 55 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 60 60 60 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 10 10 10 10 

AF RR2DO11TF U 4
AF RR2CI74TF U 5
AF RR2AA89JQ C 134
AF RR2AA89TF U 134
AF RR2AL77TF U 5
AF RR2C218TF U 1
AF RR2BC33JQ C 1
AF RR2DT71JQ C 411
AF RR2BF91JQ C 1
AF RR2BF91TF U 1
AF RR2DT71TF U 109
AF RR2DO11JQ C 150
AF RR2BC33TF U 1
AF RR2CI74JQ C 73
AF RR2DD92JQ C 125
BS 1 5 RR2BF91TF
BS 6 72 RR2CI74TF
BS 73 73 RR2DO11TF
BS 74 139 RR2CI74TF
BS 140 140 RR2DO11TF
BS 141 154 RR2CI74TF
BS 155 155 RR2DO11TF
BS 156 175 RR2CI74TF
BS 176 176 RR2DO11TF
BS 177 187 RR2CI74TF
BS 188 188 RR2DO11TF
BS 189 239 RR2CI74TF
BS 240 240 RR2DO11TF
BS 241 250 RR2CI74TF
BS 251 251 RR2DO11TF
BS 252 319 RR2CI74TF
BS 320 320 RR2DO11TF
BS 321 349 RR2CI74TF
BS 350 350 RR2DO11TF
BS 351 365 RR2CI74TF
BS 366 367 RR2DO11TF
BS 368 385 RR2CI74TF
BS 386 386 RR2DO11TF
BS 387 401 RR2CI74TF
BS 402 402 RR2DO11TF
BS 403 409 RR2CI74TF
BS 410 410 RR2DO11TF
BS 411 648 RR2CI74TF
BS 649 649 RR2BF91TF
BS 650 717 RR2CI74TF
BS 718 773 RR2BF91TF
BS 774 777 RR2CI74JQ

RD RR2DO11TF 576 0 0
GG
ACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAGCGAGTTGCAGATATTTTCTCAGGCCTCCAA
GATCTAATATTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTTCTACG
CTAAACCCCAACGCACCTCTCTTTGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATTTCTCT
CCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCAGCCAG
CACCAGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTGAT
CTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATGGATGATGTCTTCGGAGCTGAGTTTGAT
CATCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGACTTTGGTTTAGGG
AAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAGT*GAGCGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTGTTGAA
CCGGCGAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAG*TTGCTCCACGAAAC
ATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGGTTGTG
GTAA

QA 3 572 3 572
DS 

RD RR2CI74TF 721 0 0
A
ACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAGCGAGTTGCAGATATTTTCTCAGGCCTCCAA
GATCTAAGATTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTTCTACG
CTAAACCCCAACGCGCCTCTCTTCGTTCCCGCAGCCGTTAGACAAGTGGAGGATTTCTCT
CCAGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCGGCCAG
CACCAAGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTGAT
CTTCTTCCGGAATCTTTTGATTTCGATGACATGGAAGATGTCTTTCAAGCTGAGTTTGAT
TGTCATCAAGGATACGTTGGACAACAAATGTATCAGACACCTTCGGACTTTGGTTTAGGG
AAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGCGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTGTTGAA
CCGGCGAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAAC
ATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTAG
CCACCTGTACCTTTGTAATTTTT*AGTATTTTCTGCTTTCCCC*AAGAGAGAAGCTGTAA
CTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCTCAAAAAAA
TGTAAAAA

QA 2 713 2 713
DS 

RD RR2AA89JQ 572 0 0
G
AACGCACCTCTCTTCGTTCCAGCAGCTGTTAGACAAGTGGAAGATTTCTCTCCGGAGTGG
TGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCAGCCAGCACCAGGGA
GCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTTCCG
GAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGACGTCTTCCAAGCTGAGTTTGATCATCATCAA
GGATACGTTGGGCAACAAGTGTACCAGGCACCTTCTGAGTTTGGTCTAGGGAAGAATGGT
GAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTGTTGAACCGGCCAAG
TATGCAGAGAAGCCAGCGAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAACATCCACCAG
CCTCGTTGAAGTGGGTTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTAGCCACCTGTA
CCTTTGTAATTTTT*AGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGTAACTTCTTTGT
ATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGT
C

QA 2 571 2 571
DS 

RD RR2AA89TF 572 0 0
G
AACGCACCTCTCTTCGTTCCAGCAGCTGTTAGACAAGTGGAAGATTTCTCTCCGGAGTGG
TGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCAGCCAGCACCAGGGA
GCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTTCCG
GAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGACGTCTTCCAAGCTGAGTTTGATCATCATCAA
GGATACGTTGGGCAACAAGTGTACCAGGCACCTTCTGAGTTTGGTCTAGGGAAGAATGGT
GAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTGTTGAACCGGCCAAG
TATGCAGAGAAGCCAGCGAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAACATCCACCAG
CCTCGTTGAAGTGGGTTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTAGCCACCTGTA
CCTTTGTAATTTTT*AGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGTAACTTCTTTGT
ATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGT
C

QA 2 571 2 571
DS 

RD RR2AL77TF 709 0 0
GGACGTCGTG
TTTCATCCTTATCAACTTGAGCGAGTTGCAGATATTTTCTCAGGTCTCCAAGATCTAATA
TTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTTCTACGCTAAACCCC
AACGCACCTCTCTTTGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATTTCTCTCCGGAGTGG
TGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCAGCCAGCACCAGGGA
GCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTTCCG
GAATCGTTTGATTTCGATGACATGGATGATGTCTTCGGAGCTGAGTTTGATCATCATCAA
GGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGACTTTGGTTTAGGGAAGAATGGT
GAGATGGTGAGGAAGTCGAGCGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTGTTGAACCGGCGAAG
TATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAACATCCACCAG
CCTCGTTGAAGTGGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTAGCCACCTGTA
CCTTTGTAATTTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCA*GAGAGAAGCTGTAACTTCTTTGT
ATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCTCAAA

QA 11 709 11 709
DS 

RD RR2C218TF 714 0 0
GGGTCACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAGCGAGTTGCAGATATTTTCTCAGGCC
TCCAAGATCTAATATTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTT
CTACGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTTTGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATT
TCTCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCA
GCCAGCACCAGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGGGAATCGGGAAGTCGATGTAG
CTGATCTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATGGATGATGTCTTCGGAGCTGAGT
TTGATCATCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGACTTTGGTT
TAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAGTCGAGCGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTG
TTGAACCGGCGAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCAC
GAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATC
TTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTT*AGTATTTTCTGCTTTCCCC*AAGAGAGAAGC
TGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAA*CTTGTTATCTCAAAA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2BC33JQ 775 0 0
GGGTCACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAGCGAGTTGCAGATATTTTCTCAGGCC
TCCAAGATCTAAGATTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTT
CTACGCTAAACCCCAACGCGCCTCTCTTCATTCCCGCAGCCGTTAGACAAGTGGAGGATT
TCTCTCCAGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCA
GCCAGCACCAAGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAG
CTGATCTTCTTCCGGAATCTTTTGATTTCGATGACATAGAAGATGTCTTTCAAGCTGAGT
TTGATTGTCATCAAGGATACGTTGGACAACAAATGTATCAGACACCTTCGGACTTTGGTT
TAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGCGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTG
TTGAACCGGCGAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCAC
GAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATC
TTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTT*AGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGC
TGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCTCAAAAAAAATG
TAAAAAACATAAAAA*TTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAATAGCGTTACGC
AG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2DT71JQ 363 0 0
GG
GTTTGGTCTAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAG
GTCGATTGTTGAACCGGCCAAGTATGCAGAGAAGCCAGCGAAATGGGGAAACCAGAAGGT
TGCTCCACGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGTTTGTGATAACTAGGCAGAGTAT
GTTGTATCTTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTT*AGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAG
AGAGAAGCTGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCTCAA
AAAAAATGTAAAAAACATAAAAAATTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAATAGCGTTACG
C

QA 3 363 3 363
DS 

RD RR2BF91JQ 773 0 0
GGGTCACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAGCGAGTTGCAGATATTTTCTCAGGCC
TCCAAGATCTAATATTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTT
CTACGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTTTGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATT
TCTCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCA
GCCAGCACCAGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAG
CTGATCTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATGGATGATGTCTTCGGAGCTGAGT
TTGATCATCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGACTTTGGTT
TAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAGTCGAGCGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTG
TTGAACCGGCGAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCAC
GAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATC
TTTAGCCCCCTGTACCTTTGTAATTTTT*AGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGC
TGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCTCAAAAAAAATG
TAAAAAACATAAAAA*TTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAATAGCGTTACGC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2BF91TF 773 0 0
GGGTCACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAGCGAGTTGCAGATATTTTCTCAGGCC
TCCAAGATCTAATATTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTT
CTACGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTTTGTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATT
TCTCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCA
GCCAGCACCAGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAG
CTGATCTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATGGATGATGTCTTCGGAGCTGAGT
TTGATCATCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGACTTTGGTT
TAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAGTCGAGCGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTG
TTGAACCGGCGAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCAC
GAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATC
TTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTT*AGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGC
TGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCTCAAAAAAAATG
TAAAAAACATAAAAA*TTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAATAGCGTTACGC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2DT71TF 665 0 0
G
AGGAAGACGTTCTACGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTTCGTTCCAGCAGCTGTTAGACA
AGTGGAAGATTTCTCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTATCATGA
CTACTGGATCAGCCAGCACCAGGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGA
AGTCGATGTAGCTGATCTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGACGTCTT
CCAAGCTGAGTTTGATCATCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAGTGTACCAGGCACCTTC
TGGGTTTGGTCTAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCC
TAGGTCGATTGTTGAACCGGCCAAGTATGCAGAGAAGCCAGCGAAATGGGGAAACCAGAA
GGTTGCTCCACGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGTTTGTGATAACTAGGCAGAG
TATGTTGTATCTTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTT*AGTATTTTCTGCTTTCCCCC
AAGAGAGAAGCTGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCT
CAAAAAAAATGTAAAAAACATAAAAAATTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAATAGCGTT
ACGC

QA 2 665 2 665
DS 

RD RR2DO11JQ 624 0 0
GTTCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATTTCTCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACG
ACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCAGCCAGCACCAGGGAGCTGATGGTTTCTAC
GACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTC
GATGACATGGATGATGTCTTCGGAGCTGAGTTTGATCATCATCAAGGATACGTTGGGCAA
CAAATGTATCAGGCACCTTCTGACTTTGGTTTAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAG
T*GAGCGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTGTTGAACCGGCGAAGTATGCAGAGAAGCCA
GCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGG
GTTGTGGTAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTT*
AGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTC
AGTCTCAAAACTTGTTATCTCAAAAAAAATGTAAAAAACATAAAAAATTGTATAATTTGA
AGAGTAATGAGAATAGCGTTACGC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2BC33TF 775 0 0
GGGTCACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGAGCGAGTTGCAGATATTTTCTCAGGCC
TCCAAGATCTAAGATTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTT
CTACGCTAAACCCCAACGCGCCTCTCTTCATTCCCGCAGCCGTTAGACAAGTGGAGGATT
TCTCTCCAGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCA
GCCAGCACCAAGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAG
CTGATCTTCTTCCGGAATCTTTTGATTTCGATGACATAGAAGATGTCTTTCAAGCTGAGT
TTGATTGTCATCAAGGATACGTTGGACAACAAATGTATCAGACACCTTCGGACTTTGGTT
TAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGCGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTG
TTGAACCGGCGAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCAC
GAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATC
TTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTT*AGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGC
TGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCTCAAAAAAAATG
TAAAAAACATAAAAA*TTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAATAGCGTTACGC
AG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2CI74JQ 705 0 0
GATTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTTCTACGCTAAACC
CCAACGCGCCTCTCTTCGTTCCCGCAGCCGTTAGACAAGTGGAGGATTTCTCTCCAGAGT
GGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCGGCCAGCACCAAG
GAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTTC
CGGAATCTTTTGATTTCGATGACATGGAAGATGTCTTTCAAGCTGAGTTTGATTGTCATC
AAGGATACGTTGGACAACAAATGTATCAGACACCTTCGGACTTTGGTTTAGGGAAGAATG
GTGAGATGGTGAGGAAATCGAGCGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTGTTGAACCGGCGA
AGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAACATCCACC
AGCCTCGTTGAAGTGGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTAGCCACCTG
TACCTTTGTAATTTTT*AGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGTAACTTCTTT
GTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCTCAAAAAAAATGTAAAAAACATAA
AAA*TTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAATAGCGTTACGCACAT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2DD92JQ 649 0 0
GCTAAACCCCAACGCGCCTCTCTTCGTTCCCGCAGCCGTTAGACAAGTGGAGGATTTCTC
TCCAGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCAGCCA
GCACCGAGGAGCTGATGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTGA
TCTTCTTCCGGAATCTTTTGATTTCGATGACATGGAAGATGTCTTTCAAGCTGAGTTTGA
TTGTCATCAAGGATACGTTGGACAACAAATGTATCAGACACCTTCGGACTTTGGTTTAGG
GAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGCGGGAACAGGAGCCCTAGGTCAATTGTTGA
ACCGGCGAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAA
CATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTA
GCCACCTGTACCTTTGTAATTTTT*AGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGTA
ACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCTCAAAAAAAATGTAAA
AAACATAAAAA*TTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAATAGCGTTACG
T

QA 1 648 1 648
DS 



AS 3 15

CO CL111Contig1 1332 7 3 U
GTTTCAGATGATTCTCGTGTTATTAAGGAATCATCTTTTGTGTGGTCAGTAGACAGGTTC
TACAATTTCTTTTATAAGCCCTCTTTTGTGTTATTTCCGTTAATATACATGAATTTATTG
ACAAACGCGTTTGTCTGTGACATTATAAAAGAAAGCACAATACAATTATACATCATTGGA
TCATACATTCTTTACACTAAGAATATATATCGTCATGTATGATATTGTCGCCTGTAACAT
GAATATTAAAATTAAACATGGTAAGAAACAAGAAACTAAATCATGCAAGGCCTTTCCTCA
TCTGATAGATAAGAGGTTTAGATATTACTTCATAGGCTCTCATGGTGGGGTGAGCGAAGT
CATAGAATACGTACTCATCTGGGTTTCGGCATGGTATTATCGATGTCACCATACAACAAC
ACGATCTTTTCGCTTCTGCAAACCCAAAGGCCTTAGGATGGTTGATAAGATTCATAATAG
AGCCGTACATGTCGACGTAAACAAACTTTGCACCTTTAAAACATTCTTCTACTTCGTAAC
CAATAAGAGCTTTCCGCAATTTTGTGTTGAAGTCTTCCGAAATTTTATTCATCATGAAGT
TACACCATGCAAATACTCCACCAAATATGAAGCGATGGAAAGGCAAGCATCCTACCGGAA
TCGCTCCCATCACCGCGAATTTTCTCGCTCCAAGATCGTATAAATCTTGTAGGAATGTTT
TTGTCCAAAAAACCATGTTACTTGTGTATGTATCTTTGGATTGTAATCGTAGACGAGCGG
GAGTCACGAAGTATGCAATATCGTTGTTTCCCTCAGAAATAAGAAACACCGCGTTTGAAA
TTATATTTTTCATCTCTTTCTTATTTTTCGTCGCATTTTTTAGTTGCTTCAAATATTTTT
TGAAATCTCTTACTTGGTCCTCTGTCGATAAGACTCTATGTATTCTAGATGTAAGATCGT
CGATTCCTGAACCACCTGATGCGAAACAAACGCCAGTTTTAAGGTCGTTGCGCTTGATGC
GACGCATCCTACGATAAGCGGGTACAACTCTTTTCAACCCCAACCCTTGAGCAACCATAT
CGGTGAAAACTCTCCCATTTCCAAATCTGCCCGTCGGTATCTTAAAGTCATAGTTCCAAC
CATATGGCCAGTAATTTCCCTTGAATACAGTAAGAAGACGATTATTGTTACCAGTATCTA
GTATTGAATCTCCAAAAGCAAAAACTGCAGAAAAGGATTTGTTTTGTCCAGCCGCTGATG
AAAGCCAATAAATGGAAAATAATGTCAAGACCAATATATTTTCCCTAAACATATCGACTA
TTAAGTTCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY94JQ U 74
AF RR2FG60JQ U 120
AF RR2EF08JQ U 97
AF RR2AX07JQ U 1
AF RR2AX07TFB C 661
AF RR2FY94TF C 654
AF RR2FG60TF C 683
BS 1 844 RR2AX07JQ
BS 845 1324 RR2FY94TF
BS 1325 1332 RR2FG60TF

RD RR2FY94JQ 528 0 0
ATAAG
CCCTCTTTTGTGTTATTTCCGTTAATATACATGAATTTATTGACAAACGCGTTTGTCTGT
GACATTATAAAAGAAAGCACAATACAATTATACATCATTGGATCATACATTCTTTACACT
AAGAATATATATCGTCATGTATGATATTGTCGCCTGTAACATGAATATTAAAATTAAACA
TGGTAAGAAACAAGAAACTAAATCATGCAAGGCCTTTCCTCATCTGATAGATAAGAGGTT
TAGATATTACTTCATAGGCTCTCATGGTGGGGTGAGCGAAGTCATAGAATACGTACTCAT
CTGGGTTTCGGCATGGTATTATCGATGTCACCATACAACAACACGATCTTTTCGCCTCTG
CAAACCCAAAGGCCTTAGGATGGTTGATAAGATTCATAATAGAGCCGTACATGTCGACGT
AAACAAACTTTGCACCTTTAAAACATTCTTCTACTTCGTAACCAATAAGAGCTTTCCGCA
ATTTTGTGTTGAAGTCTTCCGAAATTTTATTCATCATGAAGTT

QA 6 528 6 528
DS 

RD RR2FG60JQ 556 0 0
GACAAACGCGTTTGTCTGTGACATTATAAAAGAAAGCACAATACAATTATACATCATTGG
ATCATACATTCTTTACACTAAGAATATATATCGTCATGTATGATATTGTCGCCTGTAACA
TGAATATTAAAATTAAACATGGTAAGAAACAAGAAACTAAATCATGCAAGGCCTTTCCTC
ATCTGATAGATAAGAGGTTTAGATATTACTTCATGGGCTCTCATGGTGGGGTGAGCGAAG
TCATAGAATACGTACTCATCTGGGTTTCGGCATGGTATTATCGATGTCACCATACAACAA
CACGATCTTTTCGCTTCTGCAAACCCAAAGGCCTTAGGATGGTTGATAAGATTCATAATA
AAGCCGTACATGTCGACGTAAACAAACTTTGCACCTTTAAAACATTCTTCTACTTCGTAA
CCAATAAGAGCTTTCCGCAATTTTGTGTTGAAGTCTTCCGAAATTTTATTCATCATGAAG
TTACACCATGCAAATACTCCACCAAATATGAAGCGATGGAAAGACAAGCATCCTACCGGA
ATCGCTCCCGTCACCG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2EF08JQ 628 0 0
CCGTTAATATACATGAATTTATTGACAAACGCGTTTGTCTGTGACATTATAAAAGAAAGC
ACAATACAATTATACATCATTGGATCATACATTCTTTACACTAAGAATATATATCGTCAT
GTATGATATTGTCGCCTGTAACATGAATATTAAAATTAAACATGGTAAGAAACAAGAAAC
TAAATCATGCAAGGCCTTTCCTCATCTGATAGATAAGAGGTTTAGATATTACTTCATAGG
CTCTCATGGTGGGGTGAGCGAAGTCATAGAATACGTACTCATCTGGGTTTCGGCATGGTA
TTATCGATGTCACCATACAACAACACGATCTTTTCGCTTCTGCAAACCCATAGGCCTTAG
GATGGTTGATAAGATTCATAATAGAGCCGTACATGTCGACGTAAACAAACTTTGCACCTT
TAAAACATTCTTCTACTTCGTAACCAATAAGAGCTTTCCGCAATTTTGTGTTGAAGTCTT
CCGAAATTTTATTCATCATGAAGTTACACCATGCAAATACTCCACCAAATATGAAGCGAT
GGAAAGGCAAGCATCCTACCGGAATCGCTCCCATCACCGCGAATTTTCTCGCTCCAAGAT
CGTATAAATCTTGTAGGAATGTTTTTGT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2AX07JQ 844 0 0
GTTTCAGATGATTCTCGTGTTATTAAGGAATCATCTTTTGTGTGGTCAGTAGACAGGTTC
TACAATTTCTTTTATAAGCCCTCTTTTGTGTTATTTCCGTTAATATACATGAATTTATTG
ACAAACGCGTTTGTCTGTGACATTATAAAAGAAAGCACAATACAATTATACATCATTGGA
TCATACATTCTTTACACTAAGAATATATATCGTCATGTATGATATTGTCGCCTGTAACAT
GAATATTAAAATTAAACATGGTAAGAAACAAGAAACTAAATCATGCAAGGCCTTTCCTCA
TCTGATAGATAAGAGGTTTAGATATTACTTCATAGGCTCTCATGGTGGGGTGAGCGAAGT
CATAGAATACGTACTCATCTGGGTTTCGGCATGGTATTATCGATGTCACCATACAACAAC
ACGATCTTTTCGCTTCTGCAAACCCAAAGGCCTTAGGATGGTTGATAAGATTCATAATAG
AGCCGTACATGTCGACGTAAACAAACTTTGCACCTTTAAAACATTCTTCTACTTCGTAAC
CAATAAGAGCTTTCCGCAATTTTGTGTTGAAGTCTTCCGAAATTTTATTCATCATGAAGT
TACACCATGCAAATACTCCACCAAATATGAAGCGATGGAAAGGCAAGCATCCTACCGGAA
TCGCTCCCATCACCGCGAATTTTCTCGCTCCAAGATCGTATAAATCTTGTAGGAATGTTT
TTGTCCAAAAAACCATGTTACTTGTGTATGTATCTTTGGATTGTAATCGTAGACGAGCGG
GAGTCACGAAGTATGCAATATCGTTGTTTCCCTCAGAAATAAGAAACACCGCGTTTGAAA
TTAT

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR2AX07TFB 260 0 0
TCGCTCCCATCACCGCGAATTTTCTCGCTCCAAGATCGTATAAATCTTGTAGGAATGTTT
TTGTCCAAAAAACCATGTTACTTGTGTATGTATCTTTGGATTGTAATCGTAGACGAGCGG
GAGTCACGAAGTATGCAATATCGTTGTTTCCCTCAGAAATAAGAAACACCGCGTTTGAAA
TTATATTTTTCATCTCTTTCTTATTTTTCGTCGCATTTTTTAGTTGCTTCAAATATTTTT
TGAAATCTCTTACTTGGTCC

QA 1 260 1 260
DS 

RD RR2FY94TF 679 0 0
ACG
GGAATCGCTCCCATCACCGCGAATTTTCTCGCTCCAAGATCGTATAAATCTTGTAGGAAT
GTTTTTGTCCAAAAAACCATGTTACTTGTGTATGTATCTTTGGATTGTAATCGTAGACGA
GCGGGAGTCACGAAGTATGCAATATCGTTGTTTCCTTCAGAAATAAGAAACACCGCGTTT
GAAATTATATTTTTCATCTCTTTCTTATTTTTCGTCGCATTTTTTAGTTGCTTCAAATAT
TTTTTGAAATCTCTTACTTGGTCCTCTGTCGATAAGACTCTATGTATTCTAGATGTAAGA
TCGTCGATTCCTGAACCACCTGATGCGAAACAAACGCCAGTTTTAAGGTCGTTGCGCTTG
ATGCGACGCATCCTACGATAAGCGGGTACAACTCTTTTCAACCCCAACCCTTGAGCAACC
ATATCGGTGAAAACTCTCCCATTTCCAAATCTGCCCGTCGGTATCTTAAAGTCATAGTTC
CAACCATATGGCCAGTAATTTCCCTTGAATACAGTAAGAAGACGATTATTGTTACCAGTA
TCTAGTATTGAATCTCCAAAAGCAAAAACTGCAGAAAAGGATTTGTTTTGTCCAGCCGCT
GATGAAAGCCAATAAATGGAAAATAATGTCAAGACCAATATATTTTCCCTAAACATATCG
ACTATTAA
GTTCACCC

QA 4 671 4 671
DS 

RD RR2FG60TF 650 0 0
TCTCGCTCCAAGATCGTATAAATCTTGTAGGAATGTTTTTGTCCAAAAAACCATGTTACT
TGTGTATGTATCTTTGGATTGTAATCGTAGACGAGCGGGAGTCACGAAGTATGCAATATC
GTTGTTTCCTTCAGAAATAAGAAACACCGCGTTTGAAATTATATTTTTCATCTCTTTCTT
ATTTTTCGTCGCATTTTTTAGTTGCTTCAAATATTTTTTGAAATCTCTTACTTGGTCCTC
TGTCGATAAGACTCTATGTATTCTAGATGTAAGATCGTCGATTCCTGAACCACCTGATGC
GAAACAAACGCCAGTTTTAAGGTCGTTGCGCTTGATGCGACGCATCCTACGATAAGCGGG
TACAACTCTTTTCAACCCCAACCCTTGAGCAACCATATCGGTGAAAACTCTCCCATTTCC
AAATCTGCCCGTCGGTATCTTAAAGTCATAGTTCCAACCATATGGCCAGTAATTTCCCTT
GAATACAGTAAGAAGACGATTATTGTTACCAGTATCTAGTATTGAATCTCCAAAAGCAAA
AACTGCAGAAAAGGATTTGTTTTGTCCAGCCGCTGATGAAAGCCAATAAATGGAAAATAA
TGTCAAGACCAATATATTTTCCCTAAACATATCGACTATTAAGTTCACCC

QA 1 650 1 650
DS 



CO CL111Contig2 1120 5 11 U
GGGTGAACTTAATTAATTGTCAATATGTTTAGGGAGAAAATATTGGTGTTGTCATTATTT
TCCATTTATTGCCTTTCATCGGCTGGAAAAAACAAATCTTTTTCTGCACTTTTCGCTTTT
GGAGATTCAATACTAGATACTGGTAACAATAATCGTCTTCTTACTCTACTCAAGGCAAAT
TACTGGCCATATGGATTGAAATATGACTTTAAGATACCGACCGGAAGATTTTCAAGTGGA
AGAGTTTTCACCGATGTGGTTGCTGAAGGGTTGGGGATAAAAAGAATTGTACCAGCTTAT
CGTAGGATGCGTCGCATCAAGCCCGACGACCTTAAAACTGGCGTTTGTTTCGCATCAGGT
GGTTCAGGAATCGACGATCTTACATCTGGACTACATAGAGTCTTATCGACAGAGGACCAA
GTAAGAGATTTCAAAAAATATTTGAAGCAACTAAAAAATGAGACGAAAAAAAAGAAAGAG
ATGAAAGATATCATTTCAAACGCAGTGTTTCTTGTTTCTAGAGGAAATAACGATACTGGA
TACTTCGTGAGTCCCGCTCGTTATATGCGATTACAATCCAAAGAAAAATACACAAGTAAC
CTGGTTTTTTGGACAAAAACATTCCTACAAGATTTATATGATCTTGGAGCTAGAAAATTC
GCGGTGATGGGAGTGCTGCCGGCAAGGTGTTTGCCGCTCCATCGATTTCTATTTGGTGAA
GGATTCGCATGGTGTAACTTCATAATGAATAGACTTTCGGTGAACTTTAACACAAAATTG
CAGAAAGCTCTTATTGGTTACGGAGTAGAAGAGTCTTTTAAAGGTGCAAAGTTTGTTTAC
GTTGACATGTACGGCAGTCTTATGGATATTATCAACCATCCCAAGGCTTATGGGTTTAAA
GAAGTGAAACGATCGTGTTGTTGTATGGTGAATTCGATAATACCATGCCGAAACCCGGAT
GAGTATGCATTCTATGACTTCATTCACCCCACCACGAAAGCCTATGAAGTTATATCTAAA
CCTCTTGTCCATCAAATGAGGAAAGGCCTTGCTTGATTTAGTTTCTTGTTTCTTACAATC
AATCCATATTATTAAAACATGATCATTGTTATATTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AZ96TFB U 1
AF RR2GK62TF U 3
AF RR2BC14TF U 2
AF RR2BC14JQ C 364
AF RR2GK62JQ C 439
BS 1 79 RR2AZ96TFB
BS 80 80 RR2BC14TF
BS 81 175 RR2AZ96TFB
BS 176 176 RR2BC14TF
BS 177 276 RR2AZ96TFB
BS 277 278 RR2BC14TF
BS 279 410 RR2AZ96TFB
BS 411 411 RR2BC14TF
BS 412 465 RR2AZ96TFB
BS 466 785 RR2BC14TF
BS 786 1120 RR2BC14JQ

RD RR2AZ96TFB 465 0 0
GGGTGAACTTAATTAATTGTCAATATGTTTAGGGAGAAAATATTGGTGTTGTCATTATTT
TCCATTTATTGCCTTTCATTGGCTGGAAAAAACAAATCTTTTTCTGCACTTTTCGCTTTT
GGAGATTCAATACTAGATACTGGTAACAATAATCGTCTTCTTACTCTACTCAAGGGAAAT
TACTGGCCATATGGATTGAAATATGACTTTAAGATACCGACCGGAAGATTTTCAAGTGGA
AGAGTTTTCACCGATGTGGTTGCTGAAGGGTTGGGGGGAAAAAGAATTGTACCAGCTTAT
CGTAGGATGCGTCGCATCAAGCCCGACGACCTTAAAACTGGCGTTTGTTTCGCATCAGGT
GGTTCAGGAATCGACGATCTTACATCTGGACTACATAGAGTCTTATCGACGGAGGACCAA
GTAAGAGATTTCAAAAAATATTTGAAGCAACTAAAAAATGAGACG

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2GK62TF 657 0 0
GGGAACTTAA
TTAATTGTCAATATGTTTAGGGAGAAAATATTGGTGTTGTCATTATTTTCCATTTATTGC
CTTTCATCGGCTGGAAAAAACAAATCTTTTTCTGCACTTTTCGCTTTTGGAGATTCAATA
CTAGATACTGGTAACAATAATCGTCTTCTTACTCTACTCAAGGCAAATTACTGGCCATAT
GGATTGAAATATGACTTTAAGATACCGACCGGAAGATTTTCAAGTGGAAGAGTTTTCACC
GATGTGGTTGCTGAAGGGTTGGGGATAAAAAGAATTGTACCAGCTTATCGTAGGATGCGT
CGCATCAAGCCCGACGACCTTAAAACTGGCGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTTCAGGAATC
GACGATCTTACATCTGGACTACATAGAGTCTTATCGACAGAGGACCAAGTAAGAGATTTC
AAAAAATATTTGAAGCAACTAAAAAATGAGACGAAAAAAAAGAAAGAGATGAAAGATATC
ATTTCAAACGCAGTGTTTCTTGTTTCTAGAGGAAATAACGATATTGGATACTTCGTGAGT
CCCGCTCGTTATATGCGATTACAATCCAAAGAAAAATACACAAGTAACCTGGTTTTTTGG
ACAAAAACATTCCTACAAGATTTATATGATCTTGGAGCTAGAAAATT

QA 11 657 11 657
DS 

RD RR2BC14TF 792 0 0
GGGGAACTTAA
TTAATTGTCAATATGTTTAGGGAGAAAATATTGGTGTTGTCATTATTTTCCATTTATTGC
CTTTCATCGGCTGGAAAAAACAAATCTTTTTCTGCACTTTTCGCTTTTGGAGATTCAATA
CTAGATACTGGTAACAATAATCGTCTTCTCACTCTACTCAAGGCAAATTACTGGCCATAT
GGATTGAAATATGACTTTAAGATACCGACCGGAAGATTTTCAAGTGGAAGAGTTTTCACC
GATGTGGTTGCTGAAGGGTTGGGGATAAAAAGAATTGTACCAGCTTATCGTAGGATGCGT
CGCATCAAGCCCGACGACCTTAAAACTGGCGTTTGTTTCGCATCAGGTGGTTCAGGAATC
GACGATCTTACATCTGGACTACATAGAGTCTTATCGACAGAGGACCAAGTAAGAGATTTC
AAAAAATATTTGAAGCAACTAAAAAATGAGACGAAAAAAAAGAAAGAGATGAAAGATATC
ATTTCAAACGCAGTGTTTCTTGTTTCTAGAGGAAATAACGATACTGGATACTTCGTGAGT
CCCGCTCGTTATATGCGATTACAATCCAAAGAAAAATACACAAGTAACCTGGTTTTTTGG
ACAAAAACATTCCTACAAGATTTATATGATCTTGGAGCTAGAAAATTCGCGGTGATGGGA
GTGCTGCCGGCAAGGTGTTTGCCGCTCCATCGATTTCTATTTGGTGAAGGATTCGCATGG
TGTAACTTCATAATGAATAGACTTTCGGTGAACTTTAACACAAAATTGCAGAA
GCTCTTAT

QA 12 784 12 784
DS 

RD RR2BC14JQ 757 0 0
TCAGGAATCGACGATCTTACATCTGGACTACATAGAGTCTTATCGACAGAGGACCAAGTA
AGAGATTTCAAAAAATATTTGAAGCAACTAAAAAATGAGACGAAAAAAAAGAAAGAGATG
AAAGATATCATTTCAAACGCAGTGTTTCTTGTTTCTAGAGGAAATAACGATACTGGATAC
TTCGTGAGTCCCGCTCGTTATATGCGATTACAATCCAAAGAAAAATACACAAGTAACCTG
GTTTTTTGGACAAAAACATTCCTACAAGATTTATATGATCTTGGAGCTAGAAAATTCGCG
GTGATGGGAGTGCTGCCGGCAAGGTGTTTGCCGCTCCATCGATTTCTATTTGGTGAAGGA
TTCGCATGGTGTAACTTCATAATGAATAGACTTTCGGTGAACTTTAACACAAAATTGCAG
AAAGCTCTTATTGGTTACGGAGTAGAAGAGTCTTTTAAAGGTGCAAAGTTTGTTTACGTT
GACATGTACGGCAGTCTTATGGATATTATCAACCATCCCAAGGCTTATGGGTTTAAAGAA
GTGAAACGATCGTGTTGTTGTATGGTGAATTCGATAATACCATGCCGAAACCCGGATGAG
TATGCATTCTATGACTTCATTCACCCCACCACGAAAGCCTATGAAGTTATATCTAAACCT
CTTGTCCATCAAATGAGGAAAGGCCTTGCTTGATTTAGTTTCTTGTTTCTTACAATCAAT
CCATATTATTAAAACATGATCATTGTTATATTTTACC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2GK62JQ 682 0 0
TATTTGAAGCAACTAAAAAATGAGACGAAAAAAAAGAAAGAGATGAAAGATATCATTTCA
AACGCAGTGTTTCTTGTTTCTAGAGGAAATAACGATATTGGATACTTCGTGAGTCCCGCT
CGTTATATGCGATTACAATCCAAAGAAAAATACACAAGTAACCTGGTTTTTTGGACAAAA
ACATTCCTACAAGATTTATATGATCTTGGAGCTAGAAAATTCGCGGTGATGGGAGTGCTG
CCGGCAGGGTGTTTGCCGCTCCATCGATTTCTATTTGGTGAAGGATTCGCATGGTGTAAC
TTCATAATGAATAGACTTTCGGTGAACTTTAACACAAAATTGCAGAAAGCTCTTATTGGT
TACGGAGTAGAAGAGTCTTTTAAAGGTGCAAAGTTTGTTTACGTTGACATGTATGGCAGT
CTTATGGATATTATCAACCATCCCAAGGCTTATGGGTTTAAAGAAGTGAAACGATCGTGT
TGTTGTATGGTGAATTCGATAATACCATGCCGAAACCCGGGTGAGTATGCATTCTATGAC
TTCATTCACCCCACCACGAAAGCCTATGAAGTTATATCTAAACCTCTTGTCCATCAAATG
AGGAAAGGCCTTGCTTGATTTAGTTTCTTGTTTCTTACAATCAATCCATATTATTAAAAC
ATGATCATTGTTATATTTTACC

QA 1 682 1 682
DS 



CO CL111Contig3 818 3 8 U
AGAAACTAAAGAATGCGACGAAAAATAAGAAAGAAATGAAATACATAATTTCGAACGCAG
TGTTTCTTATTTCTGAAGGAAATAACGACATTGGATACTTCGCGACTCCCGCTCGTCTAC
GATTACAATCCAAAGATACATACACAAGTAACATGGTTTTTTGGACAAAAACATTCCTAC
AAGATTTATACGATCTTGGAGCGAGAAAATTCGCGGTGATGGGAGCGATTCCGGTAGGAT
GCTTGCCTTTCCATCGCTTCCTATTTGGTGGAGTATTTGCATGGTGTAACTTCATGATGA
ATAAAGTTTCGGAAGACTTCAACACAAAATTGCGGAAAGCTCTTATTGGTTACGAAGTAG
AAGAATGTTTTAAAGGTGCAAAGTTTGTTTACGTCGACATGTACGGCTCTCTTATGGATC
TTATCAGCCATCCTAAGGCCTTTGGGTTTACAGAAGGGAAAAGATCGTGTTGTTGTATGG
TGACATCGATAATACCATGCCTAAACCCGGATGAGTACGTATTCTATGACTTCGCTCACC
CCACCATGAGAGCCTATGAAGTAATATCTAAACCTCTTGTCTATCAGATAAGGAAAGGCC
TTGCATGATTTAGTTTCTTGTTTCTTACCATGTTTAATTTTAATATTCATGTAACAGGCG
ACAATATCATACATGACGATATATATTCGTAGTGTAAAGAATGTATGATCCAATGATGTA
TAATTGTATTGTCCTTTCTTTTATATTGTCACCAGACAAACGCGTTTATCAATAAATGGA
TGTATATTAACGGAAATAACACAAAAGAGGGTTGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A169TF U 264
AF RR2F711JQ C 1
AF RR2GM17TF U 315
BS 1 264 RR2F711JQ
BS 265 288 RR2A169TF
BS 289 289 RR2F711JQ
BS 290 444 RR2A169TF
BS 445 446 RR2GM17TF
BS 447 767 RR2A169TF
BS 768 811 RR2GM17TF
BS 812 818 RR2F711JQ

RD RR2A169TF 507 0 0
G
TTGGTGGAGTATTTGCATGGTGTAGCTTCATGATGAATAAAGTTTCGGAAGACTTCAACA
CAAAATTGCGGAAAGCTCTTATTGGTTACGAAGTAGAAGAATGTTTTAAAGGTGCAAAGT
TTGTTTACGTCGACATGTACGGCTCTCTTATGGATCTTATCAGCCATCCTAAGGCCTTTG
**TTTACAGAAGGGAAAAGATCGTGTTGTTGTATGGTGACATCGATAATACCATGCCTAA
ACCCGGATGAGTACGTATTCTATGACTTCGCTCACCCCACCATGAGAGCCTATGAAGTAA
TATCTAAACCTCTTGTCTATCAGATAAGGAAAGGCCTTGCATGATTTAGTTTCTTGTTTC
TTACCATGTTTAATTTTAATATTCATGTAACAGGCGACAATATCATACATGACGATATAT
ATTCGTAGTGTAAAGAATGTATGATCCAATGATGTATAATTGTATTGTCCTTTCTTTTAT
ATTGTCACCAGACAAACGCGTTT
ATC

QA 2 504 2 504
DS 

RD RR2F711JQ 818 0 0
AGAAACTAAAGAATGCGACGAAAAATAAGAAAGAAATGAAATACATAATTTCGAACGCAG
TGTTTCTTATTTCTGAAGGAAATAACGACATTGGATACTTCGCGACTCCCGCTCGTCTAC
GATTACAATCCAAAGATACATACACAAGTAACATGGTTTTTTGGACAAAAACATTCCTAC
AAGATTTATACGATCTTGGAGCGAGAAAATTCGCGGTGATGGGAGCGATTCCGGTAGGAT
GCTTGCCTTTCCATCGCTTCCTATTTGGTGGAGTATTTGCATGGTGTAACTTCATGATGA
ATAAAGTTTCGGAAGACTTCAACACAAAATTGCGGAAAGCTCTTATTGGTTACGAAGTAG
AAGAATGTTTTAAAGGTGCAAAGTTTGTTTACGTCGACATGTACGGCTCTCTTATGGATC
TTATCAGCCATCCTAAGGCCTTTGGGTTTACAGAAGGGAAAAGATCGTGTTGTTGTATGG
TGACATCGATAATACCATGCCTAAACCCGGATGAGTACGTATTCTATGACTTCGCTCACC
CCACCATGAGAGCCTATGAAGTAATATCTAAACCTCTTGTCTATCAGATAAGGAAAGGCC
TTGCATGATTTAGTTTCTTGTTTCTTACCATGTTTAATTTTAATATTCATGTAACAGGCG
ACAATATCATACATGACGATATATATTCGTAGTGTAAAGAATGTATGATCCAATGATGTA
TAATTGTATTGTCCTTTCTTTTATATTGTCACCAGACAAACGCGTTTATCAATAAATGGA
TGTATATTAACGGAAATAACACAAAAGAGGGTTGTTGC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2GM17TF 500 0 0
GACTTCAACACAAAATTGCGGAAAGCTCTTATTGGTTACGAAGTAGAAGAATGTTTTAAA
GGTGCAAAGTTTGTTTACGTCGACATGTACGGCTCTCTTATGGATCTTATCAGCCATCCT
AAGGCCTTTGGGTTTACAGAAGGGAAAAGATCGTGTTGTTGTATGGTGACATCGATAATA
CCATGCCTAAACCCGGATGAGTACGTATTCTATGACTTCGCTCACCCCACCATGAGAGCC
TATGAAGTAATATCTAAACCTCTTGTCTATCAGATAAGGAAAGGCCTTGCATGATTTAGT
TTCTTGTTTCTTACCATGTTTAATTTTAATATTCATGTAACAGGCGACAATATCATACAT
GACGATATATATTCGTAGTGTAAAGAATGTATGATCCAATGATGTATAATTGTATTGTCC
TTTCTTTTATATTGTCACCAGACAAACGCGTTTATCAATAAATGGATGTATATTAACGGA
AATAACACAAAAGAGGG
TTG

QA 1 497 1 497
DS 



AS 2 16

CO CL112Contig1 733 7 38 U
AACACACAATAACAGAGTTTTCTTATTGACATGAAAAGCTTATAGTAAAACATTACAAAA
TTCATTCAACAAAACATTACATATTTTTACAAATCTTTTTTCTTAGTTTGACATGGATTC
TTATTATAATTGAGTGGTTGATAATAGCCGAAAATAAAAACACAAAAGGGTTGGTAATAA
CACAAAGATAGAGCTGAATGTTCCTTTAGTTAACTAAGGGAAGTACGTGGTAGTAGAAAT
AGCCTCCAATTGGACTTCAACGATCAACGCGTCATTCACAAGGAAACCCTTTGATGAATC
TCTGAGATCATCGAAAGAGATAAGGTCCACGATACCCCAAGAATAGGTTCTTCCGTACCA
ATTCCTGAGTTCCGATTCGCGGTTACTGAGTTTCCGTTGGTTAAGAACTCGAAACTTGAC
TCGAACATAAATGTACTCATATGCTCTTCTTTGATCTGTAGAAAGTTGAAGAAACAATGA
AACGTATTTTCCGCTTCCGGGGCCAGAACCAGTTGGAACCACTCTTAAGTTCCATTTTTT
TCCTCCAAGAGAGAACACAGATGAGTAAACATCTTTGACCAACGTGGAGAAGTTCTCAAT
TCTCCAGGTGAATTTATCAGAACTACTGCTGATTGAGAAAGTTTCTGATTCTTCAAAGGG
AGTAGGAACGGTCACATCAACACCAAACTCACAGTGTTCTCCATTGTAAAGGTAACCATT
TTTCGGGTCTTTG


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E318JQ U 1
AF RR2EB64JQ U 1
AF RR2E543JQ U 28
AF RR2DX59JQ U 1
AF RR2H350JQ U 1
AF RR2E490JQ U 2
AF RR2EB64TF C 576
BS 1 12 RR2EB64JQ
BS 13 13 RR2E318JQ
BS 14 14 RR2EB64JQ
BS 15 15 RR2DX59JQ
BS 16 19 RR2EB64JQ
BS 20 20 RR2E318JQ
BS 21 21 RR2EB64JQ
BS 22 22 RR2E318JQ
BS 23 94 RR2EB64JQ
BS 95 95 RR2E318JQ
BS 96 141 RR2EB64JQ
BS 142 142 RR2DX59JQ
BS 143 186 RR2EB64JQ
BS 187 187 RR2DX59JQ
BS 188 189 RR2EB64JQ
BS 190 190 RR2DX59JQ
BS 191 196 RR2EB64JQ
BS 197 197 RR2E318JQ
BS 198 208 RR2EB64JQ
BS 209 209 RR2DX59JQ
BS 210 214 RR2EB64JQ
BS 215 215 RR2DX59JQ
BS 216 235 RR2EB64JQ
BS 236 236 RR2DX59JQ
BS 237 305 RR2EB64JQ
BS 306 317 RR2DX59JQ
BS 318 318 RR2E543JQ
BS 319 326 RR2DX59JQ
BS 327 327 RR2H350JQ
BS 328 430 RR2DX59JQ
BS 431 431 RR2E543JQ
BS 432 500 RR2DX59JQ
BS 501 501 RR2H350JQ
BS 502 540 RR2DX59JQ
BS 541 541 RR2H350JQ
BS 542 552 RR2DX59JQ
BS 553 646 RR2H350JQ
BS 647 733 RR2E490JQ

RD RR2E318JQ 238 0 0
AACG
CACAATAACAGAGTTTTCTTATTGACATGAAAAGCTTATAGTAAAACATTACAAAATTCA
TTCAACAAAACATTACATATTTTTACGAATCTTTTTTCTTAGTTTGACATGGATTCTTAT
TATAATTGAGTGGTTGATAATAGCCGAAAATAAAAACACAAAAGGGTTGGTAATACCACA
AAGATAGAGCTGAATGTTCCTTTAGTTAACTAAGGGAAGTACTTGGTAGTAGAA

QA 5 238 5 238
DS 

RD RR2EB64JQ 308 0 0
AACACACAATAAAAAAGTTCTATTATTGACATGAAAAGCTTATAGTAAAACATTACAAAA
TTCATTCAACAAAACATTACATATTTTTACAAATTTTTTTTCTTAGTTTGACATGGATTC
TTATTATAATTGAGTGGTTGAAAATAGCCGAAAATAAAAACACAAAAGGGTTGGTAATAA
CACAAAAATGGAGCTGTATGTTCCTTTATTTAACCAAGGGAAGTACGTGGTAGTAAAAAT
AGCCTCCAATTGGACTTCAACGATCAACGCGTCATTCACAAGGAAACCCTTTGATGAATC
TCTGA
AAT

QA 1 305 1 305
DS 

RD RR2E543JQ 462 0 0
GC
CATGAGAAGCTTATAGTAAAACATTACAAAATTCATTCAACAAAACATTACATATTTTTA
CAAATTTTTTTTCTTAGTTTGACATGGATTCTTATTATAATTGAGTGGTTGATAATAGCC
GAAAATAAAAACACAGAAGGGTTGGTAATAACACAAAGATAGAGCTGTATGTTCCTTTAG
TTAACTAAGGGAAGTACGTGGTAGTAGAAATAGCCTCCAATTGGACTTCAACGATCAACG
CGTCATTCACAAGGAAACCCTTTGATGAATCTCTGAGATCATCGAAAGAGATAAGGTTCA
CGATACCCCAAGAATAGGTTCTTCCGTACCAATTCCTGAGTTCCGATTCGCGGTCACTGA
GTTTCCGTTGGTTAAGAACTCGAAACTTGACTCGAACATAAATGTACTCATATGCTCTTC
TTTGATCTGTAGAAAGTTGAAGAAACAATGAAACGTATTT

QA 3 462 3 462
DS 

RD RR2DX59JQ 552 0 0
GACA
CACAATAAAAGAGTTCTATTATTGACATGAAAAGCTTATAGTAAAACATTACAAAATTCA
TTCAACAAAACATTACATATTTTTACAAATTTTTTTTCTTAGTTTGACATGGATTCTTAT
TATAATTGAGTGGTTGATAATAGCCGAAAATAAAAACACAGAAGGGTTGGTAATAACACA
AAGATAGAGCTGTATGTTCCTTTAGTTAACTAAGGGAAGTACGTGGTAGTAGAAATAGCC
TCCAATTGGACTTCAACGATCAACGCGTCATTCACAAGGAAACCCTTTGATGAATCTCTG
AGATCATCGAAAG*GATAAGGTTCACGATACCCCAAGAATAGGTTCTTCCGTACCAATTC
CTGAGTTCCGATTCGCGGTTACTGAGTTTCCGTTGGTTAAGAACTCGAAACTTGACTCGA
ACATAAGTGTACTCATATGCTCTTCTTTGATCTGTAGAAAGTTGAAGAAACAATGAAACG
TATTTTCCGCTTCCGGAGCCAGAACCAGTTGGAACCACTCTTAAGTTCCATTTTTT*CCT
CCAAGAGA

QA 5 552 5 552
DS 

RD RR2H350JQ 646 0 0
GGCG
CACAATAACAGAGTTTTCTTATTGACATGAAAAGCTTATAGTAAAACATTACAAAATTCA
TTCAACAAAACATTACATATTTTTACGAATCTTTTTTCTTAGTTTGACATGGATTCTTAT
TATAATTGAGTGGTTGATAATAGCCGAAAATAAAAACACAAAAGGGTTGGTAATAACACA
AAGATAGAGCTGAATGTTCCTTTAGTTAACTAAGGGAAGTACTTGGTAGTAGAAATAGCC
TCCAATTGGACTTCAACGATCAACGCGTCATTCACAAGGAAACCCTTTGATGAATCTCTG
AAATCATCGAAAGAGATAAGGTCCGCGATACCCCAAGAATAGGTTCTTCCGTACCAATTC
CTGAGTTCCGATTCGCGGTTACTGAGTTTGCGTTGGTTAAGAACTCGAAACTTGACTCGA
ACATAAATGTACTCATATGCTCTTCTTTGATCTGTAGAAAATTGAAGAAACAATGAAACG
TATTTTCCGCTTCCGGGGCCAGAACCAGTTGGAACCACTCTTAAGTTCCATTTTTTTCCT
CCAAGAGAGAACACAGATGAGTAAACATCTTTGACCAACGTGGAGAAGTTCTCAATTCTC
CAGGTGAATTTATCAGAACTACTGCTGATTGAGAAAGTTTCT

QA 5 646 5 646
DS 

RD RR2E490JQ 732 0 0
ACG
CACAATAACAGAGTTTTCTTATTGACATGAAAAGCTTATAGTAAAACATTACAAAATTCA
TTCAACAAAACATTACATATTTTTACGAATCTTTTTTCTTAGTTTGACATGGATTCTTAT
TATAATTGAGTGGTTGATAATAGCCGAAAATAAAAACACAAAAGGGATGGTAATAACACA
AAGATAGAGCTGAATGTTCCTTTAGTTAACTAAGGGAAGTACTTGGTAGTAGAAATAGCC
TCCAATTGGACTTCAACGATCAACGCGTCATTCACAAGGAAACCCTTTGATGAATCTCTG
AGATCATCGAAAGAGATAAGGTCCGCGATACCCCAAGAATAGGTTCTTCCGTACCAATTC
CTGAGTTCCGATTCGCGGTTACTGAGTTTGCGTTGGTTAAGAACTCGAAACTTGACTCGA
ACATAAATGTACTCATATGCTCTTCTTTGATCTGTAGAAAGTTGAAGAAACAATGAAACG
TATTTTCCGCTTCCGGGGCCAGAACCAGTTGGAACCACTCTTAAGTTCCATTTTTTTCCT
CCAAGAGAGAACACAGATGAGTAAACATCTTTGACCAACGTGGAGAAGTTCTCAATTCTC
CAGGTGAATTTATCAGAACTACTGCTGATTGAGAAAGTTTCTGATTCTTCAAAGGGAGTA
GGAACGGTCACATCAACACCAAACTCACAGTGTTCTCCATTGTAAAGGTAACCATTTTTC
GGGTCTTTG

QA 4 732 4 732
DS 

RD RR2EB64TF 153 0 0
TGACCAACGTGGAGAAGTTCTCAATTCTCCAGGTGAATTTATCAGAACTACTGCTGATTG
AGAAAGTTTCTGATTCTTCAAAGGGAGTAGGAACGGTCACATCAACACCAAACTCACAGT
GTTCTCCATTGTAAAGGTAACCATTTTTCGGG
C

QA 1 152 1 152
DS 



CO CL112Contig2 764 9 18 U
GGGACACTCCATCCACAGAAAAACATGAAAAATCACTACAGAAACACCATCTCTATCTCT
CTTACATATCTCTTTCTTTGTCTCTTTATCACATATGCGTCTTCACAATCCTTGATAAGA
CAAATCACCGATGACTTCAATACAAATCTAAAAGAAGAAGTGCCTTACGTACAAAAACAT
CAAGAGATCTCATCGCGTCACTATAATGTCTCTCATTCGAAGACGGTAACAGGTATGAGA
AATCGTCGTCCATCAACCTACTCTTACAAGATTGAGACGAACGTTATAGACCAATTTGAA
ACTCGTCCTTTCACGGTTGGTGGATACAATTGGATTCTCCGTGTGTACCTTAATGGGAAC
ACAAAGGATGGTGGTGCAGGTTATGTTTCTCTTTACGTAGAAATAGACAAGTCAGGTTTC
GTGGATTCTGCACATCAAGAGGTTTACGCGGATCTCAGGTTTTACATCTTCAACAGGAAC
GAGAGGAAATATTTTACCATCCAAGATACGGATGTGTGGCGATTCGATGCCTTCAACACG
ATGTGGGG*ATTCTCTCAGGTCCTCCCCGTTGATACCTTCAAAGACCCGAAAAATGGTTA
CCTTTACAATGGAGAACACTGTGAGTTTGG*TGTTGATGTGACCGTTCCTACTCCCTTTG
AAGAATCAGAAACTTTCTCAATCAGCAGTAGTTCTGATAAAT*CACCTGGAGAATTGAGA
CTTCTCCACGTTGGTCAAAGATGTTTACTCATCTGTGTCTCTCT


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 30 45 45 45 45 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 5 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 20 45 45 10 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX75TF U 20
AF RR2EJ48TF U 1
AF RR2EF68TF U 46
AF RR2E543TF U 2
AF RR2GJ02TF U 2
AF RR2E490TF U 2
AF RR2H350TF U 2
AF RR2E318TF U 9
AF RR2DX59TF U 23
BS 1 30 RR2EJ48TF
BS 31 31 RR2E490TF
BS 32 304 RR2EJ48TF
BS 305 305 RR2E490TF
BS 306 341 RR2EJ48TF
BS 342 342 RR2E490TF
BS 343 392 RR2EJ48TF
BS 393 393 RR2E490TF
BS 394 398 RR2EJ48TF
BS 399 399 RR2E490TF
BS 400 422 RR2EJ48TF
BS 423 423 RR2E490TF
BS 424 564 RR2EJ48TF
BS 565 669 RR2E490TF
BS 670 680 RR2H350TF
BS 681 681 RR2E318TF
BS 682 758 RR2H350TF
BS 759 764 RR2DX59TF

RD RR2EX75TF 375 0 0
AAAACATGAAAAATCACTACAGAAACACCATCTCTATCTCTCTTACATATCTCTTTCTTT
GTCTCCTTATCACGTATGTGTCTTCACAATCCTTGATACGACAAATCACCGATGACTTCA
ATACAAATCTAAAAGAAGAAGTGCCTTATGTACAAAAACATCAAGAGATCTCATCGCGTC
ACTATAATGTCTCTCATTCGAAGACGGTAACAGGTATGAGAAATCGTCGTCCATCAACCT
ACTCTTACAAGATTGAGACGAACGTTATGGACCAATTTGAAACTCGTCCTTTCACGGTTG
GTGGATACAATTGGATTCTCCGTGTGTACCTTAATGGGAACACAAAGGATGGTGGTGCAG
GTTATGTTTCTCTTT

QA 1 375 1 375
DS 

RD RR2EJ48TF 564 0 0
GGGACACTCCATCCACAGAAAAACATGAAAGATCACTACAGAAACACCATCTCTATCTCT
CTTACATATCTCTTTCTTTGTCTCTTTATCACATATGCGTCTTCACAATCCTTGATAAGA
CAAATCACCGATGACTTCAATACAAATCTAAAAGAAGAAGTGCCTTACGTACAAAAACAT
CAAGAGATCTCATCGCGTCACTATAATGTCTCTCATTCGAAGACGGTAACAGGTATGAGA
AATCGTCGTCCATCAACCTACTCTTACAAGATTGAGACGAACGTTATAGACCAATTTGAA
ACTCTTCCTTTCACGGTTGGTGGATACAATTGGATTCTCCGCGTGTACCTTAATGGGAAC
ACAAAGGATGGTGGTGCAGGTTATGTTTCTCTCTACGTGGAAATAGACAAGTCAGGTTTC
GTCGATTCTGCACATCAAGAGGTTTACGCGGATCTCAGGTTTTACATCTTCAACAGGAAC
GAGAGGAAATATTTTACCATCCAAGATACGGATGTGTGGCGATTCGATGCCTTCAACACG
ATGTGGGG*ATTCTCTCAGGTCCT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2EF68TF 538 0 0
G
CCATCTCTATCTCCCTTACATATCTCTTTCTTTGTCTCTTTATCACATATGCGTCTTCAC
AATCCTTGATAAGACAAATCACCGATGACTTCAATACAAATCTAAAAGAAGAAGTGCCTT
ACGTACAAAAACATCAAGAGATCTCATCGCGTCACTATAATGTCTCTCATTCGAAGACGG
TAACAGGTATGAGAAATCGTCGTCCATCAACCTACTCTTACAAGATTGAGACGAACGTTA
TAGACCAATTTGAAACTCTTCCTTTCACGGTTGGTGGATACAATTGGATTCTCCGCGTGT
ACCTTAATGGGAACACAAAGGATGGTGGTGCAGGTTATGTTTCTCTTTACGTGGAAATAG
ACAAGTCAGGTTTCGTCGATTCTGCACATCAAGAGGTTTACGCGGATCTCAGGTTTTACA
TCTTCAACAGGAACGAGAGGAAATATTTTACCATCCAAGATACGGATGTGTGGCGATTCG
ATGCCTTCAACACGATGTGGGG**TTCTCTCAGGTCCTCCCCGTTGATACCTTCAAA

QA 2 538 2 538
DS 

RD RR2E543TF 651 0 0
GGACACTACATCCACAGAAAAACATGAAAAATCACTACAGAAACACCATCCCTATCTCTC
TTACATATCTCTTTCTTTGTCTCTTTATCACATATGCGTCTTCACAATCCTTGATAAGAC
AAATCACCGATGACTTCAATACAAATCTAAAAGAAGAAGTGCCTTACGTACAAAAACATC
AAGAGATCTCATCGCGTCACTATAATGTCTCTCATTCGAAGACGGTAACAGGTATGAGAA
ATCGTCGTCCATCAACCTACTCTTACAAGATTGAGGCGAACGTTATAGACCAATTTGAAA
CTCGTCCTTTCACGGTTGGTGGATACAATTGGATTCTCCGTGTGTACCTTAATGGGAACA
CAAAGGATGGTGGTGCGGGTTATGTTTCTCTTTACGTAGAAATCGACAAGTCAGGTTTCG
TGGATTCTGCACATCAAGAGGTTTACGCGGATCTCAGGTTTTACATCTTCAACAGGAACG
AGAGGAAATATTTTACCATCCAAGATACGGATGTGTGGCGATTCGATGCCTTCAACACGA
TGTGGGG*ATTCTCTAAG*TCCTCCCCGTTGATACCTTCAA*GACCCGAAAA*TGGTTAC
CTTTACAATGGAGA*CACTGTGAGTTTGG*TGTTGATGTGACCGTTCCTAC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2GJ02TF 656 0 0
GGACACTCCATCCACAGAAAAACATGAAAGATCACTACAGAAACACCATCTCTATCTCTC
TTACATATCTCTTCCTTTGTCTCTTTATCACATATGCGCCTTCACAATCCTTGATAAGAC
AAATCACCGATGACTTCAATACAAATCTAAAAGAAGAAGTGCCTTACGTACAAAAACATC
AAGAGATCTCATCGCGTCACTATAATGTCTCTCATTCGAAGACGGTAACAGGTATGAGAA
ATCGTCGTCCATCAACCTACTCTTACAAGATTGAGACGAACGTTATAGACCAATTTGAAA
CTCGTCCTTTCACGGTTGGTGGATACAATTGGATTCTCCGCGTGTACCTTAATGGGAACA
CAAAGGATGGTGGTGCAGGTTATGTTTCTCTTTACGTGGAAATAGACAAGTCAGGTTTCG
TCGATTCTGCACATCAGGAGGTTTACGCGGATCTCAGGTTTTACATCTTCAACAGGAACG
AGAGGAAATATTTTACTATCCAAGATACGGATGTGTGGCGATTCGATGCCTTCAACACGA
TGTGGGGGATTCTCTCAG*TCCTCCCCGTTGATACCTTCAAA*ACCCGAAAAATGGTTAC
CTTTACAATGGAGAACACTGTGAGTTTGG*TGTTGATGTGACCGTTCCTACTCCCT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2E490TF 668 0 0
GGACACTCCATCCACAGAAAAACATGAAAAATCACTACAGAAACACCATCTCTATCTCTC
TTACATATCTCTTTCTTTGTCTCTTTATCACATATGTGTCTTCACAATCCTTGATACGAC
AAATCACCGATGACTTCAATACAAATCTAAAAGAAGAAGTGCCTTATGTACAAAAACATC
AAGAGATCTCATCGCGTCACTATAATGTCTCTCATTCGAAGACGGTAACAGGTATGAGAA
ATCGTCGTCCATCAACCTACTCTTACAAGATTGAGACGAACGTTATAGACCAATTTGAAA
CTCGTCCTTTCACGGTTGGTGGATACAATTGGATTCTCCGTGTGTACCTTAATGGGAACA
CAAAGGATGGTGGTGCAGGTTATGTTTCTCTTTACGTAGAAATAGACAAGTCAGGTTTCG
TGGATTCTGCACATCAAGAGGTTTACGCGGATCTCAGGTTTTACATCTTCAACAGGAACG
AGAGGAAATATTTTACCATCCAAGATACGGATGTGTGGCGATTCGATGCCTTCAACACGA
TGTGGGG*ATTCTCTCAG*TCCTCCCCGTTGATACCTTCAAAGACCCGAAAAATGGTTAC
CTTTACAATGGAGAACACTGTGAGTTTGG*TGTTGATGTGACCGTTCCTACTCCCTTTGA
AGAATCAG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2H350TF 765 0 0
GGACACTCCATCCACAGAAAAACATGAAAAATCACTACAGAAACACCATCTCTATCTCTC
TTACATATCTCTTTCTTTGTCTCTTTATCACATATGTGTCTTCACAATCCTTGATACGAC
AAATCACCGATGACTTCAATACAAATCTAAAAGAAGAAGTGCCTTATGTACAAAAACATC
AAGAGATCTCATCGCGTCACTATAATGTCTCTCATTCGAAGACGGTAACAGGTATGAGAA
ATCGTCGTCCATCAACCTACTCTTACAAGATTGAGACGAACGTTATAGACCAATTTGAAA
CTCGTCCTTTCACGGTTGGTGGATACAATTGGATTCTCCGTGTGTACCTTAATGGGAACA
CAAAGGATGGTGGTGCAGGTTATGTTTCTCTTTACGTAGAAATAGACAAGTCAGGTTTCG
CGGATTCTGCACATCAAGAGGTTTACGCGGATCTCAGGTTTTACATCTTCAACAGGAACG
AGAGGAAATATTTTACCATCCAAGATACGGATGTGTGGCGATTCGATGCCTTCAACACGA
TGTGGGG*ATTCTCTCAGGTCCTCCCCGTTGATACCTTCAAAGACCCGAAAAATGGTTAC
CTTTACAATGGAGA*CACTGTGAGTTTGG*TGTTGATGTGACCGCTCCTACTCCCTTTGA
AGAATCAGAAACTTTCTCA*TCAGCAGTAGTTCTGATAAAT*CACCTGGAGAATTGAGAC
TTCTCCACGTTGGTCAAAGATGTTTACTCATCTGTGT
CTCTCTTG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2E318TF 752 0 0
GG
ATCCACAGAAAAACATGAAAAATCACTAAA**AACACCATCTCTATCTCTCTTACATATC
TCTTTCTTTGTCTCTTTATCACATATGTGTCTTCACAATCCTTGATACGACAAATCACCG
ATGACTTCAATACAAATCTAAAAGAAGAAGTGCCTTATGTACAAAAACATCAAGAGATCT
CATCGCGTCACTATAATGTCTCTCATTCGAAGACGGTAACAGGTATGAGAAATCGTCGTC
CATCAACCTACTCTTACAAGATTGAGACGAACGTTATAGACCAATTTGAAACTCGTCCTT
TCACGGTTGGTGGATACAATTGGATTCTCCGTTTGTACCTTAATGGGAACACAAAGGATG
GTGGTGCAGGTTATGTTTCTCTTTACGTAGAAATAGACAAGTCAGGTTTCGTGGATTCTG
CACATCAAGAGGTTTACGCGGATCTCAGGTTTTACATCTTCAACAGGAACGAGAGGAAAT
ATTTTACCATCCAAGATACGGATGTGTGGCGATTCGATGCCTTCAACACGATGTGGGG*A
TTCTCTCAGGTCCTCCCCGTTGATACCTTCAAAGACCCGAAAAATGGTTACCTTTACAAT
GGAGAACACTGTGAGTTTGGGTGTTGATGTGACCGTTCCTACTCCCTTTGAAGAATCAGA
AACTTTCTCAATCAGCAGTAGTTCTGATAAAT*CACCTGGAGA*TTGAGACTTCTCCACG
TTGGTCAAAGATGTTTACTCATCTGTGT
CT

QA 3 750 3 750
DS 

RD RR2DX59TF 742 0 0
GG
ATGAAAAATCACTACAGAAACACCATCCCTATCTCTCTTACATATCTCTTTCTTTGTCTC
TTTATCACATATGCGTCTTCACAATCCTTGATAAGACAAATCACCGATGACTTCAATACA
AATCTAAAAGAAGAAGTGCCTTACGTACAAAAACATCAAGAGATCTCATCGCGTCACTAT
AATGTCTCTCATTCGAAGACGGTAACAGGTATGAGAAATCGTCGTCCATCAACCTACTCT
TACAAGATTGAGACGAACGTTATAGACCAATTTGAAACTCGTCCTTTCACGGTTGGTGGA
TACAATTGGATTCTCCGTGTGTACCTTAATGGGAACACAAAGGATGGTGGTGCAGGTTAT
GTTTCTCTTTACGTAGAAATCGACAAGTCAGGTTTCGTGGATTCTGCACA*CAAGAGGTT
TACGCGGATCTCAGGTTTTACATCTTCAACAGGAACGAGAGGAAATATTTTACCATCCAA
GATACGGATGTGTGGCGATTCGATGCCTTCAACACGATGTGGGG*ATTCTCTAAGGTCCT
CCCCGTTGATACCTTCAAAGACCCGAAAAATGGTTACCTTTACAATGGAGAACACTGTGA
GTTTGG*TGTTGATGTGACCGTTCCTACTCTCTTTGAAGAATCAGAAACTTTCTCAATCA
GCAGTAGTTCTGATAAATTCACCTGGAGAATTGAGACTTCTCCACGTTGGTCGA*GATGT
T*ACTCATCTGTGTCTCTCT

QA 3 742 3 742
DS 



AS 3 18

CO CL113Contig1 733 9 6 U
GGGTTATCGAGTGGGTAAGAAGAGAAACAGAAACAGAAACAGAGATATGGCGAATTCAAT
CTGCTTCTTCTCTTCTCCTCCTCCTCCTTGCCTCCTTCAGTCTCCCGGAAAAAGTGTTAA
ACCTCCTCTCTTCTTCCCCATTGGTGATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATC
CAAAAGCTTCGAGATTCAGGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGT
TTGTCAAAAGTGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGT
GAATTTGACTGATCATTTTAATGGACAGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAG
AGGTAAAAAGGAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTTTCTT
GAGCACCTTCGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCAAAAAATGGGATCTTTGTGCTGTT
ATTATCAACATTCAAAAACTGTCAGAAGAAGTCTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGT
TGCTTTTTCTTGTTAAACACTATCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTT***CATGTCTC
TCTCTCTCACATTTCATGTTCTTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGTCTCGAGTTCTTGT
AACCAAAACGGTCATAAAGATTGTTATCGTAACTACTTTTTAAGATCATGCGGAGTGTGA
ATATGCAAAAAAA


BQ
10 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF65TF U 3
AF RR2AF29TF U 1
AF RR2F513JQ C 1
AF RR2B777TF U 4
AF RR2F513TF U 1
AF RR2AF29JQ C 131
AF RR2ES82JQ C 131
AF RR2FF65JQ C 87
AF RR2ES82TF U 1
BS 1 553 RR2AF29TF
BS 554 554 RR2B777TF
BS 555 594 RR2AF29TF
BS 595 595 RR2B777TF
BS 596 719 RR2AF29TF
BS 720 733 RR2ES82TF

RD RR2FF65TF 110 0 0
GGG
ATCGAGTGGGTAAGAAGAGAAACAGAAACAGAAACAGAGATATGGCGAATTCAATCTGCT
TCTTCTCTTCTCCTCCTCCTCCTTGCCTCCTTCAGTCTCCCGGAAAA

QA 4 110 4 110
DS 

RD RR2AF29TF 719 0 0
GGGTTATCGAGTGGGTAAGAAGAGAAACAGAAACAGAAACAGAGATATGGCGAATTCAAT
CTGCTTCTTCTCTTCTCCTCCTCCTCCTTGCCTCCTTCAGTCTCCCGGAAAAAGTGTTAA
ACCTCCTCTCTTCTTCCCCATTGGTGATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATC
CAAAAGCTTCGAGATTCAGGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGT
TTGTCAAAAGTGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGT
GAATTTGACTGATCATTTTAATGGACAGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAG
AGGTAAAAAGGAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTTTCTT
GAGCACCTTCGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCAAAAAATGGGATCTTTGTGCTGTT
ATTATCAACATTCAAAAACTGTCAGAAGAAGTCTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGT
TGCTTTTTCTTGTCAAACACTATCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTT***CACGTCTC
TCTCTCTCACATTTCATGTTCTTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGTCTCGAGTTCTTGT
AACCAAAACGGTCATAAAGATTGTTATCGTAACTACTTTTTAAGATCATGCGGAGTGTG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2F513JQ 707 0 0
G
GGTTATCGAGTGGGTAAGAAGAGAAACAGAAACAGAAACAGAGATATGGCGAATTCAATC
TGCTTCTTCTCTTCTCCTCCTCCTCCTTGCCTCCTTCAGTCTCCCGGAAAAAGTGTTAAA
CCTCCTCTCTTCTTCCCCATTGGTGATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATCC
AAAAGCTTCGAGATTCAGGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTT
TGTCAAAAGTGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGTG
AATTTGACTGATCATTTTAATGGACAGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAGA
GGTAAAAAGGAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTTTCTTG
AGCACCTTCGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCAAAAAATGGGATCTTTGTGCTGTTA
TTATCAACATTCAAAAACTGTCAGAAGAAGTCTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTT
GCTTTTTCTTGTTAAACACTATCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTT***CATGTCTCT
CTCTCTCACATTTCATGTTCTTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGTCTCGAGTTCTTGTA
ACCAAAACGGTCATGAAGATTGTTATCGTAACTACTTTTTAAGA
CC

QA 2 705 2 705
DS 

RD RR2B777TF 684 0 0
GG
ATCGAGTGGGTAAGAAGAGAAACAGAAACAGAAACATAGATATGGCGAATTCAATCTGCT
TCTTCTCTTCTCCTCCTCCTCCTTGCCTCCTTCAGTCTCCCGGAAAAAGTGTTAAACCTC
CTCTCTTCTTCCCCATTGGTGATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATCCAAAA
GCTTCGAGATTCAGGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTTTGTC
AAAAGTGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGCGTGAATT
TGACTGATCATTTTAATGGACAGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAGAGGTA
AAAAGGAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTTTCTTGAGCA
CCTTCGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCAAAAAATGGGATCTTTGTGCTGTTATTAT
CAACATTCAAAAACTGTCAGAAGAAGTCTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCTT
TTTCTTGTTAAACACTATCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTT***CATGTCTCTCTCT
CTCACATTTCATGTTCTTCATCTCTCTCTCTCTCTC**GTGTCTCGAGTTCTTGTAACCA
AAACGGTCATAAAGATTGTTAT

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR2F513TF 694 0 0
G
GGTTATCGAGTGGGTAAGAAGAGAAACAGAAACAGAAACAGAGATATGGCGAATTCAATC
TGCTTCTTCTCTTCTCCTCCTCCTCCTTGCCTCCTTCAGTCTCCCGGAAAAAGTGTTAAA
CCTCCTCTCTTCTTCCCCATTGGTGATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATCC
AAAAGCTTCGAGATTCAGGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTT
TGTCAAAAGTGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGTG
AATTTGACTGATCATTTTAATGGACAGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAGA
GGTAAAAAGGAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTTTCTTG
AGCACCTTCGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCAAAAAATGGGATCTTTGTGCTGTTA
TTATCAACATTCAAAAACTGTCAGAAGAAGTCTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTT
GCTTTTTCTTGTTAAACACTATCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTT***CATGTCTCT
CTCTCTCACATTTCATGTTCTTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGTCTCGAGTTCTTGTA
ACCAAA*CGGTCATGAAGATTGTTATCGTAACT

QA 2 694 2 694
DS 

RD RR2AF29JQ 589 0 0
TTCTTCCCCATTGGTGATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATCCAAAAGCTTC
GAGATTCAGGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTTTGTCAAAAG
TGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGTGAATTTGACT
GATCATTTTAATGGACAGTTTAAAGCTGGTGGCCTTTGTTGGCTTTGCAGAGGTAAAAAG
GAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTTTTTTGAGCCCCTTC
GATGAGTAATGCAGAAAAGCTTTTTCAAAAAATGGGATCTTTGTGCTGTTATTATCAACA
TTCAAAAACTGTCAGAAGAAGTTTTCTTTTTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCTTTTTTT
TGTCAAACACTATCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTT***CACGTCTCTCTCTCTCAC
ATTTCATGTTTTTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGTCTCGAGTTCTTGTAACCAAAACG
GTCATAAAGATTGTTATTGTAACTACTTTTTAAGATCATGCGGAGTGTG

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2ES82JQ 596 0 0
TTCTTCCCCATTGGTGATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATCCAAAAGCTTC
GAGATTCAGGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTTTGTCAAAAG
TGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGTGAATTTGACT
GATCATTTTAATGGACAGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAGAGGTAAAAAG
GAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTTTCTTGAGCACCTTC
GATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCAAAAAATGGGATCTTTGTGCTGTTATTATCAACA
TTCAAAAACTGTCAGAAGAAGTCTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCTTTTTCT
TGTTAAACACTATCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTTTT*CATGTCTCTCTCTCTCAC
ATTTCATGTTCTTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGTCTCTAGTTCTTGTAACCAAAACG
GTCATAAAGATTGTTATCGTAACTACTTTTTAAGATCATGCGGAGTGTG
AATATGC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2FF65JQ 615 0 0
CTTGCCTCCTTCAGTCTCCCGGAAAAAGTGTTAAACCTCCTCTCTTCTTCCCCATTGGTG
ATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATCCAAAAGCTTCGAGATTCAGGCAACCA
ACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTTTGTCAAAAGTGTGAAGGGAATGGTG
CTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGTGAATTTGACTGATCATTTTAATGGAC
AGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAGAGGTAAAAAGGAGGTTTTGTGTGGAG
AATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTTTCTTGAGCACCTTCGATGAGTAATGCAGAA
AAGCTTTTTCAAAAAATGGGATCTTTGTGCTGTTATTATCAACATTCAAAAACTGTCAGA
AGAAGTCTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCTTTTTCTTGTTAAACACTATCTT
TGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTTTTTCATGTCTCTCTCTCTCACATTTCATGTTCTTCAT
CTCTCTCTCTCTCTC**GTGTCTCGAGTTCTTGTAACCAAAACGGTCATAAAGATTGTTA
TCGTAACTACTTTTT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2ES82TF 733 0 0
A
GGTTATCGAGTGGGTAAGAAGAGAAACAGAAACAGAAACAGAGATATGGCGAATTCAATC
TGCTTCTTCTCTTCTCCTCCTCCTCCTTGCCTCCTTCAGTCTCCCGGAAAAAGTGTTAAA
CCTCCTCTCTTCTTCCCCATTGGTGATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATCC
AAAAGCTTCGAGATTCAGGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTT
TGTCAAAAGTGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGTG
AATTTGACTGATCATTTTAATGGACAGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAGA
GGTAAAAAGGAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTTTCTTG
AGCACCTTCGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCAAAAAATGGGATCTTTGTGCTGTTA
TTATCAACATTCAAAAACTGTCAGAAGAAGTCTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTT
GCTTTTTCTTGTTAAACACTATCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTTTT*CATGTCTCT
CTCTCTCACATTTCATGTTCTTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGTCTCTAGTTCTTGTA
ACCAAAACGGTCATAAAGATTGTTATCGTAACTACTTTTTAAGATCATGCGGAGTGTGAA
TATGCAAAAAAA

QA 2 733 2 733
DS 



CO CL113Contig2 677 5 5 U
CACACTCCGCATGATCTTAAAAATTAGTTACGATAACAATCTTTATGACCGTTTTGGTTA
CAAGAACTGGAGACATGAGATAGAGAGACATGAAAAGAAAAAACAACAAAACGATCAAAG
ATAGTGTTCAACAAGAAAAAGCAACACATTCAGCATTGATAGAGAAAGAATCCTTCTTCT
GACGTTTTTT**TGGATAATAATAGCACAAAGATTCCCATTTTTTGAAGAAGCTTTTCTG
CATTACTCATCGAAGGTGCTCAAGAAACCACCAATGAAACCAGCTCCGTTGCATTCTCCA
CACAAAACCTCCTTTTTACCTCTGCAAAGCCAACAGAGGCCACCAGCTTTAAACTGCCCA
TTAAAATGATCAGTCAAATTCACACCACCTCCTTTGCATTGTGAACATGCCACAGCACCA
TTCCCTTCACACTTTTGACAAACTATGCTGCTGACTTTAGGAGTCTGGGTACCGTTGGTT
GCCTGAATCTCGAAGCTTTTGGATTTGCAAGTCTTAAACACTTCACTCTTATTATCACCA
ATGGGGAAGAAGAGAGGAGGTTTAACACTTTTTCCGGGAGACTGAAGGAGGCAAAAGGTA
GGAGGAGGAGGAGAAGAGAAGAAGCAGATTGAATTCGCCATATCTCTGTTTCTGTTTCTC
TTTTACCCACTCGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV18JQB U 13
AF RR2DS15JQ U 1
AF RR2HB34JQ U 60
AF RR2HB34TF C 60
AF RR2GV18TF C 314
BS 1 189 RR2DS15JQ
BS 190 192 RR2HB34JQ
BS 193 542 RR2DS15JQ
BS 543 647 RR2HB34JQ
BS 648 677 RR2GV18TF

RD RR2GV18JQB 517 0 0
GATCTTAAAAATTAGTTACGATAACAATCTTTATGACCGTTTTGGTTACAAGAACTGGAG
ACATGAGATAGAGAGACATGAAAAGAAAAAACAACAAAACGATCAAAGATAGTGTTCAAC
AAGAAAAAGCAACACATTCAGCATTGATAGAGAAAGAATCCTTCTTCTGACGTTTTTGAA
TGGATAATAATAGCACAAAGATTCCCATTTTTTGAAAAAGCTTTTCTGCATTACTCATCG
AAGGGGCTCAAGAAACCACCAATGAAACCAGCTCCGTTGCATTCTCCACACAAAACCTCC
TTTTTACCTCCGCAAAGCCAACAGAGGCCACCAGCTTTAAACTGCCCATTAAAATGATCA
GTCCAATTCACACCACCTCCTTTGCATTGTGAACATGCCACAGCACCATTCCCTTCACAC
TTTTGACAAACTATGCTGCTGACTTTAGGAGTCTGGGTACCGTTGGTTGCCTGAATCTCG
AAGCTTTTGGATTTGCAAGTCTTAAACACTTCACTCT

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2DS15JQ 542 0 0
CACACTCCGCATGATCTTAAAAATTAGTTACGATAACAATCTTTATGACCGTTTTGGTTA
CAAGAACTGGAGACATGAGATAGAGAGACATGAAAAGAAAAAACAACAAAACGATCAAAG
ATAGTGTTCAACAAGAAAAAGCAACACATTCAGCATTGATAGAGAAAGAATCCTTCTTCT
GACGTTTTTGAATGGATAATAATAGCACAAAGATTCCCATTTTTTGAAGAAGCTTTTCTG
CATTACTCATCGAAGGTGCTCAAGAAACCACCAATGAAACCAGCTCCGTTGCATTCTCCA
CACAAAACCTCCTTTTTACCTCTGCAAAGCCAACAGAGGCCACCAGCTTTAAACTGCCCA
TTAAAATGATCAGTCAAATTCACACCACCTCCTTTGCATTGTGAACATGCCACAGCACCA
TTCCCTTCACACTTTTGACAAACTATGCTGCTGACTTTAGGAGTCTGGGTACCGTTGGTT
GCCTGAATCTCGAAGCTTTTGGATTTGCAAGTCTTAAACACTTCACTCTTATTATCACCA
AT

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2HB34JQ 590 0 0
ACAAGAACTGGAGACATGAGATAGAGAGACATGAAAAGAAAAAACAACAAAACGATCAAA
GATAGTGTTCAACAAGAAAAAGCAACACATTCAGCATTGATAGAGAAAGAATCCTTCTTC
TGACGTTTTTT**TGGATAATAATAGCACAAAGATTCCCATTTTTTGAAGAAGCTTTTCT
GCATTACTCATCGAAGGTGCTCAAGAAACCACCAATGAAACCAGCTCCGTTGCATTCTCC
ACACAAAACCTCCTTTTTACCTCTGCAAAGCCAACAGAGGCCACCAGCTTTAAACTGCCC
ATTAAAATGATCAGTCAAATTCACACCACCTCCTTTGCATTGTGAACATGCCACAGCACC
ATTCCCTTCACACTTTTGACAAACTATGCTGCTGACTTTAGGAGTCTGGGTACCGTTGGT
TGCCTGAATCTCGAAGCTTTTGGATTTGCAAGTCTTAAACACTTCACTCTTATTATCACC
AATGGGGAAGAAGAGAGGAGGTTTAACACTTTTTCCGGGAGACTGAAGGAGGCAAAAGGT
AGGAGGAGGAGGAGAAGAGAAGAAGCAGATTGAATTCGCCATATCTCT
CC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2HB34TF 590 0 0
ACAAGAACTGGAGACATGAGATAGAGAGACATGAAAAGAAAAAACAACAAAACGATCAAA
GATAGTGTTCAACAAGAAAAAGCAACACATTCAGCATTGATAGAGAAAGAATCCTTCTTC
TGACGTTTTTT**TGGATAATAATAGCACAAAGATTCCCATTTTTTGAAGAAGCTTTTCT
GCATTACTCATCGAAGGTGCTCAAGAAACCACCAATGAAACCAGCTCCGTTGCATTCTCC
ACACAAAACCTCCTTTTTACCTCTGCAAAGCCAACAGAGGCCACCAGCTTTAAACTGCCC
ATTAAAATGATCAGTCAAATTCACACCACCTCCTTTGCATTGTGAACATGCCACAGCACC
ATTCCCTTCACACTTTTGACAAACTATGCTGCTGACTTTAGGAGTCTGGGTACCGTTGGT
TGCCTGAATCTCGAAGCTTTTGGATTTGCAAGTCTTAAACACTTCACTCTTATTATCACC
AATGGGGAAGAAGAGAGGAGGTTTAACACTTTTTCCGGGAGACTGAAGGAGGCAAAAGGT
AGGAGGAGGAGGAGAAGAGAAGAAGCAGATTGAATTCGCCATATCTCT
CC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2GV18TF 364 0 0
TTTTTCCTCCGCAAAGCCAACAGAGGCCACCAGCTTTAAA*TGCCCATTAAAATGATCAG
TCAAATTCACACCACCTCCTTTGCATTGTGAACATGCCACAGCACCATTCCCTTCACACT
TTTGACAAACTATGCTGCTGACTTTAGGAGTCTGGGTACCGTTGGTTGCCTGAATCTCGA
AGCTTTTGGATTTGCAAGTCTTAAACACTTCACTCTTATTATCACCAATGGGGAAGAAGA
GAGGAGGTTTAACACTTTTTCCGGGAGACTGAAGGAGGCAAAAGGTAGGAGGAGGAGGAG
AAGAGAAGAAG*AGATTGAATTCGCCATATCTCTGTTTCTGTTTCTCTTTTACCCACTCG
ATCC

QA 1 364 1 364
DS 



CO CL113Contig3 698 4 12 U
GGGGTAAGAAGAGAAACAGGAACAGAAACAGAGATATGGCGAATTCAATCTGCTTCTTCT
CTTCTCCTCCTCCTCCTACCTTTTGCCTCCTTCAGTCTCCCGGACAAAGTGTAAAGCCTC
CCCCTCTTCTTCCCCATTGGTGATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATCCAAA
AGCTTCGAGATTCATGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTTTGT
CAAAAGTGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGTGAAT
TTGACTGATCATTTTAATGGGCAGTTTAAAGCTGGTGGCCCCTGTTGGCTTTGCAGAGGT
AAAAAGGAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTCTCTTGAGC
ACCTTCGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCAAAAAAATGGGATCTTTGTGCTGTTATT
ATCAACATTCAAAAACTGTCAGAAGAAGTCTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGC
CTTTTCTTGTTAAACACTATCTTTGATCGTTCTGTTGTTTTTTTTTCATGTCTCTCTCTC
TCACATTTCATGTTCTTCATCTCTCTCTCTCTCGTGTCTCGAGTTCTTGTAACCAAAACG
GTCATAAAGATTGTTATCGTAACTACTTTTTAAGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2FD42TF U 1
AF RR2FD42JQ C 95
AF RR2H569JQB C 197
AF RR2H569TF U 197
BS 1 123 RR2FD42TF
BS 124 124 RR2FD42JQ
BS 125 340 RR2FD42TF
BS 341 341 RR2H569TF
BS 342 411 RR2FD42TF
BS 412 412 RR2H569TF
BS 413 458 RR2FD42TF
BS 459 459 RR2H569TF
BS 460 571 RR2FD42TF
BS 572 572 RR2H569TF
BS 573 697 RR2FD42TF
BS 698 698 RR2FD42JQ

RD RR2FD42TF 698 0 0
GGGGTAAGAAGAGAAACAGGAACAGAAACAGAGATATGGCGAATTCAATCTGCTTCTTCT
CTTCTCCTCCTCCTCCTACCTTTTGCCTCCTTCAGTCTCCCGGACAAAGTGTAAAGCCTC
CCC*TCTTCTTCCCCATTGGTGATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATCCAAA
AGCTTCGAGATTCATGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTTTGT
CAAAAGTGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGTGAAT
TTGACTGATCATTTTAATGGGCAGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAGAGGT
AAAAAGGAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTTTCTTGAGC
ACCTTCGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCAAAAAA*TGGGATCTTTGTGCTGTTATT
ATCAACATTCAAAAACTGTCAGAAGAAGTCTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGC
CTTTTCTTGTTAAACACTATCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTTCATGTCTCTCTCTC
TCACATTTCATGTTCTTCATCTCTCTCTCTCTCGTGTCTCGAGTTCTTGTAACCAAAACG
GTCATAAAGATTGTTATCGTAACTACTTTTTAAGATC
T

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2FD42JQ 604 0 0
GTCTCCCGGACAAAGTGTAAAGCCTCCCCCTCTTCTTCCCCATTGGTGATAAGAAGAGTG
AAGTGTTTAAGACTTGCAAATCCAAAAGCTTCGAGATTCATGCAACCAACGGTACTCAGA
CTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTTTGTCAAAAGTGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTT
CACAATGCAAAGGAGGTGGTGTGAATTTGACTGATCATTTTAATGGGCAGTTTAAAGCTG
GTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAGAGGTAAAAAGGAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAG
CTGGTTTCATTGGTGGTTTCTTGAGCACCTTCGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCAA
AAAA*TGGGATCTTTGTGCTGTTATTATCAACATTCAAAAACTGTCAGAAGAAGTCTTCT
TTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCCTTTTCTTGTTAAACACTATCTTTGATCGTTTTG
TTGTTTTTTTTTCATGTCTCTCTCTCTCACATTTCATGTTCTTCATCTCTCTCTCTCTCG
TGTCTCGAGTTCTTGTAACCAAAACGGTCATAAAGATTGTTATCGTAACTACTTTTTAAG
ATCT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2H569JQB 483 0 0
G
AACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTTTGTCAAAAGTGTGAAGGGAA
TGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGTTGTGAATTTGACTGATCATTTTAA
TGGGCAGTTTAAAGCTGGTGGCCCCTGTTGGCTTTGCAGAGGTAAAAAGGAGGTTTTGTG
TGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTCTCTTGAGCACCTTCGATGAGTAATG
CAGAAAAGCTTCTTCAAAAAAATGGGATCTTTGTGCTGTTATTATCAACATTCAAAAACT
GTCAGAAGAAGTCTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCTTTTTCTTGTTAAACAC
TATCTTTGATCGTTCTGTTGTTTTTTTTTCATGTCTCTCTCTCTCACATTTCATGTTCTT
CATCTCTCTCTCTCTCGTGTCTCGAGTTCTTGTAACCAAAACGGTCATAAAGATTGTTAT
CG

QA 2 483 2 483
DS 

RD RR2H569TF 483 0 0
G
AACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTTTGTCAAAAGTGTGAAGGGAA
TGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGTTGTGAATTTGACTGATCATTTTAA
TGGGCAGTTTAAAGCTGGTGGCCCCTGTTGGCTTTGCAGAGGTAAAAAGGAGGTTTTGTG
TGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTCTCTTGAGCACCTTCGATGAGTAATG
CAGAAAAGCTTCTTCAAAAAAATGGGATCTTTGTGCTGTTATTATCAACATTCAAAAACT
GTCAGAAGAAGTCTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCTTTTTCTTGTTAAACAC
TATCTTTGATCGTTCTGTTGTTTTTTTTTCATGTCTCTCTCTCTCACATTTCATGTTCTT
CATCTCTCTCTCTCTCGTGTCTCGAGTTCTTGTAACCAAAACGGTCATAAAGATTGTTAT
CG

QA 2 483 2 483
DS 



AS 1 19

CO CL114Contig1 861 19 28 U
GGGCGTCATATATAATCCGACACTGAGTCTTCTCTTTAACCGGCTGGAAAGGGAGAAGAA
GCAGCCC*GAGAGGAATCAATCGAGTAGGGAGGAGATGGTGTCAGGTTCAGGGATATGCG
CGAAGCGCGTGGTGGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGGGCGTCTTGCTTCCATCATCG
CCAAGGAGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGTCGTCGTCCGATGCGAAGAGATTTGTCTGT
CAGGTGGACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAGCGCATGAACA
CTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCCAAGATCTTCTGGCGTACCC
TTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCCCGTTTGAAGG
TTTTTGAAGGAGTACCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGAATGGTCATTCCTGATGCTC
TCAAGGTTTTGAGGCTTCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTTTCTTCTG
AGGTTGGCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAGGTCAAGAGAAAGGAGAGGT
CACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTCAGGACAAAGGCCGAGAAGG
TTGCAGAGGAGAAACTTGGACCCCAGCTCGATGTTCTTGCACCGATTAAGTACTGAGAAT
TCACATCTGTCTTTTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTACTCGTCTCGATTCTACTCTTT
GAAATTTCGGTTTTGCATTTGGTAGCTTGTAAACGTAAAGATTGGAATGAGACATTTTGG
TTTTGTTTTTTTGGAGCTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 25 55 55 55 55 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 
65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 55 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 60 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 55 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 55 97 97 97 97 97 97 90 97 
97 97 97 90 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 25 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 70 97 97 97 90 97 97 97 70 97 97 80 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 75 90 60 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 25 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 20 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
70 70 70 70 70 70 70 70 55 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 35 65 65 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 45 45 25 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS63TF U 1
AF RR2GA47TF U 44
AF RR2E874TF U 48
AF RR2D002TF U 42
AF RR2AW75TFB U 330
AF RR2B522JQ C 426
AF RR2A541TF U 40
AF RR2B522TF U 42
AF RR2FP02TF U 42
AF RR2BE56TF U 42
AF RR2FP02JQ C 421
AF RR2A806TF U 39
AF RR2GL14TF U 43
AF RR2AW75JQ C 190
AF RR2BE56JQ C 71
AF RR2A806JQ C 39
AF RR2D002JQ C 63
AF RR2GA47JQ C 187
AF RR2E874JQ C 110
BS 1 41 RR2DS63TF
BS 42 43 RR2A541TF
BS 44 103 RR2DS63TF
BS 104 104 RR2B522TF
BS 105 130 RR2DS63TF
BS 131 131 RR2B522TF
BS 132 211 RR2DS63TF
BS 212 212 RR2B522TF
BS 213 385 RR2DS63TF
BS 386 386 RR2B522TF
BS 387 433 RR2DS63TF
BS 434 434 RR2B522TF
BS 435 484 RR2DS63TF
BS 485 485 RR2A541TF
BS 486 496 RR2DS63TF
BS 497 497 RR2B522TF
BS 498 526 RR2DS63TF
BS 527 527 RR2B522TF
BS 528 538 RR2DS63TF
BS 539 680 RR2A541TF
BS 681 681 RR2B522TF
BS 682 722 RR2A541TF
BS 723 723 RR2B522TF
BS 724 812 RR2A541TF
BS 813 837 RR2B522TF
BS 838 839 RR2GL14TF
BS 840 840 RR2AW75JQ
BS 841 861 RR2GL14TF

RD RR2DS63TF 538 0 0
GGGCGTCATATATAATCCGACACTGAGTCTTCTCTTTAACCTTCTGGAAAGGGAGAAGAA
GCAGCCC*GAGAGGAATCAATCGAGTAGGGAGGAGATGGTGTCTGGTTCAGGGATATGCG
CGAAGCGCGTCGTGGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGGGCGTCTTGCTTCCATCATCG
CCAAGGAGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGTGGTCGTCCGATGCGAAGAGATTTGTCTGT
CAGGTGGACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAGCGCATGAACA
CTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCCAAGATCTTCTGGCGTACCC
TTCGTGGGATGATTCCACACAAGACGAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCCCGTTTGAAGG
TTTTTGAAGGAGTCCCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGAATGGTCATTCCTGATGCTC
TCAAAGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGTCGTCTTTCTTC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2GA47TF 546 0 0
GGGA
AAAGGGAGAAGCAGCAGCCCCGAGAG*AATCAATCGAGTAGGGAGGAGATGGTGTCTGGT
TCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTCGTGGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGGGCGTCCT
GCTTCCATCATCGCCAAGGAGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGTCGTCGTCCGATGCGAA
GAGATTTGTCTGTCAGGTGGACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGG
AAGCGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCCAAGATC
TTCTGGCGTACCCTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTT
GCCCGTTTGAAGGTTTTTGAAGGAGTACCTCCTCCGTACGACAAAGTCAAGAGAATGGTC
ATTCCCGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGC
CGTCTTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAGGTCAAG
AG

QA 5 546 5 546
DS 

RD RR2E874TF 593 0 0
GG
AGGGAGAAGAAGCAGCCC*GAGAGGAATCAATCGAGTAGGGAGGAGATGGTGTCAGGTTC
AGGGATATGCGCGAAGCGCGTGGTGGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGGGCGTCTTGC
TTCCATCATCGCCAAGGAGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGTCGTCGTCCGATGCGAAGA
GATTTGTCTGTCAGGTGGACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAA
GCGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCCAAGATCTT
CTGGCGTACCCTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGC
CCGTTTGAAGGTTTTTGAAGGAGTACCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGAATGGTCAT
TCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTTCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCG
TCTTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAGGTCAAGAG
AAAGGAGAGGTCACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCT

QA 3 593 3 593
DS 

RD RR2D002TF 667 0 0
GGCTGGAAAGGGAGAAGAAGCAGCCC*GAGAGGAATCAATCGAGTAGGGAGGAGATGGTG
TCAGGTTCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTGGTGGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGGG
CGTCTTGCTTCCATCATCGCCAAGGAGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGTCGTCGTCCGA
TGCGAAGAGATTTGTCTGTCAGGTGGACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTT
CTCAGGAAGCGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCC
AAGATCTTCTGGCGTACCCTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCT
GCTCTTGCCCGTTTGAAGGTTTTTGAAGGAGTACCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGA
ATGGTCATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTTCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTG
TTGGGCCGTCTTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAG
GTCAAGAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTC
ACGACAAAGGCCGAGAAG*TTGCAGAGGAGAAACTTGGACCCCAGCTCGATGTTCTTGCA
CCGATTA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2AW75TFB 332 0 0
AGGGCTCCCTCCAAGATCTTCTGGCGTACCCTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAG
CGTGGAGCTGCTGCTCTTGCCCGTTTGAAGGTTTTTGAAGGAGTACCTCCTCCTTACGAC
AAAGTCAAGAGAATGGTCATTCCTGATGCTCTCAAGGGTTTGAGGCTTCAGGCTGGTCAC
AAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCACTACGACACCATC
AAGGAGCTTGAGGTCAAGAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAACAG
CTCATCAAGCTCAGGACAAAGGCCGAGAAGGT

QA 1 332 1 332
DS 

RD RR2B522JQ 335 0 0
GAAGGAGTACCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGAATGGTCATTCCTGATGCTTTCAAG
GTTTTGAGGCTTCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGTGCCGTTTTTTTTTTGAGGTT
GGCTGGAACCACTACGACCCCATCAAGGAGCTTGAGGTCAAGAGAAAGGAGAGGTCACAG
GCTGTGTATGAGGGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTCAGGACAAAGGCCGAGAAGGTTGCA
GAGGAGAAACTTGGACCCCAGCTCGATGTTTTTGCACCGATTAAGTACTGAGAATTCACA
TCTGTCTTTTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTAC

QA 1 335 1 335
DS 

RD RR2A541TF 773 0 0
GG
GGCTGGAAAGGGAGAAGAAGCAGCCC*GAGAGGAATCAATCGAGTAGGGAGGAGATGGTG
TCTGGTTCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTCGTGGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGGG
CGTCTTGCTTCCATCATCGCCAAGGAGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGTGGTCGTCCGA
TGCGAGGAGATTTGTCTGTCAGGTGGACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTT
CTCAGGAAGCGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCC
AAGATCTTCTGGCGTACCCTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACGAAGCGTGGAGCTGCT
GCTCTTGCCCGTTTGAAGGTTTTTGAAGGAGTCCCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGA
ATGGTCATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCGCAAGTACTGCTTG
TTGGGTCGTCTTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAG
GTCAAGAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTC
AGGACAAAGGCCGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAACTTGGAGCCCAGCTCGATGTTCTTGCA
CCGATTAAGTACTGAGAATTCGCATCTGTCTTTTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTACT
CGTCTCGATTCTACTCTTTGAAATTTCGGTTTTGCATTTGGTAGCTTGTAA

QA 3 773 3 773
DS 

RD RR2B522TF 796 0 0
GGCTGGAAAGGGAGAAGAAGCAGCCC*GAGAGGAATCAATCGAGTAGGGAGGAGATGGTG
TCAGGTTCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTGGTGGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGG*
CGTCTTGCTTCCATCATCGCCAAGGAGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGTCGTCGTCCGA
TGCGAAGAGATTTGTCTGTCAGGTGGACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTT
CTCAGGAAGCGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCC
AAGATCTTCTGGCGTACCCTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCT
GCTCTTGCCCGTTTGAAGGTTTTTGAAGGAGTACCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGA
ATGGTCATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTTCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTG
TTGTGCCGTCTTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAG
GTCAAGAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTC
AGGACAAAGGCCGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAACTTGGACCCCAGCTCGATGTTCTTGCA
CCGATTAAGTACTGAGAATTCACATCTGTCTTTTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTACT
CGTCTCGATTCTACTCTTTGAAATTTCGGTTTTGCATTTGGTAGCTTGTAAACGTAAAGA
TTGGAATGAGACATTT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2FP02TF 740 0 0
GGCTGGAAAGGGAGAAGAAGCAGCCC*GAGAGGAATCAATCGAGTAGGGAGGAGATGGTG
TCAGGTTCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTGGTGGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGGG
CGTCTTGCTTCCATCATCGCCAAGGAGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGTCGTCGTCCGA
TGCGAAGAGATTTGTCTGTCAGGTGGACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTT
CTCAGGAAGCGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCTATTCACTTCAGGGCTCCCTCC
AAGATCTTCTGGCGTACCCTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCT
GCTCTTGCCCGTGTGAAGGTTTTTGAAGGAGTACCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGA
ATGGTCATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTTCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTG
TTGGGCCGTCTTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAG
GTCAAGAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTC
AGGACAAAGGCCGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAACTTGGACCCCAGCTCGATGTTCTTGCA
CCGATTAAGTACTGAGAATTCACATCTGTCTTTTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTACT
CGTCTCGATTCTACTCTTTG

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2BE56TF 783 0 0
GGCTGGAAAGGGAGAAGCAGCAGCCCCGAGAG*AATCAATCGAGTAGGGAGGAGATGGTG
TCTGGTTCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTCGTGGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGGG
CGTCTTGCTTCCATCATCGCCAAGGAGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGCCGTCGTCCGA
TGCGAAGAGATTTGTCTGTCAGGTGGACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTT
CTCAGGAAGCACATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCC
AAGATCTTCTGGCGTACCCTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCT
GCTCTTGCCCGTTTGAAGGTTTTTGAAGGAGTACCTCCTCCGTACGACAAAGTCAAGAGA
ATGGTCATTCCCGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCCGGTCACAAGTACTGCTTG
TTGGGCCGTCTTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAG
GTCAAGAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTC
AGGACAAAGGCCGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAACTTGGAGCCCAGCTCGATGTTCTTGCA
CCGATTAAGTACTGAGAATTCGCATCTGTCTTTTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTACT
CGTCTCGATTCTACTCTTTGAAATTTCGGTTTTGCATTTGGTAGCTTGTAAACGTAAAGA
TTG

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2FP02JQ 386 0 0
TTTTTGAAGGAGTACCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGAATGGTCATTCCTGATGCTC
TCAAGGTTTTGAGGCTTCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTTTTTTCTG
AGGTTGGCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAGGTCAAGAGAAAGGAGAGGT
CACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTCAGGACAAAGGCCGAGAAGG
TTGCAGAGGAGAAACTTGGACCCCAGCTCGATGTTCTTGCACCGATTAAGTACTGAGAAT
TCACATCTGTCTTTTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTACTCGTCTCGATTCTACTCTTT
GAAATTTCGGTTTTGCATTTGGTAGC

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR2A806TF 793 0 0
GGCTT
CTGGAAAGGGAGAAGAAGCAGCCC*GAGAGGAATCAATCGAGTAGGGAGGAGATGGTGTC
AGGTTCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTGGTGGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGGGCG
TCTTGCTTCCATCATCGCCAAGGAGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGTCGTCGTCCGATG
CGAAGAGATTTGTCTGTCAGGTGGACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCT
CAGGAAGCGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCCAA
GATCTTCTGGCGTACCCTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGC
TCTTGCCCGTTTGAAGGTTTTTGAAGGAGTACCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGAAT
GGTCATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTTCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTT
GGGCCGTCTTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAGGT
CAAGAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTCAG
GGCGAAGGCCGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAACTTGGACCCCAGCTCGATGTTCTTGCACC
GATTAAGTACTGAGAATTCACATCTGTCTTTTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTACTCG
TCTCGATTCTACTCTTTGAAATTTCGGTTTTGCATTTGGTAGCTTGCAAACGTAAAGATT
GGAATGAG

QA 6 793 6 793
DS 

RD RR2GL14TF 819 0 0
GCTGGAAAGGGAGAAGAAGCAGCCC*GAGAGGAATCAATCGAGTAGGGAGGAGATGGTGT
CTGGTTCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTCGTGGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGGGC
GTCTTGCTTCCATCATCGCCAAGGAGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGTGGTCGTCCGAT
GCGAAGAGATTTGTCTGTCAGGTGGACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTC
TCAGGAAGCGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCCA
AGATCTTCTGGCGTACCCTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACGAAGCGTGGAGCTGCTG
TTCTTGCCCGTTTGAAGGTTTTTGAAGGAGTCCCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGAA
TGGTCATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGT
TGGGTCGTCTTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAGG
TCAAGAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTCA
GGACAAAGGCCGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAACTTGGAGCCCAGCTCGATGTTCTTGCAC
CGATTAAGTACTGAGAATTCGCATCTGTCTTTTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTACTC
GTCTCGATTCTACTCTTTGAAATTTCG*TTTTGCATTTGGTAGCTTGTAA*CGTAAAGAT
*GGAATGAGACATTTTGTTTTTGTTTTTTTGGAGCTTCT

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2AW75JQ 661 0 0
TGCTCAACGGACAGAGAGTTGTCGTCGTCCGATGCGAAGAGATTTGTCTGTCAGGTGGAC
TGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAGCGCATGAACACTAAGCCTT
CTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCCAAGATCTTCTGGCGTACCCTTCGTGGGA
TGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCCCGTTTGAAGGTTTTTGAAG
GAGTACCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGAATGGTCATTCCTGATGCTCTCAAGGTTT
TGAGGCTTCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTTTCTTCTGAGGTTGGCT
GGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAGGTCAAGAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTG
TGTATGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTCAGGACAAAGGCCGAGAAGGTTGCAGAGG
AGAAACTTGGACCCCAGCTCGATGTTCTTGCACCGATTAAGTACTGAGAATTCACATCTG
TCTTTTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTACTCGTCTCGATTCTACTCTTTGAAATTTCG
GCTTTGCATTTGGTAGCTTGTAAACGTAAAGATTGGAATGAGACATTTTGGTTTTGTTTT
T

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2BE56JQ 780 0 0
AGA
GAATCAATCGAGTAGGGAGGAGATGGTGTCTGGTTCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTCGT
GGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGGGCGTCTTGCTTCCATCATCGCCAAGGAGTTGCT
CAACGGACAGAGAGTTGCCGTCGTCCGATGCGAAGAGATTTGTCTGTCAGGTGGACTGGT
TCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAGCACATGAACACTAAGCCTTCTCA
CGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCCAAGATCTTCTGGCGTACCCTTCGTGGGATGAT
TCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCCCGTTTGAAGGTTTTTGAAGGAGT
ACCTCCTCCGTACGACAAAGTCAAGAGAATGGTCATTCCCGATGCTCTCAAGGTTTTGAG
GCTCCAGGCCGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTTTTTTTTGAGGTTGGCTGGAA
CCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAGGTCAAGAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTGTGTA
TGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTCAGGACAAAGGCCGAGAAGGTTGCAGAGGAGAA
ACTTGGAGCCCAGCTCGATGTTCTTGCACCGATTAAGTACTGAGAATTCGCATCTGTCTT
TTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTACTCGTCTCGATTCTACTCTTTGAAATTTCGGTTT
TGCATTTGGTAGCTTGTAAACGTAAAGATTGGAATGAGACATTTTGGTTTTGT
CTTT

QA 4 776 4 776
DS 

RD RR2A806JQ 812 0 0
GGCTT
CTGGAAAGGGAGAAGAAGCAGCCC*GAGAGGAATCAATCGAGTAGGGAGGAGATGGTGTC
AGGTTCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTGGTGGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGGGCG
TCTTGCTTCCATCATCGCCAAGGAGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGTCGTCGTCCGATG
CGAAGAGATTTGTCTGTCAGGTGGACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCT
CAGGAAGCGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCCAA
GATCTTCTGGCGTACCCTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGC
TCTTGCCCGTTTGAAGGTTTTTGAAGGAGTACCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGAAT
GGTCATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTTCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTT
GGGCCGTCTTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAGGT
CAAGAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTCAG
GGCGAAGGCCGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAACTTGGACCCCAGCTCGATGTTCTTGCACC
GATTAAGTACTGAGAATTCACATCTGTCTTTTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTACTCG
TCTCGATTCTACTCTTTGAAATTTCGGTTTTGCATTTGGTAGCTTGCAAACGTAAAGATT
GGAATGAGACATTTTGGTTTTGTTTT
A

QA 6 811 6 811
DS 

RD RR2D002JQ 788 0 0
AGCCC*GAGAGGAATCAATCGAGTAGGGAGGAGATGGTGTCAGGTTCAGGGATATGCGCG
AAGCGCGTGGTGGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGGGCGTCTTGCTTCCATCATCGCC
AAGGAGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGTCGTCGTCCGATGCGAAGAGATTTGTCTGTCA
GGTGGACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAGCGCATGAACACT
AAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCCAAGATCTTCTGGCGTACCCTT
CGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCCCGTTTGAAGGTT
TTTGAAGGAGTACCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGAATGGTCATTCCTGATGCTCTC
AAGGTTTTGAGGCTTCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTTTCTTCTGAG
GTTGGCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAGGTCAAGAGAAAGGAGAGGTCA
CAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTCAGGACAAAGGCCGAGAAGGTT
GCAGAGGAGAAACTTGGACCCCAGCTCGATGTTCTTGCACCGATTAAGTACTGAGAATTC
ACATCTGTCTTTTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTACTCGTCTCGATTCTACTCTTTGA
AATTTCGGTTTTGCATTTGGTAGCTTGTAAACGTAAAGATTGGAATGAGACATTTTGGTT
TTGTTTT
T

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2GA47JQ 663 0 0
AGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGTCGTCGTCCGATGCGAAGAGATTTGTCTGTCAGGTG
GACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAGCGCATGAACACTAAGC
CTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCCAAGATCTTCTGGCGTACCCTTCGTG
GGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCCCGTTTGAAGGTTTTTG
AAGGAGTACCTCCTCCGTACGACAAAGTCAAGAGAATGGTCATTCCCGATGCTCTCAAGG
TTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTTTCTTCTGAGGTTG
GCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAGGTCAAGAGAAAGGAGAGGTCACAGG
CTGTGTATGAGCGTAAGAAATAGCTCATCAAGCTCAGGACAAAGGCCGAGAAGGTTGCAG
AGGAGAAACTTGGAGCCCAGCTCGATGTTCTTGCACCGATTAAGTACTGAGAATTCGCAT
CTGTCTTTTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTACTCGTCTCGATTCTACTCTTTGAAATT
TCGGTTTTGCATTTGGTAGCTTGTAAACGTAAAGATTGGAATGAGACATTTTGGTTTTGT
TTT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2E874JQ 740 0 0
AGGGATATGCGCGAAGCGCGTGGTGGTCGATGCGAGGCACCACATGTTGGGGCGTCTTGC
TTCCATCATCGCCAAGGAGTTGCTCAACGGACAGAGAGTTGTCGTCGTCCGATGCGAAGA
GATTTGTCTGTCAGGTGGACTGGTTCGTCAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAA
GCGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCCAAGATCTT
CTGGCGTACCCTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGC
CCGTTTGAAGGTTTTTGAAGGAGTACCTCCTCCTTACGACAAAGTCAAGAGAATGGTCAT
TCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTTCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCG
TCTTTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTTGAGGTCAAGAG
AAAGGAGAGGTCACAGGCTGTGTATGAGCGTAAGAAACAGCTCATCAAGCTCAGGACAAA
GGCCGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAACTTGGACCCCAGCTCGATGTTCTTGCACCGATTAA
GTACTGAGAATTCACATCTGTCTTTTGGTTTAATACTTGCTGCGTTTGTACTCGTCTCGA
TTCTACTCTTTGAAATTTCGGTTTTGCATTTGGTAGCTTGTAAACGTAAAGATTGGAATG
AGACATTTTGGTTTTGTTTT

QA 1 740 1 740
DS 



AS 2 17

CO CL115Contig1 1377 13 13 U
CATCACGAAGTTGTTTCTTAATCATTTATCCAATGATAGACCAAAATAAATACAACCGCA
TTATGTTTGTAATTGCATGATTATATAAAGATCATAGGAGTCTAGACGATTATACATTAT
ACGACCGAAAATGATATATATTTAAAAAACAACCTGCTCATATCGAATCA**AGCCTGTG
CATTAGCTCCAGCAACAATCTCAAGAATCTCACCAGTAATCTTAGCTTGACGTTTTCTAT
TATAAACCATCGAAAGCGATTTCTTAAGATCCGATGCATTATCCGAAGCACTACTCATCG
CACTCATCCTAGCGGCGAGCTCACTCGCCAAAGACTCCTGTAACGCCCTAAGAATCTGAC
TGTTCAGATACAAAGGCAACAAAGCATCAAGAATCTGAACAGGGTCTTGCTCGAACTGCA
AGATCGGCGAGAAATCAGCAGTTGCTGTCCGAAAAGTCTCTCTCTCGACCGTCAGCTTCC
CTTCTTTCGTCGTTAACCTGAAGAACTCGTCTTCAGCAGCGTCCACACAGTTCCCGTTGA
TGTCACAGATCTCTCCTTTGGGTGATAGAGGCAGTAGCGTGTGGATCACGGGTTCTGACC
TGACCAAAGACACAAACTTCGTGTACAAGAGCTCGACTTTGTCGACTTCCTCGCTTATAA
ACAGAGAGAAGACATCATCGGCAACAGCTTGAGCTTCCTTCGCCGTAGGTAAGGTTCCGG
CCTCGAGGTACTTGTCGAC*GGGGATGTACGGACGGCGGAGGAAGTAAGAGTTTCCCTTC
TTCCCCACGCTAATGACTGTGTAGTCAAGACCTAACCCTTGAAGCTCCTTGATCCTCGCC
TCTGCTTTCTTGATAATGAAGTTATTAAACCCACCGCATAAGCCACGGTCTCCCGTTACG
ACAACGAGTGCAACCTTCTTAACCGGTCTGATCTTGGTTAAGGGCACATCGATATCATCG
GTTTGAAGCTGTTCGTTGATGTTGTAAAGAACTTCGACTAGGGTTTCGGAGAATGGTCGT
CCGTTGACGACAGCTTCTTGAGCTCTCCTGACTTTTGCTGCAGCGACAAGCTTCATGGCT
TCGGTGATCTTCTGGGTGTTTTTGACTGAATCGATACGGTCTCTGAGCTCACGGAGGGAG
GATTGGATTGGAGCAACGGAGGAGGATCTTGAAGGAGAGAGGTTGTGGTTTGGGAGAGGA
AGTGGGTTGAGACCAGAACGGAAGGACAAGGAAGAGGAATCGGAAAGAGATGCGTTTGAC
GAAACCCACATTGTTGTTAGATTACTGCAAGCCATTGTTCTTGATTTTGGTTCAAACTGA
AAGACAAGTTTTTTTGTTCAGACAGTGTTTTGGTTTAATCTTATCTACGTTCTTTCC


BQ
25 25 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 45 45 60 45 60 45 60 60 60 
60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 0 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 25 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 
70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 45 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 45 70 70 70 70 70 70 
70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 0 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 35 60 75 75 75 75 60 75 75 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 60 60 60 60 45 60 60 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 15 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK74JQ U 1
AF RR2G522JQ U 1
AF RR2G545JQ U 1
AF RR2G522TF C 1
AF RR2F538JQ U 8
AF RR2BI51JQ U 1
AF RR2F722JQ U 28
AF RR2F722TF C 28
AF RR2A063JQ U 159
AF RR2A063TF C 481
AF RR2DV77TF C 150
AF RR2GN96TF C 245
AF RR2E092TF C 563
BS 1 256 RR2BI51JQ
BS 257 257 RR2FK74JQ
BS 258 409 RR2BI51JQ
BS 410 410 RR2FK74JQ
BS 411 544 RR2BI51JQ
BS 545 545 RR2FK74JQ
BS 546 758 RR2BI51JQ
BS 759 759 RR2F722TF
BS 760 763 RR2A063JQ
BS 764 776 RR2F722TF
BS 777 862 RR2DV77TF
BS 863 1040 RR2GN96TF
BS 1041 1377 RR2E092TF

RD RR2FK74JQ 715 0 0
CG
TCACGAAGTTTTTTCTTAATCATTTATCCAATGAAAGACCAAAATAAATACAACCGCATT
ATGTTTGTAATTGCATGATTATATAAAGATCATAGGAGTCTAGACGATTATACATTATAC
GACCGAAAATGATATATATTTAAAAAACAACCTGCTCATATCGA*TCA**AGCCTGTGCA
TTAGCTCCAGCAACAATCTCAAGAATCTCACCAGTAATCTTAGCTTGACGTTTTCTATTA
TAAACCATGGAAAGCGACTTCTTAAGATCCGACGCATTATCCGAAGCACTACTCATCGCA
CTCATCCGAGCCGCGAGCTCACTCGCCAAAGACTCCTGTAACGCCCTAAGAATCTGACTG
TTCAGATACAAAGGCAACAAAGCATCAAGAATCTGAACAGGGTCTTGCTCGAACTGCAAG
ATCGGTGAGAAATCAGCAGTTGCTGTCCGAAAAGTCTCTCTCTCGACCGTCAGCTTCCCT
TCTTTCGTCGTTAACCTGAAGAACTCGTCTTCAGCAGCGTCCACACAGTTCCCGTTGATG
TCACAGATCTCTCCTTTGGGTGATAGAGGCAGTAGCGTGTGGATCACGGGTTCTGATCTG
ACCAAAGACACAAACTTCGTGTACAAGAGTTCCACTTTGTCGACTTCCTCGCTTATGAAC
AGAGAGAAGACATCATCGGCAACAGCTTGAGCTTCCTTCGCCGTCGGTAAGGT

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR2G522JQ 693 0 0
CATCACGAAGTTGTTTCTTAATCATTTATCCAATGATAGACCAAAATAAATACAACCGCA
TTATGTTTGTAATTGCATGATTATATAAAGATCATAGGAGTCTAGACGATTATACATTAT
ACGACCGAAAATGATATATATTTAAAAAACAACCTGCTCATATCGAATCA**AGCCTGTG
CATTAGCTCCAGCAACAATCTCAAGAATCTCACCAGTAATCTTAGCTTGACGTTTTCTAT
TATAAACCATCGAAAGTGATTTCTTAAGATCCGATGCATTATCCGAAGCACTACTCATCG
CACTCATCCTAGCGGCGAGCTCACTCGCCAAAGACTCCTGTAACGCCCTAAGAATCTGAC
TGTTCAGATACAAAGGCAACAAAGCATCAAGAATCTGAACAGGGTCTTGCTCGAACTGCA
AGATCGGCGAGAAATCAGCAGTTGCTGTCCGAAAAGTCTCTCTCTCGACCGTCAGCTTCC
CTTCTTTCGTCGTTAACCTGAAGAACTCGTCTTCAGCAGCGTCCACACAGTTCTCGTTGA
TGTCACAGATCTCTCCTTTGGGTGATAGAGGCAGTAGCGTGTGGATCACGGGTTCTGACC
TGACCAAAGACACAAACTTCGTGTACAAGAGCTCGACTTTGTCGACTTCCTCGCTTATAA
ACAGAGAGAAGACATCATCGGCAACAGCTTGAG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2G545JQ 661 0 0
CG
TCACGAAGTTGTTTCTTAATCATTTATCCAATGATAGACCAAAATAAATACAACCGCATT
ATGTTTGTAATTGCATGATTATATAAAGATCATAGGAGTCTAGACGATTATACATTATAC
GACCGAAAATGATATATATTTAAAAAACAACCTGCTCATATCGAATCA**AGCCTGTGCA
TTAGCTCCAGCAACAATCTCAAGAATCTCACCAGTAATCTTAGCTTGACGTTTTCTATTA
TAAACCATCGAAAGTGATTTCTTAAGATCCGATGCATTATCCGAAGCACTACTCATCGCA
CTCATCCTAGCGGCGAGCTCACTCGCCAAAGACTCCTGTAACGCCCTAAGAATCTGACTG
TTCAGATACAAAGGCAACAAAGCATCAAGAATCTGAACAGGGTCTTGCTCGAACTGCAAG
ATCGGCGAGAAATCAACAGTTGCTGTCCGAAAAGTCTCTCTCTCGACCGTCAGCTTCCCT
TCTTTCGTCGTTAACCTGAAGAACTCGTCTTCAGCAGCGTCCACACAGTTCCCGTTGATG
TCACAGATCTCTCCTTTGGGTGATAGAGGCAGTAGCGTGTGGATCACGGGTTCTGACCTG
ACCAAAGACACAAACTTCGTGTACAAGAGCTCGACTTTGTCGACTTCCTCGCTTATAAA

QA 3 661 3 661
DS 

RD RR2G522TF 693 0 0
CATCACGAAGTTGTTTCTTAATCATTTATCCAATGATAGACCAAAATAAATACAACCGCA
TTATGTTTGTAATTGCATGATTATATAAAGATCATAGGAGTCTAGACGATTATACATTAT
ACGACCGAAAATGATATATATTTAAAAAACAACCTGCTCATATCGAATCA**AGCCTGTG
CATTAGCTCCAGCAACAATCTCAAGAATCTCACCAGTAATCTTAGCTTGACGTTTTCTAT
TATAAACCATCGAAAGTGATTTCTTAAGATCCGATGCATTATCCGAAGCACTACTCATCG
CACTCATCCTAGCGGCGAGCTCACTCGCCAAAGACTCCTGTAACGCCCTAAGAATCTGAC
TGTTCAGATACAAAGGCAACAAAGCATCAAGAATCTGAACAGGGTCTTGCTCGAACTGCA
AGATCGGCGAGAAATCAGCAGTTGCTGTCCGAAAAGTCTCTCTCTCGACCGTCAGCTTCC
CTTCTTTCGTCGTTAACCTGAAGAACTCGTCTTCAGCAGCGTCCACACAGTTCTCGTTGA
TGTCACAGATCTCTCCTTTGGGTGATAGAGGCAGTAGCGTGTGGATCACGGGTTCTGACC
TGACCAAAGACACAAACTTCGTGTACAAGAGCTCGACTTTGTCGACTTCCTCGCTTATAA
ACAGAGAGAAGACATCATCGGCAACAGCTTGAG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2F538JQ 693 0 0
GG
GTTGTTTCTTAATCATTTATCCAATGATAGACCAAAATAAATACAACCGCATTATGTTTG
TAATTGCATGATTATATAAAGATCATAGGAGTCTAGACGATTATACATTATACGACCGAA
AATGATATATATTTAAAAAACAACCTGCTCATATCGAATCA**AGCCTGTGCATTAGCTC
CAGCAACAATCTCAAGAATCTCACCAGTAATCTTAGCTTGACGTTTTCTATTATAAACCA
TCGAAAGTGATTTCTTAAGATCCGATGCATTATCCGAAGCACTACTCATCGCACTCATCC
TAGCGGCGAGCTCACTCGCCAAAGACTCCTGTAACGCCCTAAGAATCTGACTGTTCAGAT
ACAAAGGCAACAAAGCATCAAGAATCTGAACAGGGTCTTGCTCGAACTGCAAGATCGGCG
AGAAATCAGCAGTTGCTGTCCGAAAAGTCTCTCTCTCGACCGTCAGCTTCCCTTCTTTCG
TCGTTAACCTGAAGAACTCGTCTTCAGCAGCGTCCACACAGTTCCCGTTGATGTCACAGA
TCTCTCCTTTGGGTGATAGAGGCAGTAGCGTGTGGATCACGGGTTCTGACCTGACCAAAG
ACACAAACTTCGTGTACAAGAGCTCGACTTTGTCGACTTCCTCGCTTATAAACAGAGAGA
AGACATCATCGGCAACAGCTTGAGCTTCCTT

QA 3 693 3 693
DS 

RD RR2BI51JQ 758 0 0
CATCACGAAGTTGTTTCTTAATCATTTATCCAATGATAGACCAAAATAAATACAACCGCA
TTATGTTTGTAATTGCATGATTATATAAAGATCATAGGAGTCTAGACGATTATACATTAT
ACGACCGAAAATGATATATATTTAAAAAACAACCTGCTCATATCGAATCA**AGCCTGTG
CATTAGCTCCAGCAACAATCTCAAGAATCTCACCAGTAATCTTAGCTTGACGTTTTCTAT
TATAAACCATCGAAAGTGATTTCTTAAGATCCGATGCATTATCCGAAGCACTACTCATCG
CACTCATCCTAGCGGCGAGCTCACTCGCCAAAGACTCCTGTAACGCCCTAAGAATCTGAC
TGTTCAGATACAAAGGCAACAAAGCATCAAGAATCTGAACAGGGTCTTGTTCGAACTGCA
AGATCGGCGAGAAATCAGCAGTTGCTGTCCGAAAAGTCTCTCTCTCGACCGTCAGCTTCC
CTTCTTTCGTCGTTAACCTGAAGAACTCGTCTTCAGCAGCGTCCACACAGTTCCCGTTGA
TGTCGCAGATCTCTCCTTTGGGTGATAGAGGCAGTAGCGTGTGGATCACGGGTTCTGACC
TGACCAAAGACACAAACTTCGTGTACAAGAGCTCGACTTTGTCGACTTCCTCGCTTATAA
ACAGAGAGAAGACATCATCGGCAACAGCTTGAGCTTCCTTCGCCGTAGGTAAGGTTCCGG
CCTCGAGGTACTTGTCGAC*GGGGATGTACGGACGGCG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2F722JQ 716 0 0
ATCCAATGAAAGACCAAAATAAATACGACCGCATTATGTTTGTAATTGCATGATTATATA
AAAATCATAGGAGTCTAGACGATTATACATTATACGACCGAAAATGATATATATTTAAAA
AACAACCTGCTCATATCGAATCA**AGCCTGTGCATTAGCTCCAGCAACAATCTCAAGAA
TCTCACCAGTAATCTTAGCTTGACGTTTTCTATTATAAACCATGGAAAGCGACTTCTTAA
GATCCGACGCATTATCCGAAGCACTACTCATCGCACTCATCCGAGCCGCGAGCTCACTCG
CCAAAGACTCCTGTAACGCCCTAAGAATCTGACTGTTCAGATACAAAGGCAACAAAGCAT
CAAGAATCTGAACAGGGTCTTGCTCGAACTGCAAGATCGGCGAGAAATCAGCAGTTGCTG
TCCGAAAAGTCTCTCTCTCGACCGTCAGCTTCCCTTCTTTCGTCGTTAACCTGAAGAACT
CGTCTTCAGCAGCGTCAACACAGTTCCCGTTGATGTCACAGATCTCTCCTTTGGGTGATA
GAGGCAGTAGCGTGTGGATCACGGGTTCTGATCTGACCAAAGACACAAACTTCGTGTACA
AGAGCTCCACTTTGTCGACTTCCTCACTTATAAACAGAGAGAAGACATCATCGGCAACGG
CTTGAGCTTCCTTCGCCGTCGGTAAGGTTCCGGCCTCGAGGTACTTGTCGAC*GGG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2F722TF 749 0 0
ATCCAATGAAAGACCAAAATAAATACGACCGCATTATGTTTGTAATTGCATGATTATATA
AAAATCATAGGAGTCTAGACGATTATACATTATACGACCGAAAATGATATATATTTAAAA
AACAACCTGCTCATATCGAATCA**AGCCTGTGCATTAGCTCCAGCAACAATCTCAAGAA
TCTCACCAGTAATCTTAGCTTGACGTTTTCTATTATAAACCATGGAAAGCGACTTCTTAA
GATCCGACGCATTATCCGAAGCACTACTCATCGCACTCATCCGAGCCGCGAGCTCACTCG
CCAAAGACTCCTGTAACGCCCTAAGAATCTGACTGTTCAGATACAAAGGCAACAAAGCAT
CAAGAATCTGAACAGGGTCTTGCTCGAACTGCAAGATCGGCGAGAAATCAGCAGTTGCTG
TCCGAAAAGTCTCTCTCTCGACCGTCAGCTTCCCTTCTTTCGTCGTTAACCTGAAGAACT
CGTCTTCAGCAGCGTCAACACAGTTCCCGTTGATGTCACAGATCTCTCCTTTGGGTGATA
GAGGCAGTAGCGTGTGGATCACGGGTTCTGATCTGACCAAAGACACAAACTTCGTGTACA
AGAGCTCCACTTTGTCGACTTCCTCACTTATAAACAGAGAGAAGACATCATCGGCAACGG
CTTGAGCTTCCTTCGCCGTCGGTAAGGTTCCGGCCTCGAGGTACTTGTCGAC*GGGGATG
TAGGGACGGCGGAGGAAGTAAGAGTTTCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2A063JQ 605 0 0
CATATCGAATCA**AGCCGGGGCATTAGCTCCAGCAACAATCTCAAGAATCTCACCAGTA
ATCTTAGCTGGACGTTTTCTATTATAAACCATCGAAAGGGATTTCTTAAGAACCGATGCA
TTATCCGAAGCACTACTCATCGCACTCATCCTAGCGGCGAGCTCACTCGCCAAAGACTCC
TGTAACGCCCTAAGAATCTGACTGTTCTGATACAAAGGCAACAAAGCATCAAGAATCTGA
ACAGGGTCTTGCTCGAACTGCAAGATCGGCGAGAAATCAGCAGTTGCTGTCCGAAAAGTC
TCTCTCTCGACCGTCAGCTTCCCTTCTTTCGTCGTTAACCTGAAGAACTCGTCTTCAGCA
GCGTCCACACAGTTCCCGTTGATGTCACAGATCTCTCCTTTGGGTGATAGAGGCAGTAGC
GTGTGGATCACGGGTTCTGACCTGACCAAAGACACAAACTTCGTGTACAAGAGCTCGACT
TTGTCGACTTCCTCGCTTATAAACAGAGAGAAGACATCATCGGCAACAGCTTGAGCTTCC
TTCGCCGTAGGTAAGGTTCCGGCCTCGAGGTACTTGTCGAC*AGGGATGTACGGACGGCG
AAGGA

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2A063TF 279 0 0
CTTCTTTCGTCGTTAAC*TGAAGAACTCGTCTTCAGCAGCGTCCACACAGTTCCCGTTGA
TGTCACAGATCTCTCCTTTGGGTGATAGAGGCAGTAGCGTGTGGATCACGGGTTCTGA*C
TGACCAAAGACACAAACTTCGTGTACAAGAGCTCGACTTTGTCGACTTCCTCGGTTATAA
ACAGAGAGAAGACATCATCGGCAACAGCTTGAGCTTCCTTCGCCGTAGGTAAGGTTCCGG
CCTCGAGGTACTTGTCGACAGGGGATGTACGGACGGCG
A

QA 1 278 1 278
DS 

RD RR2DV77TF 714 0 0
AAGTG
TGCTCATATCGAATCATCAAGCTGTGCATTGGCTCCAGCAACAATCTCAAGAATCTCACC
AGTAATCTTAGCTTGACGTTTTCTATTATAAACCATCGAAAGCGATTTCTTAAGATCCGA
TGCATTATCCGAAGCACTACTCATCGCACTCATCCTAGCCGCGAGCTCACTCGCCAAAGA
CTCCTGTAACGCCCTAAGAATCTGACTGTTCAGATACAAAGGCAACAAAGCATCAAGAAT
CTGAACAGGGTCTTGCTCGAACTGCAAGATCGGCGAGAAATCAGCAGTTGCTGTCCGAAA
AGTCTCTCTCTCGACTGTCAGCTTCCCTTCTTTAGTCGTCAACCTGAAGAACTCGTCTTC
AGCAGCGTCAACACAGTTCCCATTGATGTCACAGATCTCTCCTTTGGGTGATAGAGGCAG
TAGCGTGTGGATCACGGGTTCTGATCTGACCAAAGACACAAACTTCGTGTACAAGAGCTC
CACTTTGTCGACTTCCTCGCTTATAAACAGAGAGAAGACATCATCGGCAACGGCTTGAGC
TTCCTTCGCCGTAGGTAAGGTTCCGGCCTCGAGGTACTTGTCGAC*GGGGATGTACGGAC
GGCGGAGGAAGTAAGAGTTTCCCTTCTTCCCCACGCTAATGACTGTGTAGTCAAGACCTA
ACCCTTGAAGCTCCTTGATCCTCGCCTCTGCTTTCTTGATAATGAAGT
C

QA 6 713 6 713
DS 

RD RR2GN96TF 797 0 0
AACCATCGAAAGCGATTTCTTAAGATCCGATGCAT*ATCCGAAGCACTACTCATCGCACT
CATCCTAGCCGCGAGCTCACTCGCCAAAGACTC*TGTAACGCCCTAAGAATCTGACTGTT
CAGATACAAAGGCAACAAAGCATCAAGAATCTGAACAGGGTCTTGCTCGAACTGCAAGAT
CGGCGAGAAATCAGCAGTTGCTGTCCGAAAAGTCTCTCTCTCGACTGTCAGCTTCCCTTC
TTTAGTCGTCAACCTGAAGAACTCGTCTTCAGCAGCGTCAACACAGTTCCCATTGATGTC
ACAGATCTCTCCTTTGGGTGATAGAGGCAGTAGCGTGTGGATCACGGGTTCTGATCTGAC
CAAAGACACAAACTTCGTGTACAAGAGCTCCACTTTGTCGACTTCCTCGCTTATAAACAG
AGAGAAGACATCATCGGCAACGGCTTGAGCTTCCTTCGCCGTAGGTAAGGTTCCGGCCTC
AAGGTACTTGTCGAC*GGGGATGTACGGACGGCGGAGGAAGTAAGAGTTTCCCTTCTTCC
CCACGCTAATGACTGTGTAGTCAAGACCTAACCCTTGAAGCTCCTTGATCCTCGCCTCTG
CTTTCTTGATAATGAAGTTATTAAACCCACCGCATAAGCCACGGTCTCCCGTTACGACAA
CGAGTGCAACCTTCTTAACCGGTCTGATCTTGGTTAAGGGCACATCGATATCATCGGTTT
GAAGCTGTTCGTTGATGTTGTAAAGAACTTCGACTAGGGTTTCGGAGAATGGTCGTCCGT
TGACGACAGCTTCTTG
C

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2E092TF 815 0 0
TGATAGAGGCAGTAGCGTGTGGATCACGGGTT*TGATCTGACCAAAGACACAAACTTCGT
GTACAAGAGCTCGACTTTGTCGACT*CCTCACTTATAAACAGAGAGAAGACATCATCGGC
AACGGCTTGAGCTTC*TTCGCCGTCGGTAAGGT*CCGGCCTCGAGGTACTTGTCGAC*GG
GGATGTACGGACGGCGGAGGAAGTAAGAGTTTCCCTTCTTCCCCACGCTAATGACTGTGT
AGTCAAGACCTAACCCTTGAAGCTCCTTGATCCTCGCCTCTGCTTTCTTGATAATGAAGT
TATTAAACCCACCGCATAATCCACGGTCTCCCGTTACGACAACGAGTGCAACCTTCTTAA
CCGGTCTGATCTTGGTTAAGGGCACATCGATATCATCGGTTTGAAGCTGTTCGTTGATGT
TGTAAAGAACTTCGACTAGGGTTTCGGAGAATGGTCGTCCGTTGACGACAGCTTCTTGAG
CTCTCCTGACTTTTGCTGCAGCGACAAGCTTCATGGCTTCGGTGATCTTCTGGGTGTTTT
TGACTGAATCGATACGGTCTCTGAGCTCACGGAGGGAGGATTGGATTGGAGCAACGGAGG
AGGATCTTGAAGGAGAGAGGTTGTGGTTTGGGAGAGGAAGTGGGTTGAGACCAGAACGGA
AGGACAAGGAAGAGGAATCGGAAAGAGATGCGTTTGACGAAACCCACATTGTTGTTAGAT
TACTGCAAGCCATTGTTCTTGATTTTGGTTCAAACTGAAAGACAAGTTTTTTTGTTCAGA
CAGTGTTTTGGTTTAATCTTATCTACGTTCTTTCC

QA 1 815 1 815
DS 



CO CL115Contig2 869 4 9 U
GGAAAGGAGAATAAACCTTATCTCCAAACCTCATCCATTACCTTCTCTTCCCCCACTCAA
TCTCTCTTCTCTTCTGTCTTACAATCAAAGAAAAGGTAGATAAGGTTAAACCAAAACACT
GTCTGAACAAAAAAAT**TTGTCTTTCCGTTTGAACCAAAATCAAGAACAATGGCTTGCA
GTAATCTAACAACAATGTGGGTTTCATCAAACGCATCTCTTTCCGATTCCTCTTCCTTGT
CCTTCCGTTCTGTTCTCAACCCACTTCCTCTCCCAAACCACAACTCCTCTCCTTCAAGAT
CCTCCTTCGTTGCTCCAATCCAATCCTCCCTTCGTGAGCTCAGAGACCGAATCGACTCAG
TCAAAAACACTCAGAAGATCACTGAAGCCATGAAGCTTGTCGCTGCCGCAAAAGTCAGGA
GAGCTCAAGAAGCTGTCGTCAACGGACGACCATTCTCCGAAACCCTAGTCGAAGTTCTTT
ACAACATCAACGAACAGCTTCAAACCGATGATATCGATGTGCCCTTAACCAAGATAAGAC
CGGTTAAGAAGGTTGCACTCGTTGTCGTAACGGGAGACCGTGGATTATGCGGTGGGTTTA
ATAACTTCATTATCAAGAAAGCAGAGGCGAGGATCAAGGAGCTTCAAGGGTTAGGTCTTG
ACTACACAGTCATTAGCGTGGGGAAGAAGGGAAACTCTTACTTCCTTCGCCGTCCGTACA
TCCCCGTCGACAAGTACCTCGAGGCCGGAACCTTACCTACGGCGAAAGAAGCTCAAGCTG
TTGCCGATGATGTCTTCTCTCTGTTCATAAGCGAGGAAGTCGACAAAGTCGAACTCTTGT
ACACGAAGTTTGTGTCTTTGGTCACGTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 20 20 5 20 20 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI51TF U 1
AF RR2G545TF U 119
AF RR2FK74TF U 106
AF RR2F538TF U 257
BS 1 399 RR2BI51TF
BS 400 400 RR2G545TF
BS 401 764 RR2BI51TF
BS 765 826 RR2FK74TF
BS 827 827 RR2F538TF
BS 828 829 RR2FK74TF
BS 830 830 RR2F538TF
BS 831 853 RR2FK74TF
BS 854 869 RR2F538TF

RD RR2BI51TF 764 0 0
GGAAAGGAGAATAAACCTTATCTCCAAACCTCATCCATTACCTTCTCTTCCCCCACTCAA
TCTCTCTTCTCTTCTGTCTTACAATCAAAGAAAAGGTAGATAAGGTTAAACCAAAACACT
GTCTGAACAAAAAAAT**TTGTCTTTCCGTTTGAACCAAAATCAAGAACAATGGCTTGCA
GTAATCTAACAACAATGTGGGTTTCATCAAACGCATCTCTTTCCGATTCCTCTTCCTTGT
CCTTCCGTTCTGTTCTCAACCCACTTCCTCTCCCAAACCACAACTCCTCTCCTTCAAGAT
CCTCCTTCGTTGCTCCAATCCAATCCTCCCTTCGTGAGCTCAGAGACCGAATCGACTCAG
TCAAAAACACTCAGAAGATCACTGAAGCCATGAAGCTTGCCGCTGCCGCAAAAGTCAGGA
GAGCTCAAGAAGCTGTCGTCAACGGACGACCATTCTCCGAAACCCTAGTCGAAGTTCTTT
ACAACATCAACGAACAGCTTCAAACCGATGATATCGATGTGCCCTTAACCAAGATAAGAC
CGGTTAAGAAGGTTGCACTCGTTGTCGTAACGGGAGACCGTGGATTATGCGGTGGGTTTA
ATAACTTCATTATCAAGAAAGCAGAGGCGAGGATCAAGGAGCTTCAAGGGTTAGGTCTTG
ACTACACAGTCATTAGCGTGGGGAAGAAGGGAAACTCTTACTTCCTTCGCCGTCCGTACA
TCCCCGTCGACAAGTACCTCGAGGCCGGAACCTTACCTACGGCG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2G545TF 641 0 0
GGGTCTGAAC
AAAAAAAT**TTGTCTTTCCGTTTGAACCAAAATCAAGAACAATGGCTTGCAGTAATCTA
ACAACAATGTGGGTTTCATCAAACGCATCTCTTTCCGATTCCTCTTCCTTGTCCTTCCGT
TCTGTTCTCAACCCACTTCCTCTCCCAAACCACAACTCCTCTCCTTCAAGATCCTCCTTC
GTTGCTCCAATCCAATCCTCCCTTCGTGAGTTCAGAGACCGAATCGACTCAGTCAAAAAC
ACTCAGAAGATCACTGAAGCCATGAAGCTTGTCGCTGCCGCAAAAGTCAGGAGAGCTCAA
GAAGCTGTCGTCAACGGACGACCATTCTCCGAAACCCTAGTCGAAGTTCTTTACAACATC
AACGAACAGCTTCAAACCGATGATATCGATGTGCCCTTAACCAAGATAAGACCGGTTAAG
AAGGTTGCACTCGTTGTCGTAACGGGAGACCGTGGATTATGCGGTGGGTTTAATAACTTC
ATTATCAAGAAAGCAGAGGCGAGGATCAAGGAGCTTCAAGGGTTAGGTCTTGACTACACA
GTCATTAGCGTGGGGAAGAAGGGAAACTCTTACTTCCTTCGCCGTCCGTACATCCCCGTC
GACAAGTACCTCGAGGCCGGAACCTTACCTA

QA 11 641 11 641
DS 

RD RR2FK74TF 748 0 0
GG
AAACCAAAACACTGTCTGAACAAAAAAAAAATTGTCTTTCCGTTTGAACCAAAATCAAGA
ACAATGGCTTGCAGTAGTCTAACAACAATGTGGGTTTCATCAAACCCATCTCTTTCCGAT
TCCTCTTCCTTGTCCTTCCGTTCTGTTCTCAACCCACTTCCTCTCCCAAACCACAACTCC
TCTCCTTCAAGATCCTCCTTCGTTGCTCCAATCCAATCCACCCTTCGTGAGCTCAGAGAC
CGAATCGACTCAGTCAAAAACACCCAGAAGATCACCGAAGCCATGAAGCTTGTCGCTGCC
GCAAAAGTCAGGAGAGCTCAAGAAGCCGTCGTCAACGGACGACCATTCTCCGAAACCCTA
GTCGAAGTTCTTTACAACATCAACGAACAGCTTCAAACCGATGATATCGATGTGCCCTTA
ACCAAGATAAGACCGGTTAAGAAGGTTGCACTCGTTGTCGTAACGGGAGACCGTGGATTA
TGCGGTGGGTTTAATAACTTCATTATCAAGAAAGCAGAGGCGAGGATCAAGGAGCTTCAA
GGGTTAGGTCTTGACTACACAGTCATTAGCGTGGGGAAGAAGGGAAACTCTTACTTCCTC
CGCCGTCCGTACATCCCCGTCGACAAGTACCTCGAGGCCGGAACCTTACCGACG*CGAAA
GAAGCTCAAGCTGTTGCCGATGATGTCTTCTCTCTGTTCATAAGCGAGGAAGTCGACAA*
GTGGAACTCTTGTACACGAAGTTTGT

QA 3 748 3 748
DS 

RD RR2F538TF 613 0 0
G
AACCCACTTCCTCTCCCAAACCACAACTCCTCTCCTTCAAGATCCTCCTTCGTTGCTCCA
ATCCAATCCTCCCTTCGTGAGCTCAGAGACCGAATCGACTCAGTCAAAAACACTCAGAAG
ATCACTGAAGCCATGAAGCTTGTCGCTGCCGCAAAAGTCAGGAGAGCTCAAGAAGCTGTC
GTCAACGGACGACCATTCTCCGAAACCCTAGTCGAAGTTCTTTACAACATCAACGAACAG
CTTCAAACCGATGATATCGATGTGCCCTTAACCAAGATAAGACCGGTTAAGAAGGTTGCA
CTCGTTGTCGTAACGGGAGACCGTGGATTATGCGGTGGGTTTAATAACTTCATTATCAAG
AAAGCAGAGGCGAGGATCAAGGAGCTTCAAGGGTTAGGTCTTGACTACACAGTCATTAGC
GTGGGGAAGAAGGGAAACTCTTACTTCCTTCGCCGTCCGTACATCCCCGTCGACAAGTAC
CTCGAGGCCGGAACCTTACCTACGGCGAAGGAAGCTCAAGCTGTTGCCGATGATGTCTTC
TCTCTGTTTATAAGCGAGGAAGTCGACAAAGTCGAGCTCTTGTACACGAAGTTTGTGTCT
TTGGTCACGTCA

QA 2 613 2 613
DS 



AS 3 13

CO CL116Contig1 478 2 1 U
GCCGATGCTTAAGGCGGGTAACGCGTACCACAAGTACCGTGTGAAGAGGAACTGCTGGCC
TAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAATCCAGTTGAGCATCCTCACGGAGGAGGTAACCATCA
ACATATTGGTCACGCTAGTACTGTTCGTCGTGATGCGCCTCCTGGGCAAAAGGTTGGTCT
TATTGCTGCGAGGAGGACTGGTCGTCTCAGAGGTCAAGCTGCTGCTCTTGCTTCCAAGCA
AGAATAAGGAGAGGAGGCTTGAGGATGAAATCGCTCAATGTTTTTGGATCGTGTTTAAGA
CCTTGTTTTGAAACCTTAAGGAGAGGAGACAGTGTTCTTTGAGACCTTTTCTCGATCTAT
TTCTTCAGTTTATTGGTTTCCATTTTCATTTTGCGTGCCTCTTTCATACTAATACTCAAA
ACATAAAGATGTAATATCTGCCAACTTTGAGAGAAACAGTCTATTTGATGTTGAAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AA56JQ C 1
AF RR2AA56TF U 1
BS 1 478 RR2AA56TF

RD RR2AA56JQ 478 0 0
GCCGATGCTTAAGGCGGGTAACGCGTACCACAAGTACCGTGTGAAGAGGAACTGCTGGCC
TAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAATCCAGTTGAGCATCCTCACGGAGGAGGTAACCATCA
ACATATTGGTCACGCTAGTACTGTTCGTCGTGATGCGCCTCCTGGGCAAAAGGTTGGTCT
TATTGCTGCGAGGAGGACTGGTCGTCTCAGAGGTCAAGCTGCTGCTCTTGCTTCCAAGCA
AGAATAAGGAGAGGAGGCTTGAGGATGAAATCGCTCAATGTTTTTGGATCGTGTTTAAGA
CCTTGTTTTGAAACCTTAAGGAGAGGAGACAGTGTTCTTTGAGACCTTTTCTCGATCTAT
TTCTTCAGTTTATTGGTTTCCATTTTCATTTTGCGTGCCTCTTTCATACTAATACTCAAA
ACATAAAGATGTAATATCTGCCAACTTTGAGAGAAACAGTCTATTTGATGTTGAAACT

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2AA56TF 478 0 0
GCCGATGCTTAAGGCGGGTAACGCGTACCACAAGTACCGTGTGAAGAGGAACTGCTGGCC
TAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAATCCAGTTGAGCATCCTCACGGAGGAGGTAACCATCA
ACATATTGGTCACGCTAGTACTGTTCGTCGTGATGCGCCTCCTGGGCAAAAGGTTGGTCT
TATTGCTGCGAGGAGGACTGGTCGTCTCAGAGGTCAAGCTGCTGCTCTTGCTTCCAAGCA
AGAATAAGGAGAGGAGGCTTGAGGATGAAATCGCTCAATGTTTTTGGATCGTGTTTAAGA
CCTTGTTTTGAAACCTTAAGGAGAGGAGACAGTGTTCTTTGAGACCTTTTCTCGATCTAT
TTCTTCAGTTTATTGGTTTCCATTTTCATTTTGCGTGCCTCTTTCATACTAATACTCAAA
ACATAAAGATGTAATATCTGCCAACTTTGAGAGAAACAGTCTATTTGATGTTGAAACT

QA 1 478 1 478
DS 



CO CL116Contig2 974 7 12 U
GGGCCGTAAACTCAAGAAGAGGAAGGAAGATCATCATCCATGGGTCGTGTCATCAGAGCT
CAACGTAAAGGAGCAGGCTCCGTCTTCAAGTCCCACACTCACCACCGCAAGGGCCCCGCC
AAGTTCAGGAGCCTCGATTTCGGCGAGAGAAATGGTTACCTCAAGGGTGTCGTCACGGAG
ATCATCCACGATCCTGGTCGCGGTGCTCCGTTAGCCCGCGTCGCCTTCCGTCATCCTTTC
CGTTACAAGAAGCAGAAGGAGCTCTTCGTCGCCGCCGAAGGTATGTACACCGGACAGTTC
CTCTACTGCGGTAAGAAGGCCACTCTCGTCGTCGGAAATGTCCTGCCTCTCAGATCTATC
CCCGAGGGAGCTGTTGTCTGCAACGTCGAGCACCATGTCGGTGACCGTGGTGTGCTCGCT
AGAGCTTCTGGTGATTACGCTATCGTTATTTCACACAACCCTGACAACGACACGACAAGG
GTTAAGTTGCCATCTGGATCGAAGAAGATTGTCCCAAGTGGATGCAGGGCCATGATTGGT
CAAGTTGCTGGTGGTGGAAGAACTGAGAAGCCGATGCTCAAGGCGGGTAACGCGTACCAC
AAGTACCGTGTGAAGAGGAACTGCTGGCCTAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAATCCTGTT
GAGCATCCTCACGGAGGAGGTAACCATCAACATATCGGTCACGCCAGTACCGTCCGTCGT
GATGCACCACCCGGGCAAAAGGTTGGTCTTATTGCTGCAAGGAGGACTGGTCGTCTCAGA
GGTCAAGCTGCTGCTCTTGCCTCCAAGCAAGAATAAGGAGGGGAAGCTTCATGATGATGA
AACTGTTTACTTTTGTTGGATTTTTGCTGAGACCTTGTTTTGAATCCTTTAGATTTTCTT
TAATCTTCTTTGAGACCTTTGGCTTCAGGATCAAACCTCCACATTATCATTTTAAATTTC
AGGATTCAGTTTCG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2DZ52TF U 1
AF RR2CC79TF U 1
AF RR2D483TF U 1
AF RR2EG15TF U 1
AF RR2D483JQ C 138
AF RR2DZ52JQ C 304
AF RR2EG15JQ C 394
BS 1 186 RR2CC79TF
BS 187 187 RR2D483TF
BS 188 241 RR2CC79TF
BS 242 242 RR2D483TF
BS 243 669 RR2CC79TF
BS 670 670 RR2D483TF
BS 671 672 RR2EG15TF
BS 673 725 RR2D483JQ
BS 726 726 RR2DZ52JQ
BS 727 728 RR2D483JQ
BS 729 729 RR2DZ52JQ
BS 730 974 RR2D483JQ

RD RR2DZ52TF 612 0 0
GGGCCGTAAACTCAAGAAGAGGAAGGAAGATCATCATCCATGGGTCGTGTCATCAGAGCT
CAACGTAAAGGAGCAGGCTCCGTCTTCAAGTCCCACACTCACCACCGCAAGGGCCCCGCC
AAGTTCAGGAGCCTCGATTTCGGCGAGAGAAATGGTTACCTCAAGGGTGTCGTCACGGAG
ATCATCCACGATCCTGGTCGCGGTGCTCCGTTAGCCCGCGTCGCCTTCCGTCATCCTTTC
CGTTACAAGAAGCAGAAGGAGTTCTTCGTCGCCGCCGAAGGTATGTACACCGGACAGTTC
CTCTACTGCGGTAAGAAGGCCACTCTCGTCGTCGGAAATGTCCTGCCTCTCAGATCTATC
CCCGAGGGAGCTGTTGTCTGCAACGTCGAGCACCATGTCGGTGACCGTGGTGTGCTCGCT
AGAGCTTCTGGTGATTACGCTATCGTTATTTCACACAACCCTGACAACGACACGACAAGG
GTTAAGTTGCCATCTGGATCGAAGAAGATTGTCCCAAGTGGATGCAGGGCCATGATTGGT
CAAGTTGCTGGTGGTGGAAGAACTGAGAAGCCGATGCTCAAG*CGGGTAACGCGTACCAC
AAGTACCGTGTG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2CC79TF 669 0 0
GGGCCGTAAACTCAAGAAGAGGAAGGAAGATCATCATCCATGGGTCGTGTCATCAGAGCT
CAACGTAAAGGAGCAGGCTCCGTCTTCAAGTCCCACACTCACCACCGCAAGGGCCCCGCC
AAGTTCAGGAGCCTCGATTTCGGCGAGAGAAATGGTTACCTCAAGGGTGTCGTCACGGAG
ATCATC*ACGATCCTGGTCGCGGTGCTCCGTTAGCCCGCGTCGCCTTCCGTCATCCTTTC
CTTTACAAGAAGCAGAAGGAGCTCTTCGTCGCCGCCGAAGGTATGTACACCGGACAGTTC
CTCTACTGCGGTAAGAAGGCCACTCTCGTCGTCGGAAATGTCCTGCCTCTCAGATCTATC
CCCGAGGGAGCTGTTGTCTGCAACGTCGAGCACCATGTCGGTGACCGTGGTGTGCTCGCT
AGAGCTTCTGGTGATTACGCTATCGTTATTTCACACAACCCTGACAACGACACGACAAGG
GTTAAGTTGCCATCTGGATCGAAGAAGATTGTCCCAAGTGGATGCAGGGCCATGATTGGT
CAAGTTGCTGGTGGTGGAAGAACTGAGAAGCCGATGCTCAAGGCGGGTAACGCGTACCAC
AAGTACCGTGTGAAGAGGAACTGCTGGCCTAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAATCCTGTT
GAGCATCCT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2D483TF 670 0 0
GGGCCGTAAACTCAAGAAGAGGAAGGGAGATCATCATCCATGGGTCGTGTCATCAGAGCT
CAACGTAAAGGAGCAGGCTCCGTCTTCAAGTCCCACACTCACCACCGCAAGGGCCCCGCC
AAGTTCAGGAGCCTCGATTTCGGCGAGAGAAATGGTTACCTCAAGGGTGTCGTCACGGAG
ATCATCCACGATCCTGGTCGCGGTGCTCCGTTAGCCCGCGTCGCCTTCCGTCATCCTTTC
CGTTACAAGAAGCAGAAGGAGCTCTTCGTCGCCGCCGAAGGTATGTACACCGGACAGTTC
CTCTACTGCGGTAAGAAGGCCACTCTCGTCGTCGGAAATGTCCTGCCTCTCAGATCTATC
CCCGAGGGAGCTGTTGTCTGCAACGTCGAGCACCATGTCGGTGACCGTGGTGTGCTCGCT
AGAGCTTCTGGTGATTACGCTATCGTTATTTCACACAACCCTGACAACGACGCGACAAGG
GTTAAGTTGCCATCTGGATCGAAGAAGATTGTCCCAAGTGGATGCAGGGCCATGATTGGT
CAAGTTGCTGGTGGTGGAAGAACTGAGAAGCCGATGCTCAAGGCGGGTAACGCGTACCAC
AAGTACCGTGTGAAGAGGAACTGCTGGCCTAAG*TTCGTGGTGTGGCTATGAATCCTGTT
GAGCATCCTC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2EG15TF 672 0 0
GGGCCGTAAACTCAAGAAGAGGAAGGAAGATCATCATCCATGGGTCGTGTCATCAGAGCT
CAACGTAAAGGAGCAGGCTCCGTCTTCAAGTCCCACACTCACCACCGCAAGGGCCCTGCC
AAGTTCAGGAGCCTCGATTTCGGCGAGAGAAATGGTTACCTCAAGGGTGTCGTCACGGAG
ATCATCCACGATCCTGGTCGCGGTGCTCCGTTAGCCCGCGTCGCCTTCCGTCATCCTTTC
CGTTACAAGAAGCAGAAGGAGCTCTTCGTCGCCGCCGAAGGTATGTACACCGGACAGTTC
CTCTACTGCGGTAAGAAGGCCACTCTCGTCGTCGGAAATGTCCTGCCTCTCAGATCTATC
CCCGAGGGAGCTGTTGTCTGCAACGTCGAGCACCATGTCGGTGACCGTGGTGTGCTCGCT
AGAGCTTCTGGTGATTACGCTATCGTTATTTCACACAACCCTGACAACGACACGACAAGG
GTTAAGTTGCCATCTGGATCGAAGAAGATTGTCCCAAGTGGATGCAGGGCCATGATTGGT
CAAGTTGCTGGTGGTGGAAGAACTGAGAAGCCGATGCTCAAGGCGGGTAACGCGTACCAC
AAGTACCGTGTGAAGAGGAACTGCTGGCCTAAG*TTCGTGGTGTGGCTATGAATCCTGTT
GAACATCCTCAC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2D483JQ 837 0 0
TTTCGGCGAGAGAAATGGTTACCTCAAGGGTGTCGTCACGGAGATCATCCACGATCCTGG
TCGCGGTGCTCCGTTAGCCCGCGTCGCCTTCCGTCATCCTTTCCGTTACAAGAAGCAGAA
GGAGCTCTTCGTCGCCGCCGAAGGTATGTACACCGGACAGTTCCTCTACTGCGGTAAGAA
GGCCACTCTCGTCGTCGGAAATGTCCTGCCTCTCAGATCTATCCCCGAGGGAGCTGTTGT
CTGCAACGTCGAGCACCATGTCGGTGACCGTGGTGTGCTCGCTAGAGCTTCTGGTGATTA
CGCTATCGTTATTTCACACAACCCTGACAACGACGCGACAAGGGTTAAGTTGCCATCTGG
ATCGAAGAAGATTGTCCCAAGTGGATGCAGGGCCATGATTGGTCAAGTTGCTGGTGGTGG
AAGAACTGAGAAGCCGATGCTCAAGGCGGGTAACGCGTACCACAAGTACCGTGTGAAGAG
GAACTGCTGGCCTAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAATCCTGTTGAGCATCCTCACGGAGG
AGGTAACCATCAACATATCGGTCACGCCAGTACCGTCCGTCGTGATGCCCCCCCCGGGCA
AAAGGTTGGTCTTATTGCTGCAAGGAGGACTGGTCGTCTCAGAGGTCAAGCTGCTGCTCT
TGCCTCCAAGCAAGAATAAGGAGGGGAAGCTTCATGATGATGAAACTGTTTACTTTTGTT
GGATTTTTGCTGAGACCTTGTTTTGAATCCTTTAGATTTTCTTTAATCTTCTTTGAGACC
TTTGGCTTCAGGATCAAACCTCCACATTATCATTTTAAATTTCAGGATTCAGTTTCG

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR2DZ52JQ 671 0 0
TACTGCGGTAAGAAGGCCACTCTCGTCGTCGGAAATGTCCTGCCTCTCAGATCTATCCCC
GAGGGAGCTGTTGTCTGCAACGTCGAGCACCATGTCGGTGACCGTGGTGTGCTCGCTAGA
GCTTCTGGTGATTACGCTATCGTTATTTCACACAACCCTGACAACGACACGACAAGGGTT
AAGTTGCCATCTGGATCGAAGAAGATTGTCCCAAGTGGATGCAGGGCCATGATTGGTCAA
GTTGCTGGTGGTGGAAGAACTGAGAAGCCGATGCTCAAGGCGGGTAACGCGTACCACAAG
TACCGTGTGAAGAGGAACTGCTGGCCTAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAATCCTGTTGAG
CATCCTCACGGAGGAGGTAACCATCAACATATCGGTCACGCCAGTACCGTCCGTCGTGAT
GCACCACCCGGGCAAAAGGTTGGTCTTATTGCTGCAAGGAGGACTGGTCGTCTCAGAGGT
CAAGCTGCTGCTCTTGCCTCCAAGCAAGAATAAGGAGGGGAAGCTTCATGATGATGAAAC
TGTTTACTTTTGTTGGATTTTTGCTGAGACCTTGTTTTGAATCCTTTAGATTTTCTTTAA
TCTTCTTTGAGACCTTTGGCTTCAGGATCAAACCTCCACATTATCATTTTAAATTTCAGG
ATTCAGTTT
TG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2EG15JQ 574 0 0
CATGTCGGTGACCGTGGTGTGCTCGCTAGAGCTTCTGGTGATTACGCTATCGTTATTTCA
CACAACCCTGACAACGACACGACAAGGGTTAAGTTGCCATCTGGATCGAAGAAGATTGTC
CCAAGTGGATGCAGGGCCATGATTGGTCAAGTTGCTGGTGGTGGAAGAACTGAGAAGCCG
ATGCTCAAGGCGGGTAACGCGTACCACAAGTACCGTGTGAAGAGGAACTGCTGGCCTAAG
GTTCGTGGTGTGGCTATGAATCCTGTTGAACATCCTCACGGAGGAGGTAACCATCAACAT
ATCGGTCACGCCAGTACCGTCCGTCGTGATGCACCACCCGGGCAAAAGGTTGGTCTTATT
GCTGCAAGGAGGACTGGTCGTCTCAGAGGTCAAGCTGCTGCTCTTGCCTCCAAGCAAGAA
TAAGGAGGGGAAGCTTCATGATGATGAAACTGTTTACTTTTGTTGGATTTTTGCTGAGAC
CTTGTTTTGAATCCTTTAGATTTTCTTTAATCTTCTTTGAGACCTTTGGCTTCAGGATCA
AACCTCCACATTATCATTTTAAATTTCAGGATTC

QA 1 574 1 574
DS 



CO CL116Contig3 887 4 6 U
GGGAGCAGGTTCCGTCTTCAAGTCCCACACTCACCACCGCAAGGGCCCCGCCAAGTTCAG
GAGCCTCGACTTCGGCGAGAGGAACGGTTACCTCAAGGGTGTCGTCACGGAGATCATCCA
CGATCCAGGACGTGGTGCTCCGTTAGCTCGCGTCGCCTTCCGTCATCCTTTCCGTTACAA
GAAGCAGAAGGAGCTCTTCGTCGCCGCCGAGGGTATGTACACCGGACAGTTTCTCTACTG
CGGTAAGAAGGCCACTCTCGTTGTCGGAAATGTTCTTCCTCTCAGATCTATCCCTGAAGG
AGCTGTTGTCTGCAACGTTGAGCACCATGTCGGTGATCGTGGTGTGCTCGCTAGAGCTTC
TGGGGATTACGCTATCGTGATTTCACACAACCCTGACAACGACACGACCAGGGTTAAGTT
GCCATCTGGATCGAAGAAGATTGTCCCAAGTGGATGCAGGGCTATGATTGGTCAAGTTGC
TGGAGGAGGAAGGACAGAGAAGCCAATGCTCAAGGCGGGTAACGCGTACCACAAGTACCG
TGTGAAGAGAAACTGCTGGCCTAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAACCCTGTTGAGCATCC
TCACGGAGGAGGTAACCATCAGCATATTGGTCACGCCAGTACTGTTCGTCGTGATGCACC
CCCTGGGCAAAAGGTCGGTCTTATTGCTGCAAGGAGAACTGGTCGTCTCAGAGGTCAAGC
TGCTGCTCTTGCCTCCAAGCAAGAATAAGGAGACGAGTCTTGAAGATGATGAATCTATTC
ACTTTTGTTTTTTGGTTTTTGCTGCTGAGACCTTGTTTTGATACTTTAAGATTTGCTATT
ATGTTATCTGCGACCTTTCTAGTAGAATCTATGTTTTTGGAGTTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2H945TF U 1
AF RR2CJ84JQ C 177
AF RR2H945JQ C 277
AF RR2CO10TF U 373
BS 1 516 RR2H945TF
BS 517 517 RR2CO10TF
BS 518 561 RR2H945TF
BS 562 776 RR2CO10TF
BS 777 777 RR2CJ84JQ
BS 778 887 RR2CO10TF

RD RR2H945TF 561 0 0
GGGAGCAGGTTCCGTCTTCAAGTCCCACACTCACCACCGCAAGGGCCCCGCCAAGTTCAG
GAGCCTCGACTTCGGCGAGAGGAACGGTTACCTCAAGGGTGTCGTCACGGAGATCATCCA
CGATCCAGGACGTGGTGCTCCGTTAGCTCGCGTCGCCTTCCGTCATCCTTTCCGTTACAA
GAAGCAGAAGGAGCTCTTCGTCGCCGCCGAGGGTATGTACACCGGACAGTTTCTCTACTG
CGGTAAGAAGGCCACTCTCGTTGTCGGAAATGTTCTTCCTCTCAGATCTATCCCTGAAGG
AGCTGTTGTCTGCAACGTTGAGCACCATGTCGGTGATCGTGGTGTGCTCGCTAGAGCTTC
TGGGGATTACGCTATCGTGATTTCACACAACCCTGACAACGACACGACCAGGGTTAAGTT
GCCATCTGGATCGAAGAAGATTGTCCCAAGTGGATGCAGGGCTATGATTGGTCAAGTTGC
TGGAGGAGGAAGGACAGAGAAGCCAATGCTCAAGGCTGGTAACGCGTACCACAAGTACCG
TGTGAAGAGAAACTGCTGGCC

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2CJ84JQ 709 0 0
ACAAGAAGCAGAAGGAGCTCTTCGTCGCCGCCGAGGGTATGTACACCGGACAGTTTCTCT
ACTGCGGTAAGAAGGCCACTCTCGTTGTCGGAAATGTTCTTCCTCTCAGATCTATCCCTG
AGGGAGCTGTTGTCTGCAACGTCGAGCACCATGTCGGTGATCGTGGTGTGCTCGCTAGAG
CTTCTGGGGATTACGCTATCGTGATTTCACACAACCCTGACAACGACACGACCAGGGTTA
AGTTGCCATCTGGATCGAAGAAGATTGTCCCAAGTGGATGCAGGGCTATGATTGGTCAAG
TTGCTGGAGGTGGAAGGACAGAGAAGCCAATGCTCAAGGCGGGTAACGCGTACCACAAGT
ACCGTGTGAAGAGAAACTGCTGGCCTAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAACCCTGTTGAGC
ATCCTCACGGAGGAGGTAACCATCAGCATATTGGTCACGCCAGTACTGTTCGTCGTGATG
CACCCCCTGGGCAAAAGGTCGGTCTTATTGCTGCAAGGAGAACTGGTCGTCTCAGAGGTC
AAGCTGCTGCTCTTGCCTCCAAGCAAGAATAAGGAGACGAGTCTTGAAGATGATGAATCT
ATTCACTTTTGTTTTTTGGTTTTTGCTGCTGAGACCTTGTTTTGATACTTTAAGATTTGC
TATTATGTTATCTGCGACCTTTCTAGTAGAATCTATGTTTTTGGAGT
CG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2H945JQ 589 0 0
TCCTCTCAGATCTATCCCTGAAGGAGCTGTTGTCTGCAACGTTGAGCACCATGTCGGTGA
TCGTGGTGTGCTCGCTAGAGCTTCTGGGGATTACGCTATCGTGATTTCACACAACCCTGA
CAACGACACGACCAGGGTTAAGTTGCCATCTGGATCGAAGAAGATTGTCCCAAGTGGATG
CAGGGCTATGATTGGTCAAGTTGCTGGAGGAGGAAGGACAGAGAAGCCAATGCTCAAGGC
TGGTAACGCGTACCACAAGTACCGTGTGAAGAGAAACTGCTGGCCTAAGGTTCGTGGTGT
GGCTATGAACCCTGTTGAGCATCCTCACGGAGGAGGTAACCATCAACATATTGGTCACGC
CAGTACTGTTCGTCGTGATGCACCCCCTGGGCAAAAGGTTGGTCTTATTGCTGCAAGGAG
AACTGGACGTCTCAGAGGTCAAGCTGCTGCTCTTGCTTCCAAGCAAGAATAAGGAGACAA
GGATTGAAGATGATGAATCTATTCACTTTTGTTTTTGGGTTTTTGCTG***AGACCTTGT
TTTGATATTTTAAGATTTGCTATAATGTTATTTGCG
GCCATTCTCTATC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2CO10TF 515 0 0
G
ATCGTGATTTCACACAACCCTGACAACGACACGACCAGGGTTAAGTTGCCATCTGGATCG
AAGAAGATTGTCCCAAGTGGATGCAGGGCTATGATTGGTCAAGTTGCTGGAGGTGGAAGG
ACAGAGAAGCCAATGCTCAAGGCGGGTAACGCGTACCACAAGTACCGTGTGAAGAGAAAC
TGCTGGCCTAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAACCCTGTTGAGCATCCTCACGGAGGAGGT
AACCATCAGCATATTGGTCACGCCAGTACTGTTCGTCGTGATGCACCCCCTGGGCAAAAG
GTCGGTCTTATTGCTGCAAGGAGAACTGGTCGTCTCAGAGGTCAAGCTGCTGCTCTTGCC
TCCAAGCAAGAATAAGGAGACGAGTCTTGAAGATGATGAATCTGTTCACTTTTGTTTTTT
GGTTTTTGCTGCTGAGACCTTGTTTTGATACTTTAAGATTTGCTATTATGTTATCTGCGA
CCTTTCTAGTAGAATCTATGTTTTTGGAGTTGAA

QA 2 515 2 515
DS 



AS 2 19

CO CL117Contig1 1152 16 12 U
GGACCCAATCAACAAAGTAGAGAAAAAGAAAGAGAGAGATGGCGAGTGCGAAGATGCCCT
TCTGTCGTTTAGCCTTCTTTTGTCTGTTATTACAGTTATTTTCCATCTTCCATATCGGAA
ATGCGGAACTGGAGATGAATTATTACAGAGAGAGTTGTCCGAGAGCGGAAGAGATAATCA
GGCAACAAGTGGAAACGCTTTACTACAAACACGGCAACACAGCCGTCTCTTGGCTCCGTA
ATCTCTTCCATGACTGCGTCGTCAAGTCGTGTGATGCGTCACTACTACTTGAGACAACAA
GTGGTGTGGAATCTGAGCAAAAGTCGACGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTAAGTACG
TTAAGTTTATCAAAGACGCACTCGAGAAAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATA
TTGTTGCTCTCTCTGCTAGAGATGGTATTGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGA
TCAAGACAGGAAGGAGAGACAGTAGAGGAAGCTACTTGAATGATGTTCAGACTCTAGTTC
CTAACCACAATGACTCTATCTCCTCTGTTCTCTCAAACTTCAACTCCATCGG*TATCGAT
GTTGAAGCCACCGTTGCGCTCTTAGGTGCTCACTCCGTTGGTAGGGTCCATTGCGTTAAT
CTAGTGCACCGGCTATACCCAACGATTGACCCGACTCTCGACCCAAATTACGCCCTTTAC
TTGAAAAAGCGTTGCCCAAGTCCAAACCCGGACCCGAACGCAGTCTTATACTCCCGTAAT
GACCGTGAGACTCCCATGGTTGTGGACAACATGTATTACAAGAACATCATGGCTCATAAA
GGGCTCCTTGTCATTGATGATGAGCTAGCCAGTGACCCGAGGACGGCACCTTTTGTGGCC
AAGATGGCTGCGGACAATGGTTACTTCCATGAGCAATTCTCACGCGGTGTCAGGCTCTTG
TCCGAGACCAACCCTCTTACCGGTGATCAAGGGGAGATAAGGAAGGATTGCCGTTATGTG
AACTCTAATTGATTATAATGCTGTGAAAGATAATAAACATATGTGTATGTATGTATGTAT
G****TGTGTTGAGGTTTGAATTCAATAAGAAATATCAAACTGTTATGGATTGAAATATG
ATTAAGTCGTCT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 55 55 55 55 55 35 55 55 55 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 70 70 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 50 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 
65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 25 25 25 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2AR30TF U 1
AF RR2E720TF U 1
AF RR2CW30TF U 322
AF RR2AW56TFB U 1
AF RR2CT29TF U 1
AF RR2BB49TF U 1
AF RR2FP67TF U 121
AF RR2AR71TF U 147
AF RR2FV53TF U 121
AF RR2AW56JQ C 206
AF RR2BB49JQ C 241
AF RR2E720JQ C 251
AF RR2FP67JQ C 776
AF RR2CJ30JQ C 325
AF RR2AR71JQ C 257
AF RR2FV53JQ C 567
BS 1 258 RR2AR30TF
BS 259 444 RR2AW56TFB
BS 445 445 RR2BB49TF
BS 446 606 RR2AW56TFB
BS 607 817 RR2BB49TF
BS 818 820 RR2FP67TF
BS 821 850 RR2FV53TF
BS 851 851 RR2AR71TF
BS 852 932 RR2FV53TF
BS 933 1128 RR2AW56JQ
BS 1129 1134 RR2BB49JQ
BS 1135 1152 RR2AR71JQ

RD RR2AR30TF 258 0 0
GGACCCAATCAACAAAGTAGAGAAAAAGAAAGAGAGAGATGGCGAGTGCGAAGATGCCCT
TCTGTCGTTTAGCCTTCTTTTGTCTGTTATTACAGTTATTTTCCATCTTCCATATCGGAA
ATGCGGAACTGGAGATGAATTATTACAGAGAGAGTTGTCCGAGAGCGGAAGAGATAATCA
GGCAACAAGTGGAAACGCTTTACTACAAACACGGCAACACAGCCGTCTCTTGGCTCCGTA
ATCTCTTCCATGACTGCG

QA 1 258 1 258
DS 

RD RR2E720TF 265 0 0
GGACCCAATCAACAAAGTAGAGAAAAAGAAAGAGAGAGATGGCGAGTGCGAAGATGCCCT
TCTGTCGTTTAGCCTTCTTTTGTCTGTTATTACAGTTATTTTCCATCTTCCATATCGGAA
ATGCGGAACTGGAGATGAATTATTACAGAGAGAGTTGTCCGAGAGCGGAAGAGATAATCA
GGCAACAAGTGGAAACGCTTTACTACAAACACGGCAACACAGCCGTCTCTTGGCTCCGTA
ATCTCTTCCATGACTGCGTCGTCAA

QA 1 265 1 265
DS 

RD RR2CW30TF 160 0 0
AGTCGACGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTTAGTACGTTAAGTTTATCAAAGACGCAC
TCTAGAAAGAATGTTCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATATTGTTGCTCTCTCTGCTAGAC
ATGGTATTGTCATGTTGCAAGGGCCAAAGATAGATATGAT

QA 1 160 1 160
DS 

RD RR2AW56TFB 606 0 0
GGACCCAATCAACAAAGTAGA*AAAAAGAAAGAGAGAGATGGCGAGTGCGAAGATGCCCT
TCTGTCGTTTAGCCTTCTTTTGTCTGTTATTACAGTTATTTTCCATCTTCCATATCGGAA
ATGCGGAACTGGAGATGAATTATTACAGAGAGAGTTGTCCGAGAGCGGAAGAGATAATCA
GGCAACAAGTGGAAACGCTTTACTACAAACACGGCAACACAGCCGTCTCTTGGCTCCGTA
ATCTCTTCCATGACTGCGTCGTCAAGTCGTGTGATGCGTCACTACTACTTGAGACAACAA
GTGGTGTGGAATCTGAGCAAAAGTCGACGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTAAGTACG
TTAAGTTTATCAAAGACGCACTCGAGAAAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATA
TTGTTGCTCTCTCTGCTAGAGATGTTATTGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGA
TCAAGACAGGAAGGAGAGACAGTAGAGGAAGCTACTTGAATGATGTTCAGACTCTAGTTC
CTAACCACAATGACTCTATCTCCTCTGTTCTCTCAAACTTCAACTCCATCGG*TATCGAT
GTTGAA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2CT29TF 621 0 0
GGACCCAATCAACAAAGTAGAGAAAAAGAAAGAGAGAGATGGCGAGTGCGAAGATGCCCT
TCTGTCGTTTAGCCTTCTTTTGTCTGTTATTACAGTTATTTTCCATCTTCCATATCGGAA
ATGCGGAACTGGAGATGAATTATTACAGAGAGAGTTGTCCGAGAGCGGAAGAGATAATCA
GGCAACAAGTGGAAACGCTTTACTACAAACACGGCAACACAGCCGTCTCTTGGCTCCGTA
ATCTCTTCCATGACTGCGTCGTCAAGTCGTGTGATGCGTCACTACTACTTGAGGCAACAA
GTGGTGTGGAATCTGAGCAAAAGTCGACGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTAAGTACG
TTAAGTTTATCAAAGACGCACTCGAGAAAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATA
TTGTTGCTCTCTCTGCTAGAGATGGTATTGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGA
TCAAGACAGGAAGGAGAGACAGTAGAGGAAGCTACTTGAATGATGTTCAGACTCTAGTTC
CTAACCACAATGACTCTATCTCCTCTGTTCTCTCAAACTTCAACTCCATCGGGTATCGAT
GTTGAAGCCACCGTTGCGCTC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2BB49TF 817 0 0
GGACCCAATCAACAAAGTAGAGAAAAAGAAAGAGAGAGATGGCGAGTGCGAAGATGCCCT
TCTGTCGTTTAGCCTTCTTTTGTCTGTTATTACAGTTATTTTCCATCTTCCATATCGGAA
ATGCGGAACTGGAGATGAATTATTACAGAGAGAGTTGTCCGAGAGCGGAAGAGATAATCA
GGCAACAAGTGGAAACGCTTTACTACAAACACGGCAACACAGCCGTCTCTTGGCTCCGTA
ATCTCTTCCATGACTGCGTCGTCAAGTCATGTGATGCGTCACTACTACTTGAGACAACAA
GTGGTGTGGAATCTGAGCAAAAGTCGACGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTAAGTACG
TTAAGTTTATCAAAGACGCACTCGAGAAAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATA
TTGTTGCTCTCTCTGCTAGAGATGGTATTGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGA
TCAAGACAGGAAGGAGAGACAGTAGAGGAAGCTACTTGAATGATGTCCAGACTCTAGTTC
CTAACCACAATGACTCTATCTCCTCTGTTCTCTCAAACTTCAACTCCATCGG*TATCGAT
GTTGAAGCCACCGTTGCGCTCTTAGGTGCTCACTCCGTTGGTAGGGTCCATTGCGTTAAT
CTAGTGCACCGGCTATACCCAACGATTGACCCGACTCTCGACCCAAATTACGCCCTTTAC
TTGAAAAAGCGTTGCCCAAGTCCAAACCCGGACCCGAACGCAGTCTTATACTCCCGTAAT
GACCGTGAGACTCCCATGGTTGTGGACAACATGTATT

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2FP67TF 700 0 0
GG
GCGGAACTGGAGATGAATTATTACAGAGAGAGTTGTTCGAGAGCGGAAGAGATAATCAGG
CAACAAGTGGAAACGCTTTACTACAAACATGGCAACACAGCCGTCTCTTGGCTCCGTAAT
CTCTTCCATGACTGCGTCGTCAAGTCGTGTGATGCGTCACTACTACTTGAGACAACAAGT
GGTGTGGAATCTGAGCAAAAATCGACGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTAAGTACGTT
AAGTTTATCAAAGACGCACTCGAGAAAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATATT
GTTGCTCTCTCTGCTAGAGATGGTATTGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGATC
AAGACAGGAAGGAGAGACAGTAGAGGAAGCTACTTGAATGATGCTCAGACTCTAGTTCCT
AACCACAATGACTCTATCTCCTCTGTTCTCTCAAACTTCAACTCCATCGG*TATCGATGT
TGAAGCCACCGTTGCGCTCTTAGGTGCTCACTCCGTTGGTAGGGTCCATTGCGTTAATCT
AGTGCACCGGCTATACCCAACGATTGACCCGACTCTCGACCCAA*TTACGCCCTTTACTT
GAAAAAGCGTTGCCCAAGTCCAAACCCGGACCCGAACGCAGTCTTATACTCCCGTAATGA
CCGTGAGACTCCCATGGTTGTGGACAACATGTATTACA

QA 3 700 3 700
DS 

RD RR2AR71TF 735 0 0
G
GAGAGAGTTGTCCGAGAGCGGAAGAGATAATCAGGCAACAAGTGGAAACGCTTTACTACA
AACACGGCAACACAGCCGTCTCTTGGCTCCGTAATCTCTTCCATGACTGCGTCGTCAAGT
CGTGTGATGCGTCACTACTACTTGAGACAACAAGTGGTGTGGAATCTGAGCAAAAGTCGA
CGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTAAGTACGTTAAGTTTATCAAAGACGCACTCGAGA
AAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATATTGTTGCTCTCTCTGCTAGAGATGGTA
TTGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGATCAAGACAGGAAGGAGAGACAGTAGAG
GAAGCTACTTGAATGATGTTCAGACTCTAGTTCCTAACCACAATGACTCTATCTCCTCTG
TTCTCTCAAACTTCAACTCCATCGG*TATCGATGTTGAAGCCACCGTTGCGCTCTTAGGT
GCTCACTCCGTTGGTAGGGTCCATTGCGTTAATCTAGTGCACCGGCTATACCCAACGATT
GACCCGACTCTCGACCCAAATTACGCCCTTTACTTGAAAAAGCGTTGCCCAAGTCCAAAC
CCGGACCCGAACGCAGTCTTATACTCCCGTAATGACCGTGAGACTCCCATGGTTGTGGAC
AACATGTATTACAAGAACATCATGGCTCATAAAGGGCTCCTTGTCATTGATGATGAGCTA
GCCAGTGACCCGAG

QA 2 735 2 735
DS 

RD RR2FV53TF 812 0 0
GG
GCGGAACTGGAGATGAATTATTACAGAGAGAGTTGTCCGAGAGCGGAAGAGATAATCAGG
CAACAAGTGGAAACGCTTTACTACAAACACGGCAACACAGCCGTCTCTTGGCTCCGTAAT
CTCTTCCATGACTGCGTCGTCAAGTCGTGTGATGCGTCACTACTACTTGAGACAACAAGT
GGTGTGGAATCTGAGCAAAAGTCGACGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTAAGTACGTT
AAGTTTATCAAAGACGCACTCGAGAAAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATATT
GTTGCTCTCTCTGCTAGAGATGGTATTGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGATC
AAGACAGGAAGG*GAGACAGTAGAGGAAGCTACTTGAATGATGTTCAGACTCTAGTTCCT
AACCACAATGACTCTATCTCCTCTGTTCTCTCAAACTTCAACTCCATCGG*TATCGATGT
TGAAGCCACCGTTGCGCTCTTAGGTGCTCACTCCGTTGGTAGGGTCCATTGCGTTAATCT
AGTGCACCGGCTATACCCAACGATTGACCCGACTCTCGACCCAAATTACGCCCTTTACTT
GAAAAAGCGTTGCCCAAGTCCAAACCCGGACCCGAACGCAGTCTTATACTCCCGTAATGA
CCGTGAGACTCCCATGGTTGTGGACAACATGTATTACAAGAACATCATGGCTCATAAAGG
GCTCCTTGCCATTGATGATGAGCTAGCCAGTGACCCGAGGACGGCACCTTTTGTGGCCAA
GATGGCTGCGGACAATGGTTACTTCCATGA

QA 3 812 3 812
DS 

RD RR2AW56JQ 923 0 0
CAAACACGGCAACACAGCCGTCTCT*GGCTC*GTAATCTCTTCCATGACTGCGTCGTCAA
GTCGTGTGATGCGTCACTACTACTTGAGACAACAAGTGGTGTGGAATCTGAGCAAAAGTC
GACGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTAAGTACGTTAAGTTTATCAAAGACGCACTCGA
GAAAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATATTGTTGCTCTCTCTGCTAGAGATGT
TATTGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGATCAAGACAGGAAGGAGAGACAGTAG
AGGAAGCTACTTGAATGATGTTCAGACTCTAGTTCCTAACCACAATGACTCTATCTCCTC
TGTTCTCTCAAACTTCAACTCCATCGG*TATCGATGTTGAAGCCACCGTTGCGCTCTTAG
GTGCTCACTCCGTTGGTAGGGTCCATTGCGTTAATCTAGTGCACCGGCTATACCCAACGA
TTGACCCGACTCTCGACCCAAATTACGCCCTTTACTTGAAAAAGCGTTGCCCAAGTCCAA
ACCCGGACCCGAACGCAGTCTTATACTCCCGTAATGACCGTGAGACTCCCATGGTTGTGG
ACAACATGTATTACAAGAACATCATGGCTCATAAAGGGCTCCTTGTCATTGATGATGAGC
TAGCCAGTGACCCGAGGACGGCACCTTTTGTGGCCAAGATGGCTGCGGACAATGGTTACT
TCCATGAGCAATTCTCACGCGGTGTCAGGCTCTTGTCCGAGACCAACCCTCTTACCGGTG
ATCAAGGGGAGATAAGGAAGGATTGCCGTTATGTGAACTCTAATTGATTATAATGCTGTG
AAAGATAATAAACATATGTGTATGTATGTATGTATG****TGTGTTGAGGTTTGAATTCA
ATAAGAAATATCAAACTGTTATG

QA 1 923 1 923
DS 

RD RR2BB49JQ 895 0 0
ATCTCTTCCATGACTGCGTCGTCAAGTCATGTGATGCGTCACTACTACTTGAGACAACAA
GTGGTGTGGAATCTGAGCAAAAGTCGACGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTAAGTACG
TTAAGTTTATCAAAGACGCACTCGAGAAAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATA
TTGTTGCTCTCTCTGCTAGAGATGGTATTGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGA
TCAAGACAGGAAGGAGAGACAGTAGAGGAAGCTACTTGAATGATGTCCAGACTCTAGTTC
CTAACCACAATGACTCTATCTCCTCTGTTCTCTCAAACTTCAACTCCATCGG*TATCGAT
GTTGAAGCCACCGTTGCGCTCTTAGGTGCTCACTCCGTTGGTAGGGTCCATTGCGTTAAT
CTAGTGCACCGGCTATACCCAACGATTGACCCGACTCTCGACCCAAATTACGCCCTTTAC
TTGAAAAAGCGTTGCCCAAGTCCAAACCCGGACCCGAACGCAGTTTTATACTCCCGTAAT
GACCGTGAGACTCCCATGGTTGTGGACAACATGTATTACAAGAACATCATGGCTCACAAA
GGGCTCCTTGTCATCGATGATGAGCTAGCCAGTGACCCGAGGACGGCACCTTTTGTGGCC
AAGATGGCTGCGGACAATGGTTACTTCCATGAGCAATTCTCACGCGGTGTCAGGCTCTTG
TCCGAGACCAACCCTCTTACCGGTGATCAAGGGGAGATAAGGAAGGATTGCCGTTATGTG
AACTCTAATTGATTATAATGCTGTGAAAGATAATAAACATATGTGTATGTATGTATGTAT
GTATGTGTGTTAAGGTTTGAATTCAATAAGAAATATCAAACTGTTATGGATTGA
G

QA 1 894 1 894
DS 

RD RR2E720JQ 879 0 0
TGACTGCGTCGTCAAGTCGTGTGATGCGTCACTACTACTTGAGACAACAAGTGGTGTGGA
*TCTGAGCAAAAGTCGACGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTAAGTACGTTAAGTTTAT
CAAAGACGCACTCGAGAAAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATATTGTTGCTCT
CTCTGCTAGAGATGGTATTGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGATCAAGACAGG
AAGGAGAGACAGTAGAGGAAGCTACTTGAATGATGTTCAGACTCTAGTTCCTAACCACAA
TGACTCTATCTCCTCTGTTCTCTCAAACTTCAACTCCATCGG*TATCGATGTTGAAGCCA
CCGTTGCGCTCTTAGGTGCTCACTCCGTTGGTAGGGTCCATTGCGTTAATCTAGTGCACC
GGCTATACCCAACGATTGACCCGACTCTCGACCCAAATTACGCCCTTTACTTGAAAAAGC
GTTGCCCAAGTCCAAACCCGGACCCGAACGCAGTCTTATACTCCCGTAATGACTGTGAGA
CTCCCATGGTTGTGGACAACATGTATTACAAGAACATCATGGCTCATAAAGGGCTCCTTG
TCATTGATGATGAGCTAGCCAGTGACCCGAGGACGGCACCTTTTGTGGCCAAGATGGCTG
CGGACAATGGTTACTTCCATGAGCAATTCTCACGCGGTGTCAGGCTCTTGTCCGAGACCA
ACCCTCTTACCGGTGATCAAGGGGAGATAAGGAAGGATTGCCGTTATGTGAACTCTAATT
GATTATAATGCTGTGAAAGATAATAAACATATGTGTATGTATGTATGTATG****TGTGT
TGAGGTTTGAATTCAATAAGAAATATCAAACTGTTATGG

QA 1 879 1 879
DS 

RD RR2FP67JQ 357 0 0
GTAATGACCGTGAGACTCCCATGGTTGTGGACAACATGTATTACAAGAACATCATGGCTC
ATAAAGGGCTCCTTGTCATTGATGATGAGCTAGCCAGTGACCCGAGGACGGCACCTTTTG
TGGCCAAGATGGCTGCGGACAATGGTTACTTCCATGAGCAATTCTCACGCGGCGTCAGGC
TCTTGTCCGAGACCAACCCTCTTACCGGTGATCAAGGGGAGATAAGGAAGGATTGCCGTT
ATGTGAACTCTAATTGATTATAATGCTGTGAAAGATAATAAACATATGTGTATGTATGTA
TGTATG****TGTGTTGAGGTTTGAATTCAATAAGAAATATCAAACTGTTATGGATT

QA 1 357 1 357
DS 

RD RR2CJ30JQ 805 0 0
CGACGAGGAGTTT*GGTATGAGAAACTTTAAGTACGTTAAGTTTATCAAAGACGCACTCG
AGAAAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATATTGTTGCTCTCTCTGCTAGAGATG
GTATTGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGATCAAGACAGGAAGGAGAGACAGTA
GAGGAAGCTACTTGAATGATGTTCAGACTCTAGTTCCTAACCACAATGACTCTATCTCCT
CTGTTCTCTCAAACTTCAACTCCATCGG*TATCGATGTTGAAGCCACCGTTGCGCTCTTA
GGTGCTCACTCCGTTGGTAAGGTCCATTGCGTTAATCTAGTGCACCGGCTATACCCAACG
ATTGACCCGACTCTCGACCCAAATTACGCCCTTTACTTGAAAAAGCGTTGCCCAAGTCCA
AACCCGGACCCGAACGCAGTCTTATACTCCCGTAATGACCGTGAGACTCCCATGGTTGTG
GACAACATGTATTACAAGAACATCATGGCTCATAAAGGGCTCCTTGTCATTGATGATGAG
CTAGCCAGTGACCCGAGGACGGCACCTTTTGTGGCCAAGATGGCTGCGGACAATGGTTAC
TTCCATGAGCAATTCTCACGCGGTGTCAGGCTCTTGTCCGAGACCAACCCTCTTACCGGT
GATCAAGGGGAGATAAGGAAGGATTGCCGTTATGTGAACTCTAATTGATTATAATGCTGT
GAAAGATAATAAACATATGTGTATGTATGTATGTATG****TGTGTTGAGGTTTGAATTC
AATAAGAAATATCAAACTGTTATGG

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2AR71JQ 896 0 0
CGTCGTCAAGTCGTGTGATGCGTCACTACTACTTGAGACAACAAGTGGTGTGGAATCTGA
GCAAAAGTCGACGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTAAGTACGTTAAGTTTATCAAAGA
CGCACTCGAGAAAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATATTGTTGCTCTCTCTGC
TAGAGATGGTATTGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGATCAAGACAGGAAGGAG
AGACAGTAGAGGAAGCTACTTGAATGATGTTCAGACTCTAGTTCCTAACCACAATGACTC
TATCTCCTCTGTTCTCTCAAACTTCAACTCCATCGG*TATCGATGTTGAAGCCACCGTTG
CGCTCTTAGGTGCTCACTCCGTTGGTAGGGTCCATTGCGTTAATCTAGTGCACCGGCTAT
ACCCAACGATTGACCCGACTCTCGACCCAAATTACGCCCTTTACTTGAAAAAGCGTTGCC
CAAGTCCAAACCCGGACCCGAACGCAGTCTTATACTCCCGTAATGACCGTGAGACTCCCA
TGGTTGTGGACAACATGTATTACAAGAACATCATGGCTCATAAAGGGCTCCTTGTCATTG
ATGATGAGCTAGCCAGTGACCCGAGGACGGCACCTTTTGTGGCCAAGATGGCTGCGGACA
ATGGTTACTTCCATGAGCAATTCTCACGCGGTGTCAGGCTCTTGTCCGAGACCAACCCTC
TTACCGGTGATCAAGGGGAGATAAGGAAGGATTGCCGTTATGTGAACTCTAATTGATTAT
AATGCTGTGAAAGATAATAAACATATGTGTATGTATGTATGTATG****TGTGTTGAGGT
TTGAATTCAATAAGAAATATCAAACTGTTATGGATTGAAATATGATTAAGTCGTCT

QA 1 896 1 896
DS 

RD RR2FV53JQ 586 0 0
GTTCTCTCAAACTTCAACTCCATCGG*TATCGATGTTGAAGCCACCGTTGCGCTCTTAGG
TGCTCACTCCGTTGGTAGGGTCCATTGCGTTAATCTAGTGCACCGGCTATACCCAACGAT
TGACCCGACTCTCGACCCAAATTACGCCCTTTACTTGAAAAAGCGTTGCCCAAGTCCAAA
CCCGGACCCGAACGCAGTCTTATACTCCCGTAATGACCGTGAGACTCCCATGGTTGTGGA
CAACATGTATTACAAGAACATCATGGCTCATAAAGGGCTCCTTGCCATTGATGATGAGCT
AGCCAGTGACCCGAGGACGGCACCTTTTGTGGCCAAGATGGCTGCGGACAATGGTTACTT
CCATGAGCAATTCTCACGCGGTGTCAGGCTCTTGTCCGAGACCAACCCTCTTACCGGTGA
TCAAGGGGAGATAAGGAAGGATTGCCGTTATGTGAACTCTAATTGATTATAATGCTGTGA
AAGATAATAAACATATGTGTATGTATGTATGTATG****TGTGTTGAGGTTTGAATTCAA
TAAGAAATATCGAACTGTTATGGATTGAAATATGATTAAGTCGTC
C

QA 1 585 1 585
DS 



CO CL117Contig2 1091 3 2 U
GGACCCAATCAACAAAGTAGAGAAAAAGAAAGAGAGAGATGGCGAGTGCGAAGATGCCCT
TCTGTCGTTTAGCCTTCTTTTGTCTGTTATTACAGTTATTTTCCATCTTCCATATCGGAA
ATGCGGAACTGGAGATAAATTATTACAGAGAGAGTTGTCCGAGAGCGGAAGAGATAATCA
GGCAACAAGTGGAAACGCTTTACTACAAACACGGCAACACAGCCGTCTCTTGGCTCCGTA
ATCTCTTCCATGACTGCGTCGTCAAGTCGTGTGATGCGTCACTACTACTTGAGACAACAA
GTGGTGTGGAATCTGAGCAAAAGTCGACGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTAAGTACG
TTAAGTTTATCAAAGACGCACTCGAGAAAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATA
TTGTTGCTCTCTCTGCTAGAGATGGTATCGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGA
TCAAGACAGGAAGGAGAGACAGTAGAGGAAGCTACTTGAATGATGTTCAGACTCTAGTTC
CTAACCACAATGACCCAATCAACTCCATTGCGTTAATCTAGTGCACCGGCTATACCCAAC
GATTGACCCGACTCTCGACCCAAATTACGCCCTTTACTTGAAAAAGCGTTGCCCAAGTCC
AAACCCGGACCCGAACGCAGTCTTATACTCCCGTAATGACCGTGAGACTCCCATGGTTGT
GGACAACATGTATTACAAGAACATCATGGCTCATAAAGGGCTCCTTGTCATTGATGATGA
GCTAGCCAGTGACCCGAGGACGGCACCTTTTGTGGCCAAGATGGCTGCGGACAATGGTTA
CTTCCATGAGCAATTCTCACGCGGTGTCAGGCTCTTGTCCGAGACCAACCCTCTTTCCGG
TGATCAAGGGGAGATAAGGAAGGATTGCCGTTATGTGAACTCTAATTGATTATAATGCTG
TGAAAGATAATAAACATATGTGTATGTATGTATGTATGTGTGTTGAGGTTTGAATTCAAT
AAGAAATATCAAACTGTTATGGATTGAAATATGATTAAGTCGTCTAAAGTTCTAGGAGGT
TATTTATCGTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ30TF U 1
AF RR2B411TF U 1
AF RR2B411JQ C 245
BS 1 807 RR2B411TF
BS 808 1091 RR2B411JQ

RD RR2CJ30TF 296 0 0
GGACCCAATCAACAAAGTAGTGAAAAAGAAAGAGAGAGATGGCGAGTGCGAAGATGCCCT
TCTGTCGTTTAGCCTTCTTTTGTCTGTTATTACAGTTATTTTCCATCTTCCATATCGGAA
ATGCGGAACTGGAGATGAATTATTACAGAGAGAGT*GTCCGAGAGCGGAAGAGATAATCA
GGCAACAAGTGGAAACGCTTTACTACAAACACGGCAACACAGCCGTCTCTTGGCTCCGTA
*TCTCTTCCATGACTGCGTCGTCAAGTCGTGTGATGCGTCACTACTACTTGAGACA

QA 1 296 1 296
DS 

RD RR2B411TF 807 0 0
GGACCCAATCAACAAAGTAGAGAAAAAGAAAGAGAGAGATGGCGAGTGCGAAGATGCCCT
TCTGTCGTTTAGCCTTCTTTTGTCTGTTATTACAGTTATTTTCCATCTTCCATATCGGAA
ATGCGGAACTGGAGATAAATTATTACAGAGAGAGTTGTCCGAGAGCGGAAGAGATAATCA
GGCAACAAGTGGAAACGCTTTACTACAAACACGGCAACACAGCCGTCTCTTGGCTCCGTA
ATCTCTTCCATGACTGCGTCGTCAAGTCGTGTGATGCGTCACTACTACTTGAGACAACAA
GTGGTGTGGAATCTGAGCAAAAGTCGACGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTAAGTACG
TTAAGTTTATCAAAGACGCACTCGAGAAAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATA
TTGTTGCTCTCTCTGCTAGAGATGGTATCGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGA
TCAAGACAGGAAGGAGAGACAGTAGAGGAAGCTACTTGAATGATGTTCAGACTCTAGTTC
CTAACCACAATGACCCAATCAACTCCATTGCGTTAATCTAGTGCACCGGCTATACCCAAC
GATTGACCCGACTCTCGACCCAAATTACGCCCTTTACTTGAAAAAGCGTTGCCCAAGTCC
AAACCCGGACCCGAACGCAGTCTTATACTCCCGTAATGACCGTGAGACTCCCATGGTTGT
GGACAACATGTATTACAAGAACATCATGGCTCATAAAGGGCTCCTTGTCATTGATGATGA
GCTAGCCAGTGACCCGAGGACGGCACC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2B411JQ 847 0 0
CTTCCATGACTGCGTCGTCAAGTCGTGTGATGCGTCACTACTACTTGAGACAACAAGTGG
TGTGGAATCTGAGCAAAAGTCGACGAGGAGTTTTGGTATGAGAAACTTTAAGTACGTTAA
GTTTATCAAAGACGCACTCGAGAAAGAATGTCCTGGCACAGTCTCTTGCGCTGATATTGT
TGCTCTCTCTGCTAGAGATGGTATCGTCATGTTGAAAGGGCCAAAGATAGATATGATCAA
GACAGGAAGGAGAGACAGTAGAGGAAGCTACTTGAATGATGTTCAGACTCTAGTTCCTAA
CCACAATGACCCAATCAACTCCATTGCGTTAATCTAGTGCACCGGCTATACCCAACGATT
GACCCGACTCTCGACCCAAATTACGCCCTTTACTTGAAAAAGCGTTGCCCAAGTCCAAAC
CCGGACCCGAACGCAGTCTTATACTCCCGTAATGACCGTGAGACTCCCATGGTTGTGGAC
AACATGTATTACAAGAACATCATGGCTCATAAAGGGCTCCTTGTCATTGATGATGAGCTA
GCCAGTGACCCGAGGACGGCACCTTTTGTGGCCAAGATGGCTGCGGACAATGGTTACTTC
CATGAGCAATTCTCACGCGGTGTCAGGCTCTTGTCCGAGACCAACCCTCTTTCCGGTGAT
CAAGGGGAGATAAGGAAGGATTGCCGTTATGTGAACTCTAATTGATTATAATGCTGTGAA
AGATAATAAACATATGTGTATGTATGTATGTATGTGTGTTGAGGTTTGAATTCAATAAGA
AATATCAAACTGTTATGGATTGAAATATGATTAAGTCGTCTAAAGTTCTAGGAGGTTATT
TATCGTT

QA 1 847 1 847
DS 



AS 2 19

CO CL118Contig1 661 8 7 U
GGAAAAACAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCAT
CACATGCCTCCTCGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAACAGAGTCGCACATAACGTG
TGGGACAGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATT
GCCGTCAAGCTGCTGTGTGGCAGTCAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGA
TCGCCGACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATAT
CGACCTTGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTT
CAACACCAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTAC
GAACGAATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATT
TCTATTTTATGAAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATAAC
GATAAGGAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATGTACACG
TAAAGTACCATCAGGAATAACACTTTGTCTTTCTCTTACATGTATATGATCAGAGTGCAT
G


BQ
25 30 30 30 30 30 10 10 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 15 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BY78TF U 1
AF RR2CA47JQ C 7
AF RR2AM35TF U 8
AF RR2AU55JQ C 1
AF RR2GM75JQ C 263
AF RR2GM75TF U 2
AF RR2AU55TF U 1
AF RR2CA47TF U 7
BS 1 320 RR2BY78TF
BS 321 321 RR2AM35TF
BS 322 547 RR2BY78TF
BS 548 553 RR2AM35TF
BS 554 610 RR2GM75TF
BS 611 630 RR2AU55TF
BS 631 661 RR2CA47TF

RD RR2BY78TF 547 0 0
GGAAAAACAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCAT
CACATGCCTCCTCGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAACAGAGTCGCACATAACGTG
TGGGACAGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATT
GCCGTCAAGCTGCTGTGTGGCAGTCAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGA
TCGCCGACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATAT
CGACCTTGTGGCCACACTCCTTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTT
CAACACCAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTAC
GAACGAATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATT
TCTATTTTATGAAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATAAC
GATAAGG

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2CA47JQ 588 0 0
GGAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCATCACATG
CCTCCTCGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAACAGAGTCGCACATAACGTGTGGGAC
AGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATTGCCGTC
AAGCTGCTGTGTGGCAGTCAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGATCGCCG
ACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATATCGACCT
TGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTTCAACAC
CAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTACGAACGA
ATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATTTCTATT
TTATGAAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATAACGATAAG
GAGCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATG

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2AM35TF 546 0 0
GG
ATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCATCACATGCCT
CCTCGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAACAGAGTCGCACATAACGTGTGGGACAGT
GTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATTGCCGTCAAG
CTGCTGTGTGGCAGTCAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGATCGCCGACA
AGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATATCGACCTTGT
GGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTTCAACACCAA
TTGTAACATTATTTCGATTCGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTACGAACGAATA
ATCAAATTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATTTCTATTTTA
TGAAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATAGCGATAAGGAG
CTCT

QA 3 546 3 546
DS 

RD RR2AU55JQ 636 0 0
GGAAAAACAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCAT
CACATGCCTCCTCGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAACAGAGTCGCACATAACGTG
TGGGACAGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATT
GCCGTCAAGCTGCTGTGTGGCAGTCAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGA
TCGCCGACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATAT
CGACCTTGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTT
CAACACCAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTAC
GAACGAATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATT
TCTATTTTATGAAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATAAC
GATAAGGAGCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATGTACACG
TAAAGTACCATCAGGAATAACACTTTGTCTTTCTCT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2GM75JQ 374 0 0
CTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGCCCTCAATATCGACCTTGTGGCCACACTCCCT
ACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTTCAACACCAATTGTGACAGTATT
TCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTACGAACGAATAATCAAAGTTGGCC
AGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATTTCTATTTTATGAAGTTTCTTAT
TATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATAACGATAAGGAGCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATGTACACGTAAAGTACCATCAGGAATAACA
CTTTGTCTTTCTCT

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR2GM75TF 609 0 0
GAAAAACAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCATC
ACATGCCTCCTCGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAACAGAGTCGCACATAACGTGT
GGGACAGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATTG
CCGTCAAGCTGCTGTGTGGCAGTCAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGAT
CGCCGACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATATC
GACCTTGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTTC
AACACCAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTACG
AACGAATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATTT
CTATTTTATGAAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATAACG
ATAAGGAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATGTACACGT
AAAGTACCA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2AU55TF 630 0 0
GGAAAAACAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCAT
CACATGCCTCCTCGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAACAGAGTCGCACATAACGTG
TGGGACAGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATT
GCCGTCAAGCTGCTGTGTGGCAGTCAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGA
TCGCCGACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATAT
CGACCTTGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTT
CAACACCAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTAC
GAACGAATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATT
TCTATTTTATGAAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATAAC
GATAAGGAGCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATGTACACG
TAAAGTACCATCAGGAATAACACTTTGTCT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2CA47TF 655 0 0
GGAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCATCACATG
CCTCCTCGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAACAGAGTCGCACATAACGTGTGGGAC
AGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATTGCCGTC
AAGCTGCTGTGTGGCAGTCAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGATCGCCG
ACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATATCGACCT
TGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTTCAACAC
CAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTACGAACGA
ATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATTTCTATT
TTATGAAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATAACGATAAG
GAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCAGCGCTTTGATGTATGTATGTACACGTAAAGT
ACCATCAG*AATAACACTTTGTCTTTCTCTTACATGTATATGATCAGAGTGCATG

QA 1 655 1 655
DS 



CO CL118Contig2 746 11 7 U
GGAAAAACAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCAT
CACATGCCTCCTCGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAGCAGAGTCGCACATAACGTG
TGGGACAGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATT
GCCGTCAAGCTGCTGTGTGGCAGTTAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGA
TCGCCGACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATAT
CGACCTTGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTT
CAACACCAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTAC
GAACGAATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATT
TCTATTTTATGACTTGAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAA
TAACGATAAGGAGCTCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATGTACACGTA
AAGTACCATCAGGAATAACACTTTGTCTTTCTCTTACATGTAATATGATCAAGAGGTTGC
ATGAGAAAATGAGCTTTTACTAAACCGCATATGTATATATATATATATGTAAAGTTATAG
CATCCAAGAAAAAAGGTTTGTCATAT


BQ
25 25 25 25 25 30 15 15 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 55 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV25JQ C 1
AF RR2GX23TF U 1
AF RR2DH03TF U 461
AF RR2EI42TF U 75
AF RR2BG53TF U 1
AF RR2A218TF U 7
AF RR2B039TF U 7
AF RR2GA51JQ C 11
AF RR2GA51TF U 11
AF RR2GX23JQ C 6
AF RR2DH92TF U 123
BS 1 374 RR2BG53TF
BS 375 375 RR2GX23TF
BS 376 470 RR2BG53TF
BS 471 471 RR2GX23TF
BS 472 668 RR2BG53TF
BS 669 734 RR2DH92TF
BS 735 746 RR2GX23JQ

RD RR2BV25JQ 454 0 0
GGAAAAACAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCAT
CACATGCCTCCTCGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAGCAGAGTCGCACATAACGTG
TGGGACAGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATT
GCCGTCAAGCTGCCGTGTGGCAGTTAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGA
TCGCCGACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATAT
CGACCTTGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTT
CAACACCAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGCAC
GAACGAATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCT

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR2GX23TF 636 0 0
GGAAAAACAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCAT
CACATGCCTCCTCGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAGCAGAGTCGCACATAACGTG
TGGGACAGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTG*TCCATT
GCCGTCAAGCTGCTGTGTGGCAGTTAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGA
TCGCCGACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATAT
CGACCTTGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTT
CAACACCAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTAC
GAACGAATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATT
TCTATTTTATGACTTGAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTGATAAGTAA
TAACGATAAGGAGCTCTCTCTCTCT**TTTTCG*CGCTTTGATGTATGTATGTACACGTA
AAGTACCATCAGGAATAACACTTTGTCTTTCTCTTA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2DH03TF 175 0 0
G
AATTATTCTGCTGCTAATTTCTATTTTATGACTTGAGTTTCTTATTATGTAATCATCCAT
TTCATATGGTAATAAGTAATAACGATAAGGAGCTCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTG
ATGTATGTATGTACACGTAAAGTACCATCAGGAATAACACTTTGTCTTTCTCTT

QA 2 175 2 175
DS 

RD RR2EI42TF 560 0 0
G
CCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAGCAGAGTCGCACATAACGTGTGGGACAGTGTCAAG
CACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATTGCCGTCAAGCTGCTG
TGTGGCAGTTAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGATCGCCGACAAGTATG
TGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATATCGACCTTGTGGCCAC
ACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTTCAACACCAATTGTGA
CAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTACGAACGAATAATCAAA
GTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATTTCTATTTTATGACTT
GAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATAACGATAAGGAGCT
CTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATGTACACGTAAAGTACCATCAGGAA
TAACACTTTGTCTTTCTCT

QA 2 560 2 560
DS 

RD RR2BG53TF 673 0 0
GGAAAAACAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCAT
CACATGCCTCCTCGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAGCAGAGTCGCACATAACGTG
TGGGACAGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATT
GCCGTCAAGCTGCTGTGTGGCAGTTAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGA
TCGCCGACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATAT
CGACCTTGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTT
CAACACCAATTGTGGCAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTAC
GAACGAATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTTCTGCTAATT
TCTATTTTATGACTTGAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAA
TAACGATAAGGAGCTCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATGTACACGTA
AAGTACCATCAGGAATAACACTTTGTCTTTCTCTTACATGTAATATGATCAAGAGGTTGC
ATGAGAAA
TGAGC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2A218TF 659 0 0
GGAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCATCACATG
CCTCCTCGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAGCAGAGTCGCACATAACGTGTGGGAC
AGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATTGCCGTC
AAGCTGCTGTGTGGCAGTTAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGATCGCCG
ACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATATCGACCT
TGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTTCAACAC
CAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTACGAACGA
ATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATTTCTATT
TTATGACTTGAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATAACGA
TAAGGAGCTCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATGTACACGTAAAGTAC
CATCAGGAATAACACTTTGTCTTTCTCTTACATGTAATATGATCAAGAGGTTGCATGAG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2B039TF 659 0 0
GGAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCATCACATG
CCTCCTCGTCCTTGCGATATACATTGTCGCTCCAGCAGAGTCGCACATAACGTGTGGGAC
AGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATTGCCGTC
AAGCTGCTGTGTGGCAGTTAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGATCGCCG
ACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATATCGACCT
TGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTTCAACAC
CAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAGGGAGGCTAGAGATGTACGAACGA
ATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATTTCTATT
TTATGACTTGAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATAACGA
TAAGGAGCTCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATGTACACGTAAAGTAC
CATCAGGAATAACACTTTGTCTTTCTCTTACATGTAATATGATCAAGAGGTTGCATGAG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2GA51JQ 671 0 0
GG
AAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCATCACATGCCTCCT
CGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAGCAGAGTCGCACATAACGTGTGGGACAGTGTC
AAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATTGCCGTCAAGCTG
CTGTGTGGCAGTTAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGATCGCCGACAAGT
ATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATATCGACCTTGTGGC
CACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTTCAACACCAATTG
TGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTACGAACGAATAATC
AAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATTTCTATTTTATGA
CTTGAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATAACGATAAGGA
GCTCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATGTACACGTAAAGTACCATCAG
GAATAACACTTTGTCTTTCTCTTACATGTAATATGATCAAGAGGTTGCATGAGAAAATGA
GCTTTTACT

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR2GA51TF 671 0 0
GG
AAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCATCACATGCCTCCT
CGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAGCAGAGTCGCACATAACGTGTGGGACAGTGTC
AAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATTGCCGTCAAGCTG
CTGTGTGGCAGTTAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGATCGCCGACAAGT
ATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATATCGACCTTGTGGC
CACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTTCAACACCAATTG
TGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTACGAACGAATAATC
AAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATTTCTATTTTATGA
CTTGAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATAACGATAAGGA
GCTCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATGTACACGTAAAGTACCATCAG
*AATAACACTTTGTCTTTCTCTTACATGTAATATGATCAAGAG*TTGCATGAGAAAATGA
GCTTTTACT

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR2GX23JQ 741 0 0
AACAATCAAATTCAAAAACAATTAAAACAAAAATGGCGTTTGCTTCAAAGATCATCACAT
GCCTCCTCGTCCTTGCGATATACATTGCCGCTCCAGCAGAGTCGCACATAACGTGTGGGA
CAGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTG*TCCATTGCCGT
CAAGCTGCTGTGTGGCAGTTAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGATCGCC
GACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATATCGACC
TTGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTTCAACA
CCAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTACGAACG
AATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATTTCTAT
TTTATGACTTGAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTGATAAGTAATAACG
ATAAGGAGCTCTCTCTCTCT**TTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATGTACACGTAAAGTA
CCATCAGGAATAACACTTTGTCTTTTTCTTACATGTAATATGATCAAGAGGTTGCATGAG
AAAATGAGCTTTTACTAAACCGCATATGTATATATATATATATGTAAAGTTATAGCATCC
AAGAAAAAAGGTTTGTCATAT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2DH92TF 612 0 0
GGACAGTGTCAAGCACAATGGCACAGTGCATCAGCTACTTGACCAACGGTGGTCCATTGC
CGTCAAGCTGCTGTGTGGCAGTTAAATCATTGAACCAAATGGCTCAGACCACACCGGATC
GCCGACAAGTATGTGAGTGCCTTAAATCAGCCGGTAAGGAAATTAAAGGCCTCAATATCG
ACCTTGTGGCCACACTCCCTACCACTTGTGGTGTTTCACTTTCATACCCCATTGGTTTCA
ACACCAATTGTGACAGTATTTCGATTTGATTGCCGTGTGAAGGAGGCTAGAGATGTACGA
ACGAATAATCAAAGTTGGCCAGCCTTTAACCTAAATAATAATTATTCTGCTGCTAATTTC
TATTTTATGACTTGAGTTTCTTATTATGTAATCATCCATTTCATATGGTAATAAGTAATA
ACGATAAGGAGCTCTCTCTCTCTCTTTTTCGGCGCTTTGATGTATGTATGTACACGTAAA
GTACCATCAGGAATAACACTTTGTCTTTCTCTTACATGTAATATGATCAAGAGGTTGCAT
GAGAAAATGAGCTTTTACTAAACCGCATATGTATATATATATATATGTAAAGTTATAGCA
TCCAAGAAAAAA

QA 1 612 1 612
DS 



AS 3 16

CO CL119Contig1 1346 4 5 U
GGTATCCAAAACATCTTCCTCCTCCAGTCTTGAGCAAAATTCCGGTCCAAGTTCAGTAGT
ATCAATGGCGCTACACGAAGTTCACTCAGCAAATATTATTTCCTACAAAGCTGCTTGTGA
ACAACACCCAGAGCTCAAATCCTTTGATGCTTCGCTTCAAGAGAGGGCCAACAAAGTGTT
GAATCGGTCAACGCTCAAGCCGAGACTGATTCTTATTCCGTACACACATCATACGCGGAG
CTCTACAAGTATCTGCTTGATGCATGCCAAGCTGTGGCAAATTTCATTACTTCTATTGAA
GGCGACGTGTGGGACAACGAAGATCTAAAGAAGATAGTGGAGGCCTATTTTGAGGATACC
ATCAAGACTTTACAGTTTTTCAACAGTGTTGATAAACTGGCCGACAAAGCATCAATTGGC
GACCTTTACCTTCAACGCGCGGTGGATCTCTTTGACAAAGAGTCGGCGGAAAATGGTGGG
AATACTATGAACAAGTATGAGAAAGCATTGGAGGACCTGAAGAAGTTTGAAAACATGAAA
CACGATTTTGATGGCGACAAGTTAATAGCTCAGTTCGACTTGGTCAAAAAGGAGCAGGAA
AACCTTCTGGAGCAAGTGAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGAGGCATATGAGGCGTCA
CAAGCACATAGCAAACTTGTGAATATGATTTTCGGCGGGTTGTTTGGTTTTGTTGCTCTC
GTAGGGGTGGCTCTATTTGCATTCGGGGGCGAATTTCTGGTGGGAGGTGCAATAGCTGCG
GGTTTTGCGTTACCAGTCCTTGCCGTGGGATGGGCAGGGACCAAGATTGCAATGCAGAAA
CTGGAGGACACTGTGAAGAAACAGAAAGATATAGCAGAACAGGTTGGGAAAGGTTTGGAA
GTCAACAAAGATGCGATGGCGACCATAATGAGCTTAGTCAAGAAACTTTTAAATAAGATA
AAGTTTATGTTGGAGATCGCGGATACTCCTGACGAGGCTAGCGAGAGGGACACGAAAAAT
GAACTGAAACTAATCAAGAAGAAATTGGGAGGTTTTACTGACTCAATCAACGAGGTTGAC
GAAACCGTGGCTAAACTTAGCAAATTGGTCGTTGAGTCGAGAATTAAGGTTATGGAAAAG
ATCCAAGATTAGTGGTAAACTATCAATATGCTTTATTGATGTTTACTGTTCAAGAATCAA
GACACCCTCGCTATGTTATATGTTTTAATCTTTGGTTTTCAATAATTTGGGTTTATAGCC
CATTGTACTTTTTATTTTATTTTGTAATGTTAACCATCCGAAAAGATTGGTTGATGTACC
TCTATCCCTTATTCGTGAAATAAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2A409TF U 1
AF RR2CC56TF U 590
AF RR2A409JQ C 544
AF RR2CC56JQ C 613
BS 1 766 RR2A409TF
BS 767 767 RR2CC56TF
BS 768 791 RR2A409TF
BS 792 1311 RR2CC56TF
BS 1312 1346 RR2A409JQ

RD RR2A409TF 791 0 0
GGTATCCAAAACATCTTCCTCCTCCAGTCTTGAGCAAAATTCCGGTCCAAGTTCAGTAGT
ATCAATGGCGCTACACGAAGTTCACTCAGCAAATATTATTTCCTACAAAGCTGCTTGTGA
ACAACACCCAGAGCTCAAATCCTTTGATGCTTCGCTTCAAGAGAGGGCCAACAAAGTGTT
GAATCGGTCAACGCTCAAGCCGAGACTGATTCTTATTCCGTACACACATCATACGCGGAG
CTCTACAAGTATCTGCTTGATGCATGCCAAGCTGTGGCAAATTTCATTACTTCTATTGAA
GGCGACGTGTGGGACAACGAAGATCTAAAGAAGATAGTGGAGGCCTATTTTGAGGATACC
ATCAAGACTTTACAGTTTTTCAACAGTGTTGATAAACTGGCCGACAAAGCATCAATTGGC
GACCTTTACCTTCAACGCGCGGTGGATCTCTTTGACAAAGAGTCGGCGGAAAATGGTGGG
AATACTATGAACAAGTATGAGAAAGCATTGGAGGACCTGAAGAAGTTTGAAAACATGAAA
CACGATTTTGATGGCGACAAGTTAATAGCTCAGTTCGACTTGGTCAAAAAGGAGCAGGAA
AACCTTCTGGAGCAAGTGAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGAGGCATATGAGGCGTCA
CAAGCACATAGCAAACTTGTGAATATGATTTTCGGCGGGTTGTTTGGTTTTGTTGCTCTC
GTAGGGGTGGCTCTATTTGCATTCGGGGGCGAATTTCTGGTGGGAG*TGCAATAGCTGCG
GGTTTTGCGTT

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2CC56TF 722 0 0
G
GGAGCAGGAAAACCTTCTGGAGCAAGTGAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGAGGCATA
TGAGGCGTCACAAGCACATAGCAAACTTGTGAATATGATTTTCGGCGGGTTGTTTGGTTT
TGTTGCTCTCGTAGGGGTGGCTCTATTTGCATTCGGGGGCGAATTTCTGGTGGGAGGTGC
AATAGCTGCGGGTTTTGCGTTACCAGTCCTTGCCGTGGGATGGGCAGGGACCAAGATTGC
AATGCAGAAACTGGAGGACACTGTGAAGAAACAGAAAGATATAGCAGAACAGGTTGGGAA
AGGTTTGGAAGTCAACAAAGATGCGATGGCGACCATAATGAGCTTAGTCAAGAAACTTTT
AAATAAGATAAAGTTTATGTTGGAGATCGCGGATACTCCTGACGAGGCTAGCGAGAGGGA
CACGAAAAATGAACTGAAACTAATCAAGAAGAAATTGGGAGGTTTTACTGACTCAATCAA
CGAGGTTGACGAAACCGTGGCTAAACTTAGCAAATTGGTCGTTGAGTCGAGAATTAAGGT
TATGGAAAAGATCCAAGATTAGTGGTAAACTATCAATATGCTTTATTGATGTTTACTGTT
CAAGAATCAAGACACCCTCGCTATGTTATATGTTTTAATCTTTGGTTTTCAATAATTTGG
GTTTATAGCCCATTGTACTTTTTATTTTATTTTGTAATGTTAACCATCCGAAAAGATTGG
T

QA 2 722 2 722
DS 

RD RR2A409JQ 803 0 0
GATTTTGATGGCGACAAGTTAATAGCTCAGTTCGACTTGGTCAAAAAGGAGCAGGAAAAC
CTTCTGGAGCAAGTGAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGAGGCATATGAGGCGTCACAA
GCACATAGCAAACTTGTGAATATGATTTTCGGCGGGTTGTTTGGTTTTGTTGCTCTCGTA
GGGGTGGCTCTATTTGCATTCGGGGGCGAATTTCTGGTGGGAGGTGCAATAGCTGCGGGT
TTTGCGTTACCAGTCCTTGCCGTGGGATGGGCAGGGACCAAGATTGCAATGCAGAAACTG
GAGGACACTGTGAAGAAACAGAAAGATATAGCAGAACAGGTTGGGAAAGGTTTGGAAGTC
AACAAAGATGCGATGGCGACCATAATGAGCTTAGTCGAGAAACTTTTAAATAAGATAAAG
TTTATGTTGGAGATCGCGGATACTCCTGACGAGGCTAGCGAGAGGGACACGAAAAATGAA
CTGAAGCTAATCAAGAAGAAATTGGGAGGTTTTACTGACTCAATCAACGAGGTTGACGAA
ACCGTGGCTAAACTTAGCAAATTGGTCGTTGAGTCGAGAATTAAGGTTATGGAAAAGATC
CAAGATTAGTGGTAAACTATCAATATGCTTTATTGATGTTTACTGTTCAAGAATCAAGAC
ACCCTCGCTATGTTATATGTTTTAATCTTTGGTTTTCAATAATTTGGGTTTATAGCCCAT
TGTACTTTTTATTTTATTTTGTAATGTTAACCATCCGAAAAGATTGGTTGATGTACCTCT
ATCCCTTATTCGTGAAATAAAGT

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2CC56JQ 734 0 0
CAAGTGAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGAGGCATATGAGGCGTCACAAGCACATAGC
AAACTTGTGAATATGATTTTCGGCGGGTTGTTTGGTTTTGTTGCTCTCGTAGGGGTGGCT
CTATTTGCATTCGGGGGCGAATTTCTGGTGGGAGGTGCAATAGCTGCGGGTTTTGCGTTA
CCAGTCCTTGCCGTGGGATGGGCAGGGACCAAGATTGCAATGCAGAAACTGGAGGACACT
GTGAAGAAACAGAAAGATATAGCAGAACAGGTTGGGAAAGGTTTGGAAGTCAACAAAGAT
GCGATGGCGACCATAATGAGCTTAGTCAAGAAACTTTTAAATAAGATAAAGTTTATGTTG
GAGATCGCGGATACTCCTGACGAGGCTAGCGAGAGGGACACGAAAAATGAACTGAAACTA
ATCAAGAAGAAATTGGGAGGTTTTACTGACTCAATCAACGAGGTTGACGAAACCGTGGCT
AAACTTAGCAAATTGGTCGTTGAGTCGAGAATTAAGGTTATGGAAAAGATCCAAGATTAG
TGGTAAACTATCAATATGCTTTATTGATGTTTACTGTTCAAGAATCAAGACACCCTCGCT
ATGTTATATGTTTTAATCTTTGGTTTTCAATAATTTGGGTTTATAGCCCATTGTACTTTT
TATTTTATTTTGTAATGTTAACCATCCGAAAAGATTGGTTGATGTACCTCTATCCCTTAT
TCGTGAAATAAAGT

QA 1 734 1 734
DS 



CO CL119Contig2 956 6 27 U
ACTTTATTTCACGAATAGGGGATAGAGGTACATCAACCAATCTTTTCGGATGGTTAACGT
TACAAAATAAAATAAAAAGTACAATGGGCTATAAACCCAAATTATTGAAAACCAAAGATT
AAAACATATAACATAGCGTGGGTGTCTTGATTCTTGAACAATAAACATCAATAAAGCATA
TTGATAGTTTACCACTAATCTTGGATCTTTTCCATAACCTTAATTCTCGACTCAACGACC
AATTTGCTAAGCTTAGCCACAGTTTCGTCAACCGCGTTGATTGAGTCAGTAAAACCTCCC
AATTTCTTCTTGATTAGTTTCAGTTCATTTTTCGTGTCTCTCTCGCTAGCCTCGTCAGGA
GTATCCGCGATCTCCAACATCGACTCTATCTTATCTAAAAGTTTCTTGACTAAGATCATT
ATGGTCGCCATCGCATCTTTGTTGACTTCCAAACCTTTCCCAATCTGTTCTGCTATATCT
TTCTGTTTCTTCACAGTGTCCTCCAGTATCTGCATTGCAACCTCGGTCCCTGCCCATCCC
ACAGCAACTACTGGTAACGCTAAACCCGCAGCTACTGCACCTGCCACCAGAACTTCGCCC
CCGAATGCAAATGTAGCCACCCCTATGAGAGCAACAACACCAAACAACACGCCGAAAAGT
ATATTCGTAAGTTTGCTATGTGCTTGTGCCGCCGCATATGCCGCATCAATCTTCTTTTTC
AGATCACTCACTTGCTCCAGAAGGTTTTCCTGCTCCTTTTTGACCGACGCAAACTTAGCT
ATTAACTTGTCGCCATCAAAATCGTGTTTCATGTTTTCAAACTTCTTCAGGTCCTCCAAT
GCTTTTTCATATTTGTTCTTAGTATTCCCACCATTTTCCGCCGACTCTTTGTCAAAGAGA
TCCACCGCGCGTTGAAGGTAAAGGTCGCCAATTGATGCGTTGTCGGCCAGTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 10 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 0 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E675JQ U 1
AF RR2DK41JQ U 17
AF RR2EF38JQ U 87
AF RR2EF38TF C 87
AF RR2BC19JQ U 10
AF RR2DK41TF C 277
BS 1 148 RR2E675JQ
BS 149 149 RR2BC19JQ
BS 150 414 RR2E675JQ
BS 415 415 RR2BC19JQ
BS 416 441 RR2E675JQ
BS 442 442 RR2BC19JQ
BS 443 507 RR2E675JQ
BS 508 508 RR2BC19JQ
BS 509 542 RR2E675JQ
BS 543 543 RR2BC19JQ
BS 544 548 RR2E675JQ
BS 549 549 RR2BC19JQ
BS 550 574 RR2E675JQ
BS 575 575 RR2BC19JQ
BS 576 591 RR2E675JQ
BS 592 592 RR2BC19JQ
BS 593 650 RR2E675JQ
BS 651 651 RR2BC19JQ
BS 652 663 RR2E675JQ
BS 664 741 RR2BC19JQ
BS 742 742 RR2EF38JQ
BS 743 810 RR2BC19JQ
BS 811 811 RR2DK41TF
BS 812 830 RR2BC19JQ
BS 831 831 RR2DK41TF
BS 832 913 RR2BC19JQ
BS 914 956 RR2DK41TF

RD RR2E675JQ 663 0 0
ACTTTATTTCACGAATAGGGGATAGAGGTACATCAACCAATCTTTTCGGATGGTTAACGT
TACAAAATAAAATAAAAAGTACAATGGGCTATAAACCCAAATTATTGAAAACCAAAGATT
AAAACATATAACATAGCGTGGGTGTCTTAATTCTTGAACAATAAACATCAATAAAGCATA
TTGATAGTTTACCACTAATCTTGGATCTTTTCCATAACCTTAATTCTCGACTCAACGACC
AATTTGCTAAGCTTAGCCACAGTTTCGTCAACCGCGTTGATTGAGTCAGTAAAACCTCCC
AATTTCTTCTTGATTAGTTTCAGTTCATTTTTCGTGTCTCTCTCGCTAGCCTCGTCAGGA
GTATCCGCGATCTCCAACATCGACTCTATCTTATCTAAAAGTTTCTTGACTAAGCTCATT
ATGGTCGCCATCGCATCTTTGCTGACTTCCAAACCTTTCCCAATCTGTTCTGCTATATCT
TTCTGTTTCTTCACAGTGTCCTCCAGTTTCTGCATTGCAACCTCGGTCCCTGCCCATCCC
ACGGCAACCACTGGTAACGCTAAACCCGCAGCTATTGCACCTGCCACCAGAGCTTCGCCC
CCGAATGCAAATGTAGCCACCCCTATGAGAGCAACAACACCAAACAACACACCGAAAAGT
ATA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2DK41JQ 722 0 0
G
GGGGATAGAGGTACATCAACCAATCTTTTCGGATGGTTAACGTTACAAAATAAAATAAAA
AGTACAATGGACTATAAACCCAAATTATTGAAAACCAAAGATTAAAACATATAACATAGC
GTGGGTGTCTTGATTCTTGAACAATAAACATCAATAAAGCATATTGATAGTTTACCACTA
ATCTTGGATCTTTTCCATAACCTTAATTCTCGACTCAACGACCAATTTGCTAAGCTTAGC
CACATTTTCGTCAACCGCGTTGATTGAGTCAGTAAAAGCTCCCAATTTCTTCTTGATTAG
TTTCAGTTCATTTTTCGTGTCTCTCTCGCTAGCCTCGTCAGGAGTATCCGCGATCTCCAA
CATCGACTCTATCTTATCTAAAAGTTTCTTGACTAAGATCATTATGGTCGCCATCGCATC
TTTGTTGACTTCCGAACCTTTCCCAATCTGTTCTGCTATATCTTTCTGTTTTTTCACAGT
GTCTTCCCGTATCTGCATTGCAACCTCGGTCCCTGCCCATCCCACAGCAACTACTGGTAA
CGCTAAACCCGCAGCTACTGCACCTGTCACCAGAACTTCGCCCCCGAATGCAAATGTAGC
CACCCCTATGAGAGCAACAACACCAAACAACACGCCGAAAAGTATATTCGTAAGTTTGCT
ATGTGCTTGTGCCGCCGCATATGCCGCATCAATCTTCTTTTTCAGATCACTCACTTGCTC
C

QA 2 722 2 722
DS 

RD RR2EF38JQ 703 0 0
GGCTATAAACCCAAATTATTGAAAACCAAAGATTAAAACATATAACATAGCGTGGGTGTC
TTGATTCTTGAACAATAAACATCAATAAAGCATATTGATAGTTTACCACTAATCTTGGAT
CTTTTCCATAACCTTAATTCTCGACTCAACGACCAATTTGCTAAGCTTAGCCACAGTTTC
GTCAACCGCGTTGATTGAGTCAGTAAAACCTCCCAATTTCTTCTTGATTAGTTTCAGTTC
ATTTTTCGTGTCTCTCTCGCTAGCCTCGTCAGGAGTATCCGCGATCTCCAACATCGACTC
TATCTTATCTAAAAGTTTCTTGACTAAGCTCATTATGGTTGCCATCGCATCTTTGTTGAC
TTCCAAACCTTTCCCAATCTGTTCTGCTATATCTTTCTGTTTCTTCACAGTGTCCTCCAG
TTTCTGCATTGCAACCTCGGTCCCTGCCCATCCCACGGCAACGACTGGTAACGCTAAACC
CGCAGCTACTGCACCTGCCACCAGAGCTTCGCCCCCGAATGCAAATGTAGCCACCCCTAT
GAGAGCAACAACACCAAACAACACGCCGAAAAGTATATTCGTAAGTTTGCTATGTGCTTG
TGCCGCCTCATATGCCTCATCAATCTTCTTTTTCAGATCACTCACTTGCTCCAGAAGGTT
TTCCTGCTCCTTTTTGACCGAGTCAAACTTAGCTATTAACTTG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2EF38TF 720 0 0
GGCTATAAACCCAAATTATTGAAAACCAAAGATTAAAACATATAACATAGCGTGGGTGTC
TTGATTCTTGAACAATAAACATCAATAAAGCATATTGATAGTTTACCACTAATCTTGGAT
CTTTTCCATAACCTTAATTCTCGACTCAACGACCAATTTGCTAAGCTTAGCCACAGTTTC
GTCAACCGCGTTGATTGAGTCAGTAAAACCTCCCAATTTCTTCTTGATTAGTTTCAGTTC
ATTTTTCGTGTCTCTCTCGCTAGCCTCGTCAGGAGTATCCGCGATCTCCAACATCGACTC
TATCTTATCTAAAAGTTTCTTGACTAAGCTCATTATGGTTGCCATCGCATCTTTGTTGAC
TTCCAAACCTTTCCCAATCTGTTCTGCTATATCTTTCTGTTTCTTCACAGTGTCCTCCAG
TTTCTGCATTGCAACCTCGGTCCCTGCCCATCCCACGGCAACGACTGGTAACGCTAAACC
CGCAGCTACTGCACCTGCCACCAGAGCTTCGCCCCCGAATGCAAATGTAGCCACCCCTAT
GAGAGCAACAACACCAAACAACACGCCGAAAAGTATATTCGTAAGTTTGCTATGTGCTTG
TGCCGCCTCATATGCCTCATCAATCTTCTTTTTCAGATCACTCACTTGCTCCAGAAGGTT
TTCCTGCTCCTTTTTGACCGAGTCAAACTTAGCTATTAACTTGTCGCCATCAAAATCGT
C

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2BC19JQ 904 0 0
CG
CGAATAGGGGATAGAGGTACATCAACCAATCTTTTCGGATGGTTAACGTTACAAAATAAA
ATAAAAAGTACAATGGACTATAAACCCAAATTATTGAAAACCAAAGATTAAAACATATAA
CATAGCGTGGGTGTCTTGATTCTTGAACAATAAACATCAATAAAGCATATTGATAGTTTA
CCACTAATCTTGGATCTTTTCCATAACCTTAATTCTCGACTCAACGACCAATTTGCTAAG
CTTAGCCACATTTTCGTCAACCGCGTTGATTGAGTCAGTAAAAGCTCCCAATTTCTTCTT
GATTAGTTTCAGTTCATTTTTCGTGTCTCTCTCGCTAGCCTTGTCAGGAGTATCCGCGAT
CTCCAACATCGACTCTATCTTATCTAAAAGTTTCTTGACTAAGATCATTATGGTCGCCAT
CGCATCTTTGTTGACTTCCAAACCTTTCCCAATCTGTTCTGCTATATCTTTCTGTTTTTT
CACAGTGTCTTCCAGTATCTGCATTGCAACCTCGGTCCCTGCCCATCCCACAGCAACTAC
TGGTAACGCTAAACCCGCAGCTACTGCACCTGTCACCAGAACTTCGCCCCCGAATGCAAA
TGTAGCCACCCCTATGAGAGCAACAACACCAAACAACACGCCGAAAAGTATATTCGTAAG
TTTGCTATGTGCTTGTGCCGCCGCATATGCCGCATCAATCTTCTTTTTCAGATCACTCAC
TTGCTCCAGAGGGTTTTCCTGCTCCTTTTTGACCGACGCAAACTTAGCTATTAACTTGTC
GCCATCAAAATCGTGTTTCGTGTTTTCAAACTTCTTCAG*TCCTCCAATGCTTTTTCATA
TTTGTTCTTAGTATTCCCACCATTTTCCGCCGACTCTTTGTCAAAGAGATCCACCGCGCG
TT

QA 3 904 3 904
DS 

RD RR2DK41TF 680 0 0
TTGATTGAGTCAGTAAAAGCTCCCAATTTCTTCTTGATTAGTTTCAGTTCATTTTTCGTG
TCTCTCTCGCTAGCCTCGTCAGGAGTATCCGCGATCTCCAACATCGACTCTATCTTATCT
AAAAGTTTCTTGACTAAGATCATTATGGTCGCCATCGCATCTTTGTTGACTTCCGAACCT
TTCCCAATCTGTTCTGCTATATCTTTCTGTTTTTTCACAGTGTCTTCCCGTATCTGCATT
GCAACCTCGGTCCCTGCCCATCCCACAGCAACTACTGGTAACGCTAAACCCGCAGCTACT
GCACCTGTCACCAGAACTTCGCCCCCGAATGCAAATGTAGCCACCCCTATGAGAGCAACA
ACACCAAACAACACGCCGAAAAGTATATTCGTAAGTTTGCTATGTGCTTGTGCCGCCGCA
TATGCCGCATCAATCTTCTTTTTCAGATCACTCACTTGCTCCAGAAGGCTTTCCTGCTCC
TTTTTGACCGACGCAAACTTAGCTATTAACTTGTCGCCATCAAAATCGTGTTTCATGTTT
TCAAACTTCTTCAGGTCCTCCAATGCTTTTTCATATTTGTTCTTAGTATTCCCACCATTT
TCCGCCGACTCTTTGTCAAAGAGATCCACCGCGCGTTGAAGGTAAAGGTCGCCAATTGAT
GCGTTGTCGGCCAGTTTATC

QA 1 680 1 680
DS 



CO CL119Contig3 865 6 25 U
GGGATCCAAAACATCTTCCTCCTCCAGTCTTGAGCAAAATTCCAATCCAAGTTCAGTAAT
GTCAATGGCACTACACGAAGTTCACTCAGCAAACATTAGTTCCTACAAAGCTGCTTGTGA
ACAACACCCAGAGCTCAAATCCTTTGATGCTTCGCTTCAAGAGGGGGCCAACAAAGTGTT
GAACTCGGTCAACGCTCAAGCCGAGACTGATTCTTATTCCGTACACACATCATACGCGGA
GCTCTACAAGTATCTGCTTGATGCATGCCAAGCTGTGGCAAAGTTCATTACTGCTATCGA
AGGCGACGTGTGGGACAACGAAGATCTAAAGAAGATGGTGGAGGCCTATTTTGAGGATAC
CATCAAGACTTTAGAGTTTTTCAACAGTGTTGATAAACTGGCCGACAACGCATCAATTGG
CGACCTTTACCTTCAACGCGCGGTGGATCTCTTTGACAAAGAGTCGGCGGAAAATGGTGG
GAATACTAAGAACAAGTATGAAAAAGCATTGGAGGACCTGAAGAAGTTTGAAAACATGAA
ACACGATTTTGATGGCGACAAGTTAATAGCTAAGTTTGAGTCGGTCAAAAA*GGAGCAGG
AAAACCTTCTGGAGCAAGTGAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGAGGCATATGAGGCGG
CACAAGCACATAGCAAACTTACGAATATACTTTTCGGCGTGTTGTTTGGTGTTGTTGCTC
TCATAGGGGTGGCTACATTTGCATTCGGGGGCGAAGCTCTGGTGACAGTGCAGTAGCTGC
GGGTTTAGCGTTACCAGTAGTTGCCGTGGGATGGGCAGGGACCGAGCTGCAATGCAGAAA
CTGGAGGACACTGTGAAGAAACAGA


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 5 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E675TF U 1
AF RR2CZ76TF U 2
AF RR2AU09TF U 2
AF RR2AB82TF U 2
AF RR2BC19TF U 2
AF RR2BE08TF U 327
BS 1 88 RR2E675TF
BS 89 89 RR2AB82TF
BS 90 98 RR2E675TF
BS 99 99 RR2AB82TF
BS 100 168 RR2E675TF
BS 169 169 RR2AB82TF
BS 170 336 RR2E675TF
BS 337 337 RR2AB82TF
BS 338 399 RR2E675TF
BS 400 400 RR2AB82TF
BS 401 579 RR2E675TF
BS 580 580 RR2CZ76TF
BS 581 705 RR2AB82TF
BS 706 756 RR2BC19TF
BS 757 757 RR2BE08TF
BS 758 804 RR2BC19TF
BS 805 805 RR2BE08TF
BS 806 826 RR2BC19TF
BS 827 827 RR2BE08TF
BS 828 838 RR2BC19TF
BS 839 839 RR2BE08TF
BS 840 846 RR2BC19TF
BS 847 847 RR2BE08TF
BS 848 855 RR2BC19TF
BS 856 865 RR2BE08TF

RD RR2E675TF 582 0 0
GGGATCCAAAACATCTTCCTCCTCCAGTCTTGAGCAAAATTCCAATCCAAGTTCAGTAAT
GTCAATGGCACTACACGAAGTTCACTCAACAAACATTAATTCCTACAAAGCTGCTTGTGA
ACAACACCCAGAGCTCAAATCCTTTGATGCTTCGCTTCAAGAGGGGGCTAACAAAGTGTT
GAACTCGGTCAACGCTCAAGCCGAGACTGATTCTTATTCCGTACACACATCATACGCGGA
GCTCTACAAGTATCTGCTTGATGCATGCCAAGCTGTGGCAAAGTTCATTACTGCTATCGA
AGGCGACGTGTGGGACAACGAAGATCTAAAGAAGATAGTGGAGGCCTATTTTGAGGATAC
CATCAAGACTTTAGAGTTTTTCAACAGTGTTGATAAACTAGCCGACAACGCATCAATTGG
CGACCTTTACCTTCAACGCGCGGTGGATCTCTTTGACAAAGAGTCGGCGGAAAATGGTGG
GAATACTAAGAACAAGTATGAAAAAGCATTGGAGGACCTGAAGAAGTTTGAAAACATGAA
ACACGATTTTGATGGCGACAAGTTAATAGCTAAGTTTGA
GTC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2CZ76TF 590 0 0
GGATCCAAAACATCTTCCTCCTCCAGTCTTGAGCAAAATTCCAATCCAAGTTCAGTAATG
TCAATGGCACTACACGAAGTTCACTCAGCAAACATTAGTTCCTGCAAAGCTGCTTGTGAA
CAACACCCAGAGCTCAAATCCTTTGATGCTTCGCTTCAAGAGGGGGCTAACAAAGTGTTG
AACTCGGTCAACGCTCAAGCCGAGACTGATTCTTATTCCGTACACACATCATACGCGGAG
CTCTACAAGTATCTGCTTGATGCATGCCAAGCTGTGGCAAAGTTCATTACTGCTATCGAA
GGCGACGTGTGGGACAACGAAGATCTAAAGAAGATAGTGGAGGCCTATTTTGAGGATACC
ATCAAGACTTTAGAGTTTTTCAACAGTGTTGATAAACTAGCCGACAACGCATCAATTGGC
GACCTTTACCTTCAACGCGCGGTGGATCTCTTTGACAAAGAGTCGGCGGAAAATGGTGGG
AATACTAAGAACAAGTATGAAAAAGCATTGGAGGACCTGAAGAAGTTTGAAAACATGAAA
CACGATTTTGATGGCGACAAGTTAATAGCTAAGTTTGAGTCGGTCAAAAA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2AU09TF 585 0 0
GGATCCAAAACATACTCCTCCTCCAGCCTTGAGCAAAATTCCGATCCAAGTTCAGTAATA
TCAATGGCACTACACGAAGTTCACTCAGCAAACATTAGTTCCTACAAAGCTGCTTGTGAA
CAACACCCAGAGCTCAAATCCTTTGATGCTTCGCTTCAAGAGGGGGCCAACAAAGTGTTG
AACTCGGTCAACGCTCAAGCCGAGACTGATTCTTATTTCGTACACACATCATACGCGGAG
CTCTACAAGTATCTGCTTGATGCATGCCAAGCTGTGGCAAAGTTCATTACTGCTATCGAA
GGCGACGTGTGGGACAACGAAGATCTAAGGAAGATGGTGGAGGCCTATTTTGAGGATACC
CTCAAGACTTTAGAGTTTTTCAACAGTGTTGATAAACTGGCCGACAACGCATCAATTGGC
GACCTTTACCTTCAACGCGCGGTGGATCTCTTTGACAAAGAGTCGGCGGAAAATGGTGGG
AATACTAAGAACAAATATGAAAAAGCATTGGAGGACCTGAAGAAGTTTGAAAACATGAAA
CACGATTTTGATGGCGACAAGTTAATAGCTAAGTTTGCGTCGGTC

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2AB82TF 704 0 0
GGATCCAAAACATCTTCCTCCTCCAGTCTTGAGCAAAATTCCAATCCAAGTTCAGTAATG
TCAATGGCACTACACGAAGTTCACTCAGCAAACATTAGTTCCTACAAAGCTGCTTGTGAA
CAACACCCAGAGCTCAAATCCTTTGATGCTTCGCTTCAAGAGGGGGCCAACAAAGTGTTG
AACTCGGTCAACGCTCAAGCCGAGACTGATTCTTATTCCGTACACACATCATATGCGGAG
CTCTACAAGTATCTGCTTGATGCATGCCAAGCTGTGGCAAAGTTCATTACTGCTATCGAA
GGCGATGTGTGGGACAACGAAGATCTAAAGAAGATGGTGGAGGCCTATTTTGAGGATACC
ATCAAGACTTTAGAGTTTTTCAACAGTGTTGATAAACTGGCCGACAACGCATCAATTGGC
GACCTTTACCTTCAACGCGCGGTGGATCTCTTTGACAAAGAGTCGGCGGAAAATGGTGGG
AATACTAAGAACAAGTATGAAAAAGCATTGGAGGACCTGAAGAAGTTTGAAAACATGAAA
CACGATTTTGATGGCGACAAGTTAATAGCTAAGTTTGACTCGGTCAAAAA*GGAGCAGGA
AAACCTTCTGGAGCAAGTGAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGAGGCATATGAGGCGGC
ACAAGCACATAGCAAACTTACGAATATACTTTTCGGCGTGTTGT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2BC19TF 854 0 0
GGATCCAAAACATACTCCTCCTCCAGCCTTGAGCAAAATTCCGATCCAAGTTCAGTAATA
TCAATGGCACTACACGAAGTTCACTCAGCAAACATTAGTTCCTACAAAGCTGCTTGTGAA
CAACACCCAGAGCTCAAATCCTTTGATGCTTCGCTTCAAGAGGGGGCCAACAAAGTGTTG
AACTCGGTCAACGCTCAAGCCGAGACTGATTCTTATTTCGTACACACATCATACGCGGAG
CTCTACAAGTATCTGCTTGATGCATGCCAAGCTGTGGCAAAGTTCATTACCGCTATCGAA
GGCTACGTGTGGGACAACGAAGATCTAAGGAAGATGGTGGAGGCCTATTTTGAGGATACC
CTCAAGACTTTAGAGTTTTTCAACAGTGTTGATAAACTGGCCGACAACGCATCAATTGGC
GACCTTTACCTTCAACGCGCGGTGGATCTCTTTGACAAAGAGTCGGCGGAAAATGGTGGG
AATACTAAGAACAAATATGAAAAAGCATTGGAGGACCTGAAGAAGTTTGAAAACACGAAA
CACGATTTTGATGGCGACAAGTTAATAGCTAAGTTTGCGTCGGTCAAAAA*GGAGCAGGA
AAACCCTCTGGAGCAAGTGAGTGATCTGAAAAAGAAGATTGATGCGGCATATGCGGCGGC
ACAAGCACATAGCAAACTTACGAATATACTTTTCGGCGTGTTGTTTGGTGTTGTTGCTCT
CATAGGGGTGGCTACATTTGCATTCGGGGGCGAAGTTCTGGTGACAGTGCAGTAGCTGCG
GGTTTAGCGTTACCAGTAGTTGCTGTGGGATGGGCAGGGACCGAGTTGCAATGCAGATAC
TGGAG*ACACTGTG

QA 1 854 1 854
DS 

RD RR2BE08TF 539 0 0
TAAAGAAGATGGTGGAGGCCTATTTTGAGGATACCATCAAGACTTTAGAGTTTTTCAACA
GTGTTGATAAACTGGCCGACAACGCATCAATTGGCGACCTTTACCTTCAACGCGCGGTGG
ATCTCTTTGACAAAGAGTCGGCGGAAAATGGTGGGAATACTAAGAACAAGTATGAAAAAG
CATTGGAGGACCTGAAGAAGTTTGAAAACATGAAACACGATTTTGATGGCGACAAGTTAA
TAGCTAAGTTTGACTCGGTCAAAAAAGGAGCAGGAAAACCTTCTGGAGCAAGTGAGTGAT
CTGAAAAAGAAGATTGATGAGACATATGAGGCGGCACAAGCACATAGCAAACTTACGAAT
ATACTTTTCGGCGTGTTGTTTGGTGTTGTTGCTCTCATAGGGGTGGCTACATTTGCATTC
GGGGGCGAAGCTCTGGTGGCAGTGCAGTAGCTGCGGGTTTAGCGTTACCAGTCGTTGCCG
TGGGATGGGCAGGGACCGAGCTGCAATGCAGAAACTGGAGGACACTGTGAAGAAACAGA

QA 1 539 1 539
DS 



AS 5 19

CO CL120Contig1 631 3 8 U
GCTTCTAGATAGATGCATTTATATGAATGAGCCTCAGAAAATGAAAGGACTCGAGTACAT
TTGGAACTCAAACAGCAAAGTTTCCCCCACCAAAACGTAAATTGAAGATGAGAGCATTTC
CGAAAACCAAAAACAAAAGTTTGGAGATTTTATTTGTCAAAAGAATATCTGATCAGAGAG
ACTAAAAAAGTCATGATCATGTCCAACTAAGCAGTAGCTTCCTTCAAGTAGGTAATGAGA
TCAGCACGTTCTTGTGGCTTCTTGAGCCCAGGGAAGACCATCTTCGTTCCAGGAATGTAC
TTCTTGGGGTTGAGCAAGTAATCGTACAAGGTCTTCTCTTCCCATTCGACAGCTTTGTTC
TTGTTAGCAGCAGAGTAAGAGTAACCAGCTGTTGTCCCAGATTGTCTTCCAAACAGACCG
TTTAGGTTCGGTCCTTGTTTGTGACCAGCGCCTTTGTCGACGGTGTGACACTGAGCACAC
TTGGTCCTGAAGATCTTCTCTCCGGCCTTGGAGTTTCCTGGTGGTGCTTCATCAAACGAC
GCCATTTTTCGCCTGGAGAATACGAGAAGAAAACAAAGACGGAACTCGCTTCGCTGGAGC
TTCTAAGGGTTTCTGTTAGGTGTGTGACCCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL04JQ U 1
AF RR2AV49JQ U 1
AF RR2GL04TF C 1
BS 1 76 RR2AV49JQ
BS 77 77 RR2GL04JQ
BS 78 122 RR2AV49JQ
BS 123 123 RR2GL04JQ
BS 124 566 RR2AV49JQ
BS 567 567 RR2GL04TF
BS 568 620 RR2AV49JQ
BS 621 631 RR2GL04TF

RD RR2GL04JQ 560 0 0
GCTTCTAGATAGATGCATTTATATGAATGAGCCTCAGAAAATGAAAGGACTCGAGTACAT
TTGGAACTCAAACAGCAAAGTTTCCCCCACCAAAACGTAAATTGAAGATGAGAGCATTTC
CGAAAACCAAAAACAAAAGTTTGGAGATTTTATTTGTCAAAAGAATATCTGATCAGAGAG
ACTAAAAAAGTCATGATCATGTCCAACTAAGCAGTAGCTTCCTTCAAGTAGGTAATGAGA
TCAGCACGTTCTTGTGGCTTCTTGAGCCCAGGGAAGACCATCTTCGTTCCAGGAATGTAC
TTCTTGGGGTTGAGCAAGTAATCGTACAAGGTCTTCTCTTCCCATTCGACAGCTTTGTTC
TTGTTAGCAGCAGAGTAAGAGTAACCAGCTGTTGTCCCAGATTGTCTTCCAAACAGACCG
TTTAGGTTCGGTCCTTGTTTGTGACCAGCGCCTTTGTCGACGGTGTGACACTGAGCACAC
TTGGTCCTGAAGATCTTCTCTCCGGCCTTGGAGTTTCCTGGTGGTGCTTCATCAAACGAC
GCCATTTTTCGCCTG
GAGAA

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2AV49JQ 626 0 0
GCTTCTAGATAGATGCATTTATATGAATGAGCCTCAGAAAATGAAAGGACTCGAGTACAT
TTGGAACTCAAACAGCCAAGTTTCCCCCACCAAAACGTAAATTGAAGATGAGAGCATTTC
CGCAAACCAAAAACAAAAGTTTGGAGATTTTATTTGTCAAAAGAATATCTGATCAGAGAG
ACTAAAAAAGTCATGATCATGTCCAACTAAGCAGTAGCTTCCTTCAAGTAGGTAATGAGA
TCAGCACGTTCTTGTGGCTTCTTGAGCCCAGGGAAGACCATCTTCGTTCCAGGAATGTAC
TTCTTGGGGTTGAGCAAGTAATCGTACAAGGTCTTCTCTTCCCATTCGACAGCTTTGTTC
TTGTTAGCAGCAGAGTAAGAGTAACCAGCTGTTGTCCCAGATTGTCTTCCAAACAGACCG
TTTAGGTTCGGTCCTTGTTTGTGACCAGCGCCTTTGTCGACGGTGTGACACTGAGCACAC
TTGGTCCTGAAGATCTTCTCTCCGGCCTTGGAGTTTCCTGGTGGTGCTTCATCAAACGAC
GCCATTTTTCGCCTGGAGAATACGAGGAGAAAACAAAGACGGAACTCGCTTCGCTGGAGC
TTCTAAGGGTTTCTGTTAGG
TGTGTC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2GL04TF 631 0 0
GCTTCTAGATAGATGCATTTATATGAATGAGCCTCAGAAAATGAAAGGACTCGAGTACAT
TTGGAACTCAAACAGCAAAGTTTCCCCCACCAAAACGTAAATTGAAGATGAGAGCATTTC
CGAAAACCAAAAACAAAAGTTTGGAGATTTTATTTGTCAAAAGAATATCTGATCAGAGAG
ACTAAAAAAGTCATGATCATGTCCAACTAAGCAGTAGCTTCCTTCAAGTAGGTAATGAGA
TCAGCACGTTCTTGTGGCTTCTTGAGCCCAGGGAAGACCATCTTCGTTCCAGGAATGTAC
TTCTTGGGGTTGAGCAAGTAATCGTACAAGGTCTTCTCTTCCCATTCGACAGCTTTGTTC
TTGTTAGCAGCAGAGTAAGAGTAACCAGCTGTTGTCCCAGATTGTCTTCCAAACAGACCG
TTTAGGTTCGGTCCTTGTTTGTGACCAGCGCCTTTGTCGACGGTGTGACACTGAGCACAC
TTGGTCCTGAAGATCTTCTCTCCGGCCTTGGAGTTTCCTGGTGGTGCTTCATCAAACGAC
GCCATTTTTCGCCTGGAGAATACGAGAAGAAAACAAAGACGGAACTCGCTTCGCTGGAGC
TTCTAAGGGTTTCTGTTAGGTGTGTGACCCC

QA 1 631 1 631
DS 



CO CL120Contig2 650 2 1 U
GCTTCTAGATAGATGCATTTTATATGAATGAGCCTCAGAAAATGAAAGGACTCGAGTACA
TTTGGAACTCAAACAGCCAAGTTTACTCAGCCAAAACGTAATTGAAGATGAGAGCATTTC
CGAAACCAAAAACAAAAGTTTGGAGATTTTATTTGTCAAAAGAATATCTTGATCAGAGAA
GACTAAAAAGTCATGATCATGCCCCCACTAAGCAGTAGCTTCCTTCAAGTAGGCAATGAG
ATCAGCACGTTCTTGTGGCTTCTTGAGCCCAGGGAAGACCATCTTCGTTCCAGGAATGTA
CTTCTTGGGGTTGAGCAAGTAATCGTACAAGGTCTTCTCTTCCCATTCGACAGCTTTGTT
CTTGTTAGCAGCAGAGTAGGAGTAACCAGCTGTTGTCCCAGACTGTCTTCCAAACAGACC
GTTTAGGTTCGGTCCTATTAAAAACCATTTACCAAATATAAAAAAACGTTAAAGGTTATT
CACAAGCCACAAAATTTCGCGTAATTCCAATGAAACACGACCACTCAAAAAAAAAAAAAA
GTTATGCAACTAGCAAAGAACAAAGGTCGTCTCACCCCTTCGGAATCAAAATCACATTTT
TGGATCGGATCTAACGATGATTTGACAAAACAAGCGTGCTAATCAACGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF10JQ U 18
AF RR2D321JQ U 1
BS 1 650 RR2D321JQ

RD RR2DF10JQ 334 0 0
TTTTATATGAATGAGCCTCAGAAAATGAAAGGACTCGAGTACATTTGGAACTCAAACAGC
CAAGTTTACTCAGCCAAAACGTAATTGAAGATGAGAGCATTTCCGAAACCAAAAACAAAA
GTTTGGAGATTTTATTTGTCAAAAGAATATCTTGATCAGAGAAGACTAAAAAGTCATGAT
CATGCCCCCACTAAGCAGTAGCTTCCTTCAAGTAGGCAATGAGATCAGCACGTTCTTGTG
GCTTCTTGAGCCCAGGGAAGACCATCTTCGTTCCAGGAATGTACTTCTTGGGGTTGAGCA
AGTAATCGTACAAGGTCTTCTCTTCCCATTCGAC

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR2D321JQ 650 0 0
GCTTCTAGATAGATGCATTTTATATGAATGAGCCTCAGAAAATGAAAGGACTCGAGTACA
TTTGGAACTCAAACAGCCAAGTTTACTCAGCCAAAACGTAATTGAAGATGAGAGCATTTC
CGAAACCAAAAACAAAAGTTTGGAGATTTTATTTGTCAAAAGAATATCTTGATCAGAGAA
GACTAAAAAGTCATGATCATGCCCCCACTAAGCAGTAGCTTCCTTCAAGTAGGCAATGAG
ATCAGCACGTTCTTGTGGCTTCTTGAGCCCAGGGAAGACCATCTTCGTTCCAGGAATGTA
CTTCTTGGGGTTGAGCAAGTAATCGTACAAGGTCTTCTCTTCCCATTCGACAGCTTTGTT
CTTGTTAGCAGCAGAGTAGGAGTAACCAGCTGTTGTCCCAGACTGTCTTCCAAACAGACC
GTTTAGGTTCGGTCCTATTAAAAACCATTTACCAAATATAAAAAAACGTTAAAGGTTATT
CACAAGCCACAAAATTTCGCGTAATTCCAATGAAACACGACCACTCAAAAAAAAAAAAAA
GTTATGCAACTAGCAAAGAACAAAGGTCGTCTCACCCCTTCGGAATCAAAATCACATTTT
TGGATCGGATCTAACGATGATTTGACAAAACAAGCGTGCTAATCAACGAA

QA 1 650 1 650
DS 



CO CL120Contig3 604 2 1 U
ACCCTTACAAGGCTCCAGCGAAGCTAGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCTCGTATTCTCAGGC
GAAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGAAACTCAAAGGCCGGAGAGAAGATCT
TCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTGGACAAAGGCGCCGGTCACAAGGACCGAA
CCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAGTCTGGGACAACAGCTGGTTACTCCTACTCTGCTGC
TAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCAACCC
CAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGAAGCCACAAGAACG
TGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGGCATGATCATGACTT
TTTAGTCTTCTCTGATCAAGATATTCTTTTGACAAATAAAATCTCCAAACTTTTGTCTTT
TGGTTTCGGAAATGCTCTCCATCTTCAATTACGTTTTGGTGGGGAAACTTGGCTGTTTGA
GTTCCAAATGTACTCGAGTCCTTTCATTTTCTGAGGCTCATTCATATAAAATGCATCTTT
CTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2DB17JQ C 1
AF RR2DB17TF U 1
BS 1 604 RR2DB17TF

RD RR2DB17JQ 604 0 0
ACCCTTACAAGGCTCCAGCGAAGCTAGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCTCGTATTCTCAGGC
GAAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGAAACTCAAAGGCCGGAGAGAAGATCT
TCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTGGACAAAGGCGCCGGTCACAAGGACCGAA
CCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAGTCTGGGACAACAGCTGGTTACTCCTACTCTGCTGC
TAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCAACCC
CAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGAAGCCACAAGAACG
TGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGGCATGATCATGACTT
TTTAGTCTTCTCTGATCAAGATATTCTTTTGACAAATAAAATCTCCAAACTTTTGTCTTT
TGGTTTCGGAAATGCTCTCCATCTTCAATTACGTTTTGGTGGGGAAACTTGGCTGTTTGA
GTTCCAAATGTACTCGAGTCCTTTCATTTTCTGAGGCTCATTCATATAAAATGCATCTTT
CTAG

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2DB17TF 604 0 0
ACCCTTACAAGGCTCCAGCGAAGCTAGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCTCGTATTCTCAGGC
GAAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGAAACTCAAAGGCCGGAGAGAAGATCT
TCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTGGACAAAGGCGCCGGTCACAAGGACCGAA
CCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAGTCTGGGACAACAGCTGGTTACTCCTACTCTGCTGC
TAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCAACCC
CAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGAAGCCACAAGAACG
TGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGGCATGATCATGACTT
TTTAGTCTTCTCTGATCAAGATATTCTTTTGACAAATAAAATCTCCAAACTTTTGTCTTT
TGGTTTCGGAAATGCTCTCCATCTTCAATTACGTTTTGGTGGGGAAACTTGGCTGTTTGA
GTTCCAAATGTACTCGAGTCCTTTCATTTTCTGAGGCTCATTCATATAAAATGCATCTTT
CTAG

QA 1 604 1 604
DS 



CO CL120Contig4 622 3 10 U
ACCCTTACAAGGCTCCAGCGAAGCTAGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCTCGTATTCTCAGGC
GAAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGAAACTCAAAGGCCGGAGAGAAGATCT
TCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTGGACAAAGGCGCCGGTCACAAACAAGGAC
CGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAGTCTGGGACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTG
CTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCA
ACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGAAGCCACAAG
AACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGGCATGATCATG
ACTTTTTAGTCTTCTCTGATCAAGATATTCTTTTGACAAATAAAATCTCCAAACTTTTGT
TTTTGGTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTACGCTTTGGCTGAGTAAACTTGGCTGTT
TGAGTTCCAAATGTACTCGAGTCCTTTCATTTCCTGAGGCTCATTCATATAAAATGCATC
TATCTAGAAGCACTTTCTTTCA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2DF10TF U 1
AF RR2F492JQ C 1
AF RR2F492TF U 1
BS 1 226 RR2DF10TF
BS 227 227 RR2F492TF
BS 228 232 RR2DF10TF
BS 233 233 RR2F492TF
BS 234 515 RR2DF10TF
BS 516 516 RR2F492TF
BS 517 572 RR2DF10TF
BS 573 573 RR2F492TF
BS 574 601 RR2DF10TF
BS 602 622 RR2F492TF

RD RR2DF10TF 619 0 0
ACCCTTACAAGGCTCCAGCGAAGCTAGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCTCGTATTCTCAGGC
GAAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGAAACTCAAAGGCCGGAGAGAAGATCT
TCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTGGACAAAGGCGCCGGTCACAAACAAGGAC
CGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAGTCTGGGACAACAGCTGGCTACTCCTACTCTG
CTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCA
ACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGAAGCCACAAG
AACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGGCATGATCATG
ACTTTTTAGTCTTCTCTGATCAAGATATTCTTTTGACAAATAAAATCTCCAAACTTTTGT
TTTTGGTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTACGTTTTGGCTGAGTAAACTTGGCTGTT
TGAGTTCCAAATGTACTCGAGTCCTTTCATTTTCTGAGGCTCATTCATATAAAATGCATC
T
ACTTAGAAGCACTTTCTT

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2F492JQ 621 0 0
ACCCTTACAAGGCTCCAGCGAAGCTAGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCTCGTATTCTCAGGC
GAAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGAAACTCAAAGGCCGGAGAGAAGATCT
TCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTGGACAAAGGCGCCGGTCACAAACAAGGAC
CGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAGTCTGGGACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTG
CTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCA
ACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGAAGCCACAAG
AACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGGCATGATCATG
ACTTTTTAGTCTTCTCTGATCAAGATATTCTTTTGACAAATAAAATCTCCAAACTTTTGT
TTTTGGTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTACGCTTTGGCTGAGTAAACTTGGCTGTT
TGAGTTCCAAATGTACTCGAGTCCTTTCATTTCCTGAGGCTCATTCATATAAAATGCATC
TATCTAGAAGCACTTTCTTT
C

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2F492TF 622 0 0
ACCCTTACAAGGCTCCAGCGAAGCTAGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCTCGTATTCTCAGGC
GAAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGAAACTCAAAGGCCGGAGAGAAGATCT
TCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTGGACAAAGGCGCCGGTCACAAACAAGGAC
CGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAGTCTGGGACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTG
CTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCA
ACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGAAGCCACAAG
AACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGGGGGCATGATCATG
ACTTTTTAGTCTTCTCTGATCAAGATATTCTTTTGACAAATAAAATCTCCAAACTTTTGT
TTTTGGTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTACGCTTTGGCTGAGTAAACTTGGCTGTT
TGAGTTCCAAATGTACTCGAGTCCTTTCATTTCCTGAGGCTCATTCATATAAAATGCATC
TATCTAGAAGCACTTTCTTTCA

QA 1 622 1 622
DS 



CO CL120Contig5 765 9 7 U
GGGTCACACGCCTAACAGAAACCCTTTAGAAGCTCCAGCGAAGCGAGTTCCGTCTTTGTT
TTCTCCCCCTCCTCGTATTCTCAGGCGAAAAATGGCATCATTCGATGAAGCACCACCAGG
AAACTCCAAGGCCGGAGAGAAGATCTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGA
CAAAGGCGCTGGTCACAAACAAGGACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAGTCTGG
TACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGA
GAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGT
CTTCCCTGGGCTCAAGAAGCCACAAGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGC
TACTGCTTAGTTGGACATGATCATGACTTTTTGAGTCTCTCTGATCAAGATATTCTTTTG
ACAAATAAGATCTCCAAACTTTTGTTTTTGGTTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTTA
CGTTTTGGTGGGGGAAACTTTGCTGTTTAAGTTCCAAATGTACTCGAGTCCTTTCATTGT
CTGAGGCTCATTCATATAAAATGCATCTCTCTAGAAGCGCTTTCTTTACTATCAACATAT
TTTGCATTGTACATAGATAACAAAAACCAAGTTATATCAACTACGAATAATGGGGCAAGA
TCAATGTCAACCTAGATATAACATGTTATCTTTGGCAATCATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ49TF U 144
AF RR2DF43TF U 1
AF RR2CR48JQ C 6
AF RR2AG08JQ C 78
AF RR2DF43JQ C 46
AF RR2AG08TF U 8
AF RR2CR48TF U 6
AF RR2E248TF U 6
AF RR2E248JQ C 167
BS 1 535 RR2DF43TF
BS 536 536 RR2EJ49TF
BS 537 605 RR2DF43TF
BS 606 640 RR2AG08TF
BS 641 653 RR2CR48TF
BS 654 749 RR2E248TF
BS 750 765 RR2E248JQ

RD RR2EJ49TF 398 0 0
TCTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCTGGTCACAAACAAG
GACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAGTCTGGTACAACAGCTGGTTACTCTTACT
CTGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGG*AAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGC
TCAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGAAGCCAC
AAGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTTGGACATGATCA
TGACTTTTTGAGTCTCTCTGATCAAGATATTCTTTTGACAAATAAGATCTCCAAACTTTT
GTTTTTGGTTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTTAC

QA 1 398 1 398
DS 

RD RR2DF43TF 606 0 0
GGGTCACACGCCTAACAGAAACCCTTTAGAAGCTCCAGCGAAGCGAGTTCCGTCTTTGTT
TTCTCCCCCTCCTCGTATTCTCAGGCGAAAAATGGCATCATTCGATGAAGCACCACCAGG
AAACTCCAAGGCCGGAGAGAAGATCTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGA
CAAAGGCGCTGGTCACAAACAAGGACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAGTCTGG
TACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGA
GAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGT
CTTCCCTGGGCTCAAGAAGCCACAAGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGC
TACTGCTTAGTTGGACATGATCATGACTTTTTGAGTCTCTCTGATCAAGATATTCTTTTG
ACAAATAAGATCTCCAAACTTTTGTTTTTGGTTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCA*TTTA
CGTTTTGGTGGGGGAAACTTTGCTGTTTAAGTTCCAAATGTACTCGAGTCCTTTCATTGT
CTGAG
C

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2CR48JQ 648 0 0
GG
ACGCCTAACAGAAACCCTTTAGAAGCTCCAGCGAAGCGAGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCC
CCTCCTCGTATTCTCAGGCGAAAAATGGCATCATTCGATGAAGCACCACCAGGAAACTCC
AAGGCCGGAGAGAAGATCTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGC
GCTGGTCACAAACAAGGACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAGTCTGGTACAACA
GCTGGTTACTCTTACTCTGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACC
TTGTACGATTACTTGCTCAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCT
GGGCTCAAGAAGCCACAAGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCT
TAGTTGGACATGATCATGACTTTTTGAGTCTCTCTGATCAAGATATTCTTTTGACAAATA
AGATCTCCAAACTTTTGTTTTTGGTTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTTACGTTTTG
GTGGGGGAAACTTTGCTGTTTAAGTTCCAAATGTACTCGAGTCCTTTCATTGTCTGAGGC
TCATTCATATAAAATGCATCTCTCTAGAAGCGCTTTCTTTACTATC

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR2AG08JQ 563 0 0
TTCTCAGGCGAAAAATGGCATCATTCGATGAAGCACCACCAGGAAACTCCAAGGCCGGAG
AGAAGATCTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCTGGTCACA
AACAAGGACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAATACAGTCTGGTACAACAGCTGGTTACT
CTTATTCTGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGCCCTTGTACGATT
ACTTGCTCAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGA
AGCCACAAGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTTGGACA
TGATCATGACTTTTTGAGTCTCTCTGATCAAGATATTCTTTTGACAAATAAGATCTCCAA
ACTTTTGTTTTTGGTTTTCGGAAATGCTTTCATCTTCAATTTACGTTTTGGTGGGGGAAA
CTTTGCTGTTTAAGTTCCAAATGTACTCGAGTCCTTTCATTGTCTGAGGCTCATTCATAT
AAAATGCATCTCTCTAGAAGCGC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2DF43JQ 596 0 0
AGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCCCCTCCTCGTATTCTCAGGCGAAAAATGGCATCATTCGA
TGAAGCACCACCAGGAAACTCCAAGGCCGGAGAGAAGATTTTCAGGACCAAGTGTGCTCA
GTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCTGGTCACAAACAAGGACCGAACCTAAACGGTCTGTT
TGGAAGACAGTCTGGTACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTGCTGCTAACAAGAACAAAGC
TGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCAACCCCAAGAAGTACATTCC
TGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGAAGCCACAAGAACGTGCTGATCTCATTGC
CTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTTGGACATGATCATGACTTTTTGAGTCTCTCTGAT
CAAGATATTCTTTTGACAAATAAGATCTCCAAACTTTTGTTTTTGGTTTTCGGAAATGCT
TTCATCTTCAATTTACGTTTTGGTGGGGGAAACTTTGCTGTTTAAGTTCCAAATGTACTC
GAGTCCTTTCATTGTCTGAGGCTCATTCATATAAAATGCATCTCTCTAGAAGCGCT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2AG08TF 633 0 0
GG
GCCTAACAGAAACCCTTTAGAAGCTCCAGCGAAGCGAGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCCCC
TCCTCGTATTCTCAGGCGAAAAATGGCATCATTCGATGAAGCACCACCAGGAAACTCCAA
GGCCGGAGAGAAGATCTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGC
TGGTCACAAACAAGGACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAATACAGTCTGGTACAACAGC
TGGTTACTCTTACTCTGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACCTT
GTACGATTACTTGCTCAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCTGG
GCTCAAGAAGCCACAAGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTA
GTTGGACATGATCATGACTTTTTGAGTCTCTCTGATCAAGATATTCTTTTGACAAATAAG
ATCTCCAAACTTTTGTTTTTGGTTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTTACGTTTTGGT
GGGGGAAACTTTGCTGTTTAAGTTCCAAATGTACTCGAGTCCTTTCATTGTCTGAGGCTC
ATTCATATAAAATGCATCTCTCTAGAAGCGC

QA 3 633 3 633
DS 

RD RR2CR48TF 648 0 0
GG
ACGCCTAACAGAAACCCTTTAGAAGCTCCAGCGAAGCGAGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCC
CCTCCTCGTATTCTCAGGCGAAAAATGGCATCATTCGATGAAGCACCACCAGGAAACTCC
AAGGCCGGAGAGAAGATCTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGC
GCTGGTCACAAACAAGGACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAGTCTGGTACAACA
GCTGGTTACTCTTACTCTGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACC
TTGTACGATTACTTGCTCAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCT
GGGCTCAAGAAGCCACAAGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCT
TAGTTGGACATGATCATGACTTTTTGAGTCTCTCTGATCAAGATATTCTTTTGACAAATA
AGATCTCCAAACTTTTGTTTTTGGTTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTTACGTTTTG
GTGGGGGAAACTTTGCTGTTTAAGTTCCAAATGTACTCGAGTCCTTTCATTGTCTGAGGC
TCATTCATATAAAATGCATCTCTCTAGAAGCGCTTTCTTTACTATC

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR2E248TF 744 0 0
GG
ACGCCTAACAGAAACCCTTTAGAAGCTCCAGCGAAGCGAGTTCCGTCTTTGTTTTCTCCC
CCTCCTCGTATTCTCAGGCGAAAAATGGCATCATTCGATGAAGCACCACCAGGAAACTCC
AAGGCCGGAGAGAAGATCTTCAGGACCAAGTGTGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGC
GCTGGTCACAAACAAGGACCGAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGACAGTCTGGTACAACA
GCTGGTTACTCTTACTCTGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTCGAATGGGAAGAGAAGACC
TTGTACGATTACTTGCTCAACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACGAAGATGGTCTTCCCT
GGGCTCAAGAAGCCACAAGAACGTGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCT
TAGTTGGACATGATCATGACTTTTTGAGTCTCTCTGATCAAGATATTCTTTTGACAAATA
AGATCTCCAAACTTTTGTTTTTGGTTTTCGGAAATGCTCTCATCTTCAATTTACGTTTTG
GTGGGGGAAACTTTGCTGTTTAAGTTCCAAATGTACTCGAGTCCTTTCATTGTCTGAGGC
TCATTCATATAAAATGCATCTCTCTAGAAGCGCTTTCTTTACTATCAACATATTTTGCAT
TGTACATAGATAACAAAAACCAAGTTATATCAACTACGAATAATGGGGCAAGATCAATGT
CAACCTAGATATAACATGTTAT

QA 3 744 3 744
DS 

RD RR2E248JQ 599 0 0
TGTCACACCGTCGACAAAGGCGCTGGTCACAAACAAGGACCGAACCTAAACGGTCTGTTT
GGAAGACAGTCTGGTACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTGCTGCTAACAAGAACAAAGCT
GTCGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCAACCCCAAGAAGTACATTCCT
GGAACGAAGATGGTCTTCCCTGGGCTCAAGAAGCCACAAGAACGTGCTGATCTCATTGCC
TACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTTGGACATGATCATGACTTTTTGAGTCTCTCTGATC
AAGATATTCTTTTGACAAATAAGATCTCCAAACTTTTGTTTTTGGTTTTCGGAAATGCTC
TCATCTTCAATTTACGTTTTGGTGGGGGAAACTTTGCTGTTTAAGTTCCAAATGTACTCG
AGTCCTTTCATTGTTTGAGGCTCATTCATATAAAATGCATCTCTCTAGAAGCGCTTTCTT
TACTATCAACATATTTTGCATTGTACATAGATAACAAAAACCAAGTTATATCAACTACGA
ATAATGGGGCAAGATCAATGTCAACCTAGATATAACATGTTATCTTTGGCAATCATCCT

QA 1 599 1 599
DS 



AS 3 18

CO CL121Contig1 704 3 1 U
CGTCTAAAGTTCTAGGTTCTCCATACGTGTTGTTGAATTGAAGCTTCTACCATTTTCAAG
TCTCTCTCGACCAAGAAGTTTGTCATCTTTTAAAAGTCAAAATATATGTAATTAATGCTT
TGAATAATAATACGTTTCGAGAAGGCTTTGAAGCTATCTCGTTAGAGATTACAATATTGT
TAACTAAACATGTTTAAGAGAAGGAATGCTCACCAGCCTGATGATGGTTCTCAGCATGAT
AACAAGGTTAGAGAATTGAGATCTGGGATAGGACCGCTCTCTGGACATAGTTCAGTGTTC
TGCTCTGATGCTTCTTTGAGGAGGTATTTGGCTGCTCGTAACTGGAACGTGGAGAAAGCC
AAGAAAATGCTTGAGGAGACTCTTAAGTGGAGATCAACATACAAACCTCAAGAGATTCGA
TGGAATCAAGTAGCACATGAAGGTGAGACCGGTAAAGTTTCAAGAGCTGGTTTTCATGAT
AGACAAGGTAGAGTAGTGCTTATAATGAGACCAGCATTACAGAATTCAACATCAGCAGAA
GGTAATATCAAGCATTTGGTCTATCTTCTTGAAAATGCAATCCTCAATCTTCCCAAGGGA
CAAGAACAAATGTCTTGGCTCATTGATTTCACTGGTTGGTCTATGGCTGCTAATGTCCCT
ATGAAACACACGAGAGATTGTCTACATTCTACAGAATCATTACC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL64TF U 2
AF RR2AL64JQ C 454
AF RR2BN35TF U 1
BS 1 704 RR2BN35TF

RD RR2AL64TF 204 0 0
GTCTAAAGTTCTAGGTTCTCCATACGTGTTGTTGAATTGAAGCTTCTACCATTTTCAAGT
CTCTCTCGACCAAGAAGTTTGTCATCTTTTAAAAGTCAAAATATATGTAATTAATGCTTT
GAATAATAATACGTTTCGAGAAGGCTTTGAAGCTATCTCGTTAGAGATTACAATATTGTT
AACTAAACATGTTTAAGAGAAGGA

QA 1 204 1 204
DS 

RD RR2AL64JQ 196 0 0
AAAGTTTCAAGAGCTGGTTTTCATGATAGACAAGGTAGAGTAGTGCTTATAATGAGACCA
GCATTACAGAATTCAACATCAGCAGAAGGTAATATCAAGCATTTGGTCTATCTTCTTGAA
AATGCAATCCTCAATCTTCCCAAGGGACAAGAACAAATGTCTTGGCTCATTGATTTCACT
GGTTGGTCTATGGCTG

QA 1 196 1 196
DS 

RD RR2BN35TF 704 0 0
CGTCTAAAGTTCTAGGTTCTCCATACGTGTTGTTGAATTGAAGCTTCTACCATTTTCAAG
TCTCTCTCGACCAAGAAGTTTGTCATCTTTTAAAAGTCAAAATATATGTAATTAATGCTT
TGAATAATAATACGTTTCGAGAAGGCTTTGAAGCTATCTCGTTAGAGATTACAATATTGT
TAACTAAACATGTTTAAGAGAAGGAATGCTCACCAGCCTGATGATGGTTCTCAGCATGAT
AACAAGGTTAGAGAATTGAGATCTGGGATAGGACCGCTCTCTGGACATAGTTCAGTGTTC
TGCTCTGATGCTTCTTTGAGGAGGTATTTGGCTGCTCGTAACTGGAACGTGGAGAAAGCC
AAGAAAATGCTTGAGGAGACTCTTAAGTGGAGATCAACATACAAACCTCAAGAGATTCGA
TGGAATCAAGTAGCACATGAAGGTGAGACCGGTAAAGTTTCAAGAGCTGGTTTTCATGAT
AGACAAGGTAGAGTAGTGCTTATAATGAGACCAGCATTACAGAATTCAACATCAGCAGAA
GGTAATATCAAGCATTTGGTCTATCTTCTTGAAAATGCAATCCTCAATCTTCCCAAGGGA
CAAGAACAAATGTCTTGGCTCATTGATTTCACTGGTTGGTCTATGGCTGCTAATGTCCCT
ATGAAACACACGAGAGATTGTCTACATTCTACAGAATCATTACC

QA 1 704 1 704
DS 



CO CL121Contig2 1358 13 23 U
GGATTCTCATGTTCATTTCATTCGTCTAAAGTTATAGTTTCTCCATATGTGTTGTTGAAT
TGAAGCTTCTACCATTTTCAAGCCTCTCTCGACCAAGAAGTTTGTTATCTTTCAAAAGTC
AAAATATATGTAACTAATGCTTTGAATAATAATTCGTTTCTAGAAGGCTTTGAAGCTATC
TCGTTAGAGATTACAATATTGTTAACTAAACATGTTTAAGAGAAGGAATGCTCACCAGCC
TGATGATGGTTCTCAGCATGATAACAAGGTTAGAGAATTGAGATCTGGGATAGGACCGCT
CTCTGGACATAGTTCAGTGTTCTGCTCTGATGCTTCTTTGAGGAGGTATTTGGCTGCTCG
TAACTGGAACGTGGAGAAAGCCAAGAAAATGCTTGAGGAGACTCTTAAGTGGAGATCAAC
ATACAAACCTCAAGAGATTCGATGGAATCAAGTAGCACATGAAGGTGAGACCGGTAAAGT
TTCAAGAGCTGGTTTTCATGATAGACAAGGTAGAGTAGTGCTTATAATGAGACCAGCATT
ACAGAATTCAACATCAGCAGAAGGTAATATCAAGCATTTGGTCTATCTTCTTGAAAATGC
AATCCTCAATCTTCCCAAGGGGCAAGAACAAATGTCTTGGCTCATTGATTTCACTGGTTG
GTCTATGGCTGCTAATGTCCCTATGAAAACAACACGGGAGATTGTCTACATTCTACAGAA
TCATTACCCTGAGAGACTCGGTATCGCCTTTCTCTACAATCCACCAAGACTCTTCCAAGC
AGTCTACAAGGCTGTTAAATACTTCTTGGACCCATGTACAGCTCAAAAGGTCAAATTTGT
GTACCCTAAAGACAAAACAAGTGATGAACTGATGACATCACATTTTGATGTTGAGAATCT
TCCCAGGGAGTTTGGAGGAGAAGCAACACTAGAGTATGATCATGAGGAGTTCTCAAAACA
AATGTGTGAAGATGATGTCAAAACAGCAAAGTTCTGGGGATTGGAGGAGAAACAGTATCC
GAAACCAAACGGTTTCTCTCCAGCCGATGTTGTTCCTGAGCCAGCCACTTTTATTGCATC
AGCAGCTAGCTGAGTTATAGAGATATATACACACAGAAACAAGAAGAGATGAATAGTAAA
GGTTTATTCTCGTCCAAGAAGAGCCAATAAAAATGTCCTGTTTACTTAGATAATTAATAA
GGTTCCAAGTCTTTGCTTAGTGAACCAATGACTTTAAAAAATGTTATAATTAACAGAGAC
GTTCCTTGTCATGAATGTTGTATGTGTGAGAATATTGTTACCATTTGTAAAACTGTTTCG
TGTTTAGTAATTGAAGCTAGCAGAGTAATCCTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 35 10 10 35 10 10 35 35 10 35 20 10 10 35 35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 40 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 35 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2DQ89TF U 1
AF RR2GR22TF U 69
AF RR2CD07TF U 23
AF RR2GX22TF U 64
AF RR2EV05TF U 145
AF RR2AV82TF U 142
AF RR2CI94TF U 340
AF RR2AV82JQ C 437
AF RR2EV05JQ C 470
AF RR2D040JQ C 482
AF RR2DQ89JQ C 612
AF RR2CD07JQ C 716
AF RR2GX22JQ C 756
BS 1 157 RR2DQ89TF
BS 158 158 RR2CD07TF
BS 159 289 RR2DQ89TF
BS 290 290 RR2CD07TF
BS 291 563 RR2DQ89TF
BS 564 564 RR2CD07TF
BS 565 621 RR2DQ89TF
BS 622 688 RR2CD07TF
BS 689 691 RR2GX22TF
BS 692 716 RR2CD07TF
BS 717 746 RR2GX22TF
BS 747 818 RR2AV82TF
BS 819 820 RR2CI94TF
BS 821 829 RR2AV82TF
BS 830 830 RR2CI94TF
BS 831 891 RR2AV82TF
BS 892 982 RR2CI94TF
BS 983 983 RR2AV82JQ
BS 984 1023 RR2CI94TF
BS 1024 1325 RR2AV82JQ
BS 1326 1328 RR2EV05JQ
BS 1329 1355 RR2CD07JQ
BS 1356 1358 RR2GX22JQ

RD RR2DQ89TF 622 0 0
GGATTCTCATGTTCATTTCATTCGTCTAAAGTTATAGTTTCTCCATATGTGTTGTTGAAT
TGAAGCTTCTACCATTTTCAAGCCTCTCTCGACCAAGAAGTTTGTTATCTTTCAAAAGTC
AAAATATATGTAACTAATGCTTTGAATAATAATTCGTCTCTAGAAGGCTTTGAAGCTATC
TCGTTAGAGATTACAATATTGTTAACTAAACATGTTTAAGAGAAGGAATGCTCACCAGCC
TGATGATGGTTCTCAGCATGATAACAAGGTTAGAGAATTGAGATCTGGGGTAGGACCGCT
CTCTGGACATAGTTCAGTGTTCTGCTCTGATGCTTCTTTGAGGAGGTATTTGGCTGCTCG
TAACTGGAACGTGGAGAAAGCCAAGAAAATGCTTGAGGAGACTCTTAAGTGGAGATCAAC
ATACAAACCTCAAGAGATTCGATGGAATCAAGTAGCACATGAAGGTGAGACCGGTAAAGT
TTCAAGAGCTGGTTTTCATGATAGACAAGGTAGAGTAGTGCTTATAATGAGACCAGCATT
ACAGAATTCAACATCAGCAGAAG*TAATATCAAGCATTTGGTCTATCTTCTTGAAAATGC
AATCCTCAATCTTCCCAAGGG
C

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2GR22TF 577 0 0
GG
ACCATTTTCAAGCCTCTCTCGACCAAGAAGTTTGTTATCTTTCAAAAGTCAAAATATATG
TAACTAATGCTTTGAATAATAATTCGTTTCTAGAAGGCTTTGAAGCTATCTCGTTAGAGA
TTACAATATTGTTAACTAAACATGTTTAAGAGAAGGAATGCTCACCAGCCTGATGATGGT
TCTCAGCATGATAACAAGGTTAGAGAATTGAGATCTGGGATAGGACCGCTCTCTGGACAT
AGTTCAGTGTTCTGCTCTGATGCTTCTTTGAGGAGGTATTTGGCTGCTCGTAACTGGAAC
GTGGAGAAAGCCAAGAAAATGCTTGAGGAGACTCTTAAGTGGAGATCAACATACAAACCT
CAAGAGATTCGATGGAATCAAGTAGCACATGAAGGTGAGACCGGTAAAGTTTCAAGAGCT
GGTTTTCATGATAGACAAGGTAGAGTAGTGCTTATAATGAGACCAGCATTACAGAATTCA
ACATCAGCAGAAGGTAATATCAAGCATTTGGTCTATCTTCTTGAAAATGCAATCCTCAAT
CTTCCCAAGGGGCAAGAACAAATGTCTTGGCTCAT

QA 3 577 3 577
DS 

RD RR2CD07TF 694 0 0
C
GTCTAAAGTTATAGTTTCTCCATATGTGTTGTTGAATTGAAGCTTCTACCATTTTCAAGC
CTCTCTCGACCAAGAAGTTTGTTATCTTTCAAAAGTCAAAATATATGTAACTAATGCTTT
GAATAATAATTCGTTTCTAGAAGGCTTTGAAGCTATCTCGTTAGAGATTACAATATTGTT
AACTAAACATGTTTAAGAGAAGGAATGCTCACCAGCCTGATGATGGTTCTCAGCATGATA
ACAAGGTTAGAGAATTGAGATCTGGGATAGGACCGCTCTCTGGACATAGTTCAGTGTTCT
GCTCTGATGCTTCTTTGAGGAGGTATTTGGCTGCTCGTAACTGGAACGTGGAGAAAGCCA
AGAAAATGCTTGAGGAGACTCTTAAGTGGAGATCAACATACAAACCTCAAGAGATTCGAT
GGAATCAAGTAGCACATGAAGGTGAGACCGGTAAAGTTTCAAGAGCTGGTTTTCATGATA
GACAAGGTAGAGTAGTGCTTATAATGAGACCAGCATTACAGAATTCAACATCAGCAGAAG
GTAATATCAAGCATTTGGTCTATCTTCTTGAAAATGCAATCCTCAATCTTCCCAAGGGGC
AAGAACAAATGTCTTGGCTCATTGATTTCACTGGTTGGTCTATGGCTGCTAATGTCCCTA
TGAAAC**ACACGGGAGATTGTCTACATTCTAC

QA 2 694 2 694
DS 

RD RR2GX22TF 683 0 0
AGCTTCTACCATTTTCAAGCCTCTCTCGACCAAGAAGTTTGTTATCTTTCAAAAGTCAAA
ATATATGTAACTAATGCTTTGAATAATAATTCGTTTCTAGAAGGCTTTGAAGCTATCTCG
TTAGAGATTACAATATTGTTAACTAAACATGTTTAAGAGAAGGAATGCTCACCAGCCTGA
TGATGGTTCTCAGCATGATAACAAGGTTAGAGAATTGAGATCTGGGATAGGACCGCTCTC
TGGACATAGTTCAGTGTTCTGCTCTGATGCTTCTTTGAGGAGGTATTTGGCTGCTCGTAA
CTGGAACGTGGAGAAAGCCAAGAAAATGCTTGAGGAGACTCTTAAGTGGAGATCAACATA
CAAACCTCAAGAGATTCGATGGAATCAAGTAGCACATGAAGGTGATACCGGTAAAGTTTC
AAGAGCTGGTTTTCATGATAGACAAGGTAGAGTAGTGCTTATAATGAGACCAGCATTACA
GTATTCAACATCAGCAGAAGGTAATATCAAGCATTTGGTCTATCTTCTTGAAAATGCAAT
CCTCAATCTTCCCAAGGGGCAAGAACAAATGTCTTGGCTCATTGATTTCACTGGTTGGTC
TATGGCTGCTAATGTCCCTATGAAAACAACACGGGAGATTGTCTACATTCTACAGAATCA
TTACCCTGAGAGACTCGGTATCG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2EV05TF 641 0 0
GG
AACGAGATCCTTATTATCAGGCTTTGAAGCTATCTCGTTAGAGATTACAATATTGTTAAC
TAAACATGTTTAAGAGAAGGAATGCTCACCAGCCTGATGATGGTTCTCAGCATGATAACA
AGGTTAGAGAATTGAGATCTGGGATAGGACCGCTCTCTGGACATAGTTCAGTGTTCTGCT
CTGATGCTTCTTTGAGGAGGTATTTGGCTGCTCGTAACTGGAACGTGGAGAAAGCCAAGA
AAATGCTTGAGGAGACTCTTAAGTGGAGATCAACATACAAACCTCAAGAGATTCGATGGA
ATCAAGTAGCACATGAAGGTGAGACCGGTAAAGTTTCAAGAGCTGGTTTTCATGATAGAC
AAGGTAGAGTAGTGCTTATAATGAGACCAGCATTACAGAATTCAACATCAGCAGAAGGTA
ATATCAAGCATTTGGTCTATCTTCTTGAAAATGCAATCCTCAATCTTCCCAAGGGGCAAG
AACAAATGTCTTGGCTCATTGATTTCACTGGTTGGTCTATGGCTGCTAATGTCCCTATGA
AAACAACACGGGAGATTGTCTACATTCTACAGAATCATTACCCTGAGAGACTCGGTATCG
CCTTTCTCTACAATCCACCAAGACTCTTCCAAGCAGTCT

QA 3 641 3 641
DS 

RD RR2AV82TF 750 0 0
GATAC
AACGAGATCCTTATTATCAGGCTTTGAAGCTATCTCGTTAGAGATTACAATATTGTTAAC
TAAACATGTTTAAGAGAAGGAATGCTCACCAGCCTGATGATGGTTCTCAGCATGATAACA
AGGTTAGAGAATTGAGATCTGGGATAGGACCGCTCTCTGGACATAGTTCAGTGTTCTGCT
CTGATGCTTCTTTGAGGAGGTATTTGGCTGCTCGTAACTGGAACGTGGAGAAAGCCAAGA
AAATGCTTGAGGAGACTCTTAAGTGGAGATCAACATACAAACCTCAAGAGATTCGATGGA
ATCAAGTAGCACGTGAAGGTGAGACCGGTAAAGTTTCAAGAGCTGGTTTTCATGATAGAC
AAGGTAGAGTAGTGCTTATAATGAGACCAGCATTACAGAATTCAACATCAGCAGAAGGTA
ATATCAAGCATTTGGTCTATCTTCTTGAAAATGCAATCCTCAATCTTCCCAAGGGGCAAG
AACGAATGTCTTGGCTCATTGATTTCACTGGTTGGTCTATGGCTGCTAATGTCCCTATGA
AAACAACACGGGAGATTGTCTACATTCTACAGAATCATTACCCTGAGAGACTCGGTATCG
CCTTTCTCTACAATCCACCAAGACTCTTCCAAGCAGTCTACAAGGCTGTTAAATACTTCT
TGGACCCATGTA**GCTCAAAAG*TCAAATTTGTGTACCCTAAAGACAAAACAAGTGATG
AACTGATGACATCACATTTTGATGT

QA 6 750 6 750
DS 

RD RR2CI94TF 684 0 0
GG
GGAGGTATTTGGCTGCTCGTAACTGGAACGTGGAGAAAGCCAAGAAAATGCTTGAGGAGA
CTCTTAAGTGGAGATCAACATACAAACCTCAAGAGATTCGATGGAATCAAGTAGCACATG
AAGGTGAGACCGGTAAAGTTTCAAGAGCTGGTTTTCATGATAGACAAGGTAGAGTAGTGC
TTATAATGAGACCAGCATTACAGAATTCAACATCAGCAGAAGGTAATATCAAGCATTTGG
TCTATCTTCTTGAAAATGCAATCCTCAATCTTCCCAAGGGGCAAGAACAAATGTCTTGGC
TCATTGATTTCACTGGTTGGTCTATGGCTGCTAATGTCCCTATGAAAACAACACGGGAGA
TTGTCTACATTCTACAGAATCATTACCCTGAGAGACTCGGTATCGCCTTTCTCTACAATC
CACCAAGACTCTTCCAAGCAGTCTACAAGGCTGTTAAATACTTCTTGGACCCATGTACAG
CTCAAAAGGTCAAATTTGTGTACCCTAAAGACAAAACAAGTGATGAACTGATGACATCGC
ATTTTGATGTTGAGAATCTTCCCAGGGAGTTTGGAGGAGAAGCAACACTAGAGTATGATC
ATGAGGAGTTCTCAAAACAAATGTGTGAAGATGATGTCAAA*CAGCAAAGTTCTGGGGAT
TGGAGGAGAAACAGTATCCGAA

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR2AV82JQ 889 0 0
ATTCGATGGAATCAAGTAGCACGTGAAGGTGAGACCGGTAAAGTTTCAAGAGCTGGTTTT
CATGATAGACAAGGTAGAGTAGTGCTTATAATGAGACCAGCATTACAGAATTCAACATCA
GCAGAAGGTAATATCAAGCATTTGGTCTATCTTCTTGAAAATGCAATCCTCAATCTTCCC
AAGGGGCAAGAACGAATGTCTTGGCTCATTGATTTCACTGGTTGGTCTATGGCTGCTAAT
GTCCCTATGAAAACAACACGGGAGATTGTCTACATTCTACAGAATCATTACCCTGAGAGA
CTCGGTATCGCCTTTCTCTACAATCCACCAAGACTCTTCCAAGCAGTCTACAAGGCTGTT
AAATACTTCTTGGACCCATGTA**GCTCAAAAGGTCAAATTTGTGTACCCTAAAGACAAA
ACAAGTGATGAACTGATGACATCACATTTTGATGTTGAGAATCTTCCCAGGGAGTTTGGA
GGGGAAGCAACACTAGAGTATGATCATGAGGAGTTCTCAAAACAAATGTGGGAAGATGAT
GTCAAAACAGCAAAGTTCTGGGGATTGGAGGAGAAACAGTATCCGAAACCAAACGGTTTC
TCTCCAGCCGATGTTGTTCCTGAGCCAGCCACTTTTATTGCATCAGCAGCTAGCTGAGTT
ATAGAGATATATACACACAGAAACAAGAAGAGATGAATAGTAAAGGTTTATTCTCGTCCA
AGAAGAGCCAATAAAAATGTCCTGTTTACTTAGATAATTAATAAGGTTCCAAGTCTTTGC
TTAGTGAACCAATGACTTTAAAAAATGTTATAATTAACAGAGACGTTCCTTGTCATGAAT
GTTGTATGTGTGAGAATATTGTTACCATTTGTAAAACTGTTTCGTGTTT

QA 1 889 1 889
DS 

RD RR2EV05JQ 859 0 0
ACCGGTAAAGTT*CAAGAGCTGGTTT*CATGATAGACAAGGTAGAGTAGTGCTTATAATG
AGACCAGCATTACAGAATTCAACATCAGCAGAAGGTAATATCAAGCATTTGGTCTATCTT
CTTGAAAATGCAATCCTCAATCTTCCCAAGGGGCAAGAACAAATGTCTTGGCTCATTGAT
TTCACTGGTTGGTCTATGGCTGCTAATGTCCCTATGAAAACAACACGGGAGATTGTCTAC
ATTCTACAGAATCATTACCCTGAGAGACTCGGTATCGCCTTTCTCTACAATCCACCAAGA
CTCTTCCAAGCAGTCTACAAGGCTGTTAAATACTTCTTGGACCCATGTACAGCTCAAAAG
GTCAAATTTGTGTACCCTAAAGACAGAACAGGTGATGAACTGATGACATCACATTTTGAT
GTTGAGAATCTTCCCAGGGAGTTTGGAGGAGAAGCAACACTAGAGTATGATCATGAGGAG
TTCTCAAAACAAATGTGTGAAGATGATGTCAAAACAGCAAAGTTCTGGGGATTGGAGGAG
AAACAGTATCCGAAACCAAACGGTTTCTCTCCAGCCGATGTTGTTCCTGAGCCAGCCACT
TCTATTGCATCAGCAGCTAGCTGAGTTATAGAGATATATACACACAGAAACAAGAAGAGA
TGAATAGTAAAGGTTTATTCTCGTCCAAGAAGAGCCAATAAAAATGTCCTGTTTACTTAG
ATAATTAATAAGGTTCCAAGTCTTTGCTTAGTGAACCAATGACTTTAAAAAATGTTATAA
TTAACAGAGACGTTCCTTGTCATGAATGTTGTATGTGTGAGAATATTGTTACCATTTGTA
AAACTGTTTCGTGTTTAGT

QA 1 859 1 859
DS 

RD RR2D040JQ 854 0 0
GTTCAAGAGCTG
TTTCATGATAGACAAGGTAGAGTAGTGCTTATAATGAGACCAGCAT*ACAGAATTCAACA
TCAGCAGAAGGTAATATCAAGCATTTGGTCTATCTTCTTGAAAATGCAATCCTCAATCTT
CCCAAGGGGCAAGAACAAATGTCTTGGCTCATTGATTTCACTGGTTGGTCTATGGCTGCT
AATGTCCCTATGAAAACAACACGGGAGATTGTCTACATTCTACAGAATCATTACCCTGAG
AGACTCGGTATCGCCTTTCTCTACAATCCACCAAGACTCTTCCAAGCAGTCTACAAGGCT
GTTAAATACTTCTTGGACCCATGTACAGCTCAAAAGGTCAAATTTGTGTACCCTAAAGAC
AAAACAAGTGATGAACTGATGACATCACATTTTGATGTTGAGAATCTTCCCAGGGAGTTT
GGAGGAGAAGCAACACTAGAGTATGATCATGAGGAGTTCTCAAAACAAATGTGTGAAGAT
GATGTCAAAACAGCAAAGTTCTGGGGATTGGAGGAGAAACAGTATCCGAAACCAAACGGT
TTCTCTCCAGCCGATGTTGTTCCTGAGCCAGCCACTTCTATTGCATCAGCAGCTAGCTGA
GTTATAGAGATATATACACACAGAAACAAGAAGAGATGAATAGTAAAGGTTTATTCTCGT
CCAAGAAGAGCCAATAAAAATGTCCTGTTTACTTAGATAATTAATAAGGTTCCAAGTCTT
TGCTTAGTGAACCAATGACTTTAAAAAATGTTATAATTAACAGAGACGTTCCTTGTCATG
AATGTTGTATGTGTGAGAATATTGTTACCATTTGTAAAACTGTTTCGTGTTTAGT
AATTGAA

QA 13 847 13 847
DS 

RD RR2DQ89JQ 717 0 0
TTCCCAAGGGGCAAGAACAAATGTCTTGGCTCATTGATTTCACTGGTTGGTCTATGGCTG
CTAATGTCCCTATGAAAACAACACGGGAGATTGTCTACATTCTACGGAATCATTACCCTG
AGAGACTCGGTATCGCCTTTCTCTACAATCCACCAAGACTCTTCCAAGCAGTCTACAAGG
CTGTTAAATACTTCTTGGACCCATGTACAGCTCAAAAGGTCAAATTTGTGTACCCTAAAG
ACAAAACAAGTGATGAACTGATGACATCACATTTTGATGTTGAGAATCTTCCCAGGGAGT
TTTGAGGAGAAGCAACACTAGAGTATGATCATGAGGAGTTCTCAAAACAAATGTGTGAAG
ATGATGTCAAAACAGCAAAGTTCTGGGGATTGGAGGAGAAACAGTATCCGAAACCAAACG
GTTTCTCTCCAGCCGATGTTGTTCCTGAGCCAGCCACTTTTATTGCATCAGCAGCTAGCT
GAGTTATAGAGATATATACACACAGAAACAAGAAGAGGTGAATAGTAAAGGTTTATTTTC
GTCCAAGAAGAGCCAATAAAAATGTCCTGTTTACTTAGATAATTAATAAGGTTCCAAGTC
TTTGCTTAGTGAACCAATGACTTTAAAAAATGTTATAATTAACAGAGACGTTCCTTGTCA
TGAATGTTGTATGTGTGAGAATATTGTTACCATTTGTAAAACTGTTTCGTGTTTAGT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2CD07JQ 640 0 0
CAGAATCATTACCCTGAGAGACTCGGTATCGCCCTTCTCTACAATCCACCAAGACTCTTC
CAAGCAGTTTACAAGGCTGTTAAATACTTTTTGGACCCATGTACAGCTCAAAAGGTCAAA
TTTGTGTACCCTAAAGACAAAACAAGTGATGAACTGATGACATCACATTTTGATGTTGAG
AATCTTCCCAGGGAGTTTGGAGGAGAAGCAACACTAGAGTATGATCATGAGGAGTTTTCA
AAACAAATGTGTGAAGATGATGTCAAAACAGCAAAGTTTTGGGGATTGGAGGAGAAACAG
TATCCGAAACCAAACGGTTTCTCTCCAGCCGATGTTGTTCCTGAGCCAGCCACTTTTATT
GCATCAGCAGCTAGCTGAGTTATAGAGATATATACACACAGAAACAAGAAGAGATGAATA
GTAAAGGTTTATTTTCGTCCAAGAAGAGCCAATAAAAATGTCCTGTTTACTTAGATAATT
AATAAGGTTCCAAGTCTTTGCTTAGTGAACCAATGACTTTAAAAAATGTTATAATTAACA
GAGACGTTCCTTGTCATGAATGTTGTATGTGTGAGAATATTGTTACCATTTGTAAAGCTG
TTTCGTGTTTAGTAATTGAAGCTAGCAGAGTAATCCTTTT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2GX22JQ 603 0 0
ACAATCCACCAAGACTCTTCCAAGCAGTCTACAAGGCTGTTAAATACTTCTTGGACCCAT
GTACAGCTCAAAAGGTCAAATTTGTGTACCCTAAAGACAAAACAATTGATGAACTGATGA
CATCACATTTTGATGTTGAGAATCTTCCCAGGGAGTTTGGAGGAGAAGCAACACTAGAGT
ATGATCATGAGGAGTTCTCAAAACGAATGTGTGAAGATGATGTCAAAGCAGCAAAGTTTT
GGGGATTGGAGGAGAAACAGTATCCGAAACCAAACGGTTTCTCTCCAGCCGATGTTGTTC
CTGAGCCAGCCACTTTTATTGCATCAGCAGCTAGCTGAGTTATAGAGATATATACACACA
GAAACAAGAAGAGATGAATAGTAAAGGTTTATTTTCGTCCAAGAAGAGCCAATAAAAATG
TCCTGTTTACTTAGATAATTAATAAGGTTCCAAGTCTTTGCTTAGTGAACCAATGACTTT
AAAAAATGTTATAATTAACAGAGACGTTCCTTGTCATGAATGTTGTATGTGTGAGAATAT
TGTTACCATTTGTAAAACTGTTTCGTGTTTAGTAATTGAAGCTAGCAGAGTAATCCTTTT
ATT

QA 1 603 1 603
DS 



CO CL121Contig3 624 2 6 U
GGAGAGATTGTCTACATTCTACAGAATCATTACCCTGAGAGACTCGGTATCGCCTTTCTC
TACAATCCACCAAGACTCTTCCAAGCAGTCTACAAGGCTGTTAAATACTTCTTGGACCCA
TGTACAGCTCAAAAGGTCAAATTTGTGCACCCTAAAGACAAAACAAGTGATGAACTGATG
ACATCACATTTTGATGTTGAGAATCTTCCCAGGGAGTTTGGAGGAGAAGCAACACTAGAG
TATGATCATGAGGAGTTCTCAAAACAAATGTGTGAAGATGATGTCAAAACAGCAAAGTCC
TGGGGATTGGAGGAGAAACAGTATCCGAAACCAAACGGTTTCTCTCCAGCCGATGTTGTT
CCTGAGCCAGCCACTTCTATTGCATCAGCAGCTAGCTGAGTTATATATATACACACAGAA
AAGAAGAGATGAATAGTAAATGTTTATTCTCGTCCAAGAAGAGCCAATAAAATGTCCTGT
TTACTTAGATAATTAATAAGGTTCCAAGTCTTTGCTTAGTGAGCCAAAGTCTTTTCTTAA
AATGTTATAATTAACAGAGACGTTCCTTGTCATGAATGTTGTATGTGTGAGAATATTGAT
ACCATGTGTAACTGTTTTGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G536TF U 1
AF RR2FA93TF U 91
BS 1 147 RR2G536TF
BS 148 148 RR2FA93TF
BS 149 298 RR2G536TF
BS 299 299 RR2FA93TF
BS 300 611 RR2G536TF
BS 612 624 RR2FA93TF

RD RR2G536TF 621 0 0
GGAGAGATTGTCTACATTCTACAGAATCATTACCCTGAGAGACTCGGTATCGCCTTTCTC
TACAATCCACCAAGACTCTTCCAAGCAGTCTACAAGGCTGTTAAATACTTCTTGGACCCA
TGTACAGCTCAAAAGGTCAAATTTGTGTACCCTAAAGACAAAACAAGTGATGAACTGATG
ACATCACATTTTGATGTTGAGAATCTTCCCAGGGAGTTTGGAGGAGAAGCAACACTAGAG
TATGATCATGAGGAGTTCTCAAAACAAATGTGTGAAGATGATGTCAAAACAGCAAAGTTC
TGGGGATTGGAGGAGAAACAGTATCCGAAACCAAACGGTTTCTCTCCAGCCGATGTTGTT
CCTGAGCCAGCCACTTCTATTGCATCAGCAGCTAGCTGAGTTATATATATACACACAGAA
AAGAAGAGATGAATAGTAAATGTTTATTCTCGTCCAAGAAGAGCCAATAAAATGTCCTGT
TTACTTAGATAATTAATAAGGTTCCAAGTCTTTGCTTAGTGAGCCAAAGTCTTTTCTTAA
AATGTTATAATTAACAGAGACGTTCCTTGTCATGAATGTTGTATGTGTGAGAATATTGAT
ACCATGTGTAA
CTGTTTCGTG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2FA93TF 534 0 0
G
ACAAGGCTGTTAAATACTTCTTGGACCCATGTACAGCTCAAAAGGTCAAATTTGTGCACC
CTAAAGACAAAACAAGTGATGAACTGATGACATCACATTTTGATGTTGAGAATCTTCCCA
GGGAGTTTGGAGGAGAAGCAACACTAGAGTATGATCATGAGGAGTTCTCAAAACAAATGT
GTGAAGATGATGTCAAAACAGCAAAGTCCTGGGGATTGGAGGAGAAACAGTATCCGAAAC
CAAACGGTTTCTCTCCAGCCGATGTTGTTCCTGAGCCAGCCACTTCTATTGCATCAGCAG
CTAGCTGAGTTATATATATACACACAGAAAAGAAGAGATGAATAGTAAATGTTTATTCTC
GTCCAAGAAGAGCCAATAAAATGTCCTGTTTACTTAGATAATTAATAAGGTTCCAAGTCT
TTGCTTAGTGAGCCAAAGTCTTTTCTTAAAATGTTATAATTAACAGAGACGTTCCTTGTC
ATGAATGTTGTATGTGTGAGAATATTGATACCATGTGTAACTGTTTTGTGTTT

QA 2 534 2 534
DS 



AS 1 19

CO CL122Contig1 569 19 14 U
GGGAAAGTAAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAA
TCCTTTGCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATGAGCGCTCTAGAGACCGGAACT
ATGGTTCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTG
GTTCTGCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCA
ACTAA*CAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTG
TAACCTCCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAAC
GGTCAGTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAG
CATTTTAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTC
AATACTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTAAAA
TAATTACATCTTTACAGACGTGCTTTTAT


BQ
10 10 10 10 35 40 40 40 55 60 70 70 70 70 70 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 5 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 50 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 85 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 60 97 97 97 97 97 20 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 15 15 15 15 15 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 15 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 20 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 95 75 75 75 75 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2AH74JQ C 193
AF RR2AH74TF U 193
AF RR2EO05JQ C 108
AF RR2EO05TF U 8
AF RR2B195JQ C 14
AF RR2E665JQ C 323
AF RR2B195TF U 14
AF RR2E665TF U 6
AF RR2EO89JQ C 6
AF RR2EO89TF U 6
AF RR2F165JQ C 3
AF RR2F165TF U 3
AF RR2EU37TF U 4
AF RR2AB11JQ C 1
AF RR2E640JQ C 10
AF RR2E640TF U 10
AF RR2FI57TF U 2
AF RR2AR50TF U 227
AF RR2AB11TF U 1
BS 1 4 RR2AB11JQ
BS 5 8 RR2F165TF
BS 9 9 RR2E665TF
BS 10 117 RR2EO05TF
BS 118 118 RR2F165TF
BS 119 192 RR2EO05TF
BS 193 370 RR2AH74TF
BS 371 371 RR2EO05TF
BS 372 515 RR2AH74TF
BS 516 526 RR2EO05TF
BS 527 527 RR2E640TF
BS 528 536 RR2EO05TF
BS 537 555 RR2E640TF
BS 556 569 RR2FI57TF

RD RR2AH74JQ 323 0 0
GCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAA*CAAAGA
TTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACCTCCCCTC
TTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCAGTTCCTA
GGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTAAATAA
TGAGAAAGTGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTCAATACTTATGAC
ACATCTATTAATATCGTTTTCAT

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR2AH74TF 323 0 0
GCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAA*CAAAGA
TTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACCTCCCCTC
TTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCAGTTCCTA
GGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTAAATAA
TGAGAAAGTGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTCAATACTTATGAC
ACATCTATTAATATCGTTTTCAT

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR2EO05JQ 430 0 0
AGAGACCGGACCTATGGTTCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATTTGAGCAATATGCAAGT
GTGTGCGCCGCTGGTTCTGCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCAT
CGCTCTCCAAGCAACTAA*CAAAGATTGTATATGTAACGTTTTTCGAGCAGCCACCACAT
TTACCACTACTTGTAACCTCCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGC*****C
TAGTTCCAGCAACGGTCAGTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAG
AATAAAATAAAAGCATTTTAAATAATGAGAAAATGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTATGTT
GTTTGGTTGGTTCAATACTTATAACACATCTATTAATATAGTTTTCATATTTATTATGGA
GAATATTTT
T

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR2EO05TF 530 0 0
GG
AAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCTTTGCA
ACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGTTCGT
GCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCTGCCT
GGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAA*CAA
AGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACATTTACCACTACTTGTAACCTCCC
CTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGC*****CTAGTTCCAGCAACGGTCAGTTC
CGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTAAA
TAATGAGAAAATGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTCAATACTTAT
AACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGAGAATATTTT
T

QA 3 529 3 529
DS 

RD RR2B195JQ 523 0 0
GG
ATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCTTTGCAACTATT
CTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGTTCGTGCTCAA
CAATGCCTAGACAATTTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCTGCCTGGTGCG
GTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAA*CAAAGATTG
TATATGTAGCGCTCTTCGAGCAGCCACCACATTTACCACTACTTGTAACCTCCCCTCTTT
AGATTGTGGTATAACCATATAAGTGC*****CTAGTTCCAGCAACGGTCAGTTCCGAGGA
TTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTAAATAATGA
GAAAATGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTCAATACTTATAACACA
TCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGAGAATATTTT

QA 3 523 3 523
DS 

RD RR2E665JQ 159 0 0
GGTATAACCATATAAGTGC*****CTAGTTCCAGCAACGGTCAGTTCCGAGGATTTGGGG
AGTTTGGTTTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTAAATAATGAGAAAATG
TTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTCA

QA 1 159 1 159
DS 

RD RR2B195TF 523 0 0
GG
ATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCTTTGCAACTATT
CTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGTTCGTGCTCAA
CAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCTGCCTGGTGCG
GTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAA*CAAAGATTG
TATATGTAGCGCTCTTCGAGCAGCCACCACATTTACCACTACTTGTAACCTCCCCTCTTT
AGATTGTGGTATAACCATATAAGTGC*****CTAGTTCCAGCAACGGTCAGTTCCGAGGA
TTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTAAATAATGA
GAAAATGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTCAATACTTATAACACA
TCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGAGAATATTTT

QA 3 523 3 523
DS 

RD RR2E665TF 514 0 0
GGG
AAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCTTTGC
AACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGTTCG
TGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCTGCC
TGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAA*CA
AAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGTTACCACATTTACCACTACTTGTAACCTCT
CCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGC*****CTAGTTCCAGCAACGGTCAGTT
CCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTAA
ATAATGAGAAAATGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTCAATACTTA
TAACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTT

QA 4 514 4 514
DS 

RD RR2EO89JQ 514 0 0
GGG
AAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCTTTGC
AACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGTTCG
TGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCTGCC
TGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAA*CA
AAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGTTACCACATTTACCACTACTTGTAACCTCT
CCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGC*****CTAGTTCCAGCAACGGTCAGTT
CCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTAA
ATAATGAGAAAATGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTCAATACTTA
TAACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTT

QA 4 514 4 514
DS 

RD RR2EO89TF 514 0 0
GGG
AAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCTTTGC
AACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGTTCG
TGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCTGCC
TGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAA*CA
AAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGTTACCACATTTACCACTACTTGTAACCTCT
CCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGC*****CTAGTTCCAGCAACGGTCAGTT
CCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTAA
ATAATGAGAAAATGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTCAATACTTA
TAACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTT

QA 4 514 4 514
DS 

RD RR2F165JQ 513 0 0
GG
AAGTAAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCT
TTGCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATGAGCGCTCTAGAGACCGGAACTATGG
TTCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTC
TGCCTGGTGCAGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTA
A*CAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAAC
CTCCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTC
AGTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATT
TTAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTCGTTTGGTTGGTTCAATA
CTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCAT

QA 3 513 3 513
DS 

RD RR2F165TF 513 0 0
GG
AAGTAAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCT
TTGCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATGAGCGCTCTAGAGACCGGAACTATGG
TTCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTC
TGCCTGGTGCAGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTA
A*CAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAAC
CTCCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTC
AGTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATT
TTAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTCGTTTGGTTGGTTCAATA
CTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCAT

QA 3 513 3 513
DS 

RD RR2EU37TF 511 0 0
GG
AGTAAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCTT
TGCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATGAGCGCTCTAGAGACCGGAACTATGGT
TCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCT
GCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAA
*CAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACC
TCCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCA
GTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTT
TAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTCAATAC
TTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCA

QA 3 511 3 511
DS 

RD RR2AB11JQ 569 0 0
GGGAAAGTAAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAA
TCCTTTGCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATAAGCGCTCTAGAGACCGGAACT
ATGGTTCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTG
GTTCTGCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCA
ACTAA*CAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTG
TAACCTCCCCTCTTTAGGTTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAAC
GGTCAGTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAG
CATTTTAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTC
AATACTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTAAAA
TAATTACATCTTTACAGACGTGCTTTTAT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2E640JQ 546 0 0
G
AAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCTTTGCAA
CTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATGAGCGCTCTAGAGACCGGAACTATGGTTCGTG
CTCAACAATGCCTAGACAATTTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCTGCCTG
GTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAAACAAA
GATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACCTCCCC
TCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCAGTTCC
GAGGATTTGGTGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTAAAT
AATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTCAATACTTATG
ACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTAAAATAATTACATC
TTTAC

QA 2 546 2 546
DS 

RD RR2E640TF 546 0 0
G
AAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCTTTGCAA
CTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATGAGCGCTCTAGAGACCGGAACTATGGTTCGTG
CTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCTGCCTG
GTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAAACAAA
GATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACCTCCCC
TCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCAGTTCC
GAGGATTTGGTGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTAAAT
AATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTCAATACTTATG
ACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTAAAATAATTACATC
TTTAC

QA 2 546 2 546
DS 

RD RR2FI57TF 568 0 0
GGA
AAGTAAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCT
TTGCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATGAGCGCTCTAGAGACCGGAACTATGG
TTCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTC
TGCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTA
A*CAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAAC
CTCCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTC
AGTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATT
TTAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTCAATA
CTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTAAAATAAT
TACATCTTTACAGACGTGCTTTTAT

QA 4 568 4 568
DS 

RD RR2AR50TF 327 0 0
G
CGCTCTCCAAACAACTAA*CAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGT
TTACCACTACTTGTAACCTCCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCC
TAGTTCCAGCAACGGTCAGTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAG
AATAAAATAAAAGCATTTTAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTT
GTTTGGTTGGTTCAATACTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGG
GAATATTTTAAAATAATTACATCTTT

QA 2 327 2 327
DS 

RD RR2AB11TF 569 0 0
GGGA
AAGTAAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCT
TTGCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCCATAAGCGCTCTAGAGACCGGAACTATGG
TTCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTC
TGCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTA
A*CAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAAC
CTCCCCTCTTTAGGTTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTC
AGTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATT
TTAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTAAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGTTCAATA
CTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTAAAATAAT
TACATCTTTACAGACGTGCTTTTAT

QA 5 569 5 569
DS 



AS 1 18

CO CL123Contig1 678 18 18 U
GGATTTCTGCAACTAATTGATAAGGAGGACGAAACAGAAAGAAGGGGAAGGGTGGCGCGA
ATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAACATCATGGCCTTATCTCA
AGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCATCAAGCTAGGAAGAAT
CACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAGATCCACCTTTGCTTC
TGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAGAGTAAGAAGTGGAAA
CAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGAAGGAGGCAGCGGTTT
GGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATTTCTGTTGAGAT
CGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTGCCTACCGTTGC
TTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCATCTTCCAGTCTTCTTC
CAAAAACTGATAAAAGCTCCCCCCCCC*ATCTGTTTTTT*GTCATCTTTTTGTTGTATCT
AAGATTCTTCTCTCATAAAAACTCTACATTCATCCGAATGAAATCCCTCATATTAGTTTT
CTTTTTGCTCCGAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 40 40 45 60 60 60 60 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 50 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 20 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 75 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 50 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 75 75 75 75 75 65 65 65 65 65 50 40 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AI04JQ C 245
AF RR2DZ38TF U 1
AF RR2AG96JQ C 46
AF RR2AG96TF U 46
AF RR2E172JQ C 172
AF RR2CV90TF U 47
AF RR2AI04TF U 52
AF RR2E172TF U 89
AF RR2AT09JQ C 52
AF RR2AT09TF U 52
AF RR2DG54JQ C 50
AF RR2DG54TF U 91
AF RR2C695JQ C 46
AF RR2E315JQ C 133
AF RR2G137TF U 46
AF RR2AA73JQ C 49
AF RR2AA73TF U 49
AF RR2C695TF U 46
BS 1 45 RR2DZ38TF
BS 46 46 RR2AG96TF
BS 47 414 RR2DZ38TF
BS 415 415 RR2AG96TF
BS 416 429 RR2DZ38TF
BS 430 430 RR2AG96TF
BS 431 444 RR2DZ38TF
BS 445 445 RR2AG96TF
BS 446 454 RR2DZ38TF
BS 455 520 RR2AG96TF
BS 521 521 RR2CV90TF
BS 522 544 RR2AG96TF
BS 545 545 RR2CV90TF
BS 546 595 RR2AG96TF
BS 596 596 RR2CV90TF
BS 597 649 RR2AG96TF
BS 650 661 RR2G137TF
BS 662 678 RR2C695TF

RD RR2AI04JQ 114 0 0
TCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAGAGTAAGAAGTGGAAACAGA
GGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAGGCGAGCAAAGTTCAGAAGGAGGCAGCGGT

QA 1 114 1 114
DS 

RD RR2DZ38TF 454 0 0
GGATTTCTGCAACTAATTGATAAGGAGGACGAAACAGAAAGAAGGAGAAGGGTGGCGCGA
ATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAACATCATGGCCTTATCTCA
AGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCATCAAGCTAGGAAGAAT
CACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAGATCCACCTTTGCTTC
TGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAGAGTAAGAAGTGGAAA
CAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGAAGGAGGCAGCGGTTT
GGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATTTCTGT*GAGAT
CGCTACTGG*AAAGGACTTCTTGA*AACTTTGGG

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR2AG96JQ 605 0 0
GGAAGGGTGGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAACAT
CATGGCCTTATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCAT
CAAGCTAGGAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAG
ATCCACCTTTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAG
AGTAAGAAGTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGA
AGGAGGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGC
CATTTCTGTTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCC
ATTGCCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTGTCAT
CTTCCAGTCTTCTTCCAAAGACTGATAAAAGCTCCCCCCCCC*ATCTGTTTTTT*GTCAT
CTTTTTGTTGCATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAAACTCTACATTCATCCGAATGAAATC
CCTC
G

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2AG96TF 605 0 0
GGAAGGGTGGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAACAT
CATGGCCTTATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCAT
CAAGCTAGGAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAG
ATCCACCTTTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAG
AGTAAGAAGTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGA
AGGAGGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGC
CATTTCTGTTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCC
ATTGCCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTGTCAT
CTTCCAGTCTTCTTCCAAAGACTGATAAAAGCTCCCCCCCCC*ATCTGTTTTTT*GTCAT
CTTTTTGTTGCATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAAACTCTACATTCATCCGAATGAAATC
CCTC
G

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2E172JQ 483 0 0
AGGAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAGATCCAC
CTTTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAACGACTCGTGGAAGAGTAAG
AAGTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGAAGGAGG
CAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATTTC
TGTTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTGCC
TACCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCATCTTCCA
GTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCCCCCCCC**ATCTGTTTTTT*GTCATCTTTTT
GTTGTATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAAACTCTACATTCATCCGAATGAAATCCCTCAT
ATT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR2CV90TF 575 0 0
GG
AGGGTGGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAACATCAT
GGCCTTATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCATCAA
GCTAGGAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAGATC
CACCTTTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAGAGT
AAGAAGTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAGCGATCAAAGTTCAGAAGG
AGGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCAT
TTCTGTTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATT
GCCCACCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCATCTT
CCAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCCCCCCCCC*ATCTGTTTTTT*GTCATCTT
TTTGTTGTATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAAA

QA 3 575 3 575
DS 

RD RR2AI04TF 610 0 0
GG
GGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAACATCATGGCCT
TATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCATCAAGCTAG
GAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAGATCCACCT
TTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAGAGTAAGAA
GTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAGGCGAGCAAAGTTCAGAAGGAGGCA
GCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATTTCTG
TTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTGCCTA
CCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCATCTTCCAGT
CTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCCCCCCCC**ATCTGTTTTTT*GTCATCTTTTTGT
TGTATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAACCTCTACATTCATCCGAATGAAATCCCTCATAT
TAGTTT
CC

QA 3 608 3 608
DS 

RD RR2E172TF 566 0 0
TGCAATAGAAGGAACATCATGGCCTTATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTCTT
TCCAATCCTGGAGCCATCAAGCTAGGAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCT
CAACTTGCTGGAAGCAGATCCACCTTTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTG
AAAACGACTCGTGGAAGAGTAAGAAGTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGA
AGCGAGCAAAGTTCAGAAGGAGGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATG
ATTGGTTTTGCTGTCGCCATTTCTGTTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAAC
TTTGGGGTAGCAAGTCCATTGCCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTT
CTGACTGCGGTTTTCATCTTCCAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCCCCCCCC**
ATCTGTTTTTT*GTCATCTTTTTGTTGTATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAAACTCTACA
TTCATCCGAATGAAATCCCTCATATT

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2AT09JQ 610 0 0
GG
GGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAACATCATGGCCT
TATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCATCAAGCTAG
GAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAGATCCACCT
TTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAGAGTAAGAA
GTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAGGCGAGCAAAGTTCAGAAGGAGGCA
GCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATTTCTG
TTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTGCCTA
CCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCATCTTCCAGT
CTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCCCCCCCC**ATCTGTTTTTT*GTCATCTTTTTGT
TGTATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAACCTCTACATTCATCCGAATGAAATCCCTCATAT
TAGTTT
CC

QA 3 608 3 608
DS 

RD RR2AT09TF 610 0 0
GG
GGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAACATCATGGCCT
TATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCATCAAGCTAG
GAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAGATCCACCT
TTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAGAGTAAGAA
GTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAGGCGAGCAAAGTTCAGAAGGAGGCA
GCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATTTCTG
TTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTGCCTA
CCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCATCTTCCAGT
CTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCCCCCCCC**ATCTGTTTTTT*GTCATCTTTTTGT
TGTATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAACCTCTACATTCATCCGAATGAAATCCCTCATAT
TAGTTT
CC

QA 3 608 3 608
DS 

RD RR2DG54JQ 611 0 0
GGGTGGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAACATCATG
GCCTTATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCATCAAG
CTAGGAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAGATCC
ACCTTTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAGAGTA
AGAAGTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGAAGGA
GGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATT
TCTGTTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTG
CCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCATCTTC
CAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCCCCCCCCC*ATCTGTTTTTT*GTCATCTTT
TTGTTGTATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAAACTCTACATTCATCCGAATGAAATCCCTC
ATATTAGTTTT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2DG54TF 570 0 0
CAATAGAAGGAACATCATGGCCTTATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTCTTTC
CAATCCTGGAGCCATCAAGCTAGGAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCA
ACTTGCTGGAAGCAGATCCACCTTTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAA
AATGACTCGTGGAAGAGTAAGAAGTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAG
CGAGCAAAGTTCAGAAGGAGGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGAT
TGGTTTTGCTGTCGCCATTTCTGTTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTT
TGGGGTAGCAAGTCCATTGCCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCT
GACTGCGGTTTTCATCTTCCAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCCCCCCCCC*AT
CTGTTTTTT*GTCATCTTTTTGTTGTATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAAACTCTACATT
CATCCGAATGAAATCCCTCATATTAGTTTT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2C695JQ 627 0 0
GGAAGGGTGGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAACAT
CATGGCCTTATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCAT
CAAGCTAGGAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAG
ATCCACCTTTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAG
AGTAAGA*GTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGA
AGGAGGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGC
CATTTCTGTTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCC
ATTGCCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCAT
CTTCCAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCCCCCCCCC*ATCTGTTTTTC*GTCAT
CTTTTTGTTGTATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAAACTCTACATTCATCCGAATGAAATC
CCTCATATTAGTTTTCTTTTTGCTCCG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2E315JQ 540 0 0
TCTAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCATCAAGCTAGGAAGAATCACAAACCCTTG
TAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAGATCCACCTTTGCTTCTGGTTCTCCTCT
CTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTAGAAGAGTAAGAAGTGGAAACAGAGGAGGAGC
TTCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGAAGGAGGCAGCGGTTTGGACATATGGCT
TGGTCGTGGCGCCATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATTTCTGTTGAGATCGCTACTGGTAA
AGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTGCCTACCGTTGCTTTGGCTGTTAC
AGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCATCTTCCAGTCTTCTTCCAAAAACTGATA
AAAGCTCCCCCCCC**ATCTGTTTTTTTGTCATCTTTTTGTTGTATTTAAGATTCTTCTC
TCATAAAAACTCTACATTCATCCGAATGAAATCCCTCATATTAGTTTTCTTTTTGCTCCG

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2G137TF 616 0 0
GGAAGGGTGGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAACAT
CATGGCCTTATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCAT
CAAGCTAGGAAGAATCACAAACC*TTGTAGGGTTCATGTATCTCAACTTGCTGGAAGCAG
ATCCACCTTTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAG
AGTAAGAAGTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGA
AGGAGGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGC
CATTTCTGTTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCC
ATTGCCTACCGTTGCTTTGACTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCAT
CTTCCAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCCCCCCCCCCATCTGTTTTTT*GTCAT
CTTTTTGTTGTATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAAACTCTACATTCATCCGAATGAAATC
CCTCATATTAGTTTTC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2AA73JQ 613 0 0
G
GGGTGGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAACATCATG
GCCTTATCTCAAGTATCTGCGTCTCCAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCATCAAG
CTAGGAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAGATCC
ACCTTTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAGAGTA
AGAAGTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGAAGGA
GGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATT
TCTGTTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTG
CCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCATCTTC
CAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCCCCCCCCC*ATCTGTTTTTT*GTCATCTTT
TTGTTGTATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAAACTCTACATTCATCCGAATGAAATCCCTC
ATATTAGTTTTC

QA 2 613 2 613
DS 

RD RR2AA73TF 613 0 0
G
GGGTGGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAACATCATG
GCCTTATCTCAAGTATCTGCGTCTCCAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCATCAAG
CTAGGAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAGATCC
ACCTTTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAGAGTA
AGAAGTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGAAGGA
GGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATT
TCTGTTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTG
CCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCATCTTC
CAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCCCCCCCCC*ATCTGTTTTTT*GTCATCTTT
TTGTTGTATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAAACTCTACATTCATCCGAATGAAATCCCTC
ATATTAGTTTTC

QA 2 613 2 613
DS 

RD RR2C695TF 633 0 0
GGAAGGGTGGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTCTGCAATAGAAGGAACAT
CATGGCCTTATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTCTTTCCAATCCTGGAGCCAT
CAAGCTAGGAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTCATGTACCTCAACTTGCTGGAAGCAG
ATCCACCTTTGCTTCTGGTTCTCCTCTCTTGCCGTTGAACTTGAAAATGACTCGTGGAAG
AGTAAGA*GTGGAAACAGAGGAGGAGCTTCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGA
AGGAGGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGC
CATTTCTGTTGAGATCGCTACTGGTAAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCC
ATTGCCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGGTTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCAT
CTTCCAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCCCCCCCCC*ATCTGTTTTTC*GTCAT
CTTTTTGTTGTATCTAAGATTCTTCTCTCATAAAAACTCTACATTCATCCGAATGAAATC
CCTCATATTAGTTTTCTTTTTGCTCCGAAAAAA

QA 1 633 1 633
DS 



AS 3 19

CO CL124Contig1 675 2 4 U
GGAGAGCAGCAAAAACTTAAAACCAACCAATCAATCAATAAAAAATGTTGCGCATTATCT
TCCTCTTATCTCTCCTCTTTGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTAACCA
ACCTGAAACGCGCCGAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCCATCCACGTCAAAG
CCTCGGACTTCGTCTTCAGCTTAGGCACTCCTGGTAACACCACCAACATCATCAGCGCTG
CGGTCACGCCAGGCTTCGTCGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGG
CTAGGCTTGACCTAGCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTG
AGGTTCTCTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTG
TCTACGTGCAGACGCTGAAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATT
TCCAGATCAATGCGGGCAAAACAGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAGTC
CTGGTCTCCAGATTCTTGACTTTGCCCTATTCGCCAACACTCTTTCCACTGAACTCGTCT
CGGCTACTACTTTCCTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAAGGGTGTTCTTGGTGGA
ACTGGCTAAAGGACT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2AG94TF U 1
AF RR2BD83TF U 5
BS 1 586 RR2AG94TF
BS 587 587 RR2BD83TF
BS 588 674 RR2AG94TF
BS 675 675 RR2BD83TF

RD RR2AG94TF 674 0 0
GGAGAGCAGCAAAAACTTAAAACCAACCAATCAATCAATAAAAAATGTTGCGCATTATCT
TCCTCTTATCTCTCCTCTTTGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTAACCA
ACCTGAAACGCGCCGAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCCATCCACGTCAAAG
CCTCGGACTTCGTCTTCAGCTTAGGCACTCCTGGTAACACCACCAACATCATCAGCGCTG
CGGTCACGCCAGGCTTCGTCGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGG
CTAGGCTTGACCTAGCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTG
AGGTTCTCTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTG
TCTACGTGCAGACGCTGAAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATT
TCCAGATCAATGCGGGCAAAACAGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAGTC
CTGGTCTCCAGATTCTTGACTTTGCCCTATTCGCCAACACTCTTTCTACTGAACTCGTCT
CGGCTACTACTTTCCTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAAGGGTGTTCTTGGTGGA
ACTGGCTAAAGGAC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2BD83TF 671 0 0
G
GCAGCAAAAACTTAAAACCAACCAATCAATCAATAAAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTC
TTATCTCTCCTCTTTGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTAGCCAACCTG
AAACGCGCCGAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCCATCCACGTCAAAGCCTCG
GACTTCGTCTTCAGCTTAGGCACTCCTGGTAACACCACCAACATCATCAGCGCTGCGGTC
ACGCCAGGCTTCGTCGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGGCTAGG
CTTGACCTAGCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTT
CTCTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTGTCTAC
GTGCAGACGCTGAAACCGGTACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAG
ATCAATGCGGGCAAAACAGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAGTCCTGGT
CTCCAGATTCTTGACTTTGCCCTATTCGCCAACACTCTTTCCACTGAACTCGTCTCGGCT
ACTACTTTCCTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAA*GGGTGTTCTTGGTGGAACTGG
CTAAAGGACT

QA 2 671 2 671
DS 



CO CL124Contig2 835 12 15 U
AGGGAGAGCAGCAAAAACTTAAAACCAACCAATCAAACAATAAAAAATGTTGCGCATTAT
CTTCCTCTTATCTCTCCTCTTTGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTTGC
CAACCTGAAACGCGCCGAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCTATCCACGTCAA
AGCCTCGGACTTCGTCTTCAGCTTAGGCACTCCTGGTAACACCACAAACATCATCAGCGC
CGCGGTCACGCCGGGCTTCGTCGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCAC
GGCTAGGCTTGACCTAGCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTC
TGAGGTTCTCTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTC
TGTCTACGTGCAGACGCTGAAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCA
TTTCCAGATCAATGCCGGCAAAACCGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAG
TCCTGGTCTCCAGATTCTTGACTTCGCGCTTTTCGCCAACAGCCTTTCCACTGAACTCGT
CTCGGCTACTACTTTCCTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTCTTGGTGG
AACTGGCTAAAGGACTTAGGAACAACAACGCCTGTTTGTTTTTTCTTCTCTTTCTTTGAT
GGATTCTTCTTGTCTTTGTCTGTTTTGTAATTCTTCAAAAAAACCTGTCAACATGGTTAC
ATTGTAATGTGAGCTTTTCATTTCATATCCTTAAAGTTGGTAGACCGTTTATATT


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 0 0 45 45 0 0 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 5 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 50 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 55 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 40 70 45 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 10 70 55 70 70 55 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 
50 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 
60 60 60 60 60 60 60 55 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 20 40 40 40 20 20 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B417JQ C 19
AF RR2CE74TF U 3
AF RR2BS60TF U 1
AF RR2D716TF U 2
AF RR2E942TF U 3
AF RR2H733TF U 4
AF RR2B417TF U 4
AF RR2BS60JQ C 47
AF RR2BD83JQ C 77
AF RR2AG94JQ C 263
AF RR2E942JQ C 129
AF RR2D716JQ C 80
BS 1 37 RR2BS60TF
BS 38 38 RR2B417TF
BS 39 40 RR2BS60TF
BS 41 42 RR2B417TF
BS 43 295 RR2BS60TF
BS 296 296 RR2D716TF
BS 297 675 RR2BS60TF
BS 676 707 RR2B417TF
BS 708 708 RR2BS60JQ
BS 709 711 RR2B417TF
BS 712 713 RR2BS60JQ
BS 714 762 RR2B417TF
BS 763 763 RR2BS60JQ
BS 764 819 RR2B417TF
BS 820 835 RR2BS60JQ

RD RR2B417JQ 581 0 0
CTT
AAACCAACCAACCAATCAATAAAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTATCTCTCCTCTT
TGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTGGCCAACCTGAAACGCGCTGAGAC
CCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCCATCCATGTCAAAGCCTCGGACTTCGTCTTCAG
CTTAGGCACTCCTGGCAACACCACCAACATCATCAGCGCCGCGGTCACGCCGGGCTTCGT
CGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGGCTAGGCTTGACCTAGCACC
CAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTTTGAGGTTCTTTTCGTCCTCGA
CGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTGTTTACGTGCAGACGCTGAA
ACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAGATCAATGCCGGCAA
AACAGCTGCTGCTGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAGTCCTGGTCTCCAGATTCTTGA
CTTCACGCTTTTCGCCAACAGTCTTTCCACTGAACTCG

QA 4 581 4 581
DS 

RD RR2CE74TF 657 0 0
GGAGAGCAGCAAAAACTTAAAACCAACCAATCAAATAA**AAAAATGTTGCGCATTATCT
TCCTCTTATCTCTCCTCTTTGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTTGCCA
ACCTGAAACGCGCCGAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCTATCCACGTCAAAG
CCTCGGACTTCGTCTTCAGCTTAGGCACTCCTGGTAACACCGCAAACATCATCAGCGCCG
CGGTCACGCCGGGCTTCGTCGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGG
CTAGGCTTGACCTAGCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTG
AGGTTCTCTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTG
TCTACGTGCAGACGCTGAAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATT
TCCAGATCAATGCCGGCAAAACCGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAGTC
CTGGTCTCCAGATTCTTGACTTCGCGCTTTTCGCCAACAGCCTTTCCACTGAACTCGTCT
CGGCTACTACTTTCCTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGG*TGTTCTTGGTG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2BS60TF 675 0 0
AGGGAGAGCAGCAAAAACTTAAAACCAACCAATCAAATAA**AAAAATGTTGCGCATTAT
CTTCCTCTTATCTCTCCTCTTTGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTTGC
CAACCTGAAACGCGCCGAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCTATCCACGTCAA
AGCCTCGGACTTCGTCTTCAGCTTAGGCACTCCTGGTAACACCACAAACATCATCAGCGC
CGCGGTCACGCCGGGCTTCGTCGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCATCGCCAC
GGCTAGGCTTGACCTAGCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTC
TGAGGTTCTCTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTC
TGTCTACGTGCAGACGCTGAAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCA
TTTCCAGATCAATGCCGGCAAAACCGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAG
TCCTGGTCTCCAGATTCTTGACTTCGCGCTTTTCGCCAACAGCCTTTCCACTGAACTCGT
CTCGGCTACTACTTTCCTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTCTTGGTGG
AACTGGCTAAAGGAC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2D716TF 674 0 0
G
GGAGAGCAGCAAAAACTTAAAACCAACCAATCAAATAA**AAAAATGTTGCGCATTATCT
TCCTCTTATCTCTCCTCTTTGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTTGCCA
ACCTGAAACGCGCCGAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCTATCCACGTCAAAG
CCTCGGACTTCGTCTTCAGCTTAGGCACTCCTGGTAACACCACAAACATCATCAGCGCCG
CGGTCACGCCGGGCTTCGTCGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGG
CTAGGCTTGACCTAGCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTG
AGGTTCTCTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTG
TCTACGTGCAGACGCTGAAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATT
TCCAGATCAATGCCGGCAAAACCGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAGTC
CTGGTCTCCAGATTCTTGACTTCGCGCTTTTCGCCAACAGCCTTTCCACTGAACTCGTCT
CGGCTACTACTTTCCTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTCTTGGTGGAA
CTGGCTAAAGGAC

QA 2 674 2 674
DS 

RD RR2E942TF 666 0 0
GGAGAGCAGCAAAAACTTAAAACCAACCAATCAAATAA**AAAAATGTTGCGCATTATCT
TCCTCTTATCTCTCCTCTT*GCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTTGCCA
ACCTGAAACGCGCCGAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCTATCCACGTCAAAG
CCTCGGACTTCGTCTTCAGCTTAGGCACTCCTGGTAACACCACAAACATCATCAGCGCCG
CGGTCACGCCGGGCTTCGTCGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGG
CTAGGCTTGACCTAGCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTG
AGGTTCTCTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTG
TCTACGTGCAGACGCTGAAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATT
TCCAGATCAATGCCGGCAAAACCGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAGTC
CTGGTCTCCAGATTCTTGACTTCGCGCTTTTCGCCAACAGCCTTTCCACTGAACTCGTCT
CGGCTACTACTTTCCTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTCTTGGTGGAA
CTGGCT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2H733TF 664 0 0
GGAGAGCAAAAAAAACTT
AAACCAACCAATCAATCAATAAAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTATCTCTCCTCTT
TGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTGGCCAACCTGAAACGCGCTGAGAC
CCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCCATCCATGTCAAAGCCTCGGACTTCGTCTTCAG
CTTAGGCACTCCTGGCAACACCACCAACATCATCAGCGCCGCGGTCACGCCGGGCTTCGT
CGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCGTCTCCACGGCTAGGCTTGACCTAGCACC
CAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTCTTCGTCCTCGA
CGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTGTCTACGTGCAGACGCTGAA
ACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAGATCAATGCCGGCAA
AACAGCTGCTGCTGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAGTCCTGGTCTCCAGATTCTTGA
CTTCGCGCTTTTCGCCAACAGTCCTTCCACTGAACTCGTCTCTGCTACTACTTTCCTTGA
GCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGG*TGTTCTTGGTGGAACTGGC

QA 19 664 19 664
DS 

RD RR2B417TF 816 0 0
GGAGAGCAAAAAAAACTT
AAACCAACCAACCAATCAATAAAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTATCTCTCCTCTT
TGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTGGCCAACCTGAAACGCGCTGAGAC
CCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCCATCCATGTCAAAGCCTCGGACTTCGTCTTCAG
CTTAGGCACTCCTGGCAACACCACCAACATCATCAGCGCCGCGGTCACGCCGGGCTTCGT
CGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGGCTAGGCTTGACCTAGCACC
CAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTCTTCGTCCTCGA
CGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTGTCTACGTGCAGACGCTGAA
ACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAGATCAATGCCGGCAA
AACAGCTGCTGCTGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAGTCCTGGTCTCCAGATTCTTGA
CTTCACGCTTTTCGCCAACAGTCTTTCCACTGAACTCGTCTCTGCTACTACTTTCCTTGA
GCCCAAAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTCTTGGTGGAACTGGCTAAAGGACTTAGGA
ACAACAACGCCTGTTTGTTTTTTCTTTTCT**CTTTGATGGATTCTTCTTGTCTTTGTCT
GTTTTGTAATTCTTCAAAAAA*CCTGTCAACATGGTTACATTGTAATGTGAGCTTTTCAT
TTCATATCCTTAAAGTTG

QA 19 816 19 816
DS 

RD RR2BS60JQ 789 0 0
ATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTATCTCTCCTCTTTGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAA
GACTTCTGCGTTGCCAACCTGAAACGCGCCGAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGC
CCTATCCACGTCAAAGCCTCGGACTTCGTCTTCAGCTTAGGCACTCCTGGTAACACCACA
AACATCATCAGCGCCGCGGTCACGCCGGGCTTCGTCGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGT
CTAGGCATCTCCACGGCTAGGCTTGACCTAGCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACT
CACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTCTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATC
TCCTCCGCCAACTCTGTCTACGTGCAGACGCTGAAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCG
CAGGGCTTGCTTCATTTCCAGATCAATGCCGGCAAAACCGCTGCTGCAGCGTTTGTCACT
TTCAGCAGCGCGAGTCCTGGTCTCCAGATTCTTGACTTCGCGCTTTTCGCCAACAGCCTT
TCCACTGAACTCGTCTCGGCTACTACTTTCCTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAG
GGTGTTCTTGGTGGAACTGGCTAAAGGACTTAGGAACAACAACGCCTGTTTGTTTTTTCT
TCTCTTTCTTTGATGGATTCTTCTTGTCTTTGTCTGTCTTGTAATTCTTCAAAAAAACCT
GTCAACATGGTTACATTGTAATGTGAGCTTTTCATTTCATATCCT*AAAGTTGGTAGACC
GTTTATATT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2BD83JQ 737 0 0
CTCTTTGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTAGCCAACCTGAAACGCGCC
GAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCCATCCACGTCAAAGCCTCGGACTTCGTC
TTCAGCTTAGGCACTCCTGGTAACACCACCAACATCATCAGCGCTGCGGTCACGCCAGGC
TTCGTCGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGGCTAGGCTTGACCTA
GCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTCTTCGTC
CTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTGTCTACGTGCAGACG
CTGAAACCGGTACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAGATCAATGCG
GGCAAAACAGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAGTCCTGGTCTCCAGATT
CTTGACTTTGCCCTATTCGCCAACACTCTTTCCACTGAACTCGTCTCGGCTACTACTTTC
CTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTCTTGGTGGAACTGGCTAAAGGACT
TAGGAACAACAACACCTGTTTGTTTTTTCTTCTCTTTCTTTGATGGATTCTGCTTGTCTT
TGTCTGTTTTGTAATTCTTCAAAAAAACCTGTCAACATGGTTACATTGTAATGTGAGCTT
TTCATTTCATATC
AAAG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2AG94JQ 523 0 0
GCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGGCTAGGCTTGACCTAGCACCC
AAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTCGTCCTCGAC
GGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTGTCTACGTGCAGACGCTGAAA
CCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAGATCAATGCGGGCAAA
ACAGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAGTCCTGGTCTCCAGATTCTTGAC
TTTGCCCTATTCGCCAACACTCTTTTTACTGAACTCGTTTCGGCTACTACTTTCCTTGAG
CCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTCTTGGTGGAACTGGCTAAAGGACTTAGGAA
CAACAACGCCTGTTTGTTTTTTCTTCTCTTTCTTTGATGGATTCTTCTTGTCTTTGTCTG
TTTTGTAATTCTTCAAAAAAACCTGTCAACATGGTTACATTG
C

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2E942JQ 681 0 0
AACGCGCCGAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCTATCCACGTCAAAGCCTCGG
ACTTCGTCTTCAGCTTAGGCACTCCTGGTAACACCACAAACATCATCAGCGCCGCGGTCA
CGCCGGGCTTCGTCGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGGCTAGGC
TTGACCTAGCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTC
TCTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTGTCTACG
TGCAGACGCTGAAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAGA
TCAATGCCGGCAAAACCGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAGTCCTGGTC
TCCAGATTCTTGACTTCGCGCTTTTCGCCAACAGCCTTTCCACTGAACTCGTCTCGGCTA
CTACTTTCCTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTCTTGGTGGAACTGGCT
AAAGGACTTAGGAACAACAACGCCTGTTTGTTTTTTCTTCTCTTTCTTTGATGGATTCTT
CTTGTCTTTGTCTGTCTTGTAATTCTTCAAAAAAACCTGTCAACATGGTTACATTGTAAT
GTGAGCTTTTCATTTCATATC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2D716JQ 731 0 0
TTTGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTTGCCAACCTGAAACGCGCCGAG
ACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCTATCCACGTCAAAGCCTCGGACTTCGTCTTC
AGCTTAGGCACTCCTGGTAACACCACAAACATCATCAGCGCCGCGGTCACGCCGGGCTTC
GTCGCTCAGTTCCCAGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGGCTAGGCTTGACCTAGCA
CCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTCTTCGTCCTC
GACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTGTCTACGTGCAGACGCTG
AAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAGATCAATGCCGGC
AAAACCGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCGAGTCCTGGTCTCCAGATTCTT
GACTTCGCGCTTTTCGCCAACAGCCTTTCCACTGAACTCGTCTCGGCTACTACTTTCCTT
GAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTCTTGGTGGAACTGGCTAAAGGACTTAG
GAACAACAACGCCTGTTTGTTTTT*CTTCTCTTTCTTTGATGGATTCTTCTTGTCTTTGT
CTGTCTTGTAATTCTTCAAAAAAACCTGTCAACATGGTTACATTGTAATGTGAGCTTTTC
ATTTCATATCC

QA 1 731 1 731
DS 



CO CL124Contig3 697 5 2 U
AGCAAGTAATAATAATATAAACGGTCTGACCAACTTTAAGGATATGAAATGAAAAGCTCA
CATTACAATGTAACCATGTTGACAGGTTTTTTTGAAGAATTACAAAACAGACAAAGACAA
GAAGAATCCATCAAAGAAAGAGAAGAAAAAACAAACAGGCGTTGTTGTTCCTAAGTCCTT
TAGCCAGTTCCACCAAGAACACCCTTAAGCGTCTTGATTACTTTAGGCTCAAGGAAAGTA
GTAGCCGAGACGAGTTCAGTGGAAAGAGTGTTGGCGAATAGGGCAAAGTCAAGAATCTGG
AGACCAGGACTCGCGCTGCTGAAAGTGACAAACGCTGCAGCAGCTGTTTTGCCCGCATTG
ATCTGGAAATGAAGCAAGCCCTGCGGGAACACCATGACCTGTCCCGGTTTCAGCGTCTGC
ACGTAGACAGAGTTGGCGGAGGAGATGAACCCGGCGGTGATTGAGCCGTCGAGGACGAAG
AGAACCTCAGAGGCACCAGGGTGAGTGTGCATTGGGATCACACCTTTGGGTGCTAGGTCA
AGCCTAGCCGTGGAGATGCCTAGACCGTTGAGAGCTGGGAAGCGACTCCACTTCGGCTGG
CCGGACTTTCGTGCATATGGAAACTTTGGCCTTGCCGCGGAGTAGAGACTATGTGGCACG
TGAGCCATCTTTTATTTTTCTAGCATTTTTCAGAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H733JQB U 9
AF RR2GV27JQB U 1
AF RR2GV27TF C 1
AF RR2G676JQ U 14
AF RR2G676TF C 14
BS 1 360 RR2GV27JQB
BS 361 697 RR2G676JQ

RD RR2H733JQB 260 0 0
GTAAT
AATATAAACGGTTTAACCAACTTTAAGGATATGAAATGAAAAGCTCACATTACAATGTAA
CCATGTTGACAGGTTTTTT*GAAGAATTACAAAACAGACAAAGACAAGAAGAATCCATCA
AAGA**GAAAAGAAAAAACAAACAGGCGTTGTTGTTCCTAAGTCCTTTAGCCAGTTCCAC
CAAGAACACCCTTAAGCGTCTTGATTACTTTAGGCTCAAGGAAAGTAGTAGCAGAGACGA
GTTCAGTGGAA
GGAC

QA 6 256 6 256
DS 

RD RR2GV27JQB 361 0 0
AGCAAGTAATAATAATATAAACGGTCTGACCAACTTTAAGGATATGAAATGAAAAGCTCA
CATTACAATGTAACCATGTTGACAGGTTTTTTTGAAGAATTACAAAACAGACAAAGACAA
GAAGAATCCATCAAAGAAAGAGAAGAAAAAACAAACAGGCGTTGTTGTTCCTAAGTCCTT
TAGCCAGTTCCACCAAGAACACCCTTAAGCGTCTTGATTACTTTAGGCTCAAGGAAAGTA
GTAGCCGAGACGAGTTCAGTGGAAAGAGTGTTGGCGAATAGGGCAAAGTCAAGAATCTGG
AGACCAGGACTCGCGCTGCTGAAAGTGACAAACGCTGCAGCAGCTGTTTTGCCCGCATTG
C

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR2GV27TF 361 0 0
AGCAAGTAATAATAATATAAACGGTCTGACCAACTTTAAGGATATGAAATGAAAAGCTCA
CATTACAATGTAACCATGTTGACAGGTTTTTTTGAAGAATTACAAAACAGACAAAGACAA
GAAGAATCCATCAAAGAAAGAGAAGAAAAAACAAACAGGCGTTGTTGTTCCTAAGTCCTT
TAGCCAGTTCCACCAAGAACACCCTTAAGCGTCTTGATTACTTTAGGCTCAAGGAAAGTA
GTAGCCGAGACGAGTTCAGTGGAAAGAGTGTTGGCGAATAGGGCAAAGTCAAGAATCTGG
AGACCAGGACTCGCGCTGCTGAAAGTGACAAACGCTGCAGCAGCTGTTTTGCCCGCATTG
C

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR2G676JQ 684 0 0
AATATAAACGGTCTGACCAACTTTAAGGATATGAAATGAAAAGCTCACATTACAATGTAA
CCATGTTGACAGGTTTTTTTGAAGAATTACAAAACAGACAAAGACAAGAAGAATCCATCA
AAGAAAGAGAAGAAAAAACAAACAGGCGTTGTTGTTCCTAAGTCCTTTAGCCAGTTCCAC
CAAGAACACCCTTAAGCGTCTTGATTACTTTAGGCTCAAGGAAAGTAGTAGCCGAGACGA
GTTCAGTGGAAAGAGTGTTGGCGAATAGGGCAAAGTCAAGAATCTGGAGACCAGGACTCG
CGCTGCTGAAAGTGACAAACGCTGCAGCAGCTGTTTTGCCCGCATTGATCTGGAAATGAA
GCAAGCCCTGCGGGAACACCATGACCTGTCCCGGTTTCAGCGTCTGCACGTAGACAGAGT
TGGCGGAGGAGATGAACCCGGCGGTGATTGAGCCGTCGAGGACGAAGAGAACCTCAGAGG
CACCAGGGTGAGTGTGCATTGGGATCACACCTTTGGGTGCTAGGTCAAGCCTAGCCGTGG
AGATGCCTAGACCGTTGAGAGCTGGGAAGCGACTCCACTTCGGCTGGCCGGACTTTCGTG
CATATGGAAACTTTGGCCTTGCCGCGGAGTAGAGACTATGTGGCACGTGAGCCATCTTTT
ATTTTTCTAGCATTTTTCAGAACC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2G676TF 684 0 0
AATATAAACGGTCTGACCAACTTTAAGGATATGAAATGAAAAGCTCACATTACAATGTAA
CCATGTTGACAGGTTTTTTTGAAGAATTACAAAACAGACAAAGACAAGAAGAATCCATCA
AAGAAAGAGAAGAAAAAACAAACAGGCGTTGTTGTTCCTAAGTCCTTTAGCCAGTTCCAC
CAAGAACACCCTTAAGCGTCTTGATTACTTTAGGCTCAAGGAAAGTAGTAGCCGAGACGA
GTTCAGTGGAAAGAGTGTTGGCGAATAGGGCAAAGTCAAGAATCTGGAGACCAGGACTCG
CGCTGCTGAAAGTGACAAACGCTGCAGCAGCTGTTTTGCCCGCATTGATCTGGAAATGAA
GCAAGCCCTGCGGGAACACCATGACCTGTCCCGGTTTCAGCGTCTGCACGTAGACAGAGT
TGGCGGAGGAGATGAACCCGGCGGTGATTGAGCCGTCGAGGACGAAGAGAACCTCAGAGG
CACCAGGGTGAGTGTGCATTGGGATCACACCTTTGGGTGCTAGGTCAAGCCTAGCCGTGG
AGATGCCTAGACCGTTGAGAGCTGGGAAGCGACTCCACTTCGGCTGGCCGGACTTTCGTG
CATATGGAAACTTTGGCCTTGCCGCGGAGTAGAGACTATGTGGCACGTGAGCCATCTTTT
ATTTTTCTAGCATTTTTCAGAACC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 2 17

CO CL125Contig1 825 10 18 U
GGATCGCTCCAAATAAATAAAATAAAAAGAGTAGAAGATGGCTCTCGAAGTCTGCGTGAA
AGCCGCCGTTGGTGCCCCTGATGTTCTCGGCGACTGCCCTTTCAGCCAACGGGTTCTTCT
CACCCTCGAGGAGAAGCATCTGCCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGCCAAACC
TCAATGGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGGAAAGTACCAGTCCTTAAGAACGACGACAA
GTGGGTGCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCCGACCCATC
TCTCAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATCTTCGGCACTTTCGTCAC
TTTCTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGA
AGCTCTCGAGAATCACCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGTGGGAAAGCCAC
AGCGGTGGATCTTAGCTTAGCACCGAAGCTTTACCATCTCAAGGTCGCTCTTGGACACTA
CAAAAGCTGGTCTGTCCCGGAGAGCTTGCCACATGTTCATGGCTACATGAAAGCTTTGTT
CTCTCTTGACTCGTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCAGGATGGGA
ACACAAGGTCAACCCTTGAAAACTACTACTAGTTGTTCCATCTGTTGTTGTGTGATGATG
ATGTGGTTCAAGGTCTATCCTCTCTTATCAGTAAAATAATGTTCTTGGACCTGTTTATGT
TGTTGTTATTGTGTATCAGATCAAATAATAAGGATCGTTTGAATT


BQ
20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 25 10 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 0 50 50 0 50 50 
50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 25 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 40 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 10 

AF RR2D150TF U 1
AF RR2CH16TF U 1
AF RR2AQ59TF U 2
AF RR2FO25TF U 1
AF RR2EL74TF U 155
AF RR2CH16JQ C 103
AF RR2AQ59JQ C 114
AF RR2D150JQ C 304
AF RR2GU89TF U 245
AF RR2DC69JQ C 282
BS 1 291 RR2CH16TF
BS 292 292 RR2FO25TF
BS 293 297 RR2CH16TF
BS 298 298 RR2FO25TF
BS 299 652 RR2CH16TF
BS 653 653 RR2AQ59TF
BS 654 654 RR2CH16TF
BS 655 663 RR2AQ59TF
BS 664 666 RR2FO25TF
BS 667 667 RR2EL74TF
BS 668 681 RR2FO25TF
BS 682 682 RR2EL74TF
BS 683 732 RR2FO25TF
BS 733 733 RR2EL74TF
BS 734 768 RR2FO25TF
BS 769 769 RR2EL74TF
BS 770 824 RR2GU89TF
BS 825 825 RR2AQ59JQ

RD RR2D150TF 266 0 0
GGATCGCTCCAAATAAATAAAGTAAAAAGAGTAGAAGATGGCTCTCGAAGTCTGCGTGAA
AGCCGCCGTTGGTGCCCCTGATGTTCTCGGCGACTGCCCTTTCAGCCAACGGGTTCTTCT
CACCCTCGAGGAGAAGCATCTGCCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGCCAAACC
TCAATGGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGGAAAGTACCAGTCCTTAAGAACGACGACAA
GTGGGTGCCTGATTCCGACGTCATCA

QA 1 266 1 266
DS 

RD RR2CH16TF 654 0 0
GGATCGCTCCAAATAAATAAAATAAAAAGAGTAGAAGATGGCTCTCGAAGTCTGCGTGAA
AGCCGCCGTTGGTGCCCCTGATGTTCTCGGCGACTGCCCTTTCAGCCAACGGGTTCTTCT
CACCCTCGAGGAGAAGCATCTGCCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGCCAAACC
TCAATGGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGGAAAGTACCAGTCCTTAAGAACGACGACAA
GTGGGTGCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCTGACCCCTC
TCTCAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATCTTCGGCACTTTCGTCAC
TTTCTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGA
AGCTCTCGAGAATCACCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGTGGGAAAGCCAC
AGCGGTGGATCTTAGCTTAGCACCGAAGCTTTACCATCTCAAGGTCGCTCTTGGACACTA
CAAAAGCTGGTCTGTCCCGGAGAGCTTGCCACATGTTCATGGCTACATGAAAGCTTTGTT
CTCTCTTGACTCGTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCACG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2AQ59TF 662 0 0
GATCGCTCCAAATAAATAAAATAAAAAGAGTAGAAGATGGCTCTCGAAGTCTGCGTGAAA
GCCGCCGTTGGTGCCCCTGATGTTCTCGGCGACTGCCCTTTCAGCCAACGGGTTCTTCTC
ACCCTCGAGGAGAAGCATCTGCCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGCCAAACCT
CAATGGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGGAAAGTACCAGTCCTTAAGAACGACGACAAG
TGGGTGCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCTGACCCCTCT
CTCAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATCTTCGTCACTTTCGTCACT
TTCTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGAA
GCTCTCGAGAATCACCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGTGGGAAAGCCACA
GCGGTGGATCTTAGCTTAGCACCGAAGCTTTACCATCTCAAGGTCGCTCTTGGACACTAC
AAAAGCTGGTCTGTCCCGGAGAGCTTGCCACATGTTCATGGCTACATGAAAGCTTTGTTC
TCTCTTGACTCGTTTGAGAAAACAAAGACCGAGTAGAAGTATGTGATCGCAGGATGGGAA
CA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2FO25TF 768 0 0
GGATCGCTCCAAATAAA****ATTAAAAG****GAAGATGGCTCTCGAAGTCTGCGTGAA
AGCCGCCGTTGGTGCCCCTGATGTTCTCGGCGACTGCCCTTTCAGCCAACGGGTTCTTCT
CACCCTCGAGGAGAAGCATCTACCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGACAAACC
TCAATGGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGCAAAGTACCAGTGCTCAAGAACGACGACAA
GTGGGTGCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCCGAGCCATC
TCTCAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATCTTCGGCGCTTTCGTCAC
TTTCTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGA
AGCTCTCGAGAATCACCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGTGGGAAAGCCAC
AGCGGTGGATCTAAGCTTAGCACCGAAGCTTTACCATCTCAAAGTCGCTCTCGGACACTA
CAAAAGTTGGTCTGTCCCGGAGAGCTTGCCAGATGTCCATGGCTACATGAAAGCTTTGTT
CTCTCTTGACTCGTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCACGATGGGA
ACACAAAGTCAACCCTTGAAA*CTACTACTAGTTGTTCCATCTGTTGTTGTGTGATGATG
ATGTGGTTCAAG*TCTATCCTCTCTTATCAGTAAAATAATGTTCTTGG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2EL74TF 615 0 0
G
ATCTCATTAACGTCTCCGACAAACCTCAATGGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGCAAAG
TACCAGTGCTCAAGAACGACGACAAGTGGGTGCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATTC
TCGAGGAGAAGTACCCCGAGCCATCTCTCAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGAT
CCAAAATCTTCGGCGCTTTCGTCACTTTCTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCG
AGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGAAGCTCTCGAGAATCACCTCAAGACTCATGACGGTC
CTTTCATCGCGGGTGGGAAAGCCACAGCGGTGGATCTAAGCTTAGCACCGAAGCTTTACC
ATCTCAAAGTCGCTCTCGGACACTACAAAAGTTGGTCTGTCCCGGAGAGCTTGCCAGATG
TCCATGGCTACATGAAAGCTTTGTTCTCTCTTGACTCGTTTGAGAAAACAAAGACCGAGG
AGAAGTATGTGATCGCAGGATGGGAACACAAGGTCAACCCTTGAAAACTACTACTAGTTG
TTCCATCTGTTGTTGTGTGATGATGATGTGGTTCAAGGTCTATCCTCTCTTATCAGTAAA
ATAATGTTCTTGGA

QA 2 615 2 615
DS 

RD RR2CH16JQ 723 0 0
CAGCCAACGGGTTCTTCTCACCCTCGAGGAGAAGCATCTGCCCTACAAAATGCATCTCAT
TAACGTCTCCGCCAAACCTCAATGGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGGAAAGTACCAGT
CCTTAAGAACGACGACAAGTGGGTGCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGA
GAAGTACCCTGACCCCTCTCTCAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAAT
CTTCGGCACTTTCGTCACTTTCTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGC
CTTGCTCGATGAGCTTGAAGCTCTCGAGAATCACCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCAT
CGCGGGTGGGAAAGCCACAGCGGTGGATCTTAGCTTAGCACCGAAGCTTTACCATCTCAA
GGTCGCTCTTGGACACTACAAAAGCTGGTCTGTCCCGGAGAGCTTGCCACATGTTCATGG
CTACATGAAAGCTTTGTTCTCTCTTGACTCGTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTA
TGTGATCGCAGGATGGGAACACAAGGTCAACCCTTGAAAACTACTACTAGTTGTTCCATC
TGTTGTTGTGTGATGATGATGTGGTTCAAGGTCTATCCTCTCTTATCAGTAAAATAATGT
TCTTGGACCTGTTTATGTTGTTGTTATTGTGTATCAGATCAAATAATAAGGATCGTTTGA
A
CT

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2AQ59JQ 712 0 0
TTCTTCTCACCCTCGAGGAGAAGCATCTGCCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCG
CCAAACCTCAATGGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGGAAAGTACCAGTCCTTAAGAACG
ACGACAAGTGGGTGCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCTG
ACCCCTCTCTCAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATCTTCGTCACTT
TCGTCACTTTCTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATG
AGCTTGAAGCTCTCGAGAATCACCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGTGGGA
AAGCCACAGCGGTGGATCTTAGCTTAGCACCGAAGCTTTACCATCTCAAGGTCGCTCTTG
GACACTACAAAAGCTGGTCTGTCCCGGAGAGCTTGCCACATGTTCATGGCTACATGAAAG
CTTTGTTCTCTCTTGACTCGTTTGAGAAAACAAAGACCGAGTAGAAGTATGTGATCGCAG
GATGGGAACACAAGGTCAACCCTTGAAAACTACTACTAGTTGTTCCATCTGTTGTTGTGT
GATGATGATGTGGTTCAAGGTCTATCCTCTCTTATCAGTAAAATAATGTTCTTGGACCTG
TTTATGTTGTTGTTATTGTGTATCAGATCAAATAATAAGGATCGTTTGAATT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2D150JQ 522 0 0
CAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATTTTCGGCACTTTCGTCACTTT
CTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGAAGC
TCTCGAGAATCACCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGTGGGAAAGCCACAGC
GGTGGATTTTAGCTTAGCACCGAAGCTTTACCATTTCAAGGTCGCTTTTGGACACTACAA
AAGCTGGTCTGTCCCGGAGAGCTTGCCACATGTTCATGGCTACATGAAAGCTTTGTTCTT
TCTTGACTCGTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCAGGATGGGAACA
CAAGGTCAACCCTTGAAAACTACTACTAGTTGTTCCATCTGTTGTTGTGTGATGATGATG
TGGTTCAAGGTCTATCCTCTTTTATCAGTAAAATAATGTTCTTGGACCTGTTTATGTTGT
TGTTATTGTGTACCAGATCAAATAATAAGGATCGTTTGAAT
T

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2GU89TF 580 0 0
GG
GCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCCGAGCCATCTCTCAA
AACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATCTTCGGCGCTTTCGTCACTTTCTT
GAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGAAGCTCT
CGAGAATCACCTCAAGACTCATGACGGTCCTCTCATCGCGGGTGGGAAAGCCACAGCGGT
GGATCTAAGCTTAGCACCGAAGCTTTACCATCTCAAAGTCGCTCTCGGACACTACAAAAG
TTGGTCTGTCCCGGAGAGCTTGCCAGATGTCCATGGCTACATGAAAGCTTTGTTCTCTCT
TGACTCGTTTGAGAAAA**AAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCAGGATGGGAACACAA
GGTCAACCCTTGAAAACTACTACTAGTTGTTCCATCTGTTGTTGTGTGATGATGATGTGG
TTCAAGGTCTATCCTCTCTTATCAGTAAAATAATGTTCTTGGACCTGTTTATGTTGTTGT
TATTGTGTATCAGATCAAATAATAAGGATCGTTTGAAT

QA 3 580 3 580
DS 

RD RR2DC69JQ 540 0 0
AGAAGTACCCCGAGCCATCTCTCAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAA
TTTTCGGCGCTTTCGTCACTTTCTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGG
CCTTGCTCGATGAGCTTGAAGCTCTCGAGAATCACCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCA
TCGCGGGTGGGAAAGCCACAGCGGTGGATTTAAGCTTAGCACCGAAGCTTTACCATCTCA
AAGTCGCTCTCGGACACTACAAAAGTTGGTCTGTCCCGGAGAGCTTGCCAGATGTCCATG
GCTACATGAAAGCTTTGTTCTCTCTTGACTCGTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGT
ATGTGATCGCAGGATGGGAACACAAGGTCAACCCTTGAAAACTACTACTAGTTGTTCCAT
CTGTTGTTGTGTGATGATGATGCGGTTCAAGGTCTATCCTCTCTTATCAGTAAAATAATG
TTCTTGGACCTGTTTATGTTGTTGTTATTGTGTATCAGATCAAATAATAAGGATCGTTTG

QA 1 540 1 540
DS 



CO CL125Contig2 827 7 14 U
GGGATCGCTCCAAATAAATAAAATAAAAAGAGTAAAAGATGGCTCTAGAAGTCTGCGTGA
AAGCCGCCGTTGGTGCCCCTGATGTTCTCGGCGACTGCCCTTTCAGCCAACGGGTTCTTC
TCACCCTCGAGGAGAAGCATCTACCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGACAAAC
CTCAATGGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGCAAAGTACCAGTGCTCAAGAACGACGACA
AGTGGGTGCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCCGAGCCAT
CTCTCAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATCTTCGGCACTTTCGTCA
CTTTCTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTG
AAGCTCTCGAGAATCATCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGCGGGAAAGTCA
GCGCGGTGGATCTTAGCTTAGCACCTAAGCTTTACCATCTCAAAGTCGCTCTCGGACACT
ACAAAAGCTGGTCCGTCCCCGAGAGCTTGCCTCATGTCCATGGCTACATGAAAGCTTTGT
TCTCTCTCGACTCATTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCAGGATGGG
AACACAAGGTCAACCCTTGAAAACTACTACTAGTTGTTCCATGTGTTGTTGTGTGATGAT
GATGTGGTTCAAGGTCTATCTTCTCTTATCAGTAAAATAATGTTCTTGGACCTGTTTATG
TTGTTGTTATTGTGTAACAAAATCAAATAATAAGGATCGTTTGAACT


BQ
10 15 15 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 15 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F029TF U 1
AF RR2CW06TF U 5
AF RR2CP27TF U 0
AF RR2D902TF U 2
AF RR2CW06JQ C 5
AF RR2F029JQ C 150
AF RR2D902JQ C 104
BS 1 650 RR2F029TF
BS 651 653 RR2D902TF
BS 654 654 RR2CW06TF
BS 655 667 RR2D902TF
BS 668 668 RR2CW06JQ
BS 669 682 RR2D902TF
BS 683 683 RR2CW06JQ
BS 684 733 RR2D902TF
BS 734 734 RR2CW06JQ
BS 735 746 RR2D902TF
BS 747 747 RR2CW06JQ
BS 748 756 RR2D902TF
BS 757 779 RR2CW06JQ
BS 780 827 RR2D902JQ

RD RR2F029TF 650 0 0
GGGATCGCTCCAAATAAATAAAATAAAAAGAGTAAAAGATGGCTCTAGAAGTCTGCGTGA
AAGCCGCCGTTGGTGCCCCTGATGTTCTCGGCGACTGCCCTTTCAGCCAACGGGTTCTTC
TCACCCTCGAGGAGAAGCATCTACCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGACAAAC
CTCAATGGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGCAAAGTACCAGTGCTCAAGAACGACGACA
AGTGGGTGCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCCGAGCCAT
CTCTCAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATCTTCGGCACTTTCGTCA
CTTTCTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTG
AAGCTCTCGAGAATCATCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGCGGGAAAGTCA
GCGCGGTGGATCTTAGCTTAGCACCTAAGCTTTACCATCTCAAAGTCGCTCTCGGACACT
ACAAAAGCTGGTCCGTCCCCGAGAGCTTGCCTCATGTCCATGGCTACATGAAAGCTTTGT
TCTCTCTCGACTCATTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2CW06TF 657 0 0
GG
GCTCCAAATAAATAAAATAAAAAGAGTAAAAGATGGCTCTAGAAGTCTGCGTGAAAGCCG
CCGTTGGTGCCCCTGATGTTCTCGGCGACTGCCCTTTCAGCCAACGGGTTCTTCTCACCC
TCGAGGAGAAGCATCTACCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGACAAACCTCAAT
GGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGCAAAGTACCAGTGCTCAAGAACGACGACAAGTGGG
TGCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATCCTCGAGGAGAAGTACCCCGAGCCATCTCTCA
AAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATCTTCGGCACTTTCGTCACTTTCT
TGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGAAGCTC
TCGAGAATCATCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGCGGGAAAGTCAGCGCGG
TGGATCTTAGCTTAGCACCTAAGCTTTACCATCTCAAAGTCGCTCTCGGACACTACAAAA
GCTGGTCCGTCCCCGAGAGCTTGCCTCATGTCCATGGCTACATGAAAGCTTTGTCCTCTC
TCGACTCATTTGAGAAA*CAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCAG
ATGGGAA

QA 3 650 3 650
DS 

RD RR2CP27TF 664 0 0
GGCC
ATCGCTCCAAATAAATAAAATAAAAAGAGTAAAAGATGGCTCTAGAAGTCTGCGTGAAAG
CCGCCGTTGGTGCCCCTGATGTTCTCGGCGACTGCCCTTTCAGCCAACGGGTCCTTCTCA
CCCTCGAGGAGAAGCATCTACCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGACAAACCTC
AATGGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGCAAAGTACCAGTGCTCAAGAACGACGACAAGT
GGGTGCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCCGAGCCATCTC
TCAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATCTTCGGCACTTTCGTCACTT
TCTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGAAG
CTCTCGAGAATCATCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGCGGGAAAGTCAGCG
CGGTGGATCTTAGCTTAGCACCTAAGCTTTACCATCTCAAAGTCGCTCTCGGACACTACA
AAAGCTGGTCCGTCCCCGAGAGCTTGCCTCATGTCCATGGCTACATGAAAGCTTTGTTCT
CTCTCGACTCATTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCACGATGGGA
CA

QA 5 662 5 662
DS 

RD RR2D902TF 773 0 0
GGATCGCTCCAAATAAATAAAATAAAAAGAGTAAAAGATGGCTCTAGAAGTCTGCGTGAA
AGCCGCCGTTGGTGCCCCTGATGTTCTCGGCGACTGCCCTTTCAGCCAACGGGTTCTTCT
CACC*TCGAGGAGAAGCATCTACCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGACAAACC
TCAATGGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGCAAAGTACCAGTGCTCAAGAACGACGACAA
GTGGGTGCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCCGAGCCATC
TCTCAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATCTTCGGCACTTTCGTCAC
TTTCTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGA
AGCTCTCGAGAATCATCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGCGGGAAAGTCAG
CGCGGTGGATCTTAGCTTAGCACCTAAGCTTTACCATCTCAAAGTCGCTCTCGGACACTA
CAAAAGCTGGTCCGTCCCCGAGAGCTTGCCTCATGTCCATGGCTACATGAAAGCTTTGTT
CTCTCTCGACTCATTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCACGATGGGA
ACACAAAGTCAACCCTTGAAA*CTACTACTAGTTGTTCCATGTGTTGTTGTGTGATGATG
ATGTGGTTCAAG*TCTATCTTCTCT*ATCAGTAAA
TATGTTCTTGGACTGTTT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2CW06JQ 775 0 0
GG
GCTCCAAATAAA*AAAATAAAA*GAGTAAAAGATGGCTCTAGAAGTCTGCGTGAAAGCCG
CCGTTGGTGCCCCTGATGTTCTCGGCGACTGCCCTTTCAGCCAACGGGTTCTTCTCACCC
TCGAGGAGAAGCATCTACCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGACAAACCTCAAT
GGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGCAAAGTACCAGTGCTCAAGAACGACGACAAGTGGG
TGCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATCCTCGAGGAGAAGTACCCCGAGCCATCTCTCA
AAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATCTTCGGCACTTTCGTCACTTTCT
TGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGAAGCTC
TCGAGAATCATCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGCGGGAAAGTCAGCGCGG
TGGATCTTAGCTTAGCACCTAAGCTTTACCATCTCAAAGTCGCTCTCGGACACTACAAAA
GCTGGTCCGTCCCCGAGAGCTTGCCTCATGTCCATGGCTACATGAAAGCTTTGTCCTCTC
TCGACTCATTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCAGGATGGGAACACA
AGGTCAACCCTTGAAAACTACTACTAGTTGTTCCATGTGTTGTTGTGTGATGATGATGTG
GTTCAAGGTCTATCTTCTCTTATCAGTAAAATAATGTTCTTGGACCTGTTTAT

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR2F029JQ 623 0 0
AAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGACAAACCTCAATGGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAA
GGCAAAGTACCAGTGCTCAAGAACGACGACAAGTGGGTGCCTGATTCCGACGTCATCACC
GGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCCGAGCCATCTCTCAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCT
GTCGGATCCAAAATCTTCGGCACTTTCGTCACTTTCTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGAC
GGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGAAGCTCTCGAGAATCATCTCAAGACTCAT
GACGGTCCTTTCATCGCGGGCGGGAAAGTCAGCGCGGTGGATCTTAGCTTAGCACCTAAG
CTTTACCATCTCAAAGTCGCTTTCGGACACTACAAAAGCTGGTCCGTCCCCGAGAGCTTG
CCTCATGTCCATGGCTACATGAAAGCTTTGTTCTCTCTCGACTCATTTGAGAAAACAAAG
ACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCAGGATGGGAACACAAGGTCAACCCTTGAAAACTACTA
CTAGTTGTTCCATGTGTTGTTGTGTGATGATGATGTGGTTCAAGGTCTATCTTCTCTTAT
CAGTAAAATAATGTTCTTGGACC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2D902JQ 724 0 0
CAGCCAACGGGTTCTTCTCACC*TCGAGGAGAAGCATCTACCCTACAAAATGCATCTCAT
TAACGTCTCCGACAAACCTCAATGGTTCTTAGCCATTAGTCCTGAAGGCAAAGTACCAGT
GCTCAAGAACGACGACAAGTGGGTGCCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGA
GAAGTACCCCGAGCCATCTCTCAAAACCCCTCCCGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAAT
CTTCGGCACTTTCGTCACTTTCTTGAAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGC
CTTGCTCGATGAGCTTGAAGCTCTCGAGAATCATCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCAT
CGCGGGCGGGAAAGTCAGCGCGGTGGATCTTAGCTTAGCACCTAAGCTTTACCATCTCAA
AGTCGCTCTCGGACACTACAAAAGCTGGTCCGTCCCCGAGAGCTTGCCTCATGTCCATGG
CTACATGAAAGCTTTGTTCTCTCTCGACTCATTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTA
TGTGATCGCAGGATGGGAACACAAGGTCAACCCTTGAAAACTACTACTAGTTGTTCCATG
TGTTGTTGTGTGATGATGATGTGGTTCAAGGTCTATCTTCTCTTATCAGTAAAATAATGT
TCTTGGACCTGTTTATGTTGTTGTTATTGTGTAACAAAATCAAATAATAAGGATCGTTTG
AACT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 4 17

CO CL126Contig1 183 2 3 U
GATAACTGATCGAAGTAAAAAAAATGTTACTATTACAGATGTATGAAACGGCCACTAAAA
TGAAGCAGCTTATTTTGGTCAAATGTAAAAAGATGATATTTCAATTTGTACTTCTTTTTC
TTTCTTATAAATTGCATTTTCAAAAACTGGATTCCTCAGTAAATGGACGCCTCAAGAAGT
ACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 

AF RR2AO82JQ U 1
AF RR2GC12JQ U 22
BS 1 154 RR2AO82JQ
BS 155 155 RR2GC12JQ
BS 156 183 RR2AO82JQ

RD RR2AO82JQ 183 0 0
GATAACTGATCGAAGTAAAAAAAATGTTACTATTACAGATGTATGAAACGGCCACTAAAA
TGAAGCAGCTTATTTTGGTCAAATGTAAAAAGATGATATTTCAATTTGTACTTCTTTTTC
TTTCTTATAAATTGCATTTTCAAAAACTGGATTCGTCAGTAAATGGACGCCTCAAGAAGT
ACC

QA 1 183 1 183
DS 

RD RR2GC12JQ 162 0 0
AAATGTTACTATTACAGATGTATGAAACGGCCACTAAAATGAAGCAGCTTATTTTGGTCA
AATGTAAAAAGATGATATTTCAATTTGTACTTCTTTTTCTTTCTTATAAATTGCATTTTC
AAAAACTGGATTCCTCAGTAAATGGACGCCTCAAGAAGTACC

QA 1 162 1 162
DS 



CO CL126Contig2 1158 9 35 U
AACTATGGTCCTCTCATGCGGATAAGATGAGACCAGTCCAGAGGCTCTTGTTCTTCTTCC
CTTTTTCTCTCTAACGTTTTCCTCACTTTCTTTTTATT***TATTATTTCTTTGCTTCGG
GTTCAAGTCAGCTATGGTGGCTATGGCCTCTGCTTCTGGTTCAGCTCTTTGTTTTACTGA
TGCTTCTAGTTCCCCAGCTATCAGACGTGATGTTGGAGCTTTCTGTCTTCCTCCTAGCAC
AATCACGTTTGGATATGTCGATAAGCCTATTATAAATCTTCAGCGACTCAGATTATCAAG
TTTGAAGCCACGAGCTGCAAACGCTACTGCTGTGGAGCAAGGTGGAAGTGCAGCTGATTC
TGACAAAGTTCCAACTCCAGTGGTCATAATCGACCAAGATTCTGACCCTGAAGCAACCGT
TCTGGAAGTTACATTTGGAGACCGTCTCGGAGCTCTGCTTGACACTATGAATGCGCTCAA
AAACTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGATTCTTCTGGCAAGCACAA
CAAATTCGCCATTACCAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTGAACTGCTCGA
GGCCATCCGTCTCACTGTCATAAACAATTTGCTAGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTCTCA
GTTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTGATGTGGACAT
TGCAACACATATAAAAATTGAAGATGATGGATCAGACCGCAGTTTACTATACATAGAAAC
AGCGGATAGGCCTGGACTATTAGTTGAGCTGGTGAAGATGATTACAGATATCAGTGTAGC
TGTCGAATCTGGAGAATTTGACACCGAGGGTCTCTTGGCTAAGGTTAAGTTCCACGTAAG
TTACAGGAACAAAGCCCTAATCAAGTCTCTCCAGCAGGTTCTTGCCAATAGTTTGAGGTA
CTTCTTGAGGCGTCCATCTACTGACGAATCCAGTTTCTGAAAATGCAATTTATAAGAAAA
AAAA*GTACAAATTGAAATATCGTCTTTTTACATTTGACCAAAATAAGCTGCTTCATTTT
AGTGGCCGTTTCATACATCTGTAATAGTAACATTTTCTCTACTTCGATCATTTATCAAAT
TTACCTTCATCCACGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 10 25 25 10 25 25 25 25 30 5 30 15 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM32TF U 28
AF RR2AO82TF U 1
AF RR2EC51TF U 29
AF RR2A039TF U 96
AF RR2BE76TF U 31
AF RR2HA35TF U 132
AF RR2BD60TF U 332
AF RR2BD60JQ C 412
AF RR2EC51JQ C 484
BS 1 101 RR2AO82TF
BS 102 102 RR2EC51TF
BS 103 109 RR2AO82TF
BS 110 110 RR2EC51TF
BS 111 192 RR2AO82TF
BS 193 193 RR2EC51TF
BS 194 195 RR2AO82TF
BS 196 196 RR2EC51TF
BS 197 381 RR2AO82TF
BS 382 382 RR2EC51TF
BS 383 404 RR2AO82TF
BS 405 405 RR2EC51TF
BS 406 456 RR2AO82TF
BS 457 457 RR2EC51TF
BS 458 474 RR2AO82TF
BS 475 475 RR2EC51TF
BS 476 539 RR2AO82TF
BS 540 664 RR2EC51TF
BS 665 665 RR2A039TF
BS 666 702 RR2EC51TF
BS 703 703 RR2A039TF
BS 704 736 RR2EC51TF
BS 737 816 RR2BE76TF
BS 817 817 RR2HA35TF
BS 818 822 RR2BE76TF
BS 823 823 RR2HA35TF
BS 824 846 RR2BE76TF
BS 847 847 RR2HA35TF
BS 848 855 RR2BE76TF
BS 856 856 RR2BD60TF
BS 857 858 RR2BE76TF
BS 859 871 RR2HA35TF
BS 872 952 RR2BD60TF
BS 953 953 RR2BD60JQ
BS 954 1158 RR2BD60TF

RD RR2DM32TF 374 0 0
GGA
GACCAGTCCAGAGGCTCTTGTTCTTCTTCCCTTTTTCTCTCTAACGTTTTCCTCACTTTC
TTTTTATT****ATTATTT*TTTGCTTCGGGTTCAAGTCAGCTATGGTGGCTATGGCCTC
TGCTTCTGGTTCAGCTCTTTGTTTTACTGATGCTTCTAGTTCTCCCGCTATCAGACGTGA
TGTTGGAGCTTTCTGTCTTCCTCCTAGCACA*TCACGTTTGGATATGTCGATAAGCCTAT
TATAAATCTTCAGCGACTCAGATTATCAAGTT*GAAGC*ACGAGCTGCAAACGCTACTGC
TGTGGAGCAAGG*GGAAGTGCAGCTGATTCTGACAA*GTTCCA*CTTCAGTTGTCATA*T
CGACCAAGATT

QA 4 374 4 374
DS 

RD RR2AO82TF 539 0 0
AACTATGGTCCTCTCATGCGGATAAGATGAGACCAGTCCAGAGGCTCTTGTTCTTCTTCC
CTTTTTCTCTCTAACGTTTTCCTCACTTTCTTTTTATT****ATTATTT*TTTGCTTCGG
GTTCAAGTCAGCTATGGTGGCTATGGCCTCTGCTTCTGGTTCAGCTCTTTGTTTTACTGA
TGCTTCTAGTTCTCCCGCTATCAGACGTGATGTTGGAGCTTTCTGTCTTCCTCCTAGCAC
AATCACGTTTGGATATGTCGATAAGCCTATTATAAATCTTCAGCGACTCAGATTATCAAG
TTTGAAGCCACGAGCTGCAAACGCTACTGCTGTGGAGCAAGGTGGAAGTGCAGCTGATTC
TGACAAAGTTCCAACTCCAGTTGTCATAATCGACCAAGATTCTGGCCCTGAAGCAACCGT
TCTGGAAGTTACATTTGGAGACCGTCTCGGAGCTCTACTTGACACTATGAATGCCCTCAA
AAACTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGATTCTTCTGGCAAGCACA

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2EC51TF 710 0 0
GG
GACCTGTCCAGAGGCTCTTGTTCTTCTTCCCTTTTTCTCTCTAACGTTTTCCTCTTTCTT
TTTTTATT***TATTATTTCTTTGCTTCGGGTTCAAGTCAGCTATGGTGGCTATGGCCTC
TGCTTCTGGTTCAGCTCTTTGTTTTACTGATGCTTCTAGTTCCCCAGCTATCAGACGTGA
TGTTGGAGCTTTCTGTCTTCCTCCTAGCACAATCACGTTTGGATATGTCGATAAGCCTAT
TATAAATCTTCAGCGACTCAGATTATCAAGTTTGAAGCCACGAGCTGCAAACGCTACTGC
TGTGGAGCAAGGTGGAAGTGCAGCTGATTCTGACAAAGTTCCAACTCCAGTGGTCATAAT
CGACCAAGATTCTGACCCTGAAGCAACCGTTCTGGAAGTTACATTTGGAGACCGTCTCGG
AGCTCTGCTTGACACTATGAATGCGCTCAAAAACTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAA
TGTCTACCTAGATTCTTCTGGCAAGCACAACAAATTCGCCATTACCAAAGCGGATAGTGG
AAGAAAAGTAGAAGACCCTGAACTGCTCGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATAAACAATTT
GCTAGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTCTCAGTTGACAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCT
TCCACCAACTGA*CAGGTTGATGTGGACATTGCAACACATATAAAA
TT

QA 3 708 3 708
DS 

RD RR2A039TF 637 0 0
AT
T***TATTATTTCTTTGCTTCGGGTTCAAGTCAGCTATGGTGGCTATGGCCTCTGCTTCT
GGTTCAGCTCTTTGTTTTACTGATGCTTCTAGTTCCCCAGCTATCAGACGTGATGTTGGA
GCTTTCTGTCTTCCTCCTAGCACAATCACGTTTGGATATGTCGATAAGCCTATTATAAAT
CTTCAGCGACTCAGATTATCAAGTTTGAAGCCACGAGCTGCAAACGCTACTGCTGTGGAG
CAAGGTGGAAGTGCAGCTGATTCTGACAAAGTTCCAACTCCAGTGGTCATAATCGACCAA
GATTCTGACCCTGAAGCAACCGTTCTGGAAGTTACATTTGGAGACCGTCTCGGAGCTCTG
CTTGACACTATGAATGCGCTCAAAAACTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTAC
CTAGATTCTTCTGGCAAGCACAACAAATTCGCCATTACCAAAGCGGATAGTGGAAGAAAA
GTAGAAGACCCTGAACTGCTCGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATAAACAATTTGCTAGAG
TTTCATCCTGAATCAAGTTCTCAGTTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCA
ACTGAACAGGTTGATGTGGACATTGCAACACATAT

QA 3 637 3 637
DS 

RD RR2BE76TF 840 0 0
AGGGA
GTCCAGAGGCTCTTGTTCTTCTTCCCTTTTTCTCTCTAACGTTTTCCTCACGTTCTTATT
ATTATTTACTATTTTCTTGCTTCGGGTTCAAGTCAGCTATGGTGTCTATGGCCTCTGCTT
CTGGTTCAGCTCTTTGTTTCACTGATGCTTCTAGTTCTCCCGCTATCAGACGTGATGTTG
GAGCTTTCTGTCTTCCTCCTAGCACAATCACGTTTGGATATGTCGATAAGCCTATTATAA
ATCTTCAGCGACTCAGATTACCAGGTTTGAAGCCACGAGCTGCAAACGCTACTGCTGTGG
AGCAAGGTGGAAGTGCAGCTGATTCTGACAAAGTTCCAACTCCAGTGGTCATAATCGACC
AAGATTCTGATCCTGAAGCAACCGTTCTGGAAGTTACATTTGGAGACCGTCTCGGAGCTC
TGCTTGACACTATGAATGCGCTAAAAAACTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAACGTCT
ACCTAGATTCTTCTGGCAAGCACAACAAATTCGCCATTACCAAAGCGGATAGTGGAAGAA
AAGTAGAAGACCCTGAACTGCTCGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATAAACAATTTGCTCG
AGTTTCATCCTTAATCAAGTTCTCAGTTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCAC
CAACTGAACAGGTTGATGCGGACATTGCAACACATATAAAAATTGAAGATGATGGATCAG
ACCGCAGTTTACTATACATAGAAACAGCGGATAGGCCTGGACTATTAGTTGAGCTGGTGA
AAATGAT*ACAGATATCAGTGTAGCTGTCGA*TCTGGAGA*TT
GACACAGAGGTC

QA 6 828 6 828
DS 

RD RR2HA35TF 740 0 0
GG
ATGGTGGCTATGGCCTCTGCTTCTGGTTCAGCTCTTTGTTTTACTGATGCTTCTAGTTCC
CCAGCTATCAGACGTGATGTTGGAGCTTTCTGTCTTCCTCCTAGCACAATCACGTTTGGA
TATGTCGATAAGCCTATTATAAATCTTCAGCGACTCAGATTATCAAGTTTGAAGCCACGA
GCTGCAAACGCTACTGCTGTGGAGCAAGGTGGAAGTGCAGCTGATTCTGACAAAGTTCCA
ACTCCAGTGGTCATAATCGACCAAGATTCTGACCCTGAAGCAACCGTTCTGGAAGTTACA
TTTGGAGACCGTCTCGGAGCTCTGCTTGACACTATGAATGCGCTCAAAAACTTGGGTCTG
AATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGATTCTTCTGGCAAGCACAACAAATTCGCCATT
ACCAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTGAACTGCTCGAGGCCATCCGTCTC
ACTGTCATAAACAATTTGCTAGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTCTCAGTTGGCAATGGGA
GCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTGATGTGGACATTGCAACACATATA
AAAATTGAAGATGATGGATCAGACCGCAGTTTACTATACATAGAAACAGCGGATAGGCCT
GGACTATTAGTTGAGCTGGTGAAGATGATTACAGATATCAGTGTAGCTGTCGAATCTGGA
GA*TTTGACACCGAGGGT

QA 3 740 3 740
DS 

RD RR2BD60TF 827 0 0
GTGGAGCAAGGTGGAAGTGCAGCTGATTCTGACAAAGTTCCAACTCCAGTGGTCATAATC
GACCAAGATTCTGACCCTGAAGCAACCGTTCTGGAAGTTACATTTGGAGACCGTCTCGGA
GCTCTGCTTGACACTATGAATGCGCTCAAAAACTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAAT
GTCTACCTAGATTCTTCTGGCAAGCACAACAAATTCGCCATTACCAAAGCGGATAGTGGA
AGAAAAGTAGAAGACCCTGAACTGCTCGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATAAACAATTTG
CTAGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTCTCAGTTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTT
CCACCAACTGAACAGGTTGATGTGGACATTGCAACACATATAAAAATTGAAGATGATGGA
TCAGACCGCAGTTTACTATACATAGAAACAGCGGATAGGCCTGGACTATTAGTTGAGCTG
GTGAAGATGATTACAGATATCAGTGTAGCTGTCGAATCTGGAGAATTTGACACCGAGGGT
CTCTTGGCTAAGGTTAAGTTCCACGTAAGTTACAGGAACAAAGCCCTAATCAAGTCTCTC
CAGCAGGTTCTTGCCAATAGTCTGAGGTACTTCTTGAGGCGTCCATCTACTGACGAATCC
AGTTTCTGAAAATGCAATTTATAAGAAAAAAAA*GTACAAATTGAAATATCGTCTTTTTA
CATTTGACCAAAATAAGCTGCTTCATTTTAGTGGCCGTTTCATACATCTGTAATAGTAAC
ATTTTCTCTACTTCGATCATTTATCAAATTTACCTTCATCCACGAAA

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2BD60JQ 744 0 0
AGCAACCGTTCTGGAAGTTACATTTGGAGACCGTCTCGGAGCTCTGCTTGACACTATGAA
TGCGCTCAAAAACTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGATTCTTCTGG
CAAGCACAACAAATTCGCCATTACCAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTGA
ACTGCTCGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATAAACAATTTGCTAGAGTTTCATCCTGAATC
AAGTTCTCAGTTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTGA
TGTGGACATTGCAACACATATAAAAATTGAAGATGATGGATCAGACCGCAGTTTACTATA
CATAGAAACAGCGGATAGGCCTGGACTATTAGTTGAGCTGGTGAAGATGATTACAGATAT
CAGTGTAGCTGTCGAATCTGGAGAATTTGACACCGAGGGTCTCTTGGCTAAGGTTAAGTT
CCACGTAAGTTACAGGAACAAAGCCCTAATCAAGTCTCTCCAGCAGGTTCTTGCCAATAG
TTTGAGGTACTTCTTGAGGCGTCCATCTACTGACGAATCCAGTTTCTGAAAATGCAATTT
ATAAGAAAAAAAA*GTACAAATTGAAATATCGTCTTTTTACATTTGACCAAAATAAGCTG
CTTCATTTTAGTGGCCGTTTCATACATCTGTAATAGTAACATTTTCTCTACTTCGATCAT
TTATCAAATTTACCTTCATCC
ACG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2EC51JQ 672 0 0
CTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGATTCTTCTGGCAAGCACAACAA
ATTCGCCATTACCAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTGAACTGCTCGAGGC
CATCCGTCTCACTGTCATAAACAATTTGCTAGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTCTCAGTT
GACAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTGATGTGGACATTGC
AACACATATAAAAATTGAAGATGATGGATCAGACCGCAGTTTACTATACATAGAAACAGC
GGATAGGCCTGGACTATTAGTTGAGCTGGTGAAGATGATTACAGATATCAGTGTAGCTGT
CGAATCTGGAGAATTTGACACCGAGGGTCTCTTGGCTAAGGTTAAGTTCCACGTAAGTTA
CAGGAACAAAGCCCTAATCAAGCCTCTCCAGCAGGTTCTTGCCAATAGTTTGAGGTACTT
CTTGAGGCGTCCATCTACTGACGAATCCAGTTTCTGAAAATGCAATTTATAAGAAAAAAA
AAGTACAAATTGAAATATCGTCTTTTTACATTTGACCAAAATAAGCTGCTTCGTTTTAGT
GGCCGTTTCATACATCTGTAATAGTAACATTTTCTCTACTTCGATCATTTATCAAATTTA
CCTTCATCC
ACG

QA 1 669 1 669
DS 



CO CL126Contig3 1234 2 6 U
GGATATGGAAGAGTGGGGAAGGAAAATGAAAGCTAGAGAGATGACTATCTAATGGTGAAG
ATAATTTTTGTATTTTTTTTTTAATTATGGTCCTCTCATGGCAGATAAGATGAGACCTGT
CTAGAGGCTCTTGTTCTTCTTCCCCTTTTTTTCTCTAACGTTGTCCTCACTTTCTTATTA
TTATTTTTATTTTGCTTCGGGTTCAAGTCAGCTATGGTGGCTATGGCCTCTGCTTCTGGT
TCAGCTCTTTGTTTTACTGATGCTTCTAGTTCTCCCGCTATCAGACGTGATGTTGGAGCT
TTCTGTCTTCCTCCTAGCACAATCACGTTTGGATATGTCGATAAGCCTATTATAAATCTT
CAGCGACTCAGATTATCAGGTTTGAAGCCACGAGCTGCAAACGCTACTGCTGTGGAGCAA
GGTGGAAGTGCAGCTGATTCTGACAAAGTTCCAACTCCAGTGGTCATAATCGACCAAGAT
TCTGACCCTGAAGCAACCGTTCTGGAAGTTACATTTGGAGACCGTCTCGGAGCTCTGCTT
GACACTATGAATGCGCTCAAAAACTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTA
GATTCTTCTGGCAAGCACAACAAATTCGCCATTACCAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTA
GAAGACCCTGAATTGCTTGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATAAACAATTTGCTTGAGTTT
CATCCTGAATCAAGTTCTCAGTTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACT
GAACAGGTTGATGTGGACATTGCAACACATATAAAAATTGAAGATGATGGATCAGACCGC
AGTTTACTATACATAGAAACAGCGGATAGGCCTGGACTATTAGTTGAGCTGGTGAAGATG
ATTACAGATATCAGTGTAGCTGTCGAATCTGGAGAATTTGACACCGAGGGTCTCTTGGCT
AAGGTTAAGTTCCACGTAAGTTACAGGAACAAAGCCCTAATCAAGCCTCTCCAGCAGGTT
CTTGCCAATAGTCTGAGGTACTTCTTGAGGCGTCCATCTACTGGCGAATCCAGTTTCTGA
AAATGCAATTTATAAGAAAGAAAAAGAAGTACAAATTGAAATATCATCTTTTTACATTTG
ACCAAAATAAGCTGCTTCATTTTAGTGGCCGTTTCATACATCTGTAATAGTAACATTTTC
TCTACTCGATCAGTTATCAAATTTACCTTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F270TF U 1
AF RR2F270JQ C 581
BS 1 681 RR2F270TF
BS 682 682 RR2F270JQ
BS 683 747 RR2F270TF
BS 748 748 RR2F270JQ
BS 749 771 RR2F270TF
BS 772 1234 RR2F270JQ

RD RR2F270TF 771 0 0
GGATATGGAAGAGTGGGGAAGGAAAATGAAAGCTAGAGAGATGACTATCTAATGGTGAAG
ATAATTTTTGTATTTTTTTTTTAATTATGGTCCTCTCATGGCAGATAAGATGAGACCTGT
CTAGAGGCTCTTGTTCTTCTTCCCCTTTTTTTCTCTAACGTTGTCCTCACTTTCTTATTA
TTATTTTTATTTTGCTTCGGGTTCAAGTCAGCTATGGTGGCTATGGCCTCTGCTTCTGGT
TCAGCTCTTTGTTTTACTGATGCTTCTAGTTCTCCCGCTATCAGACGTGATGTTGGAGCT
TTCTGTCTTCCTCCTAGCACAATCACGTTTGGATATGTCGATAAGCCTATTATAAATCTT
CAGCGACTCAGATTATCAGGTTTGAAGCCACGAGCTGCAAACGCTACTGCTGTGGAGCAA
GGTGGAAGTGCAGCTGATTCTGACAAAGTTCCAACTCCAGTGGTCATAATCGACCAAGAT
TCTGACCCTGAAGCAACCGTTCTGGAAGTTACATTTGGAGACCGTCTCGGAGCTCTGCTT
GACACTATGAATGCGCTCAAAAACTTGGGTCTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTA
GATTCTTCTGGCAAGCACAACAAATTCGCCATTACCAAAGCGGATAGTGGAAGAAAAGTA
GAAGACCCTGAATTGCTTGAG*CCATCCGTCTCACTGTCATAAACAATTTGCTTGAGTTT
CATCCTGAATCAAGTTCTCAGTTGGCA*TGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2F270JQ 654 0 0
TCAAGGCTAATGTCTACCTAGATTCTTCTGGCAAGCACAACAAATTCGCCATTACCAAAG
CGGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTGAATTGCTTGAGGCCATCCGTCTCACTGTCA
TAAACAATTTGCTTGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTCTCAGTTGGCAATGGGAGCAGCTT
TTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTGATGTGGACATTGCAACACATATAAAAATTG
AAGATGATGGATCAGACCGCAGTTTACTATACATAGAAACAGCGGATAGGCCTGGACTAT
TAGTTGAGCTGGTGAAGATGATTACAGATATCAGTGTAGCTGTCGAATCTGGAGAATTTG
ACACCGAGGGTCTCTTGGCTAAGGTTAAGTTCCACGTAAGTTACAGGAACAAAGCCCTAA
TCAAGCCTCTCCAGCAGGTTCTTGCCAATAGTCTGAGGTACTTCTTGAGGCGTCCATCTA
CTGGCGAATCCAGTTTCTGAAAATGCAATTTATAAGAAAGAAAAAGAAGTACAAATTGAA
ATATCATCTTTTTACATTTGACCAAAATAAGCTGCTTCATTTTAGTGGCCGTTTCATACA
TCTGTAATAGTAACATTTTCTCTACTCGATCAGTTATCAAATTTACCTTTATCC

QA 1 654 1 654
DS 



CO CL126Contig4 1126 4 21 U
GGGAGACCTGTCCAAATCCAAAGGCTTGTGTTCACTTCCCCTCTCTAGCGTTTTCCTCAT
TCTTTCTTGTTTTTGCTTCGGATTCAAGTCAGATAATATGGTGGCCGCTGCTATGGCCTC
TGCTTCTGCTCCTTGTTTCACTGATGCTCGCGTTATCAGACGCGATGCTGGAGCTTTCTG
TCTTGCTCCTAGGACAGTCACGTTCGGTGGATTCGTCGATAAATCTATTACCAATTTCAA
CAGACTAAGGTTATCTGGTTTGAAGACTAGAGCATCCAATGCTACTGCTGTAGAGAATGC
AAATGCTGCTGATTCGGACAAAGTTCCAACACCAGTGGTCATAATTGACCAAGATTCTGA
CCCTGATGCGACCGTCGTTGAAGTTACATTCGGAGACCGTCTTGGAGCTCTACTTGACAC
TATGAATGCGCTCAAGAACTTGGGTTTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGACTC
TTCCGACAAGCACAACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGCGGAAGAAAGGTAGAAGA
CCCTGAACTGCTTGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTTGAGTTTCATCC
TGAATCAAGTTCTCAATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACA
GGTTGATGTGGACATTGCAACACACATAAGCATTGAAGATGATGGACCTGACCGCAGTTT
ACTATACATAGAAACAGCAGATAGGCCTGGGCTGTTAGTTGAGCTGGTGAAAATCATTTC
TGATATCAGCGTCGCTGTCGAATCTGGAGAGTTTGACACCGAGGGTTTGTTGGCTAAGGT
AAAGTTCCACGTAAGTTACAGAAACAAAGCTTTAATCAAGCCTCTCCAGCAGGTTATTGC
TAATAGTCTGAGGTATTTCTTGAGGCGTCCATCAACTGACGAGTCAAGTTTCTGAAATGC
TATTTACTGAAAAATGAAGTCACATTCCATATGACTGCTTTTTACCACTTCTTTTTTATT
TTACATTTTGACAAAAATAAGCTGTTTCTTTTTAGTTGCCTTATCTCATACATCTGTAGT
AGCAACATTCTCTGTTTCAATATCAAATTTACTTACATTTACGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2E843TF U 72
AF RR2F623TF U 1
AF RR2F623JQ C 316
AF RR2CP95JQ C 385
BS 1 105 RR2F623TF
BS 106 106 RR2E843TF
BS 107 215 RR2F623TF
BS 216 217 RR2E843TF
BS 218 291 RR2F623TF
BS 292 292 RR2E843TF
BS 293 407 RR2F623TF
BS 408 408 RR2E843TF
BS 409 661 RR2F623TF
BS 662 662 RR2F623JQ
BS 663 679 RR2F623TF
BS 680 680 RR2F623JQ
BS 681 696 RR2F623TF
BS 697 697 RR2F623JQ
BS 698 733 RR2F623TF
BS 734 769 RR2F623JQ
BS 770 770 RR2CP95JQ
BS 771 1101 RR2F623JQ
BS 1102 1102 RR2CP95JQ
BS 1103 1124 RR2F623JQ
BS 1125 1126 RR2CP95JQ

RD RR2E843TF 586 0 0
GGG
GCTTCGGATTCAAGTCAGATAATATGGTGGCCGCTGCTATGGCCTCTGCTTCTGCTCCTT
GTTTCACTGATGCTCGCGTTATCAGACGCGATGCTGGAGCTTTCTGTCTTGCTCCTAGGA
CAGTCACGTTCGGTGGATTCGTCGATAAATCTATTACCAATTTCAACAGACTAAGGTTAT
CTGGTTTGAAGACTAGAGCATCCAATGCTACTGCTGTAGAGAATGCAAATGCTGCTGATT
CGGACAAAGTTCCAACACCAGTGGTCATAATCGACCAAGATTCTGACCCTGATGCCACCG
TCGTTGAAGTTACATTCGGAGACCGTCTTGGAGCTCTACTTGACACTATGAATGCGCTCA
AGAACTTGGGTTTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGACTCTTCCGGCAAGCACA
ACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGCGGAAGAAAGGTAGAAGACCCTGAACTGCTTG
AGGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTTGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTCTC
AATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGA

QA 4 586 4 586
DS 

RD RR2F623TF 739 0 0
GGGAGACCTGTCCAAATCCAAAGGCTTGTGTTCACTTCCCCTCTCTAGCGTTTTCCTCAT
TCTTTCTTGTTTTTGCTTCGGATTCAAGTCAGATAATATGGTGGCTGCTGCTATGGCCTC
TGCTTCTGCTCCTTGTTTCACTGATGCTCGCGTTATCAGACGCGATGCTGGAGCTTTCTG
TCTTGCTCCTAGGACAGTCACGTTCGGTGGATTCG**GATAAATCTATTACCAATTTCAA
CAGACTAAGGTTATCTGGTTTGAAGACTAGAGCATCCAATGCTACTGCTGTTGAGAATGC
AAATGCTGCTGATTCGGACAAAGTTCCAACACCAGTGGTCATAATTGACCAAGATTCTGA
CCCTGATGCGACCGTCGTTGAAGTTACATTCGGAGACCGTCTTGGAGTTCTACTTGACAC
TATGAATGCGCTCAAGAACTTGGGTTTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGACTC
TTCCGACAAGCACAACAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGCGGAAGAAAGGTAGAAGA
CCCTGAACTGCTTGAGGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTTGAGTTTCATCC
TGAATCAAGTTCTCAATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACA
G*TTGATGTGGACATTGCA*CACACATAAGCATTGA*GATGATGGACCTGACCGCAGTTT
ACTATACATAGAA
CAGCAG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2F623JQ 811 0 0
GGACAAAGTTCCAACACCAGTGGTCATAATTGACCAAGATTCTGACC*TGATGCGACCGT
CGTTGAAGTTACATTCGGAGACCGTCTTGGAGTTCTACTTGACACTATGAATGCGCTCAA
GAACTTGGGTTTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGACTCTTCCGACAAGCACAA
CAAATTTGCCATTACTAAAGCGGATAGCGGAAGAAAGGTAGAAGACCCTGAACTGCTTGA
GGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTTGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTCTCA
ATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTGATGTGGACAT
TGCAACACACATAAGCATTGAAGATGATGGACCTGACCGCAGTTTACTATACATAGAAAC
AGCAGATAGGCCTGGGCTGTTAGTTGAGCTGGTGGAAATCATTTCTGATATCAGCGTCGC
TGTCGAATCTGGAGAGTTTGACACCGAGGGTTTGTTGGCTAAGGTAAAGTTCCACGTAAG
TTACAGAAACAAAGCTTTAATCAAGCCTCTCCAGCAGGTTATTGCTAATAGTCTGAGGTA
TTTCTTGAGGCGTCCATCAACTGACGAGTCAAGTTTCTGAAATGCTATTTACTGAAAAAT
GAAGTCACATTCCATATGACTGCTTTTTACCACTTCTTTTTTATTTTACATTTTGACAAA
AATAAGCTGTTTCTTTTTAGTTGCCTTATCTCATACATCTGTAGTAGCAACATTCTCTGT
TTCAATGTCAAATTTACTTACATTTACGA
TC

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2CP95JQ 742 0 0
TACATTCGGAGACCGTCTTGGAGCTCTACTTGACACTATGAATGTGCTCAAGAACTTGGG
TTTGAATGTCGTCAAGGCTAATGTCTACCTAGACTCTTCCGGCAAGCACAACAAATTTGC
CATTACTAAAGCGGATAGCGGAAGAAAGGTAGAAGACCCTGAACTGCTTGAGGCCATCCG
TCTCACTGTCATCAACAACATGCTTGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTCTCAATTGGCAAT
GGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACAGGTTGATGTGGACATTGCAACACA
CATAAGCATTGAAGATGATGGACCTGACCGCAGTTTACTATACATAGAAACAGCAGATAG
GCCTGGGCTGTTAGTTGAGCTGGTGAAAATCATTTCTGATATCAGCGTCGCTGTCGAATC
TGGAGAGTTTGACACCGAGGGTTTGTTGGCTAAGGTAAAGTTCCACGTAAGTTACAGAAA
CAAAGCTTTAATCAAGCCTCTCCAGCAGGTTATTGCTAATAGTCTGAGGTATTTCTTGAG
GCGTCCATCAACTGACGAGTCAAGTTTCTGAAATGCTATTTACTGAAAAATGAAGTCACA
TTCCATATGACTGCTTTTTACCACTTCTTTTTTATTTTACATTTTGACAAAAATAAGCTG
TTTCTTTTTAGTTGCCTTATCTCATACATCTGTAGTAGCAACATTCTCTGTTTCAATATC
AAATTTACTTACATTTACGACC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 3 18

CO CL127Contig1 961 4 14 U
GGACACATCAAAGCATCACACACACAAACACACACTTTCTCTTCTCTTCTTTGATCTTTC
CTCTTTTCTACACATTCAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCAGCCGCAGC
TGAGCACGTCGAGGTGACACCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTTGTGGCTGA
CTCTGCTCCAGCACCGGTAACAGAAACTGAAGCTACCATGGAAAAAACAGAGGAAACCAA
GACAGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTCGAAGTAACCACTAAAGA
CGTCCCTGTGGAAGAAGCTCCAGTGGAATCTCCTGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGAC
AGAGGAAGTCGTAGAGCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACACAGGAAAC
TCCAGCGGTTGTGGAGGAAGAGAGCAAAGCAGAGGAAGTTGTAGAGCCAAAGAAAGAGGA
AGAAACTCCGGCGGTTGTGGAGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAA
AGAGGAAGGAACTCCGGCGGTTGTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAA
AGAGGAAGAAGCTCCGGTGGTTGTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGAAGTGAAGAC
AGAGGAAACTCCAGCTGTTGTGGAGGAAGAGAAGAAGACAGAAGCAGAGGAGGAGAAAAC
CACTGAAGTAGCAGCCGTGGAAGCCGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAA
GGCTGATGAGTAAATTTGAAAGAAGAAGAAGAAGTACACTATTTGCTACTTTTCTTTTAA
GTACGTTGCGTCTTTGCTTTGTTGTTCTGAGTCTGTCACTATTGTCCCTTTTTGCATCAC
CCTCTCTCTTTTTAAGTATATCTATCTTCATATGTTTAATATAAATTAAAAATCATCTTT
A


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RR2EQ70TF U 1
AF RR2AC06TF U 1
AF RR2AC06JQ C 114
AF RR2G154JQ C 171
BS 1 23 RR2AC06TF
BS 24 24 RR2EQ70TF
BS 25 652 RR2AC06TF
BS 653 653 RR2EQ70TF
BS 654 781 RR2AC06TF
BS 782 782 RR2AC06JQ
BS 783 795 RR2AC06TF
BS 796 796 RR2AC06JQ
BS 797 803 RR2AC06TF
BS 804 804 RR2AC06JQ
BS 805 809 RR2AC06TF
BS 810 812 RR2AC06JQ
BS 813 832 RR2AC06TF
BS 833 961 RR2AC06JQ

RD RR2EQ70TF 701 0 0
GGACACATCAAAGCATCACACACACTAACACACACTTTCTCTTCTCTTCTTTGATCTTTC
CTCTTTTCTACACATTCAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCAGCCGCAGC
TGAGCACGTCGAGGTGACACCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTTGTGGCTGA
CTCTGCTCCAGCACCGGTAACAGAAACTGAAGCTACCATGGAAAAAACAGAGGAAACCAA
GACAGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTCGAAGTAACCACTAAAGA
CGTCCCTGTGGAAGAAGCTCCAGTGGAATCTCCTGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGTAAGAC
AGAGGAAGTCGTAGAGCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACACGGGAAAC
TCCAGCGGTTGTGGAGGAAGAGAGCAAAGCAGAGGAAGTTGTAGAGCCAAAGAAAGAGGA
AGAAACTCCGGCGGTTGTGTAGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAA
AGAGGAAGGAACTCCGGCGGTTGTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAA
AGAGGAAGAAGCTCCGGTGGTTGTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGAAGTGAAGAC
AGAGGAAACTCCAGCTGTTGTGGAGGAAGAGAAGA
GACAGA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2AC06TF 848 0 0
GGACACATCAAAGCATCACACACGCAAACACACACTTTCTCTTCTCTTCTTTGATCTTTC
CTCTTTTCTACACATTCAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCAGCCGCAGC
TGAGCACGTCGAGGTGACACCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTTGTGGCTGA
CTCTGCTCCAGCACCGGTAACAGAAACTGAAGCTACCATGGAAAAAACAGAGGAAACCAA
GACAGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTCGAAGTAACCACTAAAGA
CGTCCCTGTGGAAGAAGCTCCAGTGGAATCTCCTGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGAC
AGAGGAAGTCGTAGAGCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACACAGGAAAC
TCCAGCGGTTGTGGAGGAAGAGAGCAAAGCAGAGGAAGTTGTAGAGCCAAAGAAAGAGGA
AGAAACTCCGGCGGTTGTGGAGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAA
AGAGGAAGGAACTCCGGCGGTTGTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAA
AGAGGAAGAAGCTCCGGTGGTTGTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGAATTGAAGAC
AGAGGAAACTCCAGCTGTTGTGGAGGAAGAGAAGAAGACAGAAGCAGAGGAGGAGAAAAC
CACTGAAGTAGCAGCCGTGGAAGCCGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAA
G*CTGATGAGTAAATCTGAAAGA*GAAGA**GAGTACACTATTTGCTACTTT
CTTTAAGTACGTGCGT

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR2AC06JQ 848 0 0
CCGCAGCTGAGCACGTCGAGGTGACACCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTTG
TGGCTGACTCTGCTCCAGCACCGGTAACAGAAACTGAAGCTACCATGGAAAAAACAGAGG
AAACCAAGACAGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTCGAAGTAACCA
CTAAAGACGTCCCTGTGGAAGAAGCTCCAGTGGAATCTCCTGCCGCTGTGGAGGAAGAGA
GCAAGACAGAGGAAGTCGTAGAGCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAC
AGGAAACTCCAGCGGTTGTGGAGGAAGAGAGCAAAGCAGAGGAAGTTGTAGAGCCAAAGA
AAGAGGAAGAAACTCCGGCGGTTGTGGAGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTAGAGC
CCAAGAAAGAGGAAGGAACTCCGGCGGTTGTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTAGAGC
CCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTGGTTGTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGAAT
TGAAGACAGAGGAAACTCCAGCTGTTGTGGAGGAAGAGAAGAAGACAGAAGCAGAGGAGG
AGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCGTGGAAGCCGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGCCG
TGGAGAAGGCTGATGAGTAAATTTGAAAGAAGAAGAAGAAGTACACTATTTGCTACTTTT
CTTTTAAGTACGTTGCGTCTTTGCTTTGTTGTTCTGAGTCTGTCACTATTGTCCCTTTTT
GCATCACCCTCTCTCTTTTTAAGTATATCTATCTTCATATGTTTAATATAAATTAAAAAT
CATCTTTA

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR2G154JQ 791 0 0
TTGTGGCTGACTCTGCTCCAGCACCGGTAACAGAAACTGAGGCTACCATGGAAAAA*CAG
AGGAAACCAAGACAGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTCGAAGTAA
CCACTAAAGACGTCCCTGTGGAAGAAGCTCCAGTGGAATCTCCTGCCGCTGTGGAGGAAG
AGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTAGAGCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGA
CACAGGAAACTCCAGTGGTTGTGGAGGAAGAGAGCAAAGTAGAGGAAGTTGTAGAGCCAA
AGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGGTTGTGGAGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTAG
AGCCCAAGAAAGAGGAAGGAACTCCGGCGGTTGTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTAG
AGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTGGTTGTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAG
AAGTGGAGACAGAGGAAACTCCAGCTGTTGTGGAGGAAGAGAAGAAGACAGAAGCAGAGG
AGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCGTGGAAGCCGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTG
CCGTGGAGAAGGCTGATGAGTAAATTTGAAAGAAGAAGAAGAAGTACACTATTTGCTACT
TTTCTTTTAAGTACGTTGCGTCTTTGCTTTGTTGTTCTGAGTCTGTCACTATTGTCCCTT
TTTGCATCACCCTCTCTCTTTTTAAGTATATCTATCTTCATATGTTTAATATAAATTAAA
AATCATCTTTA

QA 1 791 1 791
DS 



CO CL127Contig2 941 2 2 U
GGACACACATCAAAGCATCACACACACAAACACACACTTTCTCTTCTCTTCTTTGATCTT
TCCTCTTTTCTACACATTCAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCAGCCGCA
GCTGAGCACGTCGAGGTGACACCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTCGCTGCT
GCCGTTGTGGCTGACTCTGCTCCAGCTCCGGTAACAGAAACTGAAGCTCCAGTGGAAGAG
ACAGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTTGAAGTAACCACTAAAGAC
GTCCCTGTGGAAGAAGCTCCAGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTA
GAGCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCGGTTGTG
GAGGAAGAGAGCAAAGCAGAGGAAGTCGTAGAGCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTGGAAGAA
ACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCCGTTGTTGAGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTA
GAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGGTTGTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTA
GAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTGGTTGTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAA
GAAGTGAAGACAGAGGAAACTCCAGCTGTTGTGGAGGAAGAGAAGAAGCCAGAAGCAGAG
GAGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCGTGGAAGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGCC
GTGGAGAAGGCTGATGAGTAAATCTGAAAGAAGAAGAAGTACACTATTTGCTACTTTTTT
TTTAAAAGTACGTTGCGTCTTTGCTTTGTTGTTCTGAGTCTGTCACTATTGTCCTTTTTT
GCATCACCCTCTCTCTTTTTAAGTATATCTATCTTCATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV78TF U 1
AF RR2BV78JQ C 240
BS 1 602 RR2BV78TF
BS 603 941 RR2BV78JQ

RD RR2BV78TF 602 0 0
GGACACACATCAAAGCATCACACACACAAACACACACTTTCTCTTCTCTTCTTTGATCTT
TCCTCTTTTCTACACATTCAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCAGCCGCA
GCTGAGCACGTCGAGGTGACACCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTCGCTGCT
GCCGTTGTGGCTGACTCTGCTCCAGCTCCGGTAACAGAAACTGAAGCTCCAGTGGAAGAG
ACAGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTTGAAGTAACCACTAAAGAC
GTCCCTGTGGAAGAAGCTCCAGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTA
GAGCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCGGTTGTG
GAGGAAGAGAGCAAAGCAGAGGAAGTCGTAGAGCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTGGAAGAA
ACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCCGTTGTTGAGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTA
GAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGGTTGTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTA
GA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2BV78JQ 702 0 0
GACAGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTTGAAGTAACCACTAAAGA
CGTCCCTGTGGAAGAAGCTCCAGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGT
AGAGCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCGGTTGT
GGAGGAAGAGAGCAAAGCAGAGGAAGTCGTAGAGCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTGGAAGA
AACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCCGTTGTTGAGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGT
AGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGGTTGTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGT
AGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTGGTTGTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGA
AGAAGTGAAGACAGAGGAAACTCCAGCTGTTGTGGAGGAAGAGAAGAAGCCAGAAGCAGA
GGAGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCGTGGAAGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGC
CGTGGAGAAGGCTGATGAGTAAATCTGAAAGAAGAAGAAGTACACTATTTGCTACTTTTT
TTTTAAAAGTACGTTGCGTCTTTGCTTTGTTGTTCTGAGTCTGTCACTATTGTCCTTTTT
TGCATCACCCTCTCTCTTTTTAAGTATATCTATCTTCATATG

QA 1 702 1 702
DS 



CO CL127Contig3 879 12 21 U
GGGACACATCAAAGCATCACACACACAAACACACACTTTCTCTTCTCTTCTTTGATCTTT
CCTCTTTTCTACACATTCAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCACCCGCAG
CTGAGCACGTCGAGGTGACACCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTCGCTGCTG
CCGTTGTGGATGACTCTGCTCCAGCTCCGGTAACAGAAACTGAAGCTCCAGTGGAAGAGA
CAGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTTGAAGTAACCACTAAAGACG
TCCCTGTGGAAGAAGCTCCAGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTAG
AGCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCCGTTGTTG
AGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGG
TTGTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTGG
TTGTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGAAGTGAAGACAGAGGAAACTCCAGCTGTTG
TGGTGGAAGAGAAGAAGCCAGAAGCAGAGGAAGGGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCG
TGGAAGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAGGCTGATGAGTAAATCTGAA
AGAAGAAGAAGGAAGTACACTATTTGCTACTTTTTTTTAAAAGTACGTTGCGTCTTTGCT
TTGTTGTTCTGAGTCTGTCACTATTGTCCCTTTTTGCATCACCCTCTCTTTTCAAGTATC
TATCTTCATATGTTTAATATAAATTAAAAATCATCTTTA


BQ
10 25 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 
55 55 55 55 55 25 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 45 60 45 60 60 60 55 
55 55 55 20 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2EA42TF U 1
AF RR2FK37TF U 3
AF RR2FK37JQ C 369
AF RR2DQ34TF U 1
AF RR2DD78TF U 2
AF RR2BF78TF U 2
AF RR2GT08TF U -2
AF RR2BF78JQ C 17
AF RR2DQ34JQ C 54
AF RR2EA42JQ C 120
AF RR2DD78JQ C 196
AF RR2BT27TF U 437
BS 1 125 RR2DQ34TF
BS 126 126 RR2EA42TF
BS 127 152 RR2DQ34TF
BS 153 153 RR2EA42TF
BS 154 520 RR2DQ34TF
BS 521 521 RR2EA42TF
BS 522 589 RR2DQ34TF
BS 590 590 RR2DD78TF
BS 591 632 RR2DQ34TF
BS 633 633 RR2FK37TF
BS 634 701 RR2DQ34TF
BS 702 702 RR2DD78TF
BS 703 723 RR2DQ34TF
BS 724 731 RR2BF78TF
BS 732 732 RR2BT27TF
BS 733 757 RR2GT08TF
BS 758 759 RR2BT27TF
BS 760 768 RR2GT08TF
BS 769 769 RR2BT27TF
BS 770 804 RR2GT08TF
BS 805 879 RR2BT27TF

RD RR2EA42TF 562 0 0
G
GGACACATCAAAGCATCACACACACAAACACACACTTTCTCTTCTCTTCTTTGATCTTTC
CTCTTTTCTACACATTCAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCACCCGCAGC
TGAGCACGTCGAGGTGACACCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTCGCTGCTGC
CGTTGTGGATGACTCTGCTCCAGCTCCGGTAACAGAAACTGAAGCTCCAGTGGAAGAGAC
AGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTTGAAGTAACCACTAAAGACGT
CCCTGTGGAAGAAGCTCCAGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTAGA
GCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCCGTTGTTGA
GGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGGT
TGTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTGGT
TGTGGAAGAAGAGACCAAAGC

QA 2 562 2 562
DS 

RD RR2FK37TF 717 0 0
GACACATCAAAGCATCACACACACAAACACACACTTTCTCTTCTCTTCTTTGATCTTTCC
TCTTTTCTACACATTCAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCACCCGCAGCT
GAGCACGTCGAGGTGACACCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTCGCTGCTGCC
GTTGTGGATGACTCTGCTCCAGCTCCGGTAACAGAAACTGAAGCTCCAGTGGAAGAGACA
GAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCTCGTTGAAGTAACCACTAAAGACGTC
CCTGTGGAAGAAGCTCCAGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTAGAG
CCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCCGTTGTTGAG
GAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGGTT
GTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTGGTT
GTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGAAGTGAAGACAGAGGAAACTCCAGCTGTTGTG
GTGGAAGAGAAGAAGCCAGAAGCAGAGGAAGGGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCGTG
GAAGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAG*CTGATGAGTAAATCTGA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2FK37JQ 344 0 0
AAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGCCAGAGGAAACTCCAGCCGTTGTTGAGGAAGAG
AGCAAAACAGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAATTCCGGCGGTTGTGGAG
GAAGAGAGCAAAGAAGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTGGTTGTGGAA
GAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGAAGTGAAGACAGAGGAAACTCCAGCTGTTGTGGTGGAA
GAGAAGAAGCCAGAAGCAGAGGAAGGGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCGTGGAAGCC
GCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAGGCTGATGAGTA

QA 1 344 1 344
DS 

RD RR2DQ34TF 724 0 0
GGGACACATCAAAGCATCACACACACAAACACACACTTTCTCTTCTCTTCTTTGATCTTT
CCTCTTTTCTACACATTCAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCACCCGCAG
CTGAGTACGTCGAGGTGACACCACCAAAGACATTGGAGCCTGAGGAAACCGTCGCTGCTG
CCGTTGTGGATGACTCTGCTCCAGCTCCGGTAACAGAAACTGAAGCTCCAGTGGAAGAGA
CAGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTTGAAGTAACCACTAAAGACG
TCCCTGTGGAAGAAGCTCCAGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTAG
AGCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCCGTTGTTG
AGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGG
TTGTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAGGAGGAAGAAGCTCCGGTGG
TTGTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGAAGTGAAGACAGAGGAAACCCCAGCTGTTG
TGGTGGAAGAGAAGAAGCCAGAAGCAGAGGAAAGGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCG
TGGAAGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAG*CTGATGAGTAAATCTGAA
AGAG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2DD78TF 723 0 0
GGACACATCAAAGCATCACACACACAAACACACACTTTCTCTTCTCTTCTTTGATCTTTC
CTCTTTTCTACACATTCAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCACCCGCAGC
TGAGCACGTCGAGGTGACACCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTCGCTGCTGC
CGTTGTGGATGACTCTGCTCCAGCTCCGGTAACAGAAACTGAAGCTCCAGTGGAAGAGAC
AGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTTGAAGTAACCACTAAAGACGT
CCCTGTGGAAGAAGCTCCAGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTAGA
GCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCCGTTGTTGA
GGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGGT
TGTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTGGT
TGTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGAAGTGAGGACAGAGGAAACTCCAGCTGTTGT
GGTGGAAGAGAAGAAGCCAGAAGCAGAGGAAAGGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCGT
GGAAGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAGGCTGATGAGTAAATCTGAAA
GA
G

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2BF78TF 730 0 0
GGACACATCAAAGCATCACACACACAAACACACACTTTCTCTTCTCTTCTTTGATCTTTC
CTCTTTTCTACACATTCAAATGGCCACTGCTGAT*TTGAACAAGTGACTCCACCCGCAGC
TGAGCACGCCGAGGTGACACCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTCGCTGCTGC
CGTTGTGGATGACTCTGCTCCAGCTCCGGTAACAGAAACTGAAGCTCCAGTGGAAGAGAC
AGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTTGAAGTAACCACTAAAGACGT
CCCTGTGGAAGAAGCTCCAGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTAGA
GCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCCGTTGTTGA
GGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGGT
TGTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTGGT
TGTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGAAGTGAAGTCAGAGGAAACTCCAGCTGTTGT
GGTGGAAGAGAAGAATCCAGAAGCAGAGGAAGGGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCGT
GGAAGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAAGCTGATGAGTAAATCTGAAA
GAAGAAGAAG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2GT08TF 807 0 0
GGGCTC
ACACATCAAAGCATCACACACACAAACACACACTTTCTCTTCCCTTCTTTGATCTTTCCT
CTTTTCTACACATTCAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCACCCGCAGCTG
AGCACGTCGAGGTGACATCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTCGCTGCTGCCG
TTGTGGATGACTCTGCTCCAGCTCCGGTAACAGAAACTGAAGCTCCAGTGGAAGAGACAG
AGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTTGAAGTAACCACTAAAGACGTCC
CTGTGGAAGAAGCTCCAGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTAGAGC
CTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCTAGCCGTTGTTGAGG
AAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGGTTG
TCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTGGTTG
TGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGAAGTGAAGACAGAGGAAACTCCAGCTGTTGTGG
TGGAAGAGAAGAAGCCAGAAGCAGAGGAAGGGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCGTGG
AAGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAG*CTGATGAGTAA*TCTGAAAGA
*GAAGAAG*AAGTACACTATTTGCTACTTTTTTT**AAAGTACGT*GCGTCTTTGCTTTG
TTGTTCTGAGTCTGTCACTAT

QA 7 807 7 807
DS 

RD RR2BF78JQ 836 0 0
TCACACACACAAACACACACTTTCTCTTCTCTTCTTTGATCTTTCCTCTTTTCTACACAT
TCAAATGGCCACTGCTGAT*TTGAACAAGTGACTCCACCCGCAGCTGAGCACGCCGAGGT
GACACCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTCGCTGCTGCCGTTGTGGATGACTC
TGCTCCAGCTCCGGTAACAGAAACTGAAGCTCCAGTGGAAGAGACAGAGACGGAGGAGAT
CAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTTGAAGTAACCACTAAAGACGTCCCTGTGGAAGAAGC
TCCAGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTAGAGCCTAAGAAAGAGGA
AGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCCGTTGTTGAGGAAGAGAGCAAAAC
AGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGGTTGTCGAGGAAGAGAG
CAAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTGGTTGTGGAAGAAGAGAC
CAAAGCAGAGGAAGAAGTGAAGTCAGAGGAAACTCCAGCTGTTGTGGTGGAAGAGAAGAA
TCCAGAAGCAGAGGAAGGGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCGTGGAAGCCGCCGCAGC
TCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAGGCTGATGAGTAAATCTGAAAGAAGAAGAAGGAAGT
ACACTATTTGCTACTTTTTTTTAAAAGTACGTTGCGTCTTTGCTTTGTTGTTCTGAGTCT
GTCACTATTGTCCCTTTTTGCATCACCCTCTCTTTTCAAGTATCTATCTTCATATG

QA 1 836 1 836
DS 

RD RR2DQ34JQ 826 0 0
TTGATCTTCCTC
TTTCTACACAT*CAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCACCCGCAGCTGAG
TACGTCGAGGTGACACCACCAAAGACATTGGAGC*TGAGGAAACTGTCGCTGCTGCCGTT
GTGGATGACTCTGCTCCAGCTCCGGTAACAGAAACTGAAGCTCCAGTGGAAGAGACAGAG
ACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTTGAAGTAACCACTAAAGACGTCCCT
GTGGAAGAAGCTCCAGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTAGAGCCT
AAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCCGTTGTTGAGGAA
GAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGGTTGTC
GAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAGGAGGAAGAAGCTCCGGTGGTTGTG
GAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGAAGTGAAGACAGAGGAAACCCCAGCTGTTGTGGTG
GAAGAGAAGAAGCCAGAAGCAGAGGAAGGGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCGTGGAA
GCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAGGCTGATGAGTAAATCTGAAAGAAG
AAGAAGGAAGTACACTATTTGCTACTTTTTTTTAAAAGTACGTTGCGTCTTTGCTTTGTT
GTTCTGAGTCTGTCACTATTGTCCCTTTTTGCATCACCCTCTCTTTTCAAGTATCTATCT
TCATATGTTTAATATAAATTAAAAATCATCTTTA

QA 13 826 13 826
DS 

RD RR2EA42JQ 760 0 0
GCTGAGCACGTCGAGGTGACACCACCAAAGACAGTGGAGC*TGAGGAAACCGTCGCTGCT
GCCGTTGTGGATGACTCTGCTCCAGCTCCGGTAACAGAAACTGAAGCTCCAGTGGAAGAG
ACAGAGACGGAGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTTGAAGTAACCACTAAAGAC
GTCCCTGTGGAAGAAGCTCCAGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTA
GAGCCTAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCCGTTGTT
GAGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCG
GTTGTCGAGGAAGAGAGCAAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTG
GTTGTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGAAGTGAAGACAGAGGAAACTCCAGCTGTT
GTGGTGGAAGAGAAGAAGCCAGAAGCAGAGGAAGGGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCC
GTGGAAGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAGGCTGATGAGTAAATCTGA
AAGAAGAAGAAGGAAGTACACTATTTGCTACTTTTTTTTAAAAGTACGTTGCGTCTTTGC
TTTGTTGTTCTGAGTCTGTCACTATTGTCCCTTTTTGCATCACCCTCTCTTTTCAAGTAT
CTATCTTCATATGTTTAATATAAATTAAAAATCATCTTTA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2DD78JQ 657 0 0
CTGCTCCAGCTCCGGTAACAGAAACTGAAGCTCCAGTGGAAGAGACAGAGACGGAGGAGA
TCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTTGAAGTAACCACTAAAGACGTCCCTGTGGAAGAAG
CTCCAGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTAGAGCCTAAGAAAGAGG
AAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCCGTTGTTGAGGAAGAGAGCAAAA
CAGAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGGTTGTCGAGGAAGAGA
GCAAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTGGTTGTGGAAGAAGAGA
CCAAAGCAGAGGAAGAAGTGAGGACAGAGGAAACTCCAGCTGTTGTGGTGGAAGAGAAGA
AGCCAGAAGCAGAGGAAGGGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCGTGGAAGCCGCCGCAG
CTCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAGGCTGATGAGTAAATTTGAAAGAAGAAGAAGGAAG
TACACTATTTGCTACTTTTTTTTAAAAGTACGTTGCGTCTTTGCTTTGTTGTTCTGAGTC
TGTCACTATTGTCCCTTTTTGCATCACCCTCTCTTTTCAAGTATCTATCTTCATATG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2BT27TF 443 0 0
G
GAGGAAGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCGGCGGTTGTCGAGGAAGAGAGC
AAAGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCGGTGGTTGTGGAAGAAGAGACC
AAAGCAGAGGAAGAAGTGAAGACAGAGGAAACTCCAGCTGTTGTGGTGGAAGAGAAGAAG
CCAGAAGCAGAGGAAGGGGAGAAAACCACTGAAGTAGCAGCCGTGGAAGCCGCCGCAGCT
CCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAGGCTGATGAGTAAATCTGAAAGAAGAAGAAGGAAGTA
CACTATTTGCTACTTTTTTTTAAAAGTACGTTGCGTCTTTGCTTTGTTGTTCTGAGTCTG
TCACTATTGTCCCTTTTTGCATCACCCTCTCTTTTCAAGTATCTATCTTCATATGTTTAA
TATAAATTAAAAATCATCTTTA

QA 2 443 2 443
DS 



AS 2 18

CO CL128Contig1 612 11 12 U
GGGAGAACACAGAGATCGGTCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGAGA
GAAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAACCTGCGGGTTTCACGGT
GGAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTCAG
AATCGTCGCGAGTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAG
CATGGACTTGAGGGACGGCGTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTTTA
CAAATTCGTGGACAAGTACGGTGCTAACGTTGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAGGA
CGAGTGGTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGACTCACTGGTTTGGCGATTTGGGC
GGTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGGGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCTTT
GGCTCAGTAAAATCTTGAAAGTGTGTGTACTTATTATGCTTATCTGTTTTTAGCGTCATT
GTTCTGTTCTATGTAATGTTGTTAAGTAACTTAAAGAACATACTTTGAATATATATAACC
TCTAGTGTTTTG


BQ
10 30 30 30 30 30 35 35 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 30 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 50 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 55 40 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR2DR81JQ C 1
AF RR2DR81TF U 1
AF RR2CI56JQ C 7
AF RR2CI56TF U 7
AF RR2AZ62TFB U 10
AF RR2CQ12TF U 5
AF RR2AZ62JQ C 163
AF RR2E470JQ C 2
AF RR2CH10JQ C 11
AF RR2CH10TF U 11
AF RR2E470TF U 2
BS 1 1 RR2DR81JQ
BS 2 98 RR2DR81TF
BS 99 99 RR2CH10TF
BS 100 196 RR2DR81TF
BS 197 197 RR2CH10TF
BS 198 345 RR2DR81TF
BS 346 346 RR2CH10TF
BS 347 553 RR2DR81TF
BS 554 554 RR2CH10TF
BS 555 591 RR2DR81TF
BS 592 609 RR2CH10TF
BS 610 612 RR2E470JQ

RD RR2DR81JQ 595 0 0
GGGAGAACACAGAGATCGGTCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGAGA
GAAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATCGAAACCTGCGGGTTTCACGGT
GGAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTCAG
AATCGTCGCGAGTGGCTTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAG
CATGGACTTGAGGGACGGCGTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTTTA
CAAATTCGTGGACAAGTACGGTGCTAACGTTGATGGATACAGCCCCATCTACAACGAGGA
CGAGTGGTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGACTCACTGGTTTGGCGATTTGGGC
GGTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGGGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCTTT
GGCTCAGTAAAATCTTGAAAGTGTGTGTACTTATTATGCTTATCTGTTTTTAGCGTCATT
GTTCTGTTCTATGCAATGTTGTTAAGTAACTTAAAGAACATACTTTGAATA
AAGG

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2DR81TF 595 0 0
G
GGAGAACACAGAGATCGGTCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGAGAG
AAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATCGAAACCTGCGGGTTTCACGGTG
GAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTCAGA
ATCGTCGCGAGTGGCTTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAGC
ATGGACTTGAGGGACGGCGTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTTTAC
AAATTCGTGGACAAGTACGGTGCTAACGTTGATGGATACAGCCCCATCTACAACGAGGAC
GAGTGGTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGACTCACTGGTTTGGCGATTTGGGCG
GTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGGGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCTTTG
GCTCAGTAAAATCTTGAAAGTGTGTGTACTTATTATGCTTATCTGTTTTTAGCGTCATTG
TTCTGTTCTATGCAATGTTGTTAAGTAACTTAAAGAACATACTTTGAATA
AAGG

QA 2 591 2 591
DS 

RD RR2CI56JQ 586 0 0
GG
ACAGAGATCGGTCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGAGAGGAAATGG
CTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAACCTGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGA
TGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCCTCCTTCAGAATCGTCG
CGAGTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACT
TGAGGGACGGCGTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTTTACAAATTCG
TGGACAAGTACGGTGCTAACGTTGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAGGACGAGTGGT
CAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGACTCACTGGTTTGGCGATTTGGGCGGTGACAC
TCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGGGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCTTTGGCTCAGT
AAAATCTTGAAAGTGTGTGTACTTATTATGCTTATCTGTTTTTAGCGTCATTGTTCTGTT
CTATGTAATGTTGTTAAGTAACTTAAAGAACATACTTTGAATAT

QA 3 586 3 586
DS 

RD RR2CI56TF 586 0 0
GG
ACAGAGATCGGTCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGAGAGGAAATGG
CTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAACCTGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGA
TGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCCTCCTTCAGAATCGTCG
CGAGTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACT
TGAGGGACGGCGTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTTTACAAATTCG
TGGACAAGTACGGTGCTAACGTTGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAGGACGAGTGGT
CAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGACTCACTGGTTTGGCGATTTGGGCGGTGACAC
TCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGGGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCTTTGGCTCAGT
AAAATCTTGAAAGTGTGTGTACTTATTATGCTTATCTGTTTTTAGCGTCATTGTTCTGTT
CTATGTAATGTTGTTAAGTAACTTAAAGAACATACTTTGAATAT

QA 3 586 3 586
DS 

RD RR2AZ62TFB 581 0 0
GG
GAGATCGGTCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGAGAGAAAATGGGTG
CTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAACCTGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGT
CGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTCAGAATCGTCGCGA
GTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGA
GGGACGGCGTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTTTACAAATTCGTGG
ACAAGTACGGTGCTAACGTTGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAGGACGAGTGGTCAG
CGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGACTCACTGGTTTGGCGATTTGGGCGGTGACACTCG
CCGGAATTCTTGCCGGAGGGGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCTTTGGCTCAGTAAA
ATCTTGAAAGTGTGTGTACTTATTATGCTTATCTGTTTTTAGCGTCATTGTTCTGTTCTA
TGTAATGTTGTTAAGTAACTTAAAGAACATACTTTGAAT

QA 3 581 3 581
DS 

RD RR2CQ12TF 585 0 0
GG
ACACAGAGATCGGTCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGAGAGAAAAT
GGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAACCTGCGGGTTTCACGGTGGAGAA
GATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTCAGAATCGT
CGCGAGTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGA
CTTGAGGGACGGCGTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTTTACAAATT
CGTGGACAAGTACGGTGCTAACGTTGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAGGACGAGTG
GTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGACTCACTGGTTTGGCGATTTGGGCGGTGAC
ACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGGGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCTTTGGCTCA
GTAAAATCTTGAAAGTGTGTGTACTTATTATGCTTATCTGTTTTTAGCGTCATTGTTCTG
TTCTATGTAATGTTGTTAAGTAACTTAAAGAACATACTTTGAA

QA 3 585 3 585
DS 

RD RR2AZ62JQ 432 0 0
TTCTCCTTCTTCCTTCAGAATCGTCGCGAGGGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCC
CTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGGGTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGG
CAAGGGATATGGTGTTTACAAATTCGTGGACAAGTACGGTGCTAACGTTGATGGATACAG
CCCTATTTACAACGAGGACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGACTCAC
TGGTTTGGCGATTTGGGCGGTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGGGCTCTTTTTGT
GTACAACACTAGTGCTTTGGCTCAGTAAAATCTTGAAAGTGTGTGTACTTATTATGCTTA
TCTGTTTTTAGCGTCATTGTTCTGTTCTATGTAATGTTGTTAAGTAACTTAAAGACCATA
CTTTGAATA
AAA

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR2E470JQ 611 0 0
GGAGAACACAGAGATCGGTCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGAGAG
AAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAACCTGCGGGTTTCACGGTG
AAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTCAGA
ATCGTCGCGAGTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAGC
ATGGACTTGAGGGACGGCGTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTTTAC
AAATTCGTGGACAAGTACGGTGCTAACGTTGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAGGAC
GAGTGGTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGACTCACTGGTTTGGCGATTTGGGCG
GTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGGGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCTTTG
GCTCAGTAAAATCTTGAAAGTGTGTGTACTTATTATGCTTATCTGTTTTTAGCGTCATTG
TTCTGTTCTATGTAATGTTGTTAAGTAACTTAAAGAACATACTTTGAATATATATAACCT
CTAGTGTTTTG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2CH10JQ 600 0 0
GGAGAGATCGGTC
GAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGAGAGAAAATGGCTGCTTCAGTGATGC
TTTCATCAGTGACATTGAAACCTGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCAGCGAGAGGAT
TACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTCAGAATCGTCGAGAGTGGCGTCAAGA
AGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCGTCG
ACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTTTACAAATTCGTGGACAAGTACGGTG
CTAACGTTGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAGGACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGACG
TGTACAAGGGAGGACTCACTGGTTTGGCGATTTGGGCGGTGACACTCGCCGGAATTCTTG
CCGGAGGGGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCTTTGGCTCAGTAAAATCTTGAAAGTG
TGTGTACTTATTATGCTTATCTGTTTTTAGCGTCATTGGTCTGTTCTATGTAATGTTGTT
AAGTAACTTAAAGAACATACTTTGAATATATATAACCTCTAGTGTT
T

QA 14 599 14 599
DS 

RD RR2CH10TF 600 0 0
GGAGAGATCGGTC
GAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGAGAGAAAATGGCTGCTTCAGTGATGC
TTTCATCAGTGACATTGAAACCTGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCAGCGAGAGGAT
TACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTCAGAATCGTCGAGAGTGGCGTCAAGA
AGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCGTCG
ACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTTTACAAATTCGTGGACAAGTACGGTG
CTAACGTTGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAGGACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGACG
TGTACAAGGGAGGACTCACTGGTTTGGCGATTTGGGCGGTGACACTCGCCGGAATTCTTG
CCGGAGGGGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCTTTGGCTCAGTAAAATCTTGAAAGTG
TGTGTACTTATTATGCTTATCTGTTTTTAGCGTCATTGGTCTGTTCTATGTAATGTTGTT
AAGTAACTTAAAGAACATACTTTGAATATATATAACCTCTAGTGTT
T

QA 14 599 14 599
DS 

RD RR2E470TF 608 0 0
GGAGAACACAGAGATCGGTCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGAGAG
AAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAACCTGCGGGTTTCACGGTG
AAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTCAGA
ATCGTCGCGAGTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAGC
ATGGACTTGAGGGACGGCGTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTTTAC
AAATTCGTGGACAAGTACGGTGCTAACGTTGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAGGAC
GAGTGGTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGACTCACTGGTTTGGCGATTTGGGCG
GTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGGGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCTTTG
GCTCAGTAAAATCTTGAAAGTGTGTGTACTTATTATGCTTATCTGTTTTTAGCGTCATTG
TTCTGTTCTATGTAATGTTGTTAAGTAACTTAAAGAACATACTTTGAATATATATAACCT
CTAGTGTT

QA 1 608 1 608
DS 



CO CL128Contig2 631 7 12 U
GGGCGAGAGCATAGGGATAGAGATCGAGATCGAGATCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAA
GTTTGATCTTGTGAGAGAACATGACTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAAC
CGGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTT
CTCCTTCTTCCTTCAGAATCGTCGCGAGTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCT
TTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCA
AGGGATATGGTGTTTACAAATTCGTCGACAAGTACGGTGCTAACGTCGATGGATACAGCC
CTATCTACAACGAGGACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGGGTCACTG
GTTTGGCTATTTGGGCGGTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGT
ACAACACTAGTGCTTTGGCTCAGTAAAATCATGAAAGTGTGTGTACTTATGCTTATCTGT
TTTTAGTGTCATTGTTCTGTTCCATGTAATGTTGTTAAGTAACTTGAAGAACATACTTTG
AATGAATATATAAGACCTCTAGTGTTTGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 35 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2FR75TF U 1
AF RR2FF23JQ C 11
AF RR2FF23TF U 11
AF RR2DJ60TF U 15
AF RR2DJ60JQ C 15
AF RR2EA72JQ C 15
AF RR2EA72TF U 15
BS 1 14 RR2FR75TF
BS 15 15 RR2DJ60TF
BS 16 18 RR2FR75TF
BS 19 19 RR2FF23TF
BS 20 35 RR2FR75TF
BS 36 37 RR2FF23TF
BS 38 65 RR2FR75TF
BS 66 66 RR2FF23TF
BS 67 559 RR2FR75TF
BS 560 560 RR2FF23TF
BS 561 629 RR2FR75TF
BS 630 631 RR2EA72JQ

RD RR2FR75TF 629 0 0
GGGCGAGAGCATAGAGATCGAGATCGAGATCGAGA**GAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAA
GTTTGGTCTTGTGAGAGAACATGACTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAAC
CGGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTT
CTCCTTCTTCCTTCAGAATCGTCGCGAGTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCT
TTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCA
AGGGATATGGTGTTTACAAATTCGTCGACAAGTACGGTGCTAACGTCGATGGATACAGCC
CTATCTACAACGAGGACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGGGTCACTG
GTTTGGCTATTTGGGCGGTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGT
ACAACACTAGTGCTTTGGCTCAGTAAAATCATGAAAGTGTGTGTACTTATGCTTATCTGT
TTTTAGTGTCATTGTTCTGCTCCATGTAATGTTGTTAAGTAACTTGAAGAACATACTTTG
AATGAATATATAAGACCTCTAGTGTTTGT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2FF23JQ 594 0 0
GGGAGC
ATAGAGATCGAGATCGAGATCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGAGA
GAACATGACTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAACCGGCGGGTTTCACGGT
GGAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTCAG
AATCGTCGCGAGTGGCGTCAAGAAGATCGAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAG
CATGGACTTGAGGGACGGCCTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTTTA
CAAATTCGTCGACAAGTACGGTGCTAACGTCGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAGGA
CGAGTGGTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGGGTCACTGGTTTGGCTATTTGGGC
GGTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCTTT
GGCTCAGTAAAATCATGAAAGTGTGTGTACTTATGCTTATCTGTTTTTAGTGTCATTGTT
CTGTTCCATGTAATGTTGTTAAGTAACTTGAAGAACATACTTTGAATG

QA 7 594 7 594
DS 

RD RR2FF23TF 594 0 0
GGGAGC
ATAGAGATCGAGATCGAGATCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGAGA
GAACATGACTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAACCGGCGGGTTTCACGGT
GGAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTCAG
AATCGTCGCGAGTGGCGTCAAGAAGATCGAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAG
CATGGACTTGAGGGACGGCCTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTTTA
CAAATTCGTCGACAAGTACGGTGCTAACGTCGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAGGA
CGAGTGGTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGGGTCACTGGTTTGGCTATTTGGGC
GGTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCTTT
GGCTCAGTAAAATCATGAAAGTGTGTGTACTTATGCTTATCTGTTTTTAGTGTCATTGTT
CTGTTCCATGTAATGTTGTTAAGTAACTTGAAGAACATACTTTGAATG

QA 7 594 7 594
DS 

RD RR2DJ60TF 601 0 0
GGATAGAGATCGAGATCGAGATCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGA
GAGAACATGACTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAACCGGCGGGTTTCACG
GTGGAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTC
AGAATCGTCGCGAGTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGC
AGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTT
TACAAATTCGTCGACAAGTACGGTGCTAACGTCGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAG
GACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGGGTCACTGGTTTGGCTATTTGG
GCGGTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCT
TTGGCTCAGTAAAATCATGAAAGTGTGTGTACTTATGCTTATCTGTTTTTAGTGTCATTG
TTCTGTTCCATGTAATGTTGTTAAGTAACTTGAAGAACATACTTTGAATGAATA
AAAAAAA

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2DJ60JQ 590 0 0
GGATAGAGATCGAGATCGAGATCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGA
GAGAACATGACTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAACCGGCGGGTTTCACG
GTGGAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTC
AGAATCGTCGCGAGTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGC
AGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTT
TACAAATTCGTCGACAAGTACGGTGCTAACGTCGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAG
GACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGGGTCACTGGTTTGGCTATTTGG
GCGGTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCT
TTGGCTCAGTAAAATCATGAAAGTGTGTGTACTTATGCTTATCTGTTTTTAGTGTCATTG
TTCTGTTCCATGTAATGTTGTTAAGTAACTTGAAGAACATACTTTGAATG

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2EA72JQ 617 0 0
GGATAGAGATCGAGATCGAGATCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGA
GAGAACATGACTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAACCGGCGGGTTTCACG
GTGGAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTC
AGAATCGTCGCGAGTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGC
AGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTT
TACAAATTCGTCGACAAGTACGGTGCTAACGTCGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAG
GACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGGGTCACTGGTTTGGCTATTTGG
GCGGTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCT
TTGGCTCAGTAAAATCATGAAAGTGTGTGTACTTATGCTTATCTGTTTTTAGTGTCATTG
TTCTGTTCCATGTAATGTTGTTAAGTAACTTGAAGAACATACTTTGAATGAATATATAAG
ACCTCTAGTGTTTGTAT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2EA72TF 617 0 0
GGATAGAGATCGAGATCGAGATCGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAGAAGTTTGATCTTGTGA
GAGAACATGACTGCTTCAGTGATGCTTTCATCAGTGACATTGAAACCGGCGGGTTTCACG
GTGGAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTC
AGAATCGTCGCGAGTGGCGTCAAGAAGATCAAGACAGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGC
AGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCGACGCTTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATATGGTGTT
TACAAATTCGTCGACAAGTACGGTGCTAACGTCGATGGATACAGCCCTATCTACAACGAG
GACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGACGTGTACAAGGGAGGGGTCACTGGTTTGGCTATTTGG
GCGGTGACACTCGCCGGAATTCTTGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACTAGTGCT
TTGGCTCAGTAAAATCATGAAAGTGTGTGTACTTATGCTTATCTGTTTTTAGTGTCATTG
TTCTGTTCCATGTAATGTTGTTAAGTAACTTGAAGAACATACTTTGAATGAATATATAAG
ACCTCTAGTGTTTGT
AT

QA 1 615 1 615
DS 



AS 4 18

CO CL129Contig1 620 8 9 U
GGAAAGCACAAACTCACATTCACAAATTAACTCGAAAAAGATCGTAGAAGAGAGACTCAG
AAATGGCTTCTACCTCCGCTGTAGCATCGGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTT
CGGCGAAAACCATTGCTTTTCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAAGGCGTCCTCCT
TCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGA
AGGCTGTGAGCGGCTTAGCCGCGGCAGCTCTCACTGTTTTCATGGTGATCCCTGAGGTGG
CTGAAGCGGCAGGCTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAATAACTTCTTGCTTAGCATTGCTG
CAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATC
CTGTCAAGAGAGCCTAAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAGAGAAATGATCTCTGTTAT
TACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATGCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCT
TCAATCTTATATGCTTCTTATATATTAAGCTATCATGACCAGATTTGGCCTTCATATTAA
GGATTCATCTTTGATGTCAG


BQ
40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 20 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 
30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2DY23TF U 1
AF RR2AY83TFB U 1
AF RR2D234JQ C 1
AF RR2D234TF U 1
AF RR2A986JQ C 1
AF RR2A986TF U 1
AF RR2FA68JQ C 5
AF RR2FA68TF U 5
BS 1 199 RR2AY83TFB
BS 200 200 RR2D234TF
BS 201 250 RR2AY83TFB
BS 251 251 RR2D234TF
BS 252 580 RR2AY83TFB
BS 581 597 RR2D234TF
BS 598 603 RR2A986TF
BS 604 615 RR2FA68TF
BS 616 620 RR2FA68JQ

RD RR2DY23TF 500 0 0
GGAAAGCACAAACTCACATTCACAAATCAACTCGAAAAAGATCGTAGAAGAGAGACTCAC
AAATGGCTTCTACCTCCGCTGTAGCATCGGTCATGCCACTAACCCAAAACCGATCATCTT
CGGCGAAAACCATTGCTTTTCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAAGGCGTCCTCCT
TCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGA
AGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACTGTTTCCATGGTGGTCCCTGAGGTGG
CTGAAGCGGCAGGCTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAATAACTTCTTGCTTAGCATTGCTG
CAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATC
CTGTCAAGAGAGCCTAAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAGAGAA*TGATCTCTGTTAT
TACTCTTTGTTGTCTGTTAT

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2AY83TFB 580 0 0
GGAAAGCACAAACTCACATTCACAAATTAACTCGAAAAAGATCGTAGAAGAGAGACTCAG
AAATGGCTTCTACCTCCGCTGTAGCATCGGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTT
CGGCGAAAACCATTGCTTTTCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAAGGCGTCCTCCT
TCTCCGTAGCCATGCCTTCGCGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGA
AGGCTGTGAGTGGCTTAGCCGCGGCAGCTCTCACTGTTTTCATGGTGATCCCTGAGGTGG
CTGAAGCGGCAGGCTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAATAACTTCTTGCTTAGCATTGCTG
CAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATC
CTGTCAAGAGAGCCTAAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAGAGAAATGATCTCTGTTAT
TACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATGCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCT
TCAATCTTATATGCTTCTTATATATTAAGCTATCATGACC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2D234JQ 598 0 0
GGAAAGCACAAACTCACATTCACAAATTAACTCGAAAAAGATCGTAGAAGAGAGACTCAG
AAATGGCTTCTACCTCCGCTGTAACATCGGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATTTT
CGGCGAAAACCATTGCTTTTCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATTTAAGGCGTCCTCCT
TCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGA
AGGCTGTGAGCGGCTTAGCCGCGGCAGCTCTCACTGTTTTCATGGTGATCCCTGAGGTGG
CTGAAGCGGCAGGCTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAATAACTTCTTGCTTAGCATTGCTG
CAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATC
CTGTCAAGAGAGCCTAAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAGAGAAATGATCTCTGTTAT
TACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATGCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCT
TCAATCTTATATGCTTCTTATATATTAAGCTATCATGACCAGATTTGGCCTTCATAT
C

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2D234TF 598 0 0
GGAAAGCACAAACTCACATTCACAAATTAACTCGAAAAAGATCGTAGAAGAGAGACTCAG
AAATGGCTTCTACCTCCGCTGTAACATCGGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTT
CGGCGAAAACCATTGCTTTTCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAAGGCGTCCTCCT
TCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGA
AGGCTGTGAGCGGCTTAGCCGCGGCAGCTCTCACTGTTTTCATGGTGATCCCTGAGGTGG
CTGAAGCGGCAGGCTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAATAACTTCTTGCTTAGCATTGCTG
CAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATC
CTGTCAAGAGAGCCTAAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAGAGAAATGATCTCTGTTAT
TACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATGCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCT
TCAATCTTATATGCTTCTTATATATTAAGCTATCATGACCAGATTTGGCCTTCATAT
C

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2A986JQ 603 0 0
GGAAAGCACAAACTCACATTCACAAATTAACTCGAAAAAGATCGTAGAAGAGAGACTCAG
AAATGGCTTCTACCTCCGCTGTAGCATCGGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTT
CGGCGAAAACCATTGCTTTTCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATTTAAGGCGTCCTCCT
TCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGA
AGGCTGTGAGCGGCTTAGCCGCGGCAGCT**CACTGTTTTCATGGTGATCCCTGAGGTGG
CTGAAGCGGCAGGCTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAATAACTTCTTGCTTAGCATTGCTG
CAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATC
CTGTCAAGAGAGCCTAAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAGAGAAATGATCTCTGTTAT
TACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATGCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCT
TCAATCTTATATGCTTCTTATATATTAAGCTATCATGACCAGATTTGGCCTTCATATTAA
GGA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2A986TF 603 0 0
GGAAAGCACAAACTCACATTCACAAATTAACTCGAAAAAGATCGTAGAAGAGAGACTCAG
AAATGGCTTCTACCTCCGCTGTAGCATCGGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTT
CGGCGAAAACCATTGCTTTTCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAAGGCGTCCTCCT
TCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGA
AGGCTGTGAGCGGCTTAGCCGCGGCAGCT**CACTGTTTTCATGGTGATCCCTGAGGTGG
CTGAAGCGGCAGGCTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAATAACTTCTTGCTTAGCATTGCTG
CAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATC
CTGTCAAGAGAGCCTAAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAGAGAAATGATCTCTGTTAT
TACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATGCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCT
TCAATCTTATATGCTTCTTATATATTAAGCTATCATGACCAGATTTGGCCTTCATATTAA
GGA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2FA68JQ 616 0 0
GGG
ACAAACTCACATTCACAAATTAACTCGAAAAAGATCGTAGAAGAGAGACTCAGAAATGGC
TTCTACCTCCGCTGTAGCATCGGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTTCGGCGAA
AACCATTGCTTTTCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATTTAAGGCGTCCTCCTTCTCCGT
AGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGAAGGCTGT
GAGCGGCTTAGTCGCGGCAGCTCTCACTGTTTTCATGGTGATCCCTGAGGTGGCTGAAGC
GGCAGGCTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAATAACTTCTTGCTTAGCATTGCTGCAGGAGG
CGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATCCTGTCAA
GAGAGCCTAAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAGAGAAATGACCTCTGTTATTACTCTT
TGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATGCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCTTCAATCT
TATATGCTTCTTATATATTAAGCTATCATGACCAGATTTGGCCTTCATATTAAGGATTCA
TCTTTGATGTCAG

QA 4 616 4 616
DS 

RD RR2FA68TF 616 0 0
GGG
ACAAACTCACATTCACAAATTAACTCGAAAAAGATCGTAGAAGAGAGACTCAGAAATGGC
TTCTACCTCCGCTGTAGCATCGGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTTCGGCGAA
AACCATTGCTTTTCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAAGGCGTCCTCCTTCTCCGT
AGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGAAGGCTGT
GAGCGGCTTAGTCGCGGCAGCTCTCACTGTTTTCATGGTGATCCCTGAGGTGGCTGAAGC
GGCAGGCTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAATAACTTCTTGCTTAGCATTGCTGCAGGAGG
CGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATCCTGTCAA
GAGAGCCTAAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAAAGAGAAATGACCTCTGTTATTACTCTT
TGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATGCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCTTCAATCT
TATATGCTTCTTATATATTAAGCTATCATGACCAGATTTGGCCTTCATATTAAGGATTCA
TCTTTGAT
GTCAG

QA 4 611 4 611
DS 



CO CL129Contig2 613 4 3 U
GGAAAGCACAAACTCACATTCACAAATCAACTCGAAAAAGATCGAAGAAGAGAGACTCAG
AAATGGCTTCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTT
CGGCGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAACGCGTCCTCCT
TCTCCGTAGCGATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGA
AGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACCGTTTCCATGGTGATCCCTGAGGTGG
CTGAAGCGGCAGGTTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAAGAACTTTTTGCTTAGCATTGCCG
CAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATC
CTGTCAAGAGAGGCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAAATGATCTCTGTTAT
TACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATGCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCT
TCAATCTTATATGCTTCTTATATTAAGCTATCATGACCAGATTTGGCCTTCATATTAAGG
ATTCATCTTTGAT


BQ
15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM02JQ C 197
AF RR2GM02TF U 1
AF RR2CH86TF U 1
AF RR2G669TF U -2
BS 1 457 RR2CH86TF
BS 458 459 RR2GM02TF
BS 460 613 RR2CH86TF

RD RR2GM02JQ 368 0 0
TTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGAAGGCTGTGAGCGGCTT
AGCAGCGGCAGCTCTCACCGTTTCCATGGTGATCCCTGAGGTGGCTGAAGCGGCAGGTTC
AGGTATCTCTCCTTCTCTCAAGAACTTTTTGCTTAGCATTGCCGCAGGAGGCGTGGTGCT
CACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATCCTGTCAAGAGAGGCTA
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAAATGATCTCTGTTATTACTCTTTGTTGTCTG
TTATCGATTTGTGAATGCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCTTCAATCTTATATGCTT
CTTATAT
C

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR2GM02TF 564 0 0
GGAAAGCACAAACTCACATTCACAAATCAACTCGAAAAAGATCGAAGAAGAGAGACTCAG
AAATGGCTTCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTT
CGGCGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAACGCGTCCTCCT
TCTCCGTAGCGATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGA
AGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACCGTTTCCATGGTGATCCCTGAGGTGG
CTGAAGCGGCAGGTTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAAGAACTTTTTGCTTAGCATTGCCG
CAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATC
CTGTCAAGAGAGGCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAAATGATCTCTGTTAT
TACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATGCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCT
TCAATCTTATATGCTTCTTATAT
C

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2CH86TF 613 0 0
GGAAAGCACAAACTCACATTCACAAATCAACTCGAAAAAGATCGAAGAAGAGAGACTCAG
AAATGGCTTCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTT
CGGCGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAACGCGTCCTCCT
TCTCCGTAGCGATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGA
AGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACCGTTTCCATGGTGATCCCTGAGGTGG
CTGAAGCGGCAGGTTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAAGAACTTTTTGCTTAGCATTGCCG
CAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATC
CTGTCAAGAGAGGCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA**AAGAGAAATGATCTCTGTTAT
TACTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATGCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCT
TCAATCTTATATGCTTCTTATATTAAGCTATCATGACCAGATTTGGCCTTCATATTAAGG
ATTCATCTTTGAT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2G669TF 607 0 0
GGGAA
AAAGCACAAACTCACATTCACAAATCAACTCGAAAAAGATCGAAGAAGAGAGACTCAGAA
ATGGCTCCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTTCG
GCGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAACGCGTCCTCCTTC
TCCGTAGCGATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGAAG
GCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACCGTTTCCATGGTGATCCCTGAGGTGGCT
GAAGCGGCAGGTTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAAGAACTTTTTGCTTAGCATTGCCGCA
GGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATCCT
GTCAAGAGAGGCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAAATGATCTCTGTTATTA
CTCTTTGTTGTCTGTTATCGATTTGTGAATGCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCTTC
AATCTTATATGCTTCTTATATTAAGCTATCATGACCAGATTTGGCCTTCAT*TTAAGGAT
TC

QA 6 607 6 607
DS 



CO CL129Contig3 569 4 3 U
GGAAAAGAACAAACTCACATTCACAAATCAACTCGAAAAAGATCGAAGAAGAGAGACTCA
GAAATGGCTTCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCATGCCACTCACCGAAAACCGCTCGTCT
TCCGTGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCCAAGGCGTCCTCC
TTCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAG
AAGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACCGTTTCCATGGTGATCCCTGAGGTG
GCTGAAGCGGCAGGTTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAAGAACTTTTTGCTTAGCATTGCC
GCAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCACCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGAT
CCTGTCAAGAGAGGCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGATCTCTGTTATTACTCTTTGTT
GTCTGTTACCGATTTGTGAATTCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCTTCAATCTTATA
TGCTTCTTATATATTAAGCTATCATGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EX46JQ C 6
AF RR2EX46TF U 6
AF RR2DF32TF U 1
AF RR2DF32JQ C 33
BS 1 59 RR2DF32TF
BS 60 60 RR2EX46TF
BS 61 569 RR2DF32TF

RD RR2EX46JQ 526 0 0
GGA
ACAAACTCACATTCACAAATCAACTCGAAAAAGATCGAAGAAGAGAGACTCAGAAATGGC
TTCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCATGCCACTCACCGAAAACCGCTCGTCTTCCGTGAA
AACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCCAAGGCGTCCTCCTTCTCCGT
AGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGAAGGCTGT
GAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACCGTTTCCATGGTGATCCCTGAGGTGGCTGAAGC
GGCAGGTTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAAGAACTTTTTGCTTAGCATTGCCGCAGGAGG
CGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATCCTGTCAA
GAGAGGCTAAGAGAGAGAGAGAGA**AATGATCTCTGTTATTACTCTTTGTTGTCTGTTA
CCGATTTGTGAATTCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCTTC

QA 4 526 4 526
DS 

RD RR2EX46TF 526 0 0
GGA
ACAAACTCACATTCACAAATCAACTCGAAAAAGATCGAAGAAGAGAGACTCAGAAATGGC
TTCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCATGCCACTCACCGAAAACCGCTCGTCTTCCGTGAA
AACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCCAAGGCGTCCTCCTTCTCCGT
AGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGAAGGCTGT
GAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACCGTTTCCATGGTGATCCCTGAGGTGGCTGAAGC
GGCAGGTTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAAGAACTTTTTGCTTAGCATTGCCGCAGGAGG
CGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATCCTGTCAA
GAGAGGCTAAGAGAGAGAGAGAGA**AATGATCTCTGTTATTACTCTTTGTTGTCTGTTA
CCGATTTGTGAATTCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCTTC

QA 4 526 4 526
DS 

RD RR2DF32TF 569 0 0
GGAAAAGAACAAACTCACATTCACAAATCAACTCGAAAAAGATCGAAGAAGAGAGACTCG
GAAATGGCTTCTACCTCCGCTGTATCATTTGTCATGCCACTCACCGAAAACCGCTCGTCT
TCCGTGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCCAAGGCGTCCTCC
TTCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAG
AAGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACCGTTTCCATGGTGATCCCTGAGGTG
GCTGAAGCGGCAGGTTCAGGTATCTCTCCTTCTCTCAAGAACTTTTTGCTTAGCATTGCC
GCAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCACCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGAT
CCTGTCAAGAGAGGCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGATCTCTGTTATTACTCTTTGTT
GTCTGTTACCGATTTGTGAATTCATGTAATGAACTTTTGGCATTCTTCTTCAATCTTATA
TGCTTCTTATATATTAAGCTATCATGACC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2DF32JQ 537 0 0
TCGAAAAAGATCGAAGAAGAGAGACTCGGAAATGGCTTCTACCTCCGCTGTATCATTTGT
CATGCCACTCACCGAAAACCGCTCGTCTTCCGTGAAAACCATTGCCTTCCTCAAGCCACT
GCCTTTGAAACCATCCAAGGCGTCCTCCTTCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCA
AGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGAAGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCT
CACCGTTTCCATGGTGATCCCTGAGGTGGCTGAAGCGGCAGGTTCAGGTATCTCTCCTTC
TCTCAAGAACTTTTTGCTTAGCATTGCCGCAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCACCATCGG
TGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATCCTGTCAAGAGAGGCTAAGAGAGAGAGAGAGA
GAAATGATCTCTGTTATTACTCTTTGTTGTCTGTTACCGATTTGTGAATTCATGTAATGA
ACTTTTGGCATTCTTCTTCAATCTTATATGCTTCTTATATATTAAGCTATCATGACC

QA 1 537 1 537
DS 



CO CL129Contig4 514 2 2 U
AATGCCAAAAGTTCATTACATGCATTCACAAATCGATAACAGACAACAAAGAGTAATAAC
AGAGATCATTTCTCTTTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTAGGCTCTCTTGACAGGATCA
AAGTTGGAGACACTAACAACAACACCGATGATGACCGTGAGCACCACGCCTCCTGCAGCA
ATGCTAAGCAAGAAGTTATTGAGAGAAGGAGAGATACCTGAGCCTGCCGCTTCAGCCACC
TCAGGGATCACCATGAAAACAGTGAGAGCTGCCGCGGCTAAGCCGCTCACAGCCTTCTCC
ATCTTCAGGTTAGACGCATTCACTTGAAACTTCCGTGAAGGCATGGCTACGGAGAAGGAG
GACGCCTTTGAAACCATCTAAGGCAGTGGCTTGAGAAAAGCACTGGTTTTCGCCGAAGAT
GATTGGTTTTGGGTGAGTGGCATGACCGATGCTACAGCGGAGGTAGAAGCCATTTCTGAG
TCTCTCTTCTACGATCTTTTTCGAGTTAATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2FI74TF C 1
AF RR2FI74JQ U 43
BS 1 42 RR2FI74TF
BS 43 514 RR2FI74JQ

RD RR2FI74TF 514 0 0
AATGCCAAAAGTTCATTACATGCATTCACAAATCGATAACAGACAACAAAGAGTAATAAC
AGAGATCATTTCTCTTTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTAGGCTCTCTTGACAGGATCA
AAGTTGGAGACACTAACAACAACACCGATGATGACCGTGAGCACCACGCCTCCTGCAGCA
ATGCTAAGCAAGAAGTTATTGAGAGAAGGAGAGATACCTGAGCCTGCCGCTTCAGCCACC
TCAGGGATCACCATGAAAACAGTGAGAGCTGCCGCGGCTAAGCCGCTCACAGCCTTCTCC
ATCTTCAGGTTAGACGCATTCACTTGAAACTTCCGTGAAGGCATGGCTACGGAGAAGGAG
GACGCCTTTGAAACCATCTAAGGCAGTGGCTTGAGAAAAGCACTGGTTTTCGCCGAAGAT
GATTGGTTTTGGGTGAGTGGCATGACCGATGCTACAGCGGAGGTAGAAGCCATTTCTGAG
TCTCTCTTCTACGATCTTTTTCGAGTTAATTT
CC

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2FI74JQ 472 0 0
ACAACAAAGAGTAATAACAGAGATCATTTCTCTTTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTAG
GCTCTCTTGACAGGATCAAAGTTGGAGACACTAACAACAACACCGATGATGACCGTGAGC
ACCACGCCTCCTGCAGCAATGCTAAGCAAGAAGTTATTGAGAGAAGGAGAGATACCTGAG
CCTGCCGCTTCAGCCACCTCAGGGATCACCATGAAAACAGTGAGAGCTGCCGCGGCTAAG
CCGCTCACAGCCTTCTCCATCTTCAGGTTAGACGCATTCACTTGAAACTTCCGTGAAGGC
ATGGCTACGGAGAAGGAGGACGCCTTTGAAACCATCTAAGGCAGTGGCTTGAGAAAAGCA
CTGGTTTTCGCCGAAGATGATTGGTTTTGGGTGAGTGGCATGACCGATGCTACAGCGGAG
GTAGAAGCCATTTCTGAGTCTCTCTTCTACGATCTTTTTCGAGTTAATTTCC

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 19

CO CL130Contig1 1536 19 15 U
GGACTCATTTCATCTCTACCTTATCTATCTTGTTGATTTACCAACCAGAATTAAATAACA
ACAATGACAAACCATCTTCAAGATCCCTTAACCAGTTACCTCAATCCTGGTCTAACCAAA
CAAGAAGAACAAGCTGACCAAGAAATGATGAGCTTGCAAGCGTTGAAGATCACAAACACA
TTGGCTTTCCCAATGGTCTTCAAAGCTGTTTTAGAGCTAGGCGTCCTTGACACCATTGCT
TCATTCGGTCAAGGTGCGTGGCTGTCATCTTCAGAAATAGCGTTTGGTCTACCAACCAAG
CCCACCAACCCCGAGGCGCCAATGTTGCTAGACCGGATGTTACGGTTACTCGTCAGCCAC
TCGGTCTTGAAGTGCCGTATAGTTGAAACCGGAGAAAAAGATATAACCGGAAAGATAAAC
ATGGAATATGCAGCCGAACCGGTTTGCACGTTTTTCTTAAATCATGGTCCTGAGTCGGGT
ACTTTCAAGTCCCTATTCATGTTGTTCCAAAGCCAAGTCTTTTTCAACACTTGGACACAT
CTGAAAGATCTGATACAAGAAGGGAAAGATACGTTCAATTCTGCTCATGGCATGAGACTT
TTT*GAATACATCGGATTGGATGAACAATTCGCTTGTATGTTTAACCGTGCAATGTCAGA
ATCTGCTACCATGTTCATGAAGAAGATTTTAGAAACTTACAAAGGATTCAAAGATATTAA
CACTTTGGTGGATATTGGAGGAGGACTTGGCACCACACTGAATCTTATCACTTCGAAGTA
TCCTCAAATCAAGGGTATCAATTTCGACTTAGACAAGGTTTTAGCTCAAGCTCCTCTTTA
TCCAGGTGTGGAGAATGTATCTGGAGATATGTTTATAGAAGTTCCAAAAGGAGATGCTAT
CTTTATGAAATGTATATTACATGACTGGGCAGATGGAGATTGTGTGAAGATTCTGAAAAA
CTGTTGGAAGAGTCTTCCTGAAAAGGGAAAAGTAATAATAGTAGACATTGTTACACCAAT
AGAACCAAAACGTGATGACCCTTTCTCTAACATTGTTTTCAGCATGGATATGTTGATGCT
AACACAATGTTCAGGTGGTAAAGAGAGGTCTTTCTCTCAGTTCGAAGCTTTAGCCTCTGC
ATCAGGTTTTCTACGCTGTGAAATAATTTATATTGCTTATACATTTTCTGTTATCGAATT
TCACAAATAGATTCGAAGACATAAAAGATAAGCAACAATGGTTCTAAGTGTGGAAATTAT
AAACTAAAAGCAAGTCTTCCATGTTTTTTTTACTTGTTTGAATAAAGATTTAATGTAATG
GTCTTTGTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGT
TCATGGTTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGT
TCATGGTTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGT
TTTCACACGAATAAAGAATATAATTAATTTGTGAGT


BQ
10 25 25 25 25 25 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 35 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 55 40 55 55 55 55 55 55 55 40 55 15 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 50 50 30 15 45 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 
50 50 50 50 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 30 60 60 60 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 50 65 65 65 65 65 10 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 50 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR2DD96TF U 1
AF RR2DL57TF U 1
AF RR2FL04TF U 1
AF RR2EJ22TF U 2
AF RR2CM60TF U 56
AF RR2BO08TF U 8
AF RR2BF55TF U 5
AF RR2DS38TF U 451
AF RR2AP07TF U 466
AF RR2E620JQ C 1118
AF RR2DD96JQ C 786
AF RR2E620TF U 909
AF RR2FL04JQ C 737
AF RR2EJ22JQ C 650
AF RR2DS38JQ C 738
AF RR2CM60JQ C 650
AF RR2BO08JQ C 689
AF RR2DL57JQ C 832
AF RR2BF55JQ C 805
BS 1 602 RR2DD96TF
BS 603 706 RR2DL57TF
BS 707 778 RR2EJ22TF
BS 779 813 RR2BF55TF
BS 814 904 RR2DS38TF
BS 905 905 RR2AP07TF
BS 906 1094 RR2DS38TF
BS 1095 1095 RR2AP07TF
BS 1096 1107 RR2DS38TF
BS 1108 1144 RR2AP07TF
BS 1145 1145 RR2E620TF
BS 1146 1320 RR2AP07TF
BS 1321 1469 RR2E620TF
BS 1470 1531 RR2CM60JQ
BS 1532 1536 RR2BO08JQ

RD RR2DD96TF 602 0 0
GGACTCATTTCATCTCTACCTTATCTATCTTGTTGATTTACCAACCAGAATTAAATAACA
ACAATGACAAACCATCTTCAAGATCCCTTAACCAGTTACCTCAATCCTGGTCTAACCAAA
CAAGAAGAACAAGCTGACCAAGAAATGATGAGCTTGCAAGCGTTGAAGATCACAAACACA
TTGGCTTTCCCAATGGTCTTCAAAGCTGTTTTAGAGCTAGGCGTCCTTGACACCATTGCT
TCATTCGGTCAAGGTGCGTGGCTGTCATCTTCAGAAATAGCGTTTGGTCTACCAACCAAG
CCCACCAACCCCGAGGCGCCAATGTTGCTAGACCGGATGTTACGGTTACTCGTCAGCCAC
TCGGTCTTGAAGTGCCGTATAGTTGAAACCGGAGAAAAAGATATAACCGGAAAGATAAAC
ATGGAATATGCAGCCGAACCGGTTTGCACGTTTTTCTTAAATCATGGTCCTGAGTCGGGT
ACTTTCAAGTCCCTATTCATGTTGTTCCAAAGCCAAGTCTTTTTCAACACTTGGACACAT
CTGAAAGATCTGATACAAGAAGGGAAAGATACGTTCAATTCTGCTCATGGCATGAGACTT
TT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2DL57TF 706 0 0
G
GACTCATTTCATCTCTACCTTATCTATCTTGTTGATTTACCAACCAGAATTAAATAACAA
CAATGACAAACCATCTTCAAGATCCCTTAACCAGTTACCTCAATCCTGGTCTAACCAAAC
AAGAAGAACAAGCTGACCAAGAAATGATGAGCTTGCAAGCGTTGAAGATCACAAACACAT
TGGCTTTCCCAATGGTCTTCAAAGCTGTTTTAGAGCTAGGCGTCCTTGACACCATTGCTT
CATTCGGTCAAGGTGCGTGGCTGTCATCTTCAGAAATAGCGTTTGGTCTACCAACCAAGC
CCACCAACCCCGAGGCGCCAATGTTGCTAGACCGGATGTTACGGTTACTCGTCAGCCACT
CGGTCTTGAAGTGCCGTATAGTTGAAACCGGAGAAAAAGATATAACCGGAAAGATAAACA
TGGAATATGCAGCCGAACCGGTTTGCACGTTTTTCTTAAATCATGGTCCTGAGTCGGGTA
CTTTCAAGTCCCTATTCATGTTGTTCCAAAGCCAAGTCTTTTTCAACACTTGGACACATC
TGAAAGATCTGATACAAGAAGGGAAAGATACGTTCAATTCTGCTCATGGCATTAGACTTT
TT*GAATACATCGGATTGGATGAACAATTCGCTTGTATGTTTAACCGTGCAATGTCAGAA
TCTGCTACCATGTTCATGAAGAAGATTTTAGAAACTTACAAAGGA

QA 2 706 2 706
DS 

RD RR2FL04TF 707 0 0
G
GACTCATTTCATCTCTACCTTATCTATCTTGTTGATTTACCAACCAGAATTAAATAACAA
CAATGACAAACCATCCTCAAGATCCCTTAACCAGTTACCTCAATCCTGGTCTAACCAAAC
AAGAAGAACAAGCTGACCAAGAAATGATGAGCTTGCAAGCGTTGAAGATCACAAACACAT
TGGCTTTCCCAATGGTCTTTAAAGCTGTTTTAGAGCTAGGCGTCCTTGACACCATTGCTT
CATTCGGTCAAGGTGCGTGGCTGTCATCTTCAGAAATAGCGTTTGGTCTACCAACCAAGC
CCACCAACCCCGAGGCGCCAATGTTGCTAGACCGGATGTTACGGTTACTCGTCAGCCACT
CGGTCTTGAAGTGCCGTATAGTTGAAACCGGAGAAAAAGATATAACCGGAAAGATAAACA
TGGAATATGCAGCTGAACCGGTTTGCACGTTTTTCTTAAATCATGGTCCTGAGTCGGGTA
CTTTCAAGTCCCTATTCATGTTGTTCCAAAGCCAAGTCTTTTTCAACACTTGGACACATC
TGAAAGATCTGATACAAGAAGGGAAAGATACGTTCAATTCTGCTCATGGCATGAGACTTT
TT*GAATACATCAGATTGGATGAACAATTCGCTTGTATGTTTAACCGTGCAATGTCAGAA
TCTGCTACCATGTTCATGAAGAAGATTTTAGAA*CTTACAAAG
ATT

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR2EJ22TF 777 0 0
GACTCATTTCATCTCTACCTTATCTATCTTGTTGATTTACCAACCAGAATTAAATAACAA
CAATGACAAACCATCTTCAAGATCCCTTAACCAGTTATCTCAATCCTGGTCTAACCAAAC
AAGAAGAACAAGCTGACCAAGAAATGATGAGCTTGCAAGCGTTGAAGATCACAAACACAT
TGGCTTTCCCAATGGTCTTCAAAGCTGTTTTAGAGCTAGGCGTCCTTGACACCATTGCTT
CATTCGGTCAAGGTGCGTGGCTGTCATCTTCAGAAATAGCGTTTGGTCTACCAACCAAGC
CCACCAACCCCGAGGCGCCAATGTTGCTAGACCGGATGTTACGGTTACTCGTCAGCCACT
CGGTCTTGAAGTGCCGTATAGTTGAAACCGGAGAAAAAGATATAACCGGAAAGATAAACA
TGGAATATGCAGCCGAACCGGTTTGCACGTTTTTCTTAAATCATGTTCCTGAGTCGGGTA
CTTTCAAGTCCCCATTCATGTTGTTCCAAAGCCAAGTCTTTTTCAACACTTGGACACATC
TGAAAGATCTGATACAAGAAGGGAAAGATACGTTCAATTCTGCTCATGGCATGAGACTTT
TT*GAATACATCGGATTGGATGAACAATTCGCTTGTATGTTTAACCGTGCAATGTCAGAA
TCTGCTACCATGTTCATGAAGAAGATTTTAGAAACTTACAAAGGATTCAAAGATATTAAC
ACTTTGGTGGATATTGGAGGAGGACTTGGCACCACACTGAATCTTATCACTTCGAAG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2CM60TF 682 0 0
G
AACAACAATGACAAACCATCTTCAAGATCCCTTAACCAGTTACCTCAATCCTGGTCTAAC
CAAACAAGAAGAACAAGCTGACCAAGAAATGATGAGCTTGCAAGCGTTGAAGATCACAAA
CACATTGGCTTTCCCAATGGTCTTCAAAGCTGTTTTAGAGCTAGGCGTCCTTGCCACCAT
TGCTTCATTCGGTCAAGGTGCGTGGCTGTCATCTTCAGAAATAGCGTTTGGTCTACCAAC
CAAGCCCACCAACCCCGAGGCGCCAATGTTGCTAGACCGGATGTTACGGTTACTCGTCAG
CCACTCGGTCTTGAAGTGCCGTATAGTTGAAACCGGAGAAAAAGATATAACCGGAAAGAT
AAACATGGAATATGCAGCCGAACCGGTTTGCACGTTTTTCTTAAATCATGGTCCTGAGTC
GGGTACTTTCAAGTCCCTATTCATGTTGTTCCAAAGCCAAGTCTTTTTCAACACTTGGAC
ACATCTGAAAGATCTGATACAAGAAGGGAAAGATACGTTCAATTCTGCTCATGGCATGAG
ACTTTTT*GAATACATCGGATTGGATGAACAATTCGCTTGTATGTTTAACCGTGCAATGT
CAGAATCTGCTACCATGTTCATGAAGAAGATTTTAGAAACTTACAAAGGATTCAAAGATA
T*AACACTTTGGTGGAT
GTTG

QA 2 678 2 678
DS 

RD RR2BO08TF 724 0 0
TTTCATCTCTACCTTATCTATCTTGTTGATTTACCAACCAGAATTAAATAACAACAATGA
CAAACCATCTTCAAGATCCCTTAACCAGTTACCTCAATCCTGGTCTAACCAAACAAGAAG
AACAAGCTGACCAAGAAATGATGAGCTTGCAAGCGTTGAAGATCACAAACACATTGGCTT
TCCCAATGGTCTTCAAAGCTGTTTTAGAGCTAGGCGTCCTTGACACCATTGCTTCATTCG
GTCAAGGTGCGTGGCTGTCATCTTCAGAAATAGCGTTTGGTCTACCAACCAAGCCCACCA
ACCCCGAGGCGCCAATGTTGCTAGACCGGATGTTACGGTTACTCGTCAGCCACTCGGTCT
TGAAGTGCCGTATAGTTGAAACCGGAGAAAAAGATATAACCGGAAAGATAAACATGGAAT
ATGCAGCCGAACCGGTTTGCACGTTTTTCTTAAATCATGGTCCTGAGTCGGGTACTTTCA
AGTCCCTATTCATGTTGTTCCAAAGCCAAGTCTTTTTCAACACTTGGACACATCTGAAAG
ATCTGATACAAGAAGGGAAAGATACGTTCAATTCTGCTCATGGCATGAGACTTTTT*GAA
TACATCGGATTGGATGAACAATTCGCTTGTATGTTTAACCGTGCAATGTCAGAATCTGCT
ACCATGTTCATGAAGAAGATTTTAGAAACTTACAAAGGATTCAAAGATATTAACACTTTG
GTGG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2BF55TF 809 0 0
GG
ATTTCATCTCTACCTTATCTATCTTGTTGATTTACCAACCAGAATTAAATAACAACAATG
ACAAACCATCTTCAAGATCCCTTAACCAGTTACCTCAATCCTGGTCTAACCAAACAAGAA
GAACAAGCTGACCAAGAAATGATGAGCTTGCAAGCGTTGAAGATCACAAACACATTGGCT
TTCCCAATGGTCTTCAAAGCTGTTTTAGAGCTAGGCGTCCTTGACACCATTGCTTCATTC
GGTCAAGGTGCGTGGCTGTCATCTTCAGAAATAGCGTTTGGTCTACCAACCAAGCCCACC
AACCCCGAGGCGCCAATGTTGCTAGACCGGATGTTACGGTTACTCGTCAGCCACTCGGTC
TTGAAGTGCCGTATAGTTGAAACCGGAGAAAAAGATATAACCGGAAAGATAAACATGGAA
TATGCAGCCGAACCGGTTTGCACGTTTTTCTTAAATCATGGTCCTGAGTCGGGTACTTTC
AAGTCCCTATTCATGTTGTTCCAAAGCCAAGTCTTTTTCAACACTTGGACACATCTGAAA
GATCTGATACAAGAAGGGAAAGATACGTTCAATTCTGCTCATGGCATGAGACTTTTTTGA
ATACATCGGATTGGATGAACAATTCGCTTGTATGTTTAACCGTGCAATGTCAGAATCTGC
TACCATGTTCATGAAGAAGATTTTAGAAACTTACAAAGGATTCAAAGATATTAACACTTT
GGTGGATATTGGAGGAGGACTTGGCACCACACTGAATCTTATCACTTCGAAGTATCCTCA
AATCAAGGGTATCAATTTCGACTTAGA

QA 3 809 3 809
DS 

RD RR2DS38TF 664 0 0
TTTTTCTTAAATCATGGTCCTGAGTCGGGTACTTTCAAGTCCCTATTCATGTTGTTCCAA
AGCCAAGTCTTTTTCAACACTTGGACACATCTGAAAGATCTGATACAAGAAGGGAAAGAT
ACGTTCAATTCTGCTCATGGCATGAGACTTTTT*GAATACATCGGATTGGATGAACAATT
CGCTTGTATGTTTAACCGTGCAATGTCAGAATCTGCTACCATGTTCATGAAGAAGATTTT
AGAAACTTACAAAGGATTCAAAGATATTAACACTTTGGTGGATATTGGAGGAGGACTTGG
CACCACACTGAATCTTATCACTTCGAAGTATCCTCAAATCAAGGGTATCAATTTCGACTT
AGACAAGGTTTTAGCTCAAGCTCCTCTTTATCCAGGTGTGGAGAATGTATCTGGAGATAT
GTTTATAGAAGTTCCAAAAGGAGATGCTATCTTTGTGAAATGTATATTACATGACTGGGC
AGATGGAGATTGTGTGAAGATTCTGAAAAACTGTTGGAAGAGTCTTCCTGAAAAGGGAAA
AGTAATAATAGTAGACATTGTTACACCAATAGAACCAAAACGTGATGACCCTTTCTCTAA
CATTGTTTTCAGCATGGATATGTTGATGCTAACACAATGTTCAG*TGGTAAAGAGAG
TCTTTCT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2AP07TF 855 0 0
GGTCCTGAGTCGGGTACTTTCAAGTCCCTATTCATGTTGTTCCAAAGCCAAGTCTTTTTC
AACACTTGGACACATCTGAAAGATCTGATACAAGAAGGGAAAGATACGTTCAATTCTGCT
CATGGCATGAGACTTTTT*GAATACATCGGATTGGATGAACAATTCGCTTGTATGTTTAA
CCGTGCAATGTCAGAATCTGCTACCATGTTCATGAAGAAGATTT*AGAAACTTACAAAGG
ATTCAAAGAT*TTAACACTTTGGTGGATACTGGAGGAGGACTTGGCACCACACTGAATCT
TATCACTTCGAAGTATCCTCAAATCAAGGGTATCAATTTCGACTTAGACAAGGTTTTAGC
TCAAGCTCCTCTTTATCCAGGTGTGGAGAATGTATCTGGAGATGTGTTTATAGAAGTTCC
AAAAGGAGATGCTATCTTTATGAAATGTGTATTACATGACCGGGCAGATGGAGATTGTGT
GAAGATTCTGAAAAACTGTTGGAAGAGTCTTCCTGAAAAGGGAAAAGTAATAATAGTAGA
CATTGTTACACCAATAGAACCAAAACGTGATGACCCTTTCTCTAACATTGTTTTCAGCAT
GGATATGTTGATGCTAACACAATGTTCAGGTGGTAAAGAGAGGTCTTTCTCTCAGTTCGA
AGCTTTAGCCTCTGCATCACGTTTTCTACGCTGTGAAATAATTTATATTGCTTATACATT
TTCTGTTATCGAATTTCACAAATAGATTCGAAGACATAAAAGATAAGCAACAATGGTTCT
AAGTGTGGAAATTATAAACTAAAAGCAAGTCTTCCATGTTTTTTTTACTTGTTTGAATAA
AGATTTAATGTAATG

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR2E620JQ 351 0 0
CAGTTGGAAGCTTTAGCCTCTGCATCAGGTTTTCTACGCTGTGAAATAATTTATATTGCT
TATACATTTTCTGTTATCGAATTTCACAAATAGATTCGAAGACATAAAAGATAAGCAACA
ATGGTTCTAAGTGTGGAAATTATAAACTAAAAGCAAGTCTTCCATGTTTTTTTTACTTGT
TTGAATAAAGATTTAATGTAATGGTCTTTGTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGT
GTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTCATGGTTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGT
GTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTCATGGTTTTCTGATTCAAGATTGTTGT

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR2DD96JQ 691 0 0
AAATCAAGGGTATCAATTTCGACTTAGACAAGGTTTTAGCTCAAGCTCCTCTTTATCCAG
GTGTGGAGAATGTATCTGGAGATATGTTTATAGAAGTTCCAAAAGGAGATGCTATCTTTA
TGAAATGTATATTACATGACTGGGCAGATGGAGATTGTGTGAAGATTCTGAAAAACTGTT
GGAAGAGTCTTCCTGAAAAGGGAAAAGTAATAATAGTAGACATTGTTACACCAATAGAAC
CAAAACGTGATGACCCTTTCTCTAACATTGTTTTCAGCATGGATATGTTGATGCTAACAC
AATGTTCAGGTGGTAAAGAGAGGTCTTTCTCTCAGTTCGAAGCTTTAGCCTCTGCATCAG
GTTTTCTACGCTGTGAAATAATTTATATTGCTTATACATTTTCTGTTATCGAATTTCACA
AATAGATTCGAAGACATAAAAGATAAGCAACAATGGTTCTAAGTGTGGAAATTATAAACT
AAAAGCAAGTCTTCCATGTTTTTTTTACTTGTTTGAATAAAGATTTAATGTAATGGTCTT
TGTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTCATG
GTTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTCATG
GTTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2E620TF 562 0 0
AATGTATATTACATGACTGGGCAGATGGAGATTGTGTGAAGATTCTGAAAAACTGTTGGA
AGAGTCTTCCTGAAAAGGGAAAAGTAATAATAGTAGACATTGTTACACCAATAGAACCAA
AACGTGATGACCCTTTCTCTAACATTGTTTTCAGCATGGATATGTTGATGCTAACACAAT
GTTCAGGTGGTAAAGAGAGGTCTTTCTCTCAGTTCGAAGCTTTAGCCTCTGCATCAGGTT
TTCTACGCTGTGAAATAATTTATATTGCTTATACATTTTCTGTTATCGAATTTCACAAAT
AGATTCGAAGACATAAAAGATAAGCAACAATGGTTCTAAGTGTGGAAATTATAAACTAAA
AGCAAGTCTTCCATGTTTTTTTTACTTGTTTGAATAAAGATTTAATGTAATGGTCTTTGT
TTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTCATGGTT
TTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTCATGGTT
TTCTGATTCAAGATTGTTGTA
C

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2FL04JQ 743 0 0
GGAGGAGGACT*GGCACCACACTGAATCTTATCACTTCGAAGTATCCTCGAATCAAGGGT
ATCAATTTCGACTTAGACAAGGTTTTAGCTCAAGCTCCTCTTTATCCAGGTGTGGAGAAT
GTATCTGGAGATATGTTTATAGAAGTTCCAAAAGGAGATGCTATCTTTATGAAATGTATA
TTACATGACTGGGCAGATGGAGATTGTGTAAAGATTCTGAAAAACTGTTGGAAGAGTCTT
CCTGAAAAGGGAAAAGTAATAATAGTAGACATTGTTACACCAATAGAACCAAAACGTGAT
GACCCTTTCTCTAACATTGTTTTCAGCATGGATATGTTGATGCTAACACAATGTTCAGGT
GGTAAAGAGAGGTCTTTCTCTCAGTTCGAAGCTTTAGCCTCTGCATCAGGTTTTCTACGC
TGTGAAATAATTTATATTGCTTATACATTTTCTGTTATCGAATTTCACAAATAGATTCGA
AGACTTAAAAGATAAGCAACAATGGTTCTAAGTGTGGAAATTATAAACTAAAAGCAAGTC
TTCCATGTTTCTTT*ACTTGTTTGAATAAAGATTTAATGTAATGGTCTTTGTTTCTGATT
CAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTCATGGTTTTCTGATT
CAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTCATGGTTTTCTGATT
CAAGATTGTTGTATTAAGTGTGT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2EJ22JQ 804 0 0
GCAATGTCAGAATCTGCTACCATGTTCATGAAGAAGATTTTAGAAACTTACAAAGGATTC
AAAGATATTAACACTTTGGTGGATATTGGAGGAGGACTTGGCACCACACTGAATCTTATC
ACTTCGAAGTATCCTCAAATCAAGGGTATCAATTTCGACTTAGACAAGGTTTTAGCTCAA
GCTCCTCTTTATCCAGGTGTGGAGAATGTATCTGGAGATATGTTTATAGAAGTTCCAAAA
GGAGATGCTATCTTTATGAAATGTATATTACATGACTGGGCAGATGGAGATTGTGTGAAG
ATTCTGAAAAACTGTTGGAAGAGTCTTCCTGAAAAGGGAAAAGTAATAATAGTAGACATT
GTTACACCAATAGAACCAAAACGTGATGACCCTTTCTCTAACATTGTTTTCAGCATGGAT
ATGTTGATGCTAACACAATGTTCAGGTGGTAAAGAGAGGTCTTTCTCTCAGTTCGAAGCT
TTAGCCTCTGCATCAGGTTTTTTACGCTGTGAAATAATTTATATTGCTTATACATTTTCT
GTTATCGAATTTCACAAATAGATTCGAAGACATAAAGGATGAGCAACAATGGTTCTAAGT
GTGGAAATTATAAACTAAAAGCAAGTCTCCCATGTTTTTTTTACTTGTTTGAATAAAGAT
TTAATGTAATGGTCTTTGTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTT
CAAGAGTGTGTTCATGGTTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTT
CAAGAGTGTGTTCATGGTTTTCTG

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2DS38JQ 716 0 0
GAGGAGGACTTGGCACCACACTGAATCTTATCACTTCGAAGTATCCTCAAATCAAGGGTA
TCAATTTCGACTTAGACAAGGTTTTAGCTCAAGCTCCTCTTTATCCAGGTGTGGAGAATG
TATCTGGAGATATGTTTATAGAAGTTCCAAAAGGAGATGCTATCTTTGTGAAATGTATAT
TACATGACTGGGCAGATGGAGATTGTGTGAAGATTCTGAAAAACTGTTGGAAGAGTCTTC
CTGAAAAGGGAAAAGTAATAATAGTAGACATTGTTACACCAATAGAACCAAAACGTGATG
ACCCTTTCTCTAACATTGTTTTCAGCATGGATATGTTGATGCTAACACAATGTTCAGGTG
GTAAAGAGAGGTCTTTCTCTCAGTTCGAAGCTTTAGCCTCTGCATCAGGTTTTTTACGCT
GTGAAATAATTTATATTGCTTATACATTTTCTGTTATCGAATTTCACAAATAGATTCGAA
GACATAAAAGATAAGCAACAATGGTTCTAAGTGTGGAAATTATAAACTAAAAGCAAGTCT
TCCATGTTTTTTTTACTTGTTTGAATAAAGATTTAATGTAATGGTCTTTGTTTTTGATTC
AAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTCATGGTTTTTTGATTC
AAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTCATGGTTTTCTG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2CM60JQ 887 0 0
GCAATGTCAGA*TCTGCTACCATGTTCATGAAGAAGATTT*AGAAACTTACAAAGGAT*C
AAAGATAT*AACACTT*GGTGGATGTTGGAGGAGGACTTGGCACCACACTGAATCTTATC
ACTTCGAAGTATCCTCAAATCAAGGGTATCAATTTCGACTTAGACAAGGTTTTAGCTCAA
GCTCCTCTTTATCCAGGTGTGGAGAATGTATCTGGAGATATGTTTATAGAAGTTCCAAAA
GGAGATGCTATCTTTATGAAATGTATATTACATGACTGGGCAGATGTAGATTGTGTGAAG
ATTCTGAAAAACTGTTGGAAGAGTCTTCCTGAAAAGGGAAAAGTAATAATAGTAGACATT
GTTACACCAATAGAACCAAAACGTGATGACCCTTTCTCTAACATTGTTTTCAGCATGGAT
ATGTTGATGCTAACGCAATGTTCAGGTGGTAAAGAGAGGTCTTTCTCTCAGTTCGAAGCT
TTAGCCTCTGCATCAGGTTTTCTACGCTGTGAAATAATTTATATTGCTTATACATTTTCT
GTTATCGAATTTCACAAATAGATTCGAAGACATAAAAGATAAGCAACAATGGTTCTAAGT
GTGGAAATTATAAACTAAAAGCAAGTCTTCCATGTTTTTTTTACTTGTTTGAATAAAGAT
TTAATGTAATGGTCTTTGTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTT
CAAGAGTGTGTTCATGGTTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTT
CAAGAGTGTGTTCATGGTTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTT
CAAGAGTGTGTTTTCACACGAATAAAGAATATAATTAATTTG
TGAGC

QA 1 882 1 882
DS 

RD RR2BO08JQ 848 0 0
TTAGAAACTTACAAAGGATTCAAAGATAT*AACACTTTGGTGGATA*TGGAGGAGGACTT
GGCACCACACTGAATCTTATCACTTCGAAGTATCCTCAAATCAAGGGTATCAATTTCGAC
TTAGACAAGGTTTTAGCTCAAGCTCCTCTTTATCCAGGTGTGGAGAATGTATCTGGAGAT
ATGTTTATAGAAGTTCCAAAAGGAGCTGCTATCTTTATGAAATGTATATTACATGACTGG
GCAGATGGAGATTGTGTGAAGATTCTGAAAAACTGTTGGAAGAGTCTTCCTGAAAAGGGA
AAAGTAATAATAGTAGACATTGTTACACCAATAGAACCAAAACGTGATGACCCTTTCTCT
AACATTGTTTTCAGCATGGATATGTTGATGCTAACACAATGTTCAGGTGGTAAAGAGAGG
TCTTTCTCTCAGTTCGAAGCTTTAGCCTCTGCATCAGGTTTTTTACGCTGTGAAATAATT
TATATTGCTTATACATTTTCTGTTATCGAATTTCACAAATAGATTCGAAGACATAAAAGA
TAAGCAACAATGGTTCTAAGTGTGGAAATTATAAACTAAAAGCAAGTCTTCCATGTTTTT
TTTACTTGTTTGAATAAAGATTTAATGTAATGGTCTTTGTTTCTGATTCAAGATTGTTGT
ATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTCATGGTTTTCTGATTCAAGGTTGTTGC
ATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTCATGGTTTTCTGATTCAAGATTGTTGT
ATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTTTCACACGAATAAAGAATATAATTAAT
TTGTGAGT

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR2DL57JQ 705 0 0
TCCTCTTTATCCAGGTGTGGAGAATGTATCTGGAGATATGTTTATAGAAGTTCCAAAAGG
AGATGCTATCTTTATGAAATGTATATTACATGACTGGGCAGATGGAGATTGTGTGAAGAT
TCTGAAAAACTGTTGGAAGAGTCTTCCTGAAAAGGGAAAAGTAATAATAGTAGACATTGT
TACACCAATAGAACCAAAACGTGAGGACCCTTTCTCTAACATTGTTTTCAGCATGGATAT
GTTGATGCTAACACAATGTTCAGGTGGTAAAGAGAGGTCTTTCTCTCAGTTCGAAGCTTT
AGCCTCTGCATCAGGTTTTTTACGCTGTGAAATAATTTATATTGCTTATACATTTTCTGT
TATCGAATTTCACAAATAGATTCGAAGACATAAAAGATAAGCAACAATGGTTATAAGTGT
GGAAATTATAAACTAAAAGCAAGTCTTCCATGTTTTTTTTACTTGTTTGAATAAAGATTT
AATGTAATGGTCTTTGTTTCTGAT*CAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCA
AGAGTGTGTTCATGGTTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCA
AGAGTGTGTTCATGGTTTTCTGATTCAAGATTGTTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCA
AGAGTGTGTTTTCACACGAATAAAGAATATAATTAATTTG
TGAGC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2BF55JQ 732 0 0
CGACTTAGACAAGGTTTTAGCTCAAGCTCCTCTTTATCCAGGTGTGGAGAATGTATCTGG
AGATATGTTTATAGAAGTTCCAAAAGGAGATGCTATCTTTATGAAATGTATATTACATGA
CTGGGCAGATGGAGATTGTGTGAAGATTCTGAAAAACTGTTGGAAGAGTCTTCCTGAAAA
GGGAAAAGTAATAATAGTAGACATTGTTACACCAATAGAACCAAAACGTGATGACCCTTT
CTCTAACATTGTTTTCAGCATGGATATGTTGATGCTAACACAATGTTCAGGTGGTAAAGA
GAGGTCTTTCTCTCAGTTCGAAGCTTTAGCCTCTGCATCAGGTTTTTTACGCTGTGAAAT
AATTTATATTGCTTATACATTTTCTGTTATCGAATTTCACAAATAGATTCGAAGACATAA
AAGATAAGCAACAATGGTTCTAAGTGTGGAAATTATAAACTAAAAGCAAGTTTTCCATGT
TTTTTTTACTTGTTTGAATAAAGATTTAATGTAATGGTCTTTGTTTTTGATTCAAGATTG
TTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTCATGGTTTTTTGATTCAAGATTG
TTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTTAAGAGTGTGTTCATGGTTTTCCGATTCAAGATTG
TTGTATTAAGTGTGTGTTTTTCTTTCAAGAGTGTGTTTTCACACGAATAAAGAATATAAT
TAATTTG
GGAGT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 2 18

CO CL131Contig1 742 16 9 U
GGCCCAGCCAAAAATTCACAGCC*ATTGAGAGTTTAACATTTCATCC*AAAAAATGTTTT
TT*CAGATTATTCAGGAGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCT
GGTATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTT*GTCCT
ATTCAGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACAACGGGCTTGTC
GGCCACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTT
TAAGGCGAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTCTAAGCC
AGTGTCTGGGGGGTAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATT
AAATGAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTTTCTTTAATATA
ATACTAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGT
GTTACGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACGAATCAAGTGATATCAGTGA
TATTACCATAGATTATTATAGTCAAGTTACATTGTTGATTCACTGAATCATTCGACTTTG
AACCAAGTGTTGTTTCTACCACATTATGTTTTAAAAGATAAGCCTTAAAGTTCTTAATTT
GCAACTACCGATTTTATCTGAT


BQ
55 55 55 55 60 60 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 65 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 65 80 80 40 80 80 80 80 80 
80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 25 80 80 80 80 80 80 80 80 20 65 
80 45 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 65 65 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 55 80 80 80 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 55 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 70 70 70 70 70 70 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H640TF U 2
AF RR2DP08JQ C 1
AF RR2DP08TF U 1
AF RR2G123JQ C 272
AF RR2DJ25JQ C 2
AF RR2DJ25TF U 2
AF RR2F128JQ C 1
AF RR2F128TF U 5
AF RR2G123TF U 1
AF RR2BK12JQ C 1
AF RR2BK12TF U 1
AF RR2AL92TF U 1
AF RR2H369JQ C 1
AF RR2H369TF U 1
AF RR2CT92JQ C 411
AF RR2CT92TF U 411
BS 1 275 RR2AL92TF
BS 276 276 RR2DP08TF
BS 277 628 RR2AL92TF
BS 629 629 RR2F128TF
BS 630 679 RR2AL92TF
BS 680 680 RR2H369TF
BS 681 689 RR2AL92TF
BS 690 693 RR2H369TF
BS 694 742 RR2CT92TF

RD RR2H640TF 420 0 0
GGCCCA
CCAAAAATTCTCAGCC*ATTGAGAGTTTAACACTTCATCC*AAAAAATGTTTTTT*CAGA
TTATTCAGGGGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCGTTCGCTGGTATAA
CCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTT*GTCCTATTCAGT
CCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTGTCGGCCACC
GGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTATTAAGGCG
AAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTCTAAGCCAGCGTCT
GGGGGGTAAACGAAGTAG*CCTTTC*TA*TATGAGACGATCTAAGGGGGA
TTAA

QA 7 416 7 416
DS 

RD RR2DP08JQ 581 0 0
GGCCCAGCCAAAAATTCACAGCC*ATTGAGAGTTTAACATTTCATCC*AAAAAATGTTTT
TT*CAGATTATTCAGGAGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCT
GGTATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTTTGTCCT
ATTCAGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACAACGGGCTTGTC
GGCCACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTT
TAAGGCGAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTCTAAGCC
AGTGTCTGGGGGGTAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATT
AAATGAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTTTCTTTAATATA
ATACTAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGT
GTTACGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACG

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2DP08TF 581 0 0
GGCCCAGCCAAAAATTCACAGCC*ATTGAGAGTTTAACATTTCATCC*AAAAAATGTTTT
TT*CAGATTATTCAGGAGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCT
GGTATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTTTGTCCT
ATTCAGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACAACGGGCTTGTC
GGCCACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTT
TAAGGCGAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTCTAAGCC
AGTGTCTGGGGGGTAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATT
AAATGAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTTTCTTTAATATA
ATACTAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGT
GTTACGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACG

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2G123JQ 272 0 0
CGCATCATTTGGAAGCTTTACAAGGGTTTTAAGGGGAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGA
TTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTTTAAGCCAGTTTTTGGGGGGTAAACGGAGTAGGCCTTT
TGTAGTATGAGATGATTTAAGGGGGAATTAAATGAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAA
GCCTAAAATTATCCACTTTTTTTAATATAATACTAATTACACGGGGATGAACCTAATGTT
TCAAATACCATTTTTCATATGTATATCGTGTT

QA 1 272 1 272
DS 

RD RR2DJ25JQ 576 0 0
GGCCG
GCCAAAAATTCTCAGCC*ATTGAGAGTTTAACATTTCATCC*AAAAAATGTTTTTT*CAG
ATTATTCAGGGGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCGTTCGCTGGTATA
ACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTT*GTCCTATTCAG
TCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTGTCGGCCAC
CGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTATTAAGGC
GAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTTTAAGCCAGCGTT
TGGGGGGTAAACGAAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGACGATCTAAGGGGGAATTAAATGA
GAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTCTCTTTAATATAATACTA
ATTACACGCGT*TGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGTGTTACG
AAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTT
AG

QA 6 574 6 574
DS 

RD RR2DJ25TF 576 0 0
GGCCG
GCCAAAAATTCTCAGCC*ATTGAGAGTTTAACATTTCATCC*AAAAAATGTTTTTT*CAG
ATTATTCAGGGGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCGTTCGCTGGTATA
ACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTT*GTCCTATTCAG
TCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTGTCGGCCAC
CGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTATTAAGGC
GAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTCTAAGCCAGCGTC
TGGGGGGTAAACGAAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGACGATCTAAGGGGGAATTAAATGA
GAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTCTCTTTAATATAATACTA
ATTACACGCGT*TGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGTGTTACG
AAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTT
AG

QA 6 574 6 574
DS 

RD RR2F128JQ 636 0 0
GGCCCAGCCAAAAATTCACAGCC*ATTGAGAGTTTAACATTTCATCC*AAAAAATGTTTT
TT*CAGATTATTCAGGAGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCT
GGTATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTT*GTCCT
ATTCAGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACAACGGGCTTGTC
GGCCACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTT
TAAGGCGAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTTTAAGCC
AGTGTCTGGGGG*TAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATTTAAGGGGGAATT
AAATGAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTTTCTTTAATATA
ATACTAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGT
GTTACGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACGAATCAAGTGATATCAGTGA
TATTACCATAGATTATTATAGTCAAGTTACATTGTT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2F128TF 632 0 0
CAGCCAAAAATTCACAGCC*ATTGAGAGTTTAACATTTCATCC*AAAAAATGTTTTTT*C
AGATTATTCAGGAGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCTGGTA
TAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTT*GTCCTATTC
AGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACAACGGGCTTGTCGGCC
ACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTTTAAG
GCGAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTCTAAGCCAGTG
TCTGGGGG*TAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTAAAT
GAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTTTCTTTAATATAATAC
TAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGTGTTA
CGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACGAATCAAGTGATATCAGTGATATT
ACCATAGATTATTATAGTCAAGTTACATTGTT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2G123TF 635 0 0
GGCCCAGCCAAAAATTCACAGCC*ATTGAGAGTTTAACATTTCATCC*AAAAAATGTTTT
TT*CAGATTATTCAGGAGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCT
GGTATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTT*GTCCT
ATTCAGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACAACGGGCTTGTC
GGCCACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTT
TAAGGCGAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTCTAAGCC
AGTGTCTGGGGGGTAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATT
AAATGAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTTTCTTTAATATA
ATACTAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGT
GTTACGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACGAATCAAGTGATATCAGTGA
TATTACCATAGATTATTATAGTCAAGTTACATTGT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2BK12JQ 645 0 0
GGCCCAGCCAAAAATTCACAGCC*ATTGAGAGTTTAACATTTCATCC*AAAAAATGTTTT
TT*CAGATTATTCAGGAGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCAT*AGCTCTATTGGCATTCGCT
GGTATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTT*GTCCT
ATTCAGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACAACGGGCTTGTC
GGCCACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTT
TAAGGCGAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTTTAAGCC
AGTGTTTGGGGGGTAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATT
AAATGAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTTTCTTTAATATA
ATACTAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGT
GTTACGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACGAATCAAGTGATATCAGTGA
TATTACCATAGATTATTATAGTCAAGTTACATTGTTGATTCACTG

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2BK12TF 645 0 0
GGCCCAGCCAAAAATTCACAGCC*ATTGAGAGTTTAACATTTCATCC*AAAAAATGTTTT
TT*CAGATTATTCAGGAGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCAT*AGCTCTATTGGCATTCGCT
GGTATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTT*GTCCT
ATTCAGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACAACGGGCTTGTC
GGCCACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTT
TAAGGCGAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTCTAAGCC
AGTGTCTGGGGGGTAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATT
AAATGAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTTTCTTTAATATA
ATACTAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGT
GTTACGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACGAATCAAGTGATATCAGTGA
TATTACCATAGATTATTATAGTCAAGTTACATTGTTGATTCACTG

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2AL92TF 689 0 0
GGCCCAGCCAAAAATTCACAGCC*ATTGAGAGTTTAACATTTCATCC*AAAAAATGTTTT
TT*CAGATTATTCAGGAGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCT
GGTATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTT*GTCCT
ATTCAGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACAACGGGCTTGTC
GGCCACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCACCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTT
TAAGGCGAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTCTAAGCC
AGTGTCTGGGGGGTAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATT
AAATGAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTTTCTTTAATATA
ATACTAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGT
GTTACGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACGAATCAAGTGATATCAGTGA
TATTACCATAGATTATTATAGTCAAGTTGCATTGTTGATTCACTGAATCATTCGACTTTG
AACCAAGTGTTGTTTCTAC*ACATTATGT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2H369JQ 715 0 0
GGCCCAGCCAAAAATTCACAGCCCATTGAGAGTTTAACATTTCATCCCAAAAAATGTTTT
TTTCAGATTATTCAGGAGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCT
GGTATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTT*GTCCT
ATTCAGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACAACGGGCTTGTC
GGCCACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTT
TAAGGCGAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTTTAAGCC
AGCGTCTGGGGGGTAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATT
AAATGAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTTTCTTTAATATA
ATACTAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGT
GTTACGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACGAATCAAGTGATATCAGTGA
TATTACCATAGATTATTATAGTCAAGTTACATTGTTGATTCACTGAATCATTCGACTTTG
AACCAAGTGTTGTTTCTACCACATTATGTTTTAAAAGATAAGCCTTAAAGTTCTT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2H369TF 693 0 0
GGCCCAGCCAAAAATTCACAGCC*ATTGAGAGTTTAACATTTCATCC*AAAAAATGTTTT
TT*CAGATTATTCAGGAGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCT
GGTATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTT*GTCCT
ATTCAGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACAACGGGCTTGTC
GGCCACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTT
TAAGGCGAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTCTAAGCC
AGCGTCTGGGGGGTAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATT
AAATGAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTTTCTTTAATATA
ATACTAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGT
GTTACGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACGAATCAAGTGATATCAGTGA
TATTACCATAGATTATTATAGTCAAGTTACATTGTTGATTCACTGAATCATTCGACTTTG
AACCAAGTGTTGTTTCTACCACATTATGTTTTA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2CT92JQ 332 0 0
G
GGGGGAATTAAATGAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTTTC
TTTAATATAATACTAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATAT
GTATATCGTGTTACGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACGAATCAAGTGA
TATTAGTGATATTACCATAGATTATTATAGTCAAGTTACATTGTTGATTCACTGAATCAT
TCGACTTTGAACCAAGTGTTGTTTCTACCACATTATGTTTTAAAAGATAAGCCTTAAAGT
TCTTAATTTGCAACTACCGATTTTATCTGAT

QA 2 332 2 332
DS 

RD RR2CT92TF 332 0 0
G
GGGGGAATTAAATGAGAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTTTC
TTTAATATAATACTAATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATAT
GTATATCGTGTTACGAAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACGAATCAAGTGA
TATTAGTGATATTACCATAGATTATTATAGTCAAGTTACATTGTTGATTCACTGAATCAT
TCGACTTTGAACCAAGTGTTGTTTCTACCACATTATGTTTTAAAAGATAAGCCTTAAAGT
TCTTAATTTGCAACTACCGATTTTATCTGAT

QA 2 332 2 332
DS 



CO CL131Contig2 624 2 2 U
GGAACAAACCCCAGCCAAAAATTCTCAGCCATTGAGAGTTTAACATTTCATCCAAAAATG
TTTTTTCAGATTATTCAGGGGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCGTTC
GCTGGTATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTTGTC
CTATTCAGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTG
TCGGCCACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGT
TTTAAGGCGAAGGGAGGGTCAAAAATATTCCGGGATTGGCCCCGTCCAGAGTCTAAACCA
GCGTCTGGGGGTAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTTA
ATGAGAATTATTGGGATTCCTTAAATAAAACCTAAAATTATCCAGTCTCTTTAATATAAT
ACTAGGTAGTAACCCGCGCCTAGCGCGAAATGAGATGATTAATTGTGCTATTTTGTAAGA
TATAAGAAAGTAGATCTGTTTAGTTTGAATATTGGTTCGATGTTAGGTTTTGTGTTTTTT
TGGTATTCAATCTCGGTTGTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F123JQ C 1
AF RR2F123TF U 1
BS 1 9 RR2F123JQ
BS 10 624 RR2F123TF

RD RR2F123JQ 624 0 0
GGAACAAACCCCAGCCAAAAATTCTCAGCCATTGAGAGTTTAACATTTCATCCAAAAATG
TTTTTTCAGATTATTCAGGGGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCGTTC
GCTGGTATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTTGTC
CTATTCAGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTG
TCGGCCACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGT
TTTAAGGCGAAGGGAGGGTCAAAAATATTCCGGGATTGGCCCCGTCCAGAGTCTAAACCA
GCGTCTGGGGGTAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTTA
ATGAGAATTATTGGGATTCCTTAAATAAAACCTAAAATTATCCAGTCTCTTTAATATAAT
ACTAGGTAGTAACCCGCGCCTAGCGCGAAATGAGATGATTAATTGTGCTATTTTGTAAGA
TATAAGAAAGTAGATCTGTTTAGTTTGAATATTGGTTCGATGTTAGGTTTTGTGTTTTTT
TGGTATTCAATCTCGGTTGTGCCC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2F123TF 624 0 0
GGAACAAAC
CCCAGCCAAAAATTCTCAGCCATTGAGAGTTTAACATTTCATCCAAAAATGTTTTTTCAG
ATTATTCAGGGGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCGTTCGCTGGTATA
ACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTTGTCCTATTCAGT
CCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTGTCGGCCACC
GGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTTTAAGGCG
AAGGGAGGGTCAAAAATATTCCGGGATTGGCCCCGTCCAGAGTCTAAACCAGCGTCTGGG
GGTAAACGGAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTTAATGAGAATT
ATTGGGATTCCTTAAATAAAACCTAAAATTATCCAGTCTCTTTAATATAATACTAGGTAG
TAACCCGCGCCTAGCGCGAAATGAGATGATTAATTGTGCTATTTTGTAAGATATAAGAAA
GTAGATCTGTTTAGTTTGAATATTGGTTCGATGTTAGGTTTTGTGTTTTTTTGGTATTCA
ATCTCGGTTGTGCCC

QA 10 624 10 624
DS 



AS 1 19

CO CL132Contig1 802 19 11 U
AGGGACGGATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACAC
TAACTCTCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTATCCGCATC
GGCCCCGGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAG
CTCCGGCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGA
CATTGTAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAA
CGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTT
GAATCTGAACTCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGG
TAAAGACGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGC
TTGCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGG
TGAGTACCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAA
ATAATGAAGTTGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATT
GTCTTTCAACTCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTG
GGATGG*CATTGATCTAAAAGTTCCAATCGAATTAATCTGTGAGAATATTCAGCCAAACA
ATTAGATATCTTTAATTATCTT


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 70 70 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 75 90 
90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 65 90 65 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 75 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 85 
97 97 97 97 55 97 97 97 97 85 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 95 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 70 70 70 70 
40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 65 55 55 50 35 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2BQ84TF U 1
AF RR2A051JQ C 373
AF RR2A051TF U 3
AF RR2BN19TF U 3
AF RR2CR47TF U 7
AF RR2CR47JQ C 7
AF RR2F056TF U 7
AF RR2AA11TF U 3
AF RR2AA11JQ C 298
AF RR2F056JQ C 147
AF RR2BA19JQ C 7
AF RR2BA19TF U 7
AF RR2EW30TF U 7
AF RR2CV47TF U 7
AF RR2G589TF U 7
AF RR2B508JQ C 7
AF RR2BN19JQ C 356
AF RR2CV47JQ C 38
AF RR2B508TF U 7
BS 1 6 RR2BQ84TF
BS 7 8 RR2CR47TF
BS 9 136 RR2BQ84TF
BS 137 137 RR2A051TF
BS 138 616 RR2BQ84TF
BS 617 617 RR2A051TF
BS 618 668 RR2BQ84TF
BS 669 746 RR2AA11TF
BS 747 769 RR2G589TF
BS 770 798 RR2B508TF
BS 799 802 RR2B508JQ

RD RR2BQ84TF 676 0 0
AGGGACTCATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACAC
TAACTCTCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTATCCGCATC
GGCCCCGGCCGAACAAAAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAG
CTCCGGCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGA
CATTGTAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAA
CGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTT
GAATCTGAACTCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGG
TAAAGACGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGC
TTGCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGG
TGAGTACCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAA
ATAATGAAGTTGTCTAAGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATT
GTCTTTCA
CTCGTGAT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2A051JQ 295 0 0
TGACGGCTCCGGCGATAGGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGGTAAAGACGACCA
GGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCGTCGACG
AGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTACCAGTG
TCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATGAAGTTG
TCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATTGTCTTTC

QA 1 295 1 295
DS 

RD RR2A051TF 665 0 0
GGACTCATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTA
ACTCTCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTATCCGCATCGG
CCCCGGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCT
CCGGCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACA
TTGTAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACG
GCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGA
ATCTGAACTCTGACGGCTCCGGCGATAGGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGGTA
AAGACGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTT
GCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTG
AGTACCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAAT
AATGAAGTTGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATTGT
CTTTC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2BN19TF 698 0 0
GGACTCATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTA
ACTCTCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTATCCGCATCGG
CCCCGGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCT
CCGGCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACA
TTGTAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACG
GCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGA
ATCTGAACTCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGGTA
AAGACGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTT
GCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTG
AGTACCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAAT
AATGAAGTTGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAA*TTGAATAACATTGT
CTTTCA*CTCGTGATAGCA*TAATGTAGATTGA
TAAAA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2CR47TF 699 0 0
GGATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTAACTC
TCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTATCCGCATCGGCCCC
GGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCTCCGG
CACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTGT
AGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAA
TCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGAATCT
GAACTCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGGTAAAGA
CGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCG
TCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTA
CCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATG
AAGTTGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATTGTCTTT
CAACTCGTGATAGCAATAATGTATATTGA*TAAAACTGC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2CR47JQ 708 0 0
GGATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTAACTC
TCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTATCCGCATCGGCCCC
GGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCTCCGG
CACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATTTTGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTGT
AGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAA
TCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGAATTT
GAACTTTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGGTAAAGA
CGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCG
TCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTA
CCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATG
AAGTTGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATTGTCTTT
CAACTCGTGATAGCAATAATGTATATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2F056TF 711 0 0
GGATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTAACTC
TCCCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTACCCGCATCGGCCCC
GGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCTCCGG
CACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTGT
AGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAA
TCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGAATCT
GAACTCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGGTAAAGA
CGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCG
TCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTA
CCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATG
AAGTTGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATTGTCTTT
CAACTCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2AA11TF 744 0 0
GGACTCATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACTACTATGGCTCACACTA
ACTCTCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTATCCGCATCGG
CCCCGGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATGGCC
CCGGCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACA
TTGTAGACCTAGA*AAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACG
GCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGA
ATCTGAACTCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGGTA
AAGACGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTT
GCCGTCGACGAGCCGCCGCATGGGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCATGCAGACGGTG
AGTACCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAAT
AATGAAGTTGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATTGT
CTTTCAACTCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGG
ATGG*CATTGATCTAAAAGTTCCA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2AA11JQ 453 0 0
GAACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTT
TTTGAATTTGAACTCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGG
AGGTAAAGACGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAAT
GGCTTGCCGTTGACGAGCCGCCGCATGGGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCATGCAGA
CGGTGAGTACCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATAT
GAAATAATGAAGTTGTTTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAAC
ATTGTCTTTCAACTCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGT
GTGGGATGG*CATTGATCTAAAAGTTCCAATCG

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR2F056JQ 615 0 0
ACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCTCCGGCACCGATTCGATCATAGGGG
CTTCAATTTTGGACAAATCCGGACAGCACATTGACATTGTAGACCTAGAGAAATGGGGTG
GTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGA
CAGCGCCGTGTTTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGAATTTGAACTTTGACGGCTCCGGCG
ATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGGTAAAGACGACCAGGCCTGGAGTTGAG
ACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAG
CTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTACCAGTGTCGGTGTTGGTTGT
GAGAACAGGAAGTGCATCTTTTCAATCATATGAAATAATGAAGTTGTTTAGGAGAAGTAA
CACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATTGTCTTTCAACTCGTGATAGCAATAAT
GTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGGATGG*CATTGATTTAAAAGTTCCA
ATCGAATTAAT
TTGG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2BA19JQ 730 0 0
GGAC
TCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTAACTCTCTC
CTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTATCCGCATCGGCCCCGGCC
GAACAGGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGACAGCTCCGGCACC
GATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTGTAGAC
CTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAATCTT
GATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGAATCTGAAC
TCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGGTAAAGACGAC
CAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCGTCGA
CGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTACCAG
TGTCGGTGTTGGTTGTGAGAGCAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATGAAGT
TGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATTGTCTTTCAAC
TCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGGATGG*CAT
TGATCT

QA 5 730 5 730
DS 

RD RR2BA19TF 730 0 0
GGAC
TCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTAACTCTCTC
CTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTATCCGCATCGGCCCCGGCC
GAACAGGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGACAGCTCCGGCACC
GATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTGTAGAC
CTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAATCTT
GATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGAATCTGAAC
TCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGGGTATGTTAAATACGTGGAGGTAAAGACGAC
CAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCGTCGA
CGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTACCAG
TGTCGGTGTTGGTTGTGAGAGCAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATGAAGT
TGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATTGTCTTTCAAC
TCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGGATGGGCAT
TGATCT

QA 5 730 5 730
DS 

RD RR2EW30TF 729 0 0
GGATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACACTCCAACAACTATGGCTCACACTAACTC
TCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTATCCGCATCGGCCCC
GGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCTCCGG
CACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTGT
AGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAA
TCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGAATCT
GAACTCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGGTAAAGA
CGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCG
TCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTA
CCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATG
AAGTTGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATTGTCTTT
CAACTCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGGATGG
*CATTGATC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2CV47TF 732 0 0
GGATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTAACTC
TCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTATCCGCATCGGCCCC
GGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCTCCGG
CACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTGT
AGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAA
TCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGAATCT
GAACTCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGGTAAAGA
CGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCG
TCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTA
CCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATG
AAGTTGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATTGTCTTT
CAACTCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGTATGG
*CATTGATCTAA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2G589TF 763 0 0
GGATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTAACTC
TCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTATCCGCATCGGCCCC
GGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCTCCGG
CACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTGT
AGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAA
TCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTT*GAATCT
GAACTCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGGTAAAGA
CGAACAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCG
TCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTA
CCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATG
AAGTTGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAGTGCAAAATTGAATAACATTGTCTTT
CAACTCGTGATAGCAATAATGTAGATTGA*TAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGGATGG
*CATTGATCTAAA*GTTCCAATCGAATTAATCTGTGAGAATAT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2B508JQ 796 0 0
GGATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTAACTC
TCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTATCCGCATCGGCCCC
GGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCTCCGG
CACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACACCGACATTGT
AGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAA
TCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGAATCT
GAACTCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGGTAAAGA
CGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCG
TCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTA
CCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATG
AAGTTGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATTGTCTTT
CAACTCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGGATGG
*CATTGATCTAAAAGTTCCAATCGAATTAATCTGTGAGAATATTCAGCCAAACAATTAGA
TATCTTTAATTATCTT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2BN19JQ 435 0 0
TTTTTGAATTTGAATTCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGT
GGAGGTAAAGACGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCA
ATGGCTTGCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCA
GACGGTGAGTACCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCAT
ATGAAATAATGAAGTTGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATA
ACATTGTCTTTCAACTCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGA
GTGTGGGATGG*CATTGATCTAAAAGTTCCAATCGAATTAATCTGTGAGAATATTCAGCC
AAACAATTAGATATC

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR2CV47JQ 763 0 0
CA
TCCAACAACTATGGCTCACACTAACTCTCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCAT
CGCCACCGTTGTATCCGCATCGGCCCCGGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAAT
CAAAACCGGAACGAGAGATAGCTCCGGCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGA
CAAATCCGGACAGCACATCGACATTGTAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACA
AGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCT
TCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGAATCTGAACTCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTG
G*TATGTTAAATACGTGGAGGTAAAGACGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGT
ACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAAC
GGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTACCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGT
GCATCTCTTCAATCATATGAAATAATGAAGTTGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATAT
AATGCAAAATTGAATAACATTGTCTTTCAACTCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAA
AACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGTATGG*CATTGATCTAAAAGTTCCAATCGAATTAATCT
GTGAGAATATTCAGCCAAACAATTAGATATCTTTAATTA
CC

QA 3 761 3 761
DS 

RD RR2B508TF 796 0 0
GGATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTAACTC
TCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCATCGCCACCGTTGTATCCGCATCGGCCCC
GGCCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCTCCGG
CACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACACCGACATTGT
AGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAA
TCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGAATCT
GAACTCTGACGGCTCCGGCGATAAGCCCGGCTGG*TATGTTAAATACGTGGAGGTAAAGA
CGACCAGGCCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCG
TCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTA
CCAGTGTCGGTGTTGGTTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATG
AAGTTGTCTAGGAGAAGTAACACGGCAATATATAATGCAAAATTGAATAACATTGTCTTT
CAACTCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGGATGG
*CATTGATCTAAAAGTTCCAATCGAATTAATCTGTGAGAATATTCAGCCAAACAATTAGA
TATCTTTAATTA
TCTT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 18

CO CL133Contig1 812 18 10 U
GGAATTAAATTATTGCCACTGAATGAGAACATAGATATCATCGAAGGTCCTCCAAGCTCA
CAAACAGCTCCGAGAGGATCCAAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGACTCTTT
CAACATCTCTCTCTCTTCCCAGGAATACTCAACAACTCCACCCTTCATCTGGCTTTTCTC
TGAAACCAGTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTTTCGGCCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCC
AGTTTTCTGCTCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATG
ACAGTTCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGG
GCGCTCTTGGATGTGTGTATGCACCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAA
AGGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAA
CTCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCCATCGACGATGTGTCCT
CTCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCAGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGG
CTACAGCCTGAAATAAATCTCTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACAAATTGTGGGTCAT
TGTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTT*GTCTAAACTTTTCCTCC*ATCT
TCAAAACCACTACCATTGTCCTGTCTGTTTTT*TTTTTTTCATTAGACTATGTTGAACGA
TTTATCA*TCATCATTTCAGATTCCTTACGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 
70 70 70 70 70 70 70 70 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 85 35 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 65 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 30 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 30 90 
90 30 90 90 90 75 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 30 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
55 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 30 30 90 90 90 90 90 65 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
80 80 80 55 70 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 15 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR2CZ01TF U 64
AF RR2E614TF U 72
AF RR2GH73TF U 59
AF RR2ES71TF U 1
AF RR2BA10JQ C 59
AF RR2BA10TF U 59
AF RR2E379TF U 28
AF RR2E379JQ C 227
AF RR2HA52TF U 1
AF RR2CB13TF U 64
AF RR2G716JQ C 60
AF RR2G716TF U 60
AF RR2HA52JQ C 134
AF RR2AI94JQ C 183
AF RR2ES71JQ C 208
AF RR2AI94TF U 183
AF RR2F807TF U 449
AF RR2E614JQ C 232
BS 1 199 RR2ES71TF
BS 200 200 RR2BA10TF
BS 201 210 RR2ES71TF
BS 211 211 RR2BA10TF
BS 212 334 RR2ES71TF
BS 335 335 RR2BA10TF
BS 336 744 RR2ES71TF
BS 745 745 RR2G716TF
BS 746 811 RR2AI94TF
BS 812 812 RR2AI94JQ

RD RR2CZ01TF 228 0 0
GG
AGCTCCGAGAGGATCCAAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGACTCTTTCAACA
TCTCTCTCTCTTCCCAGGAATACTCAACAACTCCACCCTTCATCTGGCTTTTCTCTGAAA
CCAGTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTTTCGGCCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCAGTTT
TCTGCTCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCC
TTCAGCATACAG

QA 3 216 3 216
DS 

RD RR2E614TF 296 0 0
GG
GAGGATCCAAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGACTCTTTCAACATCTCTCTC
TCTTCCCAGGAATACTCAACAACTCCATCCTTCATCCGGCTTTTCTCTGAAACCAGTTGC
TCGTCGTGTCAACGTTTCTGTCGGTCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCAGTTTTCTGCTCC
CAGAAA*AAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATGACAGTTCAGGAAG
CACTGGCCTGTTTGTGGGAGGGT*CATTTTGGGCGGGCTCATAGTCGGTGCTCT

QA 3 296 3 296
DS 

RD RR2GH73TF 637 0 0
GGA
AAACAGCTCCGAGAGGATCCAAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGACTCTTTC
AACATCTCTCTCTCTTCCCAGGAATACTCAACAACTCCACCCTTCATCTGGCTTTTCTCT
GAAACCAGTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTTTCGGCCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCA
GTTTTCTGCTCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATGG
CAGTTCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGGG
CGCTCTTGGATGTGTGTATGCACCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAA
GGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAAC
TCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCCATCGACGATGTGTCCTC
TCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCAGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGGC
TACAGCCTGAAATAAATCTCTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACAAATTGTGGGTCATT
GTTACTTCATGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATT

QA 4 637 4 637
DS 

RD RR2ES71TF 744 0 0
GGAATTAAATTATTGCCACTGAATGAGAACATAGATATCATCGAAGGTCCTCCAAGCTCA
CAAACAGCTCCGAGAGGATCCAAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGACTCTTT
CAACATCTCTCTCTCTTCCCAGGAATACTCAACAACTCCACCCTTCATCTGGCTTTTCTC
TGAAACCAGTTGCTCGTCGCGTCAACGTTTTTTTCGGCCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCC
AGTTTTCTGCTCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATG
ACAGTTCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGGAGGATTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGG
GCGCTCTTGGATGTGTGTATGCACCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAA
AGGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAA
CTCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCCATCGACGATGTGTCCT
CTCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCAGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGG
CTACAGCCTGAAATAAATCTCTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACAAATTGTGGGTCAT
TGTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTT*GTCTAAACTTTTCCTCC*ATCT
TCAAAACCACTACCATTGTCCTGT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2BA10JQ 673 0 0
GGA
AAACAGCTCCGAGAGGATCCAAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGACTCTTTC
AACATCTCTCTCTCTTCCCAGGAATACTCAACAACTCCACCCTTCATCTGGCTTTTCTCT
GAAACCAGTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTTTCGGCCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCA
TTTTTCTGCTCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATGA
CAGTTCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGGG
CGCTCTTGGATGTGTGTATGCACCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAA
GGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAAC
TCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCCATCGACGATGTGTCCTC
TCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCAGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGGC
TACAGCCTGAAATAAATCTCTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACAAATTGTGGGTCATT
GTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTT*GTCTAAACTTTTCCTCC*ATCTT
CAAAACCACT

QA 4 673 4 673
DS 

RD RR2BA10TF 673 0 0
GGA
AAACAGCTCCGAGAGGATCCAAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGACTCTTTC
AACATCTCTCTCTCTTCCCAGGAATACTCAACAACTCCACCCTTCATCTGGCTTTTCTCT
GAAACCAGTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTTTCGGCCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCA
TTTTTCTGCTCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATGA
CAGTTCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGGG
CGCTCTTGGATGTGTGTATGCACCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAA
GGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAAC
TCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCCATCGACGATGTGTCCTC
TCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCAGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGGC
TACAGCCTGAAATAAATCTCTCATCTGTTTTTATGATGCTGAAACAAATTGTGGGTCATT
GTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTT*GTCTAAACTTTTCCTCC*ATCTT
CAAAACCACT

QA 4 673 4 673
DS 

RD RR2E379TF 707 0 0
G
ACATAGATATCATCGAAGGTCCTCCAAGCTCACAAACAGCTCCGAGAGGATCCAAGTTTC
TTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGACTCTTTCAACATCTCTCTCTCTTCCCAGGAATAC
TCAACAACTCCACCCTTCATCTGGCTTTTCTCTGAAACCAGTTGCTCGTCGTGTCAACGT
TTCTTTCGGCCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCAGTTTTCTGCTCCCAGAAGCAAAAGGAT
CCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATGACAGTTCAGGAAGCACTGGCCTATTTGT
GGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGGGCGCTCTTGGATGTGTGTATGCACCACA
GATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAAGGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTT
CATTTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAACTCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGC
TCAGCTCAACTCTGCCATCGACGATGTGTCCTCTCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAA
TGGTGCAGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGGCTACAGCCTGAAATAAATCTCTCATCTG
TTTTTAGGGTGCTGAAACAAATTGTGGGTCATTGTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTG
TGTAATTTT*GTCTAAACTTTTCCTCC*ATCTTCAAAAC
AAAAAAA

QA 2 700 2 700
DS 

RD RR2E379JQ 496 0 0
TTCTAAAAAGCTCCAGTTTTCTGCTCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGC
ATACAGAGATGATGACAGTTCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGG
CGGGCTCATAGTGGGCGCTCTTGGATGTGTGTATGCACCACAGATCAGCAAGGCTATAGC
TGGAGCAGACCGAAAGGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGATGAGGAAAA
AGCTTTGGAGAAAACTCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCCAT
CGACGATGTGTCCTCTCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCAGCTCTAAGCAC
CGATGAAGTCGAGGCTACAGCCTGAAATAAATCTCTCATCTGTTTTTAGGGTGCTGAAAC
AAATTGTGGGTCATTGTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTT*GTCTAAAC
TTTTCCTCC*ATCTTC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2HA52TF 733 0 0
GGAATTAAATTATTGCCACTGAATGAGAACATAGATATCATCGAAGGTCCTCCAAGCTCA
CAAACAGCTCCGAGAGGATCCAAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGACTCTTT
CAACATCTCTCTCTCTTCCCAGGAATACTCAACAACTCCACCCTTCATCTGGCTTTTCTC
TGAAACCAGTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTTTCGGCCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCC
AGTTTTCTGCTCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATG
ACAGTTCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGG
GCGCTCTTGGATGTGTGTATGCACCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAA
AGGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAA
CTCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCCATCGACGATGTGTCCT
CTCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCAGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGG
CTACAGCCTGAAATAAATCTCTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACAAATTGTGGGTCAT
TGTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTT*GTCTAAACTTTTCCTCC*ATCT
TCAAA
CCACTACA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2CB13TF 668 0 0
GG
AGCTCCGAGAGGATCCAAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGACTCTTTCAACA
TCTCTCTCTCTTCCCAGGAATACTCAACAACTCCATCCTTCATCCGGCTTTTCTCTGAAA
CCAGTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTGTCGGTCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCAGTTT
TCTGCTCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATGACAGT
TCAGGAAGCACTGGCCTGTTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTCGGTGCT
CTTGGATGTGTTTATGCACCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAAGGAT
CTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAACTCGC
AAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCTATCGACGATGTGTCCTCTCAG
CTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCAGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGGCTACA
GCCTGAAAATAATCTCTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACAAATTGTGGGTCATTGTTA
CTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTTTGTCTAAACTTTTCCTCCCATCTTCAAA
CCACTA

QA 3 662 3 662
DS 

RD RR2G716JQ 688 0 0
GG
AAACAGCTCCGAGAGGATCCGAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGACTCTTTC
AACATCTCTCTCTCTTCCCAGGAATACTCAACAACTCCACCCTTCATCTGGCTTTTCTCT
GAAACCAGTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTTTCGGCCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCA
GTTTTCTGCTCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATGA
CAGTTCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGGG
CGCTCTTGGATGTGTGTATGCACCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAA
GGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAAC
TCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCCATCGACGATGTGTCCTT
TCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCAGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGGC
TACAGCCTGAAATAAATCTCTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACAAATTGTGGGTCATT
GTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTT*GTCTAAACTTTTCCTCC*ATCTT
CAAAACCACTACCATTGTCCTGTC
AG

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR2G716TF 694 0 0
GG
AAACAGCTCCGAGAGGATCCGAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGACTCTTTC
AACATCTCTCTCTCTTCCCAGGAATACTCAACAACTCCACCCTTCATCTGGCTTTTCTCT
GAAACCAGTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTTTCGGCCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCA
GTTTTCTGCTCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATGA
CAGTTCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGGG
CGCTCTTGGATGTGTGTATGCACCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAA
GGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAAC
TCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCCATCGACGATGTGTCCTC
TCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCAGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGGC
TACAGCCTGAAATAAATCTCTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACAAATTGTGGGTCATT
GTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTT*GTCTAAACTTTTCCTCC*ATCTT
CAAA*CCACTACCATTGTCCTGTC
AGAAAAAA

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR2HA52JQ 650 0 0
TCTTCCCAGGAATACTCAACAACTCCACCCTTCATCTGGCTTTTCTTTGAAACCAGTTGC
TCGTCGTGTCAACGTTTCTTTCGGCCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCAGTTTTTTGCTCC
CAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATGACAGTTCAGGAAG
CACTGGCCTATTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGGGCGCTTTTGGATG
TGTGTATGCACCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAAGGATTTCATGAG
GAAATTGCCTAAGTTCATTTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAACTCGCAAGGTATT
GGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCCATCGACGATGTGTCCTCTCAGCTAAAATC
AGAAGACACCCCTAATGGTGCAGCTTTAAGCACCGATGAAGTCGAGGCTACAGCCTGAAA
TAAATCTTTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACAAATTGTGGGTCATTGTTACTTCTTGT
TGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTT*GTCTAAACTTTTCCTCC*ATCTTCAAAACCACTAC
CATTGTCCTGTCTGTTTTT*TTTTTT*CATTAGACTATGTTGAACGATTT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2AI94JQ 630 0 0
GCATCC
GTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTGTCGGTCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCAGTTTTCT
GCTCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCTGCATACAGAGATGATGACAGTTCA
GGAAGCACTGGCCTGTTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTCGGTGCTCTT
GGATGTGTTTATGCACCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAAGGATCTC
ATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAACTCGCAAG
GTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCTATCGACGATGTGTCCTTTCAGCTA
AAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCAGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGGCTACAGCC
TGAAAATAATCTCTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACAAATTGTGGGTCATTGTTACTT
CTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTTTGTCTAAACTTTTCCTCCCATCTTCAAAACC
ACTACCATTGTCCTGTCTGTTTTT*TTTTTTTCATTAGACTATGTTGAACGATTTATCA*
TCATCATTTCAGATTCCTTACGCC

QA 7 630 7 630
DS 

RD RR2ES71JQ 599 0 0
TTTT
TTTCGGCCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCAGTTTTCTGCTCCCAGAAGCAAAAGGATCCT
AACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATGACAGTTCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGG
AGGATTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGGGCGCTCTTGGATGTGTGTATGCACCACAGAT
CAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAAGGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCAT
TTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAACTCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCA
GCTCAACTCTGCCATCGACGATGTGTCCTTTCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGG
TGCAGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGGCTACAGCCTGAAATAAATCTTTCATCTGTTT
TTAGGATGCTGAAACAAATTGTGGGTCATTGTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGT
AATTTT*GTCTAAACTTTTCCTCC*ATCTTCAAAACCACTACCATTGTCCTGTCTGTTTT
T*TTTTT**CATTAGCCTATGTTGAACGATTTATCAATCATCATTTCAGATTC
GC

QA 5 597 5 597
DS 

RD RR2AI94TF 630 0 0
GCATCC
GTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTGTCGGTCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCAGTTTTCT
GCTCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCTGCATACAGAGATGATGACAGTTCA
GGAAGCACTGGCCTGTTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTCGGTGCTCTT
GGATGTGTTTATGCACCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAAGGATCTC
ATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAACTCGCAAG
GTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCTATCGACGATGTGTCCTCTCAGCTA
AAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCAGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGGCTACAGCC
TGAAAATAATCTCTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACAAATTGTGGGTCATTGTTACTT
CTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTTTGTCTAAACTTTTCCTCCCATCTTCAAAACC
ACTACCATTGTCCTGTCTGTTTTT*TTTTTTTCATTAGACTATGTTGAACGATTTATCA*
TCATCATTTCAGATTCCTTACGC
C

QA 7 629 7 629
DS 

RD RR2F807TF 364 0 0
G
ATTTATGATGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAACTCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCT
CAGCTCAACTCTGCTATCGACGATGTGTCCTCTCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAAT
GGTGCAGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGGCTACAGCCTGAAAATAATCTCTCATCTGT
TTTTAGGATGCTGAAACAAATTGTGGGTCATTGTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGT
GTAATTTTTGTCTAAACTTTTCCTCCCATCTTCAAAACCACTACCATTGTCCTGTCTGTT
TTTCTTTTTTTCATTAGACTATGTTGAACGATTTATCA*TCATCATTTCAGATTCCTTAC
GC
G

QA 2 363 2 363
DS 

RD RR2E614JQ 581 0 0
AAAAGCTCCAGTTTTCTGCTCCCAGAAA*AAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACA
GAGATGATGACAGTTCAGGAAGCACTGGCCTGTTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGC
TCATAGTCGGTGCTCTTGGATGTGTTTATGCACCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAG
CAGACCGAAAGGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGATGAGGAAAAAGCTT
TGGAGAAAACTCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCTATCGACG
ATGTGTCCTCTCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCAACTCTAAGCACCGATG
AAGTCGAGGCTACAGCCTGAAAATAATCTCTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACAAATT
GTGGGTCATTGTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTTTGTCTAAACTTTTC
CTCCCATCTTCAAAACCACTACCATTGTCCTGTCTGTTTTT**TTTTTTCATTAGACTAT
GTTGAACTATTTATCA*TCATCATTTCAGATTCCTTACGC
T

QA 1 580 1 580
DS 



AS 2 19

CO CL134Contig1 741 17 8 U
GGATAAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAG
AGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATG
GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCC
GTGGCATTAGCCGTTTCCACGCCGATTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCC
ACTATAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACG
GGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAG
CCATCCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGG
TTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAA
AAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAG
GGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATA
GGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCA
TGTATTCCAATATTTAGAATACTTTGTGTATTCATGAATTTATGCCACCTATTATAATAA
AAGGCTTTGATTAATAATGGC


BQ
50 50 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 70 85 55 85 60 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 70 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 60 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 65 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 65 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 30 25 25 25 25 10 

AF RR2EU63TF U 3
AF RR2FZ80TF U 1
AF RR2E096TF U 3
AF RR2GF63TF U 1
AF RR2AQ55TF U 3
AF RR2EG62TF U 1
AF RR2DL49TF U 3
AF RR2EU63JQ C 142
AF RR2DQ46TF U 1
AF RR2DQ46JQ C 1
AF RR2A811TF U 435
AF RR2GG06TF U 435
AF RR2FZ80JQ C 1
AF RR2GF63JQ C 268
AF RR2GR73JQ C 1
AF RR2GR73TF U 1
AF RR2E096JQ C 191
BS 1 435 RR2FZ80TF
BS 436 497 RR2A811TF
BS 498 498 RR2FZ80TF
BS 499 606 RR2A811TF
BS 607 607 RR2FZ80TF
BS 608 735 RR2A811TF
BS 736 740 RR2GR73TF
BS 741 741 RR2E096JQ

RD RR2EU63TF 595 0 0
GGATAAGAAA
ATGAGGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAGAGAGAGGGGAGA
ATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATGGCTTCTGTTGCC
TCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCAGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCCGTGGCATTAGCC
GTTTCCACGCCGATTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCCACTATAGCCACG
ACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACGGGCATGGGTCTC
CTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAGCCATCCTTCTTA
TCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGGTTAATTGATATA
CCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAAAAAGGTAAAGGT
AAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAGGGTAAAGGTTCA
CGTAAGGGTTCATCTGAG*ATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCAT

QA 11 595 11 595
DS 

RD RR2FZ80TF 627 0 0
GGATAAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAG
AGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATG
GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCC
GTGGCATTAGCCGTTTCCACGCCGATTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCC
ACTATAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACG
GGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAG
CCATCCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGG
TTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAA
AAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAG
GGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATA
GGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2E096TF 673 0 0
GG
AAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAACACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAGAGAG
AGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATGGCTT
CCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCCGTGG
CATTAGCCGTTTCCACGCCGATTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCCACTA
TAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACGGGCA
TGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAGCCAT
CCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGGTTAA
TTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAAAAAG
GTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAGGGTA
AAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAG*ATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATAGGAA
TTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAGTTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCATGTA
TTCCAATATTT

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR2GF63TF 690 0 0
GGATAAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAG
AGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATG
GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCC
GTGGCATTAGCCGTTTCCACGCCGATTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCC
ACTATAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACG
GGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAG
CCATCCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGG
TTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAA
AAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAG
GGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCGTAAATGGAAGCTCATATA
GGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCA
TGTATTC*AATATTTAGA*TACTTTGTGTA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2AQ55TF 711 0 0
GG
AAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAGAGAG
AGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATGGCTT
CCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCCGTGG
CATTAGCCGTTTCCACGCCGATTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCCACTA
TAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACGGGCA
TGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGTCAGCTCAGCCAT
CCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGGTTAA
TTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAAAAAG
GTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAGGGTA
AAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATAGGAA
TTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGTTCCATGTA
TTCCAATATTTAGAATACTTTGTGTATTCATGAATTTATGC
ACTATATA

QA 3 703 3 703
DS 

RD RR2EG62TF 719 0 0
GGATAAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAG
AGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATG
GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTTTTTCAGCC
GTGGCATTAGCCGTTTCCACGCCGATTTTCATCATCTTCAGTCTGATTCTCGTACCCGCC
ACTATAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACG
GGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCTGGCAGCTCAG
CCATCCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGG
TTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAA
AAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAG
GGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAG*ATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATA
GGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCA
TGTATTCCAATATTTAGAATACTTTGTGTATTCATGAATCTATGCCACCTATTATAATA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2DL49TF 730 0 0
GG
AAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAGAGAG
AGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAATGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATGGCTT
CCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCCGTGG
CATTAGCCGTTTCCACGCCGATTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCCACTA
TAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACGGGCA
TGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAGCCAT
CCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGGTTAA
TTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAAAAAG
GTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAGGGTA
AAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATAGGAA
TTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCATGTA
TTCCAATATTTAGAATACTTTGTGTATTCATGAATTTATGCCACCTATTATA
TAAAAGCTTTGATTAT

QA 3 714 3 714
DS 

RD RR2EU63JQ 542 0 0
TTTTTAGGCTTCGCCAGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCCGTGGCATTAGCCGTTTCCACG
CCGATTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCCACTATAGCCACGACCCTCCTA
GCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACGGGCATGGGTCTCCTCATGCGG
CTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAGCCATCCTTCTTATCTCTGTTG
GAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGGTTAATTGATATACCAGGAATT
GGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAAAAAGGTAAAGGTAAGAAAAAA
GGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAGGGTAAAGGTTCACGTAAGGGT
TCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATAGGAATTGTGGTAAATGTATGG
GTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCATGTATTCCAATATTTAGAATA
CT

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2DQ46TF 719 0 0
GGATAAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAG
AGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATG
GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCC
GTGGCATTAGCCGTTTCCACGCCGATTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCC
ACTATAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACG
GGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAG
CCATCCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGG
TTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAA
AAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAG
GGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATA
GGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCA
TGTATTCCAATATTTAGAATACTTTGTGTATTCATGAATTTATGCCACCTATTATAATA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2DQ46JQ 737 0 0
GGATAAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAG
AGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATG
GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCC
GTGGCATTAGCCGTTTCCACGCCGATTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCC
ACTATAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACG
GGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAG
CCATCCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGG
TTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAA
AAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAG
GGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATA
GGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCA
TGTATTCCAATATTTAGAATACTTTGTGTATTCATGAATTTATGCCACCTATTATAATAA
AAGGCTTTGATTAATA
G

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2A811TF 301 0 0
G
GGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAAAAAGGTAAAGGTAAG
AACAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAGGGTAAAGGTTCACGT
AAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATAGGAATTCTGGTAAAT
GTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCATGTATTCCAATATTT
AGAATACTTTGTGTATTCATGAATTTATGCCACCTATTATAATAAAAGGCTTTGATTAAT

QA 2 301 2 301
DS 

RD RR2GG06TF 298 0 0
G
GGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAAAAAGGTAAAGGTAAG
AACAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAGGGTAAAGGTTCACGT
AAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATAGGAATTCTGGTAAAT
GTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCATGTATTCCAATATTT
AGAATACTTTGTGTATTCATGAATTTATGCCACCTATTATAATAAAAGGCTTTGATT

QA 2 298 2 298
DS 

RD RR2FZ80JQ 732 0 0
GGATAAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAG
AGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATG
GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCC
GTGGCATTAGCCGTTTCCACGCCGATTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCC
ACTATAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACG
GGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGTTCAG
CCATCCTTTTTATTTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGG
TTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAA
AAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAG
GGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATA
GGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCA
TGTATTCCAATATTTAGAATACTTTGTGTATTCATGAATTTATGCCACCTATTATAATAA
AAGGCTTTGATT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2GF63JQ 465 0 0
GGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACGGGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATT
AAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGTTCAGCCATCCTTTTTATTTCTGTTGGAAATG
CCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGGTTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAA
TCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAAAAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAA
GGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAGGGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCT
GAGGATGAAAGTTCGTAAATGGAAGCTCATATAGGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAG
ATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCATGTATTCCAATATTTAGAATACTTTGT
GTATTCATGAATTTATGCCACCTATTATAATAAAAGGCTTTGATT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2GR73JQ 741 0 0
GGATAAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAG
AGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGATTATCAAGGTGGTTATG
GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGATGTAACACTCGCTTGTTCAGCC
GTGGCATTAGCCGTTTCCACGCCGATTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCC
ACTATAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACG
GGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAATAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCGGCTCAG
CCATCCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGG
TTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAA*GGTAAATCTAAAGGTAAA
AAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAG
GGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCGTATA
GGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCA
TGTATTCCAATATTTAGAATACTTTGTGTATTCATGAATTTATGCCACCTATTATAATAA
AAGGCTTTGATTAATAATGG
T

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2GR73TF 741 0 0
GGATAAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAG
AGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGATTATCAAGGTGGTTATG
GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGATGTAACACTCGCTTGTTCAGCC
GTGGCATTAGCCGTTTCCACGCCGATTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCC
ACTATAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACG
GGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAATAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCGGCTCAG
CCATCCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGG
TTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAA*GGTAAATCTAAAGGTAAA
AAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAG
GGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCGTATA
GGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCA
TGTATTCCAATATTTAGAATACTTTGTGTATTCATGAATTTATGCCACCTATTATAATAA
AAG*CTTTGATTAATAATGG
T

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2E096JQ 551 0 0
CCGTTTCCACGCCGATTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCCACTATAGCCA
CGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACGGGCATGGGTC
TCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAGCCATCCTTCT
TATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGGTTAATTGATA
TACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAAAAAGGTAAAG
GTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAAGATAAGAAAAAGGGTAAAGGTT
CACGTAAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATAGGAATTGTGG
TAAATGTATGGGTAAAGATAAGTTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCATGTATTCCAA
TATTTAGAATACTTTGTGTATTCATGAATTTATGCCACCTATTATAATAAAAGGCTTTGA
TTAATAATGGC

QA 1 551 1 551
DS 



CO CL134Contig2 634 2 2 U
GGATAAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAG
AGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATG
GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTAGTGCCGCC
CTCGGAGCGACGGGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCC
CCGGCAGCTCAGCCATCCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAG
ATGCAAGAAAGGTTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAA
TCTAAAGGTAAAAAAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAA
AGATAAGAAAAAGGGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAAT
GGAAGCTCATATAGGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAG
ACACATTGGTCCATGTATTCCAATATTTAGAATACTTTGTGTATTCATGAATTTATGCCA
CCTATTATAATAAAAGGCTTTGATTAATAATGGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE09JQ C 1
AF RR2EE09TF U 1
BS 1 612 RR2EE09TF
BS 613 634 RR2EE09JQ

RD RR2EE09JQ 634 0 0
GGATAAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAG
AGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATG
GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTAGTGCCGCC
CTCGGAGCGACGGGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCC
CCGGCAGCTCAGCCATCCTTTTTATTTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAG
ATGCAAGAAAGGTTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAA
TCTAAAGGTAAAAAAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAA
AGATAAGAAAAAGGGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAAT
GGAAGCTCATATAGGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAG
ACACATTGGTCCATGTATTCCAATATTTAGAATACTTTGTGTATTCATGAATTTATGCCA
CCTATTATAATAAAAGGCTTTGATTAATAATGGT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2EE09TF 612 0 0
GGATAAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAG
AGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATG
GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTAGTGCCGCC
CTCGGAGCGACGGGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCC
CCGGCAGCTCAGCCATCCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAG
ATGCAAGAAAGGTTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAA
TCTAAAGGTAAAAAAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAA
AGATAAGAAAAAGGGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGAGGATGAAAGTTCATAAAT
GGAAGCTCATATAGGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAG
ACACATTGGTCCATGTATTCCAATATTTAGAATACTTTGTGTATTCATGAATTTATGCCA
CCTATTATAATA

QA 1 612 1 612
DS 



AS 3 16

CO CL135Contig1 695 3 11 U
GGACCCCAACACTGCCTTCCAGACCATAACTGAACCACAGCATCTCTTGGTGACACAAAG
AAAAGTTCAAGAAACAGATAAAAAATGGCAGCACAAGCACTTGTGTCTTCTTCACTTACC
TCCTCTGTTCAGACCGCTAGACAGATATTCGGCACAAAACCAGTTGTGTCCGTGAGGAAG
ACTTCCTTTGTTGTCAAGGCTGCTTCAACTCCACCTGTAAAGCAAGGAGCAAACAGACCA
TTGTGGTTTGCCTCTTCACAATCTCTGTCTTACTTGGATGGGAGCTTACCTGGCGACTAT
GGATTCGACCCTCTTGGTCTTTCAGACCCAGAAGGTACTGGAGGTTTCATCGAGCCAAGA
TGGTTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGGAGGTTCGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCT
ATTGCCCC*TGAGATTCTTGGCAAAGCTGGTTTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTG
GTTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACATACAGCTACTGGGCAGACCCTTACAC
ACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGATTTGCTGAGCACCGGAGGTTGCAGGACTG
GTACAACCCAGGATCAATGGGAAAACAGTACTTCTTGGGCTTAGAGAAAGGTTTTGCCGG
TTCAGAGACCCGTCTTACCCGGGTGGACCTTTCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C190TF U 1
AF RR2AZ65TFB U 1
AF RR2DE32TF U 96
BS 1 39 RR2AZ65TFB
BS 40 40 RR2C190TF
BS 41 194 RR2AZ65TFB
BS 195 195 RR2DE32TF
BS 196 251 RR2AZ65TFB
BS 252 252 RR2DE32TF
BS 253 282 RR2AZ65TFB
BS 283 283 RR2DE32TF
BS 284 428 RR2AZ65TFB
BS 429 429 RR2DE32TF
BS 430 695 RR2AZ65TFB

RD RR2C190TF 640 0 0
GGACCCCAACACTGCCTTCCAGACCATAACTGAACCACAGCATCTCTTGGTGACACAAAG
AAAAGTTCAAGAAACAGATAAAAAATGGCAGCACAAGCACTTGTGTCTTCTTCACTTACC
TCCTCTGTTCAGACCGCTAGACAGATATTCGGCACAAAACCAGTTGTGTCCGTGAGGAAG
ACTTCCTTTGTTGTCAAGGCTGCTTCAACTCCACCTGTAAAGCAAGGAGCAAACAGACCA
TTGTGGTTTGCCTCTTCACAATCTCTGTCTTACTTGGATGGCATCTTACCTGGCGACTAT
GGATTCGACCCTCTTGGTCTTTCAGACCCAAAAGGTACTGGAGGTTTCATCTAGCCAAGA
TGGTTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGGAGGTTCGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCT
ATTGCCCC*TGAGATTCTTGGCAAAGCTGGTTTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTG
GTTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACATACAGCTACTGGGCAGACCCTTACAC
ACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGATTTGCTGAGCACCGGAGGTTGCAGGACTG
GTACAACCCAGGATCAATGGGAAAACAGTACTTCTTGGGC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2AZ65TFB 695 0 0
GGACCCCAACACTGCCTTCCAGACCATAACTGAACCACATCATCTCTTGGTGACACAAAG
AAAAGTTCAAGAAACAGATAAAAAATGGCAGCACAAGCACTTGTGTCTTCTTCACTTACC
TCCTCTGTTCAGACCGCTAGACAGATATTCGGCACAAAACCAGTTGTGTCCGTGAGGAAG
ACTTCCTTTGTTGTTAAGGCTGCTTCAACTCCACCTGTAAAGCAAGGAGCAAACAGACCA
TTGTGGTTTGCATCTTCACAATCTCTGTCTTACTTGGATGGGGGCTTACCTGGCGACTAT
GGATTCGACCCTCTTGGTCTTTCAGACCCAGAAGGTACTGGAGGTTTCATCGAGCCAAGA
TGGTTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGGAGGTTCGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCT
ATTGCCCCCTGAGATTCTTGGCAAAGCTGGTTTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTG
GTTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACATACAGCTACTGGGCAGACCCTTACAC
ACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGATTTGCTGAGCACCGGAGGTTGCAGGACTG
GTACAACCCAGGATCAATGGGAAAACAGTACTTCTTGGGCTTAGAGAAAGGTTTTGCCGG
TTCAGAGACCCGTCTTACCCGGGTGGACCTTTCTT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2DE32TF 574 0 0
GGCA
CTTGTGTCTTCTTCACTTACCTCCTCTGTTCAGACCGCTAGACAGATATTCGGCACAAAA
CCAGTTGTGTCCGTGAGGAAGACTTCCTTTGTTGTCAATGCTGCTTCAACTCCACCTGTA
AAGCAAGGAGCAAACAGACCATTGTGGTTTGCCTCTTCACAATCTCTGTCTTACTTGGAT
GGGAGCTTACCTGGCGACTATGGATTCGACCCTCTTGGTCTTTCAGATCCAGAAGGTACT
GGAGGTTTCATCGAGCCAAGATGGTTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGGAGGTTCGCT
ATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCCCC*TGAGATTCTTGGCAAAGCTGGTTTGATTCC
AGCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATCCCACCTGCAGGGACATACAG
CTACTGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGATTTGCTGA
GCACCGGAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCAGGATCAATGGGAAAACAGTACTTCTTGGG
CTTAGAGAAAGGTTTTGCCGGTTCA
AGAGA

QA 5 569 5 569
DS 



CO CL135Contig2 1057 8 40 U
GGAATCATCGTCTCTTGGTGACAGAAGAGAAAAAGTTTAAGCAAAAAAAAA*TGGCAGCA
CAAGCGCTTGTGTCTTCTTCACTTACCTCCTCTGTTCAGACAGCTAGACAGATATTCGGC
ACAAAACCAGCTGTGTCCGTATCACAGAGGAAGTTGGTTGTTAAGGCTGCCTCAACTCCA
CCTGCCAAGCAAGGAGCAAACAGGCAATTGTGGTTTGCATCATCACAGAGTCTCTCTTAC
TTGGATGGCAGCTTACCTGGCGACTTTGGATTCGACCCGCTTGGTCTTTCAGACCCAGAG
GGTACTGGAGGGTTCATCGAGCCGAGATGGCTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGCCGT
TTCGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTCTG
ATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACG
TACAGCTACTGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTT
GCTGAGCACAGAAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCAGGATCTATGGGTAAACAATACTTC
TTGGGTCTAGAGAAAGGTTTCTCCGGTTCAGGTAACCCGGCTTACCCCGGTGGACCTTTC
TTCAACCCTCTTGGGTTTGGAAAAGATGAGAAGTCGATGAAGGAGTTGAAACTCAAGGAG
GTCAAGAACGGTAGACTGGCAATGCTCGCCATCCTTGGCTATTTTATCCAGGGACTAGTG
ACCGGTGTGGGACCTTACCAGAACCTTCTTGATCATTTGGCGGATCCCGTCAACAACAAT
GTCTTGACCAGCCTCAAGTTCCACTGAGGTGATCATATCATATCATATCATCCCATGGTG
TT*GTCTGTTGGTCTCCCATTCTCTTGTATCCTACAGTCTTGTTTCTCTCTCTTTGATAC
CATCAGTTTCTTTGTGTTGTAACACCATATGTAAACATATTCGTCTTTTGTAAGAAATGA
CAATATCAGTGGCCATAATGAAACAATTTCTAGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F967TF U 5
AF RR2BX28TF U 1
AF RR2A668TF U 5
AF RR2FQ35TF U 27
AF RR2D789TF U 1
AF RR2FD24TF U 108
AF RR2GG36JQB C 309
AF RR2A668JQ C 338
BS 1 33 RR2BX28TF
BS 34 34 RR2D789TF
BS 35 51 RR2BX28TF
BS 52 52 RR2F967TF
BS 53 228 RR2BX28TF
BS 229 229 RR2F967TF
BS 230 240 RR2BX28TF
BS 241 241 RR2F967TF
BS 242 425 RR2BX28TF
BS 426 426 RR2F967TF
BS 427 575 RR2BX28TF
BS 576 576 RR2D789TF
BS 577 631 RR2BX28TF
BS 632 632 RR2A668TF
BS 633 650 RR2BX28TF
BS 651 651 RR2D789TF
BS 652 664 RR2BX28TF
BS 665 665 RR2D789TF
BS 666 686 RR2BX28TF
BS 687 687 RR2D789TF
BS 688 699 RR2BX28TF
BS 700 701 RR2D789TF
BS 702 702 RR2FD24TF
BS 703 722 RR2D789TF
BS 723 832 RR2FD24TF
BS 833 835 RR2GG36JQB
BS 836 886 RR2FD24TF
BS 887 891 RR2GG36JQB
BS 892 915 RR2FD24TF
BS 916 916 RR2GG36JQB
BS 917 921 RR2FD24TF
BS 922 935 RR2GG36JQB
BS 936 936 RR2A668JQ
BS 937 947 RR2GG36JQB
BS 948 948 RR2A668JQ
BS 949 956 RR2GG36JQB
BS 957 957 RR2A668JQ
BS 958 986 RR2GG36JQB
BS 987 987 RR2A668JQ
BS 988 1057 RR2GG36JQB

RD RR2F967TF 611 0 0
GG
ATCGTCTCTTGGTGACAGAAGAGAAAA*GTTTAAGCAAAAAAAAA*TGGCAGCACAAGCG
CTTGTGTCTTCTTCACTTACCTCCTCTGTTCAGACAGCTAGACAGATATTCGGCACAAAA
CCAGCTGTGTCCGTATCACAGAGGAAGTTGGTTGTTAAGGCTGCCTCAACTCCACCTGCC
AAGCAAGGAGCAAACAGGCAATTGTGGTTTGCATCATCACAGAGTCTCTCTTACTTGGAT
GGCAGCTTACCTGGCGACTTTGGATTCGACCCGCTTGGTCTTTCAGACCCAGAGGGTACT
GGAGGGTTCATCGAGCCGAGATGGCTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGCCGTTTCGCT
ATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTCTGATTCCA
GCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACGTACAGC
TACTGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAG
CACAGAAAGTTGCACGACTGGTACAACCCGGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGT
CTAGA
AGAA

QA 3 607 3 607
DS 

RD RR2BX28TF 699 0 0
GGAATCATCGTCTCTTGGTGACAGAAGAGAAAA*GTTTAAGCAAAAAAAAAATGGCAGCA
CAAGCGCTTGTGTCTTCTTCACTTACCTCCTCTGTTCAGACAGCTAGACAGATATTCGGC
ACAAAACCAGCTGTGTCCGTATCACAGAGGAAGTTGGTTGTTAAGGCTGCCTCAACTCCA
CCTGCCAAGCAAGGAGCAAACAGGCAATTGTGGTTTGCATCATCACAGGGTCTCTCTTAC
CTGGATGGCAGCTTACCTGGCGACTTTGGATTCGACCCGCTTGGTCTTTCAGACCCAGAG
GGTACTGGAGGGTTCATCGAGCCGAGATGGCTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGCCGT
TTCGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTCTG
ATTCCGGCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACG
TACAGCTACTGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTT
GCTGAGCACAGAAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCGGGATCTATGGGTAAACAATACTTC
TTGGGTCTAGAGAAAGGTTTCTCCGGTTCAG*TAACCCGGCTTACCCCGGCGGACCTTTC
TTCA*CCCTCTTGGGTTTGGAAAAGACGAGAAGTCGATG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2A668TF 710 0 0
GG
ATCGTCTCTTGGTGACAGAAGAGAAAAAGTTTAAGCAAAAAAAA**TGGCAGCACAAGCG
CTTGTGTCTTCTTCACTTACCTCCTCTGTTCAGACAGCTAGACAGATATTCGGCACAAAA
CCAGCTGTGTCCGTATCACAGAGGAAGTTGGTTGTTAAGGCTGCCTCAACTCCACCTGCC
AAGCAAGGAGCAAACAGGCAATTGTGGTTTGCATCATCACAGAGTCTCTCTTACTTGGAT
GGCAGCTTACCTGGCGACTTTGGATTCGACCCGCTTGGTCTTTCAGACCCAGAGGGTACT
GGAGGGTTCATCGAGCCAAGATGGTTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGCCGTTTCGCT
ATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTTTGATTCCA
GCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACGTACAGC
TACTGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAG
CACAGGAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCAGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGT
CTAGAGAAAGGTTTCTCCGGTTCAGGTAACCCGGCTTACCCCGGTGGACCTTTCTTCAAC
CCTCTTGGGTTTGGAAAAGATGAGAAGTCGATGAACGAGTTGAAACTC

QA 3 710 3 710
DS 

RD RR2FQ35TF 672 0 0
GGGA
AAAAGTTTAAGCAAAAAAAA**TGGCAGCACAAGCGCTTGTGTCTTCTTCACTTACCTCC
TCTGTTCAGACAGCTAGACAGATATTCGGCACAAAACCAGCTGTGTCCGTATCACAGAGG
AAGTTGGTTGTTAAGGCTGCCTCAACTCCACCTGCCAAGCAAGGAGCAAACAGGCAATTG
TGGTTTGCATCATCACAGAGTCTCTCTTACTTGGATGGCAGCTTACCTGGCGACTTTGGA
TTCGACCCGCTTGGTCTTTCAGACCCAGAGGGTACTGGAGGGTTCATCGAGCCAAGATGG
TTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGCCGTTTCGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATC
GCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTTTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTC
CAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACGTACAGCTACTGGGCAGACCCTTACACACTC
TTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAGCACAGGAGGTTGCAGGACTGGTAC
AACCCAGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGTCTAGAGAAAGGTTTCTCCGGTTCA
GGTAACCCGGCTTACCCCGGTGGACCTTTCTTCA*CCCTCTTGGGTTTGGAAA*GATGAG
AAGTCGAT

QA 5 672 5 672
DS 

RD RR2D789TF 722 0 0
GGAATC
ATCGTCTCTTGGTGACAGAAGAGAAAAAGTTTAAGCAAAAAAAAA*TGGCAGCACAAGCG
CTTGTGTCTTCTTCACTTACCTCCTCTGTTCAGACAGCTAGACAGATATTCGGCACAAAA
CCAGCTGTGTCCGTATCACAGAGGAAGTTGGTTGTTAAGGCTGCCTCAACTCCACCTGCC
AAGCAAGGAGCAAACAGGCAATTGTGGTTTGCATCATCACAGAGTCTCTCTTACTTGGAT
GGCAGCTTACCTGGCGACTTTGGATTCGACCCGCTTGGTCTTTCAGACCCAGAGGGTACT
GGAGGGTTCATCGAGCCAAGATGGTTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGCCGTTTCGCT
ATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTTTGATTCCA
GCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACGTACAGC
TACTGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAG
CACAGGAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCAGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGT
CTAGAGAAAGGTTTCTCCGGTTCAG*TAACCCGGCTTACCCCGGTGGACCTTTCTTCAAC
CCTCTTGGGTTTGGAAA*GATGAGAAGTCGATGAA*GAGTTGAAACTCAAGGAGGT

QA 7 722 7 722
DS 

RD RR2FD24TF 818 0 0
G
CAGATATTCGGCACAAAACCAGCTGTGTCCGTATCCCATAGGAAGTTGGTTGTTAAGGCT
GCCTCAACTCCACCTGCCAAGCAAGGAGCAAACAGGCAATTGTGGTTTGCATCATCACAG
AGTCTCTCTTACTTGGATGGCAGCTTACCTGGCGACTTTGGATTCGACCCGCTTGGTCTT
TCAGACCCAGAGGGTACTGGAGGGTTCATCGAGCCGAGATGGCTAGCCTACGGAGAGATC
ATCAACGGCCGTTTCGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGA
AAGGCCGGTCTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATTCCA
CCTGCAGGGACGTACAGCTACTGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCT
TTGATGGGTTTTGCTGAGCACAGAAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCGGGATCTATGGGT
AAACAATACTTCTTGGGTCTAGAGAAAGGTTTCTCCGGTTCAGGTAACCCGGCTTACCCC
GGCGGACCTTTCTTCAACCCTCTTGGGTTTGGAAAAGACGAGAAGTCGATGAAGGAGTTG
AAACTCAAGGAGGTCAAGAACGGTAGACTGGCAATGCTCGCCATCCTTGGCTATTTTATC
CAGGGACTAGTGACCGGTGTGGGACCTTACCAGAACCTTCTTGATCATTTGGCGGATCCC
GTCAC**ACAATGTCTTGACCAGCCTCAAGTTCCACTGAGGTGATCATATCATATCAT**
***CCCATGGTGTT*GTCTGTTGGTCTTCCATT
CTCT

QA 2 814 2 814
DS 

RD RR2GG36JQB 749 0 0
AGGGTTCATCGAGCCGAGATGGCTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGCCGTTTCGCTAT
GTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTCTGATTCCAGC
AGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACGTACAGCTA
CTGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAGCA
CAGAAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCGGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGTCT
AGAGAAAGGTTTCTCCGGTTCAGGTAACCCGGCTTACCCCGGCGGACCTTTCTTCAACCC
TCTTGGGTTTGGAAAAGACGAGAAGTCGATGAAGGAGTTGAAACTCAAGGAGGTCAAGAA
CGGTAGACTGGCAATGCTCGCCATCCTTGGCTATTTTATCCAGGGACTAGTGACCGGTGT
GGGACCTTACCAGAACCTTTTTGATCATTTGGCGGATCCCGTCAACAACAATGTCTTGAC
CAGCCTCAAGTTCCACTGAGGTGATCATATCATATCATATCATCCCATGGTGTT*GTCTG
TTGGTCTCCCATTCTCTTGTATCCTACCGTCTTGTTTCTTTCTCTTTGGTACCATCAGTT
TCTTTGTGTTGTAACACCCTATGTAAACATATTCGTCTTTTGTAAGAAATGACAATATCA
GTGGCCATAATGAAACAATTTCTAGGATC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2A668JQ 697 0 0
ACGGAGAGATCATCAACGGCCGTTTCGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCACCTG
AGATTCTAGGAAAGGCCGGTTTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCG
GTGTGATTCCACCTGCAGGGACGTACAGCTACTGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTC
TCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAGCACAGGAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCAG
GATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGTCTAGAGAAAGGTTTCTCCGGTTCAGGTAACC
CGGCTTACCCCGGTGGACCTTTCTTCAACCCTCTTGGGTTTGGAAAAGATGAGAAGTCGA
TGAAGGAGTTGAAACTCAAGGAGGTCAAGAACGGTAGACTGGCAATGCTCGCCATCCTTG
GATATTTTATCCAGGGACTAGTGACCAGTGTGGGACCTTACCAGAACCTTCTTGATCATT
TGGCGGATCCCGTCAACAACAATGTCTTGACCAGCCCCAAGTTCCACTGAGGTGATCATA
TCATATCATATCATCCCATGGTGTTTGTCTGTTGGTCTCCCATTCTCTTGTATCTTACAG
TCTTGTTTCTCTCTCTTTGATACCATCAGTTTCTTTGTGTTGTAACACCATGTGTAAACA
TATTCGTCTTTTGTAAGAAATGACAATATCAGTGGCC

QA 1 697 1 697
DS 



CO CL135Contig3 1019 5 27 U
AATCCTAAAAGTTGTTTCATTATGGCCACTGATATTGTCATTTCTTACAAAAGACGAATA
TGTTTACACATGGTGTTACAACACAAAGAAACTGATGGTATCAAAGAAAGAGAAACAAGA
CTGTAAAATACAAGAAAATGGGAGACCAACAGACAAACACCATGGGATGATATGATATGA
TATGATCACCTCAGTGGAACTTGAGGCTGGTCAAGACATTGTTGTTGACGGGATCCGCCA
AATGATCAAAAAGGTTCTGAAAAGGTCCCACACCGGTCACTAGTCCCTGGATAAAATAGC
CAAGGATGGCGAGCATTGCCAGTCTACCGTTCTTGACCTCCTTGAGTTTCAACTCCTTCA
TCGACTTCTCGTCTTTTCCAAACCCAAGAGGGTTGAAAAAAGGTCCGCCGGGGTAAGCCG
GGTTACCTGAACCGGAAAAACCTTTCTCTAGACCCAAGAAGTATTGTTTACCCATAGATC
CCGGGTTGTACCAGTCCTGCAACCTTCTGTGCTCAGCAAAACCCATCAAAGCCATCTCGA
GAACAAAGAGTGTGTAAGGGTCTGCCCAGTAGCTGTACGTCCCTGCAGGTGGAATCACAC
CGGTTTGGAACCAGGGAAGAGCAGTGTCTGCTGGAATCAGACCGGCCTTTCCTAGAATCT
CAGG*TGCAATAGCTCCAGCTGCACCCAACATAGCGAAACGGCCGTTGATGATCTCTCCG
TAGGCTAGCCATCTCGGCTCGATGAACCCTCCAGTACCCTCTGGGTCTGAAAGACCAAGC
GGGTCGAATCCAAAGTCGCCAGGTAAGCTGCCATCCAAGTAAGAGAGACTCTGTGATGAT
GCAAACCACAATTGCCTTAACAACCAACTTCCTCTGTGATACGGACACAGCTGGTTTTGT
GCCGAATATCTGTCTAGCTGTCTGAACAGAGGAGGTAAGTGAAGAAGACACAAGCGCTTG
TGCTGCCATTTTTTTTTTGCTTAAACTTTTCTCTTCTGTCACCAAGAGACGATGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ35JQ U 24
AF RR2F967JQ U 146
AF RR2D789JQ U 1
AF RR2FW64TF C 352
AF RR2GG36TF C 348
BS 1 119 RR2D789JQ
BS 120 120 RR2FQ35JQ
BS 121 135 RR2D789JQ
BS 136 136 RR2FQ35JQ
BS 137 259 RR2D789JQ
BS 260 261 RR2F967JQ
BS 262 269 RR2D789JQ
BS 270 270 RR2F967JQ
BS 271 298 RR2D789JQ
BS 299 299 RR2F967JQ
BS 300 370 RR2D789JQ
BS 371 371 RR2F967JQ
BS 372 406 RR2D789JQ
BS 407 407 RR2F967JQ
BS 408 476 RR2D789JQ
BS 477 477 RR2FW64TF
BS 478 481 RR2D789JQ
BS 482 482 RR2FW64TF
BS 483 505 RR2D789JQ
BS 506 506 RR2FW64TF
BS 507 639 RR2D789JQ
BS 640 640 RR2FW64TF
BS 641 664 RR2D789JQ
BS 665 665 RR2FW64TF
BS 666 702 RR2D789JQ
BS 703 1005 RR2FW64TF
BS 1006 1019 RR2GG36TF

RD RR2FQ35JQ 229 0 0
GGCCACTGATATTGTCATTTCTTACAAAAGACGAATATGTTTACACATGGTGTTACAACA
CAAAGAAACTGATGGTATCAAAGAAAGAGAAACAAGACTGTAAGATACAAGAAAATGGGA
GACCAACAGACAAACACCATGGGATGATATGATATGATATGATCACCTCAGTGGAACTTG
AGGCTGGTCAAGACATTGTTGTTGACGGGATCCGCCAAATGATCAAAAA

QA 1 229 1 229
DS 

RD RR2F967JQ 315 0 0
CCAACAGACAA*CACCATGGGATGATATGATATGATATGATCACCTCAGTGGAACTTGAG
GCTGGTCAAGACATTGTTGTTGACGGGATCCGCCAAATGATCAAAAAGGTTCTGAAAAGG
TCCCACACCGGTCACTAGTCCCTGGATAAAATAGCCAAGGATGGCGAGCATTGCCAGTCT
ACCGTTCTTGACCTCCTTGAGTTTCAACTCCTTCATCGACTTCTCGTCTTTTCCAAACCC
AAAAGGGTTGAAAAAAGGTCCGCCGGGGTAAACCGGGTTACCTGAACCGGAAAAACCTTT
CTCTACACCCAA
AAA

QA 1 312 1 312
DS 

RD RR2D789JQ 702 0 0
AATCCTAAAAGTTGTTTCATTATGGCCACTGATATTGTCATTTCTTACAAAAGACGAATA
TGTTTACACATGGTGTTACAACACAAAGAAACTGATGGTATCAAAGAAAGAGAAACAAGG
CTGTAAAATACAAGAGAATGGGAGACCAACAGACAAACACCATGGGATGATATGATATGA
TATGATCACCTCAGTGGAACTTGAGGCTGGTCAAGACATTGTTGTTGACGGGATCCGCCA
AATGATCAAAAAGGTTCTGGTAAGGTCCCGCACCGGTCACTAGTCCCTGGATAAAATATC
CAAGGATGGCGAGCATTGCCAGTCTACCGTTCTTGACCTCCTTGAGTTTCAACTCCTTCA
TCGACTTCTCATCTTTTCCAAACCCAAGAGGGTTGAAAAAAGGTCCACCGGGGTAAGCCG
GGTTACCTGAACCGGAAAAACCTTTCTCTAGACCCAAGAAGTATTGTTTACCCATAAATC
CTGGGTTGTACCAGTCCTGCAACCTCCTGTGCTCAGCAAAACCCATCAAAGCCATCTCGA
GAACAAAGAGTGTGTAAGGGTCTGCCCAGTAGCTGTACGTCCCTGCAGGTGGAATCACAC
CGGTTTGGAACCAGGGAAGAGCAGTGTCTGCTGGAATCAAACCGGCCTTTCCTAGAATCT
CAGGGTGCAATAGCTCCAGCTGCACCCAACATAGCGAAACGG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2FW64TF 654 0 0
ACTCCTTCATCGACTTCTCGTCTTT*CCAAACCCAAGAGGGT*GAAGAAAGGTCCGCCGG
GGTAAGCCGGGTTACCTGAACCGGAGAAACCTTTCTCTAGACCCAAGAAGTATTGTTTAC
CCATAGATCCCGGGTTGTACCAGTCCTGCAACCTTCTGTGCTCAGCAAAACCCATCAAAG
CCATCTCGAGAACAAAGAGTGTGTAAGGGTCTGCCCAGTAGCTGTACGTCCCTGCAGGTG
GAATCACACCGGTTTGGAACCAGGGAAGAGCAGTGTCTGCTGGAATCAGACCGGCCTTTC
CTAGAATCTCAGG*TGCAATAGCTCCAGCTGCACCCAACATAGCGAAACGGCCGTTGATG
ATCTCTCCGTAGGCTAGCCATCTCGGCTCGATGAACCCTCCAGTACCCTCTGGGTCTGAA
AGACCAAGCGGGTCGAATCCAAAGTCGCCAGGTAAGCTGCCATCCAAGTAAGAGAGACTC
TGTGATGATGCAAACCACAATTGCCTTAACAACCAACTTCCTCTGTGATACGGACACAGC
TGGTTTTGTGCCGAATATCTGTCTAGCTGTCTGAACAGAGGAGGTAAGTGAAGAAGACAC
AAGCGCTTGTGCTGCCATTTTTTTTTTGCTTAAACTTTTCTCTTCTGTCACCAA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2GG36TF 672 0 0
TTTCAACT
CTTCATCGACTTCTCGTCTTTTCCAAACCCAAGAGGGTTGAAGAAAGGTCCGCCGGGGTA
AGCCGGGTTACCTGAACCGGAGAAACCTTTCTCTAGACCCAAGAAGTATTGTTTACCCAT
AGATCCCGGGTTGTACCAGTCCTGCAACCTTCTGTGCTCAGCAAAACCCATCAAAGCCAT
CTCGAGAACAAAGAGTGTGTAAGGGTCTGCCCAGTAGCTGTACGTCCCTGCAGGTGGAAT
CACACCGGTTTGGAACCAGGGAAGAGCAGTGTCTGCTGGAATCAGACCGGCCTTTCCTAG
AATCTCAGG*TGCAATAGCTCCAGCTGCACCCAACATAGCGAAACGGCCGTTGATGATCT
CTCCGTAGGCTAGCCATCTCGGCTCGATGAACCCTCCAGTACCCTCTGGGTCTGAAAGAC
CAAGCGGGTCGAATCCAAAGTCGCCAGGTAAGCTGCCATCCAAGTAAGAGAGACTCTGTG
ATGATGCAAACCACAATTGCCTTAACAACCAACTTCCTCTGTGATACGGACACAGCTGGT
TTTGTGCCGAATATCTGTCTAGCTGTCTGAACAGAGGAGGTAAGTGAAGAAGACACAAGC
GCTTGTGCTGCCATTTTTTTTTTGCTTAAACTTTTCTCTTCTGTCACCAAGAGACGATGA
TTCC

QA 9 672 9 672
DS 



AS 4 16

CO CL136Contig1 862 6 14 U
GGACGTTTCTCGGATCCACAAAAACGAAAGTAACAAAAAAAA*AGGACGATTTGATAGCA
ATCAAAATGGCGGAAGAGAAGAGCTACAAGTACGTGATCGTCGGAGGTGGCGTCGCCGCC
GGATACGCAGCGAGAGAGTTCTCTAAGCAAGGTCTCAAGCCTGGTGAACTTGCTATCATC
TCCAAGGAACCGGTGCCTCCTTATGAGCGTCCTGCACTCAGCAAAGGATATATTAATTTC
CAGAATAAAGCTTCACTTCCGGGTTTCTATGTCTGTGCTGGAAGTGGGGGAGAGAGACAG
TTCCCGCCGTGGTACAAAGAGAATGGGATTGATCTGTTTCTGGAGACAGAGATTGTCAAA
GCAGATCTTGCTTCAAAGACTCTCGTCAGTGGCACCGGACAAGTCTTCAAGTACCAAACC
TTGATTGCTGCTACCGGTTCTTCTGTCACAAGGTTGTCAGATTTTGGGGTGGAAGGAGCT
GATGCTAAGAATATATTCTACCTAAGAGAGCTTGTAGACGCTGATGAGCTTCTGACTGCA
ATGCTCGAAAAGGAAAATGGCAAAGCTGTGGTTGTTGGTGGCGGTTACATTGGTCTTGAA
CTCAGTTCTGCTCTCAAGGTTAACAACATGGAAGTTACCATGGTTTATCCAGAGCCTTGG
TGCATGCCTCGGCTTTTCACCGCTGACATTGCTTCCTTCTACGAGGGT*ACTACGCCAAC
AAAGGGATCAACATTGTTAAAGCACCGTTGCTGCCGGTTCACCACTAACTCTGCTGGAGA
GGTCACTGAGTGTTGTTGAAGACGGAAGAAACTAGAGCTGATATAGTGATCGTAGTGTTG
GTGCTAGACTATTACATCACTC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 0 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO57TF U 1
AF RR2DF67TF U 1
AF RR2E866TF U 1
AF RR2CK22TF U 1
AF RR2DH26TF U 1
AF RR2DI18TF U 53
BS 1 128 RR2CK22TF
BS 129 129 RR2DO57TF
BS 130 184 RR2CK22TF
BS 185 185 RR2DO57TF
BS 186 229 RR2CK22TF
BS 230 230 RR2DO57TF
BS 231 391 RR2CK22TF
BS 392 392 RR2DH26TF
BS 393 622 RR2CK22TF
BS 623 623 RR2DH26TF
BS 624 693 RR2CK22TF
BS 694 694 RR2DH26TF
BS 695 730 RR2CK22TF
BS 731 862 RR2DI18TF

RD RR2DO57TF 371 0 0
GGACGTTTCTCGGATCCACAAAAACAAAAGTAACAAAAAAAAGAGGACGATTTCATAGCA
ATCAAAATGGCGGAAGAGAAGAGCTACAAGTACGTGATCGTCGGAGGTGGCGTCGCCGCC
GGATACGCAGCGAGAGAGTTCTCTAAGCAAGGTCTCAAGCCTGGTGAACTTGCTATCATC
TCCAAGGAACCGGTGCCTCCTTATGAGCGTCCTGCACTCAGCAAAGGATATATTAATTTC
CAGAATAAAGCTTCACTTCCGGGTTTCTATGTCTGTGCTGGAAGTGGGGGAGAGAGACAG
TTCCCTCCTTGGTACAAAGAGAATGGGATTGATCTGTTTCTGGAGACAGAGATTGTCAAA
GCAGATCTTGC

QA 1 371 1 371
DS 

RD RR2DF67TF 709 0 0
GGACGTTTCTCGGATCCACAAAAACGAAAGTAACAAAAAAAA*AGGACGATTTGATAGCA
ATCAAAATGGCGGAAGAGAAGAGCTACAAGTACGTGATCGTCGGAGGTGGCGTCGCCGCC
GGATACGCGGCGAGAGAGTTCTCTAAGCAAGGTCTCAAGCCTGGTGAACTTGCTATCATC
TCCAGGGAACCGGTGCCTCCTTATGAGCGTCCTGCACTCAGCAAAGGATATATTAATTTC
CAGAATAAAGCTTCACTTCCGGGTTTCTATGTCTGTGCTGGAAGTGGGGGAGAGAGACAG
TTCCCGCCGTGGTACAAAGAGAATGGGATTGATCTGTTTCTGGAGACAGAGATTGTCAAA
GCAGATCTTGCTTCAAAGACTCTCGTCAGTGGCACCGGACAAGTCTTCAAGTACCAAACC
TTGATTGCTGCTACCGGTTCTTCTGTCACAAGGTTGTCAGATTTTGGGGTGGAAGGAGCT
GATGCTAAGAATATATTCTACCTAAGAGAGCTTGTAGACGCTGATGAGCTTCTGACTGCA
ATGCTCGAAAAGGAAAATGGCAAAGCTGTGGTTGTTGGTGGCGGTTACATTGGTCTTGAA
CTCAGTTCTGCTCTCAAGGTTAACAACATGGAAGTTACCATGGTTTATCCAGAGCCTTGG
TGCATGCCTCGGCTTTTCACCGCTGACATTGCTTCCTTCTACGAGGGT
A

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2E866TF 688 0 0
GGACGTTTCTCGGATCCACAAAAACAAAAGTAACAAAAAAAAGAGGACGATTTCATAGCA
ATCAAAATGGCGGAAGAGAAGAGCTACAAGTACGTGATCGTCGGAGGTGGCGTCGCCGCC
GGATACGCAGCGAGAGAGTTCTCTAAGCAAGGTCTCAAGCCTGGTGAACTTGCTATCATC
TCCAAGGAACCGGTGCCTCCTTATGAGCGTCCTGCACTCAGCAAAGGATATATTAATTTC
CAGAATAAAGCTTCACTTCCGGGTTTCTATGTCTGTGCTGGAAGTGGGGGAGAGAGACAG
TTCCCTCCTTGGTACAAAGAGAATGGGATTGATCTGTTTCTGGAGACAGAGATTGTCAAA
GCAGATCTTGCTTCAAAGACTCTCGTCAGTGGCACTGGACAAGTCTTCAAGTACCAAACC
TTGATAGCTGCTACTGGTTCTTCTGTCACAAGGTTGTCAGATTTTGGGGTGGAAGGAGCA
GATGCTAAGAATATATTCTACCTAAGAGAGCTTGTAGATGCTGATGAGCTTCTGACTGCA
ATGCTCGAAAAGGAAAATGGCAAAGCTGTGGTTGTTGGTGGCGGTTACATTGGTCTCGAA
CTCAGTTCTGCTCTCAAGGTTAACAACATGGAAGTTACCATGGTTTATCCAGAGCCTTGG
TGCATGCCTCGGCTTTTCACCGCTGACA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2CK22TF 737 0 0
GGACGTTTCTCGGATCCACAAAAACGAAAGTAACAAAAAAAA*AGGACGATTTGATAGCA
ATCAAAATGGCGGAAGAGAAGAGCTACAAGTACGTGATCGTCGGAGGTGGCGTCGCCGCC
GGATACGCGGCGAGAGAGTTCTCTAAGCAAGGTCTCAAGCCTGGTGAACTTGCTATCATC
TCCAGGGAACCGGTGCCTCCTTATGAGCGTCCTGCACTCAGCAAAGGATTTATTAATTTC
CAGAATAAAGCTTCACTTCCGGGTTTCTATGTCTGTGCTGGAAGTGGGGGAGAGAGACAG
TTCCCGCCGTGGTACAAAGAGAATGGGATTGATCTGTTTCTGGAGACAGAGATTGTCAAA
GCAGATCTTGCTTCAAAGACTCTCGTCAGTGACACCGGACAAGTCTTCAAGTACCAAACC
TTGATTGCTGCTACCGGTTCTTCTGTCACAAGGTTGTCAGATTTTGGGGTGGAAGGAGCT
GATGCTAAGAATATATTCTACCTAAGAGAGCTTGTAGACGCTGATGAGCTTCTGACTGCA
ATGCTCGAAAAGGAAAATGGCAAAGCTGTGGTTGTTGGTGGCGGTTACATTGGTCTTGAA
CTCAGTTCTGCTCTCAAGGTTA*CAACATGGAAGTTACCATGGTTTATCCAGAGCCTTGG
TGCATGCCTCGGCTTTTCACCGCTGACATTGCT*CCTTCTACGAGGGT*ACTACGCCAAC
AAAGGGATCA
CATTGTC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2DH26TF 737 0 0
GGACGTTTCTCGGATCCACAAAAACGAAAGTAACAAAAAAAA**GGACGATTTGATAGCA
ATCAAAATGGCGGAAGAGAAGAGCTACAAGTACGTGATCGTCGGAGGTGGCGTCGCCGCC
GGATACGCGGCGAGAGAGTTCTCTAAGCAAGGTCTCAAGCCTGGTGAACTTGCTATCATC
TCCAGGGAACCGGTGCCTCCTTATGAGCGTCCTGCACTCAGCAAAGGATATATTAATTTC
CAGAATAAAGCTTCACTTCCGGGTTTCTATGTCTGTGCTGGAAGTGGGGGAGAGAGACAG
TTCCCGCCGTGGTACAAAGAGAATGGGATTGATCTGTTTCTGGAGACAGAGATTGTCAAA
GCAGATCTTGCTTCAAAGACTCTCGTCAGTGGCACCGGACAAGTCTTCAAGTACCAAACC
TTGATTGCTGCTACCGGTTCTTCCGTCACAAGGTTGTCAGATTTTGGGGTGGAAGGAGCT
GATGCTAAGAATATATTCTACCTAAGAGAGCTTGTAGACGCTGATGAGCTTCTGACTGCA
ATGCTCGAAAAGGAAAATGGCAAAGCTGTGGTTGTTGGTGGCGGTTACATTGGTCTTGAA
CTCAGTTCTGCTCTCAAGGTTAACAACATGGAAGTTACCATGGTTTATCCAGAGCCTTGG
TGCATGCCTCGGCTTTTCACTGCTGACATTGCTTCCTTCTACGAGGGT*ACTACGCCA*C
AAAGGGATCA
CATTGTC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2DI18TF 810 0 0
G
GATAGCAATCAAAATGGCGGAAGAGAAGAGCTACAAGTACGTGATCGTCGGAGGTGGCGT
CGCCGCCGGATACGCAGCGAGAGAGTTCTCTAAGCAAGGTCTCAAGCCTGGTGAACTTGC
TATCATCTCCAAGGAACCGGTGCCTCCTTATGAGCGTCCTGCACTCAGCAAAGGATATAT
TAATTTCCAGAATAAAGCTTCACTTCCGGGTTTCTATGTCTGTGCTGGAAGTGGGG*AGA
GAGACAGTTCCCTCCTTGGTACAAAGAGAATGGGATTGATCTGTTTCTGGAGACAGAGAT
TGTCAAAGCAGATCTTGCTTCAAAGACTCTCGTCAGTGGCACTGGACAAGTCTTCAAGTA
CCAAACCTTGATAGCTGCTACTGGTTCTTCTGTCACAAGGTTGTCAGATTTTGGGGTGGA
AGGAGCAGATGCTAAGAATATATTCTACCTAAGAGAGCTTGTAGATGCTGATGAGCTTCT
GACTGCAATGCTCGAAAAGGAAAATGGCAAAGCTGTGGTTGTTGGTGGCGGTTACATTGG
TCTTGAACTCAGTTCTGCTCTCAAGGTTAACAACATGGAAGTTACCATGGTTTATCCAGA
GCCTTGGTGCATGCCTCGGTTTTTCACCGCTGACATTGCTTCCTTCTATGAGGGTTACTA
CGCCAACAAAGGGATCAACATTGTTAAAGCACCGTTGCTGCCGGTTCACCACTAACTCTG
CTGGAGAGGTCACTGAGTGTTGTTGAAGACGGAAGAAACTAGAGCTGATATAGTGATCGT
AGTGTTGGTGCTAGACTATTACATCACTC

QA 2 810 2 810
DS 



CO CL136Contig2 734 3 7 U
AAAAGTAACAAAGATTGAAAGGGATTCAACAAATACATTTTTGAACTAAATAGTTCCAAA
TTTATTTCTCAATCAAAATAAATCCCAACAAACCAATAAGTAAAACAGATATAGTGAGAA
ATGACATAAAGCCACTCAAAACTCAAGACAGAACACACTAAACAACACACAAACACAAGT
CAGAACGTAGAAGCAGTTCTGTTCCTTTCTTTTTTTGCTTTCATATGTTGCTGACGAAGG
AAAGTCCTTCCTTGGACAACACCTCAACGCTCTCAACAGAAGGCTGTTCTCTCGCAGCCT
TAGCAATCGCCTTGTTCTCATCAGGACTCCCTCCTTCTAGAAACACTCCTATCAACTTCC
CTTCTTTAACCCAGTAGCTCCCAAACTTCGGCTTAGCAGATGTCGGGTCATTGTCACCAA
ACAACACTGTCTCTCCAACGTTATCACCGTAGAACTGCCACGAGAGATTGAAAGCTCTAG
AGTAGAAGTACGGAAGATAGTCATATTCGGGAATCGAGTTCCCTTCCTCCGCAGCCTTGA
TCGCCTTAACGGCTTGTTCAGCAGACTTGCGAGCATGGTCCACGTGTTCGACGCGTCTCA
TATCGTTGTAGAGTTTCATCGGGAAGGTGGCTATGTCACCAACGGCGTATACATCTGGAA
CGCTTGTTCTGAAGAATGCATCAGTCTTGAGTCCACCCTTCTCTTCTTCAACTTGGCCTT
TGAAGAGTGATGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2F087JQ U 281
AF RR2DF67JQ U 1
AF RR2DH26JQ U 43
BS 1 183 RR2DF67JQ
BS 184 184 RR2DH26JQ
BS 185 486 RR2DF67JQ
BS 487 487 RR2F087JQ
BS 488 525 RR2DF67JQ
BS 526 526 RR2F087JQ
BS 527 734 RR2DF67JQ

RD RR2F087JQ 325 0 0
AGGCTGTTCTCTCGCAGCCTTAGCAATCGCCTTGGTCTCATCAGGACTCCCTCCTTCTAG
AAACACTCCTATCAACTTCCCTTCTTTAACCCAGTAGCTCCCAAACTTCGGCTTAACAGA
TGTCGGGTCATTGTCACCAAACAACACTGTCTCTCCAACGTTATCACCGTAAAACTGCCA
CGAGAGATTGAAAGCTCTAGAGTAGAAGTACGGAAGATAGTCATATTCGGGAATCGAGTT
CCCTTCCTCCGCAGCCTTGATCGCCTTAACGGCTTGTTCAGCAGACTTGCGAGCGTGGTC
CACGTGTTCGACGCGTCTCATATCG

QA 1 325 1 325
DS 

RD RR2DF67JQ 734 0 0
AAAAGTAACAAAGATTGAAAGGGATTCAACAAATACATTTTTGAACTAAATAGTTCCAAA
TTTATTTCTCAATCAAAATAAATCCCAACAAACCAATAAGTAAAACAGATATAGTGAGAA
ATGACATAAAGCCACTCAAAACTCAAGACAGAACACACTAAACAACACACAAACACAAGT
CAGGACGTAGAAGCAGTTCTGTTCCTTTCTTTTTTTGCTTTCATATGTTGCTGACGAAGG
AAAGTCCTTCCTTGGACAACACCTCAACGCTCTCAACAGAAGGCTGTTCTCTCGCAGCCT
TAGCAATCGCCTTGTTCTCATCAGGACTCCCTCCTTCTAGAAACACTCCTATCAACTTCC
CTTCTTTAACCCAGTAGCTCCCAAACTTCGGCTTAGCAGATGTCGGGTCATTGTCACCAA
ACAACACTGTCTCTCCAACGTTATCACCGTAGAACTGCCACGAGAGATTGAAAGCTCTAG
AGTAGAGGTACGGAAGATAGTCATATTCGGGAATCGAGTTCCCTTACTCCGCAGCCTTGA
TCGCCTTAACGGCTTGTTCAGCAGACTTGCGAGCATGGTCCACGTGTTCGACGCGTCTCA
TATCGTTGTAGAGTTTCATCGGGAAGGTGGCTATGTCACCAACGGCGTATACATCTGGAA
CGCTTGTTCTGAAGAATGCATCAGTCTTGAGTCCACCCTTCTCTTCTTCAACTTGGCCTT
TGAAGAGTGATGTA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2DH26JQ 692 0 0
GAACTAAATAGTTCCAAATTTATTTCTCAATCAAAATAAATCCCAACAAACCAATAAGTA
AAACAGATATAGTGAGAAATGACATAAAGCCACTCAAAACTCAAGACAGAACACACTAAA
CAACACACAAACACAAGTCAGAACGTAGAAGCAGTTCTGTTCCTTTCTTTTTTTGCTTTC
ATATGTTGCTGACGAAGGAAAGTCCTTCCTTGGACAACACCTCAACGCTCTCAACAGAAG
GCTGTTCTCTCGCAGCCTTAGCAATCGCCTTGTTCTCATCAGGACTCCCTCCTTCTAGAA
ACACTCCTATCAACTTCCCTTCTTTAACCCAGTAGCTCCCAAACTTCGGCTTAGCAGATG
TCGGGTCATTGTCACCAAACAACACTGTCTCCCCAACGTTATCACCGTAGAACTGCCACG
AGAGATTGAAAGCTCTAGAGTAGAAGTACGGAAGATAGTCATATTCGGGAATCGAGTTCC
CTTCCTCCGCAGCCTTGATCGCCTTAACGGCTTGTTCAGCAGACTTGCAAGCATGGTCCA
CGTGTTCGACGCGTCTCATATCGTTGTAGAGTTTCATCGGGAAGGTGGCTATGTCACCAA
CGGCGTATACATCTGGAACGCTTGTTCTGAAGAATGCATCAGTCTTGGGTCCACCCTTCT
CTTCTTCA*CTTGGCCTTTGAAGAGTGATGTA

QA 1 692 1 692
DS 



CO CL136Contig3 769 3 2 U
AGTAGTTTCAAATTTATTTCTCAATCAAATAAATCCCAACAAACGTAATGAGACATGACA
TAAAGCCACTCAAACTCAAGACAGAACACACTAAACAACACACAAACACAAGTCAGAACG
TAGAACCAGTTCTGTTCCTATTTTTTTGTTTTCATATGTTGCTGACGAAGGAAAGACCTT
CCTTGGACAACACCTCAACGCTCTCAACAGAAGGCTGTTCCCTCGCAGCCTTAGCAATCG
CCTTGTTCTCATCAGGACTCCCTCCTTCTAGAAACACTCCTATCAACTTCCCTTCTTTGA
TCCAGTAGCTCCCGAACTTCGGTTTAGCAGATGTCGGGTCATTGTCACCAAACAACACGG
TCTCTCCAACGTTGTCACCGTAGAACTGCCACGAGAGGTTAAAGGCTCTAGAGTAGAAGT
ACGGAAGATAGTCATATTCAGGAATAGAACTTCCTTCCTCTGCAGCTTTGATCGCCTTAA
CGGCTTGTTCAGCAGACTTGCGAGCATGGTCCACGTGTTCAACGCGTCTCATATCGTTGT
AGAGTTTCATCGGGAAGGTGGCTATGTCACCAACGGCGTATACATCTGGAACGCTTGTTC
TGAAGAATGCATCAGTCTTGAATCCACCCTTCTCTTCTTCAACTTGACCTTTGAAGAGTG
ATGTAATAGGTCTAGCACCAACACCTACGATCACTATATCAGCTTCTAATTTTCTTCCGT
CCTTCAATAACACCTCAGTGACCTCTCCATTTGAGTTAGTGGTGAAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL82JQ U 1
AF RR2DL82TF C 1
AF RR2CD13JQ U 9
BS 1 664 RR2DL82JQ
BS 665 769 RR2CD13JQ

RD RR2DL82JQ 665 0 0
AGTAGTTTCAAATTTATTTCTCAATCAAATAAATCCCAACAAACGTAATGAGACATGACA
TAAAGCCACTCAAACTCAAGACAGAACACACTAAACAACACACAAACACAAGTCAGAACG
TAGAACCAGTTCTGTTCCTATTTTTTTGTTTTCATATGTTGCTGACGAAGGAAAGACCTT
CCTTGGACAACACCTCAACGCTCTCAACAGAAGGCTGTTCCCTCGCAGCCTTAGCAATCG
CCTTGTTCTCATCAGGACTCCCTCCTTCTAGAAACACTCCTATCAACTTCCCTTCTTTGA
TCCAGTAGCTCCCGAACTTCGGTTTAGCAGATGTCGGGTCATTGTCACCAAACAACACGG
TCTCTCCAACGTTGTCACCGTAGAACTGCCACGAGAGGTTAAAGGCTCTAGAGTAGAAGT
ACGGAAGATAGTCATATTCAGGAATAGAACTTCCTTCCTCTGCAGCTTTGATCGCCTTAA
CGGCTTGTTCAGCAGACTTGCGAGCATGGTCCACGTGTTCAACGCGTCTCATATCGTTGT
AGAGTTTCATCGGGAAGGTGGCTATGTCACCAACGGCGTATACATCTGGAACGCTTGTTC
TGAAGAATGCATCAGTCTTGAATCCACCCTTCTCTTCTTCAACTTGACCTTTGAAGAGTG
ATGT
C

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2DL82TF 665 0 0
AGTAGTTTCAAATTTATTTCTCAATCAAATAAATCCCAACAAACGTAATGAGACATGACA
TAAAGCCACTCAAACTCAAGACAGAACACACTAAACAACACACAAACACAAGTCAGAACG
TAGAACCAGTTCTGTTCCTATTTTTTTGTTTTCATATGTTGCTGACGAAGGAAAGACCTT
CCTTGGACAACACCTCAACGCTCTCAACAGAAGGCTGTTCCCTCGCAGCCTTAGCAATCG
CCTTGTTCTCATCAGGACTCCCTCCTTCTAGAAACACTCCTATCAACTTCCCTTCTTTGA
TCCAGTAGCTCCCGAACTTCGGTTTAGCAGATGTCGGGTCATTGTCACCAAACAACACGG
TCTCTCCAACGTTGTCACCGTAGAACTGCCACGAGAGGTTAAAGGCTCTAGAGTAGAAGT
ACGGAAGATAGTCATATTCAGGAATAGAACTTCCTTCCTCTGCAGCTTTGATCGCCTTAA
CGGCTTGTTCAGCAGACTTGCGAGCATGGTCCACGTGTTCAACGCGTCTCATATCGTTGT
AGAGTTTCATCGGGAAGGTGGCTATGTCACCAACGGCGTATACATCTGGAACGCTTGTTC
TGAAGAATGCATCAGTCTTGAATCCACCCTTCTCTTCTTCAACTTGACCTTTGAAGAGTG
ATGT
C

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2CD13JQ 761 0 0
CAAATTTATTTCTCAATCAAATAAATCCCAACAAACGTAATGAGACATAACATAAAGCCA
CTCAAACTCAAGACAGAACACACTAAACAACACACAAACACAAGTCAGAACGTAGAACCA
GTTCTGTTCCTATTTTTTTGTTTTCATATGTTGCTGACGAAGGAAAGACCTTCCTTGGAC
AACACCTCAACGCTCTCAACAGAAGGCTGTTCCCTCGCAGCCTTAGCAATCGCCTTGTTC
TCATCAGGACTCCCTCCTTCTAGAAACACTCCTATCAACTTCCCTTCTTTGATCCAGTAG
CTCCCGAACTTCGGTTTAGCAGATGTCGGGTCATTGTCACCAAACAACACGGTCTCTCCA
ACGTTGTCACCGTAGAACTGCCACGAGAGGTTAAAGGCTCTAGAGTAGAAGTACGGAAGA
TAGTCATATTCAGGAATAGAACTTCCTTCCTCTGCAGCTTTGATCGCCTTAACGGCTTGT
TCAGCAGACTTGCGAGCATGGTCCACGTGTTCAACGCGTCTCATATCGTTGTAGAGTTTC
ATCGGGAAGGTGGCTATGTCACCAACGGCGTATACATCTGGAACGCTTGTTCTGAAGAAT
GCATCAGTCTTGAGTCCACCCTTCTCTTCTTCAACTTGACCTTTGAAGAGTGATGTAATA
GGTCTAGCACCAACACCTACGATCACTATATCAGCTTCTAATTTTCTTCCGTCCTTCAAT
AACACCTCAGTGACCTCTCCATTTGAGTTAGTGGTGAAACC

QA 1 761 1 761
DS 



CO CL136Contig4 1358 4 11 U
GGCCTCCTTATGAGCGTCCTGCACTCAGCAAAGGATATATTAATTTCCAGAATAAAGCTT
CACTTCCGGGTTTCTATGTCTGTGCTGGAAGTGGGGGAGAGAGACAGTTCCCGCCGTGGT
ACAAAGAGAATGGGATTGATCTGTTTCTGGAGACAGAGATTGTCAAAGCAGATCTTGCTT
CAAAGACTCTCGTCAGTGGCACCGGACAAGTCTTCAAGTACCAAACCTTGATTGCTGCTA
CCGGTTCTTCTGTCACAAGGTTGTCAGATTTTGGGGTGGAAGGAGCTGATGCTAAGAATA
TATTCTACCTAAGAGAGCTTGTAGACGCTGATTAGCTTCTGACTGCAATGCTCGAAAAGG
AAAATGGCAAAGCTGTGGTTGTTGGTGGCGGTTACATTGGTCTTGAACTCAGTTCTGCTC
TCAAGGTTAACAACATGGAAGTTACCATGGTTTATCCAGAGCCTTGGTGCATGCCTCGGC
TTTTCACCGCTGACATTGCTTCCTTCTACGAGGGTTACTACGCCAACAAAGGGATCAACA
TTGTCAAAGGCATCGTTGCAGCCGGTTTCACCACTAACTCTGCTGGAGAGGTCACTGAGG
TGTTATTGAAGGACGGAAGAAAACTAGAAGCTGATATAGTGATCGTAAGTGTTGGTGCTA
GACCTATTACATCACTCTTCAAAGGCCAAGTTGAAGAAGAGAAGGGTGGACTCAAGACTG
ATGCATTCTTCAGAACGAGCGTTCCAGATGTATACGCCGTTGGTGACATAGCCACCTTCC
CGATGAAACTCTACAACGATATGAGACGTGTTGAACACGTGGACCATGCCCGCAAGTCAG
CTGAACAGGCCGTTAAGGCGATCAAGGCTGCAGAGGAAGGGAACTCGATTCCCGAATATG
ACTACCTTCCGTACTTCTACTCTCGAGCCTTTAATCTCTCGTGGCAGTTCTACGGTGATA
ACGTTGGAGAGACCGTGTTGTTTGGTGACAATGACCCGACATCTGCTAAACCGAAGTTCG
GGAGCTACTGGATCAAAGAAGGGAAGTTGATAGGAGTTTTCTTAGAAGGAGGGAGTCCTG
ATGAGAACAAGGCGATTGCTAAGGCTGCGAGAGAACAGCCTTCTGTTGAGAGCGTTGAGG
TGTTGTCCAAGGAAGGACTTTCCTTCGTCAGCAACATATGAAAGCAAAAAAAGAAAGGAA
CAGAACTGCTTCTACGTTCTGACTTGTGTTTGTGTGTTGTTTAGTGTGTTCTGTCTTGAG
TTTTGAGTGGCTTTATGTCATTTCTCACTATATCTGTTTTACTTATTGGTTTGTTGGGAT
TATTTTGATTGAGAAATAAATTTGGAACTATTTAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 

AF RR2F087TF U 1
AF RR2DI18JQ C 620
AF RR2E866JQ C 676
AF RR2B821TF U 920
BS 1 680 RR2F087TF
BS 681 829 RR2DI18JQ
BS 830 830 RR2E866JQ
BS 831 924 RR2DI18JQ
BS 925 1093 RR2B821TF
BS 1094 1094 RR2DI18JQ
BS 1095 1113 RR2B821TF
BS 1114 1114 RR2DI18JQ
BS 1115 1191 RR2B821TF
BS 1192 1192 RR2DI18JQ
BS 1193 1358 RR2B821TF

RD RR2F087TF 680 0 0
GGCCTCCTTATGAGCGTCCTGCACTCAGCAAAGGATATATTAATTTCCAGAATAAAGCTT
CACTTCCGGGTTTCTATGTCTGTGCTGGAAGTGGGGGAGAGAGACAGTTCCCGCCGTGGT
ACAAAGAGAATGGGATTGATCTGTTTCTGGAGACAGAGATTGTCAAAGCAGATCTTGCTT
CAAAGACTCTCGTCAGTGGCACCGGACAAGTCTTCAAGTACCAAACCTTGATTGCTGCTA
CCGGTTCTTCTGTCACAAGGTTGTCAGATTTTGGGGTGGAAGGAGCTGATGCTAAGAATA
TATTCTACCTAAGAGAGCTTGTAGACGCTGATTAGCTTCTGACTGCAATGCTCGAAAAGG
AAAATGGCAAAGCTGTGGTTGTTGGTGGCGGTTACATTGGTCTTGAACTCAGTTCTGCTC
TCAAGGTTAACAACATGGAAGTTACCATGGTTTATCCAGAGCCTTGGTGCATGCCTCGGC
TTTTCACCGCTGACATTGCTTCCTTCTACGAGGGTTACTACGCCAACAAAGGGATCAACA
TTGTCAAAGGCATCGTTGCAGCCGGTTTCACCACTAACTCTGCTGGAGAGGTCACTGAGG
TGTTATTGAAGGACGGAAGAAAACTAGAAGCTGATATAGTGATCGTAAGTGTTGGTGCTA
GACCTATTACATCACTCTTC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2DI18JQ 739 0 0
AAAACTAGAAGCTGATATAGTGATCGTAGGTGTTGGTGCTAGACCTATTACATCACTCTT
CAAAGGCCAAGTTGAAGAAGAGAAGGGTGGACTCAAGACTGATGCATTCTTCAGAACGAG
CGTTCCAGATGTATACGCCGTTGGTGACATAGCCACCTTCCCGATGAAACTCTACAACGA
TATGAGACGTGTTGAACACGTGGACCATGCTCGCAAGTCAGCTGAACAGGCCGTTAAGGC
GATCAAGGCTGCAGAGGAAGGGAACTCGATTCCCGAATATGACTACCTTCCGTACTTCTA
CTCTCGAGCCTTTAATCTCTCGTGGCAGTTCTACGGTGATAACGTTGGAGAGACCGTGTT
GTTTGGTGACAATGACCCGACATCTGCTAAACCGAAGTTCGGGAGCTACTGGATCAAAGA
AGGGAAGTTGATAGGAGTTTTCTTAGAAGGAGGGAGTCCTGATGAGAACAAGGCGATTGC
TAAGGCTGCGAGAGAACAGCCTTCTGTTTAGAGCGTTGAGGTGTTGTCCAAGGAAGGACT
TTCCTTCGTCAGCAACATATGAAAGCAAAAAAAGAAAGGAACAGAACTGCTTCTACGTTC
TGACTTGTGTTTGTGTGTTGTTTAGTGTGTTCTGTCTTGAGTTTTGAGTGGCTTTATGTC
ATTTCTCACTATATCTGTTTTACTTATTGGTTTGTTGGGATTATTTTGATTGAGAAATAA
ATTTGGAACTATTTAGT
CC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2E866JQ 683 0 0
TCTTCAAAGGCCAAGTTGAAGAAGAGAAGGGTGGACTCAAGACTGATGCATTCTTCAGAA
CGAGCGTTCCAGATGTATACGCCGTTGGTGACATAGCCACCTTCCCGATGAAACTCTACA
ACGATATGAGACGTGTTGAACACGTGGACCATGCCCGCAAGTCAGCTGAACAGGCCGTTA
AGGCGATCAAGGCTGCAGAGGAAGGGAACTCGATTCCCGAATATGACTACCTTCCGTACT
TTTACTCTCGAGCCTTTAATCTTTCGTGGCAGTTTTACGGTGATAACGTTGGAGAGACCG
TGTTGTTTGGTGACAATGACCCGACATCTGCTAAACCGAAGTTCGGGAGCTACTGGATCA
AAGAAGGGAAGTTGATAGGAGTTTTTTTAGAAGGAGGGAGTCCTGATGAGAACAAGGCGA
TTGCTAAGGCTGCGAGAGAACAGCCTTTTGTTGAGAGCGTTGAGGTGTTGTCCAAGGAAG
GACTTTCCTTCGTCAGCAACATATGAAAGCAAAAAAAGAAAGGAACAGAACTGCTTTTAC
GTTTTGACTTGTGTTTGTGTGTTGTTTAGTGTGTTCTGTCTTGAATTTTGAGTGGCTTTA
TGTCATTTCTCACTATATCTGTTTTACTTATTGGTTTGTTGGGATTATTTTGATTGAGAA
ATAAATTTGGAACTATTTAGTTC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2B821TF 439 0 0
GTCTC
GAGCCTTTAATCTCTCGTGGCAGTTCTACGGTGATAACGTTGGAGAGACCGTGTTGTTTG
GTGACAATGACCCGACATCTGCTAAACCGAAGTTCGGGAGCTACTGGATCAAAGAAGGGA
AGTTGATAGGAGTTTTCTTAGAAGGAGGGAGTCCTGATGAGAACAAGGCAATTGCTAAGG
CTGCGAGAGGACAGCCTTCTGTTGAGAGCGTTGAGGTGTTGTCCAAGGAAGGACTTTCCT
TCGTCAGCAACATATGAAAGCAAAAAA*GAAAGGAACAGAACTGCTTCTACGTTCTGACT
TGTGTTTGTGTGTTGTTTAGTGTGTTCTGTCTTGAGTTTTGAGTGGCTTTATGTCATTTC
TCACTATATCTGTTTTACTTATTGGTTTGTTGGGATTATTTTGATTGAGAAATAAATTTG
GAACTATTTAGTTC

QA 6 439 6 439
DS 



AS 2 18

CO CL137Contig1 631 2 2 U
TGTGGGCGTTGACTAAGTCTCTCTCAATCTCTTTATTATTTCAAACTCAAAACATCAAAA
GTTTAACAATGTTTGAAACTAAAAAGTTCAGCAGCAAAGTACGAAAATACATACATATAG
TTCACAATGCTCATCGTTTTAGCTCTCTTGATTCAGCATTTAGGTTTGTTTTTGGACAAA
GCTATCTTACTGCAAGAACTCCCTTGGGTCGGTGACATGACCGGTCAGAGCCGAGGCTGC
AGCGGTGTAAGGCGAAGCCAAGTAAATCTGCCCTTCTTTGTGTCCCATCCGACCAGGAAA
GTTTTGTTTGTTGTCGAGACACACACTTGAGGTTCATTCAAGCGAGCATAGGTATCTGCT
GGGCCACCAAGGCAGGCACCACAACTGGGACTAGTTGGTGTGTCGCAGCCAGCTTCTTCG
AATATCTGTGCACACGTCTTTCCACCTGCTCCAGGCACAGGGAGGGCATACACATCCATC
CACACCTTCTGGGTAGCGGGGACAAGGAAAGTTGGGACTTTGACTTGTGCAAGCGCGACA
TGGCAGACACCTTTGTAGCAAACTGACCAAACGCTCCAGCAGTACATGTGTGGGAGTCTG
TTCCCAACAAAACCTCTCCTGGCCTGCAATC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2AH77TF C 1
AF RR2AH77JQ U 2
BS 1 5 RR2AH77TF
BS 6 631 RR2AH77JQ

RD RR2AH77TF 631 0 0
TGTGGGCGTTGACTAAGTCTCTCTCAATCTCTTTATTATTTCAAACTCAAAACATCAAAA
GTTTAACAATGTTTGAAACTAAGAAGTTCAGCAGCAAAGTACGAAAATACATACATATAG
TTCACAATGCTCATCGTTTTAGCTCTCTTGATTCAGCATTTAGGTTTGTTTTTGGACAAA
GCTATCTTACTGCAAGAACTCCCTTGGGTCGGTGACATGACCGGTCAGAGCCGAGGCTGC
AGCGGTGTAAGGCGAAGCCAAGTAAATCTGCCCTTCTTTGTGTCCCATCCGACCAGGAAA
GTTTTGTTTGTTGTCGAGACACACACTTGAGGTTCATTCAAGCGAGCATAGGTATCTGCT
GGGCCACCAAGGCAGGCACCACAACTGGGACTAGTTGGTGTGTCGCAGCCAGCTTCTTCG
AATATCTGTGCACACGTCTTTCCACCTGCTCCAGGCACAGGGAGGGCATACACATCCATC
CACACCTTCTGGGTAGCGGGGACAAGGAAAGTTGGGACTTTGACTTGTGCAAGCGCGACA
TGGCAGACACCTTTGTAGCAAACTGACCAAACGCTCCAGCAGTACATGTGTGGGAGTCTG
TTCCCAACAAAACCTCTCCTGGCCTGCAAT
C

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2AH77JQ 630 0 0
GTGG
GCGTTGACTAAGTCTCTCTCAATCTCTTTATTATTTCAAACTCAAAACATCAAAAGTTTA
ACAATGTTTGAAACTAAAAAGTTCAGCAGCAAAGTACGAAAATACATACATATAGTTCAC
AATGCTCATCGTTTTAGCTCTCTTGATTCAGCATTTAGGTTTGTTTTTGGACAAAGCTAT
CTTACTGCAAGAACTCCCTTGGGTCGGTGACATGACCGGTCAGAGCCGAGGCTGCAGCGG
TGTAAGGCGAAGCCAAGTAAATCTGCCCTTCTTTGTGTCCCATCCGACCAGGAAAGTTTT
GTTTGTTGTCGAGACACACACTTGAGGTTCATTCAAGCGAGCATAGGTATCTGCTGGGCC
ACCAAGGCAGGCACCACAACTGGGACTAGTTGGTGTGTCGCAGCCAGCTTCTTCGAATAT
CTGTGCACACGTCTTTCCACCTGCTCCAGGCACAGGGAGGGCATACACATCCATCCACAC
CTTCTGGGTAGCGGGGACAAGGAAAGTTGGGACTTTGACTTGTGCAAGCGCGACATGGCA
GACACCTTTGTAGCAAACTGACCAAACGCTCCAGCAGTACATGTGTGGGAGTCTGTTCCC
AACAAAACCTCTCCTGGCCTGCAATC

QA 5 630 5 630
DS 



CO CL137Contig2 1787 16 50 U
GGAAGTTAAAAACACACGCCCCCATCATTTCGTTTCGACACAGAGAAGGCAACGCACACA
CA**CCCAAAGAGAAGAATGGCTTCCTCTGTAATCTCTTCATCTCCTTTCCTTTGCAAAT
CCTCACAGGCGAAGGATTTAGGGTTCCCAAAACCGTCGCAGATATCGGTTCACAGATGTC
AGAAGCGATCGATTTCTCGGAAGATCGTCTCCGTCATGGCGCCCCAGCGATCGTCCAGCT
CCACTGGATCGGTGAAAACAGGGATGACGATGACGGAGAAGATTCTTGCAAAGGCGGCAG
AGAAATCACAAGTGGTCCCTGGTGATAACATCTGGGTTAACGTTGATGTTCTCATGACTC
ATGATGTGTGTGGCCCTGGTGCTTTTGGTATCTTCAAGCGAGAGTTCGGTGAAAAGGCCA
AGGTTTGGGACCCGGAGAAGATTGTTGTCATTCCTGACCATTACATTTTCACTACTGATC
AGCGTGCCAACCGCAACGTCGACATCATGAGGGAGCATTGCAGGGAGCAGAACATCAAGT
ATTTCTATGATATCACCGACCTTGGAGACTTTCGGGCTAATCCTGACTACAAAGGTGTCT
GCCATGTCGCGCTTGCACAAGAAGGTCATTGCAGACCAGGAGAGGTTTTGTTGGGAACAG
ACTCCCACACATGTACTGCTGGAGCCTTTGGTCAGTTTGCTACAGGAATTGGAAACACCG
ATGCAGGATTTGTGCTAGGCACTGGCAAAATCCTCCTTAAGGTTCCACCAACAATGAGGT
TTATCTTGGATGGTGAAATGCCCAGTTATCTGCAAGCAAAGGATCTGATTTTACAAATCA
TTGGTGAAATATCTGTTGCTGGTGCAACTTACAAGACGATGGAGTTCAGTGGCACAACTA
TTGAAAGTCTGACTATGGAAGAAAGAATGACATTGTGCAACATGGTTGTGGAAGCTGGGG
GAAAGAATGGTGTTATCCCTCCTGATGCGACGACATTTAACTACGTTGAGAACAGGACAT
CTGTACCCTTTGAAGCCGTATATAGTGATGGAAATGCAAGCTTTGTTGCAGATTATCGAT
TTGACGTGTCAAAGCTGGAGCCTGTGGTGGCTAAGCCTCATTCTCCTGACAACCGGGCTC
TAGCAAGAGAATGCAAAGATGTGAAAATTGACAGAGTATACATTGGCTCTTGTACTGGTG
GGAAGACTGAGGATTTTATGGCTGCAGCTAAACTTCTCCATGCAGCAGGAAAGCAAGTCA
AAGTCCCAACTTTCCTTGTCCCCGCTACCCAGAAGGTGTGGATGGATGTGTATGCCCTCC
CTGTGCCTGGAGCAGGTGGAAAGACGTGTGCACAGATATTCGAAGAAGCTGGCTGCGACA
CACCAACTAGTCCTAGTTGTGGTGCCTGCCTTGGTGGCCCAGCAGACACCTACGCTCGCT
TGAATGAACCTCAAGTGTGTGTCTCGACAACAAACAGAAACTTTCCTGGTCGGATGGGAC
ACAAAGAAGGGCAGATTTACTTGGCTTCGCCTTACACCGCTGCAGCCTCGGCTCTGACCG
GTCATGTCACCGACCCAAGAGAGTTCTTGCAGTAAGATAGCTTTGTCCAAAAACAAACCT
AAATGCTGAATCAAGCGAGAGCTAAAACGATGAGCATTGTGAACTATATGTATGTATTTT
CGTACTTTGCTGTTGAACTTCTTAGTTTCAAACATTGTTAAACTTTTGATGTTTTGAGTT
TGAAATAATAAAGAGATTGAGAGAGACTTAGTCAACGCTCATAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 
40 40 25 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 0 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 0 0 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT81TF U 35
AF RR2BR69TF U 1
AF RR2D739TF U 38
AF RR2E033TF U 35
AF RR2CP41TF U 29
AF RR2DI08TF U 62
AF RR2A706TF U 329
AF RR2GJ23TF U 608
AF RR2GL48TF U 1239
AF RR2GL48JQ C 1239
AF RR2CP41JQ C 1170
AF RR2A706JQ C 949
AF RR2GJ23JQB C 1113
AF RR2D739JQ C 1115
AF RR2BR69JQ C 1032
AF RR2GT81JQB C 1127
BS 1 87 RR2BR69TF
BS 88 88 RR2CP41TF
BS 89 97 RR2BR69TF
BS 98 99 RR2CP41TF
BS 100 286 RR2BR69TF
BS 287 287 RR2CP41TF
BS 288 298 RR2BR69TF
BS 299 299 RR2D739TF
BS 300 361 RR2BR69TF
BS 362 362 RR2D739TF
BS 363 367 RR2BR69TF
BS 368 368 RR2CP41TF
BS 369 385 RR2BR69TF
BS 386 386 RR2CP41TF
BS 387 401 RR2BR69TF
BS 402 402 RR2GT81TF
BS 403 418 RR2BR69TF
BS 419 419 RR2D739TF
BS 420 442 RR2BR69TF
BS 443 443 RR2CP41TF
BS 444 448 RR2BR69TF
BS 449 449 RR2D739TF
BS 450 508 RR2BR69TF
BS 509 509 RR2GT81TF
BS 510 624 RR2BR69TF
BS 625 625 RR2CP41TF
BS 626 634 RR2BR69TF
BS 635 635 RR2CP41TF
BS 636 685 RR2BR69TF
BS 686 686 RR2D739TF
BS 687 697 RR2BR69TF
BS 698 707 RR2CP41TF
BS 708 708 RR2DI08TF
BS 709 722 RR2CP41TF
BS 723 726 RR2DI08TF
BS 727 905 RR2A706TF
BS 906 906 RR2GJ23TF
BS 907 1111 RR2A706TF
BS 1112 1248 RR2GJ23TF
BS 1249 1249 RR2GL48TF
BS 1250 1292 RR2GJ23TF
BS 1293 1470 RR2GL48TF
BS 1471 1471 RR2A706JQ
BS 1472 1589 RR2GL48TF
BS 1590 1621 RR2A706JQ
BS 1622 1622 RR2BR69JQ
BS 1623 1637 RR2A706JQ
BS 1638 1638 RR2GJ23JQB
BS 1639 1773 RR2A706JQ
BS 1774 1787 RR2BR69JQ

RD RR2GT81TF 556 0 0
GG
GACACAGAGAAGGCAACGCACACACA**CCCAAAGAGAAGAATGGCTTCCTTTGTAATCT
CGCCATCTCCTTTCCTTTGCAAATCCTCACAGGCGAAGGATTTAGGGTTCCCAAAACCGT
CGCAGATATTGGTTCACAGATGTCAGAAGCGATCGATTTCTCGGAAGATCGTCTCCGTCA
TGGCGCCCCAGCGATCGTCCAGCTCCACTGGATCGGTGAAAACAGGGATGACGATGACGG
AGAAGATTCTCGCAAAGGCGGCGGAGAAATCACAAGTGGTCCCTGGTGATAACATCTGGG
TTAACGTTGATGTTCTCATGACTCACGATGTCTGTGGCCCTGGTGCTTTCGGTATCTTCA
AGCGAGAGTTCAGTGAAAAGGCAAAGGTTCGGGACCCGGAGAAGATCGTTGTGATTCCTG
ACCATTACATTTTCACTACTGATCAGCGTGCCAACCGCAACGTCGACATCATGAGGGAGC
ATTGCAGGGAGCAGAACATCAAGTATTTCTATGATATCACCGACCTTGGAGACTTTCGGG
CTAATCCTGACTAC

QA 3 556 3 556
DS 

RD RR2BR69TF 698 0 0
GGAAGTTAAAAACACACGCCCCCATCATTTCGTTTCGACACAGAGAAGGCAACGCACACA
CA**CCCAAAGAGAAGAATGGCTTCCTTTGTAATCTCGCCATCTCCTTTCCTTTGCAAAT
CCTCACAGGCGAAGGATTTAGGGTTCCCAAAACCGTCGCAGATATCGGTTCACAGATGTC
AGAAGCGATCGATTTCTCGGAAGATCGTCTCCGTCATGGCGCCCCAGCGATCGTCCAGCT
CCACTGGATCGGTGAAAACAGGGATGACGATGACGGAGAAGATTCTCGCAAAGGCGGCGG
AGAAATCACAAGTGGTCCCTGGTGATAACATCTGGGTTAACGTTGATGTTCTCATGACTC
ACGATGTCTGTGGCCCTGGTGCTTTCGGTATCTTCAAGCGAAAGTTCGGTGAAAAGGCAA
AGGTTTGGGACCCGGAGAAGATCGTTGTGATTCCTGACCATTACATTTTCACTACTGATC
AGCGTGCCAACCGCAACGTCGACATCATTAGGGAGCATTGCAGGGAGCAGAACATCAAGT
ATTTCTATGATATCACCGACCTTGGAGACTTTCGGGCTAATCCTGACTACAAAGGTGTCT
GCCATGTCGCGCTTGCACAAGAAG*TCATTGCAG*CCAGGAGAGGTTTTGTTGGGAACAG
ACTCCCACACATGTACTGCTGGAGCGTTTGGTCAGTT
G

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2D739TF 683 0 0
GG
ACAGAGAAGGCAACGCACACACA**CCCAAAGAGAAGAATGGCTTCCTCTGTAATCTCTT
CATCTCCTTTCCTTTGCAAATCCTCACAGGCGAAGGATTTAGGGTTCCCAAAACCGTCGC
AGATATCGGTTCACAGATGTCAGAAGCGATCGATTTCTCGGAAGATCGTCTCCGTCATGG
CGCCCCAGCGATCGTCCAGCTCCACTGGATCGGTGAAAACAGGGATGACGATGACGGAGA
AGATTCTTGCAAAGGCGGCAGAGAAATCACAAGTGGTCCCTGGTGATAACATCTGGGTTA
ACGTTGATGTTCTCATGACTCATGACGTGTGTGGCCCTGGTGCTTTTGGTATCTTCAAGC
GAGAGTTCGGTGAAAAGGCCAAGGTTTGGGACCCGGAGAAGATTGTTGTCATTCCTGACC
ATTACATTTTCACTACTGATCAGCGTGCCAACCGCAACGTCGACATCATGAGGGAGCATT
GCAGGGAGCAGAACATCAAGTATTTCTATGATATCACCGACCTTGGAGACTTTCGGGCTA
ATCCTGACTACAAAGGTGTCTGCCATGTCGCGCTTGCACAAGAAGGTCATTGCAGACCAG
GAGAGGTTTTGTTGGGAACAGACTCCCACACATGTACTGCTGGAGCCTTTGGTCAGTTTG
CTACAG
AATTGGAACACCGAT

QA 3 668 3 668
DS 

RD RR2E033TF 668 0 0
GG
GACACAGAGAAGGCAACGCACACACA**CCCAAAGAGAAGAATGGCTTCCTCTGTAATCT
CTTCATCTCCTTTCCTTTGCAAATCCTCACAGGCGAAGGATTTAGGGTTCCCAAAACCGT
CGCAGATATCGGTTCACAGATGTCAGAAGCGATCGATTTCTCGGAAGATCGTCTCCGTCA
TGGCGCCCCAGCGATCGTCCAGCTCCACTGGATCGGTGAAAACAGGGATGACGATGACGG
AGAAGATTCTTGCAAAGGCGGCAGAGAAATCACAAGTGGTCCCTGGTGATAACATCTGGG
TTAACGTTGATGTTCTCATGACTCATGATGTGTGTGGCCCTGGTGCTTTTGGTATCTTCA
AGCGAGAGTTCGGTGAAAAGGCCAAGGTTTGGGACCCGGAGAAGATTGTTGTCATTCCTG
ACCATTACATTTTCACTACTGATCAGCGTGCCAACCGCAACGTCGACATCATGAGGGAGC
ATTGCAGGGAGCAGAACATCAAGTATTTCTATGATATCACCGACCTTGGAGACTTTCGGG
CTAATCCTGACTACAAAGGTGTCTGCCATGTCGCGCTTGCACAAGAAAGTCATTGCAGAC
CAGGAGAGGTTTTGTTGGGAACAGACTCCCACACATGTACTGCTGGAGCCTTTGGTCAGT
TTGCTA

QA 3 668 3 668
DS 

RD RR2CP41TF 694 0 0
GGCGTTTC
GACACACAGAAGGCAACGCACACACACACCCAAGGAGAAGAATGGCTTCCTCTGTAATCT
CTTCATCTCCTTTCCTTTGCAAATCCTCACAGGCGAAGGACTTAGGGTTCCCAAAACCGT
CGCAGATATCGGTTCACAGATGTCAGAAGCGATCGATTTCTCGGAAGATCGTCTCCGTCA
TGGCGCCCCAGCGATCGTCCAGCTCCACTGGATCGGTGAAAACAGGGATGACGATGACGG
AGAAGATTCTTGCAAGGGCGGCGGAGAAATCACAAGTGGTCCCTGGTGATAACATCTGGG
TTAACGTTGATGTTCTCATGACTCACGATGTGTGTGGCCCTGGTGCTTTTGGTATCTTCA
AGCGAGAGTTCGGTGAAAAGGCTAAGGTTTGGGACCCGGAGAAGATTGTTGTGATTCCAG
ACCATTACATTTTCACTACTGATCAGCGTGCCAACCGCAACGTCGACATCATGAGGGAGC
ATTGCAGGGAGCAGAACATCAAGTATTTCTATGATATCACCGACCTTGGAGACTTTCGGG
CTAATCCTGACTACAAAGGTGTCTGCCATGTCGCGCTTGCACAAGAAGGTCATTGCAGAC
CAGGAGAGGTTTTGTTGGGAACAGACTCCCACACATGTACTGCTGGAGCGTTTGGTCAGT
TTGCTACAGGA*TTGGAAACACCGAT

QA 9 694 9 694
DS 

RD RR2DI08TF 673 0 0
G
CACCCAAAGAGAAGAATGGCTTCCTCTGTAATCTCTTCATCTCCTTTCCTTTGCAAATCC
TCACAGGCGAAGGATTTAGGGTTCCCAAAACCGTCGCAGATATCGGTTCACAGATGTCAG
AAGCGATCGATTTCTCGGAAGATCGTCTCCGTCATGGCGCCCCAGCGATCGTCCAGCTCC
ACTGGATCGGTGAAAACAGGGATGACGATGACGGAGAAGATTCTTGCAAAGGCGGCAGAG
AAATCACAGGTGGTCCCTGGTGATAACATCTGGGTTAACGTTGATGTTCTCATGACTCAT
GATGTGTGTGGCCCTGGTGCTTTTGGTATCTTCAAGCGAGAGTTCGGTGAAAAGGCCAAG
GTTTGGGACCCGGAGAAGATTGTTGTCATTCCTGACCATTACATTTTCACTACTGATCAG
CGTGCCAACCGCAACGTCGACATCATGAGGGAGCATTGCAGGGAGCAGAACATCAAGTAT
TTCTATGATATCACCGACCTTGGAGACTTTCGGGCTAATCCTGACTACAAAGGTGTCTGC
CATGTCGCGCTTGCACAAGAAGGTCATTGCAGACCAGGAGAGGTTTTGTTGGGAACAGAC
TCCCACACATGTACTGCTGGAGCCTTTGGTCAGTTTGCTACAGGAATTGGAAACACCGAT
GCAG
ATTTGTGC

QA 2 665 2 665
DS 

RD RR2A706TF 783 0 0
G
ATCTGGGTTAACGTTGATGTTCTCATGACTCATGATGTGTGTGGCCCTGGTGCTTTTGGT
ATCTTCAATCGAGAGTTCGGTGAAAAGGCCAAGGTTTGGGACCCGGAGAAGATTGTTGTC
ATTCCTGACCATTACATTTTCACTACTGATCAGCGTGCCAACCGCAACGTCGACATCATG
AGGGAGCATTGCAGGGAGCAGAACATCAAGTATTTCTATGATATCACCGACCTTGGAGAC
TTTCGGGCTAATCCTGACTACAAAGGTGTCTGCCATGTCGCGCTTGCACAAGAAGGTCAT
TGCAGACCAGGAGAGGTTTTGTTGGGAACAGACTCCCACACATGTACTGCTGGAGCCTTT
GGTCAGTTTGCTACAGGAATTGGAAACACCGATGCAGGATTTGTGCTAGGCACTGGCAAA
ATCCTCCTTAAGGTTCCACCAACAATGAGGTTTATCTTGGATGGTGAAATGCCCAGTTAT
CTGCAAGCAAAGGATCTGATTTTACAAATCATTGGTGAAATATCTGTTGCTGGTGCAACT
TACAAGACGATGGAGTTCAGTGGCACAACTATTGAAGGTCTGACTATGGAAGAAAGAATG
ACATTGTGCAACATGGTTGTGGAAGCTGGGGGAAAGAATGGTGTTATCCCTCCTGATGCG
ACGACATTTAACTACGTTGAGAACAGGACATCTGTACCCTTTGAAGCCGTATATAGTGAT
GGAAATGCAAGCTTTGTTGCAGATTATCGATTTGACGTGTCAAAGCTGGAGCCTGTGGTG
GC

QA 2 783 2 783
DS 

RD RR2GJ23TF 685 0 0
G
GCGCTTGCACAAGAAGGTCATTGCAGACCAGGAGAGGTTTTGTTGGGAACAGACTCCCAC
ACATGTACTGCTGGAGCCTTTGGTCAGTTTGCTACAGGAATTGGAAACACCGATGCAGGA
TTTGTGCTAGGCACTGGCAAAATCCTCCTTAAGGTTCCACCAACAATGAGGTTTATCTTG
GATGGTGAAATGCCCAGTTATCTGCAAGCAAAGGATCTGATTTTACAAATCATTGGTGAA
ATATCTGTTGCTGGTGCAACTTACAAGACGATGGAGTTCAGTGGCACAACTATTGAAAGT
CTGACTATGGAAGAAAGAATGACATTTTGCAACATGGTTGTGGAAGCTGGGGGAAAGAAT
GGTGTTATCCCTCCTGATGCGACGACATTTAACTACGTTGAGAACAGGACATCTGTACCC
TTTGAAGCCGTATATAGTGATGGAAATGCAAGCTTTGTTGCAGATTATCGATTTGACGTG
TCAAAGCTGGAGCCTGTGGTGGCTAAGCCTCATTCTCCTGACAACCGGGCTCTAGCAAGA
GAATGCAAAGATGTGAAAATTGACAGAGTATACATTGGCTCTTGTACTGGTGGGAAGACT
GAGGATTTTATGGCTGCAGCTAAACTTCTCCATGCAGCAG*AAAGCAAGTCAAAGTCCCA
ACTTTCCTTGTCCCCGCTACCCAG

QA 2 685 2 685
DS 

RD RR2GL48TF 351 0 0
G
ATGCAGCAAGAAAGCAAGTCAAAGTCCCAACTTTCCTTGTCCCCGCTACCCAGAAGGTGT
GGATGGATGTGTATGCCCTCCCTGTGCCTGGAGCAGGTGGAAAGACGTGTGCACAGATAT
TCGAAGAAGCTGGCTGCGACACACCAACTAGTCCTAGTTGTGGTGCCTGCCTTGGTGGCC
CAGCAGACACCTACGCTCGCTTGAATGAACCTCAAGTGTGTGTCTCGACAATAAACAGAA
ACTTTCCTGGTCGGATGGGACACAAAGAAGGGCAGATTTACTTGGCTTCGCCTTACACCG
CTGCAGCCTCGGCTCTGACCGGTCATGTCACCGACCCAAGAGAGTTCTTG

QA 2 351 2 351
DS 

RD RR2GL48JQ 375 0 0
G
ATGCAGCAGGAAAGCAAGTCAAAGTCCCAACTTTCCTTGTCCCCGCTACCCAGAAGGTGT
GGATGGATGTGTATGCCCTCCCTGTGCCTGGAGCAGGTGGAAAGACGTGTGCACAGATAT
TCGAAGAAGCTGGCTGCGACACACCAACTAGTCCTAGTTGTGGTGCCTGCCTTGGTGGCC
CAGCAGACACCTACGCTCGCTTGAATGAACCTCAAGTGTGTGTCTCGACAATAAACAGAA
ACTTTCCTGGTGGGATGGGACACAAAGAAGGGCAGATTTACTTGGCTTCGCCTTACACCG
CTGCAGCCTGGGCTCTGACCGGTCATGTCACCGACCCAAGAGAGTTCTTGCAGTAAGATA
GCTTTGTCCAAAAA

QA 2 375 2 375
DS 

RD RR2CP41JQ 479 0 0
GACAGAGTATACATTGGTTCTTGTACTGGTGG*AAGACTGAGGATTT*ATGGCTGCAGCT
AAACTTCTCCATGCAGCAGGAAAGCAAGTCAAAGTCCCAACTT*CCTTGTCCCCGCTACC
CAGAAGGTGTGGATGGATGTGTATGCCCTCCCTGTGCCTGGAGCAGGTGGAAAGACGTGT
GCACAGATATTCGAAGAAGCTGGCTGCGACACACCAACTAGTCCTAGTTGTGGTGCCTGC
CTTGGTGGCCCAGCAGATACCTATGCTCGCTTGAATGAACCTCAAGTGTGTGTCT*GACA
ACAAACAGAAACTTTCCTGGTCGGATGGGACACAAAGAAGGGCAGATTTACTTGGCTTCG
CCTTACACCGCTGCAGCCTCGGCTCTGACCGGTCATGTCACCGACCCAAGAGAGTTCTTG
CAGTAAGATAGCTTTGTCCAAAAACAAACCTAAATGCTGAATCAAG**AGAGCTAAAA
A

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2A706JQ 825 0 0
TGGAAGCTGGGGGAAAGAATGGTGTTATCCCTC*TGATGCGACGACATTTAACTACGTTG
AGAACAGGACATCTGTACCCTTTGAAGCCGTATATAGTGATGGAAATGCAAGCTTTGTTG
CAGATTATCGATTTGACGTGTCAAAGCTGGAGCCTGTGGTGGCTAAGCCTCATTCTCCTG
ACAACCGGGCTCT*GCATGAGAATGCAAAGATGTGAAA*TTGACAGAGTATACATTGGCT
CTTGTACTGGTGGGAAGACTGAGGATTTTATGGCTGCAGCTAAACTTCTCCATGCAGCAG
GAAAGCAAGTCAAAGTCCCAACTTTCCTTGTCCCCGCTACCCAGAAGGTGTGGATGGATG
TGTATGCCCTCCCTGTGCCTGGAGCAGGTGGAAAGACGTGTGCACAGATATTCGAAGAAG
CTGGCTGCGACACACCAACTAGTCCTAGTTGTGGTGCCTGCCTTGGTGACCCAGCAGACA
CCTACGCTCGCTTGAATGAACCTCAAGTGTGTGTCTCGACAACAAACAGAAACTTTCCTG
GTCGGATGGGACACAAAGAAGGGCAGATTTACTTGGCTTCGCCTTACACCGCTGCAGCCT
CGGCTCTGACCGGTCATGTCACCGACCCAAGAGAGTTCTTGCAGTAAGATAGCTTTGTCC
AAAAACAAACCTAGATGCTGAATCAAGCGGGAGCTAAAACGATGAGCATTGTGAACTATA
TGTATGTATTTTCGTACTTTGCTGTTGAACTTCTTAGTTTCAAACATTGTTAAACTTTTG
ATGTTTTGAGTTTGAAATAATAAAGAGATTGAGAGAGACTTAGTC

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR2GJ23JQB 661 0 0
AAGCCTCATTCTCCTGACAACCGGGCTCTAGCAAGAGAATGCAAAGATGTGAAAATTGAC
AGAGTATACATTGGCTCTTGTACTGGTGGGAAGACTGAGGATTTTATGGCTGCAGCTAAA
CTTCTCCATGCAGCAGGAAAGCAAGTCAAAGTCCCAACTTTCCTTGTCCCCGCTACCCAG
AAGGTGTGGATGGATGTGTATGCCCTCCCTGTGCCTGGAGCAGGTGGAAAGACGTGTGCA
CAGATATTCGAAGAAGCTGGCTGCGACACACCAACTAGTCCTAGTTGTGGTGCCTGCCTT
GGTGGCCCAGCAGACACCTACGCTCGCTTGAATGAACCTCAAGTGTGTGTCTCGACAACA
AACAGAAACTTTCCTGGTCGGTTGGGACACAAAGAAGGTCAGATTTACTTGGCTTCGCCT
TACACCGCTGCAGCCTCGGCTCTGACCGGTCATGTCACCGACCCAAGAGAGTTCTTGCAG
TAAGATAGCTTTGTCCAAAAACAAACCTAGATGCTGAATCAAGCGAGAGCTAAAACGATG
AGCATTGTGAACTATATGTATGTATTTTCGTACTTTGCTGTTGAACTTCTTAGTTTCAAA
CATTGTTAAACTTTTGATGTTTTGAGTTTGAAATAATAAAGAGATTGAGAGAGACTTAG
CC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2D739JQ 659 0 0
GCCTCATTCTCCTGACAACCGGGCTCTAGCAAGAGAATGCAAAGATGTGAAAATTGACAG
AGTATACATTGGCTCTTGTACTGGTGGGAAGACTGAGGATTTTATGGCTGCAGCTAAACT
TCTCCATGCAGCAGGAAAGCAAGTCAAAGTCCCAACTTTCCTTGTCCCCGCTACCCAGAA
GGTGTGGATGGATGTGTATGCCCTCCCTGTGCCTGGAGCAGGTGGAAAGACGTGTGCACA
GATATTCGAAGAAGCTGGCTGCGACACACCAACTAGTCCTAGTTGTGGTGCCTGCCTTGG
TGGCCCAGCAGACACCTACGCTCGCCTGAATGAACCTCAAGTGTGTGTCTCGACAACAAA
CAGAAACTTTCCTGGTCGGATGGGACACAAAGAAGGGCAGATTTACTTGGTTTCGCCTTA
CACCGCTGCAGCCTCGGTTCTGACCGGTCATGTCACCGACCCAAGAGAGTTCTTGCAGTA
AGATAGCTTTGTCCAAAAACAAACCTAGATGCTGAATCAAGCGAGAGCTAAAACGATGAG
CATTGTGAACTATATGTATGTATTTTCGTACTTTGCTGTTGAACTTTTTAGTTTCAAACA
TTGTTAAACTTTTGATGTTTTGAGTTTGAAATAATAAAGAGATTGAGAGAGACTTAGTC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2BR69JQ 756 0 0
GAGGCG
GTATATAGTGATGGAAATGCAAGCTTTGTTGCAGATTATCGATTTGACGTGTCAAAGCTG
GAGCCTGTGGTGGCTAAGCCTCATTCTCCTGACAACCGGGCTCTAGCAAGAGAATGCAAA
GATGTGAAAATTGACAGAGTATACATTGGCTCTTGTACTGGTGGGAAGACTGAGGATTTT
ATGGCTGCAGCTAAACTTCTCCATGCAGCAGGAAAGCAAGTCAAAGTCCCAACTTTCCTT
GTCCCCGCTACCCAGAAGGTGTGGATGGATGTGTATGCCCTCCCTGTGCCTGGAGCAGGT
GGAAAGACGTGTGCACAGATATTCGAAGAAGCTGGCTGCGACACACCAACTAGTCCCAGT
TGTGGTGCCTGCCTTGGTGGCCCAGCAGATACCTATGCTCGCTTGAATGAACCTCAAGTG
TGTGTCTCGACAACAAACAGAAACTTTCCTGGTCGGATGGGACACAAAGAAGGGCAGATT
TACTTGGTTTCGCCTTACACCGCTGCAGCCTCGGTTCTGACCGGTCATGTCACCGACCCA
AGGGAGTTCTTGCAGTAAGATAGCTTTGTCCAAAAACAAACCTAAATGCTGAATCGAG**
AGAGCTAAAACGATGAGCATTGTGAACTATATGTATGTATTTTCGTACTTTGCTGTTGAA
CTTTTTAGTTTCAAACATTGTTAAACTTTTGATGTTTTGAGTTTGAAATAATAAAGAGAT
TGAGAGAGACTTAGTCAACGCTCATAATCC

QA 7 756 7 756
DS 

RD RR2GT81JQB 642 0 0
TGACAACCGGGCTCTAGCAAGAGAATGCAAAGATGTGAAAATTGACAGAGTATACATTGG
CTCTTGTACTGGTGGGAAGACTGAGGATTTTATGGCTGCAGCTAAACTTCTCCATGCAGC
AGGAAAGCAAGTCAAAGTCCCAACTTTCCTTGTCCCCGCTACCCAGAAGGTGTGGATGGA
TGTGTATGCCCTCCCTGTGCCTGGAGCAGGTGGAAAGACGTGTGCACAGATATTCGAAGA
AGCTGGCTGCGACACACCAACTAGTCCCAGTTGTGGTGCCTGCCTTGGTGGCCCAGCAGA
TACCTATGCTCGCTTGAATGAACCTCAAGTGTGTGTCTCGACAACAAACAGAAACTTTCC
TGGTCGGATGGGACACAAAGAAGGGCAGATTTACTTGGCTTCGCCTTACACCGCTGCAGC
CTCGGCTCTGACCGGTCATGTCACCGACCCAAGGGAGTTCTTGCAGTAAGATAGCTTTGT
CCAAAAACAAACCTAAATGCTGAATCAAG**AGAGCTAAAACGATGAGCATTGTGAACTA
TATGTATGTATTTTCGTACTTTGCTGTTGAACTTCTTAGTTTCAAACATTGTTAAACTTT
TGATGTTTTGAGTTTGAAATAATAAAGAGATTGAGAGAGACT

QA 1 642 1 642
DS 



AS 4 14

CO CL138Contig1 705 2 3 U
GGACACAACTTCAGCTTTGAGGTAAAGCTTAAACTAAAAAAAAACATAACAGAGATGGGT
TTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATATGCAGA
GAGAAGACAAAATGTTTCCTCGATGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTGAAG
GACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAACAG
AGCATCACCCACAAGTTCGAGAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGCTCACT
GGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGAC
AAAGAGAAGATCACTTTCAAGTCACCAACCACACTGTCTAGGACTTTCCCTGTCTCAGCT
TTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGT
GAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCAGTCAAGGAGACCTAATCAAGCTTCTCCCTG
CTTCTACTGTTAAAAGAGACCAAAATCTATTGAAGTGTACTTCACAATGTAAAGAGACTA
TTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTCTGC
TTGTTTTACTACATGTAATAAGATGTCAAGATCATCCTGTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2BC46JQ C 1
AF RR2BC46TF U 65
BS 1 64 RR2BC46JQ
BS 65 703 RR2BC46TF
BS 704 705 RR2BC46JQ

RD RR2BC46JQ 705 0 0
GGACACAACTTCAGCTTTGAGGTAAAGCTTAAACTAAAAAAAAACATAACAGAGATGGGT
TTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATATGCAGA
GAGAAGACAAAATGTTTCCTCGATGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTGAAG
GACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAACAG
AGCATCACCCACAAGTTCGAGAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGCTCACT
GGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGAC
AAAGAGAAGATCACTTTCAAGTCACCAACCACACTGTCTAGGACTTTCCCTGTCTCAGCT
TTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGT
GAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCAGTCAAGGAGACCTAATCAAGCTTCTCCCTG
CTTCTACTGTTAAAAGAGACCAAAATCTATTGAAGTGTACTTCACAATGTAAAGAGACTA
TTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTCTGC
TTGTTTTACTACATGTAATAAGATGTCAAGATCATCCTGTTAAGC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2BC46TF 641 0 0
TCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATATGCAGAGAGA
AGACAAAATGTTTCCTCGATGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTGAAGGACA
TTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAACAGAGCA
TCACCCACAAGTTCGAGAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGCTCACTGGAG
TCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAG
AGAAGATCACTTTCAAGTCACCAACCACACTGTCTAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTG
TAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAG
CCGCCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCAGTCAAGGAGACCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTC
TACTGTTAAAAGAGACCAAAATCTATTGAAGTGTACTTCACAATGTAAAGAGACTATTGA
GAGTTGGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTCTGCTTGT
TTTACTACATGTAATAAGATGTCAAGATCATCCTGTTAA
GC

QA 1 639 1 639
DS 



CO CL138Contig2 672 2 13 U
TTTAACAGGATGATCTTGACAACTTATTACATGTAGTAAAACAAGCAGAAACGAGTGGTA
GATAATACATGAGAGTAAGAGCAGTGAGAAACACCAACTCTCAATAGTCTCTTTACATTG
TGGAAGTACACTTCAATAGATTTTGGTCTCTTTTAACAGTAGAAGCAGGGAGAAGCTTGA
TTAGGCCTCCTTGACTGCAACAGCCTCCTTGACCTCGGCGGCTTCACTGATCTTCTCCTT
GAGAGCTTCTTCCTTGGCAGGTTCCACTTCCTCTGGGACTACAAAAGCTGAAACAGGGAA
AGTCCTAGACAGTGTGGTTGGTGACTTGAAAGTGATCTTCTCTTTGTCATCTGTATAGAT
ATCACTGATAGAGACCCAGGTCTGGACCACGGCAGTGACCTCGGTTCCGTAGGAGACAAG
CTTATCGATCTTCTCGAACTTGTGGGTGATGCTCTGTTTCTGCTTCAGCCACACAACACC
TGACTCTCTGTCATACCCAACCTCTTCAATGTCCTTCAATGGTAGTAAGCCATTAGGCAT
AGATATTTCATCGAGGAAACATTTTGTCTTCTCTCTGCATATCTCATCTCCGTACATCTC
TGCCTTAGCTCTCACCTCCTCTGTGACCAAACCCATCTCTGTTATGTTTTTTTTTAGTTT
AAGCTTTACCTC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G911JQ U 0
AF RR2DC08TF C 1
BS 1 3 RR2DC08TF
BS 4 14 RR2G911JQ
BS 15 15 RR2DC08TF
BS 16 35 RR2G911JQ
BS 36 38 RR2DC08TF
BS 39 121 RR2G911JQ
BS 122 122 RR2DC08TF
BS 123 125 RR2G911JQ
BS 126 126 RR2DC08TF
BS 127 306 RR2G911JQ
BS 307 307 RR2DC08TF
BS 308 376 RR2G911JQ
BS 377 672 RR2DC08TF

RD RR2G911JQ 377 0 0
GTCG
AACAGGATGATGTTGACAACTTATTACATGTA***AAACAAGCAGAAACGAGTGGTAGAT
AATACATGAGAGTAAGAGCAGTGAGAAACACCAACTCTCAATAGTCTCTTTACATTGTTG
AATTACACTTCAATAGATTTTGGTCTCTTTTAACAGTAGAAGCAGGGAGAAGCTTGATTA
GGCCTCCTTGACTGCAACAGCCTCCTTGACCTCGGCGGCTTCACTGATCTTCTCCTTGAG
AGCTTCTTCCTTGGCAGGTTCCACTTCCTCTGGGACTACAAAAGCTGAAACAGGGAAAGT
CCTGGACAGTGTGGTTGGTGACTTGAAAGTGATCTTCTCTTTGTCATCTGTATAGATATC
ACTGATAGAGACC

QA 5 377 5 377
DS 

RD RR2DC08TF 672 0 0
TTTAACAGGATGATCTTGACATCTTATTACATGTAGTAAAACAAGCAGAAACGAGTGGTA
GGTAATACATGAGAGTAAGAGCAGTGAGAAACACCAACTCTCAATAGTCTCTTTACATTG
TGGAAGTACACTTCAATAGATTTTGGTCTCTTTTAACAGTAGAAGCAGGGAGAAGCTTGA
TTAGGTCTCCTTGACTGCAACAGCCTCCTTGACCTCGGCGGCTTCACTGATCTTCTCCTT
GAGAGGTTCTTCCTTGGCAGGTTCCACTTCCTCTGGGACTACAAAAGCTGAGACAGGGAA
AGTCCTAGACAGTGTGGTTGGTGACTTGAAAGTGATCTTCTCTTTGTCATCTGTATAGAT
ATCACTGATAGAGACCCAGGTCTGGACCACGGCAGTGACCTCGGTTCCGTAGGAGACAAG
CTTATCGATCTTCTCGAACTTGTGGGTGATGCTCTGTTTCTGCTTCAGCCACACAACACC
TGACTCTCTGTCATACCCAACCTCTTCAATGTCCTTCAATGGTAGTAAGCCATTAGGCAT
AGATATTTCATCGAGGAAACATTTTGTCTTCTCTCTGCATATCTCATCTCCGTACATCTC
TGCCTTAGCTCTCACCTCCTCTGTGACCAAACCCATCTCTGTTATGTTTTTTTTTAGTTT
AAGCTTTACCTC

QA 1 672 1 672
DS 



CO CL138Contig3 889 3 19 U
AGCTCGAACTTTATCTTCGTAATAGGTTTCCAGTGTTCTTGAAGTGACCTACAGAACCAA
CTTCAATAATAGTTTATACATAATTATACGGTAATATTTGTAAAAAAGGATGATGTTGAC
ATCTTATTACAAGTAAAAACAAGCAGCAACCAGTGATAGGTAATAGATGAGAGTAAGAGC
AGTGAGAAACACTAACTCTTATTGGTCGGTTTAAATTGTTTAAGTACACTTCAAAAGATT
TCGGTATCTCTTAACGGTAGAAGCAGTGAGAAGCTTGATAAGGCCTCCTTGACGGCAACA
GCCTCCTTGGCAGATTCTTCCTTGGCAGCCTCCTTGGCAGGTTCTCCCTTGGCAGCCTCT
CCCTTGGCAGCCTCCTCGGTGGCTTCACTGCTCTTCTCCTTGGCAGGTTCTTCCTTGGCA
GGTTCCACTTCCTCTGGGACTACAAAAGCTGAAACAGGGAAAGTCCTGGAGAGTGTGGTT
GGTGACATAAAGGTGATCTTCTCTTTCTCCTCTGTATATATCTCACTGATAGTGACCCAG
ATAAGAAGCTCCTTGGAATTGACTCCAGTGAGCTTCTTGATCTTACCGGTTTGGACCACG
GCAGTAACTTCGGTTCCATAGGAGACAAGCTTATCGATCGCTTCGAACTTGTGGGTGATG
CTCTGTTTCTGCTTCAGCCACACAACACCTGACTCTCTGTCATACCCAACCTCTTCTATG
TCCTTCAAAGGTAGTAAGCCATTGGGCATAGAGATTTCCTTGAGGAAGACTTTTATCTTC
TCTTGGCACATCTCATCTCCGGTGTACATCTCTGCCTTAGCTCTCACCTCCTCTGTGACC
AGACCCATCTCTGTTCTAGCTCTGTTGTGGGGGGTTTAGTTGTGTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM27JQ U 64
AF RR2G566JQ U 1
AF RR2CM27TF C 293
BS 1 102 RR2G566JQ
BS 103 103 RR2CM27JQ
BS 104 105 RR2G566JQ
BS 106 106 RR2CM27JQ
BS 107 131 RR2G566JQ
BS 132 132 RR2CM27JQ
BS 133 155 RR2G566JQ
BS 156 156 RR2CM27JQ
BS 157 227 RR2G566JQ
BS 228 228 RR2CM27JQ
BS 229 557 RR2G566JQ
BS 558 558 RR2CM27JQ
BS 559 801 RR2G566JQ
BS 802 802 RR2CM27TF
BS 803 827 RR2G566JQ
BS 828 830 RR2CM27TF
BS 831 839 RR2G566JQ
BS 840 840 RR2CM27TF
BS 841 889 RR2G566JQ

RD RR2CM27JQ 718 0 0
CG
ATAATAGTTTATACATAATTATACGGTAATATTTGTAAAAAAGGATGATGTTGACATCTT
ATTACAAGTAAAAACAAGCAGCAACCAGTGATAGGTAATAGATGAGAGTAAGAGCAGTGA
GAAACACTAACTCTTATTGGTCGGTTTAAATTGTTTAAGTACACTTCAAAAGATTTCGGT
ATCTCTTAACGGTAGAAGCAGTGAGAAGCTTGATTAGGCCTCCTTGACGGCAACAGCCTC
CTTGGCAGATTCTTCCTTGGCAGCCTCCTTGGCAGGTTCTCCCTTGGCAGCCTCTCCCTT
GGCAGCCTCCTCGGTGGCTTCACTGCTCTTCTCCTTGGCAGGTTCTTCCTTGGCAGGTTC
CACTTCCTCTGGGACTACAAAAGCTGAAACAGGGAAAGTCCTGGAGAGTGTGGTTGGTGA
CATAAAGGTGATCTTCTCTTTCTCCTCTGTATATATCTCACTGATAGTGACCCAAATAAG
AAGCTCCTTGGAATTGACTCCAGTGAGCTTCTTGATCTTACCGGTTTGGACCACGGCAGT
AACTTCGGTTCCATAGGAGACAAGCTTATCGATCGCTTCGAACTTGTGGGTGATGCTCTG
TTTCTGCTTCAGCCACACAACACCTGACTCTCTGTCATACCCAACCTCTTCTATGTCCTT
CAAAGGTAGTAAGCCATTGGGCATAGAGATTTCCTTGAGGAAGACTTTTATCTTCT

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR2G566JQ 889 0 0
AGCTCGAACTTTATCTTCGTAATAGGTTTCCAGTGTTCTTGAAGTGACCTACAGAACCAA
CTTCAATAATAGTTTATACATAATTATACGGTAATATTTGTAGAAGAGGATGATGTTGAC
ATCTTATTACAGGTAAAAACAAGCAGCAACCAGTGGTAGGTAATAGATGAGAGTAAGAGC
AGTGAGAAACACTAACTCTTATTGGTCGGTTTAAATTGTTTAAGTACGCTTCAAAAGATT
TCGGTATCTCTTAACGGTAGAAGCAGTGAGAAGCTTGATAAGGCCTCCTTGACGGCAACA
GCCTCCTTGGCAGATTCTTCCTTGGCAGCCTCCTTGGCAGGTTCTCCCTTGGCAGCCTCT
CCCTTGGCAGCCTCCTCGGTGGCTTCACTGCTCTTCTCCTTGGCAGGTTCTTCCTTGGCA
GGTTCCACTTCCTCTGGGACTACAAAAGCTGAAACAGGGAAAGTCCTGGAGAGTGTGGTT
GGTGACATAAAGGTGATCTTCTCTTTCTCCTCTGTATATATCTCACTGATAGTGACCCAG
ATAAGAAGCTCCTTGGACTTGACTCCAGTGAGCTTCTTGATCTTACCGGTTTGGACCACG
GCAGTAACTTCGGTTCCATAGGAGACAAGCTTATCGATCGCTTCGAACTTGTGGGTGATG
CTCTGTTTCTGCTTCAGCCACACAACACCTGACTCTCTGTCATACCCAACCTCTTCTATG
TCCTTCAAAGGTAGTAAGCCATTGGGCATAGAGATTTCCTTGAGGAAGACTTTTATCTTC
TCTTGGCACATCTCATCTCCG*TGTACATCTCTGCCTTAGCTCTCAC**TCTCTGTGAC*
AGACCCATCTCTGTTCTAGCTCTGTTGTGGGGGGTTTAGTTGTGTCCCC

QA 1 889 1 889
DS 

RD RR2CM27TF 560 0 0
CGGCAACAGCCTCCTTGGCAGATTCTTCCTTGGCAGCCTCCTTGGCAGATTCTCCCTTGG
CAGCCTCTCCCTTGGCAGCCTCCTCGGTGGCTTCACTGCTCTTCTCCTTGGCAGGTTCTT
CCTTGGCAGGTTCCACTTCCTCTGGGACTACAAAAGCTGAGACAGGAAAAGTCCTGGAGA
GTGTGGTTGGTGACATAAAGGTGATCTTCTCTTTCTCCTCTGTATATATCTCACTGATAG
TGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGAATTGACTCCAGTGAGCTTCTTGATCTTACCGGTTT
GGACCACGGCAGTAACTTCGGTTCCATAGGAGACAAGCTTATCGATCGCTTCGAACTTGT
GGGTGATGCTCTGTTTCTGCTTCAGCCACACAACACCTGACTCTCTGTCATACCCAACCT
CTTCTATGTCCTTCAAAGGTAGTAAGCCATTGGGCATAGAGATTTCCTTGAGGAAGACTT
TTATCTTCTCTTGGCACATCTCATCTCCGGTGTACATCTCTGCCTTAGCTCTCACCTCCT
CTGTGACCAGACCCATCTCT

QA 1 560 1 560
DS 



CO CL138Contig4 753 7 23 U
GGAATACACAACTTCAGCTTTGAGGTAAAGCTTAAACTAAAAAAAAA*CATAACAGAGAT
GGGTTTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATATG
CAGAGAGAAGACAAAATGTTTCCTCGATGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATT
GAAGGACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAA
ACAGAGCATCACCCACAAGTTCGAGAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGT
CACTGCCGTGGTCCAGACCGGCAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCT
TCTTATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAA
GTCACCAACCACACTGTCTAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGT
GGAACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGA
GGCTGTTGCAGTCAAGGAGACCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGAC
CAAAATCTATTGAAGTGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTC
ACTGCTCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAAT
AAGATGTCAAGATCATCCTGTTAAACAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS25TF U 6
AF RR2G911TF U 1
AF RR2DP51JQ C 440
AF RR2A359TF U 4
AF RR2DP94TF U 19
AF RR2GS25JQB C 321
AF RR2A359JQ C 83
BS 1 50 RR2G911TF
BS 51 51 RR2A359TF
BS 52 147 RR2G911TF
BS 148 148 RR2A359TF
BS 149 168 RR2G911TF
BS 169 169 RR2A359TF
BS 170 222 RR2G911TF
BS 223 223 RR2A359TF
BS 224 240 RR2G911TF
BS 241 241 RR2A359TF
BS 242 264 RR2G911TF
BS 265 265 RR2A359TF
BS 266 270 RR2G911TF
BS 271 271 RR2A359TF
BS 272 297 RR2G911TF
BS 298 298 RR2A359TF
BS 299 438 RR2G911TF
BS 439 439 RR2A359TF
BS 440 499 RR2G911TF
BS 500 500 RR2A359TF
BS 501 550 RR2G911TF
BS 551 715 RR2A359TF
BS 716 753 RR2DP94TF

RD RR2GS25TF 528 0 0
GG
ACAACTTCAGCTTTGAGGTAAAGCTTAAACTAAAAAAAAA*CATAACAGAGATGGGTTTG
GTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATATGCAGAGAG
AAGACAAAATGTTTCCTCGATGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTGAAGGAC
ATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAACAGAGC
ATCACCCACAAGTTCGAGAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGTCACTGCC
GTGGTCCAGACCGGCAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATC
TGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAGTCACCA
ACCACACTGTCTAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCT
GCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGG

QA 3 528 3 528
DS 

RD RR2G911TF 550 0 0
GGAATACACAACTTCAGCTTTGAGGTAAAGCTTAAACTAAAAAAAAA*CAGAACAGAGAT
GGGTTTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATATG
CAGAGAGAAGACAAAATGTTTCCTCGAGGAAATATCTATGCCTAATGGTTTACTACCATT
GAAGGACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGCTGAAGCAGAA
GCAGAGCATCACCCACAAGTTCGAAAAGATTGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAAGT
CACTGCCGTGGTCCAGACCGGCAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCT
TCTTATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAA
GTCACCAACCACACTGTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGT
GGAACCTGCCAAGGAAGAAGCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGA
GGCTGTTGCA

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2DP51JQ 102 0 0
AGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAGAA
CCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAG

QA 1 102 1 102
DS 

RD RR2A359TF 712 0 0
GG
ACACAACTTCAGCTTTGAGGTAAAGCTTAAACTAAAAAAAAA*CATAACAGAGATGGGTT
TGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATATGCAGAG
AGAAGACAAAATGTTTCCTCGATGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTGAAGG
ACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAACAGA
GCATCACCCACAAGTTCGAGAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGTCACTG
CCGTGGTCCAGACCGGCAAGATCAAGAAGCCCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTA
TCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAGTCG*
*AACCACACTGTCTAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAAC
CTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCTG
TTGCAGTCAAGGAGACCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGACCAAAA
TCTATTGAAGTGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGC
TCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACAT

QA 3 712 3 712
DS 

RD RR2DP94TF 735 0 0
TTTGAGGTAAAGCTTAAACTAAAAAAAAAACATAACAGAGATGGGTTTGGTCACAGAGGA
GGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATATGCAGAGAGAAGACAAAATG
TTTCCTCGATGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTGAAGGACATTGAAGAGGT
TGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAACAGAGCATCACCCACAA
GTTCGAGAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGTCACTGCCGTGGTCCAGAC
CGGCAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATCTGGGTCTCTAT
CAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAGTCACCAACCACACTGTC
TAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAGA
ACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCAGTCAAGGA
GACCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGACCAAAATCTATTGAAGTGT
ACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATG
TATTACCTACCACTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAGATGTCAAGATCATCC
TGTTAAACAAAAAAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2GS25JQB 422 0 0
GCAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATCTGGGTCTCTATCA
GTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAGTCACCAACCACACTGTCTA
GGACTTTCCCTGTTTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAGAAC
CTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCAGTCAAGGAGA
CCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGGCCAAAATCTATTGAAGTGTAC
TTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATGTA
TTACCTACCACTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAGATGTCAAGATCATCCTG
TT

QA 1 422 1 422
DS 

RD RR2A359JQ 664 0 0
AGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATATGCAGAGAGAAGACAAAATGTTTC
CTCGATGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTGAAGGACATTGAAGAGGTTGGG
TATGACAGAGAGTCAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAACAGAGCATCACCCACAAGTTC
GAGAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGTCACTGCCGTGGTCCAGACCGGC
AAGATCAAGAAGCCCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATCTGGGTCTCTATCAGT
GATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAGTCG**AACCACACTGTTTAGG
ACTTTCCCTGTTTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAGAACCT
CTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCAGTCAAGGAGACC
TAATCAAGCTTCTCCCTGCTTTTACTGTTAAAAGAGACCAAAATCTATTGAAGTGTACTT
CCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATGTATT
ACCTACCACTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAGATGTCAAGATCATCCTGTT
AA
GC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 2 17

CO CL139Contig1 936 15 30 U
GGACCACAGTCACCAATCTTTCCCTATCTTCATCATCTTCTTCCATTTCACAATTACTTG
AAGGAAGTGCGTGAAG*CTAGTGGCAGACGTCTTTGATAGAGAGAACAAAAAAAAA***C
ATGGCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTACATTTTTCACTTTCTCTAGTCAGACCACACTGCAC
TCTCTTCATCACAGAAACACCATTCTCACCAAAACCCAGTTTCCAGTTCCCACAAAATCA
TCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGACTCTCTCCCTCCACCTCTCTCTCTCCCCTCTAC
TCTCCCTGTTCTTTCAAAAGCTCGATCTTTGCTAAGGTTAACAAGGGGCAGAGTGCACCA
GACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAAAGCCGGTGAGCCTGAAGAAGTATAAAGGGAAG
CCTGTTGTTCTATATTTTTACCCTGCAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGT
GCTTTCAGAGACTCTTATGAGAAATTCAAGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGT
GGTGATGATTCTGCTTCTCACAAGGCTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCTTACACATTG
TTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGAGGAAAGATTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGG
GCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATGTTCTTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATCTAC
AACAACCAGTTCCAGCCTGAGAAACACATTGATGAGACCTTGAAATTCCTCAAAGCTGCT
TGATCCTTGTCTTCTTCCTCTTCTGGATCTTTACAAAACAACAATTCATGACCTTCCTTT
ATTGTTATCATTGCTGTTTTCCCCAATGACTCCAATTCAAAACACCAAACTTGATAATAA
AACAAAATATAAGAGTTTAATTTCACAAAATTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 0 10 30 30 30 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 0 50 5 50 5 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 
70 70 70 0 70 70 70 0 70 75 75 75 75 75 60 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 20 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 30 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 70 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 0 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 50 80 80 80 20 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 55 80 80 80 80 80 0 80 
80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 45 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 25 55 40 55 55 55 55 55 0 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 50 50 35 35 35 50 50 50 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY88TF U 88
AF RR2DD39TF U 87
AF RR2DA41TF U 1
AF RR2EZ28TF U 6
AF RR2EP47TF U 84
AF RR2B135TF U 54
AF RR2D760TF U 58
AF RR2EB20TF U 88
AF RR2H356TF U 88
AF RR2EB20JQ C 155
AF RR2EP47JQ C 259
AF RR2BY88JQ C 168
AF RR2EZ28JQ C 311
AF RR2B135JQ C 184
AF RR2DD39JQ C 194
BS 1 75 RR2DA41TF
BS 76 76 RR2EZ28TF
BS 77 110 RR2DA41TF
BS 111 111 RR2EZ28TF
BS 112 112 RR2B135TF
BS 113 113 RR2DA41TF
BS 114 114 RR2B135TF
BS 115 115 RR2DA41TF
BS 116 116 RR2B135TF
BS 117 168 RR2DA41TF
BS 169 169 RR2EZ28TF
BS 170 187 RR2DA41TF
BS 188 188 RR2B135TF
BS 189 191 RR2DA41TF
BS 192 192 RR2EZ28TF
BS 193 341 RR2DA41TF
BS 342 343 RR2EZ28TF
BS 344 620 RR2DA41TF
BS 621 621 RR2EZ28TF
BS 622 694 RR2DA41TF
BS 695 747 RR2B135TF
BS 748 748 RR2D760TF
BS 749 775 RR2B135TF
BS 776 794 RR2EB20TF
BS 795 797 RR2H356TF
BS 798 798 RR2EB20JQ
BS 799 808 RR2H356TF
BS 809 897 RR2EB20JQ
BS 898 922 RR2BY88JQ
BS 923 936 RR2B135JQ

RD RR2BY88TF 291 0 0
G
GGTCTTTGATAGAGAGAACAAAAAAAAA***CATGGCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTACAT
TTTTCACTTTCTCTAGTCAGACCACACTGCACTCTCTTCATCACAGAAACAACATTCTCA
CCAAAACCCAGTTTCCAGTTCCCACAAAATCATCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGAC
TCTCTCCCTCCACCTC**TCTCTCCCCTCTACTCTCCCTGTTCTTTCAAAAGCTCGATCT
TTGCTAAGGTTAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGACTTCACACTAAAGGAT

QA 2 291 2 291
DS 

RD RR2DD39TF 523 0 0
GT
GGTCTTTGATAGAGAGAACAAAC*AGA****CATGGCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTACAT
TTTTCACTTTCTCTAGTCAGGCCACACTGCACTCTCTTCCTCAGAGAAACACCATTCTCA
CCAAAACCCAGTTTCCAGTTCCCACAAAATCATCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGAC
TCTCTCCCTCCACCTCTCTCTCTCCCCTCTACTCTCCCTGTTCTTTCAAAAGCTCGATCT
TTGCTAAGGTTAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAA
AGCCGGTGAGCCTGAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTCTATATTTTTACCCTGCAG
ATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCTTTCAGAGACTCTTATGAGAAATTCA
AGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCTCACAAGGCTT
TTGCAAGCAAATACAAGCTTCCTTACACATTGTTGAGTGAC

QA 3 523 3 523
DS 

RD RR2DA41TF 694 0 0
GGACCACAGTCACCAATCTTTCCCTATCTTCATCATCTTCTTCCATTTCACAATTACTTG
AAGGAAGTGCGTGAAC*CTAGTGGCAGACGTCTTTGATAGAGAGAACAAAC*AGA****C
ATGGCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTACATTTTTCACTTTCTCTAGTCAGGCCACACTGCAC
TCTCTTCCTCAGAGAAACACCATTCTCACCAAAACCCAGTTTCCAGTTCCCACAAAATCA
TCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGACTCTCTCCCTCCACCTCTCTCTCTCCCCTCTAC
TCTCCCTGTTCTTTCAAAAGCTCGATCTTTGCTAAGGTTAA**AGGGGCAGAGTGCACCA
GACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAAAGCCGGTGAGCCTGAAGAAGTATAAAGGGAAG
CCTGTTGTTCTATATTTTTACCCTGCAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGT
GCTTTCAGAGACTCTTATGAGAAATTCAAGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGT
GGTGATGATTCTGCTTCTCACAAGGCTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCTTACACATTG
TTGAGTGACGAAGGGAATAAAGTGAGGAAAGATTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGG
GCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATGTTCTTGACA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2EZ28TF 688 0 0
GGAGA
CACCAATCTTTCCCTATCTTCATCATCTTCTTCCATTTCACAATTACTTGAAGGAAGTGC
GTGAAG*CTAGTGCCAGACGTCTTTGATAGAGAGAACAAAAGAGA****CATGGCTTCTT
CTTCTTCTTGCTCTACATTTTTCACTTTCTCTAGTCAGACCACACTGCACTCTCTTCCTC
ACAGAAACTCCATTCTCACCAAAACCCAGTTTCCAGTTCCCACAAAATCATCAGAATCTA
ACTTCTTTGGTCTCAGACTCTCTCCCTCCACCTCTCTCTCTCCCCTCTATTCTCCCTGTT
CTTTCAGAAGCTCAATCTTTGCTAAGGTTAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGACTTCACAC
TAAAGGATCAAAACGGAAAGCCGGTGAGCCTGAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTC
TATATTTTTACCCTGCAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCTTTCAGAG
ACTCTTATGAGAAATTCAAGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATT
CTGCTTCTCACAAGGCTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCTTACACATTGTTGAGTGACG
AAGGGAATAAGGTAAGGGAAGATTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAG
GGAGGCAGACTTATGTTCTTGAC

QA 6 688 6 688
DS 

RD RR2EP47TF 584 0 0
GG
AGACGTCTTTGATAGAGAGAACAAAAAAAAAA**CATGGCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTA
CATTTTTCACTTTCTCTAGTCAGACCACACTGCACTCTCTTCATCACAGAAACAACATTC
TCACCAAAACCCAGTTTCCAGTTCCCACAAAATCATCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCA
GACTCTCTCCCTCCACCTCCCTCTCTCCCCTCTACTCTCCCTGTTCTTTCAAAAGCTCGA
TCTTTGCTAAGGTTAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGACTTCACACTAAAGGATCAAAACG
GAAAGCCAGTGAGCCTGAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTCGTTTTATATTTCTACCCTG
CAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCGTTCAGAGACTCTTATGAGAAAT
TCAAGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCTCACAAGG
CTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCTTACACATTGTTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGA
GGAAAGATTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGC

QA 3 584 3 584
DS 

RD RR2B135TF 722 0 0
GGACTT
GAAGGAATTGCGTGAAGGCTAGTGGCAGACGTCTTTGATAGAGAGAACAAAAAAAAAAAA
CATGGCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTACATTTTTCACTTTCTCTAGTCAGACCACACTGCA
CTCTCTTCATCACAGAAACAACATTCTCACCAAAACCCAGTTTCCAGTTCCCACAAAATC
ATCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGACTCTCTCCCTCCACCTCTCTCTCTCCCCTCTA
CTCTCCCTGTTCTTTCAAAAGCTCGATCTTTGCTAAGGTTAACAAGGGGCAGAGTGCACC
AGACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAAAGCCAGTGAGCCTGAAGAAGTATAAAGGGAA
GCCTGTTGTTTTATATTTCTACCCTGCAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGACTTG
TGCGTTCAGAGACTCTTATGAGAAATTCAAGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAG
TGGTGATGATTCTGCTTCTCACAAGGCTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCTTACACATT
GTTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGAGGAAAGATTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGG
GGCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATGTTCTTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATCTA
CAACAACCAGTTCCAGCCTGAGAAACACGTTGATGAGACCTTGAAATTCCTCAAAG

QA 7 722 7 722
DS 

RD RR2D760TF 703 0 0
GG
GAAGGAAGTGCGTGAAG*CTAGTGTGAGACGTCTTTGATAGAGAGAACAAAAAAAAAA**
CATGGCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTACATTTTTCACTTTCTCTAGTCAGACCACACTGCA
CTCTCTTCCTCAGAGAAACACCATTCTCACCAAAACCCAGTTTCCAGTTCCCACAAAATC
ATCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGACTCTCTCCCTCCACCTCTCTCTCTCCCCTCTA
CTCTCCCTGTTCTTTCAAAAGCTCTATCTTTGCTAAGGTTAACAAGGGGCAGACTGCACC
AGACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAAAGCCCGTGAGCCTGAAGAAGTATAAAGGGAA
GCCTGTTGTTCTATATTTCTACCCTGCAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCGTG
TGCATTCAGAGACTCTTATGAGAAATTCAAGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAG
TGGTGATGATTCTGCTTCTCACAAGGCTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCTTACACATT
GTTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGAGGAAAGATTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGG
GGCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATGTTCTTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATCTA
CAACAACCAGTTCCAGCCTGAGAA*CACATTGATGAGACCT

QA 3 703 3 703
DS 

RD RR2EB20TF 707 0 0
G
GGTCTTTGATAGAGAGAACAAAC*AGA****CATGGCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTACAT
TTTTCACTTTCTCTAGTCAGGCCACACTGCACTCTCTTCCTCAGAGAAACACCATTCTCA
CCAAAACCCAGTTTCCAGTTCCCACAAAATCATCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGAC
TCTCTCCCTCCACCTCTCTCTCTCCCCTCTACTCTCCCTGTTCTTTCAAAAGCTCGATCT
TTGCTAAGGTTAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAA
AGCCGGTGAGCCTGAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTCTATATTTTTACCCTGCAG
ATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCTTTCAGAGACTCTTATGAGAAATTCA
AGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCTCACAAGGCTT
TTGCAAGCAAATACAAGCTTCCTTACACATTGTTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGAGGA
AAGATTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATGTTC
TTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATCTACAACAACCAGTTCCAGCCTGAGAAACACA
TTGATGAGACCTTGAAATTCCTCACAGCTGCTTGATCCTTGTCTTC

QA 2 707 2 707
DS 

RD RR2H356TF 737 0 0
G
GGTCTTTGATAGAGAGAACAAAAAAAAA***CATGGCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTACAT
TTTTCACTTTCTCTAGTCAGACCACACTGCACTCTCTTCCTCAGAGAAACACCATTCTCA
CCAAAACCCAGTTTCCAGTTCCCACAAAATCATCAGAACCTAACTTCTTTGGTCTCAGAC
TCTCTCCCTCCACCTCTCTCTCTCCCCTCTACTCTCCCTGTTCTTTCAAAAGCTCTATCT
TTGCTGAGGTTAACAAGGGGCAGACTGCACCAGACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAA
AGCCTGTGAGCCTGAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTCTATATTTCTACCCTGCAG
ATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCGTGTGCATTCGGAGACTCTTATGAGAAATTCA
AGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCTCACAAGGCTT
TTGCAAGCAAATACAAGCTTCCTTACACATTGTTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGAGGA
AAGATTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATGTTC
TTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATCTACAACAACCAGTTCCAGCCTGAGAAACACA
TTGATGAGACCTTGAAGT*CCTCA*AGCTGCTTGATCCTTGTCTTCTTC*TCTTCTGGAT
TTTACACACAATCATG

QA 2 721 2 721
DS 

RD RR2EB20JQ 743 0 0
CTTTCTCTAGTCAGGCCACACTGCACTCTCTTC*TCAGAGAAACACCATTCTCACCAAAA
CCCAGTTTCCAGTTCCCACAAAATCATCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGACTCTCTC
CCTCCACCTCTCTCTCTCCCCTCTACTCTCCCTGTTCTTTCAAAAGCTCGATCTTTGCTA
AGGTTAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAAAGCCGG
TGAGCCTGAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTCTATATTTTTACCCTGCAGATGAAA
CCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCTTTCAGAGACTCTTATGAGAAATTCAAGAAGG
CCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCTCACAAGGCTTTTGCAA
GCAAATACAAGCTTCCTTACACATTGTTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGAGGAAAGATT
GGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATGTTCTTGACA
AAAACGGTGTCGTTCAGCTCATTTACAACAACCAGTTCCAGCCTGAGAAACACATTGATG
AGACCTTGAAATTCCTCACAGCTGCTTGATCCTTGTCTTCTTCCTCTTCTGGATCTTTAC
AAAACAACAATTCATGACCTTCCTTTATTGTTATCATTGCTGTTTTCCCCAATGACTCCA
ATTCAAAACACCAAACTTGATAA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2EP47JQ 637 0 0
GGTCTCAGACTCTCTCCCTCCACCTCCCTCTCTCCCCTCTACTCTCCCTGTTCTTTCAAA
AGCTCGATCTTTGCTAAGGTTAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGACTTCACACTAAAGGAT
CAAAACGGAAAGCCAGTGAGCCTGAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTCGTTTTATATTTT
TACCCTGCAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCGTTCAGAGACTCTTAT
GAGAAATTCAAGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCT
CACAAGGCTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCTTACACATTGTTGAGTGACGAAGGGAAT
AAGGTGAGGAAAGATTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGGGAGGCAG
ACTTATGTTCTTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATCTACAACAACCAGTTCCAGCCT
GAGAAACACATTGATGAGACCTTGAAATTCCTCAAAGCTGCTTGATCCTTGTTTTCTTCC
TCTTCTGGATCTTTACAAAACAACAATTCATGACCTTCCTTTATTGTTATCATTGCTGTT
TTCCCCAATGACTCCAATTCAAAACACCAAACTTGAT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2BY88JQ 757 0 0
GACCACACTGCACTCTCTTCATCACAGAAACAACATTCTCACCAAAACCCAGTTTCCAGT
TCCCACAAAATCATCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGACTCTCTCCCTCCACCTC**T
CTCTCCCCTCTACTCTCCCTGTTCTTTCAAAAGCTCGATCTTTGCTAAGGTTAACAAGGG
GCAGAGTGCACCAGACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAAAGCCAGTGAGCCTGAAGAA
GTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTTTATATTTCTACCCTGCAGATGAAACCCCTGGCTGCAC
CAAGCAGGCTTGTGCGTTCAGAGACTCTTATGAGAAATTCAAGAAGGCCGGCGCAGAGGT
CATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCTCACAAGGCTTTTGCAAGCAAATACAAGCT
TCCTTACACATTGTTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGAGGAAAGATTGGGGAGTGCCTGG
AGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGCGAGGCAGACTTATGTTCTTGACAAAAACGGTGTCGT
TCAGCTCATCTACAACAACCAGTTCCAGCCTGAGAAACACATTGATGAGACCTTGAAATT
CCTCAAAGCTGCTTGATCCTTGTCTTCTTCCTCTTCTGGATCTTTACAAAACAACAATTC
ATGACCTTCCTTTATTGTTATCATTGCTGTTTTCCCCAATGACTCCAATTCAAAACACCA
AACTTGATAATAAAACAAAATATAAGAGTTTAATT
GC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2EZ28JQ 614 0 0
CTTTCAGAAGCTCAATCTTTGCTAAGGTTAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGACTTCACAC
TAAAGGATCAAAACGGAAAGCCGGTGAGCCTGAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTC
TATATTTTTACCCTGCAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCTTTCAGAG
ACTCTTATGAGAAATTCAAGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATT
CTGCTTCTCACAAGGCTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCTTACACATTGTTGAGTGACG
AAGGGAATAAGGTAAGGGAAGATTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAG
GGAGGCAGACTTATGTTCTTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATTTACAACAACCAGT
TCCAGCCTGAGAAACACATTGATGAGACCTTGAAGTTCCTCAAAGCTGCTTGATC*TTCT
CTTCTTCCTCTTCTGCATCTTTACAAAACAGCAATTCATGACCTTCCTTTATTGTTCTCA
TTGCTGTTTTCCC*AATGACTCCAATTCAAAACACCAAACTTGATAATAAAACAACATAT
AAGAGTTTAATT
GC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2B135JQ 753 0 0
CTTCATCACAGAAACAACATTCTCACCAAAACCCAGTTTCCAGTTCCCACAAAATCATCA
GAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGACTCTCTCCCTCCACCTCTCTCTCTCCCCTCTACTCT
CCCTGTTCTTTCAAAAGCTCGATCTTTGCTAAGGTTAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGAC
TTCACACTAAAGGATCAAAACGGAAAGCCAGTGAGCCTGAAGAAGTATAAAGGGAAGCCT
GTTGTTTTATATTTCTACCCTGCAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGACTTGTGCG
TTCAGAGACTCTTATGAGAAATTCAAGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGT
GATGATTCTGCTTCTCACAAGGCTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCTTACACATTGTTG
AGTGACGAAGGGAATAAGGTGAGGAAAGATTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCA
TTGCCAGGGAGGCAGACTTATGTTCTTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATCTACAAC
AACCAGTTCCAGCCTGAGAAACACGTTGATGAGACCTTGAAATTCCTCAAAGCTGCTTGA
TCCTTGTCTTCTTCCTCTTCTGGATCTTTACAAAACAACAATTCATGACCTTCCTTTATT
GTTATCATTGCTGTTTTCCCCAATGACTCCAATTCAAAACACCAAACTTGATAATAAAAC
AAAATATAAGAGTTTAATTTCACAAAATTTTCC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2DD39JQ 733 0 0
GAAACACCATTCTCACCAAAACCCAGTTTCCAGTTCCCACAAAATCATCAGAATCTAACT
TCTTTGGTCTCAGACTCTCTCCCTCCACCTCTCTCTCTCCCCTCTACTCTCCCTGTTCTT
TCAAAAGCTCGATCTTTGCTAAGGTTAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGACTTCACACTAA
AGGATCAAAACGGAAAGCCGGTGAGCCTGAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTCTAT
ATTTTTACCCTGCAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCTTTCAGAGACT
CTTATGAGAAATTCAAGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTG
CTTCTCACAAGGCTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCTTACACATTGTTGAGTGACGAAG
GGAATAAGGTGAGGAAAGATTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGGGA
GGCAGACTTATGTTCTTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATCTACAACAACCAGTTCC
AGCCTGAGAAACACATTGATGAGACCTTGAAATTCCTCACAGCTGCTTGATCCTTGCCTT
CTTCCTCTTCTGGATCTTTACAAAACAACAATTCATGACCTTCCTTTATTGTTATCATTG
CTGTTTTCCCCAATGACTCCAATTCAAAACACCAAACTTGATAATAAAACAAAATATAAG
AGTTTAATT
TCAC

QA 1 729 1 729
DS 



CO CL139Contig2 833 2 6 U
CTGAACGGGATGAAGCGGGTTGCTGCCCTTTATATTTTTAGCTAAAATATGAAAAACAAT
CACAATAAAAATTAGAAAAATTTAGAAGACTAAGAGTAATTTAGAAAAAAATTGTGAAAT
CGAACTCTCATATTTTGTTTTATTATCAAGTTTGGTGTTTTTGAAGGGGAGTCATTGGGG
AAAACAGCAATGATGATAACAATAAAGGAAGGTCATGAATTGTTGTTGTAAAAATCCAGA
AGAGGAAGAAGACAAGGATCAAGCAGCTTTGAGGAACTTCAAGGTCTCATCAATGTGTTT
CTCAGGCTGGAACTGGTTGTTGTAAATGAGCTGAACGACACCGTTTTTGTCAAGAACATA
AGTCTGCCTCCCTGGCAATGCCCCAAACAGATCTCCAGGCACTCCCCAATCTTTCCTCAC
CTTATTCCCTTCGTCACTCAACAATGTGTAAGGAAGCTTGTATTTGCTTGCAAAAGCCTT
GTGAGAAGCAGAATCATCACCACTTATGCCAATGACCTCTGCGCCGGCCTTCTTGAATTT
CTCATAAGAGTCTCCGAATGCACACGCCTACTTGGTGCAGCCAGGGGTTTCATCTGCAGG
GTAGAAATATAGAACAACAGGCTTCCCTTTATACTTCTTCAGGCTCACAGGCTTTCCGTT
TTGATCCTTTAGTGTGAAGTCTGGTGCAGTCTGCCCCTTGGTAACCTCAGCAAAGATAGA
GCTTTTGAAAGAACAGGGAGAGTAGAGGGGAGAGAGAGGTGGAGGGAGAGAGTCTGAGAC
CAAAGAAGTTAGATTCTGATGATTTTGTGGGAACTGGAAACTGAGTTTTGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H356JQ U 1
AF RR2CV01JQ U 103
BS 1 569 RR2H356JQ
BS 570 570 RR2CV01JQ
BS 571 700 RR2H356JQ
BS 701 701 RR2CV01JQ
BS 702 728 RR2H356JQ
BS 729 833 RR2CV01JQ

RD RR2H356JQ 728 0 0
CTGAACGGGATGAAGCGGGTTGCTGCCCTTTATATTTTTAGCTAAAATATGAAAAACAAT
CACAATAAAAATTAGAAAAATTTAGAAGACTAAGAGTAATTTAGAAAAAAATTGTGAAAT
CGAACTCTCATATTTTGTTTTATTATCAAGTTTGGTGTTTTTGAAGGGGAGTCATTGGGG
AAAACAGCAATGATGATAACAATAAAGGAAGGTCATGAATTGTTGTTGTAAAAATCCAGA
AGAGGAAGAAGACAAGGATCAAGCAGCTTTGAGGAACTTCAAGGTCTCATCAATGTGTTT
CTCAGGCTGGAACTGGTTGTTGTAAATGAGCTGAACGACACCGTTTTTGTCAAGAACATA
AGTCTGCCTCCCTGGCAATGCCCCAAACAGATCTCCAGGCACTCCCCAATCTTTCCTCAC
CTTATTCCCTTCGTCACTCAACAATGTGTAAGGAAGCTTGTATTTGCTTGCAAAAGCCTT
GTGAGAAGCAGAATCATCACCACTTATGCCAATGACCTCTGCGCCGGCCTTCTTGAATTT
CTCATAAGAGTCTCCGAATGCACACGCCTGCTTGGTGCAGCCAGGGGTTTCATCTGCAGG
GTAGAAATATAGAACAACAGGCTTCCCTTTATACTTCTTCAGGCTCACAGGCTTTCCGTT
TTGATCCTTTAGTGTGAAGTCTGGTGCAGTCTGCCCCTTGTTAACCTCAGCAAAGATAGA
GCTTTTGA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2CV01JQ 731 0 0
AGAAAAAAA
TTGTGAAATCGAACTCTCATATTTTGTTTTATTATCAAGTTTGGTGTTTTTGAAGGGGAG
TCATTGGGGAAAACAGCAATGATGATAACAATAAAGGAAGGTCATGAATTGTTGTTGTAA
AAATCCAGAAGAGGAAGAAGACAAGGATCAAGCAGCTTTGAGGAACTTCAAGGTCTCATC
AATGTGTTTCTCAGGCTGGAACTGGTTGTTGTAGATGAGCTGAACGACACCGTTTTTGTC
AAGAACATAAGTCTGCCTCCCTGGCAATGCCCCAAACAGATCTCCAGGCACTCCCCAATC
TTTCCTCACCTTATTCCCTTCGTCACTCAACAATGTGTAAGGAAGCTTGTATTT*CTTGC
AAAAGCCTTGTGAGAAGCAGAATCATCACCACTTATGCCAATGACCTCTGCGCCGGCCTT
CTTGAATTTCTCATAAGAGTCTCTGAATGCACACGCCTACTTGGTGCAGCCAGGGGTTTC
ATCTGCAGGGTAGAAATATAGAACAACAGGCTTCCCTTTATACTTCTTCAGGCTCACAGG
CTTTCCGTTTTGATCCTTTAGTGTGAAGTCTGGTGCAGTCTGCCCCTTGGTAACCTTAGC
AAAGATAGAGCTTTTGAAAGAACAGGGAGAGTAGAGGGGAGAGAGAGGTGGAGGGAGAGA
GTCTGAGACCAAAGAAGTTAGATTCTGATGATTTTGTGGGAACTGGAAACTGAGTTTTGG
TG

QA 10 731 10 731
DS 



AS 2 18

CO CL140Contig1 705 14 8 U
GGTTAACCGCAAAACTTGCATTTTCCAAACAAATCTCAAGACCTGTCTACTAACAAGTTC
TGTATTCAATATTCAAAAACAACGAATAAGACAAAAGAGGAACAGAAAGTGGACACAAGA
AAAATGAAATGGGTTTTTTTTTGGGGAATGGGAAGCATATGGTTGAGAGATCCGACTTTG
CTGAATTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACC
GTAATCCTTGACTACAAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATC
AATCTTGCAAAGACCAGCCCACTCTCCTAGGGTTTTGGCGCTTGGAACAGTAAGCAAGTT
GATACTGTGATCAGCGCAAAGAGCCTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAATC
TTCGGCCAAGACACAGAGCTGAGCAGAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTTTCATGGAG
ACCACGAACCACACCACCGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTTAACTCCAATGCAGTCAA
CAGATCCATGTCCTCTGGAATAGCAGCTGCCTCAGCAACCGGAGGAACAACAGTAGGAGC
AGCAGCAGCTTCATCACCAGACATGTTGAATTGCCTTGGAAACTAAGAAAAGCAAAAGCT
CTTTTTAAATCTTAGAGAGAGAGAGGCGCTACAAGGACGAGGTCC


BQ
10 10 10 10 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 60 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 

AF RR2BC90JQ U 98
AF RR2D110JQ U 1
AF RR2DN12JQ U 5
AF RR2GU03JQB U 5
AF RR2CV71JQ U 5
AF RR2G705JQ U 18
AF RR2BC90TF C 5
AF RR2DN12TF C 470
AF RR2GU03TF C 140
AF RR2CV71TF C 25
AF RR2D110TF C 47
AF RR2G705TF C 18
AF RR2H892JQ U 18
AF RR2H892TF C 47
BS 1 82 RR2D110JQ
BS 83 83 RR2DN12JQ
BS 84 442 RR2D110JQ
BS 443 443 RR2DN12JQ
BS 444 580 RR2D110JQ
BS 581 606 RR2G705JQ
BS 607 671 RR2H892JQ
BS 672 705 RR2BC90TF

RD RR2BC90JQ 331 0 0
AGGAACAAAAAGTGGACACAAAAAAAATGAAATGGGTTTTTTTTTGGGGAATGGGAAGCA
TATGGTTGAAAGATCCGACTTTGCTGAATTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATG
TTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAATCCTTGACTACAAGGGACGAGCATCCAACAACC
TTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCAATCTTGCAAAGACCAGCCCACTCTCCTAGGGTTTTG
GTGCTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATACTGTGATCAGCGCAAAGAGCCTTGACCAGCTTG
ACGTAATCAGGCTGGTTGCAATCTTCGGCCA

QA 1 331 1 331
DS 

RD RR2D110JQ 580 0 0
GGTTAACCGCAAAACTTGCATTTTCCAAACAAATCTCAAGACCTGTCTACTAACAAGTTC
TGTATTCAATATTCAAAAACAAAGAATAAGACAAAAGAGGAACAGAAAGTGGACACAAGA
AAAATGAAATGGGTTTTTTTTTGGGGAATGGGAAGCATATGGTTGAGAGATCCGACTTTG
CTGAATTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACC
GTAATCCTTGACTACAAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATC
AATCTTGCAAAGACCAGCCCACTCTCCTAGGGTTTTGGCGCTTGGAACAGTAAGCAAGTT
GATACTGTGATCAGCGCAAAGAGCCTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAATC
TTCGGCCAAGACACAGAGCTGAACAGAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTTTCATGGAG
ACCACGAACCACACCACCGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTTAACTCCAATGCAGTCAA
CAGATCCATGTCCTCTGGAATAGCAGCTGCCTCAGCAACC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2DN12JQ 549 0 0
AACCGCAAAACTTGCATTTTCCAAACAAATCTCAAGACTTGTCTACTAACAAGTTCTGTA
TTCAATATTCAAAAACAACGAATAAGGCAAAAGAGGAACAGAAAGTGGACACAAGAAAAA
TGAAATGGGTTTTTTTTTGGGGAATGGGAAGCATATGGTTGAGAGATCCGACTTTGCTGA
ATTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAATTGTCTCCTCACCGTAA
TCCTTGACTACAAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCAATC
TTGCAAAGACCAGCCCACTCTCCTAGGGTTTTGGCGCTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATA
CTGTGATCAGCGCAAAGAGCCTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAATCTTCG
GCCAAGACACAGAGCTGAGCAGAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTTTCATGGAGACCA
CGAACCACACCACCGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTTAACTCCAATGCAGTCAACAGA
TCCATGTCC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2GU03JQB 555 0 0
C
ACCGCAAAACTTGCATTTTCCAAACAAATCTCAAGACCTGTCTACTAACAAGTTCTGTAT
TCAATATTCAAAAACAACGAATAAGACAAAAGAGGAACAGAAAGTGGACACAAGAAAAAT
GAAATGGGTTTTTTTTTGGGGAATGGGAAGCATATGGTTGAGAGATCCGACTTTGCTGAA
TTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAAT
CCTTGACTACAAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCAATCT
TGCAAAGACCAGCCCACTCTCCTAGGGTTTTGGCGCTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATAC
TGTGATCAGCGCAAAGAGCCTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAATCTTCGG
CCAAGACACAGAGCTGAGCAAAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTTTCATGGAGACCAC
GAACCACACCACCGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTTAACTCCAATGCAGTCAACAGAT
CCATGTCCTCTGGA

QA 2 555 2 555
DS 

RD RR2CV71JQ 576 0 0
G
ACCGCAAAACTTGCATTTTCCAAACAAATCTCAAGACCTGTCTACTAACAAGTTCTGTAT
TCAATATTCAAAAACAACGAATAAGACAAAAGAGGAACAGAAAGTGGACACAAGAAAAAT
GAAATGGGTTTTTTTT*GGGGAATGGGAAGCATATGGTTGAGAGATCCGACTTTGCTGAA
TTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAAT
CCTTGACTACGAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCAATCT
TGCAAAGACCAGCCCACTCTCCTAGGGTTTTGGCGCTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATAC
TGTGATCAGCGCAAAGAGCCTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAATCTTCGG
CCAAGACACAGAGCTGAACAGAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTTTCATGGAGACCAC
GAACCACACCACCGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTTAACTCCAATGCAGTCAACAGAT
CCATGTCCTCTGGAATAGCAGCTGCCTCAGCAACC

QA 2 576 2 576
DS 

RD RR2G705JQ 589 0 0
GCATTTTCCAAACAAATCTCAAGACCTGTCTACTAACAAGTTCTGTATTCAATATTCAAA
A*CAACGAATAAGACAAAAGAGGAACAGAAAGTGGACACAAGAAAAATGAAATGGGTTTT
TTTTTGGGGAATGGGAAGCATATGGTTGAGAGATCCGACTTTGCTGAATTTAGTTAGATT
CAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGCCTCCTCACCGTAATCCTTGACTACAA
GGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCAATCTTGCAAAGACCAG
CCCACTCTCCTAGGGTTTTGGCGCTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATACTGTGATCAGCGC
AAAGAGCCTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAATCTTCGGCCAAGACACAGA
GCTGAGCAGAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTTTCATGGAGACCACGAACCACACCAC
CGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTTAACTCCAATGCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTG
GAATAGCAGCTGCCTCAGCAACCGGAGGAACAACAGTAGGAGCAGCAGC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2BC90TF 701 0 0
AACCGCAAAACTTGCATTTTCCAAACAAATCTCAAGACCTGTCTACTAACAAGTTCTGTA
TTCAATATTCAAAAACAACGAATAAGACAAAAGAGGAACAGAAAGTGGACACAAGAAAAA
TGAAATGGGTTTTTTTTTGGGGAATGGGAAGCATATGGTTGAGAGATCCGACTTTGCTGA
ATTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAA
TCCTTGACTACAAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCAATC
TTGCAAAGACCAGCCCACTCTCCTAGGGTTTTGGTGCTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATA
CTGTGATCAGCGCAAAGAGCCTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAATCTTCG
GCCAAGACACAGAGCTGAGCAGAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTTTCATGGAGACCA
CGAACCACACCACCGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTTAACTCCAATGCAGTCAACAGA
TCCATGTCCTCTGGAATAGCAGCTGCCTCAGCAACCGGAGGAACAACAGTAGGAGCAGCA
GCAGCTTCATCACCAGACATGTTGAATTGCCTTGGAAACTAAGAAAAGCAAAAGCTCTTT
TTAAATCTTAGAGAGAGAGAGGCGCTACAAGGACGAGGTCC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2DN12TF 243 0 0
CTTTCACGGAGACCACGAACCACACCACCGTGAGCACGAGCTTTCTTTAGCGTTAACTCC
AATGCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTGGAATAGCAGCTGCCTCAGCAACCGGAGGAACA
ACAGTAGGAGCAGCAGCAGCTTCATCACCAGACATGTTGAATTGCCTTGGAAACTAAGAA
AAGCAAAAGCTCTTTTTAAATCTTAGAGAGAGAGAGGCGCTACAAGGACGAGGT
GAAGGGCCC

QA 1 234 1 234
DS 

RD RR2GU03TF 566 0 0
TTTGGGGAATGGGAAGCATATGGTTGAGAGATCCGACTTTGCTGAATTTAGTTAGATTCA
ATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAATCCTTGACTACAAGG
CACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCAATCTTGCAAAGACCAGCC
CACTCTCCTAGGGTTTTGGCGCTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATACTGTGATCAGCGCAA
AGAGCCTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAATCTTCGGCCAAGACACAGAGC
TGAGCAGAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTTTCATGGAGACCACGAACCACACCACCG
TGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTTAACTCCAATGCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTGGA
ATAGCAGCTGCCTCAGCAACCGGAGGAACAACAGTAGGAGCAGCAGCAGCTTCATCACCA
GACATGTTGAATTGCCTTGGAAACTAAGAAAAGCAAAAGCTCTTTTTAAATCTTAGAGAG
AGAGAGGCGCTACAAGGACGAGGTCC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2CV71TF 657 0 0
CCAAACAAATCTCAAGAC*TGTCTACTAACAAGTTCTGTATTCAATATTCAAAAACAACG
AATAAGACAAAAGAGGAACAGAAAGTGGACACAAGAAAAATGAAATGGGTTTTTTT**GG
GGAATGGGAAGCATATGGTTGAGAGATCCGACTTTGCTGAATTTAGTTAGATTCAATATG
CTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAATCCTTGACTACGAGGCACGA
GCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCAATCTTGCAAAGACCAGCCCACTC
TCCTAGGGTTTTGGCGCTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATACTGTGATCAGCGCAAAGAGC
CTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAATCTTCGGCCAAGACACAGAGCTGAGC
AGAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTTTCATGGAGACCACGAACCACACCACCGTGAGC
ACGAGCTTTCCTTAGCGTTAACTCCAATGCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTGGAATAGC
AGCTGCCTCAGCAACCGGAGGAACAACAGTAGGAGCAGCAGCAGCTTCATCACCAGACAT
GTTGAATTGCCTTGGAAACTAAGAAAAGCAAGAGCTCTTTTTAA*TCTTAGAGAGAG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2D110TF 658 0 0
CTACTAACAAGTTCTGTATTCAATATTCAAAAACAAAGAATAAGACAAAAGAGGAACAGA
AAGTGGACACAAGAAAAATGAAATGGGTTTTTTTTTGGGGAATGGGAAGCATATGGTTGA
GAGATCCGACTTTGCTGAATTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCA
GTTGTCTCCTCACCGTAATCCTTGACTACAAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCA
TTGCCCTCTGAATCAATCTTGCAAAGACCAGCCCACTCTCCTAGGGTTTTGGCGCTTGGA
ACAGTAAGCAAGTTGATACTGTGATCAGCGCAAAGAGCCTTGACCAGCTTGACGTAATCA
GGCTGGTTGCAATCTTCGGCCAAGACACAGAGCTGAGCAGAACGCTTCTCAATAAGCTTA
GCGCTTTCATGGAGACCACGAACCACACCACCGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTTAAC
TCCAATGCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTGGAATAGCAGCTGCCTCAGCAACCGGAGGA
ACAACAGTAGGAGCAGCAGCAGCTTCATCACCAGACATGTTGAATTGCCTTGGAAACTAA
GAAAAGCAAAAGCTCTTTTTAAATCTTAGAGAGAGAGAGGCGCTACAAGGACGAGGTC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2G705TF 688 0 0
GCATTTTCCAAACAAATCTCAAGAC*TGTCTACTAACAAGTTCTGTATTCAATATTCAAA
A*CAACGAATAAGACAAAAGAGGAACAGAAAGTGGACACAAGAAAAATGAAATGGGTTTT
TTTTTGGGGAATGGGAAGCATATGGTTGAGAGATCCGACTTTGCTGAATTTAGTTAGATT
CAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGCCTCCTCACCGTAATCCTTGACTACAA
GGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCAATCTTGCAAAGACCAG
CCCACTCTCCTAGGGTTTTGGCGCTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATACTGTGATCAGCGC
AAAGAGCCTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAATCTTCGGCCAAGACACAGA
GCTGAGCAGAACGCTTCTCAATAAGCTTAGCGCTTTCATGGAGACCACGAACCACACCAC
CGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTTAACTCCAATGCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTG
GAATAGCAGCTGCCTCAGCAACCGGAGGAACAACAGTAGGAGCAGCAGCAGCTTCATCAC
CAGACATGTTGAATTGCCTTGGAAACTAAGAAAAGCAAAAGCTCTTTTTAAATCTTAGAG
AGAGAGAGGCGCTACAAGGACGAGGTCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2H892JQ 654 0 0
GCATTTTCCAAACAAATCTCAAGACCTGTCTACTAACAAGTTCTGTATTCAATATTCAAA
A*CAACGAATAAGACAAAAGAGGAACAGAAAGTGGACACAAGAAAAATGAAATGGGTTTT
TTTTTGGGGAATGGGAAGCATATGGTTGAGAGATCCGACTTTGCTGAATTTAGTTAGATT
CAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGCCTCCTCACCGTAATCCTTGACTACAA
GGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCAATCTTGCAAAGACCAG
CCCACTCTCCTAGGGTTTTGGCGCTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATACTGTGATCAGCGC
AAAGAGCCTTGACCAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAATCTTCGGCCAAGACACAGA
GCTGAGCAGAACGCTTCTCAATAAGCTTAACGCTTTCATGGAGACCACGAACCACACCAC
CGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTTAACTCCAATGCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTG
GAATAGCAGCTGCCTCAGCAACCGGAGGAACAACAGTAGGAGCAGCAGCAGCTTCATCAC
CAGACATGTTGAATTGCCTTGGAAACTAAGAAAAGCAAAAGCTCTTTTTAAATC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2H892TF 659 0 0
CTACTAACAAGTTCTGTATTCAATATTCAAAA*CAACGAATAAGACAAAAGAGGAACAGA
AAGTGGACACAAGAAAAATGAAATGGGTTTTTTTTTGGGGAATGGGAAGCATATGGTTGA
GAGATCCGACTTTGCTGAATTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCA
GTTGCCTCCTCACCGTAATCCTTGACTACAAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCA
TTGCCCTCTGAATCAATCTTGCAAAGACCAGCCCACTCTCCTAGGGTTTTGGCGCTTGGA
ACAGTAAGCAAGTTGATACTGTGATCAGCGCAAAGAGCCTTGACCAGCTTGACGTAATCA
GGCTGGTTGCAATCTTCGGCCAAGACACAGAGCTGAGCAGAACGCTTCTCAATAAGCTTA
GCGCTTTCATGGAGACCACGAACCACACCACCGTGAGCACGAGCTTTCCTTAGCGTTAAC
TCCAATGCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTGGAATAGCAGCTGCCTCAGCAACCGGAGGA
ACAACAGTAGGAGCAGCAGCAGCTTCATCACCAGACATGTTGAATTGCCTTGGAAACTAA
GAAAAGCAAAAGCTCTTTTTAAATCTTAGAGAGAGAGAGGCGCTACAAGGACGAGGTCC

QA 1 659 1 659
DS 



CO CL140Contig2 718 4 18 U
GGACCTCGTCCTTGTAGCGCCTCTCTCTCTCTCTCT**GTAAGATTTAAAAAAAAGAGCT
TTTACTTTTTTCTTAGTTTCCAAGGCAATTCAACATGTCTGGTGATGAAGCTGCTGCTGC
TCCTACTGTTGTTCCTCCGGTTGCTGAGGCAGCTGTCATTCCAGAGGACATGGATCTGTT
GACTGCATTGGAGTTGACGCTAAGGAAAGCTCGTGCTCACGGTGGCGTGGTTCGTGGTCT
CCATGAAAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGATCTGCCCAGCTCTGTGTCTTGGCCGAAGA
TTGCAACCAGCCTGATTACGTCAAGCTGGTGAAAGCTCTTTGCGCTGATCACAGCATCAA
CTTGCTTACTGTTCCAAGTGCCAAAACCCTCGGGGAGTGGGCTGGGCTTTGCAAGATTGA
TTCAGAGGGCAATGCAAGGAAGGTTGTTGGGTGCTCGTGCCTTGTAGTCAAGGATTACGG
TGAGGAGACAACTGCACTCAACATCGTCAAGAAGCATATTGAATCTAACTAAATTCAGCA
AAGTCGGATCTCTCAACCATATGCTTCCCATTCCCCCAAAAAAAAACCCATTTCATTTTT
CTTGTGTCCACTTTCTGTTCCTCTTTTGTCTTCTTCGTTGTTTTTGATATTGAATACAGA
ACTTGTTAGTAGACAGGTCTTGAGATTTGTTTGGAAAATGCAAGTTTTGCGGTTAACC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D509TF U 1
AF RR2GK14TF U 1
AF RR2GK14JQ C 1
AF RR2D509JQ C 122
BS 1 36 RR2D509TF
BS 37 38 RR2GK14TF
BS 39 207 RR2D509TF
BS 208 208 RR2GK14TF
BS 209 373 RR2D509TF
BS 374 374 RR2GK14TF
BS 375 577 RR2D509TF
BS 578 578 RR2GK14TF
BS 579 585 RR2D509TF
BS 586 586 RR2GK14TF
BS 587 608 RR2D509TF
BS 609 609 RR2GK14TF
BS 610 676 RR2D509TF
BS 677 677 RR2GK14TF
BS 678 687 RR2D509TF
BS 688 688 RR2GK14TF
BS 689 712 RR2D509TF
BS 713 718 RR2D509JQ

RD RR2D509TF 724 0 0
GGACCTCGTCCTTGTAGCGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTAAGATTTAAAAAAAAGAGCT
TTTACTTTTTTCTTAGTTTCCAAGGCAATTCAACATGTCTGGTGATGAAGCTGCTGCTGC
TCCTACTGTTGTTCCTCCGGTTGCTGAGGCAGCTGTCATTCCAGAGGACATGGATCTGTT
GACTGCATTGGAGTTGACGCTAAGGAAGGCTCGTGCTCACGGTGGCGTGGTTCGTGGTCT
CCATGAAAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGATCTGCCCAGCTCTGTGTCTTGGCCGAAGA
TTGCAACCAGCCTGATTACGTCAAGCTGGTGAAAGCTCTTTGCGCTGATCACAGCATCAA
CTTGCTTACTGTTTCAAGTGCCAAAACCCTCGGGGAGTGGGCTGGGCTTTGCAAGATTGA
TTCAGAGGGCAATGCAAGGAAGGTTGTTGGGTGCTCGTGCCTTGTAGTCAAGGATTACGG
TGAGGAGACAACTGCACTCAACATCGTCAAGAAGCATATTGAATCTAACTAAATTCAGCA
AAGTCGGATCTCTCAACCATATGCTTCCCATTCCCCCGAAAAAAA*CCCATTTCATTTTT
CTTGTGTCTACTTTCTGTTCCTCTTTTGTCTTCTTCGTTGTTTTTGATATTGAATACAGA
ACTTGTTAGTAGACAG*TCTTGAGATT*GTTTGGAAAATGCAAGTTTTGCGG
TAACCAAAAAAA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2GK14TF 723 0 0
GGACCTCGTCCTTGTAGCGCCTCTCTCTCTCTCTCT**GTAAGATTTAAAAAAAAGAGCT
TTTACTTTTTTCTTAGTTTCCAAGGCAATTCAACATGTCTGGTGATGAAGCTGCTGCTGC
TCCTACTGTTGTTCCTCCGGTTGCTGAGGCAGCTGTCATTCCAGAGGACATGGATCTGTT
GACTGCATTGGAGTTGACGCTAAGGAAAGCTCGTGCTCACGGTGGCGTGGTTCGTGGTCT
CCATGAAAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGATCTGCCCAGCTCTGTGTCTTGGCCGAAGA
TTGCAACCAGCCTGATTACGTCAAGCTGGTGAAAGCTCTTTGCGCTGATCACAGCATCAA
CTTGCTTACTGTTCCAAGTGCCAAAACCCTCGGGGAGTGGGCTGGGCTTTGCAAGATTGA
TTCAGAGGGCAATGCAAGGAAGGTTGTTGGGTGCTCGTGCCTTGTAGTCAAGGATTACGG
TGAGGAGACAACTGCACTCAACATCGTCAAGAAGCATATTGAATCTAACTAAATTCAGCA
AAGTCGGATCTCTCAACCATATGCTTCCCATTCCCCCAAAAAAAAACCCATTTCATTTTT
CTTGTGTCCACTTTCTGTTCCTCTTTTGTCTTCTTCGTTGTTTTTGATATTGAATACAGA
ACTTGTTAGTAGACAGGTCTTGAGATTTGTTTGGAAAATGCAAGTTTTGCGG
CCAAAAAAAAA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2GK14JQ 714 0 0
GGACCTCGTCCTTGTAGCGCCTCTCTCTCTCTCTCT**GTAAGATTTAAAAAAAAGAGCT
TTTACTTTTTTCTTAGTTTCCAAGGCAATTCAACATGTCTGGTGATGAAGCTGCTGCTGC
TCCTACTGTTGTTCCTCCGGTTGCTGAGGCAGCTGTCATTCCAGAGGACATGGATCTGTT
GACTGCATTGGAGTTGACGCTAAGGAAAGCTCGTGCTCACGGTGGCGTGGTTCGTGGTCT
CCATGAAAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGATCTGCCCAGCTCTGTGTCTTGGCCGAAGA
TTGCAACCAGCCTGATTACGTCAAGCTGGTGAAAGCTCTTTGCGCTGATCACAGCATCAA
CTTGCTTACTGTTCCAAGTGCCAAAACCCTCGGGGAGTGGGCTGGGCTTTGCAAGATTGA
TTCAGAGGGCAATGCAAGGAAGGTTGTTGGGTGCTCGTGCCTTGTAGTCAAGGATTACGG
TGAGGAGACAACTGCACTCAACATCGTCAAGAAGCATATTGAATCTAACTAAATTCAGCA
AAGTCGGATCTCTCAACCATATGCTTCCCATTCCCCCAAAAAAAAACCCATTTCATTTTT
CTTGTGTCCACTTTCTGTTCCTCTTTTGTCTTCTTCGTTGTTTTTGATATTGAATACAGA
ACTTGTTAGTAGACAGGTCTTGAGATTTGTTTGGAAAATGCAAGTTTTGCGG
CC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2D509JQ 597 0 0
CCTACTGTTGTTCCTCCGGTTGCTGAGGCAGCTGTCATTCCAGAGGACATGGATCTGTTG
ACTGCATTGGAGTTGACGCTAAGGAAGGCTCGTGCTCACGGTGGCGTGGTTCGTGGTCTC
CATGAAAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGATCTGCCCAGCTCTGTGTCTTGGCCGAAGAT
TGCAACCAGCCTGATTACGTCAAGCTGGTGAAAGCTCTTTGCGCTGATCACAGCATCAAC
TTGCTTACTGTTTCAAGTGCCAAAACCCTCGGGGAGTGGGCTGGGCTTTGCAAGATTGAT
TCAGAGGGCAATGCAAGGAAGGTTGTTGGGTGCTCGTGCCTTGTAGTCAAGGATTACGGT
GAGGAGACAACTGCACTCAACATCGTCAAGAAGCATATTGAATCTAACTAAATTCAGCAA
AGTCGGATCTCTCAACCATATGCTTCCCATTCCCCCGAAAAAAAACCCATTTCATTTTTC
TTGTGTCTACTTTCTGTTCCTCTTTTGTCTTCTTCGTTGTTTTTGATATTGAATACAGAA
CTTGTTAGTAGACAGGTCTTGAGATTTGTTTGGAAAATGCAAGTTTTGCGGTTAACC

QA 1 597 1 597
DS 



AS 3 17

CO CL141Contig1 700 4 12 U
GGAAAAGAGAAGCGAATGGTTTGAGAGGTAGATAAGTAGAAGAAGGAGATAGAGACGAAG
AGAGAGAGGGGGAGATCAAAAAAATCATGATCCTTGCGGTGTTGTTCGCTAATTCCGTAG
GGAACGTCTTGATCGAAAGGTTCGATGGAGTGCCAGCTGAGGAACGTCTCACCTGGCGAT
CTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTTAAAGGTGTTAAGAACGAGGAGCTTCTCG
TTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCATCTTCC
TTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATTTTTATCATAACAG
GGGCTGTGAAAGACATATGCGGCAAGCCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACAAATACG
GAAGGATTTGTTTGTGCCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTTGAGAACACTGACA
AAGACAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGATTCCCTCCAT
GTCCAACTCCAAACCACACCCTTTTGCAATATGTTTTTTTTCAACACTTATCAACAGAAT
GTCAGTTGCTGAATCACTTCTCTCTATCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGATGTTCTTC
GTTCAGACATTGAAGCAATTTAGTGTGGCGATGTTTATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2C333JQ C 1
AF RR2AJ63TF U 32
AF RR2EU80TF U 10
AF RR2C333TF U 1
BS 1 11 RR2C333TF
BS 12 33 RR2EU80TF
BS 34 68 RR2AJ63TF
BS 69 69 RR2C333TF
BS 70 143 RR2AJ63TF
BS 144 144 RR2C333TF
BS 145 189 RR2AJ63TF
BS 190 190 RR2EU80TF
BS 191 385 RR2AJ63TF
BS 386 386 RR2C333TF
BS 387 698 RR2AJ63TF
BS 699 700 RR2C333JQ

RD RR2C333JQ 700 0 0
GGAAAAGAGAAGCGAATGGTTTGAGAGGTAGATAAGTAGAAGAAGGAGATAGAGACGAAG
AGAGAGAGGGGGAGATCAAAAAAATCATGATCCTTGCGGTGTTGTTCGCTAATTCCGTAG
GGAACGTCTTGATCGAAAGGTTCGATGGAGTGCCAGCTGAGGAACGTCTCACCTGGCGAT
CTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTTAAAGGTGTTAAGAACGAGGAGCTTCTCG
TTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCATCTTCC
TTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATTTTTATCATAACAG
GGGCTGTGAAAGACATATGCGGCAAGCCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACAAATACG
GAAGGATTTGTTTGTGCCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTTGAGAACACTGACA
AAGACAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTTTGAGTTTTGATTCCCTCCAT
GTCCAACTCCAAACCACACCCTTTTGCAATATGTTTTTTTTCAACACTTATCAACAGAAT
GTCAGTTGCTGAATCACTTCTCTCTATCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGATGTTCTTC
GTTCAGACATTGAAGCAATTTAGTGTGGCGATGTTTATTG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2AJ63TF 667 0 0
GG
AAGTAGAAGAAGGAGATAGAGACGAAGAGAGAGAGAGGGAGATCAAAAAAATCATGATCC
TTGCGGTGTTGTTCGCTAATTCCGTAGGGAACGTCTTGATCGAAAGGTTCAATGGAGTGC
CAGCTGAGGAACGTCTCACCTGGCGATCTTTCTTGGCTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTTA
AAGGTGTTAAGAACGAGGAGCTTCTCGTTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACA
CAATGCTAGGGGATGTTAGCATCTTCCTTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTT
TGGCAGAAGCCATTTTTATCATAACAGGGGCTGTGAAAGACATATGCGGCAAACCTCCTA
CAGAGCGAGTGTTTCTGGACAAATACGGAAGGATTTGTTTGTGCCTTGATGAAATCGTTT
GGAACGGACTTCTTGAGAACACTGACAAAGACAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAAC
CTCCTTCTGAGTTTTGATTCCCTCCATGTCCAACTCCAAACCACACCCTTTTGCAATATG
TTTTTTTTCAACACTTATCAACAGAATGTCAGTTGCTGAATCACTTCTCTCTATCAAGTA
TTGTACTGTTAACTACTGATGTTCTTCGTTCAGACATTGAAGCAATTTAGTGTGGCGATG
TTTAT

QA 3 667 3 667
DS 

RD RR2EU80TF 681 0 0
GG
GCGAATGGTTTGAGAGGTAGATAAGTAGAAGAAGGAGATAGAGACGAAGAGAGAGAGAGG
GAGATCAAAAAAATCATGATCCTTGCGGTGTTGTTCGCTAATTCCGTAGGGAACGTCTTG
ATCGAAAGGTTCAATGGAGTGCCAGCTGAGGAACGTCTCACCTGGCGATCTTTCTTGGTT
AAGTTGGGAGCAGAGAATCTTAAAGGTGTTAAGAACGAGGAGCTTCTCGTTGCTTGCCAC
AAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCATCTTCCTTGTTGGTAAA
GACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATTTTTATCATAACAGGGGCTGTGAAA
GACATATGCGGCAAACCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACAAATACGGAAGGATTTGT
TTGTGCCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTTGAGAACACTGACAAAGACAGGATC
AAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGATTCCCTCCATGTCCAACTCCA
AACCACACCCTTTTGCAATATGTTTTTTTTCAACACTTATCAACAGAATGTCAGTTGCTG
AATCACTTCTCTCTATCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGACGTTATTCGTTCAGACATT
GAAGCAATTTAGTGTGGCG

QA 3 681 3 681
DS 

RD RR2C333TF 686 0 0
GGAAAAGAGAAGCGAATGGTTTGAGAGGTAGATAAGTAGAAGAAGGAGATAGAGACGAAG
AGAGAGAGGGGGAGATCAAAAAAATCATGATCCTTGCGGTGTTGTTCGCTAATTCCGTAG
GGAACGTCTTGATCGAAAGGTTCGATGGAGTGCCAGCTGAGGAACGTCTCACCTGGCGAT
CTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTTAAAGGTGTTAAGAACGAGGAGCTTCTCG
TTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCATCTTCC
TTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATTTTTATCATAACAG
GGGCTGTGAAAGACATATGCGGCAAGCCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACAAATACG
GAAGGATTTGTTTGTGCCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTTGAGAACACTGACA
AAGACAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGATTCCCTCCAT
GTCCAACTCCAAACCACACCCTTTTGCAATATGTTTTTTTTCAACACTTATCAACAGAAT
GTCAGTTGCTGAATCACTTCTCTCTATCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGATGTTCTTC
GTTCAGACATTGAAGCAATTTAGTGT

QA 1 686 1 686
DS 



CO CL141Contig2 714 11 4 U
CAATAAACATCGCCACACTAAATTGCTTCAATGTCTGAACGAAGAACAGCAGTAGTTAAC
AGTACAATACTTGATAGAGAGAAGCGATTCAGCAACTGACATTCTGTTGATAAGTGTTGA
AAAAAAA*GCATATTGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGGGAAATCAAAACTCAG
AAGGAGGTTTCAATCTAATGAGACGCTTGATCCTGTCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGTC
CGTTCCAAACGATTTCATCAAGACACAGACAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAACACTC
GCTCAGTAGGAGGTTTGCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGTTATGATAAAGATGGCTT
CTGCCAAAGCAAGTTCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCCCCTA
GCATTGTGTACACGATATAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTCTTAA
CACCTTTGAGATTCTCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGACGTTCCT
CAGCTGGCACTCCATTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAGCGAACAACA
CCGCAAGGATCATGATTTTTTTATCTCTCTCTCCTTCTTCTGCTTATCTACCTCTCAAAC
CATTCGCTTCCCTTTGATTTGATCTCTCTTTTACTTTGGTGTACCCGAACACCC


BQ
10 10 10 10 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 30 60 60 50 50 50 50 50 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C631JQ U 149
AF RR2E910JQ U 1
AF RR2DD88JQ U 15
AF RR2DD88TF C 15
AF RR2FC07JQ U 5
AF RR2FC07TF C 6
AF RR2A825JQ U 15
AF RR2E910TF C 122
AF RR2AH39JQ U 15
AF RR2AH39TF C 15
AF RR2A825TF C 15
BS 1 179 RR2E910JQ
BS 180 180 RR2DD88JQ
BS 181 671 RR2E910JQ
BS 672 714 RR2A825JQ

RD RR2C631JQ 369 0 0
GTTTGGAGTTGGAGAGGGAAATCAAAACTCAAAAGGAGGTTTCAATCTAATGAGACGCTT
GATCCTGTCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGTCCGTTCCAAACGATTTCATCAAGACACAG
ACAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAACACTCGCTCAGTAGGAGGTTTGCCGCATATGTC
TTTCACAGCCCCTGTTATGATAAAGATGGCTTCTGCCAAAGCAGGTTCATCGTACTCGTC
TTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCCCCTAGCATTGTGTACACGATACAAACCGACTT
GTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTCTTAACACCTTTGAGATTCTCTGCTCCCAACTT
AACCAA
AAA

QA 1 366 1 366
DS 

RD RR2E910JQ 671 0 0
CAATAAACATCGCCACACTAAATTGCTTCAATGTCTGAACGAAGAACAGCAGTAGTTAAC
AGTACAATACTTGATAGAGAGAAGCGATTCAGCAACTGACATTCTGTTGATAAGTGTTGA
AAAAAAA*GCATATTGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGGGAAATCAAAACTCAA
AAGGAGGTTTCAATCTAATGAGACGCTTGATCCTGTCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGTC
CGTTCCAAACGATTTCATCAAGACACAGACAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAACACTC
GCTCAGTAGGAGGTTTGCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGTTATGATAAAGATGGCTT
CTGCCAAAGCAAGTTCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCCCCTA
GCATTGTGTACACGATATAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTCTTAA
CACCTTTGAGATTCTCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGACGTTCCT
CAGCTGGCACTCCATTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAGCGAACAACA
CCGCAAGGATCATGATTTTTTTATCTCTCTCTCCTTCTTCTGCTTATCTACCTCTCAAAC
CATTCGCTTCC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2DD88JQ 653 0 0
ACACTAAATTGCTTCAATGTCTGAACGAAGAACAGCAGTAGTTAACAGTACAATACTTGA
TAGAGAGAAGCGATTCAGCAACTGACATTCTGTTGATAAGTGTTGAAAAAAAA*GCATAT
TGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGGGAAATCAAAACTCAGAAGGAGGTTTCAAT
CTAATGAGACGCTTGATCCTGTCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGTCCGTTCCAAACGATT
TCATCAAGACACAGACAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAACACTCGCTCAGTAGGAGGT
TTGCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGTTATGATAAAGATGGCTTCTGCCAAAGCAAGT
TCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCCCCTAGCATTGTGTACACG
ATATAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTCTTAACACCTTTGAGATTC
TCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGACGTTCCTCAGCTGGCACTCCA
TTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAGCGAACAACACCGCAAGGATCATG
ATTTTTTTATCTCTCTCTCCTTCTTCTGCTTATCTACCTCTCAAACCATTC
CC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2DD88TF 653 0 0
ACACTAAATTGCTTCAATGTCTGAACGAAGAACAGCAGTAGTTAACAGTACAATACTTGA
TAGAGAGAAGCGATTCAGCAACTGACATTCTGTTGATAAGTGTTGAAAAAAAA*GCATAT
TGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGGGAAATCAAAACTCAGAAGGAGGTTTCAAT
CTAATGAGACGCTTGATCCTGTCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGTCCGTTCCAAACGATT
TCATCAAGACACAGACAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAACACTCGCTCAGTAGGAGGT
TTGCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGTTATGATAAAGATGGCTTCTGCCAAAGCAAGT
TCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCCCCTAGCATTGTGTACACG
ATATAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTCTTAACACCTTTGAGATTC
TCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGACGTTCCTCAGCTGGCACTCCA
TTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAGCGAACAACACCGCAAGGATCATG
ATTTTTTTATCTCTCTCTCCTTCTTCTGCTTATCTACCTCTCAAACCATTC
CC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2FC07JQ 668 0 0
AAACATCGCCACACTAAATTGCTTCAATGTATGAACGAAGAACAGCAGTAGTTAACAGTA
CAATACTTGATAGAGAGAAGCGATTCAGCAACTGACATTCTGTTGATAAGTGTTGAAAAA
AAA*GCATATTGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGGGAAATCAAAACTCAGAAGG
AGGTTTCAATCTAATGAGACGCTTGATCCTGTCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGTCCGTT
CCAAACGATTTCATCAAGACACAGACAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAACACTCGCTC
AGTAGGAGGTTTGCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGTTATGATAAAGATGGCTTCTGC
CAAAGCAAGTTCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCCCCTAGCAT
TGTGTACACGATATAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTCTTAACACC
TTTGAGATTCTCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGACGTTCCTCAGC
TGGCACTCCATTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAGCGAACAACACCGC
AAGGATCATGATTTTTTTATCTCTCTCTCCTTCTTCTGCTTATCTACCTCTCAAACCAGT
CGCTTCC
C

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2FC07TF 667 0 0
AACATCGCCACACTAAATTGCTTCAATGTATGAACGAAGAACAGCAGTAGTTAACAGTAC
AATACTTGATAGAGAGAAGCGATTCAGCAACTGACATTCTGTTGATAAGTGTTGAAAAAA
AA*GCATATTGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGGGAAATCAAAACTCAGAAGGA
GGTTTCAATCTAATGAGACGCTTGATCCTGTCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGTCCGTTC
CAAACGATTTCATCAAGACACAGACAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAACACTCGCTCA
GTAGGAGGTTTGCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGTTATGATAAAGATGGCTTCTGCC
AAAGCAAGTTCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCCCCTAGCATT
GTGTACACGATATAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTCTTAACACCT
TTGAGATTCTCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGACGTTCCTCAGCT
GGCACTCCATTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAGCGAACAACACCGCA
AGGATCATGATTTTTTTATCTCTCTCTCCTTCTTCTGCTTATCTACCTCTCAAACCAGTC
GCTTCC
C

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2A825JQ 700 0 0
ACACTAAATTGCTTCAATGTCTGAACGAAGAACAGCAGTAGTTAACAGTACAATACTTGA
TAGAGAGAAGCGATTCAGCAACTGACATTCTGTTGATAAGTGTTGAAAAAAAAAGCATAT
TGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGGGAAATCAAAACTCAGAAGGAGGTTTCAAT
CTAATGAGACGCTTGATCCTGTCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGTCCGTTCCAAACGATT
TCATCAAGACACAGACAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAACACTCGCTCAGTAGGAGGT
TTGCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGTTATGATAAAGATGGCTTCTGCCAAAGCAAGT
TCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCCCCTAGCATTGTGTACACG
ATATAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTCTTAACACCTTTGAGATTC
TCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGACGTTCCTCAGCTGGCACTCCA
TTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAGCGAACAACACCGCAAGGATCATG
ATTTTTTTATCTCTCTCTCCTTCTTCTGCTTATCTACCTCTCAAACCATTCGCTTCTCTT
TGATTTGATCTCTCTTTTACTTTGGTGTACCCGAACACCC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2E910TF 550 0 0
AAAAAAAGCATATTGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGGGAAATCAAAACTCAGA
AGGAGGTTTCAATCTAATGAGACGCTTGATCCTGTCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGTCC
GTTCCAAACGATTTCATCAAGACACAGACAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAACACTCG
CTCAGTAGGAGGTTTGCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGTTATGATAAAGATGGCTTC
TGCCAAAGCAAGTTCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCCCCTAG
CATTGTGTACACGATATAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTCTTAAC
ACCTTTGAGATTCTCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGACGTTCCTC
AGCTGGCACTCCATTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAGCGAACAACAC
CGCAAGGATCATGATTTTTTTATCTCTCTCTCCTTCTTCTGCTTATCTACCTCTCAAACC
ATTCGCTTCC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2AH39JQ 680 0 0
ACACTAAATTGCTTCAATGTCTGAACGAAGAACAGCAGTAGTTAACAGTACAATACTTGA
TAGAGAGAAGCGATTCAGCAACTGACATTCTGTTGATAAGTGTTGAAAAAAAA*GCATAT
TGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGGGAAATCAAAACTCAGAAGGAGGTTTCAAT
CTAATGAGACGCTTGATCCTGTCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGTCCGTTCCAAACGATT
TCATCAAGACACAGACAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAACACTCGCTCAGTAGGAGGT
TTGCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGCTATGATAAAGATGGCTTCTGCCAAAGCAAGT
TCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCCCCTAGCATTGTGTACACG
ATACAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTCTTAACACCTTTGAGATTC
TCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGACGTTCCTCAGCTGGCACTCCA
TTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAGCGAACAACACCGCAAGGATCATG
ATTTTTTTATCTCTCTCTCCTTCTTCTGCTTATCTACCTCTCAAACCATTCGCTTCTCTT
TGATTTGATCTCTCTTTT
CC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2AH39TF 680 0 0
ACACTAAATTGCTTCAATGTCTGAACGAAGAACAGCAGTAGTTAACAGTACAATACTTGA
TAGAGAGAAGCGATTCAGCAACTGACATTCTGTTGATAAGTGTTGAAAAAAAA*GCATAT
TGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGGGAAATCAAAACTCAGAAGGAGGTTTCAAT
CTAATGAGACGCTTGATCCTGTCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGTCCGTTCCAAACGATT
TCATCAAGACACAGACAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAACACTCGCTCAGTAGGAGGT
TTGCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGCTATGATAAAGATGGCTTCTGCCAAAGCAAGT
TCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCCCCTAGCATTGTGTACACG
ATACAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTCTTAACACCTTTGAGATTC
TCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGACGTTCCTCAGCTGGCACTCCA
TTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAGCGAACAACACCGCAAGGATCATG
ATTTTTTTATCTCTCTCTCCTTCTTCTGCTTATCTACCTCTCAAACCATTCGCTTCTCTT
TGATTTGATCTCTCTTTT
CC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2A825TF 700 0 0
ACACTAAATTGCTTCAATGTCTGAACGAAGAACAGCAGTAGTTAACAGTACAATACTTGA
TAGAGAGAAGCGATTCAGCAACTGACATTCTGTTGATAAGTGTTGAAAAAAAAAGCATAT
TGCAAGGGTGTGTGGTTTGGAGTTGGAGAGGGAAATCAAAACTCAGAAGGAGGTTTCAAT
CTAATGAGACGCTTGATCCTGTCTTTGTCGGTGTTCTCGAGAAGTCCGTTCCAAACGATT
TCATCAAGACACAGACAAATCCTTCCGTATTTGTCCAGAAACACTCGCTCAGTAGGAGGT
TTGCCGCATATGTCTTTCACAGCCCCTGTTATGATAAAGATGGCTTCTGCCAAAGCAAGT
TCATCGTACTCGTCTTTACCAACAAGGAAGATGCTAACATCCCCTAGCATTGTGTACACG
ATATAAACCGACTTGTGGCAAGCAACGAGAAGCTCCTCGTTCTTAACACCTTTGAGATTC
TCTGCTCCCAACTTAACCAAGAAAGATCGCCAGGTGAGACGTTCCTCAGCTGGCACTCCA
TTGAACCTTTCGATCAAGACGTTCCCTACGGAATTAGCGAACAACACCGCAAGGATCATG
ATTTTTTTATCTCTCTCTCCTTCTTCTGCTTATCTACCTCTCAAACCATTCGCTTCTCTT
TGATTTGATCTCTCTTTTACTTTGGTGTACCCGAACACCC

QA 1 700 1 700
DS 



CO CL141Contig3 639 2 2 U
AGGAGAAGAAGGAGAGAGAGATAAAAAAATCATGATCCTTGCGGTGTTGTTCGCTAATTC
CGTAGGGAACGTCTTGATCGAAAGGTTCAATGGAGTGCCAGCTGAGGAACGTCTCACCTG
GCGATCTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTCAAAGGTGTTAAGAACGAGGAGCT
TCTCGTTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCAT
CTTCCTTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATCTTTATCAT
AACAGGGGCTGTGAAAGACATATGCGGCAAACCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACAA
ATATGGAAGGATTTGTTTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCGAGAACAC
TGACAAAGACAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGATTCCC
CTCTCCAACTCCAAACCACACCCTTGCAATATGTTTTTTTTCAACACTTATCAACAGAAT
GCCAGTTGCTGAATCACTTCTCTACCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGCTGTTCTTCGT
TCAGACATTGAAAGCAATTTAGTGTGGCGATGTTTATTG


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F080JQ C 1
AF RR2F080TF U 1
BS 1 3 RR2F080JQ
BS 4 639 RR2F080TF

RD RR2F080JQ 639 0 0
AGGAGAAGAAGGAGAGAGAGATAAAAAAATCATGATCCTTGCGGTGTTGTTCGCTAATTC
CGTAGGGAACGTCTTGATCGAAAGGTTCAATGGAGTGCCAGCTGAGGAACGTCTCACCTG
GCGATCTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTCAAAGGTGTTAAGAACGAGGAGCT
TCTCGTTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCAT
CTTCCTTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATCTTTATCAT
AACAGGGGCTGTGAAAGACATATGCGGCAAACCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACAA
ATATGGAAGGATTTGTTTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCGAGAACAC
TGACAAAGACAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGATTCCC
CTCTCCAACTCCAAACCACACCCTTGCAATATGTTTTTTTTCAACACTTATCAACAGAAT
GCCAGTTGCTGAATCACTTCTCTACCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGCTGTTCTTCGT
TCAGACATTGAAAGCAATTTAGTGTGGCGATGTTTATTG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2F080TF 639 0 0
AGG
AGAAGAAGGAGAGAGAGATAAAAAAATCATGATCCTTGCGGTGTTGTTCGCTAATTCCGT
AGGGAACGTCTTGATCGAAAGGTTCAATGGAGTGCCAGCTGAGGAACGTCTCACCTGGCG
ATCTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTCAAAGGTGTTAAGAACGAGGAGCTTCT
CGTTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCATCTT
CCTTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATCTTTATCATAAC
AGGGGCTGTGAAAGACATATGCGGCAAACCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACAAATA
TGGAAGGATTTGTTTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCGAGAACACTGA
CAAAGACAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGATTCCCCTC
TCCAACTCCAAACCACACCCTTGCAATATGTTTTTTTTCAACACTTATCAACAGAATGCC
AGTTGCTGAATCACTTCTCTACCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGCTGTTCTTCGTTCA
GACATTGAAAGCAATTTAGTGTGGCGATGTTTATTG

QA 4 639 4 639
DS 



AS 2 18

CO CL142Contig1 769 12 6 U
GCAACAAACACACTACCTTCCCAAACTTTTCTCAATAACAATAAAAAAAAAA*GCAAATG
GCTTCGTCCCTGCTAACACCCGCAGCAGCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTAGCCTACTG
CTTGGATCTGCAGAGCAAGTTAGCGGACTGCGTCATGTCCCCAAGTCCCATAAGACCACC
ACTGATGTCAAACACCCTGATTTTCTTGTCACCATTGAGCCCAAACCAACTATTCTCATC
CCCGGTGTTGGAAGGTTCTTGCTTCCTCCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCCTTACAAT
CCTGTCACTGGAGCTCCACTTACTGGTGGGTCTATCGGTGGCCAAATCCCATCATATGGT
GGTGGACAAGGGGGCGGAACTCGAACCCAGCTCCCTGGTGGCGATGATACCCTTGTCCCA
AACCCCGGATATGAAACTCCAACCCCAAGCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCCGGAGCTGGC
GCTGGAAACAACGGGCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTCTTTTTCAATGTCTG
TCAACAAATAAGCATTTCTTAGATGCAAAAGGGTCTATATGAGTATTACCTT*CTGGTTT
ACTAGCCGTTACCTTATGAGTCA*TATGTTTGTCATCTCTCTCTTTCTTTTCGGATCTCT
CTATAACAAGAGAGAGAATCTTGTGTCTTGTTCTTCACTTAATGTTGTCATCTACAGTGT
TTATTTACATGCCATTACATTACATTTAAATATCAAAATCCTTTATGAT


BQ
20 10 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 45 70 70 70 40 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 40 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 50 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR2G789TF U 0
AF RR2DI44TF U 1
AF RR2F435TF U -5
AF RR2AS32TF U 1
AF RR2DI44JQ C 119
AF RR2EG86TF U -5
AF RR2EG86JQ C -3
AF RR2FS13TF U 1
AF RR2GD20TF U 8
AF RR2GD20JQ C 74
AF RR2A943TF U 151
AF RR2G789JQ C 328
BS 1 1 RR2AS32TF
BS 2 2 RR2G789TF
BS 3 13 RR2AS32TF
BS 14 14 RR2G789TF
BS 15 766 RR2AS32TF
BS 767 769 RR2G789JQ

RD RR2G789TF 542 0 0
GG
CAACAAACACACTACCTTCCCAAACTTTTCTCAATAACAATAAAAAAAAAA*GCAAATGG
CTTCGTCCCTGCTAACACCCGCAGCAGCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTAGCCTACTGC
TTGGATCTGCAGAGCAAGTTAGCGGACTGCGTCATGTCCCCAAGTCCCATAAGACCACCA
CTGATGTCAAACACCCTGATTTTCTTGTCACCATTGAGCCCAAACCAACTATTCTCATCC
CCGGTGTTGGAAGGTTCTTGCTTCCTCCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCCTTACAATC
CTGTCACTGGAGCTCCACTTACTGGTGGGTCTATCGGTGGCCAAATCCCATCATATGGTG
GTGGACAAGGGGGCGGAACTCGAACCCAGCTCCCTGGTGG**ATGATACCCTTGTCCCAA
ACCCCGGATATGAAACTCCAACCCCAAGCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCCGGAGCTGGCG
CTGGAAACAACGGGCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTCTTTTTCAATGTCTGT

QA 3 542 3 542
DS 

RD RR2DI44TF 647 0 0
GGAACAAACACACTACCTTCCCAAGCTTTTCTCGATAACAATAAAAAAAAAAAGCAAATG
GCTTCGTCCCTGCTAACACCCGCAGCAGCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTAGCCTACTG
CTTGGATCTGCGGAGCAAGTTAGCGGACTGCGTCATGTCCCCAAGTCCCATAAGACCACC
ACTGATGTCAAACACCCTGATTTTCTTGTCACCATTGAGCCCAAACCAACTATTCTCATC
CCCGGTGTTGGAAGGTTCTTGCTTCCTCCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCTTTACAAT
CCTGTCACTGGAGCTCCACTTACTGGTTGGTCTATCGGTGGCCAAATCCCATCATATGGT
GGTGGACAAGGGGGCGGAACTCGAACCCAGCTCCCTGGTGGCGATGATACCCTTGTCCCA
AACCCCGGATATGAAACTCCAACCCCAAGCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCCGGAGCTGGC
GCTGGAAACAACGGGCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTCTTTTTCAATGTCTG
TCAACAAATAAGCATTTCTTAGATGCAAAAGGGTCTATATGAGTATTACCTT*CTGGTTT
ACTAGCCGTTACCTTATGAGTCA*TATGTTTGTCATCTCTCTCTTTC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2F435TF 726 0 0
GGAAGAC
CAACAAACACACTACCTTCCCAAACTTTTCTCAATAACAATAAAAAAAAAA*GCAAATGG
CTTCGTCCCTGCTAACACCCGCAGCAGCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTAGCCTACTGC
TTGGATCTGCAGAGCAAGTTAGCGGACTGCGTCATGTCCCCAAGTCCCATAAGACCACCA
CTGATGTCAAACACCCTGATTTTCTTGTCACCATTGAGCCCAAACCAACTATTCTCATCC
CCGGTGTTGGAAGGTTCTTGCTTCCTCCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCCTTACAATC
CTGTCACTGGAGCTCCACTTACTGGTGGGTCTATCGGTGGCTAAATCCCATCATATGGTG
GTGGACAAGGGGGCGGAACTCAAATCCAGCCCCCTGGTGGCGATGATACCCTTGTCCCAA
ACCCCGGATATGAAACTCCAACCCCAAGCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCCGGAGCTGACG
CTGGAAACAACGGGCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTCTTTTTCAATGTCTGT
CAACAAATAAGCATTTCTTAGATGCAAAAGGGTCTATATGAGTATTACCTT*CTGGTTTA
CTAGCCGTTACCTTATGAGTCA*TATGTTTGTCATCTCTCTCTTTCTTTTCGGATCTCTC
TATAACAAGAGAGAGAATCTTGTGTCTTGTTCTTCACTTAATGTTGTCATCTACAGTGT

QA 8 726 8 726
DS 

RD RR2AS32TF 766 0 0
GGAACAAACACACAACCTTCCCAAACTTTTCTCAATAACAATAAAAAAAAAA*GCAAATG
GCTTCGTCCCTGCTAACACCCGCAGCAGCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTAGCCTACTG
CTTGGATCTGCAGAGCAAGTTAGCGGACTGCGTCATGTCCCCAAGTCCCATAAGACCACC
ACTGATGTCAAACACCCTGATTTTCTTGTCACCATTGAGCCCAAACCAACTATTCTCATC
CCCGGTGTTGGAAGGTTCTTGCTTCCTCCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCCTTACAAT
CCTGTCACTGGAGCTCCACTTACTGGTGGGTCTATCGGTGGCCAAATCCCATCATATGGT
GGTGGACAAGGGGGCGGAACTCGAACCCAGCTCCCTGGTGGCGATGATACCCTTGTCCCA
AACCCCGGATATGAAACTCCAACCCCAAGCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCCGGAGCTGGC
GCTGGAAACAACGGGCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTCTTTTTCAATGTCTG
TCAACAAATAAGCATTTCTTAGATGCAAAAGGGTCTATATGAGTATTACCTT*CTGGTTT
ACTAGCCGTTACCTTATGAGTCA*TATGTTTGTCATCTCTCTCTTTCTTTTCGGATCTCT
CTATAACAAGAGAGAGAATCTTGTGTCTTGTTCTTCACTTAATGTTGTCATCTACAGTGT
TTATTTACATGCCATTACATTACATTTAAATATCAAAATCCTTTAT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2DI44JQ 615 0 0
TGCTTGGATCTGCGGAGCAAGTTAGCGGACTGCGTCATGTCCCCAAGTCCCATAAGACCA
CCACTGATGTCAAACACCCTGATTTTCTTGTCACCATTGAGCCCAAACCAACTATTCTCA
TCCCCGGTGTTGGAAGGTTCTTGCTTCCTCCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCTTTACA
ATCCTGTCACTGGAGCTCCACTTACTGGTTGGTCTATCGGTGGCCAAATCCCATCATATG
GTGGTGGACAAGGGGGCGGAACTCGAACCCAGCTCCCTGGTGGCGATGATACCCTTGTCC
CAAACCCCGGATATGAAACTCCAACCCCAAGCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCCGGAGCTG
GCGCTGGAAACAACGGGCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTCTTTTTCAATGTC
TGTCAACAAATAAGCATTTCTTAGATGCAAAAGGGTCTATATGAGTATTACCTT*CTGGT
TTACTAGCCGTTACCTTATGAGTCA*TATGTTTGTCATCTCTCTCTTTCTTTTCGGATCT
CTCTATAACAAGAGAGAGAATCTTGTGTCTTGTTCTTCACTTAATGTTGTCATCTACAGT
GTTTATTTACATGCC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2EG86TF 727 0 0
GGAAGAC
CAACAAACACACTACCTTCCCAAACTTTTCTCAATAACAATAAAAAAAAAAAGCAAATGG
CTTCGTCCCTGCTAACACCCGCAGCAGCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTAGCCTACTGC
TTGGATCTACAGAGCAAGTTAGCGGACTGCGTCATGTCCCCAAGTCCCATAAGACCACCA
CTGATGTCAAACACCCTGATTTTCTTGTCACCATTGAGCCCAAACCAACTATTCTCATCC
CCGGTGTTGGAAGGTTCTTGCTTCCTCCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCCTTACAATC
CTGTCACTGGAGCTCCACTTACTGGTGGGTCTATCGGTGACCAAATCCCATCATATGGTG
GTGGACAAGGGGGCGGAACTCGAACCCAACTCCCTGGTGGCGATGATACCCTTGTCCCAA
ACCCCGGATATGAAACTCCAACCCCAAGCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCCGGAGCTGGCG
CTGGAAACAACGGGCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTCTTTTTCAATGTCTGT
CAACAAATAAGCATTTCTTAGATGCAAAAGGGTCTATATGAGTATTACCTT*CTGGTTTA
CTAGCCGTTACCTTATGAGTCA*TATGTTTGTCATCTCTCTCTTTCTTTTCGGATCTCTC
TATAACAAGAGAGAGAATCTTGTGTCTTGTTCTTCACTTAATGTTGTCATCTACAGTGTT

QA 8 727 8 727
DS 

RD RR2EG86JQ 726 0 0
AAGAC
CAACAAACACACTACCTTCCCAAACTTTTCTCAATAACAATAAAAAAAAAAAGCAAATGG
CTTCGTCCCTGCTAACACCCGCAGCAGCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTAGCCTACTGC
TTGGATCTACAGAGCAAGTTAGCGGACTGCGTCATGTCCCCAAGTCCCATAAGACCACCA
CTGATGTCAAACACCCTGATTTTCTTGTCACCATTGAGCCCAAACCAACTATTCTCATCC
CCGGTGTTGGAAGGTTCTTGCTTCCTCCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCCTTACAATC
CTGTCACTGGAGCTCCACTTACTGGTGGGTCTATCGGTGACCAAATCCCATCATATGGTG
GTGGACAAGGGGGCGGAACTCGAACCCAACTCCCTGGTGGCGATGATACCCTTGTCCCAA
ACCCCGGATATGAAACTCCAACCCCAAGCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCCGGAGCTGGCG
CTGGAAACAACGGGCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTCTTTTTCAATGTCTGT
CAACAAATAAGCATTTCTTAGATGCAAAAGGGTCTATATGAGTATTACCTT*CTGGTTTA
CTAGCCGTTACCTTATGAGTCA*TATGTTTGTCATCTCTCTCTTTCTTTTCGGATCTCTC
TATAACAAGAGAGAGAATCTTGTGTCTTGTTCTTCACTTAATGTTGTCATCTACAGTGTT
T

QA 6 726 6 726
DS 

RD RR2FS13TF 745 0 0
GGAACAAACACACTACCTTCCCAAACTTTTCTCAATAACAATAAAAAAAAA**GCAAATT
GCTTCGTCCCTGCTAACACCCGCAGCAGCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTAGCCTACTG
CTTGGATCTGCAGAGCAAGTTAGCGGACTGCGTCATGTCCCCAAGTCCCATAAGACCACC
ACTGATGTCAAACACCCTGATTTTCTTGTCGCCATTGAGCCCAAACCAACTATTCTCATC
CCCAGTGTTGGAAGGTTCTTGCTTCCTCCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCCTTACAAT
CCTGTCACTGGAGCTCCACTTACTGGTGGGTCTATCGGTGGCCAAATCCCATCATATGGT
GGTGGACAAGGGGGCGGAACTCGAACCCAGCTCCCTGGTGGCGATGATACC*TTGTCCCA
AACCCCGGATATGAAACTCCAACCCCAAGCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCCGGAGCTGGC
GCTGGAAACAACGGGCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTCTTTTTCAATGTCTG
TCAACAAATAAGCATTTCTTAGATGCAAAAGGGTCTATATGAGTATTACCTT*CTGGTTT
ACTAGCCGTTACCTTATGAGTCA*TATGTTTGTCATCTCTCTCTTTCTTTTCGGATCTCT
CTATAACAAGAGAGAGAATCTTGTGTCTTGTTCTTCACTTAATGTTGTCATCTACAGTGT
TTATTTACATGCCATTACATTACAT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2GD20TF 744 0 0
GG
ACACTACCTTCCCAAACTTTTCTCAATAACAATAAAAAAAAAA*GCAAATGGCTTCGTCC
CTGCTAACACCCGCAGCAGCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTAGCCTACTGCTTGGATCT
GCAGAGCAAGTTAGCGGACTGCGTCATGTCCCCAAGTCCCATAAGACCACCACTGATGTC
AAACACCCTGATTTTCTTGTCACCATTGAGCCCAAACCAACTATTCTCATCCCCGGTGTT
GGAAGGTTCTTGCTTCCTCCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCCTTACAATCCTGTCACT
GGAGCTCCACTTACTGGTGGGTCTATCGGTGGCCAAATCCCATCATATGGTGGTGGACAA
GGGGGCGGAACTCGAACCCAGCTCCCTGGTGGCGATGATACCCTTGTCCCAAACCCCGGA
TATGAAACTCCAACCCCAAGCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCCGGAGCTGGCGCTGGAAAC
AACGGGCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTCTTTTTCAATGTCTGTCAACAAAT
AAGCATTTCTTAGATGCAAAAGGGTCTATATGAGTATTACCTT*CTGGTTTACTAGCCGT
TACCTTATGAGTCA*TATGTTTGTCATCTCTCTCTTTCTTTTCGGATCTCTCTATAACAA
GAGAGAGAATCTTGTGTCTTGTTCTTCACTTAATGTTGTCATCTACAGTGTTTATTTACA
TGCCATTACATTACATTTAAAT

QA 3 744 3 744
DS 

RD RR2GD20JQ 696 0 0
TAACACCCGCAGCAGCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTAGCCTACTGCTTGGATCTGCAG
AGCAAGTTAGCGGACTGCGTCATGTCCCCAAGTCCCATAAGACCACCACTGATGTCAAAC
ACCCTGATTTTCTTGTCACCATTGAGCCCAAACCAACTATTCTCATCCCCGGTGTTGGAA
GGTTCTTGCTTCCTCCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCCTTACAATCCTGTCACTGGAG
CTCCACTTACTGGTGGGTCTATCGGTGGCCAAATCCCATCATATGGTGGTGGACAAGGGG
GCGGAACTCGAACCCAGCTCCCTGGTGGCGATGATACCCTTGTCCCAAACCCCGGATATG
AAACTCCAACCCCAAGCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCCGGAGCTGGCGCTGGAAACAACG
GGCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTTTTTTTCAATGTCTGTCAACAAATAAGC
ATTTTTTAGATGCAAAAGGGTCTATATGAGTATTACCTT*TTGGTTTACTAGCCGTTACC
TTATGAGTCA*TATGTTTGTCATCTCTCTCTTTCTTTTCGGATCTCTCTATAACAAGAGA
GAGAATCTTGTGTCTTGTTCTTCACTTAATGTTGTCATCTACAGTGTTTATTTACATGCC
ATTACATTACATTTAAATATCAAAATCCTTTAT
GAT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2A943TF 617 0 0
CGTCATGTCCCCAAGTCCCATAAGACCACCACTGATGTCAAACACCCTGATTTTCTTGTC
ACCATTGAGCCCAAACCAACTATTCTCATCCCCGGTGTTGGAAGGTTCTTGCTTCCTCCC
AAATGTAAGAAACCATTCTACCCTTACAATCCTGTCACTGGAGCTCCACTTACTGGTGGG
TCTATCGGTGGCTAAATCCCATCATATGGTGGTGGACAAGGGGGCGGAACTCAAATCCAG
CCCCCTGGTGGCGATGATACCCTTGTCCCAAACCCCGGATATGAAACTCCAACCCCAAGC
ACTGGAGCTGGAGCTGGAGCCGGAGCTGACGCTGGAAACAACGGGCAAGTTCCTCCGGTG
CCACTACCCTGATTTCTTTTTCAATGTCTGTCAACAAATAAGCATTTCTTAGATGCAAAA
GGGTCTATATGAGTATTACCTTTCTGGTTTACTAGCCGTTACCTTATGAGTCAATATGTT
TGTCATCTCTCTCTTTCTTTTCGGATCTCTCTATAACAAGAGAGAGAATCTTGTGTCTTG
TTCTTCACTTAATGTTGTCATCTACAGTGTTTATTTACATGCCATTACATTACATTTAAA
TATCAAAATCCTTTAT
G

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2G789JQ 442 0 0
GGGTCTATCGGTGGCCAAATCCCATCATATGGTGGTGGACAAGGGGGCGGAACTCGAACC
CAGCTCCCTGGTGG**ATGATACCCTTGTCCCAAACCCCGGATATGAAACTCCAACCCCA
AGCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCCGGAGCTGGCGCTGGAAACAACGGGCAAGTTCCTCCG
GTGCCACTACCCTGATTTCTTTTTCAATGTCTGTCAACAAATAAGCATTTTTTAGATGCA
AAAGGGTCTATATGAGTATTACCTT*CTGGTTTACTAGCCGTTACCTTATGAGTCA*TAT
GTTTGTCATCTCTCTCTTTCTTTTCGGATCTCTCTATAACAAGAGAGAGAATCTTGTGTC
TTGTTCTTCACTTAATGTTGTCATCTACAGTGTTTATTTACATGCCATTACATTACATTT
AAATATCAAAATCCTTTATGAT

QA 1 442 1 442
DS 



CO CL142Contig2 799 6 2 U
CCTCATCTAGTTTATTTAGTATGCGGAATGAAGGAGTACGAGTACATTTTTCTTAAAGGA
TTTTGACATTTAAATGTAATGGCATGTAAATAAATACTATAGATGACAACATTAAGTGAA
GAAGAAGACACAACATTATAGAGAGATCCAAAAAGAAAGAGAGATAGAGATGACAAACAT
ATGACTCATAAGGTAACGGCTAGTAAACCAGAAGGTAAGACTCATATAGACCTTTTGCAT
CAAAGAAATGCTTATTTGTTGACAGATATTGAAAAATAAATCAGGGTAGTGGCACCGGAG
GAACTTGGCCGTTGTTTCCAGCGCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGGGGTTGTGG
TTGGAGTTTCATATCCGGGGTTTGGGACAAGGGTATCATCGCCACCAGGGAGCTGGGTGT
GAGTTCCGCCCCCTTGTCCACCACCATATGATGGGATTTGGCCACCGATAGACCCACCAG
TAAGTGGAGCTCCAGTGACAGGATTGTAAGGGTAGAATGGTTTCTTACATTTGGGAGGAA
GCAAGAACCTTCCAACACCGGGTATGAGAATTGTTGGTTTGGGCTCAATGGTGACAAGAA
AATCAGGGTGTTTTACATCAGTGGTGGTCTTATGGGACTTGGGGACATGACGCAGTCCGC
TAACTTGCTCTGCAGATCCAAGCAGTAGGCCAAGAAGCATGACAGTGACTGCTGCTGCTG
CGGGTGTTAGCAGGGACGAACCCATTTGTTTTTTTTTATTGTTATTGAGAAAAGTTTGGG
AAGGTAGTGTGTTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 

AF RR2GA78JQ U 1
AF RR2BL70JQ U 69
AF RR2BL70TF C 64
AF RR2A324JQ U 81
AF RR2GA78TF C 240
AF RR2A324TF C 81
BS 1 729 RR2GA78JQ
BS 730 799 RR2A324JQ

RD RR2GA78JQ 729 0 0
CCTCATCTAGTTTATTTAGTATGCGGAATGAAGGAGTACGAGTACATTTTTCTTAAAGGA
TTTTGACATTTAAATGTAATGGCATGTAAATAAATACTATAGATGACAACATTAAGTGAA
GAAGAAGACACAACATTATAGAGAGATCCAAAAAGAAAGAGAGATAGAGATGACAAACAT
ATGACTCATAAGGTAACGGCTAGTAAACCAGAAGGTAAGACTCATATAGACCTTTTGCAT
CAAAGAAATGCTTATTTGTTGACAGATATTGAAAAATAAATCAGGGTAGTGGCACCGGAG
GAACTTGGCCGTTGTTTCCAGCGCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGGGGTTGTGG
TTGGAGTTTCATATCCGGGGTTTGGGACAAGGGTATCATCGCCACCAGGGAGCTGGGTGT
GAGTTCCGCCCCCTTGTCCACCACCATATGATGGGATTTGGCCACCGATAGACCCACCAG
TAAGTGGAGCTCCAGTGACAGGATTGTAAGGGTAGAATGGTTTCTTACATTTGGGAGGAA
GCAAGAACCTTCCAACACCGGGTATGAGAATTGTTGGTTTGGGCTCAATGGTGACAAGAA
AATCAGGGTGTTTTACATCAGTGGTGGTCTTATGGGACTTGGGGACATGACGCAGTCCGC
TAACTTGCTCTGCAGATCCAAGCAGTAGGCCAAGAAGCATGACAGTGACTGCTGCTGCTG
CGGGTGTTA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2BL70JQ 660 0 0
TTTAAATGTAATGGCATGTAAATAAATACTATAGATGACAACATTAAGTGAAGAAGAAGA
CACAACATTATAGAGAGATCCAAAAAGAAAGAGAGATAGAGATGACAAACATATGACTCA
TAAGGTAACGGCTAGTAAACCAGAAGGTAAGACTCATATAGACCTTTTGAATCAAAGAAA
TGCTTATTTGTTGACAGATATTGAAAAATAAATCAGGGTAGTGGCACCGGAGGAACTTGG
CCGTTGTTTCCAGCGCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGGGGTTGTGGTTGGAGTT
TCATATCCGGGGTTTGGGACAAGGGTATCATCGCCACCAGGGAGCTGGGTGTGAGTTCCG
CCCCCTTGTCCACCACCATATGATGGGATTTGGCCACCGATAGACCCACCAGTAAGTGGA
GCTCCAGTGACAGGATTGTAAGGGTAGAATGGTTTCTTACATTTGGGAGGAAGCAAGAAC
CTTCCAACACCGGGTATGAAAATTGTTGGTTTGGGATCAATGGTGACAAGAAAATCAGGG
TGTTTTACATCAGTGGTGGTCTTATGGGACTTGGGGACATGACGCAGTCCGCTAACTTGC
TCTGCAGATCCAAGCAGTAGGCCAAGAAGCATGACAGTGACTGCTGCTGCTGCGGGTGTT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2BL70TF 733 0 0
TGACA
TTTAAATGTAATGGCATGTAAATAAATACTATAGATGACAACATTAAGTGAAGAAGAAGA
CACAACATTATAGAGAGATCCAAAAAGAAAGAGAGATAGAGATGACAAACATATGACTCA
TAAGGTAACGGCTAGTAAACCAGAAGGTAAGACTCATATAGACCTTTTGAATCAAAGAAA
TGCTTATTTGTTGACAGATATTGAAAAATAAATCAGGGTAGTGGCACCGGAGGAACTTGG
CCGTTGTTTCCAGCGCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGGGGTTGTGGTTGGAGTT
TCATATCCGGGGTTTGGGACAAGGGTATCATCGCCACCAGGGAGCTGGGTGTGAGTTCCG
CCCCCTTGTCCACCACCATATGATGGGATTTGGCCACCGATAGACCCACCAGTAAGTGGA
GCTCCAGTGACAGGATTGTAAGGGTAGAATGGTTTCTTACATTTGGGAGGAAGCAAGAAC
CTTCCAACACCGGGTATGAGAATTGTTGGTTTGGGATCAATGGTGACAAGAAAATCAGGG
TGTTTTACATCAGTGGTGGTCTTATGGGACTTGGGGACATGACGCAGTCCGCTAACTTGC
TCTGCAGATCCAAGCAGTAGGCCAAGAAGCATGACAGTGACTGCTGCTGCTGCGGGTGTT
AGCAGGGACGAACCCATTTGTTTTTTTT*ATTGTTATTGAGAAAAGTTTGGGAAGGTAGT
GTGTTT
CC

QA 6 731 6 731
DS 

RD RR2A324JQ 719 0 0
GA
CATGTAAATAAATACTATAGATGACAACATTAAGTGAAGAAGAAGACACAACATTATAGA
GAGATCCAAAAAGAAAGAGAGATAGAGATGACAAACATATGACTCATAAGGTAACGGCTA
GTAAACCAGAAGGTAAGACTCATATAGACCTTTTGCATCAAAGAAATGCTTATTTGTTGA
CAGATATTGAAAAATAAATCAGGGTAGTGGCACCGGAGGAACTTGGCCGTTGTTTCCAGC
GCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGGGGTTGTGGTTGGAGTTTCATATCCGGGGTT
TGGGACAAGGGTATCATCGCCACCAGGGAGCTGGGTGTGAGTTCCGCCCCCTTGTCCACC
ACCATATGATGGGATTTGGCCACCGATAGACCCACCAGTAAGTGGAGCTCCAGTGACAGG
ATTGTAAGGGTAGAATGGTTTCTTACATTTGGGAGGAAGCAAGAACCTTCCAACACCGGG
TATGAGAATTGTTGGTTTGGGCTCAATGGTGACAAGAAAATCAGGGTGTTTTACATCAGT
GGTGGTCTTATGGGACTTGGGGACATGACGCAGTCCGCTAACTTGCTCTGCAGATCCAAG
CAGTAGGCCAAGAAGCATGACAGTGACTGCTGCTGCTGCGGGTGTTAGCAGGGACGAACC
CATTTGTTTTTTTTTATTGTTATTGAGAAAAGTTTGGGAAGGTAGTGTGTTTGTTCC

QA 3 719 3 719
DS 

RD RR2GA78TF 560 0 0
TCAAAGAAATGCTTATTTGTTGACAGATATTGAAAAATAAATCAGGGTAGTGGCACCGGA
GGAACTTGGCCGTTGTTTCCAGCGCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGGGGTTGTG
GTTGGAGTTTCATATCCGGGGTTTGGGACAAGGGTATCATCGCCACCAGGGAGCTGGGTG
TGAGTTCCGCCCCCTTGTCCACCACCATATGATGGGATTTGGCCACCGATAGACCCACCA
GTAAGTGGAGCTCCAGTGACAGGATTGTAAGGGTAGAATGGTTTCTTACATTTGGGAGGA
AGCAAGAACCTTCCAACACCGGGTATGAGAATTGTTGGTTTGGGCTCAATGGTGACAAGA
AAATCAGGGTGTTTTACATCAGTGGTGGTCTTATGGGACTTGGGGACATGACGCAGTCCG
CTAACTTGCTCTGCAGATCCAAGCAGTAGGCCAAGAAGCATGACAGTGACTGCTGCTGCT
GCGGGTGTTAGCAGGGACGAACCCATTTGTTTTTTTT*ATTGTTATTGAGAAAAGTTTGG
GAAGGTAGTGTGTTTGTTCC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2A324TF 719 0 0
GA
CATGTAAATAAATACTATAGATGACAACATTAAGTGAAGAAGAAGACACAACATTATAGA
GAGATCCAAAAAGAAAGAGAGATAGAGATGACAAACATATGACTCATAAGGTAACGGCTA
GTAAACCAGAAGGTAAGACTCATATAGACCTTTTGCATCAAAGAAATGCTTATTTGTTGA
CAGATATTGAAAAATAAATCAGGGTAGTGGCACCGGAGGAACTTGGCCGTTGTTTCCAGC
GCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGGGGTTGTGGTTGGAGTTTCATATCCGGGGTT
TGGGACAAGGGTATCATCGCCACCAGGGAGCTGGGTGTGAGTTCCGCCCCCTTGTCCACC
ACCATATGATGGGATTTGGCCACCGATAGACCCACCAGTAAGTGGAGCTCCAGTGACAGG
ATTGTAAGGGTAGAATGGTTTCTTACATTTGGGAGGAAGCAAGAACCTTCCAACACCGGG
TATGAGAATTGTTGGTTTGGGCTCAATGGTGACAAGAAAATCAGGGTGTTTTACATCAGT
GGTGGTCTTATGGGACTTGGGGACATGACGCAGTCCGCTAACTTGCTCTGCAGATCCAAG
CAGTAGGCCAAGAAGCATGACAGTGACTGCTGCTGCTGCGGGTGTTAGCAGGGACGAACC
CATTTGTTTTTTTTTATTGTTATTGAGAAAAGTTTGGGAAGGTAGTGTGTTTGTTCC

QA 3 719 3 719
DS 



AS 3 13

CO CL143Contig1 1085 5 7 U
GGCTACTCTCTCTTCTCTATCTGGGCTCTATTAGCAAATATTTGAAAATTATAGTGAGGG
ATGGCGGCAACAGCAGCTACAAGCTTGCAAATGGCTACAACAAAAAGGCAGAGCATTTCT
GCTGCCTTTAGCAAAGTTGGGACCAATCCCAGGAACAATGCATCATGGGACAAAATTGCC
TGCACTCGCCGTCTATCGAACCTGGGATGTTTGAGAAACAACAAGACTGCTCTTCTTCCA
ACTTCTAAAAAGAGTTTTTCTTTTTCAACAAAGGCCATGTCTGAAGAATCCAGCCAAAAC
AAGGCTTCTTCTGGACTTCCTATTGATTTGAGAGGGAAAAGGGCATTCATTGCTGGTATT
GCTGATGATAATGGATATGGTTGGGCCATTGCCAAATCTCTTGCTGCTGCTGGTGCTGAA
ATTTTGGTTGGCACTTGGGTTCCTGCGCTTAACATTTTTGAGACGAGCTTGAGACGTGGA
AAATTCGACCAGTCACGCGTGTTGCCAGACGGATCACTGATGGAGATTAAAAAGGTTTAT
CCTTTGGATGCTGTGTTTGACAATCCTGATGATGTCCCTGAAGATGTGAAAGCGAATAAG
CGATATGCTGGATCATCAAACTGGACTGTACAGGAAGCTGCAGAATGTGTGAGGAAAGAT
TTTGGAAGCATTGACATTCTTGTCCACTCACTTGCAAATGGACCAGAGGTTAGCAAACCT
CTTCTGGAGACATCGAGGAAAGGCTATCTTGCTGCTATCTCTGCTTCTAGTTACTCCTTT
GTTTCTCTCCTCAGCCATTTTCTGCCAATTATGAACCCAGGAGGTGCTTCTATCTCTCTT
ACTTACATTGCCTCTGAAAGGATCATTCCCGGGTATGGTGGAGGTATGGGTTCTGCCAAA
GCCGCACTAGAGAGTGACACACGTGTGCTTGCATTTGAAGCTGGGAGGAAACAAAACATT
AGGGTCAACACTATCTCTGCAGGTCCTTTGGGAAGCCGAGCAGCTAAAGCAATTGGGTTC
ATAGATACAATGATCGAGTATTCATACAATAACGCGCCTATTCAGAAACACTGACCGCAG
ATGAA


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2FW60TF U 3
AF RR2BN59TF U 4
AF RR2B304TF U 1
AF RR2BU03TF U 179
AF RR2EX54TF U 329
BS 1 131 RR2B304TF
BS 132 132 RR2FW60TF
BS 133 737 RR2B304TF
BS 738 738 RR2BU03TF
BS 739 813 RR2B304TF
BS 814 857 RR2BU03TF
BS 858 1085 RR2EX54TF

RD RR2FW60TF 648 0 0
GG
ACTCTCTCTTCTCTATCTGGGCTCTATTAGCAAATATTTGAAAATTATAGTGAGGGATGG
CGGCAACAGCAGCTACAAGCTTGCAAATGGCTACAACAAAAAGGCAGAGCATTTCTGCTG
CCTTTAGCAGAGTTGGGACCAATCCCAGGAACAATGCATCATGGGACAAAATTGCCTGCC
CTCGCCGTCTATCGAACCTGGGATGTTTGAGAAACAACAAGACTGCTCTTCTTCCAACTT
CTAAAAAGAGTTTTTCTTTTTCAACAAAGGCCATGTCTGAAGAATCCAGCCAAAACAAGG
CTTCTTCTGGACTTCCTATTGATTTGAGAGGGAAAAGGGCATTCATTGCTGGTATTGCTG
ATGATAATGGATATGGTTGGGCCATTGCCAAATCTCTTGCTGCTGCTGGTGCTGAAATTT
TGGTTGGCACTTGGGTTCCTGCGCTTAACATTTTTGAGACGAGCTTGAGACGTGGAAAAT
TCGACCAGTCACGCGTGTTGCCAGACGGATCACTGATGGAGATTAAAAAGGTTTATCCTT
TGGATGCTGTGTTTGACAATCCTGATGATGTCCCTGAAGATGTGAAAGCGAATAAGCGAT
ATGCTGGATCATCAAACTGGACTGTACAGGAAGCTGCAGAATGTGT

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR2BN59TF 730 0 0
G
ACTCTCTCTTCTCTATCTGGGCTCTATTAGCAAATATTTGAAAATTATAGTGAGGGATGG
CGGCAACAGCAGCTACAAGCTTGCAAATGGCTACAACAAAAAGGCAGAGCATTTCTGCTG
CCTTTAGCAAAGTTGGGACCAATCCCAGGAACAATGCATCATGGGACAAAATTGCCTGCA
CTCGCCGTCTATCGAACCTGGGATGTTTGAGAAACAACAAGACTGCTCTTCTTCCAACTT
CTAAAAAGAGTTTTTCTTTTTCAACAAAGGCCATGTCTGAAGAATCCAGCCAAAACAAGG
CTTCTTCTGGACTTCCTATTGATTTGAGAGGGAAAAGGGCATTCATTGCTGGTATTGCTG
ATGATAATGGATATGGTTGGGCCATTGCCAAATCTCTTGCTGCTGCTGGTGCTGAAATTT
TGGTTGGCACTTGGGTTCCTGCGCTTAACATTTTTGAGACGAGCTTGAGACGTGGAAAAT
TCGACCAGTCACGCGTGTTGCCAGACGGATCACTGATGGAGATTAAAAAGGTTTATCCTT
TGGATGCTGTGTTTGACAATCCTGATGATGTCCCTGAAGATGTGAAAGCGAATAAGCGAT
ATGCTGGATCATCAAACTGGACTGTACAGGAAGCTGCAGAATGTGTGAGAAAAGATTTTG
GAAGCATTGACATTCTTGTCCACTCACTTGCAAATGGACCAGAG*TTAGCAAACCTCTTC
TGGAGACAT

QA 2 730 2 730
DS 

RD RR2B304TF 813 0 0
GGCTACTCTCTCTTCTCTATCTGGGCTCTATTAGCAAATATTTGAAAATTATAGTGAGGG
ATGGCGGCAACAGCAGCTACAAGCTTGCAAATGGCTACAACAAAAAGGCAGAGCATTTCT
GCTGCCTTTAGTAAAGTTGGGACCAATCCCAGGAACAATGCATCATGGGACAAAATTGCC
TGCACTCGCCGTCTATCGAACCTGGGATGTTTGAGAAACAACAAGACTGCTCTTCTTCCA
ACTTCTAAAAAGAGTTTTTCTTTTTCAACAAAGGCCATGTCTGAAGAATCCAGCCAAAAC
AAGGCTTCTTCTGGACTTCCTATTGATTTGAGAGGGAAAAGGGCATTCATTGCTGGTATT
GCTGATGATAATGGATATGGTTGGGCCATTGCCAAATCTCTTGCTGCTGCTGGTGCTGAA
ATTTTGGTTGGCACTTGGGTTCCTGCGCTTAACATTTTTGAGACGAGCTTGAGACGTGGA
AAATTCGACCAGTCACGCGTGTTGCCAGACGGATCACTGATGGAGATTAAAAAGGTTTAT
CCTTTGGATGCTGTGTTTGACAATCCTGATGATGTCCCTGAAGATGTGAAAGCGAATAAG
CGATATGCTGGATCATCAAACTGGACTGTACAGGAAGCTGCAGAATGTGTGAGGAAAGAT
TTTGGAAGCATTGACATTCTTGTCCACTCACTTGCAAATGGACCAGAGGTTAGCAAACCT
CTTCTGGAGACATCGAGAAAAGGCTATCTTGCTGCTATCTCTGCTTCTAGTTACTCCTTT
GTTTCTCTCCTCAGCCATTTTCTGCCAATTATG

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2BU03TF 679 0 0
G
CTGCACTCGCCGTCTATCGAACCTGGGATGTTTGAGAAACAACAAGACTGCTCTTCTTCC
AACTTCTAAAAAGAGTTTTTCTTTTTCAACAAAGGCCATGTCTGAAGAATCCAGCCAAAA
CAAGGCTTCTTCTGGACTTCCTATTGATTTGAGAGGGAAAAGGGCATTCATTGCTGGTAT
TGCTGATGATAATGGATATGGTTGGGCCATTGCCAAATCTCTTGCTGCTGCTGGTGCTGA
AATTTTGGTTGGCACTTGGGTTCCTGCGCTTAACATTTTTGAGACGAGCTTGAGACGTGG
AAAATTCGACCAGTCACGCGTGTTGCCAGACGGATCACTGATGGAGATTAAAAAGGTTTA
TCCTTTGGATGCTGTGTTTGACAATCCTGATGATGTCCCTGAAGATGTGAAAGCGAATAA
GCGATATGCTGGATCATCAAACTGGACTGTACAGGAAGCTGCGGAATGTGTGAGGAAAGA
TTTTGGAAGCATTGACATTCTTGTCCACTCACTTGCAAATGGACCAGAGGTTAGCAAACC
TCTTCTGGAGACATCGAGGAA*GGCTATCTTGCTGCTATCTCTGCTTCTAGTTACTCCTT
TGTTTCTCTCCTCAGCCATTTTCTGCCAATTATGAACCCAGGAGGTGCTTCTATCTCTCT
TACTTACATTGCCTCTGA

QA 2 679 2 679
DS 

RD RR2EX54TF 757 0 0
G
GAGAGGGAAAAGGGCATTCATTGCTGGTATTGCTGATGATAATGGATATGGTTGGGCCAT
TTCCAAATCTCTTGCTGCTGCTGGTGCTGAAATTTTGGTTGGCACTTGGGTTCCTGCGCT
TAACATTTTTGAGACGAGCTTGAGACGTGGAAAATTCGACCAGTCACGCGTGTTGCCAGA
CGGATCACTGATGGAGATTAAAAAGGTTTATCCTTTGGATGCTGTGTTTGACAATCCTGA
TGATGTCCCTGAATATGTGAAAGCGAATAAGCGATATGCTGGATCATCAAACTGGACTGT
ACAGGAAGCTGCAGAATGTGTGAGGAAAGATTTTGGAAGCATTGACATTCTTGTCCACTC
ACTTGCAAATGGACCAGAGGTTAGCAAACCTCTTCTGGAGACATCGAGGAAAGGCTATCT
TGCTGCTATCTCTGCTTCTAGTTACTCCTTTGTTTCTCTCCTCAGCCATTTTCTGCCAAT
TATGAACCCAGGAGGTGCTTCTATCTCTCTTACTTACATTGCCTCTGAAAGGATCATTCC
CGGGTATGGTGGAGGTATGGGTTCTGCCAAAGCCGCACTAGAGAGTGACACACGTGTGCT
TGCATTTGAAGCTGGGAGGAAACAAAACATTAGGGTCAACACTATCTCTGCAGGTCCTTT
GGGAAGCCGAGCAGCTAAAGCAATTGGGTTCATAGATACAATGATCGAGTATTCATACAA
TAACGCGCCTATTCAGAAACACTGACCGCAGATGAA

QA 2 757 2 757
DS 



CO CL143Contig2 518 2 8 U
GGAAACTTCAATCATTAGAGGAAAATAGTGCAGCAGTTATTACATAACATTGCTAAAGTG
ACAAACTAAAAACATAACATCTTTTTTAAAAGGAAAAAAATAACAAAGCCGATGGGGGCC
ACATATGCTCCCTATTTGTTGAGGTCTTTGAAAACAGGGCTGTCCAGAGCAACACCCATT
GAATTCAAGCCATTGTCCACATAGATGGTTGCACCAGTTATGGCAAAAGCCAATGGAGAT
GCCAAGAAGGCTGCTGCATTTCCAACTTCATCTGCGGTCAGTGTTTTCTGAATAGGCGCG
TTATTGTATGAATACTCGATCATTGTATCTATGAACCCAATTGCTTTAGCTGCTCGGCTT
CCCAAAGGACCTGCAAAAATAGTGTTGACCCTAATGTTTTGTTTCCTCCCAGCTTCAAAT
GCAAGCACACGTGTGTCACTCTCTAGTGCGGCTTTGGCAAAACTCATACCTCCACCATAC
CCGGGAATGATCCTTTCAAAGGCAATGTAAGTAAAAAA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU03JQ U 1
AF RR2BN59JQ U 2
BS 1 225 RR2BU03JQ
BS 226 226 RR2BN59JQ
BS 227 375 RR2BU03JQ
BS 376 376 RR2BN59JQ
BS 377 459 RR2BU03JQ
BS 460 460 RR2BN59JQ
BS 461 496 RR2BU03JQ
BS 497 518 RR2BN59JQ

RD RR2BU03JQ 496 0 0
GGAAACTTCAATCATTAGAGGAAAATAGTGCAGCAGTTATTACATAACATTGCTAAAGTG
ACAAACTAAAAACATAACATCTTTTTTAAAAGGAAAAAAATAACAAAGCCGATGGGGGCC
ACATATGCTCCCTATTTGTTGAGGTCTTTGAAAACAGGGCTGTCCAGAGCAACACCCATT
GAATTCAAGCCATTGTCCACATAGATGGTTGCACCAGTTATGGCAGAAGCCAATGGAGAT
GCCAAGAAGGCTGCTGCATTTCCAACTTCATCTGCGGTCAGTGTTTTCTGAATAGGCGCG
TTATTGTATGAATACTCGATCATTGTATCTATGAACCCAATTGCTTTAGCTGCTCGGCTT
CCCAAAGGACCTGCAGAAATAGTGTTGACCCTAATGTTTTGTTTCCTCCCAGCTTCAAAT
GCAAGCACACGTGTGTCACTCTCTAGTGCGGCTTTGGCAGAACTCATACCTCCACCATAC
CCGGGAATGATCCTTT

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2BN59JQ 517 0 0
C
AAACTTCAATCATTAGAGGAAAATAGTGCAGCAGTTATTACATAACATTGCTAAAGTGAC
AAACTAGAAACATAACATCTTTTTTAAAAGGAAAAAA*TAACAAAGCCGATGGGGGCCAC
ATATGCTCCCTATTTGTTGAGGTCTTTGAAAACAGGGCTGTCCAGAGCAACACCCATTGA
ATTCAAGCCATTGTCCACATAGATGGTTGCACCAGTTATGGCAAAAGCCAATGGAGATGC
CAAGAAGGCTGCTGCATTTCCAACTTCATCTGCGGTCAGTGTTTTCTGAATGGGCGCGTT
ATTGTATGAATACTCGATCATTGTATCTATGAACCCAATTGCTTTAGCTGCTCGGCTTCC
CAAAGGACCTGCAAAGATAGTGTTGACCCTAATGTTTTGTTTCCTCCCAGCTTCAAATGC
AAGCACACGTGTGTCACTCTCTAGTGCGGCTTTGGCAAAACTCATACCTCCACCATACCC
GGGAATGATCCTTTCAAAGGCAATGTAAGTAAAAAA

QA 2 517 2 517
DS 



CO CL143Contig3 1375 6 10 U
ATATTCTACTTTTTGACTGGATTTATTCTGATTGTTTTAAATATTATATTTTGTTCTAGA
AACAAGGTTGTTCGAAAAAAAAAGAAAAACATTCTCAATTGAAACAAAAAAACAAATGCA
ACACAAGAAAAAGAGTTTCCCCAGTTACTTAAAAGTCTCTATTTGAGGTCTTTGAAAACT
G*ACTGTCGATGGCAACACCCATTGAATTCAAGCCATTGTCAACATAGATGGTTGCACCA
GTTATGGCAGAGGCCAATGGAGATACCAAGAAGGCAGCTGCATTCCCAACTTCATCTGCG
GTCAATGTTTTCTGAACAGGCGCATTATTGTATGAATACTCAATCATGGTGTCTATGAAC
CCAATTGCTTTTGCTGCTCGGCTTCCCAAAGGACCTGCAGAGATGGTGTTGACCCTAATG
TTTTGTTTCCTTCCAGCTTCAAATGCAAGCACCCGTGTATCACTCTCTAGTGCGGCTTTT
GCAGAACTCATACCTCCACCATACCCAGGAATGATCCTTTCAGAAGCAATGTAAGTAAGA
GATATAGAAGCACCTCCAGGGTTCATAATTGGCAGGAAATGCCTGAGGAGGGAAACAAAA
GAGTAACTCGAAGCAGAGATAGCAGCGAGGTAGCCCTTTCTTGATGTCTCTAGAAGAGGT
TTGCTAACCTCTGGTCCATTTGCAAGTGAGTGGACAAGAATGTCAATGGTTCCGAAATCT
TTTCTCACACATTCAGCAGCTTCCTGTACTGTCCAGTTTGATGATCCAGCATATCGCTTA
TTCGCTTTCACATCCTCAGGCACATCTTCAGGATTGTCAAACACAGCATCCAAAGGATAG
ACCTTTTTAACCTCCATCAATGACCCGTCAGGCAGCACGCGTGACTGGTCAAATTTTCCA
CGCCTCAGGCTCGTCTCAAAAATGTTAAGTGCAGGAACCCATGTCCCAACCAATATTTCA
GCACCAGCAGCAGCAAGAGATTTGGCTATGGCCCAACCATATCCATTATCATCAGCAATA
CCAGCAATGAAAGCCCTTTTCCCTCTCAAATCAATAGGAAGTCCAGAAGAAGCGTTGTTC
TGGCTGGATTCAGACATTGCCTTTGTTGAAAAGGAAAAACTCTTTTTAGAAGTTGGAAGA
GAACTGTTGTTTCTCAAACATCCGAGGTTCGATAGAGGACGAGTGCAAGCAAGTTTGTCC
CATGATGCGTTCCTGGGATTGGCACCGACAATGCAGGTCCCTGCTTTAAAAACTTTGCTA
GAGATGCTTGGCCTTATTGTAGCAAATTGCAAGCTTGAAGCGGCCGTCGCCGCCATTCTC
ACAACCTTTTTAATGTTTTTTGAGAGAGCCTAGAGAGAGAGAAAGTGGGGAGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP44JQ U 1
AF RR2EP44TF C 1
AF RR2C186JQ U 28
AF RR2AW53JQ U 15
AF RR2AW53TFB C 713
AF RR2C186TF C 714
BS 1 547 RR2EP44JQ
BS 548 557 RR2AW53JQ
BS 558 558 RR2C186JQ
BS 559 804 RR2AW53JQ
BS 805 850 RR2AW53TFB
BS 851 851 RR2C186TF
BS 852 1301 RR2AW53TFB
BS 1302 1302 RR2C186TF
BS 1303 1308 RR2AW53TFB
BS 1309 1375 RR2C186TF

RD RR2EP44JQ 548 0 0
ATATTCTACTTTTTGACTGGATTTATTCTGATTGTTTTAAATATTATATTTTGTTCTAGA
AACAAGGTTGTTCGAAAAAAAAAGAAAAACATTCTCAATTGAAACAAAAAAACAAATGCA
ACACAAGAAAAAGAGTTTCCCCAGTTACTTAAAAGTCTCTATTTGAGGTCTTTGAAAACT
G*ACTGTCGATGGCAACACCCATTGAATTCAAGCCATTGTCAACATAGATGGTTGCACCA
GTTATGGCAGAGGCCAATGGAGATACCAAGAAGGCAGCTGCATTCCCAACTTCATCTGCG
GTCAATGTTTTCTGAACAGGCGCATTATTGTATGAATACTCAATCATGGTGTCTATGAAC
CCAATTGCTTTTGCTGCTCGGCTTCCCAAAGGACCTGCAGAGATGGTGTTGACCCTAATG
TTTTGTTTCCTTCCAGCTTCAAATGCAAGCACCCGTGTATCACTCTCTAGTGCGGCTTTT
GCAGAACTCATACCTCCACCATACCCAGGAATGATCCTTTCAGAAGCAATGTAAGTAAGA
GATATAG
C

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2EP44TF 548 0 0
ATATTCTACTTTTTGACTGGATTTATTCTGATTGTTTTAAATATTATATTTTGTTCTAGA
AACAAGGTTGTTCGAAAAAAAAAGAAAAACATTCTCAATTGAAACAAAAAAACAAATGCA
ACACAAGAAAAAGAGTTTCCCCAGTTACTTAAAAGTCTCTATTTGAGGTCTTTGAAAACT
G*ACTGTCGATGGCAACACCCATTGAATTCAAGCCATTGTCAACATAGATGGTTGCACCA
GTTATGGCAGAGGCCAATGGAGATACCAAGAAGGCAGCTGCATTCCCAACTTCATCTGCG
GTCAATGTTTTCTGAACAGGCGCATTATTGTATGAATACTCAATCATGGTGTCTATGAAC
CCAATTGCTTTTGCTGCTCGGCTTCCCAAAGGACCTGCAGAGATGGTGTTGACCCTAATG
TTTTGTTTCCTTCCAGCTTCAAATGCAAGCACCCGTGTATCACTCTCTAGTGCGGCTTTT
GCAGAACTCATACCTCCACCATACCCAGGAATGATCCTTTCAGAAGCAATGTAAGTAAGA
GATATAG
C

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2C186JQ 585 0 0
CTGATTGTTTTAAATATTATATTTTGTTCTAGAAACAAGGTTGTTCGAAAAAAAAAGAAA
AACATTCTCAATTGAAACAAAAAAACAAATGCAACACAAGAAAAAGAGTTTCCCCAGTTA
CTTAAAAGTCTCTATTTGAGGTCTTTGAAAACTGGACTGTCGATGGCAACACCCATTGAA
TTCAAGCCATTGTCAACATAGATGGTTGCACCAGTTATGGCAGAGGCCAATGGAGATACC
AAGAAGGCAGCTGCATTCCCAACTTCATCTGCGGTCAATGTTTTCTGAACAGGCGCATTA
TTGTATGAATACTCAATCATGGTGTCTATGAACCCAATTGCTTTTGCTGCTCGGCTTCCC
AAAGGACCTGCAGAGATGGTGTTGACCCTAATGTTTTGTTTCCTTCCAGCTTCAAATGCA
AGCACCCGTGTATCACTCTCTAGTGCGGCTTTCGCAGAACTCATACCTCCACCATACCCA
GGAATGATCCTTTCAGAAGCAATGTAAGTAAGAGATATAGAAGCACCTCCAGGGTTCATA
ATTGGCAGGAAATGCCTGAGGAGGGAAACAAAAGAGTAACT
CGAA

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2AW53JQ 790 0 0
GACTGGATTTATTCTGATTGTTTTAAATATTATATTTTGTTCTAAAAACAAGGTTGTTCG
AAAAAAAAAGAAAAACATTCTCAATTGAAACAAAAAAACAAATGCAACACAAGAAAAAGA
GTTTCCCCAGTTACTTAAAAGTCTCTATTTGAGGTCTTCGAAAACTGGACTGTCGATGGC
AACACCCATTGAATTCAAGCCATTGTCAACATAGATGGTTGCACCAGTTATGGCAGAGGC
CAATGGAGATACCAAGAAGGCAGCTGCATTCCCAACTTCATCTGCGGTCAATGTTTTCTG
AACAGGCGCATTATTGTATGAATACTCAATCATGGTGTCTATGAACCCAATTGCTTTTGC
TGCTCGGCTTCCCAAAGGAACTGCAAAGATGGTGTTGACCCTAATGTTTTGTTTCCTTCC
AGCTTCAAATGCAAGCACCCGTGTATCACTCTCTAGTGCGGCTTTCGCAAAACTCATACC
TCCACCATACCCAGGAATGATCCTTTCAGAAGCAATGTAAGTAAGAGATATAGAAGCACC
TCCTGGGTTCATAATTGGCAGGAAATGCCTGAGGAGGGAAACAAAAGAGTAACTCGAAGC
AGAGATAGCAGCGAGGTAGCCCTTTCTTGATGTCTCTAGAAGAGGTTTGCTAACCTCTGG
TCCATTTGCAAGTGAGTGGACAAGAATGTCAATGGTTCCGAAATCTTTTCTCACACATTC
AGCAGCTTCCTGTACTGTCCAGTTTGATGATCCAGCATATCGCTTATTCGCTTTCACATC
CTCAGGCACA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2AW53TFB 596 0 0
CG
AAATCTTTTCTCACACATTCAGCAGCTTCCTGTACTGTCCAGTTTGATGATCCAGCATAT
CGCTTATTCGCTTTCACATCCTCAGGCACATCTTCAGGATTGTCAAACACAGCATCCAAA
GGATAGACCTTTTTAATCTCCATCAATGACCCGTCAGGCAGCACGCGTGACTGGTCAAAT
TTTCCACGCCTCAGGCTCGTCTCAAAAATGTTAAGTGCAGGAACCCATGTCCCAACCAAT
ATTTCAGCACCAGCAGCAGCAAGAGATTTGGCTATGGCCCAACCATATCCATTATCATCA
GCAATACCAGCAATGAAAGCCCTTTTCCCTCTCAAATCAATAGGAAGTCCAGAAGAAGCG
TTGTTCTGGCTGGATTCAGACATTGCCTTTGTTGAAAAGGAAAAACTCTTTTTAGAAGTT
GGAAGAGAACTGTTGTTTCTCAAACATCCGAGGTTCGATAGAGGACGAGTGCAAGCAAGT
TTGTCCCATGATGCGTTCCTGGGATTGGCACCGACAATGCAGGTCCCTGCTTTAAAAACT
TTGCTAGAGATGCTTGGCCTTATTGTAGCAAATTGCAAGCTTGAAGCTGCCGTC

QA 3 596 3 596
DS 

RD RR2C186TF 662 0 0
G
AAATCTTTTCTCACACATTCAGCAGCTTCCTGTACTGTCCAGTTTGATGATCCAGCATAT
CGCTTATTCGCTTTCACATCCTCAGGCACATCTTCAGGATTGTCAAACACAGCATCCAAA
GGATAGACCTTTTTAACCTCCATCAATGACCCGTCAGGCAGCACGCGTGACTGGTCAAAT
TTTCCACGTCTCAGGCTCGTCTCAAAAATGTTAAGTGCAGGAACCCATGTCCCAACCAAT
ATTTCAGCACCAGCAGCAGCAAGAGATTTGGCTATGGCCCAACCATATCCATTATCATCA
GCAATACCAGCAATGAAAGCCCTTTTCCCTCTCAAATCAATAGGAAGTCCAGAAGAAGCG
TTGTTCTGGCTGGATTCAGACATTGCCTTTGTTGAAAAGGAAAAACTCTTTTTAGAAGTT
GGAAGAGAACTGTTGTTTCTCAAACATCCGAGGTTCGATAGAGGACGAGTGCAAGCAAGT
TTGTCCCATGATGCGTTCCTGGGATTGGCACCGACAATGCAGGTCCCTGCTTTAAAAACT
TTGCTAGAGATGCTTGGCCTTATTGTAGCAAATTGCAAGCTTGAAGCGGCCGTCGCCGCC
ATTCTCACAACCTTTTTAATGTTTTTTGAGAGAGCCTAGAGAGAGAGAAAGTGGGGAGTC
C

QA 2 662 2 662
DS 



AS 1 18

CO CL144Contig1 490 18 18 U
GGACAAAAAAAAAAACACACTAAAAATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATT
CAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAG
CTCCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTGGTAGCA
TCTGGGGCCGTTGAATATTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTC
ATACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAG
CTAGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTC
TGACTTTCTTCAATTGTATTTAAGAATTTTATAAATGTTACATAAAATGAGAATATACCC
ATTTAAGACG


BQ
50 50 0 0 50 15 65 75 85 85 85 85 85 85 85 85 95 95 95 95 95 95 95 95 35 5 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 15 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 65 95 95 50 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 45 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 5 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 45 95 95 95 95 95 65 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 10 10 97 97 97 97 97 
97 97 97 60 60 97 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 20 85 50 97 60 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 
97 97 97 70 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 10 97 50 97 97 50 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 15 95 95 95 95 95 95 95 65 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 60 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 70 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR2CQ83TF U 4
AF RR2GM95TF U 208
AF RR2H925TF U 2
AF RR2FI96JQ C 15
AF RR2FI96TF U 15
AF RR2FW69JQ C 1
AF RR2FW69TF U 1
AF RR2GA57JQ C 1
AF RR2GA57TF U 1
AF RR2BF64TF U 2
AF RR2H925JQ C 2
AF RR2BW40TF U 2
AF RR2FX95JQ C 1
AF RR2FX95TF U 1
AF RR2CS39JQ C 1
AF RR2CS39TF U 1
AF RR2GW64JQ C 1
AF RR2GW64TF U 1
BS 1 16 RR2FW69TF
BS 17 24 RR2FI96TF
BS 25 25 RR2FW69TF
BS 26 59 RR2FI96TF
BS 60 60 RR2H925TF
BS 61 116 RR2FI96TF
BS 117 117 RR2FW69TF
BS 118 119 RR2FI96TF
BS 120 120 RR2FW69TF
BS 121 303 RR2FI96TF
BS 304 304 RR2FW69TF
BS 305 309 RR2FI96TF
BS 310 310 RR2FW69TF
BS 311 411 RR2FI96TF
BS 412 412 RR2FW69TF
BS 413 427 RR2FI96TF
BS 428 489 RR2CS39TF
BS 490 490 RR2GW64JQ

RD RR2CQ83TF 343 0 0
GGAC
AAAAAAAACACACTAAAATTTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATTCAAAGTT
GCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCTCAA
AGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTATGGTTGGTGTTGCAGCTCCACT
ACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTTTCTGGTAGCATCTGGGG
CCGTTGAATATTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTC
ATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATCATTCCTATTC

QA 5 343 5 343
DS 

RD RR2GM95TF 205 0 0
AGCA
GAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATCTAAGGGCGTTGAATTTTTCTGAAGAGAAT
TTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAA
TAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAGCTAGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTT
CTTTGAAAGTTCAATAAATAG

QA 5 205 5 205
DS 

RD RR2H925TF 402 0 0
GGAC
AAAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGACATTCAAAG
TTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCTC
AAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCCA
CTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCAGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATCTAA
GGGCGTTGAATTTTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACT
TCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAGCTAGT
ATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTC

QA 5 402 5 402
DS 

RD RR2FI96JQ 413 0 0
GG
ACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAAGTTGCTTTATTT
TGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGACATCCCTCAAAGAAAACCT
AAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCCACTACACAATGC
CGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTGGTAGCATCTGGGGCCGTTGAAT
ATTTTTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATATTTCATCAATTTA
AATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAGCTAGTATTATGTACTA
AATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATATTTATTTTCTGACTTT

QA 3 413 3 413
DS 

RD RR2FI96TF 413 0 0
GG
ACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAAGTTGCTTTATTT
TGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGACATCCCTCAAAGAAAACCT
AAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCCACTACACAATGC
CGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTGGTAGCATCTGGGGCCGTTGAAT
ATTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATATTTCATCAATTTA
AATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAGCTAGTATTATGTACTA
AATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATATTTATTTTCTGACTTT

QA 3 413 3 413
DS 

RD RR2FW69JQ 425 0 0
GGACAAAAAAAAAAACACACTAAAAATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATC
CAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTTTAAGGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAG
CTCCACTACACAATGCCGAAGCACTAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCA
TCTGGGGCCGTTGAATTTCTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTC
ATACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAACTCTTATTCCACAGGAGGAGCAG
CTAGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTC
TGACT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR2FW69TF 425 0 0
GGACAAAAAAAAAAACACACTAAAAATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATC
CAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAGGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAG
CTCCACTACACAATGCCGAAGCACTAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCA
TCTGGGGCCGTTGAATTTCTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTC
ATACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAACTCTTATTCCACAGGAGGAGCAG
CTAGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTC
TGACT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR2GA57JQ 425 0 0
GGACAAAAAAAAAAACACACTAAAAATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATC
CAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAGGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAG
CTCCACTACACAATGCCGAAGCACTAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCA
TCTGGGGCCGTTGAATTTCTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTC
ATACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAACTCTTATTCCACAGGAGGAGCAG
CTAGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTC
TGACT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR2GA57TF 425 0 0
GGACAAAAAAAAAAACACACTAAAAATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATC
CAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAGGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAG
CTCCACTACACAATGCCGAAGCACTAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCA
TCTGGGGCCGTTGAATTTCTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTC
ATACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAACTCTTATTCCACAGGAGGAGCAG
CTAGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTC
TGACT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR2BF64TF 424 0 0
GGAC
AAAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAAG
TTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGGATGTGCCAGCCCTC
AAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCCA
CTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATCTGG
GGCCGTTGAATAATTATGAAGAGAATTTCCATCATTATATGTTCCAAATATTTGCATACT
TCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAGCTAGT
ATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTGACT

QA 5 424 5 424
DS 

RD RR2H925JQ 424 0 0
GGAC
AAAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGACATTCAAAG
TTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCTC
AAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCCA
CTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCAGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATCTAA
GGGCGTTGAATTTTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACT
TCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAGCTAGT
ATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTGAC
C

QA 5 423 5 423
DS 

RD RR2BW40TF 424 0 0
GGCTAC
AAAAAAAACACACTAAAATTTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATTCAAAGTT
GCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCTCAA
AGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTATGGTTGGTGTTGCAGCTCCATT
ACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTGGTAGCATCTGGGG
CCGTTGAATATTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTC
ATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATCATTCCTATTCCACAGAAGGAGCAGCTAGTAT
TATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTGACT

QA 7 424 7 424
DS 

RD RR2FX95JQ 425 0 0
GGCTACAAAAAAAAACACACTAAAATTTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATT
CAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTATGGTTGGTGTTGCAG
CTCCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTGGTAGCA
TCTGGGGCCGTTGAATATTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTC
ATACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATCATTCCTATTCCACAGAAGGAGCAG
CTAGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTC
TGAC
C

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR2FX95TF 425 0 0
GGCTACAAAAAAAAACACACTAAAATTTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATT
CAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTATGGTTGGTGTTGCAG
CTCCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTGGTAGCA
TCTGGGGCCGTTGAATATTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTC
ATACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATCATTCCTATTCCACAGAAGGAGCAG
CTAGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTC
TGAC
C

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR2CS39JQ 489 0 0
GGCTACAAAAAAAAACACACTAAAATTTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATT
CAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTCGTCTTCATGAATGTGCCAC
CCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTATGGTTGGTGTTGCAG
CTCCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTGGTAGCA
TCTGGGGCCGTTGAATATTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTC
ATACTTCATAAATTTAAATTTGTATAATAAATAATCATTCCTATTCCACAGAAGGAGCAG
CTAGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTC
TGACTTTCTTCAATTGTATTTAAGAATTTTATAAATGTTACATAAAATGAGAATATACCC
ATTTAAGAC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2CS39TF 489 0 0
GGCTACAAAAAAAAACACACTAAAATTTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATT
CAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTCGTCTTCATGAATGTGCCAG
CCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTATGGTTGGTGTTGCAG
CTCCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTGGTAGCA
TCTGGGGCCGTTGAATATTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTC
ATACTTCATAAATTTAAATTTGTATAATAAATAATCATTCCTATTCCACAGAAGGAGCAG
CTAGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTC
TGACTTTCTTCAATTGTATTTAAGAATTTTATAAATGTTACATAAAATGAGAATATACCC
ATTTAAGAC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2GW64JQ 490 0 0
AGGGCTAC
AAAAAAACACACTAAAATTTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATTCAAAGTTG
CTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCTCAAA
GAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTATGGTTGGTGTTGCAGCTCCACTA
CACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTGGTAGCATCTGGGGC
CGTTGAATATTTTTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTCA
TAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATCATTCCTATTCCACAGAAGGAGCATCTAGTATT
ATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTGACTTTC
TTCAATTGTATTTAAGAATTTTATAAATGTTACATAAAATGAGAATATACCCATTTAAGA
CG

QA 9 490 9 490
DS 

RD RR2GW64TF 490 0 0
AGGGCTAC
AAAAAAACACACTAAAATTTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATTCAAAGTTG
CTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCTCAAA
GAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTATGGTTGGTGTTGCAGCTCCACTA
CACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTGGTAGCATCTGGGGC
CGTTGAATATTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTCA
TAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATCATTCCTATTCCACAGAAGGAGCATCTAGTATT
ATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTGACTTTC
TTCAATTGTATTTAAGAATTTTATAAATGTTACATAAAATGAGAATATACCCATTTAAGA
C
G

QA 9 489 9 489
DS 



AS 1 16

CO CL145Contig1 1252 16 17 U
TTTTTACCGTTTTGTAATTTAATTATAAATGGCTCCAGGAACTCTAACCGAGCTTGCCGG
AGAGACTAAGCTCAACTCTAAGTTCGTCCGGGACGAGGATGAACGTCCCAAGGTTGCCTA
CAATGAGTTCAGCACGGAGATCCCCGTAATCTCTCTTGCCGGAATCGACGATGTTGGTGG
GAAAAGAGGAGAGATCTGTCGTCAGATCGTTGAAGCTTGTGAGAACTGGGGTGTTTTTCA
GGTGGTCGATCATGGAGTGGATACTAGTTTGGTGGCGGATATGACTCGTCTCGCTCGTGA
CTTTTTCGCTCTAACTCCTGAGGAGAAACTGAAGTTCGACATGTCCGGTGGTAAAAAGGG
AGGATTCATTGTCTCTAGTCATCTTCAGGGAGAGTCTGTTCAAGATTGGAGAGAGATCGT
GACGTATTTCTCGTACCCGGTGAGAAACAGAGACTACTCACGGTGGCCGACTAAGCCGGA
AGGGTGGGTGAAAGTGACGGAGGAGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCTTGTAAACT
TCTTGAGGTTTTGTCTGAAGCTATGGGGCTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGT
CGATATGGACCAGAAAATAGTTGTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAGCCTGATCTAAC
CCTCGGACTCAAGCGTCACACTGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAAGACCAAGT
CGGTGGTTTACAAGCCACACGAGACGATGGGAAGACATGGATTACGGTTCAGCCTGTTGA
AGGAGCTTTTGTCGTTAATCTCGGCGACCATGGCCACTATCTGAGCAACGGGAGGTTCAA
GAACGCGGATCACCAGGCGGTGGTGAACTCCAACTCGAGCAGATTATCAATAGCCACGTT
CCAGAATCCGGCGCCGGAAGCAACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAAGGAGAGAAGCC
GATCCTGGAGGAGCCTATTACGTTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATGAGTAGAGATAT
TGAGCTGGCTCGCCTCAAGAAGCTGGCGAAAGAAGAACATGACCACAAGGAAGCTGCCAA
GCCGCTCGACCAAATCATCGCTTAGACTCCTTGTGTTGGCCCCTTGCTATTGTGTTGGTT
CGGTTGTGTAAGTTGGTACTGAAATTAAGTTATGTCATGTTGGGTGAAATTGTGTTGTAT
CTCTTTTCTATCATATAGAAATAATGATAATAATGTCTATGACGCAAACACC


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 5 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G783TF U 1
AF RR2DA74TF U 1
AF RR2DI66TF U 1
AF RR2ES57TF U 1
AF RR2EW82TF U 1
AF RR2FP53TF U 1
AF RR2GY19TF U 1
AF RR2GU86TF U 363
AF RR2GU85TF U 363
AF RR2ES57JQ C 911
AF RR2EW82JQ C 482
AF RR2F979JQ C 1007
AF RR2F979TF U 1007
AF RR2G783JQ C 549
AF RR2FP53JQ C 503
AF RR2GY19JQ C 658
BS 1 80 RR2DA74TF
BS 81 81 RR2DI66TF
BS 82 109 RR2DA74TF
BS 110 110 RR2DI66TF
BS 111 419 RR2DA74TF
BS 420 420 RR2DI66TF
BS 421 532 RR2DA74TF
BS 533 555 RR2DI66TF
BS 556 556 RR2ES57TF
BS 557 609 RR2DI66TF
BS 610 658 RR2ES57TF
BS 659 711 RR2EW82TF
BS 712 809 RR2GU85TF
BS 810 810 RR2EW82JQ
BS 811 1035 RR2GU85TF
BS 1036 1245 RR2F979TF
BS 1246 1252 RR2EW82JQ

RD RR2G783TF 345 0 0
TTTTTACCGTTTTGTAATTTAATTATAAATGGCTCCAGGAACTCTAACCGAGCTTGCCGG
AGAGACTAAGCCCAACTCTAAGTTCGTCCGGGACGAGGATGAACGTCCCAAGGTTGCCTA
CAATGAGTTCAGCACGGAGATCCCCGTAATCTCTCTTGCCGGAATCGACGATGTTGGTGG
GAAAAGAGGAGGGATCTGTCGTCAGATCGTTGAAGCTTGTGAGAACTGGGGTGCTTTTCA
GGTGGTCGATCATGGAGTGGATACTAGTTTGGTGGCGGATATGACTCGTCTCGCTCGTGA
CTTTTTCGCTCTAACTCCTGAGGAGAAACTGAAGTTCCACATGTC

QA 1 345 1 345
DS 

RD RR2DA74TF 551 0 0
TTTTTACCGTTTTGTAATTTAATTATAAATGGCTCCAGGAACTCTAACCGAGCTTGCCGG
AGAGACTAAGCTCAACTCTAGGTTCGTCCGGGACGAGGATGAACGTCCCGAGGTTGCCTA
CAATGAGTTCAGCACGGAGATCCCCGTAATCTCTCTTGCCGGAATCGACGATGTTGGTGG
GAAAAGAGGAGAGATCTGTCGTCAGATCGTTGAAGCTTGTGAGAACTGGGGTGTTTTTCA
GGTGGTCGATCATGGAGTGGATACTAGTTTGGTGGCGGATATGACTCGTCTCGCTCGTGA
CTTTTTCGCTCTAACTCCTGAGGAGAAACTGAAGTTCGACATGTCCGGTGGTAAAAAGGG
AGGATTCATTGTCTCTAGTCATCTTCAGGGAGAGTCTGTTCAAGATTGGAGAGAGATCGC
GACGTATTTCTCGTACCCGGTGAGAAACAGAGACTACTCACGGTGGCCGACTAAGCCGGA
AGGGTGGGTGAAAGTGACGGAGGAGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCT
GGCGAAAGAAGAACATGAC

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2DI66TF 609 0 0
TTTTTACCGTTTTGTAATTTAATTATAAATGGCTCCAGGAACTCTAACCGAGCTTGCCGG
AGAGACTAAGCTCAACTCTAAGTTCGTCCGGGACGAGGATGAACGTCCCAAGGTTGCCTA
CAATGAGTTCAGCACGGAGATCCCCGTAATCTCTCTTGCCGGAATCGACGATGTTGGTGG
GAAAAGAGGAGAGATCTGTCGTCAGATCGTTGAAGCTTGTGAGAACTGGGGTGTTTTTCA
GGTGGTCGATCATGGAGTGGATACTGGTTTGGTGGCGGATATGACTCGTC*CGCTCGTGA
CTTTTTCGCTCTAACTCCTGAGGAGAAACTGAAGTTCGACATGTCCGGTGGTAAAAAGGG
AGGATTCATTGTCTCTAGTCATCTTCAGGGAGAGTCTGTTCAAGATTGGAGAGAGATCGT
GACGTATTTCTCGTACCCGGTGAGAAACAGAGACTACTCACGGTGGCCGACTAAGCCGGA
AGGGTGGGTGAAAGTGACGGAGGAGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCTTGTAAACT
TCTTGAGGTTTTGTCCGAAGCTATGGGGCTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGT
CGATATGGA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2ES57TF 658 0 0
TTTTTACCGTTTTGTAATTTAATTATAAATGGCTCCAGGAACTCTAACCGAGCTTGCCGG
AGAGACTAAGCTCAACTCTAAGTTCGTCCGGGACGAGGATGAACGTCCCAAGGTTGCCTA
CAATGAGTTCAGCACGGAGATCCCCGTAATCTCTCTTGCCGGAATCGACGATGTTGGTGG
GAAAAGAGGAGAGATCTGTCGTCAGATCGTTGAAGCTTGTGAGAACTGGGGTGTTTTTCA
GGTGGTCGATCATGGAGTGGATACTAGTTTGGTGGCGGATATGACTCGTCTCGCTCGTGA
CTTCTTCGCTTTATCTCCTGAGGAGAAACTGAAGTTCGACATGTCCGGTGGTAAAAAGGG
AGGATTCATTGTCTCTAGTCATCTTCAGGGAGAGTCTGTTCAAGATTGGAGAGAGATCGT
GACGTATTTCTCGTACCCGGTGAGAAACAGAGACTACTCACGGTGGCCGACTAAGCCGGA
AGGGTGGGTGAAAGTGACGGAGGAGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCTTGTAAACT
TCTTGAGGTTTTGTCTGAAGCTATGGGGCTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGT
CGATATGGACCAGAAAATAGTTGTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAGCCTGATCTA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2EW82TF 716 0 0
TTTTTACCGTTTTGTAATTTAATTATAAATGGCTCCAGGAACTCTAACCGAGCTTGCCGG
AGAGACTAAGCTCAACTCTAAGTTCGTCCGGGACGAGGATGAACGTCCCAAGGTAGCCTA
CAATGAGTTCAGCACGGAGATCCCCGTAATCTCTCTTGCCGGAATCGACGATGTTGGTGG
GAAAAGAGGAGAGATCTGTCGTCAGATCGTTGAAGCTTGTGAGAACTGGGGTGTTTTTCA
GGTGGTCGATCATGGAGTGGATACTAGTTTGGTGGCGGATATGACTCGTCTCGCTCGTGA
CTTCTTCGCTTTATCTCCTGAGGAGAAACTGAAGTTCGACATGTCCGGTGGTAAAAAGGG
AGGATTCATTGTCTCTAGTCATCTTCAGGGAGAGTCTGTTCAAGATTGGAGAGAGATCGT
GACGTATTTCTCGTACCCGGTGAGAAACAGAGACTACTCACGGTGGCCGACTAAGCCGGA
AGGGTGGGTGAAAGTGACGGAGGAGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCTTGTAAACT
TCTTGAGGTTTTGTCTGAAGCTATGGGGCTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGT
CGATATGGACCAGAAAATAGTTGTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAGCCTGATCTAAC
CCTCGGACTCAAGCGTCACACTGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCA
GACCA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2FP53TF 671 0 0
TTTTTACCGTTTTGTAATTTAATTATAAATGGCTCCAGGAACTCTAACCGAGCTTGCCGG
AGAGACTAAGCTCAACTCTAAGTTCGTCCGGGACGAGGATGAACGTCCCAAGGTTGCCTA
CAATGAGTTCAGCACGGAGATCCCCGTAATCTCTCTTGCCGGAATCGACGATGTTGGTGG
GAAAAGAGGAGAGATCTGTCGTCAGATCGTTGAAGCTTGTGGGAACTGGGGTGTTTTTCA
GGTGGTCGATCATGGAGTGGATACTAGTTTGGTGGCGGATATGACTCGTCTCGCTCGTGA
CTTTTTCGCTCTAACTCCTGAGGAGAAACTGAAGTTCGACATGTCCGGTGGTAAAAAGGG
AGGATTCATTGTCTCTAGTCATCTTCAGGGAGAGTCTGTTCAAGATTGGAGAGAGATCGT
GACGTATTTCTCGTACCCGGTGAGAAACAGAGACTACTCACGGTGGCCGACTAAGCCGGA
AGGGTGGGTGAAAGTGACGGAGGAGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCTTGTAAACT
TCTTGAGGTTTTGTCTGAAGCTATGGGGCTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGT
CGATATGGACCAGAAAATAGTTGTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAGCCTGATCTAAC
CCTCGGACTCA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2GY19TF 709 0 0
TTTTTACCGTTTTGTAATTTAATTATAAATGGCTCCAGGAACTCTAACCGAGCTTGCCGG
AGAGACTAAGCTCAACTCTAAGTTCGTCCGGGACGAGGATGAACGTCCCAAGGTTGCCTA
CAATGAGTTCAGCACGGAGATCCCCGTAATCTCTCTTGCCGGAATCGACGATGTTGGTGG
GAAAAGAGGAGAGATCTGTCGTCAGATCGTTGAAGCTTGTGAGAACTGGGGTGTTTTTCA
GGTGGTCGATCATGGAGTGGATACTAGTTTGGTGGCGGATATGACTCGTCTCGCTCGTGA
CTTCTTCGCTTTATCTCCTGAGGAGAAACTGAAGTTCGACATGTCCGGTGGTAAAAAGGG
AGGATTCATTGTCTCTAGTCATCTTCAGGGAGAGTCTGTTCAAGATTGGAGAGAGATCGT
GACGTATTTCTCGTACCCGGTGAGAAACAGAGACTACTCACGGTGGCCGACTAAGCCGGA
AGGGTGGGTGAAAGTGATGGAGGAGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCTTGTAAACT
TCTTGAGGTTTTGTCTGAAGCTATGGGGCTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGT
CGATATGGACCAGAAAATAGTTGTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAGCCTGATCTAAC
CCTCGGACTCAAGTGTCACACTGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2GU86TF 490 0 0
GATTCATTGTCTCTAGTCATCTTCAGGGAGAGTCTGTTCAAGATTGGAGAGAGATCGTGA
CGTATTTCTCGTACCCGGTGAGAAACAGAGACTACTCACGGTGGCCGACTAAGCCGGAAG
GGTGGGTGAAAGTGACGGAGGGGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCTTGTAAACTTC
TTGAGGTTTTGTCTGAAGCTATGGGGCTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGTCG
ATATGGACCAGAAAATAGTTGTTAACTATTACCCAAAATGTCCTCAGCCTGATCTAACCC
TCGGACTCAAGCGTCACACTGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAAGACCAAGTCG
GTGGTTTACAAGCCACACGAGACGATGGGAAGACATGGATTACGGTTCAGCCTGTTGAAG
GAGCTTTTGTCGTTAATCTCGGCGACCGTGGCCACTATCTGAGCAACGGGAGGTTCAAGA
ACGCGGATCA

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR2GU85TF 673 0 0
GATTCATTGTCTCTAGTCATCTTCAGGGAGAGTCTGTTCAAGATTGGAGAGAGATCGTGA
CGTATTTCTCGTACCCGGTGAGAAACAGAGACTACTCACGGTGGCCGACTAAGCCGGAAG
GGTGGGTGAAAGTGACGGAGGGGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCTTGTAAACTTC
TTGAGGTTTTGTCTGAAGCTATGGGGCTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGTCG
ATATGGACCAGAAAATAGTTGTTAACTATTACCCAAAATGTCCTCAGCCTGATCTAACCC
TCGGACTCAAGCGTCACACTGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAAGACCAAGTCG
GTGGTTTACAAGCCACACGAGACGATGGGAAGACATGGATTACGGTTCAGCCTGTTGAAG
GAGCTTTTGTCGTTAATCTCGGCGACCGTGGCCACTATCTGAGCAACGGGAGGTTCAAGA
ACGCGGATCACCAGGCGGTGGTGAACTCCAACTCGAGCAGATTATCAATAGCCACGTTCC
AGAATCCGGCGCCGGAAGCAACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAAGGAGAGAAGCCGA
TCCTGGAGGAGCCTATTACGTTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATGAGTAGAGATATTG
AGCTGGCTCGCCT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2ES57JQ 289 0 0
GCGCCGGAAGCAACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAAGGAGAGAAGCCGATCCTGGAG
GAGCCTATTACGTTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATGAGTAGAGATATTGAGCTGGCT
CGCCTCAAGAAGCTGGCGAAAGAAGAACATGACCACAAGGAAGCTGCCAAGCCGCTCGAC
CAAATCATCGCCTAGACTCCTTGTGTTGGCCCCTTGCTATTGTGTTGGTTCGGTTGTGTA
AGTTGGTACTGAAATTAAGTTATGTCATGTTGGGTGAAATTGTGTTGTA

QA 1 289 1 289
DS 

RD RR2EW82JQ 771 0 0
GGGTGGGTGAAAGTGACGGAGGAGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCTTGTAAACTT
CTTGAGGTTTTGTCTGAAGCTATGGGGCTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGTC
GATATGGACCAGAAAATAGTTGTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAGCCTGATCTAACC
CTCGGACTCAAGCGTCACACTGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAAGACCAAGTC
GGTAGTTTACAAGCCACACGAGACGATGGGAAGACATGGATTACGGTTCAGCCTGTTGAA
GGAGCTTTTGTCGTTAATCTCGGCGACCATGGCCACTATCTGAGCAACGGGAGGTTCAAG
AACGCGGATCACCAGGCGGTGGTGAACTCCAACTCGAGCAGATTATCAATAGCCACGTTC
CAGAATCCGGCGCCGGAAGCAACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAAGGAGAGAAGCCG
ATCCTGGAGGAGCCTATTACGTTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATGAGTAGAGATATT
GAGCTGGCTCGCCTCAAGAAGCTGGCGAAAGAAGAACATGACCACAAGGAAGCTGCCAAG
CCGCTCGACCAAATCATCGCTTAGACTCCTTGTGTTGGCCCCTTGCTATTGTGTTGGTTC
GGTTGTGTAAGTTGGTACTGAAATTAAGTTATGTCATGTTGGGTGAAATTGTGTTGTATC
TCTTTTCTATCATATAGAAATAATGATAATAATGTCTATGACGCAAACACC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2F979JQ 239 0 0
G
TGAGTAGAGATATTGAGCTGGCTCGCCTCAAGAAGCTGGCGAAAGAAGAACATGACCACA
AGGAAGCTGCCAAGCCGCTCGACCAAATCATCGCTTAGACTCCTTGTGTTGGCCCCTTGC
TATTGTGTTGGTTCGGTTGTGTAAGTTGGTACTGAAATTAAGTTATGTCATGTTGGGTGA
AATTGTGTTGTATCTCTTTTCTATCATATAGAAATAATGATAATAATGTCTATGACGC

QA 2 239 2 239
DS 

RD RR2F979TF 239 0 0
G
TGAGTAGAGATATTGAGCTGGCTCGCCTCAAGAAGCTGGCGAAAGAAGAACATGACCACA
AGGAAGCTGCCAAGCCGCTCGACCAAATCATCGCTTAGACTCCTTGTGTTGGCCCCTTGC
TATTGTGTTGGTTCGGTTGTGTAAGTTGGTACTGAAATTAAGTTATGTCATGTTGGGTGA
AATTGTGTTGTATCTCTTTTCTATCATATAGAAATAATGATAATAATGTCTATGACGC

QA 2 239 2 239
DS 

RD RR2G783JQ 704 0 0
TTTTGTCTGAAGCTATGGGGCTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGTCGATATGG
ACCAGAAAATAGTTGTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAGCCTGATCTAACCCTCGGAC
TCAAGCGTCACACTGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAAGACCAAGTCGGTGGTT
TACAAGCCACACGAGACGATGGGAAGACATGGATTACGGTTCAGCCTGTTGGAGGAGCTT
TTGTCGTTAATCTCGGCGACCATGGCCACTATCTGAGCAACGGGAGGTTCAAGAACGCGG
ATCACCAGGCGGTGGTGAACTCCAACTCGAGCAGATTATCAATAGCCACGTTCCAGAATC
CGGCGCCGGAAGCAACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAAGGAGAGAAGCCGATCCTGG
AGGAGCCTATTACGTTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATGAGTAGAGATATTGAGCTGG
CTCGCCTCAAGAAGCTGGCGAAAGAAGAACATGACCACAAGGAAGCTGCCAAGCCGCTCG
ACCAAATCATCGCTTAGACTCCTTGTGTTGGCCCCTTGCTATTGTGTTGGTTCGGTTGTG
TAAGTTGGTACTGAAATTAAGTTATGTCATGTTGGGTGAAATTGTGTTGTATCTCTTTTC
TATCATATAGAAATAATGATAATAATGTCTATGACGC
AAACACC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2FP53JQ 743 0 0
GAGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCTTGTAAACTTCTTGAGGTTTTGTCTGAAGCT
ATGGGGCTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGTCGATATGGACCAGAAAATAGTT
GTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAGCCTGATCTAACCCTCGGACTCAAGCGTCACACT
GACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAAGACCAAGTCGGTGGTTTACAAGCCACACGA
GACGATGGGAAGACATGGATTACGGTTCAGCCTGTTGAAGGAGCTTTTGTCGTTAATCTC
GGCGACCATGGCCACTATCTGAGCAACGGGAGGTTCAAGAACGCGGATCACCAGGCGGTG
GTGAACTCCAACTCGAGCAGATTATCAATAGCCACGTTCCAGAATCCGGCGCCGGAAGCA
ACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAAGGAGAGAAGCCGATCCTGGAGGAGCCTATTACG
TTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATGAGTAGAGATATTGAGCTGGCTCGCCTCAAGAAG
CTGGCGAAAGAAGAACATGACCACAAGGAAGCTGCCAAGCCGCTCGACCAAATCATCGCT
TAGACTCCTTGTGTTGGCCCCTTGCTATTGTGTTGGTTCGGTTGTGTAAGTTGGTACTGA
AATTAAGTTATGTCATGTTGGGTGAAATTGTGTTGTATCTCTTTTCTATCATATAGAAAT
AATGATAATAATGTCTATGACGC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2GY19JQ 588 0 0
AACCCTCGGACTCAAGTGTCACACTGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAAGACCA
AGTCGGTGGTTTACAAGCCACACGAGACGATGGGAAGACATGGATTACGGTTCAGCCTGT
TGAAGGAGCTTTTGTCGTTAATCTCGGCGACCATGGCCACTATCTGAGCAACGGGAGGTT
CAAGAACGCGGATCACCAGGCGGTGGTGAACTCCAACTCGAGCAGATTATCAATAGCCAC
GTTCCAGAATCCGGCGCCGGAAGCAACCGTGTATCCTCTTAAAGTGAGAGAAGGAGAGAA
GCCGATCCTGGAGGAGCCTATTACGTTTGCGGAGATGTATAAGAGAAAGATGAGTAGAGA
TATTGAGCTGGCTCGCCTCAAGAAGCTGGCGAAAGAAGAATATGACCACAAGGAAGCTGC
CAAGCCGCTCGACCAAATCATCGCTTAGACTCCTTGTGTTGGCCCCTTGCTATTGTGTTG
GTTCGGTTGTGTAAGTTGGTACTGAAATTAAGTTATGTCATGTTGGGTGAAATTGTGTTG
TATCTCTTTTCTATCATATAGAAATAATGATAATAATGTCTATGACGC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 2 15

CO CL146Contig1 942 3 2 U
AATGCAAGTTTGATTTTCATCTCTTTTATTGAACCAAACATCATTGGAGTTGTAGATAAT
ATAAGAATATCAACTGAAATCTACATACAGTTTTGTAACCAACAGAGAGCATATAAAAAG
AGTAACTGAAGATTTGTTTATTGTCTCTTGTCAAATCTGAAGAATCTTCAAAGAGTCTGC
AACAACTTGGAGCTGCTTCTTCACTTTCCTCCATCTTCTCTCGTTTGCTCCAACTATGAG
TGTATAGTATCTGTTATTTCCAACAGCCACAGTTGCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATGGG
AGTTCTTAGTCCATACTCAAATGTGTAATAGCTCCTTCCATCCTCCACCCTCTCTTTCAT
ATCATAGATGGTAGCTACTTGGTTTGGTGCTGCAAACTTATGCTTCACTAGATCATAAAC
CACCTCATCCATTGGACCCACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGAC
ACGAACATTCTGCAGCTGCAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCTGAAGTC
AAATTCCCTCCAGTCTGATGGGTAATAATACGAATAACCATCTTCTCTATCCACAAAAGC
AGAGTAGCTTTTTGGTACCTCTTCAGCGAGAAGCAAAGTTGCTGGAACTGAAGTTGCCAA
TAAAGTTCCTACTCCCACAAGAGCTTGCCTTCTCTTCCAGTTGCTTCCATTTCTATTCTC
CGAGGAGTCAAGACTGCTGCCGGATGAAAGTGAACAACAAGCTCTGAGTGATGGGTTTGG
ACAGGGAATATCTGCCTTGTGGGAGATTGTTGGTGAAACACAAAAGCGGATTGACAGCGA
GAGACTGCCATAATGGCTACCACTTGCAAGTCTATAGATGATGATCAATGTTCATTGCCT
TAAGTTTTGTATGTTCGGATAAGAGACTTCTGTTTTTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI74JQ U 59
AF RR2CT52JQ U 1
AF RR2CT52TF C 215
BS 1 737 RR2CT52JQ
BS 738 942 RR2CT52TF

RD RR2DI74JQ 545 0 0
ATATAAGAATATCAACTGAAATCTACATACAGTTTTGTAACCAACAGAGAGCATATAAAA
AGAGTAACTTAAGATTTGTTTATTGTCTCTTGTCAAATCTGAAGAATCTTCAAAGAGTCT
GCAACAACTTGGAGCTGCTTCTTCACTTTCCTCCATCTTCTCTCGTTTGCTCCAACTATG
AGTGTATAGTATCTGTTATTTCCAACAGCCACAGTTGCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATG
GGAGTTCTTAGTCCATACTCAAATGTGTAATAGCTCCTTCCATCCTCCACCCTCTCTTTC
ATATCATAGATGGTAGCTACTTGGTTTGGTGCTGCAAACTTATGCTTCACTAGATCATAA
ACCACCTCATCCATTGGACCCACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTG
ACACGAACATTCTGCAGCTGCAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCTGAAG
TCAAATTCCCTCCAGTCTGATGGGTAATAATACGAATAACCATCTTCTCTATCCACAAAA
GCAGA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2CT52JQ 737 0 0
AATGCAAGTTTGATTTTCATCTCTTTTATTGAACCAAACATCATTGGAGTTGTAGATAAT
ATAAGAATATCAACTGAAATCTACATACAGTTTTGTAACCAACAGAGAGCATATAAAAAG
AGTAACTGAAGATTTGTTTATTGTCTCTTGTCAAATCTGAAGAATCTTCAAAGAGTCTGC
AACAACTTGGAGCTGCTTCTTCACTTTCCTCCATCTTCTCTCGTTTGCTCCAACTATGAG
TGTATAGTATCTGTTATTTCCAACAGCCACAGTTGCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATGGG
AGTTCTTAGTCCATACTCAAATGTGTAATAGCTCCTTCCATCCTCCACCCTCTCTTTCAT
ATCATAGATGGTAGCTACTTGGTTTGGTGCTGCAAACTTATGCTTCACTAGATCATAAAC
CACCTCATCCATTGGACCCACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGAC
ACGAACATTCTGCAGCTGCAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCTGAAGTC
AAATTCCCTCCAGTCTGATGGGTAATAATACGAATAACCATCTTCTCTATCCACAAAAGC
AGAGTAGCTTTTTGGTACCTCTTCAGCGAGAAGCAAAGTTGCTGGAACTGAAGTTGCCAA
TAAAGTTCCTACTCCCACAAGAGCTTGCCTTCTCTTCCAGTTGCTTCCATTTCTATTCTC
CGAGGAGTCAAGACTGC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2CT52TF 728 0 0
CTTCTCTCGTT*GCTCCAACTATGAGTGTATAGTATCTGTTATTTCCAACAGCCACAGTT
GCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATGGGAGTTCTTAGTCCATACTCAAATGTGTAATAGCTC
CTTCCATCCTCCACCCTCTCTTTCATATCATAGATGGTAGCTACTTGGTTTGGTGCTGCA
AACTTATGCTTCACTAGATCATAAACCACCTCATCCATTGGACCCACTTCGCGGATGTCT
GTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGACACGAACATTCTGCAGCTGCAAATATCTATCCTTG
AAGGCTGAATCATGTGCCCTGAAGTCAAATTCCCTCCAGTCTGATGGGTAATAATACGAA
TAACCATCTTCTCTATCCACAAAAGCAGAGTAGCTTTTTGGTACCTCTTCAGCGAGAAGC
AAAGTTGCTGGAACTGAAGTTGCCAATAAAGTTCCTACTCCCACAAGAGCTTGCCTTCTC
TTCCAGTTGCTTCCATTTCTATTCTCCGAGGAGTCAAGACTGCTGCCGGATGAAAGTGAA
CAACAAGCTCTGAGTGATGGGTTTGGACAGGGAATATCTGCCTTGTGGGAGATTGTTGGT
GAAACACAAAAGCGGATTGACAGCGAGAGACTGCCATAATGGCTACCACTTGCAAGTCTA
TAGATGATGATCAATGTTCATTGCCTTAAGTTTTGTATGTTCGGATAAGAGACTTCTGTT
TTTTCCCC

QA 1 728 1 728
DS 



CO CL146Contig2 898 12 10 U
CGGTTGAAATTCCATCTCTATTATTGAACCAAAACATCATTGGAGTTGTAGAGAATATAA
GAATATCAACTGAAATCTACATACAGTTTTATAACCAACAGAGAGCATAGAAAAAAGAGT
AACAGAAGATTTGTTTATCGTCTCTTGTCAAATCTGAAGAATCTTCAAAGAGTCGGCAAC
AACTTGGAGCTGCTTCTTCACTTTCCTCCATCTTCTCTCGTTTGCTCCAACTATGAGTGT
GTAGTATCTGTTGTTTCCAACAGCCACAGTTGCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATGGGAGT
TCTTAGTCCATACTCAAATGTGTAGTAGCTCCTTCCATCCTCCACCCTCTCTTTCATATC
ATAAATGGTAGCTACTTGGTTTGGTGCTGCAAACTTATGCTTCACTAGATCGTAAACCAC
CTCATCCATTGGACCCACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGACACG
AACATTCTGCAGCTGCAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCTGAAGTCAAA
TTCCCTCCAGTCTGATGGGTAATAATACGAATAACCATCTTCTCTATCCACAAAAGCAGA
GTAGCTTTTAGGTACCTCTTCAGCAAGAAGCAAAGTTGCTGGAACTGAAGTTGCCAATAA
AGTTCCTACTCCCACAAGAGCTTGCCTTCTCTTCCAGTTGCTTCCATTTCTATTCTCCGA
GGAGTCAAGACTGCTGCCGGATGAAAGTGAACAACAAGCTCTGAGTGATGGGTTTGGACA
GGGAATATCTGTCTTGTGCGAGTTTGTTGGTGAAAAACAAAAGCGGATTGAGAGTGAAGA
GACTGCCATAGTGGCTACCACTTACAAGTCTATAGATGATCAATGTTCATTGCCTTCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 25 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 
35 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E362JQ U 2
AF RR2FE33JQ U 104
AF RR2H401JQB U 2
AF RR2CR53JQ U 16
AF RR2FE33TF C 389
AF RR2EM06JQ U 1
AF RR2AB07JQ U 2
AF RR2CR53TF C 102
AF RR2AB07TF C 135
AF RR2E362TF C 243
AF RR2EM06TF C 187
AF RR2H401TF C 206
BS 1 268 RR2EM06JQ
BS 269 269 RR2AB07JQ
BS 270 360 RR2EM06JQ
BS 361 361 RR2AB07JQ
BS 362 572 RR2EM06JQ
BS 573 573 RR2AB07JQ
BS 574 776 RR2EM06JQ
BS 777 778 RR2AB07JQ
BS 779 871 RR2CR53TF
BS 872 898 RR2AB07TF

RD RR2E362JQ 531 0 0
GA
TTGAAATTCCATCTCTATTATTGAACCAAAACATCATTGGAGTTGTAGAGAATATAAGAA
TATCAACTGAAATCTACATACAGTTTTATAACCAACAGAGAGCATAGAAAAAAGAGTAAC
AGAAGATTTGTTTATCGTCTCTTGTCAAATCTGAAGAATCTTCAAAGAGTCGGCAACAAC
TTGGAGCTGCTTCTTCACTTTCCTCCATCTTCTCTCGTTTGCTCCAACTATGAGTGTGTA
GTATCTGTTGTTTCCAACAGCCACAGTTGCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATGGGAGTTCT
TAGTCCATACTCAAATGTGTAGTAGCTCCTTCCATCCTCCACCCTCTCTCTCATATCATA
AATGGTAGCTACTTGGTTTGGTGCTGCAAACTTATGCTTCACTAGATCGTAAACCACCTC
ATCCATTGGACCCACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGACACGAAC
ATTCTGCAGCTGCAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCTG

QA 3 531 3 531
DS 

RD RR2FE33JQ 459 0 0
AGCATAGAAAAAAGAGTAACAGAAGATTTGTTTATCGTCTCTTGTCAAATCTGAAGAATC
TTCAAAGAGTCGGCAACAACTTGGAGCTGCCTCTTCACTTTCCTCCATCTTCTCTCGTTT
GCTCCAACTATGAGTGTGTAGTATCTGTTGTTTCCAACAGCCACAGTTGCAAAAGAAGTG
GTTGCATAGATGGGAGTTCTTAGTCCATACTCAAATGTGTAGTAGCTCCTTCCATCCTCC
ACCCTCTCTTTCATATCATAAACGGTAGCTACTTGGTTTGGTGCTGCAAACTTATGCTTC
ACTAGATCGTAAACCACCTCATCCATTGGACCCACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTGTT
GGTATGAACCTGACACGAACATTCCGCAGCTGCAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAATCA
TGTGCCCTGAAGTCAAATTCCCTCCAGTCTGATGGGTAA

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR2H401JQB 544 0 0
GA
TTGAATTTCCATCTCTATTATTGAACCAAAACATCATTGGAGTTGTAGAGAATATAAGAA
TATCAACTGAAATCTACATACAGTTTTATAACCAACAGAGAGCATATAAAAA*GAGTAAC
AGAAGATTTGTTTATCGTCTCTTGTCAAATCTGAAGAATCTTCAAAGGGTCGGCAACAAC
TTGGAGCTGCTTCTTCACTTTCCTCCATCTTCTCTCGTTTGCTCCAACTATGAGTGTGTA
GTATCTGTTGTTTCCAACAGCCACAGTTGCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATGGAAGTTCT
TAGTCCATACTCAAATGTGTAGTAGCTCCTTCCATCCTCCACCCTCTCTTTCATATCATA
AATGGTAGCTACTTGGTTTGGTGCTGCAAACTTATGCTTCACTAAATCGTAAACCACCTC
ATCCATTGGACCCACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGACACGAAC
ATTCTGCAGCTGCAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCTGAAGTCAAATTC
CC

QA 3 544 3 544
DS 

RD RR2CR53JQ 668 0 0
CTCTATTATTGAACCAAAACATCATTGGAGTTGTAGAGAATATAAGAATATCAACTGAAA
TCTACATACAGTTTTATAACCAACAGAGAGCATAGAAAAAAGAGTAACAGAAGATTTGTT
TATCGTCTCTTGTCAAATCTGAAGAATCTTCAAAGAGTCGGCAACAACTTGGAGCTGCTT
CTTCACTTTCCTCCATCTTCTCTCGTTTGCTCCAACTATGAGTGTGTAGTATCTGTTGTT
TCCAACAGCCAAAGTTGCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATGGGAGTTCTTAGTCCATACTC
AAATGTGTAGTAGCTCCTTCCATCCTCCACCCTCTCTTTCATATCATAAATGGTAGCTAC
TTGGTTTGGTGCTGCAAACTTATGCTTCACTAGATCGTAAACCACCTCATCCATTGGACC
CACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGACACGAACATTCTGCAGCTA
CAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCTGAAGTCAAATTCCCTCCAGTCTGA
TGGGTAATAATACGAATAACCATCTTCTCTATCCACAAAAGCAGAGTAGCTTTTAGGTAC
CTCTTCAGCAAGAAGCAAAGTTGCTGGAACTGAAGTTGCCAATAAAGTTCCTACTCCCAC
AAGAGCTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2FE33TF 325 0 0
GCAAACTTATGCTTCAGTAGATCGTAAACCACCTCATCCATTGGACCCACTTCGCGGATG
TCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGACACGAACATTCCGCAGCTGCAAATATCTATCC
TTGAAGGCTGAATCATGTGCCCTGAAGTCAAATTCCCTCCAGTCTGATGGGTAATAATAC
GAATAACCATCTTCTCTATCCACAAAAGCAGAGTAGCTTTTAGGTACCTCTTCAGCAAGA
AGCAAAGTTGCTGGAACTGAAGTTACCAATAAAGTTCCTACTCCCACAAGAGCTTGCCTT
CTCTTCCAGTTGCTTCCATTTCTAT

QA 1 325 1 325
DS 

RD RR2EM06JQ 776 0 0
CGGTTGAAATTCCATCTCTATTATTGAACCAAAACATCATTGGAGTTGTAGAGAATATAA
GAATATCAACTGAAATCTACATACAGTTTTATAACCAACAGAGAGCATAGAAAAAAGAGT
AACAGAAGATTTGTTTATCGTCTCTTGTCAAATCTGAAGAATCTTCAAAGAGTCGGCAAC
AACTTGGAGCTGCTTCTTCACTTTCCTCCATCTTCTCTCGTTTGCTCCAACTATGAGTGT
GTAGTATCTGTTGTTTCCAACAGCCACAATTGCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATGGGAGT
TCTTAGTCCATACTCAAATGTGTAGTAGCTCCTTCCATCCTCCACCCTCTCTTTCATATC
GTAAATGGTAGCTACTTGGTTTGGTGCTGCAAACTTATGCTTCACTAGATCGTAAACCAC
CTCATCCATTGGACCCACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGACACG
AACATTCTGCAGCTGCAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCTGAAGTCAAA
TTCCCTCCAGTCTGATGGGTAATAATACGAATGACCATCTTCTCTATCCACAAAAGCAGA
GTAGCTTTTAGGTACCTCTTCAGCAAGAAGCAAAGTTGCTGGAACTGAAGTTGCCAATAA
AGTTCCTACTCCCACAAGAGCTTGCCTTCTCTTCCAGTTGCTTCCATTTCTATTCTCCGA
GGAGTCAAGACTGCTGCCGGATGAAAGTGAACAACAAGCTCTGAGTGATGGGTTTG

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2AB07JQ 777 0 0
GA
TTGAAATTCCATCTCTATTATTGAACCAAAACATCATTGGAGTTGTAGAGAATATAAGAA
TATCAACTGAAATCTACATACAGTTTTATAACCAACAGAGAGCATAGAAAAAAGAGTAAC
AGAAGATTTGTTTATCGTCTCTTGTCAAATCTGAAGAATCTTCAAAGAGTCGGCAACAAC
TTGGAGCTGCTTCTTCACTTTCCTCCATCTTCTCTCGTTTGCTCCAACTATGAGTGTGTG
GTATCTGTTGTTTCCAACAGCCACAGTTGCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATGGGAGTTCT
TAGTCCATACTCAAATGTGTAGTAGCTCCTTCCATCCTCCACCCTCTCTTTCATATCATA
AATGGTAGCTACTTGGTTTGGTGCTGCAAACTTATGCTTCACTAGATCGTAAACCACCTC
ATCCATTGGACCCACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGACACGAAC
ATTCTGCAGCTGCAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCCGAAGTCAAATTC
CCTCCAGTCTGATGGGTAATAATACGAATAACCATCTTCTCTATCCACAAAAGCAGAGTA
GCTTTTAGGTACCTCTTCAGCAAGAAGCAAAGTTGCTGGAACTGAAGTTGCCAATAAAGT
TCCTACTCCCACAAGAGCTTGCCTTCTCTTCCAGTTGCTTCCATTTCTATTCTCCGAGGA
GTCAAGACTGCTGCCGGATGAAAGTGAACAACAAGCTCTGAGTGATGGGTTTGGA

QA 3 777 3 777
DS 

RD RR2CR53TF 771 0 0
AGAGCATA*AAAAAAGAGTA*CAGA*GATTTGTT*ATCGTCTCT*GTCAAATCTGAAGAA
TCTTCAAAGAGTCGGCAACAACT*GGAGCTGCTTCTTCACTTTCCTCCATCTTCTCTCGT
TTGCTCCAACTATGAGTGTGTAGTATCTGTTGTTTCCAACAGCCAAAGTTGCAAAAGAAG
TGGTTGCATAGATGGGAGTTCTTAGTCCATACTCAAATGTGTAGTAGCTCCTTCCATCCT
CCACCCTCTCTTTCATATCATAAATGGTAGCTACTTGGTTTGGTGCTGCAAACTTATGCT
TCACTAGATCGTAAACCACCTCATCCATTGGACCCACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTG
TTGGTATGAACCTGACACGAACATTCTGCAGCTACAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAAT
CATGTGCCCTGAAGTCAAATTCCCTCCAGTCTGATGGGTAATAATACGAATAACCATCTT
CTCTATCCACAAAAGCAGAGTAGCTTTTAGGTACCTCTTCAGCAAGAAGCAAAGTTGCTG
GAACTGAAGTTGCCAATAAAGTTCCTACTCCCACAAGAGCTTGCCTTCTCTTCCAGTTGC
TTCCATTTCTATTCTCCGAGGAGCCAAGACTGCTGCCGGATGAAAGTGAACAACAAGCTC
TGAGTGATGGGTTTGGACAGGGAATATCTGTCTTGTGCGAGTTTGTTGGTGAAAAACAAA
AGCGGATTGAGAGTGAAGAGACTGCCATAGTGGCTACCACTTACAAGTCT
C

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2AB07TF 764 0 0
TTATCGTCTCTTGTCAAATCTGAAGAATCTTCAAAGAGTCGGCAACAACTTGGAGCTGCT
TCTTCACTTTCCTCCATCTTCTCTCGTTTGCTCCAACTATGAGTGTGTGGTATCTGTTGT
TTCCAACAGCCACAGTTGCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATGGGAGTTCTTAGTCCATACT
CAAATGTGTAGTAGCTCCTTCCATCCTCCACCCTCTCTTTCATATCATAAATGGTAGCTA
CTTGGTTTGGTGCTGCAAACTTATGCTTCACTAGATCGTAAACCACCTCATCCATTGGAC
CCACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGACACGAACATTCTGCAGCT
GCAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCCGAAGTCAAATTCCCTCCAGTCTG
ATGGGTAATAATACGAATAACCATCTTCTCTATCCACAAAAGCAGAGTAGCTTTTAGGTA
CCTCTTCAGCAAGAAGCAAAGTTGCTGGAACTGAAGTTGCCAATAAAGTTCCTACTCCCA
CAAGAGCTTGCCTTCTCTTCCAGTTGCTTCCATTTCTATTCTCCGAGGAGTCAAGACTGC
TGCCGGATGAAAGTGAACAACAAGCTCTGAGTGATGGGTTTGGACAGGGAATATCTGTCT
TGTGCGAGTTTGTTGGTGAAAAACAAAAGCGGATTGAGAGTGAAGAGACTGCCATAGTGG
CTACCACTTACAAGTCTATAGATGATCAATGTTCATTGCCTTCC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2E362TF 631 0 0
AGTATCTGTTGTTTCCAACAGCCACAGTTGCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATGGGAGTTC
TTAGTCCATACTCAAATGTGTAGTAGCTCCTTCCATCCTCCACCCTCTCTCTCATATCAT
AAATGGTAGCTACTTGGTTTGGTGCTGCAAACTTATGCTTCACTAGATCGTAAACCACCT
CATCCATTGGACCCACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGACACGAA
CATTCTGCAGCTGCAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCTGAAGTCAAATT
CCCTCCAGTCTGATGGGTAATAATACGAATAACCATCTTCTCTATCCACAAAAGCAGAGT
AGCTTTTAGGTACCTCTTCAGCAAGAAGCAAAGTTGCTGGAACTGAAGTTGCCAATAAAG
TTCCTACTCCCACAAGAGCTTGCCTTCTCTTCCAGTTGCTTCCATTTCTATTCCCCGAGG
AGTCAAGACTGCTGTCGGATGAAAGTGAACAACAAGCTCTGAGTGATGGGTTTGGACAGG
GAATATCTGTCTTGTGCGAGTTTGTTGGTGAAAAACAAAAGCGGATTGAGAGTGAAGAGA
CTGCCATAGTGGCTACCACTTACAAGTCT
CC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2EM06TF 681 0 0
GAGCTGCTTCTTCACTTTCCTCCATCTTCTCTCGTTTGCTCCAACTATGAGTGTGTAGTA
TCTGTTGTTTCCAACAGCCACAATTGCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATGGGAGTTCTTAG
TCCATACTCAAATGTGTAGTAGCTCCTTCCATCCTCCACCCTCTCTTTCATATCGTAAAT
GGTAGCTACTTGGTTTGGTGCTGCAAACTTATGCTTCACTAGATCGTAAACCACCTCATC
CATTGGACCCACTTCGCGGATGTCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGACACGAACATT
CTGCAGCTGCAAATATCTATCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCTGAAGTCAAATTCCCT
CCAGTCTGATGGGTAATAATACGAATGACCATCTTCTCTATCCACAAAAGCAGAGTAGCT
TTTAGGTACCTCTTCAGCAAGAAGCAAAGTTGCTGGAACTGAAGTTGCCAATAAAGTTCC
TACTCCCACAAGAGCTTGCCTTCTCTTCCAGTTGCTTCCATTTCTATTCTCCGAGGAGTC
AAGACTGCTGCCGGATGAAAGTGAACAACAAGCTCTGAGTGATGGGTTTGGACAGGGAAT
ATCTGTCTTGTGCGAGTTTGTTGGTGAAAAACAAAAGCGGATTGAGAGTGAAGAGACTGC
CATAGCGGCTACCACTTAC
CC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2H401TF 673 0 0
CTCCATCTTCTCTCGTTTGCTCCAACTATGAGTGTGTAGTATCTGTTGTTTCCAACAGCC
ACAGTTGCAAAAGAAGTGGTTGCATAGATGGAAGTTCTTAGTCCATACTCAAATGTGTAG
TAGCTCCTTCCATCCTCCACCCTCTCTTTCATATCATAAATGGTAGCTACTTGGTTTGGT
GCTGCAAACTTATGCTTCACTAGATCGTAAACCACCTCATCCATTGGACCCACTTCGCGG
ATGTCTGTTTTCTCTGTTGGTATGAACCTGACACGAACATTCTGCAGCTGCAAATATCTA
TCCTTGAAGGCTGAATCATGTGCCCTGAAGTCAAATTCCCTCCAGTCTGATGGGTAATAA
TACGAATAACCATCTTCTCTATCCACAAAAGCAGAGTAGCTTTTAGGTACCTCTTCAGCA
AGAAGCAAAGTTGCTGGAACTGAAGTTGCCAATAAAGTTCCTACTCCCACAAGAACTTGC
CTTCTCTTCCAGTTGCTTCCATTTCTATTCTCCGAGGAGTCAAGACTGCTGCCGGATGAA
AGTGAACAACAAGCTCTGAGTGATGGGTTTGGACAGGGAATATCTGTCTTGTGCGAGTTT
GTTGGTGAAAAACAAAAGCGGATTGAGAGTGAAGAGACTGCCATAGTGGCTACCACTTAC
AAGTCTATAGATG

QA 1 673 1 673
DS 



AS 2 18

CO CL147Contig1 787 7 17 U
GGGGTTTTCCTCCGGAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAA
GAAGACCAAAAGGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCT
GTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCT
TTTCATGAGCAAAGTCAACAAGGCTCCTCTTTCTCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAA
TGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATTTGAGAGTGCA
CGACCTTCCTGCCATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACCGAGAGGGCTAGGGCTAGGAT
TGAGAAAGCTGGTGGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGG
ACAAAACACGGTTCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGG
TCCAGCTCCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAA
GTTTGAGAAGGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCA
AAACTGTTTTCGAGGTTGTTGTTTCCTTATGGTTGTTGCTGCTTTCAGAATCGAAGTTTT
TGTAGACCCCGCTTTTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCTATCT
TTCTGTTCTGATCGACAATTGAATGTTTTGCTTCGCCAATATTCTTAATATAAGAAATAG
AGGCTGG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 5 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 15 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A457TF U 1
AF RR2BT07TF U 2
AF RR2F401TF U 13
AF RR2EL27JQ C 14
AF RR2EL27TF U 14
AF RR2BT07JQ C 95
AF RR2F401JQ C 40
BS 1 14 RR2A457TF
BS 15 15 RR2EL27TF
BS 16 343 RR2A457TF
BS 344 344 RR2BT07TF
BS 345 382 RR2A457TF
BS 383 383 RR2BT07TF
BS 384 400 RR2A457TF
BS 401 401 RR2BT07TF
BS 402 524 RR2A457TF
BS 525 525 RR2BT07TF
BS 526 591 RR2A457TF
BS 592 660 RR2BT07TF
BS 661 661 RR2F401TF
BS 662 678 RR2BT07TF
BS 679 697 RR2F401TF
BS 698 699 RR2EL27JQ
BS 700 787 RR2F401JQ

RD RR2A457TF 591 0 0
GGGGTTTTCCTCCGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAA
GAAGACCAAAAGGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCT
GTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCT
TTTCATGAGCAAAGTCAACAAGGCTCCTCTTTCTCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAA
TGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATTTGAGAGTGCA
CGACCTTCCTGCCATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACCGAGGGGGCTAGGGCTAGGAT
TGAGAAAGCTGGTGGGGAGTGCCTGACCTTTGACCAGCTAACTCTCGTTGCTCCATTGGG
ACAAAACACGGTTCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGG
TCCAGCTCCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCTTATGTTATGTCTAAGGGAAGGAA
GTTTGAGAAGGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2BT07TF 686 0 0
GGGTTTTCCTCCGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAG
AAGACCAAAAGGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTATCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTG
TACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTT
TTCATGAGCAAAGTCAACAAGGCTCCTCTTTCTCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAAT
GGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATTTGAGAGTGCAC
GACCTTCCTGCCATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACCTAGAGGGCTAGGGCTAGGATT
GAGAAAGCTGGTGGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGGA
CAAAACACGGTTCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGT
CCAGCTCCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAG
TTTGAGAAGGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAA
AACTGTTTTCGAGGTTGTTGTTTCCTTATGGTTGTTGCTGCTTTCAGAATCGAAGTTTT*
GTAGACCCCGCTTTTGT
ACTTTTGCC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2F401TF 685 0 0
GGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAG
GACAGCTCCAAAGTCCGATGATGCCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTTT
GGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCAA
AGTCAACAAGGCTCCTCTTTCTCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAATGGCAAGGATGG
TAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATTTGAGAGTGCACGACCTTCCTGC
CATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACCGAGAGGGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGG
TGGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAAAACACGGT
TCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGG
TGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGGC
TAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTTCG
AGGTTGTTGTTTCCTTATGGTTGTTGCTGCTTTCAGAATCGAAGTTTTTGTAGACCCCGC
TTTTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2EL27JQ 686 0 0
GGAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGG
ACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTTTG
GTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCAAA
GTCAACAAGGCTCCTCTTTCTCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAATGGCAAGGATGGT
AAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATTTGAGAGTGCACGACCTTCCTGCC
ATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACCGAGAGGGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGT
GGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAAAACACGGTT
CTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCTGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGT
GTGCCACACAGTCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGGCT
AGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTTCGA
GGTTGTTGTTTCCTTATGGTTGTTGCTGCTTTCAGAATCGAAGTTTTTGTAGACCCCGCT
TTTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGAC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2EL27TF 666 0 0
GGAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGG
ACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTTTG
GTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCAAA
GTCAACAAGGCTCCTCTTTCTCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAATGGCAAGGATGGT
AAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATTTGAGAGTGCACGACCTTCCTGCC
ATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACCGAGAGGGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGT
GGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAAAACACGGTT
CTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCTGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGT
GTGCCACACAGTCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGGCT
AGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTTCGA
GGTTGTTGTTTCCTTATGGTTGTTGCTGCTTTCAGAATCGAAGTTTT*GTAGACCCCGCT
TTTGTT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2BT07JQ 622 0 0
GTCTATCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAG
TTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCAAAGTCAACAAGGCTCCTCTTTCT
CTTTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAATGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGG
ACAATCACTGATGATTTGAGAGTGCACGACCTTCCTGCCATGAAGGTTACTGCCTTGAGG
TTTACCTAGAGGGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGGGGAGTGCTTGACCTTTGAC
CAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAAAACACGGTTTTGCTAAGAGGACCCAAGAAC
TCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAG
CCTTATGTTAGGTTTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGT
GGTTTCAAGGTTTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTTCGAGGTTGTTGTTTCCTTATGGTT
GTTGCTGCTTTCAGAATCGAAGTTTTTGTAGACCCCGCTTTTGTTACTTTTTGCCTTTTG
CAGACATTGGTTTGAGTTTT
TT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2F401JQ 748 0 0
TATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGCCTA
CCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGA
TGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCAAAGTCAACAAGGCTCCTCTTTCTCTCTC
CAAGCTCGTTGAGTTTATGAATGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAAT
CACTGATGATTTGAGAGTGCACGACCTTCCTGCCATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTAC
CGAGAGGGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCT
AGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAAAACACGGTTTTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCG
TGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCTTA
TGTTAGGTTTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGTTT
CAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTTCGAGGTTGTTGTTTCCTTATGGTTGTTGC
TGCTTTCAGAATCGAAGTTTTTGTAGACCCCGCTTTTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGAC
ATTGGTTTGAGTTTTCTATCTTTCTGTTCTGATCGACAATTGAATGTTTTGCTTCGCCAA
TATTCTTAATATAAGAAATAGAGGCTGG

QA 1 748 1 748
DS 



CO CL147Contig2 767 11 8 U
GGGGTTTTCCTGGGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAA
GAAGACCAAAAGGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCT
GTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCT
TTTCATGAGCAAAGTCAACAAGGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAA
TGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCA
TGAGATTCCTGCAATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGAT
TGAGAAAGCTGGTGGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGG
ACAGAATACGGTTCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGG
TCCAGCTCCTGGTGTGCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAA
GTTTGAGAAGGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCA
AAACTGTTTCGAGGTTCTTGTTTCCTTATGATTGTTGCTGTTTTCAGAATCGAAGTTTTT
GTAGACCGCTTTTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTGTTTC
TGTTCTAATCGACAATTGAATGTTTTGCTTCCGCCAATATTCTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 50 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 25 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2D086TF U 12
AF RR2BO19TF U 12
AF RR2BT70TF U 12
AF RR2BT70JQ C 12
AF RR2AJ95JQ C 607
AF RR2FJ67TF U 1
AF RR2AJ95TF U 12
AF RR2CM36JQ C 14
AF RR2D086JQ C 311
AF RR2FJ67JQ C 16
AF RR2CM36TF U 14
BS 1 11 RR2FJ67TF
BS 12 13 RR2BO19TF
BS 14 727 RR2FJ67TF
BS 728 728 RR2AJ95TF
BS 729 734 RR2FJ67TF
BS 735 735 RR2CM36JQ
BS 736 745 RR2FJ67TF
BS 746 767 RR2CM36TF

RD RR2D086TF 567 0 0
GGGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAA
GGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTT
TGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCA
AAGTCAACAAGGCTCCTCCTTCGCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTGTGAATGGCAAGGATG
GTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTG
CAATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTG
GTGGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAATACGG
TTCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTG
GTGTGCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGG
CTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGAT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2BO19TF 652 0 0
GGGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAA
GGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCCACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTT
TGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCA
AAGTCAACAAGGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAATGGCAAGGATG
GTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTG
CAA**AAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTG
GTGGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAATACGG
TTCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGGGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTG
GTGTGCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGG
CTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTCG
AGGTTCTTGTTTCCTTATGATTGTTGCTGTTTTCAGAATCGAAGTTTT
GTAG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2BT70TF 629 0 0
GGGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAA
GGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTT
TGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCCCAAGAGGCTTTTCATGAGCA
AAGTCAACAAGGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAATGGCAAGGATG
GTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTG
CAATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTG
GTGGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAATACGG
TTCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGTAGCACCTTGGTCCAGCTCCTG
GTGTGCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGG
CTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTCG
AGGTTCTTGTTTCCTTATGATTGTTGCTG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2BT70JQ 705 0 0
GGGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAA
GGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTT
TGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCCCAAGAGGCTTTTCATGAGCA
AAGTCAACAAGGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAATGGCAAGGATG
GTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATTCCTG
CAATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTG
GTGGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAATACGG
TTCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGTAGCACCTTGGTCCAGCTCCTG
GTGTGCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTTTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGG
CTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTCG
AGGTTCTTGTTTCCTTATGATTGTTGCTGTTTTCAGAATCGAAGTTTTTGTAGACCGCTT
TTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2AJ95JQ 111 0 0
TTTG
GAGGTTCTTGTTTCCTTATGATCGTTGCTGTTTTCAGAATGGAAGTTTTTGTAGACCGCT
TTTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTGT

QA 5 111 5 111
DS 

RD RR2FJ67TF 750 0 0
GGGGTTTTCCTCCGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAA
GAAGACCAAAAGGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCT
GTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCT
TTTCATGAGCAAAGTCAACAAGGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAA
TGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCA
TGAGATTCCTGCAATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGAT
TGAGAAAGCTGGTGGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGG
ACAGAATACGGTTCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGG
TCCAGCTCCTGGTGTGCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAA
GTTTGAGAAGGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCA
AAACTGTTTCGAGGTTCTTGTTTCCTTATGATTGTTGCTGTTTTCAGAATCGAAGTTTTT
GTAGACCGCTTTTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTGTTTC
TGTTCTA*TCGACA*TTGAATGTTT
GCTTC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2AJ95TF 723 0 0
GGGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAA
GGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTT
TGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCA
AAGTCAACAAGGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAATGGCAAGGATG
GTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTG
CAATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTG
GTGGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAATACGG
TTCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTG
GTGTGCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTTAAGTCTAAGGGTAGGAAGTTTGAGAAGG
CTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTCG
AGGTTCTTGTTTCCTTATGATCGTTGCTGTTTTCAGAATCGAAGTTTTTGTAGACCGCTT
TTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTGTTTCTGTTCTAATCG
ACA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2CM36JQ 752 0 0
GGAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGG
ACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTTTG
GTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTCATGAGTAAA
GTCAACAAGGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAATGGCAAGGATGGT
AAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTGCA
ATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGT
GGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAATACGGTT
CTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGT
GTGCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGGCT
AGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTCGAG
GTTCTTGTTTCCTTATGATTGTTGCTGTTTTCAGAATCGAAGTTTTTGTAGACCGCTTTT
GTTACTTTTTGCCTCTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTGTTTCTGTTCTAATCGAC
AATTGAATGTTTTGCTTCCGCCAATATTCTT
G

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2D086JQ 442 0 0
GCAATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCT
GGTGGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAATACG
GTTCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCT
GGTGTGCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTTTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAG
GCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTTTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTC
GAGGTTCTTGTTTCCTTATGATTGTTGCTGTTTTCAGAATCGAAGTTTTTGTAGACCGCT
TTTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTGTTTCTGTTCTAATC
GACAATTGAATGTTTTGCTTCC

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR2FJ67JQ 737 0 0
AACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGGAC
AGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTTTGGT
AAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCAAAGT
CAACAAGGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAATGGCAAGGATGGTAA
GATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTGCAAT
GAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGG
GGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAATACGGTTCT
GCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGT
GCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTTTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGGCTAG
AGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTTTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTCGAGGT
TCTTGTTTCCTTATGATTGTTGCTGTTTTCAGAATCGAAGTTTTTGTAGACCGCTTTTGT
TACTTTTTGCCTTTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTGTTTCTGTTCTAATCGACAA
TTGAATGTTTTGCTTCC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2CM36TF 754 0 0
GGAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGG
ACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTTTG
GTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTCATGAGTAAA
GTCAACAAGGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTTGAGTTTATGAATGGCAAGGATGGT
AAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTGCA
ATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGAGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGT
GGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAATACGGTT
CTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGT
GTGCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGGCT
AGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTCGAG
GTTCTTGTTTCCTTATGATTGTTGCTGTTTTCAGAATCGAAGTTTTTGTAGACCGCTTTT
GTTACTTTTTGCCTCTTGCAGACATTGGTTTGAGTTTTCCGTGTTTCTGTTCTAATCGAC
A*TTGAATGTTTTGCTTCCGCCAATATTCTTGAT

QA 1 754 1 754
DS 



AS 3 18

CO CL148Contig1 846 3 6 U
GCAAAACTTTCTATAGTTTACTACTTTAACTGATAAAAGGATAAAACAGAGAGAACTTGA
AACAAACTGCTTTATGATAATCATAGAGGTCTTTTATTCACTCAAAAAGACAGTTGAAAC
TAAATAAGAATTAAGAAAATAAATCCTTGAAAATGTCTTATGCCAGAATTTCAAAATAAA
AAGAACATTAAAAAAAAACAAAGAGCAGCATAACCACTTCTTTTCAGAAGAATGATGAAT
CTTGAGCTTAAAAACACTTCCTGTGAACAATGGATGGGCCTGACTCATCATACTCTGCCT
TTGCGATCCACATCTGCTGGAAGGTACTGAGTGAGGCCAAGATAGACCCTCCAATCCAGA
CAGAGTATTTCCTCTCAGGAGGAGCAACAACTTTGATCTTCATGCTGCTTGGAGCCAAAG
CAGTGATCTCTTTGCTCATTCTATCAGCAATCCCCGGGAACATTGTGGTTCCACCACTAA
GCACAATGTTACCGTACAAGTCCTTTCTGATGTCGACATCACACTTCATTATGGAGTTAT
AGGTTGTTTCATGGATACCTGGATTCTCCATACCAATCATAGACGGCTGGTAAAGAACCT
CAGGGCAACGGAACCGTTCAGCACCGATGGTGATCACCTGTCCATCAGGCATTTCGTAGT
TCTTCTCAACAGATGAGCTAGTTTTGGATGTCTCTAGCTCCTGCTCGTAGTCAAGAGCAA
TGTAGCAGAGCTTCTCCTTGATGTCTCTGACGATTTCACGCTCTGCTGTGGTGGTGAAAG
AGTAGCCACGCTCGGTTAGGATCTTCATAAACGCGTCCGTGAGGTCACGACCCGCGAGAT
CAAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ90JQ U 1
AF RR2EQ81JQ U 59
AF RR2CP21JQ U 54
BS 1 91 RR2CQ90JQ
BS 92 92 RR2CP21JQ
BS 93 618 RR2CQ90JQ
BS 619 643 RR2CP21JQ
BS 644 644 RR2EQ81JQ
BS 645 846 RR2CP21JQ

RD RR2CQ90JQ 618 0 0
GCAAAACTTTCTATAGTTTACTACTTTAACTGATAAAAGGATAAAACAGAGAGAACTTGA
AACAAACTGCTTTATGATAATCATAGAGGTCCTTTATTCACTCAAAAAGACAGTTGAAAC
TAAATAAGAATTAAGAAAATAAATCCTTGAAAATGTCTTATGCCAGAATTTCAAAATAAA
AAGAACATTAAAAAAAAACAAAGAGCAGCATAACCACTTCTTTTCAGAAGAATGATGAAT
CTTGAGCTTAAAAACACTTCCTGTGAACAATGGATGGGCCTGACTCATCATACTCTGCCT
TTGCGATCCACATCTGCTGGAAGGTACTGAGTGAGGCCAAGATAGACCCTCCAATCCAGA
CAGAGTATTTCCTCTCAGGAGGAGCAACAACTTTGATCTTCATGCTGCTTGGAGCCAAAG
CAGTGATCTCTTTGCTCATTCTATCAGCAATCCCCGGGAACATTGTGGTTCCACCACTAA
GCACAATGTTACCGTACAAGTCCTTTCTGATGTCGACATCACACTTCATTATGGAGTTAT
AGGTTGTTTCATGGATACCTGGATTCTCCATACCAATCATAGACGGCTGGTAAAGAACCT
CAGGGCAACGGAACCGTT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2EQ81JQ 671 0 0
GG
AACAAACTGCTTTATGATAATCATAGAGGTCTTTTATTCACTCAAAAAGACAGTTGAAA*
*AAATAAGAATTAAGAAAATAAATCCTTGAAAATGTCTTATGCCAGAATTTCAAAATAAA
AAGAACATTAAAAAAAA*CAAAG**CAGAATAACCACTTCTTTTCAGAAGAATGATGAAT
CTTGAGCTTAAAAACACTTCCTATGAACAATGGATGGGCCTGACTCATCATACTCTGCCT
TTGCGATCCACATCTGCTGGAAGGTACTGAGTGAGGCCAAGATAGACCCTCCAATCCAGA
CAGAGTATTTCCTCTCAGGAGGAGCAACAACTTTGATCTTCATGCTGCTTGGAGCCAAAG
CAGTGATCTCTTTGCTCATTCTATCAGCAATCCCCGGGAACATTGTGGTTCCACCACTAA
GCACAATGTTACCGTACAAGTCCTTTCTGATGTCGACATCACACTTCATTATGGAGTTAT
AGGTTGTTTCATGGATACCTGGATTCTCCATACCAATCATAGACGGCTGGTAAAGAACCT
CAGGGCAACGGAACCGTTCAGCACCGATGGTGATCACCTGTCCATCAGGCATTTCGTAGT
TCTTCTCAACAGATGAGCTAGTTTTGGATGTCTCTAGCTCCTGCTCGTAGTCAAGAGCAA
TGTAGCAGA

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR2CP21JQ 793 0 0
AACTTGA
AACAAACTGCTTTATGATAATCATAGAGGTCTTTTATTCACTCAAAAAGACAGTTGAAAC
TAAATAAGAATTAAGAAAATAAATCCTTGAAAATGTCTTATGCCAGAATTTCAAAATAAA
AAGAACATTAAAAAAAAACAAAGAGCAGCATAACCACTTCTTTTCAGAAGAATGATGAAT
CTTGAGCTTAGAAACACTTCCTGTGAACAATGGATGGGCCTGACTCATCATACTCTGCCT
TTGCGATCCACATCTGCTGGAAGGTACTGAGTGAGGCCAAGATAGACCCTCCAATCCAGA
CAGAGTATTTCCTCTCAGGAGGAGCAACAACTTTGATCTTCATGCTGCTTGGAGCCAAAG
CAGTGATCTCTTTGCTCATTCTATCAGCAATCCCCGGGAACATTGTGGTTCCACCACTAA
GCACAATGTTACCGTACAAGTCCTTTCTGATGTCGACATCACACTTCATTATGGAGTTAT
AGGTTGTTTCATGGATACCTGGATTCTCCATACCAATCATAGACGGCTGGTAAAGAACCT
CAGGGCAACGGAACCGTTCAGCACCGATGGTGATCACCTGTCCGTCAGGCATTTCGTAGT
TCTTCTCAACAGATGAGCTAGTTTTGGATGTCTCTAGCTCCTGCTCGTAGTCAAGAGCAA
TGTAGCAGAGCTTCTCCTTGATGTCTCTGACGATTTCACGCTCTGCTGTGGTGGTGAAAG
AGTAGCCACGCTCGGTTAGGATCTTCATAAACGCGTCCGTGAGGTCACGACCCGCGAGAT
CAAGAC

QA 8 793 8 793
DS 



CO CL148Contig2 705 3 7 U
CTCTCGGTTTCAGATCCTTTTGTTTTGCAGAAAGGTAGCAAAATGGCTGACGGTGAAGAC
ATTCAACCTCTTGTCTGCGACAACGGAACTGGAATGGTTAAGGCTGGTTTTGCTGGTGAT
GATGCACCTCGAGCTGTGTTTCCCAGCATCGTGGGTCGTCCTCGTCACACCGGAGTGATG
GTTGGTATGGGACAAAAGGATGCTTACGTTGGTGACGAAGCTCAATCCAAGCGTGGTATC
CTAACGCTCAAGTACCCTATCGAGCACGGTATTGTCAACAACTGGGACGACATGGAGAAG
ATTTGGCATCATACTTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCACCTGAGGAGCATCCCATTTTG
TTGACTGAAGCACCTCTTAACCCGAAAGCTAACCGTGAGAAGATGACTCAGATCATGTTT
GAGACTTTCAATGCTCCGGCTATGTATGTGGCTATTCAGGCTGTGCTTTCCCTTTACGCC
AGTGGTCGTACAACCGGTATCGTGCTCGACTCTGGAGATGGCGTGAGCCACACGGTTCCT
ATCTACGAGGGTTATGCACTTCCACATGCCATCCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGAC
CTCACGGACGCGTTTATGAAGATCCTAACCGAGCGTGGCTACTCTTTCACCACCACAGCA
GAGCGTGAAATCGTCAGAGACATCAAGGAGAGCTCTGCTACATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ81TF U 1
AF RR2CP21TF U 18
AF RR2CQ90TF U 22
BS 1 524 RR2EQ81TF
BS 525 525 RR2CP21TF
BS 526 526 RR2EQ81TF
BS 527 527 RR2CP21TF
BS 528 659 RR2EQ81TF
BS 660 683 RR2CP21TF
BS 684 705 RR2CQ90TF

RD RR2EQ81TF 659 0 0
CTCTCGGTTTCAGATCCTTTTGTTTTGCAGAAAGGTAGCAAAATGGCTGACGGTGAAGAC
ATTCAACCTCTTGTCTGCGACAACGGAACTGGAATGGTTAAGGCTGGTTTTGCTGGTGAT
GATGCACCTCGAGCTGTGTTTCCCAGCATCGTGGGTCGTCCTCGTCACACCGGAGTGATG
GTTGGTATGGGACAAAAGGATGCTTACGTTGGTGACGAAGCTCAATCCAAGCGTGGTATC
CTAACGCTCAAGTACCCTATCGAGCACGGTATTGTCAACAACTGGGACGACATGGAGAAG
ATTTGGCATCATACTTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCACCTGAGGAGCATCCCATTTTG
TTGACTGAAGCACCTCTTAACCCGAAAGCTAACCGTGAGAAGATGACTCAGATCATGTTT
GAGACTTTCAATGCTCCGGCTATGTATGTGGCTATTCAGGCTGTGCTTTCCCTTTACGCC
AGTGGTCGTACAACCGGTATCGTGCTCGACTCTGGAGATGGCGTTATCCACACGGTTCCT
ATCTACGAGGGTTATGCACTTCCACATGCCATCCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGAC
CTCACGGACGCGTTTATGAAGATCCTAACCGAGCGTGGCTACTCTTTCACCACCACAGC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2CP21TF 666 0 0
CTCTCGGTTTCAGAA
AGGTAGCAAAATGGCTGACGGTGAAGACATTCAACCTCTTGTCTGCGACAACGGAACTGG
AATGGTTAAGGCTGGTTTTGCTGGTGATGATGCACCTCGAGCTGTGTTTCCCAGCATCGT
GGGTCGTCCTCGTCACACCGGAGTGATGGTTGGTATGGGACAAAAGGATGCTTACGTTGG
TGACGAAGCTCAATCCAAGCGTGGTATCCTAACGCTCAAGTACCCTATCGAGCACGGTAT
TGTCAACAACTGGGACGACATGGAGAAGATTTGGCATCATACTTTCTACAACGAGCTCCG
TGCTGCACCTGAGGAGCATCCCATTTTGTTGACTGAAGCACCTCTTAACCCGAAAGCTAA
CCGTGAGAAGATGACTCAGATCATGTTTGAGACTTTCAATGCTCCGGCTATGTATGTGGC
TATTCAGGCTGTGCTTTCCCTTTACGCCAGTGGTCGTACAACCGGTATCGTGCTCGACTC
TGGAGATGGCGTGAGCCACACGGTTCCTATCTACGGGGGTTATGCACTTCCACATGCCAT
CCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCTCACGGACGCGTTTATGAAGATCCTAACCGA
GCGTGGCTACTCTTTCACCACCACAGCAGAGCGTGAAATCGTCAGAGACAT

QA 16 666 16 666
DS 

RD RR2CQ90TF 684 0 0
CTCTCGGTTTC
AGGTAGCAAAATGGCTGACGGTGAAGACATTCAACCTCTTGTCTGCGACAACGGAACTGG
AATGGTTAAGGCTGGTTTTGCTGGTGATGATGCACCTCGAGCTGTGTTTCCCAGCATCGT
GGGTCGTCCTCGTCACACCGGAGTGATGGTTGGTATGGGACAAAAGGATGCTTACGTTGG
TGACGAAGCTCAATCCAAGCGTGGTATCCTAACGCTCAAGTACCCTATCGAGCACGGTAT
TGTCAACAACTGGGACGACATGGAGAAGATTTGGCATCATACTTTCTACAACGAGCTCCG
TGTTGCACCTGAGGAGCATCCCATTTTGTTGACTGAAGCACCTCTTAACCCGAAAGCTAA
CCGTGAGAAGATGACTCAGATCATGTTTGAGACTTTCAATGCTCCGGCTATGTATGTGGC
TATTCAGGCTGTGCTTTCCCTTTACGCCAGTGGTCGTACAACCGGTATCGTGCTCGACTC
TGGAGATGGCGTGAGCCACACGGTTCCTATCTACGAGGGTTATGCACTTCCACATGCCAT
CCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCTCACGGACGCGTTTATGAAGATCCTAACCGA
GCGTGGCTACTCTTTCACA**CACAGCAGAGCGTGAAATCGTCAGAGACATCAAGGAGAG
CTCTGCTACATTG

QA 12 684 12 684
DS 



CO CL148Contig3 1320 12 30 U
TTTTTTGGCTTCGAGAAACGTATCAACAATGGCTGACGGTGAAGACATTCAACCTCTTGT
TTGCGACAATGGAACTGGAATGGTTAAAGCTGGTTTTGCTGGGGATGATGCACCTCGAGC
CGTGTTCCCCAGCATCGTGGGTCGTCCACGTCACACCGGTGTGATGGTTGGAATGGGACA
AAAGGATGCGTACGTTGGTGATGAAGCTCAATCCAAACGTGGTATTCTAACTCTCAAGTA
CCCTATTGAGCATGGTATTGTCAACAACTGGGACGACATGGAGAAGATCTGGCATCACAC
TTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCACCCGAGGAGCATCCCGTTCTCCTCACGGAAGCACC
TCTCAACCCTAAAGCTAACCGTGAGAAGATGACTCAAATCATGTTTGAGACTTTCAATGC
CCCTGCCATGTACGTGGCTATTCAGGCTGTGCTCTCCCTTTATGCCAGTGGTCGTACTAC
CGGTATTGTGCTTGACTCTGGAGATGGTGTGAGCCACACGGTTCCTATCTACGAGGGCTA
TGCGCTTCCACATGCCATCCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCTCACCGACGCGTT
TATGAAGATCCTAACCGAGCGTGGTTACTCTTTCACCACTACAGCAGAGCGTGAAATCGT
CAGAGACATAAAGGAGAAGCTCTGCTACATTGCTCTCGACTACGAGCAGGAGCTAGAGAC
ATCCAAAACAAGCTCATCTGTTGAGAAGAACTACGAGATGCCTGATGG*ACAAGTGATCA
CTATCGGTGCTGAACGTTTCCGTTGTCCTGAGGTTCTTTACCAGCCGTCTATGATTGGTA
TGGAGAATCCAGGTATCCATGAAACGACCTATAACTCCATAATGAAGTGTGATGTCGACA
TCAGGAAGGACTTGTATGGTAACATCGTCCTCAGTGGTGGAACTACAATGTTCCCTGGAA
TCGCTGATAGAATGAGTAAGGAGATCACTGCTTTGGCTCCAAGCAGCATGAAGATCAAAG
TTGTTGCACCTCCTGAGAGGAAATACTCTGTTTGGATTGGAGGGTCCATCTTGGCTTCAC
TCAGTACCTTCCAGCAGATGTGGATTGCTAAGGCAGAGTATGACGAGTCAGGCCCGTCTA
TTGTTCACAGGAAGTGCTTCTAAGTATGAAGTTCATCATTTTTCAGACAAGAAGCAAGCT
ACTCTTTGTTTTGGTTCTTTTATATTCATTTTATTTGAGTTCAACTTTCTTTTGAGTTAA
TAATGATTGATGACACATCTTTCTCTTTTAACTATTTTATAGCAATGTGGTTCATGTGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 40 55 40 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 45 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 45 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM82TF U 1
AF RR2FZ30TF U 1
AF RR2B158TF U 60
AF RR2AP04TF U 32
AF RR2FU83TF U 197
AF RR2BA67TF U 288
AF RR2BA67JQ C 460
AF RR2AP04JQ C 687
AF RR2FU83JQ C 753
AF RR2FC52TF U 556
AF RR2B158JQ C 565
AF RR2FZ30JQ C 530
BS 1 266 RR2FM82TF
BS 267 267 RR2FZ30TF
BS 268 433 RR2FM82TF
BS 434 434 RR2FZ30TF
BS 435 605 RR2FM82TF
BS 606 606 RR2AP04TF
BS 607 636 RR2FM82TF
BS 637 637 RR2FZ30TF
BS 638 677 RR2FM82TF
BS 678 678 RR2AP04TF
BS 679 709 RR2FM82TF
BS 710 710 RR2AP04TF
BS 711 727 RR2FM82TF
BS 728 730 RR2AP04TF
BS 731 746 RR2FZ30TF
BS 747 812 RR2AP04TF
BS 813 813 RR2FU83TF
BS 814 886 RR2AP04TF
BS 887 935 RR2FU83TF
BS 936 979 RR2BA67TF
BS 980 980 RR2FC52TF
BS 981 1057 RR2BA67TF
BS 1058 1081 RR2FC52TF
BS 1082 1083 RR2BA67JQ
BS 1084 1257 RR2FC52TF
BS 1258 1258 RR2BA67JQ
BS 1259 1290 RR2FC52TF
BS 1291 1291 RR2BA67JQ
BS 1292 1314 RR2FC52TF
BS 1315 1320 RR2BA67JQ

RD RR2FM82TF 739 0 0
TTTTTTGGCTTCGAGAAACGTATCAACAATGGCTGACGGTGAAGACATTCAACCTCTTGT
TTGCGACAATGGAACTGGAATGGTTAAAGCTGGTTTTGCTGGGGATGATGCACCTCGAGC
CGTGTTCCCCAGCATCGTGGGTCGTCCACGTCACACCGGTGTGATGGTTGGAATGGGACA
AAAGGATGCGTACGTTGGTGATGAAGCTCAATCCAAACGTGGTATTCTAACTCTCAAGTA
CCCTATTGAGCATGGTATTGTCAACAGCTGGGACGACATGGAGAAGATCTGGCATCACAC
TTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCACCCGAGGAGCATCCCGTTCTCCTCACGGAAGCACC
TCTCAACCCTAAAGCTAACCGTGAGAAGATGACTCAAATCATGTTTGAGACTTTCAATGC
CCCTGCCATGTACATGGCTATTCAGGCTGTGCTCTCCCTTTATGCCAGTGGTCGTACTAC
CGGTATTGTGCTTGACTCTGGAGATGGTGTGAGCCACACGGTTCCTATCTACGAGGGCTA
TGCGCTTCCACATGCCATCCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCTCACCGACGCGTT
TATGA*GATCCTAACCGAGCGTGGTTACTCTTTCAC*ACTACAGCAGAGCGTGAAATCGT
CAGAGACATAAAGGAGA*GCTCTGCTACATTGCTCTCGACTACGAGCAG*AGCTAGAGAC
ATCCAAA
CAGCTCATCTGT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2FZ30TF 752 0 0
TTTTTTGGTTTCGAGAAACGTATCAACAATGGCTGACGGTGAAGACATTCAACCTCTTGT
TTGCGACAATGGAACTGGAATGGTTAAAGCTGGTTTTGCTGGGGATGATGCACCTCGAGC
CGTGTTCCCCAGCATCGTGGGTCGTCCACGTCACACCGGTGTGATGGTTGGAATGGGACA
AAAGGATGCGTACGTGGGTGATGAAGCTCAATCCAAACGTGGTATTCTAACTCTCAAGTA
CCCTATTGAGCATGGTATTGTCAACAACTGGGACGACATGGAGAAGATCTGGCATCACAC
TTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCACCCGAGGAGCATCCCGTTCTCCTCACGGAAGCACC
TCTCAACCCTAAAGCTAACCGTGAGAAGATGACTCAAATCATGTTTGAGACTTTCAATGC
CCCTGCCATGTACGTGGCTATTCAGGCTGTGCTCTCCCTTTATGCCAGTGGTCGTACTAC
CGGTATTGTGCTTGACTCTGGAGATGGTGTGAGTCACACGGTTCCTATCTACGAGGGCTA
TGCGCTTCCACATGCCATCCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCTCACCGACGCGTT
TATGA*GATCCTAACCGAGCGTGGTTACTCTTTCACCACTACAGCAGAGCGTGAAATCGT
CAGAGACATAAAGGAGA*GCTCTGCTACATTGCTCTCGACTACGAGCAG*AGCTAGAGAC
ATCCAAAC**AGCTCATCTGTTGAGA
GACTAC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2B158TF 759 0 0
TTTGCGACAATGGAACTGGAATGGTTAAAGCTGGTTTTGCTGGGGATG***CACCTCGAT
CCGTGTTCCCCAGCATCGTGGGTCGTCCACGTCACACCGGTGTGATGGTTGGAATGGGAC
AAAAGGATGCGTACGTTGGTGATGAAGCTCAATCCAAACGTGGTATTCTAACTCTCAAGT
ACCCTATTGAGCATGGTATTGTCAACAACTGGGACGACATGGAGAAGATCTGGCATCACA
CTTTCTACAACGAGCTCTGTGTTGCACCCGAGGAGCATCCCGTTCTCCTCACGGAAGCAC
CTCTCAACCCTAAAGCTAACCGTGAGAAGATGACTCAAATCATGTTTGAGACTTTCAATG
CCCCTGCCATGTACGTGGCTATTCAGGCTGTGCTCTCCCTTTATGCCAGTGGTCGTACTA
CCGGTATTGTGCTTGACTCTGGAGATGGTGTGAGCCACACGGTTCCTATCTACGAGGGCT
ATGCGCTTCCACATGCCATCCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCTCACCGACGCGT
TTATGAAGATCCTAACCGAGCGTGGTTACTCTTTCACCACTACAGCAGAGCGTGAAATCG
TCAGAGACATAAAGGAGAAGCTCTGCTACATTGCTCTCGACTACGAGCAGGAGCTAGAGA
CATCCAAAACAAGCTCATCTGTTGAGAAGAACTACGAGATGCCTGATGGGACAAGTGATC
ACTATCGGTGCTGAACGTTTCCGTTGTCCTGAG
TTCTTT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2AP04TF 855 0 0
GCTGACGGTGAAGACATTCAACCTCTTGTTTGCGACAATGGAACTGGAATGATTAAAGCT
GGTTTTGCTGGGGATGATGCACCTCGAGCCGTGTTCCCCAGCATCGTGGGTCGTCCACGT
CACACCGGTGTGATGGTTGGAATGGGACAAAAGGATGCGTACGT****GATGAAGCTCAA
TCCAAACGTGGTATTCTAACTCTCAAGTACCCTATTGAGCATGGTATTGTCAACAACTGG
GACGACATGGAGAAGATCTGGCATCACACTTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCACCCGAG
GAGCATCCCGTTCTCCTCACGGAAGCACCTCTCAACCCTAAAGCTAACCGTGAGAAGATG
ACTCAAATCATGTTTGAGACTTTCAATGCCCCTGCCATGTACGTGGCTATTCAGGCTGTG
CTCTCCCTTTATGCCAGTGGTCGTACTACCGGTATTGTGCTTGACTCTGGAGATGGTGTG
AGCCACACGGTTCCTATCTACGAGGGCTATGCGCTTCCACATGCCATCCTACGTCTTGAT
CTCGCGGGTCGTGACCTCACCGACGCGTTTATGAAGATCCTAACCGAGCGTGGTTACTCT
TTCACCACTACAGCAGAGCGTGAAATCGTCAGATACATAAAGGAGAAGCTCTGCTACATT
GCTCTCGACTACGAGCAGGAGCTAGAGACATCCAAAACAAGCTCATCTGTTGAGAAGAAC
TACGAGATGCCTGATGG*ACAAGTGATCACTATCGGTGCTGAACGTTTCCGTTGTCCTGA
G*TTCTTTACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTATCCATGAAACGACCTA
TAACTCCATAATGAA

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR2FU83TF 739 0 0
GGTGATGAAGCTCAATCCAAACGTGGTATTCTAACTCTCAAGTACCCTATTGAGCATGGT
ATTGTCAACAACTGGGACGACATGGAGAAGATCTGGCATCACACTTTCTACAACGAGCTC
CGTGTTGCACCCGAGGAGCATCCCGTTCTCCTCACGGAAGCACCTCTCAACCCTAAAGCT
AACCGTGAGAAGATGACTCAAATCATGTTTGAGACTTTCAATGCCCCTGCCATGTACGTG
GCTATTCAGGCTGTGCTCTCCCTTTATGCCAGTGGTCGTACTACCGGTATTGTGCTTGAC
TCTGGAGATGGTGTGAGCCACACGGTTCCTATCTACGAGGGCTATGCGCTTCCACATGCC
ACCCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCTCACCGACGCGTTTATGAAGATCCTAACC
GAGCGTGGTTACTCTTTCACCACTACAGCAGAGCGTGAAATCGTCAGAGACATAAAGGAG
AAGCTCTGCTACATTGCTCTCGACTACGAGCAGGAGCTAGAGACATCCAAAACAAGCTCA
TCTGTTGAGAAGAACTACGAGATGCCTGATGG*ACAAGTGATCACTATCGGTGCTGAACG
TTTCCGTTGTCCTGAGGTTCTTTACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTAT
CCATGAAACGACCTATAACTCCATAATGAAGTGTGATGTCGACATCAGGAAGGACTTGTA
TGGTAACATCGTCCTCAGT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2BA67TF 770 0 0
G
CTGGCATCACACTTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCACCCGAGGAGCATCCCGTTCTCCT
CACGGAAGCACCTCTCAACCCTAAAGCTAACCGTGAGAAGATGACTCAAATCATGTTTGA
GACTTTCAATGCCCCTGCCATGTACGTGGCTATTCAGGCTGTGCTCTCCCTTTATGCCAG
TGGTCGTACTACCGGTATTGTGCTTGACTCTGGAGATGGTGTGAGCCACACGGTTCCTAT
CTACGAGGGCTATGCGCTTCCACATGCCATCCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCT
CACCGACGCGTTTATGAAGATCCTAACCGAGCGTGGTTACTCTTTCACCACTACAGCAGA
GCGTGAAATCGTCAGAGACATAAAGGAGAAGCTCTGCTACATTGCTCTCGACTACGAGCA
GGAGCTAGAGACATCCAAAACAAGCTCATCTGTTGAGAAGAACTACGAGATGCCTGATGG
*ACAAGTGATCACTATCGGTGCTGAACGTTTCCGTTGTCCTGAGGTTCTTTACCAGCCGT
CTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTATCCATGAAACGACCTATAACTCCATAATGAAGT
GTGATGTCGACATCAGGAAGGACTTGTATGGTAACATCGTCCTCAGTGGTGGAACTACAA
TGTTCCCTGGAATCGCTGATAGAATGAGTAAAGAGATCACTGCTTTGGCTCCAAGCAGCA
TGAAGATCAAAGTTGTTGCACCTCCTGAGAGGAAATACTCTGTTTGGAT

QA 2 770 2 770
DS 

RD RR2BA67JQ 861 0 0
TTATGCCAGTGGTCGTACTACCGGTATTGTGCTTGACTCTGGAGATGGTGTGAGCCACAC
GGTTCCTATCTACGAGGGCTATGCGCTTCCACATGCCATC*TACGTCTTGATCTCGCGGG
TCGTGACCTCACCGACGCGTTTATGAAGATCCTAACCGAGCGTGGTTACTCTTTCACCAC
TACAGCAGAGCGTGAAATCGTCAGAGACATAAAGGAGAAGCTCTGCTACATTGCTCTCGA
CTACGAGCAGGAGCTAGAGACATCCAAAACAAGCTCATCTGTTGAGAAGAACTACGAGAT
GCCTGATGG*ACAAGTGATCACTATCGGTGCTGAACGTTTCCGTTGTCCTGAGGTTCTTT
ACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTATCCATGAAACGACCTATAACTCCA
TAATGAAGTGTGATGTCGACATCAGGAAGGACTTGTATGGTAACATCGTCCTCAGTGGTG
GAACTACAATGTTCCCTGGAATCGCTGATAGAATGAGTAAGGAGATCACTGCTTTGGCTC
CAAGCAGCATGAAGATCAAAGTTGTTGCACCTCCTGAGAGGAAATACTCTGTTTGGATTG
GAGGGTCCATCTTGGCTTCACTCAGTACCTTCCAGCAGATGTGGATTGCTAAGGCAGAGT
ATGACGAGTCAGGCCCGTCTATTGTTCACAGGAAGTGCTTCTAAGTATGAAGTTCATCAT
TTTTCAGACAAGAAGCAAGCTACTCTTTGTTTTGGTTCTTTTATATTCATTTTATTTGAG
TTCAACTTTCTTTTGAGTTAATAATGATTGATGACACATCTTTCTCTTTTAACTATTTTA
TAGCAATGTGGTTCATGTGCC

QA 1 861 1 861
DS 

RD RR2AP04JQ 633 0 0
ACATTGCTCTCGACTACGAGCAGGAGCTAGAGACATCCAAAACAAGCTCATCTGTTGAGA
AGAACTACGAGATGCCTGATGG*ACAAGTGATCACTATCGGTGCTGAACGTTTCCGTTGT
CCTGAGGTTCTTTACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTATCCATGAAACG
ACCTATAACTCCATAATGAAGTGTGATGTCGACATCAGGAAGGACTTGTATGGTAACATC
GTCCTCAGTGGTGGAACTACAATGTTCCCTGGAATCGCTGATAGAATGAGTAAGGAGATC
ACTGCTTTGGCTCCAAGCAGCATGAAGATCAAAGTTGTTGCACCTCCTGAGAGGAAATAC
TCTGTTTGGATTGGAGGGTCCATCTTGGCTTCACTCAGTACCTTCCAGCAGATGTGGATT
GCTAAGGCAGAGTATGACGAGTCAGGCCCGTCTATTGTTCACAGGAAGTGCTTCTAAGTA
TGAAGTTCATCATTTTTCAGACAAGAAGCAAGCTACTCTTTGTTTTGGTTCTTTTATATT
CATTTTATTTGAGTTCAACTTTCTTTTGAGTTAATAATGATTGATGACACATCTTTCTCT
TTTAACTATTTTATAGCAATGTGGTTC
GTGTAC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2FU83JQ 522 0 0
ACGAGATGCCTGATGG*ACAAGTGATCACTATCGGTGCTGAACGTTTCCGTTGTCCTGAG
GTTCTTTACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTATCCATGAAACGACCTAT
AACTCCATAATGAAGTGTGATGTCGACATCAGGAAGGACTTGTATGGTAACATCGTCCTC
AGTGGTGGAACTACAATGTTCCCTGGAATCGCTGATAGAATGAGTAAGGAGATCACTGCT
TTGGCTCCAAGCAGCATGAAGATCAAAGTTGTTGCACCTCCTGAGAGGAAATACTCTGTT
TGGATTGGAGGGTCCATCTTGGCTTCACTCAGTACCTTCCAGCAGATGTGGATTGCTAAG
GCAGAGTATGACGAGTCAGGCCCGTCTATTGTTCACAGGAAGTGCTTCTAAGTATGAAGT
TCATCATTTTTCAGACAAGAAGCAAGCTACTCTTTGTTTTGGTTCTTTTATATTCATTTT
ATTTGAGTTCAACTTTCTTTTGAGTTAATAATGATTGATGAC

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2FC52TF 759 0 0
G
ATCCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCTCACCGACGCGTTTATGAAGATCCTAACC
GAGCGTGGTTACTCTTTCACCGCTACAGCAGAGCGTGAAATCGTCAGAGACATAAAGGAG
AAGCTCTGCTACATTGCTCTCGACTACGAGCAGGAGCTAGAGACATCCAAAACAAGCTCA
TCTGTTGAGAAGAACTACGAGATGCCTGATGG*ACAAGTGATCACTATCGGTGCTGAACG
TTTCCGTTGTCCTGAGGTTCTTTACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTAT
CCACGAAACGACCTATAACTCCATAATGAAGTGTGATGTCGACATCAGGAAGGACTTGTA
TGGTAACATCGTCCTCAGTGGTGGAACTACAATGTTCCCTGGAATCGCTGATAGAATGAG
TAAGGAGATCACTGCTTTGGCTCCAAGCAGCATGAAGATCAAAGTTGTTGCACCTCCTGA
GAGGAAATACTCTGTTTGGATTGGAGGGTCCATCTTGGCTTCACT**GTACCTTCCAGCA
GATGTGGATTGCTAAGGCAGAGTATGACGAGTCAGGCCCGTCTATTGTTCACAGGAAGTG
CTTCTAAGTATGAAGTTCATCATTTTTCAGACAAGAAGCAAGCTACTCTTTGTTTTGGTT
CTTTTATATTCATTTTATTTGAGTTCAACTTTCTTTTGAGT*AATAATGATTGATGACAC
ATCTTTCTCTTTTA*CTATTTTATAGCAATGTGGTTCA

QA 2 759 2 759
DS 

RD RR2B158JQ 755 0 0
TCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCTCACCGACGCGTTTATGAAGATCCTAACCGAGCGTGG
TTACTCTTTCACCACTACAGCAGAGCGTGAAATCGTCAGAGACATAAAGGAGAAGTTCTG
CTACATTGCTCTCGACTACGAGCAGGAGCTAGAGACATCCAAAACAAGCTCATCTGTTGA
GAAGAACTACGAGATGCCTGATGG*ACAAGTGATCACTATCGGTGCTGAACGTTTCCGTT
GTCCTGAGGTTCTTTACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTATCCAGGAAA
CGACCTATAACTCCATAATGAAGTGTGATGTCGACATCAGGAAGGACTTGTATGGTAACA
TCGTCCTCAGTGGTGGAACTACAATGTTCCCTGGAATCGCTGATAGAATGAGTAAGGAGA
TCACTGCTTTGGCTCCAAGCAGCATGAAGATCAAAGTTGTTGCACCTCCTGAGAGGAAAT
ACTCTGTTTGGATTGGAGGGTCCATCTTGGCTTCACTCAGTACCTTCCAGCAGATGTGGA
TTGCTAAGGCAGAGTATGACGAGTCAGGCCCGTCTATTGTTCACAGGAAGTGCTTCTAAG
TATGAAGTTCATCATTTTTCAGACAAGAAGCAAGCTACTCTTTGTTTTGGTTCTTTTATA
TTCATTTTATTTGAGTTCAACTTTCTTTTGAGTTAATAATGATTGATGACACATCTTTCT
CTTTTAACTATTTTATAGCAATGTGGTTCA
TGTGC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2FZ30JQ 791 0 0
TACGAGGGCTATGCGCTTCCACATGCCATCCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCTC
ACCGACGCGTTTATGAAGATCCTAACCGAGCGTGGTTACTCTTTCACCACTACAGCAGAG
CGTGAAATCGTCAGAGACATAAAGGAGAAGCTCTGCTACATTGCTCTCGACTACGAGCAG
GAGCTAGAGACATCCAAAACAAGCTCATCTGTTGAGAAGAACTACGAGATGCCTGATGG*
ACAAGTGATCACTATCGGTGCTGAACGTTTCCGTTGTCCTGAGGTTCTTTACCAGCCGTC
TATGATTGGTGTGGAGAATCCAGGTATCCATGAAACGACCTATAACTCCATAATGAAGTG
TGATGTCGACATCAGGAAGGACTTGTATGGTAACATCGTCCTCAGTGGTGGAACTACAAT
GTCCCCTGGAATCGCTGATAGAATGAGTAAGGAGATTACTGCTTTGGCTCCAAGCAGCAT
GAAGATCAAAGTTGTTGCACCTCCTGAGAGGAAATACTCTGTTTGGATTGGAGGGTCCAT
CTTGGCTTCACTCAGTACCTTCCAGCAGATGTGGATTGCTAAGGCAGAGTATGACGAGTC
AGGCCCGTCTATTGTTCACAGGAAGTGCTTCTAAGTATGAAGTTCATCATTTTTCAGACA
AGAAGCAAGCTACTCTTTGTTTTGGTTCTTTTATATTCATTTTATTTGAGTTCAACTTTC
TTTTGAGTTAATAATGATTGATGATACATCTTTCTCTTTTAACTATTTTATAGCAATGTG
GTTCA
TGTGCT

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 18

CO CL149Contig1 653 18 4 U
GGAAAAGGATCAACACAGAAAAGCAAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTT
CTCACTAACACTTTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATG
GTCTGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAG
AGGAGCCGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAA
TGGTAGCAGGGACAGAACTGGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTG
GTCTGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGT
AAACAAGAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAA
ACACAACAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAA
CTAGCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACATAATTAAT
CTCAATAAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCA
CTCGTGTAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTACTTATCA


BQ
10 10 10 35 35 35 10 10 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 70 95 80 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 80 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 80 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 55 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 40 40 30 10 10 10 

AF RR2FO14JQ C 311
AF RR2EB23TF U 1
AF RR2FX45JQ C 291
AF RR2EM69TF U 2
AF RR2FX45TF U 2
AF RR2FO14TF U 1
AF RR2EZ87JQ C 113
AF RR2B469JQ C 7
AF RR2B469TF U 7
AF RR2D959TF U 16
AF RR2D723JQ C 7
AF RR2DD54JQ C 494
AF RR2D723TF U 7
AF RR2DD54TF U 7
AF RR2EU29TF U 7
AF RR2EZ87TF U 7
AF RR2G875TF U 1
AF RR2H330TF U 2
BS 1 6 RR2EB23TF
BS 7 8 RR2B469TF
BS 9 647 RR2EB23TF
BS 648 653 RR2FO14TF

RD RR2FO14JQ 153 0 0
TGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATGAGTTTTTTGTAAACAAGAAC
GCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAAACCCAACAAT
GTCAACGATAATTATGAAGGGAAAGAGG
GGGCA

QA 1 148 1 148
DS 

RD RR2EB23TF 647 0 0
GGAAAACTATCAACACAGAAAAGCAAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTT
CTCACTAACACTTTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATG
GTCTGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAG
AGGAGCCGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAA
TGGTAGCAGGGACAGAACTGGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTG
GTCTGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGT
AAACAAGAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAA
ACACAACAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAA
CTAGCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACATAATTAAT
CTCAATAAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCA
CTCGTGTAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTAC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2FX45JQ 357 0 0
TGACTTGCTGGTCTGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATG
AGTCTTTCGTAAACAAGAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCG
AGACGTTCAAACACAACAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACAC
CACAATCTAACTAGCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTT*GAATTTATAATAATTAA
CATAATTAATCTCAATAAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTG
GAATATTTCACTCGTGTAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTAC

QA 1 357 1 357
DS 

RD RR2EM69TF 631 0 0
GG
AAACTATCAACACAGAAAAGCAAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCTC
ACTAACACTTTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTC
TGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAGAGG
AGCCGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAATGG
TAGCGGGGACAGAACTTGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTC
TGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGTAAA
CAAGAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAAACA
CAACAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTA
GCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACATAATTAATCTC
AATAAGTCTCATCAGATCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTC
GTGTAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAG

QA 3 631 3 631
DS 

RD RR2FX45TF 646 0 0
GG
AAACTATCAACACAGAAAAGCAAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCTC
ACTAACACTTTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTC
TGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCCTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAGAGG
AGCCGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAATGG
TAGCAGGGACAGAACTGGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTC
TGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGTAAA
CAAGAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAAACA
CAACAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTA
GCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTT*GAATTTATAATAATTAACATAATTAATCTC
AATAAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTC
GTGTAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTAC

QA 3 646 3 646
DS 

RD RR2FO14TF 653 0 0
GGA
AAACTATCAACACAGAAAAGCAAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCTC
ACTAACACTTTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTC
TGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAGAGG
AGCCGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAATGG
TAGCAGGGACAGAACTGGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTC
TGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGTAAA
CAAGAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAAACA
CAACAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTA
GCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACATAATTAATCTC
AATAAGTCTCATCAGGCCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTC
GTGTAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAA*TTTTACTTATCA

QA 4 653 4 653
DS 

RD RR2EZ87JQ 536 0 0
CAGAAATGGTCTGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTT
TGCATTAGAGGAGCCGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATT
CGATACAATGGTAGCAGGGACAGAACTGGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTG
ACTTGCTGGTCTGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATGAG
TCTCTCGTAAACAAGAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAGCATCCC*GAG
ACGTTCAAACACAACAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACACCA
CAATCTAACTAGCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACA
TAATTAATCTCAATAAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGA
ATATTTCACTCGTGTAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTAC
C

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2B469JQ 607 0 0
GGATCAACACAGAAAAGCAAAAATGACAGAACTCGAATGGATATGCCTTTGCTTCTCACT
AACACTTTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTCTGT
TGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAGAGGAGC
CGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAATGGTAG
CAGGGACAGAACTGGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCTGG
CTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGTAAACAA
GAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAAACACAA
CAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACGCCACAATCTAACTAGCT
AATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACATAATTAATCTCAAT
AAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTG
TAAACAG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2B469TF 607 0 0
GGATCAACACAGAAAAGCAAAAATGACAGAACTCGAATGGATATGCCTTTGCTTCTCACT
AACACTTTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTCTGT
TGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAGAGGAGC
CGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAATGGTAG
CAGGGACAGAACTGGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCTGG
CTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGTAAACAA
GAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAAACACAA
CAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACGCCACAATCTAACTAGCT
AATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACATAATTAATCTCAAT
AAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTG
TAAACAG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2D959TF 635 0 0
CAGAAAAGCAAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCTCACTAACACTTTT
GCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTCTGTTGGAAACCA
CTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAGAGGAGCCGGTGGGAG
CAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAATGGTAGCAGGGACAG
AACTGGTTTCAGGGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCTGGCTCATGTGA
TGCACTCCATTTGCATTTGGACAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGTAAACAAGAACGCAGC
AAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAAACACAACAATGTCAA
CGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCTAATGAAGTT
TTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACATAATTAATCTCAATAAGTCTCAT
CAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTGTAAACAGAG
AAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTACTTA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2D723JQ 646 0 0
GGATCAACACAGAAAAGCAAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCCCACT
AACACTTTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTCTGT
TGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAGAGGAGC
CGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAATGGTAG
CAGGGACAGAACTGGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCTGG
CTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGCCAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGTAAACAA
GAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAAACACAA
CAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCT
AATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACATAATTAATCTCAAT
AAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTG
TAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTACTTA
TC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2DD54JQ 156 0 0
TTTTTAGTTTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACATAATTAATTTCAATAAGTTTC
ATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTTGTGTAAACAG
AGAAATAATAAAATAGTAGAATAACAAATTTTACTT

QA 1 156 1 156
DS 

RD RR2D723TF 599 0 0
GGATCAACACAGAAAAGCAAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCCCACT
AACACTTTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTCTGT
TGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAGAGGAGC
CGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAATGGTAG
CAGGGACAGAACTGGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCTGG
CTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGCCAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGTAAACAA
GAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAAACACAA
CAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCT
AATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACATAATTAATCTCAAT
AAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2DD54TF 643 0 0
GGATCAACACAGAAAAGCAAAACTGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCTCACT
AACACTTTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTCTGT
TGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAGAGGAGC
CGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAATGGTAG
CAGGGACAGAACTGGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCTGG
CTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGTAAACAA
GAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAAACACAA
CAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCT
AATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACATAATTAATCTCAAT
AAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTG
TAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTACTT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2EU29TF 613 0 0
GGATCAACACAGAAAAGCAAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCTCACT
AACACTTTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTCTGT
TGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAGAGGAGC
CGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAATGGTAG
CAGGGACAGAACTGGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCTGG
CTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGTAAACAA
GAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAAACACAA
CAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCT
AATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACATAATTAATCTCAAT
AAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTG
TAAACAGAGAAAT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2EZ87TF 642 0 0
GGATCAACACAGAAAAGCAAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCTCACT
AACACTTTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTCTGT
TGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAGAGGAGC
CGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAATGGTAG
CAGGGACAGAACTGGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTCTGG
CTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGTAAACAA
GAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAGCATCCC*GAGACGTTCAAACACAA
CAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTAGCT
AATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACATAATTAATCTCAAT
AAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTCGTG
TAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTAC
C

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2G875TF 650 0 0
GGA
AAACTATCAACACAGAAAAGCAAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCTC
ACTAACACTTTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTC
TGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAGAGG
AGCCGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAATGG
TAGCAGGGACAGAACTGGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGCC
TGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGTAAA
CAAGAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAAACA
CAACAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTA
GCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATAATAATTAACATAATTAATCTC
AATAAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTC
GTGTAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATA*CAAATTTTACTTA

QA 4 650 4 650
DS 

RD RR2H330TF 648 0 0
GG
AAACTATCAACACAGAAAAGCAAAAATGACAGAACTCAAATGGATATGCCTTTGCTTCTC
ACTAACACTTTTGCTCAGCTTAGCAGTTGGATCACATAACACAGTCTCTCAGAAATGGTC
TGTTGGAAACCACTTTGGTTACGATGGAGGCTTTTGTCTTCCCGGTCTTTGCATTAGAGG
AGCCGGTGGGAGCAGAGTCAATTTTGGCCGTGGTGGTCGTGGAAGAATTCGATACAATGG
TAGCAGGGACAGAACTGGTTTCAGAGAGACAATGTACTGCAAACCGCTGACTTGCTGGTC
TGGCTCATGTGATGCACTCCATTTGCATTTAGACAAAGGGCTGTATGAGTCTCTCGTAAA
CAAGAACGCAGCAAAACAACCATCAACTGTTGATTACAACATCCCCGAGACGTTCAAACA
CAACAATGTCAACGATAATTATGAAGTGAAAGAGGCTGCAATGACACCACAATCTAACTA
GCTAATGAAGTTTTTAGTCTTTTGTCGTTTGAATTTATATTAATTAACATAATTAATCTC
AATAAGTCTCATCAGACCGAGATGTTGTTATCACAAGAACATTAGTGGAATATTTCACTC
GTGTAAACAGAGAAATAATAAACTAGTAGAATAACAAATTTTAC
CA

QA 3 646 3 646
DS 



AS 1 17

CO CL150Contig1 718 17 11 U
GGAAAGGAAAACAAAATCAAAGCTTTGAAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCCAAA
AAA**TCAAACTTAATTCCAAAGGAGAAGAATACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAG
TTTATCTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGG
CGAAGTCCGCCCTTCTCGGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAG
ATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGC
AATCAAACGCTGCATCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCA
GACGAGTTGTGTCGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTG
AAGTGGCTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCAT
GGCTTTTCTCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTAGTCCTATCTACTAACTTC
ATTTCTTTATTCAACAATATCCAAATGCAATCAAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGA
AGCTATTATTAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTC
ATAAATAAA*GGCCAAAGATGCTATAAAGATGTGATGAAATTACTGAAATTTTTCCCC


BQ
65 65 65 65 65 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 65 80 80 80 80 80 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 35 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 60 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 35 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 35 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 35 95 80 95 80 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 35 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 30 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 30 90 90 
90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 55 
70 65 65 65 50 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2G236TF U 1
AF RR2GF41TF U 1
AF RR2EU86JQ C 6
AF RR2G961TF U 1
AF RR2EU86TF U 6
AF RR2AJ31TF U 1
AF RR2BO14TF U 1
AF RR2C757TF U 1
AF RR2CF74TF U 1
AF RR2CF74JQ C 1
AF RR2AW74TFB U 135
AF RR2GF41JQ C 1
AF RR2G329JQ C 141
AF RR2C757JQ C 185
AF RR2G329TF U 141
AF RR2FM89JQ C 1
AF RR2FM89TF U 1
BS 1 157 RR2AJ31TF
BS 158 158 RR2BO14TF
BS 159 502 RR2AJ31TF
BS 503 503 RR2BO14TF
BS 504 588 RR2AJ31TF
BS 589 589 RR2BO14TF
BS 590 669 RR2AJ31TF
BS 670 670 RR2C757TF
BS 671 702 RR2AJ31TF
BS 703 713 RR2FM89TF
BS 714 718 RR2FM89JQ

RD RR2G236TF 559 0 0
GGAAAGGAAAACAAAATCAAAGCTTTGAAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCCAAA
AAA**TCAAACTTAATTCCAAAGGAGAAGAATACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAG
TTTATCTTATCAGACTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGG
CGAAGTCCGCCCTTCTCGGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAG
ATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGC
AATCAAACGCTGCATCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCA
GACGAGTTGTGTCGGCTCAAAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTG
AAGTGGCTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCAT
GGCTTTTCTCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTAGTCCTATCTACTAACTTC
ATTTCTTTATTCAACAATA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2GF41TF 639 0 0
GGAAAGGAAAACAAAATCAAAGCTTTGAAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCCAAA
AAA**TCAAACTTAATTCCAAAGGAGAAGAATACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAG
TTTATCTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGG
CGAAGTCCGCCCTTCTCGGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAG
ATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGC
AATCAAACGCTGCATCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCA
GACGAGTTGTGTCGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTG
AAGTGGCTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCAT
GGCTTTTCTCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTAGTCCTATCTACTAACTTC
ATTTCTTTATTCAACAATATCCAAATGCAATCAAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGA
AGCTATTATTAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2EU86JQ 616 0 0
GGAAAACAAAATCAAAGCTTT*AAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCCAAAAAAAA
TCAAACTTAAG*CCAAAGGAGAAGAATACAAAAGTTATAGGCAATATGTCAAAAGTTTCT
CTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAAG
TCCGCCCTTCTCGGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAGATTCA
AGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGCAAACA
AACGCTGCATCCACTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCAGACGA
GTTGTGTCGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTGAAGTG
GGTCAACCCGATGGCACCAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCATGGCTT
TTTTCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCTACTAACTTCATTTC
TTTATTCAACAATATCCAAATGCAATCCAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGAAGTTA
TTATTAACAATGGGCT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2G961TF 620 0 0
GGAAAGTAAAACAAAATCAAAGCTTT*AAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCCAAA
AAAAATCAAACTTAAG*CCAAAGGAGAAGAATACAAAAGTTATAAACAATATGTCAAAAG
TTTCTCTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGG
CGAAGTCCGCCCTTCTCCGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAG
ATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGC
AAACAAACGCTGCATCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCA
GACGAGTTGTGTCGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTG
AAGTGGGTCAACCCGATGGCACCAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCAT
GGCTTTTTTCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCTACTAACTTC
ATTTCTTTATTCAACAATATCCAAATGCAATCCAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGA
AGTTATTATTGACAATGGGC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2EU86TF 658 0 0
GGAAAACAAAATCAAAGCTTT*AAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCCAAAAAAAA
TCAAACTTAAG*CCAAAGGAGAAGAATACAAAAGTTATAGGCAATATGTCAAAAGTTTCT
CTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAAG
TCCGCCCTTCTCGGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAGATTCA
AGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGCAAACA
AACGCTGCATCCACTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCAGACGA
GTTGTGTCGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTGAAGTG
GGTCAACCCGATGGCACCAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCATGGCTT
TTTTCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCTACTAACTTCATTTC
TTTATTCAACAATATCCAAATGCAATCCAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGAAGTTA
TTATTAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGT
CCGAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2AJ31TF 706 0 0
GGAAAGGAAAACAAAATCAAAGCTTTGAAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCCAAA
AAA**TCAAACTTAATTCCAAAGGAGAAGAATACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAG
TTTATCTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTAATGGCCGTCGTGACTCCATCGG
CGAAGTCCGCCCTTCTCGGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAG
ATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGC
AATCAAACGCTGCATCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCA
GACGAGTTGTGTCGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTG
AAGTGGCTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCAT
GGCTTTTCTCTAAGAAGTTGCTTGAATTCACTCCTGTTGCTAGTCCTATCTACTAACTTC
ATTTCTTTATTCAACAATATCCAAATGCAATCAAAAAGACCAAAAATGCGCATGATATGA
AGCTATTATTAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTC
ATAAATAAAAGGCCAAAGATGCTATAAAGATGTGATGAAATT
ACTG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2BO14TF 666 0 0
GGAAAGGAAAACAAAATCAAAGCTTTGAAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCCAAA
AA***TCAAACTTAATTCCAAAGGAGAAGAATACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAG
TTTATCTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGG
CGAAGTCCGCCCTTCTCGGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAG
ATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGC
AATCAAACGCTGCATCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCA
GACGAGTTGTGTCGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTG
AAGTGGCTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTTACTCAGTTATAGTTATTCAACCAT
GGCTTTTCTCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTAGTCCTATCTACTAACTTC
ATTTCTTTATTCAACAATATCCAAATGCAATCAAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGA
AGCTATTATTAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTC
ATAAAT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2C757TF 697 0 0
GGAAAGGAAAACAAAATCAAAGCTTTGAAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCCAAA
AAA**TCAAACTTAATTCCAAAGGAGAAGAATACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAG
TTTATCTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGG
CGAAGTCCGCCCTTCTCGGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAG
ATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGC
AATCAAACGCTGCATCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCA
GACGAGTTGTGTCGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTG
AAGTGGCTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCAT
GGCTTTTCTCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTAGTCCTATCTACTAACTTC
ATTTCTTTATTCAACAATATCCAAATGCAATCAAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGA
AGCTATTATTAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTC
ATAAATAAA*GGCCAAAGATGCTATAAAGATGTGA
CG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2CF74TF 685 0 0
GGAAAGGAAAACAAAATCAAAGCTTTGAAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCCAAA
AAA**TCAAACTTAATTCCAAAGGAGAAGAATACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAG
TTTATCTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGG
CGAAGTCCGCCCTTCTCGGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAG
ATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGC
AATCAAACGCTGCATCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCA
GACGAGTTGTGTCGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTG
AAGTGGCTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCAT
GGCTTTTCTCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTAGTCCTATCTACTAACTTC
ATTTCTTTATTCAACAATATCCAAATGCAATCAAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGA
AGCTATTATTAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTC
ATAA*TAAA**GCCAAAGATGCTA
A

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2CF74JQ 683 0 0
GGAAAGGAAAACAAAATCAAAGCTTTGAAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCCAAA
AAA**TCAAACTTAATTCCAAAGGAGAAGAATACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAG
TTTATCTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGG
CGAAGTCCGCCCTTCTCGGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAG
ATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGC
AATCAAACGCTGCATCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCA
GACGAGTTGTGTCGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTG
AAGTGGCTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCAT
GGCTTTTCTCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTAGTCCTATCTACTAACTTC
ATTTCTTTATTCAACAATATCCAAATGCAATCAAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGA
AGCTATTATTAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTC
ATAAATAAA*GGCCAAAGATGCT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2AW74TFB 537 0 0
TTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAAGTCCGCCTTT
CTCGGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAGATTCAAGAACTTGG
AAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGCAATCAAACGCTGCA
TCCATTGTGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCAGACGAGTTGTGTCG
GCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTGAAGTGGCTCAACCC
GATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCATGGCTTTTCTCT**G
AAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTAGTCCTATCTACTAACTTCATTTCTTTATTCAA
CAATATCCAAATGCAATCAAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGAAGCTATTATTAACA
ATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTCATAAATAAAGG

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2GF41JQ 705 0 0
GGAAAGGAAAACAAAATCAAAGCTTTGAAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCCAAA
AAA**TCAAACTTAATTCCAAAGGAGAAGAATACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAG
TTTATCTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGG
CGAAGTCCGCCCTTCTCGGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAG
ATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGC
AATCAAACGCTGCATCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCA
GACGAGTTGTGTCGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATTTAAGGATTG
AAGTGGCTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCAT
GGCTTTTCTCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTAGTCCTATCTACTAACTTC
ATTTCTTTATTCAACAATATCCAAATGCAATCAAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGA
AGCTATTATTAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTC
ATAAATAAA*GGCCAAAGATGCTATAAAGATGTGATGAAATT
ACT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2G329JQ 562 0 0
TTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAAGTCCGCCCTTCTCGGA
GGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAGATTCAAGAACTTGGAAGGTA
CTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGCAATCAAACGCTGCATCCATT
GCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCAGACGAGTTGTGTCGGCTCAG
AAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATTTAAGGATTGAAGTGGCTCAACCCGATGGC
ACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCATGGCTTTTCTCTAAGAAGTTG
CTCGAATTCACTCCTGTTGCTAGTCCTATCTACTAACTTCATTTCTTTATTCAACAATAT
CCAAATGCAATCAAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGAAGCTATTATTAACAATGGGC
TAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTCATAAATAAA*GGCCAAAGAT
GCTATAAAGATGTGATGAAATT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2C757JQ 489 0 0
GTCCGCCCTTCTCGGAGGGAAAGTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAGATTC
AAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAAATTCAATCTACAAGAAAATGAGCGAGCAATC
AAACGCTGCATCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCAGACG
AGTTGTGTCGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATTTAAGGATTGAAGT
GGCTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCATGGCT
TTTCTCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTAGTCCTATCTACTAACTTCATTT
CTTTATTCAACAATATCCAAATGCAATCAAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGAAGCT
ATTATTAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTCATAA
ATAAA*GGC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2G329TF 562 0 0
TTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAAGTCCGCCCTTCTCGGA
GGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAGATTCAAGAACTTGGAAGGTA
CTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGCAATCAAACGCTGCATCCATT
GCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCAGACGAGTTGTGTCGGCTCAG
AAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTGAAGTGGCTCAACCCGATGGC
ACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCATGGCTTTTCTCTAAGAAGTTG
CTCGAATTCACTCCTGTTGCTAGTCCTATCTACTAACTTCATTTCTTTATTCAACAATAT
CCAAATGCAATCAAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGAAGCTATTATTAACAATGGGC
TAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTCATAAATAAA*GGCCAAAGAT
GCTATAAAGATGTGATGAAATT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2FM89JQ 718 0 0
GGAAAGTAAAACAAAATCAAAGCTTT*AAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCCAAA
AAAA*TCAAACTTAAG*CCAAAGGAGAAGAATACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAG
TTTCTCTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGG
CGAAGTCCGCCCTTCTCGGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAG
ATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGC
AAACAAACGCTGCATCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCA
GACGAGTTGTGTCGGTTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTG
AAGTGGGTCAACCCGATGGCACCAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCAT
GGCTTTTTTTTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCTACTAACTTC
ATTTCTTTATTCAACAATATCCAAATGCAATCCAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGA
AGTTATTATTAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTC
ATAAATAAA*GGCCAAAGATGTTATAAAGATGTGATGAAATTACTGAAATTTTTCCCC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2FM89TF 717 0 0
GGAAAGTAAAACAAAATCAAAGCTTT*AAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCCAAA
AAAA*TCAAACTTAAG*CCAAAGGAGAAGAATACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAG
TTTCTCTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGG
CGAAGTCCGCCCTTCTCGGAGGGAA*GTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAG
ATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAA*TTCAATCTACAAGAAA*TGAGCGAGC
AAACAAACGCTGCATCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCA
GACGAGTTGTGTCGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACCAAATACTATCTAAGGATTG
AAGTGGGTCAACCCGATGGCACCAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCAT
GGCTTTTTTCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCTACTAACTTC
ATTTCTTTATTCAACAATATCCAAATGCAATCCAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGA
AGTTATTATTAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTC
ATAAATAAA*GGCCAAAGATGTTATAAAGATGTGATGAA*TTACTGAAATTTT
CCCC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 2 17

CO CL151Contig1 1021 10 47 U
CTTCTCCATTGAGATTTTCTCTCCAAATTCAAAAACCAGAATCGAA*******AATGTTG
GCTGTGTTCGAGAAGACGGTAGCGAATAGCCCCGAAGCACTGCAGAGTCCCCACTCGGGA
TCATCGCCTTCGTACGCGTTGAAAGAAGGATATCTAGCGAGTCAATTCGTCTCCAAAAAC
TCAAACTCCGTCACGCTTAGCCTCGGATCCTCGGGAGTGCTCGCTTACTCTCTTGATAAC
ACCGATCCTCTTGTTCACAGATTGTTTGCGGTTGTGGATGACATCTTCTGCATCTTCAGA
GGACACATTGAGAACCTCCCGTTTCTGAGGCAGCAGTACGGGCTGAGCAAAGTCACAAAC
GAGGCCATCATGGTCATTGAGGCTTACAGGACTCTACGTGACCGTGGCCCTTACCCCGTC
GACAAAGTTGTCAGAGACTTCCATGGCAACTTCGCCTTCATCCTCTTCGATGGCACCAAC
AAAACCGTCTTCACTGCTGCTGATGCTGATGGGACTGTGCCTTTCTTCTGGGGTACTGAT
GCTGAAGGTCACCTTGTTCTCTCTGATGACACTGCCATTGTGAAGAAAGGTTGCTCCAAA
TCTTACAGTCCGTTCCCTAAAGGTTGCTTCTTTACATCGTCGGGAGGATTGAGGAGCTAC
GAGCACCCGAAGAACCAGCTTAAGCCAGTGCCGA*GGGTGGATAGCTCAGGAGAGGTTTG
TGGTGCCACCTTTCAGGTTGATGCCGAGGCTAAGAGAGAGGGTACCACCGGCATGCCTAG
AGTCGAGAGCTCCCAAAACTGGGCTGGTCATATCTAAACCGGAAATGTTTACCTAAATTT
CAAAGCTCAAGCAGAGACGAGACTTTGTTTCGTTTGATATATCTCTGAGACTTTACTTTA
CCAATGTTGTTTCTCTGTTTCCGTTTGCGTTTCTTGGATTCAAATAAAAAATAAGATTTT
TTTAATCATTGTTTTAGGTTTGAAGACATATATAGTCTTTAAAATTTATCTTCTATTCTT
C


BQ
15 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 25 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 20 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 20 50 45 45 45 45 40 40 35 35 0 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB95TF U 1
AF RR2D138TF U -7
AF RR2BH73TF U 1
AF RR2EP57TF U -14
AF RR2CM31TF U -7
AF RR2EQ12TF U -14
AF RR2DB93TF U -10
AF RR2CS31TF U -7
AF RR2DB93JQ C 278
AF RR2EQ12JQ C 302
BS 1 41 RR2AB95TF
BS 42 42 RR2BH73TF
BS 43 86 RR2AB95TF
BS 87 87 RR2BH73TF
BS 88 155 RR2AB95TF
BS 156 156 RR2BH73TF
BS 157 302 RR2AB95TF
BS 303 303 RR2BH73TF
BS 304 317 RR2AB95TF
BS 318 318 RR2EP57TF
BS 319 329 RR2AB95TF
BS 330 330 RR2EP57TF
BS 331 338 RR2AB95TF
BS 339 339 RR2EP57TF
BS 340 437 RR2AB95TF
BS 438 438 RR2EP57TF
BS 439 452 RR2AB95TF
BS 453 453 RR2BH73TF
BS 454 509 RR2AB95TF
BS 510 510 RR2BH73TF
BS 511 512 RR2AB95TF
BS 513 513 RR2EP57TF
BS 514 521 RR2AB95TF
BS 522 522 RR2BH73TF
BS 523 533 RR2AB95TF
BS 534 534 RR2EP57TF
BS 535 583 RR2AB95TF
BS 584 611 RR2BH73TF
BS 612 612 RR2EP57TF
BS 613 638 RR2BH73TF
BS 639 639 RR2EP57TF
BS 640 692 RR2BH73TF
BS 693 693 RR2EP57TF
BS 694 694 RR2BH73TF
BS 695 695 RR2EP57TF
BS 696 708 RR2BH73TF
BS 709 710 RR2EQ12TF
BS 711 711 RR2DB93JQ
BS 712 715 RR2DB93TF
BS 716 716 RR2CS31TF
BS 717 736 RR2DB93TF
BS 737 737 RR2DB93JQ
BS 738 748 RR2DB93TF
BS 749 749 RR2DB93JQ
BS 750 764 RR2DB93TF
BS 765 951 RR2DB93JQ
BS 952 1021 RR2EQ12JQ

RD RR2AB95TF 583 0 0
CTTCTCCATTGAGATTTTCTCTCCAAATTCAAAAACCAGAACCGAA*******AATGTTG
GCTGTGTTCGAGAAGACGGTAGCGAACAGCCCCGAAGCACTGCAGAGTCCCCACTCGGGA
TCATCGCCTTCGTACGCGTTGAAAGAAGGATATCTCGCGAGTCAATTCGTCTCCAAAAAC
TCAAACTCCGTCACGCTTAGCCTCGGATCCTCGGGAGTGCTCGCTTACTCTCTTGATAAC
ACCGATCCTCTTGTTCACAGATTGTTTGCGGTTGTGGATGACATCTTCTGCATCTTCAGA
GGCCACATTGAGAACCTTCCGTTTCTGAGACAGCAGTATGGGCTGAGCAAAGTCACAAAC
GAGGCCATCATGGTCATTGAGGCTTACAGGACTCTACGTGACCGTGGCCCTTACCCCGTC
GACAAAGTTGTCAGAGATTTCCATGGCAACTTTGCCTTCATCCTCTTCGATGGCACCAAC
AAAACCGTCTTCACTGCTGCTGATGCTGACGGTACTGTGCCCTTCTTCTGGGGCACTGAT
GCTGAAGGTCACCTTGTTCTCTCTGATGACACTGCCATTGTGA

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2D138TF 593 0 0
TTTTTTTTC
TTCTCCATTGAGATTTTCTCTCCAAATTCAAAAACCAGAATCGAA*******AATGTTGG
CTGTGTTCGAGAAGACGGTAGCGAACAGCCCCGAAGCACTGCAGAGTCCCCACTCGGGAT
CATCGCCTTCGTACGCGTTGAAAGAAGGATATCTCGCGAGTCAATTCGTCTCCAAAAACT
CAAACTCCGTCACGCTTAGCCTCGGATCCTCGGGAGTGCTCGCTTACTCTCTTGATAACA
CCGATCCTCTTGTTCACAGATTGTTTGCGGTTGTGGATGACATCTTCTGCATCTTCAGAG
GCCACATTGAGAACCTTCCGTTTCTGAGACAGCAGTATGGGCTGAGCAAAGTCACAAACG
AGGCCATCATGGTCATTGAGGCTTACAGGACTCTACGTGACCGTGGCCCTTACCCCGTCG
ACAAAGTTGTCAGAGATTTCCATGGCAACTTTGCCTTCATCCTCTTCGATGGCACCAACA
AAACCGTCTTCACTGCTGCTGATGCTGACGGTACTGTGCCCTTCTTCTGGGGCACTGATG
CTGAAG*TCACCTTGTTCTCTCTGATGACACTGCCATTGTGAAG

QA 10 593 10 593
DS 

RD RR2BH73TF 708 0 0
CTTCTCCATTGAGATTTTCTCTCCAAATTCAAAAACCAGAATCGAA*******AATGTTG
GCTGTGTTCGAGAAGACGGTAGCGAATAGTCCCGAAGCACTGCAGAGTCCTCACTCGGGA
TCATCGCCTTCGTACGCGTTGAAAGAAGGATATCTAGCGAGTCAATTCGTCTCCAAAAAC
TCAAACTCCGTCACGCTTAGCCTCGGATCCTCCGGAGTGCTCGCTTACTCTCTTGATAAC
ACCGATCCTCTTGTTCACAGATTGTTTGCGGTTGTGGATGACATCTTCTGCATCTTCAGA
GGACACATTGAGAACCTTCCGTTTCTGAGACAGCAGTATGGGCTGAGCAAAGTCACAAAC
GAGGCCATCATGGTCATTGAGGCTTACAGGACTCTACGTGACCGTGGCCCTTACCCCGTC
GACAAAGTCGTCAGAGATTTCCATGGCAACTTCGCCTTCATCCTCTTCGATGGCACCAAC
AAAACCGTCTTCACTGCTGCTGATGCTGATGGTACTGTGCCTTTCTTCTGGGGAACTGAT
GCTGAAGGTCACCTTGTTCTCTCTGATGACACTGCCATTGTGAAGAAAGGTTGCTCCAAA
TCTTACAGTCCTTTCCCTAAAGGTTGCTTCTTTACATCATCGGGAGGATTGAGGAGCTAC
GAGCACCCGAAGAACCAGCTTAAGCCAGTGCCAAAGGGTGGATAGCTC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2EP57TF 721 0 0
GGATCTGTAAGTTCTT
TTCTTCATTGAGATTTTCTCTCCAAATTCAAAAACCAGAATCAAAGAATCGAAATGTTGG
CTGTGTTCGAGAAGACGGTAGCGAATAGCCCCGAAGCACTGCAGAGTCCCCACTCGGTAT
CATCGCCTTCGTACGCGTTGAAAGAAGGATATCTAGCGAGTCAATTCGTCTCCAAAAACT
CCAACTCCGTCACGCTTAGCCTCGGATCCTCGGGAGTGCTCTCTTACTCTCTTGATAACA
CCGATCCTCTTGTTCACAGATTGTTTGCGGTTGTGGATGACATCTTCTGCGTCTTCAGAG
GACACATTGAGAACCTCCCGTTTCTGAGGCAGCAGTACGGGCTGAGCAAAGTCACAAACG
AGGCCATCATGGTCATTGAGGCTTACAGGACTCTACGTGACTGCGGCCCTTACCCCGTCG
ACAAAGTTGTCAGAGACTTCCATGGCAACTTCGCCTTCATCCTCTTCGATGGCACCAACA
AAACCGTCTTCACTGCTGCTGATGCTGATGGGACTGTGCCTTTCTTCTGGGGTACTGATG
CTGAAGGTCACCTTGTTCTCTCTGATGACGCTGCCATTGTGAAGAAAGGTTGCTCCAAAT
CTTACAGTCCGTTCCCTAAAGGTTGCTTCTTTACATCGTCGGGAGGATTGAGGAGCTACG
AGCACCCGAAGAACCAGCTTAAGCCAGTGCCGA*GGGTGGATAGC

QA 17 721 17 721
DS 

RD RR2CM31TF 710 0 0
TTTTTTTTC
TTCTCCATTGAGATTTTCTCTCCAAATTCAAAAACCAGAATCGAA*******AATGTTGG
CTGTGTTCGAGAAGACGGTAGCGAACAGCCCCGAAGCACTGCAGAGTCCCCACTCGGGAT
CATCTCCTTCGTACGCGTTGAAAGAAGGATATCTCGCGAGTCAATTCGTCTCCAAAAACT
CAAACTCCGTCACGCTTAGCCTCGGATCCTCGGGAGTGCTCGCTTACTCTCTTGATAACA
CCGATCCTCTTGCTCACAGATTGTTTGCGGTTGTGGATGACATCTTCTGCATCTTCAGAG
GCCACATTGAGAACCTTCCGTTTCTGAGACAGCAGTATGGGCTGAGCAAAGTCACAAACG
AGGCCATCATGGTCATTGAGGCTTACAGGACTCTACGTGACCGTGGCCCTTACCCCGTCG
ACAAAGTTGTCAGAGATTTCCATGGCAACTTTGCCTTCATCCTCTTCGATGGCACCAACA
AAACCGTCTTCACTGCTGCTGATGCTGACGGTACTGTGCCCTTCTTCTGGGGCACTGATG
CTGAAGGTCACCTTGTTCTCTCTGATGACGCTGCCATTGTGAAGAAAGGTTGCTCCAAAT
CTTACAGTCCTTTCCCTAAAGGTTGCTTCTTTACATCATCGGGGGGATTGAGGAGCTACG
AGCACCCGAAGA*CCAGCTTAAGC*AGTGCCGA*GGGTGGA

QA 10 710 10 710
DS 

RD RR2EQ12TF 725 0 0
GGATCTGTAAGTTCTT
TTCTTCATTGAGATTTTCTCTCCAAATTCAAAAACCAGAATCAAAGAATCGAAATGTTGG
CTGTGTTCGAGAAGACGGTAGCGAATAGCCCCGAAGCACTGCAGAGTCCCCACTCGGGAT
CATCGCCTTCGTACGCGTTGAAAGAAGGATATCTAGCGAGTCAATTCGTCTCCAAAAACT
CCAACTCCGTCACGCTTAGCCTCGGATCCTCGGGAGTGCTCGCTTACTCTCTTGATAACA
CCGATCCTCCTGTTCACAGATTGTTTGCGGTTGTGGATGACATCTTCTGCGTCTTCAGAG
GACACATTGAGAACCTCCCGTTTCTGAGGCAGCAGTACGGGCTGAGCAAAGCCACAAACG
AGGCCATCATGGTCATTGAGGCTTACAGGACTCTACGTGACCGTGGCCCTTACCCCGTCG
ACAAAGTTGTCAGAGACTTCCATGGCAACTTCGCCTTCATCCTCTTCGATGGCACCAACA
AAACCGTCTTCACTGCTGCTGATGCTGATGGGACTGTGCCTTTCTTCTGGGGTACTGATG
CTGAAGGTCACCTTGTTCTCTCTGATGACACTGCCATTGTGAAGAAAGGTTGCTCCAAAT
CTTACAGTCCGTTCCCTAA**GTTGCTTCTTTACATCGTCGGGAGGATTGAGGAGCTACG
AGCACCCGAAGAACCAGCTTAAGCCAGTGCCGA*GGGTGAATAGCTCAG

QA 17 725 17 725
DS 

RD RR2DB93TF 775 0 0
GGGTAAGTTCTT
TTCTTCATTGAGATTTTCTCTCCAAATTCAAAAACCAGAATCAAAGAATCGAAATGTTGG
CTGTGTTCGAGAAGACGGTAGCGAATAGCCCCGAAGCACTGCAGAGTCCCCACTCGGGAT
CATCGCCTTCGTACGCGTTGAAAGAAGGATATCTAGCGAGTCAATTCGTCTCCAAAAACT
CCAACTCCGTCACGCTTAGCCTCGGATCCTCGGGAGTGCTCGCTTACTCTCTTGATAACA
CCGATCCTCTTGTTCACAGATTGTTTGCGGTTGTGGATGACATCTTCTGCGTCTTCAGAG
GACACATTGAGAACCTCCCGTTTCTGAGGCAGCAGTACGGGCTGAGCAAAGTCACAAACG
AGGCCATCATGGTCATTGAGGCTTACAGGACTCTACGTGACCGTGGCCCTTACCCCGTCG
ACAAAGTTGTCAGAGACTTCCATGGCAACTTCGCCTTCATCCTCTTCGATGGCACCAACA
AAACCGTCTTCACTGCTGCTGATGCTGATGGGACTGTGCCTTTCTTCTGGGGTACTGATG
CTGAAGGTCACCTTGTTCTCTCTGATGACACTGCCATTGTGAAGAAAGGTTGCTCCAAAT
CTTACAGTCCGTTCCCTAAA*GTTGCTTCTTTACATCGTCGGGAGGATTGAGGAGCTACG
AGCACCCGAAGAACCAGCTTAAGCCAGTGCCGA*GGGTGGATAGCTCAG*AGAG*TTTGT
GGTGCCACCTTTCAG*TTGATGCCGAG*CTAAGAGAGAGGGTA

QA 13 775 13 775
DS 

RD RR2CS31TF 733 0 0
TTTTTTTTC
TTCTCCATTGAGATTTTCTCTCCAAATTCAAAAACCAGAATCGAA*******AATGTTGG
CTGTGTTCGAGAAGACGGTAGCGAATAGCCCCGAAGCACTGCAGAGTCCTCACTCGGGAT
CATCGCCTTCGTACGCGTTGAAAGAAGGATATCTAGCGAGTCAATTCGTCTCCAAAAACT
CAAACTCCGTCACGCTTAGCCTCGGATCCTCCGGAGTGCTCGCTTACTCTCTTGATAACA
CCGATCCTCTTGTTCACAGATTGTTTGCGGTTGTGGATGACATCTTCTGCATCTTCAGAG
GACACATTGAGAACCTTCCGTTTCTGAGACAGCAGTATGGGCTGAGCAAAGTCACAAACG
AGGCCATCATGGTCATTGAGGCTTACAGGACTCTACGTGACCGTGGCCCTTACCCCGTCG
ACAAAGTCGTCAGAGATTTCCATGGCAACTTCGCCTTCATCCTCTTCGATGGCACCAACA
AAACCGTCTTCACTGCTGCTGATGCTGATGGTACTGTGCCTTTCTTCTGGGGAACTGATG
CTGAAGGTCACCTTGTTCTCTCTGATGACACTGCCATTGTGAAGAAAGGTTGCTCCAAAT
CTTACAGTCCTTTCCCTAAAGGTTGCTTCTTTACATCATCGGGAGGATTGAGGAGCTACG
AGCACCCGAAGAACCAGCTTAAGCCAGTGCCAA*GGGTGGATAGCTCAG*AGAGGTGTGT
GGTG

QA 10 733 10 733
DS 

RD RR2DB93JQ 686 0 0
ATGACATCTTCTGCGTCTTCAGAGGACACATTGAGAACCTCCCGTTTCTGAGGCAGCAGT
ACGGGCTGAGCAAAGTCACAAACGAGGCCATCATGGTCATTGAGGCTTACAGGACTCTAC
GTGACCGTGGCCCTTACCCCGTCGACAAAGTTGTCAGAGACTTCCATGGCAACTTCGCCT
TCATCCTCTTCGATGGCACCAACAAAACCGTCTTCACTGCTGCTGATGCTGATGGGACTG
TGCCTTTCTTCTGGGGTACTGATGCTGAAGGTCACCTTGTTCTCTCTGATGACACTGCCA
TTGTGAAGAAAGGTTGCTCCAAATCTTACAGTCCGTTCCCTAAAGGTTGCTTCTTTACAT
CGTCGGGAGGATTGAGGAGCTACGAGCACCCGAAGAACCAGCTTAAGCCAGTGCCGA*GG
GTGGATAGCTCAGGAGAGGTTTGTGGTGCCACCTTTCAGGTTGATGCCGAGGCTAAGAGA
GAGGGTACCACCGGCATGCCTAGAGTCGAGAGCTCCCAAAACTGGGCTGGTCATATCTAA
ACCGGAAATGTTTACCTAAATTTCAAAGCTCAAGCAGAGACGAGACTTTGTTTCGTTTGA
TATATCTCTGAGACTTTACTTTACCAATGTTGTTTCTCTGTTTCCGTTTGCGTTTCTTGG
ATTCAAATAAAAAA
TAAGATTTTTTT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2EQ12JQ 720 0 0
GACACATTGAGAACCTCCCGTTTCTGAGGCAGCAGTACGGGCTGAGCAAAGCCACAAACG
AGGCCATCATGGTCATTGAGGCTTACAGGACTCTACGTGACCGTGGCCCTTACCCCGTCG
ACAAAGTTGTCAGAGACTTCCATGGCAACTTCGCCTTCATCCTCTTCGATGGCACCAACA
AAACCGTCTTCACTGCTGCTGATGCTGATGGGACTGTGCCTTTCTTCTGGGGTACTGATG
CTGAAGGTCACCTTGTTCTCTCTGATGACACTGCCATTGTGAAGAAAGGTTGCTCCAAAT
CTTACAGTCCGTTCCCTAA*GGTTGCTTCTTTACATCGTCGGGAGGATTGAGGAGCTACG
AGCACCCGAAGAACCAGCTTAAGCCAGTGCCGA*GGGTGAATAGCTCAGGAGAGGTTTGT
GGTGCCACCTTTCAGGTTGATGCCGAGGCTAAGAGAGAGGGTACCACCGGCATGCCTAGA
GTTGAGAGCTCCCAAAACTGGGCTGGTCATATCTAAACCGGAAATGTTTACCTAAATTTC
AAAGCTCAAGCAGAGACGAGACTTTGTTTCGTTTGATATATCTCTGAGACTTTACTTTAC
CAATGTTGTTTCTCTGTTTCCGTTTGCGTTTCTTGGATTCAAATAAAAAATAAGATTTTT
TTAATCATTGTTTTAGGTTTGAAGACATATATAGTCTTTAAAATTTATCTTCTATTCTTC

QA 1 720 1 720
DS 



CO CL151Contig2 860 7 25 U
GAAACTAAAAGCATTAGACAAGTGAAGAATAGAAGATAAATTTTAAAGACTATATCCAAG
TCTTCAAACCTAAAACA*******AATGACGAAAAAAAATCTTATTTTTTTTATTTGAAT
CCGAGAAACGCAAACGGAAACAGAGAAACAACATTGGTAAAGTAAAGTCTCAGAGATATA
TTAAACGAAACAAAGTCTCGTCTCTGCTT*GAGCTTTGAAATTTCGGTAAACATTTCCGG
TTTAGATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGCTCTCGACTCTAGGCATGCCGGTGGTACCCT
CTCTCTTAGCCTCGGCATCAACCTGAAAGGTGGCACCACACACCTCTCCTGAGCTATCCA
CCCTCGGCACTGGCTTAAGCTGGTTCTTCGGGTGCTCGTAGCTCCTCAATCCCCCCGATG
ATGTAAAGAAGCAACCTTTAGGGAAAGGACTGTAAGATTTGGAGCAACCTTTCTTCACAA
TGGCAGTGTCATCAGAGAGAACAAGGTGACCTTCAGCATCAGTGCCCCAGAAGAAAGGCA
CAGTACCGTCAGCATCAGCAGCAGTGAAGACGGTTTTGTTGGTGCCATCGAAGAGGATGA
AGGCAAAGTTGCCATGGAAATCTCTGACAACTTTGTCGACGGGGTAAGGGCCACGGTCAC
GTAGAGTCCTGTAAGCCTCAATGACCATGATGGCCTCGTTTGTGACTTTGCTCAGCCCAT
ACTGCTGTCTCAGAAACGGAAGGTTCTCAATGTGGCCTCTGAAGATGCAGAAGATGTCAT
CCACAACCGCAAACAATCTGTGAACAAGAGGATCGGTGTTATCAAGAGAGTAAGCGAGCA
CTCCCGAGGATCCGAGGCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 0 40 40 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 15 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB24JQ U 91
AF RR2DY25JQ U 31
AF RR2D138JQ U 28
AF RR2DY25TF C 32
AF RR2CM31JQ U 1
AF RR2BH73JQ U 20
AF RR2AB95JQ U 92
BS 1 77 RR2CM31JQ
BS 78 84 RR2BH73JQ
BS 85 86 RR2CM31JQ
BS 87 87 RR2BH73JQ
BS 88 89 RR2CM31JQ
BS 90 90 RR2DY25JQ
BS 91 96 RR2CM31JQ
BS 97 97 RR2DY25JQ
BS 98 122 RR2CM31JQ
BS 123 123 RR2BH73JQ
BS 124 209 RR2CM31JQ
BS 210 210 RR2BH73JQ
BS 211 224 RR2CM31JQ
BS 225 226 RR2BH73JQ
BS 227 352 RR2CM31JQ
BS 353 353 RR2BH73JQ
BS 354 486 RR2CM31JQ
BS 487 487 RR2D138JQ
BS 488 535 RR2CM31JQ
BS 536 536 RR2BH73JQ
BS 537 762 RR2CM31JQ
BS 763 763 RR2BH73JQ
BS 764 764 RR2AB95JQ
BS 765 779 RR2CM31JQ
BS 780 860 RR2AB95JQ

RD RR2GB24JQ 292 0 0
GAAAAAGAATCTTATTTTTTTTATTTGAATCCGAGAAACGCAAACGGAAACAGAGAAACA
ACATTGGTAAAGTAAAGTCTCAGAGATATATTAAACGAAACAAAGTCTCGTCTCTGCTT*
GAGCTTTGAAATTTCGGTAAACATTTCCGGTTTAGATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGC
TCTCGACTCTAGGCATGCCGGTGGTACCCTCTCTCTTAGCCTCGGCATCAACCTGAAAGG
GGGCACCACACACCTCTCCTGAGCTATCCACCCTTGGCACTGGCTTAAGCTG

QA 1 292 1 292
DS 

RD RR2DY25JQ 370 0 0
AAAAA
ATAAATTTTAAAGACTATATCCAAGTCTTCAAATCTAAAACA*******AATGACGAAAA
AAAATCTTATTTTTTTTATTTGAATCCGAAAAACGCAAACGGAAACAAAAAAACAACACT
GGTAAAGTAAAGTCTCAAAAATATATCAAACGAAACAAAGTCTCGTCTCTGCTT*GAGCT
TTGAAATTTCGGTAAACATTTCCGGTTTAAATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGCTCTCG
ACTCTAGGCATGCCGGGGGTACCCTCTCTCTTAGCCTCGGCATCAACCTGAAAGGGGGCA
CCACACACTTCTCCTGAGCTATCCACCCTCGGCACTGGCTTAAGCTGGTTCTTCGGGGGC
TCGTA

QA 6 370 6 370
DS 

RD RR2D138JQ 543 0 0
AATA
GAAGATAAATTTTAAAGACTATATCCAAGTCTTCAAACCTAAAACATAAAACAAAGGATG
AAAAA*AATCTTATTTTTTTTATTTGAATCCAAGAAACGCAAACGGAAACAGAGAAACAA
CATTGGTAAAGTAAAGTCTCAGAGATATATTAAACGAAACAAAGTCTCGTCTCTGCTTTG
AGCTTTGAAATTTAAGTAAACATTTCCGGTTTAGATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGCT
CTCGACTCTAGGCATGCCGGTGGTACCCTCTCTCTTAGCCTCGGCATCAACCTGAAAGGT
GGCACCACACACCTCTCCTGAACTATCCACCCTCGGCACTGGCTTAAGCTGGTTCTTCGG
GTGCTCGTAGCTCCTCAATCCCCCCGATGATGTAAAGAAGCAACCTTTAGGGAAAGGACT
GTAAGATTTGGAGCAACCTTTCTTCACAATGGCAGTGTCATCAGAGAGAACAAGGTGACC
TTCAGCATCAGTGCCCCAGAAGAAGGGCACAGTACCGTCAGCATCAGCAGCAGTGAAGA

QA 5 543 5 543
DS 

RD RR2DY25TF 514 0 0
GAAGATAAATTTTAAAGACTATATCCAAGTCTTCAAATCTAAAACA*******AATGACG
AAAAAAAATCTTATTTTTTTTATTTGAATCCGAGAAACGCAAACGGAAACAAAGAAACAA
CACTGGTAAAGTAAAGTCTCAGAGATATATCAAACGAAACAAAGTCTCGTCTCTGCTT*G
AGCTTTGAAATTTCGGTAAACATTTCCGGTTTAGATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGCT
CTCGACTCTAGGCATGCCGGTGGTACCCTCTCTCTTAGCCTCGGCATCAACCTGAAAGGT
GGCACCACACACTTCTCCTGAGCTATCCACCCTCGGCACTGGCTTAAGCTGGTTCTTCGG
GTGCTCGTAGCTCCTCAATCCTCCCGACGATGTAAAGAAGCAACCTTTAGGGAACGGACT
GCAAGATTTGGAGCAACCTTTCTTCACAATGGCAGTGTCATCAGAGAGAACAAGGTGACC
TTCAGCATCAGTACCCCAGAAGAAAGGCACAGTC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2CM31JQ 779 0 0
GAAACTAAAAGCATTAGACAAGTGAAGAATAGAAGATAAATTTTAAAGACTATATCCAAG
TCTTCAAACCTAAAACATAAAACAAAGGATGAAAAA*AATCTTATTTTTTTTATTTGAAT
CCAAGAAACGCAAACGGAAACAGAGAAACAACATTGGTAAAGTAAAGTCTCAGAGATATA
TTAAACGAAACAAAGTCTCGTCTCTGCTTTGAGCTTTGAAATTTAAGTAAACATTTCCGG
TTTAGATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGCTCTCGACTCTAGGCATGCCGGTGGTACCCT
CTCTCTTAGCCTCGGCATCAACCTGAAAGGTGGCACCACACACCTCTCCTGAACTATCCA
CCCTCGGCACTGGCTTAAGCTGGTTCTTCGGGTGCTCGTAGCTCCTCAATCCCCCCGATG
ATGTAAAGAAGCAACCTTTAGGGAAAGGACTGTAAGATTTGGAGCAACCTTTCTTCACAA
TGGCAGCGTCATCAGAGAGAACAAGGTGACCTTCAGCATCAGTGCCCCAGAAGAAGGGCA
CAGTACCGTCAGCATCAGCAGCAGTGAAGACGGTTTTGTTGGTGCCATCGAAGAGGATGA
AGGCAAAGTTGCCATGGAAATCTCTGACAACTTTGTCGACGGGGTAAGGGCCACGGTCAC
GTAGAGTCCTGTAAGCCTCAATGACCATGATGGCCTCGTTTGTGACTTTGCTCAGCCCAT
ACTGCTGTCTCAGAAACGGAAGGTTCTCAATGTGGCCTCTGAG*ATGCAGAAGATGTCA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2BH73JQ 744 0 0
GAGT
GAAGAATAGAAGATAAATTTTAAAGACTATATCCAAGTCTTCAGACCTAAAACA******
*AATGATGAAAAAGAATCTTATTTTTTTTATTTGAATCCGAGAAACGCAAACGGAAACAG
AGAAACAACATTGGTAAAGTAAAGTCTCAGAGATATATTAAACGAAACAAAGTCTCGTCT
CTGCTT*GAGCTTTGAAATTTCGGTAAACATTTCCGGTTTAGATATGACCGGCCCAGTTT
TGGGAGCTCTCGACTCTAGGCATGCCGGTGGTACCCTCTCTCTTAGCCTCGGCATCAACC
TGAAAGGTGGCACCACACACCTCTCCTGAGCTATCCACCCTTGGCACTGGCTTAAGCTGG
TTCTTCGGGTGCTCGTAGCTCCTCAATCCTCCCGATGATGTAAAGAAGCAACCTTTAGGG
AAAGGACTGTAAGATTTGGAGCAACCTTTCTTCACAATGGCAGTGTCATCAGAGAGAACA
AGGTGACCTTCAGCATCAGTTCCCCAGAAGAAAGGCACAGTACCATCAGCATCAGCAGCA
GTGAAGACGGTTTTGTTGGTGCCATCGAAGAGGATGAAGGCGAAGTTGCCATGGAAATCT
CTGACGACTTTGTCGACGGGGTAAGGGCCACGGTCACGTAGAGTCCTGTAAGCCTCAATG
ACCATGATGGCCTCGTTTGTGACTTTGCTCAGCCCATACTGCTGTCTCAGAAACGGAAGG
TTCTCAATGTGTCCTCTGAA

QA 5 744 5 744
DS 

RD RR2AB95JQ 769 0 0
G
AAAAAAATCTTATTTTTTTTATTTGAATCCAAGAAACGCAAACGGAAACAGAGAAACAAC
ATTGGTAAAGTAAAGTCTCAGAGATATATTAAACGAAACAAAGTCTCGTCTCTGCTTTGA
GCTTTGAAATTTAAGTAAACATTTCTGGTTTAGATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGCTC
TCGACTCTAGGCATGCCGGTGGTACCCTCTCTCTTAGCCTCGGCATCAACCTGAAAGGTG
GCACCACACACCTCTCCTGAACTATCCACCCTCGGCACTGGCTTAAGCTGGTTCTTCGGG
TGCTCGTAGCTCCTCAATCCCCCCGATGATGTAAGGAAGCAACCTTTAGGGAAAGGACTG
TAAGATTTGGAGCAACCTTTCTTCACAATGGCAGTGTCATCAGAGAGAACAAGGTGACCT
TCAGCATCAGTGCCCCAGAAGAAGGGCACAGTACCGTCAGCATCAGCAGCAGTGAAGACG
GTTTTGTTGGTGCCATCGAAGAGGATGAAGGCAAAGTTGCCATGGAAATCTCTGACAACT
TTGTCGACGGGGTAAGGGCCACGGTCACGTAGAGTCCTGTAAGCCTCAATGACCATGATG
GCCTCGTTTGTGACTTTGCTCAGCCCATACTGCTGTCTCAGAAACGGAAGGTTCTCAATG
TGGCCTCTGAAGATGCAGAAGATGTCATCCACAACCGCAAACAATCTGTGAACAAGAGGA
TCGGTGTTATCAAGAGAGTAAGCGAGCACTCCCGAGGATCCGAGGCTA

QA 2 769 2 769
DS 



AS 1 17

CO CL152Contig1 442 17 20 U
GGACAACACATAAAGCAATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAA
GAGAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGA
CTCTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAA
CTGTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTAATTATGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAA
AACCGGGGGGA*AAAATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGT**TTGAATAA
ATATTTGGCATAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCCTAACTTTTTCCTGCTTCTAT
GTGTTGATTGTGTGATTGTCTAATATGTTTCAATTTGTAACTTAAGAAAACAAAAAAAA*
TATATTGACTTTTGTGATTGTT


BQ
50 50 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 75 90 60 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 50 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 50 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 45 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 70 70 70 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 45 45 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU94TF U 17
AF RR2DC63TF U 1
AF RR2AV87JQ C 17
AF RR2AV87TF U 17
AF RR2FU94JQ C 17
AF RR2EB12JQ C 1
AF RR2EB12TF U 1
AF RR2CM45TF U 145
AF RR2CM45JQ C 102
AF RR2G538JQ C 82
AF RR2HB29TF U -1
AF RR2DC63JQ C 1
AF RR2BJ82TF U 1
AF RR2AG91JQ C 1
AF RR2AG91TF U 1
AF RR2G538TF U 1
AF RR2EZ19TF U 2
BS 1 16 RR2EB12TF
BS 17 61 RR2FU94TF
BS 62 62 RR2EB12TF
BS 63 71 RR2FU94TF
BS 72 72 RR2EB12TF
BS 73 213 RR2FU94TF
BS 214 214 RR2EB12TF
BS 215 246 RR2AV87TF
BS 247 247 RR2EB12TF
BS 248 251 RR2AV87TF
BS 252 252 RR2EB12TF
BS 253 290 RR2AV87TF
BS 291 292 RR2EB12TF
BS 293 339 RR2AV87TF
BS 340 340 RR2EB12TF
BS 341 390 RR2AV87TF
BS 391 392 RR2EB12TF
BS 393 403 RR2AV87TF
BS 404 436 RR2AG91TF
BS 437 442 RR2G538TF

RD RR2FU94TF 197 0 0
AATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAAGGGAAGAGAAGGAATG
GCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGACTCTTGCAGTTGCGAG
AAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAACTGTAGCTGTGGGGAC
AGCTGCAGCTGTTAATT

QA 1 197 1 197
DS 

RD RR2DC63TF 255 0 0
GGACAACACATAAAGCAATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAA
GAGAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGA
CTCTC*CAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAA
CTGTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTAATTATGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAA
AACCGGGGGGAAAAA

QA 1 255 1 255
DS 

RD RR2AV87JQ 387 0 0
AATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAAGGGAAGAGAAGGAATG
GCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGACTCTTGCAGTTGCGAG
AAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAACTGTAGCTGTGGGGAC
AGCTGCAGCTGTTAATTGTGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAAAACCGGTGGGAGAAAA
TGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGTGTTTGAATAAATATTTGGCATAATAT
GTTGCGTAATAACTCTCTTAACCTTAACTTTTTCCTGCTTCTATGTGTTGATTGTGTGAT
TGTCTAATATGTTTTCATTTGTAACTT

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR2AV87TF 387 0 0
AATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAAGGGAAGAGAAGGAATG
GCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGACTCTTGCAGTTGCGAG
AAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAACTGTAGCTGTGGGGAC
AGCTGCAGCTGTTAATTGTGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAAAACCGGTGGGAGAAAA
TGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGTGTTTGAATAAATATTTGGCATAATAT
GTTGCGTAATAACTCTCTTAACCTTAACTTTTTCCTGCTTCTATGTGTTGATTGTGTGAT
TGTCTAATATGTTTTCATTTGTAACTT

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR2FU94JQ 387 0 0
AATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAAGGGAAGAGAAGGAATG
GCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGACTCTTGCAGTTGCGAG
AAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAACTGTAGCTGTGGGGAC
AGCTGCAGCTGTTAATTGTGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAAAACCGGTGGGAGAAAA
TGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGTGTTTGAATAAATATTTGGCATAATAT
GTTGCGTAATAACTCTCTTAACCTTAACTTTTTCCTGCTTCTATGTGTTGATTGTGTGAT
TGTCTAATATGTTTTCATTTGTAACTT

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR2EB12JQ 403 0 0
GGACAACACATAAAGCAATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAA
GAGAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGACGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGA
CTCTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAA
CTGTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTAATTATGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAA
AACCGGGGGGA*AAAATGTGCTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGT**TTGAATAA
ATATTTGGCATAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCCTAACTTTTTCCTGCTTCTAT
GTGTTGATTGTGTGATTGTCTAATATGTTTCAATTTGTAACTT

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2EB12TF 403 0 0
GGACAACACATAAAGCAATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAA
GAGAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGACGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGA
CTCTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAA
CTGTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTAATTATGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAA
AACCGGGGGGA*AAAATGTGCTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGT**TTGAATAA
ATATTTGGCATAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCCTAACTTTTTCCTGCTTCTAT
GTGTTGATTGTGTGATTGTCTAATATGTTTCAATTTGTAACTT

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2CM45TF 259 0 0
CAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAACTGTAGCTGTGGGGACAGCTGCAG
CTGTTAATTATGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAAAACCGGGGGGA*AAAATGTGTTTG
ATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGT**TTGAATAAATATTTGGCATAATATGTTGCGTA
ATAACTCTCTTAACCCTAACTTTTTCCTGCTTCTATGTGTTGATTGTGTGATTGTCTAAT
ATGTTTCAATTTGTAACTT

QA 1 259 1 259
DS 

RD RR2CM45JQ 302 0 0
G
CGGTTGCAAATGTGGCGACTCTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAA
CTGCAGCTGCGGATCAAACTGTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTAATTATGGTGTAA
ATCACATGTATGCAGGAAAACCGGGGGGA*AAAATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGT
GTGTGTGT**TTGAATAAATATTTGGCATAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCCTA
ACTTTTTCCTGCTTCTATGTGTTGATTGTGTGATTGTCTAATATGTTTCAATTTGTAACT
T

QA 2 302 2 302
DS 

RD RR2G538JQ 322 0 0
TTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGACTCTTGCAGTTGCGAGAAGAA
CTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAACTGTAGCTGTGGGGACAGCTG
CAGCTGTTAATTATGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAAAACCGGGGGGA*AAAATGTGT
TTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGT**TTGAATAAATATTTGGCATAATATGTTGC
GTAATAACTCTCTTAACCCTAACTTTTTCCTGCTTCTATGTGTTGATTGTGTGATTGTCT
AATATGTTTCAATTTGTAACTT

QA 1 322 1 322
DS 

RD RR2HB29TF 405 0 0
GGAC
ACAACACATAAAGCAATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAAGA
GAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGACT
CTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAACT
GTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTAATTATGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAAAA
CCGGGGGGA*AAAATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGT**TTGAATAAAT
ATTTGGCATAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCCTAACTTTTTCCTGCTTCTTCTT
GTTGATTGTGTGATTGTCTAATATGTTTCAATTTGTAACTT

QA 5 405 5 405
DS 

RD RR2DC63JQ 403 0 0
GGACAACACATAAAGCAATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAA
GAGAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGA
CTCTC*CAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAA
CTGTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTAATTATGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAA
AACCGGGGGGA*AAAATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGT**TTGAATAA
ATATTTGGCATAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCCTAACTTTTTCCTGCTTCTAT
GTGTTGATTGTGTGATTGTCTAATATGTTTCAATTTGTAACTT

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2BJ82TF 403 0 0
GGACAACACATAAAGCAATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAA
GAGAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGA
CTCTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAA
CTGTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTAATTATGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAA
AACCGGGGGGA*AAAATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGT**TTGAATAA
ATATTTGGCATAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCCTAACTTTTTCCTGCTTCTAT
GTGTTGATTGTGTGATTGTCTAATATGTTTCAATTTGTAACTT

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2AG91JQ 436 0 0
GGACAACACATAAAGCAATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAA
GAGAAGAGAAGCAATGGCAGGTTTTAACTGTGGATGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGA
CTTTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAA
CTGTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTAATTATGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAA
AACCGGGGGGA*AAAATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGT**TTGAATAA
ATATTTGGCATAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCCTAACTTTTTCCTGCTTTTAT
GTGTTGATTGTGTGATTGTTTAATATGTTTCAATTTGTAACTTAAGAAAACAAAAAAAA*
TATATTGACTTTTGTG

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR2AG91TF 436 0 0
GGACAACACATAAAGCAATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAA
GAGAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGA
CTCTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAA
CTGTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTAATTATGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAA
AACCGGGGGGA*AAAATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGT**TTGAATAA
ATATTTGGCATAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCCTAACTTTTTCCTGCTTCTAT
GTGTTGATTGTGTGATTGTCTAATATGTTTCAATTTGTAACTTAAGAAAACAAAAAAAA*
TATATTGACTTTTGTG

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR2G538TF 442 0 0
GGACAACACATAAAGCAATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAA
GAGAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGA
CTCTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAA
CTGTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTAATTATGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAA
AACCGGGGGGA*AAAATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGT**TTGAATAA
ATATTTGGCATAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCCTAACTTTTTCCTGCTTCTAT
GTGTTGATTGTGTGATTGTCTAATATGTTTCAATTTGTAACTTAAGAAAACAAAAAAAAA
TATATTGACTTTTGTGATTGTT

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR2EZ19TF 438 0 0
GGG
AACACATAAAGCAATCAAAAAGAAGAAAAACAAACAAACTACAACTTTAAATTAAAGAGA
AGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGGTTGCAAATGTGGCGACTCT
TGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACACTGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAACTGT
AGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTAATTATGGTGTAAATCACATGTATGCAGGAAAACC
GGGGGGA*AAAATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGT**TTGAATAAATAT
TTGGCATAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCCTAACTTTTTCCTGCTTCTATGTGT
TGATTGTGTGATTGTCTAATATGTTTCAATTTGTAACTTAAGAAAACAAAAAAAA*TATA
TTGACTTTTGTG
ATT

QA 4 435 4 435
DS 



AS 1 14

CO CL153Contig1 949 14 25 U
GGTCTCTCCTTGTTACTATCTAAAAGCTCACGTCGTCTGATTCTCTGCGACTCCGAAAAC
ATGGCTCTACCAAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATTGTTGGT
GACGGAGGCACAGGGAAAACCACTTTCGTCAAGAGACATCTTACTGGAGAGTTTGAGAAG
AAGTATGAACCTACCATTGGTGTGGAGGTTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGC
AAGATCCGTTTCTACTGCTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGAT
GGTTACTACATCCATGGTCAATGTGCAGTGATTATGTTTGACGTCACAGCGCGGCTCACA
TACAAGAACGTTCCGACATGGCACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATT
GTTCTCTGCGGGAACAAAGTCGATGTCAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACG
TTCCACAGGAAGAAGAATCTGCAGTACTATGAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTC
GAGAAGCCCTTCTTGTACCTCGCTAGGAAACTTGCAGGCGACCCTAACCTTCACTTTGTT
GAGTCACCAGCTCTTGCTCCCCCTGAGGTTCACATCGACGTTGCCGAGCAGCAGAAGAAC
GAGGCTGATCTCATTGCCGCCGCTGCTCAGCCTCTTCCAGATGATGATGATGACGCTTTT
GAGTAAGCAAAAGATGTTCCAAGATGTGTGCTGCCGTGGTTTTGCTGATTCGCTTCTTTG
TTTTGGTTTTTATTCTATGTTGCGTTGATGTTACATATGGAATGAATCGAGTGTTTTAGA
ACTAATATTGGGGAATATTGAGATTGTTCCGTTTTGGAATAGAGCGAGTTGTTTTTGAAC
CAAAATAGATATGCAATCAAGGATCTTATTTGGGGAGACTTTTAACTTG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 65 80 65 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 40 60 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 65 65 65 65 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 45 60 60 60 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E826TF U 13
AF RR2CL15TF U 4
AF RR2C517TF U 10
AF RR2ES51TF U 53
AF RR2C626TF U 10
AF RR2EN90TF U 2
AF RR2ES51JQ C 199
AF RR2BE81TF U 1
AF RR2C517JQ C 136
AF RR2EQ25TF U 149
AF RR2EN90JQ C 143
AF RR2CL15JQ C 195
AF RR2BE81JQ C 149
AF RR2E826JQ C 222
BS 1 431 RR2BE81TF
BS 432 432 RR2E826TF
BS 433 731 RR2BE81TF
BS 732 732 RR2EQ25TF
BS 733 778 RR2BE81TF
BS 779 781 RR2EQ25TF
BS 782 790 RR2BE81TF
BS 791 793 RR2EQ25TF
BS 794 811 RR2BE81TF
BS 812 812 RR2EQ25TF
BS 813 821 RR2BE81TF
BS 822 822 RR2EQ25TF
BS 823 836 RR2BE81TF
BS 837 837 RR2EQ25TF
BS 838 840 RR2BE81TF
BS 841 841 RR2EQ25TF
BS 842 844 RR2BE81TF
BS 845 845 RR2EQ25TF
BS 846 854 RR2BE81TF
BS 855 855 RR2EQ25TF
BS 856 874 RR2BE81TF
BS 875 898 RR2EQ25TF
BS 899 900 RR2C517JQ
BS 901 939 RR2EN90JQ
BS 940 949 RR2E826JQ

RD RR2E826TF 643 0 0
GG
ACTATCTAAAAGCTCACGTCGTCTGATTCTCTGCGACCCCGAAAACATGGCTCTACCAAA
CCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATTGTTGGTGACGGAGGCACAGG
GAAAACCACTTTCGTCAAGAGACATCTTACTGGAGAGTTTGAGAAGAAGTATGAACCTAC
CATTGGTGTGGAGGTTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTTCTA
CTGCTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACTACATCCA
TGGTCAATGTGCAGTGATTATGTTTGACGTCACAGCGCGGCTCACATACAAGAACGTTCC
GACATGGCACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCTCTGCGGGAA
CAAAGTCGATGTCAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAA
GAATCCGCAGTACTATGAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTT
GTACCTCGCTAGGTAACTTGCAGGCGACCCTAACCTTCACTTTGTTGAGTCACCAGCTCT
TGCTCCCCCTGAG*TTCACATCGACGTTGCCGAGCAGCAGA

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR2CL15TF 650 0 0
GGCTCCTT
GTTACTATCTAAAAGCTCACGTCGTCTGATTCTCTGCGACTCCGAAAACATGGCTCTACC
AAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATTGTTGGTGACGGAGGCAC
AGGGAAAACCACTTTCGTCAAGAGACATCTTACTGGAGAGTTTGAGAAGAAGTATGAACC
TACCATTGGTGTGGAGGTTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTT
CTACTGCTGGGATACTGCTGGTCAAGATAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACTACAT
CCATGGTCAATGTGCAGTGATTATGTTTGACGTCACAGCGCGGCTCACATACAAGAACGT
TCCGACATGGCACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCTCTGCGG
GAACAAAGTCGATGTCAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAA
GAAGAATCTGCAGTACTATGAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCCTT
CTTGTACCTCGCTAGGAAACTTGCAGGCGACCCTAACCTTCACTTTGTTGAGTCACCAGC
TCTTGCTCCCCCTGAG*TTCACATCGACGTTGCCGAGCAGCA

QA 9 650 9 650
DS 

RD RR2C517TF 650 0 0
GG
GTTACTATCTAAAAGCTCACGTCGTCTGATTCTCTGCGACTCCGAAAACATGGCTCTACC
AAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATTGTTGGTGACGGAGGCAC
AGGGAAAACCACTTTCGTCAAGAGACATCTTACTGGAGAGTTTGAGAAGAAGTATGAACC
TACCATTGGTGTGGAGGTTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTT
CTACTGCTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACTACAT
CCATGGTCAATGTGCAGTGATTATGTTTGACGTCACAGCGCGGCTCACATACAAGAACGT
TCCGACATGGCACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCTCTGCGG
GAACAAAGTCGATGTCAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAA
GAAGAATCTGCAGTACTATGAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCCTT
CTTGTACCTCGCTAGGAAACTTGCAGGCGACCCTAACCTTCACTTTGTTGAGTCACCAGC
TCTTGCTCCCCCTGAGGTTCACATCGACGTTGCCGAGCAGCAGAAGAA

QA 3 650 3 650
DS 

RD RR2ES51TF 571 0 0
GG
GAAAACATGGCTCTACCAAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATT
GTTGGTGACGGAGGCACAGGGAAAACCACTTTCGTCAAGAGACATCTTACTGGAGAGTTT
GAGAAGAAGTATGAACCTACCATTGGTGTGGAGGTTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAAC
TGTGGCAAGATCCGTTTCTACTGCTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTT
AGGGATGGTTACTACATCCATGGTCAATGTGCAGTGATTATGTTTGACGTCACAGCGCGG
CTCACATACAAGAACGTTCCGACATGGCACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATC
CCTATTGTTCTCTGCGGGAACAAAGTCGATGTCAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAG
GTGACGTTCCACAGGAAGAAGAATCTGCAGTACTATGAGATATCTGCCAAGAGTAACTAC
AACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACCTCGCTAGGAAACTTGCAGGCGACCCTAACCTTCAC
TTTGTTGAGTCACCAGCTCTTGCTCCCCC

QA 3 571 3 571
DS 

RD RR2C626TF 727 0 0
GG
GTTACTATCTAAAAGCTCACGTCGTCTGATTCTCTGCGACTCCGAAAACATGGCTCTACC
AAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATTGTTGGTGACGGAGGCAC
AGGGAAAACCACTTTCGTCAAGAGACATCTTACTGGAGAGTTTGAGAAGAAGTATGAACC
TACCATTGGTGTGGAGGTTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTT
CTACTGCTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACTACAT
CCATGGTCAATGTGCAGTGATTATGTTTGACGTCACAGCGCGGCTCACATACAAGAACGT
TCCGACATGGCACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCTCTGCGG
GAACAAAGTCGATGTCAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAA
GAAGAATCTGCAGTACTATGAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCCTT
CTTGTACCTCGCTAGGAAACTTGCAGGCGACCCTAACCTTCACTTTGTTGAGTCACCAGC
TCTTGCTCCCCCTGAG**TCACATCGACGTTGCCGAGCAGCAGAAGAACGAG*CTGATCT
CATTGCCGC*GCTGCTCAGC*TCTTC*AGATGATGATGATGACGCTTT
GAGTAGCAAAGATGTTC

QA 3 710 3 710
DS 

RD RR2EN90TF 698 0 0
GGCT
CTCCTTGTTACTATCTAAAAGCTCACGTCGTCTGATTCTCTGCGACTCCGAAAACATGGC
TCTACCAAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATTGTTGGTGACGG
AGGCACAGGGAAAACCACTTTCGTCAAGAGACATCTTACTGGAGAGTTTGAGAAGAAGTA
TGAACCTACCATTGGTGTGGAGGTTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGAT
CCGTTTCTACTGCTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTA
CTACATCCATGGTCAATGTGCAGTGATTATGTTTGACGTCACAGCGCGGCTCACATACAA
GAACGTTCCGACATGGCACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCT
CTGCGGGAACAAAGTCGATGTCAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCA
CAGGAAGAAGAATCTGCAGTACTATGAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAA
GCCCTTCTTGTACCTCGCTAGGAAACTTGCAGGCGACCCTAACCTTCACTTTGTTGAGTC
ACCAGCTCTTGCTCCCCCTGAGGTTCACATCGACGTTGCCGAGCAGCAGAAGAACGAGGC
TGATCTCATTGCCGCCGCTGCTCAGCCTCTTC
AG

QA 5 696 5 696
DS 

RD RR2ES51JQ 632 0 0
GGTGTGGAGGTTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTTCTACTGC
TGGGATACTGCTGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACTACATCCATGGT
CAATGTGCAGTGATTATGTTTGACGTCACAGCGCGGCTCACATACAAGAACGTTCCGACA
TGGCACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCTCTGCGGGAACAAA
GTCGATGTCAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAAGAAT
CTGCAGTACTATGAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTAC
CTCGCTAGGAAACTTGCAGGCGACCCTAACCTTCACTTTGTTGAGTCACCAGCTCTTGCT
CCCCCTGAGGTTCACATCGACGTTGCCGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATTGCC
GCCGCTGCTCAGCCTCTTCCAGATGATGATGATGACGCTTTTGAGTAAGCAAAAGATGTT
CCAAGATGTGTGCTGCCGTGGTTTTGCTGATTCGCTTCTTTGTTTTGGTTTTTATTCTAT
GTTGCGTTGATGTTACATATGGAATGAATCGA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2BE81TF 878 0 0
GGTCTCTCCTTGTTACTATCTAAAAGCTCACGTCGTCTGATTCTCTGCGACTCCGAAAAC
ATGGCTCTACCAAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATTGTTGGT
GACGGAGGCACAGGGAAAACCACTTTCGTCAAGAGACATCTTACTGGAGAGTTTGAGAAG
AAGTATGAACCTACCATTGGTGTGGAGGTTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGC
AAGATCCGTTTCTACTGCTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGAT
GGTTACTACATCCATGGTCAATGTGCAGTGATTATGTTTGACGTCACAGCGCGGCTCACA
TACAAGAACGTTCCGACATGGCACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATT
GTTCTCTGCGGTAACAAAGTCGATGTCAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACG
TTCCACAGGAAGAAGAATCTGCAGTACTATGAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTC
GAGAAGCCCTTCTTGTACCTCGCTAGGAAACTTGCAGGCGACCCTAACCTTCACTTTGTT
GAGTCACCAGCTCTTGCTCCCCCTGAGGTTCACATCGACGTTGCCGAGCAGCAGAAGAAC
GAGGCTGATCTCATTGCCGCCGCTGCTCAGCCTCTTCCAGATGATGATGATGACGCTTTT
GAGTAAGCAAA*GATGTTCCAAGATGTGTGCTGCCGTGGTTTTGCTGATTCGCTTCTT**
GTTTGGTTTT**ATCTATGTTGCGTTGATGT*ACATATGGA*TGAATCGAGTGTTT*AGA
*CTA*TATTGGGGA*TATTGAGATTGTTCCGTTT
GGAT

QA 1 874 1 874
DS 

RD RR2C517JQ 765 0 0
AAAACCACTTTCGTCAAGAGACATCTTACTGGAGAGTTTGAGAAGAAGTATGAACCTACC
ATTGGTGTGGAGGTTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTTCTAC
TGCTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACTACATCCAT
GGTCAATGTGCAGTGATTATGTTTGACGTCACAGCGCGGCTCACATACAAGAACGTTCCG
ACATGGCACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCTCTGCGGGAAC
AAAGTCGATGTCAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAAG
AATCTGCAGTACTATGAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTG
TACCTCGCTAGGAAACTTGCAGGCGACCCTAACCTTCACTTTGTTGAGTCACCAGCTCTT
GCTCCCCCTGAGGTTCACATCGACGTTGCCGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATT
GCCGCCGCTGCTCAGCCTCTTCCAGATGATGATGATGACGCTTTTGAGTAAGCAAAAGAT
GTTCCAAGATGTGTGCTGCCGTGGTTTTGCTGATTCGCTTCTTTGTTTTGGTTTTTATTC
TATGTTGCGTTGATGTTACATATGGAATGAATCGAGTGTTTTAGAACTAATATTGGGGAA
TATTGAGATTGTTCCGTTTTGGAATAGAGCGAGTTGTTTTTGAAC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2EQ25TF 750 0 0
GG
AAGAGACATCTTACTGGAGAGTTTGAGAAGAAGTATGAACCTACCATTGGTGTGGAGGTT
CATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTTCTACTGCTGGGATACTGCT
GGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACTACATCCATGGTCAATGTGCAGTG
ATTATGTTTGACGTCACAGCGCGGCTCACATACAAGAACGTTCCGACATGGCACCGTGAT
CTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCTCTGCGGGAACAAAGTCGATGTCAAG
AACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAAGAATCTGCAGTACTAT
GAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACCTCGCTAGGAAA
CTTGCAGGCGACCCTAACCTTCACTTTGTTGAGTCACCAGCTCTTGCTCCCCCTGAGGTT
CACATCGACGTTGCCGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATTGCCGCCGCTGCTCAG
CCTCTTCCAGATGATGATGATGACGCTTTTGAGTAAGCAAAAGATGTTCCAAGATGTGTG
CTGCCGTGGTTTTGCTGATTCGCTTCTTTGTTTTGGTTTTTATTCTATGTTGCGTTGATG
TTACATATGGAATGAATCGAGTGTTTTAGAACTAATATTGGGGAATATTGAGATTGTTCC
GTTTTGGAATAGAGCGAGTTGTTTTTGA

QA 3 750 3 750
DS 

RD RR2EN90JQ 801 0 0
CTTTCGTCAAGAGACATCTTACTGGAGAGTT*GAGAAGAAGTATGAACCTACCATTGGTG
TGGAGGTTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTTCTACTGCTGGG
ATACTGCTGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACTACATCCATGGTCAAT
GTGCAGTGATTATGTTTGACGTCACAGCGCGGCTCACATACAAGAACGTTCCGACATGGC
ACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTTTCTGCGGGAACAAAGTCG
ATGTCAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAAGAATCTGC
AGTACTATGAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACCTCG
CTAGGAAACTTGCAGGCGACCCTAACCTTCACTTTGTTGAGTCACCAGCTCTTGCTCCCC
CTGAGGTTCACATCGACGTTGCCGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATTGCCGCCG
CTGCTCAGCCTCTTCCAGATGATGATGATGACGCTTTTGAGTAAGCAAAAGATGTTCCAA
GATGTGTGCTGCCGTGGTTTTGCTGATTCGCTTCTTTGTTTTGGTTTTTATTCTATGTTG
CGTTGATGTTACATATGGAATGAATCGAGTGTTTTAGAACTAATATTGGGGAATATTGAG
ATTGTTCCGTTTTGGAATAGAGCGAGTTGTTTTTGAACCAAAATAGATATGCAATCAAGG
ATCTTATTTGGGGAGAC
TCTT

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2CL15JQ 745 0 0
CATTGGTGTGGAGGTTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTTCTA
CTGCTGGGATACTGCTGGTCAAGATAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACTACATCCA
TGGTCAATGTGCAGTGATTATGTTTGACGTCACAGCGCGGCTCACATACAAGAACGTTCC
GACATGGCACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCTCTGCGGGAA
CAAAGTCGATGTCAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAA
GAATCTGCAGTACTATGAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTT
GTACCTCGCTAGGAAACTTGCAGGCGACCCTAACCTTCACTTTGTTGAGTCACCAGCTCT
TGCTCCCCCTGAGGTTCACATCGACGTTGCCGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCAT
TGCCGCCGCTGCTCAGCCTCTTCCAGATGATGATGATGACGCTTTTGCGTAAGCAAAAGA
TGTTCCAAGATGTGTGCTGCCGTGGTTTTGCTGATTCGCTTCTTTGTTTTGGTTTTTATT
CTATGTTGCGTTGATGTTACATATGGAATGAATCGAGTGTTTTAGAACTAATATTGGGGA
ATATTGAGTTTGTTCCGTTTTGGAATAGAGCGAGTTGTTTTTGAACCAAAATAGATATGC
AATCAAGGATCTTATTTGGGGAGAC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2BE81JQ 755 0 0
TCAAGAGACATCTTACTGGAGAGTTTGAGAAGAAGTATGAACCTACCATTGGTGTGGAGG
TTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTTCTACTGCTGGGATACTG
CTGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACTACATCCATGGTCAATGTGCAG
TGATTATGTTTGACGTCACAGCGCGGCTCACATACAAGAACGTTCCGACATGGCACCGTG
ATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCTCTGCGGTAACAAAGTCGATGTCA
AGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAAGAATCTGCAGTACT
ATGAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACCTCGCTAGGA
AACTTGCAGGCGACCCTAACCTTCACTTTGTTGAGTCACCAGCTCTTGCTCCCCCTGAGG
TTCACATCGACGTTGCCGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATTGCCGCCGCTGCTC
AGCCTCTTCCAGATGATGATGATGACGCTTTTGAGTAAGCAAAAGATGTTCCAAGATGTG
TGCTGCCGTGGTTTTGCTGATTCGCTTCTTTGTTTTGGTTTTTATTCTATGTTGCGTTGA
TGTTACATATGGAATGAATCGAGTGTTTTAGAACTAATATTGGGGAATATTGAGATTGTT
CCGTTTTGGAATAGAGCGAGTTGTTTTTGAACCA
G

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2E826JQ 728 0 0
TTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTTCTACTGCTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAA
GTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACTACATCCATGGTCAATGTGCAGTGATTATGTTTGA
CGTCACAGCGCGGCTCACATACAAGAACGTTCCGACATGGCACCGTGATCTATGCAGGGT
GTGTGAGAACATCCCTATTGTTCTTTGCGGGAACAAAGTCGATGTCAAGAACAGGCAAGT
CAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAAGAATCCGCAGTACTATGAGATATTTGC
CAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACCTCGCTAGGTAACTTGCAGGCGA
CCCTAACCTTCACTTTGTTGAGTCACCAGCTCTTGCTCCCCCTGAGGTTCACATTGACGT
TGCCGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATTTCATTGCCGCCGCTGCTCAGCCTTTTCCAGA
TGATGATGATGACGCTTTTGAGTAAGCAAAAGATGTTCCAAGATGTGTGCCGCCGTGGTT
TTGCTGATTCGCTTCTTTGTTTTGGTTTTTATTTTATGTTGCGTTGATGTTACATATGGA
ATGAATCGAGTGTTTTAGAACTAATATTGGGGAATATTGAGATTGTTCCGTTTTGGAATA
GAGCGAGTTGTTTTTGAACCAAAATAGATATGCAATCAAGGATTTTATTTGGGGAGACTT
TTAACTTG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 4 16

CO CL154Contig1 738 2 1 U
GGGAGTAGAAGGAGAGAACGCCGTCACATACACAACACGCAGACACACCTTCTCCGTCGT
CTCCTCCACCAATCTCATCGCAACCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGCCGCGCAATCTC
CAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTTTTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCA
TCCTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTC
CAAGGAGTACGTGCGCGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTAACCAACGA
AGGCATTGACTTTTTGAGGACTTACCTCAATCTCCCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTT
GAAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCG
TTCTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTC
TGGTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGC
ACCTGGAGCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGCTATGGTGCTGGTCC
AGTTTCTGGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTTGGTTATA
TTGTACCTTGGGATTTGAGATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTCTTTTACAT
TACAAAGAATGTTCAATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B553JQ C 1
AF RR2B553TF U 1
BS 1 738 RR2B553TF

RD RR2B553JQ 738 0 0
GGGAGTAGAAGGAGAGAACGCCGTCACATACACAACACGCAGACACACCTTCTCCGTCGT
CTCCTCCACCAATCTCATCGCAACCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGCCGCGCAATCTC
CAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTTTTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCA
TCCTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTC
CAAGGAGTACGTGCGCGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTAACCAACGA
AGGCATTGACTTTTTGAGGACTTACCTCAATCTCCCTTTTGAGATTGTTCCCGCCACTTT
GAAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCG
TTTTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTC
TGGTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGC
ACCTGGAGCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGCTATGGTGCTGGTCC
AGTTTCTGGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTTGGTTATA
TTGTACCTTGG*ATTTGAGATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTCTTTTACAT
TACAAAGAATGTTCAATG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2B553TF 738 0 0
GGGAGTAGAAGGAGAGAACGCCGTCACATACACAACACGCAGACACACCTTCTCCGTCGT
CTCCTCCACCAATCTCATCGCAACCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGCCGCGCAATCTC
CAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTTTTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCA
TCCTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTC
CAAGGAGTACGTGCGCGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTAACCAACGA
AGGCATTGACTTTTTGAGGACTTACCTCAATCTCCCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTT
GAAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCG
TTCTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTC
TGGTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGC
ACCTGGAGCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGCTATGGTGCTGGTCC
AGTTTCTGGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTTGGTTATA
TTGTACCTTGGGATTTGAGATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTCTTTTACAT
TACAAAGAATGTTCAATG

QA 1 738 1 738
DS 



CO CL154Contig2 786 6 13 U
GGGGAGTAGAAGGAGAGAACGCCGTCACACACACAACACGCAGACACCTTCTCCGTCGTC
TCCTCCACCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGCCGTGCAATCTCC
AAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCAT
CCTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTCT
AAGGAGTACGTTCGTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACCAACGAA
GGCATTGACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTG
AAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGT
TCTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCT
GGTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCA
CCTGGAGCTGGATCGAGACCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGCTATGGTGCTGGTCCA
GCTGCTGGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTT*TCTCTTTTT*GGTTATA
TTGTACCTTGGATTTGAAATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTTTTTACGTTA
CAAAGAATGTTCAATGTTCTGGATCGTTACAAATTTTTTAGTGTCTGATGGTTTAAAGTT
ATAATT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2D102TF U 1
AF RR2CH78JQ C 208
AF RR2BK46TF U 2
AF RR2CH78TF U 2
AF RR2BK46JQ C 57
AF RR2B232JQ C 52
BS 1 332 RR2D102TF
BS 333 333 RR2BK46TF
BS 334 535 RR2D102TF
BS 536 536 RR2BK46TF
BS 537 599 RR2D102TF
BS 600 600 RR2BK46TF
BS 601 639 RR2D102TF
BS 640 656 RR2BK46TF
BS 657 657 RR2CH78TF
BS 658 687 RR2BK46TF
BS 688 701 RR2CH78TF
BS 702 771 RR2BK46JQ
BS 772 786 RR2B232JQ

RD RR2D102TF 639 0 0
GGGGAGTAGAAGGAGAGAACGCCGTCACACACACAACACGCAGACACCTTCTCCGTCGTC
TCCTCCACCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGCCGTGCAATCTCC
AAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCAT
CCTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTCT
AAGGAGTACGTTCGTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACCAACGAA
GGCATTGACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTTCCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTG
AAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGT
TCTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCT
GGTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCACGGCA
CCTGGAGCTGGATCGAGACCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGCTATGGTGCTGGTCCG
GCTGCTGGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2CH78JQ 399 0 0
CAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTTTAAGGAGTACGTTCGTGAGACGTTTGCG
TGGATGCACTACT***GGTTCCTCACCAACGAAGGCATTGACTTTTTGAGGACTTACCTC
AACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGT
CCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGTACTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGT
GACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTGGTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGA
GCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCACCTGGAGCTGGATCGAGACCTGGGTTT
GGCCGTGGAGCTGGTGGCTATGGTGCTGGTCCAGCTGCT

QA 1 399 1 399
DS 

RD RR2BK46TF 686 0 0
GGGAGTAGAAGGAGAGAACGCCGTCACACACACAACACGCAGACACCTTCTCCGTCGTCT
CCTCCACCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGCCGTGCAATCTCCA
AGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCATC
CTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTCTA
AGGAGTACGTTCGTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACCAACGAAG
GCATTGACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGA
AGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGTT
CTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTG
GTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGTTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCAC
CTGGAGCTGGATCGAGACCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGCTATGGTGCTGGTCCAG
CTGCTGGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTT*TCTCTTTTT*GGT*ATAT
TGTACCTTGGATTTGAAATGGAATTG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2CH78TF 700 0 0
GGGAGTAGAAGGAGAGAACGCCGTCACACACACAACACGCAGACACCTTCTCCGTCGTCT
CCTCCACCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGCCGTGCAATCTCCA
AGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCATC
CTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTCTA
AGGAGTACGTTCGTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACT***GGTTCCTCACCAACGAAG
GCATTGACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGA
AGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGTA
CTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTG
GTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCAC
CTGGAGCTGGATCGAGACCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGCTATGGTGCTGGTCCAG
CTGCTGGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTT*TCTCTTTTT*GGTTATAT
TGTACCTTGGATTTGAAATGGGATTGTCTTTTACTCAATA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2BK46JQ 726 0 0
CGTCTCCTCCACCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGCCGTGCAAT
CTCCAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCA
GCATCCTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAA
GTCTAAGGAGTACGTTCGTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACCAA
CGAAGGCATTGACTTTTTGAGAACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCAC
TTTGAAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACC
TCGTTCTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAG
GTCTGGTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGTTGATTACCAGCCTTCCTTCAG
GGCACCTGGAGCTGGATCGAGACCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGCTATGGTGCTGG
TCCAGCTGCTGGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTT*TCTCTTTTT*GGT
TATATTGTACCTTGGATTTGAAATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTTTTTAC
GTTACAAAGAATGTTCAATGTTCTGGATCGTTACAAATTTTTTAGTGTCTGATGG
TTTGAAGTTAT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2B232JQ 735 0 0
CGTCGTCTCCTCTCT
ACCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGCCGCGCAATCTCCAAGTAC
CTCTTCCAAGAGGGAGTTCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCATCCTTTG
ATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAATTGATGCAGAGCTTCAAGTCTAAGGAG
TACGTGCGCGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTGACTAACGAAGGGATT
GACTTTTTGAGGACTTACCTCAATCTCCCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAG
CAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGTTCTGAT
GGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTGGTGGT
GAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCACCTGGA
GCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTGCTGGTCCAGCTGCT
GGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTTTGGTTATATTGTAC
CTTGGATTTGAAATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTTTTTACGTTACAAAGG
ATGTTCAATGTTCTGGATCGTTACAAATTTTTTAGTGTCTGATGGTTTAAAGTTATAATT

QA 16 735 16 735
DS 



CO CL154Contig3 797 6 16 U
GGGGGGTTACGCGAAAGGAGAAAGAGAGAACGCCGTCACGCTAACACAACACGTAGACAG
ACACCTTCTCCGTCGTCTTCTCTATCGCAACCATGATTATGTCAGAGGACAACCGTCGCG
CAATCTCCAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTTCTGTTTGCGAAAAAAGATTTCAATTTAG
CGCAGCATCCATTGGTGGAAGGTGTACCGAATCTGCAAGTCATAAAATTGATGCAGAGCT
TCAAGTCTAAGGAGTACGTTCGCGAGACGTTTGCATGGATGCATTACTACTGGTTTCTCA
CCAACCAAGGCATTGACTTTCTGAGGACTTACCTCAATCTCCCTTCTGAGATTGTTCCCG
CCACTTTGAAGAAACAACAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATTGGTGGTGACCGTCCCCGTG
GCCCACCTCGTTCTGATGGAGAGAGGAGGTTTGGTGACAGAGATGGATACCGGGGAGTAC
CAAGATCAGGAGGAGAGTTTGGTGACAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCT
TCAGGGGACCTGGAGCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCCGGTGGGTTTGGTG
CTGGTCCAGCTGCTGGATCAGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTCGTTTCTTTTT
GGCTAAATTGTACTTCAGATTTGAGAAGAATGTCTTTTACTCAACATGATTGTTTTTACG
TACGTTAGAATTTTATTAAGGACGTTCAGTGTTTTTGATCGTTACAAAAATGTTTCCCAT
ATTTTGAGATTTTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU20TF U 11
AF RR2EN21TF U 1
AF RR2EN85TF U 2
AF RR2EN85JQ C 75
AF RR2EN21JQ C 76
AF RR2DU20JQ C 656
BS 1 59 RR2EN21TF
BS 60 63 RR2EN85TF
BS 64 106 RR2EN21TF
BS 107 107 RR2EN85TF
BS 108 109 RR2EN21TF
BS 110 110 RR2EN85TF
BS 111 472 RR2EN21TF
BS 473 473 RR2EN85TF
BS 474 490 RR2EN21TF
BS 491 491 RR2EN85TF
BS 492 524 RR2EN21TF
BS 525 525 RR2EN85TF
BS 526 644 RR2EN21TF
BS 645 749 RR2EN85TF
BS 750 776 RR2EN85JQ
BS 777 797 RR2DU20JQ

RD RR2DU20TF 157 0 0
AG
GAAAGGAGAAAGATAGAACGCCGTCACGCTAACACAACACGTAGACAGACACCTTCTCCG
TCGTCTTCTCTATCGCAACCATGATTATGTCAGAGGACAACCGTCGCGCAATCTCCAAGT
ACCTCTTCCAAGAGGGAGTTCTGTTTGCGAAAAAA

QA 3 157 3 157
DS 

RD RR2EN21TF 653 0 0
GGGGGGTTACGCGAAAGGAGAAAGAGAGAACGCCGTCACGCTAACACAACACGTAGACA*
***CCTTCTCCGTCGTCTTCTCTATCGCAACCATGATTATGTCAGAAGAGAACCGTCGCG
CAATCTCCAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTTCTGTTTGCGAAAAAAGATTTCAATTTAG
CGCAGCATCCATTGGTGGAAGGTGTACCGAATCTGCAAGTCATAAAATTGATGCAGAGCT
TCAAGTCTAAGGAGTACGTTCGCGAGACGTTTGCATGGATGCATTACTACTGGTTTCTCA
CCAACCAAGGCATTGACTTTCTGAGGACTTACCTCAATCTCCCTTCTGAGATTGTTCCCG
CCACTTTGAAGAAACAACAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATTGGTGGTGACCGTCCCCGTG
GCCCACCTCGTTCTGATGGAGAGAGGAGGTTTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGTAC
CAAGATCAGGTGGAGAGTTTGGTGACAAGAGTGGAGCTCCTGCTTATTACCAGCCTTCCT
TCAGGGGACCTGGAGCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCCGGTGGGTTTGGTG
CTGGTCCAGCTGCTGGATCAGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTA
TCTGTCTTT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2EN85TF 748 0 0
GGACGCGAAAG
GAAAGGAGAAAGAGAGAACGCCGTCACGCTAACACAACACGTAGACAGACACCTTCTCCG
TCGTCTTCTCTATCGCAACCATGATTATGTCAGAGGACAACCGTCGCGCAATCTCCAAGT
ACCTCTTCCAAGAGGGAGTTCTGTTTGCGAAAAAAGATTTCAATTTAGCGCAGCATCCAT
TGGTGGAAGGTGTACCGAATCTGCAAGTCATAAAATTGATGCAGAGCTTCAAGTCTAAGG
AGTACGTTCGCGAGACGTTTGCATGGATGCATTACTACTGGTTTCTCACCAACCAAGGCA
TTGACTTTCTGAGGACTTACCTCAATCTCCCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGA
AACAACAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATTGGTGGTGACCGTCCCCGTGGCCCACCTCGTT
CTGATGGAGAGAGGAGGTTTGGTGACAGAGATGGATACCGGGGAGTACCAAGATCAGGAG
GAGAGTTTGGTGACAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGGACCTG
GAGCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCCGGTGGGTTTGGTGCTGGTCCAGCTG
CTGGATCAGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTCGTTTCTTTTTGGCTAAATTGTA
CTTCAGATTTGAGAAGAATGTCTTTTACTCAACATGATTGTTTTTACGTACGTTAGAATT
TTATTAAGGACGTTCAG

QA 12 748 12 748
DS 

RD RR2EN85JQ 705 0 0
GTCTTCTCTATCGCAACCATGATTATGTCAGAGGACAACCGTCGCGCAATCTCCAAGTAC
CTCTTCCAAGAGGGAGTTCTGTTTGCGAAAAAAGATTTCAATTTAGCGCAGCATCCATTG
GTGGAAGGTGTACCGAATCTGCAAGTCATAAAATTGATGCAGAGCTTCAAGTCTAAGGAG
TACGTTCGCGAGACGTTTGCATGGATGCATTACTACTGGTTTCTCACCAACCAAGGCATT
GACTTTTTGAGGACTTACCTCAATCTCCCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAA
CAACAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATTGGTGGTGACCGTCCCCGTGGCCCACCTCGTTTT
GATGGAGAGAGGAGGTTTGGTGACAGAGATGGATACCGGGGAGTACCAAGATCAGGAGGA
GAGTTTGGTGACAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGGACCTGGA
GCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCCGGTGGGTTTGGTGCTGGTCCAGCTGCT
GGATCAGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTCGTTTCTTTTTGGCTAAATTGTACT
TCAGATTTGAGAAGAATGTCTTTTACTCAACATGATTGTTTTTACGTACGTTAGAATTTT
ATTAAGGACGTTCAGTGTTTTTGATCGTTACAAAAATGTTTC
TCG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2EN21JQ 676 0 0
TCTTCTCTATCGCAACCATGATTATGTCAGAAGAGAACCGTCGCGCAATCTCCAAGTACC
TCTTCCAAGAGGGAGTTCTGTTTGCGAAAAAAGATTTCAATTTAGCGCAGCATCCATTGG
TGGAAGGTGTACCGAATCTGCAAGTCATAAAATTGATGCAGAGCTTCAAGTCTAAGGAGT
ACGTTCGCGAGACGTTTGCATGGATGCATTACTACTGGTTTCTCACCAACCAAGGCATTG
ACTTTCTGAGGACTTACCTCAATCTCCCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAAC
AACAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATTGGTGGTGACCGTCCCCGTGGCCCACCTCGTTCTG
ATGGAGAGAGGAGGTTTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGTACCAAGATCAGGTGGAG
AGTTTGGTGACAAGAGTGGAGCTCCTGCTTATTACCAGCCTTCCTTCAGGGGACCTGGAG
CTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCCGGTGGGTTTGGTGCTGGTCCAGCTGCTG
GATCAGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTTTCTTTTTGGCTAAATTGTATTT
CAGATTTGAGAAGAATGTCTTTTACTCAACATGATTGTTTTTACGTACGTTAGAATTTTA
TAAAGGACGTTCAG
TG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2DU20JQ 142 0 0
TTTTTGGCTAAATTGTACTTCAGATTTGAGAAGAATGTCTTTTACTCAACATGATTGTTT
TTACGTACGTTAGAATTTTATTAAGGACGTTCAGTGTTTTTGATCGTTACAAAAATGTTT
CCCATATTTTGAGATTTTAATG

QA 1 142 1 142
DS 



CO CL154Contig4 779 2 4 U
GGGAGTAGAAGGAGAGAACGCCGTCACATACACAACACGCTGACACACCTTCTCCGTCGT
CTCCTCCACCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGCCGCGCAATCTC
CAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTTCTGTTTGCGAAGAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCA
TCCTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTC
CAAGGAGTACGTGCGCGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTGACTAACGA
AGGCATTGACTTTCTGAGGACTTACCTCAACCTCCCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTT
GAAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCG
TTCTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTC
TGGTGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCA
CCTGGAGCTGGATCTAGGCCTGGTTTTGGCCGTGGAGCAGGTGGCTATGGTGCTGGTCCA
GCTGCTGCATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCCTGTCTCTTTTTGGTTATAT
TGTACCTTGGATTTGTGATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTCTTTACGTTAC
AGAGAATGTTCAATGTTCTGGGTCGTTACAATTTTTTTAGTGTCTAATGGCTTAAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G733TF U 1
AF RR2G733JQ C 192
BS 1 580 RR2G733TF
BS 581 581 RR2G733JQ
BS 582 757 RR2G733TF
BS 758 779 RR2G733JQ

RD RR2G733TF 764 0 0
GGGAGTAGAAGGAGAGAACGCCGTCACATACACAACACGCTGACACACCTTCTCCGTCGT
CTCCTCCACCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGCCGCGCAATCTC
CAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTTCTGTTTGCGAAGAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCA
TCCTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTC
CAAGGAGTACGTGCGCGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTGACTAACGA
AGGCATTGACTTTCTGAGGACTTACCTCAACCTCCCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTT
GAAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCG
TTCTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTC
TGGTGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCA
CCTGGAGCTGGATCTAGGCCTGGTTTTGGCCGTGGAGCAG*TGGCTATGGTGCTGGTCCA
GCTGCTGCATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCCTGTCTCTTTTTGGTTATAT
TGTACCTTGGATTTGTGATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTCTTTACGTTAC
AGAGAATGTTCAATGTTCTGGGTCGTTACAATTTTTT
AGTGTCT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2G733JQ 588 0 0
AAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTCCAAGGAGTACG
TGCGCGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTGACTAACGAAGGCATTGACT
TTCTGAGGACTTACCTCAACCTCCCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAGCAGC
AGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGTTCTGATGGAG
AGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTGGTGTGAGTT
TGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCACCTGGAGCTGG
ATCTAGGCCTGGTTTTGGCCGTGGAGCAGGTGGCTATGGTGCTGGTCCAGCTGCTGCATC
TGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCCTGTCTCTTTTTGGTTATATTGTACCTTGGA
TTTGTGATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTCTTTACGTTACAGAGAATGTTC
AATGTTCTGGGTCGTTACAATTTTTTTAGTGTCTAATGGCTTAAAGTT

QA 1 588 1 588
DS 



AS 2 15

CO CL155Contig1 669 3 6 U
GTGCAAAGAGAGTTGTGTTGATTAAATTAAAAAGTGGTCAAGGTTGATTCACAAGCTGTA
AAGTCAAGTTATTCTGGTTAAACAGATTCGTAGTAATTTGTTTAAAAGCTTTTAAAATAT
TGAATTAGCCTTATTTCTGGAGTGCATCTTTTCTCTAAATTCTTTAAAGTCTTCGGGCAG
CTCAACCGTTCGTATACTCTTAGCCGTGTTCTGAAGTGCTTTGAGCAGATTTTTGGAGGA
TTTGATGGTGTTCCCACGGATGTACCAAGAAAGCGGCGGTAGATTAAATGGAGGATATAG
CTCAAAGTATTGGTTTACTGTCAATTTTGACGCAATCTTTCCTTGGTCACCACTACATTT
TTTGTATTCTTCTATACTTTTTGGTAACCTCTTTTTGCACAATCGTTCTTGATCTATATA
TATAGGCTCCACTTTAAAGTTGCCTTGGAACACTTTCATGAACATTACTTTCTCTTTCTT
ATACTTTCCCGTAAGATCTTTTTCGTTTTCTTCCACAATTAGATGTAACGGGATAGGTAT
AGACGTCAGCGATAAGAAGTCATGAACCACAACTTTCTTCACCTTGATGACCCGCCTCGG
ACCATCCTCCGTCAAAACCTTTCGTTCTACGTTTTTCATAAGGCCGCAACACTTCTTCTC
ATCAAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F838JQ U 67
AF RR2AI89JQ U 1
AF RR2E773JQ U 1
BS 1 227 RR2AI89JQ
BS 228 228 RR2F838JQ
BS 229 643 RR2AI89JQ
BS 644 644 RR2E773JQ
BS 645 663 RR2AI89JQ
BS 664 669 RR2E773JQ

RD RR2F838JQ 268 0 0
AGTTATTCTGGTTAAACAGATTCGTAGTAATTTGTTTAAAAGCTTTTAAAATATTGAATT
AGCCTTATTTCTGGAGTGCATCTTTTCTCTAAATTCTTTAAAGTCTTCGGGCAGCTCAAC
CGTTCGTATACTCTTAGCCGTGTTCTGAAGTGCTTTGAGCAGATTTTTGGAGGATTTGAT
GGTGTTCCCACGGATGTACCAAGAAAGCGGCGGGAGATTAAATGGAGGATATAGCTCAAA
GTATTGGTTCACTGTCAATTTTGACGCA

QA 1 268 1 268
DS 

RD RR2AI89JQ 663 0 0
GTGCAAAGAGAGTTGTGTTGATTAAATTAAAAAGTGGTCAAGGTTGATTCACAAGCTGTA
AAGTCAAGTTATTCTGGTTAAACAGATTCGTAGTAATTTGTTTAAAAGCTTTTAAAATAT
TGAATTAGCCTTATTTCTGGAGTGCATCTTTTCTCTAAATTCTTTAAAGTCTTCGGGCAG
CTCAACCGTTCGTATACTCTTAGCCGTGTTCTGAAGTGCTTTGAGCAAATTTTTGGAGGA
TTTGATGGTGTTCCCACGGATGTACCAAGAAAGCGGCGGTAGATTAAATGGAGGATATAG
CTCAAAGTATTGGTTTACTGTCAATTTTGACGCAATCTTTCCTTGGTCACCACTACATTT
TTTGTATTCTTCTATACTTTTTGGTAACCTCTTTTTGCACAATCGTTCTTGATCTATATA
TATAGGCTCCACTTTAAAGTTGCCTTGGAACACTTTCATGAACATTACTTTCTCTTTCTT
ATACTTTCCCGTAAGATCTTTTTCGTTTTCTTCCACAATTAGATGTAACGGGATAGGTAT
AGACGTCAGCGATAAGAAGTCATGAACCACAACTTTCTTCACCTTGATGACCCGCCTCGG
ACCATCCTCCGTCAAAACCTTTCGTTCTACGTTTTTCATAAGGTCGCAACACTTCTTCTC
ATC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2E773JQ 669 0 0
GTGCAAAGAGAGTTGTGTTGATTAGATTAGAAGGTGGTCAAGGTTGATTCACAAGCTGTA
AAGTCAAGTTATTCTGGTTAAACAGATTCGTAGTAATTTGTTTAAAAGCTTTTAAAATAT
TGAATTAGCCTTATTTCTGGAGTGCATCTTTTCTCTAAATTCTTTAAAGTCTTCGGGCAG
CTCAACCGTTTGTATACTCTTAGCCGTGTTCTGAAGTGCTTTGAGCAGATTTTTGGAGGA
TTTGATGGTGTTCCCACGGATGTACCAAGAAAGCGGCGGTAGATTAAATGGAGGATATAA
CTCAAAGTATTGGTTTACTGTCAATTTTGACGCAATCTTTCCTTGGTCACCACTACATTT
TTTGTATTCTTCTATACTTTTTGGTAACCTCTTTTTGCACAATCGTTCTTGATCTATATA
TATAGGCTCCACTTTAAAGTTGCCTTGGAACACTTTCATGAACATTACTTTCTCTTTCTT
ATACTTTCCCGTAAGATCTTTTTCGTTTTCTTCCACAATTAGATGTAACGGGATAGGTAT
AGACGTCAGCGATAAGAAGTCATGAACCACAACTTTCTTCACCTTGATGACCCGCCTCGG
ACCATCCTCCGTCAAAACCTTTCGTTCTACGTTTTTCATAAGGCCGCGCCACTTCTTCTC
ATCAAAAAA

QA 1 669 1 669
DS 



CO CL155Contig2 1050 12 23 U
GGGGCTCGC*TCAGGTAATAGGAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTAGCTGGATCAGT
AAGAACACTCAACAGCTTCTTAAGGCCGAGTCCAAGAGATCTGAAAATGACGAATCTAAG
TCGGTGTCAGAGAAAGACACTAATTATAATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATAT
GTTTATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAG
CATCCTTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAAAAAAGAAGGGTGTTTACCAT
ATGAACTTAGAAGTGACCATAGGAGCGGCGCCTGAAAAAACCTTCTTATGGTTGACTGAT
CCATGGGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAAGTGGGG*CGTGACCTTATGAAAAACGTA
GAACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAATTGTG
GTTCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAA
AACGAAAAAGATCTTACGGGAAAGTATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTAATGAAAGTGTTC
CAAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAGAGG
TTACCAAAAAGTCGAGAAGAATATAAAGAATGTAGTGGTGGCCAAGGAAAGATTGCGTCA
AAATTGACAGTAAACCAATACTTTGAGCTATATCCTCCATTTAATCTACCGCCGCTTTCT
TGGTACATCCGTGGGAACACCATCAAAACCTCCAAAAATCTGCTTAAAGCACTTCAGAAC
ACGGCTAAGAGTATACGAACGGTTGATCTGCCCGAAGAGTATAAAGAACTTAGAGCAAAG
ATGAACTCCAGGAATAAGGCTAATTCAATATTTTAAATGCTTTTAAACAAATTACAACGA
ATCTGTTTAATCAGAATAACTTGACTTTACAGCTTGTGAATCATCATTGACCGCTTTCTA
ATCTAATCAACACAACTCTCTTTGCACAAG


BQ
10 30 45 50 50 50 50 5 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 15 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 10 60 60 60 15 15 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 20 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 15 50 50 50 50 50 50 15 35 50 25 50 35 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E773TF U 2
AF RR2E165TF U 2
AF RR2DE04TF U 2
AF RR2C756TF U 2
AF RR2AU28TF U 1
AF RR2AI89TF U 2
AF RR2ES44TF U 3
AF RR2F838TF U 2
AF RR2B441TF U -1
AF RR2C756JQ C 581
AF RR2AU28JQ C 128
AF RR2ES44JQ C 298
BS 1 7 RR2AU28TF
BS 8 10 RR2AI89TF
BS 11 21 RR2AU28TF
BS 22 22 RR2AI89TF
BS 23 96 RR2AU28TF
BS 97 97 RR2AI89TF
BS 98 109 RR2AU28TF
BS 110 110 RR2AI89TF
BS 111 680 RR2AU28TF
BS 681 681 RR2F838TF
BS 682 702 RR2AU28TF
BS 703 703 RR2B441TF
BS 704 705 RR2F838TF
BS 706 706 RR2B441TF
BS 707 731 RR2F838TF
BS 732 732 RR2B441TF
BS 733 735 RR2F838TF
BS 736 736 RR2B441TF
BS 737 752 RR2F838TF
BS 753 807 RR2B441TF
BS 808 808 RR2AU28JQ
BS 809 809 RR2B441TF
BS 810 1050 RR2AU28JQ

RD RR2E773TF 291 0 0
GGGCTCGC*TCAGGTAATAGGAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTAGCTGGATCAGTA
AGAACACTCAACAGCTTCTTAAGGCCGAGTCCAAGAGATCTGAAAATGACGAATCTAAGT
CGGTGTCAGAGAAAGACACTAATAATAATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGGATATG
TTTATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAGC
ATCCTTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAACAAAGAAGGGTG

QA 1 291 1 291
DS 

RD RR2E165TF 636 0 0
GGGCTCGC*TCAGGTAATAGGAAGTGGGTATATTCCCTGGATTTGGTAGCTGGATCAGTA
AGAACACTCAACAGCTTCTTAAGGCCGAGTCCAAGAGATCTGAAAATGACGAATCTAAGT
CGGTGTCAGAGAAAGACACTAATAATAATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATATG
TTTATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAGC
ATCCTTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAACAAAGAAGGGTGTTTACCATA
TGAACTTAGAAGTGACCATAGGAGCCGCGCCTCAACAAACCTTCTTATGGTTGACTGATG
CATGGGGCAGTTCGTTTTTTGATGAGAAGAAGTGGCG*CG**ACCTTATGAAAAACGTAG
AACGAAAGGTTTTTACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAGTTGTGG
TTCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAA
ACGAAAAAGATCTTACGGGAAAGTATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTCATGAAAGTGTTCC
AAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2DE04TF 636 0 0
G
GGCTCTTATCAGGTAATAGAAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTAGCTGGATCAGTAA
GAACACTCAACAGCTTCTTAAGGCCGAGTCCAAGGGATCTGAAAATGTCGAATCTAAGTC
GGTGTCAGAGAAAGACACTAATTATAATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATATGT
TTATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAGCA
TCCTTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAAAAAAGAAGGGTGTTTACCATAT
GAACTTAGAAGTGACCATAGGAGCGGCGCCTGAAAAAACCTTCTTATGGTTGACTGATCC
ATGGGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAAGTGGGGGCGTGCCCTTATGAAAAACGTAGA
ACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTTCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAATTGTGGT
TCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAA
CGAAAAAGATCTTACGGGAAAGTATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTAATGAAAGTGTTCCA
AG*CAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATC

QA 2 636 2 636
DS 

RD RR2C756TF 636 0 0
G
GGCTCTTATCAGGTAATAGAAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTAGCTGGATCAGTAA
GAACACTCAACAGCTTCTTAAGGCCGAGTCCAAGGGATCTGAAAATGTCGAATCTAAGTC
GGTGTCAGAGAAAGACACTAATTATAATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATATGT
TTACGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAGCA
TCCTTGGCATAGTCCCCCTTCCAAGGTCAAGGTGACAAAAAAGAAGGGTGTTTACCATAT
GAACTTAGAAGTGACCATAGGAGCGGCGCCTGAAAAAACCTTCTTATGGTTGACTGATCC
ATGGGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAAGTGGGGGCGTGACCTTATGAAAAACGTAGA
ACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCGAGGTGAAGAAAATTGTGGT
TCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAA
CGAAAAAGATCTTACGGGAAAGTATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTAATGAAAGTGTTCCA
AGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATC

QA 2 636 2 636
DS 

RD RR2AU28TF 702 0 0
GGGGCTCTTATCAGGTAATAGAAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTAGCTGGATCAGT
AAGAACACTCAACAGCTTCTTAAGGCCGAGTCCAAGGGATCTGAAAATGTCGAATCTAAG
TCGGTGTCAGAGAAAGACACTAATTATAATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATAT
GTTTATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAG
CATCCTTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAAAAAAGAAGGGTGTTTACCAT
ATGAACTTAGAAGTGACCATAGGAGCGGCGCCTGAAAAAACCTTCTTATGGTTGACTGAT
CCATGGGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAAGTGGGG*CGTGACCTTATGAAAAACGTA
GAACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAATTGTG
GTTCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAA
AACGAAAAAGATCTTACGGGAAAGTATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTAATGAAAGTGTTC
CAAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAGAGG
TTACCAAAAAGTCGAGAAGA*TATAAAGAATGTAGTGGTGGC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2AI89TF 685 0 0
GGGCTCGC*TCAGGTAATAGGAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTAGCTGGATCAGTA
AGAACACTCAACAGCTTCTTAAGGCCGAGTCCAAGAGATCTGAAAATGACGAATCTAAGT
CGGTGTCAGAGAAAGACACTAATAATAATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATATG
TTTATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAGC
ATCCTTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAACAAAGAAGGGTGTTTACCATA
TGAACTTAGAAGTGACCATAGGAGCCGCGCCTCAACAAACCTTCTTATGGTTGACTGATG
CATGGGGCAGTTCGTTTTTTGATGAGAAGAAGTGTTG*CG**ACCTTATGAAAAACGTAG
AACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAGTTGTGG
TTCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAA
ACGAAAAAGATCTTACGGGAAAGTATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTCATGAAAGTGTTCC
AAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAGAGGT
TACCAAAAAGTATAGAAGA**ATAC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2ES44TF 700 0 0
GGCTCTTATCAGGTAATAGAAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTAGCTGGATCAGTAA
GAACACTCAACAGCTTCTTAAGGCCGAGTCCAAGGGATCTGAAAATGTCGAATCTAAGTC
GGTGTCAGAGAAAGACACTAATTATAATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATATGT
TTATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAGCA
TCCTTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAAAAAAGAAGGGTGTTTACCATAT
GAACTTAGAAGTGACCATAGGAGCGGCGCCTGAAAAAACCTTCTTATGGTTGACTGATCC
ATGGGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAAGTGGGGGCGTGACCTTATGAAAAACGTAGA
ACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAATTGTGGT
TCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAGGAAAA
CGAAAAAGATCTTACGGGAAAGTATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTAATGAAAGTGTTCCA
AGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAGAGGTT
ACCAAAAAGTCGAGAAGA*TATAAAGAATGTAGTGGTGGC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2F838TF 751 0 0
GGGCTCGC*TCAGGTAATAGGAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTAGCTGGATCAGTA
AGAACACTCAACAGCTTCTTAAGGCCGAGTCCAAGAGATCTGAAAATGACGAATCTAAGT
CGGTGTCAGAGAAAGACACTAATAATAATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATATG
TTTATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAGC
ATCCTTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAACAAAGAAGGGTGTTTACCATA
TGAACTTAGAAGTGACCATAGGAGCCGCGCCTCAACAAACCTTCTTATGGTTGACTGATG
CATGGGGCAGTTCGTTTTTTGATGAGAAGAAGTGGCG*CG**ACCTTATGAAAAACGTAG
AACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAGTTGTGG
TTCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAA
ACGAAAAAGATCTTACGGGAAAGTATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTCATGAAAGTGTTCC
AAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAGAG*T
TACCAAAAAGTATAGAAGAATACAAAAAATGTAGTGGTGAC*AAAGAAAGATTGCGTCAA
AATTGACAGTGAAC*AATACTTTGAGCTATA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2B441TF 811 0 0
GGCTT
GCTCGC*TCAGGTAATAGGAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTAGCTGGATCAGTAAG
AACACTCAACAGCTTCTTAAGGCCGAGTCCAAGAGATCTGAAAATGACGAATCTAAGTCG
GTGTCAGAGAAAGACACTAATAATAATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATATGTT
TATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAGCAT
CCTTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAACAAAGAAGGGTGTTTACCATATG
AACTTAGAAGTGACCATAGGAGCCGCGCCTCAACAAACCTTCTTATGGTTGACTGATGCA
TGGGGCAGTTCGTTTTTTGATGAGAAGAAGTGGCG*CG**ACCTTATGAAAAACGTAGAA
CGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAGTTGTGGTT
CATAACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAAC
GAAAAAGATCTTACGGGAAAGTATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTCATGAAAGTGTTCCAA
GGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAGAGGTTA
CCAAAAAGTATAGAAGAATACAAAAAATGTAGTGGTGACCAAGGAAAGATTGCGTCAAAA
TTGACAGTAAACCAATACTTTGAGCTATATCCTCCATTTAATCTACCGCCGCTTTCTTGG
TACATCCGTGGGAACACCATCAAATC

QA 6 811 6 811
DS 

RD RR2C756JQ 338 0 0
TAATGTTAATGAAAGTGTTCCAAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAAG
AACGATTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAAAGTCGAGAAGAATATAAAGAATGTAGTGGTG
GCCAAGGAAAGATTGCGTCAAAATTGACAGTAAACCAATACTTTGAGCTATATCCTCCAT
TTAATCTACCGCCGCTTTCTTGGTACATCCGTAGGAACACCATCAAAACCTCCAAAAATC
TGCTTAAAGCACTTCAGAACACGGCTAAGAGTATACGAACGGTTGATCTGCCCGAAGAGT
ATAAAGAACTTAGGGCAAAGATGAACTCCAGGAATAAG

QA 1 338 1 338
DS 

RD RR2AU28JQ 923 0 0
CAGAGAAAGACACTAATTATAATGCTC*TGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATATGTTTATG
ATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAGCATCCTT
GGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAAAAAAGAAGGGTGTTTACCATATGAACT
TAGAAGTGACCATAGGAGCGGCGCCTGAAAAAACCTTCTTATGGTTGACTGATCCATGGG
GCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAAGTGGGG*CGTGACCTTATGAAAAACGTAGAACGAA
AGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAATTGTGGTTCATG
ACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAACGAAA
AAGATCTTACGGGAAAGTATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTAATGAAAGTGTTCCAAGGCA
ACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAGAGGTTACCAA
AAAGTCGAGAAGAATATAAAGAATGTAGTGGTGGCCAAGGAAAGATTGCGTCAAAATTGA
CAGTAAACCAATACTTTGAGCTATATCCTCCATTTAATCTACCGCCGCTTTCTTGGTACA
TCCGTGGGAACACCATCAAAACCTCCAAAAATCTGCTTAAAGCACTTCAGAACACGGCTA
AGAGTATACGAACGGTTGATCTGCCCGAAGAGTATAAAGAACTTAGAGCAAAGATGAACT
CCAGGAATAAGGCTAATTCAATATTTTAAATGCTTTTAAACAAATTACAACGAATCTGTT
TAATCAGAATAACTTGACTTTACAGCTTGTGAATCATCATTGACCGCTTTCTAATCTAAT
CAACACAACTCTCTTTGCACAAG

QA 1 923 1 923
DS 

RD RR2ES44JQ 733 0 0
CATATGAACTTAGAAGTGACCATAGGAGCGGCGCCTGAAAAAACCTTCTTATGGTTGACT
GATCCATGGGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAAGTGGGGGCGTGACCTTATGAAAAAC
GTAGAACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAATT
GTGGTTCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAG
GAAAACGAAAAAGATCTTACGGGAAAGTATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTAATGAAAGTG
TTCCAAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAG
AGGTTACCAAAAAGTCGAGAAGAATATAAAGAATGTAGTGGTGGCCAAGGAAAGATTGCG
TCAAAATTGACAGTAAACCAATACTTTGAGCTATATCCTCCATTTAATCTACCGCCGCTT
TCTTGGTACATCCGTGGGAACACCATCAAAACCTCCAAAAATCTGCTTAAAGCACTTCAG
AACACGGCTAAGAGTATACGAACGGTTGATCTGCCCGAAGAGTATAAAGAACTTAGAGCA
AAGATGAACTCCAGGAATAAGGCTAATTCAATATTTTAAATGCTTTTAAACAAATTACAA
CGAATCTGTTTAATCAGAATAACTTGACTTTACAGCTTGTGAATCATCATTGACCGCTTT
CTAATCTAATCAA

QA 1 733 1 733
DS 



AS 2 16

CO CL156Contig1 763 2 16 U
AAAGGGTAGCACAATCCTGATGAACTTGGTTCCTTTGTACACTGAAGATTTTTAAATGTG
CTACAACAATACCATAAGGTCTCATGCTCACAAACCAAGAACTCTAAGATGCAACACACA
CAGAGATATTAAGGTAGCATAAGATAGAGATGTATTAAATTCATAGGCCCGTCTTAAATC
ATCCGCTGAAGGTTTGGACAAGAGTGTTGTGCCATGGGTCAGACAAGTGCTGCAACAGGT
TCTCAAATGGTCCCTTTCCAGTCACATTGTGTTGAATCACGAACCCTAAGAATGCCAACA
TCGCCAACCTCCCATTTGCAAGCTCCTTCTCCTTAGCCTCGAGAGTAGGAGCGAAGTTAA
GAGGGTTAAAGATTCCTCCGGGGTAACCAACTTCATTTGGAGGCAAGCTGTATTGCTTGA
AGATAGGGTCTTGGTTCACACTCCCTGGGTTCTTAATGTCCTGCCACCGTCTGATCTCAA
CGTAATGAAACAATATGAATTCGATCACGAACAATGTTGATGATGATGCAAAATACTGCT
CTTTCCCGGCATCATACCACTCAGGAACGTTGATGATTCCGATCTTGGTGAAAACTTCAG
GCAAAAGCATCCCTGCGACGCCGAGCATGGCCCACCGTCCGTTGACAAGCTCTGCCTGGA
TGAACCACTTCAAGTTCTCTGGATCCTCTGCTAGTCCCAATGGGTCAAACCCATTATCAC
CGGCAAGACTGCCGTTGAGATAACCAGGAGATGCCAAACCGGG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW86JQ U 1
AF RR2GH39JQB U 1
BS 1 16 RR2BW86JQ
BS 17 17 RR2GH39JQB
BS 18 80 RR2BW86JQ
BS 81 81 RR2GH39JQB
BS 82 201 RR2BW86JQ
BS 202 203 RR2GH39JQB
BS 204 343 RR2BW86JQ
BS 344 344 RR2GH39JQB
BS 345 387 RR2BW86JQ
BS 388 388 RR2GH39JQB
BS 389 442 RR2BW86JQ
BS 443 443 RR2GH39JQB
BS 444 604 RR2BW86JQ
BS 605 605 RR2GH39JQB
BS 606 716 RR2BW86JQ
BS 717 763 RR2GH39JQB

RD RR2BW86JQ 716 0 0
AAAGGGTAGCACAATCTTGATGAACTTGGTTCCTTTGTACACTGAAGATTTTTAAATGTG
CTACAACAATACCATAAGGTTTCATGCTCACAAACCAAGAACTCTAAGATGCAACACACA
CAGAGATATTAAGGTAGCATAAGATAGAGATGTATTAAATTCATAGGCCCGTCTTAAATC
ATCCGCTGAAGGTTTGGACAATGGTGTTGTGCCATGGGTCAGACAAGTGCTGCAACAGGT
TCTCAAATGGTCCCTTTCCAGTCACATTGTGTTGAATCACGAACCCTAAGAATGCCAACA
TCGCCAACCTCCCATTTGCAAGCTCCTTCTCCTTAGCCTCGAGCGTAGGAGCGAAGTTAA
GAGGGTTAAAGATTCCTCCGGGGTAACTAACTTCATTTGGAGGCAAGCTGTATTGCTTGA
AGATAGGGTCTTGGTTCACACTTCCTGGGTTCTTAATGTCCTGCCACCGTCTGATCTCAA
CGTAATGAAACAATATGAATTCGATCACGAACAATGTTGATGATGATGCAAAATACTGCT
CTTTCCCGGCATCATACCACTCAGGAACGTTGATGATTCCGATCTTGGTGAAAACTTCAG
GCAACAGCATCCCTGCGACGCCGAGCATGGCCCACCGTCCGTTGACAAGCTCTGCCTGGA
TGAACCACTTCAAGTTCTCTGGATCCTCTGCTAGTCCCAATGGGTCAAACCCATTA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2GH39JQB 763 0 0
GAAGA
GTAGCATAATCCTGATGAACTTGGTTCCTTTGTACACTGAAGATTTTTAAATGTGCTACA
ACAATACCATATTGTCTCATGCTCACAAACCAAGAACTCTAAGATGCAACACACACAGAT
ATATTAAGGTAGCATAAGATAGAGATGTATTAAATTCATAGGTCCGTCTTAAATCATCCG
CTGAAGGTTTGGACAAGAGTGTTGTGCCATGGGTCAGACAAGTGCTGCAACAGGTTCTCA
AATGGTCCCTTTCCAGTCACATTGTGTTGAATCACGAACCCTAAGAATGCCAACATCGCC
AACCTCCCATTTGCAAGCTCTTTCTCCTTAGCCTCGAGAGTAGGAGCGAAGTTAAGGGGG
TTAAAGATTCCTCCGGGGTAACCAACTTCATTTGGAGGCAAGCTGTATTGCTTGAAGATA
GGGTCTTGGTTCACACTCCCTGGGTTCTTAATGTCTTGCCACCGTCTGATCTCAACGTAA
TGAAACAATATGAATTCGATCACGAACAATGTTGATGATGATGCAAAATACTGCTCTTTC
CCGGCGTCATACCACTCAGGAACGTTGATGATTCCGATCTTGGTGAAAACTTCAGGCAAA
AGCATCCCTGCGACGCCGAGCATGGCCCACCGTCCGTTGACAAGCTCTGCCTGGATGAAC
CACTTCAAGTTCTCTGGATCCTCTGCTAGTCCCAATGGGTCAAACCCATTATCACCGGCA
AGACTGCCGTTGAGATAACCAGGAGATGCCAAACCGGG

QA 6 763 6 763
DS 



CO CL156Contig2 987 14 29 U
GGAATCTCTTCTTGATTCCAATCCATTCTCTACCACCTTCCTGTATCCAAGCTCTGTAGG
GGAAATGGCCACTGTCACTACTCAAGCCTCGGCCTCGATATTCAGACCATGCACTTCAAA
GCCAAGATTCCTCACCGGTTCTTCCGGTAGGTTGAACCGAGAATTGTCGTTTAAGTCAAT
CGGCTCAAAGACGTCCTCGTTCAAGGTTGAAGCTAAGAAAGGAGAATGGTTGCCCGGTTT
GGCATCTCCTGGTTATCTCAACGGCAGTCTTGCCGGTGATAATGGGTTTGACCCATTGGG
ACTAGCAGAGGATCCAGAGAACTTGAAGTGGTTCATCCAGGCAGAGCTTGTCAACGGACG
GTGGGCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTTTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAAT
CATCAACGTTCCTGAGTGGTATGACGCCGGGAAAGAGCAGTATTTTGCATCATCATCAAC
ATTGTTCGTGATCGAATTCATATTGTTTCATTACGTTGAGATCAGACGGTGGCAGGACAT
TAAGAACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAGCTTGCCCCCAAA
TGAAGTTGGTTACCCCGGAGGTATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTCCTACTCTCGAGGC
TAAGGAGAAAGAGCTTGCAAATGGGAGGTTGGCGATGTTGGCATTCTTAGGGTTCGTGAT
TCAACACAATGTGACTGGAAAGGGACCATTTGAGAACCTGTTGCAGCACTTGTCTGACCC
ATGGCACAACACCATTGTCCAAACCTTCAGCGGATGATTTAAGACGGAGCTATGAATTTA
ATGTCTCTCTATCTTATGGTGCCTTAATATATCTGTGTGTGTTCCATCTTTAGAGTTCTT
GGTTTGTGAGCATGAAACAATATGGTATTGCTGTAGCACATTTAAAAATCTTCAGTGTAC
AAAGGAACCAAGTTCATCAGGATTATG


BQ
30 35 35 35 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 0 0 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 25 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 60 75 75 75 75 75 
75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 20 75 75 75 75 75 
75 45 75 75 75 75 75 60 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 55 70 70 35 70 70 65 65 65 65 40 65 
65 65 65 50 20 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 45 45 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DE09TF U 1
AF RR2BW86TF U 1
AF RR2CI17TF U 2
AF RR2CU67TF U 1
AF RR2CX06TF U 1
AF RR2GF39TF U 1
AF RR2BV52TF U 8
AF RR2GH39TF U 195
AF RR2B133TF U 5
AF RR2CX06JQ C 233
AF RR2EL90TF U 365
AF RR2CU67JQ C 268
AF RR2EL90JQ C 365
AF RR2ET79TF U 452
BS 1 34 RR2BW86TF
BS 35 37 RR2CU67TF
BS 38 126 RR2BW86TF
BS 127 127 RR2CU67TF
BS 128 275 RR2BW86TF
BS 276 276 RR2CU67TF
BS 277 390 RR2BW86TF
BS 391 391 RR2CU67TF
BS 392 444 RR2BW86TF
BS 445 445 RR2CU67TF
BS 446 594 RR2BW86TF
BS 595 595 RR2CU67TF
BS 596 607 RR2BW86TF
BS 608 608 RR2CU67TF
BS 609 620 RR2BW86TF
BS 621 622 RR2CU67TF
BS 623 642 RR2BW86TF
BS 643 664 RR2CU67TF
BS 665 665 RR2B133TF
BS 666 687 RR2CU67TF
BS 688 688 RR2BV52TF
BS 689 693 RR2GF39TF
BS 694 694 RR2BV52TF
BS 695 713 RR2GF39TF
BS 714 795 RR2B133TF
BS 796 796 RR2EL90TF
BS 797 805 RR2B133TF
BS 806 924 RR2EL90TF
BS 925 987 RR2ET79TF

RD RR2DE09TF 316 0 0
GGAATCTCTTCTTGATTCCAATCCATTCTCTACC**TTTCCTGTATCCAAGCTCTGTAGG
GGAAATGGCCACTGTCACTACTCAAGCCTCGGCCTCGATATTCAGACCATGCACTTCAAA
GCCAAGGTTCCTCACCGGTTCTTCCGGTAGGTTGAACCGAGAATTGTCGTTTAAGTCAAT
CGGCTCAGAGACGTCCTCGTTCAAGGTTGAAGCTAAGAAAGGAGAATGGTTGCCCGGTTT
GGCATCTCCTGGTTATCTCAACGGCAGTCTTGCCGGTGATAATGGGTTTGACCCATTGGG
ACTAACAGAGGATCCA

QA 1 316 1 316
DS 

RD RR2BW86TF 642 0 0
GGAATCTCTTCTTGATTCCAATCCATTCTCTACC**TTTCCTGTATCCAAGCTCTGTAGG
GGAAATGGCCACTGTCACTACTCAAGCCTCGGCCTCGATATTCAGACCATGCACTTCAAA
GCCAAGGTTCCTCACCGGTTCTTCCGGTAGGTTGAACCGAGAATTGTCGTTTAAGTCAAT
CGGCTCAAAGACGTCCTCGTTCAAGGTTGAAGCTAAGAAAGGAGAATGGTTGCCCGGTTT
GGCATCTCCTGGTTATCTCAACGGCAGTCTTGCCGTTGATAATGGGTTTGACCCATTGGG
ACTAGCAGAGGATCCAGAGAACTTGAAGTGGTTCATCCAGGCAGAGCTTGTCAACGGACG
GTGGGCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTGTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAAT
CATCAACGTTCCTGAGTGGTATGATGCCGGGAAAGAGCAGTATTTTGCATCATCATCAAC
ATTGTTCGTGATCGAATTCATATTGTTTCATTACGTTGAGATCAGACGGTGGCAGGACAT
TAAGAACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAGCTTGCCTCCAAA
TGAAGTTAGTTACCCCGGAGA*ATCTTTAACCCTCTTAACTT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2CI17TF 653 0 0
GAATCTCTTCTTGATTCCAATCCATTCTCTACC**TTTCCTGTATCCAAGCTCTGTAGGG
GAAATGGCCACTGTCACTACTCAAGCCTCGGCCTCGATATTCAGACCATGCACTTCAAAG
CCAAGGTTCCTCACCGGTTCTTCCGGTAGGTTGAACCGAGAATTGTCGTTTAAGTCAATC
GGCTCAAAGACGTCCTCGTTCAAGGTTGAAGCTAAGAAAGGAGAATGGTTGCCCGGTTTG
GCATCTCCTGGTTATCTCAACGGCAGTCTTGCCGGTGATAATGGGTTTGACCCATTGGGA
CTAGCAGAGGATCCAGAGAACTTGAAGTGGTTCATCCAGGCAGAGCTTGTCAACGGACGG
TGGGCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTGTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAATC
ATCAACGTTCCTGAGTGGTATGATGCCGGGAAAGAGCAGTATTTTGCATCATCATCAACA
TTGTTCGTGATCGAATTCATATTGTTTCATTACGTTGAGATCAGACGGTGGCAGGACATT
GAGAACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAGCTTGCCTCCAAAT
GAAGTTGGTTACCCCGGAGGAATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTCCTACGCT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2CU67TF 687 0 0
GGAATCTCTTCTTGATTCCAATCCATTCTCTACCACCTTCCTGTATCCAAGCTCTGTAGG
GGAAATGGCCACTGTCACTACTCAAGCCTCGGCCTCGATATTCAGACCATGCACTTCAAA
GCCAAGATTCCTCACCGGTTCTTCCGGTAGGTTGAACCGAGAATTGTCGTTTAAGTCAAT
CGGCTCAAAGACGTCCTCGTTCAAGGTTGAAGCTAAGAAAGGAGAATGGTTGCCCGGTTT
GGCATCTCCTGGTTATCTCAACGGCAGTCTTGCCGGTGATAATGGGTTTGACCCATTGGG
ACTAGCAGAGGATCCAGAGAACTTGAAGTGGTTCATCCAGGCAGAGCTTGTCAACGGACG
GTGGGCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTTTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAAT
CATCAACGTTCCTGAGTGGTATGACGCCGGGAAAGAGCAGTATTTTGCATCATCATCAAC
ATTGTTCGTGATCGAATTCATATTGTTTCATTACGTTGAGATCAGACGGTGGCAGGACAT
TAAGAACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAGCTTGCCCCCAAA
TGAAGTTGGTTACCCCGGAGGTATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTCCTACTCTCGAGGC
TAAG*AGAAAGAGCTTGCAAATGGGAG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2CX06TF 679 0 0
GGAATCTCTTCTTGATTCCAATCCATTCTCTACCACCTTCCTGTATCCAAGCTCTGTAGG
GGAAATGGCCACTGTCACTACTCAAGCCTCGGCCTCGATATTCAGACCATGCACTTCAAA
GCCAAGATTCCTCACCGGTTCTTCCGGTAGGTTGAACCGAGAATTGTCGTTTAAGTCAAT
CGGCTCAAAGACGTCCTCGTTCAAGGTTGAAGCTAAGAAAGGAGAATGGTTGCCCGGTTT
GGCATCTCCTGGTTATCTCAACGGCAGTCTTGCCGGTGATAATGGGTTTGACCCATTGGG
ACTAGCAGAGGATCCAGAGAACTTGAAGTGGTTCATCCAGGCAGAGCTTGTCAACGGACG
GTGGGCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTTTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAAT
CATCAACGTTCCTGAGTGGTATGACGCCGGGAAAGAGCAGTATTTTGCATCATCATCAAC
ATTGTTCGTGATCGAATTCATATTGTTTCGTTACGTTGAGATCAGACGGTGGCAGGACAT
TAAGAACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAGCTTGCCCCCAAA
TGAAGTTGGTTACCCCGGAGGTATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTCCTACTCTCGAGGC
TAAG*AGAAAGAGCTTGCA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2GF39TF 732 0 0
GGAATCTCTTCTTGATTCCAATCCATTCTCCACCACCTTCCTGTATCCAAGCTCTGTAGG
GGAAATGGCCACTGTCACTACTCAAGCCTCGGCCTCGATATTCAGACCATGCACTTCAAA
GCCAAGATTCCTCACCGGTTCTTCCGGTAGGTTGAACCGAGAATTGTCGTTTAAGTCAAT
CGGCTCAAAGACGTCCTCATTCAAGGTTGAAGCTAAGAAAGGCGAATGGTTGCCCGGTTT
GGCATCTCCTGGTTATCTCAACGGCAGTCTTGCCGGTGATAATGGGTTTGACCCATTGGG
ACTAGCAGAGGATCCAGAGAACTTGAAGTGGTTCATCCAGGCAGAGCTTGTCAACGGACG
GTGGGCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTTTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAAT
CATCAACGTTCCTGAGTGGTACGATGCCGGGAAAGAGCAGTATTTTGCATCATCATCGAC
ATTGTTCGTGATCGAATTCATATTGTTTCATTACGTTGAGATCAGACGGTGGCAGGACAT
TAAGAACCCAGGGAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAGCTTGCCTCCAAA
TGAAGTTGGCTACCCCGGAGGAATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTCCTACGCTCGAG*C
TAAG*AGAAAGAGCTTGCAAATGGGAG*TTGGC*ATGTTGGCATTCTTAGGGT
CGTGATCACACATGTGACT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2BV52TF 693 0 0
CTTCTTGATTCCAATCCATTCTCTACC**TTTCCTGTATCCAAGCTCTGTAGGGGAAATG
GCCACTGTCACTACTCAAGCCTCGGCCTCGATATTCAGACCATGCACTTCAAAGCCAAGG
TTCCTCACCGGTTCTTCCGGTAGGTTGAACCGAGAATTGTCGTTTAAGTCAATCGGCTCA
AAGACGTCCTCGTTCAAGGTTGAAGCTAAGAAAGGAGAATGGTTGCCCGGTTTGGCATCC
CCTGGTTATCTCAACGGCAGTCTTGCCGGTGATAATGGGTTTGACCCATTGGGACTAGCA
GAGGATCCAGAGAACTTGAAGTGGTTCATCCAGGCAGAGCTTGTCAACGGACGGTGGGCC
ATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTGTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAATCATCAAC
GTTCCTGAGTGGTATGATGCCGGGAAAGAGCAGTATTTTGCATCATCATCAACATTGTTC
GTGATCGAATTCATATTGTTTCATTACGTTGAGATCAGACGGTGGCAGGACATTAAGAAC
CCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAGCTTGCCTCCAAATGAAGTT
GGTTACCCCGGAGGAATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTCCCACGCTCGAG*CTAAG*AG
AA*GAGCTTGCAAATGGGAGGTTGGCGATGTTG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2GH39TF 564 0 0
G
CTCGTTCAAGGTTGAAGCTAAGAAAGGAGAATGGTTGCCCGGTTTGGCATCTCCTGGTTA
TCTCAACGGCAGTCTTGCCGGTGATAATGGGTTTGACCCATTGGGACTAGCAGAGGATCC
AGAGAACTTGAAGTGGTTCATCCAGGCAGAGCTTGTCAACGGACGGTGGGCCATGCTCGG
CGTCGCAGGGATGCTTTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAATCATCAACGTTCCTGA
GTGGTATGACGCCGGGAAAGAGCAGTATTTTGCATCATCATCAACATTGTTCGTGATCGA
ATTCATATTGTTTCATTACGTTGAGATCAGACGGTGGCAAGACATTAAGAACCCAGGGAG
TGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAGCTTGCCTCCAAATGAAGTTGGTTACCC
CGGAGGAATCTTTAACCCCCTTAACTTCGCTCCTACTCTCGAGGCTAAAGAGAAAGAGCT
TGCAAATGGGAGGTTGGCGATGTTGGCATTCTTAGGGTTCGTGATTCAACACAATGTGAC
TGGAAAGGGACCATTTGAGAACC

QA 2 564 2 564
DS 

RD RR2B133TF 801 0 0
TCTCTTCTTGATTCCAATCCATTCTCTACCACCTTCCTGTATCCAAGCTCTGTAGGGGAA
ATGGCCACTGTCACTACTCAAGCCTCGGCCTCGATATTCAGACCATGCACTTCAAAGCCA
AGATTCCTCACCGGTTCTTCCGGTAGGTTGAACCGAGAATTGTCGTTTA*GTCAATCGGC
TCAAAGACGTCCTCGTTCAAGGTTGAAGCTAAGAAAGGAGAATGGTTGCCCGGTTTGGCA
TCTCCTGGTTATCTCAACGGCAGTCTTGCCGGTGATAATGGGTTTGACCCATTGGGACTA
GCAGAGGATCCAGAGAACTTGAAGTGGTTCATCCAGGCAGAGCTTGTCAACGGACGGTGG
GCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTTTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAATCATC
AACGTTCCTGAGTGGTATGACGCCGGGAAAGAGCAGTATTTTGCATCATCATCAACATTG
TTCGTGATCGAATTCATATTGTTTCATTACGTTGAGATCAGACGGTGGCAGGACATTAAG
AACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAGCTTGCCCCCAAATGAA
GTTGGTTACCCCGGAGGTATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTCCTACTCTCGAGGCTAAG
GAGAAAGAGCTTGCAAATGGGGAGTTGGCGATGTTGGCATTCTTAGGGTTCGTGATTCAA
CACAATGTGACTGGAAAGGGACCATTTGAGAACCTGTTGCAGCACTTGTCTGACCCATGG
CACAACACCATCGTCCAAACC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2CX06JQ 716 0 0
CCCGGTTTGGCATCTCCTGGTTATCTCAACGGCAGTCTTGCCGGTGATAATGGGTTTGAC
CCATTGGGACTAGCAGAGGATCCAGAGAACTTGAAGTGGTTCATCCAGGCAGAGCTTGTC
AACGGACGGTGGGCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTTTTGCCTGAAGTTTTCACCAAG
ATCGGAATCATCAACGTTCCTGAGTGGTATGACGCCGGGAAAGAGCAGTATTTTGCATCA
TCATCAACATTGTTCGTGATCGAATTCATATTGTTTCGTTACGTTGAGATCAGACGGTGG
CAGGACATTAAGAACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAGCTTG
CCCCCAAATGAAGTTGGTTACCCCGGAGGTATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTCCTACT
CTCGAGGCTAAGGAGAAAGAGCTTGCAAATGGGAGGTTGGCGATGTTGGCATTCTTAGGG
TTCGTGATTCAACACAATGTGACTGGAAAGGGACCATTTGAGAACCTGTTGCAGCACTTG
TCTGACCCATGGCACAACACCATTGTCCAAACCTTCAGCGGATGATTTAAGGCGGAGCTA
TGAATTTAATGTCTCTCTATCTTATGGTGCCTTAATATATCTGTGTGTGTTCCATCTTTA
GAGTTCTTGGTTTGTGAGCATGAAACAATATGGTATTGCTGTAGCACATTTAAAAA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2EL90TF 560 0 0
GCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTTTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAATCATC
AACGTTCCTGAGTGGTATGACGCCGGGAAAGAGCAGTATTTTGCATCATCATCAACATTG
TTCGTGATCGAATTCATATTGTTTCATTACGTTGAGATCAGACGGTGGCGGGACATTAAG
AACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAGCTTGCCCCCAAATTAA
GTTGGTTACCCCGGAGGTATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTCCTACTCTCGAGGCTAAG
GAGAAAGAGCTTGCAAATGGGAGGTTGGCGATGTTGGCATTCTTAGGGTTCGTGATTCAA
CACAATGTGACTGGAAAGGGACCATTTGAGAACCTGTTGCAGCACTTGTCTGACCCATGG
CACAACACCATTGTCCAAACCTTCAGCGGATGATTTAAGACGGAGCTATGAATTTAATGT
CTCTCTATCTTATGGTGCCTTAATATATCTGTGTGTGTTCCATCTTTAGAGTTCTTGGTT
TGTGAGCATGAAACAATATG

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2CU67JQ 714 0 0
TCTTGCCGGTGATAATGGGTTTGACCCATTGGGACTAGCAGAGGATCCAGAGAACTTGAA
GTGGTTCATCCAGGCAGAGCTTGTCAACGGACGGTGGGCCATGCTTGGCGTCGCAGGGAT
GCTTTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAATCATCAACGTTCCTGAGTGGTATGACGC
CGGGAAAGAGCAGTATTTTGCATCATCATCAACATTGTTCGTGATCGAATTCATATTGTT
TCATTACGTTGAGATCAGACGGTGGCAGGACATTAAGAACCCAGGAAGTGTGAACCAAGA
CCCTATTTTCAAGCAATACAGCTTGCCCCCAAATGAAGTTGGTTACCCCGGAGGTATCTT
TAACCCTCTTAACTTCGCTCCTACTCTCGAGGCTAAGGAGAAAGAGCTTGCAAATGGGAG
GTTGGCGATGTTGGCATTCTTAGGGTTCGTGATTCAACACAATGTGACTGGAAAGGGACC
ATTTGAGAACCTGTTGCAGCACTTGTTTGACCCATGGCACAACACCATTGTCCAAACCTT
CAGCGGATGATTTAAGACGGAGCTATGAATTTAATGTCTCTCTATCTTATGGTGCCTTAA
TATATCTGTGTGTGTTCCATCTTTAGAGTTCTTGGTTTGTGAGCATGAAACAATATGGTA
TTGCTGTAGCACATTTAAAAATCTTCAGTGTACAAAGGAACCAAGTTCATCA
GG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2EL90JQ 607 0 0
GCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTTTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAATCATC
AACGTTCCTGAGTGGTATGACGCCGGGAAAGAGCAGTATTTTGCATCATCATCAACATTG
TTCGTGATCGAATTCATATTGTTTCATTACGTTGAGATCAGACGGTGGCGGGACATTAAG
AACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAGCTTGCCCCCAAATTAA
GTTGGTTACCCCGGAGGTATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTCCTACTCTCGAGGCTAAG
GAGAAAGAGCTTGCAAATGGGAGGTTGGCGATGTTGGCATTCTTAGGGTTCGTGATTCAA
CACAATGTGACTGGAAAGGGACCATTTGAGAACCTGTTGCAGCACTTGTCTGACCCATGG
CACAACACCATTGTCCAAACCTTCAGCGGATGATTTAAGACGGAGCTATGAATTTAATGT
CTCTCTATCTTATGGTGCCTTAATATATCTGTGTGTGTTCCATCTTTAGAGTTCTTGGTT
TGTGAGCATGAAACAATATGGTATTGCTGTAGCACATTTAAAAATCTTCAGTGTACAAAG
GAACCAA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2ET79TF 536 0 0
G
AAGAGCAGTATTTTGCATCATCATCAACATTGTTCGTGATCGAATTCATATTGTTTCATT
ACGTTGAGATCAGACGGTGGCAGGACATTAAGAACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTA
TCTTCAAGTAATACAGCTTGCCCCCAAATGAAGTTGGTTACCCCGGAGGTATCTTTAACC
CTCTTAACTTCGCTCCTACTCTCGAGGCTAAGGAGAAAGAGCTTGCAAATGGGAGGTTGG
CGATGTTGGCATTCTTAGGGTTCGTGATTCAACACAATGTGACTGGAAAGGGACCATTTG
AGAACCTGTTGCAGCACTTGTCTGACCCATGGCACAACACCATTGTCCAAACCTTCAGCG
GATGATTTAAGACGGAGCTATGAATTTAATGTCTCTCTATCTTATGGTGCCTTAATATAT
CTGTGTGTGTTCCATCTTTAGAGTTCTTGGTTTGTGAGCATGAAACAATATGGTATTGCT
GTAGCACATTTAAAAATCTTCAGTGTACAAAGGAACCAAGTTCATCAGGATTATG

QA 2 536 2 536
DS 



AS 1 16

CO CL157Contig1 807 16 38 U
GGACTGACTCACATAAACACCTAAAGAAGCAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGC
AACGAGGCAGTCTTCTATGGTAGGGGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGCCCCCGC
CCACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAAGATCTCCCGAAAGCCACTCCTGA
CAACGTCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAAAAGTTGGAAGTATCCTGTT
CTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTTGA
GCCGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAA
GAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAA
GTGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGC
GGCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGA
TTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCT
ATCTATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCT
AAGACTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATCATACACGATGTCTAGCGTGTT
ACGTCCGTTTGAAGTTG**AAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAATGTGTTTT
CTTCCCAGATCTTAAATTAAGTCCCAC


BQ
30 35 35 35 5 10 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 55 75 75 75 75 75 75 40 75 30 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 55 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
30 75 75 75 75 30 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 35 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 35 80 80 80 80 80 35 80 80 80 80 80 80 80 35 80 80 80 80 80 80 80 65 80 
80 80 80 80 35 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 35 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 65 80 35 80 80 
80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 40 85 55 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 75 75 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 
90 65 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
45 45 45 45 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 40 60 60 75 75 40 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 65 60 
60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 25 40 40 40 40 40 40 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2F639TF U 1
AF RR2G351TF U 1
AF RR2CF11TF U 1
AF RR2CO51TF U 5
AF RR2CY06TF U 1
AF RR2FK33TF U 2
AF RR2CY06JQ C 247
AF RR2BT66TF U 5
AF RR2H417TF U 5
AF RR2EE33TF U 5
AF RR2BV12TF U 6
AF RR2BH42TF U 1
AF RR2A239TF U 5
AF RR2H417JQB C 365
AF RR2BT66JQ C 73
AF RR2EE33JQ C 6
BS 1 5 RR2BH42TF
BS 6 6 RR2CO51TF
BS 7 29 RR2BH42TF
BS 30 30 RR2CY06TF
BS 31 60 RR2BH42TF
BS 61 61 RR2CY06TF
BS 62 65 RR2BH42TF
BS 66 66 RR2CY06TF
BS 67 84 RR2BH42TF
BS 85 85 RR2CY06TF
BS 86 156 RR2BH42TF
BS 157 157 RR2CY06TF
BS 158 162 RR2BH42TF
BS 163 163 RR2CY06TF
BS 164 170 RR2BH42TF
BS 171 171 RR2CY06TF
BS 172 184 RR2BH42TF
BS 185 185 RR2CY06TF
BS 186 220 RR2BH42TF
BS 221 221 RR2CY06TF
BS 222 237 RR2BH42TF
BS 238 238 RR2CY06TF
BS 239 297 RR2BH42TF
BS 298 298 RR2CY06TF
BS 299 322 RR2BH42TF
BS 323 323 RR2CF11TF
BS 324 446 RR2BH42TF
BS 447 447 RR2CF11TF
BS 448 600 RR2BH42TF
BS 601 604 RR2CY06TF
BS 605 698 RR2BH42TF
BS 699 699 RR2CY06TF
BS 700 737 RR2BH42TF
BS 738 739 RR2A239TF
BS 740 772 RR2BH42TF
BS 773 773 RR2A239TF
BS 774 805 RR2BH42TF
BS 806 807 RR2EE33JQ

RD RR2F639TF 618 0 0
GGACTCACTCACATAAACACCTAAAGAAGCAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGC
AACGAGGCAGTCTTCTATGGTAGGGGGGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGCCCCCGC
CCACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAAGATCTCCCGAAAGCCACTCCTGA
CAACGTCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAAAAGTTGGAAGTATCCTGTT
CTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTTGA
GCCGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAA
GAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAA
GTGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGC
G*CTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGA
TTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCT
ATCTATTTATCTATTGTG

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2G351TF 638 0 0
GGACTCACTCACATAAACACCTAAAGAAGCAGAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGC
AACGAGGCAGTCTTCTATGGTAGGGGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGC*CCCGC
CCACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAAGATCTCCCGAAAGCCACTCCTGA
CAACGTCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAAAAGTTGGAAGTATCCTGTT
CTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTTGA
GCCGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAA
GAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAA
GTGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGC
GGCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGA
TTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCT
ATCTATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTAC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2CF11TF 686 0 0
GGACTCACTCACATAAACACCTAAAGAAGAAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGC
TACGATGCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGCCCCCGC
CCACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTAA
CAACATCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCATATT
CTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGA
GCCGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAA
GAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAA
GTGTCAGATGAAGTATGAGAAGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGC
GGCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGA
TTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCT
****ATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCT
AAGACTGAAGAGATCTAAATATGTAA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2CO51TF 710 0 0
GGACTCACATAAACACCTAAAGAAGAAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGCTACG
ATGCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGCACCCGCCCAC
AAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTGACAAC
ATCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTATTCTTC
AACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGAGCCG
GAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGACCTAATGCAAGAGTTCAAGAGC
TTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGT
CAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCT
TTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCT
TTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCT****
ATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGA
CTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTA*TAATTATACACGATGTCTAG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2CY06TF 718 0 0
GGACTCACTCACATAAACACCTAAAGAAGCAAAACATCAGTCTGAAAAAACGGCACAGGC
AACGAGGCAGTCTTCTATGGTAGGGGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGCCCCCGC
CCACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAAGATCTCCCGAAAGCCACTCCTGA
CAACGTCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAAAAGTTGGAAGTAACCTGTT
CTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTTGG
GCCGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAA
GAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAA
GCGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGC
GGCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGA
TTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCT
ATCTATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCT
AAGACTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTA*TAATCATACACGATGTCTAGCGTG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2FK33TF 718 0 0
GACTCACTCACATAAACACCTAAAGAAGAAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGCT
ACGATGCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGCCCCCGCC
CACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTGAC
AACATCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTATTC
TTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGAG
CCGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAG
AGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAG
TGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCG
*CTTTTGTCAAATCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGAT
TCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCT*
***ATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTA
AGACTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2CY06JQ 514 0 0
CTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTTGGGCCGGA
GAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATTTAATGCAAGAGTTCAAGAGCTT
CTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGCGTCA
GATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCTTT
TGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCTTT
GGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATCTAT
TTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGACT
GAAGAGTTCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATCATACACGATGTCTAGCGTGTTACGTCC
GTTTGAAGTTG**AAAGTTGTAAACCGAATAAGT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2BT66TF 741 0 0
GGACTCACATAAACACCTAAAGAAGCAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGCAACG
AGGCAGTCTTCTATGGTAGGGGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGCCCCCGCCCAC
AAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAAGATCTCCCGAAAGCCACTCCTGACAAC
GTCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAAAAGTTGGAAGTATCCTGTTCTTC
AACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTTGAGCCG
GAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGC
TTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGT
CAGATGAAGTATG*GAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCT
TTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCT
TTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATCT
ATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGA
CTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTA**TATCATACACGATGTCTAGCGTGTTACGT
CCGTTTGAAGTTG**AAAGTT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2H417TF 770 0 0
GGACTCACATAAACACCTAAAGAAGCAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGCAACG
AGGCAGTCTTCTATGGTAGGGGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGCCCCCGCCCAC
AAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAAGATCTCCCGAAAGCCACTCCTGACAAC
GTCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAAAAGTTGGAAGTATCCTGTTCTTC
AACTATGTCGTTGATGGTCAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTTGAGCCG
GAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGC
TTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGT
CAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCT
TTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCT
TTGGATATCTGTTTATCCACCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATCT
ATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGA
CTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATCATACACGATGTCTAGCGTGTTACGT
CCGTTTGAAGTTG**AAAGTTGTAAACCGAATA
GTGTGTGATGCATGTGT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2EE33TF 772 0 0
GGACTCACATAAACACCTAAAGACGCAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGCAACG
AGGCAGTCTTCTATGGTAGGGGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGCCCCCGCCCAC
AAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAAGATCTCCCGAAAGCCACTCCTGACAAC
GTCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAAAAGTTGGAAGTATCCTGTTCTTC
AACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTTGAGCCG
GAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGC
TTCTTGATCACTGCCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGT
CAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCT
TTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCT
TTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATCT
ATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGA
CTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATCATACACGATGTCTAGCGTGTTACGC
CCGTTTGAAGTTG**AAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCA
TGTGT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2BV12TF 774 0 0
GACTCACATAAACACCTAAAGAAGCAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGCAACGA
GGCAGTCTTCTATGGTAGGGGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGCCCCCGCCCACA
AGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAAGATCTCCCGAAAGCCACTCCTGACAACG
TCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAAAAGTTGGAAGTATCCTGTTCTTCA
ACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTTGAGCCGG
AGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGCT
TCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGTC
AGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCTT
TTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCTT
TGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATCTA
TTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGAC
TGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATCATACACGATGTCTAGCGTGTTACGTC
CGTTTGAAGTTG**AAAGTTGTAA*CCGAATAAGTTGTGTGATGCAATGTGTTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2BH42TF 806 0 0
GGACTCACTCACATAAACACCTAAAGAAGAAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGC
TACGATGCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGCCCCCGC
CCACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTGA
CAACATCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTATT
CTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGA
GCCGGAGAAGAATCTGATGGTGTCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAA
GAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAA
GTGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGGCGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGC
GGCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGA
TTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCT
****ATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCT
AAGACTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGTT
ACGTCCGTTTGAAGTTGTGAAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAACGTGTTTT
CTTCCCAGATCTTAAATTAAGTCCC
A

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2A239TF 801 0 0
GGACTCACATAAACACCTAAAGAAGCAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGCAACG
AGGCAGTCTTCTATGGTAGGGGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGCCCCCGCCCAC
AAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAAGATCTCCCGAAAGCCACTCCTGACAAC
GTCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAAAAGTTGGAAGTATCCTGTTCTTC
AACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTTGAGCCG
GAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGC
TTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGT
CAGATGAAGTATGAGGGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCT
TTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCT
TTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATCT
ATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGA
CTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATCATACACGATGTCTAGCGTGTTACGT
CCGTTTGAAGTTG**AAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAATGTGTTTTCTTC
CCAGATCTTAAATTAAGTCCC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2H417JQB 428 0 0
TTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGT
CAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATTTACTTGCGGCT
TTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCT
TTGGATATCTGTTTATCCACCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATCT
ATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGA
CTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATCATACACGATGTCTAGCGTGTTACGT
CCGTTTGAAGTTG**AAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAATGTGTTTTCTTC
CCAGATCT

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR2BT66JQ 711 0 0
TTCTATGGTAGGGGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGCCCCCGCCCACAAGTACTA
CCACATGCTCACCGGAAGACCACAAGATCTCCCGAAAGCCACTCCTGACAACGTCAAGAG
ATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAAAAGTTGGAAGTATCCTGTTCTTCAACTATGT
CGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTTGAGCCGGAGAAGAA
TCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGCTTCTTGAT
CACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGTCAGATGAA
GTATG*GAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCTTTTGTCAA
AGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCTTTGGATAT
CTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATCTATTTATCT
ATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGACTGAAGAG
ATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATCATACACGATGTCTAGCGTGTTACGTCCGTTTGA
AGTTG**AAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAATGTGTTTTC
CT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2EE33JQ 802 0 0
GACTCACATAAACAC*TAAAGACGCAAAACATCAGTCTGAAAAA*TGGCACAGGCAACGA
GGCAGTCTTCTATGGTAGGGGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAGCCCCCGCCCACA
AGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAAGATCTCCCGAAAGCCACTCCTGACAACG
TCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAAAAGTTGGAAGTATCCTGTTCTTCA
ACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTTGAGCCGG
AGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGCT
TCTTGATCACTGCCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGTC
AGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCTT
TTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCTT
TGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATCTA
TTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGAC
TGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATCATACACGATGTCTAGCGTGTTACGCC
CGTTTGAAGTTG**AAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAATGTGTTTTCTTCC
CAGATCTTAAATTAAGTCCCAC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 3 13

CO CL158Contig1 1124 3 11 U
GTAAATTATGATCAAACTTGATGACAAAAAGATCTAACTGTTAAACAACGTAATAGAAGA
TAACAACTTAAAAGAGAGAAAAGTATCCTTAAATTCAAAATCCTCGAACGCAAGTGAAAT
GTGAAAGAAACCAAGTGTTTAGGTCTGAAAGAAAGAAAAACTGAAACAATAAGCTTAAGA
AGTAAACAGCTAAACATTACGAGGCAACGAAAGCTGTGGTGATTTACTCTTCGTCGTCCT
CATCATCATCATCACCACCTGCTGCTCCGTTCAATGCCTTGACTCTCTCGATCAACTTGT
TCTTCCTTTCCTCATAGGTCAACTTCTTCAAATTGTACCTCTTGTGTGCCTTGGGGGCAG
GTTTCACGGTCTTCTTGGGGTTGGGGTCAGCACGGATAGCTGCATGAACCTTCTTGTACA
GCTCCTCCATCTTCTCAGCGTCAACTCCTTTCTTCAAGTACTGACTGAAGTGAGTTTGAA
ACTTCTCTGGCTCATCTTCGTTCAACATCTTCATGTAGTTCGAGACATGGCCACCAAAGA
TGTAGTTCCTGTGGGTCTCAGCATCAAGTTGTTTGTTCTCTTTGTTGAAACCTGCAAACC
TCTTGTCACTGTGGGGGATATCAAGTCCTCCATCCAAAGCACCCTTGAGGGCACCGAAGA
CACGGTTCCCTGTGGTGGTCCTGATGAGTCCAACATCAAGAAGAGCACGGAAAGGCCTCC
TTGACTCTGTTGGTTCCACGGAGAACACGGCGAGCCAAAAGAAGACCGGTACAGTAAGCT
GCAGCGTAGTTGGTAAGACCAACAGTGAGTCCATACTGAGGCAACTCATGAGCGTAAGCA
GAGGCCTTGACAATGTCACCGGCTATGCTTGCGGACACGATTTGAGCAACGATGTCTTTG
TTGGTGAACCGGACAACGAAACGGTACTTGGGTGTGTTGTACTTATTTTTGTCTTGGTTA
ATGAGACGGATTCTTGCTCTGTAATCGGTCTTACCAGCTCTTCTTCTCCTGAACTTGACT
TGGTACCTCTTGAAGTATGCATTCGACTTTGATGGCTTCACAAACACCATTGTTTAAGCG
AAGCGAGTAAGCTTTGGTGTGAGAGATGAGTGAGGAGAAGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW32JQ U 1
AF RR2C919JQ U 140
AF RR2C919TF C 452
BS 1 152 RR2BW32JQ
BS 153 153 RR2C919JQ
BS 154 164 RR2BW32JQ
BS 165 165 RR2C919JQ
BS 166 251 RR2BW32JQ
BS 252 254 RR2C919JQ
BS 255 590 RR2BW32JQ
BS 591 591 RR2C919JQ
BS 592 714 RR2BW32JQ
BS 715 845 RR2C919JQ
BS 846 1124 RR2C919TF

RD RR2BW32JQ 714 0 0
GTAAATTATGATCAAACTTGATGACAAAAAGATCTAACTGTTAAACAACGTAATAGAAGA
TAACAACTTAAAAGAGAGAAAAGTATCCTTAAATTCAAAATCCTCGAACGCAAGTGAAAT
GTGAAAGAAACCAAGTGTTTAGGTCTGAAAGATAGAAAAACTGAGACAATAAGCTTAAGA
AGTAAACAGCTAAACATTACGAGGCAACGAAAGCTGTGGTGATTTACTCTTCGTCGTCCT
CATCATCATCA***CCACCTGCTGCTCCGTTCAATGCCTTGACTCTCTCGATCAACTTGT
TCTTCCTTTCCTCATAGGTCAACTTCTTCAAATTGTACCTCTTGTGTGCCTTGGGGGCAG
GTTTCACGGTCTTCTTGGGGTTGGGGTCAGCACGGATAGCTGCATGAACCTTCTTGTACA
GCTCCTCCATCTTCTCAGCGTCAACTCCTTTCTTCAAGTACTGACTGAAGTGAGTTTGAA
ACTTCTCTGGCTCATCTTCGTTCAACATCTTCATGTAGTTCGAGACATGGCCACCAAAGA
TGTAGTTCCTGTGGGTCTCAGCATCAAGTTGTTTGTTCTCTTTGTTGAAAACTGCAAACC
TCTTGTCACTGTGGGGGATATCAAGTCCTCCATCCAAAGCACCCTTGAGGGCACCGAAGA
CACGGTTCCCTGTGGTGGTCCTGATGAGTCCAACATCAAGAAGAGCACGGAAAG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2C919JQ 707 0 0
TAGGTCTGAAAGAAAGAAAAACTGAAACAATAAGCTTAAGAAGTAAACAGCTAAACATTA
CGAGGCAACGAAAGCTGTGGTGATTTACTCTTCGTCGTCCTCATCATCATCATCACCACC
TGCTGCTCCGTTCAATGCCTTGACTCTCTCGATCAACTTGTTCTTCCTTTCCTCATAGGT
CAACTTCTTCAAATTGTACCTCTTGTGTGCCTTGGGGGCAGGTTTCACGGTCTTCTTGGG
GTTGGGGTCAGCACGGATAGCTGCATGAACCTTCTTGTACAGCTCCTCCATCTTCTCAGC
GTCAACTCCTTTCTTCAAGTACTGACTGAAGTGAGTTTGAAACTTCTCTGGCTCATCTTC
GTTCAACATCTTCATGTAGTTCGAGACATGGCCACCAAAGATGTAGTTCCTGTGGGTCTC
AGCATCAAGTTGTTTGTTCTCTTTGTTGAAACCTGCAAACCTCTTGTCACTGTGGGGGAT
ATCAAGTCCTCCATCCAAAGCACCCTTGAGGGCACCGAAGACACGGTTCCCTGTGGTGGT
CCTGATGAGTCCAACATCAAGAAGAGCACGGAAAGGCCTCCTTGACTCTGTTGGTTCCAC
GGAGAACACGGCGAGCCAAAAGAAGACCGGTACAGTAAGCTGCAGCGTAGTTGGTAAGAC
CAACAGTGAGTCCATACTGAGGCAACTCATGAGCGTAAGCAGAGGC
T

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2C919TF 673 0 0
CTTCAAGTACTGACTGAAGTGAGTTTGAAACTTCTCTGGCTCATCTTCGTTCAACATCTT
CATGTAGTTCGAGACATGGCCACCAAAGATGTAGTTCCTGTGGGTCTCAGCATCAAGTTG
TTTGTTCTCTTTGTTGAAACCTGCAAACCTCTTGTCACTGTGGGGGATATCAAGTCCTCC
ATCCAAAGCACCCTTGAGGGCACCGAAGACACGGTTCCCTGTGGTGGTCCTGATGAGTCC
AACATCAAGAAGAGCACGGAAAGGCCTCCTTGACTCTGTTGGTTCCACGGAGAACACGGC
GAGCCAAAAGAAGACCGGTACAGTAAGCTGCAGCGTAGTTGGTAAGACCAACAGTGAGTC
CATACTGAGGCAACTCATGAGCGTAAGCAGAGGCCTTGACAATGTCACCGGCTATGCTTG
CGGACACGATTTGAGCAACGATGTCTTTGTTGGTGAACCGGACAACGAAACGGTACTTGG
GTGTGTTGTACTTATTTTTGTCTTGGTTAATGAGACGGATTCTTGCTCTGTAATCGGTCT
TACCAGCTCTTCTTCTCCTGAACTTGACTTGGTACCTCTTGAAGTATGCATTCGACTTTG
ATGGCTTCACAAACACCATTGTTTAAGCGAAGCGAGTAAGCTTTGGTGTGAGAGATGAGT
GAGGAGAAGACCC

QA 1 673 1 673
DS 



CO CL158Contig2 732 5 10 U
GGTAAATTAAGATCAAATTTGATGACAAAAAGATCTAACTGTTAAACAACGTAATAGAAG
ATAACAGCTTAAAGGAGAGAAAAGTATCCTTAAATTCAAAATCCTCGAACGCAAATGAAA
TGTGAAAGAAACCAAGTGTTTAGGTCTGAAAGATAGAAAAACTGAGACGATAATAAGCTT
AAGAAGTAAACAGCTAAACATCATTACGAGGCAACGAAAGCTGTGGTGATCTACTCTTCG
TCGTCCTCATCATCATCATCACCACCTGCTGCTCCGTTCAATGCCTTGACTCTCTCGATC
AACTTATTCTTCCTTTCCTCATAGGTCAACTTCTTCAAATTGTACCTCTTGTGTGCCTTG
GGGGCAGGTTTCACGGTCTTCTTAGGGTTGGGGTCAGCACGGATAGCTGCATGAACCTTC
TTGTACAGCTCCTCCATCTTCTCAGCGTCAACTCCTTTCTTCAAGTACTGACCGAAGTGA
GTCTGAAACTTCTCTGGCTCATCTTCGTTCAACATCTTCATGTAGTTTGAGACATGGCCA
CCAAAGATGTAGTTCCTGTGGGTCTCAGCATCGAGCTGTTTGTTTTCTTTGTTGAAACCT
GCAAACCTCTTGTCACTGTGGGGGATATCAAGTCCTCCATCCAAGGCACCCTTGAGGGCA
CCGAAGACACGGTTCCCTGTGGTGGTCCTGATGAGTCCAACATCAAGAAGAGCACGGAAA
GGCCTCCTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ35JQ U 1
AF RR2DF04JQ U 57
AF RR2BD26JQ U 57
AF RR2EK69JQ U 75
AF RR2HA67JQ U 21
BS 1 364 RR2DZ35JQ
BS 365 366 RR2HA67JQ
BS 367 407 RR2DZ35JQ
BS 408 408 RR2HA67JQ
BS 409 414 RR2DZ35JQ
BS 415 472 RR2HA67JQ
BS 473 473 RR2BD26JQ
BS 474 562 RR2HA67JQ
BS 563 563 RR2BD26JQ
BS 564 732 RR2HA67JQ

RD RR2DZ35JQ 414 0 0
GGTAAATTAAGATCAAATTTGATGACAAAAAGATCTAACTGTTAAACAACGTAATAGAAG
ATAACAGCTTAAAGGAGAGAAAAGTATCCTTAAATTCAAAATCCTCGAACGCAAATGAAA
TGTGAAAGAAACCAAGTGTTTAGGTCTGAAAGATAGAAAAACTGAGACGATAATAAGCTT
AAGAAGTAAACAGCTAAACATCATTACGAGGCAACGAAAGCTGTGGTGATCTACTCTTCG
TCGTCCTCATCATCATCATCACCACCTGCTGCTCCGTTCAATGCCTTGACTCTCTCGATC
AACTTATTCTTCCTTTCCTCATAGGTCAACTTCTTCAAATTGTACCTCTTGTGTGCCTTG
GGGG**GGTTTCACGGTCTTCTTAGGGTTGGGGTCAGCACGGATAGCAGCATGA

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR2DF04JQ 588 0 0
GC
AGATAACAGCTTAAAGGAGAGAAAAGTATCCTTAAATTCAAAATCCTCGAACGCAAATGA
AATGTGAAAGAAACCAAGTGTTTAGGTCTGAAAGATAGAAAAACTGAGACGATAATAAGC
TTAAGAAGTAAACAGCTAAACATCATTACGAGGCAACGAAAGCTGTGGTGATCTACTCTT
CGTCGTCCTCATCATCATCATCACCACCTGCTGCTCCGTTCAATGCCTTGACTCTCTCGA
TCAACTTATTCTTCCTTTCCTCATAGGTCAACTTCTTCAAATTGTACCTCTTGTGTGCCT
TGGGGGCAGGTTTCACGGTCTTCTTAGGGTTGGGGTCAGCACGGATAGCTGCATGAACCT
TCTTGTACAGCTCCTCCATCTTCTCAGCGTCAACTCCTTTCTTCAAGTACTGACCGAAGT
GAGTCTGAAACTTCTCTGGCTCATCTTCGTTCAACATCTTCATGTAGTTTGAGACATGGC
CACCAAAGATGTAGTTCCTGTGGGTCTCAGCATCGAGCTGTTTGTTTTCTTTGTTGAAAC
CTGCAAACCTCTTGTCACTGTGGGGGATATCAAGTCCTCCATCCAA

QA 3 588 3 588
DS 

RD RR2BD26JQ 629 0 0
GC
AGATAACAGCTTAAAGGAGAGAAAAGTATCCTTAAATTCAAAATCCTCGAACGCAAATGA
AATGTGAAAGAAACCAAGTGTTTAGGTCTGAAAGATAGAAAAACTGAGACGATAATAAGC
TTAAGAAGTAAACAGCTAAACATCATTACGAGGCAACGAAAGCTGTGGTGATCTACTCTT
CGTCGTCCTCATCATCATCATCACCACCTGCTGCTCCGTTCAATGCCTTGACTCTCTCGA
TCAACTTATTCTTCCTTTCCTCATAGGTCAACTTCTTCAAATTGTACCTCTTGTGTGCCT
TGGGGGCAGGTTTCACGGTCTTCTTAGGGTTGGGGTCAGCACGGATAGCTGCATGAACCT
TCTTGTACAGCTCCTCCATCTTCTCAGCGTCAACTCCTTTCTTCAAGTACTGACCGAAGT
GAGTCTGAAACTTCTCTGGCTCATCTTCGTTCAACATCTTCATGTAGTTTGAGACATGGC
CACCAAAGATGTAGTTCCTGTGGGTCTCAGCATCGAGCTGTTTGTTTTCTTTGTTGAAAC
CTGCAAACCTCTTGTCACTGTGGGGGATATCAAGTCCTCCATCCAAGGCACCCTTGAGGG
CACCGAAGACACGGTTCCCTGTGGTGG

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR2EK69JQ 590 0 0
GG
GAGAAAAGTATCCTTAAATTCAAAATCCTCGAACGCAAATGAAATGTGAAAGAAACCAAG
TGTTTAGGTCTGAAAGACAGAGAAACTGAGACAATAATAAGCTTAAAAAGTAAACAGCTA
AACATCATTACGAGGCAACGAAAGCTGTGGTGATTTACTCTTCGTCGTCCTCATCATCAT
CGTCACCACCTGCTGCTCCGTTCAATGCCTTGACTCTCTCGATCAACTTATTCTTCCTTT
CCTCATAGGTCAACTTCTTCAAATTGTACCTCTTGTGTGCCTTGGGGGCAGGTTTCACCG
TCTTCTTGGGGTTGGGGTCAGCACGGATAGCTGCATGAACCTTCTTGTACAACTCCTCCA
TCTTCTCAGCGTCAACTCCTTTCTTCAAGTACTGACTGAAGTGAGTTTGAAACTTCTCTG
GCTCATCTTCGTTCAACATCTTCATGTAGTTTGAGACATGTCCACCAAAGATGTAGTTCC
TGTGGGTCTCAGCATCGAGTTGCTTGTTTTCTTTGTTGAAACCTGCAAACCTCTTGTCAC
TGTGGGGTATATCAAGTCCTCCATCCAAGGCACCCTTGAGGGCACCGA

QA 3 590 3 590
DS 

RD RR2HA67JQ 712 0 0
GG
TGACAAAAAGATCTAACTGTTAAACAACGTAATAGAAGATAACAGCTTAAAGGAGAGAAA
AGTATCCTTAAATTCAAAATCCTCGAACGCAAATGAAATGTGAAAGAAACCAAGTGTTTA
GGTCTGAAAGATAGAAAAACTGAGACGATAATAAGCTTAAGAAGTAAACAGCTAAACATC
ATTACGAGGCAACGAAAGCTGTGGTGATCTACTCTTCGTCGTCCTCATCATCATCATCAC
CACCTGCTGCTCCGTTCAATGCCTTGACTCTCTCGATCAACTTATTCTTCCTTTCCTCAT
AGGTCAACTTCTTCAAATTGTACCTCTTGTGTGCCTTGGGGGCAGGTTTCACGGTCTTCT
TAGGGTTGGGGTCAGCACGGATAGCTGCATGAACCTTCTTGTACAGCTCCTCCATCTTCT
CAGCGTCAACTCCTTTCTTCAAGTACTGACTGAAGTGAGTCTGAAACTTCTCTGGCTCAT
CTTCGTTCAACATCTTCATGTAGTTTGAGACATGGCCACCAAAGATGTAGTTCCTGTGGG
CCTCAGCATCGAGCTGTTTGTTTTCTTTGTTGAAACCTGCAAACCTCTTGTCACTGTGGG
GGATATCAAGTCCTCCATCCAAGGCACCCTTGAGGGCACCGAAGACACGGTTCCCTGTGG
TGGTCCTGATGAGTCCAACATCAAGAAGAGCACGGAAAGGCCTCCTTGAC

QA 3 712 3 712
DS 



CO CL158Contig3 825 5 9 U
GGTCTTCTCCACTCATCTCTCACACCAAAGCTTCTTCGCTTCGCTTGAACAATGGTGTTT
GTGAAGCCATCAAAGTCGAATGCATACTTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGA
AGAGCTGGTAAGACCGATTACAGAGCAAGAATCCGTCTCATTAACCAAGACAAAAACAAG
TACAACACACCCAAGTACCGTTTCGTTGTCAGGTTCACCAACAAAGACATTGTTGCTCAA
ATCGTGTCCGCAAGCATAGCCGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTACGCACACGAGTTG
CCTCAGTATGGACTCACTGTTGGTCTTACCAACTACGCTGCAGCTTACTGTACCGGCCTT
CTTTTGGCTCGCCGTGTTCTCAAGATGTTGGAAATGGATGCCGAGTATGAGGGCAACGTT
GAGGCCACTGGAGAAGACTTTTCCGTGGAACCAACCGAGTCAAGGAGGCCTTTCCGTGCT
CTTCTTGATGTTGGACTCATCAGGACCACCACAGGGAACCGTGTCTTCGGTGCCCTCAAG
GGTGCCTTGGATGGAGGACTTGATATCCCCC*ACAGTGACAAGAGGTTTGCAGGTTTCAA
CAAAGAAAACAAACAGCTCGATGCTGAGACCCACAGGAACTACATCTTTGGTGGCCATGT
CTCAAACTACATGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCACTTCAG
TCAGTACTTGAAGAAAGGAGTTGACGCTGAGAGATGGAGAGCTGTACAAGAAGTTCATGC
AGCTACCCGTGCTGACCCACCCTAAGAAGACGTGAAACTGCCCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA67TF U 8
AF RR2DF04TF U 7
AF RR2FM22TF U 1
AF RR2DZ35TF U 9
AF RR2G661TF U 21
BS 1 571 RR2FM22TF
BS 572 572 RR2DZ35TF
BS 573 636 RR2FM22TF
BS 637 637 RR2DZ35TF
BS 638 665 RR2FM22TF
BS 666 666 RR2DZ35TF
BS 667 692 RR2FM22TF
BS 693 752 RR2DZ35TF
BS 753 825 RR2G661TF

RD RR2HA67TF 359 0 0
GGG
ACTCATCTCTCACACCAAAGCTTCTTCGCTTCGCTTGAACAATGGTGTTTGTGAAGCCAT
CAAAGTCGAATGCATACTTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGAAGAGCTGGTA
AGACCGATTACAGAGCAAGAATCCGTCTCATTAACCAAGACAAAAACAAGTACAACACAC
CCAAGTACCGTTTCGTTGTCAGGTTCACCAACAAAGACATTGTTGCTCAAATCGTGTCCG
CAAGCATAGCCGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTACGCACACGAGTTGCCTCAGTATG
GACTCACTGTTGGTCTTACCAACTACGCTGCAGCTTACTGTACCGGCCTTCTTTTG

QA 4 359 4 359
DS 

RD RR2DF04TF 494 0 0
GGC
CACTCGTCTCCCACACCAAAGCTTCTTCGCTTCGCTTGAACAATGGTGTTTGTGAAGCCA
TCAAAGTCGAATGCATACTTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGAAGAGCTGGT
AAGACCGATTACAGAGCAAGAATCCGTCTCATTAACCAAGACAAAAACAAGTACAACACA
CCCAAGTACCGTTTCGTTGTCAGGTTCACCAACAAAGACATTGCTGCTCAAATCGTGTCC
GCAAGCATAGCCGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTACGCACACGAGTTGCCTCAGTAT
GGACTCACTGTTGGTCTTACCAACTACGCTGCAGCTTACTGTACCGGCCTTCTTTTGGCT
CGCCGTGTTCTCAAGATGTTGGAAATGGATGCCGAGTATGAGGGCAACGTTGAGGCCACT
GGAGAAGACTTTTCCGTGGAACCAACCGAGTCAAGGAGGCCTTTCCGTGCTCTTCTTGAT
GTTGGACTCAT

QA 4 494 4 494
DS 

RD RR2FM22TF 692 0 0
GGTCTTCTCCACTCATCTCTCACACCAAAGCTTCTTCGCTTCGCTTGAACAATGGTGTTT
GTGAAGCCATCAAAGTCGAATGCATACTTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGA
AGAGCTGGTAAGACCGATTACAGAGCAAGAATCCGTCTCATTAACCAAGACAAAAACAAG
TACAACACACCCAAGTACCGTTTCGTTGTCAGGTTCACCAACAAAGACATTGTTGCTCAA
ATCGTGTCCGCAAGCATAGCCGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTACGCACACGAGTTG
CCTCAGTATGGACTCACTGTTGGTCTTACCAACTACGCTGCAGCTTACTGTACCGGCCTT
CTTTTGGCTCGCCGTGTTCTCAAGATGTTGGAAATGGATGCCGAGTATGAGGGCAACGTT
GAGGCCACTGGAGAAGACTTTTCCGTGGAACCAACCGAGTCAAGGAGGCCTTTCCGTGCT
CTTCTTGATGTTGGACTCATCAGGACCACCACAGGGAACCGTGTCTTCGGTGCCCTCAAG
GGTGCCTTGGATGGAGGACTTGATATCCCCCCACAGTGACAAGAGGTTTGCAGGTTTCAA
CAAAGAAAACAAACAGCTCGATGCTGAGACCCACAG*AACTACATCTTTGGTGGCCATGT
CTCAA*CTACATGAAGATGTTGAACGAAGATG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2DZ35TF 744 0 0
GG
ACTCATCTCTCACACCAAAGCTTCTTCGCTTCGCTTGAACAATGGTGTTTGTGAAGCCAT
CAAAGTCGAATGCATACTTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGAAGAGCTGGTA
AGACCGATTACAGAGCAAGAATCCGTCTCATTAACCAAGACAAAAACAAGTACAACACAC
CCAAGTACCGTTTCGTTGTCAGGTTCACCAACAAAGACATTGTTGCTCAAATCGTGTCCG
CAAGCATAGCCGGTGACATTGTCAGGGCCTCTGCTTACGCACACGAGTTGCCTCAGTATG
GACTCACTGTTGGTCTTACCGACTACGCTGCAGCTTACTGTACCGGCCTTCTTTTGGCTC
GCCGTGTTCTCAAGATGTTGGAAATGGATGCCGAGTATGAGGGCAACGTTGAGGCCACTG
GAGAAGACTTTTCCGTGGAACCAACCGAGTCAAGGAGGCCTTTCCGTGCTCTTCTTGATG
TTGGACTCATCAGGACCACCACAGGGAACCGTGTCTTCGGTGCCCTCAAGGGTGCCTTGG
ATGGAGGACTTGATATCCCCC*ACAGTGACAAGAGGTTTGCTGGTTTCAACAAAGAAAAC
AAACAGCTCGATGCTGAGACCCACAGGAACTACATCTTTGGTGGCCATGTCTCAAACTAC
ATGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCACTTCAGTCAGTACTTG
AAGAAAGGAGTTGACGCTGAGA

QA 3 744 3 744
DS 

RD RR2G661TF 805 0 0
G
ACACCAAAGCTTCTTCGCTTCGCTTGAACAATGGTGTTTGTGAAGCCATCAAAGTCGAAT
GCATACTTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGAAGAGCTGGTAAGACCGATTAC
AGAGCAAGAATCCGTCCCATTAACCAAGACAAAAACAAGTACAACACACCCAAGTACCGT
TTCGTTGTCAGGTTCACCAACAAAGACATTGTTGCTCAAATCGTGTCCGCAAGCATAGCC
GGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTACGCACACGAGTTGCCTCAGTATGGACTCACTGTT
GGTCTTACCAACTACGCTGCAGCTTACTGTACCGGCCTTCTTTTGGCTCGCCGTGTTCTC
AAGATGTTGGAAATGGATGCCGAGTATGAGGGCAACGTTGAGGCCACTGGAGAAGACTTT
TCCGTGGAACCAACCGAGTCAAGGAGGCCTTTCCGTGCTCTTCTTGATGTTGGACTCATC
AGGACCACCGCAGGGAACCGTGTCTTCGGTGCCCTCAAGGGTGCCTTGGATGGAGGACTT
GATATCCCCC*ACAGTGACAAGAGGTTTGCAGGTTTCAACAAAGAAAACAAACAGCTCGA
TGCTGAGACCCACAGGAACTACATCTTTGGTGGCCATGTCTCAAACTACATGAAGATGTT
GAACGAAGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCACTTCAGTCAGTACTTGAAGAA**GAGT
TGACGCTGAGAGATGGAGAGCTGTACAAGAAGTTCATGCAGCTACCCGTGCTGACCCACC
CTAAGAAGACGTGAAACTGCCCCA

QA 2 805 2 805
DS 



AS 3 14

CO CL159Contig1 833 5 5 U
GGGGATCAGACGACGTTTTAATTCCTCCTCGTCTTCGCATTCTCCAATCAGTGTTTGTTT
GTTTGTTTTGGGGTGAAATTGAGAGAGAAAAAAA*TGAGCGGAGCGGGGAAGAAAGTGGG
GGAAGTGGCGTTCAAAGCGTCGAGGACGATAGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTCCTTGT
CACCGATGAGGCTCGAAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGATGAGGTCAACAC
CCAGCTCCAGACCAAGTTCAGTCAGGAGCCGGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAAA
GGGTATTGGCTCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCATTGAGATTCC
TAAGTACGTGGACAATGTTACCCCTGAGTACAAGCCCAAGTTTGATGCTTTGTTGGTGGA
ACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTCAAGGAGTCTGAACGGCTAGAGAAAGAAATTGT
TGATGTTCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACCATGACCGCAGATGAGTACTTCGAGAA
GCACCCAGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTG
ATTCACCATGTTGTATCTCTCTGGCCTGGAAAAGAAACTCGTTCTCTTTTTCGTTTGATG
TGATTTTGTGAGAGTCGATCCATAACATAATAAGGACCACTCCATTTACTTTGAGATATT
CATTGGAGATCCAATGAGACAATGACGATAAACCCATTTGGTTTTCAGTTGTCAATGTCA
TAATATTGTTTGTTTCGTTCTAAAGAGAATAATAAGAGTGAAAAAGATCTCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA54TF U 22
AF RR2DD64TF U 1
AF RR2B761TF U 1
AF RR2AA54JQ C 32
AF RR2DR38TF U 316
BS 1 619 RR2B761TF
BS 620 620 RR2AA54TF
BS 621 755 RR2B761TF
BS 756 824 RR2DR38TF
BS 825 833 RR2AA54JQ

RD RR2AA54TF 670 0 0
GG
CCTCCTCGTCTTCGCATTCTCCAATCAGTGTTTGTTTGTTTGTTTTGGGGTGAAATTGAG
AGAGAAAAAAA*TGAGCGGAGCGGGGAAGAAAGTGGGGGAAGTGGCGTTCAAAGCGTCGA
GGACGATAGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTCCTTGTCACCGATGAGGCTCGAAGAGAGT
TCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGATGAGGTCAACACCCAGCTCCAGACCAAGTTCAGTC
AGGAGCCGGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAAAGGGTATTGGCTCTGGCATTGTTG
ACATGTACAAGGAGGCTTATGACAGTATTGAGATTCCTAAGTACGTGGACAATGTTACCC
CTGAGTACAAGCCCAAGTTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCGGAACAGAAGT
CGCTCAAGGAGTCTGAACGGCTAGAGAAAGAAATTGTTGATGTTCAAGAGATAAGCAAAA
AGCTCAGCACCATGACCGCAGATGAGTACTTCGAGAAGCACCCAGAACTCAAAAAGAAGT
TTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATTCACCATGTTGTATCTCTCTG
GCCTGGAAAAGAAACTCGTTCTCTTTTTCGTTTGATGTGATTTTGTGAGAGTCGATCCAT
AACATAAT

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR2DD64TF 689 0 0
GGGGATCAGACGACGTTTTAATTCCTCCTCGTCTTCGCATTCTCCAATCAGTGTTTGTTT
GTTTGTTTTGGGGTGAAATTGAGAGAGAAAAAAAATGAGCGGAGCGGGGAAGAAAGTGGG
GGAAGTGGCGTTCAAAGCGTCGAGGACGATAGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTCCTTGT
CACCGATGAGGCTCGAAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGATGAGGTCAACAC
CCTGCTCCAGACCAAGTTCAGTCAGGAGCCGGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAAA
GGGTATTGGCTCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCATTGAGATTCC
TAAGTACGTGGACAATGTTACCCCTGAGTACAAGCCCAAGTTTGATGCTTTGTTGGTGGA
ACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTCAAGGAGTCTGAACGGCTAGAGAAAGAAATTGT
TGATGTTCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACCATGACCGCAGATGAGTACTTCGAGAA
GCACCCAGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTG
ATTCACCATGTTGTATCTCTCTGGCCTGGAAAAGAAACTCGTTCTCTTTTTCGTTTGATG
TGATTTTGTGAGAGTCGATCCATAACATA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2B761TF 755 0 0
GGGGATCAGACGACGTTTTAATTCCTCCTCGTCTTCGCATTCTCCAATCAGTGTTTGTTT
GTTTGTTTTGGGGTGAAATTGAGAGAGAAAAAAA*TGAGCGGAGCGGGGAAGAAAGTGGG
GGAAGTGGCGTTCAAAGCGTCGAGGACGATAGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTCCTTGT
CACCGATGAGGCTCGAAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGATGAGGTCAACAC
CCAGCTCCAGACCAAGTTCAGTCAGGAGCCGGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAAA
GGGTATTGGCTCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCATTGAGATTCC
TAAGTACGTGGACAATGTTACCCCTGAGTACAAGCCCAAGTTTGATGCTTTGTTGGTGGA
ACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTCAAGGAGTCTGAACGGCTAGAGAAAGAAATTGT
TGATGTTCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACCATGACCGCAGATGAGTACTTCGAGAA
GCACCCAGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTG
ATTCACCATGTTGTATCTCCCTGGCCTGGAAAAGAAACTCGTTCTCTTTTTCGTTTGATG
TGATTTTGTGAGAGTCGATCCATAACATAATAAGGACCACTCCATTTACTTTGAGATATT
CATTGGAGATCCAATGAGACAATGACGATAAACCC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2AA54JQ 802 0 0
TCTTCGCATTCTCCAATCAGTGTTTGTTTGTTTGTTTTGGGGTGAAATTGAGAGAGAAAA
AAA*TGAGCGGAGCGGGGAAGAAAGTGGGGGAAGTGGCGTTCAAAGCGTCGAGGACGATA
GATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTCCTTGTCACCGATGAGGCTCGAAGAGAGTTCTCTAAC
CTCCGTCGCGCTTTCGATGAGGTCAACACCCAGCTCCAGACCAAGTTCAGTCAGGAGCCG
GAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAAAGGGTATTGGCTCTGGCATTGTTGACATGTAC
AAGGAGGCTTATGACAGTATTGAGATTCCTAAGTACGTGGACAATGTTACCCCTGAGTAC
AAGCCCAAGTTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCGGAACAGAAGTCGCTCAAG
GAGTCTGAACGGCTAGAGAAAGAAATTGTTGATGTTCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGC
ACCATGACCGCAGATGAGTACTTCGAGAAGCACCCAGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGAC
GAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATTCACCATGTTGTATCTCTCTGGCCTGGAA
AAGAAACTCGTTCTCTTTTTCGTTTGATGTGATTTTGTGAGAGTCGATCCATAACATAAT
AAGGACCACTCCATTTACTTTGAGATATTCATTGGAGATCCAATGAGACAATGACGATAA
ACCCATTTGGTTTTCAGTTGTCAATGTCATAATATTGTTTGTTTCGTTCTAAAGAGAATA
ATAAGAGTGAAAAAGATCTCCC

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2DR38TF 510 0 0
G
ATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCATTGAGATTCCTAAGTACGTGGACAAT
GTTACCCCTGAGTACAAGCCCAAGTTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAA
CAGAAGTCGCTCAAGGAGTCTGAACGGCTAGAGAAAGAAATTGTTGATGTTCAAGAGATA
AGCAAAAAGCTCAGCACCATGACCGCAGTTGAGTACTTCGAGAAGCACCCAGAACTCAAA
AAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATTCACCATGTTGTAT
CTCTCTGGCCTGGAAAAGAAACTCGTTCTCTTTTTCGTTTGATGTGATTTTGTGAGAGTC
GATCCATAACATAATAAGGACCACTCCATTTACTTTGAGATATTCATTGGAGATCCAATG
AGACAATGACGATAAACCCATTTGGTTTTCAGTTGTCAATGTCATAATATTGTTTGTTTC
GTTCTAAAGAGAATAATAAGAGTGAAAA
A

QA 2 509 2 509
DS 



CO CL159Contig2 815 4 6 U
GGAGGGCTTTCTTTCCCTTGGCGGATCAGACGACGTTTTACTTCCTCTTCCTCTTCCTCT
TCTTCGCATTCTCTCCATCAGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGGGTGAAATTGAGAAAA
GAAAATGAGCGGAGCGGGGAAGAAAGTGGCGGATGTGGCGTTCAAAGCGTCGAGGACGAT
AGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTCCTTGTCACCGATGAGGCTCGAAGAGAGTTCTCTAA
CCTCCGTCGCGCTTTCGATGAGGTCAACACCCAGCTCCAGACCAAGTTCAGTCAGGAGCC
TGAACCCATTGATTGGGACTTCTACAGAAAGGGTATTGGCTCTGGCATTGTTGACATGTA
CAAGGAAGCTTATGACAGCATTGAGATTCCCAAGTACGTGGACAATGTTACCCCTGAGTA
CAAGCCCAAGTTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTCAA
GGAGTCTGAACGGCTAGAGAAAGAAATTGTTGATGTTCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAG
CACCATGACTGCAGATGAGTACTTCGAGAAGCACCCAGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGA
CGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATTCACCATGCTGTATCTCTGGCCTGGAAA
AGAAACTCTTTTCTCTTTTTCTTTTCATGTGATTTTGTGAGAGTCGATCCATATAACATA
ATAAGACACTCCATTTACTTTGAGATATTCATTGGAGATCCAATGAGACATGACGATAAA
CCCATTTGGTTTCAGTTGTCATGTCATAATATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F812TF U 25
AF RR2D710TF U 1
AF RR2H001TF U 38
AF RR2F566TF U 37
BS 1 163 RR2D710TF
BS 164 164 RR2F812TF
BS 165 254 RR2D710TF
BS 255 255 RR2F812TF
BS 256 534 RR2D710TF
BS 535 815 RR2F566TF

RD RR2F812TF 350 0 0
ATCAGACGACGTTTTACTTCCTCTTTCTCTTCCTCTTCTTCGCATTCTCTCCATCAGTGT
TTGTTTGTTTGTTTGTTTTGGGTGAAATTGAGAAAAGAAAATGAGCGGAGCGGGGAAGAA
AGTGGCGGATATGGCGTTCAAAGCGTCGAGGACGATAGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGT
CCTTGTCACCGATGAGGCTCGAAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCCATGAGGT
CAACACCCAGCTCCAGACCAAGTTCAGTCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGACTTCTA
CAGAAAGGGTATTGGCTCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATG

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR2D710TF 534 0 0
GGAGGGCTTTCTTTCCCTTGGCGGATCAGACGACGTTTTACTTCCTCTTCCTCTTCCTCT
TCTTCGCATTCTCTCCATCAGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGGGTGAAATTGAGAAAA
GAAAATGAGCGGAGCGGGGAAGAAAGTGGCGGATGTGGCGTTCGAAGCGTCGAGGACGAT
AGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTCCTTGTCACCGATGAGGCTCGAAGAGAGTTCTCTAA
CCTCCGTCGCGCTTCCGATGAGGTCAACACCCAGCTCCAGACCAAGTTCAGTCAGGAGCC
TGAACCCATTGATTGGGACTTCTACAGAAAGGGTATTGGCTCTGGCATTGTTGACATGTA
CAAGGAAGCTTATGACAGCATTGAGATTCCCAAGTACGTGGACAATGTTACCCCTGAGTA
CAAGCCCAAGTTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTCAA
GGAGTCTGAACGGCTAGAGAAAGAAATTGTTGATGTTCAAGAGATAAGCAAAAA

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2H001TF 489 0 0
GG
ACTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCTTCGCATTCTCTCCATCAGTGTTTGTTTGTTTGTTTG
TTTTGGGTGAAATTGAGAAAAGAAAATGAGCGGAGCGGGGAAGAAAGTGGCGGATGTAGC
GTTCAAAGCGTCGAGGACGATAGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTCCTTGTCACCGATGA
GGCTCGAAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGATGAGGTCAACACCCAGCTCCA
GACCAAGTTCAGTCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGACTTCTACAGAAAGGGTATTGG
CTCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCATTGAGATTCCCAAGTACGT
GGACAATGTTACCCCTGAGTACAAGCCCAAGTTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGA
AGCAGAACAGAAGTCGCTCAAGGAGTCTGAACGGCTAGAGAAAGAAATTGTTGATGTTCA
GGAGATA

QA 3 489 3 489
DS 

RD RR2F566TF 779 0 0
GGG
ACTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCTTCGCATTCTCTCCATCAGTGTTTGTTTGTTTGTTTG
TTTTGGGTGAAATTGAGAAAAGAAAATGAGCGGAGCGGGGAAGAAAGTGGCGGATGTGGC
GTTCAAAGCGTCGAGGACGATAGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTCCTTGTCACCGATGA
GGCTCGAAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGATGAGGTCAACACCCAGCTCCA
GACCAAGTTCAGTCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGACTTCTACAGAAAGGGTATTGG
CTCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCATTGAGATTCCCAAGTACGT
GGACAATGTTACCCCTGAGTACAAGCCCAAGTTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGA
AGCAGAACAGAAGTCGCTCAAGGAGTCTGAACGGCTAGAGAAAGAAATTGTTGATGTTCA
AGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACCATGACTGCAGATGAGTACTTCGAGAAGCACCCAGA
ACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATTCACCAT
GCTGTATCTCTGGCCTGGAAAAGAAACTCTTTTCTCTTTTTCTTTTCATGTGATTTTGTG
AGAGTCGATCCATATAACATAATAAGACACTCCATTTACTTTGAGATATTCATTGGAGAT
CCAATGAGACATGACGATAAACCCATTTGGTTTCAGTTGTCATGTCATAATATTGT

QA 4 779 4 779
DS 



CO CL159Contig3 795 5 4 U
GGCAATCTGTGTGTGTGTGTGTATTTGGGTGAAAATCGAGAAAAAATGAGCGGAGCAGGA
AAGAAAGTAGCGGATGTGGCATTCAAAGCGTCGAGGACTATAGACTGGGAAGGGATGGCA
AAGGTCCTTGTCACCGACGAGGCTCGCAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGAC
GAGGTCAACACCCAGCTCCAAACCAAGTTCAGCCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGAT
TTCTACAGAAAGGGTATTGGATCTGGCATCGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGC
GTTGAGATTCCCAAGTACGTGGACAATGTTACCCCTGAATACAAGCCAAAATTTGATGCT
TTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTCAAGGAGTCTGAACGGCTGGAG
AAAGAAATTATTGATGTCCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACGATGACTGCAGATGAG
TACTTTGAGAAGCACCCTGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTGC
TGGGGATACTGATGATCATCACGTTTCTTGCATCTCCGGCCTTGAAAAGAAACTAAACTC
TCTCTTTTTTTCTTGTACTGTGATTTTTTTTTCTTGAATAAGTACACTCCACTGTTGAGA
TCTTCATTGGAGATCCAATAAGACAATGATGATCAACTGGCTATAGTTTATCCATTTCAT
AGATGAGTTGATTACATTAAACGACATTTTCTATTTTC**TTTACACTAAGTGACACTTT
TCACATGTGAGATAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D012TF U 31
AF RR2AL28TF U 24
AF RR2FE16JQ C 1
AF RR2FE16TF U 1
AF RR2FS55TF U 12
BS 1 732 RR2FE16TF
BS 733 733 RR2FS55TF
BS 734 789 RR2FE16TF
BS 790 795 RR2FS55TF

RD RR2D012TF 479 0 0
GAAAATCGAGAAAAAATGAGCGGAGCAGGAAAGAAAGTAGCGGATGTGGCATTCAAAGCG
TCGGGGACTATAGACTGGGAAGGGATGGCAAAGGTCCTTGTCACCGACGAGGCTCGCAGA
GAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGACGAGGTCAACACCCAGCTCCAAACCAAGTTC
AGCCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAAAGGGTATTGGATCTGGCATC
GTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTACGTGGACAATGTT
ACCCCTGAATACAAGCCAAAATTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAACAG
AAGTCGCTCAAGGAGTCTGAACGGCTGGAGAAAGAAATTATTGATGTCCAAGAGATAAGC
AAAAAGCTCAGCACGATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCACCCTGAACTCAAAAA

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR2AL28TF 729 0 0
TTTGGGTGAAAATCGAGAAAAAATGAGCGGAGCAGGAAAGAAAGTAGCGGATGTGGCATT
CAAAGCGTCGAGGACTATAGACTGGGAAGGGATGGCAAAGGTCCTTGTCACCGACGAGGC
TCGCAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGACGAGGTCAACACCCAGCTCCAAAC
CAAGTTCAGCCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAAAGGGTATTGGATC
TGGCATCGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTACGTGGA
CAATGTTACCCCTGAATACAAGCCAAAATTTGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGC
AGAACAGAAGTCGCTCAAGGAGTCTGAACGGCTGGAGAAAGAAATTATTGATGTCCAAGA
GATAAGCAAAAAGCTCAGCACGATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCACCCTGAACT
CAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATGATCATCACG
TTTCTTGCATCTCCGGCCTTGAAAAGAAACTAAACTCTCCCTTTTTTTCTTGTACTGTGA
TTTTTTTTTCTTGAATAAGTACACTCCACTGTTGAGATCTTCATTGGAGATCCAATA*GA
CAATGATGATCAACTGGCTATAGTTTATCCATTTCATAGATGAGTTGATTACATTAAACG
ACATTTTCT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2FE16JQ 789 0 0
GGCAATCTGTGTGTGTGTGTGTATTTGGGTGAAAATCGAGAAAAAATGAGCGGAGCAGGA
AAGAAAGTAGCGGATGTGGCATTCAAAGCGTCGAGGACTATAGACTGGGAAGGGATGGCA
AAGGTCCTTGTCACCGACGAGGCTCGCAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGAC
GAGGTCAACACCCAGCTCCAAACCAAGTTCAGCCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGAT
TTCTACAGAAAGGGTATTGGATCTGGCATCGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGC
GTTGAGATTCCCAAGTACGTGGACAATGTTACCCCTGAATACAAGCCAAAATTTGATGCT
TTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTCAAGGAGTCTGAACGGCTGGAG
AAAGAAATTATTGATGTCCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACGATGACTGCAGATGAG
TACTTTGAGAAGCACCCTGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTGC
TGGGGATACTGATGATCATCACGTTTCTTGCATCTCCGGCCTTGAAAAGAAACTAAACTC
TCTCTTTTTTTCTTGTACTGTGATTTTTTTTTCTTGAATAAGTACACTCCACTGTTGAGA
TCTTCATTGGAGATCCAATAAGACAATGATGATCAACTGGCTATAGTTTATCCATTTCAT
AGATGAGTTGATTACATTAAACGACATTTTCTATTTTTCTTTTACACTAAGTGACACTTT
TCACATGTG

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2FE16TF 794 0 0
GGCAATCTGTGTGTGTGTGTGTATTTGGGTGAAAATCGAGAAAAAATGAGCGGAGCAGGA
AAGAAAGTAGCGGATGTGGCATTCAAAGCGTCGAGGACTATAGACTGGGAAGGGATGGCA
AAGGTCCTTGTCACCGACGAGGCTCGCAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGAC
GAGGTCAACACCCAGCTCCAAACCAAGTTCAGCCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGAT
TTCTACAGAAAGGGTATTGGATCTGGCATCGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGC
GTTGAGATTCCCAAGTACGTGGACAATGTTACCCCTGAATACAAGCCAAAATTTGATGCT
TTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTCAAGGAGTCTGAACGGCTGGAG
AAAGAAATTATTGATGTCCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACGATGACTGCAGATGAG
TACTTTGAGAAGCACCCTGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTGC
TGGGGATACTGATGATCATCACGTTTCTTGCATCTCCGGCCTTGAAAAGAAACTAAACTC
TCTCTTTTTTTCTTGTACTGTGATTTTTTTTTCTTGAATAAGTACACTCCACTGTTGAGA
TCTTCATTGGAGATCCAATAAGACAATGATGATCAACTGGCTATAGTTTATCCATTTCAT
AGATGAGTTGAT*ACATTAAACGACATTTTCTATTTTC**TTTACACTAAGTGACACTTT
TCACATGTG
AAAAA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2FS55TF 784 0 0
GGG
GTGTGTGTGTTTGGGTGAAAATCGAGAAAAAATGAGCGGAGCAGGAAAGAAAGTAGCGGA
TGTGGCATTCAAAGCGTCGAGGACTATAGACTGGGAAGGGATGGCAAAGGTCCTTGTCAC
CGACGAGGCTCGCAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGACGAGGTCAACACCCA
GCTCCAAACCAAGTTCAGCCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAAAGGG
TATTGGATCTGGCATCGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAA
GTACGTGGACAATGTTACCCCTGAATACAAGCCAAAATTTGATGCTTTGTTGGTGGAACT
GAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTCAAGGAGTCTGAACGGCTGGAGAAAGAAATTATTGA
TGTCCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACGATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCA
CCCTGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACTGATG
ATCATCACGTTTCTTGCATCTCCGGCCTTGAAAAGAAACTAAACTCTCTCTTTTTTTCTT
GTACTGTGATTTTTTTTTCTTGAATAAGTACACTCCACTGTTGAGATCTTCATTGGAGAT
CCAATAAGACAATGATGATCAACTGGCTATAGTTTATCCATTTCATAGATGAGTTGATTA
CATTAAACGACATTTTCTATTTTC**TTTACACTAAGTGACACTTTTCACATGTGAGATA
T

QA 4 784 4 784
DS 



AS 2 17

CO CL160Contig1 611 3 1 U
GGTAAGCAAAAGATAGATTATTAAGCTCCTCTAAATTCAAACCTCAACTCAATCACACAA
GTTACAATATGAAACAGAAGAGACAGAGAAGTGACATACATAGGATAAGAGGAGGCATAC
AGTTCCACTCTTTATTAAACACAAACATTGCTTAGAAACTCAAAAAACAAGAACAAGAAC
AATGATGATGATCATCATCATCTTTAAGCAGGGAATGAGTACTTCTCAATAGTCTCCTTC
CAGGCAGGACGGCTGCTAATATCATCCCACCACGCGCTCACGTGCTTCCTGTCTTTGATC
AGGTAAGCCTTACCGATGGGACCAACCAAGTAATCAGTGAAAGGGAGGTGAGCCAAATCA
GCCAAGCTGACAAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTTGGAGAGCTGTGCCTCGTAGACA
TCGAGCACAGCAGCGAGCTTCTCCTCGCTCTCCTTGATCAGCTTCTCATCAGATGGGAAT
CCCATGACCGATGCAAACATGATGCGGAGTGTGAGGTTAAGGAGGGGTGGGTGGAAAGTG
GTGGCCTCAACGTCGAGCCATTGCTCAACTTGACCTCTGTCTTCAACGGTTTTGCCCAAA
AGGTCAGGTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CQ78JQ U 23
AF RR2CR86JQ U 1
AF RR2CR86TF C 1
BS 1 611 RR2CR86JQ

RD RR2CQ78JQ 498 0 0
AAGCTCCTCTAAATTCAAACCTCAACTCAATCACACAAGTTACAATATGAAACAGAAGAG
ACAGAGAAGTGACATACATAAGATAAGAGGAGGCATACAGTTCCACTCTTTATTAAACAC
AGACATTGCTTAGAAACTCAAAAAACAAGAACAAGAACAATGATGATGATCATCATCATC
TTTAAGCAGGGAATGAGTACTTCTCAATAGTCTCCTTCCAGGCAGGACGGCTGCTAATAT
CATCCCACCACGCGCTCACGTGCTTCCTGTCTTTGATCAGGTAAGCCTTACCGATGGGAC
CAACCAAGTAATCAGTGAAAGGGAGGGGAGCCAAATCAGCCAAGCTGACAAAGTCACCAG
CCAAGTACTTGCTCTTGGAGAGCTGTGCCTCGTAAACATCGAGCACAGCATCGAGCTTCT
CCTCGCTCTCCTTGATCAGCTTCTCATCAGATGGGAATCCCATGACCGATGCAAACATGA
TGTGGGGTGTGAGGTTAA

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2CR86JQ 611 0 0
GGTAAGCAAAAGATAGATTATTAAGCTCCTCTAAATTCAAACCTCAACTCAATCACACAA
GTTACAATATGAAACAGAAGAGACAGAGAAGTGACATACATAGGATAAGAGGAGGCATAC
AGTTCCACTCTTTATTAAACACAAACATTGCTTAGAAACTCAAAAAACAAGAACAAGAAC
AATGATGATGATCATCATCATCTTTAAGCAGGGAATGAGTACTTCTCAATAGTCTCCTTC
CAGGCAGGACGGCTGCTAATATCATCCCACCACGCGCTCACGTGCTTCCTGTCTTTGATC
AGGTAAGCCTTACCGATGGGACCAACCAAGTAATCAGTGAAAGGGAGGTGAGCCAAATCA
GCCAAGCTGACAAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTTGGAGAGCTGTGCCTCGTAGACA
TCGAGCACAGCAGCGAGCTTCTCCTCGCTCTCCTTGATCAGCTTCTCATCAGATGGGAAT
CCCATGACCGATGCAAACATGATGCGGAGTGTGAGGTTAAGGAGGGGTGGGTGGAAAGTG
GTGGCCTCAACGTCGAGCCATTGCTCAACTTGACCTCTGTCTTCAACGGTTTTGCCCAAA
AGGTCAGGTCC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2CR86TF 611 0 0
GG
TAAGCAAAAGATAGATTATTAAGCTCCTCTAAATTCAAACCTCAACTCAATCACACAAGT
TACAATATGAAACAGAAGAGACAGAGAAGTGACATACATAGGATAAGAGGAGGCATACAG
TTCCACTCTTTATTAAACACAAACATTGCTTAGAAACTCAAAAAACAAGAACAAGAACAA
TGATGATGATCATCATCATCTTTAAGCAGGGAATGAGTACTTCTCAATAGTCTCCTTCCA
GGCAGGACGGCTGCTAATATCATCCCACCACGCGCTCACGTGCTTCCTGTCTTTGATCAG
GTAAGCCTTACCGATGGGACCAACCAAGTAATCAGTGAAAGGGAGGTGAGCCAAATCAGC
CAAGCTGACAAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTTGGAGAGCTGTGCCTCGTAGACATC
GAGCACAGCAGCGAGCTTCTCCTCGCTCTCCTTGATCAGCTTCTCATCAGATGGGAATCC
CATGACCGATGCAAACATGATGCGGAGTGTGAGGTTAAGGAGGGGTGGGTGGAAAGTGGT
GGCCTCAACGTCGAGCCATTGCTCAACTTGACCTCTGTCTTCAACGGTTTTGCCCAAAAG
GTCAGGTCC

QA 3 611 3 611
DS 



CO CL160Contig2 1070 14 18 U
AAACTTTTAATTGTTGAATGATGTTATGTATGTGTGCTCATGGGGACAATAATCAAAATG
TGTTTGGAATTTGCTAAGCAAAAGATAGATTATTAAGCTCCTCTAAATTCAAACCTCAAC
TCAATCACACAAGTTACAATATGAAACAGAAGAGACAGAGAAGTGACATACATAAGATAA
GAGGAGGCATACAGTTCCACTCTTTATTAAA**CACAAACATTGCTTGGAAACTCAAAAA
*CAAGAACAAGAACAATGATGATGATCATCATCATCTTTAAGCAGGGAATGAGTACTTCT
CAATAGTCTCCTTCCAGGCAGGACGGCTGCTAATATCATCCCACCACGCGCTCACGTGCT
TCCTGTCTTTGATCATGTAAGCCTTACCGATGGGTCCAACCAAGTAATCAGTGAAAGGGA
GGTGAGCCAAATCAGCCAAGCTGACGAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTTGGAGAGCT
GTGCCTCGTAGACATCGAGCACAGCAGCGAGCTTCTCCTCGCTCTCCTTGATCAGCTTCT
CGTCAGATGGGAATCCCATGACCGATGCGAACATGATGTGGAGTGTGAGGTTAAGGAGGG
GTGGGTGGAAAGTGGTGGCCTCAACGTCGAGCCATTGCTCAACTTGACCTCTGTCTTCAA
CGGTTTTGCCCAAAAGGTCAGGTCCTTGTGACCTGTACTTCTCAGCTACATACCTCATCA
CGGCACGTGACTCGAAGATCTTGTAGTCACCGTCGACAACAGCAGGAACGGTACCGAAAG
GCTGTAAGGCGAGATAAGCAGGCTGCTTGTGCTCTCCTTTCATGAGATCGACGGGGATGG
TCTCGAAGGGAACGCCCTTCTCGATAAGCGTTACCAGAGCACGCTTGGGCGAAGCAAAGT
GAGGTCCGTACACCTTTAGCACCATCTTTCCTCTCTTTTCTATTACAAAACACACACAAA
CACAGTTGCTAAGCTTGTTAGTAAGTGATATTGACTCTGTGATGATGAGACGCCTTCTTT
ATAGCGAGGAGCGGAGGCTTGGCAGATAGAGAGCGATCATTTATTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 10 40 40 40 40 40 40 25 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 
45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 30 30 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 30 70 40 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 40 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 60 75 75 75 45 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 40 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 
70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 0 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 55 70 20 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 55 70 70 70 65 65 15 65 50 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI21JQ U 352
AF RR2DB82JQ U 1
AF RR2F941JQ U 151
AF RR2EI20TF C 120
AF RR2EI20JQ U 87
AF RR2F941TF C 73
AF RR2CL82JQ U 95
AF RR2AO05JQ U 73
AF RR2B768JQ U 84
AF RR2B768TF C 126
AF RR2CQ78TF C 293
AF RR2DB82TF C 315
AF RR2AO05TF C 241
AF RR2CL82TF C 292
BS 1 495 RR2DB82JQ
BS 496 527 RR2AO05JQ
BS 528 528 RR2EI20JQ
BS 529 562 RR2AO05JQ
BS 563 563 RR2F941JQ
BS 564 575 RR2AO05JQ
BS 576 576 RR2EI20JQ
BS 577 583 RR2AO05JQ
BS 584 584 RR2EI20JQ
BS 585 586 RR2AO05JQ
BS 587 587 RR2EI20JQ
BS 588 843 RR2AO05JQ
BS 844 933 RR2B768TF
BS 934 934 RR2CQ78TF
BS 935 971 RR2B768TF
BS 972 972 RR2DB82TF
BS 973 1017 RR2B768TF
BS 1018 1070 RR2CL82TF

RD RR2EI21JQ 124 0 0
TCACGTGCTTCCTGTCTTTGATCAGGTAAGCTTTACCGATGGGACCAACCAAGTAATCAG
TGAAAGGGAGGTGAGCCAAATCAGCCAAGCTGACGAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCT
TGGA

QA 1 124 1 124
DS 

RD RR2DB82JQ 495 0 0
AAACTTTTAATTGTTGAATGATGTTATGTATGTGTGCTCATGGGGACAATAATCAAAATG
TGTTTGGAATTTGCTAAGCAAAAGATAGATTATTAAGCTCCTCTAAATTCAAACCTCAAC
TCAATCACACAAGTTACAATATGAAACAGAAGAGACAGAGAAGTGACATACATAAGATAA
GAGGAGGCATACAGTTCCACTCTTTATTAAA**CACAAACATTGCTTGGAAACTCAAAAA
*CAAGAACAAGAACAATGATGATGATCATCATCATCTTTAAGCAGGGAATGAGTACTTCT
CAATAGTCTCCTTCCAGGCAGGACGGCTGCTAATATCATCCCACCACGCGCTCACGTGCT
TCCTGTCTTTGATCATGTAAGCCTTACCGATGGGTCCAACCAAGTAATCAGTGAAAGGGA
GGTGAGCCAAATCAGCCAAGCTGACGAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTTGGAGAGCT
GTGCCTCGTAGACAT

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR2F941JQ 527 0 0
AGAA
ACAGAGAAGTGACATACATAAAATAAAAGGAGGCATACAGTTCCACTCTTTATTAAA**C
ACAAACATTGCTTGGAAACTCAAAAA*CAAGAACAAGAACAATGATGATGATCATCATCA
TCTTTAAGCAGGGAATGAGTACTTCTCAATAGTCTCCTTCCAGGCAGGACGGCTGCTAAT
ATCATCCCACCACGCGCTCACGTGCTTCCTGTCTTTGATCATGTAAGCCTTACCGATGGG
TCCAACCAAGTAATCAGTGAAAGGGAGGTGAGCCAAATCAGCCAAGCTGACGAAGTCACC
AGCCAAGTACTTGCTCTTGGAAAGCTGTGCCTCGTAAACATCGAGCACAGCAGCGAGCTT
CTCCTCGCTCTCCTTGATCAGCTTCTCGTCAGAAGGGAATCCCATGACCGATGCGAACAT
GATGTGGAGTGTGAGGTTAAGGAGGGGTGGGTGGAAAGTGGTGGCCTCAACGTCGAGCCA
TTGCTCAACTTGACCTCTGTCTTCAACGGTTTTGCCCAAAAGG

QA 5 527 5 527
DS 

RD RR2EI20TF 641 0 0
CTCAATCACACAAGTTACAATATGAAACAGAAGAGACAGAGAAGTAACATACATAAGATA
AGAGGAGGCATACAGTTCCACTCTTTATTAAA**CACAAACATTGCTTAGAAACTCAAAA
A*CAAGAACAAGAACAATGATGATGATCATCATCATCTTTAAGCAGGGAATGAGTACTTC
TCAATAGTCTCCTTCCAGGCAGGACGGCTGCTAATATCGTCCCACCACGCGCTCACGTGC
TTCCTGTCTTTGATCAGGTAAGCTTTACCGATGGGACCAACCAAGTAATCAGTGAAAGGG
AGGTGAGCCAAATCAGCCAAGCTGACGAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTTGGAGAGC
TGTGCCTCGTAGACATCGAGCACAGCAGCGAGCTTCTCCTCGCTCTCCTTGATCAGCTTC
TCATCAGATGGGAATCCCATGACTGATGCGAACATGATGTGGAGTGTGAGGTTAAGGAGG
GGTGGGTGGAAAGTGGTGGCCTCAACGTCGAGCCATTGCTCGACTTGACCTCTGTCTTCA
ACGGTTTTGCCCAAAAGGTCAGGTCCTTGTGACCTGTACTTCTCAGCTACATACCTCATC
ACGGCACGTGACTCGAAGATCTTGTAGTCACCGTCGACAAC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2EI20JQ 658 0 0
AGATAATTAAGTTCCTCTTGATTCAAACCTCAACTCAATCACACAAGTTACAATATGAAA
CAGAAGAGACAGAGAAGTAACATACATAAGATAAGAGGAGGCATACAGTTCCACTCTTTA
TTAAA**CACAAACATTGCTTAGAAACTCAAAAA*CAAGAACAAGAACAATGATGATGAT
CATCATCATCTTTAAGCAGGGAATGAGTACTTCTCAATAGTCTCCTTCCAGGCAGGACGG
CTGCTAATATCGTCCCACCACGCGCTCACGTGCTTCCTGTCTTTGATCAGGTAAGCTTTA
CCGATGGGACCAACCAAGTAATCAGTGAAAGGGAGGTGAGCCAAATCAGCCAAGCTGACG
AAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTTGGAGAGCTGTGCCTCGTAGACATCGAGCACAGCA
GCGAGCTTCTCCTCGCTCTCCTTGATCAGCTTCTCATCAGATGGGAATCCCATGACTGAT
GCGAACATGATGTGGAGTGTGAGGTTAAGGAGGGGTGGGTGGAAAGTGGTGGCCTCAACG
TCGAGCCATTGCTCGACTTGACCTCTGTCTTCAACGGTTTTGCCCAAAAGGTCAGGTCCT
TGTGACCTGTACTTCTCAGCTACATACCTCATCACGGCACGTGACTCGAAGATCTTGT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2F941TF 660 0 0
GC
TAAGCAAAAGATAGATTATTAAGCTCCTCTAAATTCAAACCTCAACTCAATCACACAAGT
TACAATATGAAACAGAAGAGACAGAGAAGTGACATACATAAGATAAGAGGAGGCATACAG
TTCCACTCTTTATTAAA**CACAAACATTGCTTGGAAACTCAAAAA*CAAGAACAAGAAC
AATGATGATGATCATCATCATCTTTAAGCAGGGAATGAGTACTTCTCAATAGTCTCCTTC
CAGGCAGGACGGCTGCTAATATCATCCCACCACGCGCTCACGTGCTTCCTGTCTTTGATC
ATGTAAGCCTTACCGATGGGTCCAACCAAGTAATCAGTGAAAGGGAGGTGAGCCAAATCA
GCCAAGCTGACGAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTTGGAGAGCTGTGCCTCGTAGACA
TCGAGCACAGCAGCGAGCTTCTCCTCGCTCTCCTTGATCAGCTTCTCGTCAGAAGGGAAT
CCCATGACCGATGCGAACATGATGTGGAGTGTGAGGTTAAGGAGGGGTGGGTGGAAAGTG
GTGGCCTCAACGTCGAGCCATTGCTCAACTTGACCTCTGTCTTCAACGGTTTTGCCCAAA
AGGTCGGATCCTTGGGACCTGTACTTCTCAGCTACATACCTCATCACGGCACGTGAC
C

QA 3 659 3 659
DS 

RD RR2CL82JQ 703 0 0
AAGT
TCCTCTAGATTCAAACCTCAACTCAATCACACAAGTTACAATATGAAACAGAAGAGACAG
AG**GTGACATACATAAGATAAGAGGAGGCATACAGTTCCACTCTTTATTAAAAACACAA
ACATTGCTTAAAAACTCAAAAAACAAGAACAAGAACAATGATGATGATCATCATCATCTT
TAAGCAGGGAATGAGTACTTCTCAATAGTCTCCTTCCAGGCAGGACGGCTGCTAATATCA
TCCCACCACGCGCTCACGTGCTTCCTGTCTTTGATCATGTAAGCCTTACCGATGGGTCCA
ACCAAGTAATCAGTGAAAGGGAGGTGAGCCAAATCAGCCAAGCTGACGAAGTCACCAGCC
AAGTACTTGCTCTTGGAGAGCTGTGCCTCGTAAACATCGAGCACAGCAGCGAGCTTCTCC
TCGCTCTCCTTGATCAGCTTCTCGTCAGATGGGAATCCCATGACTGATGCGAACATGATG
TGGAGGGTTAGGTTAAGGAGGGGTGGGTGGAAAGTGGTGGCCTCAACGTCGAGCCATTGC
TCAACTTGACCTCTGTCTTCAACGGTTTTGCCCAAAAGGTCAGGTCCTTGTGACCTGTAC
TTCTCAGCTACATACCTCATCACGGCACGTGACTCGAAGATCTTGTAGTCACCGTCGACA
ACAGCAGGAACGGTACCGAAAGGCTGTAAGGCGAG
GTAA

QA 5 699 5 699
DS 

RD RR2AO05JQ 771 0 0
AC
TAAGCAAAAGATGGATTATTAAGTTCCTCTAGATTCAAACCTCAACTCAATCACACAAGT
TACAATATGAAACAGAAGAGACAGAG**GTGACATACATAAGATAAGAGGAGGCATACAG
TTCCACTCTTTATTAAAAACACAAACATTGCTTAGAAACTCAAAAAACAAGAACAAGAAC
AATGATGATGATCATCATCATCTTTAAGCAGGGAATGAGTACTTCTCAATAGTCTCCTTC
CAGGCAGGACGGCTGCTAATATCATCCCACCACGCGCTCACGTGCTTCCTGTCTTTGATC
ATGTAAGCCTTACCGATGGGTCCAACCAAGTAATCAGTGAAAGGGAGGTGAGCCAAATCA
GCCAAGCTGACGAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTTGGAGAGCTGTGCCTCGTAGACA
TCGAGCACAGCAGCGAGCTTCTCCTCGCTCTCCCTGATCAGCTTCTCGTCAGATGGGAAT
CCCATGACTGATGCGAACATG*TGTGGAGGGTTAGGTTAAGGAGGGGTGGGTGGAAAGTG
GTGGCCTCAACGTCGAGCCATTGCTCAACTTGACCTCTGTCTTCAACGGTTTTGCCCAAA
AGGTCAGGTCCTTGTGACCTGTACTTCTCAGCTACATACCTCATCACGGCACGTGACTCG
AAGATCTTGTAGTCACCGTCGACAACAGCAGGAACGGTACCGAAAGGCTGTAAGGCGAGA
TAAGCAGGCTGCTTGTGCTCTCCTTTCATGAGATCGACGGGGATGGTCT

QA 3 771 3 771
DS 

RD RR2B768JQ 760 0 0
GG
TAGATTATTAAGCTCCTCTAAATTCAAACCTCAACTCAATCACACAAGTTACAATATGAA
ACAGAAGAGACAGAGAAGTGACATACATAAGATAAGAGGAGGCATACAGTTCCACTCTTT
ATTAAA**CACAAACATTGCTTGGAAACTCAAAAA*CAAGAACAAGAACAATGATGATGA
TCATCATCATCTTTAAGCAGGGAATGAGTACTTCTCAATAGTCTCCTCCCAGGCAGGACG
GCTGCTAATATCATCCCACCACGCGCTCACGTGCTTCCTGTCTTTGATCATGTAAGCCTT
ACCGATGGGTCCAACCAAGTAATCAGTGAAAGGGAGGTGAGCCAAATCAGCCAAGCTGAC
GAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTTGGAGAGCCGTGCCTCGTAAACATCGAGCACAGC
AGCGAGCTTCTCCTCGCTCTCCTTGATCAGCTTCTCGTCAGAAGGGAATCCCATGACCGA
TGCGAACATGATGTGGAGTGTGAGGTTAAGGAGGGGTGGGTGGAAAGTGGTGGCCTCAAC
GTCGAGCCATTGCTCAACTTGACCTCTGTCTTCAACGGTTTTGCCCAGAAGGTCGGGTCC
TTGGGACCTGTACTTCTCAGCTACATACCTCATCACGGCACGTGACTCGAAGATCTTGTA
GTCACCGTCGACAACAGCTGGAACGGTACCGAAAGGCTGTAAGGCGAGATAAGCAGGCCG
CTTGTGCTCTCCTTTCATGAGATCGACGGGGATGGTCT

QA 3 760 3 760
DS 

RD RR2B768TF 893 0 0
CACACAAGTTACAATATGAAACAGAAGAGACAGAGAAGTGACATACATAAGATAAGAGGA
GGCATACAGTTCCACTCTTTATTAAA**CACAAACATTGCTTGGAAACTCAAAAA*CAAG
AACAAGAACAATGATGATGATCATCATCATCTTTAAGCAGGGAATGAGTACTTCTCAATA
GTCTCCTCCCAGGCAGGACGGCTGCTAATATCATCCCACCACGCGCTCACGTGCTTCCTG
TCTTTGATCATGTAAGCCTTACCGATGGGTCCAACCAAGTAATCAGTGAAAGGGAGGTGA
GCCAAATCAGCCAAGCTGACGAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTTGGAGAGCCGTGCC
TCGTAGACATCGAGCACAGCAGCGAGCTTCTCCTCGCTCTCCTTGATCAGCTTCTCGTCA
GAAGGGAATCCCATGACCGATGCGAACATGATGTGGAGTGTGAGGTTAAGGAGGGGTGGG
TGGAAAGTGGTGGCCTCAACGTCGAGCCATTGCTCAACTTGACCTCTGTCTTCAACGGTT
TTGCCCAGAAGGTCGGGTCCTTGGGACCTGTACTTCTCAGCTACATACCTCATCACGGCA
CGTGACTCGAAGATCTTGTAGTCACCGTCGACAACAGCTGGAACGGTACCGAAAGGCTGT
AAGGCGAGATAAGCAGGCCGCTTGTGCTCTCCTTTCATGAGATCGACGGGGATGGTCTCG
AAGGGAACGCCCTTCTCGATAAGCGTTACCAGAGCACGCTTGGGCGAAGCAAAGTGAGGT
CCGTACACCTTTAGCACCATCTTTCCTCCCTTTTCTATTACAAAACACACACAAACACAG
TTGCTAGGCTTGTTAGTAAGTGATATTGACTCTGTGATGATGAGACGCCTTC
C

QA 1 892 1 892
DS 

RD RR2CQ78TF 687 0 0
GTACTTCTCAATAGTCTC*TTCCAGGCAGGACGGCTGCTAATATCATCCCACCACGCGCT
CACGTGCTTCCTGTCTTTGATCAGGTAAGCCTTACCGATGGGACCAACCAAGTAATCAGT
GAAAGGGAGGTGAGCCAAATCAGCCAAGCTGACAAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTT
GGAGAGCTGTGCCTCGTAGACATCGAGCACAGCATCGAGCTTCTCCTCGCTCTCCTTGAT
CAGCTTCTCATCAGATGGGAATCCCATGACCGATGCAAACATGATGTGGGGTGTGAGGTT
AAGGAGGGGTGGGTGGAAAGTGGTGGCCTCAACGTCGAGCCATTGCTCAACTTGACCTCT
GTCTTCAACGGTTTTGCCCAACAGGTCAGGTCCTTGGGACCTGTACTTCTCAGCTACGTA
CCTCATCACCGCACGTGACTCGAAGATCTTGTAGTCACCGTCGACAACAGCTGGAACGGT
ACCGAAAGGCTGTAAGGCGAGATAAGCAGGCTGCTTGTGCTCTCCTTTCATGAGATCGAC
GGGGATGGTCTCGAAGGGAACGCCCTT*TCGATAAGCGTTACCAGAGCACGCTTGGGCGA
AGCAAAGTGAGGTCCGTACACCTTTAGCACCATCTTTCCTCTCTTTTCTATTACAAAACA
CACACAAACACAGTTG
AGCTTGTTCCC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2DB82TF 677 0 0
CAGGCAGGACGGCTGCTAATATCATCCCACCACGCGCTCACGTGCTTCCTGTCTTTGATC
ATGTAAGCCTTACCGATGGGTCCAACCAAGTAATCAGTGAAAGGGAGGTGAGCCAAATCA
GCCAAGCTGACGAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTTGGAGAGCTGTGCCTCGTAGACA
TCGAGCACAGCAGCGAGCTTCTCCTCGCTCTCCTTGATCAGCTTCTCGTCAGAAGGGAAT
CCCATGACCGATGCGAACATGATGTGGAGTGTGAGGTTAAGGAGGGGTGGGTGGAAAGTG
GTGGCCTCAACGTCGAGCCATTGCTCAACTTGACCTCTGTCTTCAACGGTTTTGCCCAAA
AGGTCGGGTCCTTGGGACCTGTACTTCTCAGCTACATACCTCATCACGGCACGTGACTCG
AAGATCTTGTAGTCACCGTCGACAACAGCTGGAACGGTACCGAAAGGCTGTAAGGCGAGA
TAAGCAGGCTGCTTGTGCTCTCCTTTCATGAGATCGACGGGGATGGTCTCGAAGGGAACG
CCCTTCTCGATAAGCGTTACCAGAGCACGCTTGGGCGAAGCAAAGTGAGGTCCGTACACC
TTTAGCACCATCTTTCCTCTCTTTTCTATTACAAAACACACACAAACACAGTTGCTAAGC
TTGTTAGTAAGTGAT
CC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2AO05TF 754 0 0
ACAAGAACAAGAACAATGATGATGATCATCATCATCTTTAAGCAGGGAATGAGTACTTCT
CAATAGTCTCTTTCCAGGCAGGACGGCTGCTAATATCATCCCACCACGCGCTCACGTGCT
TCCTGTCTTTGATCATGTAAGCCTTACCGATGGGTCCAACCAAGTAATCAGTGAAAGGGA
GGTGAGCCAAATCAGCCAAGCTGACGAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTTGGAGAGCT
GTGCCTCGTAGACATCGAGCACAGCAGCGAGCTTCTCCTCGCTCTCCCTGATCAGCTTCT
CGTCAGATGGGAATCCCATGACTGATGCGAACATG*TGTGGAGGGTTAGGTTAAGGAGGG
GTGGGTGGAAAGTGGTGGCCTCAACGTCGAGCCATTGCTCAACTTGACCTCTGTCTTCAA
CGGTTTTGCCCAAAAGGTCAGGTCCTTGTGACCTGTACTTCTCAGCTACATACCTCATCA
CGGCACGTGACTCGAAGATCTTGTAGTCACCGTCGACAACAGCAGGAACGGTACCGAAAG
GCTGTAAGGCGAGATAAGCAGGCTGCTTGTGCTCTCCTTTCATGAGATCGACGGGGATGG
TCTCGAAGGGAACGCCCTTCTCGATAAGCGTTACCAGAGCACGCTTGGGTGAAGCAAAGT
GAGGTCCGTACACCTTTAGCACCATCTTTTCTCTCTTTTCTATTGCAAAACACACA**AA
CACAGTTGCTAAGCTTGTTAGTAAGTGAT
ATTCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2CL82TF 779 0 0
GAGTAC
TCTCAATAGTCTC*TTCCAGGCAGGACGGCTGCTAATATCATCCCACCACGCGCTCACGT
GCTTCCTGTCTTTGATCATGTAAGCCT*ACCGATGGGTCCAACCAAGTAATCAGTGAAAG
GGAGGTGAGCCAAATCAGCCAAGCTGACGAAGTCACCAGCCAAGTACTTGCTCTTGGAGA
GCTGTGCCTCGTAGACATCGAGCACAGCAGCGAGCTTCTCCTCGCTCTCCTTGATCAGCT
TCTCGTCAGATGGGAATCCCATGACTGATGCGAACATGATGTGGAGGGTTAGGTTAAGGA
GGGGTGGGTGGAAAGTGGTGGCCTCAACGTCGAGCCATTGCTCAACTTGACCTCTGTCTT
CAACGGTTTTGCCCAAAAGGTCAGGTCCTTGTGACCTGTACTTCTCAGCTACATACCTCA
TCACGGCACGTGACTCGAAGATCTTGTAGTCACCGTCGACAACAGCAGGAACGGTACCGA
AAGGCTGTAAGGCGAGGTAAGCAGGCTGCTTGTGCTCTCCTTTCATGAGATCGACGGGGA
TGGTCTCGAAGGGAACGCCCTTCTCGATAAGCGTTACCAGAGCACGCTTGGGTGAAGCAA
AGTGAGGTCCGTACACCTTTAGCACCATCTTTTCTCTCTTTTCTATTGCAAAACACACA*
*AACACAGTTGCTAAGCTTGTTAGTAAGTGATATTGACTCTGTGATGATGAGACGCCTTC
TTTATAGCGAGGAGCGGAGGCTTGGCAGATAGAGAGCGATCATTTATTTGTCC

QA 7 779 7 779
DS 



AS 3 15

CO CL161Contig1 949 10 12 U
GGGTTCCTTTGAGACCAATGCTCCTCCTTTTCTTCTTCATATAAACCACATATCCTCTCC
TCCATATCTTAACAATTTTATAGCAAACCCTAAAACTGAGTAAGAGAGAGAATTTGAGAG
AGAGAGAGAGAGATGGGTAGAGGCAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAAAACGCAAACAAC
AGAGTGGTGACGTTCTCAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTGAAGAAGGCCAAAGAAATCACT
GTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGAT
TATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGCTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGC
AAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAGCCTCAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAA
GAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCAGGCACTTGAAGGGGGAAGATATACAGTCTCTC
AACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGA
GACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAAAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGCGGAGGAG
AATAGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCTAGCAACGCAAGA
GGAATGATGATGAGGGATCATGATGGACAATTTGGATATAGAGTCCAGCCGATTCAGCCA
AATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATTGATTGATCTTCGAGATTTGTAATCTCA
TCAACAATCTACTACCTATTCCCTTTGTCTTTATGAATGTGTGTGTCTCCTTTCAATCTC
GAGCCGCCTATGTACTCCCTTCAGGACTTTTACTTAAGCTTATATTTGTGTTGTTTGCTT
ACGAAAACTCTATGTATGTGTTTTTT*GCTTAATTAAACGTTTGAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 20 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 15 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2BU14TF U 236
AF RR2CY84TF U 100
AF RR2AY93TFB U 454
AF RR2FB95TF U 34
AF RR2AD42TF U 1
AF RR2AO86TF U 72
AF RR2AD42JQ C 120
AF RR2AY93JQ C 195
AF RR2FB95JQ C 307
AF RR2AO86JQ C 359
BS 1 131 RR2AD42TF
BS 132 133 RR2FB95TF
BS 134 478 RR2AD42TF
BS 479 480 RR2FB95TF
BS 481 666 RR2AD42TF
BS 667 667 RR2FB95TF
BS 668 860 RR2AD42TF
BS 861 864 RR2AO86TF
BS 865 865 RR2AD42JQ
BS 866 888 RR2AO86TF
BS 889 939 RR2AD42JQ
BS 940 949 RR2AY93JQ

RD RR2BU14TF 103 0 0
TCACTGTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCCAGTAATGGTAAGATGA
CTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGCTGGA

QA 1 103 1 103
DS 

RD RR2CY84TF 472 0 0
GG
AAGAGAGAGAATTTGAGAGAGAGAGAGAGA**TGGGTAGAGGCAAGATAGAGATAAAGAG
GATAGAAAACGCAAACAACAGAGTGGTGACGTTCCCAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTGAA
GAAGGCCAAAGAAATCACTGTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAG
TAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGCTGGACCA
ATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAGCCTCAGCAATGA
GATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCAGGCACTTGAAGGG
GGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACA
CGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAAA

QA 3 472 3 472
DS 

RD RR2AY93TFB 163 0 0
TTGAAGGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCC
ATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAAAGG
AGAAATGAGAAAATGTTGGCGGAGGAGAATAGGCAACTCAGTT

QA 1 163 1 163
DS 

RD RR2FB95TF 757 0 0
G
CTTCATATAAACCACATATCCTCTCCTCCATATCTTAACAATTTTATAGCAAACCCTAAA
ACTGAGTAAGAGAGAGAATTTGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGGTAGAGGCAAGATAGAGA
TAAAGAGGATAGAAAACGCAAACAACAGAGTGGTGACGTTCTCAAAGAGGAGGAATGGGT
TGGTGAAGAAGGCCAAAGAAATCACTGTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATAGTCT
TTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGC
TGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAGCCTCA
GCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCAGGCACT
TGAAGGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCCA
TTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAAAGGA
GAAATGAGAAAATGTTGGCGGAGGAGAATAGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAACAGG
AGATGGCTATAGCTAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAGGGATCATGATGGACAATTTG
GATATAGAGTCCAGCCGATTCAGCCAAATCTTCAG*AAAAGATTATGTCTTTGGTCATTG
ATTGATCTTCGAGATTTGTAATCTCATCAACAATCT

QA 2 757 2 757
DS 

RD RR2AD42TF 860 0 0
GGGTTCCTTTGAGACCAATGCTCCTCCTTTTCTTCTTCATATAAACCACATATCCTCTCC
TCCATATCTTAACAATTTTATAGCAAACCCTAAAACTGAGTAAGAGAGAGAATTTGAGAG
AGAGAGAGAGA**TGGGTAGAGGCAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAAAACGCAAACAAC
AGAGTGGTGACGTTCTCAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTGAAGAAGGCCAAAGAAATCACT
GTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGAT
TATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGCTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGC
AAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAGCCTCAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAA
GAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCAGGCACTTGAAGGGGGAAGATATACAGTCTC**
AACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGA
GACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAAAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGCGGAGGAG
AATAGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCTAGCAACGCAAGA
GGAATGGTGATGAGGGATCATGATGGACAATTTGGATATAGAGTCCAGCCGATTCAGCCA
AATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATTGATTGATCTTCGAGATTTGTAATCTCA
TCAACAATCTACTACCTATTCCCTTTGTCTTTATGAATGTGTGTGTCTCCTTTCAATCTC
GAGCCGCCTATGTACTCCCT

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR2AO86TF 817 0 0
GG
AATTTTATAGCAAACCCTAAAACTGAGTAAGAGAGAGAATTTGAGAGAGAGAGAGAGA**
TGGGTAGAGGCAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAAAACGCAAACAACAGAGTGGTGACGT
TCTCAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTGAAGAAGGCCAAAGAAATCACTGTTCTTTGCGATG
CAAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTT
CCATGGATCTTGGTGCTATGCTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAACTATGGG
ATGCTAAGCATGAGAGCCTCAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAACT
TGCAACTTGAGCTCAGGCACTTGAAGGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACC
TGATGGCTGTAGAGCATGCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGG
AGTACCTCATGACAAAAAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGCGGAGGAGGATAGGCAACTCA
GTTTCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCTAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGA
GGGATCATGATGGACAAT**GGATATAGAGTCCAGCCGATTCAGCCAAATCTTCAGGAAA
AGATTATGTCTTTGGTCATTGATTGATCTTCGAGATTTGTAATCTCATCAACAATCTACT
ACCTATTCCCTTTGTCTTTATGAATGTGTGTGTCTCCTTTCAATCTCGAGCCGCCTATGT
ACTCCCTTCAG*ACTTTTACTTAAGCTTATATTTG

QA 3 817 3 817
DS 

RD RR2AD42JQ 820 0 0
GAGAGAGAGAGAGATGGGTAGAGGCAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAAAACGCAAACAA
CAGAGTGGTGACGTTCTCAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTGAAGAAGGCCAAAGAAATCAC
TGTTCTTTGCGATGCAAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGA
TTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGCTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGG
CAAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAGCCTCAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAA
AGAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCAGGCACTTGAAGGGGGAAGATATACAGTCTC*
*AACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCG
AGACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAAAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGCGGAGGA
GAATAGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCTAGCAACGCAAG
AGGAATGGTGATGAGGGATCATGATGGACAATTTGGATATAGAGTCCAGCCGATTCAGCC
AAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATTGATTGATCTTCGAGATTTGTAATCTC
ATCAACAATCTACTACCTATTCCCTTTGTCTTTATGAATGTGTGTGTCTCCTTTCAATCT
CGAGCCGCCTATGTACTCCCTTCAGGACTTTTACTTAAGCTTATATTTGTGTTGTTTGCT
TACGAAAACTCTATGTATGTGTTTTTT*GCTTAATTAAAC

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR2AY93JQ 755 0 0
CTCAAAGAGGAGGAATGGGTTGGTGAAGAAGGCCAAAGAAATCACTGTTCTTTGCGATGC
AAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTATTGTTGTCCTTC
CATGGATCTTGGTGCTATGCTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAACTATGGGA
TACTAAGCATGAGAGCCTCAGCAATGAGGTTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAACTT
GCAACTTGAGCTCAGGCACTTGAAGGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTAAAAAACCT
GATGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGA
GTACCTCATGACAAAAAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGCGGAGGAGAATAGGCAACTCAG
TTTCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCTAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAG
GGATCATGATGGACAATTTGGATATAGAGTCCAGCCGATTCAGCCAAATCTTCAGGAAAA
GATTATGTCTTTGGTCATTGATTGATTTTCGAGATTTGTAATTTCATCAACAATCCACTA
CCTATTCCCTTTGTCTTTATGAATGTGTGTGTCTCCTTTCAATCTCGAGCCGCCTATGTA
CTCCCTTCAGGACTTATACTTAAGCTTATATTTGTGTTGTTTGCTTACGAAAACTCTATG
TATGTGTTTTTTTGCTTAATCAAACGTTTGAAACT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2FB95JQ 643 0 0
TGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGCTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAAAAA
CTATGGGATGCTAAGCATGAGAGCCTCAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAAT
GATAACTTGCAACTTGAGCTCAGGCACTTGAAGGGGGAAGATATACAGTCTCTCAACTTA
AAAAACCTGATGGCCGTAGAGCATGCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCCGAGACCAC
CAGATGGAGTACCTCATGACAAAAAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGCGGAGGAGAATAGG
CAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCTAGCAACGCAAGAGGAATG
ATGATGAGGGATCATGATGGACAATTTGGATATAGAGTCCAGCCGATTCAGCCAAATCTT
CAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATTGATTGATCTTCGAGATTTGTAATCTCATCAACA
ATTTACTACCTATTCCCTTTGTCTTTATGAATGTGTGTGTCTCCTTTCAATCTCGAGCCG
CCTATGTACTCCCTTCAGGACTTTTACTTAAGCTTATATTTGTGTTGTTTGCTTACGAAA
ACTCTATGTATGTGTTTTTT*GCTTAATTAAACGTTTGAAACT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2AO86JQ 581 0 0
GCAAAAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAGCCTCAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGA
AAGAGAATGATAACTTGCAACTTGAGCTCAGGCACTTGAAGGGGGAAGATATACAGTCTC
TCAACTTAAAAAACCTGATGGCTGTAGAGCATGCCATTGAACACGGCCTAGACAAAGTCC
GAGACCACCAGATGGAGTACCTCATGACAAAAAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGCGGAGG
AGGATAGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCTAGCAACGCAA
GAGGAATGATGATGAGGGATCATGATGGACAAT**GGATATAGAGTCCAGCCGATTCAGC
CAAATTTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATTGATTGATTTTCGAGATTTGTAATTT
CATCAACAATTTACTACCTATTCCCTTTGTCTTTATGAATGTGTGTGTCTCCTTTCAATC
TCGAGCCGCCTATGTACTCCCTTCAGGACTTTTACTTAAGCTTATATTTGTGTTGTTTGC
TTACGAAAACTCTATGTATGTGTTTTTT*GCTTAATTAAAC

QA 1 581 1 581
DS 



CO CL161Contig2 918 3 2 U
GGATAGCAAAACCTAAAATTGAGAAAAGAGAGCTAGAGAGAGAAAGATGGGAAGAGGGAA
GATAGAGATAAAAAGGATAGAAAACGCAAACAACAGAGTGGTGACTTTCTCAAAGAGGAG
GAATGGGTTGGTGAAGAAGGCTAAAGAGATCACTGTCCTCTGCGATGCAAAAGTTGCTCT
CATAATCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGACTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGG
TGCTATGTTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAGAAACTATGGGATACTAAGCATGA
GAACCTCAACAATGAAATTGATAGGATCAAAAAAGAGAATGACAGCTTACAACTGGAACT
CAGGCATTTGAAGGGGGAAGATATACAATCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGA
ACATGCCATTGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTTC**CATTAC
AAAGAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGTGGAGGAGAATCGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCA
ACAACAAGAGATGGCTATAGCTAGCAACACAAGAGGAATGATGATGAGAGATCAAGATGA
GCAATTTGGATATATAGTTCAGCCGATTCAACCAAATCTACAGGAAAAGATTATGTCTTT
GGTCATCGACTGATCATCAAGATTTGCAAGCTCATAACCCATCTACTATCTATTTCATGG
TCCCTTAATTTGTCTTTATGAATGTGTGTGTCCTATTAATCTCGAGCCATATATAGACTC
TCTATCGGACTTTTTTAGACTCTCTATCGGACTTTTACTTATGCTTTTATGTGTGTGGTT
TACTTATGTAGGTGTTAATCGGGTTGTACTCAGTGGCGAATCTAGAAAACTTTTGTAGTG
GATGCATAACTTAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE27TF U 1
AF RR2BE27JQ C 418
AF RR2GC89TF U 286
BS 1 796 RR2BE27TF
BS 797 918 RR2GC89TF

RD RR2BE27TF 801 0 0
GGATAGCAAAACCTAAAATTGAGAAAAGAGAGCTAGAGAGAGAAAGATGGGAAGAGGGAA
GATAGAGATAAAAAGGATAGAAAACGCAAACAACAGAGTGGTGACTTTCTCAAAGAGGAG
GAATGGGTTGGTGAAGAAGGCTAAAGAGATCACTGTCCTCTGCGATGCAAAAGTTGCTCT
CATAATCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGACTATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGG
TGCTATGTTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAGAAACTATGGGATACTAAGCATGA
GAACCTCAACAATGAAATTGATAGGATCAAAAAAGAGAATGACAGCTTACAACTGGAACT
CAGGCATTTGAAGGGGGAAGATATACAATCTCTCAACTTAAAAAACCTGATGGCCGTAGA
ACATGCCATTGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGTTC**CATTAC
AAAGAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGTGGAGGAGAATCGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCA
ACAACAAGAGATGGCTATAGCTAGCAACACAAGAGGAATGATGATGAGAGATCAAGATGA
GCAATTTGGATATATAGTTCAGCCGATTCAACCAAATCTACAGGAAAAGATTATGTCTTT
GGTCATCGACTGATCATCAAGATTTGCAAGCTCATAACCCATCTACTATCTATTTCATGG
TCCCTTAATTTGTCTTTATGAATGTGTGTGTCCTATTAATCTCGAGCCATATATAGACTC
TCTATCGGACTTTTTT
AAAAG

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2BE27JQ 379 0 0
AGAA
CATGCCATTGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGGGACCACCAGATGGAGTTC**CATTACA
AAGAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGTGGAGGAGAATCGGCAACTCAGTTTCCAGCTGCAA
CAACAAGAGATGGCTATAGCTAGCAACACAAGAGGAATGATGATGAGAGATCAAGATGAG
CAATTTGGATATATAGTTCAGCCGATTCAACCAAATCTACAGGAAAAGATTATGTCTTTG
GTCATCGACTGATCATCAAGATTTGCAAGCTCATAACCCATCTACTATCTATTTCATGGT
CCCTTAATTTGTCTTTATGAATGTGTGTGTCCTATTAATCTCGAGCCATATATAGACTCT
CTATCGGACTTTTTT

QA 5 379 5 379
DS 

RD RR2GC89TF 633 0 0
GGATACTAAGCATGAGAACCTCAACAATGAAATTGATAGGATCAAAAAAGAGAATGACAG
CTTACAACTGGAACTCAGGCATTTGAAGGGGGAAGATATACAATCTCTCAACTTAAAAAA
CCTGATGGCCGTAGAACATGCCATTGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGACCACCAGAT
GGAGTTCCTCATGACAAAGAGGAGAAATGAGAAAATGTTGGTGGAGGAGAATCGGCAACT
CAGTTTCCAGCTGCAACAACAAGAGATGGCTATAGCTAGCAACACAAGAGGAATGATGAT
GAGAGATCAAGATGAGCAATTTGGATATAGAGTTCAGCCGATTCAACCAAATCTACAGGA
AAAGATTATGTCTTTGGTCATCGACTGATCATCAAGATTTGCAAGCTCATAACCCATCTA
CTATCTATTTCATGGTCCCTTAATTTGTCTTTATGAATGTGTGTGTCCTATTAATCTCGA
GCCATATATAGACTCTCTATCGGACTTTTTTAGACTCTCTATCGGACTTTTACTTATGCT
TTTATGTGTGTGGTTTACTTATGTAGGTGTTAATCGGGTTGTACTCAGTGGCGAATCTAG
AAAACTTTTGTAGTGGATGCATAACTTAAAAAA

QA 1 633 1 633
DS 



CO CL161Contig3 599 2 1 U
GGATCACTGTTCCTTTAAGACCAGTGCTCTTCCTTTTCTTCTCCATATAAACCACATATC
CTCGCCTCCATATCTTAACAATTTCTCATAGAACCCTAAAAACTGAGAAAAGAGAGCTAG
AGAGAGAAAGATGGGAAGAGGGAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAGAACGTAAACAACAG
AGTGGTGACGTTCTCAAAAAGGAGGAATGGGTTGGTTAAGAAGGCGAAAGAGATCACAGT
TCTCTGTGATGCAAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTA
TTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGTTGGACCAATACCAGAAGCTATCTGGCAA
GAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTCAACAATGAGATTGATATGATTAAAAAGGA
GAATGATAGCTTACAACTGGAGCTCAGGCATTTGAAAGGGGAAGATATACAGTCTCTCAA
CTTAAAAAACTTGATGGCCGTAGAGCATGGCGTTGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGA
CCACCAGATGGAGTTCCTTATGACAAAGAGGAGAAACGAGAAAATGATGGTGGAGGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY91TF U 299
AF RR2H321TF U 1
BS 1 599 RR2H321TF

RD RR2DY91TF 119 0 0
G
ATTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGTTGGACCAATACCAGAAGCTATCTGGCA
AGAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTCAACAATGAGATTGATATGATTAAAAA

QA 2 119 2 119
DS 

RD RR2H321TF 599 0 0
GGATCACTGTTCCTTTAAGACCAGTGCTCTTCCTTTTCTTCTCCATATAAACCACATATC
CTCGCCTCCATATCTTAACAATTTCTCATAGAACCCTAAAAACTGAGAAAAGAGAGCTAG
AGAGAGAAAGATGGGAAGAGGGAAGATAGAGATAAAGAGGATAGAGAACGTAAACAACAG
AGTGGTGACGTTCTCAAAAAGGAGGAATGGGTTGGTTAAGAAGGCGAAAGAGATCACAGT
TCTCTGTGATGCAAAAGTTGCTCTCATAGTCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGACTGATTA
TTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGTTGGACCAATACCAGAAGCTATCTGGCAA
GAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTCAACAATGAGATTGATATGATTAAAAAGGA
GAATGATAGCTTACAACTGGAGCTCAGGCATTTGAAAGGGGAAGATATACAGTCTCTCAA
CTTAAAAAACTTGATGGCCGTAGAGCATGGCGTTGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGA
CCACCAGATGGAGTTCCTTATGACAAAGAGGAGAAACGAGAAAATGATGGTGGAGGAGA

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 14

CO CL162Contig1 831 14 35 U
GGGCATCTGTGGAGGTTTCTTCTTTCTACCGACG*AAAATGGGCGCTTTCAGGTTTCACC
AGTACCAGGTTGTAGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTCCAACCTAAGATTTACC
GGATGAAGCTATGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGA
GGAAGCTGAAGAAGGTGAAGAAGAGCAATGGTCAGATGCTCGCCATCAACGAGATCTTTG
AGAAGAACCCAACAACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTG
GATACCACAACATGTACAAGGAGTACCGCGACACCACCTTGAACGGAGCCGTGGAACAGA
TGTACACCGAGATGGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGA
CGGCGACTGTTCCAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCA
AAATCAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGCAAGGTCAGACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCA
CCTACAAGGCCTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAACAGTGTCTCTCTCTCTCTGATT
GACCGACGACTTCACATAAAACCTTTTTGTTT**GGGTGATAGAGAATCTTGATGATGGA
AGTTATCTGCTGTTTTGTTTTTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTTATCAACA***TTTTAG
TATTATTCATGGAACTAAACTCGACTTCGTCTTG*ATTTTGTGGTTCTTGCTTCTTCTTT
ATTTAGACAAAGTCCCTTTCTTTCTTGATTCCTAAGTTATCTCTTTATTAG


BQ
10 25 25 25 25 25 0 25 30 30 0 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 45 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 75 45 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 60 35 75 75 5 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 
65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 0 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 30 45 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H426TF U 2
AF RR2H912TF U 138
AF RR2G849TF U 9
AF RR2EA65TF U 2
AF RR2AI43TF U 11
AF RR2FX03TF U 11
AF RR2FX03JQ C 240
AF RR2G862TF U 2
AF RR2G862JQ C 370
AF RR2H426JQB C 35
AF RR2B387JQ C 11
AF RR2B387TF U 11
AF RR2A990TF U 1
AF RR2H912JQ C 251
BS 1 6 RR2A990TF
BS 7 7 RR2G862TF
BS 8 10 RR2A990TF
BS 11 12 RR2AI43TF
BS 13 34 RR2A990TF
BS 35 35 RR2EA65TF
BS 36 40 RR2A990TF
BS 41 41 RR2EA65TF
BS 42 130 RR2A990TF
BS 131 131 RR2AI43TF
BS 132 157 RR2A990TF
BS 158 158 RR2EA65TF
BS 159 328 RR2A990TF
BS 329 329 RR2EA65TF
BS 330 424 RR2A990TF
BS 425 425 RR2EA65TF
BS 426 427 RR2A990TF
BS 428 428 RR2EA65TF
BS 429 444 RR2A990TF
BS 445 445 RR2EA65TF
BS 446 484 RR2A990TF
BS 485 485 RR2EA65TF
BS 486 581 RR2A990TF
BS 582 583 RR2FX03TF
BS 584 629 RR2A990TF
BS 630 630 RR2AI43TF
BS 631 632 RR2A990TF
BS 633 634 RR2AI43TF
BS 635 639 RR2A990TF
BS 640 640 RR2FX03TF
BS 641 711 RR2A990TF
BS 712 714 RR2FX03TF
BS 715 754 RR2A990TF
BS 755 755 RR2FX03TF
BS 756 831 RR2A990TF

RD RR2H426TF 280 0 0
GGCATCTGTTTAGGTTTCTTCTTTCTACCGACG*AAAATGGGCGCTTTCAGGTTTCACCA
GTACCAGGTTGTAGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTCCAACCTAAGATTTACCG
GATGAAGCTATGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAG
GAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGCAACGGTCAGATGCTCGCTATCAACGAGATCTTTGA
GAAGAACCCAACAACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTG

QA 1 280 1 280
DS 

RD RR2H912TF 339 0 0
ACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAGGAAGCTGAAGAAGGTG
AAGAAGAGCAATGGTCAGATGCTCGCCATCAACGAGATCTTTGAGAAGAACCCAACAACC
ATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGGATACCACAACATGTAC
AAGGAGTACCGCGACACCACCTTGAACGGAGCCGTGGAACAGATGTACACCGAGATGGCG
TCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGACGGCGACCGTTCCAGCC
AAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAAC

QA 1 339 1 339
DS 

RD RR2G849TF 462 0 0
GTTTAGGTTTCTTCTTTCTACCGACG*AAAATGGGCGCTTTCAGGTTTCACCAGTACCAG
GTTGTAGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTCCAACCTAAGATTTACCGGATGAAG
CTATGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAGGAAGCTG
AAGAAGGTCAAGAAGAGCAACGGTCAGATGCTCGCTATCAACGAGATCTTTGAGAAGAAC
CCAACAACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGGATACCAC
AACATGTACAAGGAGTACCGCGACACCACCTTGAACGGAGCCGTGGAACAGATGTACACC
GAGATGGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGACGGCGACT
GTACCAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTC

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2EA65TF 543 0 0
GGCATTTGTTTAGGTTTCTTCTTTCTACCGACG*AAAATGGGCGCTTTCAGGTTTCACCA
GTACCAGGTTGTTGGAAGAGCTCTCCTGACAGAGAAGGATGTCCAGCCTAAGATTTACCG
GGTGAAGCTCTGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAATTTCTGGTACTTCTTGAG
GAAGCTGAAGAAGGTGAAGAAGAGCAATGGTCAGATGCTCGCCATCAACGAGATCTTTGA
GAAGAACCCAACAACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGG
ATACCACAACATGTACAAGGAGT*CCGCGACACCACCTTGAACGGAGCCGTGGAACAGAT
GTACACCGAGATGGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTCCCCTTGCATCCAGATCATCAAGAC
GGCGACTGTTCCAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCAA
AATCAAGTTCCCATTGGTGTTCCGCAAGGTCAGACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCAC
CTA

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2AI43TF 662 0 0
GGAGGTTTCTTCTTTCTACCGACG*AAAATGGGCGCTTTCAGGTTTCACCAGTACCAGGT
TGTAGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTCCAACCTAAGATTTACCGGATGAAGCT
ATGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAGGAAGCTGAA
GAAGGTGAAGAAGAGCAATGGTCAGATGCTCGCCATCAACGAGATCTTTGAGAAGAACCC
AACAACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGGATACCACAA
CATGTACAAGGAGTACCGCGACACCACCTTGAACGGAGCCGTGGAACAGATGTACACCGA
GATGGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGACGGCGACCGT
TCCAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCAAAATCAAGTT
CCCCTTGGTGTTCCGCAAGGTCAGACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCACCTACAAGGC
CTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAACAG**TCTCTCTCTCT**GATTGACCGACGAC
TTCACATAAAACCTTTTTGTTT**GGGTGTTAGAGAATCTTGATGATGGAAGTTATCTGC
TG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2FX03TF 771 0 0
GGAGGTTTCTTCTTTCTACCGACA*AAAATGGGCGCTTTCAGGTTTCACCAGTACCAGGT
TGTAGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTCCAACCTAAGATTTACCGGATGAAGCT
ATGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAGGAAGCTGAA
GAAGGTCAAGAAGAGCAACGGTCAGATGCTCGCTATCAACGAGATCTTTGAGAAGAACCC
AACAACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGGATACCACAA
CATGTACAAGGAGTACCGCGACACCACCTTGAACGGAGCCGTGGAACAGATGTACACCGA
CATGGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGACGGCGACTGT
ACCAGCCAAGCCTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCAAAATCAAGTT
CCCCTTGGTGTTCCGCAAGGTCAGACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCACCTACAAGGC
CTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAACAGTGTCTCTCTCTCTCTGATTGACCGACGAC
TTCACATAAAACCTTTTTGTTT**GGGTGATAGAGAATCTTGATGATGGAAGTTATCTGC
TGTTTTGTTTTTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTTATCAACA***TTTTAGTATTATTCAT
GGAACTAAACTCGACTTTGTCTTG*ATTTTGTGGTTCTTGCTTCTTT
TTTA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2FX03JQ 546 0 0
GAGAAGAACCCAACAACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACT
GGATACCACAACATGTACAAGGAGTACCGCGACACCCCCTTGAACGGAGCCGTGGAACAG
ATGTACACCGACATGGGGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAG
ACGGGGACTGTACCAGCCAAGCCTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGC
AAAATCAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGCAAGGTCAGACCCCCAACCAGGAAGCTCAAGACC
ACCTACAAGGCCTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAACAGTGTCTCTCTCTTTTTGAT
TGACCGACGACTTCACATAAAACCTTTTTGTTT**GGGTGATAGAGAATTTTGATGATGG
AAGTTATTTGCTGTTTTGTTTTTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTTATCAACA***TTTTA
GTATTATTCATGGAACTAAACTCGACTTTGTCTTG*ATTTTGTGGTTCTTGCTTCTT
TATTTAGAC

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2G862TF 736 0 0
GGCATCTGTTTAGGTTTCTTCTTTCTACCGACG*AAAATGGGCGCTTTCAGGTTTCACCA
GTACCAGGTTGTAGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTCCAACCTAAGATTTACCG
GATGAAGCTATGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAG
GAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGCAACGGTCAGATGCTCGCTATCAACGAGATCTTTGA
GAAGAACCCAACAACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGG
ATACCACAACATGTACAAGGAGTACCGCGACACCACCTTGAACGGAGCCGTGGAACAGAT
GTACACCGAGATGGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGAC
GGCGACTGTACCAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCAA
AATCAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGCAAGGTCAGACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCAC
CTACAAGGCCTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAACAGTGTCTCTCTCTCTCTGATTG
ACCGACGACTTCACATAAAACCTTTTTGTTT**GGGTGATAGAGAATCTTGATGATGGAA
GTTATCTGCTGTTTTGTTTTTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTTATCAACA***TTTTAGT
ATTATTCATGGAACTA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2G862JQ 367 0 0
AGATGGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGACGGCGACTG
TACCAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCAAAATCAAGT
TCCCCTTGGTGTTCCGCAAGGTCAGACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCACCTACAAGG
CCTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAACAGTGTCTCTCTCTCTCTGATTGACCGACGA
CTTCACATAAAACCTTTTTGTTT**GGGTGATAGAGAATCTTGATGATGGAAGTTATCTG
CTGTTTTGTTTTTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTTATCAACA***TTTTAGTATTATTCA
TGGAACT

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR2H426JQB 702 0 0
GAAAATGGGCGCTTTCAGGTTTCACCAGTACCAGGTTGTAGGAAGAGCTCTCCCGACAGA
GAAGGATGTCCAACCTAAGATTTACCGGATGAAGCTATGGGCCACGAACGAGGTTCGTGC
CAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGCAACGGTCA
GATGCTCGCTATCAACGAGATCTTTGAGAAGAACCCAACAACCATCAAGAACTTCGGAAT
CTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGGATACCACAACATGTACAAGGAGTACCGCGACAC
CACCTTGAACGGAGCCGTGGAACAGATGTACACCGAGATGGCGTCGAGACACCGTGTCAG
GTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGACGGCGACTGTACCAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGA
GAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCAAAATCAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGCAAGGTCAG
ACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCACCTACAAGGCCTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTG
AAAACAGTGTCTCTCTCTCTCTGATTGACCGACGACTTCACATAAAACCTTTTTGTTT**
GGGTGATAGAGAATCTTGATGATGGAAGTTATCTGCTGTTTTGTTTTTCTTTTCAAGGAT
ATTTTTCTTTATCAACA***TTTTAGTATTATTCATGGAACT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2B387JQ 744 0 0
GGAGGTTTCTTCTTTCTACCGACGGAAAATGGGCGCTTTCAGGTTTCACCAGTACCAGGT
TGTAGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTCCAACCTAAGATTTACCGGATGAAGCT
CTGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAGGAAGCTGAA
GAAGGTGAAGAAGAGCAATGGTCAGATGCTCGCCATCAACGAGATCTTTGAGAAGAACCC
AACAACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGGATACCACAA
CATGTACAAGGAGTACCGTGACACCACCTTGAACGGAGCCGCGGAACAGATGTACACCGA
GATGGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGACGGCTACCGT
TCCAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCAAAATCAAGTT
CCCCTTTGTGTTCCGCAAGGTCAGACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCACCTACAAGGC
CTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAACAG**TCTCTCTCTCTCTGATTGACCGACGAC
TTCACATAAAACCTTTTTGTTT**GGGTGTTAGAGAATCTTGATGATGGAAGTTATCTGC
TGTTTTGTTTTTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTTATCAACAACATTTTAGTATTATTCAT
GGAACTAAACTCGACTTCGTCTTG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2B387TF 744 0 0
GGAGGTTTCTTCTTTCTACCGACGGAAAATGGGCGCTTTCAGGTTTCACCAGTACCAGGT
TGTAGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTCCAACCTAAGATTTACCGGATGAAGCT
CTGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAGGAAGCTGAA
GAAGGTGAAGAAGAGCAATGGTCAGATGCTCGCCATCAACGAGATCTTTGAGAAGAACCC
AACAACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGGATACCACAA
CATGTACAAGGAGTACCGTGACACCACCTTGAACGGAGCCGCGGAACAGATGTACACCGA
GATGGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGACGGCTACCGT
TCCAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCAAAATCAAGTT
CCCCTTTGTGTTCCGCAAGGTCAGACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCACCTACAAGGC
CTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAACAG**TCTCTCTCTCTCTGATTGACCGACGAC
TTCACATAAAACCTTTTTGTTT**GGGTGTTAGAGAATCTTGATGATGGAAGTTATCTGC
TGTTTTGTTTTTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTTATCAACAACATTTTAGTATTATTCAT
GGAACTAAACTCGACTTCGTCTTG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2A990TF 831 0 0
GGGCATTTGTTTAGGTTTCTTCTTTCTACCGACGGAAAATTGGCGCTTTCAGGTTTCACC
AGTACCAGGTTGTAGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTCCAACCTAAGATTTACC
GGATGAAGCTCTGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAATCCAAGTTCTGGTACTTCTTGA
GGAAGCTGAAGAAGGTGAAGAAGAGCAATGGTCAGATGCTCGCCATCAACGAGATCTTTG
AGAAGAACCCAACAACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTG
GATACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACCACCTTGAACGGAGCCGTGGAACAGA
TGTACACCGAGATGGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGA
CGGCTACCGTTCCAGCCAAGCTTTTCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCA
AAATTAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGCAAGGTCAGACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCA
CCTACAAGGCCTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAACAG**TCTCTCTCTCTCTGATT
GACCGACGACTTCACATAAAACCTTTTTGGTTTGGGGTGTTAGAGAATCTTGATGATGGA
AGTTATCTGCTGTTTTGTTTTTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTTATCAACAACATTTTAG
TATTATTCATGGAACTAAACTCGACTTCGTCTTGGATTTTGTGGTTCTTGCTTCTTCTTT
ATTTAGACAAAGTCCCTTTCTTTCTTGATTCCTAAGTTATCTCTTTATTAG

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR2H912JQ 550 0 0
AACAACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGGATACCACAA
CATGTACAAGGAGTACCGCGACACCACCTTGAACGGAGCCGTGGAACAGATGTACACCGA
GATGGCGTCGAGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATCAAGACGGCGACCGT
TCCAGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTCCACAACAGCAAAATCAAGTT
CCCCTTGGTGTTCCGCAAGGTCAGACCACCAACCAGGAAGCTCAAGACCACCTACAAGGC
CTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAATAG**TCTCTCTCTCTCTGATTGACCGACGAC
TTCACATAAAACCTTTTTGTTT**GGGTGTTAGAGAATCTTGATGATGGAAGTTATCTGC
TGTTTTGTTTTTCTTTTCAAGGATATTTTTCTTTATCAACAACATTTTAGTATTATTCAT
GGAACTAAACTCGACTTCGTCTTG*ATTTTGTGGTTCTTGCTTCTTCTTTATTTAGACA
AAGTCCCTTTC

QA 1 539 1 539
DS 



AS 2 17

CO CL163Contig1 628 9 5 U
GGATAACAATAATATCCAAATCAGTAAACTAATCTCCTAAAACAACAAGAAAAAATGCAG
GGAGCTTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTT*CTCCAAA
GATAACTCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAAGGTTCAAGACTCTCATC
TCTTAGATCAAATGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTC
CCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGC
TGACATCTACCCTGAGGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTC
CGAGAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTTTCGTGGCGGA
GGCCTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGATATCAAAAAGATGTCTAGTA
GAAGAAGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATA
TAAGCTAGCTTCACTTAATCAAGACTGAAATTGTGAATCAAACCCCAAGTTTCCAAAGTT
AATAAAACAGTAATGATTTATCAACACA


BQ
30 30 20 20 35 15 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 10 10 10 10 

AF RR2A808JQ C 1
AF RR2A808TF U 1
AF RR2FA76JQ C 1
AF RR2BK68TF U 3
AF RR2FA76TF U 1
AF RR2DM54TF U 5
AF RR2GJ89JQB C 142
AF RR2GJ89TF U 6
AF RR2G741TF U 6
BS 1 539 RR2A808TF
BS 540 567 RR2BK68TF
BS 568 575 RR2FA76TF
BS 576 624 RR2DM54TF
BS 625 628 RR2G741TF

RD RR2A808JQ 539 0 0
GGATAACAATAATATCCAAATCAGTAAACTAATCTCCTAAAACAACAAGAAAAAATGCAG
GGAGCTTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTT*CTCCAAA
GATAACTCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAAGGTTCAAGACTCTCATC
TCTTAGATCAAATGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTC
CCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGC
TGACATCTACCCTGAGGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTC
CGAGAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTTTCGTGGCGGA
GGCCTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGATATCAAAAAGATGTCTAGTA
GAAGAAGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATAT

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2A808TF 539 0 0
GGATAACAATAATATCCAAATCAGTAAACTAATCTCCTAAAACAACAAGAAAAAATGCAG
GGAGCTTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTT*CTCCAAA
GATAACTCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAAGGTTCAAGACTCTCATC
TCTTAGATCAAATGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTC
CCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGC
TGACATCTACCCTGAGGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTC
CGAGAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTTTCGTGGCGGA
GGCCTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGATATCAAAAAGATGTCTAGTA
GAAGAAGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATAT

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2FA76JQ 575 0 0
GGATAACAATAATATCCAAATCAGTAAACTAATCTCCTAAAACAACAAGAAAAAATGCAG
GGAGCTTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTT*CTCCAAA
GATAACTCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAAGGTTCAAGACTCTCATC
TCTTAGATCAAATGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTC
CCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGC
TGACATCTACCCTGAGGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTC
CGAGAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTTTCGTGGCGGA
GGCCTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGATATCAAAAAGATGTCTAGTA
GAAGAAGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATA
TAAGCTAGCTTCACTTAATCAAGACTGAAATTGTG

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2BK68TF 565 0 0
GGAACAATAATATCCAAATCAGTAAACTAATCTCCTAAAACAACAAGAAAAAATGCAGGG
AGCTTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTT*CTCCAAAGA
TAACTCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAAGGTTCAAGACTCTCATCTC
TTAGATCAAATGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCC
TCCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGCTG
ACATCTACCCTGAGGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTCCG
AGAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTTTCGTGGCGGAGG
CCTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGATATCAAAAAGATGTCTAGTAGA
AGAAGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATATA
AGCTAGCTTCACTTAATCAAGACTG

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2FA76TF 575 0 0
GGATAACAATAATATCCAAATCAGTAAACTAATCTCCTAAAACAACAAGAAAAAATGCAG
GGAGCTTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTT*CTCCAAA
GATAACTCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAAGGTTCAAGACTCTCATC
TCTTAGATCAAATGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTC
CCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGC
TGACATCTACCCTGAGGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTC
CGAGAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTTTCGTGGCGGA
GGCCTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGATATCAAAAAGATGTCTAGTA
GAAGAAGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATA
TAAGCTAGCTTCACTTAATCAAGACTGAAATTGTG

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2DM54TF 620 0 0
G
GGAATAATATCCAAATCAGTAAACTAATCTCCTAAAACAACAAGAAAAAATGCAGGGAGC
TTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTT*CTCCAAAGATAA
CTCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAAGGTTCAAGACTCTCATCTCTTA
GATCAAATGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCC
TTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGCTGACA
TCTACCCTGAGGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTCCGAGA
ACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTTTCGTGGCGGAGGCCT
GCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGATATCAAAAAGATGTCTAGTAGAAGA
AGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATATAAGC
TAGCTTCACTTAATCAAGACTGAAATTGTGAATCAAACCCCAAGTTTCCAAAGTTAATAA
AACAGTAATGATTTATCAA

QA 2 620 2 620
DS 

RD RR2GJ89JQB 484 0 0
TCAGACCATCACAAACACTAAAGGTTCAAGACTCTCATCTCTTAGATCAAATGCATCATC
TCCTACAACCTCTGATCCTCCCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTGTTTTCCCAGC
CGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGCTGACATTTACCCTGAGGTCAA
GCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTCCGAGAACGTAGACCGAGAATA
CCTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTTTCGTGGCGGAGGCCTGCGATGATCTCGGAGG
AGAGTTCTGTGAACCTGGATATCAAAAAGATGCCTAGTAGAAGAAGCAAGATTTGATGTG
ATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATATAAGCTAGCTTCACTTAATCA
AGACTGAAATTGTGAATCAAACCCCAAGTTTCCAAAGTTAATAAAACAGTAATGATTTAT
CA
GC

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR2GJ89TF 619 0 0
GGAATAATATCCAAATCAGTAAACTAATCTCCTAAAACAACAAGAAAAAATGCAGGGAGC
TTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTT*CTCCAAAGATAA
CTCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAAGGTTCAAGACTCTCATCTCTTA
GATCAAATGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCCCACCGTTGACTATGACTCCCTCC
TTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGCTGACA
TCTACCCTGAGGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTCCGAGA
ACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTTTCGTGGCGGAGGCCT
GCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGATATCAAAAAGATGCCTAGTAGAAGA
AGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATATAAGC
TAGCTTCACTTAATCAAGACTGAAATTGTGAATCAAACCCCAAGTTTCCAAAGTTAATAA
AACAGTAATGATTTATCA
G

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2G741TF 623 0 0
GGAATAATATCCAAATCAGTAAACTAATCTCCTAAAACAACAAGAAAAAATGCAGGGAGC
TTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTTTCTCCAAAGATAA
CTCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAAGGTTCAAGACTCTCATCTCTTA
GATCAAATGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCC
TTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGCTGACA
TCTACCCTGAGGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTCCGAGA
ACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTTTCGTGGCGGAGGCCT
GCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGATATCAAAAAGATGTCTAGTAGAAGG
AGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATATAAGC
TAGCTTCACTTAATCAAGACTGAAATTGTGAATCAAACCCCAAGTTTCCAAAGTTAATAA
A*CAGTAATGATTTATCAACACA

QA 1 623 1 623
DS 



CO CL163Contig2 625 8 8 U
GGAACAATAATATCCAAATCAGTAAACTATCTCCTAAAACAACAACAAAAAAATGCAGGG
AGCTTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGAC
AACTCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAGGGTTCAAGACTTTCATCTCT
CAGACCAAACGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCT
CCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGTTCAGCTGA
CATCTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTCAGA
GAACAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCCAAAACTGTTTTCGTCGAGGA
GGCGTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTA
GAAGAAGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATA
AAGCTAGCGTCACTTAATCAAGACTGAAATTGTGAACCAAACCCCAAGTCTCCAAAGTAA
TAAAACAGTAAAGATTTATCAACAC


BQ
25 25 25 5 5 35 35 35 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 10 10 10 

AF RR2DV14JQ C 4
AF RR2DV14TF U 4
AF RR2CL47TF U 1
AF RR2AO92TF U 10
AF RR2CD96JQ C 1
AF RR2CD96TF U 1
AF RR2BM77TF U 7
AF RR2BM77JQ C 126
BS 1 5 RR2CL47TF
BS 6 220 RR2DV14TF
BS 221 221 RR2CL47TF
BS 222 557 RR2DV14TF
BS 558 576 RR2AO92TF
BS 577 620 RR2CD96TF
BS 621 622 RR2BM77TF
BS 623 625 RR2BM77JQ

RD RR2DV14JQ 556 0 0
GGAATAATATCCAAATCAGTAAACTATCTCCTAAAACAACAACAAAAAAATGCAGGGAGC
TTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGACAAC
TCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAGGGTTCAAGACTTTCATCTCTCAG
ACCAAACGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCGCCGTTGACTATGACTCCCTCCT
TTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGTTCAGCTGACAT
CTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTCAGAGAA
CAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCCAAAACTGTTTTCGTCGAGGAGGC
GTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTAGAA
GAAGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATAAAG
CTAGCGTCACTTAA
CC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2DV14TF 556 0 0
GGAATAATATCCAAATCAGTAAACTATCTCCTAAAACAACAACAAAAAAATGCAGGGAGC
TTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGACAAC
TCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAGGGTTCAAGACTTTCATCTCTCAG
ACCAAACGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCGCCGTTGACTATGACTCCCTCCT
TTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGTTCAGCTGACAT
CTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTCAGAGAA
CAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCCAAAACTGTTTTCGTCGAGGAGGC
GTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTAGAA
GAAGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATAAAG
CTAGCGTCACTTAA
CC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2CL47TF 556 0 0
GGAACAATAATATCCAAATCAGTAAACTATCTCCTAAAACAACAACAAAAAAATGCAGGG
AGCTTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGAC
AACTCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAGGGTTCAAGACTTTCATCTCT
CAGACCAAACGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCT
CCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGTTCAGCTGA
CATCTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTCAGA
GAACAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCCAAAACTGTTTTCGTCGAGGA
GGCGTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTA
GAAGAAGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATA
AAGCTAGCGTCACTTA

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2AO92TF 567 0 0
GG
ATCCAAATCAGTAAACTATCTCCTAAAACAACAACAAAAAAATGCAGGGAGCTTTGTGCA
TCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGACAACTCTTCTTC
TTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAGGGTTCAAGACTTTCATCTCTCAGACCAAACG
CATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTGTTT
TCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGTTCAGCTGACATCTACCCTG
AAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTCAGAGAGCAACGTAG
ACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCCAAAACTGTCTTCGTCGAGGAGGCGTGCGATG
ATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTAGAAGAAGCAAG
ATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATAAAGCTAGCGTC
ACTTAATCAAGACTGAAATTGTGAA

QA 3 567 3 567
DS 

RD RR2CD96JQ 620 0 0
GGAACAATAATATCCAAATCAGTAAACTATCTCCTAAAACAACAACAAAAAAATGCAGGG
AGCTTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGAC
AACTCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAGGGTTCAAGACTTTCATCTCT
CAGACCAAACGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCT
CCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGTTCAGCTGA
CATCTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTCAGA
GAACAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCCAAAACTGTTTTCGTCGAGGA
GGCGTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTA
GAAGAAGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATA
AAGCTAGCGTCACTTAATCAAGACTGAAATTGTGAACCAAACCCCAAGTCTCCAAAGTAA
TAAAACAGTAAAGATTTATC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2CD96TF 620 0 0
GGAACAATAATATCCAAATCAGTAAACTATCTCCTAAAACAACAACAAAAAAATGCAGGG
AGCTTTGTGCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGAC
AACTCTTCTTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAGGGTTCAAGACTTTCATCTCT
CAGACCAAACGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCT
CCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGTTCAGCTGA
CATCTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTCAGA
GAACAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCCAAAACTGTTTTCGTCGAGGA
GGCGTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTA
GAAGAAGCAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATA
AAGCTAGCGTCACTTAATCAAGACTGAAATTGTGAACCAAACCCCAAGTCTCCAAAGTAA
TAAAACAGTAAAGATTTATC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2BM77TF 619 0 0
GG
AATATCCAAATCAGTAAACTATCTCCTAAAACAACAACAAAAAAATGCAGGGAGCTTTGT
GCATCAAACCAACCATTCCTCCTCTTGCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGACAACTCTTC
TTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAGGGTTCAAGACTTTCATCTCTCAGACCAA
ACGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTG
TTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGTTCAGCTGACATCTACC
CTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTCAGAGAACAACG
TAGACCGAGAATACCCAGAGTATAACACCCCCAAAACTGTTTTCGTCGAGGAGGCGTGCG
ATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTAGAAGAAGC
AAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATAAAGCTAGC
GTCACTTAATCAAGACTGAAATTGTGAACCAAACCCCAAGTCTCCAAAGTAATAAAACAG
TAAAGATTTATCAA
CAC

QA 3 616 3 616
DS 

RD RR2BM77JQ 500 0 0
TTT
TTCTTCCTCCTCAGACCATCACAAACACTAAGGGTTCAAGACTTTCATCTTTCAGACCAA
ACGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTG
TTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGTTCAGCTGACATCTACC
CTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCGTCCCGTGACTTCTTCAGAGAACAACG
TAGACCGAGAATACCCAGAGTATAACACCCCCAAAACTGTTTTCGTCGAGGAGGCGTGCG
ATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTAGAAGAAGC
AAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATAAAGCTAGC
GTCACTTAATCAAGACTGAAATTGTGAACCAAACCCCAAGTCTCCAAAGTAATAAAACAG
TAAAGATTTATCAACAC

QA 4 500 4 500
DS 



AS 6 15

CO CL164Contig1 1052 2 4 U
GCCTCTTAACCCTAAAGCTAACAGGGAGAAGATGACTCAGATCATGTTCGAGACTTTCAA
TGTCCCTGCCATGTATGTTGCTATCCAGGCCGTTCTTTCTCTCTACGCTAGTGGGCGTAC
TACTGGTATTGTGCTCGACTCTGGTGATGGTGTGTCTCACACCGTGCCGATCTACGAGGG
TTATGCTCTTCCTCACGCTATCCTCCGTCTCGATCTTGCGGGTAGGGATCTCACTGATTC
TCTGACGAAGATTCTCACGGAGAGAGGTTACATGTTCACCACCACCGCCGAGCGAGAAAT
AGTCCGTGACATTAAAGAGAAACTTGCTTACGTGGCTCTCGACTACGAGCAAGAGCTGGA
GACGGCTAAGAGCAGCTCTTCGGTGGAGAAGAACTACGAGCTACCTGATGGACAAGTCAT
CACCATCGGAGCTGAAAGATTCCGTTGCCCTGAAGTACTCTTCCAGCCGTCGCTTGTCGG
GATGGAAGCCCCTGGAATCCATGAGACGACATACAACTCCATCATGAAGTGCGACGTGGA
TATCAGGAAGGATCTGTATGGAAACATCGTGCTCAGTGGTGGTTCGACCATGTTCCCAGG
AATCGCTGACCGTATGAGCAAGGAGATCACCGCGCTGGCACCAAGCAGCATGAAGATCAA
GGTGGTTGCACCGCCTGAGAGGAAATACAGTGTCTGGATTGGAGGATCTATCCTTGCATC
CCTCAGCACTTTCCAACAGATGTGGATCTCGAAGGGAGAGTACGATGAGTCGGGTCCATC
CATCGTCCACAGGAAATGCTTTTAAGGTGTTTCTTCTCTCGTTCGTGGTGGTATGAGTTT
GTTACGATCTCCCCTTGTTGAGATGGGGACTGAAACTATATGTTGTTATTGTGGTTGTTT
TTTTTTTTTGGTCTCTTTAGAACCTTTTGGATGTTTCTCGAGTCTTTCTATGTACTTTAG
TTTTATCTTTGTTTCTTTTTTCTCTTTAAGGATGCTTGTGATGATGCTTTGGTCCTTATT
AAGCAAAAAAAAAAGAAGTCATATTATATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ84TF U 1
AF RR2AJ84JQ C 457
BS 1 661 RR2AJ84TF
BS 662 662 RR2AJ84JQ
BS 663 735 RR2AJ84TF
BS 736 1052 RR2AJ84JQ

RD RR2AJ84TF 735 0 0
GCCTCTTAACCCTAAAGCTAACAGGGAGAAGATGACTCAGATCATGTTCGAGACTTTCAA
TGTCCCTGCCATGTATGTTGCTATCCAGGCCGTTCTTTCTCTCTACGCTAGTGGGCGTAC
TACTGGTATTGTGCTCGACTCTGGTGATGGTGTGTCTCACACCGTGCCGATCTACGAGGG
TTATGCTCTTCCTCACGCTATCCTCCGTCTCGATCTTGCGGGTAGGGATCTCACTGATTC
TCTGACGAAGATTCTCACGGAGAGAGGTTACATGTTCACCACCACCGCCGAGCGAGAAAT
AGTCCGTGACATTAAAGAGAAACTTGCTTACGTGGCTCTCGACTACGAGCAAGAGCTGGA
GACGGCTAAGAGCAGCTCTTCGGTGGAGAAGAACTACGAGCTACCTGATGGACAAGTCAT
CACCATCGGAGCTGAAAGATTCCGTTGCCCTGAAGTACTCTTCCAGCCGTCGCTTGTCGG
GATGGAAGCCCCTGGAATCCATGAGACGACATACAACTCCATCATGAAGTGCGACGTGGA
TATCAGGAAGGATCTGTATGGAAACATCGTGCTCAGTGGTGGTTCGACCATGTTCCCAGG
AATCGCTGACCGTATGAGCAAGGAGATCACCGCGCTGGCACCAAGCAGCATGAAGATCAA
G*TGGTTGCACCGCCTGAGAGGAAATACAGTGTCTGGATTGGAGGATCTATCCTTGCATC
CCTCAGCACTTTCCA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2AJ84JQ 596 0 0
ACTCTTCCAGCCGTCGCTTGTCGGGATGGAAGCCCCTGGAATCCATGAGACGACATACAA
CTCCATCATGAAGTGCGACGTGGATATCAGGAAGGATCTGTATGGAAACATCGTGCTCAG
TGGTGGTTCGACCATGTTCCCAGGAATCGCTGACCGTATGAGCAAGGAGATCACCGCGCT
GGCACCAAGCAGCATGAAGATCAAGGTGGTTGCACCGCCTGAGAGGAAATACAGTGTCTG
GATTGGAGGATCTATCCTTGCATCCCTCAGCACTTTCCAACAGATGTGGATCTCGAAGGG
AGAGTACGATGAGTCGGGTCCATCCATCGTCCACAGGAAATGCTTTTAAGGTGTTTCTTC
TCTCGTTCGTGGTGGTATGAGTTTGTTACGATCTCCCCTTGTTGAGATGGGGACTGAAAC
TATATGTTGTTATTGTGGTTGTTTTTTTTTTTTGGTCTCTTTAGAACCTTTTGGATGTTT
CTCGAGTCTTTCTATGTACTTTAGTTTTATCTTTGTTTCTTTTTTCTCTTTAAGGATGCT
TGTGATGATGCTTTGGTCCTTATTAAGCAAAAAAAAAAGAAGTCATATTATATTTG

QA 1 596 1 596
DS 



CO CL164Contig2 597 3 2 U
GACCAAATAGAATATGATAGTATATCTTTTTTGCTTAAGAAGGACAAAAAAAACCAGCAT
CATCACAAGCATCCTAAAGAGAAAATAATAAACAGAGGTAAACTAAAGTACACAGAGACT
CGAGAGAAGGTTTTTTTTTAAAAGACCCAAGAAAAAACAACAACCACATGACAACAGATA
GTTTCACTTCCCATCTCAACTTCGGGAAATAGATTTGTAAAACAACACTCACCACAAGAA
ACCACTTAAAAGCATTTCCTGTGGACAATCGACGGACCAGACTCATCGTACTCTCCCTTC
GAGATCCACATCTGTTGGAAAGTGCTGAGGGATGCAAGGATAGATCCTCCAATCCAGACA
CTGTATTTCCTCTCGGGCGGTGCGACCACCTTGATCTTCATGCTGCTTGGTGCCAGCGCC
GTGATCTCTTTGCTCATACGGTCAGCGATTCCTGGGAACATGGTTGAACCACCACTGAGC
ACGATGTTTCCATACAGATCCTTCCTGATATCCACGTCACACTTCATGATGGAGTTGTAA
GTCGTTTCATGGATTCCGGGGGCTTCCATTCCGATCAGCGATGGCTGGAAGAGTACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B303JQ U 1
AF RR2B303TF C 1
AF RR2DS72JQ U 45
BS 1 414 RR2B303JQ
BS 415 597 RR2DS72JQ

RD RR2B303JQ 414 0 0
GACCAAATAGAATATGATAGTATATCTTTTTTGCTTAAGAAGGACAAAAAAAACCAGCAT
CATCACAAGCATCCTAAAGAGAAAATAATAAACAGAGGTAAACTAAAGTACACAGAGACT
CGAGAGAAGGTTTTTTTTTAAAAGACCCAAGAAAAAACAACAACCACATGACAACAGATA
GTTTCACTTCCCATCTCAACTTCGGGAAATAGATTTGTAAAACAACACTCACCACAAGAA
ACCACTTAAAAGCATTTCCTGTGGACAATCGACGGACCAGACTCATCGTACTCTCCCTTC
GAGATCCACATCTGTTGGAAAGTGCTGAGGGATGCAAGGATAGATCCTCCAATCCAGACA
CTGTATTTCCTCTCGGGCGGTGCGACCACCTTGATCTTCATGCTGCTTGGTGCC

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR2B303TF 414 0 0
GACCAAATAGAATATGATAGTATATCTTTTTTGCTTAAGAAGGACAAAAAAAACCAGCAT
CATCACAAGCATCCTAAAGAGAAAATAATAAACAGAGGTAAACTAAAGTACACAGAGACT
CGAGAGAAGGTTTTTTTTTAAAAGACCCAAGAAAAAACAACAACCACATGACAACAGATA
GTTTCACTTCCCATCTCAACTTCGGGAAATAGATTTGTAAAACAACACTCACCACAAGAA
ACCACTTAGAAGCATTTCCTGTGGACAATCGACGGACCAGACTCATCGTACTCTCCCTTC
GAGATCCACATCTGTTGGAAAGTGCTGAGGGATGCAAGGATAGATCCTCCAATCCAGACA
CTGTATTTCCTCTCGGGCGGTGCGACCACCTTGATCTTCATGCTGCTTGGTGCC

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR2DS72JQ 553 0 0
CA
AAAAAAACCAGCATCATCACAAGCATCCTAAAGAGAAAATAATAAACAGAGGTAAACTAA
AGTACACAGAGACTCGAGAGAGGGTTTTTTTT*AAAAGACCCAAGAAAAAACAACAACCA
CATAACAACAGATAGTTTCACTTCCCATCTCAACTTCGGGAAATAGATTTGTAAAACAAC
ACTCACCACAAGAAACCACTTAAAAGCATTTCCTGTGGACAATCGACGGACCAAACTCAT
CGTACTCTCCCTTCAAGATCCACATCTGTTGGAAAGTGCTGAGGGATGCAAGGATAGATC
CTCCAATCCAGACACTGTATTTCCTCTCGGGCGGTGCGACCACCTTGATCTTCATGCTGC
TTGGGGCGAGCGCCGTGATCTCTTTGCTCATACGGTCAGCGATTCCTGGGAACATGGTTG
AACCACCACTGAGCACGATGTTTCCATACAGATCCTTCCTGATATCCACGTCACACTTCA
TGATGGAGTTGTAAGTCGTTTCATGGATTCCGGGGGCTTCCATTCCGATCAGCGATGGCT
GGAAGAGTACT

QA 3 553 3 553
DS 



CO CL164Contig3 970 4 37 U
AGAATACGATATATTTTTTTGCTTAATAAGGACAAAAAAACCAGCATCATCACAAAGCAT
CCTAAAGAGAAAATAATAAACAGAGGTAAAACTAAAGTACACAGAGACTCAAAAGAAGGT
TTTTTAAAAAGAGACCCAAGAAAAAACAACAACCACATAACAACAGATAGTTTCACTTCC
CATCTCAACTTCGGGAAATAGATTTTGTAAAACAACACTCACCACAAGAAACCACTTAGA
AGCATTTCCTGTGGACAATCGACGGACCAGACTCATCGTACTCTCCCTT*GGAGATCCAC
ATCTGTTGAAAAGTGCTGAGCGATGCAAGGATAGATCCTCCAATCCAGACACTGTATTTC
CTCTCGGGCGGTGCGACCACCTTGATCTTCATGCTGCTTGGTGCGAGCGCCGTGATCTCT
TTGCTCATACGGTCAGCGATTCCTGGGAACATGGTTGAACCACCACTGAGCACGATGTTT
CCATACAGATCCTTCCTGATATCCACGTCACACTTCATGATGGAGTTGTAAGTCGTTTCA
TGGATTCCAGGAGCTTCCATTCCGATCAGCGATGGCTGGAAGAGTACTTCAGGGCAACGG
AATCTCTCAGCTCCAATTGTGATGACTTGTCCATCAGGTAGCTCGTAGTTCTTCTCCACC
GAAGAACTGCTCTTAGCTGTCTCGAGCTCTTGCTCGAAGTCGAGAGCGACATAAGCAAGT
TTCTCTTTGATGTCACGGACAATTTCTCGCTCGGCGGTAGTGGTGAACATGTAACCTCTC
TCGGTGAGAATCTTCATTAGAGAATCCGTGAGATCCCTACCCGCAAGATCCAGACGAAGG
ATGGCATGGGGAAGAGCATAACCCTCGTAGATTGGCACAGTGTGAGACACACCATCACCA
GAGTCGAGCACAATACCGGTAGTACGCCCACTGGCGTAAAGAGAAAGAACGGCCTGAATG
GCAACATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B473JQ U 1
AF RR2AC55JQ U 80
AF RR2GI22TF C 214
AF RR2AC55TF C 230
BS 1 105 RR2B473JQ
BS 106 107 RR2AC55JQ
BS 108 112 RR2B473JQ
BS 113 113 RR2AC55JQ
BS 114 125 RR2B473JQ
BS 126 126 RR2AC55JQ
BS 127 143 RR2B473JQ
BS 144 145 RR2AC55JQ
BS 146 205 RR2B473JQ
BS 206 206 RR2AC55JQ
BS 207 239 RR2B473JQ
BS 240 240 RR2AC55JQ
BS 241 268 RR2B473JQ
BS 269 269 RR2AC55JQ
BS 270 308 RR2B473JQ
BS 309 309 RR2AC55JQ
BS 310 320 RR2B473JQ
BS 321 321 RR2AC55JQ
BS 322 365 RR2B473JQ
BS 366 366 RR2AC55JQ
BS 367 470 RR2B473JQ
BS 471 471 RR2AC55JQ
BS 472 473 RR2B473JQ
BS 474 474 RR2AC55JQ
BS 475 551 RR2B473JQ
BS 552 552 RR2AC55JQ
BS 553 566 RR2B473JQ
BS 567 567 RR2AC55JQ
BS 568 806 RR2B473JQ
BS 807 807 RR2AC55JQ
BS 808 817 RR2B473JQ
BS 818 818 RR2AC55JQ
BS 819 824 RR2B473JQ
BS 825 825 RR2AC55JQ
BS 826 835 RR2B473JQ
BS 836 945 RR2AC55JQ
BS 946 970 RR2AC55TF

RD RR2B473JQ 835 0 0
AGAATACGATATATTTTTTTGCTTAATAAGGACAAAAAAACCAGCATCATCACAAAGCAT
CCTAAAGAGAAAATAATAAACAGAGGTAAAACTAAAGTACACAGA**CTCAAGAGAAGGT
TTTTTTAAAAGAGACCCAAGAAA**ACAACAACCACATAACAACAGATAGTTTCACTTCC
CATCTCAACTTCGGGAAATAGATTT*GTAAAACAACACTCACCACAAGAAACCACTTAGG
AGCATTTCCTGTGGACAATCGACGGACCGGACTCATCGTACTCTCCCTT*GGAGATCCAC
ATCTGTTGGAAAGTGCTGAGGGATGCAAGGATAGATCCTCCAATCCAGACACTGTATTTC
CTCTCAGGCGGTGCGACCACCTTGATCTTCATGCTGCTTGGTGCGAGCGCCGTGATCTCT
TTGCTCATACGGTCAGCGATTCCTGGGAACATGGTTGAACCACCACTGAGGACTATGTTT
CCATACAGATCCTTCCTGATATCCACGTCACACTTCATGATGGAGTTGTAAGTCGTTTCA
TGGATTCCAGGGGCTTCCATTCCGATAAGCGATGGCTGGAAGAGTACTTCAGGGCAACGG
AATCTCTCAGCTCCAATTGTGATGACTTGTCCATCAGGTAGCTCGTAGTTCTTCTCCACC
GAAGAACTGCTCTTAGCTGTCTCGAGCTCTTGCTCGAAGTCGAGAGCGACATAAGCAAGT
TTCTCTTTGATGTCACGGACAATTTCTCGCTCGGCGGTAGTGGTGAACATGTAACCTCTC
TCGGTGAGAATCTTCATTAGAGAATCTGTGAGATCCCGACCCGCGAGATCCAGAC

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR2AC55JQ 868 0 0
ACAGAGGTA
AAACTAAAGTACACAGAGACTCGAAAGAAGGTTTTTTAAAAA*AGACCCAAGAAAAAACA
ACAACCACATAACAACAGATAGTTTCACTTCCCATCTCAACTTCGGGAAATAGATTTTGT
AAAACAACACTCACCACAAGAAACCACTTAGAAGCATTTCCTGTGGACAATCGACGGACC
AGACTCATCGTACTCTCCCTT*GGAGATCCACATCTGTTGAAAAGTGCTGAGCGATGCAA
GGATAGATCCTCCAATCCAGACACTGTATTTCCTCTCGGGCGGTGCGACCACCTTGATCT
TCATGCTGCTTGGTGCGAGCGCCGTGATCTCTTTGCTCATACGGTCAGCGATTCCTGGGA
ACATGGTTGAACCACCACTGAGCACGATGTTTCCATACAGATCCTTCCTGATATCCACGT
CACACTTCATGATGGAGTTGTAAGTCGTTTCATGGATTCCAGGAGCTTCCATTCCGATCA
GCGATGGCTGGAAGAGTACTTCAGGGCAACGGAATCTCTCAGCTCCAATTGTGATGACTT
GTCCATCAGGTAGCTCGTAGTTCTTCTCCACCGAAGAACTGCTCTTAGCTGTCTCGAGCT
CTTGCTCGAAGTCGAGAGCGACATAAGCAAGTTTCTCTTTGATGTCACGGACGATTTCTC
GCTCGGCGGTAGTGGTGAACATGTAACCTCTCTCGGTGAGAATCTTCATTAGAGAATCCG
TGAGATCCCTACCCGCAAGATCCAGACGAAGGATGGCATGGGGAAGAGCATAACCCTCGT
AGATTGGCACAGTGTGAGACACACCATCACCAGAGTCGAGCACAATACCGGTAGTACGCC
CACTGGCGTAAAGAGAA
GA

QA 10 866 10 866
DS 

RD RR2GI22TF 726 0 0
AACACTCACCACAAGAAACCACTTAGAAGCATT*CCTGTGGACAATCGACGGACCAGACT
CATCGTACTCTCC*TT*CGAGATCCACATCTGTTGGAAAGTGCTGAGGGATGCAAGGATA
AATCCTCCAATCCAGACACTGTATTTCCTCTCGGGCGGTGCGACCACCTTGATCTTCATA
CTGCTTGGTGCGAGCGCCGTGATCTCTTTGCTCATACGGTCAGCGATTCCTGGGAACATG
GTTGAACCACCACTGAGCACGATGTTTCCATACAGATCCTTCCTGATATCCACGTCACAC
TTCATGATGGAGTTGTAAGTCGTTTCATGGATTCCGGGGGCTTCCATTCCGATCAGCGAT
GGCTGGAAGAGTACTTCAGGACAACGGAATCTCTCAGCTCCAATTGTGATGACTTGTCCA
TCAGGTAGCTCGTAGTTCTTCTCCACCGAAGAACTGCTCTTAGCTGTCTCGAGCTCTTGC
TCGAAGTCGAGAGCGACATAAGCAAGTTTCTCTTTGATGTCACGGACAATTTCTCGCTCG
GCGGTAGTGGTGAACATGTAACCTCTCTCGGTGAGGATCTTCATTAGAGAATCAGTGAGA
TCCCTACCCGCAAGATCCAGACGAAGGATGGCATGGGGAAGAGCATAACCCTCGTAAATT
GGCACAGTGTGAGACACACCATCACCAGAGTCGAGCACAATACCGGTAGTACGCCCACTG
GCGTA
C

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2AC55TF 741 0 0
AACCACTTAGAAGCATT*CCTGTGGACAATCGACGGACCAGACTCATCGTACTCTCCCTT
TGGAGATCCACATCTGTTGAAAAGTGCTGAGCGATGCAAGGATAGATCCTCCAATCCAGA
CACTGTATTTCCTCTCGGGCGGTGCGACCACCTTGATCTTCATGCTGCTTGGTGCGAGCG
CCGTGATCTCTTTGCTCATACGGTCAGCGATTCCTGGGAACATGGTTGAACCACCACTGA
GCACGATGTTTCCATACAGATCCTTCCTGATATCCACGTCACACTTCATGATGGAGTTGT
AAGTCGTTTCATGGATTCCAGGAGCTTCCATTCCGATCAGCGATGGCTGGAAGAGTACTT
CAGGGCAACGGAATCTCTCAGCTCCAATTGTGATGACTTGTCCATCAGGTAGCTCGTAGT
TCTTCTCCACCGAAGAACTGCTCTTAGCTGTCTCGAGCTCTTGCTCGAAGTCGAGAGCGA
CATAAGCAAGTTTCTCTTTGATGTCACGGACGATTTCTCGCTCGGCGGTAGTGGTGAACA
TGTAACCTCTCTCGGTGAGAATCTTCATTAGAGAATCCGTGAGATCCCTACCCGCAAGAT
CCAGACGAAGGATGGCATGGGGAAGAGCATAACCCTCGTAGATTGGCACAGTGTGAGACA
CACCATCACCAGAGTCGAGCACAATACCGGTAGTACGCCCACTGGCGTAAAGAGAAAGAA
CGGCCTGAATGGCAACATACC

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL164Contig4 801 2 22 U
GGAGCTCTAGTGTATCTGCTGGCCGTTTCTGCTTCCATCTTCTCGAAACGTCTTCTCTGC
CCTATCATCTTCTTCTTCTTCTTCCCTAAGCTTAGCGAAAGATGGCCGATGGTGAAGACA
TTCAACCCCTTGTCTGTGACAATGGAACTGGAATGGTGAAGGCTGGGTTTGCAGGTGACG
ATGCCCCCAGAGCTGTGTTCCCAAGTATCGTTGGCCGTCCCAGACACACTGGTGTCATGG
TTGGGATGGGTCAGAAAGATGCTTACGTTGGTGACGAAGCTCAGTCCAAGAGAGGTATCC
TCACTCTCAAGTATCCCATCGAGCACGGTATTGTGAGCAACTGGGATGACATGGAGAAGA
TCTGGCATCACACTTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCCCCTGAAGAGCACCCGGTTCTTC
TCACTGAGGCACCTCTCAACCCTAAAGCTAACAGGGAGAAGATGACTCAGATCATGTTCG
AGACTTTCAATGTCCCTGCCATGTATGTTGCTATCCAGGCCGTTCTTTCTCTCTACGCTA
GTGGGCGTACTACTGGTATTGTGCTCGACTCTGGTGATGGTGTGTCTCACACCGTGCCAA
TCTACGAGGGTTATGCTCTTCCTCACGCTATCCTCCGTCTCGATCTTGCGGGGAGGGATC
TCACTGATTCTCTGATGAAGATTCTCACGGAGAGAGGTTACATGTTCACCACCACCGCCG
AGCGAGAATTGTCCGTGACATTAAAGAGAAACTTGCTTACGTCGCTCTCGACTACGAGCA
GAGCTGGAGACAGCCAAGAGC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C668TF U 1
AF RR2H574TF U 1
BS 1 99 RR2C668TF
BS 100 100 RR2H574TF
BS 101 115 RR2C668TF
BS 116 116 RR2H574TF
BS 117 208 RR2C668TF
BS 209 209 RR2H574TF
BS 210 225 RR2C668TF
BS 226 226 RR2H574TF
BS 227 274 RR2C668TF
BS 275 275 RR2H574TF
BS 276 298 RR2C668TF
BS 299 299 RR2H574TF
BS 300 426 RR2C668TF
BS 427 427 RR2H574TF
BS 428 436 RR2C668TF
BS 437 437 RR2H574TF
BS 438 532 RR2C668TF
BS 533 533 RR2H574TF
BS 534 598 RR2C668TF
BS 599 599 RR2H574TF
BS 600 647 RR2C668TF
BS 648 801 RR2H574TF

RD RR2C668TF 647 0 0
GGAGCTCTAGTGTATCTGCTGGCCGTTTCTGCTTCCATCTTCTCGAAACGTCTTCTCTGC
CCTATCATCTTCTTCTTCTTCTTCCCTAAGCTTAGCGAA*GATGGCCGATGGTGAGGACA
TTCAACCCCTTGTCTGTGACAATGGAACTGGAATGGTGAAGGCTGGGTTTGCAGGTGACG
ATGCCCCCAGAGCTGTGTTCCCAAGTATTGTTGGCCGTCCCAGACGCACTGGTGTCATGG
TTGGGATGGGTCAGAAAGATGCTTACGTTGGTGATGAAGCTCAGTCCAAGAGAGGTATTC
TCACTCTCAAGTATCCCATCGAGCACGGTATTGTGAGCAACTGGGATGACATGGAGAAGA
TCTGGCATCACACTTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCCCCTGAAGAGCACCCGGTTCTTC
TCACTGGGGCACCTCTTAACCCTAAAGCTAACAGGGAGAAGATGACTCAGATCATGTTCG
AGACTTTCAATGTCCCTGCCATGTATGTTGCTATCCAGGCCGTTCTTTCTCTTTACGCTA
GTGGGCGTACTACTGGTATTGTGCTCGACTCTGGTGATGGTGTGTCTCACACCGTGCCGA
TCTACGAGGGTTATGCTCTTCCTCACGCTATCCTCCGTCTCGATCTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2H574TF 801 0 0
GGAT
CTCTAGTGTATCTGCTGGCCGTTTCTGCTTC*ATCTTCTCGAAACGTCTTCTCTGCTCTA
TCATCTTCTTCTTCTTCTTCCCTAAGCTTAGCGAAAGATGGCCGATGGTGAAGACATTCA
ACCCCTTGTGTGTGACAATGGAACTGGAATGGTGAAGGCTGGGTTTGCAGGTGACGATGC
CCCCAGGGCTGTGTTCCCAAGTATCGTTGGCCGTCCCAGACACACTGGTGTCATGGTTGG
GATGGGTCAGAAAGATGCTTACGTTGGTGACGAAGCTCAGTCCAAGAGAGGTATCCTCAC
TCTCAAGTATCCGATCGAGCACGGTATTGTGAGCAACTGGGATGACATGGAGAAGATCTG
GCATCACACTTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCCCCTGAAGAGCACCCGGTTCTTCTCAC
TGAGGCGCCTCTCAACCCTAAAGCTAACAGGGAGAAGATGACTCAGATCATGTTCGAGAC
TTTCAATGTCCCTGCCATGTATGTTGCTATCCAGGCCGTTCTTTCTCTCTACGCTAGTGG
GCGTACTACTGGTATTGTGCTCGACTCTGGTGATGGTGTGTCTCACACCGTGCCAATCTA
TGAGGGTTATGCTCTTCCTCACGCTATCCTCCGTCTCGATCTTGCGGGGAGGGATCTCAC
TGATTCTCTGATGAAGATTCTCACGGAGAGAGGTTACATGTTCACCACCACCGCCGAGCG
AGAATTGTCCGTGACATTAAAGAGAAACTTGCTTACGTCGCTCTCGACTACGAGCAGAGC
TGGAGACAGCCAAGAGC

QA 5 801 5 801
DS 



CO CL164Contig5 745 2 2 U
TTTTAGGACATCCAAACAATATTTATAAGGAAAAAAACCAAAAAATTGAAACAACGACCA
AAATATAATTTGATAAATTTTTGCTTAAGGACAAAAAAAAAAACAGCAATCACAAGCATC
CTAAAGAGAAATAGAAGACACAGATAGAACTAAAGTACACAGAAACTTCTCGACACAGCC
AAAAGGTTCTAAAGAACCATATAACAACAGATAGTTTCAATTCCCATAATCAACTCGGGA
AAGAGACTCGTAAACAGACTCACCACCACGAAACAGAGAGCAGAGCCCTTAGGAGCACTT
TCTGTGAACAATGGATGGACCCGACTCGTCGTACTCTCCCTTTGAAATCCACATCTGTTG
GAAAGTGCTGAGGGATGCAAGGATGGATCCTCCAATCCAGACACTGTATTTCCTCTCAGG
AGGCGCGACCACCTTGATCTTCATGCTGCTTGGCGCGAGTGCCGTGATCTCTTTGCTCAT
ACGGTCAGCGATTCCTGGGAACATGGTTGAACCACCACTGAGGACGATGTTTCCATACAG
ATCCTTCCTGATATCGACATCACACTTCATGATGGAGTTGTAAGTCGTTTCGTGGATTCC
AGGGGCTTCCATTCCGATGAGCGACGGCTGGAACAATACTTCAGGGCAACGGAACCTTTC
AGCTCCGATGGTGATGACTTGTCCATCAGGTAGCTCGTAGTTCTTCTCCACTGACGAACT
GCTCTTTGCTGTATCCAGCTCTTGC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D757TF C 1
AF RR2D757JQ U 5
BS 1 4 RR2D757TF
BS 5 745 RR2D757JQ

RD RR2D757TF 745 0 0
TTTTAGGACATCCAAACAATATTTATAAGGAAAAAA*CCAAAAAATTGAAACAACGACCA
AAATATAATTTGATAAATTTTTGCTTAAGGACAAAAAAAAAAACAGCAATCACAAGCATC
CTAAAGAGAAATAGAAGACACAGATAGAACTAAAGTACACAGAAACTTCTCGACACAGCC
AAAAGGTTCTAAAGAACCATATAACAACAGATAGTTTCAATTCCCATAATCAACTCGGGA
AAGAGACTCGTAAACAGACTCACCACCACGAAACAGAGAGCAGAGCCCTTAGGAGCACTT
TCTGTGAACAATGGATGGACCCGACTCGTCGTACTCTCCCTTTGAAATCCACATCTGTTG
GAAAGTGCTGAGGGATGCAAGGATGGATCCTCCAATCCAGACACTGTATTTCCTCTCAGG
AGGCGCGACCACCTTGATCTTCATGCTGCTTGGCGCGAGTGCCGTGATCTCTTTGCTCAT
ACGGTCAGCGATTCCTGGGAACATGGTTGAACCACCACTGAGGACGATGTTTCCATACAG
ATCCTTCCTGATATCGACATCACACTTCATGATGGAGTTGTAAGTCGTTTCGTGGATTCC
AGGGGCTTCCATTCCGATGAGCGACGGCTGGAACAATACTTCAGGGCAACGGAACCTTTC
AGCTCCGATGGTGATGACTTGTCCATCAGGTAGCTCGTAGTTCTTCTCCACTGACGAACT
GCTCTTTGCTGTATCCAGCTCTTGC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2D757JQ 741 0 0
AGGACATCCAAACAATATTTATAAGGAAAAAAACCAAAAAATTGAAACAACGACCAAAAT
ATAATTTGATAAATTTTTGCTTAAGGACAAAAAAAAAAACAGCAATCACAAGCATCCTAA
AGAGAAATAGAAGACACAGATAGAACTAAAGTACACAGAAACTTCTCGACACAGCCAAAA
GGTTCTAAAGAACCATATAACAACAGATAGTTTCAATTCCCATAATCAACTCGGGAAAGA
GACTCGTAAACAGACTCACCACCACGAAACAGAGAGCAGAGCCCTTAGGAGCACTTTCTG
TGAACAATGGATGGACCCGACTCGTCGTACTCTCCCTTTGAAATCCACATCTGTTGGAAA
GTGCTGAGGGATGCAAGGATGGATCCTCCAATCCAGACACTGTATTTCCTCTCAGGAGGC
GCGACCACCTTGATCTTCATGCTGCTTGGCGCGAGTGCCGTGATCTCTTTGCTCATACGG
TCAGCGATTCCTGGGAACATGGTTGAACCACCACTGAGGACGATGTTTCCATACAGATCC
TTCCTGATATCGACATCACACTTCATGATGGAGTTGTAAGTCGTTTCGTGGATTCCAGGG
GCTTCCATTCCGATGAGCGACGGCTGGAACAATACTTCAGGGCAACGGAACCTTTCAGCT
CCGATGGTGATGACTTGTCCATCAGGTAGCTCGTAGTTCTTCTCCACTGACGAACTGCTC
TTTGCTGTATCCAGCTCTTGC

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL164Contig6 543 2 2 U
GGAAGGGTCTGTATGGAAACATCGTCCTCAGTGGTGGTTCAACCATGTTCCCAGGAATCG
CTGACCGTATGAGCAAAGAGATCACGGCACTCGCGCCAAGCAGCATGAAGATCAAGGTGG
TCGCGCCTCCTGAGAGGAAATACAGTGTCTGGATTGGAGGATCCATCCTTGCATCCCTCA
GCACTTTCCAACAGATGTGGATTTCAAAGGGAGAGTACGACGAGTCGGGTCCATCCATTG
TTCACAGAAAGTGCTTCTAAGGGCTCTGCTCTCTGTTTCGTGGTGGTGAGTCTGTTTACG
AGTCTCTTTCCCGAGTTGATTATGGGAATTGAAACTATCTGTTGTTATATGGTTCTTTAG
AACCTTTTGGCTGTGTCAAGAAGTTTCTGTGTACTTTAGTTCTATCTGTGTCTTCTATTT
CTCTTTAGGATGCTTGTGATTGCTGTTTTTTTTGTCCTTAAGCAAAAATTTATCAAATTA
TATTTTGGTCGTTGTTTCAATTTCTTGGTTTTTTTCCTTATAAATATTGTTTGGATGTCC
TAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2FQ72TF U 1
AF RR2FQ72JQ C 1
BS 1 127 RR2FQ72TF
BS 128 543 RR2FQ72JQ

RD RR2FQ72TF 127 0 0
GGAAGGGTCTGTATGGAAACATCGTCCTCAGTGGTGGTTCAACCATGTTCCCAGGAATCG
CTGACCGTATGAGCAAAGAGATCACGGCACTCGCGCCAAGCAGCATGAAGATCAAGGTGG
TCGCGCC

QA 1 127 1 127
DS 

RD RR2FQ72JQ 543 0 0
GGAAGGGTCTGTATGGAAACATCGTCCTCAGTGGTGGTTCAACCATGTTCCCAGGAATCG
CTGACCGTATGAGCAAAGAGATCACGGCACTCGCGCCAAGCAGCATGAAGATCAAGGTGG
TCGCGCCTCCTGAGAGGAAATACAGTGTCTGGATTGGAGGATCCATCCTTGCATCCCTCA
GCACTTTCCAACAGATGTGGATTTCAAAGGGAGAGTACGACGAGTCGGGTCCATCCATTG
TTCACAGAAAGTGCTTCTAAGGGCTCTGCTCTCTGTTTCGTGGTGGTGAGTCTGTTTACG
AGTCTCTTTCCCGAGTTGATTATGGGAATTGAAACTATCTGTTGTTATATGGTTCTTTAG
AACCTTTTGGCTGTGTCAAGAAGTTTCTGTGTACTTTAGTTCTATCTGTGTCTTCTATTT
CTCTTTAGGATGCTTGTGATTGCTGTTTTTTTTGTCCTTAAGCAAAAATTTATCAAATTA
TATTTTGGTCGTTGTTTCAATTTCTTGGTTTTTTTCCTTATAAATATTGTTTGGATGTCC
TAC

QA 1 543 1 543
DS 



AS 3 12

CO CL165Contig1 949 7 15 U
GGGATTGTGTGTCATTACTTCGTCGTTTAGCTTCCGGGGACGAGAATCGGCGAGAGCTTT
GATTCAGTCGTTAATCTGTTCCGATCTCGTGTTCTGTAACGAAATTATCAACTTCTTGTA
AGAAACAGAAGCAATGATTGGGTTGTTTAAAGTAAAGGAAAAGCAAAGAGAACAAGCTCA
GAACGCTAGTAGAGGAGGAGGAGCTTCTGTTAAGAAGCAATCTGCTGGTGAACTTCGTCT
TCACAAAGATATATCAGAGTTGAACCTTCCAAGTTCGTGTACGATAACGTTTCCTAATGG
CAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCTGATGATGGTTACTACCATAA
TGGTACATTTGTTTTCACGTTCCAAGTCTCTCCTGTGTATCCACATGAAGCTCCTAAAGT
TAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATTGATTTGGAAGGAAACGTCTGCCTCAA
CATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTTAACATCAACACTGTTATCTATGGACTCTT
CCATCTTTTCACGGAACCCAATTCTGAAGATCCATTGAACCATGATGCAGCACAAGTTTT
AAGGGACAACCCTAAGCTATTTGAGACCAATGTCCGGAGGGCCATGACCGGTGGATATGT
TGGTCAAACCTTTTTCCCGCGCTGTATCTAAAACTGAAAGCTCTGGTTTGTCTTCTTCGT
GCAAAAAAAGAGAAGAACCAAAAACCCTTTTATTTGCTTATTGTATTTCTCAAAGAACCC
TT*GTTTTTGTAAGACTACCTTGTGCGTAAGAAAACCCTTTCCCCCCTTAGCTCATTATC
TTTCTGAAACTTTTAGCTCGTGAGAGTTGGACAAAGGAACTGAGAACTCTAAAAATGTGG
ATTGTGTGTAACATGCTTGATCTTTTGTCTTATATTTATGGTTCTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV48TF U 5
AF RR2C949TF U 28
AF RR2BE86TF U 1
AF RR2DP04TF U 1
AF RR2C949JQ C 1
AF RR2CV48JQ C 24
AF RR2BE86JQ C 243
BS 1 198 RR2BE86TF
BS 199 200 RR2CV48TF
BS 201 362 RR2BE86TF
BS 363 363 RR2DP04TF
BS 364 370 RR2BE86TF
BS 371 371 RR2DP04TF
BS 372 393 RR2BE86TF
BS 394 394 RR2DP04TF
BS 395 408 RR2BE86TF
BS 409 409 RR2DP04TF
BS 410 722 RR2BE86TF
BS 723 728 RR2DP04TF
BS 729 729 RR2CV48JQ
BS 730 827 RR2C949JQ
BS 828 949 RR2BE86JQ

RD RR2CV48TF 554 0 0
GGGTGTGTCAT
TACTTCGTCGTTTAGCTTCCGGGGACGAGAATCGGCGAGAGCTTTGATTCAGTCGTTAAT
CTGTTCCGATCTCGTGTTCTGTAACGAAATTATCAACTTCTTGTAAGAAACAGAAGCAAT
GATTGGGTTGTTTAAAGTAAAGGAAAAGCAAAGAGAACAAGCTCAGAACGCTAGTAGAGG
AGGAGGAGCTTCTGTTAAGAAGCAATCCGCTGGTGAACTTCGTCTTCACAAAGATATATC
AGAGTTGAACCTTCCAAGTTCGTGTACGATAACGTTTCCTAATGGCAAAGATGATTTGAT
GAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCTGATGATGGTTACTACCATAATGGTACATTTGTTTT
CACGTTCCAAGTCTCTCCTGTGTATCCACATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAA
GGTTTATCATCCCAATATTGATTTGGAAGGAAACGTCTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGA
CTGGAAACCTGTTCTTAACATCAACACTGTTATCTATGGACTCTTCCATCTTTTCACAGA
ACC

QA 12 554 12 554
DS 

RD RR2C949TF 606 0 0
TAGCTTCCGGGGACGAGAATCGGCGAGAGCTTTGATTCAGTCGTTAATCTGTTTCGATCT
CGTGTTCTGTAACGAAATTATCAACTTCTTGTAAGAAACAGAAGCAATGATTGGGTTGTT
TAAAGTAAAGGAAAAGCAAAGAGAACAAGCTCAGAACGCTAGTAGAGGAGGAGGAGCTTC
TGTTAAGAAGCAATCTGCTGGTGAACTTCGTCTTCACAAAGATATATCAGAGTTGAACCT
TCCAAGTTCGTGTACGATAACGTTTCCTAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGT
CTCCATTAAACCTGATGATGGTTACTACCATAATGGTACATTTGTTTTCACGTTCCAAGT
CTCTCCTGTGTATCCACATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCC
CAACATTGATTTGGAAGGAAACGTCTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGT
TCTTAACATCAACACTGTTATCTATGGACTCTTCCATCTTTTCACGGAACCCAATTCTGA
AGATCCATTGAACCATGATGCAGCACAAGTTTTAAGGGACAACCCTAAGCTATTTGAGAC
CAATGT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2BE86TF 722 0 0
GGGATTGTGTGTCATTACTTCGTCGTTTAGCTTCCGGGGACGAGAATCGGCGAGAGCTTT
GATTCAGTCGTTAATCTGTTCCGATCTCGTGTTCTGTAACGAAATTATCAACTTCTTGTA
AGAAACAGAAGCAATGATTGGGTTGTTTAAAGTAAAGGAAAAGCAAAGAGAACAAGCTCA
GAACGCTAGTAGAGGAGG**GAGCTTCTGTTAAGAAGCAATCTGCTGGTGAACTTCGTCT
TCACAAAGATATATCAGAGTTGAACCTTCCAAGTTCGTGTACGATAACGTTTCCTAATGG
CAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCTGATGATGGTTACTACCATAA
TGATACATTTTTTTTCACGTTCCAAGTCTCTCCCGTGTATCCACATGAGGCTCCTAAAGT
TAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATTGATTTGGAAGGAAACGTCTGCCTCAA
CATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTTAACATCAACACTGTTATCTATGGACTCTT
CCATCTTTTCACGGAACCCAATTCTGAAGATCCATTGAACCATGATGCAGCACAAGTTTT
AAGGGACAACCCTAAGCTATTTGAGACCAATGTCCGGAGGGCCATGACCGGTGGATATGT
TGGTCAAACCTTTTTCCCGCGCTGTATCTAAAACTGAAAGCTCTGGTTTGTCTTCTTCGT
GC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2DP04TF 728 0 0
GGGATT
GTGTGTCATTACTTCGTCGTTTAGCTTCCGGGGACGAGAATCGGCGAGAGCTTTGATTCA
GTCGTTAATCT**TCCGATCTCGTGTTCTGTAACGAAATTATCAACTTCTTGTAAGAAAC
AGAAGCAATGATTGGGTTGTTTAAAGTAAAGGAAAAGCAAAGAGAACAAGCTCAGAACGC
TAGTAGAGGAGG***AGCTTCTGTTAAGAAGCAATCTGCTGGTGAACTTCGTCTTCACAA
AGATATATCAGAGTTGAACCTTCCAAGTTCGTGTACGATAACGTTTCCTAATGGCAAAGA
TGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCTGATGATGGTTACTACCATAATGGTAC
ATTTGTTTTCACGTTCCAAGTCTCTCCTGTGTATCCACATGAAGCTCCTAAAGTTAAATG
CAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATTGATTTGGAAGGAAACGTCTGCCTCAACATCTT
GCGTGAAAACTGGAAACCTGTTCTTAACATCAACACTGTTATCTATGGACTCTTCCATCT
TTTCACGGAACCCAATTCTGAAGATCCATTGAACCATGATGCAGCACAAGTTTTAAGGGA
CAACCCTAAGCTATTTGAGACCAATGTCCGGAGGGCCATGACCGGTGGATATGTTGGTCA
AACCTTTTTCCCGCGCTGTATCTAAAACTGAAAGCTCTGGTTTGTCTTCTTCGTGCAAAA
AA

QA 7 728 7 728
DS 

RD RR2C949JQ 828 0 0
AACGATTGTGTGTCA
TACTTCGTCGTTTAGCTTCCGGGGACGAGAATCGGCGAGAGCTTTGATTCAGTCGTTAAT
CTGTTTCGATCTCGTGTTCTGTAACGAAATTATCAACTTCTTGTAAGAAACAGAAGCAAT
GATTGGGTTGTTTAAAGTAAAGGAAAAGCAAAGAGAACAAGCTCAGAACGCTAGTAGAGG
AGGAGGAGCTTCTGTTAAGAAGCAATCTGCTGGTGAACTTCGTCTTCACAAAGATATATC
AGAGTTGAACCTTCCAAGTTCGTGTACGATAACGTTTCCTAATGGCAAAGATGATTTGAT
GAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCTGATGATGGTTACTACCATAATGGTACATTTGTTTT
CACGTTCCAAGTCTCTCCTGTGTATCCACATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAA
GGTTTATCATCCCAACATTGATTTGGAAGGAAACGTCTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGA
CTGGAAACCTGTTCTTAACATCAACACTGTTATCTATGGACTCTTCCATCTTTTCACGGA
ACCCAATTCTGAAGATCCATTGAACCATGATGCAGCACAAGTTTTAAGGGACAACCCTAA
GCTATTTGAGACCAATGTCCGGAGGGCCATGACCGGTGGATATGTTGGTCAAACCTTTTT
CCCGCGCTGTATCTAAAACTGAAAGCTCTGGTTTGTCTTCTTCGTGCAAAAAA*GAGAAG
AACCAAAAACCCTTTTATTTGCTTATTGTATTTCTCAAAGAACCCTT*GTTTTTGTAAGA
CTACCTTGTGCGTAAGAAAACCCTTTCCCCCC
G

QA 16 827 16 827
DS 

RD RR2CV48JQ 804 0 0
CGTTTAGCTTCCGGGGACGAGAATCGGCGAGAGCTTTGATTCAGTCGTTAATCTGTTCCG
ATCTCGTGTTCTGTAACGAAATTATCAACTTCTTGTAAGAAACAGAAGCAATGATTGGGT
TGTTTAAAGTAAAGGAAAAGCAAAGAGAACAAGCTCAGAACGCTAGTAGAGGAGGAGGAG
CTTCTGTTAAGAAGCAATCCGCTGGTGAACTTCGTCTTCACAAAGATATATCAGAGTTGA
ACCTTCCAAGTTCGTGTACGATAACGTTTCCTAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTG
AAGTCTCCATTAAACCTGATGATGGTTACTACCATAATGGTACATTTGTTTTCACGTTCC
AAGTCTCTCCTGTGTATCCACATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATC
ATCCCAATATTGATTTGGAAGGAAACGTCTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAAC
CTGTTCTTAACATCAACACTGTTATCTATGGACTCTTCCATCTTTTCACGGAACCCAATT
CTGAAGATCCATTGAACCATGATGCAGCACAAGTTTTAAGGGACAACCCTAAGCTATTTG
AGACCAATGTCCGGAGGGCCATGACCGGTGGATATGTTGGTCAAACCTTTTTCCCGCGCT
GTATCTAAAACTGAAAGCTCTGGTTTGTCTTCTTCGTGCAAAAAAAGAGAAGAACCAAAA
ACCCTTTTATTTGCTTATTGTATTTCTCAAAGAACCCTT*GTTTTTGTAAGACTACCTTG
TGCGTAAGAAAACCCTTTCCCCCC

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2BE86JQ 707 0 0
ACAAAGATATATCAGAGTTGAACCTTCCAAGTTCGTGTACGATAACGTTTCCTAATGGCA
AAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCTGATGATGGTTACTACCATAATG
ATACATTTTTTTTCACGTTCCAAGTCTCTCCCGTGTATCCACATGAGGCTCCTAAAGTTA
AATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATTGATTTGGAAGGAAACGTCTGCCTCAACA
TCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTTAACATCAACACTGTTATCTATGGACTCTTCC
ATCTTTTCACGGAACCCAATTCTGAAGATCCATTGAACCATGATGCAGCACAAGTTTTAA
GGGACAACCCTAAGCTATTTGAGACCAATGTCCGGAGGGCCATGACCGGTGGATATGTTG
GTCAAACCTTTTTCCCGCGCTGTATCTAAAACTGAAAGCTCTGGTTTGTCTTCTTCGTGC
AAAAAAAGAGAAGAACCAAAAACCCTTTTATTTGCTTATTGTATTTCTCAAAGAACCCTT
TGTTTTTGTAAGACTACCTTGTGCGTAAGAAAACCCTTTCCCCCCTTAGCTCATTATCTT
TCTGAAACTTTTAGCTCGTGAGAGTTGGACAAAGGAACTGAGAACTCTAAAAATGTGGAT
TGTGTGTAACATGCTTGATCTTTTGTCTTATATTTATGGTTCTCCCT

QA 1 707 1 707
DS 



CO CL165Contig2 951 3 15 U
CTAATACCACCACAGTATAAACATTGATACCGAGATCTAATCAAACAGTACAGAATGTTA
TACAATTCCTTTGTCGAACTCTCAGAGCTTAAACAGAATGTGATATTACAGAAGCAAACA
AACAAGCAAAGTGTGTCCTCTGAGAATAAGAGATACAAGAGCGGATAAAGGGTGGGGTAG
TTCCAGTTCTTATCTTTTTTGCTTTAAGAAGAAGGAACCAGAGCTTTTGTTAGATGCAGC
GCGGGAAAAAGGTCTGGCCAACATAGCCACCAGCCATGGCTCTACGAACATTGGTCTCAA
ACAGCTTTGGATTATCCCTTAAAACTTGTGCTGCGTCATGGTTCAAAGGATCTTCAGAGT
TGGGTTCCGTGAAAAGATGGAAGAGTCCATAGATAACAGTGTTAATGTTAAGAACAGGTT
TCCAGTCTTCACGCAAGATGTTGAGGCAGACGTTTCCTTCCAAATCGATATTGGGATGAT
AAACCTTGGTTTTGCATTTAACTTTAGGAGCTTCATGAGGATACACAGGAGACACTTGGA
ACGTGAAAACAAATGTACCATTGTGGTAGTAACCATCATCAGGTTTAATGGAGACTTCAA
AGTTCATCAAATCATCTTTGCCATTAGGAAACGTTATCGTACACGAGCTTGGAAGATTCA
ACTCTGATATATCTTTGTGAAGACGAAGTTCACCAGCAGATTGCTTCTTGACAGAAGCTC
CACCTCCTCTACTAGCGTTCTGAGCTTGTTCTCTTTGCTTTTCCTTTACTTTAAACAACC
CAATCATTTTGCTCCTGCTTCTGACCTCTCTTTTAAGAAAACTCACACAACAGAAGATGG
TAATTTCGTTACAGAACACGAGATCGGAACAGATTAACGACTGAATCAAAGCTCGCCCGA
TTCTCGTCTCCGGAAGCTAAACGACGAAGAGTGACCCGATCGTTTAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 5 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK49JQ U 1
AF RR2EH06JQ U 4
AF RR2CH23TF C 313
BS 1 129 RR2BK49JQ
BS 130 130 RR2EH06JQ
BS 131 159 RR2BK49JQ
BS 160 160 RR2EH06JQ
BS 161 273 RR2BK49JQ
BS 274 274 RR2EH06JQ
BS 275 310 RR2BK49JQ
BS 311 311 RR2EH06JQ
BS 312 356 RR2BK49JQ
BS 357 357 RR2EH06JQ
BS 358 633 RR2BK49JQ
BS 634 634 RR2EH06JQ
BS 635 682 RR2BK49JQ
BS 683 710 RR2EH06JQ
BS 711 951 RR2CH23TF

RD RR2BK49JQ 682 0 0
CTAATACCACCACAGTATAAACATTGATACCGAGATCTAATCAAACAGTACAGAATGTTA
TACAATTCCTTTGTCGAACTCTCAGAGCTTAAACAGAATGTGATATTACAGAAGCAAACA
AACAAGCAA*GTGTGTCCTCTGAGAATAAGAGATACAAGGGCGGATAAAGGGTGGGGTAG
TTCCAGTTCTTATCTTTTTTGCTTTAAGAAGAAGGAACCAGAGCTTTTGTTAGATGCAGC
GCGGGAAAAAGGTCTGGCCAACATAGCCACCAGTCATGGCTCTACGAACATTGGTCTCAA
ACAGCTTTGGGTTATCCCTTAAAACTTGTGCTGCGTCATGGTTCAAAGGATCTTCAAAGT
TGGGTTCCGTGAAAAGATGGAAGAGTCCATAGATAACAGTGTTAATGTTAAGAACAGGTT
TCCAGTCTTCACGCAAGATGTTGAGGCAGACGTTTCCTTCCAAATCGATATTGGGATGAT
AAACCTTGGTTTTGCATTTAACTTTAGGAGCTTCATGAGGATACACAGGAGACACTTGGA
ACGTGAAAACAAATGTACCATTGTGGTAGTAACCATCATCAGGTTTAATGGAGACTTCAA
AGTTCATCAAATCATCTTTGCCATTAGGAAACGATATCGTACACGAGCTTGGAAGATTCA
ACTCTGATATATCTTTGTGAAG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2EH06JQ 707 0 0
CAAAT
ACCACAGTATAAACATTGATACCGAGATCTAATCAAATAGTACAGAATGTTATACAATTC
CTTTGTCGAACTCTCGGAGCTTAAACAGAATGTGATATTACAGAAGCAAACAAACAAGCA
AAGTGTGTCCTCTGAGAATAAGAGATACAAGAGCGGATAAAGGGTGGGGTAGTTCCAGTT
CTTATCTTTTTTGCTTTAAGAAGAAGGAACCAGAGCTTTTGTTAGATGCAGCGCGGGAAA
AAGGTCTGGCCAACATAGCCACCAGCCATGGCTCTACGAACATTGGTCTCAAACAGCTTT
GGATTATCCCTTAACACTTGTGCTGCGTCATGGTTCAAAGGATCTTCAGAGTTGGGCTCC
GTGAAAAGATGGAAGAGTCCATAGATAACAGTGTTAATGTTAAGAACAGGTTTCCAGTCT
TCACGCAAGATGTTGAGGCAGACGTTTCCTTCCAGATCGATATTGGGATGATAAACCTTG
GTTTTGCATTTAACTTTAGGAGCCTCGTGAGGATACACAGGAGACACTTGGAACGTGAAA
ACAAACGTACCATTGTGGTAGTAACCATCATCAGGTTTAATGGAGACTTCAAAGTTCATC
AAATCATCTTTGCCATTAGGAAACGTTATCGTACACGAGCTTGGAAGATTCAACTCTGAT
ATATCTTTGTGAAGACGAAGTTCACCAGCAGATTGCTTCTTG

QA 6 707 6 707
DS 

RD RR2CH23TF 639 0 0
TATCCCTTAAAACTTGTGCTGCATCATGGTTCAATGGATCTTCAGAGTTTGGTTCAGTGA
AAAGATGGAAGAGTCCATAGATAACAGTGTTGATGTTAAGAACAGGTTTCCAGTCTTCAC
GCAAGATGTTGAGGCAGACGTTTCCTTCCAAATCAATATTGGGATGATAAACCTTGGTTT
TGCATTTAACTTTAGGAGCTTCATGTGGATACACAGGAGACACTTGGAACGTGAAAACAA
ATGTACCATTATGGTAGTAACCATCATCAGGTTTAATAGAGACTTCAAAGTTCATCAAAT
CATCTTTGCCATTAGGAAACGTTATCGTACACGAGCTTGGAAGGTTCAACTCTGATATAT
CTTTGTGAAGACGAAGTTCACCAGCAGATTGCTTCTTGACAGAAGCTCCACCTCCTCTAC
TAGCGTTCTGAGCTTGTTCTCTTTGCTTTTCCTTTACTTTAAACAACCCAATCATTTTGC
TCCTGCTTCTGACCTCTCTTTTAAGAAAACTCACACAACAGAAGATGGTAATTTCGTTAC
AGAACACGAGATCGGAACAGATTAACGACTGAATCAAAGCTCGCCCGATTCTCGTCTCCG
GAAGCTAAACGACGAAGAGTGACCCGATCGTTTAGCTCC

QA 1 639 1 639
DS 



CO CL165Contig3 1253 2 2 U
GGGAGTTCTCGTCATTACCTATGATCGTCCCATTGTTCTTGCAATAGGTACTCTCTGTTG
GGCTCTGTCAACTGCTGCTGTTGGAGCTAGCAACTACTTCATCCAGGTTGCTTTGTGGAG
AGCAGTGAATGGGTTTGGATTAGCTATCGTTATACCGGCGCTTCAGTCGTTTATAGCAGA
TAGTTACAAGGATGGCACCAGAGGAGCTGGTTTCGGTTTGTTGAATCTCATTGGTACTAT
TGGTGGTATCGGAGGAGGTGTTGTAGCAACGGTTATGGCCGGTTCAGAGTTTTGGGGGGT
GCCTGGATGGCGTTGTGCTTTCATCATGATGGCAACGCTTAGTGCTGTGATTGGTTTACT
AGTTTTCCTCTTTGTGGTTGACCCCAGGAAGCACATTGAACGAGAGGAACTAATGGTTCA
TAAGATATCGGTTTGGAATGATTCATGGGCAGCTACAAAGTCGGTAGTTAAAGTAAGGAC
GTTCCAGATAATTGTCTTGCAAGGAATCGTTGGTTCATTACCTTGGACTGCAATGGTTTT
CTTCACAATGTGGTTTGAGCTTATTGGGTTTGATCATAACCAGACAGCTGCTTTGCTTGG
GGTGTTTGCGACTGGATGCGCTATAGGAACTTTGATGGGAGGCATCATCGCTGATAAGAT
GTCACGGATTTATCCAAACTCAGGTAGAGTGATGTGTGCGCAGTTCAGTGCCTTCATGGG
GATCCCATTCTCAATCATCCTTCTGAAAGCAATCCCACAGAGCAGAGATAGCTACTTGAT
CTTCTCCGTCACTCTCTTCTTGATGGGTCTCACCATAAGCTGGTGCGGTTCAGCGGTTAA
CGCGCCTATGTTTGCTGAAGTCGTCCCACCTAAGCACCGGACGATGATCTACGCGTTTGA
CCGGGCTTTCGAAGGATCTTTCTCCTCCTTTGCTGCGCCTTTGGTTGGGATCTTGTCTGA
GAAGATGTTTGGTTATGACTCGAAAGGTATTGATCCTTTGAAAGGTTCGTCTGTGCGTGA
AGCTGAGGCTCTCTCCAAGGGGCTTTTGTCCATGATGGCTGTTCCCTTTGGGCTCTGTTG
TCTGTCTTACACGCCTTTGCATTTCGTTTTCAAGAAAGATAGAGAGAACGCGAAGACTGC
TAGCTATAAAGACGTTGAAATGATCTGAGTTTTCGCTTATGTTTTGATTCTTTCAAATAC
CACAGTATAAACATTGATACCGAGATCTAATCAAATAGTACAGAATGTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET36TF U 1
AF RR2ET36JQ C 543
BS 1 707 RR2ET36TF
BS 708 1253 RR2ET36JQ

RD RR2ET36TF 707 0 0
GGGAGTTCTCGTCATTACCTATGATCGTCCCATTGTTCTTGCAATAGGTACTCTCTGTTG
GGCTCTGTCAACTGCTGCTGTTGGAGCTAGCAACTACTTCATCCAGGTTGCTTTGTGGAG
AGCAGTGAATGGGTTTGGATTAGCTATCGTTATACCGGCGCTTCAGTCGTTTATAGCAGA
TAGTTACAAGGATGGCACCAGAGGAGCTGGTTTCGGTTTGTTGAATCTCATTGGTACTAT
TGGTGGTATCGGAGGAGGTGTTGTAGCAACGGTTATGGCCGGTTCAGAGTTTTGGGGGGT
GCCTGGATGGCGTTGTGCTTTCATCATGATGGCAACGCTTAGTGCTGTGATTGGTTTACT
AGTTTTCCTCTTTGTGGTTGACCCCAGGAAGCACATTGAACGAGAGGAACTAATGGTTCA
TAAGATATCGGTTTGGAATGATTCATGGGCAGCTACAAAGTCGGTAGTTAAAGTAAGGAC
GTTCCAGATAATTGTCTTGCAAGGAATCGTTGGTTCATTACCTTGGACTGCAATGGTTTT
CTTCACAATGTGGTTTGAGCTTATTGGGTTTGATCATAACCAGACAGCTGCTTTGCTTGG
GGTGTTTGCGACTGGATGCGCTATAGGAACTTTGATGGGAGGCATCATCGCTGATAAGAT
GTCACGGATTTATCCAAACTCAGGTAGAGTGATGTGTGCGCAGTTCA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2ET36JQ 711 0 0
TCACAATGTGGTTTGAGCTTATTGGGTTTGATCATAACCAGACAGCTGCTTTGCTTGGGG
TGTTTGCGACTGGATGCGCTATAGGAACTTTGATGGGAGGCATCATCGCTGATAAGATGT
CACGGATTTATCCAAACTCAGGTAGAGTGATGTGTGCGCAGTTCAGTGCCTTCATGGGGA
TCCCATTCTCAATCATCCTTCTGAAAGCAATCCCACAGAGCAGAGATAGCTACTTGATCT
TCTCCGTCACTCTCTTCTTGATGGGTCTCACCATAAGCTGGTGCGGTTCAGCGGTTAACG
CGCCTATGTTTGCTGAAGTCGTCCCACCTAAGCACCGGACGATGATCTACGCGTTTGACC
GGGCTTTCGAAGGATCTTTCTCCTCCTTTGCTGCGCCTTTGGTTGGGATCTTGTCTGAGA
AGATGTTTGGTTATGACTCGAAAGGTATTGATCCTTTGAAAGGTTCGTCTGTGCGTGAAG
CTGAGGCTCTCTCCAAGGGGCTTTTGTCCATGATGGCTGTTCCCTTTGGGCTCTGTTGTC
TGTCTTACACGCCTTTGCATTTCGTTTTCAAGAAAGATAGAGAGAACGCGAAGACTGCTA
GCTATAAAGACGTTGAAATGATCTGAGTTTTCGCTTATGTTTTGATTCTTTCAAATACCA
CAGTATAAACATTGATACCGAGATCTAATCAAATAGTACAGAATGTTATAC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 2 14

CO CL166Contig1 1124 3 15 U
GGAATGTCGAAAGAAGTGAGCGAAGAGGGACAAACCCACCACCATGGCAAAGACTACGTT
GACCCTCCACCAGCTCCGCTTCTCGACACGGCAGAGCTCAAAAAGTGGTCTTTCTACAGA
GCTCTCATCGCCGAGTTCGTAGCCACACTCCTCTTCCTCTACGTCACCGTAGTCACCGTC
ATTGGCCACAAGAAACAGACCGGTCCTTGCGACGGCGTTGGTTTACTCGGAATCGCTTGG
GCTTTCGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTTTACTGCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCAC
ATTAATCCAGCTGTGACTTTCGGTCTGTTCTTGGCACGTAAGGTGTCTTTGGTGAGAGCT
GTTGGTTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCCATTTGCGGTGTGGGTTTCGTGAAAGCT
TTCATGAAAACTCCGTACAACACTCTCGGAGGCGGAGCTAACACTGTAGCAGATGGTTAC
AGTAACGGGACTGCTCTAGGAGCTGAGATTATTGGAACTTTTGTCCTTGTTTACACCGTG
TTCTCTGCAACTGACCCCAAGAGGAGCGCTCGTGACTCTCACATCCCCGTCTTGGCTCCA
CTTCCAATTGGATTCGCTGTGTTCATGGTACATTTGGCTACTATCCCCATTACTGGAACC
GGAATTAACCCAGCCAGAAGCTTTGGTGCTGCTGTTATCTACAACAACGAGAA*GGCATG
GGATGACCATTGGATCTTCTGGGTCGGTCCATTCGTGGGAGCACTAGCAGCCGCAGCTTA
CCATCAATACATTTTGAGAGCTGGAGCAGTTAAGGCCTTGGCCTCATTCCGAAGCAACCC
AACCAACTGATGAAGAAGTTTGAATTTCCCCACTTAGTGATGAAGGCTTAAATATGAAGA
AACAACTTTTATGTGCTTTTAATATGTATGATTATTTGTGTGTTTGTGAGTGAGAATCAT
GAAATGGGTCTGTTATCTCTTTCCTTTTTTTTTGTCTTTTCATTTAGTGCCCACATTGTT
AGTTTACTATTTGTAGTTTAGTTTCTAAGTGTATTTCTTGTGAAATTATTTCCCTCTTTC
TCCCTACATCCAGTTAATTTTGTGATATCAGACAATCCGAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG26TF U 1
AF RR2BL57TF U 229
AF RR2BG26JQ C 265
BS 1 713 RR2BG26TF
BS 714 714 RR2BL57TF
BS 715 814 RR2BG26TF
BS 815 815 RR2BL57TF
BS 816 836 RR2BG26TF
BS 837 837 RR2BL57TF
BS 838 863 RR2BG26TF
BS 864 883 RR2BL57TF
BS 884 884 RR2BG26JQ
BS 885 891 RR2BL57TF
BS 892 892 RR2BG26JQ
BS 893 901 RR2BL57TF
BS 902 902 RR2BG26JQ
BS 903 921 RR2BL57TF
BS 922 1124 RR2BG26JQ

RD RR2BG26TF 863 0 0
GGAATGTCGAAAGAAGTGAGCGAAGAGGGACAAACCCACCACCATGGCAAAGACTACGTT
GACCCTCCACCAGCTCCGCTTCTCGACACGGCAGAGCTCAAAAAGTGGTCTTTCTACAGA
GCTCTCATCGCCGAGTTCGTAGCCACACTCCTCTTCCTCTACGTCACCGTAGTCACCGTC
ATTGGCCACAAGAAACAGACCGGTCCTTGCGACGGCGTTGGTTTACTCGGAATCGCTTGG
GCTTTCGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTTTACTGCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCAC
ATTAATCCAGCTGTGACTTTCGGTCTGTTCTTGGCACGTAAGGTGTCTTTGGTGAGAGCT
GTTGGTTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCCATTTGCGGTGTGGGTTTCGTGAAAGCT
TTCATGAAAACTCCGTACAACACTCTCGGAGGCGGAGCTAACACTGTAGCAGATGGTTAC
AGTAACGGGACTGCTCTAGGAGCTGAGATTATTGGAACTTTTGTCCTTGTTTACACCGTG
TTCTCTGCAACTGACCCCAAGAGGAGCGCTCGTGACTCTCACATCCCCGTCTTGGCTCCA
CTTCCAATTGGATTCGCTGTGTTCATGGTACATTTGGCTACTATCCCCATTACTGGAACC
GGAATTAACCCAGCCAGAAGCTTTGGTGCTGCTGTTATCTACAACAACGAGAAAGGCATG
GGATGACCATTGGATCTTCTGGGTCGGTCCATTCGTGGGAGCACTAGCAGCCGCAGCTTA
CCATCAATACATTTTGAGAGCTGGAGCAGTTAAG*CCTTGGCCTCATTCCGAAGCA*CCC
AACCAACTGATGAAGAAGTTTGA

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR2BL57TF 694 0 0
GGA
ATCGCTTGGGCTTTCGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTTTACTGCACCGCCGGTATCTCT
GGTGGTCACATTAATCCAGCTGTGACTTTCGGTCTGTTCTTGGCACGTAAGGTGTCTTTG
GTGAGAGCTGTTGGTTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCCATTTGCGGTGTGGGTTTC
GTGAAAGCTTTCATGAAAACTCCGTGCAACACTCTCGGAGGCGGAGCTAACACTGTAGCA
GATGGTTACAGTAACGGGACTGCTCTAGGAGCTGAGATTATTGGAACTTTTGTCCTTGTT
TACACCGTGTTCTCTGCAACTGACCCCAAGAGGAGCGCTCGTGACTCTCACATCCCCGTC
TTGGCTCCACTTCCAATTGGATTCGCTGTGTTCATGGTACATTTGGCTACTATCCCCATT
ACTGGAACCGGAATTAACCCAGCCAGAAGCTTTGGTGCTGCTGTTATCTACAACAACGAG
AA*GGCATGGGATGACCATTGGATCTTCTGGGTCGGTCCATTCGTGGGAGCACTAGCAGC
CGCAGCTTACCATCAATACATTTTGAGAGCTGGAGCAGTTAAGGCCTTGGCCTCATTCCG
AAGCAACCCAACTAACTGATGAAGAAGTTTGAATTTCCCCACTTAGTGATGA*GGCTTAA
*TATGAAGAA*CAACTTTTATGTGCTTTTA
T

QA 4 693 4 693
DS 

RD RR2BG26JQ 860 0 0
CTCGTTTACTGCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATTAATCCAGCTGTGACTTTCGGT
CTGTTCTTGGCACGTAAGGTGTCTTTGGTGAGAGCTGTTGGTTACATGATAGCTCAGTGT
CTTGGAGCCATTTGCGGTGTGGGTTTCGTGAAAGCTTTCATGAAAACTCCGTACAACACT
CTCGGAGGCGGAGCTAACACTGTAGCAGATGGTTACAGTAACGGGACTGCTCTAGGAGCT
GAGATTATTGGAACTTTTGTCCTTGTTTACACCGTGTTCTCTGCAACTGACCCCAAGAGG
AGCGCTCGTGACTCTCACATCCCCGTCTTGGCTCCACTTCCAATTGGATTCGCTGTGTTC
ATGGTACATTTGGCTACTATCCCCATTACTGGAACCGGAATTAACCCAGCCAGAAGCTTT
GGTGCTGCTGTTATCTACAACAACGAGAA*GGCATGGGATGACCATTGGATCTTCTGGGT
CGGTCCATTCGTGGGAGCACTAGCAGCCGCAGCTTACCATCAATACATTTTGAGAGCTGG
AGCAGTTAAGGCCTTGGCCTCATTCCGAAGCAACCCAACCAACTGATGAAGAAGTTTGAA
TTTCCCCACTTAGTGATGAAGGCTTAAATATGAAGAAACAACTTTTATGTGCTTTTAATA
TGTATGATTATTTGTGTGTTTGTGAGTGAGAATCATGAAATGGGTCTGTTATCTCTTTCC
TTTTTTTTTGTCTTTTCATTTAGTGCCCACATTGTTAGTTTACTATTTGTAGTTTAGTTT
CTAAGTGTATTTCTTGTGAAATTATTTCCCTCTTTCTCCCTACATCCAGTTAATTTTGTG
ATATCAGACAATCCGAACTC

QA 1 860 1 860
DS 



CO CL166Contig2 1058 11 31 U
GGGACTCACCACCACTCAATTCTAGCAAAAAACTCCATACCTATCTAGAGAGAGAGAGAA
ACTTAAGGTTTCTAGAGAGATGTCGAAAGAAGTGAGCGAAGAGGGACACACTCAAAGCCA
TGGAAAAGACTACGTCGATCCTCCACCAGCTCCCTTCCTCGACATGGGTGAGCTCAAGTC
TTGGTCTTTCTACAGAGCTCTCATCGCCGAGTTCGTCGCCACCCTCCTCTTCCTCTACGT
CACCATAGCCACCGTCATCGGCCACAAGAAGCAAACCGGTCCTTGCGACGGCGTCGGTTT
ACTCGGTATCGCTTGGGCCTTCGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTTTACTGCACCGCCGG
TATCTCTGGTGGTCACATCAACCCAGCTGTGACTTTCGGTCTGTTCTTGGCGCGTAAGGT
GTCTCTGGTGAGAGCCGTTGGGTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCTATCTGTGGTGT
GGGTTTCGTGAAGGCTTTCATGAAGACTCCTTACAACACTCTTGGAGGCGGAGCTAACAC
TGTGGCCCCTGGTTACAACAAAGGAACTGCTCTTGGAGCTGAGATCATTGGAACTTTCGT
CCTCGTTTACACCGTCTTCTCTGCCACTGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACAT
CCCTGTTTTGGCTCCACTTCCAATTGGATTCGCTGTGTTCATGGTGCATTTGGCTACTAT
CCCCATTACTGGAACCGGAATTAACCCAGCTAGAAGCTTTGGTGCTGCTGTTATCTACAA
CAACGAGAAGGCCTGGGATGACCATTGGATCTTCTGGGTTGGTCCGTTCGTGGGAGCACT
AGCAGCCGCAGCTTACCATCAATACATTTTGAGAGCTGCAGCAGTTAAGGCATTGGCCTC
TTTCAGAAGCAGTGCTACAAACTGATGATGAAGTGTGAATTTACCCACTTAGTGGAGGAT
TAAATGTTACTTTATTTGTTGCTTTTGTGTGTTATGAGAAAGAATTTAAGTTGGTGGATG
GATGATGTTAATTATGAAATGAGTCTATGCTTTCTTTG


BQ
10 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 35 35 35 
35 35 20 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 60 60 60 60 30 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F527TF U 2
AF RR2CU61TF U 2
AF RR2F605TF U 6
AF RR2GM47TF U 1
AF RR2FR05TF U 2
AF RR2D336TF U 2
AF RR2F605JQ C 324
AF RR2CU61JQ C 326
AF RR2D171JQ C 615
AF RR2F527JQ C 375
AF RR2D336JQ C 404
BS 1 53 RR2GM47TF
BS 54 57 RR2FR05TF
BS 58 63 RR2GM47TF
BS 64 64 RR2FR05TF
BS 65 123 RR2GM47TF
BS 124 124 RR2F527TF
BS 125 156 RR2GM47TF
BS 157 157 RR2F527TF
BS 158 180 RR2GM47TF
BS 181 181 RR2F527TF
BS 182 198 RR2GM47TF
BS 199 199 RR2FR05TF
BS 200 246 RR2GM47TF
BS 247 247 RR2F527TF
BS 248 312 RR2GM47TF
BS 313 313 RR2F527TF
BS 314 401 RR2GM47TF
BS 402 402 RR2F527TF
BS 403 411 RR2GM47TF
BS 412 412 RR2FR05TF
BS 413 471 RR2GM47TF
BS 472 472 RR2F527TF
BS 473 519 RR2GM47TF
BS 520 520 RR2FR05TF
BS 521 522 RR2GM47TF
BS 523 523 RR2FR05TF
BS 524 573 RR2GM47TF
BS 574 574 RR2FR05TF
BS 575 771 RR2GM47TF
BS 772 1050 RR2F605JQ
BS 1051 1058 RR2CU61JQ

RD RR2F527TF 511 0 0
GGACTCACCACCACTCAATTCTAGCAAAAAAATCCATACCTATCTAGAGAGA****GAAA
CACAAGGTTTCTAGAGAGATGTCGAAAGAAGTGAGCGAAGAGGGACACACTCAGAGCCAT
GGAAAAGACTACGTCGATCCTCCACCAGCTCCCTTCCTCGACATGGGGGAGCTCAAGTCT
TGGTCTTTCTACAGAGCCCTCATCGCCGAGTTCGTCGCCACCCTCCTCTTCCTCTACGTC
ACCATAGCCACCGTCATCGGCCACAAGAAGCAAACCGGTCCTTGCGACGGCGTCGGTTTA
CTCGGTATCGCTTGGGCTTTCGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTTTACTGCACCGCCGGT
ATCTCTGGTGGTCACATCAACCCAACTGTGACTTTCGGTCTGTTCTTGGCACGTAAGGTG
TCTCTGGTGAGAGCTGTTGGGTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCTATCTGTGGTGTG
GGTTTCGTGAAGGCTTTCATGAAGACTCCTT

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2CU61TF 691 0 0
GGACTCACCACCACTCAATTCTAGCAAAAAACTCCATACCTATCTAGAGAGAGAGAGAAA
CTTAAGGTTTCTAGAGAGATGTCGAAAGAAGTGAGCGAAGAGGGACACACTCAAAGCCAT
GGAAAAGACTACGTCGATCCTCCACCAGCTCCCTTCCTCGACATGGGTGAGCTCAAGTCT
TGGTCTTTCTACAGAGCTCTCATCGCCGAGTTCGTCGCCACCCTCCTCTTCCTCTACGTC
ACCATAGCCACCGTCATCGGCCACAAGAAGCAAACCGGTCCTTGCGACGGCGTCGGTTTA
CTCGGTATCGCTTGGGCCTTCGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTTTACTGCACCGCCGGT
ATCTCTGGTGGTCACATCAACCCAGCTGTGACTTTCGGTCTGTTCTTGGCGCGTAAGGTG
TCTCTGGTGAGAGCCGTTGGGTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCTATCTGTGGTGTG
GGTTTCGTGAAGGCTTTCATGAAGACTCCTTACAACACTCTTGGAGGCGGAGCTAACACT
GTGGCCCCTGGTTACAACAAAGGAACTGCTCTTGGAGCTGAGATCATTGGAACTTTCGTC
CTCGTTTACACCGTCTTCTCTGCCACTGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACATC
CCTGTTTTGGCTCCACTTCCAATTGGATTCG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2F605TF 665 0 0
GG
ACCACCACTCAATTCTAGCAAAAAACTCCATACCTATCTAGAGAGAGAGAGAAACTTAAG
GTTTCTAGAGAGATGTCGAAAGAAGTGAGCGAAGAGGGACACACTCAAAGCCATGGAAAA
GACTACGTCGATCCTCCACCAGCTCCCTTCCTCGACATGGGTGAGCTCAAGTCTTGGTCT
TTCTACAGAGCTCTCATCGCCGAGTTCGTCGCCACCCTCCTCTTCCTCTACGTCACCATA
GCCACCGTCATCGGCCACAAGAAGCAAACCGGTCCTTGCGACGGCGTCGGTTTACTCGGT
ATCGCTTGGGCCTTCGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTTTACTGCACCGCCGGTATCTCT
GGTGGTCACATCAACCCAGCTGTGACTTTCGGTCTGTTCTCGGCGCGTAAGGTGTCTCTG
GTGAGAGCCGTTGGGTACATGATAGCTCAGTGTCCTGGAGCTATCTGTGGTGTGGGTTTC
GTGAAGGCTTTCATGAAGACTCCTTACAACACTCTTGGAGGCGGAGCTAACACTGTGGCC
CCTGGTTACAACAAAGGAACTGCTCTTGGAGCTGAGATCATTGGAACTTTCGTCCTCGTT
TACACCGTCTTCTCTGCCACTGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACATCCCTGTT
TTG

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR2GM47TF 776 0 0
GGGACTCACCACCACTCAATTCTAGCAAAAAACTCCATACCTATCTAGAGAGA****GAA
ACTCAAGGTTTCTAGAGAGATGTCGAAAGAAGTGAGCGAAGAGGGACACACTCAAAGCCA
TGGGAAAGACTACGTCGATCCTCCACCAGCTCCCTTTCTCGACATGGGTGAGCTCAAGTC
ATGGTCTTTCTACAGAGCCCTCATCGCCGAGTTCGTCGCCACCCTCCTCTTCCTCTACGT
CACCATCGCCACCGTCATCGGCCACAAGAAGCAAACCGGTCCTTGCGACGGCGTCGGTTT
ACTCGGTATCGCATGGGCCTTCGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTTTACTGCACCGCCGG
TATCTCTGGTGGTCACATCAACCCAGCTGTGACTTTCGGTCCGTTCTTGGCACGTAAGGT
GTCTCTGGTGAGAGCCGTTGGGTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCTATTTGTGGTGT
GGGTTTCGTGAAGGCTTTCATGAAGACTCCTTACAACACGCTCGGAGGCGGAGCTAACAC
TGTGGCCCCTGGTTACAACAAAGGAACTGCTCTCGGAGCTGAGATCATTGGAACTTTCGT
CCTCGTTTACACCGTCTTCTCTGCCACTGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACAT
CCCTGTTTTGGCTCCACTTCCAATTGGATTCGCTGTGTTCATGGTGCATTTGGCTACTAT
CCCCATTACTGGAACCGGAATTAACCCAGCTAGAAGCTTTGGTGCTGCTGT
ATCTA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2FR05TF 729 0 0
GGACTCACCACCACTCAATTCTAGCAAAAAACTCCATACCTATCTAGAGAGAGAGAGAAA
CTTAAGGTTTCTAGAGAGATGTCGAAAGAAGTGAGCGAAGAGGGACACACTCAAAGCCAT
GGAAAAGACTACGTCGATCCTCCACCAGCTCCCTTCCTCGACATGGGTGAGCTCAAGTCT
TGGTCTTTCTACAGAGCTCTCATCGCCGAGTTCGTCGCCACCCTCCTCTTCCTCTACGTC
ACCATAGCCACCGTCATCGGCCACAAGAAGCAAACCGGTCCTTGCGACGGCGTCGGTTTA
CTCGGTATCGCTTGGGCCTTCGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTTTACTGCACCGCCGGT
ATCTCTGGTGGTCACGTCAACCCAGCTGTGACTTTCGGTCTGTTCTTGGCGCGTAAGGTG
TCTCTGGTGAGAGCCGTTGGGTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCTATCTGTGGTGTG
GGTTTCGTGAAGGCTTTCATGAAGACTCCTTACAACACTCTTGGAGGCGGAGCTAACACT
GTGGCCCCTGGTTACAACAAAGGAACTGCTCTTGGAGCTGAGATCATTGGAACTTTCGTC
CTCGCTTACACCGTCTTCTCTGCCACTGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACATC
CCTGTTTTGGCTCCACTTCCAATTGGATTCGCTGTGTTCATGGTGCATTTGGCTACTATC
CCCATTACT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2D336TF 726 0 0
GGACTCACCACCACTCAATTCTAGCAAAAAACTCCATACCTATCTAGAGAGAGAGAGAAA
CTTAAGGTTTCTAGAGAGATGTCGAAAGAAGTGAGCGAAGAGGGACACACTCAAAGCCAT
GGAAAAGACTACGTCGATCCTCCACCAGCTCCCTTCCTCGACATGGGTGAGCTCAAGTCT
TGGTCTTTCTACAGAGCTCTCATCGCCGAGTTCGTCGCCACCCTCCTCTTCCTCTACGTC
ACCATAGCCACCGTCATCGGCCACAAGAAGCAAACCGGTCCTTGCGACGGCGTCGGTTTA
CTCGGTATCGCTTGGGCCTTCGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTTTACTGCACCGCCGGT
ATCTCTGGTGGTCACATCAACCCAGCTGTGACTTTCGGTCTGTTCTTGGCGCGTAAGGTG
TCTCTGGTGAGAGCCGTTGGGTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCTATCTGTGGTGTG
GGTTTCGTGAAGGCTTTCATGAAGACTCCTTACAACACTCTTGGAGGCGGAGCTAACACT
GTGGCCCCTGGTTACAACAAAGGAACTGCTCTTGGAGCTGAGATCATTGGAACTTTCGTC
CTCGTTTACACCGTCTTCTCTGCCACTGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACATC
CCTGTTTTGGCTCCACTTCCAATTGGATTCGCTGTGTTCATGGTGCATTTGGCTACTATC
CCCATT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2F605JQ 727 0 0
GTGGTATGATCTTCGTCCTCGTTTACTGCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATCAACC
CAGCTGTGACTTTCGGTCTGTTCTCGGCGCGTAAGGTGTCTCTGGTGAGAGCCGTTGGGT
ACATGATAGCTCAGTGTCCTGGAGCTATCTGTGGTGTGGGTTTCGTGAAGGCTTTCATGA
AGACTCCTTACAACACTCTTGGAGGCGGAGCTAACACTGTGGCCCCTGGTTACAACAAAG
GAACTGCTCTTGGAGCTGAGATCATTGGAACTTTCGTCCTCGTTTACACCGTCTTTTCTG
CCACTGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACATCCCTGTTTTGGCTCCACTTCCAA
TTGGATTCGCTGTGTTCATGGTGCATTTGGCTACTATCCCCATTACTGGAACCGGAATTA
ACCCAGCTAGAAGCTTTGGTGCTGCTGTTATCTACAACAACGAGAAGGCCTGGGATGACC
ATTGGATCTTCTGGGTTGGTCCGTTCGTGGGAGCACTAGCAGCCGCAGCTTACCATCAAT
ACATTTTGAGAGCTGCAGCAGTTAAGGCATTGGCCTCTTTCAGAAGCAGTGCTACAAACT
GATGATGAAGTGTGAATTTACCCACTTAGTGGAGGATTAAATGTTACTTTATTTGTTGCT
TTTGTGTGTTATGAGAAAGAATTTAAGTTGGTGGATGGATGATGTTAATTATGAAATGAG
TCTATGC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2CU61JQ 733 0 0
GGTATGATCTTCGTCCTCGTTTACTGCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATCAACCCA
GCTGTGACTTTCGGTCTGTTCTTGGCGCGTAAGGTGTCTCTGGTGAGAGCCGTTGGGTAC
ATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCTATCTGTGGTGTGGGTTTCGTGAAGGCTTTCATGAAG
ACTCCTTACAACACTCTTGGAGGCGGAGCTAACACTGTGGCCCCTGGTTACAACAAAGGA
ACTGCTCTTGGAGCTGAGATCATTGGAACTTTCGTCCTCGTTTACACCGTCTTTTCTGCC
ACTGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACATCCCTGTTTTGGCTCCACTTCCAATT
GGATTCGCTGTGTTCATGGTGCATTTGGCTACTATCCCCATTACTGGAACCGGAATTAAC
CCAGCTAGAAGCTTTGGTGCTGCTGTTATCTACAACAACGAGAAGGCCTGGGATGACCAT
TGGATCTTTTGGGTTGGTCCGTTCATGGGAGCACTAGCAGCCGCAGCTTACCATCAATAC
ATTTTGAGAGCTGCAGCAGTTAAGGCATTGGCCTCTTTCAGAAGCAGTGCTACAAACTGA
TGATGAAGTGTGAATTTACCCACTTAGTGGAGGATTAAATGTTACTTTATTTGTTGCTTT
TGTGTGTTATGAGAAAGAATTTAAGTTGGTGGATGGATGATGTTAATTATGAAATGAGTC
TATGCTTTCTTTG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2D171JQ 437 0 0
TCTTCTCTGCCACTGACCCTAAGAGAAGCGCCCGTGACTCTCACATCCCTGTTTTGGCTC
CACTTCCAATTGGATTCGCTGTGTTCATGGTGCATTTGGCTACTATCCCCATTACTGGAA
CCGGAATTAACCCAGCTAGAAGCTTTGGTGCTGCTGTTATCTACAACAACGAGAAGGCCT
GGGATGACCATTGGATCTTCTGGGTTGGTCCGTTCGTGGGAGCACTAGCAGCCGCAGCTT
ACCATCAATACATTTTGAGAGCTGCAGCAGTTAAGGCATTGGCCTCTTTCAGAAGCAGTG
CTACAAACTGATGATGAAGTGTGAATTTACCCACTTAGTGGAGGATTAAATGTTACTTTA
TTTGTTGCTTTTGTGTGTTATGAGAAAGAATTTAAGTTGGTGGATGGATGATTTTAATTA
TGAAATGAGTCTATGCT

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR2F527JQ 683 0 0
ACATCAACCCAACTGTGACTTTCGGTCTGTTCTTGGCACGTAAGGTGTCTCTGGTGAGAG
CTGTTGGGTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCTATCTGTGGTGTGGGTTTCGTGAAGG
CTTTCATGAAGACTCCTTACAACACTCTTGGAGGCGGAGCTAACACTGTGGCCCCTGGTT
ACAACAAAGGAACTGCTCTCGGAGCTGAGATCATTGGAACTTTCGTCCTCGTTTACACCG
TCTTCTCTGCCACTGACCCTAAGCGAAGCGCTCGTGACTCTCACATCCCTGTTTTGGCTC
CACTTCCAATTGGATTCGCTGTGTTCATGGTGCATTTGGCTACTATCCCCATTACTGGAA
CCGGAATTAACCCAGCTAGAAGCTTTGGTGCTGCTGTTATCTACAACAACGAGAAGGCCT
GGGATGACCATTGGATCTTCTGGGTTGGTCCGTTCGTTGGAGCACTAGCAGCAGCAGCTT
ACCATCAATACATTTTGAGAGCTGCAGCAGTTAAGGCCTTGGCCTCATTCAGAAGCAGTG
CTACAAACTGATGATGAAGTGTGGATTTACCCACTTAGTGGAAGATTAAATGTTACTTTA
TTTGTTGCTTTTGTGTGTTATAAGAAAGAATTTAAGTTGGTGGATGGATGATGTTAATTA
TGAAATGAGTCTATGCT
TTCTTT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2D336JQ 647 0 0
TTCTTGGCGCGTAAGGTGTCTCTGGTGAGAGCCGTTGGGTACATGATAGCTCAGTGTCTT
GGAGCTATCTGTGGTGTGGGTTTCGTGAAGGCTTTCATGAAGACTCCTTACAACACTCTT
GGAGGCGGAGCTAACACTGTGGCCCCTGGTTACAACAAAGGAACTGCTCTTGGAGCTGAG
ATCATTGGAACTTTCGTCCTCGTTTACACCGTCTTCTCTGCCACTGACCCTAAGAGAAGC
GCTCGTGACTCTCACATCCCTGTTTTGGCTCCACTTCCAATTGGATTCGCTGTGTTCATG
GTGCATTTGGCTACTATCCCCATTACTGGAACCGGAATTAACCCAGCTAGAAGCTTTGGT
GCTGCTGTTATCTACAACAACGAGAAGGCCTGGGATGACCATTGGATCTTCTGGGTTGGT
CCGTTCGTGGGAGCACTAGCAGCCGCAGCTTACCATCAATACATTTTGAGAGCTGCAGCA
GTTAAGGCATTGGCCTCTTTCAGAAGCAGTGCTACAAACTGATGACGAAGTGTGAATTTA
CCCACTTAGTGGAGGATTAAATGTTACTTTATTTGTTGCTTTTGTGTGTTATGAGAAAGA
ATTTAAGTTGGTGGATGGATGATGTTAATTATGAAATGAGTCTATGC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 3 14

CO CL167Contig1 969 6 7 U
GGATCACAGCTCTTTACAATCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGATTA
TCAGTTCTCGTTAATTGTTCAGTTAATCAAGAGTAACTAACCATGGCCGAAGAGTACAAG
AACGCTTCTGAGGAGTTCAAGAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACG
GAAGAACCGTCGGCTACGACGGGAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTTTTGGGG
AAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCACACCGCTAGCCTCGGAGGTCGAGCAT
AAAGCCCAGATCACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCAGGAAGAAGAGAAGGAGCAT
AAGCCTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCA
AGTCTCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAA
GGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGACGAG
AAGAAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAAACCTGAT
GATTCTCAAGCCTTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGTGGAGCAT
CCGGAGGAGAAGAAAGGTATTCTTGAGAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCT
AAGAGCACTGAAGAGGATGAGGAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTGATGCTTAAGAAAATGAT
ATAAATAATGTTGGAGTGGGACAGTTGCTGTGTTTCTTTCTGTGATGATTTATATTTTAT
CTTTAAGCTATTCTGTAAGATTGTGTCTTTCGTTGGTTTGCATTCTTCACCGCTATATTG
TAATTTCAGTATCTCTTTTTTTAAACTTCGCATATGGTTTCTAAGTAATGTTCATTTTCT
ATCTCCACA


BQ
15 15 15 15 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ47TF U 1
AF RR2A116TF U 1
AF RR2B480TF U 1
AF RR2FP04TF U 4
AF RR2FP04JQ C 243
AF RR2A116JQ C 464
BS 1 312 RR2B480TF
BS 313 313 RR2FJ47TF
BS 314 514 RR2B480TF
BS 515 515 RR2FJ47TF
BS 516 814 RR2B480TF
BS 815 952 RR2FP04JQ
BS 953 969 RR2A116JQ

RD RR2FJ47TF 733 0 0
GGATCACAGCTCTTTACAATCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGATTA
TCAGTTCTCGTTAATTGTTCAGTTAATCAAGAGTAACTAACCATAGCCGAAGAGTACAAG
AACGCTTCTGAGGAGTTCAAGAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACG
GAAGAACCGTCGGCTACGACGGGAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTTTTGGGG
AAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCACACCGCTAGCCTCGGAGGTCGAGCAT
AAAGCCCAGATCACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCAGGAAGAAGAGAAGGAGCAT
AAGCCTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCA
AGTCTCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAA
GGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGACGAG
AAGAAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAAACCTGAT
GATTCTCAAGCCTTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGTGGAGCAT
CCGGAGGAGAAGAAAG*TATTCTTGAGAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCT
AAGAGCACTGAAG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2A116TF 732 0 0
GGAG
CACAGCTCTTTACAATCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGATTATCAG
TTCTCGTTAATTGTTCAGTTAATCAAGAGTAACTAACCATGGCCGAAGAGTACAAGAACG
CTTCTGAGGAGTTCAAGAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACGGAAG
AACCGTCGGCTACGACGGGAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTTTTGGGGAAAA
AGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCACACCGCTAGCCTCGGAGGTCGAGCATAAAG
CCCAGATCACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCAGGAAGAAGAGAAGGAGCATAAGC
CTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCAAGTC
TCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTG
AAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGACGAGAAGA
AGGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAAACCTGATGATT
CTCAAGCCTTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGTGGAGCATCCGG
AGGAGAAGAAAGGTATTCTTGAGAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCTAAGA
GCACTGAA

QA 5 732 5 732
DS 

RD RR2B480TF 814 0 0
GGATCACAGCTCTTTACAATCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGATTA
TCAGTTCTCGTTAATTGTTCAGTTAATCAAGAGTAACTAACCATGGCCGAAGAGTACAAG
AACGCTTCTGAGGAGTTCAAGAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACG
GAAGAACCGTCGGCTACGACGGGAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTTTTGGGG
AAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCACACCGCTAGCCTCGGAGGTCGAGCAT
AAAGCCCAGATCGCGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCAGGAAGAAGAGAAGGAGCAT
AAGCCTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCA
AGTCTCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAA
GGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGA*GAAGAAGATCGTTGAAGGAGACGAG
AAGAAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAAACCTGAT
GATTCTCAAGCCTTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGTGGAGCAT
CCGGAGGAGAAGAAAGGTATTCTTGAGAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCT
AAGAGCACTGAAGAGGATGAGGAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTGATGCTTAAGAAAATGAT
ATAAATAATGTTGGAGTGGGACAGTTGCTGTGTT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR2FP04TF 824 0 0
GG
ACAGCTCTTTACAATCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGATTATCAGT
TCTCGTTAATTGTTCAGTTAATCAAGAGTAACTAACCATGGCCGAAGAGTACAAGAACGC
TTCTGAGGAGTTCAAGAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACGGAAGA
ACCGTCGGCTACGACGGGAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTTTTGGGGAAAAA
GGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCACACCGCTAGCCTCGGAGGTCGAGCATAAAGC
CCAGATCACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCAGGAAGAAGAGAAGGAGCATAAGCC
TACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCTGAAGCACGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCAAGTCT
CTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGA
AGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGA***AGAAGATCGTTGAAGGAGACGAGAAGAA
GGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAAACCTGATGATTC
TCAAGCCCTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGGAGGAAAAG*TGGAGCATCCGGA
GGAGAAGAAAGGTATTCTTGAGAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGCTATCACGCTAAGAG
CACTGAAGAGGATGAGGAGAG**AAGAAAAGGAGTCTGATGCTTAAGAAA*TGATATAAA
TAATGTTGGAGTGGGACAGTTGCTGTGTT
CTTCTGTGATGAT

QA 3 811 3 811
DS 

RD RR2FP04JQ 718 0 0
AAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCACACCGCTAGCCTCGGAGGTCGAGCATAA
AGCCCAGATCACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCAGGAAGAAGAGAAGGAGCATAA
GCCTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCTGAAGCACGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCAAG
TCTCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGG
TGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGA***AGAAGATCGTTGAAGGAGACGAGAA
GAAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAAACCTGATGA
TTCTCAAGCCCTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGTGGAGCATCC
GGAGGAGAAGAAAGGTATTCTTGAGAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGCTATCACGCTAA
GAGCACTGAAGAGGATGAGGAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTGATGCTTAAGAAAATGATAT
AAATAATGTTGGAGTGGGACAGTTGCTGTGTTTCTTTCTGTGATGATTTATATTTTATCT
TTAAGCTATTCTGTAAGATTGTGTCTTTCGTTGGTTTGCATTCTTCACCGCTATATTGTA
ATTTCAGTATCTCTTTTTTTAAACTTCGCATATGGTTTCTAAGTAATGTT
CATTTGCT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2A116JQ 506 0 0
CTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGA
TCGTTGAAGGAGACGAGAAGAAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTC
ACAGTGAAAAACCTGATGATTCTCAAGCCTTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGG
AGGAAAAGGTGGAGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGTATTCTTGAGAAGATCAAAGAGAAGC
TTCCAGGTTATCACGCTAAGAGCACTGAAGAGGATGAGGAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTG
ATGCTTAAGAAAATGATATAAATAATGTTGGAGTGGGACAGTTGCTGTGTTTCTTTCTGT
GATGATTTATATTTTATCTTTAAGCTATTCTGTAAGATTGTGTCTTTCGTTGGTTTGCAT
TCTTCACCGCTATATTGTAATTTCAGTATCTCTTTTTT*AAACTTCGCATATGGTTTCTA
AGTAATGTTCATTTTCTATCTCCACA

QA 1 506 1 506
DS 



CO CL167Contig2 981 5 9 U
GGGATCACAGCTCTTTACAATCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGTTT
ATCACTTCTCGTTAACTGTTCAGTTAATCAAGAGTAACTAACCATGGCCGAAGAGTACAA
GAACGCTTCTGAGGAATTCAAGAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCAC
GGAAGAACCGTCGGCTACGACGGGAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGG
GAAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCGCACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCA
TAAAGCCCAGATCACGGGAGAGACGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGCATAAGCC
TACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAAGAAGAGAACAAGCCAAGTCT
CTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGA
AGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGACGAGAAGAAGGG
AGTGATGGAAAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAAACCTGATGATTCTCA
AGTCGTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGCGGAGCATTCAGAGGA
GAAGAAAGGGATTCTTGAAAAGATCACGGGAGGAGGAGGAGGATTCCAGGTTATCACGCT
AAGAGCACTGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTGATGCTTAAGAAAGATGA
TATAAATAATGTCGGAGTGGGACAGTTGCTGTGTTTCTTTCTGTGATGATTTATATTATA
TCTTTAAGCTATTCTGTAAGATTGCGTCTTTCGTTGGTTTGCATTCTTCACCGCTATATT
GTAATTTCAGTATCTCTTTTGTAAACTTCGCATATGGTTACTAAGTAATGTTTCGAGTTA
TGTGTGTAATGTTCATTTGCT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G827TF U 2
AF RR2DT57TF U 1
AF RR2CF34TF U 2
AF RR2DT57JQ C 640
AF RR2G827JQ C 261
BS 1 639 RR2DT57TF
BS 640 641 RR2CF34TF
BS 642 642 RR2G827JQ
BS 643 671 RR2CF34TF
BS 672 685 RR2G827JQ
BS 686 686 RR2DT57JQ
BS 687 939 RR2G827JQ
BS 940 940 RR2DT57JQ
BS 941 981 RR2G827JQ

RD RR2G827TF 585 0 0
GGATCACAGCTCTTTACAATCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCTTTTTCTCTGTTTA
TCACTTCTCGTTAACTGTTCAGTTAATCAAGAGTAACTAACCATGGCCGAAGAGTACAAG
AACGCTTCTGAGGAATTCAAGAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACG
GAAGAACCGTCGGCTACGACGGGAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGG
AAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCGCACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCAT
AAAGCCCAGATCACGGGAGAGACGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGCATAAGCCT
ACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAAGAAGAGAACAAGCCAAGTCTC
TTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAA
GACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGACGAGAAGAAGGGA
GTGATGGAAAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAAA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2DT57TF 639 0 0
GGGATCACAGCTCTTTACAATCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGTTT
ATCACTTCTCGTTAACTGTTCAGTTAATCAAGAGTAACTAACCATGGCCGAAGAGTACAA
GAACGCTTCTGAGGAATTCAAGAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCAC
GGAAGAACCGTCGGCTACGACGGGAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGG
GAAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCGCACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCA
TAAAGCCCAGATCACGGGAGAGACGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGCATAAGCC
TACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAAGAAGAGAACAAGCCAAGTCT
CTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGA
AGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGACGAGAAGAAGGG
AGTGATGGAAAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAAACCTGATGATTCTCA
AGTCGTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGGAGGA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2CF34TF 670 0 0
GGATCACAGCTCTTTACAATCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGTTTA
TCACTTCTCGTTAACTGTTCAGTTAATCAAGAGTAACTAACCATGGCCGAAGAGTACAAG
AACGCTTCTGAGGAATTCAAGAGCGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACG
GAAGAACCGTCGGCTACGACGGGAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGG
AAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCGCACCGCTATCTTCGGAGGTCGAGCAT
AAAGCCCAGATCACGGGAGAGACGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGCATAAGCCT
ACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAAGAAGAGAACAAGCCAAGTCTC
TTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAA
GACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGACGAGAAGAAGGGA
GTGATGGAAAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAA*CCTGATGATTCTCAA
GTCGTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGGAGGAAA*GGCGGAGCATTCAGAGGAG
AAGAAAGGGA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2DT57JQ 328 0 0
AAAGGCGGAGCATTCAGAGGAGAAGAAAGGGATTCTTGAAAAGATCACGGGAGGAGGAGG
AGGATTCCAGGTTATCACGCTAAGAGCACTGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGAAAAGGAG
TCTGATGCTTAAGAAAGATGATATAAATAATGTCGGAGTGGGACAGTTGCTGTGTTTCTT
TCTGTGATGATTTATATTATATCTTTAAGCTATTCTGTAAGATTGCGTCTTTCGTTGGTT
TGCATTCTTCACCGCTATATTGTAATTTCAGTATCTCTTTTGTAAACTTCGCATATGGTT
ACTAAGTAATGTT
TCGAGTTATGTGTGT

QA 1 313 1 313
DS 

RD RR2G827JQ 721 0 0
CTCAAGAAACGACCGCACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCATAAAGCCCAGATCACGGGAG
AGACGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGCATAAGCCTACTCTCCTCGAGCAGCTTC
ACCAGAAGCACGAGGAGGAAGAAGAGAACAAGCCAAGTCTCTTCCAGAAGCTTCACCGAT
CCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGA
AGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGACGAGAAGAAGGGAGTGATGGAAAAGATCAAGG
AGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAAACCTGATGATTCTCAAGTCGTCAACACGGAGGCTG
CAGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGCGGAGCATTCAGAGGAGAAGAAAGGGATTCTTGAAA
AGATCGCGGGAGGAGGAGGAGGATTCCAGGTTATCACGCTAAGAGCACTGAAGAGGAGGA
GGAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTGATGCTTAAGAAAGATGATATAAATAATGTCGGAGTGG
GACAGTTGCTGTGTTTCTTTCTGTGATGATTTATATTATATCTTTAAGCTATTCTGTAAG
ATTGCGTCTTTCGTTGGTTTGCATTCTTCACCGCTATATTGTAATTTCAGTATCTCTTTT
GTAAACTTCGCATATGGTTTCTAAGTAATGTTTCGAGTTATGTGTGTAATGTTCATTTGC
T

QA 1 721 1 721
DS 



CO CL167Contig3 890 3 11 U
GGATCACAGCTCTTTACACTCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGTTTA
TCACTTCTCGTTAACTGTTCAGTCTATCAAGAGTAACTAACCATGGCCGAAGAGTACAAG
AACGCTTCTGAGGAGTTCAAGAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACG
GAGGAACCGTCGGCTACGACGGCAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGG
AAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCGCACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCAT
AAAGCCCAGATCACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGAGAAGCACGAAGAAGAGAAGGAGCAT
AAGCCTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCA
AGTCTCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAA
GGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGATGAGAAG
AAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAAACCTGATGAT
TCTCAAGTCGTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGCGGAGCATCCA
GAGGAGAAGAAAGGGATTCTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCTAAG
AGCACTGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTGATGCTTAAGAAAGATGATAT
AAATAATGTTGGAGTGGGATGGGACAGTTGCTGTGTTTCTTTCTGTGATGATTTATCTTT
TATCTTTAAGCTATTCTGTAAGATTATGTCTATGACAACCCGTTCCGTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW39TF U 1
AF RR2G922TF U 1
AF RR2DW39JQ C 231
BS 1 283 RR2DW39TF
BS 284 388 RR2G922TF
BS 389 389 RR2DW39JQ
BS 390 488 RR2G922TF
BS 489 489 RR2DW39JQ
BS 490 529 RR2G922TF
BS 530 530 RR2DW39JQ
BS 531 590 RR2G922TF
BS 591 591 RR2DW39JQ
BS 592 601 RR2G922TF
BS 602 890 RR2DW39JQ

RD RR2DW39TF 283 0 0
GGATCACAGCTCTTTACACTCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGTTTA
TCACTTCTCGTTAACTGTTCAGTCTATCAAGAGTAACTAACCATGGCCGAAGAGTACAAG
AACGCTTCTGAGGAGTTCAAGAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACG
GAGGAACCGTCGGCTACGACGGCAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGG
AAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCGCACCGCTAG

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR2G922TF 601 0 0
GGATCACAGCTCTTTACACTCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGTTTA
TCACTTCTCGTTAACTGTTCAGTCTATCAAGAGTAACTAACCATGGCCGAAGAGTACAAG
AACGCTTCTGAGGAGTTCAAGAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACG
GAGGAACCGTCGGCTACGACGGCAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGG
AAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCGAGAAACGACCGCACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCAT
AAAGCCCAGATCACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGAGAAGCACGAAGAAGAGAAGGAGCAT
AAGCCTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCTGAAGCACGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCA
AGTCTCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAA
GGTGAAGATGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAG*AGATGAGAAG
AAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAA*CCTGATGAT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2DW39JQ 660 0 0
TTTCTTGGGGAAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCGCACCGCTAGCTTCGGA
GGTCGAGCATAAAGCCCAGATCACGGGAGAGCCGGCGTTTGTGGAGAAGCACGAAGAAGA
GAAGGAGCATAAGCCTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCACGAGGAGGAGGAAGA
GAACAAGCCAAGTCTCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAG
CGAGGAAGAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGG
AGATGAGAAGAAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAA
ACCTGATGATTCTCAAGTCGTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGC
GGAGCATCCAGAGGAGAAGAAAGGGATTCTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTA
TCACGCTAAGAGCACTGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGAAAAGGAGTCTGATGCTTAAGA
AAGATGATATAAATAATGTTGGAGTGGGATGGGACAGTTGCTGTGTTTCTTTCTGTGATG
ATTTATCTTTTATCTTTAAGCTATTCTGTAAGATTATGTCTATGACAACCCGTTCCGTGG

QA 1 660 1 660
DS 



AS 2 15

CO CL168Contig1 906 3 11 U
GGATTGATTCTATTAGTTTAATAGTATGGAAACGAAAACAAACTCCATTATTATTTATTT
AGTTGCGATAGGATATCTGGACTCATAGGAGGTGGATGCATGGGAACAACAAATACATGA
AAGAAAGATGCTCAATCAGTTCTTGTAGTAGAGTGGATTCGGGAGCTTGAAAGTCCTTCT
CCCAGGGCTGTCTTTAGCCAAATCAGCCCATTGGTCTCCAATATTCCCAATGATAGTGTG
GCCACTCCTCACCAGCCTCTTCCTCTCCTTTGACTTGAAATTTGATATCTTCGTGTTCGA
ACCCGTTGGTTTGAATAAGATTTGTCTCCAATAGGTGAAGCCCGCAGCTTCGAGATTCTT
TAGAGTGACTTCCTCCAACTCTTGGTAACGCTCAGTGAGTAAGATAGGCTCAATCCCCAA
CTCTTGGATGTTTTGGTAAAGATGCAAAGTCTCTGGGAGCACGGGAACTTCTCCGGCCTC
CAGCCACTTCCGGAAAGCATTCGGGTCTCGTCAAGGTCAAAGATCCAAACATTGACGGTG
TCATTCTTCAAAGCAAGTCCTTTGGCGTAGAAATAAGCTTCTTTGCACACCGTTTTGGAG
TCAGCACGGTACTGTACGGAAGTGAGGTAGTCTTCAACATAGTCTTTGCAATTTGCGGAC
ACTGTCTGGAAGTTTATGATGTTAGAGGTCTCAACACCAAGGTGCCAGCTTCTGCAGTTG
GGGTAGCTGATGGCGAGTCGTTGTTCCTCTGAGAGTTCGGCTTCATTGGTTGATGTGAGG
AGTTCAATGAGCCTAGGCACATTTAGCGAAGGTCGGCCTTGGGAGACCGTAGCGGCCAAG
AGCAAGAGAAGTGAAAGTGAGAGGATCTTCATTTTTTTAGTATAGTTATTGTTTCAGTTG
TGATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT56JQ U 1
AF RR2FG43JQ U 1
AF RR2FG43TF C 129
BS 1 150 RR2AT56JQ
BS 151 151 RR2FG43JQ
BS 152 318 RR2AT56JQ
BS 319 319 RR2FG43JQ
BS 320 351 RR2AT56JQ
BS 352 352 RR2FG43JQ
BS 353 362 RR2AT56JQ
BS 363 363 RR2FG43JQ
BS 364 401 RR2AT56JQ
BS 402 681 RR2FG43JQ
BS 682 906 RR2FG43TF

RD RR2AT56JQ 401 0 0
GGATTGATTCTATTAGTTTAATAGTATGGAAACGAAAACAAACTCCATTATTATTTATTT
AGTTGCGATAGGATATCTGGACTCATAGGAGGTGGATGCATGGGAACAACAAATACATGA
AAGAAAGATGCTCAATCAGTTCTTGTAGTAAAGTGGATTCGGGAGCTTGAAAGTCCTTCT
CCCAGGGCTGTCTTTAGCCAAATCAGCCCATTGGTCTCCAATATTCCCAATGATAGTGTG
GCCACTCCTCACCAGCCTCTTCCTCTCCTTTGACTTGAAATTTGATATCTTCGTGTTCGA
ACCCGTTGGTTTGAATAAAATTTGTCTCCAATAGGTGAAGCCCGCAGCTTCCAGATTCTT
TAAAGTGACTTCCTCCAACTCTTGGTAACGCTCAGTGAGTA

QA 1 401 1 401
DS 

RD RR2FG43JQ 681 0 0
GGATTGATTCTATTAGTTTAATAGTATGGAAACGAAAACAAACTCCATTATTATTTATTT
AGTTGCGATAGGATATCTGGACTCATAGGAGGTGGATGCATGGGAACAACAAATACATGA
AAGAAAGGTGCTTAATCAGTTCTTGTAGTAGAGTGGATTCGGGAGCTTGAAAGTCCTTCT
CCCAGGGCTGTCTTTAGCCAAATCAGCCCATTGGTCTCCAATATTCCCAATGATAGTGTG
GCCACTCCTCACCAGCCTCTTCCTCTCCTTTGACTTGAAATTTGATATCTTCGTGTTCGA
ACCCGTTGGTTTGAATAAGATTTGTCTCCAATAGGTGAAGCCCGCAGCTTCGAGATTCTT
TAGAGTGACTTCCTCCAACTCTTGGTAACGCTCAGTGAGTAAGATAGGCTCAATCCCCAA
CTCTTGGATGTTTTGGTAAAGATGCAAAGTCTCTGGGAGCACGGGAACTTCTCCGGCCTC
CAGCCACTTCCGGAAAGCATTCGGGTCTCGTCAAGGTCAAAGATCCAAACATTGACGGTG
TCATTCTTCAAAGCAAGTCCTTTGGCGTAGAAATAAGCTTCTTTGCACACCGTTTTGGAG
TCAGCACGGTACTGTACGGAAGTGAGGTAGTCTTCAACATAGTCTTTGCAATTTGCGGAC
ACTGTCTGGAAGTTTATGATG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2FG43TF 778 0 0
GGTGCTTATCAG
TCTTGTAGTAGAGTGGATTCGGGAGCTTGAAAGTCAT*CTCCCAGGGCTGTCTTTAGCCA
AATCAGCCCATTGGTCTCCAATATTCCCAATGATAGTGTGGCCACTCCTCACCAGCCTCT
TCCTCTCCTTTGACTTGAAATTTGATATCTTCGTGTTCGAACCCGTTGGTTTGAATAAGA
TTTGTCTCCAATAGGTGAAGCCCGCAGCTTCGAGATTCTTTAGAGTGACTTCCTCCAACT
CTTGGTAACGCTCAGTGAGTAAGATAGGCTCAATCCCCAACTCTTGGATGTTTTGGTAAA
GATGCAAAGTCTCTGGGAGCACGGGAACTTCTCCGGCCTCCAGCCACTTCCGGAAAGCAT
TCGGGTCTCGTCAAGGTCAAAGATCCAAACATTGACGGTGTCATTCTTCAAAGCAAGTCC
TTTGGCGTAGAAATAAGCTTCTTTGCACACCGTTTTGGAGTCAGCACGGTACTGTACGGA
AGTGAGGTAGTCTTCAACATAGTCTTTGCAATTTGCGGACACTGTCTGGAAGTTTATGAT
GTTAGAGGTCTCAACACCAAGGTGCCAGCTTCTGCAGTTGGGGTAGCTGATGGCGAGTCG
TTGTTCCTCTGAGAGTTCGGCTTCATTGGTTGATGTGAGGAGTTCAATGAGCCTAGGCAC
ATTTAGCGAAGGTCGGCCTTGGGAGACCGTAGCGGCCAAGAGCAAGAGAAGTGAAAGTGA
GAGGATCTTCATTTTTTTAGTATAGTTATTGTTTCAGTTGTGATCC

QA 13 778 13 778
DS 



CO CL168Contig2 938 12 13 U
GGATCACAACTGAAACAATAACTATACTAAAAAAATGAAGATCCTCTCACTTTCACTTCT
CTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTAAATGTGCCTAGGCTCAT
TGAACTCCTCACATCAACCAATGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCGCCATCAG
CTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTTCCA
GACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGTACAGTACCG
TGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAA
GAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGTTCC
CTTTTACGCTCAGTATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCGAATGCTTTCCGGAAGTG
GCTGGAGGCCGGAGAAGTTCCCGTGCTCCCAGAGACTTTGCATCTTTACCAAAACATCCA
AGAGTTGGGGATTGAGCCTATCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGG*AGGAAGTCA
CTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCGGGCTTCACCTATTGGAGACAAATCTTATTCAAACCAA
CGGGTTCGAACACGAAGATATCAAATTTCAAGTCAAAGGAGAGGAAGAGGCTGGTGAGGA
GTGGCCACACTATCATTGGGAATATTGGAGACCAATGGGCTGATTTGGCTAAAGACAGCC
CTGGGAGAAGGACTTTCAAGCTCCCGAATCCACTCTACTACAAGAACTGATTAAGCATCT
TTCTTTCATGTATTTGTTGTTCCCATGCATCCACCTCCTATGAGTCCAGATATCCTATCG
CAACTAAATAAATAATAATGGAGTTTGTTTTCGTTTCC


BQ
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 35 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK27TF U 1
AF RR2D080TF U 235
AF RR2AY68TFB U 1
AF RR2FG15TF U 1
AF RR2H156TF U 65
AF RR2H903TF U 1
AF RR2AT56TF U 2
AF RR2B108TF U 320
AF RR2D080JQ C 413
AF RR2AY68JQ C 117
AF RR2H903JQ C 213
AF RR2H156JQ C 341
BS 1 136 RR2AY68TFB
BS 137 137 RR2EK27TF
BS 138 463 RR2AY68TFB
BS 464 464 RR2EK27TF
BS 465 688 RR2AY68TFB
BS 689 698 RR2FG15TF
BS 699 714 RR2AT56TF
BS 715 777 RR2B108TF
BS 778 814 RR2AY68JQ
BS 815 815 RR2D080JQ
BS 816 930 RR2AY68JQ
BS 931 931 RR2H903JQ
BS 932 938 RR2H156JQ

RD RR2EK27TF 504 0 0
GGATCACAACTGAAACAATAACTATACTAAAAAAATGAAGATCCTCTCACTTTCACTTCT
CTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTAAATGTGCCTAGGCTCAT
TGAACTCCTCACATCAACCAATGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCGCCATCAG
CTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTTCCA
GACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGTACAGTACCG
TGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAA
GAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGTTCC
CTTTTACGCTCAGTATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCGAATGCTTTCCGGAAGTG
GCTGGAGGCCGGAGAAGTTCCCGT

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2D080TF 408 0 0
CTTCCGGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGTACA
GTACCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGC
TTTGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAA
TGTTCCCTTTTACGCTCAGTATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCGAATGCTTTCCG
GAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGTTCCCGTGCTCCCAGAGACTTTGCATCTTTACCAAAA
CATCCAAGAGTTGGGGATTGAGCCTATCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGG*AGG
AAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCGGGCTTCACCTATTGGAGAC

QA 1 408 1 408
DS 

RD RR2AY68TFB 688 0 0
GGATCACAACTGAAACAATAACTATACTAAAAAAATGAAGATCCTCTCACTTTCACTTCT
CTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTAAATGTGCCTAGGCTCAT
TGAACTCCTCACATCAGCCAATGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCGCCATCAG
CTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTTCCA
GACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGTACAGTACCG
TGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAA
GAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGTTCC
CTTTTACGCTCAGTATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCGGATGCTTTCCGGAAGTG
GCTGGAGGCCGGAGAAGTTCCCGTGCTCCCAGAGACTTTGCATCTTTACCAAAACATCCA
AGAGTTGGGGATTGAGCCTATCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGG*AGGAAGTCA
CTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCGGGCTTCACCTATTGGAGACAAATCTTATTCAAACCAA
CGGGTTCGAACACGAAGATATCAAATTT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2FG15TF 702 0 0
GGATCACAACTGAAACAATAACTATACTAAAAAAATGAAGATCCTCTCACTTTCACTTCT
CTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTAAATGTGCCTAGGCTCAT
TGAACTCCTCACATCAACCAATGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCGCCATCAG
CTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTTCCA
GACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGTACAGTACCG
TGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAA
GAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGTTCC
CTTTTACGCTCAGTATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCGAATGCTTTCCGGAAGTG
GCTGGAGGCCGGAGAAGTTCCCGTGCTCCCAGAGACTTTGCATCTTTACCAAAACATCCA
AGAGTTGGGGATTGAGCCTATCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGG*AGGAAGTCA
CTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCGGGCTTCACCTATTGGAGACAAATCTTATTCAAACCAA
CGGGTTCGAACACGAAGATATCAAATTTCAAGTCAAAG
AGAG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2H156TF 626 0 0
CTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTAAATGTGCCTAGGCTCATTGAA
CTCCTCACATCAACCAATGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCGCCATCAGCTAC
CCCAACTGCAGAAGCTG*CACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTTCCAGACA
GTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGTACAGTACCGTGCT
GACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAAGAAT
GACTC*GTCAATGTTTGGATCTTCGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGTTCCCTTT
TACGCTCAGTATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCGAATGCTTTCCGGAAGTGGCTG
GAGGCCGGAGAAGTTCCCGTGCTCCCAGAGACTTTGCATCTTTACCAAAACATCCAAGAG
TTGGGGATTGAGCCTATCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGGGAGGAAGTCACTCT
AAAGAATCTCGAAGCTGTGGGCTTCACCTATTGGAGACAAATCTTATTCAAACCAACGGG
TTCGAACACGAAGATATCAAATTTCA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2H903TF 701 0 0
GGATCACAACTGAAACAATAACCATACTAAAAAA*TGAAGATCCTCTCACTTTCACTTCT
CTTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTAAATGTGCCTAGGCTCAT
TGAACTCCTCACATCAACCAATGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCGCCATCAG
CTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTTCCA
GACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGTACAGTACCG
TGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAA
GAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGAC*TTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGTTCC
CTTTTACGCTCAGTATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCGAATGCTTTCCGGAAGTG
GCTGGAGGCCGGAGAAGTTCCCGTGCTCCCAGAGACTTTGCATCTTTACCAAAACATCCA
AGAGTTGGGGATTGAGCCTATCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGG*AGGAAGTCA
CTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCGGGCTTCACCTATTGGAGACAAATCTTATTCAAACCAA
CGGGTTCGAACACGAAGATATCAAATTTCAAGTCAAAG
AGA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2AT56TF 713 0 0
GATCACAACTGAAACAATAACTATACTAAAAAAATGAAGATCCTCTCACTTTCACTTCTC
TTGCTCTTGGCCGCTACGGTCTCCCAAGGCCGACCTTCGCTAAATGTGCCTAGGCTCATT
GAACTCCTCACATCAACCAATGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCGCCATCAGC
TACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACTTCCAG
ACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGTACAGTACCGT
GCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACACCAAAGGACTTGCTTTGAAG
AATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGTTCCC
TTTTACGCTCAGTATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCGAATGCTTTCCGGAAGTGG
CTGGAGGCCGGAGAAGTTCCCGTGCTCCCAGAGACTTTGCATCTTTACCAAAACATCCAA
GAGTTGGGGATTGAGCCTATCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGG*AGGAAGTCAC
TCTAAAGAATCTCGAAGCTGCGGGCTTCACCTATTGGAGACAAATCTTATTCAAACCAAC
GGGTTCGAACACGAAGATATCAAATTTCAAGTCAAAGGAGAGGAAGAGGCTGG

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2B108TF 458 0 0
TGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAAGAATGACACCGTCAATGTT
TGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCCAATGTTCCCTTTTACGCTCAGTATGGA
TACGGGACAGAGAAGCAAGACCCGAATGCTTTCCGGAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGTT
CCCGTGCTCCCAGAGACTTTGCATCCTTACCAAAACGTCCAAGAGTTGGGGATTGAGCCT
ATCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGG*AGGAAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGC
TGCGGGCTTCACCTATTGGAGACAAATCTTATTCAAACCAACGGGTTCGAACACGAAGAT
ATCAAATTTCAAGTCAAAGGAGAGGAAGAGGCTGGTGAGGAGTGGCCACACTATCATTGG
GAATATTGGAGACCAATGGGCTGATTTGGCTAAAGACA

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2D080JQ 464 0 0
AATGTTCCCTTTTACGCTCAGTATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCGAATGCTTTC
CGGAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGTTCCCGTGCTCCCAGAGACTTTGCATCTTTACCAA
AACATCCAAGAGTTGGGGATTGAGCCTATCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGG*A
GGAAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCGGGCTTCACCTATTGGAGACAAATTTTATT
CAAACCAACGGGTTCGAACACGAAGATATCAAATTTCAAGTCAAAGGAGAGGAAGAGGCT
GGTGAGGAGTGGCCACACTATCATTGGGAATATTGGAGACCAATGGGCTGATTTGGCTAA
AGACAGCCCTGGGAGAAGGACTTTCAAGCTCCCGAATCCACTCTACTACAAGAACTGATT
AAGCATCTTTCTTTCATGTATTTGTTGTTCCCATGCATCCACCT

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2AY68JQ 816 0 0
TCATTGAACTCCTCACATCAGCCAATGAAGCCGAACTCTCAGAGGAACAACGACTCGCCA
TCAGCTACCCCAACTGCAGAAGCTGGCACCTTGGTGTTGAGACCTCTAACATCATAAACT
TCCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTGAAGACTACCTCACTTCCGTACAGT
ACCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTTATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTT
TGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGACCTTGACGAGACCCTCCTCTCTAATG
TTCCCTTTTACGCTCAGTATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGACCCGGATGCTTTCCGGA
AGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGTTCCCGTGCTCCCAGAGACTTTGCATCTTTACCAAAACA
TCCAAGAGTTGGGGATTGAGCCTATCTTACTCACTGAGCGTTACCAAGAGTTGG*AGGAA
GTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGCGGGCTTCACCTATTGGAGACAAATCTTATTCAAA
CCAACGGGTTCGAACACGAAGATATCAAATTTCAAGTCAAAGGAGAGGAAGAGGCTGGTG
AGGAGTGGCCACACTATCATTGGGAATATTGGAGACCAATGGGCTGATTTGGCTAAAGAC
AGCCCTGGGAGAAGGACTTTCAAGCTCCCGAATCCACTTTACTACAAGAACTGATTAAGC
ATCTTTCTTTCATGTATTTGTTGTTCCCATGCATCCACCTCCTATGAGTCCAGATATCCT
ATCGCAACTAAATAAATAATAATGGAGTTTGTTT
CC

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR2H903JQ 719 0 0
TTGAGACCTCTAACATCATAAACTTCCAGACAGTGCCCGCAAATTGCAAAGACTATGTTG
AAGACTACCTCACTTCCGTACAGTACCGTGCTGACTCCAAAACGGTGTGCAAAGAAGCTT
ATTTCTACGCCAAAGGACTTGCTTTGAAGAATGACACCGTCAATGTTTGGATCTTTGAC*
TTGACGAGACCCTCCTCTCTAATGTTCCCTTTTACGCTCAGTATGGATACGGGACAGAGA
AGCAAGACCCGAATGCTTTCCGGAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGTTCCCGTGCTCCCAG
AGACTTTGCATCTTTACCAAAACATCCAAGAGTTGGGGATTGAGCCTATCTTACTCACTG
AGCGTTACCAAGAGTTGG*AGGAAGTCACTTTAAAGAATCTCGAAGCTGCGGGCTTCACC
TATTGGAGACAAATTTTATTCAAACCAACGGGTTCGAACACGAAGATATCAAATTTCAAG
TCAAAGGAGAGGAAGAGGCTGGTGAGGAGTGGCCACACTATCATTGGGAATATTGGAGAC
CAATGGGCTGATTTGGCTAAAGACAGCCCTGGGAGAAGGACTTTCAAGCTCCCGAATCCA
CTTTACTACAAGAACTGATTAAGCATCTTTCTTTCATGTATTTGTTGTTCCCATGCATCC
ACCTCCTATGAGTCCAGATATCCTATCGCAACTAAATAAATAATAATGGAGTTTGTTTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2H156JQ 598 0 0
GCCAAAGGACTTGCTTTGAAGAATGACTC*GTCAATGTTTGGATCTTCGACCTTGACGAG
ACCCTCCTCTCTAATGTTCCCTTTTACGCTCAGTATGGATACGGGACAGAGAAGCAAGAC
CCGAATGCTTTCCGGAAGTGGCTGGAGGCCGGAGAAGTTCCCGTGCTCCCAGAGACTTTG
CATCTTTACCAAAACATCCAAGAGTTGGGGATTGAGCCTATCTTACTCACTGAGCGTTAC
CAAGAGTTGG*AGGAAGTCACTCTAAAGAATCTCGAAGCTGTGGGCTTCACCTATTGGAG
ACAAATCTTATTCAAACCAACGGGTTCGAACACGAAGATATCAAATTTCAAGTCAAAGGA
GAGGAAG*GGCTGGTGAGGAGTGGCCACACTATCATTGGGAATATTGGAGACCAATGGGC
TGATTTGGCTAAAGACAGCCCTGGGAGAAGGACTTTCAAGCTCCCGAATCCACTCTACTA
CAAGAACTGATTAAGCATCTTTCTTTCATGTATTTGTTGTTCCCATGCATCCACCTCCCA
TGAGTCCAGATATCCTATCGCAACTAAATAAATAATAATGGAGTTTGTTTTCGTTTCC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 2 17

CO CL169Contig1 1190 7 9 U
GGGAAAATCTCTGTTATATATCAGAAGTAGTAGCTTCCTCACTACGGAGAACACAACCAC
TCAGAATCACAATGAAGTTCCTTCTTCATCTCTCTGTCTTGTTGTCCATACTCTTCATCT
CTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCAAATGACAAGATTGCCCTCCTCGAAATCAAGA
AAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTGGAACCCCCAAACCGACTCCTGCACCA
CCTGGACCGGCGTAGAGTGCACCAACGGCCGTGTCACCGCCCTCACCATATCCTCCGGCG
AAATATCCGGCCAGATCCCGGTTCAGATCGGCGACCTCCTTGAGCTCCGTACGCTTGACT
TCAGTTACTTGACTCATCTCACTGGAAACATTCCACACACCATCACCAAACTCAAGTACC
TGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCCGGTCCAATCCCTGATTTCATCAGCG
AGCTCAAGAGTGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTACCGGTCCAATTCCCG
GGTCGCTTTCTCAGATGCCTAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACAACAATAAGTTAACCG
GTTCAATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACAGTTCCTAATCTCTACCTGTATA
ACAATAAGCTCTCAGGAAAAGTACCAGAATCGTTGTCAAAGTACGACTTTAACGCAGTGG
ATCTGTCGGGAAACGGTTTCACAGGAGATGGTTCGATGTTTTTCGGACGTAACAAAACAA
CAATACGTGTGAATCTATGCAGGAACATGTTTGAGTTCGATCTCTCCAAGGTTAAGTTTG
CTAGGAGCATAGTGTCGTTGGATTTGAGCCACAACAAAATCTTCGGGAAGTTTCCTAGGG
AGCTGAGCAAGCTGCGTCTCGAGCATTTCGACGTTAGTTACAATCATTTATGCGGAAAAA
TCCCACGTGGTGGTCTCCTTCAGACATTTGAACCATCTGCTTTCTCTCACAACCTCTGTC
TTTGTGGGACCCCACTTAAGGCTTGTTGATTTGGTTTAATGGCGTGAGAAGAAATAAGTA
GTATGTCTTTATCTGTATGATGATGATGTGTTAATTATCAGGCCGCCTATCAAGTGAATT
GTTCTATTTAATAAAATTAATGTTAAGAGTTTGGTAAGAATGTTGTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B176TF U 1
AF RR2EO47TF U 46
AF RR2AN87TF U 46
AF RR2EO47JQ C 475
AF RR2B176JQ C 433
AF RR2AN87JQ C 562
AF RR2AB05TF U 704
BS 1 45 RR2B176TF
BS 46 47 RR2EO47TF
BS 48 658 RR2B176TF
BS 659 798 RR2AN87TF
BS 799 863 RR2AB05TF
BS 864 864 RR2B176JQ
BS 865 1032 RR2AB05TF
BS 1033 1033 RR2B176JQ
BS 1034 1190 RR2AB05TF

RD RR2B176TF 658 0 0
GGGAAAATCTCTGTTATATATCAGAAGTAGTAGCTTCCTCACTACTCAGAACACAACCAC
TCAGAATCACAATGAAGTTCCTTCTTCATCTCTCTGTCTTGTTGTCCATACTCTTCATCT
CTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCAAATGACAAGATTGCCCTCCTCGAAATCAAGA
AAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTGGAACCCCCAAACCGACTCCTGCACCA
CCTGGACCGGCGTAGAGTGCACCAACGGCCGTGTCACCGCCCTCACCATATCCTCCGGCG
AAATATCCGGCCAGATCCCGGTTCAGATCGGCGACCTCCTTGAGCTCCGTACGCTTGACT
TCAGTTACTTGACTCATCTCACTGGAAACATTCCACACACCATCACCAAACTCAAGTACC
TGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCCGGTCCAATCCCTGATTTCATCAGCG
AGCTCAAGAGTGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTACCGGTCCAATTCCCG
GGTCGCTTTCTCAGATGCCTAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACAACAATAAGTTAACCG
GTTCAATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACAGTTCCTAATCTCTACCTGTA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2EO47TF 613 0 0
GGAGAACACAACCACTCAGAATCACAATGAAGTTCCTTCTTCATCTCTCTGTCTTGTTGT
CCATACTCTTCATCTCTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCAAATGACAAGATTGCCC
TCCTCGAAATCAAGAAAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTGGAACCCCCAAA
CCGACTCCTGCACCACCTGGACCGGCGTAGAGTGCACCAACGGCCGTGTCACCGCCCTCA
CCATATCCTCCGGCGAAATATCCGGCCAGATCCCGGTTCAGATCGGCGACCTCCTTGAGC
TCCGTACGCTTGACTTCAGTTACTTGACTCATCTCACTGGAAACATTCCACACACCATCA
CCAAACTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCCGGTCCAATCC
CTGATTTCATCAGCGAGCTCAAGAGTGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTA
CCGGTCCAATTCCCGGGTCGCTTTCTCAGATGCCTAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACA
ACAATAAGTTAACCGGTTCAATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACAGTTCCTA
ATCTCTACCTGTA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2AN87TF 753 0 0
GGAGAACACAACCACTCAGAATCACAATGAAGTTCCTTCTTCATCTCTCTGTCTTGTTGT
CCATACTCTTCATCTCTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCAAATGACAAGATTGCCC
TCCTCGAAATCAAGAAAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTG*AACCCCCAAA
CCGACTCCTGCACCACCTGGACCGGCGTAGAGTGCACCAACGGCCGTGTCACCGCCCTCA
CCATATCCTCCGGCGAAATATCCGGCCAGATCTCGGTTCAGATCGGCGACCTCCTTGAGC
TCCGTACGCTTGACTTCAGTTACTTGACTCATCTCACTGGAAACATTCCACACACCATCA
CCAAACTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCCGGTCCAATCC
CTGATTTCATCAGCGAACTCAAGAGTGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTA
CCGGTCCAATTCCCGGGTCGCTTTCTCAGATGCCTAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACA
ACAATAAGTTAACCGGTTCAATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACAGTTCCTA
ATCTCTACCTGTATAACAATAAGCTCTCAGGAAAAGTACCAGAATCGTTGTCAAAGTACG
ACTTTAACGCAGTGGATCTGTCGGGAAACGGTTTCACAGGAGATGGTTCGATGTTTTTCG
GACGTAACAAAACAACAATACGTGTGAATCTAT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2EO47JQ 622 0 0
TCAGCGAGCTCAAGAGTGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTACCGGTCCAA
TTCCCGGGTCGCTTTCTCAGATGCCTAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACAACAATAAGT
TAACCGGTTCAATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACAGTTCCTAATCTCTACC
TGTATAACAATAAGCTTTCAGGAAAAGTACCAGAATCGTTGTCAAAGTACGACTTTAACG
CAGTGGATCTGTCGGGAAACGGTTTCACAGGAGATGGTTCGATGTTTTTCGGACGTAACA
AAACAACAATACGTGTGAATCTATGCAGGAACATGTTTGAGTTCGATCTCTCCAAGGTTA
AGTTTGCTAGGAGCATAGTGTCGTTGGATTTGAGCCACAACAAAATTTTCGGGAAGTTTC
CTAGGGAGCTGAGCAAGCTGCGTCTCGAGCATTTCGACGTTAGTTACAATCATTTATGCG
GAAAAATCCCACGTGGTGGTCTCCTTCAGACATTTGAACCATCTGCTTTCTCTCACAACC
TCTGTCCTTGTGGGACCCCACTTAAGGCTTGTTGATTTGGTTTAATGGCGTGAGAAGAAA
TAAGTAGTATGTCTTTATCTG
C

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2B176JQ 746 0 0
GGTTAAAGGAGACCAATCTCTCCGGTCCAATCCCTGATTTCATCAGCGAGCTCAAGAGTG
TTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTACCGGTCCAATTCCCGGGTCGCTTTCTC
AGATGCCTAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACAACAATAAGTTAACCGGTTCAATACCAG
ACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACAGTTCCTAATCTCTACCTGTATAACAATAAGCTCT
CAGGAAAAGTACCAGAATCGTTGTCAAAGTACGACTTTAACGCAGTGGATCTGTCGGGAA
ACGGTTTCACAGGAGATGGTTCGATGTTTTTCGGACGTAACAAAACAACAATACGTGTGA
ATCTATGCAGGAACATGTTTGAGTTCGATCTCTCCAAGGTTAAGTTTGCTAGGAGCATAG
TGTCGTTGGATTTGAGCCACAACAAAATCTTCGGGAAGTTTCCTAGGGAGCTGAGCAAGC
TGCGTCTCGAGCATTTCGACGTTAGTTACAATCATTTATGCGGAAAAATCCCACGTGGTG
GTCTCCTTCAGACATTTGAACCATCTGCTTTCTCTCACAACCTCTGTCTTTGTGGGACCC
CACTTAAGGTTTGTTGATTTGGTTTAATGGCGTGAGAAGAAATAAGTAGTATGTCTTTAT
CTGTATGATGATGATGTGTTAATTATCAGGCCGCCTATCAAGTGAATTGTTCTATTTAAT
AAAATTAATGTTAAGAGTTTGGTAAG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2AN87JQ 614 0 0
AGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACAACAATAAGTTAACCGGTTCAATACCAGACTCTTTCG
GTTCTTTTGTAGGCACAGTTCTTAATCTCTACCTGTATAACAATAAGCTCTCAGGAAAAG
TACCAGAATCGTTGTCAAAGTACGACTTTAACGCAGTGGATCTGTCGGGAAACGGTTTCA
CAGGAGATGGTTCGATGTTTTTCGGACGTAACAAAACAACAATACGTGTGAATCTATGCA
GGAACATGTTTGAGTTCGATCTCTCCAAGGTTAAGTTTGCTAGGAGCATAGTGTCGTTGG
ATTTGAGCCACAACAAAATTTTCGGGAAGTTTCCTAGGGAGCTGAGCAAGCTGCGTCTCG
AGCATTTCGACGTTAGTTACAATCATTTATGCGGAAAAATCC*ACGTGGTGGTCTCCTTC
AGACATTTGAACCATCTGCTTTCTCTCACAACCTCTGTCTTTGTGGGACCCCACTTAAGG
CTTGTTGATTTGGTTTAATGGCGTGAGAAGAAATAAGTAGTATGTCTTTATCTGTATGAT
GATG***TGTTAATTATCAGGCCGCCTATCGAGTGAATTGTTCTATTTAATAAAATTAAT
GTTAAGAGTTTGG
C

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2AB05TF 487 0 0
G
GACTTTAACGCAGTGGATCTGTCGGGAAACGGTTTCACAGGAGATGGTTCGATGTTTTTC
GGACGTAACAAAACAACAATACGTGTGAATCTATGCAGGAACATGTTTGAGTTCGATCTC
TCCAAGGTTAAGTTTGCTAGGAGCATAGTGTCGTTGGATCTGAGCCACAACAAAATCTTC
GGGAAGTTTCCTAGGGAGCTGAGCAAGCTGCGTCTCGAGCATTTCGACGTTAGTTACAAT
CATTTATGCGGAAAAATCCCACGTGGTGGTCTCCTTCAGACATTTGAACCATCTGCTTTC
TCTCACAACCTCTGTCTTTGTGGGACCC*ACTTAAGGCTTGTTGATTTGGTTTAATGGCG
TGAGAAGAAATAAGTAGTATGTCTTTATCTGTATGATGATGATGTGTTAATTATCAGGCC
GCCTATCAAGTGAATTGTTCTATTTAATAAAATTAATGTTAAGAGTTTGGTAAGAATGTT
GTTGAG

QA 2 487 2 487
DS 



CO CL169Contig2 1148 10 20 U
GGAGAACACAACCACTCAAAATCACAATGAAGTTCCTTCCTCATCTCTCTGTCTTGTTCT
CCATACTCTTCATCTCTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCGAATGACAAGATTGCCC
TCCTCGAAATCAAGAAAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTGGAACCCACAAA
CCGACTTCTGCACCACCTGGACTGGCGTCGAGTGCACCAACGGCCGTGTCACCGCCCTCA
CCATCTCCTCCGGCGAAATATCCGGCCAGATCCCTGTTCAGATCGGCGACCTCCTTGAGC
TCCGTACGCTTGACTTCAGTTACTTGACTCATCTCACTGGAAACATTCCACACACCATCA
CCAAACTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCCGGTCCAATCC
CTGATTTCATCAGCGAGCTCAAGAGTGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTA
CCGGTCCAATTCCCAGTTCGATTTCTCAGATGCCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACG
ATAATAAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTA
ATCTCTACCTGTTTAACAATAAGCTCTCAGGAAAAGTACCAGAATCGTTGTCAAAGTACG
ACTTTAACGCAGTGGATCTGTCGGGAAACGGTTTCACAGGAGATGGTTCGATGTTTTTCG
GACGTAACAAAACAACAATACGTGTGAATATAGCCAGGAACATGTTTGAGTTCGATCTCT
CCAAGGTTAAGTTTGCTAGGAGCATAGTGTCGTTGGATCTGAGCCACAACAAAATCTTCG
GGAAGTTTCCTAGGGAGCTGAGTAAGCTGCGTCTCGAGCATTTCGACGTTAGTTACAATC
ATCTATGCGGAAAAATCCCACGTGGTGGTCTCCTTCAGACATTTGAACCATCTGCTTTCT
CTCACAACCTCTGTCTTTGTGGGACCCCACTTAAGGCTTGTTGATTTGGTTTAGTGGCGT
GAGAAGAAATAAGTAGTATGTCTTTATCTGTATGATGATGATGTGTTTAATTATCAGGCC
GCCTATCAAGTGAATTGTTCTATTTAATAAAATTAATGCTAAGAGTTTGGTAAGAATGTT
GTTGAGAT


BQ
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2GK91TF U 1
AF RR2H840TF U 1
AF RR2GN88TF U 1
AF RR2BQ76TF U 1
AF RR2FV63TF U -3
AF RR2BQ76JQ C 386
AF RR2FV63JQ C 425
AF RR2GN88JQ C 441
AF RR2C145JQ C 533
AF RR2C145TF U 533
BS 1 611 RR2BQ76TF
BS 612 612 RR2GK91TF
BS 613 630 RR2BQ76TF
BS 631 631 RR2FV63TF
BS 632 634 RR2BQ76TF
BS 635 635 RR2GN88TF
BS 636 666 RR2BQ76TF
BS 667 667 RR2GN88TF
BS 668 687 RR2BQ76TF
BS 688 688 RR2FV63TF
BS 689 693 RR2BQ76TF
BS 694 694 RR2FV63TF
BS 695 699 RR2BQ76TF
BS 700 700 RR2FV63TF
BS 701 726 RR2BQ76TF
BS 727 731 RR2FV63TF
BS 732 733 RR2C145TF
BS 734 771 RR2FV63TF
BS 772 1146 RR2C145TF
BS 1147 1148 RR2C145JQ

RD RR2GK91TF 612 0 0
GGAGAACACAACCACTCAAAATCACAATGAAGTTCCTTCCTCATCTCTCTGTCTTGTTCT
CCATACTCTTCATCTCTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCGAATGACAAGATTGCCC
TCCTCGAAATCAAGAAAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTGGAACCCACAAA
CCGACTTCTGCACCACCTGGACTGGCGTCGAGTGCACCAACGGCCGTGTCACCGCCCTCA
CCATCTCCTCCGGCGAAATATCCGGCCAGATCCCAGTTCAGATCGGCGACCTCCTTGAGC
TCCGTACGCTTGACTTCAGTTACTTGACTCATCTCACTGGAAACATTCCACACACCATCA
CCAAACTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCCGGTCCAATCC
CTGATTTCATCAGCGAGCTCAAGAGTGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTA
CCGGTCCAATTCCCAGTTCGATTTCTCAGATGCCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACG
ATAATAAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTA
ATCTCTACCTGT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2H840TF 612 0 0
GGAGAACACAACCACTCAAAATCACAATGAAGTTCCTTCCTCATCTCTCTGTCTTGTTCT
CCATACTCTTCATCTCTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCGAATGACAAGATTGCCC
TCCTCGAAATCAAGAAAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTGGAACCCACAAA
CCGACTTCTGCACCACCTGGACTGGCGTCGAGTGCACCAACGGCCGTGTCACCGCCCTCA
CCATCTCCTCCGGCGAAATATCCGGCCAGATCCCTGTTCAGATCGGCGACCTCCTTGAGC
TCCGTACGCTTGACTTCAGTTACTTGACTCATCTCACTGGAAACATTCCACACACCATCA
CCAAACTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCCGGTCCAATCC
CTGATTTCATCAGCGAGCTCAAGAGTGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTA
CCGGTCCAATTCCCAGTTCGATTTCTCAGATGCCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACG
ATAATAAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTA
ATCTCTACCTGT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2GN88TF 685 0 0
GGAGAACACAACCACTCAAAATCACAATGAAGTTCCTTCCTCATCTCTCTGTCTTGTTCT
CCATACTCTTCATCTCTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCGAATGACAAGATTGCCC
TCCTCGAAATCAAGAAAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTGGAACCCACAAA
CCGACTTCTGCACCACCTGGACTGGCGTCGAGTGCACCAACGGCCGTGTCACCACCCTCA
CCATCTCCTCCGGCGAAATATCCGGCCAGATCCCTGTTCAGATCGGCGACCTCCTTGAGC
TCCGTACGCTTGACTTCAGTTACTTGACTCATCTCACTGGAAACATTCCACACACCATCA
CCAAACTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCCGGTCCAATCC
CTGATTTCATCAGCGAGCTCAAGAGTGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTA
CCGGTCCAATTCCCAGTTCGATTTCTCAGATGCCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACG
ATAATAAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTA
ATCTCTACCTGTTTAACAATAAGCTCTCAG*AAAAGTACCAGAATCGTTGTCAAAGTACG
ACTTTAACGCAGTGGATCTGTCGGG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2BQ76TF 726 0 0
GGAGAACACAACCACTCAAAATCACAATGAAGTTCCTTCCTCATCTCTCTGTCTTGTTCT
CCATACTCTTCATCTCTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCGAATGACAAGATTGCCC
TCCTCGAAATCAAGAAAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTGGAACCCACAAA
CCGACTTCTGCACCACCTGGACTGGCGTCGAGTGCACCAACGGCCGTGTCACCGCCCTCA
CCATCTCCTCCGGCGAAATATCCGGCCAGATCCCTGTTCAGATCGGCGACCTCCTTGAGC
TCCGTACGCTTGACTTCAGTTACTTGACTCATCTCACTGGAAACATTCCACACACCATCA
CCAAACTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCCGGTCCAATCC
CTGATTTCATCAGCGAGCTCAAGAGTGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTA
CCGGTCCAATTCCCAGTTCGATTTCTCAGATGCCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACG
ATAATAAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTA
ATCTCTACCTGCTTAACAATAAGCTCTCAG*AAA*GTACCAGAATCGTTGTCAAAGTACG
ACTTTA*CGCAGTGGATCTGTCGGGAA*CGGTT*CACAG*AGATGGTTCGATGTTTTTCG
GACGTA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2FV63TF 780 0 0
GGACTC
AGAACACAACCACTCAAAATCACAATGAAGTTCCTTCCTCATCTCTCTGTCTTGTTCTCC
ATACTCTTCATCTCTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCGAATGACAAGATTGCCCTC
CTCGAAATCACGAAAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTGGAACCCACAAACC
GACTTCTGCACCACCTGGACTGGCGTCGAGTGCACCAACGGCCGTGTCACCGCCCTCACC
ATCTCCTCCGGCGAAATATCCGGCCAGATCCCTGTTCAGACCGGCGACCTCCTTGAGCTC
CGTACGCTTGACTTCAGTTACTTGACTCATCTCACTGGAAACATTCCACACACCATCACC
AAACTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCCGGTCCAATCCCT
GATTTCATCAGCGAGCTCAAGAGTGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTACC
GGTCCAATTCCCAGTTCGATTTCTCAGATGCCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACGAT
AATAAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTAAT
CTCTACCTGTTTAACAATAAGCTCTCAGGAAAAGTACCAGAATCGTTGTCAAAGTACGAC
TTTAACGCAGTGGATCTGTCGGGAAACGGTTTCACAGGAGATGGTTCGATGTTTTTCGGA
CGTAACAAAT*AACAATACGTGTGAATATAGCCAGGAACATGTTTGAGT
CGATC

QA 7 775 7 775
DS 

RD RR2BQ76JQ 746 0 0
CCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCCGGTCCAATCCCTGATTTCATCAGCGAGCTCAAGAG
TGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTACCGGTCCAATTCCCAGTTCGATTTC
TCAGATGCCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACGATAATAAGTTAACCGGTTCTATACC
AGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTAATCTCTACCTGCTTAACAATAAGCT
CTCAGGAAAAGTACCAGAATCGTTGTCAAAGTACGACTTTAACGCAGTGGATCTGTCGGG
AAACGGTTTCACAGGAGATGGTTCGATGTTTTTCGGACGTAACAAAACAACAATACGTGT
GAATATAGCCAGGAACATGTTTGAGTTCGATCTCTCCAAGGTTAAGTTTGCTAGGAGCAT
AGTGTCGTTGGATCTGAGCCACAACAAAATCTTCGGGAAGTTTCCTAGGGAGCTGAGTAA
GCTGCGTCTCGAGCATTTCGACGTTAGTTGCAATCATCTATGCGGAAAAATCCCACGTGG
TGGTCTCCTTCAGACATTTGAACCATCTACTTTCTCTCACAACCTCTGTCTTTGTGGGAC
CCCACTTAAGGCTTGTTGATTTGGTTTAGTGGCGTGAGAAGAAATAAGTAGTATGTCTTT
ATCTGTATGATGATGATGTGTTTAATTATCAGGCCGCCTATCAAGTGAATTGTTCTATTT
AATAAAATTAATGCTAAGAGTTTGG
C

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2FV63JQ 707 0 0
TTTCATCAGCGAGCTCAAGAGTGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTACCGG
TCCAATTCCCAGTTCGATTTCTCAGATGCCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACGATAA
TAAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTAATCT
CTACCTGTTTAACAATAAGCTCTCAGGAAAAGTACCAGAATCGTTGTCAAAGTACGACTT
TAACGCAGTGGATCTGTCGGGAAACGGTTTCACAGGAGATGGTTCGATGTTTTTCGGACG
TAACAAAATAACAATACGTGTGAATATAGCCAGGAACATGTTTGAGTTCGATCTCTCCAA
GGTTAAGTTTGCTAGGAGCATAGTGTCGTTGGATTTGAGCCACAACAAAATCTTCGGGAA
GTTTCCTAGGGAGCTGAGTAAGCTGCGTCTCGAGCATTTCGACGTTAGTTACAATCATCT
ATGCGGAAAAATCCCACGTGGTGGTCTCCTTCAGACATTTGAACCATCTGCTTTCTCTCA
CAACCTCTGTCTTTGTGGGACCCCACTTAAGGCTTGTTGATTTGGTTTAGTGGCGTGAGA
AGAAATAAGTAGTATGTCTTTATCTGTATGATGATGATGTGTTTAATTATCAGGCCGCCT
ATCAAGTGAATTGTTCTATTTAATAAAATTAATGCTAAGAGTTTGG
G

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2GN88JQ 691 0 0
AAGAGTGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTACCGGTCCAATTCCCAGTTCG
ATTTCTCAGATGCCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACGATAATAAGTTAACCGGTTCT
ATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTAATCTCTACCTGTTTAACAAT
AAGCTCTCAGGAAAAGTACCAGAATCGTTGTCAAAGTACGACTTTAACGCAGTGGATCTG
TCGGGAAACGGTTTCACAGGAGATGGTTCGATGTTTTTCGGACGTAACAAAACAACAATA
CGTGTGAATATAGCCAGGAACATGTTTGAGTTCGATCTCTCCAAGGTTAAGTTTGCTAGG
AGCATAGTGTCGTTGGATTTGAGCCACAACAAAATCTTCGGGAAGTTTCCTAGGGAGCTG
AGTAAGCTGCGTCTCGAGCATTTCGACGTTAGTTACAATCATCTATGCGGAAAAATCCCA
CGTGGTGGTCTCCTTCAGACATTTGAACCATCTGCTTTCTCTCACAACCTCTGTCTTTGT
GGGACCCCACTTAAGGCTTGTTGATTTGGTTTAGTGGCGTGAGAAGAAATAAGTAGTATG
TCTTTATCTGTATGATGATGATGTGTTTAATTATCAGGCCGCCTATCAAGTGAATTGTTC
TATTTAATAAAATTAATGCTAAGAGTTTGGT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2C145JQ 616 0 0
GAGATTG
GATAATAAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCT
AATCTCTACCTGTTTAACAATAAGCTCTCAGGAAAAGTACCAGAATCGTTGTCAAAGTAC
GACTTTAACGCAGTGGATCTGTCGGGAAACGGTTTCACAGGAGATGGTTCGATGTTTTTC
GGACGTAACAAAACAACAATACGTGTGAATATAGCCAGGAACATGTTTGAGTTCGATCTC
TCCAAGGTTAAGTTTGCTAGGAGCATAGTGTCGTTGGATTTGAGCCACAACAAAATCTTC
GGGAAGTTTCCTAGGGAGCTGAGTAAGCTGCGTCTCGAGCATTTCGACGTTAGTTACAAT
CATCTATGCGGAAAAATCCCACGTGGTGGTCTCCTTCAGACATTTGAACCATCTGCTTTC
TCTCACAACCTCTGTCTTTGTGGGACCCCACTTAAGGCTTGTTGATTTGGTTTAGTGGCG
TGAGAAGAAATAAGTAGTATGTCTTTATCTGTATGATGATGATGTGTTTAATTATCAGGC
CGCCTATCAAGTGAATTGTTCTATTTAATAAAATTAATGCTAAGAGTTTGGTAAGAATGT
TGTTGAGAT

QA 8 616 8 616
DS 

RD RR2C145TF 616 0 0
GAGATTG
GATAATAAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCT
AATCTCTACCTGTTTAACAATAAGCTCTCAGGAAAAGTACCAGAATCGTTGTCAAAGTAC
GACTTTAACGCAGTGGATCTGTCGGGAAACGGTTTCACAGGAGATGGTTCGATGTTTTTC
GGACGTAACAAAACAACAATACGTGTGAATATAGCCAGGAACATGTTTGAGTTCGATCTC
TCCAAGGTTAAGTTTGCTAGGAGCATAGTGTCGTTGGATCTGAGCCACAACAAAATCTTC
GGGAAGTTTCCTAGGGAGCTGAGTAAGCTGCGTCTCGAGCATTTCGACGTTAGTTACAAT
CATCTATGCGGAAAAATCCCACGTGGTGGTCTCCTTCAGACATTTGAACCATCTGCTTTC
TCTCACAACCTCTGTCTTTGTGGGACCCCACTTAAGGCTTGTTGATTTGGTTTAGTGGCG
TGAGAAGAAATAAGTAGTATGTCTTTATCTGTATGATGATGATGTGTTTAATTATCAGGC
CGCCTATCAAGTGAATTGTTCTATTTAATAAAATTAATGCTAAGAGTTTGGTAAGAATGT
TGTTGAG
AT

QA 8 614 8 614
DS 



AS 1 17

CO CL170Contig1 736 17 51 U
GGACAGCCTTCTTCCAGAGACCCCTCATCCAAAAAGCCCTAGCATTT*GTCTCTTCTCAT
CCATCGGTGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACAGTAACTCTC
GGACCTGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTC
AACGACACTTTCATCCATGTTACTGATCTGTCGGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTATCACC
GGTGGGATGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCC
GCTCAAGATGTTGCTCAGAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCAATGCACGTGAAGCTC
CGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGA
GCCCTT*GCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTGACTCCAATTCCCAC
AGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGTCCTATGAGAG
CCTCATGATCGTTCAGCTGTTGTACCCTTGACTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACACTTTG
AAGTTAGTTTTGTCTCTCCATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTTCGAAAACTTGTGTCTTTC
TTGAGCATTGTAAAACATTTATACATTTGGAGTTATTTTGCATTTTCTTTCTTTAGTTAC
ATCATCAGCTTCATCG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 35 10 10 35 35 35 35 35 55 55 55 55 55 55 30 55 30 10 30 30 30 55 55 30 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 
70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 5 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 5 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 45 85 90 90 40 90 45 95 95 95 95 95 95 50 95 80 95 95 5 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 45 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
65 45 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 5 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 5 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 60 95 95 95 95 30 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 60 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 5 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 0 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 0 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 0 90 90 90 90 90 90 0 90 90 90 90 0 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 0 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 40 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 0 90 90 90 90 90 90 90 90 90 0 90 90 90 90 90 90 75 90 90 
90 60 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 55 90 90 90 90 0 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 75 50 75 75 75 75 75 75 65 65 65 65 60 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 35 35 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C991TF U 4
AF RR2D018TF U 1
AF RR2E230TF U 3
AF RR2E230JQ C 215
AF RR2FW51TF U 6
AF RR2FW51JQ C 219
AF RR2C991JQ C 169
AF RR2CK21JQ C 170
AF RR2B125TF U 103
AF RR2GC41JQ C 14
AF RR2GC41TF U 14
AF RR2CK21TF U 14
AF RR2D018JQ C 43
AF RR2EY26TF U 4
AF RR2EY26JQ C 43
AF RR2BZ30TF U 4
AF RR2BZ30JQ C 38
BS 1 8 RR2D018TF
BS 9 10 RR2BZ30TF
BS 11 21 RR2D018TF
BS 22 22 RR2BZ30TF
BS 23 23 RR2D018TF
BS 24 24 RR2BZ30TF
BS 25 25 RR2C991TF
BS 26 26 RR2BZ30TF
BS 27 27 RR2D018TF
BS 28 28 RR2BZ30TF
BS 29 47 RR2D018TF
BS 48 48 RR2BZ30TF
BS 49 55 RR2D018TF
BS 56 56 RR2BZ30TF
BS 57 64 RR2D018TF
BS 65 65 RR2BZ30TF
BS 66 182 RR2D018TF
BS 183 183 RR2C991TF
BS 184 194 RR2D018TF
BS 195 195 RR2C991TF
BS 196 212 RR2D018TF
BS 213 213 RR2BZ30TF
BS 214 218 RR2D018TF
BS 219 219 RR2BZ30TF
BS 220 230 RR2D018TF
BS 231 231 RR2C991TF
BS 232 284 RR2D018TF
BS 285 285 RR2BZ30TF
BS 286 302 RR2D018TF
BS 303 303 RR2BZ30TF
BS 304 317 RR2D018TF
BS 318 318 RR2C991TF
BS 319 344 RR2D018TF
BS 345 345 RR2C991TF
BS 346 395 RR2D018TF
BS 396 396 RR2E230TF
BS 397 465 RR2D018TF
BS 466 466 RR2C991TF
BS 467 480 RR2D018TF
BS 481 481 RR2FW51TF
BS 482 492 RR2D018TF
BS 493 493 RR2E230TF
BS 494 504 RR2D018TF
BS 505 505 RR2FW51TF
BS 506 609 RR2D018TF
BS 610 610 RR2BZ30TF
BS 611 679 RR2D018TF
BS 680 680 RR2FW51TF
BS 681 692 RR2D018TF
BS 693 716 RR2E230TF
BS 717 736 RR2BZ30TF

RD RR2C991TF 469 0 0
GGGC
CTTCTTCCAGAGACCCCTCATCCAAAAAGCCCTAGCATTT*GTCTCTTCTCATCCATCGG
TGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACAGTGACTCTCGGACCTG
CTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACA
CTTTCATCCATGTTACTGACCTGTCGGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTATCACCGGTGGGA
TGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGCTCAAG
ATGTTGCTCAGAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCAATGCACGTGAAGCTCCGTGCCA
CTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTT
GCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTGACTCCA

QA 5 469 5 469
DS 

RD RR2D018TF 692 0 0
GGACAGCCAGCTTCCAGAGACGCG*AAACCAAAAAGCCCTAGCATTTCGTCTCTTGTCAT
CCATTGGTGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACAGTAACTCTC
GGACCTGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTC
AATGACACTTTCATTCATGTTACTGATCTGTCTGGAAGGGAAACTCTCGTTCGTATCACC
GGTGGGATGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCTTACGCTGCTATGCTTGCC
GCCCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCACGTGAAGCTC
CGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGA
GCCCTT*GCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTTACTCCAATTCCCAC
CGACAGTACACGCAGAAAGGGTGGGCGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGTCCTATGAGAG
CCTCATGATCGTTCAGCTGTTGTACCCTTGACTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACACTTTG
AAGTTAGTTATGTCTCTCCATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTTCGAAAACTTGTGTCTTTC
TTGAGCATTGTAAAACATT*ATACATTTGGAG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2E230TF 724 0 0
GG
AGCCAGCTTCCAGAGACGCG*AAACCAAAAAGCCCTAGCATTTCGTCTCTTGTCATCCAT
TGGTGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACAGTAACTCTCGGAC
CTGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAATG
ACACTTTCATTCATGTTACTGATCTGTCTGGAAGGGAAACTCTCGTTCGTATCACCGGTG
GGATGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCTTACGCTGCTATGCTTGCCGCCC
AAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCACGTGAAGCTCCGTG
CCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCC
TT*GCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTTACTCCAATTCCCACCGAC
AGTACACGTAGAAAGGGTGGGCGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGTCCTATGAGAGCCTC
ATGATCGTTCAGCTGTTGTACCCTTGACTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACACTTTGAAGT
TAGTTATGTCTCTCCATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTTCGAAAACTTGTGTCTTTCTTGG
GCATTGTAAA*CATT*ATACATTTGGAGTTATTTTGCATTTTCTTTCTTTAG
CAAAAAAAAA

QA 3 714 3 714
DS 

RD RR2E230JQ 503 0 0
GAAGGGAAACTCTCGTTCGTATCACCGGTGGGATGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAAT
CCTCTCCTTACGCTGCTATGCTTGCCGCCCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTG
GCATCACAGCCATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAG
GCCCTGGTGCTCAGTCTGCTTTCAGAGCCCTT*GCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGT
ATTGAGGACGTTACTCCAATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGGCGAAGAGGA
AGAAGACTCTGATTGTCCTATGAGAGCCTCATGATCGTTCAGCTGTTGTACCCTTGACTC
GTGTAGTTTCTTGGGTACACACTTTGAAGTTAGTTATGTCTCTCCATTTCATCCTGTCAA
GTTTGCTTCGAAAACTTGTGTCTTTCTTGGGCATTGTAAAACATT*ATACATTTGGAGTT
ATTTTGCATTTTCTTTCTTTAG
C

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR2FW51TF 717 0 0
GG
CTTCTTCCAGAGACCCCTCATCCAAAAAGCCCTAGCATTTTGTCTCTTCTCATCCATCGG
TGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACAGTGACTCTCGGACCTG
CTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACA
CTTTCATCCATGTTACTGATCTGTCGGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTATCACCGGTGGGA
TGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGCTCAAG
ATGTTGCTCAGAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCAATGCACGTGAAGCTCCGTGCCA
CTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTT*
GCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTGACTCCAATTCCCACAGACAGT
ACACGTAGAAAGGGTGGACGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGTCCTATGAGAGCCTCATG
ATCGTTCAGTTGTTGTGCCCTGGACTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACGCTTTGAAGTTAG
TTTTGTCTCTCCATTTCATCCTGTCAAGTTCGCTTTGAAAACTTGCGTCTTTCTTGAGCA
TTGTAAAACATTTATACATTTGGAGTTATTTTGCATTTTCTTTCTTTA
TTTAAAA

QA 3 710 3 710
DS 

RD RR2FW51JQ 486 0 0
AGAAACTCTCGTCCGTATCACCGGTGGGATGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAATCCTC
TCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGCTCAAGATGTTGCTCAGAGATGCAAGGAGCTTGGCAT
CACAGCAATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCC
TGGTGCTCAGTTTGCTTTCAGAGCCCTT*GCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTG
AGGACGTGACTCCAATTCCCACAGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGAAGAGGAAGAA
GACTCTGATTGTCCTATGAGAGCCTCATGATCGTTCAGTTGTTGTGCCCTGGACTCGTGT
AGTTTCTTGGGTACACGCTTTGAAGTTAGTTTTGTCTCTCCATTTCATCCTGTCAAGTTC
GCTTTGAAAACTTGCGTCTTTCTTGAGCATTGTAAAACATTTATACATTTGGAGTTATTT
TGCATT

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR2C991JQ 546 0 0
TTTGCTTCTTTCAACGACACTTTCATCCATGTTACTGATCTGTCGGGAAGAGAAACTTTT
GTCCGTATCACCGGTGGGATGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCT
GCTATGCTTGCCGCTCAAGATGTTGTTCAGAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCAATG
CACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAG
TTTGCTTTCAGAGCCCTT*GCTCGTTTTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTGAC
TCCAATTCCCACAGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGAAGAGGAAGAAGACTTTGATT
GTCCTATGAGAGCCTCATGATCGTTCAGTTGTTGTGCCCTGGACTCGTGTAGTTTCTTGG
GTACACGCTTTGAAGTTAGTTTTGTCTTTCCATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTTTGAAAA
CTTGGGTCTTTTTTGAGCATTGTAAAACATTTATACATTTGGAGTTATTTTGCATTTT
TTTTTTTT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2CK21JQ 531 0 0
TTGCTTCTTTCAACGACACTTTCATCCATGTTACTGATCTGTCGGGAAGAGAAACTTTCG
TCCGTATCACCGGTGGGATGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCTG
CTATGCTTGCCGCTCAAGATGTTGCTCAGAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCAATGC
ACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCCCAGT
TTGCTTTCAGAGCCCTT*GCTCGTTTTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTGACT
CCAATTCCCACAGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTG
TCCTATGAGAGCCTCATGATCGTTCAGTTGTTGTGCCCTGGACTCGTGTAGTTTCTTGGG
TACACGCTTTGAAGTTAGTTTTGTCTCTCCATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTTTGAAAAC
TTGCGTCTTTCTTGAGCATTGTAAAACATTTATACATTTGGAGTTATTTTG

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2B125TF 613 0 0
GAGGAAACAGTGACTCTCGGACCTGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTT
CACATCTTTGCTTCTTTCAACGACACTTTCATCCATGTTACTGATCTGTCGGGAAGAGAA
ACTCTCGTCCGTATCACCGGTGGGATGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCT
TATGCTGCTATGCTTGCCGCTCAAGATGTTGCTCAGAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACA
GCAATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGT
GCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTT*GCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGA
CGTGACTCCAATTCCCACAGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGAAGAGGAAGAAGACT
CTGGTTGTCCTATGAGAGCCTCATGATCGTTCAGTTGTTGTGCCCTGGACTCGTGTAGTT
TCTTGGGTACACGCTTTGAAGTTAGTTTTGTCTCTCCATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTT
TGAAAACTTGCGTCTTTCTTGAGCATCGTAAAACATTTATACATTTGGAGTTATTTTGCA
TTT*CTTTCTTTA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2GC41JQ 679 0 0
GG
AGAGACCCCTCATCCAAAAAGCCCTAGCATTTTGTCTCTTCTCATCCATCGGTGAACATG
TCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACAGTGACTCTCGGACCTGCTGTTCGT
GACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACACTTTCATC
CATGTTACTGATCTGTCGGGAAGAGAAACTTTCGTCCGTATCACCGGTGGGACGAAGGTG
AAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGCTCAAGATGTTGCT
CAGAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCAATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGA
AACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTTTCAGAGCCCTT*GCTCGTTC
TGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTGACTCCAATTCCCACAGACAGTACACGTAG
AAAGGGTGGACGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGTCCTATGAGAGCCTCATGATCGTTCA
GTTGTTGTGCCCT*GACTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACGCTTTGAAGTTAGTTTTGTCT
CTCCATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTTTGAAAACTTGCGTCTTTCTTGAGCATTGTAAAA
CATTTATACATTTGGAG

QA 3 679 3 679
DS 

RD RR2GC41TF 679 0 0
GG
AGAGACCCCTCATCCAAAAAGCCCTAGCATTTTGTCTCTTCTCATCCATCGGTGAACATG
TCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACAGTGACTCTCGGACCTGCTGTTCGT
GACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACACTTTCATC
CATGTTACTGATCTGTCGGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTATCACCGGTGGGACGAAGGTG
AAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGCTCAAGATGTTGCT
CAGAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCAATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGA
AACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTT*GCTCGTTC
TGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTGACTCCAATTCCCACAGACAGTACACGTAG
AAAGGGTGGACGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGTCCTATGAGAGCCTCATGATCGTTCA
GTTGTTGTGCCCT*GACTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACGCTTTGAAGTTAGTTTTGTCT
CTCCATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTTTGAAAACTTGCGTCTTTCTTGAGCATTGTAAAA
CATTTATACATTTGGAG

QA 3 679 3 679
DS 

RD RR2CK21TF 687 0 0
GG
AGAGACCCCTCATCCAAAAAGCCCTAGCATTTTGTCTCTTCTCATCCATCGGTGAACATG
TCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACAGTGACTCTCGGACCTGCTGTTCGC
GACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACACTTTCATC
CATGTTACTGATCTGTCGGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTATCACCGGTGGGATGAAGGTG
AAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGCTCAAGATGTTGCT
CAGAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCAATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGA
AACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCCCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTT*GCTCGTTC
TGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTGACTCCAATTCCCACAGACAGTACACGTAG
AAAGGGTGGACGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGTCCTATGAGAGCCTCATGATCGTTCA
GTTGTTGTGCCCTGGACTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACGCTTTGAAGTTAGTTTTGTCT
CTCCATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTTTGAAAACTTGCGTCTTTCTTGAGCATTGTAAA*
CATTTATACATTTGGAGTTATTTTG

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR2D018JQ 676 0 0
CATTTCGTCTCTTGTCATCCATTGGTGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAG
GAGGAAACAGTAACTCTCGGACCTGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTT
CACATCTTTGCTTCTTTCAATGACACTTTCATTCATGTTACTGATCTGTCTGGAAGGGAA
ACTCTCGTTCGTATCACCGGTGGGATGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCT
TACGCTGCTATGCTTGCCGCCCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACA
GCCATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGT
GCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTT*GCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGA
CGTTACTCCAATTCCCACCGACAGTACACGCAGAAAGGGTGGGCGAAGAGGAAGAAGACT
CTGATTGTCCTATGAGAGCCTCATGATCGTTCAGCTGTTGTACCCTTGACTCGTGTAGTT
TCTTGGGTACACACTTTGAAGTTAGTTATGTCTCTCCATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTT
CGAAAACTTGTGTCTTTCTTGAGCATTGTAAAACATT*ATACATTTGGAGTTATTTTGCA
TTTTCTTTCTTTAGTT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2EY26TF 716 0 0
GGGC
CTTCTTCCAGAGACCCC*CCTCCCAAAAGCCCTAGCATTT*GTCTCTTCTCATCCATCGG
TGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACAGTAACTCTCGGACCTG
CTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAATGACA
CTTTCATTCATGTTACTGATCTGTCGGGACGAGAAACTCTCGTTCGTATCACCGGTGGGA
TGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGTTCAAG
ATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCACGTGAAGCTCCGTGCCA
CTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTT*
GCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTTACTCCAATTCCCACCGACAGT
ACACGTAGAAAGGGTGGGCGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGTCCTATGAGAGCCTCATG
ATCGTTCAGCTGTTGTACCCTTGACTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACACTTTGAAGTTAG
TTTTGTCTCTCCATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTTCGAAAACTTGTGTCTTTCTTGAGCA
TTGTAAA*CATT*ATACATTTGGAGT*ATTTTGCATTTTCTTTCTTTAGTT
A

QA 5 715 5 715
DS 

RD RR2EY26JQ 676 0 0
CATTT*GTCTCTTCTCATCCATCGGTGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAG
GAGGAAACAGTAACTCTCGGACCTGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTT
CACATCTTTGCTTCTTTCAATGACACTTTCATTCATGTTACTGATCTGTCGGGACGAGAA
ACTCTCGTTCGTATCACCGGTGGGATGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCT
TATGCTGCTATGCTTGCCGTTCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACA
GCCATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGT
GCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTT*GCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGA
CGTTACTCCAATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGGCGAAGAGGAAGAAGACT
CTGATTGTCCTATGAGAGCCTCATGATCGTTCAGCTGTTGTACCCTTGACTCGTGTAGTT
TCTTGGGTACACACTTTGAAGTTAGTTTTGTCTCTCCATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTT
CGAAAACTTGTGTCTTTCTTGAGCATTGTAAAACATT*ATACATTTGGAGTTATTTTGCA
TTTTCTTTCTTTAGTT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2BZ30TF 733 0 0
GGGC
CTTCTTCCAGAGACCCC*CCTCCCAAAAGCCCTAGCATTT*GTCTCTTCTCATCCATCGG
TGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACAGTAACTCTCGGACCTG
CTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAATGACA
CTTTCATTCATGTTACTGATCTGTCGGGACGAGAAACTCTCGTTCGTATCACCGGTGGGA
TGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGCTCAAG
ATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCACGTGAAGCTCCGTGCCA
CTGGAGGAAGCAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTT*
GCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTTACTCCAATTCCCACCGACAGT
ACACGTAGAAAGGGTGGGCGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGTCCTATGAGAGCCTCATG
ATCGTTCAGCTGTTGTACCCTTGACTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACACTTTGAAGTTAG
TTTTGTCTCTCCATTTCATCCTGTCAAGTTTGCTTCGAAAACTTGTGTCTTTCTTGAGCA
TTGTAAAACATT*ATACATTTGAAGT*ATTTTGCATTTTCTTTCTTTAGTTACATCATCA
GCTTCATCG

QA 5 733 5 733
DS 

RD RR2BZ30JQ 699 0 0
CCTAGCATTT*GTCTCTTCTCATCCATCGGTGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGC
CCAAGGAGGAAACAGTAACTCTCGGACCTGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTG
TTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAATGACACTTTCATTCATGTTACTGATCTGTCGGGAC
GAGAAACTTTCGTTCGTATCACCGGTGGGATGAAGGTGAAGGCTGACCGTGATGAATCCT
CTCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGCTCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCA
TCACAGCCATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAGCAAAACCAAGACTCCAGGCC
CTGGTGCTCAGTCTGCTTTCAGAGCCCTT*GCTCGTTTTGGCATGAAGATTGGTCGTATT
GAGGACGTTACTCCAATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGGCGAAGAGGAAGA
AGACTCTGATTGTCCTATGAGAGCCTCATGATCGTTCAGCTGTTGTACCCTTGACTCGTG
TAGTTTCTTGGGTACACACTTTGAAGTTAGTTTTGTCTCTCCATTTCATCCTGTCAAGTT
TGCTTCGAAAACTTGTGTCTTTCTTGAGCATTGTAAAACATT*ATACATTTGAAGTTATT
TTGCATTTTCTTTCTTTAGTTACATCATCAGCTTCATCG

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 15

CO CL171Contig1 953 15 15 U
GGACATTTCCCCAGGTATCCTCTCAGTTTCACTTCCGGCTTTTATTCATTCATCACTCTC
TCTCTGAACCAACAACAAAGAAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCAGATCTGCTTCGAG
AGCAGCAAGGTCTCTTCTCTCTTCAGCTAAGAATGCTCGTTTCTTCTCTGAAGGACGAGC
CGTTGGTGCAGCAGCAGCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCATCTAACTT
TGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGAGTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCT
TCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAGGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCAC
TTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCG
ATTCGAACGCAAGGGATTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTT
CGCACAGAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTT
CCTTAGCTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACGG
GCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGACAATCCGTGGAGA
TCTTGCAGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACTGCGAA
GGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTACACCAACAACGCTGA
GAAGTGGATCTATGGCGACAACTAAATTCCTATTTCTCTCTTCTTTTGACATCCAATGAA
ATTGTTCTTGTTCCTTACCCCCAAACAATAAAAACAAAAGACAGGTATTACGGATACAAA
CACATTCCGGGTTTTGTATTTTCCCTGGTGAACTCAGTTGTCAGAGCAGAAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 10 55 10 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 40 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
85 85 85 85 70 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 25 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 65 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 70 70 70 55 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 40 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 
50 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 45 45 40 35 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR2E926TF U 1
AF RR2D990TF U 29
AF RR2D267TF U 421
AF RR2GV03TF U 1
AF RR2A909TF U 1
AF RR2E993TF U 46
AF RR2DI16TF U 42
AF RR2EZ47TF U 15
AF RR2EQ05TF U 57
AF RR2A909JQ C 165
AF RR2GV03JQB C 382
AF RR2DI16JQ C 226
AF RR2E993JQ C 208
AF RR2EZ47JQ C 412
AF RR2D990JQ C 187
BS 1 636 RR2A909TF
BS 637 637 RR2EZ47TF
BS 638 717 RR2A909TF
BS 718 718 RR2EZ47TF
BS 719 775 RR2A909TF
BS 776 776 RR2DI16TF
BS 777 777 RR2EQ05TF
BS 778 782 RR2EZ47TF
BS 783 783 RR2EQ05TF
BS 784 800 RR2EZ47TF
BS 801 801 RR2A909JQ
BS 802 826 RR2EQ05TF
BS 827 827 RR2A909JQ
BS 828 838 RR2EQ05TF
BS 839 953 RR2A909JQ

RD RR2E926TF 527 0 0
GGACATTTCCCCAGGTATCCTCTCAGTTTCACTTCCGGCTTTTATTCATTCATCACTCTC
TCTCTGAACCAACAACAAAGAAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCAGATCTGCTTCGAG
AGCAGCAAGGTCTCTTCTCTCTTCAGCTAAGAATGCTCGTTTCTTCTCTGAAGGACGAGC
CGTTGGTGCAGCAGCAGCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCATCTAACTT
TGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGAGTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCT
TCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAGGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCAC
TTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCG
ATTCGAACGCAAGGGATTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTT
CGCACAGAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCA
TGG

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2D990TF 567 0 0
GG
ACTTCCGGCTTTTATTCATTCACCACTCTCTCTCTGAACCAACAACAAAGAAGAAAAAAT
GATCTCCCAAATCTGCAGATCTGCTTCTAGAGCAGCAAGGTCTCTTCTCTCTTCAGCTAA
GAATGCTCGTTTCTTCTCTGAAGGACGAGCCGTTGGTGCAGCAGCAACGGTTACCGCATC
TGGAAAGATGCCTCTCTATGCATCTAACTTTGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTC
AAAGAGTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCTTCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCA
GGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCACTTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCA
GCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGATTCGTACGCAAGGGGTTCAAGCTTGTTGG
TATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTTCGCACAGAAGCATTACCATGATCTCAAGGA
AAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGT
ATGGGAAGGAGAAAGTGTGATCAGA

QA 3 567 3 567
DS 

RD RR2D267TF 170 0 0
ATTCCAACGCAAGGGATTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTT
CGCACAGAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGATCTTTCTTCAATGGCTTGCGTGGCTT
CCTTAGCTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGA

QA 1 170 1 170
DS 

RD RR2GV03TF 629 0 0
GGACATTTTCCCAGGTATCCTCTCAGTTTCACTTCCGGCTTTTATTCATTCATCACTCTC
TCTCTGAACCAACAACAAAGAAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCAGATCTGCTTCGAG
AGCAGCAAGGTCTCTTCTCTCTTCAGCTAAGAATGCTCGTTTCTTCTCTGAAGGACGAGC
CGTTGGTGCAGCAGCAGCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCATCTAACTT
TGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGAGTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCT
TCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAGGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCAC
TTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCG
ATTCGAACGCAAGGGATTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTT
CGCACAGAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTT
CCTTAGCTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACTG
GCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2A909TF 775 0 0
GGACATTTCCCCAGGTATCCTCTCAGTTTCACTTCCGGCTTTTATTCATTCATCACTCTC
TCTCTGAACCAACAACAAAGAAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCAGATCTGCTTCGAG
AGCAGCAAGGTCTCTTCTCTCTTCAGCTAAGAATGCTCGTTTCTTCTCTGAAGGACGAGC
CGTTGGTGCAGCAGCAGCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCATCTAACTT
TGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGAGTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCT
TCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAGGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCAC
TTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCG
ATTCGAACGCAAGGGATTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTT
CGCACAGAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTT
CCTTAGCTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACGG
GCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCCGAGCCTGGGACAATCCGTGGAGA
TCTTGCAGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACTGCAAA
GGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTACACCAACAAC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2E993TF 699 0 0
GG
ATTCATCACTCTCTCTCTGAACCAACAAGAAAGAAGGAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCA
GATCTGCTTCGAGAGTAGCAAGGTCTCTTCTCTCTTCATCTAAGAATGTTCGTTTCTTCT
CCGAAGGACGAGCCATCGGTGCAGCAGCAGCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCT
ATGCATCTAACTTTGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGAGTTGGATCACTG
GACTCTTGGCTCTTCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAAGAGGTTTTTGCTGCTG
AGATGGAACGCACTTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAG
AGATCATTTCTCGATTCGAACGCAAGGGATTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTC
CTTCCAAGGATTTCGCACAGAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATG
GCTTGTGTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAAGTG
TGATCAGATACGGGCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGA
CAATCCGTGGAGATCTTGCAGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGAC
CAGAGACTGCGAAG*ATGAGATCA*TCTGTGGTTTA
G

QA 3 698 3 698
DS 

RD RR2DI16TF 735 0 0
GGATTCATCACTCT
CTCTCTCTCTGAACCAACAACAAAGAAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCAGATCTGCT
TCGAGAGCAGCAAGGTCTCTTCTCTCTTCAGCTAAGAATGCTCGTTTCTTCTCCGAAGGA
CGAGCCATCGGTGCAGCAGCAGCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCATCT
AACTTTGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCTAAGACTTGGATCCCTGGACTCTTG
GCTCTTCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAGGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAA
CGCACTTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATT
TCTCGATTCGAACGCAAGGGCTTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAG
GATTTCGCACAGAAGCATTATCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGT
GACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGA
TACGGGCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGACAATCCGT
GGAGATCTTGCCGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACT
GCGAAAGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTACACCAACAAC
G

QA 15 735 15 735
DS 

RD RR2EZ47TF 803 0 0
GG
ATCCTCTCAGTTTCACTTCCGGCTTTTATTCATTCATCACTCTCTCTCTGAACCAACAAG
AAAGAAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCAGATCTGCTTCGAGAGCAGCAAGGTCTCTT
CTCTCTTCATCTAAGAATGCTCGTTTCTTCTCCGAAGGACGAGCCATCGGTGCAGCAGCA
GCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCATCTAACTTTGGAAGATCATCAGGT
TCTGGTGCCGCCTCAAAGAGTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCTTCCTGCTGCAGCCTTC
ATGGTTCAAGATCAAGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCACTTTCATTGCTATCAAG
CCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGATTCGAACGCAAGGGA
TTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTTCGCACAGAAGCATTAC
CATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCT
GTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACGGGCGTAAACTGATTGGA
GCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGACAATCCGTGGAGATCTTGCAGTTGTTGTT
GGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACTGCGAAG*ATGAGATCAATCTG
TGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTACAC*AACACGC*TGAGA*GTGGATCTATGGC
GACA
CTAAATTCTATCTCTCT

QA 3 786 3 786
DS 

RD RR2EQ05TF 782 0 0
GG
TCTCTCTGAACCAACAAGAAAGAAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCAGATCTGCTTCG
AGAGCAGCAAGGTCTCTTCTCTCTTCATCTAAGAATGCTCGTTTCTTCTCCGAAGGACGA
GCCATCGGTGCAGCAGCAGCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCATCTAAC
TTTGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGAGTTGGATCACTGGACTCTTGGCT
CTTCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAAGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGC
ACTTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCT
CGATTCGAACGCAAGGGATTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCTAGGAT
TTCGCACAGAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGAC
TTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATAC
GGGCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGACAATCCGTGGA
GATCTTGCAGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACTGCG
AAGGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTACACCAACAACGCT
GAGAAGTGGATCTATGGCGACA*CTAAATTCCTATTTCTCTCTTCTTT*GACATCCAATG

QA 3 782 3 782
DS 

RD RR2A909JQ 789 0 0
TCTCTGAAGGACGAGCCGTTGGTGCAGCAGCAGCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTC
TCTATGCATCTAACTTTGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGAGTTGGATCA
CTGGACTCTTGGCTCTTCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAGGAGGTTTTTGCTG
CTGAGATGGAACGCACTTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATAT
CAGAGATCATTTCTCGATTCGAACGCAAGGGATTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTG
TTCCTTCCAAGGATTTCGCACAGAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCA
ATGGCTTGTGTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAG
GTGTGATCAGATACGGGCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCCGAGCCTG
GGACAATCCGTGGAGATCTTGCAGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATG
GACCAGAGACTGCAAAGGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTT
ACACCAACAACGCTGAGAAGTGGATCTATGGCGACAACTAAATTCCTCTTTCTCTCTTCT
TTTGACATCCAATAAAATTGTTCTTGTTCCTTACCCCCAAACAATAAAAACAAAAGACAG
GTATTACGGATACAAACACATTCCGGGTTTTGTATTTTCCCTGGTGAACTCAGTTGTCAG
AGCAGAAGT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2GV03JQB 572 0 0
TGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGATTCGAACGCAAGGGATTCAA
GCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTTCGCACAGAAGCATTACCATGA
TCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTAT
TGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACGGGCGTAAACTGATTGGAGCCAC
CGATCCTCAGAAATTTGAGCCTGGGACAATCCGTGGAGATCTTGCAGTTGTTGTTGGGAG
GAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACTGCAAAGGATGAGATCAATCTGTGGTT
TAAGCCTCAAGAACTTGTTTCTTACACCAACAACGCTGAGAAGTGGATCTATGGCGACAA
CTAAATTCCTCTTTCTCTCTTCTTTTGACATCCAATAAAATTGTTCTTGTTCCTTACCCC
CAAACAATAAAAGCAAAAGACAGGTATTACGGATACAAACACATTCCGGGTTTTGTATTT
TCCCTGGTGAACTCAGTTGTCAGAGCAGAAGT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2DI16JQ 728 0 0
CTATGCATCTAACTTTGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGC*TCTAAGACTTGGATCCC
TGGACTCTTGGCTCTTC*TGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAGGAGGTTTTTGCTGC
TGAGATGGAACGCACTTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATC
AGAGATCATTTCTCGATTCGAACGCAAGGGCTTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGT
TCCTTCCAAGGATTTCGCACAGAAGCATTATCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAA
TGGCTTGTGTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGG
TGTGATCAGATACGGGCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGG
GACAATCCGTGGAGATCTTGCCGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGG
ACCAGAGACTGCGAAGGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTA
CACCAACAACGCTGAGAAGTGGATCTATGGCGACAACTAAATTCCTCTTTCTCTCTTCTT
TTGACATCCAATGAAATTGTTCTTGTTCCTTACCCCCAAACAATAAAAACAAAAGACAGG
TATTACGGATACAAACACATTCCGGGTTTTGTATTTTCCCTGGTGAACTCAGTTGTCAGA
GCAGAAGT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2E993JQ 746 0 0
ATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCATCTAACTTTGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGC
CTCAAAGAGTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCTTCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGA
TCAAGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCACTTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGT
GCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGATTCGAACGCAAGGGATTCAAGCTTGT
TGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTTCGCACAGAAGCATTACCATGATCTCAA
GGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTATTGCCAT
GGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACGGGCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCC
TCAGAAATCTGAGCCTGGGACAATCCGTGGAGATCTTGCAGTTGTTGTTGGGAGGAACAT
AATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACTGCGAAGGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCC
TCAAGAACTTGTCTCTTACACCAACAACGCTGAGAAGTGGATCTATGGCGACAACTAAAT
TCCTATTTCTCTCTTCTTTTGACATCCAATGAAATTGTTCTTGTTCCTTACCCCCAAACA
ATAAAAACAAAAGACAGGTATTACGGATACAAACACATTCCGGGTTTTGTATTTTCCCTG
GTGAACTCAGTTGTCAGAGCAGAAGT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2EZ47JQ 542 0 0
CATTTCTCGATTCGAACGCAAGGGATTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTC
CAAGGATTTCGCACAGAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTT
GTGTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGAT
CAGATACGGGCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGACAAT
CCGTGGAGATCTTGCAGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGA
GACTGCGAAGGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTACACCAA
CAACGCTGAGAAGTGGATCTATGGCGACAACTAAATTCCTATCTCTCTCTTCTTTTGACA
TCCAATGAAATTGTTCTTGTTCCTTACCCCCAAGCAATAAAAACAAAAGACAGGTATTAC
GGATACAAACACATTCCGGGTTTTGTATTTTCCCTGGTGAACTCAGTTGTCAGAGCAGAA
GT

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2D990JQ 767 0 0
TGCAGCAGCAACGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCATCTAACTTTGGAAG
ATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGAGTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCTTCCTGC
TGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAGGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCACTTTCAT
TGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGATTCGT
ACGCAAGGGGTTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTTCGCACA
GAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTTCCTTAG
CTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACGGGCGTAA
ACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATTTGAGCCTGGGACAATCCGTGGAGATCTTGC
AGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACTGCAAAGGATGA
GATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTACACCAACAACGCTGAGAAGTG
GATCTATGGCGACAACTAAATTCCTCTTTCTCTCTTCTTTTGACATCCAATAAAATTGTT
CTTGTTCCTTACCCCCAAACAATAAAAACAAAAGACAGGTATTACGGATACAAACACATT
CCGGGTTTTGTATTTTCCCTGGTGAACTCAGTTGTCAGAGCAGAAGT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 2 17

CO CL172Contig1 849 15 6 U
GGATTGCGGTGGGAGGGTTCACGAGCGGAGGAAACCAATCGCAGATCTGTGACATACCAA
ATTCCAACGAAGATCCATGGCCATCTCCTTAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGT
TTTCACGCTGGTCTCCGCTTCGTTCGCGACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTTCACAA
GAAAGTTACTCTCAACAGGCTCAAATCCGGCGCCGAGCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACAT
CTACAACCAAGGATCTGCGACGGCGTATGATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAA
GAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGAAACACTTCAAAGTCATGGGAGAGACTTGATGCAGG
AGGTATTCTGTCTCATTCTTTCGAACTTGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTCTATGGTAA
CCCTGCTGTCGTTACTTTCCGCATCCCCACAAAGACTGCTCTTCAGCAAGCCTTCTCAAA
TCCAATACTACCTTTAAACATTCTCGCAGACCTCCCTCCAACTGACCCACTTGCCGTGGC
TAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGATCACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTGGTTTTGTT
CATATACTTGGTAGCAACACCTTCAAAGTCCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGCAAGAAGAA
GCGCTAAGTTATTTGAAAATGAAGCTAAGAATGGTTGTTACGTTGCTTTTTCTTTTTGTG
TTTAGCAGTTAAAACACAGTTTGAAAACTTGTAAGAAACGTAGAACACACTTTCACTTTG
GTGTTT*GCAGAGGACTATGTTAAAGAGTTATTTTGGTTTTGCGTCATAACGTCTTTTTG
ACAGCGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 55 70 70 70 70 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 75 5 75 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 60 60 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 40 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 60 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 45 75 75 75 40 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 55 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 0 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 
55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2DY35TF U 27
AF RR2DM17TF U 30
AF RR2GH01TF U 27
AF RR2ER67TF U 1
AF RR2F715TF U 28
AF RR2DM96TF U 29
AF RR2AM36TF U 26
AF RR2AY15TFB U 26
AF RR2DM17JQ C 234
AF RR2DY35JQ C 340
AF RR2ER67JQ C 265
AF RR2AM36JQ C 260
AF RR2B221TF U 26
AF RR2GH01JQB C 93
AF RR2B221JQ C 233
BS 1 26 RR2ER67TF
BS 27 27 RR2AM36TF
BS 28 621 RR2ER67TF
BS 622 809 RR2AM36TF
BS 810 846 RR2B221TF
BS 847 849 RR2B221JQ

RD RR2DY35TF 286 0 0
GGAGGAAACCAATCGCAGATCTGTGACATACCAAATTCCAACGAAGATCCATGGCCATCT
CCTTAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGTTTTCACGCTGGTCTCCGCTTCGTTCG
CGACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTTCACAAGAAAGTTACTCTCAACAGGCTCAAAT
CCGGCGCCGAGCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGACGGCGT
ATGATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGA

QA 1 286 1 286
DS 

RD RR2DM17TF 326 0 0
GGAAACCAATCGCAGATCTGTGACATACCAAATTCCAACGAAGATCCATGGCCATCTCCT
TAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGTTTTCACGCTGGTCTCCGCTTCGTTCGCGA
CCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTTCACAAGAAAGTTACTCTCAACAGGCTCAAATCCG
GCGCCGAGCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGACGGCGTATG
ATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGAAACA
CTTCAAAGTCATGGGAGAGACTTGAT

QA 1 326 1 326
DS 

RD RR2GH01TF 476 0 0
GGAGGAAACCAATCGCAGATCTGTGACATACCAAATTCCAACGAAGATCCATGGCCATCT
CCTTAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGTTTTCACGCTGGTCTCCGCTTCGTTCG
CGACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTTCACAAGAAAGTTACTCTCAACAGGCTCAAAT
CCGGCGCCGAGCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGACGGCGT
ATGATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGAA
ACACTTCAAAGTCATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCTTTCGAAC
TTGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTCTATGGTAACCCTGCTGTCGTTACTTTCCGCATCC
CCACAAAGACCGCTCTTCAGCAAGCCTTCTCAAATCCAATACTACCTTTAAACATT

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR2ER67TF 621 0 0
GGATTGCGGTGGGAGGGTTCACGAGCTGAGGAAACCAATCGCAGATCTGTGACATACCAA
ATTCCAACGAAGATCCATGGCCATCTCCTTAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGT
TTTCACGCTGGTCTCCGCTTCGTTCGCGACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTTCACAA
GAAAGTTACTCTCAACAGGCTCAAATCCGGCGCCGAGCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACAT
CTACAACCAAGGATCTGCGACGGCGTATGATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAA
GAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGAAACACTTCAAAGTCATGGGAGAGACTTGATGCAGG
AGGTATTCTGTCTCATTCTTTCGAACTTGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTCTATGGTAA
CCCTGCTGTCGTTACTTTCCGCATCCCCACAAAGACTGCTCTTCAGCAAGCCTTCTCAAA
TCCAATACTACCTTTAAACATTCTCGCAGACCTCCCTCCAACTGACCCACTTGCCGTGGC
TAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGATCACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTGGTTTTGTT
CATATACTTGGTAGCAACACC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2F715TF 607 0 0
GG
GGAAACCAATCGCAGATCTGTGACATACCAAATCCCAACGAAGATCCATGGCCATCTCCT
TAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGTTTTCACGCTGGTCTCCGCTTCGTTCGCGA
CCTCGGAAATGCCATTCATGGTGGTTCACAAGAAAGTTACTCTCAACAGGCTCAAATCCG
GCGCCGAGCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGACGGCGTATG
ATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGATGTTGTTAATGGAAACA
CTTCTAGATCATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCTTTCGAACTTG
AGGCCAAGGTTAAAGGGCCCTTCTATGGTAACCCTGCTGTCGTTACTTTCCGCATCCCCA
CAAAGACTGCTCTTCAGCAAGCCTTCTCAAATCCAATACTACCTTTAAACAT*CTCGCAG
ACCTCCCTCCAACTGACCCGCTTGCCGTGGCCAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGATCAC
TTGTTTCAGTGATATCGATGGTGGTTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACGCCTTCAAAGT
CCAAT

QA 3 607 3 607
DS 

RD RR2DM96TF 745 0 0
G
GGAAACCAATCGCAGATCTGTGACATACCAAATTCCAACGAAGATCCATGGCCATCTCCT
TAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGTTTTCACGCTGGTCTCCGCTTCGTTCGCGA
CCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTTCACAAGAAAGTTACTCTCAACAGGCTCAAATCCG
GCGCCGAGCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGACGGCGTATG
ATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGAAACA
CTTCAAAGTCATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCTTTCGAACTTG
AGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTCTATGGTAACCCTGCTGTCGTTACTTTCCGCATCCCCA
CAAAGACTGCTCTTCAGCAAGCCTTCTCAAATCCAATACTACCTTTAAACATTCTCGCAG
ACCTCCCTCCAACTGACCCACTTGCCGTGGCTAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGATCAC
TTGTTTCAGTGGTATCGATGGTGGTTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACACCTTCAAAGT
CCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGCAAGAAGAAGCGCTAAGTTATTTGAAAATGAAGCTAAG
AATGGTTGTTACGTTGCTTTTTCTTTTTGTGTTTAGCAGTTAAAACACAGTTTGAAAACT
TGTAAGAAACGTAGAACACACTTT

QA 2 745 2 745
DS 

RD RR2AM36TF 784 0 0
G
GGAGGAAACCAATCGCAGATCTGTGACATACCAAATCCCAACGAAGATCCATGGCCATCT
CCTTAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGTTTTCATGCTGGTCTCCGCATCGTTCG
CGACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTCCACAAGAAAGTTACTCTCAACAGGCTCAAAT
CCGGCGCCGAGCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGACGGCGT
ATGATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGATGTTGTTAGTGGAA
ACACTTCAAAGTCATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCTTTCGAAC
TTGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTCTATGGTAACCCTGCTGTCGTTACTTTCCGTATCC
CCACAAAGACTGCTCTTCAGCAAGCCTTCTCAAATCCAATACTACCTTTAAACATTCTCG
CAGACCTCCCTCCAACTGACCCGCTTGCCGTGGCTAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGAT
CACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTGGTTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACACCTTCAA
AGTCCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGCAAGAAGAAGCGCTAAGTTATTTGAAAATGAAGCT
AAGAATGGTTGTTACGTTGCTTTTTCTTTTTGTGTTTAGCAGTTAAAACACAGTTTGAAA
ACTTGTAAGAAACGTAGAACACACTTTCACTTTGGTGTTT*GCAGAGGACTATGTTAAAG
AGT

QA 2 784 2 784
DS 

RD RR2AY15TFB 784 0 0
G
GGAGGAAACCAATCGCAGATCTGTGACATACCAAATCCCAACGAAGATCCATGGCCATCT
CCTTAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGTTTTCATGCTGGTCTCCGCATCGTTCG
CGACCTCGGAAATGCTGTTCATGGTGGTCCACAAGAAAGTTACTCTCAACAGGCTCAAAT
CCGGCGCCGAGCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAACCAAGGACCTGCGACGGCGT
ATGATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGGTGTTGTTAGTGGAA
ACACTTCAAAGTCATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCTTTCGAAC
TTGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTCTATGGTAACCCTGCCGTCGTTACTTTCCGTACCC
CCACAAAGACTGCTCTTCAGCAAGCCTTCTCAAATCCAATACTACCTTTAAACATTCTCG
CAGACCTCCCTCCAACTGACCCGCTTGCCGTGGCTAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGAT
CACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTGGTTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACACCTTCAA
AGTCCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGCAAGAAGAAGCGCTAAGTTATTTGAAAATGAAGCT
AAGAATGGTTGTTACGTTGCTTTTTCTTTTTGTGTTTAGCAGTTAAAACACAGTTTGAAA
ACTTGTAAGAAACGTAGAACACACTTTCACTTTGGTGTTT*GCAGAGGACTATGTTAAAG
AGT

QA 2 784 2 784
DS 

RD RR2DM17JQ 593 0 0
TCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGACGGCGTATGATGTGACTCTGGTTGATAAAACCT
GGATTAAGAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGAAACACTTCAAAGTCATGGGAGAGACTTG
ATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCTTTCGAACTTGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTCT
ATGGTAACCCTGCTGTCGTTACTTTCCGCATCCCCACAAAGACTGCTCTTCAGCAAGCCT
TCTCAAATCCAATACTACCTTTAAACATTCTCGCAGACCTCCCTCCAACTGACCCACTTT
CCGTGGCTAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGATCACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTGG
TTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACACCTTCAAAGTCCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGCA
AGAAGAAGCGCTAAGTTATTTGAAAATGAAGCTAAGAATGGTTGTTACGTTGCTTTTTCT
TTTTGTGTTTAGCAGTTAAAACACAGTTTGAAAACTTGTAAGAAACGTAGAACACACTTT
CACTTTGGTGTTTTGCAGAGGACTATGTTAAAGAGTTATTTTGGTTTTGCGTC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2DY35JQ 487 0 0
ATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCTTTCGAACTTGAGGCTAAGGT
TAAAGGGCCCTTCTATGGTAACCCTGCTGTCGTTACTTTCCGCATCCCCACAGAGACTGC
TCTTCAGCAAGCCTTCTCAAATCCAATACTACCTTTAAACATTCTCGCAGACCTCCCTCC
AACTGACCCACTTGCCGTGGCTAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGATCACTTGTTTCAGT
GATATCGATGGTGGTTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACACCTTCAAAGTCCAATTTAGC
AAAGGCTGGCAGCAAGAAGAAGCGCTAAGTTATTTGAAAATGAAGCTAAGAATGGTTGTT
ACGTTGCTTTTTCTTTTTGTGTTTAGCAGTTAAAACACAGTTTGAAAACTTGTAAGAAAC
GTAGAACACACTTTCACTTTGGTGTTTTGCAGAGGACTATGTTAAAGAGTTATTTTGGTT
TTGCGTC

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR2ER67JQ 555 0 0
GTATGATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGATCTTGTTAATGG
AAACACTTCAAAGTCATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCTTTCGA
ACTTGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTTTATGGTAACCCTGCTGTCGTTACTTTCCGCAT
CCCCACAAAGACTGCTTTTCAGCAAGCCTTTTCAAATCCAATACTACCTTTAAACATTTT
CGCAGACCTCCCTCCAACTGACCCACTTGCCGTGGCTAAGAGGATTCTGGCGAAATATGG
ATCACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTGGTTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACCCCTTC
AAAGTCCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGCAAGAAGAAGCGCTAAGTTATTTGAAAATGAAG
CTAAGAATGGTTGTTACGTTGCTTTTTTTTTTTGTGTTTAGCAGTTAAAACACAGTTTGA
AAACTTGTAAGAAACGTAGAACACACTTTCACTTTGGTGTTTTGCAGAGGACTATGTTAA
AGAGTTATTTTGGTT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2AM36JQ 567 0 0
ACGGCGTATGATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGATGTTGTT
AGTGGAAACACTTCAAAGTCATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCT
TTCGAACTTGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTTTATGGTAACCCTGCTGTCGTTACTTTC
CGTATCCCCACAAAGACTGCTTTTCAGCAAGCCTTCTCAAATCCAATACTACCTTTAAAC
ATTCTCGCAGACCTCCCTCCAACTGACCCGCTTGCCGTGGCTAAGAGGATTCTGGCGAAA
TATGGATCACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTGGTTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACA
CCTTCAAAGTCCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGCAAGAAGAAGCGCTAAGTTATTTGAAAA
TGAAGCTAAGAATGGTTGTTACGTTGCTTTTTCTTTTTGTGTTTAGCAGTTAAAACACAG
TTTGAAAACTTGTAAGAAACGTAGAACACACTTTCACTTTGGTGTTT*GCAGAGGACTAT
GTTAAAGAGTTATTTTGGTTTTGCGTC

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2B221TF 822 0 0
G
GGAGGAAACCAATCGCAGATCTGTGACATACCAAATCCCAACGAAGATCCATGGCCATCT
CCTTAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGTTTTCATGCTGGTCTCCGCATCGTTCG
CGACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTCCACAAGAAAGTTACTCTCAACAGGCTCAAAT
CCGGCGCCGAGCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGACGGCGT
ATGATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGATGTTGTTAGTGGAA
ACACTTCAAAGTCATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCTTTCGAAC
TTGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTCTATGGTAACCCTGCTGTCGTTACTTTCCGTATCC
CCACAAAGACTGCTCTTCAGCAAGCCTTCTCAAATCCAATACTACCTTTAAACATTCTCG
CAGACCTCCCTCCAACTGACCCGCTTGCCGTGGCTAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGAT
CACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTGGTTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACACCTTCAA
AGTCCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGCAAGAAGAAGCGCTAAGTTATTTGAAAATGAAGCT
AAGAATGGTTGTTACGTTGCTTTTTCTTTTTGTGTTTAGCAGTTAAAACACAGTTTGAAA
ACTTGTAAGAAACGTAGAACACACTTTCACTTTGGTGTTT*GCAGAGGACTATGTTAAAG
AGTTATTTTGGTTTTGCGTCATAACGTCTTTTTGACAGCG
T

QA 2 821 2 821
DS 

RD RR2GH01JQB 754 0 0
CTAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGTTTTCACGCTGGTCTCCGCTTCGTTCGCGACCT
CGGAAATGCCGTTCATGGTGGTTCACAAGAAAGTTACTCTCAACAGGCTCAAATCCGGCG
CCGAGCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGACGGCGTATGATG
TGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGAAACACTT
CAAAGTCATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCTTTCGAACTTGAGG
CTAAGGTTAAAGGGCCCTTCTATGGTAACCCTGCTGTCGTTACTTTCCGCATCCCCACAA
AGACCGCTCTTCAGCAAGCCTTCTCAAATCCAATACTACCTTTAAACATTCTCGTAGACC
TCCCTCCAACTGACCCACTTGCCGTGGCTAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGATCACTTG
TTTCAGTGATATCGATGGTGGTTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACACCTTCAAAGTCCA
ATTTAGCAAAGGCTGGCAGCAAGAAGAAGCGCTAAGTTATTTGAAAATGAAGCTAAGAAT
GGTTGTTACGTTGCTTTTTCTTTTTGTGTTTAGCAGTTAAAACACAGTTTGAAAACTTGT
AAGAAACGTAGAACACACTTTCACTTTGGTGTTTTGCAGAGGACTATGTTAAAGAGTTAT
TTTGGTTTTGCGTCATAACGTCTTTTTGACAGCG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2B221JQ 617 0 0
TTCGACATCTACAACCAAGGATTTGCGACGGCGTATGATGTGACTCTGGTTGATAAAACC
TGGATTAAGAAAACTTTTGATGTTGTTAGTGGAAACACTTCAAAGTCATGGGAGAGACTT
GATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCTTTCGAACTTGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTT
TATGGTAACCCTGCTGTCGTTACTTTCCGTATCCCCACAAAGACTGCTTTTCAGCAAGCC
TTCTCAAATCCAATACTACCTTTAAACATTCTCGCAGACCTCCCTCCAACTGACCCGCTT
GCCGTGGCTAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGATCACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTG
GTTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACACCTTCAAAGTCCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGC
AAGAAGAAGCGCTAAGTTATTTGAAAATGAAGCTAAGAATGGTTGTTACGTTGCTTTTTC
TTTTTGTGTTTAGCAGTTAAAACACAGTTTGAAAACTTGTAAGAAACGTAGAACACACTT
TCACTTTGGTGTTT*GCAGAGGACTATGTTAAAGAGTTATTTTGGTTTTGCGTCATAACG
TCTTTTTGACAGCGTTG

QA 1 617 1 617
DS 



CO CL172Contig2 737 2 2 U
CGCAAAACCAAAATAACTCTTTAACATAGTCCTCTGCAAAACACCAAAGTGAAAGTGTGT
TCTACGTTTCTTACAAGTTTTCAAACTGTGTGTTTAACTGCTAAACACAAAAAGGAAAAA
AAAAGCATCGTAACAACCATTCTTAGCTTCATTTCACTGACTTAGCGCTTCTTCTTGCTG
CCAGCCTTTGCTAAATTGGACTTTGAAGGCGTTGCTACCAAGTATATGAACAAAACCACC
ATCGATATCACTGAAACAAGTGATCCATATTTCGCCAGAATCCTCTTGGCCACGGCAAGC
GGGTCAGTTGGAGGGAGGTCTGCGAGAATGTTTAAAGGTAGTATTGGATTTGAGAAGGCT
TGCTGAAAAGCAGTCTTTGTGGGGATGCGGAAAGTAACGACAGCAGGGTTACCATAGAAG
GGCCCTTTAACCTTGGCCTCAAGTTCGAAAGAATGAAACAGAATACCTCCTGCATCAAGT
CTCTCCCATGATCTAGAAGTGTTTCCATTAACAACATCAAAAGTTTTCTTAATCCAGGTT
TTATCAACCAGAGTCACATCATACGCCGTCGCAGATCCTTGGTTGTAGATGTCGAAGGAG
ACGAGGACGCGCTCGGCGCCGGATTTGAGCCTGTTGAGAGTAACTTTCTTGTGAACCACC
ATGAATGGCATTTCCGAGGTCGCGAACGAAGCGGAGACCAGCGTGAAAACCGCCATGGCG
GAGATCAGAAGCTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H425JQB U 1
AF RR2F715JQ U 36
BS 1 491 RR2H425JQB
BS 492 737 RR2F715JQ

RD RR2H425JQB 491 0 0
CGCAAAACCAAAATAACTCTTTAACATAGTCCTCTGCAAAACACCAAAGTGAAAGTGTGT
TCTACGTTTCTTACAAGTTTTCAAACTGTGTGTTTAACTGCTAAACACAAAAAGGAAAAA
AAAAGCATCGTAACAACCATTCTTAGCTTCATTTCACTGACTTAGCGCTTCTTCTTGCTG
CCAGCCTTTGCTAAATTGGACTTTGAAGGCGTTGCTACCAAGTATATGAACAAAACCACC
ATCGATATCACTGAAACAAGTGATCCATATTTCGCCAGAATCCTCTTGGCCACGGCAAGC
GGGTCAGTTGGAGGGAGGTCTGCGAGAATGTTTAAAGGTAGTATTGGATTTGAGAAGGCT
TGCTGAAAAGCAGTCTTTGTGGGGATGCGGAAAGTAACGACAGCAGGGTTACCATAGAAG
GGCCCTTTAACCTTGGCCTCAAGTTCGAAAGAATGAAACAGAATACCTCCTGCATCAAGT
CTCTCCCATGA

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2F715JQ 702 0 0
GCAAAACACCAAAGTGAAAGTGTGTTCTACGTTTCTTACAAGTTTTCAAACTGTGTGTTT
AACTGCTAAACACAAAAAGGAAAAAAAAAGCATCGTAACAACCATTCTTAGCTTCATTTC
ACTGACTTAGCGCTTCTTCTTGCTGCCAGCCTTTGCTAAATTGGACTTTGAAGGCGTTGC
TACCAAGTATATGAACAAAACCACCATCGATATCACTGAAACAAGTGATCCATATTTCGC
CAGAATCCTCTTGGCCACGGCAAGCGGGTCAGTTGGAGGGAGGTCTGCGAGA*TGTTTAA
AGGTAGTATTGGATTTGAGAAGGCTTGCTGAAGAGCAGTCTTTGTGGGGATGCGGAAAGT
AACGACAGCAGGGTTACCATAGAAGGGCCCTTTAACCTTGGCCTCAAGTTCGAAAGAATG
AGACAGAATACCTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGATCTAGAAGTGTTTCCATTAACAAC
ATCAAAAGTTTTCTTAATCCAGGTTTTATCAACCAGAGTCACATCATACGCCGTCGCAGA
TCCTTGGTTGTAGATGTCGAAGGAGACGAGGACGCGCTCGGCGCCGGATTTGAGCCTGTT
GAGAGTAACTTTCTTGTGAACCACCATGAATGGCATTTCCGAGGTCGCGAACGAAGCGGA
GACCAGCGTGAAAACCGCCATGGCGGAGATCAGAAGCTTAGC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 2 15

CO CL173Contig1 658 4 10 U
GCCAGAGTGAAATAAACTTAATTGTTTCAATTTTTTTCAACTTAGAATGATTACAAAGAT
AATGATACTATGCTCTAAATGTTTTGCATTACAAAGTCCTCAATACAAAAAAAAAA*CGA
TTCTGCCAAAAGACTCGCCCTCTCTCTCACTGTCACACACACACACACTAGGCCTTATTC
ACCCGAATCTTCTGTCCTTCCAGCAAAGAGTTGTTAAGAGCCAAAATAGCAGCATCGACA
TCTTCATCAGAAGAAAACGTAACAAACCCAAACCCAGTAGATTTCGAAGTACCAGGCACT
CTCGAAACCTTAGCACTCAAAACTTTCCCTTTCTCAAAAAACAAATTCTCAAGCATCTCT
TTAGTAACACTCTTCGCTAGATTCCCTACATACACTTTGTAAGGACTATCCACAAATGCT
GCATCTTCAGACTGAAGCAGCGACAAATCAGGAGACGATGATGATGATAATTCTATAGGC
TTCTCTGTAATATTAACCTTCACCTCACGTCCTTCAATTGTAGTGCCGTTCAACTTCTCA
ATGACAGCATTGGCATCTTCAACTGATTTCATAGTAGCGAAACCAAACCTACGGCTTCTT
CCTGAGTACTTATCATACATCACCTGGACTTGTTCAACGGCGCCGTGCTCTTCGACGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ05JQ U 9
AF RR2GT02JQB U 248
AF RR2F759JQ U 1
AF RR2DR58JQ U 5
BS 1 99 RR2F759JQ
BS 100 100 RR2DR58JQ
BS 101 169 RR2F759JQ
BS 170 170 RR2DR58JQ
BS 171 506 RR2F759JQ
BS 507 507 RR2DR58JQ
BS 508 540 RR2F759JQ
BS 541 541 RR2DR58JQ
BS 542 650 RR2F759JQ
BS 651 658 RR2DR58JQ

RD RR2GZ05JQ 447 0 0
GAAATAAACTTAATTG
TTTCAATTTTTTTCAACTTAAAATGATTACAAAGATAATGATACTATGCTCTAAATGTTT
TGCATTACAAAGTCCTCAATACAAAAAAAAAA*CGATTCTGCCAAAAGGCTCGCCCTCTC
TCTCACTGTCACACACACACACACTAGGCCTTATTCACCCGAATCTTCTGTCCTTCCAGC
AAAGAGTTGTTAAGAGCCAAAATAGCAGCATCGACATCTTCATCAGAAGAAAACGTAACA
AACCCAAACCCAGTAGATTTCGAAGTACCAGGCACTCTCGAAACCTTAGCACTCAAAACT
TTCCCTTTCTCAGAAAACAAATTCTCAAGCATCTCTTTAGTAACACTCTTCGCTAGATTC
CCTACATACACTTTGTAAGGACTATCCACAAATGCTGCATCTTCAGACTGAAGCAGCGAC
AAATCAGGAGA

QA 17 447 17 447
DS 

RD RR2GT02JQB 297 0 0
CAAAAA
AAAACGTAACAAACCCAAACCCAGTAAATTTCGAAGTACCAGGCACTCTCGAAACCTTAG
CACTCAAAACTTTCCCTTTCTCAAAAAACAAATTCTCAAGCATCTCTTTAGTAACACTCT
TCGCTAGATTCCCTACATACACTTTGTAAGGACTATCCACAAATGCTGCATCTTCAGACT
GAAGCAGCGACAAATCAGGAGACGATGATGAT***AATTCTATAGGCTTCTCTGTAATAT
TAACCTTCACCTCACGTCCTTCAATTGTAGTGCCGTTCAACTTCTCAATGA

QA 7 297 7 297
DS 

RD RR2F759JQ 650 0 0
GCCAGAGTGAAATAAACTTAATTGTTTCAATTTTTTTCAACTTAGAATGATTACAAAGAT
AATGATACTATGCTCTAAATGTTTTGCATTACAAAGTCCCCAATACAAAAAAAAAA*CGA
TTCTGCCAAAAGACTCGCCCTCTCTCTCACTGTCACACACACACACACTGGGCCTTATTC
ACCCGAATCTTCTGTCCTTCCAGCAAAGAGTTGTTAAGAGCCAAAATAGCAGCATCGACA
TCTTCATCAGAAGAAAACGTAACAAACCCAAACCCAGTAGATTTCGAAGTACCAGGCACT
CTCGAAACCTTAGCACTCAAAACTTTCCCTTTCTCAAAAAACAAATTCTCAAGCATCTCT
TTAGTAACACTCTTCGCTAGATTCCCTACATACACTTTGTAAGGACTATCCACAAATGCT
GCATCTTCAGACTGAAGCAGCGACAAATCAGGAGACGATGATGATGATAATTCTATAGGC
TTCTCTGTAATATTAACCTTCACCTCGCGTCCTTCAATTGTAGTGCCGTTCAACTTCTCA
GTGACAGCATTGGCATCTTCAACTGATTTCATAGTAGCGAAACCAAACCTACGGCTTCTT
CCTGAGTACTTATCATACATCACCTGGACTTGTTCAACGGCGCCGTGCTC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2DR58JQ 654 0 0
GGGT
GAAATAAACTTAATTGTTTCAATTTTTTTCAACTTAGAATGATTACAAAGATAATGATAC
TATGCTCTAAATGTTTTGCATTACAAAGTCCTCAATACAAAAAAAAAAACGATTCTGCCA
AAAGACTCGCCCTCTCTCTCACTGTCACACACACACACACTAGGCCTTATTCACCCGAAT
CTTCTGTCCTTCCAGCAAAGAGTTGTTAAGAGCCAAAATAGCAGCATCGACATCTTCATC
AGAAGAAAACGTAACAAACCCAAACCCAGTAGATTTCGAAGTACCAGGCACTCTCGAAAC
CTTAGCACTCAGAACTTTCCCTTTCTCAGAAAACAAATTCTCAAGCATCTCTTTAGTAAC
ACTCTTCGCTAGATTCCCTACATACACTTTGTAAGGACTATCCACAAATGCTGCATCTTC
AGACTGAAGCAGCGACAAATCAGGAGACGATGATGATGATAATTCTATAGGCTTCTCTGT
AATATTAACCTTCACCTCACGTCCTTCAATTGTAGTGCCGTTCAACTTCTCAATGACAGC
ATTGGCATCTTCAACTGATTTCATAGTAGCGAAACCAAACCTACGGCTTCTTCCTGAGTA
CTTATCATACATCACCTGGACTTGTTCAACGGCGCCGTGCTCTTCGACGA

QA 5 654 5 654
DS 



CO CL173Contig2 1004 11 17 U
GGACACAACACAACACAACACAACACCTTCTTCTCTTTTCCCCCATTATCTCCTTCCTTC
CTTCCTTC*TCCGACAATGGCTACTTTCCTAACAGCTGTTGTTTCAATCAAACCCACACT
CTTCTCATTCCACTCCGAGTCCTCCACCTCTTTGCAATCTCAAACCAATGCATTCGCTCT
CAAAGCCAAAGCCTTTCCTTCTGTCCCCAGACCCATCTCTCTTCCTCGGACCTCCAGGAT
GAGACTCATCCCTCGCGCAACGTTGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCTAACGC
AGAATCCTCAAGACGCGTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACTAACGAACAGCT
CACCAAACTCGTCGAAGAACACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTA
CTCAGGAAGAAGCCGTAGGTTTGGTTTCGCTACTATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGC
TGTCATTGAGAAGTTGAACGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTAC
AGAGAAGCCTATAGAATTATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTGA
AGATGCAGCATTTGTGGATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCAAAGAGTGT
TACTAAAGAGATGCTTGAGAATTTGTTTTCTGAGAAAGGGAAAGTTCTGAGTGCTAAGGT
TTCGAGAGTGCCTGGTACTTCCAAATCTACTGGGTTTGGGTTTGTTACTTTTTCTTCTGA
TGAAGATGTCGAAGCTGCTATTTTGGCTCTTAACAACGCTTTGCTGGAAGGACAGAAGAT
TCGGGTGAACAAGGCCTAGTATGTGAGAGAGAGAGGGCGAGTCTTTTGGCAGAATCTTTT
TTTGTATTGAAGGGTTTGTAATGCAAAACATTTAGAGCAATAGTATCATTATCTTTGTAA
TCATTCTAAGTTGAAAAGAAAATGAAAGCATTAAAGTTTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 35 35 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 35 50 5 5 5 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 5 60 60 60 60 60 40 60 60 60 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 0 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 10 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 10 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 40 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 50 65 65 65 50 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 0 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2D389TF U 7
AF RR2CD80TF U 5
AF RR2DR58TF U 8
AF RR2AC14TF U 8
AF RR2GT02TF U 15
AF RR2GZ05TF U 15
AF RR2F759TF U 13
AF RR2CN24TF U 19
AF RR2FS96TF U 1
AF RR2CN24JQ C 202
AF RR2CD80JQ C 236
BS 1 48 RR2FS96TF
BS 49 49 RR2AC14TF
BS 50 51 RR2FS96TF
BS 52 54 RR2AC14TF
BS 55 68 RR2FS96TF
BS 69 69 RR2D389TF
BS 70 119 RR2FS96TF
BS 120 120 RR2D389TF
BS 121 225 RR2FS96TF
BS 226 226 RR2D389TF
BS 227 609 RR2FS96TF
BS 610 610 RR2D389TF
BS 611 718 RR2FS96TF
BS 719 719 RR2CN24JQ
BS 720 728 RR2FS96TF
BS 729 1002 RR2CN24JQ
BS 1003 1004 RR2CD80JQ

RD RR2D389TF 607 0 0
GGG
ACAACACAACACAACACCTTCTTCTCTTTTCCCCCATTA*TTATCTCCTTCCTTC*****
TCCGACAATGGCTACTTTCCTAACAGCTGTTGTTTCAATCAAACCCACACTCTTCTCATT
CCACTCCGAGTCCTCCACCTCTTTGCAATCTCAAACCAATGCATTCGCTCTCAAAGCCAA
AGCCTTTCCTTCTGTCCCCAGACCC*TCTCTCTTCCTCGGACCTCCAGGATGAGACTCAT
CCCTCGCGCAACGTTGGAGACCGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCTAACGCAGAATCCTC
GAGACGCGTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACTAACGAACAGCTCACCAAACT
CGTCGAAGAACACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTACTCAGGAAG
AAGCCGTAGGTTTGGTTTCGCTACAATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGCTGTCATTGA
GAAGTTGAACGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTACAGAGAAGCC
TATAGAATTATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCACTGCTACAGTCTGAAGATGCAGC
ATTT

QA 4 607 4 607
DS 

RD RR2CD80TF 644 0 0
GGAAC
ACAACACAACACAACACCTTCTTCTCTTTTCCCCCATTA*CTATCTCCTTCCTTCCTTCC
TCCGACAATGGCTACTTTCCTAACAGCTGTTGTTTCAATCAAACCCACACACTTCTCATT
CCACTCCGAGTCCTCCACCTCTTTGCAATCTCAAACCAATGCATTCGCTCTCAAAGCCAA
AGCCTTTCCTTCTGTCCCCAGACCCATCTCT**TCCACGGACCTCCAGGATGAGACTCAT
CCCTCGCGCAACGTTGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCTAACGCAGAATCCTC
AAGACGCGTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACTAACGAACAGCTCACCAAACT
CGTCGAAGAACACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTACTCAGGAAG
AAGCCGTAGGTTTGGTTTCGCTACTATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGCTGTCATTGA
GAAGTTGAACGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTACAGAGAAGCC
TATAGAATTATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTGAAGATGCAGC
TTTTGTGGATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGA
TCTA

QA 6 640 6 640
DS 

RD RR2DR58TF 630 0 0
GG
ACAACACAACACAACACCTTCTTCTCTTTTCCCCCATTATCTCCTTCCTTCCTTCCTTC*
TCCGACAATGGCTACTTTCCTAACAGCTGTTGTTTCAATCAAACCCACACTCTTCTCATT
CCACTCCGAGTCCTCCACCTCTTTGCAATCTCAAACCAATGCATTCGCTCTCAAAGCCAA
AGCCTTTCCTTCTGTCTCCAGACCCATCTCTCTTCCTCGGACCTCCAGGATGAGACTCAT
CCCTCGCGCAACGTTGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCTAACGCAGAATCCTC
GAGACGCGTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACAAACGAACAGCTCACCAAACT
CGTCGAAGAGCACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTACTCAGGAAG
AAGCCGTAGGTTTGGTTTCGCTACTATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGCTGTCATTGA
GAAGTTGAACGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTACAGAGAAGCC
TATAGAATTATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTGAAGATGCAGC
ATTTGTGGATAGTCCTTACAAAGTGTAT

QA 3 630 3 630
DS 

RD RR2AC14TF 707 0 0
GG
ACAACACAACACAACACCTTCTTCTCTTT*CCCCCATTATCTCCTTCCTTCCTTCCTTC*
TCCGACAATGGCTACTTTCCTAACAGCTGTTGTTTCAATCAAACCCACACTCTTCTCATT
CCACTCCGAGTCCTCCACCTCTTTGCAATCTCAAACCAATGCATTCGCTCTCAAAGCCAA
AGCCTTTCCTTCTGTCCCCAGACCCATCTCTCTTCCTCGGACCTCCAGGATGAGACTCAT
CCCTCGCGCAACGTTGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCTAACGCAGAATCCTC
GAGACGCGTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACAAACGAACAGCTCACCAAACT
CGTCGAAGAGCACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTACTCAGGAAG
AAGCCGTAGGTTTGGTTTCGCTACTATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGCTGTCATTGA
GAAGTTGAACGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTACAGAGAAGCC
TATAGAATTATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGCCTGAAGATGCAGC
ATTTGTGGATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCGAAGAGTGTTACTAAAGA
GATGCTTGAGAATTTGTTTTCTGAGAAAGGGAAAGTTCTGAGTGC

QA 3 707 3 707
DS 

RD RR2GT02TF 687 0 0
GG
AACACAACACCTTCTTCTCTTTTCCCCCATTATCTCCTTCCTTCCTTCCTTC*TCCGACA
ATGGCTACTTTCCTAACAGCCGTTGTTTCAATCAAACCCACACTCTTCTCATTCCACTCC
GAGTCCTCCACCTCTTTGCAATCTCAAACCAATGCATTCGCTCTCAAAGCCAAAGCCTTT
CCTTCTGTCCCCAGACCCATCTCTCTTCCTCGGACCTCCAGGATGAGACTCATCCCTCGC
GCAACGTTGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCTAACGCAGAATCCTCGAGACAC
GTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACAAACGAACAGCTCACCAAACTCGTCGAA
GAGCACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTACTCAGGAAGAAGCCGT
AGGTTTGGTTTCGCTACTATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGCTGTCATTGAGAAGTTG
AACGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTACAGAGAAGCCTATAGAA
TTATCATCATC***GTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTGAAGATGCAGCATTTGTG
GATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCGAAGAGTGTTACTAAAGAGATGCTT
GAGAATTTGTTTTCTGAGAAAGGGA

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR2GZ05TF 658 0 0
GG
AACACAACACCTTCTTCTCTTTTCCCCCATTATCTCCTTCCTTCCTTCCTTC*TCCGACA
ATGGCTACTTTCCTAACAGCCGTTGTTTCAATCAAACCCACACTCTTCTCATTCCACTCC
GAGTCCTCCACCTCTTTGCAATCTCAAACCAATGCATTCGCTCTCAAAGCCAAAGCCTTT
CCTTCTGTCCCCAGACCCATCTCTCTTCCTCGGACCTCCAGGATGAGACTCATCCCTCGC
GCAACGTTGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCTAACGCAGAATCCTCGAGACAC
GTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACAAACGAACAGCTCACCAAACTCGTCGAA
GAGCACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTACTCAGGAAGAAGCCGT
AGGTTTGGTTTCGCTACTATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGCTGTCATTGAGAAGTTG
AACGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTACAGAGAAGCCTATAGAA
TTATCATCATC***GTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTGAAGATGCAGCATTTGTG
GATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCGAAGAGTGTTACTAAAGAGAT

QA 3 658 3 658
DS 

RD RR2F759TF 689 0 0
GG
ACAACACAACACCTTCTTCTCTTTTCCCCCATTATCTCCTTCCTTCCTTCCTTC*TCCGA
CAATGGCTACTTTCCTAACAGCTGTTGTTTCAATCAAACCCACACTCTTCTCATTCCACT
CCGAGTCCTCCACCTCTTTGCAATCTCAAACCAATGCATTCGCTCTCAAAGCCAAAGCCT
TTCCTTCTGTCCCCAGACCCATCTCTCTTCCTCGGACCTCCAGGATGAGACTCATCCCTC
GCGCAACGTTGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCTAACGCAGAATCCTCGAGAC
GCGTCTACATCGGAAACAT*CCAAGAACCGTAACAAACGAACAGCTCACCAAACTCGTCG
AAGAGCACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTACTCAGGAAGAAGCC
GTAGGTTTGGTTTCGCTACTATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGCTGTCACTGAGAAGT
TGAACGGCACTACAATTGAAGGACGCGAGGTGAAGGTTAATATTACAGAGAAGCCTATAG
AATTATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTGAAGATGCAGCATTTG
TGGATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCGAAGAGTGTTACTAAAGAGATGC
TTGAGAATTTGTTTTCTGAGAAAGGGA

QA 3 689 3 689
DS 

RD RR2CN24TF 698 0 0
GGA
AACACCTTCTTCTCTTTTCCCCCATTA*CTATCTCCTTCCTTCCTTCCTCCGACAATGGC
TACTTTCCTAACAGCTGTTGTTTCAATCAAACCCACACACTTCTCATTCCACTCCGAGTC
CTCCACCTCTTTGCAATCTCAAACCAATGCATTCGCTCTCAAAGCCAAAGCCTTTCCTTC
TGTCCCCAGACCCATCTCTCTTCCACGGACCTCCAGGATGAGACTCATCCCTCGCGCAAC
GTTGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCTAACGCAGAATCCTCAAGACGCGTCTA
CATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACTAACGAACAGCTCACCAAACTCGTCGAAGAACA
CGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTACTCAGGAAGAAGCCGTAGGTT
TGGTTTCGCTACTATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGCTGTCATTGAGAAGTTGAACGG
CACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTACGGAGAAGCCTATAGAATTATC
ATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTGAAGATGCAGCTTTTGTGGATAG
TCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCAAAGAGTGTTACTAAAGAGATGCTTGAGAA
TTTGTTTTCTGAGAAAGGGAAAGTTCTGAGTGCTA

QA 4 698 4 698
DS 

RD RR2FS96TF 728 0 0
GGACACAACACAACACAACACAACACCTTCTTCTCTTTTCCCCCATTA*CTATCTCCTTC
CTTCCTTCCTCCGACAATGGCTACTTTCCTAACAGCTGTTGTTTCAATCAAACCCACACA
CTTCTCATTCCACTCCGAGTCCTCCACCTCTTTGCAATCTCAAACCAATGCATTCGCTCT
CAAAGCCAAAGCCTTTCCTTCTGTCCCCAGACCCATCTCTCTTCCACGGACCTCCAGGAT
GAGACTCATCCCTCGCGCAACGTTGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCTAACGC
AGAATCCTCAAGACGCGTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACTAACGAACAGCT
CACCAAACTCGTCGAAGAACACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTA
CTCAGGAAGAAGCCGTAGGTTTGGTTTCGCTACTATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGC
TGTCATTGAGAAGTTGAACGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTAC
AGAGAAGCCTATAGAATTATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTGA
AGATGCAGCTTTTGTGGATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCAAAGAGTGT
TACTAAAGAGATGCTTGAGAATTTGTTTTCTGAGAAAGGGAAAGTTCTGAGTGCTAAG*T
TTCGAGAG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2CN24JQ 803 0 0
TGTCCCCAGACCCATCTCTCTTCCACGGAC*TCCAGGATGAGACTCATCCCTCGCGCAAC
GTTGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCTAACGCAGAATCCTCAAGACGCGTCTA
CATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACTAACGAACAGCTCACCAAACTCGTCGAAGAACA
CGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTACTCAGGAAGAAGCCGTAGGTT
TGGTTTCGCTACTATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGCTGTCATTGAGAAGTTGAACGG
CACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTACGGAGAAGCCTATAGAATTATC
ATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTGAAGATGCAGCTTTTGTGGATAG
TCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCAAAGAGTGTTACTAAAGAGATGCTTGAGAA
TTTGTTTTCTGAGAAAGGGAAAGTTCTGAGTGCTAAGGTTTCGAGAGTGCCTGGTACTTC
CAAATCTACTGGGTTTGGGTTTGTTACTTTTTCTTCTGATGAAGATGTCGAAGCTGCTAT
TTTGGCTCTTAACAACGCTTTGCTGGAAGGACAGAAGATTCGGGTGAACAAGGCCTAGTA
TGTGAGAGAGAGAGGGCGAGTCTTTTGGCAGAATCTTTTTTTGTATTGAAGGGTTTGTAA
TGCAAAACATTTAGAGCAATAGTATCATTATCTTTGTAATCATTCTAAGTTGAAAAGAAA
ATGAAAGCATTAAAGTTTATT
TC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2CD80JQ 769 0 0
AGGATGAGACTCATCCCTCGCGCAACGTTGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCT
AACGCAGAATCCTCAAGACGCGTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACTAACGAA
CAGCTCACCAAACTCGTCGAAGAACACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGAT
AAGTACTCAGGAAGAAGCCGTAGGTTTGGTTTCGCTACTATGAAATCAGTTGAAGATGCC
AATGCTGTCATTGAGAAGTTGAACGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAAT
ATTACAGAGAAGCCTATAGAATTATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAG
TCTGAAGATGCAGCTTTTGTGGATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCAAAG
AGTGTTACTAAAGAGATGCTTGAGAATTTGCTTTCTGAGAAAGGGAAAGTTCTGAGTGCT
AAGGTTTCGAGAGTGCCTGGTACTTCCAAATCTACTGGGTTTGGGTTTGTTACTTTTTCT
TCTGATGAAGATGTCGAAGCTGCTATTTTGGCTCTTAACAACTCTTTGCTGGAAGGACAG
AAGATTCGGGTGAACAAGGCCTAGTATGTGAGAGAGAGAGGGCGAGTCTTTTGGCAGAAT
CTTTTTTTGTATTGAAGGGTTTGTAATGCAAAACATTTAGAGCAATAGTATCATTATCTT
TGTAATCATTCTAAGTTGAAAAGAAAATGAAAGCATTAAAGTTTATTCC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 2 16

CO CL174Contig1 971 7 11 U
GGAGAAGAGCTTCTCATCAGATCGGTTTCCCATGGCTGCAGTTGCTAACACCGCCGCTAT
TTTCGCCTCTCCTTCCCAGCCTTTTTCTTCTAAACGCAGTCTCTTTTACAGTTCAACGAT
TAGTCCACTACAAAGGAGATTTCCAACGAGGAAGCTTGATCTCCATGTAAAAGCTGCTGC
CACGACTCTTGCACCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTT
CGAGATGGGGAGAGCTCCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGG
TGAAAAGTTGAAACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTA
TGGGGTTGCTTTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATAATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGC
AATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCAT
TCCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCC
ATACAGGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAA
TGAGGGTCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATATCCTGA
CTCCAACATTGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGTCGAAGGAGGTGA
TAGATGCAATCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCC
GTTGGCTAATGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTGGAGTTATCCGATTCTGATGAATAGAA
CTGATATATATTCATGTAAATATATAAACACAGATATGTTTATATCAGTGTGAGTTTGAA
TATGTATGCATGTGGAAGTGGTAAGTGAATACGCTAAATGTCACTTGTTAGTTTTTGTAT
AGTTATATAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2B555TF U 1
AF RR2DL93TF U 11
AF RR2H128TF U 5
AF RR2B555JQ C 180
AF RR2A501TF U 290
AF RR2DL93JQ C 257
AF RR2A501JQ C 340
BS 1 706 RR2B555TF
BS 707 707 RR2A501TF
BS 708 713 RR2H128TF
BS 714 714 RR2A501TF
BS 715 716 RR2H128TF
BS 717 717 RR2A501TF
BS 718 728 RR2H128TF
BS 729 729 RR2A501TF
BS 730 739 RR2H128TF
BS 740 957 RR2A501TF
BS 958 971 RR2DL93JQ

RD RR2B555TF 709 0 0
GGAGAAGAGCTTCTCATCAGATCGGTTTCCCATGGCTGCAGTTGCTAACACCGCCGCTAT
TTTCGCCTCTCCTTCCCAGCCTTTTTCTTCTAAACGCAGTCTCTTTTACAGTTCAACGAT
TAGTCCACTACAAAGGAGATTTCCAACGAGGAAGCTTGATCTCCATGTAAAAGCTGCTGC
CACGACTCTTGCACCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTT
CGAGATGGGGAGAGCTCCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGG
TGAAAAGTTGAAACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTA
TGGGGTTGCTTTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATAATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGC
AATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCAT
TCCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCC
ATACAGGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAA
TGAGGGTCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATATCCTGA
CTCCAACATTGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACG
TCG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2DL93TF 692 0 0
GG
CTCATCAGATCGGTTTCCCATGGCTGCAGTTGCTAACACCGCCGCTATTTTCGCCTCTCC
TTCCCAGCCTTTTTCTTCTAAACGCAGTCTCTTTTACAGTTCAACGATTAGTCCGCTACA
AAGGAGACTTCCAACGAGGAAGCTTGATCTCCATGTAAAAGCTGCTGCCACGACTCTTGC
ACCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGAGATGGGGAG
AGCTCCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAAGTTGAA
ACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTT
CAACGGAGGTTTTAACCAACCAATAATGTGTGGTGGGTAACCAAGAGCAATGCTTAAAAA
GGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGC
TGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAGGCTTCA
GTTCCAAGTCCCTAAGAGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTAGC
GAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATATCCTGACTCCAACATTGT
TGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTT

QA 3 692 3 692
DS 

RD RR2H128TF 735 0 0
GGGAGCTT
CTCATCAGATCGGTTTCCCATGGCTGCAGTCCCTAACAGCGCCGCTATTTTCGCCTCTCC
TTCTCAGCCTTTATCTTCTAAACGCAGTCTCTTTTACAGTTCAACGATTAGTCCACTACA
AAGGAGATTTCCAACGAGGAAGCTTGATCTCCAAGTAAAAGCTGCTGCCACGACTCTTGC
CCCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGAGATGGGGAG
AGCTCCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACGGCAGGTGAAAAGTTGAA
ACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTT
CAACGGAGGTTTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGCAATGCTTAAAAA
AGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGC
TGTGAATTTGATATTCTCATTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAGGCTTCA
GTTCCAAGTCCCTAAGAGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTAGC
GAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATTTCCTGACTCCAACATTGT
TGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACG*TCGAAGAAG*TGATAGATGCA*TCT
AGATCTC

QA 9 735 9 735
DS 

RD RR2B555JQ 763 0 0
CCACGACTCTTGCACCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGT
TCGAGATGGGGAGAGCTCCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAG
GTGAAAAGTTGAAACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACT
ATGGGGTTGCTTTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATAATGTGTGGTGGGGAACCAAGAG
CAATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCA
TTCCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATTTTCGTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTC
CATACAGGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTTTTCA
ATGAGGGTCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATATCCTG
ACTCCAACATTGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGTCGAAGGAGGTG
ATAGATGCAATCTAGATCTCGTTCCTGGGGGTATGGATACAAATTCAGAACATTCCAACC
CGTTGGCTAATGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTGGAGTTATCCGATTCTGATGAATAGA
ACTGATATATATTCATGTAAATATATAAACACAGATATGTTTATATCAGTGTGAGTTTGA
ATATGTATGCATGTGGATGTGGTAAGTGAATACGATAAATGTC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2A501TF 668 0 0
G
CAACCGCAGGTGAAAAGTTGAAACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTA
ACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATAATGTGTGGTGGGG
AACCAAGAGCAATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGC
AGATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGACT
GGGACGGTCCATACAGGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAGATGGCAAAACAAACCTATTG
AGTTCTTCAATGAGGGTCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAA
TATATCCTGACTCCAACATTGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGTCG
AAGGAGGTGATAGATGCAATCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAAC
ATTTCAACCCGTTGGCTAATGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTGGAGTTATCCGATTCTG
ATGAATAGAACTGATATATATTCATGTAAATATATAAACACAGATATGTTTATATCAGTG
TGAGTTTGAATATGTATGCATGTGGAAGTGGTAAGTGAATACGCTAAATGTCACTTGTTA
GTTTTTG

QA 2 668 2 668
DS 

RD RR2DL93JQ 715 0 0
CCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAAGTTGAAACTT
TTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAAC
GGAGGTTTTAACCAACCAATAATGTGTGGTGGGTAACCAAGAGCAATGCTTAAAAAGGAT
CGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTG
AATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAGGCTTCAGTTC
CAAGTCCCTAAGAGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTAGCGAAT
GAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGAGAGCAATATATCCTGACTCCAACATTGTTGCG
ACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGTCGAAGGAGGTGATAGATGCAATCTAGAT
CTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGGCTAATGTTGAT
GATGGTTCTTGCCCTCTGGAGTTATCCGATTCGGATGAATAGAACTGATATATATTCATG
TAAATATATAAACACAGATATGTTTATATCAGTGTGAGTTTGAATATGTATGCATGTGGA
TGTGGTAAGTGAATACGATAAATGTCACTTGTTAGTTTTTGTATAGTTATATAAG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2A501JQ 632 0 0
ACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATAAT
GTGTGGTGGGGAACCAAGAGCAATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCAT
ATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAA
TGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAGGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAGATGGCAAAA
CAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTG
CGAGAGAGCAATATATCCTGACTCCAACATTGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAA
CTTGACGGTCGAAGGAGGTGATAGATGCAATCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATAC
AAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGGCTAATGTTGATGATGGTTCTTGCCCTCTGGAGTT
ATCCGATTCTGATGAATAGAACTGATATATATTCATGTAAATATATAAACACAGATATGT
TTATATCAGTGTGAGTTTGAATATGTATGCATGTGGAAGTGGTAAGTGAATACGCTAAAT
GTCACTTGTTAGTTTTTGTATAGTTATATAAG

QA 1 632 1 632
DS 



CO CL174Contig2 919 9 52 U
GGGAACAGAGTTTCTCATCAGATTGGTTCACATGGCCGCAGCTGCTAACACCGCAGTTTT
TGTATCCCCTTCACAGCCTTTATCCTCTAAACGCAGTTTTTTGTACAGCTCGACGGTTAG
TCCAATACAGAGGAGATTTCCAAGGAGGAAACTTGAACTGCAAGTAAAAGCTGCTGCCAC
CACTCTTGCACCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGA
GATGGGGACAGCTCCAGTTTTCTGGAAAACCATGAACGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGA
AAAGTTGAAACTGTTCTACAATCCAGCTGCAACCAAACTCAGTCCTAACGAGGACTATGG
GGTTGCTTTCAACGGAGGATTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGCAAT
GCTTAAGAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATTTACACTATGCAGATTTGCATTCC
TAAGCACGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGCCGATTGGG*ATGGTCCAT
ACAGACTTCAGTTCCAAGTTCCCAAGCGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTTTTCAATG
AGGGTCTAGCTAAAGAGTTGAGCCAAGATGGAGCCTGTGAGCGAGCAATATTTCCTGACT
CGAACATAGTCGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTAACGGTCGAAGGAGGAGATA
GATGCAATCTGGACCTTGTTCCTGGATGCATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCTT
TGGCTAATGTTGATGATGGCTCTTGTCCTCTTGAGTTATCTGATTCTGATGAATAGAACT
ATATCATCTTT*CTTCGTGTAAATATAATATATAGTCAGTATTTGAATATGTTATACATG
AAAGAACTGAATACGATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 5 30 30 30 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 
55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 50 50 50 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 10 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2FO93TF U 1
AF RR2G491TF U 5
AF RR2D857TF U 26
AF RR2FH31TF U 2
AF RR2D719TF U 270
AF RR2BC06TF U 103
AF RR2D719JQ C 270
AF RR2BC06JQ C 178
AF RR2FH31JQ C 201
BS 1 29 RR2FO93TF
BS 30 30 RR2FH31TF
BS 31 36 RR2FO93TF
BS 37 37 RR2FH31TF
BS 38 66 RR2FO93TF
BS 67 67 RR2FH31TF
BS 68 81 RR2FO93TF
BS 82 82 RR2FH31TF
BS 83 111 RR2FO93TF
BS 112 112 RR2FH31TF
BS 113 123 RR2FO93TF
BS 124 124 RR2FH31TF
BS 125 169 RR2FO93TF
BS 170 170 RR2FH31TF
BS 171 173 RR2FO93TF
BS 174 174 RR2FH31TF
BS 175 291 RR2FO93TF
BS 292 292 RR2FH31TF
BS 293 341 RR2FO93TF
BS 342 342 RR2FH31TF
BS 343 521 RR2FO93TF
BS 522 522 RR2FH31TF
BS 523 537 RR2FO93TF
BS 538 538 RR2G491TF
BS 539 543 RR2FO93TF
BS 544 544 RR2FH31TF
BS 545 559 RR2FO93TF
BS 560 560 RR2FH31TF
BS 561 592 RR2FO93TF
BS 593 593 RR2FH31TF
BS 594 670 RR2FO93TF
BS 671 671 RR2FH31TF
BS 672 711 RR2FO93TF
BS 712 712 RR2BC06TF
BS 713 762 RR2FO93TF
BS 763 763 RR2BC06TF
BS 764 766 RR2FH31TF
BS 767 767 RR2BC06TF
BS 768 774 RR2FH31TF
BS 775 775 RR2BC06TF
BS 776 786 RR2FH31TF
BS 787 787 RR2BC06TF
BS 788 790 RR2FH31TF
BS 791 791 RR2BC06TF
BS 792 798 RR2FH31TF
BS 799 799 RR2BC06TF
BS 800 832 RR2FH31TF
BS 833 851 RR2BC06TF
BS 852 852 RR2BC06JQ
BS 853 870 RR2BC06TF
BS 871 916 RR2BC06JQ
BS 917 919 RR2FH31JQ

RD RR2FO93TF 762 0 0
GGGAACAGAGTTTCTCATCAGATTGGTTCCCATGGCTGCAGCTGCTAACACCGCAGTTTT
TGTATCTCCTTCACAGCCTTTGTCCTCTAAACGCAGTTTTTTGTACAGCTCAACGGTTAG
TCCGATACAGAGGAGATTTCCAAGGAGGAAACTTGAACTGCAAGTAAAATCTGTTGCCAC
CACTCTTGCACCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGA
GATGGGGACAGCTCCAGTTTTCTGGAAAACCATGAACGGTCTTCCTCCAACAGCAGGTGA
AAAGTTGAAACTGTTCTACAATCCAGCTGCAACCAAACTCACTCCTAACGAGGACTATGG
GGTTGCTTTCAACGGAGGATTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGCAAT
GCTTAAGAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATTTACACTATGCAGATTTGCATTCC
TAAGCACGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGATTGGG*ATGGTC*AT
ACATACTTCAGTTCCAAGTCCCCAAGCGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATG
AGGGTCTAGCTAAAGAGTTGAGCCAAGATGGAGCCTGTGAGCGAGCAATATTTCCTGACT
CGAACATAGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTAACGGTCGAAG*AGGAGATA
GATGCAATCTGGACCTTGTTCCTGGATGCATGGATACAAATT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2G491TF 738 0 0
GGAGAGTTTC
TCATCAGATTGGTTCCCATGGCTGCAGCTGCTAACACCGCAGTTTTTGTATCTCCTTCAC
AGCCTTTGTCCTCTAAACGCAGTTTTTTGTACAGCTCAACGGTTAGTCCGATACAGAGGA
GATTTCCAAGGAGGAAACTTGAACTGCAAGTAAAATCTGTTGCCACCACTCTTGCACCCC
TCGAATAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGAGATGGGGACAGCTC
CAGTTTTCTGGAAAACCATGAACGGTCTTCCTCCAACAGCAGGTGAAAAGTTGAAACTGT
TCTACAATCCAGCTGCAACCAAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACG
GAGGATTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGCAATGCTTAAGAAAGATC
GAGGCAAAGCCGATTCTCCCATTTACACTATGCAGATTTGTATTCCTAAGCACGCCGTGA
ATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGTCGATTGGG*ATGGTCCATACACACTTCAGTTC
CAAGTCCCCAAGCGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTAGCTAAA
GAGTTGAGCCAAGATGGAGCCTGTGAGCGAGCAATATTTCCTGACTCGAACATAGTTGCG
ACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTAACGGTCGAAG*AGGAGATAGATGCAATCTGGAC
CTTGTTCC

QA 11 738 11 738
DS 

RD RR2D857TF 714 0 0
GTTCACATGGCCGCAGCTGTTAACACCGCAGTTTTTGTATCCCCTTCACAGCTTTTATCC
TCTAAACGCAGTTTTTTGTACAGCTCGACGGTTAGTCCAATACAGAGGAGATTTCCAAGG
AGGAAACTTGAACTGCAAGTAAAAGCTGCTGCCACCACTCTTGCACCCCTCGAAGAGATC
AAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGAGATGGGGACAGCTCCAGTGTTCTGG
AAAACCATGAACGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAAGTTGAAACTGTTCTACAATCCA
GCTGCAACCAAACTCAGTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACGGAGGATTTAAC
CAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGCAATGCTTAAGAAAGATCGAGGCAAAGCC
GATTCTCCCATTTACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATTC
TCGTTCACCAATGGTGCCGATTGGG*ATGGTCCATACAGACTTCAGTTCCAAGTTCCCAA
GCGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTTTTCAATGAGGGTCTAGCTAAAGAGTTGAGCCA
AGATGGAGCCTGTGAGCGAGCAATATTTCCTGACTCGAACATAGTCGCGACACGGTGCAC
AATGATTGCCAACTTAACGGTCGAAG*AGGAGATAGATGCAATCTGGACTTTGT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2FH31TF 831 0 0
GGGAACAGTTTTA
TCATCAGATTGGTTCACATGGCCGCAGCTGTTAACACCGCAGTTTTTGCATCCCCTTCAC
AGCTTTTATCCTCTAAACGCAGTTTTTTGTACAGCTCGACGGTTAGTCCAATACAGAGGA
GATTTCCAAGGAGGAAACTTGAACTGCAAGTAAAAGCTGCTGCCACCACTCTTGTACCCC
TCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGAGATGGGGACAGCTC
CAGTT**CTGGAAAACCATGAACGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAAGTTGAAACTGT
TCTACGATCCAGCTGCAACCAAACTCAGTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACG
GAGGATTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGCAATGCTTAAGAAAGATC
GAGGCAAAGCCGATTCTCCCATTTACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTGA
ATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGCCGATTGGG*ATGGTCCATACAGACTTCAGTTC
CAAGTTCCCAAGCGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTTTTCAATGAGGGTCTAGCTAAA
GAGTTGAGCCAAGATGGAGCCTGTGAGCGAGCAATATTTCCTGACTCGAACATAGTCGCG
ACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTAACGGTCGAAG*AG*AGATAGATGCAATCTGGAC
*TTGTTCCTGG*TGCATGGATACAATTC*AGA*CATTTCA*CCCTTTGGCTA*TGT*GAT
GATG*CTCTTGTCCTCTTGAGTTATCTGATTCTGATGA

QA 14 831 14 831
DS 

RD RR2D719TF 565 0 0
G
CATGAACGGTCTTCCTCCAACAGCAGGTGAAAAGTTGAAACTGTTCTACAATCCAGCTGC
AACCAAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACGGAGGATTTAACCAACC
AATCATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGCAATGCTTAAGAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTC
TCCCATTTACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTGGATTTGATATTCTCGTT
CACCAATGGTGTCGATTGGG*ATGGTCCATACATACTTCAGTTCCAAGTCCCCAAGCGAT
GGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTAGCTAAAGAGTTGAGCCAAGGTG
GAGCCTGTGAGCGAGCAATATTTCCTGACTCGAACATAGTTGCGACACGGTGCACAATGA
TTGCCAACTTAACGGTCGAAGGAGGAGATAGATGCAATCTGGACCTTGTTCCTGGATGCA
TGGATACAAATTCAGAACATTTCAATCCGTTGGCTAATGTTGATGATGGCTCTTGTCCTC
TTGAGTTATCTGATTCTGATGAAT

QA 2 565 2 565
DS 

RD RR2BC06TF 768 0 0
GTACAGCTCGACGGTTAGTCCAATACAGAGGAGATTTCCAAGGAGGAAACTTGAACTGCA
AGTAAAAGCTGCTGCCACCACTCTTGCACCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCC
TTCATGGGCAATGTTCGAGATGGGGACAGCTCCAGTGTTCTGGAAAACCATGAACGGTCT
TCCTCCAACCGCAGGTGAAAAGTTGAAACTGTTCTACAATCCAGCTGCAACCAAACTCAG
TCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACGGAGGATTTAACCAACCAAGCATGTGTGG
TGGGGAACCAAGAGCAATGCTTAAGAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATTTACAC
TATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGC
CGATTGGGGATGGTCCATACAGACTTCAGTTCCAAGTTCCCAAGCGATGGCAAAACAAAC
CTATTGAGTTTTTCAATGAGGGTCTAGCTAAAGAGTTGAGCCAAGATGGAGCCTGTGAGC
GAGCAATATTTCCTGACTCGAACATAGTCGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTAA
CGGTCGAAGGAGGAGATAGATGCAATCTGGACCTTGTTCCTGGGTGCATGGATACAAATT
CAGAACATTTCAACCCTTTGGCTAATGTTGATGATGGCTCTTGTCCTCTTGAGTTATCTG
ATTCTGATGAATAGAACTATATCATCTTTTCTTCGTGTAAATATAATA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2D719JQ 587 0 0
G
CATGAACGGTCTTCCTCCAACAGCAGGTGAAAAGTTGAAACTGTTCTACAATCCAGCTGC
AACCAAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACGGAGGATTTAACCAACC
AATCATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGCAATGCTTAAGAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTC
TCCCATTTACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTGGATTTGATATTCTCGTT
CACCAATGGTGTCGATTGGG*ATGGTCCATACATACTTCAGTTCCAAGTCCCCAAGCGAT
GGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTAGCTAAAGAGTTGAGCCAAGGTG
GAGCCTGTGAGCGAGCAATATTTCCTGACTCGAACATAGTTGCGACACGGTGCACAATGA
TTGCCAACTTAACGGTCGAAGGAGGAGATAGATGCAATCTGGACCTTGTTCCTGGATGCA
TGGATACAAATTCAGAACATTTCAATCCGTTGGCTAATGTTGATGATGGCTCTTGTCCTC
TTGAGTTATCTGATTCTGATGAATAGAACTATATAATCTTT
CTTCC

QA 2 582 2 582
DS 

RD RR2BC06JQ 740 0 0
CACCACTCTTGCACCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTT
CGAGATGGGGACAGCTCCAGTGTTCTGGAAAACCATGAACGGTCTTCCTCCAACCGCAGG
TGAAAAGTTGAAACTGTTCTACAATCCAGCTGCAACCAAACTCAGTCCTAACGAGGACTA
TGGGGTTGCTTTCAACGGAGGATTTAACCAACCAAGCATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGC
AATGCTTAAGAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATTTACACTATGCAGATTTGCAT
TCCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATTCTCGTTCACCAATGGTGCCGATTGGG*ATGGTC
CATACAGACTTCAGTTCCAAGTTCCCAAGCGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTTTTCA
ATGAGGGTCTAGCTAAAGAGTTGAGCCAAGATGGAGCCTGTGAGCGAGCAATATTTCCTG
ACTCGAACATAGTCGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTAACGGTCGAAGGAGGAG
ATAGATGCAATCTGGACCTTGTTCCTGGGTGCATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACC
CTTTGGCTAATGTTGATGATGGCTCTTGTCCTCTTGAGTTATCTGATTCTGATGAATAGA
ACTATATCATCTTT*CTTCGTGTAAATATAATATATAGTCAGTATTTGAATATGTTATAC
ATGAAAGAACTGAATACGA
C

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2FH31JQ 719 0 0
AGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGAGATGGGGACAGCTCCAGTT*
*CTGGAAAACCATGAACGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAAGTTGAAACTGTTCTACG
ATCCAGCTGCAACCAAACTCAGTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACGGAGGAT
TTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGCAATGCTTAAGAAAGATCGAGGCA
AAGCCGATTCTCCCATTTACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTGAATTTGA
TATTCTCGTTCACCAATGGTGCCGATTGGG*ATGGTCCATACAGACTTCAGTTCCAAGTT
CCCAAGCGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTTTTCAATGAGGGTCTAGCTAAAGAGTTG
AGCCAAGATGGAGCCTGTGAGCGAGCAATATTTCCTGACTCGAACATAGTCGCGACACGG
TGCACAATGATTGCCAACTTAACGGTCGAAGGAGGAGATAGATGCAATCTGGACCTTGTT
CCTGGGTGCATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCTTTGGCTAATGTTGATGATGGC
TCTTGTCCTCTTGAGTTATCTGATTCTGATGAATAGAACTATATCATCTTT*CTTCGTGT
AAATATAATATATAGTCAGTATTTGAATATGTTATACATGAAAGAACTGAATACGATAC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 2 17

CO CL175Contig1 669 11 9 U
GGACAACTACAAAACCAAAAAAAAAAAACAATCTCGTGGGATCAAGGCTT*GTGAGTTTG
GAAAAGCTAAAAGACAATGGCAAGCTTCACTTCCTCCGTCACTTGTCCTAATCTTCTTAT
GAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTCTATGGTCTTCCAAGGATGATCAA
GAGAAGCAGTGGAGTGAAATGCTCGATGGAGACAAAGCAGCCCAAGCAAGAAAAGAGCTC
AACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTAACAGCTGTGGTGAGTAGTAGCCCAGC
AATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGACTGCCTTTTGGTCTGAG
CAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTTGGTTTGATATGGGCTGTTTACTT
TAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCTGGGCTTTCCCTCTGAAAGTTCCC
ACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAAAGTGAAAATGCTCTGTACCTTCT
TGTAAAGTTTCAAGTGAAAAAAAAAAGAGAGAGACCAGA********CCTTGTGTAAAAT
GCAGTAAAATGTGTATTGTTTGTGGGTTCAATAAATTTATTGGGCCAATACAAAAGCCCA
TTAATGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 45 45 30 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 45 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2CA46JQ C 337
AF RR2GS48JQB C 111
AF RR2GS48TF U 38
AF RR2FW32TF U 28
AF RR2H802TF U 42
AF RR2ER83TF U 1
AF RR2EF12TF U 42
AF RR2H049TF U 38
AF RR2AJ22TF U 28
AF RR2CA46TF U 38
AF RR2H049JQ C 38
BS 1 37 RR2ER83TF
BS 38 39 RR2GS48TF
BS 40 120 RR2ER83TF
BS 121 121 RR2AJ22TF
BS 122 565 RR2ER83TF
BS 566 566 RR2AJ22TF
BS 567 620 RR2ER83TF
BS 621 665 RR2AJ22TF
BS 666 669 RR2CA46TF

RD RR2CA46JQ 137 0 0
AACAGGACTGCCTTTTGGTCTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTT
TGGTTTGATATGGGCTATTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTC
TGGGCTTTCCCTCTGAA

QA 1 137 1 137
DS 

RD RR2GS48JQB 446 0 0
ATCTTCTTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTCTATGGTCTTCCAA
GGATGATCAAGAGAAGCAGTGGAGTGAAATGCTCGATGGAGACAAAGCAGCCCAAGCAAG
AAAAGAGCTCAACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTGACAGCTGTGGTGAGTA
GTAGCCCAGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGACTGCCTT
TTGGTCTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTTGGTTTGATATGGG
CTGTTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCTGGGCTTTCCCTCT
GAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAAAGTGAAAATGCTC
TGTACCTTCTTGTAAAGTTTCAAGTG

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR2GS48TF 519 0 0
GGGATCAAGGCTT*GTGAGTTTGGAAAAGCTAAAAGACAATGGCAAGCTTCACTTCCTCC
GTCACTTGTCCTAATCTTCTTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTC
TATGGTCTTCCAAGGATGATCAAGAGAAGCAGTGGAGTGAAATGCTCGATGGAGACAAAG
CAGCCCAAGCAAGAAAAGAGCTCAACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTGACA
GCTGTGGTGAGTAGTAGCCCAGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGA
ACAGGACTGCCTTTTGGTCTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTT
GGTTTGATATGGGCTGTTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCT
GGGCTTTCCCTCTGAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAA
AGTGAAAATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGTTTCAAGTG

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2FW32TF 529 0 0
GG
AATCTCGTTTGATCAAGGCTTAGTGAGTTTGGAAAAGCTAAAAGACAATGGCAAGCTTCA
CTTCCTCCGTCACTTGTCCTAATCTTCTTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTG
AGATTGTCTATGGTCTTCCAAGGATGATCAAGAGAAGCAGTGGAGTGAAATGCTCGATGG
AGACAAAGCAGCCCAAGCAAGAAAAGAGCTCAACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTA
TGTTAACAGCTGTGGTGAGTAGTAGCCCAGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCA
CGGAAGGAACAGGACTGCCTTTTGGTCTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGG
GCGTGTTTGGTTTGATATGGGCTATTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATG
ATGATTCTGGGCTTTCCCTCTGAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTG
AACATGAAAGTGAAAATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGTTTCAAGTG

QA 3 529 3 529
DS 

RD RR2H802TF 554 0 0
GGAAGGCTT*GTGAGCTTGGAAAAGCTAAAAGACAATTGCAAGCTTCACTTCCTCCGTCA
CTTGTCCTAATCTTCTTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTCTATG
GTCTTCCAAGGATGATCAAGAGAAGCAGTGGAGTGAAATGCTCGATGGAGACAAAGCAGC
CCAAGCAAGAAAAGAGCTCAACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTAACAGCTG
TGGTGAGTAGTAGCCCAGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGAACAG
GACTGCCTTTTGGTCTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTTGGTT
TGATATGGGCTGTTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCTGGGC
TTTCCCTCTGAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAAAGTG
AAAATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGTTTCAAGTGAAAAAAAAAAGAGAGAGACCAGA**
******CCTTGTGT

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2ER83TF 620 0 0
GGACAACTACAAAACCAAAAAAAAAAAACAATCTCGTTTGATCAAGGCTT*GTGAGTTTG
GAAAAGCTAAAAGACAATGGCAAGCTTCACTTCCTCCGTCACTTGTCCTAATCTTCTTAT
TAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTCTATGGTCTTCCAAGGATGATCAA
GAGAAGCAGTGGAGTGAAATGCTCGATGGAGACAAAGCAGCCCAAGCAAGAAAAGAGCTC
AACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTAACAGCTGTGGTGAGTAGTAGCCCAGC
AATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGACTGCCTTTTGGTCTGAG
CAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTTGGTTTGATATGGGCTGTTTACTT
TAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCTGGGCTTTCCCTCTGAAAGTTCCC
ACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAAAGTGAAAATGCTCTGTACCTTCT
TGTAAAGTTTCAAGTGAAAAAAAAA*GAGAGAGACCAGA********CCTTGTGTAAAAT
GCAGTAAAATGTGTATTGTT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2EF12TF 602 0 0
GGAAGGCTT*GTGAGTTTGGAAAAGCTAAAAGACAATGGCAAGCTTCACTTCCTCCGTCA
CTTGTCCTAATCTTCTTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTCTATG
GTCTTCCAAGGATGATCAAGAGAAGCAGTGGAGTGAAATGCTCGATGGAGACAAAGCAGC
CCAAGCAAGAAAAGAGCTCAACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTAACAGCTG
TGGTGAGTAGTAGCCCAGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGAACAG
GACTGCCTTTTGGTCTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTTGGTT
TGATATGGGCTGTTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCTGGGC
TTTCCCTCCGAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAAAGTG
AAAATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGTTTCAAGTGAAAAAAAAAA*AGAGAGACCAGA**
******CCTTGTGTAAAATGCAGTAAAATGTGTATTGTTTGTGGGTTCAATAAATTTATT
GG

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2H049TF 607 0 0
GGGATCAAGGCTT*GTGAGTTTGGAAAAGCTAAAAGACAATGGCAAGCTTCACTTCCTCC
GTCACTTGTCCTAATCTTCTTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTC
TATGGTCTTCCAAGGATTATCAAGAGAAGCAGTGGAGTGAAGTGCTCGATGGAGACAAAG
CAGCCCAAGCAAGAAAAGAGCTCAACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTAACA
GCTGTGGTGAGTAGTAGCCCAGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGA
ACAGGACTGCCTTTTGGTCTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTT
GGTTTGATATGGGCTGTTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCT
GGGCTTTCCCTCTGAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAA
AGTGAAAATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGTTTCAAGTGAAAAAAAAAAGAGAGAGACCA
GA********CCTTGTGTAAAATGCAGTAAAATGTGTATTGTTTGTGGGTTCAATAAATT
TATTGGG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2AJ22TF 639 0 0
GG
AATCTCGTTTGATCAAGGCTT*GTGAGTTTGGAAAAGCTAAAAGACAATGGCAAGCTTCA
CTTCCTCCGTCACTTGTCCTAATCTTCTTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTG
AGATTGTCTATGGTCTTCCAAGGATGATCAAGAGAAGCAGTGGAGTGAAATGCTCGATGG
AGACAAAGCAGCCCAAGCAAGAAAAGAGCTCAACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTA
TGTTAACAGCTGTGGTGAGTAGTAGCCCAGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCA
CGGAAGGAACAGGACTGCCTTTTGGTCTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGG
GCGTGTTTGGTTTGATATGGGCTGTTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATG
ATGATTCTGGGCTTTCCCTCTGAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTG
AACATGAAAGTGAAAATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGTTTCAAGTGAAAAAAAAAAGAG
AGAGACCAGA********CCTTGTGTAAAATGCAGTAAAATGTGTATTGTTTGTGGGTTC
AATAAATTTATTGGGCCAATACAAAAGCCCATTAAT
G

QA 3 638 3 638
DS 

RD RR2CA46TF 632 0 0
GGGATCAAGGCTT*GTGAGTTTGGAAAAGCTAAAAGACAATGGCAAGCTTCACTTCCTCC
GTCACTTGTCCTAATCTTCCTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTC
TATGGTCTTCCAAGGATGATCAAGAGAAGCAGTGGAGTGAAATGCTCGATGGAGACAAAG
CAGCCCAAGCAAGAAAAGAGCTCAACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTAACA
GCTGTGGTGAGTAGTAGCCCAGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGA
ACAGGACTGCCTTTTGGTCTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTT
GGTTTGATATGGGCTATTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCT
GGGCTTTCCCTCTGAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAA
AGTGAAAATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGTTTCAAGTGAAAAAAAAA*GAGAGAGACCA
GAGTCACAGACCTTGTGTAAAATGCAGTAAAATGTGTATTGTTTGTGGGTTCAATAAATT
TATTGGGCCAATACAAA*GCCCATTAATGTTC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2H049JQ 632 0 0
GGGATCAAGGCTT*GTGAGTTTGGAAAAGCTAAAAGACAATGGCAAGCTTCACTTCCTCC
GTCACTTGTCCTAATCTTCTTATGAAGCCTTCAGTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTC
TATGGTCTTCCAAGGATTATCAAGAGAAGCAGTGGAGTGAAGTGCTCGATGGAGACAAAG
CAGCCCAAGCAAGAAAAGAGCTCAACGGCAGGTTCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTAACA
GCTGTGGTGAGTAGTAGCCCAGCAATGGCATTGGTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGA
ACAGGACTGCCTTTTGGTTTGAGCAATAACCTGTTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTT
GGTTTGATATGGGCTGTTTACTTTAACTACACGTCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCT
GGGCTTTCCCTCTGAAAGTTCCCACTCTCTGTTTCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAA
AGTGAAAATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGTTTCAAGTGAAAAAAAAAAGAGAGAGACCA
GA********CCTTGTGTAAAATGCAGTAAAATGTGTATTGTTTGTGGGTTCAATAAATT
TATTGGGCCAATACAAAGGCCCATTAAT
GTCC

QA 1 628 1 628
DS 



CO CL175Contig2 633 6 8 U
ATTAATGGGCTTTTGTATTGGCCCAATAAATTTATTGAACCCACAAACAATACACATTTT
ACTGCATTTTACACAAGGTCTGTGACTCTGGTCTCTCTCTTTTTTTTTCACTTGAAACTT
TACAAGAAGGTACAGAGCATTTTCACTTTCATGTTCACTGAAAAATAAGAGAGAATGGGA
ACTTTCAGAGGGAAAGCCCAGAATCATCATCCTCATCGAGGGAAGACGTGTAGTTAAAGT
AAACAGCCCATATCAAACCAAACACGCCCAACAAAATCCAACCCAACAGGTTATTGCTCA
GACCAAAAGGCAGTCCTGTTCCTTCCGTGGACATCCTCTCGTCCACCAATGCCATTGCTG
GGCTACTACTCACCACAGCTGTTAACATAAGCGCCAACACGGACGAACCTGCCGTTGAGC
TCTTTTCTTGCTTGGGCTGCTTTGTCTCCATCGAGCATTTCACTCCACTGCTTCTCTTGA
TCATCCTTGGAAGACCATAGACAATCTCAGTGGAGATAGCTGTGACTGAAGGCTTCATAA
GAAGATTAGGACAAGTGACGGAGGAAGTGAAGCTTGCCATTGTCTTTTAGCTTTTCCAAA
CTCACAAGCCTTGATCAAACGAGATTGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 30 30 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2H638TF C 1
AF RR2DA92JQ U 20
AF RR2E385JQ U 37
AF RR2E385TF C 37
AF RR2DA92TF C 20
AF RR2FF55JQ U 84
BS 1 19 RR2H638TF
BS 20 107 RR2DA92JQ
BS 108 108 RR2E385JQ
BS 109 300 RR2DA92JQ
BS 301 301 RR2FF55JQ
BS 302 499 RR2DA92JQ
BS 500 500 RR2E385JQ
BS 501 633 RR2DA92JQ

RD RR2H638TF 620 0 0
ATTAATGGGCTTTTGTATTGGCCCAATAAATTTATTGAACCCACAAACAATACACATTTT
ACTGCATTTTACACAAGGTCTGCGACTCTGGTCTCTCTCTTTTTTTT*CACTTGAAACTT
TACAAGAAGGTACAGAGCATTTTCACTTTCATGTTCACTGAAAAATAAGAGAGAATGGGA
ACTTTCAGAGGGAAAGCCCAGAATCATCATCCTCATCGAGGGAAGACGTGTAGTTAAAGT
AAACAGCCCATATCAAACCAAACACGCCCAACAAAATCCAACCCAACAGGTTATTGCTCA
GACCAAAAGGCAGTCCTGTTCCTTCCGTGGACATCCTCTCGTCCACCAATGCCATTGCTG
GGCTACTACTCACCACAGCTGTTAACATAAGCGCCAACACGGACGAACCTGCCGTTGAGC
TCTTTTCTTGCTTGGGCTGCTTTGTCTCCATCGAGCATTTCACTCCACTGCTTCTCTTGA
TCATCCTTGGAAGACCATAGACAATCTCAGTGGAGATAGCTGTGACTGAAGGCTTCATAA
GAAGATTAGGACAAGTGACGGAGGAAGTGAAGCTTGCCATTGTCTTTTAGCTTTTCCAAA
CTCACAAGCCTTGATCC
GCC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2DA92JQ 614 0 0
GGCCCAATAAATTTATTGAACCCACAAACAATACACATTTTACTGCATTTTACACAAGGT
CTGTGACTCTGGTCTCTCTCTTTTTTTT*CACTTGAAACTTTACAAGAAGGTACAGAGCA
TTTTCACTTTCATGTTCACTGAAAAATAAGAGAGAATGGGAACTTTCAGAGGGAAAGCCC
AGAATCATCATCCTCATCGAGGGAAGACGTGTAGTTAAAGTAAACAGCCCATATCAAACC
AAACACGCCCAACAAAATCCAACCCAACAGGTTATTGCTCAAACCAAAAGGCAGTCCTGT
TCCTTCCGTGGACATCCTCTCGTCCACCAATGCCATTGCTGGGCTACTACTCACCACAGC
TGTTAACATAAGCGCCAACACGGACGAACCTGCCGTTGAGCTCTTTTCTTGCTTGGGCTG
CTTTGTCTCCATCGAGCATTTCACTCCACTGCTTCTCTTGATCATCCTTGGAAGACCATA
AACAATCTCAGTGGAGATAGCTGTGACTGAAGGCTTCATAAGAAGATTAGGACAAGTGAC
GGAGGAAGTGAAGCTTGCCATTGTCTTTTAGCTTTTCCAAACTCACAAGCCTTGATCAAA
CGAGATTGTTTTCC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2E385JQ 578 0 0
GAACCCACAAACAATACACATTTTACTGCATTTTACACAAGGTCTGTGACTCTGGTCTCT
CTCTTTTTTTTTCACTTGAAACTTTACAAGAAGGTACAGAGCATTTTCACTTTCATGTTC
ACTGAAAAATAAGAGAGAATGGGAACTTTCAGAGGGAAAGCCCAGAATCATCATCCTCAT
CGAGGGAAGACGTGTAGTTAAAGTAAACAGCCCATATCAAACCAAACACGCCCAACAAAA
TCCAACCCAACAGGTTATTGCTCAAACCAAAAGGCAGTCCTGTTCCTTCCGTGGACATCC
TCTCGTCCACCAATGCCATTGCTGGGCTACTACTCACCACAGCTGTCAACATAAGCGCCA
ACACGGACGAACCTGCCGTTGAGCTCTTTTCTTGTTTGGGCTGCTTTGTCTCCATCGAGC
ATTTCACTCCACTGCTTCTCTTGATCATCCTTGGAAGACCATAGACAATCTCAGTGGAAA
TAGCTGTGACTGAAGGCTTCATAAGAAGATTAGGACAAGTGACGGAGGAAGTGAAGCTTG
CCATTGTCTTTTAGCTTTTCCAAACTCACAAGCCTTCC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2E385TF 578 0 0
GAACCCACAAACAATACACATTTTACTGCATTTTACACAAGGTCTGTGACTCTGGTCTCT
CTCTTTTTTTTTCACTTGAAACTTTACAAGAAGGTACAGAGCATTTTCACTTTCATGTTC
ACTGAAAAATAAGAGAGAATGGGAACTTTCAGAGGGAAAGCCCAGAATCATCATCCTCAT
CGAGGGAAGACGTGTAGTTAAAGTAAACAGCCCATATCAAACCAAACACGCCCAACAAAA
TCCAACCCAACAGGTTATTGCTCAGACCAAAAGGCAGTCCTGTTCCTTCCGTGGACATCC
TCTCGTCCACCAATGCCATTGCTGGGCTACTACTCACCACAGCTGTCAACATAAGCGCCA
ACACGGACGAACCTGCCGTTGAGCTCTTTTCTTGTTTGGGCTGCTTTGTCTCCATCGAGC
ATTTCACTCCACTGCTTCTCTTGATCATCCTTGGAAGACCATAGACAATCTCAGTGGAGA
TAGCTGTGACTGAAGGCTTCATAAGAAGATTAGGACAAGTGACGGAGGAAGTGAAGCTTG
CCATTGTCTTTTAGCTTTTCCAAACTCACAAGCCTTCC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2DA92TF 614 0 0
GGCCCAATAAATTTATTGAACCCACAAACAATACACATTTTACTGCATTTTACACAAGGT
CTGTGACTCTGGTCTCTCTCTTTTTTTT*CACTTGAAACTTTACAAGAAGGTACAGAGCA
TTTTCACTTTCATGTTCACTGAAAAATAAGAGAGAATGGGAACTTTCAGAGGGAAAGCCC
AGAATCATCATCCTCATCGAGGGAAGACGTGTAGTTAAAGTAAACAGCCCATATCAAACC
AAACACGCCCAACAAAATCCAACCCAACAGGTTATTGCTCAGACCAAAAGGCAGTCCTGT
TCCTTCCGTGGACATCCTCTCGTCCACCAATGCCATTGCTGGGCTACTACTCACCACAGC
TGTTAACATAAGCGCCAACACGGACGAACCTGCCGTTGAGCTCTTTTCTTGCTTGGGCTG
CTTTGTCTCCATCGAGCATTTCACTCCACTGCTTCTCTTGATCATCCTTGGAAGACCATA
GACAATCTCAGTGGAGATAGCTGTGACTGAAGGCTTCATAAGAAGATTAGGACAAGTGAC
GGAGGAAGTGAAGCTTGCCATTGTCTTTTAGCTTTTCCAAACTCACAAGCCTTGATCAAA
CGAGATTGTTTT
CC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2FF55JQ 550 0 0
GG
CTCTGGTCTCTCTCTTTTTTTTTCACTTGAAACTTTACAAGAAGGTACAGAGCATTTTCA
CTTTCATGTTCACTGAAAAATAAGAGAGAATGGGAACTTTCAGAGGGAAAGCCCAGAATC
ATCATCCTCATCGAGGGAAGACGTGTAGTTAAAGTAAACAGCCCATATCAAACCAAACAC
GCCCAACAAAATCCAACCCAACAGGTTATTGCTCAGACCAAAAGGCAGTCCTGTTCCTTC
CGTGGACATCCTCTCGTCCACCAATGCCATTGCTGGGCTACTACTCACCACAGCTGTTAA
CATAAGCGCCAACACGGACGAACCTGCCGTTGAGCTCTTTTCTTGCTTGGGCTGCTTTGT
CTCCATCGAGCATTTCACTCCACTGCTTCTCTTGATCATCCTTGGAAGACCATAGACAAT
CTCAGTGGAGATAGCTGTGACTGAAGGCTTCATAAGAAGATTAGGACAAGTGACGGAGGA
AGTGAAGCTTGCCATTGTCTTTTAGCTTTTCCAAACTCACAAGCCTTGATCAAACGAGAT
TGTTTT
CC

QA 3 548 3 548
DS 



AS 3 14

CO CL176Contig1 995 3 8 U
GAGCTCAAAATATTTTTAAAAAGGTTAAACTTAATAGAACAAAAAGTCGCAATCGTAACT
TGGTTCTTATGGAGGAAGTCAAACTCCATCCCCATACAAAATTTATTCAATAAGAAAATT
TCCCCTTGCTCCTCTCTCTAGTTTATAGCAAAAAATTTCATCAACATCTTGACCTTCTTT
AAAAAGTCTGAAAAACTGAAAATTAAATCGAGAAAAATAAAAATAAAGCCGAAGGTTTCA
ACTGTTGTTGGTGACTGGTGGATTAGTATGCTTAGCCGGATCCAGATCCGTACTTCTTTC
CGAGAAGAAGTAACTGCAGCTTGTCGTATCCAGAGAGCACACCAGCACCTGCAATGGCAC
GAAGGATGTTGGCACCAGCACCCTTGAACAGAGACTTTGGTCCTTCCTTCTTCAGGATCT
GTTGGAATGCATCCATCGAACTCTTGTACTTGACGGCTTCACCGGAGGTCATCATCATTC
TTCTACGGACAGTGTCGATTGGGTAAAATGCAAGACCAGCACCGTTGGTGATGAGCCATC
CAAGGGCAAAACTAGCGAAGAAGCTGTACTGGAGATCAGCAGGGAGAAGAGGCTTCAAAG
AGTCGTAGAGACAAAGTAGAGACCACGGTAGACAATGATACCAACACAGGAGATGTTGAA
TCCACGATAAAGCCCAGCAATACCATCAGACTTGAGGGTCTTCTTGTAGACATCAACAAG
ACCGTTGAACTGCCTTTCACCTCCCTTCTTTGCTGCCTTGGAGTCATTGGCAAGACGGAT
ACGTGCATAGTCAAGAGAGTAGACGAAGAGAAGGGAAGATGCACCAGCAGCACCTCCAGA
TCCCAAGTTACCAGCAACCATTCCAGTAACCATCCCTGTCCTTCTTGAAGTTGAAAAGCC
TCTTGAAGTAATCTTTGAACGCAAAGTTCAAGGCCTGAGTGGGGAAGTAACGGATAACGT
TAGCAGTGTTTCCTCTCCACAGAGAACCAAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ50JQ U 116
AF RR2AO59JQ U 1
AF RR2FY55TF C 717
BS 1 153 RR2AO59JQ
BS 154 154 RR2CZ50JQ
BS 155 506 RR2AO59JQ
BS 507 507 RR2CZ50JQ
BS 508 778 RR2AO59JQ
BS 779 779 RR2FY55TF
BS 780 849 RR2AO59JQ
BS 850 995 RR2FY55TF

RD RR2CZ50JQ 488 0 0
AAATTTCCCCTTGCTCCTCTCTCTAGTTTATAGCAAAAAATTTCATCAACATCTTGACCT
TTTTTAAAAAGTCTGAAAAACTGAAAATTAAATCGAGAAAAATAAAAATAAAGCCGAAGG
TTTCAACTGTTGTTGGTGACTGGTGGATTAGTATGCTTAGCCGGATCCAGATCCGTACTT
CTTTCCGAGAAGAAGTAACTGCAGCTTGTCGTATCCAGAGAGCACACCAGCACCTGCAAT
GGCACGAAGGATGTTGGCACCAGCACCCTTGAACAGAGACTTTGGTCCTTCCTTCTTCAG
GATCTGTTGGAATGCATCCATCGAACTCTTGTACTTGACGGCTTCACCGGAGGTCATCAT
CATTCTTCTACGGACAGTGTCGATTGGGTAAAATGCAAGACCAGCACCGTTGGTGATGAG
CCATCCAAGGGCAAAACTAGCGAAGAAGCTGTCCTGGAGATCAGCAGGGAGAAGAGGCTT
CAAAGAGT

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2AO59JQ 849 0 0
GAGCTCAAAATATTTTTAAAAAGGTTAAACTTAATAGAACAAAAAGTCGCAATCGTAACT
TGGTTCTTATGGAGGAAGTCAAACTCCATCCCCATACAAAATTTATTCAATAAGAAAATT
TCCCCTTGCTCCTCTCTCTAGTTTATAGCAAAAGATTTCATCAACATCTTGACCTTCTTT
AAAAAGTCTGAAAAACTGAAAATTAAATCGAGAAAAATAAAAATAAAGCCGAAGGTTTCA
ACTGTTGTTGGTGACTGGTGGATTAGTATGCTTAGCCGGATCCAGATCCGTACTTCTTTC
CGAGAAGAAGTAACTGCAGCTTGTCGTATCCAGAGAGCACACCAGCACCTGCAATGGCAC
GAAGGATGTTGGCACCAGCACCCTTGAACAGAGACTTTGGTCCTTCCTTCTTCAGGATCT
GTTGGAATGCATCCATCGAACTCTTGTACTTGACGGCTTCACCGGAGGTCATCATCATTC
TTCTACGGACAGTGTCGATTGGGTAAGATGCAAGACCAGCACCGTTGGTGATGAGCCATC
CAAGGGCAAAACTAGCGAAGAAGCTGTACTGGAGATCAGCAGGGAGAAGAGGCTTCAAAG
AGTCGTAGAGACAAAGTAGAGACCACGGTAGACAATGATACCAACACAGGAGATGTTGAA
TCCACGATAAAGCCCAGCAATACCATCAGACTTGAGGGTCTTCTTGTAGACATCAACAAG
ACCGTTGAACTGCCTTTCACCTCCCTTCTTTGCTGCCTTGGAGTCATTGGCAAGACGGGT
ACGTGCATAGTCAAGAGAGTAGACGAAGAGAAGGGAAGATGCACCAGCAGCACCTCCAGA
TCCCAAGTT

QA 1 849 1 849
DS 

RD RR2FY55TF 279 0 0
CAAGACCGTTGAA*TGCCTTTCACCTCCCTTCTTTGCTGCCTTGGAGTCATTGGCAAGAC
GGATACGTGCATAGTCAAGAGAGTAGA*GAAGAGAAGGGAAGATGCACCAGCAGCACCTC
CAGATCCCAAGTTACCAGCAACCATTCCAGTAACCATCCCTGTCCTTCTTGAAGTTGAAA
AGCCTCTTGAAGTAATCTTTGAACGCAAAGTTCAAGGCCTGAGTGGGGAAGTAACGGATA
ACGTTAGCAGTGTTTCCTCTCCACAGAGAACCAAAACCC

QA 1 279 1 279
DS 



CO CL176Contig2 1438 5 18 U
GGGCAGCTCCTTCAACCACAAAGACAATTCTCTCGTTCTTCGTCTTCTTCGCTCCATTGA
GTTTCGCTCTGCCATCGCTTCCTCTCGAGGTCAAAATGGTTGAACAAACTCAGAACCCGA
CGATTCTCCAGAAGGCGACATCTGGCCAAATCATGATGCGATCTGGTGTTTCTCAGGACA
TTCATGGTTACACTTCCTCCTTCCAGAGGCGTGCGACGTACGGAAACTACTCCAACGCTG
CATTCCAGTACCCTCTTGCCGCCACATCCAGGATCATGACGACTACTACCTCTCCCGTGT
TTGTGCAAGCTCCGAGTGAGAAAGGATTCTCTAGCTTCGCTATTGATTTCCTCATGGGTG
GTGTGTCCGCTGCTGTCTCCAAGACTGCTGCTGCTCCCATCGAGCGTGTCAAGCTTTTGA
TTCAGAACCAGGATGAGATGCTCAAGGCTGGCAGGTTATCTGAGCCTTACAAGGGTATTG
GTGACTGTTTCGGCAGGACCATTAAGGATGAGGGTTTTGGTTCTTTGTGGAGAGGAAACA
CTGCTAATGTTATCCGTTACTTCCCCACTCAGGCCTTGAACTTTGCATTCAAAGATTACT
TCAAGAGGCTTTTCAACTTTAAGAAGGACAGGGATGGGTACTGGAAGTGGTTTGCTGGTA
ACTTGGGATCTGGAGGTGCTGCTGGTGCCTCTTCCCTTCTCTTTGTGTACTCTCTTGACT
ACGCACGTACCCGTCTTGCCAATGACTCTAAGGCGGCCAAGAAGGGAGGTGAAAGGCAGT
TCAATGGTCTTGTTGATGTCTACAAGAAGACCCTCAAGTCTGATGGTATTGCTGGGCTTT
ACCGTGGATTCAACATCTCCTGTGTTGGTATCATTGTCTACCGTGGTCTCTACTTTGGAC
TGTACGACTCTTTGAAGCCTCTTCTCCCTGCTGACCTCCAGGACAGTTTCTTCGCTAGTT
TTGCCCTTGGATGGCTCATCACCAACGGTGCTGGTCTTGCATCTTACCCAATCGACACTG
TCCGTAGAAGAATGATGATGACCTCCGGTGAAGCCGTCAAGTACAAGAGTTCGATGGATG
CATTCCAACAGATCCTGAAGAAGGAAGGACCAAAGTCTCTGTTCAAGGGTGCTGGTGCCA
ACATCCTTCGTGCAATTGCAGGTGCTGGTGTGCTCTCTGGATACGACAAGCTGCAGTTAC
TTCTCCTCGGAAAGAAGTACGGATCTGGATCCGGCTAAGCGTGCTAGTCACCAGTCGCCA
CCACCATAAAGCTTCGGCTTTATTTTTTTT**CTCGATTTATTTGCGGTTTCAAACTTTT
AAAAAAAGGATCAAGATGTTGATGAAATCTTTTACCATAAAACTAGAGATGAGCATGGGA
AAGCTTTATCATTTCGACGATAAGTTTTTTCTTATGGAATAAATTTTTGTATGGGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2D591TF U 1
AF RR2CT76TF U 12
AF RR2AQ77TF U 598
AF RR2AQ77JQ C 598
AF RR2D591JQ C 700
BS 1 54 RR2D591TF
BS 55 55 RR2CT76TF
BS 56 68 RR2D591TF
BS 69 69 RR2CT76TF
BS 70 199 RR2D591TF
BS 200 200 RR2CT76TF
BS 201 364 RR2D591TF
BS 365 365 RR2CT76TF
BS 366 451 RR2D591TF
BS 452 452 RR2CT76TF
BS 453 586 RR2D591TF
BS 587 587 RR2CT76TF
BS 588 741 RR2D591TF
BS 742 742 RR2CT76TF
BS 743 752 RR2D591TF
BS 753 1320 RR2AQ77TF
BS 1321 1435 RR2AQ77JQ
BS 1436 1438 RR2D591JQ

RD RR2D591TF 758 0 0
GGGCAGCTCCTTCAACCACAAAGACAATTCTCTCGTTCTTCGTCTTCTTCGCTC*ATTGA
GTTTCGCTTTGCCATCGCTTCCTCTCGAGGTCAAAATGGTTGAACAAACTCAGAACCCGA
CGATTCTCCAGAAGGCGACATCTGGCCAAATCATGATGCGATCTGGTGTTTCTCAGGACA
TTCATGGTTACACTTCCTCTTTCCAGAGGCGTGCGACGTACGGAAACTACTCCAACGCTG
CATTCCAGTACCCTCTTGCCGCCACATCCAGGATCATGACGACTACTACCTCTCCCGTGT
TTGTGCAAGCTCCGAGTGAGAAAGGATTCTCTAGCTTCGCTATTGATTTCCTCATGGGTG
GTGTTTCCGCTGCTGTCTCCAAGACTGCTGCTGCTCCCATCGAGCGTGTCAAGCTTTTGA
TTCAGAACCAGGATGAGATGCTCAAGGCTGGGAGGTTATCTGAGCCTTACAAGGGTATTG
GTGACTGTTTCGGCAGGACCATTAAGGATGAGGGTTTTGGTTCTTTGTGGAGAGGAAACA
CTGCTAATGTTATCCGTTACTTCCCCACTCAGGCCTTGAACTTTGCTTTCAAAGATTACT
TCAAGAGGCTTTTCAACTTTAAGAAGGACAGGGATGGGTACTGGAAGTGGTTTGCTGGTA
ACTTGGGATCTGGAGGTGCTGCTGGTGCCTCTTCCCTTCTCTTTGTGTACTCTCTTGACT
ACGCACGTACCCGTCTTGCCA*TGACTCTAAG
CGGCCA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2CT76TF 748 0 0
GG
AACCACAAAGATAATTCTC*CGT*CTTCGTCTTCTTCGCTCCATTGAGTTTCGCTCTGCC
GTCGCTTCCTCTCGAGGTCAAAATGGTTGAACAAACTCAGAACCCGACGATTCTCCAGAA
GGCGGCATCTGGCCAAATCATGATGCGATCTGGTGTTTCTCAGGACTTTCATGGTTACAC
TTCCTCCTTCCAGAGGCGTGCGACGTACGGAAACTACTCCAACGCTGCATTCCAGTACCC
TCTTGCCGCCACATCCAGGATCATGACGACTACTACCTCTCCCGTGTTTGTGCAAGCTCC
GAGTGAGAAAGGATTCTCTAGCTTTGCTATTGATTTCCTCATGGGTGGTGTGTCCGCTGC
TGTCTCCAAGACTGCTGCTGCTCCCATCGAGCGTGTCAAGCTTTTGATTCAGAACCAGGA
TGAGATGCTTAAGGCTGGCAGGTTATCTGAGCCTTACAAGGGTATTGGTGACTGTTTCGG
CAGGACTATTAAGGATGAGGGTTTTGGTTCTTTGTGGAGAGGAAACACTGCTAATGTTAT
CCGTTACTTCCCCACTCAGGCCTTGAACTTTGCATTCAAAGATTACTTCAAGAGGCTTTT
CAACTTCAAGAAG*ACAGGGATGGTTACTGGAAGTGGTTTGCTGGTAACTTGGGATCTGG
AGGTGCTGCTGGTGCCTCTTCCCTTCTCTTTGTGTACTCTCTTGACTACGCACGTACCCG
TCTTGCCAATGACTC
CAAGCAGCAAA

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR2AQ77TF 723 0 0
G
CTTCAAGAGGCTTTTCAACTTTAAGAAGGACAGGGATGGGTACTGGAAGTGGTTTGCTGG
TAACTTGGGATCTGGAGGTGCTGCTGGTGCCTCTTCCCTTCTCTTTGTGTACTCTCTTGA
CTACGCACGTACCCGTCTTGCCAATGACTCTAAGGCGGCCAAGAAGGGAGGTGAAAGGCA
GTTCAATGGTCTTGTTGATGTCTACAAGAAGACCCTCAAGTCTGATGGTATTGCTGGGCT
TTACCGTGGATTCAACATCTCCTGTGTTGGTATCATTGTCTACCGTGGTCTCTACTTTGG
ACTGTACGACTCTTTGAAGCCTCTTCTCCCTGCTGACCTCCAGGACAGTTTCTTCGCTAG
TTTTGCCCTTGGATGGCTCATCACCAACGGTGCTGGTCTTGCATCTTACCCAATCGACAC
TGTCCGTAGAAGAATGATGATGACCTCCGGTGAAGCCGTCAAGTACAAGAGTTCGATGGA
TGCATTCCAACAGATCCTGAAGAAGGAAGGACCAAAGTCTCTGTTCAAGGGTGCTGGTGC
CAACATCCTTCGTGCAATTGCAGGTGCTGGTGTGCTCTCTGGATACGACAAGCTGCAGTT
ACTTCTCCTCGGAAAGAAGTACGGATCTGGATCCGGCTAAGCGTGCTAGTCACCAGTCGC
CACCACCATAAAGCTTCGGCTTTATTTTTTTT**CTCGATTTATTTGCGGTTTCAAACTT
TT

QA 2 723 2 723
DS 

RD RR2AQ77JQ 838 0 0
G
CTTCAAGAGGCTTTTCAACTTTAAGAAGGACAGGGATGGGTACTGGAAGTGGTTTGCTGG
TAACTTGGGATCTGGAGGTGCTGCTGGTGCCTCTTCCCTTCTCTTTGTGTACTCTCTTGA
CTACGCACGTACCCGTCTTGCCAATGACTCTAAGGCGGCCAAGAAGGGAGGTGAAAGGCA
GTTCAATGGTCTTGTTGATGTCTACAAGAAGACCCTCAAGTCTGATGGTATTGCTGGGCT
TTACCGTGGATTCAACATCTCCTGTGTTGGTATCATTGTCTACCGTGGTCTCTACTTTGG
ACTGTACGACTCTTTGAAGCCTCTTCTCCCTGCTGACCTCCAGGACAGTTTCTTCGCTAG
TTTTGCCCTTGGATGGCTCATCACCAACGGTGCTGGTCTTGCATCTTACCCAATCGACAC
TGTCCGTAGAAGAATGATGATGACCTCCGGTGAAGCCGTCAAGTACAAGAGTTCGATGGA
TGCATTCCAACAGATCCTGAAGAAGGAAGGACCAAAGTCTCTGTTCAAGGGTGCTGGTGC
CAACATCCTTCGTGCAATTGCAGGTGCTGGTGTGCTCTCTGGATACGACAAGCTGCAGTT
ACTTCTCCTCGGAAAGAAGTACGGATCTGGATCCGGCTAAGCGTGCTAGTCACCAGTCGC
CACCACCATAAAGCTTCGGCTTTATTTTTTTT**CTCGATTTATTTGCGGTTTCAAACTT
TTAAAAAAAGGATCAAGATGTTGATGAAATCTTTTACCATAAAACTAGAGATGAGCATGG
GAAAGCTTTATCATTTCGACGATAAGTTTTTTCTTATGGAATAAATTTTTGTATGGG

QA 2 838 2 838
DS 

RD RR2D591JQ 739 0 0
TCTTTGTGTACTCTCTTGACTACGCACGTACCCGTCTTGCCAATGACTCTAAGGCGGCCA
AGAAGGGAGGTGAAAGGCAGTTCAATGGTTTTGTTGATGTCTACAAGAAGACCCTCAAGT
CTGATGGTATTGCTGGGCTTTACCGTGGATTCAACATCTCCTGTGTTGGTATCATTGTCT
ACCGTGGTCTCTACTTTGGACTGTACGACTCTTTGAAGCCTCTTCTCCCTGCTGACCTCC
AGGACAGTTTCTTCGCTAGTTTTGCCCTTGGATGGCTCATCACCAACGGTGCTGGTCTTG
CATCTTACCCAATCGACACTGTCCGTAGAAGAATGATGATGACCTCCGGTGAAGCCGTCA
AGTACAAGAGTTCGATGGATGCATTCCAACAGATCCTGAAGAAGGAAGGACCAAAGTCTC
TGTTCAAGGGTGCTGGTGCCAACATCCTTCGTGCAATTGCAGGTGCTGGTGTGCTCTCTG
GATACGACAAGCTGCAGTTACTTCTCCTCGGAAAGAAGTACGGATCTGGATCCGGCTAAG
CGTGCTAGTCACCAGTCGCCACCACCATAAAGCTTCGGCTTTATTTTTTTTTTCTCGATT
TATTTGCGGTTTCAAACTTTTAAAAAAAGGATCAAGATGTTGATGAAATCTTTTACCATA
AAACTAGAGATGAGCATGGGAAAGCTTTATCATTTCGACGATAAGTTTTTTCTTATGGAA
TAAATTTTTGTATGGGAGT

QA 1 739 1 739
DS 



CO CL176Contig3 1048 6 10 U
GCAGGATGAGATGCTCAAGGCTGGTAGGCTCTCTGAGCCTTACAAGGGTATTGGTGACTG
TTTCGGAAGGACTATTAAGGATGAGGGTTTTGGTTCTCTCTGGAGAGGCAACACTGCTAA
TGTTATCCGTTACTTCCCCACTCAGGCCTTGAACTTTGCCTTCAAAGATTACTTCAAGAG
GCTTTTCAACTTCAAGAAAGACAGGGATGGTTATTGGAAGTGGTTTGCTGGTAACTTGGG
ATCTGGAGGTGCTGCTGGTGCCTCTTCGCTTCTCTTTGTGTACTCTCTTGACTACGCACG
TACCCGTCTTGCCAATGACTCTAAGGCAGCCAAGAAGGGAGGTGAAAGGCAGTTCAATGG
ACTTGTTGATGTCTACAAGAAGACCCTCAAGTCTGATGGTATCGCTGGACTTTACCGTGG
ATTCAACATCTCCTGTGTTGGTATCATTGTCTACCGTGGTCTCTACTTTGGACTGTACGA
CTCTTTGAAGCCTCTTCTCCCTGCTGACCTCCAGGACAGCTTCTTCGCTAGCTTTGCACT
TGGATGGCTCATCACCAACGGTGCAGGTCTTGCATCCTACCCCATTGACACTGTCCGTAG
AAGAATGATGATGACGTCAGGTGAGGCCGTGAAGTACAAGAGTTCGATGGATGCCTTCCA
GCAGATTCTCAAGAAGGAAGGACCCAAGTCACTCTTCAAGGGTGCTGGTGCCAACATCCT
TCGTGCCATTGCAGGTGCTGGTGTGCTCTCTGGATACGACAAGCTGCAGTTACTTCTTCT
CGGGAAGAAGTACGGATCAGGATCTGGTTAAGTAATGCTAATCACCAGTCGCCACCAACC
ATAAAGCTTTGGCTTTATTTTTTTCTTTTTCATTTCGATTTATTTGCAGTTTCAGACTTT
TTAAAAAGATCAAGATGTTGATGAAACCCTTTTGCCATAAAACTAGAGAGTAGCATGGGA
AAAGTTTTTATCATTTCGAAATAAGTTTTGTATGTGCTGGAGATCTTGACTCCAAACTAA
TTTTATAGTTATGATTTTTTGTTTGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC81TF U 1
AF RR2FK40TF U 152
AF RR2ET67TF U 187
AF RR2GC81JQ C 259
AF RR2CU16JQ C 722
AF RR2CU16TF U 722
BS 1 557 RR2GC81TF
BS 558 651 RR2FK40TF
BS 652 652 RR2ET67TF
BS 653 799 RR2FK40TF
BS 800 800 RR2ET67TF
BS 801 849 RR2FK40TF
BS 850 850 RR2ET67TF
BS 851 863 RR2FK40TF
BS 864 1034 RR2CU16TF
BS 1035 1048 RR2GC81JQ

RD RR2GC81TF 557 0 0
GCAGGATGAGATGCTCAAGGCTGGTAGGCTCTCTGAGCCTTACAAGGGTATTGGTGACTG
TTTCGGAAGGACTATTAAGGATGAGGGTTTTGGTTCTCTCTGGAGAGGCAACACTGCTAA
TGTTATCCGTTACTTCCCCACTCAGGCCTTGAACTTTGCCTTCAAAGATTACTTCAAGAG
GCTTTTCAACTTCAAGAAAGACAGGGATGGTTATTGGAAGTGGTTTGCTGGTAACTTGGG
ATCTGGAGGTGCTGCTGGTGCCTCTTCGCTTCTCTTTGTGTACTCTCTTGACTACGCACG
TACCCGTCTTGCCAATGACTCTAAGGCAGCCAAGAAGGGAGGTGAAAGGCAGTTCAATGG
ACTTGTTGATGTCTACAAGAAGACCCTCAAGTCTGATGGTATCGCTGGACTTTACCGTGG
ATTCAACATCTCCTGTGTTGGTATCATTGTCTACCGTGGTCTCTACTTTGGACTGTACGA
CTCTTTGAAGCCTCTTCTCCCTGCTGACCTCCAGGACAGCTTCTTCGCTAGCTTTGCACT
TGGATGGCTCATCACCA

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2FK40TF 713 0 0
G
ACTTTGCCTTCAAAGATTACTTCAAGAGGCTTTTCAACTTCAAGAAAGACAGGGATGGTT
ATTGGAAGTGGTTTGCTGGTAACTTGGGATCTGGAGGTGCTGCTGGTGCCTCTTCGCTTC
TCTTTGTGTACTCTCTTGACTACGCACGTACCCGTCTTGCCAATGACTCTAAGGCAGCCA
AGAAGGGAGGTGAAAGGCAGTTCAATGGACTTGTTGATGTCTACAAGAAGACCCTCAAGT
CTGATGGTATCGCTGGACTTTACCGTGGATTCAACATCTCCTGTGTTGGTATCATTGTCT
ACCGTGGTCTCTACTTTGGACTGTACGACTCTTTGAAGCCTCTTCTCCCTGCTGACCTCC
AGGACAGCTTCTTCGCTAGCTTTGCACTTGGATGGCTCATCACCAACGGTGCAGGTCTTG
CATCCTACCCCATTGACACTGTCCGTAGAAGAATGATGATGACGTCAGGTGAGGCCGTGA
AGTACAAGAGTTCGATGGACGCCTTCCAGCAGATTCTCAAGAAGGAAGGACCCAAGTCAC
TCTTCAAGGGTGCTGGTGCCAACATCCTTCGTGCCATTGCAGGTGCTGGTGTGCTCTCTG
GATACGACAAGCTGCAGTTACTTCTTCTCGGGAAGAAGTACGGATCACGATCTGGTTAAG
TAATGCTAATCACCAGTCGCCACCAACCATAAAGCTT*GGCTTTATTTTTT
C

QA 2 712 2 712
DS 

RD RR2ET67TF 678 0 0
G
AACTTCAAGAAAGACAGGGATGGTTATTGGAAGTGGTTTGCTGGTAACTTGGGATCTGGA
GGTGCTGCTGGTGCCTCTTCGCTTCTCTTTGTGTACTCTCTTGACTACGCACGTACCCGT
CTTGCCAATGACTCTAGGGCAGCCAAGAAGGGAGGTGAAAGGCAGTTCAATGGACTTGTT
GATGTCTACAAGAAGACCCTCAAGTCTGATGGTATCGCTGGACTTTACCGTGGATTCAAC
ATCTCCTGTGTTGGTATCATTGTCTACCGTGGTCTCTACTTTGGACTGTACGACTCTTTG
AAGCCTCTTCTCCCTGCTGACCTCCAGGACAGCTTCTTCGCTAGCTTTGCACTTGGATGG
CTCATCACCAACGGTGCAGGTCTTGCATCCTACCCCATTGACACTGTCCGTAGAAGAATG
ATGATGACGTCAGGTGAGGCCGTGAAGTACAAGAGTTCGATGGATGCCTTCCAGCAGATT
CTCAAGAAGGAAGGACCCAAGTCACTCTTCAAGGGTGCTGGTGCCAACATCCTTCGTGCC
ATTGCAGGTGCTGGTGTGCTCTCTGGATACGACAAGCTGCAGTTACTTCTTCTCGGGAAG
AAGTACGGATCAGGATCTGGTTAAGTAATGCTAATCACCGGTCGCCGCCA*CCATAAAGC
TTTGGCTTTATTTTTT
C

QA 2 677 2 677
DS 

RD RR2GC81JQ 790 0 0
TGCCTCTTCGCTTCTCTTTGTGTACTCTCTTGACTACGCACGTACCCGTCTTGCCAATGA
CTCTAAGGCAGCCAAGAAGGGAGGTGAAAGGCAGTTCAATGGACTTGTTGATGTCTACAA
GAAGACCCTCAAGTCTGATGGTATCGCTGGACTTTACCGTGGATTCAACATCTCCTGTGT
TGGTATCATTGTCTACCGTGGTCTCTACTTTGGACTGTACGACTCTTTGAAGCCTCTTCT
CCCTGCTGACCTCCAGGACAGCTTCTTCGCTAGCTTTGCACTTGGATGGCTCATCACCAA
CGGTGCAGGTCTTGCATCCTACCCCATTGACACTGTCCGTAGAAGAATGATGATGACGTC
AGGTGAGGCCGTGAAGTACAAGAGTTCGATGGATGCCTTCCAGCAGATTCTCAAGAAGGA
AGGACCCAAGTCACTCTTCAAGGGTGCTGGTGCCAACATCCTTCGTGCCATTGCAGGTGC
TGGTGTGCTCTCTGGATACGACAAGCTGCAGTTACTTCTTCTCGGGAAGAAGTACGGATC
AGGATCTGGTTAAGTAATGCTAATCACCAGTCGCCACCAACCATAAAGCTTTGGCTTTAT
TTTTTTCTTTTTCATTTCGATTTATTTGCAGTTTCAGACTTTTTAAAAAGATCAAGATGT
TGATGAAACCCTTTTGCCATAAAACTAGAGAGTAGCATGGGAAAAGTTTTTATCATTTCG
AAATAAGTTTTGTATGTGCTGGAGATCTTGACTCCAAACTAATTTTACAGTTATGATTTT
TTGTTTGTCT

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2CU16JQ 313 0 0
G
GTGCCATTGCAGGTGCTGGTGTGCTCTCTGGATACGACAAGCTGCAGTTACTTCTTCTCG
GGAAGAAGTACGGATCAGGATCTGGTTAAGTAATGCTAATCACCAGTCGCCCCCAACCAT
AAAGCTTTGGCTTTATTTTTTTCTTTTTCATTTCGATTTATTTGCAGTTTCAGACTTTTT
AAAAAGATCAAGATGTTGATGAAACCCTTTTGCCATAAAACTAGAGAGTAGCATGGGAAA
AGTTTTTATCATTTCGAAATAAGTTTTGTATGTGCTGGAGATCTTGACTCCAAACTAATT
TTATAGTTATGA

QA 2 313 2 313
DS 

RD RR2CU16TF 313 0 0
G
GTGCCATTGCAGGTGCTGGTGTGCTCTCTGGATACGACAAGCTGCAGTTACTTCTTCTCG
GGAAGAAGTACGGATCAGGATCTGGTTAAGTAATGCTAATCACCAGTCGCCACCAACCAT
AAAGCTTTGGCTTTATTTTTTTCTTTTTCATTTCGATTTATTTGCAGTTTCAGACTTTTT
AAAAAGATCAAGATGTTGATGAAACCCTTTTGCCATAAAACTAGAGAGTAGCATGGGAAA
AGTTTTTATCATTTCGAAATAAGTTTTGTATGTGCTGGAGATCTTGACTCCAAACTAATT
TTATAGTTATGA

QA 2 313 2 313
DS 



AS 2 17

CO CL177Contig1 621 10 23 U
GGATCCAAACCAAATCCTCTCGAAGCAGAGTAACACAAGAGGGAAGCAAAAATATGACGA
CAATGGCGACGCAGGGGGCTTTTCTGAGATTACGAACGACCTCATCCTCAAAGTCCGTCT
CTAAGCCAACGGAGCTCGGGTTCCTCAGCTCCCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCAGG
GTCCCTCCAGTGACGTCATCAACCGCATCTCTCTCCCTTCCTTTCCCGGTGCTCTTCAGC
CAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTCACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCAAACAAAG
TCTCCTTCTCTAACCACAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAGG
TTTGGTGGGAAGCTGGCAAACGTTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGCCTTAAAGA
CCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATCGATCTTCGCAAGA
AATAGATATGATTTGATTGATATGCCATTTCTTCTTGTTAATTTCTTTTCTTAATACATT
TCCTTCAATGGACCGTTTATGAGTTTGAATCAGAACCTTCTTGAGCCAGTCAAGAATTAG
ACAAAACTCGTTAAAAAAAAA


BQ
25 25 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 30 60 60 60 45 60 60 60 
45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD46TF U 44
AF RR2GH87TF U -6
AF RR2GH87JQB C -6
AF RR2H980TF U 5
AF RR2A194JQ C 1
AF RR2A194TF U 1
AF RR2BS37TF U 1
AF RR2ET07JQ C 15
AF RR2GZ31TF U 5
AF RR2ET07TF U 15
BS 1 96 RR2A194TF
BS 97 97 RR2BS37TF
BS 98 112 RR2A194TF
BS 113 113 RR2BS37TF
BS 114 178 RR2A194TF
BS 179 179 RR2BS37TF
BS 180 211 RR2A194TF
BS 212 212 RR2BS37TF
BS 213 214 RR2A194TF
BS 215 215 RR2BS37TF
BS 216 268 RR2A194TF
BS 269 269 RR2BS37TF
BS 270 415 RR2A194TF
BS 416 416 RR2BS37TF
BS 417 466 RR2A194TF
BS 467 467 RR2BS37TF
BS 468 552 RR2A194TF
BS 553 553 RR2BS37TF
BS 554 571 RR2A194TF
BS 572 572 RR2BS37TF
BS 573 602 RR2A194TF
BS 603 613 RR2BS37TF
BS 614 621 RR2ET07TF

RD RR2FD46TF 237 0 0
AAGCAAAAATATGACGACAATGGCGACGCAGGGGGCTTTTCTGAGATTACGAACGACCTC
ATCCTCGAAGTCCTTCTCTAAGCCAACGGAGCTCGGGTTCCTCACCTCCCAGCTCAGTGG
CTTAAGAATCTCGCAGGGTCCCTCCAGTGACGTCATCAACCGCATCTCTCTCCCTTCCTT
TCCCGGTGCTCTTCAGCCAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTCACTGGGAAGAA

QA 1 237 1 237
DS 

RD RR2GH87TF 273 0 0
GGCTTCTTT
ATCCAAACCAAATCCTCTCGAAGCAGAGTAACACAAGAGGGAAGCAAAAATATGACGACA
ATGGCGACGCAGGGGGCTTTTCTGAGATTACGAACGACCTCATCCTCAAAGTCCGTCTCT
AAGCCAACGGAGCTCGGGTTCCTCAGCTCCCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCAGGGT
CCCTCCAGTGACGTCATCAACCGCATCTCTCTCCCTTCCTTTCCCGGTGCTCTTCAGCCA
ATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCT

QA 10 273 10 273
DS 

RD RR2GH87JQB 598 0 0
GGCTTCTTT
ATCCAAACCAAATCCTCTCGAAGCAGAGTAACACAAGAGGGAAGCAAAAATATGACGACA
ATGGCGACGCAGGGGGCTTTTCTGAGATTACGAACGACCTCATCCTCAAAGTCCGTCTCT
AAGCCAACGGAGCTCGGGTTCCTCAGCTCCCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCAGGGT
CCCTCCAGTGACGTCATCAACCGCATCTCTCTCCCTTCCTTTCCCGGTGCTCTTCAGCCA
ATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTCACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCAAACAAAGTC
TCCTTCTCTAACCACAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAGGTT
TGGTGGGAAGCTGGCAAACGTTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGCCTTAAAGACC
ATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATCGATCTTCGCAAGAAA
TAGATATGATTTGATTGATATGCCATTTCTTCTTGTTAATTTCTTTTCTTAATACATTTC
CTTCAATGGACCGTTTATGAGTTTGAATCAGAACCTTCTTGAGCCAGTC

QA 10 598 10 598
DS 

RD RR2H980TF 583 0 0
GG
AAACCAAATCCTCTCGAAGCAGAGTTACACAAGAGGGAAGCAAAAATATGACGACAATGG
CGACGCAGGGG*CTTTTCTGAGATTACGAACGACCTCATCCTCAAAGTCCGTCTCTAAGC
CAACGGAGCTCGGGTTCCTCAGCTCCCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCAGGGTCCCT
CCAGTGACGTCATCAACCGCATCTCTCTCCCTTCCTTTCCCGGTGCTCTTCAGCCAATCG
TCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTCACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCAAACAAAGTCTCCT
TCTCTAACCACAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAGGTTTGGT
GGGAAGCTGGCAAACGTTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGCCTTAAAGACCATTG
AGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATCGATCTTCGCAAGAAATAGA
TATGATTTGATTGATATGCCATTTCTTCTTGTTAATTTCTTTTCTTAATGCATTTCCTTC
AATGGACCGTTTATGAGTTTGAATCAGAACCTTCTTGAGCC

QA 3 583 3 583
DS 

RD RR2A194JQ 602 0 0
GGATCCAAACCAAATCCTCTCGAAGCAGAGTAACACAAGAGGGAAGCAAAAATATGACGA
CAATGGCGACGCAGGGGGCTTTTCTGAGATTACGAAAGACCTCATCCTCAAATTCCGTCT
TTAAGCCAACGGAGCTCGGGTTCCTCAGCTCCCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCATG
GTCCCTCCAGTGACGTCATCAACCGCATCTCCCTTCCTTCCTTTCCCGGTGCTCTTCAGC
CAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTTACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCAAACAAAG
TCTCCTTCTCTAACCACAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAGG
TTTGGTGGGAAGCTGGCAAACGTTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGCCTTGAAGA
CCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATTGATCTTCGCAAGA
AATAGATATGATTTGATTGATATGCCATTTCTTCTTGTTAATTTCTTTTCTTAATACATT
TCCTTCAATGGAACGTTTATGAGTTTGAATCGGAACCTTCTTGAGCCAGTCAAGAATTAG
AC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2A194TF 602 0 0
GGATCCAAACCAAATCCTCTCGAAGCAGAGTAACACAAGAGGGAAGCAAAAATATGACGA
CAATGGCGACGCAGGGGGCTTTTCTGAGATTACGAAAGACCTCATCCTCAAATTCCGTCT
CTAAGCCAACGGAGCTCGGGTTCCTCAGCTCCCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCATG
GTCCCTCCAGTGACGTCATCAACCGCATCTCCCTTCCTTCCTTTCCCGGTGCTCTTCAGC
CAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTTACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCAAACAAAG
TCTCCTTCTCTAACCACAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAGG
TTTGGTGGGAAGCTGGCAAACGTTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGCCTTGAAGA
CCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATTGATCTTCGCAAGA
AATAGATATGATTTGATTGATATGCCATTTCTTCTTGTTAATTTCTTTTCTTAATACATT
TCCTTCAATGGAACGTTTATGAGTTTGAATCGGAACCTTCTTGAGCCAGTCAAGAATTAG
AC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2BS37TF 614 0 0
GGATCCAAACCAAATCCTCTCGAAGCAGAGTAACACAAGAGGGAAGCAAAAATATGACGA
CAATGGCGACGCAGGGGGCTTTTCTGAGATTACGAGCGACCTCATCCTCAAAGTCCGTCT
CTAAGCCAACGGAGCTCGGGTTCCTCAGCTCCCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCAGG
GTCCCTCCAGTGACGTCATCAACCGCATCTCTCTCCCTTCCTTTCCCGGTGCTCTTCAGC
CAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTCACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCAAACAAAG
TCTCCTTCTCTAACCACAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAGG
TTTGGTGGGAAGCTGGCAAACGTTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGCCTTAAAGA
CCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATCGATCTTCGCAAGA
AATAGATATGATTTGATTGATATGCCATTTCTTCTCGTTAATTTCTTTTCTTAATACATT
TCCTTCAATGGACCGTTTATGAGTTTGAATCAGAACCTTCTTGAGCCAGTCAAGAATTAG
ACAAAACTCGTTA
A

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2ET07JQ 591 0 0
GG
CTCTCGAAGCAGAGTAACACAAGAGGGAAGCAAAAATATGACGACAATGGCGACGCAGGG
GGCTTTTCTGAGATTACGAACGACCTCATCCTCAAAGTCCGTCTCTAAGCCAACGGAGCT
CGGGTTCCTCAGCTCCCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCAGGGTCCCTCCAGTGACGT
CATCAACCGCATCTCTCTCCCTTCCTTTCCCGGTGCTCTTCAGCCAATCGTCGCCCGGAG
GATCTGTCCTTTCACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCAAACAAAGTCTCCTTCTCTAACCA
CAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAGGTTTGGTGGG**GCTGG
CAAACGTTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGCCTTAAAGACCATTGAGAAGAACGG
TCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATCGATCTTCGCAAGAAATAGATATGATTTGA
TTGATATGCCATTTCTTCTTGTTAATTTCTTTTCTTAATACATTTCCTTCAATGGACCGT
TTATGAGTTTGAATCAGAACCTTCTTGAGCCAGTCAAGAATTAGACAAA

QA 3 591 3 591
DS 

RD RR2GZ31TF 609 0 0
GG
AAACCAAATCCTCTCGAAGCAGGGTAACACAAGAGGGAAGCAAAAATATGACGACAATGG
CGACGCAGGGGGCTTTTCTGAGATTACGAACGACCTCATCCTCAAAGTCCGTCTCTAAGC
CAACGGAGCTCGGGTTCCTCAGCTCCCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCAGGGTCCCT
CCAGTGACGTCATCAACCGCATCTCTCTCCCTTCCTTTCCCGGTGCTCTTCAGCCAATCG
TCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTCACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCAAACAAAGTCTCCT
TCTCTAACCACAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAGGTTTGGT
GGGAAGCTGACAAACGTTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGCCTTAAAGACCATTG
AGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATCGATCTTCGCAAGAAATAGA
TATGATTTGATTGATATGCCATTTCTTCTTGTTAATTTCTTTTCTTAATACATTTCCTTC
AATGGACCGTTTATGAGTTTGAATCAGAACCTTCTTGAGCCAGTCAAGAATTAGACAAAA
CTCGTTA

QA 3 609 3 609
DS 

RD RR2ET07TF 607 0 0
GG
CTCTCGAAGCAGAGTAACACAAGAGGGAAGCAAAAATATGACGACAATGGCGACGCAGGG
GGCTTTTCTGAGATTACGAACGACCTCATCCTCAAAGTCCGTCTCTAAGCCAACGGAGCT
CGGGTTCCTCAGCTCCCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCAGGGTCCCTCCAGTGACGT
CATCAACCGCATCTCTCTCCCTTCCTTTCCCGGTGCTCTTCAGCCAATCGTCGCCCGGAG
GATCTGTCCTTTCACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCAAACAAAGTCTCCTTCTCTAACCA
CAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAGGTTTGGTGGG**GCTGG
CAAACGTTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGCCTTAAAGACCATTGAGAAGAACGG
TCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATCGATCTTCGCAAGAAATAGATATGATTTGA
TTGATATGCCATTTCTTCTTGTTAATTTCTTTTCTTAATACATTTCCTTCAATGGACCGT
TTATGAGTTTGAATCAGAACCTTCTTGAGCCAGTCAAGAATTAGACAAAACTCGTTAAAA
AAAAA

QA 3 607 3 607
DS 



CO CL177Contig2 671 7 5 U
GGATCCAAACCAAATCCTCTCGAAGCAGAGTAACAGCAAAGGGGGAGCCAAAAAAAAA*T
GACGACGATAATGGCGACGCAGGGGGCTATTCTGCGATTACGAACGAGCTCATCCTCAAA
GTCCGTCGCTAAGCCAACGGAGCTCGGCTTCCTCAGCTCTCAGCTCAGTGGCTTAAGAAT
CTCGCATGCTCCCTCCGATGACGTCATCAACCGCATCTCCCTTCCTTCCTTTCCCGGTGC
TCTTCAGCCAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTTACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGC
AAACAAAGTCTCCTTCTCTAACCACAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTA
CAAGAAAGTTTGGTGGGAAGCTGGGAAACGCTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGC
CTTGAAGACCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATAGATCT
TCGCAAGAAATAGATATGATTTGATTGATATGCATTTTTCTTGCTGTTAATTTCTTTTCT
TAATACATTTCCTTCAATGGAACGTTTATGAGTTTGAATCAGAAAACTGTTTAATGTTTC
CCCCTTCTTGAGCCAGTCAAGAATTAGACAAAACTCGTTAAAAAAGAAAGAAAATATTAC
ATTTCAAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO45JQ C 274
AF RR2G413TF U 5
AF RR2G413JQ C 97
AF RR2GO45TF U 1
AF RR2GQ37TF U 1
AF RR2E273JQ C 449
AF RR2E273TF U 1
BS 1 143 RR2E273TF
BS 144 144 RR2G413TF
BS 145 192 RR2E273TF
BS 193 193 RR2G413TF
BS 194 671 RR2E273TF

RD RR2GO45JQ 208 0 0
TTTTACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCAAACAAAGTCTCCTTCTCTAACCACAAGACCAA
GAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAAGTTTGGTGGGAAGCTGGGAAACGCTT
CGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGCCTTGAAGACCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGC
TGTTGCCAAGAAAGCTGGCATAGATCTT

QA 1 208 1 208
DS 

RD RR2G413TF 595 0 0
GG
AAACCAAATCCTCTCGAAGTAGAGTAACAGCAAAGGGGGAGCCAAAAAAAAAATGACGAC
GATAATGGCGACGCAGGGGGCTATTCTGCGATTACGAACGAGCTCATCCTCAAAGTCCGT
CGCTAAGCCAACGGAGCTCGGCTTCCTCAGCTCTCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCA
TGCTCCCTCCGATGACGTCATCAACCGCATCTCCCTTCCTTCCTTTCCCGGTGCTCTTCA
GCCAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTTACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCAAACAA
AGTCTCCTTCTCTAACCACAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAA
AGTTTGGTGGGAAGCTGGGAAACGCTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGCCTTGAA
GACCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATAGATCTTCGCAA
GAAATAGATATGATTTGATTGATATGCATTTTTCTTGCTGTTAATTTCTTTTCTTAATAC
ATTTCCTTCAATGGAACGTTTATGAGTTTGAATCAGAAAACTGTTTAATG
GAA

QA 3 592 3 592
DS 

RD RR2G413JQ 501 0 0
ATTACGAACGAGCTCATCCTCAAAGTCCGTCGCTAAGCCAACGGAGCTCGGCTTCCTCAG
CTCTCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCATGCTCCCTCCGATGACGTCATCAACCGCAT
CTCCCTTCCTTCCTTTCCCGGTGCTCTTCAGCCAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTT
TACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCAAACAAAGTCTCCTTCTCTAACCACAAGACCAAGAA
GTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAAGTTTGGTGGGAAGCTGGGAAACGCTTCGT
CAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGCCTTGAAGACCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGT
TGCCAAGAAAGCTGGCATAGATCTTCGCAAGAAATAGATATGATTTGATTGATATGCATT
TTTCTTGCTGTTAATTTCTTTTCTTAATACATTTCCTTCAATGGAACGTTTATGAGTTTG
AATCAGAAAACTGTTTAATG
G

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2GO45TF 580 0 0
GGATCCAAACCAAATCCTCTCGAAGCAGAGTAACAGCAAAGGGGGAGCCAAAAAAAAA*T
GACGACGATAATGGCGACGCAGGGGGCTATTCTGCGATTACGAACGAGCTCATCCTCAAA
GTCCGTCGCTAAGCCAACGGAGCTCGGCTTCCTCAGCTCTCAGCTCAGTGGCTTAAGAAT
CTCGCATGCTCCCTCCGATGACGTCATCAACCGCATCTCCCTTCCTTCCTTTCCCGGTGC
TCTTCAGCCAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTTACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGC
AAACAAAGTCTCCTTCTCTAACCACAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTA
CAAGAAAGTTTGGTGGGAAGCTGGGAAACGCTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGC
CTTGAAGACCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATAGATCT
TCGCAAGAAATAGATATGATTTGATTGATATGCATTTTTCTTGCTGTTAATTTCTTTTCT
TAATACATTTCCTTCAATGGAACGTTTATTAGTTTGAA
CC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2GQ37TF 597 0 0
GGATCCAAACCAAATCCTCTCGAAGCAGAGTAACAGCAAAGGGGGAGCCAAAAAAAAA*T
GACGACGATAATGGCGACGCAGGGGGCTATTCTGCGATTACGAACGAGCTCATCCTCAAA
GTCCGTCGCTAAGCCAACGGAGCTCGGCTTCCTCAGCTCTCAGCTCAGTGGCTTAAGAAT
CTCGCATGCTCCCTCCGATGACGTCATCAACCGCATCTCCCTTCCTTCCTTTCCCGGTGC
TCTTCGGCCAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTTACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGC
AAACAAAGTCTCCTTCTCTAACCACAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTA
CAAGAAAGTTTGGTGGGAAGCTGGGAAACGCTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGC
CTTGAAGACCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATAGATCT
TCGCAAGAAATAGATATGATTTGATTGATATGCATTTTTCTTGCTGTTAATTTCTTTTCT
TAATACATTTCCTTCAATGGAACGTTTATGAGTTTGAATCAGAAA*CTGTTTAATG
T

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2E273JQ 206 0 0
GACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATAGATTTTCGCAAGAAATAGATATGATTTGATTGA
TATGCATTTTTCTTGCTGTTAATTTTTTTTTTTAATACATTTCCTTCAATGGAACGTTTA
TGAGTTTGAATCAGAAAACTGTTTAATGTTTCCCCCTTTTTGAGCCAGTCAAGAATTAGA
CAAAACTCGTTAAAAAA
AGAAAGAAA

QA 1 197 1 197
DS 

RD RR2E273TF 671 0 0
GGATCCAAACCAAATCCTCTCGAAGCAGAGTAACAGCAAAGGGGGAGCCAAAAAAAAA*T
GACGACGATAATGGCGACGCAGGGGGCTATTCTGCGATTACGAACGAGCTCATCCTCAAA
GTCCGTCGCTAAGCCAACGGAGCCCGGCTTCCTCAGCTCTCAGCTCAGTGGCTTAAGAAT
CTCGCATGCTCC*TCCGATGACGTCATCAACCGCATCTCCCTTCCTTCCTTTCCCGGTGC
TCTTCAGCCAATCGTCGCCCGGAGGATCTGTCCTTTTACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGC
AAACAAAGTCTCCTTCTCTAACCACAAGACCAAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTA
CAAGAAAGTTTGGTGGGAAGCTGGGAAACGCTTCGTCAAGCTTCGTTTATCAACAAAGGC
CTTGAAGACCATTGAGAAGAACGGTCTCGACGCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATAGATCT
TCGCAAGAAATAGATATGATTTGATTGATATGCATTTTTCTTGCTGTTAATTTCTTTTCT
TAATACATTTCCTTCAATGGAACGTTTATGAGTTTGAATCAGAAAACTGTTTAATGTTTC
CCCCTTCTTGAGCCAGTCAAGAATTAGACAAAACTCGTTAAAAAAGAAAGAAAATATTAC
ATTTCAAAAAA

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 17

CO CL178Contig1 561 17 18 U
GGCGGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATT
TAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGT
TTCCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGC
TTCAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAA
AGCTGAAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGT
ACATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTT
GTTAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACA
TTATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTA
AATAAAGTTTACATTCTCATATTATTTGTGGCTTTCTGGGGTAAACGTCTAATGCAAAAA
CACTCAAAAGGATTCAATTTG


BQ
35 35 0 5 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 65 95 95 95 
95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 75 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 55 85 85 55 85 85 85 85 85 55 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 5 5 5 5 5 5 5 5 5 85 
85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 0 80 80 80 75 65 55 55 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB58TF U 1
AF RR2AJ37TF U 68
AF RR2AJ37JQ C 1
AF RR2DM09JQ C 3
AF RR2DM09TF U 3
AF RR2DC56JQ C 1
AF RR2FQ18JQ C 61
AF RR2FQ18TF U 61
AF RR2EB58JQ C 1
AF RR2ES15JQ C 3
AF RR2FE93TF U 3
AF RR2G624TF U 4
AF RR2EW18TF U 2
AF RR2ES15TF U 3
AF RR2DC56TF U 1
AF RR2GB59TF U 61
AF RR2G364TF U 61
BS 1 3 RR2EB58TF
BS 4 20 RR2DM09TF
BS 21 21 RR2EB58TF
BS 22 67 RR2DM09TF
BS 68 236 RR2AJ37TF
BS 237 237 RR2DM09TF
BS 238 357 RR2AJ37TF
BS 358 358 RR2DM09TF
BS 359 404 RR2AJ37TF
BS 405 413 RR2DM09TF
BS 414 414 RR2FQ18TF
BS 415 470 RR2DM09TF
BS 471 479 RR2FE93TF
BS 480 492 RR2DM09TF
BS 493 493 RR2FE93TF
BS 494 498 RR2DM09TF
BS 499 500 RR2FQ18TF
BS 501 561 RR2G364TF

RD RR2EB58TF 355 0 0
GGCTGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATT
TAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGT
TTCCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGC
TTCAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAA
AGCTGAAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCA*T
ACATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGG*ATTCCTTACCC

QA 1 355 1 355
DS 

RD RR2AJ37TF 337 0 0
CATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTTCCCGC
TCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTTCAGCC
TTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTACAAAGCTGAA
GGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGTACATTAG
CTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAATTGTTAAAA
CTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTA

QA 1 337 1 337
DS 

RD RR2AJ37JQ 500 0 0
GGCTGAGCAAATATATTAAATACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATT
TAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGT
TTCCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGC
TTCAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTACAA
AGCTGAAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGT
ACATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTT
GTTAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACA
TTATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTT*********A
AATAAAGTTTACTTTCTCAT

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2DM09JQ 496 0 0
GGGAGCAAATATATTAAATACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTA
GTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTT
CCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTT
CAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGTTGACTGTTGTGCAAAG
CTGGAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGTAC
ATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGT
TAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGGATAACATT
ATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTT*********AAA
TAAAGTTTACTTTCTC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2DM09TF 496 0 0
GGGAGCAAATATATTAAATACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTA
GTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTT
CCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTT
CAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGTTGACTGTTGTGCAAAG
CTGGAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGTAC
ATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGT
TAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGGATAACATT
ATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTT*********AAA
TAAAGTTTACTTTCTC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2DC56JQ 500 0 0
GGCTGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAA*CAGCTTAACATATACAAATAATT
TAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGT
TTCCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGC
TTCAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAA
AGCTGAAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGT
ACATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTT
GTTAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACA
TTATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTA
AATAAAGTTTACATTCTCAT

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2FQ18JQ 440 0 0
TAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGT
TTCCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGC
TTCAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAA
AGCTGAAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGT
ACATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTT
GTTAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACG
TTATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTT*********A
AATAAAGTTTACCTTCTCAT

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR2FQ18TF 440 0 0
TAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGT
TTCCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGC
TTCAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAA
AGCTGAAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGT
ACATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTT
GTTAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACG
TTATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTT*********A
AATAAAGTTTACCTTCTCAT

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR2EB58JQ 483 0 0
GGCTGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATT
TAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTTTGACATCGT
TTCCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGC
TTCAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAA
AGCTGAAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGT
ACATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTT
GTTAAAACTTTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACA
TTATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTA
AAT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR2ES15JQ 498 0 0
GGGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTA
GTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTT
CCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTT
CAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAG
CTGAAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGTAC
ATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGT
TAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGGTGAATAACATT
ATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAAA
TAAAGTTTACATTCTCAT

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2FE93TF 495 0 0
GGGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTA
GTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTT
CCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTT
CAGCCTTGCCCGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGCGCAAAG
CTGAAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGTAC
ATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGT
TAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACATT
ATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAAA
TAAAGTTTACATTCT

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR2G624TF 494 0 0
GGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTAG
TAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTTC
CCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTTC
AGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAGC
TGAAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGTACA
TTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGTT
AAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACATTA
TATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAAAT
AAAGTTTACATTCT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2EW18TF 495 0 0
GTGA
AGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTAGTA
GACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTTCCC
GCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTTCAG
CCTTGCCTGGCAGCGATTACCGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAGCTG
AAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGTACATT
AGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGTTAA
AACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACATTATA
TCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACTGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAAATAA
AGTTTACATTC

QA 5 495 5 495
DS 

RD RR2ES15TF 498 0 0
GGGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTA
GTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTT
CCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTT
CAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAG
CTGAAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGTAC
ATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGT
TAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGGTGAATAACATT
ATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAAA
TAAAGTTTACATTCTCAT

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2DC56TF 500 0 0
GGCTGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAA*CAGCTTAACATATACAAATAATT
TAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGT
TTCCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGC
TTCAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAA
AGCTGAAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGT
ACATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTT
GTTAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACA
TTATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTA
AATAAAGTTTACATTCTCAT

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2GB59TF 480 0 0
TAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGT
TTCCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGC
TTCAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAA
AGCTGAAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGT
ACATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTT
GTTAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACA
TTATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTT*********A
AATAAAGTTTACTTTCTCATATTATTTGTGGCTTTCTGGGGTAAACGTCTAATGCAAAAA

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2G364TF 501 0 0
TAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGACACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGT
TTCCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGC
TTCAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAA
AGCTGAAGGACCAACAACAATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCTTTTGCTCAGT
ACATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTT
GTTAAAACTCTTAAGAGTTTTTACAAATAAATAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACA
TTATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAAATAACCGCTAGTATGTAATGGTT*********A
AATAAAGTTTACTTTCTCATATTATTTGTGGCTTTCTGGGGTAAACGTCTAATGCAAAAA
CACTCAAAAGGATTCAATTTG

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 16

CO CL179Contig1 1017 16 14 U
GGATCGCCTGTTCCTCCTCTTCCGGTTCCTGCATCAGCATATTCACCTCCAACTGGTATC
AAGAAGACATGGGAAGCCAATCATACGAAGACGCCATCGAAGCTCTCAAGAAGCTTATCA
TTGAGAAGGATGACCTGAAGACGGTGGCTGCGGCCAAGGTGGAGAAGCTCACAGCGGAGC
TTAAGACAATCTCGTCATCGGACGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAAG
GCTTCGTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTTG
CCAAAGGTCAAAGCCCAAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCGGACTCACGTGTGTGCCCAT
CACACGTGCTTAACTTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATGG
TTCCTCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTCT
TGCACCTTAAGGTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAGG
GACTTATGTCATTTGCTCTTGACGGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTAA
AAATCTGTTTGCCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATTTGAAG
ACCAATGTGGCCGATGTGAAAGGGAGGCAGTGAATGTGTCACTAGCAAACCTATTAACAT
ACCCATTTGTGAGGGAAGGAGTTGTCAAAGGAACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTATTATG
ACTTTGTTAAGGGAGCTTTTGAGCTTTGGGAACTCCAGTTCGGCCTCTCTCCCGCTCATC
CAGTTTGAGCCAATATATCATAATCATCTTCACCGTCTTCATCACCTTGTTCTCTACTCT
TGATCTCCCATCTAAATTAATGGCTACTCGAATAACTGCTTTTTTATTTGAGTTAAGCTA
CATTTTCTCAACTATCTATCCGACTTATAAAATGAATAAAAATAAATTCTGAATTCC


BQ
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 
60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 50 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 50 65 65 35 65 65 65 65 65 
65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DW17TF U 1
AF RR2DW34TF U 1
AF RR2EO58TF U 95
AF RR2CE45TF U 1
AF RR2FR60TF U 1
AF RR2AP48TF U 1
AF RR2D786TF U 1
AF RR2DH09TF U 4
AF RR2ES56TF U 67
AF RR2EO58JQ C 404
AF RR2AP48JQ C 180
AF RR2AD70TF U 182
AF RR2CE45JQ C 264
AF RR2DW34JQ C 312
AF RR2D786JQ C 391
AF RR2DW17JQ C 425
BS 1 17 RR2AP48TF
BS 18 18 RR2DW17TF
BS 19 569 RR2AP48TF
BS 570 570 RR2CE45TF
BS 571 662 RR2AP48TF
BS 663 663 RR2D786TF
BS 664 678 RR2AP48TF
BS 679 683 RR2DH09TF
BS 684 750 RR2ES56TF
BS 751 751 RR2AD70TF
BS 752 764 RR2ES56TF
BS 765 991 RR2AD70TF
BS 992 992 RR2CE45JQ
BS 993 1017 RR2DW34JQ

RD RR2DW17TF 292 0 0
GGATCGCCTGTTCCTCCTCTTCCGGTTCCTGCATCAGCATATTCACCTCCAACTGGTATC
AAGAAGACATGGGAAGCCAATCATACGAAGACGCCATCGCAGCTCTCAAGAAGCTTATCA
TTGAGAAGGATGACCTGAAGACGGTGGCTGCGGCCAAGGTGGAGAAGCTCACAGCGGAGC
TTAAGACAATCTCGTCATCGGACGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAAG
GCTTCGTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCCTTGT
GCGG

QA 1 288 1 288
DS 

RD RR2DW34TF 285 0 0
GGATCGCCTGTTCCTCCTCTTCCGGTTCCTGCATCAGCATATTCACCTCCAACTGGTATC
AAGAAGACATGGGAAGCCAATCATACGAAGACGCCATCGAAGCTCTCAAGAAGCTTATCA
TTGAGAAGGATGACCTGAAGACGGTGGCTGCGGCCAAGGTGGAGAAGCTCACAGCGGAGC
TTAAGACAATCTCGTCATCGGACGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAAG
GCTTCGTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTT

QA 1 285 1 285
DS 

RD RR2EO58TF 415 0 0
CATCGAAGCTCTCAAGAAGCTTATCATTGAGAAGGATGACCTGAAGACGGTGGCTGCGGC
CAAGGTGGAGAAGCTCACAGCGGAGCTTAAGACAATCTCGTCATCGGACGGCAAAGCATT
CGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAAGGCTTCGTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATAC
GAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTTGCCAAAGGTCAAAGCCCAAAGTACATGGTGTTTGC
TTGTTCGGACTCACGTGTGTGCCCATCACACGTGCTTAACTTCCATCCTGGAGATGCCTT
CGTGGTTCGTAACATTGCAAATATGGTTCCTCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGT
TGGAGCCGCCATTGAAT**GCTGTCTTGCACCTTAAGGTCGAGAACATTGTGATA

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR2CE45TF 648 0 0
GGATCGCCTGTTCCTCCTCTTCCGGTTCCTGCATCAGCATATTCACCCCCAACTAGTATC
AAGAAGACATGGGAAGCCAATCATACGAAGACGCCATCGAAGCTCTCAAGAAGCTTATCA
TTGAGAAGGATGACCTGAAGACGGTGGCTGCGGCCAAGGTGGAGAAGCTCACAGCGGAGC
TTAAGACAATCTCGTCATCGGACGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAAG
GCTTCGTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTTG
CCAAAGGTCAAAGCCCAAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCGGACTCACGTGTGTGCCCAT
CACACGTGCTTAACTTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATGG
TTCCTCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTCT
TGCACCTTAAGGTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAGG
GACTTATGTCATTTGCTCTTGACGGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTAA
AAATCTGTTTGCCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2FR60TF 634 0 0
GGATCGCCTGTTCCTCCTCTTCCGGTTCCTGCATCAGCATATTCACCTCCAACTGGTATC
AAGAAGACATGGGAAGCCAATCATACGAAGACGCCATCGAAGCTCTCAAGAAGCTTATCA
TTGAGAAGGATGACCTGAAGACGGTGGCTTCGGCCAAGGTGGAGAAGCTCACAGCGGAGC
TTAAGACAATCTCGTCATCGGACGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAAG
GCTTCGTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTTG
CCAAAGGTCAAAGCCCAAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCGGACTCACGTGTGTGCCCAT
CACACGTGCTTAACTTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATGG
TTCCTCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTCT
TGCACCTTAAGGTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAGG
GACTTATGTCATTTGCCCTTGACGGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTAA
AAATCTGTTTGTCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2AP48TF 678 0 0
GGATCGCCTGTTCCTCCCCTTCCGGTTCCTGCATCAGCATATTCACCTCCAACTGGTATC
AAGAAGACATGGGAAGCCAATCATACGAAGACGCCATCGAAGCTCTCAAGAAGCTTATCA
TTGAGAAGGATGACCTGAAGACGGTGGCTGCGGCCAAGGTGGAGAAGCTCACAGCGGAGC
TTAAGACAATCTCGTCATCGGACGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAAG
GCTTCGTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTTG
CCAAAGGTCAAAGCCCAAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCGGACTCACGTGTGTGCCCAT
CACACGTGCTTAACTTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATGG
TTCCTCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTCT
TGCACCTTAAGGTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAGG
GACTTATGTCATTTGCTCTTGACGGAAACGACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTAA
AAATCTGTTTGCCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATTTGAAG
ACTAATGTGGCCGATGTG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2D786TF 678 0 0
GGATCGCCTGTTCCTCCTCTTCCGGTTCCTGCATCAGCATATTCACCTCCAACTGGTATC
AAGAAGACATGGGAAGCCAATCATACGAAGACGCCATCGAAGCTCTCAAGAAGCTTATCA
TTGAGAAGGATGACCTGAGGACGGTGGCTGCGGCCAAGGTGGAGAAGCTCACAGCGGAGC
TTAAGACAATCTCGTCATCGGACGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAAG
GCTTCGTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTTG
CCAAAGGTCAAAGCCCAAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCGGACTCACGTGTGTGCCCAT
CACACGTGCTTAACTTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATGG
TTCCTCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTCT
TGCACCTTAAGGTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAGG
GACTTATGTCATTTGCTCTTGACGGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTAA
AAATCTGTTTGCCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATCTGAAG
ACCAATGTGGCCGATGTG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2DH09TF 684 0 0
GG
GCCTGTTCCTCCTCTTCCGGTTCCTGCATCAGCATATTCACCCCCAACTAGTATCAAGAA
GACATGGGAAGCCAATCATACGAAGACGCCATCGAAGCTCTCAAGGAGCTTATCATTGAG
AAGGATGACCTGAAGACGGTG*CTGCGGCCAAGGTGGAGAAGCTCACAGCGGAGCTTAAG
ACAATCTCGTCATCGGACGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAAGGCTTC
GTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTTGCCAAA
GGTCAAAGCCCAAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCGGACTCACGTGTGTGCCCATCACAC
GTGCTTAACTTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATGGTTCCT
CCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTCTTGCAC
CTTAAGGTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAGGGACTT
ATGTCATTTGCTCTTGACGGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTAAAAATC
TGTTTGCCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATTTGAAGACCAA
TGTGGCCGATGTGAAAGG
AGGC

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR2ES56TF 698 0 0
G
CATGGGAAGCCAATCATACGAAGACGCCATCGAAGCTCTCAAGAAGCTTATCATTGAGAA
GGATGACCTGAAGACGGTGGCTGCGGCCAAGGTGGAGAAGCTCACAGCGGAGCTTAAGAC
AATCTCGTCATCGGACGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAAGGCTTCGT
CACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTTGCCAAAGG
TCAAAGCCCAAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCGGACTCACGTGTGTGCCCATCACACGT
GCTTAACTTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACGTTGCAAATATGGTTCCTCC
TTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTCTTGCACCT
TAAGGTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAGGGACTTAT
GTCATTTGCTCTTGACGGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTAAAAATCTG
TTTGCCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATTTGAAGACCAATG
TGGCCGATGTGAAAGGGAGGCAGTGAATGTGTCACTAGCAAACCTATTAACATACCCATT
TGTGAGGGAAGGAGTTGTCAAAG*AACACTTGCTTTG

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR2EO58JQ 489 0 0
TAACATTGCAAATATGGTTCCTCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGC
CATTGAAT**GCTGTCTTGCACCTTAAGGTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGC
ATGTGGTGGCATCAAGGGACTTATGTCATTTGCTCTTGACGGAAACAACTCCACTGATTT
CATAGAGGATTGGGTAAAAATCTGTTTGCCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGA
AAGTTCAGCATTTGAAGACCAATGTGGCCGATGTGAAAGGGAGGCAGTGAGTGTGTCACT
AGCAAACCTATTAACATACCCATTTGTGAGGGAAGGAGTTGTCAAAGGAACACTTGCTTT
GAAGGGAGGCTATTATGACTTTGTTAAGGGAGCTTTTGAGCTTTGGGAACTCCAGTTCGG
CCTCTCTCCCGCTCATCCAGTTTGAGCCAATATATCATAATCATTTTCACCGTCTTCATC
ACCTTG
CTC

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR2AP48JQ 794 0 0
CTTAAGACAATCTCGTCATCGGACGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAA
GGCTTCGTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTT
GCCAAAGGTCAAAGCCCAAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCGGACTCACGTGTGTGCCCA
TCACACGTGCTTAACTTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATG
GTTCCTCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTC
TTGCACCTTAAGGTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAG
GGACTTATGTCATTTGCTCTTGACGGAAACGACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTA
AAAATCTGTTTGCCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATTTGAA
GACTAATGTGGCCGATGTGAAAGGGAGGCAGTGAATGTGTCACTAGCAAACCTATTAACA
TACCCATTTGTGAGGGAAGGAGTTGTCAAAGGAACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTATTAT
GACTTTGTTAAGGGAGCTTTTGAGCTTTGGGAACTCCAGTTCGGCCTCTCTCCCGCTCAT
CCAGTTTGAGCCAATATATCATAATCATCTTCACCGTCTTCATCACCTTGTTCTCTACTC
TTGATCTCCCATCTAAATTAATGGCTACTCGAATAACTGCTTTTTTATTTGAGTTAAGCT
ACATTTTCTCAACT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2AD70TF 814 0 0
G
AAGACAATCTCGTCATCGGGCGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAAGGC
TTCGTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTTGCC
AAAGGTCAAAGCCCAAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCGGACTCACGTGTGTGCCCATCA
CACGTGCTTAACTTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATGGTT
CCTCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTCTTG
CACCTTAAGGTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAGGGA
CTTATGTCATTTGCTCTTGACGGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTAAAA
ATCTGTTTGCCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATTTGAAGAC
CAATGTGGCCGATGTGGAAGGGAGGCAGTGGATGTGTCACTAGCAAACCTATTAACATAC
CCATTTGTGAGGGAAGGAGTTGTCAAAGGAACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTATTATGAC
TTTGTTAAGGGAGCTTTTGAGCTTTGGGAACTCCAGTTCGGCCTCTCTCCCGCTCATCCA
GTTTGAGCCAATATATCATAATCATCTTCACCGTCTTCATCACCTTGTTCTCTACTCTTG
ATCTCCCATCTAAATTAATGGCTACTCGAATAACTGCTTTTTTATTTGAGTTAAGCTACA
TTTTCTCAACTATCTATCCGACTTATAAA
TGAA

QA 2 810 2 810
DS 

RD RR2CE45JQ 730 0 0
AAATACGATACGAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTTGCCAAAGGTCAAAGCCCAAAGTAC
ATGGTGTTTGCTTGTTCGGACTCACGTGTGTGCCCATCACACGTGCTTAACTTCCATCCT
GGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATGGTTCCTCCTTATGACCAGGTCAAA
TATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTCTTGCACCTTAAGGTCGAGAACATT
GTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAGGGACTTATGTCATTTGCTCTTGAC
GGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTAAAAATCTGTTTGCCAGCAAAGTCA
AAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATTTGAAGACCAATGTGGCCGATGTGAAAGG
GAGGCAGTGAATGTGTCACTAGCAAACCTATTAACATACCCATTTGTGAGGGAAGGAGTT
GTCAAAGGAACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTATTATGACTTTGTTAAGGGAGCTTTTGAG
CTTTGGGAACTCCAGTTCGGCCTCTCTCCCGCTCATCCAGTTTGAGCCAATATATCATAA
TCATCTTCACCGTCTTCATCACCTTGCTCTCTACTCTTGATCTTCCATCTAAATTAATGG
CTACTCGAATAACTGGTTTTTTATTTGAGCTAAGCTTCATTTTCTCAACTATCTATCCGA
CTTATAAAA
A

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2DW34JQ 706 0 0
AGCCCAAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCGGACTCACGTGTGTGCCCATCACACGTGCTT
AACTTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATGGTTCCTCCTTAT
GACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTCTTGCACCTTAAG
GTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAGGGACTTATGTCA
TTTGCTCTTGACGGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTAAAAATCTGTTTG
CCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGTATTTGAAGACCAATGTGGC
CGATGTGAAAGGGAGGCAGTGAATGTGTCACTAGCAAACCTATTAACATACCCATTTGTG
AGGGAAGGAGTTGTCAAAGGAACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTATTATGACTTTGTTAAG
GGAGCTTTTGAGCTTTGGGAACTCCAGTTCGGCCTCTCTCCCGCTCATCCAGTTTGAGCC
AATATATCATAATCATCTTCACCGTCTTCATCACCTTGTTCTCTACTCTTGATCTCCCAT
CTAAATTAATGGCTACTCGAATAACTGCTTTTTTATTTGAGTTAAGCTACATTTTCTCAA
CTATCTATCCGACTTATAAAATGAATAAAAATAAATTCTGAATTCC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2D786JQ 627 0 0
CCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATGGTTCCTCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAG
GAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTCTTGCACCTTAAGGTCGAGAACATTGTGATAA
TAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAGGGACTTATGTCATTTGCTCTTGACGGAAACA
ACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTAAAAATCTGTTTGCCAGCAAAGTCAAAAGTTT
TGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATCTGAAGACCAATGTGGCCGATGTGAAAGGGAGGCAG
TGAATGTGTCACTAGCAAACCTATTAACATACCCATTTGTGAGGGAAGGAGTTGTCAAAG
GAACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTATTATGACTTTGTTAAGGAAGCTTTTGAGCTTTGGG
AACTCCAGTTCGGCCTCTCTCCCGCTCATCCAGTTTGAGCCAATATATCATAATCATCTT
CACCGTCTTCATCACCTTGTTCTCTACTCTTGATCTCCCATCTAAATTAATGGCTACTCG
AATAACTGCTTTTTTATTTGAGTTAAGCTACATTTTCTCAACTATCTATCCGACTTATAA
AATGAATAAAAATAAATTCTGAATTCC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2DW17JQ 578 0 0
TCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTCTTGCA
CCTTAAGGTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAGGGACT
TATGTCATTTGCTCTTGACGGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTAAAAAT
CTGTTTGCCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATTTGAAGACCA
ATGTGGCCGATGTGAAAGGGAGGCAGTGAATGTGTCACTAGCAAACCTATTAACATACCC
ATTTGTGAGGGAAGGAGTTGTCAAAGGAACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTATTATGACTT
TGTTAAGGAAGCTTTTGAGCTTTGGGAACTCCAGTTCGGCCTCTCTCCCGCTCATCCAGT
TTGAGCCAATATATCATAATCATCTTCACCGTCTTCATCACCTCGTTCTCTACTCTTGAT
CTCCCATCTAAATTAATGGCTACTCGAATAACTGCTTTTTTATTTGAGTTAAGCTACATT
TTCTCAACTATCTATCCGACTTATAAAA
TGGATAAAAA

QA 1 568 1 568
DS 



AS 3 17

CO CL180Contig1 698 2 4 U
GGATCTCAAAAACCAACAAAAAAAAAAAAAAAAACTTTTTCGAATCCCTAAAAAAGATGT
CGACGGAGGAAGAACCCAAGGTCGTGGAGTCGGGAGACGCCGAAGCCGAAGCCGCAACGG
TGACGACGACGGAGAAGAAACCTGCTGCTAAAGCTAAAGCTAAGAAGACGAAGGAAGCTA
AGAAGAAGCCTGCTGCTGCTGCTGCTCCGAGGAAGAGAACCACTTCGTCTCATCCTCCTT
ACGAAGAGATGATAAAGGATGCGATCGTGACGTTGAAGGAGAGTACCGGATCTAGCCAAT
ACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCAGAAGTCGCTTCCTCCTACTTTCACGAAGC
TTCTTCTCGTCAATCTCAGGAGACTCGTCGCTTCGGGGAAGCTCGTCAAAGTCAAAGCCT
CTTTCAAGATTCCTTCTGCTTCAGCGGCTAAACCGGCTGCGGTTAAGAAGAAACCGGCTG
CTTCGGTTACTAAACCGAAGGGTAAAGCAGCTGCTGCTCCTGCTAAGAAGGCCAAACCAG
CTGCTAAAGGGACCAAGAAACCTGCTGCTTCTGCTGCTAAGCCTAAGGCAAAGACGACGA
CAACTAAAACTGCTGCGAAGCCGAAAGTTACAGCGAAGCCTAAGACGAAGAGTGTAGCTG
CGGTTTCGAAGACTAAAGCTGTTGCTGCTAAGCCTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A903TF U 1
AF RR2GS77TF U 3
BS 1 21 RR2A903TF
BS 22 22 RR2GS77TF
BS 23 393 RR2A903TF
BS 394 698 RR2GS77TF

RD RR2A903TF 393 0 0
GGATCTCAAAAACCAACAAAACAAAAAAAAAAAACTTTTTCGAATCCCTAAAAAAGATGT
CGACGGAGGAAGAACCCAAGGTCGTGGAGTCGGGAGACGCCGAAGCCGAAGCCGCAACGG
TGACGACGACGGAGAAGAAACCTGCTGCTAAAGCTAAAGCTAAGAAGACGAAGGAAGCTA
AGAAGAAGCCTGCTGCTGCTGCTGCTCCGAGGAAGAGAACCACTTCGTCTCATCCTCCTT
ACGAAGAGATGATAAAGGATGCGATCGTGACGTTGAAGGAGAGTACCGGATCTAGCCAAT
ACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCAGAAGTCGCTTCCTCCTACTTTCACGAAGC
TTCTTCTCGTCAATCTCAGGAGACTCGTCGCTT

QA 1 393 1 393
DS 

RD RR2GS77TF 696 0 0
GGATCTCAAAAACAAAAA
AAAAAAAAAAAAAACTTTTTCGAATCCCTAAAAAAGATGTCGACGGAGGAAGAACCCAAG
GTCGTGGAGTCGGGAGACGCCGAAGCCGAAGCCGCAACGGTGACGACGACGGAGAAGAAA
CCTGCTGCTAAAGCTAAAGCTAAGAAGACGAAGGAAGCTAAGAAGAAGCCTGCTGCTGCT
GCTGCTCCGAGGAAGAGAACCACTTCGTCTCATCCTCCTTACGAAGAGATGATAAAGGAT
GCGATCGTGACGTTGAAGGAGAGTACCGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATC
GAGGAGAAGCAGAAGTCGCTTCCTCCTACTTTCAGGAAGCTTCTTCTCGTCAATCTCAGG
AGACTCGTCGCTTCGGGGAAGCTCGTCAAAGTCAAAGCCTCTTTCAAGATTCCTTCTGCT
TCAGCGGCTAAACCGGCTGCGGTTAAGAAGAAACCGGCTGCTTCGGTTACTAAACCGAAG
GGTAAAGCAGCTGCTGCTCCTGCTAAGAAGGCCAAACCAGCTGCTAAAGGGACCAAGAAA
CCTGCTGCTTCTGCTGCTAAGCCTAAGGCAAAGACGACGACAACTAAAACTGCTGCGAAG
CCGAAAGTTACAGCGAAGCCTAAGACGAAGAGTGTAGCTGCGGTTTCGAAGACTAAAGCT
GTTGCTGCTAAGCCTAAG

QA 19 696 19 696
DS 



CO CL180Contig2 1055 2 12 U
GGATCTCAAAAACCAACAAAACAAAAAAAAACTTTTTCGAATCCCTAAAAAAGATGTCGA
CGGAGGAAGAACCCAAGGTCGTGGAGTCGGGAGACGCCGAAGCCGAAGCCGCAACGGTGA
CGACGACGGAGAAGAAACCTGCTGCTAAAGCTAAAGCTAAGAAGACGAAGGAAGCTAAGA
AGAAGCCTGCTGCTGCTGCTGCTCCGAGGAAGAGAACCACTTCGTCTCATCCTCCTTACG
AAGAGATGATAAAGGATGCGATCGTGACGTTGAAGGAGAGGACCGGATCTAGCCAATACG
CGATTCAGAAGTTCATCGAAGAGAAGCAGAAGTCGCTTCCTCCTACTTTCAGGAAGCTTC
TCCTCGTCAATCTCAGGAGACTCGTCGCTTCGGGGAAGCTCGTCAAAGTCAAAGCCTCTT
TCAAGATTCCTTCTGCTTCAGCGGCTAAACCGGCTGCGGTTAAGAAGAAACCGGCTGCTT
CGGTTACTAAACCGAAGGGTAAAGCAGCTGCTGCTCCTGCTAAGGCCAAAGCAGCTGCTA
AAGGAACCAAGAAACCTGCTGCTGCTAAGCCTAAGGCAAAGGCTAAGACGACGACAACTA
AAACTGCTGCGAAGCCGAAAGTTACTGCGAAGCCTAAGACGAAGAGTGTAGCTGCGGTTT
CGAAGACTAAAGCTGTTGCTGCTAAGCCTAAGGCGAAGGAGAGACCTGCTAAAGCTTCGA
GGACTTCGACTAGGACGTCTCCAGGGAAGAAGGCTGCTCCTGCTAAGAAGGCAGCTCCAG
CTAAGAAAGCTGCTGCGCCTGCTAAGAAAGCTCCGGCTAAGAGTGCGAAGGTTAAGTCTC
CAGCGAAAAGAGCTTCGACGAGGAAGAAGTGAAGAAGAGGATGATGGTTTAGCTTCTCTT
AGGGTTAAAAGTCTTTTGTATAATTGAATCGTCTATGAAGGGGGCTTGTTTTTTTTTTAC
TTCCAAAGTTTTATCTTTGTCTTGGTTTCTTCTCGAAACCCTTTTATCTTGTAATTTTTG
GTTTGTTTGAAATTTTAATAGCTATATGTGATGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL38TF U 1
AF RR2FL38JQ C 347
BS 1 692 RR2FL38TF
BS 693 693 RR2FL38JQ
BS 694 697 RR2FL38TF
BS 698 698 RR2FL38JQ
BS 699 705 RR2FL38TF
BS 706 706 RR2FL38JQ
BS 707 725 RR2FL38TF
BS 726 726 RR2FL38JQ
BS 727 733 RR2FL38TF
BS 734 734 RR2FL38JQ
BS 735 746 RR2FL38TF
BS 747 1055 RR2FL38JQ

RD RR2FL38TF 746 0 0
GGATCTCAAAAACCAACAAAACAAAAAAAAACTTTTTCGAATCCCTAAAAAAGATGTCGA
CGGAGGAAGAACCCAAGGTCGTGGAGTCGGGAGACGCCGAAGCCGAAGCCGCAACGGTGA
CGACGACGGAGAAGAAACCTGCTGCTAAAGCTAAAGCTAAGAAGACGAAGGAAGCTAAGA
AGAAGCCTGCTGCTGCTGCTGCTCCGAGGAAGAGAACCACTTCGTCTCATCCTCCTTACG
AAGAGATGATAAAGGATGCGATCGTGACGTTGAAGGAGAGGACCGGATCTAGCCAATACG
CGATTCAGAAGTTCATCGAAGAGAAGCAGAAGTCGCTTCCTCCTACTTTCAGGAAGCTTC
TCCTCGTCAATCTCAGGAGACTCGTCGCTTCGGGGAAGCTCGTCAAAGTCAAAGCCTCTT
TCAAGATTCCTTCTGCTTCAGCGGCTAAACCGGCTGCGGTTAAGAAGAAACCGGCTGCTT
CGGTTACTAAACCGAAGGGTAAAGCAGCTGCTGCTCCTGCTAAGGCCAAAGCAGCTGCTA
AAGGAACCAAGAAACCTGCTGCTGCTAAGCCTAAGGCAAAGGCTAAGACGACGACAACTA
AAACTGCTGCGAAGCCGAAAGTTACTGCGAAGCCTAAGACGAAGAGTGTAGCTGCGGTTT
CGAAGACTAAAGCTGTTGCTGCTAAGCCTAAG*CGAATGAGAGAC*TGCTAAAGCTTCGA
GGACT*CGACTAG*ACGTCTCCAGGG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2FL38JQ 709 0 0
TTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTCAATCTCAGGAGACTCGTCGCTTCGGGGAAGCTCGTCAA
AGTCAAAGCCTCTTTCAAGATTCCTTCTGCTTCAGCGGCTAAACCGGCTGCGGTTAAGAA
GAAACCGGCTGCTTCGGTTACTAAACCGAAGGGTAAAGCAGCTGCTGCTCCTGCTAAGGC
CAAAGCAGCTGCTAAAGGAACCAAGAAACCTGCTGCTGCTAAGCCTAAGGCAAAGGCTAA
GACGACGACAACTAAAACTGCTGCGAAGCCGAAAGTTACTGCGAAGCCTAAGACGAAGAG
TGTAGCTGCGGTTTCGAAGACTAAAGCTGTTGCTGCTAAGCCTAAGGCGAAGGAGAGACC
TGCTAAAGCTTCGAGGACTTCGACTAGGACGTCTCCAGGGAAGAAGGCTGCTCCTGCTAA
GAAGGCAGCTCCAGCTAAGAAAGCTGCTGCGCCTGCTAAGAAAGCTCCGGCTAAGAGTGC
GAAGGTTAAGTCTCCAGCGAAAAGAGCTTCGACGAGGAAGAAGTGAAGAAGAGGATGATG
GTTTAGCTTCTCTTAGGGTTAAAAGTCTTTTGTATAATTGAATCGTCTATGAAGGGGGCT
TGTTTTTTTTTTACTTCCAAAGTTTTATCTTTGTCTTGGTTTCTTCTCGAAACCCTTTTA
TCTTGTAATTTTTGGTTTGTTTGAAATTTTAATAGCTATATGTGATGGT

QA 1 709 1 709
DS 



CO CL180Contig3 1021 13 9 U
GGCAAACCATCATCACATATAGCTATTAAAATTTCAAACAAACCAAAAATTACAAAGATA
AAAGGGTTTCGAGAAGAAACCAAAGACAAATATAACAAAAGATAAAACTTTGGAAGTAAA
AAAAAA*CAAGCCCCCTTCATAGACGATTCAATTATACAAAAGACTTTAACCCTAAGAGA
AGCTAAACCATCATCACTTCTTCCTCGTCGAAGCCCTTTTCGCCGGAGACTTCACCTTCG
CACTCTTAGCCGGAGCTTTCTTAGCCACAGGCGCAGCCGCTTTCTTAGCAGGAGCAGCCT
TCTTCCCTGGAGACGTCCTACTCGAAGTCCTCGAAGCTTTAGCAGGTCTCTCCTTCGCCT
TAGGCTTAGCAGCAACAGCTTTAGTCTTCGAAACCGCAGCTACACTCTTCGTCTTAGGCT
TCGCTGTAACTTTCGGCTTCGCAGCAGTTTTAGTTGTCGTCGTCTTTGCCTTAGGCTTAG
CAGCAGAAGCAGCAGGTTTCTTGGTCCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTCTTAGCAGGAG
CAGCAGCTGCTTTACCCTTCGGTTTAGTAACCGAAGCAGCCGGTTTCTTCTTAACCGCAG
CCGGTTTAGCCGCTGAAGCAGAAGGAATCTTGAAAGAGGCTTTGACTTTGACGAGCTTCC
CCGAAGCGACGAGTCTCCTGAGATTGACGAGAAGAAGCTTCCTGAAAGTAGGAGGAAGCG
ACTTCTGCTTCTCCTCGATGAACTTCTGAATCGCGTATTGGCTAGATCCGGTACTCTCCT
TCAACGTCACGATCGCATCCTTTATCATCTCTTCGTAAGGAGGATGAGACGAAGTGGTTC
TCTTCCTCGGAGCAGCAGCAGCAGCAG***GCTTCTTCTTAGCTTCCTTCGTCTTCTTAG
CTTTAGCTTTAGCAGGTTTCTTCTCCGTCGTCGTCACCGTGGCTTCGGCGGCTTCGGCGT
CTCCCGACTCCACGACCTTGGGTTCTTCCTCCGTCGACATCTTTTTTAGGGATTTGAAAA
A


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 
55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 30 65 70 70 70 70 5 70 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 

AF RR2G421JQ U 2
AF RR2GS77JQB U 1
AF RR2F846JQ U 2
AF RR2A903JQ U 2
AF RR2FP16JQ U 19
AF RR2AP40JQ U 2
AF RR2BI20JQ U 22
AF RR2BI20TF C 240
AF RR2AP40TF C 262
AF RR2FP16TF C 304
AF RR2G421TF C 355
AF RR2GE27TF C 304
AF RR2F846TF C 361
BS 1 67 RR2GS77JQB
BS 68 68 RR2A903JQ
BS 69 318 RR2GS77JQB
BS 319 320 RR2A903JQ
BS 321 619 RR2GS77JQB
BS 620 797 RR2A903JQ
BS 798 818 RR2AP40JQ
BS 819 1016 RR2BI20TF
BS 1017 1021 RR2FP16TF

RD RR2G421JQ 568 0 0
GCAAACCATCATCACATATAGCTATTAAAATTTCAAACAAACCAAAAATTACAAAGATAA
AAGGGTTTCGAGAAGAAACCAAAGACAAATATAACAAAAGATAAAACTTTGGAAGTAAAA
AAAAA*CAAGCCCCCTTCATAGACGATTCAATTATACAAAAGACTTTAACCCTAAGAGAA
GCTAAACCATCATCACTTCTTCCTCGTCGAAGCCCTTTTCGCCGGAGACTTCACCTTCGC
ACTCTTAGCCGGAGCTTTCTTAGCCACAGGCGCAGCCGCTTTCTTAGCAGGAGCAGCCTT
CTTCCCTGGAGACGTCCTACTCGAAGTCCTCGAAGCTTTAGCAGGTCTCTCCTTCGCCTT
AGGCTTAGCAGCAACAGCTTTAGTCTTCGAAACCGCGGCTACACTCTTCGTCTTAGGCTT
CGCTGTAACTTTCGGCTTCGCAGCAGTTT*AGTTGTCGTCGTCTTTGCCTTAGGCTTAGC
AGCAGAAGCAGCAGGTTTCTTGGTCCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTCTTAGCAGGAGC
AGCAGCTGCTTTACCCTTCGGTTTAGTA

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2GS77JQB 619 0 0
GGCAAACCATCATCACATATAGCTATTAAAATTTCAAACAAACCAAAAATTACAAAGATA
AAAGGGTCTCGAGAAGAAACCAAAGACAAATATAACAAAAGATAAAACTTTGGAAGTAAA
AAAAAA*CAAGCCCCCTTCATAGACGATTCAATTATACAAAAGACTTTAACCCTAAGAGA
AGCTAAACCATCATCACTTCTTCCTCGTCGAAGCCCTTTTCGCCGGAGACTTCACCTTCG
CACTCTTAGCCGGAGCTTTCTTAGCCACAGGCGCAGCCGCTTTCTTAGCAGGAGCAGCCT
TCTTCCCTGGAGACGTCC**CTCGAAGTCCTCGAAGCTTTAGCAGGTCTCTCCTTCGCCT
TAGGCTTAGCAGCAACAGCTTTAGTCTTCGAAACCGCAGCTACACTCTTCGTCTTAGGCT
TCGCTGTAACTTTCGGCTTCGCAGCAGTTTTAGTTGTCGTCGTCTTTGCCTTAGGCTTAG
CAGCAGAAGCAGCAGGTTTCTTGGTCCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTCTTAGCAGGAG
CAGCAGCTGCTTTACCCTTCGGTTTAGTAACCGAAGCAGCCGGTTTCTTCTTAACCGCAG
CCGGTTTAGCCGCTGAAGC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2F846JQ 693 0 0
GCAAACCCTCATCACATATAGCTATTAAAATTTCAAACAAACCAAAAATTACAAAGATAA
AAGGGTTTCGAGAAGAAACCAAAGACAAATATAACAAAAGATAAAACTTTGGAAGTAAAA
AAAAA*CAAGCCCCCTTCATAGACGATTCAATTATACAAAAGACTTTAACCCTAAGAGAA
GCTAAACCATCATCACTTCTTCCTCGTCGAAGCCCTTTTCGCCGGAGACTTCACCTTCGC
ACTCTTAGCCGGAGCTTTCTTAGCCACAGGCGCAGCCGCTTTCTTAGCAGGAGCAGCCTT
CTTCCCTGGAGACGTCCTACTCGAAGTCCTCGAAGCTTTAGCAGGTCTCTCCTTCGCCTT
AGGCTTAGCAGCAACAGCTTTAGTCTTCGAAACCGCAGCTACACTCTTCGTCTTAGGCTT
CGCTGTAACTTTCGGCTTCGCAGCAGTTTTAGTTGTCGTCGTCTTTGCCTTAGGCTTAGC
TGCAGAAGCAGCAGGTTTCTTGGTCCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTCTTAGCAGGAGC
AGCAGCTGCTTTACCCTTCGGTTTAGTAACCGAAGCAGCCGGTTTCTTCTTAACCGCAGC
CGGTTTAGCCGCTGAAGCAGAAGGAATCTTGAAAGAGGCTTTGACTTTGACGAGCTTCCC
CGAAGCGACGAGTCTCCTGAGATTGACGAGAAG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2A903JQ 796 0 0
GCAAACCATCATCACATATAGCTATTAAAATTTCAAACAAACCAAAAATTACAAAGATAA
AAGGGTTTCGAGAAGAAACCAAAGACAAATATAACAAAAGATAAAACTTTGGAAGTAAAA
AAAAA*CAAGCCCCCTTCATAGACGATTCAATTATACAAAAGACTTTAACCCTAAGAGAA
GCTAAACCATCATCACTTCTTCCTCGTCGAAGCCCTTTTCGCCGGAGACTTCACCTTCGC
ACTCTTAGCCGGAGCTTTCTTAGCCACAGGCGCAGCCGCTTTCTTAGCAGGAGCAGCCTT
CTTCCCTGGAGACGTCCTACTCGAAGTCCTCGAAGCTTTAGCAGGTCTCTCCTTCGCCTT
AGGCTTAGCAGCAACAGCTTTAGTCTTCGAAACCGCAGCTACACTCTTCGTCTTAGGCTT
CGCTGTAACTTTCGGCTTCGCAGCAGTTTTAGTTGTCGTCGTCTTTGCCTTAGGCTTAGC
AGCAGAAGCAGCAGGTTTCTTGGTCCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTCTTAGCAGGAGC
AGCAGCTGCTTTACCCTTCGGTTTAGTAACCGAAGCAGCCGGTTTCTTCTTAACCGCAGC
CGGTTTAGCCGCTGAAGCAGAAGGAATCTTGAAAGAGGCTTTGACTTTGACGAGCTTCCC
CGAAGCGACGAGTCTCCTGAGATTGACGAGAAGAAGCTTCCTGAAAGTAGGAGGAAGCGA
CTTCTGCTTCTCCTCGATGAACTTCTGAATCGCGTATTGGCTAGATCCGGTACTCTCCTT
CAACGTCACGATCGCA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2FP16JQ 763 0 0
ATAGCTATTAAAATTTCAAACAAACCAAAAATTACAAAGATAAAAGGGTTTCGAGAAGAA
ACCAAAGACAAATATAACAAAAGATAAAACTTTGGAAGTAAAAAAAAAACAAGCCCCCTT
CATAGACGATTCAATTATACAAAAGACTTTAACCCTAAGAGAAGCTAAACCATCATCACT
TCTTCCTCGTCGAAGCCCTTTTCGCCGGAGACCTCACCTTCGCACTCTTAGCCGGAGCTT
TCTTAGCCACAGGCGCAGCCGCTTTCTTAGCAGGAGCAGCCTTCTTCCCTGGAGACGTCC
TACTCGAAGTCCTCGAAGCTTTAGCAGGTCTCTCCTTCGCCTTAGGCTTAGCAGCAACAG
CTTTAGTCTTCGAAACCGCAGCTACACTCTTCGTCTTAGGCTTCGCTGTAACTTTCGGCT
TCGCAGCAGTTTTAGTTGTCGTCGTCTTTGCCTTAGGCTTAGCAGCAGAAGCAGCAGGTT
TCTTGGTCCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTCTTAGCAGGAGCAGCAGCTGCTTTACCCT
TCGGTTTAGTAACCGAAGCAGCCGGTTTCT*CTTAACCGCAGCCGGTTTAGCCGCTGAAG
CAGAAGGAATCTTGAAAGAGGCTTTGACTTTGACGAGCTTCCCCGAAGCGACGAGTCTCC
TGAGATTGACGAGAAGAAGCTTCCTGAAAGTAGGAGGAAGCGACTTCTGCTTCTCCTCGA
TGAACTTCTGAATCGCGTATTGGCTAGATCCGGTACTCTCCTT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2AP40JQ 821 0 0
GCAAACCATCATCACATATAGCTATTAAAATTTCAAACAAACCAAAAATTACAAAGATAA
AAGGGTTTCGAGAAGAAACCAAAGACAAATATAACAAAAGATAAAACTTTGGAAGTAAAA
AAAA**CAAGCCCCCTTCATAGACGATTCAATTATACAAAAGACTTTAACCCTAAGAGAA
GCTAAACCATCATCACTTCTTCCTCGTCGAAGCCCTTTTCGCCGGAGACTCCACCTTCGC
ACTCTTAGCCGGAGCTTTCTTAGCCACAGGCGCAGCCGCTTTCTTAGCAGGAGCAGCCTT
CTTCCCTGGAGACGTCCTACTCGAAGTCCTCGAAGCTTTAGCAGGTCTCTCCTTCGCCTT
AGGCTTAGCAGCAACAGCTTTAGTCTTCGAAACCGCAGCTACACTCTTCGTCTTAGGCTT
CGCTGTAACTTTCGGCTTCGCAGCAGTTTTAGTTGTCGTCGTCTTTGCCTTAGGCTTAGC
AGCAGAAGCAGCAGGTTTCTTGGTCCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTCTTAGCAGGAGC
AGCAGCTGCTTTACCCTTCGGTTTAGTAACCGAAGCAGCCGGTTTCTTCTTAACCGCAGC
CGGTTTAGCCGCTGAAGCAGAAGGAATCTTGAAAGAGGCTTTGACTTTGACGAGCTTCCC
CGAAGCGACGAGTCTCCTGAGATTGACGAGAAGAAGCTTCCTGAAAGTAGGAGGAAGCGA
CTTCTGCTTCTCCTCGATGAACTTCTGAATCGCGTATTGGCTAGATCCGGTACTCTCCTT
CAACGTCACGATCGCATCCTTTATCATCTCTTCGTAA
AGAG

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2BI20JQ 797 0 0
GCTATTAAAATTTCAAACAAACCAAAAATTACAAAGATAAAAGGGTTTCGAGAAGAAACC
AAAGACAAATATAACAAAAGATAAAACTTTGGAAGTAAAAAAAAA*CAAGCCCCCTTCAT
AGACGATTCAATTATACAAAAGACTTTAACCCTAAGAGAAGCTAAACCATCATCACTTCT
TCCTCGTCGAAGCCCTTTTCGCCGGAGACTTCACCTTCGCACTCTTAGCCGGAGCTTTCT
TAGCCACAGGCGCAGCCGCTTTCTTAGCAGGAGCAGCCTTCTTCCCTGGAGACGTCCTAC
TCGAAGTCCTCGAAGCTTTAGCAGGTCTCTCCTTCGCCTTAGGCTTAGCAGCAACAGCTT
TAGTCTTCGAAACCGCAGCTACACTCTTCGTCTTAGGCTTCGCTGTAACTTTCGGCTTCG
CAGCAGTTTTAGTTGTCGTCGTCTTTGCCTTAGGCTTAGCAGCAGAAGCAGCAGGTTTCT
TGGTCCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTCTTAGCAGGAGCAGCAGCTGCTTTACCCTTCG
GTTTAGTAACCGAAGCAGCCGGTTTCTTCTTAACCGCAGCCGGTTTAGCCGCTGAAGCAG
AAGGAATCTTGAAAGAGGCTTTGACTTTGACGAGCTTCCCCGAAGCGACGAGTCTCCTGA
GGTTGACGAGAAGAAGCTTCCTGAAAGTAGGAGGAAGCGACTTCTGCTTCTCCTCGATGA
ACTTCTGAATCGCGTATTGGCTAGATCCGGTACTCTCCTTCAACGTCACGATCGCATCCT
TTATCATCTCTTCGTAA

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2BI20TF 777 0 0
GCACTCTTAGCCGGAGCTTTCTTAGCCACAGGCGCAGCCGCTTTCTTAGCAGGAGCAGCT
TTCTTCCCTGGAGACGTCCTACTCGAAGTCCTCGAAGCTTTAGCAGGTCTCTCCTTCGCT
TTAGGCTTAGCAGCAACAGCTTTAGTCTTCGAAACCGCAGCTACACTCTTCGTCTTAGGC
TTCGCTGTAACTTTCGGCTTCGCAGCAGTTTTAGTTGTCGTCGTCTTTGCCTTAGGCTTA
GCAGCAGAAGCAGCAGGTTTCTTGGTCCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTCTTAGCAGGA
GCAGCAGCTGCTTTACCCTTCGGTTTAGTAACCGAAGCAGCCGGTTTCTTCTTAACCGCA
GCCGGTTTAGCCGCTGAAGCAGAAGGAATCTTGAAAGAGGCTTTGACTTTGACGAGCTTC
CCCGAAGCGACGAGTCTCCTGAGGTTGACGAGAAGAAGCTTCCTGAAAGTAGGAGGAAGC
GACTTCTGCTTCTCCTCGATGAACTTCTGAATCGCGTATTGGCTAGATCCGGTACTCTCC
TTCAACGTCACGATCGCATCCTTTATCATCTCTTCGTAAGGAGGATGAGACGAAGTGGTT
CTCTTCCTCGGAGCAGCAGCAGCAGCAG***GCTTCTTCTTAGCTTCCTTCGTCTTCTTA
GCTTTAGCTTTAGCAGGTTTCTTCTCCGTCGTCGTCACCGTGGCTTCGGCGGCTTCGGCG
TCTCCCGACTCCACGACCTTGGGTTCTTCCTCCGTCGACATCTTTTTTAGGGATTTG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2AP40TF 755 0 0
TAGCCACAGGCGCAGCCGCTT*CTTAGCAGGAGCAGC*TTCTTCCCTGGAGACGTC*TAC
TCGAAGTCCTCGAAGCTTTAGCAGGTCTCTC*TTCGC*TTAGGCTTAGCAGCAACAGCTT
TAGTCTTCGAAACCGCAGCTACACTCTTCGTCTTAGGCTTCGCTGTAACTTTCGGCTTCG
CAGCAGTTTTAGTTGTCGTCGTCTTTGCCTTAGGCTTAGCAGCAGAAGCAGCAGGTTTCT
TGGTCCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTCTTAGCAGGAGCAGCAGCTGCTTTACCCTTCG
GTTTAGTAACCGAAGCAGCCGGTTTCTTCTTAACCGCAGCCGGTTTAGCCGCTGAAGCAG
AAGGAATCTTGAAAGAGGCTTTGACTTTGACGAGCTTCCCCGAAGCGACGAGTCTCCTGA
GATTGACGAGAAGAAGCTTCCTGAAAGTAGGAGGAAGCGACTTCTGCTTCTCCTCGATGA
ACTTCTGAATCGCGTATTGGCTAGATCCGGTACTCTCCTTCAACGTCACGATCGCATCCT
TTATCATCTCTTCGTAAGGAGGATGAGACGAAGTGGTTCTCTTCCTCGGAGCAGCAGCAG
CAGCAG***GCTTCTTCTTAGCTTCCTTCGTCTTCTTAGCTTTAGCTTTAGCAGGTTTCT
TCTCCGTCGTCGTCACCGTGGCTTAGGCGGCTTCGGCGTCTCCCGACTCCACGACCTTGG
GTTCTTCCTCCGTCGACATCTTTTTTAGGGATTTG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2FP16TF 718 0 0
TCCCTGGAGACGTC*TACTCGAAGTCCTCGAAGCTTTAGCAGGTCTCTC*TTCGC*TTAG
GCTTAGCAGCAACAGCTTTAGTCTTCGAAACCGCAGCTACACTCTTCGTCTTAGGCTTCG
CTGTAACTTTCGGCTTCGCAGCAGTTTTAGTTGTCGTCGTCTTTGCCTTAGGCTTAGCAG
CAGAAGCAGCAGGTTTCTTGGTCCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTCTTAGCAGGAGCAG
CAGCTGCTTTACCCTTCGGTTTAGTAACCGAAGCAGCCGGTTTCT*CTTAACCGCAGCCG
GTTTAGCCGCTGAAGCAGAAGGAATCTTGAAAGAGGCTTTGACTTTGACGAGCTTCCCCG
AAGCGACGAGTCTCCTGAGATTGACGAGAAGAAGCTTCCTGAAAGTAGGAGGAAGCGACT
TCTGCTTCTCCTCGATGAACTTCTGAATCGCGTATTGGCTAGATCCGGTACTCTCCTTCA
ACGTCACGATCGCATCCTTTATCATCTCTTCGTAAGGAGGATGAGACGAAGTGGTTCTCT
TCCTCGGAGCAGCAGCAGCAG******GCTTCTTCTTAGCTTCCTTCGTCTTCTTAGCTT
TAGCTTTAGCAGGTTTCTTCTCCGTCGTCGTCACCGTGGCTTCGGCGGCTTCGGCGTCTC
CCGACTCCACGACCTTGGGTTCTTCCTCCGTCGACATCTTTTTTAGGGATTTGAAAAA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2G421TF 667 0 0
TCGC*TTAGGCTTAGCAGCAACAGCTTTAGTCTTCGAAACCGCGGCTACACTCTTCGTCT
TAGGCTTCGCTGTAACTTTCGGCTTCGCAGCAGTTT*AGTTGTCGTCGTCTTTGCCTTAG
GCTTAGCAGCAGAAGCAGCAGGTTTCTTGGTCCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTCTTAG
CAGGAGCAGCAGCTGCTTTACCCTTCGGTTTAGTAACCGAAGCAGCCGGTTTCTTCTTAA
CCGCAGCCGGTTTAGCCGCTGAAGCAGAAGGAATCTTGAAAGAGGCTTTGACTTTGACGA
GCTTCCCCGAAGCGACGAGTCTCCTGAGATTGACGAGAAGAAGCTTCCTGAAAGTAGGAG
GAAGCGACTTCTGCTTCTCCTCGATGAACTTCTGAATCGCGTATTGGCTAGATCCGGTAC
TCTCCTTCAACGTCGCGATCGCATCCTTTATCATCTCTTCGTAAGGAGGATGAGACGAAG
TGGTTCTCTTCCTCGGAGCAGCAGCAGCAGCAG***GCTTCTTCTTAGCTTCCTTCGTCT
TCTTAGCTTTAGCTTTAGCAGGTTTCTTCTCCGTCGTCGTCACCGTGGCTTCGGCGGCTT
CGGCGTCTCCCGACTCCACGACCTTGGGTTCTTCCTCCGTCGACATCTTTTTTAGGGATT
TGAAAAA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2GE27TF 718 0 0
TCCCTGGAGACGTC*TACTCGAAGTCCTCGAAGCTTTAGCAG*TCTCTC*TTCGC*TTAG
GCTTAGCAGCAACAGCTTTAGTCTTCGAAACCGCAGCTACACTCTTCGTCTTAGGCTTCG
CTGTAACTTTCGGCTTCGCAGCAGTTTTAGTTGTCGTCGTCTTTGCCTTAGGCTTAGCAG
CAGAAGCAGCAGGTTTCTTGGTCCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTCTTAGCAGGAGCAG
CAGCTGCTTTACCCTTCGGTTTAGTAACCGAAGCAGCCGGTTTCTTCTTAACCGCAGCCG
GTTTAGCCGCTGAAGCAGAAGGAATTTTGAAAGAGGCTTTGACTTTGACGAGCTTCCCCG
AAGCGACGAGTCTCCTGAGATTGACGAGAAGAAGCTTCCTGAAAGTAGGAGGAAGCGACT
TCTGCTTCTCCTCGATGAACTTCTGAATCGCGTATTGGCTAGATCCGGTACTCTCCTTCA
ACGTCACGATCGCATCCTTTATCATCTCTTCGTAAGGAGGATGAGACGAAGTGGTTCTCT
TCCTCGGAGCAGCAGCAGCAGCAG***GCTTCTTCTTAGCTTCCTTCGTCTTCTTAGCTT
TAGCTTTAGCAGGTTTCTTCTCCGTCGTCGTCACCGTGGCTTCGGCGGCTTCGGCGTCTC
CCGACTCCATGACCTTGGGTTCTTCCTCCGTCGACATCTTTTTTAGGGATTTGAAAAA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2F846TF 661 0 0
TAGGCTTAGCAGCAACAGCTTTAGTCTTCGAAACCGCAGCTACACTCTTCGTCTTAGGCT
TCGCTGTAACTTTCGGCTTCGCAGCAGTTTTAGTTGTCGTCGTCTTTGCCTTAGGCTTAG
CTGCAGAAGCAGCAGGTTTCTTGGTCCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTCTTAGCAGGAG
CAGCAGCTGCTTTACCCTTCGGTTTAGTAACCGAAGCAGCCGGTTTCTTCTTAACCGCAG
CCGGTTTAGCCGCTGAAGCAGAAGGAATCTTGAAAGAGGCTTTGACTTTGACGAGCTTCC
CCGAAGCGACGAGTCTCCTGAGATTGACGAGAAGAAGCTTCCTGAAAGTAGGAGGAAGCG
ACTTCTGCTTCTCCTAGATGAACTTCTGAATCGCGTATTGGCTAGATCCGGTACTCTCCT
TCAACGTCACGATCGCATCCTTTATCATCTCTTCGTAAGGAGGATGAGACGAAGTGGTTC
TCTTCCTCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGCTTCTTCTTAGCTTCCTTCGTCTTCTTAG
CTTTAGCTTTAGCAGGTTTCTTCTCCGTCGTCGTCACCGTGACTTCGGCGGCTTCGGCGT
CTCCCGACTCCACGACCTTGGGTTCTTCCTCCGTCGACATCTTTTTTAGGGATTTGAAAA
A

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 14

CO CL181Contig1 1513 14 33 U
GGAGTGCGCCATTACGGCCGGGGATCTTACTGTTTTCGAAGAAGGTGCGATCTGAGTTTC
TAGCGATGGCGAAACTAAACCCTAGCTTCATCTCTCTGATCCTTATCGGCCTCGTCGCGA
TCGCATCTGCTAGTGTTATCTTCGAGGAGAAATTCGACGATGGATGGGAGAAGAGATGGG
TAAAATCTGACTGGAAGAAAGATGACAACACTGCTGGGGAATGGAGCCACACTGCTGGCA
ACTGGTCTGGTGACGCTAACGACAAAGGTATCCAGACTAGCGAGGACTACAGATTCTACG
CCATTTCAGCTGAGTTCCCTGAGTTCAGCAACAAGGACAAGACCCTTGTGTTCCAATTCT
CTGTCAAGCACGAGCAGAAGCTGGACTGTGGTGGTGGATACATGAAGCTTCTTAGTGGTG
ATGTTGACCAGAAGAAATTCGGTGGAGACACTCCTTACAGCATCATGTTTGGTCCTGATA
TCTGTGGCTACGACACCAAGAAAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGGAACAAACCATC
TGATCAAGAAGGAGGTTCCATGTGAGACTGATCAGCTCACGCATGTCTACACGTTCATCC
TCCGCCCAGATGCTACTTACAGTATTCTTATCGATAACGTTGAGAAGCAAACTGGTAGCC
TCTACTCTGACTGGGATCTCCTCCC*AGCCAAGAAGATTAAGGATCCAAGCGCCAAGAAG
CCTGAGGACTGGGATGACAAAGAGTACATTCCTGATCCTGAAGACACAAAGCCAGCTGGA
TATGATGACATCCCAAAGGAGATCCCAGACGCTGATGCAAAGAAGCCTGAGGACTGGGAT
GATGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCCCCTACCATTCCCAACCCCGAGTACAACGGTGAA
TGGAAGCCCAAGAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGGGCAAATGGAAGGCTCCAATGATT
GACAACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTATGTTGGA
GTAGAGTTGTGGCAGGTGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTATTAGTCTGCGATGAC
CCTGAGTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCAAGGATGCTGAGAAA
GCAGCATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAATCAAAGGATGCTCCTGCT
GCTGATTCTGATGCTGAGGATGAACAAGAGGACGATGACCATGAAGGAGATGATTCCGAC
ACTGAATCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAACCTCCTCAGACAAAGATGATGCCGCC
CATGACGAGCTCTAAGCCGAAGAAGGTGGAGATTATGAAGGATCCAACAAGTTTTCAGAG
TCGTATTTTGTTTTTCTTTCTTTTAAAGAATTATTTTAGCGCTAGTTTGTTGGGGATGTT
AGTACTTTTTTAGCTACCAAAAAAAA*GAATATGGTGAAATGATGGGCGTGGCAGCTTCT
TTTAGACTTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 15 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 30 45 45 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 10 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 15 15 15 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 10 10 10 10 

AF RR2GO08TF U 1
AF RR2GI36TF U 23
AF RR2FK65TF U 22
AF RR2AV54TF U 22
AF RR2A734TF U 22
AF RR2AJ32TF U 470
AF RR2AD87TF U 555
AF RR2GA06JQ C 911
AF RR2GA06TF U 911
AF RR2FV67TF U 796
AF RR2AJ32JQ C 758
AF RR2AV54JQ C 589
AF RR2GO08JQ C 830
AF RR2GI36JQB C 835
BS 1 230 RR2GO08TF
BS 231 231 RR2A734TF
BS 232 295 RR2GO08TF
BS 296 296 RR2A734TF
BS 297 399 RR2GO08TF
BS 400 403 RR2A734TF
BS 404 439 RR2GO08TF
BS 440 440 RR2A734TF
BS 441 691 RR2GO08TF
BS 692 831 RR2A734TF
BS 832 832 RR2AJ32TF
BS 833 845 RR2A734TF
BS 846 1181 RR2AJ32TF
BS 1182 1195 RR2AD87TF
BS 1196 1196 RR2GA06TF
BS 1197 1197 RR2FV67TF
BS 1198 1229 RR2AD87TF
BS 1230 1230 RR2GA06TF
BS 1231 1245 RR2AD87TF
BS 1246 1246 RR2GA06TF
BS 1247 1253 RR2AD87TF
BS 1254 1254 RR2FV67TF
BS 1255 1307 RR2AD87TF
BS 1308 1308 RR2FV67TF
BS 1309 1339 RR2AD87TF
BS 1340 1342 RR2GA06TF
BS 1343 1345 RR2FV67TF
BS 1346 1465 RR2GA06TF
BS 1466 1466 RR2FV67TF
BS 1467 1477 RR2GA06TF
BS 1478 1508 RR2AV54JQ
BS 1509 1509 RR2GO08JQ
BS 1510 1513 RR2GI36JQB

RD RR2GO08TF 696 0 0
GGAGTGCGCCATTACGGCCGGGGATCTTACTGTTTTCGAAGAAGGTGCGATCTGAGTTTC
TAGCGATGGCGAAACTAAACCCTAGCTTCATCTCTCTGATCCTTATCGGCCTCGTCGCGA
TCGCATCTGCTAGTGTTATCTTCGAGGAGAAATTCGACGATGGATGGGAGAAGAGATGGG
TAAAATCTGACTGGAAGAAAGATGACAACACTGCTGGGGAATGGAGCCACGCTGCTGGCA
ACTGGTCTGGTGACGCTAACGACAAAGGTATCCAGACTAGCGAGGACTACAGATTTTACG
CCATTTCAGCTGAGTTCCCTGAGTTCAGCAACAAGGACAAGACCCTTGTGTTCCAATTCT
CTGTCAAGCACGAGCAGAAGCTGGACTGTGGTGGTGGAT****GAAGCTTCTTAGTGGTG
ATGTTGACCAGAAGAAATTTGGTGGAGACACTCCTTACAGCATCATGTTTGGTCCTGATA
TCTGTGGCTACGACACCAAGAAAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGGAACAAACCATC
TGATCAAGAAGGAGGTTCCATGTGAGACTGATCAGCTCACGCATGTCTACACGTTCATCC
TCCGCCCAGATGCTACTTACAGTATTCTTATCGATAACGTTGAGAAGCAAACTGGTAGCC
TCTACTCTGACTGGGATCTCCTCCC*AGCCA
GAAGA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2GI36TF 675 0 0
GATCTTACTGTTTTCGAAGAAGGTGCGATCTGAGTTTCTAGCGATGGCGAAACTAAACCC
TAGCTTCATCTCTCTGATCCTTATCGGCCTCGTCGCGATCGCATCTGCTAGTGTTATCTT
CGAGGAGAAATTCGACGATGGATGGGAGAAGAGATGGGTAAAATCTGACTGGAAGAAAGA
TGACAACACTGCTGGGGAATGGAGCCACACTGCTGGCAACTGGTCTGGTGACGCTAACGA
CAAAGGTATCCAGACTAGCGAGGACTACAGATTCTACGCCATTTCAGCTGAGTTCCCTGA
GTTCAGCAACAAGGACAAGACCCTTGTGTTCCAATTCTCTGTCAAGCACGAGCAGAAGCT
GGACTGTGGTGGTGGATACATGAAGCTTCTTAGTGGTGATGTTGACCAGAAGAAATTCGG
TGGAGACACTCCTTACAGCATCATGTTTGGTCCTGATATCTGTGGCTACGACACCAAGAA
AGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGGAACAAACCATCTGATCAAGAAGGAGGCTCCATG
TGAGACTGATCAGCTCACGCATGTCTACACGTTCATCCTCCGCCCAGATGCTACTTACAG
TATTCTTATCGATAACGTTGAGAAGCAAACTGGTAGCCTCTACTCTGACTGGGATCTCCT
CCC*AGCCAAGAAGA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2FK65TF 724 0 0
GGATCTTACTGTTTTCGAAGAAGGTGCGATCTGAGTTTCTAGCGATGGCGAAACTAAACC
CTAGCTTCATCTCTCTGATCCTTATCGGCCTCGTCGCGATCGCATCTGCTAGTGTTATCT
TCGAGGAGAAATTCGACGATGGATGGGAGAAGAGATGGGTAAAATCTGACTGGAAGAAAG
ATGACAACACTGCTGGGGAATGGAGCCACACTGCTGGCAACTGGTCTGGTGACGCTAACG
ACAAAGGTATCCAGACTAGCGAGGACTACAGATTCTACGCCATTTCAGCTGAGTTCCCTG
AGTTCAGCAACAAGGACAAGACCCTTGTGTTCCAATTCTCTGTCAAGCACGAGCAGAAGC
TGGACTGTGGTGGTGGATACATGAAGCTTCTTAGTGGTGATGTTGACCAGAAGAAATTCG
GTGGAGACACTCCTTACAGCATCATGTTTGGTCCTGATATCTGTGGCTACGACACCAAGA
AAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGGAACAAACCATCTGATCAAGAAGGAGGTTCCAT
GTGAGACTGATCAGCTCACGCATGTCTACACGTTCATCCTC*GCCCAGATGCTACTTACA
GTATTCTTATCGATAACGTTGAGAAGCAAACTGGTAGCCTCTACTCTGACTGGGATCTCC
TCCC*AGCCAAGAAGATTAT*GATCCAAGCGCCAAGAAGCCTGAG*ACTGGGATGACAA
GAGTA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2AV54TF 771 0 0
GGATCTTACTGTTTTCGAAGAAGGTGCGATCTGAGTTTCTAGCGATGGCGAAACTAAACC
CTAGCTTCATCTCTCTGATCCTTATCGGCCTCGTCGCGATCGCATCTGCTAGTGTTATCT
TCGAGGAGAAATTCGACGATGGATGGGAGAAGAGATGGGTAAAATCTGACTGGAAGAAAG
ATGACAACACTGCTGGGGAATGGAGCCACACTGCTGGCAACTGGTCTGGTGACGCTAACG
ACAAAGGTATCCAGACTAGCGAGGACTACAGATTCTACGCCATTTCAGCTGAGTTCCCTG
AGTTCAGCAACAAGGACAAGACCCTTGTGTTCCAATTCTCTGTCAAGCACGAGCAGAAGC
TGGACTGTGGTGGTGGATACATGAAGCTTCTTAGTGGTGATGTTGACCAGAAGAAATTCG
GTGGAGACACTCCTTACAGCATCATGTTTGGTCCTGATATCTGTGGCTACGACACCAAGA
AAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGGAACAAACCATCTGATCAAGAAGGAGGTTCCAT
GTGAGACTGATCAGCTCACGCATGTCTACACGTTCATCCTCCGCCCAGATGCTACTTACA
GTATTCTTATCGATAACGTTGAGAAGCAAACTGGTAGCCTCTACTCTGACTGGGATCTCC
TCCC*AGCCAAGAAGATTAAAGATCCAAGCGCCAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGACAAA
GAGTACATTCCTGATCCTGAAGACACAAAGCCAGCTGGATATGATGACATC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2A734TF 826 0 0
GGATCTTACTGTTTTCGAGGAAGGTGCGATCTGAGTTTCTAGCGATGGCGAAACTAAACC
CTAACTTCATCTCTCTGATTCTTATCGGCCTCGTCGCGATCGCATCTGCTAGCATTATCT
TCGAGGAGAAATTCGACGATGGATGGGAGAAGAGATGGGTAAAATCTGACTGGAAGAAAG
ATGACAACACTGCTGGAGAATGGAGCCACACTGCTGGGAACTGGTCTGGTGACGCTAACG
ACAAAGGTATCCAGACTAGCGAGGACTACAGATTCTACGCCATTTCCGCTGAGTTCCCTG
AGTTCAGCAACAAGGACAAGACCCTTGTGTTCCAATTCTCCGTCAAGCACGAGCAGAAGC
TGGACTGTGGTGGTGGATACATGAAGCTTCTCAGTGGTGATGTTGACCAGAAGAAATTCG
GTGGAGACACTCCTTACAGCATCATGTTTGGTCCTGATATCTGTGGCTACGACACCAAGA
AAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGGAACAAACCATCTGATCAAGAAGGAGGTTCCAT
GTGAGACTGATCAGCTCACACACGTCTACACGTTCATCCTCCGCCCAGATGCTACTTACA
GTATTCTTATCGATAACGTTGAGAAGCAAACTGGTAGCCTCTACTCTGATTGGGATCTCC
TCCC*AGCCAAGAAGATTAAGGATCCAAGCGCCAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGACAAA
GAGTACATTCCTGATCCTGAAGACACAAAGCCAGCTGGATATGATGACATCCCAAAGGAG
ATCCCAGACGCTGATGCAAAGAAGCCTGAG*ACTGGGATGATGA
GA

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2AJ32TF 714 0 0
G
GGTCCTGATATCTGTGGCTACGACACCAAGAAAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGGA
ACAAACCATCTGATCAAGAAGGAGGTTCCATGTGAGACTGATCAGCTCACGCATGTCTAC
ACGTTCATCCTCCGCCCAGATGCTACTTACAGTATTCTTATCGATAACGTTGAGAAGCAA
ACTGGTAGCCTCTACTCTGACTGGGATCTCCTCCC*AGCCAAGAAGATTAAGGATCCAAG
CGCCAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGACAAAGAGTACATTCCTGATCCTGAAGACACAAA
GCCAGCTGGATATGATGACATCCCAAAGGAGATCCCAGACGCTGATGCAAAGAAGCCTGA
GGACTGGGATGATGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCCCCTACCATTCCCAACCCCGAGTA
CAACGGTGAATGGAAGCCCAAGAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGGGCAAATGGAAGGC
TCCAATGATTGACAACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAA
GTATGTTGGAGTAGAGTTGTGGCAGGTGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTATTAGT
CTGCGATGACCCTGAGTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCAAGGA
TGCTGAGAAAGCAGCATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGA
TC

QA 2 712 2 712
DS 

RD RR2AD87TF 785 0 0
GTTCCATGTGAGACTGATCAGCTCACACACGTCTACACGTTCATCCTCCGCCCAGATGCT
ACTTACAGTATTCTTATCGATAACGTTGAGAAGCAAACTGGTAGCCTCTACTCTGATTGG
GATCTCCTCCC*AGCCAAGAAGATTAAGGATCCAAGCGCCAAGAAGCCTGAGGACTGGGA
TGACAAAGAGTACATTCCTGATCCTGAAGACACAAAGCCAGCTGGATATGATGACATCCC
AAAGGAGATCCCAGACGCTAATGCAAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGATGAAGAAGATGG
TGAGTGGACTGCCCCTACCATTCCCAACCCCGAGTACAACGGTGAATGGAAGCCCAAGAA
AATCAAGAACCCTAACTACAAGGGCAAATGGAAGGCTCCAATGATTGACAACCCTGACTT
CAAGGGTGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTATGTTGGAGTAGAGTTGTGGCA
GGTGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTCTTAGTCTGCGATGACCCTGAGTATGCTAA
GAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCAAGGATGCTGAGAAAGCAGCATTCGACGA
AGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAATCAAAGGATGCTCTCGCTGCTGATTCTGATGC
TGAGGATGAACAAGACGACGATGACCATGAAAGAGATGAATCCGACACTGAATCAAAAAC
TGAGGAAACCAAGGAAGAAACCTCCTCAGACAA*GATGATGCCGCCCATGACGAGCTCTA
AGCCG

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2GA06JQ 567 0 0
G
GAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGGGCAAATGGAAGGCTCCAATGATTGACAACCCTGA
CTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTATGTTGGAGTAGAGTTGTG
GCAGGTGAAATCAGGATCATTGTTCGACAATGTCTTAGTCTGCGATGACCCTGAGTACGC
TAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAGGCTCAAGGATGCTGAGAAAGCAGCATTCGA
CGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAATCAAAGGATGCTCCCGCTGCTGATTCTGA
TGCTGAGGATGAACAAGAGGACGATGACCATGAAGGAGATGAATCCGACACTGAATCAAA
AACTGAGGAAACCAAGGAAGAAGCCTCCTCAGACAAGGATGATGCCGCCCATGACGAGCT
TTAAGCCGAAG***GTGGAGATTATGAAGGATCCAACAAGTTTTCAGAGTCGTATTTTGT
TTTTCTTTCTTTTAAAGAATTATTTTAGCGCTAGTTTGTTGGGGATGTTAGTACTTTTTT
AGCTACCAAAAAAA**GAATATGGTG

QA 2 567 2 567
DS 

RD RR2GA06TF 567 0 0
G
GAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGGGCAAATGGAAGGCTCCAATGATTGACAACCCTGA
CTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTATGTTGGAGTAGAGTTGTG
GCAGGTGAAATCAGGATCATTGTTCGACAATGTCTTAGTCTGCGATGACCCTGAGTACGC
TAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAGGCTCAAGGATGCTGAGAAAGCAGCATTCGA
CGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAATCAAAGGATGCTCCCGCTGCTGATTCTGA
TGCTGAGGATGAACAAGAGGACGATGACCATGAAGGAGATGAATCCGACACTGAATCAAA
AACTGAGGAAACCAAGGAAGAAGCCTCCTCAGACAAGGATGATGCCGCCCATGACGAGCT
CTAAGCCGAAG***GTGGAGATTATGAAGGATCCAACAAGTTTTCAGAGTCGTATTTTGT
TTTTCTTTCTTTTAAAGAATTATTTTAGCGCTAGTTTGTTGGGGATGTTAGTACTTTTTT
AGCTACCAAAAAAA**GAATATGGTG

QA 2 567 2 567
DS 

RD RR2FV67TF 671 0 0
G
AGGAGATCCCAGACGCTGATGCAAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGATGAAGAAGATGGTG
AGTGGACTGCCCCTACCATTCCCAACCCCGAGTACAACGGTGAATGGAAGCCCAAGAAAA
TCAAGAACCCTAACTACAAGGGCAAATGGAAGGCTCCAATGATTGACAACCCTGACTTCA
AGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTATGTTGGAGTAGAGTTGTGGCAGG
TGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTATTAGTCTGCGATGACCCTGAGTACGCTAAGA
AGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCAAGGATGCTGAGAAAGCAGCATTCGACGAAG
CTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAATCAAAGGATGCTCCTGCTGCTGATTCTGATGCTG
AGGATGAACAAGAGGACGATGACCATGAAGGAGATGATTCCGACACTGAATCAAAAACTG
AGGAAACCAAGGAAGAAACCTCCTCAGACAAAGATGATGCCGCCCATGACGAGCTCTAAG
CCGAAGAAGGTGGAGATT**GAAGGATCCAACAAGTTTTCAGAGTCGTATTTTGTTTTTC
TTTCTTTTAAAGAATTATTTTAGCGCTAGTTTGTTGGGGATGTTAGTACTTTTTTAGCTA
CCAAAAAAAA

QA 2 671 2 671
DS 

RD RR2AJ32JQ 701 0 0
CTGAAGACACAAAGCCAGCTGGATATGATGACATCCCAAAGGAGATCCCAGACGCTGATG
CAAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGATGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCCCCTACCATTC
CCAACCCCGAGTACAACGGTGAATGGAAGCCCAAGAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGG
GCAAATGGAAGGCTCCAATGATTGACAACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATG
TCTTCAAATTTAAGTATGTTGGAGTAGAGTTGTGGCAGGTGAAATCTGGATCATTGTTCG
ACAATGTATTAGTCTGCGATGACCCTGAGTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGG
GAAAGCTCAAGGATGCTGAGAAAGCAGCATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAG
AGGAATCAAAGGATGCTCCTGCTGCTGATTCTGATGCTGAGGATGAACAAGAGGACGATG
ACCATGAAGGAGATGATTCCGACACTGAATCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAACCT
CCTCAGACAAAGATGATGCCGCCCATGACGAGCTTTAAGCCGAAGAAGGTGGAGATTATG
AAGGATCCAACAAGTTTTCAGAGTCGTATTTTGTTTTTCTTTCTTTTAAAGAATTATTTT
AGCGCTAGTTTGTTGGGGATGTTAGTACTTTTTTAGCTACC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2AV54JQ 920 0 0
ACACGTTCATCCTCCGCCCAGATGCTACTTACAGTATTCTTATCGATAACGTTGAGAAGC
AAACTGGTAGCCTCTACTCTGACTGGGATCTCCTCCCCAGCCAAGAAGATTAAGGATCCA
AGCGCCAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGACAAAGAGTACATTCCTGATCCTGAAGACACA
AAGCCAGCTGGATATGATGACATCCCAAAGGAGATCCCAGACGCTGATGCAAAGAAGCCT
GAGGACTGGGATGATGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCCCCTACCATTCCCAACCCCGAG
TACGACGGTGAATGGAAGCCCAAGAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGGGCAAATGGAAG
GCTCCAATGATTGACAACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTT
AAGTATGTTGGAGTAGAGTTGTGGCAGGTGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTATTA
GTCTGCGATGACCCTGAGTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCAAG
GATGCTGAGAAAGCAGCATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGGATCAAAG
GATGCTCCTGCTGCTGATTCTGATGCTGAGGATGAACAAGAGGACGATGACCATGAAGGA
GATGATTCCGACACTGAATCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAACCTCCTCAGACAAA
GATGATGCCGCCCATGACGAGCTCTAAGCCGAAGAAGGTGGAGATTATGAAGGATCCAAC
AAGTTTTCAGAGTCGTATTTTGTTTTTCTTTCTTTTAAAGAATTATTTTAGCGCTAGTTT
GTTGGGGATGTTAGTACTTTTTTAGCTACCAAAAAAAA*GAATATGGTGAAATGATGGGC
GTGGCAGCTTCTTTTAGACT

QA 1 920 1 920
DS 

RD RR2GO08JQ 684 0 0
AGGACTGGGATGATGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCCCCTACCATTCCCAACCCCGAGT
ACAACGGTGAATGGAAGCCCAAGAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGGGCAAATGGAAGG
CTCCAATGATTGACAACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTA
AGTATGTTGGAGTAGAGTTGTGGCAGGTGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTATTAG
TTTGCGATGACCCTGAGTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCAAGG
ATGCTGAGAAAGCAGCATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAATCAAAGG
ATGCTCCTGCTGCTGATTCT*ATGCTGAGGATGAACAAGAGGACGATGACCATGAAGGAG
ATGATTCCGACACTGAATCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAACCTCCTCAGACAAAG
ATGATGCCGCCCATGACGAGCTTTAAGCCGAAGAAGGTGGAGATTATGAAGGATCCAACA
AGTTTTCAGAGTCGTATTTTGTTTTTCTTTCTTTTAAAGAATTATTTTAGCGCTAGTTTG
TTGGGGATGTTAGTACTTTTTTAGCTACCAAAAAAAAAGAATATGGTGAAATGATGGGCG
TGGCAGCTTCTTTTAGACTT
TCAC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2GI36JQB 679 0 0
TGGGATGATGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCCCCTACCATTCCCAACCCCGAGTACAAC
GGTGAATGGAAGCCCAAGAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGGGCAAATGGAAGGCTCCA
ATGATTGACAACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTAT
GTTGGAGTAGAGTTGTGGCAGGTGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTATTAGTCTGC
GATGACCCTGAGTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCAAGGATGCT
GAGAAAGCAGCATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAATCAAAGGATGCT
CCTGCTGCTGATTCTGATGCTGAGGATGAACAAGAGGACGATGACCATGAAGGAGATGAT
TCCGACACTGAATCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAACCTCCTCAGACAAAGATGAT
GCCGCCCATGACGAGCTTTAAGCCGAAGAAGGTG*AGATTATGAAGGATCCAACAAGTTT
TCAGAGTCGTATTTTGTTTTTCTTTCTTTTAAAGAATTATTTTAGCGCTAGTTTGTTGGG
GATGTTAGTACTTTTTTAGCTACCAAAAAAAAAGAATATGGTGAAATGATGGGCGTGGCA
GCTTCTTTTAGACTTTCAC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 13

CO CL182Contig1 538 13 8 U
CTCAAAGACGGTATTCATGTTCTATTTCACTCCCCGATGGGGGTTCTTTTCACCCTTCCC
TCACGGTACTACTTCGCTATCGGTCACCCAGGAGTATTTAGCCTTGCAAGGTGGTCCTTG
CTGATTCACACGGGATTCCACGTGCCCCATGCTACTCGGGTCAGAGCATAAGCTAGTGAT
GCTTTCGGCTACTGGACTCTCGCCATCTAGGGTGCGGCACTCCACCGCTTCGCCTAGCAG
CACGACGCTTTTATTGCTCTCCCACAACCCCGTTTTCACGGTTTAGGCTGCTCCCATTTC
GCTCGCCGCTACTACGGGAATCGCTTTTGCTTTCTTTTCCTCTGGCTACTAAGATGTTTC
AGTTCGCCAGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTCAGCAGCAGTTCAAAAGGTTAACCT
ATTCGGGAATCTCCGGATCTACGCTTATTTTCAACTCCCCGAAGCATTTCGTCGCTTACT
ACGCCCTTCCTCGTCTCTGGGTGCCTAGGTATCCACCGTAAGCCTTTCCTCGTTTGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 25 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 40 75 75 75 75 75 75 75 
45 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 10 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 

AF RR2BR76JQ U 1
AF RR2BR76TF C 1
AF RR2A173TF C 51
AF RR2C132JQ U 339
AF RR2C132TF C 339
AF RR2EX25JQ U 167
AF RR2BF76JQ U 51
AF RR2BF76TF C 51
AF RR2BI81JQ U 51
AF RR2FN47JQ U 90
AF RR2BI81TF C 51
AF RR2FN47TF C 51
AF RR2A173JQ U 123
BS 1 162 RR2BR76JQ
BS 163 163 RR2BF76JQ
BS 164 352 RR2BR76JQ
BS 353 353 RR2C132JQ
BS 354 360 RR2BR76JQ
BS 361 361 RR2C132JQ
BS 362 461 RR2BR76JQ
BS 462 538 RR2C132JQ

RD RR2BR76JQ 462 0 0
CTCAAAGACGGTATTCATGTTCTATTTCACTCCCCGATGGGGGTTCTTTTCACCCTTCCC
TCACGGTACTACTTCGCTATCGGTCACCCAGGAGTATTTAGCCTTGCAAGGTGGTCCTTG
CTGATTCACACGGGATTCCACGTGCCCCATGCTACTCGGGTCGGAGCATAAGCTAGTGAT
GCTTTCGGCTACTGGACTCTCGCCATCTAGGGTGCGGCACTCCACCGCTTCGCCTAGCAG
CACGACGCTTTTATTGCTCTCCCACAACCCCGTTTTCACGGTTTAGGCTGCTCCCATTTC
GCTCGCCGCTACTACGGGAATCGCTTTTGCTTTCTTTTCCTCTGGCTACTAAAATGTTTC
GGTTCGCCAGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTCAGCAGCAGTTCAAAAGGTTAACCT
ATTCGGGAATCTCCGGATCTACGCTTATTTTCAACTCCCCG
C

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR2BR76TF 434 0 0
CTCAAAGACGGTATTCATGTTCTATTTCACTCCCCGATGGGGGTTCTTTTCACCCTTCCC
TCACGGTACTACTTCGCTATCGGTCACCCAGGAGTATTTAGCCTTGCAAGGTGGTCCTTG
CTGATTCACACGGGATTCCACGTGCCCCATGCTACTCGGGTCGGAGCATAAGCTAGTGAT
GCTTTCGGCTACTGGACTCTCGCCATCTAGGGTGCGGCACTCCACCGCTTCGCCTAGCAG
CACGACGCTTTTATTGCTCTCCCACAACCCCGTTTTCACGGTTTAGGCTGCTCCCATTTC
GCTCGCCGCTACTACGGGAATCGCTTTTGCTTTCTTTTCCTCTGGCTACTAAGATGTTTC
GGTTCGCCAGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTCAGCAGCAGTTCAAAAGGTTAACCT
ATTCGGGAATCTCC

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR2A173TF 488 0 0
CACCCTTCCCTCACGGTACTACTTCGCTATCGGTCACCCAGGAGTATTTAGCCTTGCAAG
GTGGTCCTTGCTGATTCACACAGGATTCCACGTGCCCCATGCTACTCGGGTCAGAGCATA
AGCTAGTGATGCTTTCGGCTACTGGACTCTCGCCATCTAGGGTGCGGCACTCCACCGCTT
CGCCTAGCAGCACGACGCTTTTATTGCTCTCCCACAACCCCGTTTTCACGGTTTAGGCTG
CTCCCATTTCGCTCGCCGCTACTACGGGAATCGCTTTTGCTTTCTTTTCCTCTGGCTACT
AAGATGTTTCAGTTCGCCAGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTCAGCAGCAGTTCAAA
AGGTTAACCTATTCGGGAATCTCCGGATCTACGCTTATTTTCAACTCCCCGAAGCATTTC
GTCGCTTACTACGCCCTTCCTCGTCTCTGGGTGCCTAGGTATCCACCGTAAGCCTTTCCT
CGTTTGAC

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2C132JQ 200 0 0
CCTCTGGCTACTAAGATGTTTCAGTTCGCCAGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTCAG
CAGCAGTTCAAAAGGTTAACCTATTCGGGAATCTCCGGATCTACGCTTATTTTCAACTCC
CCGAAGCATTTCGTCGCTTACTACGCCCTTCCTCGTCTCTGGGTGCCTAGGTATCCACCG
TAAGCCTTTCCTCGTTTGAC

QA 1 200 1 200
DS 

RD RR2C132TF 200 0 0
CCTCTGGCTACTAAGATGTTTCAGTTCGCCAGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTCAG
CAGCAGTTCAAAAGGTTAACCTATTCGGGAATCTCCGGATCTACGCTTATTTTCAACTCC
CCGAAGCATTTCGTCGCTTACTACGCCCTTCCTCGTCTCTGGGTGCCTAGGTATCCACCG
TAAGCCTTTCCTCGTTTGAC

QA 1 200 1 200
DS 

RD RR2EX25JQ 354 0 0
CATAAGCTAGTGATGCTTTCGGCTACTGGACTCTCGCCATCTAGGGTGCGGCACTCCACC
GCTTCGCCTAGCAGCACGACGCTTTTATTGCTCTCCCACAACCCCGTTTTCACGGTTTAG
GCTGCTCCCATTTCGCTCGCCGCTACTACGGGAATCGCTTTTGCTTTCTTTTCCTCTGGC
TACTAAGATGTTTCAGTTCGCCAGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTCAGCAGCAGTT
CAAAAGGTTAACCTATTCGGGAATCTCCGGATCTACGCTTATTTTCAACTCCCCGAAGCA
TTTCGTCGCTTACTACGCCCTTCCTCGTCTCTGGGTGCCTAGGTATCCACCGTA

QA 1 354 1 354
DS 

RD RR2BF76JQ 486 0 0
CATCTTTA
CCTCGCGGTACTACTTCGCTATCGGCCACCCAGGAGTATTTAGCCTTGCAAGGTGGTCCT
TGCTGATTCACACGGGATTCCACGTGCCCCATGCTACTCGGGTCAGAGCATAAGCTAGTG
ATGCTTTCGGCTACTGGACTCTCGCCATCTAGGGTGCGGCACTCCACCGCTTCGCCTAGC
AGCACGACGCTTTTATTGCTCTCCCACAACCCCGTTTTCACGGTTTAGGCTGCTCCCATT
TCGCTCGCCGCTACTACGGGAATCGCTTTTGCTTTCTTTTCCTCTGGCTACTAAGATGTT
TCAGTTCGCCGGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTCAGCAGCAGTTCAAAAGGTTAAC
CTATTCGGGAATCTCCGGATCTACGCTTATTTTCAACTCCCCGAAGCATTTCGTCGCTTA
CTACGCCCTTCCTCGTCTCTGGGTGCCTAGGTATCCACCGTAAGCCTTT
TCGTTTGAC

QA 9 477 9 477
DS 

RD RR2BF76TF 486 0 0
CATCTTTA
CCTCGCGGTACTACTTCGCTATCGGCCACCCAGGAGTATTTAGCCTTGCAAGGTGGTCCT
TGCTGATTCACACGGGATTCCACGTGCCCCATGCTACTCGGGTCAGAGCATAAGCTAGTG
ATGCTTTCGGCTACTGGACTCTCGCCATCTAGGGTGCGGCACTCCACCGCTTCGCCTAGC
AGCACGACGCTTTTATTGCTCTCCCACAACCCCGTTTTCACGGTTTAGGCTGCTCCCATT
TCGCTCGCCGCTACTACGGGAATCGCTTTTGCTTTCTTTTCCTCTGGCTACTAAGATGTT
TCAGTTCGCCGGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTCAGCAGCAGTTCAAAAGGTTAAC
CTATTCGGGAATCTCCGGATCTACGCTTATTTTCAACTCCCCGAAGCATTTCGTCGCTTA
CTACGCCCTTCCTCGTCTCTGGGTGCCTAGGTATCCACCGTAAGCCTTT
TCGTTTGAC

QA 9 477 9 477
DS 

RD RR2BI81JQ 488 0 0
CACCCTTCCCTCACGGTACTACTTCGCTATCGGTCACCCAGGAGTATTTAGCCTTGCAAG
GTGGTCCTTGCTGATTCACACGGGATTCCACGTGCCCCATGCTACTCGGGTCAAAGCATA
AGCTAGTGATGCTTTCGGCTACTGGACTCTCGCCATCTAGGGTGCGGCACTCCACCGCTT
CGCCTAGCAGCACGACGCTTTTATTGCTCTCCCACAACCCCGTTTTCACGGTTTAGGCTG
CTCCCATTTCGCTCGCCGCTACTACGGGAATCGCTTTTGCTTTCTTTTCCTCTGGCTACT
AAGATGTTTCAGTTCGCCAGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTCAGCAGCAGTTCAAA
AGGTTAACCTATTCGGGAATCTCCGGATCTACGCTTATTTTCAACTCCCCGAAGCATTTC
GTCGCTTACTACGCCCTTCCTCGTCTCTGGGTGCCTAGGTATCCACCGTAAGACTTTCCT
CGTTTGAC

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2FN47JQ 449 0 0
AGGAGTATTTAGCCTTGCAAGGTGGTCCTTGCTGATTCACACGGGATTCCACGTGCCCCA
TGCTACTCGGGTCAAAGCATAAGCTAGTGATGCTTTCGGCTACTGGACTCTCGCCATCTA
GGGTGCGGCACTCCACCGCTTCGCCTAGCAGCACGACGCTTTTATTGCTCTCCCACAACC
CCGTTTTCACGGTTTAGGCTGCTCCCATTTCGCTCGCCGCTACTACGGGAATCGCTTTTG
CTTTCTTTTCCTCTGGCTACTAAAATGTTTCAGTTCGCCAGGTTGTCTCTTGCCTGCCCA
TGGATTCAGCAGCAGTTCAAAAGGTTAACCTATTCGGGAATCTCCGGATCTACGCTTATT
TTCAACTCCCCGAAGCATTTCGTCGCTTACTACGCCCTTCCTCGTCTCTGGGTGCCTAGG
TATCCACCGTAAGACTTTCCTCGTTTGAC

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2BI81TF 488 0 0
CACCCTTCCCTCACGGTACTACTTCGCTATCGGTCACCCAGGAGTATTTAGCCTTGCAAG
GTGGTCCTTGCTGATTCACACGGGATTCCACGTGCCCCATGCTACTCGGGTCAGAGCATA
AGCTAGTGATGCTTTCGGCTACTGGACTCTCGCCATCTAGGGTGCGGCACTCCACCGCTT
CGCCTAGCAGCACGACGCTTTTATTGCTCTCCCACAACCCCGTTTTCACGGTTTAGGCTG
CTCCCATTTCGCTCGCCGCTACTACGGGAATCGCTTTTGCTTTCTTTTCCTCTGGCTACT
AAGATGTTTCAGTTCGCCAGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTCAGCAGCAGTTCAAA
AGGTTAACCTATTCGGGAATCTCCGGATCTACGCTTATTTTCAACTCCCCGAAGCATTTC
GTCGCTTACTACGCCCTTCCTCGTCTCTGGGTGCCTAGGTATCCACCGTAAGACTTTCCT
CGTTTGAC

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2FN47TF 488 0 0
CACCCTTCCCTCACGGTACTACTTCGCTATCGGTCACCCAGGAGTATTTAGCCTTGCAAG
GTGGTCCTTGCTGATTCACACGGGATTCCACGTGCCCCATGCTACTCGGGTCAGAGCATA
AGCTAGTGATGCTTTCGGCTACTGGACTCTCGCCATCTAGGGTGCGGCACTCCACCGCTT
CGCCTAGCAGCACGACGCTTTTATTGCTCTCCCACAACCCCGTTTTCACGGTTTAGGCTG
CTCCCATTTCGCTCGCCGCTACTACGGGAATCGCTTTTGCTTTCTTTTCCTCTGGCTACT
AAGATGTTTCAGTTCGCCAGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTCAGCAGCAGTTCAAA
AGGTTAACCTATTCGGGAATCTCCGGATCTACGCTTATTTTCAACTCCCCGAAGCATTTC
GTCGCTTACTACGCCCTTCCTCGTCTCTGGGTGCCTAGGTATCCACCGTAAGACTTTCCT
CGTTTGAC

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2A173JQ 416 0 0
GATTCACACAGGATTCCACGTGCCCCATGCTACTCGGGTCAAAGCATAAGCTAGTGATGC
TTTCGGCTACTGGACTCTCGCCATCTAGGGGGCGGCACTCCACCGCTTCGCCTAGCAGCA
CGACGCTTTTATTGCTCTCCCACAACCCCGTTTTCACGGTTTAGGCTGCTCCCATTTCGC
TCGCCGCTACTACGGGAATCGCTTTTGCTTTCTTTTCCTCTGGCTACTAAAATGTTTCAG
TTCGCCAGGTTGTCTCTTGCCTGCCCATGGATTCAGCAGCAGTTCAAAAGGTTAACCTAT
TCGGGAATCTCCGGATCTACGCTTATTTTCAACTCCCCGAAGCATTTCGTCGCTTACTAC
GCCCTTCCTCGTCTCTGGGTGCCTAGGTATCCACCGTAAGCCTTTCCTCGTTTGAC

QA 1 416 1 416
DS 



AS 2 16

CO CL183Contig1 1266 11 51 U
CTCTCTATAAAATCAATCATCTATCTGCTTCTACTCGGAACATACATACACTTCACCAGC
GAGACAGTTAAAAGATCTAAGAACCTGCAA*AGCAAAAAA*TGGCGACCCTTAAGGTTCC
TTCTCATGTTCCTTCCCCATCTGAAGATGCTGAGCAACTGAAAAGCGCCTTTGAGGGATG
GGGTACAAACGAGGACTTGATCATATCAATTTTGGCACACAGAAGCGCTGAACAGAGGAA
GCTGATAAGGCAGACATACCATGAAGCCTGTGGAGAAGACCTTCTCAAGACTCTTGACAA
GGAACTCACTAGCGACTTCGAGAGAGCCATCTTGCTCTGGACCCTTGAACCCGGTGAGCG
TGATGCCTTGTTGGCCAATGAAGCTACCAAAAGATGGACTTCAAGCAACCAAGTGCTTAT
GGAAGTAGCCTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCTTCACGCTAGGCAAGCCTACCATGC
TCGTTACAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTCGCTCACCACACCACCGGTGACTTCAGAAA
GCTTTTGGTGTCTCTTGTTACCTCATACAGGTACGAAGGAGACGAGGTGAACATGACATT
GGCGAAGCAAGAAGCGAAGCTGATCCATGAGAAAATCAAGGACAAGCACTACAGCGATGA
GGATGTCATTAGGATTTTGTCCACAAGGAGCAGAGCTCAGATCAATGCTACTTTCAATCG
CTACCAAGATGAGCACGGCGAGGAAATCCTCAAGAGTCTTGAGGAAGGAGATGAGGACGA
CAAGTTCCTCGGACTGTTGAGGTCAACCATTCAATGCTTGACAAGACCAGAGCTCTACTT
TGTGGATGTTCTTCGTTCTGCTATCAACAAAACCGGAACAGACGAAGGAGCTCTCACGAG
AATTGTGACTACAAGAGCTGAGATTGACTTGAAGGTGATCGGAGAAGAGTATCAGAGGAG
GAACAGCATTCCACTGGAGAAGGCCGTTACCAAAGACACTCGCGGAGATTACGAGAAGAT
GCTCGTCGCACTTCTCGGTGAAGATGATGCTTAAATC*********CTCCTGAGAGAAAC
AAAAGCTTTTCT*GGCTTCTGTTTTCTCTCATCTCCCTCTCTCTTTCTTGTCTTGAAATC
GTTTGATTCTGTTCTTTGAAAACTTGTCTGTTGTTTCTGTTGTGTGTTTTGAGTTTCCAA
ATAATGCGCGAGAGAGAAAGAGAGTCTGTCTGTTAAGTTATATGAACTAATAAAAATAAT
GCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 30 30 30 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 15 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 45 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 50 40 15 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX58TF U 418
AF RR2BK60TF U 40
AF RR2DI06TF U 37
AF RR2GM87TF U 37
AF RR2BI68TF U 1
AF RR2FG61TF U 37
AF RR2FS91TF U 37
AF RR2A328TF U 44
AF RR2BS23TF U 443
AF RR2C581TF U 942
AF RR2BI68JQ C 484
BS 1 36 RR2BI68TF
BS 37 38 RR2DI06TF
BS 39 68 RR2BI68TF
BS 69 69 RR2DI06TF
BS 70 72 RR2BI68TF
BS 73 73 RR2DI06TF
BS 74 89 RR2BI68TF
BS 90 91 RR2DI06TF
BS 92 141 RR2BI68TF
BS 142 142 RR2DI06TF
BS 143 186 RR2BI68TF
BS 187 187 RR2DI06TF
BS 188 216 RR2BI68TF
BS 217 217 RR2DI06TF
BS 218 246 RR2BI68TF
BS 247 247 RR2DI06TF
BS 248 291 RR2BI68TF
BS 292 292 RR2BK60TF
BS 293 330 RR2BI68TF
BS 331 331 RR2DI06TF
BS 332 351 RR2BI68TF
BS 352 352 RR2DI06TF
BS 353 417 RR2BI68TF
BS 418 418 RR2DI06TF
BS 419 471 RR2BI68TF
BS 472 472 RR2DI06TF
BS 473 615 RR2BI68TF
BS 616 616 RR2DI06TF
BS 617 660 RR2BI68TF
BS 661 661 RR2DI06TF
BS 662 760 RR2BI68TF
BS 761 767 RR2FG61TF
BS 768 797 RR2FS91TF
BS 798 827 RR2A328TF
BS 828 985 RR2BS23TF
BS 986 986 RR2C581TF
BS 987 987 RR2BS23TF
BS 988 988 RR2C581TF
BS 989 1057 RR2BS23TF
BS 1058 1066 RR2C581TF
BS 1067 1070 RR2BS23TF
BS 1071 1071 RR2C581TF
BS 1072 1088 RR2BS23TF
BS 1089 1089 RR2C581TF
BS 1090 1092 RR2BS23TF
BS 1093 1093 RR2C581TF
BS 1094 1154 RR2BS23TF
BS 1155 1223 RR2C581TF
BS 1224 1224 RR2BI68JQ
BS 1225 1255 RR2C581TF
BS 1256 1266 RR2BI68JQ

RD RR2DX58TF 196 0 0
GG
TGGAAGTAGCCTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCTTCACGCTAGGCAAGCCTACCATG
CTCGTTACAAGAAGTCAATTGAAGAGGATGTCGCTCACCACACCACCGGTGACTTCAGAA
AGCTTTTGGTCTCTCTTGTTACCGCATACAGGTACGAAGGAGACGAGGTGAACATGACAT
TGGCTAAGCAAGAA

QA 3 196 3 196
DS 

RD RR2BK60TF 644 0 0
GG
ATACATACACTTCACCAGCGAGACAGTGAAA*GATCTAAGAACCTGCAGCAGCAAAAAAA
TGGCGACCCTTAAGGTTCCTTCTCATGTTCCTTCCCCATCCGAAGATGCTGAGCAACTGA
AAAGCACCTTTGAGGGATGGGGTACCAACGAGGACTTGATCATATCAATTTTGGCTCACA
GAAGCGCTGAACAGAGGAATCTGATCAGGCAGACATACCATGAAGCCTGTGGAGAAGACC
TTCTCAAGACTCTTGACAAGGAACTCACTAGCGACTTCGAGAGAGCCATATTGCTCTGGA
CCCTTGAACCTGGTGAGCGTGATGCCTTGTTGGCCAATGAAGCTACCAAAAGATGGACTT
CAAGCAACCAAGTGCTCATGGAAGTAGCCTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCTTCACG
CTAGGCAAGCTTACCATGCTCGTTACAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTCGCTCACCACA
CCACCGGTGACTTCAGAAAGCTTTTGTTGTCTCTTGTTACCTCATACAGGTACGAAGGAG
ACGAGGTGAACATGACATTGGCGAAGCAAGAAGCAAAGCTGATCCATGAGAAAATCAAGG
ACAAGCACTACAGCGATGAAGATGTCATTAGGATTTTGTCCA

QA 3 644 3 644
DS 

RD RR2DI06TF 647 0 0
GGAACATACATACACTTCACCAGCGAGACAGTTAAAAGATCTAAGAACCTGCAA*AGCAA
AAAA*TGGCGACCCTTAAGGTTCCTTCTCATGTTCCTTCCCCATCTGAAGATGCTGAGCA
ACTGAAAAGCGCCTTTGAGGGATGGGGTACAAACGAGGACTTGATCATATCAATTTTGGC
ACACAGAAGCGCTGAACAGAGGAAGCTGATAAGGCAGACATACCATGAAGCCTGTGGAGA
AGACCTTCTCAAGACTCTTGACAAGGAACTCACTAGCGACTTCGAGAGAGCCATCTTGCT
CTGGACCCTTGAACCCGGTGAGCGTGATGCCTTGTTGGTCAATGAAGCTACCAAAAGATG
GACTTCAAGCAACCAAGTGCTTATGGAAGTAGCCTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCT
TCACGCTAGGCAAGCCTACCATGCTCGTTACAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTCGCTCA
CCACACCACCGGTGACTTCAGAAAGCTTTTGGTCTCTCTTGTTACCGCATACAGGTACGA
AGGAGACGAGGTGAACATGACATTGGCTAAGCAAGAAGCGAAGCTGATCCATGAGAAAAT
CAAGGACAAACACTACAGCGATGAGGATGTCATTAGGATTTTGTCCA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2GM87TF 646 0 0
GGAACATACATACACTTCACCAGCGAGACAGTTAAAAGATCTAAGAACCTGCAA*AGCAA
AAAA*TGGCGACCCTTAAGGTTC*TTCTCATGTTCCTTCCCCATCTGAAGATGCAGAGCA
ACTGAAAAGCGCCTTTGAGGGATGGGGTACAAACGAGGACTTGATCATATCAATTTTGGC
ACACAGAAGCGCTGAACAGAGGAAGCTGATAAGGCAGACATACCATGAAGCCTGTGGAGA
AGACCTTCTCAAGACTCTTGACAAGGAACTCACTAGCGACTTCGAGAGAGCCATCTTGCT
CTGGACCCTTGAACCCGGTGAGCGTGATGCCTTGTTGGCCAATGAAGCTACCAAAAGATG
GACTTCAAGCAACCAAGTGCTTATGGAAGTAGCCTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCT
TCACGCTAGGCAAGCCTACCATGCTCGTTACAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTCGCTCA
CCACACCACCGGTGACTTCAGAAAGCTTTTGGTCTCTCTTGTTACCGCATACAGGTACGA
AGGAGACGAGGTGAACATGACATTGGCTAAGCAAGAAGCGAAGCTGATCCATGAGAAAAT
CAAGGACAAACACTACAGCGATGAGGATGTCATTAGGATTTTGTCC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2BI68TF 760 0 0
CTCTCTATAAAATCAATCATCTATCTGCTTCTACTCTCAACATACATACACTTCACCAGC
GAGACAGTGAAA*GATCTAAGAACCTGCAGCAGCAAAAAA*TGGCGACCCTTAAGGTTCC
TTCTCATGTTCCTTCCCCATCCGAAGATGCTGAGCAACTGAAAAGCGCCTTTGAGGGATG
GGGTACCAACGAGGACTTGATCATATCAATTTTGGCTCACAGAAGCGCTGAACAGAGGAA
GCTGATCAGGCAGACATACCATGAAGCCTGTGGAGAAGACCTTCTCAAGACCCTTGACAA
GGAACTCACTAGCGACTTCGAGAGAGCCATATTGCTCTGGACCCTTGAACCTGGTGAGCG
TGATGCCTTGTTGGCCAATGAAGCTACCAAAAGATGGACTTCAAGCAACCAAGTGCTCAT
GGAAGTAGCCTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCTTCACGCTAGGCAAGCTTACCATGC
TCGTTACAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTCGCTCACCACACCACCGGTGACTTCAGAAA
GCTTTTGGTGTCTCTTGTTACCTCATACAGGTACGAAGGAGACGAGGTGAACATGACATT
GGCGAAGCAAGAAGCAAAGCTGATCCATGAGAAAATCAAGGACAAGCACTACAGCGATGA
AGATGTCATTAGGATTTTGTCCACAAGGAGCAGAGCTCAGATCAATGCTACTTTCAATCG
CTACCAAGATGAGCACGGCGAGGAAATCCTCAAGAGTCTT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2FG61TF 735 0 0
GGAACATACATACACTTCACCAGCGAGACAGTTAAAAGATCTAAGAACCTGCAA*AGCAA
AAAA*TGGCGACCCTTAAGGTTCCTTCTCATGTTCCTTCCCCATCTGAAGATGCTGAGCA
ACTGAAAAGCGCCTTTGAGGGATGGGGTACAAACGAGGACTTGATCATATCAATTTTGGC
ACACAGAAGCGCTGAACAGAGGAAGCTGATAAGGCAGACATACCATGAAGCCTGTGGAGA
AGACCTTCTCAAGACTCTTGACAAGGAACTCACTAGCGACTTCGAGAGAGCCATCTTGCT
CTGGACCCTTGAACCCGGTGAGCGTGATGCCTTGTTGGCCAATGAAGCTACCAAAAGATG
GACTTCAAGCAACCAAGTGCTTATGGAAGTAGCCTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCT
TCACGCTAGGCAAGCCTACCATGCTCGTTACAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTCGCTCA
CCACACCACCGGTGACTTCAGAAAGCTTTTGGTCTCTCTTGTTACCGCATACAGGTACGA
AGGAGACGAGGTGAACATGACATTGGCTAAGCAAGAAGCGAAGCTGATCCATGAGAAAAT
CAAGGACAAACACTACAGCGATGAGGATGTCATTAGGATTTTGTCCACAAAGAGCAGAGC
TCAGATCAATGCTACTTTCAATCGCTACCAAGATGAGCACGGCGAGGAAATCCTCAAGAG
TCTTGAGGAAG
AGAT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2FS91TF 761 0 0
GGAACATACATACACTTCACCATCGAGACAGTTAAAAGATCTAAGAACCTGCAA*AGCAA
AAAAATGGCGACCCTTAAGGTTCCATCTCATGTTCCTTCCCCATCCGAAGATGCTGAGCA
ACTGAAAAGCGCCTTTGAGGGATGGGGTACCAACGAGGACTTGATCATATCAATTTTGGC
ACACAGAAGCGCTGAACAGAGGAAGCTGATCAGGCAGACATACCATGAAGCCTGTGGAGA
AGACCTTCTCAAGACTCTTGACAAGGAACTCACTAGCGACTTCGAGAGAGCCATCTTGCT
CTGGACCCTTGAACCCGGTGAGCGTGATGCCTTGTTGGCCAATGAAGCTACCAAAAGATG
GACTTCAAGCAACCAAGTGCTTATGGAAGTAGCCTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCT
TCACGCTAGGCAAGCTTACCGTGCTCGTTACAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTCGCTCA
CCGCACCACCGGTGACTTCAGAAAGCTTTTGGTGTCTCTTGTTACCTCATACAGGTACGA
AGGAGACGAGGTGAACATGACATTGGCGAAGCAAGAAGCGAAGCTGATCCATGAGAAAAT
CAAGGACAAGCACTACAGCGATGAGGATGTCATTAGGATTTTGTCTACTAGGAGCAGAGC
TCAGATCAATGCTACTTTCAATCGCTACCAAGATGAGCACGGCGAGGAAATCCTCAAGAG
CCTTGAGGAAGGAGATGAGGACGACAAGTTCCTCGGACTGT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2A328TF 791 0 0
ACATACACTTCACCAGCGAGACAGTTAAAAGAA*TAAGAACCTGCAA*AGCAAAAAA*TG
GCGACCCTTAAGGTTCCTTCTCATGTTCCTTCCCCATCTGAAGATGCTGAGCAACTGAAA
AGCGCCTTTGAGGGATGGGGTACAAACGAGGACTTGATCATATCAATTTTGGCACACGGA
AGCGCTGAACAGAGGAAGCTGATAAGGCAGACATACCATGAAGCCTGTGGAGAAGACCTT
CTCAAGACTCTTGACAAGGAACTCACTAGCGACTTCGAGAGAGCCATCTTGCTCTGGACC
CTTGAACCCGGTGAGCGTGATGCCTTGTTGGCCAATGAAGCTACCAAAAGATGGACTTCA
AGCAACCAAGTGCTTATGGAAGTAGCCTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCTTCACGCT
AGGCAAGCCTACCATGCTCGTTACAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTCGCTCACCACACC
ACCGGTGACTTCAGAAAGCTTTTGGTCTCTCTTGTTACCGCATACAGGTACGAAGGAGAC
GAGGTGAACATGACATTGGCTAAGCAAGAAGCGAAGCTGATCCATGAGAAAATCAAGGAC
AAACACTACAGCGATGAGGATGTCATTAGGATTTTGTCCACAAGGAGCAGAGCTCAGATC
AATGCTACTTTCAATCGCTACCAAGATGAGCACGGCGAGGAAATCCTCAAGAGTCTTGAG
GAAGGAGATGAGGACGACAAGTTCCTCGGACTGTTGAGGTCAACCATTCAATGCTTGACA
AGAC
AGAGCTC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2BS23TF 712 0 0
G
CAACGCAGCTGCTTCACGCTGGGCAAGCTTACCATGCTCGTTACAAGAAGTCTATTGAAG
AGGATGTCGCTCACCACACCACCGGTGACTTCAGAAAGCTTTTGGTGTCTCTTGTTACCT
CATACAGGTACGAAGGAGACGAGGTGAACATGACATTGGCGAAGCAAGAAGCGAAGCTGA
TCCATGAGAAAATCAAGGACAAGCACTACAGCGATGAGGATGTCATTAGGATTTTGTCCA
CTAGGAGCAGAGCTCAGATCAATGCTACTTTCAATCGCTACCAAGATGAGCACGGCGAGG
AAATCCTCAAGAGTCTTGAGGAAGGAGATGAGGACGACAAGTTCCTCGGACTGTTGAGGT
CAACCATCCAATGCTTGACAAGACCAGAGCTCTACTTTGTGGATGTTCTTCGTTCTGCTA
TCAACAAAACCGGAACAGACGAAGGAGCTCTCACGAGAATTGTGACTACAAGAGCTGAGA
TTGACTTGAAGGTGATCGGAGAAGAGTATCAGAGGAGGAACAGCATTCCACTGGAGAAGG
CCATCACCAAAGACACTCGCGGAGATTACGAGAAGATGCTCGTCGCACTTCTCGGTGAAG
ATGATGCTTAAATCTAAACAGTCCTCCAGAGAGAAACAAAAGCTTCTCTTGGCTTCTGTT
TTCTCTCATCTCCCTCTCTCTTTCTTGTCTTGAAATCGTTTGATTCTGTTC

QA 2 712 2 712
DS 

RD RR2C581TF 315 0 0
GAGAAGAGTATCAGAGGAGGAACAGCATTCCACTGGAGAAGGCCGTTACCAAAGACACTC
GCGGAGATTACGAGAAGATGCTCGTCGCACTTCTCGGTGAAGATGATGCTTAAATC****
*****CTCCTGAGAGAAACAAAAGCTTTTCT*GGCTTCCGTTTTCTCTCATCTCCCTCTC
TCTTTCTTGTCCTGAAATCGTTTGATTCTGTTCTTTGAAAACTTGTCTGTTGTTTCTGTT
GTGTGTTTTGAGTTTCCAAATAATGCGCGAGAGAGAAAGAGATTCTGTCTGTTAAGTTAT
ATGAACTAATAAAA
A

QA 1 314 1 314
DS 

RD RR2BI68JQ 783 0 0
TTACAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTCGCTCACCACACCACCGGTGACTTCAGAAAGCT
TTTGGTGTCTCTTGTTACCTCATACAGGTACGAAGGAGACGAGGTGAACATGACATTGGC
GAAGCAAGAAGCAAAGCTGATCCATGAGAAAATCAAGGACAAGCACTACAGCGATGAAGA
TGTCATTAGGATTTTGTCCACAAGGAGCAGAGCTCAGATCAATGCTACTTTCAATCGCTA
CCAAGATGAGCACGGCGAGGAAATCCTCAAGAGTCTTGAGGAAGGAGATGAGGACGACAA
GTTCCTCGGACTGTTGAGGTCAACCATTCAATGCTTGACAAGGCCAGAGCTCTACTTTGT
GGATGTTCTTCGTTCTGCTATCAACAAAACCGGAACAGACGAAGGAGCTCTCACTAGAAT
TGTGACTACAAGAGCTGAGATTGACTTGAAGGTGATCGGAGAAGAGTATCAGAGGAGGAA
CAGCATTCCACTGGAGAAGGCCGTTACCAAGGACACTCGCGGAGATTACGAGAAGATGCT
CGTCGCACTTCTCGGTGAAGATGATGCTTAAATC*********CTCCTGAGAGAAACAAA
AGCTTTTCT*GGCTTCTGTTTTCTCTCATCTCCCTCTCTCTTTCTTGTCTTGAAATCGTT
TGATTCTGTTCTTTGAAAACTTGTCTGTTGTTTCTGTTGTGTGTTTTGAGTTTCCAAATA
ATGCGCGAGAGAGAAAGAGGGTCTGTCTGTTAAGTTATATGAACTAATAAAAATAATGCT
TTC

QA 1 783 1 783
DS 



CO CL183Contig2 851 5 5 U
GAAGGCATTACTTTTATTAGTTTATAATAACTTAACAGACAGACTCTCTTTCTCTCTCGC
GCATTATTTGGAAACTCAAAACACACAACAGAAACAACAGACAAGTTTTCAAAGAACAGA
ATCAAACGATTTCAAGACAAGAAAGAGAGAGGGAGATGAGAGAAAACAGAAGCCAAGAGA
AGCTTTTGTTTCTCTCTGGAGGACTGTTTAGATTTAAGCATCATCTTCACCGAGAAGTGC
GACGAGCATCTTCTCGTAATCTCCGCGAGTGTCTTTGGTAATGGCCTTCTCCAGTGGAAT
GCTGTTCCTCCTCTGATACTCTTCTCCGATCACCTTCAAGTCAATCTCAGCTCTTGTAGT
CACAATTCTAGTGAGAGCTCCTTCGTCTGTTCCGGTTTTGTTGATAGCAGAACGAAGAAC
ATCCACAAAGTAGAGCTCTGGTCTTGTCAAGCATTGAATGGTTGACCTCAACAGTCCGAG
GAACTTGTCGTCCTCATCTCCTTCCTCAAGACTCTTGAGGATTTCCTCGCCGTGCTCATC
TTGGTAGCGATTGAAAGTAGCATTGATCTGAGCTCTGCTCCTTGTGGACAAAATCCTAAT
GACATCCTCATCGCTGTAGTGTTTGTCCTTGATTTTCTCATGGATCAGCTTCGCTTCTTG
CTTAGCCAATGTCATGTTCACCTCGTCTCCTTCGTACCTGTATGCGGTAACAAGAGACAC
CAAAAGCTTTCTGAAGTCACCGGGGGGGGTGGTGAGCGACATCCTCTTCAATAGACTTCT
TGTACGAGCATGGTAGCTTGCCTAGCGTGAAGCAGCTGCGTTGAGGTCCTTGTGCAGCTA
CTTCATAAGCA


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM87JQ U 1
AF RR2FG61JQ U 1
AF RR2A328JQ U 176
AF RR2FS91JQ U 1
AF RR2DI06JQ U 1
BS 1 106 RR2DI06JQ
BS 107 107 RR2GM87JQ
BS 108 717 RR2DI06JQ
BS 718 718 RR2FS91JQ
BS 719 851 RR2DI06JQ

RD RR2GM87JQ 508 0 0
GA
AGGCATTACTTTTATTAGTTTATAATAACTTAACAGACAGACTCTCTTTCTCTCTCGCGC
ATTATTTGGAAACTCAAAACACACAACAGAAACAACAGACAAGTTTTCAAAGAACAGAAT
CAAACGATTTCAAGACAAGAAAGAGAGAGGGAGATGAGAGAAAACAGAAGCCAAGAGAAG
CTTTTGTTTCTCTCTGGAGGACTGTTTAGATTTAAGCATCATCTTCACCGAGAAGTGCGA
CGAGCATCTTCTCGTAATCTCCGCGAGTGTCTTTGGTAATGGCCTTCTCCAGTGGAATGC
TGTTCCTCCTCTGATACTCTTCTCCGATCACCTTCAAGTCAATCTCAGCTCTTGTAGTCA
CAATTCTAGTGAGAGCTCCTTCGTCTGTTCCGGTTTTGTTGATAGCAGAACGAAGAACAT
CCACAAAGTAGAGCTCTGGTCTTGTCAAGCATTGAATGGTTGACCTCAACAGTCCGAGGA
ACTTGTCGTCCTCATCTCCTTCCTCA

QA 3 508 3 508
DS 

RD RR2FG61JQ 637 0 0
GA
AGGCATTACTTTTATTAGTTTATAATAACTTAACAGACAGACTCTCTTTCTCTCTCGCGC
ATTATTTGGAAACTCAAAACACACAACAGAAACAACAGACAAGTTTTCAAAGAACAGAAT
CAAACGATTTCAAGACAAGAAAGAGAGAGGGAGATGAGAGAAAACAGAAGCCAAGAGAAG
CTTTTGTTTCTCTCTGGAGGACTGTTTAGATTTAAGCATCATCTTCACCGAGAAGTACGA
CGAGCCTCTTCTCGTAATCTCCGCGAGTGTCTTTGGTAATGGCCTTCTCCAGTGGAATGC
TGTTCCTCCTCTGATACTCTTCTCCGATCACCTTCAAGTCAATCTCAACTCTTGTAGTCA
CAATTCTAGTGAGAGCTCCTTCGTCTGTTCCGGTTTTGTTGATAGCAGAACGAAGAACAT
CCACAAAGTAGAGCTCTGGTCTTGTCAAGCATTGAATGGTTGACCTCAACAGTCCGAGGA
ACTTGTCGTCCTCATCTCCTTCCTCAAGACTCTTGAGGATTTCCTCGCCGTGCTCATCTT
GGTAGCGATTGAAAGTAGCATTGATCTGAGCTCTGCTCCTTGTGGACAAAATCCTAATGA
CATCCTCATCGCTGTAGTGTTTGTCCTTGATTTTC

QA 3 637 3 637
DS 

RD RR2A328JQ 536 0 0
AGAA
AAGCTTTTGTTTCTCTCTGGAGGACTGTTTAAATTTAAGCATCATCTTCACCGAAAAGTG
CGACGAGCATCTTCTCGTAATCTCCGCGAGGGTCTTTGGTAATGGCCTTCTCCAGTGGAA
TGCTGTTCCTCCTCTGATACTCTTCTCCGATCACCTTCAAGTCAATCTCAGCTCTTGTAG
TCACAATTCTAGTGAGAGCTCCTTCGTCTGTTCCGGTTTTGTTGATAGCAAAACGAAAAA
CATCCACAAAGTAAAGCTCTGGTCTTGTCAAGCATTGAATGGTTGACCTCAACAGTCCGA
GGAACTTGTCGTCCTCATCTCCTTCCTCAAGACTCTTGAGGATTTCCTCCCCGTGCTCAT
CTTGGTAGCGATTGAAAGTAGCATTGATCTGAGCTCTGCTCCTTGTGGACAAAATCCTAA
TGACATCCTCATCGCTGTAGTGTTTGTCCTTGATTTTCTCATGGATCAGCTTCGCTTCTT
GCTTAGCCAATGTCATGTTCACCTCGTCTCCTTCGTACCTGTATGCGGTAAC

QA 5 536 5 536
DS 

RD RR2FS91JQ 734 0 0
GG
AGGCATTACTTTTATTAGTTTATAATAACTTAACAGACAGACTCTCTTTCTCTCTCGCGC
ATTATTTGGAAACTCAAAACACACAACAGAAACAACAGACAAGTTTTCAAAGAACAGAAT
CAAACGATTTCAAGACAAGAAAGAGAGAGGGAGATGAGAGAAAACAGAAGCCAAGAGAAG
CTTTTGTTTCTCTCTGGAGGACTGTTTAGATTTAAGCATCATCTTCACCGAGAAGTGCGA
CGAGCATCTTCTCGTAATCTCCGCGAGTGTCTTTGGTAATGGCCTTCTCCAGTGGAATGC
TGTTCCTCCTCTGATACTCTTCTCCGATCACCTTCAAGTCAATCTCAGCTCTTGTAGTCA
CAATTCTCGTGAGAGCTCCTTCGTCTGTTCCGGTTTTGTTGATAGCAGAACGAAGAACAT
CCACAAAGTAGAGCTCTGGTCTTGTCAAGCATTGGATGGTTGACCTCAACAGTCCGAGGA
ACTTGTCGTCCTCATCTCCTTCCTCAAGGCTCTTGAGGATTTCCTCGCCGTGCTCATCTT
GGTAGCGATTGAAAGTAGCATTGATCTGAGCTCTGCTCCTAGTAGACAAAATCCTAATGA
CATCCTCATCGCTGTAGTGCTTGTCCTTGATTTTCTCATGGATCAGCTTCGCTTCTTGCT
TCGCCAATGTCATGTTCACCTCGTCTCCTTCGTACCTGTATGAGGTAACAAGAGACACCA
AAAGCTTTCTGA

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR2DI06JQ 851 0 0
GAAGGCATTACTTTTATTAGTTTATAATAACTTAACAGACAGACTCTCTTTCTCTCTCGC
GCATTATTTGGAAACTCAAAACACACAACAGAAACAACAGACAAGTCTTCAAAGAACAGA
ATCAAACGATTTCAAGACAAGAAAGAGAGAGGGAGATGAGAGAAAACAGAAGCCAAGAGA
AGCTTTTGTTTCTCTCTGGAGGACTGTTTAGATTTAAGCATCATCTTCACCGAGAAGTGC
GACGAGCATCTTCTCGTAATCTCCGCGAGTGTCTTTGGTAATGGCCTTCTCCAGTGGAAT
GCTGTTCCTCCTCTGATACTCTTCTCCGATCACCTTCAAGTCAATCTCAGCTCTTGTAGT
CACAATTCTAGTGAGAGCTCCTTCGTCTGTTCCGGTTTTGTTGATAGCAGAACGAAGAAC
ATCCACAAAGTAGAGCTCTGGTCTTGTCAAGCATTGAATGGTTGACCTCAACAGTCCGAG
GAACTTGTCGTCCTCATCTCCTTCCTCAAGACTCTTGAGGATTTCCTCGCCGTGCTCATC
TTGGTAGCGATTGAAAGTAGCATTGATCTGAGCTCTGCTCCTTGTGGACAAAATCCTAAT
GACATCCTCATCGCTGTAGTGTTTGTCCTTGATTTTCTCATGGATCAGCTTCGCTTCTTG
CTTAGCCAATGTCATGTTCACCTCGTCTCCTTCGTACCTGTATGCGGTAACAAGAGAGAC
CAAAAGCTTTCTGAAGTCACCGGGGGGGGTGGTGAGCGACATCCTCTTCAATAGACTTCT
TGTACGAGCATGGTAGCTTGCCTAGCGTGAAGCAGCTGCGTTGAGGTCCTTGTGCAGCTA
CTTCATAAGCA

QA 1 851 1 851
DS 



AS 2 17

CO CL184Contig1 977 12 17 U
GGATTCTATTCGCGTGGTTTTGACGAGACGAGGAAGGGGAACAAACGCATAACGAAGACG
ACGATGGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGAAGTGATTCAGGCATGGTACATGGAT
GATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCTC
GACAAACTTGCAGAGCTTGGGGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACT
GATGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAG
GTATGCCCTGAGAAGCTTCAGAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGAGGAACAT
CTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGG
GACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTGCCT
GCTGGAATTTATCATCGCTTCACTGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTT
TTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTGCAAGG
AAAGAATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCGTAGAGAGCTCTC
TCTCTCTTTCTCTTACTTCTAAAGAAACACGATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATAAAG
AGAGATCTTGAATCTATAATATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTAATGGTATGCATG
TCTTGTAAACTTAATCACACTCTGTTAAGTCTTTATTTACCATCTTTGCCGTTTCCGTTT
TTACGAGAAGTTGTATCGACTCGGTTTGATCATATATTTTCCTGCGTACGTTTCTTCGTG
AGGTGTGTTGCAACTAAGGAAAAATAATAAGAGTTGTTTATTGCTGTGTGTGGATAATAT
AATGAGCCTCTTATTTT


BQ
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 40 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2D788TF U 1
AF RR2F237TF U 47
AF RR2FP31JQ C 268
AF RR2AG95TF U 32
AF RR2AY08TFB U 134
AF RR2FP31TF U 4
AF RR2D631TF U 1
AF RR2D788JQ C 127
AF RR2F237JQ C 121
AF RR2AG95JQ C 647
AF RR2D631JQ C 363
AF RR2C770TF U 406
BS 1 93 RR2D631TF
BS 94 94 RR2D788TF
BS 95 401 RR2D631TF
BS 402 402 RR2D788TF
BS 403 552 RR2D631TF
BS 553 553 RR2D788TF
BS 554 602 RR2D631TF
BS 603 603 RR2FP31TF
BS 604 714 RR2D631TF
BS 715 715 RR2C770TF
BS 716 768 RR2D631TF
BS 769 769 RR2C770TF
BS 770 783 RR2D631TF
BS 784 784 RR2C770TF
BS 785 805 RR2D631TF
BS 806 974 RR2C770TF
BS 975 977 RR2D631JQ

RD RR2D788TF 585 0 0
GGATTCTATTCGCGTGGTTTTGACGAGACGAGGAAGGGGAACAAACGCATAACGAAGACG
ACGATGGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGAAGTGATTCAGGCATGGTACATGGAT
GATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCTC
GACAAACTTGCAGAGCTTGGGGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACT
GATGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAG
GTATGCCCTGAGAAGCTTCAGAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGAGGAACAT
CTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGG
GACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTGCCT
GCTGGAATTTATCATCGCTTCACTGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTT
TTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGAC

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2F237TF 503 0 0
GG
ATAACGAAGACGACGATGGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGAAGTGATTCAGGCA
TGGTACATGGATGATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAG
TTCATCTCTCTCGACAAACTTGCAGAGCTTGGGGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGAT
CACTACGAAACTGATGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTCGTGGTTACTCCTACATG
GACTTCTGTGAGGTATGCCCTGAGAAGCTTCAGAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTT
TTCGAGGAACATCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTAC
TTTGATGTGAGGGACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATG
ATAGTCTTGCCTGCTGGAATTTATCATCGCTTCACTGTGGATTCTGACAACTATATCAAG
GCAATGCGTCTTTTCGTG
CGT

QA 3 500 3 500
DS 

RD RR2FP31JQ 325 0 0
TCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTATGCCCTGAGAAGCTTCAGAATTAT
GAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGAGGAACATCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTAC
TGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGGGACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTT
TGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTGCCTGCTGGAATTTATCATCGCTTCACTGTG
GATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACACCA
TACAATCGTCCACACGACCATCTTC

QA 1 325 1 325
DS 

RD RR2AG95TF 597 0 0
GGAAGGGGAACAAACGCATAACGAAGACGACGATGGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAG
AAGAAGTGATTCAGGCATGGTACATGGATGATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACC
ACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCTCGACAAACTTGCAGAGCTTGGGGTCCTTAGCT
GGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACTGATGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTC
GTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTATGCCCTGAGAAGCTTCAGAATTATGAAG
AGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGAGGAACATCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCG
TTGCAGGAAGTGGCTACTTTGACGTGAGGGACCGCAACGAAGCTTGGATCACAGTTTGGG
TGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTGCCTGCTGGAATTTATCATCTCTTCACTGTGGATT
CTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACACCATACA
ATCGTCCACACGACCATCTTCCTGCAAGGAAAGAATATGTTGATAATTTCGTGAACA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2AY08TFB 568 0 0
ATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCTCGACAAACTTGCAG
AGCTTGGGGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACTGATGAGGAGTTGA
AAAAGATCCGCGACTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTATGCCCTGAGA
AGCTTCAGAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGAGGAACATCTTCACACTGATG
AAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGGGACCGCAACGAAG
CTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTGCCTGCTGGAATTTATC
ATCGCTTCACTGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGTGGGTGAAC
CGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTGCAAGGAAAGAATATGTTG
ATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCGTAGAGAGCTCTCTCTCTCTTTCTCT
TACTTCTAAAGAAACACGATCTATAATA

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2FP31TF 760 0 0
GG
CTATTCGCGTGGTTTTGACGAGACGAGGAAGGGGAACAAACGCATAACGAAGACGACGAT
GGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGAAGTGATTCAGGCATGGTACATGGATGATAG
CCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCTCGACAA
ACTTGCAGAGCTTGGGGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACTGATGA
GGAGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTATG
CCCTGAGAAGCTTCAGAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGAGGAACATCTTCA
CACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGGGACCG
CAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTGCCTGCTGG
AATTTATCATCGCTTCACTGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGT
GGGTGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTGCAAGGAAAGA
ATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCGTAGAGAGCTCTCTCTCT
CTTTCTCTTACTTCTAAAGAAACACGATCTATAATAAACTTGGCCTGCA*TAAAGAGAGA
TCTTGAATCTATAATATGCATGTGGAGAATGATTGCTT

QA 3 760 3 760
DS 

RD RR2D631TF 805 0 0
GGATTCTATTCGCGTGGTTTTGACGAGACGAGGAAGGGGAACAAACGCATAACGAAGACG
ACGATGGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAACAAGTGATTCAGGCATGGTACATGGAT
GATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCTC
GACAAACTTGCAGAGCTTGGGGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACT
GATGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAG
GTATGCCCTGAGAAGCTTCAGAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGAGGAACAT
CTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGCGGCTACTTTGATGTGAGG
GACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTGCCT
GCTGGAATTTATCATCGCTTCACTGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTT
TTCGTGGGTGAATCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTGCAAGG
AAGGAATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCGTAGAGAGCTCTC
TCTCTCTTTCTCTTACTTCTAAAGAAACACGATCTATAATAAACTTGGCCTGCA*TAAAG
AGAGATCTTGAATCTATAATATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTA*TGGTATGCATG
TCT*GTAAACTTAATCACACTCTGT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2D788JQ 709 0 0
CAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCTCGACAAA
CTTGCAGAGCTTGGGGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACTGATGAG
GAGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTATGC
CCTGAGAAGCTTCAGAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGAGGAACATCTTCAC
ACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGGGACCGC
AACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTGCCTGCTGGA
ATTTATCATCGCTTCACTGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGTG
GGTGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTGCAAGGAAAGAA
TATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGTCGTTAACGCCTCTGCGTAGAGAGCTCTCTCTCTC
TTTCTCTTACTTCTAAAGAAACGCGATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATAAAGAGAGAT
CTTGAATCTATAATATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTAATGGTATGCATGTCTTGT
AAACTTAATCACACTCTGTTAAGTCTTTATTTACCATCTTTGCCGTTTC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2F237JQ 774 0 0
GATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCTC
GACAAACTTGCAGAGCTTGGGGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACT
GATGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAG
GTATGCCCTGAGAAGCTTCAGAATTATGAAGAGAAAGTAAAGAGTTTTTTCGAGGAACAT
CTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGG
GACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTGCCT
GCTGGAATTTATCATCGCTTCACTGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTT
TTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTGCAAGG
AAAGAATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCGTAGAGAGCTCTC
TCTCTCTTTCTCTTACTTCTAAAGAAACACGATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATAAAG
AGAGATCTTGAATCTATAATATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTAATGGTATGCATG
TCTTGTAAACTTAATCACACTCTGTTAAGTCTTTATTTACCATCTTTGCCGTTTCCGTTT
TTACGAGAAGTTGTATCGACTCGGTTTGATCATATATTTTCCTGCGTACGTTT
C

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2AG95JQ 307 0 0
TGGGTAGAGAG
CTCTCTCTCTTTCTCTTAGTTCTAAAGAAACACGATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATA
AAGAGAGATCTTGAATCTATAATATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTAATGGTATGC
ATGTCTTGTAAACTTAATCACACTCTGTTAAGTCTTTATTTACCATCTTTGCCGTTTCCG
TTTTTACGAGAAGTTGTATAGACTCGGTTTGATCATATATTTTCCTGCGTACGTTTCTTC
GTGAGGTGTGTTGCAACTAAGGAAAAATAATAAGAGTTGTTTATTGCTGTGTGTGG

QA 12 307 12 307
DS 

RD RR2D631JQ 615 0 0
TCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGCGGCTACTTTGATGTGAGGGA
CCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTTTTGCCTGC
TGGAATTTATCATCGCTTCACTGTGGATTTTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTT
CGTGGGTGAATCGGTGTGGACACCATACAATTGTCCACACGACCATTTTCCTGCAAGGAA
GGAATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTTTGCGTAGAGAGCTCTCTC
TTTCTTTTTTTTACTTTTAAAGAAACACGATTTATAATAAACTTGGCCTGCAATAAAGAG
AGATCTTGAATTTATAATATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTAATGGTATGCATGTC
TTGTAAACTTAATCCCACTCTGTTAAGTCTTTATTTACCATTTTTGCCGTTTCCGTTTTT
ACGAGAAGTTGTATCGACTCGGTTTGATCATATATTTTCCTGCGTACGTTTTTTCGTGAG
GTGTGTTGCAACTAAGGAAAAATAATAAGAGTTGTTTATTGCTGTGTGTGGATAATATAA
TGAGCCTCTTATTTT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2C770TF 569 0 0
TACTTTGATGTGAGGGACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGA
ATGATAGTCTTGCCTGCTGGAATTTATCATCGCTTCACTGTGGATTCTGACAACTATATC
AAGGCAATGCGTCTTTTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGAC
CATCTTCCTGCAAGGAAAGAATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCT
GCGTAGAGAGCTCTCTCTCTCTTTCTCTTACTTCTAAAGAAACACGATCTATAATAAACT
TGGCCTGCAATAAAGAGAGATCTTGAATCTATAATATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTG
GTAATGGTATGCATGTCTTGTAAACTTAATCACACTCTGTTAAGTCTTTATTTACCATCT
TTGCCGTTTCCGTTTTTACGAGAAGTTGTATCGACTCGGTTTGATCATATATTTTCCTGC
GTACGTTTCTTCGTGAGGTGTGTTGCAACTAAGGAAAAATAATAAGAGTTGTTTATTGCT
GTGTGTGGATAATATAATGAGCCTCTTAT

QA 1 569 1 569
DS 



CO CL184Contig2 888 5 17 U
GGATTCTATTCGCGTGGTTTTGACGGAGACGAGGAAGGGAACAAACGCATAACGAAAGAC
GACGATGGGTGAAGCCGTGGAGGATGGAAGAGAAGACGTGATTCAGGCATGGTACATGGA
TGATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCT
CGACAAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAAC
CGACGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGAGTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGA
GGTATGCCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTGAAGAGCTTTTTCGAGGAACA
TCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAG
GGACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAAGGAGGAATGATAGTCTTACC
TGCTGGAATTTATCATCGCTTCACTGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCT
TTTCGTGGGTGAA*CCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTGCAA
GGAAAGAATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCTTAGAGAGCTC
TCTCTCTCTTGGTTCTAAAGAAACATGATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATAAAGAGAG
AGATCTTGAATCTATAATATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTAATGGTATCCATGTC
TTGTAAACTTAATCACACTCTGTTAAGTCTTTATTTACCATCTTTGCCGTTTCCGTTTTT
TACGAAAATTTGTATCGACTCAGTTTGATCATATATTTTCCTGCGTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU65TF U 6
AF RR2CO78TF U 7
AF RR2DJ68JQ C 1
AF RR2FM44TF U 1
AF RR2FM44JQ C 159
BS 1 7 RR2FM44TF
BS 8 548 RR2CU65TF
BS 549 551 RR2FM44TF
BS 552 599 RR2CU65TF
BS 600 600 RR2FM44TF
BS 601 699 RR2CU65TF
BS 700 729 RR2FM44TF
BS 730 730 RR2DJ68JQ
BS 731 751 RR2FM44TF
BS 752 752 RR2DJ68JQ
BS 753 756 RR2FM44TF
BS 757 757 RR2DJ68JQ
BS 758 766 RR2FM44TF
BS 767 767 RR2DJ68JQ
BS 768 781 RR2FM44TF
BS 782 822 RR2DJ68JQ
BS 823 888 RR2FM44JQ

RD RR2CU65TF 694 0 0
GG
ATTCGCGTGGTTTTGACGGAGACGAGGAAGGGAACAAACGCATAACGAAAGACGACGATG
GGTGAAGCCGTGGAGGATGGAAGAGAAGACGTGATTCAGGCATGGTACATGGATGATAGC
CAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCTCGACAAA
CTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACCGACGAG
GAGTTGAAAAAGATCCGCGAGTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTATGC
CCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTGAAGAGCTTTTTCGAGGAACATCTTCAC
ACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGGGACCGC
AACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAAGGAGGAATGATAGTCTTACCTGCTGGA
ATTTATCATCGCTTCACTGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGTG
GTGAAA*CCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTGCA*GGAAAGA
ATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCTTAGAGAGCTCTCTCTCT
CTTGGTTCTAAAGAAACATGATCTATAATAAA

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR2CO78TF 691 0 0
TATTCGCGTGGTTTTGACGGAGACGAGGAAGGGAACAAACGCATAACGAAAGACGACGAT
GGGTGAAGCCGTGGAGGATGGAAGAGAAGACGTGATTCAGGCATGGTACATGGATGATAG
CCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCTCGGCAA
ACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACCGACGA
GGAGTTGAAAAAGATCCGCGAGTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTATG
CCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTGAAGAGCTTTTTCGAGGAACATCTTCA
CACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGGGACCG
CAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAAGGAGGAATGATAGTCTTACCTGCTGG
AATTTATCATCGCTTCACTGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGT
GGGTGAAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTGCAAGGAAAG
AATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCTTAGAGAGCTCTCTCTC
TCTTGGTTCTAAAGAAACATGATCTATAATA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2DJ68JQ 822 0 0
GGATTCTATTCGCGTGGTTT*GACGGAGACGAGGAAGGGAACAAACGCATAACGAAAGAC
GACGATGGGTGAAGCCGTGGAGGATGGAAGAGAAGACGTGATTCAGGCATGGTACATGGA
TGATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCT
CGACAAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAAC
CGACGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGAGTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGA
GGTATGCCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTGAAGAGCTTTTTCGAGGAACA
TCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAG
GGACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAAGGAGGAATGATAGTCTTACC
TGCTGGAATTTATCATCGCTTCACAGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCT
TTTCGTGGGTGAA*CCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCCGCAA
GGAAAGAATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCTTAGAGAGCTC
TCTCTCTCTTGGTTCTAAAGAAACATGATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATAAAGAGAG
AGATCTTGAATCTATAATATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTAATGGTATCCATGTC
TTGTAAACTTAATCACACTCTGTTAAGTCTTTATTTACCATC

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR2FM44TF 799 0 0
GGATTCTATTCGCGTGGTTTTGACGGAGACGAGGAAGGGAACAAACGCATAACGAAAGAC
GACGATGGGTGAAGCCGTGGAGGATGGAAGAGAAGACGTGATTCAGGCATGGTACATGGA
TGATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGAGTTCATCTCTCT
CGACAAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAAC
CGACGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGAGTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGA
GGTATGCCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTGAAGAGCTTTTTCGAGGAACA
TCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAG
GGACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAAGGAGGAATGATAGTCTTACC
TGCTGGAATTTATCATCGCTTCACTGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCT
TTTCGTGGGTGAA*CCGGTGTGGACACCAAACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTGCAA
GGAAAGAATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCTTAGAGAGCTC
TCTCTCTCTTGGTTCTAAAGAAACATGATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATAAAGAGAG
AGATCTTGA*TCTATAATATGCATGTGGAGA*TGAT*GCTTTGGTA*TGGTATCCATGTC
T
GTAACTAATCACACTCTG

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2FM44JQ 730 0 0
ATCCTAAAGAGTTCATCTCTCTCGACAAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGAC
TTGATGCTGATCACTACGAAACCGACGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGAGTCTCGTGGTT
ACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTATGCCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAG
TGAAGAGCTTTTTCGAGGAACATCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAG
GAAGTGGCTACTTTGATGTGAGGGACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGA
AAGGAGGAATGATAGTCTTACCTGCTGGAATTTATCATCGCTTCACTGTGGATTCTGACA
ACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGTGGGTGAA*CCGGTGTGGACACCAAACAATCGT
CCACACGACCATCTTCCTGCAAGGAAAGAATATGTTGATAATTTCGTGAACAAAGCCGTT
AACGCCTCTGCTTAGAGAGCTCTCTCTCTCTTGGTTCTAAAGAAACATGATCTATAATAA
ACTTGGCCTGCAATAAAGAGAGAGATCTTGAATCTATAATATGCATGTGGAGAATGATTG
CTTTGGTAATGGTATCCATGTCTTGTAAACTTAATCACACTCTGTTAAGTCTTTATTTAC
CATCTTTGCCGTTTCCGTTTTTTACGAAAATTTGTATCGACTCAGTTTGATCATATATTT
TCCTGCGTAG

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 17

CO CL185Contig1 1382 17 42 U
GGGGGCCTCACGAACCATTCACAGACACTCAAAGACTTCAAATAAGACCTTTGCTTCAGT
TTTTGCTCAGAGAGTGAACCAATAAGCATGGCGAAGATGATGATGCTGCAACAGAGCCAG
CCTTCTTTATCTCTCCTTACTTCTTCTCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTA
CAAGTCCAGTACAAGAGGAAAGTTCAACAGCCAAAAGGAGCACTCTATGTATCAGCATCG
AGCGAAAAGAAGATTCTTATAATGGGTGGCACTCGATTCATCGGTATCTTCTTGTCCAGG
CTCCTTGTCAAAGAGGGACATCAGGTTACATTGTTCACAAGAGGTAAATCTCCTATTGCC
AAACAATTGCCTGGCGAATCTGACCAAGACTTTGCTGATTTTTCCTCCAAGATTCTTCAC
TTGAAAGGAGACAGAAAGGATTATGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCAGCTGAGGGCTTC
GATGTTGTTTATGATATCAACGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCCATAATAGAGGCA
CTTCCTAAACTAGAACAGTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGAT
GTCTTGCCACACTGTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCACAAGGGGAAGCTG
GAGACAGAGAGCTTACTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATACGTCCTGTCTAC
ATCTACGGTCCATTGAACTACAACCCCGTTGAAGAATGGTTCTTCCACCGTCTCAAAGCT
GGTCGACCTATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAACTCGGTCACGTTAA*
GGACTTGGCAACAGCCTTTCTTGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCCAGCAGAGAGATATT
CAACATCTCAGGAGAGAAGTACGTCACCTTTGATGGCTTAGCAAAAGCTTGCGCAAAGGC
TGGTGGGTTTCCAGAGCCAGAGATTGTTCACTACAACCCTAAAGAGTTCGACTTTGGGAA
GAAGAAAGCCTTCCCTTTCCGTGACCAGCATTTCTTTGCCTCGGTGGAGAAAGCAAAGCA
TGTCTTGGGATGGAAACCAGAGTTCGACTTGGTGGATGGTCTCACTGACTCATACAACCT
CGACTTCGGTCGTGGAACTTTCAGAAAAGAGGCGGATTTCACTACTGACGACATGATTCT
AAGCAAGAAGCTTGTTCTTCAATAGAAACATTCTTGGCTTGTATATGGTTGTGTGTTTGA
TCTCAAACTGAAGAAGATTCTCAAGTTTATCGTCGTCTCAAATGTATTTTCTGTATGGAT
TGTGTTCGAGTTTTTTCTATAAAAAA*GAGGCGCGCGGTCTGAATATTTTTTTCTACAAA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 5 5 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 0 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 60 60 60 65 65 65 65 65 65 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 70 65 65 65 35 65 65 65 25 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 20 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 65 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 
40 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 5 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 
55 25 55 55 55 55 55 55 30 55 40 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 5 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ33TF U 21
AF RR2C620TF U 1
AF RR2H939TF U 25
AF RR2EL12TF U 5
AF RR2GX58TF U 21
AF RR2D688TF U 75
AF RR2FF32TF U 69
AF RR2AB59TF U 91
AF RR2A057TF U 80
AF RR2A566TF U 429
AF RR2GZ33JQ C 552
AF RR2D688JQ C 599
AF RR2FF32JQ C 640
AF RR2GX58JQ C 593
AF RR2A566JQ C 719
AF RR2EL12JQ C 720
AF RR2AB59JQ C 719
BS 1 20 RR2C620TF
BS 21 21 RR2EL12TF
BS 22 62 RR2C620TF
BS 63 65 RR2EL12TF
BS 66 105 RR2C620TF
BS 106 106 RR2EL12TF
BS 107 407 RR2C620TF
BS 408 408 RR2H939TF
BS 409 640 RR2C620TF
BS 641 643 RR2EL12TF
BS 644 644 RR2FF32TF
BS 645 648 RR2EL12TF
BS 649 649 RR2GX58TF
BS 650 650 RR2FF32TF
BS 651 661 RR2GX58TF
BS 662 662 RR2FF32TF
BS 663 663 RR2GX58TF
BS 664 664 RR2FF32TF
BS 665 683 RR2GX58TF
BS 684 841 RR2FF32TF
BS 842 842 RR2AB59TF
BS 843 850 RR2FF32TF
BS 851 851 RR2A057TF
BS 852 863 RR2FF32TF
BS 864 864 RR2A057TF
BS 865 875 RR2FF32TF
BS 876 911 RR2A057TF
BS 912 912 RR2A566TF
BS 913 917 RR2A057TF
BS 918 918 RR2A566TF
BS 919 919 RR2A057TF
BS 920 920 RR2A566TF
BS 921 934 RR2A057TF
BS 935 944 RR2A566TF
BS 945 945 RR2GZ33JQ
BS 946 1023 RR2A566TF
BS 1024 1024 RR2GZ33JQ
BS 1025 1026 RR2A566TF
BS 1027 1027 RR2GZ33JQ
BS 1028 1252 RR2A566TF
BS 1253 1375 RR2GZ33JQ
BS 1376 1382 RR2AB59JQ

RD RR2GZ33TF 195 0 0
GG
AGACACTCAAAGACTTCAAATAAGACCTTTGCTTCAGTTTTTGCTCAGAGAGTGAACCAA
TAAGCATGGCGAAGATGATGATGCTGCAACAGAGCCAGCCTTCTTTATCTCTCCTTACTT
CTTCTCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTACAAGTCCAGTACAAGAGGAAAG
TTCAACAGCCAAA

QA 3 195 3 195
DS 

RD RR2C620TF 640 0 0
GGGGGCCTCACGAACCATTCTCAGACACTCAAAGACTTCAAATAAGACCTTTGCTTCAGT
TTA**CTCAGAGAGTGAACCAATAAGCATGGCGAAGATGATGATGATGCAACAGAGCCAG
CCTTCTTTATCTCTCCTTACTTCTTCTCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTA
CAAGTCCAGTACAAGAGGAAAGTTCAACAGCCAAAAGGAGCACTCTATGTATCAGCATCG
AGCGAAAAGAAGATTCTTATAATGGGTGGCACTCGATTCATCGGTATCTTCTTGTCCAGG
CTCCTTGTCAAAGAGGGACATCAGGTTACATTGTTCACAAGAGGTAAATCTCCTATTGCC
AAACAATTGCCTGGCGAATCTGACCAAGACTTTGCTGATTTTTCCTCTAAGATTCTTCAC
TTGAAAGGAGACAGAAAGGATTATGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCAGCTGAGGGCTTC
GATGTTGTTTATGATATCAACGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCCATAATAGAGGCA
CTTCCTAAACTAGAACAGTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGAT
GTCTTGCCACACTGTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2H939TF 585 0 0
GG
ACTCAAAGACTTCAAATAAGACCTTTGCTTCAGTTTA**CTCAGAGAGTGAACCAATAAG
CATGGCGAAGATGATGATGATGCAACAGAGCCAGCCTTCTTTATCTCTCCTTACTTCTTC
TCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTACAAGTCCAGTACAAGAGGAAAGTTCA
ACAGCCAAAAGGAGCACTCTATGTATCAGCATCTAGCGAAAAGAAGATTCTTATAATGGG
TGGCACTCGATTCATCGGTATCTTCTTGTCCAGGCTCCTTGTCAAAGAGGGACATCAGGT
TACATTGTTCACAAGAGGTAAATCTCCTATTGCCAAACAATTGCCTGGCGAATCTGACCA
AGACTTTGCTGATTTTTCCTCCAAGATTCTTCACTTGAAAGGAGACAGAAAGGATTATGA
CTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCAGCTGAGGGCTTCGATGTTGTTTATGATATCAACGGGAG
GGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCCATAATAGAGGCACTTCCTAAACTAGAACAGTACATCTA
CTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATGTCTTGCCA

QA 3 585 3 585
DS 

RD RR2EL12TF 644 0 0
AGGGGACA
AACCATTCACAGACACTCAAAGACTTCAAATAAGACCTTTGCTTCAGTTTTTGCTCAGAG
AGTGAACCAATAAGCATGGCGAAGATGATGATGCTGCAACAGAGCCAGCCTTCTTTATCT
CTCCTTACTTCTTCTCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTACAAGTCCAGTAC
AAGAGGAAAGTTCAACAGCCAAAAGGAGCACTCTATGTATCAGCATCGAGCGAGAAGAAG
ATTCTTATAATGGGTGGCACTCGGTTCATTGGTATCTTCTTGTCCAGGCTCCTTGTCAAA
GAGGGACATCAGGTTACATTGTTCACAAGAGGTAAATCTCCTATTGCCAAACAATTGCCT
GGCGAATCTGACCAAGACTTTGCTGATTTTTCTTCCGAGATTCTTCACTTGAAAGGAGAC
AGAAAGGACTATGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCAGCTGAAGGCTTCGATGTTGTTTAT
GATATCAACGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCCATATTAGAGGCACTTCCTAAACTA
GAACAGTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATGTCTTGCCACAC
TGTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCACGCAC

QA 9 644 9 644
DS 

RD RR2GX58TF 663 0 0
GG
AGACACTCAAAGACTTCAAATAAGACCTTTGCTTCAGTTTTTGCTCAGAGAGTGAACCAA
TAAGCATGGCGAAGATGATGATGCTGCAACAGAGCCAGCCTTCTTTATCTCTCCTTACTT
CTTCTCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTACAAGTCCAGTACAAGAGGAAAG
TTCAACAGCCAAAAGGAGCACTCTATGTATCAGCATCGAGCGAGAAGAAGATTCTTATAA
TGGGTGGCATTCGGTTCATTGGTATCTTCTTGTCCAGGCTCCTTGTCAAAGAGGGACATC
AGGTTACATTGTTCACAAGAGGTAAATCTCCTATTGCCAAACAATTGCCTGGCGAATCTG
ACCAAGACTTTGCTGATTTTTCTTCCAAGATTCTTCACTTGAAAGGAGACAGAAAGGACT
ATGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCAGCTGAAGGCTTCGATGTTGTTTATGATATCAACG
GGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCCATATTAGAGGCACTTCCTAAACTAGAACAGTACA
TCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATGTCTTGCCACACTGTGAGGTGG
ATGCAGTTGACCCGAAGAGCA*GCAAA*GGGGAAGCTGGGGGCAGAGAGCTTACTGCAAT
C

QA 3 663 3 663
DS 

RD RR2D688TF 761 0 0
G
GAACCAATAAGCATGGCGAAGATGATGATGCTGCAACAGAGCCAGCCTTCTTTATCTCTC
CTTACTTCTTCTCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTACAAGTCCAGTACAAG
AGGAAAGTTCAACAGCCAAAAGGAGCACTCTATGTATCAGCATCGAGCGAGAAGAAGATT
CTTATAATGGGTGGCACTCGGTTCATTGGTATCTTCTTGTCCAGGCTCCTTGTCAAAGAG
GGACATCAGGTTACATTGTTCACAAGAGGTAAATCTCCTATTGCCAAACAATTGCCTGGC
GAATCTGACCAAGACTTTGCTGATTTTTCTTCCAAGATTCTTCACTTGAAAGGAGACAGA
AAGGACTATGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCAGCTGAAGGCTTCGATGTTGTTTATGAT
ATCAACGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCCATATTAGAGGCACTTCCTAAACTAGAA
CAGTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATGTCTTGCCACACTGT
GAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCACAAGGGGAAGCTGGAGACAGAGAGCTTA
CTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATACGTTCTGTCTACATCTACGGTCCATTG
AACTACAACCCCGTTGAAGAATGGTTCTTCCACCGTCTCAAAGCTGGTCGACCTATCCCA
GTTCCAAACTCTGGGATC*AGATCTCACAACTCGGTCACG

QA 2 761 2 761
DS 

RD RR2FF32TF 821 0 0
G
GAGAGTGAACCAATAAGCATGGCGAAGATGATGATGCTGCAACAGAGCCAGCCTTCTTTA
TCTCTCCTTACTTCTTCTCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTACAAGTCCAG
TACAAGAGGAAAGTTCAACAGCCAAAAGGAGCACTCTATGTATCAGCATCGAGCGAGAAG
AAGATTCTTATAATGGGTGGCACTCGGTTCATTGGTATCTTCTTGTCCAGGCTCCTTGTC
AAAGAGGGACATCAGGTTACATTGTTCACAAGAGGTAAATCTCCTATTGCCAAACAATTG
CCTGGCGAATCTGACCAAGACTTTGCTGATTTTTCTTCCAAGATTCTTCACTTGAAAGGA
GACA*AAAGGACTATGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCAGCTGAAGGCTTCGATGTTGTT
TATGATATCAACGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCCATATTAGAGGCACTTCCTAAA
CTAGAACAGTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATGTCTTGCCA
CACTGTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCACAAGGGGAAGCTGGAGACAGAG
AGCTTACTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATACGTCCTGTCTACATCTACGGT
CCATTGAACTACAACCCCGTTGAAGAATGGTTCTTCCACCGTCTCAAAGCTGGTCGACCT
ATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAACTCGGTCACGTTAA*G*ACTTGGC
A*CAGCCTTTCTTGTCGTGCTTGGTA
CGAGAAGCAGCAGA

QA 2 807 2 807
DS 

RD RR2AB59TF 817 0 0
GG
GAAGATGATGATGATGCAACAGAGCCAGCCTTCTTTATCTCTCCTTACTTCTTCTCTCTC
TGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTACAAGTCCAGTACAAGAGGAAAGTTCAACAGCC
AAAAGGAGCACTCTATGTATCAGCATCGAGCGAAAAGAAGATTCTTATAATGGGTGGCAC
TCGATTCATCGGTATCTTCTTGTCCAGGCTCCTTGTCAAAGAGGGACATCAGGTTACATT
GTTCACAAGAGGTAAATCTCCTATTGCCAAACAATTGCCTGGCGAATCTGACCAAGACCT
TGCTGATTTTTCCTCCAAGATTCTTCACTTGAAAGGAGACAGAAAGGATTATGACTTTGT
GAAGTCAAGTCTTTCAGCTGAGGGCTTCGATGTTGTTTATGATATCAACGGGAGGGAAGC
TGAAGAAGTTGAGCCCATAATAGAGGCACTTCCTAAACTAGAACAGTACATCTACTGTTC
TTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATGTCTTGCCACACTGTGAGGTGGATGCAGTTAA
CCCGAAGAGCAGGCACAAGGGGAAGCTGGAGACAGAGAGCTTACTGCAATCAAAAGGTGT
AAACTGGACTTCTATACGTCCTGTCTACATCTACGGTCCATTGAACTACAACCCCGTAGA
AGAATGGTTCTTTCACCGTCTCAAAGCTGGTCGACCTATCCCAGTTCCAAACTCTGGGAT
CCAGATCTCACAACTCGGTCACGTTAAAGGACTTGGCAACAGCCTTTTTGGCCGTGCTTG
GTAACGAGAAAGCCAGCAGAGAGATAT
CAACATCT

QA 3 809 3 809
DS 

RD RR2A057TF 855 0 0
G
AATAAGCATGGCGAAGATGATGATGATGCAACAGAGCCAGCTCTCTTTATCTCTCCTTAC
TTCTTCTCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTACAAGTCCAGTACAAGAGGAA
AGTTCAACAGCCAAAAGGAGCACTCTATGTATCAGCATCGAGCGAAAAGAAGATTCTTAT
AATGGGTGGCACTCGATTCATCGGTATCTTCTTGTCCAGGCTCCTTGTCAAAGAGGGACA
TCAGGTTACATTGTTCACAAGAGGTAAATCTCCTATTGCCAAACAATTGCCTGGCGAATC
TGACCAAGACTTTGCTGATTTTTCCTCCAAGATTCTTCACTTGAAAGGAGACAGAAAGGA
TTATGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCAGCTGAGGGCTTCGATGTTGTTTATGATATCAA
CGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCCATAATAGAGGCACTTCCTAAACTAGAACAGTA
CATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATGTCTTGCCACACTGTGAGGT
GGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCACAAGGGGAAGCTGGAGACAGAGAGCTTACTGCA
ATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATACGTCCTGTCTACATCTACGGTCCATTGAACTA
CAACCCCGTAGAAGAATGGTTCTTTCACCGTCTCAAAGCTGGTCGACCTATCCCAGTTCC
AAACTCTGGGATCCAGATCTCACAACTCGGTCACGTTAAAG*ACTTGGCAACAGCCTTTT
TGGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCCAGCAGAGAGATATTCAACATCTCAG*AGAGA*GC
ACGTCACCTTTGAT

QA 2 855 2 855
DS 

RD RR2A566TF 824 0 0
G
GACAGAAAGGATTATGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCAGCTGAGGGCTTCGATGTTGTT
TATGATATCAACGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCCATAATAGAGGCACTTCCTAAA
CTAGAACAGTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATGTCTTGCCA
CACTGTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCACAAGGGGAAGCTGGAGACAGAG
AGCTTACTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATACGTCCTGTCTACATCTACGGT
CCATTGAACTACAACCCCGTAGAAGAATGGTTCTTTCACCGTCTCAAAGCTGGTCGACCT
ATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAACTCGGTCACGTTAA*GGACTTGGC
AACAGCCTTTTTGGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCCAGCAGAGAGATATTCAGCATCTC
AGGAGAGAAGTACGTCACCTTTGATGGCTTAGCAAGAGCTTGCGCAAAGGCTGGTGGGTT
TCCAGAGCCAGAGATTGTTCACTACAACCCTAAAGAGTTCGACTTTGGGAAGAAAAAGGC
CTTCCCTTTCCGTGACCAGCATTTCTTTGCCTCGGTGGAGAAAGCAAAGCATGTCTTGGG
ATGGAAACCAGAGTTCGACTTGGTGGATGGTCTCACTGACTCATACAACCTCGACTTCGG
TCGTGGAACTTTCAGAAAAGAGGCGGATTTCACTACTGACGACATGATTCTAAGCAAGAA
GCTTGTTCTTCAATAGAAACATTCTTGGCTTGTATATGGTTGT

QA 2 824 2 824
DS 

RD RR2GZ33JQ 826 0 0
GA
AACAGTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTAC*TGAAATCTGATGTCTTGCCACACT
GTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCA*AAGGGGAAGCTGGGGGCAGAGAGCT
TACTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATACGTCCTGTCTACATCTACGGTCCAT
TGAACTACAACCCCGTTGAAGAATGGTTCTTCCACCGTCTCAAAGCTGGTCGACCTATCC
CAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAACTCGGTCACGTTAA*GGACTTGGCAACA
GCCTTTCTTGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCCAGCAGAGAGATATTCAACATCTCGGGA
GAGAAGTACGTCACCTTTGATGGCTTAGCAAAAGCTTGCGCAAAGGCTGGTGGGTTTCCA
GAGCCAGAGATTGTTCACTACAACCCTAAAGAGTTCGACTTTGGGAAGAAGAAAGCCTTC
CCTTTCCGTGACCAGCATTTCTTTGCCTCGGTGGAGAAAGCAAAGCATGTCTTGGGATGG
AAACCAGAGTTCGACTTGGTGGATGGTCTCACTGACTCGTACAACCTCGACTTCGGTCGT
GGAACTTTCAGAAAAGAGGCGGATTTCACTACTGACGACATGATTCTAAGCAAGAAGCTT
GTTCTTCAATAGAAACATTCTTGGCTTGTATATGGTTGTGTGTTTGATCTCAAACTGAAG
AAGATTCTCAAGTTTATCGTCGTCTCAAATGTATTTTCTGTATGGATTGTGTTCGAGTTT
TTTCTATAAAAAA*GAGGCGCGCGGTCTGAATATTTTTTTCT
GC

QA 3 824 3 824
DS 

RD RR2D688JQ 772 0 0
ATGTCTTGCCACACTGTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCACAAGGGGAAGC
TGGAGACAGAGAGCTTACTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATACGTTCTGTCT
ACATCTACGGTCCATTGAACTACAACCCCGTTGAAGAATGGTTCTTCCACCGTCTCAAAG
CTGGTCGACCTATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAACTCGGTCACGTTA
A*GGACTTGGCAACAGCCTTTCTTGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCCAGCAGAGAGATA
TTCAACATCTCAGGAGAGAAGTACGTCACCTTTGATGGCTTAGCAAAAGCTTGCGCAAAG
GCTGGTGGGTTTCCAGAGCCAGAGATTGTTCACTACAACCCTAAAGAGTTCGACTTTGGG
AAGAAGAAAGCCTTCCCTTTCCGTGACCAGCATTTCTTTGCCTCGGTGGAGAAAGCAAAG
CATGTCTTGGGATGGAAACCAGAGTTCGACTTGGTGGATGGTCTCACTGACTCATACAAC
CTCGACTTCGGTCGTGGAACTTTCAGAAAAGAGGCGGATTTCACTACTGACGACATGATT
CTAAGCAAGAAGCTTGTTCTTCAATAGAAACATTCTTGGCTTGTATATGGTTGTGTGTTT
GATCTCAAACTGAAGAAGATTCTCAAGTTTATCGTCGTCTCAAATGTATTTTCTGTATGG
ATTGTGTTCGAGTTTTTTCTATAAAAAA*GAGGCGCGCGGTCTGAATATTTT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2FF32JQ 723 0 0
AGCAGGCACAAGGGGAAGCTGGAGACAGAGAGCTTACTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGG
ACTTCTATACGTCCTGTCTACATCTACGGTCCATTGAACTACAACCCCGTTGAAGAATGG
TTCTTCCACCGTCTCAAAGCTGGTCGACCTATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATC
TCACAACTCGGTCACGTTAA*GGACTTGGCAACAGCCTTTCTTGTCGTGCTTGGTAACGA
GAAAGCCAGCAGAGAGATATTCAACATCTCAGGAGAGAAGTACGTCACCTTTGATGGCTT
AGCAAAAGCTTGCGCAAAGGCTGGTGGGTTTCCAGAGCCAGAGATTGTTCACTACAACCC
TAAAGAGTTCGACTTTGGGAAGAAGAAAGCCTTCCCTTTCCGTGACCAGCATTTCTTTGC
CTCGGTGGAGAAAGCAAAGCATGTCTTGGGATGGAAACCAGAGTTCGACTTGGTGGATGG
TCTCACTGACTCATACAACCTCGACTTCGGTCGTGGAACTTTCAGAAAAGAGGCGGATTT
CACTACTGACGACATGATTTTAAGCAAGAAGCTTGTTCTTCAATAGAAACATTCTTGGCT
TGTATATGGTTGTGTGTTTGATCTCAAACTGAAGAAGATTCTCAAGTTTATCGTCGTCTC
AAATGTATTTTCTGTATGGATTGTGTTCGAGTTTTTTCTATAAAAAA*GAGGCGCGCGGT
CTG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2GX58JQ 785 0 0
AATCTGATGTCTTGCCACACTGTGAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCA*AAGG
GGAAGCTGGGGGCAGAGAGCTTACTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATACGTC
CTGTCTACATCTACGGTCCATTGAACTACAACCCCGTTGAAGAATGGTTCTTCCACCGTC
TCAAAGCTGGTCGACCTATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAACTCGGTC
ACGTTAA*GGACTTGGCAACAGCCTTTCTTGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCCAGCAGA
GAGATATTCAACATCTCGGGAGAGAAGTACGTCCCCTTTGATGGCTTAGCAAAAGCTTGC
GCAAAGGCTGGTGGGTTTCCAGAGCCAGAGATTGTTCACTACAACCCTAAAGAGTTCGAC
TTTGGGAAGAAGAAAGCCTTCCCTTTCCGTGACCAGCATTTCTTTGCCTCGGTGGAGAAA
GCAAAGCATGTCTTGGGATGGAAACCAGAGTTCGACTTGGTGGATGGTCTCACTGACTCG
TACAACCTCGACTTCGGTCGTGGAACTTTCAGAAAAGAGGCGGATTTCACTACTGACGAC
ATGATTCTAAGCAAGAAGCTTGTTCTTCAATAGAAACATTCTTGGCTTGTATATGGTTGT
GTGTTTGATCTCAAACTGAAGAAGATTCTCAAGTTTATCGTCGTCTCAAATGTATTTTCT
GTATGGATTGTGTTCGAGTTTTTTCTATAAAAAA*GAGGCGCGCGGTCTGAATATTTTTT
TCT
GC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2A566JQ 620 0 0
ACATCTACGGTCCATTGAACTACAACCCCGTAGAAGAATGGTTCTTTCACCGTCTCAAAG
CTGGTCGACCTATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAACTCGGTCACGTTA
A*GGACTTGGCAACAGCCTTTTTGGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCCAGCAGAGAGATA
TTCAGCATCTCAGGAGAGAAGTACGTCACCTTTGATGGCTTAGCAAGAGCTTGCGCAAAG
GCTGGTGGGTTTCCAGAGCCAGAGATTGTTCACTACAACCCTAAAGAGTTCGACTTTGGG
AAGAAAAAGGCCTTCCCTTTCCGTGACCAGCATTTCTTTGCCTCGGTGGAGAAAGCAAAG
CATGTCTTGGGATGGAAACCAGAGTTCGACTTGGTGGATGGTCTCACTGACTCATACAAC
CTCGACTTCGGTCGTGGAACTTTCAGAAAAGAGGCGGATTTCACTACTGACGACATGATT
TTAAGCAAGAAGCTTGTTCTTCAATAGAAACATTCTTGGCTTGTATATGGTTGTGTGTTT
GATCTCAAACTGAAGAAGATTCTCAAGTTTATCGTCGTCTCAAATGTATTTTCTGTATGG
ATTGTGTTCGAGTTTTTTC
C

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2EL12JQ 658 0 0
CATCTACGGTCCATTGAACTACAACCCCGTTGAAGAATGGTTCTTCCACCGTCTCAAAGC
TGGTCGACCTATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCTAGATCTCACAACTCGGTCACGTTAA
*GGACTTGGCAACAGCCTTTCTTGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCCAGCAGAGAGATAT
TCAACATCTCAGGAGAGAAGTACGTCACCTTTGATGGCTTAGCAAAAGCTTGCGCAAAGG
CTGGTGGGTTTCCAGAGCCAGAGATTGTTCACTACAACCCTAAAGAGTTCGACTTTGGGA
AGAAGAAAGCCTTCCCTTTCCGTGACCAGCATTTCTTTGCCTCGGTGGAGAAAGCAAAGC
ATGTCTTGGGATGGAAACCAGAGTTCGACTTGGTGGATGGTCTCACTGACTCATACAACC
TCGACTTCGGTCGTGGAACTTTCAGAAAAGAGGCGGATTTCACTACTGACGACATGATTC
TAAGCAAGAAGCTTGTTCTTCAATAGAAACATTCTTGGCTTGTATATGGTTGTGTGTTTG
ATCTCAAACTGAAGAAGATTCTCAAGTTTATCGTCGTCTCAAATGTATTTTCTGTATGGA
TTGTGTTCGAGTTTTTTCTATAAAAAA*GAGGCGCACGGTCTGAATATTTTTTTCT
AC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2AB59JQ 664 0 0
ACATCTACGGTCCATTGAACTACAACCCCGTAGAAGAATGGTTCTTTCACCGTCTCAAAG
CTGGTCGACCTATCCCAGTTCCAAACTCTGGGATCCAGATCTCACAACTCGGTCACGTTA
A*GGACTTGGCAACAGCCTTTTTGGCCGTGCTTGGTAACGAGAAAGCCAGCAGAGAGATA
TTCAACATCTCAGGAGAGAAGTACGTCACCTTTGATGGCTTAGCAAGAGCTTGCGCAAAG
GCTGGTGGGTTTCCAGAGCCAGAGATTGTTCACTACAACCCTAAAGAGTTCGACTTTGGG
AAGAAAAAGGCCTTCCCTTTCCGTGACCAGCATTTCTTTGCCTCGGTGGAGAAAGCAAAG
CATGTCTTGGGATGGAAACCAGAGTTCGACTTGGTGGATGGTCTCACTGACTCATACAAC
CTCGACTTCGGTCGTGGAACTTTCAGAAAAGAGGCGGATTTCACTACTGACGACATGATT
TTAAGCAAGAAGCTTGTTCTTCAATAGAAACATTCTTGGCTTGTATATGGTTGTGTGTTT
GATCTCAAACTGAAGAAGATTCTCAAGTTTATCGTCGTCTCAAATGTATTTTCTGTATGG
ATTGTGTTCGAGTTTTTTCTATAAAAAAAGAGGCGCGCGGTCTGAATATTTTTTTCTACA
AACC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 3 16

CO CL186Contig1 917 10 11 U
GGAAGTCGTTTCGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTCCTGGAGCAGAGCTGAG
CTCCGTCGTCAATCCTAGCAAGCTATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCAAGG
TCATCATTTTTGGGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCGTTTGCTCGAGTG
GGTTTCTCCAGCAAGACCATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAACCCATCGCT
GTACCATCCAATGTAACCATCGCGTTGGAAGGTCAGGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTA
GGAGAGCTCGCTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTTTA
TTGAGGGTCAAAAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGG
ACGCTAACGGATAACATGGTGGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTA
GTGGGTGTTGGTTACCGTGCCACCGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTCGGGTTT
TCTCACCCGGTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAGGAGAACACG
AGGATCACGGTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTTGCTGCGACGGTGAGG
AAGTGGAGGCCTCCGGAGCCGTACAAGGGTAAGGGAGTTAAGTATTCAGATGAGATTGTG
AGGAGGAAAGAAGGCAAAGCTGGAAAGAAGAAGTGATCTTTGTTCCTTGTTGTTGTGTAT
TTTACCCTTTCTATGTTAAATGTGTATTTGCGCAAATCCTTTTTTATGAAAAAAATGTGA
AACTTTTCTCCATGATTCAATGGTTGCAAACTTACGAGAAAAAAAAAAGTAAACTTTTAA
CGAGAGTTTTAGCTTCT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 55 55 55 25 55 55 55 55 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 50 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H856TF U 1
AF RR2AI40TF U 1
AF RR2AL11TF U 1
AF RR2C782TF U 1
AF RR2H660TF U 1
AF RR2C047TF U 19
AF RR2AI40JQ C 58
AF RR2C047JQ C 133
AF RR2H856JQ C 179
AF RR2AL11JQ C 171
BS 1 156 RR2AI40TF
BS 157 157 RR2AL11TF
BS 158 173 RR2AI40TF
BS 174 174 RR2AL11TF
BS 175 598 RR2AI40TF
BS 599 599 RR2AL11TF
BS 600 664 RR2AI40TF
BS 665 673 RR2AL11TF
BS 674 683 RR2C047TF
BS 684 876 RR2AI40JQ
BS 877 917 RR2AL11JQ

RD RR2H856TF 650 0 0
GGAAGTCGTTTCGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTCCTGGAGCAGAGCTGAG
CTCCGTCGTCAATCCTAGCAAGCTATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCAAGG
TCATCATTTTTGGGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCGTTTGCTCGAGTG
GGTTTCTCCAGCAAGACCATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAACCCATCGCT
GTACCATCCAATGTAACCATCGCGTTGGAAGGTCAGGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTA
GGAGAGCTCACTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTTTA
TTGAGGGTCAAAAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGG
ACGCTAACGGATAACATGGTGGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTA
GTGGGTGTTGGTTACCGTGCCACCGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTCGGGTTT
TCTCACCCGGTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAGGAGAACACG
AGGATCACGGTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTTGCTGC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2AI40TF 664 0 0
GGAAGTCGTTTCGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTCCTGGAGCAGAGCTGAG
CTCCGTCGTCAATCCTAGCAAGCTATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCAAGG
TCATCATTTTTGGGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCCCAACCAAGCCGTTTGCACGAGTG
GGTTTCTCCAGCAAGACCATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAACCCATCGCT
GTACCATCCAATGTAACCATCGCGTTGGAAGGTCAGGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTA
GGAGAGCTCGCTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTTTA
TTGAGGGTCAAAAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGG
ACGCTAACGGATAACATGGTGGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTA
GTGGGTGTTGGTTACCGTGCCACCGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTCGGGTTT
TCTCACCCGGTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAGGAGAACATG
AGGATCACGGTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTTGCTGCGACGGTGAGG
AAGT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2AL11TF 673 0 0
GGAAGTCGTTTCGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTCCTGGAGCAGAGCTGAG
CTCCGTCGTCAATCCTAGCAAGCTATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCAAGG
ACATCATTTTTGGGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCGTTTGCTCGAGTG
GGTTTCTCCAGCCAGACCATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAACCCATCGCT
GTACCATCCAATGTAACCATCGCGTTGGAAGGTCAGGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTA
GGAGAGCTCGCTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTTTA
TTGAGGGTCAAAAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGG
ACGCTAACGGATAACATGGTGGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTA
GTGGGTGTTGGTTACCGTGCCACCGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTCGGGTTT
TCTCACCCGGTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAGGAGAACACG
AGGATCACGGTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTTGCTGCGACGGTGAGG
AAGTGGAGGCCTC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2C782TF 665 0 0
GGAAGTCGTTTCGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTCCTGGAGCAGAGCTGAG
CTCCGTCGTCAATCCTAGCAAGCTATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCAAGG
TCATCATTTTTGGGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCGTTTGCTCGAGTG
GGTTTCTCCAGTAAGACCATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAACCCATCGCT
GTACCATCCAATGTAACCATCGCGTTGGAAGGTCAGGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTA
GGAGAGCTCGCTCTAACTTACCCACGC*AAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTTTA
TTGAGGGTCAAAAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGG
ACGCTAACGGATAACATGGTGGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTA
GTGGGTGTTGGTTACCGTGCCACCGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTCGGGTTT
TCTCACCCGGTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAGGAGAACACG
AGGATCACGGTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTTGCTGCGACGGTGAGG
AAGTG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2H660TF 673 0 0
GGAAGTCGTTTCGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTCCTGGAGCAGAGCTGAG
CTCCGTCGTCAATCCTAGCAAGCTATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCAAGG
TCATCATTTTTGGGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCC*TTTGCTCGAGTG
GGTTTCTCCAGCAAGACCATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAACCCATCGCT
GTACCATCCAATGTAACCATCGCGTTGGAAGGTCAGGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTA
GGAGAGCTCGCTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTTTA
TTGAGGGTCAAAAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGG
ACGCTAACGGATAACATGGTGGTGGGTGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTA
GTGGGTGTTGGTTACCGTGCCACCGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTCGGGTTT
TCTCACCCGGTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAGGAGAACACG
AGGATCACGGTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAATTTGCTGCGACGGTGAGG
AAGTGGAGGCCTC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2C047TF 665 0 0
AACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTCCTGGAGCAGAGCTGAGCTCCGTCGTCAATCCTAG
CAAGCTATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCAAGGTCATCATTTTTGGGCGAT
AGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCGTTTGCTCGAGTGGGTTTCTCCAGCAAGACC
ATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAACCCATCGCTGTACCATCCAATGTAACC
ATCGCGTTGGAAGGTCAGGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTAGGAGAGCTCGCTCTAACT
TACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAGG**GATGCTGGTTTATTGAGGGTCAAAAAAACC
GTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGGACGCTAACGGATAACATG
GTGGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTAGTGGGTTTTGGTTACCGT
GCCACCGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTCGGGTTTTCTCACCCGGTGAAGATG
CAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAGGAGAACACGAGGATCACGGTGAGTGGA
TACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTTGCTGCGACGGTGAGGAAGTGGAGGCCTCCGGAG
CCGTA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2AI40JQ 819 0 0
GAGCTCCGTCGTCAATCCTAGCAAGCTATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCA
AGGTCATCATTTTTGGGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCCCAACCAAGCCGTTTGCACGA
GTGGGTTTCTCCAGCAAGACCATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAACCCATC
GCTGTACCATCCAATGTAACCATCGCGTTGGAAGGTCAGGACTTGAAAGTCAAAGGTCCA
TTAGGAGAGCTCGCTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGT
TTATTGAGGGTCAAAAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGGCCTTTTC
AGGACGCTAACGGATAACATGGTGGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATA
CTAGTGGGTGTTGGTTACCGTGCCACCGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTTTGAATCTCGGG
TTTTCTCACCCGGTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAGGAGAAC
ATGAGGATCACGGTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTTGCTGCGACGGTG
AGGAAGTGGAGGCCTCCGGAGCCGTACAAGGGTAAGGGAGTTAAGTATTCAGATGAGATT
GTGAGGAGGAAAGAAGGCAAAGCTGGAAAGAAGAAGTGATCTTTGTTCCTTGTTGTTGTG
TATTTTACCCTTTCTATGTTAAATGTGTATTTGCGCAAATCCTTTTTTATGAAAAAAATG
TGAAACTTTTCTCCATGATTCAATGGTTGCAAACTTACG

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2C047JQ 746 0 0
GGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCGTTTGCTCGAGTGGGTTTCTCCAGC
AAGACCATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAACCCATCGCTGTACCATCCAAT
GTAACCATCGCGTTGGAAGGTCAGGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTAGGAGAGCTCGCT
CTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAGG**GATGCTGGTTTATTGAGGGTCAAA
AAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGGACGCTAACGGAT
AACATGGTGGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTAGTGGGTTTTGGT
TACCGTGCCCCCGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTTTGAATCTCGGGTTTTTTCACCCGGTG
AAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAGGAGAACACGAGGATCACGGTG
AGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTTGCTGCGACGGTGAGGAAGTGGAGGCCT
CCGGAGCCGTACAAGGGTAAGGGAGTTAAGTATTCAGATGAGATTGTGAGGAGGAAAGAA
GGCAAAGCTGGAAAGAAGAAGTGATCTTTGTTCCTTGTTGTTGTGTATTTTACCCTTTTT
ATGTTAAATGTGTATTTGCGCAAATCCTTTTTTATGAAAAAAATGTGAAACTTTTTTCCA
TGATTCAATGGTTGCAAACTTACG
AG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2H856JQ 700 0 0
TGGGTTTCTCCAGCAAGACCATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAACCCATCG
CTGTACCATCCAATGTAACCATCGCGTTGGAAGGTCAGGACTTGAAAGTCAAAGGTCCAT
TAGGAGAGCTCACTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTT
TATTGAGGGTCAAAAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGGCCTTTTCA
GGACGCTAACGGATAACATGGTGGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATAC
TAGTGGGTGTTGGTTACCGTGCCACCGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTTTGAATTTCGGGT
TTTCTCACCCGGTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAGGAGAACA
CGAGGATCACGGTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTTGCTGCGACGGTGA
GGAAGTGGAGGCCTCCGGAGCCGTACAAGGGTAAGGGAGTTAAGTATTCAGATGAGATTG
TGAGGAGGAAAGAAGGCAAAGCTGGAAAGAAGAAGTGATCTTTGTTCCTTGTTGTTGTGT
ATTTTACCCTTTTTATGTTAAATGTGTATTTGCGCAAATCCTTTTTTATGAAAAAAATGT
GAAACTTTTCTCCATGATTCAATGGTTGCAAACTTACG
AG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2AL11JQ 747 0 0
TGCTCGAGTGGGTTTCTCCAGCCAGACCATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCA
ACCCATCGCTGTACCATCCAATGTAACCATCGCGTTGGAAGGTCAGGACTTGAAAGTCAA
AGGTCCATTAGGAGAGCTCGCTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGA
TGCTGGTTTATTGAGGGTCAAAAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCTAACCAAATGCACGG
CCTTTTCAGGACGCTAACGGATAACATGGTGGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAA
GCTGATACTAGTGGGTGTTGGTTACCGTGCCACCGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTTTGAA
TCTCGGGTTTTCTCACCCGGTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGA
GGAGAACACGAGGATCACGGTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTTGCTGC
GACGGTGAGGAAGTGGAGGCCTCCGGAGCCGTACAAGGGTAAGGGAGTTAAGTATTCAGA
TGAGATTGTGAGGAGGAAAGAAGGCAAAGCTGGAAAGAAGAAGTGATCTTTGTTCCTTGT
TGTTGTGTATTTTACCCTTTCTATGTTAAATGTGTATTTGCGCAAATCCTTTTTTATGAA
AAAAATGTGAAACTTTTCTCCATGATTCAATGGTTGCAAACTTACGAGAAAAAAAAAAGT
AAACTTTTAACGAGAGTTTTAGCTTCT

QA 1 747 1 747
DS 



CO CL186Contig2 597 2 5 U
GAAGTCGTTTTGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTGGAGCAGAGCTCAGCTCC
GTCGCTAATCCTAGCAAGCTATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCCAGGTCAG
CATTTTTGGGCGATAGAAGCGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCGCTTGCTCGAGTGGGTT
TCTCCAGCAAGACCATAATAGAGTGCAAGGAATCAAGTATAGGGAAGCAGCCCATCGCTG
TACCATCCAATGTAACCATCGCATTGGAAGGTCAGGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTAG
GAGAGCTCGCTCTGACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGACGCTGGTTTAT
TGAGGGTCAAGAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCCAACCAAATGCACGGTCTTTTCAGGA
CGCTAACGGATAACATGGCGGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTAG
TGGGTGTTGGTTACCGTGCTACAGTTGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTGGGGTTTT
CTCACCCGGTTAAAATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAAGAGAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU15TF U 1
AF RR2EB56TF U 325
BS 1 438 RR2DU15TF
BS 439 439 RR2EB56TF
BS 440 553 RR2DU15TF
BS 554 554 RR2EB56TF
BS 555 597 RR2DU15TF

RD RR2DU15TF 597 0 0
GAAGTCGTTTTGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTGGAGCAGAGCTCAGCTCC
GTCGCTAATCCTAGCAAGCTATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCCAGGTCAG
CATTTTTGGGCGATAGAAGCGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCGCTTGCTCGAGTGGGTT
TCTCCAGCAAGACCATAATAGAGTGCAAGGAATCAAGTATAGGGAAGCAGCCCATCGCTG
TACCATCCAATGTAACCATCGCATTGGAAGGTCAGGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTAG
GAGAGCTCGCTCTGACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGACGCTGGTTTAT
TGAGGGTCAAGAAAACCGTCGAAACTAGAAGAGCCAACCAAATGCACGGTCTTTTCAGGA
CGCTAACGGATAACATGGTGGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTAG
TGGGTGTTGGTTACCGTGCTACAGTTGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTGGGGTTTT
CTCACCCGGTTAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAAGAGAACA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2EB56TF 264 0 0
GCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGACGCTGGTTTATTGAGGGTCAAGAAAACCGTCGAAA
CTAGAAGAGCCAACCAAATGCACGGTCTTTTCAGGACGCTAACGGATAACATGGCGGTGG
GAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTAGTGGGTGTTGGTTACCGTGCTACAG
TTGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTGGGGTTTTCTCACCCGGTTAAAATGCAGATAC
CGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGG

QA 1 264 1 264
DS 



CO CL186Contig3 820 4 10 U
CGTTTTGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTGGAGAAGAGCTCAGCTCCGTCGC
CAATCCTAGCAAGCTATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCCAGGTCATCATTT
TTGGGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCTTTTGCTCGAGTGGGTTACTCC
AGCAAGACCATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAGCCCATCGCTGTACCATCC
AATGTAACCATCGCATTGGAAGGTCAAGACTTGAAAGTCAAGGGTCCATTAGGAGAGCTC
GCTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTTTATTGAGGGTC
AAAAAAACTGTCGAAACTAGAAGAGCCAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGGACGCTAACG
GATAACATGGTAGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTAGTGGGTGTC
GGTTACCGTGCCACCGTGGGAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTGGGGTTCTCTCACCCG
GTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAAGAGAACACGAGGATCACG
GTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTCGCTGCGACGGTGAGGAAGTGGAGA
CCTCCGGAGCCGTACAAGGGTAAGG*AGTGAAGTATTCAGATGAGATTGTGAGGAGGAAA
GAAGGCAAAGCTGGAAAGAAGAAGTGATCATCTTTTGTTCTTGTTTGTTGTTGTGTATTA
CACTTTCTATGTTTAAATTTGTATTTTGCTCAAATTTACG


BQ
10 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG34TF U 1
AF RR2G462TF U 0
AF RR2FJ91TF U -1
AF RR2FG34JQ C 85
BS 1 675 RR2FG34TF
BS 676 719 RR2G462TF
BS 720 724 RR2FJ91TF
BS 725 725 RR2FG34JQ
BS 726 736 RR2FJ91TF
BS 737 737 RR2FG34JQ
BS 738 742 RR2FJ91TF
BS 743 743 RR2FG34JQ
BS 744 758 RR2FJ91TF
BS 759 820 RR2FG34JQ

RD RR2FG34TF 675 0 0
CGTTTTGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTGGAGAAGAGCTCAGCTCCGTCGC
CAATCCTAGCAAGCTATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCCAGGTCATCATTT
TTGGGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCTTTTGCTCGAGTGGGTTACTCC
AGCAAGACCATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAGCCCATCGCTGTACCATCC
AATGTAACCATCGCATTGGAAGGTCAAGACTTGAAAGTCAAGGGTCCATTAGGAGAGCTC
GCTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTTTATTGAGGGTC
AAAAAAACTGTCGAAACTAGAAGAGCCAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGGACGCTAACG
GATAACATGGTAGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTAGTGGGTGTC
GGTTACCGTGCCACCGTGGGAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTGGGGTTCTCTCACCCG
GTGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAAGAGAACACGAGGATCACG
GTGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTCGCTGCGACGGTGAGGAAGTGGAGA
CCTCCGGAGCCGTAC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2G462TF 720 0 0
GG
GTTTTGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTGGAGAAGAGCTCAGCTCCGTCGCC
AATCCTAGCAAGCTATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCCAGGTCATCATTTT
TGGGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCTTTTGCTCGAGTGGGTTACTCCA
GCAAGACCATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAGCCCATCGCTGTACCATCCA
ATGTAACCATCGCATTGGAAGGTCAAGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTAGGAGAGCTCG
CTCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTTTATTGAGGGTCA
AAAAAACTGTCGAAACTAGAAGAGCCAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGGACGCTAACGG
ATAACATGGTAGCGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTAGTGGGTGTCG
GTTACCGTGCCACCGTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTGGGGTTCTCTCTCC*GG
TGAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAGGTGGAAGAGAACACGAGGATCACGG
TGAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTCGCTGCGACGGTGAGGAAGTGGAGAC
CTCCGGAGTCGTACAAGGGTAAGG*AGTGAAGTATTCAGATGAGATTGTGAGGAGGAA

QA 3 720 3 720
DS 

RD RR2FJ91TF 764 0 0
TTTT
TTTTGGATAAAACACTCTCTTCTCTCCATCCTCCTGGAGAAGAGCTCAGCTCCGTCGCCA
ATCCTAGCAAGCTATGGCTTCCTCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCCAGGTCATCATTTTT
GGGCGATAGAAACGTGTTCAAGGTCTCAACCAAGCCTTTTGCTCGAGTGGGTTACTCCAG
CAAGACCATAGAGTGCAAGGAATCAAGGATAGGGAAGCAGCCCATCGCTGTACCATCCAA
TGTAACCATCGCATTGGAAGGTCAAGACTTGAAAGTCAAAGGTCCATTAGGAGAGCTCGC
TCTAACTTACCCACGCGAAGTTGAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTTTATTGAGGGTCAA
AAAAACTGTCGAAACTAGAAGAGCCAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGGACGCTAACGGA
TAACATGGTAGTGGGAGTGTCAAAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTAGTGGGTGTCGG
TTACCGTGCCACCTTGGAAGGGAAAGAGCTGGTTCTGAATCTGGGGTTCTCTCACCCGGT
GAAGATGCAGATACCGGATAGTTTGAAAGTGAAAGTGGAAGAGAACACGAGGATCACGGT
GAGTGGATACGACAAGAGCGAGATAGGGCAGTTCGCTGCGACGGTGAGGAAGTGGAGACC
TCCGGAGCCGTACAAGGGTAAGG*AGTGAAGTATTCAGATGAGATTGTGAGGAGGAAAGA
AG*CAAAGCTGGAA*GAAGA*GTGATCATCTTTTGT
CTGT

QA 5 760 5 760
DS 

RD RR2FG34JQ 736 0 0
TCAGTCGTCACTTCTTTTCAACCCAGGTCATCATTTTTGGGCGATAGAAACGTGTTCAAG
GTCTCAACCAAGCCTTTTGCTCGAGTGGGTTACTCCAGCAAGACCATAGAGTGCAAGGAA
TCAAGGATAGGGAAGCAGCCCATCGCTGTACCATCCAATGTAACCATCGCATTGGAAGGT
CAAGACTTGAAAGTCAAGGGTCCATTAGGAGAGCTCGCTCTAACTTACCCACGCGAAGTT
GAGCTCATCAAAGAAGATGCTGGTTTATTGAGGGTCAAAAAAACTGTCGAAACTAGAAGA
GCCAACCAAATGCACGGCCTTTTCAGGACGCTAACGGATAACATGGTAGTGGGAGTGTCA
AAGGGATTTGAGAAGAAGCTGATACTAGTGGGTGTCGGTTACCGTGCCACCGTGGGAGGG
AAAGAGCTGGTTTTGAATCTGGGGTTCTCTCACCCGGTGAAGATGCAGATACCGGATAGT
TTGAAAGTGAAAGTGGAAGAGAACACGAGGATCACGGTGAGTGGATACGACAAGAGCGAG
ATAGGGCAGTTCGCTGCGACGGTGAGGAAGTGGAGACCTCCGGAGCCGTACAAGGGTAAG
GGAGTGAAGTATTCAGATGAGATTGTGAGGAGGAAAGAAGGCAAAGCTGGAAAGAAGAAG
TGATCATCTTTTGTTCTTGTTTGTTGTTGTGTATTACACTTTCTATGTTTAAATTTGTAT
TTTGCTCAAATTTACG

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 14

CO CL187Contig1 1002 14 14 U
GGACTCATCTGAAAGAAAGAAAAAAACAAAAATTAAATAAATAAAAACACGCAGCGATAT
CCACGCTGCCCCATCTCTCTCTCGCCAGATTTCAATCGTCGACTCGATTCTCAGATTTCA
GATCCAAATCCAAAAAAAAAAAA**TTCAGCATGTCAACCTTCAGCGGCGATGAAACAGC
TCCTTTCTTCGGCTTCCTCGGCGCTGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGC
TTATGGAACAGCAAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCTATGGGAGTGATGAGGCCAGAGTT
GGTCATGAAGTCCATTGTCCCTGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATTTACGGTTTGAT
TATTGCTGTTATCATCAGTACCGGAATCAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGA
TGGGTACGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCCGGAAT
GGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTT
TGTTGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTCGCTCTTTACGGGCTTATTGT
AGGAATCATCCTCTCCTCTAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAATGTGACCCACA
AGATTTGCCGTCGTTCTGAGAATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTCTGTGTGCTTTT
TTTTGTTCTTTCCTTCTTTAGTATTTATCATCGGTAAACCTACAGATTTACTGGATTCTT
GGAACTTTGTTTCGGAAGCAAACTCACCTATTCGTCATCCCCTTTTCTCTTTCGGTGGTT
TGCTTTCAGGTTTGTAGGGGTTCTCTTATCGTTCGGTTCTGTAATAAAGAGCTCTCAGGA
GCTTGGTATGTTTCTGTATTTTTGTATTGTCCTGAGGAAGTTTAAATAACATTTATTTGT
TTTGATTAAAAAGTTGCATTTATACGTAAAGAAGTTTGCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 0 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 60 60 60 60 60 60 45 60 60 30 60 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 55 70 70 70 70 70 40 70 70 40 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 60 75 75 60 75 75 75 75 
75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 50 80 80 80 65 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 30 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 
60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 45 45 45 45 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO52TF U 3
AF RR2F395TF U 68
AF RR2D372TF U 1
AF RR2F891TF U 52
AF RR2DU68TF U 66
AF RR2FZ83TF U 118
AF RR2A420TF U 1
AF RR2CQ70JQ C 411
AF RR2C103TF U 259
AF RR2DU68JQ C 433
AF RR2F891JQ C 255
AF RR2A420JQ C 219
AF RR2FZ83JQ C 244
AF RR2H566JQB C 229
BS 1 103 RR2A420TF
BS 104 104 RR2F891TF
BS 105 143 RR2A420TF
BS 144 145 RR2F891TF
BS 146 395 RR2A420TF
BS 396 396 RR2F891TF
BS 397 742 RR2A420TF
BS 743 743 RR2DU68TF
BS 744 799 RR2A420TF
BS 800 853 RR2C103TF
BS 854 957 RR2A420JQ
BS 958 958 RR2FZ83JQ
BS 959 967 RR2A420JQ
BS 968 1002 RR2H566JQB

RD RR2FO52TF 569 0 0
GGTCATCTGAAA
GAAAGAAAAAAACAAAAATTAAATAAATAAAAACACGCAGCGATATCCACGCTGCCCCAT
CTCTCTCTCGCCAGATTTCAATCGTCGACTCGATTCTCAGATTTCAGATCCAAATCCAAA
AAAAAAAAA**TTCAGCATGTCAACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTCCTTTCTTCGGCT
TCCTCGGCGCTGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATGGAACAGCAA
AGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCTATGGGAGTGATGAGGCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCA
TTGTCCCTGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATTTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCA
TCAGTACCGGAATCAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGATGGGTACGCTCACC
TCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCCGGAATGGCCATTGGGATCG
TCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTTGGGATGATTC
TTATCCTCATCTTCGCA

QA 13 569 13 569
DS 

RD RR2F395TF 630 0 0
GGA
CCATCTCTCTCTCGCCAGATTTCAATCGTCGACTCGATTCTCAGATTTCAGATCCAAATC
CAAAAAAAAAAAC**TTAAACATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTCCTTTCTTC
GGCTTCCTCGGCGCTGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATGGAACG
GCCAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGGCCAGAGTTGGTCATGAAG
TCCATTGTCCCCGTTGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATTTACGGTTTGATTATTGCTGTT
ATCATCAGTACCGGTATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGATGGGTACGCT
CACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTTTCCGCTGGAGTGGCCATTGGG
ATCGTCGGGGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTTGGGATG
ATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTCGCTCTTTACGGGCTTATTGTAGGAATCATC
CTCTCCTCCAGAGCTGGCCAGTCCAGAGCTGAATGAGAATGTGACC*ACAAGATTTGCCA
TCGTTCTGAGAAT
ATTTACTGGATTCT

QA 4 616 4 616
DS 

RD RR2D372TF 684 0 0
GGACTCATCTGAAA
GAAAGAAAAAAACAAAAATTAAATAAATAAAAACACGCAGCGATATCCACGCTGCCCCAT
CTCTCTCTCGCCAGATTTCAATCGTCGACTCGATTCTCAGATTTCAGATCCAAATCCAAA
AAAAAAAAAAATTCAGCATGTCAACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTCCTTTCTTCGGCT
TCCTCGGCACTGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATGGAACAGCAA
AGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCTATGGGAGTGATGAGGCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCA
TTGTCCCTGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATTTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCA
TCAGTACCGGAATCAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGATGGGTACGCTCACC
TCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCCGGAATGGCCATTGGGATCG
TCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTTGGGATGATTC
TTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTCGCTCTTTACGGGCTTATTGTAGGAATCATCCTCT
CCTCTAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAATGTGACCCACAAGATTTGCCGTCGT
TCTGAGAATG

QA 15 684 15 684
DS 

RD RR2F891TF 671 0 0
CAGCGATATCCACGCTGCCCCATCTCTCTC**GCCAGATTTCAATCGTCGACTCGATTCT
CAGATTTCAGATCCAAATCCAAAAAAAAGA****TTCAGCATGTCAACCTTCAGCGGCGA
TGAAACAGCTCCTTTCTTCGGCTTCCTCGGCGCTGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTAT
GGGAGCTGCTTATGGAACAGCAAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCTATGGGAGTGATGAG
GCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCATTGTCCCTGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATTTA
CGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGAATCAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTA
CCTCTTCGATGGGTACGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTC
CGCCGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCGAATGCTCAGCAGCC
TAAGCTCTTTGTTGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTCGCTCTTTACGG
GCTTATTGTAGGAATCATCCTCTCCTCTAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAATG
TGACCCACAAGATTTGCCGTCGTTCTGAGAATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTCTG
TGTGCTTTTTT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2DU68TF 695 0 0
GG
GCCCCATCTCTCTCTCGCCAGATTTCAATCGTCGACTCGATTCTCAGATTTCAGATCCAA
ATCCAAAAAAAAAAA***TTCAGCATGTCAACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTCCTTTC
TTCGGCTTCCTCGGCGCTGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATGGA
ACAGCAAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCTATGGGAGTGATGAGGCCAGAGTTGGTCATG
AAGTCCATTGTCCCTGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATTTACGGTTTGATTATTGCT
GTTATCATCAGTACCGGAATCAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGATGGGTAC
GCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCCGGAATGGCCATT
GGGATCGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTTGGG
ATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTCGCTCTTTACGGGCTTATTGTAGGAATC
ATCCTCTCCTCTAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAATGTGACCCGCAAGATTTG
CCGTCGTTCTGA*AATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTCTGTGTGCTTTTTTT*GTT
CTTTCCTTCTTTAGTATTTATCATCGGTAAAC
T

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR2FZ83TF 634 0 0
GG
AGATCCAAATCCAAAAAAAAAAAA**TTCAGCATGTCAACCTTCAGCGGCGATGAAACAG
CTCCTTTCTTCGGCTTCCTCGGCGCTGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTG
CTTATGGAACAGCAAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCTATGGGAGTGATGAGGCCAGAGT
TGGTCATGAAGTCCATTGTCCCTGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATTTACGGTTTGA
TTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGAATCAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCG
ATGGGTACGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCCGGAA
TGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCT
TTGTTGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTCGCTCTTTACGGGCTTATTG
TAGGAATCATCCTCTCCTCTAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAATGTGACCCAC
AAGATTTGCCGTCGTTCTGAGAATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTCTGTGTGCTTT
TTTTTGTTCTTTCCTTCTTTAGTATTTATCAT

QA 3 634 3 634
DS 

RD RR2A420TF 799 0 0
GGACTCATCTGAAAGAAAGAAAAAAACAAAAATTAAATAAATAAAAACACGCAGCGATAT
CCACGCTGCCCCATCTCTCTCTCGCCAGATTTCAATCGTCGACCCGATTCTCAGATTTCA
GATCCAAATCCAAAAAAAAAAAAAATTCAGCATGTCAACCTTCAGCGGCGATGAAACAGC
TCCTTTCTTCGGCTTCCTCGGCGCTGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGC
TTATGGAACAGCAAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCTATGGGAGTGATGAGGCCAGAGTT
GGTCATGAAGTCCATTGTCCCTGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATTTACGGTTTGAT
TATTGCTGTTATCATCAGTACCGGAATCAACCCCAGGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGA
TGGGTACGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCCGGAAT
GGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTT
TGTTGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTCGCTCTTTACGGGCTTATTGT
AGGAATCATCCTCTCCTCTAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAATGTGACCCACA
AGATTTGCCGTCGTTCTGAGAATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTCTGTGTGCTTTT
TTTTGTTCTTTCCTTCTTTAGTGTTTATCATCGGTAAACCTACAGATTTACTGGATTCTT
GGAACTTTGTTTCGGAAGC

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2CQ70JQ 394 0 0
ACCTCTTCGATGGGTACGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCT
CCGCCGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGC
CTAAGCTCTTTGTTGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTCGCTCTTTACG
GGCTTATTGTAGGAATCATCCTCTCCTCTAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAAT
GTGACCCCCAAGATTTGCCGTCGTTCTGAGAATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTCT
GTGTGCTTTTTTTTGTTCTTTCCTTCTTTAGTATTTATCATCGGTAAACCTACAGATTTA
CTGGATTCTTGGAACTTTGTTTCGGAAGCAAACT

QA 1 394 1 394
DS 

RD RR2C103TF 595 0 0
GGGC
GTTGGTGTGGCTTCTATGGGAGTGATGAGGCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCATTGTCCCT
GTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATTTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACC
GGAATCAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGATGGGTACGCTCACCTCTCCTCC
GGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCCGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGAT
GCCGGTGTCTGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTTGGGATGATTCTTATCCTT
ATCTTCGCAGAAGCGCTCGCTCTTTACGGGCTTATTGTAGGAATCATCCTCTCCTCTAGA
GCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAATGTGACCCACAAGATTTGCCGTCGTTCTGAGAA
TGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTCTGTGTGCTTTTTTTTGTTCTTTCCTTCTTTAGT
ATTTATCATCGGTAAACCTACGGATTTACTGGATTCTTGGAACTTTGTTTCGGAAGCAAA
CTCACCTATTCGTCATCCCCTTTTCTCTTTCGGTGGTTTGCTTTCAGGTTT

QA 5 595 5 595
DS 

RD RR2DU68JQ 519 0 0
CCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCCGGAATGGCCATTGGGAT
CGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTTGGGATGAT
TCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTCGCTCTTTACGGGCTTATTGTAGGAATCATCCT
CTCCTCTAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAATGTGACCCGCAAGATTTGCCGTC
GTTCTGA*AATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTCTGTGTGCTTTTTTT*GTTCTTTC
CTTCTTTAGTATTTATCATCGGTAAACCTACAGATTTACTGGATTCTCGGAACTTTGTTT
CGGAAGCAAACTCACCTATTCGTCATCCCCTTTTCTCTTTCGGTGGTTTGCTTTCAGGTT
TGTAGGGGTTCTCTTATCGTTCGGTTCTGTAATAAAGAGCTCTCAGGAGCTTGGTATGTT
TCTGTATTTTTGTATTGTCCTGAGGAAGTTTAAATA
ACG

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2F891JQ 689 0 0
AGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCTATGGGAGTGATGAGGCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCA
TTGTCCCTGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATTTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCA
TCAGTACCGGAATCAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGATGGGTACGCTCACC
TCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCCGGAATGGCCATTGGGATCG
TCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCGAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTTGGGATGATTC
TTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTCGCTCTTTACGGGCTTATTGTAGGAATCATCCTCT
CCTCTAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAATGTGACCCACAAGATTTGCCGTCGT
TCTGAGAATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTCTGTGTGCTTTTTTTTGTTCTTTCCT
TCTTTAGTATTTATCATCGGTAAACCTACAGATTTACTGGATTCTTGGAACTTTGTTTCG
GAAGCAAACTCACCTATTCGTCATCCCCTTTTCTCTTTCGGTGGTTTGCTTTCAGGTTTG
TAGGGGTTCTCTTATCGTTCGGTTCTGTAATAAAGAGCTCTCAGGAGCTTGGTATGTTTC
TGTATTTTTGTATTGTCCTGAGGAAGTTT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2A420JQ 750 0 0
TCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATGGAACAGCAAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCTA
TGGGAGTGATGAGGCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCATTGTCCCTGTGGTTATGGCTGGTG
TGTTGGGTATTTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGAATCAACCCCAGGG
CTAAGTCTTACTACCTCTTCGATGGGTACGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTC
TTGCTGGTCTCTCCGCCGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAA
ATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTTGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGC
TCGCTCTTTACGGGCTTATTGTAGGAATCATCCTCTCCTCTAGAGCTGGCCAGTCTAGAG
CTGAATGAGAATGTGACCCACAAGATTTGCCGTCGTTCTGAGAATGAGAGAATGTTACTT
CCTTTTCGTTCTGTGTGCTTTTTTTTGTTCTTTCCTTCTTTAGTGTTTATCATCGGTAAA
CCTACAGATTTACTGGATTCTTGGAACTTTGTTTCGGAAGCAAACTCACCTATTCGTCAT
CCCCTTTTCTCTTTCGGTGGTTTGCTTTCAGGTTTGTAGGGGTTCTCTTATCGTTCGGTT
CTGTAATAAAGAGCTCTCAGGAGCTTGGTATGTTTCTGTATTTTTGTATTGTCCTGAGGA
AGTTTAAATAACATTTATTCGTTTTGATT
T

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2FZ83JQ 724 0 0
TGGAACAGCAAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCTATGGGAGTGATGAGGCCAGAGTTGGT
CATGAAGTCCATTGTCCCTGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATTTACGGTTTGATTAT
TGCTGTTATCATCAGTACCGGAATCAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGATGG
GTACGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTCTCCGCCGGAATGGC
CATTGGGATCGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGT
TGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTCGCTCTTTACGGGCTTATTGTAGG
AATCATCCTCTCCTCTAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAATGTGACCCACAAGA
TTTGCCGTCGTTCTGAGAATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTTCTGTGTGCTTTTTTT
TGTTCTTTCCTTCTTTAGTATTTATCATCGGTAAACCTACAGATTTACTGGATTCTTGGA
ACTTTGTTTCGGAAGCAAACTCACCTATTCGTCATCCCCTTTTCTCTTTCGGTGGTTTGC
TTTCAGGTTTGTAGGGGTTCTCTTATCGTTCGGTTCTGTAATAAAGAACTCTCAGGAGCT
TGGTATGTTTCTGTATTTTTGTATTGTCCTGAGGAAGTTTAAATAACATTTATTTGTTTT
GATT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2H566JQB 774 0 0
TATGGGAGCTGCTTATGGAACAGCGAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGAT
GAGGCCAGAGTTGGTGATGAAGTCTATCGTCCCCGTTGTCATGGCTGGTGTGTTGGGTAT
TTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGAATCAACCCCAAGGCTAAGTCTTA
CTACCTATTTGATGGATACGCTCACCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCT
CTCCGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCA
GCCTAAGCTCTTTGTTGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTTGCTCTTTA
CGGGCTTATTGTAGGAATCATCCTCTCCTCCAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGA
ATGTGACCCACAAGATTTGCCGTCGTTCTGAGAATGAGAGAATGTTACTTCCTTTTCGTT
CTGTGTGCGTTTTTTTGTTCTTTCCTTCTTTAGTATTTATCATCGGTAAACCTACAGATT
TACTGGATTCTTGGAACTTTGTTCCGGAAACAAACCCACCTATTCGTCGTCCCCTTTTCT
CTTTCGGTGGTTTGCTTTCGGGTTTGTAGGGGTTCTCTTATCGTTCGGTTCTGTAATAAA
GAGCTCTCAGGAGCTTGGTATGTCTCTGTATTTTTGTATTGTCCTGAGGAAGTTTAAATA
*CATTTATTTGTTTTGATTAAAAAGTTGCATTTATACGTAAAGAAGTTTGCTTT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 4 14

CO CL188Contig1 677 2 2 U
GGACAGATCAATTCGATCGTCTTTCTCAAAACAGAACAGCAAGAACATTACGAGGAACCA
TGTCATCGAACCAAGAAAATGTGAAGAAGGAGAAACTTCATATAACAATGAAGACACAGG
AAGTGGATCCAAACGAGAAGGAAGAGAAGTCTGAGGTGGAGATGGAAGTTAAGGCCAAGT
CAGTTGAGAAGGTTAAAATAAAGGACGAAGTAGACAAGAGTGGAGAGAAATCAAAAGATG
AGAAGGAAAAAGAAAAGACAAAGGTAAAAGACGAAAAAAAGAAACATGGGAAAGATGATG
AAGGCCATGGAGATATGGAAGTGGAAGAGGAAGATAAGAAACAAAAGAAGAAAAAGAAAG
GTAAGGAGAAGAAAGATGAGGATGTATCACAAGGAAATGAGGAGTTAGAAGATGACAAAG
AAGGTAAGAAGAAGGCGAATAAAGAGAAGAAAACGAAAGAAGATTCCAAGAAGGGTAAGG
AAGACAAGAAGAAGAAAAAGGAAGAGAAAGATGAGCCTGAGGAAAAAATTGAAGGAAAGA
AGAAAAAAGAGAAGAAAGACTCTGATGTAAAAGATGAAGAAACAGAGAAGGAACACAAGA
AGAAAAAGAAAGATAAGGAGAAGAAAGATGAGGATGCATCACAACAAAAAGAGGATTTAG
AAGTAGAAGGTGGTAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ58JQ C 1
AF RR2AQ58TF U 1
BS 1 661 RR2AQ58TF
BS 662 677 RR2AQ58JQ

RD RR2AQ58JQ 677 0 0
GGACAGATCAATTCGATCGTCTTTCTCAAAACAGAACAGCAAGAACATTACGAGGAACCA
TGTCATCGAACCAAGAAAATGTGAAGAAGGAGAAACTTCATATAACAATGAAGACACAGG
AAGTGGATCCAAACGAGAAGGAAGAGAAGTCTGAGGTGGAGATGGAAGTTAAGGCCAAGT
CAGTTGAGAAGGTTAAAATAAAGGACGAAGTAGACAAGAGTGGAGAGAAATCAAAAGATG
AGAAGGAAAAAGAAAAGACAAAGGTAAAAGACGAAAAAAAGAAACATGGGAAAGATGATG
AAGGCCATGGAGATATGGAAGTGGAAGAGGAAGATAAGAAACAAAAGAAGAAAAAGAAAG
GTAAGGAGAAGAAAGATGAGGATGTATCACAAGGAAATGAGGAGTTAGAAGATGACAAAG
AAGGTAAGAAGAAGGCGAATAAAGAGAAGAAAACGAAAGAAGATTCCAAGAAGGGTAAGG
AAGACAAGAAGAAGAAAAAGGAAGAGAAAGATGAGCCTGAGGAAAAAATTGAAGGAAAGA
AGAAAAAAGAGAAGAAAGACTCTGATGTAAAAGATGAAGAAACAGAGAAGGAACACAAGA
AGAAAAAGAAAGATAAGGAGAAGAAAGATGAGGATGCATCACAACAAAAAGAGGATTTAG
AAGTAGAAGGTGGTAAT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2AQ58TF 677 0 0
GGACAGATCAATTCGATCGTCTTTCTCAAAACAGAACAGCAAGAACATTACGAGGAACCA
TGTCATCGAACCAAGAAAATGTGAAGAAGGAGAAACTTCATATAACAATGAAGACACAGG
AAGTGGATCCAAACGAGAAGGAAGAGAAGTCTGAGGTGGAGATGGAAGTTAAGGCCAAGT
CAGTTGAGAAGGTTAAAATAAAGGACGAAGTAGACAAGAGTGGAGAGAAATCAAAAGATG
AGAAGGAAAAAGAAAAGACAAAGGTAAAAGACGAAAAAAAGAAACATGGGAAAGATGATG
AAGGCCATGGAGATATGGAAGTGGAAGAGGAAGATAAGAAACAAAAGAAGAAAAAGAAAG
GTAAGGAGAAGAAAGATGAGGATGTATCACAAGGAAATGAGGAGTTAGAAGATGACAAAG
AAGGTAAGAAGAAGGCGAATAAAGAGAAGAAAACGAAAGAAGATTCCAAGAAGGGTAAGG
AAGACAAGAAGAAGAAAAAGGAAGAGAAAGATGAGCCTGAGGAAAAAATTGAAGGAAAGA
AGAAAAAAGAGAAGAAAGACTCTGATGTAAAAGATGAAGAAACAGAGAAGGAACACAAGA
AGAAAAAGAAAGATAAGGAGAAGAAAGATGAGGATGCATCACAACAAAAAGAGGATTTAG
A
AGTAGAAAGTGGTAAT

QA 1 661 1 661
DS 



CO CL188Contig2 513 2 1 U
TCGTCTTTCTCAAAACAGAACAGCAAGAACATTACGAGGAACCATGTCATCGAACCAAGA
AAATGTGAAGAAAGAGAAACTTCATATAACAATGAAGACACAGGAAGTGGATCCAAACGA
GAAGGAAGAGAAGTCTGAGGTGGAAGTTAAGGCCAAGTCAGTTGAGAAGGTTAAAATAAA
GGACGAAGTAGACAAGAGTGGAGAGAAATCAAAAGATGAGAAGGAAAAAGAAAAGACAAA
GGTAAAAGATGAAAAAAAGAAACATGGGAAAGATGATGAAGGCCATGGAGATATGGAAGT
GGAAGAGGAAGATAAGAAACAAAAGAAGAAAAAGAAAGGTAAGGAGAAGAAAGATGAGGA
TGTATCACAAGGAAATGAGGAGTTAGAAGATGACAAAGAAGGTAAGAAGAAGGCGAATAA
AGAGAAGAAAACGAAAGAAGATTCCAAGAAGGGTAAGGAAGACAAGAAGAAGAAAAAGGA
AGAGAAAGATGAGCCTGAGGAAAAAATTGAAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EP31JQ C 1
AF RR2EP31TF U 1
BS 1 513 RR2EP31TF

RD RR2EP31JQ 513 0 0
TCGTCTTTCTCAAAACAGAACAGCAAGAACATTACGAGGAACCATGTCATCGAACCAAGA
AAATGTGAAGAAAGAGAAACTTCATATAACAATGAAGACACAGGAAGTGGATCCAAACGA
GAAGGAAGAGAAGTTTGAGGTGGAAGTTAAGGCCAAGTCAGTTGAGAAGGTTAAAATAAA
GGACGAAGTAGACAAGAGTGGAGAGAAATCAAAAGATGAGAAGGAAAAAGAAAAGACAAA
GGTAAAAGATGAAAAAAAGAAACATGGGAAAGATGATGAAGGCCATGGAGATATGGAAGT
GGAAGAGGAAGATAAGAAACAAAAGAAGAAAAAGAAAGGTAAGGAGAAGAAAGATGAGGA
TGTATCACAAGGAAATGAGGAGTTAGAAGATGACAAAGAAGGTAAGAAGAAGGCGAATAA
AGAGAAGAAAACGAAAGAAGATTCCAAGAAGGGTAAGGAAGACAAGAAGAAGAAAAAGGA
AGAGAAAGATGAGCCTGAGGAAAAAATTGAAGG

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2EP31TF 513 0 0
TCGTCTTTCTCAAAACAGAACAGCAAGAACATTACGAGGAACCATGTCATCGAACCAAGA
AAATGTGAAGAAAGAGAAACTTCATATAACAATGAAGACACAGGAAGTGGATCCAAACGA
GAAGGAAGAGAAGTCTGAGGTGGAAGTTAAGGCCAAGTCAGTTGAGAAGGTTAAAATAAA
GGACGAAGTAGACAAGAGTGGAGAGAAATCAAAAGATGAGAAGGAAAAAGAAAAGACAAA
GGTAAAAGATGAAAAAAAGAAACATGGGAAAGATGATGAAGGCCATGGAGATATGGAAGT
GGAAGAGGAAGATAAGAAACAAAAGAAGAAAAAGAAAGGTAAGGAGAAGAAAGATGAGGA
TGTATCACAAGGAAATGAGGAGTTAGAAGATGACAAAGAAGGTAAGAAGAAGGCGAATAA
AGAGAAGAAAACGAAAGAAGATTCCAAGAAGGGTAAGGAAGACAAGAAGAAGAAAAAGGA
AGAGAAAGATGAGCCTGAGGAAAAAATTGAAGG

QA 1 513 1 513
DS 



CO CL188Contig3 776 2 6 U
TCGTCTTTCTCAAAAACAGAACAAGAAGAACACTATAAGGAATCATGGCAACGAACCAAG
AAAATGTCAAGAAAGAGAAACTTCACATAGAAATGAAGACGGAGGAAGTGGATCCAAACG
AGAAGGGAGAGAAGGTTAAGGTGGAGATGGAAGTTAAGGCCAAGTCAATTGAGAAGACAA
AGGTAAAAGATGAGGCAGAAGAAGACAAACATGCCAAGAATAAAGATAAACATGGGAAAG
GTGAAGAAGGCCATGGAGAAATGGAAGTGGAAGAGGAAGATAAGAAACAAAAGAAGAAAA
AGAAAGACAAAAAGAAGAACAAGAAAAAAGACCCAAAGGAAAAGAAAAAAACAAAGGATG
AAGATGAGAAGAAAGCTCATACAGAAGTTGAGGCCAAGGACGTCAACATAGCAGGGTCAA
AAGATGAAGTTGGCGATGAACAAAAGGAGAAGAAGAAAGAAAAAGATGTTAAGAAGCCTA
ATGACACCAAGAAGAAGGGTAATGACATCGGTAAGCTGAAAATGAAGCTAAAGAAGATCG
ATGAAAAAATAGGAGCTCTAATGGAGAAAAAGGCAGAAATTGTGAATCAGATTAAAGACG
CAGAGGGAATGGGAAAGGGAGAGCAAGAAGGGTGAAACATAAATAATTAGGAAGCGTCTG
AAAAATATAAACTGGCTTAACAATACAGAGAAGCTTTATAATGTTGAACTGGACACTAAT
CTTTTATGTTTTTCTTTCTCAAGAGTTGTTGTGATAACTTGAAATGGTTCATCTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC06TF U 1
AF RR2GC06JQ C 1
BS 1 548 RR2GC06TF
BS 549 549 RR2GC06JQ
BS 550 552 RR2GC06TF
BS 553 553 RR2GC06JQ
BS 554 571 RR2GC06TF
BS 572 776 RR2GC06JQ

RD RR2GC06TF 571 0 0
TCGTCTTTCTCAAAAACAGAACAAGAAGAACACTATAAGGAATCATGGCAACGAACCAAG
AAAATGTCAAGAAAGAGAAACTTCACATAGAAATGAAGACGGAGGAAGTGGATCCAAACG
AGAAGGGAGAGAAGGTTAAGGTGGAGATGGAAGTTAAGGCCAAGTCAATTGAGAAGACAA
AGGTAAAAGATGAGGCAGAAGAAGACAAACATGCCAAGAATAAAGATAAACATGGGAAAG
GTGAAGAAGGCCATGGAGAAATGGAAGTGGAAGAGGAAGATAAGAAACAAAAGAAGAAAA
AGAAAGACAAAAAGAAGAACAAGAAAAAAGACCCAAAGGAAAAGAAAAAAACAAAGGATG
AAGATGAGAAGAAAGCTCATACAGAAGTTGAGGCCAAGGACGTCAACATAGCAGGGTCAA
AAGATGAAGTTGGCGATGAACAAAAGGAGAAGAAGAAAGAAAAAGATGTTAAGAAGCCTA
ATGACACCAAGAAGAAGGGTAATGACATCGGTAAGCTGAAAATGAAGCTAAAGAAGATCG
ATGAAAAA*TAG*AGCTCTAATGGAGAAAAA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2GC06JQ 776 0 0
TCGTCTTTCTCAAAAACAGAACAAGAAGAACACTATAAGGAATCATGGCAACGAACCAAG
AAAATGTCAAGAAAGAGAAACTTCACATAGAAATGAAGACGGAGGAAGTGGATCCAAACG
AGAAGGGAGAGAAGGTTAAGGTGGAGATGGAAGTTAAGGCCAAGTCAATTGAGAAGACAA
AGGTAAAAGATGAGGCAGAAGAAGACAAACATGCCAAGAATAAAGATAAACATGGGAAAG
GTGAAGAAGGCCATGGAGAAATGGAAGTGGAAGAGGAAGATAAGAAACAAAAGAAGAAAA
AGAAAGACAAAAAGAAGAACAAGAAAAAAGACCCAAAGGAAAAGAAAAAAACAAAGGATG
AAGATGAGAAGAAAGCTCATACAGAAGTTGAGGCCAAGGACGTCAACATAGCAGGGTCAA
AAGATGAAGTTGGCGATGAACAAAAGGAGAAGAAGAAAGAAAAAGATGTTAAGAAGCCTA
ATGACACCAAGAAGAAGGGTAATGACATCGGTAAGCTGAAAATGAAGCTAAAGAAGATCG
ATGAAAAAATAGGAGCTCTAATGGAGAAAAAGGCAGAAATTGTGAATCAGATTAAAGACG
CAGAGGGAATGGGAAAGGGAGAGCAAGAAGGGTGAAACATAAATAATTAGGAAGCGTCTG
AAAAATATAAACTGGCTTAACAATACAGAGAAGCTTTATAATGTTGAACTGGACACTAAT
CTTTTATGTTTTTCTTTCTCAAGAGTTGTTGTGATAACTTGAAATGGTTCATCTAC

QA 1 776 1 776
DS 



CO CL188Contig4 1487 8 9 U
TTTTAATTCGAACTTGCAAATATATATATTCAAACACAATCGAAACCGTTACAACATGGA
TGATATGAAAGAACAAAACCAAAGGTAGATGAACCATTTCAAGTTATCACAACAACTCTT
GAGAAAGAAAAACATAAAAGATTAGTGTCCAGTTCAACATTATAAAGCTTCTCTGTATTG
TTAAGCCAGTTTATATTTTTCAGACGCTTCCAAATTATTTATGTTTCACCCTTCTTGCTC
TCCCTTTCCCATTCCCTCTGCGTCTTTAATCTGATTCACAATTTCTGCCTTTTTCTCCAT
TAGAGCTCCTATTTTTTCATCGATCTTCTTTAGCTTCATTTTCAGCTTACCGATGTCATT
ACCCTTCTTCTTGGTGTCATTAGGCTTCTTAACATCTTTTTCTTTCTTCTCCTCCTTTTG
TTCATCGCCAACTTCATCTTTTGACCCTGCTATGTTGACGTCCTTGGCCTCAACTTCTGT
ATGAGCTTTCTTCTCATCTTCATCCTTTGTTTTTTTCTTTTCCTTTGGGTCTTTTTTCTT
GTTCTTCTTTTTGTCTTTCTTCTTGTTTTTCTTCCCATCTTCACCCTCTCCGCCTTCATC
TTTGTTTTGGCTCTCTTCTTCACTAACATTTTCTCCCTCGGTATCTTTTCCATTCTTAGT
TTTCTTGTCCTTGGACTTGCCTTCCTCTCCTTCAACTCCTGGTTCTTCAAATTTAATATC
TCTAGACAACACTTCAACTTCTTTGTTATCTTTTTCACCTTTCTCCTTATTCTTCTTTTG
CTTCTTTTCTCCTTCATCCTCATCAGTCTCCTTCTTCTTCGCCTTATCTTTACTCTTCTT
CTTTTCCTCCTTATGATCTTCTTTCTTCTCCCCTTTTTCTTCCACTCCATGCTCATCCTT
CTCTCCTTTTTTCAGCTTCTTTTCTTTCTTATCCTTTGATTCTTCTCTCAGTTTCTTCTC
TCTATCTTTCTTATTTCCCTCCTTATGATCTTCTTTCTTCTCCCCTTCTTCTTCTTCTTC
TCCATGCTCATCCTTCTCCTCTTTTTTCAGCTTCTTTTCTTTCTTATCCTTGGATTCTTC
TTTCAGTTTCTTCTTGTCTTTTCCGTCTGCACCTGATTCATCCTTCTCTTTCTTCTTCTT
TTTATTACTTTCTTCTTCCTCTAAATCCTCTTTTTGTTGTGATACATCCTCATCTTTCTT
CTCCTTATCTTTCTTTTTCTTCTTGTGTTCCTTCTCTGTTTCTTCATCTTTTACATCAGA
ATCTTTCTCCTCTTTTTTCTTCTTTCCTTCAATTTTTTCCTCAGTCTCATCCTCTCTTCC
TTTTTCTTCTTCTTTTCTTCCTTACCCTTGGAATCTTCTTTCGTTTTCTTCTCTTTATTC
GCCTTCTTCTTACCTTCTTTGTCATCTTCTAACTCCTCATTTCCTTGTGACACATCCTCA
TCTTTCTTCTCCTTATCTTTCTTTTTCTTCTTTTGTTTCTTATCTTC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD30JQ U 37
AF RR2GT42TF C 1
AF RR2GD30TF C 5
AF RR2GT42JQB U 5
AF RR2CX46JQ U 94
AF RR2CX46TF C 110
AF RR2E790JQ U 574
AF RR2BP60JQ U 789
BS 1 4 RR2GT42TF
BS 5 36 RR2GT42JQB
BS 37 302 RR2GD30JQ
BS 303 303 RR2CX46JQ
BS 304 478 RR2GD30JQ
BS 479 624 RR2GT42JQB
BS 625 814 RR2CX46JQ
BS 815 1207 RR2E790JQ
BS 1208 1487 RR2BP60JQ

RD RR2GD30JQ 442 0 0
CAATCGAAACCGTTACAACATGGATGATATGAAAGAACAAAACCAAAGGTAGATGAACCA
TTTCAAGTTATCACAACAACTCTTGAGAAAGAAAAACATAAAAGATTAGTGTCCAGTTCA
ACATTATAAAGCTTCTCTGTATTGTTAAGCCAGTTTATATTTTTCAGACGCTTCCAAATT
ATTTATGTTTCACCCTTCTTGCTCTCCCTTTCCCATTCCCTCTGCGTCTTTAATCTGATT
CACAATTTCTGCCTTTTTCTCCATTAAAGCTCCTATTTTTTCATCGATCTTCTTTAGCTT
CATTTTCAGCTTACCGATGTCATTACCCTTCTTCTTGGTGTCATTAGGCTTCTTAACATC
TTTTTCTTTCTTCTCCTCCTTTTGTTCATCGCCAACTTCATCTTTTGACCCTGCTATGTT
GACGTCCTTGGCCTCAACTTCT

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR2GT42TF 625 0 0
TTTTAATTCGAACTTGCAAATATATATATTCAAACACAATCGAAACCGTTACAACATGGA
TGATATGAAAGAACAAAACCAAAGGTAGATGAACCATTTCAAGTTATCACAACAACTCTT
GAGAAAGAAAAACATAAAAGATTAGTGTCCAGTTCAACATTATAAAGCTTCTCTGTATTG
TTAAGCCAGTTTATATTTTTCAGACGCTTCCAAATTATTTATGTTTCACCCTTCTTGCTC
TCCCTTTCCCATTCCCTCTGCGTCTTTAATCTGATTCACAATTTCTGCCTTTTTCTCCAT
TAGAGCTCCTATTTTTTCATCGATCTTCTTTAGCTTCATTTTCAGCTTACCGATGTCATT
ACCCTTCTTCTTGGTGTCATTAGGCTTCTTAACATCTTTTTCTTTCTTCTCCTCCTTTTG
TTCATCGCCAACTTCATCTTTTGACCCTGCTATGTTGACGTCCTTGGCCTCAACTTCTGT
ATGAGCTTTCTTCTCATCTTCATCCTTTGTTTTTTTCTTTTCCTTTGGGTCTTTTTTCTT
GTTCTTCTTTTTGTCTTTCTTCTTGTTTTTCTTCCCATCTTCACCCTCTCCGCCTTCATC
TTTGTTTTGGCTCTCTTCTTCACT
C

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2GD30TF 621 0 0
AATTCGAACTTGCAAATATATATATTCAAACACAATCGAAACCGTTACAACATGGATGAT
ATGAAAGAACAAAACCAAAGGTAGATGAACCATTTCAAGTTATCACAACAACTCTTGAGA
AAGAAAAACATAAAAGATTAGTGTCCAGTTCAACATTATAAAGCTTCTCTGTATTGTTAA
GCCAGTTTATATTTTTCAGACGCTTCCAAATTATTTATGTTTCACCCTTCTTGCTCTCCC
TTTCCCATTCCCTCTGCGTCTTTAATCTGATTCACAATTTCTGCCTTTTTCTCCATTAGA
GCTCCTATTTTTTCATCGATCTTCTTTAGCTTCATTTTCAGCTTACCGATGTCATTACCC
TTCTTCTTGGTGTCATTAGGCTTCTTAACATCTTTTTCTTTCTTCTCCTCCTTTTGTTCA
TCGCCAACTTCATCTTTTGACCCTGCTATGTTGACGTCCTTGGCCTCAACTTCTGTATGA
GCTTTCTTCTCATCTTCATCCTTTGTTTTTTTCTTTTCCTTTGGGTCTTTTTTCTTGTTC
TTCTTTTTGTCTTTCTTCTTGTTTTTCTTCCCATCTTCACCCTCTCCGCCTTCATCTTTG
TTTTGGCTCTCTTCTTCACT
C

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2GT42JQB 621 0 0
AATTCGAACTTGCAAATATATATATTCAAACACAATCGAAACCGTTACAACATGGATGAT
ATGAAAGAACAAAACCAAAGGTAGATGAACCATTTCAAGTTATCACAACAACTCTTGAGA
AAGAAAAACATAAAAAATTAGTGTCCAGTTCAACATTATAAAGCTTCTCTGTATTGTTAA
GCCAGTTTATATTTTTCAAACGCTTCCAAATTATTTATGTTTCACCCTTCTTGCTCTCCC
TTTCCCATTCCCTCTGCGTCTTTAATCTGATTCACAATTTCTGCCTTTTTCTCCATTAAA
GCTCCTATTTTTTCATCGATCTTCTTTAGCTTCATTTTCAGCTTACCGATGTCATTACCC
TTCTTCTTGGTGTCATTAGGCTTCTTAACATCTTTTTCTTTCTTCTCCTCCTTTTGTTCA
TCGCCAACTTCATCTTTTGACCCTGCTATGTTGACGTCCTTGGCCTCAACTTCTGTATGA
GCTTTCTTCTCATCTTCATCCTTTGTTTTTTTCTTTTCCTTTGGGTCTTTTTTCTTGTTC
TTCTTTTTGTCTTTCTTCTTGTTTTTCTTCCCATCTTCACCCTCTCCGCCTTCATCTTTG
TTTTGGCTCTCTTCTTCACT
C

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2CX46JQ 721 0 0
CCATTTCAAGTTATCACAACAACTCTTGAGAAAGAAAAACATAAAAGATTAGTGTCCAGT
TCAACATTATAAAGCTTTTCTGTATTGTTAAGCCAGTTTATATTTTTCAAACGCTTCCAA
ATTATTTATGTTTCACCCTTCTTGCTCTCCCTTTCCCATTCCCTCTGCGTCTTTAATCTG
ATTCACAATTTCTGCCTTTTTCTCCATTAGAGCTCCTATTTTTTCATCGATCTTCTTTAG
CTTCATTTTCAGCTTACCGATGTCATTACCCTTCTTCTTGGTGTCATTAGGCTTCTTAAC
ATCTTTTTCTTTCTTCTTCTCCTTTTGTTCATCGCCAACTTCATCTTTTGACCCTGCTAT
GTTGACGTCCTTGGCCTCAACTTCTGTATGAGCTTTCTTCTCATCTTCATCCTTTGTTTT
TTTCTTTTCCTTTGGGTCTTTTTTCTTGTTCTTCTTTTTGTCTTTCTTCTTGTTTTTCTT
CCCATCTTCACCCTCTCCGCCTTCATCTTTGTTTTGGTTCTCTTCTTCACTAACATTTTC
TCCCTCGGTATCTTTTCCATTCTTAGTTTTCTTGTCCTTGGACTTGCCTTCCTCTCCTTC
AACTCCTGGTTCTTCAAATTTAATATCTCTAGACAACACTTCAACTTCTTTGTTATCTTT
TTCACCTTTCTCCTTATTCTTCTTTTGCTTCTTTTCTCCTTCATCCTCATCAGTCTCCTT
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2CX46TF 735 0 0
CAACAACTCTTGAGAAAGAAAA*CATAAAAGATTAGTGTCCAGTTCAACATTATAAAGCT
T*TCTGTATTGTTAAGCCAGTTTATATTTTTCAGACGCTTCCAAATTATTTATGTTTCAC
CCTTCTTGCTCTCCCTTTCCCATTCCCTCTGCGTCTTTAATCTGATTCACAATTTCTGCC
TTTTTCTCCATTAGAGCTCCTATTTTTTCATCGATCTTCTTTAGCTTCATTTTCAGCTTA
CCGATGTCATTACCCTTCTTCTTGGTGTCATTAGGCTTCTTAACATCTTTTTCTTTCTTC
TTCTCCTTTTGTTCATCGCCAACTTCATCTTTTGACCCTGCTATGTTGACGTCCTTGGCC
TCAACTTCTGTATGAGCTTTCTTCTCATCTTCATCCTTTGTTTTTTTCTTTTCCTTTGGG
TCTTTTTTCTTGTTCTTCTTTTTGTCTTTCTTCTTGTTTTTCTTCCCATCTTCACCCTCT
CCGCCTTCATCTTTGTTTTGGTTCTCTTCTTCACTAACATTTTCTCCCTCGGTATCTTTT
CCATTCTTAGTTTTCTTGTCCTTGGACTTGCCTTCCTCTCCTTCAACTCCTGGTTCTTCA
AATTTAATATCTCTAGACAACACTTCAACTTCTTTGTTATCTTTTTCACCTTTCTCCTTA
TTCTTCTTTTGCTTCTTTTCTCCTTCATCCTCATCAGTCTCCTTCTTCTTCGCCTTATCT
TTACTCTTCTTC
ACC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2E790JQ 634 0 0
CCCATCTTCACCCTCTCCGCCTTCATCTTTGTTTTGGTTCTCTTCTTCACTAACATTTTC
TCCCTCGGTGTCTTTTCCATTCTTAGTTTTCTTGTCCTTGGACTTGCCTTCCTCTCCTTC
AGCTCCTGGTTCTTCAAATTTAATATCTCTAGACAACACTTCAACTTCTTTGTTATCTTT
TTCACCTTTCTCCTTCTTCTTCTTTTGCTTCTTTTCTCCTTCATCCTCATCAGTCTCCTT
CTTCTTCGCCTTATCTTTACTCTTCTTCTTTTCCTCCTTATGATCTTCTTTCTTCTCCCC
TTTTTCTTCCACTCCATGCTCATCCTTCTCTCCTTTTTTCAGCTTCTTTTCTTTCTTATC
CTTTGATTCTTCTCTCAGTTTCTTCTCTCTATCTTTCTTATTTCCCTCCTTATGATCTTC
TTTCTTCTCCCCTTCTTCTTCTTCTTCTCCATGCTCATCCTTCTCCTCTTTTTTCAGCTT
CTTTTCTTTCTTATCCTTGGATTCTTCTTTCAGTTTCTTCTTGTCTTTTCCGTCTGCACC
TGATTCATCCTTCTCTTTCTTCTTCTTTTTATTACTTTCTTCTTCCTCTAAATCCTCTTT
TTGTTGTGATACATCCTCATCTTTCTTCTCCTTA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2BP60JQ 699 0 0
CTCCTTCATCCTCATCAGTCTCCTTCTTCTTCGCCTTATCTTTACTCTTCTTCTTTTCCT
CCTTATGATCTTCTTTCTTCTCCCCTTTTTCTTCCACTCCATGCTCATCCTTCTCTCCTT
TTTTCAGCTTCTTTTCTTTCTTATCCTTTGATTCTTCTTTCAGTTTCTTCTCTTTATCTT
TCTTATTTCCCTCCTTATGATCTTCTTTCTTCTCCCCTTCTTCTTCTTCTTCTCCATGCT
CATCCTTCTCCTCTTTTTTCAGCTTCTTTTCTTTCTTATCCTTGGATTCTTCTTTCAGTT
TCTTCTTGTCTTTTCCGTCTGCACCTGATTCATCCTTCTCTTTCTTCTTCTTTTTATTAC
TTTCTTCTTCCTCTAAATCCTCTTTTTGTTGTGATACATCCTCATCTTTCTTCTCCTTAT
CTTTCTTTTTCTTCTTGTGTTCCTTCTCTGTTTCTTCATCTTTTACATCAGAATCTTTCT
CCTCTTTTTTCTTCTTTCCTTCAATTTTTTCCTCAGTCTCATCCTCTCTTCCTTTTTCTT
CTTCTTTTCTTCCTTACCCTTGGAATCTTCTTTCGTTTTCTTCTCTTTATTCGCCTTCTT
CTTACCTTCTTTGTCATCTTCTAACTCCTCATTTCCTTGTGACACATCCTCATCTTTCTT
CTCCTTATCTTTCTTTTTCTTCTTTTGTTTCTTATCTTC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 16

CO CL189Contig1 1221 16 15 U
GGAACAAATTGCCGCTATGGTGAAATTGGTAGACACGCTGCTCTTAGAGAGCAGTGCTAG
AGCATCTCGGTTCGAGTCCGAGTAGCGGCATAAGATCTTATAAAAGAGATATTATAAGTT
TTATAATCAAATTAATACCCGACTTTTTTTATAAAATCGGGTAAAACCTAGTATTAATTT
ATTAATTTTTAACAAATTTTTTATGATTTTTTCAATTTTAGAGCATATATTAACTCATAT
ATCTTTTTCGGTCGTTTCAATTGTACTACTAATTTATTTTTTAACTTTATTAGTTAATTT
AGATGAAATCATAGGATTTTTTGATTCATCAGATAAAGGAATCGTAATTACGTTTTTTGG
TATAACAGGATTATTATTCACGCGTTGGATTTATTCAGGACATTTTCCATTAAGCAATTT
ATATGAATCATTAATTTTTCTTTCATGGGCTTTTGCAATTATTCATATAGTTTCCTATTT
TAATAAAAAAAAAAAAAA*TCACTTAAACGCAATAACTGCGCCAAGTGCTATTTTTATTC
AGGGTTTTGCTACTTCAGGCCTTTTAAACAACATGCCTCAGTCTGCAATATTAGTACCAG
CTCTCCAGTCCCAGTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGATCTTAGGCTATGGCGCTC
TGTTATGCGGATCATTATTATCAATAGCTCTTCTAGTCATTACATTTCGCAAGGTCGGAT
CTACTTTTTGGAAAAATAATATGAAAATAAAATTTTTATTAAATGAATTTTTTTCTTTTG
ATGTACTTTACTACATAAACGAAAGAAATTCTATTTTACTACAACAAAACATTAATTTTA
GTTTTTCTAGAAATTATTATAGGTATCAATTGATTGAACAATTAGATTATTGGAGTTTTC
GTATTATTAGTCTCGGATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTGTATGGG
CTAATGAAACGTGGGGTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTGGGCATTTATTA
CTTGGACCATCTTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAGGTATAA
ATTCTGCAATTGTGGCTTCGCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTGGCGTCA
ATCTTTTAGGAATAGGTTTACATAGTTATGGTTCATTTACATCGAATTAACTAAAACATT
AACAAAAAAAGAAAAGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 
55 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 40 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 
30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF55TF U 1
AF RR2CS93JQ C 99
AF RR2CS93TF U 99
AF RR2G620TF U 212
AF RR2AF40TF U 283
AF RR2A558TF U 359
AF RR2DF55JQ C 552
AF RR2FL76JQ C 476
AF RR2G620JQ C 485
AF RR2FL76TF U 476
AF RR2A558JQ C 428
AF RR2EZ11JQ C 842
AF RR2EZ11TF U 842
AF RR2AG61JQ C 775
AF RR2AG61TF U 775
AF RR2AF40JQ C 440
BS 1 481 RR2DF55TF
BS 482 927 RR2G620TF
BS 928 928 RR2AF40TF
BS 929 936 RR2G620TF
BS 937 937 RR2AF40TF
BS 938 948 RR2G620TF
BS 949 949 RR2A558TF
BS 950 963 RR2G620TF
BS 964 988 RR2AF40TF
BS 989 1065 RR2A558TF
BS 1066 1169 RR2EZ11TF
BS 1170 1170 RR2AG61TF
BS 1171 1201 RR2EZ11TF
BS 1202 1203 RR2AG61TF
BS 1204 1221 RR2AF40JQ

RD RR2DF55TF 481 0 0
GGAACAAATTGCCGCTATGGTGAAATTGGTAGACACGCTGCTCTTAGAGAGCAGTGCTAG
AGCATCTCGGTTCGAGTCCGAGTAGCGGCATAAGATCTTATAAAAGAGATATTATAAGTT
TTATAATCAAATTAATACCCGACTTTTTTTATAAAATCGGGTAAAACCTAGTATTAATTT
ATTAATTTTTAACAAATTTTTTATGATTTTTTCAATTTTAGAGCATATATTAACTCATAT
ATCTTTTTCGGTCGTTTCAATTGTACTACTAATTTATTTTTTAACTTTATTAGTTAATTT
AGATGAAATCATAGGATTTTTTGATTCATCAGATAAAGGAATCGTAATTACGTTTTTTGG
TATAACAGGATTATTATTCACGCGTTGGATTTATTCAGGACATTTTCCATTAAGCAATTT
ATATGAATCATTAATTTTTCTTTCATGGGCTTTTGCAATTATTCATATAGTTTCCTATTT
T

QA 1 481 1 481
DS 

RD RR2CS93JQ 383 0 0
G
ATAAAAGAGATATTATAAGTTTTATAATCAAATTAATACCCGACTTTTTTTATAAAATCG
GGTAAAACCTAGTATTAATTTATTAATTTTTAACAAATTTTTTATGATTTTTTCAATTTT
AGAGCATATATTAACTCATATATCTTTTTCGGTCGTTTCAATTGTACTACTAATTTATTT
TTTAACTTTATTAGTTAATTTAGATGAAATCATAGGATTTTTTGATTCATCAGATAAAGG
AATCGTAATTACGTTTTTTGGTATAACAGGATTATTATTCACGCGTTGGATTTATTCAGG
ACATTTTCCATTAAGCAATTTATATGAATCATTAATTTTTCTTTCATGGGCTTTTGCAAT
TATTCATATAGTTTCCTATTTT

QA 2 383 2 383
DS 

RD RR2CS93TF 383 0 0
G
ATAAAAGAGATATTATAAGTTTTATAATCAAATTAATACCCGACTTTTTTTATAAAATCG
GGTAAAACCTAGTATTAATTTATTAATTTTTAACAAATTTTTTATGATTTTTTCAATTTT
AGAGCATATATTAACTCATATATCTTTTTCGGTCGTTTCAATTGTACTACTAATTTATTT
TTTAACTTTATTAGTTAATTTAGATGAAATCATAGGATTTTTTGATTCATCAGATAAAGG
AATCGTAATTACGTTTTTTGGTATAACAGGATTATTATTCACGCGTTGGATTTATTCAGG
ACATTTTCCATTAAGCAATTTATATGAATCATTAATTTTTCTTTCATGGGCTTTTGCAAT
TATTCATATAGTTTCCTATTTT

QA 2 383 2 383
DS 

RD RR2G620TF 753 0 0
G
CAATTTTAGAGCATATATTAACTCATATATCTTTTTCGGTCGTTTCAATTGTACTACTAA
TTTATTTTTTAACTTTATTAGTTAATTTAGATGAAATCATAGGATTTTTTGATTCATCAG
ATAAAGGAATCGTAATTACGTTTTTTGGTATAACAGGATTATTATTCACGCGTTGGATTT
ATTCAGGACATTTTCCATTAAGCAATTTATATGAATCATTAATTTTTCTTTCATGGGCTT
TTGCAATTATTCATATAGTTTCCTATTTTAATAAAAAAAAAAAAAA*TCACTTAAACGCA
ATAACTGCGCCAAGTGCTATTTTTATTCAGGGTTTTGCTACTTCAGGCCTTTTAAACAAC
ATGCCTCAGTCTGCAATATTAGTACCAGCTCTCCAGTCCCAGTGGTTAATGATGCACGTA
AGTATGATGATCTTAGGCTATGGCGCTCTGTTATGCGGATCATTATTATCAATAGCTCTT
CTAGTCATTACATTTCGCAAGGTCGGATCTACTTTTTGGAAAAATAATATGAAAATAAAA
TTTTTATTAAATGAATTTTTTTCTTTTGATGTACTTTACTACATAAACGAAAGAAATTCT
ATTTTACTACAACAAAACATTAATTTTAGTTTTTCTAGAAATTATTATAGGTATCAATTG
ATTGAACAATTAGATTATTGGAGTTTTCGTATTATTAGTCTCGGATTTATCTTTT*AACC
GTCG*CATTCTTTCAG*AGCTGTATGGGCTA
T

QA 2 752 2 752
DS 

RD RR2AF40TF 708 0 0
AACTTTATTAGTTAATTTAGATGAAATCATAGGATTTTTTGATTCATCAGATAAAGGAAT
CGTAATTACGTTTTTTGGTATAACAGGATTATTATTCACGCGTTGGATTTATTCAGGACA
TTTTCCATTAAGCAATTTATATGAATCATTAATTTTTCTTTCATGGGCTTTTGCAATTAT
TCATATAGTTTCCTATTTTAATAAAAAAAAAAAAA**TCACTTAAACGCAATAACTGCGC
CAAGTGCTATTTTTATTCAGGGTTTTGCTACTTCAGGCCTTTTAAACAACATGCCTCAGT
CTGCAATATTAGTACCAGCTCTCCAGTCCCAGTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGA
TCTTAGGCTATGGCGCTCTGTTATGCGGATCATTATTATCAATAGCTCTTCTAGTCATTA
CATTTCGCAAGGTCGGATCTACTTTTTGGAAAAATAATATGAAAATAAAATTTTTATTAA
ATGAATTTTTTTCTTTTGATGTACTTTACTACATAAACGAAAGAAATTCTATTTTACTAC
AACAAAACATTAATTTTAGTTTTTCTAGAAATTATTATAGGTATCAATTGATTGAACAAT
TAGATTATTGGAGTTTTCGTATTATTAGTCTCGGATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTC
TTTCAG*AGCTGTATGGGCTAATGAAACGTGGGGTTCATATTGGAA
AT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2A558TF 707 0 0
GGTATAACAGGATTATTATTCACGCGTTGGATTTATTCAGGACATTTTCCATTAAGCAAT
TTATATGAATCATTAATCTTTCTTTCATGGGCTTTTGCAATTATTCATATAGTTTCCTAT
TTTAATAAAAAAAAAAAAAA*TCACTTAAACGCAATAACTGCGCCAAGTGCTATTTTTAT
TCAGGGTTTTGCTACTTCAGGCCTTTTAAACAACATGCCTCAGTCTGCAATATTAGTACC
AGCTCTCCAGTCCCAGTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGATCTTAGGCTATGGCGC
TCTGTTATGCGGATCATTATTATCAATAGCTCTTCTAGTCATTACATTTCGCAAGGTCGG
ATCTACTTTTTGGAAAAATAATATGAAAATAAAATTTTTATTAAATGAATTTTTTTCTTT
TGATGTACTTTACTACATAAACGAAAGAAATTCTATTTTACTACAACAAAACATTAATTT
TAGTTTTTCTAGAAATTATTATAGGTATCAATTGATTGAACAATTAGATTATTGGAGTTT
TCGTATTATTAGTCTCGGATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTGTATG
GGCTAATGAAACGTGGGGTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTGGGCATTTAT
TACTTGGACCATCTTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2DF55JQ 649 0 0
ACTTCAGGCCTTTTAAACAACATGCCTCCG****CAATATTAGTACCAGCTCTCCAGTCC
CAGTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGATCTTAGGCTATGGCGCTCTGTTATGCGGA
TCATTATTATCAATAGCTCTTCTAGTCATTACATTTCGCAAGGTCGGATCTACTTTTTGG
AAAAATAATATGAAAATAAAATTTTTATTAAATGAATTTTTTTCTTTTGATGTACTTTAC
TACATAAACGAAAGAAATTCTATTTTACTACAACAAAACATTAATTTTAGTTTTTCTAGA
AATTATTATAGGTATCAATTGATTGAACAATTAGATTATTGGAGTTTTCGTATTATTAGT
CTCGGATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTGTATGGGCTAATGAAACG
TGGGGTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTGGGCATTTATTACTTGGACCATC
TTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAGGTATAAATTCTGCAATT
GTGGCTTCGCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTGGCGTCAATCTTTTAGGA
ATAGGTTTACATAGTTATGGTTCATTTACATCGAATTAACTAAAACATT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2FL76JQ 725 0 0
GATTTTAATA
AAAAAAAAAAAAAATCACTTAAACGCAATAACTGCGCCAAGTGCTATTTTTATTCAGGGT
TTTGCTACTTCAGGCCTTTTAAACAACATGCCTCAGTCTGCAATATTAGTACCAGCTCTC
CAGTCCCAGTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGATCTTAGGCTATGGCGCTCTGTTA
TGCGGATCATTATTATCAATAGCTCTTCTAGTCATTACATTTCGCAAGGTCGGATCTACT
TTTTGGAAAAATAATATGAAAATAAAATTTTTATTAAATGAATTTTTTTCTTTTGATGTA
CTTTACTACATAAACGAAAGAAATTCTATTTTACTACAACAAAACATTAATTTTAGTTTT
TCTAGAAATTATTATAGGTATCAATTGATTGAACAATTAGATTATTGGAGTTTTCGTATT
ATTAGTCTCGGATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTGTATGGGCTAAT
GAAACGTGGGGTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTGGGCATTTATTACTTGG
ACCATCTTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAGGTATAAATTCT
GCAATTGTGGCTTCGCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTGGCGTCAATCTT
TTAGGAATAGGTTTACATAGTTATGTTTCATTTACATCGAATTAACTAAAACATT

QA 11 725 11 725
DS 

RD RR2G620JQ 716 0 0
A
AAAAAAAAAAAAAATCACTTAAACGCAATAACTGCGCCAAGTGCTATTTTTATTCAGGGT
TTTGCTACTTCAGGCCTTTTAAACAACATGCCTCAGTCTGCAATATTAGTACCAGCTCTC
CAGTCCCAGTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGATCTTAGGCTATGGCGCTCTGTTA
TGCGGATCATTATTATCAATAGCTCTTCTAGTCATTACATTTCGCAAGGTCGGATCTACT
TTTTGGAAAAATAATATGAAAATAAAATTTTTATTAAATGAATTTTTTTCTTTTGATGTA
CTTTACTACATAAACGAAAGAAATTCTATTTTACTACAACAAAACATTAATTTTAGTTTT
TCTAGAAATTATTATAGGTATCAATTGATTGAACAATTAGATTATTGGAGTTTTCGTATT
ATTAGTCTCGGATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTGTATGGGCTAAT
GAAACGTGGGGTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTGGGCATTTATTACTTGG
ACCATCTTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAGGTATAAATTCT
GCAATTGTGGCTTCGCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTGGCGTCAATCTT
TTAGGAATAGGTTTACATAGTTATGGTTCATTTACATCGAATTAACTAAAACATT

QA 2 716 2 716
DS 

RD RR2FL76TF 725 0 0
G
ATTTTAATAAAAAAAAAAAAAA*TCACTTAAACGCAATAACTGCGCCAAGTGCTATTTTT
ATTCAGGGTTTTGCTACTTCAGGCCTTTTAAACAACATGCCTCAGTCTGCAATATTAGTA
CCAGCTCTCCAGTCCCAGTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGATCTTAGGCTATGGC
GCTCTGTTATGCGGATCATTATTATCAATAGCTCTTCTAGTCATTACATTTCGCAAGGTC
GGATCTACTTTTTGGAAAAATAATATGAAAATAAAATTTTTATTAAATGAATTTTTTTCT
TTTGATGTACTTTACTACATAAACGAAAGAAATTCTATTTTACTACAACAAAACATTAAT
TTTAGTTTTTCTAGAAATTATTATAGGTATCAATTGATTGAACAATTAGATTATTGGAGT
TTTCGTATTATTAGTCTCGGATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTGTA
TGGGCTAATGAAACGTGGGGTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTGGGCATTT
ATTACTTGGACCATCTTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAGGT
ATAAATTCTGCAATTGTGGCTTCGCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTGGC
GTCAATCTTTTAGGAATAGGTTTACATAGTTATGTTTCATTTACATCGAATTAACTAAAA
CATT

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR2A558JQ 776 0 0
TCATTAATCTTTCTTTCATGGGCTTTTGCAATTATTCATATAGTTTCCTATTTTAATAAA
AAAAAAAAAAAATCACTTAAACGCAATAACTGCGCCAAGTGCTATTTTTATTCAGGGTTT
TGCTACTTCAGGCCTTTTAAACAACATGCCTCAGTCTGCAATATTAGTACCAGCTCTCCA
GTCCCAGTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGATCTTAGGCTATGGCGCTCTGTTATG
CGGATCATTATTATCAATAGCTCTTCTAGTCATTACATTTCGCAAGGTCGGATCTACTTT
TTGGAAAAATAATATGAAAATAAAATTTTTATTAAATGAATTTTTTTCTTTTGATGTACT
TTACTACATAAACGAAAGAAATTCTATTTTACTACAACAAAACATTAATTTTAGTTTTTC
TAGAAATTATTATAGGTATCAATTGATTGAACAATTAGATTATTGGAGTTTTCGTATTAT
TAGTCTCGGATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTGTATGGGCTAATGA
AACGTGGGGTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTGGGCATTTATTACTTGGAC
CATCTTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAGGTATAAATTCTGC
AATTGTGGCTTCGCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTGGCGTCAATCTTTT
AGGAATAGGTTTACATAGTTATGGTTCATTTACATCGAATTAACTAAAACATTAAC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2EZ11JQ 362 0 0
TTTTTCTAGAAATTATTATAGGTATCAATTGATTGAACAATTAGATTATTGGAGTTTTCG
TATTATTAGTCTCGGATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTGTATGGGC
TAATGAAACGTGGGGTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTGGGCATTTATTAC
TTGGACCATCTTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAGGTATAAA
TTCTGCAATTGTGGCTTCGCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTGGCGTCAA
TCTTTTAGGAATAGGTTTACATAGTTATAGTTCATTTACATCGAATTAACTAAAACATTA
GC

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR2EZ11TF 362 0 0
TTTTTCTAGAAATTATTATAGGTATCAATTGATTGAACAATTAGATTATTGGAGTTTTCG
TATTATTAGTCTCGGATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTGTATGGGC
TAATGAAACGTGGGGTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTGGGCATTTATTAC
TTGGACCATCTTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAGGTATAAA
TTCTGCAATTGTGGCTTCGCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTGGCGTCAA
TCTTTTAGGAATAGGTTTACATAGTTATAGTTCATTTACATCGAATTAACTAAAACATTA
GC

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR2AG61JQ 429 0 0
CTTTTGATGTACTTTACTACATAAACGAAAGAAATTCTATTTTACTACAACAAAACATTA
ATTTTAGTTTTTCTAGAAATTATTATAGGTATCAATTGATTGAACAATTAGATTATTGGA
GTTTTCGTATTATTAGTCTCGGATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTG
TATGGGCTAATGAAACGTGGGGTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTAGGCAT
TTATTACTTGGACCATCTTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAG
GTATAAATTCTGCAATTGTGGCTTCGCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTG
GCGTCAATCTTTTAGGAATAGGTTTACATAGTTATGGTTCATTTACATCGAATTAACTAA
AACATTAAC

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR2AG61TF 429 0 0
CTTTTGATGTACTTTACTACATAAACGAAAGAAATTCTATTTTACTACAACAAAACATTA
ATTTTAGTTTTTCTAGAAATTATTATAGGTATCAATTGATTGAACAATTAGATTATTGGA
GTTTTCGTATTATTAGTCTCGGATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTG
TATGGGCTAATGAAACGTGGGGTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTAGGCAT
TTATTACTTGGACCATCTTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAG
GTATAAATTCTGCAATTGTGGCTTCGCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTG
GCGTCAATCTTTTAGGAATAGGTTTACATAGTTATGGTTCATTTACATCGAATTAACTAA
AACATTAAC

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR2AF40JQ 782 0 0
CTTTCATGGGCTTTTGCAATTATTCATATAGTTTCCTATTTTAATAAAAAAAAAAAAAA*
TCACTTAAACGCAATAACTGCGCCAAGTGCTATTTTTATTCAGGGTTTTGCTACTTCAGG
CCTTTTAAACAACATGCCTCAGTCTGCAATATTAGTACCAGCTCTCCAGTCCCAGTGGTT
AATGATGCACGTAAGTATGATGATCTTAGGCTATGGCGCTCTGTTATGCGGATCATTATT
ATCAATAGCTCTTCTAGTCATTACATTTCGCAAGGTCGGATCTACTTTTTGGAAAAATAA
TATGAAAATAAAATTTTTATTAAATGAATTTTTTTCTTTTGATGTACTTTACTACATAAA
CGAAAGAAATTCTATTTTACTACAACAAAACATTAATTTTAGTTTTTCTAGAAATTATTA
TAGGTATCAATTGATTGAACAATTAGATTATTGGAGTTTTCGTATTATTAGTCTCGGATT
TATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTGTATGGGCTAATGAAACGTGGGGTTC
ATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTGGGCATTTATTACTTGGACCATCTTCGCAAT
TTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAGGTATAAATTCTGCAATTGTGGCTTC
GCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTGGCGTCAATCTTTTAGGAATAGGTTT
ACATAGTTATGGTTCATTTACATCGAATTAACTAAAACATTAACAAAAAAAGAAAAGAAT
CC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 2 10

CO CL190Contig1 1101 5 27 U
GGGATCACAAAAACCATAACCATCTGTCGCCATGGCAGCCTCTCTCCAATCCGCCGCTAC
ATTTCTCCAGTCGGCGAAAATCGCCACTGTTCCTTCTCGTGGCAGTGCTCCCCTCCGGTC
GACTCAGACCGTCGGCAAATCATTCGGGCTAGAAACTTCCTCTGCTCGCCTCACTTGTTC
CTTCCAGTCTGACTTCAAGGACTTCGCCGGTAAATGCTCCGACGCTGTCAAGATCGCCGG
ATTCGCTCTCGCAACCTCTGCTCTCGTCGTCTCGGGAGCAAGTGCAGAAGGAGCTCCCAA
GAGACTGACTTACGACGAGATACAGAGCAAGACATACATGGAAGTCAAGGGAACTGGAAC
GGCTAACCAGTGCCCAACTATTGACGGTGGCTCTGAGACTTTCTCCTTCAAACCGGGAAA
GTACGCTGGCAAGAAGTTCTGCTTCGAGCCTACTTCCTTCACCGTCAAGGCTGAGAGTGT
TAGCAAGAATGCGCCTCCTGACTTCCAAAACACCAAGCTCATGACCCGTCTCACCTACAC
TCTCGACGAAATCGAAGGCCCCTTCGAGGTTTCTTCTGACGGAAGCGTGAACTTCAAGGA
AGAAGACGGCATCGACTACGCTGCAGTCACTGTCCAGCTTCCAGGAGGCGAGCGTGTGCC
CTTCCTCTTCACAGTCAAGCAGCTTGACGCCTCAGGCAAACCAGACAACTTCACTGGCAA
ATTCTTGGTCCCTTCATACCGTGGCTCCTCCTTCTTGGACCCAAAGGGTCGTGGTGGATC
CACAGGATATGACAACGCAGTTGCATTGCCAGCTGGAGGGAGAGGAGACGAAGAGGAGCT
TTCAAAGGAGAACGTCAAGAACACAGCAGCTTCAGTGGGAGAGATCACTTTGAAAGTGAC
AAAGAGCAAACCGGAAACTGGTGAAGTGATCGGAGTGTTTGAGAGTCTTCAGCCGTCGGA
TACTGACTTGGGTGCCAAGGTACCAAAGGATGTTAAGATCCAAGGGGTGTGGTATGGTCA
ACTTGAGTGATCATGTTATCTATATCAAAACATCTTCTCTCTTAAATTGTATTCGATGAT
AATGAGAACATCTTTTGATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF36TF U 28
AF RR2E638TF U 5
AF RR2FW62TF U 1
AF RR2C528TF U 364
AF RR2DF36JQ C 407
BS 1 82 RR2FW62TF
BS 83 83 RR2E638TF
BS 84 234 RR2FW62TF
BS 235 235 RR2E638TF
BS 236 489 RR2FW62TF
BS 490 490 RR2E638TF
BS 491 492 RR2FW62TF
BS 493 493 RR2E638TF
BS 494 507 RR2FW62TF
BS 508 508 RR2E638TF
BS 509 549 RR2FW62TF
BS 550 550 RR2E638TF
BS 551 564 RR2FW62TF
BS 565 565 RR2E638TF
BS 566 585 RR2FW62TF
BS 586 586 RR2E638TF
BS 587 691 RR2FW62TF
BS 692 707 RR2C528TF
BS 708 708 RR2DF36JQ
BS 709 804 RR2C528TF
BS 805 805 RR2DF36JQ
BS 806 822 RR2C528TF
BS 823 823 RR2DF36JQ
BS 824 924 RR2C528TF
BS 925 925 RR2DF36JQ
BS 926 988 RR2C528TF
BS 989 1101 RR2DF36JQ

RD RR2DF36TF 541 0 0
C
GCCATGGCAGCCTCTCTCCAATCCGCCGCTACATTTCTCCAGTCGGCGAAAATCGCCACT
GTTCCTTCTCGTGGCAGTGCTCCCCTCCGGTCGACTCAGACCGTCGGCAAATCATTCGGG
CTAGAAACTTCCTCTGCTCGCCTCACTTGTTCCTTCCAGTCTGACTTCAAGGACTTCGCC
GGTAAATGCTCCGACGCTGTCAAGATCGCCGGATTCGCTCTCGCAACCTCTGCTCTCGTC
GTCTCGGGAGCAAGTGCAGAAGGAGCTCCCGAGAGACTGACTTACGACGAGATACAGAGC
AAGACATACATGGAAGTCAAGGGAACTGGAACGGCTAACCAGTGCCCAACTATTGACGGT
GGCTCTGAGACTTTCTCCTTCAAACCGGGAAAGTACGCTGGCAAGAAGTTCTGCTTCGAG
CCTACTTCCTTCACCGTCAAGGCTGAGAGTGTTAGCAAGAATGCGCCTCCTGACTTCCAA
AACACCGAGCTCATGACCCGTCTCACCTACACTCTCGACGAAATCGAAAGCCCCTTCGAG

QA 2 541 2 541
DS 

RD RR2E638TF 598 0 0
GG
ACAAAAACCATAACCATCTGTCGCCATGGCAGCCTCTCTCCAATCCGCCGCTACATTTCT
CCAGTCGGCGAAAATCGCCACTGTTCCTTCTCGTGGCAGTGCTCCCCTCCGGTCGACTCA
GACCGTCGGCAAATCATTCGGGCTAGAAACTTCCTCTGCTCGCCTCACTTGTTCCTTCCA
GTCTGACTTCAAGGACTTCGCCGGTAAATGCTCCGACGCTGTCAAGATCGCCGGATTCGC
TCTCGCAACCTCTGCTCTCGTCGTCTCGGGAGCAAGTGCAGAAGGAGCTCCCAAGAGACT
GACTTACGACGAGATACAGAGCAAGACATACATGGAAGTCAAGGGAACTGGAACGGCTAA
CCAGTGCCCAACTATTGACGGTGGCTCTGAGACTTTCTCCTTCAAACCGGGAAAGTACGC
TGGCAAGAAGTTCTGCTTCGAGCCTACTTCCTTCACCGTCAAGGCTGAGAGTGTTAGCAA
GAATGCGCCTCCTGACTTCCAAAACACCAAGCTCATGACCCGTCTCACCTACACTCTCGA
CGAAATCGAAGGCCCCTTCGAGGTTTCTTCTGACGGAAGCGTGAACTTCAAGGAAG

QA 3 598 3 598
DS 

RD RR2FW62TF 691 0 0
GGGATCACAAAAACCATAACCATCTGTCGCCATGGCAGCCTCTCTCCAATCCGCCGCTAC
ATTTCTCCAGTCGGCGAAAATCACCACTGTTCCTTCTCGTGGCAGTGCTCCCCTCCGGTC
GACTCAGACCGTCGGCAAATCATTCGGGCTAGAAACTTCCTCTGCTCGCCTCACTTGTTC
CTTCCAGTCTGACTTCAAGGACTTCGCCGGTAAATGCTCCGACGCTGTCAAGATAGCCGG
ATTCGCTCTCGCAACCTCTGCTCTCGTCGTCTCGGGAGCAAGTGCAGAAGGAGCTCCCAA
GAGACTGACTTACGACGAGATACAGAGCAAGACATACATGGAAGTCAAGGGAACTGGAAC
GGCTAACCAGTGCCCAACTATTGACGGTGGCTCTGAGACTTTCTCCTTCAAACCGGGAAA
GTACGCTGGCAAGAAGTTCTGCTTCGAGCCTACTTCCTTCACCGTCAAGGCTGAGAGTGT
TAGCAAGAACGCACCTCCTGACTTCCAGAACACCAAGCTCATGACCCGTCTCACCTACAC
TCTCGACGAGATCGAAGGCCCCTTTGAGGTTTCTTCTGACGGAAGTGTGAACTTCAAGGA
AGAAGACGGCATCGACTACGCTGCAGTCACTGTCCAGCTTCCAGGAGGCGAGCGTGTGCC
CTTCCTCTTCACAGTCAAGCAGCTTGACGCC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2C528TF 636 0 0
G
AACCAGTGCCCAACTATTGACGGTGGCTCTGAGACTTTCTCCTTCAAACCGGGAAAGTAC
GCTGGCAAGAAGTTCTGCTTCGAGCCTACTTCCTTCACCGTCAAGGCTGAGAGTGTTAGC
AAGAACACACCTCCTGACTTCCAGAACACCAAGCTCATGACCCGTCTCACCTACACTCTC
GACGAGATCGAAGGCCCCTTTGAGGTTTCTTCTGACGGAAGTGTGAACTTCAAGGAAGAA
GACGGCATCGACTACGCTGCAGTCACTGTCCAGCTTCCAGGAGGCGAGCTTGTGCCCTTC
CTCTTCACAGTCAAGCAGTTTGACGCCTCAGGCAAACCAGACAGCTTCACTGGCAAATTC
TTGGTCCCTTCATACCGTGGCTCCTCCTTCTTGGACCCAAAGGGTCGTGGTGGATCCACA
GGATATGACAACGCAGTTGCGTTGCCAGCTGGAGGGAGGGGAGACGAAGAGGAGCTTTCA
AAGGAGAACGTCAAGAACACAGCAGCTTCAGTGGGAGAGATCACTTTGAAAGTGACAAAG
AGCAAACCGGAAACTGGTGAGGTGATCGGAGTGTTTGAGAGTCTTCAGCCGTCGGATACT
GACTTGGGTGCCAAGGTACCAAAG
ATGTTAAGATC

QA 2 625 2 625
DS 

RD RR2DF36JQ 695 0 0
TTCAAACCGGGAAAGTACGCTGGCAAGAAGTTCTGCTTCGAGCCTACTTCCTTCACCGTC
AAGGCTGAGAGTGTTAGCAAGAATGCGCCTCCTGACTTCCAAAACACCGAGCTCATGACC
CGTCTCACCTACACTCTCGACGAAATCGAAGGCCCCTTCGAGGTTTCTTCTGACGGAAGC
GTGAACTTCAAGGAAGAAGACGGCATCGACTACGCTGCAGTCACTGTCCAGCTTCCAGGA
GGCGAGCGTGTGCCATTCCTCTTCACAGTCAAGCAGCTTGACGCCTCTGGCAAACCAGAC
AACTTCACTGGCAAATTCTTGGTCCCTTCATACCGTGGCTCCTCCTTCTTGGACCCAAAG
GGTCGTGGTGGATCCACAGGATATGACAACGCAGTTGCATTGCCAGCTGGAGGGAGAGGA
GACGAAGAGGAGCTTTCAAAGGAGAACGTCAAGAACACAGCAGCTTCAGTGGGAGAGATC
ACTTTGAAAGTGACAAAGAGCAAACCGGAAACTGGTGAAGTGATCGGAGTGTTTGAGAGT
CTTCAGCCGTCGGATACTGACTTGGGTGCCAAGGTACCAAAGGATGTTAAGATCCAAGGG
GTGTGGTATGGTCAACTTGAGTGATCATGTTATCTATATCAAAACATCTTCTCTCTTAAA
TTGTATTCGATGATAATGAGAACATCTTTTGATGC

QA 1 695 1 695
DS 



CO CL190Contig2 747 5 15 U
CTGCACAAGTTATTTCTCAGCATTAGACCATATGATTAAAGTTACATAGAGAACTATGGG
TACAAAAAGAAACAATTCAAGATTTAGGGCATGTGCATTTTTTATAATAGAAAAAGAAGA
AAATGTACTCATTGTAATGAAATACAAACAGAAGATGATTAGATATGATAACATGATCAC
TCAAGTTGACCATACCACACCCCTTGGATCTTCACATCCTTTGGTACCTTGGCACCTAGG
TCAGTATCCGAGGGCTGAAGACTCTCGAACACTCCGATCACTTCTCCAGTCTCTGGTTTG
CTCTTTGTCACTTTGAGAGTGATCTCTCCCACCGAAGCTGCCGTGTTCTTCACGTTCTCC
TTTGAAAGCTCCTCTTCGTCTCCTCTGCCTCCAGCTGGCAATGCAACGGCGTTGTCATAT
CCTGTGGATCCACCACGGCCCTTTGGGTCCAAGAAGGAGGAGCCACGGTATGAAGGGACT
AAGAATTTGCCAGTGAAGTTGTCTGGTTTACCAGAGGCGTCAAGCTGCTTGACTGTGAAG
AGGAAGGGCACGCGCTCGCCTCCTGGAAACTGGACAGTGACTGCAGCGTAGTCGATGCCG
TCTTCTTCCTTGAAGTTGACGCTTCCGTCAGAAGAAACCTCGAAGGGGCCTTCGATTTCG
TCAAGGGTGTAAGTGAGACGGGTCATGAGCTTGGTGTTCTGGAAATCGGGAGGAGCATTC
TTGCTAACACTCTCAGCCTTGACGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A920TF C 86
AF RR2GQ89JQ U 18
AF RR2GQ89TF C 18
AF RR2FM56JQ U 86
AF RR2HA82JQ U 1
BS 1 59 RR2HA82JQ
BS 60 60 RR2GQ89JQ
BS 61 62 RR2HA82JQ
BS 63 63 RR2GQ89JQ
BS 64 204 RR2HA82JQ
BS 205 205 RR2GQ89JQ
BS 206 437 RR2HA82JQ
BS 438 438 RR2GQ89JQ
BS 439 451 RR2HA82JQ
BS 452 452 RR2GQ89JQ
BS 453 500 RR2HA82JQ
BS 501 501 RR2GQ89JQ
BS 502 509 RR2HA82JQ
BS 510 510 RR2GQ89JQ
BS 511 747 RR2HA82JQ

RD RR2A920TF 329 0 0
AGGGCATGTGCATTTTTTATAATAGAAAAAGAAGAAAATGTACTCATTGTAATGAAATAC
AAACAGAAGATGATTAGATATGATAACATGATCACTCAAGTTGACCATACCACACCCCTT
GGATCTTCACATCCTTTGGTACCTTGGCACCTAGGTCAGTATCCGAGGGCTGAAGACTCT
CGAACACTCCGATCACTTCTCCAGTCTCTGGTTTGCTCTTTGTCACTTTGAGAGTGATCT
CTCCCACCGAAGCTGCCGTGTTCTTCACGTTCTCCTTTGAAAGCTCCTCTTCGTCTCCTC
TGCCTCCAGCTGGCAATGCAACGGCGTT
C

QA 1 328 1 328
DS 

RD RR2GQ89JQ 514 0 0
CG
GCATTAGACCATATGATTAAAGTTACATAGAGAACTATGGGTACAAAAAGAAACAATTCA
AGATTTAGGGCATGTGCATTTTTTATAATAGAAAAAGAAGAAAATGTACTCATTGTAATG
AAATACAAACAGAAGATGATTAGATATGATAACATGATCACTCAAGTTGACCATACCACA
CCCCTTGGATCTTCACATCCTTTGGTACCTTGGCACCTAGGTCAGTATCCGAGGGCTGAA
GACTCTCGAACACTCCGATCACTTCTCCAGTCTCTGGTTTGCTCTTTGTCACTTTGAGAG
CGATCTCTCCCACCGAAGCTGCCGTGTTCTTCACGTTCTCCTTTGAAAGCTCCTCTTCGT
CTCCTCTGCCTCCAGCTGGCAATGCAACGGCGTTGTCATATCCTGTGGATCCACCACGGC
CCTTTGGGTCCAAGAAGGAGGAGCCACGGTATGAAGGGACTAAGAATTTGCCAGTGAAGT
TGTCTGGTTTACCAGAGGCGTCAAGCTGCTT
C

QA 3 513 3 513
DS 

RD RR2GQ89TF 514 0 0
CG
GCATTAGACCATATGATTAAAGTTACATAGAGAACTATGGGTACAAAAAGAAACAATTCA
AGATTTAGGGCATGTGCATTTTTTATAATAGAAAAAGAAGAAAATGTACTCATTGTAATG
AAATACAAACAGAAGATGATTAGATATGATAACATGATCACTCAAGTTGACCATACCACA
CCCCTTGGATCTTCACATCCTTTGGTACCTTGGCACCTAGGTCAGTATCCGAGGGCTGAA
GACTCTCGAACACTCCGATCACTTCTCCAGTCTCTGGTTTGCTCTTTGTCACTTTGAGAG
CGATCTCTCCCACCGAAGCTGCCGTGTTCTTCACGTTCTCCTTTGAAAGCTCCTCTTCGT
CTCCTCTGCCTCCAGCTGGCAATGCAACGGCGTTGTCATATCCTGTGGATCCACCACGGC
CCTTTGGGTCCAAGAAGGAGGAGCCACGGTATGAAGGGACTAAGAATTTGCCAGTGAAGT
TGTCTGGTTTACCAGAGGCGTCAAGCTGCTT
C

QA 3 513 3 513
DS 

RD RR2FM56JQ 510 0 0
AGGGCATGTGAATTTTTTATAATAGAAAAAGAAGAAAATGTACTCATTGTAATGAAATAC
AAACAGAAGATGATTAGATATGATAACATGATCACTCAAGTTGACCATACCACACCCCTT
GGATCTTCACATCCTTTGGTACCTTGGCACCTAGGTCAGTATCCGAGGGCTGAAGACTCT
CGAACACTCCGATCACTTCTCCAGTCTCTGGTTTGCTCTTTGTCACTTTGAGAGTGATCT
CTCCCACCGAAGCTGCCGTGTTCTTCACGTTCTCCTTTGAAAGCTCCTCTTCGTCTCCTC
TGCCTCCAGCTGGCAATGCAACGGCGTTGTCATATCCTGTGGATCCACCACGACCCTTTG
GGTCCAGGAAGGAGGAGCCACGGTATGAAGGGACTAAGAATTTGCCAGTGAAGTTGTCTG
GTTTGCCAGAGGCGTCAAGCTGCTTGACTGTGAAGAGGAAGGGCACGCGCTCGCCTCCTG
GAAGCTGGACAGTGACTGCAGCGTAGTCGA

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2HA82JQ 747 0 0
CTGCACAAGTTATTTCTCAGCATTAGACCATATGATTAAAGTTACATAGAGAACTATGGA
TA*AAAAAGAAACAATTCAAGATTTAGGGCATGTGCATTTTTTATAATAGAAAAAGAAGA
AAATGTACTCATTGTAATGAAATACAAACAGAAGATGATTAGATATGATAACATGATCAC
TCAAGTTGACCATACCACACCCCTCGGATCTTCACATCCTTTGGTACCTTGGCACCTAGG
TCAGTATCCGAGGGCTGAAGACTCTCGAACACTCCGATCACTTCTCCAGTCTCTGGTTTG
CTCTTTGTCACTTTGAGAGTGATCTCTCCCACCGAAGCTGCCGTGTTCTTCACGTTCTCC
TTTGAAAGCTCCTCTTCGTCTCCTCTGCCTCCAGCTGGCAATGCAACGGCGTTGTCATAT
CCTGTGGATCCACCACGACCCTTTGGGTCCAGGAAGGAGGAGCCACGGTATGAAGGGACT
AAGAATTTGCCAGTGAAGTTATCTGGTTTGCCAGAGGCGTCAAGCTGCTTGACTGTGAAG
AGGAAGGGCACGCGCTCGCCTCCTGGAAACTGGACAGTGACTGCAGCGTAGTCGATGCCG
TCTTCTTCCTTGAAGTTGACGCTTCCGTCAGAAGAAACCTCGAAGGGGCCTTCGATTTCG
TCAAGGGTGTAAGTGAGACGGGTCATGAGCTTGGTGTTCTGGAAATCGGGAGGAGCATTC
TTGCTAACACTCTCAGCCTTGACGGTG

QA 1 747 1 747
DS 



AS 2 15

CO CL191Contig1 533 2 3 U
TTTTTCTCTCAACAATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTGTCTCCGGT
CAGAGATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTCACTCTCTACTCGACATATGTTCTCTG
TGTTACCGGAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCATCAGGCTCCAAGA
ATTCTAGATTACGACAACGAGGAGGGAACATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTACTACAG
GGATTCCATTGGTGAACGATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGATGAGCCTG
TTGTTGTTGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCCCATCGTCA
ATGAACTAGCACAGCAGTACACAGGGAAGTTGAAGTTCTTCAAGCTAAACACGGACGAGT
CTCCTGCAACCCCGGGAAAGTACGGTGTTAGAAGCATACCAACCATCATGATCTTTGTTA
AGGGCGAGAAGAAGGATACAATCATCGGCGCGGTGTCTAAAACCACATTAGCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED61TF U 1
AF RR2E895TF U 1
BS 1 171 RR2E895TF
BS 172 172 RR2ED61TF
BS 173 533 RR2E895TF

RD RR2ED61TF 218 0 0
TTTTTCTCTCAACAATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTGTCTCCGGT
CAGAGATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTCACTCTCTACTCGACATATGTTCTCTG
TGTTACCGGAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCATCGGGCTCCAAGA
ATTCTAGATTACGACAACGAGGAGGGAACATCATCTGT

QA 1 218 1 218
DS 

RD RR2E895TF 533 0 0
TTTTTCTCTCAACAATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTGTCTCCGGT
CAGAGATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTCACTCTCTACTCGACATATGTTCTCTG
TGTTACCGGAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCATCAGTCTCCAAGA
ATTCTAGATTACGACAACGAGGAGGGAACATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTACTACAG
GGATTCCATTGGTGAACGATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGATGAGCCTG
TTGTTGTTGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCCCATCGTCA
ATGAACTAGCACAGCAGTACACAGGGAAGTTGAAGTTCTTCAAGCTAAACACGGACGAGT
CTCCTGCAACCCCGGGAAAGTACGGTGTTAGAAGCATACCAACCATCATGATCTTTGTTA
AGGGCGAGAAGAAGGATACAATCATCGGCGCGGTGTCTAAAACCACATTAGCA

QA 1 533 1 533
DS 



CO CL191Contig2 742 13 10 U
CCTGGATATCATTTACATTTTGAGGTCTCAGAAGAATCTCAGCAACAGAACAAATCGTGT
GGTTCTTGTTTTTCTCTCCACAATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTG
TCTCCGTTCAGAGATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTCACTCTCTACTCGACATAT
GTTCTCTGTGTTACCGGAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCGGTCTC
GAAGAATTCTAGATTACGACAACGAGGAGGGATCATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTAC
TACAGGGATTCCATTGGTGAACGATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGATGA
GCCCGTTGTTGTGGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCCCAT
CGTCAATGAACTAGCACAGCAGTACACAGGGAAGATGAAGTTCTTCAAACTTAACACAGA
CGAGTCTCCTGCAACCCCGGGACAGTACGGTGTTAGAAGCATCCCAACCATCATGATCTT
CGTTAAGGGCGAGAAGAAGGATACAATCATCGGCGCAGTGTCTAAAACCACATTAGCAAC
AAGCTTTGATAAATTCTTGCAGTGAAGCATGTGATGTGGATCTCTCTCTCTTTTCTTCTC
TATATGTATTTCGACTTAACTTATCTACTACTCCTGCTCATCTAGACATGTATGATGATA
ATAATATAATCTTGGTTTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 20 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 
40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 40 40 

AF RR2E554TF U 9
AF RR2F256TF U 1
AF RR2F847TF U 9
AF RR2EM85TF U 14
AF RR2EM85JQ C 123
AF RR2E554JQ C 9
AF RR2F932TF U 69
AF RR2F256JQ C 22
AF RR2B179JQ C 74
AF RR2DA42JQ C 204
AF RR2DA42TF U 204
AF RR2F847JQ C 106
AF RR2B179TF U 74
BS 1 158 RR2F256TF
BS 159 159 RR2F847TF
BS 160 196 RR2F256TF
BS 197 197 RR2E554TF
BS 198 220 RR2F256TF
BS 221 221 RR2E554TF
BS 222 543 RR2F256TF
BS 544 655 RR2F847TF
BS 656 737 RR2F932TF
BS 738 742 RR2DA42TF

RD RR2E554TF 353 0 0
GG
ATTTACATTTTGAGGTCTCAAAA**ATCTCA*CAACAGAACAAATCGTGTGGTTCTTGTT
TTTCTCTCC*CAATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTGTCTCCGTTCA
GAGATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGG*TTCACTCTCTACTCGACATATGTTCTCTGTG
TTACCGGAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCGGTCTCGAAGAATTCT
AGATTACGACAACGAGGAGGG*TCATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTACTACAGGGATT
CCATTG*TGAACGATTCAACATGGGA*TCTCTTG*ACTCAAGGCA
ATGACC

QA 3 347 3 347
DS 

RD RR2F256TF 543 0 0
CCTGGATATCATTTACATTTTGAGGTCTCAGAAGAATCTCAGCAACAGAACAAATCGTGT
GGTTCTTGTTTTTCTCTCCACAATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTG
TCTCCGTTCAGAGATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGCTTCACTCTCTACTCGACATAT
GTTCTCTGTGTTACCGAAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCTTCTCATTATCATCGGTCTC
GAAGAATTCTAGATTACGACAACGAGGAGGGATCATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTAC
TACAGGGATTCCATTGGTGAACGATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGATGA
GCCCGTTGTTGTGGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCCCAT
CGTCAATGAACTAGCACAGCAGTACACAGGGAAGATGAAGTTCTTCAAACTTAACACAGA
CGAGTCTCCTGCAACCCCGGGACAGTACGGTGTTAGAAGCATCCCAACCATCATGATCTT
CGT

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2F847TF 647 0 0
GG
ATTTACATTTTGAGGTCTCAGAAGAATCTCAGCAATAGAACAAATCGTGTGGTTCTTGTT
TTTCTCTCCACAATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTGTCTCCGTTCA
GAGATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTCACTCTCTACTTGACATATGTTCTCTGTG
TTACCGGAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCGGTCTCGAAGAATTCT
AGATTACGACAACGAGGAGGGATCATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTACTACAGGGATT
CCATTGGTGAACGATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGATGAGCCCGTTGTT
GTGGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCCCATCGTCAATGAA
CTAGCACAGCAGTACACAGGGAAGATGAAGTTCTTCAAACTTAACACAGACGAGTCTCCT
GCAACCCCGGGACAGTACGGTGTTAGAAGCATCCCAACCATCATGATCTTCGTTAAGGGC
GAGAAGAAGGATACAATCATCGGCGCAGTGTCTAAAACCACATTAGCAACAAGCTTTGAT
AAATTCTTGCAGTGAAGCATGTGATGTGGATCTCTCTCTCTTTTC

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR2EM85TF 704 0 0
G
ACATTTTGAGGTCTCAGAAGAATCTCAGCAATAGAACAAATCGTGTGGTTCTTGTTTTTC
TCTCCACAATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTGTCTCCGTTCAGAGA
TGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTCACTCTCTACTCGACATATGTTCTCTGTGTTAC
CGGAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCGGTCTCGAAGAATTCTAGAT
TACGACAACGAGGAGGGATCATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTACTACAGGGATTCCAT
TGGTGAACGATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGATGAGCCCGTTGTTGTGG
ACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCCCATCGTCAATGAACTAG
CACAGCAGTACACAGGGAAGATGAAGTTCTTCAAACTTAACACAGACGAGTCTCCTGCAA
CCCCGGGACAGTACGGTGTTAGAAGCATCCCAACCATCATGATCTTCGTTAAGGGCGAGA
AGAAGGATACAATCATCGGCGCAGTGTCTAAAACCACATTAGCAACAAGCTTTGATAAAT
TCTTGCAGTGAAGCATGTGATGTGGATCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTATATGTATTTCGA
CTTAACTTACCTACTACTCCTGCTCATCTAGACATGTATGATG

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR2EM85JQ 577 0 0
TCCGTTCAGAGATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTCACTCTCTACTCGACATATGT
TCTCTGTGTTACCGGAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCGGTCTCGA
AGAATTCTAGATTACGACAACGAGGAGGGATCATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTACTA
CAGGGATTCCATTGGTGAACGATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGATGAGC
CCGTTGTTGTGGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCCCATCG
TCAATGAACTAGCACAGCAGTACACAGGGAAGATGAAGTTCTTCAAACTTAACACAGACG
AGTCTCCTGCAACCCCGGGACAGTACGGTGTTAGAAGCATCCCAACCATCATGATCTTCG
TTAAGGGCGAGAAGAAGGATACAATCATCGGCGCAGTGTCTAAAACCACATTAGCAACAA
GCTTTGATAAATTCTTGCAGTGAAGCATGTGATGTGGATCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTA
TATGTATTTCGACTTAACTTACCTACTACTCCTGCTC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2E554JQ 732 0 0
GG
ATTTACATTTTGAGGTCTCAGAAGAATCTCAGCAACAGAACAAATCGTGTGGTTCTTGTT
TTTCTCTCCACAATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTGTCTCCGTTCA
GAGATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTCACTCTCTACTCGACATATGTTCTCTGTG
TTACCGGAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCGGTCTCGAAGAATTCT
AGATTACGACAACGAGGAGGGATCATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTACTACAGGGATT
CCATTGGTGAACGATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGATGAGCCCGTTGTT
GTGGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCCCATCGTCAATGAA
CTAGCACAGCAGTACACAGGGAAGATGAAGTTCTTCAAACTTAACACAGACGAGTCTCCT
GCAACCCCGGGACAGTACGGTGTTAGAAGCATCCCAACCATCATGATCTTCGTTAAGGGC
GAGAAGAAGGATACAATCATCGGCGCAGTGTCTAAAACCACATTAGCAACAAGCTTTGAT
AAATTCTTGCAGTGAAGCATGTGATGTGGATCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTATATGTATT
TCGACTTAACTTATCTACTACTCCTGCTCATCTAGACATGTATGATGATAATAATATAAT
CTTGGTTTTC

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR2F932TF 669 0 0
TTTTTCTCTCCACAATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTGTCTCCGTT
CAGAGATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTCACTCTCTACTCGACATATGTTCTCTG
TGTTACCGGAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCGGTCTCGAAGAATT
CTAGATTACGACAACGAGGAGGGATCATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTACTACAGGGA
TTCCATTGGTGAACGATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGATGAGCCCGTTG
TTGTGGACTTTTGGGCACCACGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCCCATCGTCAATG
AACTAGCACAGCAGTACACAGGGAAGATGAAGTTCTTCAAACCTAACACAGACGAGTCTC
CTGCAACCCCGGGACAGTACGGTGTTAGAAGCATCCCAACCATCATGATCTTCGTTAAGG
GCGAGAAGAAGGATACAATCATCGGCGCAGTGTCTAAAACCACATTAGCAACAAGCTTTG
ATAAATTCTTGCAGTGAAGCATGTGATGTGGATCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTATATGTA
TTTCGACTTAACTTATCTACTACTCCTGCTCATCTAGACATGTATGATGATAATAATATA
ATCTTGGTT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2F256JQ 721 0 0
GAGGTCTCAGAAGAATCTCAGCAACAGAACAAATCGTGTGGTTCTTGTTTTTCTCTCCAC
AATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTGTCTCCGTTCAGAGATGAGGAT
CGCATCCTCTAAGAAGGCTTCACTCTCTACTCGACATATGTTCTCTGTGTTACCGAAATC
GGGAGGGCTGAGGACTCGCTTCTCATTATCATCGGTCTCGAAGAATTCTAGATTACGACA
ACGAGGAGGGATCATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTACTACAGGGATTCCATTGGTGAA
CGATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGATGAGCCCGTTGTTGTGGACTTTTG
GGCACCATGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCCCATCGTCAATGAACTAGCACAGCA
GTACACAGGGAAGATGAAGTTCTTCAAACTTAACACAGACGAGTCTCCTGCAACCCCGGG
ACAGTACGGTGTTAGAAGCATCCCAACCATCATGATCTTCGTTAAGGGCGAGAAGAAGGA
TACAATCATCGGCGCAGTGTCTAAAACCACATTAGCAACAAGCTTTGATAAATTCTTGCA
GTGAAGCATGTGATGTGGATCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTATATGTATTTCGACTTAACT
TATCTACTACTCCTGCTCATCTAGACATGTATGATGATAATAATATAATCTTGGTTTTCA
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2B179JQ 669 0 0
CTCTCCACAATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTGTCTCCGTTCAGAG
ATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTCACTCTCTACTCGACATATGTTCTCTGTGTTA
CCGGAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCGGTCTCGAAGAATTCTAGA
TTACGACAACGAGGAGGGATCATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTACTACAGGGATTCCA
TTGGTGAACGATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGATGAGCCCGTTGTTGTG
GACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCCCATCGTCAATGAACTA
GCACAGCAGTACACAGGGAAGATGAAGTTCTTCAAACTTAACACAGACGAGTCTCCTGCA
ACCCCGGGACAGTACGGTGTTAGAAGCATCCCAACCATCATGATCTTCGTTAAGGGCGAG
AAGAAGGATACAATCATCGGCGCAGTGTCTAAAACCACATTAGCAACAAGCTTTGATAAA
TTCTTGCAGTGAAGCATGTGATGTGGATCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTATATGTATTTCG
ACTTAACTTATCTACTACTCCTGCTCATCTAGACATGTATGATGATAATAATATAATCTT
GGTTTTCAG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2DA42JQ 539 0 0
GAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCGGTCTCGAAGAATTCTAGATTACGACAAC
GAGGAGGGATCATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTACTACAGGGATTCCATTGGTGAACG
ATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGATGATCCCGTTGTTGTGGACTTTTGGG
CACCATGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCCCATCGTCAATGAACTAGCACAGCAGT
ACACAGGGAAGATGAAGTTCTTCAAACTTAACACAGACGAGTCTCCTGCAACCCCGGGAC
AGTACGGTGTTAGAAGCATCCCAACCATCATGATCTTCGTTAAGGGCGAGAAGAAGGATA
CAATCATCGGCGCAGTGTCTAAAACCACATTAGCAACAAGCTTTGATAAATTCTTGCAGT
GAAGCATGTGATGTGGATCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTATATGTATTTCGACTTAACTTA
TCTACTACTCCTGCTCATCTAGACATGTATGATGATAATAATATAATCTTGGTTTTCAG

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2DA42TF 539 0 0
GAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCGGTCTCGAAGAATTCTAGATTACGACAAC
GAGGAGGGATCATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTACTACAGGGATTCCATTGGTGAACG
ATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGATGATCCCGTTGTTGTGGACTTTTGGG
CACCATGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCCCATCGTCAATGAACTAGCACAGCAGT
ACACAGGGAAGATGAAGTTCTTCAAACTTAACACAGACGAGTCTCCTGCAACCCCGGGAC
AGTACGGTGTTAGAAGCATCCCAACCATCATGATCTTCGTTAAGGGCGAGAAGAAGGATA
CAATCATCGGCGCAGTGTCTAAAACCACATTAGCAACAAGCTTTGATAAATTCTTGCAGT
GAAGCATGTGATGTGGATCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTATATGTATTTCGACTTAACTTA
TCTACTACTCCTGCTCATCTAGACATGTATGATGATAATAATATAATCTTGGTTTTCAG

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2F847JQ 637 0 0
TTGTCCGCCGATTTGTCTCCGTTCAGAGATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTCACT
CTCTACTTGACATATGTTCTCTGTGTTACCGGAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTC
ATTATCATCGGTCTCGAAGAATTCTAGATTACGACAACGAGGAGGGATCATCATCTGTGA
AGCTCAGGAAGCTACTACAGGGATTCCATTGGTGAACGATTCAACATGGGAGTCTCTTGT
ACTCAAGGCAGATGAGCCCGTTGTTGTGGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCCTGCAA
AATGATCGATCCCATCGTCAATGAACTAGCACAGCAGTACACAGGGAAGATGAAGTTCTT
CAAACTTAACACAGACGAGTCTCCTGCAACCCCGGGACAGTACGGTGTTAGAAGCATCCC
AACCATCATGATCTTCGTTAAGGGCGAGAAGAAGGATACAATCATCGGCGCAGTGTCTAA
AACCACATTAGCAACAAGCTTTGATAAATTCTTGCAGTGAAGCATGTGATGTGGATCTCT
CTCTCTTTTCTTCTCTATATGTATTTCGACTTAACTTATCTACTACTCCTGCTCATCTAG
ACATGTATGATGATAATAATATAATCTTGGTTTTCAG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2B179TF 669 0 0
CTCTCCACAATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTGTCTCCGTTCAGAG
ATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTCACTCTCTACTCGACATATGTTCTCTGTGTTA
CCGGAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCGGTCTCGAAGAATTCTAGA
TTACGACAACGAGGAGGGATCATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGCTACTACAGGGATTCCA
TTGGTGAACGATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGATGAGCCCGTTGTTGTG
GACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCCCATCGTCAATGAACTA
GCACAGCAGTACACAGGGAAGATGAAGTTCTTCAAACTTAACACAGACGAGTCTCCTGCA
ACCCCGGGACAGTACGGTGTTAGAAGCATCCCAACCATCATGATCTTCGTTAAGGGCGAG
AAGAAGGATACAATCATCGGCGCAGTGTCTAAAACCACATTAGCAACAAGCTTTGATAAA
TTCTTGCAGTGAAGCATGTGATGTGGATCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTATATGTATTTCG
ACTTAACTTATCTACTACTCCTGCTCATCTAGACATGTATGATGATAATAATATAATCTT
GGTTTTCAG

QA 1 669 1 669
DS 



AS 2 15

CO CL192Contig1 802 9 8 U
GGACATCCCTCAAAACCATTTCGAAATCATTTTAGTTTGAGAGAGAGAATACAGACGACA
CCAAGTTTCTTTCGACCTCTTCGCCGCAGATCAAATTCTCCTATTCCTCGGATAAACCTC
TCCTTCTGCGGCGGCGATAAAAAAAAGAACAAACCTCCCAAACAACAACAAAAGTTTCAA
CCTTTTATTGTCTGTTCCGTCTCTCTCTCTCTC******TTTCAAGAAACCAAATATTTC
GATAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGA
ACTCTCTAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGGGGGTAAGTCTAGCGGTGG
AAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAA
GATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAACGA
GATTGACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTTGATTAATT
CAGAAAAACTCTGATTTATTTGGATTAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATT
AGGGGAAGTGGGTAATTATCCGTGGTGGTGAACCCTATTTTCATCTGCTATTTGCGATTC
TTTAATAAACTAATAGAGAAGCTTCTTTAATAAACTAATAGAGAAGCAGCCTTCTTGGTT
TTTCTATTTTGTAACAAAAAGGATCGTTGGATGCTTATGTATTATCCATAATATAGTTTT
TAATCAATTATTTACTAGTAGC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 0 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 5 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 5 45 50 50 50 50 50 50 50 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 25 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2C993JQ C 399
AF RR2AW14TFB U 406
AF RR2BS87TF U 3
AF RR2C993TF U 3
AF RR2AW14JQ C 13
AF RR2B544TF U 1
AF RR2B544JQ C 40
AF RR2FC35TF U 1
AF RR2FC35JQ C 266
BS 1 232 RR2B544TF
BS 233 233 RR2BS87TF
BS 234 483 RR2B544TF
BS 484 484 RR2BS87TF
BS 485 780 RR2B544TF
BS 781 782 RR2FC35JQ
BS 783 799 RR2FC35TF
BS 800 802 RR2FC35JQ

RD RR2C993JQ 114 0 0
GAGTGGAAGGATCGAACCAGAAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACA
GACCGGAAACCGGTTCCAACGAGATTGACCCAGGGGGGTTACGAGCAGCT
TTTT

QA 1 110 1 110
DS 

RD RR2AW14TFB 112 0 0
AGAATCGAACCAGAAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGA
AACCGGTTCCAACGAGATTGACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAAC

QA 1 112 1 112
DS 

RD RR2BS87TF 656 0 0
GG
ATCCCTCAGAACCATTTCGAAATCATTTTAGTTTGAGAGAGAGAATACAGACGACACCAA
GTTTCTTTCGACCTCTTCGCCGCAGATCAAATTCTCCTATTCCTCGGATAAACCTCTCCT
TCTGCGGCGGCGATAAAAAA**GAACAAACCTCCCAAACAACAACAAAAGTTTCAACCTT
TTATTGTCTGTTCCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCAAGAAACCAAATATTTCGATA
AACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTACCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTC
TCTAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATACGGCCACAGCGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAA
GGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAAAGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAAGATT
GCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAACGAGATT
GACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTTGATTAATTCAGA
AAAACTCTGATTTATTTGGATTAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATTAGGG
GAAGAGGGTAATTATCCGTTGTGGTGAACCCTATTTTCATCTGCTATGTGCGAT

QA 3 656 3 656
DS 

RD RR2C993TF 692 0 0
GG
ATCCCTCAGAACCATTTCGAAATCATTTTAGTTTGAGAGAGAGAATACAGACGACACCAA
GTTTCTTTCGACCTCTTCGCCGCAGATCAAATTCTCCTATTCCTCGGATAAACCTCTCCT
TCTGCGGCGGCGATAAAAAAA*GAACAAACCTCCCAAACAACAACAAAAGTTTCAACCTT
TTATTGTCTGTTCCGTCTCTCTCTCTCT********TTCAAGAAACCAAATATTTCGATA
AACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTC
TCTAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATACGGCCACAGCGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAA
GGTGGGGCCGTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAAAGGAGTGGAAGGATCGAACCAGAAGATT
GCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAACGAGATT
GACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTTGATTAATTCAGA
AAAACTCTGATTTATTTGGATTAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATTAGGG
GAAGAGGGTAATTATCCGTTGTGGTGAACCCTATTTTCATCTGCTATGTGCGATTCTTTA
ATAAACTAATAGAGAAGC
CTTCTTGGTTTT

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR2AW14JQ 663 0 0
G
AACCATTTCGAAATCATTTTAGTTTGAGAGAGAGAATACAGACGACACCAAGTTTCTTTC
GACCTCTTCGCCGCAGATCAAATTCTCCTATTCCTCGGATAAACCTCTCCTTCTGCGGCG
GCGATAAAAAAA*GAACAAACCTCCCAAACAACAACGAAAGTTTCAACCTTTTATTGTCT
GTTCCGTCTCTCTCTCTCTC******TTTCAAGAAACCAAATATTTCGATAAACATGGCT
CGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCTAATGCA
ATCTTCCGACGCGGTTATACGGCCACAGCGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAAGGTGGAGCC
GTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAGAGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAAGATTGCTTGGATT
CCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAACGAGATTGACCCAGCG
GAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTTGATTAATTCAGAAAAACTCTG
ATTTATTCGGATTAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATTAGGGGAAGAGGGT
AATTATCCGTTGTGGTGAACCCTATTTTCATCTGCTATGTGCGATTCTTTAATAAACTAA
TA

QA 2 663 2 663
DS 

RD RR2B544TF 785 0 0
GGACATCCCTCAAAACCATTTCGAAATCATTTTAGTTTGAGAGAGAGAATACAGACGACA
CCAAGTTTCTTTCGACCTCTTCGCCGCAGATCAAATTCTCCTATTCCTCGGATAAACCTC
TCCTTCTGCGGCGGCGATAAAAAAAAGAACAAACCTCCCAAACAACAACAAAAGTTTCAA
CCTTTTATTGTCTGTTCCGTCTCTCTCTCTCTC******TTTCAAGAAACCACATATTTC
GATAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGA
ACTCTCTAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGGGGGTAAGTCTAGCGGTGG
AAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAA
GATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAACGA
GATCGACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTTGATTAATT
CAGAAAAACTCTGATTTATTTGGATTAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATT
AGGGGAAGTGGGTAATTATCCGTGGTGGTGAACCCTATTTTCATCTGCTATTTGCGATTC
TTTAATAAACTAATAGAGAAGCTTCTTTAATAAACTAATAGAGAAGCAGCCTTCTTGGTT
TTTCTATTTTGTAACAAAAAGGATCGTTGGATGCTTATGTATTATCCATAATATAGTTTT
TAATC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2B544JQ 746 0 0
AGAGAGAGAATACAGACGACACCAAGTTTCTTTCGACCTCTTCGCCGCAGATCAAATTCT
CCTATTCCTCGGATAAACCTCTCCTTCTGCGGCGGCGATAAAAAAAAGAACAAACCTCCC
AAACAACAACAAAAGTTTCAACCTTTTATTGTCTGTTCCGTCTCTCTCTCTCTC******
TTTCAAGAAACCACATATTTCGATAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGT
ATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCTAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCAC
GGGGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAAGGG
AGTGGAAGAATCGAACCAGAAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAG
ACCGGAAACCGGTTCCAACGAGATCGACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAA
CAAGCAGTGATTTGATTAATTCAGAAAAACTCTGATTTATTTGGATTAGTTATATTAATG
TTAATTAAATGTCTTAAGATTAGGGGAAGTGGGTAATTATCCGTGGTGGTGAACCCTATT
TTCATCTGCTATTTGCGATTCTTTAATAAACTAATAGAGAAGCTTCTTTAATAAACTAAT
AGAGAAGCAGCCTTCTTGGTTTTTCTATTTTGTAACAAAAAGGATCGTTGGATGCTTATG
TATTATCCATAATATAGTTTT
TAATC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2FC35TF 799 0 0
GGAC
ATCCCTCAAAACCATTTCGAAATCATTTTAGTTTGAGAGAGAGAATACAGACGACACCAA
GTTTCTTTCGACCTCTTCGCCGCAGATCAAATTCTCCTATTCCTCGGATAAACCTCTCCT
TCTGCGGCGGCGATAAAAAAAAGATCAAACCTCCCAAACAACAACAAAAGTTTCAACCTT
TTATTGTCTGTTCCCTCTCTCTCTCTCT********TTCAAGAAACCACATATTTCGATA
AACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTC
TCTAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGGGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAA
GGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAAGATT
GCTTGGATTCCGGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAACGAGATC
TACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAATAAGCAGTGATTTGATTAATTCAGA
AAAACTCTGATTTATTTGGATTAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATTAGGG
GAAGTGGGTAATTATCCGTGGTGGTGAACCCTATTTTCATCTGCTATTTGCGATTCTTTA
ATAAACTAATAGAGAAGCTTCTTTAATAAACTAATTGAGAAGCAGCCTTCTTGGTTTT*C
TATTTTGTAACAAAAAGGATCGTTGGATGCTTATGTATTATCCATAATATAGTTTT**AT
CAATTATTTACTAGT

QA 5 799 5 799
DS 

RD RR2FC35JQ 537 0 0
AACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCTAATGCAATCTTCCGACGC
GGTTATGCGGCCACGGGGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCG
GTAGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAAGATTGCTTGGATTCCGGACCCCAAA
ACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAACGAGATCTACCCAGCGGAGTTACGAGCA
GCTTTCTTAAACAATAAGCAGTGATTTGATTAATTCAGAAAAACTCTGATTTATTTGGAT
TAGTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAAGATTAGGGGAAGTGGGTAATTATCCGTGG
TGGTGAACCCTATTTTCATCTGCTATTTGCGATTCTTTAATAAACTAATAGAGAAGCTTC
TTTAATAAACTAATTGAGAAGCAGCCTTCTTGGTTTTTTTATTTTGTAACAAAAAGGATC
GTTGGATGCTTATGTATTATCCATAATATAGTTTTTAATCAATTATTTACTAGTAGC

QA 1 537 1 537
DS 



CO CL192Contig2 722 6 9 U
GGATCTCCTCAAGCCATTTCGAAATCAATCTAGTTTGAGAGAGATAACACAGACGAAACC
AAGCTTCTTCCATCTCGTTGCCGCAGATCAAACTTTCCTATTCCTCGGATAAACCTCTCC
TTCTGCGGCGGCGAAACAGAGGAACAAACCTCACTAACAAAAAAAGTTTATACCTTTATA
TTGTCTGTTCTATCTCTCTCTTCCAAAAATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGTTCGT
ATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGGCGTGGTTATGCGGCCAC
GGCGGCGCAGTCGAGCAGTGGAAAAGGTAGAGCGGTTGTTTCCGCGGTGACGAAGAAGGG
AGTGGAAGAATCGAACAAGAAGATTTCTTGGATTCCTGATCCCAAAACCGGTTATTACAG
ACCGGACACCGGTTCCAACGAGATTGACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAA
AAAGCAGTGATTGGTTAATTTTAAAAGATTGTCTTTTTGATTAATTATTTGATGCTTATT
TTAGTGTCTTGAGAGGAGATTAGAGGGTAATGATTTGATGCAGTGAATCCTATTTTCATC
TGCTACTTGCGATCCTGTAATAAATGTATAGAGAAGCCTTTTGGGTTCTCTGTGTTGGAA
TATGGATCGTTGGATGTATGTATGTATCCAGTATAGTTTTCTAAAATCATCTATTTATCA
CC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 

AF RR2BX04TF U 1
AF RR2CF64TF U 1
AF RR2G644TF U 1
AF RR2HA93TF U 1
AF RR2HA93JQ C 126
AF RR2G644JQ C 358
BS 1 333 RR2BX04TF
BS 334 334 RR2CF64TF
BS 335 437 RR2BX04TF
BS 438 438 RR2CF64TF
BS 439 449 RR2BX04TF
BS 450 683 RR2CF64TF
BS 684 705 RR2G644TF
BS 706 720 RR2HA93JQ
BS 721 722 RR2G644JQ

RD RR2BX04TF 453 0 0
GGATCTCCTCAAGCCATTTCGAAATCAATCTAGTTTGAGAGAGATAACACAGACGAAACC
AAGCTTCTTCCATCTCGTTGCCGCAGATCAAACTTTCCTATTCCTCGGATAAACCTCTCC
TTCTGCGGCGGCGAAACAGAGGAACAAACCTCACTAACAAAAAAAGTTTATACCTTTATA
TTGTCTGTTCTATCTCTCTCTTCCAAAAATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGTTCGT
ATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGGCGTGGTTATGCGGCCAC
GGCGGCGCAGTCGAGCAGTGGAAAAGGTAGAGCAGTTGTTTCCGCGGTGACGAAGAAGGG
AGTGGAAGAATCGAACAAGAAGATTTCTTGGATTCCTGATCCCAAAACCGGTTATTACAG
ACCGGACACCGGTTCCA*CGAGATTGACC
AGCG

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2CF64TF 683 0 0
GGATCTCCTCAAGCCATTTCGAAATCAATCTAGTTTGAGAGAGATAACACAGACGAAACC
AAGCTTCTTCCATCTCGTTGCCGCAGATCAAACTTTCCTATTCCTCGGATAAACCTCTCC
TTCTGCGGCGGCGAAACAGAGGAACAAACCTCACTAACAAAAAAAGTTTATACCTTTATA
TTGTCTGTTCTATCTCTCTCTTCCAAAAATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGTTCGT
ATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGGCGTGGTTATGCGGCCAC
GGCGGCGCAGTCGAGCAGTGGAAAAGGTAGAGCGGTTGTTTCCGCGGTGACGAAGAAGGG
AGTGGAAGAATCGAACAAGAAGATTTCTTGGATTCCTGATCCCAAAACCGGTTATTACAG
ACCGGACACCGGTTCCAACGAGATTGACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAA
AAAGCAGTGATTGGTTAATTTTAAAAGATTGTCTTTTTGATTAATTATTTGATGCTTATT
TTAGTGTCTTGAGAGGAGATTAGAGGGTAATGATTTGATGCAGTGAATCCTATTTTCATC
TGCTACTTGCGATCCTGTAATAAATGTATAGAGAAGCCTTTTGGGTTCTCTGTGTTGGAA
TATGGATCGTTGGATGTATGTAT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2G644TF 712 0 0
GGATCTCCTCAAGCCATTTCGAAATCAATCTAGTTTGAGAGAGATGACACAGACGAAACC
AAGCTTCTTCCATCTCGTTGCCGCAGATCAAACTTTCCTATTCCTCGGATAAACCTCTCC
TTCTGCGGCGGCGAAACAGAGGAACAAACCTCACTAACAAAAAAAGTTTATACCTTTATA
TTGTCTGTTCTATCTCTCTCTTCCAAAAATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGTTCGT
ATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGGCGTGGTTATGCGGCCAC
GGCGGCGCAGTCGAGCAGTGGAAAAGGTAGAGCGGTTGTTTCCGCGGTGACGAAGAAGGG
AGTGGAAGAATCGAACAAGAAGATTTCTTGGATTCCTGATCCCAAAACCGGTTATTACAG
ACCGGACACCGGTTCCAACGAGATTGACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAA
AAAGCAGTGATTGGTTAATTTTAAAAGATTGTCTTTTTGATTAATTATTTGATGCTTATT
TTAGTGTCTTGAGAGGAGATTAGAGGGTAATGATTTGATGCAGTGAATCCTATTTTCATC
TGCTACTTGCGATCCTGTAATAAATGTATAGAGAAGCCTTTTGGGTTCTCTGTGTTGGAA
TATGGATCGTTGGATGTATGTATGTATCCAGTATAGTTTTCTAAA
TCATCTA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2HA93TF 712 0 0
GGATCTCCTCAAGCCATTTCGAAATCAATCTAGTTTGAGAGAGATGACACAGACGAAACC
AAGCTTCTTCCATCTCGTTGCCGCAGATCAAACTTTCCTATTCCTCGGATAAACCTCTCC
TTCTGCGGCGGCGAAACAGAGGAACAAACCTCACTAACAAAAAAAGTTTATACCTTTATA
TTGTCTGTTCTATCTCTCTCTTCCAAAAATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGTTCGT
ATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGGCGTGGTTATGCGGCCAC
GGCGGCGCAGTCGAGCAGTGGAAAAGGTAGAGCGGTTGTTTCCGCGGTGACGAAGAAGGG
AGTGGAAGAATCGAACAAGAAGATTTCTTGGATTCCTGATCCCAAAACCGGTTATTACAG
ACCGGACACCGGTTCCAACGAGATTGACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAA
AAAGCAGTGATTGGTTAATTTTAAAAGATTGTCTTTTTGATTAATTATTTGATGCTTATT
TTAGTGTCTTGAGAGGAGATTAGAGGGTAATGATTTGATGCAGTGAATCCTATTTTCATC
TGCTACTTGCGATCCTGTAATAAATGTATAGAGAAGCCTTTTGGGTTCTCTGTGTTGGAA
TATGGATCGTTGGATGTATGTATGTATCCAGTATAGTTTTCTAAA
TCATCTA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2HA93JQ 597 0 0
CGGCGGCGAAACAGAGGAACAAACCTCACTAACAAAAAAAGTTTATACCTTTATATTGTC
TGTTCTATCTCTCTCTTCCAAAAATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGTTCGTATCTG
CTTTCGTCTCTCAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGGCGTGGTTATGCGGCCACGGCGG
CGCAGTCGAGCAGTGGAAAAGGTAGAGCGGTTGTTTCCGCGGTGACGAAGAAGGGAGTGG
AAGAATCGAACAAGAAGATTTCTTGGATTCCTGATCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGG
ACACCGGTTCCAACGAGATTGACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAAAAAGC
AGTGATTGGTTAATTTTAAAAGATTGTCTTTTTGATTAATTATTTGATGCTTATTTTAGT
GTCTTGAGAGGAGATTAGAGGGTAATGATTTGATGCAGTGAATCCTATTTTCATCTGCTA
CTTGCGATCCTGTAATAAATGTATAGAGAAGCCTTTTGGGTTCTCTGTGTTGGAATATGG
ATCGTTGGATGTATGTATGTATCCAGTATAGTTTTCTAAAATCATCTATTTATCA
CC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2G644JQ 365 0 0
GGGAGTGGAAGAATCGAACAAGAAGATTTCTTGGATTCCTGATCCCAAAACCGGTTATTA
CAGACCGGACACCGGTTCCAACGAGATTGACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAA
CAAAAAGCAGTGATTGGTTAATTTTAAAAGATTGTCTTTTTGATTAATTATTTGATGCTT
ATTTTAGTGTCTTGAGAGGAGATTAGAGGGTAATGATTTGATGCAGTGAATCCTATTTTC
ATCTGCTACTTGCGATCCTGTAATAAATGTATAGAGAAGCCTTTTGGGTTCTCTGTGTTG
GAATATGGATCGTTGGATGTATGTATGTATCCAGTATAGTTTTCTAAAATCATCTATTTA
TCACC

QA 1 365 1 365
DS 



AS 2 15

CO CL193Contig1 763 8 7 U
TATTTAGTTAAACACTGATGTGATAGAACAATGCAAATCGCCAAAAAGCAAGAGAGAATA
ACAAATAGGTTTTAAGCAAAAGAAAAAGAATAACAAATAGCAAATTAATTAAACATTGTT
TACGAAAAA*TTGAATCGTATCAAACCAAGAAAAAGAAAGAGGAAAACAATATTCTTTAA
ATAAACATAATTTTAATAAGCCTCCAGCTTCTTAGAGAAAATCCAGAAACCAAATCAAAT
ATATTAGTTTGTAGAAGAAAATAATGTGGAAGTTGGAATCTTCTAGAAGGGTTGATGAGA
TGGAGGCCTAGAGATCCTGTTCGAGGAGGTAATCACCCAACCTCTCGACGACCATGTTGC
ACTGTCCTGGTGTTACGGGCTCTTCATAGAGCCCAAACACACATGATTGTCCTGTTTTCT
TTATGGTTATGCCTCCTGCACCCTTCTTGCCACGGATTACAGCGCCAGGCTCGCCTTGGA
TGACCATGTACTTGGCTCCAGCTAGAAATAACCCTGTGGGAGCTAAGTGACCCGGTTCAT
CAAAATCTTTCATTATACCAGTGAACTCTTGTGCCTTGAACTGAGGGAAGTTAGCGCTCT
GAGCCCAAACGCTACCGTCATGACCAACGATTGCGGCGGCAGTAAGGTGATGGCCCTGGC
CGTCTCCGACATCACACATCAAATGCTCATCAACGTAAGTTTGCCACGACATCTTCTTCT
TCTTTCCTTTGTTTTTCTGTATACGTTATCTTATGTTATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 10 20 20 20 

AF RR2H423JQB U 51
AF RR2B437TF C 1
AF RR2ER50JQ U 6
AF RR2ER50TF C 0
AF RR2AQ03JQ U 98
AF RR2DM80TF C 285
AF RR2DM80JQ U 111
AF RR2AQ03TF C 98
BS 1 6 RR2B437TF
BS 7 80 RR2ER50JQ
BS 81 81 RR2H423JQB
BS 82 732 RR2ER50JQ
BS 733 733 RR2AQ03JQ
BS 734 757 RR2ER50JQ
BS 758 763 RR2AQ03JQ

RD RR2H423JQB 596 0 0
C
GAGAGAATAACAAATAGGTTTTAAGCAAAAGAAAAAGAATAACAAATAGCAAATTAATTA
AACATTGTTTACGAAAAA*TTGAATCGTATCAAACCAAGAAAAAGAAAGAGGAAAACAAT
ATTCTTTAAATAAACATAATTTTAATAGGCCTCCAGCTTCTTAGAGAAAATCCAGAAACC
AAATCAAATATATTAGTTTGTAGAAAAAAATAATGTGGAAGTTGGAATCTTCTAGAAGGG
TTGATGAGATGGAGGCCTAGAGATCCTGTTCGAGGAGGTAATCACCCAACCTCTCGACGA
CCATGTTGCACTGTCCTGGTGTTACGGGCTCTTCATAGAGCCCAAACACACATGATTGTC
CTGTTTTCTTTATGGTTATGCCTCCTGCACCCTTCTTGCCACGGATTACAGCGCCAGGCT
CGCCTTGGATGACCATGTACTTGGCTCCAGCTAGAAATAACCCTGTGGGAGCTAAGTGAC
CCGGTTCATCAAAATCTTTCATTATACCAGTGAACTCTTGTGCCTTGAACTGAGGGAAGT
TAGCGCTCTGAGCCCAAACGCTACCGTCATGACCAACGATTGCGGCGGCAGTAAG

QA 2 596 2 596
DS 

RD RR2B437TF 761 0 0
TATTTAGTTAAACACTGATGTGATAGAACAATGCAAATCGCCAAAAAGCAAGAGAGAATA
ACAAATAGGTTTTAAGCAAAAGAAAAAGAATAACAAATAGCAAATTAATTAAACATTGTT
TACGAAAAA*TTGAATCGTATCAAACCAAGAAAAAGAAAGAGGAAAACAATATTCTTTAA
ATAAACATAATTTTAATAAGCCTCCAGCTTCTTAGAGAAAATCCAGAAACCAAATCAAAT
ATATTAGTTTGTAGAAGAAAATAATGTGGAAGTTGGAATCTTCTAGAAGGGTTGATGAGA
TGGAGGCCTAGAGATCCTGTTCGAGGAGGTAATCACCCAACCTCTCGACGACCATGTTGC
ACTGTCCTGGTGTTACGGGCTCTTCATAGAGCCCAAACACACATGATTGTCCTGTTTTCT
TTATGGTTATGCCTCCTGCACCCTTCTTGCCACGGATTACAGCGCCAGGCTCGCCTTGGA
TGACCATGTACTTGGCTCCAGCTAGAAATAACCCTGTGGGAGCTAAGTAACCCGGTT*AT
CAAAATCTTTCATTATACCAGTGAACTCTTGTGCCTTGAACTGAGGGAAGTTAGCGCTCT
GAGCCCAAACGCTACCGTCATGACCAACGATTGCGGCGGCAGTAAGGTGATGGCCCTGGC
CGTCTCCGACATCACACATCAAATGCTCATCAACGTAAGTTTGCCACGACATCTTCTTCT
TCTTTCCTTTGTTTTTCTGTATACGTTATCTTATGTTATC
C

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2ER50JQ 754 0 0
A
GTTAAACACTGATGTGATAGAACAATGCAAATCGCCAAAAAGCAAGAGAGAATAACAAAT
AGGTTTTAAGCAAA*GAAAAAGAATAACAAATAGCAAATTAATTAAACATTGTTTACGAA
AAA*TTGAATCGTATCAAACCAAGAAAAAGAAAGAGGAAAACAATATTCTTTAAATAAAC
ATAATTTTAATAAGCCTCCAGCTTCTTAGAGAAAATCCAGAAACCAAATCAAATATATTA
GTTTGTAGAAGAAAATAATGTGGAAGTTGGAATCTTCTAGAAGGGTTGATGAGATGGAGG
CCTAGAGATCCTGTTCGAGGAGGTAATCACCCAACCTCTCGACGACCATGTTGCACTGTC
CTGGTGTTACGGGCTCTTCATAGAGCCCAAACACACATGATTGTCCTGTTTTCTTTATGG
TTATGCCTCCTGCACCCTTCTTGCCACGGATTACAGCGCCAGGCTCGCCTTGGATGACCA
TGTACTTGGCTCCAGCTAGAAATAACCCTGTGGGAGCTAAGTGACCCGGTTCATCAAAAT
CTTTCATTATACCAGTGAACTCTTGTGCCTTGAACTGAGGGAAGTTAGCGCTCTGAGCCC
AAACGCTACCGTCATGACCAACGATTGCGGCGGCAGTAAGGTGATGGCCCTGGCCGTCTC
CGACATCACACATCAAATGCTCATCAACGTAAGTTTGCCACGACATCTTCTTCTTCTTTC
CTTTGTCTTTCTGTATACGTTATCTTATGTT
CC

QA 2 752 2 752
DS 

RD RR2ER50TF 760 0 0
TTTTTTA
GTTAAACACTGATGTGATAGAACAATGCAAATCGCCAAAA*GCAAGAGAGAATAACAAAT
AGGTTTTAAGCAAA*GAAAAAGAATAACAAATAGCAAATTAATTAAACATTGTTTACGAA
AAA*TTGAATCGTATCAAACCAAGAAAAAGAAAGAGGAAAACAATATTCTTTAAATAAAC
ATAATTTTAATAAGCCTCCAGCTTCTTAGAGAAAATCCAGAAACCAAATCAAATATATTA
GTTTGTAGAAGAAAATAATGTGGAAGTTGGAATCTTCTAGAAGGGTTGATGAGATGGAGG
CCTAGAGATCCTGTTCGAGGAGGTAATCACCCAACCTCTCGACGACCATGTTGCACTGTC
CTGGTGTTACGGGCTCTTCATAGAGCCCAAACACACATGATTGTCCTGTTTTCTTTATGG
TTATGCCTCCTGCACCCTTCTTGCCACGGATTACAGCGCCAGGCTCGCCTTGGATGACCA
TGTACTTGGCTCCAGCTAGAAATAACCCTGTGGGAGCTAAGTGACCCGGTTCATCAAAAT
CTTTCATTATACCAGTGAACTCTTGTGCCTTGAACTGAGGGAAGTTAGCGCTCTGAGCCC
AAACGCTACCGTCATGACCAACGATTGCGGCGGCAGTAAGGTGATGGCCCTGGCCGTCTC
CGACATCACACATCAAATGCTCATCAACGTAAGTTTGCCACGACATCTTCTTCTTCTTTC
CTTTGTCTTTCTGTATACGTTATCTTATGTT
CC

QA 8 758 8 758
DS 

RD RR2AQ03JQ 666 0 0
TAGCAAATTAATTAAACATTGTTTACGAAAAA*TTGAATCGTATCAAACCAAGAAAAAGA
AAGAGGAAAACAATATTCTTTAAATAAACATAATTTTAATAAGCCTCCAGCTTCTTAGAG
AAAATCCAGAAACCAAATCAAATATATTAGTTTGTAGAAAAAAATAATGTGGAAGTTGGA
ATCTTCTAGAAGGGTTGATGAGATGGAGGCCTAGAGATCCTGTTCGAGGAGGTAATCACC
CAACCTCTCGACGACCATGTTGCACTGTCCTGGTGTTACGGGCTCTTCATAGAGCCCAAA
CACACATGATTGTCCTGTTTTCTTTATGGTTATGCCTCCTGCACCCTTCTTGCCACGGAT
TACAGCGCCAGGCTCGCCTTGGATGACCATGTACTTGGCTCCAGCTAGAAATAACCCTGT
GGGAGCTAAGTGACCCGGTTCATCAAAATCTTTCATTATACCAGTGAACTCTTGTGCCTT
GAACTGAGGGAAGTTAGCGCTCTGAGCCCAAACGCTACCGTCATGACCAACGATTGCGGC
GGCAGTAAGGTGATGGCCCTGGCCGTCTCCGACATCACACATCAAATGCTCATCAACGTA
AGTTTGCCACGACATCTTCTTCTTCTTTCCTTTGTTTTTCTGTATACGTTATCTTATGTT
ATGTCC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2DM80TF 450 0 0
AGAAGGGTTGATGAGATGGAGGCCTAGAGATCCTGTTCGAGGAGGTAATCACCCAACCTC
TCGACGACCATGTTGCACTGTCCTGGTGTTACGGGCTCTTCATAGAGCCCAAACACACAT
GATTGTCCTGTTTTCTTTATGGTTATGCCTCCTGCACTCTTCTTGCCACGGATTACAGCG
CCAGGCTCGCCTTGGATGACCATGTACTTGGCTCCAGCTAGAAATAACCCTGTGGGAGCT
AAGTGACCCGGTTCATCAAAATCTTTCATTATACCAGTGAACTCTTGTGCCTTGAACTGA
GGGAAGTTAGCGCTCTGAGCCCAAACGCTACCGTCATGACCAACGATTGCGGCGGCAGTA
AGGTGATGGCCCTGGCCGTCTCCGACATCACACATCAAATGCTCATCAACGTAAGTTTGC
CACGACATCTTCTTCTTCTTTCCTTTGTT
C

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2DM80JQ 624 0 0
AAACATTGTTTACGAAAAA*TTGAATCGTATCAAACCAAGAAAAAGAAAGAGGAAAACAA
TATTCTTTAAATAAACATAATTTTAATAAGCCTCCAGCTTCTTAGAGAAAATCCAGAAAC
CAAATCAAATATATTAGTTTGTAGAAGAAAATAATGTGGAAGTTGGAATCTTCTAGAAGG
GTTGATGAGATGGAGGCCTAGAGATCCTGTTCGAGGAGGTAATCACCCAACCTCTCGACG
ACCATGTTGCACTGTCCTGGTGTTACGGGCTCTTCATAGAGCCCAAACACACATGATTGT
CCTGTTTTCTTTATGGTTATGCCTCCTGCACCCTTCTTGCCACGGATTACAGCGCCAGGC
TCGCCTTGGATGACCATGTACTTGGCTCCAGCTAGAAATAACCCTGTGGGAGCTAAGTGA
CCCGGTTCATCAAAATCTTTCATTATACCAGTGAACTCTTGTGCCTTGAACTGAGGGAAG
TTAGCGCTCTGAGCCCAAACGCTACCGTCATGACCAACGATTGCGGCGGCAGTAAGGTGA
TGGCCCTGGCCGTCTCCGACATCACACATCAAATGCTCATCAACGTAAGTTTGCCACGAC
ATCTTCTTCTTCTTTCCTTTGTT
C

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2AQ03TF 666 0 0
TAGCAAATTAATTAAACATTGTTTACGAAAAAATTGAATCGTATCAAACCAAGAAAAAGA
AAGAGGAAAACAATATTCTTTAAATAAACATAATTTTAATAAGCCTCCAGCTTCTTAGAG
AAAATCCAGAAACCAAATCAAATATATTAGTTTGTAGAAGAAAATAATGTGGAAGTTGGA
ATCTTCTAGAAGGGTTGATGAGATGGAGGCCTAGAGATCCTGTTCGAGGAGGTAATCACC
CAACCTCTCGACGACCATGTTGCACTGTCCTGGTGTTACGGGCTCTTCATAGAGCCCAAA
CACACATGATTGTCCTGTTTTCTTTATGGTTATGCCTCCTGCACCCTTCTTGCCACGGAT
TACAGCGCCAGGCTCGCCTTGGATGACCATGTACTTGGCTCCAGCTAGAAATAACCCTGT
GGGAGCTAAGTGACCCGGTTCATCAAAATCTTTCATTATACCAGTGAACTCTTGTGCCTT
GAACTGAGGGAAGTTAGCGCTCTGAGCCCAAACGCTACCGTCATGACCAACGATTGCGGC
GGCAGTAAGGTGATGGCCCTGGCCGTCTCCGACATCACACATCAAATGCTCATCAACGTA
AGTTTGCCACGACATCTTCTTCTTCTTTCCTTTGTTTTTCTGTATACGTTATCTTATGTT
ATGTCC

QA 1 666 1 666
DS 



CO CL193Contig2 815 7 6 U
GGAGATAACATAAGATAACGCATACAGAAAAAACAAAGGAAAGAAGAAGAAGATGTCGTG
GCAAACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTCGGAGACGGCCAAGGTCATCACCT
TACTGCCGCCGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCACAGAGCGCTAACTTCCC
TCAGTTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGTCACTT
AGCTCCCACAGGGTTATTTCTAGCTGGAGCCAAGTACATGGTCATCCAAGGCGAGCCTGG
CGCTGTAATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATC
ATGTGTGTTTGGTATCTATGAAGAGCCCGTAACACCAGGGCAGTGCAACATGGTCGTCGA
GAGGTTGGGTGATTACCTCCTCGAACAGGATCTCTAGGCCTCCATCTCATCAACCCTTCT
AGAAGATTCCAACTTCCACATTATTTTCTTCTACAAACTAATATATTTGATTTGGTTTCT
GGATTCTCTCTAAGAAGCTGGAGGCTTATTAAGATTATGTTTCTTCAAAAAATATTGTTT
TCCTCTTTCTTTTCTTGGTTTCATACGATTCAAACTTTCGTAAACCATGTTTAATTAATT
TATTTGTTAATTCTTTTCTTTTTTGCTTAAAACCTATTTGTTATTCTCTCTTGCTTTTTG
ACGATTTGCATTGTTCTGTCACATCAGTGTTTAACAAAATAGAATTACATCTGTCCGTAC
AGCAACTAAATATATCTACGCTGCGTGTTAATTTT


BQ
20 20 20 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2F365JQ C 1
AF RR2F365TF U 1
AF RR2BQ83TF U 2
AF RR2BP92TF U 3
AF RR2BQ83JQ C 2
AF RR2AQ29TF U 4
AF RR2AQ29JQ C 17
BS 1 3 RR2F365TF
BS 4 4 RR2BQ83TF
BS 5 643 RR2F365TF
BS 644 694 RR2BP92TF
BS 695 810 RR2AQ29TF
BS 811 815 RR2AQ29JQ

RD RR2F365JQ 656 0 0
GGACATAACATAAGATAACGCATACAGAAAAAACAAAGGAAAGAAGAAGAAGATGTCGTG
GCAAACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTCGGAGACGGCCAAGGTCATCACCT
TACTGCCGCCGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCACAGAGCGCTAACTTCCC
TCAGTTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGTCACTT
AGCTCCCACAGGGTTATTTCTAGCTGGAGCCAAGTACATGGTCATCCAAGGCGAGCCTGG
CGCTGTAATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATC
ATGTGTGTTTGGTATCTATGAAGAGCCCGTAACACCAGGGCAGTGCAACATGGTCGTCGA
GAGGTTGGGTGATTACCTCCTCGAACAGGATCTCTAGGCCTCCATCTCATCAACCCTTCT
AGAAGATTCCAACTTCCACATTATTTTCTTCTACAAACTAATATATTTGATTTGGTTTCT
GGATTCTCTCTAAGAAGCTGGAGGCTTATTAAGATTATGTTTCTTCAAAAAATATTGTTT
TCCTCTTTCTTTTCTTGGTTTCATACGATTCAAACTTTCGTAAACCATGTTTAATT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2F365TF 643 0 0
GGACATAACATAAGATAACGCATACAGAAAAAACAAAGGAAAGAAGAAGAAGATGTCGTG
GCAAACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTCGGAGACGGCCAAGGTCATCACCT
TACTGCCGCCGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCACAGAGCGCTAACTTCCC
TCAGTTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGTCACTT
AGCTCCCACAGGGTTATTTCTAGCTGGAGCCAAGTACATGGTCATCCAAGGCGAGCCTGG
CGCTGTAATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATC
ATGTGTGTTTGGTATCTATGAAGAGCCCGTAACACCAGGGCAGTGCAACATGGTCGTCGA
GAGGTTGGGTGATTACCTCCTCGAACAGGATCTCTAGGCCTCCATCTCATCAACCCTTCT
AGAAGATTCCAACTTCCACATTATTTTCTTCTACAAACTAATATATTTGATTTGGTTTCT
GGATTCTCTCTAAGAAGCTGGAGGCTTATTAAGATTATGTTTCTTCAAAAAATATTGTTT
TCCTCTTTCTTTTCTTGGTTTCATACGATTCAAACTTTCGTAA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2BQ83TF 632 0 0
GT
GATAACATAAGATAACGCATACAAAAAAAACAAAGGAAAGAAGAAGAAGATGTCGTGGCA
AACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTCGGAGACGGCCAAGGTCATCACCTTAC
TGCCGCCGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCACAGAGCGCTAACTTCCCTCA
GTTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAGC
TCCCACAGGGTTATTTCTAGCTGGAGCCAAGTACATGGTCATCCAAGGCGAGCCTGGCGC
TGTAATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCATG
TGTGTTTGGTATCTATGAAGAGCCCGTAACACCAGGGCAGTGCAACATGGTCGTCGAGAG
GTTGGGTGATTACCTCCTCGAACAGGATCTCTAGGCCTCCATCTCATCAACCCTTCTAGA
AGATTCTAACTTCCACATTATTTTCTTCTACAAACTAATATATTTGATTTGGTTTCTGGA
TTCTCTCTAAGAAGCTGGAGGCTTATTAAGATTATGTTTCTTCAAAAAATATTGTTTTCC
TCTTTCTTTTCTTGGTTTCATACGATTCAA

QA 3 632 3 632
DS 

RD RR2BP92TF 692 0 0
G
GATAACATAAGATAACGCATACAGAAAAAACAAAGGAAAGAAGAAGAAGATGTCGTGGCA
AACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTCGGAGACGGCCAAGGTCATCACCTTAC
TGCCGCCGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCACAGAGCGCTAACTTCCCTCA
GTTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAGC
TCCCACAGGGTTATTTCTAGCTGGAGCCAAGTACATGGTCATCCAAGGCGAGCCTGGCGC
TGTAATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCATG
TGTGTTTGGTATCTATGAAGAGCCCGTAACACCAGGGCAGTGCAACATGGTCGTCGAGAG
GTTGGGTGATTACCTCCTCGAACAGGATCTCTAGGCCTCCATCTCATCAACCCTTCTAGA
AGATTCCAACTTCCACATTATTTTCTTCTACAAACTAATATATTTGATTTGGTTTCTGGA
TTCTCTCTAAGAAGCTGGAGGCTTATTAAGATTATGTTTCTTCAAAAAATATTGTTTTCC
TCTTTCTTTTCTTGGTTTCATACGATTCAA*CTTTCGTAAACCATGTTTAATTAATTTAT
TTGTTAATTCTTTTCTTTTTTGCTTAAAACC

QA 2 692 2 692
DS 

RD RR2BQ83JQ 739 0 0
GT
GATAACATAAGATAACGCATACAAAAAAAACAAAGGAAAGAAGAAGAAGATGTCGTGGCA
AACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTCGGAGACGGCCAAGGTCATCACCTTAC
TGCCGCCGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCACAGAGCGCTAACTTCCCTCA
GTTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAGC
TCCCACAGGGTTATTTCTAGCTGGAGCCAAGTACATGGTCATCCAAGGCGAGCCTGGCGC
TGTAATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCATG
TGTGTTTGGTATCTATGAAGAGCCCGTAACACCAGGGCAGTGCAACATGGTCGTCGAGAG
GTTGGGTGATTACCTCCTCGAACAGGATCTCTAGGCCTCCATCTCATCAACCCTTCTAGA
AGATTCTAACTTCCACATTATTTTCTTCTACAAACTAATATATTTGATTTGGTTTCTGGA
TTCTCTCTAAGAAGCTGGAGGCTTATTAAGATTATGTTTCTTCAAAAAATATTGTTTTCC
TCTTTCTTTTCTTGGTTTCATACGATTCAAACTTTCGTAAACCATGTTTAATTAATTTAT
TTGTTAATTCTTTTCTTTTTTGCTTAAAACCTATTTGTTATTCTCTCTTGCTTTTTGACG
ATTTGCATTGTTCT
GTC

QA 3 736 3 736
DS 

RD RR2AQ29TF 807 0 0
GATAACATAAGATAACGCATACAGAAAAAACAAAGGAAAGAAGAAGAAGATTTCGTGGCA
AACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGGTGTCGGAGACGGCCAAGGTCATCACCTTAC
TGCCGCCGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCACAGAGCGCTAACTTCCCTCA
GTTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAGC
TCCCACAGGGTTATTTCTAGCTGGAGCCAAGTACATGGTCATCCAAGGCGAGCCTGGCGC
TGTAATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCATG
TGTGTTTGGTATCTATGAAGAGCCCGTAACACCAGGGCAGTGCAACATGGTCGTCGAGAG
GTTGGGTGATTACCTCCTCGAACAGGATCTCTAGGCCTCCATCTCATCAACCCTTCTAGA
AGATTCCAACTTCCACATTATTTTCTTCTACAAACTAATATATTTGATTTGGTTTCTGGA
TTCTCTCTAAGAAGCCGGAGGCTTATTAAGATTATGTTTCTTCAAAAAATATTGTTTTCC
TCTTTCTTTTCTTGGTTTCATACGATTCAAACTTTCGTAAACCATGTTTAATTAATTTAT
TTGTTAATTCTTTTCTTTTTTGCTTAAAACCTATTTGTTATTCTCTCTTGCTTTTTGACG
ATTTGCATTGTTCTGTCACATCAGTGTTTAACAAAATAGAATTACATCTGTCCGTACAGC
AACTAAATATATCTACGCTGCGTGTTA

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2AQ29JQ 799 0 0
AACGCATACAGAAAAAACAAAGGAAAGAAGAAGAAGATTTCGTGGCAAACTTACGTTGAT
GAGCATTTGATGTGTGGTGTCGGAGACGGCCAAGGTCATCACCTTACTGCCGCCGCAATC
GTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCACAGAGCGCTAACTTCCCTCAGTTCAAGGCACAA
GAGTTCACTGGTATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAGCTCCCACAGGGTTA
TTTCTAGCTGGAGCCAAGTACATGGTCATCCAAGGCGAGCCTGGCGCTGTAATCCGTGGC
AAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCATGTGTGTTTGGTATC
TATGAAGAGCCCGTAACACCAGGGCAGTGCAACATGGTCGTCGAGAGGTTGGGTGATTAC
CTCCTCGAACAGGATCTTTAGGCCTCCATTTCATCAACCCTTTTAGAAGATTCCAACTTC
CACATTATTTTTTTCTACAAACTAATATATTTGATTTGGTTTCTGGATTCTCTCTAAGAA
GCCGGAGGCTTATTAAGATTATGTTTCTTCAAAAAATATTGTTTTCCTCTTTCTTTTCTT
GGTTTCATACGATTCAAACTTTCGTAAACCATGTTTAATTAATTTATTTGTTAATTCTTT
TCTTTTTTGCTTAAAACCTATTTGTTATTCTCTCTTGCTTTTTGACGATTTGCATTGTTC
TGTCACATCAGTGTTTAACAAAATAGAATTACATCTGTCCGTACAGCAACTAAATATATT
TACGCTGCGTGTTAATTTT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 15

CO CL194Contig1 1121 15 31 U
GCTAGACACAAAGCTAAAAAGTAATTATCGTCCCTATGGTATTGATTTTCTTATGGGAGT
CGCCACCGGTAGATTCAGCAACGGAAGGGTCGCTTCCGATTATATATCCAAATATTTGGG
AGTAAAAGAAATTGTACCGGCATATTTAGACAAGAAACTACAACAAAACGACGATCTATA
ACAAAGCGATCTACTTACGGGCGTACCTTTTGCTTCGGGTGGTGCTGGCTATCTTCCTCA
AACATCTGAATCATGGAAAGTATTAACAATGTTGGACCAGTTGAGATATTTCCAAGACTA
CAAGAAAAGAATGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAAACATATAGTGAGAAAAGG
AGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTGGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGC
TCAACGCCTCAAAAATGACGTTGACTCTTTTACCACTATGATGGCTGATTCTGCTGCCAG
TTTCGTTTTGCAACTGTATGG*ATTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGG*TCGGAACACCA
CCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTTAAAAGGAAAAAAATATGTAATGAAGATCTA
AATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAAATGTCCAGA
ACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTA
GAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTG
CTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTCT
TATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAA
CTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTG
GTAATCTTTTTATCATACGATCGAAAAGGAAAACTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCAT
GATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAACAAGATTTGAGATAGTCATGTAAACTTTTGGT
TTTTGTAAACAAATTCCTCAACGATCCAGCCATCTTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 10 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 
45 30 30 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 55 10 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 25 50 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 15 50 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 40 55 55 55 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 20 20 20 20 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW15JQ C 120
AF RR2G146TF U 340
AF RR2FW15TF U 120
AF RR2G146JQ C 120
AF RR2C187TF U 1
AF RR2DU87TF U 150
AF RR2A496TF U 230
AF RR2C187JQ C 233
AF RR2A496JQ C 309
AF RR2CI63TF U 392
AF RR2D527JQ C 335
AF RR2DU87JQ C 698
AF RR2CR73JQ C 607
AF RR2CR73TF U 461
AF RR2CO91TF U 858
BS 1 146 RR2C187TF
BS 147 147 RR2FW15TF
BS 148 174 RR2C187TF
BS 175 175 RR2FW15TF
BS 176 178 RR2C187TF
BS 179 179 RR2FW15TF
BS 180 205 RR2C187TF
BS 206 206 RR2FW15TF
BS 207 275 RR2C187TF
BS 276 276 RR2FW15TF
BS 277 354 RR2C187TF
BS 355 355 RR2G146TF
BS 356 441 RR2C187TF
BS 442 442 RR2G146TF
BS 443 456 RR2C187TF
BS 457 457 RR2G146TF
BS 458 504 RR2C187TF
BS 505 505 RR2G146TF
BS 506 509 RR2C187TF
BS 510 510 RR2G146TF
BS 511 517 RR2C187TF
BS 518 518 RR2G146TF
BS 519 557 RR2C187TF
BS 558 558 RR2G146TF
BS 559 684 RR2C187TF
BS 685 757 RR2DU87TF
BS 758 916 RR2A496TF
BS 917 1086 RR2CR73TF
BS 1087 1096 RR2CO91TF
BS 1097 1097 RR2D527JQ
BS 1098 1121 RR2CO91TF

RD RR2FW15JQ 451 0 0
GAGTAAAAGAAATTGTACCGGCATATTTAGACAAGAAACTACAACAAAACGACGATCTAT
AACAAAGCGATCTACTTACGGGCGTACCTTTTGCTTCGGGTGGTGCTGGCTATTTTCCTC
AAACATTTGAATCATGGAAAGTATTAACAATGTTGGACCAGTTGAGATATTTCCAAGAAT
ACAAGAAAAGAATGAAGAATCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAAGCATATAGTGAGAAAAG
GAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTGGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTG
CTCAACGCCTCAAAAATGACGTTGACTCTTTTACCACTATGATGGCTGATTCTGCTGCCA
GTTTCGTTTTGCAACTGTATGG*ATTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGG*TCGGAACACC
ACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTT

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR2G146TF 231 0 0
TAAGCATATAGTGAGAAAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTGGTTTA
TACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGCCTCAAAAATGACGTTGACTCTTTTACCACTAT
GATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGGATTTGGAACAAGACGTA
TAGGAGTGGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTT

QA 1 231 1 231
DS 

RD RR2FW15TF 451 0 0
GAGTAAAAGAAATTGTACCGGCATATTTAGACAAGAAACTACAACAAAACGACGATCTAT
AACAAAGCGATCTACTTACGGGCGTACCTTTTGCTTCGGGTGGTGCTGGCTATCTTCCTC
AAACATCTGAATCATGGAAAGTATTAACAATGTTGGACCAGTTGAGATATTTCCAAGAAT
ACAAGAAAAGAATGAAGAATCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAAGCATATAGTGAGAAAAG
GAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTGGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTG
CTCAACGCCTCAAAAATGACGTTGACTCTTTTACCACTATGATGGCTGATTCTGCTGCCA
GTTTCGTTTTGCAACTGTATGG*ATTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGG*TCGGAACACC
ACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTT

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR2G146JQ 451 0 0
GAGTAAAAGAAATTGTACCGGCATATTTAGACAAGAAACTACAACAAAACGACGATCTAT
AACAAAGCGATCTACTTACGGGCGTACCTTTTGCTTCGGGTGGTGCTGGCTATCTTCCTC
AAACATTTGAATCATGGAAAGTATTAACAATGTTGGACCAGTTGAGATATTTCCAAGAAT
ACAAGAAAAGAATGAAGAATCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAAGCATATAGTGAGAAAAG
GAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTGGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTG
CTCAACGCCTCAAAAATGACGTTGACTCTTTTACCACTATGATGGCTGATTTTGCTGCCA
GTTTCGTTTTGCAACTGTATGG*ATTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGG*TCGGAACACC
ACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTT

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR2C187TF 684 0 0
GCTAGACACAAAGCTAAAAAGTAATTATCGTCCCTATGGTATTGATTTTCTTATGGGAGT
CGCCACCGGTAGATTCAGCAACGGAAGGGTCGCTTCCGATTATATATCCAAATATTTGGG
AGTAAAAGAAATTGTACCGGCATATTCAGACAAGAAACTACAACAAAACGACGAACTACA
ACAAAGCGATCTACTTACGGGCGTATCTTTTGCTTCGGGTGGTGCTGGCTATCTTCCTCA
AACATCTGAATCATGGAAAGTATTAACAATGTTGGGCCAGTTGAGATATTTCCAAGACTA
CAAGAAAAGAATGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAAACATATAGTGAGCAAAGG
AGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTGGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGC
TCAACGCCTCAAAAATGACGTCGACTCTTTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAG
TTTCGTTTTGCAACTGTATGG*ATATGGAGCAAGACGAATAGGAGTGG*TCGGAACACCA
CCACTTGGATGTACACCATCACAGAGAGTTAAAAGGAAAAAAATATGTAATGAAGATCTA
AATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAAATGTCCAGA
ACCCTACCAAATTCTACAATTGTT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2DU87TF 608 0 0
G
CAAGAAACTACAACAAAACGACGAACTACAACAAAGCGATCTACTTACGGGCGTATCTTT
TGCTTCGGGTGGTGCTGGCTATCTTCCTCAAACATCTGAATCATGGAAAGTATTAACAAT
GTTGGACCAGTTGAGATATTTCCAAGACTAC**GAAAAGAATGAAGAAGCTAGTAGGAAA
AAAGAAGACTAAACATATAGTGAGCAAAGGAGCGGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGA
TCTGGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGCCTCAAAAATGACGTCGACTCTTT
TACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGG*ATATGGAG
CAAGACGAATAGGAGTGG*TCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCATCACAGAGAGTT
AAAAGGAAAAAAATATGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAAG
CTCTCAATTAGTTTGGGTCAAATGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGGA
GACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAG
ATAAAGA

QA 2 608 2 608
DS 

RD RR2A496TF 687 0 0
G
ATCTTCCTCAAACATCTGAATCATGGAAAGTATTAACAATGTTGGACCAGTTGAGATATT
TCCAAGACTACAAGAAAAGAATGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAAACATATAG
TGAGCAAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTGGTTTATACATATTTTG
GAAGTCGTGCTCAACGCCTCAAAAATGACGTCGACTCTTTTACCACCATGATGGCTGATT
CTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGG*ATATGGAGCAAGACGAATAGGAGTGG*T
CGGAACACCACCACTTGGATGTACACCATCACAGAGAGTTAAAAGGAAAAAAATATGTAA
TGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCA
AATGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGACATCTACTCTATCTTCAG
TAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGGCTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAA
AACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAA
TACATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATC
AAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACC

QA 2 687 2 687
DS 

RD RR2C187JQ 719 0 0
CTTCCTCAAACATCTGAATCATGGAAAGTATTAACAATGTTGGGCCAGTTGAGATATTTC
CAAGACTACAAGAAAAGAATGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAAACATATAGTG
AGCAAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTGGTTTATACATATTTTGGA
AGTCGTGCTCAACGCCTCAAAAATGACGTCGACTCTTTTACCACCATGATGGCTGATTCT
GCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGG*ATATGGAGCAAGACGAATAGGAGTGG*TCG
GAACACCACCACTTGGATGTACACCATCACAGAGAGTTAAAAGGAAAAAAATATGTAATG
AAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGTTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAAA
TGTCCAGAACCCTACCAAATTTTACAATTGTTTACGGAGACATTTACTCTATCTTCAGTA
AGATGCTAGAAAGCCCTTAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAA
CAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATA
CATCTTTTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCGTCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAA
ACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCCACTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAG
C

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2A496JQ 765 0 0
GAATGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAAACATATAGTGAGCAAAGGAGCAGCCA
TTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTGGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGCC
TCAAAAATGACGTCGACTCTTTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTT
TGCAACTGTATGG*ATATGGAGCAAGACGAATAGGAGTGG*TCGGAACACCACCACTTGG
ATGTACACCATCACAGAGAGTTAAAAGGAAAAAAATATGTAATGAAGATCTAAATTATGC
TGCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAAATGTCCAGAACCCTACC
AAATTCTACAATTGTTTACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCC
TGAAGGCTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGG
AGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTCTTATCTGTT
TTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAA
GAAATACCTCCACTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTT
TTTATCTTACG****AAAAGGAAAACTTGTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATT
TCTTCCACAAATAATGTAAACAAGATTTGAGATAGTCATGTAAAC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2CI63TF 675 0 0
GG
GGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGCCTCAAAAATGACGTTGACTCTTTTAC
CACTATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGG*ATTTGGAACAA
GACGTATAGGAGTGG*TCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTTAAA
AGGAAAAAAATATGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTC
TCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGAC
ATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATA
AAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACA
TCAAAAATATGTCCCAATACATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAG
AGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATTA
ATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCATACGATCGAAAAGGAAAA
CTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAACAAGA
TTTGAGATAGTCA

QA 3 675 3 675
DS 

RD RR2D527JQ 769 0 0
AAGACTAAGCATATAGTGAGAAAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTG
GTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGCCTCAAAAATGACGTTGACTCTTTTACC
ACTATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGG*ATTTGGGACAAG
ACGTATAGGAGTGG*TCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTTAAAA
GGAAAAAAATATGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCT
CAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGACA
CCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAA
AGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACAT
CAAAAATATGTCCCAATACATCTTTTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGA
GAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAGATACCTCCATTTTATCTGATTAA
TAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCATACGATCGAAAAGGAAAAC
TTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAACAAGAT
TTGAGATAGTCATGTAAACTTTTGGTTTTTGTAAACAAATTCCTCAACG

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2DU87JQ 406 0 0
ACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGA
AACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGAAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACATCAA
AAATATGTCCCAATACATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAG
CTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAACTACCTCCACTTTATCTGATTAATAA
GTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCTTACG****AAAAGGAAAACTTG
TGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAACAAGATTTG
AGATAGTCATGTAAACTTTTGGTTTTTGTAAACAAATTCCTCAACG

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR2CR73JQ 480 0 0
GCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTA
CCAAATTTTACAATTGTTTACGGAGACATTTACTCTATTTTCAGTAAGATGCTAGAAAGC
CCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAA
GGAGGTGTATTTTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATTTTTTTATTTG
TTTTGGGACGGTATCCATCCCATTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTA
AAGAAATACCTCCATTTTATTTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATC
TTTTTATCATACGATCGAAAAGGAAAACTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAA
TTTTTTCCACAAATAATGTAAACAAGATTTGAGATAGTCATGTAAACTTTTGGTTTTTGT

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2CR73TF 626 0 0
G
TGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGG*ATTTGGAACAAGACGTATA
GGAGTGG*TCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTTAAAAGGAAAAA
AATATGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAG
TTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGACATCTACTC
TATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACC
GTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAAT
ATGTCCCAATACATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCATTCAGAGAGCTTA
TGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTAT
CTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCATACGATCGAAAAGGAAAACTTTTGCA
ATATTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAACAAGATTTGAGAT
AGTCATGTAAACTTTTGGTTTTTGT

QA 2 626 2 626
DS 

RD RR2CO91TF 264 0 0
TATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAACACCT
CCATTTTATCTGATTAATAAGCATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCATA
CGATCGAATAGGAAAACTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCCACA
**TAATGTAAACAAGATTTGAGATAGTCATGTAAACTTTTGGTTTTTGTAAACAAATTCT
TCAACGATCCAGCCATCTTTGTTT

QA 1 264 1 264
DS 



AS 3 15

CO CL195Contig1 1626 5 18 U
TAAAAAAAAAAAAGAAAAAAACTCAAAACGAGAGAAAATGAGAGAGATCCTCCACATCCA
AGGCGGCCAATGTGGAAACCAGATCGGTGCCAAGTTCTGGGAAGTGATCTGCGACGAGCA
CGGCATTGACCACACCGGCCAATGCGTCGGCGACTCTCCTCTCCAGCTCGAACGCATCGA
TGTCTATTTCAACGAAGCGAGCGGCGGAAAGTACGTCCCTCGCGCCGTCCTCATGGATCT
GGAGCCTGGAACCATGGACTCTCTCAGATCTGGTCCCTACGGCCAGATCTTCCGTCCCGA
TAACTTCGTCTTTGGCCAGTCCGGCGCCGGGAATAACTGGGCCAAAGGTCATTACACGGA
GGGAGCCGAGTTAATCGATTCCGTTCTCGATGTTGTGAGAAAGGAAGCTGAGAACAGCGA
TTGCCTTCAAGGTTTCCAAGCGTGTCACTCGTTGGGAGGTGGAACTGGATCTGGGATGGG
AACGCTTTTGATCTCTAAGATAAGAGAGGAGTATCCAGACCGTATGATGATGACCTTCTC
GGTGTTTCCTTCTCCTAAGGTCTCCGACACTGTTGTTGAGCCATACAACGCAACGCTCTC
TGTGCATCAGCTCGTTGAAAACGCCGACGAGTGTATGGTTCTCGACAACGAGGCTCTCTA
CGACATCTGCTTCCGTACCCTCAAGCTCTCTAACCCCTCTTTTGGTGATCTTAACCATCT
CATCTCGGCAACAATGAGTGGTGTTACATGCTGTCTTCGTTTCCCTGGTCAACTCAACTC
TGACCTTAGGAAGCTCGCTGTGAACCTCATCCCTTTCCCAAGGCTCCACTTCTTCATGGT
GGGTTTTGCTCCGTTGACATCCAGAGGTTCACAGCAGTACAGTGCCTTGAGTGTCCCTGA
ACTCACCCAGCAGATGTGGGATGCAAAGAACATGATGTGCGCTGCTGACCCTCGTCACGG
ACGTTACTTAACTGCATCAGCTGTGTTCCGTGGGAAGCTGAGCACTAAGGAGGTCGATGA
GCAGATGATGAACATCCAGAACAAGAACTCATCCTACTTTGTGGAATGGATCCCGAACAA
TGTCAAGTCCAGCGTCTGTGACATTGCACCAAAGGGTTTGAAGATGGCGTCGACTTTCAT
CGGGAACCCAACTTCAATCCAGGAGATGTTCAGGCGTGTGAGTGAACAGTTCACAGCTAT
GTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGCATGGACGAGATGGAGTT
CACGGAAGCTGAGAGTAACATGAATGATCTCGTTGCAGAGTATCAGCAGTACCAGGATGC
TACAGCCGGTGAAGAGGAGTACGAGGATGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGT
TCGTTCATCAATGGCTTGGTCGGGATTCATAAGCTGTGTAAGCCGCAGTTGCTTCCTTCT
TCCCTTTTAAATCTATTTCTTTTGTTCAGTTTATGTGTGCTTTGTTCTTGAAACACAAGT
TCATTTTGGGATGTTAAAAAAACTTATGCGTGTATTGCTTTATTGTTTTTGTCACTGCCA
AAAAAAATATTGCTTTTGTTCTTTCAAGCTTTGTGTTTCATTTTCGGATTATAAATCTCA
AAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2A632TF U 1
AF RR2AL83TF U 185
AF RR2FB07TF U 821
AF RR2FB07JQ C 910
AF RR2AL83JQ C 891
BS 1 228 RR2A632TF
BS 229 229 RR2AL83TF
BS 230 297 RR2A632TF
BS 298 298 RR2AL83TF
BS 299 366 RR2A632TF
BS 367 367 RR2AL83TF
BS 368 729 RR2A632TF
BS 730 730 RR2AL83TF
BS 731 789 RR2A632TF
BS 790 790 RR2AL83TF
BS 791 816 RR2A632TF
BS 817 1003 RR2AL83TF
BS 1004 1521 RR2FB07TF
BS 1522 1522 RR2AL83JQ
BS 1523 1549 RR2FB07TF
BS 1550 1550 RR2AL83JQ
BS 1551 1565 RR2FB07TF
BS 1566 1626 RR2AL83JQ

RD RR2A632TF 816 0 0
TAAAAAAAAAAAAGAAAAAAACTCAAAACGAGAGAAAATGAGAGAGATCCTCCACATCCA
AGGCGGCCAATGTGGAAACCAGATCGGTGCCAAGTTCTGGGAAGTGATCTGCGACGAGCA
CGGCATTGACCACACCGGCCAATGCGTCGGCGACTCTCCTCTCCAGCTCGAACGCATCGA
TGTCTATTTCAACGAAGCGAGCGGCGGAAAGTACGTCCCTCGCGCCGTTCTCATGGATCT
GGAGCCTGGAACCATGGACTCTCTCAGATCTGGTCCCTACGGCCAGATCTTCCGTCCTGA
TAACTTCGTCTTTGGCCAGTCCGGCGCCGGGAATAACTGGGCCAAAGGTCATTACACGGA
GGGAGCGGAGTTAATCGATTCCGTTCTCGATGTTGTGAGAAAGGAAGCTGAGAACAGCGA
TTGCCTTCAAGGTTTCCAAGCGTGTCACTCGTTGGGAGGTGGAACTGGATCTGGGATGGG
AACGCTTTTGATCTCTAAGATAAGAGAGGAGTATCCAGACCGTATGATGATGACCTTCTC
GGTGTTTCCTTCTCCTAAGGTCTCCGACACTGTTGTTGAGCCATACAACGCAACGCTCTC
TGTGCATCAGCTCGTTGAAAACGCCGACGAGTGTATGGTTCTCGACAACGAGGCTCTCTA
CGACATCTGCTTCCGTACCCTCAAGCTCTCTAACCCCTCTTTTGGTGATCTTAACCATCT
CATCTCGGCTACAATGAGTGGTGTTACATGCTGTCTTCGTTTCCCTGGTCAACTCAACTC
TGACCTTAG*AAGCTCGCTGTGAACCTCATCCCTTT

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR2AL83TF 819 0 0
G
ATTTCAACGAAGCGAGCGGCGGAAAGTACGTCCCTCGCGCCGTCCTCATGGATCTGGAGC
CTGGAACCATGGACTCTCTCAGATCTGGTCCCTACGGCCAGATCTTCCGTCCCGATAACT
TCGTCTTTGGCCAGTCCGGCGCCGGGAATAACTGGGCCAAAGGTCATTACACGGAGGGAG
CCGAGTTGATCGATTCCGTTCTCGATGTTGTGAGAAAGGAAGCTGAGAACAGCGATTGCC
TTCAAGGTTTCCAAGTGTGTCACTCGTTGGGAGGTGGAACTGGATCTGGGATGGGGACGC
TTTTGATCTCTAAGATAAGAGAGGAGTATCCAGACCGTATGATGATGACCTTCTCGGTGT
TTCCTTCTCCTAAGGTCTCCGACACTGTTGTTGAGCCGTACAACGCAACGCTCTCTGTGC
ATCAGCTCGTTGAAAACGCCGACGAGTGTATGGTTCTCGACAACGAGGCTCTCTACGACA
TTTGCTTCCGTACCCTCAAGCTTTCTAACCCCTCTTTTGGTGATCTTAACCATCTCATCT
CGGCAACAATGAGTGGTGTTACATGCTGTCTTCGTTTCCCTGGTCAACTCAACTCTGACC
TTAGGAAGCTCGCTGTGAACCTGATCCCTTTCCCAAGGCTCCACTTCTTCATGGTGGGTT
TTGCTCCGTTGACATCCAGAGGTTCACAGCAGTACAGTGCCTTGAGTGTCCCTGAACTCA
CCCAGCAGATGTGGGATGCAAAGAACATGATGTGCGCTGCTGACCCTCGTCACGGACGTT
ACTTAACTGCATCAGCTGTGTTCCGTGGGAAGCTGAGC

QA 2 819 2 819
DS 

RD RR2FB07TF 745 0 0
G
GGCTCCACTTCTTCATGGTGGGTTTTGCTCCGTTGACATCCAGAGGTTCACAGCAGTACA
GTGCCTTGAGTGTCCCTGAACTCACCCAGCAGATGTGGGATGCAAAGAACATGATGTGCG
CTGCTGACCCTCGTCACGGACGTTACTTAACTGCATCAGCTGTGTTCCGTGGGAAGCTGA
GCACTAAGGAGGTCGATGAGCAGATGATGAACATCCAGAACAAGAACTCATCCTACTTTG
TGGAATGGATCCCGAACAATGTCAAGTCCAGCGTCTGTGACATTGCACCAAAGGGTTTGA
AGATGGCGTCGACTTTCATCGGGAACCCAACTTCAATCCAGGAGATGTTCAGGCGTGTGA
GTGAACAGTTCACAGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAG
GCATGGACGAGATGGAGTTCACGGAAGCTGAGAGTAACATGAATGATCTCGTTGCAGAGT
ATCAGCAGTACCAGGATGCTACAGCCGGTGAAGAGGAGTACGAGGATGAAGAAGAGGAGT
ACGATGAGGCTTGAGATGTTCGTTCATCAATGGCTTGGTCGGGATTCATAAGCTGTGTAA
GCCGCAGTTGCTTCCTTCTTCCCTTTTAAATCTATTTCTTTTGTTCAGTTTATGTGTGCT
TTGTTCTTGAAACACAAGTTCATTTTGGGATGTTAAAAAA*CTTATGCGTGTATTGCTTT
ATTGTTTT*GTCACTGCCAAAAAA

QA 2 745 2 745
DS 

RD RR2FB07JQ 676 0 0
GCAGATGTGGGATGCAAAGAACATGATGTGCGCTGCTGACCCTCGTCACGGACGTTACTT
AACTGCATCAGCTGTGTTCCGTGGGAAGCTGAGCACTAAGGAGGTCGATGAGCAGATGAT
GAACATCCAGAACAAGAACTCATCCTACTTTGTGGAATGGATCCCGAACAATGTCAAGTC
CAGCGTCTGTGACATTGCACCAAAGGGTTTGAAGATGGCGTCGACTTTCATCGGGAACCC
AACTTCAATCCAGGAGATGTTCAGGCGTGTGAGTGAACAGTTCACAGCTATGTTCAGGAG
AAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGCATGGACGAGATGGAGTTCACGGAAGC
TGAGAGTAACATGAATGATCTCGTTGCAGAGTATCAGCAGTACCAGGATGCTACAGCCGG
TGAAGAGGAGTACGAGGATGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTCGTTCATC
AATGGCTTGGTCGGGATTCATAAGCTGTGTAAGCCGCAGTTGCTTCCTTCTTCCCTTTTA
AATCTATTTCTTTTGTTCAGTTTATGTGTGCTTTGTTCTTGAAACACAAGTTCATTTTGG
GATGTTAAAAAAACTTATGCGTGTATTGCTTTATTGTTTTTGTCACTGCCAAAAAAA*TA
TTGCTTTTGTTCTTTC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2AL83JQ 736 0 0
GTGTCCCTGAACTCACCCAGCAGATGTGGGATGCAAAGAACATGATGTGCGCTGCTGACC
CTCGTCACGGACGTTACTTAACTGCATCAGCTGTGTTCCGTGGGAAGCTGAGCACTAAGG
AGGTCGATGAGCAGATGACGAACATCCAGAACAAGAACTCATCCTACTTTGTGGAATGGA
TCCCGAACAATGTCAAGTCCAGCGTCTGTGACATCGCACCAAAGGGTTTGAAGATGGCGT
CGACTTTCATCGGGAACTCGACTTCAATCCAGGAGATGTTCAGGCGTGTGAGTGAACAGT
TCACAGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGCATGGACG
AGATGGAGTTCACGGAAGCTGAGAGTAACATGAATGATCTCGTTGCAGAGTATCAGCAGT
ACCAGGATGCTACAGCCGGTGAAGAGGAGTACGAGGATGAAGAAGAGGAGTACGATGAGG
CTTGAGATGTTCGTTCATCAATGGCTTGGTCGGGATTCATAAGCTGTGTAAGCCGCAGTT
GCTTCCTTCTTCCCTTTTAAATCTATTTCTTTTGTTCAGTTTATGTGTGCTTTGTTCTTG
AAACACAAGTTCATTTTGGGATGTTAAAAAAACTTATGCGTGTATTGCTTTATTGTTTTT
GTCACTGCCAAAAAAAATATTGCTTTTGTTCTTTCAAGCTTTGTGTTTCATTTTCGGATT
ATAAATCTCAAAAGCC

QA 1 736 1 736
DS 



CO CL195Contig2 925 6 9 U
GCTCTCTACGATATCTGCTTCCGTACCCTCAAGCTTGCTAATCCCACTTTTGGTGACCTT
AACCACCTCATCTCGGCTACAATGAGTGGTGTCACATGCTGTCTTCGTTTCCCTGGTCAG
CTTAACTCTGACCTTAGGAAGCTTGCTGTGAACCTCATCCCTTTCCCAAGGCTCCACTTC
TTCATGGTTGGTTTTGCTCCGTTGACGTCGAGAGGATCGCAGCAGTACAGTGCCTTGAGT
GTCCCTGAGCTGACCCAGCAGATGTGGGATGCGAAGAACATGATGTGCGCTGCTGACCCT
CGTCACGGACGCTACCTAACCGCATCCGCTGTGTTCCGTGGGAAGCTGAGCACTAAGGAG
GTGGATGAGCAGATGATGAACATTCAGAACAAAAACTCGTCCTACTTTGTGGAGTGGATC
CCGAACAATGTTAAGTCCAGCGTCTGTGATATTGCACCGACGGGTTTGAAAATGGCCTCG
ACTTTCATCGGGAACTCGACTTCGATCCAGGAGATGTTTAGGCGTGTGAGCGAGCAGTTC
ACTGCTATGTTCAGGAGAAA*GGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGAATGGACGA
GATGGAGTTCACGGAAGCAGAGAGTAACATGAACGATCTTGTTGCAGAGTATCAGCAGTA
CCAGGATGCTACGGCCGACGGTGAAGAGGAGTATGAAGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGA
GGCTTGAGATGTTCGGTCAATGGCTTCCTCTGACTCATAAGCTGTGAAAGTTGCAGTCTG
TTTCTTCTTTCTATGTTTCTTCTTTAAATATATCTCTCCTTTTTTCCAGTTTATGTTTGC
TTTGTTCTTTCACTCGTTCTGGATTGTTAAACGTTTGCGTGCATTGGTTTATTGTTTTGT
CAAGTGAAAAAAAAATATTATTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 25 25 25 10 25 25 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2DB43TF U 1
AF RR2D213TF U 8
AF RR2D213JQ C 406
AF RR2FX50JQ C 680
AF RR2FX50TF U 680
AF RR2DB43JQ C 406
BS 1 560 RR2DB43TF
BS 561 561 RR2D213TF
BS 562 672 RR2DB43TF
BS 673 673 RR2D213JQ
BS 674 679 RR2DB43TF
BS 680 680 RR2FX50TF
BS 681 694 RR2DB43TF
BS 695 906 RR2FX50TF
BS 907 925 RR2D213JQ

RD RR2DB43TF 694 0 0
GCTCTCTACGATATCTGCTTCCGTACCCTCAAGCTTGCTAATCCCACTTTTGGTGACCTT
AACCACCTCATCTCGGCTACAATGAGTGGTGTCACATGCTGTCTTCGTTTCCCTGGTCAG
CTTAACTCTGACCTTAGGAAGCTTGCTGTGAACCTCATCCCTTTCCCAAGGCTCCACTTC
TTCATGGTTGGTTTTGCTCCGTTGACGTCGAGAGGATCGCAGCAGTACAGTGCCTTGAGT
GTCCCTGAGCTGACCCAGCAGATGTGGGATGCGAAGAACATGATGTGCGCTGCTGACCCT
CGTCACGGACGCTACCTAACCGCATCCGCTGTGTTCCGTGGGAAGCTGAGCACTAAGGAG
GTGGATGAGCAGATGATGAACATTCAGAACAAAAACTCGTCCTACTTTGTGGAGTGGATC
CCGAACAATGTTAAGTCCAGCGTCTGTGATATTGCACCGACGGGTTTGAAAATGGCCTCG
ACTTTCATCGGGAACTCGACTTCGATCCAGGAGATGTTTAGGCGTGTGAGCGAGCAGTTC
ACTGCTATGTTCAGGAGAAAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGAATGGACGA
GATGGAGTTCACGGAAGCAGAGAGTAACATGAACGATCTTGTTGCAGAGTATCAGCAGTA
CCAGGATGCTACAGCCGACTGTGAAGAGGAGTAT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2D213TF 669 0 0
G
CGATATCTGCTTCCGTACCCTCAAGCTTGCTAATCCCACTTTTGGTGACCTTAACCACCT
CATCTCGGCTACAATGAGTGGTGTCACATGCTGTCTTCGTTTCCCTGGTCAGCTTAACTC
TGACCTTAGGAAGCTTGCTGTGAACCTCATCCCTTTCCCAAGGCTCCACTTCTTCATGGT
TGGTTTTGCTCCGTTGACGTCGAGAGGATCGCAGCAGTACAGTGCCTTGAGTGTCCCTGA
GCTGACCCAGCAGATGTGGGATGCGAAGAACATGATGTGCGCTGCTGACCCTCGTCACGG
ACGCTACCTAACCGCATCCGCTGTGTTCCGTGGGAAGCTGAGCACTAAGGAGGTGGATGA
GCAGATGATGAACATTCAGAACAAAAACTCGTCCTACTTTGTGGAGTGGATCCCGAACAA
TGTTAAGTCCAGCGTCTGTGATATTGCACCGACGGGTTTGAAAATGGCCTCGACTTTCAT
CGGGAACTCGACTTCGATCCAGGAGATGTTTAGGCGTGTGAGCGAGCAGTTCACTGCTAT
GTTCAGGAGAAA*GGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGAATGGATGAGATGGAGT
TCACGGAAGCAGAGAGTAACATGAACGATCTTGTTGCAGATTATCAGCAGTACCAGGATG
CTAC
GGCC

QA 2 665 2 665
DS 

RD RR2D213JQ 520 0 0
TTTGTGGAGTGGATCCCGAACAATGTTAAGTCCAGCGTCTGTGATATTGCACCGACGGGT
TTGAAAATGGCCTCGACTTTCATCGGGAACTCGACTTCGATCCAGGAGATGTTTAGGCGT
GTGAGCGAGCAGTTCACTGCTATGTTCAGGAGAAA*GGCTTTCCTTCATTGGTACACAGG
AGAAGGAATGGATGAGATGGAGTTCACGGAAGCAGAGAGTAACATGAACGATCTTGTTGC
AGATTATCAGCAGTACCAGGATGTTACGGCCTACGGTGAAGAGGAGTATGAAGAGGAAGA
AGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTCGGTCAATGGCTTCCTCTGACTCATAAGCTGT
GAAAGTTGCAGTCTGTTTTTTCTTTTTACGTTTTTTCTTTAAATATATCTCTCCTTTTTT
CCAGTTTATGTTTGCTTTGTTCTTTCACTCGTTCTGGATTATTAAACGTTTGCGTGCATT
GGTTTATTGTTTTGTCAAGTGAAAAAAAAATATTATTGCC

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2FX50JQ 227 0 0
GGTGAAGAGGAGTATGAAGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTCGGTCA
ATGGCTTCCTCTGACTCATAAGCTGTGAAAGTTGCAGTCTGTTTCTTCTTTCTATGTTTC
TTCTTTAAATATATCTCTCCTTTTTTCCAGTTTATGTTTGCTTTGTTCTTTCACTCGTTT
TGGATTGTTAAACGTTTGCGTGCATTGGTTTATTGTTTTGTCAAGTG

QA 1 227 1 227
DS 

RD RR2FX50TF 227 0 0
GGTGAAGAGGAGTATGAAGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTCGGTCA
ATGGCTTCCTCTGACTCATAAGCTGTGAAAGTTGCAGTCTGTTTCTTCTTTCTATGTTTC
TTCTTTAAATATATCTCTCCTTTTTTCCAGTTTATGTTTGCTTTGTTCTTTCACTCGTTC
TGGATTGTTAAACGTTTGCGTGCATTGGTTTATTGTTTTGTCAAGTG

QA 1 227 1 227
DS 

RD RR2DB43JQ 520 0 0
TTTGTGGAGTGGATCCCGAACAATGTTAAGTCCAGCGTCTGTGATATTGCACCGACGGGT
TTGAAAATGGCCTCGACTTTCATCGGGAACTCGACTTCGATCCAGGAGATGTTTAGGCGT
GTGAGCGAGCAGTTCACTGCTATGTTCAGGAGAAA*GGCTTTCCTTCATTGGTACACAGG
AGAAGGAATGGACGAGATGGAGTTCACGGAAGCAGAGAGTAACATGAACGATCTTGTTGC
AGAGTATCAGCAGTACCAGGATGCTACGGCCGACTGTGAAGAGGAGTATGAAGAGGAAGA
AGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTCGGTCAATGGCTTCCTCTGACTCATAAGCTGT
GAAAGTTGCAGTCTGTTTCTTCTTTCTATGTTTCTTCTTTAAATATATCTCTCCTTTTTT
CCAGTTTATGTTTGCTTTGCTCTTTCACTCGTTCTGGATTGTTAAACGTTTGCGTGCATT
GGTTTATTGTTTTGTCAAGTGAAAAAAAAATATTATTGC
C

QA 1 519 1 519
DS 



CO CL195Contig3 1270 4 6 U
GGGCAGTCCGGCGCCGGGAACAACTGGGCTAAAGGTCACTACACGGAGGGCGCGGAGTTG
ATCGATTCGGTCCTTGATGTTGTCAGGAAGGAAGCTGAGAACAGCGATTGTCTCCAAGGT
TTCCAGGTTTGTCATTCATTGGGAGGAGGAACTGGATCTGGGATGGGAACGCTTCTCATC
TCTAAGATAAGAGAGGAGTATCCAGACCGTATGATGATGACATTCTCTGTGTTTCCTTCT
CCTAAGGTCTCTGACACTGTTGTTGAGCCATACAATGCAACGCTCTCTGTTCACCAGCTT
GTTGAAAACGCTGACGAGTGTATGGTTTTGGACAATGAGGCTCTCTACGATATCTGCTTC
CGTACACTCAAGCTTGCTAATCCCACTTTTGGTGATCTTAACCATCTTATCTCGGCTACG
ATGAGCGGTGTCACATGCTGTCTTCGTTTCCCTGGTCAACTCAACTCTGACCTTAGGAAG
CTTGCTGTGAACTTGATCCCTTTCCCCAGGCTCCACTTCTTCATGGTTGGTTTTGCTCCG
TTGACGTCGAGAGGTTCGCAGCAGTACAGTGCGTTGAGTGTCCCTGAGCTGACCCAGCAG
ATGTGGGATGCGAAGAACATGATGTGCGCTGCTGACCCTCGTCACGGACGCTACCTAACC
GCATCCGCTGTGTTCCGTGGGAAGCTGAGCACTAAGGAGGTGGATGAGCAGATGATGAAC
ATTCAGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTGGAGTGGATCCCGAACAATGTTAAGTCCAGC
GTCTGTGATATTGCGCCGACGGGTTTGAAAATGGCGTCGACTTTCATCGGGAACTCGACT
TCGATCCAGGAGATGTTTAGGCGTGTGAGCGAACAGTTCACTGCTATGTTCAGGAGAAAG
GCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGAATGGACGAGATGGAGTTCACGGAAGCAGAG
AGTAACATGAACGATCTTGTTGCAGAGTATCAGCAGTACCAGGATGCTACAGCCGACGGT
GAAGAGGAGTATGAAGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTGGTCAATGG
CTTTGTCTTGACTCATGAGCTGTGAAAGTTGCAGTCTGTTTCTTCTTTCTATGTTTCTTC
TTTAAATATATCTCCCCTTTTTTCCAGTTTATGTTTGCTTTGTTCTTTCACTCGTTCTGG
ATTGTTAAACGTTTGCGTGCATTGGTTTATTGTTTTGTCAAGTGAAAAAAAAATATTATT
GCTTTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ55TF U 1
AF RR2AL02TF U 315
AF RR2AL02JQ C 537
AF RR2FJ55JQ C 672
BS 1 640 RR2FJ55TF
BS 641 1118 RR2AL02TF
BS 1119 1154 RR2AL02JQ
BS 1155 1155 RR2FJ55JQ
BS 1156 1262 RR2AL02JQ
BS 1263 1270 RR2FJ55JQ

RD RR2FJ55TF 640 0 0
GGGCAGTCCGGCGCCGGGAACAACTGGGCTAAAGGTCACTACACGGAGGGCGCGGAGTTG
ATCGATTCGGTCCTTGATGTTGTCAGGAAGGAAGCTGAGAACAGCGATTGTCTCCAAGGT
TTCCAGGTTTGTCATTCATTGGGAGGAGGAACTGGATCTGGGATGGGAACGCTTCTCATC
TCTAAGATAAGAGAGGAGTATCCAGACCGTATGATGATGACATTCTCTGTGTTTCCTTCT
CCTAAGGTCTCTGACACTGTTGTTGAGCCATACAATGCAACGCTCTCTGTTCACCAGCTT
GTTGAAAACGCTGACGAGTGTATGGTTTTGGACAATGAGGCTCTCTACGATATCTGCTTC
CGTACACTCAAGCTTGCTAATCCCACTTTTGGTGATCTTAACCATCTTATCTCGGCTACG
ATGAGCGGTGTCACATGCTGTCTTCGTTTCCCTGGTCAACTCAACTCTGACCTTAGGAAG
CTTGCTGTGAACTTGATCCCTTTCCCCAGGCTCCACTTCTTCATGGTTGGTTTTGCTCCG
TTGACGTCGAGAGGTTCGCAGCAGTACAGTGCGTTGAGTGTCCCTGAGCTGACCCAGCAG
ATGTGGGATGCGAAGAACATGATGTGCGCTGCTGACCCTC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2AL02TF 804 0 0
G
GAGTGTATGGTTTTGGACAATGAGGCTCTCTACGATATCTGCTTCCGTACACTCAAGCTT
GCTAATCCCACTTTTGGTGATCTTAACCATCTTATCTCGGCTACGATGAGTGGTGTCACA
TGCTGTCTTCGTTTCCCTGGTCAACTCAACTCTGACCTTAGGAAGCTTGCTGTGAACTTG
ATCCCTTTCCCCAGGCTCCACTTCTTCATGGTTGGTTTTGCTCCGTTGACGTCGAGAGGT
TCGCAGCAGTACAGTGCGTTGAGTGTCCCTGAGCTGACCCAGCAGATGTGGGATGCGAAG
AACATGATGTGCGCTGCTGACCCTCGTCACGGACGCTACCTAACCGCATCCGCTGTGTTC
CGTGGGAAGCTGAGCACTAAGGAGGTGGATGAGCAGATGATGAACATTCAGAACAAGAAC
TCGTCCTACTTTGTGGAGTGGATCCCGAACAATGTTAAGTCCAGCGTCTGTGATATTGCG
CCGACGGGTTTGAAAATGGCGTCGACTTTCATCGGGAACTCGACTTCGATCCAGGAGATG
TTTAGGCGTGTGAGCGAACAGTTCACTGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCATTGG
TACACAGGAGAAGGAATGGACGAGATGGAGTTCACGGAAGCAGAGAGTAACATGAACGAT
CTTGTTGCAGAGTATCAGCAGTACCAGGATGCTACAGCCGACGGTGAAGAGGAGTATGAA
GAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTGGTCAATGGCTTTGTCTTGACTCA
TGAGCTGTGAAAGTTGCAGTCTG

QA 2 804 2 804
DS 

RD RR2AL02JQ 727 0 0
TCCGTTGACGTCGAGAGGTTCGCAGCAGTACAGTGCGTTGAGTGTCCCTGAGCTGACCCA
GCAGATGTGGGATGCGAAGAACATGATGTGCGCTGCTGACCCTCGTCACGGACGCTACCT
AACCGCATCCGCTGTGTTCCGTGGGAAGCTGAGCACTAAGGAGGTGGATGAGCAGATGAT
GAACATTCAGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTGGAGTGGATCCCGAACAATGTTAAGTC
CAGCGTCTGTGATATTGCGCCGACGGGTTTGAAAATGGCGTCGACTTTCATCGGGAACTC
GACTTCGATCCAGGAGATGTTTAGGCGTGTGAGCGAACAGTTCACTGCTATGTTCAGGAG
AAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGAATGGACGAGATGGAGTTCACGGAAGC
AGAGAGTAACATGAACGATCTTGTTGCAGAGTATCAGCAGTACCAGGATGCTACAGCCGA
CGGTGAAGAGGAGTATGAAGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTGGTCA
ATGGCTTTGTCTTGACTCATGAGCTGTGAAAGTTGCAGTCTGTTTCTTCTTTCTATGTTT
CTTCTTTAAATATATCTCTCCTTTTTTCCAGTTTATGTTTGCTTTGTTCTTTCACTCGTT
CTGGATTGTTAAACGTTTGCGTGCATTGGTTTATTGTTTTGTCAAGTGAAAAAAAAATAT
TATTGC
T

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2FJ55JQ 599 0 0
GTTCCGTGGGAAGCTGAGCACTAAGGAGGTGGATGAGCAGATGATGAACATTCAGAACAA
GAACTCGTCCTACTTTGTGGAGTGGATCCCGAACAATGTTAAGTCCAGCGTCTGTGATAT
TGCGCCGACGGGTTTGAAAATGGCGTCGACTTTCATCGGGAACTCGACTTCGATCCAGGA
GATGTTTAGGCGTGTGAGCGAACAGTTCACTGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCA
TTGGTACACAGGAGAAGGAATGGACGAGATGGAGTTCACGGAAGCAGAGAGTAACATGAA
CGATCTTGTTGCAGAGTATCAGCAGTACCAGGATGCTACAGCCGACGGTGAAGAGGAGTA
TGAAGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTGGTCAATGGCTTTGTCTTGA
CTCATGAGCTGTGAAAGTTGCAGTCTGTTTCTTCTTTCTATGTTTCTTCTTTAAATATAT
CTCCCCTTTTTTCCAGTTTATGTTTGCTTTGTTCTTTCACTCGTTTTGGATTGTTAAACG
TTTGCGTGCATTGGTTTATTGTTTTGTCAAGTGAAAAAAAAATATTATTGCTTTTGTTC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 2 15

CO CL196Contig1 1051 11 19 U
GGACCTTTTCTAGAGAGACTCGTAATCATCCTCTGTTTCGAAACAGAGTATCTCTGAAAC
GAAGCAGAGCAGCGACTCCTGTTTTTTTTTTT*GGATTCCATGGCTTTGACTTCGTGCCT
AAAGACTGGGGTAGTTCCGATGTCTCCGACCACCGGACTGTATCTTTCCGGGAGTCTTGT
GAAGTCGGACAGTGGCTTCTCCGTTCCGACCAAGTTACAGAGCGTTCGAAAAAGCAGCGA
TAGAGAGAGGCTGAGAATCCAAGCCGTGTTCAGCTTTCCTCCGGCGTTTCTGACGAGAAA
CGGTAGAGCAGAGAAGCAGAAGCAGCTGAAGCAAGATCTTCTCGAAGCCATTGCCCCTCT
CGAACGTGGCGCTACTGCTTCTCCTGATGACCAGCTTCGTATCGATCAGTTGGCGCGAAA
AGTGGAAGCAGTGAATCCAACCAGGGAGCCTTTGAAATCTGATTTAATCAATGGGAAATG
GG*AGCTCATTTACACAACCTCTGCTTCTATTCTGCAGGCCAAGAAACCAAGGTTCTTGA
GGTCAATAACAAACTACCAATCTATCAATGTGGATACACTCAAGGTTCAAAACATGGAGA
CTTGGCCTTTCTTCAACTCGGTAACTGGAGACATAAGACCTCTCAATTCAAGGAAGGTTG
CTGTTCAGCTCAAAGTGTTTAAAATTCTCGGCCTTATCCCTGTAAATGCACCTGAAACCG
CACGTGGTGAACTAGAGATTACCTATGTTGACGAGGAGCTACGGCTGTCAAGGGGTGACA
AGGGCAATTTGTTTATACTGAAGATGTTTGATCCAACTTATCGAATCCCTCTCTGAAGCA
AGCCAATCATACAAACACATACATTACCCCCCAACGCTTGTTCTGTCTCTCTTCATCGTA
TGTATAGATGAATGTTTCTTCTTCTACAAACATAAAAATCTAATAACAAGAAAAAGAAAA
GAGACAAGTTATTGCCTCAATTTTAACGTTGTTGTGATCAACATTGCATTGTAAGCAGAT
GAAATGTAACGAATAAACTCTTTATCATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 35 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 35 50 35 50 35 50 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU17TF U 1
AF RR2DV70TF U 26
AF RR2GN06TF U 8
AF RR2FJ24TF U 8
AF RR2EK10TF U 291
AF RR2DT42TF U 1
AF RR2GU17JQB C 506
AF RR2FJ24JQ C 510
AF RR2F908TF U 311
AF RR2F908JQ C 510
AF RR2GN06JQ C 657
BS 1 92 RR2DT42TF
BS 93 93 RR2GU17TF
BS 94 318 RR2DT42TF
BS 319 319 RR2FJ24TF
BS 320 603 RR2DT42TF
BS 604 604 RR2FJ24TF
BS 605 656 RR2DT42TF
BS 657 657 RR2FJ24TF
BS 658 705 RR2DT42TF
BS 706 706 RR2F908TF
BS 707 739 RR2DT42TF
BS 740 740 RR2F908TF
BS 741 763 RR2DT42TF
BS 764 764 RR2F908TF
BS 765 774 RR2DT42TF
BS 775 979 RR2F908TF
BS 980 980 RR2F908JQ
BS 981 1043 RR2F908TF
BS 1044 1051 RR2GN06JQ

RD RR2GU17TF 266 0 0
GGACCTTTTCT
AGAGAGACTCGTAATCATCCTCTGTTTCGAAACAGAGTATCTCTGAAACGAAGCAGAGCA
GCGACTCCTGTTTTTTTTTT**GGATTCCATGGCTTTGACTTCGTGCCTAAAGACTGGGG
TAGTTC*GATGTCTCCGACCACCGGACTGTATCTTTCCGGGAGTCTTGTGAAGTCGGACA
GTGGCTTCTCCGTTCCGACCAAGTTACAGAGCGTTCGAAAAAGCAGCGATAGAGGGAGGC
TGAGAATCCAAGCCG

QA 12 266 12 266
DS 

RD RR2DV70TF 555 0 0
GG
ATCCTCTGTTTCGAAACAGAGTATCTCTGAAACGAAGCAGAGCAGCGACTCCTGTTTTTT
TTTTT*GGATTCCATGGCTTTGACTTCGTGCCTAAAGACTGGGGTAGTTCCGATGTCTCC
GACCACCGGACTGTATCTTTCCGGGAGTCTTGTGAAGTCGGACAGTGGCTTCTCCGTTCC
GACCAAGTTACAGAGCGTTCGAAAAAGCAGCGATAGAGAGAGGCTTAGAATCCAAGCCGT
GTTCAGCTTTCCTCCGGCGTTTCTGACGAGAAACGGTAGAGCAGAGAAGCAGAAGCAGCT
GAAGCAAGATCTTCTCGAAGCCATTGCCCCTCTCGAACGTGGCGCTACTGCTTCTCCTGA
TGACCAGCTTCGTATCGATCAGTTGGCGCGAAAAGTGGAAGCAGTGAATCCAACCAGGGA
GCCTTTGAAATCTGATTTAATCAATGGGAAATGGGGAGCTCATTTACACAACCTCTGCTT
CTATTCTGCAGGCCAAGAAACCAAGGTTCTTGAGGTCAATAACAAACTACCAATCTATCA
ATGTGGATACACT

QA 3 555 3 555
DS 

RD RR2GN06TF 641 0 0
GGAG
AGAGAGACTCGTAATCATCCTCTGTTTCGAAACAGAGTATCTCTGAAACGAAGCAGAGCA
GCGACTCCTGTTTTTTTTT***GGATTCCATGGCTTTGACTTCGTGCCTAAAGACTGGGG
TAGTTCCGATGTCTCCGACCACCGGAATGTATCTTTCCGGGAGTCTTGTGAAGTCGGACA
GTGGCTTCTCCGTTCCGACCAAGTTACAGAGCGTTCGAAAAAGCAGCGATAGAGAGAGGC
TGAGAATCCAAGCCGTGTTCAGCTTTCCTCCGGCGTTTCTGACGAGAAACGGTAGAGCAG
AGAAGCAGAAGCAGCTGAAGCAAGATCTTCTCGAAGCCATTGCCCCTCTCGAACGTGGCG
CTACTGCTTCTCCTGATGACCAGCTTCGTATCGATCAGTTGGCGCGAAAAGTGGAAGCAG
TGAATCCAACCAGGGAGCCTTTGAAATCTGATTTAATTAATGGGAAATGGG*AGCTCATT
TACACAACCTCTGCTTCTATTCTGCAGGCCAAGAAACCAAGGTTCTTGAGGTCAATAACA
AACTACCAATCTATCAATGTGGATACACTCAAG*TTCAAAACATGGAGACTTGGCCTTTC
TTCAACTCGGTAACTGGAGACATAAGACCTCTCAATT

QA 5 641 5 641
DS 

RD RR2FJ24TF 697 0 0
GGCT
AGAGAGACTCGTAATCATCCTCTGTTTCGAAACAGAGTATCTCTGAAACGAAGCAGAGCA
GCGACTCCTGTTTTTTTTTTT*GGATTCCATGGCTTTGACTTCGTGCCTAAAGACTGGGG
TAGTTCCGATGTCTCCGACCACCGGACTGTATCTTTCCGGGAGTCTTGTGAAGTCGGACA
GTGGCTTCTCCGTTCCGACCAAGTTACAGAGCGTTCGAAAAAGCAGCGATAGAGAGAGGC
TGAGAATCCAAGCCGTATTCAGCTTTCCTCCGGCGTTTCTGACGAGAAACGGTAGAGCAG
AGAAGCAGAAGCAGCTGAAGCAAGATCTTCTCGAAGCCATTGCCCCTCTCGAACGTGGCG
CTACTGCTTCTCCTGATGACCAGCTTCGTATCGATCAGTTGGCGCGAAAAGTGGAAGCAG
TGAATCCAACCAGGGAGCCTTTGAAATCTGATTTAATCAATGGGAAATGGG*AGCTCATT
TACACAACCTCTGCTTCTATTCTGCAGGCCAAGAAACCAAGGTTCTTGAGGTCAATAACA
AACTACCAATCTATCAATGTGGATACACTCAAGGTTCAAAACATGGAGACTTGGCCTTTC
TTCAACTCGGTAACTGGAGACATAAGACCTCTCAATTCAAGGAAGGTTGCTGCTCAGCTC
AAAGTGTTTAAAATTCTCGGCCTTATCC
TGTAA

QA 5 692 5 692
DS 

RD RR2EK10TF 372 0 0
TGACGAGAAACGGTAGAGCAGAGAAGCAGAAGCAGCTGAAGCAAGATCTTCTCGAAGCCA
TTGCCCCTCTCGAACGTGGCGCTACTGCTTCTCCTGATGACCAGCTTCGTATCGATCAGT
TGGCGCGAAAAGTGGAAGCAGTGAATCCAACCAGGGAGCCTTTGAAATCTGATTTAATCA
ATGGGAAATGGG*AGCTCATTTACACAACCTCTGCTTCTATTCTGCAGGCCAAGAAACCA
AGGTTCTTGAGGTCAATAACAAACTACCAATCTATCAATGTGGATACACTCAAGGTTCAA
AACATGGAGACTTGGCCTTTCTTCAACTCGGTA******GACATAAGACCTCTCAATTCA
AGGAAGGTTGCT

QA 1 372 1 372
DS 

RD RR2DT42TF 775 0 0
GGACCTTTTCTAGAGAGACTCGTAATCATCCTCTGTTTCGAAACAGAGTATCTCTGAAAC
GAAGCAGAGCAGCGACTCCTGTTTTTTTTTTTTGGATTCCATGGCTTTGACTTCGTGCCT
AAAGACTGGGGTAGTTCCGATGTCTCCGACCACCGGACTGTATCTTTCCGGGAGTCTTGT
GAAGTCGGACAGTGGCTTCTCCGTTCCGACCAAGTTACAGAGCGTTCGAAAAAGCAGCGA
TAGAGAGAGGCTGAGAATCCAAGCCGTGTTCAGCTTTCCTCCGGCGTTTCTGACGAGAAA
CGGTAGAGCAGAGAAGCATAAGCAGCTGAAGCAAGATCTTCTCGAAGCCATTGCCCCTCT
CGAACGTGGCGCTACTGCTTCTCCTGATGACCAGCTTCGTATCGATCAGTTGGCGCGAAA
AGTGGAAGCAGTGAATCCAACCAGGGAGCCTTTGAAATCTGATTTAATCAATGGGAAATG
GG*AGCTCATTTACACAACCTCTGCTTCTATTCTGCAGGCCAAGAAACCAAGGTTCTTGA
GGTCAATAACAAACTACCAATCTATCAATGTGGATACACTCAAGGTTCAAAACATGGAGA
CTTAGCCTTTCTTCAACTCGGTAACTGGAGACATAAGACCTCTCAATTCAAGGAAG*TTG
CTGTTCAGCTCAAAGTGTTTAAAATTCTCGGCCTTATCCCTGTAA*TGCACCTGAAACCG
CACGTGGTGAACTAGAGAT*ACCTATGTTGACGAGGAGCTACG*CTGTCAAGGG
T

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2GU17JQB 473 0 0
TTCTATTCTGCAGGCCAAGAAACCAAGGTTCTTGAGGTCAATAACAAACTACCAATCTAT
CAATGTGGATACACTCAAGGTTCAAAACATGGAGACTTGGCCTTTCTTCAACTCGGTAAC
TGGAGACATAAGACCTCTCAATTCAAGGAAGGTCGCTGTTCAGCTCAAAGTGTTTAAAAT
TTTCGGCCTTATCCCTGTAAATGCACCTGAAACCGCACGTGGTGAACTAGAGATTACCTA
TGTTGACGAGGAGCTACGGCTGTCAAGGGGTGACAAGGGCAATTTGTTTATACTGAAGAT
GTTTGATCCAACTTATCGAATCCCTTTCTGAAGCAAGCCAATCATACAAACACATACATT
ACCCCCCAACGCTTGTTCTGTCTCTTTTCATCGTATGTATAGATGAATGTTTCTTTTTCT
ACAAACATAAAAATCTAATAACAAGAAAAAGAAAAGAGACAAGTTATTGCCTC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2FJ24JQ 487 0 0
ATTCTGCAGGCCAAGAAACCAAGGTTCTTGAGGTCAATAACAAACTACCAATCTATCAAT
GTGGATACACTCAAGGTTCAAAACATGGAGACTTGGCCTTTTTTCAACTCGGTAACTGGA
GACATAAGACCTCTCAATTCAAGGAAGGTTGCTGCTCAGCTCAAAGTGTTTAAAATTTTC
GGCCTTATCCCTGTAAATGCACCTGAAACCGCACGTGGTGAACTAGAGATTACCTATGTT
GACGAGGAGCTACGGCTGTCAAGGGGTGACAAGGGCAATTTGTTTATACTGAAGATGTTT
GATCCAACTTATCGAATCCCTCTTTGAAGCAAGCCAATCGTACAAACACATACATTACCC
CCCAACGCTTGTTCTGTCTCTCTTCATCGTATGTATAGATGAATGTTTCTTTTTCTACAA
ACATAAAAATCTAATAACAAGAAAAAGAAAAGAGACAAGTTATTGCCTCAATTTTAACGT
TGTTGTG

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR2F908TF 737 0 0
GAGAAGCAGAAGCAGCTGAAGCAAGATCTTCTCGAAGCCATTGCCCCTCTCGAACGTGGC
GCTACTGCTTCTCCTGATGACCAGCTTCGTATCGATCAGTTGGCGCGAAAAGTGGAAGCA
GTGAATCCAACCAGGGAGCCTTTGAAATCTGATTTAATCAATGGGAAATGGG*AGCTCAT
TTACACAACCTCTGCTTCTATTCTGCAGGCCAAGAAACCAAGGTTCTTGAGGTCAATAAC
AAACTACCAATCTATCAATGTGGATACGCTCAAGGTTCAAAACATGGAGACTTGGCCTTT
CCTCAACTCGGTAACTGGAGACATAAGACCTCTCAATTCAAGGAAGGTTGCTGTTCAGCT
CAAAGTGTTTAAAATTCTCGGCCTTATCCCTGTAAATGCACCTGAAACCGCACGTGGTGA
ACTAGAGATTACCTATGTTGACGAGGAGCTACGGCTGTCAAGGGGTGACAAGGGCAATTT
GTTTATACTGAAGATGTTTGATCCAACTTATCGAATCCCTCTCTGAAGCAAGCCAATCAT
ACAAACACATACATTACCCCCCAACGCTTGTTCTGTCTCTCTTCATCGTATGTATAGATG
AATGTTTCTTCTTCTACAAACATAAAAATCTAATAACAAGAAAAAGAAAAGAGACAAGTT
ATTGCCTCA*TTTTAACGTTGTTGTGATCAACATTGCATTGTAAGCAGATGAAATGTAAC
GAATAAACTCTTT
AAAA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2F908JQ 534 0 0
ATTCTGCAGGCCAAGAAACCAAGGTTCTTGAGGTCAATAACAAACTACCAATCTATCAAT
GTGGATACGCTCAAGGTTCAAAACATGGAGACTTGGCCTTTCCTCAACTCGGTAACTGGA
GACATAAGACCTCTCAATTCAAGGAAGGTTGTTGTTCAGCTCAAAGTGTTTAAAATTCTC
GGCCTTATCCCTGTAAATGCACCTGAAACCGCACGTGGTGAACTAGAGATTACCTATGTT
GACGAGGAGCTACGGCTGTCAAGGGGTGACAAGGGCAATTTGTTTATACTGAAGATGTTT
GATCCAACTTATCGAATCCCTCTCTGAAGCAAGCCAATCATACAAACACATACATTACCC
CCCAACGCTTGTTCTGTCTCTCTTCATCGTATGTATAGATGAATGTTTCTTCTTCTACAA
ACATAAAAATCTAATAACAAGAAAAAGAAAAGAGACAAGTTATTGCCTCAATTTTAACGT
TGTTGTGATCAACATTGCATTGTAAGCAGATGAAATGTAACGAATAAACTCTTT

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2GN06JQ 395 0 0
GTTGCTGTTCAGCTCAAAGTGTTTAAAATTTTCGGCCTTATCCCTGTAAATGCCCCTGAA
ACCGCACGTGGTGAACTAGAGATTACCTATGTTGACGAGGAGCTACGGCTGTCAAGGGGT
GACAAGGGCAATTTGTTTATACTGAAGATGTTTGATCCAACTTATCGAATCCCTCTCTGA
AGCAAGCCAATCATACAAACACATACATTACCCCCCAACGCTTGTTCTGTCTCTCTTCAT
CGTATGTATAGATGAATGTTTCTTCTTCTACAAACATAAAAATCTAATAACAAGAAAAAG
AAAAGAGACAAGTTATTGCCTCAATTTTAACGTTGTTGTGATCAACATTACATTGTAAGC
AGATGAAATGTAACGAATAAACTCTTTATCATGTC

QA 1 395 1 395
DS 



CO CL196Contig2 944 4 5 U
GGAGAGAGAGACTCGTAATCATCCTCTGTTTCGAAACAGAGTATCTCTGAAAACGAAGCA
GAGCAGCGACTCCTGTTTTTTTTTTCTTTTCGATTCCATGGCTTTGACTTCGTGCCTAAA
GACTGGAGTAGTTCCGATGTCTCCGACCACCGGATTGTATCTTTCCGGCAGTCTTGTGAA
GTCGGACAGTGGCTTCTCCGTTCCGACCAAGTCACAGAGCATTCGAAAAAGCAGCGACAG
AGAGAGGCTGAGAATCCAAGCGGTGTTCAGCTTTCCTCCGGCGTTTCTAACGAGAAACGG
TAGAGCAGAGAAGCAGAAGCAGCTGAAGCTAGACCTTCTCGAAGCCATCGAGCCTCTCGA
ACGCGGCGCCAAGGCTTCTCCTGATGACCAGCTTCGTATTGATCAGTTGGCGCGAAAAGT
GGAAGCAGTGAATCCAACCAGGGAGCCTTTGAAATCTGATTTAATCAATGGGAAATGGGA
GCTCATTTACACAACCTCTGCTTCTATTCTGCAGGCTAAGAAACCAAGGTTCTTGAGGTC
AATAACAAACTACCAATCTATTAATGTGGATACACTCAAGGTTCAAAACATGGAGACTTG
GCCTTTCTTCAACTCGGTAACTGGAGACATAAGACCCCTCAATTCAAGGAAGGTTGCTGT
GCAGCTCAAAGTGTTTAAAATTCTCGGCCTTATCCCTGTAAATGCACCTGAAACCGCACG
TGGTGAACTAGAGATTACCTATGTGGACGAGGAGCTACGGTTGTCAAGGGGTGACAAGGG
CAATTTGTTTATACTGAAGATGTTTGATCCAACTTATCGAATCCCTCTCTGAAACAATCC
ATCATACAAATATACATTGCCCTCATCTCTTGTTCTGTCTCTCCTCATCATATGTATAGA
TGAATGTTTTTCTTCTTCTACAAACATAAAGTCTAATAAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 25 5 
5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN82TF U 1
AF RR2G305TF U 31
AF RR2EN82JQ C 344
AF RR2G305JQ C 707
BS 1 778 RR2EN82TF
BS 779 779 RR2G305TF
BS 780 782 RR2EN82JQ
BS 783 799 RR2G305TF
BS 800 944 RR2EN82JQ

RD RR2EN82TF 778 0 0
GGAGAGAGAGACTCGTAATCATCCTCTGTTTCGAAACAGAGTATCTCTGAAAACGAAGCA
GAGCAGCGACTCCTGTTTTTTTTTTCTTTTCGATTCCATGGCTTTGACTTCGTGCCTAAA
GACTGGAGTAGTTCCGATGTCTCCGACCACCGGATTGTATCTTTCCGGCAGTCTTGTGAA
GTCGGACAGTGGCTTCTCCGTTCCGACCAAGTCACAGAGCATTCGAAAAAGCAGCGACAG
AGAGAGGCTGAGAATCCAAGCGGTGTTCAGCTTTCCTCCGGCGTTTCTAACGAGAAACGG
TAGAGCAGAGAAGCAGAAGCAGCTGAAGCTAGACCTTCTCGAAGCCATCGAGCCTCTCGA
ACGCGGCGCCAAGGCTTCTCCTGATGACCAGCTTCGTATTGATCAGTTGGCGCGAAAAGT
GGAAGCAGTGAATCCAACCAGGGAGCCTTTGAAATCTGATTTAATCAATGGGAAATGGGA
GCTCATTTACACAACCTCTGCTTCTATTCTGCAGGCTAAGAAACCAAGGTTCTTGAGGTC
AATAACAAACTACCAATCTATTAATGTGGATACACTCAAGGTTCAAAACATGGAGACTTG
GCCTTTCTTCAACTCGGTAACTGGAGACATAAGACCCCTCAATTCAAGGAAGGTTGCTGT
GCAGCTCAAAGTGTTTAAAATTCTCGGCCTTATCCCTGTAAATGCACCTGAAACCGCACG
TGGTGAACTAGAGATTACCTATGTGGACGAGGAGCTACGGTTGTCAAGGGGTGACAAG

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2G305TF 769 0 0
GG
GAAACAGAGTATCTCTGAAAACGAAGCAGAGCAGCGACTCCTGTTTTTTTTT*CTTTTCG
ATTCCATGGCTTTGACTTCGTGCCTAAAGACTGGAGTAGTTCCGATGTCTCCGATCACCG
GATTGTATCTTTCCGGCAGTCTTGTGAAGTCGGACAGTGGCTTCTCCGTTCCGACCAAGT
CACAGAGCATTCGAAAAAGCAGCGACAGAGAGAGGCTGAGAATCCAAGCGGTGTTCAGCT
TTCCTCCGGCGTTTCTAACGAGAAACGGTAGAGCAGAGAAGCAGAAGCAGCTGAAGCTAG
ACCTTCTCGAAGCCATCGAGCCTCTCGAACGCGGCGCCAAGGCTTCTCCTGATGACCAGC
TTCGTATTGATCAGTTGGCGCGAAAAGTGGAAGCAGTGAATCCAACCAGGGAGCCTTTGA
AATCTGATTTAATCAATGGGAAATAGGAGCTCATTTACACAACCTCTGCTTCTATTCTGC
AGGCTAAGAAACCAAGGTTCTTGAGGTCAATAACAAACTACCAATCTATTAATGCGGATA
CACTCAAGGTTCAAAACATGGAGACTTGGCCTTTCTTCAACTCGGTAACTGGAGACATAA
GACCCCCCAATTCAAGGAAGGTTGCTGTGCAGCTCAAAGTGTTTAAAATTCTCGGCCTTA
TCCCTGTAA*TGCACCTGAAACCGCACGTGGTGAACTAGAGAT*ACCTATGTGGACGAG*
AGCTACG*TTGTCAAGGG*TGACAGGG**CATTTGTTTATACTGAAG

QA 3 769 3 769
DS 

RD RR2EN82JQ 601 0 0
GCCATCGAG
CCTCTCGAACGCGGCGCCAAGGCTTCTCCTGATGACCAGCTTCGTATTGATCAGTTGGCG
CGAAAAGTGGAAGCAGTGAATCCAACCAGGGAGCCTTTGAAATCTGATTTAATCAATGGG
AAATGGGAGCTCATTTACACAACCTCTGCTTTTATTCTGCAGGCTAAGAAACCAAGGTTC
TTGAGGTCAATAACAAACTACCAATCTATTAATGTGGATACACTCAAGGTTCAAAACATG
GAGACTTGGCCTTTCTTCAACTCGGTAACTGGAGACATAAGACCCCTCAATTCAAGGAAG
GTTGCTGTGCAGCTCAAAGTGTTTAAAATTCTCGGCCTTATCCCTGTAAATGCACCTGAA
ACCGCACGTGGTGAACTAGAGATTACCTATGTGGACGAGGAGCTACGGTTGTCAAGGGGT
GACAAGGGCAATTTGTTTATACTGAAGATGTTTGATCCAACTTATCGAATCCCTCTCTGA
AACAATCCATCATACAAATATACATTGCCCTCATCTCTTGTTCTGTCTCTCCTCATCATA
TGTATAGATGAATGTTTTTCTTCTTCTACAAACATAAAGTCTAATAAGAGCC

QA 10 601 10 601
DS 

RD RR2G305JQ 238 0 0
CCTGAAACCGCACGTGGTGAACTAGAGATTACCTATGTGGACGAGGAGCTACGGTTGTCA
AGGGGTGACAAGGGCAATTTGTTTATACTGAAGATGTTTGATCCAACTTATGGAATCCCT
TTTTGAAACAATCCATCATACAAATATACATTGCCCTCATTTCTTGTTCTGTCTCTCCTC
ATCATATGTATAGATGAATGTTTTTTTTTTTCTACAAACATAAA
GTTTAATAAGAGCC

QA 1 224 1 224
DS 



AS 2 15

CO CL197Contig1 662 8 11 U
GGGCCGCTCAGAGAGGTTTTGTGGAAAAGGATCTCACTTTGAGCAATGTCTCCAGCTAAA
GTTGATGTAACTAAGAAGGCTGATCCAAAGGCTAAGGCCTTGAAAGCTGCCAAGGCAGTG
AAGTCAGGGCAAATCATCAAGAAGAAGGCGAAGAAGATCAGAACAAAGGTGACATTCCAC
AGGCCAAAGACATTGACTAAGGCTAGAGACCCAAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCCG
AGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCCGCAATG
AAGAAGATCGAAGACAACAATACCTTGGTCTTCATCGTCGACATCCGTGCCGACAAGAAG
AAGATCAAGGATGCTGTCAAGAAAATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACCCTC
ATTAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGTGAGATTGACTCCTGATTACGATGCTTTG
GACGTAGCTAACAAAATCGGGATCATCTAATCTCATTTTCTTTTTTTGGTGTTTGAAAAC
GGGCTTCTTGTTTCTGTCTTCTTTATTCTGAGTTTTGCTAGAGAAATTTAATGGTCTTAT
CGTTTAGACTCGAAGATTTTTTTTTTTTT*GGGTACGAGTGCGTAATAATTTTCCTATTG
TC


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 30 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 30 10 10 
10 

AF RR2GG69TF U 1
AF RR2BD62TF U 1
AF RR2CU28TF U 1
AF RR2BD62JQ C 52
AF RR2EC40TF U 1
AF RR2GG69JQB C 338
AF RR2G756TF U 1
AF RR2G756JQ C 1
BS 1 230 RR2BD62TF
BS 231 231 RR2CU28TF
BS 232 376 RR2BD62TF
BS 377 377 RR2CU28TF
BS 378 526 RR2BD62TF
BS 527 527 RR2CU28TF
BS 528 629 RR2BD62TF
BS 630 630 RR2CU28TF
BS 631 658 RR2BD62TF
BS 659 659 RR2CU28TF
BS 660 662 RR2G756JQ

RD RR2GG69TF 586 0 0
GGGCCGCTCAGAGAGGTTTTGTGGAAAAGGATCTCACTTTGAGCAATGTCTCCAGCTAAA
GTTGATGTAACTAAGAAGGCTGATCCAAAGGCTAAGGCCTTGAAAGCTGCCAAGGCAGTG
AAGTCAGGGCAAATCATCAAGAAGAAGGCGAAGAAGATCAGAACAAAGGTGACATTCCAC
AGGCCAAAGACATTGACTAAGGCTAGAGACCCAAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCCG
AGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCCGCAATG
AAGAAGATCGAAGACAACAATACCTTGGTCTTCATCGTCGACATCCGTGCCGACAAGAAG
AAGATCAAGGATGCTGTCAAGAAAATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACCCTC
ATTAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGTGAGATTGACTCCTGATTACGATGCTTTG
GACGTAGCTAACAAAATCGGGATCATCTAATCTCATTTTCTTTTTTTGGTGTTTGAAAAC
GGGCTTCTTGTTTCTGTCTTCTTTATTCTGAGTTTTGCTAGAGAAA

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2BD62TF 658 0 0
GGGCCGCTCAGAGAGGTTTTGTGGAAAAGGATCTCACTTTGAGCAATGTCTCCAGCTAAA
GTTGATGTAACTAAGAAGGCTGATCCAAAGGCTAAGGCCTTGAAAGCTGCCAAGGCAGTG
AAGTCAGGGCAAATCATCAAGAAGAAGGCGAAGAAGATCAGAACAAAGGTGACATTCCAC
AGGCCAAAGACATTGACTAAGGCTAGAGACCCAAAGTACCCACGCATCAGCGCAACTCCG
AGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCCGCAATG
AAGAAGATCGAAGACAACAATACCTTGGTCTTCATCGTCGACATCCGTGCCGACAAGAAG
AAGATCAAGGATGCTGCCAAGAAAATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACCCTC
ATTAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGTGAGATTGACTCCTGATTACGATGCTTTG
GACGTAGCTAACAAAATCGGGATCATCTAATCTCATTTTCTTTTTT*GGTGTTTGAAAAC
GGGCTTCTTGTTTCTGTCTTCTTTATTCTGAGTTTTGCTAGAGAAATTTAATGGTCTTAT
CGTTTAGACTCGAAGATTTTTTTTTTTTTTGGGTACGAGTGCGTAATAATTTTCCTAT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2CU28TF 659 0 0
GGGCCGCTCAGAGAGGTTTTGTGGAAAAGGATCTCACTTTGAGCAATGTCTCCAGCTAAA
GTTGATGTAACTAAGAAGGCTGATCCAAAGGCTAAGGCCTTGAAAGCTGCCAAGGCAGTG
AAGTCAGGGCAAATCATCAAGAAGAAGGCGAAGAAGATCAGAACAAAGGTGACATTCCAC
AGGCCAAAGACATTGACTAAGGCTAGAGACCCAAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCCG
AGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCCGCAATG
AAGAAGATCGAAGACAACAATACCTTGGTCTTCATCGTCGACATCCGTGCCGACAAGAAG
AAGATCAAGGATGCTGTCAAGAAAATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACCCTC
ATTAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGTGAGATTGACTCCTGATTACGATGCTTTG
GACGTAGCTAACAAAATCGGGATCATCTAATCTCATTTTCTTTTTTTGGTGTTTGAAAAC
GGGCTTCTTGTTTCTGTCTTCTTTATTCTGAGTTTTGCTAGAGAAATTTAATGGTCTTAT
CGTTTAGACTCGAAGATTTTTTTTTTTTT*GGGTACGAGTGCGTAATAATTTTCCTATT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2BD62JQ 607 0 0
CCAGCTAAAGTTGATGTAACTAAGAAGGCTGATCCAAAGGCTAAGGCCTTGAAAGCTGCC
AAGGCAGTGAAGTCAGGGCAAATCATCAAGAAGAAGGGGAAGAAGATCAGAACAAAGGTG
ACATTCCCCAGGCCAAAGACATTGACTAAGGCTAGAGACCCAAAGTACCCACGCATCAGC
GCAACTCCGAGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAG
TCCGCAATGAAGAAGATCGAAGACAACAATACCTTGGTTTTCATTGTCGACATCCGTGCC
GACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGCCAAGAAAATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTC
AACACCCTCATTAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGTGAGATTGACTCCTGATTAC
GATGCTTTGGACGTAGCTAACAAAATCGGGATCATTTAATTTCATTTT*TTTTTTTGGTG
TTTGAAAACGGGCTTCTTGTTTCTGTTTTCTTTATTTTGAGTTTTGCTAGAGAAATTTAA
TGGTTTTATCGTTTAGACTCGAAGATTTTTTTTTTTTTTGGGTACGAGTGCGTAATAATT
TTCCTAT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2EC40TF 655 0 0
GGGCCGCTCAGAGAGGTTTTGTGGAAAAGGATCTCACTTTGAGCAATGTCTCCAGCTAAA
GTTGATGTAACTAAGAAGGCTGATCCGAAGGCTAAGGCCTTGAAAGCTGCCAAGGCAGTG
AAGTCAGGGCAAATCATCAAGAAGAAGGCGAAGAAGATCAGAACAAAGGTGACATTCCAC
AGGCCAAAGACATTGACTAAGGCTAGAGACCCAAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCCG
AGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCCGCAATG
AAGAAAATCGAAGACAACAACACCTTGGTCTTCATCGTCGACATCCGTGCCGACAAGAAG
AAGATCAAGGATGCTGTCAAGAAAATGTATGACATTTAGACCAAGAAAGTCAACACCCTC
ATTAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGTGAGATTGACTCCTGATTACGATGCTTTG
GACGTAGCTAACAAAATCGGGATCATCTAATCTCATTTTCTTTTTTTGGTGTTTGAAAAC
GGGCTTCTTGCTTCTGTCTTCTTTATTCTGAGTTTTGCTAGAGAAATTTAATGGTCTTAT
CGTTTAGACTCGAAGATTTTTTTTTTTTTTGGGTACGAGTGCGTAATAATTTTCC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2GG69JQB 325 0 0
TCGACATCCGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTCAAGAAAATGTATGACATTC
AGACCAAGAAAGTCAACACCCTCATTAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGTGAGAT
TGACTCCTGATTACGATGCTTTGGACGTAGCTAACAAAATCGGGATCATTTAATTTCATT
TTCTTTTTTTGGTGTTTGAAAACGGGCTTCTTGTTTCTGTTTTCTTTATTTTGAGTTTTG
CTAGAGAAATTTAATGGTCTTATCGTTTAGACTCGAAGATTTTTTTTTTTT**GGGTACG
AGTGCGTAATAATTTTCCTATT
GCC

QA 1 322 1 322
DS 

RD RR2G756TF 662 0 0
GGGCCGCTCAGAGAGGTTTTGTGGAAAAGGATCTCACTTTGAGCAATGTCTCCAGCTAAA
GTTGATGTAACTAAGAAGGCTGATCCAAAGGCTAAGGCCTTGAAAGCTGCCAAAGCAGTG
AAGTCAGGGCAAATCATCAAGAAGAAGGCGAAGAAGATCAGAACAAAGGTGACATTCCAC
AGGCCAAAGACATTGACTAAGGCTAGAGACCCAAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCCG
AGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCCGCAATG
AAGAAGATCGAAGACAACAATACCTTGGTCTTCATCGTCGACATCCGTGCCGACAAGAAG
AAGATCAAGGATGCTGTCAAGAAAATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACCCTC
ATTAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGCGAGATTGACTCCTGATTACGATGCTTTG
GACGTAGTTAACAAAATCGGGATCATCTAATCTCATTTTCTTTTTTTGGTGTTTGAAAAC
GGGCTTCTTGTTTCTGTCTTCTTTATTCTGAGTTTTGCTAGAGAAATTTAATGGTCTTAT
CGTTTAGACTCGAAGATTTTTTTTTTTT**GGGTACGAGTGCGTAATAATTTTCCTATT
GTC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2G756JQ 662 0 0
GGGCCGCTCAGAGAGGTTTTGTGGAAAAGGATCTCACTTTGAGCAATGTCTCCAGCTAAA
GTTGATGTAACTAAGAAGGCTGATCCAAAGGCTAAGGCCTTGAAAGCTGCCAAAGCAGTG
AAGTCAGGGCAAATCATCAAGAAGAAGGCGAAGAAGATCAGAACAAAGGTGACATTCCAC
AGGCCAAAGACATTGACTAAGGCTAGAGACCCAAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCCG
AGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAGTCCGCAATG
AAGAAGATCGAAGACAACAATACCTTGGTTTTCATCGTCGACATCCGTGCCGACAAGAAG
AAGATCAAGGATGCTGTCAAGAAAATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACCCTC
ATTAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGCGAGATTGACTCCTGATTACGATGCTTTG
GACGTAGTTAACAAAATCGGGATCATCTAATCTCATTTTCTTTTTTTGGTGTTTGAAAAC
GGGCTTCTTGTTTCTGTCTTCTTTATTCTGAGTTTTGCTAGAGAAATTTAATGGTCTTAT
CGTTTAGACTCGAAGATTTTTTTTTTTT**GGGTACGAGTGCGTAATAATTTTCCTATTG
TC

QA 1 662 1 662
DS 



CO CL197Contig2 889 7 8 U
TTTTTCGCCGCTCCAGATTTTGTGGAAAGGATCTGACTTTTGAGTAATGGCTCCAGCTAA
AGTTGATGTAACTAAGAAGTCTGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGAAAGCTGCGAAAGCGGT
GAAATCAGGGCAAATCATCAAGAAGGCGGCGAAGAAGATCAGGACGAAGGTGACATTCCA
CAGGCCAAAGACATTGACAAAGGCTAGAGACCCCAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCC
AAGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACCGAGTCTGCCAT
GAAGAAGATCGAAGACAACAACACCTTGGTCTTCATTGTTGATATCCGTGCTGACAAGAA
GAAGATCAAAGATGCTGTCAAGAAGATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACACT
CATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGTGAGATTGACTCCTGATTATGATGCTTT
GGATGTTGCTAATAAAATTGGAATCATCTAAGCTATTATAATATCATCTGAGCAGTCATT
TTACTTTTGGAGTTAAAAACAGACTTTTGTCTTAGTCTCAGTTTTGCTAGAAAAAGATAC
CCTTTGTTGTGCTTTATCCGTGGATTCGAAGCTCTGTTTTGGTTTTTGTTTCTCTCTTGT
TTCCCCAATTTCTATTTGCTGCCTATTTTATACCGGTTAGATCGTGTTAAATGTTGTTAA
ATCGGTTAGTTCTAGTTGAAGCGCACCAATATTAAATCCAACTAGAATTTGATCCGAGTT
CTGACGATTATGTTTCCACATCTATACGAATAGAATAGGATACTCCTATTAATCAAGTGT
CCTATTTGAGTTTATCTTAGAATATTACCCTATTTGAAGTTTATCTTGC


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN94TF U 1
AF RR2CG57JQ C 1
AF RR2CG57TF U 1
AF RR2DH86TF U 1
AF RR2ET87JQ C 1
AF RR2ET87TF U 1
AF RR2DN94JQ C 203
BS 1 240 RR2DN94TF
BS 241 241 RR2CG57TF
BS 242 309 RR2DN94TF
BS 310 607 RR2CG57TF
BS 608 608 RR2DH86TF
BS 609 653 RR2CG57TF
BS 654 694 RR2ET87TF
BS 695 889 RR2DN94JQ

RD RR2DN94TF 309 0 0
TTTTTCGCCGCTCCAGATTTTGTGGAAAGGATCTGACTTTTGAGTAATGGCTCCAGCTAA
AGTTGATGTAACTAAGAAGTCTGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGAAAGCTGCGAAAGCGGT
GAAATCAGGGCAAATCATCAAGAAGGCGGCGAAGAAGATCAGGACGAAGGTGACATTCCA
CAGGCCAAAGACATTGACAAAGGCTAGAGACCCCAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCC
GAGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACCGAGTCTGCCAT
GAAGAAGAT

QA 1 309 1 309
DS 

RD RR2CG57JQ 655 0 0
TTTTTCGCCGCTCCAGATTTTGTGGAAAGGATCTGACTTTTGAGTAATGGCTCCAGCTAA
AGTTGATGTAACTAAGAAGTCTGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGAAAGCTGCGAAAGCGGT
GAAATCAGGGCAAATCATCAAGAAGGCGGCGAAGAAGATCAGGACGAAGGTGACATTCCA
CAGGCCAAAGACATTGACAAAGGCTAGAGACCCCAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCC
AAGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACCGAGTCTGCCAT
GAAGAAGATCGAAGACAACAACACCTTGGTCTTCATTGTTGATATCCGTGCTGACAAGAA
GAAGATCAAAGATGCTGTCAAGAAGATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACACT
CATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGTGAGATTGACTCCTGATTATGATGCTTT
GGATGTTGCTAATAAAATTGGAATCATCTAAGCTATTATAATATCATCTGAGCAGTCATT
TTACTTTTGGAGTTAAAAACAGACTTTTGTCTTAGTTTCAGTTTTGCTAGAAAAAGATAC
CCTTTGTCGTGCTTTATCCGTGGATTCGAAGCTCTGTTTTGGTTTTTGTTTCTCT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2CG57TF 653 0 0
TTTTTCGCCGCTCCAGATTTTGTGGAAAGGATCTGACTTTTGAGTAATGGCTCCAGCTAA
AGTTGATGTAACTAAGAAGTCTGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGAAAGCTGCGAAAGCGGT
GAAATCAGGGCAAATCATCAAGAAGGCGGCGAAGAAGATCAGGACGAAGGTGACATTCCA
CAGGCCAAAGACATTGACAAAGGCTAGAGACCCCAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCC
AAGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACCGAGTCTGCCAT
GAAGAAGATCGAAGACAACAACACCTTGGTCTTCATTGTTGATATCCGTGCTGACAAGAA
GAAGATCAAAGATGCTGTCAAGAAGATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACACT
CATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGTGAGATTGACTCCTGATTATGATGCTTT
GGATGTTGCTAATAAAATTGGAATCATCTAAGCTATTATAATATCATCTGAGCAGTCATT
TTACTTTTGGAGTTAAAAACAGACTTTTGTCTTAGTCTCAGTTTTGCTAGAAAAAGATAC
CCTTTGTCGTGCTTTATCCGTGGATTCGAAGCTCTGTTTTGGTTTTTGTTTCT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2DH86TF 650 0 0
TTTTTCGCCGCTCCAGATTTTGTGGAAAGGATCTGACTTTTGAGTAATGGCTCCAGCTAA
AGTTGATGTAACTAAGAAGTCTGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGAAAGCTGCGAAAGCGGT
GAAATCAGGGCAAATCATCGAGAAGGCGGCGAAGAAGATCAGGACGAAGGTGACATTCCA
CAGGCCAAAGACATTGACAAAGGCTAGAGACCCCAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCC
AAGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACCGAGTCTGCCAT
GAAGAAGATCGAAGACAACAACACCTTGGTCTTCATTGTTGATATCCGTGCTGACAAGAA
GAAGATCAAAGATGCTGTCAAGAAGATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACATACT
CATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGTGAGATTGACTCCTTATTATGATGCTTT
GGATGTTGCTAATAAAATTGGAATCATCTAAGCTATTATAATATCATCTGAGCAGTCATT
TTACTTTTGGAGTTAAAAACAGACTTTTGTCTTAGTCTCAGTTTTGCTAGAAAAAGATAC
CCTTTGTTGTGCTTTATCCGTGGATTCGAAGCTCTGTTTTGGTTTTTGTT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2ET87JQ 695 0 0
TTTTTCGCCGCTCCAGATTTTGTGGAAAGGATCTGACTTTTGAGTAATGGCTCCAGCTAA
AGTTGATGTAACTAA**AGTCTGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGAAAGCTGCGAAAGCGGT
GAAATCAGGGCAAATCATCAAGAAGGCGGCGAAGAAGATCAGGACGAAGGTGACATTCCA
CAGGCCAAAGACATTGACAAAGGCTAGAGACCCCAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCC
AAGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACCGAGTCTGCCAT
GAAGAAGATCGAAGACAACAACACCTTGGTCTTCATTGTTGATATCCGTGCTGACAAGAA
GAAGATCAAAGATGCTGTCAAGAAGATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACACT
CATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGTGAGATTGACTCCTGATTATGATGCTTT
GGATGTTGCTAATAAAATTGGAATCATCTAAGCTATTATAATATCATCTGAGCAGTCATT
TTACTTT*GGAGTTAAAAACAGACTTTTGTCTTAGTCTCAGTTTTGCTAGAAAAAGATAC
CCTTTGTTGTGCTTTATCCGTGGATTCGAAGCTCTGTTTTGGTTTTTGTTTCTCTCTTGT
TTCCCCAATTTCTATTTGCTGCCTATTTTATACC
T

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2ET87TF 702 0 0
TTTTTCGCCGCTCCAGATTTTGTGGAAAGGATCTGACTTTTGAGTAATGGCTCCAGCTAA
AGTTGATGTAACTAA**AGTCTGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGAAAGCTGCGAAAGCGGT
GAAATCAGGGCAAATCATCAAGAAGGCGGCGAAGAAGATCAGGACGAAGGTGACATTCCA
CAGGCCAAAGACATTGACAAAGGCTAGAGACCCCAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCC
AAGGAACAAGTTGGACCACTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACCGAGTCTGCCAT
GAAGAAGATCGAAGACAACAACACCTTGGTCTTCATTGTTGATATCCGTGCTGACAAGAA
GAAGATCAAAGATGCTGTCAAGAAGATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACACT
CATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGTGAGATTGACTCCTGATTATGATGCTTT
GGATGTTGCTAATAAAATTGGAATCATCTAAGCTATTATAATATCATCTGAGCAGTCATT
TTACTTT*GGAGTTAAAAACAGACTTTTGTCTTAGTCTCAGTTTTGCTAGAAAAAGATAC
CCTTTGTTGTGCTTTATCCGTGGATTCGAAGCTCTGTTTTGGTTTTTGTTTCTCTCTTGT
TTCCCCAATTTCTATTTGCTGCCTATTTTATACC
TAAAAAAA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2DN94JQ 687 0 0
GCTAGAGACCCCAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCCAAGGAACAAGTTGGACCACTAC
GGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACCGAGTCTGCCATGAAGAAGATCGAAGACAACAAC
ACCTTGGTCTTCATTGTTGATATCCGTGCTGACAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTCAAG
AAGATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACACTCATCAGGCCTGATGGAACGAAG
AAGGCGTACGTGAGATTGACTCCTGATTATGATGCTTTGGATGTTGCTAATAAAATTGGA
ATCATCTAAGCTATTATAATATCATCTGAGCAGTCATTTTACTTTTGGAGTTAAAAACAG
ACTTTTGTCTTAGTCTCAGTTTTGCTAGAAAAAGATACCCTTTGTTGTGCTTTATCCGTG
GATTCGAAGCTCTGTTTTGGTTTTTGTTTCTCTCTTGTTTCCCCAATTTCTATTTGCTGC
CTATTTTATACCGGTTAGATCGTGTTAAATGTTGTTAAATCGGTTAGTTCTAGTTGAAGC
GCACCAATATTAAATCCAACTAGAATTTGATCCGAGTTCTGACGATTATGTTTCCACATC
TATACGAATAGAATAGGATACTCCTATTAATCAAGTGTCCTATTTGAGTTTATCTTAGAA
TATTACCCTATTTGAAGTTTATCTTGC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 2 11

CO CL198Contig1 926 9 53 U
GGACGCATACAAAAGATAAGCTATCTAGACAAGACACACCACAACGGAATATAAACTAAT
GAAGATGCTTACTCTCTGTTTAACCACTCTCACCGTTCTCTCAGCCGTCTTGGCCGCAGC
TTCTGCCGCCAATGCTCTACCAGGCAAAGCAGTCGTAGACATAGCAGGACATCCAGTTCA
GTCCAATGTCCAATACTACATAATACCGGCTAAGATCGGAGCCGGAAGTGGTCTTATCCC
TTCAAGCCGAAATGTAAACACACA**AGACTCGTGTCTGAATCTTGACATCGTACAGTCA
TCATCTCCTTTCTTCTCAGGCCTTCCAGTAACTTTCTCTCCGCTCAACACAAAAGCCAAG
GATGTCCAGCTCTCAGCTAGCCTCAGCCTCGAGTTTGATTCCACGGTTTGGTTATGCCCT
GAATCTAAAGTGTGGAGAATCGACCACTCCGTGCAACTCAGGAAGAGCTTTGTGAGCATT
GGTGGTGAGAAAGGTAAAGGGAATAGCTTGTTTCAGATTCAAGAAGATGGAGATGCTTAC
AAGCTTATGTATTGTCCGGTTATCTCCTCTGTTTCGTGTATCAACGTGGGTCTAGAGATC
GATGATCTTGGAGTTAGACGTTTGGTTCTTAGCAATGATCAATCTTTTGCTGTGAAGTTT
CAAAGGGCTTATGATGATTCAAACTCCAACTGTCATCTCAGGCCTCGTTGGAGGATGTTC
CCTTTGTTCTAAAATGTGAAATAATTGTATCTTGTATTATGGTTGGAGAATGCTT*GTGA
TCATACCAAAGTTGTGATGTAACCAACGGTTTATATGAAATAAGACATGTGGTTATTGTA
TGTATGTTAAGAATCCTTGTAACAACACCAAGTTTGTGATGTAACCAACGGTTTATAATG
GAATTAAACATATGGTTATTGTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 0 15 0 15 0 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 20 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 15 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 
50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 5 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 0 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 5 30 
45 45 45 30 45 45 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE53TF U 64
AF RR2BC37TF U 29
AF RR2BS58TF U 1
AF RR2BH59JQ C 90
AF RR2BH59TF U 90
AF RR2E851JQ C 131
AF RR2FK01JQ C 142
AF RR2BV43JQ C 295
AF RR2FP58TF U 367
BS 1 44 RR2BS58TF
BS 45 47 RR2BC37TF
BS 48 48 RR2BS58TF
BS 49 49 RR2BC37TF
BS 50 50 RR2BS58TF
BS 51 51 RR2BC37TF
BS 52 54 RR2BS58TF
BS 55 55 RR2BC37TF
BS 56 129 RR2BS58TF
BS 130 130 RR2BC37TF
BS 131 161 RR2BS58TF
BS 162 162 RR2BC37TF
BS 163 202 RR2BS58TF
BS 203 203 RR2BC37TF
BS 204 441 RR2BS58TF
BS 442 442 RR2BC37TF
BS 443 449 RR2BS58TF
BS 450 450 RR2FP58TF
BS 451 473 RR2BS58TF
BS 474 474 RR2BC37TF
BS 475 479 RR2BS58TF
BS 480 480 RR2BC37TF
BS 481 495 RR2BS58TF
BS 496 496 RR2BC37TF
BS 497 506 RR2BS58TF
BS 507 507 RR2BC37TF
BS 508 581 RR2BS58TF
BS 582 582 RR2BC37TF
BS 583 599 RR2BS58TF
BS 600 600 RR2BC37TF
BS 601 614 RR2BS58TF
BS 615 616 RR2FP58TF
BS 617 701 RR2BS58TF
BS 702 702 RR2BH59TF
BS 703 713 RR2BS58TF
BS 714 714 RR2BH59TF
BS 715 733 RR2BS58TF
BS 734 734 RR2FP58TF
BS 735 735 RR2BH59TF
BS 736 740 RR2BS58TF
BS 741 741 RR2BH59TF
BS 742 781 RR2BS58TF
BS 782 782 RR2FP58TF
BS 783 783 RR2BH59TF
BS 784 786 RR2BS58TF
BS 787 787 RR2BH59TF
BS 788 789 RR2BS58TF
BS 790 791 RR2FP58TF
BS 792 801 RR2BS58TF
BS 802 828 RR2BH59TF
BS 829 917 RR2FP58TF
BS 918 918 RR2FK01JQ
BS 919 926 RR2BV43JQ

RD RR2CE53TF 381 0 0
GATGCTTACTCTCTGTTTAACCACTCTCACCGTTCTCTCAGCCGTCTTGGCCGCAGCTTC
TGCCGCCAATGCTCTACCAGGCAAAGCAGTCGTAGACATAGCAGGACATCCAGTTCAGTC
CAATGTCCAATACTACATAATACCGGCTAAGATCGGAGCCGGAAGTGGTCTTATCCCTTC
AAGCCGAAATGTAAACACACA**AGACTCGTGTCTGAATCTTGACATCGTACAGTCATCA
TCTCCTTTCTTCTCAGGCCTTCCAGTAACTTTCTCTCCGCTCAACACAAAAGCCAAGGAT
GTCCAGCTCTCAGCTAGCCTCAGCCTCGAGTTTGATTCCACGGTTTGGCTATGCCCTGAA
TCTAAAGTGTGGAGAATCGAC

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR2BC37TF 670 0 0
GG
AAGACACACCACAACGGAATATTAACTAATGAAGATGCTTACTCTCTGTTTAACCACTCT
CACCGTTCTCTCCGCCGTCTTGGCCGCAGCTTCTGCCGCCAATGCTCTACCAGGCAAAGC
AGTCGTAGACATAGCAGGACATCCAGTTCAGTCCAATGTCCAATACTACATAATACCGGC
TAAGATCGGAGCCGGAAGTGGTCTTATCCCTTCAAGCCGAAATGTAAACACACACAAGAC
TCGTGTCTGAATCTTGACATCGTACAGTCATCATCTCCTTTCTTCTCAGGCCTTCCAGTA
ACTTTCTCTCCGCTCAACACAAAAGCCAAGGATGTCCAGCTCTCAGCTAGCCTCAGCCTC
GAGTTTGATTCCACGGTTTGGCTATGCCCTGAATCTAAAGTGTGGAGAATCGACCACTCT
GTGCAACTCAGGAAGAGCTTTGTGAGCATTGGTGGTGAGAAGGGTAAAGGGAATAGCTTG
TTCCAGATTCAAGAAGATGGAGATGCTTACAAGCTTATGTATTGTCCGGTTATCTCCTCT
GTTTCGTGTATCAACGTGGGTCTAGAGATCGATGATCTTGGAGTACGACGTTTGGTTCTT
AGCAATGATCAATCTTTTGCTGTGAAGTTTCAAAGGGCTTATGATGATTCAAACTCCAAC
TGTCATCT

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR2BS58TF 804 0 0
GGACGCATACAAAAGATAAGCTATCTAGACAAGACACACCACAA***ACTCTAACCTAAT
GAAGATGCTTACTCTCTGTTTAACCACTCTCACCGTTCTCTCAGCCGTCTTGGCCGCAGC
TTCTGCCGCAAATGCTCTACCAGGCAAAGCAGTCGTAGACAGAGCAGGACATCCAGTTCA
GTCCAATGTCCAATACTACATAGTACCGGCTAAGATCGGAGCCGGAAGTGGTCTTATCCC
TTCAAGCCGAAATGTAAACACACA**AGACTCGTGTCTGAATCTTGACATCGTACAGTCA
TCATCTCCTTTCTTCTCAGGCCTTCCAGTAACTTTCTCTCCGCTCAACACAAAAGCCAAG
GATGTCCAGCTCTCAGCTAGCCTCAGCCTCGAGTTTGATTCCACGGTTTGGTTATGCCCT
GAATCTAAAGTGTGGAGAATCAACCACTCTGTGCAACTCAGGAAGAGCTTTGTAAGCATC
GGTGGTGAGAAAGGTGAAGGGAATAGTTTGTTTCAGATTCAAGAAGATGGAGATGCTTAC
AAGCTTATGTATTGTCCGGTTATCTCCTCTGTTTCGTGTATAAACGTGGGTCTAGAGATT
GATGATCTTGGAGTGCGACGTTTGGTTCTTAGCAATGATCAATCTTTTGCTGTGAAGTTT
CAAAGGGCTTATGATGATTCAAACTCCAACTGTCATCTCAG*CCTCGTTGGAG*ATGTTC
CCTTTGTTCTAAAT*GTGAA*TAATTGTATCTTGTATTATGGTTGGAGAATGCTT*GTGA
TA*TAC*AAGTTTGTGATGTA
CCA

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2BH59JQ 754 0 0
G
CACCGTTCTCTCAGCCGTCTTGGCCGCAGCTTCTGCCGCCAATGCTCTACCAGGCAAAGC
AGTCGTAGACATAGCAGGACATCCAGTTCAGTCCAATGTCCAATACTACATAATACCGGC
TAAGATCGGAGCCGGAAGTGGTCTTATCCCTTCAAGCCGAAATGTAAACACACA**AGAC
TCGTGTCTGAATCTTGACATCGTACAGTCATCATCTCCTTTCTTCTCAGGCCTTCCAGTA
ACTTTCTCTCCGCTCAACACAAAAGCCAAGGATGTCCAGCTCTCAGCTAGCCTCAGCCTC
GAGTTTGATTCCACGGTTTGGCTATGCCCTGAATCTAAAGTGTGGAGAATCGACCACTCT
GTGCAACTCAGGAAGAGCTTTGTGAGCATTGGTGGTGAGAAGGGTAAAGGGAATAGCTTG
TTTCAGATTCAAGAAGATGGAGATGCTTACAAGCTTATGTATTGTCCGGTTATCTCCTCT
GTTTCGTGTATCAACGTGGGTCTAGAGATCGATGATCTTGGAGTACGACGTTTGGTTCTT
AGCAATGATCAATCTTTTGCTGTGAAGTTTCAAAGGGCTTATGATGATTCAAACTCCAAC
TGTCATCTCAGGCCTCGTTGGAGGATGTTCCCTTTGTTCTAAATTGTGAAATAATTGTAT
CTTGTATTATGGTTGGAGAATGCTTTGTGACAATACCAAGTTTGTGATGTAACCAACGGT
TTATATGAAATAAGACAT
ATATATGGTTATTGT

QA 2 739 2 739
DS 

RD RR2BH59TF 754 0 0
G
CACCGTTCTCTCAGCCGTCTTGGCCGCAGCTTCTGCCGCCAATGCTCTACCAGGCAAAGC
AGTCGTAGACATAGCAGGACATCCAGTTCAGTCCAATGTCCAATACTACATAATACCGGC
TAAGATCGGAGCCGGAAGTGGTCTTATCCCTTCAAGCCGAAATGTAAACACACA**AGAC
TCGTGTCTGAATCTTGACATCGTACAGTCATCATCTCCTTTCTTCTCAGGCCTTCCAGTA
ACTTTCTCTCCGCTCAACACAAAAGCCAAGGATGTCCAGCTCTCAGCTAGCCTCAGCCTC
GAGTTTGATTCCACGGTTTGGCTATGCCCTGAATCTAAAGTGTGGAGAATCGACCACTCT
GTGCAACTCAGGAAGAGCTTTGTGAGCATTGGTGGTGAGAAGGGTAAAGGGAATAGCTTG
TTTCAGATTCAAGAAGATGGAGATGCTTACAAGCTTATGTATTGTCCGGTTATCTCCTCT
GTTTCGTGTATCAACGTGGGTCTAGAGATCGATGATCTTGGAGTACGACGTTTGGTTCTT
AGCAATGATCAATCTTTTGCTGTGAAGTTTCAAAGGGCTTATGATGATTCAAACTCCAAC
TGTCATCTCAGGCCTCGTTGGAGGATGTTCCCTTTGTTCTAAATTGTGAAATAATTGTAT
CTTGTATTATGGTTGGAGAATGCTTTGTGACAATACCAAGTTTGTGATGTAACCAACGGT
TTATATGAAATAAGACAT
ATATATGGTTATTGT

QA 2 739 2 739
DS 

RD RR2E851JQ 771 0 0
AATGCTCTACCAAGCAAAACAGTCCTAGACATAGCAGGACATCCAGTTCAGTCCAATGTC
CAATACTACATAATACCGGCTAAGATCGGAGCCGGAATTGGTCTTATCCCTTCAAGCCGA
AATGTAAACACACA**AGACTCGTGTCTGAATCTTGACATCGTACAGTCGTCATCTCCTT
TCTTCTCAGGCCTTCCCGTGACTTTCTCTCCACTCAACACCAAAGCCAAGCATGTCCAGC
TCTCAACTAGTTTCAGCCTCGAGTTTGATTCCACGGTTTGGTTATGCCCTGAATCTAAAG
TGTGGAGAATCGACCACTCCGTGCAACTCAGGAAGAGCTTTGTGAGCATTGGTGGTGAGA
AAGGTAAAGGGAATAGCTTGTTTCAGATTCAAGAAGATGGAGATGCTTACAAGCTTATGT
ATTGTCCGGTTATCTCCTCTGTTTCGTGTATCAACGTGGGTCTAGAGATCGATGATCTTG
GAGTTAGACGTATGGTTCTTAGCAATGATCAATCTTTTGCTGTGAAGTTTCAAAGGGCTT
ATGATGATTCAAACTCCAACTGTCATCTCAGGCCTCGTTGGAGGATGTTCCCTTTGTTCT
AAAATGTGAAATAATTGTATCTTGTATTATGGTTGGAGAATGCTT*GTGATCATACCAAA
GTTGTGATGTAACCAACGGTTTATATGAAATAAGACATGTGGTTATTGTATGTATGTTAA
GAATCCTTGTAACAACACCAAGTTTGTGATGTAACCAACGGTTTATAATGG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2FK01JQ 785 0 0
AAGCAAAACAGTCCTAGACATAGCAGGACATCCAGTTCAGTCCAATGTCCAATACTACAT
AATACCGGCTAAGATCGGAGCCGGAAGTGGTCTTATCCCTTCAAGCCGAAATGTAAACAC
ACA**AGACTCGTGTCTGAATCTTGACATCGTACAGTCGTCATCTCCTTTCTTCTCAGGC
CTTCCCGTAACTTTCTCTCCACTCAACACCAAAGCCAAGCATGTCCAGCTCTCAACTAGT
CTCAGCCTCGAGTTTGATTCCACGGTTTGGTTATGCCCTGAATCTAAAGTGTGGAGAATC
GACCACTCCGTGCAACTCAGGAAGAGCTTTGTGAGCATTGGTGGTGAGAAAGGTAAAGGG
AATAGCTTGTTTCAGATTCAAGAAGGTGGAGATGCTTACAAGCTTATGTATTGTCCGGTT
ATCTCCTCTGTTTCGTGTATCAACGTGGGTCTAGAGATCGATGATCTTGGAGTTAGACGT
TTGGTTCTTAGCAATGATCAATCTTTTGCTGTGAAGTTTCAAAGGGCTTATGATGATTCA
AACTCCAACTGTCATCTCAGGCCTCGTTGGAGGATGTTCCCTTTGTTCTAAAATGTGAAA
TAATTGTATCTTTTATTATGGTTGGAGAATGCTT*GTGATCATACCAAAGTTGTGATGTA
ACCAACGGTTTATATGAAATAAGACATGTGGTTATTGTATGTATGTTAAGAATCCTTGTA
ACAACACCAAGTTTGTGATGTAACCAACGGTTTATAATGGAATTAAACATATGGTTA
TTGTATGT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2BV43JQ 632 0 0
CAGTCGTCATCTCCTTTCTTCTCAGGCCTTCCCGTAACTTTCTCTCCACTCAACACCAAA
GCCAAGCATGTCCAGCTCTCAACTAGTTTCAGCCTCGAGTTTGATTCCACGGTTTGGTTA
TGCCCTGAATTTAAAGTGTGGAGAATCGACCACTCCGTGCAACTCAGGAAGAGCTTTGTG
AGCATTGGTGGTGAGAAAGGTAAAGGGAATAGCTTGTTTCAGATTCAAGAAGATGGAGAT
GCTTACAAGCTTATGTATTGTCCGGTTATCTCCTCTGTTTCGTGTATCAACGTGGGTCTA
GAGATCGATGATCTTGGAGTTAGACGTTTGGTTCTTAGCAATGATCAATCTTTTGCTGTG
AAGTTTCAAAGGGCTTATGATGATTCAAACTCCAACTGTCATCTCAGGCCTCGTTGGAGG
ATGTTCCCTTTGTTCTAAAATGTGAAATAATTGTATCTTGTATTATGGTTGGAGAATGCT
T*GTGATCATACCAAAGTTGTGATGTAACCAACGGTTTATATGAAATAAGACATGTGGTT
ATTGTATGTATGTTAAGAATCCTTGTAACAACACCAAGTTTGTGATGTAACCAACGGTTT
ATAATGGAATTAAACATATGGTTATTGTATGC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2FP58TF 558 0 0
G
AGCTCTCAACTAGTCTCAGCCTCGAGTTTGATTCCACGGTTTGGTTATGCCCTGAATCTA
AAGTGTGGAGAATCGACCACTCCGTGCAACTCAGGAAGAGCTTTGTGAGCATTGGTGGTG
AGAAAGGTAAAGGGAATAGCTTGTTTCAGATTCAAGAAGATGGAGATGCTTACAAGCTTA
TGTATTGTCCGGTTATCTCCTCTGTTTCGTGTATCAACGTGGGTCTAGAGATCGATGATC
TTGGAGTTAGACGTTTGGTTCTTAGCAATGATCAATCTTTTGCTGTGAAGTTTCAAAGGG
CTTATGATGATTCAAACTCCAACTGTCATCTCAGGCCTCGTTGGAGGATGTTCCCTTTGT
TCTAAAATGTGAAATAATTGTATCTTGTATTATGGTTGGAGAATGCTT*GTGATCATACC
AAAGTTGTGATGTAACCAACGGTTTATATGAAATAAGACATGTGGTTATTGTATGTATGT
TAAGAATCCTTGTAACAACACCAAGTTTGTGATGTAACCAACGGTTTATAATGGAATTAA
ACATATGGTT
AAAAAAA

QA 2 551 2 551
DS 



CO CL198Contig2 678 2 4 U
GGAGGCAAGACACACCACAAACTCTAACCTAATGAAGATGCTTACTCTCTCTTTAACCGC
TCTCACCGTTCTCTCAGCCTTCTTGGCCGCAGCTCCTGCCGCAAATGCTCTACCAAGCAA
AACAGTCCTAGACATAGCAGGACATCCAGTTCAGTCCAATGTCCAATACTACATAATACC
GGCTAAGATCGGAGCCGGAAGTGGTCTTATCCCTTCAAGCCGAAATGTAAACACACAAGA
CTCGTGTCTGAATCTTGACATCGTACAGTCGTCATCTCCTTTCTTCTCAGGCCTTCCCGT
AACTTTCTCTCCACTCAACACCAAAGCCAAGCATGTCCAGCTCTCAACTAGTCTCAGCCT
CGAGTTTGATTCCACGGTTTGGTTATGCCCTGAATCTAAAGTGTGGAGAATCGACCACTC
CGTGCAACTCAGGAAGAGCTTTGTGAGCATTGGTGGTGAGAAAGGTAAAGGGAATAGCTT
GTTTCAGATTCAAGAAGATGGAGATGCTTACAAGCTTATGTATTGTCCGGTTATCTCCTC
TGTTTCGTGTATCAACGTGGGTCTAGAGATCGATGATCTTGGAGTTAGACGTATGGTTCT
TAGCAATGATCAATCTTTTGCTGTGAAGTTTCAAAGGGCTTATGATGATTCAAACTCCAA
CTGTCATCTCAGCCTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV43TF U 1
AF RR2E851TF U 14
BS 1 592 RR2BV43TF
BS 593 593 RR2E851TF
BS 594 669 RR2BV43TF
BS 670 678 RR2E851TF

RD RR2BV43TF 669 0 0
GGAGGCAAGACACACCACAAACTCTAACCTAATGAAGATGCTTACTCTCTCTTTAACCGC
TCTCACCGTTCTCTCAGCCTTCTTGGCCGCAGCTCCTGCCGCAAATGCTCTACCAAGCAA
AACAGTCCTAGACATAGCAGGACATCCAGTTCAGTCCAATGTCCAATACTACATAATACC
GGCTAAGATCGGAGCCGGAAGTGGTCTTATCCCTTCAAGCCGAAATGTAAACACACAAGA
CTCGTGTCTGAATCTTGACATCGTACAGTCGTCATCTCCTTTCTTCTCAGGCCTTCCCGT
AACTTTCTCTCCACTCAACACCAAAGCCAAGCATGTCCAGCTCTCAACTAGTCTCAGCCT
CGAGTTTGATTCCACGGTTTGGTTATGCCCTGAATCTAAAGTGTGGAGAATCGACCACTC
CGTGCAACTCAGGAAGAGCTTTGTGAGCATTGGTGGTGAGAAAGGTAAAGGGAATAGCTT
GTTTCAGATTCAAGAAGATGGAGATGCTTACAAGCTTATGTATTGTCCGGTTATCTCCTC
TGTTTCGTGTATCAACGTGGGTCTAGAGATCGATGATCTTGGAGTTAGACGTTTGGTTCT
TAGCAATGATCAATCTTTTGCTGTGAAGTTTCAAAGGGCTTATGATGATTCAAACTCCAA
CTGTCATCT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2E851TF 665 0 0
ACCACAAACTCTAAC
CTAATGAAGATGCTTACTCTCTCTTTAACCGCTCTCACCGTTCTCTCAGCCTTCTTGGCC
GCAGCTCCTGCCGCAAATGCTCTACCAAGCAAAACAGTCCTAGACATAGCAGGACATCCA
GTTCAGTCCAATGTCCAATACTACATAATACCGGCTAAGATCGGAGCCGGAATTGGTCTT
ATCCCTTCAAGCCGAAATGTAAACACACAAGACTCGTGTCTGAATCTTGACATCGTACAG
TCGTCATCTCCTTTCTTCTCAGGCCTTCCCGTGACTTTCTCTCCACTCAACACCAAAGCC
AAGCATGTCCAGCTCTCAACTAGTCTCAGCCTCGAGTTTGATTCCACGGTTTGGTTATGC
CCTGAATCTAAAGTGTGGAGAATCGACCACTCCGTGCAACTCAGGAAGAGCTTTGTGAGC
ATTGGTGGTGAGAAAGGTAAAGGGAATAGCTTGTTTCAGATTCAAGAAGATGGAGATGCT
TACAAGCTTATGTATTGTCCGGTTATCTCCTCTGTTTCGTGTATCAACGTGGGTCTAGAG
ATCGATGATCTTGGAGTTAGACGTATGGTTCTTAGCAATGATCAATCTTTTGCTGTGAAG
TTTCAAAGGGCTTATGATGATTCAAACTCCAACTGTCATCTCAGCCTCGT

QA 16 665 16 665
DS 



AS 4 16

CO CL199Contig1 752 9 5 U
GGGCTCCTAGATGCATCACACAGGGACCTAAGGCGTGCAAGAGCCGCAGCACTGAACATT
GTACCTACTAGCACAGGTGCAGCAAAGGCGGTGTCGTTGGTGCTCCCCCAGTTGAAGGGT
AAACTCAACGGCATTGCACTCCGTGTGCCGACCCTAAACGTCTCTGTGGTTGACCTTGTT
ATAAACGTTGAGAAGAAAGGTTTGACAGCTGAAGACGTTAACGACGCCTTCAGAAAAGCG
GCCGCTGGACCGCTCAAGGGCGTTTTAGACGTCTGCGACACGCCACTTGTCTCTTGTGAC
TTCAGGTGCTCTGATGTCTCAACCACCATTGATTCGTCCCTCACAATGGTCATGGGTGAT
GATATGGTCAAGGTGGTCGCCTGGTACGACAACGAGTGGGGTTACAGCCAAAGAG*AGTG
GATTTGGCTCACCTTGTGGCTGCCAAGTGGCCGGGAGAGGTTGCTGCTGGAAGCGGAGAC
CCTTTGGAAGATTTCTGCAAGACAAACCCAGCCGACGAGGAATGCAAAGTCTATGAAGCT
TGATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGCAATTTGGTTTATCTTCCAGTGACAA
TTTATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAACCCAATCATGTATTTGGTTTTCTTTAT
TTTTACTATTATATCAAGAGGCGATGTAATACCCATTCCTTTTCATTGCCTCATGAGCGA
TCTCGAGGATATACTATAACTTCTCTAATTTC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2G108JQ C 1
AF RR2CC07JQ C 1
AF RR2G108TF U 304
AF RR2CI72JQ C 278
AF RR2CC07TF U 1
AF RR2F511TF U 455
AF RR2F044JQ C 165
AF RR2B478TF U 456
AF RR2DW94TF U 456
BS 1 1 RR2CC07JQ
BS 2 303 RR2CC07TF
BS 304 636 RR2G108TF
BS 637 704 RR2F511TF
BS 705 752 RR2B478TF

RD RR2G108JQ 595 0 0
G
GGCTCCTAGATGCATCACACAGGGACCTAAGGCGTGCAAGAGCCGCAGCACTGAACATTG
TACCTACTAGCACAGGTGCAGCAAAGGCGGTGTCGTTGGTGCTCCCCCAGTTGAAGGGTA
AACTCAACGGCATTGCACTCCGTGTGCCGACCCTAAACGTCTCTGTGGTTGACCTTGTTA
TAAACGTTGAGAAGAAAGGTTTGACAGCTGAAGACGTTAACGACGCCTTCAGAAAAGCGG
CCGCTGGACCGCTCAAGGGCGTTTTAGACGTCTGCGACACGCCACTTGTCTCTTGTGACT
TCAGGTGCTCTGATGTCTCAACCACCATTGATTCGTCCCTCACAATGGTCATGGGTGATG
ATATGGTCAAGGTGGTCGCCTGGTACGACAACGAGTGGGGTTACAGCCAAAGAG*AGTGG
ATTTGGCTCACCTTGTGGCTGCCAAGTGGCCGGGAGAGGTTGCTGCTGGAAGCGGAGACC
CTTTGGAAGATTTCTGCAAGACAAACCCAGCCGACGAGGAATGCAAAGTCTATGAAGCTT
GATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGCAATTTGGTTTATCTTCCAGT

QA 2 595 2 595
DS 

RD RR2CC07JQ 636 0 0
GGGCTCCTAGATGCATCACACAGGGACTTAAGGCGTGCAAGAGCCGCAGCACTGAACATT
GTACCTACTAGCACAGGTGCAGCAAAGGCGGTGTCGTTGGTGCTCCCCCAGTTGAAGGGT
AAACTCAACGGCATTGCACTCCGTGTGCCGACCCTAAACGTCTCTGTGGTTGACCTTGTT
ATAAACGTTGAGAAGAAAGGTTTGACAGCTGAAGACGTTAACGACGCCTTCAGAAAAGCG
GCCGCTGGACCGCTCAAGGGCGTTTTAGACGTCTGCGACACGCCACTTGTCTCTTGTGAC
TTCAGGTGCTCTGATGTCTCAACCACCATTGATTCGTCCCTCACAATGGTCATGGGTGAT
GATATGGTCAAGGTGGTCGCCTGGTACGACAACGAGTGGGGTTACAGCCAAAGAG*AGTG
GATTTGGCTCACCTTGTGGCTGCCAAGTGGCCGGGAGAGGTTGCTGCTGGAAGCGGAGAC
CCTTTGGAAGATTTCTGCAAGACAAACCCAGCCGACGAGGAATGCAAAGTCTATGAAGCT
TGATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGCAATTTGGTTTATCTTCCAGTGACAA
TTTATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAACCC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2G108TF 333 0 0
AGGTGCTCTGATGTCTCAACCACCATTGATTCGTCCCTCACAATGGTCATGGGTGATGAT
ATGGTCAAGGTGGTCGCCTGGTACGACAACGAGTGGGGTTACAGCCAAAGAG*AGTGGAT
TTGGCTCACCTTGTGGCTGCCAAGTGGCCGGGAGAGGTTGCTGCTGGAAGCGGAGACCCT
TTGGAAGATTTCTGCAAGACAAACCCAGCCGACGAGGAATGCAAAGTCTATGAAGCTTGA
TTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGCAATTTGGTTTATCTTCCAGTGACAATTT
ATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAACCC

QA 1 333 1 333
DS 

RD RR2CI72JQ 359 0 0
ACACGCCACTTGTCTCTTGTGACTTCAGGTGCTCTGATGTCTCAACCACCATTGACTCTT
CCCTCACAATGGTCATGGGTGATGATATGGTCAAGGTGGTCGCCTGGTACGACAACGAGT
GGGGTTACAGCCAAAGAGTAGTGGATTTGGCTCACCTTGTGGCTGCCAAGTGGCCGGGAG
AGGTTGCTGCTGGAAGCGGAGACCCTTTGGAAGATTTCTGCAAGACAAACCCAGCCGACG
AGGAATGCAAAGTCTATGAAGCTTGATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGCAA
TTTGGTTTATCTTCCAGTGACAATTTATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAACCC

QA 1 359 1 359
DS 

RD RR2CC07TF 636 0 0
G
GGCTCCTAGATGCATCACACAGGGACCTAAGGCGTGCAAGAGCCGCAGCACTGAACATTG
TACCTACTAGCACAGGTGCAGCAAAGGCGGTGTCGTTGGTGCTCCCCCAGTTGAAGGGTA
AACTCAACGGCATTGCACTCCGTGTGCCGACCCTAAACGTCTCTGTGGTTGACCTTGTTA
TAAACGTTGAGAAGAAAGGTTTGACAGCTGAAGACGTTAACGACGCCTTCAGAAAAGCGG
CCGCTGGACCGCTCAAGGGCGTTTTAGACGTCTGCGACACGCCACTTGTCTCTTGTGACT
TCAGGTGCTCTGATGTCTCAACCACCATTGATTCGTCCCTCACAATGGTCATGGGTGATG
ATATGGTCAAGGTGGTCGCCTGGTACGACAACGAGTGGGGTTACAGCCAAAGAG*AGTGG
ATTTGGCTCACCTTGTGGCTGCCAAGTGGCCGGGAGAGGTTGCTGCTGGAAGCGGAGACC
CTTTGGAAGATTTCTGCAAGACAAACCCAGCCGACGAGGAATGCAAAGTCTATGAAGCTT
GATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGCAATTTGGTTTATCTTCCAGTGACAAT
TTATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAACCC

QA 2 636 2 636
DS 

RD RR2F511TF 250 0 0
GAGAGGTTGCTGCTGGAAGCGGAGACCCTTTGGAAGATTTCTGCAAGACAAACCCAGCCG
ACGAGGAATGCAAAGTCTATGAAGCTTGATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAG
CAATTTGGTTTATCTTCCAGTGACAATTTATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAAC
TCAATCATGTATTTGGTTTTCTTTATTTTTACTATTATATCAAGAGGCGATGTAATACCC
ATTCCTTTTC

QA 1 250 1 250
DS 

RD RR2F044JQ 573 0 0
TGTGGTTGACCTTGTTATAAACGTTGAGAAGAAAGGTTTGACAGCTGAAGACGTTAACGA
CGCCTTCAGAAAAGCGGCCGCTGGACCGCTCAAGGGCGTTTTAGACGTTTGCGACACGCC
ACTTGTTTCTTGTGACTTCAGGTGCTCTGATGTCTCAACCACCATTGATTCGTCCCTCAC
AATGGTCATGGGTGATGATATGGTCAAGGTGGTCGCCTGGTACGACAACGAGTGGGGTTA
CAGCCAAAGAGTAGTGGATTTGGCTCACCTTGTGGCTGCCAAGTGGCCGGGAGAGGTTGC
TGCTGGAAGCGGAGACCCTTTGGAAGATTTTTGCAAGACAAACCCAGCCGACGAGGAATG
CAAAGTCTATGAAGCTTGATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGCAATTTGGTT
TATCTTCCAGTGACGATTTATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAACTCAATCATGT
ATTTGGTTTTCTTTATTTTTACTATTATATCAAGAGGCGATGTAATACCCATTCCTTTTC
ATTGCCTCATGAGCGATCTCGAGGATATACTAT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2B478TF 297 0 0
AGAGGTTGCTGCTGGAAGCGGAGACCCTTTGGAAGACTTCTGCAAGACAAACCCAGCCGA
CGAGGAATGCAAAGTCTATGAAGCTTGATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGC
AATTTGGTTTATCTTCCAGTGACAATTTATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAACT
CAATCATGTATTTGGTTTTCTTTATTTTTACTATTATATCAAGAGGCGATGTAATACCCA
TTACTTTTCATTGCCTCATGAGCGATCTCGAGGATATACTATAACTTCTCTAATTTC

QA 1 297 1 297
DS 

RD RR2DW94TF 297 0 0
G
GAGGTTGCTGCTGGAAGCGGAGACCCTTTGGAAGATTTCTGCAAGACAAACCCAGCCGAC
GAGGAATGCAAAGTCTATGAAGCTTGATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGCA
ATTTGGTTTATCTTCCAGTGACAATTTATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAACTC
AATCATGTATTTGGTTTTCTTTATTTTTACTATTATATCAAGAGGCGATGTAATACCCAT
TACTTTTCATTGCCTCATGAGCGATCTCGAGGATATACTATAACTTCTCTAATTTC

QA 2 297 2 297
DS 



CO CL199Contig2 1219 3 13 U
GGGATTAGCATCCTTAGCCTTTCACTTGCAACTATGGCCACACATTCAGCTCTTGCCGTC
TCCAGAATCCCTGTCAAACCTAGGCAGCAGTCCAAGAGTGCCATTCACTCTTTCCCAGCT
CAATGTTCCTCCAAGAGGCTAGAAGTGGCTGCATTCTCCGGCTTGCGAGTCAGCAACAAC
GGTGGGGAAGCATCTTTCTTTGATGCCATAGCTGCACAAATCACCCCCAAGGCTGTGGGA
ACATCCACTCCTGTTAGAGGAGAAACAGTGGCAAAACTGAAGGTTGCCATCAATGGGTTT
GGAAGGATTGGTAGGAACTTCCTCAGGTGTTGGCACGGCCGCAAGGACTCTCCCCTCGAA
GTTGTTGTGCTTAACGACAGTGGTGGTGTCAAGAACGCATCCCACTTGCTCAAGTATGAC
TCCATGCTTGGAACCTTCAAGGCCGATGTGAAAATAGTCGACAATGAAACTATCAGCGTT
GATGGCAAGCTCATCAAAGTCGTCTCAAACAGAGATCCTCTTAAGCTTCCATGGGCTGAG
CTCGGCATTGACATTGTCATCGAGGGAACAGGAGTGTTTGTTGATGGGCCAGGAGCAGGG
AAGCACATCCAAGCTGGAGCCTCGAAAGTGATCATCACAGCACCAGCTAAAGGCGCTGAT
ATCCCAACCTATGTTGTGGGAGTCAATGAGCAAGACTATTCTCATGACGTTGCTAACATC
ATTAGCAATGCATCTTGCACCACCAACTGTTTGGCTCCCTTTGCGAAAGTTTTGGATGAA
GAATTTGGAATCGTCAAGGGCACAATGACAACAACACACTCTTACACCGGAGACCAAAGG
CTCCTAGATGCATCACACAGGGACCTAAGGCGTGCAAGAGCCACAGCACTGAACATTGTA
CCTACTAGCACAGGTGCAGCAAAGGCGGTGTCGTTGGTGCTCCCCCAGCTGAAAGGTAAA
CTCAACGGCATTGCACTCCGTGTGCCGACCCCAAACGTCTCTGTGGTTGACCTTGTTATA
AACGTTGAGAAGAAAGGTTTGACAGCTGAAGACGTTAACGACGCCTTCAGAAAAGCGGCC
GCTGGACCGCTCAAGGGCGTTTTAGACGTCTGCGACACGCCACTTGTCTCTTGTGACTTC
AGTGCTCTGATGTCTCACCACCATTGACTCTTCCTCACATGGTCATGGGTGATGATATGG
TCAAGTGGTCGCTGGTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI72TF U 1
AF RR2F044TF U 227
AF RR2E504TF U 467
BS 1 263 RR2CI72TF
BS 264 264 RR2F044TF
BS 265 302 RR2CI72TF
BS 303 303 RR2F044TF
BS 304 715 RR2CI72TF
BS 716 812 RR2F044TF
BS 813 813 RR2E504TF
BS 814 882 RR2F044TF
BS 883 883 RR2E504TF
BS 884 948 RR2F044TF
BS 949 949 RR2E504TF
BS 950 996 RR2F044TF
BS 997 1219 RR2E504TF

RD RR2CI72TF 719 0 0
GGGATTAGCATCCTTAGCCTTTCACTTGCAACTATGGCCACACATTCAGCTCTTGCCGTC
TCCAGAATCCCTGTCAAACCTAGGCAGCAGTCCAAGAGTGCCATTCACTCTTTCCCAGCT
CAATGTTCCTCCAAGAGGCTAGAAGTGGCTGCATTCTCCGGCTTGCGAGTCAGCAACAAC
GGTGGGGAAGCATCTTTCTTTGATGCCATAGCTGCACAAATCACCCCCAAGGCTGTGGGA
ACATCCACTCCTGTTAGAGGAGAGACAGTGGCAAAACTGAAGGTTGCCATCAATGGGTTT
GGGAGGATTGGTAGGAACTTCCTCAGGTGTTGGCACGGCCGCAAGGACTCTCCCCTCGAA
GTTGTTGTGCTTAACGACAGTGGTGGTGTCAAGAACGCATCCCACTTGCTCAAGTATGAC
TCCATGCTTGGAACCTTCAAGGCCGATGTGAAAATAGTCGACAATGAAACTATCAGCGTT
GATGGCAAGCTCATCAAAGTCGTCTCAAACAGAGATCCTCTTAAGCTTCCATGGGCTGAG
CTCGGCATTGACATTGTCATCGAGGGAACAGGAGTGTTTGTTGATGGGCCAGGAGCAGGG
AAGCACATCCAAGCTGGAGCCTCGAAAGTGATCATCACAGCACCAGCTAAAGGCGCTGAT
ATCCCAACCTATGTTGTGGGAGTCAATGAGCAAGACTATTCTCATGACGTTGCTA
CATC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2F044TF 770 0 0
G
CAAGGCTGTGGGAACATCCACTCCTGTTAGAGGAGAAACAGTGGCAAAACTGAAGGTTGC
CATCAATGGGTTTGGAAGGATTGGTAGGAACTTCCTCAGGTGTTGGCACGGCCGCAAGGA
CTCTCCCCTCGAAGTTGTTGTGCTTAACGACAGTGGTGGTGTCAAGAACGCATCCCACTT
GCTCAAGTATGACTCCATGCTTGGAACCTTCAAGGCCGATGTGAAAATAGTCGACAATGA
AACTATCAGCGTTGATGGCAAGCTCATCAAAGTCGTCTCAAACAGAGATCCTCTTAAGCT
TCCATGGGCTGAGCTCGGCATTGACATTGTCATCGAGGGAACAGGAGTGTTTGTTGATGG
GCCAGGAGCAGGGAAGCACATCCAAGCTGGAGCCTCGAAAGTGATCATCACAGCACCAGC
TAAAGGTGCTGATATCCCAACCTATGTTGTGGGAGTCAATGAGCAAGACTATTCTCATGA
CGTTGCTAACATCATTAGCAATGCATCTTGCACCACCAACTGTTTGGCTCCCTTTGCGAA
AGTTTTGGATGAAGAATTTGGAATCGTCAAGGGCACAATGACAACGACACACTCTTACAC
CGGAGACCAAAGGCTCCTAGATGCATCACACAGGGACCTAAGGCGTGCAAGAGCCGCAGC
ACTGAACATTGTACCTACTAGCACAGGTGCAGCAAAGGCGGTGTCGTTGGTGCTCCCCCA
GTTGAAAGGTAAACTCAACGGCATTGCACTCCGTGTGCCGACCCCAAAC

QA 2 770 2 770
DS 

RD RR2E504TF 753 0 0
G
AACTATCAGCGTTGATGGCAAGCTCATCAAAGTCGTCTCAAACAGAGATCCTCTTAAGCT
TCCATGGGCTGAGCTCGGCATTGACATTGTCATCGAGGGAACAGGAGTGTTTGTTGATGG
GCCAGGAGCAGGGAAGCACATCCAAGCTGGAGCCTCGAAAGTGATCATCACAGCACCAGC
TAAAGGCGCTGATATCCCAACCTATGTTGTGGGAGTCAATGAGCAAGACTATTCTCATGA
CGTTGCTAACATCATTAGCAATGCATCTTGCACCACCAACTGTTTGGCTCCCTTTGCGAA
AGTTTTGGATGAAGAATTTGGAATCGTCAAGGGGACAATGACAACAACACACTCTTACAC
CGGAGACCAAAGGCTCCTAGATGCATCACACAGGGACCTAAGGCGTGCAAGAGCCACAGC
ACTGAACATTGTACCTACTAGCACAGGTGCAGCGAAGGCGGTGTCGTTGGTGCTCCCCCA
GCTGAAGGGTAAACTCAACGGCATTGCACTCCGTGTGCCGACCCCAAACGTCTCTGTGGT
TGACCTTGTTATAAACGTTGAGAAGAAAGGTTTGACAGCTGAAGACGTTAACGACGCCTT
CAGAAAAGCGGCCGCTGGACCGCTCAAGGGCGTTTTAGACGTCTGCGACACGCCACTTGT
CTCTTGTGACTTCAGTGCTCTGATGTCTCACCACCATTGACTCTTCCTCACATGGTCATG
GGTGATGATATGGTCAAGTGGTCGCTGGTACG

QA 2 753 2 753
DS 



CO CL199Contig3 534 2 1 U
GGAGCATCCTTAGCCTTTCACTTGCAACTATGGCCACACATTCAGCTCTTGCCGTCTCCA
GAATCCCTGTCAAACCGAGGCAGCAGTCCAAGAGTGCCATTCACTCTTTCCCAGCTCAAT
GTTCCTCCAAGAGGCTAGAAGTGGCTGCATTCTCCGGCTTGCGAGTCAGTAACAACGGTG
GGGAAGCATCTTTCTTTGATGCCATAGCTGCACAAATCACCCCCAAGGCTGTGGGAACAT
CCACTCCTGTTAGAGGAGAGACAGTGACAAAACTGAAGGTTGCCATCAATGGGTTTGGGA
GAGGTTGCTGCTGGAAGCGGAGACCCTTTGGAAGATTTCTGCAAGACAAACCCAGCCGAC
GAGGAATGCAAAGTCTATGAAGCTTGATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGCA
ATTTGGTTTATCTTCCAGTGACAATTTATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAACTC
AATCATGTATTTGGTTTTCTTTATTTTTACTATTATATCAAGAGGCGATGTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D369TF U 300
AF RR2D205TF U 1
BS 1 534 RR2D205TF

RD RR2D369TF 181 0 0
G
GAGGTTGCTGCTGGAAGCGGAGACCCTTTGGAAGATTTCTGCAAGACAAACCCAGCCGAC
GAGGAATGCAAAGTCTATGAAGCTTGATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGCA
ATTTGGTTTATCTTCCAGTGACAATTTATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAACTC

QA 2 181 2 181
DS 

RD RR2D205TF 534 0 0
GGAGCATCCTTAGCCTTTCACTTGCAACTATGGCCACACATTCAGCTCTTGCCGTCTCCA
GAATCCCTGTCAAACCGAGGCAGCAGTCCAAGAGTGCCATTCACTCTTTCCCAGCTCAAT
GTTCCTCCAAGAGGCTAGAAGTGGCTGCATTCTCCGGCTTGCGAGTCAGTAACAACGGTG
GGGAAGCATCTTTCTTTGATGCCATAGCTGCACAAATCACCCCCAAGGCTGTGGGAACAT
CCACTCCTGTTAGAGGAGAGACAGTGACAAAACTGAAGGTTGCCATCAATGGGTTTGGGA
GAGGTTGCTGCTGGAAGCGGAGACCCTTTGGAAGATTTCTGCAAGACAAACCCAGCCGAC
GAGGAATGCAAAGTCTATGAAGCTTGATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGCA
ATTTGGTTTATCTTCCAGTGACAATTTATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAACTC
AATCATGTATTTGGTTTTCTTTATTTTTACTATTATATCAAGAGGCGATGTAAT

QA 1 534 1 534
DS 



CO CL199Contig4 580 2 3 U
GGATCCTTAGCCTTTCACTTGCAACTATGGCCACACATTCAGCTCTTGCCGTCTCCAGAA
TCCCTGTCAAACCGAGGCAGCAGTCCAAGAGTGCCATTCACTCTTTCCCAGCTCAATGTC
CCTCCAAGAGGCTAGAAGTGGCTGCATTCTCCGGCTTGCGAGTCAGCAACAACGGTGGGG
AAGCATCTTTCTTTGATGCCATAGCTGCACAAATCACCCCCAAGGCTGTGGGAACATCCA
CTCCTGTTAGAGGAGAGACAGTGGCAAAACTGAAGGTTGCCATCAATGGGTTTGGGAGGA
TTGGTAGGAACTTCCTCAGGTGTTGGCTGCCAAGTGGCCGGGAGAGGTTGCTGCTGGAAG
CGGAGACCCTTTGGAAGATTTCTGCAAGACAAACCCAGCCGACGAGGAATGCAAAGTCTA
TGAAGCTTGATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGCAATTTGGTTTATCTCCCA
GTGACAATTTATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAACTCAATCATGTATTTGGTTT
TCTTTATTTTTACTATTATATCAAGAGGCGATGTAATACC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO31JQ C 1
AF RR2DO31TF U 1
BS 1 2 RR2DO31JQ
BS 3 546 RR2DO31TF
BS 547 580 RR2DO31JQ

RD RR2DO31JQ 580 0 0
GGATCCTTAGCCTTTCACTTGCAACTATGGCCACACATTCAGCTCTTGCCGTCTCCAGAA
TCCCTGTCAAACCGAGGCAGCAGTCCAAGAGTGCCATTCACTCTTTCCCAGCTCAATGTC
CCTCCAAGAGGCTAGAAGTGGCTGCATTTTCCGGCTTGCGAGTCAGCAACAACGGTGGGG
AAGCATCTTTCTTTGATGCCATAGCTGCACAAATCACCCCCAAGGCTGTGGGAACATCCA
CTCCTGTTAGAGGAGAGACAGTGGCAAAACTGAAGGTTGCCATCAATGGGTTTGGGAGGA
TTGGTAGGAACTTCCTCAGGTGTTGGCTGCCAAGTGGCCGGGAGAGGTTGCTGCTGGAAG
CGGAGACCCTTTGGAAGATTTCTGCAAGACAAACCCAGCCGACGAGGAATGCAAAGTCTA
TGAAGCTTGATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGCAATTTGGTTTATCTCCCA
GTGACAATTTATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAACTCAATCATGTATTTGGTTT
TCTTTATTTTTACTATTATATCAAGAGGCGATGTAATACC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2DO31TF 546 0 0
GG
ATCCTTAGCCTTTCACTTGCAACTATGGCCACACATTCAGCTCTTGCCGTCTCCAGAATC
CCTGTCAAACCGAGGCAGCAGTCCAAGAGTGCCATTCACTCTTTCCCAGCTCAATGTCCC
TCCAAGAGGCTAGAAGTGGCTGCATTCTCCGGCTTGCGAGTCAGCAACAACGGTGGGGAA
GCATCTTTCTTTGATGCCATAGCTGCACAAATCACCCCCAAGGCTGTGGGAACATCCACT
CCTGTTAGAGGAGAGACAGTGGCAAAACTGAAGGTTGCCATCAATGGGTTTGGGAGGATT
GGTAGGAACTTCCTCAGGTGTTGGCTGCCAAGTGGCCGGGAGAGGTTGCTGCTGGAAGCG
GAGACCCTTTGGAAGATTTCTGCAAGACAAACCCAGCCGACGAGGAATGCAAAGTCTATG
AAGCTTGATTCCAATCTTTTTCTCCAAACTGTTTCCAAGCAATTTGGTTTATCTCCCAGT
GACAATTTATCGATATCATATAATCCATACCTCTTAAACTCAATCATGTATTTGGTTTTC
TTTA

QA 3 546 3 546
DS 



AS 2 13

CO CL200Contig1 1122 9 18 U
GGATAGACGCCACAGAAAGCAGAGAGGTTTTGTTCTGTAGTGTCTTCTTCGAATCCCTCT
CGATAACTATCATCTCTCAAGAATGGGGAAAGGACCAGGTCTCTACACTGACATCGGCAA
AAAAGCCAAAGATCTGCTGTACAAGGACCACAACAGCGACCAGAAATTCAGTATCACCAC
TTCCACTCCTGCCGGTGTTGCCATCACTTCAACTGGAACCAAGAAAGGTGACTCACTCTT
GGGAGATGTTGCTTTTCAACTCAAGCAAAAAAACACCACTACCGATTTTAGAGTTTCCAC
TGACAATACCGCTTTGATCACTGCTACGGTTGATGAGGCTACACCTGGATTGAAGTCCAT
CTTCAGCTTCAGGGCCCCTGACCAGAACTCCGGCAAGATTGAGCTTCAGTACTTGCATGA
ATATGCCGGTATCAGCACCAGCATGGGCTTGACTCAAAACCCCACTGTCAACTTCTCTGG
TGTTATGGGTACCAATGTGTTTGCCCTTGGTACCGATGTTTCCTTCGACACCAAATCAGG
CAGTTTCACCAAGATCAATGCTGGAGTTAACTTCATCAAGGATGATTTAATTGCCTCCCT
TACCCTGAACGACAAAGGAGATACTGTCAACGCTTCATTCTACCACCTTGTTAACCCGCT
GTTCAACACCGCTGTTGGAGCTGAAGTGAACCACAAGTTCTCCACCAATGTCAACACCAT
AACCGTGGGAACGCAGCATTCGCTTGACCCCTTGACCACTGTGAAGGCACGTGTGAACAG
TGCCGGGATAGCCAATGCACTCATTCAGCACCAGTGGACACCCAAATCCTTCTTCACCAT
CTCTGGAGAAGTTGACACTAAGGCTATTGACAAGAATGCTAAGGTTGGTTTGGCCCTTTC
TCTCAAGCCTTGGAAATGAGAGCCAACTGATGAATATCCAACCAAAGCAAGTTTTTTCTG
ATGCGGTGTACTGCTTGGTTTGGTTGTTTTAATGGTTACTGCTCAAATATTTTCCTCAGT
TTCTTATCGGATTTGTAGAGCATAATAAATTTGGATTAATTGATCGTCTGTCTTGGTGAT
ACGATGAAACTCTAAAGATCCTTTTCCTTTCCCAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 40 25 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK63TF U 35
AF RR2BB38TF U 1
AF RR2CQ04TF U 5
AF RR2BG57TF U 35
AF RR2FR74TF U 18
AF RR2BG57JQ C 289
AF RR2FR74JQ C 353
AF RR2EF69TF U 394
AF RR2EF69JQ C 529
BS 1 288 RR2BB38TF
BS 289 289 RR2FR74TF
BS 290 311 RR2BB38TF
BS 312 312 RR2FR74TF
BS 313 340 RR2BB38TF
BS 341 341 RR2FR74TF
BS 342 384 RR2BB38TF
BS 385 385 RR2FR74TF
BS 386 438 RR2BB38TF
BS 439 439 RR2FR74TF
BS 440 501 RR2BB38TF
BS 502 502 RR2FR74TF
BS 503 753 RR2BB38TF
BS 754 754 RR2EF69TF
BS 755 766 RR2FR74TF
BS 767 767 RR2EF69TF
BS 768 814 RR2FR74TF
BS 815 1122 RR2EF69TF

RD RR2EK63TF 579 0 0
GG
GTAGTGTCTTCTTCGAATCCCTCTCGATAACTATCATCTCTCAAGAATGGGGAAAGGACC
AGGTCTCTACACTGACATCGGCAAAAAAGCCAAAGATCTGCTGTACAAGGGCCACAACAG
CGACCAGAAATTCAGTATCACCACTTCCACTCCTGCCGGTGTTGCCATCACTTCAACTGG
AACCAAGAAAGGTGACTCACTCTTGGGAGATGTTGCTTTTCAACTCAAGCAAAAAAACAC
CACTACCGATTTGAGAGTTTCCACTGACAATACCGTTTTGATCACTGCTACGGTTGATGA
GGCTGCACCTGGATTGAAGTCCATCTTCAGCTTCAGGGCCCCTGACCAAAACTCCGGCAA
GATTGAGCTTCAGTACTTGCATGAATATGCCGGTATCAGCACAAGCATGGGCTTGACTCA
AAACCCCACTGTCAACTTCTCTGGTGTTATGGGTACCAATGTGTTGGCCCTTGGTACTGA
TGTTTCCTTCGACACCAAATCAGGCAGTTTCACCAAGATCAATGCTGGAGTTAACTTCAT
CAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACCCTGAACGAC

QA 3 579 3 579
DS 

RD RR2BB38TF 756 0 0
GGATAGACGCCACAGAAAGCAGAGAGGTTTTGTTCTGTAGTGTCTTCTTCGAATCCCTCT
CGATAACTATCATCTCTCAAGAATGGGGAAAGGACCAGGTCTCTACACTGACATCGGCAA
AAAAGCCAAAGATCTGCTGTACAAGGACCACAACAGCGACCAGAAATTCAGTATCACCAC
TTCCACTCCTGCCGGTGTTGCCATCACTTCAACTGGAACCAAGAAAGGTGACTCACTCTT
GGGAGATGTTGCTTTTCAACTCAAGCAAAAAAACACCACTACCGATTTGAGAGTTTCCAC
TGACAATACCGTTTTGATCACTGCTACGGTTGATGAGGCTGCACCTGGATTGAAGTCCAT
CTTCAGCTTCAGGGCCCCTGACCAAAACTCCGGCAAGATTGAGCTTCAGTACTTGCATGA
ATATGCCGGTATCAGCACAAGCATGGGCTTGACTCAAAACCCCACTGTCAACTTCTCTGG
TGTTATGGGTACCAATGTGTTGGCCCTTGGTACCGATGTTTCCTTCGACACCAAATCAGG
CAGTTTCACCAAGATCAATGCTGGAGTTAACTTCATCAAGGATGATTTAATTGCCTCCCT
TACCCTGAACGACAAAGGAGATACTGTCAACGCTTCATTCTACCACCTTGTTAACCCGCT
GTTCAACACCGCTGTTGGAGCTGAAGTGAACCACAAGTTCTCCACCAATGTCAACACCAT
AACCGTGGGAACGCAGCATTCGCTTGACCCCTT
AAC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2CQ04TF 731 0 0
AGACGCCGCAGAAAGCAGAGAGGTTTTGTTCTGTAGTGTCTTCTTCGAATCCCTCTCGAT
AACTATCATCCCTCAAGAATGGGGAAAGGACCAGGTCTCTACACTGACATCGGCAAAAAA
GCCAAAGATCTGCTGTACAAGGACCACAACAGCGACCAGAAATTCAGTATCACCACTTCC
ACTCCTGCCGGTGTTGCCATCACTTCAACTGGAACCAAGAAAGGTGACTCACTCTTGGGA
GATGTTGCTTTTCAACTCAAGCAAAAAAACACCACTACCGATTTGAGAGTTTCCACTGAC
AATACCGTTTTGATCACTGCTACGGTTGATGAGGCTGCACCTGGATTGAAGTCCATCTTC
AGCTTCAGGGCCCCTGACCAAAACTCCGGCAAGATTGAGCTTCAGTACTTGCATGAATAT
GCCGGTATCAGCACAAGCATGGGCTTGACTCAAAACCCCACTGTCAACTTCTCTGGTGTT
ATGGGTACCAATGTGTTGGCCCTTGGTACCGATGTTTCCTTCGACACCAAATCAGGCAGT
TTCACCAAGATCAATGCTGGAGTTAACTTCATCAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACC
CTGAACGACAAAGGAGATACTGTCAACGCTTCATTCTACCACCTTGTTAACCCGCTGT*C
AACACCGCTGTTGGAGCTGAAGTGAACCACAAGTTCTCCACCAATGTCA*CACCATAACC
GTGGGA
CGCAT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2BG57TF 713 0 0
GG
GTAGTGTCTTCTTCGAATCCCTCTCGATAACTATCATCTCTCAAGAATGGGGAAAGGACC
AGGTCTCTACACTGACATCGGCAAAAAAGCCAAAGATCTGCTGTACAAGGACCACAACAG
CGACCAGAAATTCAGTATCACCACTTCCACTCCTGCCGGTGTTGCCATCACTTCAACTGG
AACCAAGAAAGGTGACTCACTCTTGGGAGATGTTGCTTTTCAACTCAAGCAAAAAAACAT
CACTACCGATTTTAGAGTTTCCACTGACAATACCGCTTTGATCACTGCTACGGTTGATGA
GGCTACACCTGGATTGAAGTCCATCTTCAGCTTCAGGGCCCCTGACCAGAACTCCGGCAA
GATTGAGCTTCAGTACTTGCATGAATATGCCGGTATCAGCACCAGCATGGGCTTGACTCA
AAACCCCACTGTCAACTTCTCTGGTGTTATGGGTACCAATGTGTTTGCCCTTGGTACCGA
TGTTTCCTTCGACACCAAATCAGGCAGTTTCACCAAGATCAATGCTGGAGTTAACTTCAT
CAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACCCTGAACGACAAAGGAGATACTGTCAACGCTTC
ATTCTACCACCTTGTTAACCCGCTGTTCAACACCGCTGTTGGAGCTGAAGTGAACCACAA
GTTCTCCACCAATGTCAACACCATAACCGTGGGAACGCAGCATTCGCTTGA

QA 3 713 3 713
DS 

RD RR2FR74TF 797 0 0
GGG
AGAGAGGTTTTGTTCTGTAGTGTCTTCCTCGAATCCCTCTCGATAACTATCATCTCTCAA
GAATGGGGAAAGGACCAGGTCTCTACACTGACATCGGCAAAAAAGCCAAAGATCTGCTGT
ACAAGGACCACAACAGCGACCAGAAATTCAGTATCACCACTTCCACTCCTGCCGGTGTTG
CCATCACTTCAACTGGAACCAAGAAAGGTGACTCACTCTTGGGAGATGTTGCTTTTCAAC
TCAAGCAAAAAAACATCACTACCGATTTTAGAGTTTCCACTGACAATACCGCTTTGATCA
CTGCTACGGTTGATGAGGCTACACCTGGATTGAAGTCCATCTTCAGCTTCAGGGCCCCTG
ACCAGAACTCCGGCAAGATTGAGCTTCAGTACTTGCATGAATATGCCGGTATCAGCACCA
GCATGGGCTTGACTCAAAACCCCACTGTCAACTTCTCTGGTGTTATGGGTACCAATGTGT
TTGCCCTTGGTACCGATGTTTCCTTCGACACCAAATCAGGCAGTTTCACCAAGATCAATG
CTGGAGTTAACTTCATCAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACCCTGAACGACAAAGGAG
ATACTGTCAACGCTTCATTCTACCACCTTGTTAACCCGCTGTTCAACACCGCTGTTGGAG
CTGAAGTGAACCACAAGTTCTCCACCAATGTCAACACCATAACCGTGG*AACGCAGCATT
CGCTTGACCCTTG*ACCACTGTGAAG*CACGTGTGAACAGTGCCGGGATAGCCAATGCAC
TCATTCAGCACCAG

QA 4 797 4 797
DS 

RD RR2BG57JQ 823 0 0
TAGAGTTTCCACTGACAATACCGCTTTGATCACTGCTACGGTTGATGAGGCTACACCTGG
ATTGAAGTCCATCTTCAGCTTCAGGGCCCCTGACCAGAACTCCGGCAAGATTGAGCTTCA
GTACTTGCATGAATATGCCGGTATCAGCACCAGCATGGGCTTGACTCAAAACCCCACTGT
CAACTTCTCTGGTGTTATGGGTACCAATGTGTTTGCCCTTGGTACCGATGTTTCCTTCGA
CACCAAATCAGGCAGTTTCACCAAGATCAATGCTGGAGTTAACTTCATCAAGGATGATTT
AATTGCCTCCCTTACCCTGAACGACAAAGGAGATACTGTCAACGCTTCATTCTACCACCT
TGTTAACCCGCTGTTCAACACCGCTGTTGGAGCTGAAGTGAACCACAAGTTCTCCACCAA
TGTCAACACCATAACCGTGGGAACGCAGCATTCGCTTGACCCCTTGACCACTGTGAAGGC
ACGTGTGAACAGTGCCGGGATAGCCAATGCACTCATTCCGCACCAGTGGACACCCAAATC
CTTCTTCACCATCTCTGGAGAAGTTGACACTGAGGCTATTGACAAGAATGCTAAGGTTGG
TTTGGCCCTTTCTCTCAAGCCTTGAAAATGAGAGCCAACTGATGAATATCCAACCAAAGC
AAGTTTTTTCTGATGCGGTGTACTGCTTGGTTTGGTTGTTTTAATGGTTACTGCTCAAAT
ATTTTCCTCAGTTTCTTATCGGATTTGTAGAGCATAATAAATTTGGATTAATTGATCGTC
TGTCTTGGTGATACGATGAAACTCTAAAGATCCTTTTCCTT
CC

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR2FR74JQ 755 0 0
AAGTCCATCTTCAGCTTCAGGGCCC*TGACCAGAACTCCGGCAAGATTGAGCTTCAGTAC
TTGCATGAATATGCCGGTATCAGCACCAGCATGGGCTTGACTCAAAACCCCACTGTCAAC
TTCTCTGGTGTTATGGGTACCAATGTGTTTGCCCTTGGTACCGATGTTTCCTTCGACACC
AAATCAGGCAGTTTCACCAAGATCAATGCTGGAGTTAACTTCATCAAGGATGATTTAATT
GCCTCCCTTACCCTGAACGACAAAGGAGATACTGTCAACGCTTCATTCTACCACCTTGTT
AACCCGCTGTTCAACACCGCTGTTGGAGCTGAAGTGAACCACAAGTTCTCCACCAATGTC
AACACCATAACCGTGG*AACGCAGCATTCGCTTGACCCCTTGACCACTGTGAAGGCACGT
GTGAACAGTGCCGGGATAGCCAATGCACTCATTCAGCACCAGTGGACACCCAAATCCTTT
TTCACCATTTCTGGAGAAGTTGACACTAAGGCTATTGACAAGAATGCTAAGGTTGGTTTG
GCCCTTTCTCTCAAGCCTTGAAAATGAGAGCCAACTGATGAATATCCAACCAAAGCAAGT
TTTTTCTGATGCGGTGTACTGCTTGGTTTGGTTGTTTTAATGGTTACTGCTCAAATATTT
TCCTCAGTTTCTTATCGGATTTGTAGAGCATAATAAATTTGGATTAATTGATCGTCTGTC
TTGGTGATACGATGAAACTCTAAAGATCCTTTTCC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2EF69TF 729 0 0
G
AAGATTGAGCTTCAGTACTTGCATGAATATGCCGGTATCAGCACCAGCATGGGCTTGACT
CAAAACCCCACTGTCAACTTCTCTGGTGTTATGGGTACCAATGTGTTTGCCCTTGGTACC
GATGTTTCCTTCGACACCAAATCAGGCAGTTTCACCAAGATCAATGCTGGAGTTAACTTC
ATCAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACCCTGAACGACAAAGGAGATACTGTCAACGCT
TCATTCTACCACCTTGTTAACCCGCTGTTCAACACCGCTGTTGGAGCTGAAGTGAGCCAC
AAGTTCTCCACCAATGTCAACACCATAACCGTGGGAACGCAGCATTCGCTTGACCCCTTG
ACCACTGTGAAGGCACGTGTGAACAGTGCCGGGATAGCCAATGCACTCATTCAGCACCAG
TGGACACCCAAATCCTTCTTCACCATCTCTGGAGAAGTTGACACTAAGGCTATTGACAAG
AATGCTAAGGTTGGTTTGGCCCTTTCTCTCAAGCCTTGGAAATGAGAGCCAACTGATGAA
TATCCAACCAAAGCAAGTTTTTTCTGATGCGGTGTACTGCTTGGTTTGGTTGTTTTAATG
GTTACTGCTCAAATATTTTCCTCAGTTTCTTATCGGATTTGTAGAGCATAATAAATTTGG
ATTAATTGATCGTCTGTCTTGGTGATACGATGAAACTCTAAAGATCCTTTTCCTTTCCCA
AAAAAAAA

QA 2 729 2 729
DS 

RD RR2EF69JQ 585 0 0
CACCAAATCAGGCAGTTTCACCAAGATCAATGCTGGAGTTAACTTCATCAAGGATGATTT
AATTGCCTCCCTTACCCTGAACGACAAAGGAGATACTGTCAACGCTTCATTCTACCACCT
TGTTAACCCGCTGTTCAACACCGCTGTTGGAGCTGAAGTGAGCCACAAGTTCTCCACCAA
TGTCAACACCATAACCGTGGGAACGCAGCATTCGCTTGACCCCTTGACCACTGTGAAGGC
ACGTGTGAACAGTGCCGGGATAGCCAATGCACTCATTCAGCACCAGTGGACACCCAAATC
CTTCTTCACCATCTCTGGAGAAGTTGACACTAAGGCTATTGACAAGAATGCTAAGGTTGG
TTTGGCCCTTTCTCTCAAGCCTTGGAAATGAGAGCCAACTGATGAATATCCAACCAAAGC
AAGTTTTTTCTGATGCGGTGTACTGCTTGGTTTGGTTGTTTTAATGGTTACTGCTCAAAT
ATTTTCCTCAGTTTCTTATCGGATTTGTAGAGCATAATAAATTTGGATTAATTGATCGTC
TGTCTTGGTGATACGATGAAACTCTAAAGATCCTTTTCCTT
TCCC

QA 1 581 1 581
DS 



CO CL200Contig2 1094 4 11 U
ACTCAAAAGGATCTTTAGTGTTTCATCATGTCAACAAGACAGACGGATCTTTTACAACCT
TCTTATTCTCTACAAATCCGACAAGAAAAAGGGGGAAAGTTTTAAGCAGTAGCCATTAAA
ACCCAACAAACCAAGCAGAGGAAACACAACCCAAGTCTAAAAAAAAACTATTTTAAATGC
TTTGATTTGTTTGGCTCATCAGTTTCAAGGCCTGAGAGAGAGAGCCAAACCAACCTTAGC
ATTCTTGTCAATAGCTTTGGTGTCAACTTCTCCAGAGATAGTGAAGAAGGATCCGGGTGT
CCACTGGTGTTGAATGAGAGCATTGGCTAACCCGGCACTGTTCACACGTGCCTTAACCAT
GGTCAAAGGGTCGAGTGAATGCTGAGTTCCCACTGTGATGGTGTTGGCCTTGCTAGAGAA
CTTGTGACTCACTTCGGCTCCAACAGCAGTGTTGAACAGCGGGTTAACAATGTGGTAGTA
TGAAGCGTTGACACAATCTCCTTTGCCATTCAGGGTAAGGGAGGCAATTAAATCATCCTT
GGTGAAGTTTAAACCAGCATTGATCTTGGTGAAATTGCCGGATTTGGTGTCGAAGGAAAC
ATCAGTACCAGCAGCTAACAGATTGGTTCCAATAACACCAGAGAAGTTGACAGTGGGGTT
CTGAGTCAATCCCATGCTGGTGCTGATACCAGCGTAGTCATGCAAGTACTGAAGCTCGAT
CTTGCCGGAATTTTGGTCAGGGGCCCTGAAGCTGAAGATAGACTTGAGTCCAGGTGCAGC
CTCATCAACCGTAGCAGTGATCAAAACGGTATTGTCAGTGGAAACTCTAAAATCAGTTGT
GATGTTCTTTTGCTTCAAAAGAAAAGCGACATCTCCCAAAAGGAGGTCACCTTTCTTAGT
TCCAGTTGAAGTGATGGCAACACCGGCTGGAGAGAGAGTGGTGATACTCAATTTGTGGTC
GCTGTTGTGGTCCTTGTACAGCAGATCTCTGACTTTTTTGCCGATGTCAGTGTAGAGACC
TGGACCTTTCACCATTTTTGCTTCGCTTCCTTATACAAAGAGCAAAAGATACCGAGAGAG
GGCAGAGAGAATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H441JQB U 1
AF RR2H441TF C 1
AF RR2GX60JQ U 38
AF RR2GX60TF C 436
BS 1 215 RR2H441JQB
BS 216 216 RR2GX60JQ
BS 217 276 RR2H441JQB
BS 277 277 RR2GX60JQ
BS 278 317 RR2H441JQB
BS 318 318 RR2GX60JQ
BS 319 505 RR2H441JQB
BS 506 506 RR2GX60JQ
BS 507 554 RR2H441JQB
BS 555 591 RR2GX60JQ
BS 592 1094 RR2GX60TF

RD RR2H441JQB 554 0 0
ACTCAAAAGGATCTTTAGTGTTTCATCATGTCAACAAGACAGACGGATCTTTTACAACCT
TCTTATTCTCTACAAATCCGACAAGAAAAAGGGGGAAAGTTTTAAGCAGTAGCCATTAAA
ACCCAACAAACCAAGCAGAGGAAACACAACCCAAGTCTAAAAAAAAACTATTTTAAATGC
TTTGATTTGTTTGGCTCATCAGTTTCAAGGCCTGAAAGAGAGAGCCAAACCAACCTTAGC
ATTCTTGTCAATAGCTTTGGTGTCAACTTCTCCAGAAATAGTGAAGAAGGATCCGGGTGT
CCACTGGTGTTGAATGAAAGCATTGGCTAACCCGGCACTGTTCACACGTGCCTTAACCAT
GGTCAAAGGGTCGAGTGAATGCTGAGTTCCCACTGTGATGGTGTTGGCCTTGCTAGAGAA
CTTGTGACTCACTTCGGCTCCAACAGCAGTGTTGAACAGCGGGTTAACAATGTGGTAGTA
TGAAGCGTTGACACAATCTCCTTTGTCATTCAGGGTAAGGGAGGCAATTAAATCATCCTT
GGTGAAGTTTAAAC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2H441TF 572 0 0
ACTCAAAAGGATCTTTAGTGTTTCATCATGTCAACAAGACAGACGGATCTTTTACAACCT
TCTTATTCTCTACAAATCCGACAAGAAAAAGGGGGAAAGTTTTAAGCAGTAGCCATTAAA
ACCCAACAAACCAAGCAGAGGAAACACAACCCAAGTCTAAAAAAAAACTATTTTAAATGC
TTTGATTTGTTTGGCTCATCAGTTTCAAGGCCTGAGAGAGAGAGCCAAACCAACCTTAGC
ATTCTTGTCAATAGCTTTGGTGTCAACTTCTCCAGAGATAGTGAAGAAGGATCCGGGTGT
CCACTGGTGTTGAATGAGAGCATTGGCTAACCCGGCACTGTTCACACGTGCCTTAACCAT
GGTCAAAGGGTCGAGTGAATGCTGAGTTCCCACTGTGATGGTGTTGGCCTTGCTAGAGAA
CTTGTGACTCACTTCGGCTCCAACAGCAGTGTTGAACAGCGGGTTAACAATGTGGTAGTA
TGAAGCGTTGACACAATCTCCTTTGTCATTCAGGGTAAGGGAGGCAATTAAATCATCCTT
GGTGAAGTTTAAACCAGCATTGATCTTGGTG
C

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2GX60JQ 554 0 0
GACAGACGGATCTTTTACAACCTTCTTATTCTCTACAAATCCGACAAGAAAAAGGGGGAA
AGTTTTAAGCAGTAGCCATTAAAACCCAACAAACCAAGCAGAGGAAACACAACCCAAGTC
TAAAAAAAAACTATTTTAAATGCTTTGATTTGTTTGGCTCATCAGTTTCAAGGCCTGAGA
GAGAGAGCCAAACCAACCTTAGCATTCTTGTCAATAGCTTTGGTGTCAACTTCTCCAGAG
ATAGTGAAGAAGGATCCGGGTGTCCACTGGTGTTGAATGAGAGCATTGGCTATCCCGGCA
CTGTTCACACGTGCCTTAACCATGGTCAAAGGGTCGAGTGAATGCTGAGTTCCCACTGTG
ACGGTGTTGGCCTTGCTAGAGAACTTGTGGCTCACTTCGGCTCCAACAGCAGTGTTGAAC
AGCGGGTTAACAATGTGGTAGTATGAAGCGTTGACACAATCTCCTTTGCCATTCAGGGTA
AGGGAGGCAATTAAATCATCCTTGGTGAAGTTTAAACCAGCATTGATCTTGGTGAAATTG
CCGGATTTGGTGTC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2GX60TF 659 0 0
GGCTCCAACAGCAGTGTTGAACAGCGGGTTAACAATGTGGTAGTATGAAGCGTTGACACA
ATCTCCTTTGCCATTCAGGGTAAGGGAGGCAATTAAATCATCCTTGGTGAAGTTTAAACC
AGCATTGATCTTGGTGAAATTGCCGGATTTGGTGTCGAAGGAAACATCAGTACCAGCAGC
TAACAGATTGGTTCCAATAACACCAGAGAAGTTGACAGTGGGGTTCTGAGTCAATCCCAT
GCTGGTGCTGATACCAGCGTAGTCATGCAAGTACTGAAGCTCGATCTTGCCGGAATTTTG
GTCAGGGGCCCTGAAGCTGAAGATAGACTTGAGTCCAGGTGCAGCCTCATCAACCGTAGC
AGTGATCAAAACGGTATTGTCAGTGGAAACTCTAAAATCAGTTGTGATGTTCTTTTGCTT
CAAAAGAAAAGCGACATCTCCCAAAAGGAGGTCACCTTTCTTAGTTCCAGTTGAAGTGAT
GGCAACACCGGCTGGAGAGAGAGTGGTGATACTCAATTTGTGGTCGCTGTTGTGGTCCTT
GTACAGCAGATCTCTGACTTTTTTGCCGATGTCAGTGTAGAGACCTGGACCTTTCACCAT
TTTTGCTTCGCTTCCTTATACAAAGAGCAAAAGATACCGAGAGAGGGCAGAGAGAATCC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 3 15

CO CL201Contig1 1193 9 21 U
TTTTTGTAGACTAATTAACTTTGGAATAAAAATGGGTCTATTCCCCGGATTTGGTGGCTG
GATCAATCAGAATATTCAACAGCCCCTTCAGACGACGTCCAAGAGATCTAAGAATGGTAA
ATCTAGTTCAGTTTCAGAAGAAGATAGGTATATTGAGGGACCATGGTATTGGGATCCTGA
TTTAACCCCTAAAGAAAAGGCCGAATCCTTGGAATTAGACCATGTTAAATCTATGCCACT
GCGTGCTACCGATCCTAAGTACTATGACTCGAAAGAAGTGGCGAGGCAATACAACCTTTG
GAATTCTGAATTTAAAAAACATCCATGGAAAGATGCACCTGCTAAGGTGAAGGTGAAAAC
AAAAAACGGCATTTGCCATTTAAACATAGATTTCACATTGGGATCTCCTCCTCAAGCTGT
CTTCGAGTTGTTCACTGATCCAAGAAATATGGGATTTTTCCATTCAATGGGCAAGTACAA
GAACAATTGGCGCACACGTTTGGACACATTAGCAACAAAGGTTTTAAAGAAGGATGGACC
AAGGCAGATCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGAT
TATCCCAATACATCTAATCATCGATGAAAACCATCAAAAAGTTACAGCAACATATAAGAA
AGTGAAAGTGATGCACATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAATAGAGCCACTGTACGT
AGATCAGAAACGGTTGTGCAAATCTAGGTCACCGATTAGTGAAGAAGAGTACAAAAAATG
TAGCGGCAGTAAGGGAAGGATTGGGTCAAAGGTGACAATGGAGCATATATTTCAGCCATC
TTCGCTTCTTAATGTGCCACCGGTTTCTTGGTTCATCCGTGGTATCGCCGTCAAAGTCAC
CAAGGCTTTGCTCCAAGATCTTAGAGAACATGTAATCACCATGAACAAAATGGAGACGGT
AGACCCGCTGGTGTATGCTAAAGTAGTAGAAGAAGTCAAAAAAAAAATGGAAGCCGAAAA
AGAATCTGAACTAAAAGAATCGGAGTATTAAATGTTTGGACTATCTCCAATGATAATAAT
CAATATATAGCCATCCAACTCACTAAAAATAATAGACCAATCAGAATACAATTTAGTTAA
GGGATAATTTGTCAATTTGAAAAGAAAATTAAGTGCAGAACATTGATTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 20 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN50TF U 6
AF RR2BO71TF U 1
AF RR2FV02TF U 1
AF RR2D296TF U 21
AF RR2AL24TF U 69
AF RR2H765JQB C 466
AF RR2AN50JQ C 348
AF RR2AL24JQ C 460
AF RR2C870JQ C 493
BS 1 101 RR2BO71TF
BS 102 102 RR2AN50TF
BS 103 639 RR2BO71TF
BS 640 640 RR2FV02TF
BS 641 682 RR2BO71TF
BS 683 734 RR2FV02TF
BS 735 735 RR2D296TF
BS 736 747 RR2FV02TF
BS 748 772 RR2AL24TF
BS 773 835 RR2AN50JQ
BS 836 836 RR2H765JQB
BS 837 839 RR2AN50JQ
BS 840 840 RR2AL24JQ
BS 841 919 RR2AN50JQ
BS 920 920 RR2AL24JQ
BS 921 1009 RR2AN50JQ
BS 1010 1010 RR2H765JQB
BS 1011 1025 RR2AN50JQ
BS 1026 1026 RR2AL24JQ
BS 1027 1159 RR2AN50JQ
BS 1160 1193 RR2AL24JQ

RD RR2AN50TF 277 0 0
GTAGACTAATTAACTTTGGAATAAAAATGGGTCTATTCCCCGGATTTGGTGGCTGGATCA
ATCAGAATATTCAACAGCCCCTTCAGACGACGTCCAAGAGATCTAAGAATGGTAAATCTA
GTTCAGTTTCAGAAGAAGATAGGTATATTGAGGGACCATGGTATTGGGATCCTGATTTAA
CCCCTAAAGAAAAGGCCGAATCCTTGGAATTAGACCATGTTAAATCTATGCCACTGCGCG
CTACCGATCCTAAGTACTATGACTCGAAAGAAGTGGC

QA 1 277 1 277
DS 

RD RR2BO71TF 682 0 0
TTTTTGTAGACTAATTAACTTTGGAATAAAAATGGGTCTATTCCCCGGATTTGGTGGCTG
GATCAATCAGAATATTCAACAGCCCCTTCAGACGACGTCCAGGAGATCTAAGAATGGTAA
ATCTAGTTCAGTTTCAGAAGAAGATAGGTATATTGAGGGACCATGGTATTGGGATCCTGA
TTTAACCCCTAAAGAAAAGGCCGAATCCTTGGAATTAGACCATGTTAAATCTATGCCACT
GCGTGCTACCGATCCTAAGTACTATGACTCGAAAGAAGTGGCGAGGCAATACAACCTTTG
GAATTCTGAATTTAAAAAACATCCATGGAAAGATGCACCTGCTAAGGTGAAGGTGAAAAC
AAAAAACGGCATTTGCCATTTAAACATAGATTTCACATTGGGATCTCCTCCTCAAGCTGT
CTTCGAGTTGTTCACTGATCCAAGAAATATGGGATTTTTCCATTCAATGGGCAAGTACAA
GAACAATTGGCGCACACGTTTGGACACATTAGCAACAAAGGTTTTAAAGAAGGATGGACC
AAGGCAGATCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGAT
TATCCCAATACATCTAATCATCGATGAAAACCATCAAAA*GTTACAGCAACATATAAGAA
AGTGAAAGTGATGCACATGAAA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2FV02TF 747 0 0
TTTTT
GTAGACTAATTAACTTTGGAATAAAAATGGGTCTATTCCCCGGATTTGGTGGCTAGATCA
ATCAGAATATTCAACAGCCCCTTCAGACGACGTCCAAGAGATCTAAGAATGGTAAATCTA
GTTCAGTTTCAGAAGAAGATAGGTATATTGAGGGACCATGGTATTGGGATCCTGATTTAA
CCCCTAAAGAAAAGGCCGAATCCTTGGAATTAGACCATGTTAAATCTATGCCACTGCGTG
CTACCGATCCTAAGTACTATGACTCGAAAGAAGTGGCGAGGCAATACAACCTTTGGAATT
CTGATTTTAAAAAACATCCATGGAAAGATGTACCTGCTAAGGTGAAGGTGAAAACAAAAA
ACGGCATTTGCCATTTAAACATAGATTTCACATTGGGATCTCCTCCTCAAGCTGTCTTCG
AGTTGTTCACTGATCCAAGAAATATGGGATTTTTCCATTCAATGGGCAAGTACAAGAACA
ATTGGCGCACACGTTTGGACACATTAGCAACAAAGGTTTTAAAGAAGGATGGACCAAGGC
AGATCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGATTATCC
CAATACATCTAATCATCGATGAAAACCATCAAAAAGTTACAGCAACATATAAGAAAGTGA
AAGTGATGCACATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAATAGAGCCACTGTACGTAGATC
AGAAACGGT*GTGCAAATCTAG

QA 6 747 6 747
DS 

RD RR2D296TF 724 0 0
GG
GGAATAAAAATGGGTCTATTCCCCGGATTTGGTGGCTGGATCAATCAGAATATTCAACAG
CCCCTTCAGACGACGTCCAAGAGATCTAAGAATGGTAAATCTAGTTCAGTTTCAGAAGAA
GATAGGTATATTGAGGGACCATGGTATTGGGATCCTGATTTAACCCCTAAAGAAAAGGCC
GAATCCTTGGAATTAGACCATGTTAAATCTATGCCACTGCGTGCTACCGATCCTAAGTAC
TATGACTCGAAAGAAGTGGCGAGGCAATACAACCTTTGGAATTCTGAATTTAAAAAACAT
CCATGGAAAGATGCACCTGCTAAGGTGAAGGTGAAAACAAAAAACGGCATTTGCCATTTA
AACATAGATTTCACATTGGGATCTCCTCCTCAAGCTGTCTTCGAGTTGTTCACTGATCCG
AGAAATATGGGATTTTTCCATTCAATGGGCAAGTACAAGAACAATTGGCGCACACGTTTG
GACACATTAGCAACAAAGGTTTTAAAGAAGGATGGACCAAGGCAGATCACGGAAGTGGAA
AAGGTTTTGAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGATTATCCCAATACATCTAATCATC
GATGAAAACCATCAAAAAGTTACAGCAACATATAAGAAAGTGAAAGTGATGCACATGAAA
GTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAATAGAGCCACTGTACGTAGATCAGAAACGGTTGTGCAAA
TC

QA 3 724 3 724
DS 

RD RR2AL24TF 704 0 0
G
GAATATTCAACAGCCCCTTCAGACGACGTCCAAGAGATCTAAGAATGGTAAATCTAGTTC
AGTTTCAGAAGAAGATAGGTATATTGAGGGACCATGGTATTGGGATCCTGATTTAACCCC
TAAAGAAAAGGCCGAATCCTTGGAATTAGACCATGTTAAATCTATGCCACTGCGTGCTAC
CGATCCTAAGTACTATGACTCGAAAGAAGTGGCGAGGCAATACAACCTTTGGAATTCTGA
ATTTAAAAAACATCCATGGAAAGATGCACCTGCTAAGGTGAAGGTGAAAACAAAAAACGG
CATTTGCCATTTAAACATAGATTTCACATTGGGATCTCCTCCTCAAGCTGTCTTCGAGTT
GTTCACTGATCCAAGAAATATGGGATTTTTCCATTCAATGGGCAAGCACAAGAACAATTG
GCGCACACGTTTGGACACATTAGCAACAAAGGTTTTAAAGAAGGATGGACCAAGGCAGAT
CACGGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGATTATCCCAAT
ACATCTAATCATCGATGAAAACCATCAAAAAGTTACAGCAACATATAAGAAAGTGAAAGT
GATGCACATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAATAGAGCCACTGTACGTAGATCAGAA
ACGGTTGTGCAAATCTAGGTCACCGATTAGTGAAGAAGAGTAC

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR2H765JQB 639 0 0
AATGGGCAAGTACAAGAACAATTGGCGCACACGTTTGGACACATTAGCAACAAAGATTTT
AAAGAAGGATGGACCAAGGCAGATCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAAGATACT
TGGGTATAATGGGATTATCCCAATACATCTAATCATCGATGAAAACCATCAAAAAGTTAC
AGCAACATATAAGAAAGTGAAAGTGATGCACATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAAT
AGAGCCACTGTACGTAGATCAGAAACGGTTGTGCAAATCTAGGTCACCGATTAGTGAAGA
AGAGTACAAAAAATGTAGCGGCAGCAAGGGAAGGATTGGGTCAAAGGTGACAATGGAGCA
TATATTTCAGCCATTTTCGCTTCTTAATGTGCCACCGGTTTCTTGGTTCATCCGTGGTAT
CGCCGTCAAAGTCACCAAGGCTTTGCTCCAAGATTTTAGAGAACATGTAATCACCATGAA
CAAAATGGAGACGGTAGACCCGCTGGTGTATGCTAAAGTAGTAGAAGAAGTCAAAAAAAA
AATGGAAGCCGAAAAAGAATTTGAACTAAAAGAATCGGAGTATTAAATGTTTGGACTATC
TCCAATGATAATAATCAATATATAGCCATCCAACTCACT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2AN50JQ 812 0 0
TGAAGGTGAAAACAAAAAACGGCATTTGCCATTTAAACATAGATTTCACATTGGGATCTC
CTCCTCAAGCTGTCTTCGAGTTGTTCACTGATCCAAGAAATATGGGATTTTTCCATTCAA
TGGGCAAGTACAAGAACAATTGGCGCACACGTTTGGACACATTAGCAACAAAGGTTTTAA
AGAAGGATGGACCAAGGCAGATCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAAGATACTTG
GGTATAATGGGATTATCCCAATACATCTAATCATCGATGAAAACCATCAAAAAGTTACAG
CAACATATAAGAAAGTGAAAGTGATGCACATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAATAG
AGCCACTGTACGTAGATCAGAAACGGTTGTGCAAATTTAGGTCACCGATTAGTGAAGAAG
AGTACAAAAAATGTAGCGGCAGTAAGGGAAGGATTGGGTCAAAGGTGACAATGGAGCATA
TATTTCAGTCATTTTCGCTTCTTAATGTGCCACCGGTTTCTTGGTTCATCCGTGGTATCG
CCGTCAAAGTCACCAAGGCTTTGCTCCAAGATTTTAGAGAACATGTAATCACCATGAACA
AAATGGAGACGGTAGACCCGCTGGTGTATGCTAAAGTAGTAGAAGAAGTCAAAAAAAAAA
TGTAAGCCGAAAAAGAATTTGAACTAAAAGAATCGGAGTATTAAATGTTTGGACTATCTC
CAATGATAATAATCAATATATAGCCATCCAACTCACTAAAAATAATAGACCAATCAGAAT
ACAATTTAGTTAAGGGATAATTTGTCAATTTG

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR2AL24JQ 734 0 0
CCATTCAATGGGCAAGCACAAGAACAATTGGCGCACACGTTTGGACACATTAGCAACAAA
GGTTTTAAAGAAGGATGGACCAAGGCAGATCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAA
GATACTTGGGTATAATGGGATTATCCCAATACATCTAATCATCGATGAAAACCATCAAAA
AGTTACAGCAACATATAAGAAAGTGAAAGTGATGCACATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTG
GAAAATAGAGCCACTGTACGTAGATCAGAAACGGTTGTGCAAATTTAGGTCACCGATTAG
TGAAGAAGAGTACAAAAAATGTAGCGGCAGTAAGGGAAGGATTGGGTCAAAGGTGACAAT
GGAGCATATATTTCAGCCATCTTCGCTTCTTAATGTGCCACCGGTTTCTTGGTTCATCCG
TGGTATCGCCGTCAAAGTCACCAAGGCTTTGCTCCAAGATCTTAGAGAACATGTAATCAC
CATGAACAAAATGGAGACGGTAGACCCGCTGGTGTATGCTAAAGTAGTAGAAGAAGTCAA
AAAAAAA*TGGAAGCCGAAAAAGAATCTGAACTAAAAGAATCGGAGTATTAAATGTTTGG
ACTATCTCCAATGATAATAATCAATATATAGCCATCCAACTCACTAAAAATAATAGACCA
ATCAGAATACAATTTAGTTAAGGGATAATTTGTCAATTTGAAAAGAAAATTAAGTGCAGA
ACATTGATTTTGAC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2C870JQ 671 0 0
CACACGTTTGGACACATTAGCAACAAAGATTTTAAAGAAGGATGGACCAAGGCAGATCAC
GGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGATTATCCCAATACA
TCTAATCATCGATGAAAACCATCAAAAAGTTACAGCAACATATAAGAAAGTGAAAGTGAT
GCACATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAATAGAGCCACTGTACGTAGATCAGAAACG
GTTGTGCAAATCTAGGTCACCGATTAGTGAAGAAGAGTACAAAAAATGTAGCGGCAGTAA
GGGAAGGATTGGGTCAAAGGTGACAATGGAGCATATATTTCAGCCATCTTCGCTTCTTAA
TGTGCCACCGGTTTCTTGGTTCATCCGTGGTATCGCCGTCAAAGTCACCAAGGCTTTGCT
CCAAGATCTTAGAGAACATGTAATCACCATGAACAAAATGGAGACGGTAGACCCGCTGGT
GTATGCTAAAGTAGTAGAAGAAGTCAAAAAAAAAATGGAAGCCGAAAAAGAATCTGAACT
AAAAGAATCGGAGTATTAAATGTTTGGACTATCTCCAATGATAATAATCAATATATAGCC
ATCCAACTCACTAAAAATAATAGACCAATCAGAATACAATTTAGTTAAGGGATAATTTGT
CAATTTG
AAAA

QA 1 667 1 667
DS 



CO CL201Contig2 1346 4 9 U
GGGATGCAGATACTTTAACTAACATTACACAAATTATAAAATATAAATCTATAGATCGAA
AAAAAAGGAAAAAAAACTATAGATCGTTATTTACTCTTGCTCTCATCTGATAAGCGTTGG
TTTTTGTAGACTAACTTTGGAATAGAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTGGCTGGATC
AATCAGAATATTCAACAATCCCTCAAGGCGTCCACCAAGAGATCTGAGAAGGGTAAATCT
AGTTCAGTTTCAGAAGAAGAGAGGTATCTTCAGGGACCATGGTATTGGAATCCTGCTTTA
AGCCCTAAAGAGAAGGCCGAATCCATGGAACTAGACCATGTTAAATCTATGCCAATGTTT
GCTTCCGATCCTAAGTACTATGACCTGGATGAACGGGTGAGGCAAGCAGGACTTTGGATG
TCCGAAAATAAAAAACATCCGTGGCACGATGAAGCTGCTAAGGTGAAGGCGAAAACAAAA
AATGGCATTTGCCATTTAAACATATATTTCACATTGGGACGGCCTCCTCAATCAGTCTAT
GAGATGTTCACTGATCCAAGAAACGTGGGATTCTTCCATTCAGTGGGCAAGTACAAGAAC
CATTGGCGCACACGTTTGGACACAATAGCAACAAAGGTTTTAAAGAAGGATGGACCAAGG
CAGATCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGACTATC
CCAATACATTTAATCATCGATGAAAACCATCAGAAAGTTACCGCAACATATAAGAAAGTG
AAAGTGAAGCACATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAATGGAGCCACTGTACGTAGAT
CAGGAACGGTTGTGCAAGTCTAGGTCGCGTATTAGTGAAGATGAGTACAAGAAATGTAGC
GGCGGTAAAGGAAGGATTGGGTCAAAGGTGACAATGGAGCATATATTTCAACCCTCTTCT
CTTCTTAATGTGCCACCGATTTCTTGGTTCATCCGTGGTATCGCCGTCAAAGTCACCAAG
ACTTTGATCCAAGATCTTAGAGAACATGTAATCATGATGAACAAATTGGAGGTCTTGGAT
CCAGCTGACGGTAAATAAACAAAAAGAATCAAGTATTAAATGTTTGGATTATATTGAGTG
CGGATCAATATCTAGCAATTCTCGTCACTAAAGACAATCCACCAATCAGTACACAGTTTA
TGTAAATGCAATCTGGATTATATTGAGTGAGGATCAATATCTAGCCATCCATGTCACTTA
TGTCACTAAAGATAATAGACCAAACATAATACAGTTTATGTAAATGCTATTTTCTAATTA
AATAATAAATTATTTATTAGTTTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2E960TF U 1
AF RR2B007TF U 43
AF RR2B007JQ C 529
AF RR2E960JQ C 642
BS 1 369 RR2E960TF
BS 370 370 RR2B007TF
BS 371 491 RR2E960TF
BS 492 492 RR2B007TF
BS 493 572 RR2E960TF
BS 573 573 RR2B007TF
BS 574 613 RR2E960TF
BS 614 887 RR2B007TF
BS 888 1346 RR2B007JQ

RD RR2E960TF 613 0 0
GGGATGCAGATACTTTAACTAACATTACACAAATTATAAAATATAAATCTATAGATCGAA
AAAAAAGGAAAAAAAACTATAGATCGTTATTTACTCTTGCTCTCATCTGATAAGCGTTGG
TTTTTGTAGACTAACTTTGGAATAGAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTGGCTGGATC
AATCAGAATATTCAACAATCCCTCAAGGCGTCCACCAAGAGATCTGAGAAGGGTAAATCT
AGTTCAGTTTCAGAAGAAGAGAGGTATCTTCAGGGACCATGGTATTGGAATCCTGCTTTA
AGCCCTAAAGAGAAGGCCGAATCCATGGAACTAGACCATGTTAAATCTATGCCAATGTTT
GCTTCCGATTCTAAGTACTATGACCTGGATGAACGGGTGAGGCAAGCAGGACTTTGGATG
TCCGAAAATAAAAAACATCCGTGGCACGATGAAGCTGCTAAGGTGAAGGCGAAAACAAAA
AATGGCATTTGTCATTTAAACATATATTTCACATTGGGACGGCCTCCTCAATCAGTCTAT
GAGATGTTCACTGATCCAAGAAACGTGGGATTTTTCCATTCAGTGGGCAAGTACAAGAAC
CATTGGCGCACAC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2B007TF 845 0 0
GGAG
ATCTATAGATCGAAAAAAAAGGAAAAAAAACTATAGATCGTTATTTACTCTTGCTCTCAT
CTGATAAGCGTTGGTTTTTGTAGACTAACTTTGGAATAGAAATGGGTATATTCCCTGGAT
TTGGTGGCTGGATCAATCAGAATATTCAACAATCCCTCAAGGCGTCCACCAAGAGATCTG
AGAAGGGTAAATCTAGTTCAGTTTCAGAAGAAGAGAGGTATCTTCAGGGACCATGGTATT
GGAATCCTGCTTTAAGCCCTAAAGAGAAGGCCGAATCCATGGAACTAGACCATGTTAAAT
CTATGCCAATGTTTGCTTCCGATCCTAAGTACTATGACCTGGATGAACGGGTGAGGCAAG
CAGGACTTTGGATGTCTGAAAATAAAAAACATCCGTGGCACGATGAAGCTGCTAAGGTGA
AGGCGAAAACAAAAAATGGCATTTGCCATTTAAACATATATTTCACATTGGGACGGCCTC
CTCAATCAGTCTATGAGATGTTCACTGATCCAAGAAACGTGGGATTCTTCCATTCAGTGG
GCAAGTACAAGAACCATTGGCGCACACGTTTGGACACAATAGCAACAAAGGTTTTAAAGA
AGGATGGACCAAGGCAGATCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAAGATACTTGGGT
ATAATGGGACTATCCCAATACATTTAATCATCGATGAAAACCATCAGAAAGTTACCGCAA
CATATAAGAAAGTGAAAGTGAAGCACATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAATGGAGC
CACTGTACGTAGATCAGGAACGGTTGTGCAAGTCTAGGTCGCGTATTAGTGAAGATGAGT
A

QA 5 845 5 845
DS 

RD RR2B007JQ 818 0 0
CAATCAGTCTATGAGA
TGTTCACTGATCCAAGAAACGTGGGATTCTTCCATTCAGTGGGCAAGTACAAGAACCATT
GGCGCACACGTTTGGACACAATAGCAACAAAGGTTTTAAAGAAGGATGGACCAAGGCAGA
TCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGACTATCCCAA
TACATTTAATCATCGATGAAAACCATCAGAAAGTTACCGCAACATATAAGAAAGTGAAAG
TGAAGCACATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAATGGAGCCACTGTACGTAGATCAGG
AACGGTTGTGCAAGTCTAGGTCGCGTATTAGTGAAGATGAGTACAAGAAATGTAGCGGCG
GTAAAGGAAGGATTGGGTCAAAGGTGACAATGGAGCATATATTTCAACCCTCTTCTCTTC
TTAATGTGCCACCGATTTCTTGGTTCATCCGTGGTATCGCCGTCAAAGTCACCAAGACTT
TGATCCAAGATCTTAGAGAACATGTAATCATGATGAACAAATTGGAGGTCTTGGATCCAG
CTGACGGTAAATAAACAAAAAGAATCAAGTATTAAATGTTTGGATTATATTGAGTGCGGA
TCAATATCTAGCAATTCTCGTCACTAAAGACAATCCACCAATCAGTACACAGTTTATGTA
AATGCAATCTGGATTATATTGAGTGAGGATCAATATCTAGCCATCCATGTCACTTATGTC
ACTAAAGATAATAGACCAAACATAATACAGTTTATGTAAATGCTATTTTCTAATTAAATA
ATAAATTATTTATTAGTTTAAT

QA 17 818 17 818
DS 

RD RR2E960JQ 702 0 0
AAAGAAGGATGGACCAAGGCAGATCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAAGATACT
TGGGTATAATGGGACTATCCCAATACATTTAATCATCGATGAAAACCATCAGAAAGTTAC
CGCAACATATAAGAAAGTGAAAGTGAAGCACATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTGGAAAAT
GGAGCCACTGTACGTAGATCAGGAACGGTTGTGCAAGTCTAGGTCGCGTATTAGTGAAGA
TGAGTACAAGAAATGTAGCGGCGGTAAAGGAAGGATTGGGTCAAAGGTGACAATGGAGCA
TATATTTCAACCCTCTTTTCTTCTTAATGTGCCACCGATTTCTTGGTTCATCCGTGGTAT
CGCCGTCAAAGTCACCAAGACTTTGATCCAAGATCTTAGAGAACATGTAATCATGATGAA
CAAATTGGAGGTCTTGGATCCAGCTGACGGTAAATAAACAAAAAGAATCAAGTATTAAAT
GTTTGGATTATATTGAGTGCGGATCAATATCTAGCAATTCTCGTCACTAAAGACAATCCA
CCAATCAGTACACAGTTTATGTAAATGCAATCTGGATTATATTGAGTGAGGATCAATATC
TAGCCATCCATGTCACTTATGTCACTAAAGATAATAGACCAAACATAATACAGTTTATGT
AAATGCTATTTTCTAATTAAATAATAAATTATTTATTAGTT
C

QA 1 701 1 701
DS 



CO CL201Contig3 743 2 7 U
TTTTTGTAGACTAATTAACTTTGGAATAAAAATGGGTTTATTCCCCGGATTTGGTGGCTG
GATCAATCAGAATATTCAACAGCCCCTTAAGACGTCCAAGAGATCTAAGAATGGTAAATC
TAGTTCAGCTTCAGATGAAGATAGGTATATTCAGGGACCATGGTATTGGGATCCTGATTT
AACCCCTAAAGAAAAGGCCGAATCCTTGGAAATAGACCATGTTAGATCTATGCCACTGCT
TGCTACGGATCCTAAGTACTATGACCTGAAAGAACTGGCGAGGCAAAACGATCTTTGGAA
TTCTGAATATAAAAAACATCCATGGAACGATGCACCTGCTAAGGTGAAGGTGAAAACAAA
AAAACGGCATTTGCCATTTAAACATAGATTTCACATTGGGATCTCCTCCTCAAGCCGTCT
TCGAGTTGTTCACTGATCCAAGAAATATGGGATCTTTCCATTCAATGGGCAAGTACAAGA
ACAATTGGCGCACACGTTTGGACACATTAGCAACAAAGATTTTAAAGAAGGATGGACCAA
GGCAGATCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGATTA
TCCCAATACATCTAATCATCGATGAAAACCATCAAAAAGTTACAGCAACATATAAGAAAG
TGAAGTGATGCACATGAAGTGTTTGAGGTAGCTGGAAAAAGAGCCACTGTACGTAGATCA
GAAACGTTGTGCAATCTAGTCAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C870TF U 6
AF RR2H765TF U 1
BS 1 68 RR2H765TF
BS 69 69 RR2C870TF
BS 70 331 RR2H765TF
BS 332 332 RR2C870TF
BS 333 363 RR2H765TF
BS 364 364 RR2C870TF
BS 365 743 RR2H765TF

RD RR2C870TF 594 0 0
GTAGACTAATTAACTTTGGAATAAAAATGGGTTTATTCCCCGGATTTGGTGGCTGGATCA
ATCAGAATATTCAACAGCCCCTTAAGACGTCCAAGAGATCTAAGAATGGTAAATCTAGTT
CAGCTTCAGATGAAGATAGGTATATTCAGGGACCATGGTATTGGGATCCTGATTTAACCC
CTAAAGAAAAGGCCGAATCCTTGGAAATAGACCATGTTAGATCTATGCCACTGCTTGCTA
CGGATCCTAAGTACTATGACTTGAAAGAACTGGCGAGGCAAAACGATCTTTGGAATTCTG
AATATAAAAAACATCCATGGAACGATGCACCTGCTAAGGTGAAGGTGAAAACAAAAAAAC
GGCATTTGCCATTTAAACATAGATTTCACATTGGGATCTCCTCCTCAAGCCGTCTTCGAG
TTGTTCACTGATCCAAGAAATATGGGATCTTTCCATTCAATGGGCAAGTACAAGAACAAT
TGGCGCACACGTTTGGACACATTAGCAACAAAGATTTTAAAGAAGGATGGACCAAGGCAG
ATCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGATT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2H765TF 743 0 0
TTTTTGTAGACTAATTAACTTTGGAATAAAAATGGGTTTATTCCCCGGATTTGGTGGCTG
GATCAATCGGAATATTCAACAGCCCCTTAAGACGTCCAAGAGATCTAAGAATGGTAAATC
TAGTTCAGCTTCAGATGAAGATAGGTATATTCAGGGACCATGGTATTGGGATCCTGATTT
AACCCCTAAAGAAAAGGCCGAATCCTTGGAAATAGACCATGTTAGATCTATGCCACTGCT
TGCTACGGATCCTAAGTACTATGACCTGAAAGAACTGGCGAGGCAAAACGATCTTTGGAA
TTCTGAATATAAAAAACATCCATGGAACGATTCACCTGCTAAGGTGAAGGTGAAAACAAA
AAA*CGGCATTTGCCATTTAAACATAGATTTCACATTGGGATCTCCTCCTCAAGCCGTCT
TCGAGTTGTTCACTGATCCAAGAAATATGGGATCTTTCCATTCAATGGGCAAGTACAAGA
ACAATTGGCGCACACGTTTGGACACATTAGCAACAAAGATTTTAAAGAAGGATGGACCAA
GGCAGATCACGGAAGTGGAAAAGGTTTTGAGATGGAAGATACTTGGGTATAATGGGATTA
TCCCAATACATCTAATCATCGATGAAAACCATCAAAAAGTTACAGCAACATATAAGAAAG
TGAAGTGATGCACATGAAGTGTTTGAGGTAGCTGGAAAAAGAGCCACTGTACGTAGATCA
GAAACGTTGTGCAATCTAGTCAC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 2 14

CO CL202Contig1 1714 8 20 U
GGAAGCTTTTCAGTTGGTGTGTGCCCTCCATGGCTGTTCCACTCTCTATCTCAACAAATC
TTCCCATCTCCCGCCAATGTCACCGCCCCTGCTTCCCTTCCACTTCATTTAAGGGAAATG
TAAGCGTCTTAGGAGCAAACCCACGTCAGATTCTTTCTCTGAAACTCCACCACAAGCGTC
GAACGGGACCCCTTGTTGTGTTCAACCAAACATCGTCTTCTTCTCCTTCTTCTTCTCCAG
CAGCGTCAGAGAGGTTCCGTCTGGATAATTTGGGACCACAACCTGGTTCGAGGAAGAGGG
CGAAGAGGAAAGGTAGAGGTATCTCTGCAGGACAAGGAGCGAGCTGTGGTTTCGGGATGA
GAGGTCAGAAGTCACGATCTGGTCCTGGAATCATGAGAGGTTTTGAAGGTGGTCAAACCG
CTCTTTATCGCCGTCTTCCCAAACTTCGAGGAATCGCCGGAGGTATGCGTTCAGGATTGC
CCAAGTACGTACCAGTTAATCTCAAGGACATTGAAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATG
AAGTGTCACTGGAGACGTTGAAGCTAAAGGGTTTGATCAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGA
AACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACTGGAGAACTAAGCGTGAAGCTCAACTTCAAAGCTC
GTGCATTCTCAACATCAGCCAAAGAGAAGCTTGAAGCTTCAGGCTGTACACTCACAGTGC
TCCCCGGAAGAAAGAAATGGGTGAAGCCTTCAGTTGCAAAGAACCTTGCACGTGCAGACG
AATACTTTGCAAAGAAGAGAGCTGATGCAGCAGCAGCAGC******TTCAGAACCAGCTA
CTTCTGCTTAAACATGCTCATTTTTCAAGCTTTTCAATGTTGTAAAGGTTTTGTAAAATG
GTAAAAATTATTATTGAACATTTTGTTTCTCAATTAAAAAAAATAAGCTTTTTCTCAAAT
CTTCAACAAAATTTTACAGAATAGGTTTCATTATTACTACAAAGTTTCCACCATTTTCTT
TGCATAAACACCAAAGAGTCATCAAGGTTCTTCATCATCATCATCATCAGCGATGAAAGC
TCTTCTACGTACACGACGTCTAGAAGACTCTTGTTCATCAGAAGATTGATTGTTGTTCTC
TTCATCTCTATCTCTAGATGATGTTCCCGTATCACCTTCATAGCTCTCTCCCCAAAGCCT
TGAAGATCTTCTCCTCACACCTATATGAGACCTAGCTCTAGACGTCCCAGACCAGCTACT
ACTCCTTGATCCACCACCACTCGATTCTGGTCTAAACACACGGATGAGGAAGAACACCGT
AAGCCAACCACACATGTAAGGACGGCAACCTTTATCAAAGGAAGAGCAAATGAGAAGGAT
GCCGTTGTGAGGATGTTCCATACAGACAGGACAACGAGCTTCTTCCCATTCCTTAACTTG
CTTCTCACTAGGCTTCTTCAAAGCACGGCTTGACTCACAATACAAAGGCGATGATGATGC
TCTTAACCTTTCATGAGATACAGATCGGTCTTTCCTCTCTTTAGGCATAATAATTCTCAA
AAAAGAAACTGTCTTTTAAAACAGGAAGAGTCTAGAGCGTTGTGGCGATGGTCAAATCGA
TAGATAAATCGAACGAAACCCTTAAATCGGGCATCCCATCGAGAGAGAGAGAGCCAAGGA
GGTGAGACGATGAAGATGAGGCGGCTACTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 
40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 15 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GY84TF U 1
AF RR2CF89TF U 1
AF RR2ET42TF U 28
AF RR2ET42JQ C 97
AF RR2AS35JQ C 247
AF RR2GZ51JQ C 434
AF RR2AY27JQ U 893
AF RR2AY27TFB C 968
BS 1 87 RR2CF89TF
BS 88 88 RR2GY84TF
BS 89 440 RR2CF89TF
BS 441 441 RR2GY84TF
BS 442 499 RR2CF89TF
BS 500 500 RR2GY84TF
BS 501 685 RR2CF89TF
BS 686 759 RR2ET42TF
BS 760 760 RR2ET42JQ
BS 761 792 RR2ET42TF
BS 793 795 RR2ET42JQ
BS 796 842 RR2ET42TF
BS 843 843 RR2ET42JQ
BS 844 851 RR2ET42TF
BS 852 852 RR2ET42JQ
BS 853 864 RR2ET42TF
BS 865 887 RR2ET42JQ
BS 888 888 RR2AS35JQ
BS 889 892 RR2ET42JQ
BS 893 1714 RR2AY27JQ

RD RR2GY84TF 653 0 0
GGAAGCTTTTCAGT
TGGTGTGTGCCCTCCATGGCTGTTCCACTCTCTATCTCAACAAATCTTCCCATCTCCCGC
CAATGTCACCGCCCCTGCTTCCCTTCCACTTCATTTAAGGGAAATGTAAGCGTCTTAGGA
GCAAACCCACGTCAGATTCTTTCTCTGAAACTCCACCACAAGCGTCGAACGGGACCCCTT
GTTGTGTTCAACCAAACATCGTCTTCTTCTCCTTCTTCTTCTCCAGCAGCGTCAGAGAGG
TTCCGTCTGGATAATTTGGGACCACAACCTGGTTCGAGGAAGAGGGCGAAGAGGAAAGGT
AGAGGTATCTCTGCAGGACAAGGAGCGAGCTGTGGTTTCGGGATGAGAGGTCAGAAGTCA
CGATCTGGTCCTGGAATCATGAGAGGTTTTGAAGGTGGTCAAACCGCTCTTTATCGCCGT
CTTCCCAAACTTCGAGGAATCGCCGGAGGTATGCGTTCAGGATTGCCCAAGTACGTACCA
GTTAATCTCAAGGACATTGAAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTGGAG
ACGTTGAAGCTAAAGGGTTTGATCAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAG
ATTCTTGGTACTGGAGAACTAAGCGTGAAGCTCAACTTC

QA 15 653 15 653
DS 

RD RR2CF89TF 685 0 0
GGAAGCTTTTCAGTTGGTGTGTGCCCTCCATGGCTGTTCCACTCTCTATCTCAACAAATC
TTCCCATCTCCCGCCAATGTCACCGCCTCTGCTTCCCTTCCACTTCATTTAAGGGAAATG
TAAGCGTCTTAGGAGCAAACCCACGTCAGATTCTTTCTCTGAAACTCCACCACAAGCGTC
GAACGGGACCCCTTGTTGTGTTCAACCAAACATCGTCTTCTTCTCCTTCTTCTTCTCCAG
CAGCGTCAGAGAGGTTCCGTCTGGATAATTTGGGACCACAACCTGGTTCGAGGAAGAGGG
CGAAGAGGAAAGGTAGAGGTATCTCTGCAGGACAAGGAGCGAGCTGTGGTTTCGGGATGA
GAGGTCAGAAGTCACGATCTGGTCCTGGAATCATGAGAGGTTTTGAAGGTGGTCAAACCG
CTCTTTATCGCCGTCTTCCCGAACTTCGAGGAATCGCCGGAGGTATGCGTTCAGGATTGC
CCAAGTACGTACCAGTTAACCTCAAGGACATTGAAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATG
AAGTGTCACTGGAGACGTTGAAGCTAAAGGGTTTGATCAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGA
AACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACTGGAGAACTAAGCGTGAAGCTCAACTTCAAAGCTC
GTGCATTCTCAACATCAGCCAAAGA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2ET42TF 841 0 0
GG
ATGGCTGTTCCACTCTCTATCTCAACAAATCTTCCCATCTCCCGCCAATGTCACCGCCCC
TGCTTCCCTTCCACTTCATTTAAGGGAAATGTAAGCGTCTTAGGAGCAAACCCACGTCAG
ATTCTTTCTCTGAAACTCCACCACAAGCGTCGAACGGGACCCCTTGTTGTGTTCAACCAA
ACATCGTCTTCTTCTCCTTCTTCTTCTCCAGCAGCGTCAGAGAGGTTCCGTCTGGATAAT
TTGGGACCACAACCTGGTTCGAGGAAGAGGGCGAAGAGGAAAGGTATAGGTATCTCTGCA
GGACAAGGAGCGAGCTG**GTTTCGGGATGAGAGGTCAGAAGTCACGATCTGGTCCTGGA
ATCATGAGAGGTTTTGAAGGTGGTCAAACCGCTCTTTATCGCCGTCTTCCCAAACTTCGA
GGAATCGCCGGAGGTATGC*TTCAGGATTGCCCAAGTACGTACCAGTTAATCTCAAGGAC
ATTGAAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTGGAGACGTTGAAGCTAAAG
GGTTTGATCAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACTGGA
GAACTAAGCGTGAAGCTCAACTTCAAAGCTCGTGCATTCTCAACATCAGCCAAAGAGAAG
CTTGAAGCTTCAGGCTGTACACTCACAGTGCTCCCCGGAAGAAAGAAATGGGTGAAGCCT
TCAGTTGCAA*GAACCTTGCACGTGCAGACGAATACTTTGCAA**GAGAGAGCTGATGCA
GCAGCAGCAGC******TTCAGAACCAGCTACT*CTGCTTAA*CATGCTCATTTT
CAGC

QA 3 837 3 837
DS 

RD RR2ET42JQ 806 0 0
CTTCCACTTCATT*AAGGGAAATGTAAGCGTCTTAGGAGCAAACCCACGTCAGATTCTTT
CTCTGAAACTCCACCACAAGCGTCGAACGGGACCCCTTGTTGTGTTCAACCAAACATCGT
CTTCTTCTCCTTCTTCTTCTCCAGCAGCGTCAGAGAGGTTCCGTCTGGATAATTTGGGAC
CACAACCTGGTTCGAGGAAGAGGGCGAAGAGGAAAGGTATAGGTATCTCTGCAGGACAAG
GAGCGAGCTG**GTTTCGGGATGAGAGGTCAGAAGTCACGATCTGGTCCTGGAATCATGA
GAGGTTTTGAAGGTGGTCAAACCGCTCTTTATCGCCGTCTTCCCAAACTTCGAGGAATCG
CCGGAGGTATGC*TTCAGGATTGCCCAAGTACGTACCAGTTAATCTCAAGGACATTGAAA
CAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTGGAGACGTTGAAGCTAAAGGGTTTGA
TCAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACTGGAGAACTAA
GCGTGAAGCTCAACTTCAAAGCTCGTGCATTCTCAACATCAGCCAAAGAGAAGCTTGAAG
CTTCAGGCTGTACACTCACAGTGCTCCCCGGAAGAAAGAAATGGGTGAAGCCTTCAGTTG
CAAAGAACCTTGCACGTGCAGACGAATACTTTGCAAAGAAGAGAGCTGATGCAGCAGCAG
CAGC******TTCAGAACCAGCTACTTCTGCTTAAACATGCTCATTTTTCAAGCTTTTCA
ATGTTGTAAAGATTTTGTAAAATGGT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2AS35JQ 715 0 0
CAGAGAGGTTCCGTCTGGATAATCTGGGACCACAACCTGGGTCGAGGAAGAGGGCGAAGA
GGAAAGGTAGAGGTATCTCTGCAGGACAAGGAGCGAGCTGTGGTTTCGGGATGAGAGGTC
AGAAGTCACGATCTGGTCCTGGAATCATGAGAGGTTTTGAAGGTGGTCAAACCGCTCTTT
ATCGCCGTCTTCCCAAACTTCGAGGAATCGCCGGAGGTATGCGTTCAGGATTACCTAAGT
ACGTACCAGTTAATCTTAAAGACATTGAAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGT
CACTAGAGACTTTGAAGCTAAAGGGTTTGATCAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGAAACTCC
CTCTTAAGATTCTTGGTACTGGAGAACTAAGCGTGAAGCTCAACTTCAAAGCTCGTGCAT
TCTCAACATCAGCCAAAGAGAAGCTCGAAGCTTCAGGTTGTACACTCACAGTGCTGCCCG
GAAGAAAGAAATGGGTGAAGCCTTCAGTTGCAAAGAACCTTGCACGTGCTGATGAATACT
TTGCAAAGAAGAGAGCTGATGCAGCAGCAGCAGCAGCTTCTTCAGAACCAGCTACTTCTG
CTTAAACATGTTCATTTTTCAAGCTTTTCAATGTTGTAAAGGTTTTGTAAAATGGTAAAA
ATTATTATTGAACATTTTGTTTCTCAATTAAAAAAAATAAGCTTTTTC
TCAAACC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2GZ51JQ 523 0 0
TCTTCCCAAACTTCGAGGAATCGCCGGAGGTATGCGTTCAGGATTACCTAAGTACGTACC
AGTTAATCTTAAAGACATTGAAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTTTCACTAGA
GACTTTGAAGCTAAAGGGTTTGATCAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAA
GATTCTTGGTACTGGAGAACTAAGCGTGAAGCTCAACTTCAAAGCTCGTGCATTCTCAAC
ATCAGCCAAAGAGAAGCTCGAAGCTTCAGGTTGTACACTCACAGTGCTGCCCGGAAGAAA
GAAATGGGTGAAGCCTTCAGTTGCAAAGAACCTTGCACGTGCTGATGAATACTTTGCAAA
GAAGAGAGCTGATGCAGCAGCAGCAGCAGCTTCTTCAGAACCAGCTACTTCTGCTTAAAC
ATGTTCATTTTTCAAGCTTTTCAATGTTGTAAAGGTTTTGTAAAATGGTAAAAATTATTA
TTGAACATTTTGTTTCTCAATTAAAAAAA*TAAGCTTTTTC
CC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2AY27JQ 822 0 0
GTAAAATGGTAAAAATTATTATTGAACATTTTGTTTCTCAATTAAAAAAAATAAGCTTTT
TCTCAAATCTTCAACAAAATTTTACAGAATAGGTTTCATTATTACTACAAAGTTTCCACC
ATTTTCTTTGCATAAACACCAAAGAGTCATCAAGGTTCTTCATCATCATCATCATCAGCG
ATGAAAGCTCTTCTACGTACACGACGTCTAGAAGACTCTTGTTCATCAGAAGATTGATTG
TTGTTCTCTTCATCTCTATCTCTAGATGATGTTCCCGTATCACCTTCATAGCTCTCTCCC
CAAAGCCTTGAAGATCTTCTCCTCACACCTATATGAGACCTAGCTCTAGACGTCCCAGAC
CAGCTACTACTCCTTGATCCACCACCACTCGATTCTGGTCTAAACACACGGATGAGGAAG
AACACCGTAAGCCAACCACACATGTAAGGACGGCAACCTTTATCAAAGGAAGAGCAAATG
AGAAGGATGCCGTTGTGAGGATGTTCCATACAGACAGGACAACGAGCTTCTTCCCATTCC
TTAACTTGCTTCTCACTAGGCTTCTTCAAAGCACGGCTTGACTCACAATACAAAGGCGAT
GATGATGCTCTTAACCTTTCATGAGATACAGATCGGTCTTTCCTCTCTTTAGGCATAATA
ATTCTCAAAAAAGAAACTGTCTTTTAAAACAGGAAGAGTCTAGAGCGTTGTGGCGATGGT
CAAATCGATAGATAAATCGAACGAAACCCTTAAATCGGGCATCCCATCGAGAGAGAGAGA
GCCAAGGAGGTGAGACGATGAAGATGAGGCGGCTACTTTTCC

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR2AY27TFB 747 0 0
AAAATTTTACAGAATAGGTTTCATTATTACTACAAAGTTTCCACCATTTTCTTTGCATAA
ACACCAAAGAGTCATCAAGGTTCTTCATCATCATCATCATCAGCGATGAAAGCTCTTCTA
CGTACACGACGTCTAGAAGACTCTTGTTCATCAGAAGATTGATTGTTGTTCTCTTCATCT
CTATCTCTAGATGATGTTCCCGTATCACCTTCATAGCTCTCTCCCCAAAGCCTTGAAGAT
CTTCTCCTCACACCTATATGAGACCTAGCTCTAGACGTCCCAGACCAGCTACTACTCCTT
GATCCACCACCACTCGATTCTGGTCTAAACACACGGATGAGGAAGAACACCGTAAGCCAA
CCACACATGTAAGGACGGCAACCTTTATCAAAGGAAGAGCAAATGAGAAGGATGCCGTTG
TGAGGATGTTCCATACAGACAGGACAACGAGCTTCTTCCCATTCCTTAACTTGCTTCTCA
CTAGGCTTCTTCAAAGCACGGCTTGACTCACAATACAAAGGCGATGATGATGCTCTTAAC
CTTTCATGAGATACAGATCGGTCTTTCCTCTCTTTAGGCATAATAATTCTCAAAAAAGAA
ACTGTCTTTTAAAACAGGAAGAGTCTAGAGCGTTGTGGCGATGGTCAAATCGATAGATAA
ATCGAACGAAACCCTTAAATCGGGCATCCCATCGAGAGAGAGAGAGCCAAGGAGGTGAGA
CGATGAAGATGAGGCGGCTACTTTTCC

QA 1 747 1 747
DS 



CO CL202Contig2 1088 6 11 U
TTTTTCATCTCTTGTTGACGCGCTCCTCCATGGCCGTTCCTCTCACCATCTCGTCAAACT
CGCTCATCTCCCGCCTCTCCTTCCCTCCCACTTCATTCAAGGGCAATGTAAGCGTCTTAG
GAGCAAACCCATCTCACCAGATCCTCTCTCTGAAACTCCACCACAATCGTGGAATCGGAA
AACAACAACAGCAAATCGCGAGGCCTCTCGTTGTGACGGCGGCGACCTCTTCTTCTTCTC
TGGAAGCAGCAGTGATGAGCTCGGAGAGGTTCCGTCTGGATAACCTCGGACCACAACCCG
GTTCGAGAAAGAGGGCCAAGAGAAAGGGTAGAGGTATCTCCGCGGGACAAGGAGCGAGCT
GCGGGTTCGGGATGAGGGGACAGAAGTCGCGGTCTGGTCCTGGGATCATGAGAGGCTTTG
AAGGAGGTCAAA*CCGCTCTTTATCGCCGTCTTCCCAAACTTAGAGGAATCGCTGGAGGT
ATGCGTGCAGGGTTACCTAAGTACGTGCCAGTGAATCTCAAAGACATTGAGACAGCTGGG
TTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTGGAGACATTGAAGCAAAAGGGTTTGATTAATCCT
TCTGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACGGGAGAACTAAGCGTGAAG
CTCACCTTCAAAGCCCGTGCTTTCTCGACATCAGCAAAGGAGAAGCTTGAAGCTTCGGGT
TGTACACTCACTGTGTTGCCCGGAAGAAAGAAGTGGGTGAAGCCATCGGTTGCTAAGAAC
CAAGCACGAGCAGATGAATACTTTGCTAAGAAGAGAGCTGCTGCAGCTGAAGCAGCAGCT
TCAGAACCTGCAGCTTCTGCCTAATCTTTCTTACATTTTTCAAGCTCTTCGATGTTGTAA
AGCTGCAGAGATAATTTTAGCTTTGTCTATGAGAAGCGTTTGTTAATCTACAATCCGTTT
CTTTCTTTATGTATGGTGAAGAATTTTACATTTTGTTGTTTATGAGTAATCGTTATCAGA
AAGTTTTTGTAAAACTGTATTACAGTATCTTTCAGTCTCCTACGAAATGTTTACAGAATG
TATTTCAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ17TF U 1
AF RR2GZ79TF U 1
AF RR2CV19TF U 94
AF RR2EJ17JQ C 302
AF RR2GZ79JQ C 599
AF RR2CV19JQ C 330
BS 1 249 RR2EJ17TF
BS 250 250 RR2GZ79TF
BS 251 256 RR2EJ17TF
BS 257 257 RR2GZ79TF
BS 258 348 RR2EJ17TF
BS 349 349 RR2GZ79TF
BS 350 605 RR2EJ17TF
BS 606 693 RR2GZ79TF
BS 694 798 RR2CV19TF
BS 799 1081 RR2EJ17JQ
BS 1082 1088 RR2CV19JQ

RD RR2EJ17TF 605 0 0
TTTTTCATCTCTTGTTGACGCGCTCCTCCATGGCCGTTCCTCTCACCATCTCGTCAAACT
CGCTCATCTCCCGCCTCTCCTTCCCTCCCACTTCATTCAAGGGCAATGTAAGCGTCTTAG
GAGCAAACCCATCTCACCAGATCCTCTCTCTGAAACTCCACCACAATCGTGGAATCGGAA
AACAACAACAGCAAATCGCGAGGCCTCTCGTTGTGACGGCGGCGACCTCTTCTTCTTCTC
TGGAAGCAGTAGTGATTAGCTCGGAGAGGTTCCGTCTGGATAACCTCGGACCACAACCCG
GTTCGAGAAAGAGGGCCAAGAGAAAGGGTAGAGGTATCTCCGCGGGACGAGGAGCGAGCT
GCGGGTTCGGGATGAGGGGACAGAAGTCGCGGTCTGGTCCTGGGATCATGAGAGGCTTTG
AAGGAGGTCAAA*CCGCTCTTTATCGCCGTCTTCCCAAACTTAGAGGAATCGCTGGAGGT
ATGCGTGCAGGGTTACCTAAGTACGTGCCAGTGAATCTCAAAGACATTGAGACAGCTGGG
TTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTGGAGACATTGAAGCAAAAGGGTTTGATTAATCCT
TCTGG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2GZ79TF 693 0 0
TTTTTCATCTCTTGTTGACGCGCTCCTCCATGGCTGTTCCTCTCACCATCTCGTCAAACT
CTCTCATCTCCCGCCTCTCCTTCCCTCCCACTTCATTCAAGGGCAATGTAAGCGTCTTAG
GAGCAAACCCATCTCACCAGATCCTCTCTCTGAAACTCCACCACAATCGTGGAATCGGAA
AACAACAACAGCAAATCGCGAGGCCTCTCGTTGTGACGGCGGCGACCTCTTCTTCTTCTC
CGGAAGCAGCAGTGATGAGCTCGGAGAGGTTCCGTCTGGATAACCTCGGACCACAACCCG
GTTCGAGAAAGAGGGCCAAGAGAAAGGGTAGAGGTATCTCCGCGGGACAAGGAGCGAGCT
GCGGGTTCGGGATGAGGGGACAGAAGCCGCGGTCTGGTCCTGGGATCATGAGAGGCTTTG
AAGGAGGTCAAA*CCGCTCTTTATCGCCGTCTTCCCAAACTTAGAGGAATCGCTGGAGGT
ATGCGTGCAGGGTTACCTAAGTACGTGCCAGTGAATCTCAAAGACATTGAGACAGCTGGG
TTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTGGAGACATTGAAGCAAAAGGGTTTGATTAATCCT
TCTGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACGGGAGAACTAAGCGTGAAG
CTCACCTTCAAAGCCCGTGCTTTCTCGACATCA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2CV19TF 705 0 0
G
ATTCAAGGGCAATGTAAGCGTCTTATGAGCAAACCCATCTCACCAGATCCTCTCTCTGAA
ACTCCACCACAATCGTGGAATCGGAAAACAACAACAGCAAATCGCGAGGCCTCTCGTTGT
GACGGCGGCGACCTCTTCTTCTTCTCTGGAAGCAGCAGTGATGAGCTCGGAGAGGTTCCG
TCTGGATAACCTCGGACCACAACCCGGTTCGAGAAAGAGGGCCAAGAGAAAGGGTAGAGG
TATCTCCGCGGGACAAGGAGCGAGCTGCGGGTTCGGGATGAGGGGACAGAAGTCTCGGTC
TGGTCCTGGGATCATGAGAGGCTTTGAAGGAGGTCAAA*CCGCTCTTTATCGCCGTCTTC
CCAAACTTAGAGGAATCGCTGGAGGTATGCGTGCAGGGTTACCTAAGTACGTGCCAGTGA
ATCTCAAAGACATTGAGACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTGGAGACAT
TGAAGCAAAAGGGTTTGATTAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGAAATTCCCTCTTAAGATTC
TTGGTACGGGAGAACTAAGCGTGAAGCTCACCTTCAAAGCCCGTGCTTTCTCGACATCAG
CAAAGGAGAAGCTTGAAGCTTCGGGTTGTACACTCACTGTGTTGCCCGGAAGAAAGAAGT
GGGTGAAGCCATCGGTTGCTAAGAACCAAGCACGAGCAGATGAA

QA 2 705 2 705
DS 

RD RR2EJ17JQ 780 0 0
TTCGAGAAAGAGGGCCAAGAGAAAGGGTAGAGGTATCTCCGCGGGACGAGGAGCGAGCTG
CGGGTTCGGGATGAGGGGACAGAAGTCGCGGTCTGGTCCTGGGATCATGAGAGGCTTTGA
AGGAGGTCAAAACCGCTCTTTATCGCCGTCTTCCCAAACTTAGAGGAATCGCTGGAGGTA
TGCGTGCAGGGTTACCTAAGTACGTGCCAGTGAATCTCAAAGACATTGAGACAGCTGGGT
TTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTGGAGACATTGAAGCAAAAGGGTTTGATTAATCCTT
CTGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACGGGAGAACTAAGCGTGAAGC
TCACCTTCAAAGCCCGTGCTTTCTCGACATCAGCAAAGGAGAAGCTTGAAGCTTCGGGTT
GTACACTCACTGTGTTGCCCGGAAGAAAGAAGTGGGTGAAGCCATCGGTTGCTAAGAACC
AAGCACGAGCAGATGAATACTTTGCTAAGAAGAGAGCTGCTGCAGCTGAAGCAGCAGCTT
CAGAACCTGCAGCTTCTGCCTAATCTTTCTTACATTTTTCAAGCTCTTCGATGTTGTAAA
GCTGCAGAGATAATTTTAGCTTTGTCTATGAGAAGCGTTTGTTAATCTACAATCCGTTTC
TTTCTTTATGTATGGTGAAGAATTTTACATTTTGTTGTTTATGAGTAATCGTTATCAGAA
AGTTTTTGTAAAACTGTATTACAGTATCTTTCAGTCTCCTACGAAATGTTTACAGAATGT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2GZ79JQ 483 0 0
CTTCTGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACGGGAGAACTAAGCGTGA
AGCTCACCTTCAAAGCCCGTGCTTTCTCGACATCAGCAAAGGAGAAGCTTGAAGCTTCGG
GTTGTACACTCACTGTGTTGCCCGGAAGAAAGAAGTGGGTGAAGCCATCGGTTGTTAAGA
ACCAAGCACGAGCAGATGAATACTTTGCTAAGAAGAGAGCTGCTGCAGCTGAAGCAGCAG
CTTCAGAACCTGCAGCTTTTGCCTAATCTTTTTTACATTTTTCAAGCTTTTCGATGTTGT
AAAGCTGCAGAGATAATTTTAGCTTTGTTTATGAGAAGCGTTTGTTAATTTACAATCCGT
TTCTTTCTTTATGTATGGTGAAGAATTTTACATTTTGTTGTTTATGAGTAATCGTTATCA
GAAAGTTTTTGTAAAACTGTATTACGGTATCTTTCAGTTTCCTACAAAATGTTTACAGAA
TGT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR2CV19JQ 759 0 0
AGAGGTATCTCCGCGGGACAAGGAGCGAGCTGCGGGTTCGGGATGAGGGGACAGAAGTCT
CGGTCTGGTCCTGGGATCATGAGAGGCTTTGAAGGAGGTCAAA*CCGCTCTTTATCGCCG
TCTTCCCAAACTTAGAGGAATCGCTGGAGGTATGCGTGCAGGGTTACCTAAGTACGTGCC
AGTGAATCTCAAAGACATTGAGACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTGGA
GACATTGAAGCAAAAGGGTTTGATTAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGAAATTCCCTCTTAA
GATTCTTGGTACGGGAGAACTAAGCGTGAAGCTCACCTTCAAAGCCCGTGCTTTCTCGAC
ATCAGCAAAGGAGAAGCTTGAAGCTTCGGGTTGTACACTCACTGTGTTGCCCGGAAGAAA
GAAGTGGGTGAAGCCATCGGTTGCTAAGAACCAAGCACGAGCAGATGAATACTTTGCTAA
GAAGAGAGCTGCTGCAGCTGAAGCAGCAGCTTCAGAACCTGCAGCTTCTGCCTAATCTTT
CTTACATTTTTCAAGCTCTTCGATGTTGTAAAGCTGCAGAGATAATTTTAGCTTTGTCTA
TGAGAAGCGTTTGTTAATCTACAATCCGTTTCTTTCTTTATGTATGGTGAAGAATTTTAC
ATTTTGTTGTTTATGAGTAATCGTTATCAGAAAGTTTTTGTAAAACTGTATTACAGTATC
TTTCAGTCTCCTACGAAATGTTTACAGAATGTATTTCAC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 14

CO CL203Contig1 829 14 24 U
CCTTTAATCCAAAAGATAATAATAATAACACTTAAGGGTAAGATTGAGCTTCTGATTTGT
TTCTCAAACAATACAAAACATTGCTGGGTCTCTGTGATCGAAGTGCCAGAGCCATGGCTT
CCCTTTCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAAGTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCTAGAC
AAGCCTCCACCTCTTCTCCGTCGTGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCCTCAGCCGCTTC
AGTCCACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCTACCGAAGTTG
AAGCTTCGGTCACTGCCGACGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTCAAGACCGCTC
AAGAAGCTTGGGAGAAA*GTGGAGGACAAGTATGCAATTGGTTCTCTCGCATTTGCTGCT
TTGTTGGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGTTT
CCAGGTGTTTTT*GAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCTTACAAGAATC
TGATCTTCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACATACAGAGACA
TACTAGGGAGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGAGCAGCTGAATCGAAGAATCTAA
CACATGTCTATGTCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTAATATACCATGCGTCTTATATCAGT
GTTGTAGATTCCATCATCTCTCTCTCTCTGCTCTCCTTGTAGCTCAAATATCATCCATTT
TATGTTGTAAATTCCTCAAGACTATGCAATGATGAGATATTTCATTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 30 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 50 65 65 70 70 70 70 70 0 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 45 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 
80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 75 70 70 70 70 55 55 55 70 70 70 70 70 55 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2EC96TF U 79
AF RR2CS94JQ C 489
AF RR2C591TF U 1
AF RR2GQ01TF U 32
AF RR2C591JQ C 349
AF RR2DH60TF U 44
AF RR2CS94TF U 59
AF RR2H950TF U 57
AF RR2CW37TF U 63
AF RR2CZ49TF U 126
AF RR2DH60JQ C 133
AF RR2CZ49JQ C 199
AF RR2GQ01JQ C 173
AF RR2GQ87JQ C 232
BS 1 154 RR2C591TF
BS 155 155 RR2DH60TF
BS 156 199 RR2C591TF
BS 200 200 RR2DH60TF
BS 201 228 RR2C591TF
BS 229 229 RR2GQ01TF
BS 230 520 RR2C591TF
BS 521 521 RR2GQ01TF
BS 522 607 RR2C591TF
BS 608 608 RR2GQ01TF
BS 609 651 RR2C591TF
BS 652 654 RR2GQ01TF
BS 655 659 RR2C591TF
BS 660 660 RR2GQ01TF
BS 661 696 RR2C591TF
BS 697 697 RR2GQ01TF
BS 698 709 RR2C591TF
BS 710 775 RR2GQ01TF
BS 776 798 RR2H950TF
BS 799 799 RR2CZ49TF
BS 800 808 RR2H950TF
BS 809 811 RR2CZ49TF
BS 812 826 RR2DH60JQ
BS 827 829 RR2GQ01JQ

RD RR2EC96TF 572 0 0
G
ATTGCTGGGTCTCTGTGATCGAAGTGCCAGAGCCATGGCTTCCCTTTCAATCACTTCCTC
TTCGACAATCATCAATTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCTAGACAAGCCTCCACCTCTTCTCC
ATCGTGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCCTCAGCCGCTTCAGTCCACTGCTTACTGTCG
GAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCTACCGAAGTTGAAGCTTCGGTCACTGCCGA
CGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTCAAGACCGCTCAAGAAGCTTGGGAGAAG*G
TGGAGGACAAGTATGCAATTGGTTCTCTCGCATTTGCCGCTTTGTTGGCTCTTTGGGGTT
CTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGTTTCCAGGTGTTTTT*GAACTT
GTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCTTACAAGAATCTGATCTTCAAACCAGACAG
GGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACATACAGAGACATACTAGGGAGCAGCAGCTG
AATCAGAGGAAGAATGAGAGCAGCTGA
TCGA

QA 2 568 2 568
DS 

RD RR2CS94JQ 159 0 0
TTTTTGAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCTTACAAGAATTTGATTTTC
AAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACATGCAGAGACATACTAGGG
AGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGGGCAGCTGAA

QA 1 159 1 159
DS 

RD RR2C591TF 709 0 0
CCTTTAATCCAAAAGATAATAATAATAACACTTAAGGGTAAGATTGAGCTTCTGATTTGT
TTCTCAAACAATACAAAACATTGCTGGGTCTCTGTGATCGAAGTGCCAGAGCCATGGCTT
CCCTTTCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAATTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCTAGAC
AAGCCTCCACCTCTTCTCCATCGTGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCTTCAGCCGCTTC
AGTCCACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCTACCGAAGTTG
AAGCTTCGGTCACTGCCGACGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTCAAGACCGCTC
AAGAAGCTTGGGAGAAA*GTGGAGGACAAGTATGCAATTGGTTCTCTCGCATTTGCTGCT
TTGTTGGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGTTT
CCAGGTGTTTTT*GAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGGGTGGTTTGCTTACAAGAATC
TGATCTTCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACATACAGAGACA
TACTAGG*AGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGAGCAGCTGAATCGA**GATCTA*
CACATGTCTATGTCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTA*TATACCATGCGT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2GQ01TF 744 0 0
GG
AAGGGTAAGATTGAGCTTCTGATTTGTTTCTCAAACAATACAAAACATTGCTGGGTCTCT
GTGATCGAAGTGCCAGAGCCATGGCTTCCCTTTCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCA
ATTCTAGAGCTTC*CCTCTTCCTAGACAAACCTCCACCTCTTCTCCATCGTGTATTTCCC
TTCCCATGCTTCCTCCTCAGCCGCTTCAGTCCACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGA
ACGTTCTGACAAGAGCTACCGAAGTTGAAGCTTCGGTCACTGCCGACGCTGACACTACAG
AGTTGCCAGAAATCTTCAAGACCGCTCAAGAAGCTTGGGAGAAA*GTGGAGGACAAGTAT
GCAATTGGTTCTCTCGCATTTGCTGCTTTGTTGGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATC
TCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGTTTCCAGGTGTTTTT*GAACTTGTAGGCATTGGTTA
CACTGGG*TGGTTTGCTTACAAGAATCTGATCTTCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTC
AGAAGATCAAAGACACATACAGAGACATACTAGGGAGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAA
TGAGAGCAGCTGAATCGAAGAATCTAACACATGTCTATGTCTCTCTGTGCTCCTTGTAGC
TTAATATACCATGCGTCTTATATCAGTGTTGTAGATTCCATCATCTCTCTCTCTCTGCTC
TCCTTGTAGCTCAAATATCATC

QA 3 744 3 744
DS 

RD RR2C591JQ 378 0 0
TCAAGACCGCTCAAGAAGCTTGGGAGAAAAGTGGAGGACAAGTATGCAATTGGTTCTCTC
GCATTTGCTGCTTTGTTGGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGG
CTTCCATTGTTTCCAGGTGTTTTT*GAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTG
CTTACAAGAATCTGATCTTCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACA
CATACAGAGACATACTAGGGAGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGAGCAGCTGAAT
CGAAGAATCTAACACATGTCTATGTCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTAATATACCATGCG
TCTTATATCAGTGTTGTA

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR2DH60TF 723 0 0
GGAAGAG
TCTGATTTGTTTCTCAAACAATACAAAACATTGCTGGGTCTCTGTGGTCGAAGTGCCAGA
GCCATGGCTTCCCTTTCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAAGTCTAGAGCTTCTCCT
CTTCCTAGACAAGCTTCCACCTCTTCTCCGTCGTGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCCT
CAGCCGGTTCAGTCCACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCT
ACCGAAGTTGAAGCTTCGGTCACTGCCGACGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTC
AAGACCGCTCAAGAAGCTTGGGAGAAA*GTGGAGGACAAGTATGCAATTAGTTCTCTCGC
ATTTGCTGCTTTGTTGGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCT
TCCATTGTTTCCAGGTGTTTTTTGAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCT
TACAAGAATCTGATCTTCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACA
TACAGAGACATACTAGGGAGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGAGCAGCTGAATCG
AAGAATCTAACACATGTCTATGTCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTAATATACCATGCGTC
TTATATCAGTGTTGTAGATTCCATCATCTCTCTCTCTCTGCTCTCCTTGTAGCTCA

QA 8 723 8 723
DS 

RD RR2CS94TF 717 0 0
GG
TTCTCAAACAATACAAAACATTGCTAGGTCTCTGTGATCGAAGTGCCAGAGCCATGGCTT
CCCTTTCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAAGTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCTAGAC
AAGCTTCCACCTCTTCTCCGTCGTGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCCTCAGCCGGTTC
AGTCCACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCTACCGAAGTTG
AAGCTTCGGTCACTGCCGACGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTCAAGACCGCTC
AAGAAGCTTGGGAGAAA*GTGGAGGACAAGTATGCAATTAGTTCTCTCGCATTTGCTGCT
TTGTTGGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGTTT
CCAGGTGTTTTT*GAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCTTACAAGAATC
TGATCTTCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACATGCAGAGACA
TACTAGGGAGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGGGCAGCTGAATCGAAGAATCTAA
CACATGTCTATGCCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTAATATACCATGCGTCTTATATCAGT
GTTGTAGATTCCATCATCTCTCTCTCTCTGTTCTCCTTGTAGCTCAAATATCATC

QA 3 717 3 717
DS 

RD RR2H950TF 756 0 0
GG
GTTTCTCAAACAATACAAAACATTGCTGGGTCTCTGTGATCGAAGTGCCAGAGCCATGGC
TTCCCTTTCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAATTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCTAG
ACAAGCCTCCACCTCTTCTCCATCGTGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCCTCAGCCGCT
TCAGTCCACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCTACCGAAGT
TGAAGCTTCGGTCACTGCCGACGCTGTCACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTCAAGACCGC
TCAAGAAGCTTGGGAGAAA*GTGGAGGACAAGTATGCAATTGGTTCTCTCGCATTTGCTG
CTTTGTTGGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGT
TTCCAGGTGTTTTT*GAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCTTACAAGAA
TCTGATCTTCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACATACAGAGA
CATACTAGGGAGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGAGCAGCTGAATCGAAGAATCT
AACACATGTCTATGTCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTAATATACCATGCGTCTTATATCA
GTGTTGTAGATTCCATCATCTCTCTCTCTCTGCTCTCCTTGTAGCTCAAATATCATCCAT
TTTATGTTGTAAATTCCTCA*GACTATGCA
TGAT

QA 3 752 3 752
DS 

RD RR2CW37TF 723 0 0
GGA
AAACAATACAAAACATTGCTGGGTCTCTGTGATCGAAGTGCCAGAGCCATGGCTTCCCTT
TCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAAGTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCTAGACAAGCT
TCCACCTCTTCTCCGTCGTGTATTTCCCTTCCCATGCCTCCTCCTCAGCCGGTTCAGTCC
ACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAATAGCTACCGAAGTTGAAGCT
TCGGTCACTGCCGACGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTCAAGACCGCTCAAGAA
GCTTGGGAGAAA*GTGGAGGACAAGTATGCAATTAGTTCTCTCGCATTTGCTGCTTTGTT
GGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGTTTCCAGG
TGTTTTT*GAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCTTACAAGAATCTGATC
TTCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACATACAGAGACATACTA
GGGAGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGAGCAGCTGAATCGAAGAATCTAACACAT
GTCTATGTCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTAATATACCATGCGTCTTATATCAGTGTTGT
AGATTCCATCATCTCTCTCTCTCTGCTCTCCTTGTAGCTCAAATATCATCCATTTTATGT

QA 4 723 4 723
DS 

RD RR2CZ49TF 686 0 0
G
CAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAAGTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCTAGACAAGCTT
CCACCTCTTCTCCGTCGTGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCCTCAGCCGGTTCAGTCCA
CTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCTACCGAAGTTGAAGCTT
CGGTCACTGCCGACGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTCAAGACCGCTCAAGAAG
CTTGGGAGAAA*GTGGAGGACAAGTATGCAATTAGTTCTCTCGCATTTGCTGCTTTGTTG
GCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGTTTCCAGGT
ATTTTT*GAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCTTACAAGAATCTGATCT
TCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACATACAGAGACATACTAG
GGAGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGAGCAGCTGAATCGAAGAATCTAACACATG
TCTATGTCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTAATATACCATGCGTCTTATATCAGTGTTGTA
GATTCCATCATCTCTCTCTCTCTGCTCTCCTTGTAGCTCAAATATCATCCATTTTATGTT
GTAAATTCCTCAAGACTATGCAATG

QA 2 686 2 686
DS 

RD RR2DH60JQ 694 0 0
CTTCCTCTTCGACAATCATCAAGTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCTAGACAAGCTTCCACCT
CTTCTCCGTCGTGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCCTCAGCCGGTTCAGTCCACTGCTT
ACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCTACCGAAGTTGAAGCTTCGGTCA
CTGCCGACGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTCAAGACCGCTCAAGAAGCTTGGG
AGAAA*GTGGAGGACAAGTATGCAATTAGTTCTCTCGCATTTGCTGCTTTGTTGGCTCTT
TGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGTTTCCAGGTGTTTTT
TGAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCTTACAAGAATCTGATCTTCAAAC
CAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACATACAGAGACATACTAGGGAGCA
GCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGAGCAGCTGAATCGAAGAATCTAACACATGTCTATG
TCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTAATATACCATGCGTCTTATATCAGTGTTGTAGATTCC
ATCATCTCTCTCTCTCTGCTCTCCTTGTAGCTCAAATATCATCCATTTTATGTTGTAAAT
TCCTCAAGACTATGCAATGATGAGATATTTCATT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2CZ49JQ 613 0 0
CGTCGTGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCCTCAGCCGGTTCAGTCCACTGCTTACTGTC
GGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCTACCGAAGTTGAAGCTTCGGTCACTGCCG
ACGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTCAAGACCGCTCAAGAAGCTTGGGAGAAA*
GTGGAGGACAAGTATGCAATTAGTTCTCTCGCATTTGCTGCTTTGTTGGCTCTTTGGGGT
TCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGTTTCCAGGTATTTTT*GAACT
TGTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCTTACAAGAATCTGATCTTCAAACCAGACA
GGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACATACAGAGACATACTAGGGAGCAGCAGCT
GAATCAGAGGAAGAATGAGAGCAGCTGAATCGAAGAATCTAACACATGTCTATGTCTCTC
TGTGCTCCTTGTAGCTTAATATACCATGCGTCTTATATCAGTGTTGTAGATTCCATCATC
TCTCTCTCTCTGCTCTCCTTGTAGCTCAAATATCATCCATTTTATGTTGTAAATTCCTCA
AGACTATGCAATG

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2GQ01JQ 657 0 0
TCCTAGACAAACCTCCACCTCTTCTCCATCGTGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCCTCA
GCCGCTTCAGTCCACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCTAC
CGAAGTTGAAGCTTCGGTCACTGCCGACGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCTTCAA
GACCGCTCAAGAAGCTTGGGAGAAA*GTGGAGGACAAGTATGCAATTGGTTCTCTCGCAT
TTGCTGCTTTGTTGGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTC
CATTGTTTCCAGGTGTTTTT*GAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCTTA
CAAGAATCTGATCTTCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACATA
CAGAGACATACTAGGGAGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGAGCAGCTGAATCGAA
GAATCTAACACATGTCTATGTCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTAATATACCATGCGTCTT
ATATCAGTGTTGTAGATTCCATCATCTCTCTCTCTCTGCTCTCCTTGTAGCTCAAATATC
ATCCATTTTATGTTGTAAATTCCTCAAGACTATGCAATGATGAGATATTTCATTCTC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2GQ87JQ 598 0 0
AGCCGCTTCAGTCCACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCTA
CCGAAGTTGAAGCTTCGGTCACTGCCGACGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTCA
AGACTGCTCAAGAAGCTTGGGAGAAA*GTGGAGGACAAGTATGCAATTGGCTCTCTCGCA
TTTGCTGCTTTGTTGGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTT
CCATTGTTTCCAGGTGTTTTT*GAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCTT
ACAAGAATCTGATCTTCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACAT
ACAGAGACATACTAGGGAGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGAGCAGCTGAATCGA
AGAATCTAACACATGTCTATGTCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTAATATACCATGCGTCT
TATATCAGTGTTGTAGATTCCATCATCTCTCTCTTTCTGCTCTCCTTGTAGCTCAAATAT
CATCCATTTTATGTTGTAAATTCCTCAAGACTATGCAATGATGAGATATTTCATT
CCC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 2 16

CO CL204Contig1 501 5 3 U
GGAGAGAGAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAATAATTGAGCTCCTA
ATCGGAGTTTCTCTTACAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAAAATA
ACAAACAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAATTATTTTCTCTCTAGCT
TTTGTGGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATGTTGAGGCAACAAGATACATAGGCTAT
GATGGCCTTCATCGTGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGC
AAGAAGGTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTATCGAACGTTGCCATGGT
TAATTTCTACAAATGCCATCCCCATATTAATATCAAATGATTAATTTCATGTGTTTGTTA
TTTATATTCTTTTATTGCTTATGTAACTGATTGTTACCCTATTATTTTTGATAATATCAA
TAAACTAATTATATATGTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 25 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 

AF RR2CP78TF U 1
AF RR2G559JQ C 6
AF RR2G559TF U 6
AF RR2FU26JQ C 4
AF RR2FU26TF U 4
BS 1 117 RR2CP78TF
BS 118 118 RR2G559TF
BS 119 501 RR2CP78TF

RD RR2CP78TF 501 0 0
GGAGAGAGAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAATAATTGAGCTCCTA
ATCGGAGTTTCTCTTACAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAAA*TA
ACAAACAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAATTATTTTCTCTCTAGCT
TTTGTGGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATGTTGAGGCAACAAGATACATAGGCTAT
GATGGCCTTCATCGTGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGC
AAGAAGGTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTATCGAACGTTGCCATGGT
TAATTTCTACAAATGCCATCCCCATATTAATATCAAATGATTAATTTCATGTGTTTGTTA
TTTATATTCTTTTATTGCTTATGTAACTGATTGTTACCCTATTATTTTTGATAATATCAA
TAAACTAATTATATATGTTAA

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR2G559JQ 494 0 0
GG
GAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAATAATTGAGCTCCTAATCGGAG
TTTCTCTTACAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAAAATAACAAACA
ATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAATTATTTTCTCTCTAGCTTTTGTGG
TGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATGTTGAGGCAACAAGATACATAGGCTATGATGGCC
TTCATCGTGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGG
TACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTATCGGACGTTGCCATGGTTAATTTC
TACAAATGCCATCCCCATATTAATATCAAATGATTAATTTCATGTGTTTGTTATTTATAT
TCTTTTATTGCTTATGTAACTGATTGTTACCCTATTATTTT*GATAATATCAATAAACTA
ATTATATAT
GCT

QA 3 491 3 491
DS 

RD RR2G559TF 494 0 0
GG
GAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAATAATTGAGCTCCTAATCGGAG
TTTCTCTTACAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAAAATAACAAACA
ATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAATTATTTTCTCTCTAGCTTTTGTGG
TGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATGTTGAGGCAACAAGATACATAGGCTATGATGGCC
TTCATCGTGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGG
TACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTATCGGACGTTGCCATGGTTAATTTC
TACAAATGCCATCCCCATATTAATATCAAATGATTAATTTCATGTGTTTGTTATTTATAT
TCTTTTATTGCTTATGTAACTGATTGTTACCCTATTATTTT*GATAATATCAATAAACTA
ATTATATAT
GCT

QA 3 491 3 491
DS 

RD RR2FU26JQ 493 0 0
GGG
AGAGCAGATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAATAATTGAGCTCCTAATCGGA
GTTTCTCTTACAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAAAATAACAAAC
AATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAATTATTTTCTCTCTAGCTTTTGTG
GTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATGTTGAGGCAACAAGATACATAGGCTATGATGGC
CTTCATCGTGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAG
GTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTATCGAACGTTGCCATGGTTAATTT
CTACAAATGCCATCCCCATATTAATATCAAATGATTAATTTCATGTGTTTGTTATTTATA
TTCTTTTATTGCTTATGTAACTGATTGTTACCCTATTATTTTTGATAATATCAATAAACT
AATTATATAT

QA 4 493 4 493
DS 

RD RR2FU26TF 493 0 0
GGG
AGAGCAGATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAATAATTGAGCTCCTAATCGGA
GTTTCTCTTACAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAAAATAACAAAC
AATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAATTATTTTCTCTCTAGCTTTTGTG
GTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATGTTGAGGCAACAAGATACATAGGCTATGATGGC
CTTCATCGTGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAG
GTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTATCGAACGTTGCCATGGTTAATTT
CTACAAATGCCATCCCCATATTAATATCAAATGATTAATTTCATGTGTTTGTTATTTATA
TTCTTTTATTGCTTATGTAACTGATTGTTACCCTATTATTTTTGATAATATCAATAAACT
AATTATATAT

QA 4 493 4 493
DS 



CO CL204Contig2 522 11 3 U
AGGACAGAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTA
ATAGGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAAC
AAATAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTAGCTTT
TGTGGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTATGG
CCTTCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAA
GGTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTAGCCAACGTTGCCGTGATAACGC
TCAAAAGTAGACCACCACTCTTGCTTAATTTTTAAATGCCATCCCCGTATTAATATCAAA
TGATTAATTCCATGTGTTTGTTATTTATATTCTTTTATTGCTCATGTAACTGATTGTTAC
CCTATTATTTATGATAATCAATAAAATAATTATATTTATGTT


BQ
10 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 30 

AF RR2H085TF U 3
AF RR2C408JQ C 2
AF RR2EN41JQ C 1
AF RR2EN41TF U 1
AF RR2A857JQ C 2
AF RR2D515JQ C 2
AF RR2D515TF U 2
AF RR2C408TF U 2
AF RR2A857TF U 2
AF RR2H085JQ C 3
AF RR2G261TF U 2
BS 1 1 RR2EN41JQ
BS 2 521 RR2EN41TF
BS 522 522 RR2C408TF

RD RR2H085TF 201 0 0
GACAGAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTAAT
AGGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACAA
ATAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTAGCTTTTG
TGGTGTTCTTGGCTTATGCAG

QA 1 201 1 201
DS 

RD RR2C408JQ 381 0 0
GGACAGAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTAA
TAGGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACA
AATAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTAGCTTTT
GTGGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTATGGC
CTTCATAAAGGAGATCCCGAATCCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAAG
GTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTAGCCAACGTTGCCGTGATAACGCT
CAAAAGTAGACCACCACTCTT

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR2EN41JQ 522 0 0
AGGACAGAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTA
ATAGGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAAC
AAATAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTAGCTTT
TGTGGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTATGG
CCTTCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAA
GGTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTAGCCAACGTTGCCGTGATAACGC
TCAAAAGTAGACCACCACTCTTGCTTAATTTTTAAATGCCATCCCCGTATTAATATCAAA
TGATTAATTCCATGTGTTTGTTATTTATATTCTTTTATTGCTCATGTAACTGATTGTTAC
CCTATTATTTATGATAATCAATAAAATAATTATATTTATGT
G

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2EN41TF 522 0 0
A
GGACAGAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTAA
TAGGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACA
AATAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTAGCTTTT
GTGGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTATGGC
CTTCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAAG
GTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTAGCCAACGTTGCCGTGATAACGCT
CAAAAGTAGACCACCACTCTTGCTTAATTTTTAAATGCCATCCCCGTATTAATATCAAAT
GATTAATTCCATGTGTTTGTTATTTATATTCTTTTATTGCTCATGTAACTGATTGTTACC
CTATTATTTATGATAATCAATAAAATAATTATATTTATGT
G

QA 2 521 2 521
DS 

RD RR2A857JQ 521 0 0
GGACAGAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTAA
TAGGAGTTTTTTTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACA
AATAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTAGCTTTT
GTGGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTATGGC
CTTCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAAG
GTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTAGCCAACGTTGCCGTGATAACGCT
CAAAAGTAGACCACCACTCTTGCTTAATTTTTAAATGCCATCCCCGTATTAATATCAAAT
GATTAATTCCATGTGTTTGTTATTTATATTCTTTTATTGCTCATGTAACTGATTGTTACC
CTATTATTTATGATAATCAATAAAATAATTATATTTATGTT

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2D515JQ 516 0 0
GGACAGAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTAA
TAGGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACA
AATAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTAGCTTTT
GTGGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTATGGC
CTTCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAAG
GTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTAGCCAACGTTGCCGTGATAGCGCT
CAAAAGTAGACCACCACTCTTGCTTAATTTTTAAATGCCATCCCCGTATTAATATCAAAT
GATTAATTCCATGTGTTTGTTATTTATATTCTTTTATTGCTCATGTAACTGATTGTTACC
CTATTATTTATGATAATCAATAAAATAATTATAT
CT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2D515TF 516 0 0
GGACAGAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTAA
TAGGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACA
AATAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTAGCTTTT
GTGGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTATGGC
CTTCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAAG
GTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTAGCCAACGTTGCCGTGATAGCGCT
CAAAAGTAGACCACCACTCTTGCTTAATTTTTAAATGCCATCCCCGTATTAATATCAAAT
GATTAATTCCATGTGTTTGTTATTTATATTCTTTTATTGCTCATGTAACTGATTGTTACC
CTATTATTTATGATAATCAATAAAATAATTATAT
CT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2C408TF 521 0 0
GGACAGAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTAA
TAGGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACA
AATAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTAGCTTTT
GTGGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTATGGC
CTTCATAAAGGAGATCCCGAATCCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAAG
GTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTAGCCAACGTTGCCGTGATAACGCT
CAAAAGTAGACCACCACTCTTGCTTAATTTTTAAATGCCATCCCCGTATTAATATCAAAC
GATTAATTCCATGTGTTTGTTATTTATATTCTTTTATTGCTCATGTAACTGATTGTTACC
CTATTATTTATGATAATCAATAAAATAATTATATTTATGTT

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2A857TF 521 0 0
GGACAGAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTAA
TAGGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACA
AATAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTAGCTTTT
GTGGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTATGGC
CTTCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAAG
GTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTAGCCAACGTTGCCGTGATAACGCT
CAAAAGTAGACCACCACTCTTGCTTAATTTTTAAATGCCATCCCCGTATTAATATCAAAT
GATTAATTCCATGTGTTTGTTATTTATATTCTTTTATTGCTCATGTAACTGATTGTTACC
CTATTATTTATGATAATCAATAAAATAATTATATTTATGTT

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2H085JQ 519 0 0
GACAGAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTAAT
AGGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACAA
ATAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTAGCTTTTG
TGGTGTTCTTGGCTTATGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTATGGCC
TTCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAAGG
TACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTAGCCAACGTTGCCGTGATAACGCTC
AAAAGTAGACCACCACTCTTGCTTAATTTTTAAATGCCATCCCCGTATTAATATCAAATG
ATTAATTCCATGTGTTTGTTATTTATATTCTTTTATTGCTCATGTAACTGATTGTTACCC
TATTATTTATGATAATCAATAAAATAATTATATTTATGT

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2G261TF 521 0 0
GGACAGAGCAAATTTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTAA
TAGGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACA
AATAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTAGCTTTT
GTGGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTATGGC
CTTCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAAG
GTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTAGCCAACGTTGCCGTGATAACGCT
CAAAAGTAGACCACCACTCTTGCTTAATTTTTAAATGCCATCCCCGTATTAATATCAAAT
GATTAATTCCATGTGTTTGTTATTTATATTCTTTTATTGCTCATGTAACTGATTGTTACC
CTATTATTTATGATAATCAATAAAATAATTATATTTATGTT

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 14

CO CL205Contig1 1156 14 23 U
GGGTGGCTTAGACGAGAGAGAGGATCAAAGATGGATCACGAAGCAGATGCATACCGTACG
GATTTGATGACCATCACGAGGTTCGTGCTGAATGAGCAATCAAAGTACCCAGAGTCTCGT
GGTGATTTCACCATTTTGCTCAGCAACATCGTTTTGGGATGCAAATTCGTCTGCAGTGCT
GTCAACAAGGCTGGTTTGGCCAAGCTAATTGGGCTTGCTGGGGAAACAAATATCCAGGGT
GAAGAGCAAAAGAAACTCGATGTGCTCTCTAATGATGTCTTTGTCAAAGCTTTGGTTAGC
AGTGGCAGAACTTCTGTTCTTGTCTCAGAAGAAGATGAGGAAGCAACGTTCGTGGAGTCA
TCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATCGAC
TGTGGTGTCTCCATTGGAACCATCTTTGGGATTTACACAATGAGCCACAATGATGAGCCA
ACTACTGAAGATGTCTTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCTGCGGGTTACTGTATGTAC
GGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACTGGTGTCAATGGATTTACCCTGGAC
CCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCGGACATTAAGATTCCGAAAAAGGGGAAC
ATCTATTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGATGGTCCAACCACAAAGTATGTA
GAGAAATGCAAGTTTCCTAAAGATGGTTCTCCCGCTAAGTCTCTGAGATATGTGGGAAGT
ATGGTAGCTGATGTTCATCGCACACTGCTTTATGGAGGAATCTTCTTGTACCCGGCTGAC
AAGAAAAGCCCCAATGGGAAACTGCGTGTTCTGTATGAAGTCTTCCCGATGTCGTTCTTG
ATGGAGCAAGCCGGAGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGGCGCTAGACCTTGTGCCC
GAGAAGATCCATGAGCGTTCTCCAATATTTCTTGGTAGCTACGAAGATGTAGAGGAGATT
AAGGCTCTGTATGCTGCAGAGAACTAAGATTCTCATTCTTCTTATTTTATTAATTGTCTC
TCCCT**TATTTCTATATCTTCTTCTGTTGAGACAAACAAACGACTCATTTATACAAGGG
AGACTTTTTCTCATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 40 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 45 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 45 45 45 10 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 30 45 45 45 45 30 30 45 30 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 10 10 10 10 

AF RR2DN46TF U 6
AF RR2DV55TF U 55
AF RR2EZ84TF U 6
AF RR2DE41TF U 1
AF RR2ED31TF U 1
AF RR2C181TF U 96
AF RR2EP67TF U 21
AF RR2AT31TF U 7
AF RR2AT31JQ C 244
AF RR2DN46JQ C 346
AF RR2C181JQ C 352
AF RR2EP67JQ C 524
AF RR2ED31JQ C 443
AF RR2DE41JQ C 393
BS 1 274 RR2DE41TF
BS 275 275 RR2DN46TF
BS 276 283 RR2DE41TF
BS 284 284 RR2DN46TF
BS 285 653 RR2DE41TF
BS 654 656 RR2AT31TF
BS 657 657 RR2DN46JQ
BS 658 678 RR2AT31TF
BS 679 679 RR2AT31JQ
BS 680 752 RR2AT31TF
BS 753 753 RR2C181JQ
BS 754 767 RR2AT31TF
BS 768 1041 RR2AT31JQ
BS 1042 1042 RR2C181JQ
BS 1043 1072 RR2AT31JQ
BS 1073 1073 RR2C181JQ
BS 1074 1082 RR2AT31JQ
BS 1083 1083 RR2C181JQ
BS 1084 1085 RR2AT31JQ
BS 1086 1087 RR2C181JQ
BS 1088 1106 RR2AT31JQ
BS 1107 1107 RR2C181JQ
BS 1108 1156 RR2AT31JQ

RD RR2DN46TF 282 0 0
GGAGACGA
GAGAGAGAGGATCAAAGATGGATCACGAAGCAGATGCATACCGTACGGATTTGATGACCA
TTACGAGGTTCGTGCTGAATGAGCAATCAAAGTACCCAGAGTCTCGTGGTGATTTCACCA
TTTTGCTCAGCAACATCGTTTTGGGATGCAAATTCGTCTGCAGTGCTG*CAACAAGGCTG
GTTTGGCCAAGCTAATTGGGCTTGCTGGGGAAACAA*TATCCAGGGTGAAGAGCAAAG**
AACTCGATGTGCTCTCTAATGATGTCTTTGTCAA

QA 9 282 9 282
DS 

RD RR2DV55TF 367 0 0
CGTACGGATTTGATGACCATCACGAGGTTCGTGCTGAATGA*CAATCAAAGTACCCAGAG
TCTCGTGGTGATTTCACCATTTTGCTCA*CAACATCGTTTTGGGATGCAAATTC*TCTGC
AGTGCTGTCAACAAGGCTGGTTTGGCCAAGCTAATTGGGCTTGCTGGGGAAACAAATATC
CAGGGTGAAGAGCAAAAGAAACTCGATGTGCTCTCTAATGATGTCTTTGTCAAAGCTTTG
GT*AGCAGTGGCAGAACTTCTGTTCTTGTCTCA*AAGAAGATGAGGAAGCAACGTTCGTG
GA*TCATCCAAGCGTGGAAA*TACTGTGTTGTTTT*GATCCACTTGATGGATCCTCAAAC
ATCGACT

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR2EZ84TF 578 0 0
GGAGACGA
GAGAGAGAGGATCAAAGATGGATCACGAAGCAGATGCATACCGTACGGATTTGATGACCA
TCACGAGGTTCGTGCTGAATGAGCAATCAAAGTACCCAGAGTCTCGTGGTGATTTCACCA
TTTTGCTCAGCAACATCGTTTTGGGATGCAAATTCGTCTGCAGTGCTGTCAACAAGGCTG
GTTTGGCCAAGCTAATTGGGCTTGCTGGGGAAACAAATATCCAGGGTGAAGAGCAAAAGA
AACTCGATGTGCTCTCTAATGATGTCTTTGTCAAAGCTTTGGTTAGCAGTGGCAGAACTT
CTGTTCTTGTCTCAGAAGAAGATGAGGAAGCAACGTTCGTGGAGTCATCCAAGCGTGGAA
AGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATCGACTGTGGTGTTTCCA
TTGGAACCATCTTTGGGATTTACACAATGAGCCACAATGATGAGCCAACTACTGAAGATG
TCTTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCTGCGGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCA
TGCTTGTGTTGAGCACTGGAACTGGTGTCA

QA 9 578 9 578
DS 

RD RR2DE41TF 653 0 0
GGGTGGCTTAGACGAGAGAGAGGATCAAAGATGGATCACGAAGCAGATGCATACCGTACG
GATTTGATGACCATCACGAGGTTCGTGCTGAATGAGCAATCAAAGTACCCAGAGTCTCGT
GGTGATTTCACCATTTTGCTCAGCAACATCGTTTTGGGATGCAAATTCGTCTGCAGTGCT
GTCAACAAGGCTGGTTTGGCCAAGCTAATTGGGCTTGCTGGGGAAACAAATATCCAGGGT
GAAGAGCAAAAGAAACTCGATGTGCTCTCTAATGGTGTCTTTGCCAAAGCTTTGGTTAGC
AGTGGCAGAACTTCTGTTCTTGTCTCAGAAGAAGATGAGGAAGCAACGTTCGTGGAGTCA
TCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATCGAC
TGTGGTGTCTCCATTGGAACCATCTTTGGGATTTACACAATGAGCCACAATGATGAGCCA
ACTACTGAAGATGTCTTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCTGCGGGTTACTGTATGTAC
GGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACTGGTGTCAATGGATTTACCCTGGAC
CCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCGGACATTAAGATTCCGAAAAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2ED31TF 653 0 0
GGGTGGCTTAGAC
GAGAGAGAGGATCAAAGATGGATCACGAAGCAGATGCATACCGTACGGATTTGATGACCA
TCACGAGGTTCGTGCTGAATGAGCAATCAAAGTACCCAGAGTCTCGTGGTGATTTCACCA
TTTTGCTCAGCAACATCGTTTTGGGATGCAAATTCGTCTGCAGTGCTGTCAACAAGGCTG
GTTTGGCCAAGCTAATTGGGCTTGCTGGGGAAACAAATATCCAGGGTGAAGAGCAAAAGA
AACTCGATGTGCTCTCTAATGATGTCTTTGTCAAAGCTTTGGTTAGCAGTGGCAGAACTT
CTGTTCTTGTCTCAGAAGAAGATGAGGAAGCAACGTTCGTGGAGTCATCCAAGCGTGGAA
AGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATCGACTGTGGTGTCTCCA
TTGGAACCATCTTTGGGATTTACACAATGAGCCACAATGATGAGCCAACTACTGAAGATG
TCTTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCTGCGGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCA
TGCTTGTGTTGAGCACTGGAACTGGTGTCAATGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAG
AGTTCATATTAACTCACCCGGACATTAAGATTCCGAAAAA

QA 14 653 14 653
DS 

RD RR2C181TF 555 0 0
GCAATCAAAGTACCCAGAGTCTCGTGGTGATTTCACCATTTTGCTCAGCAACATCGTTTT
GGGATGCAAATTCGTCTGCAGTGCTGTCAACAAGGCTGGTTTGGCCAAGCTAATTGGGCT
TGCTGGGGAAACAAATATCCAGGGTGAAGAGCAAAAGAAACTCGATGTGCTCTCTAATGA
TGTCTTTGTCAAAGCTTTGGTTAGCAGTGGCAGAACTTCTGTTCTTGTCTCAGAAGAAGA
TGAGGAAGCAACGTTCGTGGAGTCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCC
ACTTGATGGATCCTCAAACATCGACTGTGGTGTCTCCATTGGAACCATCTTTGGGATTTA
CACAATGAGCCACAATGATGAGCCAACTACTGAAGATGTCTTGAAACCTGGGAATGAAAT
GGTTGCTGCGGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAAC
TGGTGTCAATGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCGGA
CATTAAGATTCCGAA

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2EP67TF 618 0 0
G
GGATCAAAGATGGATCACGAAGCAGATGCATACCGTACGGATTTGATGACCATCACGAGG
TTCGTGCTGAATGAGCAATCAAAGTACCCAGAGTCTCGTGGTGATTTCGCCATTTTGCTC
AACAACATCGTTTTGGGATGCAAATTCGTCTGCAGTGCTGTCAACAAGGCTGGTTTGGCC
AAGCTAATTGGGCTTGCTGGGGAAACAAATATCCAGGGTGAAGAGCAAAAGAAACTCGAT
GTGCTCTCTAATGATGTCTTTGTCAAAGCTTTGGTTAGCAGTGGCAGAACTTCTGTTCTT
GTCTCAGAAGAAGATGAGGAAGCAACGTTCGTGGAGTCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGT
GTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATCGACTGTGGTGTCTCCATTGGAACC
ATCTTTGGGATTTACACAATGAGCCACAATGATGAGCCAACTACTGAAGATGTCTTGAAA
CCTGGGAATGAAATGGTTGCTGCGGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTG
TTGAGCACTGGAACTGGTGTCAATGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATA
TTAACTCACCCGGACAT

QA 2 618 2 618
DS 

RD RR2AT31TF 761 0 0
GAGACGA
GAGAGAGAGGATCAAAGATGGATCATGAAGCAGATGCATACCGTACGGATTTGATGACCA
TTACGAGGTTCGTGCTGAATGAGCAATCAAAGTACCCAGAGTCTCGTGGTGATTTCACCA
TTTTGCTCAGCAACATCGTTTTGGGATGCAAATTCGTCTGCAGTGCTGTCAACAAGGCTG
GTTTGGCCAAGCTAATTGGGCTTGCTGGGGAAACAAATATCCAGGGTGAAGAGCAAAAGA
AACTCGATGTGCTCTCTAATGATGTCTTTGTCAAAGCTTTGGTTAGCAGTGGCAGAACTT
CTGTTCTTGTCTCAGAAGAAGATGAGGAAGCAACGTTCGTGGAGTCATCCAAGCGTGGAA
AGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATCGACTGTGGTGTTTCCA
TTGGAACCATCTTTGGGATTTACACAATGAGCCACAATGATGAGCCAACTACTGAAGATG
TCTTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCTGCGGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCA
TGCTTGTGTTGAGCACTGGAACTGGTGTCAATGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAG
AGTTCATATTAACTCACCCGGACATTAATATTCCGAAAAAGGGAAACATCTATTCAGTGA
ATGAAAGCAATGCTCAGAACTGGGATGGTCCAACCACAAAGTATGTAGAGAAATGCAAGT
TTCCTAAAGATGGTTCTCCTGCTAAGTCTCTGAG

QA 8 761 8 761
DS 

RD RR2AT31JQ 913 0 0
GAGCAAAAGAAACTCGATGTGCTCTCTAATGATGTCTTTGTCAAAGCTTTGGTTAGCAGT
GGCAGAACTTCTGTTCTTGTCTCAGAAGAAGATGAGGAAGCAACGTTCGTGGAGTCATCC
AAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATCGACTGT
GGTGTTTCCATTGGAACCATCTTTGGGATTTACACAATGAGCCACAATGATGAGCCAACT
ACTGAAGATGTCTTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCTGCGGGTTACTGTATGTACGGA
AGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACTGGTGTCAATGGATTTACCCTGGACCCA
TCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCGGACATTAATATTCCGAAAAAGGGAAACATC
TATTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGATGGTCCAACCACAAAGTATGTAGAG
AAATGCAAGTTTCCTAAAGATGGTTCTCCTGCTAAGTCTTTGAGATATGTGGGAAGTATG
GTAGCTGATGTTCATCGCACACTGCTTTATGGAGGAATCTTCTTGTACCCGGCTGACAAG
AAAAGCCCCAATGGGAAACTGCGTGTTCTGTATGAAGTCTTCCCGATGTCGTTCTTGATG
GAGCAAGCCGGAGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGGCGCTAGACCTTGTGCCCGAG
AAGATCCATGAGCGTTCTCCAATATTTCTTGGTAGCTACGAAGATGTAGAGGAGATTAAG
GCTCTGTATGCTGCAGAGGACTAAGATTCTCATTCTTCTTATTTTATTACTTGTCTCTCT
CTCTTATTTCTATATCTTCTTCTATTGAGACAAACAAACGACTCATTTATACAAGGGAGA
CTTTTTCTCATCG

QA 1 913 1 913
DS 

RD RR2DN46JQ 810 0 0
ACGTTCGTGGAGTCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGA
TCCTCAAACATCGACTGTGGTGTTTCCATTGGAACCATCTTTGGGATTTACACAATGAGC
CACAATGATGAGCCAACTACTGAAGATGTCTTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCTGCG
GGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCCGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACTGGTGTCAAT
GGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCGGACATTAAGATT
CCGAAAAAGGGGAACATCTATTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGATGGTCCA
ACCACAAAGTATGTAGAGAAATGCAAGTTTCCTAAAGATGGTTCTCCTGTTAAGTCTCTG
AGATATGTGGGAAGTATGGTAGCTGATGTTCATCGCACACTGCTTTATGGAGGAATCTTC
TTGTACCCGGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAACTGCGTGTTCTGTATGAAGTCTTC
CCGATGTCGTTCTTGATGGAGCAAGCCGGAGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGGCG
CTAGACCTTGTGCCCGAGAAGATCCATGAGCGTTCTCCAATATTTCTTGGTAGCTACGAA
GATGTAGAGGAGATTAAGGCTCTGTATGCTGCAGAGGACTAAGATTCTCATTCTTCTTAT
TTTATTACTTGTCTCTCTCTCTTATTTCTATATCTTCTTCTATTGAGACAAACAAACGAC
TCATTTATACAAGGGAGACTTTTTCTC
ATC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2C181JQ 801 0 0
GTGGAGTCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTT*GATCCACTTGATGGATCCTCA
AACATCGACTGTGGTGTCTCCATTGGAACCATCTTTGGGATTTACACAATGAGCCACAAT
GATGAGCCAACTACTGAAGATGTCTTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCTGCGGGTTAC
TGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACTGGTGTCAATGGATTT
ACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCGGACATTAAGATTCCGAAA
AAGGGGAACATCTATTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGATGGTCCAACCACA
AAGTATGTAGAGAAATGCAAGTTTCCTAAAGATGGTTCTCCCGCTAAGCCTCTGAGATAT
GTGGGAAGTATGGTAGCTGATGTTCATCGCACACTGCTTTATGGAGGAATCTTCTTGTAC
CCGGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAACTGCGTGTTCTGTATGAAGTCTTCCCGATG
TCGTTCTTGATGGAGCAAGCCGGAGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGGCGCTAGAC
CTTGTGCCCGAGAAGATCCATGAGCGTTCTCCAATATTTCTTGGTAGCTACGAAGATGTA
GAGGAGATTAAGGCTCTGTATGCTGCAGAGAACTAAGATTCTCATTCTTCTTATTTTATT
AATTGTCTCTCCCT**TATTTCTATATCTTCTTCTGTTGAGACAAACAAACGACTCATTT
ATACAAGGGAGACTTTTTCTC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2EP67JQ 632 0 0
CGGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACTGGTGTCA
ATGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCGGACATTAAGA
TTCCGAAAAAGGGGAGCATCTATTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGATGGTC
CAACCACAAAGTATGTAGAGAAATGCAAGTTTCCTAAAGATGGTTCTCCCGCTAAGTTTC
TGAGATATGTGGGAAGTATGGTAGCTGATGTTCATCGCACACTGCTTTATGGAGGAATCT
TCTTGTACCCGGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAACTGCGTGTTCTGTATGAAGTCT
TCCCGATGTCGTTCTTGATGGAGCAAGCCGGAGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGG
CGCTAGACCTTGTGCCCGAGAAGATCCATGAGCGTTCTCCAATATTTCTTGGTAGCTACG
AAGATGTAGAGGAGATTAAGGCTCTGTATGCTGCAGAGAACTAAGATTCTCATTCTTCTT
ATTTTATTAATTGTCTCTCCCT**TATTTCTATATCTTCTTCTGTTGAGACAAACAAACG
ACTCATTTATACAAGGGAGACTTTTTC
GCAAA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2ED31JQ 708 0 0
TCTTTGGGATTTACACAATGAGCCACAATGATGAGCCAACTACTGAAGATGTCTTGAAAC
CTGGGAATGAAATGGTTGCTGCGGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGT
TGAGCACTGGAACTGGTGTCAATGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATAT
TAACTCACCCGGACATTAAGATTCCGAAAAAGGGGAACATCTATTCAGTGAATGAAGGCA
ATGCTCAGAACTGG*ATGGTCCAACCACAAAGTATGTAGAGAAATGCAAGTTTCCTAAAG
ATGGTTCTCCCGCTAAGTCTCTGAGATATGTGGGAAGTATGGTAGCTGATGTTCATCGCA
CACTGCTTTATGGAGGAATCTTCTTGTACCCGGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAAC
TGCGTGTTCTGTATGAAGTCTTCCCGATGTCGTTCTTGACGGAGCAAGCCGGAGGTCAGG
CCTTCACTGGCAAGAAAAGGGCGCTAGACCTTGTGCCCGAGAAGATCCATGAGCGTTCTC
CAATATTTCTTGGTAGCTACGAAGATGTAGAGGAGATTAAGGCTCTGTATGCTGCAGAGA
ACTAAGATTCTCATTCTTCTTATTTTATTAATTGTCTCTCCCT**TATTTCTATATCTTC
TTCTGTTGAGACAAACAAACGACTCATTTATACAAGGGAGACTTTTTC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2DE41JQ 760 0 0
TCCACTTGATGGATCCTCAAACATCGACTGTGGTGTCTCCATTGGAACCATCTTTGGGAT
TTACACAATGAGCCACAATGATGAGCCAACTACTGAAGATGTCTTGAAACCTGGGAATGA
AATGGTTGCTGCGGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGG
AACTGGTGTCAATGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCC
GGACATTAAGATTCCGAAAAAGGGGAACATCTATTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAA
CTGGGATGGTCCAACCATAAAGTATGTAGAGAAATGCAAGTTTCCTAAAGATGGTTCTCC
CGCTAAGTCTCTGAGATATGTGGGAAGTATGGTAGCTGATGTTCATCGCACACTGCTTTA
TGGAGGAATCTTCTTGTACCCGGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAACTGCGTGTTCT
GTATGAAGTCTTCCCGATGTCGTTCTTGATGGAGCAAGCCGGAGGTCAGGCCTTCACTGG
CAAGAAAAGGGCGCTAGACCTTGTGCCCGAGAAGATCCATGAGCGTTCTCCAATATTTCT
TGGTAGCTACGAAGATGTAGAGGAGATTAAGGCTCTGTATGCTGCAGAGAACTAAGATTC
TCATTCTTCTTATCTTATTAATTGTCTCTCCCT**TATTTCTATATCTTCTTCTGTTGAG
ACAAACAAACGACTCATTTATACAAGGGAGACTTTTTCTC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 3 15

CO CL206Contig1 803 2 23 U
CCCAACCGATATATAGTAATAATGATCTTAAATTATCAATGATTATGGTAATAAAAGGGT
GGTGATAAACCAAAAAAAAAAGCCAAAAAGAAAACACTCGGGCAATAATCGTTGAGAGTT
TGTGGAATCAAAGATGCTTGTTTTTATTTGGAAGAAACCACAAAACAAAGGATGGCTCAG
TGTGGATTTAGTTGAAGTCGGGCTTCTCAGGGTAAGTGCAGCCAGATCTTTGGATCACCA
CGTTCGACGCGTAGCATCCGGCCTTCACGCACTCCTCAATCGATTTCTCTTTCACCAACT
GTGACATGAATCCTCCCACAAATGCATCACCTGCACCGTTGGTGTCAACAAGCTTCTCCT
TTGGGAGAAGGATGACAGGGTACTTCGTCACCTTTCCATCTTCAGCAACAACCACTGGGT
CTGCCCCCTGTGTAATCACGGCGGTCCTCTTGTATGTTCCTGTGGCCTTGGGTAACTGTG
AAATCTTGATGGCTATTTGTTCCACATCTTCGGTCTCCCAGCCATGAACCTTGGAGAAGG
TTCTTGCTTCTGTCTCGTTACCAAAAACAAAGTCCATGTATGGCAAGAACTTCTCCTGCG
CATCTTTGAAGAATTCACTGATGAATGGAGCGGAGAGGTTCATTGTGAAGACCTTGTTGT
TAGCAGCAGCGTGCTCAGATACCAACTGAATGGATTCGGGGGACACTGTGAGGAAGAATC
CAGCAATGTAGTAGAACTTGGCCTTCTCAACCAATGCCCAGTTTTCAGGCTTCTTAAGGT
GCTCAACCTTGTAGCAGTTAGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK33JQ U 15
AF RR2AT71JQ U 1
BS 1 80 RR2AT71JQ
BS 81 81 RR2BK33JQ
BS 82 123 RR2AT71JQ
BS 124 124 RR2BK33JQ
BS 125 155 RR2AT71JQ
BS 156 156 RR2BK33JQ
BS 157 157 RR2AT71JQ
BS 158 158 RR2BK33JQ
BS 159 178 RR2AT71JQ
BS 179 179 RR2BK33JQ
BS 180 244 RR2AT71JQ
BS 245 245 RR2BK33JQ
BS 246 277 RR2AT71JQ
BS 278 278 RR2BK33JQ
BS 279 365 RR2AT71JQ
BS 366 366 RR2BK33JQ
BS 367 368 RR2AT71JQ
BS 369 369 RR2BK33JQ
BS 370 439 RR2AT71JQ
BS 440 440 RR2BK33JQ
BS 441 469 RR2AT71JQ
BS 470 470 RR2BK33JQ
BS 471 803 RR2AT71JQ

RD RR2BK33JQ 512 0 0
G
GTAATAATGATCTTAAATTATCAATGATTATGGTAATAAAAGGGTG***ATAAACCAAAA
AAAAAAGCCAAAAAGATAACACTCGGGCAATAATCGTTGAGAGTTTGTGGAATCAAAGAT
GCTTGTTTTTATTTGGAAGAAACCACAAAACAAAGGATGGCTCAGTGTGGATTTAGTTGA
AGTCGGGCTTCTCAGGGTATGTGCAGCCAGATCTTTGGATCACCACGTTCGACGCGTAGC
ATCCGGCCTTCACGCACTCCTCAATCGATTTCTCTTTCACCAACTGTGACATGAATCCTC
CCACAAATGCATCACCTGCACCGTTGGTGTCAACAAGCTTCTCCTTTGGGAGAAGGATGA
CAGGGTACTTCGTCACCTTTCCATTTTCAGCAACAACCACTGGGTCTGCCCCCTGTGTAA
TCACGGTGGTCCTCTTGTATGTTCCTGTGGCCTTGGGTAACTGTGAAATCTTGATGGCTA
TTTGTTCCACATCTTCGGTCTCCCAGCCATG

QA 2 512 2 512
DS 

RD RR2AT71JQ 803 0 0
CCCAACCGATATATAGTAATAATGATCTTAAATTATCAATGATTATGGTAATAAAAGGGT
GGTGATAAACCAAAAAAAAA*GCCAAAAAGAAAACACTCGGGCAATAATCGTTGAGAGTT
TGTTGAATCAAAGATGCTTGTTTTTATTTGGAAGATATCACAAAACAAAGGATGGCTCGG
TGTGGATTTAGTTGAAGTCGGGCTTCTCAGGGTAAGTGCAGCCAGATCTTTGGATCACCA
CGTTTGACGCGTAGCATCCGGCCTTCACGCACTCCTCGATCGATTTCTCTTTCACCAACT
GTGACATGAATCCTCCCACAAATGCATCACCTGCACCGTTGGTGTCAACAAGCTTCTCCT
TTGGGGGAGGGATGACAGGGTACTTCGTCACCTTTCCATCTTCAGCAACAACCACTGGGT
CTGCCCCCTGTGTAATCACTGCGGTCCTCTTGTATGTTCCTGTGGCCTTTGGTAACTGTG
AAATCTTGATGGCTATTTGTTCCACATCTTCGGTCTCCCAGCCATGAACCTTGGAGAAGG
TTCTTGCTTCTGTCTCGTTACCAAAAACAAAGTCCATGTATGGCAAGAACTTCTCCTGCG
CATCTTTGAAGAATTCACTGATGAATGGAGCGGAGAGGTTCATTGTGAAGACCTTGTTGT
TAGCAGCAGCGTGCTCAGATACCAACTGAATGGATTCGGGGGACACTGTGAGGAAGAATC
CAGCAATGTAGTAGAACTTGGCCTTCTCAACCAATGCCCAGTTTTCAGGCTTCTTAAGGT
GCTCAACCTTGTAGCAGTTAGCA

QA 1 803 1 803
DS 



CO CL206Contig2 870 7 36 U
GGGCACCAACTTTCTCTGGGCTCTTTGATTATAAACAGACGCCTTCACACTCACCCACTT
AAACTCCCCCTCCTCATCAGATCTGAATCTAAACTTCTCTTCTCAGATTCATCGAAATGG
CTTCCACTAACAACTACGATGGAATCCTTCTCGGAATGGGCAACCCACTCCTCGACATCT
CTGCCGTCGTCGACGAGGCATTTCTCACCAAGTACGACGTCAAGTTGAACAATGCTATTC
TCGCCGAGGAGAAACATTTGCCCATGTATGAAGAGATGAGTAGCAAGTTCAATGTTGAAT
ACATTGCC*GGAGGTGCTACTCAGAACTCAATCAAAGTGGCTCAGTGGATGCTTCAAATT
CCTGGGGCAACCAGTTACATGGGTTCCATTGGAAAGGACAAATATGGTGAGGCTATGAAG
AAGGATGCTACTGCTGCTGGTGTCAATGTTCACTACTACGAGGATGAGTCTGCACCTACT
GGAACTTGCGGTGTCTGTGTTGTTGGTGG*AGAGAGGTCGCTTATTGCTAATCTTTCAGC
TGCTAACTGCTACAAGGTTGAGCACCTTAAGAAGCCTGAAAACTGGGCTTTGGTTGAGAA
GGCCAAGTTCTACTACATTGCTGGATTCTTCCTCACAGTGTCCCCCGAATCCATTCAGTT
GGTATCTGAGCACGCTGCTGCTAACAACAAGGTGTTCACAATGAACCTCTCTGCTCCATT
CATCTGTGAATTCTTCAAAGATGCGCAG*AGAAGTTCTTGCCGTACATGGACTTTGTTTT
TGGCAACGAGACAGAAGCAAGAACCTTCTCCAAGTTCATGGCTGGGAGACCGAAGATGTG
GAACAAATAGCCATCAAGATTCACAGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT71TF U 89
AF RR2FZ75TF U 1
AF RR2HB63TF U 16
AF RR2GZ69TF U 16
AF RR2EB54TF U 72
AF RR2C056TF U 111
AF RR2EK11TF U 142
BS 1 65 RR2FZ75TF
BS 66 67 RR2GZ69TF
BS 68 173 RR2FZ75TF
BS 174 174 RR2AT71TF
BS 175 235 RR2FZ75TF
BS 236 236 RR2GZ69TF
BS 237 250 RR2FZ75TF
BS 251 251 RR2GZ69TF
BS 252 271 RR2FZ75TF
BS 272 272 RR2GZ69TF
BS 273 404 RR2FZ75TF
BS 405 405 RR2GZ69TF
BS 406 410 RR2FZ75TF
BS 411 411 RR2GZ69TF
BS 412 425 RR2FZ75TF
BS 426 426 RR2GZ69TF
BS 427 431 RR2FZ75TF
BS 432 432 RR2GZ69TF
BS 433 458 RR2FZ75TF
BS 459 459 RR2GZ69TF
BS 460 482 RR2FZ75TF
BS 483 483 RR2GZ69TF
BS 484 534 RR2FZ75TF
BS 535 535 RR2GZ69TF
BS 536 588 RR2FZ75TF
BS 589 589 RR2GZ69TF
BS 590 690 RR2FZ75TF
BS 691 691 RR2C056TF
BS 692 736 RR2GZ69TF
BS 737 738 RR2EB54TF
BS 739 739 RR2C056TF
BS 740 779 RR2EB54TF
BS 780 783 RR2C056TF
BS 784 784 RR2EK11TF
BS 785 804 RR2C056TF
BS 805 870 RR2EK11TF

RD RR2AT71TF 243 0 0
GG
AAACTTCTCTTCTCAGATTCATCGAAATGGCTTCCACTAACAACTACGATGGAATCCTTC
TCGGAATGGGCAACCCACTCCTCGACATCTCTGCCGTCGTCGACGAGGCATTTCTCACCA
AGTACGGCGTCATGTTGAACAATGCGATTCTCGCCGAGGAAAAACATTTGCCCATGTATG
ATGAGATGAGTAGCAAGTTCAATGTTGAATACATTGCCCGGAGGTGCTACTCAGAACTCA
A

QA 3 243 3 243
DS 

RD RR2FZ75TF 690 0 0
GGGCACCAACTTTCTCTGGGCTCTTTGATTATAAACAGACGCCTTCACACTCACCCACTT
AAACTTGCCCTCCTCATCAGATCTGAATCTAAACTTCTCTTCTCAGATTCATCGAAATGG
CTTCCACTAACAACTACGATGGAATCCTTCTCGGAATGGGCAACCCACTCCTCAACATCT
CTGCCGTCGTCGACGAGGCATTTCTCACCAAGTACGACGTCAAGTTGAACAATGCGATTC
TCGCCGAGGAAAAACATTTGCCCATGTATGATGAGATGAGTAGCAAGTTCAATGTTGAAT
ACATTGCC*GGAGGTGCTACTCAGAACTCAATCAAAGTGGCTCAGTGGATGCTTCAAATT
CCTGGGGCAACCAGTTACATGGGTTCCATTGGAAAGGACAAATACGGTGAAGCTATGAAG
AAGGACGCTACAGCTGCTGGTGTCAATGTTCACTACTATGAGGATGAGTCTGCACCTACT
GGTACTTGCGGTGTCTGTGTTGTTGGTGG*AGAGAGGTCGCTTATTGCTAATCTCTCAGC
TGCTAACTGCTACAAGGTTGAGCACCTTAAGAAGCCTGAAAACTGGGCATTGGTTGAGAA
GGCCAAGTTCTACTACATTGCTGGATTCTTCCTCACAGTGTCCCCCGAATCCATTCAGTT
GGTATCTGAGCACGCTGCTGCTAACAACAA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2HB63TF 698 0 0
GGGA
GCTCTTTGATTATAAACAGACGCCTTCACACTCACCCACTTAAACTCCCCCTCCTCATCA
GATCTGAATCTAAACTTCTCTTCTCAGATTCATCGAAATGGCTTCCACTAACAACTACGA
TGGAATCCTTCTCGGAATGGGCAACCCACTCCTCGACATCTCTGCCGTCGTCGACGAGGC
ATTTCTCACCAAGTACGACGTCAAGTTGAACAATGCTATTCTCGCCGAGGAGAAACATTT
GCCCATGTATGAAGAGATGAGTAGCAAGTTCAATGTTGAATACATTGCC*GGAGGTGCTA
CTCAGAACTCAATCAAAGTGGCTCAGTGGATGCTTCAAATTCCTGGGGCAACCAGTTACA
TGGGTTCCATTGGAAAGGACAAATATGGTGAGGCTATGAAGAAGGATGCTACTGCTGCTG
GTGTCAATGTTCACTACTACGAGGATGAGTCTGCACCTACTGGAACTTGCGGTGTCTGTG
TTGTTGGTGG*AGAGAGGTCGCTTATTGCTAATCTTTCAGCTGCTAACTGCCACAAGGTT
GAGCACCTTAAGAAGCCTGAAAACTGGGCTTTGGTTGAGAAGGCCAAGTTCTACTACATT
GCTGGATTCTTCCTCACAGTGTCCCCCGAATCCATTCAGTTGGTATCTGAGCACGCTGCT
GCTAACAACAA*GTGTTCACAATGAACCTCTCTG

QA 5 698 5 698
DS 

RD RR2GZ69TF 721 0 0
GGGA
GCTCTTTGATTATAAACAGACGCCTTCACACTCACCCACTTAAACTCCCCCTCCTCATCA
GATCTGAATCTAAACTTCTCTTCTCAGATTCATCGAAATGGCTTCCACTAACAACTACGA
TGGAATCCTTCTCGGAATGGGCAACCCACTCCTCGACATCTCTGCCGTCGTCGACGAGGC
ATTTCTCACCAAGTACGACGTCAAGTTGAACAATGCTATTCTCGCCGAGGAGAAACATTT
GCCCATGTATGAAGAGATGAGTAGCAAGTTCAATGTTGAATACATTGCC*GGAGGTGCTA
CTCAGAACTCAATCAAAGTGGCTCAGTGGATGCTTCAAATTCCTGGGGCAACCAGTTACA
TGGGTTCCATTGGAAAGGACAAATATGGTGAGGCTATGAAGAAGGATGCTACTGCTGCTG
GTGTCAATGTTCACTACTACGAGGATGAGTCTGCACCTACTGGAACTTGCGGTGTCTGTG
TTGTTGGTGG*AGAGAGGTCGCTTATTGCTAATCTTTCAGCTGCTAACTGCCACAAGGTT
GAGCACCTTAAGAAGCCTGAAAACTGGGCTTTGGTTGAGAAGGCCAAGTTCTACTACATT
GCTGGATTCTTCCTCACAGTGTCCCCCGAATCCATTCAGTTGGTATCTGAGCACGCTGCT
GCTAACAACAA*GTGTTCACAATGAACCTCTCTGCTCCATTCATCTGTGAATTCTTC

QA 5 721 5 721
DS 

RD RR2EB54TF 708 0 0
GG
TCATCAGATCTGAATCTAAACTTCTCTTCTCAGATTCATCGAAATGGCTTCCACTAACAA
CTACGATGGAATCCTTCTCGGAATGGGCAACCCACTCCTCGACATCTCTGCCGTCGTCGA
CGAGGCATTTCTCACCAAGTACGACGTCAAGTTGAACAATGCTATTCTCGCCGAGGAGAA
ACATTTGCCCATGTATGAAGAGATGAGTAGCAAGTTCAATGTTGAATACATTGCC*GGAG
GTGCTACTCAGAACTCAATCAAAGTGGCTCAGTGGATGCTTCAAATTCCTGGGGCAACCA
GTTACATGGGTTCCATTGGAAAGGACAAATATGGTGAGGCTATGAAGAAGGATGCTACTG
CTGCTGGTGTCAATGTTCACTACTACGAGGATGAGTCTGCACCTACTGGAACTTGCGGTG
TCTGTGTTGTTGGTGG*AGAGAGGTCGCTTATTGCTAATCTTTCAGCTGCTAACTGCTAC
AAGGTTGAGCACCTTAAGAAGCCTGAAAACTGGGCTTTGGTTGAGAAGGCCAAGTTCTAC
TACATTGCTGGATTCTTCCTCACAGTGTCCCCCGAATCCATTCAGTTGGTATCTGAGCAC
GCTGCTGCTAACAACAAAGTGTTCACAATGAACCTCTCTGCTCCATTCATCTGTGAATTC
TTCAA*GATGCGCAG*AGAAGTTCTTGCCGTACATGGACTTTGTTT

QA 3 708 3 708
DS 

RD RR2C056TF 698 0 0
ATCGAAATGGCTTCCACTAACAACTACGATGGAATCCTTCTCGGAATGGGCAACCCACTC
CTCGACATCTCTGCCGTCGTCGACGAGGCATTTCTCACCAAGTACGACGTCAAGTTGAAC
AATGCGATTCTCGCCGAGGAAAAACATTTGCCCATGTATGATGAGATGAGTAGCAAGTTC
AATGTTGAATACATTGCC*GGAGGTGCTACTCAGAACTCAATCAAAGTGGCTCAGTGGAT
GCTTCAAATTCCTGGGGCAACCAGTTACATGGGTTCCATTGGAAAGGACAAATACGGTGA
AGCTATGAAGAAGGACGCTACAGCTGCTGGTGTCAATGTTCACTACTATGAGGATGAGTC
TGCACCTACTGGTACTTGCGGTGTCTGTGTTGTTGGTGGGAGAGAGGTCGCTTATTGCTA
ATCTCTCAGCTGCTAACTGCTACAAGGTTGAGCACCTTAAGAAGCCTGAAAACTGGGCAT
TGGTTGAGAAGGCCAAGTTCTACTACATTGCTGGATTCTTCCTCACAGTGTCCCCCGAAT
CCATTCAGTTGGTATCTGAGCACGCTGCTGCTAACAACAAGGTCTTCACAATGAACCTCT
CCGCTCCATTCATCTGTGAATTCTCCAAAGATGCGCAG*AGAAGTTCTTGCA*TACATGG
ACTTTGTTTTTGGTAACGAGACAGAAGCAAGAAC
TTCT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2EK11TF 729 0 0
GAATCCTTCTCGGAATGGGCAACCCACTCCTCGACATCTCTGCCGTCGTCGACGAGGCAT
TTCTCACCAAGTACGACGTCAAGTTGAACAATGCTATTCTCGCCGAGGAGAAACATTTGC
CCATGTATGAAGAGATGAGTAGCAAGTTCAATGTTGAATACATTGCC*GGAGGTGCTACT
CAGAACTCAATCAAAGTGGCTCAGTGGATGCTTCAAATTCCTGGGGCAACCAGTTACATG
GGTTCCATTGGAAAGGACAAATATGGTGAGGCTATGAAGAAGGATGCTACTGCTGCTGGT
GTCAATGTTCACTACTACGAGGATGAGTCTGCACCTACTGGAACTTGCGGTGTCTGTGTT
GTTGGTGG*AGAGAGGTCGCTTATTGCTAATCTTTCAGCTGCTAACTGCTACAAGGTTGA
GCACCTTAAGAAGCCTGAAAACTGGGCTTTGGTTGAGAAGGCCAAGTTCTACTACATTGC
TGGATTCTTCCTCACAGTGTCCCCCGAATCCATTCAGTTGGTATCTGAGCACGCTGCTGC
TAACAACAAGGTGTTCACAATGAACCTCTCTGCTCCATTCATCTGTGAATTCTTCAAAGA
TGCGCAGGAGAAGTTCTTGCCGTACATGGACTTTGTTTTTGGCAATGAGACAGACGCAAG
AACCTTCTCCAAGTTCATGGCTGGGAGACCGAAGATGTGGAACAAATAGCCATCAAGATT
CACAGTTAC

QA 1 729 1 729
DS 



CO CL206Contig3 1286 6 17 U
CTCAACCGATATATAGTAATAATGATCTTAAATTATCAATGATTATGGTAATAAAAGGGT
GATAAACAAACCAAAAAGAAAAGCCAAAAAGATAACACTCGGGCAATAATCGTTGAGAGT
ATGTTGAATCAAAGATGCTTGTTTTTATTTGGAAGATATCACAAAAACAAAGGATGGCTC
AGTGTGGATTTAGTTGAAGTCGGGCTTCTCAGGGTAAGTGCAGCCAGATCTTTGGATCAC
CACGTCTGACGCATAGCATCCGGCCTTCACGCACTCCTCAATCGATTTCTCTTTCACCAA
CTGTGACATGAATCCTCCAACAAATGCATCACCTGCACCGTTGGTGTCAACAAGCTTCCC
CTTTGGGAGAGGGATGACAGGGTACTTCGTGACCTTTCCATCTTCAGCAACAACCACTGG
GTCTGCCCCCTGTGTAATCACGGTGGTCCTCTTGTATGTTCCTGTGGCCTTGGGTAACTG
TGAAATCTTGATGGCTATTTGTTCCACATCTTCGGTCTCCCAGCCATGAACCTTGGAGAA
GGTTCTTGCCTCTGTCTCATTGCCAAAAACAAAGTCCATGTACGGCAAGAACTTCTCCTG
CGCATCTTTGAAGAATTCACAGATGAATGGAGCAGAGAGGTTCATTGTGAATACCTTGTT
GTTAGCAGCAGCGTGCTCAGACACCAACTGAATGGATTCGGGGGATACAGTGAGAAAGAA
TCCAGCAATGTAGTAGAACTTGGCCTTCTCAACCAGAGCCCAGTTTTCAGGCTTCTTAAG
GTGCTCAACCTTGTAGCAGTTAGCAGCAGAAAGATTAGCAATAAGCGACCTCTCTCCACC
AACAACACAGACACCGCAAGTACCAGTAGGTGCAGACTCATCCTCATAGTAGTGAACATT
GACACCAGCAGCAGTAGCATCCTTCTTCATAGCCTCACCGTATTTGTCCTTTCCAATGGA
ACCCATGTAACTGGCTGCCCCAGGAATTTGAAGCATCCACTGAGCCACTTTGATTGAGTT
CTGAGTAGCACCTCCGGCAATGTATTCAACATTGAACTTGCTACTCATCTCATCATACAT
GGGCAAATGTTTTTCCTCGGCGAGAATCGCATTGTTCAACTTGACGTCGTACTTGGTGAG
AAATGCCTCGTCGACGACGGCAGAGATATCGAGGAGTGGGTTGCCCATTCCGAGAAGGAT
TCCATCGTAGTTGTTAGAGGAGGCCATTTCGATGAATCTGAGAAGAGAAGTTTAGATTCA
GATCTGATGAGGAGGCAAGTGTTCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 0 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ69JQ U 1
AF RR2HB63JQ U 1
AF RR2EK11JQ U 13
AF RR2C119JQ U 89
AF RR2BK33TF C 552
AF RR2C119TF C 554
BS 1 536 RR2GZ69JQ
BS 537 651 RR2HB63JQ
BS 652 652 RR2C119JQ
BS 653 664 RR2HB63JQ
BS 665 681 RR2EK11JQ
BS 682 682 RR2C119JQ
BS 683 705 RR2EK11JQ
BS 706 706 RR2C119JQ
BS 707 708 RR2EK11JQ
BS 709 709 RR2C119JQ
BS 710 714 RR2EK11JQ
BS 715 715 RR2C119JQ
BS 716 716 RR2EK11JQ
BS 717 835 RR2C119JQ
BS 836 854 RR2BK33TF
BS 855 855 RR2C119TF
BS 856 1286 RR2BK33TF

RD RR2GZ69JQ 536 0 0
CTCAACCGATATATAGTAATAATGATCTTAAATTATCAATGATTATGGTAATAAAAGGGT
GATAAACAAACCAAAAAGAAAAGCCAAAAAGATAACACTCGGGCAATAATCGTTGAGAGT
ATGTTGAATCAAAGATGCTTGTTTTTATTTGGAAGATATCACAAAAACAAAGGATGGCTC
AGTGTGGATTTAGTTGAAGTCGGGCTTCTCAGGGTAAGTGCAGCCAGATCTTTGGATCAC
CACGTCTGACGCATAGCATCCGGCCTTCACGCACTCCTCAATCGATTTCTCTTTCACCAA
CTGTGACATGAATCCTCCAACAAATGCATCACCTGCACCGTTGGTGTCAACAAGCTTCCC
CTTTGGGAGAGGGATGACAGGGTACTTCGTGACCTTTCCATCTTCAGCAACAACCACTGG
GTCTGCCCCCTGTGTAATCACGGTGGTCCTCTTGTATGTTCCTGTGGCCTTGGGTAACTG
TGAAATCTTGATGGCTATTTGTTCCACATCTTCGGTCTCCCAGCCATGAACCTTGG

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2HB63JQ 664 0 0
CT
CAACCGATATATAGTAATAATGATCTTAAATTATCAATGATTATGGTAATAAAAGGGTGA
TAAACAAACCAAAAAGAAAAGCCAAAAAGATAACACTCGGGCAATAATCGTTGAAAGTAT
GTTGAATCAAAGATGCTTGTTTTTATTTGGAAGATATCACAAAAACAAAGGATGGCTCAG
TGTGGATTTAGTTGAAGTCGGGCTTCTCAGGGTAAGTGCAGCCAGATCTTTGGATCACCA
CGTCTGACGCATAGCATCCGGCCTTCACGCACTCCTCAATCGATTTCTCTTTCACCAACT
GTGACATGAATCCTCCAACAAATGCATCACCTGCACCGTTGGTGTCAACAAGCTTCCCCT
TTGGGAGAGGGATGACAGGGTACTTCGTGACCTTTCCATCTTCAGCAACAACCACTGGGT
CTGCCCCCTGTGTAATCACGGTGGTCCTCTTGTATGTTCCTGTGGCCTTGGGTAACTGTG
AAATCTTGATGGCTATTTGTTCCACATCTTCGGTCTCCCAGCCATGAACCTTGGAGAAGG
TTCTTGCCTCTGTCTCATTGCCAAAAACAAAGTCCATGTACGGCAAGAACTTCTCCTGCG
CATCTTTGAAGAATTCACAGATGAATGGAGCAGAGAGGTTCATTGTGAACACCTTGTTGT
TA

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR2EK11JQ 704 0 0
ATAGTAATAATGATCTTAAATTATCAATGATTATGGTAATAAAAGGGTGATAAACAAACC
AAAAAGAAAAGCCAAAAAGATAACACTCGGGCAATAATCGTTGAGAGTATGTTGAATCAA
AGATGCTTGTTTTTATTTGGAAGATATCACAAAAACAAAGGATGGCTCAGTGTGGATTTA
GTTGAAGTCGGGCTTCTCAGGGTAAGTGCAGCCAGATCTTTGGATCACCACGTTTGACGC
ATAGCATCCGGCCTTCACGCACTCCTCAATCGATTTCTCTTTCACCAACTGTGACATGAA
TCCTCCAACAAATGCATCACCTGCACCGTTGGTGTCAACAAGCTTCTCCTTTGGGAGAGG
GATGACAGGGTACTTCGTGACCTTTCCATCTTCAGCAACAACCACTGGGTCTGCCCCCTG
TGTAATCACGGTGGTCCTCTTGTATGTTCCTGTGGCCTTGGGTAACTGTGAAATCTTGAT
GGCTATTTGTTCCACATCTTCGGTCTCCCAGCCATGAACCTTGGAGAAGGTTCTTGCCTC
TGTCTCATTGCCAAAAACAAAGTCCATGTACGGCAAGAACTTCTCCTGCGCATCTTTGAA
GAATTCACAGATGAATGGAGCAGAGAGGTTCATTGTGAACACCTTGTTGTTAGCAGCAGC
GTGCTCAGATACCAACTGAATGGATTCGGGGGACACTGTGAGGA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2C119JQ 747 0 0
G
AGATAACACTCGGGCAATAATCGTTGAGAGTTTGTGGAATCAAAGATGCTTGTTTTTATT
TGGAAGAAACCACAAAA*CAAAGGATGGCTCAGTGTGGATTTAGTTGAAGTCGGGCTTCT
CAGGGTATGTGCAGCCAGATCTTTGGACCACCACGTTCGACGCGTAGCATCCGGCCTTCA
CGCACTCCTCAATCGATTTCTCTTCCACCAACTGTGACATGAATCCTCCCACAAATGCAT
CACCTGCACCGTTGGTGTCAACAAGCTTCTCCCTTGGGAGAAGGATGACAGGGTACTTCG
TCACCTTTCCATTTTCAGCAACAACCACTGGGTCTGCCCCCTGTGTAATCACGGTGGTCC
TCTTGTATGTTCCTGTGGCCTTGGGTAACTGTGAAATCTTGATGGCTATTTGTTCCACAT
CTTAGGTCTCCCAGCCACGAACCTTGGAGAAGGTTCTTGCCTCTGTCTCATTGCCAAAAA
CAAAGTCCATGTACGGCAAGAACTTCTCCTGCGCATCTTTGAAGAATTCACAGATGAATG
GAGCAGAAAGGTTCATTGTGAATACCTTGTTGTTAGCAGCAGCGTGCTCAGACACCAACT
GAATGGATTCGGGGGATACAGTGAGAAAGAATCCAGCAATGTAGTAGAACTTGGCCTTCT
CAACCAGAGCCCAGTTTTCAGGCTTCTTAAGGTGCTCAACCTTGTAGCAGTTAGCAGCAG
AAAGATTAGCAATAAGCGACCTCTCT

QA 2 747 2 747
DS 

RD RR2BK33TF 735 0 0
CTGTCTCATTGCCAAAA*CAAAGTCCATGTACGGCAAGAACTTCTC*TGCGCATCTTTGA
AGAATTCACAGATAAATGGAGCAGAGAGGTTCATTGTGAATACCTTGTTGTTAGCAGCAG
CGTGCTCAGACACCAACTGAATGGATTCGGGGGATACAGTGAGAAAGAATCCAGCAATGT
AGTAGAACTTGGCCTTCTCAACCAGAGTCCAGTTTTCAGGCTTCTTAAGGTGCTCAACCT
TGTAGCAGTTAGCAGCAGAAAGATTAGCAATAAGCGACCTCTCTCCACCAACAACACAGA
CACTGCAAGTACCAGTAGGTGCAGACTCATCCTCATAGTAGTGAACATTGACACCAGCAG
CAGTAGCATCCTTCTTCATAGCCTCACCGTATTTGTCCTTTCCAATGGAACCCATGTAAC
TGGCTGCCCCAGGAATTTGAAGCATCCACTGAGCCACTTTGATTGAGTTCTGAGTAGCAC
CTCCGGCAATGTATTCAACATTGAACTTGCTACTCATCTCATCATACATGGGCAAATGTT
TTTCCTCGGCGAGAATCGCATTGTTCAACTTGACGTCGTACTTGGTGAGAAATGCCTCGT
CGACGACGGCAGAGATATCGAGGAGTGGGTTGCCCATTCCGAGAAGGATTCCATCGTAGT
TGTTAGAGGAGGCCATTTCGATGAATCTGAGAAGAGAAGTTTAGATTCAGATCTGATGAG
GAGGCAAGTGTTCCC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2C119TF 732 0 0
GTCTCATTGCCAAAA*CAAAGTCCATGTACGGCAAGAACTTCTCCTGCGCATCTTTGAAG
AATTCACAGATGAATGGAGCAGAGAGGTTCATTGTGAATAC*TTGTTGTTAGCAGCAGCG
TGCTCAGACACCAACTGAATGGATTCGGGGGATACAGTGAGAAAGAATCCAGCAATGTAG
TAGAACTTGGCCTTCTCAACCAGAGCCCAGTTTTCAGGCTTCTTAAGGTGCTCAACCTTG
TAGCAGTTAGCAGCAGAAAGATTAGCAATAAGCGACCTCTCTCCACCAACAACACAGACA
CCGCAAGTACCGGTAGGTGCAGACTCATCCTCATAGTAGTGAACATTGACACCAGCAGCA
GTAGCATCCTTCTTCATAGCCTCACCGTATTTGTCCTTTCCAATGGAACCCATGTAACTG
GTTGCCCCAGGAATTTGAAGCATCCACTGAGCCACTTTGATTGAGTTCTGAGTAGCACCT
CCGGCAATGTATTCAACATTGAACTTGCTACTCATCTCATCATACATGGGCAAATGTTTT
TCCTCGGCGAGAATCGCATTGTTCAACTTGACGTCGTACTTGGTGAGAAATGCCTCGTCG
ACGACGGCAGAGATATCGAGGAGTGGGTTGCCCATTCCGAGAAGGATTCCATCGTAGTTG
TTAGAGGAGGCCATTTCGATGAATCTGAGAAGAGAAGTTTAGATTCAGATCTGATGAGGA
GG
CAAGTGTTCC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 4 16

CO CL207Contig1 771 4 13 U
GGACCGATTTGCGCGAGAGTTAAAGAGTGTAAAACGGCGAGAGCTTCGCATCTTCTCTCT
CAGGCAGCTCATTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCGCTTGTAGCAAACGAGGAGTTCC
AGCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAAATTATGTTTGCTC
TTACTTCCATCAAGGGTATTGGAAGAAGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAGCCGATG
TCGACATGAACAAGAGAGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCCGAGATCGATAACCTCATGACCA
TCGTTACAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACT
ACAAGGATGGAAAGTACTCTCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATGAAGCTGAGGGATG
ATCTCGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTCC
GTGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTA
AGAAGCGTTAAGACAATGATGCTAGCTGCAGCTGGATTGGATCTTTGACAGTCCCGTTTT
TATGTTTTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTAGGTGTTTGT
TAAGACATCCTTCTCTTGTTTTGTTATATTTCGAGATAATATTGTTGTCACGGGATCTTG
AAGTCAATTCTTTTGTTTTCCTTATAAAACTATCCAAATATTCTTTGCAAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CR78JQ C 1
AF RR2CR78TF U 1
AF RR2B344JQ C 60
AF RR2B344TF U 60
BS 1 2 RR2CR78JQ
BS 3 305 RR2CR78TF
BS 306 306 RR2B344TF
BS 307 424 RR2CR78TF
BS 425 425 RR2B344TF
BS 426 652 RR2CR78TF
BS 653 653 RR2B344TF
BS 654 685 RR2CR78TF
BS 686 686 RR2B344TF
BS 687 690 RR2CR78TF
BS 691 691 RR2B344TF
BS 692 714 RR2CR78TF
BS 715 771 RR2B344TF

RD RR2CR78JQ 720 0 0
GGACCGATTTGCGCGAGAGTTAAAGAGTGTAAAACGGCGAGAGCTTCGCATCTTCTCTCT
CAGGCAGCTCATTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCGCTTGTAGCAAACGAGGAGTTCC
AGCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAAATTATGTTTGCTC
TTACTTCCATCAAGGGTATTGGAAGAAGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAGCCGATG
TCGACATGAACAAGAGAGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCCGAGATCGATAACCTCATGACCA
TCGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACT
ACAAGGATGGAAAGTACTCTCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATGAAGCTGAGGGATG
ATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTTTGAGACACTACTGGGGTCTCC
GTGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTA
AGAAGCGTTAAGACAATGATGCTAGCTGCAGCTGGATTGGATCTTTGACAGTCCCGTTTT
TATGTTTTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTAGGTGTTTGT
TAAGACATCCTTCTCTTGTTTTGTTATATTTCGAGATAATATTGTTGTCACGGGATCTTG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2CR78TF 714 0 0
GG
ACCGATTTGCGCGAGAGTTAAAGAGTGTAAAACGGCGAGAGCTTCGCATCTTCTCTCTCA
GGCAGCTCATTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCGCTTGTAGCAAACGAGGAGTTCCAG
CACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAAATTATGTTTGCTCTT
ACTTCCATCAAGGGTATTGGAAGAAGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAGCCGATGTC
GACATGAACAAGAGAGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCCGAGATCGATAACCTCATGACCATC
GTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTAC
AAGGATGGAAAGTACTCTCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATGAAGCTGAGGGATGAT
CTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGT
GTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAAG
AAGCGTTAAGACAATGATGCTAGCTGCAGCTGGATTGGATCTTTGACAGTCCCGTTTTTA
TGTTTTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTAG*TGTTTGTTA
AGACATCCTTCTCTTGTTTTGTT*TATT*CGAGATAATATTGTTGTCACGGG

QA 3 714 3 714
DS 

RD RR2B344JQ 712 0 0
GG
AGGCAGCTCATTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCGCTTGTAGCAAACGAGGAGTTCCA
GCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAAATTATGTTTGCTCT
TACTTCCATCAAGGGTATTGGAAGAAGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAGCCGATGT
CGACATGAACAAGAGAGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCCGAGATCGATAACCTCATGACCAT
CGTTACAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACGGACAGAAAGACTA
CAAGGATGGAAAGTACTCTCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATGAAGCTGAGGGATGA
TCTCGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTCCG
TGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAA
GAAGCGTTAAGACAATGATGCTAGCTGCAGCTGGATTGGATCTTTGACAGTCCCGTTTTT
ATGTTTTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTAGGTGTTTGTT
AAGACATCCTTCTCTTGTTTTGTTATATTTCGAGATAATATTGTTGTCACGGGATCTTGA
AGTCAATTCTTTTGTTTTCCTTATAAAACTATCCAAATATTCTTTGCAAC

QA 3 712 3 712
DS 

RD RR2B344TF 712 0 0
GG
AGGCAGCTCATTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCGCTTGTAGCAAACGAGGAGTTCCA
GCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAAATTATGTTTGCTCT
TACTTCCATCAAGGGTATTGGAAGAAGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAGCCGATGT
CGACATGAACAAGAGAGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCCGAGATCGATAACCTCATGACCAT
CGTTACAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACGGACAGAAAGACTA
CAAGGATGGAAAGTACTCTCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATGAAGCTGAGGGATGA
TCTCGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTCCG
TGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAA
GAAGCGTTAAGACAATGATGCTAGCTGCAGCTGGATTGGATCTTTGACAGTCCCGTTTTT
ATGTTTTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTAGGTGTTTGTT
AAGACATCCTTCTCTTGTTTTGTTATATTTCGAGATAATATTGTTGTCACGGGATCTTGA
AGTCAATTCTTTTGTTTTCCTTATAAAACTATCCAAATATTCTTTGCAAC

QA 3 712 3 712
DS 



CO CL207Contig2 753 4 6 U
GGATTTTCTAACCGATTTGTGCGAGTGTTAAAGAGTGTAAACGGCGAGAGCTTCGCATCT
TCTCTCTCCCTCTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCGCTGGTAGCAAACGAGGAGTTCC
AGCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAGATTATGTTTGCTC
TTACCTCCATCAAGGGTATTGGAAGAAGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAGCCGATG
TCGACATGAACAAGAGGGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCTGAGATCGATAACCTCATGACCA
TCGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACT
ACAAGGATGGAAAGTACTCCCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATGAAGCTGAGGGATG
ATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGCCTGAGACACTACTGGGGTCTCC
GTGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTA
AGAAGCGTTAAGAAAATGATGCTAGCTGCAGCTTGATTGGATCTTTGGCAATCCCGTTTT
TTTTTTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTTAGGCCTTTTGT
AAGACATCCTTCACTTGTTTTGTTATATTTCGAGATAATATTTTTGTCACTTGATCTTGA
AATCAAGTCTATAATATCTTTTGTTTTCCTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2CU06TF U 1
AF RR2BQ91JQ C 48
AF RR2CU06JQ C 228
AF RR2BQ91TF U 48
BS 1 457 RR2CU06TF
BS 458 458 RR2BQ91TF
BS 459 606 RR2CU06TF
BS 607 607 RR2BQ91TF
BS 608 711 RR2CU06TF
BS 712 753 RR2BQ91TF

RD RR2CU06TF 711 0 0
GGATTTTCTAACCGATTTGTGCGAGTGTTAAAGAGTGTAAACGGCGAGAGCTTCGCATCT
TCTCTCTCCCTCTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCGCTGGTAGCAAACGAGGAGTTCC
AGCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAGATTATGTTTGCTC
TTACCTCCATCAAGGGTATTGGAAGAAGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAGCCGATG
TCGACATGAACAAGAGGGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCTGAGATCGATAACCTCATGACCA
TCGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACT
ACAAGGATGGAAAGTACTCCCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATGAAGCTGAGGGATG
ATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTCC
GTGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTA
AGAAGCGTTAAGAAAATGATGCTAGCTGCAGCTTGATTGGATCTTTGGCAATCCCGTTTT
TTTTTT*GTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTTAGGCCTTTTGT
AAGACATCCTTCACTTGTTTTGTTATATTTCGAGATAATATTTTTGTCACT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2BQ91JQ 704 0 0
GAGCTTC
GCATCTTCTCTCTCCCTCTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCGCTGGTAGCAAACGAGG
AGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAGATTATGT
TTGCTCTTACCTCCATCAAGGGTATTGGAAGAAGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAG
CCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCTGAGATCGATAACCTCA
TGACCATCGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGA
AAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCCCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATGAAGCTGA
GGGATGATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGCCTGAGACACTACTGGG
GTCTCCGTGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTG
TCTCTAAGAAGCGTTAAGAAAATGATGCTAGCTGCAGCTTGATTGGATCTTTGGCAATCC
CGTTTTTTTTTTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTTAGGCC
TTTTGTAAGACATCCTTCACTTGTTT*GTTATATTTCGAGATAATATTTTTGTCACTTGA
TCTTGAAATCAAGTCTATAATATCTTTTGTTTTCC
TC

QA 8 702 8 702
DS 

RD RR2CU06JQ 523 0 0
AAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCTGAGATCGAT
AACCTCATGACCATCGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAAC
AGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCCCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATG
AAGCTGAGGGATGATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTTTGAGACAC
TACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACT
GTTGGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGAAAATGATGCTAGCTGCAGCTTGATTGGATCTTTG
GCAATCCCGTTTTTTTTTT*GTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTT
TTAGGCCTTTTGTAAGACATCCTTCACTTGTTTTGTTATATTTCGAGATAATATTTTTGT
CACTTGATCTTGAAATCAAGTCTATAATATCTTTTGTTTTCC
C

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2BQ91TF 706 0 0
GAGCTTC
GCATCTTCTCTCTCCCTCTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCGCTGGTAGCAAACGAGG
AGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAGATTATGT
TTGCTCTTACCTCCATCAAGGGTATTGGAAGAAGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAG
CCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCTGAGATCGATAACCTCA
TGACCATCGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGA
AAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCCCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATGAAGCTGA
GGGATGATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGCCTGAGACACTACTGGG
GTCTCCGTGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTG
TCTCTAAGAAGCGTTAAGAAAATGATGCTAGCTGCAGCTTGATTGGATCTTTGGCAATCC
CGTTTTTTTTTTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTTAGGCC
TTTTGTAAGACATCCTTCACTTGTTT*GTTATATTTCGAGATAATATTTTTGTCACTTGA
TCTTGAAATCAAGTCTATAATATCTTTTGTTTTCCTCAA

QA 8 706 8 706
DS 



CO CL207Contig3 746 4 4 U
GGAACCGATTTGCGCGAGAGTTAAAGAGTGTAAAACGGCGAGAGCTTCGCATCTTCTCTC
TCAGGCAGCTCTCTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCACTGGTAGCAAACGAGGAGTTC
CAGCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAGATTATGTTTGCT
CTCACCTCCATCAAGGGTATTGGAAGGAGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAGCCGAT
GTCGACATGAACAAGAGGGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACC
ATCGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGAC
TACAAGGATGGAAAGTACTCCCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACACGAAGCTGAGGGAT
GATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTTTGAGACACTACTGGGGTCTC
CGTGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCT
AAGAAGCGTTAAGACAATGTTGCTAGCTGCAAGCTGAATTGGATCTTTGACAGTCTCGTT
TTTATGTTTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGAATTTAGGTTTTTT
GTAAGACATCCTTCACTTGTTTTGTTATATTTCGGGATAATATTGTTGTCACGGGATCTT
GCAAGTCAATTTTTTTTGTTTTCCCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN61TF U 1
AF RR2DR35TF U 1
AF RR2DR35JQ C 2
AF RR2FN61JQ C 83
BS 1 173 RR2DR35TF
BS 174 174 RR2FN61TF
BS 175 653 RR2DR35TF
BS 654 746 RR2DR35JQ

RD RR2FN61TF 493 0 0
GG
AACCGATTTGCGCGAGAGTTAAAGAGTGTAAAACGGCGAGAGCTTCGCATCTTCTCTCTC
AGGCAGCTCTCTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCGCTGGTAGCAAACGAGGAGTTCCA
GCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAGATTATGTTTGCTCT
CACCTCCATCAAGGGTATTGGAAGGGGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAGCCGATGT
CGACATGAACAAGAGGGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACCAT
CGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTA
CAAGGATGGAAAGTACTCCCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATGAAGCTGAGGGATGA
TCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTTTGAGACACTACTGGGGTCTCCG
TGTCCGTGGAC

QA 3 493 3 493
DS 

RD RR2DR35TF 654 0 0
GGAACCGATTTGCGCGAGAGTTAAAGAGTGTAAAACGGCGAGAGCTTCGCATCTTCTCTC
TCAGGCAGCTCTCTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCACTGGTAGCAAACGAGGAGTTC
CAGCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAGATTAT*TTTGCT
CTCACCTCCATCAAGGGTATTGGAAGGAGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAGCCGAT
GTCGACATGAACAAGAGGGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACC
ATCGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGAC
TACAAGGATGGAAAGTACTCCCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACACGAAGCTGAGGGAT
GATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTTTGAGACACTACTGGGGTCTC
CGTGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCT
AAGAAGCGTTAAGACAATGTTGCTAGCTGCAAGCTGAATTGGATCTTTGACAGTCTCGTT
TTTATGTTTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGAATTTAG
T

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2DR35JQ 745 0 0
G
AACCGATTTGCGCGAGAGTTAAAGAGTGTAAAACGGCGAGAGCTTCGCATCTTCTCTCTC
AGGCAGCTCTCTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCACTGGTAGCAAACGAGGAGTTCCA
GCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAGATTAT*TTTGCTCT
CACCTCCATCAAGGGTATTGGAAGGAGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAGCCGATGT
CGACATGAACAAGAGGGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACCAT
CGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTA
CAAGGATGGAAAGTACTCCCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACACGAAGCTGAGGGATGA
TCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTTTGAGACACTACTGGGGTCTCCG
TGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAA
GAAGCGTTAAGACAATGTTGCTAGCTGCAAGCTGAATTGGATCTTTGACAGTCTCGTTTT
TATGTTTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGAATTTAGGTTTTTTGT
AAGACATCCTTCACTTGTTTTGTTATATTTCGGGATAATATTGTTGTCACGGGATCTTGC
AAGTCAATTTTTTTTGTTTTCCCC

QA 2 745 2 745
DS 

RD RR2FN61JQ 664 0 0
CCGATCGAACAATGTCGCTGGTAGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTTA
ACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAGATTATGTTTGCTCTCACCTCCATCAAGGGTATTG
GAAGGGGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCCG
GTGAGCTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACCATCGTTGCAAACCCAAAGCAGT
ACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCCC
AGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATGAAGCTGAGGGATGATCTTGAACGTCTCAAGAAGA
TCAGGAACCACCGTGGTTTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGACAACACACCA
AGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGACAATGTTG
CTAGCTGCAAGCTGAATTGGATCTTTGACAGTCTCGTTTTTATGTTTTGTTATTTCGTAC
AATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGAATTTAGGTTTTTTGTAAGACATCCTTCACTTGTTT
TGTTATATTTCGGGATAATATTGTTGTCACGGGATCTTGCAAGTCAATTTTTTT
TGTTTTCCCC

QA 1 654 1 654
DS 



CO CL207Contig4 707 4 6 U
CTATAAGGAAAACAAAAGATATTACTATTGACTTGACTACAAGATCCCGTGCCCAAAATA
TTATCTCGAAATATAACAAAACAAGTGAAGGATGTCTTACAAAAGGCCTAAAATCGAGTC
TTTGAGACTTGCAAAATTGTACGAAATAACAAAAACATAAAAACGGGACTGCCAAAGATC
CAATCAAGCCGCAGCTAGCATAATTGTCTTAACGCTTCTTAGAGACACCAACAGTCTTTC
CTCTGCGACCAGTTGTCTTGGTGTGTTGTCCACGGACACGGAGACCCCAGTAGTGTCTCA
AACCACGGTGGTTCCTGATATTCTTGAGACGTTCAAAATCATCCCTCAGCTTCATGTCGA
GTGCATTGGAAACAACCTGGGAGTACTTTCCATCCTTGTAGTCTTTCTGTCTGTTCAAGA
ACCAATCTGGAATCTTGTACTGCTTTGGGTTTGCAACGATGGTCATGAGGTTATCGATCT
CAGCTGCAGACAGCTCACCGGCCCTCTTGTTCATGTCGACATCGGCTTTCTTGCGGACAA
TGTTGGCCAATCTCCTTCCAATACCCTTGATGGAGGTAAGAGCAAACATAATCTTTTGTT
TGCCATCAACGTTAGTGTTAAGCACACGCAGAATGTGCTGGAACTCCTCGTTTGCTACCA
GCGACATTGTTCGATCGGTAGAGTAGAGAGGGAGAGAGATGATGCCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G739JQ U 4
AF RR2GO78JQ U 1
AF RR2G739TF C 6
AF RR2GO78TF C 143
BS 1 189 RR2GO78JQ
BS 190 190 RR2G739JQ
BS 191 319 RR2GO78JQ
BS 320 320 RR2G739JQ
BS 321 579 RR2GO78JQ
BS 580 707 RR2G739TF

RD RR2G739JQ 349 0 0
CA
AGGAAAACAAAAAATATTACTATTGACTTGACTACAAAATCCCGTGCCCAAAATATTATC
TCGAAATATAACAAAACAAGTGAAGGATGTCTTACAAAAGGCCTAAAATCGAGTCTTTGA
AACTTGCAAAATTGTACAAAATAACAAAAACATAAAAACGGGACTGCCAAAAATCCAATC
AAGCCGCAGCTAGCATAATTGTCTTAACGCTTCTTAAAAACACCAACAGTCTTTCCTCTG
CGACCAGTTGTCTTGGTGTGTTGTCCACGGACACGGAAACCCCAGTAGTGTCTCAAACCA
CGGGGGTTCCTGATATTCTTGAAACGTTCAAAATCATCCCTCAGCTT

QA 3 349 3 349
DS 

RD RR2GO78JQ 579 0 0
CTATAAGGAAAACAAAAGATATTACTATTGACTTGACTACAAGATCCCGTGCCCAAAATA
TTATCTCGAAATATAACAAAACAAGTGAAGGATGTCTTACAAAAGGCCTAAAATCGAGTC
TTTGAGACTTGCAAAATTGTACGAAATAACAAAAACATAAAAACGGGACTGCCAAAGATC
CAATCAAGCTGCAGCTAGCATAATTGTCTTAACGCTTCTTAGAGACACCAACAGTCTTTC
CTCTGCGACCAGTTGTCTTGGTGTGTTGTCCACGGACACGGAGACCCCAGTAGTGTCTCA
AACCACGGTGGTTCCTGATCTTCTTGAGACGTTCAAAATCATCCCTCAGCTTCATGTCGA
GTGCATTGGAAACAACCTGGGAGTACTTTCCATCCTTGTAGTCTTTCTGTCTGTTCAAGA
ACCAATCTGGAATCTTGTACTGCTTTGGGTTTGCAACGATGGTCATGAGGTTATCGATCT
CAGCTGCAGACAGCTCACCGGCCCTCTTGTTCATGTCGACATCGGCTTTCTTGCGGACAA
TGTTGGCCAATCTCCTTCCAATACCCTTGATGGAGGTAA

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2G739TF 702 0 0
AGGAAAACAAAAGATATTACTATTGACTTGACTACAAGATCCCGTGCCCAAAATATTATC
TCGAAATATAACAAAACAAGTGAAGGATGTCTTACAAAAGGCCTAAAATCGAGTCTTTGA
GACTTGCAAAATTGTACGAAATAACAAAAACATAAAAACGGGACTGCCAAAGATCCAATC
AAGCCGCAGCTAGCATAATTGTCTTAACGCTTCTTAGAGACACCAACAGTCTTTCCTCTG
CGACCAGTTGTCTTGGTGTGTTGTCCACGGACACGGAGACCCCAGTAGTGTCTCAGACCA
CGGTGGTTCCTGATATTCTTGAGACGTTCAAGATCATCCCTCAGCTTCATGTCGAGTGCA
TTGGAAACAACCTGGGAGTACTTTCCATCCTTGTAGTCTTTCTGTCTGTTCAAGAACCAA
TCTGGAATCTTGTACTGCTTTGGGTTTGCAACGATGGTCATGAGGTTATCGATCTCAGCT
GCAGACAGCTCACCGGCCCTCTTGTTCATGTCGACATCGGCTTTCTTGCAGACAATGTTG
GCCAATCTCCTTCCAATACCCTTGATGGAGGTAAGAGCAAACATAATCTTTTGTTTGCCA
TCAACGTTAGTGTTAAGCACACGCAGAATGTGCTGGAACTCCTCGTTTGCTACCAGCGAC
ATTGTTCGATCGGTAGAGTAGAGAGGGAGAGAGATGATGCCC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2GO78TF 522 0 0
GAAATAACAAAAACATAAAAACGGGACTGCCAAAGATCCAATCAAGCTGCAGCTAGCATA
ATTGTCTTAACGCTTCTTAGAGACACCAACAGTCTTTCCTCTGCGACCAGTTGTCTTGGT
GTGTTGTCCACGGACACGGAGACCCCAGTAGTGTCTCAGACCACGGTGGTTCCTGATCTT
CTTGAGACGTTCAAGATCATCCCTCAGCTTCATGTCGAGTGCATTGGAAACAACCTGGGA
GTACTTTCCATCCTTGTAGTCTTTCTGTCTGTTCAAGAACCAATCTGGAATCTTGTACTG
CTTTGGGTTTGCAACGATGGTCATGAGGTTATCGATCTCAGCTGCAGACAGCTCACCGGC
CCTCTTGTTCATGTCGACATCGGCTTTCTTGCGGACAATGTTGGCCAATCTCCTTCCAAT
ACCCTTGATGGAGGTAAGAGCAAACATAATCTTTTGTTTGCCATCAACGTTAGTGTTAAG
CACACGCAGAATGTGCTGGAACTCCTCGTTTGCTACCAGCGA

QA 1 522 1 522
DS 



AS 2 16

CO CL208Contig1 756 2 4 U
GTCAAACAAAAAAAATTTCAAAAGAAAAAGAAAAACTAACTAATAGTTGTAACAAACTGG
GTTATGACTCTAAAATAATTGAGTCATCAAAAAAAGTTGGCAGACATTAAAAAAAAAATA
CTCGATTAATTCGTAAATCTGTTTTTTTTATAAAATTTTGCGTTGAACAACTGTCTATAA
CTATTTTTCTAGGTATCGTTAATATTCCAAGAATTACTACACAACTTTTTGTTGATTCAA
CAAAAAAAATTCTTGATCGATATATTTACAAGAATGAGGAAAATGGAGAAAAAAATTTAT
TTTCGTTTTTTAACAGTTTGGGGGCTGGAAACTGACCTACCTTTTGGTTCTACCAAACCA
AAACCTTCTTTTTTTAAACCTATTTTTAAAGAATTAAAAAAAAGAATCAAAAAATCCAAA
ACGAAGTCTTTTCCGGTTTTAAGGATTTTCAAAGAAAGAGCAACAATTTTCCTAAAAGTC
GAAAAAGAAATTAAAAACTGGATTATAAAAAACTTGCTTTTTCTAAAAGAAAAAAAAAAA
CCTTTCAAAACAAAATAGAATTTCATTAGTTGGCGAGAGCAATATATGAATTAAATGAAA
CTAAAAAAGATTTAATAATGAGTAATCAGATGATTCATGAACTATCTGTTCGAAAAAAAT
CCACGGAGTGGCCAAATTCTTCACTCAGCGAAAACAAAATAAAAAATGTGATTGATAAAA
TAAAGACAATCAGAAATCAAACAAAAAAAATTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE91TF U 1
AF RR2CE91JQ C 2
BS 1 658 RR2CE91TF
BS 659 659 RR2CE91JQ
BS 660 693 RR2CE91TF
BS 694 756 RR2CE91JQ

RD RR2CE91TF 697 0 0
GTCAAACAAAAAAAATTTCAAAAGAAAAAGAAAAACTAACTAATAGTTGTAACAAACTGG
GTTATGACTCTAAAATAATTGAGTCATCAAAAAAAGTTGGCAGACATTAAAAAAAAAATA
CTCGATTAATTCGTAAATCTGTTTTTTTTATAAAATTTTGCGTTGAACAACTGTCTATAA
CTATTTTTCTAGGTATCGTTAATATTCCAAGAATTACTACACAACTTTTTGTTGATTCAA
CAAAAAAAATTCTTGATCGATATATTTACAAGAATGAGGAAAATGGAGAAAAAAATTTAT
TTTCGTTTTTTAACAGTTTGGGGGCTGGAAACTGACCTACCTTTTGGTTCTACCAAACCA
AAACCTTCTTTTTTTAAACCTATTTTTAAAGAATTAAAAAAAAGAATCAAAAAATCCAAA
ACGAAGTCTTTTCCGGTTTTAAGGATTTTCAAAGAAAGAGCAACAATTTTCCTAAAAGTC
GAAAAAGAAATTAAAAACTGGATTATAAAAAACTTGCTTTTTCTAAAAGAAAAAAAAAAA
CCTTTCAAAACAAAATAGAATTTCATTAGTTGGCGAGAGCAATATATGAATTAAATGAAA
CTAAAAAAGATTTAATAATGAGTAATCAGATGATTCATGAACTATCTGTTCGAAAAAA*T
CCACGGAGTGGCCAAATTCTTCACTCAGCGAAA
CAAA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2CE91JQ 755 0 0
GTCAAAC
AAAAAAATTTCAAAAGAAAAAGAAAAACTAACTAATAGTTGTAACAAACTGGGTTATGAC
TCTAAAATAATTGAGTCATCAAAAAAAGTTGGCAGACATTAAAAAAAAAATACTCGATTA
ATTCGTAAATCTGTTTTTTTTATAAAATTTTGCGTTGAACAACTGTCTATAACTATTTTT
CTAGGTATCGTTAATATTCCAAGAATTACTACACAACTTTTTGTTGATTCAACAAAAAAA
ATTCTTGATCGATATATTTACAAGAATGAGGAAAATGGAGAAAAAAATTTATTTTCGTTT
TTTAACAGTTTGGGGGCTGGAAACTGACCTACCTTTTGGTTCTACCAAACCAAAACCTTC
TTTTTTTAAACCTATTTTTAAAGAATTAAAAAAAAGAATCAAAAAATCCAAAACGAAGTC
TTTTCCGGTTTTAAGGATTTTCAAAGAAAGAGCAACAATTTTCCTAAAAGTCGAAAAAGA
AATTAAAAACTGGATTATAAAAAACTTGCTTTTTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTTCAA
AACAAAATAGAATTTCATTAGTTGGCGAGAGCAATATATGAATTAAATGAAACTAAAAAA
GATTTAATAATGAGTAATCAGATGATTCATGAACTATCTGTTCGAAAAAAATCCACGGAG
TGGCCAAATTCTTCACTCAGCGAAAACAAAATAAAAAATGTGATTGATAAAATAAAGACA
ATCAGAAATCAAACAAAAAAAATTTCAG

QA 8 755 8 755
DS 



CO CL208Contig2 1816 14 17 U
GGATGGTATACTTCTGAAGATTAATTCTCAAAAATTTGAACAAACAATAGAAAAATTTAA
AAGAAAATCTTTATCAATAGAGAAAAAACTTTCTTTTTTTTCAGAACCCCAAGAAGAAAA
AATTCAGTCAGAAGAAGAAATAAAAATTTTCAAAATTTTATTTGATATCGTTATAATTTA
TAATAATGATCAAACTCTTATAAAAAATTTTATTGATTTCCATGAAATCAATAAACAAGT
TCCTCAATGGTCATACAAATTAACAAGTGAATTGGAAGCGGTGGAAGGCGAAACTGAAGA
AAATATACCAACCGAGCCTGGAATTCGTTCAAGAAAAGCAAAACTTGTAGTGGTTTTTAC
TGATTTAAAAGAACCGCATAACGAGATTTATACTAATCTCAAAGATAATCAAAATTCTGA
TCAACCAGATGAAATGACTTTGATTCGTTATTCAGAACAATCTGATTTTCGTCGAGACAT
AATTAAAGGATCCATGCGTTCCCAAAGGCGTAAAACTGTTATTTGGGAA*TTTTTGCAAG
CCAAAGCACATTCGCCCCTTTTTTTTGATAGAATAGATAAATTTTTTTTTTTTTCGTTTG
ATATATGGGGGCTAAAAAAAAAA***TTCTTAGAAATTTCATGTGGAAAAAAAAAATTAT
TATTTATAAAAACGAAGAAGAACAATCAAAAAAA*GACGAACAAAGACGCCTAGAAATTG
CGGAAACTTGGGATAGCTTCCTATTTGCTCAAATAATAAGAGGTTTTATTTTAATAACTC
AATCTATTCTTAGAAAATATATTATATTACCTTTATTGATAATAATTAAAAATAGCATTC
GTATCATATTATTTCAACTTCCCGAGTGGGAAGAGGATTTCAAGGATTGGAAACGTGAAA
TGCATGTTAAATGTACTTATAATGGGGTTCAACTATCCGAAACAGAATTTCCACGAAACT
GGTTAACGGATGGTATTCAGATAAAAATCATATTTCCGTTTTATCTTAAACCTTGGCATA
AATATAAATTTCAATCATCTCAGAAGGCTCGACTAAAAAAA**ACAAAAGGAGAAAAAAT
TTATTTTCGTTTTTTAACAGTTTGGGGGCTGGAAACTGACCTACCTTTTGGTTCTACCAA
ACCAAAACCTTCTTTTTTTAAACCTATTTTTAAAGAATTAAAAAAAAGAATCAAAAAATC
CAAAACGAAGTCTTTTCCGGTTTTAAGGATTTTCAAAGAAAGAGCAACAATTTTCCTAAA
AGTCGAAAAAGAAATTAAAAACTGGATTATAAAAAACTTGCTTTTTCTAAAAGAAAAAAA
AAAAAAACCTTTCAAAACAAAATAGAATTTCATTAGTTGGCCCGAGAGCAATATATGAAT
TAAATGAAACTAAAAAAGATTTAATAATGAGTAATCAGATGATTCATGAACTATCTGTTC
AAAAAAAATCCACGGAGTGGCCAAATTCTTCACTCAGCGAAAACAAAATAAAAAATGTGA
TTGATAAAATAAAGACAATCAGAAATCAAACAAAAAAAATTTCAAAAGAAAAAGAAAAAC
TAACTAATAGTTGTAACAAACTGGGTTATGACTCTAAAATAATTGAGTCATCAAAAAAAA
GTTGGCAGACATTAAAAAAAAAAAAATACTCGATTAATTCGTAAATCTGTTTTTTTTATA
AAATTTTGCGTTGAACAACTGTCTATAACTATTTTTCTAGGTATCGTTAATATTCCAAGA
ATTACTACACAACTTTTTGTTGATTCAACAAAAAAAATTCTTGATCGATATATTTACAAG
AATGAGGAAAATGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 10 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2CU51TF U 1
AF RR2CU51JQ C 17
AF RR2AU57TF C 595
AF RR2BN08TF U 195
AF RR2FD13TF U 317
AF RR2BC15TF U 319
AF RR2F958TF U 416
AF RR2BN08JQ C 593
AF RR2BC15JQ C 680
AF RR2F958JQ C 668
AF RR2CR25TF U 930
AF RR2AN18TF U 930
AF RR2CR25JQ C 1154
AF RR2AN18JQ C 1160
BS 1 380 RR2CU51TF
BS 381 381 RR2BN08TF
BS 382 565 RR2CU51TF
BS 566 566 RR2BN08TF
BS 567 645 RR2CU51TF
BS 646 880 RR2BN08TF
BS 881 1017 RR2FD13TF
BS 1018 1018 RR2BC15TF
BS 1019 1044 RR2FD13TF
BS 1045 1045 RR2F958TF
BS 1046 1060 RR2FD13TF
BS 1061 1061 RR2F958TF
BS 1062 1740 RR2AN18TF
BS 1741 1742 RR2CR25JQ
BS 1743 1767 RR2AN18TF
BS 1768 1814 RR2CR25JQ
BS 1815 1816 RR2AN18JQ

RD RR2CU51TF 645 0 0
GGATGGTATACTTCTGAAGATTAATTCTCAAAAATTTGAACAAACAATAGAAAAATTTAA
AAGAAAATCTTTATCAATAGAGAAAAAACTTTCTTTTTTTTCAGAACCCCAAGAAGAAAA
AATTCAGTCAGAAGAAGAAATAAAAATTTTCAAAATTTTATTTGATATCGTTATAATTTA
TAATAATGATCAAACTCTTATAAAAAATTTTATTGATTTCCATGAAATCAATAAACAAGT
TCCTCAATGGTCATACAAATTAACAAGTGAATTGGAAGCGGTGGAAGGCGAAACTGAAGA
AAATATACCAACCGAGCCTGGAATTCGTTCAAGAAAAGCAAAACTTGTAGTGGTTTTTAC
TGATTTAAAAGAACCGCATAGCGAGATTTATACTAATCTCAAAGATAATCAAAATTCTGA
TCAACCAGATGAAATGACTTTGATTCGTTATTCAGAACAATCTGATTTTCGTCGAGACAT
AATTAAAGGATCCATGCGTTCCCAAAGGCGTAAAACTGTTATTTGGGAA*TTTTTGCAAG
CCAAAGCACATTCGCCCCTTTTTTT*GATAGAATAGATAAATTTTTTTTTTTTTCGTTTG
ATATATGGGGGCTAAAAAAAAAA***TTCTTAGAAATTTCATGTG

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2CU51JQ 597 0 0
AAGATTAATTCTCAAAAATTTGAACAAACAATAGAAAAATTTAAAAGAAAATCTTTATCA
ATAGAGAAAAAACTTTTTTTTTTTTCAGAACCCCAAGAAGAAAAAATTCAGTCAGAAGAA
GAAATAAAAATTTTCAAAATTTTATTTGATATCGTTATAATTTATAATAATGATCAAACT
TTTATAAAAAATTTTATTGATTTCCATGAAATCAATAAACAAGTTCCTCAATGGTCATAC
AAATTAACAAGTGAATTGGAAGCGGTGGAAGGCGAAACTGAAGAAAATATACCAACCGAG
CCTGGAATTCGTTCAAGAAAAGCAAAACTTGTAGTGGTTTTTACTGATTTAAAAGAACCG
CATAGCGAGATTTATACTAATTTCAAAGATAATCAAAATTCTGATCAACCAGATGAAATG
ACTTTGATTCGTTATTCAGAACAATTTGATTTTTGTCGAGACATAATTAAAGGATCCATG
CGTTCCCAAAGGGGTAAAACTGTTATTTGGGAA*TTTTTGCAAGCCAAAGCACATTCGCC
CCTTTTTTT*GATAGAATAGATAAATTTTTTTTTTTTTCGTTTGATATATGGGGGCT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2AU57TF 227 0 0
CGTTTGATATATGGGGGCTAAAAAAAAAAAAATTCTTAGAAATTTCATGTGGAAAAAAAA
AATTATTATTTATAAAAACGAAGAAGAACAATCAAAAAAA*GACGAACAAAGACGCCTAG
AAATTGCGGAAACTTGGGATAGCTTCCTATTTGCTCAAATAATAAGAGGTTTTATTTTAA
TAACTCAATCTATTCTTAGAAAATATATTATATTACCTTTATTGAT
C

QA 1 226 1 226
DS 

RD RR2BN08TF 686 0 0
GTC
TTATAAAAAATTTTATTGATTTCCATGAAATCAATAAACAAGTTCCTCAATGGTCATACA
AATTAACAAGTGAATTGGAAGCGGTGGAAGGCGAAACTGAAGAAAATATACCAACCGAGC
CTGGAATTCGTTCAAGAAAAGCAAAACTTGTAGTGGTTTTTACTGATTTAAAAGAACCGC
ATAACGAGATTTATACTAATCTCAAAGATAATCAAAATTCTGATCAACCAGATGAAATGA
CTTTGATTCGTTATTCAGAACAATCTGATTTTCGTCGAGACATAATTAAAGGATCCATGC
GTTCCCAAAGGCGTAAAACTGTTATTTGGGAA*TTTTTGCAAGCCAAAGCACATTCGCCC
CTTTTTTTTGATAGAATAGATAAATTTTTTTTTTT**CGTTTGATATATGGGGGCTAAAA
AAAAAA***TTCTTAGAAATTTCATGTGGAAAAAAAAAATTATTATTTATAAAAACGAAG
AAGAACAATCAAAAAAA*GACGAACAAAGACGCCTAGAAATTGCGGAAACTTGGGATAGC
TTCCTATTTGCTCAAATAATAAGAGGTTTTATTTTAATAACTCAATCTATTCTTAGAAAA
TATATTATATTACCTTTATTGATAATAATTAAAAATAGCATTCGTATCATATTATTTCAA
CTTCCCGAGTGGGAAGAGGATTT

QA 4 686 4 686
DS 

RD RR2FD13TF 744 0 0
G
CTGGAATTCGTTCAAGAAAATCAAAACTTGTAGTGGTTTTTACTGATTTAAAAGAACCGC
ATAACGAGATTTATACTAATCTCAAAGATAATCAAAATTCTGATCAACCAGATGAAATGA
CTTTGATTCGTTATTCAGAACAATCTGATTTTCGTCGAGACATAATTAAAGGATCCATGC
GTTCCCAAAGGCGTAAAACTGTTATTTGGGAA*TTTTTGCAAGCCAAAGCACATTCGCCC
CTTTTTTTTGACAGAATAGATAAATTTTTTTTTTTTTCGTTTGATATATGGGGGCTAAAA
AAAAAA***TTCTTAGAAATTTCATGTGGAAAAAAAAATTTATTATTTATAAAAACGAAG
AAGAACAATCAAAAAAA*GACGAACAAAGACGCCTAGAAATTGCGGAAACTTGGGATAGC
TTCCTATTTGCTCAAATAATAAGAGGTTTTATTTTAATAACTCAATCTATTCTTAGAAAA
TATATTATATTACCTTTATTGATAATAATTAAAAATAGCATTCGTATCATATTATTTCAA
CTTCCCGAGTGGGAAGAGGATTTCAAGGATTGGAAACGTGAAATGCATGTTAAATGTACT
TATAATGGGGTTCAACTATCCGAAACAGAATTTCCACGAAACTGGTTAACGGATGGTATT
CAGATAAAAATCATATTTCCGTTTTATCTTAAACCTTGGCTTAAATATAAATTTCAATCA
TCTCAGA*GGCTCGACTAAAAAA

QA 2 744 2 744
DS 

RD RR2BC15TF 724 0 0
G
GGAATTCGTTCAAGAAAAGCAAAACTTGTAGTGGTTTTTACTGATTTAAAAGAACCGCAT
AACGAGATTTATACTAATCTCAAAGATAATCAAAATTCTGATCAACCAGATGAAATGACT
TTGATTCGTTATTCAGAACAATCTGATTTTCGTCGAGACATAATTAAAGGATCCATGCGA
TCCCAAAGGCGTAAAACTGTTATTTGGGAA*TTTTTGCAAGCCAAAGCACATTCGCCCCT
TTTTTTTGATAGAATAGATAAATTTTTTTTTTTT*CGTTTGATATATGGGGGCTAAAAAA
AAAAAA*TTCTTAGAAATTTCATGTGGAAAAAAAAAATTATTATTTATAAAAACGAAGAA
GAACAATCAAAAAAA*GACGAACAAAGACGCCTAGAAATTGCGGAAACTTGGGATAGCTT
CCTATTTGCTCAAATAATAAGAGGTTTTATTTTAATAACTCAATCTATTCTTAGAAAATA
TATTATATTACCTTTATTGATAATAATTAAAAATAGCATTCGTATCATATTATTTCAACT
TCCCGAGTGGGAAGAGGATTTCAAGGATTGGAAACGTGAAATGCATGTTAAATGTACTTA
TAATGGGGTTCAACTATCCGAAACAGAATTTCCACGAAACTGGTTAACGGATGGTATTCA
GATAAAAATCATATTTCCGTTTTATCTTAAACCTTGGCATAAATATAAATTTCAATCATC
TCA

QA 2 724 2 724
DS 

RD RR2F958TF 646 0 0
G
CTGATCAACCAGATGAAATGACTTTTATTCGTTATTCAGAACAATCTGATTTTCGTCGAG
ACATAATTAAAGGATCCATGCGTTCCCAAAGGCGTAGAACTGTTATTTGGGAAATTTTTG
CAAGCCAAAGCACATTCGCCCCTTTTTTTTGATAGAATAGATAAATTTTTTTTTTT**CG
TTTGATATATGGGGGCTAAAAAAAAAA***TTCTTAGAAATTTCATGTGGAAAAAAAAA*
TTATTATTTATAAAAACGAAGAAGAACAATCAAAAAAAAGACGAACAAAGACGCCTAGAA
ATTGCGGAAACTTGGGATAGCTTCCTATTTGCTCAAATAATAAGAGGTTTTATTTTAATA
ACTCAATCTATTCTTAGAAAATATATTATATTACCTTTATTGATAATAATTAAAAATAGC
ATTCGTATCATATTATTTCAACTTCCCGAGTGGGAAGAGGATTTCAAGGATTGGAAACGT
GAAATGCATGTTAAATGTACTTATAATGGGGTTCAACTATCCTAAACAGAATTTCCACGA
AACTGGTTAACGGATGGTATTCAGATAAAAATCATATTTCCGTTTTATCTTAAACCTTGG
CATAAATATAAATTTCAATCATCTCAGAAGGCTCGACTAAAAAAA

QA 2 646 2 646
DS 

RD RR2BN08JQ 701 0 0
TTCGTTTGATATATGGGGGCTAAAAAAAAAA***TTCTTAGAAATTTCATGTGGAAAAAA
AAAATTATTATTTATAAAAACGAAGAAGAACAATCAAAAAAA*GACGAACAAAGACGCCT
AGAAATTGCGGAAACTTGGGATAGCTTCCTATTTGCTCAAATAATAAGAGGTTTTATTTT
AATAACTCAATCTATTCTTAGAAAATATATTATATTACCTTTATTGATAATAATTAAAAA
TAGCATTCGTATCATATTATTTCAACTTCCCGAGTGGGAAGAGGATTTCAAGGATTGGAA
ACGTGAAATGCATGTTAAATGTACTTATAATGGGGTTCAACTATCCGAAACAGAATTTCC
ACGAAACTGGTTAACGGATGGTATTCAGATAAAAATCATATTTCCGTTTTATCTTAAACC
TTGGCATAAATATAAATTTCAATCATCTCAGAAGGCTCGACTAAAAAAA**ACAAAAGGA
GAAAAAATTTATTTTCGTTTTTTAACAGTTTGGGGGCTGGAAACTGACCTACCTTTTGGT
TCTACCAAACCAAAACCTTCTTTTTTTAAACCTATTTTTAAAGAATTAAAAAAAAGAATC
AAAAAATCCAAAACGAAGTCTTTTCCGGTTTTAAGGATTTTCAAAGAAAGAGCAACAATT
TTCCTAAAAGTCGAAAAAGAAATTAAAAACTGGATTATAAA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2BC15JQ 611 0 0
GAACAATCAAAAAAA*GACGAACAAAGACGCCTAGAAATTGCGGAAACTTGGGATAGCTT
CCTATTTGCTCAAATAATAAGAGGTTTTATTTTAATAACTCAATCTATTCTTAGAAAATA
TATTATATTACCTTTATTGATAATAATTAAAAATAGCATTCGTATCATATTATTTCAACT
TCCCGAGTGGGAAGAGGATTTCAAGGATTGGAAACGTGAAATGCATGTTAAATGTACTTA
TAATGGGGTTCAACTATCCGAAACAGAATTTCCACGAAACTGGTTAACGGATGGTATTCA
GATAAAAATCATATTTCCGTTTTATCTTAAACCTTGGCATAAATATAAATTTCAATCATC
TCAGAAGGCTCGACTAAAAAAAAAACAAAAGGAGAAAAAATTTATTTTCGTTTTTTAACA
GTTTGGGGGCTGGAAACTGACCTACCTTTTGGTTCTACCAAACCAAAACCTTCTTTTTTT
AAACCTATTTTTAAAGAATTAAAAAAAAGAATCAAAAAATCCAAAACGAAGTCTTTTCCG
GTTTTAAGGATTTTCAAAGAAAGAGCAACAATTTTCCTAAAAGTCGAAAAAGAAATTAAA
AACTGGATTAT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2F958JQ 625 0 0
AAAAACGAAGAAGAACAATCAAAAAAAAGACGAACAAAGACGCCTAGAAATTGCGGAAAC
TTGGGATAGCTTCCTATTTGCTCAAATAATAAGAGGTTTTATTTTAATAACTCAATCTAT
TCTTAGAAAATATATTATATTACCTTTATTGATAATAATTAAAAATAGCATTCGTATCAT
ATTATTTCAACTTCCCGAGTGGGAAGAGGATTTCAAGGATTGGAAACGTGAAATGCATGT
TAAATGTACTTATAATGGGGTTCAACTATCCTAAACAGAATTTCCACGAAACTGGTTAAC
GGATGGTATTCAGATAAAAATCATATTTCCGTTTTATCTTAAACCTTGGCATAAATATAA
ATTTCAATCATCTCAGAAGGCTCGACTAAAAAAA**ACAAAAGGAGAAAAAATTTATTTT
CGTTTTTTAACAGTTTGGGGGCTGGAAACTGACCTACCTTTTGGTTCTACCAAACCAAAA
CCTTCTTTTTTTAAACCTATTTTTAAAGAATTAAAAAAAAGAATCAAAAAATCCAAAACG
AAGTCTTTTCCGGTTTTAAGGATTTTCAAAGAAAGAGCAACAATTTTCCTAAAAGTCGAA
AAAGAAATTAAAAACTGGATTATAA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2CR25TF 609 0 0
G
AACTATCCGAAACAGAATTTCCACGAAACTGGTTAACGGATGGTATTCAGATAAAAATCA
TATTTCCGTTTTATCTTAAACCTTGGCATAAATATAAATTTCAATCATCTCAGAAGGCTC
GACTAAAAAAAA*ACAAAAGGAGAAAAAATTTATTTTCGTTTTTTAACAGTTTGGGGGCT
GGAAACTGACCTACCTTTTGGTTCTACCAAACCAAAACCTTCTTTTTTTAAACCTATTTT
TAAAGAATTAAAAAAAAGAATCAAAAAATCCAAAACGAAGTCTTTTCCGGTTTTAAGGAT
TTTCAAAGAAAGAGCAACAATTTTCCTAAAAGTCGAAAAAGAAATTAAAAACTGGATTAT
AAAAAACTTGCTTTTTCTAAAAGAAAAAAAAAAAAA*CCTTTCAAAACAAAATAGAATTT
CATTAGTTGGCCCGAGAGCAATATATGAATTAAATGAAACTAAAAAAGATTTAATAATGA
GTAATCAGATGATTCATGAACTATCTGTTCAAAAAAAATCCACGGAGTGGCCAAATTCTT
CACTCAGCGAAAACAAAATAAAAAATGTGATTGATAAAATAAAGACAATCAGAAATCAAA
CAAAAAAA

QA 2 609 2 609
DS 

RD RR2AN18TF 839 0 0
G
AACTATCCGAAACAGAATTTCCACGAAACTGGTTAACGGATGGTATTCAGATAAAAATCA
TATTTCCGTTTTATCTTAAACCTTGGCATAAATATAAATTTCAATCATCTCAGAAGGCTC
GACTAAAAAAA**ACAAAAGGAGAAAAAATTTATTTTCGTTTTTTAACAGTTTGGGGGCT
GGAAACTGACCTACCTTTTGGTTCTACCAAACCAAAACCTTCTTTTTTTAAACCTATTTT
TAAAGAATTAAAAAAAAGAATCAAAAAATCCAAAACGAAGTCTTTTCCGGTTTTAAGGAT
TTTCAAAGAAAGAGCAACAATTTTCCTAAAAGTCGAAAAAGAAATTAAAAACTGGATTAT
AAAAAACTTGCTTTTTCTAAAAGAAAAAAAAAAAAAACCTTTCAAAACAAAATAGAATTT
CATTAGTTGGCCCGAGAGCAATATATGAATTAAATGAAACTAAAAAAGATTTAATAATGA
GTAATCAGATGATTCATGAACTATCTGTTCAAAAAAAATCCACGGAGTGGCCAAATTCTT
CACTCAGCGAAAACAAAATAAAAAATGTGATTGATAAAATAAAGACAATCAGAAATCAAA
CAAAAAAAATTTCAAAAGAAAAAGAAAAACTAACTAATAGTTGTAACAAACTGGGTTATG
ACTCTAAAATAATTGAGTCATCAAAAAAAAGTTGGCAGACATTAAAAAAAAAAAAATACT
CGATTAATTCGTAAATCTGTTTTTTTTATAAAATTTTGCGTTGAACAACTGTCTATAACT
ATTTTTCTAGGTATCGTTAATATTCCAAGA**TACTACACAACTTTTTGTTGATTCA
C

QA 2 838 2 838
DS 

RD RR2CR25JQ 661 0 0
TTTTTTAAACCTATTTTTAAAGAATTAAAAAAAAGAATCAAAAAATCCAAAACGAAGTCT
TTTCCGGTTTTAAGGATTTTCAAAGAAAGAGCAACAATTTTCCTAAAAGTCGAAAAAGAA
ATTAAAAACTGGATTATAAAAAACTTGCTTTTTTTAAAAGAAAAAAAAAAAAA*CCTTTC
AAAACAAAATAGAATTTCATTAGTTGGCCCGAGAGCAATATATGAATTAAATGAAACTAA
AAAAGATTTAATAATGAGTAATCAGATGATTCATGAACTATCTGTTCAAAAAAAATCCAC
GGAGTGGCCAAATTCTTCACTCAGGGAAAACAAAATAAAAAATGTGATTGATAAAATAAA
GACAATCAGAAATCAAACAAAAAAAATTTCAAAAGAAAAAGAAAAACTAACTAATAGTTG
TAACAAACTGGGTTATGACTCTAAAATAATTGAGTCATCAAAAAAAAGTTGGCAGACATT
AAAAAAAAAAA**TACTCGATTAATTCGTAAATCTGTTTTTTTTATAAAATTTTGCGTTG
AACAACTGTCTATAACTATTTTTCTAGGTATCGTTAATATTCCAAGAATTACTACACAAC
TTTTTGTTGATTCAACAAAAAAAATTCTTGATCGATATATTTACAAGAATGAGGAAAATG
G

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2AN18JQ 657 0 0
AAACCTATTTTTAAAGAATTAAAAAAAAGAATCAAAAAATCCAAAACGAAGTTTTTTCCG
GTTTTAAGGATTTTCAAAGAAAGAGCAACAATTTTCCTAAAAGTCGAAAAAGAAATTAAA
AACTGGATTATAAAAAACTTGCTTTTTTTAAAAGAAAAAAAAAAAAAACCTTTCAAAACA
AAATAGAATTTCATTAGTTGGCCCGAGAGCAATATATGAATTAAATGAAACTAAAAAAGA
TTTAATAATGAGTAATCAGATGATTCATGAACTATCTGTTCAAAAAAAATCCACGGAGTG
GCCAAATTCTTCACTCAGCGAAAACAAAATAAAAAATGTGATTGATAAAATAAAGACAAT
CAGAAATCAAACAAAAAAAATTTCAAAAGAAAAAGAAAAACTAACTAATAGTTGTAACAA
ACTGGGTTATGACTCTAAAATAATTGAGTCATCAAAAAAAAGTTGGCAGACATTAAAAAA
AAAAAAATACTCGATTAATTCGTAAATCTGTTTTTTTTATAAAATTTTGCGTTGAACAAC
TGTCTATAACTATTTTTCTAGGTATCGTTAATATTCCAAGAATTACTACACAACTTTTTG
TTGATTCAACAAAAAAA*TTCTTGATCGATATATTTACAAGAATGAGGAAAATGGAG

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 15

CO CL209Contig1 784 15 10 U
GGAGAGGAAATAAATATCTTGAATCTTAGAGAAGAAGGAAAAGGAGAAGGAAAGAAAAGA
TGGCGACGGAGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAGGTCTAGACTTGGAGAGGTACATGG
GCCGTTGGTACGAGATTGCTTCTTTCCCATCCAGGTTTCAGCCCAAGGACGGTGTAGACA
CTCGCGCCACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGGTTAAA*GTCTTGAACGAGACGTGG
AACGGAGGCAA*GAGAGGTTTCATCCAAGG*CTCAGCCTTCAAAACTGATCCTAAGAGCG
ATGAGGCCAAGTTTAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTCCTTTCCTCCCTATCATTCCCGTTA
CCGGTGATTACTGGGTGCTGTACATAGATCCTGAGTACCAGCATGCTGTCATTGGGCAGC
CTTCGAGGAGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGACGGCGCATGTGGAGGAAGAGACATACA
AGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTATGACGTCAGCAAGCTTCACAAGACTC
CTCAGAGTGACACACCACCTGAGTCCAACGCTGCTCCTGATGACACCAAGGGCATCTGGT
GGCTCAAATCTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAAAACACAAAGACT*****TGTTTCC
ACCTCCTTTTACTTCCCTT***TGTCTGTGTAA*CATACTCTACCCCTTTTGTTTACTCC
AGTGAACATCATCGTTTCTGCTTTTGTTTAATATCCAACATCTAAATCTATTTGCGGAAA
AAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 50 50 55 55 55 55 55 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 50 70 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 55 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 55 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 45 85 55 85 85 85 25 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 50 80 50 80 
50 80 80 80 20 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 35 75 45 75 75 75 60 75 75 45 75 75 75 75 75 60 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 45 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 70 55 70 55 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 55 70 40 70 70 70 70 70 70 70 50 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 45 45 
60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 20 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 50 35 50 50 50 50 45 45 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C569JQ C 67
AF RR2F066TF U 59
AF RR2AH55JQ C 37
AF RR2A075TF U 87
AF RR2A075JQ C 59
AF RR2CR30TF U 1
AF RR2AH55TF U 37
AF RR2D807JQ C 37
AF RR2C649TF U 63
AF RR2C510JQ C 46
AF RR2C510TF U 46
AF RR2C569TF U 47
AF RR2F066JQ C 85
AF RR2CR30JQ C 54
AF RR2D807TF U 37
BS 1 128 RR2CR30TF
BS 129 129 RR2F066TF
BS 130 637 RR2CR30TF
BS 638 638 RR2AH55TF
BS 639 692 RR2CR30TF
BS 693 693 RR2AH55TF
BS 694 744 RR2CR30TF
BS 745 747 RR2AH55TF
BS 748 749 RR2C649TF
BS 750 784 RR2D807TF

RD RR2C569JQ 219 0 0
CGGG
GAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAGGTCTAGACTTGGAGAGGTACATGGGCCGCTGGTA
CGAGATTGCTTCTTTCCCATCCAGGTTTCAGCCCAAGGACGGTGTAGACACTCGCGCCAC
CTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGGTTAAAAGTCTTGAACGAGACGTGGAACGGAGGCA
AAGAGAGGTTTCATCCAAGG*CTCAGCCTTCAAAA

QA 5 219 5 219
DS 

RD RR2F066TF 269 0 0
GATGGCGACGGAGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAGGTCTAGACTTGGAGAGGTACAT
GGGCCGTTGGTACGAGATTGCTTCTTTCCCATCCAGGTTTCAGCCCAAGGACGGTGTAGA
CACTCGCGCCACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGGTTAAA*GTCTTGAACGAGACGT
GGAACGGAGGCAA*GAGAGGTTTCATCCAAGGGCTCAGCCTTCAAAACTGATCCTAAGAG
CTACGAGGCCAAGTTTAAAGTCAGGTTCT

QA 1 269 1 269
DS 

RD RR2AH55JQ 397 0 0
GGAAAAGGAGAAGGAAAGAAAAGATGGCGACGGAGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAG
GTCTAGACTTGGAGAGGTACATGGGCCGTTGGTACGAGATTGCTTCTTTCCCATCCAGGT
TTCAGCCCAAGGACGGTGTAGACACTCGCGCCACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGG
TTAAA*GTCTTGAACGAGACGTGGAACGGAGGCAA*GAGAGGTTTCATCCAAGG*CTCAG
CCTTCAAAACTGATCCTAAGAGCGATGAGGCCAAGTTTAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTC
CTTTCCTCCCTACCATTCCCGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTACATAGATCCTGAGT
ACCAGCATGCTGTCATTGGGCAGCCTTCGAGGAGTTA

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR2A075TF 476 0 0
GTGGTGAAAGGTCTAGACCTGGAGAGGTACATGGGCCGTTGGTACGAGATTGCTTCTTTC
CCATCCAGGTTTCAGCCCAAGGACGGTGTAGACACTCGCGCCACCTACAGCCTTAACCCT
GACGGCACGGTTAAA*GTCTTGAACGAGACGTGGAACGGAGGCAA*GAGAGGTTTCATCC
AAGG*CTTAGCTTTCAAAACTGATCCCAAGAGCGATGCGGCAAAGTTCAAAGTCAGGTTC
TACCTCCCTCCTTTCCTCCCAATCATTCCCGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTATATA
GATCCTGAGTACCAGCATGCCGTTATTGGGCAGCCTTCAAGGAGTTATCTCTGGATCCTG
AGCAGGACGGCGCATGTGGAGGAAGAGACATACAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAG
CAAGGGTATGACGTCAGCAAGCTTCACAAGACTCCTCAGAGTGACACACCACC
CGA

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2A075JQ 579 0 0
GATGGCGACTGAGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAGGTCTAGACCTGGAGAGGTACAT
GGGCCGTTGGTACGAGATTGCTTCTTTCCCATCCAGGTTTCAGCCCAAGGACGGTGTAGA
CACTCGCGCCACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGGTTAAA*GTCTTGAACGAGACGT
GGAACGGAGGCAA*GAGAGGTTTCATCCAAGG*CTTAGCTTTCAAAACTGATCCCAAGAG
CGATGCGGCAAAGTTCAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTCCTTTCCTCCCAATCATTCCCGT
TACCGGTGATTACTGGGTGCTGTATATAGATCCTGAGTACCAGCATGCCGTTATTGGGCA
GCCTTCAAGGAGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGACGGCGCATGTGGAGGAAGAGACATA
CAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTATGACGTCAGCAAGCTTCACAAGAC
TCCTCAGAGTGACACACCACCCGAGTCCAACGCTGCTCCTGATGACACCAAGGGCATCTG
GTGGCTCAAATCTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAAA

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2CR30TF 752 0 0
GGAGAGGAAATAAATATCTTGAATCTTAGAGAAGAAGGAAAAGGAGAAGGAAAGAAAAGA
TGGCGACGGAGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAGGTCTAGACTTGGAGAGGTACATGG
GCCGTTGGCACGAGATTGCTTCTTTCCCATCCAGGTTTCAGCCCAAGGACGGTGTAGACA
CTCGCGCCACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGGTTAAA*GTCTTGAACGAGACGTGG
AACGGAGGCAA*GAGAGGTTTCATCCAAGG*CTCAGCCTTCAAAACTGATCCTAAGAGCG
ATGAGGCCAAGTTTAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTCCTTTCCTCCCTATCATTCCCGTTA
CCGGTGATTACTGGGTGCTGTACATAGATCCTGAGTACCAGCATGCTGTCATTGGGCAGC
CTTCGAGGAGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGACGGCGCATGTGGAGGAAGAGACATACA
AGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTATGACGTCAGCAAGCTTCACAAGACTC
CTCAGAGTGACACACCACCTGAGTCCAACGCTGCTCCTGATGACACCAAGGGCATCTGGT
GGCTCAAATCTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAAA*CACAAAGACT*****TGTTTCC
ACCTCCTTTTACTTCCCTT***TGTCTGTGTA**CATACTCTACCCCTTTTGTTTACTCC
AGTGAACATCATCGTTTCTGCTTT
AAAAAAAA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2AH55TF 711 0 0
GGAAAAGGAGAAGGAAAGAAAAGATGGCGACGGAGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAG
GTCTAGACTTGGAGAGGTACATGGGCCGTTGGTACGAGATTGCTTCTTTCCCATCCAGGT
TTCAGCCCAAGGACGGTGTAGACACTCGCGCCACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGG
TTAAA*GTCTTGAACGAGACGTGGAACGGAGGCAA*GAGAGGTTTCATCCAAGG*CTCAG
CCTTCAAAACTGATCCTAAGAGCGATGAGGCCAAGTTTAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTC
CTTTCCTCCCTACCATTCCCGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTACATAGATCCTGAGT
ACCAGCATGCTGTCATTGGGCAGCCTTCGAGGAGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGACGG
CGCATGTGGAGGAAGAGACATACAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTATG
ACGTCAGCAAGCTTCACAAGACTCCTCAGAGTGACACACCACCTGAGTCCAACGCTGCTC
CTGATGACACCAAGGGCATCTGGTGGCTCAAATCTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAA
AACACAAAGACT*****TGTTTCCACCTCCCTTTACTTCCCTT***TGTCTGTGTAA*CA
TACTCTACCCCTTTTGTTTACTCCAGTGAACATCATCGTTTCTGCTTTTGT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2D807JQ 741 0 0
GGAAAAGGAGAAGGAAAGAAAAGATGGCGACGGAGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAG
GTCTAGACTTGGAGAGGTACATGGGCCGTTGGTACGAGATTGCTTCTTTCCCATCCAGGT
TTCAGCCCAAGGACGGTGTAGACACTCGCGCCACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGG
TTAAA*GTCTTGAACGAGACGTGGAACGGAGGCAA*GAGAGGTTTCATCCAAGG*CTCAG
CCTTCAAAACTGATCCTAAGAGCGATGAGGCCAAGTTTAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTC
CTTTCCTCCCTATCATTCCCGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTACATAGATCCTGAGT
ACCAGCATGCTGTCATTGGGCAGCCTTCGAGGAGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGACGG
CGCATGTGGAGGAAGAGACATACAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTATG
ACGTCAGCAAGCTTCACAAGACTCCTCAGAGTGACACACCACCTGAGTCCAACGCTGCTC
CTGATGACACCAAGGGCATCTGGTGGCTCAAATCTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAA
AACACAAAGACT*****TGTTTCCACCTCCTTTTACTTCTCTT***TGTCTGTGTAA*CA
TACTCTACCCCTTTTGTTTACTCCAGTGAACATCATCGTTTCTGCTTTTGTTTAATATCC
AACATCTAAATCTATTTGCGG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2C649TF 688 0 0
GGGACC
GAGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAGGTCTAGACTTGGAGAGGTGCATGGGCCGTTGG
TACGAGATTGCTTCTTTCCCATCCAGGTTTCAGCCCAAGGACGGTGTAGACACTCGCGCC
ACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGGTTAAA*GTCTTGAACGAGACGTGGAACGGAGG
CAA*GAGAGGTTTCATCCAAGG*GTCAGCTTTCAAAACTGATCCTAAGAGCGATGAGGCA
AAGTTCAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTCCTTTCCTCCCAATCATCCCCGTTACTGGTGAT
TACTGGGTGCTGTATATAGATCCTGAGTACCAGCATGCTGTCATTGGGCAGCCTTCGAGG
AGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGACGGCGCATGTGGAGGAAGAGACATACAAGGAGCTG
GTGGAGAAGGCTGTGGAGCAAGGGTATGACGTCAGCAAGCTTCACAAGACCCCTCAGAGT
GGCACACCACCTGAGTCAAACGCTGCTCCTGATGACACCAAGGGCATCTGGTGGCTCAAA
TCTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAAAACACAA*GACTTGTTATGTTTTCACCTCCTC
TTACTTCCCTT***TGTCTGTGTAA*TATACT**ACCCCTTTTGTTTACTCCAGTGAACA
TCATCGTTTCTGCTTTTGTTT
T

QA 7 687 7 687
DS 

RD RR2C510JQ 696 0 0
GGAGAC
AAGAAAAGATGGCGACGGTGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAGGTCTAGACTTGGAGA
GGTACATGGGCCGTTGGTACGAGATTGCTTCTTTCCCATCCAGGTTTCAGCCCAAGGACT
GTGTGGACACTCGCGCCACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGGTTAAA*GTCTTGAAC
GAGACGTGAAACGGAGGCAA*GAGAGGTTTCATCCAAGG*GTCAGCTTTCAAAACTGATC
CTAAGAGCGATGAGGCAAAGTTTAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTCCTTTCCTACCTATCA
TTCCTGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTATATAGATCCTGAGTACCAGCATGCTGTCA
TCGGGCAGCCTTCAAGGAGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGACGGCGCATGTGGAGGAAG
AGACATACAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTATGACGTCAGCAAGCTTC
ACAAGACTCCTCAGAGTGACGCACCACCTGAGTCCAACGCTGCTCCTGATGACACCAAGG
GCATTTGGTGGCTCAAATCTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAAAACACAA*GACT***
**TGTTTCCACCTCCTTTTACTTCCTTTGTCTGTCTGTGTAAACATACT**ACCCCTTTT
GTTTACTCCAGTGAACATCATCGTT
CTGCC

QA 7 691 7 691
DS 

RD RR2C510TF 701 0 0
GGAGAC
AAGAAAAGATGGCGACGGTGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAGGTCTAGACTTGGAGA
GGTACATGGGCCGTTGGTACGAGATTGCTTCTTTCCCATCCAGGTTTCAGCCCAAGGACT
GTGTGGACACTCGCGCCACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGGTTAAA*GTCTTGAAC
GAGACGTGAAACGGAGGCAA*GAGAGGTTTCATCCAAGG*GTCAGCTTTCAAAACTGATC
CTAAGAGCGATGAGGCAAAGTTTAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTCCTTTCCTACCTATCA
TTCCTGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTATATAGATCCTGAGTACCAGCATGCTGTCA
TCGGGCAGCCTTCAAGGAGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGACGGCGCATGTGGAGGAAG
AGACATACAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTATGACGTCAGCAAGCTTC
ACAAGACTCCTCAGAGTGACGCACCACCTGAGTCCAACGCTGCTCCTGATGACACCAAGG
GCATTTGGTGGCTCAAATCTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAAAACACAA*GACT***
**TGTTTCCACCTCCTTTTACTTCCTTTGTCTGTCTGTGTAA*CATACT**ACCCCTTTT
GTTTACTCCAGTGAACATCATCGTT
CTGCCGAAAA

QA 7 691 7 691
DS 

RD RR2C569TF 696 0 0
GG
GGAAAGAAAAGATGGCGACGGGGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAGGTCTAGACTTGG
AGAGGTACATGGGCCGCTGGTACGAGATTGCTTCTTTCCCATCCAGGTTTCAGCCCAAGG
ACGGTGTAGACACTCGCGCCACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGGTTAAA*GTCTTG
AACGAGACGTGGAACGGAGGCAA*GAGAGGTTTCATCCAAGG*CTCAGCCTTCAAAACTG
ATCCTAAGAGCGATGAGGCCAAGTTTAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTCCTTTCCTCCCTA
TCATTCCCGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTACATAGATCCTGAGTACCAGCATGCTG
TCATTGGGCAGCCTTCGAGGAGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGACGGCGCATGTGGAGG
AAGAGACATACAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTATGACGTCAGCAAGC
TTCACAAGACTCCTCAGAGTGACACACCACCTGAGTCCAACGCTGCTCCTGATGACACCA
AGGGCATCTGGTGGCTCAAATCTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAAA*CACAAAGACT
*****TGTTTCCACCTCCTTTTACTTCCCTT***TGTCTGTGTAA*CATACTCTACCCCT
TTTGTTTACTCCAGTGAACATCATCGTTTCTGCT

QA 3 696 3 696
DS 

RD RR2F066JQ 693 0 0
AAGTGGTGAAAGGTCTAGACTTGGAGAGGTACATGGGCCGTTGGTACGAGATTGCTTCTT
TCCCATCCAGGTTTCAGCCCAAGGACGGTGTAGACACTCGCGCCACCTACAGCCTTAACC
CTGACGGCACGGTTAAA*GTCTTGAACGAGACGTGGAACGGAGGCAA*GAGAGGTTTCAT
CCAAGG*CTCAGCCTTCAAAACTGATCCTAAGAGCTACGAGGCCAAGTTTAAAGTCAGGT
TCTACCTCCCTCCTTTCCTCCCTATCATTCCCGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTACA
TAGATCCTGAGTACCAGCATGCTGTCATTGGGCAGCCTTCGAGGAGTTATCTCTTGATCC
TGAGCAGGACGGCGCATGTGGAGGAAGAGACATACAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGG
AGCAAGGGTATGACGTCAGCAAGCTTCACAAGACTCCTCAGAGTGACACACCACCTGAGT
CCAACGCTGCTCCTGATGACACCAAGGGCATCTGGTGGCTCAAATCTATCTTTGGCAAAT
AGTTTATAGAAAAACACAAAGACT*****TGTTTCCACCTCCTTTTACTTCCCTT***TG
TCTGTGTAA*CATACTCTACCCCTTTTGTTTACTCCAGTGAACATCATCGTTTCTGCTTT
TGTTTAATATCCAACATCTAAATCTATTTGCGG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2CR30JQ 691 0 0
GAAAAGATGGCGACGGAGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAGGTCTAGACTTGGAGAGG
TACATGGGCCGTTGGCACGAGATTGCTTCTTTCCCATCCAGGTTTCAGCCCAAGGACGGT
GTAGACACTCGCGCCACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGGTTAAA*GTCTTGAACGA
GACGTGGAACGGAGGCAA*GAGAGGTTTCATCCAAGG*CTCAGCCTTCAAAACTGATCCT
AAGAGCGATGAGGCCAAGTTTAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTCCTTTCCTCCCTATCATT
CCCGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTACATAGATCCTGAGTACCAGCATGCTGTCATT
GGGCAGCCTTCGAGGAGTTATTTTTGGATCCTGAGCAGGACGGCGCATGTGGAGGAAGAG
ACATACAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTATGACGTCAGCAAGCTTCAC
AAGACTCCTCAGAGTGACACACCACCTGAGTCCAACGCTGCTCCTGATGACACCAAGGGC
ATCTGGTGGCTCAAATCTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAAAACACAAAGACT*****
TGTTTCCACCTCCTTTTACTTCCCTT***TGTCTGTGTAA*CATACTCTACCCCTTTTGT
TTACTCCAGTGAACATCATCGTTTTTGCTTT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2D807TF 748 0 0
GGAAAAGGAGAAGGAAAGAAAAGATGGCGACGGAGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAG
GTCTAGACTTGGAGAGGTACATGGGCCGTTGGTACGAGATTGCTTCTTTCCCATCCAGGT
TTCAGCCCAAGGACGGTGTAGACACTCGCGCCACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGG
TTAAA*GTCTTGAACGAGACGTGGAACGGAGGCAA*GAGAGGTTTCATCCAAGG*CTCAG
CCTTCAAAACTGATCCTAAGAGCGATGAGGCCAAGTTTAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTC
CTTTCCTCCCTATCATTCCCGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTACATAGATCCTGAGT
ACCAGCATGCTGTCATTGGGCAGCCTTCGAGGAGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGACGG
CGCATGTGGAGGAAGAGACATACAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTATG
ACGTCAGCAAGCTTCACAAGACTCCTCAGAGTGACACACCACCTGAGTCCAACGCTGCTC
CTGATGACACCAAGGGCATCTGGTGGCTCAAATCTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAA
AACACAAAGACT*****TGTTTCCACCTCCTTTTACTTCTCTT***TGTCTGTGTAA*CA
TACTCTACCCCTTTTGTTTACTCCAGTGAACATCATCGTTTCTGCTTTTGTTTAATATCC
AACATCTAAATCTATTTGCGGAAAAAAA

QA 1 748 1 748
DS 



AS 2 13

CO CL210Contig1 723 2 3 U
GGAAATCTGAAACAATCCAATAATCTCCTTCTGGCTTTTGTGCTCCACCAACACTTTATA
AGAGTTTGACGGGGGATATGGTAAAGGAGAGTGAATATTACGACGTCTTAGGCGTCAAGA
CTGATGCCTCAGCTACCGACATTAAGAAAGCTTATTATATCAAAGCAAGGCAAGTCCATC
CAGACAAGAACCCTAATGATCCTCAGGCTGCTAAAAACTTTCAGACACTAGGTGAAGCTT
ACCAGGTTCTTAGCGATCCCGAGAAGCGAACTGCTTATGATAAATTTGGCAAAGACGGCG
TTCAACAGGATGCAATGGTTAATCCTGCAGCTGTATTTGGCATGCTCTTTGGCAGCGAGT
TGTTTGAGGACTACATTGGCCAACTTGCTCTTGCTTCAATTGCATCCCTCGACGCTGAAG
TAGAATCCCATGAGCCTGAGATTAGGAAAAAGTTGCTTCAAGACAAGATCAAAGCGATGC
AAAAAGAAAGGGAAGACAAGCTTGTCACTACGCTGAAGAACAAACTCGAACCATTCGTGG
AAGGACGAACCGATGATTTTGTGAATTGGGCTACCGCTGAGGCAAGGCGACTCTCAACTG
CTGGTTTTGGGGGAAGCAATGCTGCACACTGTGGGTTACATCTACACTAGAAAAGCTGCG
AAAGAACTCGGGAAGGACTAACGTCTCATGAAAGTACCCTTCTTAGCTGAATGGGTGCGT
GAC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2GS44TF U 1
AF RR2AF33TF U 1
BS 1 119 RR2AF33TF
BS 120 120 RR2GS44TF
BS 121 723 RR2AF33TF

RD RR2GS44TF 539 0 0
GGAA
ATCTGAAACAATCCAATAATCTCCTTCTGGCTTTTGTGCTCCACCAACACTTTATAAGAG
TTTGACGGGGGATATGGTAAAGGAGAGTGAATATTACGACGTCTTAGGCGTCAAGACTGA
TGCCTCAGCTACTGACATTAAGAAAGCTTATTATATCAAAGCAAGGCAAGTCCATCCAGA
CAAGAACTCTAATGATCCTCAGGCTGCTAAAAACTTTCAGACACTAGGTGAAGCTTACCA
GGTTCTTAGCGATCCCGAGAAGCGAACTGCTTATGATAAATTTGGCAAAGACGGCGTTCA
ACAGGATGCAATGGTTGATCCTGCAGCTGTATTTGGCATGCTCTTTGGCAGCGAGTTGTT
TGAGGACTACATTGGCCAACTTGCTCTTGCTTCAATTGCATCCCTCGACGCTGAAGTAGA
ATCCCATGAGCCTGAGATTAGGAAAAAGTTGCTTCAAGACAAGATCAAAGCGATGCAAAA
AGAAAGGGAAGACAAGCTTGTCACTACGCTGAAGAACAAACTCGAACCATTCGTG

QA 5 539 5 539
DS 

RD RR2AF33TF 723 0 0
GGAAATCTGAAACAATCCAATAATCTCCTTCTGGCTTTTGTGCTCCACCAACACTTTATA
AGAGTTTGACGGGGGATATGGTAAAGGAGAGTGAATATTACGACGTCTTAGGCGTCAAGG
CTGATGCCTCAGCTACCGACATTAAGAAAGCTTATTATATCAAAGCAAGGCAAGTCCATC
CAGACAAGAACCCTAATGATCCTCAGGCTGCTAAAAACTTTCAGACACTAGGTGAAGCTT
ACCAGGTTCTTAGCGATCCCGAGAAGCGAACTGCTTATGATAAATTTGGCAAAGACGGCG
TTCAACAGGATGCAATGGTTAATCCTGCAGCTGTATTTGGCATGCTCTTTGGCAGCGAGT
TGTTTGAGGACTACATTGGCCAACTTGCTCTTGCTTCAATTGCATCCCTCGACGCTGAAG
TAGAATCCCATGAGCCTGAGATTAGGAAAAAGTTGCTTCAAGACAAGATCAAAGCGATGC
AAAAAGAAAGGGAAGACAAGCTTGTCACTACGCTGAAGAACAAACTCGAACCATTCGTGG
AAGGACGAACCGATGATTTTGTGAATTGGGCTACCGCTGAGGCAAGGCGACTCTCAACTG
CTGGTTTTGGGGGAAGCAATGCTGCACACTGTGGGTTACATCTACACTAGAAAAGCTGCG
AAAGAACTCGGGAAGGACTAACGTCTCATGAAAGTACCCTTCTTAGCTGAATGGGTGCGT
GAC

QA 1 723 1 723
DS 



CO CL210Contig2 1335 11 53 U
GCCAAAGTATAAATTTTATTATATTGGAGGGGCCAACTTATAAAAAACACGAAAAAACCA
TGTCCATATATAACAGTACCTTACAGAACACGCGACCCAGAGTTTTGTGAAACCC*AACA
CGGAAGGTAAACAGATTCAATAAA*GAAAGGGAATGGAATTTAAAGACGAAACCATCACT
TCGCAT*AACATTAAATACGAACTTCGGTTTTCTTCTTTTAAGTCGCCGGTTTCGAGGAA
TCTCCGGCGTCAAGTTTCACGGCGGAATTTTCGTGGCGCAAGCTATTTTCCCTAGAGTAT
GGTTTCTTAGAACCCTGGAAAATGTTTCCGAGCTTCCTCAACCCTCTTGCTCTAGTTCGA
AGAACATCTTTTGAAACACTTGGATCTTTAAGCACCGCTTGGCAGACACGAGATAAGGTT
GATTCGATGTCAAGCACGTTGATTTGCCAAAGGGACTGAAGCATTGCATCTTTTTTAGCT
TCAATCGCCTTCTGAATATGCTCCTCTTTGTTCTCTCCCTGGTTCAGCTTGCTCACTTCG
TCCTGCAACACTAGTAACGAAACCGCACCAGAAGCAGCCATGACTTGAGATTTGATGAGG
TGGCCTTTGTCACGCACCCATTCAGCTAAGAAGGGTACTTTCATGAGACGTTTGTCCTTC
CCGAGTTCTTTCGCAGCTTTTCTAGTGTAAATGTAACCCACAGTGTGCAGCATTGCTTCC
CCAAAACCAGCAGTTGAGAGTCGCCTTGCCTCAGCGGTAGCCCAATTCACAAAATCATCG
GTTCGTCCTTCCACGAATGGTTCGAGTTTGTTCTTCAGCGTAGTGACAAGCTTGTCTTCC
CTTTCTTTTTGCATCGCTTTGATCTTGTCTTGAAGCAACTTTTTCCTAATCTCAGGCTCA
TGGGATTCTACTTCAGCGTCGAGGGATGCAATGGAAGCGAGAGCAAGTTGGCCAATATAG
TCCTCAAACAACTCGCTGCCAAAGAGCATGCCAAATACAGCTGCAGGATCAACCATTGCA
TCCTGTTGAACGCCGTCTTTGCCAAATTTATCATAAGCAGTTCGCTTCTCGGGATCGCTA
AGAACCTGGTAAGCTTCACCTAGTGTCTGAAAGTTTTTAGCAGCCTGAGGATCATTAGGG
TTCTTGTCTGGATGGACTTGCCTTGCTTTGATATAATAAGCTTTCTTAATGTCAGAAGCA
GAGGCATCAGTCTTGACGCCTAAGACGTCGTAATACTCACTCTCCTTCACCATTCCCCCC
TCAAACTCTCTATAAAGTGTTGGTGTGGAGCACAAAAGCCAGAAGGAGATTATTGGATTG
TTTCAGATTTGGTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 5 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 5 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 
40 40 40 40 40 40 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 0 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS44JQB U 1
AF RR2CG70JQ U 23
AF RR2D886JQ U 23
AF RR2EX39JQ U 23
AF RR2FB90JQ U 23
AF RR2B252JQ U 23
AF RR2AF33JQ U 4
AF RR2B252TF C 524
AF RR2D886TF C 566
AF RR2CW61TF C 575
AF RR2CG70TF C 661
BS 1 130 RR2GS44JQB
BS 131 131 RR2AF33JQ
BS 132 132 RR2B252JQ
BS 133 133 RR2GS44JQB
BS 134 134 RR2B252JQ
BS 135 144 RR2GS44JQB
BS 145 145 RR2B252JQ
BS 146 182 RR2GS44JQB
BS 183 183 RR2B252JQ
BS 184 186 RR2GS44JQB
BS 187 187 RR2B252JQ
BS 188 224 RR2GS44JQB
BS 225 225 RR2B252JQ
BS 226 229 RR2GS44JQB
BS 230 230 RR2B252JQ
BS 231 262 RR2GS44JQB
BS 263 263 RR2B252JQ
BS 264 272 RR2GS44JQB
BS 273 273 RR2AF33JQ
BS 274 309 RR2GS44JQB
BS 310 310 RR2AF33JQ
BS 311 311 RR2GS44JQB
BS 312 312 RR2B252JQ
BS 313 331 RR2GS44JQB
BS 332 332 RR2AF33JQ
BS 333 411 RR2GS44JQB
BS 412 452 RR2AF33JQ
BS 453 453 RR2D886JQ
BS 454 503 RR2AF33JQ
BS 504 504 RR2D886JQ
BS 505 518 RR2AF33JQ
BS 519 519 RR2D886JQ
BS 520 652 RR2AF33JQ
BS 653 653 RR2B252JQ
BS 654 689 RR2AF33JQ
BS 690 690 RR2B252JQ
BS 691 895 RR2AF33JQ
BS 896 896 RR2B252TF
BS 897 926 RR2AF33JQ
BS 927 1034 RR2B252TF
BS 1035 1035 RR2D886TF
BS 1036 1142 RR2B252TF
BS 1143 1143 RR2D886TF
BS 1144 1195 RR2B252TF
BS 1196 1196 RR2D886TF
BS 1197 1245 RR2B252TF
BS 1246 1246 RR2D886TF
BS 1247 1285 RR2B252TF
BS 1286 1287 RR2D886TF
BS 1288 1319 RR2B252TF
BS 1320 1324 RR2D886TF
BS 1325 1328 RR2CW61TF
BS 1329 1335 RR2CG70TF

RD RR2GS44JQB 411 0 0
GCCAAAGTATAAATTTTATTATATTGGAGGGGCCAACTTATAAAAAACACGAAAAAACCA
TGTCCATATATAACAGTACCTTACAGAACACGCGACCCAGAGTTTTGTGAAACCC*AACA
CGGAAGGTAAGAATATTCAATAAAAGAAAGGGAATGGAATTTAAAGACGAAACCATCACT
TCACATTAACATTAAATACGAACTTCGGTTTTCTTCTTTTAAGTTGCCGATTTCGAGGAA
TCTCCGGCGTCAAGTTTCACGGGGGAATTTTCATGGCGCAAGCTATTTTCCCTAGAGTAT
GGTTTCTTAAAGCCCTGGAAAATGTTTCCGAACTTCCTCAACCCTCTTGCTCTAGTTCGA
AGAACATCTTTTGAAACACTTGGATCTTTAAGCACCGCTTGGCAGACACGA

QA 1 411 1 411
DS 

RD RR2CG70JQ 389 0 0
ATTGGAGGGGCCAACTTATAAAAAACACGAAAAAACCATGTCCATATATAACAGTACCTT
ACAGAACACGCGACCCAGAGTTTTGTGAGACCCCAACACGGAAGGGAAACAGATTCAATA
AA*GAAAGGGAATGGAATTTAAAGACGAAACCATCACTTCGCAT*AACATTAAATACGAA
CTTCGGTTTTCTTCTTTTAAGTCGCCGGTTTCGAGGAATCTCCAGCGTCAAGTTTCACGG
CGGAATTTTCGTGGCGCAAGCTATTTTCCCTAAAGTATGGTTTCTTAAAACCCTGGAAAA
TGTTTCCGAGCTTCCTCAACCCTCTTGCTCTAGTTCGAAAAACATCTTTTGAAACACTCG
GATCTTTAAGCACCGCTTGGCAAACACGA

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2D886JQ 527 0 0
ATTGGAGGGGCCAACTTATAAAAAACACGAAAAAACCATGTCCATATATAACAGTACCTT
ACAGAACACGCGACCCAGAGTTTTGTGAAACCC*AACACGGAAGGTAAAAATATTCAATA
AAAGAAAGGGAATGGAATTTAAAGACAAAACCATCACTTCACATTAACATTAAATACGAA
CTTCGGTTTTCTTCTTTTAAGTTGCCGATTTCGAGGAATCTCCGGCGTCAAGTTTCACGG
TGGAATTTTCGTGGCGCAAGCTATTTTCCCTAGAGTATGGTTTCTTAGAGCCCTGGAAAA
TGTTTCCGAGCTTCCTCAACCCTCTTGCTCTAGTTCGAAGAACATCTTTTGAAACACTTG
GATCTTTAAGCACCGCTTGGCAGACACGAGATAAGGTTGATTCGATGTCAAGCACGTTGA
TTTGCCAAAGGGACTGAAGCATTGCATCTTTTTTAGCTTCAATGGCCTTCTGAATATGCT
CCTCTTTGTTCCCTCCCTGGTTCAGCTTGCTCACTTCGTCCTGCAAC

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2EX39JQ 547 0 0
ATTGGAGGGGCCAACTTATAAAAAACACGAAAAAACCATGTCCATATATAACAGTACCTT
ACAGAACACGCGACCCAGAGTTTTGTGAAACCC*AACACGGAAGGTAAACAGATTCAATA
AA*GAAAGGGAATGGAATTTAAAGACGAAACCATCACTTCGCAT*AACATTAAATACGAA
CTTCGGTTTTCTTCTTTTAAGTCGCCGGTTTCGAGGAATCTCCAGCGTCAAGTTTCACGG
CGGAATTTTCGTGGCGCAAGTTATTTTCCCTAGAGTATGGTTTCTTAGAACCCTGGAAAA
TGTTTCCGAGCTTCCTCAACCCTCTTGCTCTAGTTCGAAGAACATCTTTTGAAACACTTG
GATCTTTAAGCACCGCTTGGCAGACACGAGATAAGGTTGATTCGATGTCAAGCACGTTGA
TTTGCCAAAGGGACTGAAGCATTGCATCCTTTTTAGCCTCAATCGCCTTCTGAATATGCT
CCTCTTTGTTCTCTCCCTGGTTCAGCTTGCTCACTTCGTCCTGCAACACCAGTAACGAAA
CCGCACC

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2FB90JQ 758 0 0
ATTGGAGGGGCCAACTTATAAAAAACACGAAAAAACCATGTCCATATATAACAGTACCTT
ACAGAACACGCGACCCAGAGTTTTGTGAAACCC*AACACGGAAGGTAAACAGATTCAATA
AA*GAAAGGGAATGGAATTTAAAGACGAAACCATCACTTCGCAT*AACATTAAATACGAA
CTTCGGTTTTCTTCTTTTAAGTCGCCGGTTTCGAGGAATCTCCAGCGTCAAGTTTCACGG
CGGAATTTTCGTGGCGCAAGCTATTTTCCCTAGAGTATGGTTTCTTAAAACCCTGGAAAA
TGTTTCCGAGCTTCCTCAACCCTCTTGCTCTAGTTCGAAAAACATCTTTCGAAACACTTG
GATCTTTAAGCACCGCTTGGCAGACACGAGATAAGGTTGATTCGATGTCAAGCACGTTGA
TTTGCCAAAGGGACTGAAGCATTGCATCCTTTTTAGCTTCAATCGCCTTCTGAATATGCT
CCTCTTTGTTCTCTCCCTGGTTCAGCTTGCTCACTTCGTCCTGCAACACCAGTAACGAAA
CCGCACCAGAAGCAGCCATGACTTGAGATTTGATGAGGTGGCCTTTGTCACGCACCCATT
CAGCTAAGAGGGGTACTTTCATGAGACGTTTGTCCTTCCCAAGTTCTTTCGCAGCTTTTC
TAGTGTAAATGTAACCCACAGTATGCAGCATTGCTTCCCCAAAACCAGCAGTTGAGAGTC
GCCTTGCCTCAGCGGTAGCCCAATTCACAAAATCATCG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2B252JQ 833 0 0
ATTGGAGGGGCCAACTTATAAAAA*CACGAAAAAACCATGTCCATATATAACAGTACCTT
ACAGAACACGCGACCCAGAGTTTTGTGAAACCCCAACACGGAAGGTAAACAGATTCAATA
AA*GAAAGGGAATGGAATTTAAAGACGAAACCATCACTTCGCAT*AACATTAAATACGAA
CTTCGGTTTTCTTCTTTTAAGTCGCCGGTTTCGAGGAATCTCCGGCGTCAAGTTTCACGG
CGGAATTTTCGTGGCGCAAGCTATTTTCCCTAGGGTATGGTTTCTTAGAACCCTGGAAAA
TGTTTCCGAGCTTCCTCAACCCTCTTGCTCTAGTTCGAAGAACATCTTTTGAAACACTCG
GATCTTTAAGCACCGCTTGGCAGACACGAGATAAGGTTGATTCGATGTCAAGCACGTTGA
TTTGCCAAAGGGACTGAAGCATTGCATCTTTTTTAGCTTCAATCGCCTTCTGAATATGCT
CCTCTTTGTTCTCTCCCTGGTTCAGCTTGCTCACTTCGTCCTGCAACACTAGTAACGAAA
CCGCACCAGAAGCAGCCATGACTTGAGATTTGATGAGGTGGCCTTTGTCACGGACCCATT
CAGCTAAGAAGGGTACTTTCATGAGACGTTTGTCCTTCCCGAGTTCTTTCGCAGCTTTTC
TAGTGTAAATGTAGCCCACAGTGTGCAGCATTGCTTCCCCAAAACCAGCAGTTGAGAGTC
GCCTTGCCTCAGCGGTAGCCCAATTCACAAAATCATCGGTTCGTCCTTCCACGAATGGTT
CGAGTTTGTTCTTCAGCGTAGTGACAAGCTTGTCTTCCCTTTCTTTTTGCATC

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2AF33JQ 923 0 0
AAAGTATAGATTTTATTATATTGGAGGGGCCAACTTATAAAAAACACGAAAAAACCATGT
CCATATATAACAGTACCTTACAGAACACGCGACCCAGAGTTTTGTGAAACCC*AACACGG
AAGGTAAAAATATTCAATAAAAGAAAGGGAATGGAATTTAAAGACGAAACCATCACTTCA
CATTAACATTAAATACGAACTTCGGTTTTCTTCTTTTAAGTTGCCGATTTCGAGGAATCT
CCGGCGTCAAGTTTCACGGTGGAATTTTCGTGGCGCAAGCTATTTTCCCTAGAGTATGGT
TTCTTAGAGCCCTGGAAAATGTTTCCGAGCTTCCTCAACCCTCTTGCTCTAGTTCGAAGA
ACATCTTTTGAAACACTTGGATCTTTAAGCACCGCTTGGCAGACACGAGATAAGGTTGAT
TCGATGTCAAGCACGTTGATTTGCCAAAGTGACTGAAGCATTGCATCTTTTTTAGCTTCA
ATCGCCTTCTGAATATGCTCATCTTTGTTCTCTCCTTGGTTCAGCTTGCTCACTTCGTCC
TGCAACACTAGTAACGAAACCGCACCAGAAGCAGCCATGACTTGAGATTTGATGAGGTGG
CCTTTGTCACGCACCCATTCAGCTAAGAAGGGTACTTTCATGAGACGTTAGTCCTTCCCG
AGTTCTTTCGCAGCTTTTCTAGTGTAGATGTAACCCACAGTGTGCAGCATTGCTTCCCCA
AAACCAGCAGTTGAGAGTCGCCTTGCCTCAGCGGTAGCCCAATTCACAAAATCATCGGTT
CGTCCTTCCACGAATGGTTCGAGTTTGTTCTTCAGCGTAGTGACAAGCTTGTCTTCCCTT
TCTTTTTGCATCGCTTTGATCTTGTCTTGAAGCAACTTTTTCCTAATCTCAG*CTCATGG
GATTCTACTTCAGCGTCGAGGGA

QA 1 923 1 923
DS 

RD RR2B252TF 798 0 0
TCAGCTTGCTCACTTCGTC*TGCAACACTAGTAACGAAACCGCACCAGAAGCAGCCATGA
CTTGAGATTTGATGAGGTGGCCTTTGTCACGGACCCATTCAGCTAAGAAGGGTACTTTCA
TGAGACGTTTGTCCTTCCCGAGTTCTTTCGCAGCTTTTCTAGTGTAAATGTAGCCCACAG
TGTGCAGCATTGCTTCCCCAAAACCAGCAGTTGAGAGTCGCCTTGCCTCAGCGGTAGCCC
AATTCACAAAATCATCGGTTCGTCCTTCCACGAATGGTTCGAGTTTGTTCTTCAGCGTAG
TGACAAGCTTGTCTTCCCTTTCTTTTTGCATCGCTTTGATCTTGTCTTGAAGCAACTTTT
TCCTAATCTCAGGCTCATGGGATTCTACTTCAGCGTCGAGGGATGCAATGGAAGCGAGAG
CAAGTTGGCCAATATAGTCCTCAAACAACTCGCTGCCAAAGAGCATGCCAAATACAGCTG
CAGGATCAACCATTGCATCCTGTTGAACGCCTTCTTTGCCAAATTTATCATAAGCAGTTC
GCTTCTCGGGATCGCTAAGAACCTGGTAAGCTTCACCTAGTGTCTGAAAGTTTTTAGCAG
CCTGAGGATCATTAGGGTTTTTGTCTGGATGGACTTGCCTTGCTTTGATATAATAAGCTT
TCTTAATGTCAGCAGCAGAGGCATCAGTCTTGACGCCTAAGACGTCGTAATACTCACTCT
CCCTCACCATTCCCCCCTCAAACTCTCTATAAAGTGTTGGTG**GAGCACAAAAGCCAGA
AGGAGATTATTGGATT
CC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2D886TF 761 0 0
CACCAGAAGCAGCCATGACTTGAAATTTGATGAGGTGGC*TTTGTCACGCACCCATTCAG
CTAAGAAGGGTACTTTCATGAGACGTTTGTCCTTCCCGAGTTCTTTCGCAGCTTTTCCAG
TGTAGATGTAACCCACAGTGTGCAGCATTGCTTCCCCAAAACCAGCAGTTGAGAGTCGCC
TTGCCTCAGCGGTAGCCCAATTCACAAAATCATCGGTTCGTCCTTCCACGAATGGTTCGA
GTTTGTTCTTCAGTGTAGTGACAAGCTTGTCTTCCCTTTCTTTTTGCATCGCTTTGATCT
TGTCTTGAAGCAACTTTTTCCTAATCTCAGGCTCATGGGATTCTACTTCAGCGTCGAGGG
ATGCAATGGAAGCGAGAGCAAGTTGGCCAATATAGTCCTCAAACAACTCGCTGCCAAAGA
GCATGCCAAATACAGCTGCAGGATCAACCATTGCATCCTGTTGAACGCCGTCTTTGCCAA
ATTTATCATAAGCAGTTCGCTTCTCGGGATCGCTAAGAACCTGGTAAGCTTCACCTAGTG
TCTGAAAGTTTTTAGCAGCCTGAGGATCATTAGGGTTCTTGTCTGGATGGACTTGCCTTG
CTTTGATATAATAAGCTTTCTTAATGTCAGAAGCTGAGGCATCAGTCTTGACGCCTAAGA
CGTCGTAATACTCACTCTCCTTCACCATTCTCTCCTCAAACTCTCTATAAAGTGTTGGTG
TGGAGCACAAAAGCCAGAAGGAGATTATTGGATTGTTTC
CC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2CW61TF 757 0 0
CAGCCATGACTTGAGATTTGATGAGGTGGC*TTTGTCACGCACCCATTCAGCTAAGAAGG
GTACTTTCATGAGACGTTTGTCCTTCCCGAGTTCTTTCGCAGCTTTTCTAGTGTAGATGT
AACCCACAGTGTGCAGCATTGCTTCCCCAAAACCAGCAGTTGAGAGTCGCCTTGCCTCAG
CGGTAGCCCAATTCACAAAATCATCGGTTCGTCCTTCCACGAATGGTTCGAGTTTGTTCT
TCAGTGTAGTGACAAGCTTGTCTTACCTTTCTTTTTGCATCGCTTTGATCTTGTCTTGAA
GCAACTTTTTCCTAATCTCAGGCTCATGGGATTCTACTTCAGCGTCGAGGGATGCAATGG
AAGCGAGAGCAAGTTGGCCAATATAGTCCTCAAACAACTCGCTGCCAAAGAGCATGCCAA
ATACAGCTGCAGGATCAACCATTGCATCCTGTTGAACGCCGTCTTTGCCAAATTTATCAT
AAGCAGTTCGCTTCTCGGGATCGCTAAGAACCTGGTAAGCTTCACCTAGTGTCTGAAAGT
TTTTAGCAGCCTGAGGATCATTAGGGTTCTTGTCTGGATGGACTTGCCTTGCTTTGATAT
AATAAGCTTTCTTAATGTCAGAAGCTGAGGCATCAGTCTTGACGCCTAAGACGTCGTAAT
ACTCACTCTCCTTCACCATTCTCTCCTCAAACTCTCTATAAAGTGTTGGTGTGGAGCACA
AAAGCCAGAAGGAGATTATTGGATTGTTTCAGAT
CCC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2CG70TF 675 0 0
CCGAGTTCTTTCGCAGCTTT*CTAGTGTAAATGTAGCCCACAGTGTGCAGCATTGCTTCC
CCAAAACCAGCAGTTGAGAGTCGCCTTGCCTCAGCGGTAGCCCAATTCACAAAATCATCG
GTTCGTCCTTCCACGAATGGTTCGAGTTTGTTCTTCAGCGTAGTGACAAGCTTGTCTTCC
CTTTCTTTTTGCATCGCTTTGATCTTGTCTTGAAGCAACTTTTTCCTAATCTCAGGCTCA
TGGGATTCTACTTCAGCGTCGAGGGATGCAATGGAAGCGAGAGCAAGTTGGCCAATATAG
TCCTCAAACAACTCGCTGCCAAAGAGCATGCCAAATACAGCTACAGGATCAACCATTGCA
TCCTGTTGAACGCCTTCTTTGCCAAATTTATCATAAGCAGTTCGCTTCTCGGGATCGCTA
AGAACTTGGTAAGCTTCACCTAGTGTCTGAAAGTTTTTAGCAGCCTGAGGATCATTAGGG
TTTTTGTCTGGATGGACTTGCCTTGCTTTGATATAATAAGCTTTCTTAATGTCAGCAGCA
GAGGCATCAGTCTTGACGCCTAAGACGTCGTAATACTCACTCTCCTTCACCATTCCCCCC
TCAAACTCTCTATAAAGTGTTGGTG**GAGCACAAAAGCCAGAAGGAGATTATTGGATTG
TTTCAGATTTGGTCC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 2 14

CO CL211Contig1 1009 6 5 U
GGAATCGTCGAAAATGTTGAGATCCTCGTTTCGGCTTCTCTATATAACAAGAAGTACCAA
TCTTCTTGTCCGAGCTTCATCATCATCATCATCGCTCTCTCTGTTCTCGTCTAAGTCCTC
CAATTCTGCGAAACCACTTTTCACTTCTCATCGTCAGGTTCCATTACCAACAACGGGAGC
TAAACTCTCTAGGTCGGAACATTCCATGGCTACTTCCTCCGAGCCCAAGTCCATCTATGA
TTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAAAGATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGT
TCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACTGAGCT
TGCACAGCTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAA
CCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCG
CTTCAAGGCGGAGTACCCTATCTTTGACAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCC
AATCTATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTTTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAA
CTTCGCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTAC
TTCCCCTCTCAGCATTGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTTAAGCAAC
GAAATGGCGCTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTC
TTGAGCGTCTTTGGGATGAGTTGTTTCCTGCTACTTAATTCATCGTTTTAGCTACTTATG
TGTGTAATATCGTCGCCCTAAATATCATAATCGCTGTTCCTACTATACTTTGCCTGTTTC
CATGAACCATGGGGAGAAGTAAGCTAGAGACAGCGCAATATGGTATTTTAAAAATTTAGA
GTTGAAAGTCAAATAATTTTAATTTGATTTTGACCCTTTTTAATTTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV38TF U 94
AF RR2DO08TF U 5
AF RR2BH89TF U 1
AF RR2EE02JQ C 154
AF RR2DO08JQ C 180
AF RR2BH89JQ C 357
BS 1 786 RR2BH89TF
BS 787 862 RR2EE02JQ
BS 863 863 RR2DO08JQ
BS 864 882 RR2EE02JQ
BS 883 1009 RR2BH89JQ

RD RR2AV38TF 557 0 0
GCTCTCTCTGTTCTCGTCTAAGTCCTCCAATTCTGCGAAACCACTTTTCACTTCCCATCG
TCAGGTTCCATTACCAACAACGGGAGCTAAACTCTCTAGGTCGGAACATTCCATGGCTAC
TTCCTCCGAGCCCAAGTCCATCTATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATGATGT
TGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGG
TTTGACCAATTCGAACTATACTGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGG
GTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGA
AGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCGATCTTTGATAAGGT
TGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGG
GCTCTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAACTTCGCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAA
TGTTGTGGACCGTTACG

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2DO08TF 710 0 0
GGGTCG
AAAATGTTGAGATCCTCGTTTCGGCTTCTCTATATAACAAGAAGTACCAATCTTCTTGTC
CGAGCTTCATCATCATCATCATCGCTCTCTCTGTTCTCGTCTAAGTCCTCCAATTCTGCG
AAACCACTTTTCACTTCTCATCGTCAGGTTCCATTACCAACAACGGGAGCTAAACTCTCT
AGGTCGGAACATTCCATGGCTACTTCCTCCGAGCCCAAGTCCATCTATGATTTCACCGTC
AAGGATGCGAAGGGAAAAGATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATT
GTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACTGAGCTTGCACAGCTG
TACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGG
AATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGCTTCAAGGCG
GAGTACCCTATCTTTGACAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTACTCCAATCTATAAG
TTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTTTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAACTTCGCCAAG
TTCTTGGTTGACAAAGATGGGAATGCTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCTC
AGCATTGAGAAAGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTTA

QA 7 710 7 710
DS 

RD RR2BH89TF 786 0 0
GGAATCGTCGAAAATGTTGAGATCCTCGTTTCGGCTTCTCTATATAACAAGAAGTACCAA
TCTTCTTGTCCGAGCTTCATCATCATCATCATCGCTCTCTCTGTTCTCGTCTAAGTCCTC
CAATTCTGCGAAACCACTTTTCACTTCTCATCGTCAGGTTCCATTACCAACAACGGGAGC
TAAACTCTCTAGGTCGGAACATTCCATGGCTACTTCCTCCGAGCCCAAGTCCATCTATGA
TTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAAAGATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGT
TCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACTGAGCT
TGCACAGCTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAA
CCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCG
CTTCAAGGCGGAGTACCCTATCTTTGACAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCC
AATCTATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTTTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAA
CTTCGCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTAC
TTCCCCTCTCAGCATTGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTTAAGCAAC
GAAATGGCGCTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTC
TTGAGC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2EE02JQ 731 0 0
TCAGGTTCCATTACCAACAACGGGAGCTAAACTCTCTAGGTCGGAACATTCCATGGCTAC
TTCCTCCGAGCCCAAGTCCATCTATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAAAGATGT
TGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGG
TTTGACCAATTCGAACTATACTGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGG
GTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGA
AGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGCTTCAAGGCGGAGTACCCTATCTTTGACAAGGT
TGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGG
GCTTTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAACTTCGCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAA
TGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCTCAGCATTGAGAAGGACCTGAAGAA
ACTGTTGGGAGTTACTGCTCAAGCAACGAAATGGCGCTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTA
CAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTCTTTGGGATGAGTTGTTTCCTGCTA
CTTAATTCATCGTTTTAGCTACTTATGTGTGTAATATCGTCGCCCTAAACATCATAATCG
CTGTTCCTA
CT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2DO08JQ 705 0 0
CTAAACTCTCTAGGTCGGAACATTCCATGGCTACTTCCTCCGAGCCCAAGTCCATCTATG
ATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAAAGATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGG
TTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACTGAGC
TTGCACAGCTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTA
ACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCC
GCTTCAAGGCGGAGTACCCTATCTTTGACAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTACTC
CAATCTATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTTTTTGGAGACGGAATCAAGTGGA
ACTTCGCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAATGCTGTGGACCGTTACGCCCCAACTA
CTTCCCCTCTCAGCATTGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTTAAGCAA
CGAAATGGCGCTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTT
CTTGAGCGTCTTTGGGATGAGTTGTTTCCTGCTACTTAATTCATCGTTTTAGCTACTTAT
GTGTGTAATATCGTCGCCCTAAATATCATAATCGCTATTCCTA
CC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2BH89JQ 653 0 0
AGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTGGAGATCCTTGCGTTCCCCT
GTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTA
CCCGCTTCAAGGCGGAGTACCCTATCTTTGACAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTG
CTCCAATCTATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTTTTTGGAGACGGAATCAAGT
GGAACTTCGCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAA
CTACTTCCCCTCTCAGCATTGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTTAAG
CAACGAAATGGCGCTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTAT
GTTCTTGAGCGTCTTTGGGATGAGTTGTTTCCTGCTACTTAATTCATCGTTTTGGCTACT
TATGTGTGTAATATCGTCGCCCTAAATATCATAATCGCTGTTCCTACTATACTTTGCCTG
TTTCCATGAACCATGGGGAGAAGTAAGCTAGAGACAGCGCAATATGGTATTTTAAAAATT
TAGAGTTGAAAGTCAAATAATTTTAATTTGATTTTGACCCTTTTTAATTTTTA

QA 1 653 1 653
DS 



CO CL211Contig2 925 8 18 U
GGAAAATATCTAAATCTTCAAGGTGAAAAAAGAATCTAATCGTCGAAAAATGTTGAGATC
CTCGTTTCGGCTTCTCTATATAACAAGAAGTACCAATCTACTTGTCCGAGCTTCATCATC
ATCATCATCATCATCGCTCTCTCTGTTCTCATCTAAATCCAATTCCCCGAAACCACTTCT
CACTTCTCATCGTCAGGTTCCATTATCAACAACGGGAGTTAAATTCTCTAAGTCGGAACA
TTCCATGGCCACTTCCTCGGAGCCCAAGTCCATCTATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAA
GGGAAATGATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGC
TTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTA
CAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACC
TGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCGAT
CTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAAATC
AAGCAAAGGTGGGCTTTTTGGAGACGGTATCAAGTGGAACTTTGCCAAGTTCTTGGTTGA
CAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCTCAGCATTGAGAA
GGACCTGAAGAAACTGTTGGG*AGTTACTGCTTAAGCAACGAAGAGGCGCTAGTACTCAA
ATAAAAGCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTCTTTGGGATGAG
TTGTTTCCTGCTACTTAATTCTTCGTTTAGCTACTTATGTGTGTAATATCGTCGACCTAA
ATATCATAATTGCTGTTCCTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 15 15 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 15 10 10 10 10 10 

AF RR2DR76TF U 40
AF RR2F069TF U 1
AF RR2FH32TF U 116
AF RR2FH32JQ C 117
AF RR2DR76JQ C 285
AF RR2BV74TF U 131
AF RR2BV74JQ C 188
AF RR2F069JQ C 290
BS 1 132 RR2F069TF
BS 133 135 RR2DR76TF
BS 136 305 RR2F069TF
BS 306 306 RR2DR76TF
BS 307 421 RR2F069TF
BS 422 422 RR2DR76TF
BS 423 702 RR2F069TF
BS 703 785 RR2FH32TF
BS 786 786 RR2BV74TF
BS 787 851 RR2FH32TF
BS 852 885 RR2BV74TF
BS 886 886 RR2FH32JQ
BS 887 896 RR2BV74TF
BS 897 897 RR2FH32JQ
BS 898 918 RR2BV74TF
BS 919 919 RR2FH32JQ
BS 920 920 RR2BV74JQ
BS 921 925 RR2F069JQ

RD RR2DR76TF 528 0 0
GGGTCGA
AAAATGTTGAGATCCTCGTTTCGGCTTCTCTATATAACAAGAAGTACCAATCTACTTGTC
CGAGCTTCATCATCATCATCATCATCATCGCTCTCTCTGTTCTCATCTAAATCCAATTCC
CCGAAACCACTTCTCACTTCTCATCGTCAGGTTCCATTATCAACAACGGGAGTTAAATTC
TCTAAGTCGGAACATTCCATGGCCACTTCCTCGGAGCCCAAGTCCATCTATGATTTCACC
GTCAAGGATGCGAAGGGAAATGATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTG
ATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAG
CTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTT
GGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAG
GCTGAGTACCCGATCTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGA

QA 8 528 8 528
DS 

RD RR2F069TF 702 0 0
GGAAAATATCTAAATCTTCAAGGTGAAAAAAGAATCTAATCGTCGAAAAATGTTGAGATC
CTCGTTTCGGCTTCTCTATATAACAAGAAGTACCAATCTACTTGTCCGAGCTTCATCATC
ATCATCATCATC***GCTCTCTCTGTTCTCATCTAAATCCAATTCCCCGAAACCACTTCT
CACTTCTCATCGTCAGGTTCCATTATCAACAACGGGAGTTAAATTCTCTAAGTCGGAACA
TTCCATGGCCACTTCCTCGGAGCCCAAGTCCATCTATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAA
GGGAAGTGATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGC
TTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTA
CGAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACC
TGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCGAT
CTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAAATC
AAGCAAAGGTGGGCTTTTTGGAGACGGTATCAAGTGGAACTTTGCCAAGTTCTTGGTTGA
CAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2FH32TF 736 0 0
GG
ATCATCATCATCATCATCGCTCTCTCTGTTCTCATCTAAATCCAATTCCCCGAAACCACT
TCTCACTTCTCATCGTCAGGTTCCATTATCAACAACGGGAGTTAAATTCTCTAAGTCGGA
ACATTCCATGGCCACTTCCTCGGAGCCCAAGTCCATCTATGATTTCACCGTCAAGGATGC
GAAGGGAAATGATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGT
TGCTTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAA
GTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGA
ACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGACTGAGTACCC
GATCTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAA
ATCAAGCAAAGGTGGGCTTTTTGGAGACGGTATCAAGTGGAACTTTGCCAAGTTCTTGGT
TGACAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCTCAGCATTGA
GAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGG*AGTTACTGCTTAAGCAACGAAGAGGCGCTAGTACT
CAAATAAA*GCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTCTTTGGGAT
GAGTTGTTTCCTGC

QA 3 736 3 736
DS 

RD RR2FH32JQ 806 0 0
G
ATCATCATCATCATCATCGCTCTCTCTGT*CTCATCTAAATCCAATTCCC*GAAACCACT
TCTCACTTCTCATCGTCAGGTTCCATTATCAACAACGGGAGTTAAATTCTCTAAGTCGGA
ACATTCCATGGCCACTTCCTCGGAGCCCAAGTCCATCTATGATTTCACCGTCAAGGATGC
GAAGGGAAATGATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGT
TGCTTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAA
GTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGA
ACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGACTGAGTACCC
GATCTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAA
ATCAAGCAAAGGTGGGCTTTTTGGAGACGGTATCAAGTGGAACTTTGCCAAGTTCTTGGT
TGACAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCTCAGCATTGA
GAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGG*AGTTACTGCTTAAGCAACGAAGAGGCGCTAGTACT
CAAATAAAAGCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTCTTTGGGAT
GAGTTGTTTCCTGCTACTTAATTCTTCGTTTAGCTACTTATGTGTGTAATATCGTCGACC
TAAATATCATAATTGCTGTTCC
CAG

QA 2 803 2 803
DS 

RD RR2DR76JQ 635 0 0
CCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATGATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCT
TGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCAC
AGCTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGT
TTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCA
AGGCTGAGTACCCGATCTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCT
ATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTTTTTGGAGACGGTATCAAGTGGAACTTTG
CCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCC
CTCTCAGCATTGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGG*AGTTACTGCTTAAGCAACGAAG
AGGCGCTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGA
GCGTCTTTGGGATGAGTTGTTTCCTGCTACTTAATTCTTCGTTTAGCTACTTATGTGTGT
AATATCGTCGACCTAAATATCATAATTGCTGTTCC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2BV74TF 791 0 0
GG
ATCGCTCTCTCTGTTCTCATCTAAATCCAATTCCCCGAAACCACTTCTCACTTCTCATCG
TCAGGTTCCATTATCAACAACGGGAGTTAAATTCTCTAAGTCGGAACATTCCATGGCCAC
TTCCTCGGAGCCCAAGTCCATCTATGATTTC***GTCAAGGATGCGAAGGGAAATGATGT
TGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGG
TTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGG
GTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGGACCTGGTTCTAATGA
AGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCGATCTTTGATAAGGT
TGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGG
GCTTTTTGGAGACGGTATCAAGTGGAACTTTGCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAA
TGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCTCAGCATTGAGAAGGACCTGAAGAA
ACTGTTGGGGAGTTACTGCTTAAGCAACGAAGAGGCGCTAGTACTCAAATAAAAGCTCCT
ACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTCTTTGGGATGAGTTGTT*CCTGCT
ACTTAATTCTTCGTTTAGCTACTTATGTGTGTA*TATCGTCGAC*TAAATATCATAATTG
CTGTTC
TAA

QA 3 788 3 788
DS 

RD RR2BV74JQ 733 0 0
CATCGTCAGGTTCCATTATCAACAACGGGAGTTAAATTCTCTAAGTCGGAACATTCCATG
GCCACTTCCTCGGAGCCCAAGTCCATCTATGATTTC***GTCAAGGATGCGAAGGGAAAT
GATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAG
TGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTACAAAGAT
CATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGGACCTGGTTCT
AATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCGATCTTTGAT
AAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAA
GGTGGGCTTTTTGGAGACGGTATCAAGTGGAACTTTGCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGAT
GGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCTCAGCATTGAGAAGGACCTG
AAGAAACTGTTGGG*AGTTACTGCTTAAGCAACGAAGAGGCGCTAGTACTCAAATAAAAG
CTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTCTTTGGGATGAGTTGTTTC
CTGCTACTTAATTCTTCGTTTAGCTACTTATGTGTGTAATATCGTCGACCTAAATATCAT
AATTGCTGTTCCT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2F069JQ 636 0 0
AAGGATGCGAAGGGAAGTGATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATT
GTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAGCTG
TACCAGAAGTACGAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGG
AATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGGCT
GAGTACCCGATCTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAG
TTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTTTTTGGAGACGGTATCAAGTGGAACTTTGCCAAG
TTCTTGGTTGACAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCTC
AGCATTGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGG*AGTTACTGCTTAAGCAACGAAGAGGCG
CTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTC
TTTGGGATGAGTTGTTTCCTGCTACTTAATTCTTCGTTTAGCTACTTATGTGTGTAATAT
CGTCGACCTAAATATCATAATTGCTGTTCCTATTCC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 3 13

CO CL212Contig1 1333 4 17 U
GGATTTCTCGTCGCAGTAAGCTTTAGCCGCAGCTTCAGGAAGAAGAAGAGAATGTCTCAC
AGGAAGTTTGAGCACCCAAGGCACGGTTCCCTTGGTTTCCTTCCAAGGAAGAGAGCTAAC
CGTCACAGAGGAAAAGTGAAGGCCTTCCCCAAGGATGACCAAACCAAGCCTTGCAAGTTC
ACAGCCTTCATGGGATACAAGGCTGGTATGACCCACATTGTTAGAGATGTCGAGAAGCCC
GGATCCAAGCTGCACAAGAAGGAGACCTGTGAGGCTGTTACCATCATCGAGACACCGGCT
ATGGTGGTCGTTGGTGTTGTTGCCTACGTCAAGACTCCCCGTGGCCTGAGGTCTCTGAAC
ACCGTCTGGGCACAGCACTTGAGTGAGGAGGTCAGGAGAAGGTTCTACAAGAACTGGGCC
AAGTCCAAGAAGAAGGCCTTCACCGGATACGCCAAGCAGTACGAGAGCGAGGAAGGCAAG
AAGAGCATCCAGGCTCAGCTCGAGAAGATGAAGAAATACGGAACTGTTATCCGTGTTTTG
GCCCACACTCAGATCAGGAAGATGAAGGGTTTGAAGCAGAAGAAAGCTCACATGATGGAG
GTCCAGATCAACGGTGGTACCATTGCTCAGAAAGTCGACTTTGCCTACAGCTTCTTTGAG
AAGCAGATTCCCATCGATGCTGTTTTCCAGAACGATGAGATGATTGATGTCATCGGTGTG
ACCAAGGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTGTCACTCGTTGGGGTGTGACTAGGCTTCCACGT
AAGACTCACAGGGGTCTACGTAAGGTTGCTTGTATCGGTGCCTGGCATCCTGCTAGAGTT
TCCTACACTGTTGCCAGAGCTGGTCAGAACGGTTACCATCACCGTACCGAACTTAACAAG
AAGATTTACAGGTTGGGCAAGGTTGGTCAGGAGACGCACACAGCCATGACTGAATACGAC
AGGACCGAGAAGGATGTGACTCCAATGGGTGGATTTGCACACTATGGTGTGGTGAAGGAT
GACTACTTGATGATTAAGGGATGCTGCATGGGTCCAAAGAAGAGGGTTGTGACTCTTAGA
CAGTCACTTCTCACTCAGACTTCCCGTCTTGCCATGGAGCAGATCAACCTTAAGTTTATC
GACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCAAATTCCAGACCACCCAGGAAAAGAACAAGTTC
TACGGCCGTGCCTCTGCCAAAGCTTAAGCAATTTGTCTTTTTTTTCAATCTTCATGACCT
CTTTCCTCAAAAAATACTGTTTAGAACTATTCGCTGCACTTTTTGTGTTAGTTATTTGGA
GAGTTTGAACGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM80TF U 1
AF RR2GB76TF U 1
AF RR2DN37TF U 1
AF RR2CM80JQ C 649
BS 1 479 RR2CM80TF
BS 480 480 RR2DN37TF
BS 481 510 RR2CM80TF
BS 511 511 RR2DN37TF
BS 512 577 RR2CM80TF
BS 578 578 RR2DN37TF
BS 579 670 RR2CM80TF
BS 671 671 RR2DN37TF
BS 672 681 RR2CM80TF
BS 682 742 RR2DN37TF
BS 743 743 RR2CM80JQ
BS 744 770 RR2DN37TF
BS 771 771 RR2CM80JQ
BS 772 781 RR2DN37TF
BS 782 782 RR2CM80JQ
BS 783 793 RR2DN37TF
BS 794 1333 RR2CM80JQ

RD RR2CM80TF 681 0 0
GGATTTCTCGTCGCAGTAAGCTTTAGCCGCAGCTTCAGGAAGAAGAAGAGAATGTCTCAC
AGGAAGTTTGAGCACCCAAGGCACGGTTCCCTTGGTTTCCTTCCAAGGAAGAGAGCTAAC
CGTCACAGAGGAAAAGTGAAGGCCTTCCCCAAGGATGACCAAACCAAGCCTTGCAAGTTC
ACAGCCTTCATGGGATACAAGGCTGGTATGACCCACATTGTTAGAGATGTCGAGAAGCCC
GGATCCAAGCTGCACAAGAAGGAGACCTGTGAGGCTGTTACCATCATCGAGACACCGGCT
ATGGTGGTCGTTGGTGTTGTTGCCTACGTCAAGACTCCCCGTGGCCTGAGGTCTCTGAAC
ACCGTCTGGGCACAGCACTTGAGTGAGGAGGTCAGGAGAAGGTTCTACAAGAACTGGGCC
AAGTCCAAGAAGAAGGCCTTCACCGGATACGCCAAGCAGTACGAGAGCGAGGAAGGCAAT
AAGAGCATCCAGGCTCAGCTCGAGAAGATGGAGAAATACGGAACTGTTATCCGTGTTTTG
GCCCACACTCAGATCAGGAAGATGAAGGGTTTGAAGCGGAAGAAAGCTCACATGATGGAG
GTCCAGATCAACGGTGGTACCATTGCTCAGAAAGTCGACTTTGCCTACAGCTTCTTTGAG
AAGCAGATTCTCATCGATGCT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2GB76TF 729 0 0
GGATTTCTCGTCGCAGTAAGCTTTAGCCGCAGCTTCAGGAGGAAGAGGAGAATGTCTCAC
AGGAAGTTTGAGCACCCAAGGCACGGTTCCCTTGGTTTCCTTCCAAGGAAGAGAGCTAAC
CGTCACAGAGGAAAAGTGAAGGCCTTCCCCAAGGATGACCAAACCAAGCCTTGCAAGTTC
ACAGCCTTCATGGGATACAAGGCTGGTATGGCCCACATTGTTAGAGATGTCGAGAAGCCC
GGATCCAAGCTTCACAAGAAGGAGACCTGTGAGGCTGTTACCATTATCGAGACACCTGCT
ATGGTGGTCGTTGGTGTTGTTGCCTACGTCAAGACTCCCCGTGGTCTGAGGTCTTTGAAC
ACCGTCTGGGCACAGCACTTGAGCGAGGAGGTCAGGAGAAGGTTCTACAAGAACTGGGCC
AAGTCCAAGAAGAAGGCCTTCACCGGATACGCCAAGTAGTACGAGAGCGAGGAAGGCAAG
AAGAGCATCCAGGCTCAGCTTGAGAAGATGAAGAAATACGGAACCGTCATCCGTGTTTTG
GCCCACACTCAGATCAGGAAGATGAAGGGGTTGAAGCAGAAGAAGGCTCACATGATGGAG
GTCCAGATCAACGGTGGTACCATTGCTCAGAAAGTCGACTTTGCCTACAGCTTCTTTGAG
AAGCAGATTCCCATCGATGCTGTTTTCCAGAA*GATGAGATGATTGATGTCATCG*TGTG
ACCAAGGGT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2DN37TF 799 0 0
GGATTTCTCGTCGCAGTAAGCTTTAGCCGCAGCTTCAGGAAGAAGAAGAGAATGTCTCAC
AAGAAGTTTGAGCACCCAAGGCACGGTTCCCTTGGTTTCCTTCCAAGGAAGAGAGCTAAC
CGTCACAGAGGAAAAGTGAAGGCCTTCCCCAAGGATGACCAAACCAAGCCTTGCAAGTTC
ACAGCCTTCATGGGATACAAGGCTGGTATGACCCACATTGTTAGAGATGTCGAGAAGCCC
GGATCCAAGCTGCACAAGAAGGAGACCTGTGAGGCTGTTACCATCATCGAGACACCGGCT
ATGGTGGTCGTTGGTGTTGTTGCCTACGTCAAGACTCCCCGTGGCCTGAGGTCTCTGAAC
ACCGTCTGGGCACAGCACTTGAGTGAGGAGGTCAGGAGAAGGTTCTACAAGAACTGGGCC
AAGTCCAAGAAGAAGGCCTTCACCGGATACGCCAAGCAGTACGAGAGCGAGGAAGGCAAG
AAGAGCATCCAGGCTCAGCTCGAGAAGATGAAGAAATACGGAACTGTTATCCGTGTTTTG
GCCCACACTCAGATCAGGAAGATGAAGGGTTTGAAGCAGAAGAAAGCTCACATGATGGAG
ATCCAGATCAACGGTGGTACCATTGCTCAGAAGGTCGACTTTGCCTACAGCTTCTTTGAG
AAGCAGATTCCCATCGATGCTGTTTTCCAGAACGATGAGATGATTGATGTCATCGGTGTG
ACCAAGGGTAAAGGTTACGAAG*TGTTGTCACTCGTTGGGGTGTGACTAG*CTTCCACGT
A*GACTCACAGGG
TCTACG

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2CM80JQ 685 0 0
AGCTTCTTTGAGAAGCAGATTCCCATCGATGCTGTTTTCCAGAAGGATGAGATGATTGAT
GTCATCGGTGTGACCAAGGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTGTCACTCGTTGGGGTGTGACT
AGGCTTCCACGTAAGACTCACAGGGGTCTACGTAAGGTTGCTTGTATCGGTGCCTGGCAT
CCTGCTAGAGTTTCCTACACTGTTGCCAGAGCTGGTCAGAACGGTTACCATCACCGTACC
GAACTTAACAAGAAGATTTACAGGTTGGGCAAGGTTGGTCAGGAGACGCACACAGCCATG
ACTGAATACGACAGGACCGAGAAGGATGTGACTCCAATGGGTGGATTTGCACACTATGGT
GTGGTGAAGGATGACTACTTGATGATTAAGGGATGCTGCATGGGTCCAAAGAAGAGGGTT
GTGACTCTTAGACAGTCACTTCTCACTCAGACTTCCCGTCTTGCCATGGAGCAGATCAAC
CTTAAGTTTATCGACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCAAATTCCAGACCACCCAGGAA
AAGAACAAGTTCTACGGCCGTGCCTCTGCCAAAGCTTAAGCAATTTGTCTTTTTTTTCAA
TCTTCATGACCTCTTTCCTCAAAAAATACTGTTTAGAACTATTCGCTGCACTTTTTGTGT
TAGTTATTTGGAGAGTTTGAACGCC

QA 1 685 1 685
DS 



CO CL212Contig2 682 4 22 U
GGCTCGTTGCAGTGAGCTATAGCCGCAGGACTCATCGCAGCTTCAGGAGGAGGA*GAAGA
GAATGTCTCACAGGAAGTTTGAGCACCCAAGGCACGGTTCCCTTGGTTTCCTTCCCAGGA
AGAGAGCTAACCGTCACAGAGGAAAAGTGAAGGCCTTCCCAAAGGATGACCAAACCAAGC
CTTGCAAGTTCACAGCCTTCATGGGATACAAGGCTGGTATGACCCACATTGTTAGAGATG
TCGAGAAGCCCGGATCCAAGCTTCACAAGAAGGAGACCTGTGAGGCTGTTACCATCATCG
AGACACCTGCTATGGTTGTCGTTGGGGTTGTTGCCTACGTCAAGACTCCCCGTGGCCTGA
GGTCTTTGAACACCGTCTGGGCACAGCACTTGAGTGAGGAGGTGAGGAGAAGGTTCTACA
AGAACTGGGCCAAGTCCAAGAAGAAGGCCTTCACCGGATACGCCAAGCAGTACGAGAGCG
AGGAAGGCAAGAAGAGCATCCAGTCCCAGCTCGAGAAGATGAAGAAGTACGGAACCGTCA
TCCGTGTCTTGGCCCACACTCAGATCAGGAAGATGAAGGGATTGAAGCAGAAGAAAGCTC
ACATGATGGAGGTCCAGATCAACGGTGGTACCATTGCCCAGAAAGTCGACTTTGCCTACA
GCTTCTTCGAGAAGCAGATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 0 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2GN25TF U 7
AF RR2D492TF U 8
AF RR2EI45TF U 1
AF RR2CF85TF U 8
BS 1 54 RR2EI45TF
BS 55 55 RR2GN25TF
BS 56 100 RR2EI45TF
BS 101 101 RR2GN25TF
BS 102 181 RR2EI45TF
BS 182 182 RR2GN25TF
BS 183 212 RR2EI45TF
BS 213 213 RR2GN25TF
BS 214 253 RR2EI45TF
BS 254 254 RR2GN25TF
BS 255 273 RR2EI45TF
BS 274 274 RR2GN25TF
BS 275 358 RR2EI45TF
BS 359 359 RR2GN25TF
BS 360 385 RR2EI45TF
BS 386 386 RR2GN25TF
BS 387 548 RR2EI45TF
BS 549 549 RR2D492TF
BS 550 581 RR2EI45TF
BS 582 582 RR2D492TF
BS 583 679 RR2EI45TF
BS 680 682 RR2CF85TF

RD RR2GN25TF 406 0 0
GG
GCAGTGAGCTATAGCCGCAGGACTCATCGCATCTTCAGGAGGA******AGAGAATGTCT
CACAGGAAGTTTGAGCACCCAAGGCACGGTTCCCTTGGTTTCCTTCCCAGGAAGAGAGCT
AACCGTCACAGAGGAAAAGTGAAGGCCTTCCCAAAGGATGACCAAACGAAGCCTTGCAAG
TTCACAGCCTTCATGGGATACAAGGCTGGTATGACCCACATTGTTAGAGATGTCGAGAAG
CCAGGATCCAAGCTTCACAAGAAGGAGACCTGTGAGGCTGTTACTATCATCGAGACACCT
GCTATGGTTGTCGTTGGGTTTGTCGCCTACGTCAAGACTCCCCGTGGCCTGAGGTCTTTG
AACACCGTCTGGGCACAGCACTTGAGTGAGGAGGTGAGGAGAAG

QA 3 406 3 406
DS 

RD RR2D492TF 633 0 0
GGCAGTTAGCTAT
AGCCGCAGGACTCATCGCAGCTTCAGGAGGAGGAGGAAGAGAATGTCTCACAGGAAGTTT
GAGCACCCAAGGCACGGTTCTCTTGGTTTCCTTCCCAGGAAGAGAGCTAACCGTCACAGA
GGAAAAGTGAAGGCCTTCCCTAAGGATGACCAAACCAAGCCTTGCAAGTTCACAGCCTTC
ATGGGATACAAGGCTGGTATGACCCACATCGTTAGAGATGTCGAGAAGCCCGGATCCAAG
CTTCACAAGAAGGAGACCTGTGAGGCTGTTACCATCATCGAGACACCTGCTATGGTTGTC
GTTGGTGTTGTTGCCTACGTCAAGACTCCCCGTGGCCTGAGGTCCTTGAACACCGTCTGG
GCACAGCACTTGAGTGAGGAGGTCAGGAGAAGGTTCTACAAGAACTGGGCCAAGTCCAAG
AAGAAGGCCTTCACCGGATACGCCAAGCAGTACGAGAGCGAGGAAGGCAAGAAGAGCATC
CAGTCCCAGCTCGAGAAGATGAAGAAGTACGGAACCGTCATCCGTGTCTTGGCCCACACT
CAGATCAGGAAGATGAAGGGATTGAAGCAGAAGAAAGCTCACATGATGGAGGTACAGATC
AACGGTGGTACCATTGCCCA

QA 14 633 14 633
DS 

RD RR2EI45TF 679 0 0
GGCTCGTTGCAGTGAGCTATAGCCGCAGGACTCATCGCAGCTTCAGGAGGAGGAAGAAGA
GAATGTCTCACAGGAAGTTTGAGCACCCAAGGCACGGTTCTCTTGGTTTCCTTCCCAGGA
AGAGAGCTAACCGTCACAGAGGAAAAGTGAAGGCCTTCCCAAAGGATGACCAAACCAAGC
CATGCAAGTTCACAGCCTTCATGGGATACAAG*CTGGTATGACCCACATTGTTAGAGATG
TCGAGAAGCCCGGTTCCAAGCTTCACAAGAAGGGGACCTGTGAGGCTGTTACCATCATCG
AGACACCTGCTATGGTTGTCGTTGGGGTTGTTGCCTACGTCAAGACTCCCCGTGGCCTAA
GGTCTTTGAACACCGTCTGGGCACATCACTTGAGTGAGGAGGTGAGGAGAAGGTTCTACA
AGAACTGGGCCAAGTCCAAGAAGAAGGCCTTCACCGGATACGCCAAGCAGTACGAGAGCG
AGGAAGGCAAGAAGAGCATCCAGTCCCAGCTCGAGAAGATGAAGAAGTACGGAACCGTCA
TCCGTGTCCTGGCCCACACTCAGATCAGGAAGATGAAGGGACTGAAGCAGAAGAAAGCTC
ACATGATGGAGGTCCAGATCAACGGTGGTACCATTGCCCAGAAAGTCGACTTTGCCTACA
GCTTCTTCGAGAAGCAGAT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2CF85TF 675 0 0
GGAGTGTGCCAAG
AGCCGCTGGACTCATCGCAGCTTCAGGAGGAGGA***AGAGAATGTCTCACAGGAAGTTT
GAGCACCCAAGGCACGGTTCCCTTGGTTTCCTTCCCAGGAAGAGAGCTAACCGTCACAGA
GGAAAAGTGAAGGCCTTCCTAAAGGATGACCAAACCAAGCCTTGCAAGTTCACAGCCTTC
ATGGGATACAAGGCTGGCATGACCCACATTGTTAGAGATGTCGAGAAGCCCGGTTCCAAG
CTTCACAAGAAGGAGACCTGTGAGGCTGTTACCATCATCGAGACACCTGCTATGGTCGTC
GTTGGGGTTGTTGCCTACGTCAAGACTCCCCGTGGCCTGAGGTCTTTGAACACCGTCTGG
GCACAGCACTTGAGTGAGGAGGTGAGGAGAAGGTTCTACAAGAACTGGGCCAAGTCCAAG
AAGAAGGCCTTCACCGGATACGCCAAGCAGTACGAGAGCGAGGAAGGCAAGAAGAGCATC
CAGGCCCAGCTCGAGAAGATGAAGAGGTACGGAACCGTCATCCGTGTCTTGGCCCACACT
CAGATCAGGAAGATGAAGGGATTGAAGCAGAAGAAAGCTCACATGATGGAGGTCCAGATC
AACGGTGGTACCATTGCCCAGAAAGTCGACTTTGCCTACAGCTTCTTCGAGAAGCAGATC
CC

QA 14 675 14 675
DS 



CO CL212Contig3 1054 5 24 U
AGGGGAAGAAGCATATGATGTTTAAAACTCTCCAAATAACTAAAACACAAAATTGCAGCG
AATAGAGTTCAAAAGAGTATTATCAAAGACTTTTCTGAAGAAAGAGCGAATACAAACTGA
AAAAAGAACAAACTGTTTTAAGCCTTGGCAGGGGCACGGCCGTAAAACTTGTTCTTCTCC
TGGGTAGTCTGGAATTTGCCATGTCCCATCTTTGAGGAAGTGTCGATAAACTTGAGGTTG
ATCTGCTCCATGGCAAGACGGGAAGTCTGAGTGAGCAATGACTGTCTAAAAGTCACAACC
CTCTTCTTTGGACCCATGCAGCATCCCTTGATCATCAAGTAGTCATCCTTCACCACACCA
TAGTGTGCGAATCCACCCATTGGAGTCACATCCTTCTCGGTCCTGTCGTATTCAGTCATG
GCAGTGTGGGTCTCCTGACCAACCTTGCCCAACCTGTAAATCTTCTTGTTCAATTCAGTA
CGGTGATGGTAACCGTTCTGACCAGCTCTGGCAACAGTGTAGGACACTCTAGCTGGATGC
CAGGCACCGATACAAGCAACCTTACGCAGACCCCTGTGGGTCTTACGTGGAAGCCTCGTC
ACACCCCAACGGGTAACAACACCTTCGTAACCTTTACCCTTGGTCACACCAATCACATCA
ATCATCTCATCCTTCTGGAAAACAGCATCGATGGGGATCTGCTTCTCGAAGAAGCTGTAG
GCAAAGTCGACCTTCTGGGCAATGGTACCACCGTTGATCTGGACCTCCATCATGTGAGCT
TTCTTCTGCTTCAGTCCCTTCATCTTCCTGATCTGAGTGTGGGCCAGGACACGGATGACG
GTTCCGTACTTCTTCATCTTCTCGAGCTGGGACTGGATGCTCTTCTTGCCTTCCTCGCTC
TCGTACTGCTTGGCGTATCCGGTGAAGGTTAGCTCTCTTCCTGGGAAGGAAACCAAGAGA
ACCGTGCCTTGGGTGCTCAAACTTCCTGTGAGACATTCTCTTCTTCCTCCTCCTGAAGCT
GCGATGAGTCCTGCGGCTATAGCTCACTGCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 
35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN25JQ U 1
AF RR2ES09JQ U 71
AF RR2CF85JQ U 17
AF RR2D492JQ U 17
AF RR2ES09TF C 290
BS 1 42 RR2GN25JQ
BS 43 43 RR2CF85JQ
BS 44 249 RR2GN25JQ
BS 250 250 RR2CF85JQ
BS 251 277 RR2GN25JQ
BS 278 278 RR2CF85JQ
BS 279 359 RR2GN25JQ
BS 360 360 RR2CF85JQ
BS 361 367 RR2GN25JQ
BS 368 368 RR2CF85JQ
BS 369 383 RR2GN25JQ
BS 384 384 RR2CF85JQ
BS 385 480 RR2GN25JQ
BS 481 524 RR2CF85JQ
BS 525 525 RR2ES09JQ
BS 526 533 RR2CF85JQ
BS 534 534 RR2ES09JQ
BS 535 596 RR2CF85JQ
BS 597 597 RR2D492JQ
BS 598 627 RR2CF85JQ
BS 628 628 RR2D492JQ
BS 629 706 RR2CF85JQ
BS 707 754 RR2D492JQ
BS 755 1054 RR2ES09TF

RD RR2GN25JQ 480 0 0
AGGGGAAGAAGCATATGATGTTTAAAACTCTCCAAATAACTAGAACACAAAATTGCAGCG
AATAGAGTTCAAAAGAGTATTATCAAAGACTTTTCTGAAGAAAGAGCGAATACAAACTGA
AAAAAGAACAAACTGTTTTAAGCCTTGGCAGGGGCACGGCCGTAAAACTTGTTCTTCTCC
TGGGTAGTCTGGAATTTGCCATGTCCCATCTTTGAGGAAGTGTCGATAAACTTGAGGTTG
ATCTGCTCCGTGGCAAGACGGGAAGTCTGAGTGAGCAGTGACTGTCTAAAAGTCACAACC
CTCTTCTTTGGACCCATGCAGCATCCCTTGATCATCAAGTAGTCATCCTTCACCACACCG
TAGTGTGAGAATCCACCCATTGGTGTCACATCCTTCTCGGTCCTGTCGTATTCAGTCATG
GCAGTGTGGGTCTCCTGACCAACCTTGCCCAACCTGTAAATCTTCTTGTTCAATTCAGTA

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2ES09JQ 521 0 0
AAAAGAGTATTATCAAAGACTTATCTGAAGAAAGAGCGAATACAAACTGAAAAAAGAACA
AACTGTTTTAAGCCTTGGCAGGGGCACGGCCGTAAAACTTGTTCTTCTCCTGGGTAGTCT
GGAATTTGCCATGTCCCATCTTTGAGGAAGTGTCGATAAACTTGAGGTTGATCTGCTCCA
TTGCAAGACGGGAAGTCTGAGTGAGCAGTGACTGTCTAAGAGTCACAACCCTCTTCTTTG
GACCCATGCAGCATCCCTTGATCATCAAGTAGTCATCCTTCACCACACCATAGTGTGCGA
ATCCACCCATTGGAGTCACATCCTTCTCGGTCCTGTCGTATTCAGTCATGGCAGTGTGGG
TCTCCTGACCAACCTTGCCCAACCTGTAAATCTTCTTGTTCAATTCAGTACGGTGATGGT
AACCGTTCTGACCAGCTCTGGCAACAGTGTAGGACACTCTAGCTGGATGCCAGGCACCGA
TACAAGCAACCTTACGCAGACCCCTGTGGGTCTTACGTGGA

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2CF85JQ 690 0 0
GATGTTTAAAACTCTCCAAATAACTAAAACACAAAATTGCAGCCAATAGAGTTCAAAAGA
GTATTATCAAAGACTTTTCTGAAGAAAGAGCGAATAAAAACTGAAAAAAAAA*AAACTGT
TTTAAGCCTTGGCAGGGGCACGGCCGTAAAACTTGTTCTTCTCCTGGGTAGTCTGGAATT
TGCCATGTCCCATCTTTGAGGAAGTGTCGATAAACTTGAGGTTGATCTGCTCCATGGCAA
GACGGGAAGTCTGAGTGAGCAACGACTGTCTAAAAGTCACAACCCTCTTCTTTGGACCCA
TGCAGCATCCCTTGATCACCAAGTAGTCATCCTTCACCACACCATAGTGTGCAAATCCAC
CCATTGGAGTCACATCCTTCTCGGTCCTGTCGTATTCAGTCATGGCAGTGTGGGTCTCCT
GACCAACCTTGCCCAACCTGTAAATCTTCTTGTTCAATTCAATACGGTGATGGTAACCGT
TCTGACCAGCTCTGGCAACAGTGTAGGAGACTCTAGCAGGATGCCAGGCACCGATACAAG
CAACCTTACGCAGACCCCTGTGGGTCTTACGTGGAAGCCTAGTCACACCCCAACGGGTAA
CAACACCTTCGCAACCTTTACCCTTGGTCACACCAATCACATCAATCATCTCATCCTTCT
GGAAAACAGCATCGATGGGGATCTGCTTCT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2D492JQ 738 0 0
GATGTTTAAAACTCTCCAAATAACTAAAACACAAAATTGCAGCGAATAGAGTTCAAAAGA
GTATTATCAAAGACTTTTCTGAAGAAAGAGCGAATACAAACTGAAAAAAGAACAAACTGT
TTTAAGCCTTGGCAGGGGCACGGCCGTAAAACTTGCTCTTCTCCTGGGTAGTCTGGAATT
TGCCATGTCCCATCTTTGAGGAAGTGTCGATAAACTTGAGGTTGATCTGTTCCATGGCAA
GACGGGAAGTCTGAGTGAGCAAAGACTGTCTAAGAGTCACAACCCTCTTCTTTGGACCCA
TGCAGCATCCCTTGATCATCAAGTAGTCATCCTTCACCACACCGTAGTGTGCGAATCCAC
CCATTGGTGTCACATCCTTCTCGGTCCTGTCGTATTCAGTCATGGCAGTGTGGGTATCCT
GACCAACCTTGCCCAACCTGTAAATCT*CTTGTTCAATTCAGTACGGTGATGGTAACCGT
TCTGACCAGCTCTGGCAACAGTGTAGGAGACTCTAGCAGGATGCCAGGCACCGATACAAG
CAACCTTACGCAGACCCCTGTGGGTCTTACGTGGAAGCCTCGTCACACCCCAACGGGTAA
CAACACCTTCGTAACCTTTACCCTTTGTCACACCAATCACATCAATCATCTCATCCTTCT
GGAATACAGCATCGATGGGGATCTGTTTCTCGAAGAAGCTGTAGGCAAAGTCGACCTTCT
GGGCAATGGTACCACCGT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2ES09TF 765 0 0
AGAGTCAC
ACCCTCTTCTTTGGACCCATGCAGCATCCCTTGATCATCAAGTAGTCATCCTTCACCACA
CCATAGTGTGCGAATCCACCCATTGGAGTCACATCCTTCTCGGTCCTGTCGTATTCAGTC
ATGGCAGTGTGGGTCTCCTGACCAACCTTGCCCAACCTGTAAATCTTCTTGTTCAATTCA
GTACGGTGATGGTAACCGTTCTGACCAGCTCTGGCAACAGTGTAGGACACTCTAGCTGGA
TGCCAGGCACCGATACAAGCAACCTTACGCAGACCCCTGTGGGTCTTACGTGGAAGCCTC
GTCACACCCCAACGTGTAACAACACCTTCGTAACCTTTACCCTTGGTCACACCAATCACA
TCAATCATCTCATCCTTCTGGAAAACAGCATCGATGGGGATCTGCTTCTCGAAGAAGCTG
TAGGCAAAGTCGACCTTCTGGGCAATGGTACCACCGTTGATCTGGACCTCCATCATGTGA
GCTTTCTTCTGCTTCAGTCCCTTCATCTTCCTGATCTGAGTGTGGGCCAGGACACGGATG
ACGGTTCCGTACTTCTTCATCTTCTCGAGCTGGGACTGGATGCTCTTCTTGCCTTCCTCG
CTCTCGTACTGCTTGGCGTATCCGGTGAAGGTTAGCTCTCTTCCTGGGAAGGAAACCAAG
AGAACCGTGCCTTGGGTGCTCAAACTTCCTGTGAGACATTCTCTTCTTCCTCCTCCTGAA
GCTGCGATGAGTCCTGCGGCTATAGCTCACTGCAACC

QA 9 765 9 765
DS 



AS 2 11

CO CL213Contig1 761 4 13 U
GGATTCGTCATTCTATCTCACTCACTTGTTCAATTCTAAAACCCTAAGCATCGCCGACGG
GATCCGATCGTGATCCTTCCTAAACCTAACTTGGTCGTCGATTTAGAGCTT*AGC*TAAA
GCC***TCTTAAAGAAAATGAGTTTCAACAAAGTGCCCAACGTCCCAGGATCTCCAGCTC
TCTCTGCGCTTCTCAAGGTCAGCGTTATTGGTGGGCTCGGTGTCTATGCAATTACCAATA
GCCTCTACAATGTCGAGGGTGGACACCGTGCTGTCATGTTCAACCGTTTAACTGGTATCA
AGGAAAAGGTGTACCCGGAAGGAACACATTTTATGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATCA
TCTATGACGTCCGTGCACGACCCTATCTTGTTGAGAGCACCACCGGTAGTCATGACCTTC
AGATGGTGAAAATTGGACTTAGAGTTCTCACTCGTCCCATGGGTGACCGTTTGCCTCAGA
TTTACCGAACCCTAGGCGAGAATTACAGTGAAAGGGTTCTTCCTTCCATCATCCATGAAA
CCCTAAAGGCTGTGGTGGCTCAGTACAATGCAAGCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTG
TGAGCAGAGAGATACGCAAGATTCTGACGGAGAGAGCTTCTAACTTCGACATTGCTCTTG
ATGATGTCTCCATCACGACCCTCACGTTCGGCAAAGAGTTCACCGCTGCAATCGAGGCAA
AGCAAGTCGCTGCGCAGAAGCTGAACGTGCTAAGTTCATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2DX50TF U 1
AF RR2C965TF U 5
AF RR2AI14TF U 1
AF RR2EC38TF U 30
BS 1 21 RR2AI14TF
BS 22 22 RR2DX50TF
BS 23 49 RR2AI14TF
BS 50 50 RR2C965TF
BS 51 305 RR2AI14TF
BS 306 308 RR2DX50TF
BS 309 397 RR2AI14TF
BS 398 398 RR2DX50TF
BS 399 531 RR2AI14TF
BS 532 532 RR2DX50TF
BS 533 544 RR2AI14TF
BS 545 545 RR2C965TF
BS 546 761 RR2AI14TF

RD RR2DX50TF 544 0 0
GGATTCGTCATTCTAT
CTCACTCACTTGTTCAATTCTAAAACCCTAAGCTTCGCCGACGGGATCCGATCGTGATCC
TTCCTAAACCTAACTTGGTCGTCGATTTAGAGCTT*AGC*TAAAGCC***TCTTAAAGAA
AATGAGTTTCAACAAAGTGCCCAACGTCCCAGGATCTCCAGCTCTCTCTGCGCTTCTCAA
GGTCAGCGTTATTGGTGGGCTCGGTGTCTATGCAATTACCAATAGCCTCTACAATGTCGA
GGGTGGACACCGTGCTGTCATGTTCAACCGTTTAACTGGTATCAAGGAAAAGGTGTACCC
GGAAGGAACACATTTTATGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATCATCTATGACGTCCGTGC
ACGACCCTATCTTGTTGAGAGCACCACCGGTAGTCATGACCTTCAGATGGTGAAAATTGG
ACTTAGAGTTCTCACTCGTCCCATGGGTGACCGTTTGCCTCAGATTTACCGAACCCTAG*
CGAGAATTACAGTGAAAGGGTTCTTCCTTCCATCATCCATGAAACCCT

QA 17 544 17 544
DS 

RD RR2C965TF 676 0 0
GTCATTCTATCA
CTCACTCACTTGTTCAATTCTAAAACCCTAAGCATCGCCGACGGGATCCGATCGTGATCC
TTCCTAAACCTAACTTGGTCGTCGATTTAGAGCTT*AGC*TAAAGCC***TCTTAAAGAA
AATGAGTTTCAACAAAGTGCCCAACGTCCCAGGATCTCCAGCTCTCTCTGCGCTTCTCAA
GGTCAGCGTTATTGGTGGGCTCGGTGTCTATGCAATTACCAATAGCCTCTACAATGTCGA
GGGTGGACACCGTGCTGTCATGTTCAACCGTTTAACTGGTATCAAGGAAAAGGTGTACCC
GGAAGGAACACATTTTATGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATCATCTATGACGTCCGTGC
ACGACCCTATCTTGTTGAGAGCACCACCGGTAGTCATGACCTTCAAATGGTGAAAATTGG
ACTTAGAGTTCTCACTCGTCCCATGGGTGACCGTTTGCCTCAGATTTACCGAACCCTAGG
CGAGAATTACAGTGAAAGGGTTCTTCCTTCCTTCATCCATGAAACCCTAAAGGCTGTGGT
GGCTCAGTACAATGCAAGCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTGTGAGCAGAGAGATACG
CAAGATTCTGACGTAGAGAGCTTCTAACTTCGACATTGCTCTTGATGATGTCTCCATCAC
GACC

QA 13 676 13 676
DS 

RD RR2AI14TF 761 0 0
GGATTCGTCATTCTATCTCACCCACTTGTTCAATTCTAAAACCCTAAGCTTCGCCGACGG
GATCCGATCGTGATCCTTCCTAAACCTAACTTGGTCGTCGATTTAGAGCTT*AGC*TAAA
GCC***TCTTAAAGAAAATGAGTTTCAACAAAGTGCCCAACGTCCCAGGATCTCCAGCTC
TCTCTGCGCTTCTCAAGGTCAGCGTTATTGGTGGGCTCGGTGTCTATGCAATTACCAATA
GCCTCTACAATGTCGAGGGTGGACACCGTGCTGTCATGTTCAACCGTTTAACTGGTATCA
AGGAAT**GTGTACCCGGAAGGAACACATTTTATGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATCA
TCTATGACGTCCGTGCACGACCCTATCTTGTTGAGAGTACCACCGGTAGTCATGACCTTC
AGATGGTGAAAATTGGACTTAGAGTTCTCACTCGTCCCATGGGTGACCGTTTGCCTCAGA
TTTACCGAACCCTAGGCGAGAATTACAGTGAAAGGGTTCTTCCTTCCATCACCCATGAAA
CCCTCAAGGCTGTGGTGGCTCAGTACAATGCAAGCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTG
TGAGCAGAGAGATACGCAAGATTCTGACGGAGAGAGCTTCTAACTTCGACATTGCTCTTG
ATGATGTCTCCATCACGACCCTCACGTTCGGCAAAGAGTTCACCGCTGCAATCGAGGCAA
AGCAAGTCGCTGCGCAGAAGCTGAACGTGCTAAGTTCATTG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2EC38TF 729 0 0
GG
AATTCTAAAACCCTAAGCATCGCCGACGGGATCCGATCGTGATCCTTCCTAAACCTAACT
TGGTCGTCGATTTAGAGCTTTAGCCTAAAGCCTCCTCTTAAAGAAAATGAGTTTCAACAA
AGTGCCCAACGTCCCAGGATCTCCAGCTCTCTCTGCGCTTCTCAAGGTCAGCGTTATTGG
TGGGCTCGGTGTCTATGCAATTACCAATAGCCTCTACAATGTCGAGGGTGGACACCGTGC
TGTCATGTTCAACCGTTTAACTGGTATCAAGGAAAAGGTGTACCCGGAAGGAACACATTT
TATGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATCATCTATGACGTCCGTGCACGACCCTATCTTGT
TGAGAGCACCACCGGTAGTCATGACCTTCAGATGGTGAAAATTGGACTTAGAGTTCTCAC
TCGTCCCATGGGTGACCGTTTGCCTCAGATTTACCGAACCCTAGGCGAGAATTACAGTGA
AAGGGTTCTTCCTTCCATCATCCATGAAACCCTAAAGGCTGTAGTGGCTCAGTACAATGC
AAGCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTGTGAGCAGAGAGATACGCAAGATTCTGACGGA
GAGAGCTTCTAACTTCGACATTGCTCTTGATGATGTCTCCATCACGACCCTCACGTTCGG
CAAAGAGTTCACCGCTGCAATCGAGGCAAAGCAAGTCGCTGCGCAGAAGCTGA*CGTGCT
AAGTTCA

QA 3 729 3 729
DS 



CO CL213Contig2 1199 7 21 U
GGGTTTTCGCAATTCTAAACCCTAAAGCTTGGCCGACTGACTCAGATCGTGATCCTTCCC
TAAACCCTGACATCGCCGGTGACCTAGAGCTGAGCTAAAGGTCTTAAGAAATGAGTTTCA
ACAAAGTGCCCAACGTCCCTGGATCTCCTGCTCTCTCTGCACTTCTTAAGGTCAGCGTTA
TTGGTGGGCTCGGTGTCTATGCTTTGACTAATAGCCTGTACAATGTTGAGGGTGGACACC
GTGCTGTCATGTTCAACCGATTGACTGGTATCAAGGAAAAGGTTTACCCGGAAGGAACGC
ATTTTATGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATAATCTATGACGTCCGTGCACGACCCTATC
TTGTGGAGAGCACCACTGGTAGTCATGACCTTCAGATGGTGAAAGTTGGACTTAGGGTTC
TCACTCGTCCCATGGGTGACCGTTTGCCTCATATTTACCGAACCCTAGGCGAGAATTACA
GTGAAAGGGTTCTTCCTTCCATCATCCATGAAACCCTAAAAGCTGTGGTGGCTCAGTACA
ATGCAAGCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTGTGAGCAGAGAGATACGCAAGATCCTGA
CTGAGAGAGCTTCGAACTTCGACATCGCTCTTGATGATGTCTCCATCACGACTCTCACAT
TTGGCAAAGAGTTCACCGCTGCAATCGAGGCAAAACAAGTCGCTGCTCAGGACGCTGAAC
GTGCTAAGTTCATTGTGGAGAAAGCCGAGCAAGACAAGAGAAGTGCAGTCATCCGTGCGG
AGGGAGAAGCTAAAAGTGCTCAACTTATCGGACAAGCTATTGCAAACAATCAGGCATTCA
TAACTTTGAGAAAGATTGAAGCTGCGAGAGAGATTGCTCAGACCATTGCACAATCAGCTA
ACAAGGTCTACCTAAGCTCCAATGATCTGTTGCTTAACCTCCAAGAGATGAACTTGGAGC
CTAGCTTTAAGAAGTAAAATAAGTAAGTTCCATCCACTTCTATCCTCCTGAACATGGTCA
GTGTTTTGACCAAATGACTATGTTGCCCATTATCTTGGTTGATCGGATTCGCTGCTTTGG
ACAGTGGTAGTAGTTCATCATGTTCAGTTGAGCTGATTTGTTTATATTTTCTTGTGTTTT
CCCGGAAAATTGATGGAGCTGAACTAAGAGAAAAATTAATAATAACAAACATTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV13TF U 2
AF RR2G076TF U 7
AF RR2CH73TF U 1
AF RR2CQ19TF U 44
AF RR2CQ19JQ C 683
AF RR2DV13JQ C 902
AF RR2G076JQ C 469
BS 1 136 RR2CH73TF
BS 137 137 RR2DV13TF
BS 138 238 RR2CH73TF
BS 239 239 RR2DV13TF
BS 240 448 RR2CH73TF
BS 449 449 RR2G076TF
BS 450 694 RR2CH73TF
BS 695 695 RR2G076JQ
BS 696 697 RR2CH73TF
BS 698 698 RR2CQ19TF
BS 699 710 RR2CH73TF
BS 711 711 RR2G076JQ
BS 712 732 RR2CH73TF
BS 733 740 RR2CQ19TF
BS 741 741 RR2CQ19JQ
BS 742 751 RR2CQ19TF
BS 752 966 RR2G076JQ
BS 967 967 RR2DV13JQ
BS 968 971 RR2G076JQ
BS 972 972 RR2DV13JQ
BS 973 1199 RR2G076JQ

RD RR2DV13TF 334 0 0
AGGGTTC
GCAATTCTAAACCCTAAAGCTTGGCCGACTGACTCAGATCGTGATCCTTCCCTAAACCCT
GACATCGCCGGTGACCTAGAGCTGAGCTAAAGGTCTTAA**AATGAGTTTCAACAAAGTG
CCCAACGTCCCTGGATCTCCTGCTCTCTCTGCACTTCTTAAGGTCAGCGTTATTGGTGGG
CTCGGTGTCTATGCTTTGACTAATAGCCTGTACAATGTTGAGGGTGGACACCGTGCTGTC
ATGTTCAACCGATTGACTGGTATCAAGGAAAAGGTTTACCCGGAAGGAACGCATTTTATG
TTGCCATGGTTTGACAGGCCAATAATC

QA 8 334 8 334
DS 

RD RR2G076TF 680 0 0
GG
GCAATTCTAAACCCTAAAGCTTGGCCGACTGACTCAGATCGTGATCCTTCCCTAAACCCT
GACATCGCCGGTGACCTAGAGCTGAGCTAAAGGTCTTAAGAAATGAGTTTCAACAAAGTG
CCCAACGTGCCTGGATCTCCTGCTCTCTCTGCACTTCTTAAGGTCAGCGTTATTGGTGGG
CTCGGTGTCTATGCTTTGACTAATAGCCTGTACAATGTTGAGGGTGGACATCGTGCTGTC
ATGTTCAACCGATTGACTGGTATCAAGGAAAAGGTTTACCCGGAAGGAACGCATTTTATG
TTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATAATCTAT**CGTCCGTGCACGACCCTATCTTGTGGAG
AGCACCACTGGTAGTCATGACCTTCAGATGGTGAAAGTTGGACTTAGGGTTCTCACTCGT
CCCATGGGTGACCGTTTGCCTCATATTTACCGAACCCTAGGCGAGAATTACAGTGAAAGG
GTTCTTCCTTCCATCATCCATGAAACCCTAAAAGCTGTGGTGGCTCAGTACAATGCAAGC
CAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTGTGAGCAGAGAGATACGCAAGATCCTGACTGAGAGA
GCTTCGAACTTCGACATCGCTCTTGATGATGTCTCCATCACGACTCTCACATTTGGCAAA
GAGTTCACCGCTGCAATC

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR2CH73TF 732 0 0
GGGTTTTCGCAATTCTAAACCCTAAAGCTTGGCCGACTGACTCAGATCGTGATCCTTCCC
TAAACCCTGACATCGCCGGTGACCTAGAGCTGAGCTAAAGGTCTTAAGAAATGAGTTTCA
ACAAAGTGCCCAACGTGCCTGGATCTCCTGCTCTCTCTGCACTTCTTAAGGTCAGCGTTA
TTGGTGGGCTCGGTGTCTATGCTTTGACTAATAGCCTGTACAATGTTGAGGGTGGACATC
GTGCTGTCATGTTCAACCGATTGACTGGTATCAAGGAAAAGGTTTACCCGGAAGGAACGC
ATTTTATGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATAATCTATGACGTCCGTGCACGACCCTATC
TTGTGGAGAGCACCACTGGTAGTCATGACCTTCAGATGGTGAAAGTTGGACTTAGGGTTC
TCACTCGTCCCATGGGTGACCGTTTGCCCCATATTTACCGAACCCTAGGCGAGAATTACA
GTGAAAGGGTTCTTCCTTCCATCATCCATGAAACCCTAAAAGCTGTGGTGGCTCAGTACA
ATGCAAGCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTGTGAGCAGAGAGATACGCAAGATCCTGA
CTGAGAGAGCTTCGAACTTCGACATCGCTCTTGATGATGTCTCCATCACGACTCTCACAT
TTGGCAAAGAGTTCACCGCTGCAATCGAGGCAAA*CA*GTCGCTGCTCAG*ACGCTGAAC
GTGCTAAGTTCA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2CQ19TF 726 0 0
G
GATCGTGATCCTTCCCTAAACCCTGACATCGCCGGTGACCTAGAGCTGAGCTAAAGGTCT
TAAGAAATGAGTTTCAACAAAGTGCCCAACGTCCCTGGATCTCCTGCCCTCTCTGCACTT
CTTAAGGTCAGCGTTATTGGTGGGCTCGGTGTCTATGCTTTGACTAATAGCCTGTACAAT
GTTGAGGGTGGACACCGTGCTGTCATGTTCAACCGATTGACTGGTATCAAGGAAAAGGTT
TACCCGGAAGGAACGCATTTTATGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATAATCTATGACGTC
CGTGCACGACCCTATCTTGTGGAGAGCACCACTGGTAGTCATGACCTTCAGATGGTGAAA
GTTGGACTTAGGGTTCTCACTCGTCCCATGGGTGACCGTTTGCCTCATATTTACCGAACC
CTAGGCGAGAATTACAGTGAAAGGGTTCTTCCTTCCATCATCCATGAAACCCTAAAAGCT
GTGGTGGCTCAGTACAATGCAAGCCAGCTGATCACCCAGAGAGAAGCTGTGAGCAGAGAG
ATACGCAAGATTCTGACTGAGAGAGCTTCGAACTTCGACATCGCTCTTGATGATGTGTCC
ATCACGACTCTCACATTTGGCAAAGAGTTCACCGCTGCAATCGAGGCAAA*CAAGTCGCT
GCTCAG*ACGCTGAACGTGCTAAGTTCATTGTGGAG*AAGCCGAGCA
GACAGAGAGTGCAGTCAT

QA 2 708 2 708
DS 

RD RR2CQ19JQ 316 0 0
AATCGAGGCAAAACAAGTCGCTGCTCAGGACGCTGAACGTGCTAAGTTCATTGTGGAGAA
AGCCGAGCAAGACAAGAGAAGTGCAGTCATCCGTGGGGAGGGAGAAGCTAAAAGTGCTCA
ACTTTTCGGACAAGTTATTGCAAACAATCAGGCATTCATAATTTTGAGAAAGATTGAAGC
TGCGAGAGAGATTGTTCAGACCATTGCACAATCAGCTAACAAGGCCTACCTAAGCTCCAA
TGATCTGTTGCTTAACCTCCAAGAGATGAACTTGGAGCCTAGCTTTAAGAAGTAAAATAA
GTAAGTTCCATCCACT

QA 1 316 1 316
DS 

RD RR2DV13JQ 208 0 0
CAAGGTCTACCTAAGCTCCAATGATCTGTTGCTTAACCTCCAAGAGATGAACTTGGAGCC
TAGCTTTAAGAAGTAAAATAAGTAAGTTCCATCCACTTCTATCCTCCTGAACATGGTCAG
TGTTTTGACCAAATGACTATGTTGCCCATTATCTTGGTTGATCGGATTCGCTGCTTTGGA
CAGTGGTAGTAGTTCATCATGTTCAGTT

QA 1 208 1 208
DS 

RD RR2G076JQ 731 0 0
GCGAGAATTACAGTGAAAGGGTTCTTCCTTCCATCATCCATGAAACCCTAAAAGCTGTGG
TGGCTCAGTACAATGCAAGCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTGTGAGCAGAGAGATAC
GCAAGATCCTGACTGAGAGAGCTTCGAACTTCGACATCGCTCTTGATGATGTCTCCATCA
CGACTCTCACATTTGGCAAAGAGTTCACCGCTGCAATCGAGGCAAAACAAGTCGCTGCTC
AGGACGCTGAACGTGCTAAGTTCATTGTGGAGGAAGCCGAGCAAGACAAGAGAAGTGCAG
TCATCCGTGCGGAGGGAGAAGCTAAAAGTGCTCAACTTATCGGACAAGCTATTGCAAACA
ATCAGGCATTCATAACTTTGAGAAAGATTGAAGCTGCGAGAGAGATTGCTCAGACCATTG
CACAATCAGCTAACAAGGTCTACCTAAGCTCCAATGATCTGTTGCTTAACCTCCAAGAGA
TGAACTTGGAGCCTAGCTCTAAGGAGTAAAATAAGTAAGTTCCATCCACTTCTATCCTCC
TGAACATGGTCAGTGTTTTGACCAAATGACTATGTTGCCCATTATCTTGGTTGATCGGAT
TCGCTGCTTTGGACAGTGGTAGTAGTTCATCATGTTCAGTTGAGCTGATTTGTTTATATT
TTCTTGTGTTTTCCCGGAAAATTGATGGAGCTGAACTAAGAGAAAAATTAATAATAACAA
ACATTTTTTTC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 2 16

CO CL214Contig1 1386 11 10 U
GGCTAGCATCTGCTGCTACAACCTTAGCTTTGATCCTCTCTGGTCACCATGGCTTCAGCT
ACTTTCTCTGTTCCAAAACCATCTCTTCAGGGTTTCACTGAGTTCTCTGGACTGAGAAGC
TCCTCTGCTTCTCTTCCCTTCGGCAACAAGAAACTTTCCTCTGATGAGTTTGTCTCAGCC
GTCACTTTCCAGACTTCTGCAATGGGAAGCAACGGTGGATACAGGAAATGTGTGACCGAA
GCTAAACTAAAGGTAGCCATCAATGGCTTTGGTCGGATAGGGAGGAACTTCTTGAGATGC
TGGCATGGACGCAAGGACTCTCCCTTTGATGTCATTGCCATCAACGACACTGGCGGTGTC
AAGCAGGCTTCACATCTCCTCAAATACGACTCCACTCTCGGTATCTTTGACGCTGATGTG
AAACCTTCCGGAGACGCTGCTCTCTCTGTTGATGGAAAGATCATCAAGATTGTGTCTAAC
CGCAACCCGTCTCTTCTCCCCTGGAAGGAGTTGGGAATAGACATTGTCATTGAAGGAACA
GGAGTGTTTGTGGATAGAGAAGGTGCAGGGAAACACATTGAAGCTGGAGCCAAGAAAGTT
ATCATTACAGCTCCAGGGAAAGGAGACATCCCAACTTACGTTGTTGGTGTCAACGCCGAT
GCTTACAATCCTGATGAACCGATCATCAGCAATGCTTCTTGCACTACTAACTGTCTTGCT
CCCTTTGTCAAAGTTCTAGACCAGAAGTTCGGTATCATAAAGGGTACAATGACAACTACT
CACTCATACACCGGTGACCAGAGGTTACTAGACGCTAGCCACCGTGATCTAAGGAGAGCA
AGAGCAGCTGCTTTGAACATTGTTCCCACATCTACAGGAGCAGCTAAAGCCGTGGCTCTT
GTGCTCCCTAACCTCAAAGGAAAACTCAACGGAATAGCTCTCCGTGTACCGACACCAAAC
GTGTCAGTGGTTGATCTCGTTGTGCAGGTCACCAAGAAGACTTTTGCAGAGGAAGTTAAC
GCTGCTTTCAGAGACTCTGCAGAGAAAGAGCTTAAAGGTATCCTCGAAGTCTGCGATGAG
CCGCTTGTGTCAGTTGATTTCAGATGCTCGGATGTGTCGTCCACCATTGATTCTTCGCTC
ACTATGGTGATGGGAGATGATATGGTTAAGGTGATAGCTTGGTATGATAATGAATGGGGT
TACTCACAGAGAGTTGTTGATCTCGCTGACATTGTTGCCAACAACTGGAAGTGATTTGTA
ATGAAACCTCATGTTTTCTCCTTTTTTCTGCATTCTGATTCTCAAAATATCGGTCAAGAC
TGTATAAACTATAGCCCTGAGTTGTGGATTTGTAATAATGATAAAACTCAATTTGAACTT
CTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL09TF U 1
AF RR2BD25TF U 6
AF RR2E621TF U 338
AF RR2BH23TF U 257
AF RR2C316JQ C 965
AF RR2GD90TF U 454
AF RR2AL09JQ C 566
AF RR2BD25JQ C 683
AF RR2C316TF U 870
AF RR2GD90JQ C 849
AF RR2E621JQ C 650
BS 1 211 RR2AL09TF
BS 212 212 RR2BD25TF
BS 213 749 RR2AL09TF
BS 750 758 RR2BD25TF
BS 759 884 RR2BH23TF
BS 885 885 RR2E621TF
BS 886 1027 RR2BH23TF
BS 1028 1168 RR2GD90TF
BS 1169 1380 RR2C316TF
BS 1381 1386 RR2E621JQ

RD RR2AL09TF 756 0 0
GGCTAGCATCTGCTGCTACAACCTTAGCTTTGATCCTCTCTGGTCACCATGGCTTCAGCT
ACTTTCTCTGTTCCAAAACCATCTCTTCAGGGTTTCACTGAGTTCTCTGGACTGAGAAGC
TCCTCTGCTTCTCTTCCCTTCGGCAACAAGAAACTTTCCTCTGATGAGTTTGTCTCAGCC
GTCACTTTCCAGACTTCTGCAATGGGAAGCAGCGGTGGATACAGGAAATGTGTGACCGAA
GCTAAACTAAAGGTAGCCATCAATGGCTTTGGTCGGATAGGGAGGAACTTCTTGAGATGC
TGGCATGGACGCAAGGACTCTCCCTTTGATGTCATTGCCATCAACGACACTGGCGGTGTC
AAGCAGGCTTCACATCTCCTCAAATACGACTCCACTCTCGGTATCTTTGACGCTGATGTG
AAACCTTCCGGAGACGCTGCTCTCTCTGTTGATGGAAAGATCATCAAGATTGTGTCTAAC
CGCAACCCGTCTCTTCTCCCCTGGAAGGAGTTGGGAATAGACATTGTCATTGAAGGAACA
GGAGTGTTTGTGGATAGAGAAGGTGCAGGGAAACACATTGAAGCTGGAGCCAAGAAAGTT
ATCATTACAGCTCCAGGGAAAGGAGACATCCCAACTTACGTTGTTGGTGTCAACGCCGAT
GCTTACAATCCTGATGAACCGATCATCAGCAATGCTTCTTGCACTACTAACTGTCTTGCT
CCCTTTGTCAAAGTTCTAGACCAGAAGTT
GGTATCA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2BD25TF 753 0 0
GG
ATCTGCTGCTACAACCTTAGCTTTGATCCTCTCTGGTCACCATGGCTTCAGCTACTTTCT
CTGTTCCAAAACCATCTCTTCAGGGTTTCACTGAGTTCTCTGGACTGAGAAGCTCCTCTG
CTTCTCTTCCCTTCGGCAACAAGAAACTTTCCTCTGATGAGTTTGTCTCAGCCGTCACTT
TCCAGACTTCTGCAATGGGAAGCAATGGTGGATACAGGAAATGTGTGACCGAAGCTAAAC
TAAAGGTAGCCATCAATGGCTTTGGTCGGATAGGGAGGAACTTCTTGAGATGCTGGCATG
GACGCAAGGACTCTCCCTTTGATGTCATTGCCATCAACGACACTGGCGGTGTCAAGCAGG
CTTCACATCTCCTCAAATACGACTCCACTCTCGGTATCTTTGACGCTGATGTGAAACCTT
CCGGAGACACTGCTCTCTCTGTTGATGGAAAGATCATCAAGATTGTGTCTAACCGCAACC
CGTCTCTTCTCCCCTGGAAGGAGTTGGGAATAGACATTGTCATTGAAGGAACAGGAGTGT
TTGTGGATAGAGAAGGTGCGGGGAAATACATTGAAGCTGGAGCCAAGAAAGTTATCATTA
CAGCTCCAGGGAAAGGAGACATCCCAACTTACGTTGTTGGTGTCAACGCCGATGCTTACA
ATCCTGATGAACCGATCATCAGCAATGCTTCTTGCACTACTAACTGTCTTGCTCCCTTTG
TCAAAGTTCTAGACCAGAAGTTCGGTATCAT

QA 3 753 3 753
DS 

RD RR2E621TF 594 0 0
G
CATCAACGACACTGGCGGTGTCAAGCAGGCTTCACATCTCCTCAAATACGACTCCACTCT
CGGTATCTTTGACGCTGATGTGAAACCTTCCGGAGACGCTGCTCTCTCTGTTGATGGAAA
GATCATCAAGATTGTGTCTAACCGCAACCCGTCTCTTCTCCCCTGGAAGGAGTTGGGAAT
AGACATTGTCATTGAAGGAACAGGAGTGTTTGTGGATAGAGAAGGTGCAGGGAAACACAT
TGAAGCTGGAGCCAAGAAAGTTATCATTACAGCTCCAGGGAAAGGAGGCATCCCAACTTA
CGTTGTTGGTGTCAACGCCGATGCTTACAATCCTGATGAACCGATCATCAGCAATGCTTC
TTGCACTACTAACTGTCTTGCTCCCTTTGTCAAAGTTCTAGACCAGAAGTTCGGTATCAT
AAAGGGTACAATGACAACTACTCACTCATACACCGGTGACCAGAGGTTACTAGACGCTAG
CCACCGTGATCTAAGGAGAGCAAGAGCAGCTGCTTTGAACATTGTTCCCACATCTACAGG
AGCAGCTAAAGCCGTGGCTCTTGTGCTCCCTAACCTCAAAGGAAAACTCAACG

QA 2 594 2 594
DS 

RD RR2BH23TF 771 0 0
G
CATCAATGGCTTTGGTCGGATAGGGAGGAACTTCTTGAGATGCTGGCATGGACGCAAGGA
CTCTCCCTTTGATGTCATTGCCATCAACGACACTGGCGGTGTCAAGCAGGCTTCTCATCT
CCTCAAATACGACTCCACTCTCGGTATCTTTGACGCTGATGTGAAACCTTCCGGAGACGC
TGCTCTCTCTGTTGATGGAAAGATCATCAAGATTGTGTCTAACCGCAACCCCTCTCTTCT
TCCCTGGAAGGAGTTGGGGATAGACATTGTCATTGAAGGAACAGGAGTGTTTGTGGATAG
AGAAGGCGCAGGGAAACACATTGAAGCTGGAGCCAAGAAGGTTATCATTACAGCTCCAGG
CAAAGGAGACATCCCAACTTATGTTGTTGGTGTCAACGCCGATGCTTACAATCCTGATGA
ACCGATCATCAGCAATGCTTCTTGCACTACTAACTGTCTTGCTCCCTTTGTCAAAGTTCT
AGACCAGAAGTTCGGTATCATAAAGGGTACAATGACAACTACTCACTCATACACCGGTGA
CCAGAGGTTACTAGACGCTAGCCACCGTGATCTAAGGAGAGCAAGAGCAGCTGCTTTGAA
CATTGTTCCCACATCTACAGGAGCAGCCAAAGCCGTGGCTCTTGTGCTCCCTAACCTCAA
AGGAAAACTCAACGGAATAGCTCTCCGTGTACCGACACCAAACGTGTCAGTGGTTGATCT
CGTTGTGCAGGTCACCAAGAAGACTTTTGCAGAGGAAGTTAACGCTGCTT

QA 2 771 2 771
DS 

RD RR2C316JQ 138 0 0
CAGTGGTTGATCTCGTTGCGCAGGTCACCAAGAAGACTTTTGCAGAGGAAGTTAACGCTG
CTTTCAGAGACTTTGCAGAGAAAGAGCTTAAAGGTATCCTCGAAGTTTGGGATGAGCCGC
TTGTGTCAGTTGATTTCA

QA 1 138 1 138
DS 

RD RR2GD90TF 724 0 0
AGGG
AGATCATCAAGATTGTGTCTAACCGCAACCCGTCTCTTCTCCCCTGGAAGGAGTTGGGAA
TAGACATTGTCATTG**GGAACAGGAGTGTTTGTGGATAGAGAAGGTGCAGGGAAACACA
TTGAAGCTGGAGCCAAGAAAGTTATCATTACAGCTCCAGGGAAAGGAGACATCCCAACTT
ACGTTGTTGGTGTCAACGCCGATGCTTACAATCCTGATGAACCGATCATCAGCAATGCTT
CTTGCACTACTAACTGTCTTGCTCCCTTTGTCAAAGTTCTAGACCAGAAGTTCGGTATCA
TAAAGGGTACAATGACAACTACTCACTCATACACCGGTGACCAGAGGTTACTAGACGCTA
GCCACCGTGATCTAAGGAGAGCAAGAGCAGCTGCTTTGAACATTGTTCCCACATCTACAG
GAGCAGCTAAAGCCGTGGCTCTTGTGCTCCCTAACCTCAAAGGAAAACTCAACGGAATAG
CTCTCCGTGTACCGACACCAAACGTGTCAGTGGTTGATCTCGTTGTGCAGGTCACCAAGA
AGACTTTTGCAGAGGAAGTTAACGCTGCTTTCAGAGACTCTGCAGAGAAAGAGCTTAAAG
GTATCCTCGAAGTCTGCGATGAGCCGCTTGTGTCAGTTGATTTCAGATGCTCGGATGTGT
CGTCCACCATTGATTCTTCGCTCACTATGGTGATGGGAGATGATATGGTTA
GTGATAGCT

QA 5 715 5 715
DS 

RD RR2AL09JQ 815 0 0
CAGGGAAACACATTGAAGCTGGAGCCAAGAAAGTTATCATTACAGCTCCAGGGAAAGGAG
ACATCCCAACTTACGTTGTTGGTGTCAACGCCGATGCTTACAATCCTGATGAACCGATCA
TCAGCAATGCTTCTTGCACTACTAACTGTCTTGCTCCCTTTGTCAAAGTTCTAGACCAGA
AGTT*GGTATCATAAAGGGTACAATGACAACTACTCACTCATACACCGGTGACCAGAGGT
TACTAGACGCTAGCCACCGTGATCTAAGGAGAGCAAGAGCATCTGCTTTGAACATTGTTC
CCACATCTACAGGAGCAGCTAAAGCCGTGGCTCTTGTGCTCCCTAACCTCAAAGGAAAAC
TCAACGGAATAGCTCTCCGTGTACCGACACCAAACGTGTCAGTGGTTGATCTCGTTGTGC
GGGTCACCAAGAAGACTTTTGCAGAGGAAGTTAACGCTGCTTTCAGAGACTCTGCAGAGA
AAGAGCTTAAAGGTATCCTCGAAGTTTGCGATGAGCCGCTTGTGTCAGTTGATTTCAGAT
GCTCGGATGTGTCGTCCACCATTGATTCTTCGCTCACTATGGTGATGGGAGATGATATGG
TTAAGGTGATAGCTTGGTATGATAATGAATGGGGTTACTCACAGAGAGTTGTTGATCTCG
CTGACATTGTTGCCAACAACTGGAAGTGATTTGTAATGAAACCTCATGTTTTCTCCTTTT
TTCTGCATTCTGATTCTCAAAATATCGGTCAAGACTGTATAAACTATAGCCCTGAGTTGT
GGATTTGTAATAATGATAAAACTCAATTTGAACTT

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR2BD25JQ 698 0 0
TCATCAGCAATGCTTCTTGCACTACTAACTGTCTTGCTCCCTTTGTCAAAGTTCTAGACC
AGAAGTTCGGTATCATAAAGGGTACAATGACAACTACTCACTCGTACACCGGTGACCAGA
GGTTACTAGACGCTAGCCACCGTGATCTAAGGAGAGCAAGAGCAGCTGCTTTGAACATTG
TTCCCACATCTACAGGAGCAGCTAAAGCCGTGGCTCTTGTGCTCCCTAACCTCAAAGGAA
AACTCAACGGAATAGCTCTCCGTGTACCGACACCAAACGTGTCAGTGGTTGATCTCGTTG
TGCAGGTCACCAAGAAGACTTTTGCAGAGGAAGTTAACGCTGCTTTCAGAGACTTTGCAG
AGAAAGAGCTTAAAGGTATCCTCGAAGTCTGCGATGAGCCGCTTGTGTCAGTTGATTTCA
GATGCTCGGATGTGTCGTCCACCATTGATTCTTCGCTCACTATGGTGATGGGAGATGATA
TGGTTAAGGTGATAGCTTGGTATGATAATGAATGGGGTTACTCACAGAGAGTTGTTGATC
TCGCTGACATTGTTGCCAACAACTGGAAGTGATTTGTAATGAAACCTCATGTTTTCTCCT
TTTTTCTGCATTCTGATTCTCAAAATATCGGTCAAGACTGTATAAACTATAGCCCTGAGT
TGTGGATTTGTAATAATGATAAAACTCAATTTGAACTT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2C316TF 511 0 0
ATCTACAGGAGCAGCTAAAGCCGTGGCTCTTGTGCTCCCTAACCTCAAAGGAAAACTCAA
CGGAATAGCTCTCCGTGTACCGACACCAAACGTGTCAGTGGTTGATCTCGTTGCGCAGGT
CACCAAGAAGACTTTTGCAGAGGAAGTTAACGCTGCTTTCAGAGACTCTGCAGAGAAAGA
GCTTAAAGGTATCCTCGAAGTCTGCGATGAGCCGCTTGTGTCAGTTGATTTCAGATGCTC
GGATGTGTCGTCCACCATTGATTCTTCGCTCACTATGGTGATGGGAGATGATATGGTTAA
GGTGATAGCTTGGTATGATAATGAATGGGGTTACTCACAGAGAGTTGTTGATCTCGCTGA
CATTGTTGCCAACAACTGGAAGTGATTTGTAATGAAACCTCATGTTTTCTCCTTTTTTCT
GCATTCTGATTCTCAAAATATCGGTCAAGACTGTATAAACTATAGCCCTGAGTTGTGGAT
TTGTAATAATGATAAAACTCAATTTGAACTT

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2GD90JQ 532 0 0
TGCTTTGAACATTGTTCCCACATCTACAGGAGCAGCTAAAGCCGTGGCTTTTGTGCTCCC
TAACCTCAAAGGAAAACTCAACGGAATAGCTTTCCGTGTACCGACACCAAACGTGTCAGT
GGTTGATCTCGTTGTGCAGGTCACCAAGAAGACTTTTGCAGAGGAAGTTAACGCTGCTTT
CAGAGACTTTGCAGAGAAAGAGCTTAAAGGTATCCTCGAAGTTTGCGATGAGCCGCTTGT
GTCAGTTGATTTCAGATGCTCGGATGTGTCGTCCACCATTGATTTTTCGCTCACTATGGT
GATGGGAGATGATATGGTTAAGGTGATAGCTTGGTATGATAATGAATGGGGTTACTCACA
GAGAGTTGTTGATCTCGCTGACATTGTTGCCAACAACTGGAAGTGATTTGTAATGAAACC
TCATGTTTTTTCCTTTTTTTTGCATTTTGATTCTCAAAATATCGGTCAAGACTGTATAAA
CTATAGCCCTGAGTTGCGGATTTGTAATAATGATAAAACTCAATTTGAACTT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2E621JQ 737 0 0
TCAACGCCGATGCTTACAATCCTGATGAACCGATCATCAGCAATGCTTCTTGCACTACTA
ACTGTCTTGCTCCCTTTGTCAAAGTTCTAGACCAGAAGTTCGGTATCATAAAGGGTACAA
TGACAACTACTCACTCATACACCGGTGACCAGAGGTTACTAGACGCTAGCCACCGTGATC
TAAGGAGAGCAAGAGCAGCTGCTTTGAACATTGTTCCCACATCTACAGGAGCAGCTAAAG
CCGTGGCTCTTGTGCTCCCTAACCTCAAAGGAAAACTCAACGGAATAGCTCTCCGTGTAC
CGACACCAAACGTGTCAGTGGTTGATCTCGTTGTGCAGGTCACCAAGAAGACTTTTGCAG
AGGAAGTTAACGCTGCTTTCAGAGACTCTGCAGAGAAAGAGCTTAAAGGTATCCTCGAAG
TCTGCGATGAGCCGCTTGTGTCAGTTGATTTCAGATGCTCGGATGTGTCGTCCACCATTG
ATTCTTCGCTCACTATGGTGATGGGAGATGATATGGTTAAGGTGATAGCTTGGTATGATA
ATGAATGGGGTTACTCACAGAGAGTTGTTGATCT*GCTGACATTGTTGCCAACAACTGGA
AGTGATTTGTAATGAAACCTCATGTTTTCTCCTTTTTTCTGCATTCTGATTCTCAAAATA
TCGGTCAAGACTGTATAAACTATAGCCCTGAGTTGTGGATTTGTAATAATGATAAAACTC
AATTTGAACTTCTTTAC

QA 1 737 1 737
DS 



CO CL214Contig2 660 5 3 U
ACACGATTGTGAATTCTTGCAAAACACAAACAATGTATTACATTACATATCTATGTATTA
TTATTACAAACCCACAACTCAGGGCCACAGTTATACAGTCTTGAATCAGAATTTTTAAAA
AGGGAAAGAAATGGAAAACATGAGACAAGTTTTAATTTCAAAAGCTACATACAGATCACT
TCCAGTTGTTGGCAACAATGTCAGCCAAATCAACAACTCTCTGTGAGTAACCCCACTCGT
TATCATACCAAGCAATCACCTTAACCATATCATCTCCCATCACCATAGTGAGTGAAGAAT
CAATGGTCGATGACACATCTGAGCATCTGAAATCAACAGACACAAGCGGCTCGTCGCAGA
CTTCTAGGATGCCTTTAAGCTCTTTCTCCGCAGAATCTCTGAAAGCAGCGTTGACTTCCT
CAGCGAAAGTCTTCTTGGAGACCTGCACAACAAGATCAACCACTGACACGTTTGGTGTTG
GTACACGGAGAGCTATTCCGTTGAGTTTTCCTTTGAGGTTAGGGAGCACGAGAGCCACGG
CTTTAGCTGCTCCTGTAGATGTGGGAACAATGTTTAATGCAGCTGCTCTTGCTCTCCTTA
GATCACGGTGGCTGGCGTCTAACAACCTCTAATCACCGGTGTATGAGTGAGTAGTTGCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2FZ39JQ U 34
AF RR2H463JQB U 40
AF RR2H463TF C 40
AF RR2FL17JQ U 1
AF RR2FL17TF C 1
BS 1 458 RR2FL17JQ
BS 459 459 RR2FZ39JQ
BS 460 660 RR2FL17JQ

RD RR2FZ39JQ 494 0 0
TGTATT
ACATTACATATCTATGTATTATTATTACAAACCCACAACTCAGGGCCACAGTTATACAGT
CTTGAATCAGAATTTTTAAAAAGGGAAAGAAATGGAAAACATGAGACAAGTTTTAATTTC
AAAAGCTACATACAGATCACTTCCAGTTGTTGGCAACAATGTCAGCCAAATCAACAACTC
TCTGTGAGTAACCCCACTCGTTATCATACCAAGCAATCACCTTAACCATATCATCTCCCA
TCACCATAGTGAGTGAAGAATCAATGGTCGATGACACATCTGAGCATCTGAAATCAACAG
ACACAAGCGGCTCGTCGCAAACTTCTAGGATGCCTTTAAGCTCTTTCTCCGCAGAATCTC
TGAAAGCAGCGTTGACTTCCTCAGCGAAAGTCTTCTTGGAGACCTGCACAACAAGATCAA
CCACTGACACGTTTGGTGTTGGTACACGGAGAGCTATTCCGTTGAGTTTTCCTTTGAGGT
TAGGGAGC

QA 7 494 7 494
DS 

RD RR2H463JQB 512 0 0
ACATTACATATCTATGTATTATTATTACAAACCCACAACTCAGGGCCACAGTTATACAGT
CTTGAATCAAAATTTTTAAAAAGGGAAAGAAATGGAAAACATGAGACAAGTTTTAATTTC
AAAAGCTACATACAGATCACTTCCAGTTGTTGGCAACAATGTCAGCCAAATCAACAACTC
TCTGTGAGTAACCCCACTCGTTATCATACCAAGCAATCACCTTAACCATATCATCTCCCA
TCACCATAGTGAGTGAAGAATCAATGGTCGATGACACATCTGAGCATCTGAAATCAACAG
ACACAAGCGGCTCGTCGCAGACTTCTAGGATGCCTTTAAGCTCTTTCTCCGCAGAATCTC
TGAAAGCAGCGTTGACTTCCTCAGCGAAAGTCTTCTTGGAGACCTGCACAACAAGATCAA
CCACTGACACGTTTGGTGTTGGTACACGGAGAGCTATTCCGTTGAGTTTTCCTTTGAGGT
TAGGGAGCACGAGAGCCACGGCTTTAGCTGCT

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2H463TF 542 0 0
ACATTACATATCTATGTATTATTATTACAAACCCACAACTCAGGGCCACAGTTATACAGT
CTTGAATCAGAATTTTTAAAAAGGGAAAGAAATGGAAAACATGAGACAAGTTTTAATTTC
AAAAGCTACATACAGATCACTTCCAGTTGTTGGCAACAATGTCAGCCAAATCAACAACTC
TCTGTGAGTAACCCCACTCGTTATCATACCAAGCAATCACCTTAACCATATCATCTCCCA
TCACCATAGTGAGTGAAGAATCAATGGTCGATGACACATCTGAGCATCTGAAATCAACAG
ACACAAGCGGCTCGTCGCAGACTTCTAGGATGCCTTTAAGCTCTTTCTCCGCAGAATCTC
TGAAAGCAGCGTTGACTTCCTCAGCGAAAGTCTTCTTGGAGACCTGCACAACAAGATCAA
CCACTGACACGTTTGGTGTTGGTACACGGAGAGCTATTCCGTTGAGTTTTCCTTTGAGGT
TAGGGAGCACGAGAGCCACGGCTTTAGCTGCTCCTGTAGATGTGGGAACAATGTT
TAATGCA

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2FL17JQ 660 0 0
ACACGATTGTGAATTCTTGCAAAACACAAACAATGTATTACATTACATATCTATGTATTA
TTATTACAAACCCACAACTCAGGGCCACAGTTATACAGTCTTGAATCAGAATTTTTAAAA
AGGGAAAGAAATGGAAAACATGAGACAAGTTTTAATTTCAAAAGCTACATACAGATCACT
TCCAGTTGTTGGCAACAATGTCAGCCAAATCAACAACTCTCTGTGAGTAACCCCACTCGT
TATCATACCAAGCAATCACCTTAACCATATCATCTCCCATCACCATAGTGAGTGAAGAAT
CAATGGTCGATGACACATCTGAGCATCTGAAATCAACAGACACAAGCGGCTCGTCGCAGA
CTTCTAGGATGCCTTTAAGCTCTTTCTCCGCAGAATCTCTGAAAGCAGCGTTGACTTCCT
CAGCGAAAGTCTTCTTGGAGACCTGCACAACAAGATCAGCCACTGACACGTTTGGTGTTG
GTACACGGAGAGCTATTCCGTTGAGTTTTCCTTTGAGGTTAGGGAGCACGAGAGCCACGG
CTTTAGCTGCTCCTGTAGATGTGGGAACAATGTTTAATGCAGCTGCTCTTGCTCTCCTTA
GATCACGGTGGCTGGCGTCTAACAACCTCTAATCACCGGTGTATGAGTGAGTAGTTGCCC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2FL17TF 660 0 0
ACACGATTGTGAATTCTTGCAAAACACAAACAATGTATTACATTACATATCTATGTATTA
TTATTACAAACCCACAACTCAGGGCCACAGTTATACAGTCTTGAATCAGAATTTTTAAAA
AGGGAAAGAAATGGAAAACATGAGACAAGTTTTAATTTCAAAAGCTACATACAGATCACT
TCCAGTTGTTGGCAACAATGTCAGCCAAATCAACAACTCTCTGTGAGTAACCCCACTCGT
TATCATACCAAGCAATCACCTTAACCATATCATCTCCCATCACCATAGTGAGTGAAGAAT
CAATGGTCGATGACACATCTGAGCATCTGAAATCAACAGACACAAGCGGCTCGTCGCAGA
CTTCTAGGATGCCTTTAAGCTCTTTCTCCGCAGAATCTCTGAAAGCAGCGTTGACTTCCT
CAGCGAAAGTCTTCTTGGAGACCTGCACAACAAGATCAGCCACTGACACGTTTGGTGTTG
GTACACGGAGAGCTATTCCGTTGAGTTTTCCTTTGAGGTTAGGGAGCACGAGAGCCACGG
CTTTAGCTGCTCCTGTAGATGTGGGAACAATGTTTAATGCAGCTGCTCTTGCTCTCCTTA
GATCACGGTGGCTGGCGTCTAACAACCTCTAATCACCGGTGTATGAGTGAGTAGTTG
CCC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 2 14

CO CL215Contig1 775 8 8 U
GGGACGCTCGCCTTATCCCCTCGGCTCATCTTCTTCTTCTTCGTCGCAGAGGATACAGAA
GAAAGAAAAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCGCTCTCACTCATATGC
AACTGGACGAAATCGAATCCTCTCACTCGCAACACTATTTCTCTCCCAGCTTCAAACGCT
CCCAATAAGCAGAGTTTAAGCATCAGATGTGCTCGTGTTGGTGGTGTGGAGATTCCGAGT
AACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTCACGGCATTGGTCGGACTAGGGCTCGC
CAGATTCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAG
CTCATCGTGCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTATATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTC
AATGCGCTTGCTATAAAGAGATTGAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTTAGGCACATC
CAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGCAGGACTCTTAAGGGCAAG
AAGATCGCCATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCAAGTAACCTACTTATCTGATCTTCATG
TCCTTCGTGTTGTTCTGTAATACTCTTTACTTTGTCCAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGGT
TTGTGTAAGATTTGGTTCGAATCATGAGCCCTTTCCAGACCATCTTCGGCTTTATCATGT
AAAAGTTCAAAACTAATACCGTTCCAGCAGATAATGTCAAAGATGATCAGCTCTG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 5 5 5 5 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2GR87TF U 1
AF RR2AS53JQ C 1
AF RR2BJ41TF U 1
AF RR2BJ41JQ C 39
AF RR2DB94TF U 41
AF RR2AS53TF U 1
AF RR2GE18TF U 41
AF RR2GE18JQ C 144
BS 1 169 RR2GR87TF
BS 170 669 RR2BJ41TF
BS 670 704 RR2DB94TF
BS 705 716 RR2AS53TF
BS 717 753 RR2GE18TF
BS 754 754 RR2GE18JQ
BS 755 772 RR2GE18TF
BS 773 775 RR2GE18JQ

RD RR2GR87TF 169 0 0
GGGACGCTCGCCTTATCCCCTCGGCTCATCTTCTTCTTCTTCGTCGCAGAGGATACAGAA
GAAAGAAAAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCGCTCTCACTCATATGC
AACTGGACGAAATCGAATCCTCTCACTCGCAACACTATTTCTCTCCCAG

QA 1 169 1 169
DS 

RD RR2AS53JQ 716 0 0
GGGACGCTCGCCTTATCCCCTCGGCTCATCTTCTTCTTCTTCGTCGCAGAGGATACAGAA
GAAAGAAAAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCGCTCTCACTCATATGC
AACTGGACGAAATCGAATCCTCTCACTCGCAACACTATTTCTCTCCCAGCTTCAAACGCT
CCCAATA******GTTTAAGCATCAGATGTGCTCGTGTTGGTGGTGTGGAGATTCCGAGT
AACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTCACGGCATTGGTCGGACTAGGGCTCGC
CAGATTCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAG
CTCATCGTGCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTATATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTC
AATGCGCTTGCTATAAAGAGATTGAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTTAGGCACATC
CAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGCAGGACTCTTAAGGGCAAG
AAGATCGCCATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCAAGTAACCTACTTATCTGATCTTCATG
TCCTTCGTGTTGTTCTGTAATACTCTTTACTTTGTCCAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGGT
TTGTGTAAGATTTGGTTCGAATCATGAGCCCTTTCCAGACCATCTTCGGCTTTATC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2BJ41TF 669 0 0
GGGACGCTCGCCTTATCCCCTCGGCTCATCTTCTTCTTCTTCGTCGCAGAGGATACAGAA
GAAAGAAAAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCGCTCTCACTCATATGC
AACTGGACGAAATCGAATCCTCTCACTCGCAACACTATTTCTCTCCCAGCTTCAAACGCT
CCCAATAAGCAGAGTTTAAGCATCAGATGTGCTCGTGTTGGTGGTGTGGAGATTCCGAGT
AACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTCACGGCATTGGTCGGACTAGGGCTCGC
CAGATTCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAG
CTCATCGTGCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTATATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTC
AATGCGCTTGCTATAAAGAGATTGAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTTAGGCACATC
CAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGCAGGACTCTTAAGGGCAAG
AAGATCGCCATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCAAGTAACCTACTTATCTGATCTTCATG
TCCTTCGTGTTGTTCTGTAATACTCTTTACTTTGTCCAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGGT
TTGTGTAAG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2BJ41JQ 628 0 0
CTTCGTCGCAGAGGATACAGAAGAAAGAAAAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGC
GCACTCGCTCTCACTCATATGCAACTGGACGAAATCGAATCCTCTCACTCGCAACACTAT
TTCTCTCCCAGCTTCAAACGCTCCCAATAAGCAGAGTTTAAGCATCAGATGTGCTCGTGT
TGGTGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTCACGG
CATTGGTCGGACTAGGGCTCGCCAGATTCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCAC
CAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCGTGCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTATATGAT
CGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATAAAGAGATTGAAGGAGATCCAATG
TTACCGTGGGGTTAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAA
CTGCAGGACTCTTAAGGGCAAGAAGATCGCCATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCAAGTA
ACCTACTTATCTGATCTTCATGTCCTTCGTGTTGTTCTGTAATACTCTTTACTTTGTCCA
GTTTCTCTGTTTAAAATGTGGTTTGTGT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2DB94TF 664 0 0
GG
GTCGCAGAGGATACAGAAGAAAGAAAAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCAC
TCGCTCTCACTCATATGCAACTGGACGAAATCGAATCCTCTCACTCGCAACACTATTTCT
CTCCCAGCTTCAAACGCTCCCAATA******GTTTAAGCATCAGATGTGCTCGTGTTGGT
GGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTCACGGCATT
GGTCGGACTAGAGCTCGCCAGATTCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAA
GACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCGTGCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTATATGATCGAG
GGTGATCTGAGGGGATTCAATGCGCTTGCTATAAAGAGATTGAAGTAGATCCAATGTTAC
CGTGGGGTTAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGC
AGGACTCTTAAGGGCAAGAAGATCGCCATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCAAGTAACCT
ACTTATCTGATCTTCATGTCCTTCGTGTTGTTCTGTAATACTCTTTACTTTGTCCAGTTT
CTCTGTTTAAAATGTGGTTTGTGTAAGATTTGGTTCGAATCATGAGCCCTTTCCAGACCA
TC

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR2AS53TF 716 0 0
GGGACGCTCGCCTTATCCCCTCGGCTCATCTTCTTCTTCTTCGTCGCAGAGGATACAGAA
GAAAGAAAAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCGCTCTCACTCATATGC
AACTGGACGAAATCGAATCCTCTCACTCGCAACACTATTTCTCTCCCAGCTTCAAACGCT
CCCAATA******GTTTAAGCATCAGATGTGCTCGTGTTGGTGGTGTGGAGATTCCGAGT
AACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTCACGGCATTGGTCGGACTAGGGCTCGC
CAGATTCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAG
CTCATCGTGCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTATATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTC
AATGCGCTTGCTATAAAGAGATTGAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTTAGGCACATC
CAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGCAGGACTCTTAAGGGCAAG
AAGATCGCCATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCAAGTAACCTACTTATCTGATCTTCATG
TCCTTCGTGTTGTTCTGTAATACTCTTTACTTTGTCCAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGGT
TTGTGTAAGATTTGGTTCGAATCATGAGCCCTTTCCAGACCATCTTCGGCTTTATC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2GE18TF 735 0 0
GG
GTCGCAGAGGATACAGAAGAAAGAAAAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCAC
TCGCTCTCACTCATATGCAACTGGACGAAATCGAATCCTCTCACTCGCAACACTATTTCT
CTCCCAGCTTCAAACGCTCCCAATAAGCAGAGTTTAAGCATCAAATGTGCTCGTGTTGGT
GGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTCACGGCATT
GGTCGGACTAGGGCTCGCCAGATTCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAA
GACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCGTGCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTATATGATCGAG
GGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATAAAGAGATTGAAGGAGATCCAATGTTAC
CGTGGGGTTAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGC
AGGACTCTTAAGGGCAAGAAGATCGCCATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCAAGTAACCT
ACTTATCTGATCTTCATGTCCTTCGTGTTGTTCTGTAATACTCTTTACTTTGTCCAGTTT
CTCTGTTTAAAATGTGGTTTGTGTAAGATTTGGTTCGAATCATGAGCCCTTTCCAGACCA
TCTTCG*CTTTATCATGTAAAAGTTCAAAACTAATACCGTTCCAGCAGATA*TGTCAAAG
ATGATCAGCT
CTG

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR2GE18JQ 632 0 0
CACTCGCAACACTATTTCTCTCCCAGCTTCAAACGCTCCCAATAAGCAGAGTTTAAGCAT
CAAATGTGCTCGTGTTGGTGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCTCT
TCAGTACATTCACGGCATTGGTCGGACTAGGGCTCGCCAGATTCTCGTTGATCTCCAGAT
GGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCGTGCTTCGTGATGAAGT
CTCCAAGTATATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATAAAGAGATT
GAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTTAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACA
GAGAACCAAGAACAACTGCAGGACTCTTAAGGGCAAGAAGATCGCCATTGCTGGCAAGAA
GAAAGTTTCCAAGTAACCTACTTATCTGATCTTCATGTCCTTCGTGTTGTTCTGTAATAC
TCTTTACTTTGTCCAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGGTTTGTGTAAGATTTGGTTCGAATC
ATGAGCCCTTTCCAGACCATCTTCGGCTTTATCATGTAAAAGTTCAAAACTAATACCGTT
CCAGCAGATAATGTCAAAGATGATCAGCTCTG

QA 1 632 1 632
DS 



CO CL215Contig2 733 6 5 U
CGGCTCATCTTCTTCTTCTTCGTCGCAGAGGATACAGAAGAAAACAAAATGGCGCAGATG
GTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCGCTCTCACTCATATGCAACTGGACGAAATCGAATCCT
CTCACTCGCAACACTATTTCTCTCCCTGCTTCAAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTAAGC
ATCAGATGTGCTCGTGTTGGTGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCT
CTTCAGTACATTCACGGCATTGGTCGAACTAGGGCTCGCCAGATTCTCGTTGATCTCCAG
ATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATTGTTCTTCGTGATGAA
GTCTCCAAGTATATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGA
TTGAAGGAGATCCAGTGTTACCGTGGGGTAAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGA
CAGAGAACCAAGAACAACTGCAGGACTCTTAAGGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAG
AAGAAAGTTTCCAAGTAACCTACTCATCTGATCTTCATGTCCTTGGTGTTGTTCTGTAAT
ACTCCTTTTTTTTTATTCTCTAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGGTTTGTGTAAGCCCTGAG
ATTTGGTTCGAATCATGAGCCCTTTTCATCGTCCGCTTCATCATGTAAAAGTTCAAGTTA
ATACCGTTCCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2AK83JQ C 144
AF RR2CC86TF U 1
AF RR2FS95TF U 19
AF RR2AK83TF U 23
AF RR2EO65JQ C 133
AF RR2EO65TF U 133
BS 1 613 RR2CC86TF
BS 614 614 RR2EO65TF
BS 615 700 RR2CC86TF
BS 701 701 RR2EO65TF
BS 702 733 RR2AK83TF

RD RR2AK83JQ 423 0 0
CCCTGCTTCAAACGCTCCCAATAAGCAGAGTTTAAGCATCAGATGTGCTCGTGTTGGTGG
TGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTTTTTTCAGTACATTCACGGCATTGG
TCGAACTAGGGCTCGCCAGATTCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAAGA
CATGGCTGAGGAAGAGCTCATTGTTTTTCGTGATGAAGTCTCCAATTATATGATCGAGGG
TGATTTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGATTGAAGGAGATCCAGTGTTACCG
TGGGGTAAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGCAG
GACTTTTAAGGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCAAGTAACCTAC
TCA

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR2CC86TF 703 0 0
CGGCTCATCTTCTTCTTCTTCGTCGCAGAGGATACAGAAGAAAACAAAATGGCGCAGATG
GTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCGCTCTCACTCATATGCAACTGGACGAAATCGAATCCT
CTCACTCGCAACACTATTTCTCTCCCTGCTTCAAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTAAGC
ATCAGATGTGCTCGTGTTGGTGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCT
CTTCAGTACATTCACGGCATTGGTCGAACTAGGGCTCGCCAGATTCTCGTTGATCTCCAG
ATGGAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATTGTTCTTCGTGATGAA
GTCTCCAAGTATATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGA
TTGAAGGAGATCCAGTGTTACCGTGGGGTAAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGA
CAGAGAACCAAGAACAACTGCAGGACTCTTAAGGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAG
AAGAAAGTTTCCAAGTAACCTACTCATCTGATCTTCATGTCCTTGGTGTTGTTCTGTAAT
ACTCCTTTTTTTT*ATTCTCTAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGGTTTGTGTAAGCCCTGAG
ATTTGGTTCGAATCATGAGCCCTTTTCATCGTCCGCTTCA
TCA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2FS95TF 660 0 0
GG
CGTCGCAGAGGATACAGAAGAAAACAAAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCA
CTCGCTCTCACTCATATGCAACTGGACGAAATCGAATCCTCTCACTCGCAACACTATTTC
TCTCCCTGCTTCAAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTAAGCGTCAGATGTGCTCGTGTTGG
TGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAATAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTCACGGCAT
TGGTCGAACTAGGGCTCGCCAGATTCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAA
AGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATTGTTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTATATGATCGA
GGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGATTGAAGGAGATCCAGTGTTA
CCGTGGGGTAAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTG
CAGGACTCTTAAGGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCAAGTAACC
TACTCATCTGATCTTCATGTCCTTGGTGTTGTTCTGTAATACTCCTTTTTTTT*ATTCTC
TAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGGTTTGTGTAAGCCCTGAGATTTGGTTCGAATCATGA

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR2AK83TF 711 0 0
GG
GCAGAGGATACAGAAGAAAACAAAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCG
CTCTCACTCATATGCAACTGGACGAAATCGAATCCTCTCACTCGCAACACTATTTCTCTC
CCTGCTTCAAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTAAGCATCAGATGTGCTCGTGTTGGTGGT
GTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTCACGGCATTGGT
CGAACTAGGGCTCGCCAGATTCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAATCACCAAAGAC
ATGGCTGAGGAAGAGCTCATTGTTCTTCGTGATGAAGTCTCCAATTATATGATCGAGGGT
GATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGATTGAAGGAGATCCAGTGTTACCGT
GGGGTAAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGCAGG
ACTCTTAAGGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCAAGTAACCTACT
CATCTGATCTTCATGTCCTTGGTGTTGTTCTGTAATACTCCTTTTTTTT*ATTCTCTAGT
TTCTCTGTTTAAAATGTGGTTTGTGTAAGCCCTGAGATTTGGTTCGAATCATGAGCCCTT
TTCATCGTCCGCTTCACCATGTAAAAGTTCAAGTTAATACCGTTCCAGC

QA 3 711 3 711
DS 

RD RR2EO65JQ 601 0 0
G
CTATTTCTCTCCCTGCTTCAAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTAAGCATCAGATGTGCTC
GTGTTGGTGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTC
ACGGCATTGGTCGAACTAGGGCTCGCCAGATTCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAA
TCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATTGTTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTATA
TGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGATTGAAGGAGATCC
AGTGTTACCGTGGGGTAAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGA
ACAACTGCAGGACTCTTAAGGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCA
AGTAACCTACTCATCTGATCTTCATGTCCTTGGTGTTGTTCTGTAATACTCCTTTTTTTT
TATTCTCTAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGGTTTGTGTAAGCCCTGAGATTTGGTTCGAAT
CATGAGCCCTTTTCATCGTCCGCTTCATCATGTAAAAGTTCAAGTTAATACCGTTCCAGC

QA 2 601 2 601
DS 

RD RR2EO65TF 601 0 0
G
CTATTTCTCTCCCTGCTTCAAACGCTCCCAATAAGCAGAGTCTAAGCATCAGATGTGCTC
GTGTTGGTGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAATACTCTCTTCAGTACATTC
ACGGCATTGGTCGAACTAGGGCTCGCCAGATTCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAACAAAA
TCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATTGTTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTATA
TGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGATTGAAGGAGATCC
AGTGTTACCGTGGGGTAAGGCACATCCAAGGCCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGA
ACAACTGCAGGACTCTTAAGGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCCA
AGTAACCTACTCATCTGATCTTCATGTCCTTGGTGTTGTTCTGTAATACTCCTTTTTTTT
TATTCTCTAGTTTCTCTGTTTAAAATGTGGTTTGTGTAAGCCCTGAGATTTGGTTCGAAT
CATGAGCCCTTTTCATCGTCCGCTTCATCATGTAAAAGTTCAAGTTAATACCGTTCCAGC

QA 2 601 2 601
DS 



AS 1 16

CO CL216Contig1 462 16 9 U
TCTTTCTCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTACCA
AGCTTTTTGGTGCCCATAGACCCGTATCCTACATTTAAATTA


BQ
80 80 80 80 80 80 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
60 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 75 60 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 75 0 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ51TFB U 1
AF RR2B180JQ C 1
AF RR2GI63JQB C 1
AF RR2GI63TF U 1
AF RR2B180TF U 1
AF RR2EJ54JQ C 1
AF RR2FI61JQ C 1
AF RR2EJ54TF U 1
AF RR2DR63JQ C 3
AF RR2DR63TF U 3
AF RR2FI61TF U 1
AF RR2FL86JQ C 1
AF RR2FL86TF U 1
AF RR2G826JQ C 1
AF RR2G826TF U 1
AF RR2GJ45TF U 1
BS 1 147 RR2AZ51TFB
BS 148 148 RR2GI63TF
BS 149 258 RR2AZ51TFB
BS 259 259 RR2GI63TF
BS 260 412 RR2AZ51TFB
BS 413 413 RR2GI63TF
BS 414 419 RR2AZ51TFB
BS 420 434 RR2FI61TF
BS 435 462 RR2GJ45TF

RD RR2AZ51TFB 419 0 0
TCTTTCTCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAGGGTCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGGCAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATGATTACC

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR2B180JQ 419 0 0
TCTTTCTCCCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTACC

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR2GI63JQB 418 0 0
TCTTTCTCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAATAAGGTCGAGA
CCAAGCAACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTAC

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR2GI63TF 418 0 0
TCTTTCTCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAATAAGGTCGAGA
CCAAGCAACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTAC

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR2B180TF 419 0 0
TCTTTCTCCCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTACC

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR2EJ54JQ 421 0 0
TCTTTCTCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTTAGATCGATTTTTAAAGCTAA
TAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTACCT
G

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR2FI61JQ 392 0 0
TCTTTCTCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAA
GAATCACGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTGACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTCCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGC

QA 1 392 1 392
DS 

RD RR2EJ54TF 421 0 0
TCTTTCTCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTTAGATCGATTTTTAAAGCTAA
TAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTACCT
G

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR2DR63JQ 418 0 0
TCTT
TCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAAGAATCA
TGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGGCCACAA
ACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATCTTGATG
CCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCCGTGCTC
AGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGACCAAAC
AACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTTGGATTT
TCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTACC
G

QA 5 417 5 417
DS 

RD RR2DR63TF 418 0 0
TCTT
TCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAAGAATCA
TGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGGCCACAA
ACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATCTTGATG
CCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCCGTGCTC
AGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGACCAAAC
AACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTTGGATTT
TCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTACC
G

QA 5 417 5 417
DS 

RD RR2FI61TF 434 0 0
TCTTTCTCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAA
GAATCACGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTGACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTCCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTACCA
AGCTTTTTGGTGCC

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR2FL86JQ 434 0 0
TCTTTCTCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGTCTATGCT*CTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTACCT
AGCTTTTTGGTGCC

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR2FL86TF 434 0 0
TCTTTCTCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGTCTATGCT*CTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTACCT
AGCTTTTTGGTGCC

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR2G826JQ 434 0 0
TCTTTCTCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGGGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTACCA
AGCTTTTTGGTGCC

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR2G826TF 434 0 0
TCTTTCTCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGGGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTACCA
AGCTTTTTGGTGCC

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR2GJ45TF 462 0 0
TCTTTCTCTCTCTCTCGCTCCACAGATTCTTCTTCTTTTCAGATCGATTTTTAAAGCTAA
GAATCATGCAAAACGAAGAAGGTGTTGTCACTGAGCTTTACATTCCCAGGAAATGCTCGG
CCACAAACAGATTGATCACTTCAAAC***CACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATC
TTGATGCCGATGGTATCTACACTGGCCAATTCACCACACTTGCTCTCTGCGGCTTTGTCC
GTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAGA
CCAAACAACAGTGAAGGGGTCTATGCTTCTGCCTCTTGTTATTTTTGTTATGTTCAATTT
GGATTTTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGGCTTTTCTGGTTTATGAAAGATAATTACCA
AGCTTTTTGGTGCCCATAGACCCGTATCCTACATTTAAATTA

QA 1 462 1 462
DS 



AS 2 11

CO CL217Contig1 1436 9 35 U
GGAGCTCCTTCCTCTCTCTCTATTGCTTCTGCAACTCTAACAATGGCAGCTGAAATGATG
TTAGTGAAGCCAATCTCCCAATTCGCATCTCCAAAGCTCACCAACTCAAGGACATGCCTC
ACCAGCCGACGTTTCTCCACCGTGATCAGAATGTCAGCCACCTCCACGCCGCCGCCTCCG
GCCACCGCAACCTCTAAGTCCAAGAAGGGCACGAAGAAGGAGATTAACGAGTCGCTTCTG
ACACCGAGGTTCTACACTACGGACTTCGAGGAGATGGAGCAGCTTTTCAACACGGAGATC
AACAAGAACCTTAACGAGGAAGAGTTCATTGCTCTGCTTCAAGAGTTTAAGACTGATTAC
AATCAGACACATTTCGTGAGGAACAAGG*AGTTCAAAGAAGCAGCGGACAAGTTGCAAGG
*ACCTCTAAGACAGATCTTCGTTGAGTTTCTTGAGCGGTCTTGTACTGCTGAGTTCTCTG
GTTTCCTTCTTTACAAGGAGCTTGG*TAGAAGACTCAAGAAAACAAACCCTGTTGTGG*C
TGAGATCTTCTCTCTTATGTCCAGAGATGAAGCAAGACATGCCGGGTTCTTGAACAAGGG
TTTGTCTGATTTCAACTTGGCTCTTGACTTGGGTTTCTTGACAAAGGCAAGGAAATACAC
TTTCTTCAAACCCAAGTTCATCTTCTACGCCACTTACTTGTCGGAGAAAATCGGGTACTG
GAGATACATCACAATCTACAGACACCTCAAGCAAAACCCTGAGTTTCAGTGTTACCCTAT
CTTCAAGTACTTTGAGAACTGGTGCCAAGACGAGAACCGTCATGGAGATTTCTTCTCTGC
TTTGATGAAAGCTCAGCCTCAGTTCCTCAATGACTGGCAAGCCAAGCTCTGGTCTCGTTT
CTTCTGCCTCTCGGTTTATGTGACCATGTACCTCAACGATTGTCAAAGAACTAATTTCTA
CGAGGGTATTGGGTTAAACACCAAGGAGTTTGACATGCACGTCATCATTGAGACAAACCG
GACCACGGCAAGGATATTCCCAGCTGTGTTGGATGTTGAGAACCCTGAGTTCAAGAGGAA
GCTAGATAGAATGGTTGTGATCAATGAGAAGCTGATGGCTGTAGGACAAACTGATGATCC
TTCCTTTGTCAAAAACCTCAAGAGGATTCCTCTCATTGCTGGTCTAGTCTCTGAGATATT
GGCTGCTTATCTCATGCCTCCTGTTGAGTCTGGATCTGTTGATTTCGCTGAGTTTGAGCC
TAATCTTGTCTATTAGTAGCTGCATTGTCAAGTCTTGTGAGTTTATGGACGGTTCTTGAT
TTCTTGTAGTTGAATGATCAAAACTGAGAAACCTCTTTTTATTTGTAATAAACCAAATAC
TTTTACAGTATTACTGCATGTATCAATCACAATGCACAATGGATTCACCAGTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A219TF U 1
AF RR2H040TF U 237
AF RR2BN61TF U 29
AF RR2A732TF U 23
AF RR2A219JQ C 870
AF RR2A732JQ C 659
AF RR2BN61JQ C 715
AF RR2H040JQ C 763
AF RR2BO67TF U 838
BS 1 107 RR2A219TF
BS 108 108 RR2A732TF
BS 109 417 RR2A219TF
BS 418 418 RR2A732TF
BS 419 421 RR2A219TF
BS 422 422 RR2A732TF
BS 423 490 RR2A219TF
BS 491 491 RR2A732TF
BS 492 512 RR2A219TF
BS 513 513 RR2A732TF
BS 514 645 RR2A219TF
BS 646 869 RR2A732TF
BS 870 870 RR2BO67TF
BS 871 879 RR2A732TF
BS 880 924 RR2BO67TF
BS 925 925 RR2A732JQ
BS 926 952 RR2BO67TF
BS 953 953 RR2A732JQ
BS 954 981 RR2BO67TF
BS 982 982 RR2A732JQ
BS 983 990 RR2BO67TF
BS 991 991 RR2A732JQ
BS 992 999 RR2BO67TF
BS 1000 1000 RR2A732JQ
BS 1001 1008 RR2BO67TF
BS 1009 1009 RR2A732JQ
BS 1010 1020 RR2BO67TF
BS 1021 1021 RR2A732JQ
BS 1022 1152 RR2BO67TF
BS 1153 1153 RR2A732JQ
BS 1154 1197 RR2BO67TF
BS 1198 1198 RR2A732JQ
BS 1199 1325 RR2BO67TF
BS 1326 1327 RR2A732JQ
BS 1328 1436 RR2BO67TF

RD RR2A219TF 645 0 0
GGAGCTCCTTCCTCTCTCTCTATTGCTTCTGCAACTCTAACAATGGCAGCTGAAATGATG
TTAGTGAAGCCAATCTCCCAATTCGCATCTCCAAAGCTCACCAACTCGAGGACATGCCTC
ACCAGCCGACGTTTCTCCACCGTGATCAGAATGTCAGCCACCTCCACGCCGCCGCCTCCG
GCCACCGCAACCTCTAAGTCCAAGAAGGGCACGAAGAAGGAGATTAACGAGTCGCTTCTG
ACACCGAGGTTCTACACTACGGACTTCGAGGAGATGGAGCAGCTTTTCAACACGGAGATC
AACAAGAACCTTAACGAGGAAGAGTTCATTGCTCTGCTTCAAGAGTTTAAGACTGATTAC
AATCAGACACATTTCGTGAGGAACAAGG*AGTTCAAAGAAGCAGCGGACAAGTTGCAGGG
*TCCTCTAAGACAGATCTTCGTTGAGTTTCTTGAGCGGTCTTGTACTGCTGAGTTCTCTG
GTTTCCTTCTCTACAAGGAGCTTGG*TAGAAGGCTCAAGAAAACAAACCCTGTTGTGG*C
TGAGATCTTCTCTCTTATGTCCAGAGATGAAGCAAGACATGCCGGGTTCTTGAACAAGGG
TTTGTCTGATTTCAACTTGGCTCTTGACTTGGGTTTCTTGACAAA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2H040TF 463 0 0
TCTGACACCGAGGTTCTACACTACGGACTTCGAGGAGATGGAGCAGCTTTTCAACACGGA
GATCAACAAGAACCTTAACGAGGAAGAGTTCATTGCTCTGCTTCAAGAGTTTAAGACTGA
TTACAATCAGACACATTTCGTGAGGAACAAGGGAGTTCAAAGAAGCAGCGGACAAGTTGC
AAGGGACCTCTAAGACAGATCTTCGTTGAGTTTCTTGAGCGGTCTTGTACTGCTGAGTTC
TCTGGTTTCCTTCTTTACAAGGAGCTTGGGTAGAAGACTCAAGAAAACAAACCCTGTTGT
GGGCTGAGATCTTCTCTCTTATGTCCAGAGATGAAGCAAGACATGCCGGGTTCTTGAACA
AGGGTTTGTCTGATTTCAACTTGGCTCTTGACTTGGGTTTCTTGACAAAGGCAAGGAAAT
ACACTTTCTTCAAACCCAAGTTCATCTTCTACGCCACTTACTT

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2BN61TF 721 0 0
GGG
CAACTCTAACGATGGCAGCTGAAATGATGTTAGTGAAGCCAATCTCCCAATTCGCATCTC
CAAAGCTCACCAACTCAAGGACATGCCTCACCAGCCGACGTTTCTCCACCGTGATCAAAA
TGTCAGCCACCTCCACGCCGCCGCCTCCGGCCACCGCAACCTCTAAGTCCAAGAAGGGCA
CGAAGAAGGAGATTAACGAGTCGCTTCTGACACCGAGGTTCTACACTACGGACTTCGAGG
AGATGGAGCAGCTTTTCAACACGGAGATCAACAAGAACCTTAACGAGGAAGAGTTCATTG
CTCTGCTTCAAGAGTTTAAGACTGATTACAATCAGACACATTTCGTGAGGAACAAGG*AG
TTCAAAGAAGCAGCGGACAAGTTGCAAGG*ACCTCTAAGACAGATCTTCGTTGAGTTTCT
TGAGCGGTCTTGTACTGCTGAGTTCTCTGGTTTCCTTCTTTACAAGGAGCTTGG*TAGAA
GACTCAAGAAAACAAACCCTGTTGTGG*CTGAGATTTTCTCTCTTATGTCCAGAGATGAA
GCAAGACATGCCGGGTTCTTGAACAAGGGTTTGTCTGATTTCAACTTGGCTCTTGACTTG
GGTTTCTTGACAAAGGCAAGGAAATACACTTTCTTCAAACCCAAGTTCATCTTCTACGCC
ACTTACTTGTCGGAGAAAATCGGGTACTGGAGATACATCACAATCTACAGACACCTCA

QA 4 721 4 721
DS 

RD RR2A732TF 872 0 0
GGGCTTCT
GCAACTCTAACAATGGCAGCTGAAATGATGTTAGTGAAGCCAATCTCCCAATTCGCATCT
CCAAAGCTCACCAACTCAAGGACATGCCTCACCAGCCGACGTTTCTCCACCGTGATCAGA
ATGTCAGCCACCTCCACGCCGCCGCCTCCGGCCACCGCAACCTCTAAGTCCAAGAAGGGC
ACGAAGAAGGAGATTAACGAGTCGCTTCTGACACCGAGGTTCTACACTACGGACTTCGAG
GAGATGGAGCAGCTTTTCAACACGGATATCAACAAGAACCTTAACGAGGAAGAGTTCATT
GCTCTGCTTCAAGAGTTTAAGACTGATTACAATCAGACACATTTCGTGAGGAACAAGG*A
GTTCAAAGAAGCAGCGGACAAGTTGCAAGG*ACCTCTAAGACAGATCTTCGTTGAGTTTC
TTGAGCGGTCTTGTACTGCTGAGTTCTCTGGTTTCCTTCTTTACAAGGAGCTTGG*TAGA
AGACTCAAGAAAACAAACCCTGTTGTGG*CTGAGATCTTCTCTCTTATGTCCAGAGATGA
AGCAAGACATGCCGGGTTCTTGAACAAGGGTTTGTCTGATTTCAACTTGGCTCTTGACTT
GGGTTTCTTGACAAAGGCAAGGAAATACACTTTCTTCAAACCCAAGTTCATCTTCTACGC
CACTTACTTGTCGGAGAAAATCGGGTACTGGAGATACATCACAATCTACAGACACCTCAA
GCAAAACCCTGAGTTTCAGTGTTACCCTATCTTCAAGTACTTTGAGAACTGGTGCCAAGA
CGAGAACCGTCATGGAGATTTCTTCTCTGCTTTGATGAAAGCTCAGCCTCAGTTCCTCA*
TGACTGGCA
GCCAGCTCTGGTCTC

QA 9 857 9 857
DS 

RD RR2A219JQ 498 0 0
ATGACTGGCAAGCCAAGCTCTGGTCTCGTTTCTTCTGCCTCTCGGTTTATGTGACCATGT
ACCTCAACGATTGTTAAAGAACTGATTTTTACGAGGGTATTGGGTTAAACACCAAGGAGT
TTGACATGCACGTCATCATTGAGACAAACCGGACCACGGCAAGGATATTCCCAGCTGTGT
TGGATGTTGAGAACCCTGAGTTCAAGAGGAGGCTAGATAGAATGGTTGTGATCAATGAGA
AGCTGATGGCTGTAGGACAAACCGATGATCCTTCCTTTGTCAAAAACCTCAAGAGGATTC
CTCTTATTGCTGGTCTAGTGTCTGAGATTTTGGCTGCTTATCTCATGCCTCCTGTTGAGT
CTGGATCTGTTGATTTCGCCGAGTTTGAGCCTAATCTTGTCTATTAGTTGCTGCATTGTC
AAGTCTTATGAGTTTATGGATGGTTTTTGATTTCTTGTAGTTGAATGATCAAAACTGAGA
AACCTCTTT
ATTTGTAAT

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2A732JQ 731 0 0
ACTTTCTTCAAACCCAAGTTCATCTTCTACGCCACTTACTTGTCGGAGAAAATCGGGTAC
TGGAGATACATCACAATCTACAGACACCTCAAGCAAAACCCTGAGTTTCAGTGTTACCCT
ATCTTCAAGTACTTTGAGAACTGGTGCCAAGACGAGAACCGTCATGGAGATTTCTTCTCT
GCTTTGATGAAAGCTCAGCCTCAGTTCCTCAATGACTGGCAAGCCAAGCTCTGGTCTCGT
TTCTTCTGCCTCTCGGTTTATGTGACCATGTACCTCAACGATTGTCAAAGAACTAATTTC
TACGAGGGTATTGGGTTAAACACCAAGGAGTTTGACATGCACGTCATCATTGAGACAAAC
CGGACCACGGCAAGGATATTCCCAGCTGTGTTGGATGTTGAGAACCCTGAGTTCAAGAGG
AAGCTAGATAGAATGGTTGTGATCAATGAGAAGCTGATGGCTGTAGGACAAACTGATGAT
CCTTCCTTTGTCAAAAACCTCAAGAGGATTCCTCTCATTGCTGGTCTAGTCTCTGAGATA
TTGGCTGCTTATCTCATGCCTCCTGTTGAGTCTGGATCTGTTGATTTCGCTGAGTTTGAG
CCTAATCTTGTCTATTAGTAGCTGCATTGTCAAGTCTTGTGAGTTTATGGACGGTTCTTG
ATTTCTTGTAGTTGAATGATCAAAACTGAGAAACCTCTTTTTATTTGTAATAAACCAAAT
ACTTTTACAG
C

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2BN61JQ 715 0 0
GTACTGGAGATACATCACAATCTACAGACACCTCAAGCAAAACCCTGAGTTTCAGTGTTA
CCCTATCTTCAAGTACTTTGAGAACTGGTGCCAAGACGAGAACCGTCATGGAGATTTCTT
CTCTGCTTTGATGAAAGCTCAGCCTCAGTTCCTCAATGACTGGCAAGCCAAGCTCTGGTC
TCGTTTCTTCTGCCTCTCGGTTTATGTGACCATGTACCTCAACGATTGTCAAAGAACTAA
TTTTTACGAGGGTATTGGGTTAAACACCAAGGAGTTTGACATGCACGTCATCATTGAGAC
AAACCGGACCACGGCAAGGATATTCCCAGCTGTGTTGGATGTTGAGAACCCTGAGTTCAA
GAGGAAGCTAGATAGAATGGTTGTGATCAATGAGAAGCTGATGGCTGTAGGACAAACTGA
TGATCCTTCCTTTGTCAAAAACCTCAAGAGGATTCCTCTCATTGCTGGTCTAGTCTCTGA
GATATTGGCTGCTTATCTCATCCCTCCTGTTGAGTCTGGATCTGTTGATTTCGCTGAGTT
TGAGCCTAATCTTGTCTATTAGTAGCTGCATTGTCAAGTCTTGTGAGTTTATGGACGGTT
CTTGATTTCTTGTAGTTGAATGATCAAAACTGAGAAACCTCTTTTTATTTGTAATAAACC
AAATACTTTTACAGTATTACTGCATGTATCAATCACAATGCACAATGGATTC
GCC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2H040JQ 667 0 0
GTTTCAGTGTTACCCTATCTTCAAGTACTTTGAGAACTGGTGCCAAGACGAGAACCGTCA
TGGAGATTTCTTCTCTGCTTTGATGAAAGCTCAGCCTCAGTTCCTCAATGACTGGCAAGC
CAAGCTCTGGTCTCGTTTCTTCTGCCTCTCGGTTTATGTGACCATGTACCTCAACGATTG
TCAAAGAACTAATTTCTACGAGGGTATTGGGTTAAACACCAAGGAGTTTGACATGCACGT
CATCATTGAGACAAACCGGACCACGGCAAGGATATTCCCAGCTGTGTTGGATGTTGAGAA
CCCTGAGTTCAAGAGGAAGCTAGATAGAATGGTTGTGATCAATGAGAAGCTGATGGCTGT
AGGACAAACTGATGATCCTTCCCTTGTCAAAAACCTCAAGAGGATTCCTCTCATTGCTGG
TCTAGTCTCTGAGATATTGGCTGCTTATCTCATGCCTCCTGTTGAGTCTGGATCTGTTGA
TTTCGCTGAGTTTGAGCCTAATCTTGTCTATTAGTAGCTGCATTGTCAAGTCTTGTGAGT
TTATGGACGGTTCTTGATTTCTTGTAGTTGAATGATCAAAACTGAGAAACCTCTTTTTAT
TTGTAATAAACCAAATACTTTTACAGTATTACTGCATGTATCAATCACAATGCACAATGG
ATTC
GCC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2BO67TF 599 0 0
G
GCTTTGATGAAAGCTCAGCCTCAGTTCCTCAATGACTGGCAAGCCAAGCTCTGGTCTCGT
TTCTTCTGCCTCTCGGTTTATGTGACAATGTACCTCAACGATTGTCAAAGAACTGATTTC
TACGAGGGTATTGGGTTAAACACAAAGGAGTTCGACATGCATGTCATCATCGAGACAAAC
CGTACCACGGCAAGGATATTCCCAGCTGTGTTGGATGTTGAGAACCCTGAGTTCAAGAGG
AAGCTAGATAGAATGGTTGTGATCAATGAGAAGCTGATGGCTGTAGGACAAACTGATGAT
CCTTCCTTTGTCAAGAACCTCAAGAGGATTCCTCTCATTGCTGGTCTAGTCTCTGAGATC
TTGGCTGCTTATCTCATGCCTCCTGTTGAGTCTGGATCTGTTGATTTCGCTGAGTTTGAG
CCTAATCTTGTCTATTAGTAGCTGCATTGTCAAGTCTTGTGAGTTTATGGACGGTTCTTG
ATTTCTT**AGTTGAATGATCAAAACTGAGAAACCTCTTTTTATTTGTAATAAACCAAAT
ACTTTTACAGTATTACTGCATGTATCAATCACAATGCACAATGGATTCACCAGTTGAG

QA 2 599 2 599
DS 



CO CL217Contig2 810 2 16 U
GGGTTCTACACGACGGATTTCGAGGAGATGGAGCAGCTTTTCAACACGGAGATTAACAAG
AACCTTAACGAGGAGGAGTTCATTGCTCTGCTTCAGGAGTTTAAGACTGATTACAATCAG
ACACATTTCGTTAGGAACAAGGAGTTTAAAGAAGCTGCTGACAAGTTGCAGGGACCTCTC
AGACAGATCTTTGTCGAGTTTCTTGAGCGGTCTTGTACTGCTGAGTTCTCTGGTTTCCTT
CTCTACAAGGAGCTTGGCAGAAGACTCAAGAAAACAAACCCTGTAGTGGCTGAGATATTC
TCTCTTATGTCCAGAGATGAAGCAAGACATGCCGGGTTCTTGAACAAGGGTTTGTCTGAT
TTCAACTTGGCTCCTGACTTGGGTTTCCTGACAAAGGCAAGGAAGTACACTTTCTTCAAA
CCCAAGTTCATCTTCTACGCCACTTACTTATCCGAGAAAATTGGGTACTGGAGGTACATC
ACAATCTACAGACACCTCAAGCAGAACCCTGAGTTCCAGTGTTACCCTATCTTCAAGTAC
TTTGAGAACTGGTGCCAAGACGAAAACCGCCACGGAGATTTCTTCTCTGCTTTGATGAAA
GCTCAGCCTCAGTTCCTTAATGACTGGCAAGCCAAACTCTGGTCTCGTTTCTTCTGCCTC
TCGGTTTATGCGACAATGTACCTCAACGATTGTCAAAGAACTGATTTCTACGAGGGTATT
GGGTTAAACACAAAGGAGTTTGATATGCACGACATCATCGAGACAAACCGAACCACGGCA
AGAATATTCCCGGCTGTGCTGGATGTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2EB93TF U 1
AF RR2EH14TF U 128
BS 1 373 RR2EB93TF
BS 374 374 RR2EH14TF
BS 375 670 RR2EB93TF
BS 671 671 RR2EH14TF
BS 672 751 RR2EB93TF
BS 752 752 RR2EH14TF
BS 753 767 RR2EB93TF
BS 768 768 RR2EH14TF
BS 769 773 RR2EB93TF
BS 774 774 RR2EH14TF
BS 775 783 RR2EB93TF
BS 784 784 RR2EH14TF
BS 785 792 RR2EB93TF
BS 793 793 RR2EH14TF
BS 794 806 RR2EB93TF
BS 807 810 RR2EH14TF

RD RR2EB93TF 810 0 0
GGGTTCTACACGACGGATTTCGAGGAGATGGAGCAGCTTTTCAACACGGAGATTAACAAG
AACCTTAACGAGGAGGAGTTCATTGCTCTGCTTCAGGAGTTTAAGACTGATTACAATCAG
ACACATTTCGTTAGGAACAAGGAGTTTAAAGAAGCTGCTGACAAGTTGCAGGGACCTCTC
AGACAGATCTTTGTCGAGTTTCTTGAGCGGTCTTGTACTGCTGAGTTCTCTGGTTTCCTT
CTCTACAAGGAGCTTGGCAGAAGACTCAAGAAAACAAACCCTGTAGTGGCTGAGATATTC
TCTCTTATGTCCAGAGATGAAGCAAGACATGCCGGGTTCTTGAACAAGGGTTTGTCTGAT
TTCAACTTGGCTCTTGACTTGGGTTTCCTGACAAAGGCAAGGAAGTACACTTTCTTCAAA
CCCAAGTTCATCTTCTACGCCACTTACTTATCCGAGAAAATTGGGTACTGGAGGTACATC
ACAATCTACAGACACCTCAAGCAGAACCCTGAGTTCCAGTGTTACCCTATCTTCAAGTAC
TTTGAGAACTGGTGCCAAGACGAAAACCGCCACGGAGATTTCTTCTCTGCTTTGATGAAA
GCTCAGCCTCAGTTCCTTAATGACTGGCAAGCCAAACTCTGGTCTCGTTTCTTCTGCCTC
TCGGTTTATGTGACAATGTACCTCAACGATTGTCAAAGAACTGATTTCTACGAGGGTATT
GGGTTAAACACAAAGGAGTTTGATATGCACGTCATCATCGAGACAAATCGAAC*ACGGCA
AGA*TATTCCCG*CTGTGCTGGATGT
GAGA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2EH14TF 683 0 0
GCGTT
AGGAACAAGGAGTTTAAAGAAGCTGCTGACAAGTTGCAGGGACCTCTCAGACAGATCTTT
GTCGAGTTTCTTGAGCGGTCTTGTACTGCTGAGTTCTCTGGTTTCCTTCTCTACAAGGAG
CTTGGCAGAAGACTCAAGAAAACAAACCCTGTAGTGGCTGAGATATTCTCTCTTATGTCC
AGAGATGAAGCAAGACATGCCGGGTTCTTGAACAAGGGTTTGTCTGATTTCAACTTGGCT
CCTGACTTGGGTTTCCTGACAAAGGCAAGGAAGTACACTTTCTTCAAACCCAAGTTCATC
TTCTACGCCACTTACTTATCCGAGAAAATTGGGTACTGGAGGTACATCACAATCTACAGA
CACCTCAAGCAGAACCCTGAGTTCCAGTGTTACCCTATCTTCAAGTACTTTGAGAACTGG
TGCCAAGACGAAAACCGCCACGGAGATTTCTTCTCTGCTTTGATGAAAGCTCAGCCTCAG
TTCCTTAATGACTGGCAAGCCAAACTCTGGTCTCGTTTCTTCTGCCTCTCGGTTTATGCG
ACAATGTACCTCAACGATTGTCAAAGAACTGATTTCTACGAGGGTATTGGGTTAAACACA
AAGGAGTTTGATATGCACGACATCATCGAGACAAACCGAACCACGGCAAGAATATTCCCG
GCTGTGCTGGATGTTGAG

QA 6 683 6 683
DS 



AS 1 13

CO CL218Contig1 910 13 10 U
TTTTTCGTATAACATTTTTCTTAAAGAGTTCATTCATCCCCTTTTACCACAACTTATAGG
ATAATGACACGCTTCTCCGGTAATTAAGGTATTATTAATTATCTATCCTTAAGTACAAAG
CAAATCTTATATAGAGAGTCAACAAAGCCATAGATATTAGATAGAGATATAGATCTGATC
ATTTGGAAGTAAAACTAGTTGAAAGGTCTAAAACAAAACAGAGAAAGAATGTCATCAACG
GAGCAAAAGGATGTAGAAGAAAAGGGATCGTTGATCTCAGGCTTGTTGGACAAAGCCAAA
GGTTTCTTCGCAGAGAAGCTTGCCAATATTCCGACTCCGGAAGCCACCGTGGACGACGTA
GACTTCGTACGTGTGACTGCTCAAGGAGCTGATTATCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAAT
CCTTACCCTCAAGCAATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACCTCCTCAAGAGTGACACAAGG
ATGATAGCGTCTGGCACGATACCGGATCCGGGTTCGTTGATTGCGAACGGGTCGACGGTT
CTGGACGTACCGGTTAAGGTGCCTTACAGCATAGCGATAAGTTTGATGAAGGACATGTTT
TTGGACTGGGACATCGACTATCAACTTGACATCGGACTAACCATCGACCTTCCTGTTGTT
GGTGACATTACCATCCCTGTCTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTCCCTTCCTTTGCCGAC
ATCTTTAACTCTAAACCCGCTGAGTGATTTTCAATAAGTACGATCCGTAATCGA******
***TCGTTGGATGTTTCAGTTGTGGAGTACTCTTGTTTTGTTGTTGGATTAATAAAGGAT
TTTTATTTGGTTTCTGTATGTGTTCCTTTGAACATGTTGGTAAGAATAAAAAAAATTCTC
AGTTTTAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 30 
60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 
65 65 50 65 65 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
40 40 40 25 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2DM89TF U 157
AF RR2EU59TF U 161
AF RR2FI19TF U 1
AF RR2B613JQ C 139
AF RR2DR72TF U 243
AF RR2CN66TF U 195
AF RR2DR72JQ C 619
AF RR2EU59JQ C 338
AF RR2G311TF U 161
AF RR2FJ33JQ C 157
AF RR2FJ33TF U 157
AF RR2B613TF U 139
AF RR2FI19JQ C 127
BS 1 691 RR2FI19TF
BS 692 692 RR2EU59TF
BS 693 725 RR2FI19TF
BS 726 837 RR2DR72TF
BS 838 839 RR2G311TF
BS 840 840 RR2FJ33TF
BS 841 852 RR2G311TF
BS 853 853 RR2FJ33TF
BS 854 879 RR2G311TF
BS 880 910 RR2FI19JQ

RD RR2DM89TF 292 0 0
GG
AGATAGAGATATAGATCTGATCATTTGGAAGTAAAACTAGTTGAAAGGTCTAAAACAAAA
CAGAGAAAGAATGTCATCAACGGAGCAAAAGGATGTAGAAGAAAAGGGATCGTTGATCTC
AGGCTTGTTGGACAAAGCCAAAGGTTTCTTCGCAGAGAAGCTTGCCAATATTCCGACTCC
GGAAGCCACCGTGGACGACGTAGACTTCGTACGTGTGACTGCTCAAGGAGCTGATTATCA
CGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACCCTCAAGCAATCCCTATTTGCC

QA 3 292 3 292
DS 

RD RR2EU59TF 545 0 0
GG
AGAGATATAGATCTGATCATTTGGAAGTAAAACTAGTTGAAAGGTCTAAAACAAAACAGA
GAAAGAATGTCATCAACGGAGCAAAAGGATGTAGAAGAAAAGGGATCGTTGATCTCAGGC
TTGTTGGACAAAGCCAAAGGTTTCTTCGCAGAGAAGCTTGCCAATATTCCGACTCCGGAA
GCCACCGTGGACGACGTAGACTTCGTACGTGTGACTGCTCAAGGAGCTGATTATCACGCC
AAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACCCTCAAGCAATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACCTC
CTCAAGAGTGACACAAGGATGATAGCGTCTGGCACGATACCGGATCCGGGTTCGTTGATT
GCGAACGGGTCGACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGTGCCTTACAGCATAGCGATAAGT
TTGATGAAGGGCATGTTTTTGGACTGGGACATCGACTATCAACTTGACATCGGACTAACC
ATCGACCTTCCTGTTGTTGGTGACATTACCATCCCTGTCTCTACTCAGGGTGAGATCAAG
CTC

QA 3 545 3 545
DS 

RD RR2FI19TF 725 0 0
TTTTTCGTATAACATTTTTCTTAAAGAGTTCATTCATCCCCTTTTACCACAACTTATAGG
ATAATGACACGCTTCTCCGGTAATTAAGGTATTATTAATTATCTATCCTTAAGTACAAAG
CAAATCTTATATAGAGAGTCAACAAAGCCATAGATATTAGATAGAGATATAGATCTGATC
ATTTGGAAGTAAAACTAGTTGAAAGGTCTAAAACAAAACAGAGAAAGAATGTCATCAACG
GAGCAAAAGGATGTAGAAGAAAAGGGATCGTTGATCTCAGGCTTGTTGGACAAAGCCAAA
GGTTTCTTCGCAGAGAAGCTTGCCAATATTCCGACTCCGGAAGCCACCGTGGACGACGTA
GACTTCGTACGTGTGACTGCTCAAGGAGCTGATTATCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAAT
CCTTACCCTCAAGCAATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACCTCCTCAAGAGTGACACAAGG
ATGATAGCGTCTGGCACGATACCGGATCCGGGTTCGTTGATTGCGAACGGGTCGACGGTT
CTGGACGTACCGGTTAAGGTGCCTTACAGCATAGCGATAAGTTTGATGAAGGACATGTTT
TTGGACTGGGACATCGACTATCAACTTGACATCGGACTAACCATCGACCTTCCTGTTGTT
GGTGACATTACCATCCCTGTCTCTACTCAGG*TGAGATCAAGCTCCCTTCCTTTGCCGAC
ATCTT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2B613JQ 591 0 0
GG
AACAAAGCCATAGATATTAGATAGAGATATAGATCTGATCATTTGGAAGTAAAACTAGTT
GAAAGGTCTAAAACAAAACAGAGAAAGAATGCCATCAACGGAGCAAAAGGATGTAGAAGA
AAAGGGATCGTTGATTTCAGGCTTGTTGGACAAAGCCAAAGGTTTTTTCGCAGAGAGGCT
TGCCAATATTCCGACTCCGGAAGCCACCGTGGACGACGTAGACTTCGTACGTGTGACTGC
TCAAGGAGCTGATTATCACGCCAAGGTTTCCGTCAAGAATCCTTACCCTCAAGCAATCCC
TATTTGCCAGATTTTTTACCTCCTCAAGAGTGACACAAGGATGATAGCGTTTGGCACGAT
ACCGGATCCGGGTTCGTTGATTGCGAACGGGTCGGCGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGT
GCCTTACAGCATAGCGATAAGTTTGATGAAGGACATGTTTTTGGACTGGGACATCGACTA
TCAACTTGACATCGGACTAACCATCGACCTTCCTGTTGTTGGTGACATTACCATCCCTGT
CTCTACTCAGGGGGAGATCAAGCTCCCTTCCTTTGCCGACATTTTTAAC

QA 3 591 3 591
DS 

RD RR2DR72TF 595 0 0
GCAAAAGGATGTAGAAGAAAAGGGATCGTTGATCTCAGGCTTGTTGGACAAAGCCAAAGG
TTTCTTCGCAGAGAAGCTTGCCAATATTCCGACTCCGGAAGCCACCGTGGACGACGTAGA
CTTCGTACGTGTGACTGCTCAAGGAGCTGATTATCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCC
TTACCCTCAAGCAATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACCTCCTCAAGAGTGACACAAGGAT
GATAGTGTCTGGCACGATACCGGATCCGGGTTCGTTGATTGCGAACGGGTCGACGGTTCT
GGACGTACCGGTTAAGGTGCCTTACAGCATAGCGATAAGTTTGATGAAGGACATGTTTTT
GGACTGGGACATCGACTATCAACTTGACATCGGGCTAACCATCGACCTTCCTGTTGTTGG
TGACATTACCATCCCTGTCTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTCCCTTCCTTTGCCGACAT
CTTTAACTCTAAACCCGCTGAGTGATTTTCAATAAGTACGATCCGTAATCGA********
*TCGTTGGATGTTTCAGTTGTGGAGTACTCTTGTTTTGTTGTTGGATTAATAAAG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2CN66TF 620 0 0
CTAGTTGAAAGGTCTAAAACAAAACAGAGAAAGAATGTCATCAACGGAGCAAAAGGATGT
AGAAGAAAAGGGATCGTTGATCTCAGGCTTGTTGGACAAAGCCAAAGGTTTCTTCGCAGA
GAAGCTTGCCAATATTCCGACTCCGGAAGCCACCGTGGACGACGTAGACTTCGTACGTGT
GACTGGTCAAGGAGCTGATTATCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACCCTCAAGC
AATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACCTCCTCAAGAGTGACACAAGGATGATAGCGTCTGG
CACGATACCGGATCCGGGTTCGTTGATTGCGAACGGGTCGACGGTTCTGGACGTACCGGT
TAAGGTGCCTTACAGCATAGCGATAAGTTTGATGAAGGACATGTTTTTGGACTGGGACAT
TGACTATCAACTTGACATCGGACTTACCATCGACCTTCCTGTTATTGGTGACATTACCAT
CCCTGTCTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTTCCTTCCTTTGCTGACATCTTTAACTCTAA
ACCCTCTGAGTGATTTTCAATAAGTACGATCCGTAAACGA*********TCGTTGGATGT
TTCAGTTGTGGAGTACTCTT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2DR72JQ 255 0 0
TATCAACTTGACATCGGGCTAACCATCGACCTTCCTGTTGTTGGTGACATTACCATCCCT
GTCTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTCCCTTCCTTTGCCGACATCTTTAACTCTAAACCC
GCTGAGTGATTTTCAATAAGTACGATCCGTAATCGA*********TCGTTGGATGTTTCA
GTTGTGGAGTACTCTTGTTTTGTTGTTGGATTAATAAAGGATTTTTATTTGGTTTCTGTA
TGTGTTCCTTTGAAC

QA 1 255 1 255
DS 

RD RR2EU59JQ 531 0 0
CGGAAGCCACCGTGGACGACGTAGACTTCGTACGTGTGACTGCTCAAGGAGCTGATTATC
ACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACCCTCAAGCAATCCCTATTTGCCAGATCTCTT
ACCTCCTCAAGAGTGACACAAGGATGATAGCGTCTGGCACGATACCGGATCCGGGTTCGT
TGATTGCGAACGGGTCGACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGTGCCTTACAGCATAGCGA
TAAGTTTGATGAAGGGCATGTTTTTGGACTGGGACATCGACTATCAACTTGACATCGGAC
TAACCATCGACCTTCCTGTTGTTGGTGACATTACCATCCCTGTCTCTACTCAGGGTGAGA
TCAAGCTCCCTTCCTTTGCCGACATCTTTAACTCTAAACCCGCTGAGTGATTTTCAATAA
GTACGATCCGTAATCGA*********TCGTTGGATGTTTCAGTTGTGGAGTACTCTTGTT
TTGTTGTTGGATTAATAAAGGATTTTTATTTGGTTTCTGTATGTGTTCCTT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2G311TF 737 0 0
GG
AGAGATATAGATCTGATCATTTGGAAGTAAAACTAGTTGAAAGGTCTAAAACAAAACAGA
GGAAGAATGTCATCAACGGAGCAAAAGGATGTAGAAGAAAAGGGATCGTTGATCTCAGGC
TTGTTGGACAAAGCCAAAGGTTTCTTCGCAGAGAAGCTTGCCAATATTCCGACTCCGGAA
GCCACCGTGGACGACGTAGACTTCGTACGTGTGACTGCTCAAGGAGCTGATTATCACGCC
AAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACCCTCAAGCAATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACCTC
CTCAAGAGTGACACAAGGATGATAGCGTCTGGCACGATACCGGATCCGGGTTCGTTGATT
GCGAACGGGTCGACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGTGCCTTACAGCATAGCGATAAGT
TTGATGAAGGACATGTTTTTGGACTGGGACATCGACTATCAACTTGACATCGGACTAACC
ATCGACCTTCCTGTTGTTGGTGACATTACCATCCCTGTCTCTACTCAGGGTGAGATCAAG
CTCCCTTCCTTTGCCGACATCTTTAACTCTAAACCCTCTGAGTGATTTTCAATAAGTACG
ATCCGTAAACGACATAGACGATCGTTGGATGTTTCAGTTGTGGAGTACTCTTGTTTTGTT
GTTGGATTAATAAAGGACTTTTATTTGGTT*CTGTATGTGTTCCTTTGAACATGTTG
CTGGTAAGAATAAAAAAA

QA 3 719 3 719
DS 

RD RR2FJ33JQ 706 0 0
GG
AGATAGAGATATAGATCTGATCATTTGGAAGTAAA*CTAGTTGAAAGGTCTAAAACAAAA
CAGAGAAAGAATGTCATCAACAGAGCAAAAGGATGTAGAAGAAAAGGGATCGTTGATCTC
AGGCTTGTTGGACAAAGCCAAAGGTTTCTTCGCAGAGAAGCTTGCCAATATTCCGACTCC
GGAAGCCACCGTGGACGACGTAGACTTCGTACGTGTGACTGCTCAAGGAGCTGATTATCA
CGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACCCTCAAGCAATCCCTATTTGCCAGATCTCTTA
CCTCCTCAAGAGTGACACAAGGATGATAGCGTCTGGCACGATACCGGATCCGGGTTCGTT
GATTGCGAACGGGTCGACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGTGCCTTACAGCATAGCGAT
AAGTTTGATGAAGGACATGTTTTTGGACTGGGACATCGACTATCAACTTGACATCGGACT
AACCATCGACCTTCCTGTTGTTGGTGACATTACCATCCCTGTCTCTACTCAGGGTGAGAT
CAAGCTCCCTTCCTTTGCCGACATCTTTAACTCTAAACCCGCTGAGTGATTTTCAATAAG
TACGATCCGTAATCGA*********TCGTTGGATGTTCCAGTTGTGGAGTACTCTTGTTT
TGTTGTTGAATTAATAAAGGATTTTTATTTGGTTTC
AAAAAAAA

QA 3 698 3 698
DS 

RD RR2FJ33TF 698 0 0
GG
AGATAGAGATATAGATCTGATCATTTGGAAGTAAA*CTAGTTGAAAGGTCTAAAACAAAA
CAGAGAAAGAATGTCATCAACAGAGCAAAAGGATGTAGAAGAAAAGGGATCGTTGATCTC
AGGCTTGTTGGACAAAGCCAAAGGTTTCTTCGCAGAGAAGCTTGCCAATATTCCGACTCC
GGAAGCCACCGTGGACGACGTAGACTTCGTACGTGTGACTGCTCAAGGAGCTGATTATCA
CGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACCCTCAAGCAATCCCTATTTGCCAGATCTCTTA
CCTCCTCAAGAGTGACACAAGGATGATAGCGTCTGGCACGATACCGGATCCGGGTTCGTT
GATTGCGAACGGGTCGACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGTGCCTTACAGCATAGCGAT
AAGTTTGATGAAGGACATGTTTTTGGACTGGGACATCGACTATCAACTTGACATCGGACT
AACCATCGACCTTCCTGTTGTTGGTGACATTACCATCCCTGTCTCTACTCAGGGTGAGAT
CAAGCTCCCTTCCTTTGCCGACATCTTTAACTCTAAACCCGCTGAGTGATTTTCAATAAG
TACGATCCGTAATCGA*********TCGTTGGATGTTCCAGTTGTGGAGTACTCTTGTTT
TGTTGTTGAATTAATAAAGGATTTTTATTTGGTTTC

QA 3 698 3 698
DS 

RD RR2B613TF 711 0 0
GG
AACAAAGCCATAGATATTAGATAGAGATATAGATCTGATCATTTGGAAGTAAAACTAGTT
GAAAGGTCTAAAACAAAACAGAGAAAGAATGCCATCAACGGAGCAAAAGGATGTAGAAGA
AAAGGGATCGTTGATCTCAGGCTTGTTGGACAAAGCCAAAGGTTTCTTCGCAGAGAGGCT
TGCCAATATTCCGACTCCGGAAGCCACCGTGGACGACGTAGACTTCGTACGTGTGACTGC
TCAAGGAGCTGATTATCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACCCTCAAGCAATCCC
TATTTGCCAGATCTCTTACCTCCTCAAGAGTGACACAAGGATGATAGCGTCTGGCACGAT
ACCGGATCCGGGTTCGTTGATTGCGAACGGGTCGGCGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGT
GCCTTACAGCATAGCGATAAGTTTGATGAAGGACATGTTTTTGGACTGGGACATCGACTA
TCAACTTGACATCGGACTAACCATCGACCTTCCTGTTGTTGGTGACATTACCATCCCTGT
CTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTCCCTTCCTTTGCCGACATCTTTAACTCTAAACCCGC
TGAGTGATTTTCAATAAGTACGATCCGTAATCGA*********TCGTTGGATGTTTCAGT
TGTGGAGTACTCTTGTTTTGTTGTTGGATTAATAAAGGATTTTTATTTG

QA 3 711 3 711
DS 

RD RR2FI19JQ 784 0 0
TTATATAGAGAGTCAACAAAGCCATAGATATTAGATAGAGATATAGATCTGATCATTTGG
AAGTAAAACTAGTTGAAAGGTCTAAAACAAAACAGAGAAAGAATGTCATCAACGGAGCAA
AAGGATGTAGAAGAAAAGGGATCGTTGATCTCAGGCTTGTTGGACAAAGCCAAAGGTTTC
TTCGCAGAGAAGCTTGCCAATATTCCGACTCCGGAAGCCACCGTGGACGACGTAGACTTC
GTACGTGTGACTGCTCAAGGAGCTGATTATCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTAC
CCTCAAGCAATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACCTCCTCAAGAGTGACACAAGGATGATA
GCGTCTGGCACGATACCGGATCCGGGTTCGTTGATTGCGAACGGGTCGACGGTTCTGGAC
GTACCGGTTAAGGTGCCTTACAGCATAGCGATAAGTTTGATGAAGGACATGTTTTTGGAC
TGGGACATCGACTATCAACTTGACATCGGACTAACCATCGACCTTCCTGTTGTTGGTGAC
ATTACCATCCCTGTCTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTCCCTTCCTTTGCCGACATCTTT
AACTCTAAACCCGCTGAGTGATTTTCAATAAGTACGATCCGTAATCGA*********TCG
TTGGATGTTTCAGTTGTGGAGTACTCTTGTTTTGTTGTTGGATTAATAAAGGATTTTTAT
TTGGTTTCTGTATGTGTTCCTTTGAACATGTTGGTAAGAATAAAAAAAATTCTCAGTTTT
AACT

QA 1 784 1 784
DS 



AS 2 15

CO CL219Contig1 994 2 6 U
GGAGGGGAAGAACGTGAATAGTGGTGGTGGTGGTGAGAAGTTTCTGGAAATAAAAAATAA
ACTATGAGAACTATTCTCCAAGGAAGTCTCCTTCCTCCTCCTCCTATAAAACTCCGCCAC
CCTTCCCTTCTCTTCTCCCCATCCCATTCTCATCCCAACTTAAAATTCACAACCAAATCT
TCTCCTTCTCCTCCGACAATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCCCATGTCC
ACCGCCACCATGCGGGTTCTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGTTGATC
CCCGTCGACATGAGAACCGGTGCTCACAAACAGGAGCCTTTCTTTTCCCTCAACCCCTTC
GGTCAAATCCCTGCCCTCCAAGACGGTGACTTAACCCTATTTGAGTCACGAGCCATCACA
GAGTACATAGCTGATGAATACAGTGAGAAAGGCGAGAAGCTAATGTGCCCAGGGTGCAAA
AAAGTCAAGGCAATCACCAAGGTCTGGCTTAATGTTGAAGGTCAACAGTTCGACCCTATC
GCCTCCAAGATCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACTGATCCA
GCTGCCGTCCAGGAGCTCGAAAGCAAGCTCGCCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGCGAGG
CTCTCCAAATCCGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTTCATCACCTC
CCTGTCATCCACTACTTGATGGGTACTGACTCCAAGGAGCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAG
GTTTCCGAGTGGGTCAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAGGTCGTTGACCTC
CAGAAACAGTAACGAGGCTTTTGTTTAATTTCTCAAATAAAATTATTGTATCTCTGTGTG
TTTTGTGTTAATATTGTAAACTTCTCTTCAGTTTCTTACCCTTTTCTCCTCTGTTTGTGT
GTTTGTTGTGTCTTCGTTTTATGTGCAATAAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC77TF U 1
AF RR2EC77JQ C 363
BS 1 654 RR2EC77TF
BS 655 655 RR2EC77JQ
BS 656 710 RR2EC77TF
BS 711 711 RR2EC77JQ
BS 712 733 RR2EC77TF
BS 734 994 RR2EC77JQ

RD RR2EC77TF 733 0 0
GGAGGGGAAGAACGTGAATAGTGGTGGTGGTGGTGAGAAGTTTCTGGAAATAAAAAATAA
ACTATGAGAACTATTCTCCAAGGAAGTCTCCTTCCTCCTCCTCCTATAAAACTCCGCCAC
CCTTCCCTTCTCTTCTCCCCATCCCATTCTCATCCCAACTTAAAATTCACAACCAAATCT
TCTCCTTCTCCTCCGACAATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCCCATGTCC
ACCGCCACCATGCGGGTTCTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGTTGATC
CCCGTCGACATGAGAACCGGTGCTCACAAACAGGAGCCTTTCTTTTCCCTCAACCCCTTC
GGTCAAATCCCTGCCCTCCAAGACGGTGACTTAACCCTATTTGAGTCACGAGCCATCACA
GAGTACATAGCTGATGAATACAGTGAGAAAGGCGAGAAGCTAATGTGCCCAGGGTGCAAA
AAAGTCAAGGCAATCACCAAGGTCTGGCTTAATGTTGAAGGTCAACAGTTCGACCCTATC
GCCTCCAAGATCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACTGATCCA
GCTGCCGTCCAGGAGCTCGAAAGCAAGCTCGCCAGGGTCTTGGATATCTACGAG*CGAGG
CTCTCCAAATCCGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCT*CATCACCTC
CCTGTCATCCACT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2EC77JQ 632 0 0
TCAAATCCCTGCCCTCCAAGACGGTGACTTAACCCTATTTGAGTCACGAGCCATCACAGA
GTACATAGCTGATGAATACAGTGAGAAAGGCGAGAAGCTAATGTGCCCAGGGTGCAAAAA
AGTCAAGGCAATCACCAAGGTCTGGCTTAATGTTGAAGGTCAACAGTTCGACCCTATCGC
CTCCAAGATCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACTGATCCAGC
TGCCGTCCAGGAGCTCGAAGGCAAGCTCGCCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGCGAGGCT
CTCCAAATCCGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTTCATCACCTCCC
TGTCATCCACTACTTGATGGGTACTGACTCCAAGGAGCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAGGT
TTCCGAGTGGGTCAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAGGTCGTTGACCTCCA
GAAACAGTAACGAGGCTTTTGTTTAATTTCTCAAATAAAATTATTGTATCTCTGTGTGTT
TTGTGTTAATATTGTAAACTTCTCTTCAGTTTCTTACCCTTTTCTCCTCTGTTTGTGTGT
TTGTTGTGTCTTCGTTTTATGTGCAATAAAAC

QA 1 632 1 632
DS 



CO CL219Contig2 1027 13 6 U
GAGTATAATCAGAATGTTGTTTTATTTCACATAAACGACGACCCAACAAACACACAAACA
GAGGAGAAAAGGGTAAGAAAGTAAAAAGAAGATTACAATACTAACACAAAACACACACAG
AGAGGTACAATCATTTTATTTGAGAAATGAAACAAAACCCTCAGTTCGTTACTGCTTCTG
GAGGTCAACGACCTTAGCCCAAGCAGGCCTAGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCAAC
CTTGGGGCGAGACTCAAAGAGGTCCTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGG
GAGGTGGTGGAGATCAGCCAAAGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAG
CCTTTCCTCGTAGATATCCAAGACTCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCTGGACAGCGGC
TGGATCGGTGGTCATGCCAAACATGCCTTTGAAGATACGCTCGAAGGCGATCTTGGAGGC
GATAGGGTCAAACTGTTGACCTTCGACATTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACTTT
TTTGCACCCTGGGCACATAAGCTTCTCACCTTTCTCACTGTATTCATCCGCTATGTACTC
TGTGATGGCTCGTGACTCAAATAGAGTTAAGTCACCGTCTTGGAGAGCAGGGATTTGACC
GAAGGGGTTGAGTGAAACGAAAGGCTCCTGCTTGTGAGCACCGGCTCTCATGTCGACGGG
GATCAACTCGAAGTCGAGGTCCTTCTCGTAAAGAGCAGCGAGAACCCGCATGGTGGCTGT
GGACATGGGGACTCCGTGGACTTTGATGGTGGCCATGGTGATTGTCGGAGGAGAAGGAGA
AGATTTGGTTGTGAATTTCAAGTTGGAATGGGAATGGGATCCGGAGAAGAGAAGGGACGA
GTGGCTGAGTTTTATAGGAGGAGGAGGAAGGAGACTTCCTTGGAGAATGGTTCGCATTGT
TATTTTATTTCCAGAAACTTCTCACCACCACCACTATTATTCACGTCTTCCCCTCCCCCA
CTTTCCC


BQ
10 10 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 55 55 55 55 60 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 
25 60 60 45 60 60 45 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 45 45 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 50 65 50 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 
50 65 65 50 50 65 65 65 65 65 65 65 20 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 50 65 65 50 65 65 
65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F963JQ U 7
AF RR2F195JQ U 1
AF RR2GI27JQB U 1
AF RR2HB75JQ U 1
AF RR2GI23JQB U 2
AF RR2E796JQ U 7
AF RR2EP71JQ U 64
AF RR2HB75TF C 135
AF RR2GY69TF C 199
AF RR2EP71TF C 198
AF RR2GI27TF C 568
AF RR2F963TF C 271
AF RR2EX20TF C 186
BS 1 584 RR2F195JQ
BS 585 646 RR2GI27JQB
BS 647 711 RR2GI23JQB
BS 712 713 RR2EP71JQ
BS 714 882 RR2HB75TF
BS 883 1027 RR2EX20TF

RD RR2F963JQ 203 0 0
AATCAGAATGTTGTTTTATTTCACATAAACGACGACCCAACAAACACACAAACAGAGGAG
AAAAGGGTAAGAAAGTAAAAAGAAGATTACAATACTAACACAAAACACACACAGAGAGGT
ACAATCATTTTATTTGAGAAATGAAACAAAACCCTCAGTTCGTTACTGCTTCTGGAGGTC
AACGACCTTAGCCCAAGCAGGCC

QA 1 203 1 203
DS 

RD RR2F195JQ 584 0 0
GAGTATAATCAGAATGTTGTTTTATTTCACATAAACGACGACCCAACAAACACACAAACA
GAGGAGAAAAGGGTAAGAAAGTAAAAAGAAGATTACAATACTAACACAAAACACACACAG
AGAGGTACAATCATTTTATTTGAGAAATGAAACAAAACCCTCAGTTCGTTACTGCTTCTG
GAGGTCAACGACCTTAGCCCAAGCAGGCCTAGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCAAC
CTTGGGGCGAGACTCAAAGAGGTCCTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGG
GAGGTGGTGGAGATCAGCCAAAGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAG
CCTTTCCTCGTAGATATCCAAGACTCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCTGGACAGCGGC
TGGATCGGTGGTCATGCCAAACATGCCTTTGAAGATACGCTCGAAGGCGATCTTGGAGGC
GATAGGGTCAAACTGTTGACCTTCGACATTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACTTT
TTTGCACCCTGGGCACATAAGCTTCTCACCTTTCTCACTGTATT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2GI27JQB 646 0 0
GG
GTATAATCAGAATGTTGTTTTATTTCACATAAACGACGACCCAACAAACACACAAACAGA
GGAGAAAAGGGTAAGAAAGTAAAA*GAAGATTACAATACTAACACAAAACACACACAGAG
AGGTACAATCATTTTATTTGAGAAATGAAACAAAACCCTCAGTTCGTTACTGCTTCTGGA
GGTCAACGACCTTAGCCCAAGCAGGCCTAGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCAACCT
TGGGGCGAGACTCAAAGAGGTCCTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGGGA
GGTGGTGGAGATCAGCCAAAGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAGCC
TTTCCTCGTAAATATCCAAGACTCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCCGGACAGCGGCTG
GATCGGTGGTCATGCCAAACATGCCTTTGAAGATACGCTCGAAGGCGATCTTGGAGGCGA
TAGGGTCAAACTGTTGACCTTCGACATTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACTTTTT
TGCACCCTGGGCACATAAGCTTCTCACCTTTCTCACTGTATTCATCCGCTATGTACTCTG
TGATGGCTCGTGACTCAAATAGAGTTAAGTCACCGTCTTGGAGA

QA 3 646 3 646
DS 

RD RR2HB75JQ 628 0 0
GG
GTATAATCAGAATGTTGTTTTATTTCACATAAACGACGACCCAACAAACACACAAACAGA
GGAGAAAAGGGTAAGAAAGTAAAA*GAAGATTACAATACTAACACAAAACACACACAGAG
AGGTACAATCATTTTATTTGAGAAATGAAACAAAACCCTCAGTTCGTTACTGCTTCTGGA
GGTCAACGACCTTAGCCCAAGCAGGCCTAGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCAACCT
TGGGGCGAGACTCAAAGAGGTCCTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGGGA
GGTGGTGGAGATCAGCCAAAGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAGCC
TTTCCTCGTAAATATCCAAGACTCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCCGGACAGCGGCTG
GATCGGTGGTCATGCCAAACATGCCTTTGAAGATACGCTCGAAGGCGATCTTGGAGGCGA
TAGGGTCAAACTGTTGACCTTCGACATTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACTTTTT
TGCACCCTGGGCACATAAGCTTCTCACCTTTCTCACTGTATTCATCCGCTATGTACTCTG
TGATGGCTCGTGACTCAAATAGAGTT

QA 3 628 3 628
DS 

RD RR2GI23JQB 710 0 0
A
GTATAATCAGAATGTTGTTTTATTTCACATAAACGACGACCCAACAAACACACAAACAGA
GGAGAAAAGGGTAAGAAAGTAAAAAGAAGATTACAATACTAACACAAAACACACACAGAG
AGGTACAATCATTTTATTTGAGAAATGAAACAAAACCCTCAGTTCGTTACTGCTTCTGGA
GGTCAACGACCTTAGCCCAAGCAGGCCTAGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCAACCT
TGGGGCGAGACTCAAAGAGGTCCTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGGGA
GGTGGTGGAGATCAGCCAAAGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAGCC
TTTCCTCGTAAATATCCAAGACTCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCTGGACAGCGGCTG
GATCGGTGGTCATGCCAAACATGCCTTTGAAGATACGCTCGAAGGCGATCTTGGAGGCGA
TAGGGTCAAACTGTTGACCTTCGACATTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACTTTTT
TGCACCCTGGGCACATAAGCTTCTCACCTTTCTCACTGTATTCATCCGCTATGTACTCTG
TGATGGCTCGTGACTCAAATAGAGTTAAGTCACCGTCTTGGAGAGCAGGGATTTGACCGA
AGGGGTTGAGTGAAACGAAAGGCTCCTGCTTGTGAGCACCGGCTCTCAT

QA 2 710 2 710
DS 

RD RR2E796JQ 690 0 0
AATCAGAATGTTGTTTTATTTCACATAAACGACGACCCAACAAACACACAAACAGAGGAG
AAAAGGGTAAGAAAGTAAAAAGAAGATTACAATACTAACACAAAACACACACAGAGAGGT
ACAATCATTTTATTTGAGAAATGAAACAAAACCCTCAGTTCGTTACTGCTTCTGGAGGTC
AACGACCTTAGCCCAAGCAGGCCTAGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCAACCTTGGG
GCGAGACTCAAAGAGGTCCTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGGGAGGTG
GTGGAGATCAGCCAAAGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAGTCTTTC
CTCGTAGATATCCAAGACTCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCTGGACAGCGGCTGGATC
GGTGGTCATGCCAAACATGCCTTTGAAGATACGCTCGAAGGCGATCTTGGAGGCGATAGG
GTCAAACTGTTGACCTTCGACATTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACTTTTTTGCA
CCCTGGGCACATAAGCTTCTCACCTTTCTCACTGTATTCATCCGCTATGTACTCTGTGAT
GGCTCGTGACTCAAATAGAGTTAAGTCACCGTCTTGGAGAGCAGGGATTTGACCGAAGGG
GTTGAGTGAAACGAAAGGCTCCTGCTTGTG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2EP71JQ 650 0 0
GG
GAAAAGGGTAAGAAAGTAAAAAGAAGATTACAATACTAACACAAAACACACACAGAGAGG
TACAATCATTTTATTTGAGAAATGAAACAAAACCCTCAGTTCGTTACTGCTTCTGGAGGT
CAACGACCTTAGCCCAAGCAGGCCTAGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCAACCTTGG
GGCGGGACTCAAAGAGGTCCTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGGGAGGT
GGTGGAGATCAGCCAAAGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAGCCTTT
CCTCGTAAATATCCAAGACTCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCTGGACAGCGGCTGGAT
CGGTGGTCACGCCAAACATGCCTTTGAAGATACGCTCGAAGGCGATCTTGGAGGCGATAG
GGTCAAACTGTTGACCTTCGACATTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACCTTTTTGC
ACCCTGGGCACATAAGCTTCTCACCTTTCTCACTGTATTCATCCGCTATGTACTCTGTGA
TGGCTCGTGACTCAAATAGAGTTAAGTCACCGTCTTGGAGAGCAGGGATTTGACCGAAGG
GGTTGAGTGAAACGAAAGGCTCCTGCTTGTGAGCACCGGCTCTCATGT

QA 3 650 3 650
DS 

RD RR2HB75TF 748 0 0
TTTATTTGAGAAATGAA*CAAAACCCCCAGTTCGT*ACTGCTTCTGGAGGTCAACGACTT
TAGCCCAAGCAGGCCTAGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCAAC*TTGGGGCGAGACT
CAAAGAGGTCCTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGGGAGGTGGTGGAGAT
CAGCCAAAGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAGCCTTTCCTCGTAGA
TATCCAAGACTCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCCGGACAGCGGCTGGATCGGTGGTCA
TGCCAAACATGCCTTTGAAGATACGCTCGAAGGCGATCTTGGAGGCGATAGGGTCAAACT
GTTGACCTTCGACATTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACTTTTTTGCACCCTGGGC
ACATAAGCTTCTCACCTTTCTCACTGTATTCATCCGCTATGTACTCTGTGATGGCTCGTG
ACTCAAATAGAGTTAAGTCACCGTCTTGGAGAGCAGGGATTTGACCGAAGGGGTTGAGTG
AAACGAAAGGCTCCTGCTTGTGAGCACCGGCTCTCATGTCGACGGGGATCAACTCGAAGT
CGAGGTCCTTCTCGTAAAGAGCAGCGAGAACCCGCATGGTGGCTGTGGACATGGGGACTC
CGTGGACTTTGATGGTGGCCATGGTGATTGTCGGAGGAGAAGGAGAAGATTTGGTTGTGA
ATTTCAAGTTGGAATGGGAATGGGATCC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2GY69TF 684 0 0
CCAAGCAGGCCTGGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCAAC*TTAGGGCGAGACTCAAA
GAGCTCCTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGGGAGGTGATGAAGATCAGC
CAAAGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAGCCTCGCCTCGTAGATATC
CAAGACCCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCTGGACGGCAGCTGGATCAGTGGTCATGCC
AAACATGCCTTTGAAGATACGCTCGAAGGCGATCTTGGAGGCGATAGGGTCGAACTGTTG
ACCTTCAACATTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACTTTTTTGCACCCTGGGCACAT
AAGCTTCTCGCCTTTCTCACTGTATTCATCCGCTATGTACTCTGTGATTGCTCGTGACTC
AAATAGAGTTAAGTCACCGTCTTGGAGAGCAGGGATTTGACCGAAGGGGTTGAGGGAAAC
GAAAGGCTCCTGTTTGTGAGCACCGGCTCTCATGTCTACGGGGATCAACTCGAAGTCGAG
GTCCTTCTCGTAAAGAGCAGCGAGAACGCGCATGGTGGCGGTGGACATGGGGACTCCGTG
GACTTTGATGCTGGCCATGGTGATTGTCGGAGGAGAAGGAGAAGATTTGGTTGTGAATTT
CAAGTTGGAATGAGAATGGGATCC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2EP71TF 685 0 0
CCCAAGCAGGCCTAGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCAAC*TTGGGGCGGGACTCAA
AGAGGTCCTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGGGAGGTGGTGGAGATCAG
CCAAAGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAGCCTTTCCTCGTAGATAT
CCAAGACTCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCTGGACAGCGGCTGGATCGGTGGTCACGC
CAAACATGCCTTTGAAGATACGCTCGAAGGCGATCTTGGAGGCGATAGGGTCAAACTGTT
GACCTTCGACATTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACCTTTTTGCACCCTGGGCACA
TAAGCTTCTCACCTTTCTCACTGTATTCATCCGCTATGTACTCTGTGATGGCTCGTGACT
CAAATAGAGTTAAGTCACCGTCTTGGAGAGCAGGGATTTGACCGAAGGGGTTGAGTGAAA
CGAAAGGCTCCTGCTTGTGAGCACCGGCTCTCATGTCGACGGGGATCAACTCGAAGTCGA
GGTCCTTCTCGTAAAGAGCAGCGAGAACCCGCATGGTGGCTGTGGACATGGGGACTCCGT
GGACTTTGATGGTGGCCATGGTGATTGTCGGAGGAGAAGGAGAAGATTTGGTTGTGAATT
TCAAGTTGGAATGGGAATGGGATCC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2GI27TF 315 0 0
CA
CTTTCTCACTGTATTCATCCGCTATGTACTCTGTGATGGCTCGTGACTCAAATAGAGTTA
AGTCACCGTCTTGGAGAGCAGGGATTTGACCGAAGGGGTTGAGTGAAA*GAAAGGCTCCT
GCTTGTGAGCACCGGCTCTCATGTCGACGGGGATCAACTCGAAGTCGAGGTCCTTCTCGT
AAAGAGCAGCGAGAACCCGCATGGTGGCTGTGGACATGGGGACTCCGTGGACTTTGATGG
TGGCCATGGTGATTGTCGGAGGAGAAGGAGAAGATTTGGTTGTGAATTTCAAGTTGGAAT
GGGAATGGGATCC

QA 3 315 3 315
DS 

RD RR2F963TF 712 0 0
GTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGGGAGGCGGTGGAGATCAGCCAAAGTGAAGCA
ATCACAAGCGAGGAACTCAGATT*GGAGAGCCTTTCCTCGTAGATATCCAAGACTCTGAC
GAGCTTGCCTTCGAGCTCCTGGACAGCGGCTGGATCGGTGGTCATGCCAAACATGCCTTT
GAAGATACGCTCGAAGGCGATCTTGGAGGCGATAGGGTCAAACTGTTGACCTTCGACATT
AAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACTTTTTTGCACCCTGGGCACATAAGCTTCTCACC
TTTCTCACTGTATTCATCCGCTATGTACTCTGTGATGGCTCGTGACTCAAATAGAGTTAA
GTCACCGTCTTGGAGAGCAGGGATTTGACCGAAGGGGTTGAGTGAAACGAAAGGCTCCTG
CTTGTGAGCACCGGCTCTCATGTCGACGGGGATCAACTCGAAGTCGAGGTCCTTCTCGTA
AAGAGCAGCGAGAACCCGCATGGTGGCTGTGGACATGGGGACTCCGTGGACTTTGATGGT
GGCCATGGTGATTGTCGGAGGAGAAGGAGAAGATTTGGTTGTGAATTTCAAGTTGGAATG
GGAATGGGATGGGGAGAAGAGAAGGGACGAGTGGCTGAGTTTTATAGGAGGAGGAGGAAG
GAGACTTCCTTGGAGAATGGTTCGCATTGTTATTTTATTTCCAGAAACTTCT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2EX20TF 842 0 0
GTCACGA
CTTAGCCCAAGCAG*CCTAGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCA*CCTTGGG*CGAGA
CTCAAAGAGT**CTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGGGAGGTGGTGGAG
ATCAGCCAAAGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAGCCTTTCCTCGTA
GATATCCAAGACTCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCTGGACAGCGGCTGGATCGGTGGT
CATGCCAAACATGCCTTTGAAGATACGCTCGAAGGCGATCTTGGAGGCGATAGGGTCAAA
CTGTTGACCTTCGACATTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACTTTTTTGCACCCTGG
GCACATAAGCTTCTCACCTTTCTCACTGTATTCATCCGCTATATACTCTGTGATGGCTCG
TGACTCAAATAGAGTTAAGTCACCGTCTTGGAGAGCAGGGATTTGACCGAAGGGGTTGAG
TGAAACGAAAGGCTCCTGCTTGTGAGCACCGGCTCTCATGTCGACGGGGATCAACTCGAA
GTCGAGGTCCTTATCGTAAAGAGCAGCGAGAACCCGCATGGTGGCTGTGGACATGGGGAC
TCCGTGGACTTTGATGGTGGCCATGGTGATTGTCGGAGGAGAAGGAGAAGATTTGGTTGT
GAATTTCAAGTTGGAATGGGAATGGGATGGGGAGAAGAGAAGGGACGAGTGGCTGAGTTT
TATAGGAGGAGGAGGAAGGAGACTTCCTTGGAGAATGGTTCGCATTGTTATTTTATTTCC
AGAAACTTCTCACCACCACCACTATTATTCACGTCTTCCCCTCCCCCACTTTCCC

QA 8 842 8 842
DS 



AS 3 16

CO CL220Contig1 621 4 5 U
GGGCTTACGGAGTAGTCAGTCGCATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGCCGT
TCCTTTGCTTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCCCAGAG
CGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCGAAGGGTATTGACTCCAGGGT
CAGAAGGAAGTTCAAGGGTGCCACGTTGATGCCCAATGTTGGATACGGATCTGACAAGAA
GACCCGCCACTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGACCT
CGAGTTATTGATGATGCACAACAGGACTTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCAC
CAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTGGATATTATTGTCACCAACAG
GCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGAAGATAACAAGAAGAAGCTACTTG
AGATATTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTTGTTATCAGACCGTTTTGGTT
TCTTTTGTGTTTGCTGTCAAAACAAACAAGAGTTTTGGTTTGAGACAAGGCTATGTTGAG
ATCGTTCGTAAACTATTTCAG


BQ
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BK55JQ C 30
AF RR2AF72JQ C 1
AF RR2AF72TF U 1
AF RR2BK55TF U 5
BS 1 44 RR2AF72TF
BS 45 45 RR2BK55TF
BS 46 200 RR2AF72TF
BS 201 201 RR2BK55TF
BS 202 621 RR2AF72TF

RD RR2BK55JQ 568 0 0
ATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGCCGTTCCTTTGCTTACGAATAAGGTGGTGAAGA
AGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCCCAGAGCGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGCT
GGAGGAGGCCGAAGGGTATTGACTCCAGGGTCAGAAGGAAGTTCAAGGGTGCCACGTTGA
TGCCCAATGTTGGATACGGATCTGACAAGAAGACCCGCCACTACCTCCCCAATGGGTTCA
AGAATTTCGTTGTTCACAACACGAGTGACCTCGAGTTGTTGATGATGCACAACAGGACTT
ACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCACCAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAG
CTTTTCAGCTGGATATTGTTGTCACCAACAGGCTTGTTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACG
AGTGAAGAAGATAACAAGAAGAAGCTACTTGAGATATTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCA
TTTCCCTTTTTGTTATCAGACCGTTTTGGTTTCTTTTGTGTTTGCTGTCAAAACAAACAG
GAGTTTTGGTTTGAGACAAGGCTATGTT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2AF72JQ 621 0 0
GGGCTTACGGAGTAGTCAGTCGCATCGAGATCGATCTTAGGAAGTAGCAAAAATGGCCGT
TCCTTTGCTTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCCCAGAG
CGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCGAAGGGTATTGACTCCAGGGT
CAGAAGGAAGTTCAAGGGTGTCACGTTGATGCCCAATGTTGGATACGGATCTGACAAGAA
GACCCGCCACTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGACCT
CGAGTTATTGATGATGCACAACAGGACTTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCAC
CAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTTTCAGCTGGATATTATTGTCACCAACAG
GCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGAAGATAACAAGAAGAAGCTACTTG
AGATATTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTTGTTATCAGACCGTTTTGGTT
TCTTTTGTGTTTGCTGTCAAAACAAACAAGAGTTTTGGTTTGAGACAAGGCTATGTTGAG
ATCGTTCGTAAACTATTTCAG

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2AF72TF 621 0 0
GGGCTTACGGAGTAGTCAGTCGCATCGAGATCGATCTTAGGAAGTAGCAAAAATGGCCGT
TCCTTTGCTTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCCCAGAG
CGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCGAAGGGTATTGACTCCAGGGT
CAGAAGGAAGTTCAAGGGTGTCACGTTGATGCCCAATGTTGGATACGGATCTGACAAGAA
GACCCGCCACTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGACCT
CGAGTTATTGATGATGCACAACAGGACTTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCAC
CAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTGGATATTATTGTCACCAACAG
GCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGAAGATAACAAGAAGAAGCTACTTG
AGATATTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTTGTTATCAGACCGTTTTGGTT
TCTTTTGTGTTTGCTGTCAAAACAAACAAGAGTTTTGGTTTGAGACAAGGCTATGTTGAG
ATCGTTCGTAAACTATTTCAG

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2BK55TF 610 0 0
GG
ACGGAGTAGTCAGTCGCATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGCCGTTCCTTT
GCTTACGAATAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCCCAGAGCGACCG
CAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCGAAGGGTATTGACTCCAGGGTCAGAAG
GAAGTTCAAGGGTGCCACGTTGATGCCCAATGTTGGATACGGATCTGACAAGAAGACCCG
CCACTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAATTTCGTTGTTCACAACACGAGTGACCTCGAGTT
GTTGATGATGCACAACAGGACTTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCACCAAGAA
GAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTGGATATTGTTGTCACCAACAGGCTTGC
TAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGAAGATAACAAGAAGAAGCTACTTGAGATAT
TTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTTGTTATCAGACCGTTTTGGTTTCTTTT
GTGTTTGCTGTCAAAACAAACAGGAGTTTTGGTTTGAGACAAGGCTATGTTGAGATCGTT
CGTAAAC
C

QA 3 609 3 609
DS 



CO CL220Contig2 626 4 3 U
GGGCTTACGGAGTAGTCAGTCGCATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGCCGT
TCCTTTGCTTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCCCAGAG
CGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGACTCCAGGGT
CAGAAGGAAGTTCAAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAA
GACCCGCCACTACCTCCCCAACGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTGCACAACACGAGTGACCT
TGAGTTGTTGATGATGCACAACAGAACTTACTGCGCTGAGATTGCACACG**GTTTCCAC
CAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTGGATATTGTTGTCACCAACAG
GCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGATAACAAGAAGAAGCTGCTTGAGA
TATTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTGTTATCAGACGCGGTTTTGGTTTC
TTTTTGTGTTTGCTGTCAAAACAAACAAGAGTTTTTGGTTTAAGACAGGCTATGTTGAGA
TCGTTCGTAAACTATTTCAGATTCAG


BQ
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP95TF U 1
AF RR2DP95JQ C 1
AF RR2DI40TF U 5
AF RR2A204TF U 86
BS 1 529 RR2DP95TF
BS 530 609 RR2DI40TF
BS 610 626 RR2A204TF

RD RR2DP95TF 529 0 0
GGGCTTACGGAGTAGTCAGTCGCATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGCCGT
TCCTTTGCTTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCCCAGAG
CGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGACTCCAGGGT
CAGAAGGAAGTTCAAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAA
GACCCGCCACTACCTCCCCAACGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTGCACAACACGAGTGACCT
TGAGTTGTTGATGATGCACAACAGAACTTACTGCGCTGAGATTGCACACG**GTTTCCAC
CAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTGGATATTGTTGTCACCAACAG
GCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGATAACAAGAAGAAGCTGCTTGAGA
TATTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTGTTATCAGACGCG

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2DP95JQ 613 0 0
GGGCTTACGGAGTAGTCAGTCGCATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGCCGT
TCCTTTGCTTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCCCAGAG
CGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGACTCCAGGGT
CAGAAGGAAGTTCAAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAA
GACCCGCCACTACCTCCCCAACGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTGCACAACACGAGTGACCT
TGAGTTGTTGATGATGCACAACAGAACTTACTGCGCTGAGATTGCACACG**GTTTCCAC
CAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTTTCAGCTGGATATTGTTGTCACCAACAG
GCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGATAACAAGAAGAAGCTGCTTGAGA
TATTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTGTTATCAGACGCGGTTTTGGTTTC
TTTTTGTGTTTGCTGTCAAAACAAACAAGAGTTTTTGGTTTAAGACAGGCTATGTTGAGA
TCGTTCGTAAACT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2DI40TF 605 0 0
GG
ACGGAGTAGTCAGTCGCATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGCCGTTCCTTT
GCTTACGAAGGAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCCCAGAGCGACCG
CAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGACTCCAGGGTCAGAAG
GAAGTTCGAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCG
CCACTACCTCCCCAACGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTGCACAACACGAGTGACCTTGAGTT
GTTGATGATGCACAACAGAACTTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCACCAAGAA
GAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTGGATATTGTTGTCACCAACAGGCTTGC
TAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGATAACAAGAAGAAGCTGCTTGAGATATTTA
GTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTGTTATCAGACGCGGTTTTGGTTTCTTTTTG
TGTTTGCTGTCAAAACAAACAAGAGTTTTTGGTTTAAGACAGGCTATGTTGAGATCGTTC
GTA

QA 3 605 3 605
DS 

RD RR2A204TF 541 0 0
AAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCCCAGAGCGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAA
AGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGACTCCAGGGTCAGAAGGAAGTTCAAGGGTGTCACC
TTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCGCCACTACCTCCCCAACGGG
TTCAAGAAGTTCGTTGTGCACAACACGAGCGACCTTGAGTTGTTGATGATGCACAACAGA
ACTTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCACCAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAG
AGAGCTTCTCAGCTGGATGTTGTTGTCACCAACAGGCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAA
GACGAGTGAAGATAACAAGAAGAAGCTGCTTGAGATATTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGC
ATTTCCCTTTTGTTATCAGACGCGGTTTTGGTTTCTTTTTGTGTTTGCTGTCAAAACAAA
CAAGAGTTTTTGGTTTAAGACAGGCTATGTTGAGATCGTTCGTAAACTATTTCAGATTCA
G

QA 1 541 1 541
DS 



CO CL220Contig3 637 8 5 U
GGACCTTACGGAGTAGAGTCAGTCACATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGC
CGTTCCTTTGCTTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCTCA
GAGCGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCCAAGGGTATTGACTCCAG
GGTCAGAAGGAAGTTCAAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAA
GAAGACCCGTCATTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGA
CCTCGAGTTGTTGATGATGCACAACAGGACTTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTC
CACCAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTGGATATTGTTGTCACCAA
CAGGCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGAAGATAACAGCAAGCTACTTG
AGATATTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTTGTTATCAGACTGTTTTGGTT
TCTTTGGTGTTTGCTGTCAAAACAAACAAGAGTTTTGGTTTAAGACAAGGCTATGTTGAG
ATCGTTCGTAAAACTATTTCAGATTCAGTATTTCTCT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR2G379JQ C 1
AF RR2G379TF U 1
AF RR2GN52JQ C 1
AF RR2GN52TF U 1
AF RR2DS21TF U 8
AF RR2CJ68JQ C 13
AF RR2CJ68TF U 13
AF RR2DS21JQ C 92
BS 1 588 RR2G379TF
BS 589 589 RR2GN52TF
BS 590 613 RR2G379TF
BS 614 636 RR2GN52TF
BS 637 637 RR2DS21JQ

RD RR2G379JQ 609 0 0
GGACCTTACGGAGTAGAGTCAGTCACATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGC
CGTTCCTTTGCTTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCTCA
GAGCGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCCAAGGGTATTGACTCCAG
GGTCAGAAGGAAGTTCAAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATTTGACAA
GAAGACCCGTCATTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGA
CCTCGAGTTGTTGATGATGCACAACAGGACTTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTC
CACCAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTTTCAGCTGGATATTGTTGTCACCAA
CAGGCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGAAGATAACAGCAAGCTACTTG
AGATATTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTTGTTATCAGACTGTTTTGGTT
TCTTTGGTGTTTGCTGTCAAAACAAACAAGAGTTTTGGTTTAAGACAAGGCTATGTTGAG
ATCGTTCGT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2G379TF 617 0 0
GGACCTTACGGAGTAGAGTCAGTCACATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGC
CGTTCCTTTGCTTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCTCA
GAGCGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCCAAGGGTATTGACTCCAG
GGTCAGAAGGAAGTTCAAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAA
GAAGACCCGTCATTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGA
CCTCGAGTTGTTGATGATGCACAACAGGACTTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTC
CACCAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTGGATATTGTTGTCACCAA
CAGGCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGAAGATAACAGCAAGCTACTTG
AGATATTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTTGTTATCAGACTGTTTTGGTT
TCTTTGGTGTTTGCTGTCAAAACAAACAAGAGTTTTGGTTTAAGACAAAGCTATGTTGAG
ATCGTTCGTAAAA
AAAA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2GN52JQ 636 0 0
GGACCTTACGGAGTAGATTCAGTCACATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGC
CGTTCCTTTGCTTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCTCA
GAGCGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCCAAGGGTATTGACTCCAG
GGTCAGAAGGAAGTTCAAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAA
GAAGACCCGTCATTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGA
CCTCGAGTTGTTGATGATGCACAACAGGACTTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTC
CACCAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTGGATATTGTTGTCACCAA
CAGGCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGAAGATAACAGCAAGCTACTTG
AGATATTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTTGTTATCAGACTGTTTTGGTT
TCTTTGGTGTTTGCTGTCAAAACAAACAAGAGTTTTGGTTTAAGACAAGGCTATGTTGAG
ATCGTTCGTAAAACTATTTCAGATTCAGTATTTCTC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2GN52TF 637 0 0
GGACCTTACGGAGTAGATTCAGTCACATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGC
CGTTCCTTTGCTTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCTCA
GAGCGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCCAAGGGTATTGACTCCAG
GGTCAGAAGGAAGTTCAAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAA
GAAGACCCGTCATTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGA
CCTCGAGTTGTTGATGATGCACAACAGGACTTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTC
CACCAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTGGATATTGTTGTCACCAA
CAGGCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGAAGATAACAGCAAGCTACTTG
AGATATTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTTGTTATCAGACTGTTTTGGTT
TCTTTGGTGTTTGCTGTCAAAACAAACAAGAGTTTTGGTTTAAGACAAGGCTATGTTGAG
ATCGTTCGTAAAACTATTTCAGATTCAGTATTTCTC
T

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2DS21TF 630 0 0
GG
GGAGTAGAGTCAGTCACATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGCCGTTCCTTT
GCTTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCTCAGAGCGACCG
CAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCCAAGGGTATTGACTCCAGGGTCAGAAG
GAAGTTCAAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCG
TCATTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGACCTCGAGTT
GTTGATGATGCACAACAGGACTTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCACCAAGAA
GAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTGGATATTGTTGTCACCAACAGGCTTGC
TAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGAAGATAACAGCAAGCTACTTGAGATATTTA
GTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTTGTTATCAGACTGTTTTGGTTTCTTTGGTG
TTTGCTGTCAAAACAAACAAGAGTTTTGGTTTAAGACAAGGCTATGTTGAGATCGTTCGT
AAAACTATTTCAGATTCAGTATTTCTC
T

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR2CJ68JQ 611 0 0
GG
AGAGTCAGTCACATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGCCGTTCCTTTGCTTA
CGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCTCAGAGCGACCGCAGAA
TCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCCAAGGGTATTGACTCCAGGGTCAGAAGGAAGT
TCAAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCGTCATT
ACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGACCTCGAGTTGTTGA
TGATGCACAACAGGACTTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCACCAAGAAGAGGA
AGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTGTATATTGTTGTCACCAATAGGCTTGCTAGGC
TCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGAAGATAACAGCAAGCTACTTGAGATATTTAGTTGT
TTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTTGTTATCAGACTGTTTTGGTTTCTTTGGTGTTTGC
TGTCAAAACAAACAAGAGTTTTGGTTTAAGACAAGGCTATGTTGAGATCGTTCGTAAAAC
TATTTCAG
C

QA 3 610 3 610
DS 

RD RR2CJ68TF 611 0 0
GG
AGAGTCAGTCACATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGCCGTTCCTTTGCTTA
CGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCTCAGAGCGACCGCAGAA
TCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCCAAGGGTATTGACTCCAGGGTCAGAAGGAAGT
TCAAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCGTCATT
ACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGACCTCGAGTTGTTGA
TGATGCACAACAGGACTTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCACCAAGAAGAGGA
AGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTGTATATTGTTGTCACCAATAGGCTTGCTAGGC
TCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGAAGATAACAGCAAGCTACTTGAGATATTTAGTTGT
TTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTTGTTATCAGACTGTTTTGGTTTCTTTGGTGTTTGC
TGTCAAAACAAACAAGAGTTTTGGTTTAAGACAAGGCTATGTTGAGATCGTTCGTAAAAC
TATTTCAG
C

QA 3 610 3 610
DS 

RD RR2DS21JQ 546 0 0
AAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCTCAGAGCGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGC
TGGAGGAGGCCCAAGGGTATTGACTCCAGGGTCAGAAGGAAGTTCAAGGGTGTCACCTTG
ATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCGTCATTACCTCCCCAATGGGTTC
AAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGACCTCGAGTTGTTGATGATGCACAACAGGACT
TACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCACCAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGA
GCTTCTCAGCTGGATATTGTTGTCACCAACAGGCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGAC
GAGTGAAGAAGATAACAGCAAGCTACTTGAGATATTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCATT
TCCCTTTTTGTTATCAGACTGTTTTGGTTTCTTTGGTGTTTGCTGTCAAAACAAACAAGA
GTTTTGGTTTAAGACAAGGCTATGTTGAGATCGTTCGTAAAACTATTTCAGATTCAGTAT
TTCTCT

QA 1 546 1 546
DS 



AS 4 14

CO CL221Contig1 807 2 9 U
GCTAAATTTTTGACTAATATTTGAGAAATAAAGAAACACACTGTATTGCATAAGCATCAA
AATTATTCAGATATGAGAATCAAAACAACAGTAGAAAACACAGGAAACTCAAAAAAATCA
GAACACAAAAGGCCATCCTTAAAGCTCTTTTCTCCATCCTCAGATTTTGTTGAAGGCAAC
AATGTCACAGCTCTGGACAAAATCATTGATTGGCTCGACGGTGAGCGTCTCTTCAATCAT
GGTGTCAACAGAAACGAGGTCGTCAACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATACC
GTAACCAACCGGTACAAGCTTTGACGCTCCCCAGAATAAACCTTCCATCTGGACGGATCT
CACAGCTTCCTCTAGCTTCTTCATGTCAGTCTCATCATCCCAAGGCTTGATATCAATCAA
GACTGATGACTTTCCAGATTCCTTCTTCTTAGTAGATGCCTTCACGGAAGCAGCTCTCTC
TTCAGCAGCTTTCTTCTCCTCTTCGGTCTCCTCACCGAAAAGGTCAACATCATCATCATC
ATCTTCCTCATCAGCCGCATCCTTAGAATCAGCTGCTGGTGGAGTAGCAACAGCCTCCTC
TGCGACTGGGACTGATCCCTCAACAATGACACCGCTTCCTTCAGCAGAGACACCAGAGAT
CCTCAAGAGGGCATCGATGTGGCTGTACCAACGAGATGCGTTGACATACTGTGAAGTTGG
GGGCTTAGCAAGAGCTGTAAAGACAGTGATGTCATCCTTTGAAGCCTGGTACCCAGTGAT
GTAACTGCGAGTGAGGAGATGCTCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX57JQ U 23
AF RR2DQ88JQ U 1
BS 1 190 RR2DQ88JQ
BS 191 191 RR2EX57JQ
BS 192 223 RR2DQ88JQ
BS 224 224 RR2EX57JQ
BS 225 252 RR2DQ88JQ
BS 253 253 RR2EX57JQ
BS 254 402 RR2DQ88JQ
BS 403 403 RR2EX57JQ
BS 404 807 RR2DQ88JQ

RD RR2EX57JQ 440 0 0
GGGAAATAAAGAAACACAC
TGTATTGCATAAGCATCAAAATTATTCAGATATGAGAATCAAAACAACAGTAGAAAACAC
AGGAAACTCAAAAAAATCAGAACACAAAAGGCCATCCTTAAAGCTCTTTTCTCCATCCTC
AGATTTTGTTGAAGGCAACAATGTCACAGCTCTGGACAAACTCATTGATTGGCTCGACGG
TGAGCGTCTCTTCAATCATGGTGTCAACAGAAACGAGGTCGTCAACAATGGTGCACATGA
TCTGCAACTTCTTGATACCGTAACCAACCGGTACAAGCTTTGACGCTCCCCAGAATAAAC
CTTCCATCTGGACGGATCTCACAGCTTCCTCTAGCTTCTTCATGTCAGTCTCATCATCCC
AAGGCTTGATATCAATCAAGACTGATGACTTTCCAGATTCCTTCTTCTTAGTAGATGCCT
T

QA 20 440 20 440
DS 

RD RR2DQ88JQ 807 0 0
GCTAAATTTTTGACTAATATTTGAGAAATAAAGAAACACACTGTATTGCATAAGCATCAA
AATTATTCAGATATGAGAATCAAAACAACAGTAGAAAACACAGGAAACTCAAAAAAATCA
GAACACAAAAGGCCATCCTTAAAGCTCTTTTCTCCATCCTCAGATTTTGTTGAAGGCAAC
AATGTCACAGTTCTGGACAAAATCATTGATTGGCTCGACGGTGGGCGTCTCTTCAATCAT
GGTGTCAACAGAGACGAGGTCGTCAACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATACC
GTAACCAACCGGTACAAGCTTTGACGCTCCCCAGAATAAACCTTCCATCTGGACGGATCT
CACAGCTTCCTCTAGCTTCTTCATGTCAGTCTCATCATCCCATGGCTTGATATCAATCAA
GACTGATGACTTTCCAGATTCCTTCTTCTTAGTAGATGCCTTCACGGAAGCAGCTCTCTC
TTCAGCAGCTTTCTTCTCCTCTTCGGTCTCCTCACCGAAAAGGTCAACATCATCATCATC
ATCTTCCTCATCAGCCGCATCCTTAGAATCAGCTGCTGGTGGAGTAGCAACAGCCTCCTC
TGCGACTGGGACTGATCCCTCAACAATGACACCGCTTCCTTCAGCAGAGACACCAGAGAT
CCTCAAGAGGGCATCGATGTGGCTGTACCAACGAGATGCGTTGACATACTGTGAAGTTGG
GGGCTTAGCAAGAGCTGTAAAGACAGTGATGTCATCCTTTGAAGCCTGGTACCCAGTGAT
GTAACTGCGAGTGAGGAGATGCTCGTC

QA 1 807 1 807
DS 



CO CL221Contig2 950 5 29 U
CAGCAAAATCACTCATTTGACATTTGTTGGAAAGTAGAAACATCAAGCAAATAACGAAAC
TGTCTTCTTCATAAATATCAAAATTAAACAGGAGATGCGGCAAACCATAGCAAAATCAAA
AACATGAGTCCACAAGAAACTTGGAAACAATAATCAGATTGCATGAGCGCTTCCTTAAAG
CAAAGATGCCATCCTCAGATTTTGTTGAAAGCAACAATGTCACAGCTCTGGACAAACTCA
TTGATTGGCTCGACGGTGAGAGTCTCTTCAATCATGGTGTCAACAGAGACGAGGTCGTCA
ACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATACCGTAACCAACCGGTACAAGCTTGGAT
GCTCCCCAGAATAAACCTTCCATCTGGACGGATCTCACAGCTTCCTCTAGCTTCTTCATG
TCAGTCTCATCATCCCATGGCTTGATATCAATCAAAACTGATGACTTTCCAGATTCCTTC
TTCTTTGTAGATGCCTTGACAGAAGCAGCTCTCTCTTCAGCAGCCTTCTTCTCCTCCTCG
GTCTCCTCTCCGAAAAGGTCAACATCATCATCATCCTCTTCATCAGCAGCATCCTTAGAA
TCAGCTGCAGGGGGAGTAGCAACGGCCTCTTCCACAACTGGGGCTGATCCCTCAACAATG
ACACCACTTCCCTCAGCAGAGACACCAGAGATCCTCAAGAGGGCATCGATGTGGTTGTAC
CAACGAGAAGCGTTCACATATTGCGAGGTTGGTGGCTTTGCAAGAGCAGCAAAGACAGTG
ATATCATCCTTGGAAGCCTGGTACCCAGTGATGTAACTGCGAGTGAGAAGATGCTCATCG
AGCTTCTTCAATCCAGCTTCAGTGTTAAGGTTGGGAAAGGCAGCCATTATCCTCTAAAAG
CTCGAACCTGAGTTACAAGGAGACTTGAAGATGAGCGACGGAGGCGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 15 15 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2CH96JQ U 44
AF RR2GC27JQ U 1
AF RR2AR29JQ U 54
AF RR2AR29TF C 64
AF RR2CH96TF C 339
BS 1 96 RR2GC27JQ
BS 97 98 RR2CH96JQ
BS 99 260 RR2GC27JQ
BS 261 261 RR2CH96JQ
BS 262 287 RR2GC27JQ
BS 288 288 RR2CH96JQ
BS 289 347 RR2GC27JQ
BS 348 348 RR2CH96JQ
BS 349 368 RR2GC27JQ
BS 369 369 RR2AR29JQ
BS 370 400 RR2GC27JQ
BS 401 401 RR2CH96JQ
BS 402 458 RR2GC27JQ
BS 459 459 RR2CH96JQ
BS 460 461 RR2GC27JQ
BS 462 462 RR2CH96JQ
BS 463 488 RR2GC27JQ
BS 489 489 RR2CH96JQ
BS 490 497 RR2GC27JQ
BS 498 498 RR2CH96JQ
BS 499 551 RR2GC27JQ
BS 552 552 RR2CH96JQ
BS 553 596 RR2GC27JQ
BS 597 597 RR2CH96JQ
BS 598 608 RR2GC27JQ
BS 609 679 RR2AR29JQ
BS 680 722 RR2AR29TF
BS 723 723 RR2CH96TF
BS 724 950 RR2AR29TF

RD RR2CH96JQ 554 0 0
CAAGCAAATAACGAAACTGTCTTCTTCATAAATATCAAAATTAAACAGGAGATGCGGCAA
ACCATAGCAAAATCAAAAACATGAGTCCACAAGAAACTTGGAAACAATAATCAAATTGCA
TGAGCGCTTCCTTAAAGCAAAGATGCCATCCTCAGATTTTGTTGAAAGCAACAATGTCAC
AGCTCTGGACAAACTCATTGATTGGCTCGACGGTGAGAGTCTCTTCAATCATGGTGTCAA
CAGAGACGAGGTCGTCAACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATACCGTAACCAA
CCGGTACAAGCTTGGATGCTCCCCAAAATAAACCTTCCATCTGGACGGATCTCACAGCTT
CCTCTAGCTTCTTCATGTCAGTCTCATCATCCCATGGCTGGATATCAATCAAAACTGATG
ACTTTCCAGATTCCTTCTTCTTTGTAGATGCCTTGACAGAAGCAGCTCTCTCTTCAGCAG
CCTTCTTCTCCTCCTCGGTCTCCTCTCCGAAAAGGTCAACATCATCATCATCCTCTTCAT
CAGCAGCATCCTTA

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2GC27JQ 608 0 0
CAGCAAAATCACTCATTTGACATTTGTTGGAAAGTAGAAACATCAAGCAAATAACGAAAC
TGTCTTCTTCATAAATATCAAAATTAAACAGGAGATAAGGCAAACCATAGCAAAATCAAA
AACATGAGTCCACAAGAAACTTGGAAACAATAATCAGATTGCATGAGCGCTTCCTTAAAG
CAAAGATGCCATCCTCAGATTTTGTTGAAAGCAACAATGTCACAGCTCTGGACAAACTCA
TTGATTGGCTCGACGGTGAGCGTCTCTTCAATCATGGTGTCAACAGAAACGAGGTCGTCA
ACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATACCGTAACCAACCGGGACAAGCTTGGAT
GCTCCCCAAAATAAACCTTCCATCTGGACGGATCTCACAGGTTCCTCTAGCTTCTTCATG
TCAGTCTCATCATCCCATGGCTTGATATCAATCAAAACAGACGACTTTCCAGATTCCTTC
TTCTTTGTGGATGCCTTTACAGAAGCAGCTCTCTCTTCAGCAGCCTTCTTCTCCTCCTCG
GTCTCCTCTCCAAAAAGGTCAACATCATCATCATCCTCTTCATCAGCAGCATCCTTGGAA
TCAGCTGC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2AR29JQ 626 0 0
G
CGAAACTGTCTTCTTCATAAATATCAAAATTAAACAGGAGATGCGGCAAACCATAGCAAA
ATCAAAAACATGAGTCCACAAGAAACTTGGAAACAATAATCAGATTGCATGAGCGCTTCC
TTAAAGCAAAGATGCCATCCTCAGATTTTGTTGAAAGCAACAATGTCACAGCTCTGGACA
AACTCATTGATTGGCTCGACGGTGAGAGTCTCTTCAATCATGGTGTCAACAGAGACGAGG
TCGTCAACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATACCGTAACCAACCGGTACAAGC
TTGGATGCTCCCCAGAATAAACCTTCCATCTGGACGGATCTCACAGCTTCCTCTAGCTTC
TTCATGTCAGTCTCATCATCCCATGGCTTGATATCAATCAAAACTGATGACTTTCCAGAT
TCCTTCTTCTTTGTAGATGCCTTGACAGAAGCAGCTCTCTCTTCAGCAGCCTTCTTCTCC
TCCTCGGTCTCCTCTCCGAAAAGGTCAACATCATCATCATCCTCTTCATCAGCAGCATCC
TTAGAATCAGCTGCAGGGGGAGTAGCAACGGCCTCTTCCACAACTGGGGCTGATCCCTCA
ACAATGACACCACTTCCCTCAGCAG

QA 2 626 2 626
DS 

RD RR2AR29TF 887 0 0
CTTCTTCATAAATATCAAA*TTAAACAG*AGATGCG*CAAACCATAGCAAA*TCAAAA*C
ATGAGTC*ACA*GAAACTTGGAAACAATAATCAGATTGCATGAGCGCTTC*TTAAAGCAA
AGATGCCATCCTCAGATTTTGTTGAAAGCAACAATGTCACAGCTCTGGACAAACTCATTG
ATTGGCTCGACGGTGAGAGTCTCTTCAATCATGGTGTCAACAGAGACGAGGTCGTCAACA
ATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATACCGTAACCAACCGGTACAAGCTTGGATGCT
CCCCAGAATAAACCTTCCATCTGGACGGATCTCACAGCTTCCTCTAGCTTCTTCATGTCA
GTCTCATCATCCCATGGCTTGATATCAATCAAAACTGATGACTTTCCAGATTCCTTCTTC
TTTGTAGATGCCTTGACAGAAGCAGCTCTCTCTTCAGCAGCCTTCTTCTCCTCCTCGGTC
TCCTCTCCGAAAAGGTCAACATCATCATCATCCTCTTCATCAGCAGCATCCTTAGAATCA
GCTGCAGGGGGAGTAGCAACGGCCTCTTCCACAACTGGGGCTGATCCCTCAACAATGACA
CCACTTCCCTCAGCAGAGACACCAGAGATCCTCAAGAGGGCATCGATGTGGTTGTACCAG
CGAGAAGCGTTCACATATTGCGAGGTTGGTGGCTTTGCAAGAGCAGCAAAGACAGTGATA
TCATCCTTGGAAGCCTGGTACCCAGTGATGTAACTGCGAGTGAGAAGATGCTCATCGAGC
TTCTTCAATCCAGCTTCAGTGTTAAGGTTGGGAAAGGCAGCCATTATCCTCTAAAAGCTC
GAACCTGAGTTACAAGGAGACTTGAAGATGAGCGACGGAGGCGAGCC

QA 1 887 1 887
DS 

RD RR2CH96TF 612 0 0
ACCAACCGGTACAAGCTTGGATGCTCCCCAGAATAAACCTTCCATCTGGACGGATCTCAC
AGCTTCCTCTAGCTTCTTCATGTCAGTCTCATCATCCCATGGCTGGATATCAATCAAAAC
TGATGACTTTCCAGATTCCTTCTTCTTTGTAGATGCCTTGACAGAAGCAGCTCTCTCTTC
AGCAGCCTTCTTCTCCTCCTCGGTCTCCTCTCCGAAAAGGTCAACATCATCATCATCCTC
TTCATCAGCAGCATCCTTAGAATCAGCTGAAGGGGGAGTAGCAACGGCCTCTTCCACAAC
TGGGGCTGATCCCTCAACAATGACACCACTTCCCTCAGCAGAGACACCAGAGATCCTCAA
GAGGGCATCGATGTGGTTGTACCAACGAGAAGCGTTCACATATTGCGAGGTTGGTGGCTT
TGCAAGAGCAGCAAAGACAGTGATATCATCCTTGGAAGCCTGGTACCCAGTGATGTAACT
GCGAGTGAGAAGATGCTCATCGAGCTTCTTCAATCCAGCTTCAGTGTTAAGGTTGGGAAA
GGCAGCCATTATCCTCTAAAAGCTCGAACCTGAGTTACAAGGAGACTTGAAGATGGGCGA
CGGAGGCGAGCC

QA 1 612 1 612
DS 



CO CL221Contig3 905 5 33 U
GGCCTCTTCTTCCTCTTCAAGTCCGCCGTTGCAACTCAGTGATAAAGGCTCGAGCTTTGG
AAGACAATGGCTGCTTCTTTCCCCAACCTT*AACTCTGATTCTGGATTGAAGAAGCTCGA
CGAGCATCTCCTCACTCGCAGTTACATCACTGGGTACCAGGCTTCAAAGGATGACATCAC
TGTCTTTACAGCTCTTGCAAAGCCCCC*AACTTCACAGTATGTCAACGCGTCTCGTTGGT
ACAGCCACATCGATGCCCTCTTGAGGATCTCTGGTGTCTCTGCTGAAGGAAGCGGTGTCA
TTGTTGAGGGATCAGCCCCAGTCGCAGAGGAGGCTGTTGCTACTCCCCCTGCAGCTGATT
CTAAGGATGCGGCTGATGAGGAAGATGATGATGATG***TTGATCTTTTCGGTGAGGAGA
CCGAAGAGGAGAAGAAAGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCCGTGAAAGCATCTACTAAGA
AGAAGGAATCTGGAAAGTCATCAGTTTTGATTGATATCAAGCCATGGGATGATGAGACTG
ACATGAAGAAGCTAGAGGAAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAGGATTATTCTGGGG*A
GCGTCAAAGCTTGTACCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAGTTGCAGATCATGTGCACCATT
GTTGACGACCTCGTCTCTGTTGACACCATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCGAGCCAATC
AATGAGTTTGTCTAGAGCTGTGACATTGTTGCCTTCAACAAAATCTGAGGATGGAGAAAA
GAGCTTAAGGATGGCCTTTGTGTGTTTTGATTTTTTGAGTTTCCTCTGTTTTCTACTCTT
TGTTTTGATTCTGATATCTGAATAATTTCGATGCTTATGCAATACATTTCTTTATATCTC
AAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ88TF U 8
AF RR2EM68TF U 22
AF RR2GV85TF U 1
AF RR2AO50TF U 22
AF RR2AO50JQ C 19
BS 1 198 RR2GV85TF
BS 199 199 RR2AO50TF
BS 200 229 RR2GV85TF
BS 230 230 RR2AO50TF
BS 231 315 RR2GV85TF
BS 316 316 RR2AO50TF
BS 317 346 RR2GV85TF
BS 347 347 RR2AO50TF
BS 348 349 RR2GV85TF
BS 350 350 RR2AO50TF
BS 351 403 RR2GV85TF
BS 404 404 RR2AO50TF
BS 405 466 RR2GV85TF
BS 467 467 RR2AO50TF
BS 468 505 RR2GV85TF
BS 506 506 RR2AO50TF
BS 507 584 RR2GV85TF
BS 585 585 RR2AO50TF
BS 586 586 RR2GV85TF
BS 587 587 RR2AO50TF
BS 588 628 RR2GV85TF
BS 629 629 RR2AO50TF
BS 630 686 RR2GV85TF
BS 687 687 RR2AO50TF
BS 688 732 RR2GV85TF
BS 733 733 RR2AO50TF
BS 734 742 RR2GV85TF
BS 743 769 RR2AO50TF
BS 770 770 RR2AO50JQ
BS 771 789 RR2AO50TF
BS 790 790 RR2AO50JQ
BS 791 858 RR2AO50TF
BS 859 905 RR2AO50JQ

RD RR2DQ88TF 617 0 0
GGTTCCT
CTTCAAGTCCGCCGTTGCAACTCAGTGATAAAGGCTCGAGCTTTGGAAGACAATGGCTGC
TTCTTTCCCCAACCTT*AACTCTGATTCTGGATTGAAGAAGCTCGACGAGCATCTCCTCA
CTCGCAGTTACATCACTGGGTACCAGGCTTCAAAGGATGACATCACTGTCTTTACAGCTC
TTGCTAAGCCCCC*AACTTCACAGTATGTCAACGCATCTCGTTGGTACAGCCACATCGAT
GCCCTCTTGAGGATCTCTGGTGTCTCTGCTGAAGGAAGCGGTGTCATTGTTGAGGGATCA
GTCCCAGTCGCAGAGGAGGCTGTTGCTACTCCACCAGCAGCTGATTCTAAGGATGCGGCT
GATGAGGAAGATGATGATGATGATGTTGACCTTTTCGGTGAGGAGACCGAAGAGGAGAAG
AAAGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCCGTGAAGGCATCTACTAAGAAGAAGGAATCTGGA
AAGTCATCAGTCTTGATTGATATCAAGCCATGGGATGATGAGACTGACATGAAGAAGCTA
GAGGAAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAAGTTTATTCTGGGG*AGCGTCAAAGCTTGT
ACCGGTTGGT

QA 8 617 8 617
DS 

RD RR2EM68TF 691 0 0
TCCGCCGTTGCAACTCAGTGATAAAGGCTCGAGCTTTGGAAGACAATGGCTGCTTCTTTC
CCCAACCTT*AACTCTGATTCTGGATTGAAGAAGCTCGACGAGCATCTCCTCACTCGCAG
TTACATCACTGGGTACCAGGCTTCAAAGGATGACATCACTGTCTTTACAGCTCTTGCAAA
GCCCCC*AACTTCACAGTATGTCAACGCGTCTCGTTGGTACAGCCACATCGATGCCCTCT
TGAGGATCTCTGGTGTCT**GCTGAAGGAAGCGGTGTCATTGTTGAGGGATCAGCCCCAG
TCGCAGAGGAGGCTGTTGCTACTCCCCCTGCAGCTGATTCTAAGGATGCGGCTGATGAGG
AAGATGATGATGATG***TTGATCTTTTCGGTGAGGAGACCGAAGAGGAGAAGAAAGCTG
CTGAAGAGAGAGCTGCTTCCGTGAAAGCATCTACTAAGAAGAAGGAATCTGGAAAGTCAT
CAGTTTTGATTGATATCAAGCCATGGGATGATGAGACTGACATGAAGAAGCTAGAGGAAG
CTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAGGATTATTCTGGGG*AGCGTCAAAGCTTGTACCGGTT
GGTTACG*TATCAAGAAGTTGCAGATCATGTTCACCATTGTTGACGACCTCGTCTCTGTT
GACACCATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2GV85TF 742 0 0
GGCCTCTTCTTCCTCTTCAAGTCCGCCGTTGCAACTCAGTGATAAAGGCTCGAGCTTTGG
AAGACAATGGCTGCTTCTTTCCCCAACCTT*AACTCTGATTCTGGATTGAAGAAGCTCGA
CGAGCATCTCCTCACTCGCAGTTACATCACTGGGTACCAGGCTTCAAAGGATGACATCAC
TGTCTTTACAGCTCTTGCTAAGCCCCC*AACTTCACAGTATGTCAACGCATCTCGTTGGT
ACAGCCACATCGATGCCCTCTTGAGGATCTCTGGTGTCTCTGCTGAAGGAAGCGGTGTCA
TTGTTGAGGGATCAGTCCCAGTCGCAGAGGAGGCTGTTGCTACTCCACCAGCAGCTGATT
CTAAGGATGCGGCTGATGAGGAAGATGATGATGATG***TTGACCTTTTCGGTGAGGAGA
CCGAAGAGGAGAAGAAAGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCCGTGAAGGCATCTACTAAGA
AGAAGGAATCTGGAAAGTCATCAGTCTTGATTGATATCAAGCCATGGGATGATGAGACTG
ACATGAAGAAGCTAGAGGAAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAAGTTTATTCTGGGG*A
GCGTCAAAGCTTGTACCGGTTGGTTACG*TATCAAGAAGTTGCAGATCATGTGCACCATT
GTTGACGACCTCGTCTCTGTTGACAC*ATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCGAGCCAATC
AATGAGTTTGTC*AGAGCTGTG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2AO50TF 837 0 0
TCCGCCGTTGCAACTCAGTGATAAAGGCTCGAGCTTTGGAAGACAATGGCTGCTTCTTTC
CCCAACCTT*AACTCTGATTCTGGATTGAAGAAGCTCGACGAGCATCTCCTCACTCGCAG
TTACATCACTGGGTACCAGGCTTCAAAGGATGACATCACTGTCTTTACAGCTCTTGCAAA
GCCCCC*AACTTCACAGTATGTCAACGCGTCTCGTTGGTACAGCCACATCGATGCCCTCT
TGAGGATCTCTGGTGTCTCTGCTGAAGGAAGCGGTGTCATTGTTGAGGGATCAGCCCCAG
TCGCAGAGGAGGCTGTTGCTACTCCCCCTGCAGCTGATTCTAAGGATGCGGCTGATGAGG
AAGATGATGATGATG***TTGATCTTTTCGGTGAGGAGACCGAAGAGGAGAAGAAAGCTG
CTGAAGAGAGAGCTGCTTCCGTGAAAGCATCTACTAAGAAGAAGGAATCTGGAAAGTCAT
CAGTTTTGATTGATATCAAGCCATGGGATGATGAGACTGACATGAAGAAGCTAGAGGAAG
CTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAGGATTATTCTGGGGGAGCGTCAAAGCTTGTACCGGTT
GGTTACGGTATCAAGAAGTTGCAGATCATGTGCACCATTGTTGACGACCTCGTCTCTGTT
GACACCATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCGAGCCAATCAATGAGTTTGTCTAGAGCTGT
GACATTGTTGCCTTCAACAAAATCTGAG*ATGGAGAAAAGAGCTTAAG*ATGGCCTTTGT
GTGTTTTGATTTTTTGAGTTTCCTCTGTTTTCTACTCTTTGTTTTGATTCTGATATC

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR2AO50JQ 887 0 0
AAGTCCGCCGTTGCAACTCAGTGATAAAGGCTCGAGCTTTGGAAGACAATGGCTGCTTCT
TTCCCCAACCTTTAACTCTGATTCTGGATTGAAGAAGCTCGACGAGCATCTCCTCACTCG
CAGTTACATCACTGGGTACCAGGCTTCAAAGGATGACATCACTGTCTTTACAGCTCTTGC
AAAGCCCCCCAACTTCACAGTATGTCAACGCGTCTCGTTGGTACAGCCACATCGATGCCC
TCTTGAGGATCTCTGGTGTCTCTGCTGAAGGAAGCGGTGTCATTGTTGAGGGATCAGCCC
CAGTCGCAGAGGAGGCTGTTGCTACTCCCCCTGCAGCTGATTCTAAGGATGCGGCTGATG
AGGAAGATGATGATGATG***TTGATCTTTTCGGTGAGGAGACCGAAGAGGAGAAGAAAG
CTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCCGTGAAAGCATCTACTAAGAAGAAGGAATCTGGAAAGT
CATCAGTTTTGATTGATATCAAGCCATGGGATGATGAGACTGACATGAAGAAGCTAGAGG
AAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAGGATTATTCTGGGG*AGCGTCAAAGCTTGTACCG
GTTGGTTACGGTATCAAGAAGTTGCAGATCATGTGCACCATTGTTGACGACCTCGTCTCT
GTTGACACCATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCGAGCCAATCAATGAGTTTGTCTAGAGC
TGTGACATTGTTGCCTTCAACAAAATCTGAGGATGGAGAAAAGAGCTTAAGGATGGCCTT
TGTGTGTTTTGATTTTTTGAGTTTCCTCTGTTTTCTACTCTTTGTTTTGATTCTGATATC
TGAATAATTTCGATGCTTATGCAATACATTTCTTTATATCTCAAATA

QA 1 887 1 887
DS 



CO CL221Contig4 737 2 3 U
GGCTCGCCTCCGTCGCTCATCTTCAAGTCTCCTTGTAACTCAGGTTCGAGCTTTCAGAGA
GTAATGGCTGCCTTCCCCAACCTTAACACTGAAGCTGGATTGAAGAAGCTCGACGAGCAT
CTTCTCACTCGCAGTTACATCACTGGGTACCAGGCTTCCAAGGATGATATCACTGTCTTT
GCTGCCCTTGCAAAGCCACCAACCTCGCAGTATGTGAACGCTTCTCGTTGGTACAACCAC
ATCGATGCCCTCCTGAGGATCTCTGGTGTCTCTGCTGAGGGAAGTGGTGTCATTGTTGAG
GGATCAGCTCCAGTTGTGGAAGAGGCTATTGCTACTCCTCCTGCAGCTGATTCCAAGGAT
GCTGCTGATGAAGAGGATGATGATGATGTTGACCTTTTTGGAGAGGAGACCGAGGAGGAG
AAGAAGGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCTGTAAAGGCATCCACAAAGAAGAAGGAATCT
GGAAAGTCGTCTGTTTTGATTGATATCAAGCCATGGGATGATGAGACTGACATGAAGAAG
CTAGAGGAAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAGGTTTATTCTGGGGAGCATCCAAGCTT
GTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAGTTGCGGATCATGTGCACCATTGTTGACGACCTC
GTCTCTGTTGACACATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCGAGCAATCAATGAGTTTGTCAG
AGCTGCGACATTGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC27TF U 63
AF RR2H332TF U 1
BS 1 185 RR2H332TF
BS 186 186 RR2GC27TF
BS 187 737 RR2H332TF

RD RR2GC27TF 144 0 0
AATGGCTGCCTTCCCCAACCTTAACACTGAA*CTGGATTGAAGAAGCTCGACGAGCATCT
TCTCACTCGCAGTTACATCACTGGGTACCAGGCTTCCAAGGATGATATCACTGTCTTTGC
TGCCCTTGCAAAGCCACCAACCTC

QA 1 144 1 144
DS 

RD RR2H332TF 737 0 0
GGCTCGCCTCCGTCGCTCATCTTCAAGTCTCCTTGTAACTCAGGTTCGAGCTTTCAGAGA
GTAATGGCTGCCTTCCCCAACCTTAACACTGAAGCTGGATTGAAGAAGCTCGACGAGCAT
CTTCTCACTCGCAGTTACATCACTGGGTACCAGGCTTCCAAGGATGATATCACTGTCTTT
GCTGCTCTTGCAAAGCCACCAACCTCGCAGTATGTGAACGCTTCTCGTTGGTACAACCAC
ATCGATGCCCTCCTGAGGATCTCTGGTGTCTCTGCTGAGGGAAGTGGTGTCATTGTTGAG
GGATCAGCTCCAGTTGTGGAAGAGGCTATTGCTACTCCTCCTGCAGCTGATTCCAAGGAT
GCTGCTGATGAAGAGGATGATGATGATGTTGACCTTTTTGGAGAGGAGACCGAGGAGGAG
AAGAAGGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCTGTAAAGGCATCCACAAAGAAGAAGGAATCT
GGAAAGTCGTCTGTTTTGATTGATATCAAGCCATGGGATGATGAGACTGACATGAAGAAG
CTAGAGGAAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAGGTTTATTCTGGGGAGCATCCAAGCTT
GTCCCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAGTTGCGGATCATGTGCACCATTGTTGACGACCTC
GTCTCTGTTGACACATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCGAGCAATCAATGAGTTTGTCAG
AGCTGCGACATTGTTGC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 2 14

CO CL222Contig1 1119 5 31 U
GGACAAGAGCCTCTCCCAAACAGCCATTGTCGAACACGACGCAGACAGTAAGCAAAGAAA
CCCAGAAACAATCTTCTTACATGGCTGAAATCTCGGCGACTTCGTTTCCTTCTGCCTCGT
CATCTGCTCTCGCGCTTCGCAGCTCACCCAATGCTAGCTTAAGATGTCAGAATGTAGCTT
GTCCAAGAACCACTTCCTCCTCCTTTCAAGAGTTGTCTGTGAGACGAAGCCAGCTTGTTG
GCAATGCTATTGCTACTAGTCATGTTCCCGCAACCCGGGTCTGCAAGAATCAAGCTATTC
GAGCTGTTATGTCTGGTGGTGATGGACAGACTGTCCTGGCTGCTGATTCAAAGGGTGCCG
AAGCAGGGCTTCGTGGCAAACTGAAGAAAGTCGTTCTAGCTTACAGTGGAGGCTTAGACA
CCTCTGTCATCGTGCCATGGCTTAAGGAAAACTATGGCTGTGAAGTTGTATGTTTCACCG
CTGATGTTGGTCAGGGAATAAAAGAGTTGGATGGTTTGGAACAAAAGGCTAAGGCTAGTG
GTGCTTCTCAGTTGGTTGTTAAGGATCTCACCGAGGAGTTTGTTAAAGATTACATATTCC
CTTGTCTCAGAGCTGGTGCCATCTACGAACGAAAATACTTGCTTGGTACCTCCATGGCTC
GACCTGTCATTGCTAAGGCCATGGTAGATGTAGCTGCTGAGGTTGGAGCTGATGCTGTTG
CTCATGGGTGTACTGGTAAAGGAAATGACCAGGTTCGGTTTGAGCTCACCTTCTTTTCGT
TAAACCCTGAACTCAAAGTTGTGGCACCATGGAGAGAATGGGAAATCCAAGGCAGAGAAG
ACGCTATTGAGTATGCCAAGAAGCATAACGTTCCTGTCCCCGTGACGAAGAAATCTGTTT
ACAGCAGGGACAGGAACCTCTGGCACCTTAGTCACGAGGGTGATATATTGGAAGATCCAG
CTAACGAGACCAAGAAAGATATGTACATGATGAGTGTAGACCCCGAAGATGCTCCTGATA
AGCCTGAATACATCGAGATCGGGATAGAATCTGGACTTCCAGTGGCACTAAACGGGAAAG
GCACTCTCTCCAGCAACCCTTCTCTCTGAGCTAAACACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO69TF U 1
AF RR2EZ68TF U 41
AF RR2E372TF U 32
AF RR2CE65TF U 24
AF RR2AR16TF U 386
BS 1 62 RR2AO69TF
BS 63 63 RR2CE65TF
BS 64 65 RR2AO69TF
BS 66 66 RR2CE65TF
BS 67 115 RR2AO69TF
BS 116 116 RR2CE65TF
BS 117 124 RR2AO69TF
BS 125 125 RR2CE65TF
BS 126 216 RR2AO69TF
BS 217 217 RR2CE65TF
BS 218 277 RR2AO69TF
BS 278 278 RR2CE65TF
BS 279 317 RR2AO69TF
BS 318 320 RR2CE65TF
BS 321 335 RR2AO69TF
BS 336 336 RR2CE65TF
BS 337 361 RR2AO69TF
BS 362 364 RR2CE65TF
BS 365 466 RR2AO69TF
BS 467 467 RR2CE65TF
BS 468 469 RR2AO69TF
BS 470 470 RR2CE65TF
BS 471 481 RR2AO69TF
BS 482 482 RR2CE65TF
BS 483 673 RR2AO69TF
BS 674 677 RR2CE65TF
BS 678 678 RR2AR16TF
BS 679 701 RR2CE65TF
BS 702 702 RR2AR16TF
BS 703 736 RR2CE65TF
BS 737 1119 RR2AR16TF

RD RR2AO69TF 673 0 0
GGACAAGAGCCTCTCCCAAACAGCCATTGTCGAACACGACGCAGACAGTAAGCAAAGAAA
CCTAGTAACAATCTTCTTACATGGCTGAAATCTCGGCGACTTCGTTTCCTTCTGCTTCGT
CATCGGCTCTCGCGCTTCGCAGCTCACCCAATGCTAGCTTAAGATGTCAGAATGTAGCTT
GTCCAAGAACCACTTCCTCCTCCTTTCAAGAGTTGTTTGTGAGACGAAGCCAGCTTGTTG
GCAATGCTATTGCTACTAGTCATGTTCCCGCAACCCGCGTCTGCAAGAATCAAGCTATTC
GAGCTGTTATGTCTGGT***GATGGACAGACTGTCGTGGCTGCTGATTCAAAGGGTGCCG
A***AGGGCTTCGTGGCAAACTGAAGAAAGTCGTTCTAGCTTACAGTGGAGGCTTAGACA
CCTCTGTCATCGTGCCATGGCTTAAGGAAAACTATGGCTGTGAAGTCGTGTGTTTCACCG
CAGATGTTGGTCAGGGAATAAAAGAGTTGGATGGTTTGGAACAAAAGGCTAAGGCTAGTG
GTGCTTCTCAGTTGGTTGTTAAGGATCTCACCGAGGAGTTTGTTAAAGATTACATATTCC
CTTGTCTCAGAGCTGGTGCCATCTACGAACGAAAATACTTGCTTGGTACCTCCATGGCTC
GACCTGTCATTGC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2EZ68TF 634 0 0
GG
AGACAGTAAGCAAAGAAACCCAGAAACAATCTTCTTACATGGCTGAAATCTCGGCGACTT
CGTTTCCTTCTGCCTCGTCATCTGCTCTCGCGCTTCGCAGCTCACCCAATGCTAGCTTAA
GATGTCAGAATGTAGCTTGTCCAAGAACCACTTCCTCCTCCTTTCAAGAGTTGTCTGTGA
GACGAAGCCAGCTTGTTGGCAATGCTATTGCTACTAGTCATGTTCCCGCAACCCGGGTCT
GCAAGAATCAAGCTATTCGAGCTGTTATGTCTGGTGGTGATGGACAGACTGTCCTGGCTG
***ATTCAAAGGGTGCCGAAGCAGGGCTTCGTGGCAAACTGAAGAAAGTCGTTCTAGCTT
ACAGTGGAGGCTTAGACACCTCTGTCATCGTGCCATGGCTTAAGGAAAACTATGGCTGTG
AAGTTGTATGTTTCACCGCTGATGTTGGTCAGGGAATAAAAGAGTTGGATGGTTTGGAAC
AAAAGGCTAAGGCTAGTGGTGCTTCTCAGTTGGTTGTTAAGGATCTCACCGAGGAGTTTG
TTAAAGATTACATATTCCCTTGTCTCAGAGCTGGTGCCATCTACGAACGAAAATACTTGC
TTGGTACCTCCATGGCTCGACCTGTCATTGCT

QA 3 634 3 634
DS 

RD RR2E372TF 642 0 0
GA
ACACGACGCAGACAGTAAGCAAAGAAACCCAGAAACAATCTTCTTACATGGCTGAAATCT
CGGCGACTTCGTTTCCTTCTGCCTCGTCATCTGCTCTCGCGCTTCGCAGCTCACCCAATG
CTAGCTTAAGATGTCAGAATGTAGCTTGTCCAAGAACCACTTCCTCCTCCTTTCAAGAGT
TGTCTGTGAGACGAAGCCAGCTTGTTGGCAATGCTATTGCTACTAGTCATGTTCCCGCAA
CCCGGGTCTGCAAGAATCAAGCTATTCGAGCTGTTATGTCTGGTGGTGATGGACAGACTG
TCCTGGCTGCTGATTCAAAGGGTGCCGAAGCAGGGCTTCGTGGCAAACTGAAGAAAGTCG
TTCTAGCTTACAGTGGAGGCTTAGACACCTCTGTCATCGTGCCATGGCTTAAGGAAAACT
ATGGCTGTGAAGTTGTATGTTTCACCGCTGATGTTGGTCAGGGAATAAAAGAGTTGGATG
GTTTGGAACAAAAGGCTAAGGCTAGTGGTGCTTCTCAGTTGGTTGTTAAGGATCTCACCG
AGGAGTTTGTTAAAGATTACATATTCTCTTGTCTCAGAGCTGGTGCCATCTACGAACGAA
AATACTTGCTTGGTACCTCCATGGCTCGACCTGTCATTGC

QA 3 642 3 642
DS 

RD RR2CE65TF 713 0 0
GG
ATTGTCGAACACGACGCAGACAGTAAGCAAAGAAACCCAGAAACAATCTTCTTACATGGC
TGAAATCTCGGCGACTTCGTTTCCTTCTGCCTCGTCATCTGCTCTCGCGCTTCGCAGCTC
ACCCAATGCTAGCTTAAGATGTCAGAATGTAGCTTGTCCAAGAACCACTTCCTCCTCCTT
TCAAGAGTTGTCTGTGAGACGAAGCCAGCTTGTTGGCAATGCTATTGCTACTAGTCATGT
TCCCGCAACCCGGGTCTGCAAGAATCAAGCTATTCGAGCTGTTATGTCTGGTGGTGATGG
ACAGACTGTCCTGGCTGCTGATTCAAAGGGTGCCGAAGCAGGGCTTCGTGGCAAACTGAA
GAAAGTCGTTCTAGCTTACAGTGGAGGCTTAGACACCTCTGTCATCGTGCCATGGCTTAA
GGAAAACTATGGCTGTGAAGTTGTATGTTTCACCGCTGATGTTGGTCAGGGAATAAAAGA
GTTGGATGGTTTGGAACAAAAGGCTAAGGCTAGTGGTGCTTCTCAGTTGGTTGTTAAGGA
TCTCACCGGGGAGTTTGTTAAAGATTACATATTCTCTTGTCTCAGAGCTGGTGCCATCTA
CGAACGAAAATACTTGCTTGGTACCTCCATGGCTCGACCTGTCATTGCTAAG*CCATGGT
AGATGTAGCTGCTGAG*TTGGAGCTGATGCTGTTGCTCATGGGTGTACTGG

QA 3 713 3 713
DS 

RD RR2AR16TF 734 0 0
GAAAGTCGTTCTAGCTTACAGTGGGGTCTTAGACACCTCTGTCATCGTGCCATGGCTTAA
GGAAAACTATGGCTGTGAAGTTGTGTGTTTCACCGCAGATGTTGGTCAGGGAATAAAAGA
GTTGGATGGTTTGGAACAAAAGGCTAAGGCTAGTGGTGCTTCTCAGTTGGTTGTTAAGGA
TCTCACCGAGGAGTTTGTTAAAGATTACATATTCCCTTGTCTCAGAGCTGGTGCCATCTA
CGAACGAAAATACTTGCTTGGTACCTCCATGGCTCGACCTGTCATTGCTAAGGCCATGGT
AGATGTAGCTGCTGAGGTTGGAGCTGATGCTGTTGCTCATGGGTGTACTGGTAAAGGAAA
TGACCAGGTTCGGTTTGAGCTCACCTTCTTTTCGTTAAACCCTGAACTCAAAGTTGTGGC
ACCATGGAGAGAATGGGAAATCCAAGGCAGAGAAGACGCTATTGAGTATGCCAAGAAGCA
TAACGTTCCTGTCCCCGTGACGAAGAAATCTGTTTACAGCAGGGACAGGAACCTCTGGCA
CCTTAGTCACGAGGGTGATATATTGGAAGATCCAGCTAACGAGACCAAGAAAGATATGTA
CATGATGAGTGTAGACCCCGAAGATGCTCCTGATAAGCCTGAATACATCGAGATCGGGAT
AGAATCTGGACTTCCAGTGGCACTAAACGGGAAAGGCACTCTCTCCAGCAACCCTTCTCT
CTGAGCTAAACACA

QA 1 734 1 734
DS 



CO CL222Contig2 1080 9 7 U
GTGATAAAACTGTGATTAAATTGTTAATGCAACCTAAGTTACATCATTCACAGTAACACA
TTATTCAATTTATTGAAAAATAACAACAATTATTCCGGAAGCTAGACGCCATCAAATGTT
TGAACACAACAAGAGATCTTTACTGTCATGCAAATAAACTCTCAACTCCAACAAGAAGAC
ACTGTTGGTGAAACCCTTCCTCTCTAGATACCTTTCTCAAGCATCGCCCTAACTCTCATG
GGAAGCCCATAGAGACGAATAAACCCTGCTGCATCCGCTTGGTTGTAAATCTCACTCCCT
TCAAACGAAGATATGTCTTGCCTGTACAGACTGTTCGGACTCTTACGCCCCGTCACCGAC
ACAGATCCTTTGTACAGCTTCAGCGTAACTGATCCGGTGGTTTTCTCGGTTAACTTCTCC
ATGAAAGCGTCCATGGACTCCTTAAGCGGATCAAACCACCTTCCCGCGTAAACCATCTCT
GCGTATTTCAGAGCTAATGAGTCTTTCACCTGAATGCTCTCTCTGTCTAGAGTGAGCGAT
TCTAACTCCTGCACAGCTGCAAAGAGGATGGTGCCTCCTGGGGTTTCGTAGACACCACGT
GACTTCATCCCAACCAGACGGTTCTCCACCATGTCGATCCGGCCGATGCCGTGTTTCCCT
CCTATTGTGTTTAGCTCGGAGAGAAGGGTAGCTGGAGAGAGTGCCTTCCCGTTGAGTGCC
ACTGGTAGTCCAGATTCTATCCCGATCTCGATGTATTCAGGCTGATCAGGAGCATCTTCG
GGGTCTACACTCATCATGTACATATCTCTCTTGGGCTCGTTTGCTGGATCTTCCAATATA
TCACCCTCGCGACTAAGGTGCCAGAGGTTCCTATCTCGGCTGTAAATAGATTTCTTTGTC
ACGGGGACAGGAACGTTGTGCTTCTTGGCATACTCGATAGCGTCTTCTCTGCCTTGGATC
TCCCATCCTCTCCATGGTGCCACGACTTTAAGTTCAGGGTTTAACGAAAAGAAGGTGAGC
TCAAACCGAACCTGGTCATTTCCTTTACCAGTACACCCATGAGCAACAGCATCAGCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 55 
55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 40 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 40 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E372JQ U 6
AF RR2EE15JQ U 122
AF RR2AO69JQ U 48
AF RR2AR16JQ U 49
AF RR2EZ68JQ U 49
AF RR2CE65JQ U 1
AF RR2EO26JQ U 49
AF RR2EO26TF C 268
AF RR2G673TF C 360
BS 1 756 RR2CE65JQ
BS 757 857 RR2EO26JQ
BS 858 858 RR2EO26TF
BS 859 868 RR2EO26JQ
BS 869 869 RR2EO26TF
BS 870 908 RR2EO26JQ
BS 909 1080 RR2EO26TF

RD RR2E372JQ 600 0 0
AAAACTGTGATTAAATTGTTAATGCAACCTAAGTTACATCATTCACAGTAACACATTATT
CAATTTATTGAAAAATAACAACAATTATTCCGGAAGCTAGACGCCATCAAATGTTTGAAC
ACAACAAGAGATCTTTACTGTCATGCAAATAAACTCTCAACTCCAACAAGAAGACACTGT
TGGTGAAACCCTTCCTCTCTAGATACCTTTCTCAAGCATCGCCCTAACTCTCATGGGAAG
CCCATAGAGACGAATAAACCCTGCTGCATCCGCTTGGTTGTAAATCTCACTCCCTTCAAA
CGAAAATATGTCTTGCCTGTACAGACTGTTCGGACTCTTACGCCCCGTCACCGACACAGA
TCCTTTGTACAGCTTCAGCGTAACTGATCCGGTGGTTTTCTCGGTTAACTTCTCCATGAA
AGCGTCCCTGGACTCCTTAAGCGGATCAAACCACCTTCCCGCGTAAACCATCTCTGCGTA
TTTCAGAGCTAATGAGTCTTTCACCTGAATGCTCTCTCTGTCTAGAGTGAGCGATTCTAA
CTCCTGCACAGCTGCAAAGAGGATGGTGCCTCCTGGGGTTTCGTAGACACCACGTGACTT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2EE15JQ 561 0 0
GAACACAACAAGAGATTTTTACTGTCATGCAAATAAACTCTCAACTCCAACAAGAAAACA
CTGTTGGTGAAACCCTTCCTCTCTAGATACCTTTCTCAAGCATCGCCCTAACTCTCATGG
GAAGCCCATAGAGACGAATAAACCCTGCTGCATCCGCTTGGTTGTAAATCTCACTCCCTT
CAAACGAAAATATGTCTTGCCTGTACAGACTGTTCGGACTCTTACGCCCCGTCACCGACA
CAGATCCTTTGTACAGCTTCAGCGTAACTGATTCGGTGGTTTTCTCGGTTAACTTCTCCA
TGAAAGCGTCCATGGACTCCTTAAGCGGATCAAACCACCTTCCCGCGTAAACCATCTCCG
CGTATTTCAAAACTAATGAGTCTTTCACCTGAATGCTCTCTCTGTCTAGAGTGAGCGATT
CTAACTCCTGCACAGCTGCAAAGAGGATGGTGCCTCCTGGGGTTTCGTAAACACCACGTG
ACTTCATCCCAACCAGACGGTTCTCCACCATGTCGATCCGGCCGATGCCGTGTTTCCCTC
CTATTGTGTTTAGCTCGGA
AA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2AO69JQ 630 0 0
C
CACAGTAACACATTATTCAATTTATAGAAAAATAACAACAATTATTCCGGAAGCTAAACG
CCATCAAATGTTTGAACACAACAAGAGATCTTTACTGTCATGCAAATAAACTCTCAACTC
CAACAAGAAGACAATGTTGGTGAAACCCTTCCTCTCTAGATACCTTTCTCAAGCATCGCC
CTAACTCTCATAGGAAGCCCATAGAGACGAATAAACCCTGCAGCATCCGCTTGGTTGTAA
ATCTCACTCCCTTCAAACGAAAATATGTCTTGCCTGTACAGACTGTTCGGACTCTTACGC
CCCGTCACCGACACGGATCCTTTGTACAGCTTCAGCGTAACTGATCCAGTGGTTTTCTCG
GTTAACTTCTCCATGAATGCGTCCATGGACTCCTTAAGCGGATCAAACCACCTTCCCGCG
TAAACCATCTCTGCGTATTTCAGAGCTAACGAGTCTTTCACCTGAATGCTTTCTCTGTCT
AGAGTGAGTGATTCTAACTCCTGCACGGCTGCAAAGAGGATGGTGCCTCCTGGGGTTTCG
TAGACACCACGTGACTTCATCCCGACCAGACGGTTCTCCACCATGTCGATCCGGCCAATG
CCGTGTTTCCCTCCTATTGTGTTTAGCTC

QA 2 630 2 630
DS 

RD RR2AR16JQ 629 0 0
CACAGTAACACATTATTCAATTTATAGAAAAATAACAACAATTATTCCGGAAGCTAAACG
CCATCAAATGTTTGAACACAACAAGAGATCTTTACTGTCATGCAAATAAACTCTCAACTC
CAACAAGAAGACAATGTTGGTGAAACCCTTCCTCTCTAGATACCTTTCTCAAGCATCGCC
CTAACTCTCATAGGAAGCCCATAGAGACGAATAAACCCTGCAGCATCCGCTTGGTTGTAA
ATCTCACTCCCTTCAAACGAAAATATGTCTTGCCTGTACAGACTGTTCGGACTCTTACGC
CCCGTCACCGACACGGATCCTTTGTACAGCTTCAGCGTAACTGATCCAGTGGTTTTCTCG
GTTAACTTCTCCATGAATGCGTCCATGGACTCCTTAAGCGGATCAAACCACCTTCCCGCG
TAAACCATCTCTGCGTATTTCAAAGCTAACGAGTCTTTCACCTGAATGCTTTCTCTGTCT
AGAGTGAGTGATTCTAACTCCTGCACGGCTGCAAAGAGGATGGTGCCTCCTGGGGTTTCG
TAAACACCACGTGACTTCATCCCGACCAGACGGTTCTCCACCATGTAGATCCGGCCAATG
CCGTGTTTCCCTCCTATTGTGTTTAGCTC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2EZ68JQ 628 0 0
CACAGTAACACATTATTCAATTTATTGAAAAATAACAACAATTATTCCGGAAGCTAGACG
CCATCAAATGTTTGAACACAACAAGAGATCTTTACTGTCATGCAAATAAACTCTCAACTC
CAACAAGAAGACACTGTTGGTGAAACCCTTCCTCTCTAGATACCTTTCTCAAGCATCGCC
CTAACTCTCATGGGAAGCCCATAGAGACGAATAAACCCTGCTGCATCCGCTTGGTTGTAA
ATCTCACTCCCTTCAAACGAAGATATGTCTTGCCTGTACAGACTGTTCGGACTCTTACGC
CCCGTCACCGACACAGATCCTTTGTACAGCTTCAGCGTAACTGATCCGGTGGTTTTCTCG
GTTAACTTCTCCATGAAAGCGTCCATGGACTCCTTAAGCGGATCAAACCACCTTCCCGCG
TAAACCATCTCTGCGTATTTCAGAGCTAATGAGTCTTTCACCTGAATGCTCTCTCTGTCT
AGAGTGAG**ATTCTAACTCCTGCACAGCTGCAAAGAGGATGGTGCCTCCTGGGGTTTCG
TAGACACCACGTGACTTCATCCCAACCAGACGGTTCTCCACCATGTCGATCCGGCCGATG
CCGTGTTTCCCTCCTATTGTGTTTAGCT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2CE65JQ 756 0 0
GTGATAAAACTGTGATTAAATTGTTAATGCAACCTAAGTTACATCATTCACAGTAACACA
TTATTCAATTTATTGAAAAATAACAACAATTATTCCGGAAGCTAGACGCCATCAAATGTT
TGAACACAACAAGAGATCTTTACTGTCATGCAAATAAACTCTCAACTCCAACAAGAAGAC
ACTGTTGGTGAAACCCTTCCTCTCTAGATACCTTTCTCAAGCATCGCCCTAACTCTCATG
GGAAGCCCATAGAGACGAATAAACCCTGCTGCATCCGCTTGGTTGTAAATCTCACTCCCT
TCAAACGAAGATATGTCTTGCCTGTACAGACTGTTCGGACTCTTACGCCCCGTCACCGAC
ACAGATCCTTTGTACAGCTTCAGCGTAACTGATCCGGTGGTTTTCTCGGTTAACTTCTCC
ATGAAAGCGTCCATGGACTCCTTAAGCGGATCAAACCACCTTCCCGCGTAAACCATCTCT
GCGTATTTCAGAGCTAATGAGTCTTTCACCTGAATGCTCTCTCTGTCTAGAGTGAGCGAT
TCTAACTCCTGCACAGCTGCAAAGAGGATGGTGCCTCCTGGGGTTTCGTAGACACCACGT
GACTTCATCCCAACCAGACGGTTCTCCACCATGTCGATCCGGCCGATGCCGTGTTTCCCT
CCTATTGTGTTTAGCTCGGAGAGAAGGGTAGCTGGAGAGAGTGCCTTCCCGTTGAGTGCC
ACTGGTAGTCCAGATTCTATCCCGATCTCGATGTAT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2EO26JQ 860 0 0
CG
CAGTAACACATTATTCAATTTATTGAAAAATAACAACAATTATTCCGGAAGCTAGACGCC
ATCAAATGTTTGAACACAACAAGAGATCTTTACT***ATGCAAATAAACTCTCAACTCCA
ACAAGAAGACACTGTTGGTGAAACCCTTCCTCTCTAGATACCTTTCTCAAGCATCGCCCT
AACTCTCATGGGAAGCCCATAGAGACGAATAAACCCTGCTGCATCCGCTTGGTTGTAAAT
CTCACTCCCTTCAAACGAAGATATGTCTTGCCTGTACAGACTGTTCGGACTCTTACGCCC
CGTCACCGACACAGATCCTTTGTACAGCTTCAGCGTAACTGATCCGGTGGTTTTCTAGGT
TAACTTCTCCATGAAAGCGTCCATGGACTCCTTAAGCGGATCAAACCACCTTCCCGCGTA
AACCATCTCTGCGTATTTCAGAGCTAATGAGTCTTTCACCTGAATGCTCTCTCTGTCTAG
AGTGAGCGATTCTAACTCCTGCACAGCTGCAAAGAGGATGGTGCCTCCTGGGGTTTCGTA
GACACCACGTGACTTCATCCCAACCAGACGGTTCTCCACCATGTCGATCCGGCCGATGCC
GTGTTTCCCTCCTATTGTGTTTAGCTCGGAGAGAAGGGTAGCTGGAGAGAGTGCCTTCCC
GTTGAGTGCCACTGGTAGTCCAGATTCTATCCCGATCTCGATGTATTCAGGCTGATCAGG
AGCATCTTCGGGGTCTACACTCATCATGTACATATCTCTCTTGGGCTCGTTTGCTGGATC
TTCCAATATATCACCCTCGCGACTAAG*TGCCAGAGGT*CCTATCTCGGCTGTAAATAGA
TTTCTTTGTCACGGGGAC

QA 3 860 3 860
DS 

RD RR2EO26TF 813 0 0
GCTGCATCCGCTTGGTTGTAA*TCTCACTCC*TTCAAACGAAGATATGTCT*GCCTGTAC
AGACTGTTCGGACTCTTACGCCC*GTCACCGACACAGATCCTTTGTACAGCTTCAGCGTA
ACTGATCCGGTGGTTTTCTAGGTTAACTTCTCCATGAAAGCGTCCATGGACTCCTTAAGC
GGATCAAACCACCTTCCCGCGTAAACCATCTCTGCGTATTTCAGAGCTAATGAGTCTTTC
ACCTGAATGCTCTCTCTGTCTAGAGTGAGCGATTCTAACTCCTGCACAGCTGCAAAGAGG
ATGGTGCCTCCTGGGGTTTCGTAGACACCACGTGACTTCATCCCAACCAGACGGTTCTCC
ACCATGTCGATCCGGCCGATGCCGTGTTTCCCTCCTATTGTGTTTAGCTCGGAGAGAAGG
GTAGCTGGAGAGAGTGCCTTCCCGTTGAGTGCCACTGGTAGTCCAGATTCTATCCCGATC
TCGATGTATTCAGGCTGATCAGGAGCATCTTCGGGGTCTACACTCATCATGTACATATCT
CTCTTGGGCTCGTTTGCTGGATCTTCCAATATATCACCCTCGCGACTAAGGTGCCAGAGG
TTCCTATCTCGGCTGTAAATAGATTTCTTTGTCACGGGGACAGGAACGTTGTGCTTCTTG
GCATACTCGATAGCGTCTTCTCTGCCTTGGATCTCCCATCCTCTCCATGGTGCCACGACT
TTAAGTTCAGGGTTTAACGAAAAGAAGGTGAGCTCAAACCGAACCTGGTCATTTCCTTTA
CCAGTACACCCATGAGCAACAGCATCAGCTCCC

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2G673TF 675 0 0
CACAGATCCTTTGTACAGCTTCAGCGTAACTGATCCGGTGGTTTTCTCGGTTAACTTCTC
CATGAAAGCGTCCATGGACTCCTTAAGCGGATCAAACCACCTTCCCGCGTAAACCATCTC
TGCGTATTTCAGAGCTAATGAGTCTTTCACCTGAATGCTCTCTCTGTCTAGAGTGAGCGA
TTCTAACTCCTGCACAGCTGCAAAGAGGATGGTGCCTCCTGGGGTTTCGTAGACACCACG
TGACTTCATCCCAACCAGACGGTTCTCCACCATGTCGATCCGGCCGATGCCGTGTTTCCC
TCCTATTGTGTTTAGCTCGGAGAGAAGGGTAGCTGGAGAGAGTGCCTTCCCGTTGAGTGC
CACTGGTAGTCCAGATTCTATCCCGATCTCGATGCATTCAGGCTGATCAGGAGCATCTTC
GGGGTCTACACTCATCATGTACATATCTCTCTTGGGCTCGTTTGCTGGATCTTCCAATAT
ATCACCCTCGTGACTAAGGTGCCAGAGGTTCCTATCTCGGCTGTAAATAGATTTCTTTGT
CACGGGGACAGGAACGTTGTGCTTCTTGGCATACTCGATAGCGTCTTCT**GCCTTGGAT
CTCCCATTCTCTCCATGGTGCCACGACTTTAAGTTCAGGGTTTAACGAAAAGAAGGTGAG
CTCAAACCGAACCT
C

QA 1 674 1 674
DS 



AS 3 11

CO CL223Contig1 775 2 11 U
GGACGGCTCCATCATCATCTTCTCCTTCAACAAAGATTCCAGCAATCTCGTGTTCTCCGT
CATCCTCCAACAAAAACTCGAACATTCATCAGATCGGTGATGGGTTCGTCTTCCTCTTTC
CCCTCTTCGAAGCTTCTCTTCCGACAGCTCTTCGAGAAAGAGTCTTCCACCTACACTTAT
CTCCTCGCCGACATTTCCCATCCGAACAAACCCGCTCTCTTGATTGATCCGGTGGACAAG
ACTGTTGATAGAGACTTAAAGCTGATTAATGAGTTAGGGTTAAAGCTTGTCTACGCTATG
AACACTCATGTTCATGCTGATCATGTCACTGGGACTGGTCTTCTTAAGACAAAGCTCCCA
GGTGTGAAATCTGTAATCTCGAAAGCGAGTGGTTCCAAAGCAGATAAGTTTCTTGAACAT
GGAGAAAGAGTGTCTATTGGTGATATATACCTCGAGGTCCGTGCTACACCTGGACATACA
GCAGGATGTGTTACATATGTGACTGGAGAAGGACCAGATCAGCCCCAACCAAGAATGACT
TTTACAGGGGATGCTGTATTGATCCGCGGCTGTGGTAGGACCGACTTTCAGGGTGGAAGC
TCTGATCAACTCTATGAGTCTGTGCACTCTCAGATATTTACATTACCGAGGACACATTGA
TCTATCCAGCTCATGACTACAAAGGTACGAGGTAAGTACAGTTGGAGAGAGATGCACACA
CCCACGTTTACTAAAGACGAGAACATTCAAACCATCATGTCAATCTGATCTGGCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H755TF U 1
AF RR2DD59TF U 1
BS 1 16 RR2DD59TF
BS 17 17 RR2H755TF
BS 18 32 RR2DD59TF
BS 33 34 RR2H755TF
BS 35 120 RR2DD59TF
BS 121 121 RR2H755TF
BS 122 182 RR2DD59TF
BS 183 183 RR2H755TF
BS 184 204 RR2DD59TF
BS 205 205 RR2H755TF
BS 206 775 RR2DD59TF

RD RR2H755TF 277 0 0
GGACGGCTCCATCATCATCTTCTCCTTCAACCAAGATTCCAGCAATCTCGTGTTCTCCGT
CATCCTCCAACCAAAACTCGAACTTTCATCAGATCGGTGATGGGTTCGTCTTCCTCTTTC
CCTTCTTCGAAGCTTCTCTTCCGACAGCTCTTCGAGAAAGAGTCTTCCACCTACACTTAT
CTCCTCGCCGACATTTCCCATCCGAACAAACCCGCTCTCTTGATTGATCCGGTGGACAAG
ACTGTTGATAGAGACTTAAAGCTGATTAATGAGT
AGG

QA 1 274 1 274
DS 

RD RR2DD59TF 775 0 0
GGACGGCTCCATCATCTTCTTCTCCTTCAACACGGATTCCAGCAATCTCGTGTTCTCCGT
CATCCTCCAACAAAAACTCGAACATTCATCAGATCGGTGATGGGTTCGTCTTCCTCTTTC
TCCTCTTCGAAGCTTCTCTTCCGACAGCTCTTCGAGAAAGAGTCTTCCACCTACACTTAT
CTTCTCGCCGACATTTCCCATCCGGACAAACCCGCTCTCTTGATTGATCCGGTGGACAAG
ACTGTTGATAGAGACTTAAAGCTGATTAATGAGTTAGGGTTAAAGCTTGTCTACGCTATG
AACACTCATGTTCATGCTGATCATGTCACTGGGACTGGTCTTCTTAAGACAAAGCTCCCA
GGTGTGAAATCTGTAATCTCGAAAGCGAGTGGTTCCAAAGCAGATAAGTTTCTTGAACAT
GGAGAAAGAGTGTCTATTGGTGATATATACCTCGAGGTCCGTGCTACACCTGGACATACA
GCAGGATGTGTTACATATGTGACTGGAGAAGGACCAGATCAGCCCCAACCAAGAATGACT
TTTACAGGGGATGCTGTATTGATCCGCGGCTGTGGTAGGACCGACTTTCAGGGTGGAAGC
TCTGATCAACTCTATGAGTCTGTGCACTCTCAGATATTTACATTACCGAGGACACATTGA
TCTATCCAGCTCATGACTACAAAGGTACGAGGTAAGTACAGTTGGAGAGAGATGCACACA
CCCACGTTTACTAAAGACGAGAACATTCAAACCATCATGTCAATCTGATCTGGCG

QA 1 775 1 775
DS 



CO CL223Contig2 1038 6 7 U
ACACATCAATCAGCAAACCAAACAAAAGTTAAACACGTAATATATGTTATCATCTCCAAT
ACAAACTCCATATGTTCAATGTAACTTACACAAGACCTTATTGGACAAATAAACAAACTC
TCAAGAGTGTGAAAGAGAGAGAGATTTGTGTAGAGAGTTATAAGTTGGCTTGAGCAGGCA
AATCTTGTAATCCACATACCATGTTTGCTGGAACTGCAACATCAATCATCTTCGGATACG
CCAGATTCAGATTTGACATGATGGATTTGAATGTTTCTTTATCTTTAGTTAAACGAGGGT
TGTGTTGCATCTCTTCTCCAACTGTGCTTACCTCGTAACCTTTGTAGTCATGAGCTGGAT
AGATCAATGTGTCCTTTGGCAATGTAAATATCTGTGAGTGCACAGACTCATAGAGTTGAT
CCGAGCTTCCACCCTGAAAGTCTGTCCTCCCACAACCGCGGATAAGTACAGCATCCCCTG
TAAAAGCCATTCTTGGTTGGGGCTGATTCGCGTCCTCTCCAGTCACATATGTAACACATC
CTGCAGTATGTCCAGGTGTAGCACGAACCTCAAGGTATATATCACCAATAGATACTTTGT
CACCAGGCTCAAGAAACATATCTGCTTTGGAACCACTTGCTTTAGAAATGACTGATTTCA
CACCTGGGACCTTTTTCTTAAGAAGTCCAGTGCCAGTGACGTGATCGGCATGAACATGAG
TGTTCATAGCATAGACAAGCTTTAAGCCTAGCTCATTGATCAGCTTTAAGTCTCTATCAA
CAGTCTTGTCCACCGGATCAATCAACAGAGCAGGCTTATCGGGATGAGCGACGTCGGCGA
GAAGATACGTAAAAGTGGAAGACTCTTTCTCGAAGAGCTGTCGGAAGAGAAGCTTGGAGG
AAGAGGAAGAACACATCACTGATCTGATGACTGTTCGAGTTTTGATTAGAGGATGACGGA
GAGCACGAGACTGATGAGAAGAGAGGAATCTGGGTTGAAGAAGAAGAAGATGCTGGAATC
GTGAGAAATGAGTCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV17JQ U 1
AF RR2FP30JQ U 151
AF RR2BG24JQ U 32
AF RR2DV17TF C 113
AF RR2BG24TF C 244
AF RR2AR61TF C 345
BS 1 571 RR2DV17JQ
BS 572 808 RR2BG24JQ
BS 809 872 RR2DV17TF
BS 873 944 RR2BG24TF
BS 945 945 RR2AR61TF
BS 946 1023 RR2BG24TF
BS 1024 1038 RR2AR61TF

RD RR2DV17JQ 571 0 0
ACACATCAATCAGCAAACCAAACAAAAGTTAAACACGTAATATATGTTATCATCTCCAAT
ACAAACTCCATATGTTCAATGTAACTTACACAAGACCTTATTGGACAAATAAACAAACTC
TCAAGAGTGTGAAAGAGAGAGAGATTTGTGTAGAGAGTTATAAGTTGGCTTGAGCAGGCA
AATCTTGTAATCCACATACCATGTTTGCTGGAACTGCAACATCAATCATCTTCGGATACG
CCAGATTCAGATTTGACATGATGGATTTGAATGTTTCTTTATCTTTAGTTAAACGAGGGT
TGTGTTGCATCTCTTCTCCAACTGTGCTTACCTCGTAACCTTTGTAGTCATGAGCTGGAT
AGATCAATGTGTCCTTTGGCAATGTAAATATCTGTGAGTGCACAGACTCATAGAGTTGAT
CCGAGCTTCCACCCTGAAAGTCTGTCCTCCCACAACCGCGGATAAGTACAGCATCCCCTG
TAAAAGCCATTCTTGGTTGGGGCTGATTCGCGTCCTCTCCAGTCACATATGTAACACATC
CTGCAGTATGTCCAGGTGTAGCACGAACCTC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2FP30JQ 493 0 0
TAA
AGAGTTATAAGTTGGCTTGAGCAGGCAAATCTTGTAATCCACATACCATGTTTGCTGGAA
CTGCAACATCAATCATCTTCGGATACGCCAGATTCAGATTTGACATGATGGATTTGAATG
TTTCTTTATCTTTAGTTAAACGAGGGTTGTGTTGCATCTCTTCTCCAACTGTACTTACCT
CGTAACCTTTGTAGTCATGAGCTGGATAGATCAATGTGTCCTTTGGCAATGTAAATATCT
GTGAGTGCACAGACTCATAGAGTTGATCCGAGCTTCCACCCTGAAAGTCGGTCCTCCCAC
AACCGCGGATAAGTACAGCATCCCCTGTAAAAGCCATTCTTGGTTGGGGCTGATCAGCGT
CCTCTCCAGTCACATATGTAACACATCCTGCAGTATGTCCAGGTGTAGCACGAACTTGGA
GGTATATGTCACCAATGGATATTCTGTCACCAGGTTCAAGAAACATGTCTGCTTTGGAAC
CACTTGCTTT

QA 4 493 4 493
DS 

RD RR2BG24JQ 777 0 0
AACACGTAATATATGTTATCATCTCCAATACAAACTCCATATGTTCAATGTAACTTACAC
AAGACCTTATTGGACAAATAAACAAACTCTCAAGAGTGTGAAAGAGAGAGAGATTTGTGT
AGAGAGTTATAAGTTGGCTTGAGCAGGCAAATCTTGTAATCCACATACCATGTTTGCTGG
AACTGCAACATCAATCAACTTCGGATACGCCAGATTCAGATTTGACATGATGGATTTGAA
TGTTTCTTTATCTTTAGTTAAACGAGGGTTGTGTTGCATCTCTTCTCCAACTGTGCTTAC
CTCGTAACCTTTGTAGTCATGAGCTGGATAGATCAATGTGTCCTTTGGCAATGTAAATAT
CTGTGAGTGCACAGACTCATAGAGTTGATCCGAGCTTCCACCCTGAAAGTCTGTCCTCCC
ACAACCGCGGATAAGTACAGCATCCCCTGTAAAAGCCATTCTTGGTTGGGGCTGATTCGC
GTCCTCTCCAGTCACATATGTAACACATCCTGCAGTATGTCCAGGTGTAGCACGAACCTC
AAGGTATATATCACCAATAGATACTTTGTCACCAGGCTCAAGAAACATATCTGCTTTGGA
ACCACTTGCTTTAGAAATGACTGATTTCACACCTGGGACCTTTTTCTTAAGAAGTCCAGT
GCCAGTGACGTGATCGGCATGAACATGAGTGTTCATAGCATAGACAAGCTTTAAGCCTAG
CTCATTGATCAGCTTTAAGTCTCTATCAACAGTCTTGTCCACCGGATCAATCAACAG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2DV17TF 761 0 0
ACAAACTCTCAAGAGTGTGAA*GAGAGAGAGATT*GTGTAGAGAGTTATAAGTTGGCTTG
AGCAGGCAAATCTTGTAATCCACATACCATGTTTGCTGGAACTGCAACATCAATCATCTT
CGGATACGCCAGATTCAGATTTGACATGATGGATTTGAATGTTTCTTTATCTTTAGTTAA
ACGAGGGTTGTGTTGCATCTCTTCTCCAACTGTGCTTACCTCGTAACCTTTGTAGTCATG
AGCTGGATAGATCAATGTGTCCTTTGGCAATGTAAATATCTGTGAGTGCACAGACTCATA
GAGTTGATCCGAGCTTCCACCCTGAAAGTCTGTCCTCCCACAACCGCGGATAAGTACAGC
ATCCCCTGTAAAAGCCATTCTTGGTTGGGGCTGATTCGCGTCCTCTCCAGTCACATATGT
AACACATCCTGCAGTATGTCCAGGTGTAGCACGAACCTCAAGGTATATATCACCAATAGA
TACTTTGTCACCAGGCTCAAGAAACATATCTGCTTTGGAACCACTTGCTTTAGAAATGAC
TGATTTCACACCTGGGACCTTTTTCTTAAGAAGTCCAGTGCCAGTGACGTGATCGGCATG
AACATGAGTGTTCATAGCATAGACAAGCTTTAAGCCTAGCTCATTGATCAGCTTTAAGTC
TCTATCAACAGTCTTGTCCACCGGATCAATCAACAGAGCAGGCTTATCGGGATGAGCGAC
GTCGGCGAGAAGATACGTAAAAGTGGAAGACTCTTTCTCG
C

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2BG24TF 787 0 0
GATTCAGATTTGACATGATGGATTTGAATGTTTCTTTATCTTTAGTTAAACGAGGGTTGT
GTTGCATCTCTTCTCCAACTGTGCTTACCTCGTAACCTTTGTAGTCATGAGCTGGATAGA
TCAATGTGTCCTTTGGCAATGTAAATATCTGTGAGTGCACAGACTCATAGAGTTGATCCG
AGCTTCCACCCTGAAAGTCTGTCCTCCCACAACCGCGGATAAGTACAGCATCCCCTGTAA
AAGCCATTCTTGGTTGGGGCTGATTCGCGTCCTCTCCAGTCACATATGTAACACATCCTG
CAGTATGTCCAGGTGTAGCACGAACCTCAAGGTATATATCACCAATAGATACTTTGTCAC
CAGGCTCAAGAAACATATCTGCTTTGGAACCACTTGCTTTAGAAATGACTGATTTCACAC
CTGGGACCTTTTTCTTAAGAAGTCCAGTGCCAGTGACGTGATCGGCATGAACATGAGTGT
TCATAGCATAGACAAGCTTTAAGCCTAGCTCATTGATCAGCTTTAAGTCTCTATCAACAG
TCTTGTCCACCGGATCAATCAACAGAGCAGGCTTATCGGGATGAGCGACGTCGGCGAGAA
GATACGTAAAAGTGGAAGACTCTTTCTCGAAGAGCTGTCGGAAGAGAAGCTTGGAGGAAG
AGGAAGAACACATCACTGATCTGATGACTGTTCGAGTTTTGGTTAGAGGATGACGGAGAG
CACGAGACTGATGAGAAGAGAGGAATCTGGGTTGAAGAAGAAGAAGATGCTGGAATCGTG
AGAAATG

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2AR61TF 694 0 0
TAGTCATGAGCTGGATAGATCAATGTGTCCTTTGGCAATGTAAATATCTGTGAGTGCACA
GACTCATAGAGTTGATCCGAGCTTCCACCCTGAAAGTCTGTCCTCCCACAACCGCGGATA
AGTACAGCATCCCCTGTAAAAGCCATTCTTGGTTGGGGCTGATTCGCGTCCTCTCCAGTC
ACATATGTAACACATCCTGCAGTATGTCCAGGGGTAGCACGAACCTCAAGGTATATATCA
CCAATAGATACTTTGTCACCAGGCTCAAGAAACATATCTGCTTTGGAACCACTTGCTTTA
GAAATGACTGATTTCACACCTGGGACCTTTTTCTTAAGAAGTCCAGTGCCAGTGACGTGA
TCGGCATGAACATGAGTGTTCATAGCATAGACAAGCTTTAAGCCTAGCTCATTGATCAGC
TTTAAGTCTCTATCAACAGTCTTGTCCACCGGATCAATCAACAGAGCAGGCTTATCGGGA
TGAGCGACGTCGGCGAGAAGATACGTAAAAGTGGAAGACTCTTTCTCGAAGAGCTGTCGG
AAGAGAAGCTTGGAGGAAGAGGAAGAACACATCACTGATCTGATGACTGTTCGAGTTTTG
ATTAGAGGATGACGGAGAGCACGAGACTGATGAGAAGAGAGGAATCTGGGTTGAAGAAGA
AGAAGATGCTGGAATCGTGAGAAATGAGTCACCC

QA 1 694 1 694
DS 



CO CL223Contig3 885 3 4 U
CCCACCGTTCCTTTTCCTTTTGTCGTTGACACTTCCGTGGACGTGGGGATAAGCAACAAA
AAAAAGGAACTTCCTTTATAATGGCAGTGTTGACACGATTCCAGCATCTTCTTCTTCTTC
AACCCGGATTCCTCTCTTCTCACCAGTCTTGTGGTGTTCTCCGACATCCTCTAATCAGAA
CTCGAACAGTCATCAGATCGGTGATGGGTTCTACCTCTTCCTCCTCGAAGCTTCTCTTCC
GACAGCTTTTTGAGAAAGAGTCTTCCACTTACACCTATCTCCTCGCTGACGTTTCGCATC
CGGATAAACCTGCTCTGTTGATTGATCCGGTGGACAAGACTGTTGATAGAGACTTGAAGC
TGATCAATGAGTTAGGCTTGAAGCTTGTCTATGCTATGAACACTCATGTTCATGCCGATC
ATGTTACTGGAACTGGACTTCTTAAGACAAAGGTCCCTGGTGTGAAGTCTGTCATTTCGA
AAGCAAGTGGTTCCAAAGCAGACATGTTTCTTGAACCTGGTGACAGAATATCCATTGGTG
ACATATACCTCCAAGTTCGTGCTACACCTGGACATACTGCAGGATGTGTTACATATGTGA
CTGGAGAGGACGCTGATCAGCCCCAACCAAGAATGGCTTTTACAGGGGATGCTGTACTTA
TCCGCGGTTGTGGGAGGACCGACTTTCAGGGTGGAAGCTCGGATCAACTCTATGAGTCTG
TGCACTCACAGATATTTACATTGCCAAAGGACACATTGATCTATCCAGCTCATGACTACA
AAGGTTACGAGGTAAGTACAGTTGGAGAAGAGATGCAACACAACCCTCGTTTAACTAAAG
ATAAAGAAACATTCAAATCCATCATGTCAAATCTGAATCTGGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV26TF U 1
AF RR2FP30TF U 104
AF RR2FQ16TF U 104
BS 1 581 RR2DV26TF
BS 582 844 RR2FP30TF
BS 845 847 RR2FQ16TF
BS 848 885 RR2FP30TF

RD RR2DV26TF 583 0 0
CCCACCGTTCCTTTTCCTTTTGTCGTTGACACTTCCGTGGACGTGGGGATAAGCAACAAA
AAAAAGGAACTTCCTTTATAATGGCAGTGTTGACACGATTCCAGCATCTTCTTCTTCTTC
AACCCGGATTCCTCTCTTCTCACCAGTCTTGTGGTGTTCTCCGACATCCTCTAATCAGAA
CTCGAACAGTCATCAGATCGGTGATGGGTTCTACCTCTTCCTCCTCGAAGCTTCTCTTCC
GACAGCTTTTTGAGAAAGAGTCTTCCACTTACACCTATCTCCTCGCTGACGTTTCGCATC
CGGATAAACCTGCTCTGTTGATTGATCCGGTGGACAAGACTGTTGATAGAGACTTGAAGC
TGATCAATGAGTTAGGCTTGAAGCTTGTCTATGCTATGAACACTCATGTTCATGCCGATC
ATGTTACTGGAACTGGACTTCTTAAGACAAAGGTCCCTGGTGTGAAGTCTGTCATTTCGA
AAGCAAGTGGTTCCAAAGCAGACATGTTTCTTGAACCTGGTGACAGAATATCCATTGGTG
ACATATACCTCCAAGTTCGTGCTACACCTGGACATACTGCA
CG

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2FP30TF 782 0 0
GG
ATCTTCTTCTTCTTCAACCCGGATTCCTCTCTTCTCACCAGTCTTGTGGTGTTCTCCGAC
ATCCTCTAACCAGAACTCGAACAGTCATCAGATCGGTGATGGGTTCTACCTCATCCTCCT
CGAAGCTTCTCTTCCGACAGCTTTTTGAGAAAGAGTCTTCCACTTACACCTATCTCCTCG
CTGACGTTTCGCATCCGGATAAACCTGCTCTGTTGATTGATCCGGTGGACAAGACTGTTG
ATAGAGACTTGAAGCTGATCAATGAGTTAGGCTTGAAGCTTGTCTATGCTATGAACACTC
ATGTTCATGCCGATCATGTTACTGGAACTGGACTTCTTAAGACAAAGGTCCCTGGTGTGA
AGTCTGTCATTTCGAAAGCAAGTGGTTCCAAAGCAGACATGTTTCTTGAACCTGGTGACA
GAATATCCATTGGTGACATATACCTCCAAGTTCGTGCTACACCTGGACATACTGCAGGAT
GTGTTACATATGTGACTGGAGAGGACGCTGATCAGCCCCAACCAAGAATGGCTTTTACAG
GGGATGCTGTACTTATCCGCGGTTGTGGGAGGACCGACTTTCAGGGTGGAAGCTCGGATC
AACTCTATGAGTCTGTGCACTCACAGATATTTACATTGCCAAAGGACACATTGATCTATC
CAGCTCATGACTACAAAGGTTACGAGGTAAGTACAGTTGGAGAAGAGATGCAACACAACC
CTCGTTTAACTAAAGATAAG**AACATTCAAATCCATCATGTCAAATCTGAATCTGGCGT

QA 3 782 3 782
DS 

RD RR2FQ16TF 761 0 0
AG
ATCTTCTTCTTCTTCAACCCGGATTCCTCTCTTCTCACCAGTCTTGTGGTGTTCTCCGAC
ATCCTCTAATCAGAACTCGAACAGTCATCAGATCGGTGATGGGTTCTACCTCTTCCTCCT
CGAAGCTTCTCTTCCGACAGCTTTTTGAGAAAGAGTCTTCCACTTACACCTATCTCCTCG
CTGACGTTTCGCATCCGGATAAACCTGCTCTGTTGATTGATCCGGTGGACAAGACTGTTG
ATAGAGACTTGAAGCTGATCAATGAGTTAGGCTTGAAGCTTGTCTATGCTATGAACACTC
ATGTTCATGCCGATCATGTTACTGGAACTGGACTTCTTAAGACAAAGGTCCCTGGTGTGA
AGTCTGTCATTTCGAAAGCAAGTGGTTCCAAAGCAGACATGTTTCTTGAACCTGGTGACA
GAATATCCATTGGTGACATATACCTCCAAGTTCGTGCTACACCTGGACATACTGCAGGAT
GTGTTACATATGTGACTGGAGAGGACGCTGATCAGCCCCAACCAAGAATGGCTTTTACAG
GGGATGCTGTACTTATCCGCGGTTGTGGGAGGACCGACTTTCAGGGTGGAAGCTCGGATC
AACTCTATGAGTCTGTGCACTCACAGATATTTACATTGCCAAAGGACACATTGATCTATC
CAGCTCATGACTACAAAGGTTACGAGGTAAGTACAGTTGGAGA*GAGATGCAACACAACC
CTCGTTTA*CTAAAGATAAAGAAACATTCAA
TCATCATG

QA 3 753 3 753
DS 



AS 2 15

CO CL224Contig1 1536 10 26 U
GGATCAATAAGAAAAATAAAATTTCAAACAAAAAAAAAAAAAAA****ACCTAGTGGTTT
ACGAAAGAAAATAAAACATAAAAAAA*TCTTATATCACCAGTGACTAGAATCAATCCCAA
TAATGGGTGTACATTTTGGAGTATCCACATTCTTTGTCTTTTGTTTGCTGGTTTTATCAG
CAAATGCTAGAGAATTCAGAATCACTGCTCGCCCAGGTTCTGATATCACCGGCGAATTGT
CGAAACTATTCAAGGAGGCATGTGCGTGCGTGGACAGGAGCACCGTTTTGATCCCAAAAG
GTGAATTCAAGCTTGGGGAAATAGAGATGATGGGTCCATGCAAAGCTCCTATAGTAATTG
TTCTTCAAGGCACTGTGAGAGCTGATGGGAACGTCAACGGGAAGGACTATTGGGTCGCTT
TCCGCAGGATTACTAACTTCAGATTGAACGGAGGTGGTATCTTTGATGGTGAAGGTAACG
CTGCATGGAGGGCTAATAATTGTCACAAGGCGTCATTAACTCAGTGCAAAAGACTCCCTA
TCAGCATAAGGTTTGATTACATAACTGACGGTAAGGTAAGAGACATAACCTCGTTAGACG
CAAAGAACTTCCACATCAACGTGATCGGGGCAAAGAACTTGACATTCGAAGACGTCAGGA
TCATAGCCCCTGATGAGAGTCCCAACACCGATGGAATCCACGTGGGAAGGAGTGACGGAA
TCAAGATCATCAACACCAACATCAAAACGGGAGACGACTGCATCTCTGTCGGGGACGGGA
TGAAAAACCTTCTTGTCGAAGGAGTCTCATGCGGTCCGGGACACGGAATCAGTATTGGAA
GCCTTGGATTATACGGGCACGAGGAAGACGTCACTGGCATCAGGGTCGTGAACTGCACCC
TCAGAAATACTGATAATGGTGTAAGAATCAAGACATGGCCCTCTGCAGCTTGCTCCACGA
CCGCCTCTGGTATCAGTTTCGAGAATATTATGCTCCACAACGTTAGCAACCCTATCCTCA
TCGACCAAGAGTACTGCCCATGGAACCGGTGCAACAAGAATAAACCATCAACTATCAAGC
TGGTCGACATAAAGTTCAAGAATATCAGAGGAACCTCAGGGAACAAAGACGCAGTTAAGC
TATTGTGCAGCAAGGCATTTCCGTGTAAGAACGTGGAGATCGGCGACATTGATATTAAAT
ATACTGGTAAAGACGGTCCAGCAACGTTCCAGTGCTGTAACATATCCCCGAAGCTGGTGG
GTAAACAGTGTCCTAAAGCATGTAGCAGCCCACTGACGAAGGCACCAGGCCACTAGAAGC
TCGGAGTGTATATAATATATACCCGTACGCAATACTAAAATGTACACCCTAGTGTATGTT
ATTTCCTTTGAATCTTTGTAAAAAAAAAATCCTGTTTTCTTTTTGCCGCTTTGGCCCCTA
AAATTTTGCATTTTTGCTAGCTTTATTGATGTATAAAATGCATCATTCCTGTAAAAAAAA
ATTTAATATAGCAATGAGAAACTAAGATTTCACTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 10 

AF RR2H872TF U 0
AF RR2BI41TF U 1
AF RR2B550TF U 1
AF RR2CH04TF U 289
AF RR2FQ45TF U 648
AF RR2FN62JQ C 818
AF RR2FN62TF U 732
AF RR2B550JQ C 674
AF RR2A487TF U 936
AF RR2FQ45JQ C 818
BS 1 30 RR2B550TF
BS 31 31 RR2H872TF
BS 32 39 RR2B550TF
BS 40 40 RR2H872TF
BS 41 44 RR2B550TF
BS 45 48 RR2H872TF
BS 49 86 RR2B550TF
BS 87 87 RR2H872TF
BS 88 171 RR2B550TF
BS 172 172 RR2H872TF
BS 173 801 RR2B550TF
BS 802 802 RR2CH04TF
BS 803 844 RR2B550TF
BS 845 861 RR2CH04TF
BS 862 862 RR2FQ45TF
BS 863 922 RR2CH04TF
BS 923 923 RR2FQ45TF
BS 924 925 RR2CH04TF
BS 926 926 RR2FQ45TF
BS 927 1004 RR2CH04TF
BS 1005 1301 RR2FQ45TF
BS 1302 1302 RR2A487TF
BS 1303 1388 RR2FQ45TF
BS 1389 1534 RR2A487TF
BS 1535 1535 RR2B550JQ
BS 1536 1536 RR2FQ45JQ

RD RR2H872TF 709 0 0
GGATCAATAATA
AAAAATAAAATTTCAAACAAAAAAAAAAAAAAA****ACCTAGTGGTTTACGAAAGAAAA
TAAAACATAAAAAAA*TCTTATATCACCAGTGACTAGAATCAATCCCAATAATGGGTGTA
CATTTTGGAGTATCCACATTCTTTGTCTTTTGTTTGCTGGTTTTATCAGCAAATGCTAGA
GAATTCAGAATCACTGCTCGCCCAGGTTCTGATATCACCGGCGAATTGTCGAAACTATTC
AAGGAGGCATGTGCGTGCGTGGACAGGAGCACCGCTTTGATCCCAAAAGGTGAATTCAAG
CTTGGGGAAATAGAGATGATGGGTCCATGCAAAGCTCCTATAGTAATTGTTCTTCAAGGC
ACTGTGAGAGCTGATGGGAACGTCAACGGGAAGGACTATTGGGTCGCTTTCCGCAGGATT
ACTAACTTCAGATTGAACGGAGGTGGTATCTTTGATGGTGAAGGTAACGCTGCATGGAGG
GCTAATAATTGTCACAAGGCGTCATTAACTCAGTGCAAAAGACTCCCTATCAGCATAAGG
TTTGATTACATAACTGACGGTAAGGTAAGAGACATAACCTCGTTAGACGCAAAGAACTTC
CACATCAACGTGATCGGGGCAAAGAACTTGACATTCGAAGACGTCAG*ATCATAGCCCCT
GATGAGAGTCCCAACACCGATGGAATCCACGTGGGAA

QA 13 709 13 709
DS 

RD RR2BI41TF 773 0 0
GGATCAATAAG
AAAAATAAAATTTCAAACAAAAAAAAAAAAAAA*****CCTAGTGGTTTACGAAAGAAAA
TAAAACATAAAAAAA*TCTTATATCACCAGTGACTAGAATCAATCCCAATAATGGGTGTA
CATTTTGGAGTATCCACATTCTTTGTCTTTTGTTTGCTGGTTTTATCAGCAAATGCTAGA
GAATTCAGAATCACTGCTCGCCCAGGTTCTGATATCACCGGCGAATTGTCGAAACTATTC
AAGGAGGCATGTGCGTGCGTGGACAGGAGCACCGTTTTGATCCCAAAAGGTGAATTCAAG
CTTGGGGAAATAGAGATGATGGGTCCATGCAAAGCTCCTTTAGTAATTGTTCTTCAAGGC
ACTGTGAGAGCTGATGGGAACGTCAACGGGAAGGACTATTGGGTCGCTTTCCGCAGGATT
ACTAACTTCAGATTGAACGGAGGTGGTATCTTTGATGGTGAAGGTAACGCTGCATGGAGG
GCTAATAATTGTCACAAGGCGTCATTAACTCAGTGCAAAAGACTCCCTATCAGCATAAGG
TTTGATTACATAACTGACGGTAAGGTAAGAGACATAACCTCGTTAGACGCAAAGAACTTC
CACATCAACGTGATCGGGGCAAAGAACTTGACATTCGAAGACGTCAGGATCATAGCCCCT
GATGAGAGTCCCAACACCGATGGAATCCACGTGGGAAGGAGTGACGGAATCAAGATCATC
AACACCAACATCAAAACGGGAGACGACTGCATCTCTGTCGGG

QA 12 773 12 773
DS 

RD RR2B550TF 844 0 0
GGATCAATAAGAAAAATAAAATTTCAAACACAAAAAAAATAAAATAAAACCTAGTGGTTT
ACGAAAGAAAATAAAACATAAAAAAAATCTTATATCACCAGTGACTAGAATCAATCCCAA
TAATGGGTGTACATTTTGGAGTATCCACATTCTTTGTCTTTTGTTTGCTGGCTTTATCAG
CAAATGCTAGAGAATTCAGAATCACTGCTCGCCCAGGTTCTGATATCACCGGCGAATTGT
CGAAACTATTCAAGGAGGCATGTGCGTGCGTGGACAGGAGCACCGTTTTGATCCCAAAAG
GTGAATTCAAGCTTGGGGAAATAGAGATGATGGGTCCATGCAAAGCTCCTATAGTAATTG
TTCTTCAAGGCACTGTGAGAGCTGATGGGAACGTCAACGGGAAGGACTATTGGGTCGCTT
TCCGCAGGATTACTAACTTCAGATTGAACGGAGGTGGTATCTTTGATGGTGAAGGTAACG
CTGCATGGAGGGCTAATAATTGTCACAAGGCGTCATTAACTCAGTGCAAAAGACTCCCTA
TCAGCATAAGGTTTGATTACATAACTGACGGTAAGGTAAGAGACATAACCTCGTTAGACG
CAAAGAACTTCCACATCAACGTGATCGGGGCAAAGAACTTGACATTCGAAGACGTCAGGA
TCATAGCCCCTGATGAGAGTCCCAACACCGATGGAATCCACGTGGGAAGGAGTGACGGAA
TCAAGATCATCAACACCAACATCAAAACGGGAGACGACTGCATCTCTGTCGGGGACGGGA
TGAAAAACCTTCTTGTCGAAG*AGTCTCATGCGGTCCGGGACACGGAATCAGTATTGGAA
GCCT

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR2CH04TF 716 0 0
G
GATCCCAAAAGGTGAATTCAAGCTTGGGGAAATAGAGATGATGGGTCCATGCAAAGCTCC
TATAGTAATTGTTCTTCAAGGCACTGTGAGAGCTGATGGGAACGTCAACGGGAAGGACTA
TTGGGTCGCTTTCCGCAGGATTACTAACTTCAGATTGACCGGAGGTGGTATCTTTGATGG
TGAAGGTAACGCTGCATGGAGGGCTAATAATTGTCACAAGGCGTCATTAACTCAGTGCAA
AAGACTCCCTATCAGCATAAGGTTTGATTACATAACTGACGGTAAGGTAAGAGACATAAC
CTCGTTAGACGCAAAGAACTTCCACATCAACGTGATCGGGGCAAAGAACTTGACATTCGA
AGACGTCAGGATCATAGCCCCTGATGAGAGTCCCAACACCGATGGAATCCACGTGGGAAG
GAGTGACGGAATCAAGATCATCAACACCAACATCAAAACGGGAGACGACTGCATCTCTGT
CGGGGACGGGATGAAAAACCTTCTTGTCGAAGGAGTCTCATGCGGTCCGGGACACGGGAT
CAGTATTGGAAGCCTTGGATTATACGGGCACGGGGAAGACGTCACTGGCATCAGGGTCGT
GAACTGCACCCTCAGAAATACTGATAATGGTGTGAGGATCAAGACATGGCCCTCTGCAGC
TTGCTCCACGACCGCCTCTGGTATCAGTTTCGAGAATATTATGCTCCACAACGTT

QA 2 716 2 716
DS 

RD RR2FQ45TF 741 0 0
GGG
GACGTCAGGATCATAGCCCCTGATGAGAGTCCCAACACCGATGGAATCCACGTGGGAAGG
AGTGACGGAATCAAGATCATCAACACCAACATCAAAGCGGGAGACGACTGCATCTCTGTC
GGGGACGGGATGAAAAACCTTCTTGTCGAAGGAGTCTCATGCGGTCCGGGACACGGAATC
AGTATTGGAAGCCTTGGATTATACGGGCACGAGGAAGACGTCACTGGCATCAGGGTCGTG
AACTGCACCCTCAGAAATACTGATAATGGTGTAAGAATCAAGACATGGCCCTCTGCAGCT
TGCTCCACGACCGCCTCTGGTATCAGTTTCGAGAATATTATGCTCCACAACGTTAGCAAC
CCTATCCTCATCGACCAAGAGTACTGCCCATGGAACCGGTGCAACAAGAATAAACCATCA
ACTATCAAGCTGGTCGACATAAAGTTCAAGAATATCAGAGGAACCTCAGGGAACAAAGAC
GCAGTTAAGCTATTGTGCAGCAAGGCATTTCCGTGTAAGAACGTGGAGATCGGCGACATT
GATATTAAATATACTGGTAAAGACGGTCCAGCAACGTTCCAGTGCTGTAACATATCCCCG
AAGCTGGTGGGTAAACAGTGTCCTAAAGCATGTAGCAGCCCACTGACGAAG*CACCAGGC
CACTAGAAGCTCGGAGTGTATATAATATATACCCGTACGCAATACTAAAATGTACACCCT
AGTGTATGTTATTTCCTT

QA 4 741 4 741
DS 

RD RR2FN62JQ 674 0 0
GGGACACGGAATCAGTATTGGAAGCCTTGGATTATACGGGCACGAGGAAGACGTCACTGG
CATCAGGGTCGTGAACTGCACCCTCAGAAATACTGATAATGGTGTAAGAATCAAGACATG
GCCCTTTGCAGCTTGCTCCACGACCGCCTTTGGTATCAGTTTCGAGAATATTATGCTCCA
CAACGTTAGCAACCCTATCCTCATCGACCAAGAGTACTGCCCATGGAACCGGTGCAACAA
GAATAAACCATCAACTATCAAGCTGGTCGACATAAGGTTCAAGAATATCAGAGGAACCTC
AGGGAACAAAGACGCAGTTAAGCTATTGTGCAGCAAGGCATTTCCGTGTAAGAACGTGGA
GATCGGCGACATTGATATTAAATATACTGGTAAAGACGGTCCAGCAACGTTCCAGTGCTG
TAACATATCCCCGAAGCTGGTGGGTAAACAGTGTCCTAAAGCATGTAGCAGCCCACTGAC
GAAGGCACCAGGCCACTAGAAGCTCGGAGTGTATATAATATATACCCGTACGCAATACTA
AAATGTACACCCTGGTGTATGTTATTTCCTTTGAATCTTTGTAAAAAAAAAATCCTGTTT
TCTTTTTGCCGCTTTGGCCCCTAAAATTTTGCATTTTTGCTAGCTTTATTGATGTATAAA
ATGCATCATTCCTG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2FN62TF 740 0 0
GG
CACCAACATCAAAACGGGAGACGACTGCATCTCTGTCGGAGACGGGATGAAAAACCTTCT
TGTCGAAGGAGTCTCATGCGGTCCGGGACACGGAATCAGTATTGGAAGCCTTGGATTATA
CGGGCACGAGGAAGACGTCACTGGCATCAGGGTCGTGAACTGCACCCTCAGAAATACTGA
TAATGGTGTAAGAATCAAGACATGGCCCTCTGCAGCTTGCTCCACGACCGCCTCTGGTAT
CAGTTTCGAGAATATTATGCTCCACAACGTTAGCAACCCTATCCTCATCGACCAAGAGTA
CTGCCCATGGAACCGGTGCAACAAGAATAAACCATCAACTATCAAGCTGGTCGACATAAG
GTTCAAGAATATCAGAGGAACCTCAGGGAACAAAGACGCAGTTAAGCTATTGTGCAGCAA
GGCATTTCCGTGTAAGAACGTGGAGATCGGCGACATTGATATTAAATATACTGGTAAAGA
CGGTCCAGCAACGTTCCAGTGCTGTAACATATCCCCGAAGCTGGTGGGTAAACAGTGTCC
TAAAGCATGTAGCAGCCCACTGACGAAGGCACCAGGCCACTAGAAGCTCGGAGTGTATAT
AATATATACCCGTACGCAATACTAAAATGTACACCCTGGTGTATGTTATTTCCTTTGAAT
CTTTGTAAAAAAAAA*TCCTGTTTTCTTTTTGCCGCTTTGGCCCCTAAAATTTTGCATTT
TTGCTAGCTTTATTGATG

QA 3 740 3 740
DS 

RD RR2B550JQ 862 0 0
TGAGAGTCCCAACACCGATGGAATCCACGTGGGAAGGAGTGACGGAATCAAGATCATCAA
CACCAACATCAAAACGGGAGACGACTGCATCTCTGTCGGGGACGGGATGAAAAACCTTCT
TGTCGAAGGAGTCTCATGCGGTCCGGGACACGGAATCAGTATTGGAAGCCTTGGATTATA
CGGGCACGAGGAAGACGTCACTGGCATCAGGGTCGTGAACTGCACCCTCAGAAATACTGA
TAATGGTGTAAGAATCAAGACATGGCCCTCTGCAGCTTGCTCCACGACCGCCTCTGGTAT
CAGTTTCGAGAATATTATGCTCCACAACGTTAGCAACCCTATCCTCATCGACCAAGAGTA
CTGCCCATGGAACCGGTGCAACAAGAATAAACCATCAACTATCAAGCTGGTCGACATAAA
GTTCAAGAATATCAGAGGAACCTCAGGGAACAAAGACGCAGTTAAGCTATTGTGCAGCAA
GGCATTTCCGTGTAAGAACGTGGAGATCGGCGACATTGATATTAAATATACTGGTAAAGA
CGGTCCAGCAACGTTCCAGTGCTGTAACATATCCCCGAAGCTGGTGGGTAAACAGTGTCC
TAAAGCATGTAGCAGCCCACTGACGAAGGCACCAGGCCACTAGAAGCTCGGAGTGTATAT
AATATATACCCGTACGCAATACTAAAATGTACACCCTAGTGTATGTTATTTCCTTTGAAT
CTTTGTAAAAAAAAAATCCTGTTTTCTTTTTGCCGCTTTGGCCCCTAAAATTTTGCATTT
TTGCTAGCTTTATTGATGTATAAAATGCATCATTCCTGTAAAAAAAAATTTAATATAGCA
ATGAGAAACTAAGATTTCACTG

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR2A487TF 599 0 0
G
GGCCCTCTGCAGCTTGCTCCACGACCGCCTCTGGTATCAGTTTCGAGAATATTATGCTCC
ACAACGTTAGCAACCCTATCCTCATCGACCAAGAGTACTGCCCATGGAACCGGTGCAACA
AGAATAAACCATCAACTATCAAGCTGGTCGACATAAAGTTCAAGAATATCAGAGGAACCT
CAGGGAACAAAGACGCAGTTAAGCTATTGTGCAGCAAGGCATTTCCGTGTAAGAACGTGG
AGATCGGCGACATTGATATTAAATATACTGGTAAAGACGGTCCAGCAACGTTCCAGTGCT
GTAACATATCCCCGAAGCTGGTGGGTAAACAGTGTCCTAAAGCATGTAGCAGCCCACTGA
CGAAGGCACCAGGCCACTAGAAGCTCGGAGTGTATATAATATATACCCGTACGCAATACT
AAAATGTACACCCTAGTGTATGTTATTTCCTTTGAATCTTTGTAAAAAAAAAATCCTGTT
TTCTTTTTGCCGCTTTGGCCCCTAAAATTTTGCATTTTTGCTAGCTTTATTGATGTATAA
AATGCATCATTCCTGTAAAAAAAAATTTAATATAGCAATGAGAAACTAAGATTTCACT

QA 2 599 2 599
DS 

RD RR2FQ45JQ 719 0 0
GGGACACGGAATCAGTATTGGAAGCCTTGGATTATACGGGCACGAGGAAGACGTCACTGG
CATCAGGGTCGTGAACTGCACCTTCAGAAATACTGATAATGGTGTAAGAATCAAGACATG
GCCCTCTGCAGCTTGCTCCACGACCGCCTCTGGTATCAGTTTCGAGAATATTATGCTCCA
CAACGTTAGCAACCCTATCTTCATCGACCAAGAGTACTGCCCATGGAACCGGTGCAACAA
GAATAAACCATCAACTATCAAGCTGGTGGACATAAAGTTCAAGAATATCAGAGGAACCTC
AGGGAACAAAGACGCAGTTAAGCTATTGTGCAGCAAGGCATTTCCGTGTAAGAACGTGGA
GATCGGCGACATTGATATTAAATATACTGGTAAAGACGGTCCAGCAACGTTCCAGTGCTG
TAACATATCCCCGAAGCTGGTGGGTAAACAGTGTCCTAAAGCATGTAGCAGCCCACTGAC
GAAGGCACCAGGCCACTAGAAGCTCGGAGTGTATATAATATATACCCGTACGCAATACTA
AAATGTACACCCTAGTGTATGTTATTTCCTTTGAATCTTTGTAAAAAAAAAATCCTGTTT
TCTTTTTGCCGCTTTGGCCCCTAAAATTTTGCATTTTTGCTAGCTTTATTGATGTATAAA
ATGCATCATTCCTGTAAAAAAAA*TTTAATATAGCAATGAGAAACTAAGATTTCACTGC

QA 1 719 1 719
DS 



CO CL224Contig2 722 5 6 U
GCAGTGAAATCTTAGTTTCTCATTGCTATATTAGAAATTTTTTTTACAGGAATGATGCAT
TTTATACAATCAATAAAGCTAGCAAAAATGCAAAATTTTAGGGGCCAAAACGGCAAAAAG
AAAACAGATTTTTTTT*ACAAAGATTCAAAGGAAATAACATACACTAGGGTGTACATTTT
AGTATTGCGTACGGGCTTCTAGTGGCCTGGTGCCTTCGTCAGTGGGCTGCTACATGCTTT
AGGACACTGTTTACCCACCAGCTTCGGGGATATGTTACAGCACTGGAACGTTGCGGGACC
GTCTTTACCAGTATATTTAATATCAATGTCGCCGATCTCCACGTTCTTACACGGAAATGC
CTTGCTGCACAATAGCTTAACTGCGTCTTT*GTTCCCTGAGGTTCCTCTGATATTCTTGA
ACTTTATGTCGACCAGCTTGATAGTTGATGGTTTATTCTTGTTGCATCGGTTCCATGGGC
AGTACTCTTGATCGATGAGGATAGGGTTGCTAACGTTGTGGAGCATAATATTCTCGAAAC
TGATACCAGAGGCGGTCGTGGAGCAAGCTGCAGAGGGCCATGTCTTGATCCTCACACCAT
TATCAGTATTTCTGAGGGTGCAGTTCACGACCCTGATGCCAGTGACGTCTTCCTCGTGCC
CGTATAATCCAAGGCTTCCAATACTGATCCCGTGTCCCGGACCGCATGAGACTCCTTCGA
CA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI41JQ U 1
AF RR2EH15JQ U 116
AF RR2EH15TF C 116
AF RR2H872JQ U 1
AF RR2CH04JQ U 2
BS 1 294 RR2BI41JQ
BS 295 295 RR2EH15JQ
BS 296 616 RR2BI41JQ
BS 617 617 RR2EH15JQ
BS 618 713 RR2BI41JQ
BS 714 722 RR2CH04JQ

RD RR2BI41JQ 713 0 0
GCAGTGAAATCTTAGTTTCTCATTGCTATATTAGAAATTTTTTTTACAGGAATGATGCAT
TTTATACAATCAATAAAGCTAGCAAAAATGCAAAATTTTAGGGGCCAAAACGGCAAAAAG
AAAACAGATTTTTTTT*ACAAAGATTCAAAGGAAATAACATACACTAGGGTGTACATTTT
AGTATTGCGTACGGGCTTCTAGTGGCCTGGTGCCTTCGTCAGTGGGCTGCTACATGCTTT
AGGACACTGTTTACCCACCAGCTTCGGGGATATGTTACAGCACTGGAACGTTGCTGGACC
GTCTTTACCAGTATATTTAATATCAATGTCGCCGATCTCCACGTTCTTACACGGAAATGC
CTTGCTGCACAATAGCTTAACTGCGTCTTT*GTTCCCTGAGGTTCCTCTGATATTCTTGA
ACTTTATGTCGACCAGCTTGATAGTTGATGGTTTATTCTTGTTGCATCGGTTCCATGGGC
AGTACTCTTGATCGATGAGGATAGGGTTGCTAACGTTGTGGAGCATAATATTCTCGAAAC
TGATACCAGAGGCGGTCGTGGAGCAAGCTGCAGAGGGCCATGTCTTGATCCTCACACCAT
TATCAGTATTTCTGAGAGTGCAGTTCACGACCCTGATGCCAGTGACGTCTTCCTCGTGCC
CGTATAATCCAAGGCTTCCAATACTGATCCCGTGTCCCGGACCGCATGAGACT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2EH15JQ 562 0 0
AAAAGAAAACAGATTTTTTTT*ACAAAGATTCAAAGGAAATAACATACACTAGGGTGTAC
ATTTTAGTATTGCGTACGGGCTTCTAGTGGCCTGGTGCCTTCGTCAGTGGGCTGCTACAT
GCTTTAGGACACTGTTTACCCACCAGCTTCGGGGATATGTTACAGCACTGGAACGTTGCG
GGACCGTCTTTACCAGTATATTTAATATCAATGTCGCCGATCTCCACGTTCTTACACGGA
AATGCCTTGCTGCACAATAGCTTAACTGCGTCTTT*GTTCCCTGAGGTTCCTCTGATATT
CTTGAACTTTATGTCGACCAGCTTGATAGTTGATGGTTTATTCTTGTTGCATCGGTTCCA
TGGGCAGTACTCTTGATCGATGAGGATAGGGTTGCTAACGTTGTGGAGCATAATATTCTC
GAAACTGATACCAGAGGCGGTCGTGGAGCAAGCTGCAGAGGGCCATGTCTTGATCCTCAC
ACCATTATCAGTATTTCTGGGGGTGCAGTTCACGACCCTGATGCCAGTGACGTCTTCCTC
GTGCCCGTATAATCCAAGGCT
C

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2EH15TF 562 0 0
AAAAGAAAACAGATTTTTTTT*ACAAAGATTCAAAGGAAATAACATACACTAGGGTGTAC
ATTTTAGTATTGCGTACGGGCTTCTAGTGGCCTGGTGCCTTCGTCAGTGGGCTGCTACAT
GCTTTAGGACACTGTTTACCCACCAGCTTCGGGGATATGTTACAGCACTGGAACGTTGCG
GGACCGTCTTTACCAGTATATTTAATATCAATGTCGCCGATCTCCACGTTCTTACACGGA
AATGCCTTGCTGCACAATAGCTTAACTGCGTCTTT*GTTCCCTGAGGTTCCTCTGATATT
CTTGAACTTTATGTCGACCAGCTTGATAGTTGATGGTTTATTCTTGTTGCATCGGTTCCA
TGGGCAGTACTCTTGATCGATGAGGATAGGGTTGCTAACGTTGTGGAGCATAATATTCTC
GAAACTGATACCAGAGGCGGTCGTGGAGCAAGCTGCAGAGGGCCATGTCTTGATCCTCAC
ACCATTATCAGTATTTCTGGGGGTGCAGTTCACGACCCTGATGCCAGTGACGTCTTCCTC
GTGCCCGTATAATCCAAGGCT
C

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2H872JQ 712 0 0
G
CAGTGAAATCTTAGTTTCTCATTGCTATATTAGAAATTTTTTTTACAGGAATGATGCATT
TTATACAATCAATAAAGCTAGCAAAAATGCAAAATTTTAGGGGCCAAAACGGCAAAAAGA
AAACAGATTTTTTTTTACAAAGATTCAAAGGAAATAACATACACTAGGGTGTACATTTTA
GTATTGCGTACGGGCTTCTAGTGGCCTGGTGCCTTCGTCAGTGGGCTGCTACATGCTTTA
GGACACTGTTTACCCACCAGCTTCGGGGATATGTTACAGCACTGGAACGTTGCTGGACCG
TCTTTACCAGTATATTTAATATCAATGTCGCCGATCTCCACGTTCTTACACGGAAATGCC
TTGCTGCACAATAGCTTAACTGCGTCTTTTGTTCCCTGAGGTTCCTCTGATATTCTTGAA
CTTTATGTCGACCAGCTTGATAGTTGATGGTTTATTCTTGTTGCATCGGTTCCATGGGCA
GTACTCTTGATCGATGAGGATAGGGTTGCTAACGTTGTGGAGCATAATATTCTCGAAACT
GATACCAGAGGCGGTCGTGGAGCAAGCTGCAGAGGGCCATGTCTTGATCCTCACACCATT
ATCAGTATTTCTGAGGGTGCAGTTCACGACCCTGATGCCAGTGACGTCTTCCTCGTGCCC
GTATAATCCAAGGCTTCCAATACTGATCCCGTGTCCCGGACCGCATGAGAC

QA 2 712 2 712
DS 

RD RR2CH04JQ 721 0 0
CAGTGAAATCTTAGTTTCTCATTGCTATATTAGAAATTTTTTTTACAGGAATGATGCGTT
TTATACAATCAATAAAGCTAGCAAAAATGCAAAATTTTAGGGGCCAAAACGGCAAAAAGA
AAACAGATTTTTTTTCACAAAGATTCAAAGGGAATAACATACACTAGGGTGTACATTTTA
GTATTGCGTACGGGCTTCTAGTGGCCTGGTGCCTTCGTCAGTGGGCTGCTACATGCTTTA
GGACACTGTTTACCCACCAGCTTCGGGGATATGTTACAGCACTGGAACGTTGCTGGACCG
TCTTTACCAGTATATTTAATATCAATGTCGCCGATCTCCACGTTCTTACACGGAAATGCC
TTGCTGCACAATAGCTTAACTGCGTCTTT*GTTCCCTGAGGTTCCTCTGATATTCTTGAA
CTTTATGTCGACCAGCTTGATAGTTGATGGTTTATTCTTGTTGCATCGGTTCCATGGGCA
GTACTCTTGATCGATGAGGATAGGGTTGCTAACGTTGTGGAGCATAATATTCTCGAAACT
GATACCAGAGGCGGTCGTGGAGCAAGCTGCAGAGGGCCATGTCTTGATCCTCACACCATT
ATCAGTATTTCTGAGGGTGCAGTTCACGACCCTGATGCCAGTGACGTCTTCCCCGTGCCC
GTATAATCCAAGGCTTCCAATACTGATCCCGTGTCCCGGACCGCATGAGACTCCTTCGAC
A

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 15

CO CL225Contig1 735 15 19 U
GGGGCTCACATTCATCTCACACTCAAACCAAAATATATATATCACTAACTATGGCTCGTC
TTGACATTCTCCTCCTGGTCACTCTCCTCATCGCCAGTATCTCTGTCGTTGCATTGGCCG
AAGATTGCAGATACACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGATGCCTCCGGCACAGATT
CCGTCATAGGGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACATAGAAATTACAGACATTG
AGAGGTGGGGTGGGAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCGAGAATGGTAATCTGGACA
TTTTCGGTGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAGCCCAATATGTTTTCTGAGACTGAACTCTG
ATGGCTCCGGTAACAAACCCGGGTGGTATGTGGAGTACGTGGATGTTACAACGAGCAAAG
TTGGAAGCTTGAGCACGCATATACGCTTCAGTGTGCAGCAATGGCTTGCAATCGATGACA
GCCCGTATGAGCTATATGCAGAAATCAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCT
ATTCAATCGTATGAATCAATGAGGGTGTCTTGGAGACTGGTTATATGGTCACCTTGTGAA
CTCAAATGCAATAATGGTAACTGAATAAGACTGTCTTGTAAACGTGTGATATCAATAATG
GTAATAATTGAACGAAACTGTTGTCTTGTGTTGTAAAACAAATAATAAAATAAAATGTTA
TCTTGTTGAGTTTTT


BQ
30 45 45 45 45 45 45 60 60 65 65 65 65 70 70 70 40 70 70 70 40 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 
70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 55 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 40 80 50 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 40 10 50 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 45 40 55 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 30 
55 40 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2H542TF U 12
AF RR2DY87TF U 2
AF RR2CG17TF U 1
AF RR2FA32JQ C 572
AF RR2H542JQB C 104
AF RR2FA32TF U 8
AF RR2AG87JQ C 1
AF RR2AG87TF U 1
AF RR2CG17JQ C 1
AF RR2AN21JQ C 2
AF RR2AN21TF U 2
AF RR2CO03JQ C 6
AF RR2CO03TF U 6
AF RR2F356TF U 6
AF RR2F356JQ C 108
BS 1 13 RR2AG87TF
BS 14 169 RR2H542TF
BS 170 170 RR2DY87TF
BS 171 319 RR2H542TF
BS 320 320 RR2AG87TF
BS 321 343 RR2H542TF
BS 344 344 RR2AG87TF
BS 345 386 RR2H542TF
BS 387 405 RR2AG87TF
BS 406 406 RR2DY87TF
BS 407 593 RR2AG87TF
BS 594 594 RR2DY87TF
BS 595 606 RR2AG87TF
BS 607 607 RR2CG17TF
BS 608 609 RR2AG87TF
BS 610 610 RR2DY87TF
BS 611 721 RR2AG87TF
BS 722 722 RR2AN21TF
BS 723 735 RR2F356TF

RD RR2H542TF 380 0 0
GG
ATCTCACACTCAAACCAAAATATATATATCACTAACTATGGCTCGTCTTGACATTCTCCT
CCTGGTCACTCTCCTCATCGCCAGTATCTCTGTCGTTGCATTGGCCGAAGATTGCAGATA
CACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGATGCCTCTGGCACAGATTCCGTCATAGGGGT
TGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACATAGAAATTACAGACATTGAGAGGTGGGGTGG
GAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCGAGAATGGTAATCTGGACATTTTCGGTGGGAC
AAAGCA*TGTCTTCCGAGCCCAATATGTTT*CTGAGACTGAACTCTGATGGCTCCGGTAA
CAAACCCGGGTGG
ATGTG

QA 3 375 3 375
DS 

RD RR2DY87TF 660 0 0
GGGCTCACATTCATCTCACACTCAAACCAAAATATATATATCACTAACTATGGCTCGTCT
TGACATTCTCCTCCTGGTCACTCTCCTCATCGCCAGTATCTCTGTCGTTGCATTGGCCGA
AGATTGCAGATACACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGATGCCTCCGGCACAGATTC
CGTCATAGGGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACATAGAAATTACAGACATTGA
GAGGTGGGGTGGGAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCGAGAATGGTAATCTGGACAT
TTTCGGTGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAGCCCAATATGTTTTCTGAGACTGAACTCTGA
TGGCTCTGGTAACAAACCCGGGTGGTATGTGGAGTACGTGGATGTTACAACGAGCAAAGT
TGGAAGCTTGAGCACGCATATACGCTTCAGTGTGCAGCAATGGCTTGCAATCGATGACAG
CCCGTATGAGCTATATGCAGAAATCAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCTA
TTCAATCGTATGAATCAATGAGGGTGTCTTGGAGACTGGTTATATGGTCATCTTGTGAAC
TCAATAGCAATAATGGTAACTGAATAAGACTGTCTTGTAAACGTGTGATATCA
TAATGGT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2CG17TF 682 0 0
GGGGCTCACATTCATCTCACACTCAAACCAAAATATATATATCACTAACTATGGCTCGTC
TTGACATTCTCCTCCTGGTCACTCTCCTCATCGCCAGTATCTCTGTCGTTGCATTGGCCG
AAGATTGCAGATACACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGATGCCTCCGGCACAGATT
CCGTCATAGGGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACATAGAAATTACAGACATTG
AGAGGTGGGGTGGGAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCGAGAATGGTAATCTGGACA
TTTTCGGTGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAGCCCAATATGTTTTCTGAGACTGAACTCTG
ATGGCTCCGGTAACAAACCCGGGTGGTATGTGGAGTACGTGGATGTTACAACGAGCAAAG
TTGGAAGCTTGAGCACGCATATACGCTTCAGTGTGCAGCAATGGCTTGCAATCGATGACA
GCCCGTATGAGCTATATGCAGAAATCAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCT
ATTCAATCGTATGAATCAATGAGGGTGTCTTGGAGACTGGTTATATGGTCACCTTGTGAA
CTCAAATACAATAATGGTAACTGAATAAGACTGTCTTGTAAACGTGTGATATCAATAATG
GTAATAATTGAACGAAACTGTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2FA32JQ 153 0 0
GGG
GACTGGTTATATGGTCCCCTTGTGAACTCAAATGCAATAATGGTAACTGAATAAGACTGT
TTTGTAAACGTGTGATATCAATAATGGTAATAATTGAACGAAACTGTTGTTTTGTGTTGT
AAAACAAATAATAAAATAAAATGTT
TTTTT

QA 4 148 4 148
DS 

RD RR2H542JQB 617 0 0
TGTCGTTGCATTGGCCGAAGATTGCAGATACACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGA
TGCCTCTGGCACAGATTCCGTCATAGGGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACAT
AGAAATTACAGACATTGAGAGGTGGGGTGGGAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCGA
GAATGGTAATCTGGACATTTTCGGTGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAGCCCAATATGTTT
TTTGAGACTGAACTTTGATGGCTCCGGTAACAAACCCGGGTGGTATGTGGAGTACGTGGA
TGTTACAACGAGCAAAGTTGGAAGCTTGAGCACGCATATACGCTTCAGTGTGCAGCAATG
GCTTGCAATCGATGACAGCCCGTATGAGCTATATGCAGAAATCAACAAATGCTCATCTAA
TATCAAGAAGAGTGTCTATTCAATCGTATGAATCAATGAGGGTGTCTTGGAGACTGGTTA
TATGGTCACCTTGTGAACTCAAAAGCAATAATGGTAACTGAATAAGACTGTCTTGTAAAC
GTGTGATATCAATAATGGTAATAATTGAACGAAACTGTTGTCTTGTGTTGTAAAACAAAT
AATAAAATAAAATGTTA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2FA32TF 712 0 0
GG
ATTCATCTCACACTCGAACCAAAATATATATATCACTAACTATGGCTCGTCTTGACATTC
TCCTCCTGGTCACTCTCCTCATCGCCAGTATCTCTGTCGTTGCATTGGCCGAAGATTGCA
GATACACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGATGCCTCCGGCACAGATTCCGTCATAG
GGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACATAGAAATTACAGACATTGAGAGGTGGG
GTGGGAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCAAGAATGGTAATCTGGACATTTTCGGTG
GGACAAAGCAGTGTCTTCCGAGCCCAATATGTTTTCTGAGACTGAACTCTGATGGCTCCG
GTAACAAACCCGGGTGGTATGTGGAGTACGTGGATGTTACAACGAGCAAAGTTGGAAGCT
TGAGCACGCATATACGCTTCAGTGTGCAGCAATGGCTTGCAATCGATGACAGCCCGTATG
AGCTATATGCAGAAATCAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCTATTCAATCG
TATGAATCAATGAGGGTGTCTTGGAGACTGGTTATATGGTCACCTTGTGAACTCAAATGC
AATAATGGTAACTGAATAAGACTGTCTTGTAAACGTGTGATATCAATAATGGTAATAATT
GAACGAAACTGTTGTCTTGTGTTGTAAACAA
ATATAAATAAATGTTATCT

QA 3 693 3 693
DS 

RD RR2AG87JQ 732 0 0
GGGGCTCACATTCATCTCACGCTCAAACCAAAATATATATATCACTAACTATGGCTCGTC
TTGACATTCTCCTCCTGGTCACTCTCCTCATCGCCAGTATCTCTGTCGTTGCATTGGCCG
AAGATTGCAGATACACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGATGCCTCTGGCACAGATT
CCGTCATAGGGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACATAGAAATTACAGACATTG
AGAGGTGGGGTGGGAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCGAGAATGGTAATCTGGACA
TTTTCGGTGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAGCCCAATATGTTTTCTGAGACTGAACTCTG
ATGGCTCCGGTAACAAACCCGGGTGGTATGTGGAGTACGTGGATGCTACAACGAGCAAAG
TTGGAAGCTTGAGCACGCATATACGCTTCAGTGTGCAGCAATGGCTTGCAATCGATGACA
GCCCGTATGAGCTATATGCAGAAATCAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCT
ATTCAATCGTATGAATCAATGAGGGTGTCTTGGAGACTGGTTATATGGTCACCCTGTGAA
CTCAAAAGCGATAATGGTAACTGAATAAGACTGTCTTGTAAACGTGTGATATCAATAATG
GTAATAATTGAACGAAACTGTTGTCTTGTGTTGTAAAACAAATAATAAAATAAAATGTTA
T
TTTGTTGAGTT

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2AG87TF 732 0 0
GGGGCTCACATTCATCTCACGCTCAAACCAAAATATATATATCACTAACTATGGCTCGTC
TTGACATTCTCCTCCTGGTCACTCTCCTCATCGCCAGTATCTCTGTCGTTGCATTGGCCG
AAGATTGCAGATACACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGATGCCTCTGGCACAGATT
CCGTCATAGGGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACATAGAAATTACAGACATTG
AGAGGTGGGGTGGGAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCGAGAATGGTAATCTGGACA
TTTTCGGTGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAGCCCAATATGTTTTCTGAGACTGAACTCTG
ATGGCTCCGGTAACAAACCCGGGTGGTATGTGGAGTACGTGGATGCTACAACGAGCAAAG
TTGGAAGCTTGAGCACGCATATACGCTTCAGTGTGCAGCAATGGCTTGCAATCGATGACA
GCCCGTATGAGCTATATGCAGAAATCAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCT
ATTCAATCGTATGAATCAATGAGGGTGTCTTGGAGACTGGTTATATGGTCACCCTGTGAA
CTCAAAAGCGATAATGGTAACTGAATAAGACTGTCTTGTAAACGTGTGATATCAATAATG
GTAATAATTGAACGAAACTGTTGTCTTGTGTTGTAAAACAAATAATAAAATAAAATGTTA
T
TTTGTTGAGTT

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2CG17JQ 724 0 0
GGGGCTCACATTCATCTCACACTCAAACCAAAATATATATATCACTAACTATGGCTCGTC
TTGACATTCTCCTCCTGGTCACTCTCCTCATCGCCAGTATCTCTGTCGTTGCATTGGCCG
AAGATTGCAGATACACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGATGCCTCCGGCACAGATT
CCGTCATAGGGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACATAGAAATTACAGACATTG
AGAGGTGGGGTGGGAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCGAGAATGGTAATCTGGACA
TTTTCGGTGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAGCCCAATATGTTTTCTGAGACTGAACTCTG
ATGGCTCCGGTAACAAACCCGGGTGGTATGTGGAGTACGTGGATGTTACAACGAGCAAAG
TTGGAAGCTTGAGCACGCATATACGCTTCAGTGTGCAGCAATGGCTTGCAATCGATGACA
GCCCGTATGAGCTATATGCAGAAATCAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCT
ATTCAATCGTATGAATCAATGAGGGTGTCTTGGAGACTGGTTATATGGTCACCTTGTGAA
CTCAAATACAATAATGGTAACTGAATAAGACTGTCTTGTAAACGTGTGATATCAATAATG
GTAATAATTGAACGAAACTGTTGTCTTGTGTTGTAAAACAAATAATAAAATAAAATGTTA
TCTT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2AN21JQ 722 0 0
GGGCTCACATTCATCCCACACTCAAACCAAAATATATATATCACTAACTATGGCTCGTCT
TGACATTCTCCTCCTGGTCACTCTCCTCATCGCCAGTATCTCTGTCGTTGCATTGGCCGA
AGATTGCAGATACACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGATGCCTCCGGCACAGATTC
CGTCATAGGGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACATAGAAATTACAGACATTGA
GAGGTGGGGTGGGAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCGAGAATGGTAATCTGGACAT
TTTCGGTGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAGCCCAATATGTTTTCTGAGACTGAACTCTGA
TGGCTCCGGTAACAAACCCGGGTGGTATGTGGAGTACGTGGATGTTACAACGAGCAAAGT
TGGAAGCTTGAGCACGCATATACGCTTCAGTGTGCAGCAATGGCTTGCAATCGATGACAG
CCCGTATGAGCTATATGCAGAAATCAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCTA
TTCAATCGTATGAATCAATGAGGGTGTCTTGGAGACTGGTTATATGGTCACCTTGTGAAC
TCAAATGCAATAATGGTAACTGAATAAGACTGTCTTGTAAACGTGTGATATCAATAATGG
TAATAATTGAACGAAACTGTTGTCTTGTGTTGTAAAACAAATAATAAAATAAAATGTTAT
C
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2AN21TF 722 0 0
GGGCTCACATTCATCCCACACTCAAACCAAAATATATATATCACTAACTATGGCTCGTCT
TGACATTCTCCTCCTGGTCACTCTCCTCATCGCCAGTATCTCTGTCGTTGCATTGGCCGA
AGATTGCAGATACACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGATGCCTCCGGCACAGATTC
CGTCATAGGGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACATAGAAATTACAGACATTGA
GAGGTGGGGTGGGAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCGAGAATGGTAATCTGGACAT
TTTCGGTGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAGCCCAATATGTTTTCTGAGACTGAACTCTGA
TGGCTCCGGTAACAAACCCGGGTGGTATGTGGAGTACGTGGATGTTACAACGAGCAAAGT
TGGAAGCTTGAGCACGCATATACGCTTCAGTGTGCAGCAATGGCTTGCAATCGATGACAG
CCCGTATGAGCTATATGCAGAAATCAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCTA
TTCAATCGTATGAATCAATGAGGGTGTCTTGGAGACTGGTTATATGGTCACCTTGTGAAC
TCAAATGCAATAATGGTAACTGAATAAGACTGTCTTGTAAACGTGTGATATCAATAATGG
TAATAATTGAACGAAACTGTTGTCTTGTGTTGTAAAACAAATAATAAAATAAAATGTTAT
C
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2CO03JQ 720 0 0
GG
ACATTCATCTCACACTCAAACCAAAATATATATATCACTAACTATGGCCCGTCTTGACAT
TCTCCTCCTGGTCACTCTCCTCATCGCCAGTATCTCTGTCGTTGCATTGGCCGAAGATTG
CAGATACACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGATGCCTCCGGCACAGATTCCGTCAT
AGGGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACATAGAAATTACAGACATTGAGAGGTG
GGGTGTGAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCGAGAATGGTAATCTGGACATTTTCGG
TGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAGCCCAATATGTTTTCTGTGACTGAACTCTGATGGCTC
CGGTAACAAACCCGGGTGGTATGTGGAGTACGTGGATGTTACAACGAGCAAAGTTGGAAG
CTTGAGCACGCATATACGCTTCAGTGTGCAGCAATGGCTTGCAATCGATGACAGCCCGTA
TGAGCTATATGCAGAAATCAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCTATTCAAT
CGTATGAATCAATGAGGGTGTCTTGGAGACTGGTTATATGGTCACCTTGTGAACTCAAAT
GCAATAATGGTAACTGAATAAGACTGTCTTGTAAACGTGTGATATCAATAATGGTAATAA
TTGAACGAAACTGTTGTCTTGTGTTGTAAGACAAATAATAAAATAAAATGTTATCTT
G

QA 3 719 3 719
DS 

RD RR2CO03TF 728 0 0
GG
ACATTCATCTCACACTCAAACCAAAATATATATATCACTAACTATGGCCCGTCTTGACAT
TCTCCTCCTGGTCACTCTCCTCATCGCCAGTATCTCTGTCGTTGCATTGGCCGAAGATTG
CAGATACACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGATGCCTCCGGCACAGATTCCGTCAT
AGGGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACATAGAAATTACAGACATTGAGAGGTG
GGGTGTGAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCGAGAATGGTAATCTGGACATTTTCGG
TGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAGCCCAATATGTTTTCTGTGACTGAACTCTGATGGCTC
CGGTAACAAACCCGGGTGGTATGTGGAGTACGTGGATGTTACAACGAGCAAAGTTGGAAG
CTTGAGCACGCATATACGCTTCAGTGTGCAGCAATGGCTTGCAATCGATGACAGCCCGTA
TGAGCTATATGCAGAAATCAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCTATTCAAT
CGTATGAATCAATGAGGGTGTCTTGGAGACTGGTTATATGGTCACCTTGTGAACTCAAAT
GCAATAATGGTAACTGAATAAGACTGTCTTGTAAACGTGTGATATCAATAATGGTAATAA
TTGAACGAAACTGTTGTCTTGTGTTGTAAGACAAATA*TAAAATAAAATGTTAT
CTTGAAAAAAAA

QA 3 716 3 716
DS 

RD RR2F356TF 730 0 0
GG
ACATTCATCTCACACTCAAACCAAAATATATATATCACTAACTATGGCTCGTCTTTACAT
TCTCCTCCTGGTCACTCTCCTCATCGCCAGTATCTCTGTCGTTGCATTGGCCGAAGATTG
CAGATACACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGATGCCTCCGGCACAGATTCCGTCAT
AGGGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACATAGAAATTACAGACATTGAGAGGTG
GGGTGGGAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCGAGAATGGTGATCTGGACATTTTCGG
TGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAGCCCAATATGTTTTCTGAGACTGAACTCTGATGGCTC
TGGTAACAAACCCGGGTGGTATGTGGAGTACGTGGATGTTACAACGAGCAAAGTTGGAAG
CTTGAGCACGCATATACGCTTCAGTGTGCAGCAATGGCTTGCAATCGATGACAGCCCGTA
TGAGCTATATGCAGAAATCAACAAATGCTCATCTAATATCAAGAAGAGTGTCTATTCAAT
CGTATGAATCAATGAGGGTGTCTTGGAGACCGGTTATATGGTCATCTTGTGAACTCAATA
GCAATAATGGTAACTGAATAAGACTGTCTTGTAAACGTGTGATATCAATAATGGTAATAA
TTGAACAAAACTGTTGTCTTGTGTTGTAAAC**AATAATAAAATAAA*TGTTGTCTTGTT
GAGTTTTT

QA 3 730 3 730
DS 

RD RR2F356JQ 630 0 0
GTTGCATTGGCCGAAGATTGCAGATACACTATCAAAGTTCAAACCGGAACAAGAGATGCC
TCCGGCACAGATTCCGTCATAGGGGTTGAACTCGCCGATAAATCCGGCAAGTACATAGAA
ATTACAGACATTGAGAGGTGGGGTGGGAAAATGCCATCAGGTCATAACTACTTCGAGAAT
GGTGATCTGGACATTTTCGGTGGGACAAAGCAGTGTCTTCCGAGCCCAATATGTTTTTTG
AGACTGAACTTTGATGGCTCTGGTAACAAACCCGGGTGGTATGTGGAGTACGTGGATGTT
ACAACGAGCAAAGTTGGAAGCTTGAGCACGCATATACGCTTCAGTGTGCAGCAATGGCTT
GCAATCGATGACAGCCCGTATGAGCTATATGCAGAAATCAACAAATGCTCATCTAATATC
AAGAAGAGTGTCTATTCAATCGTATGAATCAATGAGGGTGTCTTGGAGACCGGTTATATG
GTCATCTTGTGAACTCAATAGCAATAATGGTAACTGAATAAGACTGTCTTGTAAACGTGT
GATATCAATAATGGTAATAATTGAACAAAACTGTTGTCTTGTGTTGTAAAACAAATAATA
AAATAAAATGTTGTCTTGTTGAGTT
TTTTT

QA 1 625 1 625
DS 



AS 2 11

CO CL226Contig1 1266 9 54 U
GGAAAGCGGGTCTATATTTTCGCTCAATCTCCGATCGATTCTCCTCCCTCATTTC*CAAC
GAAGCAAACCCTCTCGAGGAGATAACATCCGAAGAAACAAATCGAAATCGTACCATCGGA
GTTGATCCGAAGTCAGAATCTAAGGGGGGAGTCATGGGGGATCATGCGGTGAGAGCAGAG
GAATTCGAGAAGAAAGCAGAGAAGAAGCTCAACGGATGGGGAATATTCGGATCTAAGCAC
GAGGATGCTGCCGATCTCTTCGAGAAAGCTGCTAATTCCTATAAGCTCGCCAAATCATGG
GATCTAGCTGGAAAGGCTTATCTCAAAGTTGCTGACTGTCACTTGAAGTCGGACAGCAAG
CATGATGCTGCTAACGCCTATGCCGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGTTGACACTAAT
GAGGCTGCATCTTGTCTGGAGCGAGCAGTGAATATTTTCTGCGAGATAGGAAGGCTCAAC
ATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTATGAAGCAGACCAGAAGTTAGAG
CAGGCTATTGATTACTTTGAAAAGGCTGCTGAATTTTTCCAAAATGAAGAAGTGACCACT
TCTGCAAACCAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAATATGCTTCCCAGTTGGAGCAATATGAG
AAGGCTATCAAGATTTATGAAGATATAGCACGCCATTCACTCGGCAATAACTTGCTTAAG
TATGGAGTCAAGGGCCATCTTCTCAATGCTGGCTTGTGCCACCTTTGCAAAGCTGATGTT
GTTTCCATCACCAATGCTCTCGAGAAGTATCAGGATCTGGATCCAACTTTTACAGGAACA
AGAGAATGCAAACTCTTATCGGACCTTGCTTCTGCTATCGATGAAGAAGACATCGCAAAA
TTCACAGACGTTGTCAAGGAATTTGATAGCATGACTCCTCTGGACTCATGGAAGACAACT
ATGTTGTTGAGGGTGAAGGAGAAGCTGAAGGCGAAAGAGCTTGAAGAGGATGATCTCACC
TAAACATATCTCTTTCCATCCGAAGCTTTGGTCTTTATTTGTTATTGCTGGTGTGTACTC
ATCATTTGTGTTCGTGCTATTTCATGTTCGACCCTTCATTGTGTCTGGTTTATGAGATTT
AAGGTTTCTTAAGAGGTTTGGTCAAAACTATGTTTGTTTGATATCACGACTATGTTTGTT
ACGTCTCTCATTACTTCAT**CTATGTGAAATTCTCAACTACTTGGAGATTTGATTTGCT
TACATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 25 40 15 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2DQ87TF U 1
AF RR2DP57TF U 49
AF RR2F845TF U 48
AF RR2BT58TF U 1
AF RR2EV06TF U 1
AF RR2EB49TF U 223
AF RR2EV06JQ C 489
AF RR2BT58JQ C 520
AF RR2DP57JQ C 580
BS 1 24 RR2BT58TF
BS 25 28 RR2DQ87TF
BS 29 29 RR2BT58TF
BS 30 30 RR2DQ87TF
BS 31 55 RR2BT58TF
BS 56 56 RR2DQ87TF
BS 57 323 RR2BT58TF
BS 324 324 RR2DQ87TF
BS 325 632 RR2BT58TF
BS 633 633 RR2EV06TF
BS 634 641 RR2BT58TF
BS 642 642 RR2EV06TF
BS 643 663 RR2BT58TF
BS 664 664 RR2EB49TF
BS 665 706 RR2BT58TF
BS 707 707 RR2EV06TF
BS 708 709 RR2BT58TF
BS 710 710 RR2EB49TF
BS 711 735 RR2BT58TF
BS 736 736 RR2EB49TF
BS 737 748 RR2BT58TF
BS 749 749 RR2EV06TF
BS 750 789 RR2EB49TF
BS 790 791 RR2EV06JQ
BS 792 792 RR2BT58JQ
BS 793 844 RR2EV06JQ
BS 845 845 RR2BT58JQ
BS 846 852 RR2EV06JQ
BS 853 853 RR2BT58JQ
BS 854 960 RR2EV06JQ
BS 961 961 RR2BT58JQ
BS 962 983 RR2EV06JQ
BS 984 984 RR2BT58JQ
BS 985 992 RR2EV06JQ
BS 993 993 RR2BT58JQ
BS 994 995 RR2EV06JQ
BS 996 996 RR2BT58JQ
BS 997 1037 RR2EV06JQ
BS 1038 1038 RR2BT58JQ
BS 1039 1069 RR2EV06JQ
BS 1070 1070 RR2BT58JQ
BS 1071 1099 RR2EV06JQ
BS 1100 1100 RR2BT58JQ
BS 1101 1167 RR2EV06JQ
BS 1168 1168 RR2BT58JQ
BS 1169 1219 RR2EV06JQ
BS 1220 1221 RR2BT58JQ
BS 1222 1230 RR2EV06JQ
BS 1231 1231 RR2BT58JQ
BS 1232 1241 RR2EV06JQ
BS 1242 1242 RR2BT58JQ
BS 1243 1246 RR2EV06JQ
BS 1247 1248 RR2BT58JQ
BS 1249 1266 RR2DP57JQ

RD RR2DQ87TF 538 0 0
GGAAAGCGGGTCTATATTTTCGCTCAATCTCCGATCGATTCTCCTCCCTCATTTC**AAC
GAAGCAAACCCTCTCGAGGAGATAACATCCGAAGAAACAAATCGAAATCGTACCATCGGA
GTTGATCCGAAGTCAGAATCTAAGGGGG*AGTCATGGGGGATCATGCGGTGAGAGCGGAG
GAATTCGAGAAGAAAGCAGAGAAGAAGCTCAACGGATGGGGAATATTCGGATCTAAGCAC
GAGGATGCTGCCGATCTCTTCGAGAAAGCTGCTAATTCCTATAAGCTCGCCAAATCATGG
GATCTAGCTGGAAAGGCTTATCTCAAAGTTGCTGACTGTCACTTGAAGTCGGACAGCAAG
CATGATGCTGCTAACGCCTATGCCGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGTTGACACTAAT
GAGGCTGCATCTTGTCTGGAGCGAGCAGTGAATATTTTCTGCGAGATAGGAAGGCTCAAC
ATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTATGAAGCAGACCAGAAGTTAG

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2DP57TF 536 0 0
GGATTTCG
CAACGAAGCAAACCCTCTCGAGGAGATAACATCCGAAGAAACAAATCGAAATCGTACCAT
CGGAGTTGATCCGAAGTCAGAATCTAAGGGGGGAGTCATGGGGGATCATGCGGTGAGAGC
AGAGGAATTCGAGAAGAAAGCAGAGAAGAAGCTCAACGGATGGGGAATATTCGGATCTAA
GCACGAGGATGCTGCCGATCTCTTCGAGAAAGCTGCTAATTCCTATAAGCTCGCCAAATC
ATGGGATCTAGCTGGAAAGGCTTATCTTAAAGTTGCTGACTGTCACTTGAAGTCGGACAG
CAAGCATGATGCTGCTAACGCCTATGCTGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGTTGACAC
TAATGAGGCTGCATCTTGTCTGGAGCGAGCAGTGAATATTTTCTGCGAGATAGGAAGGCT
CAACATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTATGAAGCAGACCATAAGTT
AGAGCAGGCTATTGATTACTTTGGAAAGGCTGCTGAATTTTTCCAAAA

QA 9 536 9 536
DS 

RD RR2F845TF 575 0 0
GGGATTTCGCAG
CGAAGCAAACCCTCTCGAGGAGATAACATCCGAAGAAACAAATCGAAATCGTACCATCGG
AGTTGATCCGAAGTCAGAATCTAAGGGGGGAGTCATGGGGGATCATGCGGTGAGAGCAGA
GGAATTCGAGAAGAAAGCAGAGAAGAAGCTCAACGGATGGGGAATATTCGGATCTAAGCA
CGAGGATGCTGCCGATCTCTTCGAGAAAGCTGCTAATTCCTATAAGCTCGCCAAATCATG
GGATCTAGCTGGAAAGGCTTATCTTAAAGTTGCTGACTGTCACTTGAAGTCGGACAGCAA
GCATGATGCTGCTAACGCCTATGCCGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGTTGACACTAA
TGAGGCTGCATCTTGTCTGGAGCGAGCAGTGAATATTTTCTGCGAGATGGGAAGGCTCAA
CATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTATGAAGCAGACCAGAAGTTAGA
GCAGGCTATTGATTACTTTGAAAAGGCTGCTGAATTTTTCCAAAATGAAGAAGTGACCAC
TTCTGCAAACCAGTGCAATCTAA

QA 13 575 13 575
DS 

RD RR2BT58TF 748 0 0
GGAAAGCGGGTCTATATTTTCGCT****CCCCGATCGATTCTCCTCCCTCATTTCGCAAC
GAAGCAAACCCTCTCGAGGAGATAACATCCGAAGAAACAAATCGAAATCGTACCATCGGA
GTTGATCCGAAGTCAGAATCTAAGGGGGGAGTCATGGGGGATCATGCGGTGAGAGCAGAG
GAATTCGAGAAGAAAGCAGAGAAGAAGCTCAACGGATGGGGAATATTCGGATCTAAGCAC
GAGGATGCTGCCGATCTCTTCGAGAAAGCTGCTAATTCCTATAAGCTCGCCAAATCATGG
GATCTAGCTGGAAAGGCTTATCTTAAAGTTGCTGACTGTCACTTGAAGTCGGACAGCAAG
CATGATGCTGCTAACGCCTATGCCGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGTTGACACTAAT
GAGGCTGCATCTTGTCTGGAGCGAGCAGTGAATATTTTCTGCGAGATAGGAAGGCTCAAC
ATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTATGAAGCAGACCAGAAGTTAGAG
CAGGCTATTGATTACTTTGAAAAGGCTGCTGAATTTTTCCAAAATGAAGAAGTGACCACT
TCTGCAAACCAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAGTATGCTTCGCAGTTGGAGCAATATGAG
AAG*CTATCAAGATTTATGAAGATATAGCACGCCATTCACTCGGCA*TA*CTTGCTTAAG
TATGGAGTCAAGGGC*ATCTTCTCAATG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2EV06TF 749 0 0
GGAAAGCGGGTCTATATTTTCGCTCAATCTCCGATCGATTCTCCTCCCTCATTTC**AAC
GAAGCAAACCCTCTCGAGGAGATAACATCCGAAGAAACAAATCGAAATCGTACCATCGGA
GTTGATCCGAAGTCAGAATCTAAGGGGG*AGTCATGGGGGATCATGCGGTGAGAGCGGAG
GAATTCGAGAAGAAAGCAGAGAAGAAGCTCAACGGATGGGGAATATTCGGATCTAAGCAC
GAGGATGCTGCCGATCTCTTCGAGAAAGCTGCTAATTCCTATAAGCTCGCCAAATCATGG
GATCTAGCTGGAAAGGCTTATCTCAAAGTTGCTGACTGTCACTTGAAGTCGGACAGCAAG
CATGATGCTGCTAACGCCTATGCCGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGTTGACACTAAT
GAGGCTGCATCTTGTCTGGAGCGAGCAGTGAATATTTTCTGCGAGATAGGAAGGCTCAAC
ATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTATGAAGCAGACCAGAAGTTAGAG
CAGGCTATTGATTACTTTGAAAAGGCTGCTGAATTTTTCCAAAATGAAGAAGTGACCACT
TCTGCAAACCAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAATATGCTTCCCAGTTGGAGCAATATGAG
AAG*CTATCAAGATTTATGAAGATATAGCACGCCATTCACTCGGCAATA*CTTGCTTAAG
TATGGAGTTAAGG*C*ATCTTCTCAATGC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2EB49TF 567 0 0
ATATTCGGATCTAAGCACGAGGATGCTGCCGATCTCCTCGAGAAAGCTGCTAATTCCTAT
AAGCTCGCCAAATCATGGGATCTAGCTGGAAAGGCTTATCTCAAAGTTGCTGACTGTCAC
TTGAAGTCGGACAGCAAGCATGATGCTGCTAACGCCTATGCCGAAGCTGCTAAATGCTAC
AAGAAAGTTGACACTAATGAGGCTGCATCTTGTCTGGAGCGAGCAGTGAATATTTTCTGC
GAGATAGGAAGGCTCAACATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTATGAA
GCAGACCAGAAGTTAGAGCAGGCTATTGATTACTTTGAAAAGGCTGCTGAATTTTTCCAA
AATGAAGAAGTGACCACTTCTGCAAACCAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAATATGCTTCC
CAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCTATCAAGATTTATGAAGATATAGCACGCCATTCACTC
GGCAATAACTTGCTTAAGTATGGAGTTAAGGGCCATCTTCTCAATGCTGGCTTGTGCCAC
CTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATC

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2EV06JQ 758 0 0
CAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTATGAAGCAGACCAGAAGTTAGAGCAGGCTAT
TGATTACTTTGAAAAGGCTGCTGAATTTTTCCAAAATGAAGAAGTGACCACTTCTGCAAA
CCAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAATATGCTTCCCAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCTAT
CAAGATTTATGAAGATATAGCACGCCATTCACTCGGCAATAACTTGCTTAAGTATGGAGT
TAAGGGCCATCTTCTCAATGCTGGCTTGTGCCACCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCAT
CACTAATGCTCTCGAGAAGTATCAGGATCTGGATCCAACTTTTACAGGAACAAGAGGATG
CAAATTCTTATCGGACCTTGCTTCTGCTATCGATGAAGAAGACATCGCAAAATTCACAGA
CGTTGTCAAGGAATTTGATAGCATGACTCCTCTGGACTCATGGAAGACAACT*TGTTGTT
GAGGGTGAAGGAGAAACTGAAGGCAAAGGAGCTTGAAGAGGATGATCTCACCTAAACATA
TCTCTTTCCGTCCGAAGCTTTGGTCTTTATTTGTTATTGCTAGTGTGTACTCATCATTTG
TGTTCGTGCTACTTCATGTTCGACCCTTCATTGTGTCTGGTTTATGAGATTTAAGGTTTC
TTAAGAGGTTTGGTCAAAATTATGTTTGTTTGATATCACGACTATGTTTGTTACGTCTCT
CATTACTTCATATCTATGTGAACTTCTCAACTATTTGG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2BT58JQ 729 0 0
GAAGCAGACCAGAAGTTAGAGCAGGCTATTGATTACTTTGAAAAGGCTGCTGAATTTTTC
CAAAATGAAGAAGTGACCACTTCTGCAAACCAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAGTATGCT
TCGCAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCTATCAAGATTTATGAAGATATAGCACGCCATTCA
CTCGGCAATAACTTGCTTAAGTATGGAGTCAAGGGCCATTTTTTCAATGCTGGCTTGTGC
CACCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATCACCAATGCTCTCGAGAAGTATCAGGATCTG
GATCCAACTTTTACAGGAACAAGAGAATGCAAACTTTTATCGGACCTTGCTTTTGCTATC
GATGAAGAAGACATCGCAAAATTCACAGACGTTGTCAAGGAACTTGATAGCATGACTCCT
CTGGACTCATGGAAGACAACTATGTTGTTGAGGGTGAAGGAGAAGCTGAAGGCGAAAGAG
CTTGAAGAGGATGATCTCACCTAAACATATCTCTTTCCATCCGAAGCTTTGGTCTTTATT
TGTTATTGTTGGTGTGTACTCATCATTTGTGTTCGTGCTATTTCATGTTCGACCCTTCAT
TGTGTTTGGTTTATGAGATTTAAGGTTTCTTAAGAGGTTTGGTCAAAACTATGTTTGTTT
GATATCACGACTATGTTTGTTACGTCTCTCATTACTTCAT**CTATGTGAAATTCTCAAC
TACTTGGAG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2DP57JQ 687 0 0
CAAAATGAAGAAGTGACCACTTCTGCAAACCAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAGTATGCT
TCGCAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCTATCAAGATTTATGAAGATGTAGCACGCCATTCA
CTCGGCAATAACTTGCTTAAGTATGGAGTCAAGGGCCATCTTCTCAATGCTGGCTTTTGC
CACCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATCACCAATGCTCTCGAGAAGTATCAGGATCTG
GATCCAACTTTTACAGGAACAAGAGAATGCAAACTCTTATCGGACCTTGCTTCTGCTATC
GATGAAGAAGACATCGCAAAATTCACAGACGTTGTCAAGGAATTTGATAGCATGACTCCT
CTGGACTCATGGAAGACAACTATGTTGTTGAGGGTGAAGGAGAAGCTGAAGGCGAAAGAG
CTTGAAGAGGATAATCTCACCTAAACATATCTCTTTCCATCCGAAGCTTTGGTCTTTATT
TGTTATTGCTGGTGTGTACTCATCATTTGTGTTCGTGCTATTTCATGTTCGACCCTTCAT
TGTGTCTGGTTTATGAGATTTAAGGTTTCTTAAGAGGTTTGGTCAAAACTATGTTTGTTT
GATATCACGACTATGTTTGTTACGTCTCTCATTACTTCAT**CTATGTGAAATTCTCAAC
TACTTGGAGATTTGATTTGCTTACATC

QA 1 687 1 687
DS 



CO CL226Contig2 1105 2 4 U
GGGGTTTGCAGCGAAAGAAAACCCGTCGAAGCAAAAATCCTGTGGAAAGGGATAGATAGT
CATGGGGGATCATCTGGTGAGAGCTGAGGAATTCGAGAAGAAGGCTGAGAAGAAGCTCAA
CGGATGGGGAATCTTCGGATCTAAGTACGAGGATGCTGCTGATCTCCTCGAGAAATCTGC
TAATTCTTATAAGCTCGCCAAATCATGGGATCTAGCTGGAAAGGCTTATCTTAAACTTGC
TGATTGTCACTTAAAGTCCGACAGCAAACATGATGCTGCCAACGCTTACGCCGAAGCTGC
TAAATGCTACAAGAAAGTTGACACTAATGAGGCTGCATCTTGTCTAGAGCAAGCAGTGGA
TATATTCTGCGAGATAGGAAGGCTCAACATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGA
GTATTATGAAGCTGACCAGAAGATCGACCAGGCTATTTCTTACTTTGAAAAGGCAGCTGA
GTTCTTTCAAAACGAAGAAGTGACCACCTCTGCAAACCAGTGCAATCTCAAGGTGGCACA
ATATGCTGCACAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCCATCAAGATTTATGAAGAGATAGCATG
CCAATCTCTCAACAATAACTTGCTTAAGTATGGAGTTAAGGGACATCTTCTCAATGCTGG
CATGTGCCACCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATCACCAATGCGCTGGAGAGATATCA
GGATCTTGATCCAACTTTTACAGGAACAAGAGAATGCAAATTCTTATCTGACCTTGCTTC
TGCTATTGATGAAGAAGACATAGCAAAGTTCACAGACGTTGTCAAGGAGTTTGATAGCAT
GACTCCTCTGGATTCATGGAAGACGACTATGTTGTTGAGGGTGAAGGAGAAGCTGAAAGC
AAAGGAGCTCGAGGAAGATGATCTTACCTAAACATATATCTCTCTATGTAACCCAAGCTT
TCCCTTATTAATTACTGCTGGTTCGTATCACCACTAGTGTTAGTGTTACTTCTTCATTCA
TGTTTGGTTTTATTGTGTGAGGTTATCAGCTTCTAAGGTTGCCTGTGAGGTTTGATAAAA
TTGGTTTGTTTGATATCAAAAGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E146TF U 1
AF RR2E146JQ C 369
BS 1 721 RR2E146TF
BS 722 722 RR2E146JQ
BS 723 739 RR2E146TF
BS 740 1105 RR2E146JQ

RD RR2E146TF 739 0 0
GGGGTTTGCAGCGAAAGAAAACCCGTCGAAGCAAAAATCCTGTGGAAAGGGATAGATAGT
CATGGGGGATCATCTGGTGAGAGCTGAGGAATTCGAGAAGAAGGCTGAGAAGAAGCTCAA
CGGATGGGGAATCTTCGGATCTAAGTACGAGGATGCTGCTGATCTCCTCGAGAAATCTGC
TAATTCTTATAAGCTCGCCAAATCATGGGATCTAGCTGGAAAGGCTTATCTTAAACTTGC
TGATTGTCACTTAAAGTCCGACAGCAAACATGATGCTGCCAACGCTTACGCCGAAGCTGC
TAAATGCTACAAGAAAGTTGACACTAATGAGGCTGCATCTTGTCTAGAGCAAGCAGTGGA
TATATTCTGCGAGATAGGAAGGCTCAACATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGA
GTATTATGAAGCTGACCAGAAGATCGACCAGGCTATTTCTTACTTTGAAAAGGCAGCTGA
GTTCTTTCAAAACGAAGAAGTGACCACCTCTGCAAACCAGTGCAATCTCAAGGTGGCACA
ATATGCTGCACAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCCATCAAGATTTATGAAGAGATAGCATG
CCAATCTCTCAACAATAACTTGCTTAAGTATGGAGTTAAGGGACATCTTCTCAATGCTGG
CATGTGCCACCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATCACCAATGCGCTGGAGAGATATCA
G*ATCTTGATCCAACTTTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2E146JQ 737 0 0
GCGAGATAGGAAGGCTCAACATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTATG
AAGCTGACCAGAAGATCGACCAGGCTATTTCTTACTTTGAAAAGGCAGCTGAGTTCTTTC
AAAACGAAGAAGTGACCACCTCTGCAAACCAGTGCAATCTCAAGGTGGCACAATATGCTG
CACAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCCATCAAGATTTATGAAGAGATAGCATGCCAATCTC
TCAACAATAACTTGCTTAAGTATGGAGTTAAGGGACATCTTCTCAATGCTGGCATGTGCC
ACCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATCACCAATGCGCTGGAGAGATATCAGGATCTTG
ATCCAACTTTTACAGGAACAAGAGAATGCAAATTCTTATCTGACCTTGCTTCTGCTATTG
ATGAAGAAGACATAGCAAAGTTCACAGACGTTGTCAAGGAGTTTGATAGCATGACTCCTC
TGGATTCATGGAAGACGACTATGTTGTTGAGGGTGAAGGAGAAGCTGAAAGCAAAGGAGC
TCGAGGAAGATGATCTTACCTAAACATATATCTCTCTATGTAACCCAAGCTTTCCCTTAT
TAATTACTGCTGGTTCGTATCACCACTAGTGTTAGTGTTACTTCTTCATTCATGTTTGGT
TTTATTGTGTGAGGTTATCAGCTTCTAAGGTTGCCTGTGAGGTTTGATAAAATTGGTTTG
TTTGATATCAAAAGACT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 14

CO CL227Contig1 1098 14 11 U
GGGAACTTCCTATCTAAAACCTAGCGGCTGCTCTGTCAGTTTCCTTATCAACTTTTCATG
GACAAAGAAGGCATGAGGCTCAAAAAATGCTCCACATCCACCGATGTTGAGCACACACAT
GACCCCAGTGATTCGAGGACAGGCGAAAAGAAGCGCAAGAGATCCACCGTTCACGAGGCC
ACCAAACATTCGCGGAAAGTGAAAAAAGTTCGAGCGTCTAGAAAAAAGACTGCTGTTCAT
GATGCCACTATTGGTGGACTGGCCGCAAGCATAAAAGAGGCCCATGATGAAATCACAGAG
TTGAGAGAATCTATCGAAGAGATGACTGAAACTATGAAAAAACAACATGAGACATTATTG
ACAATGGCTGGAGCTATGAAAAACCTACCGGTGAAAGAAACCTCAAAAGAAAAGTCCACA
ATCGAAAGAGAGTGTGCTTTGGCACGGAAGTATCAACCAAATAATAAGAATACCATTTTC
GTTAAGGGATATGATCCCTCTATGCGTAGGGATCATGTCGAGAAGGCATTGATTGAACAT
TTTGGTTCATGTGGAGAGATCACAAGGGTGTTTGTTCCCTTCAAGTGTTACAGCCTTACT
AGCTTAGGATTTGCTTTCATTGATCTGAAAGAAGATCATAGGAAGGCTTTGCTACTCGAT
GGAAGTTACATGGG*AGGAAGGAAGCTTGAAGTTACGATGGCTTTTGACAGGGAAGAATT
TAATCCTTACGAAACTATTAGTGGGTGTTCAGATTGTAGGCGTAATGTGCTCAAACGCAC
TAAAAGGAGCTTTTATGGCTCTGGCGTATTTCGGCCACTTAGAAAATTCTCATCACCTTC
AAGTCTACACAGACTATCCTGATAACCTTAATCAACAAGCAGGAGATGGACATCTCTCTT
CAAAATATTCTTCATGATATCTTGCTGTTGTAAAACTCTTTTGTTGTAGTTTCTTTTCAT
TCTCTCTCTCGTGCTGCAAACTCACTTGCTGACAACCTTGCGAAGTCAGCCTTGCTTGAG
TTGCAGAATCTTCCTCTTCCTGAGAACTAATTTGTAGTTGGTTGAGACTCTTTTATTAAG
TAATGCATTTGTTTGATC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 55 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 35 35 

AF RR2E886TF U 2
AF RR2F469TF U 1
AF RR2GT44TF U 10
AF RR2DM11TF U 11
AF RR2AF02TF U 2
AF RR2DM11JQ C 623
AF RR2AF02JQ C 268
AF RR2FH28JQ C 494
AF RR2FH28TF U 494
AF RR2GN62TF U 468
AF RR2F469JQ C 442
AF RR2GX18JQ C 417
AF RR2GT44JQB C 398
AF RR2E886JQ C 319
BS 1 195 RR2F469TF
BS 196 196 RR2GT44TF
BS 197 585 RR2F469TF
BS 586 586 RR2GT44TF
BS 587 644 RR2F469TF
BS 645 645 RR2AF02TF
BS 646 707 RR2F469TF
BS 708 757 RR2AF02TF
BS 758 1089 RR2FH28TF
BS 1090 1090 RR2GN62TF
BS 1091 1098 RR2FH28TF

RD RR2E886TF 605 0 0
GGAACTTCCTATCTAAAACCTAGCGGCTGCTCTGTCAGTTTCCTTATCAACTTTTCATGG
ACAAAGAAGGCATGAGGCTCAAAAAATGCTCCACATCCACCGATGTTGAGCACACACATG
ACCCCAGTGATTCGAGGACAGGCGAAAAGAAGCGCAAGAGATCCACCGTTCACGAGGCCA
CCAAACATTCGCGGAAAGTGAAAAAAGTTCGAGCGTCTAGAAAAAAGACTGCTGTTCATG
ATGCCACTATTGGTGGACTGGCCGCAAGCATAAAAGAGGCCCATGATGAAATCACAGAGT
TGAGAGAATCTATCGAAGAGATGACTGAAACTATGAAAAAACAACATGAGACATTATTGA
CAATGGCTGGAGCTATGAAAAACCTACCGGTGAAAGAAACCTCAAAAGAAAAGTCCACAA
TCGAAAGAGAGTGTGCTTTGGCACGGAAGTATCAACCAAATAATAAGAATACCATTTTCG
TTAAGGGATATGATCCCTCTATGCGTAGGGATCATGTCGAGAAGGCATTGATTGAACATT
TTGGTTCATGTGGAGAGATCACAAGGGTGTTTGTTCCCTTCAAGTGCTACAGCCTTACTA
GCTTA

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2F469TF 707 0 0
GGGAACTTCCTATCTAAAACCTAGCGGCTGCTCTGTCAGTTTCCTTATCAACTTTTCATG
GACAAAGAAGGCATGAGGCTCAAAAAATGCTCCACATCCACCGATGTTGAGCACACACAT
GACCCCAGTGATTCGAGGACAGGCGAAAAGAAGCGCAAGAGATCCACCGTTCACGAGGCC
ACCAAACATTCGCGGGAAGTGAAAAAAGTTCGAGCGTCTAGAAAAAAGACTGCTGTTCAT
GATGCCACTATTGGTGGACTGGCCGCAAGCATAAAAGAGGCCCATGATGAAATCACAGAG
TTGAGAGAATCTATCGAAGAGATGACTGAAACTATGAAAAAACAACATGAGACATTATTG
ACAATGGCTGGAGCTATGAAAAACCTACCGGTGAAAGAAACCTCAAAAGAAAAGTCCACA
ATCGAAAGAGAGTGTGCTTTGGCACGGAAGTATCAACCAAATAATAAGAATACCATTTTC
GTTAAGGGATATGATCCCTCTATGCGTAGGGATCATGTCGAGAAGGCATTGATTGAACAT
TTTGGTTCATGTGGAGAGATCACAAGGGTGTTTGTTCCCTTCAAGCGTTACAGCCTTACT
AGCTTAGGATTTGCTTTCATTGATCTGAAAGAAGATCATAGGAAAGCTTTGCTACTCGAT
GGAAGTTACATGGG*AGGAAGGAAGCTTGAAGTTACGATGGCTTTTG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2GT44TF 698 0 0
GG
ATCTAAAACCTAGCGGCTGCTCTGTCAGTTTCCTTATCAACTTTTCATGGACAAAGAAGG
CATGAGGCTCAAAAAATGCTCCACATCCACCGATGTTGAGCACACACATGACCCCAGTGA
TTCGAGGACAGGCGAAAAGAAGCGCAAGAGATCCACCGTTCACGAGGCCACCAAGCATTC
GCGGAAAGTGAAAAAAGTTCGAGCGTCTAGAAAAAAGACTGCTGTTCATGATGCCACTAT
TGGTGGACTGGCCGCAAGCATAAAAGAGGCCCATGATGAAATCACAGAGTTGAGAGAATC
TATCGAAGAGATGACTGAAACTATGAAAAAACAACATGAGACATTATTGACAATGGCTGG
AGCTATGAAAAACCTACCGGTGAAAGAAACCTCAAAAGAAAAGTCCACAATCGAAAGAGA
GTGTGCTTTGGCACGGAAGTATCAACCAAATAATAAGAATACCATTTTCGTTAAGGGATA
TGATCCCTCTATGCGTAGGGATCATGTCGAGAAGGCATTGATTGAACATTTTGGTTCATG
TGGAGAGATCACAAGGGTGTTTGTCCCCTTCAAGTGTTACAGCCTTACTAGCTTAGGATT
TGCTTTCATTGATCTGAAAGAAGATCATAGGAA*GCTTTGCTACTCGATGGAAGTTACAT
GGGGAGGAAGGAAGCTTGAAGTTACGATGGCTTTTG

QA 3 698 3 698
DS 

RD RR2DM11TF 706 0 0
G
ATCTAAAACCTAGCGGCTGCTCTGTCAGTTTCCTTATCAACTTTTCATGGACAAAGAAGG
CATGAGGCTCAAAAAATGCTCCACATCCACCGATGTTGAGCACACACATGACCCCAGTGA
TTCGAGGACAGGCGAAAAGAAGCGCAAGAGATCCACCGTTCACGAGGCCACCAAACATTC
GCGGAAAATGAAAAAAGTTCGAGCGTCTAGAAAAAAGACTGCTGTTCATGATGCCACTAT
TGGTGGACTGGCCGCAAGCATAAAAGAGGCCCATGATGAAATCACAGAGTTGAGAGAATC
TATCGAAGAGATGACTGAAACTATGAAAAAACAACATGAGGCATTATTGACAATGGCTGG
AGCTATGAAAAACCTACCGGTGAAAGAAACCTCAAAAGAAAAGTCCACAATCGAAAGAGA
GTGTGCTTTGGCACGGAAGTATCAACCAAATAATAAGAATACCATTTTCGTTAAGGGATA
TGATCCCTCTATGCGTAGGGATCATGTCGAGAAGGCATTGATTGAACATTTTGGTTCATG
TGGAGAGATCACAAGGGTGTTTGTTCCCTTCAAGTGTTACAGCCTTACTAGCTTAGGATT
TGCCTTCATTGATCTGAAAGAAGATCATAGGAAGGCTTTGCTACTCGATGGAAGTTACAT
GGG*AGGAAAGAAGCTTGAAGTTACGATGGCTTTTGACAGG
AAGA

QA 2 702 2 702
DS 

RD RR2AF02TF 756 0 0
GGAACTTCCTATCTAAAACCTAGCGGCTGCTCTGTCAGTTTCCTTATCAACTTTTCATGG
ACAAAGAAGGCATGCGGCTCAAAAAATGCTCCACATCCACCGATGTTGAGCACACACATG
ACCCCAGTGATTCGAGGACAGGCGAAAAGAAGCGCAAGAGATCCACCGTTCACGAGGCCA
CCAAACATTCGCGGAAAGTGAAAAAAGTTCGAGCGTCTAGAAAAAAGACTGCTGTTCATG
ATGCCGCTATTGGTGGACTGGCCGCAAGCATAAAAGAGGCCCATGATGAAATCACAGAGT
TGAGAGAATCTATCGAAGAGATGACTGAAACTATGAAAAAACAACATGAGACATTATTGA
CAATGGCTGGAGCTATGAAAAACCTACCGGTGAAAGAAACCTCAAAAGAAAAGTCCACAA
TCGAAAGAGAGTGTGCTTTGGCACGGAAGTATCAACCAAATAATAAGAATACCATTTTCG
TTAAGGGATATGATCCCTCTATGCGTAGGGATCATGTCGAGAAGGCATTGATTGAACATT
TTGGTTCATGTGGAGAGATCACAAGGGTGTTTGTTCCCTTCAAGTGTTACAGCCTTACTA
GCTTAGGATTTGCTTTCATTGATCTGAAAGAAGATCATAGGAAGGCTTTGCTACTCGATG
GAAGTTACATGGG*AGGAAAGAAGCTTGAAGTTACGATGGCTTTTGACAGGGAAGAATTT
AATCCTTACGAAACTATTAGTGGGTGTTCAGATTGT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2DM11JQ 381 0 0
ATCTGAAAGAAGATCATAGGAAGGCTTTGCTACTCGATGGAAGTTACATGGG*AGGAAGG
AAGCTTGAAGTTACGATGGCTTTTGACAGGGAAGAATTTAATCCTTACGAAACTATTAGT
GGGTGTTCAGATTGTAGGCGTAATGTGCTCAAACGCACTAAAAGGAGCTTTTATGGCTCT
GGCGTATTTCGGCCACTTAGAAAATTCTCATCACCTTCAAGTCTACACAGACTATCCTGA
TAACCTTAATCAACAAGCAGGAGATGGACATCTCTCTTCAAAATATTCTTCATGATATCT
TGCTGTTGTAAAACTCTTTTGTTGTAGTTTCTTTTCATTCTCTCTCTCGTGCTGCAAACT
CACTTGCTGACAACCTTG
GGA

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR2AF02JQ 831 0 0
AGCATAAAAGAGGCCCATGATGAAATCACAGAGTTGAGAGAATCTATCGAAGAGATGACT
GAAACTATGAAAAAACAACATGAGACATTATTGACAATGGCTGGAGCTATGAAAAACCTA
CCGGTGAAAGAAACCTCAAAAGAAAAGTCCACAATCGAAAGAGAGTGTGCTTTGGCACGG
AAGTATCAACCAAATAATAAGAATACCATTTTCGTTAAGGGATATGATCCCTCTATGCGT
AGGGATCATGTCGAGAAGGCATTGATTGAACATTTTGGTTCATGTGGAGAGATCACAAGG
GTGTTTGTTCCCTTCAAGTGTTACAGCCTTACTAGCTTAGGATTTGCTTTCATTGATCTG
AAAGAAGATCATAGGAAGGCTTTGCTACTCGATGGAAGTTACATGGG*AGGAAGGAAGCT
TGAAGTTACGATGGCTTTTGACAGGGAAGAATTTAATCCTTACGAAACTATTAGTGGGTG
TTCAGATTGTAGGCGTAATGTGCTCAAACGCACTAAAAGGAGCTTTTATGGCTCTGGCGT
ATTTCGGCCACTTAGAAAATTCTCATCACCTTCAAGTCTACACAGACTATCCTGATAACC
TTAATCAACAAGCAGGAGATGGACATCTCTCTTCAAAATATTCTTCATGATATCTTGCTG
TTGTAAAACTCTTTTGTTGTAGTTTCTTTTCATTCTCTCTCTCGTGCTGCAAACTCACTT
GCTGACAACCTTGCGAAGTCAGCCTTGCTTGAGTTGCAGAATCTTCCTCTTCCTGAGAAC
TAATTTGTAGTTGGTTGAGACTCTTTTATTAAGTAATGCATTTGTTTGATC

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR2FH28JQ 605 0 0
G
TCCCTCTATGCGTAGGGATCATGTCGAGAAGGCATTGATTGAACATTTTGGTTCATGTGG
AGAGATCACAAGGGTGTTTGTTCCCTTCAAGTGTTACAGCCTTACTAGCTTAGGATTTGC
TTTCATTGATCTGAAAGAAGATCATAGGAAGGCTTTGCTACTCGATGGAAGTTACATGGG
*AGGAAGGAAGCTTGAAGTTACGATGGCTTTTGACAGGGAAGAATTTAATCCTTACGAAA
CTATTAGTGGGTGTTCAGATTGTAGGCGTAATGTGCTCAAACGCACTAAAAGGAGCTTTT
ATGGCTCTGGCGTATTTCGGCCACTTAGAAAATTCTCATCACCTTCAAGTCTACACAGAC
TATCCTGATAACCTTAATCAACAAGCAGGAGATGGACATCTCTCTTCAAAATATTCTTCA
TGATATCTTGCTGTTGTAAAACTCTTTTGTTGTAGTTTCTTTTCATTCTCTCTCTCGTGC
TGCAAACTCACTTGCTGACAACCTTGCGAAGTCAGCCTTGCTTGAGTTGCAGAATCTTCC
TCTTCCTGAGAACTAATTTGTAGTTGGTTGAGACTCTTTTATTAAGTAATGCATTCGTTT
GATC

QA 2 605 2 605
DS 

RD RR2FH28TF 605 0 0
G
TCCCTCTATGCGTAGGGATCATGTCGAGAAGGCATTGATTGAACATTTTGGTTCATGTGG
AGAGATCACAAGGGTGTTTGTTCCCTTCAAGTGTTACAGCCTTACTAGCTTAGGATTTGC
TTTCATTGATCTGAAAGAAGATCATAGGAAGGCTTTGCTACTCGATGGAAGTTACATGGG
*AGGAAGGAAGCTTGAAGTTACGATGGCTTTTGACAGGGAAGAATTTAATCCTTACGAAA
CTATTAGTGGGTGTTCAGATTGTAGGCGTAATGTGCTCAAACGCACTAAAAGGAGCTTTT
ATGGCTCTGGCGTATTTCGGCCACTTAGAAAATTCTCATCACCTTCAAGTCTACACAGAC
TATCCTGATAACCTTAATCAACAAGCAGGAGATGGACATCTCTCTTCAAAATATTCTTCA
TGATATCTTGCTGTTGTAAAACTCTTTTGTTGTAGTTTCTTTTCATTCTCTCTCTCGTGC
TGCAAACTCACTTGCTGACAACCTTGCGAAGTCAGCCTTGCTTGAGTTGCAGAATCTTCC
TCTTCCTGAGAACTAATTTGTAGTTGGTTGAGACTCTTTTATTAAGTAATGCATTCGTTT
GATC

QA 2 605 2 605
DS 

RD RR2GN62TF 629 0 0
GAATACCATTTTCGTTAAGGGATATGATCCCTCTATGCGTAGGGATCATGTCGAGAAGGC
ATTGATTGAACATTTTGGTTCATGTGGAGAGATCACAAGGGTGTTTGTTCCCTTCAAGTG
TTACAGCCTTACTAGCTTAGGATTTGCTTTCATTGATCTGAAAGAAGATCATAGGAAGGC
TTTGCTACTCGATGGAAGTTACATGGG*AGGAAGGAAGCTTGAAGTTACGATGGCTTTTG
ACAGGGAAGAATTTAATCCTTACGAAACTATTAGTGGGTGTTCAGATTGTAGGCGTAATG
TGCTCAAACGCACTAAAAGGAGCTTTTATGGCTCTGGCGTATTTCGGCCACTTAGAAAAT
TCTCATCACCTTCAAGTCTACACAGACTATCCTGATAACCTTAATCAACAAGCAGGAGAT
GGACATCTCTCTTCAAAATATTCTTCATGATATCTTGCTGTTGTAAAACTCTTTTGTTGT
AGTTTCTTTTCATTCTCTCTCTCGTGCTGCAAACTCACTTGCTGACAACCTTGCGAAGTC
AGCCTTGCTTGAGTTGCAGAATCTTCCTCTTCCTGAGAACTAATTTGTAGTTGGTTGAGA
CTCTTTTATTAAGTAATGCATTTGTTTGA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2F469JQ 657 0 0
GCACGGAAGTATCAACCAAATAATAAGAATACCATTTTCGTTAAGGGATATGATCCCTCT
ATGCGTAGGGATCATGTCGAGAAGGCATTGATTGAACATTTTGGTTCATGTGGAGAGATC
ACAAGGGTGTTTGTTCCCTTCAAGCGTTACAGCCTTACTAGCTTAGGATTTGCTTTCATT
GATCTGAAAGAAGATCATAGGAAGGCTTTGCTACTCGATGGAAGTTACATGGG*AGGAAG
GAAGCTTGAAGTTACGATGGCTTTTGACAGGGAAGAATTTAATCCTTACGAAACTATTAG
TGGGTGTTCAGATTGTAGGCGTAATGTGCTCAAACGCACTAAAAGGAGCTTTTATGGCTC
TGGCGTATTTCGGCCACTTAGAAAATTCTCATCACCTTCGAGTCTACACAGATTATCCTG
ATAACCTTAATCAACAAGCAGGAGATGGACATCTCTCTTCAAAATATTCTTCATGATATC
TTGCTGTTGTAAAACTCTTTTGTTGTAGTTTCTTTTCATTCTCTCTCTCGTGCTGCAAAC
TCACTTGCTGACAACCTTGCGAAGTCAGCCTTGCTTGAGTTGCAGAATCTTCCTCTTCCT
GAGAACTAATTTGTAGTTGGTTGAGACTCTTTTATTAAGTAATGCATTTGTTTGA
CT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2GX18JQ 682 0 0
CACAATCGAAAGAGAGTGTGCTTTGGCACGGAAGTATCAACCAAATAATAAGAATACCAT
TTTCGTTAAGGGATATGATCCCTCTATGCGTAGGGATCATGTCGAGAAGGCATTGATTGA
ACATTTTGGTTCATGTGGAGAGATCACAAGGGTGTTTGTTCCCTTCAAGTGTTACAGCCT
TACTAGCTTAGGATTTGCTTTCATCGATCTGAAAGAAGATCATAGGAAGGCTTTGCTACT
CGATGGAAGTTATATGGG*AGGAAGGAAGCTTGAAGTTACGATGGCTTTTGACAGGGAAG
AATTTAATCCTTACGAAACTATTAGTGGGTGTTCAGATTGTAGGCGTAATGTGCTCAAAC
GCACTAGAAGGAGCTTTTATGGCTCTGGCGTATTTCGGCCACTTAGAAAATTCTCATCAC
CTTCAAGTCTACACAGACTATCCTGATAACCTTAATCAACAAGCAGGAGATGGACATCTC
TCTTCAAAATATTCTTCATGATATCTTGCTGTTGTAAAACTCTTTTGTTGTAGTTTCTTT
TCATTCTCTCTCTCGTGCTGCAAACTCACTTGCTGACAACCTTGCGAAGTCAGCCTTGCT
TGAGTTGCAGAATCTTCCTCTTCCTGAGAACTAATTTGTAGTTGGTTGAGACTCTTTTAT
TAAGTAATGCATTTGTTTGA
GC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2GT44JQB 701 0 0
AAACCTCAAAAGAAAAGTCCACAATCGAAAGAGAGTGTGCTTTGGCACGGAAGTATCAAC
CAAATAATAAGAATACCATTTTCGTTAAGGGATATGATCCCTCTATGCGTAGGGATCATG
TCGAGAAGGCATTGATTGAACATTTTGGTTCATGTGGAGAGATCACAAGGGTGTTTGTCC
CCTTCAAGTGTTACAGCCTTACTAGCTTAGGATTTGCTTTCATTGATCTGAAAGAAGATC
ATAGGAAGGCTTTGCTACTCGATGGAAGTTACATGGG*AGGAAGGAAGCTTGAAGTTACG
ATGGCTTTTGACAGGGAAGAATTTAATCCTTACGAAACTATTAGTGGGTGTTCAGATTGT
AGGCGTAATGTGCTCAAACGCACTAAAAGGAGCTTTTATGGCTCTGGCGTATTTCGGCCA
CTTAGAAAATTCTCATCACCTTCAAGTCTACACAGACTATCCTGATAACCTTAATCAACA
AGCAGGAGATGGACATCTCTCTTCAAAATATTCTTCATGATATCTTGCTGTTGTAAAACT
CTTTTGTTGTAGTTTCTTTTCATTCTCTCTCTCGTGCTGCAAACTCACTTGCTGACAACC
TTGCGAAGTCAGCCTTGCTTGAGTTGCAGAATCTTCCTCTTCCTGAGAACTAATTTGTAG
TTGGTTGAGACTCTTTTATTAAGTAATGCATTTGTTTGATC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2E886JQ 780 0 0
GAGATGACTGAAACTATGAAAAAACAACATGAGACATTATTGACAATGGCTGGAGCTATG
AAAAACCTACCGGTGAAAGAAACCTCAAAAGAAAAGTCCACAATCGAAAGAGAGTGTGCT
TTGGCACGGAAGTATCAACCAAATAATAAGAATACCATTTTCGTTAAGGGATATGATCCC
TCTATGCGTAGGGATCATGTCGAGAAGGCATTGATTGAACATTTTGGTTCATGTGGAGAG
ATCACAAGGGTGTTTGTTCCCTTCAAGTGCTACAGCCTTACTAGCTTAGGATTTGCTTTC
ATTGATCTGAAAGAAGATCATAGGAAGGCTTTGCTACTCGATGGAAGTTACATGGG*AGG
AAGGAAGCTTGAAGTTACGATGGCTTTTGACAGGGAAGAATTTAATCCTTACGAAACTAT
TAGTGGGTGTTCAGATTGTAGGCGTAATGTGCTCAAACGCACTAAAAGGAGCTTTTATGG
CTCTGGCGTATTTCGGCCACTTAGAAAATTCTCATCACCTTCAAGTCTACACAGACTATC
CTGATAACCTTAATCAACAAGCAGGAGATGGACATCTCTCTTCAAAATATTCTTCATGAT
ATCTTGCTGTTGTAAAACTCTTTTGTTGTAGTTTCTTTTCATTCTCTCTCTCGTGCTGCA
AACTCACTTGCTGACAACCTTGCGAAGTCAGCCTTGCTTGAGTTGCAGAATCTTCCTCTT
CCTGAGAACTAATTTGTAGTTGGTTGAGACTCTTTTATTAAGTAATGCATTTGTTTGATC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 5 13

CO CL228Contig1 876 5 17 U
GGATCCACGCATAAACTCAAACTTCAAAACACAATGGCAACCATTCATCTAACGCTAGCT
CCTCTCCTCCTCCTCCTCGCCGCCATCTTCCTCTCTACAGAGGTAACTGCTCAGCCCGCC
GCTCCTGCTCCTGGCCCTGCCGGTCCCATCAACATCACATCTATCCTAGAAAAAGGCGGT
CAGTTTGTTACTTTTATCCGTCTTCTAAACACAACACAAATCGGAAACCAAATCAACATC
CAAGTCAACAGTTCATCAGAAGGCATGACCGTATTCGCACCAACGGACAACGCTTTCCAA
AACCTTAAACCGGGAGCCCTAAACAAGTTAAGCCCGGACGACCAAGTCAAGCTCATTCTT
TACCATGTTAGTCCCAAGTTCTACACAATGGATGATCTTCTCTCCGTAAGCAACCCTGTC
AGAACACAAGCTACAGGCCGAGACGGTGGAGCGGTTTACGGACTTAACTTCACCGGTCAA
GGGAACCAAGTGAACGTGTCGACAGGTGTCATCGAGACACGTGTCAGTAATGCATTAAGA
AAAGAACGTCCACTTGCGGTTTACGTGGTGAACATGGCATTGTTGCCTGAAGAGATGTTT
GGAGACCGCAAGAAGATCTCATCGGTGGCGCCTGCTCCAAAATCCAAATCTCCTGCTGTC
TCTGATGACTCATCAGACGACTCCTCTAAGAAAGCGGCGGTTCCGTCCCAGAAGTCTGGC
TCCGGTGAGATGAAGGCTGGATTAGGCTTTGGTCTTGGATTTATTCTCTTATGTTTAAAA
TTCATTGTTTAATTGTGCTGCTTTATTTTTTTTATTTAATTGTGTGGGTTGTGTAATAAG
AAACTTGTGTATTGAATATATGATGCATCATGCTGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AN71TF U 352
AF RR2E206TF U 1
AF RR2GJ92TF U 1
AF RR2H890JQ C 168
AF RR2GY35JQ C 288
BS 1 73 RR2E206TF
BS 74 76 RR2GJ92TF
BS 77 326 RR2E206TF
BS 327 327 RR2GJ92TF
BS 328 536 RR2E206TF
BS 537 537 RR2H890JQ
BS 538 570 RR2E206TF
BS 571 571 RR2H890JQ
BS 572 577 RR2E206TF
BS 578 578 RR2H890JQ
BS 579 596 RR2E206TF
BS 597 621 RR2GJ92TF
BS 622 622 RR2H890JQ
BS 623 662 RR2GJ92TF
BS 663 663 RR2H890JQ
BS 664 700 RR2GJ92TF
BS 701 876 RR2H890JQ

RD RR2AN71TF 166 0 0
CTCATTCTTTACCATGTTAGTCCCAAGTTCTACACAATGGATGATCTTCTCTCCGTAAGC
AACCCTGTCAGAACACAAGCTACAGGCCGAGACGGTGGAGCGGTTTACGGACTTAACTTC
ACCGGTCAAGGGAACCAAGTGAACGTGTCTACAGGTGTCATCG
TAG

QA 1 163 1 163
DS 

RD RR2E206TF 596 0 0
GGATCCACGCATAAACTCAAACTTCAAAACACAATGGCAACCATTCATCTAACGCTAGCT
CCTCTCCTCCTCC***TCGCCGCCATCTTCCTCTCTACAGAGGTAACTGCTCAGCCCGCC
GCTCCTGCTCCTGGCCCTGCCGGTCCCATCAACATCACATCTATCCTAGAAAAAGGCGGT
CAGTTTGTTACTTTTATCCGTCTTCTAAACACAACACAAATCGGAAACCAAATCAACATC
CAAGTCAACAGTTCATCAGAAGGCATGACCGTATTCGCACCAACGGACAACGCTTTCCAA
AACCTTAAACCGGGAGCCCTAAACAAATTAAGCCCGGACGACCAAGTCAAGCTCATTCTT
TACCATGTTAGTCCCAAGTTCTACACAATGGATGATCTTCTCTCCGTAAGCAACCCTGTC
AGAACACAAGCTACAGGCCGAGACGGTGGAGCGGTTTACGGACTTAACTTCACCGGTCAA
GGGAACCAAGTGAACGTGTCGACAGGTGTCATCGAGACACGTGTCAGTAATGCATTGAGA
AAAGAACGTCCACTTGCGGTTTACGTGGTGGACATGGTATTGTTGCCTGAAGAGAT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2GJ92TF 700 0 0
GGATCCACGCATAAACTCAAACTTCAAAACACAATGGCAACCATTCATCTAACGCTAGCT
CCTCTCCTCCTCCTCCTCGCCGCCATCTTCCTCTCTACAGAGGTAACTGCTCAGCCCGCC
GCTCCTGCTCCTGGCCCTGCCGGTCCCATCAACATCACATCTATCCTAGAAAAAGGCGGT
CAGTTTGTTACTTTTATCCGTCTTCTAAACACAACGCAAATCGGAAACCAAATCAACATC
CAAGTCAATAGTTCATCAGAAGGCATGACCGTATTCGCACCAACGGACAACGCTTTCCAA
AACCTTAAACCGGGAGCCCTAAACAAGTTAAGCCCGGACGACCAAGTCAAGCTCATTCTT
TACCATGTTAGTCCCAAGTTCTACACAATGGATGATCTTCTCTCCGTAAGCAACCCTGTC
AGAACACAAGCTACAGGCCGAGACGGTGGAGCGGTTTACGGACTTAACTTCACCGGTCAA
GGGAACCAAGTGAACGTGTCGACAGGTGTCATCGAGACACGTGTCAGTAATGCATTGAGA
AAAGAACGTCCACTTGCGGTTTACGAGGTGGACATGGTATTGTTGCCTGAAGAGATGTTT
GGAGACCGCAAGAAGATCTCACCGGTGGCGCCTGCTCCAAAATCCAAATCTCCTGCTGTC
TCCGATGACTCATCAGACGACTCCTCTAAGAAAGCGGCGG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2H890JQ 709 0 0
AGAAAAAGGCGGTCAGTTTGTTACTTTCATCCGTCTTCTAAACACAACTCAAATCGGAAA
CCAAATCAACATCCAAATCAACAGTTCGTCAGAAGGCATGACCGTATTCGCACCAACGGA
CAACGCTTTCCAAAACCTTAAACCTGGAGCCCTAAACAAGTTAAGCCCGGACGACCAAGT
CAAGCTCATTCTTTACCATGTTAGTCCCAAGTTTTACACAATGGATGACCTTCTCTCCGT
AAGCAACCCTGTCAGAACACAAGCTACTGGTCGAGACGGTGGAGCGGTTTACGGACTTAA
CTTCACCGGTCAAGTGAACCAAGTGAACGTGTCGACAGGTGTTATCGAGACACGTGTCAG
TAATGCATTAAGAAAAGAACGTCCACTTGCGGTTTACGTGGTGAACATGGCATTGTTGCC
TGAAGAGATGTTTGGAGACCGCAAGAAGATCTCATCGGTGGCGCCTGCTCCAAAATCCAA
ATCTCCTGCTGTCTCTGATGACTCATCAGACGACTCCTCTAAGAAAGCGGCGGTTCCGTC
CCAGAAGTCTGGCTCCGGTGAGATGAAGGCTGGATTAGGCTTTGGTCTTGGATTTATTCT
CTTATGTTTAAAATTCATTGTTTAATTGTGCTGCTTTATTTTTTTTATTTAATTGTGTGG
GTTGTGTAATAAGAAACTTGTGTATTGAATATATGATGCATCATGCTGC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2GY35JQ 589 0 0
CAACGCTTTCCAAAACCTTAAACCTGGAGCCCTAAACAAGTTAAGCCCGGACGACCAAGT
CAAGCTCATTCTTTACCATGTTAGTCCCAAGTTCTACACAATGGATGACCTTCTCTCCGT
AAGCAACCCTGTCAGAACACAAGCTACTGGTCGAGACGGTGGAGCGGTTTACGGACTTAA
CTTCACCGGTCAAGTGAACCAAGTGAACGTGTCGACAGGTGTTATCGAGACACGTGTCAG
TAATGCATTAAGAAAAGAACGTCCACTTGCGGTTTACGTGGTGAACATGGCATTGTTGCC
TGAAGAGATGTTTGGAGACCGCAAGAAGATCTCATCGGTGGCGCCTGCTCCAAAATCCAA
ATCTCCTGCTGTCTCTGATGACTCATCAGACGACTCCTCTAAGAAAGCGGCGGTTCCGTC
CCAGAAGTCTGGCTCCGGTGAGATGAAGGCTGGATTAGGCTTTGGTCTTGGATTTATTCT
CTTATGTTTAAAATTCATTGTTTAATTGTGCTGCTTTATTTTTTTTATTTAATTGTGTGG
GTTGTGTAATAAGAAACTTGTGTATTGAATATATGATGCATCATGCTGC

QA 1 589 1 589
DS 



CO CL228Contig2 805 2 2 U
GGATCCACGCATAAACTCAAACTTCAAAACACAATGGCAACCATTCATCTAACGCTAGCT
CCTCTCCTCCTCCTCCTCGCCGCCATCTTCCTCTCTACAGAGGTAACTGCTCATCCCGCC
GCTCCTGCTCCTGGCCCTGCCGGTCCCATCAACATCACATCTATCCTAGAAAAAGGCGGT
CAGTTTGTTACTTTTATCCGTCTTCTAAACACAACACAAATCGGAAACCAAATCAACATC
CAAGTCAACAGTTCATCAGAAGGCATGACCGTATTCGCACCAACGGACAACGCTTTCCAA
AACCTTAAACCGGGAGCCCTAAACAAGTTAAGCCCGGACGACCAAGTCAAGCTCATTCTT
TACCATGTTAGTCCCAAGTTCTACACAATGGATGATCTTCTCTCCGTAAGCAACCCTGTC
AGTAATGCATTGAGAAAAGAACGTCCACTTGCGGTTTACGTGGTGGACATGGTATTGTTG
CCTGAAGAGATGTTTGGAGACCGCAAGAAGATCTCACCGGTGGCGCCTGCTCCAAAATCC
AAATCTCCTGCTGTCTCCGATGACTCATCAGACGACTCCTCTAAGAAAGCGGCGGTTCCG
TCCGAGAAGTCTGGCTCCGGTGAGATGAAGGCTGGATTAGGCTTTGGTCTTGGATTTGTT
CTCTTATGTTTAAAATTCATTGTTTAATTGTGCTGCTTTATTTTTTTATTTAATTGTGTG
GGTTGTGTAATAAGAAACTTGTGTATTGAATATATGATGTATCATGCTGCATGGATTGAA
AACTGAAATAAGATTTTTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU04TF U 1
AF RR2EU04JQ C 141
BS 1 636 RR2EU04TF
BS 637 805 RR2EU04JQ

RD RR2EU04TF 636 0 0
GGATCCACGCATAAACTCAAACTTCAAAACACAATGGCAACCATTCATCTAACGCTAGCT
CCTCTCCTCCTCCTCCTCGCCGCCATCTTCCTCTCTACAGAGGTAACTGCTCATCCCGCC
GCTCCTGCTCCTGGCCCTGCCGGTCCCATCAACATCACATCTATCCTAGAAAAAGGCGGT
CAGTTTGTTACTTTTATCCGTCTTCTAAACACAACACAAATCGGAAACCAAATCAACATC
CAAGTCAACAGTTCATCAGAAGGCATGACCGTATTCGCACCAACGGACAACGCTTTCCAA
AACCTTAAACCGGGAGCCCTAAACAAGTTAAGCCCGGACGACCAAGTCAAGCTCATTCTT
TACCATGTTAGTCCCAAGTTCTACACAATGGATGATCTTCTCTCCGTAAGCAACCCTGTC
AGTAATGCATTGAGAAAAGAACGTCCACTTGCGGTTTACGTGGTGGACATGGTATTGTTG
CCTGAAGAGATGTTTGGAGACCGCAAGAAGATCTCACCGGTGGCGCCTGCTCCAAAATCC
AAATCTCCTGCTGTCTCCGATGACTCATCAGACGACTCCTCTAAGAAAGCGGCGGTTCCG
TCCGAGAAGTCTGGCTCCGGTGAGATGAAGGCTGGA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2EU04JQ 665 0 0
CGGTCCCATCAACATCACATCTATCCTAGAAAAAGGCGGTCAGTTTGTTACTTTTATCCG
TCTTCTAAACACAACACAAATCGGAAACCAAATCAACATCCAAGTCAACAGTTCATCAGA
AGGCATGACCGTATTCGCACCAACGGACAACGCTTTCCAAAACCTTAAACCGGGAGCCCT
AAACAAGTTAAGCCCGGACGACCAAGTCAAGCTCATTCTTTACCATGTTAGTCCCAAGTT
CTACACAATGGATGATCTTCTCTCCGTAAGCAACCCTGTCAGTAATGCATTGAGAAAAGA
ACGTCCACTTGCGGTTTACGTGGTGGACATGGTATTGTTGCCTGAAGAGATGTTTGGAGA
CCGCAAGAAGATCTCACCGGTGGCGCCTGCTCCAAAATCCAAATCTCCTGCTGTCTCCGA
TGACTCATCAGACGACTCCTCTAAGAAAGCGGCGGTTCCGTCCGAGAAGTCTGGCTCCGG
TGAGATGAAGGCTGGATTAGGCTTTGGTCTTGGATTTGTTCTCTTATGTTTAAAATTCAT
TGTTTAATTGTGCTGCTTTATTTTTTTATTTAATTGTGTGGGTTGTGTAATAAGAAACTT
GTGTATTGAATATATGATGTATCATGCTGCATGGATTGAAAACTGAAATAAGATTTTTTT
TTTTT

QA 1 665 1 665
DS 



CO CL228Contig3 801 2 10 U
GGAAGTTGAATGAAATAAAGAAGTTAAAGTTTTATCTTGTTCTATCTCTTCTTCTCTGTC
TTTAAGTTTTACCAACTAAGCCACAGCTCATCACTAAAGCATTTTTCTCATCCATATAAG
TCACATAACTTCCAACCTCACTTTCCCATCCACGCATAAACTCAAACTTCAAAACACAAT
GGCAACCATTCGTCTAGCGCTAGCTCCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCACCGCCATATTCCT
CTCCACGGAGGTAACTGCTCAGCCCGCCGCTCCTGCTCCTGGCCCTGCCGGTCCCATCAA
CATTACACCTATCCTAGAAAAAGGCGGTCAGTTTGTTACTTTCATCCGTCTTCTAAACAC
AACTCAAATCGGAAACCAAGTGAACGTGTCGACAGGTGTTATCGAGACACGTGTCAGTAA
TGCATTAAGAAAAGAACGTCCACTTGCGGTTTACGTGGTGGACATGGTATTGTTGCCTGA
AGAGATGTTTGGAGACCGCAAGAAGATCTCATCGGTGGCGCCTGCTCCAAAATCCAAATC
TCCTGCTGTCTCTGATGACTCATCAGACGACTCCTCTAAGAAAGCGGCGGTTCCGTCCCA
GAAGTCTGGCTCCGGTGAGATGAAGGCTGGATTAGGCTTTGGTCTTGGATTTATTCTCTT
ATGTTTAAAATTCATTGTTTAATTGTGCTGCTTTATTTTTTTTATTTAATTGTGTGGGTT
GTGTAATAAGAAACTTGTGTATTGAATATATGATGTATCATGCTGCATGGATTGAAAACT
GAAATAAGATTTTTTTTTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ20TF U 1
AF RR2FQ20JQ C 12
BS 1 614 RR2FQ20TF
BS 615 615 RR2FQ20JQ
BS 616 625 RR2FQ20TF
BS 626 626 RR2FQ20JQ
BS 627 635 RR2FQ20TF
BS 636 636 RR2FQ20JQ
BS 637 651 RR2FQ20TF
BS 652 652 RR2FQ20JQ
BS 653 661 RR2FQ20TF
BS 662 801 RR2FQ20JQ

RD RR2FQ20TF 661 0 0
GGAAGTTGAATGAAATAAAGAAGTTAAAGTTTTATCTTGTTCTATCTCTTCTTCTCTGTC
TTTAAGTTTTACCAACTAAGCCACAGCTCATCACTAAAGCATTTTTCTCATCCATATAAG
TCACATAACTTCCAACCTCACTTTCCCATCCACGCATAAACTCAAACTTCAAAACACAAT
GGCAACCATTCGTCTAGCGCTAGCTCCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCACCGCCATATTCCT
CTCCACGGAGGTAACTGCTCAGCCCGCCGCTCCTGCTCCTGGCCCTGCCGGTCCCATCAA
CATTACACCTATCCTAGAAAAAGGCGGTCAGTTTGTTACTTTCATCCGTCTTCTAAACAC
AACTCAAATCGGAAACCAAGTGAACGTGTCGACAGGTGTTATCGAGACACGTGTCAGTAA
TGCATTAAGAAAAGAACGTCCACTTGCGGTTTACGTGGTGGACATGGTATTGTTGCCTGA
AGAGATGTTTGGAGACCGCAAGAAGATCTCATCGGTGGCGCCTGCTCCAAAATCCAAATC
TCCTGCTGTCTCTGATGACTCATCAGACGACTCCTCTAAGAAAGCGGCGGTTCCGTCCCA
GAAGTCTGGCTCCG*TGAGATGAAG*CTGGATTAG*CTTTGGTCTTGGATT*ATTCTCTT
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2FQ20JQ 790 0 0
GAAATAAAGAAGTTAAAGTTTTATCTTGTTCTATCTCTTCTTCTCTGTCTTTAAGTTTTA
CCAACTAAGCCACAGCTCATCACTAAAGCATTTTTCTCATCCATATAAGTCACATAACTT
CCAACCTCACTTTCCCATCCACGCATAAACTCAAACTTCAAAACACAATGGCAACCATTC
GTCTAGCGCTAGCTCCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCACCGCCATATTCCTCTCCACGGAGG
TAACTGCTCAGCCCGCCGCTCCTGCTCCTGGCCCTGCCGGTCCCATCAACATTACACCTA
TCCTAGAAAAAGGCGGTCAGTTTGTTACTTTCATCCGTCTTCTAAACACAACTCAAATCG
GAAACCAAGTGAACGTGTCGACAGGTGTTATCGAGACACGTGTCAGTAATGCATTAAGAA
AAGAACGTCCACTTGCGGTTTACGTGGTGGACATGGTATTGTTGCCTGAAGAGATGTTTG
GAGACCGCAAGAAGATCTCATCGGTGGCGCCTGCTCCAAAATCCAAATCTCCTGCTGTCT
CTGATGACTCATCAGACGACTCCTCTAAGAAAGCGGCGGTTCCGTCCCAGAAGTCTGGCT
CCGGTGAGATGAAGGCTGGATTAGGCTTTGGTCTTGGATTTATTCTCTTATGTTTAAAAT
TCATTGTTTAATTGTGCTGCTTTATTTTTTTTATTTAATTGTGTGGGTTGTGTAATAAGA
AACTTGTGTATTGAATATATGATGTATCATGCTGCATGGATTGAAAACTGAAATAAGATT
TTTTTTTAGG

QA 1 790 1 790
DS 



CO CL228Contig4 289 2 4 U
AAAAAAAAAAAATCTTATTTCAGTTTTCAATCCATGCAGCATGATACATCATATATTCAA
TACACAAGTTTCTTATTACACAACCCACACAATTAAATAAAAAAATAAAGCAGCCCAATT
AAACAATGAATTTTAAACATAAAAAAACAAATCCAAAACCAAAGCCTAATCCAGCCTTCA
TCTCACCGGAGCCAGACTTCTCGGACGGAACCCCCGCTTTCTTAAAGGAGTCGTCTGATG
AGTCATCGGAAACAGCAGGAAATTTGGATTTTGGAGCAGGCGCCACCGG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ92JQB U 1
AF RR2E206JQ U 4
BS 1 86 RR2GJ92JQB
BS 87 87 RR2E206JQ
BS 88 142 RR2GJ92JQB
BS 143 289 RR2E206JQ

RD RR2GJ92JQB 147 0 0
AAAAAAAAAAAATCTTATTTCAGTTTTCAATCCATGCAGCATGATACATCATATATTCAA
TACACAAGTTTCTTATTACACAACCCCCACAATTAAATAAAAAAATAAAGCAGCCCAATT
AAACAATGAATTTTAAACATAA
AAAAA

QA 1 142 1 142
DS 

RD RR2E206JQ 286 0 0
AAAAAAAAATCTTATTTCAGTTTTCAATCCATGCAGCATGATACATCATATATTCAATAC
ACAAGTTTCTTATTACACAACCCACACGATTAAATAAAAAAATAAAGCAGCCCAATTAAA
CAATGAATTTTAAACATAAAAAAACAAATCCAAAACCAAAGCCTAATCCAGCCTTCATCT
CACCGGAGCCAGACTTCTCGGACGGAACCCCCGCTTTCTTAAAGGAGTCGTCTGATGAGT
CATCGGAAACAGCAGGAAATTTGGATTTTGGAGCAGGCGCCACCGG

QA 1 286 1 286
DS 



CO CL228Contig5 696 2 1 U
GGAAGTTGAATGAAATAAAGAAGTTAAAGTTTTATCTTGTTCTATCTCTTCTTCTCTGTC
TTTAAGTTTTACCAACTAAGCCACAGCTCATCACTAAAGCATTTTTCTCATCCATATAAG
TCACATAACTTCCAACCTCACTTTCCCATCCACGCATAAACTCAAACTTCAAAACACAAT
GGCAACCATTCGTCTAGCGCTAGCTCCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCACCGCCATATTCCT
CTCCACGGAGGTAACTGCTCAGCCCGCCGCTCCTGCTCCTGGCCCTGCCGGTCCCATCAA
CATTACATCTATCCTAGAAAAAGGCGGTCAGTTTGTTACTTTCATCCGTCTTCTAAACAC
AACTCAAATCGGAAACCAAATCAACATCCAAATCAACAGTTCGTCAGAAGGCATGACCGT
ATTCGCACCAACGGACAACGCTTTCCAAAACCTTAAACCTGGAGCCCTAAACAAGTTAAG
CCCGGACGACCAAGTCAAGCTCATTCTTTACCATGTTAGTCCCAAGTTCTACACAATGGA
TGACCTTCTCTCCGTAAGCAACCCTGTCAGAACACAAGCTACTGGTCGAGACGGTGGAGC
GGTTTACGGACTTAACTTCACCGGTCAAGTGAACCAAGTGAACGTGTCGACAGGTGTTAT
CGAGACACGTGTCAGTAATGCATTAAGAAAAGAACG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY35TF U 1
AF RR2H890TF U 1
BS 1 696 RR2GY35TF

RD RR2GY35TF 696 0 0
GGAAGTTGAATGAAATAAAGAAGTTAAAGTTTTATCTTGTTCTATCTCTTCTTCTCTGTC
TTTAAGTTTTACCAACTAAGCCACAGCTCATCACTAAAGCATTTTTCTCATCCATATAAG
TCACATAACTTCCAACCTCACTTTCCCATCCACGCATAAACTCAAACTTCAAAACACAAT
GGCAACCATTCGTCTAGCGCTAGCTCCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCACCGCCATATTCCT
CTCCACGGAGGTAACTGCTCAGCCCGCCGCTCCTGCTCCTGGCCCTGCCGGTCCCATCAA
CATTACATCTATCCTAGAAAAAGGCGGTCAGTTTGTTACTTTCATCCGTCTTCTAAACAC
AACTCAAATCGGAAACCAAATCAACATCCAAATCAACAGTTCGTCAGAAGGCATGACCGT
ATTCGCACCAACGGACAACGCTTTCCAAAACCTTAAACCTGGAGCCCTAAACAAGTTAAG
CCCGGACGACCAAGTCAAGCTCATTCTTTACCATGTTAGTCCCAAGTTCTACACAATGGA
TGACCTTCTCTCCGTAAGCAACCCTGTCAGAACACAAGCTACTGGTCGAGACGGTGGAGC
GGTTTACGGACTTAACTTCACCGGTCAAGTGAACCAAGTGAACGTGTCGACAGGTGTTAT
CGAGACACGTGTCAGTAATGCATTAAGAAAAGAACG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2H890TF 686 0 0
GGAAGTTGAATGAAATAAAGAAGTTAAAGTTTTATCTTGTTCTATCTCTTCTTCTCTGTC
TTTAAGTTTTACCAACTAAGCCACAGCTCATCACTAAAGCATTTTTCTCATCCATATAAG
TCACATAACTTCCAACCTCACTTTCCCATCCACGCATAAACTCAAACTTCAAAACACAAT
GGCAACCATTCGTCTAGCGCTAGCTCCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCACCGCCATATTCCT
CTCCACGGAGGTAACTGCTCAGCCCGCCGCTCCTGCTCCTGGCCCTGCCGGTCCCATCAA
CATTACATCTATCCTAGAAAAAGGCGGTCAGTTTGTTACTTTCATCCGTCTTCTAAACAC
AACTCAAATCGGAAACCAAATCAACATCCAAATCAACAGTTCGTCAGAAGGCATGACCGT
ATTCGCACCAACGGACAACGCTTTCCAAAACCTTAAACCTGGAGCCCTAAACAAGTTAAG
CCCGGACGACCAAGTCAAGCTCATTCTTTACCATGTTAGTCCCAAGTTCTACACAATGGA
TGACCTTCTCTCCGTAAGCAACCCTGTCAGAACACAAGCTACTGGTCGAGACGGTGGAGC
GGTTTACGGACTTAACTTCACCGGTCAAGTGAACCAAGTGAACGTGTCGACAGGTGTTAT
CGAGACACGTGTCAGTAATGCATTAA

QA 1 686 1 686
DS 



AS 2 14

CO CL229Contig1 1096 11 10 U
AGGGACCTCAGAGAAAAATCAAACCAATATGATAGATACGAAAATCTGTGGTGTTTTTGC
AGTAGCATTATGGATAACAATGGTTGATGCTAGGTTTGTCGGAGGGAGAGGAGTCGAGAA
ATATGTTACTTTCGGTCAGAACTATGTTGTTAAATGGGGTCAAGGTCATATTTCCACACT
TCACTCTGGCAAACAAGTTGATCTCTACATGGATCAGTCTTCAGGTGCCGGGTTCGAATC
CAAGAACATTTACGGATCAGGTCTCTTTCAAATGAGAATCAAAGTGCCCGGAGGAAATTC
TGGTGGCGTCGTCACCGCTTTTTATTTGACTTCGTTGGGAAGTAATCACGATGAGATTGA
CTTCGAGTTCCTAGGTAACAACGATGGAAAACCCATAACGTTACAGACAAATATCTTTGC
GAATGGAGAAGGAGACAGAGAACAGAGGTTCTTGCTTTGGTTTAACCCCATCAAACATTA
CCACACTTATGGGATTCTTTGGAACCCTTACCAAATTGTGTTTTACGTTGACAACGTCCC
AATAAGAGTGTACAAGAACGAGAAAGGTGTTAACTATCCATCAAAGCCGATGAAAGTAGA
AGCCAGTCTCTGGAACGGTGACTCTTGGGCGACTGATGGCGGTCGGACCAAGATTAACTA
TGCATTCTCTCCATTCATCGCCCATTTCCAAGACTTCTCCGGCCTCTCAGGCTGCTACGT
AGATGGTCGGAGTGATAACGTTGCCACATGTGGATCTTCCAACTATTGGTGGAATGGAGG
CAAATATCAAAGGCTAAGGGGATACGAACAGAAAATCTATGAGCATTTCAGAAACAAGTA
CATGAACTATGACTATTGCACTGATCGCTCTGAGTACCAAAGTCCTGAATGTTATTGAAA
TTACATAACGTTAATTATTATATATGTCGAGGGAAATATAAATAAATAAGTCGTAATGAA
GATAAAATACAAAAGAGGTTAGATCGGTGGGGAACAATATCGATAATCGGCTAATAGCTT
CAAAATTCTATGATAAATTTTTTTAAGAACATGTCCACAACAGAAAATAAAATTTATATA
AATTATTACGTTTTTT


BQ
10 10 35 35 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 25 25 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2DN75TF U 3
AF RR2BH88TF U 1
AF RR2GX88TF U 3
AF RR2AJ49TF U 3
AF RR2FA71TF U 3
AF RR2F323TF U 3
AF RR2B106TF U 2
AF RR2AZ83JQ C 961
AF RR2FA71JQ C 427
AF RR2B822JQ C 505
AF RR2B822TF U 505
BS 1 243 RR2BH88TF
BS 244 244 RR2GX88TF
BS 245 697 RR2BH88TF
BS 698 698 RR2FA71TF
BS 699 706 RR2BH88TF
BS 707 710 RR2B106TF
BS 711 711 RR2B822TF
BS 712 795 RR2B106TF
BS 796 1094 RR2B822TF
BS 1095 1096 RR2B822JQ

RD RR2DN75TF 571 0 0
GGACCTTAGAGAAAAATCAAACCAAGATGATACATACGAAAATCTTTGGTGTTTTTGCAT
TAGCATTATGTATAACAATGGTTGATGCTAGGTTTATCGGAGGGAGAGGAGTCCAGAAAT
ATGTTACTTTCGGTCAGAACTATGTTGTTAAATGGGGTCAAGGTCATATTTCCACACTTC
ACTCTGGCAAAGAAGTTGATCTCTACATGGATCAGTCTTCAGGTGCCGGGTTCGAATCCA
AGAACATTTACGGATCAGGTCTCTTTCAAATGAGAATCAAAGTGCCCGGAGGAAATTCTG
GTGGCGTCGTCACCGCTTTTTATTTGACTTCGTTGGGAAGTAATCACGATGAGATTGACT
TCGAGTTCTTAGGTAACAACGATGGAAAACCCATAACGTTACAGACAAATATCTTTGCGA
ATGGAGAAGGAGACAGAGAACAGAGGTTCTTGCTTTGGTTTAACCCCATCAAACATTACC
ACACTTATGGGATTCTTTGGAACCCTTACCAAATTGTGTTTTACGTTGACAACGTCCCAA
TAAGAGTGTACAAGAACGAGAAAGGTGTTAA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2BH88TF 706 0 0
AGGGACCTCAGAGAAAAATCAAACCAATATGATAGATACGAAAATCTGTGGTGTTTTTGC
AGTAGCATTATGGATAACAATGGTTGATGCTAGGTTTGTCGGAGGGAGAGGAGTCGAGAA
ATATGTTACTTTCGGTCAGAACTATGTTGTTAAATGGGGTCAAGGTCATATTTCCACACT
TCACTCTGGCAAACAAGTTGATCTCTACATGGATCAGTCTTCAGGTGCCGGGTTCGAATC
CAATAACATTTACGGATCAGGTCTCTTTCAAATGAGAATCAAAGTGCCCGGAGGAAATTC
TGGTGGCGTCGTCACCGCTTTTTATTTGACTTCGTTGGGAAGTAATCACGATGAGATTGA
CTTCGAGTTCCTAGGTAACAACGATGGAAAACCCATAACGTTACAGACAAATATCTTTGC
GAATGGAGAAGGAGACAGAGAACAGAGGTTCTTGCTTTGGTTTAACCCCATCAAACATTA
CCACACTTATGGGATTCTTTGGAACCCTTACCAAATTGTGTTTTACGTTGACAACGTCCC
AATAAGAGTGTACAAGAACGAGAAAGGTGTTAACTATCCATCAAAGCCGATGAAAGTAGA
AGCCAGTCTCTGGAACGGTGACTCTTGGGCGACTGATGGCGGTCGGACCAAGATTAACTA
TGCATTCTCTCCATTCATCGCCCATTTCCAAGACTTCCCCGGCCTC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2GX88TF 693 0 0
GGACCTTAGAGAAAAATCAAACCAAGATGATACATACGAAAATCTTTGGTGTTTTTGCAT
TAGCATTATGTATAACAATGGTTGATGCTAGGTTTATCGGAGGGAGAGGAGTCAAGAAAT
ATGTTACTTTCGGTCAGAACTATGTTGTTAAATGGGGTCAAGGTCATATTTCCACACTTC
ACTCTGGCAAAGAAGTTGATCTCTACATGGATCAGTCTTCAGGTGCCGGGTTCGAATCCA
AGAACATTTACGGATCAGGTCTCTTTCAAATGAGAATCAAAGTGCCCGGAGGAAATTCTG
GTGGCGTCGTCACCGCTTTTTATTTGACTTCGTTGGGAAGTAATCACGATGAGATTGACT
TCGAGTTCTTAGGTAACAACGATGGAAAACCCATAACGTTACAGACAAATATCTTTACGA
ATGGAGAAGGAGACAGAGAACAGAGGTTCTTGCTTTGGTTTAACCCCATCAAACATTACC
ACACTTATGGGATTCTTTGGAACCCTTACCAAATTGTGTTTTACGTTGACAACGTCCCAA
TAAGAGTGTACAAGAACGAGAAAGGTGTTAACTATCCATCAAAGCCGATGAAGGTAGAAG
CCAGTCTCTGGAACGGTGACTCTTGGGCGACTGATGGCGGTCGGACCAAGATTAACTATG
CATTCTCTCCTTTCATCGCCCATTTCCAAGACT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2AJ49TF 678 0 0
GGACCTTAGAGAAAAATCAAACCAAGATGATACATACGAAAATCTTTGGTGTTTTTGCAT
TAGCATTATGTATAACAATGGTTGATGCTAGGTTTATCGGAGGGAGAGGAGTCAAGAAAT
ATGTTACTTTCGGTCAGAACTATGTTGTTAAATGGGGTCAAGGTCATATTTCCACACTTC
ACTCTGGCAAAGAAGTTGATCTCTACATGGATCAGTCTTCAGGTGCCGGGTTCGAATCCA
AGAACATTTACGGATCAGGTCTCTTTCAAATGAGAATCAAAGTGCCCGGAGGAAATTCTG
GTGGCGTCGTCACCGCTTTTTATTTGACTTCGTTGGGAAGTAATCACGATGAGATTGGCT
TCGAGTTCTTAGGTAACAACGATGGAAAACCCATAACGTTACAGACAAATATCTTTGCGA
ATGGAGAAGGAGACAGAGAACAGAGGTTCTTGCTTTGGTTTAACCCCATCAAACATTACC
ACACTTATGGGATTCTTTGGAACCCTTACCAAATTGTGTTTTACGTTGACAACGTCCCAA
TAAGAGTGTACAAGAACGAGAAAGGTGTTAACTATCCATCAAAGCCGATGAAAGTAGAAG
CCAGTCTCTGGAACGGTGACTCTTGGGCGACTGATGGCGGTCGGACCAAGATTAACTATG
CATTCTCTCCTTTCATCG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2FA71TF 706 0 0
GGACCTCAGAGAAAAATCAAACCAATATGATAGATACGAAAATCTGTGGTGTTTTTGCAG
TAGCATTATGGATAACAATGGTTGATGCTAGGTTTGTCGGAGGGAGAGGAGTCGAGAAAT
ATGTTACTTTCGGTCAGAACTATGTTGTTAAATGGGGTCAAGGTCATATTTCCACACTTC
ACTCTGGCAAACAAGTTGATCTCTACATGGATCAGTCTTCAGGTGCCGGGTTCGAATCCA
AGAACATTTACGGATCAGGTCTCTTTCAAATGAGAATCAAAGTGCCCGGAGGAAATTCTG
GTGGCGTCGTCACCGCTTTTTATTTGACTTCGTTGGGAAGTAATCACGATGAGATTGACT
TCGAGTTCCTAGGTAACAACGATGGAAAACCCATAACGTTACAGACAAATATCTTTGCGA
ATGGAGAAGGAGACAGAGAACAGAGGTTCTTGCTTTGGTTTAACCCCATCAAACATTACC
ACACTTATGGGATTCTTTGGAACCCTTACCAAATTGTGTTTTACGTTGACAACGTCCCAA
TAAGAGTGTACAAGAACGAGAAAGGTGTTAACTATCCATCAAAGCCGATGAAAGTAGAAG
CCAGTCTCTGGAACGGTGACTCTTGGGCGACTGATGGCGGTCGGACCAAGATTAACTATG
CATTCTCTCCATTCATCGCCCATTTCCAAGACTTCTCCG
CCTCTCA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2F323TF 693 0 0
GGACCTCAGAGAAAAATCAAACCAATATGATAGATACGAAAATCTGTGGTGTTTTTGCAG
TAGCATTATGGATAACAATGGTTGATGCTAGGTTTGTCGGAGGGAGAGGAGTCGAGAAAT
ATGTTACTTTCGGTCAGAACTATGTTGTTAAATGGGGTCAAGGTCATATTTCCACACTTC
ACTCTGGCAAACAAGTTGATCTCTACATGGATCAGTCTTCAGGTGCCGGGTTCGAATCCA
AGAACATTTACGGATCAGGTCTCTTTCAAATGAGAATCAAAGTGCCCGGAGGAAATTCTG
GTGGCGTCGTCACCGCTTTTTATTTGACTTCGTTGGGAAGTAATCACGATGAGATTGACT
TCGAGTTCCTAGGTAACAACGATGGAAAACCCATAACGTTACAGACAAATATCTTTGCGA
ATGGAGAAGGAGACAGAGAACAGAGGTTCTTGCTTTGGTTTAACCCCATCAAACATTACC
ACACTTATGGGATTCTTTGGAACCCTTACCAAATTGTGTTTTACGTTGACAACGTCCCAA
TAAGAGTGTACAAGAACGAGAAAGGTGTTAACTATCCATCAAAGCCGATGAAAGTAGAAG
CCAGTCTCTGGAACGGTGACTCTTGGGCGACTGATGGCGGTCGGACCAAGATTAACTATG
CATTCTCTCCATTCATCGCCCATTTCCAAGACT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2B106TF 794 0 0
GGT
ACCTCAGAGAAAAATCAAACCAATATGATAGATACGAAAATCTGTGGTGTTTTTGCAGTA
GCATTATGGATAACAATGGTTGATGCTAGGTTTGTCGGAGGGAGAGGAGTCGAGAAATAT
GTTACTTTCGGTCAGAACTATGTTGTTAAATGGGGTCAAGGCCATATTTCCACACTTCAC
TCTGGCAAACAAGTTGATCTCTACATGGATCAGTCTTCAGGTGCCGGGTTCGAATCCAAG
AACATTTACGGATCAGGTCTCTTTCAAATGAGAATCAAAGTGCCCGGAGGAAATTCTGGT
GGCGTCGTCACCGCTTTTTATTTGACTTCGTTGGGAAGTAATCACGATGAGATTGACTTC
GAGTTCCTAGGTAACAACGATGGAAAACCCATAACGTTACAGACAAATATCTTTGCGAAT
GGAGAAGGAGACAGAGAACAGAGGTTCTTGCTTTGGTTTAACCCCATCAAACATTACCAC
ACTTATGGGATTCTT**GAACCCTTACCAAATTGTGTTTTACGTTGACAACGTCCCAATA
AGAGTGTACAAGAACGAGAAAGGTGTTAACTATCCATCAAAGCCGATGAAAGTAGAAGCC
AGTCTCTGGAACGGTGACTCTTGGGCGACTGATGGCGGTCGGACCAAGATTAACTATGCA
TTCTCTCCATTCATCGCCCATTTCCAAGACTTCTCCGGCCTCTCAG*CTGCTACGTAGAT
GGTCGGAGTGATAACGTTGCCACATGTGGATCTTCCAACTATTGGTGGAATGGAGGCAAA
TATCAAAGGCT

QA 4 794 4 794
DS 

RD RR2AZ83JQ 116 0 0
GATAAAATACAAAAGAGGTTAGATCGGTGGGGAACAATATCGATAATCGGCTAATAGCTT
CAAAATTTTATGATAAATTTTTTTAAGAACATGTCCACAACAGAAAATAAAATTTA

QA 1 116 1 116
DS 

RD RR2FA71JQ 670 0 0
AGAAGGAGACAGAGAACAGAGGTTCTTGCTTTGGTTTAACCCCATCAAACATTACCACAC
TTATGGGATTCTTTGGAACCCTTACCAAATTGTGTTTTACGTTGACAACGTCCCAATAAG
AGTGTACAAGAACGAGAAAGGTGTTAACTATCCATCAAAGCCGATGAAAGTAGAAGCCAG
TCTCTGGAACGGTGACTCTTGGGCGACTGATGGCGGTCGGACCAAGATTAACTATGCATT
CTCTCCATTCATCGCCCATTTCCAAGACTTCTCCGGCCTCTCAGGCTGCTACGTAGATGG
TCGGAGTGATAACGTTGCCACATGTGGATCTTCCAACTATTGGTGGAATGGAGGCAAATA
TCAAAGGCTAAGGGGATACGAACAGAAAATCTATGAGCATTTCAGAAACAAGTACATGAA
CTATGACTATTGCACTGATCGCTCTGAGTACCAAAGTCCTGAATGTTATTGAAATTACAT
AACGTTAATTATTATATATGTCGAGGGAAATATAAATAAATAAGTCGTAATGAAGATAAA
ATACAAAAGAGGTTAGATCGGTGGGGAACAATATCGATAATCGGCTAATAGCTTCAAAAT
TCTATGATAAATTTTTTTAAGAACATGTCCACAACAGAAAATAAAATTTATATAAATTAT
TACGTTTT
CC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2B822JQ 592 0 0
GG
CTTACCAAATTGTGTTTTACGTTGACAACGTCCCAATAAGAGTGTACAAGAACGAGAAAG
GTGTTAACTATCCATCAAAGCCGATGAAAGTAGAAGCCAGTCTCTGGAACGGTGACTCTT
GGGCGACTGATGGCGGTCGGACCAAGATTAACTATGCATTCTCTCCATTCATCGCCCATT
TCCAAGACTTTTCCGGCCTCTCAGGCTGCTACGTAGATGGTCGGAGTGATAACGTTGCCA
CATGTGGATCTTCCAACTATTGGTGGAATGGAGGCAAATATCAAAGGCTAAGGGGATACG
AACAGAAAATCTATGAGCATTTCAGAAACAAGTACATGAACTATGACTATTGCACTGATC
GCTCTGAGTACCAAAGTCCTGAATGTTATTGAAATTACATAACGTTAATTATTATATATG
TCGAGGGAAATATAAATAAATAAGTCGTAATGAAGATAAAATACAAAAGAGGTTAGATCG
GTGGGGAACAATATCGATAATCGGCTAATAGCTTCAAAATTTTATGATAAATTTTTTTAA
GAACATGTCCACAACAGAAAATAAAATTTATATAAATTATTACGTTTTTT

QA 3 592 3 592
DS 

RD RR2B822TF 592 0 0
GG
CTTACCAAATTGTGTTTTACGTTGACAACGTCCCAATAAGAGTGTACAAGAACGAGAAAG
GTGTTAACTATCCATCAAAGCCGATGAAAGTAGAAGCCAGTCTCTGGAACGGTGACTCTT
GGGCGACTGATGGCGGTCGGACCAAGATTAACTATGCATTCTCTCCATTCATCGCCCATT
TCCAAGACTTCTCCGGCCTCTCAGGCTGCTACGTAGATGGTCGGAGTGATAACGTTGCCA
CATGTGGATCTTCCAACTATTGGTGGAATGGAGGCAAATATCAAAGGCTAAGGGGATACG
AACAGAAAATCTATGAGCATTTCAGAAACAAGTACATGAACTATGACTATTGCACTGATC
GCTCTGAGTACCAAAGTCCTGAATGTTATTGAAATTACATAACGTTAATTATTATATATG
TCGAGGGAAATATAAATAAATAAGTCGTAATGAAGATAAAATACAAAAGAGGTTAGATCG
GTGGGGAACAATATCGATAATCGGCTAATAGCTTCAAAATTCTATGATAAATTTTTTTAA
GAACATGTCCACAACAGAAAATAAAATTTATATAAATTATTACGTTTT
TT

QA 3 590 3 590
DS 



CO CL229Contig2 624 3 5 U
AACAAATATCAAATCTAAAATAACTCAATGCTATTGGTGGGTGAATCTAGAGGTTTACCT
AGGGGCTGAATATAAGTTTTTTTTCTTTATGAATCTTCCTTACGACTTATTTATTTATTT
TTCCCTCGACATATATCATAATTAACGTTATGTAATTTCAATAACATTCAGGACTTTGGT
ACTCAGAGCGATCAGTGCAATAGTCATAGTTCATGTACTTATTTCTGAAATGCTCATAGA
TTTCCTGTTCGTATCCCCTTAGCCTTTGATATTTGCCTCCATTCCACCAATAGTTGGAAG
ATCCACATGTGGCAACGTTATCACTCCGACCATCTACGTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAGA
AGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAGAATGCATAGTTAATCTTGGTCCGACCGCCAT
CAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAGACTGGCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGAT
AGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTTATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAA
TTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGTTAAAACCAA
AGCAAGAACCTCTGTTCTCTGTCT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ18JQ U 1
AF RR2EZ18TF C 1
AF RR2DN75JQ U 1
BS 1 220 RR2DN75JQ
BS 221 221 RR2EZ18JQ
BS 222 243 RR2DN75JQ
BS 244 244 RR2EZ18JQ
BS 245 624 RR2DN75JQ

RD RR2EZ18JQ 363 0 0
AACAAATATCAAATCTAAAATAACTCAATGCTATTGGTGGGTGAATCTAGAGGTTTACCT
AGGGGCTGAATATAAGTTTTTTTTCTTTATGAATCTTCCTTACGACTTATTTATTTATTT
TTCCCTCGACATATATCATAATTAACGTTATGTAATTTCAATAACATTCAGGACTTTGGT
ACTCAGAGCGATCAGTGCAATAGTCATAGTTCATGTACTTATTTCTGAAATGCTCATAGA
TTTCCTGTTCGTATCCCCTTAGCCTTTGATATTTGCCTCCATTCCACCAATAGTTGGAAG
ATCCACATGTGGCAACGTTATCACTCCGACCATCTACGTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAGA
AG
C

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR2EZ18TF 363 0 0
AACAAATATCAAATCTAAAATAACTCAATGCTATTGGTGGGTGAATCTAGAGGTTTACCT
AGGGGCTGAATATAAGTTTTTTTTCTTTATGAATCTTCCTTACGACTTATTTATTTATTT
TTCCCTCGACATATATCATAATTAACGTTATGTAATTTCAATAACATTCAGGACTTTGGT
ACTCAGAGCGATCAGTGCAATAGTCATAGTTCATGTACTTATTTCTGAAATGCTCATAGA
TTTCCTGTTCGTATCCCCTTAGCCTTTGATATTTGCCTCCATTCCACCAATAGTTGGAAG
ATCCACATGTGGCAACGTTATCACTCCGACCATCTACGTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAGA
AG
C

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR2DN75JQ 624 0 0
AACAAATATCAAATCTAAAATAACTCAATGCTATTGGTGGGTGAATCTAGAGGTTTACCT
AGGGGCTGAATATAAGTTTTTTTTCTTTATGAATCTTCCTTACGACTTATTTATTTATTT
TTCCCTCGACATATATCATAATTAACGTTATGTAATTTCAATAACATTCAGGACTTTGGT
ACTCAGAGCGATCAGTGCAATAGTCATAGTTCATGTACTTCTTTCTGAAATGCTCATAGA
TTTTCTGTTCGTATCCCCTTAGCCTTTGATATTTGCCTCCATTCCACCAATAGTTGGAAG
ATCCACATGTGGCAACGTTATCACTCCGACCATCTACGTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAGA
AGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAGAATGCATAGTTAATCTTGGTCCGACCGCCAT
CAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAGACTGGCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGAT
AGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTTATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAA
TTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGTTAAAACCAA
AGCAAGAACCTCTGTTCTCTGTCT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 3 13

CO CL230Contig1 1086 3 3 U
TTGAGAAAATAATGTTAATTTATTGAATTACTAAAACAAGGGGAGATAGTGCAACACATT
ATAAAACTGAATAGTTTTGTCGAAATTATTCTAAAAGACATGCATATTAATACGTTACGT
GATTCTCACAAAAGATGACAGTTTAGGAAAAACAACCAGACCGGAATAACCACTTAAATG
ATTTTTCAGCATGTCCGTATTAGGTAAACCAAGACTTTGAAGATGTTCTGAACCAGCTAA
AATGACGCATCAAGGCACGATGGTAAACAGAGGCGTGTCAACGCTAACCGGTTTTCCATC
TTCAGCTAGTAGTTCAGTGATGGTTCCCGATTTCTCAGCCTCAATCTCATTCATTAGTTT
CATAGCTTCGATAATACAAACAACTTGACCCTTCTGCACCTTATCACCAACCTTGACAAA
AGGGGGTTCACCAGGTCCAGGAGATCTGTAGAAAGTACCAGCCATAGGACTCTTGAGTGG
AGGATGAGAAGAGGCAGGTGGGGTTGCTGGTTTTACTGTTTCAGGGGCTGAGGAGGGAGC
AGGAGAAGCAACTGGTTGAGATGGAGCCATTGGAGGAGGAGGCATAGAGTGATAAACTGG
AGCTGGTGGTGGTGCAGGTTGCTGCTGCTGTAAAGCTTCCTTCTTACGAATAACAATCTC
ACAGTCGAGCTGCTTCAGTTCAAGTTCCACTATATCTCTTGAATCCACAAGCTTAAGAAG
ACCAGAGACTCTAGCCATAAAGTCAGAGAGTTGGGCGGATTCAGGAACATTGCTCTTCAC
TTTCCCGTTACCGTTACCGTTAGTCATTGGGGTTGAGTTAGAGACAACGACCTCATTGGT
TGTCGCACGCAACCTCCAGATTGTAGATTGGTTCTGAGACACATCGGAGAGAAAGGAGAC
GCCATTGAGTTGCGGCTGACATCGGGTTCTTCCAGGAATAGATCCGAACCGTTGGTTCGG
AGCACAGATCTTGGCGTAAGGTGCAGACAGTGACGCCATTGTTTAGACAGATCAAATGCA
GAAGAGGTCGATGAAACCGAGGAAGCAGGAAGAAGAGAGAGAGAGGTACGTTTTTCACAC
TGTCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY45JQ U 1
AF RR2B462JQ U 2
AF RR2BY45TF C 284
BS 1 749 RR2BY45JQ
BS 750 884 RR2B462JQ
BS 885 1086 RR2BY45TF

RD RR2BY45JQ 749 0 0
TTGAGAAAATAATGTTAATTTATTGAATTACTAAAACAAGGGGAGATAGTGCAACACATT
ATAAAACTGAATAGTTTTGTCGAAATTATTCTAAAAGACATGCATATTAATACGTTACGT
GATTCTCACAAAAGATGACAGTTTAGGAAAAACAACCAGACCGGAATAACCACTTAAATG
ATTTTTCAGCATGTCCGTATTAGGTAAACCAAGACTTTGAAGATGTTCTGAACCAGCTAA
AATGACGCATCAAGGCACGATGGTAAACAGAGGCGTGTCAACGCTAACCGGTTTTCCATC
TTCAGCTAGTAGTTCAGTGATGGTTCCCGATTTCTCAGCCTCAATCTCATTCATTAGTTT
CATAGCTTCGATAATACAAACAACTTGACCCTTCTGCACCTTATCACCAACCTTGACAAA
AGGGGGTTCACCAGGTCCAGGAGATCTGTAGAAAGTACCAGCCATAGGACTCTTGAGTGG
AGGATGAGAAGAGGCAGGTGGGGTTGCTGGTTTTACTGTTTCAGGGGCTGAGGAGGGAGC
AGGAGAAGCAACTGGTTGAGATGGAGCCATTGGAGGAGGAGGCATAGAGTGATAAACTGG
AGCTGGTGGTGGTGCAGGTTGCTGCTGCTGTAAAGCTTCCTTCTTACGAATAACAATCTC
ACAGTCGAGCTGCTTCAGTTCAAGTTCCACTATATCTCTTGAATCCACAAGCTTAAGAAG
ACCAGAGACTCTAGCCATAAAGTCAGAGA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2B462JQ 883 0 0
A
GAGAAAATAATGTTAATTTATTGAATTACTAAAACAAGGGGAGATAGTGCAACACATTAT
AAAACTGAATAGTTTTGTCGAAATTATTCTAAAAGACATGCATATTAATACGTTACGTGA
TTCTCACAAAAGATGACAGTTTAGGAAAAACAACCAGACCGGAATAACCACTTAAATGAT
TTTTCAGCATGTCCGTATTAGGTAAACCAAGACTTTGAAGATGTTCTGAACCAGCTAAAA
TGACGCATCAAGGCACGATGGTAAACAGAGGCGTGTCAACGCTAACCGGTTTTCCATCTT
CAGCTAGTAGTTCAGTGATGGTTCCTGATTTCTCAGCCTCAATCTCATTCATTAGTTTCA
TAGCTTCGATAATACAAACAACTTGACCCTTCTGCACCTTATCACCAACCTTGACAAAAG
GGGGTTCACCAGGTCCAGGAGATCTGTAGAAAGTACCAGCCATAGGACTCTTGAGTGGAG
GATGAGAAGAGGCAGGTGGGGTTGCTGGTTTTACTGTTTCAGGGGCTGAGGAGGAAGCAG
GAGAAGCAACTGGTTGAGATGGAGCCATTGGAGGAGGAGGCATAGAGTGATAAACTGGAG
CTGGTGGTGGTGCAGGTTGCTGCTGCTGTAAAGCTTCCTTCTTACGAATAACAATCTCAC
AGTCGAGCTGCTTCAGTTCAAGTTCCACTATATCTCTTGAATCCACAAGCTTAAGAAGAC
CAGAGACTCTAGCCATAAAGTCAGAGAGTTGGGCGGATTCAGGAACATTGCTCTTCACTT
TCCCGTTACCGTTACCGTTAGTCATTGGGGTTGAGTTAGAGACAACGACCTCATTGGTTG
TCGCACGCAACCTCCAGATTGTAGATTGGTTCTGAGACACAT

QA 2 883 2 883
DS 

RD RR2BY45TF 803 0 0
CGCTACCGG
TTTCCATCTTCAGCTAGTAGTTCAGTGATG*TTCCCGATTTCTCA*CCTCAATCTCATTC
ATTAGTT*CATAGCTTCGATAATACAAACAACTTGACCCTTCTGCAC*TTATCACCA*CC
TTGACAAAAGGGGGTTCACCAGGTCCAGGAGATCTGTAGAAAGTACCAGCCATAGGACTC
TTGAGTGGAGGATGAGAAGAGGCAGGTGGGGTTGCTGGTTTTACTGTTTCAGGGGCTGAG
GAGGGAGCAGGAGAAGCAACTGGTTGAGATGGAGCCATTGGAGGAGGAGGCATAGAGTGA
TAAACTGGAGCTGGTGGTGGTGCAGGTTGCTGCTGCTGTAAAGCTTCCTTCTTACGAATA
ACAATCTCACAGTCGAGCTGCTTCAGTTCAAGTTCCACTATATCTCTTGAATCCACAAGC
TTAAGAAGACCAGAGACTCTAGCCATAAAGTCAGAGAGTTGGGCGGATTCAGGAACATTG
CTCTTCACTTTCCCGTTACCGTTACCGTTAGTCATTGGGGTTGAGTTAGAGACAACGACC
TCATTGGTTGTCGCACGCAACCTCCAGATTGTAGATTGGTTCTGAGACCCATCGGAGAGA
AAGGAGACGCCATTGAGTTGCGGCTGACATCGGGTTCTTCCAGGAATAGATCCGAACCGT
TGGTTCGGAGCACAGATCTTGGCGTAAGGTGCAGACAGTGACGCCATTGTTTAGACAGAT
CAAATGCAGAAGAGGTCGATGAAACCGAGGAAGCAGGAAGAAGAGAGAGAGAGGTACGTT
TTTCACACTGTCCC

QA 10 803 10 803
DS 



CO CL230Contig2 1147 8 21 U
GATAGTTGTTTGGTTTTCTTCGTAACCATCGAAATCAAGATTCCTTTACCCGAAAAATAA
CCATCAACCTTTTTCTTATTTATCTCTCTCTCTCTTAGCTTCCTCGGTTTCATCGTCAAC
TGCATTTCATCTGTCTCAACAATGGCGTCATTTTCTGTATCTTACGCCAAGATCTGTGCT
CCGAACCACCGGTTCGGATCTTTTCCTGGAACCCGACGGCAGCCGCAACTCAATGGCGTA
TCCTTTCCCTCCGATGTATCTCAGAATCAATCTACAATCTGGAAGTTGCGTGCAACAACC
AATGAGGTTGTCTCTAACTCAACCCCAATGACAAACGGTAACGGGAAAGTGAAGAGCAAT
GTTCCTGAACCTGCCGAACTCTCTGACTTTATGGCCAAAGTCTCTGGTCTTCTTAAGCTT
GTGGATTCAAGAGATATAGTGGAACTTGAACTGAAGCAGCTCGACTGTGAGATTGTTATT
CGCAAGAAGGAAGCTTTACAGCAGCAGCAACTTCCACCAACAGCTCCAGTTTACCACTCC
ATGCCTCCTCCAGTTACAGGATATCCAATGCCTCCATCTCAACCAGCTGCTCTTCCTCTT
GCTTCTCCTACTCCCTCCTCAGCCCCTGAAACAGCAAAACCAGCAACCCCACCTGCCTCT
TCTCATCCTCCACTCAAGAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACAGATCTCCTGGACCCGGT
GAACCCCCTTTTGTCAAGGTTGGTGATAAGGTGCAGAAGGGTCAAGTTGTTTGCATTATC
GAAGCTATGAAACTAATGAATGAGATTGAGGCTGAGAAATCAGGAACCATCACTGAACTA
CTAGCTGAAGATGGAAAACCGGTTAGCGTTGATACGCCTCTGTTTACCATCGTGCCTTGA
AGCGTCATTTTAGCTGGTTCAGAACATCTTCAAAGTCTTGGTTTAGCTAATACGGACATG
CTGAAAAATCATTTAAGTGGTTATTCCGGTCTGGTTGTTTTTCCTAAACTGTCATCTTTT
GTGAGAATCACGTAACGTATTAATATGCATGTCTTTTAGAATAATTTCGACAAAACTATT
CAGTTTTATAATGTGTTGCACTATCTCCCCTTGTTTTAGTAATTCAATAAATTAACATTA
TTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 10 10 

AF RR2DO23TF U 1
AF RR2FT66TF U 18
AF RR2AQ53TF U 116
AF RR2CA14TF U 76
AF RR2GA69JQ C 782
AF RR2AQ53JQ C 375
AF RR2BN07JQ C 377
AF RR2CA14JQ C 406
BS 1 504 RR2DO23TF
BS 505 505 RR2CA14TF
BS 506 532 RR2DO23TF
BS 533 633 RR2FT66TF
BS 634 634 RR2CA14TF
BS 635 727 RR2FT66TF
BS 728 728 RR2CA14TF
BS 729 740 RR2FT66TF
BS 741 810 RR2CA14TF
BS 811 811 RR2AQ53JQ
BS 812 823 RR2CA14TF
BS 824 824 RR2AQ53JQ
BS 825 825 RR2CA14TF
BS 826 827 RR2AQ53JQ
BS 828 854 RR2CA14TF
BS 855 1013 RR2AQ53JQ
BS 1014 1014 RR2BN07JQ
BS 1015 1115 RR2AQ53JQ
BS 1116 1116 RR2BN07JQ
BS 1117 1145 RR2AQ53JQ
BS 1146 1147 RR2BN07JQ

RD RR2DO23TF 532 0 0
GATAGTTGTTTGGTTTTCTTCGTAACCATCGAAATCAAGATTCCTTTACCCGAAAAATAA
CCATCAACCTTTTTCTTATTTATCTCTCTCTCTCTTAGCTTCCTCGGTTTCATCGTCAAC
TGCATTTCATCTGTCTCAACAATGGCGTCATTTTCTGTATCTTACGCCAAGATCTGTGCT
CCGAACCACCGGTTCGGATCTTTTCCTGGAACCCGACGGCAGCCGCAACTCAATGGCGTA
TCCTTTCCCTCCGATGTATCTCAGAATCAATCTACAATCTGGAAGTTGCGTGCAACAACC
AATGAGGTTGTCTCTAACTCAACCCCAATGACAAACGGTAACGGGAAAGTGAAGAGCAAT
GTTCCTGAACCTGCCGAACTCTCTGACTTTATGGCCAAAGTCTCTGGTCTTCTTAAGCTT
GTGGATTCAAGAGATATAGTGGAACTTGAACTGAAGCAGCTCGACTGTGAGATTGTTATT
CGCAAGAAGGAAGCTTTACAGCAGTAGCAACTTCCACCAACAGCTCCAGTTT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2FT66TF 728 0 0
CTTCGTAACCATCGAAATCAAGATTCCTTTACCCGAAAAATAACCATCAACCTTTTTCTT
ATTTATCTCTCTCTCTCTTAGCTTCCTCGGTTTCATCGTCAACTGCATTTCATCTGTCTC
AACAATGGCGTCATTTTCTGTATCTTACGCCAAGATCTGTGCTCCGAACCACCGGTTCGG
ATCTTTTCCTGGAACCCGACGGCAGCCGCAACTCAATGGCGTATCCTTTCCCTCCGATGT
ATCTCAGAATCAATCTACAATCTGGAAGTTGCGTGCAACAACCAATGAGGTTGTCTCTAA
CTCAACCCCAATGACAAACGGTAACGGGAAAGTGAAGAGCAATGTTCCTGAACCTGCCGA
ACTCTCTGACTTTATGGCCAAAGTCTCTGGTCTTCTTAAGCTTGTGGATTCAAGAGATAT
AGTGGAACTTGAACTGAAGCAGCTCGACTGTGAGATTGTTATTCGCAAGAAGGAAGCTTT
ACAGCAGTAGCAACTTCCACCAACAGCTCCAGTTTACCACTCCATGCCTCCTCCAGTTAC
AGGATATCCAATGCCTCCATCTCAACCAGCTGCTCTTCCTCTTGCTTCTCCTACTCCCTC
CTCAGCCCCTGAAACAACAAAACCAGCAACCCCACCTGCCTCTTCTCATCCTCCACTCAA
GAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACAGATCTCCTGGACCCGGTGAACCCC*TTTTGTCAA
GGT
GGTGA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2AQ53TF 640 0 0
GGAACC
GCATTTCATCTGTCTCAACAATGGCGTCATTTTCTGTATCTTACGCCAAGATCTGTGCTC
CGAACCACCGGTTCGGATCTTTTCCTGGAACCCGACGGCAGCCGCAACTCAATGGCGTAT
CCTTTCCCTCCGGTGTATCTCAGAATCAATCTACAATCTGGAAGTTGCGTGCAACAACCA
ATGAGGTTGTCTCTAACTCAACCCCAATGACAAACGGTAACGGGAAAGTGAAGAGCAATG
TTCCTGAACCTGCCGAACTCTCTGACTTTATGGCCAAAGTCTCTGGTCTTCTTAAGCTTG
TGGATTCAAGAGATATAGTGGAACTTGAACTGAAGCAGCTCGACTGTGAGATTGTTATTC
GCAAGAAGGAAGCTTTACAGCAGCAGCAACTTCCACCAACAGCTCCAGTTTACCACTCCA
TGCCTCCTCCAGTTACAGGATATCCAATGCCTCCATCTCAACCAGCTGCTCTTCCTCTTG
CTTCTCCTACTCCCTCCTCAGCCCCTGAAACAGCAAAACCAGCAACCCCACCTGCCTCTT
CTCATCCTTCACTCAAGAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACAGATCTCCTGGACCCGGTG
AACCCCCTTTTGTCAAGGTTGGTGATAAAGTGCA

QA 7 640 7 640
DS 

RD RR2CA14TF 779 0 0
GG
ATTTATCTCTCTCTCTCTTAGCTTCCTCGGTTTCATCGTCAACTGCATTTCATCTGTCTC
AACAATGGCGTCATTTTCTGTATCTTACGCCAAGATCTGTGCTCCGAACCACCGGTTCGG
ATCTTTTCCTGGAACCCGACGGCAGCCGCAACTCAATGGCGTATCCTTTCCCTCCGATGT
ATCTCAGAATCAATCTACAATCTGGAAGTTGCGTGCAACAACCAATGAGGTTGTCTCTAA
CTCAACCCCAATGACAAACGGTAACGGGAAAGTGAAGAGCAATGTTCCTGAACCTGCCGA
ACTCTCTGACTTTATGGCCAAAGTCTCTGGTCTTCTTAAGCTTGTGGATTCAAGAGATAT
AGTGGAACTTGAACTGAAGCAGCTCGACTGTGAGATTGTTATTCGCAAGAAGGAAGCTTT
ACAGCAGCAGCAACTTCCACCAACAGCTCCAGTTTACCACTCCATGCCTCCTCCAGTTAC
AGGATATCCAATGCCTCCATCTCAACCAGCTGCTCTTCCTCTTGCTTCTCCTACTCCCTC
CTCAGCCCCTGAAACAGCAAAACCAGCAACCCCACCTGCCTCTTCTCATCCTCCACTCAA
GAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACAGATCTCCTGGACCCGGTGAACCCCCTTTTGTCAA
GGTTGGTGATAAGGTGCAGAAGGGTCAAGTTGTTTGCATTATCGAAGCTATGAAACTAAT
GAATGAGATTGAG*CTGAGAAATCAGAA**CATCACTGAACTACTAGCTGAAGATGG

QA 3 779 3 779
DS 

RD RR2GA69JQ 231 0 0
AAGCTATGAAACTAATGAATGAGATTGAGGCTGAGAAATCAGGAACCATCACTGAACTAC
TAGCTGAAGATGGAAAACCGGTTAGCGTTGATACGCCTCTGTTTACCATCGTGCCTTGAA
GCGTCATTTTAGTTGGTTCAGAACATCTTCAAAGTTTTGGTTTAGCTAATACGGACATGC
TGAAAAATCATTTAAGTGGTTATTCCGGTCTGGTTGTTTTTCCTAAACTGT

QA 1 231 1 231
DS 

RD RR2AQ53JQ 773 0 0
CGAACTCTCTGACTTTATGGCCAAAGTCTCTGGTCTTCTTAAGCTTGTGGATTCAAGAGA
TATAGTGGAACTTGAACTGAAGCAGCTCGACTGTGAGATTGTTATTCGCAAGAAGGAAGC
TTTACAGCAGCAGCAACTTCCACCAACAGCTCCAGTTTACCACTCCATGCCTCCTCCAGT
TACAGGATATCCAATGCCTCCATCTCAACCAGCTGCTCTTCCTCTTGCTTCTCCTACTCC
CTCCTCAGCCCCTGAAACAGCAAAACCAGCAACCCCACCTGCCTCTTCTCATCCTTCACT
CAAGAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACAGATCTCCTGGACCCGGTGAACCCCCTTTTGT
CAAGGTTGGTGATAAGGTGCAGAAGGGTCAAGTTGTTTGCATTATCGAAGCTATGAAACT
AATGAATGAGATTGAGGCTGAGAAATCAGGAACCATCACTGAACTACTAGCTGAAGATGG
AAAACCGGTTAGCGTTGATACGCCTCTGTTTACCATCGTGCCTTGAAGCGTCATTTTAGC
TGGTTCAGAACATCTTCAAAGTCTTGGTTTAGCTAATACGGACATGCTGAAAAATCATTT
AAGTGGTTATTCCGGTCTGGTTGTTTTTCCTAAACTGTCGTCTTTTGTGAGAATCACGTA
ACGTATTAATATGCATGTCTTTTAGAATAATTTCGACAAAACTATTCAGTTTTATAATGT
GTTGCACTATCTCCCCTTGTTCTAGTAATTCAATAAATTAACATTATTTTC
CC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2BN07JQ 771 0 0
AACTCTCTGACTTTATGGCCAAAGTCTCTGGTCTTCTTAAGCTTGTGGATTCAAGAGATA
TAGTGTAACTTGAACTGAAGCAGCTCGACTGTGAGATTGTTATTCGCAAGAAGGAAGCTT
TACAGCAGCAGCAACTTCCACCAACAGCTCCAGTTTACCACTCCATGCCTCCTCCAGTTA
CAGGATATCCAATGCCTCCATCTCAACCAGCTGCTCTTCCTCTTGCTTCTCCTACTCCCT
CCTCAGCCCCTGAAACAGCAAAACCAGCAACCCCACCTGCCTCTTCTCATCCTCCACTCA
AGAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACAGATCTCCTGGACCCGGTGAACCCCCTTTTGTCA
AGGTTGGTGATAAGGTGCAGAAGGGTCAAGTTGTTTGCATTATCGAAGCTATGAAACTAA
TGAATGAGATTGAGGCTGAGAAATCAGGAACCATCACTGAACTACTAGCTGAAGATGGAA
AACCGGTTAGCGTTGATACGCCTCTGTTTACCATCGTGCCTTGAAGCGTCATTTTAGCTG
GTTCAGAACATCTTCAAAGTCTTGGTTTAGCTAATACGGACATGCTGAAAAATCATTTAA
GTGGTTATTCCGGTCTGGTTGTTTTTCCTAAACTGTCATCTTTTGTGAGAATCACGTAAC
GTATTAATATGCATGTCTTTTAGAATAATTTCGACAAAACTATTCAGTTTTATAATGTGT
TGCACTATCTCCCCTTGTTTTAGTAATTCAATAAATTAACATTATTTTCTC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2CA14JQ 747 0 0
GGTCTTCTTAAGCTTGTGGATTCAAGAGATATAGTGGAACTTGAACTGAAGCAGCTCGAC
TGTGAGATTGTTATTCGCAAGAAGGAAGCTTTACAGCAGCAGCAACTTCCACCAACAGCT
CCAGTTTACCACTCCATGCCTCCTCCAGTTACAGGATATCCAATGCCTCCATCTCAACCA
GCTGCTCTTCCTCTTGCTTCTCCTACTCCCTCCTCAGCCCCTGAAACAGCAAAACCAGCA
ACCCCACCTGCCTTTTTTCATCCTCCACTCAAGAGTCCTATGGCTGGTACTTTTTACAGA
TTTCCTGGACCCGGTGAACCCCCTTTTGTCAAGGTTGGTGATAAGGTGCAGAAGGGTCAA
GTTGTTTGCATTATCGAAGCTATGAAACTAATGAATGAGATTGAGGCTGAGAAATCAGGA
ACCATCACTGAACTACTAGCTGAAGATGGAAAACCGGTTAGCGTTGATACGCCTCTGTTT
ACCATCGTGCCTTGAAGCGTCATTTTAGCTGGTTCAGAACATCTTCAAAGTCTTGGTTTA
GCTAATACGGACATGCTGAAAAATCATTTAAGTGGTTATTCCGGTCTGGTTGTTTTTCCT
AAACTGTCATCTTTTGTGAGAATCACGTAACGTATTAATATGCATGTCTTTTAGAATAAT
TTCGACAAAACTATTCAGTTTTATAATGTGTTGCACTATCTCCCCTTGTTTTAGTAATTC
AATAAATTAACATTATTT
AAAAAAAAA

QA 1 738 1 738
DS 



CO CL230Contig3 1093 2 6 U
GGAGTGTGAAAAACGCATCTCTCTCTCTCTTCTTCCTGCTTCCTCGGTTTCATCGACCTC
TTCTGCATTTGATCTGTCTCAACAATGGCGTCACTGTCTGCACCTTACGCCAAGATCTGT
GATCCGAACCAACGGTTCGGATCTATTCCTGGAAGAACCCGATGTCAGCCGCAACTCAAT
GGCGTCTCCTTTCTCTCCGATGTGTCTCAGAACCGATCTACAATCTGGAGGTTGCGTGCG
ACAACCAATGAGGTCGTTGTCTCTAACTCAACCCCAATGACTAACGGTAACGGGAAAGTG
AAGAGCAATGTTCCTGAATCCCCCCAACTCTCTGACTTTATGGCTAGAGTCTCTGGTCTT
CTTAAGCTTGTGGATTCAAGAGATATAGTGGAACTTGAACTGAAGCAGCTCGACTGTGAG
ATTGTTATTCGCAAGAAGGAAGCTTTACAGCAGCAGCAACCTGCACCACCAGCTCCAGTT
TATCACTCTATGCCTCCTCCTCCAATGGCTCCATCTCAACCAGTTGCTTCTCCTGCTCCT
CCCACTCCCTCCTCTGCCCCTGAAACAGTTAAACCAGCAACCCCACCTACCTCTTCTCAT
CCTCCACTCAAGAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACAGGTCTCCTGGACCCGGTGAACCC
CCTTTTGTCAAGGTTGGTGATAAGGTGCAGAAGGGTCAAGTTGTTTGTATTATCGAAGCT
ATGAAACTAATGAATGAGATTGAGGCTGAGAAATTAGGAACCATCACTGAACTACTAGCT
GAAGATGGAAAACCGGTTAGCGTTGGCACGCCTCTGTTTACCATCGTGCATTGAAGCGTC
ATTTTAGCTGGTTCAGAACATCTTCGGAGTCTTGGTTTAGCTAATACCGACGTGCTAAAA
ATCTTTAAGTGCTTATCCCGGTCTGATTGTTTTTTGTTTTTCCTAAACGGTCATCTTTTG
TGAGAATCACATAACGTATTAATATGCATGTCTTTTAGAATAATTTCGACAAAACTATTC
AGTTTATAATGTGTTGCACTATCTCCCCTTGTTTTAGTAATTTAATAAATTAACATTGTT
TTCTCTTCCGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP10TF U 1
AF RR2EP10JQ C 398
BS 1 754 RR2EP10TF
BS 755 755 RR2EP10JQ
BS 756 759 RR2EP10TF
BS 760 760 RR2EP10JQ
BS 761 782 RR2EP10TF
BS 783 1093 RR2EP10JQ

RD RR2EP10TF 782 0 0
GGAGTGTGAAAAACGCATCTCTCTCTCTCTTCTTCCTGCTTCCTCGGTTTCATCGACCTC
TTCTGCATTTGATCTGTCTCAACAATGGCGTCACTGTCTGCACCTTACGCCAAGATCTGT
GATCCGAACCAACGGTTCGGATCTATTCCTGGAAGAACCCGATGTCAGCCGCAACTCAAT
GGCGTCTCCTTTCTCTCCGATGTGTCTCAGAACCGATCTACAATCTGGAGGTTGCGTGCG
ACAACCAATGAGGTCGTTGTCTCTAACTCAACCCCAATGACTAACGGTAACGGGAAAGTG
AAGAGCAATGTTCCTGAATCCCCCCAACTCTCTGACTTTATGGCTAGAGTCTCTGGTCTT
CTTAAGCTTGTGGATTCAAGAGATATAGTGGAACTTGAACTGAAGCAGCTCGACTGTGAG
ATTGTTATTCGCAAGAAGGAAGCTTTACAGCAGCAGCAACCTGCACCACCAGCTCCAGTT
TATCACTCTATGCCTCCTCCTCCAATGGCTCCATCTCAACCAGTTGCTTCTCCTGCTCCT
CCCACTCCCTCCTCTGCCCCTGAAACAGTTAAACCAGCAACCCCACCTACCTCTTCTCAT
CCTCCACTCAAGAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACAGGTCTCCTGGACCCGGTGAACCC
CCTTTTGTCAAGGTTGGTGATAAGGTGCAGAAGGGTCAAGTTGTTTGTATTATCGAAGCT
ATGAAACTAATGAATGAGATTGAGGCTGAGAAAT*AGGA*CCATCACTGAACTACTAGCT
GA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2EP10JQ 696 0 0
AACTGAAGCAGCTCGACTGTGAGATTGTTATTCGCAAGAAGGAAGCTTTACAGCAGCAGC
AACCTGCACCACCAGCTCCAGTTTATCACTCTATGCCTCCTCCTCCAATGGCTCCATCTC
AACCAGTTGCTTCTCCTGCTCCTCCCACTCCCTCCTCTGCCCCTGAAACAGTTAAACCAG
CAACCCCACCTACCTCTTTTCATCCTCCACTCAAGAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACA
GGTCTCCTGGACCCGGTGAACCCCCTTTTGTCAAGGTTGGTGATAAGGTGCAGAAGGGTC
AAGTTGTTTGTATTATCGAAGCTATGAAACTAATGAATGAGATTGAGGCTGAGAAATTAG
GAACCATCACTGAACTACTAGCTGAAGATGGAAAACCGGTTAGCGTTGGCACGCCTCTGT
TTACCATCGTGCATTGAAGCGTCATTTTAGCTGGTTCAGAACATCTTCGGAGTCTTGGTT
TAGCTAATACCGACGTGCTAAAAATCTTTAAGTGCTTATCCCGGTCTGATTGTTTTTTGT
TTTTCCTAAACGGTCATCTTTTGTGAGAATCACATAACGTATTAATATGCATGTCTTTTA
GAATAATTTCGACAAAACTATTCAGTTTATAATGTGTTGCACTATCTCCCCTTGTTTTAG
TAATTTAATAAATTAACATTGTTTTCTCTTCCGTAC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 3 12

CO CL231Contig1 959 3 12 U
AACAATAGAACTGATGTTTCTTACGAAAGTTGCAAGCAAATGTTGACACCGGCCGATAGG
TGTAAGCCCAAAAAAACACTATAAGACCACATTCATACAACAGATATTACTGATAGTGCA
TTTGAACAAACGTGAAACAATTTTATATAAACAATGAACAAGGGAGGAGCTTGATAATTT
GTAAACGATGGAGCATCAATAGTCTTTAGAGATATGGTCAAGATTACTGAGAACCGAGCC
AAGATGTGTTACGCTTTGAAGATGCTTCGGTTGAACCGTCTACCTGGTACGGTGCCTTTG
ATGTAATCCTATCCTTTCTCTTCTCCAGGAATCGATGAAGCGAAGCTCTTCTAGCAATTG
GGAGTTCGCAAGCTAAAGAGGACGTGTTGGTCTGGATTGGCTCTGGTGCTGCTGCGGTTA
TTGCAGGGCTAGGAACTTCCTTTTGGTTCTTGGCTAAGTTTTGAGTATAAGCACTTCCTT
TGTTAGCCAAGTCAATGACTTGTTTGGCTTTCTCAGCAGGGAAATCATCAAACACCATAA
CTTGACCACCGTAGAATATGGTCAACGGAGACGATTGAGACTCCACGGTCTTCTCCACTT
CCTCCTTAACTTGAGAGGAAGAGGAGGAAGAAAAGCTTGACTGGCGAGGAACCATATGCT
TTGGTTTAACGTCTTCAGGAGGAGACGAACCTTCTTCACAAGGGAAGAGATTCATCATCG
TTGGCTGACGTGACACAGCAAAAACTCCATTGATGTCGGGGTTGCATGTCATCCCCAAGC
TCAGATCTCCGAAGCTACCTTTCTCCTTGAGGTAACGACTCAAACGACTACATGTTTCTG
AGAAGCTCGGCTTCTTCTGTAAGCTCGACATCGTTCTTCTGCCTTAAAATTACGGTTTTC
TTTCTTTCTTTGATCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTGTGCACAAAGTGAGTTTTGTGAGCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H577JQB U 1
AF RR2CV53JQ U 1
AF RR2H577TF C 175
BS 1 743 RR2CV53JQ
BS 744 744 RR2H577TF
BS 745 775 RR2CV53JQ
BS 776 776 RR2H577TF
BS 777 802 RR2CV53JQ
BS 803 803 RR2H577TF
BS 804 805 RR2CV53JQ
BS 806 806 RR2H577TF
BS 807 814 RR2CV53JQ
BS 815 815 RR2H577TF
BS 816 838 RR2CV53JQ
BS 839 959 RR2H577TF

RD RR2H577JQB 574 0 0
G
ACAATAGAACTGATGTTTCTTACGAAAGTTGCAAGCAAATGTTGACACCGGCCGATAGGT
GTAAGCCCAAAAAAACACTATAAGACCACATTCATACAACAGATATTACTGATAGTGCAT
TTGAACAAACGTGAAACAATTTTATATAAACAATGAACAAGGGAGGAGCTTGATAATTTG
TAAACGATGGAGCATCAATAGTCTTTAGAGATATGGTCAAGATTACTGAGAACCGAGCCA
AGATGTGTTACGCTTTGAAGATGCTTCGGTTGAACCGTCTACCTGGTACGGTGCCTTTGA
TGTAATCCTATCCTTTCTCTTCTCCAGGAATCGATGAAGCGAAGCTCTTCTAGCAATTGG
GAGTTCGCAAGCTAAAGAGGACGTGTTGGTCTGGATTGGCTCTGGTGCTGCTGCGGTTAT
TGCAGGGCTAGGAACTTCCTTTTGGTTCTTGGCTAAGTTTTGAGTATAAGCACTTCCTTT
GTTAGCCAAGTCAATGACTTGTTTGGCTTTCTCAGCAGGGAAATCATCAAACACCATAAC
TTGACCACCGTAGAATATGGTCAACGGAGACGA

QA 2 574 2 574
DS 

RD RR2CV53JQ 838 0 0
AACAATAGAACTGATGTTTCTTACGAAAGTTGCAAGCAAATGTTGACACCGGCCGATAGG
TGTAAGCCCAAAAAAACACTATAAGACCACATTCATACAACAGATATTACTGATAGTGCA
TTTGAACAAACGTGAAACAATTTTATATAAACAATGAACAAGGGAGGAGCTTGATAATTT
GTAAACGATGGAGCATCAATAGTCTTTAGAGATATGGTCAAGATTACTGAGAACCGAGCC
AAGATGTGTTACGCTTTGAAGATGCTTCGGTTGAACCGTCTACCTGGTACGGTGCCTTTG
ATGTAATCCTATCCTTTCTCTTCTCCAGGAATCGATGAAGCGAAGCTCTTCTAGCAATTG
GGAGTTCGCAAGCTAAAGAGGACGTGTTGGTCTGGATTGGCTCTGGTGCTGCTGCGGTTA
TTGCAGGGCTAGGAACTTCCTTTTGGTTCTTGGCTAAGTTTTGAGTATAAGCACTTCCTT
TGTTAGCCAAGTCAATGACTTGTTTGGCTTTCTCAGCAGGGAAATCATCAAACACCATAA
CTTGACCACCGTAGAATATGGTCAACGGAGACGATTGAGACTCCACGGTCTTCTCCACTT
CCTCCTTAACTTGAGAGGAAGAGGAGGAAGAAAAGCTTGACTGGCGAGGAACCATATGCT
TTGGTTTAACGTCTTCAGGAGGAGACGAACCTTCTTCACAAGGGAAGAGATTCATCATCG
TTGGCTGACGTGACACAGCAAAA*CTCCATTGATGTCGGGGTTGCATGTCATCCC*AAGC
TCAGATCTCCGAAGCTACCTTTTTC*TTGAGGTA*CGACTCAAACGACTACATGTTTC

QA 1 838 1 838
DS 

RD RR2H577TF 785 0 0
ATAA
TTGTAAACGATG*AGCATCAATAGTCTT*AGAGATATG*TCAAGAT*ACTGAGAACCGAG
CCAAGATGTGTTACGCTT*GAAGATGCTTCGGTTGAAC*GTCTACCTGGTACGGTGCCTT
TGATGTAATCCTATCCTTTCTCTTCTCCAGGAATCGATGAAGCGAAGCTCTTCTAGCAAT
TGGGAGTTCGCAAGCTAAAGAGGACGTGTTGGTCTGGATTGGCTCTGGTGCTGCTGCGGT
TATTGCAGGGCTAGGAACTTCCTTTTGGTTCTTGGCTAAGTTTTGAGTATAAGCACTTCC
TTTGTTAGCCAAGTCAATGACTTGTTTGGCTTTCTCAGCAGGGAAATCATCAAACACCAT
AACTTGACCACCGTAGAATATGGTCAACGGAGACGATTGAGACTCCACGGTCTTCTCCAC
TTCCTCCTTAACTTGAGAGGAAGAGGAGGAAGAAAAGCTTGACTGGCGAGGAACCATATG
CTTTGGTTTAACGTCTTCAGGAGGAGACGAACCTTCTTCACAAGGGAAGAGATTCATCAT
CGTTGGCTGACGTGACACAGCAAAAACTCCATTGATGTCGGGGTTGCATGTCATCCCCAA
GCTCAGATCTCCGAAGCTACCTTTCTCCTTGAGGTAACGACTCAAACGACTGCATGTTTC
TGAGAAGCTCGGCTTCTTCTGTAAGCTCGACATCGTTCTTCTGCCTTAAAATTACGGTTT
TCTTTCTTTCTTTGATCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTGTGCACAAAGTGAGTTTTGTGAGC
C

QA 5 785 5 785
DS 



CO CL231Contig2 1231 3 3 U
GGATGTGCAAGTAGAGCGAAAGAAAGTATTAAAAAGACGTTCACGTTTCTTCCTCCTCAC
ACCAGCATAAGAAGAACAATTGAAGAAAGCAAGCAGGAACATAGAGATTCTTTCTTGTCC
TTTCAGTGAGGGTTTTTGGGTTTAAGCGAATCGATTGATTGCTTGATTGATTGATTTAGA
AGGATGTCGAGTTCTGCCGAGTGTTGGGAATCCTCCGGTGAGAGGAAGAGGGTGCTTGAG
AAGAAACCGAGCTTCTCGCAAACATGTAGTCGATTGAGTCGTTATCTGAAGGAGAAGGGT
AGCTTCGGAGATCTCAGCTTAAGGTTGACATGCAACCCCGACCTTAATGGGGGTTTTGGT
GTGTCACGTGAGCCCACGATGATGAATCTCTTCCCTTCTACGGCTGCTCAAGACGTTAAA
CCGAAGAGTGATGTGATTCCTCGGCAATCAAGCTTTTCTTCTTCCTCGTCCCCTGGTGGA
GTCAAGGAAGAAGTCGATAAGATCATGGATACCAAATCTGTGAAGGTGGAGTCTCAATCT
GCGCCATTGACCATATTCTACGGCGGTCAAGTTATGGTGTTTGATGATTTTCCTGCTGAG
AAAGCCAAGCAAGTCATTGACTTGGCTCACAAAGCAAGTGCTAAAAGCTTCACATCTGAG
CCGAACAGTAGCCAGATTGCTTATACTCAAAACATAGTCAAGGATCATAAAGAGATTGTT
TCTACTATCCCAAATCCAGTTCCTATTCATGTGAAAACCGCTGCACCAGAGCCAATCCAA
GCCAACAAGTCCTCTTTAGCTTGCGGTAACGAACTCCCAATTGCTAGAAGAGCTTCACTT
CATCGATTCCTCGAGAAGAGAAAGGATAGGATTTCATCAAAGGCACCGTACCAGATAGAC
GGTTCTACCGAAGCATCTTCCAAGCCAAACACATCTTGGCTCGGTTCCCAGTAATCTCTT
TGAGTTGAGACTCCTTTTGATGATGCTCCCATCGTTTACTATAATATCAAGAAGCTCTAC
TGATTTCACTCCTAGGAGTTTTGTTGTCTGTTCAATGCGCCAGAAAAAAAAACTCAGTAT
ATCTGTACGAAACTAATCCCTTATAGTTTTGCTACTTTTTTTGGGTTTAAAGCCATTGTG
TTATAGACCTTTTCATCTGCTGTTCTCAGCATTTGCTTGCAACTTTTGTAAGAAACATCA
GTTTCTTATTTATTTATTTTTGGTTGTGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2DD51TF U 1
AF RR2G933TF U 509
AF RR2G933JQ C 662
BS 1 691 RR2DD51TF
BS 692 1227 RR2G933TF
BS 1228 1231 RR2G933JQ

RD RR2DD51TF 696 0 0
GGATGTGCAAGTAGAGCGAAAGAAAGTATTAAAAAGACGTTCACGTTTCTTCCTCCTCAC
ACCAGCATAAGAAGAACAATTGAAGAAAGCAAGCAGGAACATAGAGATTCTTTCTTGTCC
TTTCAGTGAGGGTTTTTGGGTTTAAGCGAATCGATTGATTGCTTGATTGATTGATTTAGA
AGGATGTCGAGTTCTGCCGAGTGTTGGGAATCCTCCGGTGAGAGGAAGAGGGTGCTTGAG
AAGAAACCGAGCTTCTCGCAAACATGTAGTCGATTGAGTCGTTATCTGAAGGAGAAGGGT
AGCTTCGGAGATCTCAGCTTAAGGTTGACATGCAACCCCGACCTTAATGGGGGTTTTGGT
GTGTCACGTGAGCCCACGATGATGAATCTCTTCCCTTCTACGGCTGCTCAAGACGTTAAA
CCGAAGAGTGATGTGATTCCTCGGCAATCAAGCTTTTCTTCTTCCTCGTCCCCTGGTGGA
GTCAAGGAAGAAGTCGATAAGATCATGGATACCAAATCTGTGAAGGTGGAGTCTCAATCT
GCGCCATTGACCATATTCTACGGCGGTCAAGTTATGGTGTTTGATGATTTTCCTGCTGAG
AAAGCCAAGCAAGTCATTGACTTGGCTCACAAAGCAAGTGCTAAAAGCTTCACATCTGAG
CCGAACAGTAGCCAGATTGCTTATACTCAAA
CATAG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2G933TF 720 0 0
G
TACTAAATCTGTGAAGGTGGAGTCTCAATCTGCGCCATTGACCATATTCTACGGCGGTCA
AGTTATGGTGTTTGATGATTTTCCTGCTGAGAAAGCCAAGCAAGTCATTGACTTGGCTCA
CAAAGCAAGTGCTAAAAGCTTCACATCTGAGCCGAACAGTAGCCAGATTGCTTATACTCA
AAACATAGTCAAGGATCATAAAGAGATTGTTTCTACTATCCCAAATCCAGTTCCTATTCA
TGTGAAAACCGCTGCACCAGAGCCAATCCAAGCCAACAAGTCCTCTTTAGCTTGCGGTAA
CGAACTCCCAATTGCTAGAAGAGCTTCACTTCATCGATTCCTCGAGAAGAGAAAGGATAG
GATTTCATCAAAGGCACCGTACCAGATAGACGGTTCTACCGAAGCATCTTCCAAGCCAAA
CACATCTTGGCTCGGTTCCCAGTAATCTCTTTGAGTTGAGACTCCTTTTGATGATGCTCC
CATCGTTTACTATAATATCAAGAAGCTCTACTGATTTCACTCCTAGGAGTTTTGTTGTCT
GTTCAATGCGCCAGAAAAAAAAACTCAGTATATCTGTACGAAACTAATCCCTTATAGTTT
TGCTACTTTTTTTGGGTTTAAAGCCATTGTGTTATAGACCTTTTCATCTGCTGTTCTCAG
CATTTGCTTGCAACTTTTGTAAGAAACATCAGTTTCTTATTTATTTATTTTTGGTTGT
G

QA 2 719 2 719
DS 

RD RR2G933JQ 570 0 0
CGAACAGTAG
CCAGATTGCTTATACTCAAAACATAGTCAAGGATCATAAAGAGATTGTTTTTACTATCCC
AAATCCAGTTCCTATTCATGTGAAAACCGCTGCACCAGAGCCAATCCAAGCCAACAAGTC
CTCTTTAGCTTGCGGTAACGAACTCCCAATTGCTAGAAGAGCTTCACTTCATCGATTCCT
CGAGAAGAGAAAGGATAGGATTTCATCAAAGGCACCGTACCAGATAGACGGTTTTACCGA
AGCATTTTCCAAGCCAAACACATTTTGGCTCGGTTCCCAGTAATTTTTTTGAGTTGAGAC
TCCTTTTGATGATGCTCCCATCGTTTACTATAATATCAAGAAGCTTTACTGATTTCACTC
CTAGGAGTTTTGTTGTCTGTTCAATGCGCCAGAAAAAAAAACTCAGTATATCTGTACGAA
ACTAATCCCTTATAGTTTTGCTACTTTTTTTGGGTTTAAAGCCATTGTGTTATAGACCTT
TTCATTTGCTGTTTTCAGCATTTGCTTGCAACTTTTGTAAGAAACATCAGTTTTTTATTT
ATTTATTTTTGGTTGTGTCG

QA 11 570 11 570
DS 



CO CL231Contig3 1258 6 13 U
CTGGAAGCTTCAGCTCTCTCAATAAATAAGAAAAGAAAGACACACTTGGATAATTAAAGT
AAGCTGATATTAAGGTCGTCAACAACAACAACAACCAAAAATAAATAAATAAGAAACTGA
TGTTTCTTACAAAAGTTGCAAGCAAATGCTGAGAACAGCAAATGAAAAGGTCTATAACAC
AATGGCTTTAAACCCAAAAAAAAGTAGCAAAACTATAAGGGATTAGTTTCGTACAGATAT
ACTGAGTTTTTTTTCTGGCGCATTGAACAGACAACAAAACTCCTAGGAGTGAAATCAGTA
GAGCTTCTTGATATTATAGTAAACGATGGGAGCATCATCAAAAGGAGTCTCAACTCAAAG
AGATTACTGGGAACCGAGCCAAGATGTGTTTGGCTTGGAAGATGCTTCGGTAGAACCGTC
TATCTGGTACGGTGCCTTTGATGAAATCCTATCCTTTCTCTTCTCGAGGAATCGATGAAG
TGAAGCTCTTCTAGCAATTGGGAGTTCGTTACCGCAAGCTAAAGAGGACTTGTTGGCTTG
GATTGGCTCTGGTGCAGCGGTATTCACAGGACTAGGAACTGGATTTGGGGTAGTGGAAGC
AATCTCTTTATGATTCTTGGCTATGATGTTTTGAGTATAAGCACTCTGGTCACTGTTCAG
CTCAGATGTGAAGCTTTTAGCACTTGCTTTGTGAGCCAAGTCAATGACTTGCTTGGCTTT
CTCAGCAGGAAAATCATCAAACACCATAACTTGACCGCCGTAGAATATGGTCAATGGCGC
AGATTGAGACTCCACCTTCACAGATTTAGTATCCATGATCTTATCGACTTCCTCCTTGAC
TCCACCAGGGGACGAGGAAGAAGAAAAGCTTGATTGGCGAGGAATCACATCACTCTTCGG
TTTAACGTCTTGAGCAGCCGTAGAAGGGAAGAGATTCATCATCGTGGGCTCACGTGACAC
ACCAAAAGCTCCATTAAGGTCGGGGTTGCATGTCAACCCTAAGCTGAGATCTCCGAAGCT
ACCCTTCTCCTTCAGATAACGACTCAATCGACTACATGTTTGCGAGAAGCTCGGCTTCTT
CTCAAGCACCCTCTTCCTCTCACCCGACAATTCCCAACACTCGGCAGAACTCGTCATCCT
TCTAAATCAATCAATCAATCGATTCTTAAAACCAAAAACCTCACTGAAAGGACAAGAAAG
AATCTATGTTCCTGCTTGCTTTCTTCAATTGCTCTTCTTTCTTCTTATGCTGGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D728JQ U 107
AF RR2EY39JQ U 52
AF RR2BC54JQ U 48
AF RR2GA17JQ U 1
AF RR2BC54TF C 461
AF RR2D728TF C 484
BS 1 160 RR2GA17JQ
BS 161 161 RR2EY39JQ
BS 162 561 RR2GA17JQ
BS 562 562 RR2BC54TF
BS 563 644 RR2GA17JQ
BS 645 645 RR2BC54TF
BS 646 660 RR2GA17JQ
BS 661 661 RR2BC54TF
BS 662 694 RR2GA17JQ
BS 695 831 RR2BC54TF
BS 832 832 RR2D728TF
BS 833 1082 RR2BC54TF
BS 1083 1258 RR2D728TF

RD RR2D728JQ 162 0 0
AAAAAAA
AAACTGATGTTTCTTACAAAAGTTGCAAGCAAATGCTGAAAACAGCAAATGAAAAGGTCT
ATAACACAATGGCTTTAAACCCAAAAAAAAGTAGCAAAACTATAAGGGATTATTTTCGTA
CAAATATACTGAGTTTTTTTTCTGGCGCATTGAAC

QA 8 162 8 162
DS 

RD RR2EY39JQ 403 0 0
AATTAAAGTAAGCTGATATTAAGGTCGTCAACAACAACAACAACCAAAAATAAATAAATA
AGAAACTGATGTTTCTTACAAAAGTTGCAAGCAAATGCTGAGAACAGCAAATGAAAAGGT
CTATAACACAATGGCTTTAAACCCAAAAAAAAGTAGCAAAACTATAAGGGATTAGTTTCG
TACAGATATACTGAGTTTTTTTTCTGGCGCATTGAACAGACAACAAAACTCCTAGGAGTG
AAATCAGTAGAGCTTCTTGATATTATAGTAAACGATGGGAGCATCATCAAAAGGAGCCTC
AACTCAAAGAGATTACTGGGAACCGAGCCAAGATGTGTTTGGCTTGGAAGATGCTTCGGT
AGAACCGTCTATCTGGTACGGTGCCTTTGATGAAATCCTATCC

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2BC54JQ 480 0 0
GGAT
AATTAAAGTAAGCTGATATTAAGGTCGTCAACAACAACAACAACCAAAAATAAATAAATA
AGAAACTGATGTTTCTTACAAAAGTTGCAAGCAAATGCTGAGAACAGCAGATGAAAAGGT
CTATAACACAATGGCTTTAAACCCAAAAAAA*GTAGCAAAACTATAAGGGATTAGTTTCG
TACAGATATACTGAGTTTTTTT*CTGGCGCATTGAACAGACAACAAAACTCCTAGGAGTG
AAATCAGTAGAGCTTCTTGATATTATAGTAAACGATGGGAGCATCATCAAAAGGAGTCTC
AACTCAAAGAGATTACTGGGAACCGAGCCAAGATGTGTTTGGCTTGGAAGAAGCTTCGGT
AGAACCGTCTATCTGGTACGGTGCCTTTGATGAAATCCTATCCTTTCTCTTCTCGAGGAA
TCGATGAAGTGAAGCTCTTCTAGCAATTGGGAGTTCGTTACCGCAAGCTAAAGAGG

QA 5 480 5 480
DS 

RD RR2GA17JQ 694 0 0
CTGGAAGCTTCAGCTCTCTCAATAAATAAGAAAAGAAAGACACACTTGGATAATTAAAGT
AAGCTGATATTAAGGTCGTCAACAACAACAACAACCAAAAATAAATAAATAAGAAACTGA
TGTTTCTTACAAAAGTTGCAAGCAAATGCTGAGAACAGCAGATGAAAAGGTCTATAACAC
AATGGCTTTAAACCCAAAAAAAAGTAGCAAAACTATAAGGGATTAGTTTCGTACAGATAT
ACTGAGTTTTTTTTCTGGCGCATTGAACAGACAACAAAACTCCTAGGAGTGAAATCAGTA
GAGCTTCTTGATATTATAGTAAACGATGGGAGCATCATCAAAAGGAGTCTCAACTCAAAG
AGATTACTGGGAACCGAGCCAAGATGTGTTTGGCTTGGAAGATGCTTCGGTAGAACCGTC
TATCTGGTACGGTGCCTTTGATGAAATCCTATCCTTTCTCTTCTCGAGGAATCGATGAAG
TGAAGCTCTTCTAGCAATTGGGAGTTCGTTACCGCAAGCTAAAGAGGACTTGTTGGCTTG
GATTGGCTCTGGTGCAGCGGTTTTCACAGGACTAGGAACTGGATTTGGGGTAGTGGAAGC
AATCTCTTTATGATTCTTGGCTATGATGTTTTGAGTATAAGCACCCTGGTCACTGTTCAG
ATCAGATGTGAAGCTTTTAGCACTTGCTTTGTGA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2BC54TF 622 0 0
TCTCTCGA
GAATCGATGAAGTGAAGCTCT*CTAGCAAT*GGGAGTTCGTTACCGCAAGCTAAAGAGGA
CTTGTTGGCTTGGATTGGCTCTGGTGCAGCGGTATTCACAGGACTAGGAACTGGATTTGG
GGTAGTGGAAGCAATCTCTTTATGATTCTTGGCTATGATGTTTTGAGTATAAGCACTCTG
GTCACTGTTCAGCTCAGATGTGAAGCTTTTAGCACTTGCTTTGTGAGCCAAGTCAATGAC
TTGCTTGGCTTTCTCAGCAGGAAAATCATCAAACACCATAACTTGACCGCCGTAGAATAT
GGTCAATGGCGCAGATTGAGACTCCACCTTCACAGATTTAGTATCCATGATCTTATCGAC
TTCTTCCTTGACTCCACCAGGGGACGAGGAAGAAGAAAAGCTTGATTGGCGAGGAATCAC
ATCACTCTTCGGTTTAACGTCTTGAGCAGCCGTAGAAGGGAAGAGATTCATCATCGTGGG
CTCACGTGACACACCAAAAGCTCCATTAAGGTCGGGGTTGCATGTCAACCCTAAGCTGAG
ATCTCCGAAGCTACCCTTCTCCTTCAGATAACGACTCAATCGACTACATGTTTGCGAGAA
GCTCGGCTTCTTCT

QA 9 622 9 622
DS 

RD RR2D728TF 775 0 0
GAGCTC
TCTAGCAATTGGGAGT*CGT*ACCGCAAGCTAAAGAGGACTTGTTGGCTTGGATTGGCTC
TGGTGCAGCGGT*TTCACAGGACTAGGAACTGGATTTGGGGTAGTGGAAGCAATCTCTTT
ATGATTCTTGGCTATGATGTTTTGAGTATAAGCACTCTGGTCACTGTTCAGCTCAGATGT
GAAGCTTTTAGCACTTGCTTTGTGAGCCAAGTCAATGACTTGCTTGGCTTTCTCAGCAGG
AAAATCATCAAACACCATAACTTGACCGCCGTAGAATATGGTCAATGGCGCAGATTGAGA
TTCCACCTTCACAGATTTAGTATCCATGATCTTATCGACTTCCTCCTTGACTCCACCAGG
GGACGAGGAAGAAGAAAGGCTTGATTGGCGAGGAATCACATCACTCTTCGGTTTAACGTC
TTGAGCAGCCGTAGAAGGGAAGAGATTCATCATCGTGGGCTCACGTGACACACCAAAAGC
TCCATTAAGGTCGGGGTTGCATGTCAACCCTAAGCTGAGATCTCCGAAGCTACCCTTCTC
CTTCAGATAACGACTCAATCGACTACATGTTTGCGAGAAGCTCGGCTTCTTCTCAAGCAC
CCTCTTCCTCTCACCCGACAATTCCCAACACTCGGCAGAACTCGTCATCCTTCTAAATCA
ATCAATCAATCGATTCTTAAAACCAAAAACCTCACTGAAAGGACAAGAAAGAATCTATGT
TCCTGCTTGCTTTCTTCAATTGCTCTTCTTTCTTCTTATGCTGGTGTCC

QA 7 775 7 775
DS 



AS 2 14

CO CL232Contig1 753 2 5 U
ATAAACACGTAGAAGCTTTAAAAAAGAGAGAGCGAGAGAGAGAGAAATGGCGACATCAGG
AACATACGTGACGGAGGTCCCGTTGAAAGGAACAGCGGAGAAACACTACAAGAGGTGGAA
GAGCGAGAACCATGTCTTCCCTGACGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTCACCGTTCA
CGAGGGCGAGCATGACTCCCATGGTTCTATCAGGAGCTGGAACTACACATGGGATGGAAA
GGAAGAGATATTCAAGGAGAAAAGAGAGGTAGACGATGAGAACTTAACGTTGACGTTAAG
AGGACTTGAGGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTATGATGTGATCTACCAATTTAT
CCCCAAAACTGAGGATACCTGCGCCTGCAAAATCACTCTTGTATGGGAGAAGCGCAACGA
TGATTCTCCTGAACCAAGCACCTACATGAAATTCGTCAAGAGCTTAGTCGCCGACATGGA
CCACCACGTCAATAAAGCTTAATCATTTATCATCATCACCATCATGATCATCATTATCAT
CATCCACCTCGCCATCACCATCACCATCACCATCATCACTCTCTCGATTTACTTATTAAG
GTATTTTCAATATAATAAACGCGTCTTGTACGTGGAGTTTTATTTCTATGTAATTGTTTG
GTCTTGTAAGATGGTTTGATATGTTGTTATAGACCTATGGTCATATCTAGTTGGATGTAA
TGATTGTTAAGAATAATATACGTTCTTCACACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ33TF U 248
AF RR2CQ33JQ C 1
BS 1 247 RR2CQ33JQ
BS 248 301 RR2CQ33TF
BS 302 302 RR2CQ33JQ
BS 303 502 RR2CQ33TF
BS 503 753 RR2CQ33JQ

RD RR2CQ33TF 260 0 0
ATATTCAAGGAGAAAAGAGAGGTAGACGATGAGAACTTAACGTTGACGTTAAGATGACTT
GAGGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTATGATGTGATCTACCAATTTATCCCCAAA
ACTGAGGATACCTGCGCCTGCAAAATCACTCTTGTATGGGAGAAGCGCAACGATGATTCT
CCTGAACCAAGCACCTACATGAAATTCGTCAAGAGCTTAGTCGCCGACATGGACCACCAC
GTCAATAAAGCTTAA
TCAGT

QA 1 255 1 255
DS 

RD RR2CQ33JQ 753 0 0
ATAAACACGTAGAAGCTTTAAAAAAGAGAGAGCGAGAGAGAGAGAAATGGCGACATCAGG
AACATACGTGACGGAGGTCCCGTTGAAAGGAACAGCGGAGAAACACTACAAGAGGTGGAA
GAGCGAGAACCATGTCTTCCCTGACGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTCACCGTTCA
CGAGGGCGAGCATGACTCCCATGGTTCTATCAGGAGCTGGAACTACACATGGGATGGAAA
GGAAGAGATATTCAAGGAGAAGAGAGAGGTAGACGATGAGAACTTAACGTTGACGTTAAG
AGGACTTGAGGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTATGATGTGATCTACCAATTTAT
CCCCAAAACTGAGGATACCTGCGCCTGCAAAATCACTCTTGTATGGGAGAAGCGCAACGA
TGATTCTCCTGAACCAAGCACCTACATGAAATTCGTCAAGAGCTTAGTCGCCGACATGGA
CCACCACGTCAATAAAGCTTAATCATTTATCATCATCACCATCATGATCATCATTATCAT
CATCCACCTCGCCATCACCATCACCATCACCATCATCACTCTCTCGATTTACTTATTAAG
GTATTTTCAATATAATAAACGCGTCTTGTACGTGGAGTTTTATTTCTATGTAATTGTTTG
GTCTTGTAAGATGGTTTGATATGTTGTTATAGACCTATGGTCATATCTAGTTGGATGTAA
TGATTGTTAAGAATAATATACGTTCTTCACACT

QA 1 753 1 753
DS 



CO CL232Contig2 769 12 6 U
GGATCAACCATCAACACAAAATAAACACGTAGAAGCTTTAAAAAAGAGAGAGCGAGAGAG
AGAGAAATGGCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTGAAAGGAACAGCGGAG
AAACACTACAAGAGGTGGAAGAGCGAGAACCATGTCTTCCCTGACGCCATCGGCCACCAC
ATCCAAAATGTCACCGTTCACGAGGGCGAGCATGACTCCCATGGTTCTATCAGGAGCTGG
AACTACACATGGGATGGAAAAGAAGAGATATTCAAGGAGAAGAGAGAGGTAGACGATGAG
AACTTAACGTTGACGTTACGAGGACTTGAGGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTAT
GATGTGATCTACCAATTTATCCCCAAAACTGAGGATACCTGCGCCTGCAAAATCACTCTT
GTATGGGAGAAGCGCAACGATGATTCTCCTGAACCAAGCACCTACATGAAATTCGTCAAG
AGCTTAGTCGCCGATATGGACCACCACGTCAATAAATCTTAAATCATCACCATCATGATC
ATCATTATCATCATCCACCTCGCCATCACCATCACCATCACCATCATCACTCTCTCGATT
TACTTATTAAGGTATTTTCAATATAATAAATGCGTCTTGTACGTGGAGTTTTATTTCTAT
GCAATTGTTTGGTCTTGTAAGATGGTTTGATATGTTGTTATAGACCTATGGTCATCATCG
AGTTTGATGTAATGATTGTTAAGAATAATATACGTTCTTCACTTATCCA


BQ
10 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 
15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 35 35 35 35 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 35 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ29TF U 1
AF RR2GG41TF U 1
AF RR2G156TF U 2
AF RR2AG16JQ C 5
AF RR2GG41JQB C 240
AF RR2AG16TF U 5
AF RR2AB26TF U 272
AF RR2FZ29JQ C 405
AF RR2BV62JQ C 35
AF RR2BV62TF U 69
AF RR2G133JQ C 46
AF RR2G156JQ C 47
BS 1 389 RR2FZ29TF
BS 390 600 RR2GG41TF
BS 601 731 RR2G156TF
BS 732 732 RR2AG16TF
BS 733 742 RR2G156TF
BS 743 769 RR2AG16TF

RD RR2FZ29TF 389 0 0
GGATCAACCATCAACACAAAATAAACACGTAGAAGCTTTAAAAAAGAGAGAGCGAGAGAG
AGAGAAATGGCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTGAAAGGAACAGCGGAG
AAACACTACAAGAGGTGGAAGAGCGAGAACCATGTCTTCCCTGACGCCATCGGCCACCAC
ATCCAAAATGTCACCGTTCACGAGGGCGAGCATGACTCCCATGGTTCTATCAGGAGCTGG
AACTACACATGGGATGGAAAAGAAGAGATATTCAAGGAGAAGAGAGAGGTAGACGATGAG
AACTTAACGTTGACGTTACGAGGACTTGAGGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTAT
GATGTGATCTACCAATTTATCCCCAAAAC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2GG41TF 600 0 0
G
GATCAACCATCAACACAAAATAAACACGTAGAAGCTTTAAAAAAGAGAGAGCGAGAGAGA
GAGAAATGGCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTGAAAGGAACAGCGGAGA
AACACTACAAGAGGTGGAAGAGCGAGAACCATGTCTTCCCTGACGCCATCGGCCACCACA
TCCAAAATGTCACCGTTCACGAGGGCGAGCATGACTCCCATGGTTCTATCAGGAGCTGGA
ACTACACATGGGATGGAAAAGAAGAGATATTCAAGGAGAAGAGAGAGGTAGACGATGAGA
ACTTAACGTTGACGTTACGAGGACTTGAGGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTATG
ATGTGATCTACCAATTTATCCCCAAAACTGAGGATACCTGCGCCTGCAAAATCACTCTTG
TATGGGAGAAGCGCAACGATGATTCTCCTGAACCAAGCACCTACATGAAATTCGTCAAGA
GCTTAGTCGCCGATATGGACCACCACGTCAATAAATCTTAAATCATCACCATCATGATCA
TCATTATCATCATCCACCTCGCCATCACCATCACCATCACCATCATCACTCTCTCGATT

QA 2 600 2 600
DS 

RD RR2G156TF 746 0 0
GATCAACCATCAACACAAAATAAACACGTAGAAGCTTTAAAAAAGAGAGAGCGAGAGAGA
GAGAAATGGCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTGAAAGGAACAGCGGAGG
AACACTACAAGAGGTGGAAGAGCGAGAACCATGTCTTCCCTGACGCCATCGGCCACCACA
TCCAAAATGTCACCGTTCACGAGGGCGAGCATGACTCCCATGGTTCTATCAGGAGCTGGA
ACTACACATGGGATGGAAAAGAAGAGATATTCAAGGAGAAGAGAGAGGTAGACGATGAGA
ACTTAACGTTGACGTTACGAGGACTTGAGGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTATG
ATGTGATCTACCAATTAATCCCCAAAACTGAGGATACCTGCGCCTGCAAAATCACTCTTG
TATGGGAGAAGCGCAACGATGATTCTCCTGAACCAAGCACCTACATGAAATTCGTCAAGA
GCTTAGTCGCCGATATGGACCACCACGTCAATAAATCTTAAATCATCCCCATCATGATCA
TCATTATCATCATCCACCTCGCCATCACCATCACCATCACCATCATCACTCTCTCGATTT
ACTTATTAAGGTATTTTCAATATAATAAATGCGTCTTGTACGTGGAGTTTTATTTCTATG
CAATTGTTTGGTCTTGTAAGATGGTTTGATATGTTGTTATAGACCTATGGTCATCATCGA
GTTTGATGTA*TGATTGTTAA
AAAAA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2AG16JQ 753 0 0
G
AACCATCAACACAAAATAAACACGTAGAAGCTTTAAAAAAGAGAGAGCGAGAGAGAGAGA
AATGGCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTTAAAGGAACAGCGGAGAAACA
CTACAAGAGGTGGAAGAGCGAGAACCATGTCTTCCCTGACGCCATCGGCCACCACATCCA
AAATGTCACCGTTCACGAGGGCGAGCATGACTCCCATGGTTCTATCAGGAGCTGGAACTA
CACATGGGATGGAAAAGAAGAGATATTCAAGGAGAAGAGAGAGGTAGACGATGAGAACTT
AACGTTGGCGTTACGAGGACTTGAGGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTATGATGT
GATCTACCAATTTATCCCCAAAACTGAGGATACCTGCGCCTGCAAAATCACTCTTGTATG
GGAGAAGCGCAACGATGATTCTCCTGAACCAAGCACCTACATGAAATTCGTCAAGAGCTT
AGTCGCCGATATGGACCACCACGTCAATAAATCTTAAATCATCACCATCATGATCATCAT
TATCATCATCCACCTCGCCATCACCATCACCATCACCATCATCACTCTCTCGATTTACTT
ATTAAGGTATTTTCAATATAATAAATGCGTCTTGTACGTGGAGTTTTATTTCTATGCAAT
TGTTTGGTCTTGTAAGATGGTTTGATATGTTGTTATAGACCTATGGTCATCATCGAGTTT
GATGTAATGATTGTTAAGAATAATATACGTTC

QA 2 753 2 753
DS 

RD RR2GG41JQB 518 0 0
GAACTACACATGGGATGGAAAAGAAGAGATATTCAAGGAGAAGAGAGAGGTAGACGATGA
GAACTTAACGTTGACGTTACGAGGACTTGAGGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTA
TGATGTGATCTACCAATTTATCCCCAAAACTGAGGATACCTGCGCCTGCAAAATCACTCT
TGTATGGGAGAAGCGCAACGATGATTTTCCTGAACCAAGCACCTACATGAAATTCGTCAA
GAGCTTAGTCGCCGATATGGACCACCACGTCAATAAATCTTAAATCATCACCATCATGAT
CATCATTATCATCATCCACCTCGCCATCACCATCACCATCACCATCATCACTCTCTCGAT
TTACTTATTAAGGTATTTTCAATATAGTAAATGCGTCTTGTACGTGGAGTTTTATTTTTA
TGCAATTGTTTGGTCTTGTAAGATGGTTTGATATGTTGTTATAGACCTATGGTCATCATC
GAGTTTGATGTAATGATTGTTAAGAATAATATACGTTC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2AG16TF 765 0 0
G
AACCATCAACACAAAATAAACACGTAGAAGCTTTAAAAAAGAGAGAGCGAGAGAGAGAGA
AATGGCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTTAAAGGAACAGCGGAGAAACA
CTACAAGAGGTGGAAGAGCGAGAACCATGTCTTCCCTGACGCCATCGGCCACCACATCCA
AAATGTCACCGTTCACGAGGGCGAGCATGACTCCCATGGTTCTATCAGGAGCTGGAACTA
CACATGGGATGGAAAAGAAGAGATATTCAAGGAGAAGAGAGAGGTAGACGATGAGAACTT
AACGTTGGCGTTACGAGGACTTGAGGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTATGATGT
GATCTACCAATTTATCCCCAAAACTGAGGATACCTGCGCCTGCAAAATCACTCTTGTATG
GGAGAAGCGCAACGATGATTCTCCTGAACCAAGCACCTACATGAAATTCGTCAAGAGCTT
AGTCGCCGATATGGACCACCACGTCAATAAATCTTAAATCATCACCATCATGATCATCAT
TATCATCATCCACCTCGCCATCACCATCACCATCACCATCATCACTCTCTCGATTTACTT
ATTAAGGTATTTTCAATATAATAAATGCGTCTTGTACGTGGAGTTTTATTTCTATGCAAT
TGTTTGGTCTTGTAAGATGGTTTGATATGTTGTTATAGACCTATGGTCATCATCGAGTTT
GATGTAATGATTGTTAAGAATAATATACGTTCTTCACTTATCCA

QA 2 765 2 765
DS 

RD RR2AB26TF 493 0 0
G
CAAGGAGAAGAGAGAGGTAGACGATGAGAACTTAACGTTGACGTTACGAGGACTTGAGGG
TCACGTGATAGAGCAGCTCAAGGTGTATGATGTGATCTACCAATTTATCCCCAAAACTGA
GGATACCTGCGCCTGCAAAATCACTCTTGTATGGGAGAAGCGCAACGATGATTCTCCTGA
ACCAAGCACCTACATGAAATTCGTCAAGAGCTTAGTCGCCGATATGGACCACCACGTCAA
TAAATCTTAAATCATCACCATCATGATCATCATTATCATCATCCACCTCGCCATCACCAT
CACCATCACCATCATCACTCTCTCGATTTACTTATTAAGGTATTTTCAATATAATAAATG
CGTCTTGTACGTGGAGTTTTATTTCTATGCAATTGTTTGGTCTTGTAAGATGGTTTGATA
TGTTGTTATAGACCTATGGTCATCATCGAGTTTGATGTAATGATTGTTAAGAATAATATA
CGTTCTTCACTT

QA 2 493 2 493
DS 

RD RR2FZ29JQ 360 0 0
CTGCAAAATCACTCTTGTATGGGAGAAGCGCAACGATGATTCTCCTGAACCAAGCACCTA
CATGAAATTCGTCAATAGCTTAGTCGCCGATATGGACCACCACGTCAATAAATCTTAAAT
CATCACCATCATGATCATCATTATCATCATCCACCTCGCCATCACCATCACCATCACCAT
CATCACTCTCTCGATTTACTTATTAAGGTATTTTCAATATAATAAATGCGTCTTGTACGT
GGAGTTTTATTTCTATGCAATTGTTTGGTCTTGTAAGATGGTTTGATATGTTGTTATAGA
CCTATGGTCATCATCGAGTTTGATGTAATGATTGTTAAGAATAATATACGTTCTTCACTT

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR2BV62JQ 730 0 0
GCTTTAAAAAAGAGAGAGCGAGAGAGAGAGAAATGGCAACATCAGGAACATACGTGACGG
AGGTTCCGTTGAAAGGAACAACGGAGAAACACTACAAGAGGTGGAAGAGCGAGAACCATG
TCTTCCCCGACGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTCACCGTTCACGAGGGCGAGCATG
ACTCCCATGGTTTTATCAGGAGCTGGAACTACACATGGGATGGAAAGGAAGAGATATTCA
AGGAGAAGAGAGAGGTAGACGATGAGAACTTAACGTTGACGTTACGAGGACTTGAGGGTC
ACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTATGATGTGATCTACCAATTTATCCCCAAAACTGAGG
ATCCCTGCGCCTGCAAAATCACTCTTGTATGGGAGAAGCGCAACGATGATTCTCCTGAAC
CAAGCACCTACATGAAATTCGTCAAGAGCTTAGTCGCCGATATGGACCACCGCGTCAATA
AATCTTAAATCATCACCATCATGATCATCATTATCATCATCCACCTCGCCATCATCATCA
CCATCA******TCACTCTCTCGATTTACTTATTAAGGTATTTTCAATATAATAAATGCG
TCTTGTACGTGGAGTTTTATTTCTATGCAATTGTTTGGTCTTGTAAGATGGTCTGATATG
TTGTTATAGACCTATGGTCATCATCGAGTTCGATGTAATGATTGTTAAGAATAATATACG
TTCTTCACT
C

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2BV62TF 660 0 0
GGCAACA
TCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTGAAAGGAACAACGGAGAAACACTACAAGAGG
TGGAAGAGCGAGAACCATGTCTTCCCCGACGCCGTCGGCCACCACATCCAAAATGTCACC
GTTCACGAGGGCGAGCATGACTCCCATGGTTCTATCAGGAGCTGGAACTACACATGGGAT
GGAAAGGAAGAGATATTCAAGGAGAAGAGAGAGGTAGACGATGAGAACTTAACGTTGACG
TTACGAGGACTTGAGGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTATGATGTGATCTACCAA
TTTATCCCCAAAACTGAGGATACCTGCGCCTGCAAAATCACTCTTGTATGGGAGAAGCGC
AACGATGATTCTCCTGAACCAAGCACCTACATGAAATTCGTCAAGAGCTTAATCGCCGAT
ATGGACCACCGCGTCAATAAATCTTAAATCATCACCATCATGATCATCATTATCATCATC
CACCTCGCCATCATCATCACCATCA******TCACTCTCTCGATTTACTTATTAAGGTAT
TTTCAATATAATAAATGCGTCTTGTACGTGGAGTTTTATTTCTATGCAATTGTTTGGTCT
TGTAAGATGGTCTGATATGTTGTTATAGACCTATG*TCATCATCGAGT
CGATG

QA 8 655 8 655
DS 

RD RR2G133JQ 719 0 0
GAGAGAGCGAGAGAGAGAGAAATGGCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTG
AAAGGAACAGCGGAGGAACACTACAAGAGGTGGAAGAGCGAGAACCATGTCTTCCCTGAC
GCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTCACCGTTCACGAGGGCGAGCATGACTCCCATGGT
TCTATCAGGAGCTGGAACTACACATGGGATGGAAAAGAAGAGATATTCAAGGAGAAGAGA
GAGGTAGACGATGAGAACTTAACGTTGACGTTACGAGGACTTGAGGGTCACGTGATGGAG
CAGCTCAAGGTGTATGATGTGATCTACCAATTAATCCCCAAAACTGAGGATACCTGCGCC
TGCAAAATCACTCTTGTATGGGAGAAGCGCAACGATGATTCTCCTGAACCAAGCACCTAC
ATGAAATTCGTCAAGAGCTTAGTCGCCGATATGGACCACCACGTCAATAAATCTTAAATC
ATCCCCATCATGATCATCATTATCATCATCCACCTCGCCATCACCATCACCATCACCATC
ATCACTCTCTCGATTTACTTATTAAGGTATTTTCAATATAATAAATGCGTCTTGTACGTG
GAGTTTTATTTCTATGCAATTGTTTGGTCTTGTAAGATGGTTTGATATGTTGTTATAGAC
CTATGGTCATCATCGAGTTTGATGTAATGATTGTTAAGAATAATATACGTTCTTCACTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2G156JQ 718 0 0
AGAGAGCGAGAGAGAGAGAAATGGCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTGA
AAGGAACAGCGGAGGAACACTACAAGAGGTGGAAGAGCGAGAACCATGTCTTCCCTGACG
CCATCGGCCACCACATCCAAAATGTCACCGTTCACGAGGGCGAGCATGACTCCCATGGTT
CTATCAGGAGCTGGAACTACACATGGGATGGAAAAGAAGAGATATTCAAGGAGAAGAGAG
AGGTAGACGATGAGAACTTAACGTTGACGTTACGAGGACTTGAGGGTCACGTGATGGAGC
AGCTCAAGGTGTATGATGTGATCTACCAATTAATCCCCAAAACTGAGGATACCTGCGCCT
GCAAAATCACTCTTGTATGGGAGAAGCGCAACGATGATTCTCCTGAACCAAGCACCTACA
TGAAATTCGTCAAGAGCTTAGTCGCCGATATGGACCACCACGTCAATAAATCTTAAATCA
TCCCCATCATGATCATCATTATCATCATCCACCTCGCCATCACCATCACCATCACCATCA
TCACTCTCTCGATTTACTTATTAAGGTATTTTCAATATAATAAATGCGTCTTGTACGTGG
AGTTTTATTTCTATGCAATTGTTTGGTCTTGTAAGATGGTTTGATATGTTGTTATAGACC
TATGGTCATCATCGAGTTTGATGTAATGATTGTTAAGAATAATATACGTTCTTCACTT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 2 14

CO CL233Contig1 1097 7 28 U
GACATTCAAAACAAAATATTAAAACAGAGATGTGTATTTGAGATGACACTTTTCCTTCAT
CATATATGTTTGACATAAGTCTAGACCCAAAAAAAAAAACTCAAATTCCACTTACATAAC
ATCAGAGGAGTTTCTTTCACAACATCTTAAAACGTAATGCATTTCAAAAGAGCCAATTCA
CACTAATGTTACCAAGCCAGATCAAAAGAGGAAACTGAGCTAAAGCTACAAAGATCAGGA
GGTAGTGATGCCTGCTTGAGTCATAACTCCTAGCTTCCGCAAAGAGAACTCGCTTCATTG
TCTTCACAAGGAAGACCCCGCTGCACAAGCAGGTCCATGGAAGCAGAACATAGTAAGAGT
ATCCCCAGATGATCTTGCCAAGAACAGCCAAGCAGAGACCAGTGAAAGTATAGCCAGCGT
ATGACACAATATCCAAGAGGGGTGCTTCACCGCTACCCAATGAAAGCAATGTTATCTTCA
GCAGCATGACTTGCAAAAACCAGCCAACCATTCCTTTCACAAACAGCCAGTTCAGAGCTT
CCGGAGAAAACTTCCCATAGAGTCCCAAAGACAAACCAGCAAGAACAACGTATGTGCCGA
ACGCCATAAGCGGAATGTATAAGTCTGGTGCATTAATATCATATATCGGGGGCTTGTATG
AAAGCCTACCCCCAACTGGCTCCGAGATTCTAGTCCAGTGTCCCCTGTGAAGGAAAGGAA
GCAGAACAATCTTCAACTTGTTCCTCACATACTGGTCATTCACTTGAAAATAGTATTGAG
GATCGGAGAAGTAACGAGTTATGTTGCTCTGCACATACTCAGAGCTGGATCCGAAAATCT
TCTCACCATAAGCTCCCAAGCCACTTCTGATAAGACCAGAGCCAGGACCAGAGAAGGCAT
TCCCAAAAGGGTTAGGCTGAGGAACTGCCTGAGGCATTGGCATCCCAGGCTGAGGTCCCA
TGTTATTATACATATCTCTGAGAGAAGATGTGAAGGAGATGACAGATCTGGAGATTGCTT
TTTCTCGGTTGATTTGATTTAGTGCGACGGCTAACCTCTCCGGTGGTGAAGAATATCAAT
CAATAGATCCAAGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ43JQ U 40
AF RR2BQ80JQ U 1
AF RR2CE90JQ U 21
AF RR2FQ86JQ U 40
AF RR2FQ86TF C 282
AF RR2CE90TF C 305
AF RR2BQ80TF C 334
BS 1 112 RR2BQ80JQ
BS 113 113 RR2FQ86JQ
BS 114 232 RR2BQ80JQ
BS 233 233 RR2CE90JQ
BS 234 307 RR2BQ80JQ
BS 308 308 RR2FQ86JQ
BS 309 313 RR2BQ80JQ
BS 314 314 RR2FQ86JQ
BS 315 583 RR2BQ80JQ
BS 584 584 RR2CE90JQ
BS 585 589 RR2BQ80JQ
BS 590 590 RR2CE90JQ
BS 591 601 RR2BQ80JQ
BS 602 602 RR2CE90JQ
BS 603 682 RR2BQ80JQ
BS 683 683 RR2CE90JQ
BS 684 836 RR2BQ80JQ
BS 837 847 RR2FQ86TF
BS 848 848 RR2CE90TF
BS 849 874 RR2FQ86TF
BS 875 875 RR2CE90TF
BS 876 919 RR2FQ86TF
BS 920 920 RR2CE90TF
BS 921 984 RR2FQ86TF
BS 985 985 RR2CE90TF
BS 986 1035 RR2FQ86TF
BS 1036 1064 RR2CE90TF
BS 1065 1097 RR2BQ80TF

RD RR2CZ43JQ 669 0 0
GG
GATGACACTTTTCCTTCATCATATATGTTTGACATAAGTCTAGACCCAAAAAAAA***CT
CAAATTCCACTTACATAACATCAGAGGTGTTTTTTTCACAACATCTTAAAACGTAATGCA
TTTCAAAAGAGCCAATTCACACTAATGTTACCAAGCCAGATCAAAAGAGGAAACTGTGCT
AAAGCTACAAAGATCAGGAGGTAGTGATGCCTGCTTGAGTCATAACTCCTAGCTTCCGCA
AAGAGAACTCGCTTCATTGTCTTCACAAGGAAGACCCCGCTGCACAAGCAGGTCCACGGA
AGCAGAACATAGTAAGAGTATCCCCAGATGATCTTGCCAAGAACAGCCAAGCAGAGACCA
GTGAAAGTATAGCCAGCGTATGACACAATATCCAAGAGGGGTGCTTCACCGCTACCCAAT
GAAAGCAATGTTATCTTCAGCAGCATGACTTGCAAAAACCAGCCAACCATTCCTTTCACA
AACGGCCAGTTCAGAGCTTCTGGAGAAAACTTCCCATAGAGTCCCAAAGACAAACCAGCA
AGAACAACGTATGTGCCGAACGCCATAAGCGGAATGTATAAGTCTGGTGCATTAATATCA
TATATCGGGGGCTTGTATGAAAGCCTACCCCCAACTGGCTCCGAGATTCTAGTCCAGTGT
CCCCTGT

QA 3 669 3 669
DS 

RD RR2BQ80JQ 841 0 0
GACATTCAAAACAAAATATTAAAACAGAGATGTGTATTTGAGATGACACTTTTCCTTCAT
CATATATGTTTGACATAAGTCTAGACCCAAAAAAAAAAACTCAAATTCCACT*ACATAAC
ATCAGAGGAGTTTCTTTCACAACATCTTAAAACGTAATGCATTTCAAAAGAGCCAATTCA
CACTAATGTTACCAAGCCAGATCAAAAGAGGAAACTGAGCTAAAGCTACAAAAATCAGGA
GGTAGTGATGCCTGCTTGAGTCATAACTCCTAGCTTCCGCAAAGAGAACTCGCTTCATTG
TCTTCACTAGGAAAACCCCGCTGCACAAGCAGGTCCATGGAAGCAGAACATAGTAAGAGT
ATCCCCAGATGATCTTGCCAAGAACAGCCAAGCAGAGACCAGTGAAAGTATAGCCAGCGT
ATGACACAATATCCAAGAGGGGTGCTTCACCGCTACCCAATGAAAGCAATGTTATCTTCA
GCAGCATGACTTGCAAAAACCAGCCAACCATTCCTTTCACAAACAGCCAGTTCAGAGCTT
CCGGAGAAAACTTCCCATAGAGTCCCAAAGACAAACCAGCAAGTACAACATATGTGCCGA
ATGCCATAAGCGGAATGTATAAGTCTGGTGCATTAATATCATATATCGGGGGCTTGTATG
AAAGCCTACCCCCAACTGGCTCTGAGATTCTAGTCCAGTGTCCCCTGTGAAGGAAAGGAA
GCAGAACAATCTTCAACTTGTTCCTCACATACTGGTCATTCACTTGAAAATAGTATTGAG
GATCGGAGAAGTAACGAGTTATGTTGCTCTGCACATACTCAGAGCTGGATCCGAAA
TCTTC

QA 1 836 1 836
DS 

RD RR2CE90JQ 809 0 0
AAAACAGAGATGTGTATTTGAGATGACACTTTTCCTTCATCATATATGTTTGACATAAGT
CTAGACCCAAAAAAAAAAACTCAAATTCCACT*ACATAACATCAGAGGAGTTTCTTTCAC
AACATCTTAAAACGTAATGCATTTCAAAAGAGCCAATTCACACTAATGTTACCAAGCCAG
ATCAAAAGAGGAAACTGAGCTAAAGCTACAAAGATCAGGAGGTAGTGATGCCTGCTTGAG
TCATAACTCCTAGCTTCCGCAAAGAGAACTCGCTTCATTGTCTTCACTAGGAAAACCCCG
CTGCACAAGCAGGTCCATGGAAGCAGAACATAGTAAGAGTATCCCCAGATGATCTTGCCA
AGAACAGCCAAGCAGAGACCAGTGAAAGTATAGCCAGCGTATGACACAATATCCAAGAGG
GGTGCTTCACCGCTACCCAATGAAAGCAATGTTATCTTCAGCGGCATGACTCGCAAAAAC
CAGCCAACCATTCCTTTCACAAACAGCCAGTTCAGAGCTTCCGGAGAAAACTTCCCATAG
AGTCCCAAAGACAAACCAGCAAGAACAACGTATGTGCCGAACGCCATAAGCGGAATGTAT
AAGTCTGGTGCATTAATATCATATATCGGGGGTTTGTATGAAAGCCTACCCCCAACTGGC
TCCGAGATTCTAGTCCAGTGTCCCCTGTGAAGGAAAGGAAGCAGAACAATCTTCAACTTG
TTCCTCACATACTGGTCATTCACTTGAAAATAGTATTGAGGATCGGAGAAGTAACGAGTT
ATGTTGCTCTGCACATACTCAGAGCTGGA

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2FQ86JQ 784 0 0
GAGATGACACTTTTCCTTCATCATATATGTTTGACATAAGTCTAGACCCAAAAAAAAA**
CTCAAATTCCACTTACATAACATCAGAGGTGTTTTTTTCACAACATCTTAAAACGTAATG
CATTTCAAAAGAGCCAATTCACACTAATGTTACCAAGCCAGATCAAAAGAGGAAACTGTG
CTAAAGCTACAAAGATCAGGAGGTAGTGATGCCTGCTTGAGTCATAACTCCTAGCTTCCG
CAAAGAGAACTCGCTTCATTGTCTTCACAAGGAAGACCCCGCTGCACAAGCAGGTCCACG
GAAGCAGAACATAGTAAGAGTATCCCCAGATGATCTTGCCAAGAACAGCCAAGCAGAAAC
CAGTGAAAGTATAGCCAGCGTATGACACAATATCCAAGAGGGGTGCTTCACCGCTACCCA
ATGAAAGCAATGTTATCTTCAGCAGCATGACTTGCAAAAACCAGCCAACCATTCCTTTCA
CAAACAGCCAGTTCAGAGCTTCCGGAGAAAACTTCCCATAGAGTCCCAAAGACAAACCAG
CAAGAACAACGTATGTGCCGAACGCCATAAGCGGAATGTATAAGTCTGGTGCATTAATAT
CATATATCGGGGGCTTGTATGAAAGCCTACCCCCAACTGGCTCCGAGATTCTAGTCCAGT
GTCCCCTGTGAAGGAAAGGAAGCAGAACAATCTTCAACTTGTTCCTCACATACTGGTCAT
TCACTTGAAAATAGTATTGAGGATCGGAGAAGTAACGAGTTATGTTGCTCTGCACATACT
CAGA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2FQ86TF 756 0 0
AAGAGAACTCGCTTCATTGTCTTCACAAGGAAGACCCCGCTGCACAAGCAGGTCCACGGA
AGCAGAACATAGTAAGAGTATCCCCAGATGATCTTGCCAAGAACAGCCAAGCAGAGACCA
GTGAAAGTATAGCCAGCGTATGACACAATATCCAAGAGGGGTGCTTCACCGCTACCCAAT
GAAAGCAATGTTATCTTCAGCAGCATGACTTGCAAAAACCAGCCAACCATTCCTTTCACA
AACAGCCAGTTCAGAGCTTCCGGAGAAAACTTCCCATAGAGTCCCAAAGACAAACCAGCA
AGAACAACGTATGTGCCGAACGCCATAAGCGGAATGTATAAGTCTGGTGCATTAATATCA
TATATCGGGGGCTTGTATGAAAGCCTACCCCCAACTGGCTCCGAGATTCTAGTCCAGTGT
CCCCTGTGAAGGAAAGGAAGCAGAACAATCTTCAACTTGTTCCTCACATACTGGTCATTC
ACTTGAAAATAGTATTGAGGATCGGAGAAGTAACGAGTTATGTTGCTCTGCACATACTCA
GAGCTGGATCCGAAAATCTTCTCACCGTAAGCTCCCAAGCCACTTCTGATAAGTCCAGAG
CCAGGACCAGAGAAGGCATTCCCAAAAGGGTTAGGCTGGGGAACTGCCTGAGGCATTGGC
ATCCCAGGCTGAGGTCCCATGTTATTATACATATCTCTGAGAGGAGATGTGAAGGAGATG
ACAGATCTGGAGATTGCTTTTTCTCGGTTGATTT
CC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2CE90TF 765 0 0
TCACTAGGAA
ACCCCGCTGCACAAGCAGGTCCATGGAAGCAGAACATAGTAAGAGTATCCCCAGATGATC
TTGCCAAGAACAGCCAAGCAGAGACCAGTGAAAGTATAGCCAGCGTATGACACAATATCC
AAGAGGGGTGCTTCACCGCTACCCAATGAAAGCAATGTTATCTTCAGCGGCATGACTCGC
AAAAACCAGCCAACCATTCCTTTCACAAACAGCCAGTTCAGAGCTTCCGGAGAAAACTTC
CCATAGAGTCCCAAAGACAAACCAGCAAGAACAACGTATGTGCCGAACGCCATAAGCGGA
ATGTATAAGTCTGGTGCATTAATATCATATATCGGGGGTTTGTATGAAAGCCTACCCCCA
ACTGGCTCCGAGATTCTAGTCCAGTGTCCCCTGTGAAGGAAAGGAAGCAGAACAATCTTC
AACTTGTTCCTCACATACTGGTCATTCACTTGAAAATAGTATTGAGGATCGGAGAAGTAA
CGAGTTATGTTGCTCTGCACATACTCAGAGCTGGATCCGAAAATCTTCTCACCATAAGCT
CCCAAGCCACTTCTGATAAGACCAGAGCCAGGACCAGAGAAGGCATTCCCAAAAGGGTTA
GGCTGAGGAACTGCCTGAGGCATAGGCATCCCAGGCTGAGGTCCCATGTTATTATACATA
TCTCTGAGAGAAGATGTGAAGGAGATGACAGATCTGGAGATTGCTTTT*CTCGGTTGATT
TGATTTAGTGCGACGGCTAACCTCTCCGGT
GGTCC

QA 11 760 11 760
DS 

RD RR2BQ80TF 764 0 0
TCCATGGAAGCAGAACATAGTAAGAGTATCCCCAGATGATCTTGCCAAGAACAGCCAAGC
AGAGACCAGTGAAAGTATAGCCAGCGTATGACACAATATCCAAGAGGGGTGCTTCACCGC
TACCCAATGAAAGCAATGTTATCTTCAGCAGCATGACTTGCAAAAACCAGCCAACCATTC
CTTTCACAAACAGCCAGTTCAGAGCTTCCGGAGAAAACTTCCCATAGAGTCCCAAAGACA
AACCAGCAAGTACAACATATGTGCCGAATGCCATAAGCGGAATGTATAAGTCTGGTGCAT
TAATATCATATATCGGGGGCTTGTATGAAAGCCTACCCCCAACTGGCTCTGAGATTCTAG
TCCAGTGTCCCCTGTGAAGGAAAGGAAGCAGAACAATCTTCAACTTGTTCCTCACATACT
GGTCATTCACTTGAAAATAGTATTGAGGATCGGAGAAGTAACGAGTTATGTTGCTCTGCA
CATACTCAGAGCTGGATCCGAAAATCTTCTCACCATAAGCTCCCAAGTCACTTCTGATAA
GACCAGAGCCAGGACCAGAGAAGGCATTCCCAAAAGGGTTAGGCTGAGGAACTGCCTGAG
GCATTGGCATCCCAGGCTGAGGTCCCATGTTATTATACAT**CTCTGAGAGAAGATGTGA
AGGAGATGACAGATCTGGAGATTGCTTTTTCTCGGTTGATTTGATTTAGTGCGACGGCTA
ACCTCTCCGGTGGTGAAGAATATCAATCAATAGATCCAAGGTCC

QA 1 764 1 764
DS 



CO CL233Contig2 1455 7 17 U
GGGATGGTAAAGAACCATAACAATGGCTTCATCTTCCTTACTACTCATGTCCTTGTTCTT
ACTACTTGTTATCCCTTCATCAGTTCTCTCAGCCACTCTTCGATCTGACATTCAAGCTCT
AGAGTCTATCATTCGCAGCATTGATCCAAGTTCCATCTCACCATCCTCTTACCTCAGCAC
ATGGGACTTCTCTGAAGACCCCTGTGAAGGCTCAGGGACGTTCTTGGGAGTTATGTGTTC
TTTCACTCTTGAGAACACGACCAGCCGAGTCACAGAGATCGACCTTGACGATGATGGTTA
TGACGGTTTCCTCTCTGAGGCAATAGGGAACCTCACCGAGCTCACTGTACTTAGCCTGAA
CAACAACAGGTTCCGTGGTCCAATACCAGAAACTGTGTTCCAGCTCAGGAAACTCACCAA
GCTCTCTCTCTCGGGAAACTTCTTCACCGGAGATATAACCCCTGGAATCACCAAGCTCAA
GGAGCTCAAGACCATAGACCTGTCCAAGAACAGCATCGCTGGTGAGATACCTCCGAGGAT
CTCAGGCTTGAGAAGTTTGACTCACCTGATCCTATCAAACAACCATATAGACGGAAGAAT
ACCTTCGCTCAACGGCTTGTGGAAGCTACAAGTGCTAGAACTCGGTAACAACCATCTTTT
CGGAATGCTTCCTAAGCTTCCAACAAGTCTAAGAACTCTATCTCTCTGTTACAATAGCCT
TGCAGGACGTATGTCTCCTTTGCATAGACTAAAACATCTTGTGTCATTAGATGTGAGCCA
GAACAGATTCTCAGGCACCATTGGCCATGAAATCTTGACGTTTCCAGAGATTTCGCGCAT
CAATGTGTCTTTTAACCAGTTCATATCCATAGAGGTTATTCAGGTTATAGGTATGGAGAC
ACACCTGCGCATCCTTGACGCTGAAGGAAACCATTTACAGGGGCCCCTTCCACTGAACCT
GGCTACTTATGGAAACTTGAAGGACATCAATTTACGGAGCAACATGTTCTCAGGAGACAT
TCCAAGGATCTATGGGAAAAGACTTGAGAACTCATGGAGAAGCTTGTACTTGGAGAACAA
CTATCTCACAGGTACACTTCCTGAGGAGTTTCAGAGAATCTCCAAACAGATCAAAGGAAG
CCTTTCGAACAACTGTCTGCAATGTCCTAAGAATGTTACAATCTGCCAAGGAGTACAGAA
GCCGAAATCACAATGCACCAACGCAATGCAGGAAGAGGGCTTGGAGTAGAGATCATGCCA
ATGGGAAGCAGTTTATAAAAGACAGCATAATCACCAGAGTAAAGTTCATGTCCTTGTATG
CTTTTAAATAATGATGGTAGAAATGAAGTCTAGAAAAATGACATTCAAAACAAAAGATTA
AAACAGAGATGTGTATTTGAGATGACACTTTTCCTTCATCATATATGTTTGACATAAGTC
TAGACCCAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C565TF U 8
AF RR2CX19TF U 2
AF RR2B157TF U 2
AF RR2D434TF U 1
AF RR2B157JQ C 794
AF RR2D434JQ C 676
AF RR2CX19JQ C 731
BS 1 360 RR2D434TF
BS 361 361 RR2C565TF
BS 362 713 RR2D434TF
BS 714 714 RR2D434JQ
BS 715 725 RR2D434TF
BS 726 726 RR2D434JQ
BS 727 767 RR2D434TF
BS 768 768 RR2D434JQ
BS 769 778 RR2D434TF
BS 779 991 RR2D434JQ
BS 992 992 RR2CX19JQ
BS 993 1244 RR2D434JQ
BS 1245 1245 RR2CX19JQ
BS 1246 1375 RR2D434JQ
BS 1376 1376 RR2CX19JQ
BS 1377 1425 RR2D434JQ
BS 1426 1455 RR2CX19JQ

RD RR2C565TF 652 0 0
TAAAGAACCATAACAATGGCTTCATCTTCCTTACTACTCATGTCCTTGTTCTTACTACTT
GTTATCCCTTCATCAGTTCTCTCAGCCACTCTTCGATCTGACATTCAAGCTCTAGAGTCT
ATCATTCGCAGCATTGATCCAAGTTCCATCTCACCATCCTCTTACCTCAGCACATGGGAC
TTCTCTGAAGACCCCTGTGAAGGCTCAGGGACGTTCTTGGGAGTTATGTGTTCTTTCACT
CTTGAGAACACGACCAGCCGAGTCACAGAGATCGACCTTGACGATGATGGTTATGACGGT
TTCCTCTCTGAGGCAATAGGGGACCTCACCGAGCTCACTGTACTTAGCCTGAACAACAAC
AGGTTCCGTGGTCCAATACCAGAAACTGTGTTCCAGCTCAGGAAACTCACCAAGCTCTCT
CTCTCGGGAAACTTCTTCACCGGAGATATAACCCCTGGAATCACCAAGCTCAAGGAGCTC
AAGACCATAGACCTGTCCAAGAACAGCATCGCTGGTGAGATACCTCCGAGGATCTCAGGC
TTGAGAAGTTTGACTCACCTGATCCTATCAAACAACCATATAGACGGAAGAATACCTTCG
CTCAACGGCTTGTGGAAGCTACAAGTGCTAGAACTCGGTAACAACCATCTT
T

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2CX19TF 657 0 0
GGATGG
TAAAGAACCATAACAATGGCTTCATCTTCCTTACTACTCATGTCCTTGTTCTTACTACTT
GTTATCCCTTCATCAGTTCTCTCAGCCACTCTTCGATCTGACATTCAAGCTCTAGAGTCT
ATCATTCGCAGCATTGATCCAAGTTCCATCTCACCATCCTCTTACCTCAGCACATGGGAC
TTCTCTGAAGACCCCTGTGAAGGCTCAGGGACGTTCTTGGGAGTTATGTGTTCTTTCACT
CTTGAGAACACGACCAGCCGAGTCACAGAGATCGACCTTGACGATGATGGTTATGACGGT
TTCCTCTCTGAGGCAATAGGGAACCTCACCGAGCTCACTGTACTTAGCCTGAACAACAAC
AGGTTCCGTGGTCCAATACCAGAAACTGTGTTCCAGCTCAGGAAACTCACCAAGCTCTCT
CTCTCGGGAAACTTCTTCACCGGAGATATAACCCCTGGAATCACCAAGCTCAAGGAGCTC
AAGACCATAGACCTGTCCAAGAACAGCATCGCTGGTGAGATACCTCCGAGGATCTCAGGC
TTGAGAAGTTTGACTCACCTGATCCTATCAAACAACCATATAGACGGAAGAATACCTTCG
CTCAACGGCTTGTGGAAGCTACAAGTGCTAGAACTCGGTAACAACCATCTT

QA 7 657 7 657
DS 

RD RR2B157TF 720 0 0
GGATGG
TAAAGAACCATAACAATGGCTTCATCTTCCTTACTACTCATGTCCTTGTTCTTACTACTT
GTTATCCCTTCATCAGTTCTCTCAGCCACTCTTCGATCTGACATTCAAGCTCTAGAGTCT
ATCATTCGCAGCATTGATCCAAGTTCCATCTCACCATCCTCTTACCTCAGCACATGGGAC
TTCTCTGAAGACCCCTGTGAAGGCTCAGGGACGTTCTTGGGAGTTATGTGTTCTTTCACT
CTTGAGAACACGACCAGCCGAGTCACAGAGATCGACCTTGACGATGATGGTTATGACGGT
TTCCTCTCTGAGGCAATAGGGAACCTCACCGAGCTCACTGTACTTAGCCTGAACAACAAC
AGGTTCCGTGGTCCAATACCAGAAACTGTGTTCCAGCTCAGGAAACTCACCAAGCTCTCT
CTCTCGGGAAACTTCTTCACCGGAGATATAACCCCTGGAATCACCAAGCTCAAGGAGCTC
AAGACCATAGACCTGTCCAAGAACAGCATCGCTGGTGAGATACCTCCGAGGATCTCAGGC
TTGAGAAGTTTGACTCACCTGATCCTATCAAACAACCATATAGACGGAAGAATACCTTCG
CTCAACGGCTTGTGGAAGCTACAAGTGCTAGAACTCGGTAACAACCATCTTTTCGGAATG
CTTCCTAAGCTTCCAACAAGTCTAAGAACTCTATCTCTCTGTTACA
ATAGCCTT

QA 7 712 7 712
DS 

RD RR2D434TF 788 0 0
GGGATGGTAAAGAACCATAACAATGGCTTCATCTTCCTTACTACTCATGTCCTTGTTCTT
ACTACTTGTTATCCCTTCATCAGTTCTCTCAGCCACTCTTCGATCTGACATTCAAGCTCT
AGAGTCTATCATTCGCAGCATTGATCCAAGTTCCATCTCACCATCCTCTTACCTCAGCAC
ATGGGACTTCTCTGAAGACCCCTGTGAAGGCTCAGGGACGTTCTTGGGAGTTATGTGTTC
TTTCACTCTTGAGAACACGACCAGCCGAGTCACAGAGATCGACCTTGACGATGATGGTTA
TGACGGTTTCCTCTCTGAGGCAATAGGGAACCTCACCGAGCTCACTGTACTTAGCCTGAA
TAACAACAGGTTCCGTGGTCCAATACCAGAAACTGTGTTCCAGCTCAGGAAACTCACCAA
GCTCTCTCTCTCGGGAAACTTCTTCACCGGAGATATAACCCCTGGAATCACCAAGCTCAA
GGAGCTCAAGACCATAGACCTGTCCAAGAACAGCATCGCTGGTGAGATACCTCCGAGGAT
CTCAGGCTTGAGAAGTTTGACTCACCTGATCCTATCAAACAACCATATAGACGGAAGAAT
ACCTTCGCTCAACGGCTTGTGGAAGCTACAAGTGCTAGAACTCGGTAACAACCATCTTTT
CGGAATGCTTCCTAAGCTTCCAACAAGTCTAAGAACTCTATCTCTCTGTTACA*TAGCCT
TGCAG*ACGTATGTCTCCTTTGCATAGACTAAAACATCTTGTGTCAT*AGATGTGAGC
AGACAGATTC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2B157JQ 360 0 0
GGCG
CCATTGGCCATGAAATCTTGACGTTTCCAGAGATTTCGCGCATCAATGTGTCTTTTAACC
AGTTCATATCCATAGAGGTTATTCAGGTTATAGGTATGGAGACACACCTGCGCATCCTTG
ACGCTGAAGGAAACCATTTACAGGGGCCCCTTCCACTGAACCTGGCTACTTATGGAAACT
TGAAGGACATCAATTTACGGAGCAACATGTTTTCAGGAGACATTCCAAGGATTTATGGGA
AAAGACTTGAGAACTCATGGAGAAGCTTGTACTTGGAGAACAACTATTTCACAGGTACAC
TTCCTGAGGAGTTTCAGAGAATCTCCAAACAGGTCAAAGGAAGCCTTTCGAACAAC

QA 5 360 5 360
DS 

RD RR2D434JQ 750 0 0
GCTTCCAACAAGTCTAAGAACTCTATCTCTCTGTTACAATAGCCTTGCAGGACGTATGTC
TCCTTTGCATAGACTAAAACATCTTGTGTCATTAGATGTGAGCCAGAACAGATTCTCAGG
CACCATTGGCCATGAAATCTTGACGTTTCCAGAGATTTCGCGCATCAATGTGTCTTTTAA
CCAGTTCATATCCATAGAGGTTATTCAGGTTATAGGTATGGAGACACACCTGCGCATCCT
TGACGCTGAAGGAAACCATTTACAGGGGCCCCTTCCACTGAACCTGGCTACTTATGGAAA
CTTGAAGGACATCAATCTACGGAGCAACATGTTCTCAGGAGACATTCCAAGGATCTATGG
GAAAAGACTTGAGAACTCATGGAGAAGCTTGTACTTGGAGAACAACTATCTCACAGGTAC
ACTTCCTGAGGAGTTTCAGAGAATCTCCAAACAGATCAAAGGAAGCCTTTCGAACAACTG
TCTGCAATGTCCTAAGAATGTTACAATCTGCCAAGGAGTACAGAAGCCGAAATCACAATG
CACCAACGCAATGCAGGAAGAGGGCTTGGGGTAGAGATCATGCCAATGGGAAGCAGTTTA
TAAAAGACAGCATAATCACCAGAGTAAAGTTCATGTCCTTGTATGCTTTTAAATAATGAT
GGTAGAAATGAAGTCTAGAAAAATGACATTCAAAACAAAATATTAAAACAGAGATGTGTA
TTTGAGATGACACTTTTCCTTCATCATATA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2CX19JQ 725 0 0
ATA
TCTCCTTTGCATAGACTAAAACATCTTGTGTCATTAGATGTGAGCCAGAACAGATTCTCA
GGCACCATTGGCCATGAAATCTTGACGTTTCCAGAGATTTCACGCATCAATGTGTCTTTT
AACCAGTTCATATCCATAGAGGTTATTCAGGTTATAGGTATGGAGACACACCTGCGCATC
CTTGACGCTGAAGGAAACCATTTACAGGGGCCCCTTCCACTGAACCTGGCTACTTATGGA
AACTTGAAGGACATCAATTTACGGAGCAACATGTTCTCAGGAGACATTCCAAGGATCTAT
GGGAAAAGACTTGAGAACTCATGGAGAAGCTTGTACTTGGAGAACAACTATCTCACAGGT
ACACTTCCTGAGGAGTTTCAGAGAATCTCCAAACAGATCAAAGGAAGCCTTTCGAACAAC
TGTCTGCAATGTCCTAAGAATGTTACAATCTGCCAAGGAGTACAGAAGCCGAAATCACAA
TGCACCAACGCAATGCAGGAAGAGGGCTTGGAGTAGAGATCATGCCAATGGGAAGCAGTT
TATAAAAGACAGCATAATCACCAGAGTAAAGTTCATGTCCTTGTATGCTTTTAAATAATG
ATGGTAGAAATGAAGTCTAGAATAATGACATTCAAAACAAAAGATTAAAACAGAGATGTG
TATTTGAGATGACACTTTTCCTTCATCATATATGTTTGACATAAGTCTAGACCCAAAAAA
AA

QA 4 725 4 725
DS 



AS 3 15

CO CL234Contig1 718 9 12 U
GGGAAGTTTCAAAAAAACACGAAGGAAGAGGATAGATAGAGAGAGAACAATGGCGCAGAT
GGTTGCGATGCCCGTAGCCCACTCCC*TCTCCCTCATTTGCAATTGGACTAAATCAAATC
CTCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTCCCACCTACTAACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGA
GCATCAGATGTGCTCGTGTTGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACT
CTCTCCAGTACATTCATGGGATTGGTCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTTC
AGATGGAGAACAAGATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATG
AAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCACTTGCTATCAAGA
GGTTGAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTTAGACACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTG
GACAGAGAACCAAGAACAATTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCA
AGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGGTGTCCTGTAATAATACTCT
TTTGGTCTGTCTCTAGTTTTCTCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGG
TTCGAATTGAGCCCTTTCCAGACTAATCTTCAGCTTTGTTATTGTTTCCATATCTTCC


BQ
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 25 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV54JQ C 1
AF RR2BV54TF U 1
AF RR2FY52TF U 1
AF RR2FY52JQ C 2
AF RR2G034JQ C 18
AF RR2G034TF U 132
AF RR2B281TF U 17
AF RR2EK20TF U 33
AF RR2EK20JQ C 33
BS 1 337 RR2BV54TF
BS 338 338 RR2FY52TF
BS 339 430 RR2BV54TF
BS 431 431 RR2FY52TF
BS 432 644 RR2BV54TF
BS 645 645 RR2FY52TF
BS 646 678 RR2BV54TF
BS 679 679 RR2FY52TF
BS 680 683 RR2BV54TF
BS 684 706 RR2FY52TF
BS 707 707 RR2G034TF
BS 708 718 RR2B281TF

RD RR2BV54JQ 684 0 0
GGGAAGTTTCAAAAAAACACGAAGGAAGAGGATAGATAGAGAGAGAACAATGGCGCAGAT
GGTTGCGATGCCCGTAGCCCACTCCC*TCTCCCTCATTTGCAATTGGACTAAATCAAATC
CTCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTCCCACCTACTAACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGA
GCATCAGATGTGCTCGTGTTGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACT
CTCTCCAGTACATTCATGGGATTGGTCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTTC
AGATGGAGAACAAGATCACCAAAGACATGGCTGAGGATGAGCTCATCATTCTTCGTGATG
AAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCACTTGCTATCAAGA
GGTTGAAGGATATCCAATGTTACCGTGGGGTTAGACACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTG
GACAGAGAACCAAGAACAATTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCA
AGAAGAAAGTTTTTAAGTAACCAACTCATTTGAATCTTGGGTGTCCTGTAATAATACTCT
TTTGGTCTGTCTCTAGTTTTCTCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGG
TTCGAATTGAGCCCTTTCAAGAC
G

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2BV54TF 690 0 0
GGGAAGTTTCAAAAAAACACGAAGGAAGAGGATAGATAGAGAGAGAACAATGGCGCAGAT
GGTTGCGATGCCCGTAGCCCACTCCC*TCTCCCTCATTTGCAATTGGACTAAATCAAATC
CTCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTCCCACCTACTAACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGA
GCATCAGATGTGCTCGTGTTGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACT
CTCTCCAGTACATTCATGGGATTGGTCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTTC
AGATGGAGAACAAGATCACCAAAGACATGGCTGAGGATGAGCTCATCATTCTTCGTGATG
AAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCACTTGCTATCAAGA
GGTTGAAGGATATCCAATGTTACCGTGGGGTTAGACACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTG
GACAGAGAACCAAGAACAATTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCA
AGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGGTGTCCTGTAATAATACTCT
TTTGGTCTGTCTCTAGTTTTCTCTGTTTAAAATGTGATTTTGTA*TCTCCTGAAACTTGG
TTCGAATTGAGCCCTTTCAAGAC
GAAAAAA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2FY52TF 706 0 0
GGGAAGTTTCAAAAAAACACGAAGGAAGAGGATAGATAGAGAGAGAACAATGGCGCAGAT
GGTTGCGATGCCCGTAGCCCACTCCC*TCTCCCTCATTTGCAATTGGACTAAATCAAATC
CTCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTCCCACCTACTAACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGA
GCATCAGATGTGCTCGTGTTGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACT
CTCTCCAGTACATTCATGGGATTGGTCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTTC
AGATGGAGAACAAGATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTCCTCGTGATG
AAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCACTTGCTATCAAGA
GGTTGAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTTAGACACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTG
GACGGAGAACCAAGAACAATTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCA
AGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGGTGTCCTGTAATAATACTCT
TTTGGTCTGTCTCTAGTTTTCTCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGG
TTCGAATTGAGCCCTTTCCAGACTAATCTTCAGCTTTGTTATTGTT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2FY52JQ 705 0 0
GGAAGTTTCAAAAAAACACGAAGGAAGAGGATAGATAGAGAGAGAACAATGGCGCAGATG
GTTGCGATGCCCGTAGCCCACTCCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGACTAAATCAAATCC
TCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTCCCACCTACTAACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGAG
CATCAGATGTGCTCGTGTTGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTC
TCTCCAGTACATTCATGGGATTGGTCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTTCA
GATGGAGAACAAGATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTCCTCGTGATGA
AGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCACTTGCTATCAAGAG
GTTGAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTTAGACACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGG
ACGGAGAACCAAGAACAATTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAA
GAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGGTGTCCTGTAATAATACTCTT
TTGGTCTGTCTCTAGTTTTCTCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGGT
TCGAATTGAGCCCTTTCCAGACTAATCTTCAGCTTTGTTATTGTT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2G034JQ 692 0 0
CACGAAGGAAGAGGATAGATAGAGAGAGAACAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAG
CCCACTCCC*TCTCCCTCATTTGCAATTGGACTAAATCAAATCCTCTCACTCGCAACACT
CTCGCTCTCCCACCTACTAACGCTCCCAGTA******GTCTGAGCATCAGATGTGCTCGT
GTTGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTCCAGTACATTCAT
GGGATTGGTCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTTCAGATGGAGAACAAGATC
ACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATG
ATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCACTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGATCCAA
TGTTACCGTGGGGTTAGACACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAAC
AATTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCTAAG
TAACCAACTCATCTGAATCTTGGGTGTCCTGTAATAATACTCTTTTGGTCTGTCTCTAGT
TTTCTCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGGTTCGAATTGAGCCCTTT
CCAGACTAATCTTCAGCTTTGTTATTGTTT
CC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2G034TF 576 0 0
AACACTCTCGCTCTCCCACCTACTAACGCTCCCAGTA******GTCTGAGCATCAGATGT
GCTCGTGTTGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTCCAGTAC
ATTCATGGGATTGGTCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTTCAGATGGAGAAC
AAGATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAG
TACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCACTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAG
ATCCAATGTTACCGTGGGGTTAGACACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACC
AAGAACAATTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTT
TCTAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGGTGTCCTGTAATAATACTCTTTTGGTCTGTC
TCTAGTTTTCTCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGGTTCGAATTGAG
CCCTTTCCAGACTAATCTTCAGCTTTGTTATTGTTT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2B281TF 702 0 0
GG
ACGAAGGAAGAGGATAGATAGAGAGAGAACAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGC
CCACTCCC*TCTCCCTCATTTGCAATTGGACTAAATCAAATCCTCTCACTCGCAACACTC
TCGCTCTCCCACCTACTAACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGAGCATCAGATGTGCTCGTG
TTGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAATAAGAGGATTGAGTACTCTCTCCAGTACATTCATG
GGATTGGTCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTTCAGATGGAGAACAAGATCA
CCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATGA
TCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCACTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGATCCAAT
GTTACCGTGGGGTTAGACACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACA
ATTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCTAATT
AACCAACTCATCTGAATCTTGGGTGTCCTGTAATAATACTCTTTTGGTCTGTCTCTAGTT
TTCTCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGGTTCGAATTGAGCCCTTTC
CAGACTAATCTTCAGCTTTGTTATTGTTTCCATATCTTCC

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR2EK20TF 676 0 0
GG
GATAGAGAGAGAACAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCCCACTCCC*TCTCCCT
CATTTGCAATTGGACTAAATCAAATCCTCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTCCCACCTAC
TAACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGAGCATCAGATGTGCTCGTGTTGGAGGTGTGGAGAT
TCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTCCAGTACACTCATGGGATTGGTCGAACCAG
GGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTTCAGATGGAGAACAAGATCACCAAAGACATGGCTGA
GGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAG
GAGATTCAATGCACTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTTAG
ACACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAATTGTAGAACTCTTAA
AGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAA
TCTTGGGTGTCCTGTAATAATACTCTTTTGGTCTGTCTCTAGTTTTCTCTGTTTAAAATG
TGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGGTTCGAATTGAGCCCTTTCCAGACTAATCTTCAGC
TTTGTTATT
AAAAA

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR2EK20JQ 671 0 0
GG
GATAGAGAGAGAACAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCCCACTCCC*TCTCCCT
CATTTGCAATTGGACTAAATCAAATCCTCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTCCCACCTAC
TAACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGAGCATCAGATGTGCTCGTGTTGGAGGTGTGGAGAT
TCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTCCAGTACACTCATGGGATTGGTCGAACCAG
GGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTTCAGATGGAGAACAAGATCACCAAAGACATGGCTGA
GGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAG
GAGATTCAATGCACTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTTAG
ACACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAATTGTAGAACTCTTAA
AGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAA
TCTTGGGTGTCCTGTAATAATACTCTTTTGGTCTGTCTCTAGTTTTCTCTGTTTAAAATG
TGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGGTTCGAATTGAGCCCTTTCCAGACTAATCTTCAGC
TTTGTTATT

QA 3 671 3 671
DS 



CO CL234Contig2 711 2 5 U
GGGAAGTTTCAAAAAAACACGAAGGAAGAGGATAGATAGAGAGAGAACAATGGCGCAGAT
GGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGACTAAATCAAATCC
CCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTGCCACCTACTAACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGAG
CATCAGATGTGCTCGTGTGGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTC
TCTCCAGTACATTCATGGGATTGGTCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTTCA
GATGGAGAACAAGATTACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGA
AGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCACTTGCTATCAAGAG
GTTGAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTTAGACACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGG
ACAGAGAACCAAGAACAACTGCAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCCATTGCTGGTAA
GAAGAAAGTTTCCAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTT
TTGTTCTGTCTCTAGTTTTCTCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGGT
CCGAATTGAGCCCTTTCCAGACTAATCTTCAGCTTTGTTATTGTTTCCACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU75TF U 1
AF RR2EB24TF U 17
BS 1 49 RR2FU75TF
BS 50 50 RR2EB24TF
BS 51 412 RR2FU75TF
BS 413 413 RR2EB24TF
BS 414 711 RR2FU75TF

RD RR2FU75TF 711 0 0
GGGAAGTTTCAAAAAAACACGAAGGAAGAGGATAGATAGAGAGAGAACATTGGCGCAGAT
GGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGACTAAATCAAATCC
CCTCACTCGCAACACTCTCGCTCTGCCACCTACTAACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGAG
CATCAGATGTGCTCGTGTGGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTC
TCTCCAGTACATTCATGGGATTGGTCGAACCAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTTCA
GATGGAGAACAAGATTACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGA
AGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCACTTGCTGTCAAGAG
GTTGAAGGAGATCCAATGTTACCGTGGGGTTAGACACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGG
ACAGAGAACCAAGAACAACTGCAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCCATTGCTGGTAA
GAAGAAAGTTTCCAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTT
TTGTTCTGTCTCTAGTTTTCTCTGTTTAAAATGTGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGGT
CCGAATTGAGCCCTTTCCAGACTAATCTTCAGCTTTGTTATTGTTTCCACA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2EB24TF 665 0 0
GG
ACGAAGGAAGAGGATAGATAGAGAGAGAACAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGC
GCACTCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGACTAAGTCAAATCCCCTCACTCGCAACACTCT
CGCTCTGCCACCTACTAACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGAGCATCAGATGTGCTCGTGT
GGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTCCAGTACATTCATGG
GATTGGTCGAACCAGG*CTCGCCAGATCCTCGTTGATCTTCAGATGGAGAACAAGATTAC
CAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATGAT
CGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCACTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGATCCAATG
TTACCGTGGGGTTAGACACATCCAAGGGCTGCCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAA
CTGCAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCCATTGCTGGTAAGAAGAAAGTTTCCAAGTA
ACCAACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTTGTTCTGTCTCTAGTTT
TCTCTGTTTGAAATGTGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGGTTCGAATTGAGCCCTTTCC
AGA

QA 3 665 3 665
DS 



CO CL234Contig3 738 4 7 U
GGGGCTATCTTCGTCTTTCTTCTTCTTCCTCGCCTCTGAAGTTTCAAAATCCGTACGAAG
AGGATAGAGAGAACAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCCCTCTCTCTC
ATTTGCAATTGGACTAAATCAAACCCTCTCACTCGCAACACTCTTGCTCTGCCACCTACT
AACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGAGCATCAGATGTGCTCGTGTGGGAGGTGTGGAGATT
CCGAGTAACAAGAGGATTGAGCACTCTCTCCAGTACATTCATGGCATTGGCCGAACTAGG
GCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAATAAAATCACCAAAGACATGGCTGAG
GAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGG
AGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGATACAGTGTTACCGTGGTGTAAGG
CACATCCAAGGGCTACCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGCAGAACTCTTAAA
GGAAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAAT
CTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTTGTTCTGTCTCTAGTTTTTCCTCTGTTTTAAAA
TGTGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGGTTCGAATTGAGCCCTTTCCAGACTAATCTCAG
GCTTCGTTGTTGTTCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB78TF U 1
AF RR2AQ18JQ C 27
AF RR2AQ18TF U 27
AF RR2GB78JQ C 172
BS 1 142 RR2GB78TF
BS 143 143 RR2AQ18TF
BS 144 261 RR2GB78TF
BS 262 262 RR2AQ18TF
BS 263 536 RR2GB78TF
BS 537 717 RR2AQ18TF
BS 718 738 RR2GB78JQ

RD RR2GB78TF 536 0 0
GGGGCTATCTTCGTCTTTCTTCTTCTTCCTCGCCTCTGAAGTTTCAAAATCCGTACGAAG
AGGATAGAGAGAACAATGGCGCAGATGGTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCCCTCTCTCTC
ATTTGCAATTGGACTAAATCAAGCCCTCTCACTCGCAACACTCTTGCTCTGCCACCTACT
AACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGAGCATCAGATGTGCTCGTGTGGGAGGTGTGGAGATT
CCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTCCAGTACATTCATGGCATTGGCCGAACTAGG
GCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAATAAAATCACCAAAGACATGGCTGAG
GAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGG
AGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGATACAGTGTTACCGTGGTGTAAGG
CACATCCAAGGGCTACCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGCAGAACTCT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2AQ18JQ 710 0 0
GG
CTCGCCTCTGAAGTTTCAAAATCCGTACGAAGAGGATAGAGAGAACAATGGCGCAGATGG
TTGCGATGCCCGTAGCGCACTCCCTCTCTCTCATTTGCAATTGGACTAAATCAAACCCTC
TCACTCGCAACACTCTTGCTCTGCCACCTACTAACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGAGCA
TCAGATGTGCTCGTGTGGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGCACTCTC
TCCAGTACATTCATGGCATTGGCCGAACTAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGA
TGGAGAATAAAATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAG
TCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGT
TGAAGGAGATACAGTGTTACCGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTACCATGTCGTGGAC
AGAGAACCAAGAACAACTGCAGAACTCTTAAAGGAAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAGA
AGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTT
GTTCTGTCTCTAGTTTTTCCTCTGTTTTAAAATGTGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGG
TTCGAATTGAGCCCTTTCCAGACTAATCT
CAGGCTTCGTTGTTGTTCC

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR2AQ18TF 709 0 0
GG
CTCGCCTCTGAAGTTTCAAAATCCGTACGAAGAGGATAGAGAGAACAATGGCGCAGATGG
TTGCGATGCCCGTAGCGCACTCCCTCTCTCTCATTTGCAATTGGACTAAATCAAACCCTC
TCACTCGCAACACTCTTGCTCTGCCACCTACTAACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGAGCA
TCAGATGTGCTCGTGTGGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGCACTCTC
TCCAGTACATTCATGGCATTGGCCGAACTAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGA
TGGAGAATAAAATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAG
TCTCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGT
TGAAGGAGATACAGTGTTACCGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTACCATGTCGTGGAC
AGAGAACCAAGAACAACTGCAGAACTCTTAAAGGAAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAGA
AGAAAGTTTCTAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTT
GTTCTGTCTCTAGTTTTTCCTCTGTTTTAAAATGTGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGG
TTCGAATTGAGCCCTTTCCAGACTAATCT
CAGCTTCGTTGTTGTTCC

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR2GB78JQ 567 0 0
CCACCTACTAACGCTCCCAGTAAGCAGAGTCTGAGCATCAGATGTGCTCGTGTGGGAGGT
GTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTCCAGTACATTCATGGCATTGGC
CGAACTAGGGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATGGAGAATAAAATCACCAAAGAC
ATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTTTTCGTGATGAAGTCTCCAAGTACATGATCGAGGGT
GATTTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGTTGAAGGAGATACAGTGTTACCGT
GGTGTAAGGCACATCCAAGGGCTACCATGTCGTGGACAGAGAACCAAGAACAACTGCAGA
ACTTTTAAAGGAAAGAAAATTGCTATTGCTGGCAAGAAGAAAGTTTTTAAGTAACCAACT
CATTTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTTGTTCTGTCTCTAGTTTTTCCTCT
GTTTTAAAATGTGATTTTGTAATCTCCTGAAACTTGGTTCGAATTGAGCCCTTTCCAGAC
TAATCTCAGGCTTCGTTGTTGTTCCAT

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 15

CO CL235Contig1 1167 15 26 U
GGACAAATAAATCAGAACGAATAAAAGAAAACTAAAACTTTAAAACAAAATGGGAAACAC
CAAAGAAAGAAGAAGCTTGTTGGTTTCAACAATAACGGTGCTGTTCTTCTTCAACACTCA
TTATCTTCAGGTTATGAGTTGCCCCGAGCAAAAGACGAACTGTACCGATCAAGACAGAAA
ATTATTGGAGTTTCCTTTAAACTTGGAGTATCTTGAAGCTGAATTTTTCTTGTTCGGGGC
ATTAGGGTTTGGTCTTGACAAAGTCGATCCAAATTTAACTATGGGAGGGCCAAGTCCTAT
TGGAGCTCAGAAAGCTAAACTCGATCCTTTGACAAGAGATATTGTATTGCAATTTGCTTG
GCAAGAGGTTGGCCACTTGAGGGCAATCAAGAAAACGGTGACAGGGTTTGCAAGGCCGCT
ACTTGATTTGAGTATAAAATCATTTGCGAAAGTGATGGATGATGCATTCGGACGAAAATT
TGTGCCACCATTTAACCCCTATGCCAATTCTTACAATTACCTCATTGCTTCTTATTTGGT
CCCGTATGTTGGCCTCACCGGCTACGTTGGCGCTAACCCCAAACTGCAATGTCCCGCATC
AAGAAAGTTAGTAGCAGGACTTTTAGGAGTAGAATCAGGTCAGGACGCTGTGATAAGAAC
AATGCTATATGCGAGGGCGACACATATAGTTCATCCTTATGGTATCACGGTTGCGGCTTT
CACTGATAGGATCTCGTGTCTAAGGAACAAATTGGGGAAAATGGGTGTGAAAGATGAGGG
GTTAGTAGTGCCTAAAACCATGGGTGCGGAGGGACATGTGGCCGGGAATGTATTGGTTGG
TGACGAGTTATCGCTTGCGTTTGATCGAACTCCGGAGGAAATTCTGCGGATTGTGTATGG
AAGTGGAAATGAAAGGGTGCCTGGTGGATTTTACCCTAAAGGAGCTGATGGAGAAATTGC
TAAGTCTTATTTGGCTTAGTAATGATGTTGTTGACAATGAGGTTTAGTGTTAGTTGGAGT
TTAACTTCCTTTGTAGTTGTTAGCTTTTTCGGTTTATAGAGCAAAATAATTTTCATGTTA
ATGTAATAAATCCTATGGAGATATTTCCACAGTGTAAAAAGAAAAGATCTAAAAAGTATA
CAGTAGTTGTTTGAAATTAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 40 35 65 65 50 50 50 65 65 20 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT74TF U 3
AF RR2FZ60TF U 2
AF RR2EA50TF U 1
AF RR2F387TF U 1
AF RR2AQ13TF U 2
AF RR2FE05TF U 224
AF RR2AQ13JQ C 229
AF RR2FE05JQ C 409
AF RR2FZ60JQ C 572
AF RR2F387JQ C 739
AF RR2CI40JQ C 514
AF RR2DJ72TF U 827
AF RR2GT74JQB C 734
AF RR2EA50JQ C 741
AF RR2CI40TF U 514
BS 1 162 RR2EA50TF
BS 163 163 RR2F387TF
BS 164 192 RR2EA50TF
BS 193 193 RR2F387TF
BS 194 452 RR2EA50TF
BS 453 453 RR2F387TF
BS 454 569 RR2EA50TF
BS 570 570 RR2F387TF
BS 571 705 RR2EA50TF
BS 706 744 RR2F387TF
BS 745 746 RR2AQ13TF
BS 747 748 RR2F387TF
BS 749 749 RR2FE05TF
BS 750 760 RR2F387TF
BS 761 761 RR2AQ13TF
BS 762 778 RR2F387TF
BS 779 796 RR2AQ13TF
BS 797 797 RR2FE05TF
BS 798 803 RR2AQ13TF
BS 804 804 RR2FE05TF
BS 805 825 RR2AQ13TF
BS 826 826 RR2FE05TF
BS 827 868 RR2AQ13TF
BS 869 911 RR2FE05TF
BS 912 1158 RR2DJ72TF
BS 1159 1167 RR2CI40TF

RD RR2GT74TF 553 0 0
GG
AAATAAATCAGAACGAATAAAAGAAAACTAAAACTTTAAAACAAAATGGGAAACACTAAA
GAAAGAAGAAGCTTGTTGGTTTCAACAATAACGGTACTGTTCTTCTTCAACACTCATTAT
CTTCAGGTTATGAGTTGCCCCGAGCAAAAGACGAACTGTACCGATCAAGACAGAAAATTA
TTGGAGTTTCCTTTAAACTTGGAGTATCTTGAAGCTGAATTTTTCTTGTTCGGGGCATTA
GGGTTTGGTCTTGACAAAGTCGATCCAAATTTAACTATGGGAGGGCCAAGTCCTATTGGA
GCTCAGAAAGCTAAACTCGATCCTTTGACAAGAGATATTGTATTGCAATTTGCTTGGCAA
GAGGTTGGCCACTTGAGGGCAATCAAGAAAACGGTGACAGGGTTTGCAAGGCCGCTACTT
GATTTGAGTATAAAATCATTTGCGAAAGTGATGGATGATGCATTCGGACGAAAATTTGTG
CCACCATTTAACCCCTATGCCAATTCTTACAATTACCTCATTGCTTCTTATTTGGTCCCG
TATGTTGGCCT

QA 3 553 3 553
DS 

RD RR2FZ60TF 612 0 0
GGA
AAATAAATCAGAACGAATAAAAGAAAACTAAAACTTTAAAACAAAATGGGAAACACCAAA
GAAAGAAGAAGCTTGTTGGTTTCAACAATAACGGTGCTGTTCTTCTTCAACACTCATTAT
CTTCAGGTTATGAGTTGCCCCGAGCAAAAGACGAACTGTACCGATCAAGACAGAAAATTA
TTGGAGTTTCCTTTAAACTTGGAGTATCTTGAAGCTGAATTTTTCTTGTTCGGGGCATTA
GGGTTTGGTCTTGACAAAGTCGATCCAAATTTAACTATGGGAGGGCCAAGTCCTATTGGA
GCTCAGAAAGCTAAACTCGATCCTTTGACAAGAGATATTGTATTGCAATTTGCTTGGCAA
GAGGTTGGCCACTTGAGGGCAATCAAGAAAACGGTGACAGGGTTTGCAAGGCCGCTACTT
GATTTGAGTATAAAATCATTTGCGAAAGTGATGGATGATGCATTCGGACGAAAATTTGTG
CCACCATTTAACCCCTATGCCAATTCTTACAATTACCTCATTGCTTCTTATTTGGTCCCG
TATGTTGGCCTCACCGGCTACGTTGGCGCTAACCCCAAACTGCAATGTCCCGCATCAAGA
AAGTTAGTA

QA 4 612 4 612
DS 

RD RR2EA50TF 705 0 0
GGACAAATAAATCAGAACGAATAAAAGAAAACTAAAACTTTAAAACAAAATGGGAAACAC
CAAAGAAAGAAGAAGCTTGTTGGTTTCAACAATAACGGTGCTGTTCTTCTTCAACACTCA
TTATCTTCAGGTTATGAGTTGCCCCGAGCAAAAGACGAACTGCACCGATCAAGACAGAAA
ATTATTGGAGTTCCCTTTAAACTTGGAGTATCTTGAAGCTGAATTTTTCTTGTTCGGGGC
ATTAGGGTTTGGTCTTGACAAAGTCGATCCAAATTTAACTATGGGAGGGCCAAGTCCTAT
TGGAGCTCAGAAAGCTAAACTCGATCCTTTGACAAGAGATATTGTATTGCAATTTGCTTG
GCAAGAGGTTGGCCACTTGAGGGCAATCAAGAAAACGGTGACAGGGTTTGCAAGGCCGCT
ACTTGATTTGAGTATAAAATCATTTGCGAAAGAGATGGATGATGCATTCGGACGAAAATT
TGTGCCACCATTTAACCCCTATGCCAATTCTTACAATTACCTCATTGCTTCTTATTTGGT
CCCGTATGTTGGCCTCACCGGCTACGTTGTCGCTAACCCCAAACTGCAATGTCCCGCATC
AAGAAAGTTAGTAGCAGGACTTTTAGGAGTAGAATCAGGTCAGGACGCTGTGATAAGAAC
AATGCTATATGCGAGGGCGACACATATAGTTCATCCTTATGGTAT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2F387TF 778 0 0
GGAC
AAATAAATCAGAACGAATAAAAGAAAACTAAAACTTTAAAACAAAATGGGAAACACCAAA
GAAAGAAGAAGCTTGTTGGTTTCAACAATAACGGTGCTGTTCTTCTTCAACACTCATTAT
CTTCAGGTTATGAGTTGCCCCGAGCAAAAGACGAACTGTACCGATCAAGACAGAAAATTA
TTGGAGTTTCCTTTAAACTTGGAGTATCTTGAAGCTGAATTTTTCTTGTTCGGGGCATTA
GGGTTTGGTCTTGACAAAGTCGATCCAAATTTAACTATGGGAGGGCCAAGTCCTATTGGA
GCTCAGAAAGCTAAACTCGATCCTTTGACAAGAGATATTGTATTGCAATTTGCTTGGCAA
GAGGTTGGCCACTTGAGGGCAATCAAGAAAACGGTGACAGGGTTTGCAAGGCCGCTACTT
GATTTGAGTATAAAATCATTTGCGAAAGTGATGGATGATGCGTTCGGACGAAAATTTGTG
CCACCATTTAACCCCTATGCCAATTCTTACAATTACCTCATTGCTTCTTATTTGGTCCCG
TATGTTGGCCTCACCGGCTACGTTGGCGCTAACCCCAAACTGCAATGTCCCGCATCAAGA
AAGTTAGTAGCAGGACTTTTAGGAGTAGAATCAGGTCAGGACGCTGTGATAAGAACAATG
CTATATGCGAGGGCGACACATATAGTTCATCCTTATGGTATCACGGTTGCGGCTTTCACT
GATAGGATCTCGTGTCTAAG**AC*AATTGGGGAAA*TGGGTGTGAAAGATGAG

QA 5 778 5 778
DS 

RD RR2AQ13TF 867 0 0
GAC
AAATAAATCAGAACGAATAAAAGAAAACTAAAACTTTAAAACAAAATGGGAAACACCAAA
GAAAGAAGAAGCTTGTTGGTTTCAACAATAACGGTGCTGTTCTTCTTCAACACTCATTAT
CTTCAGGTTATGAGTTGCCCCGTGCAAAAGACGAACTGTACCGATCAAGACAGAAAATTA
TTGGAGTTTCCTTTAAACCTGGAGTATCTTGAAGCTGAATTTTTCTTGTTCGGGGCATTA
GGGTTTGGTCTTGACAAAGTCGATCCAAATTTAACTATGGGAGGGCCAAGTCCTATTGGA
GCTCAGAAAGCTAAACTCGATCCTTTGACAAGAGATATTGTATTGCAATTTGCTTGGCAA
GAGGTTGGCCACTTGAGGGCAATCAAGAAAACGGTGACAGGGTTTGCAAGGCCGCTACTT
GATTTGAGTATAAAATCATTTGCGAAAGTGATGGATGATGCATTCGGACGAAAATTTGTG
CCACCATTTAACCCCTATGCCAATTCTTACAATTACCTCATTGCTTCTTATTTGGTCCCG
TATGTTGGCCTCACCGGCTACGTTGGCGCTAACCCCAAACTGCAATGTCCCGCATCAAGA
AAGTTAGTAGCAGGACTTTTAGGAGTAGAATCAGGTCAGGACGCTGTGATAAGAACAATG
CTATATGCGAGGGCGACACATATAGTTCATCCTTATGGTATCACGGTTGCGGCTTTCACT
GATAGGATCTCGTGTCTAAAGAACGAATTGGGGAAAATGGGTGTGAAAGATGAGGGGTTA
GTAGTGCCTAAAGCCATGG*TGCGGAGGGACATGTGGCCGG*AATGTATTGGTTGGTGAC
GAGTTATCGCTTGCGTTTGATCGA

QA 4 867 4 867
DS 

RD RR2FE05TF 688 0 0
TTTTTCTTGTTCGGGGCATTAGGGTTTGGTCTTGACAAAGTCGATCCAAATTTAACTATG
GGAGGGCCAAGTCCTATTGGAGCTCAGAAAGCTAAACTCGATCCTTTGACAAGAGATATT
GTATTGCAATTTGCTTGGCAAGAGGTTGGCCACTTGAGGGCAATCAAGAAAACGGTGACA
GGGTTTGCAAGGCCGCTACTTGATTTGAGTATAAAATCATTTGCGAAAGTGATGGATGAT
GCATTCGGACGAAAATTTGTGCCACCATTTAACCCCTATGCCAATTCTTACAATTACCTC
ATTGCTTCTTATTTGGTCCCGTATGTTGGCCTCACCGGCTACGTTGGCGCTAACCCCAAA
CTGCAATGTCCCGCATCAAGAAAGTTAGTAGCAGGACTTTTAGGAGTAGAATCAGGTCAG
GACGCTGTGATAAGAACAATGCTATATGCGAGGGCGACACATATAGTTCATCCTTATGGT
ATCACGGTTTCGGCTTTCACTGATAGGATCTCGTGTCTAAGGAACAAATTGGGGAAAATG
GGTGTGAAAGATGAGGGGTTAGTAGTGCCTAAAACCATGGGTGCGGAGGGACATGTGGCC
GGGAATGTATTGGTTGGTGACGAGTTATCGCTTGCGTTTGATCGAACTCCGGAGGAAATT
CTGCGGATTGTGTATGGAAGTGGAAATG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2AQ13JQ 887 0 0
CTTGTTCGGGGCATTAGGGTTTGGTCTTGACAAAGTCGATCCAAATTTAACTATGGGAGG
GCCAAGTCCTATTGGAGCTCAGAAAGCTAAACTCGATCCTTTGACAAGAGATATTGTATT
GCAATTTGCTTGGCAAGAGGTTGGCCACTTGAGGGCAATCAAGAAAACGGTGACAGGGTT
TGCAAGGCCGCTACTTGATTTGAGTATAAAATCATTTGCGAAAGTGATGGATGATGCATT
CGGACGAAAATTTGTGCCACCATTTAACCCCTATGCCAATTCTTACAATTACCTCATTGC
TTCTTATTTGGTCCCGTATGTTGGCCTCACCGGCTACGTTGGCGCTAACCCCAAACTGCA
ATGTCCCGCATCAAGAAAGTTAGTAGCAGGACTTTTAGGAGTAGAATCAGGTCAGGACGC
TGTGATAAGAACAATGCTATATGCGAGGGCGACACATATAGTTCATCCTTATGGTATCAC
GGTTGCGGCTTTCACTGATAGGATCTCGTGTCTAAGGAACGAATTGGGGAAAATGGGTGT
GAAAGATGAGGGGTTAGTAGTGCCTAAAGCCATGGGTGCGGAGGGACATGTGGCCGGGAA
TGTATTGGTTGGTGACGAGTTATCGCTTGCGTTTGATCGAACTCCGGAGGAAATTCTGCG
GATTGTGTATGGAAGTGGAAATGAAAGGGTGCCTGGTGGATTTTACCCTAAAGGAGCTGA
TGGAGAAATTGCTAAGTCTTATTTGGCTTAGTAATGATGTTGTTGACAATGAGGTTTAGT
GTTAGTTGGAGTTTAACTTCCTTTGTAGTTGTTAGCTTTTTCGGTTTATAGAGCAAAATA
ATTTTCATGTTAATGTAATAAATCCTATGGAGATATTTCCACAGTG
C

QA 1 886 1 886
DS 

RD RR2FE05JQ 730 0 0
TGCAAGGCCGCTACTTGATTTGAGTATAAAATCATTTGCGAAAGTGATGGATGATGCATT
CGGACGAAAATTTGTGCCACCATTTAACCCCTATGCCAATTCTTACAATTACCTCATTGC
TTCTTATTTGGTCCCGTATGTTGGCCTCACCGGCTACGTTGGCGCTAACCCCAAACTGCA
ATGTCCCGCATCAAGAAAGTTAGTAGCAGGACTTTTAGGAGTAGAATCAGGTCAGGACGC
TGTGATAAGAACAATGCTATATGCGAGGGCGACACATATAGTTCATCCTTATGGTATCAC
GGTTTCGGCTTTCACTGATAGGATCTCGTGTTTAAGGAACAAATTGGGGAAAATGGGTGT
GAAAGATGAGGGGTTAGTAGTGCCTAAAACCATGGGTGCGGAGGGACATGTGGCCGGGAA
TGTATTGGTTGGTGACGAGTTATCGCTTGCGTTTGATCGAACTCCGGAGGAAATTTTGCG
GATTGTGTATGGAAGTGGAAATGAAAGGGTGCCCGGTGGATTTTACCCTAAAGGAGCTGA
TGGAGAAATTGCTAAGTCTTATTTGGCTTAGTAATGATGTTGTTGACAATGAGGTTTAGT
GTTAGTCGGAGTTTAACTTCCTTTGTAGTTGTTAGCTTTTTCGGTTTATAGAGTAAAATA
ATTTTCATGTTAATGTAATAAATCCTATGGAGATATTTCCACAGTGTAAAAAGAAAAGAT
CTAAAAAGT
G

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2FZ60JQ 544 0 0
GCTAACCCCAAACTGCAATGTCCCGCATCAAGAAAGTTAGTAGCAGGACTTTTAGGAGTA
GAATCAGGTCAGGACGCTGTGATAAGAACAATGCTATATGCGAGGGCGACACATATAGTT
CATCCTTATGGTATCACGGTTGCGGCTTTCACTGATAGGATCTCGTGTCTAAGGAACAAA
TTGGGGAAAATGGGTGTGAAAGATGAGGGGTTAGTAGTGCA*AAAGCCATGGGTGCGGAG
GTACATGTGGCCGGGAATGTATTGGTTGGTGACGAGTTATCGCTTGCGTTTGATCGAACT
CCGGAGGAAATTCTGCGGATTGTGTATGGAAGTGGAAATGAAAGGGTGCCTGGTGGATTT
TACCCTAAAGGAGCTGATGGAGAAATTGCTAAGTCTTATTTGGCTTAGTAATGATGTTGT
TGACAATGAGGTTTAGTGTTAGTTGGAGTTTAACTTCCTTTGTAGTTGTTAGCTTTTTCG
GTTTATAGAGCAAAATAATTTTCATGTTAATGTAATAAATCCTATGGAGATATTTCCACA
GTGT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2F387JQ 377 0 0
TT
TAAGGAACAAATTGGGGAAAATGGGTGTGAAAGATGAGGGGTTAGTAGTGCCTAAAGCCA
TGGGTGCGGAGGGACATGTGGCCGGGAATGTATTGGTTGGTGACGAGTTATCGCTTGCGT
TTGATCGAACTCCGGAGGAAATTTTGCGGATTGTGTATGGAAGTGGAAATGAAAGGGTGC
CTGGTGGATTTTCCCCTAAAGGGGCTGACGGGGAAATTGCTAAGTTTTATTTGGCTTAGT
AATGATGTTGTTGACAATGAGGTTTAGTGTTAGTTGGAGTTTAACTTCCTTTGTAGTTGT
TAGCTTTTTCGGTTTATAGGGCAAAATAATTTTCATGTTAATGTAATAAATCCTATGGAG
ATATTTCCCCAGTGT

QA 3 377 3 377
DS 

RD RR2CI40JQ 645 0 0
G
AATTACCTCATTGCTTCTTATTTGGTCCCGTATGTTGGCCTCACCGGCTACGTTGGCGCT
AACCCCAAACTGCAATGTCCCGCATCAAGAAAGTTAGTAGCAGGACTTTTAGGAGTAGAA
TCAGGTCAGGACGCTGTGATAAGAACAATGCTATATGCGAGGGCGACACATATAGTTCAT
CCTTATGGTATCACGGTTGCGGCTTTCACTGATAGGATCTCGTGTCCAAGGAACAAATTG
GGGAAAATGGGTGTGAAAGATGAGGGGTTAGTAGTGCCTAAAACCATGGGTGCGGAGGGA
CATGTGGCCGGGAATGTATTGGTTGGTGACGAGTTATCGCTTGCATTTGATCGAACTCCG
GAGGAAATTCTGCGGATTGTGTATGGAAGTGGAAATGAAAGGGTGCCCGGTGGATTTTAC
CCTAAAGGAGCTGATGGAGAAATTGCTAAGTCTTATTTGGCTTAGTAATGATGTTGTTGA
CAATGAGGTTTAGTGTTAGTCGGAGTTTAACTTCCTTTGTAGTTGTTAGCTTTTTCGGTT
*ATAGAGCAAAATAATTTTCATGTTAATGTAATAAATCCTATGGAGATATTTCCACAGTG
TAAAAAGAAAAGATCTAAAAAGTATACAGTAGTTGTTTGAAATT

QA 2 645 2 645
DS 

RD RR2DJ72TF 332 0 0
G
ATGTATTGGTTGGTGACGAGTTATCGCTTGCGTTTGATCGAACTCCGGAGGAAATTCTGC
GGATTGTGTATGGAAGTGGAAATGAAAGGGTGCCTGGTGGATTTTACCCTAAAGGAGCTG
ATGGAGAAATTGCTAAGTCTTATTTGGCTTAGTAATGATGTTGTTGACAATGAGGTTTAG
TGTTAGTTGGAGTTTAACTTCCTTTGTAGTTGTTAGCTTTTTCGGTTTATAGAGCAAAAT
AATTTTCATGTTAATGTAATAAATCCTATGGAGATATTTCCACAGTGTAAAAAGAAAAGA
TCTAAAAAGTATACAGTAGTTGTTTGAAATT

QA 2 332 2 332
DS 

RD RR2GT74JQB 420 0 0
TCGTGTCTAAGGAACAAATTGGGGAAAATGGGTGTGAAAGATGAGGGGTTAGTAGTGCCT
AAAGCCATGGGTGCGGAGGGACATGTGGCCGGGAATGTATTGGTTGGTGACGAGTTATCG
CTTGCGTTTGATCGAACTCCGGAGGAAATTTTGCGGATTGTGTATGGAAGTGGAAATGAA
AGGGTGCCTGGTGGATTTTACCCTAAAGGAGCTGATGGAGAAATTGCTAAGTCTTATTTG
GCTTAGTAATGATGTTGTTGACAATGAGGTTTAGTGTTAGTTGGAGTTTAACTTCCTTTG
TAGTTGTTAGCTTTTTCGGTTTATAGAGCAAAATAATTTTCATGTTAATGTAATAAATCC
TATGGAGATATTTCCACAGTGTAAAAAGAAAAGATCTAAAAAGTATACAGTAGTTGTTTG

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR2EA50JQ 418 0 0
TAAGGAACAAATTGGGGAAAATGGGTGTGAAAGATGAGGGGTTAGTAGTGCCTAAAACCA
TGGGTGCGGAGGGACATGTGGCCGGGAATGTATTGGTTGGTGACGAGTTATCGCTTGCGT
TTGATCGAACTCCGGAGGAAATTTTGCGGATTGTGTATGGAAGTGGAAATGAAAGGGTGC
CCGGTGGATTTTACCCTAAAGGAGCTGATGGAGAAATTGCTAAGTCTTATTTGGCTTAGT
AATGATGTTGTTGACAATGAGGTTTAGTGTTAGTCGGAGTTTAACTTCCTTTGTAGTTGT
TAGCTTTTTCGGTTTATAGAGCAAAATAATTTTCATGTTAATGTAATAAATCCTATGGAG
ATATTTCCACAGTGTAAAAAGAAATGATCTAAAAAGTATACAGTAGTTGTTTGAAATT

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR2CI40TF 654 0 0
G
AATTACCTCATTGCTTCTTATTTGGTCCCGTATGTTGGCCTCACCGGCTACGTTGGCGCT
AACCCCAAACTGCAATGTCCCGCATCAAGAAAGTTAGTAGCAGGACTTTTAGGAGTAGAA
TCAGGTCAGGACGCTGTGATAAGAACAATGCTATATGCGAGGGCGACACATATAGTTCAT
CCTTATGGTATCACGGTTGCGGCTTTCACTGATAGGATCTCGTGTCCAAGGAACAAATTG
GGGAAAATGGGTGTGAAAGATGAGGGGTTAGTAGTGCCTAAAACCATGGGTGCGGAGGGA
CATGTGGCCGGGAATGTATTGGTTGGTGACGAGTTATCGCTTGCATTTGATCGAACTCCG
GAGGAAATTCTGCGGATTGTGTATGGAAGTGGAAATGAAAGGGTGCCCGGTGGATTTTAC
CCTAAAGGAGCTGATGGAGAAATTGCTAAGTCTTATTTGGCTTAGTAATGATGTTGTTGA
CAATGAGGTTTAGTGTTAGTCGGAGTTTAACTTCCTTTGTAGTTGTTAGCTTTTTCGGTT
*ATAGAGCAAAATAATTTTCATGTTAATGTAATAAATCCTATGGAGATATTTCCACAGTG
TAAAAAGAAAAGATCTAAAAAGTATACAGTAGTTGTTTGAAATTAAAAAAAAA

QA 2 654 2 654
DS 



AS 2 13

CO CL236Contig1 820 5 9 U
GGACAACATATCGAAACAAACAAAGAACACATCTTTGATCTTCTTCCCTCTCGCTCCTCT
CGCTCATCCCTCTTGTCCGTCTCTCAAACCCTAAAAAGAACATTAGGAAAGAAAAACCAT
GGATCCGGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGTCCCATGATGAAGACAATCAA
AGGCAGCGTGACTGGTTTCGCCGCTGGGACGATCTACGGAACCATTCTGGCCACGTGGAA
AGACGTTCCGAGAGTGGAGAGGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGAT
GATGGGAACCCACGGGCTCACTTTCGCTGCCATTGGTGGAGTGTACATCGGTGTTGAGCA
GGTGGTTCAGAGTTATAGAGGAAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGT
TGCTGGTTCTTCTGTCCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATCCCAACAGCGATAGCTGCAGG
TGCAACACTAGCAGTTACATCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGA
CAACGGGAGAGAGTATTATCCTTACACCCCCGTCGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTG
ATTTCTATTTTTGGCGTCTCTGAAGTCAATAAAGCTTATCCCAGCTAGGCCTCTTGAAGA
TTGTCTCTCTTCGTTGTCATCTCTTTTTTTTTTTAATCTACTGTTGTATCTGGAGATATG
AAATCATAGAACTCTTGTTTACTCCTGTGTTTATGGAGATTTGACTTTCATCCTTTGTCT
GAACGTTGATTCCTACAATAAAGATATCAACTTTGTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2DE60TF U 27
AF RR2E383TF U 1
AF RR2C603TF U 8
AF RR2DE60JQ C 95
AF RR2E383JQ C 453
BS 1 682 RR2E383TF
BS 683 686 RR2C603TF
BS 687 761 RR2DE60JQ
BS 762 762 RR2E383JQ
BS 763 783 RR2DE60JQ
BS 784 784 RR2E383JQ
BS 785 788 RR2DE60JQ
BS 789 789 RR2E383JQ
BS 790 820 RR2DE60JQ

RD RR2DE60TF 596 0 0
GG
ACATCTTTGATCTTCTTCCCTCTCGCTCCTCTCGCTCATCCCTCTTGTCCGTCTCTCAAA
CCCTAAAAAGAACATTAGGAAAGAAAAACCATGGATCCGGCTGAGATGAGGTACTTGGAA
GAAGAGGACGGTCCCATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTGACTGGTTTCGCCGCTGGG
ACGATCTACGGAACCATTCTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGGAACGTG
GCGCTTCCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTCACTTTCGCT
GCCATTGGTGGAGTGTACATCGGTGTTGAGCAGGTGGTTCAGAGTTATAGAGGAAAGAGA
GATTTTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGTTGCTGGTTCTTCTGTCCTTGGCTATAGA
GCAAGGAGCATCCCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACACTAGCAGTTACATCTGCTTTG
ATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGGAGAGAGTATTATCCTTACACC
CCCGTCGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTGATTTCTATTTTTGGCGTCTCTG

QA 3 596 3 596
DS 

RD RR2E383TF 682 0 0
GGACAACATATCGAAACAAACAAAGAACACATCTTTGATCTTCTTCCCTCTCGCTCCTCT
CGCTCATCCCTCTTGTCCGTCTCTCAAACCCTAAAAAGAACATTAGGAAAGAAAAACCAT
GGATCCGGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGTCCCATGATGAAGACAATCAA
AGGCAGCGTGACTGGTTTCGCCGCTGGGACGATCTACGGAACCATTCTGGCCACGTGGAA
AGACGTTCCGAGAGTGGAGAGGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGAT
GATGGGAACCCACGGGCTCACTTTCGCTGCCATTGGTGGAGTGTACATCGGTGTTGAGCA
GGTGGTTCAGAGTTATAGAGGAAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGT
TGCTGGTTCTTCTGTCCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATCCCAACAGCGATAGCTGCAGG
TGCAACACTAGCAGTTACATCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGA
CAACGGGAGAGAGTATTATCCTTACACCCCCGTCGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTG
ATTTCTATTTTTGGCGTCTCTGAAGTCAATAAAGCTTATCCCAGCTAGGCCTCTTGAAGA
TTGTCTCTCTTCGTTGTCATCT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2C603TF 679 0 0
GGATCG
AAACAAACAAAGAACACATCTTTGATCTTCTTCCCTCTCGCTCCTCTCGCTCATCCCTCC
TGTCCGTCTCTCAAACCCTAAAAAGAACATTAGGAAAGAAAAACCATGGATCCGGCTGAG
ATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGTCCCATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTGACT
GGTTTCGCCGCTGGGACGATCTACGGAACCATTCTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGA
GTGGAGAGGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACCCAC
AGGCTCACTTTCGCTGCCATTGGTGGAGTGTACATCTGTGTTGAGCAGGTGGTTCAGAGT
TATAGAGGAAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGTTGCTGGTTCTTCT
GTCCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATCCCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACAGTAGCA
GTTACATCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGGAGAGAG
TATTATCCTTACACCCCCGTCGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTGATTTCTATTTTTG
GCGTCTCTGAAGTCAATAAAGCTTATCCCAGCTAG*CCTCTTGAAGATTGTCTCTCTTCG
TTGTCATCTCTTT

QA 7 679 7 679
DS 

RD RR2DE60JQ 726 0 0
AAAGAACATTAGGAAAGAAAAACCATGGATCCGGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAG
GACGGTCCCATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTGACTGGTTTCGCCGCTGGGACGATC
TACGGAACCATTCTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGGAACGTGGCGCTT
CCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTCACTTTCGCTGCCATT
GGTGGAGTGTACATCGGTGTTGAGCAGGTGGTTCAGAGTTATAGAGGAAAGAGAGATTTT
TTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGTTGCTGGTTCTTCTGTCCTTGGCTATAGAGCAAGG
AGCATCCCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACACTAGCAGTTACATCTGCTTTGATTGAC
TCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGGAGAGAGTATTATCCTTACACCCCCGTC
GAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTGATTTCTATTTTTGGCGTCTCTGAAGTCAATAAAG
CTTATCCCAGCTAGGCCTCTTGAAGATTGTCTCTCTTCGTTGTCATCTCTTTTTTTTTTT
AATCTACTGTTGTATCTGGAGATATGAAATCATAGAACTCTTGTTTACTCCTGTGTTTAT
GGAGATT*GACTTTCATCCTTTGTCTGAATGTTGGTTCCTACAATAAAGATATCAACTTT
GTCTCT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2E383JQ 368 0 0
GGAGCATCCCAACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACACTAGCAGTTACATCTGCTTTGATTG
ACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGGAGAGAGTATTATCCTTACACCCCCG
TCGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTGATTTCTATTTTTGGCGTCTCTGAAGTCAATAA
AGCTTATCCCAGCTAGGCCTCTTGAAGATTGTCTCTCTTCGTTGTCATCTCTTTTTTTTT
TTAATCTACTGTTGTATCTGGAGATATGAAATCATAGAACTCTTGTTTACTCCTGTGTTT
ATGGAGATTTGACTTTCATCTTTTGTCTGAACGTTGATTCCTACAATAAAGATATCAACT
TTGTCT
TC

QA 1 366 1 366
DS 



CO CL236Contig2 957 8 10 U
GGATATCGAAACAAACAAAGAACACATCTTTGATCTTCTTCCCTCTCGCTCCTCTCGCTC
ATCCCTCTTGTCCGTCTCTCAAACCCTAAAAAGAACCGTAGGAAAGAAAAACACCATGGA
TCCGGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGTCCGATGATGAAGACAATCAAAGG
CAGCGTGACTGGTTTCGCCGCTGGGACTATCTACGGAACCATTTTGGCCACGTGGAAAGA
CGTTCCGAGAGTGGAGAGGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGATGAT
GGGAACTCACGGGCTCACTTTTGCTGCCATCGGAGGTGTTTACATCGGTGTTGAGCAGGT
GGTTCAGAGTTATAGAGGAAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGTGGC
TGGAGCTTCTGTCCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATTCCCACAGCGATAGCTGCAGGTGC
AACTCTAGCAGTTACATCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAA
CGGGAGAGAATATTATCCTTACACCCCCGTTGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTGATC
TCTCTCCTTTTGGCGTCTGAAGTCAATAAAGCTTATCCCAGCTAGGCCTCTTGAAGATTG
TCTCTCTCTTTTTTTTTT*AATCTACTGTTGTATCTGGAGATATGAAATCATAGAACTCT
TGTTTACTCCTGTGTTTATGGAGATTGACTTTCATCTTTTGTCTGAATGTTGATTCCTAC
AATAAAGATATCAACTTTGTCTTCAAAATGTTTACAGCTTTGGGTTCTAATTCTAAATGA
TATCAGACATGTACTTGCGTCTGTTACTTCTATCTGAACGAGGCTAAGCAGTAGGAAATC
TACATGTAAAAGCTCAGTTGAATACGTGGCAATAATTCATTGGCTATCTTAAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR18TF U 176
AF RR2EQ52TF U 11
AF RR2FE78TF U 1
AF RR2EI26TF U 10
AF RR2EI26JQ C 10
AF RR2A369JQ C 9
AF RR2FE78JQ C 90
AF RR2EQ52JQ C 230
BS 1 677 RR2FE78TF
BS 678 678 RR2EI26TF
BS 679 745 RR2FE78TF
BS 746 746 RR2A369JQ
BS 747 759 RR2FE78TF
BS 760 760 RR2A369JQ
BS 761 774 RR2FE78TF
BS 775 795 RR2A369JQ
BS 796 802 RR2FE78JQ
BS 803 957 RR2EQ52JQ

RD RR2BR18TF 106 0 0
AAAGGCAGCGTGACTGGTTTCGCCGCTGGGACTATCTACGGAACCATTTTGGCCACGTGG
AAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTCA

QA 1 106 1 106
DS 

RD RR2EQ52TF 648 0 0
GG
AAACAAAGAACACATCTTTGATCTTCTTCCCTCTCGCTCCTCTCGCTCATCCCTCTTGTC
CGTCTCTCAAACCCTAAAAAGAACCGTAGGAAAGAAAAACACCATGGATCCGGCTGAGAT
GAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGTCCGATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTGACTGG
TTTCGCCGCTGGGACTATCTACGGAACCATTTTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGT
GGAGAGGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACTCACGG
GCTCACTTTTGCTGCCATCGGAGGTGTTTACATCGGTGTTGAGCAGGTGGTTCAGAGTTA
TAGAGGAAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGTGGCTGGAGCTTCTGT
CCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATTCCCACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAGTAGT
TACATCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGGAGAGAATA
TTATCCTTACACCCCCGTTGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTGATCTCTCTCCTTTTG
GCGTCTGAAGTCAATAAAGCTTATCCCAGCTAGGCCTCTTGAAGAT

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR2FE78TF 781 0 0
GGATATCGAAACAAACAAAGAACACATCTTTGATCTTCTTCCCTCTCGCTCCTCTCGCTC
ATCCCTCTTGTCCGTCTCTCAAACCCTAAAAAGAACCGTAGGAAAGAAAAACACCATGGA
TCCGGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGTCCGATGATGAAGACAATCAAAGG
CAGCGTGACTGGTTTCGCCGCTGGGACTATCTACGGAACCATTTTGGCCACGTGGAAAGA
CGTTCCGAGAGTGGAGAGGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGATGAT
GGGAACTCACGGGCTCACTTTTGCTGCCATCGGAGGTGTTTACATCGGTGTTGAGCAGGT
GGTTCAGAGTTATAGAGGAAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGTGGC
TGGAGCTTCTGTCCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATTCCCACAGCGATAGCTGCAGGTGC
AACTCTAGCAGTTACATCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAA
CGGGAGAGAATATTATCCTTACACCCCCGTTGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTGATC
TCTCTCCTTTTGGCGTCTGAAGTCAATAAAGCTTATCCCAGCTAGGCCTCTTGAAGATTG
TCTCTCTCTTTTTTTTT**AATCTACTGTTGTATCTGGAGATATGAAATCATAGAACTCT
TGTTTACTCCTGTGTTTATGGAGAT*GACTTTCATCTTT*GTCTGAATGTTGAT
CCTACAT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2EI26TF 757 0 0
GGA
AAACAAAGAACACATCTTTGATCTTCTTCCCTCTCGCTCCTCTCGCTCATCCCTCTTGTC
CGTCTCTCAAACCCTAAAAAGAACCGTAGGAAAGAAAAACACCATGGATCCGGCTGAGAT
GAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGTCCGATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTGACTGG
TTTCGCCGCTGGGACTATCTACGGAACCATTTTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGT
GGAGAGGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACTCACGG
GCTCACTTTTGCTGCCATCGGAGGTGTTTACATCGGTGTTGAGCAGGTGGTTCAGAGTTA
TAGAGGAAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGTGGCTGGAGCTTCTGT
CCTTGGCTATAGAGCAGGGAGCATTCCCACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAGCAGT
TACATCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGGAGAGAATA
TTATCCTTACACCCCCGTTGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTGATCTCTCTCCTTTTG
GCGTCTGAAGTCAATAAAGCTTATCCCAGCTAGGCCTCTTGAAGATTGTCTCTCTCTTTT
TTTTTT*AATCTACTGTTGTATCTGGAGATATGAAATCATAGAACTCTTGTTTACTC*TG
TGTTTATGGAGAT*GACTTTCATCTTT
AAAAAAA

QA 4 750 4 750
DS 

RD RR2EI26JQ 750 0 0
GGA
AAACAAAGAACACATCTTTGATCTTCTTCCCTCTCGCTCCTCTCGCTCATCCCTCTTGTC
CGTCTCTCAAACCCTAAAAAGAACCGTAGGAAAGAAAAACACCATGGATCCGGCTGAGAT
GAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGTCCGATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTGACTGG
TTTCGCCGCTGGGACTATCTACGGAACCATTTTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGT
GGAGAGGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACTCACGG
GCTCACTTTTGCTGCCATCGGAGGTGTTTACATCGGTGTTGAGCAGGTGGTTCAGAGTTA
TAGAGGAAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGTGGCTGGAGCTTCTGT
CCTTGGCTATAGAGCAGGGAGCATTCCCACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAGCAGT
TACATCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGGAGAGAATA
TTATCCTTACACCCCCGTTGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTGATCTCTCTCCTTTTG
GCGTCTGAAGTCAATAAAGCTTATCCCAGCTAGGCCTCTTGAAGATTGTCTCTCTCTTTT
TTTTTTTAATCTACTGTTGTATCTGGAGATATGAAATCATAGAACTCTTGTTTACTCCTG
TGTTTATGGAGATTGACTTTCATCTTT

QA 4 750 4 750
DS 

RD RR2A369JQ 787 0 0
AAACAAACAAAGAACACATCTTTGATCTTCTTCCCTCTCGCTCCTCTCGCTCATCCCTCT
TGTCCGTCTCTCAAACCCTAAAAAGAACCGTAGGAAAGAAAAACACCATGGATCCGGCTG
AGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGTCCGATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTGA
CTGGTTTCGCCGCTGGGACTATCTACGGAACCATTTTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGA
GAGTGGAGAGGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACTC
ATGGGCTCACTTTTGCTGCCATCGGAGGTGTTTACATCGGTGTTGAGCAGGTGGTTCAGA
GTTATAGAGGAAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGTGGCTGGAGCTT
CTGTCCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATTCCCACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAG
CAGTTACATCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGGAGAG
AATATTATCCTTACACCCCCGTTGAGAAAACAGCTAAAGCTGGTGCCTGATCTCTCTCCT
TTTGGCGTCTGAAGTCAATAAAGCTTATCCCAGCTAGGCCTCTTGAAGATTGTCTCTCTC
TTTTTTTTTT*AATCTACTGTTGTATCTGGATATATGAAATCATAGAACTCTTGTTTACT
CCTGTGTTTATGGAGATTGACTTTCATCTTTTGTCTGAATGTTGATTCCTACAATAAAGA
TATCAAC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2FE78JQ 715 0 0
AAAGAACCGTAGGAAAGAAAAACACCATGGATCCGGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAG
AGGACGGTCCGATGATGAAGACAATCAAAGGCAGCGTGACTGGTTTCGCCGCTGGGACTA
TCTACGGAACCATTTTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGGAACGTGGCGC
TTCCGGGGCTCATCAGGACGCTGAAGATGATGGGAACTCACGGGCTCACTTTTGCTGCCA
TCGGAGGTGTTTACATCGGTGTTGAGCAGGTGGTTCAGAGTTATAGAGGAAAGAGAGATT
TTTTCAATGGTGCTATTGGTGGGTTTGTGGCTGGAGCTTCTGTCCTTGGCTATAGAGCAA
GGAGCATTCCCACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAGCAGTTACATCTGCTTTGATTG
ACTCTGGAGGTCAGACCACAAGAGTAGACAACGGGAGAGAATATTATCCTTACACCCCCG
TTGAGAAAACAGCTAAAGCTGATGCCTGATCTCTCTCCTTTTGGCGTCTGAAGTCAATAA
AGCTTATCCCAGCTAGGCCTCTTGAAGATTGTCTCTCTCTTTTTTTTTT*AATCTACTGT
TGTATCTGGAGATATGAAATCATAGAACTCTTGTTTACTCCTGTGTTTATGGAGATTGAC
TTTCATCTTTTGTCTGAATGTTGATTCCTACAATAAAGATATCAACTTTGTCT
TC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2EQ52JQ 728 0 0
ACGTGGAAAGACGTTCCGAGAGTGGAGAGGAACGTGGCGCTTCCGGGGCTCATCAGGACG
CTGAAGATGATGGGAACTCACGGGCTCACTTTTGCTGCCATCGGAGGTGTTTACATCGGT
GTTGAGCAGGTGGTTCAGAGTTATAGAGGAAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTATTGGT
GGGTTTGTGGCTGGAGCTTCTGTCCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATTCCCACAGCGATA
GCTGCAGGTGCAACTCTAGTAGTTACATCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACA
AGAGTAGACAACGGGAGAGAATATTATCCTTACACCCCCGTTGAGAAAACAGCTAAAGCT
GATGCCTGATCTCTCTCCTTTTGGCGTCTGAAGTCAATAAAGCTTATCCCAGCTAGGCCT
CTTGAAGATTGTCTCTCTCTTTTTTTTTT*AATCTACTGTTGTATCTGGAGATATGAAAT
CATAGAACTCTTGTTTACTCCTGTGTTTATGGAGATTGACTTTCATCTTTTGTCTGAATG
TTGATTCCTACAATAAAGATATCAACTTTGTCTTCAAAATGTTTACAGCTTTGGGTTCTA
ATTCTAAATGATATCAGACATGTACTTGCGTCTGTTACTTCTATCTGAACGAGGCTAAGC
AGTAGGAAATCTACATGTAAAAGCTCAGTTGAATACGTGGCAATAATTCATTGGCTATCT
TAAATTCC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 2 14

CO CL237Contig1 1029 9 10 U
TTTTCTGGTGAATACAAACTTTT*ATTGCTTATGGAAATAGGATACATCCAACAATAATT
TTAACAAAAAAAAAAAGTTAGAAGTACAATTGTTGTTGTTGTTTTCAACTGATGCTGAGA
AGCTGTGTTGCTGTCCAAGACTGTCCCGGCTCGAGCTTGACATCCCCAAGCTTTGCATTT
TCAACGCAGACAAAGTCTCTGTAACAAGCTTCCATCTGTACATGCGGGTTCCACAAGACA
GCATCCGACCAGTTGGTGTTTTTGATGATTATTTGATCACCCAAGCCATTATCAAAGTGC
AATTCATTAGGGGCATCAAGATAGACGCAATCCACAAA*TCCAGGAAAAGTGACTGCATC
CCTGTCTTCTTGACCCTCTATTGGGTTTTTAGG*ATCAGGATCCTTATTGAGAGTTTTAC
AACCCTTTAAA*CCTTTCACGGATGCTCCAGTAACAGAAGCGCGGAAGTAAGTATGCAAG
GCGGTGTTAAAAGAGAACGGTTTGTTGTCTGTGTTTGTAATTTT*AAGCTCGGTGGAAAG
GCAGTCC*GCGCCAACAACGACCTTGTAAAGAGCGTGGAAAGCAAAGTCCC*ACATAGAT
CGACTATAAGGACCATCCTTGAGCTCAAGAGTAACAGCAGCATTGTCAACGGCATTCTCA
GAATCAACAACAGACC*AGTCCATGTTCCTTCCAAACCCATGCTGCTGGATAACTCCAGG
TCCAAACTGAGGGAAACAA*TGTGGAATCCCTCCGCTGATGGGTTTGATCTTATTGAAGA
CAGCATCAGGTCTAACAAAAAGAAGATCTTTCCCACTCGCTACTTTCCACGATGTAACGC
ATCCTCCAAACAGATATATCTCAGCCTCGCTCTTGTCGGGAGAAGTGAGGACGAGTTTTG
GCAAATTGCCTTGTCCTTCTGTGACTCTCACACCAGTAGTAGCCATCGCACAGAATCCTC
TTCGGCTGGTTCGGAGATGATTGGGAGAATTAAAGGTGGGGAATGAGTTGGAGACGGATA
CCATCATCG


BQ
10 10 10 10 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
30 45 30 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 10 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 35 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 30 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT67JQ U 4
AF RR2DT67TF C 4
AF RR2BV88TF C 1
AF RR2BV88JQ U 5
AF RR2DY34JQ U 7
AF RR2D649JQ U 4
AF RR2CU49JQ U 7
AF RR2A858JQ U 419
AF RR2A858TF C 291
BS 1 4 RR2BV88TF
BS 5 412 RR2DT67JQ
BS 413 413 RR2D649JQ
BS 414 566 RR2DT67JQ
BS 567 708 RR2D649JQ
BS 709 709 RR2CU49JQ
BS 710 769 RR2D649JQ
BS 770 785 RR2CU49JQ
BS 786 874 RR2A858JQ
BS 875 1029 RR2A858TF

RD RR2DT67JQ 564 0 0
G
CTGGTGAATACAAACTTTT*ATTGCTTATGGAAATAGGATACATCCAACAATAATTTTAA
CAAAAAAAAAAAGTTAGAAGTACAATTGTTGTTGTTGTTTTCAACTGATGCTGAGAAGCT
GTGTTGCTGTCCAAGACTGTCCCGGCTCGAGCTTGACATCCCCAAGCTTTGCATTTTCAA
CGCAGACAAAGTCTCTGTAACAAGCTTCCATCTGTACATGCGGGTTCCACAAGACAGCAT
CCGACCAGTTGGTGTTTTTGATGATTATTTGATCACCCAAGCCATTATCAAAGTGCAATT
CATTAGGGGCATCAAGATAGACGCAATCCACAAA*TCCAGGAAAAGTGACTGCATCCCTG
TCTTCTTGACCCTCTATTGGGTTTTTAGG*ATCAGGATCCTTATTGAGGGTTTTACAACC
CTTTAAA*CCTTTCACGGATGCTCCAGTAACAGAAGCGCGGAAGTAAGTATGCAAGGCGG
TGTTAAAAGAGAACGGTTTGTTGTCTGTGTTTGTAATTTT*AAGCTCGGTGGAAAGGCAG
TCC*GCGCCAACAACGACCTTG
C

QA 2 563 2 563
DS 

RD RR2DT67TF 564 0 0
G
CTGGTGAATACAAACTTTT*ATTGCTTATGGAAATAGGATACATCCAACAATAATTTTAA
CAAAAAAAAAAAGTTAGAAGTACAATTGTTGTTGTTGTTTTCAACTGATGCTGAGAAGCT
GTGTTGCTGTCCAAGACTGTCCCGGCTCGAGCTTGACATCCCCAAGCTTTGCATTTTCAA
CGCAGACAAAGTCTCTGTAACAAGCTTCCATCTGTACATGCGGGTTCCACAAGACAGCAT
CCGACCAGTTGGTGTTTTTGATGATTATTTGATCACCCAAGCCATTATCAAAGTGCAATT
CATTAGGGGCATCAAGATAGACGCAATCCACAAA*TCCAGGAAAAGTGACTGCATCCCTG
TCTTCTTGACCCTCTATTGGGTTTTTAGG*ATCAGGATCCTTATTGAGGGTTTTACAACC
CTTTAAA*CCTTTCACGGATGCTCCAGTAACAGAAGCGCGGAAGTAAGTATGCAAGGCGG
TGTTAAAAGAGAACGGTTTGTTGTCTGTGTTTGTAATTTT*AAGCTCGGTGGAAAGGCAG
TCC*GCGCCAACAACGACCTTG
C

QA 2 563 2 563
DS 

RD RR2BV88TF 649 0 0
TTTTCTGGTGAATACAAACTTTT*ATTGCTTATGGAAATAGGATACATCCAACAATAATT
TTAACAAAAAAAAAAAGTTAGAAGTACAATTGTTGTTGTTGTTTTCAACTGATGCTGAGA
AGCTGTGCTGCTGTCCAAGACTGTCCCGGCTCGAGCTTGACATCCCCAAGCTTTGCATTT
TCAACGCAGACAAAGTCTCTGTAACAGGCTTCCATCTGTACATGCGGGTTCCACAAGACA
GCATCCGACCAGTTGGTGTTTTTGATGATTATTTGATCACCCAAGCCATTATCAAAGTGC
AATTCATTAGGGGCATCAAGATAGACGCAATCCACAAA*TCCAGGAAAAGTGACTGCATC
CCTGTCTTATTGACCCTCTATTGGGTTTTTAGG*ATCAGGATCCTTATTGAGAGTTTTAC
AACCCTTTAAA*CCTTTCACGGATGCTCCAGTAACAGAAGCGCGGAAGTAAGTATGCAAG
GCGGTGTTAAAAGAGAACGGTTTGTTGTCTGTGTTTGTAATTTT*AAGCTCGGTGGAAAG
GCAGTCC*GCGCCAACAACGACCTTGTAAAGAACGTGGAAAGCAAAGTCCC*ACATAGAT
CGACTATAAGGACCATCCTTGAGCTCAAGAGTAACAGCAGCATTGTCA
C

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2BV88JQ 645 0 0
CTGGTGAATACAAACTTTT*ATTGCTTATGGAAATAGGATACATCCAACAATAATTTTAA
CAAAAAAAAAA*GTTAAAAGTACAATTGTTGTTGTTGTTTTCAACTGATGCTGAAAAGCT
GTGCTGCTGTCCAAGACTGTCCCGGCTCGAGCTTGACATCCCCAAGCTTTGCATTTTCAA
CGCAAACAAAGTCTCTGTAACAGGCTTCCATCTGTACATGCGGGTTCCACAAGACAGCAT
CCGACCAGTTGGTGTTTTTGATGATTATTTGATCACCCAAGCCATTATCAAAGTGCAATT
CATTAGGGGCATCAAGATAGACGCAATCCACAAA*TCCAGGAAAAGTGACTGCATCCCTG
TCTTATTGACCCTCTATTGGGTTTTTAGG*ATCAGGATCCTTATTGAGAGTTTTACAACC
CTTTAAA*CCTTTCACGGATGCTCCAGTAACAGAAGCGCGGAAGTAAGTATGCAAGGCGG
TGTTAAAAGAAAACGGTTTGTTGTCTGTGTTTGTAATTTT*AAGCTCGGTGGAAAGGCAG
TCC*GCGCCAACAACGACCTTGTAAAGAACGTGGAAAGCAAAGTCCC*ACATAGATCGAC
TATAAGGACCATCCTTGAGCTCAAGAGTAACAGCAGCATTGTCA
C

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2DY34JQ 656 0 0
GGTGAATACAAACTTTT*ATTGCTTATGGAAATAGGATACATCCAACAATAATTTTAACA
AAAAAAAA**GTTAGAAGTACAATTGTTGTTGTTGTTTTCAACTGATGCTGAGAAGCTGT
GTTGCTGTCCAAGACTGTCCCGGCTCGAGCTTGACATCCCCAAGCTTTGCATTTTCAACG
CAGACAAAGTCTCTGTAACAAGCTTCCATCTGTACATGCGGGTTCCACAAGACGGCATCC
GACCAGTTGGTGTTTTTGATGATTATTTGATCACCCAAGCCATTATCAAAGTGCAATTCA
TTAGGGGCATCAAGATAGACGCAATCCACAAA*TCCAGGAAAAGTGACTGCATCCCTGTC
TTCTTGACCCTCTATTGGGTTTTTAGG*ATCAGGATCCTTATTGAGAGTTTTACAACCCT
TTAAA*CCTTTCACGGATGCTCCAGTAACAGAAGCGCGGAAGTAAGTATGCAAGGCGGTG
TTAAAAGAGAACGGTTTGTTGTCTGTGTTTGTAATTTT*AAGCTCGGTGGAAAGGCAGTC
C*GCGCCAACAACGACCTTGTAAAGAGCGTGGAAAGCAAAGTCCC*ACATAGATCGACTA
TAAGGACCATCCTTGAGCTCAAGAGTAACAGCAGCATTGTCAACGGCATTCTCAGA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2D649JQ 766 0 0
G
CTGGTGAATACAAACTTTT*ATTGCTTATGGAAATAGGATACATCCAACAATAATTTTAA
CAAAAAAAAAA*GTTAGAAGTACAATTGTTGTTGTTGTTTTCAACTGATGCTGAGAAGCT
GTGTTGCTGTCCAAGACTGTCCCGGCTCGAGCTTGACATCCCCAAGCTTTGCATTTTCAA
CGCAGACAAAGTCTCTGTAACAAGCTTCCATCTGTACATGCGGGTTCCACAAGACAGCAT
CCGACCAGTCGGTGTTTTTGATGATTATTTGATCACCCAAGCCATTATCAAAGTGCAATT
CATTAGGGGCATCAAGATAGACGCAATCCACAAA*TCCAGGAAAAGTGACTGCATCCCTG
TCTTCTTGACCCTCTATTGGGTTTTTAGG*ATCAGGATCCTTATTGAGAGTTTTACAACC
CTTTAAA*CCTTTCACGGATGCTCCAGTAACAGAAGCGCGGAAGTAAGTATGCAAGGCGG
TGTTAAAAGAGAACGGTTTGTTGTCTGTGTTTGTAATTTT*AAGCTCGGTGGAAAGGCAG
TCC*GCGCCAACAACGACCTTGTAAAGAGCGTGGAAAGCAAAGTCCC*ACATAGATCGAC
TATAAGGACCATCCTTGAGCTCAAGAGTAACAGCAGCATTGTCAACGGCATTCTCAGAAT
CAACAACAGACC*AGTCCATGTTCCTTCCAAACCCATGCTGCTGAATAACTCCAGGTCCA
AACTGAGGGAAACAA*TGTGGAATCCCTCCGCTGATGGGTTTGAT

QA 2 766 2 766
DS 

RD RR2CU49JQ 779 0 0
GGTGAATACAAACTTTTTATTGCTTATGGAAATGGGATACATCCAACAATAATATAACAA
GAAAAAAAAAGTTAGAAGTACAATTGTTGTTGTTGTTTTCAACTGATGCTGAGAAGCTGT
GCTGCTGTCCAAGACTGTCCCGGCTCGAGCTTGATATCCCCAAGCTTTGCATTTTCAACG
CAGACGAAGTCTCTGTAACAAGCTTCCATTTGAACATGCGGGTTCCACAAGACAGCATCC
GACCAGTTGGTGTTTTTGATGATTATTTGATCACCCAAGCCATTATCAAAGTGCAATTCG
TTAGGGGCATCAAGATAGACGCAATCCACAAA*TCCAGGAAAAGTGACTGCATCCCTGTC
TTCTTGACCCTCAATTGGGTTTTTAGG*ATCAGGATCCTTATTGAGAGTTT*ACAACCCT
TTAAA*CCTTTCACGGATGCTCCAGTCACAGAAGCACGGAAGTAAGTATGCAAGGCGGTG
TTAAAAGAGAATGGTTTGTTGTCTGTGTTTGTAATTTT*AAGCTCGGTGGAAAGGCAGTC
C*GCGCCAACAACGACCTTGTAAAGAGCGTGGAAAGCAAAGTCCC*ACATGGATCGACTA
TAAGGACCATTCTTGAGTTCAAGAGTAACAGCAGCATTGTCAACGGCATTCTCAGAATCA
ACAACAGACC*AGTCCATGTTCCTTCCAAACCCATGCTGCTGGATAACTCCAGGTCCAAA
CTGAGGGAAACAA*TGTGGAATCCCTCCGCTGATGGGTTTGATCTTATTGAAGACAGCA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2A858JQ 456 0 0
ACAACCCTTTAAA*CCTTTCACGGATGCTCCAGTCACAGAAGCACGGAAGTAAGTATGCA
AGGCGGTGTTAAAAGAGAATGGTTTGTTGTCTGTGTTTGTAATTTTTAAGCTCGGTGGAA
AGGCAGTCCCGCGCCAACAACGACCTTGTAAAGAGCGTGGAAAGCAAAGTCCCCACATGG
ATCGACTATAAGGACCAACCTTGAGTTCAAGAGTAACAGCAGCATTGTCAACGGCATTCT
CAGAATCAACAACAGACC*AGTCCATGTTCCTTCCAAACCCATGCTGCTGGATAACTCCA
GGTCCAAACTGAGGGAAACAA*TGTGGAATCCCTCCGCTGATGGGTTTGATCTTATTGAA
GACAGCATCAGGTCTAACAAAAAGAAGATCTTTCCCACTCGCTACTTTCCACGATGTAAC
GCATCCTCCAAACAGATATATCTCAGCCTCGCTCTT

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR2A858TF 739 0 0
ATCAAAGTGCAATTCGTTAGGGGCATCAAGATAGACGCAATCCACAAAATCCAGGAAAAG
TGACTGCATCCCTGTCTTCTTGACCCTCAATTGGGTTTTTAGGGATCAGGATCCTTATTG
AGAGTTTTACAACCCTTTAAAACCTTTCACGGATGCTCCAGTCACAGAAGCACGGAAGTA
AGTATGCAAGGCGGTGTTAAAAGAGAATGGTTTGTTGTCTGTGTTTGTAATTTT*AAGCT
CGGTGGAAAGGCAGTCC*GCGCCAACAACGACCTTGTAAAGAGCGTGGAAAGCAAAGTCC
C*ACATGGATCGACTATAAGGACCAACCTTGAGTTCAAGAGTAACAGCAGCATTGTCAAC
GGCATTCTCAGAATCAACAACAGACCCAGTCCATGTTCCTTCCAAACCCATGCTGCTGGA
TAACTCCAGGTCCAAACTGAGGGAAACAAATGTGGAATCCCTCCGCTGATGGGTTTGATC
TTATTGAAGACAGCATCAGGTCTAACAAAAAGAAGATCTTTCCCACTCGCTACTTTCCAC
GATGTAACGCATCCTCCAAACAGATATATCTCAGCCTCGCTCTTGTCGGGAGAAGTGAGG
ACGAGTTTTGGCAAATTGCCTTGTCCTTCTGTGACTCTCACACCAGTAGTAGCCATCGCA
CAGAATCCTCTTCGGCTGGTTCGGAGATGATTGGGAGAATTAAAGGTGGGGAATGAGTTG
GAGACGGATACCATCATCG

QA 1 739 1 739
DS 



CO CL237Contig2 696 5 10 U
GGAAATAATACTTCATCGACTCAATCTAGATAGAGAGAGTGAGTGAAGGAGAGAAAGATG
GCGATGATGGTATCCGTCTCCAACTCATTCCCCACCTTTAATTCTCCCAATCATCTCCGA
ACCAGCCGAAGAAGAGGATTCTGTGCGATGGCTACTACTGGTGTGAGAGTCACAGAAGGA
CAAGGCAATTTGCCAAAACTCGTCCTCACTTCTCCCGACAAGAGCGAGGCAGAGATATAT
CTGTTTGGAGGATGCGTTACATCGTGGAAAGTAGCGAGTGGGAAAGATCTTCTTTTTGTT
AGACCTGATGCTGTCTTCAATAAGATCAAACCCATCAGCGGAGGGATTCCACATTGTTTC
CCTCAGTTTGGACCTGGAGTTATCCAGCAGCATGGGTTTGGAAGGAACATGGACTGGTCT
GTTGTTGATTCTGAGAATGCCGTTGACAATGCTGCTGTTACTCTTGAACTCAAGGATGGT
CCTTATAGTCGATCCATGTGGGACTTTGCTTTCCACGCTCTTTACAAGGTCGTTGTTGGC
GCGGACTGCCTTTCCACCGAGCTTAAAATTACAAACACAGACAACAAACCATTCTCTTTT
AACACCGCCTTGCATACTTACTTCCGCGCTTCTGTGACTGGAGCATCCGTGAAAGGTTTA
AAGGGTTGTAAAACTCTCAATAAGGATCCTGATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY34TF U 60
AF RR2CU49TF U 1
AF RR2D517TF U 5
AF RR2B264TF U 5
AF RR2AE70TF U 41
BS 1 132 RR2CU49TF
BS 133 135 RR2B264TF
BS 136 230 RR2CU49TF
BS 231 231 RR2B264TF
BS 232 474 RR2CU49TF
BS 475 475 RR2D517TF
BS 476 626 RR2CU49TF
BS 627 627 RR2B264TF
BS 628 652 RR2CU49TF
BS 653 696 RR2B264TF

RD RR2DY34TF 286 0 0
GTG
GATGATGGTATCAGTCTCCAACTCATTTCTCACCTTTAATTCTCCTAATCATCTCCGAAC
CAGCCGAAGAAGAGGATTCTATGCGATGGCTACTACTGGTGTGAGAGTCACAGAAGGTGA
AGGCAGTTTGCCAAAACTCGTCCTCACTTCTCCCGACAAGAGCGAGGCAGAGATATATCT
GTTTGGAGGATGCGTAACATCGTGGAAAGTAGCGAGTGGGAAAGATCTTCTTTTTGTTAG
ACCTGATGCTGTCTTCAATAAGATCAAACTCATCAGCGGAGGG

QA 4 286 4 286
DS 

RD RR2CU49TF 652 0 0
GGAAATAATACTTCATCGACTCAATCTAGATAGAGAGAGTGAGTGAAGGAGAGAAAGATG
GCGATGATGGTATCCGTCTCCAACTCATTCCCCACCTTTAATTCTCCCAATCATCTCCGA
ACCAGCCGAAGA***GGATTCTGTGCGATGGCTACTACTGGTGTGAGAGTCACAGAAGGA
CAAGGCAATTTGCCAAAACTCGTCCTCACTTCTCCCGACAAGAGCGAGGCGGAGATATAT
CTGTTTGGAGGATGCGTTACATCGTGGAAAGTAGCGAGTGGGAAAGATCTTCTTTTTGTT
AGACCTGATGCTGTCTTCAATAAGATCAAACCCATCAGCGGAGGGATTCCACATTGTTTC
CCTCAGTTTGGACCTGGAGTTATCCAGCAGCATGGGTTTGGAAGGAACATGGACTGGTCT
GTTGTTGATTCTGAGAATGCCGTTGACAATGCTGCTGTTACTCTTGAACTCAAGAATGGT
CCTTATAGTCGATCCATGTGGGACTTTGCTTTCCACGCTCTTTACAAGGTCGTTGTTGGC
GCGGACTGCCTTTCCACCGAGCTTAAAATTACAAACACAGACAACAAACCATTCTCTTTT
AACACCGCCTTGCATACTTACTTCCGTGCTTCTGTGACTGGAGCATCCGTGA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2D517TF 647 0 0
GG
AATACTTCATCGACTCAATCTAGATAGAGAGAGTGAGTGAAGGAGAGAAAGATGGCGATG
ATGGTATCCGTCTCCAACTCATTCCCCACCTTTAATTCTCCCAATCATCTCCGAACCAGC
CGAAGA***GGATTCTGTGCGATGGCTACTACTGGTGTGAGAGTCACAGAAGGACAAGGC
AATTTGCCAAAACTCGTCCTCACTTCTCCCGACAAGAGCGAGGCGGAGATATATCTGTTT
GGAGGATGCGTTACATCGTGGAAAGTAGCGAGTGGGAAAGATCTTCTTTTTGTTAGACCT
GATGCTGTCTTCAATAAGATCAAACCCATCAGCGGAGGGATTCCACATTGTTTCCCTCAG
TTTGGACCTGGAGTTATCCAGCAGCATGGGTTTGGAAGGAACATGGACTGGTCTGTTGTT
GATTCTGAGAATGCCGTTGACAATGCTGCTGTTACTCTTGAACTCAAGGATGGTCCTTAT
AGTCGATCCATGTGGGACTTTGCTTTCCACGCTCTTTACAAGGTCGTTGTTGGCGCGGAC
TGCCTTTCCACCGAGCTTAAAATTACAAACACAGACAACAAACCATTCTCTTTTAACACC
GCCTTGCATACTTACTTCCGTGCTTCTGTGACTGGAGCATCCGTG

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR2B264TF 692 0 0
GG
AATACTTCATCGACTCAATCTAGATAGAGAGAGTGAGTGAAGGAGAGAAAGATGGCGATG
ATGGTATCCGTCTCCAACTCATTCCCCACCTTTAATTCTCCCAATCATCTCCGAACCAGC
CGAAGAAGAGGATTCTGTGCGATGGCTACTACTGGTGTGAGAGTCACAGAAGGACAAGGC
AATTTGCCAAAACTCGTCCTCACTTCTCCCGACAAGAGCGAGGCAGAGATATATCTGTTT
GGAGGATGCGTTACATCGTGGAAAGTAGCGAGTGGGAAAGATCTTCTTTTTGTTAGACCT
GATGCTGTTTTCAATAAGATCAAGCCCATCAGCGGAGGGATTCCACATTGCTTCCCCCAG
TTTGGACCTGGAGTTATTCAGCAGCATGGATTTGGAAGGAACATGGACTGGTCTGTTGTG
GATTCTGAGAATGCCGTCGACAATGCTGCTGTGACTCTTGAGCTCAAGGATGGTCCTTAT
AGTCGATCCATGTGGGACTTTGCTTTCCACGCTCTTTACAAGGTCGTTGTTGGCGCGGAC
AGGCTTTCCACCGAGCTTAAAATTACAAACACAGACAGCAAACCGTTCTCTTTTAACACC
GCCTTGCATACTTACTTCCGCGCTTCTGTAACTGGAGCATCCGTGAAAGGTTTAAAGGGT
TGTAAAACTCTCAATAAGGATCCTGATCCT

QA 3 692 3 692
DS 

RD RR2AE70TF 641 0 0
GG
GTGAAGGAGAGAAAGATGGCGATGATGGTATCAGTCTCCAACTCATTTCTCACCTTTAAT
TCTCCTAATCATCTCCGAACCAGCCGAAGAAGAGGATTCTGTGCGATGGCTACTACTGGT
GTGAGAGTCACAGAAGGTGAAGGCAGTTTGCCAAAACTCGTCCTCACTTCTCCCGACAAG
AGCGAGGCAGAGATATATCTGTTTGGAGGATGCGTAACATCGTGGAAAGTAGCGAGTGGG
AAAGATCTTCTTTTTGTTAGACCTGATGCTGTCTTCAATAAGATCAAACCCATCAGCGGA
GGGATTCCACATTGTTTCCCTCAGTTTGGACCTGGAGTTATTCAGCAGCATGGGTTTGGA
AGGAACATGGACTGGTCTGTTGTTGATTCTGAGAATGCCGTTGACAATGCTGCTGTTACT
CTTGAGCTCAAGGATGGTCCTTATAGTCGATCTATGTGGGACTTTGCTTTCCACGCTCTT
TACAAGGTCGTTGTTGGCGCGGACTGCCTTTCCACCGAGCTTAAAATTACAAACACAGAC
AACAAACCGTTCTCTTTTAACACCGCCTTGCATACTTACTTCCGCGCTTCTGTTACTGGA
GCATCCGTGAAAGGTTTAAAGGGTTGTAAAACTCTCAAT

QA 3 641 3 641
DS 



AS 1 14

CO CL238Contig1 1919 14 25 U
GGGTACTTGCATTTGCTGAAGAATTTAGTAAGCAAGCTAGTATGAATTTCTCATCTTACC
GCGCCGGTGCTCAACCGTTGTTGGAACGCAATGTTGTGAGCGAGCCCCCCACAGGAGTTG
TATCCCGAAGAGTTGATGGCGATGACTTGATTGAAAGTTATATCGACCGGACTCGTACGG
ATGAATCTACGAATGTGGGTAGGTTTTTGGGCGATGTAGCACTTCGACGTTTAAAGTCGG
AGTTTGACACC*TCTAATGGTGATTTCCAGAAGTTGAATGTTGGTTTCCACATGACTCCT
GAAGAAAAGAATGCCCTGAAGACGAATTTTCCAGGGTTGGAGATAACGTTCAAAGATTCC
CAATTTTCCTCACACAGCTTTGCTGCGGCGCATAGAGTGTGTGAGACGAAGGAGATATAT
AATCGGTTTCAAACAAAAACCGAACTGATCATAGATTTGGGTGGTAATTATGTCACTCAT
TCTAAGGAAGCGAGACACAACGTTCATTCGTGTTGTCCGATTTTGGACGTTCGTGATGCC
GCTAGACATACCGATCGGTATATATCTTTAGCCGGTGCCGTTGAAAGGAATCACCGTGAT
TTACCAGTGAATTTCTGTTGCCATAAGTTTGAAGACTGTCAAGTGAAGGCTCCTTTCGCT
ATGGCAGTTCATTCCGTGTCAGATCTTCCTATATCCACTCTCGCCGCGCATTGTATGCGA
CGTGGTGTTAGGAAGATGATTGCATCTGTCATGATGGATCCACTTATGATGATTTATGAC
TCGGGCCATATTCCCTTGCTCAATGTGAATTGGGAGAAGGAAGAGGTGGAAGTTGAAGAT
GACGCGACTAAAGAGAAGAATTTCCTCTCTAGATTCGTCACAAGGAAGAAGAAAAAGACC
TTAATCCACTTCCACTTTGTTGATGCACCAGGATTGAGTTATACCCATGATTTTTCCGTC
TTGAGTCAATATATGACGACCAATCAGGTAATAGTCAATGATCAATACGCATATCGCGTT
GAGAGGACGACTAATTTGTCTGGGGTCTATTTAGTTGAACTTACCTTGGCGATGACTGAT
GGGATGAATTCATTCCATTTGAGACCTATGCGTGATGTTTCTTGCGCTTGGTTGACGACG
TTGAGAAAGAAAGTATTTGTTAAACTGGCTATACCAGTAACAATGCACGATTTGTATGAG
ACTCCATTTGAAATAAAATGGGCTGTCATGGATGAATCATTAGTTCGCTATGTTTCCGAG
GCTGCGTTTAGACAGTACTCGAAGACGAAGGATGCTGAAGTTTTGGTTCAGTACATAGCA
ACGATGTTATCATCTTCATCAAATCACGTCGTTATTAATGGGATAACAATGAGGAGTGGT
AGCCCTATTGCGTTGGAAGAATACGTGCCTTTGGCTGTCACTTTTTATGCATTAACGCGT
TTCAGATTTCAGATGATTTCTGGTGGTCTCGAAGCTTTGAAAACATCCGTCCCCGAAGCC
AGTAGGTGTATTGGTGATAAAGGGGAACTGGAAGGGCATTACGCCGGTCCATCTTTGTTG
GAACGAGTCGGACTCCATGTTTTTAAAGGTAAGGAGATCACTAAGACCAGGGATAACACT
TATCTGGTTCAAAGTAGAAATACTTTTAAAGAAATCGTTAATGAAGTCATGCGTACCTTC
GGCCTTAAGTTGGTCGGAGAAGCCGACGAGTATATTGATTCTGCCCCGAGTCATTATAAA
GCTGTTACCGTCTGGAGAGCCTTTGTGAAAAATTCTGGATTACCGATCGACATCAACGTT
GAACGTTGTGTTAACGACATGATGACCAAGCATCAAGAGTCTATAGCACAGTTGGTGGAG
GATGAGGAAAAGAAGGAATTCAAAGATGCAGGGATAAGCCCTGATGACATCGCAAAGTG


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 40 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A437TF U 1
AF RR2BF53TF U 1
AF RR2FZ76TF U 2
AF RR2FJ85TF U 1
AF RR2BF53JQ C 82
AF RR2FJ85JQ C 172
AF RR2GP39JQ C 218
AF RR2GP39TF U 218
AF RR2A437JQ C 281
AF RR2BK11TF U 670
AF RR2ET33TF U 817
AF RR2BK11JQ C 1072
AF RR2FZ76JQ C 1072
AF RR2GW82TF U 1780
BS 1 8 RR2A437TF
BS 9 9 RR2BF53TF
BS 10 32 RR2A437TF
BS 33 33 RR2BF53TF
BS 34 139 RR2A437TF
BS 140 140 RR2BF53TF
BS 141 586 RR2A437TF
BS 587 587 RR2BF53TF
BS 588 769 RR2A437TF
BS 770 808 RR2BF53TF
BS 809 821 RR2GP39TF
BS 822 822 RR2BK11TF
BS 823 885 RR2GP39TF
BS 886 1373 RR2BK11TF
BS 1374 1374 RR2ET33TF
BS 1375 1391 RR2BK11TF
BS 1392 1482 RR2ET33TF
BS 1483 1483 RR2BK11JQ
BS 1484 1505 RR2ET33TF
BS 1506 1506 RR2BK11JQ
BS 1507 1524 RR2ET33TF
BS 1525 1525 RR2BK11JQ
BS 1526 1534 RR2ET33TF
BS 1535 1781 RR2BK11JQ
BS 1782 1919 RR2GW82TF

RD RR2A437TF 769 0 0
GGGTACTTTCATTTGCTGAAGAATTTAGTAAGTAAGCTAGTATGAATTTCTCATCTTACC
GCGCCGGTGCTCAACCGTTGTTGGAACGCAATGTTGTGAGCGAGCCCCCCACAGGAGTTG
TATCCCGAAGAGTTGATGGTGATGACTTGATTGAAAGTTATATCGACCGGACTCGTACGG
ATGAATCTACGAATGTGGGTAGGTTTTTGGGCGATGTAGCACTTCGACGTTTAAAGTCGG
AGTTTGACACC*TCTAATGGTGATTTCCAGAAGTTGAATGTTGGTTTCCACATGACTCCT
GAAGAAAAGAATGCCCTGAAGACGAATTTTCCAGGGTTGGAGATAACGTTCAAAGATTCC
CAATTTTCCTCACACAGCTTTGCTGCGGCGCATAGAGTGTGTGAGACGAAGGAGATATAT
AATCGGTTTCAAACAAAAACCGAACTGATCATAGATTTGGGTGGTAATTATGTCACTCAT
TCTAAGGAAGCGAGACACAACGTTCATTCGTGTTGTCCGATTTTGGACGTTCGTGATGCC
GCTAGACATACCGATCGGTATATATCTTTAGCCGGTGCCGTTGAAATGAATCACCGTGAT
TTACCAGTGAATTTCTGTTGCCATAAGTTTGAAGACTGTCAAGTGAAGGCTCCTTTCGCT
ATGGCAGTTCATTCCGTGTCAGATCTTCCTATATCCACTCTCGCCGCGCATTGTATGCGA
CGTGGTGTTAGGAAGATGATTGCATCTGTCATGATGGATCCACTTATGA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2BF53TF 810 0 0
G
GGTACTTGCATTTGCTGAAGAATTTAGTAAGCAAGCTAGTATGAATTTCTCATCTTACCG
CGCCGGTGCTCAACCGTTGTTGGAACGCAATGTTGTGAGCGAGCCCCCCACAGGAGTTGT
ATCCCGAAGAGTTGATGGCGATGACTTGATTGAAAGTTATATCGACCGGACTCGTACGGA
TGAATCTACGAATGTGGGTAGGTTTTTGGGCGATGTAGCACTTCGACGTTTAAAGTCGGA
GTTTGACACC*TCTAATGGTGATTTCCAGAAGTTGAATGTTGGTTTCCACATGACTCCTG
AAGAAAAGAATGCCCTGAAGACGAATTTTCCAGGGTTGGAGATAACGTTCAAAGATTCCC
AATTTTCCTCACACAGCTTTGCTGCGGCGCATAGAGTGTGTGAGACGAAGGAGATATATA
ATCGGTTTCAAACAAAAACCGAACTGATCATAGATTTGGGTGGTAATTATGCCACTCATT
CTAAGGAAGCGAGACACAACGTTCATTCGTGTTGTCCGATTTTGGACGTTCGTGATGCCG
CTAGACATACCGATCGGTATATATCTTTAGCCGGTGCCGTTGAAAGGAATCACCGTGATT
TACCAGTGAATTTCTGTTGCCATAAGTTTGAAGACTGTCAAGTGAAAGCTCCTTTCGCTA
TGGCAGTTCATTCCGTGTCAGATCTTCCTATATCCACTCTCGCCGCGCATTGTATGCGAC
GTGGTGTTAGGAAGATGATTGCATCTGTCATGATGGATCCACTTATGATGATTTATGACT
CGGGCCATATTCCCTTGCTCAATGTGA
TT

QA 2 808 2 808
DS 

RD RR2FZ76TF 785 0 0
GGTACTTGCATTTGCTGAAGAATTTAGTAAGCAAGCTAGTATGAATTTCTCATCTTACCG
CGCCGGTGCTCAACCGTTGTTGGAACGCAATGTTGTGAGCGAGCCCCCCACAGGAGTTGT
ATCCCGAAGAGTTGATGGTGATGACTTGATTGAAAGTTATATCGACCGGACTCGTACGGA
TGAATCTACGAATGTGGGTAGGTTTTTGGGCGATGTAGCACTTCGACGTTTAAAGTCGGA
GTTTGACACC*TCTAATGGTGATTTCCAGAAGTTGAATGTTGGTTTCCACATGACTCCTG
AAGAAAAGAATGCCCTGAAGACGAATTTTCCAGGGTTGGAGATAACGTTCAAAGATTCCC
AATTTTCCTCACACAGCTTTGCTGCGGCGCATAGAGTGTGTGAGACGAAGGAGATATATA
ATCGGTTTCAAACAAAAACCGAACTGATCATAGATTTGGGTGGTAATTATGTCACTCATT
CTAAGGAAGCGAGACACAACGTTCATTCGTGTTGTCCGATTTTGGACGTTCGTGATGCCG
CTAGACATACCGATCGGTATATATCTTTAGCCGGTGCCGTTGAAAGGAATCACCGTGATT
TACCAGTGAATTTCTGTTGCCATAAGTTTGAAGACTGTCAAGCGAAAGCTCCTTTCGCTA
TGGCAGTTCATTCCGTGTCAGATCTTCCTATATCCACTCTCGCCGCGCAT*GTATGCGAC
GTGGTGTTAGGA*GATGATTGCATCTGTCATGATGGATCCACTTATGATGATTTATGACT
CGGGC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2FJ85TF 782 0 0
G
GGTACTTTCATTTGCTGAAGAATTTAGTAAGTAAGCTAGTATGAATTTCTCATCTTACCG
CGCCGGTGCTCAACCGTTGTTGGAACGCAATGTTGTGAGCGAGCCCCCCACAGGAGTTGT
ATCCCGAAGAGTTGATGGTGATGACTTGATTGAAAGTTATATCGACCGGACTCGTACGGA
TGAATCTACGAATGTGGGTAGGTTTTTGGGCGATGTAGCACTTCGACGTTTAAAGTCGGA
GTTTGACACC*TCTAATGGTGATTTCCAGAAGTTGAATGTTGGTTTCCACATGACTCCTG
AAGAAAAGAATGCCCTGAAGACGAATTTTCCAGGGTTGGAGATAACGTTCAAAGATTCCC
AATTTTCCTCACACAGCTTTGCTGCGGCGCATAGAGTGTGTGAGACGAAGGAGATATATA
ATCGGTTTCAAACAAAAACCGAACTGATCATAGATTTGGGTGGTAATTATGTCACTCATT
CTAAGGAAGCGAGACACAACGTTCATTCGTGTTGTCCGATTTTGGACGTTCGTGATGCCG
CTAGACATACCGATCGGTATATATCTTTAGCCGGTGCCGTTGAAATGAATCACCGTGATT
TACCAGTGAATTTCTGTTGCCATAAGTTTGAAGACTGTCAAGTGAAGGCTCCTTTCGCTA
TGGCAGTTCATTCCGTGTCAGATCTTCCTATATCCACTCTCGCCGCGCATTGTATGCGAC
GTGGTGTTAGGAAGATGATTGCATCTGTCATGATGGATCCACTTATGATGATTTATGACT
C

QA 2 782 2 782
DS 

RD RR2BF53JQ 804 0 0
TGGAACGCAATGTTGTGAGCGAGCCCCCCACAGGAGTTGTATCCCGAAGAGTTGATGGCG
ATGACTTGATTGAAAGTTATATCGACCGGACTCGTACGGATGAATCTACGAATGTGGGTA
GGTTTTTGGGCGATGTAGCACTTCGACGTTTAAAGTCGGAGTTTGACACC*TCTAATGGT
GATTTCCAGAAGTTGAATGTTGGTTTCCACATGACTCCTGAAGAAAAGAATGCCCTGAAG
ACGAATTTTCCAGGGTTGGAGATAACGTTCAAAGATTCCCAATTTTCCTCACACAGCTTT
GCTGCGGCGCATAGAGTGTGTGAGACGAAGGAGATATATAATCGGTTTCAAACAAAAACC
GAACTGATCATAGATTTGGGTGGTAATTATGCCACTCATTCTAAGGAAGCGAGACACAAC
GTTCATTCGTGTTGTCCGATTTTGGACGTTCGTGATGCCGCTAGACATACCGATCGGTAT
ATATCTTTAGCCGGTGCCGTTGAAAGGAATCACCGTGATTTACCAGTGAATTTCTGTTGC
CATAAGTTTGAAGACTGTCAAGTGAAGGCTCCTTTCGCTATGGCAGTTCATTCCGTGTCA
GATCTTCCTATATCCACTCTCGCCGCGCATTGTATGCGACGTGGTGTTAGGAAGATGATT
GCATCTGTCATGATGGATCCACTTATGATGATTTATGACTCGGGCCATATTCCCTTGCTC
AATGTGAATTGGGAGAAGGAAGAGGTGGAAGTTGAAGATGACGCGACTAAAGAGAAGAAT
TTCCCCTCTAGATTCGTCACAAGG

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2FJ85JQ 714 0 0
CTCGTACGGATGAATCTACGAATGTGGGTAGGTTTTTGGGCGATGTAGCACTTCGACGTT
TAAAGTCGGAGTTTGACACC*TCTAATGGTGATTTCCAGAAGTTGAATGTTGGTTTCCAC
ATGACTCCTGAAGAAAAGAATGCCCTGAAGACGAATTTTCCAGGGTTGGAGATAACGTTC
AAAGATTCCCAATTTTCCTCACACAGCTTTGCTGCGGCGCATAGAGTGTGTGAGACGAAG
GAGATATATAATCGGTTTCAAACAAAAACCGAACTGATCATAGATTTGGGTGGTAATTAT
GTCACTCATTCTAAGGAAGCGAGACACAACGTTCATTCGTGTTGTCCGATTTTGGACGTT
CGTGATGCCGCTAGACATACCGATCGGTATATATCTTTAGCCGGTGCCGTTGAAATGAAT
CACCGTGATTTACCAGTGAATTTCTGTTGCCATAAGTTTGAAGACTGTCAAGTGAAGGCT
CCTTTCGCTATGGCAGTTCATTCCGTGTCAGATCTTCCTATATCCACTCTCGCCGCGCAT
TGTATGCGACGTGGTGTTAGGAAGATGATTGCATCTGTCATGATGGATCCACTTATGATG
ATTTATGACTCGGGCCATATTCCCTTGCTCAATGTGAATTGGGAGAAGGAAGAGGTGGAA
GTTGAAGATGACGCGACTAAAGAGAAGAATTTCCTCTCTAGATTCGTCACAAGG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2GP39JQ 668 0 0
G
GCACTTCGACGTTTAAAGTCGGAGTTTGACACCCTCTAATGGTGATTTCCAGAAGTTGAA
TGTTGGTTTCCACATGACTCCTGAAGAAAAGAATGCCCTGAAGACGAATTTTCCAGGGTT
GGAGATAACGTTCAAAGATTCCCAATTTTCCTCACACAGCTTTGCTGCGGCGCATAGAGT
GTGTGAGACGAAGGAGATATATAATCGGTTTCAAACAAAAACCGAACTGATCATAGATTT
GGGTGGTAATTATGTCACTCATTCTAAGGAAGCGAGACACAACGTTCATTCGTGTTGTCC
GATTTTGGACGTTCGTGATGCCGCTAGACATACCGATCGGTATATATCTTTAGCCGGTGC
CGTTGAAAGGAATCACCGTGATTTACCAGTGAATTTCTGTTGCCATAAGTTTGAAGACTG
TTAAGTGAAGGCTCCTTTCGCTATGGCAGTTCATTCCGTGTCAGATCTTCCTATATCCAC
TCTCGCCGC**ATTGTATGCGACGTGGTGTTAGGAAGATGATTGCATCTGTCATGATGGA
TCCACTTATGATGATTTATGACTCGGGCCATATTCCCTTGCTCAATGTGAATTGGGAGAA
GGAAGAGGTGGAAGTTGAAGATGACGCGACTAAAGAGAAGAATTTCCTCTCTAGATTCGT
CACAAGG

QA 2 668 2 668
DS 

RD RR2GP39TF 668 0 0
G
GCACTTCGACGTTTAAAGTCGGAGTTTGACACC*TCTAATGGTGATTTCCAGAAGTTGAA
TGTTGGTTTCCACATGACTCCTGAAGAAAAGAATGCCCTGAAGACGAATTTTCCAGGGTT
GGAGATAACGTTCAAAGATTCCCAATTTTCCTCACACAGCTTTGCTGCGGCGCATAGAGT
GTGTGAGACGAAGGAGATATATAATCGGTTTCAAACAAAAACCGAACTGATCATAGATTT
GGGTGGTAATTATGTCACTCATTCTAAGGAAGCGAGACACAACGTTCATTCGTGTTGTCC
GATTTTGGACGTTCGTGATGCCGCTAGACATACCGATCGGTATATATCTTTAGCCGGTGC
CGTTGAAAGGAATCACCGTGATTTACCAGTGAATTTCTGTTGCCATAAGTTTGAAGACTG
TTAAGTGAAGGCTCCTTTCGCTATGGCAGTTCATTCCGTGTCAGATCTTCCTATATCCAC
TCTCGCCGC**ATTGTATGCGACGTGGTGTTAGGAAGATGATTGCATCTGTCATGATGGA
TCCACTTATGATGATTTATGACTCGGGCCATATTCCCTTGCTCAATGTGAATTGGGAGAA
GGA*GAGGTGGAAGTTGAAGATGACGCGACTAAAGAGAAGAATTTCCTCTCTAGATTCGT
CACAAGG

QA 2 668 2 668
DS 

RD RR2A437JQ 605 0 0
TTGGTTTCCACATGACTCCTGAAGAAAAGAATGCCCTGAAGACGAATTTTCCAGGGTTGG
AGATAACGTTCAAAGATTCCCAATTTTCCTCACACAGCTTTGCTGCGGCGCATAGAGTGT
GTGAGACGAAGGAGATATATAATCGGTTTCAAACAAAAACCGAACTGATCATAGATTTGG
GTGGTAATTATGTCACTCATTCTAAGGAAGCGAGACACAACGTTCATTCGTGTTGTCCGA
TTTTGGACGTTCGTGATGCCGCTAGACATACCGATCGGTATATATCTTTAGCCGGTGCCG
TTGAAATGAATCACCGTGATTTACCAGTGAATTTCTGTTGCCATAAGTTTGAAGACTGTC
AAGTGAAGGCTCCTTTCGCTATGGCAGTTCATTCCGTGTCAGATCTTCCTATATCCACTC
TCGCCGCGCATTGTATGCGACGTGGTGTTAGGAAGATGATTGCATCTGTCATGATGGATC
CACTTATGATGATTTATGACTCGGGCCATATTCCCTTGCTCAATGTGAATTGGGAGAAGG
AAGAGGTGGAAGTTGAAGATGACGCGACTAAAGAGAAGAATTTCCTCTCTAGATTCGTCA
CAAGG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2BK11TF 722 0 0
G
ATTCCGTGTCAGATCTTCCTATATCCACTCTCGCCGCGCATTGTATGCGACGTGGTGTTA
GGAAGATGATTGCATCTGTCATGATGGATCCACTTATGATGATTTATGACTCGGGCCATA
TTCCCTTGCTCAATGTGAATTGGGAGAAGGAAGAGGTGGAAGTTGAAGATGACGCGACTA
AAGAGAAGAATTTCCTCTCTAGATTCGTCACAAGGAAGAAGAAAAAGACCTTAATCCACT
TCCACTTTGTTGATGCACCAGGATTGAGTTATACCCATGATTTTTCCGTCTTGAGTCAAT
ATATGACGACCAATCAGGTAATAGTCAATGATCAATACGCATATCGCGTTGAGAGGACGA
CTAATTTGTCTGGGGTCTATTTAGTTGAACTTACCTTGGCGATGACTGATGGGATGAATT
CATTCCATTTGAGACCTATGCGTGATGTTTCTTGCGCTTGGTTGACGACGTTGAGAAAGA
AAGTATTTGTTAAACTGGCTATACCAGTAACAATGCACGATTTGTATGAGACTCCATTTG
AAATAAAATGGGCTGTCATGGATGAATCATTAGTTCGCTATGTTTCCGAGGCTGCGTTTA
GACAGTACTCGAAGACGAAGGATGCTGAAGTTTTGGTTCAGTACATAGCAACGATGTTAT
CATCTTCATCAAATCACGTCGTTATTAATGGGATAACAATGAG*AGTGGTAGCCCTATTG
C

QA 2 722 2 722
DS 

RD RR2ET33TF 724 0 0
G
AGGAAGAGGTGGAAGTTGAAGATGACGCGACTAAAGAGAAGAATTTCCTCTCTAGATCCG
TCACAAGGAAGAAGAAAAAGACCTTAATCCACTTCCACTTTGTTGATGCACCAGGATTGA
GTTATACCCATGATTTTTCCGTCTTGAGTCAATATATGACGACCAATCAGGTAATAGTCA
ATGATCAATACGCATATCGCGTTGAGAGGACGACTAATTTGTCTGGGGTCTATTTAGTTG
AACTTACCTTGGCGATGACTGATGGGATGAATTCATTCCATTTGAGACCTATGCGTGATG
TTTCTTGCGCTTGGTTGACGACGTTGAGAAAGAAAGTATTTGTTAAACTGGCTATACCAG
TAACAATGTACGATTTGTATGAGACTCCATTTGAAATAAAATGGGCTGTCATGGATGAAT
CATTAGTTCGCTATGTTTCCGAGGCTGCGTTTAGACAGTACTCGAAGACGAAGGATGCTG
AAGTTTTGGTTCAGTACATAGCAACGATGTTATCATCTTCATCAAATCACGTCGTTATTA
ATGGGATAACAATGAGGAGTGGTAGCCCTATTGCGTTGGAAGAATACGTGCCTTTGGCTG
TCACTTTTTATGCATTAACGCGTTTCAGATTTCAGATGATTTCTGGTGGTCTCGAAGCTT
TGAAA*CATCCGTCCCCGAAGCCAGTAG*TGTATTGGTGATAAAGGG*AACTGGAAG
CATTAC

QA 2 718 2 718
DS 

RD RR2BK11JQ 796 0 0
ATGACTGATGGGATGAATTCATTCCATTTGAGACCTATGCGTGATGTTTCTTGCGCTTGG
TTGACGACGTTGAGAAAGAAAGTATTTGTTAAACTGGCTATACCAGTAACAATGCACGAT
TTGTATGAGACTCCATTTGAAATAAAATGGGCTGTCATGGATGAATCATTAGTTCGCTAT
GTTTCCGAGGCTGCGTTTAGACAGTACTCGAAGACGAAGGATGCTGAAGTTTTGGTTCAG
TACATAGCAACGATGTTATCATCTTCATCAAATCACGTCGTTATTAATGGGATAACAATG
AGGAGTGGTAGCCCTATTGCGTTGGAAGAATACGCGCCTTTGGCTGTCACTTTTTATGCA
TTAACGCGTTTCAGATTTCAGATGATTTCTGGTGGTCTCGAAGCTTTGAAAACATCCGTC
CCCGAAGCCAGTAGGTGTATTGGTGATAAAGGGGAACTGGAAGGGCATTACGCCGGTCCA
TCTTTGTTGGAACGAGTCGGACTCCATGTTTTTAAAGGTAAGGAGATCACTAAGACCAGG
GATAACACTTATCTGGTTCAAAGTAGAAATACTTTTAAAGAAATCGTTAATGAAGTCATG
CGTACCTTCGGCCTTAAGTTGGTCGGAGAAGCCGACGAGTATATTGATTCTGCCCCGAGT
CATTATAAAGCTGTTACCGTCTGGAGAGCCTTTGTGAAAAATTCTGGATTACCGATCGAC
ATCAACGTTGAACGTTGTGTTAACGACATGATGACCAAGCATCAAGAGTCTATAGCACAG
TTGGTGGAGGATGAGG

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2FZ76JQ 796 0 0
ATGACTGATGGGATGAATTCATTCCATTTGAGAC*TATGCGTGATGTTTCTTGCGCTTGG
TTGACGACGTTGAGAAAGAAAGTATTTGTTAAACTGGCTATACCAGTAACAATGCACGAT
TTGTATGAGACTCCATTTGAAATAAAATGGGCTGTCATGGATGAATCATTAGTTCGCTAT
GTTTCCGAGGCTGCGTTTAGACAGTACTCGAAGACGAAGGATGCTGAAGTTTTGGTTCAG
TACATAGCAACGATGTTATCATCTTCATCAAATCACGTCGTCATTAATGGGATAACAATG
AGGAGTGGTAGCCCTATTGCGTTGGAAGAATACGTGCCTTTGGTTGTCACTTTTTATGCA
TTAACGCGTTTCAGATTTCAGATGATTTCTGGTGGTCTCGAAGCTTTGAAAACATCCGTC
CCCGAAGCCAGTAGGTGTATTGGTGATAAAGGGGAACTGGAAGGGCATTACGCCGGTCCA
TCTTTGTTGGAACGAGTCGGACTCCATGTTTTTAAAGGTAAGGAGATCACTAAGACCAGG
GATAACACTTATCTGGTTCAAAGTAGAAATACTTTTAAAGAAATCGTTAATGAAGTCATG
CGTACCTTCGGCCTTAAGTTGGTCGGAGAAGCCGACGAGTATATTGATTTTGCCCCGAGT
CATTATAAAGCTGTTACCGTCTGGAGAGCCTTTGTGAAAAATTCTGGATTACCGATCGAC
ATCAACGTTGAACGTTGTGTTAACGACATGATGACCAAGCATCAAGAGTCTATAGCACAG
TTGGTGGAGGATGAGG

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2GW82TF 140 0 0
GG
ACCGATCGACATCAACGTTGAACGTTGTGTTAACGACATGATGACCAAGCATCAAGAGTC
TATAGCACAGTTGGTGGAGGATGAGGAAAAGAAGGAATTCAAAGATGCAGGGATAAGCCC
TGATGACATCGCAAAGTG

QA 3 140 3 140
DS 



AS 3 15

CO CL239Contig1 710 8 11 U
GGATATCACAAATACATTTTACTCTTAAATCCTAAAAAAGATTGTTTCTTTCTGTAAATC
ATAGTATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACAATCGGAGGAAACGTGTTC
TCGGGTCTATCCGTATCAAATAACATCAGAAGAAAGAATACGAAGATGCTAAACAGAACT
GGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTGATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCA
GATTCATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCT
GATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGAT
ATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACGAAGGAATATGCGCCATTCGAT
GTGTATGACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGG
ATGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACAAGAGACTACTCTTCTCACGTCAACCCTTACGCTTGA
AGAAGATGAAGAAAATGATTCGAATGCACATAAATAACATCTGAAACTGATGTTAATGAA
CGATGTAGATAGGTCTCGTGAATGGTTACTTGAACATGTAAATAAAAGTAGTTTCTCCAA
TAATGTGAATCTCAAACGTTAACCTGCAAGCAATAATACCATTACTTTTG


BQ
30 30 30 30 40 40 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2C873TF U 3
AF RR2CI93TF U 1
AF RR2C618TF U 3
AF RR2D096TF U 3
AF RR2CI93JQ C 1
AF RR2FX47JQ C 1
AF RR2FX47TF U 1
AF RR2D096JQ C 68
BS 1 4 RR2CI93TF
BS 5 6 RR2C873TF
BS 7 91 RR2C618TF
BS 92 92 RR2C873TF
BS 93 476 RR2C618TF
BS 477 477 RR2CI93TF
BS 478 486 RR2C618TF
BS 487 495 RR2D096TF
BS 496 687 RR2FX47TF
BS 688 709 RR2CI93JQ
BS 710 710 RR2D096JQ

RD RR2C873TF 480 0 0
GG
ATCACAAGTACATTTTACTCTTAAATCCTAAAAAAGATTGTTTCTTTCTGTAAATCATAG
TATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACAATCGGAGGAAACGTGTTCTCGG
GTCTATCCGTATCAAATAACATCAGAAGAAAGAATACGAAGATGCTAAACAGAACTGGAG
TCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTGATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCAGATT
CATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATG
TTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGATATTG
TGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACGAAGGAATATGCGCCATTCGATGTGT
ATGACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGA
TGGATG

QA 3 474 3 474
DS 

RD RR2CI93TF 485 0 0
GGATATCACAAATACATTTTACTCTTAAATCCTAAAAAAGATTGTTTCTTTCTGTAAATC
ATAGTATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACAATCGGAGGAAACGTGTTC
TCGGGTCTATCCGTATCAAATAACATCAGAAGAAAGAATACGAAGATGCTAAACAGAACT
GGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTGATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATTCGACCA
GATTCATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCT
GATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGAT
ATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACGAAGGAATATGCGCCATTCGAT
GTGTATGACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAA
GGATGGGG

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2C618TF 488 0 0
GGAG
CACAAATACATTTTACTCTTAAATCCTAAAAAAGATTGTTTCTTTCTGTAAATCATAGTA
TTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGACTGCTTTAACAATCGGAGGAAACGTGTTCTCGGGT
CTATCCGTATCAAATAACATCAGAAGAAAGAATACGAAGATGCTAAACAGAACTGGAGTC
GTTTGTTCTTCATCTTCTGTGATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCAGATTCA
TCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATGTT
TGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGATATTGTG
TTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACGAAGGAATATGCGCCATTCGATGTGTAT
GACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGA*TGGATGGGG
GGTG

QA 5 484 5 484
DS 

RD RR2D096TF 493 0 0
GG
ATCACAAATACATTTTGCTCTTAAATCCTAAAAAAGATTGTTTCTTTCTGTAAATCATAG
TATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACAATCGGAGGAAACGTGTTCTCGG
GTCTATCCGTATCAAATAACATCAGAAGAAAGAATACGAAGATGCTAAACAGAACTGGAG
TCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTGATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCAGATT
CATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATG
TTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGATATTG
TGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACGAAGGAATATGCGCCATTCGATGCGT
ATGACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGGATGG
GGTGGGAAGGT

QA 3 493 3 493
DS 

RD RR2CI93JQ 709 0 0
GGATATCACAAATACATTTTACTCTTAAATCCTAAAAAAGATTGTTTCTTTCTGTAAATC
ATAGTATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACAATCGGAGGAAACGTGTTC
TCGGGTCTATCCGTATCAAATAACATCAGAAGAAAGAATACGAAGATGCTAAACAGAACT
GGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTGATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATTCGACCA
GATTCATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCT
GATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGAT
ATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACGAAGGAATATGCGCCATTCGAT
GTGTATGACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGG
ATGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACAAGAGACTACTCTTC**ACGTCAACCCTTACGCTTGA
AGAAGATGAAGAAAATGATTCGAATGCACATAAATAACATCTGAAACTGATGTTAATGAA
CGATGTAGATAGGTCTCGTGAATGGTTACTTGAACATGTAAATAAAAGTAGTTTCTCCAA
TAATGTGAATCTCAAACGTTAATCTGCAAGCAATAATACCATTACTTTT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2FX47JQ 688 0 0
GGATATCACAAATACATTTTACTCTTAAATCCTAAAAA*GATTGTTTCTTTCTGTAAATC
ATAGTATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACAATCGGAGGAAACGTGTTC
TCGGGTCTATCCGTATCAAATAACATCAGAAGAAAGAATACGAAGATGCTAAACAGAACT
GGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTGATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCA
GATTCATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCT
GATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGAT
ATAGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACGAAGGAATATGCGCCATTCGAT
GTGTATGACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGG
ATGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACAAGAGACTACTCTTCTCACGTCAACCCTTACGCTTGA
AGAAGATGAAGAAAATGATTCGAATGCACATAAATAACATCTGAAACTGATGTTAATGAA
CGATGTAGATAGGTCTCGTGAATGGTTACTTGAACATGTAAATAAAAGTAGTTTCTCCAA
TAATGTGAATCTCAAACGTTAACCTGC
G

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2FX47TF 688 0 0
GGATATCACAAATACATTTTACTCTTAAATCCTAAAAA*GATTGTTTCTTTCTGTAAATC
ATAGTATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACAATCGGAGGAAACGTGTTC
TCGGGTCTATCCGTATCAAATAACATCAGAAGAAAGAATACGAAGATGCTAAACAGAACT
GGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTGATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCA
GATTCATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCT
GATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGAT
ATAGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACGAAGGAATATGCGCCATTCGAT
GTGTATGACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGG
ATGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACAAGAGACTACTCTTCTCACGTCAACCCTTACGCTTGA
AGAAGATGAAGAAAATGATTCGAATGCACATAAATAACATCTGAAACTGATGTTAATGAA
CGATGTAGATAGGTCTCGTGAATGGTTACTTGAACATGTAAATAAAAGTAGTTTCTCCAA
TAATGTGAATCTCAAACGTTAACCTGC
G

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2D096JQ 643 0 0
TCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACAATCGGAGGAAACGTGTTCTCGGGTC
TATCCGTATCAAATAACATCAGAAGAAAGAATACGAAGATGCTAAACAGAACTGGAGTCG
TTTGTTCTTCATCTTCTGTGATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCAGATTCAT
TTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATGTTT
GTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGATATTGTGT
TGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACGAAGGAATATGCGCCATTCGATGCGTATG
ACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGGATGGGGT
GGGAAGGTGCAGGAACAAGAGACTACTCTTCTCACGTCAACCCTTACGCTTGAAGAAGAT
GAAGAAAATGATTCGAATGCACATAAATAACATCTGAAACTGATGTTAATGAACGATGTA
GATAGGTCTCGTGAATGGTTACTTGAACATGTAAATAAAAGTAGTTTCTCCAATAATGTG
AATCTCAAACGTTAACCTGCAAGCAATAATACCATTACTTTTG

QA 1 643 1 643
DS 



CO CL239Contig2 720 4 3 U
GGATATCACAAATACATTTTACTCTTAAATCCCAATAAATATTGTTTCTTTCTGTAAATC
ATAGTATTGTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACCATCGGAGGAAACGTGTTC
TCGGGTCCATCCGTATCAAAAAATAACATCAGAAGAAAGAACACGAAGATGCTAAACAGA
ACTGGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGA
CCAGATTCATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCAT
CCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTAC
GATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACAGAGGAATATGAGCCATTC
GATGTGTATGACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAA
TGGATGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACAAGAGACTACTCTTCTCGCGTCAACCCTTACGCT
TGAAGAAGAAGAAAATGATTCGAATGCACATAAATAACATCTGAAACTGATGTTAATGAA
CGATGTAGATAGGTCTCGTGAATGGTTACTTGGGAACATGTAAATAAAAGTAGTTTCTCC
AATCATGTGAATCTCAAACGTTAACCTACAAGCAATAATACCATTACTTTTAAAACTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU88TF U 1
AF RR2CU88JQ C 36
AF RR2BS42JQ C 67
AF RR2BS42TF U 67
BS 1 437 RR2CU88TF
BS 438 711 RR2BS42TF
BS 712 720 RR2CU88JQ

RD RR2CU88TF 437 0 0
GGATATCACAAATACATTTTACTCTTAAATCCCAATAAATATTGTTTCTTTCTGTAAATC
ATAGTATTGTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACCATCGGAGGAAACGTGTTC
TCGGGTCCATCCGTATCAAAAAATAACATCAGAAGAAAGAACACGAAGATGCTAAACAGA
ACTGGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGA
CCAGATTCATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCAT
CCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTAC
GATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACAGAGGAATATGAGCCATTC
GATGTGTATGACGACGG

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR2CU88JQ 685 0 0
TAAAT
ATTGTTTCTTTCTGTAAATCATAGTATTGTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAA
CCATCGGAGGAAACGTGTTCTCGGGTCCATCCGTATCAAAAAATAACATCAGAAGAAAGA
ACACGAAGATGCTAAACAGAACTGGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCTT
ATAAGACACTTAAGATCCGACCAGATTCATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGAC
AACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTC
AAACAATCAACGAAGCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAA
CAGAGGAATATGAGCCATTCGATGTGTATGACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAG
ATTGTGACACGTGGGAGGAATGGATGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACAAGAGACTACTCTT
CTCGCGTCAACCCTTACGCTTGAAGAAGAAGAAAACGATTCGAATGCACATAAATAACAT
CTGAAACTGATGTTAATGAACGATGTAGATAGGTCTCGTGAATGGTTACTTGGGAACATG
TAAATAAAAGTAGTTTCTCCAATCATGTGAATCTCAAACGTTAACCTACAAGCAATAATA
CCATTACTTTTAAAACTGCC

QA 6 685 6 685
DS 

RD RR2BS42JQ 645 0 0
GG
GTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACCATCGGAGGAAACGTGTTCTCGGGTCT
ATCCGTATCAAAAAATAACATCAGAAGAAAGAACGCGAAGATGCTAAACAGAACTGGAGT
CGTTTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCAGATTC
ATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATGT
TTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGATATTGT
GTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACAGAGGAATATGAGCCATTCGATGTGTA
TGACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGGATGGG
GTGGGAAGGTGCAGGAACAAGAGACTACTCTTCTCGCGTCAACCCTTACGCTTGAAGAAG
AAGAAAATGATTCGAATGCACATAAATAACATCTGAAACTGATGTTAATGAACGATGTAG
ATAGGTCTCGTGAATGGTTACTTGGGAACATGTAAATAAAAGTAGTTTCTCCAATCATGT
GAATCTCAAACGTTAACCTACAAGCAATAATACCATTACTTTT

QA 3 645 3 645
DS 

RD RR2BS42TF 645 0 0
GG
GTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACCATCGGAGGAAACGTGTTCTCGGGTCT
ATCCGTATCAAAAAATAACATCAGAAGAAAGAACGCGAAGATGCTAAACAGAACTGGAGT
CGTTTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCAGATTC
ATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATGT
TTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGATATTGT
GTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACAGAGGAATATGAGCCATTCGATGTGTA
TGACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGGATGGG
GTGGGAAGGTGCAGGAACAAGAGACTACTCTTCTCGCGTCAACCCTTACGCTTGAAGAAG
AAGAAAATGATTCGAATGCACATAAATAACATCTGAAACTGATGTTAATGAACGATGTAG
ATAGGTCTCGTGAATGGTTACTTGGGAACATGTAAATAAAAGTAGTTTCTCCAATCATGT
GAATCTCAAACGTTAACCTACAAGCAATAATACCATTACTTTT

QA 3 645 3 645
DS 



CO CL239Contig3 767 3 4 U
GGCCCAACTCAATGCACGATTCCAATTATTGAACTCTCTAATTTACTTTATTCACCAAAA
AAAAAAGTCTTTCAAGAAGTCACTTTTACTTTCTACCACCACCTTTTGTGTCTTGAAAAC
ATGACTATTGCTTTAACGATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTAACCGGATCTTCGTTT
TCATCATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTT
AACAGAACACGAGTCGTCTGTTCCTCGTCTTCAGTAATGGATTCTTATAAAACACTTCAG
ATCCGACCCGATTCACCAGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAG
TATCATCCTGATGTTTGCAGA***AGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAA
GCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTGAG
CCATTCGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGACTGTGACACGTGG
GAAGAATGGATGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCT
TACGCTTGAAGATGGAAGTAATGATTCGAATGCACATAAATAACAACATAGAGACTGATG
TAAATAAATACATGAAACTGTCTCGTGGATGGTACTTAAAATGTAAATAAAAAAGTCATT
TCTCTCCTTCATTGTAAATCTCAACGTTAAGCTTAAATGAAAATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GT51TF U 1
AF RR2GT51JQB C 221
AF RR2B660TF U 366
BS 1 405 RR2GT51TF
BS 406 713 RR2B660TF
BS 714 714 RR2GT51JQB
BS 715 767 RR2B660TF

RD RR2GT51TF 405 0 0
GGCCCAACTCAATGCACGATTCCAATTATTGAACTCTCTAATTTACTTTATTCACCAAAA
AAAAAAGTCTTTCAAGAAGTCACTTTTACTTTCTACCACCACCTTTTGTGTCTTGAAAAC
ATGACTATTGCTTTAACGATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTAACCGGATCTTCGTTT
TCATCATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTT
AACAGAACACGAGTCGTCTGTTCCTCGTCTTCAGTAATGGATTCTTATAAAACACTTCAG
ATCCGACCCGATTCACCAGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAG
TATCATCCTGATGTTTGCAGA***AGCAACTGTGGAGTACAGTTT

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR2GT51JQB 547 0 0
GAAAAG
ACACGAAGATGCTTAACAGAACACGAGTCGTCTGTTCCTCGTCTTCAGTAATGGATTCTT
ATAAAACACTTCAGATCCGACCCGATTCACCAGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGAC
AACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATGTTTGCAGA***AGCAACTGTGGAGTACAGTTTC
AGACAATCAACGAAGCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAA
CAGAGGAGTTTGAGCCATTCGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAG
ACTGTGACACGTGGGAAGAATGGATGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCT
CTCACGTCAATCCTTACGCTTGAAGATG*AAGTAATGATTCGAATGCACATAAATAACAA
CATAGAGACTGATGTAAATAAATACATGAAACTGTCTCGTGGATGGTACTTAAAATGTAA
ATAAAAAAGTCATTTCTCTCCTTCATTGTAAAT*TCAACGTTAAGCTTAAATGAAAATCA
T

QA 7 547 7 547
DS 

RD RR2B660TF 402 0 0
G
CCTGATGTTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTAC
GATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTGAGCCATTC
GATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGACTGTGACACGTGGGAAGAA
TGGATGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTACGCT
TGAAGATGGAAGTAATGATTCGAATGCACATAAATAACAACATAGAGACTGATGTAAATA
AATACATGAAACTGTCTCGTGGATGGTACTTAAAATGTAAATAAAAA*GTCATTTCTCTC
CTTCATTGTAAATCTCAACGTTAAGCTTAAATGAAAATCAT

QA 2 402 2 402
DS 



AS 1 15

CO CL240Contig1 864 15 5 U
GGATACCAACTCTATAGCTAAGATCCACCTCACAGTTTAATAGCCTTTATTTCATACTTT
CTCCTGTATTTCATTCAAACACCAAAGTTTTAGAAATGGCAACAGCATCGGTTAACATGC
AGTCAGTCTTCGCCGGTGGGTTGGCCACTCGCAAGATCAACACAAACAAGCTCTTCTTCG
CCGGAAGCCTCCCAAATCTCAAGAGGAATTATCCGGTTGGAGTGAGGTGCATGGCTGAGG
GAGAACCCATGAAGGATGAGTCTGCACCTTCCACCTCCGCTGCTCAGCCTTTGTCTAGTT
CATCACCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCG
ACTTGCTAGCGTTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTCTAGCGATGGTTG
GGTTCGTGGCAGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCT
CTGACGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACTGCGATCTTGACGCTTGCGTCGCTTG
TACCCCTTTTCAAGGGTATCACCGCCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCATGACATCCGACG
CTGAGCTTTGGAACGGACGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGT
TTGTCAAGGGTGGGACCCTTGTCTGAGAAAAGGAACTTTCTTATTGGAGGGGGGAATGTT
ATATTACAGTTTTACCCCTGAATTCTGTGAAGTAATCTTGTTTGATTAGTGTGGTTAAGC
CTACGGTGTGTTTCTTTACATATGTATTAGTCACATGAGACTTTGGGTTACAACACTATA
TCAGTAAAATCAGCGAGTTTCTCC


BQ
25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 55 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 
65 80 80 80 80 80 80 65 80 80 65 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 70 70 70 70 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 55 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 25 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 80 80 80 80 50 75 70 70 70 70 55 40 55 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 45 45 10 

AF RR2EX73TF U 1
AF RR2H975TF U 1
AF RR2CW27TF U 3
AF RR2DJ50TF U 3
AF RR2GZ42TF U 1
AF RR2AR67TF U 1
AF RR2CW27JQ C 69
AF RR2DJ50JQ C 505
AF RR2GZ42JQ C 190
AF RR2AY29TFB U 151
AF RR2AG01TF U 195
AF RR2AY29JQ C 285
AF RR2AR67JQ C 323
AF RR2CC93JQ C 336
AF RR2CC93TF U 336
BS 1 224 RR2AR67TF
BS 225 225 RR2EX73TF
BS 226 785 RR2AR67TF
BS 786 863 RR2AY29TFB
BS 864 864 RR2AY29JQ

RD RR2EX73TF 703 0 0
GGATACCAACTCTATAGCTAAGATCCACCTCACAGTTTAATAGCCTTTATTTCATACTT*
CTCCTGTATTTCATTCAAACACCAAAGTTTTAGAAGTGGCAACAGCATCGGTTAACATGC
AGTCAGTCTTCGCCGGTGGGTTGGCCACTCGCAAGATCAACACAAACAAGCTCTTCTTCG
CCGGAAGCCTCCCAAATCTCAAGAGGAATTATCCGGTTGGAGTGAGGTGCATGGCTGAGG
GAGAACCCATGAAGGATGAGTCTGCACCTTCCACCTCCGCTGCTCAGCCTTTGTCTAGTT
CATCACCTCCTCCACCTCCTCCACTTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCG
ACTTGCTAGCGTTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTCTAGCGATGGTTG
GGTTCGTGGCAGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCT
CTGACGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCG*****ACTGCGATCTTGACGCTTGCGTCGCTTG
TACCCCTTTTCAAGGGTATCACCGCCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCATGACATCCGACG
CTGAGCTTTGGAACGGACGCTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGT
TTGTCA*GGGTGGGACCCTTGTCTGAGAAAAGGA
CTTACTTAT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2H975TF 688 0 0
GGATACCAACTCTATAGCTAAGATCCACCTCACAGTTTAATAGCCTTTATTTCATACTTT
CTCCTGTATTTCATTCAAACACCAAAGTTTTAGAAATGGCAACAGCATCGGTTAACATGC
AGTCAGTCTTCGCCGGTGGGTTGGCCACTCGCAAGATCAACACAAACAAGCTCTTCTTCG
CCGGAAGCCTCCCAAATCTCAAGAGGAATTATCCAGTTGGAGTGAGGTGCATGGCTGAGG
GAGAACCCATGAAGGATGAGTCTGCACCTTCCACCTCCGCTGCTCAGCCTTTGTCTAGTT
CATCACCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCG
ACTTGCTAGCGTTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTCTAGCGATGGTTG
GGTTCGTGGCAGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCT
CTGACGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACTGCGATCTTGACGCTTGCGTCGCTTG
TACCCCTTTTCAAGGGTATCACCGCCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCATGACATCCGACG
CTGAGCTTTGGAACGGACGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGT
TTGTCAAGGGTGGGACC*TTGTCTGAGA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2CW27TF 696 0 0
GG
ACCAACTCTATAGCTAAGATCCACCTCACAGTTTAATAGCCTTTATTTCATACTTTCTCC
TGTATTTCATTCAAACACCAAAGTTTTAGAAATGGCAACAGCATCGGTTAACATGCAGTC
AGTCTTCGCCGGTGGGTTGGCCACTCGCAAGATCAACACAAACAAGCTCTTCTTCGCCGG
AAGCCTCCCAAATCTCAAGAGGAATTATCCGGTTGGAGTGAGGTGCATGGCTGAGGGAGA
ACCCATGAAGGATGAGTCTGCACCTCCCACCTCCGCTGCTCAGCCTTTGTCTAGTTCATC
ACCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCGACTT
GCTAGCGTCTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTCTAGCGATGGTTGGGTT
CGTGGCAGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCTCTGA
CGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACTGCGATCTTGACGCTTGCGTCGCTTGTACC
CCTTTTCAAGGGTATCACCGCCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCATGACATCCGACGCTGA
GCTTTGGAACGGACGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGTTTGT
CAAGGGTGGGACCCTTGTCTGAGAAAAG
ACTTCT

QA 3 690 3 690
DS 

RD RR2DJ50TF 703 0 0
GG
ACCAACTCTATAGCTAAGATCCACCTCACAGTTTAATAGCCTTTATTTCATACTTTCTCC
TGTATTTCATTCAAACACCAAAGTTTTAGAAATGGCAACAGCATCGGTTAACATGCAGTC
AGTCTTCGCCGGTGGGTTGGCCACTCGCAAGATCAACACAAACAAGCTCTTCTTCGCCGG
AAGCCTCCCAAATCTCAAGAGGAATTATCCGGTTGGAGTGAGGTGCATGGCTGAGGGAGA
ACCCATGAAGGATGAGTCTGCACCTTCCACCTCCGCTGCTCAGCCTTTGTCTAGTTCATC
ACCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCGACTT
GCTAGCGTTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTCTAGCGATGGTTGGGTT
CGTGGCAGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCTCTGA
CGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACTGCGATCTTGACGCTTGCGTCGCTTGTACC
CCTTTTCGAGGGTATCACCGCCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCATGACGTCCGACGCTGA
GCTTTGGAACGGACGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGTTTGT
CAAGGGTGGGACCCTTGTCTGAGAAAAG*AACTTTCTTATT

QA 3 703 3 703
DS 

RD RR2GZ42TF 735 0 0
GGATACCAACTCTATAGCTAAGATCCACCTCACAGTTTAATAGCCTTTATTTCATACTTT
CTCCTGTATTTCATTCAAACACCAAAGTTTTAGAAATGGCAACAGCATCGGTTAACATGC
AGTCAGTCTTCGCCGGTGGGTTGGCCACTCGCAAGATCAACACAAACAAGCTCTTCTTCG
CCGGAAGCCTCCCAAATCTCAAGAGGAATTATCCGGTTGGAGTGAGGTGCATGGCTGAGG
GAGAACCCATGAAGGATGAGTCTGCACCTTCCACCTCCGCTGCTCAGCCTTTGTCTAGTT
CATCACCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCG
ACTTGCTAGCGTTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTCTAGCGATGGTTG
GGTTCGTGGCAGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCT
CTGACGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACTGCGATCTTGACGCTTGCGTCGCTTG
TACCCCTTTTCAAGGGTATCACCGCCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCATGACATCCGACG
CTGAGCTTTGGGACGGACGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGT
TTGTCAAGGGTGGGACCCTTGTCTGAGAAAAG*AACTTC**TATTGGAGGGGGGAATGTT
ATATTACAGTTT
ACC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2AR67TF 790 0 0
GGATACCAACTCTATAGCTAAGATCCACCTCACAGTTTAATAGCCTTTATTTCATACTTT
CTCCTGTATTTCATTCAAACACCAAAGTTTTAGAAATGGCAACAGCATCGGTTAACATGC
AGTCAGTCTTCGCCGGTGGGTTGGCCACTCGCAAGATCAACACAAACAAGCTCTTCTTCG
CCGGAAGCCTCCCAAATCTCAAGAGGAATTATCCGGTTGGAGTGGGGTGCATGGCTGAGG
GAGAACCCATGAAGGATGAGTCTGCACCTTCCACCTCCGCTGCTCAGCCTTTGTCTAGTT
CATCACCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCG
ACTTGCTAGCGTTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTCTAGCGATGGTTG
GGTTCGTGGCAGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCT
CTGACGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACTGCGATCTTGACGCTTGCGTCGCTTG
TACCCCTTTTCAAGGGTATCACCGCCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCATGACATCCGACG
CTGAGCTTTGGAACGGACGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGT
TTGTCAAGGGTGGGACCCTTGTCTGAGAAAAGGAACTTTCTTATTGGAGGGGGGAATGTT
ATATTACAGTTTTACCCCTGAATTCTGTGAAGTAATCTTGTTTGATTAGTGTGGTTAAGC
CTACG
TGTGT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2CW27JQ 796 0 0
A
TTCATTCAAACACCAAAGTTTTAGAAATGGCAACAGCATCGGTTAACATGCAGTCAGTCT
TCGCCGGTGGGTTGGCCACTCGCAAGATCAACACAAACAAGCTCTTCTTCGCCGGAAGCC
TCCCAAATCTCAAGAGGAATTATCCGGTTGGAGTGAGGTGCATGGCTGAGGGAGAACCCA
TGAAGGATGAGTCTGCACCTCCCACCTCCGCTGCTCAGCCTTTGTCTAGTTCATCACCTC
CTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCGACTTGCTAG
CGTCTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTCTAGCGATGGTTGGGTTCGTGG
CAGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCTCTGACGGTG
GCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACTGCGATCTTGACGCTTGCGTCGCTTGTACCCCTTT
TCAAGGGTATCACCGCCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCATGACATCCGACGCTGAGCTTT
GGAACGGACGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGTTTGTCAAGG
GTGGGACCCTTGTCTGAGAAAAGGAACTTTCTTATTGGAGGGGGGAATGTTATATTACAG
TTTTACCCCTGAATTCTGTGAAGTAATCTTGTTTGATTAGTGTGGTTAAGCCTACGGTGT
GTTTCTTTACATATGTATTAGTCACATGAGACTTTGGGTTACAACACTATATCAGTAAAA
TCAGCGAGTTTCTC
G

QA 2 795 2 795
DS 

RD RR2DJ50JQ 360 0 0
TCGGTACGACTGCGATCTTGACGCTTGCGTCGCTTGTACCCCTTTTCGAGGGTATCACCG
CCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCATGACGTCCGACGCTGAGCTTTGGAACGGACGTTTCG
CGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGTTTGTCAAGGGTGGGACCCTTGTTT
GAGAAAAGGAACTTTCTTATTGGAGGGGGGAATGTTATATTACAGTTTTACCCCTGAATT
CTGTGAAGTAATCTTGTTTGATTAGTGTGGTTAAGCCTACGGTGTGTTTCTTTACATATG
TATTAGTCACATGAGACTTTGGGTTACAACACTATATCAGTAAAATCAGCGAGTTTCTC
T

QA 1 359 1 359
DS 

RD RR2GZ42JQ 675 0 0
TCCCAAATCTCAAGAGGAATTATCCGGTTGGAGTGAGGTGCATGGCTGAGGGAGAACCCA
TGAAGGATGAGTCTGCACCTTCCACCTCCGCTGCTCAGCCTTTGTCTAGTTCATCACCTC
CTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCGACTTGCTAG
CGTTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTCTAGCGATGGTTGGGTTCGTGG
CAGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCTCTGACGGTG
GCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACTGCGATCTTGACGCTTGCGTCGCTTGTACCCCTTT
TCAAGGGTATCACCGCCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCATGACATCCGACGCTGAGCTTT
GGGACGGACGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGTTTGTCAAGG
GTGGGACCCTTGTCTGAGAAAAGGAACTTTCTTATTGGAGGGGGGAATGTTATATTACAG
TTTTACCCCTGAATTCTGTGAAGTAATCTTGTTTGATTAGTGTGGTTAAGCCTACGGTGT
GTTTCTTTACATATGTATTAGTCACATGAGACTTTGGGTTACAACACTATATCAGTAAAA
TCAGCGAGTTTCTC
C

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2AY29TFB 713 0 0
GCAAGATCAACACAAACAAGCTCTTCTTCGCCGGAAGCCTCCCAAATCTCAAGAGGAATT
ATCCGGTTGGAGTGAGGTGCATGGCTGAGGGAGAACCCATGAAGGATGAGTCTGCACCTT
CCACCTCCGCTGCTCAGCCTTTGTCTAGTTCATCACCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTA
CTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCGACTTGCTAGCGTTTAGCGGTCCAGCACCAG
AAAGAATAAACGGGCGTCTAGCGATGGTTGGGTTCGTGGCAGCCTTGGCGGTTGAACTTT
CCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCTCTGACGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTA
CGACTGCGATCTTGACGCTTGCGTCGCTTGTACCCCTTTTCAAGGGTATCACCGCCGAGT
CTAAGTCCAAAGGTTTCATGACGTCCGACGCTGAGCTTTGGAACGGACGTTTCGCGATGC
TTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGTTTGTCAAGGGTGGGACCCTTGTCTGAGAAA
AGGAACTTTCTTATTGGAGGGGGGAATGTTATATTACAGTTTTACCCCTGAATTCTGTGA
AGTAATCTTGTTTGATTAGTGTGGTTAAGCCTACGGTGTGTTTCTTTACATATGTATTAG
TCACATGAGACTTTGGGTTACAACACTATATCAGTAAAATCAGCGAGTTTCTC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2AG01TF 667 0 0
G
ATCTCAAGAGGAATTATCCGGTTGGAGTGAGGTGCATGGCTGAGGGAGAACCCATGAAGG
ATGAGTCTGCACCTTCCACCTCCGCTGCTCAGCCTTTGTCTAGTTCATCACCTCCTCCAC
CTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCGACTTGCTAGCGTTTA
GCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTCTAGCGATGGTTGGGTTCGTGGCAGCCT
TGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCTCTGACGGTGGCGTCT
CGTGGTTCCTCGGTACGACTGCGATCTTGACGCTTGCGTCGCTTGTACCCCTTTTCAAGG
GTATCACCGCCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCATGACGTCCGACGCTGAGCTTTGGAACG
GACGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGTTTGTCAAGGGTGGGA
CCCTTGTCTGAGAAAAGGAACTTTCTTATTGGAGGGGGGAATGTTATATTACAGTTTTAC
CCCTGAATCCTGTGAAGTAATCTTGTTTGATTAGTGTGGTTAAGCCTACGGTGTGTTTCT
TTACATATGTATTAGTCACATGAGACTTTGGGTTACAACACTATATCAGTAAAATCAGCG
AGTTTC

QA 2 667 2 667
DS 

RD RR2AY29JQ 580 0 0
CAGCCTTTGTCTAGTTCATCACCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTG
AGCACGAAGTTTAGCGACTTGCTAGCGTTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGG
CGTCTAGCGATGGTTGGGTTCGTGGCAGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAAC
GTTTTGGCTCAGATTTCTGACGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACTGCGATCTTG
ACGCTTGCGTCGCTTGTACCCCTTTTCAAGGGTATCACCGCCGAGTTTAAGTCCAAAGGT
TTCATGACGTCCGACGCTGAGCTTTGGAACGGACGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCG
TTGGCGTTTACTGAGTTTGTCAAGGGTGGGACCCTTGTCTGAGAAAAGGAACTTTCTTAT
TGGAGGGGGGAATGTTATATTACAGTTTTACCCCTGAATTCTGTGAAGTAATCTTGTTTG
ATTAGTGTGGTTAAGCCTACGGTGTGTTTCTTTACATATGTATTAGTCACATGAGACTTT
GGGTTACAACACTATATCAGTAAAATCAGCGAGTTTCTCC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2AR67JQ 542 0 0
ACGTCCTATTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCGACTTGCTAGCGTTTAGCGGTCC
AGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTCTAGCGATGGTTGGGTTCGTGGCAGCCTTGGCGGT
TGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATTTTTGACGGGGGGGTTTCGTGGTT
CCTCGGTACGACTGCGATCTTGACGCTTGGGTCGCTTGTACCCCTTTTCAAGGGTATCAC
CGCCGAGTTTAAGTCCAAAGGTTTCATGACATCCGACGCTGAGCTTTGGAACGGACGTTT
CGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGTTTGTCAAGGGTGGGACCCTTGT
TTGAGAAAAGGAACTTTTTTATTGGAGGGGGGAATGTTATATTACAGTTTTACCCCTGAA
TTTTGTGAAGTAATCTTGTTTGATTAGTGTGGTTAAGCCTACGGTGTGTTTCTTTACATA
TGTATTAGTCACATGAGACTTTGGGTTACAACACTATATCAGTAAAATCAGCGAGTTT
TTTT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2CC93JQ 529 0 0
G
CAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCGACTTGCTAGCGTTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAA
TAAACGGGCGTCTAGCGATGGTTGGGTTCGTGGCAGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGG
GTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCTCTGACGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACTG
CGATCTTGACGCTTGCGTCACTTGTACCCCTTTTCAAGGGTATCACCGCCGAGTCTAAGT
CCAAAGGTTTCATGACATCCGACGCTGAGCTTTGGAACGGACGTTTCGCGATGCTTGGTT
TGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGTTTGTCAAGGGTGGGACCCTTGTCTGAGAAAAGGAAC
TTTCTTATTGGAGGGGGGAATGTTATATTACAGTTTTACCCCTGAATTCTGTGAAGTAAT
CTTGTTTGATTAGTGTGGTTAAGCCTACGGTGTGTTTCTTTACATATGTATTAGTCACAT
GAGACTTTGGGTTACAACACTATATCAGTAAAATCAGCGAGTTTCTC
T

QA 2 528 2 528
DS 

RD RR2CC93TF 529 0 0
G
CAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCGACTTGCTAGCGTTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAA
TAAACGGGCGTCTAGCGATGGTTGGGTTCGTGGCAGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGG
GTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCTCTGACGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACTG
CGATCTTGACGCTTGCGTCACTTGTACCCCTTTTCAAGGGTATCACCGCCGAGTCTAAGT
CCAAAGGTTTCATGACATCCGACGCTGAGCTTTGGAACGGACGTTTCGCGATGCTTGGTT
TGGTCGCGTTGGCGTTTACTGAGTTTGTCAAGGGTGGGACCCTTGTCTGAGAAAAGGAAC
TTTCTTATTGGAGGGGGGAATGTTATATTACAGTTTTACCCCTGAATTCTGTGAAGTAAT
CTTGTTTGATTAGTGTGGTTAAGCCTACGGTGTGTTTCTTTACATATGTATTAGTCACAT
GAGACTTTGGGTTACAACACTATATCAGTAAAATCAGCGAGTTTCTC
T

QA 2 528 2 528
DS 



AS 4 12

CO CL241Contig1 896 2 2 U
CTGCATTGTATATTTCCGGAATATGAGTAAAGTTTATGATTGGTTCGAAGAACGTCTTGA
GATTCAAGCGATTGCAGACGATATAACTAGTAAATATGTTCCTCCGCATGTCAACATATT
TTATTGTCTAGGAGGAATTACCCTTACTTGTTTTTTAGTACAAGTAGCTACGGGATTTGC
TATGACTTTTTATTACCGTCCAACTGTTACTGAGGCTTTTGCTTCTGTTCAATATATAAT
GATTGAAGCTAACTTTGGTTGGTTAATCCGATCAGTTCATCGATGGTCGGCAAGTATGAT
GGTCCCAATGATGATCCTGCACGTATTTCGTGTATACCTCACCGGTGGTTTTAAAAAACC
TCGCGAATTAACTTGGGTTACTGGTGTGGTTCTGGGTGTATTGACCGCATCTTTTGGTGT
AACAGGTTATTCTTTACCTTGGGATCAAATTGGCTATTGGGCAGTCAAAATTGTAACAGG
TGTACCTGACGCTATTCCGGTAATAGGATCGCCTCTTGTAGAATTATTACGCGGAAGTGC
TAGTGTTGGACAATCCACTTTGACTCGTTTTTATAGTTTACACACTTTTGTATTACCTCT
TCTTACGGCTGTATTTATGTTAATGCATTTCTTAATGATACGTAAGCAAGGTATTTCTGG
TCCCTTATAAATAATATAGATTCTAGATATTTTTAATTACTAATTTATCTTATTACTTGG
TGAAAGGTGGTTGGTAATTAGATTACGTGTTTGAGACCGTTATGTCTGGTTCGGGTTTTA
TTGTTCTCTTATGTGTTATGGTGTTTGGTTCTGCTGTCTGGTTCTGGTTTGTGGGTGTTT
TGGATTGTAACAGTTCGTGATTAGGTATCTGATATCTGGAAACGCAATGTTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B828TF U 1
AF RR2B828JQ C 157
BS 1 879 RR2B828TF
BS 880 896 RR2B828JQ

RD RR2B828TF 879 0 0
CTGCATTGTATATTTCCGGAATATGAGTAAAGTTTATGATTGGTTCGAAGAACGTCTTGA
GATTCAAGCGATTGCAGACGATATAACTAGTAAATATGTTCCTCCGCATGTCAACATATT
TTATTGTCTAGGAGGAATTACCCTTACTTGTTTTTTAGTACAAGTAGCTACGGGATTTGC
TATGACTTTTTATTACCGTCCAACTGTTACTGAGGCTTTTGCTTCTGTTCAATATATAAT
GATTGAAGCTAACTTTGGTTGGTTAATCCGATCAGTTCATCGATGGTCGGCAAGTATGAT
GGTCCCAATGATGATCCTGCACGTATTTCGTGTATACCTCACCGGTGGTTTTAAAAAACC
TCGCGAATTAACTTGGGTTACTGGTGTGGTTCTGGGTGTATTGACCGCATCTTTTGGTGT
AACAGGTTATTCTTTACCTTGGGATCAAATTGGCTATTGGGCAGTCAAAATTGTAACAGG
TGTACCTGACGCTATTCCGGTAATAGGATCGCCTCTTGTAGAATTATTACGCGGAAGTGC
TAGTGTTGGACAATCCACTTTGACTCGTTTTTATAGTTTACACACTTTTGTATTACCTCT
TCTTACGGCTGTATTTATGTTAATGCATTTCTTAATGATACGTAAGCAAGGTATTTCTGG
TCCCTTATAAATAATATAGATTCTAGATATTTTTAATTACTAATTTATCTTATTACTTGG
TGAAAGGTGGTTGGTAATTAGATTACGTGTTTGAGACCGTTATGTCTGGTTCGGGTTTTA
TTGTTCTCTTATGTGTTATGGTGTTTGGTTCTGCTGTCTGGTTCTGGTTTGTGGGTGTTT
TGGATTGTAACAGTTCGTGATTAGGTATCTGATATCTGG

QA 1 879 1 879
DS 

RD RR2B828JQ 740 0 0
AGTACAAGTAGCTACGGGATTTGCTATGACTTTTTATTACCGTCCAACTGTTACTGAGGC
TTTTGCTTCTGTTCAATATATAATGATTGAAGCTAACTTTGGTTGGTTAATCCGATCAGT
TCATCGATGGTCGGCAAGTATGATGGTCCCAATGATGATCCTGCACGTATTTCGTGTATA
CCTCACCGGTGGTTTTAAAAAACCTCGCGAATTAACTTGGGTTACTGGTGTGGTTCTGGG
TGTATTGACCGCATCTTTTGGTGTAACAGGTTATTCTTTACCTTGGGATCAAATTGGCTA
TTGGGCAGTCAAAATTGTAACAGGTGTACCTGACGCTATTCCGGTAATAGGATCGCCTCT
TGTAGAATTATTACGCGGAAGTGCTAGTGTTGGACAATCCACTTTGACTCGTTTTTATAG
TTTACACACTTTTGTATTACCTCTTCTTACGGCTGTATTTATGTTAATGCATTTCTTAAT
GATACGTAAGCAAGGTATTTCTGGTCCCTTATAAATAATATAGATTCTAGATATTTTTAA
TTACTAATTTATCTTATTACTTGGTGAA*GGTGGTTGGTAATTAGATTAGGTGTTTGAGA
CCGTTATGTCTGGTTCGGGTTTTATTGTTCTCTTATGTGTTATGGTGTTTGGTTCTGCTG
TCTGGTTCTGGTTTGTGG*TGTTTTGGATTGTAACAGTTCGTGATTAGGTATCTGATATC
TGGAAACGCAATGTTAAACC

QA 1 740 1 740
DS 



CO CL241Contig2 1098 4 5 U
GGAAGCATTGGTTTATACATTTCTCTTAGTATCGACTTTAGGGATCATTTTTTTCGCTAT
TTTTTTTCGGGAACCGCCTACAATTTCAACTAAAAAATGAAATAATTTTTCATTCTCTTC
ATTGACGTAATCAGCCTCCAAATAGTCGGAGGCTGATTACGTTAACTAGTCCCCGTGTTC
CTCGAATGGATCTCTTAGTTGTTGAGAGGGTTGCCCAAAGGCAGTATATAGAGCATACCC
AGTAAAACTTACAAGTAACCCAGATATAAAGATGGCGACTAGAGTTGCTGTTTCCATTAT
TATAGAATTGAAAGACCACAATGGATCTATGCTAAGATCGTTTATTTACAACGGAATGGT
ATACAAAGTCAACAGATCGTAATGAATACAAAATAAGATTTATGGCTACACAAACTGTTG
AAGATAGTTCTAGATCTGGTCCAAGAAGCACTACTGTAGGGAAGTTATTGAAACCGTTGA
ATTCTGAATATGGTAAAGTAGCTCCTGGATGGGGAACGACCCCTTTGATGGGTGTTGCAA
TGGCGCTATTTGCGGTATTCCTATCTATTATTTTGGAGATTTATAATTCTTCTGTTCTAC
TGGATGGAATTTCAGTGAATTAGACTGAGAAGAATCTTGAAGTCCTAGCTTTTTGTTCGA
TACAAAAAAAGTAAAGTATGTAGGTCTAAAATTTTTAGCCTGTTCTCCTTTGGTAGTTTG
ACCGCGAAATTTTTTTTCTGCATTGTATATTTCCGGAATATGAGTAAAGTTTATGATTGG
TTCGAAGAACGTCTTGAGATTCAAGCGATTGCAGACGATATAACTAGTAAATATGTTCCT
CCGCATGTCAACATATTTTATTGTCTAGGAGGAATTACCCTTACTTGTTTTTTAGTACAA
GTAGCTACGGGATTTGCTATGACTTTTTATTACCGTCCAACTGTTACTGAGGCTTTTGCT
TCTGTTCAATATATAATGACTGAAGCTAACTTTGGTTGGTTAATCCGATCAGTTCATCGA
TGGTCGGCAAGTATGATGGTCCTAATGATGATCCTGCACCATTCACAAAGAGAGGATTGC
TCCTCAAGTTCTTGATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM94TF U 1
AF RR2CQ42TF U 357
AF RR2FB84TF U 774
AF RR2FM87TF U 357
BS 1 662 RR2BM94TF
BS 663 669 RR2CQ42TF
BS 670 670 RR2FM87TF
BS 671 1020 RR2CQ42TF
BS 1021 1098 RR2FM87TF

RD RR2BM94TF 662 0 0
GGAAGCATTGGTTTATACATTTCTCTTAGTATCGACTTTAGGGATCATTTTTTTCGCTAT
TTTTTTTCGGGAACCGCCTACAATTTCAACTAAAAAATGAAATAATTTTTCATTCTCTTC
ATTGACGTAATCAGCCTCCAAATAGTCGGAGGCTGATTACGTTAACTAGTCCCCGTGTTC
CTCGAATGGATCTCTTAGTTGTTGAGAGGGTTGCCCAAAGGCAGTATATAGAGCATACCC
AGTAAAACTTACAAGTAACCCAGATATAAAGATGGCGACTAGAGTTGCTGTTTCCATTAT
TATAGAATTGAAAGACCACAATGGATCTATGCTAAGATCGTTTATTTACAACGGAATGGT
ATACAAAGTCAACAGATCGTAATGAATACAAAATAAGATTTATGGCTACACAAACTGTTG
AAGATAGTTCTAGATCTGGTCCAAGAAGCACTACTGTAGGGAAGTTATTGAAACCGTTGA
ATTCTGAATATGGTAAAGTAGCTCCTGGATGGGGAACGACCCCTTTGATGGGTGTTGCAA
TGGCGCTATTTGCGGTATTCCTATCTATTATTTTGGAGATTTATAATTCTTCTGTTCTAC
TGGATGGAATTTCAGTGAATTAGACTGAGAAGAATCTTGAAGTCCTAGCTTTTTGTTCGA
TA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2CQ42TF 664 0 0
G
GGTATACAAAGTCAACAGATCGTAATGAATACAAAATAAGATTTATGGCTACACAAACTG
TTGAAGATAGTTCTAGATCTGGTCCAAGAAGCACTACTGTAGGGAAGTTATTGAAACCGT
TGAATTCTGAATATGGTAAAGTAGCTCCTGGATGGGGAACGACCCCTTTGATGGGTGTTG
CAATGGCGCTATTTGCGGTATTCCTATCTATTATTTTGGAGATTTATAATTCTTCTGTTC
TACTGGATGGAATTTCAGTGAATTAGACTGAGAAGAATCTTGAAGTCCTAGCTTTTTGTT
CGATACAAAAAA*GTAAAGTATGTAGGTCTAAAATTTTTAGCCTGTTCTCCTTTGGTAGT
TTGACCGCGAAATTTTTTTTCTGCATTGTATATTTCCGGAATATGAGTAAAGTTTATGAT
TGGTTCGAAGAACGTCTTGAGATTCAAGCGATTGCAGACGATATAACTAGTAAATATGTT
CCTCCGCATGTCAACATATTTTATTGTCTAGGAGGAATTACCCTTACTTGTTTTTTAGTA
CAAGTAGCTACGGGATTTGCTATGACTTTTTATTACCGTCCAACTGTTACTGAGGCTTTT
GCTTCTGTTCAATATATAATGACTGAAGCTAACTTTGGTTGGTTAATCCGATCAGTTCAT
CGA

QA 2 664 2 664
DS 

RD RR2FB84TF 284 0 0
TGATTGGTTCGAAGAACGTCTTGAGATTCAAGCGATTGCAGACGATATAACTAGTAAATA
TGTTCCTCCGCATGTCAACATATTTTATTGTCTAGGAGGAATTACCCTTACTTGTTTTTT
AGTACAAGTAGCTACGGGATTTGCTATGACTTTTTATTACCGTCCAACTGTTACTGAGGC
TTTTGCTTCTGTTCAATATATAATGACTGAAGCTAACTTTGGTTGGTTAATCCGATCAGT
TCATCGATGGTCGGCAAGTATGATGGTCCTAATGATGATCCTGC

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2FM87TF 742 0 0
G
GGTATACAAAGTCAACAGATCGTAATGAATACAAAATAAGATTTATGGCTACACAAACTG
TTGAAGATAGTTCTAGATCTGGTCCAAGAAGCACTACTGTAGGGAAGTTATTGAAACCGT
TGAATTCTGAATATGGTAAAGTAGCTCCTGGATGGGGAACGACCCCTTTGATGGGTGTTG
CAATGGCGCTATTTGTGGTATTCCTATCTATTATTTTGGAGATTTATAATTCTTCTGTTC
TACTGGATGGAATTTCAGTGAATTAGACTGAGAAGAATCTTGAAGTCCTAGCTTTTTGTT
CGATACAAAAAAAGTAAAGTATGTAGGTCTAAAATTTTTAGCCTGTTCTCCTTTGGTAGT
TTGACCGCGAAATTTTTTTTCTGCATTGTATATTTCCGGAATATGAGTAAAGTTTATGAT
TGGTTCGAAGAACGTCTTGAGATTCAAGCGATTGCAGACGATATAACTAGTAAATATGTT
CCTCCGCATGTCAACATATTTTATTGTCTAGGAGGAATTACCCTTACTTGTTTTTTAGTA
CAAGTAGCTACGGGATTTGCTATGACTTTTTATTACCGTCCAACTGTTACTGAGGCTTTT
GCTTCTGTTCAATATATAATGACTGAAGCTAACTTTGGTTGGTTAATCCGATCAGTTCAT
CGATGGTCGGCAAGTATGATGGTCCTAATGATGATCCTGCACCATTCACAAAGAGAGGAT
TGCTCCTCAAGTTCTTGATCA

QA 2 742 2 742
DS 



CO CL241Contig3 1081 2 4 U
AAAAGACGGTTGTCGCCACTGGACGACGAAATGGATTTTGGAACTTATTAACATTTTCCA
AAAAGGGTACGGTTAATAATCCCGCCGGTACTGAAGCCATTAAAAGAACACCCAATAATT
TGTTAGGCACTGTACGAAGTATTTGAAATACAGGAAAGAAATACCATTCAGGTAATATTT
CCAAAGGAGTTGCAAAAGGGTCCGCAGGTTCACCAATCATTGATGGTTCTAAAACCGCTA
AGCCTACGTTACAGGCAATGGTACCAAGAATGACTACTGGAAAAATATATAAAAGATCAT
TGGGCCATGCGGGTTCTCCGTAATAATTATGACCCATACCTTTAGCTAATTTAGCTCGTA
ATACAGGATCATTCAAATCTGGTTTTTTTGTTACTCCCATAATCCATTTTCTCTTCATAG
AATTCCCTTCAACTTTTTATGTCAAAAAAATAATACAATATTGTGGAGTTGAAGGGAAAT
ATCCAAATACATGTCTTATTTTTTTAATAATCCATATTTATAGCAATAAAATACGATTGT
TCCTTCACCAAGTAATAAGATAAATTAGTAATTAAAAATATCTAGAATCTATATTATTTA
TAAGAGACCAGAAATACCTTGCTTACGTATCATTAAGAAATGCATTAACATAAATACAGC
CGTAAGAAGAGGTAATACAAAAGTGTGTAAACTATAAAAACGAGTCAAAGTGGATTGTCC
AACACTAGCACTTCCGCGTAATAATTCTACAAGAGGCGATCCTATTACCGGAATAGCGTC
AGGTACACCTGTTACAATTTTGACTGCCCAATAGCCAATTTGATCCCAAGGTAAAGAATA
ACCTGTTACACCAAAAGATGCGGTCAATACACCCAGAACCACACCAGTAACCCAAGTTAA
TTCGCGAGGTTTTTTAAAACCACCGGTGAGGTATACACGAAATACGTGCAGGATCATCAT
TAGGACCATCATACTTGCCGACCATCGATGAACTGATCGGATTAACCAACCAAAGTTAGC
TTCAGTCATTATATATTGAACAGAAGCAAAAGCCTCAGTAACAGTTGGACGGTAATAAAA
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2CQ42JQ U 1
AF RR2CX53JQ U 466
BS 1 526 RR2CQ42JQ
BS 527 527 RR2CX53JQ
BS 528 578 RR2CQ42JQ
BS 579 1081 RR2CX53JQ

RD RR2CQ42JQ 578 0 0
AAAAGACGGTTGTCGCCACTGGACGACGAAATGGATTTTGGAACTTATTAACATTTTCCA
AAAAGGGTACGGTTAATAATCCCGCCGGTACTGAAGCCATTAAAAGAACACCCAATAATT
TGTTAGGCACTGTACGAAGTATTTGAAATACAGGAAAGAAATACCATTCAGGTAATATTT
CCAAAGGAGTTGCAAAAGGGTCCGCAGGTTCACCAATCATTGATGGTTCTAAAACCGCTA
AGCCTACGTTACAGGCAATGGTACCAAGAATGACTACTGGAAAAATATATAAAAGATCAT
TGGGCCATGCGGGTTCTCCGTAATAATTATGACCCATACCTTTAGCTAATTTAGCTCGTA
ATACAGGATCATTCAAATCTGGTTTTTTTGTTACTCCCATAATCCATTTTCTCTTCATAG
AATTCCCTTCAACTTTTTATGTCAAAAAAATAATACAATATTGTGGAGTTGAAGGGAAAT
ATCCAAATACATGTCTTATTTTTTTAATAATCCATATTTATAGCAA*AAAATACGATTGT
TCCTTCACCAAGTAATAAGATAAATTAGTAATTAAAAA

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2CX53JQ 616 0 0
GAGTTGAAGGGAAATATCCAAATACATGTCTTATTTTTTTAATAATCCATATTTATAGCA
ATAAAATACGATTGTTCCTTCACCAAGTAATAAGATAAATTAGTAATTAAAAATATCTAG
AATCTATATTATTTATAAGAGACCAGAAATACCTTGCTTACGTATCATTAAGAAATGCAT
TAACATAAATACAGCCGTAAGAAGAGGTAATACAAAAGTGTGTAAACTATAAAAACGAGT
CAAAGTGGATTGTCCAACACTAGCACTTCCGCGTAATAATTCTACAAGAGGCGATCCTAT
TACCGGAATAGCGTCAGGTACACCTGTTACAATTTTGACTGCCCAATAGCCAATTTGATC
CCAAGGTAAAGAATAACCTGTTACACCAAAAGATGCGGTCAATACACCCAGAACCACACC
AGTAACCCAAGTTAATTCGCGAGGTTTTTTAAAACCACCGGTGAGGTATACACGAAATAC
GTGCAGGATCATCATTAGGACCATCATACTTGCCGACCATCGATGAACTGATCGGATTAA
CCAACCAAAGTTAGCTTCAGTCATTATATATTGAACAGAAGCAAAAGCCTCAGTAACAGT
TGGACGGTAATAAAAA

QA 1 616 1 616
DS 



CO CL241Contig4 849 4 9 U
GGGTATACAAAGTCAACAGATCGTAATGAATACAAAATAAGATTTATGGCTACACAAACT
GTTGAAGATAGTTCTAGATCTGGTCCAAGAAGCACTACTGTAGGGAAGTTATTGAAACCG
TTGAATTCTGAATATGGTAAAGTAGCTCCTGGATGGGGAACGACCCCTTTGATGGGTGTT
GCAATGGCGCTATTTGCGGTATTCCTATCTATTATTTTGGAGATTTATAATTCTTCTGTT
CTACTGGATGGAATTTCAGTGAATTAGACTGAGAAGAATCTTGAAGTCCTAGCTTTTTGT
TCGATACAAAAAAGTAAAGTATGTAGGTCTAAAATTTTTAGCCTGTTCTCCTTTGGTAGT
TTGACCGCGAAATTTTTTTTCTGCATTGTATATTTCCGGAATATGAGTGTGTGACTTGTT
AGAATTGACCCTATGGATAGTACAGAGAAGGGGGTCTGTCATCTTTATCAAGATGGTTTT
ACTTCGTCGGATATTCATTCGAGTATCTGGAGCACGAAATAGATCAAATAGATCACAAAG
TTTTCGAACTATGATTCATACTTAATACTTAGACCTCGTAGCCGGACTTCTTTCCGTTCT
ATCTTATAAATTTTCATAAATCAAACTTTTTTCTGCTTTTAAACTCTTATTTAGATCAAA
GGACAAACGCTTCTTTGTATTTTATGTTTTTAATCATTATAGCTCTTTTTTTTGATTGAA
TAAGTGATGATCCAATGGTTCTCACTCAGTGAACTCTGGACTTTGAAGGTTTCATTGAAT
TATCGTGGTTCTCGTATGAATCTGAGGTTTCAATTAATTAAGTAGGGTCTTAACAAGAAA
ATTCCTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2GS11TF U 1
AF RR2DL59TF U 45
AF RR2BM94JQ C 72
AF RR2GS11JQB C 122
BS 1 322 RR2GS11TF
BS 323 323 RR2DL59TF
BS 324 657 RR2GS11TF
BS 658 704 RR2DL59TF
BS 705 712 RR2BM94JQ
BS 713 713 RR2GS11JQB
BS 714 755 RR2BM94JQ
BS 756 756 RR2GS11JQB
BS 757 849 RR2BM94JQ

RD RR2GS11TF 657 0 0
GGGTATACAAAGTCAACAGATCGTAATGAATACAAAATAAGATTTATGGCTACACAAACT
GTTGAAGATAGTTCTAGATCTGGTCCAAGAAGCACTACTGTAGGGAAGTTATTGAAACCG
TTGAATTCTGAATATGGTAAAGTAGCTCCTGGATGGGGAACGACCCCTTTGATGGGTGTT
GCAATGGCGCTATTTGCGGTATTCCTATCTATTATTTTGGAGATTTATAATTCTTCTGTT
CTACTGGATGGAATTTCAGTGAATTAGACTGAGAAGAATCTTGAAGTCCTAGCTTTTTGT
TCGATACAAAAAAGTAAAGTATTTAGGTCTAAAATTTTTAGCCTGTTCTCCTTTGGTAGT
TTGACCGCGAAATTTTTTTTCTGCATTGTATATTTCCGGAATATGAGTGTGTGACTTGTT
AGAATTGACCCTATGGATAGTACAGAGAAGGGGGTCTGTCATCTTTATCAAGATGGTTTT
ACTTCGTCGGATATTCATTCGAGTATCTGGAGCACGAAATAGATCAAATAGATCACAAAG
TTTTCGAACTATGATTCATACTTAATACTTAGACCTCGTAGCCGGACTTCTTTCCGTTCT
ATCTTATAAATTTTCATAAATCAAACTTTTTTCTGCTTTTAAACTCTTATTTAGATC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2DL59TF 660 0 0
G
ATGGCTACACAAACTGTTGAAGATAGTTCTAGATCTGGTCCAAGAAGCACTACTGTAGGG
AAGTTATTGAAACCGTTGAATTCTGAATATGGTAAAGTAGCTCCTGGATGGGGAACGACC
CCTTTGATGGGTGTTGCAATGGCGCTATTTGCGGTATTCCTATCTATTATTTTGGAGATT
TATAATTCTTCTGTTCTACTGGATGGAATTTCAGTGAATTAGACTGAGAAGAATCTTGAA
GTCCTAGCTTTTTGTTCGATACAAAAAAGTAAAGTATGTAGGTCTAAAATTTTTAGCCTG
TTCTCCTTTGGTAGTTTGACCGCGAAATTTTTTTTCTGCATTGTATATTTCCGGAATATG
AGTGTGTGACTTGTTAGAATTGACCCTATGGATAGTACAGAGAAGGGGGTCTGTCATCTT
TATCAAGATGGTTTTACTTCGTCGGATATTCATTCGAGTATCTGGAGCACGAAATAGATC
AAATAGATCACAAAGTTTTCGAACTATGATTCATACTTAATACTTAGACCTCGTAGCCGG
ACTTCTTTCCGTTCTATCTTATAAATTTTCATAAATCAAACTTTTTTCTGCTTTTAAACT
CTTATTTAGATCAAAGGACAAACGCTTCTTTGTATTTTATGTTTTTAATCATTATAGCT

QA 2 660 2 660
DS 

RD RR2BM94JQ 778 0 0
TTCTAGATCTG*TCCAAGAAGCACTACTGTAGGGAAGTTATTGAAACCGTTGAATTCTGA
ATATGGTAAAGTAGCTCCTGGATGGGGAACGACCCCTTTGATGGGTGTTGCAATGGCGCT
ATTTGCGGTATTCCTATCTATTATTTTGGAGATTTATAATTCTTCTGTTCTACTGGATGG
AATTTCAGTGAATTAGACTGAGAAGAATCTTGAAGTCCTAGCTTTTTGTTCGATACAAAA
AAGTAAAGTATGTAGGTCTAAAATTTTTAGCCTGTTCTCCTTTGGTAGTTTGACCGCGAA
ATTTTTTTTCTGCATTGTATATTTCCGGAATATGAGTGTGTGACTTGTTAGAATTGACCC
TATGGATAGTACAGAGAAGGGGGTCTGTCATCTTTATCAAGATGGTTTTACTTCGTCGGA
TTTTCATTCGAGTATCTGGAGCACGAAATAGATCAAATAGATCACAAAGTTTTCGAACTA
TGATTCATACTTAATACTTAGACCTCGTAGCCGGACTTCTTTCCGTTCTATCTTATAAAT
TTTCATAAATCAAACTTTTTTCTGCTTTTAAACTCTTATTTAGATCAAAGGACAAACGCT
TCTTTGTATTTTATGTTTTTAATCATTATAGCTCTTTTTTT*GATTGAATAAGTGATGAT
CCAATGGTTCTCACTCAGTGAACTTTGGACTTTGAAGGTTTCATTGAATTATCGTGGTTC
TCGTATGAATCTGAGGTTTCAATTAATTAAGTAGGGTCTTAACAAGAAAATTCCTATC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2GS11JQB 728 0 0
TGAATTCTGAATATGGTAAAGTAGCTCCTGGATGGGGAACGACCCCTTTGATGGGTGTTG
CAATGGCGCTATTTGCGGTATTCCTATCTATTATTTTGGAGATTTATAATTCTTCTGTTC
TACTGGATGGAATTTCAGTGAATTAGACTGAGAAGAATCTTGAAGTCCTAGCTTTTTGTT
CGATACAAAAAAGTAAAGTATTTAGGTCTAAAATTTTTAGCCTGTTCTCCTTTGGTAGTT
TGACCGCGAAATTTTTTTTCTGCATTGTATATTTCCGGAATATGAGTGTGTGACTTGTTA
GAATTGACCCTATGGATAGTACAGAGAAGGGGGTCTGTCATCTTTATCAAGATGGTTTTA
CTTCGTCGGATATTCATTCGAGTATCTGGAGCACGAAATAGATCAAATAGATCACAAAGT
TTTCGAACTATGATTCATACTTAATACTTAGACCTCGTAGCCGGACTTCTTTCCGTTCTA
TCTTATAAATTTTCATAAATCAAACTTTTTTCTGCTTTTAAACTCTTATTTAGATCAAAG
GACAAACGCTTCTTTGTATTTTATGTTTTTAATCATTATAGCTCTTTTTTTTGATTGAAT
AAGTGATGATCCAATGGTTCTCACTCAGTGAACTCTGGACTTTGAAGGTTTCATTGAATT
ATCGTGGTTCTCGTATGAATCTGAGGTTTCAATTAATTAAGTAGGGTCTTAACAAGAAAA
TTCC
TATC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 2 13

CO CL242Contig1 1697 9 20 U
GGAAATGGGCTAAAGAAGAAGATTGCTAGTCACACTCTCTCCTCTCCTTCTCAATCTCTC
CTGATCCTCTCCCTCTTCTCCCAACCCCCCACATGGCATCCGTCGCAGCAAGTCCAGCTT
TCTCACTCCTCAAGTCAACCACCGGAGGAGCCTCTTCTTCCTCCGCCGCAACTCGCGCGC
GCGCCTCCCTTTCCCCCATCCCCTCTAAATCCATCTCCACCCGTCCTCTAGGCTTCTCCG
CCGTCCTCGACTCACGTTTCGCCGTCCATGTCGCCTCGAAGGTTCACTCTTTCCGAGGGA
AAGGCACCAGAGGAGTCGTTTCCATGGCGAAGAAGAGCGTTGGAGATCTTACCTCTGCTG
ATTTGAAAGGGAAGAAGGTTTTCGTTAGAGCTGATCTCAATGTACCTCTCGATGACAGTC
AGACGATCACTGATGATACTAGGATCCGTGCCGCCATTCCGACGATCAAGTACTTGATCG
ACAATGGTGCCAAAGTCATCCTCTCCACTCATCTGGGAAGGCCAAAGGGAGTGACACCGA
AGTTTAGTTTGGCTCCTCTTGTCCCTAGGCTATCTGAGCTTCTTGGTATTGAGGTCAAGA
AAGCTGACGACTGTATCGGTCCGGAAGTTGAGAGCCTTGTGGCTTCTCTACCCGATGGTG
GAGTATTGCTTCTTGAGAACGTCAGGTTCTACAAGGAAGAAGAGAAGAACGATCCAGAGT
TCGCTAAGAAGCTTGCTTCACTAGCTGACCTCTACGTCAACGATGCTTTTGGAACTGCTC
ACAGAGCTCATGCTTCCACTGAGGGAGTCACAAAGTTCTTGAAGCCTTCTGTTGCTGGTT
TCCTTCTCCAAAAGGAGCTTGATTACCTTGTGGGAGCTGTTTCAAGCCCAAAGAGACCGT
TTGCAGCTATCGTTGGTGGTTCTAAAGTCTCGTCCAAGATTGGAGTTATTGAATCGCTTC
TTGAGAAGTGTGATATCCTTCTTCTTGGTGGTGGAATGATCTTTACGTTCTACAAGGCGC
AGGGTCTTTCTGTTGGCTCGTCTCTAGTTGAAGAAGACAAGCTTGAGTTGGCTACTTCAC
TCCTCGCCAAAGCTAAGGCTAAAGGAGTCTCTCTTTTGTTGCCAACTGATGTTGTGGTTG
CTGACAAGTTCGCTCCTGATGCCAATAGTAAGGTTGTGTCTGCATCAGGCATTGAGGACG
GGTGGATGGGACTGGACATTGGTCCAGACTCGATTAAAACATTCAACGAAGCTTTGGACA
CAACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGATGGAGAAGTTTGCTG
CTGGAACAGAGGCCATTGCGAATAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGAAAGGAGTGACGACGA
TAATAGGAGGAGGAGACTCGGTGGCTGCAGTCGAGAAAGTGGGAGTTGCGGGAGTCATGA
GTCACATCTCAACTGGTGGTGGAGCCAGCTTGGAGCTCTTGGAAGGTAAAGTACTTCCCG
GTGTGATCGCTCTCGATGAAGCAATCGCAGTCACCGTTTAGAAGAAGCTCACTCTTCTGA
TGAGGCGAACGAATGTATACTCTCATATGAGTTTTTTTTTT*ACTTTCTTTTGCTGTAAA
TCTACCTATTCAACAGTTTGACTTTTATTCACTACCTCCAAGTCAGAGACTTATTATTAT
CAATAAAAGTTACTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
40 25 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 0 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2E250TF U 1
AF RR2DJ61TF U 510
AF RR2GC20TF U 902
AF RR2GO60TF U 902
AF RR2FX59TF U 1027
AF RR2GC20JQ C 903
AF RR2GO60JQ C 1186
AF RR2E250JQ C 1118
AF RR2DJ61JQ C 1032
BS 1 685 RR2E250TF
BS 686 908 RR2DJ61TF
BS 909 909 RR2GC20TF
BS 910 1047 RR2DJ61TF
BS 1048 1048 RR2GC20TF
BS 1049 1096 RR2DJ61TF
BS 1097 1097 RR2GC20TF
BS 1098 1172 RR2DJ61TF
BS 1173 1173 RR2GC20TF
BS 1174 1188 RR2DJ61TF
BS 1189 1560 RR2GC20TF
BS 1561 1564 RR2GO60TF
BS 1565 1565 RR2FX59TF
BS 1566 1599 RR2GO60TF
BS 1600 1601 RR2FX59TF
BS 1602 1619 RR2GO60TF
BS 1620 1620 RR2FX59TF
BS 1621 1673 RR2GO60TF
BS 1674 1695 RR2GC20JQ
BS 1696 1697 RR2DJ61JQ

RD RR2E250TF 704 0 0
GGAAATGGGCTAAAGAAGAAGATTGCTAGTCACACTCTCTCCTCTCCTTCTCAATCTCTC
CTGATCCTCTCCCTCTTCTCCCAACCCCCCACATGGCATCCGTCGCAGCAAGTCCAGCTT
TCTCACTCCTCAAGTCAACCACCGGAGGAGCCTCTTCTTCCTCCGCCGCAACTCGCGCGC
GCGCCTCCCTTTCCCCCATCCCCTCTAAATCCATCTCCACCCGTCCTCTAGGCTTCTCCG
CCGTCCTCGACTCACGTTTCGCCGTCCATGTCGCCTCGAAGGTTCACTCTTTCCGAGGGA
AAGGCACCAGAGGAGTCGTTTCCATGGCGAAGAAGAGCGTTGGAGATCTTACCTCTGCTG
ATTTGAAAGGGAAGAAGGTTTTCGTTAGAGCTGATCTCAATGTACCTCTCGATGACAGTC
AGACGATCACTGATGATACTAGGATCCGTGCCGCCATTCCGACGATCAAGTACTTGATCG
ACAATGGTGCCAAAGTCATCCTCTCCACTCATCTGGGAAGGCCAAAGGGAGTGACACCGA
AGTTTAGTTTGGCTCCTCTTGTCCCTAGGCTATCTGAGCTTCTTGGTATTGAGGTCAAGA
AAGCTGACGACTGTATCGGTCCGGAAGTTGAGAGCCTTGTGGCTTCTCTACCCGATGGTG
GAGTATTGCTTCTTGAGAACGTCAG
TTCTACAAGAAGAGAGAAG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2DJ61TF 683 0 0
G
ATCTGGGAAGGCCAAAGGGAGTGACACCGAAGTTTAGTTTGGCTCCTCTTGTCCCTAGGC
TATCTGAGCTTCTTGGTATTGAGGTCAAGAAAGCTGACGACTGTATCGGTCCGGAAGTTG
AGAGCCTTGTGGCTTCTCTACCCGATGGTGGAGTATTGCTTCTTGAGAACGTCAGGTTCT
ACAAGGAAGAAGAGAAGAACGATCCAGAGTTCGCTAAGAAGCTTGCTTCACTAGCTGACC
TCTACGTCAACGATGCTTTTGGAACTGCTCACAGAGCTCATGCTTCCACTGAGGGAGTCA
CAAAGTTCTTGAAGCCTTCTGTTGCTGGTTTCCTTCTCCAAAAGGAGCTTGATTACCTTG
TGGGAGCTGTTTCAAGCCCAAAGAGACCGTTTGCAGCTGTCGTTGGTGGTTCTAAAGTCT
CGTCCAAGATTGGAGTTATTGAATCGCTTCTTGAGAAGTGTGATATCCTTCTTCTTGGTG
GTGGAATGATCTTTACGTTCTACAAGGCGCAGGGTCTTTCTGTTGGCTCGTCTCTAGCTG
AAGAAGACAAGCTTGAGTTGGCTACTTCACTCCTCGCCAAAGCTAAAGCTAAAGGAGTCT
CTCTTTTGTTGCCAACTGATGTTGTGGTTGCTGACAAGTTCGCTCCTGATGCCAATAGTA
AG*TTGTGTCTGCATCAG
CATT

QA 2 679 2 679
DS 

RD RR2GC20TF 659 0 0
G
GCAGCTATCGTTGGTGGTTCTAAAGTCTCGTCCAAGATTGGAGTTATTGAATCGCTTCTT
GAGAAGTGTGATATCCTTCTTCTTGGTGGTGGAATGATCTTTACGTTCTACAAGGCGCAG
GGTCTTTCTGTTGGCTCGTCTCTAGTTGAAGAAGACAAGCTTGAGTTGGCTACTTCACTC
CTCGCCAAAGCTAAGGCTAAAGGAGTCTCTCTTTTGTTGCCAACTGATGTTGTGGTTGCT
GACAAGTTCGCTCCTGATGTCAATAGTAAGGTTGTGTCTGCATCAGGCATTGAGGACGGG
TGGATGGGACTGGACATTGGTCCAGACTCGATTAAAACATTCAACGAAGCTTTGGACACA
ACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGATGGAGAAGTTTGCTGCT
GGAACAGAGGCCATTGCGAATAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGAAAGGAGTGACGACGATA
ATAGGAGGAGGAGACTCGGTGGCTGCAGTCGAGAAAGTGGGAGTTGCGGGAGTCATGAGT
CACATCTCAACTGGTGGTGGAGCCAGCTTGGAGCTCTTGGAAGGTAAAGTACTTCCCGGT
GTGATCGCTCTCGATGAAGCAATCGCAGTCACCGTTTAGAAGAAGCTCACTCTTCTGA

QA 2 659 2 659
DS 

RD RR2GO60TF 772 0 0
G
GCAGCTATCGTTGGTGGTTCTAAAGTCTCGTCCAAGATTGGAGTTATTGAATCGCTTCTT
GAGAAGTGTGATATCCTTCTTCTTGGTGGTGGAATGATCTTTACGTTCTACAAGGCGCAG
GGTCTTTCTGTTGGCTCGTCTCTAGTTGAAGAAGACAAGCTTGAGTTGGCTACTTCACTC
CTCGCCAAAGCTAAGGCTAAAGGAGTCTCTCTTTTGTTGCCAACTGATGTTGTGGTTGCT
GACAAGTTCGCTCCTGATGTCAATAGTAAGGTTGTGTCTGCATCAGGCATTGAGGACGGG
TGGATGGGACTGGACATTGGTCCAGACTCGATTAAAACATTCAACGAAGCTTTGGACACA
ACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGATGGAGAAGTTTGCTGCT
GGAACAGAGGCCATTGCGAATAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGAAAGGAGTGACGACGATA
ATAGGAGGAGGAGACTCGGTGGCTGCAGTCGAGAAAGTGGGAGTTGCGGGAGTCATGAGT
CACATCTCAACTGGTGGTGGAGCCAGCTTGGAGCTCTTGGAAGGTAAAGTACTTCCCGGT
GTGATCGCTCTCGATGAAGCAATCGCAGTCACCGTTTAGAAGAAGCTCACTCTTCTGATG
AG*CGAACGAATGTATACTCTCATATGAGTTTTTTTT***ACTTTCTTTTGCTGTAA*TC
TACCTATTCAACAGTTTGACTTTTATTCACTACCTCCAAGTCAGAGACTTA

QA 2 772 2 772
DS 

RD RR2FX59TF 637 0 0
AGG
CTGTTGGCTCGTCTCTAGTTGAAGAAGACAAGCTTGAGTTGGCTACTTCT*TCCTCGCCA
AAGCTAAGGCTAAAGGAGTCTCTCTTTTGTTGCCAACTGATGTTGTGGTTGCTGACAAGT
TCGCTCCTGATGCCAATAGTAAGGTTGTGTCTGCATCAGGCATTGAGGACGGGTGGATGG
GACTGGACATTGGTCCAGACTCGATTAAAACATTCAACGAAGCTTTGGACACAACACAGA
CAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGATGGAGAAGTTTGCTGCTGGAACAG
AGGCCATTGCGAATAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGAAAGGAGTGACGACGATAATAGGAG
GAGGAGACTCGGTGGCTGCAGTCGAGAAAGTGGGAGTTGCGGGAGTCATGAGTCACATCT
CAACTGGTGGTGGAGCCAGCTTGGAGCTCTTGGAAGGTAAAGTACTTCCCGGTGTGATCG
CTCTCGATGAAGTAATCGCAGTCACCGTTTAGAAGAAGCTCACTCTTCTGATGAGGCGAG
CGAATGTATACTCTCATATGAGTTTTTTTTTT*ACTTTCTTTTGCTGTAAATCTACCTAT
TCAACAGTTTGACTTTTATTCACTACCTCCAAGT

QA 4 637 4 637
DS 

RD RR2GC20JQ 795 0 0
GCAGCTATCGTTGGTGGTTCTAAAGTCTCGTCCAAGATTGGAGTTATTGAATCGCTTCTT
GAGAAGTGTGATATCCTTCTTCTTGGTGGTGGAATGATCTTTACGTTCTACAAGGCGCAG
GGTCTTTCTGTTGGCTCGTCTCTAGTTGAAGAAGACAAGCTTGAGTTGGCTACTTCACTC
CTCGCCAAAGCTAAGGCTAAAGGAGTCTCTCTTTTGTTGCCAACTGATGTTGTGGTTGCT
GACAAGTTCGCTCCTGATGTCAATAGTAAGGTTGTGTCTGCATCAGGCATTGAGGACGGG
TGGATGGGACTGGACATTGGTCCAGACTCGATTAAAACATTCAACGAAGCTTTGGACACA
ACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGATGGAGAAGTTTGCTGCT
GGAACAGAGGCCATTGCGAATAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGAAAGGAGTGACGACGATA
ATAGGAGGAGGAGACTCGGTGGCTGCAGTCGAGAAAGTGGGAGTTGCGGGAGTCATGAGT
CACATCTCAACTGGTGGTGGAGCCAGCTTGGAGCTCTTGGAAGGTAAAGTACTTCCCGGT
GTGATCGCTCTCGATGAAGCAATCGCAGTCACCGTTTAGAAGAAGCTCACTCTTCTGATG
AGGCGAACGAATGTATACTCTCATATGAGTTTTTTTTT**ACTTTCTTTTGCTGTAAATC
TACCTATTCAACAGTTTGACTTTTATTCACTACCTCCAAGTCAGAGACTTATTATTATCA
ATAAAAGTTACTT
AC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2GO60JQ 512 0 0
CAGGCATTGAGGACGGGTGGATGGGACTGGACATTGGTCCAGACTCGATTAAAACATTCA
ACGAAGCTTTGGACACAACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGA
TGGAGAAGTTTGCTGCTGGAACAGAGGCCATTGCGAATAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGA
AAGGAGTGACGACGATAATAGGAGGAGGAGACTCGGTGGCTGCAGTCGAGAAAGTGGGAG
TTGCGGGAGTCATGAGTCACATCTCAACTGGTGGTGGAGCCAGCTTGGAGCTCTTGGAAG
GTAAAGTACTTCCCGGTGTGATCGCTCTCGATGAAGCAATCGCAGTCACCGTTTAGAAGA
AGCTCACTCTTCTGATGAGGCGAACGAATGTATACTCTCATATGAGTTTTTTTTT**ACT
TTCTTTTGCTGTAAATCTACCTATTCAACAGTTTGACTTTTATTCACTACCTCCAAGTCA
GAGACTTATTATTATCAATAAAAGTTACTT
AC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2E250JQ 579 0 0
GTTGCCAACTGATGTTGTGGTTGCTGACAAGTTCGCTCCTGATGCCAATAGTAAGGTTGT
GTCTGCATCAGGCATTGAGGACGGGTGGATGGGACTGGACATTGGTCCAGACTCGATTAA
AACATTCAACGAAGCTTTGGACACAACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGT
TTTCGAGATGGAGAAGTTTGCTGCTGGAACAGAGGCCATTGCGAATAAACTAGCAGAGCT
AAGTGAGAAAGGAGTGACGACGATAATAGGAGGAGGAGACTCGGTGGCTGCAGTCGAGAA
AGTGGGAGTTGCGGGAGTCATGAGTCACATCTCAACTGGTGGTGGAGCCAGCTTGGAGCT
CTTGGAAGGTAAAGTACTTCCCGGTGTGATCGCTCTCGATGAAGCAATCGCAGTCACCGT
TTAGAAGAAGCTCACTCCTCTGATTAGGCGAACGAATGTATACTCTCACATGAGTTTTTT
TTTT*ACCTTCTTTTGCTGTAAATCTACCTATTCAACAGTTTGACTTTTATTCACTACCT
CCAAGCCAGAGACTTATTATTATCAATAAAAGTTACTT
G

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2DJ61JQ 666 0 0
GTTGGCTCGTCTCTAGCTGAAGAAGACAAGCTTGAGTTGGCTACTTCACTCCTCGCCAAA
GCTAAGGCTAAAGGAGTCTCTCTTTTGTTGCCAACTGATGTTGTGGTTGCTGACAAGTTC
GCTCCTGATGCCAATAGTAAGGTTGTGTCTGCATCAGGCATTGAGGACGGGTGGATGGGA
CTGGACATTGGTCCAGACTCGATTAAAACATTCAACGAAGCTTTGGACACAACACAGACG
GTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGATGGAGAAGTTTGCTGCTGGAACAGAG
GCCATTGCGAACAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGAAAGGAGTGACGACGATAATAGGAGGA
GGAGACTCGGTGGCTGCAGTCGAGAAAGTGGGAGTTGCGGGAGTCATGAGTCACATCTCA
ACTGGTGGTGGAGCCAGCTTGGAGCTCTTGGAAGGTAAAGTACTTCCCGGTGTGATCGCT
CTCGATGAAGCAATCGCAGTCACCGTTTAGAAGAAGCTCACTCTTCTGATGAGGCGAACG
AATGTATACTCTCATATGAGTTTTTTTTTTTACTTTCTTTTGCTGTAAATCTACCTATTC
AACAGTTTGACTTTTATTCACTACCTCCAAGTCAGAGACTTATTATTATCAATAAAAGTT
ACTTGC

QA 1 666 1 666
DS 



CO CL242Contig2 1590 4 25 U
GGGGTCGCACACTCTCTCCTCAGTCTCATCTCCTCCTTGATCATACTTCAACCTCCACAT
GGCTTCCGTCGCCGCAAGTCCCGCCTTCTCCCTCCTCAAGTCCACCGGAGCCGCCGCAAC
TCGCGCGCGCGCCTCCCTTCTACCAGTCCCCTCCTTCAAATCCATCTCCTCCCGTCCTCT
CGGCTTCTCCGCCGTCCTCGACTCCCATCGTTTCACCCTCCACGTGGCCTCCAAGGTTCA
GTCTGCGCGCGGGAAAGGGAGCAGGGGAGTCGTCTCCATGGCGAAGAAGAGCGTCGGTGA
CTTGAGCTCAGCTGATTTGAAAGGGAAGAAGGTTTTCGTGAGAGCTGATCTGAATGTGCC
TCTCGATGATAATCAGAAGATTACTGACGATACGAGGATCCGTGCCGCCATTCCGACGAT
CAAGTATTTGATTGACAATGGTGCTAAAGTCATCCTCTCTACTCATCTGGGAAGACCAAA
GGGAGTGACACCAAAGTTCAGTTTAGCTCCTCTTGTCCCTAGGCTGTCTGAACTTCTTGG
TATTGAGGTCAAGAAAGCTGACGACTGTATCGGTCCGGAAGTGGAGAGCTTGGTGGCTTC
TCTCCCCGAAGGTGGAGTTCTGCTTCTTGAGAACGTCAGGTTTTACAAAGAGGAAGAGAA
GAACGATCCTGAGTTCGCTAAGAAGCTCGCTTCACTAGCTGACCTCTATGTCAACGATGC
TTTCGGAACTGCTCACAGAGCTCATGCTTCCACCGAGGGAGTCACAAAGTTCTTGAAACC
TTCAGTTGCTGGTTTCCTTCTTCAAAAAGAGCTTGATTACCTTGTGGGAGCTGTTTCGAA
CCCAAAGAGACCATTTGCAGCCATCGTGGGTGGTTCCAAGGTGTCGTCCAAGATTGGAGT
TATTGAATCGCTTCTTGAGAAGTGTGATATCCTTCTTCTTGGTGGTGGAATGATCTTTAC
GTTCTACAAGGCACAAGGTCTTTCTGTTGGCTCGTCACTTGTTGAAGAAGACAAACTTGA
GTTGGCTACGTCTCTCCTTGCTAAAGCTAAGGCTAAAGGCGTCTCTCTTTTGTCGCCAAC
CGATGTTGTGGTTGCTGACAAGTTCGCTCCTGATGCCAACAGCAAGGTTGTGCCAGCATC
AGGCATTGAGGACGGATGGATGGGACTGGACATCGGTCCAGACTCAGTAAAAACATTCAA
CGAGGCTCTGGACACAACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGAT
GGAGAAGTTTGCTGCTGGAACAGAGGCAGTTGCGAATAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGAA
AGGAGTGACAACTATAATAGGAGGAGGAGACTCAGTGGCTGCAGTGGAGAAAGTAGGAGT
TGCAGGAGTCATGAGTCACATCTCCACTGGTGGTGGAGCCAGCTTGGAGCTCTTGGAAAG
TAAAGTACTTCCCGGTGTGATCGCTCTTGATGAAGCCATCACTGTCACCGTTTAGAAAAC
TCACCCTTTTGATGAGAGGCCAACTGATGTATACTTCTTTTGCTGTAAATCATCATCATC
TACCTATTCAAGACTATGACCTTTTTTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2GF47TF U 1
AF RR2DU59TF U 597
AF RR2DR21JQ C 841
AF RR2DR21TF U 841
BS 1 603 RR2GF47TF
BS 604 604 RR2DU59TF
BS 605 662 RR2GF47TF
BS 663 663 RR2DU59TF
BS 664 727 RR2GF47TF
BS 728 728 RR2DU59TF
BS 729 753 RR2GF47TF
BS 754 993 RR2DU59TF
BS 994 994 RR2DR21TF
BS 995 1041 RR2DU59TF
BS 1042 1042 RR2DR21TF
BS 1043 1047 RR2DU59TF
BS 1048 1048 RR2DR21TF
BS 1049 1073 RR2DU59TF
BS 1074 1074 RR2DR21TF
BS 1075 1098 RR2DU59TF
BS 1099 1099 RR2DR21TF
BS 1100 1126 RR2DU59TF
BS 1127 1127 RR2DR21TF
BS 1128 1132 RR2DU59TF
BS 1133 1548 RR2DR21TF
BS 1549 1549 RR2DR21JQ
BS 1550 1570 RR2DR21TF
BS 1571 1571 RR2DR21JQ
BS 1572 1590 RR2DR21TF

RD RR2GF47TF 756 0 0
GGGGTCGCACACTCTCTCCTCAGTCTCATCTCCTCCTTGATCATACTTCAACCTCCACAT
GGCTTCCGTCGCCGCAAGTCCCGCCTTCTCCCTCCTCAAGTCCACCGGAGCCGCCGCAAC
TCGCGCGCGCGCCTCCCTTCTACCAGTCCCCTCCTTCAAATCCATCTCCTCCCGTCCTCT
CGGCTTCTCCGCCGTCCTCGACTCCCATCGTTTCACCCTCCACGTGGCCTCCAAGGTTCA
GTCTGCGCGCGGGAAAGGGAGCAGGGGAGTCGTCTCCATGGCGAAGAAGAGCGTCGGTGA
CTTGAGCTCAGCTGATTTGAAAGGGAAGAAGGTTTTCGTGAGAGCTGATCTGAATGTGCC
TCTCGATGATAATCAGAAGATTACTGACGATACGAGGATCCGTGCCGCCATTCCGACGAT
CAAGTATTTGATTGACAATGGTGCTAAAGTCATCCTCTCTACTCATCTGGGAAGACCAAA
GGGAGTGACACCAAAGTTCAGTTTAGCTCCTCTTGTCCCTAGGCTGTCTGAACTTCTTGG
TATTGAGGTCAAGAAAGCTGACGACTGTATCGGTCCGGAAGTGGAGAGCTTGGTGGCTTC
TCTTCCCGAAGGTGGAGTTCTGCTTCTTGAGAACGTCAGGTTTTACAAAGAGGAAGAGAA
GA*CGATCCTGAGTTCGCTAAGAAGCTCGCTTCACTAGCTGACCTCTATGTCAACGATGC
TTTCGGA*CTGCTCACAGAGCTCATGCTTCCAC
CGA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2DU59TF 543 0 0
CTTCTCTCCCCGAAGGTGGAGTTCTGCTTCTTGAGAACGTCAGGTTTTACAAAGAGGAAG
AGAAGAACGATCCTGAGTTCGCTAAGAAGCTCGCTTCACTAGCTGACCTCTATGTCAACG
ATGCTTTCGGAACTGCTCACAGAGCTCATGCTTCCACCGAGGGAGTCACAAAGTTCTTGA
AACCTTCAGTTGCTGGTTTCCTTCTTCAAAAAGAGCTTGATTACCTTGTGGGAGCTGTTT
CGAACCCAAAGAGACCATTTGCAGCCATCGTGGGTGGTTCCAAGGTGTCGTCCAAGATTG
GAGTTATTGAATCGCTTCTTGAGAAGTGTGATATCCTTCTTCTTGGTGGTGGAATGATCT
TTACGTTCTACAAGGCACAAGGTCTTTCTGTTGGCTCTTCACTTGTTGAAGAAGACAAAC
TTGAGTTGGCTACGTCTCTCCTTGCCAAAGCCAAGGCTAAAGGCGTCTCTCTTTTGTTGC
CAACCGATGTTGTGGTTGCTGATAAGTTCGCTCCTGATGCCAACAGCAAGATTGTG
CCAGCAT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2DR21JQ 749 0 0
G
CCAAAGAGACCATTTGCAGCCATCGTGGGTGGTTCCAAGGTGTCGTCCAAGATTGGAGTT
ATTGAATCGCTTCTTGAGAAGTGTGATATCCTTCTTCTTGGTGGTGGAATGATCTTTACG
TTCTACAAGGCACAAGGTCTTTCTGTTGGCTCGTCACTTGTTGAAGAAGACAAACTTGAG
TTGGCTACGTCTCTCCTTGCTAAAGCTAAGGCTAAAGGCGTCTCTCTTTTGTCGCCAACC
GATGTTGTGGTTGCTGACAAGTTCGCTCCTGATGCCAACAGCAAGGTTGTGCCAGCATCA
GGCATTGAGGACGGATGGATGGGACTGGACATCGGTCCAGACTCAGTAAAAACATTCAAC
GAGGCTCTGGACACAACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGATG
GAGAAGTTTGCTGCTGGAACAGAGGCAGTTGCGAATAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGAAA
GGAGTGACAACTATAATAGGAGGAGGAGACTCAGTGGCTGCAGTGGAGAAAGTAGGAGTT
GCAGGAGTCATGAGTCACATCTCCACTGGTGGTGGAGCCAGCTTGGAGCTCTTGGAAGGT
AAAGTACTTCCCGGTGTGATCGCTCTTGATGAAGCCATCACTGTCACCGTTTAGAAAACT
CACCCTTTTGATGAGAGGCCAACTGATGTATACTTCTTTTGCTGTAAATCATCATCATCT
ACCTATTCAAGACTATGACCTTTTTTT
T

QA 2 748 2 748
DS 

RD RR2DR21TF 750 0 0
G
CCAAAGAGACCATTTGCAGCCATCGTGGGTGGTTCCAAGGTGTCGTCCAAGATTGGAGTT
ATTGAATCGCTTCTTGAGAAGTGTGATATCCTTCTTCTTGGTGGTGGAATGATCTTTACG
TTCTACAAGGCACAAGGTCTTTCTGTTGGCTCGTCACTTGTTGAAGAAGACAAACTTGAG
TTGGCTACGTCTCTCCTTGCTAAAGCTAAGGCTAAAGGCGTCTCTCTTTTGTCGCCAACC
GATGTTGTGGTTGCTGACAAGTTCGCTCCTGATGCCAACAGCAAGGTTGTGCCAGCATCA
GGCATTGAGGACGGATGGATGGGACTGGACATCGGTCCAGACTCAGTAAAAACATTCAAC
GAGGCTCTGGACACAACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGATG
GAGAAGTTTGCTGCTGGAACAGAGGCAGTTGCGAATAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGAAA
GGAGTGACAACTATAATAGGAGGAGGAGACTCAGTGGCTGCAGTGGAGAAAGTAGGAGTT
GCAGGAGTCATGAGTCACATCTCCACTGGTGGTGGAGCCAGCTTGGAGCTCTTGGAAAGT
AAAGTACTTCCCGGTGTGATCGCTCTTGATGAAGCCATCACTGTCACCGTTTAGAAAACT
CACCCTTTTGATGAGAGGCCAACTGATGTATACTTCTTTTGCTGTAA*TCATCATCATCT
ACCTATTCA*GACTATGACCTTTTTTTAA

QA 2 750 2 750
DS 



AS 3 13

CO CL243Contig1 1061 5 9 U
GGATTTTCTTCTCCGTTTCTCACTCAAACAAAGTTTTTAGGGTTTTTGCGGAGGTTTTGA
AGCTAAACTACAATGGCGGAAGAGCACAAACACGAGGAATCGATCATGGAGAAGATCGCC
GAGAAGATCCACGGTCACGATAACTCTTCCTCTTCAGATTCAGATGACGATAAGAAAGAG
TCGTCCATCAAAACGAAGATCTACCGCCTCTTCGGACGAGAGAAGCCTGTCCACAAGGTC
TTCGGCGGCGGAAAACCTGCTGACATATTCCTATGGAGGAACAAGAAGGTATCAGGAGGA
GTGTTAGGTGCTGCAACTCTCTCCTGGATCTTATTCGAGTTGCTTCAGTACAACCTCCTC
ACTCTCTTCGGCCACATCTCGATTCTTGCTCTCGCTGTGTTGTTCTTGTGGTCTAGTGCT
ACTACCTTCATTCACAAGAAACCTCCTCATATCCCTGAAGTTCACATCCCCGAGGAAGTT
GTTCTCCAGCTTGCTTCTGGACTAAGGATTGAGATCAATCGTGGTTTTACTCTTCTTAGG
AACATCGCATTAGGGAGAGATCTCAAGAAGTTCCTCATGGTTGTTGCTGGTTTGTGGGTT
TTGTCCAAAGTTGGTAGCTCATGCAACTTCTTGACCTTGATCTATATCGCAACTGTTCTT
CTCTTCACCGTTCCCGTGATTTACGAAAAGTATGATGATAAAGTAGATGCCTTTGGCGAA
AAGGCAATGAAGGAGATCAAGAAGCAATACGCTGTGCTGGATGAGAAGGTTTTGAACAAG
ATGATGAGCAAAATCCCCAGAGGAGCCTTCATCAAGAAGAAGGATTAGAAGAGTGTGTAA
GTTTCTCTCTGCATCATCATCTGAGTCTTCCAGATTGATAGATGAAACTCGAAGTATTGT
TTTTTTTACTTGTTATTGGAAGCTGGCTTGGTTAAATAAAACCCTTTAGTCTCTCTTATG
TGGATTTTATTCGGGGTTTTAACCAAAATTTACACAACATATGAATTTTAATGAACTCTA
TTATTGTTGATTCTATTATGGAATACCATCAGTCTTTTATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 15 15 30 30 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF20TF U 1
AF RR2H830TF U 63
AF RR2DB91TF U 1
AF RR2CF20JQ C 271
AF RR2DB91JQ C 459
BS 1 719 RR2CF20TF
BS 720 780 RR2CF20JQ
BS 781 781 RR2DB91JQ
BS 782 864 RR2CF20JQ
BS 865 865 RR2DB91JQ
BS 866 922 RR2CF20JQ
BS 923 923 RR2DB91JQ
BS 924 1041 RR2CF20JQ
BS 1042 1061 RR2DB91JQ

RD RR2CF20TF 719 0 0
GGATTTTCTTCTCCGTTTCTCACTCAAACAAAGTTTTTAGGGTTTTTGCGGAGGTTTTGA
AGCTAAACTACAATGGCGGAAGAGCACAAACACGAGGAATCGATCATGGAGAAGATCGCC
GAGAAGATCCACGGTCACGATAACTCTTCCTCTTCAGATTCAGATGACGATAAGAAAGAG
TCGTCCATCAAAACGAAGATCTACCGCCTCTTCGGACGAGAGAAGCCTGTCCACAAGGTC
TTCGGCGGCGGAAAACCTGCTGACATATTCCTATGGAGGAACAAGAAGGTATCAGGAGGA
GTGTTAGGTGCTGCAACTCTCTCCTGGATCTTATTCGAGTTGCTTCAGTACAACCTCCTC
ACTCTCTTCGGCCACATCTCGATTCTTGCTCTCGCTGTGTTGTTCTTGTGGTCTAGTGCT
ACTACCTTCATTCACAAGAAACCTCCTCATATCCCTGAAGTTCACATCCCCGAGGAAGTT
GTTCTCCAGCTTGCTTCTGGACTAAGGATTGAGATCAATCGTGGTTTTACTCTTCTTAGG
AACATCGCATTAGGGAGAGATCTCAAGAAGTTCCTCATGGTTGTTGCTGGTTTGTGGGTT
TTGTCCAAAGTTGGTAGCTCATGCAACTTCTTGACCTTGATCTATATCGCAACTGTTCTT
CTCTTCACCGTTCCCGTGATTTACGAAAAGTATGATGATAAAGTAGATGCCTTTGGCGA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2H830TF 657 0 0
CTAACTTACA
ATGGCGGAAGAGCACAAACACGAGGAATCGATCATGGAGAAGATCGCTGAGAAGATCCAC
GGTCACGACAACTCTTCTTCTTCAGATTCAGATGACGAGAAGAAAGAGTCGTCTATCAAA
ACGAAGATCTATCGCCTCTTCGGACGAGAAAAGCCTGTCCACAAGGTCTTCGGCGGCGTA
AAACCTGCTGACATATTCCTATGGAGGAACAAGAAGGTATCAGGAGGAGTGTTGGGTGCT
GCAACTCTCTCCTGGATCTTATTCGAGTTGCTTCAGTACAACCTCCTCACTCTCTTCGGC
CACATCTCGATCCTCGCTCTCGCTGTGTTGTTCTTGTGGTCTAGTGCTACTACCTTCATT
CACAAGAAACCTCCTCATATCCCTGAAGTTCACATCCCCGAGGAAGTTGTTCTCCAGCTT
GCTTCTGGACTAAGGATTGAGATCAATCGTGGTTTTACTCTTCTTAGGAACATTGCGTTA
GGGAGAGATCTCAAGAAGTTCCTTATGGTTGTTGCTGGTTTGTGGGTTTTGTCCAAAGTT
GGTAGCTCATGCAACTTCTTGACCTTGATCTATATCGCAACTGTTCTTCTCTTCACCGTT
CCCGTGCTTTACGAAAAGTATGATGATAAAGTAGATGACTTTGCTGA

QA 11 657 11 657
DS 

RD RR2DB91TF 727 0 0
GGATTTTCTTCTCCGTTTCTCACTCAAACAAAGTTTTTAGGGTTTTTGCGGAGGTTTTGA
AGCTAAACTACAATGGCGGAAGAGCACAAACACGAGGAATCGATCGTGGAGAAGATCGCC
GAGAAGATCCACGGTCACGATAACTCTTCCTCTTCAGATTCAGATGACGATAAGAAAGAG
TCGTCCATCAAAACGAAGATCTACCGCCTCTTCGGACGAGAGAAGCCTGTCCACAAGGTC
TTCGGCGGCGGAAAACCTGCTGACATATTCCTATGGAGGAACAAGAAGGTATCAGGAGGA
GTGTTAGGTGCTGCAACTCTCTCCTGGATCTTATTCGAGTTGCTTCAGTACAACCTCCTC
ACTCTCTTCGGCCACATCTCGATTCTTGCTCTCGCTGTGTTATTCTTGTGGTCTAGTGCT
ACTACCTTCATTCACAAGAAACCTCCTCATATCCCTGAAGTTCACATCCCCGAGGAAGTT
GTTCTCGAGCTTGCTTCTGGACTAAGGATTGAGATCAATCGTGGTTTTACTCTTCTTAGG
AACATCGCATTAGGGAGAGATCTCAAGAAGTTCCTCATGGTTGTTGCTGGTTTGTGGGTT
TTGTCCAAAGTTGGTAGCTCATGCAACTTCTTGACCTTGATCTATATCGCAACTGTTCTT
CTCTTCACCGTTCCCGTGATTTACGAAAAGTATGATGATAAAGTAGATGCCTTTG
GCGAAAGGCAAT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2CF20JQ 771 0 0
CTATGGAGGAACAAGAAGGTATCAGGAGGAGTGTTAGGTGCTGCAACTCTCTCCTGGATC
TTATTCGAGTTGCTTCAGTACAACCTCCTCACTCTCTTCGGCCACATCTCGATTCTTGCT
CTCGCTGTGTTGTTCTTGTGGTCTAGTGCTACTACCTTCATTCACAAGAAACCTCCTCAT
ATCCCTGAAGTTCACATCCCCGAGGAAGTTGTTCTCCAGCTTGCTTTTGGACTAAGGATT
GAGATCAATCGTGGTTTTACTTTTTTTAGGAACATCGCATTAGGGAGAGATCTCAAGAAG
TTCCTCATGGTTGTTGCTGGTTTGTGGGTTTTGTCCAAAGTTGGTAGCTCATGCAACTTC
TTGACCTTGATCTATATCGCAACTGTTTTTCTTTTCACCGTTCCCGTGATTTACGAAAAG
TATGATGATAAAGTAGATGCCTTTGGCGAAAAGGCAATGAAGGAGATCAAGAAGCAATAC
GCTGTGCTGGATGAGAAGGTTTTGAACAAGGTGATGAGCAAAATCCCCAGAGGAGCCTTC
ATCAAGAAGAAGGATTAGAAGAGTGTGTAAGTTTCTCTCTGCATCATCATCTGATTCTTC
CAGATTGATAGATGAAACTCGAAGTATTGTTTTTTTTACTTGTTATTGGAAGTTGGCTTG
GTTAAATAAAACCCTTTAGTCTCTCTTATGTGGATTTTATTCGGGGTTTTAACCAAAATT
TACACAACATATGAATTTTAATGAACTCTATTATTGTTGATTCTATTATGG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2DB91JQ 603 0 0
AGTTCACATCCCCGAGGAAGTTGTTCTCGAGCTTGCTTCTGGACTAAGGATTGAGATCAA
TCGTGGTTTTACTCTTCTTAGGAACATCGCATTAGGGAGAGATCTCAAGAAGTTCCTCAT
GGTTGTTGCTGGTTTGTGGGTTTTGTCCAAAGTTGGTAGCTCATGCAACTTCTTGACCTT
GATCTATATCGCAACTGTTCTTCTCTTCACCGTTCCCGTGATTTACGAAAAGTATGATGA
TAAAGTAGATGCCTTTGGCGAAAAGGCAATGAAGGAGATCAAGAAGCAATACGCTGTGCT
GGATGAGAAGGTTTTGAACAAGATGATGAGCAAAATCCCCAGAGGAGCCTTCATCAAGAA
GAAGGATTAGAAGAGTGTGTAAGTTTCTCTCTGCATCATCATCTGAGTCTTCCAGATTGA
TAGATGAAACTCGAAGTATTGTTTTTTT*ACTTGTTATTGGAAGCTGGCTTGGTTAAATA
AAACCCTTTAGTCTCTCTTATGTGGATTTTATTCGGGGTTTTAACCAAAATTTACACAAC
ATATGAATTTTAATGAACTCTATTATTGTTGATTCTATTATGGAATACCATCAGTCTTTT
ATC

QA 1 603 1 603
DS 



CO CL243Contig2 985 3 9 U
GGATTCACGTCTGAACCAAGCGAGAGAGTGGTTTTGCGGAGGTTTCAAGGAAGTAAAGTA
ACGATGGCGGAAGAGCACAAACACGAGGAATCAATCATGGAGAAGATAGCTGAGAAGATC
CATGGTCACGATTCCTCTTCTTCTTCAGATTCAGATGACGAGAAGAAAGAATCCTCTATC
AAGACGAAGATCTTCCGCCTCTTCGGAAGAGAAAAGCCTGTTCACAAGGTCTTCGGTGGC
GGCAAACCTGCCGACATATTCCTATGGAGGAACAAGAAGGTATCAGGAGGAGTGTTGGGT
GCTGCAACTCTCTCCTGGATCTTGTTCGAGTTGCTTCAGTACAACCTCCTCACTCTCTTC
GGCCACATCTCGATTCTCGCTCTCGCAGTGTTGTTCTTGTGGTCTAGTGCTACTACCTTC
ATTCACAAGACACCTCCTCATATCCCTGAAGTTCACATCCCCGAGGAAGTCGTTCTCCAG
CTTGCTTCTGGACTAAGGATTGAAATCAATCGTGGTTTTACTCTTCTTAGGAACATTGCG
TTAGGGAGAGATCTCAAGAAGTTCCTTATGGTTGTTGCTGGTTTGTGGGTTTTGTCCAAA
GTTGGTAGCTCATGCAACTTCTTGACCTTGATCTATATCGCAACTGTTCTTCTCTTCACC
GTTCCCGTGCTTTACGAAAAGTATGATGATAAAGTAGATGACTTTGCTGAAAAGGCAATG
AAGGAGATCAAGAAGCAGTACGCTGTGCTTGATGAGAAGGTTTTGAGTAAGGTCATGAGC
AAAATCCCCAAAGGAGCCTTCAAGAAGAAGGATTAGAGAGTGTCTACGTTTCTCTCATCA
TCATCAGAATCTTCCAGGTTGATATATAAATCTCGAAGCATTGTTTTTTCTTACTTGTAA
TGGAAGCTGTGTTGGTTAATAAACCCTTTTAGTCTCTCAAATATCTGCTTTGTGGGTTTT
ATTCGGGGGTTTAACCTAAATTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 0 0 0 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM25TF U 1
AF RR2GN64TF U 205
AF RR2A103JQ C 232
BS 1 609 RR2EM25TF
BS 610 610 RR2GN64TF
BS 611 710 RR2EM25TF
BS 711 810 RR2GN64TF
BS 811 811 RR2A103JQ
BS 812 846 RR2GN64TF
BS 847 848 RR2A103JQ
BS 849 851 RR2GN64TF
BS 852 985 RR2A103JQ

RD RR2EM25TF 710 0 0
GGATTCACGTCTGAACCAAGCGAGAGAGTGGTTTTGCGGAGGTTTCAAGGAAGTAAAGTA
ACGATGGCGGAAGAGCACAAACACGAGGAATCAATCATGGAGAAGATAGCTGAGAAGATC
CATGGTCACGATTCCTCTTCTTCTTCAGATTCAGATGACGAGAAGAAAGAATCCTCTATC
AAGACGAAGATCTTCCGCCTCTTCGGAAGAGAAAAGCCTGTTCACAAGGTCTTCGGTGGC
GGCAAACCTGCCGACATATTCCTATGGAGGAACAAGAAGGTATCAGGAGGAGTGTTGGGT
GCTGCAACTCTCTCCTGGATCTTGTTCGAGTTGCTTCAGTACAACCTCCTCACTCTCTTC
GGCCACATCTCGATTCTCGCTCTCGCAGTGTTGTTCTTGTGGTCTAGTGCTACTACCTTC
ATTCACAAGACACCTCCTCATATCCCTGAAGTTCACATCCCCGAGGAAGTCGTTCTCCAG
CTTGCTTCTGGACTAAGGATTGAAATCAATCGTGGTTTTACTCTTCTTAGGAACATTGCG
TTAGGGAGAGATCTCAAGAAGTTCCTTATGGTTGTTGCTGGTTTGTGGGTTTTGTCCAAA
GTTGGTAGCCCATGCAACTTCTTGACCTTGATCTATATCGCAACTGTTCTTCTCTTCACC
GTTCCCGTGCTTTACGAAAAGTATGATGATAAAGTAGATGACTTTGCTGA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2GN64TF 658 0 0
GGAAGAGAAAAGCCTGTTCACAAGGTCTTCGGTGGCGGCAAACCTGCCGACATATTCCTA
TGGAGGAACAAGAAGGTATCAGGAGGAGTGTTGGGTGCTGCAACTCTCTCCTGGATCTTG
TTCGAGTTGCTTCAGTACAACCTCCTCACTCTCTTCGGCCACATCTCGATTCTCGCTCTC
GCAGTGTTGTTCTTGTGGTCTAGTGCTACTACCTTCATTCACAAGACACCTCCTCATATC
CCTGAAGTTCACATCCCCGAGGAAGTCGTTCTCCAGCTTGCTTCTGGACTAAGGATTGAA
ATCAATCGTGGTTTTACTCTTCTTAGGAACATTGCGTTAGGGAGAGATCTCAAGAAGTTC
CTTATGGTTGTTGCTGGTTTGTGGGTTTTGTCCAAAGTTGGTAGCTCATGCAACTTCTTG
ACCTTGATCTATATCGCAACTGTTCTTCTCTTCACCGTTCCCGTGCTTTACGAAAAGTAT
GATGATAAAGTAGATGACTTTGCTGAAAAGGCAATGAAGGAGATCAAGAAGCAGTACGCT
GTGCTTGATGAGAAGGTTTTGAGTAAGGTCATGAGCAAAATCCCCAAAGGAGCCTTCAAG
AAGAAG*ATTAGAGAGTGTCTACGTTTCTCTCATCATCATCATCATC
ATCTGAGTCTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2A103JQ 754 0 0
TTCGGTGGCGGCAAACCTGCCGACATATTCCTATGGAGAAACAAGAAGGTATCAGGAGGA
GTGTTGGGTGCTGCAACTCTCTCCTGGATCTTGTTCGAGTTGCTTCAGTACAACCTCCTC
ACTCTCTTCGGCCACATCTCGATTCTCGCTCTCGCTGTGTTGTTCTTGTGGTCTAGTGCT
ACTACCTTCATTCACAAGAAACCTCCTCATATCCCTGAAGTTCACATCCCCGAGGAAGTC
GTTCTCCAGCTTGCTTCTGGACTAAGGATTGAAATCAATCGTGGTTTTACTCTTCTTAGG
AACATTGCATTAGGGAGAGATCTCAAGAAGTTCCTTATGGTTGTTGCTGGTTTGTGGGTT
TTGTCCAAAGTTGGTAGCTCATGCAACTTCATGACCTTGATCTATATCGCAACTGTTCTT
CTCTTCACCGTTCCCGTGCTTTACGAAAAGTATGATGATAAAGTAGATGCCTTTGCTGAA
AAGGCAATGAAGGAGATCAAGAAGCAGTACGCTGTGCTTGATGAGAAGGTTTTGAGTAAG
GTCATGAGCAAAATCCCCAAAGGAGCCTTCAAGAAGAAGGATTAGAGAGTGTCTACGTTT
CTCTCATCATCATCTGAGTCTTCCAGGTTGATATATAAATCTCGAAGCATTGTTTTTTCT
TACTTGTAATGGAAGCTGTGTTGGTTAATAAACCCTTTTAGTCTCTCAAATATCTGCTTT
GTGGGTTTTATTCGGGGGTTTAACCTAAATTTTA

QA 1 754 1 754
DS 



CO CL243Contig3 1042 5 24 U
GATATAAGCTCAAAATTAATATGGTTGTATAAAATTTGGTTAAACCCCCGAATAAAACCC
CCACAAAGCAGATATTTGAGAGACTAAAAGGGTTTATTAACCAACACAGCTTCCATTACA
AGTAAGAAAAAACAATGCTTCGAGATTTATATATCAACCTGGAAGACTCAGATGATGATG
ATGATGA***GAGAAACGTAGACACTCTCTAATCCTTCTTCTTGAAGGCTCCTTTGGGGA
TTTTGCTCATGACCTTACTCAAAACCTTCTCATCAAGCACAGCGTACTGCTTCTTGATCT
CCTTCATTGCCTTTTCAGCAAAGTCATCTACTTTATCATCATACTTTTCGTAAAGCACGG
GAACGGTGAAGAGAAGAACAGTTGCGATATAGATCAAGGTCAAGAAGTTGCATGAGCTAC
CAACTTTGGACAAAACCC*ACAAACCAGCAACAACCATGAGGAACTTCTTGAGATCTCTC
CCTAATGCAATGTTCCTAAGAAGAGTAAAACCACGATTGATTTCAATCCTTAGTCCAGAA
GCAAGCTGGAGAACAACTTCCTCGGGG*ATGTGAACTTCAGGGATATGAGGAGGTTTCTT
GTGAATGAAGGTAGTAGCACTAGACCACAAGAACAACACAGCGAGAGCAAGAATCGAGAT
GTGGCCGAAGAGAGTGAGGAGGTTGTATTGAAGATACTCGAACAAGATCCAGGAGAGAGT
TGCAGCACCCAACACTCCTCCTGATACCTTCTTGTTCCTCCATAGGAATATGTCGGCAGG
TTTGCCGCCACCGAAGACCTTGTGGACAGGCTTTTCTCTTCCGAAGAGGCGGAAGATCTT
CGTCTTGATAGAGGATTCTTTCTTCTCGTCGTCTGAATCTGAAGAAGAAGAGTTATCGTG
ACCATGGATCTTCTCAGCTATCTTCTCCATGATTGATTCCTCGTGTTTGTGCTCTTCCGC
CATCGTTACTTTACTTCCTTGAAACCTCCGCAAAAAAAAAAAACCCTAAAACCACTCTCT
CGCTTGGTTCAGACGTGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2HB79JQ U 6
AF RR2GN64JQ U 1
AF RR2D705JQ U 78
AF RR2HB79TF C 339
AF RR2D705TF C 414
BS 1 187 RR2GN64JQ
BS 188 190 RR2HB79JQ
BS 191 458 RR2GN64JQ
BS 459 459 RR2HB79JQ
BS 460 485 RR2GN64JQ
BS 486 486 RR2HB79JQ
BS 487 554 RR2GN64JQ
BS 555 555 RR2HB79JQ
BS 556 595 RR2GN64JQ
BS 596 596 RR2HB79JQ
BS 597 639 RR2GN64JQ
BS 640 640 RR2HB79JQ
BS 641 648 RR2GN64JQ
BS 649 649 RR2HB79JQ
BS 650 687 RR2GN64JQ
BS 688 688 RR2D705JQ
BS 689 693 RR2GN64JQ
BS 694 695 RR2D705JQ
BS 696 752 RR2GN64JQ
BS 753 762 RR2D705JQ
BS 763 1000 RR2HB79TF
BS 1001 1002 RR2D705TF
BS 1003 1041 RR2HB79TF
BS 1042 1042 RR2D705TF

RD RR2HB79JQ 661 0 0
AG
GCTCAAATTTAATATGGTTGTATAAAATTTGGTTAAACCCCCGAATAAAACCC**ACAAA
GCAGATATTTGAGAGACTAAAAGGGTTTATTAACCAACACAGCTTCCATTACAAGTAAGA
AAAAACAATGCTTCGAGATTTATATATCAACCTGGAAGACTCAGATGATGATGATGATGA
***GAGAAACGTAGACACTCTCTAATCCTTCTTCTTGAAGGCTCCTTTGGGGATTTTGCT
CATGACCTTACTCAAAACCTTCTCATCAAGCACAGCGTACTGCTTCTTGATCTCCTTCAT
TGCCTTTTCAGCAAAGTCATCTACTTTATCATCATACTTTTCGTAAAGCACGGGAACGGT
GAAGAGAAGAACAGTTGCGATATAGATCAAGGTCAAGAAGTTGCATGAGCTACCAACTTT
GGACAAAACCC*ACAAACCAGCAACAACCATGAGGAACTTCTTGAGATCTCTCCCTAATG
CAATGTTCCTAAGAAGAGTAAAACCACGATTGATTTCAATCCTTAGTCCAGAAGCGAGCT
GGAGAACAACTTCCTCGGGG*ATGTGAACTTCAGGGATATGAGGAGGTTTCTTGTGAATG
AAGGTAGTAGCACTAGACCACAAGAACAACACAGCGAGAGCAAGAATCGAGATGTGGCC

QA 3 661 3 661
DS 

RD RR2GN64JQ 752 0 0
GATATAAGCTCAAAATTAATATGGTTGTATAAAATTTGGTTAAACCCCCGAATAAAACCC
CCACAAAGCAGATATTTGAGAGACTAAAAGGGTTTATTAACCAACACAGCTTCCATTACA
AGTAAGAAAAAACAATGCTTCGAGATTTATATATCAACCTGGAAGACTCAGATGATGATG
ATGATGATGAGAGAAACGTAGACACTCTCTAATCCTTCTTCTTGAAGGCTCCTTTGGGGA
TTTTGCTCATGACCTTACTCAAAACCTTCTCATCAAGCACAGCGTACTGCTTCTTGATCT
CCTTCATTGCCTTTTCAGCAAAGTCATCTACTTTATCATCATACTTTTCGTAAAGCACGG
GAACGGTGAAGAGAAGAACAGTTGCGATATAGATCAAGGTCAAGAAGTTGCATGAGCTAC
CAACTTTGGACAAAACCC*ACAAACCAGCAACAACCATAAGGAACTTCTTGAGATCTCTC
CCTAACGCAATGTTCCTAAGAAGAGTAAAACCACGATTGATTTCAATCCTTAGTCCAGAA
GCAAGCTGGAGAACGACTTCCTCGGGG*ATGTGAACTTCAGGGATATGAGGAGGTGTCTT
GTGAATGAAGGTAGTAGCACTAGACCACAAGAACAACACTGCGAGAGCGAGAATCGAGAT
GTGGCCGAAGAGAGTGAGGAGGTTGTACTGAAGCAACTCGAACAAGATCCAGGAGAGAGT
TGCAGCACCCAACACTCCTCCTGATACCTTCT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2D705JQ 685 0 0
GG
GAGACTAAAAGGGTTTATTAACCAACACAGCTTCCATTACAAGTAAGAAAAAACAATGCT
TCGAGATTTATATATCAACCTGGAAGACTCAGATGATGATGATGATGA***GAGAAACGT
AGACACTCTCTAATCCTTCTTCTTGAAGGCTCCTTTGGGGATTTTGCTCATGACCTTACT
CAAAACCTTCTCATCAAGCACAGCGTACTGCTTCTTGATCTCCTTCATTGCCTTTTCAGC
AAAGTCATCTACTTTATCATCATACTTTTCGTAAAGCACGGGAACGGTGAAGAGAAGAAC
AGTTGCGATATAGATCAAGGTCAAGAAGTTGCATGAGCTACCAACTTTGGACAAAACCC*
ACAAACCAGCAACAACCATGAGGAACTTCTTGAGATCTCTCCCTAATGCAATGTTCCTAA
GAAGAGTAAAACCACGATTGATTTCAATCCTTAGTCCAGAAGCAAGCTGGAGAACAACTT
CCTCGGGG*ATGTGAACTTCAGGGATATGAGGAGGTTTCTTGTGAATGAAGGTAGTAGCA
CTAGACCACAAGAACAACACAGCGAGAGCAAGAATCGAGATGTGGCCGAAGAGAGTGAGG
AGGTTGTATTGAAGATACTCGAACAAGATCCAGGAGAGAGTTGCAGCACCCAACACTCCT
CCTGATACCTTCTTGTTCCTCCA

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR2HB79TF 703 0 0
TCATACTTTTCGTAAAGCACGGGAACGGTGAAGAGAAGAACAGTTGCGATATAGATCAAG
GTCAAGAAGTTGCATGAGCTACCAACTTTGGACAAAACCCCACAAACCAGCAACAACCAT
GAGGAACTTCTTGAGATCTCTCCCTAATGCAATGTTCCTAAGAAGAGTAAAACCACGATT
GATTTCAATCCTTAGTCCAGAAGCGAGCTGGAGAACAACTTCCTCGGGGGATGTGAACTT
CAGGGATATGAGGAGGTTTCTTGTGAATGAAGGTAGTAGCACTAGACCACAAGAACAACA
CAGCGAGAGCAAGAATCGAGATGTGGCCGAAGAGAGTGAGGAGGTTGTATTGAAGATACT
CGAACAAGATCCAGGAGAGAGTTGCAGCACCCAACACTCCTCCTGATACCTTCTTGTTCC
TCCATAGGAATATGTCGGCAGGTTTGCCGCCACCGAAGACCTTGTGGACAGGCTTTTCTC
TTCCGAAGAGGCGGAAGATCTTCGTCTTGATAGAGGATTCTTTCTTCTCGTCGTCTGAAT
CTGAAGAAGAAGAGTTATCGTGACCATGGATCTTCTCAGCTATCTTCTCCATGATTGATT
CCTCGTGTTTGTGCTCTTCCGCCATCGTTACTTTACTTCCTTGAAACCTCCGCAAAAAAA
AA**ACCCTAAAACCACTCTCTCGCTTGGTTCAGACGTGAATC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2D705TF 629 0 0
GAGCTACCAACTTTGGACAAAACCC*ACAAACCAGCAACAACCATGAGGAACTTCTTGAG
ATCTCTCCCTAATGCAATGTTCCTAAGAAGAGTAAAACCACGATTGATTTCAATCCTTAG
TCCAGAAGCAAGCTGGAGAACAACTTCCTCGGGG*ATGTGAACTTCAGGGATATGAGGAG
GTTTCTTGTGAATGAAGGTAGTAGCACTAGACCACAAGAACAACACAGCGAGAGCAAGAA
TCGAGATGTGGCCGAAGAGAGTGAGGAGGTTGTATTGAAGATACTCGAACAAGATCCAGG
AGAGAGTTGCAGCACCCAACACTCCTCCTGATACCTTCTTGTTCCTCCATAGGAATATGT
CGGCAGGTTTGCCGCCACCGAAGACCTTGTGGACAGGCTTTTCTCTTCCGAAGAGGCGGA
AGATCTTCGTCTTGATAGAGGATTCTTTCTTCTCGTCGTCTGAATCTGAAGAAGAAGAGT
TATCGTGACCATGGATCTTCTCAGCTATCTTCTCCATGATTGATTCCTCGTGTTTGTGCT
CTTCCGCCATCGTTACTTTACTTCCTTGAAACCTCCGCAAAAAAAAAAAACCCTAAAACC
ACTCTCTCGCTTGGTTCAGACGTGAATCC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 3 15

CO CL244Contig1 699 5 6 U
GGACATTCGTGTTCTATCCTAGGCCTATTCTGTCCTAATCCGTTTCGTTTTTTTATCAAG
ACAAGAAAGATTTTCAGATATTTTCTAAACACAAAGAGATCTTAAAGAACATGGCGATGG
TTTCAGGAAGACGTTCTACTCTAAACCCCGACGCGCCTCTCTTTGTTCCGGCGGCCGTAC
GGCAAGTGGAGGATTTTTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCGACGTGGTACC
ATGACTACTGGATCAGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGATGGTGAAGTCGATG
TAGCTGATCTTCTACCAGAGTCGTTTGATTTCGATGACATGGAAGATCTATTCGTGGCTG
ATGAGTTTGATGTAGAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGAACGGTGAGATGGTGA
GGAGATCGAGAGGGAACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGA
AGCCAGCTAAATGGGCAAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTT
GAATAAGAGAGGGAGGAGGAGTTGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCA
CTGTACCTTATGTAATTTTTTTAGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGTAACTTCTTT
GTACTTTT*ATGATGTTCATTCTCAAAACTTGTTATCAT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 

AF RR2A340JQ C 1
AF RR2DG48TF U 1
AF RR2FE52TF U 1
AF RR2A340TF U 30
AF RR2DG48JQ C 58
BS 1 533 RR2DG48TF
BS 534 534 RR2FE52TF
BS 535 621 RR2DG48TF
BS 622 622 RR2FE52TF
BS 623 696 RR2DG48TF
BS 697 699 RR2FE52TF

RD RR2A340JQ 676 0 0
GGACATTCGTGTTCTATCCTAGGCCTATTCTGTCCTAATCCGTTTCGTTTTTTTATCAAG
ACAAGAAAGATTTTCAGATATTTTCTAAACACAAAGAGATCTTAAAGAACATGGCGATGG
TTTCAGGAAGACGTTTTACTCTAAACCCCGACGCGCCTCTCTTTGTTCCGGCGGCCGTAC
GGCAAGTGGAGGATTTTTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCGACGTGGTACC
ATGACTACTGGATCAGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTTTACGATGGTGAAGTCGATG
TAGCTGATCTTCTACCAGAGTCGTTTGATTTCGATGACATGGAAGATCTATTCGTGGCTG
ATGAGTTTGATGTAGAGATTTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGAACGGTGAGATGGTGA
GGAGATCGAGAGGGAACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGA
AGCCAGCTAAATGGGCAAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAAGAAACATCCCCCAGCCTCGTT
GAATAAGAGAGGGAGGAGGAGTTGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCC
CTGTACCTTATGTAATTTTTTTAGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACCTGTAACTTCTTT
GTACTTTT*ATGATGT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2DG48TF 696 0 0
GGACATTCGTGTTCTATCCTAGGCCTATTCTGTCCTAATCCGTTTCGTTTTTTTATCAAG
ACAAGAAAGATTTTCAGATATTTTCTAAACACAAAGAGATCTTAAAGAACATGGCGATGG
TTTCAGGAAGACGTTCTACTCTAAACCCCGACGCGCCTCTCTTTGTTCCGGCGGCCGTAC
GGCAAGTGGAGGATTTTTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCGACGTGGTACC
ATGACTACTGGATCAGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGATGGTGAAGTCGATG
TAGCTGATCTTCTACCAGAGTCGTTTGATTTCGATGACATGGAAGATCTATTCGTGGCTG
ATGAGTTTGATGTAGAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGAACGGTGAGATGGTGA
GGAGATCGAGAGGGAACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGA
AGCCAGCTAAATGGGCAAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAAGAAACATCCACCAGTCTCGTT
GAATAAGAGAGGGAGGAGGAGTTGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCA
CTGTACCTTATGTAATTTTTT*AGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGTAACTTCTTT
GTACTTTT*ATGATGTTCATTCTCAAAACTTGTTAT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2FE52TF 699 0 0
GGACATTCGTGTTCTATCCTAGGCCTATTCTGTCCTAATCCGTTTCGTTTTTTTATCAAG
ACAAGAAAGATTTTCAGATATTTTCTAAACACAAAGAGATCTTAAAGAACATGGCGATGG
TTTCAGGAAGACGTTCTACTCTAAACCCCGACGCGCCTCTCTTTGTTCCGGCGGCCGTAC
GGCAAGTGGAGGATTTTTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCGACGTGGTACC
ATGACTACTGGATCAGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGATGGTGAAGTCGATG
TAGCTGATCTTCTACCAGAGTCGTTTGATTTCGATGACATGGAAGATCTATTCGTGGCTG
ATGAGTTTGATGTAGAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGAACGGTGAGATGGTGA
GGAGATCGAGAGGGAACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGA
AGCCAGCTAAATGGGCAAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTT
GAATAAGAGAGGGAGGAGGAGTTGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCA
CTGTACCTTATGTAATTTTTTTAGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGTAACTTCTTT
GTACTTTT*ATGATGTTCATTCTCAAAACTTGTTATCAT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2A340TF 670 0 0
CTGTCCTAATCCGTTTCGTTTTTTTAT*AAGACAAGAAAGATTTTCAGATATTTTCTAAA
CACAAAGAGATCTTAAAGAACATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTTCTACTCTAAACCCC
GACGCGCCTCTCTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAAGTGGAGGATTTTTCACCGGAGTGG
TGGCAGTTGGTGACGACCTCGACGTGGTACCATGACTACTGGATCAGCCAGAACCAAGGA
GCAGATGGTTTCTACGATGGTGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTACCAGAGTCGTTTGAT
TTCGATGACATGGAAGATCTATTCGTGGCTGATGAGTTTGATGTAGAGATCTACCACGCA
GGTGGTTTAGGGAAGAACGGTGAGATGGTGAGGAGATCGAGAGGGAACAGGAGTCCTAAG
TTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGCCAGCTAAATGGGCAAACCAGAGGGTT
GCTGCTCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAATAAGAGAGGGAGGAGGAGTTGTTGTT
TAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTGTACCTTATGTAATTTTTTTAGTATTT
GCTTTCCCATAAGAGAACATGTAACTTCTTTGTACTTTTTATGATGTTCATTCTCAAAAC
TTGTTATCAT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2DG48JQ 642 0 0
AAGACAAGAAAGATTTTCAGATATTTTCTAAACACAAAGAGATCTTAAAGAACATGGCGA
TGGTTTCAGGAAGACGTTCTACTCTAAACCCCGACGCGCCTCTCTTTGTTCCGGCGGCCG
TACGGCAAGTGGAGGATTTTTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCGACGTGGT
ACCATGACTACTGGATCAGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGATGGTGAAGTCG
ATGTAGCTGATCTTCTACCAGAGTCGTTTGATTTCGATGACATGGAAGATCTATTCGTGG
CTGATGAGTTTGATGTAGAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGAACGGTGAGATGG
TGAGGAGATCGAGAGGGAACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGG
AGAAGCCAGCTAAATGGGCAAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAAGAAACATCCACCAGCCTC
GTTGAATAAGAGAGGGAGGAGGAGTTGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAG
CCACTGTACCTTATGTAATTTTTT*AGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGTAACTTC
TTTGTACTTTT*ATGATGTTCATTCTCAAAACTTGTTATCAT

QA 1 642 1 642
DS 



CO CL244Contig2 749 7 8 U
GGACATTCGTGTTCTGTCCTAATCCGTTTCGCGTTTTATCAAGACAAGAAAGAATTTCAG
ATATTTTCTTAACACAAAGAGATCTTAAAGAAGAACATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGT
TCTACTCTAAACCCCGACGCGCCTCTCTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAAGTGGAGGAT
TTTTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACATCGACGTGGTACCATGACTACTGGATC
AGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGATGGTGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTA
CCAGAGTCGTTTGACTTCGATGACATGGAAGATCTCTTCGTGGCTGATGAGTTTGATGTA
GAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGGACGGTGAGATGGTGAGGAGATCGAGAGGG
AACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGCCGGCTAAATGG
GCGAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTTAAACAAGAGAGGGA
GGAGGAGGAGTTGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTGGACCTTAT
GTAATTTTTTTTAGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGTAACTTCTTTGTACTTTTAT
GATGTTCATTCTCAAAACTTGTTATCATAAAAATGTAAAAACATAAAAAAGTAAACTTTG
AAGAGAAATGAGAACTTGAGTTTATTTCG


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE34TF U 1
AF RR2D815JQ C 1
AF RR2D815TF U 1
AF RR2CG01TF U 1
AF RR2CU79TF U 1
AF RR2CU79JQ C 1
AF RR2BE34JQ C 417
BS 1 59 RR2BE34TF
BS 60 60 RR2CG01TF
BS 61 218 RR2BE34TF
BS 219 219 RR2CG01TF
BS 220 630 RR2BE34TF
BS 631 667 RR2CG01TF
BS 668 693 RR2CU79TF
BS 694 749 RR2CU79JQ

RD RR2BE34TF 630 0 0
GGACATTCGTGTTCTGTCCTAATCCGTTTCGCGTTTTATCAAGACAAGAAAGAATTTCAA
ATATTTTCTTAACACAAAGAGATCTTAAAGAAGAACATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGT
TCTACTCTAAACCCCGACGCGCCTCTCTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAAGTGGAGGAT
TTTTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACATCGACATGGTACCATGACTACTGGATC
AGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGATGGTGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTA
CCAGAGTCGTTTGACTTCGATGACATGGAAGATCTCTTCGTGGCTGATGAGTTTGATGTA
GAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGGACGGTGAGATGGTGAGGAGATCGAGAGGG
AACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGCCGGCTAAATGG
GCGAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTTAAACAAGAGAGGGA
GGAGGAGGAGTTGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTGGACCTTAT
GTAATTTTTTTTAGTATTTGCTTTCCCATA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2D815JQ 658 0 0
GGACATTCGTGTTCTGTCCTAATCCGTTTCGCGTTTTATCAAGACAAGAAAGAATTTCAG
ATATTTTCTTAACACAAAGAGATCTTAAAGAAGAACATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGT
TTTACTCTAAACCCCGACGCGCCTCTCTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAAGTGGAGGAT
TTTTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACATCGACGTGGTACCATGACTACTGGATC
AGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTTTACGATGGTGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTA
CCAGAGTCGTTTGACTTCGATGACATGGAAGATCTCTTCGTGGCTGATGAGTTTGATGTA
GAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGGACGGTGAGATGGTGAGGAGATCGAGAGGG
AACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGCCGGCTAAATGG
GCGAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTTAAACAAGAGAGGGA
GGAGGAGGAGTTGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTGGACCTTAT
GTAATTTTTTT*AGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGTAACTTCTTCGTACTTTT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2D815TF 658 0 0
GGACATTCGTGTTCTGTCCTAATCCGTTTCGCGTTTTATCAAGACAAGAAAGAATTTCAG
ATATTTTCTTAACACAAAGAGATCTTAAAGAAGAACATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGT
TCTACTCTAAACCCCGACGCGCCTCTCTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAAGTGGAGGAT
TTTTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACATCGACGTGGTACCATGACTACTGGATC
AGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGATGGTGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTA
CCAGAGTCGTTTGACTTCGATGACATGGAAGATCTCTTCGTGGCTGATGAGTTTGATGTA
GAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGGACGGTGAGATGGTGAGGAGATCGAGAGGG
AACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGCCGGCTAAATGG
GCGAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTTAAACAAGAGAGGGA
GGAGGAGGAGTTGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTGGACCTTAT
GTAATTTTTTT*AGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGTAACTTCTTCGTACTTTT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2CG01TF 667 0 0
GGACATTCGTGTTCTGTCCTAATCCGTTTCGCGTTTTATCAAGACAAGAAAGAATTTCAG
ATATTTTCTTAACACAAAGAGATCTTAAAGAAGAACATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGT
TCTACTCTAAACCCCGACGCGCCTCTCTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAAGTGGAGGAT
TTTTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACATCGACGTGGTACCATGACTACTGGATC
AGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGATGGTGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTA
CCAGAGTCGTTTGACTTCGATGACATGGAAGATCTCTTCGTGGCTGATGAGTTTGATGTA
GAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGGACGGTGAGATGGTGAGGAGATCGAGAGGG
AACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGCCGGCTAAATGG
GCGAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTTAAACAAGAGAGGGA
GGAGGAGGAGTTGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTGGACCTTAT
GTAATTTTTT**AGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGTAACTTCTTTGTACTTTTAT
GATGTTC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2CU79TF 693 0 0
GGACATTCGTGTTCTGTCCTAATCCGTTTCGCGTTTTATCAAGACAAGAAAGAATTTCAG
ATATTTTCTTAACACAAAGAGATCTTAAAGAAGAACATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGT
TCTACTCTAAACCCCGACGCGCCTCTCTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAAGTGGAGGAT
TTTTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACATCGACGTGTTACCATGACTACTGGATC
AGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGATGGTGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTA
CCAGAGTCGTTTGACTTCGATGACATGGAAGATCTCTTCGTGGCTGATGAGTTTGATGTA
GAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGGACGGTGAGATGGTGAGGAGATCGAGAGGG
AACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGCCGGCTAAATGG
GCGAACCAGAGGGTTGCTGCCCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTTAAACAAGAGAGGGA
GGAGGAGGAGTTGTTGTTTAACTAGCCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTGGACCTTAT
GTAATTTTTTTTAGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGCAGCTTCTTTGTACTTTTAT
GATGTTCATTCTCAAAACTTGTTATCATAAAAA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2CU79JQ 749 0 0
GGACATTCGTGTTCTGTC*TAATCCGTTTCGCGTTTTATCAAGACAAGAAAGAATTTCAG
ATATTTTCTTAACACAAAGAGATCTTAAAGAAGAACATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGT
TCTACTCTAAACCCCGACGCGCCTCTCTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAAGTGGAGGAT
TTTTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACATCGACGTGTTACCATGACTACTGGATC
AGCCAGAACCAAGGAGCAGATGGTTTTTACGATGGTGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTA
CCAGAGTCGTTTGACTTCGATGACATGGAAGATCTCTTCGTGGCTGATGAGTTTGATGTA
GAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGGACGGTGAGATGGTGAGGAGATCGAGAGGG
AACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGCCGGCTAAATGG
GCGAACCAGAGGGTTGCTGCCCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTTAAACAAGAGAGGGA
GGAGGAGGAGTTGTTGTTTAACTAGCCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTGGACCTTAT
GTAATTTTTTTTAGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGCAGCTTCTTTGTACTTTTAT
GATGTTCATTCTCAAAACTTGTTATCATAAAAATGTAAAAACATAAAAAAGTAAACTTTG
AAGAGAAATGAGAACTTGAGTTTATTTCG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2BE34JQ 327 0 0
AGGGAACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGCCGGCTAA
ATGGGCGAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTTAAACAAGAGA
GGGAGGAGGAGGAGTTGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTGGACC
TTATGTAATTTTTTTTAGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGTAACTTCTTTGTACTT
TTATGATGTTCATTCTCAAAACTTGTTATCATAAAAATGTAAAAACATAAAAAAGTAAAC
TTTGAAGAGAAATGAGAACTTGAGTTT

QA 1 327 1 327
DS 



CO CL244Contig3 758 3 13 U
GGACATTCGTGCTCTGTCCTAAACCGTTTCGCTTTTTATCAAGACAGGAAAGAATTCCAG
ATATTTTCTTAACACAAAGAGATCTTAAAGAAGAACATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGT
TCTACTCTAAACCCCGACGCGCCACTGTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAAGTGGAGGAT
TTCTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACATCGACGTGGTACCATGACTACTGGATC
AGCCAGCACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGATGGTGAAGTCGATGTGGCTGATCTTCTA
CCAGAGTCGTTTGGTTTCGATGACATGGAAGATCTCTTCGTGGCTGATGAGTTTGATGTA
GAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGGACGGTGAGATGGTGAGGAGATCGAGAGGG
AACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGCCAGCTAAATGG
GCAAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAGGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAACAAGAGAGGGA
GGAGGAGGAGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTGTACCTTATTAT
TTTAGTATTTGCTTTCCCACAAGAGAACATGTAACTTCTTTGTACTTTTATGATGGTTCA
TTCTCAAAACTTGTTATCATAAAAAAAATGTAAAAACATAAAAAAAAAGTTGTAAACTTT
GAATGAGAAATGAGAACTAGCTAGAGTTTATTTCTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW48TF U 1
AF RR2GE04TF U 33
AF RR2GE04JQ C 50
BS 1 96 RR2FW48TF
BS 97 97 RR2GE04TF
BS 98 329 RR2FW48TF
BS 330 330 RR2GE04TF
BS 331 504 RR2FW48TF
BS 505 505 RR2GE04TF
BS 506 525 RR2FW48TF
BS 526 526 RR2GE04TF
BS 527 631 RR2FW48TF
BS 632 632 RR2GE04TF
BS 633 655 RR2FW48TF
BS 656 685 RR2GE04TF
BS 686 758 RR2GE04JQ

RD RR2FW48TF 659 0 0
GGACATTCGTGCTCTGTCCTAAACCGTTTCGCTTTTTATCAAGACAGGAAAGAATTCCAG
ATATTTTCTTAACACAAAGAGATCTTAAAGAAGAACGTGGCGATGGTTTCAGGAAGACGT
TCTACTCTAAACCCCGACGCGCCACTGTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAAGTGGAGGAT
TTCTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACATCGACGTGGTACCATGACTACTGGATC
AGCCAGCACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGATGGTGAAGTCGATGTGGCTGATCTTCTA
CCAGAGTCGTTTGGTTTCGATGACATGGAGGATCTCTTCGTGGCTGATGAGTTTGATGTA
GAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGGACGGTGAGATGGTGAGGAGATCGAGAGGG
AACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGCCAGCTAAATGG
GCAAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTCGAACAAGAGAGGGA
GGAGGAGGAGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTGTACCTTATTAT
TTTAGTATTTGCTTTCCCACAAGAGAACATGCAACTTCTTTGTACTTTTATGATG
GTTC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2GE04TF 655 0 0
TTTTTATCAAGACAGGAAAGAATTCCAGATATTTTCTTAACACAAAGAGATCTTAAAGAA
GAACATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTTCTACTCTAAACCCCGACGCGCCACTGTTTGT
TCCGGCGGCCGTACGGCAAGTGGAGGATTTCTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGAC
ATCGACGTGGTACCATGACTACTGGATCAGCCAGCACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGA
TGGTGAAGTCGATGTGGCTGATCTTCTACCAGAGTCGTTTGGTTTCGATGACATGGAAGA
TCTCTTCGTGGCTGATGAGTTTGATGTAGAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGGA
CGGTGAGATGGTGAGGAGATCGAGAGGGAACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGC
TAAGTATGCGGAGAAGCCAGCTAAATGGGCAAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAGGAAACAT
CCACCAGCCTCGTTGAACAAGAGAGGGAGGAGGAGGAGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGG
TTGTATGTTAGCCACTGTACCTTATTATTTTAGTATTTGCTTTCCCACAAGAGAACATGT
AACTTCTTTGTACTTTTATGATGGTTCATTCTCAAAACTTGTTATCATAAAAA
AA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2GE04JQ 709 0 0
AAGAATTCCAGATATTTTCTTAACACAAAGAGATCTTAAAGAAGAACATGGCGATGGTTT
CAGGAAGACGTTCTACTCTAAACCCCGACGCGCCACTGTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGC
AAGTGGAGGATTTCTCACCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACATCGACGTGGTACCATG
ACTACTGGATCAGCCAGCACCAAGGAGCAGATGGTTTCTACGATGGTGAAGTCGATGTGG
CTGATCTTCTACCAGAGTCGTTTGGTTTCGATGACATGGAAGATCTCTTCGTGGCTGATG
AGTTTGATGTAGAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGGACGGTGAGATGGTGAGGA
GATCGAGAGGGAACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATGCGGAGAAGC
CAGCTAAATGGGCAAACCAGAGGGTTGCTGCTCCAGGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAA
CAAGAGAGGGAGGAGGAGGAGTTGTTTAACTAGTCAGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACTG
TACCTTATTATTTTAGTATTTGCTTTCCCACAAGAGAACATGTAACTTCTTTGTACTTTT
ATGATGGTTCATTCTCAAAACTTGTTATCATAAAAAAAATGTAAAAACATAAAAAAAAAG
TTGTAAACTTTGAATGAGAAATGAGAACTAGCTAGAGTTTATTTCTTGG

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 13

CO CL245Contig1 584 13 11 U
GGATCCAGGGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTT
TTGCAAGCTAATAAATCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTTTACATTCCAA
GGAAATGCTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTA
ACATTGGTCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGCCCAGTTCACCACTCTTGCTCTCT
GCGGATTTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGA
AGAAGGTCGAAGCCAAACAGCAGTGAGAGATGGAGATAATCTATATGCTGCCCGCTCTTG
TTTTTGGCAATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACAAGTATCTCTGTTTTCTGAT
CGATAAAAGATATTTAAGTTTTTTTGGTGCCAATTGAATCAGTTCTCTTGATTATCTATA
CATTGAGAACTGCCACGTCACTCAGCTTGATGATTATGTAACATGAACGTGATAAGTTGA
TGATTATGCAACATGAATTTGATGACTTGAAATTGATTTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 40 5 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 60 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 45 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 
75 75 75 75 75 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ39JQ C 1
AF RR2GZ39TF U 1
AF RR2H871JQ C 1
AF RR2CT43TF U 5
AF RR2CQ10TF U 8
AF RR2CJ72TF U 8
AF RR2E924JQ C 5
AF RR2E924TF U 5
AF RR2BJ66JQ C 8
AF RR2BJ66TF U 8
AF RR2FL83JQ C 8
AF RR2G848TF U 8
AF RR2FL83TF U 8
BS 1 6 RR2GZ39JQ
BS 7 7 RR2GZ39TF
BS 8 9 RR2CQ10TF
BS 10 76 RR2GZ39TF
BS 77 77 RR2CT43TF
BS 78 350 RR2GZ39TF
BS 351 351 RR2CT43TF
BS 352 425 RR2GZ39TF
BS 426 450 RR2CT43TF
BS 451 572 RR2E924TF
BS 573 584 RR2FL83JQ

RD RR2GZ39JQ 425 0 0
GGATCCATCGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTT
TTGCAAGCTAATAAATTATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTTTACATTCCAA
GGAAATGCTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTA
ACATTGGTCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGCCCAGTTCACCACTCTTGCTCTCT
GCGGATTTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGA
AGAAGGTCGAAGCCAAACAGCAGTGAGAGATGGAGATAATCTATATGCTGTCCGCTCTTG
TTTTTGGCAATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACAAGTATCTCTGTTTTCTGAT
CGATA

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR2GZ39TF 425 0 0
GGATCC
ATCGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTGCAA
GCTAATAAATTATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTTTACATTCCAAGGAAAT
GCTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTG
GTCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGCCCAGTTCACCACTCTTGCTCTCTGCGGAT
TTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGG
TCGAAGCCAAACAGCAGTGAGAGATGGAGATAATCTATATGCTGTCCGCTCTTGTTTTTG
GCAATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACAAGTATCTCTGTTTTCTGATCGATA

QA 7 425 7 425
DS 

RD RR2H871JQ 425 0 0
GGATCC
ATCGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTGCAA
GCTAATAAATTATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTTTACATTCCAAGGAAAT
GCTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTG
GTCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGCCCAGTTCACCACTCTTGCTCTCTGCGGAT
TTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGG
TCGAAGCCAAACAGCAGTGAGAGATGGAGATAATCTATATGCTGTCCGCTCTTGTTTTTG
GCAATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACAAGTATCTCTGTTTTCTGATCGATA

QA 7 425 7 425
DS 

RD RR2CT43TF 447 0 0
GG
ATCGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGCTCGATTTTTGCAA
GCTAATAAATCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTTTACATTCCAAGGAAAT
GCTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTG
GTCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGCCCAGTTCACCACTCTTGCTCTCTGCGGAT
TTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGG
TCGAAGCCAAACAGCAGTGAGAGATGGAGATAATCTATATGCTGCCCGCTCTTGTTTTTG
GCAATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACAAGTATCTCTGTTTTCTGATCGATAA
AAGATATTTAAGTTTTTTTGGTGC
T

QA 3 446 3 446
DS 

RD RR2CQ10TF 418 0 0
GGGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTGCAAG
CTAATAAATCATGCAGAGCGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTTTACATTCCAAGGAAATG
CTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGG
TCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGCCCAGTTCACCACTCTTGCTCTCTGCGGATT
TGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGT
CGAAGCCAAACAGCAGTGAGAGATGGAGATAATCTATATGCTGCCCGCTCTTGTTTTTGG
CAATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACAAGTATCTCTGTTTTCTGATCGATA

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR2CJ72TF 465 0 0
GGGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTGCAAG
CTAATAAATCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTTTACATTCCAAGGAAATG
CTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGG
TCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGCCCAGTTCACCACTCTTGCTCTCTGCGGATT
TGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGT
CGAAGCCAAACAGCAGTGAGAGATGGAGATAATCTATATGCTGCCCGCTCTTGTTTTTGG
CAATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACAAGTATCTCTGTTTTCTGATCGATAAA
AGATATTTAAGTTTTTTTGGTGCCAATTGAATCAGTTCTCTTGA
G

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2E924JQ 565 0 0
GG
ATCGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTGCAA
GCTAATAAATCATGCAGGACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTTTACATTCCAAGGAAAT
GCTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTG
GTCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTACCCAGTTCACCACTCCTGCTCTCTGCGGAT
TTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGG
TCGAAGCCAAACAGCAGTGAGAGATGGAGATAATCTATATGCTGCCCGCTCTTGTTTTTG
GCAATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACAAGTATCTCTGTTTTCTGATCGATAA
AAGATATTTAAGTTTTTTTGGTGCCAATTGAATCAGTTCTCTTGATTATCTATACATTGA
GAACTGCCACGTCACTCAGCTTGATGATTATGTAACATGAACGTGATAAGTTGATGATTA
TGCAACATGAATTTGATGACTTG

QA 3 565 3 565
DS 

RD RR2E924TF 574 0 0
GG
ATCGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTGCAA
GCTAATAAATCATGCAGGACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTTTACATTCCAAGGAAAT
GCTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTG
GTCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTACCCAGTTCACCACTCCTGCTCTCTGCGGAT
TTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGG
TCGAAGCCAAACAGCAGTGAGAGATGGAGATAATCTATATGCTGCCCGCTCTTGTTTTTG
GCAATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACAAGTATCTCTGTTTTCTGATCGATAA
AAGATATTTAAGTTTTTTTGGTGCCAATTGAATCAGTTCTCTTGATTATCTATACATTGA
GAACTGCCACGTCACTCAGCTTGATGATTATGTAACATGAACGTGATAAGTTGATGATTA
TGCAACATGAATTTGATGACTTGAAA
AAAAAA

QA 3 568 3 568
DS 

RD RR2BJ66JQ 562 0 0
GGGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTGCAAG
CTAATAAATCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTTTACATTCCAAGGAA*TG
CTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGG
TCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGCCCAGTTCACCACTCTTGCTCTCTGCGGATT
TGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGT
CGAAGCCAAACAGCAGTGAGAGATGGAGATAATCTATATGCTGCCCGCTCTTGTTTTTGG
CAATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACAAGTATCTCTGTTTTCTGGTCGATAAA
AGATATTTAAGTTTTTTTGGTGCCAATTGAATCAGTTCTCTTGATTATCTATACATTGAG
AACTGCCACGTCACTCAGCTTGATGATTATGTAACATGAACGTGATAAGTTGATGATTAT
GCAACATGAATTTGATGACTTG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2BJ66TF 562 0 0
GGGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTGCAAG
CTAATAAATCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTTTACATTCCAAGGAA*TG
CTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGG
TCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGCCCAGTTCACCACTCTTGCTCTCTGCGGATT
TGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGT
CGAAGCCAAACAGCAGTGAGAGATGGAGATAATCTATATGCTGCCCGCTCTTGTTTTTGG
CAATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACAAGTATCTCTGTTTTCTGGTCGATAAA
AGATATTTAAGTTTTTTTGGTGCCAATTGAATCAGTTCTCTTGATTATCTATACATTGAG
AACTGCCACGTCACTCAGCTTGATGATTATGTAACATGAACGTGATAAGTTGATGATTAT
GCAACATGAATTTGATGACTTG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2FL83JQ 577 0 0
GGGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTGCAAG
CTAATAAATCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTTTACATTCCAAGGAAATG
CTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGG
TCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGCCCAGTTCACCACTCTTGCTCTCTGCGGATT
TGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGT
CGAAGCCAAACAGCAGTGAGAGATGGAGATAATCTATATGCTGCCCGCTCTTGTTTTTGG
CAATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACAAGTATCTCTGTTTTCTGATCGATAAA
AGATATTTAAGTTTTTTTGGTGCCAATTGAATCAGTTCTCTTGATTATCTATACATTGAG
AACTGCCACGTCACTCAGCTTGATGATTATGTAACATGAACGTGATAAGTTGATGATTAT
GCAACATGAATTTGATGACTTGAAATTGATTTGTGTT

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2G848TF 559 0 0
GGGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTGCAAG
CTAATAAATCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTTTACATTCCAAGGAAATG
CTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGG
TCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGCCCAGTTCACCACTCTTGCTCTCTGCGGATT
TGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGT
CGAAGCCAAACAGCAGTGAGAGATGGAGATAATCTATATGCTGCCCGCTCTTGTTTTTGG
CAATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACAAGTATCTCTGTTTTCTGATCGATAAA
AGATATTTAAGTTTTTTTGGTGCCAATTGAATCAGTTCTCTTGATTATCTATACATTGAG
AACTGCCACGTCACTCAGCTTGATGATTATGTAACATGAACGTGATAAGTTGATGATTAT
GCAACATGAATTTGATGAC

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2FL83TF 577 0 0
GGGCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAAATCGATTTTTGCAAG
CTAATAAATCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTTTACATTCCAAGGAAATG
CTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCACGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGG
TCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGCCCAGTTCACCACTCTTGCTCTCTGCGGATT
TGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGT
CGAAGCCAAACAGCAGTGAGAGATGGAGATAATCTATATGCTGCCCGCTCTTGTTTTTGG
CAATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACAAGTATCTCTGTTTTCTGATCGATAAA
AGATATTTAAGTTTTTTTGGTGCCAATTGAATCAGTTCTCTTGATTATCTATACATTGAG
AACTGCCACGTCACTCAGCTTGATGATTATGTAACATGAACGTGATAAGTTGATGATTAT
GCAACATGAATTTGATGACTTGAAA
TTGATTTGTGTT

QA 1 565 1 565
DS 



AS 3 13

CO CL246Contig1 1158 4 12 U
GGAATGGCGGAGATAACAAGCTAAAGAGACAGACTTTGCACCTCTTTCTTCTTCATTCTC
TCTTTCCTTACTTTCATTTGCATCTTGGGTTAAGAGCCATGGTGGATACAGAGTTCCTCC
GAACTCTAGATCGCCAGATTCTCTTGGGTGTCTTCGTCGCTTTCGTCGCCGTCGGTGCCG
GTGCTGCTTACTATCTCTCTTCCTCCAAAAAACGCAGAGGGTGTTTGGATCCAGAGAACT
TCAAGGATTTTAAGCTTGTTAAGAAGCAACAGCTCAGTCACAATGTCGCTAAATTCGTAT
TTGAGCTTCCAACTCGTACCTCCGTCTTGGGTCTTCCCATCGGTCAGCACATCAGCTGCA
GGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCCACAACCTTAGATT
CTGACCTTGGACGTTTTGAACTTGTTATCAAGATGTACCCGCAAGGAAGGATGTCTCATC
ATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTCAAGGGACCAAAGGGTAGGTTCA
AGTATCAGCCGGGTCAGTTTAGGGCATTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCAGGCATCACTC
CCATGTTCCAAGTGGCAAGAGCAATTCTAGAAAACCCAACAGACAAGACAAAGGTGCACC
TCATTTACGCCAATGTCACATACGAAGACATTCTCTTAAAGGAAGAATTGGAGAGTCTTA
CATCCAATTACCCAGACCAGTTCAAAATCTACTATGTTCTGAACCAGCCTCCGGAAACAT
GGGATGGTGGTGTTGGATTTGTATCCAAGGAAATGATTCAAGCCCACTGCCCTGCACCAG
CATTTGATATTCAGATCCTGAGATGTGGACCACCGCCGATGAACAAGGCCATGGCTTCAA
ACCTTGAAGCTCTTGGTTACTCTCCAGAGATGCAATTCCAGTTCTGATCTAAATACTCTG
CTTTTGATTACTTCTTACACAAAATGGAGATATTTAGAAGAAAAAAAACTCGTGTCTCTG
ATCAATAATGAGTGTTTCGCTGTCTTAATTGAGTGAGAGTTGTTGTTTTTATTACAAGCT
TCATAAACCATTGTGTTTGTTTGACGGTTTGTTATCTCGTTGGAAGTTCTGATTTATTGG
TTAAAGATTTGGTTAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR72TF U 1
AF RR2AJ28TF U 29
AF RR2EG43TF U 53
AF RR2EG43JQ C 515
BS 1 176 RR2AR72TF
BS 177 177 RR2AJ28TF
BS 178 324 RR2AR72TF
BS 325 325 RR2AJ28TF
BS 326 538 RR2AR72TF
BS 539 539 RR2AJ28TF
BS 540 647 RR2AR72TF
BS 648 697 RR2AJ28TF
BS 698 746 RR2EG43TF
BS 747 747 RR2EG43JQ
BS 748 794 RR2EG43TF
BS 795 1158 RR2EG43JQ

RD RR2AR72TF 647 0 0
GGAATGGCGGAGATAACAAGCTAAAGAGACAGACTTTGCACCTCTTTCTTCTTCATTCTC
TCTTTCCTTACTTTCATTTGCATCTTGGGTTAAGAGCCATGGTGGATACAGAGTTCCTCC
GAACTCTAGATCGCCAGATTCTCTTGGGTGTCTTCGTCGCTTTCGTCGCCGTCGGTACCG
GTGCTGCTTACTATCTCTCTTCCTCCAAAAAACGCAGAGGGTGTTTGGATCCAGAGAACT
TCAAGGATTTTAAGCTTGTTAAGAAGCAACAGCTCAGTCACAATGTCGCTAAATTCGTAT
TTGAGCTTCCAACTCGTACCTCCGCCTTGGGTCTTCCCATCGGTCAGCACATCAGCTGCA
GGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCCACAACCTTAGATT
CTGACCTTGGACGTTTTGAACTTGTTATCAAGATGTACCCGCAAGGAAGGATGTCTCATC
ATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTCAAGGGACCAAAGGGTAGGTTTA
AGTATCAGCCGGGTCAGTTTAGGGCATTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCAGGCATCACTC
CCATGTTCCAAGTGGCAAGAGCAATTCTAGAAAACCCAACAGACAAG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2AJ28TF 669 0 0
GG
AGACTTTGCACCTCTTTCTTCTTCATTCTCTCTTTCCTTACTTTCATTTGCATCCTGGGT
TAAGAGCCATGGTGGATACAGAGTTCCTCCGAACTCTAGATCGCCAGATTCTCTTGGGTG
TCTTCGTCGCTTTCGTCGCCGTCGGTGCCGGTGCTGCTTACTATCTCTCTTCCTCCAAAA
AACGCAGAGGGTGTTTGGATCCAGAGAACTTCAAGGATTTTAAGCTTGTTAAGAAGCAAC
AGCTCAGTCACAATGTCGCTAAATTCGTATTTGAGCTTCCAACTCGTACCTCCGTCTTGG
GTCTTCCCATCGGTCGGCACATCAGCTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTA
TTAAGCCTTACACTCCCACAACCTTAGATTCTGACCTTGGACGTTTTGAACTTGTTACCA
AGATGTACCCGCAAGGAAGGATGTCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATC
TTGCTGTCAAGGGACCAAAGGGTAGGTTCAAGTATCAGCCGGGTCAGTTTAGGGCATTTG
GAATGCTTGCTGGAGGTTCAGGCATCACTCCCATGTTCCAAGTGGCAAGAGCAATTCTAG
AAAACCCAACAGACAAGACAAAGGTGCACCTCATTTACGCCAATGTCACATACGAAGACA
TTCTCTT

QA 3 669 3 669
DS 

RD RR2EG43TF 742 0 0
GG
ATTCTCTCTTTCCTTACTTTCATTTGCACCTTGGGTTAAGAGCCATGGTGGATACAGAGT
TCCTCCGAACTCTAGATCGCCAGATTCTCTTGGGTGTCTTCGTCGCTTTCGTCGCCGTCG
GTGCCGGTGCTGCTTACTATCTCTCCTCCTCCAAAAAACGCAGAGGGTGTTTGGATCCAG
AGAACTTCAAGGATTTTAAGCTTGTTAAGAAGCAACAGCTCAGTCACAATGTCGCTAAAT
TCGTATTTGAGCTTCCAACTCGTACCTCCGTCTTGGGTCTTCCCATCGGTCAGCACATCA
GCTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCCACAACCT
TAGATTCTGACCTTGGACGTTTTGAACTTGTTATCAAGATGTACCCGCAAGGAAGGATGT
CTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTCAAGGGACCAAAGGGTA
GGTTCAAGTATCAGCCGGGTCAGTTTAGGGCATTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCAGGCA
TCACTCCCATGTTCCAAGTGGCAAGAGCAATTCTAGAAAACCCAACAGACAAGACAAAGG
TGCACCTCATTTACGCCAATGTCACATACGAAGACATTCTCTTAAAGGAAGAATTGGAGA
GTCTTACATCCAATTACCCAGACCAGTTCAAA*TCTACTATGTTCTGAACCAGCCTCCGG
AAACATGGGATGGTGGTGTT

QA 3 742 3 742
DS 

RD RR2EG43JQ 644 0 0
TGTCAAGGGACCAAAGGGTAGGTTCAAGTATCAGCCGGGTCAGTTTAGGGCATTTGGAAT
GCTTGCTGGAGGTTCAGGCATCACTCCCATGTTCCAAGTGGCAAGAGCAATTCTAGAAAA
CCCAACAGACAAGACAAAGGTGCACCTCATTTACGCCAATGTCACATACGAAGACATTTT
CTTAAAGGAAGAATTGGAGAGTCTTACATCCAATTACCCAGACCAGTTCAAAATTTACTA
TGTTCTGAACCAGCCTCCGGAAACATGGGATGGTGGTGTTGGATTTGTATCCAAGGAAAT
GATTCAAGCCCACTGCCCTGCACCAGCATTTGATATTCAGATCCTGAGATGTGGACCACC
GCCGATGAACAAGGCCATGGCTTCAAACCTTGAAGCTCTTGGTTACTCTCCAGAGATGCA
ATTCCAGTTCTGATCTAAATACTCTGCTTTTGATTACTTCTTACACAAAATGGAGATATT
TAGAAGAAAAAAAACTCGTGTCTCTGATCAATAATGAGTGTTTCGCTGTCTTAATTGAGT
GAGAGTTGTTGTTTTTATTACAAGCTTCATAAACCATTGTGTTTGTTTGACGGTTTGTTA
TCTCGTTGGAAGTTCTGATTTATTGGTTAAAGATTTGGTTAGGC

QA 1 644 1 644
DS 



CO CL246Contig2 1122 5 4 U
GGACACCACTCCAAAAACAACTCATTCTAATTTGATCCTTTTCGTTTGCAATGGATACCG
AGTTTCTCCGCACCTTAGATCGCCAGATTCTCTTGGGTGTCTTCATCGCTTTCGTCGCCG
TCAGTGCCGGTGCTGCTTTT*ATCTCTCCTCCTCCAAGAAACGCAGAGGGTGTTTAGATC
CAGAGAGTTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAAGCAGCAACTCAGTCACAATGTCGCCA
AATTCGTTTTTGAACTCCCTTCTTCTACTGCTGTCTTGGGTCTTCCCATTGGACAACACA
TCAGTTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCC*ACA
ACGTTAGATTCTGATCTTGGACGCTTTGAGCTTGTCATTAAGATGTATCCACAAGGAAGG
ATGTCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTAAAAGGACCAAAG
GGGAGGTTCAAGTATCAGCCAGGTCAGTTTAGGGCATTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCA
GGCATCACTCCCATGTTTCAAGTTGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCCAACAGACAAGACA
AAGGTGCATCTCATTTATGCCAATGTCACATACGAAGACATTCTCTTAA*GGGAAGAATT
GGAGAGTCTTACCGCCAATTACCCAGATCAATTCAAAATCTACTATGTTTTGAACCAGCC
CCCGGAGACATGGGATGGTGGTGTTGGATTTGTATCAAAGGAAATGATCCAGGCTCATTG
CCCTGCACCTGCATCCGATATTCAGGTCTTGAGATGTGGACCACCGCCAATGAACAAGGC
CATGGCTGCAAACCTTGAAGCTCTTGGTTACTCTCCAGAGATGCAATTCCAATTCTAATT
GGTCCTAAAAAGACGGAACTATTTAAAAGAAAAAAACTTATTTCTTTGATCAAATAATTT
TTGTTACAATTTCACTGAGACTTGTGTCTTAATTGAGTTGAGACTTGTATTTCTGTTGTG
TTATCCCATAGGGAGTTCCGGTTTGCTTTTTAACGATTTGGTTAGGCATATTGTCTTACA
TGTATCGGTTTGGTTTGATATCATATAAAGACTTGATATTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F652TF U 136
AF RR2EA05TF U 1
AF RR2AX80TFB U 1
AF RR2AX80JQ C 330
AF RR2EA05JQ C 348
BS 1 649 RR2AX80TFB
BS 650 650 RR2AX80JQ
BS 651 715 RR2AX80TFB
BS 716 1122 RR2AX80JQ

RD RR2F652TF 182 0 0
TTTT
T*ATCTCTCCTCCTCCAAGAAACGCAGAGGGTGTTTAGATCCAGGGAGTTTCAAGGAGTT
CAAGCTTGTTAAGAAGCAGCAACTCAGTCACAATGTCGCCAAATTCGTTTTTGAACTCCC
TTCTTCTACTGCTGTCTTGGGTCTTCCCATTGGACAACACATCA*TTGCAGGGGAAAG

QA 5 182 5 182
DS 

RD RR2EA05TF 522 0 0
GGACACCACTCCAAAAACAACTCATTCTAATTTGATCCTTTTCGTTTGCAATGGATACCG
AGTTTCTCCGCACCTTAGATCGCCAGATTCTCTTGGGTGTCTTCGTCGCTTTCGTCGCCG
TCAGTGCCGGTGCTGCTTTTTATCTCTCCTCCTCCAAGAAACGCAGAGGGTGTTTAGATC
CAGAGAGTTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAAGCAGCAACTCAGTCACAATGTCGCCA
AATTCGTTTTTGAACTCCCTTCTTCTACTGCTGTCTTGGGTCTTCCCATTGGACAACACA
TCAGTTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCC*ACA
ACGTTAGATTCTGATCTTGGACGCTTTGAGCTTGTCATTAAGATGTATCCACAAGGAAGG
ATGTCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTAAAAGGACCAAAG
GGGAGGTTCAAGTATCAGCCAGGTCAGTTTAGGGCATTTGGA

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2AX80TFB 715 0 0
GGACACCACTCCAAAAACAACTCATTCTAATTTGATCCTTTTCGTTTGCAATGGATACCG
AGTTTCTCCGCACCTTAGATCGCCAGATTCTCTTGGGTGTCTTCATCGCTTTCGTCGCCG
TCAGTGCCGGTGCTGCTTTT*ATCTCTCCTCCTCCAAGAAACGCAGAGGGTGTTTAGATC
CAGAGAGTTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAAGCAGCAACTCAGTCACAATGTCGCCA
AATTCGTTTTTGAACTCCCTTCTTCTACTGCTGTCTTGGGTCTTCCCATTGGACAACACA
TCAGTTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCC*ACA
ACGTTAGATTCTGATCTTGGACGCTTTGAGCTTGTCATTAAGATGTATCCACAAGGAAGG
ATGTCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTAAAAGGACCAAAG
GGGAGGTTCAAGTATCAGCCAGGTCAGTTTAGGGCATTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCA
GGCATCACTCCCATGTTTCAAGTTGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCCAACAGACAAGACA
AAGGTGCATCTCATTTATGCCAATGTCACATACGAAGACATTCTCTTAAAGGGAAGAATT
GGAGAGTCTTACCGCCAATTACCCAGATCAATTCAAAATCTACTATGTTTTGAAC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2AX80JQ 793 0 0
GAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCCCACAACGTTAGATTCTGATCTTGGACGCTTTGA
GCTTGTCATTAAGATGTATCCACAAGGAAGGATGTCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGT
TGGAGACCATCTTGCTGTAAAAGGACCAAAGGGGAGGTTCAAGTATCAGCCAGGTCAGTT
TAGGGCATTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCAGGCATCACTCCCATGTTTCAAGTTGCAAG
AGCGATTCTTGAAAACCCAACAGACAAGACAAAGGTGCATCTCATTTATGCCAATGTCAC
ATACGAAGACATTTTCTTAA*GGGAAGAATTGGAGAGTCTTACCGCCAATTACCCAGATC
AATTCAAAATCTACTATGTTTTGAACCAGCCCCCGGAGACATGGGATGGTGGTGTTGGAT
TTGTATCAAAGGAAATGATCCAGGCTCATTGCCCTGCACCTGCATCCGATATTCAGGTCT
TGAGATGTGGACCACCGCCAATGAACAAGGCCATGGCTGCAAACCTTGAAGCTCTTGGTT
ACTCTCCAGAGATGCAATTCCAATTCTAATTGGTCCTAAAAAGACGGAACTATTTAAAAG
AAAAAAACTTATTTCTTTGATCAAATAATTTTTGTTACAATTTCACTGAGACTTGTGTCT
TAATTGAGTTGAGACTTGTATTTCTGTTGTGTTATCCCATAGGGAGTTCCGGTTTGCTTT
TTAACGATTTGGTTAGGCATATTGTCTTACATGTATCGGTTTGGTTTGATATCATATAAA
GACTTGATATTGA

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2EA05JQ 768 0 0
TACACTCCC*ACAACGTTAGATTCTGATCTTGGACGCTTTGAGCTTGTCATTAAGATGTA
TCCACAAGGAAGGATGTCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGT
AAAAGGACCAAAGGGGAGGTTCAAGTATCAGCCAGGTCAGTTTAGGGCATTTGGAATGCT
TGCTGGAGGTTCAGGCATCACTCCCATGTTTCAAGTTGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCC
AACAGACAAGACAAAGGTGCATCTCATTTATGCCAATGTCACATACGAAGACATTCTCTT
AA*GGGAAGAATTGGAGAGTCTTACCGCCAATTACCCAGATCAATTCAAAATCTACTATG
TTTTGAACCAGCCCCCGGAGACATGGGATGGTGGTGTTGGATTTGTATCAAAGGAAATGA
TCCAGGCTCATTGCCCTGCATCTGCATCCGATATTCAGGTCTTGAGATGTGGACCACCGC
CAATGAACAAGGCCATGGCTGCAAACCTTGAAGCTCTTGGTTACTCTCCAGAGATGCAAT
TCCAATTCTAATTGGTCCTAAAAAGACGGAACTATTTAAAGGAAAAAA*CTTATTTCTTT
GATCAAATAATTTTTGTTACAATTTCACTGAGACTTGTGTCTTAATTGGGTTGAGACTTG
TATTTCTGTTGTGTTATCCCATAGGGAGTTCCGGTTTGCTTTTTAACGATTTGGTTAGGC
ATATTGTCTTACATGTATCGGTTTGGTTTGATATCATATAAAGACTTG

QA 1 768 1 768
DS 



CO CL246Contig3 1126 4 10 U
GGGACAGACTTTGCACCTCTTTCTTCTTCATTCTCTCTCTTTCCTTACTTTCATTTGCAT
CTTGGTTAAGAGCCATGGTGGATACAGAGTTCCCCCGAACACTAGATCGTCAGATTCTCT
TGGGTGTCTTCGTCGCTTTCGTCGCCGTCGGCGCCGGTGCTGCTTACTATCTCTCTTCCT
CCAAAAAACGCAGAGGGTGTTTGGATCCAGAGAACTTCAAGGATTTTAAGCTTGTCAAAA
AGCAACAACTTAGTCACAATGTGGCTAAATTCGTATTTGAGCTTCCATCTTCTACCCCCG
TCTTGGGTCTTCCCATTGGTCAACACATCAGCTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGG
ATGTTATTAAGCCTTACACTCCCACAACCTTAGATTCTGACCTTGGACGTTTTGAACTTG
TTATTAAGATGTATCCGCAAGGAAGGATGTCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAG
ACCATCTTGCTGTCAAGGGACCAAAGGGTAGGTTCAAGTATCAGCCGGGTCAGTTTAGGG
CATTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCAGGCATCACTCCCATGTTCCAAGTGGCAAGAGCAA
TTCTAGAAAACCCAACAGACAAGACACAGGTTCAGCTCGTTTACGCCAATGTCACATACG
AGGACATTCTCTTAAAGGAAGAATTGGAGAGTCTTACATCCAATTACCCAGACCAGTTCA
AAATCTACTATGTTCTGAACCAGCCTCCGGAGACATGGGATGGTGGTGTTGGATTTGTAT
CTAAGGAAATGATTCAGGCCCACTGCCCTGCACCAGCATCTGATATTCAGATCCTGAGAT
GTGGACCACCGCCGATGAACAAGGCCATGGCTGCAAACCTTGAAGCTCTTGGTTACTCTC
CAGAGATGCAATTCCAGTTCTGATCTAAATACTCTGCTTTTGATTGCTTCTCCACAAAAT
AGAGCTATATAAAAAAAACCCGTATCTCTGATCAATAATGAGAGTTTCGCTGTCTTAATT
GAGTGAGAGTTGTTGTTTCTATTAGAAGCTTCATAAACCATTGTGTTTGTTTGACGGTTT
GCTATCTCGTTGGATTCTGATTTATTGGTTAAAGATTTGGTTAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD89TF U 1
AF RR2FV15TF U 41
AF RR2FV15JQ C 316
AF RR2CD89JQ C 423
BS 1 93 RR2CD89TF
BS 94 94 RR2FV15TF
BS 95 658 RR2CD89TF
BS 659 757 RR2FV15TF
BS 758 819 RR2FV15JQ
BS 820 820 RR2CD89JQ
BS 821 1003 RR2FV15JQ
BS 1004 1004 RR2CD89JQ
BS 1005 1094 RR2FV15JQ
BS 1095 1126 RR2CD89JQ

RD RR2CD89TF 658 0 0
GGGACAGACTTTGCACCTCTTTCTTCTTCATTCTCTCTCTTTCCTTACTTTCATTTGCAT
CTTGGTTAAGAGCCATGGTGGATACAGAGTTCCTCCGAACACTAGATCGTCAGATTCTCT
TGGGTGTCTTCGTCGCTTTCGTCGCCGTCGGCGCCGGTGCTGCTTACTATCTCTCTTCCT
CCAAAAAACGCAGAGGGTGTTTGGATCCAGAGAACTTCAAGGATTTTAAGCTTGTCAAAA
AGCAACAACTTAGTCACAATGTGGCTAAATTCGTATTTGAGCTTCCATCTTCTACCCCCG
TCTTGGGTCTTCCCATTGGTCAACACATCAGCTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGG
ATGTTATTAAGCCTTACACTCCCACAACCTTAGATTCTGACCTTGGACGTTTTGAACTTG
TTATTAAGATGTATCCGCAAGGAAGGATGTCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAG
ACCATCTTGCTGTCAAGGGACCAAAGGGTAGGTTCAAGTATCAGCCGGGTCAGTTTAGGG
CATTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCAGGCATCACTCCCATGTTCCAAGTGGCAAGAGCAA
TTCTAGAAAACCCAACAGACAAGACACAGGTTCAGCTCGTTTACGCCAATGTCACATA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2FV15TF 717 0 0
TTCCTTACTTTCATTTGCATCTTGGTTAAGAGCCATGGTGGATACAGAGTTCCCCCGAAC
ACTAGATCGTCAGATTCTCTTGGGTGTCTTCGTCGCTTTCGTCGCCGTCGGCGCCGGTGC
TGCTTACTATCTCTCTTCCTCCAAAAAACGCAGAGGGTGTTTGGATCCAGAGAACTTCAA
GGATTTTAAGCTTGTCAAAAAGCAACAACTTAGTCACAATGTGGCTAAATTCGTATTTGA
GCTTCCATCTTCTACCTCCGTCTTGGGTCTTCCCATTGGTCAACACATCAGCTGCAGGGG
AAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCCACAACCTTAGATTCTGA
CCTTGGACGTTTTGAACTTGTTATTAAGATGTATCCGCAAGGAAGGATGTCTCATCATTT
CAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTCAAGGGACCAAAGGGTAGGTTCAAGTA
TCAGCCGGGTCAGTTTAGGGCATTTGGAATGCTTGCTTGAGGTTCAGGCATCACTCCCAT
GTTCCAAGTGGCAAGAGCAATTCTAGAAAACCCAACAGACAAGACACAGGTTCAGCTCGT
TTACGCCAATGTCACATACGAGGACATTCTCTTAAAGGAAGAATTGGAGAGTCTTACATC
CAATTACCCAGACCAGTTCAAAATCTACTATGTTCTGAACCAGCCTCCGGAGACATG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2FV15JQ 789 0 0
TTGGTCAACACATCAGCTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGC*TT
ACACTCCCACAACCTTAGATTCTGACCTTGGACGTTTTGAACTTGTTATTAAGATGTATC
CGCAAGGAAGGATGTCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTCA
AGGGACCAAAGGGTAGGTTCAAGTATCAGCCGGGTCAGTTTAGGGCATTTGGAATGCTTG
CTTGAGGTTCAGGCATCACTCCCATGTTCCAAGTGGCAAGAGCAATTCTAGAAAACCCAA
CAGACAAGACACAGGTTCAGCTCGTTTACGCCAATGTCACATACGAGGACATTCTCTTAA
AGGAAGAATTGGAGAGTCTTACATCCAATTACCCAGACCAGTTCAAAATTTACTATGTTT
TGAACCAGCCTCCGGAGACATGGGATGGTGGTGTTGGATTTGTATCTAAGGAAATGATTC
AGGCCCACTGCCCTGCACCAGCATTTGATATTCAGATCCTGAGATGTGGACCACCGCCGA
TGAACAAGGCCATGGCTGCAAACCTTGAAGCTCTTGGTTACTCTCCAGAGATGCAATTCC
AGTTCTGATCTAAATACTCTGCTTTTGATTGCTTCTCCACAAAATAGAGCTATATAAAAA
AAACCCGTATCTCTGATCAATAATGAGATTTTCGCTGTCTTAATTGAGTGAGAGTTGTTG
TTTCTATTAGAAGCTTCATAAACCATTGTGTTTGTTTGACGGTTTGCTATCTCGTTGGA
TTCTGATTAG

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2CD89JQ 704 0 0
ATTAAGATGTATCCGCAAGGAAGGATGTCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGAC
CATCTTGCTGTCAAGGGACCAAAGGGTAGGTTCAAGTATCAGCCGGGTCAGTTTAGGGCA
TTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCAGGCATCACTCCCATGTTCCAAGTGGCAAGAGCAATT
CTAGAAAACCCAACAGACAAGACACAGGTTCAGCTCGTTTACGCCAATGTCACATACGAG
GACATTTTCTTAAAGGAAGAATTGGAGAGTCTTACATCCAATTACCCAGACCAGTTCAAA
ATCTACTATGTTCTGAACCAGCCTCCGGAAACATGGGATGGTGGTGTTGGATTTGTATCT
AAGGAAATGATTCAGGCCCACTGCCCTGCACCAGCATCTGATATTCAGATCCTGAGATGT
GGACCACCGCCGATGAACAAGGCCATGGCTGCAAACCTTGAAGCTCTTGGTTACTCTCCA
GAGATGCAATTCCAGTTCTGATCTAAATACTCTGCTTTTGATTGCTTCTCCACAAAATAG
AGCTATATAAAAAAA*CCCGTATCTCTGATCAATAATGAGAGTTTCGCTGTCTTAATTGA
GTGAGAGTTGTTGTTTCTATTAGAAGCTTCATAAACCATTGTGTTTGTTTGACGGTTTGT
TATCTCGTTGGATTCTGATTTATTGGTTAAAGATTTGGTTAGAC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 15

CO CL247Contig1 659 15 4 U
GGGACCATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGAT
GGAAGGCAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCA
AGTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCG
TCTTACTGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGG
GACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATACTGTCAA
TGAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGA
ATCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGTGCTTA
TTTCTGCACCAAGGGCTCAGATAAAGCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATC
TATGTGTTGTTGTTCTCCGTGTTTTTAATAATCGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACT
CTTATACAATTTCCTGGTAGTCTATCTGACGTAGAAGGTCATCATCGATCCCTAGATTGT
CTATCCCTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCTTCTCGAATATTATC


BQ
10 65 65 65 65 65 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 35 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 35 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H051TF U 2
AF RR2BX40JQ C 5
AF RR2BR30TF U 5
AF RR2DO51TF U 2
AF RR2GJ88TF U 2
AF RR2BA82TF U 1
AF RR2DO51JQ C 2
AF RR2BB10JQ C 2
AF RR2GJ88JQB C 2
AF RR2H051JQ C 2
AF RR2BX40TF U 6
AF RR2BB10TF U 2
AF RR2GY28JQ C 1
AF RR2GY28TF U 1
AF RR2BR30JQ C 271
BS 1 548 RR2BA82TF
BS 549 549 RR2DO51TF
BS 550 648 RR2BA82TF
BS 649 659 RR2BR30JQ

RD RR2H051TF 524 0 0
GGACCATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATG
GAAGGCAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAA
GTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGT
CTTACTGGATCATCTAGGAAAACTTGTGCAAAACTCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGG
ACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATGCTGTCAAT
GAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGCGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAC
TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACTGACACATGTGCTTAT
TTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAAATCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATCT
ATGTGTTGTTGTTCTCCGTATTTTTAATAATTGTCGTGTATGTG

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2BX40JQ 540 0 0
GG
ATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATGGAAGG
CAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAAGTCGA
AGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGTCTTAC
TGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGGACAAC
ATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATACTGTCAATGAATA
CTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAATCCGA
TGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGTGCTTATTTTTG
CACCAAGGGCTCAGATAAAGCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACAATCTATGTG
TTGTTGTTCTCCGTGTTTTTAATAATCGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTCTTA

QA 3 540 3 540
DS 

RD RR2BR30TF 568 0 0
GG
ATTACAAGTTTA*GTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATGGAAGG
CAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAAGTCAA
AGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGTCTTAC
TGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGGACAAC
ATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCAAAAACTCTGGTGATACTGTCAATGAATA
CTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAATCCGA
TGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGTGCTTATTTCTG
CACCAAGGGCTCAGATAAAGCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATCTATGTG
TTGTTGTTCTCCGTGTTTTTAATAATCGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTCTTATA
CAGTTTCCTGGTAGTCTATCTGACGT

QA 3 568 3 568
DS 

RD RR2DO51TF 571 0 0
GGACCATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCATATAAGTAATCAGTCTAAAGATG
GAAGGCAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAA
GTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGT
CTTACTGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGG
ACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTAGTGATACTGTCAAT
GAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAA
TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGTGCTTAT
TTCTGCACCAAGGGCTCAGATAAAGCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATCT
ATGTGTTGTTGTTCCCCGTGTTTTTAATAATCGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTC
TTATACAATTTCCTGGTAGTCTATCTGACGT

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2GJ88TF 568 0 0
GGACCATTACAAATTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATG
GAAGGCAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAA
GTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCAT
CTTACTGGATCATCTAGGAAAACTTGTGCAAAACTCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGG
ACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATGCTGTCAAT
GAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAC
TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACTGACACATGTGCTTAT
TTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAAATCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATCT
ATGTGTTGTTGTTCTCCGTATTTTTAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTC
TTATACAATTTCCTGGTAGTCTATCTGA

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2BA82TF 648 0 0
GGGACCATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGAT
GGAAGGCAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCA
AGTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCG
TCTTACTGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGG
GACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATACTGTCAA
TGAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGA
ATCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGTGCTTA
TTTCTGCACCAAGGGCTCAGATAAAGCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATC
TATGTGTTGTTGTTCTCCGTGTTTTTAATAATCGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACT
CTTATACAGTTTCCTGGTAGTCTATCTGACGTAGAAGGTCATCATCGATCCCTAGATTGT
CTATCCCTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCTTCT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2DO51JQ 645 0 0
GGACCATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCATATAAGTAATCAGTCTAAAGATG
GAAGGCAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAA
GTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGT
CTTACTGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGG
ACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTAGTGATACTGTCAAT
GAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAA
TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGTGCTTAT
TTCTGCACCAAGGGCTCAGATAAAGCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATCT
ATGTGTTGTTGTTCCCCGTGTTTTTAATAATCGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTC
TTATACAATTTCCTGGTAGTCTATCTGACGTAGAAGGTCATCATCGATCCCTAGATTGTC
TATCCCTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCTT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2BB10JQ 645 0 0
GGACCATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATG
GAAGGCAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAA
GTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGT
CTTACTGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGG
ACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATACTGTCAAT
GAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAA
TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGTGCTTAT
TTCTGCACCAAGGGCTCAGATAAAGCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATCT
ATGTGTTGTTGTTCTCCGTGTTTTTAATAATCGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTC
TTATACAATTTCCTGGTAGTCTATCTGACGTAGAAGGTCATCATCGATCCCTAGATTGTC
TATCCCTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCT
C

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2GJ88JQB 645 0 0
GGACCATTACAAATTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATG
GAAGGCAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAA
GTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCAT
CTTACTGGATCATCTAGGAAAACTTGTGCAAAACTCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGG
ACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATGCTGTCAAT
GAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAC
TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACTGACACATGTGCTTAT
TTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAAATCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATCT
ATGTGTTGTTGTTCTCCGTATTTTTAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTC
TTATACAATTTCCTGGTAGTCTATCTGACGTAGAAGGTCATCATCGATCCCTAGATTGTC
TATCCCTTTTACTTGCTATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCT
C

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2H051JQ 645 0 0
GGACCATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATG
GAAGGCAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAA
GTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGT
CTTACTGGATCATCTAGGAAAACTTGTGCAAAACTCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGG
ACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATGCTGTCAAT
GAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGCGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAC
TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACTGACACATGTGCTTAT
TTCTGCACCAAGGGTTCAGCTAAATCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATCT
ATGTGTTGTTGTTCTCCGTATTTTTAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTC
TTATACAATTTCCTGGTAGTCTATCTGACGTAGAAGGTCATCATCGATCCCTAGATTGTC
TATCCCTTTTACTTGCTATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCC
CC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2BX40TF 639 0 0
G
ATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATGGAAGG
CAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAAGTCGA
AGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGTCTTAC
TGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGGACAAC
ATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATACTGTCAATGAATA
CTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAATCCGA
TGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGTGCTTATTTCTG
CACCAAGGGCTCAGATAAAGCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATCTATGTG
TTGTTGTTCTCCGTGTTTTTAATAATCGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTCTTATA
CAATTTCCTGGTAGTCTATCTGACGTAGAAGGTCATCATCGATCCCTAGATTGTCTATCC
CTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCC

QA 2 639 2 639
DS 

RD RR2BB10TF 645 0 0
GGACCATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATG
GAAGGCAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAA
GTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGT
CTTACTGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGG
ACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATACTGTCAAT
GAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAA
TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGTGCTTAT
TTCTGCACCAAGGGCTCAGATAAAGCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATCT
ATGTGTTGTTGTTCTCCGTGTTTTTAATAATCGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTC
TTATACAATTTCCTGGTAGTCTATCTGACGTAGAAAGTCATCATCGATCCCTAGATTGTC
TATCCCTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCT
C

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2GY28JQ 650 0 0
G
GGACCATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATG
GAAGGCAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAA
GTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGT
CTTACTGGATCCTCTAGGAAACCTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGG
ACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATACTGTCAAT
GAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAA
TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGTGCTTAT
TTTTGCACCAAGGGCTCAGATAAAGCAGTTGAAACTGCCTAGCAAGCATATCCACGATCT
ATGTGTTGTTGTTCTCCGTGTTTTTAATAATCGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTC
TTATACAGTTTCCTGGTAGTCTATCTGACGTAGAAGGTCATCATCGATCCCTAGATTGTC
TATCCCTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCTTCT
CG

QA 2 648 2 648
DS 

RD RR2GY28TF 650 0 0
G
GGACCATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATG
GAAGGCAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAA
GTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGT
CTTACTGGATCCTCTAGGAAACCTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGG
ACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATACTGTCAAT
GAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAA
TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGTGCTTAT
TTCTGCACCAAGGGCTCAGATAAAGCAGTTGAAACTGCCTAGCAAGCATATCCACGATCT
ATGTGTTGTTGTTCTCCGTGTTTTTAATAATCGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTC
TTATACAGTTTCCTGGTAGTCTATCTGACGTAGAAGGTCATCATCGATCCCTAGATTGTC
TATCCCTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCTTCT
CG

QA 2 648 2 648
DS 

RD RR2BR30JQ 389 0 0
AATTTTCA
AAAACTCTGGTGATACTGTCAATGAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTG
GTGGCTTAACCACTCTCCAGGAATCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCAC
AATGCACCGACACATGTGCTTATTTCTGCACCAAGGGCTCAGATAAAGCAGTTGAAACTG
CCTAACAAGCATATCCACGATCTATGTGTTGTTGTTCTCCGTGTTTTTAATAATCGTCGT
GTATGTGACAAAATGCTAGACTCTTATACAGTTTCCTGGTAGTCTATCTGACGTAGAAGG
TCATCATCGATCCCTAGATTGTCTATCCCTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAATAAT
GTTTCCTTCTCGAATATTATC

QA 9 389 9 389
DS 



AS 1 15

CO CL248Contig1 690 15 4 U
CAATGGCCTCCTTATCCACAGGCTCCGTTGTTGTTTCTTCGGCTTCGTCGCGTTTGTGTC
TTCCTTCTTCCTCCACCAGGAAGATCAGCGTCACTTCCGCTTCGCTTTCTCTAGGCTCGG
GTTCGAGAAGAGGAACGTTTTCTCTGAGCTCTTCAACATCAGCCTCAGCTTCTTCTCAGC
TGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCACCTCTTTCCCTCGCTTCCACATTTTCTGGTTTGT
CTATTGCGTTTGATCTCAGCAGTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAG
GGCTTGTGGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCAAGAA
AATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTAGAGCCA
CCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCA
GCGGCAAACGTGCTTGAATGTCGCCTTTCTCTCATCACCCTATCTGTAATCTTTTGTTTG
ATATGCTTTTCTTTTTTTTCTTTTT*CTTGTGTGTTTCCGGCAGAAGATACAATGAGAAA
ACACAAGTCGATGAGCTCTTTTCTGCTTTTTAACTCTTTATGTATCATTTACATTGCGCT
ATAGTACTTGCTTCGCTAGATTTTGATCCC


BQ
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 45 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 80 80 80 80 80 80 80 
55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 
85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 45 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 60 60 30 60 60 45 60 60 60 50 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B333JQ C 1
AF RR2BD05JQ C 234
AF RR2DX62TF U 1
AF RR2DX62JQ C 262
AF RR2BD01TF U 1
AF RR2H454TF U 1
AF RR2B333TF U 1
AF RR2C141JQ C 1
AF RR2C141TF U 1
AF RR2BD05TF U 1
AF RR2F168JQ C 12
AF RR2F168TF U 1
AF RR2AR74JQ C 1
AF RR2AR74TF U 1
AF RR2AT30TF U 1
BS 1 342 RR2AR74TF
BS 343 343 RR2AT30TF
BS 344 677 RR2AR74TF
BS 678 690 RR2AT30TF

RD RR2B333JQ 452 0 0
CAATGGCCTCCTTATCCACAGGCTCCGTTGTTGTTTCTTCGGCTTCGTCGCGTTTGTGTC
TTCCTTCTTCCTCCACCAGGAAGATCAGCGTCACTTCCGCTTCGCTTTCTCTAGGCTCGG
GTTCGAGAAGAGGAACGTTTTTTCTGAGCTCTTCAACATCAGCCTCAGCTTCTTTTCAGC
TGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCACCTCTTTCCCTCGCTTCCACATTTTTTGGTTTGT
TTATTGCGTTTGATCTCAGCAGTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAG
GGCTTGTGGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCAAGAA
AATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCCCCAGTGGTAGAGCCC
CCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGG

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2BD05JQ 335 0 0
GGTTTGTTTATTGCGTTTGATTTCAGCAGTGGAACAAGTGGTTTCCTGAGTAGCCAGAAA
CGCAGAGGGCTTGTGGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTTTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGG
TCAAGAAAATTTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCCCCAGTGGT
AGAGCCCCCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATTTTTGCCCTAAGTCCAAC
CCTAGCAGCGGCAAACGTGCTTGAATGTCCCCTTTCTCTCATCCCCCTATCTGTAATCTT
TTGTTTGATATGCTTTTCTTTTTTTTCTTTTT
TTT

QA 1 332 1 332
DS 

RD RR2DX62TF 579 0 0
CAATGGCCTCCTTATCCACAGGCTCCGTTGTTGTTTCTTCGGCTTCGTCGCGTTTGTGTC
TTCCTTCTTCCTCCACCAGGAAGATCAGCGTCACTTCCGCTTCGCTTTCTCTAGGCTCGG
GTTCGAGAAGAGGAACGTTTTCTCTGAGCTCTTCAACATCAGCCTCAGCTTCTTCTCAGC
TGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCACCTCTTTCCCTCGCTTCCACATTTTCTGGTTTGT
CTATTGCGTTTGATCTCAGCAGTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAG
GGCTTGTGGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCAAGAA
AATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTAGAGCCA
CCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCA
GCGGCAAACGTGCTTGAATGTCGCCTTTCTCTCATCACCCTATCTGTAATCTTTTGTTTG
ATATGCTTTTCTTTTTTTTCTTTTT*CTTGTGTGTTTCC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2DX62JQ 370 0 0
GTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAGGGCTTGTGGTGAGAGCTGGAA
AAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCAAGAAAATCTCTGGCTAGGACTCATG
GTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTAGAGCCACCATCAAGCGCCGACGTGCCA
AGGGACGTTGGAATTTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCAGCGGCAAACGTGCTTGAATGT
CGCCTTTCTCTCATCACCCTATCTGTAATCTTTTGTTTGATATGCTTTTCTTTTTTTTCT
TTTT*CTTGTGTGTTTCCGGCAGAAGATACAATGAGAAAACACAAGTCGATGAGCTCTTT
TCTGCTTTTT

QA 1 370 1 370
DS 

RD RR2BD01TF 615 0 0
CAATGGCCTCCTTATCCACAGGCTCCGTTGTTGTTTCTTCGGCTTCGTCGCGTTCGTGTC
TTCCTTCTTCCTCCACCAGGAAGATCAGCGTCACTTCCGCTTCGCTTTCTCTAGACTCGG
GTTCGAGAAGAGGAACGTTTTCTCTGAGCTCTTCAACATCAGCCTCAGCTTCTTCTCAGC
TGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCACCTCTTTCCCTCGCTTCCACATTTTCTGGTTTGT
CTATTGCGTTTGATCTCAGCAGTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAG
GGCTTGTGGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCAAGAA
AATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTAGAGCCA
CCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCA
GCGGCAAACGTGCTTGAATGTCGCCTTTCTCTCATCACCCTATCTGTAATCTTTTGTTTG
ATATGCTTTTCTTTTTTTTCTTTTT*CTTGTGTGTTTCCGGCAGAAGATACAATGAGAAA
ACACAAGTCGATGAG

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2H454TF 627 0 0
CAATGGCCTCCTTATCCACAGGCTCCGTTGTTGTTTCTTCGGCTTCGTCGCGTTTGTGTC
TTCCTTCTTCCTCCACCAGGAAGATCAGCGTCACTTCCGCTTCGCTTTCTCTAGGCTCGG
GTTCGAGAAGAGGAACGTTTTCTCTGAGCTCTTCAACATCAGCCTCAGCTTCTTCTCAGC
TGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCACCTCTTTCCCTCGCTTCCACATTTTCTGGTTTGT
CTATTGCGTTTGATCTCAGCAGTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAG
GGCTTGTGGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCAAGAA
AATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTAGAGCCA
CCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCA
GCGGCAAACGTGCTTGAATGTCGCCTTTCTCTCATCACCCTATCTGTAATCTTTTGTTTG
ATATGCTTTTCTTTTTTTTCTTTTT*CTTGCGTGTTTCCAGCAGAAGATACAATGAGAAA
*CACAAGTCGATGAGCTCTTTTCTGCT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2B333TF 617 0 0
CAATGGCCTCCTTATCCACAGGCTCCGTTGTTGTTTCTTCGGCTTCGTCGCGTTTGTGTC
TTCCTTCTTCCTCCACCAGGAAGATCAGCGTCACTTCCGCTTCGCTTTCTCTAGGCTCGG
GTTCGAGAAGAGGAACGTTTTCTCTGAGCTCTTCAACATCAGCCTCAGCTTCTTCTCAGC
TGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCACCTCTTTCCCTCGCTTCCACATTTTCTGGTTTGT
CTATTGCGTTTGATCTCAGCAGTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAG
GGCTTGTGGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCAAGAA
AATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTAGAGCCA
CCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCA
GCGGCAAACGTGCTTGAATGTCGCCTTTCTCTCATCACCCTATCTGTAATCTTTTGTTTG
ATATGCTTTTCTTTTTTTTCTTTTT*CTTGTGTGTTTCCGGCAGAAGATACAATGAGAAA
ACACAAGTCGATGAGCT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2C141JQ 628 0 0
CAATGGCCTCCTTATCCACAGGCTCCGTTGTTGTTTCTTCGGCTTCGTCGCGTTTGTGTC
TTCCTTCTTCCTCCACCAGGAAGATCAGCGTCACTTCCGCTTCGCTTTCTCTAGGCTCGG
GTTCGAGAAGAGGAACGTTTTCTCTGAGCTCTTCAACATCAGCCTCAGCTTCTTCCCAGC
TGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCACCTCTTTCCCTCGCTTCCACATTTTCTGGTTTGT
CTATTGCGTTTGATCTCAGCAGTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAG
GGCTTGTGGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCGAGAA
AATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTAGAGCCA
CCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCA
GCGGCAAACGTGCTTGAATGTCGCCTTTCTCTCATCACCCTATCTGTAATCTTTTGTTTG
ATATGCTTTTCTTTTTTTTCTTTTT*CTTGTGTGTTTCCGGCAGAAGATACAATGAGAAA
ACACAAGTCGATGAGCTCTTTTCTGC
CC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2C141TF 628 0 0
CAATGGCCTCCTTATCCACAGGCTCCGTTGTTGTTTCTTCGGCTTCGTCGCGTTTGTGTC
TTCCTTCTTCCTCCACCAGGAAGATCAGCGTCACTTCCGCTTCGCTTTCTCTAGGCTCGG
GTTCGAGAAGAGGAACGTTTTCTCTGAGCTCTTCAACATCAGCCTCAGCTTCTTCCCAGC
TGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCACCTCTTTCCCTCGCTTCCACATTTTCTGGTTTGT
CTATTGCGTTTGATCTCAGCAGTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAG
GGCTTGTGGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCGAGAA
AATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTAGAGCCA
CCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCA
GCGGCAAACGTGCTTGAATGTCGCCTTTCTCTCATCACCCTATCTGTAATCTTTTGTTTG
ATATGCTTTTCTTTTTTTTCTTTTT*CTTGTGTGTTTCCGGCAGAAGATACAATGAGAAA
ACACAAGTCGATGAGCTCTTTTCTGC
CC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2BD05TF 627 0 0
CAATGGCCTCCTTATCCACAGGCTCCGTTGTTGTTTCTTCGGCTTCGTCGCGTTTGTGTC
TTCCTTCTTCCTCCACCAGGAAGATCAGCGTCACTTCCGCTTCGCTTTCTCTAGGCTCGG
GTTCGAGAAGAGGAACGTTTTCTCTGAGCTCTTCAACATCAGCCTCAGCTTCTTCTCAGC
TGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCACCTCTTTCCCTCGCTTCCACATTTTCTGGTTTGT
CTATTGCGTTTGATCTCAGCAGTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAG
GGCTTGTGGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCAAGAA
AATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTAGAGCCA
CCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCA
GCGGCAAACGTGCTTGAATGTCGCCTTTCTCTCATCACCCTATCTGTAATCTTTTGTTTG
ATATGCTTTTCTTTTTTTTCTTTTTTCTTGTGTGTTTCCGGCAGAAGATACAATGAGAAA
ACACAAGTCGATGAGCTCTTTTCTGCT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2F168JQ 637 0 0
TTATCCACAGGCTCCGTTGTTGTTTCTTCGGCTTCGTCGCGTTTGTGTCTTCCTTCTTCC
TCCACCAGGAAGATCAGCGTCACTTCCGCTTCGCTTTCTCTAGGCTCGGGTTCGAGAAGA
GGAACGTTTTCTCTGAGCTCTTCAACATCAGCCTCAGCTTCTTCTCAGCTGCTCCATTGC
TCCTTTCTCTCTTCACCTCTTTCCCTCGCTTCCACATTTTCTGGTTTGTCTATTGCGTTT
GATCTCAGCAGTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAGGGCTTGTGGTG
AGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCAAGAAAATCTCTGGCT
AGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTAGAGCCACCATCAAGCGC
CGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCAGCGGCAAACGT
GCTTGAATGTCGCCTTTCTCTCATCACCCTATCTGTAATCTTTTGTTTGATATGCTTTTC
TTTTTTTTCTTTTT*CTTGTGTGTTTCCGGCAGAAGATACAATGAGAAAACACAAGTCGA
TGAGCTCTCTTCTGCTTTTTAACTCTTTATGTATCA
G

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2F168TF 648 0 0
CAATGGCCTCCTTATCCACAGGCTCCGTTGTTGTTTCTTCGGCTTCGTCGCGTTTGTGTC
TTCCTTCTTCCTCCACCAGGAAGATCAGCGTCACTTCCGCTTCGCTTTCTCTAGGCTCGG
GTTCGAGAAGAGGAACGTTTTCTCTGAGCTCTTCAACATCAGCCTCAGCTTCTTCTCAGC
TGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCACCTCTTTCCCTCGCTTCCACATTTTCTGGTTTGT
CTATTGCGTTTGATCTCAGCAGTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAG
GGCTTGTGGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCAAGAA
AATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTAGAGCCA
CCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCA
GCGGCAAACGTGCTTGAATGTCGCCTTTCTCTCATCACCCTATCTGTAATCTTTTGTTTG
ATATGCTTTTCTTTTTTTTCTTTTT*CTTGTGTGTTTCCGGCAGAAGATACAATGAGAAA
ACACAAGTCGATGAGCTCTCTTCTGCTTTTTAACTCTTTATGTATCA
G

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2AR74JQ 679 0 0
CAATGGCCTCCTTATCCACAGGCTCCGTTGTTGTTTCTTCGGCTTCGTCGCGTTTGTGTC
TTCCTTCTTCCTCCACCAGGAAGATCAGCGTCACTTCCGCTTCGCTTTCTCTAGGCTCGG
GTTCGAGAAGAGGAACGTTTTCTTTGAGCTCTTCAACATCAGCCTCAGCTTCTTTTCAGC
TGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCACCTCTTTCCCTCGCTTCCACATTTTTTGGTTTGT
CTATTGCGTTTGATCTCAGCAGTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAG
GGCTTGTGGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTTTGTGTCAAACGATGAGGAGCAGGTCAAGAA
AATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTAGAGCCA
CCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATTTTTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCA
GCGGCAAACGTGCTTGAATGTCGCCTTTCTCTCATCACCCTATCTGTAATCTTTTGTTTG
ATATGCTTTTCTTTTTTTTCTTTTT*CTTGTGTGTTTCCGGCAGAAGATACAATGAGAAA
ACACAAGTCGATGAGCTCTTTTTTGCTTTTTAACTCTTTATGTATCATTTACATTGCGCT
ATAGTACTTGCTTCGCT
AG

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2AR74TF 677 0 0
CAATGGCCTCCTTATCCACAGGCTCCGTTGTTGTTTCTTCGGCTTCGTCGCGTTTGTGTC
TTCCTTCTTCCTCCACCAGGAAGATCAGCGTCACTTCCGCTTCGCTTTCTCTAGGCTCGG
GTTCGAGAAGAGGAACGTTTTCTCTGAGCTCTTCAACATCAGCCTCAGCTTCTTCTCAGC
TGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCACCTCTTTCCCTCGCTTCCACATTTTCTGGTTTGT
CTATTGCGTTTGATCTCAGCAGTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAG
GGCTTGTGGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGATGAGGAGCAGGTCAAGAA
AATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTAGAGCCA
CCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCA
GCGGCAAACGTGCTTGAATGTCGCCTTTCTCTCATCACCCTATCTGTAATCTTTTGTTTG
ATATGCTTTTCTTTTTTTTCTTTTT*CTTGTGTGTTTCCGGCAGAAGATACAATGAGAAA
ACACAAGTCGATGAGCTCTTTTCTGCTTTTTAACTCTTTATGTATCATTTACATTGCGCT
ATAGTACTTGCTTCGCT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2AT30TF 690 0 0
CAATGGCCTCCTTATCCACAGGCTCCGTTGTTGTTTCTTCGGCTTCGTCGCGTTTGTGTC
TTCCTTCTTCCTCCACCAGGAAGATCAGCGTCACTTCCGCTTCGCTTTCTCTAGGCTCGG
GTTCGAGAAGAGGAACGTTTTCTCTGAGCTCTTCAACATCAGCCTCAGCTTCTTCTCAGC
TGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCACCTCTTTCCCTCGCTTCCACATTTTCTGGTTTGT
CTATTGCGTTTGATCTCAGCAGTGGAACAAGTGGTCTCCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAG
GGCTTGTGGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCAAGAA
AATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGTAGAGCCA
CCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCA
GCGGCAAACGTGCTTGAATGTCGCCTTTCTCTCATCACCCTATCTGTAATCTTTTGTTTG
ATATGCTTTTCTTTTTTTTCTTTTT*CTTGTGTGTTTCCGGCAGAAGATACAATGAGAAA
ACACAAGTCGATGAGCTCTTTTCTGCTTTTTAACTCTTTATGTATCATTTACATTGCGCT
ATAGTACTTGCTTCGCTAGATTTTGATCCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 3 9

CO CL249Contig1 741 3 16 U
GTGTCTCGAAATTCATTTATCACCATTATCAAAAACATGGAGACCACGCTTCGGTCTAGA
AAAAATCTCAAGCGTAATAAACACAGAGAAAGTTACCATTTGGTATTTCAAATCCATGGT
GAGAGAGAGACCACTTATTACTCGACAAACCAAAAAA*CAGCAAAAGGGAACAAAGATCT
TCCCTTTCACAAGAGAGAGATAGATCTTTCTTCTGCCTTTCTTACAACAAAATAAAAATG
ATCATCAAGCCTTAGATAAAGTTACGGATGTCCAAAGATTTCACGTCAGGCATTTCCTCA
TCTTTGAATTCCTCCTTCTTTTTCTGAGATTCCATTGCTTCAAGAGCATCACTCTTCAGC
TCATCCAGTTGTGCTTTGGCAATGCTTAGCTCCATGTTCTCCTCATATTTAGGAAGATCT
TCTTTCCTGATCCCAAGCTTTTTGTTGCCTTTTTCGAATTCTGCAACCAAAAGATCCATT
CCTTTCTTGTCGCTTCTCAAGAGAGGCTTCTTGATATCCTTTTCAACTTTCTCCAAAGCC
TCGAACATCATGGCCTCAGCACCGAGCTCATCAGTAAGACCCCTCCTGGTACGGATGTCC
TTCAACTTCAACAGGTAAGCACGAGCGTCTGGGATCTCTTTAGTCTCGTTCTCAATATCA
TATTTAATGCGTCGAGATTCGGAGAACATGTCTGCCTTTTGCCTGATAGTCTTCATGACA
TTAGCATACTGTTTAACCGCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C373JQ U 1
AF RR2EL42JQ U 80
AF RR2EO13JQ U 1
BS 1 58 RR2C373JQ
BS 59 59 RR2EO13JQ
BS 60 87 RR2C373JQ
BS 88 88 RR2EO13JQ
BS 89 290 RR2C373JQ
BS 291 291 RR2EO13JQ
BS 292 371 RR2C373JQ
BS 372 372 RR2EO13JQ
BS 373 373 RR2C373JQ
BS 374 374 RR2EO13JQ
BS 375 633 RR2C373JQ
BS 634 635 RR2EO13JQ
BS 636 636 RR2EL42JQ
BS 637 641 RR2EO13JQ
BS 642 642 RR2EL42JQ
BS 643 741 RR2EO13JQ

RD RR2C373JQ 633 0 0
GTGTCTCGAAATTCATTTATCACCATTATCAAAAACATGGAGACCACGCTTCGGTCTA*A
AAAAATCTCAAGCGTAATAAACACAGAAAAAGTTACCATTTGGTATTTCAAATCCATGGT
GAGAGAGAGACCACTTATTACTCGACAAACCAAAAAA*CAGCAAAAGGGAACAAAGATCT
TCCCTTTCACAAGAGAGAGATAGATCTTTCTTCTGCCTTTCTTACAACAAAATAAAAATG
ATCATCAAGCCTTAGATAAAGTTACGGATGTCCAAAGATTTCACGTCAGGGATTTCCTCA
TCTTTGAATTCCTCCTTCTTTTTCTGAGATTCCATTGCTTCAAGAGCATCACTCTTCAGC
TCATCCAGTTGGGGTTTGGCAATGCTTAGCTCCATGTTCTCCTCATATTTAGGAAGATCT
TCTTTCCTGATCCCAAGCTTTTTGTTGCCTTTTTCGAATTCTGCAACCAAAAGATCCATT
CCTTTCTTGTCGCTTCTCAAGAGAGGCTTCTTGATATCCTTTTCAACTTTCTCCAAAGCC
TCGAACATCATGGCCTCAGCACCGAGCTCATCAGTAAGACCCCTCCTGGTACGGATGTCC
TTCAACTTCAACAGGTAAGCACGAGCGTCTGGG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2EL42JQ 596 0 0
GGCA
CAGAGAAAGTTACCATTTGGTATTTCAAATCCATGGTGAGAGAGAGACCACTTATTACTC
GACAAACCAAAAAA*CAGCAAAAGGGAACAAAGATCTTCCCTTTCACAAGAAAGAGATAG
ATCTTTCTTCTGCCTTTCTTACAACAAAATAAAAATGATCATCAAGCCTTAAATAAAGTT
ACGGATGTCCAAAGATTTCACGTCAGGCATTTCCTCATCTTTGAATTCCTCCTTCTTTTT
CTGAAATTCCATTGCTTCAAGAGCATCACTCTTCAGCTCATCCAGTTGTGCTTTGGCAAT
GCTTAACTCCATGTTCTCCTCATATTTAGGAAGATCTTCTTTCCTGATCCCAAGCTTTTT
GTTGCCTTTTTCGAATTCTGCAACCAAAAGATCCATTCCTTTCTTGTCGCTTCTCAAGAG
AGGCTTCTTGATATCCTTTTCAACTTTCTCCAAAGCCTCGAACATCATGGCCTCAGCACC
GAGCTCATCAGTAAGACCCCTCCTGGTACGGATGTCCTTCAACTTCAACAGGTAAGCACG
AGCGTCTGGGATCTCTTTAGTCTCGTTCTCAATATCATATTTAATGCGTTGA

QA 5 596 5 596
DS 

RD RR2EO13JQ 741 0 0
GTGTCTCGAAATTCATTTATCACCATTATCAAAAACATGGAGACCACGCTTCGGTCTAGA
AAAAATCTCAAGCGTAATAAACGCAGAGAAAGTTACCATTTGGTATTTCAAATCCATGGT
GAGAGAGAGACCACTTATTACTCGACAAACCAAAAAAACAGCAAAAGGGAACAAAGATCT
TCCCTTTCACAAGAGAGAGATAGATCTTTCTTCTGCCTTTCTTACAACAAAATAAAAATG
ATCATCAAGCCTTAGATAAAGTTACGGATGTCCAAAGATTTCACGTCAGGCATTTCCTCA
TCTTTGAATTCCTCCTTCTTTTTCTGAGATTCCATTGCTTCAAGAGCATCACTCTTCAGC
TCATCCAGTTGTGCTTTGGCAATGCTTAGCTCCATGTTCTCCTCATATTTAGGAAGATCT
TCTTTCCTGATCCCAAGCTTTTTGTTGCCTTTTTCGAACTCGGCAACCAAAAGACCCATT
CCTTTCTTGTCGCTTCTCAGGAGAGGCTCTTTGATATCCTTTTCAACTTTCTCCAAAGCC
TCGAACATCATGGCCTCAGCACCGAGCTCATCAGTAAGACCCCTCCTGGTGCGGATGTCC
TTCAACTTCAAGAGGTAAGCACGAGCGTCTGGGATGTCTTTGGTCTCGTTCTCAATATCA
TATTTAATGCGTCGAGATTCGGAGAACATGTCTGCCTTTTGCCTGATAGTCTTCATGACA
TTAGCATACTGTTTAACCGCA

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL249Contig2 965 4 9 U
GGGTAAAAGAATAACAAAGTAGAGTAGTCTGTCTATCAAGGGACAACCCCCAAGTGCTCT
CGGATAGGGATCTCAACGCAGCAACACAAACCCTAATTTCGAGAAAGAGGAGATTCGATT
TCAAAAAAAAAATGGCGTACGCTTCTCGTTTCCTCTCCAGATCTAAGCAGCTACAAGGGA
GTCTGGTTATTTTGCAGCAGCACCATGCTATTCCCGTCCGCGCTTTTGCCAAGGAAGCTG
CTCGTCCTACTTTTAAAGGAGATGAGATGTTGAAGGGTGTTTTTACGGAGATCAAGAACA
AATTTCAGGCTGCAGTTGATATTCTCCGTAAGGAAAAGATCACCCTTGATCCTGAGGACC
CTGCTGCCGTCAAACAGTATGCTAATGTCATGAAGACCATAAGGCAAAAGGCAGACATGT
TCTCCGAATCTCAACGCATCAAATATGATATTGAGAACGAGACTAAGGAGATCCCAGATG
CTCGTGCTTACCTCTTGAAGTTGAAGGAGATCCGCACCAGGAGGGGGCTTACTGATGAGC
TAGGTGCTGAGGCCATGATGTTCGAGGCTTTGGAGAAAGTTGAAAAGGATATTAAGAAGC
CTCTCTTGAGAAGCGACAAGAAAGGAATGGATCTTTTGGTTGCAGAATTCGAGAAAGGCA
ACAAAAAGCTTGGGATTAGGAAAGAAGATCTTCCCAAGTACGAGGAGAACGTGGAGCTCA
GCATTGCCAAAGCACAGTTGGATGAGCTGAAGAGTGATGCTCTTGAAGCAATGGAATCTC
AGAAAAAGAAGGAGGAATTCAAGGATGAGGAGATGCCAGACGTGAAGTCGTTGGACATCC
GTAACTTTATGTAAGGTTTGATGATGATCCTAAGAAGAAGCATTTTGAGATTTATTGTAA
GAAAGGCAGAAGAAAGATCTCGCTCTCTCTCTCTTTTATTGTTCCCTTTTGTTGGTTTTG
GTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2CR68TF U 1
AF RR2BR02TF U 38
AF RR2FV23TF U 43
AF RR2FD66TF U 288
BS 1 400 RR2CR68TF
BS 401 401 RR2BR02TF
BS 402 456 RR2CR68TF
BS 457 457 RR2BR02TF
BS 458 562 RR2CR68TF
BS 563 563 RR2BR02TF
BS 564 620 RR2CR68TF
BS 621 667 RR2BR02TF
BS 668 965 RR2FD66TF

RD RR2CR68TF 620 0 0
GGGTAAAAGAATAACAAAGTAGAGTAGTCTGTCTATCAAGGGACAACCCCCAAGTGCTCT
CGGATAGGGATCTCAACGCAGCAACACAAACCCTAATTTCGAGAAAGAGGAGATTCGATT
TCAAAAAAAAAATGGCGTACGCTTCTCGTTTCCTCTCCAGATCTAAGCAGCTACAAGGGA
GTCTGGTTATTTTGCAGCAGCACCATGCTATTCCCGTCCGCGCTTTTGCCAAGGAAGCTG
CTCGTCCTACTTTTAAAGGAGATGAGATGTTGAAGGGTGTTTTTACGGAGATCAAGAACA
AATTTCAGGCTGCAGTTGATATTCTCCGTAAGGAAAAGATCACCCTTGATCCTGAGGACC
CTGCTGCCGTCAAACAGTATGCTAATGTCATGAAGACCATCAGGCAAAAGGCAGACATGT
TCTCCGAATCTCAACGCATCAAATATGATATTGAGAGCGAGACTAAGGAGATCCCAGATG
CTCGTGCTTACCTCTTGAAGTTGAAGGAGATCCGCACCAGGAGGGGGCTTACTGATGAGC
TAGGTGCTGAGGCCATGATGTTTGAGGCTTTGGAGAAAGTTGAAAAGGATATTAAGAAGC
CTCTCTTGAGAAGCGACAAG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2BR02TF 630 0 0
GGAACAAC
ACCCCCAAGTGCTCTCGGATAGGGATCTCAACGCAGCAGCACAAACCCTAATTTCGAGAA
AGAGGAGATTCGATTTCAAAAAAA***TGGCGTACGCTTCTCGTTTCCTCTCCAGATCTA
GGCAGCTACAAGGGAGTCTGGTTATTTTGCAGCAGCACCATGCTATTCCCGTCCGCGCTT
TTGCCAAGGAAGCTGCTCGTCCTACTTTTAAAGGAGATGAGATGTTGAAGGGTGTTTTCA
CGGAGATCAAGAACAAGTTTCAGGCTGCAGTTGATATTCTCCGTAAGGAAAAGATCACCC
TTGATCCTGAGGACCCTGCTGCTGTTAAACAGTATGCTAATGTCATGAAGACCATAAGGC
AAAAGGCAGACATGTTCTCCGAATCTCAACGCATCAAATATGATATTGAGAACGAGACTA
AGGAGATCCCAGATGCTCGTTCTTACCTCTTGAAGTTGAAGGATATCCGCACCAGGAGGG
GGCTTACTGATGAGCTAGGTGCTGAGGCGATGATGTTCGAGGCTTTGGAGAAAGTTGAAA
AGGATATTAAGAAGCCTCTCTTGAGAAGCGACAAGAAAGGAATGGATCTTTTGGTTGCAG
AATTCGAGAAAGGCAACAAAAA

QA 9 630 9 630
DS 

RD RR2FV23TF 625 0 0
GGA
ACCCCCAAGTGCTCTCGGATAGGGATCTCAACGCAGCAACACAAACCCTAATTTCGAGAA
AGAGGAGATTCGATTTCAAAAAAAAAATGGCGTACGCTTCTCGTTTCCTCTCCAGATCTA
AGCAGCTACAAGGGAGTCTGGTTATTTTGCAGCAGCACCATGCTATTCCCGTCCGCGCTT
TTGCCAAGGAAGCTGCTCGTCCTACTTTTAAAGGAGATGAGATGTTGAAGGGTGTTTTTA
CGGAGATCAAGAACAAATTTCAGGCTGCAGTTGATATTCTCCGTAAGGAAAAGATCACCC
TTGATCCTGAGGACCCTGCTGCCGTCAAACAGTATGCTAATGTCATGAAGACCATCAGGC
AAAAGGCAGACATGTTCTCCGAATCTCAACGCATCAAATATGATATTGAGAACGAGACTA
AGGAGATCCCAGATGCTCGTGCTTACCTCTTGAAGTTGAAGGAGATCCGCACCAGGAGGG
GGCTTACTGATGAGCTAGGTGCTGAGGCCATGATGTTTGAGGCTTTGGAGAAAGTTGAAA
AGGATATTAAGAAGCCTCTCTTGAGAAGCGACAAGAAAGGAATGGATCTTTTGGTTGCAG
AGTTCGAAAAAGGCAACAAAAA

QA 4 625 4 625
DS 

RD RR2FD66TF 678 0 0
GAGATCAAGAACAAGTTTCAGGCTGCAGTTGGTATTCTCCGTAAGGAAAAGATCACCCTT
GATCCTGAGGACCCTGCTGCTGTTAAACAGTATGCTAATGTCATGAAGACCATAAGGCAA
AAGGCAGACATGTTCTCCGAATCTCAACGCATCAAATATGATATTGAGAACGAGACTAAG
GAGATCCCAGATGCTCGTGCTTACCTCTTGAAGTTGAAGGATATCCGCACCAGGAGGGGG
CTTACTGATGAGCTAGGTGCTGAGGCGATGATGTTCGAGGCTTTGGAGAAAGTTGAAAAG
GATATTAAGAAGCCTCTCTTGAGAAGCGACAAGAAAGGAATGGATCTTTTGGTTGCAGAA
TTCGAGAAAGGCAACAAAAAGCTTGGGATTAGGAAAGAAGATCTTCCCAAGTACGAGGAG
AACGTGGAGCTCAGCATTGCCAAAGCACAGTTGGATGAGCTGAAGAGTGATGCTCTTGAA
GCAATGGAATCTCAGAAAAAGAAGGAGGAATTCAAGGATGAGGAGATGCCAGACGTGAAG
TCGTTGGACATCCGTAACTTTATGTAAGGTTTGATGATGATCCTAAGAAGAAGCATTTTG
AGATTTATTGTAAGAAAGGCAGAAGAAAGATCTCGCTCTCTCTCTCTTTTATTGTTCCCT
TTTGTTGGTTTTGGTTAA

QA 1 678 1 678
DS 



CO CL249Contig3 1047 2 2 U
GGAACAACAACAGCAGCAGCACAAACCCTAGAGAGATCCGATTTTGAAGAAAATGGCCTA
CGCTTCTCGTTTCCTCTCCAGATCTAAGCAGCTACAAGGGAGTCTGGGCGTTTTGCAGCA
GCACAATGCTATTCCAGTCCGAGCTTTTGCCAAGGAAGCTGCTCGCCCTTCTTTTAAAGG
AGATGAGATGTTGAAGGGCGTCTTTACGGAGATCAAAAACAAGTTTCAGGCTGCAGTTGA
TATTCTCCGTAAGGAAAAGATCACTCTTGCTCCTGAGGACCCTGCTGCGGTTAAACACTA
TGCAAATGTCATGAAGACTATCAGGCAAAAGGCAGACATGTTCTCCGAATCTCAACGCAT
TAAATATGATATTGAGAACGAGACTAAAGAGATCCCAGACGCTCGTGCTTACCTGTTGAA
GTTGAAGGACATCCGCACCAGGAGGGGTCTTACTGATGAGCTCGGTGCTGAGGCCATGAT
GTTCGAGGCTTTGGAGAAAGTTGAAAAGGATATCAAAAAGCCTCTCTTGAGAAGCGACAA
GAAAGGAATGGATCTTTTGGTTGCCGAATTCGAAAAAGGCAACAAAAAGCTTGGGGTCAG
GAAAGAAGATCTTCCTAAATATGAGGAGAACATGGAGCTAAGCATTGCCAAAGCACAACT
GGATGAGCTGAAGAGTGATGCTCTTGAAGCAATGGAATCTCAGAAAAAGAAGGAGGAATT
CAAGGATGAAGAAATGCCTGACGTGAAATCGTTGGACATCCGTAACTTTATTTAAGGTTT
GATGGTGATCAAAAGAAGCATTTGATTTGTTGTAAGAAAGGCAGAAGAAAGATCTCTCTC
TCATAAAAAGGGGAAGATCTTAGTTCCCTTTTACTGTTTTTGGTTTTGGCGTTTAATAAG
GTCTCTGTCTCACCATGGATTTTAAGTACCAAATGGTCTAACTTCCGCTGTGGGTTTACG
CTTGAGATTTTTTTACACATAAACGTGGTCTTTATGTTTCTTATAATGGTGATAAATGAG
TTGAATAAAAAGTATGTTCTCAGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE03TF U 1
AF RR2EE03JQ C 399
BS 1 588 RR2EE03TF
BS 589 1047 RR2EE03JQ

RD RR2EE03TF 588 0 0
GGAACAACAACAGCAGCAGCACAAACCCTAGAGAGATCCGATTTTGAAGAAAATGGCCTA
CGCTTCTCGTTTCCTCTCCAGATCTAAGCAGCTACAAGGGAGTCTGGGCGTTTTGCAGCA
GCACAATGCTATTCCAGTCCGAGCTTTTGCCAAGGAAGCTGCTCGCCCTTCTTTTAAAGG
AGATGAGATGTTGAAGGGCGTCTTTACGGAGATCAAAAACAAGTTTCAGGCTGCAGTTGA
TATTCTCCGTAAGGAAAAGATCACTCTTGCTCCTGAGGACCCTGCTGCGGTTAAACACTA
TGCAAATGTCATGAAGACTATCAGGCAAAAGGCAGACATGTTCTCCGAATCTCAACGCAT
TAAATATGATATTGAGAACGAGACTAAAGAGATCCCAGACGCTCGTGCTTACCTGTTGAA
GTTGAAGGACATCCGCACCAGGAGGGGTCTTACTGATGAGCTCGGTGCTGAGGCCATGAT
GTTCGAGGCTTTGGAGAAAGTTGAAAAGGATATCAAAAAGCCTCTCTTGAGAAGCGACAA
GAAAGGAATGGATCTTTTGGTTGCCGAATTCGAAAAAGGCAACAAAAA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2EE03JQ 649 0 0
ACGCTCGTGCTTACCTGTTGAAGTTGAAGGACATCCGCACCAGGAGGGGTCTTACTGATG
AGCTCGGTGCTGAGGCCATGATGTTCGAGGCTTTGGAGAAAGTTGAAAAGGATATCAAAA
AGCCTCTCTTGAGAAGCGACAAGAAAGGAATGGATCTTTTGGTTGCCGAATTCGAAAAAG
GCAACAAAAAGCTTGGGGTCAGGAAAGAAGATCTTCCTAAATATGAGGAGAACATGGAGC
TAAGCATTGCCAAAGCACAACTGGATGAGCTGAAGAGTGATGCTCTTGAAGCAATGGAAT
CTCAGAAAAAGAAGGAGGAATTCAAGGATGAAGAAATGCCTGACGTGAAATCGTTGGACA
TCCGTAACTTTATTTAAGGTTTGATGGTGATCAAAAGAAGCATTTGATTTGTTGTAAGAA
AGGCAGAAGAAAGATCTCTCTCTCATAAAAAGGGGAAGATCTTAGTTCCCTTTTACTGTT
TTTGGTTTTGGCGTTTAATAAGGTCTCTGTCTCACCATGGATTTTAAGTACCAAATGGTC
TAACTTCCGCTGTGGGTTTACGCTTGAGATTTTTTTACACATAAACGTGGTCTTTATGTT
TCTTATAATGGTGATAAATGAGTTGAATAAAAAGTATGTTCTCAGACCC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 3 13

CO CL250Contig1 689 2 8 U
GTGTAAAAAACTCACAAAATCGAAAGAGATATTTGTTCTTAGGAATGAGCACACGTATGT
CTTAGGGTCAAGTAGTTGCAGTTGTTACTAAGAACAATAAACAAAAACAAAAAAAAAATT
CACAAATTGATTGTTTATGATTTCCATTAAACCAAGAAAGATAAGCTATTATCCCCCAAA
GACTTGGAGACTGATTCGTTGGCTTTCTGGGATTCGGCTGCTCTTTCCCCTCGCTTCTTC
TTCTCCCTCTCGACATACTCCTTGAGTAGTTCCTTGGCTTGGACAAGCTTTGAAAGCAGG
TTGCGATACACATCGAGGTCCCGATCCACGCTTTTCTTGTTGATATTTAGGGATGCACAA
AGCTTGTCAAGGACGGTGGGATCAGTAGCACCTGCAAGCTCAAGCAAGCGAAACAAGCCA
ACAGCGAAAAACCTGCTGTAACTGAAACCTTCCTTACTGCCAGCTCTTTCTGAAATGTCC
TTAAAAATCGCTTCAACTTCTCCCTCCTTAGACGAGAAGCCAACTAGTGAAGCAAAAGTC
TGACTTCGGGCCCATTCCTCCATCTTCTGCGCATCAATTCGGTATTGGTTAGGATCCTCA
TTCAAAGCTTGAACGTAGGCTTGAAAAATGGAATCACGATCCTGATCGCTGGGGTAACCA
TCCATGAGCTGATCGTAGACAGTGACGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW92JQ U 1
AF RR2AB54JQ U 35
BS 1 178 RR2EW92JQ
BS 179 179 RR2AB54JQ
BS 180 190 RR2EW92JQ
BS 191 191 RR2AB54JQ
BS 192 484 RR2EW92JQ
BS 485 485 RR2AB54JQ
BS 486 515 RR2EW92JQ
BS 516 689 RR2AB54JQ

RD RR2EW92JQ 515 0 0
GTGTAAAAAACTCACAAAATCGAAAGAGATATTTGTTCTTAGGAATGAGCACACGTATGT
CTTAGGGTCAAGTAGTTGCAGTTGTTACTAAGAACAATAAACAAAAACAAAAAAAAAATT
CACAAATTGATTGTTTATGATTTCCATTAAACCAAGAAAGATAAGCTATTATCCCCCAGA
GACTTGGAGATTGATTCGTTGGCTTTCTGGGATTCGGCTGCTCTTTCCCCTCGCTTCTTC
TTCTCCCTCTCGACATACTCCTTGAGTAGTTCCTTGGCTTGGACAAGCTTTGAAAGCAGG
TTGCGATACACATCGAGGTCCCGATCCACGCTTTTCTTGTTGATATTTAGGGATGCACAA
AGCTTGTCAAGGACGGTGGGATCAGTAGCACCTGCAAGCTCAAGCAAGCGAAACAAGCCA
ACAGCGAAAAACCTGCTGTAACTGAAACCTTCCTTACTGCCAGCTCTTTCTGAAATGTCC
TTAAGAATCGCTTCAACTTCTCCCTCCTTAGACGA

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2AB54JQ 655 0 0
GTTCTTAGGAATGAGCACACGTATGTCTTAGGGTCAAGTAGTTGCAGTTGTTACTAAGAA
CAATAAACAAAAACAAAAAAAAAATTCACAAATTGATTGTTTATGATTTCCATTAAACCA
AGAAAGATAAGCTATTATCCCCCAAAGACTTGGAGACTGATTCGTTGGCTTTCTGGGATT
CGGCTGCTCTTTCCCCTCGCTTCTTCTTCTCCCTCTCGACATACTCCTTGAGTAGTTCCT
TGGCTTGGACAAGCTTTGAAAGCAGGTTGCGATACACATCGAGGTCCCGATCCACGCTTT
TCTTGTTGATATTTAGGGATGCACAAAGCTTGTCAAGGACGGTGGGATCAGTAGCACCTG
CAAGCTCAAGCAAGCGAAACAAGCCAACAGCGAAAAACCTGCTGTAACTGAAACCTTCCT
TACTGCCAGCTCTTTCTGAAATGTCCTTAAAAATCGCTTCAACTTCTCCCTCCTTAGACG
AGAAGCCAACTAGTGAAGCAAAAGTCTGACTTCGGGCCCATTCCTCCATCTTCTGCGCAT
CAATTCGGTATTGGTTAGGATCCTCATTCAAAGCTTGAACGTAGGCTTGAAAAATGGAAT
CACGATCCTGATCGCTGGGGTAACCATCCATGAGCTGATCGTAGACAGTGACGAA

QA 1 655 1 655
DS 



CO CL250Contig2 1147 8 37 U
GGACTGATCCTCCCTCTTTCCCATGGCCAAGCCATCCTCCTCTCCTCTTCCCAAATCCCA
ATAGAACAAAACTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCAATCTTCTTCAGATTCGAAATGG
CTGCAGCAATCGCTTCTCTCTCCTTTCCGGCGCTGGGCCAATCCGCAAAGATCTCCAATT
CAACCACGCCTTCTCTTCCTCTCGCCTCCGTCTCCGCCATCTCCAGGAGGATTTCTCGTC
ACTCTCTGACTTCTTCTAGAGCATCCACTTCCTCTTCGAAATTAATTATCCACTGCATGT
CTAGTGTTACCGATGTGCCACCTGTATCGGAGACAAAGTCAAACTTCCTAAAAGCGTACA
AGCGACCAATCCCCAGCATCTACAACACCGTCTTGCAGGAGCTCATCGTACAGCAGCATT
TGATGAGGTATAAAAA*GACTTACCGTTACGACCCTGTTTTCGCCCTCGGCTTCGTCACC
GTCTACGATCAGCTCATGGATGGTTATCCCAGCGATCAGGATCGTGATTCCATTTTTCAA
GCCTACGTCCAAGCTTTGAATGAGGATCCTAACCAATACCGAACTGATGCGCAGAAGATG
GAGGAATGGGCGCGAAGTCAGACTTCTGCTTCACTAGTTGACTTCTCGTCTAAGGAGGGA
GAAGTTGAAGCGATTCTTAAGGACATTTCAGAAAGAGCTGGCAGTAAGGAGGGTTTCAGT
TACAGCAGGTTCTTCGCTGTTGGTTTGTTTCGCTTGCTTGAGCTTGCAGGTGCTACTGAT
CCCACCGTCCTTGACAAGCTTTGTGCATCCCTAAATATCAACAAGAAAAGCGTGGATCGG
GACCTCGATGTGTATCGCAACCTGCTTTCAAAGCTTGTCCAAGCCAAGGAATTACTCAAG
GAGTATGTCGAGAGGGAGAAGAAGAAGCGAGGGGAAAGAGCAGCCGAATCCCAGAAAGCT
AACGAATCAATCTCCAAGTCTTTGGGAGATAATAGCTTATCTTTCTTGGTTTAATGGATA
TCATAAACAATCAATTTGTGATTTTTTTTTGTCCTTTTTGTTTGTTTATTGTTCTTAGTA
ACAACTGCAACTACTTGACCCTAAGACATACATGTGCTCATTCCTAAGAACAAATATATC
TCTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 15 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 0 0 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA34TF U 1
AF RR2DM01TF U 5
AF RR2EW92TF U 1
AF RR2AB54TF U 21
AF RR2DP54JQ C 808
AF RR2BU78TF U 453
AF RR2CW56JQ C 351
AF RR2GM52JQ C 352
BS 1 63 RR2EW92TF
BS 64 65 RR2HA34TF
BS 66 92 RR2EW92TF
BS 93 94 RR2HA34TF
BS 95 113 RR2EW92TF
BS 114 114 RR2HA34TF
BS 115 391 RR2EW92TF
BS 392 393 RR2DM01TF
BS 394 479 RR2EW92TF
BS 480 480 RR2DM01TF
BS 481 506 RR2EW92TF
BS 507 507 RR2DM01TF
BS 508 548 RR2EW92TF
BS 549 549 RR2DM01TF
BS 550 583 RR2EW92TF
BS 584 584 RR2DM01TF
BS 585 611 RR2EW92TF
BS 612 612 RR2DM01TF
BS 613 677 RR2EW92TF
BS 678 710 RR2AB54TF
BS 711 711 RR2BU78TF
BS 712 727 RR2AB54TF
BS 728 728 RR2BU78TF
BS 729 743 RR2AB54TF
BS 744 744 RR2BU78TF
BS 745 769 RR2AB54TF
BS 770 770 RR2BU78TF
BS 771 814 RR2AB54TF
BS 815 981 RR2BU78TF
BS 982 982 RR2CW56JQ
BS 983 1041 RR2BU78TF
BS 1042 1050 RR2CW56JQ
BS 1051 1051 RR2GM52JQ
BS 1052 1082 RR2CW56JQ
BS 1083 1083 RR2GM52JQ
BS 1084 1101 RR2CW56JQ
BS 1102 1147 RR2GM52JQ

RD RR2HA34TF 343 0 0
GGACT
GATCCTCCCTCTTTCCCATGGCCAAGCCATCCTCCTCTCCTCTTCCCAAATCCCAATAGA
ACAAAACTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCAATCTTCTTCAGATTCGAAATGGCTGCA
GCAATCGCTTCTCTCTCCTTTCCGGCGCTGGGCCAATCCGCAAAGATCTCCAATTCAACC
ACGCCTTCTCTTCCTCTCGCCTCCGTCTCCGCCATCTCCAGGAGGATTTCTCGTCACTCT
CTGACTTCTTCTAGAGCATCCACTTCCTCTTCGAA*TTAATTATCCACTGCATGTCTAGT
GTTACCGATGTACCACCTGTATCGGAGACAAAGTCAA
C

QA 6 342 6 342
DS 

RD RR2DM01TF 648 0 0
G
GATCCTCCCTCTTTCCCATGGCCAAGCCATCCTCCTCTCCTCTTCCCAAATCCCAATAGA
ACAAAACTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCAATCTTCTTCAGATTCGAAATGGCTGCA
GCAATCGCTTCTCTCTCCTTTCCGGCGCTGGGCCAATCCACAAAGATCTCCAATTCAACC
ACGCCTTCTCTTCCTCTCGCCTCCGTCTCCGCCATCTCCAGGAGGATTTCTCATCACTCT
CTGACTTCTTCTAGAGCATCCACTTCCTCTTCGAAATTAATTATCCACTGCATGTCTAGT
GTTACCGATGTGCCACCTGTATCGGAGACAAAGTCAAACTTCCTAAAAGCGTACAAGCGA
CCAATCCCCAGCATCTACAACACCGTCTTGCAGGAGCTCATCGTACAGCAGCATTTGATG
AGGTATAAAAA*GACTTACCGTTACGACCCTGTTTTCGCCCTCGGCTTCGTCACCGTCTA
CGATCAGCTCATGGATGGTTATCCCAGCGATCAGGATCGCGATTCTATTTTTCAAGCCTA
CGTCCAAGCTTTGAATGAGGATCCTAACCAATACCGAACTGATGCGCAGAAGATGGAGGA
ATGGGCGCGAAGTCAGACTTCTGCTTCACTAGTTGACTTCTCGTCTA

QA 2 648 2 648
DS 

RD RR2EW92TF 677 0 0
GGACTGATCCTCCCTCTTTCCCATGGCCAAGCCATCCTCCTCTCCTCTTCCCAAATCCCA
ATA**ACAAAACTCTCCTCTCTCTCTCTCTCT**TCCAATCTTCTTCAGATTCAAAATGG
CTGCAGCAATCGCTTCTCTCTCCTTTCCGGCGCTGGGCCAATCCGCAAAGATCTCCAATT
CAACCACGCCTTCTCTTCCTCTCGCCTCCGTCTCCGCCATCTCCAGGAGGATTTCTCGTC
ACTCTCTGACTTCTTCTAGAGCATCCACTTCCTCTTCGAAATTAATTATCCACTGCATGT
CTAGTGTTACCGATGTGCCACCTGTATCGGAGACAAAGTCAAACTTCCTAAAAGCGTACA
AGCGACCAATCCCCAGCATCTACAACACCGTTCTGCAGGAGCTCATCGTACAGCAGCATT
TGATGAGGTATAAAAA*GACTTACCGTTACGACCCTGTTTTCGCCCTCGGCTTCGTCACT
GTCTACGATCAGCTCATGGATGGTTACCCCAGCGATCAGGATCGTGATTCCATTTTTCAA
GCCTACGTTCAAGCTTTGAATGAGGATCCTAACCAATACCGAATTGATGCGCAGAAGATG
GAGGAATGGGCCCGAAGTCAGACTTCTGCTTCACTAGTTGACTTCTCGTCTAAGGAGGGA
GAAGTTGAAGCGATTCT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2AB54TF 794 0 0
GG
ATGGCCAAGCCATCCTCCTCTCCTCTTCCCAAATCCCAATA**ACAAAACTCTCCTCTCT
CTCTCTCTCTCTTCCAATCTTCTTCAGATTCGAAATGGCTGCAGCAATCGCTTCTCTCTC
CTTTCCGGCGCTGGGCCAATCCGCAAAGATCTCCAATTCAACCACGCCTTCTCTTCCTCT
CGCCTCCGTCTCCGCCATCTCCAGGAGGATTTCTCGTCACTCTCTGACTTCTTCTAGAGC
ATTCACTTCCTCTTCGAAATTAATTATCCACTGCATGTCTAGTGTTACCGATGTGCCACC
TGTATCGGAGACAAGGTCAAACTTCCTAAAAGCGTACAAGCGACCAATCCCCAGCATCTA
CAACACCGTTCTGCAGGAGCTCATCGTACAGCAGCATTTGATGAGGTATAAAAA*GACTT
ACCGTTACGACCCTGTTTTCGCCCTCGGCTTCGTCACTGTCTACGATCAGCTCATGGATG
GTTACCCCAGCGATCAGGATCGTGATTCCATTTTTCAAGCCTACGTTCAAGCTTTGAATG
AGGATCCTAACCAATACCGAATTGATGCGCAGAAGATGGAGGAATGGGCCCGAAGTCAGA
CTTCTGCTTCACTAGTTGGCTTCTCGTCTAAGGAGGGAGAAGTTGAAGCGATTCTTAAGG
ACATTTCAGAAAGAGCTGGCAGTAAGGAAGGTTTCAGTTACAGCACGTTCTTCGCTGTTG
GCTTGTTTCGCTTGCTTGAGCTTGCAG*TGCTACTGATCCCACCGTCCTTGACAAGCTTT
GTGCATCCCTAA

QA 3 794 3 794
DS 

RD RR2DP54JQ 163 0 0
TCCCTAAATATCAACAAGAAAAGCGTGGATCGGGACCTCGATGTGTATCGCAACCTGCTT
TCAAAGCTTGTCCAAGCCAAGGAACTACTCAAGGAGTATGTCGAGAGGGAGAAGAAGAAG
CGAGGGGAAAGAGCAGCCGAATCCCAGAAAGCTAACGAATCAA

QA 1 163 1 163
DS 

RD RR2BU78TF 589 0 0
G
CCTGTTTTCGCCCTCGGCTTCGTCACCGTCTACGATCAGCTCATGGATGGATATCCCAGC
GATCAGGATCGTGATTCCATTTTTCAAGCCTACGTCCAAGCTTTGAATGAGGATCCTAAC
CAATACCGAACTGATGCGCAGAAGATGGAGGAATGGGCGCGAAGTCAGACTTCTGCTTCA
CTAGTTGACTTCTCGTCTAAGGAGGGAGAAGTTGAAGCGATTCTTAAGGACATTTCAGAA
AGAGCTGGCAGTAAGGAGGGTTTCAGTTACAGCAGGTTCTTCGCTGTTGGTTTGTTTCGC
TTGCTTGAGCTTGCAGGTGCTGCTGATCCCACCGTCCTTGACAAGCTTTGTGCATCCCTA
AATATCAACAAGAAAAGCGTGGATCGGGACCTCGATGTGTATCGCAACCTGCTTTCAAAG
CTTGTCCAAGCCAAGGAATTACTCAAGGAGTATGTCGAGAGGGAGAAGAAGAAGCGAGGG
GAAAGAGCAGCCGAATCCCAGAAAGCTAACGAATCAATCTCCAAGTCTCTGGGAGATAAT
AGCTTATCTTTCTTGGTTTAATGGATATCATAAACAATCAATTTGTGA

QA 2 589 2 589
DS 

RD RR2CW56JQ 752 0 0
AAAGCGTACAAGCGACCAATCCCCGGCATCTACAACACCGTCTTGCAGGAGCTCATCGTA
CAGCAGCATTTGATGAGGTATAAAAA*GACTTACCGTTACGACCCTGTTTTCGCCCTCGG
CTTCGTCACCGTCTACGATCAGCTCATGGATGGATATCCCAGCGATCAGGATCGTGATTC
CATTTTTCAAGCCTACGTCCAAGCTTTGAATGAGGATCCTAACCAATACCGAACTGATGC
GCAGAAGATGGAGGAATGGGCGCGAAGTCAGACTTTTGCTTCACTAGTTGACTTCTCGTC
TAAGGAGGGAGAAGTTGAAGCGATTTTTAAGGACATTTCAGAAAGAGCTGGCAGTAAGGA
GGGTTTCAGTTACAGCAGGTTTTTCGCTGTTGGTTTGTTTCGCTTGCTTGAGCTTGCAGG
TGCTACTGATCCCACCGTCCTTGACAAGCTTTGTGCATCCCTAAATATCAACAAGAAAAG
CGTGGATCGGGACCTCGATGTGTATCGCAACCTGCTTTCAAAGCTTGTCCAAGCCAAGGA
ATTACTCAAGGAGTATGTCGAGAGGGAGAAGAAGAAGCGAGGGGAAAGAGCAGCCGAATC
CCAGAAAGCTAACGAATCAATCTCCAAGTTTTTGGGAGATAATAGCTTATCTTTCTTGGT
TTAATGGATATCATAAACAATCAATTTGTGATTTTTTTTTTTCCTTTTTGTTTGTTTATT
GTTCTTAGTAACGACTGCAACTACTTGACCC
G

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2GM52JQ 796 0 0
AAGCGTACAAGCGACCAATCCCCAGCATCTACAACACCGTCTTGCGGGAGCTCATCGTAC
AGCAGCATTTGATGAGGTATAAAAAAGACTTACCGTTACGACCCTGTTTTCGCCCTCGGC
TT*GTCACCGTCTACGATCAGCTCATGGATGGTTATCCCAGCGATCAGGATCGCGATTCC
ATTTTTCAAGCCTACGTCCAAGCTTTGAATGAGGATCCTAACCAATACCGA**TGATGCG
CAGAAGATGGAGGAATGGGCGCGAAGTCAGACTTTTGCTTCACTAGTTGACTTCTCGTCT
AAGGAGGGAGAAGTTGAAGCGATTTTTAAGGACATTTCAGAAAGAGCTGGCAGTAAGGAG
GGTTTCAGTTACAGCAGGTTTTTCGCTGTTGGTTTGTTTCGCTTGCTTGAGCTTGCAGGT
GCTACTGATCCCACCGTCCTTGACAAGCTTTGTGCGTCCCTAAATATCAACAAGAAAAGC
GTGGATCGGGACCTCGATGTGTATCGCAACCTGCTTTCAAAGCTTGTCCAAGCCAAGGAA
CTACTCAAGGAGTATGTCGAGAGGGAGAAGAAGAAGCGAGGGGAAAGAGCAGCCGAATCC
CAGAAAGCTAACGAATCAATCTCCAAGTCTTTGGGAGATAATAGCTCATCTTTCTTGGTT
TAATGGATATCATAAACAATCAATTTGTGATTTTTTTTTGT******TTTTTGTTTATTG
TTCTTAGTAACAACTGCAACTACTTGACCCTAAGACATACATGTGCTCATTCCTAAGAAC
AAATATATCTCTTTCG

QA 1 796 1 796
DS 



CO CL250Contig3 680 3 6 U
GGACTGATCCTCCCTCTTTCCCATGGCCAAGCCATCCTCCTCTCCTCTCCCCAAATCCCA
ATAACAAAACTCTCCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTTTCTTCCAATCTTCTTCAGATTCG
AAATGGCAGCTGCAATCGCTTCTCTCTCCTTTCCGGCGCTGGGCCAATCCGCAAAGATCT
CCAATTCAACCACGCCTTCTCTTCCTCTCGCCTCCGTCTCCGCCATCTCTAGGAGGATTT
CTCGCCACTCTTTGACTTCTTCTAGGGCTTCCACTTCCTCTTCGAAATTAATTATCCACT
GCATGTCTAGTGTTACCGATGTGCCACCTGTATCGGAGACAAAGTCAAACTTCCTAAAAG
CGTACAAGCGACCAATCCCCAGCATCTACAACACCGTCTTGCAGGAGCTCATCGTACAGC
AGCATTTGATGAGGTATAAAAAGACTTACCGTTACGACCCTGTTTTCGCCCTCGGCTTCG
TCACCGTCTACGATCAGCTCATGGATGGATATCCCAGCGATCAGGATCGTGATTCCATTT
TTCAAGCCTACGTCCAAGCTTTGAATGAGGATCCTAACCAATACCGAACTGATGCGCAGA
AGATGGAGGAATGGGCGCGAAGTCAGACTTCTGCTTCACTAGTTGACTTCTCGTCTAAGA
GGGAGAAGTTGAAGCGATCT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ81TF U 1
AF RR2DS04TF U 4
AF RR2CW56TF U 4
BS 1 38 RR2FZ81TF
BS 39 39 RR2CW56TF
BS 40 325 RR2FZ81TF
BS 326 326 RR2CW56TF
BS 327 520 RR2FZ81TF
BS 521 680 RR2CW56TF

RD RR2FZ81TF 520 0 0
GGACTGATCCTCCCTCTTTCCCATGGCCAAGCCATCCTTCTCTCCTCTCCCCAAATCCCA
ATAACAAAACTCTCCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTTTCTTCCAATCTTCTTCAGATTCG
AAATGGCAGCTGCAATCGCTTCTCTCTCCTTTCCGGCGCTGGGCCAATCCGCAAAGATCT
CCAATTCAACCACGCCTTCTCTTCCTCTCGCCTCCGTCTCCGCCATCTCTAGGAGGATTT
CTCGCCACTCTTTGACTTCTTCTAGGGCTTCCACTTCCTCTTCGAAATTAATTATCCACT
GCATGTCTAGTGTTACCGATGTGCCGCCTGTATCGGAGACAAAGTCAAACTTCCTAAAAG
CGTACAAGCGACCAATCCCCAGCATCTACAACACCGTCTTGCAGGAGCTCATCGTACAGC
AGCATTTGATGAGGTATAAAAAGACTTACCGTTACGACCCTGTTTTCGCCCTCGGCTTCG
TCACCGTCTACGATCAGCTCATGGATGGATATCCCAGCGA

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2DS04TF 509 0 0
GG
GATCCTCCCTCTTTCCCATGGCCAAGCCATCCTCCTCTCCTCTCCCCAAATCCCAATAAC
AAAACTCTCCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTTTCTTCCAATCTTCTTCAGATTCGAAATG
GCAGCTGCAATCGCTTCTCTCTCCTTTCCGGCGCTGGGCCAATCCGCAAAGATCTCCAAT
TCAACCACGCCTTCTCTTCCTCTCGCCTCCGTCTCCGCCATCTCTAGGAGGATTTCTCGC
CACTCTTTGACTTCTTCTAGGGCTTCCACTTCCTCTTCGAAATTAATTATCCACTGCATG
TCTAGTGTTACCGATGTGCCACCTGTATCGGAGACAAAGTCAAACTTCCTAAAAGCGTAC
AAGCGACCAATCCCCAGCATCTACAACACCGTCTTGCAGGAGCTCATCGTACAGCAGCAT
TTGATGAGGTATAAAAAGACTTACCGTTACGACCCTGTTTTCGCCCTCGGCTTCGTCACC
GTCTACGATCAGCTCATGGATGGATAT

QA 3 509 3 509
DS 

RD RR2CW56TF 677 0 0
GG
GATCCTCCCTCTTTCCCATGGCCAAGCCATCCTCCTCTCCTCTCCCCAAATCCCAATAAC
AAAACTCTCCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTTTCTTCCAATCTTCTTCAGATTCGAAATG
GCAGCTGCAATCGCTTCTCTCTCCTTTCCGGCGCTGGGCCAATCCGCAAAGATCTCCAAT
TCAACCACGCCTTCTCTTCCTCTCGCCTCCGTCTCCGCCATCTCTAGGAGGATTTCTCGC
CACTCTTTGACTTCTTCTAGGGCTTCCACTTCCTCTTCGAAATTAATTATCCACTGCATG
TCTAGTGTTACCGATGTGCCACCTGTATCGGAGACAAAGTCAAACTTCCTAAAAGCGTAC
AAGCGACCAATCCCCGGCATCTACAACACCGTCTTGCAGGAGCTCATCGTACAGCAGCAT
TTGATGAGGTATAAAAAGACTTACCGTTACGACCCTGTTTTCGCCCTCGGCTTCGTCACC
GTCTACGATCAGCTCATGGATGGATATCCCAGCGATCAGGATCGTGATTCCATTTTTCAA
GCCTACGTCCAAGCTTTGAATGAGGATCCTAACCAATACCGAACTGATGCGCAGAAGATG
GAGGAATGGGCGCGAAGTCAGACTTCTGCTTCACTAGTTGACTTCTCGTCTAAGAGGGAG
AAGTTGAAGCGATCT

QA 3 677 3 677
DS 



AS 1 12

CO CL251Contig1 1141 12 17 U
GACTATGAACATAGAGTCTTTCATCATTATCGAAAAACAGAGCTCGAGTACACAGTTCAA
TAAATATGACAAAAAGGTTTCAATTATTCAGCAAAAACAAGACAATCTTGCTCTTAACAT
TGCCGGAACATAGAAAAAAAAAGAAACAAACGGATGTAGTTCGCTGACTGTTGTGCTTTT
TATTCAATCATCAACCAATGAGTAACTTATTCTCTTCCAAGAAGCTGTAGGTTGGCACTT
CCAGGTTATACGGTGCAGGACCTTTCCTAATCCTTCCAGAGATATCGTAATGCGAACCAT
GACACGGACAAAACCAACCACCGTAATCACCAGCATTCGGCAAAGGGATACACCCCAAGT
GGGTGCAGACTCCAACAACCACCAACCATTCCGGATTCTTGACCCTCACCGAGTCCTCCT
GCGGGTCTCTCAAAGATCCAAGATCCACGCTGTTCGCCAGCTTGATGTCATCTTCTGTTC
TTCTCCTGATGAACACCGGCTTTCCACGCCACTTCACTGTGACAGTAGTTCCCGGCTCGA
TGCTCCCGAGGTCGACCTCGAGGGAGGCAAGTGCAAGGACATCTTTAC*TTGCGGACATG
CTGACAATGAGCTTGAGGACAAGAAGGCGGAGAACAGAGGCGTAGACGAACCTCCCACC*
GGACAAGACGAAATAGGCAAAGGCACGCTTGCTAGGGTCACCAGGTGGGTAACGCTCGTG
GTTGTGGTCATCATAGACAATCTTCGAGTTAGGTGTCTTGACGGCCTCCACGGTGGCAGG
TTCCGAACCGAAACCTACCTCATTTCCTTGAGTAAGGACTTGAGAAGAGAAACCTCTCAT
GAGGCTCCGGTGGTAAGAATCGAAACGTGAAAGATCGGTAGAGGAGACAGATCTGGGGGA
TTGAGATGAGTCGTCGACGCCGCCATCGGATAAGGTATGGTCACGGGAAAGCGCGAAGGA
GGACACGGTGGAAGATCTCTGCGAGAGAGAAAAAAGCCTCCTTCCTGCTACTCGCAGCAT
CTCTCTGCTCAATGGTGGATTAGGGTTTCGCTTTGGCGAGAACAGAGTTGTCCTAATGGT
TAGAGGGACGGCCGATGGCAACAGAGAGATGAATAGTCCCGTAAATTTAGTCTTCGACTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 25 55 55 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN73JQ U 19
AF RR2DR32JQ U 1
AF RR2BA07JQ U 7
AF RR2FV79JQ U 7
AF RR2GY83JQ U 7
AF RR2A959JQ U 182
AF RR2A959TF C 391
AF RR2DR32TF C 489
AF RR2GY83TF C 438
AF RR2FV79TF C 489
AF RR2DN73TF C 490
AF RR2BA07TF C 414
BS 1 114 RR2DR32JQ
BS 115 115 RR2BA07JQ
BS 116 132 RR2DR32JQ
BS 133 133 RR2BA07JQ
BS 134 150 RR2DR32JQ
BS 151 151 RR2BA07JQ
BS 152 280 RR2DR32JQ
BS 281 281 RR2BA07JQ
BS 282 363 RR2DR32JQ
BS 364 364 RR2BA07JQ
BS 365 643 RR2DR32JQ
BS 644 762 RR2BA07JQ
BS 763 810 RR2A959JQ
BS 811 887 RR2A959TF
BS 888 888 RR2BA07TF
BS 889 1062 RR2A959TF
BS 1063 1141 RR2BA07TF

RD RR2DN73JQ 526 0 0
TTTCATCATTATCGAAAAATAGAGCTCGAGTACACAGTTCAATAAATATGACAAAAAGGT
TTCAATTATTCAGCAAAAACAAGACAATCTTGCTCTTAACATTGCCGGAACATAGAAAAA
AAAAGAAACAAACGGATGTAGTTCGCTGACTGTTGTGCTTTTTATTCAATCATCAACCAA
TGAGTAACTTATTCTCTTCCAAGAAGCTGTAGGTTGGCACTTCCAGGTTATACGGTGCAG
GACCTTTCCTAATCCTTCCAGAAATATCGTAATGCGAACCATGACACGGACAAAACCAAC
CACCGTAATCACCAGCATTCGGCAAAGGGATACACCCCAAGTGGGTGCAGGCTCCAACAA
CCACCAACCATTCCGGATTCTTGACCCTCACCGAGTCCTCCTGCGGGTCTCTCAAAGATC
CAAGATCCACGCTGTTCGCCAGCTTGATGTCATCTTCTGTTCTTCTCCTGATGAACACCG
GCTTTCCACGCCACTTCACTGTGACAGTAGTTCCCGGCTCGATGCT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2DR32JQ 643 0 0
GACTATGAACATAGAGTCTTTCATCATTATCGAAAAACAGAGCTCGAGTACACAGTTCAA
TAAATATGACAAAAAGGTTTCAATTATTCAGCAAAAACAAGACAATCTTGCTCTCAACAT
TGCCGGAACATAAAAAAAAAAAGAAACAAAAGGATGTAGTTCGCTGACTGTTGTGCTTTT
TATTCAATCATCAACCAATGAGTAACTTATTCTCTTCCAAGAAGCTGTAGGTTGGCACTT
CCAGGTTATACGGTGCAGGACCTTTCCTAATCCTTCCAGAAATATCGTAATGCGAACCAT
GACACGGACAAAACCAACCACCGTAATCACCAGCATTCGGCAAAGGGATACACCCCAAGT
GGGGGCAGACTCCAACAACCACCAACCATTCCGGATTCTTGACCCTCACCGAGTCCTCCT
GCGGGTCTCTCAAAGATCCAAGATCCACGCTGTTCGCCAGCTTGATGTCATCTTCTGTTC
TTCTCCTGATGAACACCGGCTTTCCACGCCACTTCACTGTGACAGTAGTTCCCGGCTCGA
TGCTCCCGAGGTCGACCTCGAGGGAGGCAAGTGCAAGGACATCTTTAC*TTGCGGACATG
CTGACAATGAGCTTGAGGACAAGAAGGCGGAGAACAGAGGCGT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2BA07JQ 756 0 0
GG
ACATAGAGTCTTTCATCATTATCGAAAAACAGAGCTCGAGTACACAGTTCAATAAATATG
ACAAAAAGGTTTCAATTATTCAGCAAAAACAAGACAATCTTGCTCTTAACATTGCCGGGA
CATAGAAAAAAAAAGAAACAAACGGATGTAGTTCGCTGACTGTTGTGCTTTTTATTCAAT
CATCAACCAATGAGTAACTTATTCTCTTCCAAGAAGCTGTAGGTTGGCACTTCCAGGTTA
TACGGTGCAGGACCTTTCCTAATCCTTCCAGAGATATCGTAATGCGAACCATGACACGGA
CAAAACCAACCACCGTAATCACCAGCATTCGGCAAAGGGATACACCCCAAGTGGGTGCAG
ACTCCAACAACCACCAACCATTCCGGATTCTTGACCCTCACCGAGTCCTCCTGCGGGTCT
CTCAAAGATCCAAGATCCACGCTGTTCGCCAGCTTGATGTCATCTTCTGTTCTTCTCCTG
ATGAACACCGGCTTTCCACGCCAATTCACTGTGACAGTAGTTCCCGGCTCGATGCTCCCG
AGGTCGACCTCGAGGGAGGCAAGTGCAAGGACATCTTTAC*TTGCGGACATGCTGACAAT
GAGCTTGAGGACAAGAAGGCGGAGAACAGAGGCGTAGACGAACCTCCCACC*GGACAAGA
CGAAATAGGCAAAGGCACGCTTGCTAGGGTCACCAGGTGGGTAACGCTCGTGGTTGTGGT
CATCATAGACAATCTTCGAGTTAGGTGTCTTGAC

QA 3 756 3 756
DS 

RD RR2FV79JQ 752 0 0
AC
ACATAGAGTCTTTCATCATTATCGAAAAACAGAGCTCGAGTACACAGTTCAATAAATATG
ACAAAAAGGTTTCAATTATTCAGCAAAAACAAGACAATCTTGCTCTTAACATTGCCGGAA
CATAGAAAAAAAAAGAAACAAACGGATGTAGTTCGCTGACTGTTGTGCTTTTTATTCAAT
CATCAACCAATGAGTAACTTATTCTCTTCCAAGAAGCTGTAGGTTGGCACTTCCAGGTTA
TACGGTGCAGGACCTTTCCTAATCCTTCCAGAGATATCGTAATGCGAACCATGACACGGA
CAAAACCAACCACCGTAATCACCAGCATTCGGCAAAGGGATACACCCCAAGTGGGTGCAG
ACTCCAACAACCACCAACCATTCCGGATTCTTGACCCTCACCGAGTCCTCCTGCGGGTCT
CTCAAAGATCCAAGATCCACGCTGTTCGCCAGCTTGATGTCATCTTCTGTTCTTCTCCTG
ATGAACACCGGCTTTCCACGCCACTTCACTGTGACAGCAGTTCCCGGCTCGATGCTCCCG
AGGTCGACCTCGAGGGAGGCAAGTGCAAGGACATCTTTAC*TTGCGGACATGCTGACAAT
GAGCTTGAGGACAAGAAGGCGGAGAACAGAGGCGTAGACGAACCTCCCACC*GGACAAGA
CGAAATAGGCAAAGGCACGCTTGCTAGGGTCACCAGGTGGGTAACGCTCGTGGTTGTGGT
CATCATAGACAATCTTCGAGTTAG
TGTCTT

QA 3 746 3 746
DS 

RD RR2GY83JQ 738 0 0
GA
ACATAGAGTCTTTCATCATTATCGAAAAACAGAGCTCGAGTACACAGTTCAATAAATATG
ACAAAAAGGTTTCAATTATTCAGCAAAAACAAGACAATCTTGCTCTTAACATTGCCGGAA
CATAGAAAAAAAAAGAAACAAACGGATGTAGTTCGCTGACTGTTGTGCTTTTTATTCAAT
CATCAACCAATGAGTAACTTATTCTCTTCCAAGAAACTGTAGGTTGGCACTTCCAGGTTA
TACGGTGCGGGACCTTTCCTAATCCTTCCAGAGATATCGTAATGCGAACCATGACACGGA
CAAAACCAACCACCGTAATCACCAGCATTCGGCAAAGGGATACACCCCAAGTGGGTGCA*
ACTCCAACAACCACCAACCATTCCGGATTCTTGACCCTCACCGAGTCCTCCTGCGGGTCT
CTCAAAGATCCAAGATCCACGCTGTTCGCCAGCTTGATGTCATCTTCTGTTCTTCTCCTG
ATGAACACCGGCTTTCCACGCCACTTCACTGTGACAGTAGTTCCCGGCTCGATGCTCCCG
AGGTCGACCTCGAGGGAGGCAAGTGCAAGGACATCTTTAC*TTGCGGACATGCTGACAAT
GAGCTTGAGGACAAGAAGGCGGAGAACAGAGGCGTAGACGAACCTCCCACC*GGACAAGA
CGAAATAGGCAAAGGCACGCTTGCTAGGGTCACCAGGTGGGTAACGCTCGTGGTTGTGGT
CATCATAGACAATCTT

QA 3 738 3 738
DS 

RD RR2A959JQ 629 0 0
ATTCAATCATCAACCAATGAGTAACTTATTCTCTTCCAAGAAGCTGTAGGTTGGCACTTC
CAGGTTATACGGTGCAGGACCTTTCCTAATCCTTCCAGAGATATCGTAATGCGAACCATG
ACACGGACAAAACCAACCACCGTAATCACCAGCATTCGGCAAAGGGATACACCCCAAGTG
GGTGCAGACTCCAACAACCACCAACCATTCCGGATTCTTGATCCTCACCGAGTCCTCCTG
CGGGTCTCTCAAAGATCCAAGATCCACGCTGTTCGCCAGCTTGATGTCATCTTCTGTTCT
TCTCCTGATGAACACCGGCTTTCCACGCCACTTCACTGTGACAGTAGCTCCCGGCTCGAT
GCTCCCGAGGTCGACCTCGAGGGAGGCAAGTGCAAGGACATCTTTAC*TTGCGGACATGC
TGACAATGAGCTTGAGGACAAGAAGGCGGAGAACAGAGGCGTAGACGAACCTCCCACC*G
GACAAGACGAAATAGGCAAAGGCACGCTTGCTAGGGTCACCAGGTGGGTAACGCTCGTGG
TTGTGGTCATCATAGACAATCTTCGAGTTAGGTGTCTTGACGGCCTCCACGGTGGCAGGT
TCCGAACCGAAACCTACCTCATTTCCTTG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2A959TF 672 0 0
CCGGATTCTTGATCCTCACCGAGTCCTC*TGCGGGTCTCTCAAAGATCCAAGATCCACGC
TGTTCGCCAGCTTGATGTCATCTTCTGTTCTTCTCCTGATGAACACCGGCTTTCCACGCC
ACTTCACTGTGACAGTAGCTCCCGGCTCGATGCTCCCGAGGTCGACCTCGAGGGAGGCAA
GTGCAAGGACATCTTTACCTTGCGGACATGCTGACAATGAGCTTGAGGACAAGAAGGCGG
AGAACAGAGGCGTAGACGAACCTCCCACCCGGACAAGACGAAATAGGCAAAGGCACGCTT
GCTAGGGTCACCAGGTGGGTAACGCTCGTGGTTGTGGTCATCATAGACAATCTTCGAGTT
AGGTGTCTTGACGGCCTCCACGGTGGCAGGTTCCGAACCGAAACCTACCTCATTTCCTTG
AGTAAGGACTTGAGAAGAGAAACCTCTCATGAGGCTCCGGTGGTAAGAATCGAAACGTGA
AAGATCGGTAGAGGAGATAGATCTGGGGGATTGAGATGAGTCGTCGACGCCGCCATCGGA
TAAGGTATGGTCACGGGAAAGCGCGAAGGAGGACACGGTGGAAGATCTCTGCGAGAGAGA
AAAAAGCCTCCTTCCTGCTACTCGCAGCATCTCTCTGCTCAATGGTGGATTAGGGTTTCG
CTTTGGCGAGAA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2DR32TF 574 0 0
ATGAACACCGGCTTTCCACGCCACTTCACTGTGACAGTAGTTCCCGGCTCGATGCTCCCG
AGGTCGACCTCGAGGGAGGCAAGTGCAAGGACATCTTTAC*TTGCGGACATGCTGACAAT
GAGCTTGAGGACAAGAAGGCGGAGAACAGAGGCGTAGACGAACCTCCCACC*GGACAAGA
CGAAATAGGCAAAGGCACGCTTGCTAGGGTCACCAGGTGGGTAACGCTCGTGGTTGTGGT
CATCATAGACAATCTTCGAGTTAGGTGTCTTGACGGCCTCCACGGTGGCAGGTTCCGAAC
CGAAACCTACCTCATTTCCTTGAGTAAGGACTTGAGAAGAGAAACCTCTCATGAGGCTCC
GGTGGTAAGAATCGAAACGTGAAAGATCGGTAGAGGAGACAGATCTGGGGGATTGAGATG
AGTCGTCGACGCCGCCATCGGATAAGGTATGGTCACGGGAAAGCGCGAAGGAGGACACGG
TGGAAGATCTCTGCGAGAGAGAAAAAAGCCTCCTTCCTGCTACTCGCAGCATCTCTCTGC
TCAATGGTGGATTAGGGTTTCGCTTTGGCGAGAA

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2GY83TF 679 0 0
CCAAGATCCACGCTGTTCGCCAGCTTGATGTCATCTTCTGTTCTTCTCGTGATGAACACC
GGCTTTCCACGCCACTTCACTGTGACAGTAGTTCCCGGCTCGATGCTCCCGAGGTCGACC
TCGAGGGAGGCAAGTGCAAGGACATCTTTAC*TTGCGGACATGCTGACAATGAGCTTGAG
GACAAGAAGGCGGAGAACAGAGGCGTAGACGAACCTCCCACC*GGACAAGACGAAATAGG
CAAAGGCACGCTTGCTAGGGTCACCAGGTGGGTAACGCTCGTGGTTGTGGTCATCATAGA
CAATCTTCGAGTTAGGTGTCTTGACGGCCTCCACGGTGGCAGGTTCCGAACCGAAACCTA
CCTCATTTCCTTGAGTAAGGACTTGAGAAGAGAAACCTCTCATGAGACTCCGGTGGTAAG
AATCGAAACGTGAAAGATCGGTAGAGGAGACAGATCTGGGGGATTGAGATGAGTCGTCGA
CGCCGCCATCGGATAAGGTATGGTCACGGGAAAGCGCGAAGGTGGACACGGTGGAAGATC
TCTGCGAGAGAGAAAAAAGCCTCCTTCCTGCTACTCGCAGCATCTCTCTGCTCAATGGTG
GATTAGGGTTTCGCTTTGGCGAGAACAGAGTTGTCCTAATGGTTAGAGGGACGGCCGATG
GCAACAGAGAGATGAAT
CC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2FV79TF 613 0 0
ATGAACACCGGCTTTCCACGCCACTTCACTGTGACAGCAGTTCCCGGCTCGATGCTCCCG
AGGTCGACCTCGAGGGAGGCAAGTGCAAGGACATCTTTAC*TTGCGGACATGCTGACAAT
GAGCTTGAGGACAAGAAGGCGGAGAACAGAGGCGTAGACGAACCTCCCACC*GGACAAGA
CGAAATAGGCAAAGGCACGCTTGCTAGGGTCACCAGGTGGGTAACGCTCGTGGTTGTGGT
CATCATAGACAATCTTCGAGTTAGGTGTCTTGACGGCCTCCACGGTGGCAGGTTCCGAAC
CGAAACCTACCTCATTTCCTTGAGTAAGGACTTGAGAAGAGAAACCTCTCATGAGGCTCC
GGTGGTAAGAATCGAAACGTGAAAGATCGGTAGAGGAGACAGATCTGGGGGATTGAGATG
AGTCGTCGACGCCGCCATCGGATAAGGTATGGTCACGGGAAAGCGCGAAGGAGGACACGG
TGGAAGATCTCTGCGAGAGAGAAAAAAGCCTCCTTCCTGCTACTCGCAGCATCTCTCTGC
TCAATGGTGGATTAGGGTTTCGCTTTGGCGAGAACAGAGTTGTCCTAATGGTTAGAGGGA
CGGCCGATGGC
CC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2DN73TF 594 0 0
TGAACACCGGCTTTCCACGCCACTTCACTGTGACAGTAGTTCCCGGCTCGATGCTCCCGA
GGTCGACCTCGAGGGAGGCAAGTGCAAGGACATCTTTAC*TTGCGGACATGCTGACAATG
AGCTTGAGGACAAGAAGGCGGAGAACAGAGGCGTAGACGAACCTCCCACC*GGACAAGAC
GAAATAGGCAAAGGCACGCTTGCTAGGGTCACCAGGTGGGTAACGCTCGTGGTTGTGGTC
ATCATAGACAATCTTCGAGTTAGGTGTCTTGACGGCCTCCACGGTGGCAGGTTCCGAACC
GAAACCTACCTCATTTCCTTGAGTAAGGACTTGAGAAGAGAAACCTCTCATGAGGCTCCG
GTGGTAAGAATCGAAACGTGAAAGATCGGTAGAGGAGACAGATCTGGGGGATTGAGATGA
GTCGTCGACGCCGCCATCGGATAAGGTATGGTCACGGGAAAGCGCGAAGGAGGACACGGT
GGAAGATCTCTGCGAGAGAGAAAAAAGCCTCCTTCCTGCTACTCGCAGCATCTCTCTGCT
CAATGGTGGATTAGGGTTTCGCTTTGGCGAGAACAGAGTTGTCCTAATGGTT
CC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2BA07TF 728 0 0
GTCCT
CTGCGGGTCTCTCAAAGATCCAAGATCCACGCTGTTCGCCAGCTTGATGTCATCTTCTGT
TCTTCTCTTGATGAACACCGGCTTTCCACGCCAATTCACTGTGACAGTAGTTCCCGGCTC
GATGCTCCCGAGGTCGACCTCGAGGGAGGCAAGTGCAAGGACATCTTTAC*TTGCGGACA
TGCTGACAATGAGCTTGAGGACAAGAAGGCGGAGAACAGAGGCGTAGACGAACCTCCCAC
C*GGACAAGACGAAATAGGCAAAGGCACGCTTGCTAGGGTCACCAGGTGGGTAACGCTCG
TGGTTGTGGTCATCATAGACAATCTTCGAGTTAGGTGTCTTGACGGCCTCCACGGTGGCA
GGTTCCGAACCGAAACCTACCTCATTTCCTTGAGTAAGGACTTGAGAAGAGAAACCTCTC
ATGAGGCTCCGGTGGTAAGAATCGAAACGTGAAAGATCGGTAGAGGAGACAGATCTGGGG
GATTGAGATGAGTCGTCGACGCCGCCATCGGATCAGGTATGGTCACGGGAAAGCGCGAAG
GAGGACACGGTGGAGGATCTCTGCGAGAGAGAAAAAAGCCTCCTTCCTGCTACTCGCAGC
ATCTCTCTGCTCAATGGTGGATTAGGGTTTCGCTTTGGCGAGAACAGAGTTGTCCTAATG
GTTAGAGGGACGGCCGATGGCAACAGAGAGATGAATAGTCCCGTAAATTTAGTCTTCGAC
TCC

QA 6 728 6 728
DS 



AS 2 15

CO CL252Contig1 1012 11 30 U
AAAACTTTACCAACTGTTGCAAATTTTCAACAATAATTACTGAAGATTTTACACACCAGA
AGTAGCAAACTCATAATCAGCGAAACCACAAACACAAAGTGTTTTTCACTACAAATACAT
CAAATAAGAATATGATCTGTTGATAGCACCAAGTAGCAACAAAAGATATGCGAGGAACTG
CGGAAATGTATAAAAGCGTTTTCATATAGCAGAGTAGCTGTAGTTGTCAGCATCATCAAT
GGCAGAGGGAGACTTAGCAGAAGCAGTGAGCACCACTAAGGCACCAAAGAGAATGGTGAC
GATGGCTGTGAAGTTCACAAGAAACGCTTCTGGACCGTACTTGTCAAGCTTAGCACCACT
CTCCAGGAAAGTCAGCTTCTCCAGAAACCCTAGAGCTGCGTTCCCAACCGCAAGAATATA
AACAAATAGGCCTAGAATTGCGTGCCACGGAAGCAAACCGCTTCTCAGATTCGGTGACCC
TCCTGGGAAGAAGAACACTGCGAAGCTGTACACCCACTGGAAGGCATAAAGAGAAATGAC
ACCAATACCAATCCAAGAATGGAGACTGTAGAGGTTAGGGATGCCACTTTCGTTGTGGTT
CTTGAAGGCTGCACAGATTCCCCAGATCCCAAGAGCCAGAGCAATGGCATGGAGAACAAG
GTGGATCAGCTTCTTCACTGGTTTCTCCAAGGGAAGCGATTTGTAACTTATAATTGCTTC
TCCTCCCAAGATTACAAATCCAATGAGCATCAGAACAGGATGCAGGTTAAAGATGAGATT
CTTGTTTTCAGCTTCCCAAGCCAGACCACCTCTGTAGCTGATATTCCAAACAAGAACCAT
AATCGCCGCTATTACAGCCAGCGCGTGGGCCGCAAACGTCACCGGCATCGCGTTAATCCC
GACAGCCATAACTGAACTCTTTTGTTTCCTTTTTTGTTCTTTTGTCTTTTTT*CTCTCCT
CTTCTTCTACTTCTGTTGTCAGATTAATCTCGATGGTTGTGGGAACTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 5 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 20 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 20 65 65 20 65 65 20 65 65 65 65 65 20 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 20 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB33JQ U 19
AF RR2DA49JQ U 19
AF RR2CE83JQ U 1
AF RR2H817JQ U 19
AF RR2EP16JQ U 16
AF RR2F454JQ U 19
AF RR2AO90JQ U 64
AF RR2CE83TF C 332
AF RR2AO90TF C 110
AF RR2DA49TF C 339
AF RR2BM40TF C 374
BS 1 22 RR2CE83JQ
BS 23 23 RR2EP16JQ
BS 24 35 RR2CE83JQ
BS 36 36 RR2EP16JQ
BS 37 138 RR2CE83JQ
BS 139 139 RR2EP16JQ
BS 140 298 RR2CE83JQ
BS 299 299 RR2DA49JQ
BS 300 421 RR2CE83JQ
BS 422 422 RR2DA49JQ
BS 423 632 RR2CE83JQ
BS 633 633 RR2EP16JQ
BS 634 707 RR2CE83JQ
BS 708 708 RR2EP16JQ
BS 709 759 RR2CE83JQ
BS 760 765 RR2EP16JQ
BS 766 766 RR2AO90JQ
BS 767 804 RR2EP16JQ
BS 805 805 RR2AO90JQ
BS 806 812 RR2EP16JQ
BS 813 813 RR2AO90JQ
BS 814 819 RR2EP16JQ
BS 820 820 RR2AO90JQ
BS 821 831 RR2EP16JQ
BS 832 832 RR2F454JQ
BS 833 833 RR2EP16JQ
BS 834 917 RR2AO90JQ
BS 918 980 RR2AO90TF
BS 981 1000 RR2DA49TF
BS 1001 1012 RR2BM40TF

RD RR2GB33JQ 472 0 0
GCAAATTTTCAACAATAATTACTGAAGATTTTACACACCAGAAGTAGCAAACTCATAATC
AGCGAAACCACAAACACAAAGTGTTTTTCACTACAAATACATCAAATAAGAATATGATCT
GTTGATAGCACCAAGTAGCAACAAGAGATATGCGAGGAACTGCGGAAATGTACAAA*GCG
TTTTCATATAGCAGAATAGCTGTAGTTGTCAGCATCATCAATGGCAGAGGGAGACTTAGC
AGAAGCAGTGAGCACCACTAAGGCACCAAAGAGAATGGTAACGATGGCTGTGAAGTTCAC
AAGAAATGCTTCTGGACCGTACTTGTCAAGCTTAGCACCACTCTCCAGGAAAGTCAGCTT
CTCCAGAAACCCTAAAGCTGCGTTCCCAACCGCAAGAATATAAACAAATAGGCCTAGAAT
TGCGTGCCACGGAAGCAAACCGCTTCTAAGGTTTGGTGAGCCTCCTGGGAAG

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2DA49JQ 590 0 0
GC
AA*TTTTCAACAATA*TTACTGAAGATTTTACACACCAGAAGTAGCAAACTCATAATCAG
CGAAACCACAAACACAAAGTGTTTTTCACTACAAATACATCAAATAAGAATATGATCTTT
TGATAGCACCAAGTAGCAACAAAAGATATGCGAGGAACTGCGGAAATGTATAAAAGCGTT
TTCATATAGCAGAGTAGCTGTAGTTGTCAGCATCATCAATGGCAGAGGGAGACTTAGCAG
AAGCAGTGAGCACCACTAAGGCACCAAAGAGAATGGTGACGATGGCTGTGAAGTTCACAA
GAAACGCTTCTGGACCGTACTTGTCAAGCTTAGCACCACTCTCCAGGAAAGTCAGCTTCT
CCAGAAACCCTAGAGCTGCGTTCCCAACCGCAAGAATATAAACAAATAGGCCTAGAATTG
CGTGCCACGGAAGCAAACCGCTTCTCAGATTCGGTGACCCTCCTGGGAAGAAGAACACTG
CGAAGCTGTACACCCACTGGAAGGCATAAAGAGAAATGACACCAATACCAATCCAAGAAT
GGAGACTGTAGAGGTTAGGGATGCCACTTTCGTTGTGGTTCTTGAAGG

QA 3 590 3 590
DS 

RD RR2CE83JQ 759 0 0
AAAACTTTACCAACTGTTGCAA*TTTTCAACAATA*TTACTGAAGATTTTACACACCAGA
AGTAGCAAACTCATAATCAGCGAAACCACAAACACAAAGTGTTTTTCACTACAAATACAT
CAAATAAGAATATGATCTTTTGATAGCACCAAGTAGCAACAAAAGATATGCGAGGAACTG
CGGAAATGTATAAAAGCGTTTTCATATAGCAGAGTAGCTGTAGTTGTCAGCATCATCAAT
GGCAGAGGGAGACTTAGCAGAAGCAGTGAGCACCACTAAGGCACCAAAGAGAATGGTGGC
GATGGCTGTGAAGTTCACAAGAAACGCTTCTGGACCGTACTTGTCAAGCTTAGCACCACT
CTCCAGGAAAGTCAGCTTCTCCAGAAACCCTAGAGCTGCGTTCCCAACCGCAAGAATATA
AGCAAATAGGCCTAGAATTGCGTGCCACGGAAGCAAACCGCTTCTCAGATTCGGTGACCC
TCCTGGGAAGAAGAACACTGCGAAGCTGTACACCCACTGGAAGGCATAAAGAGAAATGAC
ACCAATACCAATCCAAGAATGGAGACTGTAGAGGTTAGGGATGCCACTTTCGTTGTGGTT
CTTGAAGGCTGCACAGATTCCCCAGATCCCAAAAGCCAGAGCAATGGCATGGAGAACAAG
GTGGATCAGCTTCTTCACTGGTTTCTCCAAGGGAAGCGATTTGTAACCTATAATTGCTTC
TCCTCCCAAGATTACAAATCCAATGAGCATCAGAACAGG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2H817JQ 731 0 0
GCAAATTTTCAACAATAATTACTGAAGATTTTACACACCAGAAGTAGCAAACTCATAATC
AGCGAAACCACAAACACAAAGTGTTTTTCACTACAAATACATCAAATAAGAATATGATCT
GTTGATAGCACCAAGTAGCAACAAGAGATATGCGAGGAACTGCGGAAATGTACAAA*GCG
TTTTCATATAGCAGAGTAGCTGTAGTTGTCAGCATCATCAATGGCAGAGGGAGACTTAGC
AGAAGCAGTGAGCACCACTAAGGCACCAAAGAGAATGGTGACGATGGCTGTGAAGTTCAC
AAGGAATGCTTCTGGACCGTACTTGTCAAGCTTAGCACCACTCTCCAGGAAAGTCAGCTT
CTCCAGAAACCCTAAAGCTGCGTTCCCAACCGCAAGAATATAAACAAATAGGCCTAGAAT
TGCGTGCCACGGAAGCAAACCGCTTCTAAGGTTTGGTGAGCCTCCTGGGAAGAAGAACAC
TGCGAAGCTGTACACCCACTGGAAGGCATAAAGAGAAATGACACCAATACCAATCCAAGA
ATGGAGGCTGTAGAGGTTAGGGATGCCACTTTCGTTGTGGTTCTTGAAGGCTGCGCAGAT
TCCCCAGATCCCAAGAGCCAGAGCAATGGCATGGAGAATAAGGTGGATCAGCTTCTTCAC
TGGTTTCTCCAAGGGAAGCGATTTGTAACTTATAATTGCTTCTCCTCCCAGGATTATAAA
TCCAATGAGCA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2EP16JQ 818 0 0
GGT
GCAAATTTTCAACAATAATTACTGAAGATTTTACACACCAGAAGTAGCAAACTCATAATC
AGCGAAACCACAAACACAAAGTGTTTTTCACTACAAATACATCAAATAAGAATATGATCT
GTTGATAGCACCAAGTAGCAACAAGAGATATGCGAGGAACTGCGGAAATGTACAAA*GCG
TTTTCATATAGCAGAGTAGCTGTAGTTGTCAGCATCATCAATGGCCGAGGGAGACTTAGC
AGAAGCAGTGAGCACCACTAAGGCACCAAAGAGAATGGTGACGATGGCTGTGAAGTTCAC
AAGAAATGCTTCTGGACCGTACTTGTCAAGCTTAGCACCACTCTCCAGGAAAGTCAGCTT
CTCCAGAAACCCTAAAGCTGCGTTCCCAACCGCAAGAATATAAACAAATAGGCCTAGAAT
TGCGTGCCACGGAAGCAAACCGCTTCTAAGGTTTGGTGAGCCTCCTGGGAAGAAGAACAC
TGCGAAGCTGTACACCCACTGGAAGGCATAAAGAGAAATGACACCAATACCAATCCAAGA
ATGGAGGCTGTAGAGGTTAGGGATGCCACTTTCGTTGTGGTTCTTGAAGGCTGCGCAGAT
TCCCCAGATCCCAAGAGCCAGAGCAATGGCATGGAGAATAAGGTGGATCAGCTTCTTCAC
TGGTTTCTCCAAGGGAAGCGATTTGTAACTTATAATTGCTTCTCCTCCCAGGATTATAAA
TCCAATGAGCATCAGAACAGGATGCAGATTAAAGATGAGATTCTTGTTTTCAGCTTCCCA
AGCCAGTCCACCTCGGTAGCTAATATTCCAAACCA

QA 4 818 4 818
DS 

RD RR2F454JQ 816 0 0
GCAAATTTTCAACAATAATTACTGAAGATTTTACACACCAGAAGTAGCAAACTCATAATC
AGCGAAACCACAAACACAAAGTGTTTTTCACTACAAATACATCAAATAAGAATATGATCT
GTTGATAGCACCAAGTAGCAACAAGAGATATGCGAGGAACTGCGGAAATGTACAAA*GCG
TTTTCATATAGCAGAGTAGCTGTAGTTGTCAGCATCATCAATGGCAGAGGGAGACTTAGC
AGAAGCAGTGAGCACCACTAAGGCACCAAAGAGAATGGTGACGATGGCTGTGAAGTTCAC
AAGAAATGCTTCTGGACCGTACTTGTCAAGCTTAGCACCACTCTCCAGGAAAGTCAGCTT
CCCCAGAAACCCTAAAGCTGCGTTCCCAACCGCAAGAATATAAACAAATAGGCCTAGAAT
TGCGTGCCACGGAAGCAAACCGCTTCTAAGGTTTGGTGAGCCTCCTGGGAAGAAGAACAC
TGCGAAGCTGTACACCCACTGGAAGGCATAAAGAGAAATGACACCAATACCAATCCAAGA
ATGGAGGCTGTAGAGGTTAGGGATGCCACTTTCGTTGTGGTTCTTGAAGGCTGCGCAGAT
TCCCCAGATCCCAAGAGCCAGAGCAATGGCATGGAGAATAAGGTGGATCAGCTTCTTCAC
TGGTTTCTCCAAGGGAAGCGATTTGTAACTTATAATTGCTTCTCCTCCCAGGATTATAAA
TCCAATGAGCATCAGAACAG*ATGCAGATTAAAGATGAGATTCTTGTTTTCAGCTTCCCA
AGCCAGTCCACCTCGGTAGCTA*TATTCCAAACA
GC

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR2AO90JQ 854 0 0
AGCAAACTCATAATCAGCGAAACCACAAACACAAAGTGTTTTTCACTACAAATACATCAA
ATAAGAATATGATCTTTTGATAGCACCAAGTAGCAACAAAAGATATGCGAGGAACTGCGG
AAATGTATAAAAGCGTTTTCATATAGCAGAGTAGCTGTAGTTGTCAGCATCATCAATGGC
AGAGGGAGACTTAGCAGAAGCAGTGAGCACCACTAAGGCACCAAAGAGAATGGTGACGAT
GGCTGTGAAGTTCACAAGAAACGCTTCTGGACCGTACTTGTCAAGCTTAGCACCACTCTC
CAGGAAAGTCAGCTTCTCCAGAAACCCTAGAGCTGCGTTCCCAACCGCAAGAATATAAAC
AAATAGGCCTAGAATTGCGTGCCACGGAAGCAAACCGCTTCTCAGATTCGGTGACCCTCC
TGGGAAGAAGAACACTGCGAAGCTGTACACCCACTGGAAGGCATAAAGAGAAATGACACC
AATACCAATCCAAGAATGGAGACTGTAGAGGTTAGGGATGCCACTTTCGTTGTGGTTCTT
GAAGGCTGCACAGATTCCCCAGATCCCAAGAGCCAGAGCAATGGCATGGAGAACAAGGTG
GATCAGCTTCTTCACTGGTTTCTCCAAGGGAAGCGATTTGTAACTTATAATTGCTTCTCC
TCCCAAGATTACAAATCCAATGAGCATCAGAACAGGATGCAGGTTAAAGATGAGATTCTT
GTTTTCAGCTTCCCAAGCCAGACCACCTCTGTAGCTGATATTCCAAACAAGAACCATAAT
CGCCGCTATTACAGCCAGCGCGTGGGCCGCAAACGTCACCGGCATCGCGTTAATCCCGAC
AGCCATAACTGAAC

QA 1 854 1 854
DS 

RD RR2CE83TF 628 0 0
GGACCGTACTTGTCAAGCTTAGCACCACTCTCCAGGAAAGTCAGCTTCTCCAGAAACCCT
AGAGCTGCGTTCCCAACCGCAAGAATATAAGCAAATAGGCCTAGAATTGCGTGCCACGGA
AGCAAACCGCTTCTCAGATTCGGTGACCCTCCTGGGAAGAAGAACACTGCGAAGCTGTAC
ACCCACTGGAAGGCATAAAGAGAAATGACACCAATACCAATCCAAGAATGGAGACTGTAG
AGGTTAGGGATGCCACTTTCGTTGTGGTTCTTGAAGGCTGCACAGATTCCCCAGATCCCA
AAAGCCAGAGCAATGGCATGGAGAACAAGGTGGATCAGCTTCTTCACTGGTTTCTCCAAG
GGAAGCGATTTGTAACCTATAATTGCTTCTCCTCCCAAGATTACAAATCCAATGAGCATC
AGAACAGGATGCAGGTTAAAGATGAGATTCTTGTTTTCAGCTTCCCAAGCCAGACCACCT
CTGTAGCTGATATTCCAAACAAGAACCATAATCGCCGCTATTACAGCCAGCGCGTGGGCC
GCAAACGTCACCGGCATCGCGTTAATCCCGACAGCCATAACTGAACTCTTTTGTTTCCTT
TTTTGTTCTTTTGTCTTTTTT
CTCTTCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2AO90TF 872 0 0
TACAAATACATCAAATAAGAATATGATCT*TTGATAGCACCAAGTAGCAACAAAAGATAT
GCGAGGAACTGCGGAAATGTATAAAAGCGTTTTCATATAGCAGAGTAGCTGTAGTTGTCA
GCATCATCAATGGCAGAGGGAGACTTAGCAGAAGCAGTGAGCACCACTAAGGCACCAAAG
AGAATGGTGACGATGGCTGTGAAGTTCACAAGAAACGCTTCTGGACCGTACTTGTCAAGC
TTAGCACCACTCTCCAGGAAAGTCAGCTTCTCCAGAAACCCTAGAGCTGCGTTCCCAACC
GCAAGAATATAAACAAATAGGCCTAGAATTGCGTGCCACGGAAGCAAACCGCTTCTCAGA
TTCGGTGACCCTCCTGGGAAGAAGAACACTGCGAAGCTGTACACCCACTGGAAGGCATAA
AGAGAAATGACACCAATACCAATCCAAGAATGGAGACTGTAGAGGTTAGGGATGCCACTT
TCGTTGTGGTTCTTGAAGGCTGCACAGATTCCCCAGATCCCAAGAGCCAGAGCAATGGCA
TGGAGAACAAGGTGGATCAGCTTCTTCACTGGTTTCTCCAAGGGAAGCGATTTGTAACTT
ATAATTGCTTCTCCTCCCAAGATTACAAATCCAATGAGCATCAGAACAGGATGCAGGTTA
AAGATGAGATTCTTGTTTTCAGCTTCCCAAGCCAGACCACCTCTGTAGCTGATATTCCAA
ACAAGAACCATAATCGCCGCTATTACAGCCAGCGCGTGGGCCGCAAACGTCACCGGCATC
GCGTTAATCCCGACAGCCATAACTGAACTCTTTTGTTTCCTTTTTTGTTCTTTTGTCTTT
TTT*CTCTCCTCTTCTTCTACTTCTGTTGTC
C

QA 1 871 1 871
DS 

RD RR2DA49TF 664 0 0
ACTTGTCAAGCTTAGCACCACTCTCCAGGAAAGTCAGCTTCTCCAGAAACCCTAGAGCTG
CGTTCCCAACCGCAAGAATATAAACAAATAGGCCTAGAATTGCGTGCCACGGAAGCAAAC
CGCTTCTCAGATTCGGTGACCCTCCTGGGAAGAAGAACACTGCGAAGCTGTACACCCACT
GGAAGGCATAAAGAGAAATGACACCAATACCAATCCAAGAATGGAGACTGTAGAGGTTAG
GGATGCCACTTTCGTTGTGGTTCTTGAAGGCTGCACAGATTCCCCAGATCCCAAGAGCCA
G**CAATGGCATGGAGAACAAGGTGGATCAGCTTCTTCACTGGTTTCTCCAAGGGAAGCG
ATTTGTAACTTATAATTGCTTCTCCTCCCAAGATTACAAATCCAATGAGCATCAGAACAG
GATGCAGGTTAAAGATGAGATTCTTGTTTTCAGCTTCCCAAGCCAGACCACCTCTGTAGC
TGATATTCCAAACAAGAACCATAATCGCCGCTATTACAGCCAGCGCGTGGGCCGCAAACG
TCACCGGCATCGCGTTAATCCCGACAGCCATAACTGAACTCTTTTGTTTCCTTTTTTGTT
CTTTTGTCTTTTTTTCTCTCCTCTTCTTCTACTTCTGTTGTCAGATTAATCTCGATGGTT
GT
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2BM40TF 639 0 0
AGCTTCTCCAGAAACC*TAGAGCTGCGTTCCCAACCGCAAGAATATAAACAAATAGGCCT
AGAATTGCGTGCCACGGAAGCAAACCGCTTCTCAGATTCGGTGACCCTCCTGGGAAGAAG
AACGCTGCGAAGCTGTACACCCACTGGAAGGCATAAAGAGAAATGACACCAATACCAATC
CAAGAATGGAGACTGTAGAGGTTAGGGATGCCACTTTCGTTGTGGTTCTTGAAGGCTGCA
CAGATTCCCCAGATCCCAAGAGCCAGAGCAATGGCATGGAGAACAAGGTGGATCAGCTTC
TTCACTGGTTTCTCCAAGGGAAGCGATTTGTAACTTATAATTGCTTCTCCTCCCAAGATT
ACAAATCCAATGAGCATCAGAACAGGATGCAGGTTAAAGATGAGATTCTTGTTTTCAGCT
TCCCAAGCCAGACCACCTCTGTAGCTGATATTCCAAACAAGAACCATAATCGCCGCTATT
ACAGCCAGCGCGTGGGCCGCAAACGTCACCGGCATCGCGTTAATCCCGACAGCCATAACT
GAACTCTTTTGTTTCCTTTTTTGTTCTTTTGTCTTTTTT*CTCTCCTCTTCTTCTACTTC
TGTTGTCAGATTAATCTCGATGGTTGTGGGAACTAAAAA

QA 1 639 1 639
DS 



CO CL252Contig2 835 4 14 U
GGGGTGGTTGTTTTATCTACTCATAGGTTGAAGCTTTTTGGTTTCCCACAACCATCGAGA
TTAATCTGACACAGAAGTAGAAGAAGAGGAGAGAAAAAGACAAGAAAGGAAACAAAAGAG
TTCAGTTATGGCTGTCGGGATAAACGCGATGCCGGTGACGTTTGCGGCCCACGCGCTGGC
TGTAATAGCGGCAATTATGGTGCTGGTTTGGAATATTAGCTACCGAGGTGGACTGGCTTG
GGAAGCTGAAAACAAGAATCTCATCTTTAATCTGCATCCTGTTCTGATGCTCATTGGATT
TATAATCCTGGGAGGAGAAGCAATTATAAGTTACAAATCGCTTCCCTTGGAGAAACCAGT
GAAGAAGCTGATCCACCTTATTCTCCATGCCATTGCTCTGGCTCTTGGGATCTGGGGAAT
CTGCGCAGCCTTCAAGAACCACAACGAAAGTGGCATCCCTAACCTCTACAGCCTCCATTC
TTGGATTGGTATTGGTGTCATTTCTCTTTATGCCTTCCAGTGGGTGTACAGCTTCGCAGT
GTTCTTCTTCCCAGGAGGCTCACCAAACCTTAGAAGCGGTTTGCTTCCGTGGCACGCAAT
TCTAGGCCTATTTGTTTATATTCTTGCGGTTGGGAACGCAGCTTTAGGGTTTCTGGAGAA
GCTGACTTTCCTGGAGAGTGGTGCTAAGCTTGACAAGTACGGTCCAGAAGCATTTCTTGT
GACTTCACAGCCATCGTCACCATTCTCTTTGGTGCCTTAGTGGTGCTCACTGCTTCTGCT
AAGTCTCCCTCTGCCATTGATGATGCTGACACTACAGCTACTCTGCTATATGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB33TF U 46
AF RR2H817TF U 52
AF RR2EP16TF U 1
AF RR2F454TF U 160
BS 1 701 RR2EP16TF
BS 702 702 RR2F454TF
BS 703 740 RR2EP16TF
BS 741 741 RR2F454TF
BS 742 749 RR2EP16TF
BS 750 750 RR2F454TF
BS 751 781 RR2EP16TF
BS 782 782 RR2F454TF
BS 783 791 RR2EP16TF
BS 792 792 RR2F454TF
BS 793 793 RR2EP16TF
BS 794 794 RR2F454TF
BS 795 827 RR2EP16TF
BS 828 835 RR2F454TF

RD RR2GB33TF 564 0 0
GGACAACC
ATCGAGATTAATCTGACACAGAAGTAGAAGAAGAGGAGAGAAAAAGACAAGAAAGGAAAC
AAAAGAGTTCAGTTATGGCTGTCGGGATAAACGCGATGCCGGTGACGTTTGCGGCCCACG
CGCTGGCTGTAATAGCGGCAATTATGGTGCTGGTTTGGAATATTAGCTACCGAGGTGGAC
TGGCTTGGGAAGCTGAAAACAAGAATCTCATCTTTAATCTGCATCCTGTTCTGATGCTCA
TTGGATTTATAATCCTGGGAGGAGAAGCAATTATAAGTTACAAATCGCTTCCCTTGGAGA
AACCAGTGAAGAAGCTGATCCACCTTATTCTCCATGCCATTGCTCTGGCTCTTGGGATCT
GGGGAATCTGCGCAGCCTTCAAGAACCACAACGAAAGTGGCATCCCTAACCTCTACAGCC
TCCATTCTTGGATTGGTATTGGTGTCATTTCTCTTTATGCCTTCCAGTGGGTGTACAGCT
TCGCAGTGTTCTTCTTCCCAGGAGGCTCACCAAACCTTAGAAGCGGTTTGCTTCCGTGGC
ACGCAATTCTAG
CCTA

QA 9 560 9 560
DS 

RD RR2H817TF 621 0 0
GG
ATCGAGATTAATCTGACACAGAAGTAGAAGAAGAGGAGAGAAAAAGACAAGAAAGGAAAC
AAAAGAGTTCAGTTATGGCTGTCGGGATAAACGCGATGCCGGTGACGTTTGCGGCCCACG
CGCTGGCTGTAATAGCGGCAATTATGGTGCTGGTTTGGAATATTAGCTACCGAGGTGGAC
TGGCTTGGGAAGCTGAAAACAAGAATCTCATCTTTAATCTGCATCCTGTTCTGATGCTCA
TTGGATTTATAATCCTGGGAGGAGAAGCAATTATAAGTTACAAATCGCTTCCCTTGGAGA
AACCAGTGAAGAAGCTGATCCACCTTATTCTCCATGCCATTGCTCTGGCTCTTGGGATCT
GGGGAATCTGCGCAGCCTTCAAGAACCACAACGAAAGTGGCATCCCTAACCTCTACAGCC
TCCATTCTTGGATTGGTATTGGTGTCATTTCTCTTTATGCCTTCCAGTGGGTGTACAGCT
TCGCAGTGTTCTTCTTCCCAGGAGGCTCACCAAACCTTAGAAGCGGTTTGCTTCCGTGGC
ACGCAATTCTAGGCCTATTTGTTTATATTCTTGCGGTTGGGAACGCAGCTTTAGG*TTTC
TGGAGAAGCTGACTTTCCT

QA 3 621 3 621
DS 

RD RR2EP16TF 827 0 0
GGGGTGGTTGTTTTATCTACTCATAGGTTGAAGCTTTTTGGTTTCCCACAACCATCGAGA
TTAATCTGACACAGAAGTAGAAGAAGAGGAGAGAAAAAGACAAGAAAGGAAACAAAAGAG
TTCAGTTATGGCTGTCGGGATAAACGCGATGCCGGTGACGTTTGCGGCCCACGCGCTGGC
TGTAATAGCGGCAATTATGGTGCTGGTTTGGAATATTAGCTACCGAGGTGGACTGGCTTG
GGAAGCTGAAAACAAGAATCTCATCTTTAATCTGCATCCTGTTCTGATGCTCATTGGATT
TATAATCCTGGGAGGAGAAGCAATTATAAGTTACAAATCGCTTCCCTTGGAGAAACCAGT
GAAGAAGCTGATCCACCTTATTCTCCATGCCATTGCTCTGGCTCTTGGGATCTGGGGAAT
CTGCGCAGCCTTCAAGAACCACAACGAAAGTGGCATCCCTAACCTCTACAGCCTCCATTC
TTGGATTGGTATTGGTGTCATTTCTCTTTATGCCTTCCAGTGGGTGTACAGCTTCGCAGT
GTTCTTCTTCCCAGGAGGCTCACCAAACCTTAGAAGCGGTTTGCTTCCGTGGCACGCAAT
TCTAGGCCTATTTGTTTATATTCTTGCGGTTGGGAACGCAGCTTTAGGGTTTCTGGAGAA
GCTGACTTTCCTGGAGAGTGGTGCTAAGCTTGACAAGTACG*TCCAGAAGCATTTCTTGT
GACTTCACAGCCATCGTCAC*ATTCTCTT*GGTGCCTTAGTGGTGCTCACTGCTTCTGCT
A*GTCTCCCTC*GGCATTGATGATGCTGACACTACAGCTACTCTGCT

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2F454TF 676 0 0
GTTTGCGGCCCACGCGCTGGCTGTAATAGCGGCAATTATGGTGCTGGTTTGGAATATTAG
CTACCGAGGTGGACTGGCTTGGGAAGCTGAAAACAAGAATCTCATCTTTAATCTGCATCC
TGTTCTGATGCTCATTGGATTTATAATCCTGGGAGGAGAAGCAATTATAAGTTACAAATC
GCTTCCCTTGGAGAAACCAGTGAAGAAGCTGATCCACCTTATTCTCCATGCCATTGCTCT
GGCTCTTGGGATCTGGGGAATCTGCGCAGCCTTCAAGAACCACAACGAAAGTGGCATCCC
TAACCTCTACAGCCTCCATTCTTGGATTGGTATTGGTGTCATTTCTCTTTATGCCTTCCA
GTGGGTGTACAGCTTCGCAGTGTTCTTCTTCCCAGGAGGCTCACCAAACCTTAGAAGCGG
TTTGCTTCCGTGGCACGCAATTCTAGGCCTATTTGTTTATATTCTTGCGGTTGGGAACGC
AGCTTTAGGGTTTCTGGGGAAGCTGACTTTCCTGGAGAGTGGTGCTAAGCTTGACAAGTA
CGGTCCAGAAGCATTTCTTGTGACTTCACAGCCATCGTCACCATTCTCTTTGGTGCCTTA
GTGGTGCTCACTGCTTCTGCTAAGTCTCCCTCTGCCATTGATGATGCTGACACTACAGCT
ACTCTGCTATATGAAA

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 15

CO CL253Contig1 629 15 12 U
GGGACTGATTCGCCTCTTCTCTCAAACATTCCATTCCATTCTCCTAAAAACAAGATCGAC
ACCAAAAAAAAGCGAATCTAGGGTTTTCAGAATTCTGACGAAGAAAGATGGCGATGCAGA
AGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGCAAGTCGTATTGTCCGT
ACTGTGTGAGAGTGAAGGAGCTTTTGCAGCAATTGGGTGCTAAATTCGTTGCCGTTGAGC
TCGACAAAGAGAGTGATGGTAGCCAAATTCAATCAGCTCTGGCAGAATGGACTGGGCAAC
GCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACATCGGTGGCTGCGACAATGTGACCA
AACTGCACAAAGACGGTAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCTGGAGCTATCGCTGCAA
CTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAGGGCACAATCTGTTTGTGATTTGCTTCTATCAGGAA
TAAACAAGTTCGATCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTCTTAAACTTGTGGTTATG
TCGAAGTCGTTGTTGAACTTCTGATACATTTATGTTATAATTATCAGCATTTGCTAGTAA
TTTCATTTCTCGTAATATTTCGACGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 80 80 30 80 
80 80 80 80 80 80 80 65 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G761TF U 279
AF RR2H548TF U 1
AF RR2CY17JQ C 46
AF RR2CY17TF U 46
AF RR2BI32JQ C 46
AF RR2BI32TF U 46
AF RR2H548JQB C 46
AF RR2EP80TF U 46
AF RR2EP80JQ C 46
AF RR2GF56TF U 36
AF RR2G774TF U 46
AF RR2EN65TF U 21
AF RR2E468JQ C 46
AF RR2E468TF U 46
AF RR2EN65JQ C 81
BS 1 94 RR2H548TF
BS 95 95 RR2EN65TF
BS 96 227 RR2H548TF
BS 228 228 RR2EN65TF
BS 229 538 RR2H548TF
BS 539 539 RR2EN65TF
BS 540 549 RR2H548TF
BS 550 550 RR2EN65TF
BS 551 573 RR2H548TF
BS 574 574 RR2EN65TF
BS 575 598 RR2H548TF
BS 599 629 RR2EN65TF

RD RR2G761TF 258 0 0
CTGGCAGAATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACATC
GGTGGCTGCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGTAAGTTGGTTCCTATGTTGACT
GAAGCTGGAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAGGGCACAATCTGTT
TGTGATTTGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTCGATCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAA
ATGTCTTAAACTTTTGGT

QA 1 258 1 258
DS 

RD RR2H548TF 598 0 0
GGGACTGATTCGCCTCTTCTCTCAAACATTCCATTCCATTCTCCTAAAAACAAGATCGAC
ACCAAAAAAAAGCGAATCTAGGGTTTTCAGAATTTTGACGAAGAAAGATGGCGATGCAGA
AGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGCAAGTCGTATTGTCCGT
ACTGTGTGAGAGTGAAGGAGCTTTTGCAGCAATTGGGTGCTAAATTCATTGCCGTTGAGC
TCGACAAAGAGAGTGATGGTAGCCAAATTCAATCAGCTCTGGCAGAATGGACTGGGCAAC
GCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACATCGGTGGCTGCGACAATGTGACCA
AACTGCACAAAGACGGTAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCTGGAGCTATCGCTGCAA
CTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAGGGCACAATCTGTTTGTGATTTGCTTCTATCAGGAA
TAAACAAGTTCGATCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTCTTAAACTTGTGGTTACG
TCGAAGTCGGTGTTGAACTTCTGATACATTTATTTTATAATTATCAGCATTTGCTAGT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2CY17JQ 553 0 0
AAAAACAAGATCGACACCAAAAAAAAGCGAATCTAGGGTTTTCAGAATTCTGACGAAGAA
AGATGGCGATGCAGAAGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGCA
AGTCGTATTGTCCGTACTGTGTGGGAGTGAAGGAGCTTTTGCAGCAATTGGGTGCTAAAT
TCGTTGCCGTTGAGCTCGACAAAGAGAGTGATGGTAGCCAAATTCAATCAGCTCTGGCAG
AATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACATCGGTGGCT
GCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGTAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCTG
GAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTTTGCTTAAAGGGCACAATCTGTTTGTGATT
TGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTCGATCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTCTT
AAACTTGTGGTTATGTCGAAGTCGTTGTTGAACTTTTGATACATTTATGTTATAATTATC
AGCATTTGCTAGT

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2CY17TF 553 0 0
AAAAACAAGATCGACACCAAAAAAAAGCGAATCTAGGGTTTTCAGAATTCTGACGAAGAA
AGATGGCGATGCAGAAGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGCA
AGTCGTATTGTCCGTACTGTGTGGGAGTGAAGGAGCTTTTGCAGCAATTGGGTGCTAAAT
TCGTTGCCGTTGAGCTCGACAAAGAGAGTGATGGTAGCCAAATTCAATCAGCTCTGGCAG
AATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACATCGGTGGCT
GCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGTAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCTG
GAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAGGGCACAATCTGTTTGTGATT
TGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTCGATCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTCTT
AAACTTGTGGTTATGTCGAAGTCGTTGTTGAACTTCTGATACATTTATGTTATAATTATC
AGCATTTGCTAGT

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2BI32JQ 553 0 0
AAAAACAAGATCGACACCAAAAAAAAGCGAATCTAGGGTTTTCAGAATTCTGACGAAGAA
AGATGGCGATGCAGAGGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGCA
AGTCGTATTGTCCGTACTGTGTGAGAGTGAAGGAGCTTTTGCAGCAATTGGGTGCTAAAT
TCGTTGCCGTTGAGCTCGACAAAGAGAGTGATGGTAGCCAAATTCAATCAGCTCTGGCAG
AATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACATCGGTGGCT
GCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGTAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCTG
GAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAGGGCACAATCTGTTTGTGATT
TGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTCGATCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTCTT
AAACTTGTGGTTATGTCGAAGTCGTTGTTGAACTTCTGATACATTTATGTTATAATTATC
AGCATTTGCTAGT

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2BI32TF 553 0 0
AAAAACAAGATCGACACCAAAAAAAAGCGAATCTAGGGTTTTCAGAATTCTGACGAAGAA
AGATGGCGATGCAGAGGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGCA
AGTCGTATTGTCCGTACTGTGTGAGAGTGAAGGAGCTTTTGCAGCAATTGGGTGCTAAAT
TCGTTGCCGTTGAGCTCGACAAAGAGAGTGATGGTAGCCAAATTCAATCAGCTCTGGCAG
AATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACATCGGTGGCT
GCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGTAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCTG
GAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAGGGCACAATCTGTTTGTGATT
TGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTCGATCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTCTT
AAACTTGTGGTTATGTCGAAGTCGTTGTTGAACTTCTGATACATTTATGTTATAATTATC
AGCATTTGCTAGT

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2H548JQB 553 0 0
AAAAACAAGATCGACACCAAAAAAAAGCGAATCTAGGGTTTTCAGAATTTTGACGAAGAA
AGATGGCGATGCAGAAGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGCA
AGTCGTATTGTCCGTACTGTGTGAGAGTGAAGGAGCTTTTGCAGCAATTGGGTGCTAAAT
TCATTGCCGTTGAGCTCGACAAAGAGAGTGATGGTAGCCAAATTCAATCAGCTCTGGCAG
AATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACATCGGTGGCT
GCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGTAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCTG
GAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAGGGCACAATCTGTTTGTGATT
TGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTCGATCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTCTT
AAACTTGTGGTTACGTCGAAGTCGGTGTTGAACTTCTGATACATTTATTTTATAATTATC
AGCATTTGCTAGT

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2EP80TF 553 0 0
AAAAACAAGATCGACACCAAAAAAAAGCGAATCTAGGGTTTTCAGAATTTTGACGAAGAA
AGATGGCGATGCAGAAGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGCA
AGTCGTATTGTCCGTACTGTGTGAGAGTGAAGGAGCTTTTGCAGCAATTGGGTGCTAAAT
TCATTGCCGTTGAGCTCGACAAAGAGAGTGATGGTAGCCAAATTCAATCAGCTCTGGCAG
AATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACATCGGTGGCT
GCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGTAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCTG
GAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAGGGCACAATCTGTTTGTGATT
TGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTCGATCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTCTT
AAACTTGTGGTTACGTCGAAGTCGGTGTTGAACTTCTGATACATTTATTTTATAATTATC
AGCATTTGCTAGT

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2EP80JQ 553 0 0
AAAAACAAGATCGACACCAAAAAAAAGCGAATCTAGGGTTTTCAGAATTTTGACGAAGAA
AGATGGCGATGCAGAAGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGCA
AGTCGTATTGTCCGTACTGTGTGAGAGTGAAGGAGCTTTTGCAGCAATTGGGTGCTAAAT
TCATTGCCGTTGAGCTCGACAAAGAGAGTGATGGTAGCCAAATTCAATCAGCTCTGGCAG
AATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACATCGGTGGCT
GCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGTAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCTG
GAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAGGGCACAATCTGTTTGTGATT
TGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTCGATCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTCTT
AAACTTGTGGTTACGTCGAAGTCGGTGTTGAACTTCTGATACATTTATTTTATAATTATC
AGCATTTGCTAGT

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2GF56TF 563 0 0
GG
ATTCTCCTAAAAACAAGATCGACACCAAAAAAAAGCGAATCTAGGGTTTTCAGAATTCTG
ACGAAGAAAGATGGCGATGCAGAAGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGT
TTTCAGCAAGTCGTATTGTCCGTACTGTGTGAGAGTGAAGGAGCTTTTGCAGCAATTGGG
TGCTAAATTCGTTGCCGTTGAGCTCGACAAAGAGAGTGATGGTAGCCAAATTCAATCAGC
TCTGGCAGAATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACAT
CGGTGGCTGCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGTAAGTTGGTTCCTATGTTGAC
TGAAGCTGGAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAGGGCACAATCTGT
TTGTGATTTGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTCGATCAATAAATGTGAACTTTGTCTGA
AATGTCTTAAACTTGTGGTTATGTCGAAGTTGTTGTTGAACTTCTGATACATTTATGTTA
TAATTATCAGCATTTGCTAGT

QA 3 563 3 563
DS 

RD RR2G774TF 550 0 0
AAAAACAAGATCGACACCAAAAAAAAGCGAATCTAGGGTTTTCAGAATTCTGACGAAGAA
AGATGGCGATGCAGAAGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGCA
AGTCGTATTGTCCGTACTGTGTGAGAGTGAAGGAGCTTTTGCAGCAATTGGGTGCTAAAT
TCGTTGCCGTTGAGCTCGACAAAGAGAGTGATGGTAGCCAAATTCAATCAGCTCTGGCAG
AATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACATCGGTGGCT
GCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGTAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCTG
GAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAGGGCACAATCTGTTTGTGATT
TGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTCGATCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTCTT
AAACTTTTGGTTATGTCGAAGTCGTTGTTGAACTTCTGATACATTTATGTTATAATTATC
AGCATTTGCT

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2EN65TF 609 0 0
GGA
AAACATTCCATTCCATTCTCCTAAAAACAAGATCGACACCAAAAAAAAGCGAATCTAGGG
TTTTCAGAATTCTGACGAAGAAAGATGGCGATGCAGAAGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGC
AACCCCGTCGTTGTTTTCAGCAAGTCGTATTGTCCGTACTGTGTGAGAGTGAAGGAGCTT
TTGCAGCAATTGGGTGCTAAATTCGTTGCCGTTGAGCTCGACAAAGAGAGTGATGGTAGC
CAAATTCAATCAGCTCTGGCAGAATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATA
GGTGAAAAACACATCGGTGGCTGCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGTAAGTTG
GTTCCTATGTTGACTGAAGCTGGAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTAA
AGGGCACAATCTGTTTGTGATTTGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTCGATCAATAAATG
TGAACTTTGTCTGAAATGTCTTAAACTTGTGGTTATGTCGAAGTCGTTGTTGAACTTCTG
ATACATTTATGTTATAATTATCAGCATTTGCTAGTAATTTCATTTCTCGTAATATTTCGA
CGTGAC

QA 4 609 4 609
DS 

RD RR2E468JQ 568 0 0
AAAAACAAGATCGACACCAAAAAAAAGCGAATCTAGGGTTTTCAGAATTCTGACGAAGAA
AGATGGCGATGCAGAAGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGCA
AGTCGTATTGTCCGTACTGTGTGAGAGTGAAGGAGCTTTTGCAGCAATTGGGTGCTAAAT
TCGTTGCCGTTGAGCTCGACAAAGAGAGTGATGGTAGCCAAATTCAATCAGCTCTGGCAG
AATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACATCGGTGGCT
GCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGTAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCTG
GAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAGGGCACAATCTGTTTGTGATT
TGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTCGATCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTCTT
AAACTTGTGGTTATGTCGAAGTCGTTGTTGAACTTCTGATACATTTATGTTATAATTATC
AGCATTTGCTAGTAATTTCATTTCTCGT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2E468TF 569 0 0
AAAAACAAGATCGACACCAAAAAAAAGCGAATCTAGGGTTTTCAGAATTCTGACGAAGAA
AGATGGCGATGCAGAAGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGCA
AGTCGTATTGTCCGTACTGTGTGAGAGTGAAGGAGCTTTTGCAGCAATTGGGTGCTAAAT
TCGTTGCCGTTGAGCTCGACAAAGAGAGTGATGGTAGCCAAATTCAATCAGCTCTGGCAG
AATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTCATAGGTGAAAAACACATCGGTGGCT
GCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGTAAGTTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCTG
GAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCTTAAAGGGCACAATCTGTTTGTGATT
TGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTCGATCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTCTT
AAACTTGTGGTTATGTCGAAGTCGTTGTTGAACTTCTGATACATTTATGTTATAATTATC
AGCATTTGCTAGTAATTTCATTTCTCGT
A

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2EN65JQ 549 0 0
GGGTTTTCAGAATTCTGACGAAGAAAGATGGCGATGCAGAAGGCTAAAGAGACCGTCTCC
AGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGCAAGTCGTATTGTCCGTACTGTGTGAGAGTGAAGGAG
CTTTTGCAGCAATTGGGTGCTAAATTCGTTGCCGTTGAGCTCGACAAAGAGAGTGATGGT
AGCCAAATTCAATCAGTTCTGGCAGAATGGACTGGGCAACGCACTGTTCCCAATGTGTTC
ATAGGTGAAAAACACATCGGTGGCTGCGACAATGTGACCAAACTGCACAAAGACGGTAAG
TTGGTTCCTATGTTGACTGAAGCTGGAGCTATCGCTGCAACTACTGGAGCTACTTCTGCT
TAAAGGGCACAATCTGTTTGTGATTTGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTCGATCAATAA
ATGTGAACTTTGTCTGAAATGTCTTAAACTTGTGGTTATGTCGAAGTCGTTGTTGAACTT
CTGATACATTTATGTTATAATTATCAGCATTTGCTAGTAATTTCATTTCTCGTAATATTT
CGACGTGAC

QA 1 549 1 549
DS 



AS 3 10

CO CL254Contig1 938 5 12 U
GGGCCGTCTCGTTCTCATATATACTCTTCGACTCGCTTCTCTTCTCGATCTCCGCTGCTT
CAGTTTCTTTATCCATGGCTTTACCTAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGC
TCGTCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGGAAAACGACGTTTGTGAAGAGACATCTCACTG
GAGAGTTTGAGAAGAAATATGAACCCACTATTGGTGTTGAGGTTCACCCTTTAGACTTCT
TCACTAACTGTGGCAAGATCCGGTTTTACTGCTGGGATACTGCTGGACAAGAGAAGTTTG
GTGGTCTAAGGGATGGTTACTACATCCATGGGCAGTGTGCCGTCATCATGTTTGATGTAA
CAGCTCGTCTGACATACAAGAATGTCCCAACATGGCACCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTG
AAAACATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACAAAGTTGATGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGG
CGAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTACTACGAGATCTCTGCCAAGA
GCAACTACAATTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGAAAACTTGCCGGTGACCCTA
ACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCTCCAGAAGTCCAGATTGACATGGCTG
CTCAGCAACAGCATGAGGCGGAGCTTGCAGCGGCAGCAAGTCAGCCACTCCCTGATGACG
ATGATGACACCTTCGAGTAGGGAGAGAGAGAAGAGTTCCATACTATGTGATTCCGTCACA
AGTATTATCATTTCTTTTTTTCTTTTCTTCTTTTTTTGATGGTGCTACTTTTATTTGTGT
GTTCAAAATATGAATTTAAAAATCGAGGTTTGCTTTTATCGATGTCACTAGTATTTTCCC
GTTTAAGTCCCACCTTTTAATTCTAGTTATGAAAACTA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 25 25 25 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ70TF U 45
AF RR2AY19TFB U 1
AF RR2BL39JQ C 552
AF RR2C140TF U 1
AF RR2B539TF U 95
BS 1 99 RR2C140TF
BS 100 100 RR2DJ70TF
BS 101 677 RR2C140TF
BS 678 678 RR2AY19TFB
BS 679 698 RR2C140TF
BS 699 699 RR2AY19TFB
BS 700 705 RR2C140TF
BS 706 706 RR2AY19TFB
BS 707 711 RR2C140TF
BS 712 712 RR2B539TF
BS 713 727 RR2C140TF
BS 728 938 RR2B539TF

RD RR2DJ70TF 593 0 0
GG
GATCTCCGCTACTTCAGTTTCATCATCCATGGCTTTACCTAACCAGCAAACCGTCGATTA
CCCTAGCTTCAAGCTCGTCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGGAAAACGACGTTTGTGAA
GAGACATCTCACTGGAGAGTTTGAGAAGAAATATGAACCCACTATTGGTGTTGAGGTTCA
CCCTTTAGACTTCTTCACTAACTGTGGCAAGATCCGGTTTTACTGCTGGGATACTGCTGG
ACAAGAGAAGTTTGGTGGTCTAAGGGATGGTTACTACATCCATGGGCAGTGTGCCGTCAT
CATGTTTGATGTAACAGCTCGTCTGACATACAAGAATGTCCCAACATGGCACCGTGATCT
TTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACAAAGTTGATGTGAAGAA
CAGGCAAGTGAAGGCGAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTACTACGA
GATCTCTGCCAAGAGCAACTACAATTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGAAAACT
TGCCGGTGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCTCC

QA 3 593 3 593
DS 

RD RR2AY19TFB 708 0 0
GGGG
CGTCTCGTTCTCATATATACTCTTCGACTCGCTTCTCTTCTCGATCTCCGCTGCTTCAGT
TTCTTTATCCATGGCTTTACCTAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAGGCTCGT
CATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGGAAAACGACGTTTGTGAAGAGACATCTCACTGGAGA
GTTTGAGAAGAAATATGAACCCACTATTGGTGTTGAGGTTCACCCTTTAGACTTCTTCAC
TAACTGTGGCAAGATCCGGTTTTACTGCTGGGATACTGCTGGACAAGAGAAGTTTGGTGG
TCTAAGGGATGGTTACTACATCCATGGGCAGTGTGCCGTCGTCATGTTTGATGTAACAGC
TCGTCTGACATACAAGAATGTCCCAACATGGCACCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTGAAAA
CATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACAAAGTTGATGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGGCGAA
GCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTACTACGAGATCTCTGCCAAGAGCAA
CTACAATTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGAAAACTTGCCGGTGACCCTAACCT
TCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCTCCAGAAGTCCAGATTGACATGGCTGCTCA
GCAACAGCATGAGGCGGAGCTAGCAGCGGCAACAAGTCAGCCAC

QA 5 708 5 708
DS 

RD RR2BL39JQ 161 0 0
TTT
GAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGAAAACTTGCCGGTGACCCTAGCCTTCACTTTGTG
GAATCACCTGCCCTTGCTCCTCCAGAAGTCCAGATTGACATGGCTGTTCAGCAACAGCAT
GAGGCGGAGCTTGCAGCGGCAGCAAGTCAGCCACTCCC

QA 4 161 4 161
DS 

RD RR2C140TF 727 0 0
GGGCCGTCTCGTTCTCATATATACTCTTCGACTCGCTTCTCTTCTCGATCTCCGCTGCTT
CAGTTTCTTTATCCATGGCTTTACCTAACCAGCAAACCGCCGATTACCCTAGCTTCAAGC
TCGTCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGGAAAACGACGTTTGTGAAGAGACATCTCACTG
GAGAGTTTGAGAAGAAATATGAACCCACTATTGGTGTTGAGGTTCACCCTTTAGACTTCT
TCACTAACTGTGGCAAGATCCGGTTTTACTGCTGGGATACTGCTGGACAAGAGAAGTTTG
GTGGTCTAAGGGATGGTTACTACATCCATGGGCAGTGTGCCGTCATCATGTTTGATGTAA
CAGCTCGTCTGACATACAAGAATGTCCCAACATGGCACCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTG
AAAACATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACAAAGTTGATGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGG
CGAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTACTACGAGATCTCTGCCAAGA
GCAACTACAATTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGAAAACTTGCCGGTGACCCTA
ACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCTCCAGAAGTCCAGATTGACATGGCTG
CTCAGCAACAGCATGAG*CGGAGCTTGCAGCGGCAGCA*GTCAGC*ACTCC*TGATGACG
ATGATGA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2B539TF 844 0 0
G
ACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGGAAAACG
ACGTTTGTGAAGAGACATCTCACTGGAGAGTTTGAGAAGAAATATGAACCCACTATTGGT
GTTGAGGTTCACCCTTTAGACTTCTTCACTAACTGTGGCAAGATCCGGTTTTACTGCTGG
GATACTGCTGGACAAGAGAAGTTTGGTGGTCTAAGGGATGGTTACTACATCCATGGGCAG
TGTGCCGTCATCATGTTTGATGTAACGGCTCGTCTGACATACAAGAATGTCCCAACATGG
CACCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACAAAGTT
GATGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGGCGAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTC
CAGTACTACGAGATCTCTGCCAAGAGCAACTACAATTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTT
GCTAGAAAACTTGCCGGTGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCT
CCAGAAGTCCAGATTGACATGGCTGCTCAGCAACAGCATGAGGCGGAGCTTGCAGCGGCA
GCAAGTCAGCCACTCCCTGATGACGATGATGACACCTTCGAGTAGGGAGAGAGAGAAGAG
TTCCATACTATGTGATTCCGTCACAAGTATTATCATTTCTTTTTTTCTTTTCTTCTTTTT
TTGATGGTGCTACTTTTATTTGTGTGTTCAAAATATGAATTTAAAAATCGAGGTTTGCTT
TTATCGATGTCACTAGTATTTTCCCGTTTAAGTCCCACCTTTTAATTCTAGTTATGAAAA
CTA

QA 2 844 2 844
DS 



CO CL254Contig2 1238 2 4 U
GGACTCTTTCGCCGTCTTGTTCTCTTATATACTCCTCGACTCGCTTCTCTTCTCGATCTC
CGCTACTTCAGTTTCATCATCCATGGCTTTACCTAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAG
CTTCAAGCTCGTCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGGAAAACGACGTTTGTGAAGAGACA
TCTCACTGGAGAGTTTGAGAAGAAATATGAACCCACTATTGGTGTTGAGGTTCACCCTTT
AGACTTCTTCACTAACTGTGGCAAGATCCGGTTTTACTGCTGGGATACTGCTGGACAAGA
GAAGTTTGGTGGTCTAAAGGATGGTTACTAGTAAGTCTTCTCTTCTCTGCAGTCTGTCTG
TTTGTTTATACGACTCACTTTATGATACCTGTACCCTGATTGATTTACTGAATCTTCTAG
TGCCTTATACTTTATAGAGTTCTTGTCTTGGTATTTGGGCTGTGTTGTGAAGCTTAATAA
GATACTTATTCCCTTTATTGTAGCTAGCAACATGAAAGGTTACTGTAAAGTTACTGCTGC
AAATAGTTTGTTTGACACAAAGATGTGTGTTTTGTTTTGTTGCAGCATCCATGGGCAGTG
TGCCGTCATCATGTTTGATGTAACAGCTCGTCTGACATACAAGAATGTCCCAACATGGCA
CCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACAAAGTTGA
TGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGGCGAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCA
GTACTACGAGATTTCTGCCAAGAGCGACTACAATTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGC
TAGAAAACTTGCCGGTGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCTCC
AGAAGTCCAGATTGACATGGCTGCTCAGCAACAGCATGAGACGGAGCTTGCAGCGGCAGC
AAGTCAGCCACTCCCTGATGACGATGATGACACCTTCGAGTAGGGAGAGAGAGAAGAGTT
CCGTACTATGTGATTCCGTCACAAGTATTATCATTTCTTTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTT
GATGGTGCTACTTTTATTTGTGTGTTCAAAATATGAATTTAAAAATCGAGGTTTGCTTTT
ATCGATGTCACTAGTATTTTCCCGTTTAAGTCCCACCTTTTAATTCTAGTTATGAAAACT
ATAAAAGTTCTTAATTTGAGACGAAAAATGCAGATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT57TF U 1
AF RR2CT57JQ C 444
BS 1 456 RR2CT57TF
BS 457 457 RR2CT57JQ
BS 458 648 RR2CT57TF
BS 649 1238 RR2CT57JQ

RD RR2CT57TF 648 0 0
GGACTCTTTCGCCGTCTTGTTCTCTTATATACTCCTCGACTCGCTTCTCTTCTCGATCTC
CGCTACTTCAGTTTCATCATCCATGGCTTTACCTAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAG
CTTCAAGCTCGTCATCGTTGGTGATGGAGGCACAGGGAAAACGACGTTTGTGAAGAGACA
TCTCACTGGAGAGTTTGAGAAGAAATATGAACCCACTATTGGTGTTGAGGTTCACCCTTT
AGACTTCTTCACTAACTGTGGCAAGATCCGGTTTTACTGCTGGGATACTGCTGGACAAGA
GAAGTTTGGTGGTCTAAAGGATGGTTACTAGTAAGTCTTCTCTTCTCTGCAGTCTGTCTG
TTTGTTTATACGACTCACTTTATGATACCTGTACCCTGATTGATTTACTGAATCTTCTAG
TGCCTTATACTTTATAGAGTTCTTGTCTTGGTATTTTGGCTGTGTTGTGAAGCTTAATAA
GATACTTATTCCCTTTATTGTAGCTAGCAACATGAAAGGTTACTGTAAAGTTACTGCTGC
AAATAGTTTGTTTGACACAAAGATGTGTGTTTTGTTTTGTTGCAGCATCCATGGGCAGTG
TGCCGTCATCATGTTTGATGTAACAGCTCGTCTGACATACAAGAATGT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2CT57JQ 795 0 0
TGTCTTGGTATTTGGGCTGTGTTGTGAAGCTTAATAAGATACTTATTCCCTTTATTGTAG
CTAGCAACATGAAAGGTTACTGTAAAGTTACTGCTGCAAATAGTTTGTTTGACACAAAGA
TGTGTGTTTTGTTTTGTTGCAGCATCCATGGGCAGTGTGCCGTCATCATGTTTGATGTAA
CAGCTCGTCTGACATACAAGAATGTCCCAACATGGCACCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTG
AAAACATCCCGATTGTTCTTTGTGGGAACAAAGTTGATGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGG
CGAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTACTACGAGATTTCTGCCAAGA
GCGACTACAATTTCGAGAAGCCATTCTTGTACCTTGCTAGAAAACTTGCCGGTGACCCTA
ACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCTCCAGAAGTCCAGATTGACATGGCTG
CTCAGCAACAGCATGAGACGGAGCTTGCAGCGGCAGCAAGTCAGCCACTCCCTGATGACG
ATGATGACACCTTCGAGTAGGGAGAGAGAGAAGAGTTCCGTACTATGTGATTCCGTCACA
AGTATTATCATTTCTTTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTGATGGTGCTACTTTTATTTGTGT
GTTCAAAATATGAATTTAAAAATCGAGGTTTGCTTTTATCGATGTCACTAGTATTTTCCC
GTTTAAGTCCCACCTTTTAATTCTAGTTATGAAAACTATAAAAGTTCTTAATTTGAGACG
AAAAATGCAGATATC

QA 1 795 1 795
DS 



CO CL254Contig3 826 3 6 U
GGGACCATAACTCTCACAACACTGTTCAAAAACCCTCTCTCTCTCTCTCGCCGTCTTGTT
CTCCTCTCATAAACTCTTGGACTCGCTTCTTCTCGATCTCCGCAGCTTCGGTTTCGTCAA
TGGCTTTACCGAACCAGCAAACCGTGGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATCGTTGGTG
ATGGAGGCACAGGAAAAACCACGTTTGTCAAGAGACATCTCACCGGAGAGTTTGAGAAGA
AATATGAACCCACTATTGGTGTTGAGGTTCACCCTTTAGATTTCTTCACTAACTGTGGCA
AGATCCGGTTCTACTGTTGGGATACTGCTGGACAAGAGAAGTTTGGTGGGTTAAGGGATG
GATACTACATCCATGGTCAATGTGCCGTCATCATGTTTGATGTCACAGCACGTCTGACAT
ACAAGAATGTTCCAACATGGCACCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGATTG
TACTCTGCGGGAACAAAGTTGATGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGGCGAAGCAGGTGACAT
TCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTACTACGAGATATCTGCCAAGAGCAACTACAACTTCG
AGAAGCCCTTCTTGTACCTTGCTAGGAAACTCGCCGGGGACCCTAACCTTCACTTTGTGG
AATCACCTGCCCTTGCTCCCCCAGAAGTACAGATTGACATGGCTGCTCAGCAACAGCATG
AGG*AGAGCTCGCAGCCGCAGCAAGTCAGCCACTCCCTGATGACGATGATGACACGTTCG
AGTAGGGAGAGAGAGACACTATTATCATTTCTTGTTTTTTTTTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN06TF U 22
AF RR2FD40TF U 1
AF RR2FD40JQ C 236
BS 1 52 RR2FD40TF
BS 53 53 RR2BN06TF
BS 54 223 RR2FD40TF
BS 224 224 RR2BN06TF
BS 225 786 RR2FD40TF
BS 787 826 RR2FD40JQ

RD RR2BN06TF 733 0 0
GG
GTTCAAAAACCCTCTCTCTCTCTCTCGCCGTCTTGTTCTC***TCATAAACTCTTGGACT
CGCTTCTTCTCGATCTCCGCAGCTTCGGTTTCGTCAATGGCTTTACCGAACCAGCAAACC
GTGGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATCGTTGGTGATGGTGGCACAGGAAAAACCACG
TTTGTCAAGAGACATCTCACCGGAGAGTTTGAGAAGAAATATGAACCCACTATTGGTGTT
GAGGTTCACCCTTTAGATTTCTTCACTAACTGTGGCAAGATCCGGTTCTACTGCTGGGAT
ACTGCTGGACAAGAGAAGTTTGGTGGGTTAAGGGATGGATACTACATCCATGGTCAATGT
GCCGTCATCATGTTTGATGTCACAGCACGTCTGACATACAAGAATGTTCCAACATGGCAC
CGTGATCTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGATTGTACTCTGTGAAAACAAAGTTGAT
GTGAAGAACAGGCAAGTGAAGGCGAAGCAGGTGACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAG
TACTACGAGATATCTGCCAAGAGCAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACCTTGCT
AGGAAACTCGCCGGGGACCCTAACCTTCACTTTGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCCCCA
GAAGTACAGATTGACATGGCTGCTCAGCAACAGCATGAGC*AGAGCTCGCAGCCGCAGCA
AGTCAGCCACT

QA 3 733 3 733
DS 

RD RR2FD40TF 789 0 0
GGGACCATAACTCTCACAACACTGTTCAAAAACCCTCTCTCTCTCTCTCGCCTTCTTGTT
CTCCTCTCATAAACTCTTGGACTCGCTTCTTCTCGATCTCCGCAGCTTCGGTTTCGTCAA
TGGCTTTACCGAACCAGCAAACCGTGGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATCGTTGGTG
ATGGAGGCACAGGAAAAACCACGTTTGTCAAGAGACATCTCACTGGAGAGTTTGAGAAGA
AATATGAACCCACTATTGGTGTTGAGGTTCACCCTTTAGATTTCTTCACTAACTGTGGCA
AGATCCGGTTCTACTGTTGGGATACTGCTGGACAAGAGAAGTTTGGTGGGTTAAGGGATG
GATACTACATCCATGGTCAATGTGCCGTCATCATGTTTGATGTCACAGCACGTCTGACAT
ACAAGAATGTTCCAACATGGCACCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCCGATTG
TACTCTGCGGGAACAAAGTTGATGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGGCGAAGCAGGTGACAT
TCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTACTACGAGATATCTGCCAAGAGCAACTACAACTTCG
AGAAGCCCTTCTTGTACCTTGCTAGGAAACTCGCCGGGGACCCTAACCTTCACTTTGTGG
AATCACCTGCCCTTGCTCCCCCAGAAGTACAGATTGACATGGCTGCTCAGCAACAGCATG
AGG*AGAGCTCGCAGCCGCAGCAAGTCAGCCACTCCCTGATGACGATGATGACACGTTCG
AGTAGG
AGA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2FD40JQ 591 0 0
GAAGAAATATGAACCCACTATTGGTGTTGAGGTTCACCCTTTAGATTTCTTCACTAACTG
TGGCAAGATCCGGTTCTACTGTTGGGATACTGCTGGACAAGAGAAGTTTGGTGGGTTAAG
GGATGGATACTACATCCATGGTCAATGTGCCGTCATCATGTTTGATGTCACAGCACGTCT
GACATACAAGAATGTTCCAACATGGCACCGTGATCTTTGCAGGGTCTGTGAAAACATCCC
GATTGTACTCTGCGGGAACAAAGTTGATGTGAAGAACAGGCAAGTGAAGGCGAAGCAGGT
GACATTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTACTACGAGATATCTGCCAAGAGCAACTACAA
CTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACCTTGCTAGGAAACTCGCCGGGGACCCTAACCTTCACTT
TGTGGAATCACCTGCCCTTGCTCCCCCAGAAGTACAGATTGACATGGCTGCTCAGCAACA
GCATGAGGCAGAGCTCGCAGCCGCAGCAAGTCAGCCACTCCCTGATGACGATGATGACAC
GTTCGAGTAGGGAGAGAGAGACACTATTATCATTTCTTGTTTTTTTTTTTA

QA 1 591 1 591
DS 



AS 3 15

CO CL255Contig1 536 6 9 U
GGAATTGCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTGAGCTTTCCGCTTCCCATCAACTTCTGCA
AAAAAAAAATGAAGGTTGTTGCCGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCC
CAAACAGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTC
AGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGCGGGAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTG
GAAGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCTTCTGCTCCTT
CTGCTGGTGGTGGCGGCGGTGCTGCACCTGCTGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAG
AAGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAAAGAAGCCGTT
TTTCTTTTCGTTTCAAATCTATATGATGTTTAGTTTGTTCTCGGATTTTTCTCTAAGACA
TTCCTGGGATTTTTACACAATTAGTAAGCCGCGGTCTTTTTGATCTTGTTTCAGCC


BQ
10 10 10 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR2AY24TFB U 17
AF RR2AY24JQ C 1
AF RR2EV56TF U 1
AF RR2A719JQ C 5
AF RR2A719TF U 5
AF RR2FY40TF U 51
BS 1 3 RR2AY24JQ
BS 4 68 RR2EV56TF
BS 69 69 RR2AY24TFB
BS 70 251 RR2EV56TF
BS 252 252 RR2AY24TFB
BS 253 367 RR2EV56TF
BS 368 368 RR2A719TF
BS 369 531 RR2EV56TF
BS 532 536 RR2A719JQ

RD RR2AY24TFB 266 0 0
TCGAAAACTAACTCTGAGCTTTCCGCTTCCCATCAACTTCTGGAAAAAAAAAATGAAGGT
TGTTGCCGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAAACAGTGCCGATAT
TAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGATTGAGCTTTTGTT
GAAGGAAGTCAGCGGGAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAAGGGAGAAGTTGGC
TTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTG

QA 1 266 1 266
DS 

RD RR2AY24JQ 525 0 0
GGAATTGCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTGAGCTTTCCGCTTCCCATCAACTTCTGCA
AAAAAAAAATGAAGGTTGTTGCCGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCC
CAAACAGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTC
AGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGCGGGAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTG
GAAGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCTTCTGCTCCTT
CTGCTGGTGGTGGCGGCGGTGCTGCACCTGCTGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAG
AAGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAAAGAAGCCGTT
TTTCTTTTCGTTTCAAATCTATATGATGTTTAGTTTGTTCTCGGATTTTTCTCTAAGACA
TTCCTGGGATTTTTACACAATTAGTAAGCCGCGGTCTTTTTGATC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2EV56TF 531 0 0
GGA
ATTGCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTGAGCTTTCCGCTTCCCATCAACTTCTGCAAAA
AAAAA*TGAAGGTTGTTGCCGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAA
ACAGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGA
TTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGCGGGAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAA
GGGAGAAGCTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCTTCTGCTCCTTCTG
CTGGTGGTGGCGGCGGTGCTGCACCTGCTGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAG
AGAACGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAAAGAAGCCGTTTTT
CTTTTCGTTTCAAATCTATATGATGTTTAGTTTGTTCTCGGATTTTTCTCTAAGACATTC
CTGGGATTTTTACACAATTAGTAAGCCGCGGTCTTTTTGATCTTGTTT

QA 4 531 4 531
DS 

RD RR2A719JQ 532 0 0
GG
GCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTGAGCTTTCCGCTTCCCATCAACTTCTGCAAAAAAA
AAATGAAGGTTGTTGCCGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAAACA
GTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGATTG
AGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGCGGGAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAAGGG
AGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCTTCTGCTCCTTCTGCTG
GTGGTGGCGGCGGTGCTGCACCTGCTGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGA
AGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAAAGAAGCCGTTTTTCTT
TTCGTTTCAAATCTATATGATGTTTAGTTTGTTCTCGGATTTTTCTTTAAGACATTCCTG
GGATTTTTACACAATTAGTAAGCCGCGGTCTTTTTGATCTTGTTTCAGCC

QA 3 532 3 532
DS 

RD RR2A719TF 532 0 0
GG
GCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTGAGCTTTCCGCTTCCCATCAACTTCTGCAAAAAAA
AAATGAAGGTTGTTGCCGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAAACA
GTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGATTG
AGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGCGGGAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAAGGG
AGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCTTCTGCTCCTTCTGCTG
GTGGTGGCGGCGGTGCTGCACCTGCTGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGA
AGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAAAGAAGCCGTTTTTCTT
TTCGTTTCAAATCTATATGATGTTTAGTTTGTTCTCGGATTTTTCTCTAAGACATTCCTG
GGATTTTTACACAATTAGTAAGCCGCGGTCTTTTTGATCTTGTTT
CAGCC

QA 3 527 3 527
DS 

RD RR2FY40TF 483 0 0
AACTTCTGCAAAAAAAAAATGAAGGTTGTTGCCGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGA
AAAGCTTCCCCAAACAGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGT
GAAGATGCTCAGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGCGGGAAAGACTGTGCTGAGCTC
ATTGCTGCTGGAAGGGAGAAGCTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCT
TCTGCTCCTTCTGCTGGTGGTGGCGGCGGTGCTGCACCTGCTGCTGAGGCCAAGAAAGAA
GAGAAGAAAGAAGAGAACGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAA
AGAAGCCGTTTTTCTTTTCGTTTCAAATCTATATGATGTTTAGTTTGTTCTCGGATTTTT
CTCTAAGACATTCCTGGGATTTTTACACAATTAGTAAGCCGCGGTCTTTTTGATCTTGTT
T
CG

QA 1 481 1 481
DS 



CO CL255Contig2 558 7 7 U
GGATTGCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTTTAGCTTTCCACTTCCCATCAACTTCTGCA
AAAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCA
AACAGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAG
ATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGTGGAAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGA
AGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCTTCTGCTCCTTCT
GCTGGTGGTGGCGGCGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAA
GAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGAGAACCGTTTTT
TAATGCCATCTTTTTTTTCGTTTTGAAATCTATATGATGTTACTGTTTAGTTTGTACTCG
GATTTTTCTCTTAAGACATTCCTGGGATTGTTACACAATTAGTAAGCTGCGGTCTTTTTG
ATCTTGGTTTCAGTCATC


BQ
10 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 

AF RR2E452TF U 1
AF RR2BK87JQ C 2
AF RR2G085JQ C 2
AF RR2GO32JQ C 7
AF RR2G085TF U 2
AF RR2GO32TF U 2
AF RR2BK87TF U 2
BS 1 40 RR2E452TF
BS 41 41 RR2G085TF
BS 42 437 RR2E452TF
BS 438 438 RR2G085TF
BS 439 475 RR2E452TF
BS 476 555 RR2G085TF
BS 556 558 RR2BK87JQ

RD RR2E452TF 475 0 0
GGATTGCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTTTAGCTTTCCGCTTCCCATCAACTTCTGCA
AAAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCA
AACAGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAG
ATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGTGGAAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGA
AGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCTTCTGCTCCTTCT
GCTGGTGGTGGCGGCGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAA
GAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGAGAACCGTTTTT
TAATGCCATCTTTTTTT*CGTTTTGAAATCTATATGATGTTACTGTTTAGTTTGT

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2BK87JQ 557 0 0
GATTGCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTTTAGCTTTCCGCTTCCCATCAACTTCTGCAA
AAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCTTTCTTACTGGC*GTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAA
ACAGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGA
TTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGTGGAAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAA
GGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCTTCTGCTCCTTCTG
CTGGTGGTGGCGGCGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAG
AGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGAGAACCGTTTTTT
AATGCCATCTTTTTTTTCGTTTTGAAATCTATATGATGTTACTGTTTAGTTTGTACTCGG
ATTTTTCTCTTAAGACATTCCTGGGATTGTTACACAATTAGTAAGCTGCGGTCTTTTTGA
TCTTGGTTTCAGTCATC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2G085JQ 554 0 0
GATTGCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTTTAGCTTTCCACTTCCCATCAACTTCTGCAA
AAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAA
ACAGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGA
TTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGTGGAAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAA
GGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCTTCTGCTCCTTCTG
CTGGTGGTGGCGGCGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAG
AGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGAGAACCGTTTTTT
AATGCCATCTTTTTTTTCGTTTTGAAATCTATATGATGTTACTGTTTAGTTTGTACTCGG
ATTTTTCTCTTAAGACATTCCTGGGATTGTTACACAATTAGTAAGCTGCGGTCTTTTTGA
TCTTGGTTTCAGTC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2GO32JQ 549 0 0
CCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTTTAGCTTTCCACTTCCCATCAACTTCTGCAAAAAAA
ATGAAGGTTGTCGCCGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAAACAGT
GCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGATTGAG
CTTTTGTTGAAGGAAGTCAGTGGAAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAAGGGAG
AAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCTTCTGCTCCTTCTGCTGGT
GGTGGCGGCGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAG
GAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGAGAACCGTTTTTTAATGC
CATCTTTTTTTTCGTTTTGAAATCTATATGATGTTACTGTTTAGTTTGTACTCGGATTTT
TCTCTTAAGACATTCCTGGGATTGTTACACAATTAGTAAGCTGCGGTCTTTTTGATCTTG
GTTTCAGTC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2G085TF 554 0 0
GATTGCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTTTAGCTTTCCACTTCCCATCAACTTCTGCAA
AAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAA
ACAGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGA
TTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGTGGAAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAA
GGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCTTCTGCTCCTTCTG
CTGGTGGTGGCGGCGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAG
AGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGAGAACCGTTTTTT
AATGCCATCTTTTTTTTCGTTTTGAAATCTATATGATGTTACTGTTTAGTTTGTACTCGG
ATTTTTCTCTTAAGACATTCCTGGGATTGTTACACAATTAGTAAGCTGCGGTCTTTTTGA
TCTTGGTTTCAGTC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2GO32TF 554 0 0
GATTGCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTTTAGCTTTCCACTTCCCATCAACTTCTGCAA
AAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAA
ACAGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGA
TTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGTGGAAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAA
GGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCTTCTGCTCCTTCTG
CTGGTGGTGGCGGCGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAG
AGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGAGAACCGTTTTTT
AATGCCATCTTTTTTTTCGTTTTGAAATCTATATGATGTTACTGTTTAGTTTGTACTCGG
ATTTTTCTCTTAAGACATTCCTGGGATTGTTACACAATTAGTAAGCTGCGGTCTTTTTGA
TCTTGGTTTCAGTC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2BK87TF 557 0 0
GATTGCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTTTAGCTTTCCGCTTCCCATCAACTTCTGCAA
AAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCTTTCTTACTGGC*GTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAA
ACAGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGA
TTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGTGGAAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAA
GGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCTTCTGCTCCTTCTG
CTGGTGGTGGCGGCGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGGCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAG
AGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTGTTTGAGTAGAGAACCGTTTTTT
AATGCCATCTTTTTTTTCGTTTTGAAATCTATATGATGTTACTGTTTAGTTTGTACTCGG
ATTTTTCTCTTAAGACATTCCTGGGATTGTTACACAATTAGTAAGCTGCGGTCTTTTTGA
TCTTGGTTTCAGTC
ATC

QA 1 554 1 554
DS 



CO CL255Contig3 522 2 5 U
ACTAATTGTGTAAAAATCCCAGGAATGTCTTAGAGAAAAATCCGAGTACAAACTAAACAG
TAAGATCATATAGATTTCAAAACGAAAAAAAAAGATGACATAAAAAACGGTTCTCTACTC
AAACAGACTGAAACCCATGTCATCATCGGATTCTTCCTTCTCTTCTTTCTTCTCTTCTTT
CTTGGCCTCAGCAGCAGGAGCAGCACCGCCGCCACCACCAGCAGAAGGAGCAGAAGCCAT
GGCAACACCACCACCACTTGGAACAGAAGCCAACTTCCCCCTTCCAGCAGCAATGAGCTC
AGCACAGTCTTTTCCACTGACTTCCTTCAACAAAAGCTCAATCTGAGCATCTTCACCTTC
AGCACCAACTGATCCGAGGATATTCTTAATATCGGCACTGTTTGGGGAAGCTTTTCCGCT
CAAAACGGCCAGTAAGAAAGCGGCGACAACCTTCATTTTTTTGCGGAAGTTGATGGGGTC
TCGAAGCTTAAGAGCTAGTTTTCGAAGACGACGGCAATCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H647JQB U 40
AF RR2H647TF C 1
BS 1 39 RR2H647TF
BS 40 313 RR2H647JQB
BS 314 314 RR2H647TF
BS 315 368 RR2H647JQB
BS 369 522 RR2H647TF

RD RR2H647JQB 329 0 0
ATCCGAGTACAAACTAAACAGTAAGATCATATAGATTTCAAAACGAAAAAAAAAGATGAC
ATAAAAAACGGTTCTCTACTCAAACAGACTGAAACCCATGTCATCATCGGATTCTTCCTT
CTCTTCTTTCTTCTCTTCTTTCTTGGCCTCAGCAGCAGGAGCAGCACCGCCGCCACCACC
AGCAGAAGGAGCAGAAGCCATGGCAACACCACCACCACTTGGAACAGAAGCCAACTTCCC
CCTTCCAGCAGCAATGAGCTCAGCACAGTCTTTTTCACTGACTTCCTTCAACAAAAGCTC
AATCTGAGCATCTTCACCTTCAGCACCAA

QA 1 329 1 329
DS 

RD RR2H647TF 522 0 0
ACTAATTGTGTAAAAATCCCAGGAATGTCTTAGAGAAAAATCCGAGTACAAACTAAACAG
TAAGATCATATAGATTTCAAAACGAAAAAAAAAGATGACATAAAAAACGGTTCTCTACTC
AAACAGACTGAAACCCATGTCATCATCGGATTCTTCCTTCTCTTCTTTCTTCTCTTCTTT
CTTGGCCTCAGCAGCAGGAGCAGCACCGCCGCCACCACCAGCAGAAGGAGCAGAAGCCAT
GGCAACACCACCACCACTTGGAACAGAAGCCAACTTCCCCCTTCCAGCAGCAATGAGCTC
AGCACAGTCTTTTCCACTGACTTCCTTCAACAAAAGCTCAATCTGAGCATCTTCACCTTC
AGCACCAACTGATCCGAGGATATTCTTAATATCGGCACTGTTTGGGGAAGCTTTTCCGCT
CAAAACGGCCAGTAAGAAAGCGGCGACAACCTTCATTTTTTTGCGGAAGTTGATGGGGTC
TCGAAGCTTAAGAGCTAGTTTTCGAAGACGACGGCAATCCCT

QA 1 522 1 522
DS 



AS 3 13

CO CL256Contig1 690 2 1 U
GGAGGGCTTCCAGTGTAAAACAAGTTTCAGCGCGGCGGCGTAGCCATGGTTCTCAAGACT
GAGCTTTGCCGATTTAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGGGGTATCAGATTCATCAGA
CCTGACTCACAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGCAAGCACTATTTTCATAATAAG
TTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACTATGTACCGTAAACAGCACAAGAAGGATGCT
GCTCAAGAAGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCTTACTCTAGGTCCATC
GTTGATGCTACATTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAATTTCGTGAT
GCAGCCAGAGAAGCCGCCTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACCAAGGACGAG
AAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAAGGCAATATCCCC
AAGGCTGCTGCTGCACCCAAAGCTGCTAAGTTGGGTGGTGGTGGTGGCAGACGTTGAATA
GATTAGCCAGCCCTCTTATTCATCTCTCTGCCCGCACTTATCTTAAATTGTTTCCATTTT
TGTTTTCTGTCCACCAGTTTTTGAAGCTTTGCACCATATTGACATATTGTGTACTCAAAA
AGAGATTTTTATGGATTATGAAATTTATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AU47JQ C 1
AF RR2AU47TF U 1
BS 1 690 RR2AU47TF

RD RR2AU47JQ 690 0 0
GGAGGGCTTCCAGTGTAAAACAAGTTTCAGCGCGGCGGCGTAGCCATGGTTCTCAAGACT
GAGCTTTGCCGATTTAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGGGGTATCAGATTCATCAGA
CCTGACTCACAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGCAAGCACTATTTTCATAATAAG
TTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACTATGTACCGTAAACAGCACAAGAAGGATGCT
GCTCAAGAAGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCTTACTCTAGGTCCATC
GTTGATGCTACATTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAATTTCGTGAT
GCAGCCAGAGAAGCCGCCTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACCAAGGACGAG
AAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAAGGCAATATCCCC
AAGGCTGCTGCTGCACCCAAAGCTGCTAAGTTGGGTGGTGGTGGTGGCAGACGTTGAATA
GATTAGCCAGCCCTCTTATTCATCTCTCTGCCCGCACTTATCTTAAATTGTTTCCATTTT
TGTTTTCTGTCCACCAGTTTTTGAAGCTTTGCACCATATTGACATATTGTGTACTCAAAA
AGAGATTTTTATGGATTATGAAATTTATTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2AU47TF 690 0 0
GGAGGGCTTCCAGTGTAAAACAAGTTTCAGCGCGGCGGCGTAGCCATGGTTCTCAAGACT
GAGCTTTGCCGATTTAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGGGGTATCAGATTCATCAGA
CCTGACTCACAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGCAAGCACTATTTTCATAATAAG
TTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACTATGTACCGTAAACAGCACAAGAAGGATGCT
GCTCAAGAAGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCTTACTCTAGGTCCATC
GTTGATGCTACATTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAATTTCGTGAT
GCAGCCAGAGAAGCCGCCTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACCAAGGACGAG
AAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAAGGCAATATCCCC
AAGGCTGCTGCTGCACCCAAAGCTGCTAAGTTGGGTGGTGGTGGTGGCAGACGTTGAATA
GATTAGCCAGCCCTCTTATTCATCTCTCTGCCCGCACTTATCTTAAATTGTTTCCATTTT
TGTTTTCTGTCCACCAGTTTTTGAAGCTTTGCACCATATTGACATATTGTGTACTCAAAA
AGAGATTTTTATGGATTATGAAATTTATTT

QA 1 690 1 690
DS 



CO CL256Contig2 692 3 5 U
CCAAACATAAATAAATTTCATAATCCATAAAAATCTCTTTTTGAGTACACAATATATCAA
TAAGGTGCAAAGCTTCAAAAACTGGTGACAAAAATAAAAACTGAAACAAATAAAGACAAG
TGCAGAGAGACGAATAAGAGGGGTTAATCTATTCAACGTCTGCCACCACCACCACCCAAC
TTAGCAGCCTTTGGTGCGGCTGAAGCCTTGGGGATATTGCCTTTGATTTTTTGTTGCTTG
GAAGCAAACTCGGCCTTCTTTGCCTTCTTCTCGTCCTTGGTCTTCTTGATTCTCTCCTTA
ATGTCACGTAAAGCAGCTTCTCTGGCTGCATCACGAACTTCAGGCTTCTCTGCACGCTTC
TTCTGAATGACCTCCAAAGTAGCACCAACGATTGACCTAGAGTAGGGCTTCTTGGTTGCA
CGTCTCCTCTTCTTCACAGCTTCTTGAGCAGCATCCTTCTTGTGCTGTTTACGGTACATA
GTGGTCCATGCAAGCTTGGAAGGCTTCAACTTATTATGAAAATAATGCTTGCATTTTGAG
TTAATGAACAAAAACACCTGAGAGTCAGATCTGATGAATCTGATACCCCTGCCTGGGTAA
ATCTTGTGTCCACTGAATCGGCAAAGCTCAGTCTTGAGAACCATGGCTCCGCCGCCGCGC
TGAGAGTTGTTTTACAATGGAAGCCCTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 

AF RR2BQ11JQ U 1
AF RR2CF01JQ U 19
AF RR2CF01TF C 80
BS 1 427 RR2BQ11JQ
BS 428 428 RR2CF01JQ
BS 429 686 RR2BQ11JQ
BS 687 687 RR2CF01JQ
BS 688 692 RR2BQ11JQ

RD RR2BQ11JQ 692 0 0
CCAAACATAAATAAATTTCATAATCCATAAAAATCTCTTTTTGAGTACACAATATATCAA
TAAGGTGCAAAGCTTCAAAAACTGGTGACAAAAATAAAAACTGAAACAAATAAAGACAAG
TGCAGAGAGACGAATAAGAGGGGTTAATCTATTCAACGTCTGCCACCACCACCACCCAAC
TTAGCAGCCTTTGGTGCGGCTGAAGCCTTGGGGATATTGCCTTTGATTTTTTGTTGCTTG
GAAGCAAACTCGGCCTTCTTTGCCTTCTTCTCGTCCTTGGTCTTCTTGATTCTCTCCTTA
ATGTCACGTAAAGCAGCTTCTCTGGCTGCATCACGAACTTCAGGCTTCTCTGCACGCTTC
TTCTGAATGACCTCCAAAGTAGCACCAACGATTGACCTAGAGTAGGGCTTCTTGGTTGCA
CGTCTCCCCTTCTTCACAGCTTCTTGAGCAGCATCCTTCTTGTGCTGTTTACGGTACATA
GTGGTCCATGCAAGCTTGGAAGGCTTCAACTTATTATGAAAATAATGCTTGCATTTTGAG
TTAATGAACAAAAACACCTGAGAGTCAGATCTGATGAATCTGATACCCCTGCCTGGGTAA
ATCTTGTGTCCACTGAATCGGCAAAGCTCAGTCTTGAGAACCATGGCTCCGCCGCCGCGC
TGAGAGTTGTTTTACAATGGAAGCCCCAAAAA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2CF01JQ 674 0 0
CATAATCCATAAAAATCTCTTTTTGAGTACACAATATATCAATAAGGTGCAAAGCTTCAA
AAACTGGTGACAAAAATAAAAACTGAAACAAATAAAGACAAGTGCAGAGAGACGAATAAG
AGGGGTTAATCTATTCAACGTCTGCCACCACCACCACCCAACTTAGCAGCCTTTGGTGCG
GCTGAAGCCTTGGGGATATTGCCTTTGATTTTTTGTTGCTTGGAAGCAAACTCGGCCTTC
TTTGCCTTCTTCTCGTCCTTGGTCTTCTTGATTCTCTCCTTAATGTCACGTAAAGCAGCT
TCTCTGGCTGCATCACGAACTTCAGGCTTCTCTGCACGCTTCTTCTGAATGACCTCCAAA
GTAGCACCAACGATTGACCTAAAGTAGGGCTTCTTGGTTGCACGTCTCCTCTTCTTCACA
GCTTCTTGAGCAGCATCCTTCTTGTGCTGTTTACGGTACATAGTGGTCCATGCAAGCTTG
GAAGGCTTCAACTTATTATGAAAATAATGCTTGCATTTTGAGTTAATGAACAAAAACACC
TGAGAGTCAGATCTGATGAATCTGATACCCCTGCCTGGGTAAATCTTGTGTCCACTGAAT
CGGCAAAGCTCAGTCTTGAGAACCATGGCTCCGCCGCCGCGCTGAGAGTTGTTTTACAAT
GGAAGCCCTAAAAA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2CF01TF 613 0 0
AACTGGTGACAAAAATAAAAACTGAAACAAATAAAGACAAGTGCAGAGAGACGAATAAGA
GGGGTTAATCTATTCAACGTCTGCCACCACCACCACCCAACTTAGCAGCCTTTGGTGCGG
CTGAAGCCTTGGGGATATTGCCTTTGATTTTTTGTTGCTTGGAAGCAAACTCGGCCTTCT
TTGCCTTCTTCTCGTCCTTGGTCTTCTTGATTCTCTCCTTAATGTCACGTAAAGCAGCTT
CTCTGGCTGCATCACGAACTTCAGGCTTCTCTGCACGCTTCTTCTGAATGACCTCCAAAG
TAGCACCAACGATTGACCTAGAGTAGGGCTTCTTGGTTGCACGTCTCCTCTTCTTCACAG
CTTCTTGAGCAGCATCCTTCTTGTGCTGTTTACGGTACATAGTGGTCCATGCAAGCTTGG
AAGGCTTCAACTTATTATGAAAATAATGCTTGCATTTTGAGTTAATGAACAAAAACACCT
GAGAGTCAGATCTGATGAATCTGATACCCCTGCCTGGGTAAATCTTGTGTCCACTGAATC
GGCAAAGCTCAGTCTTGAGAACCATGGCTCCGCCGCCGCGCTGAGAGTTGTTTTACAATG
GAAGCCCTAAAAA

QA 1 613 1 613
DS 



CO CL256Contig3 686 8 8 U
TTTGGAGGGCATCCATTGTAAAACAACTCTCAGCGCGGCGGCGGAGCCATGGTTCTCAAG
ACTGAGCTTTGCCGATTCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGAGGTATCAGATTCATC
AGATCTGACTCTCAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAAT
AAGTTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACTATGTACCGTAAACAACACAAGAAGGAT
GCTGCTCAAGAAGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTCTAGGTCC
ATCGTTGGAGCTACTTTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGT
GATGCAGCCAGAGAAGCTGCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAAAAGACTAAAGAC
GAGAAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAAGGCAATATC
CCCAAGGCTGCTGCTGCACCCAAAGCTGCTAAGTTGGGTGGCGGTGGTGGCAGACGTTGA
ATACATTAGCCAGCCACCTCTTATTCATCTCTGTGCACTTATCTTTATTTGTTTCAATTT
TTGAAGTTTTGCACCTTATTGATTATATTGTGTACTCAAAAGGAGATTTTTATGGATTAT
GAATTTTATTTATGTTTGGTTATCAC


BQ
15 15 15 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 10 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2DZ44TF U 4
AF RR2G291TF U 1
AF RR2AN89JQ C 57
AF RR2AN89TF U 4
AF RR2GZ19TF U 1
AF RR2G291JQ C 139
AF RR2DZ44JQ C 365
AF RR2GZ19JQ C 139
BS 1 3 RR2G291TF
BS 4 5 RR2AN89TF
BS 6 289 RR2G291TF
BS 290 290 RR2GZ19TF
BS 291 632 RR2G291TF
BS 633 642 RR2GZ19TF
BS 643 643 RR2AN89TF
BS 644 686 RR2GZ19TF

RD RR2DZ44TF 284 0 0
GGAGGGCATCCATTGTAAAACAACTCTCAGCGCGGCGGCGGAGCCATGGTTCTCAAGACT
GAGCTTTGCCGATTCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGAGGTATCAGATTCATCAGA
TCTGACTCTCAGGTGTTTTTGTTCATTAGCTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAATAAG
TTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACTATGTACCGTAAACAACACAAGAAGGATGCT
GCTCAAGAAGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCC

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2G291TF 632 0 0
TTTTTAGGGCATCCATTGTAAAACAACTCTCAGCGCGGCGGCGGAGCCATGGTTCTCAAG
ACTGAGCTTTGCCGATTCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGAGGTATCAGATTCATC
AGATCTGACTCTCAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAAT
AAGTTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACTATGTACCGTAAACAACACAAGAAGGAT
GCTGCTCAAGAAGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTGCTCTAGGTCC
ATCGTTGGAGCTACTTTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGT
GATGCAGCCAGAGAAGCTGCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAAAAGACTAAAGAC
GAGAAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAAGGCAATATC
CCCAAGGCTGCTGCTGCACCCAAAGCTGCTAAGTTGGGTGGCGGTGGTGGCAGACGTTGA
ATACATTAGCCAGCCACCTCTTATTCATCTCTGTGCACTTATCTTTATTTGTTTCAATTT
TTGAAGTTTTGCACCTTATTGATTATATTGTG

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2AN89JQ 599 0 0
CAAGACTGAGCTTTGCCGATTCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGAGGTATCAGATT
CATCAGATCTGACTCTCAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCA
TAATAAGTTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACTATGTACCGTAAACAACACAAGAA
GGATGCTGCTCAAGAAGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTTTAG
GTCCATCGTTGGAGCTACTTTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGT
TCGTGATGCAGCCAGAGAAGCTGCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAAAAGACTAA
AGACGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAAGGCAA
TATCCCCAAGGCTGCTGCTGCACCCAAAGCTGCTAAGTTGGGTGGCGGTGGTGGCAGACG
TTGAATACATTAGCCAGTCACCTCTTATTCATCTCTGTGCACTTATCTTTATTTGTTTCA
ATTTTTGAAGTTTTGCACCTTATTGATTATATTGTGTACTCAAAAGGAGATTTTTATGG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2AN89TF 652 0 0
GGAGGGCATCCATTGTAAAACAACTCTCAGCGCGGCGGCGGAGCCATGGTTCTCAAGACT
GAGCTTTGCCGATTCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGAGGTATCAGATTCATCAGA
TCTGACTCTCAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAATAAG
TTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACTATGTACCGTAAACAACACAAGAAGGATGCT
GCTCAAGAAGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTCTAGGTCCATC
GTTGGAGCTACTTTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGTGAT
GCAGCCAGAGAAGCTGCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAAAAGACTAAAGACGAG
AAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAAGGCAATATCCCC
AAGGCTGCTGCTGCACCCAAAGCTGCTAAGTTGGGTGGCGGTGGTGGCAGACGTTGAATA
CATTAGCCAGTCACCTCTTATTCATCTCTGTGCACTTATCTTTATTTGTTTCAATTTTTG
AAGTTTTGCACCTTATTGATTATATTGTGTACTCAAAAGGAGATTTTTATGG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2GZ19TF 686 0 0
TTTTTAGGGCATCCATTGTAAAACAACTCTCAGCGCGGCGGCGGAGCCATGGTTCTCAAG
ACTGAGCTTTGCCGATTCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGAGGTATCAGATTCATC
AGATCTGACTCTCAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAAT
AAGTTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACTATGTACCGTAAACAACACAAGAAGGAT
GCTGCTCAAGAAGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTTTAGGTCC
ATCGTTGGAGCTACTTTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGT
GATGCAGCCAGAGAAGCTGCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAAAAGACTAAAGAC
GAGAAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAAGGCAATATC
CCCAAGGCTGCTGCTGCACCCAAAGCTGCTAAGTTGGGTGGCGGTGGTGGCAGACGTTGA
ATACATTAGCCAGCCACCTCTTATTCATCTCTGTGCACTTATCTTTATTTGTTTCAATTT
TTGAAGTTTTGCACCTTATTGATTATATTGTGTACTCAAAAG*AGATTTTTATGGATTAT
GAATTTTATTTATGTTTGGTTATCAC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2G291JQ 548 0 0
TTTTTGTTCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAATAAGTTGAAGCCTTCCAAG
CTTGCATGGACCACTATGTACCGTAAACAACACAAGAAGGATGCTGCTCAAGAAGCTGTG
AAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTGCTCTAGGTCCATCGTTGGAGCTACTTTG
GAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGCAGCCAGAGAAGCT
GCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAAAAGACTAAAGACGAGAAGAAGGCAAAGAAG
GCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAAGGCAATATCCCCAAGGCTGCTGCTGCA
CCCAAAGCTGCTAAGTTGGGTGGCGGTGGTGGCAGACGTTGAATACATTAGCCAGCCACC
TCTTATTCATCTCTGTGCACTTATCTTTATTTGTTTCAATTTTTGAAGTTTTGCACCTTA
TTGATTATATTGTGTACTCAAAAGGAGATTTTTATGGATTATGAATTTTATTTATGTTTG
GTTATCAC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2DZ44JQ 306 0 0
CAGCCAGAGAAGCTGCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAAAAGACTAAAGACGAGA
AGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAAGGCAATATCCCCA
AGGCTGCTGCTGCACCCAAAGCTGCTAAGTTGGGTGGCGGTGGTGGCAGACGTTGAATAC
ATTAGCCAGCCACCTCTTATTCATCTCTGTGCACTTATCTTTATTTGTTTCAATTTTTGA
AGTTTTGCACCTTATTGATTATATTGTGTACTCAAAAGGAGATTTTTATGGATTATGAAT
TTTATT

QA 1 306 1 306
DS 

RD RR2GZ19JQ 548 0 0
TTTTTGTTCATTAACTCAAAATGTAAGCATTATTTTCATAATAAGTTGAAGCCTTCCAAG
CTTGCATGGACCACTATGTACCGTAAACAACACAAGAAGGATGCTGCTCAAGAAGCTGTG
AAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCCTACTTTAGGTCCATCGTTGGAGCTACTTTG
GAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGCAGCCAGAGAAGCT
GCTTTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAAAAGACTAAAGACGAGAAGAAGGCAAAGAAG
GCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAAAAAATCAAAGGCAATATCCCCAAGGCTGCTGCTGCA
CCCAAAGCTGCTAAGTTGGGTGGCGGTGGTGGCAGACGTTGAATACATTAGCCAGCCACC
TCTTATTCATCTCTGTGCACTTATCTTTATTTGTTTCAATTTTTGAAGTTTTGCACCTTA
TTGATTATATTGTGTACTCAAAAGGAGATTTTTATGGATTATGAATTTTATTTATGTTTG
GTTATCAC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 2 13

CO CL257Contig1 862 6 12 U
GGGGTGAGTCCGAAGTCGCTGTCTCCACCTTCATTTCCATGGCAGGGTCTTTCTCCTTCA
TCCGTCGCGTGTACCTCACTCTCTACAATTGGATCGTCTTTGCTGGATGGGCTCAAGTTT
TGTACTTTGCGGTAAAGACGTTGAAGGAAACGGGACATGAAAATGTCTATGAGGCCGTTG
AGAAGCCTCTCCAGCTTGCTCAGACCGCCGCTGTTCTCGAGATTCTTCATGGATTAGTAG
GTTTGGTCAGATCTCCTGTCTCTGCAACTCTGCCGCAGATAGGTTCAAGGTTGTTTCTCA
CTTGGGGCATCCTATACAGTTTTCCAGAGGTCCAATCACATTTTCTTGTTGCGTCGCTGG
TCATAAGCTGGTCTATCACGGAGATTATCCGCTACTCCTTCTTTGGACTTAAGGAAGCTC
TAGGCTTTGCACCTTCATGGCACTTGTGGCTCAGATACAGCAGCTTTTTAGTGCTATATC
CTACCGGTATCACCAGTGAAGTAGGTCTTATCTACCTTGCCTTACCACACATCAAGACGT
CTGAGATGTACAGCGTTAGGATGCCCAATACATTGAACTTCTCATTCGACTTCTTCTACG
CTACCATACTCGTACTTGCAATCTATGTACCAGGCAGTCCACACATGTATAGGTACATGC
TTGGTCAGCGTAAGAGAGCTCTCTCCAAATCCAAGAGAGAATAAGAAAAGCTTATAGAGA
GACCAAAGCTTACGCATCAATTGCTTCTTTTCCACTTGCCTAGTTTGTTTCATGTACTTC
CCTTTGTTAGACTTTTTACGTCTTTCGTATTCTGGACTACTCAACTAAGAGTAATGTAAT
GTTTTAAGATTTAATACGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2E496TF U 1
AF RR2E595TF U 4
AF RR2GZ22TF U 4
AF RR2C027TF U 255
AF RR2E496JQ C 164
AF RR2E595JQ C 545
BS 1 323 RR2E496TF
BS 324 488 RR2E595TF
BS 489 630 RR2GZ22TF
BS 631 700 RR2C027TF
BS 701 701 RR2E496JQ
BS 702 708 RR2C027TF
BS 709 709 RR2E496JQ
BS 710 723 RR2C027TF
BS 724 724 RR2E496JQ
BS 725 739 RR2C027TF
BS 740 858 RR2E496JQ
BS 859 862 RR2E595JQ

RD RR2E496TF 323 0 0
GGGGTGAGTCCGAAGTCGCTGTCTCCACCTTCATTTCCATGGCAGGGTCTTTCTCCTTCA
TCCGTCGCGTGTACCTCACTCTCTACAATTGGATCGTCTTTGCTGGATGGGCTCAAGTTT
TGTACTTTGCGGTAAAGACGTTGAAGGAAACGGGACATGAAAATGTCTATGAGGCCGTTG
AGAAGCCTCTCCAGCTTGCTCAGACCGCCGCTGTTCTCGAGATTCTTCATGGATTAGTAG
GTTTGGTCAGATCTCCTGTCTCTGCAACTCTGCCGCAGATAGGTTCAAGGTTGTTTCTCA
CTTGGGGCATCCTATACAGTTTT

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR2E595TF 485 0 0
GG
GAGTCCGAAGTCGCTGTCTCCACCTTCATTTCCATGGCAGGGTCTTTCTCCTTCATCCGT
CGCGTGTACCTCACTCTCTACAATTGGATCGTCTTTGCTGGATGGGCTCAAGTTTTGTAC
TTTGCGGTAAAGACGTTGAAGGAAACGGGACATGAAAATGTCTATGAGGCCGTTGAGAAG
CCTCTCCAGCTTGCTCAGACCGCCGCTGTTCTCGAGATTCTTCATGGATTAGTAGGTTTG
GTCAGATCTCCTGTCTCTGCAACTCTGCCGCAGATAGGTTCAAGGTTGCTTCTCACTTCG
GGCATCCTATACAGTTTTCCAGAGGTCCAATCACATTTTCTTGTTGCGTCGCTGGTCATA
AGCTGGTCTATCACGGAGATTATCCGCTACTCCTTCTTTGGACTTAAGGAAGCTCTAGGC
TTTGCACCTTCATGGCACTTGTGGCTCAGATACAGCAGCTTTTTAGTGCTATATCCTACC
GGT

QA 3 485 3 485
DS 

RD RR2GZ22TF 627 0 0
GG
GAGTCCGAAGTCGCTGTCTCCACCTTCCTTTCCATGGCAGGGTCTTTATCCTTCATCCGT
CGCGTGTACCTCACTCTCTACAACTGGATCGTCTTTGCTGGATGGGCTCAAGTGTTGTAC
TTTGCGGTAAAGACGTTGAAGGAAACAGGACATGAAAATGTCTACGACGCCGTCGAGAAG
CCTCTCCAGCTTGCTCAGACCGCCGCTGTTCTCGAGATTCTTCATGGATTAGTAGGTTTG
GTCAGATCTCCTGTCTCTGCTACTCTGCCGCAGATAGGTTCAAGGCTGTTTCTCACTTGG
GGCATCCTATACAGTTTTCCAGAGGTCCAATCACATTTTCTTGTTGCGTCGCTGGTCATA
AGCTGGTCTATCACGGAGATTATCCGCTACTCCTTCTTTGGACTTAAGGAAGCTCTAGGC
TTTGCACCTTCATGGCACCTGTGGCTCAGATACAGCAGCTTTTTAGTGCTATACCCTACC
GGTATCACCAGTGAAGTAGGTCTTATCTACCTTGCCTTACCACACATCAAGACGTCTGAG
ATGTACAGCGTTAGGATGCCCAATACATTGAACTTCTCATTCGACTTCTTCTACGCTACC
ATACTCGTACTTGCAATCTATGTAC

QA 3 627 3 627
DS 

RD RR2C027TF 496 0 0
CCTGTCTCTGCAACTCTGCCGCAGATAGGTTCAAGGTTGTTTCTCACTTGGGGCATCCTA
TACAGTTTTCCAGAGGTCCAATCACATTTTCTTGTTGCGTCGCTGGTCATAAGCTGGTCT
ATCACGGAGATTATCCGCTACTCCTTCTTTGGACTTAAGGAAGCTCTAGGCTTTGCACCT
TCATGGCACTTGTGGCTCAGATACAGCAGCTTTTTAGTGCTATATCCTACCGGTATCACC
AGTGAAGTAGGTCTTATCTACCTTGCCTTACCACACATCAAGACGTCTGAGATGTACAGC
GTTAGGATGCCCAATACATTGAACTTCTCATTCGACTTCTTCTACGCTACCATACTCGTA
CTTGCAATCTATGTACCAGGCAGTCCACACATGTATAGGTACATGCTTGGTCAGCGTAAG
AGAGCTCTCTCCAAATCCAAGAGAGA*TAAGAAA*GCTTATAGAGAGAC*AAAGCTTACG
CATCA
TGCTTCTTTCA

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2E496JQ 695 0 0
TGTCTATGAGGCCGTTGAGAAGCCTCTCCAGCTTGCTCAGACCGCCGCTGTTCTCGAGAT
TCTTCATGGATTAGTAGGTTTGGTCAGATCTCCTGTCTCTGCAACTCTGCCGCAGATAGG
TTCAAGGTTGTTTCTCACTTGGGGCATCCTATACAGTTTTCCAGAGGTCCAATCACATTT
TCTTGTTGCGTCGCTGGTCATAAGCTGGTCTATCACGGAGATTATCCGCTACTCCTTCTT
TGGACTTAAGGAAGCTCTAGGCTTTGCACCTTCATGGCACTTGTGGCTCAGATACAGCAG
CTTTTTAGTGCTATATCCTACCGGCATCACCAGTGAAGTAGGTCTTATCTACCTTGCCTT
ACCACACATCAAGACGTCTGAGATGTACAGCGTTAGGATGCCCAATACATTGAACTTCTC
ATTCGACTTCTTCTACGCTACCATACTCGTACTTGCAATCTATGTACCAGGCAGTCCACA
CATGTATAGGTACATGCTTGGTCAGCGTAAGAGAGCTCTCTCCAAATCCAAGAGAGAATA
AGAAAAGCTTATAGAGAGACCAAAGCTTACGCATCAATTGCTTCTTTTCCACTTGCCTAG
TTTGTTTCATGTACTTCCCTTTGTTAGACTTTTTACGTCTTTCGTATTCTGGACTACTCA
ACTAAGAGTAATGTAATGTTTTAAGATTTAATACG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2E595JQ 318 0 0
GATGTACAGCGTTAGGATGCCCAATACATTGAACTTTTCATTCGACTTTTTTTACGCTAC
CATACTCGTACTTGCAATCTATGTACCAGGCAGTCCACACATGTATAGGTACATGCTTGG
TCAGCGTAAGAGAGCTCTCTCCAAATCCAAGAGAGAATAAGAAAAGCTTATAGAGAGACC
AAAGCTTACGCATCAATTGCTTCTTTTCCACTTGCCTAGTTTGTTTCATGTACTTCCCTT
TGTTAGACTTTTTACGTCTTTCGTATTCTGGACTACTCAACTAAGAGTAATGTAATGTTT
TAAGATTTAATACGAAAA

QA 1 318 1 318
DS 



CO CL257Contig2 873 7 9 U
CAGATCAAAAGCTAGTTATAATTAATATAGTAGTAACCCGCATAAATTTAAATAATCTCC
AA*******AAGAAAAAGAAATACCAAGTGTAACAAAGGAAAGTACAATGAAAGAACCAC
AC**GAGAAGAAAATCAGTTGATGAGCTTTTGGTATCCTCTCTGTAAGATTTTTTTT*AT
TCTCTCTTAGATTTGGAGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCATGTACCTGTACATGTGT
GGACTACCTGGGACATAGATAGCAAGGACGAGTATGGTTGCATAGAAGAAGTCGAATGAG
AAGTTCAATGTGTTAGGCATCCTAACGCCGTACATCTCAGACGTCTTGATGTGTGGTAAG
GCAAGGTAGACAAGACCTACTTCACTGGTGATACCGGTCGGGTATAGCACTAAAAAGCTG
CTGTATCTGAGCCACAAGTGCCATGAAGGTGCAAAGCC*TAGAGCTTCCTTGAAACCAAA
GAAGGAGTAGCGAATAATCT**CCGTGATAGACCAGCTTATGACCAGCGAGGCAACAAGA
AAATGTGATTGGACCTCTGGGAAGCTGTATAGGATGCCCC*AAGTGAGAAACAGCCTTGA
GCCAATCTGTGGCAGAGTTGCAGAAACAGGAGATCTGACCAAACCTACTAAACCATGAAG
AATCTCGAGAACAGCGGCAGTCTGAGCAAGCTGGAGAGGCTTCTCGACAGCATCATAGAC
ATTTTCATGTCCCGTTTCCTTCAACGTCTTTACCGCAAAGTACAAAACCTGAGCCCATCC
AGCAAAGACGACCCAGTTGTAGAGAGTGAGGTACACTCGACGAATAATGGAGAGAAACGA
CGCCATGGAAAGTGGAGAATAGATTAGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 

AF RR2EF89JQ U 1
AF RR2BD20JQ U 9
AF RR2BD52JQ U 6
AF RR2BD52TF C 55
AF RR2BF05JQ U 31
AF RR2BF05TF C 80
AF RR2BD20TF C 179
BS 1 93 RR2EF89JQ
BS 94 94 RR2BD52JQ
BS 95 339 RR2EF89JQ
BS 340 340 RR2BD20JQ
BS 341 467 RR2EF89JQ
BS 468 657 RR2BD52JQ
BS 658 658 RR2BF05JQ
BS 659 872 RR2BD52JQ
BS 873 873 RR2BF05JQ

RD RR2EF89JQ 467 0 0
CAGATCAAAAGCTAGTTATAATTAATATAGTAGTAACCCGCATAAATTTAAATAATCTCC
AA*******AAGAAAAAGAAATACCAAGTGTAATAAAGGAAAGTACAATGAAAGAACCAC
AC**GAGAAGAAAATCAGTTGATGAGCTTTTGGTATCCTCTCTGTAAGATTTTTTTT*AT
TCTCTCTTAGATTTGGAGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCATGTACCTGTACATGTGT
GGACTACCTGGGACATAGATAGCAAGGACGAGTATGGTTGCATAGAAGAAGTCGAATGAG
AAGTTCAATGTGTTAGGCATCCTAACGCCGTACATCTCAAACGTCTTGATGTGTGGTAAG
GCAAGGTAGACAAGACCTACTTCACTGGTGATACCGGTCGGGTATAGCACTAAAAAGCTG
CTGTATCTGAGCCACAAGTGCCATGAAGGTGCAAAGCC*TAGAGCTT

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2BD20JQ 584 0 0
AAGCTAGTTATAATTAATATAGTAGTAACCCACATAAATTTAAATAATCTCCAAGGAACT
AAAGAAAAAGAAATACCAAGTGTAACAAAGGAAAGTACAATGAAAGAACCACACAAGAGA
AGAAAATCAGTTGATGAGCCTTTGGTATCCTCTCTGTAAGATTTTTTTTTATTCCCTCTT
AGATTTGGAGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCATGTACCTGTACATGTGTGGACTACC
TGGGACATAGATAGCAAGGACGAGTATGGTTGCATAGAAAAAGTCGAATGAGAAGTTCAA
TGTGTTAGGCATCCTAACGCTGTACATCTCAGACGTCTTGATGTGTGGTAAGGCAAGGTA
GACAAGACCTACTTCACTGGTGATACCGGTCGGGTATAGCACTAAAAAGCTGCTGTATCT
GAGCCACAAGTGCCATGAAGGTGCAAAGCCCTAGAGCTTCCTTGAAACCAAAGAAGGAGT
AGCGAATAATCCTCCCGTGATAGACCAGCTTATGACCAGCGAGGCAACAAGAAAATGTGA
TTGGACCTCTGGGAAGCTGTATAGGATGCCCCCAAGTGAGAAAC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2BD52JQ 867 0 0
CAA
AAGCTAGTTATAATTAATATAGTAGTAACCCGCATAAATTTAAATAATCTCCAA******
*AAGAAAAAGAAATACCAAGTGTAACAAAGGAAAGTACAATGAAAGAACCACAC**GAGA
AGAAAATCAGTTGATGAGCTTTTGGTATCCTCTCTGTAAGATTTTTTTT*ATTCTCTCTT
AGATTTGGAGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCATGTACCTGTACATGTGTGGACTACC
TGGGACATAGATAGCAAGGACGAGTATGGTTGCATAGAAGAAGTCGAATGAGAAGTTCAA
TGTGTTAGGCATCCTAACGCCGTACATCTCAAACGTCTTGATGTGTGGTAAGGCAAGGTA
GACAAGACCTACTTCACTGGTGATACCGGTCGGGTATAGCACTAAAAAGCTGCTGTATCT
GAGCCACAAGTGCCATGAAGGTGCAAAGCC*TAGAGCTTCCTTGAAACCAAAGAAGGAGT
AGCGAATAATCT**CCGTGATAGACCAGCTTATGACCAGCGAGGCAACAAGAAAATGTGA
TTGGACCTCTGGGAAGCTGTATAGGATGCCCC*AAGTGAGAAACAGCCTTGAGCCAATCT
GTGGCAGAGTTGCAGAAACAGGAGATCTGACCAAACCTACTAAACCATGGAGAATCTCGA
GAACAGCGGCAGTCTGAGCAAGCTGGAGAGGCTTCTCGACAGCATCATAGACATTTTCAT
GTCCCGTTTCCTTCAACGTCTTTACCGCAAAGTACAAAACCTGAGCCCATCCAGCAAAGA
CGACCCAGTTGTAGAGAGTGAGGTACACTCGACGAATAATGGAGAGAAACGACGCCATGG
AAAGTGGAGAATAGATTAGAGATC

QA 4 867 4 867
DS 

RD RR2BD52TF 818 0 0
ATCTCCAA*******AAGAAAAAGAAATACCAAGTGTAACAAAGGAAAGTACAATGAAAG
AACCACAC**GAGAAGAAAATCAGTTGATGAGCTTTTGGTATCCTCTCTGTAAGATTTTT
TTT*ATTCTCTCTTAGATTTGGAGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCATGTACCTGTAC
ATGTGTGGACTACCTGGGACATAGATAGCAAGGACGAGTATGGTTGCATAGAAGAAGTCG
AATGAGAAGTTCAATGTGTTAGGCATCCTAACGCCGTACATCTCAGACGTCTTGATGTGT
GGTAAGGCAAGGTAGACAAGACCTACTTCACTGGTGATACCGGTCGGGTATAGCACTAAA
AAGCTGCTGTATCTGAGCCACAAGTGCCATGAAGGTGCAAAGCC*TAGAGCTTCCTTGAA
ACCAAAGAAGGAGTAGCGAATAATCT**CCGTGATAGACCAGCTTATGACCAGCGAGGCA
ACAAGAAAATGTGATTGGACCTCTGGGAAGCTGTATAGGATGCCCC*AAGTGAGAAACAG
CCTTGAGCCAATCTGTGGCAGAGTTGCAGAAACAGGAGATCTGACCAAACCTACTAAACC
ATGGAGAATCTCGAGAACAGCGGCAGTCTGAGCAAGCTGGAGAGGCTTCTCGACAGCATC
ATAGACATTTTCATGTCCCGTTTCCTTCAACGTCTTTACCGCAAAGTACAAAACCTGAGC
CCATCCAGCAAAGACGACCCAGTTGTAGAGAGTGAGGTACACTCGACGAATAATGGAGAG
AAACGACGCCATGGAAAGTGGAGAATAGATTAGAGATC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2BF05JQ 843 0 0
TAGTAACCCGCATAAATTTAAATAATCTCCAA*******AAGAAAAAGAAATACCAAGTG
TAACAAAGGAAAGTACAATGAAAGAACCACAC**GAGAAGAAAATCAGTTGATGAGCTTT
TGGTATCCTCTCTGTAAGATTTTTTTT*ATTCTCTCTTAGATTTGGAGAGAGCTCTCTTA
CGCTGACCAAGCATGTACCTGTACATGTGTGGACTACCTGGGACATAGATAGCAAGGACG
AGTATGGTTGCATAGAAGAAGTCGAATGAGAAGTTCAATGTGTTAGGCATCCTAACGCCG
TACATCTCAGACGTCTTGATGTGTGGTAAGGCAAGGTAGACAAGACCTACTTCACTGGTG
ATACCGGTCGGGTATAGCACTAAAAAGCTGCTGTATCTGAGCCACAAGTGCCATGAAGGT
GCAAAGCC*TAGAGCTTCCTTGAAACCAAAGAAGGAGCAGCGAATAATCT**CCGTGATA
GACCAGCTTATGACCAGCGAGGCAACAAGAAAATGTGATTGGACCTCTGGGAAGCTGTAT
AGGATGCCCC*AAGTGAGAAACAGCCTTGAGCCAATCTGTGGCAGAGTTGCAGAAACAGG
AGATCTGACCAAACCTACTAAACCATGAAGAATCTCGAGAACAGCGGCAGTCTGAGCAAG
CTGGAGAGGCTTCTCGGCAGCATCATAGACATTTTCATGTCCCGTTTCCTTCAACGTCTT
TACCGCAAAGTACAAAACCTGAGCCCATCCAGCAAAGACGACCCAGTTGTAGAGAGTGAG
GTACACTCGACGAATAATGGAGAGAAACGACGCCATGGAAAGTGGAGAATAGATTAGAGA
TCC

QA 1 843 1 843
DS 

RD RR2BF05TF 794 0 0
AATACCAAGTGTAACAAAGGAAAGTACAATGAAAGAACCACAC**GAGAAGAAAATCAGT
TGATGAGCTTTTGGTATCCTCTCTGTAAGATTTTTTTT*ATTCTCTCTTAGATTTGGAGA
GAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCATGTACCTGTACATGTGTGGACTACCTGGGACATAGA
TAGCAAGGACGAGTATGGTTGCATAGAAGAAGTCGAATGAGAAGTTCAATGTGTTAGGCA
TCCTAACGCCGTACATCTCAGACGTCTTGATGTGTGGTAAGGCAAGGTAGACAAGACCTA
CTTCACTGGTGATACCGGTCGGGTATAGCACTAAAAAGCTGCTGTATCTGAGCCACAAGT
GCCATGAAGGTGCAAAGCC*TAGAGCTTCCTTGAAACCAAAGAAGGAGCAGCGAATAATC
T**CCGTGATAGACCAGCTTATGACCAGCGAGGCAACAAGAAAATGTGATTGGACCTCTG
GGAAGCTGTATAGGATGCCCC*AAGTGAGAAACAGCCTTGAGCCAATCTGTGGCAGAGTT
GCAGAAACAGGAGATCTGACCAAACCTACTAAACCATGAAGAATCTCGAGAACAGCGGCA
GTCTGAGCAAGCTGGAGAGGCTTCTCGGCAGCATCATAGACATTTTCATGTCCCGTTTCC
TTCAACGTCTTTACCGCAAAGTACAAAACCTGAGCCCATCCAGCAAAGACGACCCAGTTG
TAGAGAGTGAGGTACACTCGACGAATAATGGAGAGAAACGACGCCATGGAAAGTGGAGAA
TAGATTAGAGATCC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2BD20TF 695 0 0
ATTCCCTCTTAGATTTGGAGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCATGTACCTGTACATGT
GTGGACTACCTGGGACATAGATAGCAAGGACGAGTATGGTTGCATAGAAAAAGTCGAATG
AGAAGTTCAATGTGTTAGGCATCCTAACGCTGTACATCTCAGACGTCTTGATGTGTGGTA
AGGCAAGGTAGACAAGACCTACTTCACTGGTGATACCGGTCGGGTATAGCACTAAAAAGC
TGCTGTATCTGAGCCACAAGTGCCATGAAGGTGCAAAGCC*TAGAGCTTCCTTGAAACCA
AAGAAGGAGTAGCGAATAATCT**CCGTGATAGACCAGCTTATGACCAGCGAGGCAACAA
GAAAATGTGATTGGACCTCTGGGAAGCTGTATAGGATGCCCC*AAGTGAGAAACAGCCTT
GAGCCAATCTGTGGCAGAGTTGCAGAAACAGGAGATCTGACCAAACCTACTAATCCATGA
AGAATCTCGAGAACAGCGGCAGTCTGAGCAAGCTGGAGAGGCTTCTCGACAGCATCATAG
ACATTTTCATGTCCCGTTTCCTTCAACGTCTTTACCGAAAAGTACAAA*CCTGAGCCCAT
CCAGCAAAGACGACCCAGTTGTAGAGAGTGAGGTACACTCGACGAATAATGGAGAGAAAC
GACGCCATGGAAAGTGGAGAATAGATTAGAGATCC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 15

CO CL258Contig1 473 15 7 U
GGACCAATCAAAAACAAACAACAAAAACACAACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAG
ACAACAAGCAGAGCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATG
TGCTGATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCAGCTGGAGCGTCTGCGCAAACCGCGG
GACAGAAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCA
TGAACAAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTT*AAAATTAA
TCGTTGTGGTTTTAAATAAAAAAAATTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTCGCAGTTGT
TGTTGTTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTCAGGTGTATGTTTGGA
TGTTTATGTATTTAGTTTCCCGTTAATGAACATCTGAATCAAGCTCTTAGACC


BQ
55 65 65 65 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 70 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 55 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT02JQ C 4
AF RR2FT02TF U 4
AF RR2H873TF U 2
AF RR2AC07JQ C 1
AF RR2AC07TF U 1
AF RR2AZ36JQ C 1
AF RR2AZ36TFB U 293
AF RR2E027JQ C 1
AF RR2E840JQ C 1
AF RR2E840TF U 1
AF RR2E027TF U 1
AF RR2F491TF U 1
AF RR2FB73TF U 1
AF RR2H873JQ C 2
AF RR2CD56TF U 4
BS 1 152 RR2AC07TF
BS 153 153 RR2E840TF
BS 154 356 RR2AC07TF
BS 357 357 RR2AZ36TFB
BS 358 442 RR2AC07TF
BS 443 465 RR2AZ36TFB
BS 466 473 RR2F491TF

RD RR2FT02JQ 402 0 0
GG
AATCAAAAACAAACAACAAAAACACAACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAGACAAC
AAGCAGATCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATGTGCTG
ATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCAGCTGGAGCGTCTGCGCAAACCGCGGGACAG
AAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAACCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCATGAAC
AAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTT*AAAATTAATCGTT
GTGGTTTTAAATAAAAAAAATTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTCGCAGTTGTTGTTG
TTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTC

QA 3 402 3 402
DS 

RD RR2FT02TF 402 0 0
GG
AATCAAAAACAAACAACAAAAACACAACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAGACAAC
AAGCAGATCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATGTGCTG
ATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCAGCTGGAGCGTCTGCGCAAACCGCGGGACAG
AAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAACCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCATGAAC
AAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTT*AAAATTAATCGTT
GTGGTTTTAAATAAAAAAAATTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTCGCAGTTGTTGTTG
TTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTC

QA 3 402 3 402
DS 

RD RR2H873TF 402 0 0
GACCAATCAAAAACAAACAACAAAAACACAACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAGA
CAACAAGCAGAGCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATGT
GCTGATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCAGCTGGAGCGTCTGCGCAAACCGCGGG
ACAGAAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCAT
GAACAAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTT*AAAATTAAT
CGTTGTGGTTTTAAATAAAAAAAATTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTCGCAGTTGTT
GTTGTTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCT

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR2AC07JQ 443 0 0
GGACCAATCAAAAACAAACAACAAAAACACAACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAG
ACAACAAGCAGAGCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATG
TGCTGATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCTCAGCTGGAGCGTCTGCGCAAACCGCGG
GACAGAAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCA
TGAACAAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTT*AAAATTAA
TCGTTGTGGTTTTAAATAAAAAAAATTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTCGCAGCTGT
TGTTGTTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTCAGGTGTATGTTTGGA
TGTTTATGTATTTAGTTTCCCG
C

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR2AC07TF 443 0 0
GGACCAATCAAAAACAAACAACAAAAACACAACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAG
ACAACAAGCAGAGCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATG
TGCTGATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCTCAGCTGGAGCGTCTGCGCAAACCGCGG
GACAGAAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCA
TGAACAAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTT*AAAATTAA
TCGTTGTGGTTTTAAATAAAAAAAATTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTCGCAGCTGT
TGTTGTTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTCAGGTGTATGTTTGGA
TGTTTATGTATTTAGTTTCCCG
C

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR2AZ36JQ 465 0 0
GGACCAATCAAAAACAAACAACAAAA*CACAACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAG
ACAACAAGCAGAGCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATG
TGCTGATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCAGCTGGAGCGTCTGCGCAAACCGCGG
GACAGAAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCA
TGAACAAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTTTAAAATTAA
TCGTTGTGGTTTTAAATAAAAAAAATTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTCGCAGTTGT
TGTTGTTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTCAGGTGTATGTTTGGA
TGTTTATGTATTTAGTTTCCCGTTAATGAACATCTGAATCAAGCT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2AZ36TFB 173 0 0
AAAATTAATCGTTGTGGTTTTAAATAAAAAAAATTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTC
GCAGTTGTTGTTGTTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTCAGGTGTA
TGTTTGGATGTTTATGTATTTAGTTTCCCGTTAATGAACATCTGAATCAAGCT

QA 1 173 1 173
DS 

RD RR2E027JQ 467 0 0
GGACCAATCAAAAACAAACAACAAAAACACAACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAG
ACAACAAGCAGAGCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGCCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATG
TGCTGATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACTGCAGCTGGAGCGTTTGCGCAAACCGCGG
GACAGAAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCA
TGAACAAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTT*AAAATTAA
TCGTTGTGGTTTTAAATAAAAAAAATTGGGTGTTTTAATTGATTCTCATTTCGCAGTTGT
TGTTGTTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTCAGGTGTATGTTTGGA
TGTTTATGTATTTAGTTTCCCGTTAATGAACATCTGAATCAAGCT
AG

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2E840JQ 460 0 0
GGACCAATCAAAAACAAACAACAAAAACACGACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAG
ACAACAAGCAGAGCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATG
TGCTGATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCAGCTGGAGCGTCTGCGCAAACCGCGG
GACAGAAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCA
TGAACAAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTT*AAAATTAA
TCGTTGTGGTTTTAAATAAAAA***TTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTCGCAGTTGT
TGTTGTTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTCAGGTGTATGTTTGGA
TGTTTATGTATTTAGTTTCCCGTTAATGAACATCTGAA
CC

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2E840TF 460 0 0
GGACCAATCAAAAACAAACAACAAAAACACGACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAG
ACAACAAGCAGAGCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATG
TGCTGATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCAGCTGGAGCGTCTGCGCAAACCGCGG
GACAGAAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCA
TGAACAAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTT*AAAATTAA
TCGTTGTGGTTTTAAATAAAAA***TTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTCGCAGTTGT
TGTTGTTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTCAGGTGTATGTTTGGA
TGTT*ATGTATTTAGTTTCCCGTTAATGAACATCTGAA
CC

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2E027TF 467 0 0
GGACCAATCAAAAACAAACAACAAAAACACAACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAG
ACAACAAGCAGAGCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGCCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATG
TGCTGATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACTGCAGCTGGAGCGTCTGCGCAAACCGCGG
GACAGAAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCA
TGAACAAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTT*AAAATTAA
TCGTTGTGGTTTTAAATAAAAAAAATTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTCGCAGTTGT
TGTTGTTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTCAGGTGTATGTTTGGA
TGTTTATGTATTTAGTTTCCCGTTAATGAACATCTGAATCAAGCT
AG

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2F491TF 473 0 0
GGACCAATCAAAAACAAACAACAAAAACACAACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAG
ACAACAAGCAGAGCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATG
TGCTGATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCAGCTGGAGCGTCTGCGCAAACCGCGG
GACAGAAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCA
TGAACAAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTTTAAAATTAA
TCTTTGTGGTTTTAAATAAAAAAAATTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTCGCAGTTGT
TGTTGTTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTCAGGTGTATGTTTGGA
TGTTTATGTATTTAGTTTCCCGTTAATGAACATCTGAATCAAGCTCTTAGACC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2FB73TF 445 0 0
GGACCAATCAAAAACAAACAACAAAAACACAACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAG
ACAACAAGCAGAGCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATG
TGCTGATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCAGCTGGAGCGTCTGCGCAAACCGCGG
GACAGAAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCA
TGAACAAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTT**AAATTAA
TCGTTGTGGTTTTAAATAAAAAAAATTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTCGCAGTTGT
TGTTGTTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTCAGGTGTATGTTTGGA
TGTTTATGTATTTAGTTTCCCGTT
T

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR2H873JQ 472 0 0
GACCAATCAAAAACAAACAACAAAAACACAACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAGA
CAACAAGCAGAGCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATGT
GCTGATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCAGCTGGAGCGTCTGCGCAAACCGCGGG
ACAGAAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCAT
GAACAAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTT*AAAATTAAT
CGTTGTGGTTTTAAATAAAAAAAATTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTCGCAGTTGTT
GTTGTTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTCAGGTGTATGTTTGGAT
GTTTATGTATTTAGTTTCCCGTTAATGAACATCTGAATCAAGCT
CTTAGACC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2CD56TF 418 0 0
GG
AATCAAAAACAAACAACAAAAACACAACAAAATTCAATAAATAAACAAATGGCAGACAAC
AAGCAGAGCTTCCAAGCAGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGGGTAATGTGCTG
ATGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCAGCTGGAGCGTCTGCGCAAACCGCGGGACAG
AAGATAACGGAGGCGGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACCGGCATGAAC
AAGTAGCCCATAGGAAATAAAATTGGGACTTATAATTTCCCTTTTT*AAAATTAATCGTT
GTGGTTTTAAATAAAAAAAATTGGGTGTTCTAATTGATTCTCATTTCGCAGTTGTTGTTG
TTTTTACTTTTTAGTGTTTGAATTAATGTTTGCAACCTTCAGGTGTATGTTTGGAT

QA 3 418 3 418
DS 



AS 3 12

CO CL259Contig1 819 3 9 U
ATATTAAAACATAGAAACTGAACTTAAAACATTTGTCCAAACAAAATGTAATCATACGAT
GAACCATGTAGTATTCAACTGATACAACAAAAACGAAACAGAAAACTGCAGAAACTAGAT
TCTCAGTTGGACGACAACCACAAATCATCTCCATTCTTAATCGCTGGTGGCTGATATGAA
GGCACTTCCAGGCTGACGGTTAGCCAAGCGACCATGGTTCGACAGAAACTTAGCGTTGAC
ACCGTCAGGAACAATCCTCTTCACCTGTCTCAGCCTCGTGTAATCAGCACGGTTGAACTT
AGTGAACCCCCACTTCCTGCTAACAATAATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTTAGC
CCTCCTCAACGCCTCCTGCGCATGAGCCCCATGGTTATCCTTACACCTCACAGACAAAAG
CACCTGCCCGATCGCAACCCTAGCGCAAGTCCCCAGCGCCTTCCCGAACGCTCCCCTCAT
ACCGGTCTGAAGCCTATCAGCTCCGGCGCACGAAAGCATCTTGTTGATACGCAACACATG
GAAAGGATGAACCCTAATCCTCAGATGGAACGCGTCTTTCCCGGCGGATTTCACCATGTA
CTTGTTGCAGGCGATGCGAGCCGCCTCGAGGGCCTCGCTGGAGACGTTCTCCTTCTCCCA
GGAGACGAGGTGGACGCAGAAAGGGAACTCGTCGACTCCTTTCTTCTTCATCCCGACGTC
GTAGATCCGGATCTTCGGGTCGGGTACACCCCGGCAGTAGCGGGATTTCGGGTAGGGTTT
CCCCTTGATCTGACGGTAACATCTCGCAGGTCTTCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ44JQ U 1
AF RR2DH82JQ U 6
AF RR2AZ44TFB C 21
BS 1 100 RR2AZ44JQ
BS 101 101 RR2DH82JQ
BS 102 110 RR2AZ44JQ
BS 111 111 RR2DH82JQ
BS 112 117 RR2AZ44JQ
BS 118 118 RR2DH82JQ
BS 119 527 RR2AZ44JQ
BS 528 579 RR2DH82JQ
BS 580 819 RR2AZ44TFB

RD RR2AZ44JQ 527 0 0
ATATTAAAACATAGAAACTGAACTTAAAACATTTGTCCAAACAAAATGTAATCATACGAT
GAACCATGTAGTATTCAACTGATACAACAAAAACGAAACAAAAAACTGCAAAAACTAAAT
TCTCAGTTGGACGACAACCACAAATCATCTCCATTCTTAATCGCTGGTGGCTGATATGAA
GGCACTTCCAGGCTGACGGTTAGCCAAGCGACCATGGTTCGACAGAAACTTAGCGTTGAC
ACCGTCAGGAACAATCCTCTTCACCTGTCTCAGCCTCGTGTAATCAGCACGGTTGAACTT
AGTGAACCCCCACTTCCTGCTAACAATAATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTTAGC
CCTCCTCAACGCCTCCTGCGCATGAGCCCCATGGTTATCCTTACACCTCACAGACAAAAG
CACCTGCCCGATCGCAACCCTAGCGCAAGTCCCCAGCGCCTTCCCGAACGCTCCCCTCAT
ACCGGTCTGAAGCCTATCAGCTCCGGCGCACGAAAGCATCTTGTTGA

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2DH82JQ 574 0 0
AAAACATAGAAACTGAACTTAAAACATTTGTCCAAACAAAATGTAATCATACGATGAACC
ATGTAGTATTCAACTGATACAACAAAAACGAAACAGAAAACTGCAGAAACTAGATTCTCA
GTTGGACGACAACCACAAATCATCTCCATTCTTAATCGCTGGTGGCTGATATGAAGGCAC
TTCCAGGCTGACGGTTAGCCAAGCGACCATGGTTCGACAGAAACTTAGCGTTGACACCAT
CAGGAACAATCCTCTCCACCTGTCTCAGCCTCGTGTAATCAGCACGGTTGAACTTAGTGA
ACCCCCACTTCCTGCTAACAATAATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTTAGCCCTCC
TCAACGCCTCCTGCGCATGAGCCCCATGGTTATCCTTACACCTCACAGACAAAAGCACCT
GCCCGATCGCAACCCTAGCGCAAGTCCCCAGCGCCTTCCCGAACGCTCCCCTCATACCGG
TCTGGAGCCTATCGGCTCCGGCGCACGAAAGCATCTTGTTGATACGCAACACATGGAAAG
GATGAACCCTAATCCTCAGATGGAACGCGTCTTT

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2AZ44TFB 799 0 0
AACTTAAAACATTTGTCCAAACAAAATGTAATCATACGATGAACCATGTAGTATTCAACT
GATACAACAAAAACGAAACAGAAAACTGCAGAAACTAGATTCTCAGTTGGACGACAACCA
CAAATCATCTCCATTCTTAATCGCTGGTGGCTGATATGAAGGCACTTCCAGGCTGACGGT
TAGCCAAGCGACCATGGTTCGACAGAAACTTAGCGTTGACACCGTCAGGAACAATCCTCT
TCACCTGTCTCAGCCTCGTGTAATCAGCACGGTTGAACTTAGTGAACCCCCACTTCCTGC
TAACAATAATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTTAGCCCTCCTCAACGCCTCCTGCG
CATGAGCCCCATGGTTATCCTTACACCTCACAGACAAAAGCACCTGCCCGATCGCAACCC
TAGCGCAAGTCCCCAGCGCCTTCCCGAACGCTCCCCTCATACCGGTCTGAAGCCTATCAG
CTCCGGCGCACGAAAGCATCTTGTTGATACGCAGCACATGGAAAGGATGAACCCTAATCC
TCAGATGGAACGCGTCTTTCCCGGCGGATTTCACCATGTACTTGTTGCAGGCGATGCGAG
CCGCCTCGAGGGCCTCGCTGGAGACGTTCTCCTTCTCCCAGGAGACGAGGTGGACGCAGA
AAGGGAACTCGTCGACTCCTTTCTTCTTCATCCCGACGTCGTAGATCCGGATCTTCGGGT
CGGGTACACCCCGGCAGTAGCGGGATTTCGGGTAGGGTTTCCCCTTGATCTGACGGTAAC
ATCTCGCAGGTCTTCGTCC

QA 1 799 1 799
DS 



CO CL259Contig2 889 4 27 U
GAAACGAGAACTGGAAAAGGAACTTGATAAACTTTGAGGTATAAAAGAACATAATCCATA
AACTGAACTTAAAGCAATAGTCATAGCAAAATGAAACCATAATAGGATCCTTGTTACAAC
AAAAACAAAACAAAACAAAAAGATATTCAGAAACTAGATGATGATAGGTTCTACAACCAA
AAATCATCTCCATCCCTAATCGCTGGTGGCTGAAATGAAGGCGCTTCCAGGTTGACGGTT
AGCCAAACGACCATGGTTCGACAGAAACTTGGCATTGACACCATCAGGAACAATCCTCTT
CGACTGTCTCAACCTCGTGTAGTCAGCACGGTTGAACTTAGTGAATCCCCACTTCCTGCT
AACAATGATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTTAGCCCTCCTAAGAGCCTCCTGAGC
ATGAGCCCCATGGTTATCCTTACACCTCACAGACAAAAGCACCTGCCCAATCGCAACCCT
AGCGCAAGTCCCCAGCGCCTTCCCGAACGCACCTCTCATACCAGTCTGAAGCCTATCAGC
TCCAGCGCACGAAAGCATCTTGTTGATACGCAACACATGGAAAGGGTGAACCCTAATCCT
CAGATGGAAGGCGTCTTTCCCGGCGGATTTGACCATGTACTTGTTGCAGGCGATACGCGC
GGCCTCGAGGGCTTCGCTGGAGACGTTCTCCTTCTCCCAGGAGACGAGGTGGACGCAGAA
GGGGAACTCGTCGACTCCCTTTTTCTTCATCCCCACGTCGTAGATTCGGATCTTCGGGTC
GGGTACACCACGGCAGTAGCGGGATTTCGGGTAGGGTTTGCCCTTGATCTGGCGGTAACA
TCTCGCTGGTCTTCGTCCCATCTTGTTGGTTTGGTTTCGGCGGTAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD35JQ U 409
AF RR2D831JQ U 1
AF RR2FV69JQ U 65
AF RR2FV69TF C 213
BS 1 125 RR2D831JQ
BS 126 126 RR2FV69JQ
BS 127 172 RR2D831JQ
BS 173 173 RR2FV69JQ
BS 174 195 RR2D831JQ
BS 196 196 RR2FV69JQ
BS 197 270 RR2D831JQ
BS 271 271 RR2FV69JQ
BS 272 345 RR2D831JQ
BS 346 346 RR2FV69JQ
BS 347 351 RR2D831JQ
BS 352 352 RR2FV69JQ
BS 353 366 RR2D831JQ
BS 367 367 RR2FV69JQ
BS 368 483 RR2D831JQ
BS 484 484 RR2FV69JQ
BS 485 494 RR2D831JQ
BS 495 496 RR2FV69JQ
BS 497 501 RR2D831JQ
BS 502 502 RR2FV69JQ
BS 503 504 RR2D831JQ
BS 505 505 RR2FV69JQ
BS 506 588 RR2D831JQ
BS 589 589 RR2FV69JQ
BS 590 644 RR2D831JQ
BS 645 846 RR2FV69JQ
BS 847 889 RR2FV69TF

RD RR2FD35JQ 127 0 0
AGCCTCCTGAGCATGAGCCCCATGGTTATCCTTACACCTCACAGACAAAAGCACCTGCCC
AATCGCAACCCTAGCACAAGTCCCCAAAGCCTTACCAAACGCACCTCTCATACCAGTCTG
AAGCCTA

QA 1 127 1 127
DS 

RD RR2D831JQ 644 0 0
GAAACGAGAACTGGAAAAGGAACTTGATAAACTTTGAGGTATAAAAGAACATAATCCATA
AACTGAACTTAAAGCAATAGTCATAGCAAAATGAAACCATAATAGGATCCTTGTTACAAC
AAAAA*AAAACAAAACAAAAAGATATTCAGAAACTAGATGATGATAGGTTCTCCAACCAA
AAATCATCTCCATCCTTAATCGCTGGTGGCTGAAATGAAGGCGCTTCCAGGTTGACGGTT
AGCCAAACGACCATGGTTCGACAGAAACTTAGCATTGACACCATCAGGAACAATCCTCTT
CGACTGTCTCAACCTCGTGTAGTCAGCACGGTTGAACTTAGTGAAACCCCATTTCCTGCT
AACAATAATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTTAGCCCTCCTAAGAGCCTCCTGAGC
ATGAGCCCCATGGTTATCCTTACACCTCACAGACAAAAGCACCTGCCCAATCGCAACCCT
AGCACAAGTCCCCAAAGCCTTACCAAACGCACCTCTCATACCAGTCTGAAGCCTATCAGC
TCCAGCGCACGAAAGCATCTTGTTGATACGCAACACATGGAAAGGGTGGACCCTAATCCT
CAGATGGAAGGCGTCTTTCCCGGCGGATTTGACCATGTACTTGT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2FV69JQ 785 0 0
GAACTTAAAGCAATAGTCATAGCAAAATGAAACCATAATAGGATCCTTGTTGCAACAAAA
ACAAAACAAAACAAAAAGATATTCAGAAACTAGATGATGATAGGTTCTACAACCAAAAAT
CATCTCCATCCCTAATCGCTGGTGGCTGAAATGAAGGCGCTTCCAGGTTGACGGTTAGCC
AAACGACCATGGTTCGACAGAAACTTGGCATTGACACCATCAGGAACAATCCTCTTCGAC
TGTCTCAACCTCGTGTAGTCAGCACGGTTGAACTTAGTGAATCCCCACTTCCTGCTAACA
ATGATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTTAGCCCTCCTAAGAGCCTCCTGAGCATGA
GCCCCATGGTTATCCTTACACCTCACAGACAAAAGCACCTGCCCAATCGCAACCCTAGCG
CAAGTCCCCAGCGCCTTCCCGAACGCACCTCTCATACCAGTCTGAAGCCTATCAGCTCCA
GCGCACGAAAGCATCTTGTTGATACGCAACACATGGAAAGGGTGAACCCTAATCCTCAGA
TGGAAGGCGTCTTTCCCGGCGGATTTGACCATGTACTTGTTGCAGGCGATACGCGCGGCC
TCGAGGGCTTCGCTGGAGACGTTCTCCTTCTCCCAGGAGACGAGGTGGACGCAGAAGGGG
AACTCGTCGACTCCCTTTTTCTTCATCCCCACGTCGTAGATTCGGATCTTCGGGTCGGGT
ACACCACGGCAGTAGCGGGATTTCGGGTAGGGTTTGCCCTTGATCTGGCGGTAACATCTC
GC
TGG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2FV69TF 677 0 0
AAATGAAGGCGCTTCCAGGTTGACGGTTAGCCAAACGACCATGGTTCGACAGAAACTTGG
CATTGACACCATCAGGAACAATCCTCTTCGACTGTCTCAACCTCGTGTAGTCAGCACGGT
TGAACTTAGTGAATCCCCACTTCCTGCTAACAATGATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAA
ACTTAGCCCTCCTAAGAGCCTCCTGAGCATGAGCCCCATGGTTATCCTTACACCTCACAG
ACAAAAGCACCTGCCCAATCGCAACCCTAGCGCAAGTCCCCAGCGCCTTCCCGAACGCAC
CTCTCATACCAGTCTGAAGCCTATCAGCTCCAGCGCACGAAAGCATCTTGTTGATACGCA
ACACATGGAAAGGGTGAACCCTAATCCTCAGATGGAAGGCGTCTTTCCCGGCGGATTTGA
CCATGTACTTGTTGCAGGCGATACGCGCGGCCTCGAGGGCTTCGCTGGAGACGTTCTCCT
TCTCCCAGGAGACGAGGTGGACGCAGAAGGGGAACTCGTCGACTCCCTTTTTCTTCATCC
CCACGTCGTAGATTCGGATCTTCGGGTCGGGTACACCACGGCAGTAGCGGGATTTCGGGT
AGGGTTTGCCCTTGATCTGGCGGTAACATCTCGCTGGTCTTCGTCCCATCTTGTTGGTTT
GGTTTCGGCGGTAGTCC

QA 1 677 1 677
DS 



CO CL259Contig3 852 5 34 U
GAAATTTCTAGGGTTTTGCAACACAGAATCGCCGAACGAATCAAACCAACACCATGGGAC
GAAGACCTGCGAGATGCTACCGTCAGATCAAGGGGAAGCCCTACCCGAAATCCCGCTACT
GCCGCGGAGTCCCGGACCCCAAGATCCGAATCTACGACGTCGGGATGAAGAAGAAAGGAG
TCGACGAGTTCCCTTTCTGCGTCCACCTCGTCTCGTGGGAGAAAGAAAACGTCTCCAGCG
AGGCCCTCGAGGCGGCGCGTATCGCCTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCAGGGAAAG
ACGCCTTCCACCTGAGGATTAGGGTTCATCCTTTCCACGTGTTGCGTATCAACAAGATGC
TTTCGTGCGCCGGAGCTGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAGGTGCGTTTGGTAAGGCGC
TGGGGACTTGTGCTAGGGTTGCGATTGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATA
ACCATGGGGCTCATGCTCAGGAGGCGTTGAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGGCGTC
AGAAGATTATTGTTAGCAGGAAATGGGGTTTCACTAAGTTCAACCGTGCTGATTACACTA
GGCTGAGACAGGTTAAGAGGATTGTTCCTGATGGTGTCAATGCTAAGTTTCTGTCGAACC
ATGGTCCTTTGGCTAACCGTCAACCTGGAAGTGCGTTCATATCAGCAACCAGCGATTAAG
AATGAAAACGATTTGTGGTTGTAGTACCGATAATACTCTAGTTTCCGAAGCTATTCGTTT
TGTTTTTGTTGTAACAGTTGAAAACAAGATCCTTGTCTGGTTTCGTTTTGTTTGGACAAT
TGTTTTATGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 0 0 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 5 5 
5 25 25 25 25 25 0 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW10TF U 6
AF RR2CY42TF U 134
AF RR2E227TF U 1
AF RR2CY42JQ C 114
AF RR2E227JQ C 316
BS 1 44 RR2E227TF
BS 45 45 RR2CW10TF
BS 46 50 RR2E227TF
BS 51 51 RR2CW10TF
BS 52 76 RR2E227TF
BS 77 77 RR2CW10TF
BS 78 133 RR2E227TF
BS 134 134 RR2CW10TF
BS 135 226 RR2E227TF
BS 227 227 RR2CW10TF
BS 228 241 RR2E227TF
BS 242 242 RR2CW10TF
BS 243 292 RR2E227TF
BS 293 293 RR2CW10TF
BS 294 370 RR2E227TF
BS 371 371 RR2CW10TF
BS 372 403 RR2E227TF
BS 404 404 RR2CW10TF
BS 405 406 RR2E227TF
BS 407 407 RR2CW10TF
BS 408 414 RR2E227TF
BS 415 415 RR2CW10TF
BS 416 430 RR2E227TF
BS 431 431 RR2CW10TF
BS 432 716 RR2E227TF
BS 717 717 RR2CW10TF
BS 718 718 RR2E227TF
BS 719 721 RR2CY42JQ
BS 722 726 RR2E227TF
BS 727 727 RR2E227JQ
BS 728 763 RR2E227TF
BS 764 764 RR2CY42JQ
BS 765 786 RR2E227TF
BS 787 852 RR2E227JQ

RD RR2CW10TF 718 0 0
GG
CTAGGGTTTTGCAACACAGAATCGCCGAACGAATCCAACGC*CATCATGGGACGAAGACC
TGCGAGATGCTACCGTCAGATCAAGGGGAAGCCCTACCCGAAATCCCGCTACTGCCGCGG
AGTCCCGGACCCCAAGATCCGAATCTACGACGTCGGGATGAAGAAGAAAGGAGTCGACGA
GTTCCCTTTCTGCGTCCACCTCGCCTCGTGGGAGAAAGAAAACGTCTCCAGCGAGGCCCT
CGAGGCGGCGCGTATCGCCTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCAGGGAAAGACGCCTT
CCACCTGAGGATTAGGGTTCATCCTTTCCACGTGTTGCGTATCAACAAGATGCTTTCGTG
CGCCGGAGCTGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAGGTGCGTTTGGTAAGGCGCTGGGGAC
TTGTGCTAGGGTTGCGATTGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATAACCATGG
GGCTCATGCTCAGGAGGCGTTGAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGGCGTCAGAAGAT
TATTGTTAGCAGGAAATGGGGTTTCACTAAGTTCAACCGTGCTGATTACACTACGCTGAG
ACAGGTTAAGAGGATTGTTCCTGATGGTGTCAATGCTAAGTTTCTGTCGAACCATGGTCC
TTTGGCTAACCGTCAACCTGGAAGTGCGTTCATATCAGCAACCAGCGATTA
GAATG

QA 3 713 3 713
DS 

RD RR2CY42TF 540 0 0
G
GACCCCAAGATCCGAATCTACGACGTCGGGATGAAGAAGAAAGGAGTCGACGAGTTCCCT
TTCTGCGTCCACCTCGTCTCGTGGGAGAAAGAAAACGTCTCCAGCGAGGCCCTCGAGGCG
GCGCGTATCGCCTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCAGGGAAAGACGCCTTCCACCTG
AGGATTAGGGTTCATCCTTTCCACGTGTTGCGTATCAACAAGATGCTTTCGTGCGCCGGA
GCTGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAGGTGCGTTTGGTAAGGCGCTGGGGACTTGTGCT
AGGGTTGCGATTGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATAACCATGGGGCTCAT
GCTCAGGAGGCGTTGAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGGCGTCAGAAGATTATTGTT
AGCAGGAAATGGGGTTTCACTAAGTTCAACCGTGCTGATTACACTAGGCTGAGACAGGTT
AAGAGGATTGTTCCTGATGGTGTCAATGCTAAGTTTCTGTCGAACCATGGTCCTTTGGC

QA 2 540 2 540
DS 

RD RR2E227TF 795 0 0
GAAATTTCTAGGGTTTTGCAACACAGAATCGCCGAACGAATCAATCCAACGCCATGGGAC
GAAGACCTGCGAGATGTTACCGTCAGATCAAGGGGAAGCCCTACCCGAAATCCCGCTACT
GCCGCGGAGTCCCCGACCCCAAGATCCGAATCTACGACGTCGGGATGAAGAAGAAAGGAG
TCGACGAGTTCCCTTTCTGCGTCCACCTCGTCTCGTGGGAGAAAGAGAACGTCTCCAGCG
AAGCCCTCGAGGCGGCGCGTATCGCCTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCGGGGAAAG
ACGCCTTCCACCTGAGGATTAGGGTTCATCCTTTCCACGTGTTGCGTATCAACAAGATGC
TTTCGTGCGCTGGAGCTGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAGGGGCTTTTGGTAGGGCGC
TGGGGACTTGCGCTAGGGTTGCGATTGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATA
ACCATGGGGCTCATGCTCAGGAGGCGTTGAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGGCGTC
AGAAGATTATTGTTAGCAGGAAATGGGGTTTCACTAAGTTCAACCGTGCTGATTACACTA
GGCTGAGACAGGTTAAGAGGATTGTTCCTGATGGTGTCAATGCTAAGTTTCTGTCGAACC
ATGGTCCTTTGGCTAACCGTCAACCTGGAAGTGCGTTCATATCAGCAACCAGCGATAAG*
*ATGAA*ACGATTTGTGGTTGTAGTACCGATAATACTCTAGTT*CCGAAGCTATTCGTTT
TGTTTT
GTGTAACAG

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2CY42JQ 687 0 0
CGCTACTGCCGCGGAGTCCCGGACCCCAAGATCCGAATCTACGACGTCGGGATGAAGAAG
AAAGGAGTCGACGAGTTCCCTTTCTGCGTCCACCTCGTCTCGTGGGAGAAAGAAAACGTC
TCCAGCGAGGCCCTCGAGGCGGCGCGTATCGCCTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCA
GGGAAAGACGCCTTCCACCTGAGGATTAGGGTTCATCCTTTCCACGTGTTGCGTATCAAC
AAGATGCTTTCGTGCGCCGGAGCTGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAGGTGCGTTTGGT
AAGGCGCTGGGGACTTGTGCTAGGGTTGCGATTGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGT
AAGGATAACCATGGGGCTCATGCTCAGGAGGCGTTGAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCT
GGGCGTCAGAAGATTATTGTTAGCAGGAAATGGGGTTTCACTAAGTTCAACCGTGCTGAT
TACACTAGGCTGAGACAGGTTAAGAGGATTGTTCCTGATGGTGTCAATGCTAAGTTTCTG
TCGAACCATGGTCCTTTGGCTAACCGTCAACCTGGAAGTGCGTTCATATCAGCAACCAGC
GATTAAGAATGAATATGATTTGTGGTTGTAGTACCGATAATACTCTAGTTTCCGAAGTTA
TTCGTTTTGTTTT
TGTTGTAACAGTTG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2E227JQ 537 0 0
GGATTAGGGTTCATCCTTTCCACGTGTTGCGTATCAACAAGATGCTTTCGTGCGCTGGAG
CTGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAGGGGCTTTTGGTAGGGCGCTGGGGACTTGCGCTA
GGGTTGCGATTGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATAACCATGGGGCTCATG
CTCAGGAGGCGTTGAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGGCGTCAGAAGATTATTGTTA
GCAGGAAATGGGGTTTCACTAAGTTCAACCGTGCTGATTACACTAGGCTGAGACAGGTTA
AGAGGATTGTTCCTGATGGTGTCAATGCTAAGTTTCTGTCGAACCATGGTCCTTTGGCTA
ACCGTCAACCTGGAAGTGCGTTCATATCAGCAACCAGCGATTAAGAATGAAAACGATTTG
TGGTTGTAGTACCGATAATACTCTAGTTTCCGAAGCTATTCGTTTTGTTTTTGTTGTAAC
AGTTGAAAACAAGATCCTTGTCTGGTTTCGTTTTGTTTGGACAATTGTTTTATGGTC

QA 1 537 1 537
DS 



AS 4 13

CO CL260Contig1 1321 6 10 U
GGATTTTCTCACGTTTCTCTCTATTTCTTCTTCGTTCCTCGATCTTCTCCGTCGCCGATC
TCGCCACTTCATTCCCCGCGAGTTGATTTGGTACAAAGCGTTGAGAACAAAAAATGGTAG
GAGGAGGAGTTATCCAGCAGATTCTCAGGAGGAAGCTTCACTCCCCATCCCTCGCAACTC
CGGTCCGGTCGTGGTTTTCTTCGAAGACTGCTCATGTGGATGCTGGGTCTTCTGGTGTGA
GAGCATTTGCGCTCCTGGGTGCTGGTGTTACTGGGCTCTTGAGTTTTTCCACAGTAGCAT
CTGCTGATGAGGCCGAACACGGGTTGGCTTGTCCAGACTACCCTTGGCCTCATGATGGCA
TTCTCAGCTCATATGACCATGCTTCGATCCGTCGTGGGCATCAAGTTTATCAGCAGGTGT
GTGCATCTTGCCACTCGATGTCTCTCATCTCATACCGAGATTTGGTGGGTGTCGCCTACA
CAGAGGAAGAGGCAAAGGCAATGGCAGCTGAAATCGAGGTGGTTGATGGACCTAATGATG
AGGGTGAGATGTTCACCCGTCCTGGTAAACTCAGTGACCGCTTGCCTCAACCTTACGCCA
ATGAATCAGCGGCAAGGTTTGCTAATGGTGGAGCGTATCCTCCTGATCTCAGTCTTATCA
CTAAGGCACGTCACAACGGTCAAAACTACGTCTTTGCTCTCCTGACGGGTTACCGTGATC
CTCCTGCTGGCATTTCAATTAGAGAGGGGTTACACTACAATCCTTACTTCCCAGGGGGAG
CAATTGCTATGCCGAAAATGCTCAATGATGAAGCTGTTGAGTATGAAGATGGTGTCCCCG
CCACAGAGGCACAGATGGGTAAAGATGTTGTGTCATTCTTGTCTTGGGCAGCTGAACCAG
AAATGGAAGAGAGGAAGTTGATGGGTTTCAAATGGATATTCCTACTATCTCTCGCTCTCC
TCCAAGCAGCGTACTACAGGCGACTGAAATGGTCTGTTCTCAAGTCTCGCAAGCTGGTTC
TTGACGTGGTGAACTAAAATCACTGCGTAGTAAGCTTTTGCAGTTGGCTACTACACTGTC
CTCTTTTCAGCAAAAATCTCCATTTATGTCATAAAAATCTTTGATGGGACCATCCGTTTT
CTCGCCGGAAGGTGGAAAATCTCATCTTTCTTATTTTTTTTTT*ACTTCTGAGTATCTCT
AGGGAGTTTTATGAGGATAATAACGACAAAAAAATATTTCTGCCTCATAATCCAAACATG
ATTTTGTGGTTAATACACTTTGTTTCTTGTCCATGCCGATACGGTTCAGCTTTCGGGTTT
G


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2DO44TF U 1
AF RR2AP58TF U 1
AF RR2AP58JQ C 536
AF RR2DO44JQ C 536
AF RR2AM05JQ C 605
AF RR2AM05TF U 605
BS 1 10 RR2AP58TF
BS 11 11 RR2DO44TF
BS 12 478 RR2AP58TF
BS 479 479 RR2DO44TF
BS 480 811 RR2AP58TF
BS 812 812 RR2AM05TF
BS 813 868 RR2AP58TF
BS 869 869 RR2AM05TF
BS 870 895 RR2AP58TF
BS 896 1321 RR2AM05TF

RD RR2DO44TF 758 0 0
GGATTTTCTCACGTTTCTCTCTATTTCTTCTTCGTTCCTCGATCTTCTCCGTCGCCGATC
TCGCCACTTCATTCCCCGCGAGTTGATTTGGTACAAAGCGTTGAGAACAAAAAATGGTAG
GAGGAGGAGTTATCCAGCAGATTCTCAGGAGGAAGCTTCACTCCCCATCCCTCGCAACTC
CGGTCCGGTCGTGGTTTTCTTCGAAGACTGCTCATGTGGATGCTGGGTCTTCTGGTGTGA
GAGCATTTGCGCTCTTGGGTGCTGGTGTTACTGGGCTCTTGAGTTTTTCCACAGTAGCAT
CTGCTGATGAGGCCGAACACGGGTTGGCTTGTCCAGACTACCCTTGGCCTCATGATGGCA
TTCTCAGCTCATATGACCATGCTTCGATCCGTCGTGGGCATCAAGTTTATCAGCAGGTGT
GTGCATCTTGCCACTCGATGTCTCTCATCTCATACCGAGATTTGGTGGGTGTCGCCTACA
CAGAGGAAGAGGCAAAGGCAATGGCAGCTGAAATCGAGGTGGTTGATGGACCTAATGATG
AGGGTGAGATGTTCACCCGTCCTGGTAAACTCAGTGACCGCTTGCCTCAACCTTATGCCA
ATGAATCAGCGGCAAGGTTTGCTAATGGTGGAGCGTATCCTCCTGATCTCAGTCTTATCA
CTAAG*CACGTCACAACGGTCAAA*CTACGTCTTTGCTCTCCTGACGGGT*ACCGTGATC
CTCCTGCTGGCATTTCAATTAGAGAGGGGTTACACTAC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2AP58TF 895 0 0
GGATTTTCTCTCGTTTCTCTCTATTTCTTCTTCGTTCCTCGATCTTCTCCGTCGCCGATC
TCGCCACTTCATTCCCCGCGAGTTGATTTGGTACAAAGCGTTGAGAACAAAAAATGGTAG
GAGGAGGAGTTATCCAGCAGATTCTCAGGAGGAAGCTTCACTCCCCATCCCTCGCAACTC
CGGTCCGGTCGTGGTTTTCTTCGAAGACTGCTCATGTGGATGCTGGGTCTTCTGGTGTGA
GAGCATTTGCGCTCCTGGGTGCTGGTGTTACTGGGCTCTTGAGTTTTTCCACAGTAGCAT
CTGCTGATGAGGCCGAACACGGGTTGGCTTGTCCAGACTACCCTTGGCCTCATGATGGCA
TTCTCAGCTCATATGACCATGCTTCGATCCGTCGTGGGCATCAAGTTTATCAGCAGGTGT
GTGCATCTTGCCACTCGATGTCTCTCATCTCATACCGAGATTTGGTGGGTGTCGCCTATA
CAGAGGAAGAGGCAAAGGCAATGGCAGCTGAAATCGAGGTGGTTGATGGACCTAATGATG
AGGGTGAGATGTTCACCCGTCCTGGTAAACTCAGTGACCGCTTGCCTCAACCTTACGCCA
ATGAATCAGCGGCAAGGTTTGCTAATGGTGGAGCGTATCCTCCTGATCTCAGTCTTATCA
CTAAGGCACGTCACAACGGTCAAAACTACGTCTTTGCTCTCCTGACGGGTTACCGTGATC
CTCCTGCTGGCATTTCAATTAGAGAGGGGTTACACTACAATCCTTACTTCCCAGGGGGAG
CAATTGCTATGCCGAAAATGCTCAATGATGA*GCTGTTGAGTATGAAGATGGTGTCCCCG
CCACAGAGGCACAGATGGGTAAAGATGT*GTGTCATTCTTGTCTTGGGCAGCTGA

QA 1 895 1 895
DS 

RD RR2AP58JQ 786 0 0
TGATGAGGGTGAGATGTTCACCCGTCCTGGTAAACTCAGTGACCGCTTGCCTCAACCTTA
CGCCAATGAATCAGCGGCAAGGTTTGCTAATGGTGGAGCGTATCCTCCTGATCTCAGTCT
TATCACTAAGGCACGTCACAACGGTCAAAACTACGTCTTTGCTCTCCTGACGGGTTACCG
TGATCCTCCTGCTGGCATTTCAATTAGAGAGGGGTTACACTACAATCCTTACTTCCCAGG
GGGAGCAATTGCTATGCCGAAAATGCTCAATGATGAAGCTGTTGAGTATGAAGATGGTGT
CCCCGCCACAGAGGCACAGATGGGTAAAGATGTTGTGTCATTCTTGTCTTGGGCAGCTGA
ACCAGAAATGGAAGAGAGGAAGTTGATGGGTTTCAAATGGATATTCCTACTATCTCTCGC
TCTCCTCCAAGCAGCGTACTACAGGCGACTGAAATGGTCTGTTCTCAAGTCTCGCAAGCT
GGTTCTTGACGTGGTGAACTAAAATCACTGCGTAGTAAGCTTTTGCAGTTGGCTACTACA
CTGTCCTCTTTTCAGCAAAAATCTCCATTTATGTCATAAAAATCTTTGATGGGACCATCC
GTTTTCTCGCCGGAAGGTGGAAAATCTCATCTTTCTTATTTTTTTTTTTACTTCTGAGTA
TCTCTAGGGAGTTTTATGAGGATAATAACGACAAAAAAATATTTCTGCCTCATAATCCAA
ACATGATTTTGTGGTTAATACACTTTGTTTCTTGTCCATGCCGATACGGTTCAGCTTTCG
GGTTTG

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2DO44JQ 786 0 0
TGATGAGGGTGAGATGTTCACC*GTCCTGGTAAACTCAGTGACCGCTTGCCTCAACCTTA
TGCCAATGAATCAGCGGCAAGGTTTGCTAATGGTGGAGCGTATCCTCCTGATCTCAGTCT
TATCACTAAGGCACGTCACAACGGTCAAAACTACGTCTTTGCTCTCCTGACGGGTTACCG
TGATCCTCCTGCTGGCATTTCAATTAGAGAGGGGTTACACTACAATCCTTACTTCCCAGG
GGGAGCAATTGCTATGCCGAAAATGCTCAATGATGAAGCTGTTGAGTATGAAGATGGTGT
CCCCGCCACAGAGGCACAGATGGGTAAAGATGTTGTGTCATTCTTGTCTTGGGCAGCTGA
ACCAGAAATGGAAGAGAGGAAGTTGATGGGTTTCAAATGGATATTCCTACTATCTCTCGC
TCTCCTCCAAGCAGCGTACTACAGGCGACTGAAATGGTCTGTTCTCAAGTCTCGCAAGCT
GGTTCTTGACGTGGTGAACTAAAATCACTGCGTAGTAAGCTTTTGCAGTTGGCTACTACA
CTGTCCTCTTTTCAGCAAAAATCTCCATTTATGTCATAAAAATCTTTGATGGGACCATCC
GTTTTCTCGCCGGAAGGTGGAAAATCTCATCTTTCTTATTTTTTTTTTTACTTCTGAGTA
TCTCTAGGGAGTTTTATGAGGATAATAACGACAAAAAAATATTTCTGCCTCATAATCCAA
ACATGATTTTGTGGTTAATACACTTTGTTTCTTGTCCATGCCGATACGGTTCAGCTTTCG
GGTTTG

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2AM05JQ 717 0 0
GG
CAGCGGCAAGGTTTGCTAATGGTGGAGCGTATCCTCCTGATCTCAGTCTTATCACTAAGG
CACGTCACAACGGTCGAAACTACGTCTTTGCTCTCCTGACGGGTTACCGTGATCCTCCTG
CTGGCATTTCAATTAGAGAGGGGTTACACTACAATCCTTACTTCCCAGGGGGAGCAATTG
CTATGCCGAAAATGCTCAATGATGAAGCTGTTGAGTATGAAGATGGTGTCCCCGCCACAG
AGGCACAGATGGGTAAAGATGTTGTGTCATTCTTGTCTTGGGCAGCTGAACCAGAAATGG
AAGAGAGGAAGTTGATGGGTTTCAAATGGATATTCCTACTATCTCTCGCTCTCCTCCAAG
CAGCGTACTACAGGCGACTGAAATGGTCTGTTCTCAAGTCTCGCAAGCTGGTTCTTGACG
TGGTGAACTAAAATCACTGCGTAGTAAGCTTTTGCAGTTGGCTACTACACTGTCCTCTTT
TCAGCAAAAATCTCCATTTATGTCATAAAAATCTTTGATGGGACCATCCGTTTTCTCGCC
GGAAGGTGGAAAATCTCATCTTTCTTATTTTTTTTTT*ACTTCTGAGTATCTCTAGGGAG
TTTTATGAGGATAATAACGACAAAAAAATATTTCTGCCTCATAATCCAAACATGATTTTG
TGGTTAATACACTTTGTTTCTTGTCCATGCCGATACGGTTCAGCTTTCGGGTTTG

QA 3 717 3 717
DS 

RD RR2AM05TF 717 0 0
GG
CAGCGGCAAGGTTTGCTAATGGTGGAGCGTATCCTCCTGATCTCAGTCTTATCACTAAGG
CACGTCACAACGGTCGAAACTACGTCTTTGCTCTCCTGACGGGTTACCGTGATCCTCCTG
CTGGCATTTCAATTAGAGAGGGGTTACACTACAATCCTTACTTCCCAGGGGGAGCAATTG
CTATGCCGAAAATGCTCAATGATGAAGCTGTTGAGTATGAAGATGGTGTCCCCGCCACAG
AGGCACAGATGGGTAAAGATGTTGTGTCATTCTTGTCTTGGGCAGCTGAACCAGAAATGG
AAGAGAGGAAGTTGATGGGTTTCAAATGGATATTCCTACTATCTCTCGCTCTCCTCCAAG
CAGCGTACTACAGGCGACTGAAATGGTCTGTTCTCAAGTCTCGCAAGCTGGTTCTTGACG
TGGTGAACTAAAATCACTGCGTAGTAAGCTTTTGCAGTTGGCTACTACACTGTCCTCTTT
TCAGCAAAAATCTCCATTTATGTCATAAAAATCTTTGATGGGACCATCCGTTTTCTCGCC
GGAAGGTGGAAAATCTCATCTTTCTTATTTTTTTTTT*ACTTCTGAGTATCTCTAGGGAG
TTTTATGAGGATAATAACGACAAAAAAATATTTCTGCCTCATAATCCAAACATGATTTTG
TGGTTAATACACTTTGTTTCTTGTCCATGCCGATACGGTTCAGCTTTCGGGTTTG

QA 3 717 3 717
DS 



CO CL260Contig2 778 2 15 U
TACAAAGATGTATTCTTTATTGAAAACAAACCGGGAACGATGAACATTAGTAGTTTGAGA
GAGGAAACAAAACAAAATGTATAATCTTAAAATCATGTTTGATTACGAGGATCAAACTTT
TTTCGTTATTATCCTCATAAAACTCTCTAGAGTTACTCCAAGAAAAGAAAAACAAGAAAG
ATAGGTCTTTCCACCTTCAAAGATTTTTATGACACAGAAAAATGGAGATGCGTTATTACC
CTCAGAGAAATGGCTCTACTCCTTTTCTTTAAACATCCATTGCTGAAAAAACGACTGTGT
GGAGCCACTGCAAAAGCTTTACTACGCGGTGCTTCTTTAGTTCACCACGTCCAGAACCAG
CTTCCGGGACTTGAGAACCGACCATTTCAGTCGCCTGTAGTACGCTGCTTGGAGCAGAGC
CAGAGATAGTAGGAATATCCATTTGAAACCCATCAACTTCCTCTCTTCCATTTCTGGTTC
AGCTGCCCAAGACAAGAATGACACAACATCTTTACCCATCTGTGCCTCTGTGGCGGGGAC
ACCATCTTCATACTCAACAGCTTCATCATTAAGCATTTTCGGCATAGCAATTGCTCCCCC
AGGGAAATAAGGATTGTAATGTAACCCCTCCCTAATCGAAATGCCAGCAGGAGGATCACG
GTAACCCGTCAGAAGAGCAAAGACGTAGTTCTGACCGTTGTGACGTGCCTTAGTGATAAG
ACTTAGATCAGGAGGATACGCTCCACCATTAGCGAACCTTGCAGCTGATTCGTTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE39TF C 1
AF RR2EQ29JQ U 22
BS 1 21 RR2BE39TF
BS 22 34 RR2EQ29JQ
BS 35 35 RR2BE39TF
BS 36 150 RR2EQ29JQ
BS 151 151 RR2BE39TF
BS 152 489 RR2EQ29JQ
BS 490 490 RR2BE39TF
BS 491 501 RR2EQ29JQ
BS 502 502 RR2BE39TF
BS 503 618 RR2EQ29JQ
BS 619 619 RR2BE39TF
BS 620 738 RR2EQ29JQ
BS 739 739 RR2BE39TF
BS 740 765 RR2EQ29JQ
BS 766 778 RR2BE39TF

RD RR2BE39TF 778 0 0
TACAAAGATGTATTCTTTATTGAAAACAAACCGGGAACGATGAACATTAGTAGTTTGAGA
GAGGAAACAAAACAAAATGTATAATCTTAAAATCATGTTTGATTACGAGGATCAAACTTT
TTTCGTTATTATCCTCATAAAACTCTCTAGAGTTACTCCAAGAAAAGAAAAACAAGAAAG
ATAGGTCTTTCCACCTTCAAAGATTTTTATGACACAGAAAAATGGAGATGCGTTATTACC
CTCAGAGAAATGGCTCTACTCCTTTTCTTTAAACATCCATTGCTGAAAAAACGACTGTGT
GGAGCCACTGCAAAAGCTTTACTACGCGGTGCTTCTTTAGTTCACCACGTCCAGAACCAG
CTTCCGGGACTTGAGAACCGACCATTTCAGTCGCCTGTAGTACGCTGCTTGGAGCAGAGC
CAGAGATAGTAGGAATATCCATTTGAAACCCATCAACTTCCTCTCTTCCATTTCTGGTTC
AGCTGCCCAAGACAAGAATGACACAACATCTTTACCCATCTGTGCCTCTGTGGCGGGGAC
ACCATCTTCATACTCAACAGCTTCATCATTAAGCATTTTCGGCATAGCAATTGCTCCTCC
AGGGAAATAAGGATTGTAATGTAACCCTTCTCTTATCGAAATGCCAGCAGGAGGATCACG
GTAACCCGTCAGAAGAGCAAAGACGTAGTTCTGACCGTTGTGACGTGCCTTAGTGATAAG
ACTTAGATCAGGAGGATACGCTCCACCATTAGCGAACCTTGCAGCTGATTCGTTGGCC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2EQ29JQ 744 0 0
GAAAACAAACCGG*AACGATGAACATTAGTAGTTTGAGAGAGGAAACAAAACAAAATGTA
TAATCTTAAAATCATGTTTGATTACGAGGATCAAACTTTTTTCGTTATTATCCTCATAAA
ACTCTCTAGGGTTACTCCAAGAAAAGAAAAACAAGAAAGATAGGTCTTTCCACCTTCAAA
GATTTTTATGACACAGAAAAATGGAGATGCGTTATTACCCTCAGAGAAATGGCTCTACTC
CTTTTCTTTAAACATCCATTGCTGAAAAAACGACTGTGTGGAGCCACTGCAAAAGCTTTA
CTACGCGGTGCTTCTTTAGTTCACCACGTCCAGAACCAGCTTCCGGGACTTGAGAACCGA
CCATTTCAGTCGCCTGTAGTACGCTGCTTGGAGCAGAGCCAGAGATAGTAGGAATATCCA
TTTGAAACCCATCAACTTCCTCTCTTCCATTTCTGGTTCAGCTGCCCAGGACAAGAATGA
TACAACATCTTTACCCATCTGTGCCTCTGTGGCGGGGACACCATCTTCATACTCAACAGC
TTCATCATTAAGCATTTTCGGCATAGCAATTGCTCCCCCAGGGAAATAAGGATTGTAGTG
TAACCCCTCCCTAATCGAAATGCCAGCAGGAGGATCACGGTAACCCGTCAGAAGAGCAAA
GACGTAGTTCTGACCGTTGTGACGTGCCTTAGTGATAAGACTTAGATCAGGAGGATAGGC
TCCACCATTAGCGAACCTTGCAGC

QA 1 744 1 744
DS 



CO CL260Contig3 714 3 9 U
AAACCGAGTACAGATGATATTCTTTATTGAATAAACCGTGGTGTAACGGTCTGAGAGAAG
TAACAACACAAAATGTATATAGTAATCTCAAAAATCATGTTTGATTACGAGGCAACTTTT
TTTAATTTTCGTTATTATCCTCATAAAACTCCCAAATAGATACCTCAAAAGGAACATAAG
CTGAGGTCTTTCCACCTTCCCATCGAAGATTTTTATGTCACATAAAAAAAATGGAGATAT
GTTTTGCTGAAAAGAGGACTGTGTAGCCACTGCAAAAGCTTGCTAAGCAATGCTTTTAGT
TCACCACGTCGAGGACCAGCTTGCGGGACTTGAGAACGGACCATTTGAGTCGCCTGTAGT
ACGCTGCTTGGAGCAGAGCAAGAGATAGAAGGAATATCCATTTGAATCCCATCAATTTCC
TCTCTTCCATTTCTGGTTCAGCTGCCCAAGACAAGAATGACACAACATCTTTACCCATCT
GAGCCTCTGTGGCGGGGACACCATCTTCATACTCGACAGCTTCATCATTGAGCATTTTTG
GCATAGCAATTGCTCCCCCAGGGAAATAAGGATTGTAGTGTAGCCCCTCTCTAATTGAAA
TGCCAGCAGGAGGATCGCGGTAACCCGTCAGAAGAGCAAAGACGTAGTTTTGACCGTTGT
GACGTGCCTTGGTGATAAGACTAAGATCAGGAGGATACGCTCCACCATTAGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO68JQ U 1
AF RR2BV94JQ U 7
AF RR2CY33TF C 32
BS 1 54 RR2DO68JQ
BS 55 55 RR2BV94JQ
BS 56 59 RR2DO68JQ
BS 60 60 RR2BV94JQ
BS 61 129 RR2DO68JQ
BS 130 360 RR2BV94JQ
BS 361 361 RR2CY33TF
BS 362 373 RR2BV94JQ
BS 374 714 RR2CY33TF

RD RR2DO68JQ 129 0 0
AAACCGAGTACAGATGATATTCTTTATTGAATAAACCGTGGTGTAACGGTCTGAAAGAAA
TAACAACACAAAATGTATATAGTAATCTCAAAAATCATGTTTGATTACGAGGCAACTTTT
TTTAATTTT

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR2BV94JQ 367 0 0
G
GTACAGATGATATTCTTTATTGAATAAACCGTGGTGTAACGGTCTGAGAGAAGTAACAAC
ACAAAATGTATATAGTAATCTCAAAAATCATGTTTGATTACGAGGCAACTTTTTTTAATT
TTCGTTATTATCCTCATAAAACTCCCAAATAGATACCTCAAAAGGAACATAAGCTGAGGT
CTTTCCACCTTCCCATCGAAGATTTTTATGTCACATAAAAAAAATGGAGATATGTTTTGC
TGAAAAGAGGACTGTGTAGCCACTGCAAAAGCTTGCTAAGCAATGCTTTTAGTTCACCAC
GTCGAGGACCAGCTTGCGGGACTTGAGAACGGACCATTTGAGTCGCCTGTAGTGCGCTGC
TTGGAG

QA 2 367 2 367
DS 

RD RR2CY33TF 683 0 0
TAAACCGTGGTGTAACGGTCTGAGAGAAGTAACAACACAAAATGTATATAGTAATCTCAA
AAATCATGTTTGATTACGAGGCAACTTTTTTTAATTTTCGTTATTATCCTCATAAAACTC
CCAAATAGATACCTCAAAAGGAACATAAGCTGAGGTCTTTCCACCTTCCCATCGAAGATT
TTTATGTCACATAAAAAAAATGGAGATATGTTTTGCTGAAAAGAGGACTGTGTAGCCACT
GCAAAAGCTTGCTAAGCAATGCTTTTAGTTCACCACGTCGAGGACCAGCTTGCGGGACTT
GAGAACGGACCATTTGAGTCGCCTGTAGTACGCTGCTTGGAGCAGAGCAAGAGATAGAAG
GAATATCCATTTGAATCCCATCAATTTCCTCTCTTCCATTTCTGGTTCAGCTGCCCAAGA
CAAGAATGACACAACATCTTTACCCATCTGAGCCTCTGTGGCGGGGACACCATCTTCATA
CTCGACAGCTTCATCATTGAGCATTTTTGGCATAGCAATTGCTCCCCCAGGGAAATAAGG
ATTGTAGTGTAGCCCCTCTCTAATTGAAATGCCAGCAGGAGGATCGCGGTAACCCGTCAG
AAGAGCAAAGACGTAGTTTTGACCGTTGTGACGTGCCTTGGTGATAAGACTAAGATCAGG
AGGATACGCTCCACCATTAGCAC

QA 1 683 1 683
DS 



CO CL260Contig4 840 2 6 U
GGCGGAACTCCCATTTTCTCTCGTTTTATCTTTTACTTCTTCTTCTTCGTCCCCTCGGTC
GTCTCCGTCGCCGATCTCGTCACTTCATTTGCCGCGAGTTGATTTGGTACAAAGCGTCGT
TAAATCAAATGGTTGGAGGAGGAGTTATCCAGCAAATTCTCAGGAGGAAGCTTCACTCCC
AATCAGTCGCAACTCCGCTCCTGTCATGGTTTTCTTCTAAGAAAGCTCATGTGGACGCTG
GTTCTTCTGGCGTAAGAGCATTTGCTCTCTTGGGTGCTGGTGTTACAGGGCTGTTGAGTT
TTTCTACGGTAGCCTCTGCTGATGAGGCCGAACATGGACTTGCCTGTCCTGACTACCCCT
GGCCTCATGATGGCATTCTCAGCTCATATGACCATGCTTCGATCCGTCGTGGGCATCAAG
TTTATCAGCAAGTCTGTGCATCTTGCCATTCAATGTCTCTCATCTCATACCGTGATTTGG
TGGGTGTCGCTTACACAGAGGAAGAGGCAAAGGCAATGGCAGCTGAAATCGAGGTTGTTG
ATGGACCAAATGATGAGGGTGAGATGTTCACTCGTCCTGGTAAACTCAGTGACCGCTTGC
CTCAACCATATGCCAACGAATCAGCTGCAAGGTTCGCTAATGGTGGAGCCTATCCTCCTG
ATCTAAGTCTTATCACTAAGGCACGTCACAACGGTCAGAACTACGTCTTTGCTCTTCTGA
CGGGTTACCGTGATCCTCCTGCTGGCATTTCGATAAGGGGGGGGTTACACTACAATCCTT
ATTTCCCTGGGGGAGCAATTGCTATGCCGAAATGCTTAATGATGAAGCTGTTGAGTATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ29TF U 1
AF RR2AL20TF U 79
BS 1 205 RR2EQ29TF
BS 206 206 RR2AL20TF
BS 207 496 RR2EQ29TF
BS 497 497 RR2AL20TF
BS 498 625 RR2EQ29TF
BS 626 840 RR2AL20TF

RD RR2EQ29TF 626 0 0
GGCGGAACTCCCATTTTCTCTCGTTTTATCTTTTACTTCTTCTTCTTCGTCCCCTCGGTC
GTCTCCGTCGCCGATCTCGTCACTTCATTTGCCGCGAGTTGATTTGGTACAAAGCGTCGT
TAAATCAAATGGTTGGAGGAGGAGTTATCCAGCAAATTCTCAGGAGGAAGCTTCACTCCC
AATCAGTCGCAACTCCGCTCCTGTCGTGGTTTTCTTCTAAGAAAGCTCATGTGGACGCTG
GTTCTTCTGGCGTAAGAGCATTTGCTCTCTTGGGTGCTGGTGTTACAGGGCTGTTGAGTT
TTTCTACGGTAGCCTCTGCTGATGAGGCCGAACATGGACTTGCCTGTCCTGACTACCCCT
GGCCTCATGATGGCATTCTCAGCTCATATGACCATGCTTCGATCCGTCGTGGGCATCAAG
TTTATCAGCAAGTCTGTGCATCTTGCCATTCAATGTCTCTCATCTCATACCGTGATTTGG
TGGGTGTCGCTTACACTGAGGAAGAGGCAAAGGCAATGGCAGCTGAAATCGAGGTTGTTG
ATGGACCAAATGATGAGGGTGAGATGTTCACTCGTCCTGGTAAACTCAGTGACCGCTTGC
CTCAACCATATGCCAACGAATCAGC
T

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2AL20TF 762 0 0
GT
CACTTCATTTGCCGCGAGTTGATTTGGTACAAAGCGTCGTTAAATCAAATGGTTGGAGGA
GGAGTTATCCAGCAAATTCTCAGGAGGAAGCTTCACTCCCAATCAGTCGCAACTCCGCTC
CTGTCATGGTTTTCTTCTAAGAAAGCTCATGTGGACGCTGGTTCTTCTGGCGTAAGAGCA
TTTGCTCTCTTGGGTGCTGGTGTTACAGGGCTGTTGAGTTTTTCTACGGTAGCCTCTGCT
GATGAGGCCGAACATGGACTTGCCTGTCCTGACTACCCCTGGCCTCATGATGGCATTCTC
AGCTCATATGACCATGCTTCGATCCGTCGTGGGCATCAAGTTTATCAGCAAGTCTGTGCA
TCTTGCCATTCAATGTCTCTCATCTCATACCGTGATTTGGTGGGTGTCGCTTACACAGAG
GAAGAGGCAAAGGCAATGGCAGCTGAAATCGAGGTTGTTGATGGACCAAATGATGAGGGT
GAGATGTTCACTCGTCCTGGTAAACTCAGTGACCGCTTGCCTCAACCATATGCCAACGAA
TCAGCTGCAAGGTTCGCTAATGGTGGAGCCTATCCTCCTGATCTAAGTCTTATCACTAAG
GCACGTCACAACGGTCAGAACTACGTCTTTGCTCTTCTGACGGGTTACCGTGATCCTCCT
GCTGGCATTTCGATAAGGGGGGGGTTACACTACAATCCTTATTTCCCTGGGGGAGCAATT
GCTATGCCGAAATGCTTAATGATGAAGCTGTTGAGTATGA

QA 3 762 3 762
DS 



AS 1 14

CO CL261Contig1 593 14 7 U
GGATATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGTGGAC
GATCAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCA
AACGTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTA
TGCTATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGAC
TATTGGTCATTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAG
GTTTGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATG
ATAATAACAATTAATGCCATTACCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTAT
TATCCTACATGTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAATGTTCTGTTTCTGCTCAA
AAAA*CAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAAAAA**CTGCCATATTTC
ATGTTGATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTCAC


BQ
50 50 50 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 50 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 65 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 50 35 10 

AF RR2BP79JQ C 4
AF RR2DG43JQ C 71
AF RR2BP79TF U 4
AF RR2BP21TF U 71
AF RR2BA66JQ C 1
AF RR2BN38TF U 1
AF RR2FI20TF U 1
AF RR2BA66TF U 1
AF RR2CU48TF U 1
AF RR2DG51TF U 1
AF RR2EL13TF U 1
AF RR2H931TF U 1
AF RR2CJ44JQ C 3
AF RR2CJ44TF U 3
BS 1 4 RR2BN38TF
BS 5 457 RR2BP79TF
BS 458 458 RR2BN38TF
BS 459 476 RR2BP79TF
BS 477 591 RR2BN38TF
BS 592 592 RR2CU48TF
BS 593 593 RR2CJ44JQ

RD RR2BP79JQ 475 0 0
GATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGTGGACGAT
CAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCAAAC
GTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTATGC
TATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGACTAT
TGGTCATTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAGGTT
TGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATGATA
ATAACAATTAATGCCATTACCCTTTCGAGTTTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTATTAT
CCTACATGTTTTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAGACAATGTTCTGTTTCTGC
CC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2DG43JQ 374 0 0
TTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCAAACGTTACCT
TCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTATGCTATTCCC
AACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGACTATTGGTCAT
TCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTATTGAGAGGTTTGCCTTC
GCTCCCGACTTCCCTCCGACTTTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATGATAATAACAA
TTAATGCCATTACCCTTTCGAGTTTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTATTATCCTACAT
GTTTTAGGTCA
AAA

QA 1 371 1 371
DS 

RD RR2BP79TF 475 0 0
GATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGTGGACGAT
CAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCAAAC
GTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTATGC
TATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGACTAT
TGGTCATTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAGGTT
TGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATGATA
ATAACAATTAATGCCATTACCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTATTAT
CCTACATGTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAGACAATGTTCTGTTTCTGC
CC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2BP21TF 434 0 0
TTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCAAACGTTACCT
TCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTATGCTATTCCC
AACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGACTATTGGTCAT
CCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAGGTTTGCCTTC
GCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATGATAATAACAA
TTAATGCCATTACCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTATTATCCTACAT
GTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAATGTTCTGTTTCTGCTCAAAAAA*CAACT
TTTAACTGCCATAT

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR2BA66JQ 592 0 0
GGATATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGTGGAC
GATCAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCA
AACGTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTA
TGCTATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGAC
TATTGGTCATTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAG
GTTTGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATG
ATAATAACAATTAATGCCATTACCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTAT
TATCCTACATGTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAATGTTCTGTTTCTGCTCAA
AAAAACAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAAAAAAACTGCCATATTTC
ATGTTGATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTC
T

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2BN38TF 591 0 0
GGATATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGTGGAC
GATCAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCA
AACGTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTA
TGCTATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGAC
TATTGGTCATTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTACAGATTGTATTACTGAGAG
GTTTGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATG
ATAATAACAATTAATGCCATTACCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTAT
TATTCTACATGTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAATGTTCTGTTTCTGCTCAA
AAAA*CAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAAAAA**CTGCCATATTTC
ATGTTGATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2FI20TF 589 0 0
GGATATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGTGGAC
GATCAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCA
AACGTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTA
TGCTATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGAC
TATTGGTCATTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAG
GTTTGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATG
ATAATAACAATTAATGCCATTACCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTAT
TATCCTACATGTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAATGTTCTGTTTCTGCTCAA
AAAA*CAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAAAAAAACTGCCATATTTC
ATGTTGATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2BA66TF 592 0 0
GGATATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGTGGAC
GATCAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCA
AACGTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTA
TGCTATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGAC
TATTGGTCATTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAG
GTTTGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATG
ATAATAACAATTAATGCCATTACCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTAT
TATCCTACATGTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAATGTTCTGTTTCTGCTCAA
AAAAACAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAAAAAAACTGCCATATTTC
ATGTTGATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTC
T

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2CU48TF 593 0 0
GGATATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGTGGAC
GATCAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCA
AACGTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTA
TGCTATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGAC
TATTGGTCATTCTTGTTGTCGTGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAG
GTTTGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATG
ATAATAACAATTAATGCCATTACTCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAATTTATTGTTAT
TATCCTACATGTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAATGTTCTGTTTCTGCTCAA
AAAA*CAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAAAAAA*CTGCCATATTTC
ATGTTGATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTCA
T

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2DG51TF 592 0 0
GGATATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATTTGGAC
GATCAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCA
AACGTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTA
TGCTATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGAC
TATTGGTCATTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAG
GTTTGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATG
ATAATAACAATTAATGCCATTACCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTAT
TATCCTACATGTTCTAAGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAATGTTCTGTTTCTGCTCAA
AAAA*CAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAAAAA**CTGCCATATTTC
ATGTTGGTGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTCA

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2EL13TF 592 0 0
GGATATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGTGGAC
GATCAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCA
AACGTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTA
TGCTATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGAC
TATTGGTCATTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAG
GTTTGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATG
ATAATAACAATTAATGCCATTACCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTAT
TATCCTACATGTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAATGTTCTGTTTCTGCTCAA
AAAA*CAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAAAAA**CTGCCATATTTC
ATGTTGATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTCA

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2H931TF 590 0 0
GGATATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGTGGAC
GATCAACAAGTTTTTCTTCCTT**TCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCA
AACGTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTA
TGCTATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGAC
TATTGGTCATTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAG
GTTTGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATG
ATAATAACAATTAATGCCATTACCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTAT
TATCCTACATGTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAATGTTCTGTTTCTGCTCAA
AAAA*CAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAAAAA**CTGCCATATTTC
ATGTTGATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTT

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2CJ44JQ 591 0 0
G
GATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTTTAATAAAAAATGTGGACGAT
CAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCAAAC
GTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTATGC
TATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGACTAT
TGGTCATTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGGGGTT
TGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATGATA
ATAACAATTAATGCCATTACCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTATTAT
CCTACATGTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAATGTTCTGTTTCTGCTCAAAAA
AACAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAAAA***CTGCCATATTTCATG
TTGATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTCAC

QA 2 591 2 591
DS 

RD RR2CJ44TF 591 0 0
G
GATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGTGGACGAT
CAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCAAAC
GTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACAGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTATGC
TATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGACTAT
TGGTCATTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGGGGTT
TGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATGATA
ATAACAATTAATGCCATTACCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTATTAT
CCTACATGTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAATGTTCTGTTTCTGCTCAAAAA
AACAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAAAA***CTGCCATATTTCATG
TTGATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTCA
C

QA 2 590 2 590
DS 



AS 1 15

CO CL262Contig1 720 15 8 U
GGATACACAAATACTTCTAATAATAATTGAGTTTGTTAAGTTAGAAAATGGGATTGACTG
GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAACTCTAGAAGCTTCTATTATATATT
TATATATAAGGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAA
TAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTTATGATTCCGAAGTCTGAGTATTGGAGA
TACACTGCGTGTCTTTGAATATACGTATATGCATGATATCTATGTAGTACATTTTATTAA


BQ
50 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 45 75 
75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 35 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 45 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 80 80 80 80 80 45 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 45 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A389JQ C 20
AF RR2DU43TF U 1
AF RR2A389TF U 1
AF RR2AE52JQ C 1
AF RR2AE52TF U 1
AF RR2DU43JQ C 131
AF RR2CB36JQ C 0
AF RR2CB36TF U 0
AF RR2ED57TF U 1
AF RR2BZ65TF U 1
AF RR2ED57JQ C 1
AF RR2BZ65JQ C 285
AF RR2B009TF U 1
AF RR2CR39TF U -1
AF RR2CR39JQ C 38
BS 1 465 RR2A389TF
BS 466 466 RR2AE52TF
BS 467 522 RR2A389TF
BS 523 523 RR2AE52TF
BS 524 638 RR2A389TF
BS 639 666 RR2B009TF
BS 667 667 RR2CR39TF
BS 668 720 RR2B009TF

RD RR2A389JQ 377 0 0
ATAATAATTGAGTTTGTTAAGTTAGAAAATGGGATTGACTGGTGTTCTTCATGTGGAGGT
TGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTTTGGGTAGCACTCGGTGACGGTATCAATCTCTT
TCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTCTTGCCGGAGATGGCAACTT
TCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCACGCTGGTGAAGGTTTCGGC
GGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGACGTACAGCATCATCGGCGG
TGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCACCGTTACTCCCAAGGGCGG
GGGCAGCATTTTGAAAT

QA 1 377 1 377
DS 

RD RR2DU43TF 587 0 0
GGATACACAAATACTTCTAATAATAATTGAGTTTGTTAAGTTAGAAAATGGGATTGACTG
GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAACTCTAGAAGCTTCTATTATATATT
TATATATAAGGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAA

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2A389TF 638 0 0
GGATACACAAATACTTCTAATAATAATTGAGTTTGTTAAGTTAGAAAATGGGATTGACTG
GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCATGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAACTCTAGTAGCTTCTATTATATATT
TATATATAAGGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAA
TAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTTATGAT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2AE52JQ 636 0 0
GGATACACAAATACTTCTAATAATAATTGAGTTTGTTAAGTTAGAAAATGGGATTGA*TG
GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTTTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCATCGTCTAAACTCTAGAAGCTTCTATTATATATT
TATATATAAGGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAA
TAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTTATG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2AE52TF 636 0 0
GGATACACAAATACTTCTAATAATAATTGAGTTTGTTAAGTTAGAAAATGGGATTGA*TG
GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCATCGTCTAAACTCTAGAAGCTTCTATTATATATT
TATATATAAGGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAA
TAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTTATG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2DU43JQ 512 0 0
CAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTCTTGCCGGAGA
TGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCACGCTGGTGAA
GGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGACGTACAGCAT
CATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCACCGTTACTCC
CAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTTTGCTGAGTTTGAGAAGACCGGCCATGAGAT
TGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGATCGATGAGTA
TCTCCTTAAGCAATCCAGCGTTTAAACTCTAGAAGCTTTTATTATATATTTATATATAAG
GGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAGGAAGTTAAATAAAGTGGAA
CCTCCTTATGAATAATTATGTTTATGATTCCG

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2CB36JQ 621 0 0
GGC
ATACACAAATACTTCTAATAATAATTGAGTTTGTTAAGTTAGAAAATGGGATTGACTGGT
GTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCGGT
GACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTCTT
GCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCACG
CTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGACG
TACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCACC
GTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCGGC
CATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGATC
GATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAACTCTAGAAGCTTCTATTATATATTTA
TATATAAGGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAATA
AAGTGGAATCTCCTTATG

QA 4 621 4 621
DS 

RD RR2CB36TF 633 0 0
GGC
ATACACAAATACTTCTAATAATAATTGAGTTTGTTAAGTTAGAAAATGGGATTGACTGGT
GTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCGGT
GACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTCTT
GCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCACG
CTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGACG
TACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCACC
GTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCGGC
CATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGATC
GATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAACTCTAGAAGCTTCTATTATATATTTA
TATATAAGGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAATA
AAGTGGAATCTCCTTATGAATAA
AAAAAAA

QA 4 626 4 626
DS 

RD RR2ED57TF 643 0 0
GGATACACAAATACTTCTAATAATAATTGAGTTTGTTAAGTTAGAAAATGGGATTGACTG
GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAACTCTAGAAGCTTCTATTATATATT
TATATATAAGGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTATTATTGTCTAATTAAGAAGTTAAA
TAAAGTGGAACCTCCTTATGAATA*TTATGTTTATGA
AAAAAA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2BZ65TF 640 0 0
GGATACACAAATACTTCTAATAATAATTGAGTTTGTTAAGTTAGAAAATGGGATTGACTG
GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCATGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAACTCTAGTAGCTTCTATTATATATT
TATATATAAGGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAA
TAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTTATGAT
AA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2ED57JQ 636 0 0
GGATACACAAATACTTCTAATAATAATTGAGTTTGTTAAGTTAGAAAATGGGATTGACTG
GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAACTCTAGAAGCTTCTATTATATATT
TATATATAAGGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTATTATTGTCTAATTAAGAAGTTAAA
TAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTTATG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2BZ65JQ 354 0 0
GAAAACAAAAGCATGACGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACG
TTCAAAGGAACCATCACCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTTTGCT
GAGTTTGAGAAGACCGGCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTC
ATGAACTTCAAAGAGATCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTTTAAACTCTAGTA
GCTTTTATTATATATTTATATATAAGGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTC
TAATTAAGAAGTTAAATAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTTATGAT

QA 1 354 1 354
DS 

RD RR2B009TF 720 0 0
GGATACACAAATACTTCTAATAATAATTGAGTTTGTTAAGTTAGAAAATGGGATTGACTG
GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAACTCTAGAAGCTTCTATTATATATT
TATATATAAGGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAA
TAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTTATGATTCCGAAGTCTGAGTATTGGAGA
TACACTACGTGTCTTTGAATATACGTATATGCATGATATCTATGTAGTACATTTTATTAA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2CR39TF 688 0 0
GGT
GATACACAAATACTTCTAATAATAATTGAGTTTGTTAAGTTAGAAAATGGGATTGACCGG
TGTTCCTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCGG
TGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTCT
TGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCAC
GCTGGTGAAGGTCTCGG*GGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGAC
GTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCAC
CGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCGG
CCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGAT
CGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAACTCTAGAAGCTTCTATTATATATTT
ATATATAAGGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAAT
AAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTTATGATTCCGAAGTCTGAGTATTGGAGAT
ACACTGCGTGTCTTTGAA
AAAAAAA

QA 4 681 4 681
DS 

RD RR2CR39JQ 640 0 0
AAGTTAGAAAATGGGATTGACCGGTGTTCCTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGC
AGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCGGTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAA
GGACTACAAAACAATGCAAGTTCTTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCT
CATTATTTATGGAGAAGGATCCACGCTGGTGAAGGTCTCGG*GGAAAGAATCGAAGCAGT
GGATTTGGAAAACAAAAGCATGACGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTA
TAAGACGTTCAAAGGAACCATCACCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATG
GTTTGCTGAGTTTGAGAAGACCGGCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTT
TGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGATCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTTTAAAC
TCTAGAAGCTTTTATTATATATTTATATATAAGGGGCTTCCATCATCTCTATCAGTTTAT
TGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAATAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTTATGA
TTCCGAAGTTTGAGTATTGGAGATACACTGCGTGTCTTTG

QA 1 640 1 640
DS 



AS 2 10

CO CL263Contig1 903 5 16 U
GGGAAAGAAGAAACCACTCTGTTTGCAGAAACAAGACCAACTTACTCTGGAATTCTCCTC
TCCAATCAGCTAACTAACAAGAAGCACAAGGTAAAGGCTAATGGCGAAGATCAAGCCGCA
AGCTCTATTGCAGCAAAGCAAGAAGAAGAAAGGACCTTCTCCTATTAGCATAACCAGCAT
CGTGATTTACACCTTGGCCCTGCTTTTGGTCGTCTTCGTCCTCTTCTCCGCCTACAAACG
TTGGACCCTCAGATCTGAGATCCCAACCCACAATGGTAGATCACTTCTTCAGGATTCAGC
CAAGACTACTAATGTCCCATGGTTTGCTACCTTAGATACGGGCAAAGGTTCAGTGACCAT
TGAACTCTTCAAAGATGCTGCTCCCAACGTTGTTGACGAATTCATCAACTTATGTCAAGA
TGGGTATTTCAAAGGTTTCTTATTCAGCAGAGTTGTAAAGCATTCTGTCATTCAAGCTGG
TCACTCTGCTGAGTCCGATGCTGTCATAGATTGGGCTCTCCAAAAGAATA***ATCTTCA
TACCAGTTTAAAACAAGAGGAATTCATGGTGGGAACTCCTAAAGCTAAAAACCAGGAAGG
AGGGTTTCAGTTTTTCATTGTGTCTTCTCAGATCACAGATCTGAACGAGAAATTGACAGT
TTTTGGTCGTGTTGCAAAGGGACAAGATGTGGTTCAGGAGATCGAGGAGGTTGAGACAGA
TGAACATCATCAACCAAAAGCACCAATAGAGATCATGTCCGTCACTTTGCTTCAAGACAT
GTGAAAGCTTTATTACTTCTTGTATTGAAAAAAATCTCTTGATGTATTAATGCTTTGTAA
CTTGAATTCTTTTTTCCTATCACCTCATTTGCAACTTTGTGGTAACACAAGTTTTAATTT
TCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2BJ91TF U 1
AF RR2H487TF U 2
AF RR2DL10TF U 611
AF RR2BJ91JQ C 160
AF RR2BP40JQ C 222
BS 1 48 RR2BJ91TF
BS 49 49 RR2H487TF
BS 50 117 RR2BJ91TF
BS 118 118 RR2H487TF
BS 119 693 RR2BJ91TF
BS 694 697 RR2H487TF
BS 698 698 RR2DL10TF
BS 699 709 RR2H487TF
BS 710 710 RR2DL10TF
BS 711 720 RR2H487TF
BS 721 721 RR2DL10TF
BS 722 743 RR2H487TF
BS 744 744 RR2DL10TF
BS 745 771 RR2H487TF
BS 772 883 RR2DL10TF
BS 884 903 RR2BJ91JQ

RD RR2BJ91TF 693 0 0
GGGAAAGAAGAAACCACTCTGTTTGCAGAAACAAGACCAACTTACTCTTGAATTCTCCTC
TCCAATCAGCTAACTAACAAGAAGCACAAGGTAAAGGCTAATGGCGAAGATCAAGCCTCA
AGCTCTATTGCAGCAAAGCAAGAAGAAGAAAGGACCTTCTCCTATTAGCATAACCAGCAT
CGTGATTTACACCTTGGCCCTGCTTTTGGTCGTCTTCGTCCTCTTCTCCGCCTACAAACG
TTGGACCCTCAGATCTGAGATCCCAACCCACAATGGTAGATCACTTCTTCAGGATTCAGC
CAAGACTACTAATGTCCCATGGTTTGCTACCTTAGATACGGGCAAAGGTTCAGTGACCAT
TGAACTCTTCAAAGATGCTGCTCCCAACGTTGTTGACGAATTCATCAACTTATGTCAAGA
TGGGTATTTCAAAGGTTTCTTATTCAGCAGAGTTGTAAAGCATTCTGTCATTCAAGCTGG
TCACTCTGCTGAGTCCGATGCTGTCATAGATTGGGCTCTCCAAAAGAATA***ATCTTCA
TACCAGTTTAAAACAAGAGGAATTCATGGTGGGAACTCCTAAAGCTAAAAACCAGGAAGG
AGGGTTTCAGTTTTTCATTGTGTCTTCTCAGATCACAGATCTGAACGAGAAATTGACAGT
TTTTGGTCGTGTTGCAAAGGGACAAGATGTGGT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2H487TF 782 0 0
GGAAAGAA
GAAACCACTCTGTTTGCAGAAACAAGGCCAACTTACTCTGGAATTCTCCTCTCCA*TCAG
CTAACTAACAAGAAGCACAAGGTAAAGGCTAATGGCGAAGATCAAGCCGCAAGCTCTATT
GCAGCAAAGCAAGAAGAAGAAAGGACCTTCTCCTATTAGCATAACCAGCATCGTGATTTA
CACCTTAGCCCTGCTTTTGGTCGTCTTCGTCCTCTTCTCCGCCTACAAACGTTGGACCCT
CAGATCTGAGATCCCAACCCACAATGGTAGATCACTTCTTCAGGATTCAGCCAAGACTAC
TAATGTCCCATGGTTTGCTACCTTAGATACGGGCAAAGGTTCAGTGACCATTGAACTCTT
CAAAGATGCTGCTCCCAACGTTGTTGATGAATTCATCAACTTATGTCAAGATGGGTATTT
CAAAGGTTTCTTATTCAGCAGAGTTGTAAAGCATTCTGTCATTCAAGCTGGTCACTCTGC
TGAGTCCGATGCTGTCACAGATTGGGCTCTCCAAAAGACTACTAATCTTCATACCAGTTT
AAAACAAGAAGAATTCATGGTGGGAACTCCTAAAGCTAAAAACCAGGAAGGAGGGTTTCA
GTTTTTCATTGTATCTTCTCAGATCACGGATCTGAACGAGAAATTGACAGTTTTTGGTCG
TGTTGCAAAGGGACAAGATGTGGTTCAG*AGATCGAGGAG*TTGAGACAGACGAACATCA
TCAACCAAAAGCAC*AATAGAGATCATGTCCGTCACTTTGCT
CAGACATGTGAA

QA 9 770 9 770
DS 

RD RR2DL10TF 273 0 0
TTTTTCATTGTGTCTTCTCAGATCACAGATCTGAACGAGAAATTGACAGTTTTTGGTCGT
GTTGCAAAGGGACAAGATGTGGTTCAGGAGATCGAGGAGGTTGAGACAGATGAACATCAT
CAACCAAAAGCACCAATAGAGATCATGTCCGTCACTTTGCTTCAAGACATGTGAAAGCTT
TATTACTTCTTGTATTGAAAAAAATCTCTTGATGTATTAATGCTTTGTAACTTGAATTCT
TTTTTCCTATCACCTCATTTGCAACTTTGTGGT

QA 1 273 1 273
DS 

RD RR2BJ91JQ 744 0 0
TCCTATTAGCATAACCAGCATCGTGATTTACACCTTGGCCCTGCTTTTGGTCGTCTTCGT
CCTCTTCTCCGCCTACAAACGTTGGACCCTCAGATCTGAGATCCCAACCCACAATGGTAG
ATCACTTCTTCAGGATTCAGCCAAGACTACTAATGTCCCATGGTTTGCTACCTTAGATAC
GGGCAAAGGTTCAGTGACCATTGAACTCTTCAAAGATGCTGCTCCCAACGTTGTTGACGA
ATTCATCAACTTATGTCAAGATGGGTATTTCAAAGGTTTCTTATTCAGCAGAGTTGTAAA
GCATTCTGTCATTCAAGCTGGTCACTCTGCTGAGTCCGATGCTGTCATAGATTGGGCTCT
CCAAAAGAATA***ATCTTCATACCAGTTTAAAACAAGAGGAATTCATGGTGGGAACTCC
TAAAGCTAAAAACCAGGAAGGAGGGTTTCAGTTTTTCATTGTGTCTTCTCAGATCACAGA
TCTGAACGAGAAATTGACAGTTTTTGGTCGTGTTGCAAAGGGACAAGATGTGGTTCAGGA
GATCGAGGAGGTTGAGACAGATGAACATCA*CAACCAAAAGCACCAATAGAGATCATGTC
CGTCACTTTGCTTCAAGACATGTGAAAGCTTTATTACTTCTTGTATTGAAAAAAATCTCT
TGATGTATTAATGCTTTGTAACTTGAATTCTTTTTTCCTATCACCTCATTTGCAACTTTG
TGGTAACACAAGTTTTAATTTTCG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2BP40JQ 682 0 0
TCTTCTCCGCCTACAAACGTTGGACCCTCAGATCTGAGATCCCAACCCACAATGGTAGAT
CACTTCTTCAGGATTCAGCCAAGACTACTAATGTCCCATGGTTTGCTACCTTAGATACGG
GCAAAGGTTCAGTGACCATTGAACTCTTCAAAGATGCTGCTCCCAACGTTGTTGACGAAT
TCATCAACTTATGTCAAGATGGGTATTTCAAAGGTTTCTTATTCAGCAGAGTTGTAAAGC
ATTCTGTCATTCAAGCTGGTCACTCTGCTGAGTCCGATGCTGTCATAGATTGGGCTCTCC
AAAAGAATA***ATCTTCATACCAGTCTAAAACAAGAGGAATTCATGGTGGGAACTCCTA
AAGCTAAAAACCAGGAAGGAGGGTTTCAGTTTTTCATTGTGTCTTCTCAGATCACAGATC
TGAACGAGAAATTGACAGTTTTTGGTCGTGTTGCAAAGGGACAAGATGTGGTTCAGGAGA
TCGAGGAGGTTGAGACAGATGAACATCATCAACCAAAAGCACCAATAGAGATCATGTCCG
TCACTTTGCTTCAAGACATGTGAAAGCTTTATTACTTCTTGTATTGAAAAAAATCTCTTG
ATGTATTAATGCTTTGTAACTTGAATTCTTTTTTCCTATCACCTCATTTGCAACTTTGTG
GTAACACAAGTTTTAATTTTC
C

QA 1 681 1 681
DS 



CO CL263Contig2 903 5 9 U
GAAACTTGTGTAACCAAAAAGTTGCAAATGAGGTGATGAAAAGATTTCAAGTTACAAAGC
ATTAATACATCAAGAATCACTTGGAGATTTTTTTT**TCAATACAAGAAGTAATAAAGCT
TTCACATGTCTTGAAGCAAAGTGACGGACATGATCTCTATTGGTGCTTTTGGTTGATGAT
GTTCATCTGTCTCAACCTCCTCGATCTCCTGAACCACATCTTGTCCCTTTGCAACACGAC
CAAAAACTGTCAATTTCTCGTTCAGATCCGTGATCTGAGAAGATACAATGAAAAACTGAA
ACCCTCCTTCCTGGTTTTTAGCTTTAGGAGTTCCCACCATGAATTCTTCTTGTTTTAAAC
TGGTATGAAGATTAGTAGTCTTTTGGAGAGCCCAATCTGTGACAGCATCGGACTCAGCAG
AGTGACCAGCTTGAATGACAGAATGCTTTACAACTCTGCTGAATAAGAAACCTTTGAAAT
ACCCATCTTGACATAAGTTGATGAATTCATCAACAACGTTGGGAGCAGCATCTTTGAAGA
GTTCAATGGTCACTGAACCTTTGCCCGTATCTAAGGTAGCAAACCATGGGACATTAGTAG
TCTTGGCTGAATCCTGAAGAAGTGATCCACCATTGTGGGTTGGGATCTCAGATCTGAGGG
TCCAACGTTTGTAGGCGGAGAAGAGGACGAAGACGACCAAAAGCAGGGCCAAGGTGTAAA
TCACGATGCTGGTTATGCTAATAGGAGAAGGTCCTTTCTTCTTCTTGCTTTGCTGCAATA
GAGCTTGCGGCTTGATCTTCGCCATTAGCCTTTACCTTGTGCTTCTTGTTAGTTAGCTGA
TGGAGAGGAGAATTCCAGAGTAAGTTGGCCTTGTTTCTGCAAACAGAGTGGTTTCTTCTT
TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2D093JQ U 1
AF RR2F864JQ U 7
AF RR2H487JQB U 20
AF RR2C493TF C 326
AF RR2D093TF C 315
BS 1 94 RR2D093JQ
BS 95 95 RR2F864JQ
BS 96 143 RR2D093JQ
BS 144 144 RR2F864JQ
BS 145 466 RR2D093JQ
BS 467 467 RR2F864JQ
BS 468 648 RR2D093JQ
BS 649 649 RR2H487JQB
BS 650 903 RR2D093TF

RD RR2D093JQ 648 0 0
GAAACTTGTGTAACCAAAAAGTTGCAAATGAGGTGATGAAAAGATTTCAAGTTACAAAGC
ATTAATACATCAAGAATCACTTGGAGATTTTTTT***TCAATACAAGAAGTAATAAAGCT
TTCACATGTCTTGAAGCAAAGTGTCGGACATGATCTCTATTGGTGCTTTTGGTTGATGAT
GTTCATCTGTCTCAACCTCCTCGATCTCCTGAACCACATCTTGTCCCTTTGCAACACGAC
CAAAAACTGTCAATTTCTCGTTCAGATCCGTGATCTGAGAAGATACAATGAAAAACTGAA
ACCCTCCTTCCTGGTTTTTAGCTTTAGGAGTTCCCACCATGAATTCTTCTTGTTTTAAAC
TGGTATGAAGATTAGTAGTCTTTTGGAGAGCCCAATCTGTGACAGCATCGGACTCAGCAG
AGTGACCAGCTTGAATGACAGAATGCTTTACAACTCTGCTGAATAAAAAACCTTTGAAAT
ACCCATCTTGACATAAGTTGATGAATTCATCAACAACGTTGGGAGCAGCATCTTTGAAGA
GTTCAATGGTCACTGAACCTTTGCCCGTATCTAAGGTAGCAAACCATGGGACATTAGTAG
TCTTGGCTGAATCCTGAAGAAGTGATCCACCATTGTGGGTTGGGATCT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2F864JQ 614 0 0
G
GTGTAACCAAAAAGTTGCAAATGAGGTGATGAAAAGATTTCAAGTTACAAAGCATTAATA
CATCAAGAATCACTTGGAGATTTTTTTTTTTCAATACAAGAAGTAATAAAGCTTTCACAT
GTCTTGAAGCAAAGTGACGGACATGATCTCTATTGGTGCTTTTGGTTGATGATGTTCATC
TGTCTCAACCTCCTCGATCTCCTGAACCACATCTTGTCCCTTTGCAACACGACCAAAAAC
TGTCAATTTCTCGTTCAGATCCGTGATCTGAGAAGATACAATGAAAAACTGAAACCCTCC
TTCCTGGTTTTTAGCTTTAGGAGTTCCCACCATGAATTCTTCTTGTTTTAAACTGGTATG
AAGATTAGTAGTCTTTTGGAGAGCCCAATCTGTGACAGCATCGGACTCAGCAGAGTGACC
AGCTTGAATGACAGAATGCTTTACAACTCTGCTGAATAAGAAACCTTTGAAATACCCATC
TTGACATAAGTTGATGAATTCATCAACAACGTTGGGAGCAGCATCTTTGAAGAGTTCAAT
GGTCACTGAACCTTTGCCCGTATCTAAGGTAGCAAACCATGGGACATTAGTAGTCTTGGC
TGAATCCTGAAGA

QA 2 614 2 614
DS 

RD RR2H487JQB 630 0 0
G
GTTGCAAATGAGGTGATGAAAAGATTTCAAGTTACAAAGCATTAATACATCAAGAATCAC
TTGGAGATTTTTTTT**TCAATACAAGAAGTAATAAAGCTTTCACATGTCTTGAAGCAAA
GTGACGGACATGATCTCTATTGGTGCTTTTGGTTGATGATGTTCGTCTGTCTCAACCTCC
TCGATCTCCTGAACCACATCTTGTCCCTTTGCAACACGACCAAAAACTGTCAATTTCTCG
TTCAGATCCGTGATCTGAGAAGATACAATGAAAAACTGAAACCCTCCTTCCTGGTTTTTA
GCTTTAGGAGTTCCCACCATGAATTCTTCTTGTTTTAAACTGGTATGAAGATTAGTAGTC
TTTTGGAGAGCCCAATCTGTGACAGCATCGGACTCAGCAGAATGACCAGCTTGAATGACA
GAATGCTTTACAACTCTGCTGAATAAGAAACCTTTGAAATACCCATCTTGACATAAGTTG
ATGAATTCATCAACAACGTTGGGAGCAGCATCTTTGAAGAGTTCAATGGTCACTGAACCT
TTGCCCGTATCTAAGGTAGCAAACCATGGGACATTAGTAGTCTTGGCTGAATCCTGAAGA
AGTGATCTACCATTGTGGGTTGGGATCTC

QA 2 630 2 630
DS 

RD RR2C493TF 570 0 0
AGGAGTTCCCACCATGAATTCTTCTTGTTTTAAACTGGTATGAAGATTAGTAGTCTTTTG
GAGAGCCCAATCTGTGACAGCATCGGACTCAGCAGAGTGACCAGCTTGAATGACAGAATG
CTTTACAACTCTGCTGAATAAGAAACCTTTGAAATACCCATCTTGACATAAGTTGATGAA
TTCATCAACAACGTTGGGAGCAGCATCTTTGAAGAGTTCAATGGTCACTGAACCTTTGCC
CGTATCTAAGGTAGCAAACCATGGGACATTAGTAGTCTTGGCTGAATCCTGAAGAAGTGA
TCTACCATTGTGGGTTGGGATCTCAGATCTGAGGGTCCAACGTTTGTAGGCGGAGAAGAG
GACGAAGACGACCAAAAGCAGGGCCAAGGTGTAAATCACGATGCTGGTTATGCTAATAGG
AGAAGGTCCTTTCTTCTTCTTGCTTTGCTGCAATAGAGCTTGCGGCTTGATCTTCGCCAT
TAGCCTTTACCTTGTGCTTCTTGTTAGTTAGCTGATGGAGAGGAGAATTCCAGAGTAAGT
TGGCCTTGTTTCTGCAAACAGAGTGGTTTC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2D093TF 589 0 0
TTTTTAGCTTTAGGAGTTCCCACCATGAATTCTTCTTGTTTTAAACTGGTATGAAGATTA
GTAGTCTTTTGGAGAGCCCAATCTGTGACAGCATCGGACTCAGCAGAGTGACCAGCTTGA
ATGACAGAATGCTTTACAACTCTGCTGAATAAGAAACCTTTGAAATACCCATCTTGACAT
AAGTTGATGAATTCATCAACAACGTTGGGAGCAGCATCTTTGAAGAGTTCAATGGTCACT
GAACCTTTGCCCGTATCTAAGGTAGCAAACCATGGGACATTAGTAGTCTTGGCTGAATCC
TGAAGAAGTGATCCACCATTGTGGGTTGGGATCTCAGATCTGAGGGTCCAACGTTTGTAG
GCGGAGAAGAGGACGAAGACGACCAAAAGCAGGGCCAAGGTGTAAATCACGATGCTGGTT
ATGCTAATAGGAGAAGGTCCTTTCTTCTTCTTGCTTTGCTGCAATAGAGCTTGCGGCTTG
ATCTTCGCCATTAGCCTTTACCTTGTGCTTCTTGTTAGTTAGCTGATGGAGAGGAGAATT
CCAGAGTAAGTTGGCCTTGTTTCTGCAAACAGAGTGGTTTCTTCTTTCC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 2 12

CO CL264Contig1 1181 9 20 U
GGACAACCATTCGAACAAAAAGTTGGAGCCAAGTATTCCTTCAAAATTTTTAACCAAAAT
AAAATAAAATATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAA*TCTATAT
CCAAAAAAATGCTCTCTCGTCTCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCAGGTTGTTAGTGCTG
TCATTGTAACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCTCATTTGTGG
GATTAATCGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTACCAGCAACTA
TAGCTACCACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTGCCTTATTTGGAGTGACGGCGG
GTGCTCTCATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCCAC
CTCCAGCAGGAGCTCCACCCACCGAAGCAGCTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAAAC
CAAATGATAAACCAGCTGGAGAAGCAACAAGTAAGCCAAATGATAAACCAGCCGGAGGAG
CAACCGATAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAAC
CGGCTGCAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGATGGAGGAGCAACAGATAAAC
CAGGAAGTAAACCAGCTGGAGGACCAGCACATAAACCAGATAAACCTGCTGGAGGACCAA
CAAATAAACCAGAAAGTAAACCAGCTGGAGAACCAGCTCATAAACCAAAAGATAAACCCG
CTGGAGGACCAACAGATAAACCAGGAAATAAACCAGCTGGAGGACCAGCAGATAAACCAG
CTGGAGGACCAGCAGATAAACCTGCTGGAGGACCAACAGATAAACCAGCAGATAAACCGA
CCGGAGGGGCAGCAAATAAACCTGCTGGCGGGGCAGCAAATAAACCGGCTGAAAAACCAA
AAAAATAAACCAGTTGGAGCATCAACGGATAAACCAGCTGGAGAGAATAAACCTCCCGCA
TGGTATAGCTGAATGGAGTAGTTTGGCTTCCATAAATTATTCCTAATTTATCCTAAACTA
CATGTTTCATAATCATTTCTATGAATGTACGACATGTTACAAGGAAATGATAACCAGTGT
ACAAATTTTCTTTGTAAATTTATTAAAATGATGTGGTTATC


BQ
20 20 25 25 25 25 25 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2CL89TF U -4
AF RR2CU21TF U 1
AF RR2H587TF U 1
AF RR2FZ65TF U 5
AF RR2AI75TF U 1
AF RR2AI75JQ C 815
AF RR2CL89JQ C 359
AF RR2FZ65JQ C 463
AF RR2H587JQB C 536
BS 1 14 RR2AI75TF
BS 15 15 RR2CU21TF
BS 16 27 RR2AI75TF
BS 28 28 RR2CU21TF
BS 29 775 RR2AI75TF
BS 776 785 RR2CL89JQ
BS 786 786 RR2FZ65JQ
BS 787 839 RR2CL89JQ
BS 840 840 RR2FZ65JQ
BS 841 998 RR2CL89JQ
BS 999 999 RR2FZ65JQ
BS 1000 1029 RR2CL89JQ
BS 1030 1030 RR2FZ65JQ
BS 1031 1046 RR2CL89JQ
BS 1047 1047 RR2FZ65JQ
BS 1048 1051 RR2CL89JQ
BS 1052 1052 RR2FZ65JQ
BS 1053 1124 RR2CL89JQ
BS 1125 1177 RR2FZ65JQ
BS 1178 1181 RR2H587JQB

RD RR2CL89TF 645 0 0
GGAAAAC
ACAACCATCCGAACAAAAAGTTGGAGCCAAGTATTCCTTCAAAACTTTTAACCAAAAAAA
AAAAATATATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAAATCTATATCC
AAAAAAATGCTCCCTCGTCTCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCAGGTTGTTATTGCTGTC
ATTGTAACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCTCAGTCGTGGGA
TTAATCGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTACCAGCAACTATA
GCTACCACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTGCCTTATTTGGAGTGACGGCGGGT
GCTCTCATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCCACCT
CCAGCAGGAGCTCCACCCACCGAAGCAGCTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAAACCA
AATGATAAACCAGCTGGAGAAGCAACAAGTAAGCCAAATGATAAACCAGCTGGAGGAGCA
ACCGATAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCG
GCTGCAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAA
CCGGAT

QA 8 639 8 639
DS 

RD RR2CU21TF 681 0 0
GGACAACCATTCGAACAAAAAGTTGGAGCCAAGTATTCCTTCAAAATTTTTAACCAAAAT
AAAATAAAATATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAA*TCTATAT
CCAAAAAAATGCTCTCTCGTCTCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCAGGTTGTTAGTGCTG
TCATTGTAACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCTCATTTGTGG
GATTAATCGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTACCAGCAACTA
TAGCTACCACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTGCCTTATTGGGAGTGACGGCGG
GTGCTCTCATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCCAC
CTCCAGCAGGAGCTCCACCCACCGAAGCAGCTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAAAC
CAAATGATAAACCAGCTGGAGAAGCAACAAGTAAGCCAAATGATAAACCAGCCGGAGGAG
CAACCGATAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAAC
CGGCTGCAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGATGGAGGAGCAACAGATAAAC
CAGGAAGTAAACCAGCTGGAG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2H587TF 667 0 0
GGACAACCATTCGAACAAAAAGTTGGAGCCAAGTATTCCTTCAAAATTTTTAACCAAAAT
AAAATAAAATATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAA*TCTATAT
CCAAAAAAATGCTCTCTCGTCTCATCCCAATTTTTCGGGTTTTTCAGGTTGTTAGTGCTG
TCATTGTAACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCTCATTTGTGG
GATTAATCGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTACCAGCAACTA
TAGCTACCACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTGCCTTATTTGGAGTGACGGCGG
GTGCTCTCATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCCAC
CTCCAACAGGAGCTCCACCCACTGAAGCAGCTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAAAC
CAAATGATAAACCAGCTGGAGAAGCAACAAGTAAGCCAAATTATAAACCAGCCGGAGGAG
CAACCGATAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGGGGAGCATCAGATAAGCCAGGAGGTAAAC
CGGCTGC*GGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGATGGAGGAGCAACAGATAAAC
CAGGA
GT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2FZ65TF 664 0 0
GGG
CATTCGAACAAAAAGTTGGAGCCAAGTATTCCTTCAAAATTTTTAACCAAAATAAAATAA
AATATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCATTGTAATCTAAA*TCTATATCCAAAAA
AATGCTCTCTCGTCTCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCAGGTTGTTAGTGCTGTCATTGT
AACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCTCATTTGTGGGATTAAT
CGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTACCAGCAACTATAGCTAC
CACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTGCCTTATTTGGAGTGACGGCGGGTGCTCT
CATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCCACCTCCAGT
AGGAGCTCCACCCACCGAAGCAGCTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAAACCAAATGA
TAAACCAGCTGGAGAAGCAACAAGTAAGCCAAATGATAAACCAGCCGGAGGAGCAACCGA
TAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGCTGC
AGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGATGGAGGAGCAACAGATAA*CCAGGAAG
T

QA 4 664 4 664
DS 

RD RR2AI75TF 781 0 0
GGACAACCATTCGAGCAAAAAGTTGGATCCAAGTATTCCTTCAAAATTTTTAACCAAAAT
AAAATAAAATATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAA*TCTATAT
CCAAAAAAATGCTCTCTCGTCTCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCAGGTTGTTAGTGCTG
TCATTGTAACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCTCATTTGTGG
GATTAATCGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTACCAGCAACTA
TAGCTACCACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTGCCTTATTTGGAGTGACGGCGG
GTGCTCTCATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCCAC
CTCCAGCAGGAGCTCCACCCACCGAAGCAGCTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAAAC
CAAATGATAAACCAGCTGGAGAAGCAACAAGTAAGCCAAATGATAAACCAGCCGGAGGAG
CAACCGATAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAAC
CGGCTGCAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGATGGAGGAGCAACAGATAAAC
CAGGAAGTAAACCAGCTGGAGGACCAGCACATAAACCAGATAAACCTGCTGGAGGACCAA
CAAATAAACCAGAAAGTAAACCAGCTGGAGAACCAGCTCATAAACCAAAAGATAA
CCCGCT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2AI75JQ 182 0 0
AGCTGGAGGACCAGCAGATAAACCAGCTGGAGGACCAGCAGATAAACCTGCTGGGGGACC
AACAGATAAACCAGCAGATAAACCGACCGGAGGGGCAGCAAATAAACCTGCTGGGGGGGC
AGCAAATAAACCGGGTGAAAAACCAAAAAAATAAACCAGTTGGAGCATCAACGGATAAAC
CA

QA 1 182 1 182
DS 

RD RR2CL89JQ 766 0 0
GGGTGCTCTCATAGTTTGGCTC*TTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCC
ACCTCCAGCAGGAGCTCCACCCACCGAAGCAGCTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAA
ACCAAATGATAAACCAGCTGGAGAAGCAACAAGTAAGCCAAATGATAAACCAGCTGGAGG
AGCAACCGATAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAA
ACCGGCTGCAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGATGAAGGAGCAACAGATAA
ACCAGGAAGTAAACCAGCTGGAGGACCAGCACATAAACCAGATAAACCTGCTGGAGGACC
AACAAATAAACCAGGAAGTAAACCAGCCGGAGAACCAGCTCATAAACCAAAAGATAAACC
CGCTGGAAGACCAACAGATAAACCAGGAAATAAACCAGCTGGAGGACCAGCAGATAAACC
AACTGGAGGACCAGCAGATAAACCTGCTGGAGGACCAACAGATAAACCAGCAGATAAACC
GACCGGAGGGGCAGCAAATAAACCTGCTGGCGGGGCAGCAAATAAACCGGCTGAAAAACC
AAAAAAATAAACCAGTTGGAGCATCAACGGATAAACCAGCCGGAGAGAATAAACCTCCCG
CATGGTATAGCCGAATGGAGTAGTTTGGGTTCCGTAAATTATTCCTAATTTATCCTAAAC
TACATGTTTCATAATCATTTCTATGAATGTACGACATGTTACAAGG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2FZ65JQ 724 0 0
GTGGAGCAACAGATAAACCAAATGATAAACCAGCTGGAGAAGCAACAAGTAAGCCAAATG
ATAAACCAGCCGGAGGAGCAACCGATAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAG
ATAAGCCAGGAGGTAAACCGGCTGCAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGATG
GAGGAGCAACAGATAAACCAGGAAGTAAACCAGCTGGAGGACCAGCACATAAACCGGATA
AACCTGCTGGAGGACCAACAAATAAACCAGAAAGTAAACCAGCTGGAGAACCAGCTCATA
AACCAAAAGATAAACCCGCTGGAGGACCAACAGATAAACCAGGAAATAAACCAGCTGGAG
GACCAGCAGATAAACCAGCTGGAGGACCAGCAGATAAACCTGCTGGAGGACCAACAGATA
AACCAGCAGATAAACCGACCGGAGGGGCAGCAAATAAACCTGCTGGCGGGGCAGCAAATA
AACCGGCTGAAAAACCAAAAAAATAAACCAGTTGGAGCATCAACGGATAAACCAGCTGGA
GAGAATAAACCTCCCGCATGGTATAGCTGAATGGAGTAGTTTGGCTTCCATAAATTATTC
CTAATTTATCCTAAACTACATGTTTCATAATCATTTCTATGAATGTACGACATGTTACAA
GGAAATGATAACCAGTGTACAAATTTTCTTTGTAAATTTATTAAAATGATGTGGT
CATCATTAT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2H587JQB 646 0 0
AGGAGCAACCGATAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCATCAGATAAGCCAGGAGG
TAAACCGGCTGCAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGATGGAGGAGCAACAGA
TAAACCAGGAAGTAAACCAGCTGGAGGACCAGCACATAAACCAGATAAACCTGCTGGAGG
ACCAACAAATAAACCAGAAAGTAAACCAGCTGGAGAACCAGCTCATAAACCAAAAGATAA
ACCCGCTGGAGGACCGACAGATAAACCAGGAAATAAACCAGCTGGAGGACCAGCAGATAA
ACCAGCTGGAGGACCAGCAGATAAACCTGCTGGAGGACCAACAGATAAACCAGCAGATAA
ACCGACCGGAGGGGCAGCAAATAAACCTGCTGGCGGGGCAGCAAATAAACCGGCTGAAAA
ACCAAAAAAATAAACCAGTTGGAGCATCAACGGATAAACCAGCTGGAGAGAATAAACCTC
CCGCATGGTATAGCTGAATGGAGTAGTTTGGCTTCCATAAATTATTCCTAATTTATCCTA
AACTACATGTTTCATAATCATTTCTATGAATGTACGACATGTTACAAGGAAATGATAACC
AGTGTACAAATTTTCTTTGTAAATTTATTAAAATGATGTGGTTATC

QA 1 646 1 646
DS 



CO CL264Contig2 865 3 4 U
AATGATAACCACATCATTTTAATAATTTTACAAAAAAAATTTGTACACTGGTTATCATTT
CCTCGTAACATGTCGTACATTCATAGAAATGATTATGAAACATGTAGTTTAGGATAAATT
AGGAATAATTTACGGAACCCAAACTACTCCATTCAGCTATACCATGCGGGAGGTTTATTC
TCTCCGG*CTGGTTTATCCGTTGATGCTCCAACTGGTTTATTTTTTTGGTTTTTCAGCCG
GTTTATTTGCTGCCCCGCCAGCAGGTTTATTTGCTGCCCCTCCGGTCGGTTTATCTGCTG
GTTTATCTGTTGGTCCTCCAGCAGGTTTATCTGCTGGTCCTCCAGTTGGTTTATCTGCTG
GTCCTCCAGCTGGTTTATTTCCTGGTTAATCTGTTGGTCTTCCAGCGGGTTTATCTTTTG
GTTTATGAGCTGGTTCTCCGGCTGGTTTACTTCCTGGTTTATTTGTTGGTCCTCCAGCAG
GTTTATCTGGTTTATGTGCTGGTCCTCCAGCTGGTTTACTTCCTGGTTTATCTGTTGCTC
CTCCATCCGGTTTACCTCCTGGCTTATCTGCTGCTTCTGCAGCCGGTTTACCTCCTGGCT
TATCTGCTGCTCCTCCAGCCGGTTTATCTTCTGGCTTATCGGTTGCTCCTCCAGCTGGTT
TATCATTTGGCTTACTTGTTACAATGACAGCACTAACAACCTGAAAAACCTGAAAAATTG
GGATGAGACGAGAGAGCATTTTTTTGGATATAGATTTTAGATTACAACGGCTGAAATTTG
GTTTGAATGGGTACTATATATTTTTTTTTTGGTTAAAAGTTTTGAAGGAATACTTGGCTC
CAACTTTTTGTTCGGATGGTTGTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H519JQB U 4
AF RR2AP01JQ U 1
AF RR2AP01TF C 40
BS 1 34 RR2AP01JQ
BS 35 35 RR2H519JQB
BS 36 757 RR2AP01JQ
BS 758 865 RR2AP01TF

RD RR2H519JQB 364 0 0
GATAACCACATCATTTTAATAATTTTACAAAAAAAATTTGTACACTGGTTATCATTTCCT
TGTAACATGTCGTACATTCATAAAAATGATTATGAAACATGTAGTTTAGGATAAATTAGG
AATAATTTACGGAACCCAAACTACTCCATTCAGCTATACCATGCGGGAGGTTTATTCTCT
CCGG*CTGGTTTATCCGTTGATGCTCCAACTGGTCTATTTTTTTGGTTTTTCAGCCGGTT
TATTTGCTGCCCCGCCAGCAGGTTTATTTGCTGCCCCTCCGGTCGGTTTATCTGCTGGTT
TATCTGTTGGTCCTCCAGCAGGTTTATCTGCTGGTCCTCCAGTTGGTTTATCTGCTGGTC
CTCC

QA 1 364 1 364
DS 

RD RR2AP01JQ 757 0 0
AATGATAACCACATCATTTTAATAATTTTACAAAGAAAATTTGTACACTGGTTATCATTT
CCTCGTAACATGTCGTACATTCATAGAAATGATTATGAAACATGTAGTTTAGGATAAATT
AGGAATAATTTACGGAACCCAAACTACTCCATTCAGCTATACCATGCGGGAGGTTTATTC
TCTCCGG*CTGGTTTATCCGTTGATGCTCCAACTGGTTTATTTTTTTGGTTTTTCAGCCG
GTTTATTTGCTGCCCCGCCAGCAGGTTTATTTGCTGCCCCTCCGGTCGGTTTATCTGCTG
GTTTATCTGTTGGTCCTCCAGCAGGTTTATCTGCTGGTCCTCCAGTTGGTTTATCTGCTG
GTCCTCCAGCTGGTTTATTTCCTGGTTAATCTGTTGGTCTTCCAGCGGGTTTATCTTTTG
GTTTATGAGCTGGTTCTCCGGCTGGTTTACTTCCTGGTTTATTTGTTGGTCCTCCAGCAG
GTTTATCTGGTTTATGTGCTGGTCCTCCAGCTGGTTTACTTCCTGGTTTATCTGTTGCTC
CTCCATCCGGTTTACCTCCTGGCTTATCTGCTGCTTCTGCAGCCGGTTTACCTCCTGGCT
TATCTGCTGCTCCTCCAGCCGGTTTATCTTCTGGCTTATCGGTTGCTCCTCCAGCTGGTT
TATCATTTGGCTTACTTGTTACAATGACAGCACTAACAACCTGAAAAACCTGAAAAATTG
GGATGAGACGAGAGAGCATTTTTTTGGATATAGATTT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2AP01TF 826 0 0
TTTGTACACTGGTTATCATTTCCTCGTAACATGTCGTACAT*CATAGAAATGATTATGAA
ACATGTAGTTTAGGATAAATTAGGAATAATTTACGGAACCCAAACTACTCCATTCAGCTA
TACCATGCGGGAGGTTTATTCTCTCCGGGCTGGTTTATCCGTTGATGCTCCAACTGGTTT
ATTTTTTTGGTTTTTCAGCCGGTTTATTTGCTGCCCCGCCAGCAGGTTTATTTGCTGCCC
CTCCGGTCGGTTTATCTGCTGGTTTATCTGTTGGTCCTCCAGCAGGTTTATCTGCTGGTC
CTCCAGTTGGTTTATCTGCTGGTCCTCCAGCTGGTTTATTTCCTGGTTAATCTGTTGGTC
TTCCAGCGGGTTTATCTTTTGGTTTATGAGCTGGTTCTCCGGCTGGTTTACTTCCTGGTT
TATTTGTTGGTCCTCCAGCAGGTTTATCTGGTTTATGTGCTGGTCCTCCAGCTGGTTTAC
TTCCTGGTTTATCTGTTGCTCCTCCATCCGGTTTACCTCCTGGCTTATCTGCTGCTTCTG
CAGCCGGTTTACCTCCTGGCTTATCTGCTGCTCCTCCAGCCGGTTTATCTTCTGGCTTAT
CGGTTGCTCCTCCAGCTGGTTTATCATTTGGCTTACTTGTTACAATGACAGCACTAACAA
CCTGAAAAACCTGAAAAATTGGGATGAGACGAGAGAGCATTTTTTTGGATATAGATTTTA
GATTACAACGGCTGAAATTTGGTTTGAATGGGTACTATATATTTTTTTTTTGGTTAAAAG
TTTTGAAGGAATACTTGGCTCCAACTTTTTGTTCGGATGGTTGTCC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 2 13

CO CL265Contig1 626 2 3 U
GGGCACACCGAACGAAGACTCCCAATCATCTCCTTCCTTCTTCGTCTCCGAAACTAAAAA
TTTGATTCAGCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCAGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAG
CTCAAGTTTCTCGAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAG
GAGCAGCAGAAACAAGTGGTCGTCGAGAAAGTCGGCGAGCCTGGTCAATCCCACGACGAC
TTTGCTGCTAGTCTCCCTGCCGATGAATGCCGTTACGCTGTTTTCGATTTCGATTTCGTC
ACTGCTGAGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACGGCA
AGAGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAGCGTGAGCTTGAT
GGAATTCAAGTTGAGCTTCAAGCTACTGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAA
AGCCGAGCCAACTGAGGAGGAGTTAACATCCTCCAAGAAAAAAAATATATTTGGTTGAAT
CCAACTACTATTACTGAATGATATGCTTGTTCTTTAAGTTTGCTGTGAAAGCAACCACCA
ACCAAACAACTTCATTTCATTGGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB75TF U 1
AF RR2AN90TF U 1
BS 1 559 RR2AN90TF
BS 560 560 RR2EB75TF
BS 561 626 RR2AN90TF

RD RR2EB75TF 586 0 0
GGGCACACCGAA
CGAAGACTCCCAATCATCTCCTTCCTTCTTCGTCTCCGAAACTAAAAATTTGATTCAGCA
GCCATGGCTAATGCAGCGTCAGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAAGTTTCTC
GAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAA
CAAGTGGTCGTCGAGAAAGTCGGCGAGCCTGGTCAATCCCACGACGACTTTGCTGCTAGT
CTCCCTGCCGATGAATGCCGTTACGCTGTTTTCGATTTCGATTTCGTCACTGCTGAGAGC
TGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACGGCAAGAGTGAGAAGC
AAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAGCGTGAGCTTGATGGAATTCAAGTT
GAGCTTCAAGCTACTGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGAGCCAAC
TGAGGAGGAGTTAACATCCTCCAAGAAAAAAAATATATTTGGTTGAATCCAACTACTATT
ACTGAATGATATGCTTGTTCTTTAAGTTTGCTGT

QA 13 586 13 586
DS 

RD RR2AN90TF 626 0 0
GGGCACACCGAACGAAGACTCCCAATCATCTCCTTCCTTCTTCGTCTCCGAAACTAAAAA
TTTGATTCAGCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCAGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAG
CTCAAGTTTCTCGAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAG
GAGCAGCAGAAACAAGTGGTCGTCGAGAAAGTCGGCGAGCCTGGTCAATCCCACGACGAC
TTTGCTGCTAGTCTCCCTGCCGATGAATGCCGTTACGCTGTTTTCGATTTCGATTTCGTC
ACTGCTGAGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACGGCA
AGAGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAGCGTGAGCTTGAT
GGAATTCAAGTTGAGCTTCAAGCTACTGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAA
AGCCGAGCCAACTGAGGAGGAGTTAACATCCTCCAAGAAAAAAAATATATTTGGTTGAAT
CCAACTACTATTACTGAATTATATGCTTGTTCTTTAAGTTTGCTGTGAAAGCAACCACCA
ACCAAACAACTTCATTTCATTGGGTC

QA 1 626 1 626
DS 



CO CL265Contig2 806 11 26 U
ACGACACAATGTGCCAACAAGATTCATCTTTTGGTAAAGGGTTTGGGGGGTTTCTTACAC
AATGGTAAAAGAGCACAAGCCAAATCTCTTAAGTTTTAAGCAAAACACTGCAAGGACCAA
AAAAAAA***TATAAAAGACAATAGGAAGAAGACAAAGACCCAATGAAATGAAGTTGTTT
TGGTTGGTGGT*TGCCTTCACAGCAAACTTAAAGAACAAGCATATCATTCAGTAA*TAGT
AGTTGGATTCAACCAAATATATTTTTTTT*CCTGGAGGGATGT***TAACTCCTCCTCAG
TTGGCTCGGCTTTTGAAAACATCGAGATCCATCTCGGTTGGATCGGTAGCTTGAAGCTCA
ACTTGAATTCCATCAAGCTCACGCTTAAACCTATCCTTAGAGCTCGCGTAGATCATCTTG
CTTCTCACTCTTGCTGTGTCCGGAGACCATGCGACGAAGAAGATCTTGCTCTTCTGGCAG
CTCTCAGCAGTGACGAAATCGAAATCGAAAACAGCGTAACGGCATTCATCGGCAGGGAGA
CAAGCAGCAAAGTCGTCGTGGGATTGACCAGGCTCGCCGACTTTCTCGACGACCACTTGT
TTCTGCTGCTCCTCGATCTTGTAAACGATGAAACGGTAAGTCCGCTTGGCCTTGAGCTCG
AGAAACTTGAGCTTGCAGTCATCATGGACTGCCATTCCTGACGCTGCATTAGCCATGGCT
GCTGAATCAAATTTTTAGTTTCGGAGACGAAGAAGGAAGGAGATGATTGGGAGTCTTCGG
GTGTTCGGTGTGCGTCTTTTCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 35 35 45 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 25 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 15 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 25 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 10 65 65 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 10 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 10 10 10 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 20 35 35 35 15 30 30 15 30 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF61JQ U 1
AF RR2D928JQ U 33
AF RR2DC03JQ U 11
AF RR2EJ25JQ U 64
AF RR2EJ25TF C 67
AF RR2FJ11TF C 69
AF RR2FJ11JQ U 70
AF RR2FD27TF C 71
AF RR2BY21JQ U 98
AF RR2BY21TF C 130
AF RR2DC03TF C 127
BS 1 151 RR2EF61JQ
BS 152 152 RR2DC03JQ
BS 153 221 RR2EF61JQ
BS 222 222 RR2DC03JQ
BS 223 271 RR2EF61JQ
BS 272 272 RR2DC03JQ
BS 273 278 RR2EF61JQ
BS 279 279 RR2DC03JQ
BS 280 344 RR2EF61JQ
BS 345 345 RR2DC03JQ
BS 346 410 RR2EF61JQ
BS 411 411 RR2DC03JQ
BS 412 434 RR2EF61JQ
BS 435 435 RR2DC03JQ
BS 436 458 RR2EF61JQ
BS 459 459 RR2DC03JQ
BS 460 461 RR2EF61JQ
BS 462 530 RR2DC03JQ
BS 531 531 RR2D928JQ
BS 532 545 RR2DC03JQ
BS 546 546 RR2D928JQ
BS 547 697 RR2DC03JQ
BS 698 747 RR2EJ25JQ
BS 748 752 RR2FJ11JQ
BS 753 784 RR2BY21JQ
BS 785 806 RR2DC03TF

RD RR2EF61JQ 463 0 0
ACGACACAATGTGCCAACAAGATTCATCTTTTGGTAAAGGGTTTGGGGGGTTTCTTACAC
AATGGTAAAAGAGCACAAGCCAAATCTCTTAAGTTTTAAGCAAAACACTGCAAGGACCAA
AAAAAAA***TATAAAAGACAATAGGAAGAAAACAAAGACCCAATGAAATGAAGTTGTTT
TGGTTGGTGGT*TGCCTTCACAGCAAACTTAAAGAACAAGCGTATCATTCAGTAA*TAGT
AGTTGGATTCAACCAAATATATTTTTTTT*CTTGGAGG*ATGT***TAACTCCTCCTCAG
TTGGCTCGGCTTTTGAAAACATCGAGATCCATCTCGGTTGGATCAGTAGCTTGAAGCTCA
ACTTGAATTCCATCAAGCTCACGCTTAAACCTATCCTTAGAGCTCGCGTAAATCATCTTG
CTTCTCACTCTTGCCGTGTCCGGAGACCATGCGACGAAAAA
AA

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR2D928JQ 560 0 0
GGTAAAGGGGTTGG
GGGGTTTCTTACACAATGGTAAAAGAGCACAAGCCAAATCTCTTAAGTTTTAAGCAAAAC
ACTGCAAGGACCAAAAAAAAA***TATAAAAGACAATAGGAAGAAGACAAAGACCCAATG
AAATGAAGTTGTTTTGGTTGGTGGTGTGCCTTCACAGCAAACTTAAAGAACAAGCATATA
ATTCAGTAA*TAGTAGTTGGATTCAACCAAATATATTTTTTTTTCCTGGAGGGATGTATG
TAACTCCTCCTCAGTTGGCTCGGCTTTTGAAAACATCGAGATCCATCTCGGTTGGATCGG
TAGCTTGAAGCTCAACTTGAATTCCATCGAGCTCACGCTTAAACCTATCCTTAAAGCTCG
CGTAAATCATCTTGCTTCTCACTCTTGCTGTGTCCGGAGACCATGCGACGAAAAAAATCT
TGCTCTTCTGGCAGCTCTCAGCAGTGACGAAATCAAAATCGAAAACAGCGTAACGGCATT
CATCGGCAGGGAGACAAGCAGCAAAGTCGTCGTGGGATTGACCAGGCTCGCCGACTTTCT
CGACGA

QA 15 560 15 560
DS 

RD RR2DC03JQ 687 0 0
GTGCCAACAAGATTCATCTTT*GGTAAAGGGTTTGGGGGGTTTCTTACACAATGGTAAAA
GAGCACAAGCCAAATCTCTTAAGTTTTAAGCAAAACACTGCAAGGACCAAAAAAAAAAA*
TATAAAAGACAATAGGAAGAAGACAAAGACCCAATGAAATGAAGTTGTTTTGGTTGGTGG
T*TGCCTTCACAGCAAACTTAAAGAACAAGCATATCATTCAGTAAATAGTAGTTGGATTC
AACCAAATATATTTTTTTTTCCTGGAGGGATGG***TAACTCCTCCTCAGTTGGCTCGGC
TTTTGAAAACATCGAGATCCATCTCGGTTGGATCGGTAGCTTGAAGCTCAACTTGAATTC
CATCAAGCTCACGCTTAAACCTATCCTTGGAGCTCGCGTAGATCATCTTGTTTCTCACTC
TTGCTGTGTCCGGAGACCATGCGACGAAGAAGATCTTGCTCTTCTGGCAGCTCTCAGCAG
TGACGAAATCGAAATCGAAAACAGCGTAACGGCATTCATCAGCAGGGAGACAAGCTGCAA
AGTCGTCGTGGGATTGACCAGGCTCGCCGACTTTCTCGACGACCACTTGTTTCTGCTGCT
CCTCGATCTTGTAAACGATGAAACGGTAAGTCCGCTTGGCCTTGAGCTCGAGAAACTTGA
GCTTGCAGTCATCATGGACTGCCATTC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2EJ25JQ 684 0 0
GGTAAAAGAGCACAAGCCAAATCTCTTAAGTTTTAAGCAAAACACTGCAAGGACCAAAAA
AAAAAAATATAAAAGACAATAGGAAGAAGACAAAGACCCAATGAAATGAAGTTGTTTTGG
TTGGTGGT*TGCCTTCACAGCAAACTTAAAGAACAAGCATATCATTCAGTAAATAGTAGT
TGGATTCAACCAAATATATTTTTTTT*CCTGGAGGGATGG***TAACTCCTCCTCAGTTG
GCTCGGCTTTTGAAAACATCGAGATCCATCTCGGTTGGATCGGTAGCTTGAAGCTCAACT
TGAATTCCATCAAGCTCACGCTTAAACCTATCCTTGGAGCTCGCGTAGATCATCTTGCTT
CTCACTCTTGCTGTGTCCGGAGACCATGCGACGAAAAAGATCTTGCTCTTCTGGCAGCTC
TCAGCAGTGACGAAATCGAAATCGAAAACAGCGTAACGGCATTCATCAGCAGGGAGACAA
GCTGCAAAGTCGTCGTGGGATTGACCAGGCTCGCCGACTTTCTCGACGACCACTTGTTTC
TGCTGCTCCTCGATCTTGTAAACGATGAAACGGTAAGTCCGCTTGGCCTTGAGCTCGAGA
AACTTGAGCTTGCAGTCATCATGGACTGCCATTCCTGACGCTGCATTAGCCATGGCTGCT
GAATCAAATTTTTAGTTTCGGAGA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2EJ25TF 725 0 0
T
AAAGAGCACAAGCCAAATCTCT*AAGTTT*AAGCAAA*CACTGCAAGGACCAAAAAAAAA
AA*TATAAAAGACAATAGGAAGAAGACAAAGACCCAATGAAATGAAGTTGTTTTGGTTGG
TGGT*TGCTTTCACAGCAAACTTAAAGAACAAGCATATCATTCAGTAAATAGTAGTTGGA
TTCAACCAAATATATTTTTTTT*CCTGGAGGGATGG***TAACTCCTCCTCAGTTGGCTC
GGCTTTTGAAAACATCGAGATCCATCTCGGTTGGATCGGTAGCTTGAAGCTCAACTTGAA
TTCCATCAAGCTCACGCTTAAACCTATCCTTGGAGCTCGCGTAGATCATCTTGCTTCTCA
CTCTTGCTGTGTCCGGAGACCATGCGACGAAGAAGATCTTGCTCTTCTGGCAGCTCTCAG
CAGTGACGAAATCGAAATCGAAAACAGCGTAACGGCATTCATCAGCAGGGAGACAAGCTG
CAAAGTCGTCGTGGGATTGACCAGGCTCGCCGACTTTCTCGACGACCACTTGTTTCTGCT
GCTCCTCGATCTTGTAAACGATGAAACGGTAAGTCCGCTTGGCCTTGAGCTCGAGAAACT
TGAGCTTGCAGTCATCATGGACTGCCATTCCTGACGCTGCATTAGCCATGGCTGCTGAAT
CAAATTTTTAGTTTCGGAGACGAAGAAGGAAGGAGATGATTGGGAGTC
GAGTCTTCGGTGTGCG

QA 2 709 2 709
DS 

RD RR2FJ11TF 723 0 0
T
AGAGTACAAGCCAAA*CTCTTAAGTTTTAAGCAAAACACTGCAAGGACCAAAAAAAA***
*TATAAAAGACAATAGGAAGAAGACAAAGACCCAATGAAATGAAGTTGTTTTGGTTGGTG
GT*TGCCTTCACAGCAAACTTAAAGAACAAGCATATCATTCAGTAA*TAGTAGTTGGATT
CAACCAAATATATTTTTTTT*CTTGGAGG*ATGT***TAACTCCTCCTCAGTTGGCTCGG
CTTTTGAAAACATCGAGATCCATCTCGGTTGGATCAGTAGCTTGAAGCTCAACTTGAATT
CCATCAAGCTCACGCTTAAACCTATCCTTAGAGCTCGCGTAGATCATCTTGCTTCTCACT
CTTGCCGTGTCCGGAGACCATGCGGCGAAGAAGATCTTGCTCTTCTGGCAGCTCTCAGCA
GTGACGAAATCGAAATCGAAAACAGCGTAACGGCATTCATCGGCAGGGAGACTAGCAGCA
AAGTCGTCGTGGGATTGACCAGGCTCGCCGACTTTCTCGACGACCACTTGTTTCTGCTGC
TCCTCGATCTTGTAAACGATGAAACGGTAAGTCCGCTTGGCCTTGAGCTCGAGAAACTTG
AGCTTGCAGTCATCATGGACTGCCATTCCTGACGCTGCATTAGCCATGGCTGCTGAATCA
AATTTTTAGTTTCGGAGACGAAGAAGGAAGGAGATGATTGGGAGCCTTCG
TTCGGTGTGCCC

QA 2 711 2 711
DS 

RD RR2FJ11JQ 683 0 0
AGAGTACAAGCCAAACCTCTTAAGTTTTAAGCAAAACACTGCAAGGACCAAAAAAAA***
*TATAAAAGACAATAGGAAGAAGACAAAGACCCAATGAAATGAAGTTGTTTTGGTTGGTG
GT*TGCCTTCACAGCAAACTTAAAGAACAAGCATATCATTCAGTAA*TAGTAGTTGGATT
CAACCAAATATATTTTTTTT*CTTGGAGG*ATGT***TAACTCCTCCTCAGTTGGCTCGG
CTTTTGAAAACATCGAGATCCATCTCGGTTGGATCAGTAGCTTGAAGCTCAACTTGAATT
CCATCAAGCTCACGCTTAAACCTATCCTTAGAGCTCGCGTAGATCATCTTGCTTCTCACT
CTTGCCGTGTCCGGAGACCATGCGGCGAAAAAGATCTTGCTCTTCTGGCAGCTCTCAGCA
GTGACGAAATCGAAATCGAAAACAGCGTAACGGCATTCATCGGCAGGGAGACTAGCAGCA
AAGTCGTCGTGGGATTGACCAGGCTCGCCGACTTTCTCGACGACCACTTGTTTCTGCTGC
TCCTCGATCTTGTAAACGATGAAACGGTAAGTCCGCTTGGCCTTGAGCTCGAGAAACTTG
AGCTTGCAGTCATCATGGACTGCCATTCCTGACGCTGCATTAGCCATGGCTGCTGAATCA
AATTTTTAGTTTCGGAGACGAAG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2FD27TF 716 0 0
GAGCACAAGCCAAATCTCTTAAGTTT*AAGCAAAACACTGCAAGGACCAAAAAAAA****
TATAAAAGACAATAGGAAGAAGACAAAGACCCAATGAAATGAAGTTGTTTTGGTTGGTGG
TGTGCCTTCACAGCAAACTTAAAGAACAAGCATATCATTCAGTAA*TAGTAGTTGGATTC
AACCAAATATATTTTTTTT*CCTGGAGGGATGTATGTAACTCCTCCTCAGTTGGCTCGGC
TTTTGAAAACATCGAGATCCATCTCGGTTGGATCGGTAGCTTGAAGCTCAACTTGAATTC
CATCGAGCTCACGCTTAAACCTATCCTTAGAGCTCGCGTAGATCATCTTGCTTCTCACTC
TTGCTGTGTCCGGAGACCATGCGACGAAGAAGATCTTGCTCTTCTGGCAGCTCTCAGCAG
TGACGAAATCAAAATCGAAAACAGCGTAACGGCATTCATCGGCAGGGAGACAAGCAGCAA
AGTCGTCGTGGGATTGACCAGGCTCGCCGACTTTCTCGACGATCACTTGTTTCTGCTGCT
CCTCGATCTTGTAAACGATGAAACGGTAAGTCCGCTTGGCCTTGAGCTCGAGAAACTTGA
GCTTGCAGTCATCGTGGACTGCCATGCCTGACGCTGCATTAGCCATGGCTGCTGAATCAA
ATT***AGTTTCAGAGACGAAGAAGGAAGGAGATGATTGGGAGTCTTCGGGTGT
CC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2BY21JQ 691 0 0
AAGCAAAACACTGCAAGGACCAAAAAAAAA***TATAAAAGACAATAGGAAGAAGACAAA
GACCCAATGAAATGAAGTTGTTTTGGTTGGTGGTGTGCCTTCACAGCAAACTTAAAGAAC
AAGCATATCATTCAGTAA*TAGTAGTTGGATTCAACCAAATATATTTTTTT**CCTGGAG
GGATGTATGTAACTCCTCCTCAGTTGGCTCGGCTTTTGAAAACATCGAGATCCATCTCGG
TTGGATCGGTAGCTTGAAGCTCAACTTGAATTCCATCGAGCTCACGCTTAAACCTATCCT
TAGAGCTCGCGTAGATCATCTTGCTTCTCACTCTTGCTGTGTCCGGAGACCATGCGACGA
AAAAGATCTTGCTCTTCTGGCAGCTCTCAGCAGTGACGAAATCAAAATCGAAAACAGCGT
AACGGCATTCATCGGCAGGGAGACAAGCAGCAAAGTCGTCGTGGGATTGACCAGGCTCGC
CGACTTTCTCGACGATCACTTGTTTCTGCTGCTCCTAGATCTTGTAAACGATGAAACGGT
AAGTCCGCTTGGCCTTGAGCTCGAGAAACTTGAGCTTGCAGTCATCGTGGACTGCCATGC
CTGACGCTGCATTAGCCATGGCTGCTGAATCAAATT***AGTTTCAGAGACGAAGAAGGA
AGGAGATGATTGGGAGTCTTCGGGTGT
GCCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2BY21TF 659 0 0
ATATAAAAGACAATAGGAAGAAGACAAAGACCCAATGAAATGAAGTTGTTTTGGTTGGTG
GTGTGCCTTCACAGCAAACTTAAAGAACAAGCATATCATTCAGTAA*TAGTAGTTGGATT
CAACCAAATATATTTTTTT**CCTGGAGGGATGTATGTAACTCCTCCTCAGTTGGCTCGG
CTTTTGAAAACATCGAGATCCATCTCGGTTGGATCGGTAGCTTGAAGCTCAACTTGAATT
CCATCGAGCTCACGCTTAAACCTATCCTTAGAGCTCGCGTAGATCATCTTGCTTCTCACT
CTTGCTGTGTCCGGAGACCATGCGACGAAGAAGATCTTGCTCTTCTGGCAGCTCTCAGCA
GTGACGAAATCAAAATCGAAAACAGCGTAACGGCATTCATCGGCAGGGAGACAAGCAGCA
AAGTCGTCGTGGGATTGACCAGGCTCGCCGACTTTCTCGACGATCACTTGTTTCTGCTGC
TCCTAGATCTTGTAAACGATGAAACGGTAAGTCCGCTTGGCCTTGAGCTCGAGAAACTTG
AGCTTGCAGTCATCGTGGACTGCCATGCCTGACGCTGCATTAGCCATGGCTGCTGAATCA
AATT***AGTTTCAGAGACGAAGAAGGAAGGAGATGATTGGGAGTCTTCGGGTGT
GCCC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2DC03TF 680 0 0
AAAAATAT
AAAGACAATAGGAAGAAGACAAAGACCCAATGAAATGAAGTTGTTTTGGTTGGTGGT*TG
CCTTCACAGCAAACTTAAAGAACAAGCATATCATTCAGTAAATAGTAGTTGGATTCAACC
AAATATATTTTTTTTTCCTGGAGGGATGG***TAACTCCTCCTCAGTTGGCTCGGCTTTT
GAAAACATCGAGATCCATCTCGGTTGGATCGGTAGCTTGAAGCTCAACTTGAATTCCATC
AAGCTCACGCTTAAACCTATCCTTGGAGCTCGCGTAGATCATCTTGTTTCTCACTCTTGC
TGTGTCCGGAGACCATGCGACGAAGAAGATCTTGCTCTTCTGGCAGCTCTCAGCAGTGAC
GAAATCGAAATCGAAAACAGCGTAACGGCATTCATCAGCAGGGAGACAAGCTGCAAAGTC
GTCGTGGGATTGACCAGGCTCGCCGACTTTCTCGACGACCACTTGTTTCTGCTGCTCCTC
GATCTTGTAAACGATGAAACGGTAAGTCCGCTTGGCCTTGAGCTCGAGAAACTTGAGCTT
GCAGTCATCATGGACTGCCATTCCTGACGCTGCATTAGCCATGGCTGCTGAATCAAATTT
TTAGTTTCGGAGACGAAGAAGGAAGGAGATGATTGGGAG***TCGAGTCTTCGGTGTGCG
TCTTTTCTCTCC

QA 9 680 9 680
DS 



AS 2 12

CO CL266Contig1 808 5 2 U
GGATCACAAGATGGAACCAGATATGGAGAATTTGATTCCGTCCAAAGGAATTCTCAAGAA
CGAGGAGCTCAAAAAGTACATCTTTGAAACAACGGCATATCCAAGAGAGCATGAAGAGCT
CAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAGATGGAGGTACC
GGTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCCAAGAACACGCT
AGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCACGACGGCCCTCGCATTGCCCCAAGA
TGGCCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTCTAGAGTTCAT
CAAGAATGCTGGTGTTGATCACAAAATCAACTTCATCCAATCTGATGGTCTTCAGGCCTT
AGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAACCGGAGTATGATTTCGCATTTGTGGACGCTGA
TAAACCAAACTATGGTAAAACCCTCGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAGGGGG*AA
TAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGG*TTTGTGGCCGAGGAGGAGGAAACTGTG
CCAGTGCACATGAGGGTTAACAGAAAAGCGCTCATGGAATTGAACAAGCAGCTCGCTTCT
GATCCTCGCATTGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGGTGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGC
CTTGTGTGATCAAAAGAGACTCATCCAATGTTCTTGGTTTTTACTTAATCAAGTTTTAAG
AATCTTTAATGCTCTCTTTTCCTCTGTT


BQ
10 10 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B354TF U 7
AF RR2A611TF U 1
AF RR2DB30TF U 1
AF RR2FM38TF U 3
AF RR2A611JQ C 22
BS 1 775 RR2A611TF
BS 776 808 RR2A611JQ

RD RR2B354TF 576 0 0
CAAGACGGAACCAGATATGGAGAATTTGATTCCGTCCAAAGGAATTCTCAAGAACGAGGA
GCTCAAAAAGTACATCTTTGAAACAACGGCATATCCAAGAGAGCATGAAGAGCTCAAGAA
ACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAGATGGAGGTACCGGTTGA
TGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCCAAGAACACGCTAGAACT
CGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCACGACGGCCCTCGCATTGCCCCAAGATGGCCG
TATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTCTAGAGTTCATCAAGAA
TGCTGGTGTTGATCACAAAATCAACTTCATCCAATCTGATGGTCTTCAGGCCTTAGACAA
GTTGCTGACCGAGAATCCAAAACCGGAGTATGATTTCGCATTTGTGGACGCTGATAAACC
AAACTATGGTAAAGCCCTCGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAGGGGGGAATAATAG
CTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGGTTTGTGGCC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2A611TF 775 0 0
GGATCACAAGATGGAACCAGATATGGAGAATTTGATTCCGTCCAAAGGAATTCTCAAGAA
CGAGGAGCTCAAAAAGTACATCTTTGAAACAACGGCATATCCAAGAGAGCATGAAGAGCT
CAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAGATGGAGGTACC
GGTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCCAAGAACACGCT
AGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCACGACGGCCCTCGCATTGCCCCAAGA
TGGCCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTCTAGAGTTCAT
CAAGAATGCTGGTGTTGATCACAAAATCAACTTCATCCAATCTGATGGTCTTCAGGCCTT
AGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAACCGGAGTATGATTTCGCATTTGTGGACGCTGA
TAAACCAAACTATGGTAAAACCCTCGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAGGGGG*AA
TAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGG*TTTGTGGCCGAGGAGGAGGAAACTGTG
CCAGTGCACATGAGGGTTAACAGAAAAGCGCTCATGGAATTGAACAAGCAGCTCGCTTCT
GATCCTCGCATTGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGGTGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGC
CTTGTGTGATCAAAAGAGACTCATCCAATGTTCTTGGTTTTTACTTAATCAAGTT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2DB30TF 749 0 0
GG
ATCACAAGATGGAACCAGATATGGAGAATTTGATTCCGTCCAAAGGAATTCTCAAGAACG
AGGAGCTCAAAAAGTACATCTTTGAAACAACGGCATATCCAAGAGAGCGTGAAGAGCTCA
AGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAGATGGAGGTACCGG
TTGTTGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCCAAGAACACGCTAG
AACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCATTGCTCACGACGGCCCTCGCATTGCCCCAAGATG
GCCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTCTAGAGTTCATCA
AGAATGCTGGTGTTGATCACAAAATCAACTTCATCCAATCTGATGGTCTTCAGGCCTTAG
ACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAACCGGAGTATGATTTCGCATTTGTGGACGCTGATA
AACCAAACTATGGTAAAGCCCTCGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAGGGGG*AATA
ATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGG*TTTGTGGCCGAGGAGGAGGAAACTGTGCC
AGTGCACATGAGGGTTAACAGAAAAGCGCTCATGGAATTGAACAAGCAGCTCGCTTCTGA
TCCTCGCATTGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGGTGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCT
TGTGTGATCAAA*GAGACTCATCCA
TG

QA 3 747 3 747
DS 

RD RR2FM38TF 772 0 0
ATCACAAGATGGAACCAGATATGGAGAATTTGATTCCGTCCAAAGGAATTCTCAAGAACG
AGGAGCTCAAAAAGTACATCTTTGAAACAACGGCATATCCAAGAGAGCATGAAGAGCTCA
AGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAGATGGAGGTACCGG
TTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCCAAGAACACGCTAG
AACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCACGACGGCCCACGCATTGCCCCAAGATG
GCCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTCTAGAGTTCATCA
AGAATGCTGGTGTTGATCACAAAATCAACTTCATCCAATCTGATGGTCTTCAGGCCTTAG
ACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAACCGGAGTATGATTTCGCATTTGTGGACGCTGATA
AACCAAACTATGGTAAAGCCCTCGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAGGGGG*AATA
ATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGG*TTTGTGGCCGAGGAGGAGGAAACTGTGCC
AGTGCACATGAGGGTTAACAGAAAAGCGCTCATGGAATTGAACAAGCAGCTCGCTTCTGA
TCCTCGCATTGAG*TCTCTCAAGTCTCCATTGGTGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCT
TGTGTGATCAAA*GAGACTCATCCA*TGTTCTTGGTTTT
ACTTATCAGTTTT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2A611JQ 787 0 0
TATGGAGAATTTGATTCCGTCCAAAGGAATTCTCAAGAACGAGGAGCTCAAAAAGTACAT
CTTTGAAACAACGGCATATCCAAGAGAGCATGAAGAGCTCAAGAAACTACGAGAAGCTAC
GGTCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAGATGGAGGTACCGGTTGATGAGGGACACTTTCT
ATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCCAAGAACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGG
CTACTCGTTGCTCACGACGGCCCTCGCATTGCCCCAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGA
TATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTCTAGAGTTCATCAAGAATGCTGGTGTTGATCA
CAAAATCAACTTCATCCAATCTGATGGTCTTCAGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAGAA
TCCAAAACCGGAGTATGATTTCGCATTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTATGGTAAAAC
CCTCGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAGGGGG*AATAATAGCTTTTGATAACACAT
TGTGGTTTGGG*TTTGTGGCCGAGGAGGAGGAAACTGTGCCAGTGCACATGAGGGTTAAC
AGAAAAGCGCTCATGGAATTGAACAAGCAGCTCGCTTCTGATCCTCGCATTGAGGTCTCT
CAAGTCTCCATTGGTGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCTTGTGTGATCAAAAGAGACT
CATCCAATGTTCTTGGTTTTTACTTAATCAAGTTTTAAGAATCTTTAATGCTCTCTTTTC
CTCTGTT

QA 1 787 1 787
DS 



CO CL266Contig2 939 7 16 U
GGAGGTACAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAGGAAAGGATATGGAGAATTTGATTCCGTCCAA
AGGAATTCTCAAGAACGAGGAACTCAGAAATTACATCTTCGAAACATCGGCATATCCAAG
AGAGCATGAAGAACTCAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAATTATGGCAATTTAAG
CGAGATGGAGGTACCGGTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAA
TGCCAAGAACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCACGACGGCCCT
CGCATTACCCCAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGACATTGACAAAGAAGCTTACGAGAT
GGGTCTAGAGTTCATCAAGAATGCTGGTGTTGATCACAAAATCAACTTCATCCAATCTGA
TGGTCTTCAGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAGCCGGAGTATGATTTCGC
ATTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTATGGTAAAGCCCTTGAGAGACTAATGAAGCTGGT
GAAGGTAGGGGGAATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTGGCCGAGGA
AGAGGAAACCGTGCCAATGCGCATGAGGGTGAACAGAAAAGCCCTCATGGAGCTGAACAA
GCAGCTCGCTTCTGATCCTCGCATTGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGG*TGATGGTGTCA
CTCTCTGCAGACGCCTTGTGTGATTGAAAGAGACTCATCCAATGTTCCTTGGTTTTTACT
TTCTTTTTTTTT**TGGTAAAATGTTCCTTGGTTTTTACTTAAAATCAAGTTTTAAGAAT
CTTTAAAGCTCTCTTGTCTCTTTACTTGTTCATTCCGTGTTGCGTTTGTGTGTGTGTGTT
GGATTCTGCTAAAGAATAAAGATTTGTTCCTTTTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 0 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2H572TF U 4
AF RR2C349TF U 5
AF RR2FX30TF U 1
AF RR2BG50TF U 5
AF RR2BG50JQ C 58
AF RR2H572JQB C 419
AF RR2C349JQ C 461
BS 1 99 RR2FX30TF
BS 100 100 RR2BG50TF
BS 101 677 RR2FX30TF
BS 678 678 RR2C349TF
BS 679 688 RR2FX30TF
BS 689 689 RR2BG50TF
BS 690 708 RR2FX30TF
BS 709 709 RR2C349TF
BS 710 761 RR2FX30TF
BS 762 762 RR2BG50TF
BS 763 776 RR2FX30TF
BS 777 777 RR2BG50TF
BS 778 788 RR2FX30TF
BS 789 831 RR2BG50TF
BS 832 936 RR2BG50JQ
BS 937 939 RR2C349JQ

RD RR2H572TF 350 0 0
GGGAC
AAAAGAAAAAGAAAAAGAAAGGAAAGGATATGGAGAATTTGATTCCGTCCAAAGGAATTC
TCAAGAACGAGGAACTCAGAAATTACATCTA**AAACATCGGCATATCCAAGAGAGCATG
AAGAACTCAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAATTATGGCAATTTAAGCGAGATGG
AGGTACCGGTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAGAAATGATGAATGCCAAGA
ACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCACGACGGCCCTCGCATTAC
CCCAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGACATTGACAAAGAAGCTT

QA 6 350 6 350
DS 

RD RR2C349TF 742 0 0
GGAC
AAAAGAAAAAGAAAAAGAAAGGAAAGGATATGGAGAATTTGATTCCGTCCAAAGGAATTC
TCAAGAACGAGGAACTCAGAAATTACATCTTTGAAACATCGGCATATCCAAGAGAGCATG
AAGAACTCAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAATTATGGCAATTTAAGCGAGATGG
AGGTACCGGTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAATGCCAAGA
ACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCACGACGGCCCTCGCATTAC
CCCAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGACATTGACAAAGAAGCTTACGAGATGGGTCTAG
AGTTCATCAAGAATGCTGGTGTTGATCACAAAATCAACTTCATCCAATCTGATGGTCTTC
AGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAGCCGGAGTATGATTTCGCATTTGTGG
ACGCTGATAAACCAAACTATGGTAAAGCCCTTGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAG
GGGGAATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTGGCCGAGGAAGAGGAAA
CCGTGCCAATGCGCATGAGGGTGAACAGAAAAGCCCTCATGGAGCTGAACAAGCAGCTCG
CTTCTGATCCTCGCATTGAG*TCTCTCAAGTCTCCATTGG*TGATGGTGTCACTCTCTGC
AGACGCCTCGTGTGATTG

QA 5 742 5 742
DS 

RD RR2FX30TF 788 0 0
GGAGGTACAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAGGAAAGGATATGGAGAATTTGATTCCGTCCAA
AGGAATTCTCAAGAACGAGGAACTCAGAAATTACATCTTTGAAACATCGGCATATCCAAG
AGAGCATGAAGAACTCAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAATTATGGCAATTTAAG
CGAGATGGAGGTACCGGTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAA
TGCCAAGAACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCACGACGGCCCT
CGCATTACCCCAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGACATTGACAAAGAAGCTTACGAGAT
GGGTCTAGAGTTCATCAAGAATGCTGGTGTTGATCACAAAATCAACTTCATCCAATCTGA
TGGTCTTCAGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAGCCGGAGTATGATTTCGC
ATTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTATGGTAAAGCCCTTGAGAGACTAATGAAGCTGGT
GAAGGTAGGGGGAATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTGGCCGAGGA
AGAGGAAACCGTGCCAATGCGCATGAGGGTGAACAGAAAAGCCCTCATGGAGCTGAACAA
GCAGCTCGCTTCTGATC*TCGCATTGAG*TCTCTCAAGTCTCCATTGGGTGATGGTGTCA
CTCTCTGCAGACGCCTTGTGTGATTGAAAGAGACTCATCCA*TGTTCCTTGGTTTT*ACT
TTCTTTTT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2BG50TF 827 0 0
GACA
AAAAGAAAAAGAAAAAGAAAGGAAAGGATATGGAGAATTTGATTCCGTCCAAAGGAATTC
TCAAGAACGAGGAACTCAGAAATTACATCTTCGAAACATCGGCATATCCAAGAGAGCATG
AAGAACTCAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAATTATGGCAATTTAAGCGAGATGG
AGGTACCGGTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAATGCCAAGA
ACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCACGACGGCCCTCGCATTAC
CCCAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGACATTGACAAAGAAGCTTACGAGATGGGTCTAG
AGTTCATCAAGAATGCTGGTGTTGATCACAAAATCAACTTCATCCAATCTGATGGTCTTC
AGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAGCCGGAGTATGATTTCGCATTTGTGG
ACGCTGATAAACCAAACTATGGTAAAGCCCTTGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAG
GGGGAATAATAGCTTTTGACAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTGGCCGAGGAAGAGGAAA
CCGTGCCAATGCGCATGAGGGTGAACAGAAAAGCCCTCATGGAGCTGAACAAGCAGCTCG
CTTCTGATCCTCGCATTGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGGGTGATGGTGTCACTCTCTGC
AGACGCCTTGTGTGATTGAAAGAGACTCATCCAATGTTCCTTGGTTTTTACTTTCTTTTT
TTTT**TGGTAAAATGTTCCTTGGTTTTTACTTAAAATCAAGT

QA 5 827 5 827
DS 

RD RR2BG50JQ 881 0 0
CAAAGGAATTCTCAAGAACGAGGAACTCAGAAATTACATCTTCGAAACATCGGCATATCC
AAGAGAGCATGAAGAACTCAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAATTATGGCAATTT
AAGCGAGATGGAGGTACCGGTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGAT
GAATGCCAAGAACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCACGACGGC
CCTCGCATTACCCCAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGACATTGACAAAGAAGCTTACGA
GATGGGTCTAGAGTTCATCAAGAATGCTGGTGTTGATCACAAAATCAACTTCATCCAATC
TGATGGTCTTCAGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAGCCGGAGTATGATTT
CGCATTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTATGGTAAAGCCCTTGAGAGACTAATGAAGCT
GGTGAAGGTAGGGGGAATAATAGCTTTTGACAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTGGCCGA
GGAAGAGGAAACCGTGCCAATGCGCATGAGGGTGAACAGAAAAGCCCTCATGGAGCTGAA
CAAGCAGCTCGCTTCTGATCCTCGCATTGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGG*TGATGGTG
TCACTCTCTGCAGACGCCTTGTGTGATTGAAAGAGACTCATCCAATGTTCCTTGGTTTTT
ACTTTCTTTTTTTTT**TGGTAAAATGTTCCTTGGTTTTTACTTAAAATCAAGTTTTAAG
AATCTTTAAAGCTCTCTTGTCTCTTTACTTGTTCATTCCGTGTTGCGTTTGTGTGTGTGT
GTTGGATTCTGCTAAAGAATAAAGATTTGTTCCTTTTTG
CT

QA 1 879 1 879
DS 

RD RR2H572JQB 520 0 0
GATGGTCTTCAGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAGCCGGAGTATGATTTC
GCATTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTATGGTAAAGCCCTTGAGAGACTAATGAAGCTG
GTGAAGGTAGGGGGAATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTGGCCGAG
GAAGAGGAAACCGTGCCAATGCGCATGAGGGTGAACAGAAAAGCCCTCATGGAGCTGAAC
AAGCAGCTCGCTTCTGATCCTCGCATTGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGG*TGATGGTGT
CACTCTCTGCAGACGCCTTGTGTGATTGAAAGAGACTCATCCAATGTTCCTTGGTTTTTA
CTTTCTTTTTTTTT**TGGTAAAATGTTCCTTGGTTTTTACTTAAAATCAAGTTTTAAGA
ATCTTTAAAGCTCTCTTGTCTCTTTACTTGTTCATTCCGTGTTGCGTTTGTGTGTGTGTG
TTGGATTCTGCTAAAGAATAAAGATTTGTTCCTTTTTG
TC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2C349JQ 479 0 0
AAGCGGGAGTATGATTTCGCATTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTATGGTAAAGCCCTT
GAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAGGGGGAATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGG
TTTGGGTTTGTGGCCGAGGAAGAGGAAACCGTGCCAATGCGCATGAGGGTGAACAGAAAA
GCCCTCATGGAGCTGAACAAGCAGCTCGCTTCTGATCCTCGCATTGAGGTCTCTCAAGTC
TCCATTGG*TGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCTCGTGTGATTGAAAGAGACTCATCC
AATGTTCCTTGGTTTTTACTTTCTTTTTTTTTTTTGGTAAAATGTTCCTTGGTTTTTACT
TAAAATCAAGTTTTAAGAATCTTTAAAGCTCTCTTGTCTCTTTACTTGTTCATTCCGTGT
TGCGTTTGTGTGTGTGTGTTGGATTCTGCTAAAGAATAAAGATTTGTTCCTTTTTGTCC

QA 1 479 1 479
DS 



AS 3 13

CO CL267Contig1 1384 5 9 U
GCCGGGGGAACGCACAGCTCTGATATAAAAGAACCTTTCATCGTCTTTCGTCTACCTCTG
CGAATCAAAACCTATTTCCGCCATGGCTGCTCTTCAATACTTGGAATCTCTGAAAACTTC
GCACCCAGAGCTCAATGAATGGTACAATTCCCTCGCAGATCTGTATCAGAAAAAGCTATG
GCATCAGCTCACCCTCAAGCTCGAGCAGTTCATCGCTCTCTCCGTTTTTCAGGCTGGAGA
TGCTTTGGTACAGTTCTACCACAACTTCATCACCGACTTCGAGACGAAGATCAACCTCCT
CAAGCTTGCGCATTTCGCCGTGGTGGTCTCCCGTCAGTACTCTGAGAAAGAAGCTGCGGT
CGGCTACCTCGAAGGAGTGATTGAGAAGCTCAAAGCCACTAAAGAGCCTCGCATCACTGA
ACCGATCGTTTACATCGAGACGCAAAAGGCTTTGTTCAAGCTTGAGCAAGGTGATCAGAA
GGAGTGCAAGAAGGTTTTGGACGATGCCAAGACCTCTCTTGATAGCATGACTGATATTGA
TCCTTCGGTCCACGCTAACTTCTACTGGGTGTCTTCTCAGTACCACAAGTTCCGTCAGGA
GTTCTCTGATTTCTACAAAAGTGCTCTGCTTTTTCTTGCGTATACCTCTGTGGAGGCACT
CTCTGAATCCTTTAAGCTGGATTTGGCTTTCGATTTGTCACTTTCAGCTCTACTTGGAGA
AAACATCTACAACTTTGGGGAACTCTTGGCTCATCCCATTTTGAAAAGTCTCCTTGGAAC
AAATGTGGAATGGCTTTACCACATTCTCCAGGCGTTCAACCATGGTGACTTAGTTCAGTA
TCAAGAACTGTGTCGCGTGCACCATGCATCCTTGATTGCCCAACCTGCGCTGGTTGAGAA
TGAGAAGAAACTATTGGAGAAGATCAACATTTTTTGCCTTATCGAGATCATTTTCAGCCG
ACCTGCTGAAGATAGGACTATTCCTTTGACTGTCATTGCTGAGCGTACTAAACTTTCCAT
TGAAGACGTTGAGCACCTTTTCATGAAGAGTCTTTCTGTGCATTTGATTGAGGGGACTAT
AGATCAAGTGAATGGAACAGTTTACATCTCATGGGCCCAACCGAGAGTGTTGGGGATTCC
ACAGATCAAGTCTTTGAGGGATCAATTGGACAGTTGGGTCGACAAAGTCCACACCACTTT
GCTATCTGTTGAGGCTGAGACACCAGATCTTGTTGCCGCATAAGAAAAACCTGCCTTTTT
CCTTTTAGAGCTTACTGATTATAACTCTGTTTCTGGGATAAGGTGCAAGAATATTAGATA
TTGCAGTGTTTTGAAGTTACAATTGATTTGGATTATTGTTCCATTTTCAATATTCTCCTT
TTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2G703TF U 52
AF RR2A002TF U 1
AF RR2F670TF U 58
AF RR2CJ47JQ C 653
AF RR2D967JQ C 947
BS 1 101 RR2A002TF
BS 102 102 RR2G703TF
BS 103 816 RR2A002TF
BS 817 1026 RR2CJ47JQ
BS 1027 1027 RR2D967JQ
BS 1028 1292 RR2CJ47JQ
BS 1293 1293 RR2D967JQ
BS 1294 1356 RR2CJ47JQ
BS 1357 1384 RR2D967JQ

RD RR2G703TF 731 0 0
GGACCT
CTGCGAATCAAAACCTATTTCCGCCATGGCTGCTCTTCAATACTTGGAATCTCTGAAAAC
TTCGCACCCAGAGCTCAATGAATGGTACAATTCCCTCGCAGATCTGTATCAGAAAAAGCT
ATGGCATCAGCTCACCCTCAAGCTCGAGCAGTTCATCGCTCTCTCCGTTTTTCAGGCTGG
AGATGCTTTGGTACAGTTCTACCACAACTTCATCACCGACTTCGAGACGAAGATCAACCT
CCTCAAGCTTGCGCATTTCGCCGTGGTGGTCTCCCGTCAGTACTCTGAGAAAGAAGCTGC
GGTCGGCTACCTCGAAGGAGTGATTGAGAAGCTCAAAGCCACTAAAGAGCCTCGCATCAC
TGAACCGATCGTTTACATCGAGACGCAAAAGGCTTTGTTCAAGCTTGAGCAAGGTGATCA
GAAGGAGTGCAAGAAGGTTTTGGACGATGCCAAGACCTCTCTTGATAGCATGACTGATAT
TGATCCTTCGGTCCACACTAACTTCTACTGGGTGTCTTCTCAGTACCACAAGTTCCGTCA
GGAGTTCTCTGATTTCTACAAAAGTGCTCTGCTTTTTCTTGCGTATACCTCTGTGGAGGC
ACTCTCTGAATCCTTTAAGCTGGATTTGGCTTTCGATTTGTCACTTTCAGCTCTACTTGG
AGAAA*CATCTACAACTTTGGGGAACTCTTGGCTCATCCCATTTTGAAA*GTCTCCTTGG
AA
AAA

QA 7 728 7 728
DS 

RD RR2A002TF 816 0 0
GCCGGGGGAACGCACAGCTCTGATATAAAAGAACCTTTCATCGTCTTTCGTCTACCTCTG
CGAATCAAAACCTATTTCCGCCATGGCTGCTCTTCAATACTCGGAATCTCTGAAAACTTC
GCACCCAGAGCTCAATGAATGGTACAATTCCCTCGCAGATCTGTATCAGAAAAAGCTATG
GCATCAGCTCACCCTCAAGCTCGAGCAGTTCATCGCTCTCTCCGTTTTTCAGGCTGGAGA
TGCTTTGGTACAGTTCTACCACAACTTCATCACCGACTTCGAGACGAAGATCAACCTCCT
CAAGCTTGCGCATTTCGCCGTGGTGGTCTCCCGTCAGTACTCTGAGAAAGAAGCTGCGGT
CGGCTACCTCGAAGGAGTGATTGAGAAGCTCAAAGCCACTAAAGAGCCTCGCATCACTGA
ACCGATCGTTTACATCGAGACGCAAAAGGCTTTGTTCAAGCTTGAGCAAGGTGATCAGAA
GGAGTGCAAGAAGGTTTTGGACGATGCCAAGACCTCTCTTGATAGCATGACTGATATTGA
TCCTTCGGTCCACGCTAACTTCTACTGGGTGTCTTCTCAGTACCACAAGTTCCGTCAGGA
GTTCTCTGATTTCTACAAAAGTGCTCTGCTTTTTCTTGCGTATACCTCTGTGGAGGCACT
CTCTGAATCCTTTAAGCTGGATTTGGCTTTCGATTTGTCACTTTCAGCTCTACTTGGAGA
AAACATCTACAACTTTGGGGAACTCTTGGCTCATCCCATTTTGAAAAGTCTCCTTGGAAC
AAATGTGGAATGGCTTTACCACATTCTCCAGGCGTT

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR2F670TF 750 0 0
GG
GCGAATCAAAACCTATTTCCGCCATGGCTGCTCTTCAATACTTGGAATCTCTGAAAACTT
CGCACCCAGAGCTCAATGAATGGTACAATTCCCTCGCAGATCTGTATCAGAAAAAGCTAT
GGCATCAGCTCACCCTCAAGCTCGAGCAGTTCATCGCTCTCTCCGTTTTTCAGGCTGGAG
ATGCTTTGGTACAGTTCTACCACAACTTCATCACCGACTTCGAGACGAAGATCAACCTCC
TCAAGCTTGCGCATTTCGCCGTGGTGGTCTCCCGTCAGTACTCTGAGAAAGAAGCTGCGG
TCGGCTACCTCGAAGGAGTGATTGAGAAGCTCAAAGCCACTAAAGAGCCTCGCATCACTG
AACCGATCGTTTACATCGAGACGCAAAAGGCTTTGTTCAAGCTTGAGCAAGGTGATCAGA
AGGAGTGCAAGAAGGTTTTGGACGATGCCAAGACCTCTCTTGATAGCATGACTGATATTG
ATCCTTCGGTCCACGCTAACTTCTACTGGGTGTCTTCTCAGTACCACAAGTTCCGTCAGG
AGTTCTCTGATTTCTACAAAAGTGCTCTGCTTTTTCTTGCGTATACCTCTGTGGAGGCAC
TCTCTGAATCCTTTAAGCTGGATTTGGCTTTCGATTTGTCACTTTCAGCTCTACTTGGAG
AAAACATCTACAACTTTGGGGAACTCTTGGCTCATCCCATTTTGAAAAGTCTCCTTGGAA
CAAATGTGGAATGGCTTTACCACATTCT

QA 3 750 3 750
DS 

RD RR2CJ47JQ 704 0 0
GAGGCACTCTCTGAATCCTTTAAGCTGGATTTGGCTTTTGATTTGTCACTTTCAGCTCTA
CTTGGAGAAAACATCTACAACTTTGGGGAACTCTTGGCTCATCCCATTTTGAAAAGTCTC
CTTGGAACAAATGTGGAATGGCTTTACCACATTCTCCAGGCGTTCAACCATGGTGACTTA
GTTCAGTATCAAGAACTGTGTCGCGTGCACCATGCATCCTTGATTGCCCAACCTGCGCTG
GTTGAGAATGAGAAGAAACTATTGGAGAAGATCAACATTTTTTGCCTTATCGAGATCATT
TTCAGCCGACCTGCTGAAGATAGGACTATTCCTTTGACTGTCATTGCTGAGCGTACTAAA
CTTTCCATTGAAGATGTTGAGCACCTTTTCATGAAGAGTCTTTCTGTGCATTTGATTGAG
GGGACTATAGATCAAGTGAATGGAACAGTTTACATCTCATGGGCCCAACCGAGAGTGTTG
GGGATTCCACAGATCAAGTCTTTGAGGGATCAATTGGACAGTTGGGTCGACAAAGTCCAC
ACCACTTTGCTATCTGTTGAGGCTGAGACACCAGATCTTGTTGCCGCATAAGAAAAACCT
GCCTTTTTCCTTTTAGAGCTTACTGATTATAACTCTGTTTTTGGGATAAGGTGCAAGAAT
ATTAGATATTGCAGTGTTTTGAAGTTACAATTGATTTGGATTAT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2D967JQ 438 0 0
ATCATTTTCAGCCGACCTGCTGAAGATAGGACTATTCCTTTGACTGTCATTGCTGAGCGT
ACTAAACTTTCCATTGAAGACGTTGAGCACCTTTTCATGAAGAGTCTTTCTGTGCATTTG
ATTGAGGGGACTATAGATCAAGTGAATGGAACAGTTTACATTTCATGGGCCCAACCGAGA
GTGTTGGGGATTCCACAGATCAAGTCTTTGAGGGATCAATTGGACAGTTGGGTCGACAAA
GTCCACACCACTTTGCTATCTGTTGAGGCTGAGACACCAGATCTTGTTGCCGCATAAGAA
AAACCTGCCTTTTTCCTTTTAGAGCTTACTGATTATAACTCTGTTTCTGGGATAAGGTGC
AAGAATATTAGATATTGCAGTGTTTTGAAGTTACAATTGATTTGGATTATTGTTCCATTT
TCAATATTCTCCTTTTTT

QA 1 438 1 438
DS 



CO CL267Contig2 867 3 6 U
GGGGCGAAGCAAAACCTATTTCCGCCATGGCTGCTCTTCAATACTTGGAATCTCTTAAAA
CTTCGCATCCAGAGCTCAATGAATGGTACAATTCCCTCGCAGATCTGTATCAGAAAAAGC
TATGGCATCAGCTCACCCTTAAGCTCGAGCAGTTCATCGCTCTCTCCATCTTTCAGGCTG
GAGATGCTTTGATACAGTTCTATCACAACTTCATAACCGACTTCGAGACGAAGATCAACC
TCCTCAAGCTCGCGCATTTCGCTGTGGTGGTCTCCCGTCAGTACTCGGAGAAAGAAGCTG
CGGTTGGCTATCTCGAAGGAGTGATTGAGAAGCTCAAAGCCACTAAGGAGCCTCGGATCA
CTGAACCGATCGTTTACATCGAGACGCAAAAGGCTTTGTTCAAGCTTGAGCAAGGTGATC
AGAAGGAGTGCAAGAAGGTCTTGGACGATGCCAAGACCTCTCTTGATAGCATGACTGACA
TTGATCCTTCGGTGCACGCTAACTTCTACTGGGTGTCTTCTCAGTACCACAAGTTCCGTC
AGGAGTTCTCTGATTTCTACAAAAGTGCTCTGCTTTTTCTTGCGTATACCTCTGTGGAGG
CACTCTCTGAATCCTTTAAGCTGGATTTGGCTTTTGATTTGTCACTTTCAGCTCTACTTG
GAGAAAACATCTACAACTTTGGGGAACTCTTGGCTCATCCCATTTTGAAAAGTCTCCTTG
GAACAAATGTGGAATGGCTTTACACATTCTCAGGCGTTCACCATGGTGACTTAGTCAGTA
TCAAGACTGTGTCGCGTGCACCATGCATCCTTGATGCCCACCTGCGCTGGTCGAGATGAG
AAGAACTATTGGAGAAGATCAACATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D967TF U 36
AF RR2CJ47TF U 1
AF RR2GM76TF U 17
BS 1 188 RR2CJ47TF
BS 189 189 RR2GM76TF
BS 190 710 RR2CJ47TF
BS 711 711 RR2GM76TF
BS 712 723 RR2CJ47TF
BS 724 867 RR2GM76TF

RD RR2D967TF 683 0 0
CTTCAATACTTGGAATCTCTTAAAACTTCGCATCCAGAGCTCAATGAATGGTACAATTCC
CTCGCAGATCTGTATCAGAAAAAGCTATGGCATCAGCTCACCCTTAAGCTCGAGCAGTTC
ATCGCTCTCTCCATCTTTCAGGCTGGAGATGCTTTGATACAGTTCTATCACAACTTCATA
ACCGACTTCGAGACGAAGATCAACCTCCTCAAGCTCGCGCATTTCGCTGTGGTGGTCTCC
CGTCAGTACTCGGAGAAAGAAGCTGCGGTTGGCTATCTCGAAGGAGTGATTGAGAAGCTC
AAAGCCACTAAGGAGCCTCGGATCACTGAACCGATCGTTTACATCGAGACGCAGAAGGCT
TTGTTCAAGCTTGAGCAAGGTGATCAGAAGGAGTGCAAGAAGGTCTTGGACGATGCCAAG
ACCTCTCTTGATAGCATGACTGACATTGATCCTTCGGTGCACGCTAACTTCTACTGGGTG
TCTTCTCAGTACCACAAGTTCCGTCAGGAGTTCTCTGATTTCTACAAAAGTGCTCTGCTT
TTTCTTGCGTATACCTCTGTGGAGGCACTCTCTGAATCCTTTAAGCTGGATTTGGCTTTT
GATTTGTCACTTTCAGCTCTACTTGGAGAAA*CATCTACAACTTTGGGGAACTCTTGGCT
CATCC*ATTTTGAAAAGTCTCCT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2CJ47TF 726 0 0
GGGGCGAAGCAAAACCTATTTCCGCCATGGCTGCTCTTCAATACTTGGAATCTCTTAAAA
CTTCGCATCCAGAGCTCAATGAATGGTACAATTCCCTCGCAGATCTGTATCAGAAAAAGC
TATGGCATCAGCTCACCCTTAAGCTCGAGCAGTTCATCGCTCTCTCCATCTTTCAGGCTG
GAGATGCTCTGATACAGTTCTATCACAACTTCATAACCGACTTCGAGACGAAGATCAACC
TCCTCAAGCTCGCGCATTTCGCTGTGGTGGTCTCCCGTCAGTACTCGGAGAAAGAAGCTG
CGGTTGGCTATCTCGAAGGAGTGATTGAGAAGCTCAAAGCCACTAAGGAGCCTCGGATCA
CTGAACCGATCGTTTACATCGAGACGCAAAAGGCTTTGTTCAAGCTTGAGCAAGGTGATC
AGAAGGAGTGCAAGAAGGTCTTGGACGATGCCAAGACCTCTCTTGATAGCATGACTGACA
TTGATCCTTCGGTGCACGCTAACTTCTACTGGGTGTCTTCTCAGTACCACAAGTTCCGTC
AGGAGTTCTCTGATTTCTACAAAAGTGCTCTGCTTTTTCTTGCGTATACCTCTGTGGAGG
CACTCTCTGAATCCTTTAAGCTGGATTTGGCTTTTGATTTGTCACTTTCAGCTCTACTTG
GAGAAAACATCTACAACTTTGGGGAACTCTTGGCTCATCCCATTTTGAAA*GTCTCCTTG
GAA
AAA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2GM76TF 851 0 0
G
ATTTCCGCCATGGCTGCTCTTCAATACTTGGAATCTCTTAAAACTTCGCATCCAGAGCTC
AATGAATGGTACAATTCCCTCGCAGATCTGTATCAGAAAAAGCTGTGGCATCAGCTCACC
CTTAAGCTCGAGCAGTTCATCGCTCTCTCCATCTTTCAGGCTGGAGATGCTTTGATACAG
TTCTATCACACCTTCATAACCGACTTCGAGACGTAGATCAACCTCCTCAAGCTCGCGCAT
TTCGCTGTGGTGGTCTCCCGTCAGTACTCGGAGAAAGAAGCTGCGGTTGGCTATCTCGAA
GGAGTGATTGAGAAGCTCAAAGCCACTAAGGAGCCTCGGATCACTGAACCGATCGTTTAC
ATCGAGACGCAAAAGGCTTTGTTCAAGCTTGAGCAAGGTGATCAGAAGGAGTGCAAGAAG
GTCTTGGACGATGCCAAGACCTCTCTTGATAGCATGACTGACATTGATCCTTCGGTGCAC
GCTAACTTCTACTGGGTGTCTTCTCAGTACCACAAGTTCCGTCAGGAGTTCTCTGATTTC
TACAAAAGTGCTCTGCTTTTTCTTGCGTATACCTCTGTGGAGGCACTCTCTGAATCCTTT
AAGCTGGATTTGGCTTTTGATTTGTCACTTTCAGCTCTACTTGGAGAAAACATCTACAAC
TTTGGGGAACTCTTGGCTCATCCCATTTTGAAAAGTCTCCTTGGAACAAATGTGGAATGG
CTTTACACATTCTCAGGCGTTCACCATGGTGACTTAGTCAGTATCAAGACTGTGTCGCGT
GCACCATGCATCCTTGATGCCCACCTGCGCTGGTCGAGATGAGAAGAACTATTGGAGAAG
ATCAACATTC

QA 2 851 2 851
DS 



CO CL267Contig3 1305 5 12 U
AAAGGAGAATCTTGAAAATGGAGCAATAATCCAAAGCGATTGTAACTTCAAACACTGCAT
AGCTAATATTCTTGCATCTTATCCCAAAAATAGAGTTATAATCAGCAGCTCTAAAAGGAA
AAAAAAGGTAGGTTTTTCTTATGCCGAAACAAGATCTGGTGTCTCAGCTTCAACAGATAG
CAAAGTGGTGTGGACTTTGTCGACCCAACTGTCCAATTGATCCCTCAAAGACTTGATCTG
TGGAATCCCCAACACTCTCGGTTGGGCCCATGAGATGTAAACTGTTCCATTCACTTGATC
TATAATCCCCTCAATCAGATGCACAGAAAGACTCTTCATGAGAAGGTGCTCAACATCTTC
AATGGAAAGTTTAGTACGCTCAGCAATGACACTTAAAGGAATGGTCCTATCTTCAGCAGG
TCGGCTGAAGATGATCTCGATCAGACAGAGAATGTTGATCTTCTCCAATAGCTTCTTCTC
ATTCTCAACCAGTGCGGGTTGGGCAATCAAGGATGCATGGTGTACGCGACACAGTTCTTG
ATACTGAACTAAATCACCATGGTTGAACGCCTGGAGAATGTGGTAAAGCCATTCCACATT
TGTTCCAAGGAGACTTTTCAAAATGGGATGAGCCAAGAGTTCCCCAAAGTTGTAGATGTT
TTCTCCAAGTAGAGCTGAAAGTGACAAATCGAAAGCCAAATCCAGCTTAAAGGATTCAGA
GAGTGCCTCCACAGAGGTATACGCAAGAAAAAGCAGAGCACTTTTGTAGAAATCAGAGAA
CTCCTGACGGAACTTGTGGTACTGAGAAGACACCCAGTAGAAGTAAGCGTGGACCGAAGG
ATCAATATCAGTCATGCTATCAAGAGAGGTCTTGGCATCGTCCAAAACCTTCTTGCACTC
CTTCTGATCACCTTGGCTTTGAGCTTCTCAATCACTCCTTCGAGGTAGCCGACCGCAGCT
TCTTTCTCAGAGTACTGACGGGAGACCACCACGGCGAAATGCGCAAGCTTGAGGAGGTTG
ATCTTCGTCTCGAAGTCGGTGATGAAGTTGTGGTAGAACTGTACCAAAGCATCTCCAGCC
TGAAAAACGGAGAGAGCGATGAACTGCTCGAGCTTGAGGGTGAGCTGATGCCATAGCTTT
TTCTGATACAGATCTGCGAGGGAATTGTACCATTCATTGAGCTCTGGGTGCGAAGTTTTC
AGAGATTCCAAGTATTGAAGAGCAGCCATGGCGGAAATAGGTTTTGATTCGCAGAGGTAG
ACGAAAGACGATGAAAGGATCTTTTATATCAGAGCTGTGCGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 5 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F670JQ U 1
AF RR2AN92JQ U 14
AF RR2BR71TF C 84
AF RR2A002JQ U 162
AF RR2AN92TF C 414
BS 1 190 RR2F670JQ
BS 191 191 RR2AN92JQ
BS 192 317 RR2F670JQ
BS 318 318 RR2AN92JQ
BS 319 341 RR2F670JQ
BS 342 342 RR2AN92JQ
BS 343 438 RR2F670JQ
BS 439 747 RR2AN92JQ
BS 748 824 RR2A002JQ
BS 825 825 RR2AN92TF
BS 826 834 RR2A002JQ
BS 835 1305 RR2AN92TF

RD RR2F670JQ 438 0 0
AAAGGAGAATCTTGAAAATGGAGCAATAATCCAAAGCGATTGTAACTTCAAACACTGCAT
AGCTAATATTCTTGCATCTTATCCCAAAAATAGAGTTATAATCAGCAGCTCTAAAAGGAA
AAAAAAGGTAGGTTTTTCTTATGCCGAAACAAGATCTGGTGTCTCAGCTTCAACAGATAG
CAAAGTGGTGGGGACTTTGTCGACCCAACTGTCCAATTGATCCCTCAAAGACTTGATCTG
TGGAATCCCCAACACTCTCGGTTGGGCCCATGAGATGTAAACTGTTCCATTCACTTGATC
TATAATCCCCTCAATCAAATGCACAGAAAGACTCTTCATGAAAAGGTGCTCAACATCTTC
AATGGAAAGTTTAGTACGCTCAGCAATGACACTTAAAGGAATGGTCCTATCTTCAGCAGG
TCGGCTGAAGATGATCTC

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR2AN92JQ 734 0 0
GG
AAATGGAGCAATAATCCAAAGCGATTGTAACTTCAAACACTGCATAGCTAATATTCTTGC
ATCTTATCCCAGAAATAGAGTTATAATCAGCAGCTCTAAAAGGAAAAAAAAGGTAGGTTT
TTCTTATGCCGAAACAAGATCTGGTGTCTCAGCTTCAACAGATAGCAAAGTGGTGTGGAC
TTTGTCGACCCAACTGTCCAATTGATCCCTCAAAGACTTGATCTGTGGAATCCCCAACAC
TCTCGGTTGGGCCCATGAGATGTAAACTGTTCCATTCACTTGATCTATAATCCCCTCAAT
CAGATGCACAGAAAGACTCTTCATGAGAAGGTGCTCAACATCTTCAATGGAAAGTTTAGT
ACGCTCAGCAATGACACTTAAAGGAATGGTCCTATCTTCAGCAGGTCGGCTGAAGATGAT
CTCGATCAGACAGAGAATGTTGATCTTCTCCAATAGCTTCTTCTCATTCTCAACCAGTGC
GGGTTGGGCAATCAAGGATGCATGGTGTACGCGACACAGTTCTTGATACTGAACTAAATC
ACCATGGTTGAACGCCTGGAGAATGTGGTAAAGCCATTCCACATTTGTTCCAAGGAGACT
TTTCAAAATGGGATGAGCCAAGAGTTCCCCAAAGTTGTAGATGTTTTCTCCAAGTAGAGC
TGAAAGTGACAAATCGAAAGCCAAATCCAGCTTAAAGGATTCAGAGAGTGCCTCCACAGA
GGTATACGCAAG

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR2BR71TF 658 0 0
CCAG
AAACAGAGTTATAATCAGTAGCTCTAAAAGGAAAAAA***GCAGGTTTT*CTTATGCCGC
AACAAGATCTGGTGTCTCAGCTTCAACAGATAGCAAAGTGGGGTGGACTTTGTCGACCCA
ACTGTCCAATTGATCCCTCAAAGACTTGATCTGTGGAATCCCCAACACTCTCGGTTGGGC
CCATGAGATGTAAACTGTTCCATTCACTTGATCTATAATCCCCTCAATCAGATGCACAGA
AAGACTCTTCATGAGAAGGTGCTCAACATCTTCAATGGAAAGTTTAGTACGCTCAGCAAT
GACACTTAAAGGAATGGTCCTATCTTCAGCAGGTCGGCTGAAGATGATCTCGATCAGACA
GAGAATGTTGATCTTCTCCAATAGCTTCTTCTCATTCTCAACCAGTGCGGGTTGGGCAAT
CAAGGATGCATGGTGTACGCGACACAGTTCTTGATACTGAACTAAATCACCATGGTTGAA
CGCCTGGAGAATGTGGTAAAGCCATTCCACATTTGTTCCAAGGAGACTTTTCAAAATGGG
ATGAGCCAAGAGTTCCCCAAAGTTGTAGATGTTTTCTCCAAGTAGAGCTGAAAGTGACAA
ATCGAAAGCCAAATCCAGCTTAAAGGATTCAGAGAGTGCCTCCACAGAAGTAT
C

QA 5 657 5 657
DS 

RD RR2A002JQ 673 0 0
TCTCAGCTTCAACAGATAGCAAAGTGGTGTGGACTTTGTCGACCCAACTGTCCAATTGAT
CCCTCAAAGACTTGATCTGTGGAATCCCCAACACTCTCGGTTGGGCCCATGAGATGTAAA
CTGTTCCATTCACTTGATCTATAATCCCCTCAATCAGATGCACAGAAAGACTCTTCATGA
GAAGGTGCTCAACATCTTCAATGGAAAGTTTAGTACGCTCAGCAATGACACTTAAAGGAA
TGGTCCTATCTTCAGCAGGTCGGCTGAAGATGATCTCGATCAGACAGAGAATGTTGATCT
TCTCCAATAGCTTCTTCTCATTCTCAACCAGTGCGGGTTGGGCAATCAAGGATGCATGGT
GTACGCGACACAGTTCTTGATACTGAACTAAATCACCATGGTTGAACGCCTGGAGAATGT
GGTAAAGCCATTCCACATTTGTTCCAAGGAGACTTTTCAAAATGGGATGAGCCAAGAGTT
CCCCAAAGTTGTAGATGTTTTCTCCAAGTAGAGCTGAAAGTGACAAATCGAAAGCCAAAT
CCAGCTTAAAGGATTCAGAGAGTGCCTCCACAGAGGTATACGCAAGAAAAAGCAGAGCAC
TTTTGTAGAAATCAGAGAACTCCTGACGGAACTTGTGGTACTGAGAAGACACCCAGTAGA
AGTTAGCGTGGAC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2AN92TF 892 0 0
CTCAGCAGTC
GCTGAAGATGATCTCGATCAGACAGAGA*TGT*GATCT*CTCCAATAGCTC**TCTCAT*
CTCAACCAGTGCGGGTTGGGCAATCAAGGATGCATGGTGTACGCGACACAGTTCTTGATA
CTGAACTAAATCACCATGGTTGAACGCCTGGAGAATGTGGTAAAGCCATTCCACATTTGT
TCCAAGGAGACTTTTCAAAATGGGATGAGCCAAGAGTTCCCCAAAGTTGTAGATGTTTTC
TCCAAGTAGAGCTGAAAGTGACAAATCGAAAGCCAAATCCAGCTTAAAGGATTCAGAGAG
TGCCTCCACAGAGGTATACGCAAGAAAAAGCAGAGCACTTTTGTAGAAATCAGAGAACTC
CTGACGGAACTTGTGGTACTGAGAAGACACCCAGTAGAAGTAAGCGTGGACCGAAGGATC
AATATCAGTCATGCTATCAAGAGAGGTCTTGGCATCGTCCAAAACCTTCTTGCACTCCTT
CTGATCACCTTGGCTTTGAGCTTCTCAATCACTCCTTCGAGGTAGCCGACCGCAGCTTCT
TTCTCAGAGTACTGACGGGAGACCACCACGGCGAAATGCGCAAGCTTGAGGAGGTTGATC
TTCGTCTCGAAGTCGGTGATGAAGTTGTGGTAGAACTGTACCAAAGCATCTCCAGCCTGA
AAAACGGAGAGAGCGATGAACTGCTCGAGCTTGAGGGTGAGCTGATGCCATAGCTTTTTC
TGATACAGATCTGCGAGGGAATTGTACCATTCATTGAGCTCTGGGTGCGAAGTTTTCAGA
GATTCCAAGTATTGAAGAGCAGCCATGGCGGAAATAGGTTTTGATTCGCAGAGGTAGACG
AAAGACGATGAAAGGATCTTTTATATCAGAGCTGTGCGTTCC

QA 11 892 11 892
DS 



AS 2 11

CO CL268Contig1 869 5 9 U
GGGATCTCTCAAACACTTCTTCTCCACTAATACAATACTAATTAATTGCTTCTGATCAAT
AACATTGTTGTTGGGCTTTTCTGATTCAAGCACCTGAGCCATGGCTTCACTTTCAGTTTC
TTCCTCCTCGACAATCATCGATTCAAGAGCTCCTCCTCTTCCTTCTCGACAAGCATCTTC
TCCTTCGTGTATTTCCCTTCCGACACTTCCTCCTCAGTCGCTTCAGTCTCAGACCCGCGC
CGCCAAAGCCACTGCTTACTGTCGGAAGATAGTGAGGAACGTTTTGACACGAGCTGCCGA
TGTTGAAGTTGTTGCCACTACCCAGGTCGAAGCTCCTGCCGCCAATAGCGAAGCTGCGAG
TACAGAGTTACCGGATATCGTCAAGACCGTTCAAGAAGCTTGGGACAAAGTAGAGGATAA
GTATGCAGTTAGTTCTCTCGCAGTTTCTGGTTTTGTGGCTCTTTGGGGAACTGCTGGTGT
CATCTCGGCTATCGACAGGCTTCCATTAGTTCCTGGTGTTCTTGAAGTTGTTGGCATTGG
TTACACTGGG*TGGTTTGCTTACAAGAACCTGATATTCAAGCCAGACAGGGAGACTCTGT
TTCAGAAAGTCAAGGACACATACAGAGACATAATAGGGAGCAACTGAACCAGATGATGAA
GAAGAAGCCTTTTAGGGTGGGCAATTCATAAATTGAATGAATCTAACACATCCCACATCC
TTCATTCAATCTTCCCTTCTCGTAACTAAATAATAAATCATACATCCTCTTTGTCTCAGG
TGTCTTTTTAGCTCAAAATATATCATCCATACATCCATCTATGTCGATGTTGTAAATTCC
TCAGACTATATATATGAGATGTTTGGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C918TF U 9
AF RR2C918JQ C 223
AF RR2A475TF U 1
AF RR2A670TF U 65
AF RR2A670JQ C 240
BS 1 455 RR2A475TF
BS 456 456 RR2C918TF
BS 457 665 RR2A475TF
BS 666 666 RR2A670TF
BS 667 779 RR2A475TF
BS 780 780 RR2A670TF
BS 781 827 RR2A475TF
BS 828 860 RR2A670TF
BS 861 869 RR2A670JQ

RD RR2C918TF 657 0 0
GG
AAACACTTCTTCTCCACTAATACAATACTAATTAATTGCTTCTGATCAATAACATTGTTG
TTGGGCTTTTCTGATTCAAGCACCTGAGCCATGGCTTCACTTTCAGTTTCTTCCTCCTCG
ACAATCATCGATTCAAGAGCTCCTCCTCTTCCTTCTCGACAAGCATCTTCTCCTTCGTGT
ATTTCCCTTCCGACACTTCCTCCTCAGTCGCTTCAGTCTCAGACCCGCGCCGCCAAAGCC
ACTGCTTACTGTCGGAAGATAGTGAGGAACGTTTTGACACGAGCTGCCGATGTTGAAGTT
GTTGCCACTACCCAGGTCGAAGCTCCTGCCGCCAATAGCGAAGCTGCGAGTACAGAGTTA
CCGGATATCGTCAAGACCGTTCAAGAAGCTTTGGACAAAGTAGAGGATAAGTATGCAGTT
AGTTCTCTCGCAGTTTCTGGTTTTGTGGCTCTTTGGGGAACTGCTGGTGCCATCTCGGCT
ATCGACAGGCTTCCATTAGTTCCTGGTGTTCTTGAAGTTGTTGGCATTGGTTACACTGGG
GTGGTTTGCTTGCAAGAACCTGATATTCAAGCCAGACAGGGAGACTCTGTTTCAGAAAGT
CAAGGACACATACAGAGACATAATAGGGAGCAACTGAACCAGATGATGAAGAAGA

QA 3 657 3 657
DS 

RD RR2C918JQ 504 0 0
TCAGTCTCAGACCCGCGCCGCCAAAGCCACTGCTTACTGTCGGAAGATAGTGAGGAACGT
TTTGACACGAGCTGCCGATGTTGAAGTTGTTGCCACTACCCAGGTGGAAGCTCCTGCCGC
CAATAGGGAAGCTGCGAGTACAGAGTTACCGGATATCGTCAAGACCGTTCAAGAAGCTTT
GGACAAAGTAGAGGATAAGTATGCAGTTAGTTCTCTCGCAGTTTCTGGTTTTGTGGCTCT
TTGGGGAACTGCTGGTGCCATTTCGGCTATCGACAGGCTTCCATTAGTTCCTGGTGTTCT
TGAAGTTGTTGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCTTGCAAGAACCTGATATTCAAGC
CAGACAGGGAGACTCTGTTTCAGAAAGTCAAGGACACATACAGAGACATAATAGGGAGCA
ACTGAACCAGATGATGAAGAAGAAGCCTTTTAGGGTGGGCAATTCATAAATTGAATGAAT
CTAACACTTCCCACATCCTTCATT

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2A475TF 827 0 0
GGGATCTCTCAAACACTTCTTCTCCACTAATACAATACTAATTAATTGCTTCTGATCAAT
AACATTGTTGTTGGGCTTTTCTGATTCAAGCACCTGAGCCATGGCTTCACTTTCAGTTTC
TTCCTCCTCGACAATCATCGATTCAAGAGCTCCTCCTCTTCCTTCTCGACAAGCATCTTC
TCCTTCGTGTATTTCCCTTCCGACACTTCCTCCTCAGTCGCTTCAGTCTCAGACCCGCGC
CGCCAAAGCCACTGCTTACTGTCGGAAGATAGTGAGGAACGTTTTGACACGAGCTGCCGA
TGTTGAAGTTGTTGCCACTACCCAGGTCGAAGCTCCTGCCGCCAATAGCGAAGCTGCGAG
TACAGAGTTACCGGATATCGTCAAGACCGTTCAAGAAGCTTGGGACAAAGTAGAGGATAA
GTATGCAGTTAGTTCTCTCGCAGTTTCTGGTTTTGCGGCTCTTTGGGGAACTGCTGGTGT
CATCTCGGCTATCGACAGGCTTCCATTAGTTCCTGGTGTTCTTGAAGTTGTTGGCATTGG
TTACACTGGG*TGGTTTGCTTACAAGAACCTGATATTCAAGCCAGACAGGGAGACTCTGT
TTCAGAAAGTCAAGGACACATACAGAGACATAATAGGGAGCAACTGAACCAGATGATGAA
GAAGAGGCCTTTTAGGGTGGGCAATTCATAAATTGAATGAATCTAACACATCCCACATCC
TTCATTCAATCTTCCCTTCTCGTAACTAAATAATAAATCATACATCCTCTTTGTCTCAG*
TGTCTTTTTAGCTCAAAATATATCATCCATACATCCATCTATGTCGA

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2A670TF 796 0 0
GG
GTTGTTGGGCTTTTCTGATTCAAGCACCTGAGCCATGGCTTCACTTTCAGTTTCTTCCTC
CTCGACAATCATCGATTCAAGAGCTCCTCCTCTTCCTTCTCGACAAGCATCTTCTCCTTC
GTGTATTTCCCTTCCGACACTTCCTCCTCAGTCGCTTCAGTCTCAGACCCGCGCCGCCAA
AGCCACTGCTTACTGTCGGAAGATAGTGAGGAACGTTTTGACACGAGCTGCCGATGTTGA
AGTTGTTGCCACTACCCAGGTCGAAGCTCCTGCCGCCAATAGCGAAGCTGCGAGTACAGA
GTTACCGGATATCGTCAAGACCGTTCAAGAAGCTTGGGACAAAGTAGAGGATAAGTATGC
AGTTAGTTCTCTCGCAGTTTCTGGTTTTGTGGCTCTTTGGGGAACTGCTGGTGTCATCTC
GGCTATCGACAGGCTTCCATTAGTTCCTGGTGTTCTTGAAGTTGTTGGCATTGGTTACAC
TGGG*TGGTTTGCTTACAAGAACCTGATATTCAAGCCAGACAGGGAGACTCTGTTTCAGA
AAGTCAAGGACACATACAGAGACATAATAGGGAGCAACTGAACCAGATGATGAAGAAGAA
GCCTTTTAGGGTGGGCAATTCATAAATTGAATGAATCTAACACATCCCACATCCTTCATT
CAATCTTCCCTTCTCGTAACTAAATAATAAATCATACATCCTCTTTGTCTCAGGTGTCTT
TTTAGCTCAAAATATATCATCCATACATCCATCTATGTCGATGTTGTAAATTCCTCAGAC
TATATATATGAGAT

QA 3 796 3 796
DS 

RD RR2A670JQ 630 0 0
CCGCCAAAGCCACTGCTTACTGTCGGAAGATAGTGAGGAACGTTTTGACACGAGCTGCCG
ATGTTGAAGTTGTTGCCACTACCCAGGTCGAAGCTCCTGCCGCCAATAGCGAAGCTGCGA
GTACAGAGTTACCGGATATCGTCAAGACCGTTCAAGAAGCTTGGGACAAAGTAGAGGATA
AGTATGCAGTTAGTTCTCTCGCAGTTTCTGGTTTTGTGGCTCTTTGGGGAACTGCTGGTG
TCATCTCGGCTATCGACAGGCTTCCATTAGTTCCTGGTGTTCTTGAAGTTGTTGGCATTG
GTTACACTGGG*TGGTTTGCTTACAAGAACCTGATATTCAAGCCAGACAGGGAGACTCTG
TTTCAGAAAGTCAAGGACACATACAGAGACATAATAGGGAGCAACTGAACCAGATGATGA
AGAAGAAGCCTTTTAGGGTGGGCAATTCATAAATTGAATGAATCTAACACATCCCACATC
CTTCATTCAATCTTCCCTTTTGGTAACTAAATAATAAATCATACATCCTCTTTGTCTCAG
GTGTCTTTTTAGCTCAAAATATATCATCCATACATCCATCTATGTGGATGTTGTAAATTC
CTCAGACTATATATATGAGATGTTTGGTAC

QA 1 630 1 630
DS 



CO CL268Contig2 953 6 29 U
GGTGAGCACTATCCTGATCGAGAAACCCAAAACGAGTGGTGGAATCGTTCCCGACTACTC
ACAGAGAAACCATCTCCACAGAGAAACCATCTCCACAAGCAAATCTCTCAAAACACTTCT
TCTCCACTAATACAATACTAATTACTTCTGATCAACAACATTGTTGCTGCGATTCAAGCC
ATGGCTTCACTTTCAGTCTCTTCTTCCTCGACAATCATCGACTCAAGAGCTCCTCCTCTT
CCTTCTCGACAAGCATCTTCTCCTTCGTGTATTTCCCTTCCGACACTTCCTCCTCAGCCG
CTTCAGTCTCAGACCCGCGCCGCCAAAGCCACTGCTTACTGTCGGAAGATAGCGAGGAAC
GTTTTGACACGAGCTGCCGATGTTGAAGTTGTTGCCACTACCCAAGTCGAAGCTCCTGCC
ACCAATACCGAAGCTCCGACTACAGAGTTACCCGATATAGTCAAGACCGTTCAAGAAGCT
TGGGACAAAGTAGAGGATAAGTATGCAGTTAGTTCTCTCGCAGTTTCTGGTTTTGTGGCT
CTTTGGGGAACTGCTGGTGTGATCTCGGCTATCGACAGGCTTCCATTAGTTCCTGGTGTT
CTTGAAGTTGTTGGCATTGGTTACACTGGGTGGTTTGCTTACAAGAACCTGATATTCAAG
CCAGACAGGGAGACTCTGTTTCAGAAAGTCAAGGACACATACAGAGACATAATAGGGAGC
AACTGAACCAGATGATGATGAAGAAGCCTTTTAGGGTGGGCAATTCATAAATTGAATGAA
TCTAACACATCCC*ACATCCTTCATTCAATCTCCCTTCTCGTAACTAAATAAATTATACA
TCCTCTTTGTCTCAGGTGTCTTTTTAGCTCAAAATATATCATCCATACATCCATCTGTGT
CGATGTTGTAAATTCCTCAGACCATATATATGAGATGTTTGGTACATTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 5 5 20 5 20 5 5 5 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C348TF U 1
AF RR2GW37TF U 72
AF RR2BF92TF U 76
AF RR2BF92JQ C 164
AF RR2AO26JQ C 164
AF RR2AO26TF U 164
BS 1 80 RR2C348TF
BS 81 81 RR2GW37TF
BS 82 83 RR2C348TF
BS 84 84 RR2GW37TF
BS 85 88 RR2C348TF
BS 89 90 RR2GW37TF
BS 91 91 RR2C348TF
BS 92 92 RR2GW37TF
BS 93 93 RR2C348TF
BS 94 96 RR2GW37TF
BS 97 98 RR2C348TF
BS 99 100 RR2GW37TF
BS 101 352 RR2C348TF
BS 353 353 RR2GW37TF
BS 354 467 RR2C348TF
BS 468 468 RR2GW37TF
BS 469 491 RR2C348TF
BS 492 492 RR2GW37TF
BS 493 584 RR2C348TF
BS 585 585 RR2GW37TF
BS 586 587 RR2C348TF
BS 588 589 RR2GW37TF
BS 590 658 RR2C348TF
BS 659 734 RR2GW37TF
BS 735 855 RR2BF92TF
BS 856 856 RR2AO26TF
BS 857 941 RR2BF92TF
BS 942 945 RR2AO26TF
BS 946 953 RR2AO26JQ

RD RR2C348TF 658 0 0
GGTGAGCACTATCCTGATCGAGAAACCCAAAACGAGTGGTGGAATCGTTCCCGACTACTC
ACAGAGAAACCATCTCCACA*AGCAACCTGCACACAAAAAAAATCTCTCAAAACACTTCT
TCTCCACTAATACAATACTAATTACTTCTGATCAACAACATTGTTGCTGCGATTCAAGCC
ATGGCTTCACTTTCAGTCTCTTCTTCCTCGACAATCATCGACTCAAGAGCTCCTCCTCTT
CCTTCTCGACAAGCATCTTCTCCTTCGTGTATTTCCCTTCCGACACTTCCTCCTCAGCCG
CTTCAGTCTCAGACCCGCGCCGCCAAAGCCACTGCTTACTGTCGGAAGATAGTGAGGAAC
GTTTTGACACGAGCTGCCGATGTTGAAGTTGTTGCCACTACCCAAGTCGAAGCTCCTGCC
ACCAATACCGAAGCTCCGACTACAGAGTTACCCGATATAGTCAAGACTGTTCAAGAAGCT
TGGGACAAAGTGGAGGATAAGTATGCAGTTAGTTCTCTCGCAGTTTCTGGTTTTGTGGCT
CTTTGGGGAACTGCTGGTGTGATCTCGGCTATCGACAGGCTTCCGTT**TTCCTGGTGTT
CTTGAAGTTGTTGGCATTGGTTACACTGGGTGGTTTGCTTACAAGAACCTGATATTCA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2GW37TF 663 0 0
GGGCTC
ACAGAGAAACCATCTCCACAAGCAAATCTCTCAAAACACTTCTTCTCCACTAATACAATA
CTAATTACTTCTGATCAACAACATTGTTGCTGCGATTCAAGCCATGGCTTCACTTTCAGT
CTCTTCTTCCTCGACAATCATCGACTCAAGAGCTCCTCCTCTTCCTTCTCGACAAGCATC
TTCTCCTTCGTGTATTTCCCTTCCGACACTTCCTCCTCAGCCGCTTCAGTCTCAGACCCG
CGCCGCCAAAGCCACTGCTTACTGTCGGAAGATAGCGAGGAACGTTTTGACACGAGCTGC
CGATGTTGAAGTTGTTGCCACTACCCAAATCGAAGCTCCTGCCACCAATACCGAAGCTCC
GACTACAGAGTTACCCGATATAGTCAAGACCGTTCAAGAAGCTTGGGACAAAGTAGAGGA
TAAGTATGCAGTTAGTTCTCTCGCAGTTTCTGGTTTTGTGGCTCTTTGGGGAACTGCTGG
TGTGATCTCGGCTATCGACAGGCTTCCATTAGTTCCTGGTGTTCTTGAAGTTGTTGGCAT
TGGTTACACTGGGTGGTTTGCTTACAAGAACCTGATATTCAAGCCAGACAGGGAGACTCT
GTTTCAGAAAGTCAAGGACACATACAGAGACATAATAGGGAGCAACTGAACCAGATG

QA 7 663 7 663
DS 

RD RR2BF92TF 866 0 0
GG
ACAGAGAAACCATCTCCACAAGCAAATCTCTCAAAACACTTCTTCTCCACTAATACAATA
CTAATTACTTCTGATCAACAACGTTGTTGCTGCGATTCAAGCCATGGCTTCACTTTCAGT
CTCTTCTTCCTCGACAATCATCGACTCAAGAGCTCCTCCTCTTCCTTCTCGACAAGCATC
TTCTCCTTCGTGTATTTCCCTTCCGACACTTCCTCCTCAGCCGCTTCAGTCTCAGACCCG
CGCCGCCAAAGCCACTGCTTACTGTCGGAAGATAGCGAGGAACGTTTTGACACGAGCTGC
CGATGTTGAAGTTGTTGCCACTACCCAAGTCTAAGCTCCTGCCACCAATACCGAAGCTCC
GACTACAGAGTTACCCGATATAGTCAAGACCGTTCAAGAAGCTTGGGACAAAGTAGAGGA
TAAGTATGCAGTTAGTTCTCTCGCAGTTTCTGGTTTTGTGGCTCTTTGGGGAACTGCTGG
TGTGATCTCGACTATCGACAGGCTTCCATTAGTTCCTGGTGTTCTTGAAGTTGTTGGCAT
TGGTTACACTGGGTGGTTTGCTTACAAGAACCTGATATTCAAGCCAGACAGGGAGACTCT
GTTTCAGAAAGTCAAGGACACATACAGAGACATAATAGGGAGCAACTGAACCAGATGATG
ATGAAGAAGCCTTTTAGGGTGGGCAATTCATAAATTGAATGAATCTAACACATCCC*ACA
TCCTTCATTCAATCTCCCTTCTCGTAACTAAATAAATTATACATCCTCTTTGTCTCAG*T
GTCTTTTTAGCTCAAAATATATCATCCATACATCCATCTGTGTCGATGTTGTAAATTCCT
CAGACCATATATATGAGATGTTTG

QA 3 866 3 866
DS 

RD RR2BF92JQ 782 0 0
TTGCTGCGATTCAAGCCATGGCTTCACTTTCAGTCTCTTCTTCCTCGACAATCATCGACT
CAAGAGCTCCTCCTCTTCCTTCTCGACAAGCATCTTCTCCTTCGTGTATTTCCCTTCCGA
CACTTCCTCCTCAGCCGCTTCAGTCTCAGACCCGCGCCGCCAAAGCCACTGCTTACTGTC
GGAAGATAGCGAGGAACGTTTTGACACGAGCTGCCGATGTTGAAGTTGTTGCCACTACCC
AAGTCTAAGCTCCTGCCACCAATACCGAAGCTCCGACTACAGAGTTACCCGATATAGTCA
AGACCGTTCAAGAAGCTTGGGACAAAGTAGAGGATAAGTATGCAGTTAGTTCTCTCGCAG
TTTCTGGTTTTGTGGCTCTTTGGGGAACTGCTGGTGTGATCTCGACTATCGACAGGCTTC
CATTAGTTCCTGGTGTTCTTGAAGTTGTTGGCATTGGTTACACTGGGTGGTTTGCTTACA
AGAACCTGATATTCAAGCCAGACAGGGAGACTCTGTTTCAGAAAGTCAAGGACACATACA
GAGACATAATAGGGAGCAACTGAACCAGATGATGATGAAGAAGCCTTTTAGGGTGGGCAA
TTCATAAATTGAATGAATCTAACACATCCC*ACATCCTTCATTCAATCTCCCTTCTCGTA
ACTAAATAAATTATACATCCTCTTTGTCTCAGGTGTCTTTTTAGCTCAAAATATATCATC
CATACATCCATCTGTGTCGATGTTGTAAATTCCTCAGACCATATATATGAGATGTTTGGT
AC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2AO26JQ 790 0 0
GG
GCTGCGATTCAAGCCATGGCTTCACTTTCAGTCTCTTCTTCCTCGACAATCATCGACTCA
AGAGCTCCTCCTCTTCCTTCTCGACAAGCATTTTCTCCTTCGTGTATTTCCCTTCCGACA
CTTCCTCCTCAGCCGCTTCAGTCTCAGACCCGCGCCGCCAAAGCCACTGCTTACTGTCGG
AAGATAGCGAGGAACGTTTTGACACGAGCTGCCGATGTTGAAGTTGTTGCCACTACCCAA
GTCGAAGCTCCTGCCACCAATACCGAAGCTCCGACTACAGAGTTACCCGATATAGTCAAG
ACCGTTCAAGAAGCTTGGGACAAAGTAGAGGATAAGTATGCAGTTAGTTCTCTCGCAGTT
TCTGGTTTTGTGGCTCTTTGGGGAACTGCTGGTGTGATCTCGGCTATCGACAGGCTTCCA
TTAGTTCCTGGTGTTCTTGAAGTTGTTGGCATTGGTTACACTGGGTGGTTTGCTTACAAG
AACCTGATATTCAAGCCAGACAGGGAGACTCTGTTTCAGAAAGTCAAGGACACATACAGA
GACATAATAGGGAGCAACTGAACCAGATGATGATGAAGAAGCCTTTTAGGGTGGGCAATT
CATAAATTGAATGAATCTAACACATCCC*ACATCCTTCATTCAATCTCCCTTCTCGTAAC
TAAATAAATTATACATCCTCTTTGTCTCAGGTGTCTTTTTAGCTCAAAATATATCATCCA
TACATCCATCTGTGTCGATGTTGTAAATTCCTCAGACCATATATATGAGATGTTTGGTAC
ATTTTTAC

QA 3 790 3 790
DS 

RD RR2AO26TF 788 0 0
GG
GCTGCGATTCAAGCCATGGCTTCACTTTCAGTCTCTTCTTCCTCGACAATCATCGACTCA
AGAGCTCCTCCTCTTCCTTCTCGACAAGCATTTTCTCCTTCGTGTATTTCCCTTCCGACA
CTTCCTCCTCAGCCGCTTCAGTCTCAGACCCGCGCCGCCAAAGCCACTGCTTACTGTCGG
AAGATAGCGAGGAACGTTTTGACACGAGCTGCCGATGTTGAAGTTGTTGCCACTACCCAA
GTCGAAGCTCCTGCCACCAATACCGAAGCTCCGACTACAGAGTTACCCGATATAGTCAAG
ACCGTTCAAGAAGCTTGGGACAAAGTAGAGGATAAGTATGCAGTTAGTTCTCTCGCAGTT
TCTGGTTTTGTGGCTCTTTGGGGAACTGCTGGTGTGATCTCGGCTATCGACAGGCTTCCA
TTAGTTCCTGGTGTTCTTGAAGTTGTTGGCATTGGTTACACTGGGTGGTTTGCTTACAAG
AACCTGATATTCAAGCCAGACAGGGAGACTCTGTTTCAGAAAGTCAAGGACACATACAGA
GACATAATAGGGAGCAACTGAACCAGATGATGATGAAGAAGCCTTTTAGGGTGGGCAATT
CATAAATTGAATGAATCTAACACATCCCCACATCCTTCATTCAATCTCCCTTCTCGTAAC
TAAATAAATTATACATCCTCTTTGTCTCACGTGTCTTTTTAGCTCAAAATATATCATCCA
TACATCCATCTGTGTCGATGTTGTAAATTCCTCAGACCATATATATGAGATGTTTGGTAC
ATTTTT

QA 3 782 3 782
DS 



AS 2 14

CO CL269Contig1 810 12 14 U
GGGACTGCGACGACGGAGATCAGCAATGGGGGCATACAAGTATGTGTCTGAGCTATGGAG
GAAGAAACAGTCGGATGTGATGAGGTTTGTGCAGAGAGTGAGGTGCTGGGAGTACAGACA
GCAGCCATCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGGCCCGTCGTCTCGG
CTACAAGGCCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGTCGCAA
GAGGCCTGTTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGCT
CAAATTCCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCCGGTCGCAAGCTTGGTGG
CCTCAGGGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGAT
CATACTTGTGGACCCTGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCTG
CAACCCAGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCG
TGGTCTTCGTGGAAAGGGACACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGGGCTACCTG
GAAGAAGAACAACTCCCTTT*CTCTCCGTCGTTACCGGTGATCTGCTTTTT*GTGTTTTG
TTTTTCTTTTCAGCTCGAGTGGTGTATCTTCTGTGTGGATTGGTGTCAGAATTTCTTTGT
ATGGAAGAATATTTTACATTCAAGAGTTTGTTTTCAAGTTTTGAGCGTAACTAAAACTTC
AAATCTTACAAATAAAGTTAGACAACGTTC


BQ
30 30 30 30 30 30 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 45 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 35 25 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2BR96TF U 209
AF RR2BD37TF U 1
AF RR2BW90TF U 5
AF RR2BA49JQ C 1
AF RR2BX53TF U 1
AF RR2BA49TF U 1
AF RR2BX53JQ C 179
AF RR2G015TF U 7
AF RR2G015JQ C 9
AF RR2BC44TF U 5
AF RR2BC44JQ C 5
AF RR2BW90JQ C 9
BS 1 209 RR2BX53TF
BS 210 494 RR2BR96TF
BS 495 700 RR2BX53TF
BS 701 701 RR2BA49TF
BS 702 725 RR2BX53TF
BS 726 726 RR2BA49TF
BS 727 727 RR2G015TF
BS 728 728 RR2BC44TF
BS 729 734 RR2BX53TF
BS 735 735 RR2G015TF
BS 736 753 RR2BX53TF
BS 754 755 RR2G015TF
BS 756 760 RR2BC44TF
BS 761 810 RR2BC44JQ

RD RR2BR96TF 286 0 0
G
ACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGTCGCAAGAGGCCTGTTCCCAAGGGTATTGTGTATG
GTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGCTCAAATTCCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTG
CTGAGGAACGTGCCGGTCGCAAGCTTGGTGGCCTCAGGGTCGTTAACTCCTACTGGCTCA
ATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGATCATACTTGTGGACCCTGCACACAATGCCG
TCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCTGCAACCCAGTGCACA

QA 2 286 2 286
DS 

RD RR2BD37TF 708 0 0
GGGACTGCGACGACGGAGATCAGCAATGGGGGCATACAAGTATGTGTCTGAGCTATGGAG
GAAGAAACAGTCGGATGTGATGAGGTTTGTGCAGAGAGTGAGGTGCTGGGAGTACAGACA
GCAGCCATCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGGCCCGTCGTCTCGG
CTACAAGGCCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGTCGCAA
GAGGCCTGTTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGCT
CAAATTCCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCCGGTCGCAAGCTTGGTGG
CCTCAGGGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGAT
CATACTTGTGGACCCTGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCTG
CAACCCAGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCG
TGGTCTTCGTGGAAAGGGACACAACAACCACAAGAATAGACCTTCCCGCAGGGCTACCTG
GAAGAAGAACAACTCCCTTT*CTCTCCGTCGTTACCGGTGATCTGCTTTTT*GTGTTTTG
TTTTTCTTTTCAGCTCGAGTGGTGTATCTTCTGTGTGGATTGGTGTCA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2BW90TF 702 0 0
GG
GCGACGACGGAGATCAGCAATGGGGGCATACAAGTATGTGTCTGAGCTATGGAGGAAGAA
ACAGTCGGATGTGATGAGGTTTGTGCAGAGAGTGAGGTGCTGGGAGTACAGACAGCAGCC
ATCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGGCCCGTCGTCTCGGCTACAA
GGCCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGTCGCAAGAGGCC
TGTTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGCTCAAATT
CCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCCGGTCGCAAGCTTGGTGGCCTCAG
GGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGATCATACT
TGTGGACCCTGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCTGCAACCC
AGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCGTGGTCT
TCGTGGAAAGGGACACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGGGCTACCTGGAAGAA
GAACAACTCCCTTT*CTCTCCGTCGTTACCGGTGATCTGCTTTTT*GTGTTTTGTTTT*C
TTTTCAGCTCGAGTGGTGTATCTTCTGTGTGGAT
GGTGTC

QA 3 696 3 696
DS 

RD RR2BA49JQ 763 0 0
GGGACTGCGACGACGGAGATCAGCAATGGGGGCATACAAGTATGTGTCTGAGCTATGGAG
GAAGAAACAGTCGGATGTGATGAGGTTTGTGCAGAGAGTGAGGTGCTGGGAGTACAGACA
GCAGCCATCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGGCCCGTCGTTTCGG
CTACAAGGCCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGTCGCAA
GAGGCCTGTTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGCT
CAAATTCCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCCGGTCGCAAGCTTGGTGG
CCTCAGGGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGAT
CATACTTGTGGACCCTGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCTG
CAACCCAGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCG
TGGTCTTCGTGGAAAGGGACACAACAACCACAAGAATAGACCTTCCCGCAGGGCTACCTG
GAAGAAGAACAACTCCCTTT*CTCTCCGTCGTTACCGGTGATCTGCTTTTT*GTGTTTTG
TTTTTCTTTTCAGCTCGAGTGGTGTATCTTCTGTGTGGATTGGTGTCAGAATTTCTTTGT
ATGGAAGAATATTTTACATTCAAGAGTTTGTTTTCAAGTT
ACT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2BX53TF 755 0 0
GGGACTGCGACGACGGAGATCAGCAATGGGGGCATACAAGTATGTGTCTGAGCTATGGAG
GAAGAAACAGTCGGATGTGATGAGGTTTGTGCAGAGAGTGAGGTGCTGGGAGTACAGACA
GCAGCCATCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGGCCCGTCGTCTCGG
CTACAAGGCCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGTCGCAA
GAGGCCTGTTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGCT
CAAATTCCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCCGGTCGCAAGCTTGGTGG
CCTCAGGGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGAT
CATACTTGTGGACCCTGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCTG
CAACCCAGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCG
TGGTCTTCGTGGAAAGGGACACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGGGCTACCTG
GAAGAAGAACAACTCCCTTT*CTCTCCGTCGTTACCGGTGATCTGCTTTTT*GTGTTTTG
TTTTTCTTTTCAGCTCGAGTGGTGTATCTTCTGTGTGGAT*GGTGTCAGAATTTCTTTGT
ATGGAG**ATATTT*ACATTCAAGAGTTTGTTT
CG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2BA49TF 726 0 0
GGGACTGCGACGACGGAGATCAGCAATGGGGGCATACAAGTATGTGTCTGAGCTATGGAG
GAAGAAACAGTCGGATGTGATGAGGTTTGTGCAGAGAGTGAGGTGCTGGGAGTACAGACA
GCAGCCATCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGGCCCGTCGTCTCGG
CTACAAGGCCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGTCGCAA
GAGGCCTGTTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGCT
CAAATTCCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCCGGTCGCAAGCTTGGTGG
CCTCAGGGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGAT
CATACTTGTGGACCCTGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCTG
CAACCCAGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCG
TGGTCTTCGTGGAAAGGGACACAACAACCACAAGAATAGACCTTCCCGCAGGGCTACCTG
GAAGAAGAACAACTCCCTTT*CTCTCCGTCGTTACCGGTGATCTGCTTTTT*GTGTTTTG
TTTTTCTTTTCAGCTCGAGTGGTGTATCTTCTGTGTGGATTGGTGTCAGAATTTCTTTGT
ATGGAA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2BX53JQ 578 0 0
GGCTACAAGGCCAAGCAGGGGTTTGTTGTTTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGTCGC
AAGAGGCCTGTTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAG
CTCAAATTCCAGCGCAGTAAGAGATTTGTTGCTGAGGAACGTGCCGGTCGCAAGCTTGGT
GGCCTCAGGGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAG
ATCATACTTGTGGACCCTGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATT
TGCAACCCAGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAAT
CGTGGTTTTCGTGGAAAGGGACACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGGGCTACC
TGGAAGAAGAACAACTCCCTTT*CTTTCCGTCGTTACCGGTGATTTGCTTTTT*GTGTTT
TGTTTTTCTTTTCAGCTCGAGTGGTGTATTTTCTGTGTGGATTGGTGTCAGAATTTCTTT
GTATGGAAGAATATTTTACATTCAAGAGTTTGTTTTC
G

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2G015TF 749 0 0
GG
GACGACGGAGATCAGCAATGGGGGCATACAAGTATGTGTCTGAGCTATGGAGGAAGAAAC
AGTCGGATGTGATGAGGTTTGTGCAGAGAGTGAGGTGCTGGGAGTACAGACAGCAGCCAT
CCATTGCCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGGCCCGTCGTCTCGGCTACAAGG
CCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGTCGCAAGAGGCCTG
TTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGCTCAAATTCC
AGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCCGGTCGCAAGCTTGGTGGCCTCAGGG
TCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGATCATACTTG
TGGACCCTGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCTGCAACCCAG
TGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCGTGGTCTTC
GTGGAAAGGGACACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGGGCTACCTGGAAGAAGA
ACAACTCCCTTTTCTCTCCGTCGTTACCGGTGATCTGCTTTTT*GTGTTTTGTTTT*CTT
TTCAGCTCGAGTGGTGTATCTTCTGTGTGGATTGGTGTCAGAATTTCTTTGTATGGAAG*
ATATTTTACATTCAAGAGTTTGTTTTC

QA 3 749 3 749
DS 

RD RR2G015JQ 747 0 0
GACGACGGAGATCAGCAATGGGGGCATACAAGTATGTGTCTGAGCTATGGAGGAAGAAAC
AGTCGGATGTGATGAGGTTTGTGCAGAGAGTGAGGTGCTGGGAGTACAGACAGCAGCCAT
CCATTGCCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGGCCCGTCGTCTCGGCTACAAGG
CCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGTCGCAAGAGGCCTG
TTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGCTCAAATTCC
AGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCCGGTCGCAAGCTTGGTGGCCTCAGGG
TCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGATCATACTTG
TGGACCCTGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCTGCAACCCAG
TGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCGTGGTCTTC
GTGGAAAGGGACACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGGGCTACCTGGAAGAAGA
ACAACTCCCTTTTCTCTCCGTCGTTACCGGTGATCTGCTTTTT*GTGTTTTGTTTTTCTT
TTCAGCTCGAGTGGTGTATCTTCTGTGTGGATTGGTGTCAGAATTTCTTTGTATGGAAGA
ATATTTTACATTCAAGAGTTTGTTTTC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2BC44TF 766 0 0
GG
GCGACGACGGAGATCAGCAATGGGGGCATACAAGTATGTGTCTGAGCTATGGAGGAAGAA
ACAGTCGGATGTGATGAGGTTTGTGCAGAGAGTGAGGTGCTGGGAGTACAGACAGCAGCC
ATCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGGCCCGTCGTCTCGGCTACAA
GGCCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGTCGCAAGAGGCC
TGTTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGCTCAAATT
CCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCCGGTCGCAAGCTTGGTGGCCTCAG
GGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGATCATACT
TGTGGACCCTGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCTGCAACCC
AGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCGTGGTCT
TCGTGGAAAGGGACACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGGGCTACCTGGAAGAA
GAACAACTCCCTTT*CTCTCCGTCGTTACCGGTGATCTGCTTTTTTGTGTTTTGTTTTTC
TTTTCAGCTCGAGTGGTGTATCTTCTGTGTGGATTGGTGTCAGAATTTCTTTGTATGGAA
GAATATTTTACATTCAAGAGTTTGTTTTCAAGTT
TTGAGCGTAA

QA 3 756 3 756
DS 

RD RR2BC44JQ 806 0 0
GG
GCGACGACGGAGATCAGCAATGGGGGCATACAAGTATGTGTCTGAGCTATGGAGGAAGAA
ACAGTCGGATGTGATGAGGTTTGTGCAGAGAGTGAGGTGCTGGGAGTACAGACAGCAGCC
ATCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGGCCCGTCGTCTCGGCTACAA
GGCCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGTCGCAAGAGGCC
TGTTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGCTCAAATT
CCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCCGGTCGCAAGCTTGGTGGCCTCAG
GGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGATCATACT
TGTGGACCCTGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCTGCAACCC
AGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCGTGGTCT
TCGTGGAAAGGGACACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGGGCTACCTGGAAGAA
GAACAACTCCCTTT*CTCTCCGTCGTTACCGGTGATCTGCTTTTT*GTGTTTTGTTTTTC
TTTTCAGCTCGAGTGGTGTATCTTCTGTGTGGATTGGTGTCAGAATTTCTTTGTATGGAA
GAATATTTTACATTCAAGAGTTTGTTTTCAAGTTTTGAGCGTAACTAAAACTTCAAATCT
TACAAATAAAGTTAGACAACGTTC

QA 3 806 3 806
DS 

RD RR2BW90JQ 802 0 0
GACGACGGAGATCAGCAATGGGG*CATACAAGTATGTGTCTGAGCTATGGAGGAAGAAAC
AGTCGGATGTGATGAGGTTTGTGCAGAGAGTGAGGTGCTGGGAGTACAGACAGCAGCCAT
CCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGGCCCGTCGTCTCGGCTACAAGG
CCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGTCGCAAGAGGCCTG
TTCCCAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTAACCAGGGAGTGACACAGCTCAAATTCC
AGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCCGGTCGCAAGCTTGGTGGCCTCAGGG
TCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGATCATACTTG
TGGACCCTGCACACAATGCCGTCCGTAATGACCCAAGGATCAACTGGATCTGCAACCCAG
TGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCGTGGTCTTC
GTGGAAAGGGACACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGGGCTACCTGGAAGAAGA
ACAACTCCCTTT*CTCTCCGTCGTTACCGGTGATCTGCTTTTT*GTGTTTTGTTTTTCTT
TTCAGCTCGAGTGGTGTATCTTCTGTGTGGATTGGTGTCAGAATTTCTTTGTATGGAAGA
ATATTTTACATTCAAGAGTTTGTTTTCAAGTTTTGAGCGTAACTAAAACTTCAAATCTTA
CAA*TAAAGTTAGACAACGTTC

QA 1 802 1 802
DS 



CO CL269Contig2 536 2 2 U
GGAGGCCTGTTCCGAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTGACCAGGGAGTGACGCAAC
TCAAATTCCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCTGGTCGTAAACTTGGTG
GCCTCAGGGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGA
TCATACTTGTGGACCCGGCACACAATGCCGTCCGTAACGATCCAAGGATCAACTGGATCT
GCAACCCAGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATC
GTGGACTTCGTGGAAAGGGTCACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGAGCTACCT
GGAAGAAGAATAACTCCCTCTCTCTCCGTCGTTACCGGTGATCAGCTTTTATGTTTTGTT
TTTTTTTGCTCGAGTGGTATATCTTCTGTGTGGATTTGTGTGTTCAGAATTCTCGAATTT
CATTTGTATGGAAGAATATTTTACATTCAAGAGTTTGTTCAAGTTTGTGTTTCTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H411JQB C 1
AF RR2H411TF U 1
BS 1 1 RR2H411JQB
BS 2 536 RR2H411TF

RD RR2H411JQB 536 0 0
GGAGGCCTGTTCCGAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTGACCAGGGAGTGACGCAAC
TCAAATTCCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCTGGTCGTAAACTTGGTG
GCCTCAGGGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGA
TCATACTTGTGGACCCGGCACACAATGCCGTCCGTAACGATCCAAGGATCAACTGGATCT
GCAACCCAGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATC
GTGGACTTCGTGGAAAGGGTCACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGAGCTACCT
GGAAGAAGAATAACTCCCTCTCTCTCCGTCGTTACCGGTGATCAGCTTTTATGTTTTGTT
TTTTTTTGCTCGAGTGGTATATCTTCTGTGTGGATTTGTGTGTTCAGAATTCTCGAATTT
CATTTGTATGGAAGAATATTTTACATTCAAGAGTTTGTTCAAGTTTGTGTTTCTCC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2H411TF 536 0 0
G
GAGGCCTGTTCCGAAGGGTATTGTGTATGGTAAACCCACTGACCAGGGAGTGACGCAACT
CAAATTCCAGCGCAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCTGGTCGTAAACTTGGTGG
CCTCAGGGTCGTTAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGAT
CATACTTGTGGACCCGGCACACAATGCCGTCCGTAACGATCCAAGGATCAACTGGATCTG
CAACCCAGTGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCG
TGGACTTCGTGGAAAGGGTCACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGAGCTACCTG
GAAGAAGAATAACTCCCTCTCTCTCCGTCGTTACCGGTGATCAGCTTTTATGTTTTGTTT
TTTTTTGCTCGAGTGGTATATCTTCTGTGTGGATTTGTGTGTTCAGAATTCTCGAATTTC
ATTTGTATGGAAGAATATTTTACATTCAAGAGTTTGTTCAAGTTTGTGTTTCTCC

QA 2 536 2 536
DS 



AS 1 14

CO CL270Contig1 767 14 10 U
GGATCAACCTAAACAAACAAATAAAAAA*CAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAAT
GGCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTA
CAAGAGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAA
TGTCACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACAC
ATGCGATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAAC
GGTGACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCAT
CTTGGAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGA
GAAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGT
TGCTGACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACC
ATCATCATCATAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACCCTCACCATGATCAAT
ATCATCTCTATTACGAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGT
GAAGTTTCATTTCTTTATAAGATCATGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCATCGACCGGTTT
GATATGTTATGCTTTGATATATTCTAGTGTTATTAAGTTTGTCAAAA


BQ
25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 10 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 55 
70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 
75 75 75 75 60 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 70 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN63TF U 8
AF RR2DW05TF U 4
AF RR2GY04TF U 9
AF RR2GP73TF U 9
AF RR2GP73JQ C 9
AF RR2D712TF U 230
AF RR2GY04JQ C 32
AF RR2H671TF U 1
AF RR2B337TF U 1
AF RR2DK72TF U 1
AF RR2DW05JQ C 412
AF RR2EX52TF U 1
AF RR2B337JQ C 93
AF RR2GD01TF U 4
BS 1 311 RR2B337TF
BS 312 312 RR2DK72TF
BS 313 481 RR2B337TF
BS 482 482 RR2DK72TF
BS 483 598 RR2B337TF
BS 599 599 RR2DK72TF
BS 600 712 RR2B337TF
BS 713 713 RR2DK72TF
BS 714 761 RR2B337TF
BS 762 767 RR2EX52TF

RD RR2DN63TF 255 0 0
GGA
AAACAAACAAATAAAAA**CAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAATGGCGACGTCA
GGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTACAAGAGGTGG
AGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTCACCATT
CACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACATGCGATGGG
AAGCCAGAGGTA

QA 4 255 4 255
DS 

RD RR2DW05TF 628 0 0
GG
AACCTAAACAAACAAATAAAAAA*CAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAATGGCGA
CGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTACAAGA
GGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTCA
CCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCGTCAAGACTTGGAACTACACATGCG
ATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTGA
CGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCATCTTGG
AGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGAGAAGC
GCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTTGCTG
ACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACCATCAT
CATCCTAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACCCTCACCATGATCAATATCAT
CTCTATTACGAAATACTTATTAAGAT

QA 3 628 3 628
DS 

RD RR2GY04TF 624 0 0
GG
AAACAAACAAATAAAAAA*CAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAATGGCGACGTCA
GGAACATACGTGATGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTACAAGAGGTGG
AGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTCACCATT
CACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACATGCGATGGG
AAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTGACGTTT
AGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCATCTTGGAGTTT
ATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGAGAAGCGCAAC
GATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTTGCTGACATG
GGCGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACCATCATCATCA
TAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACCCTCACCATGATCAATATCATCTCTA
TTACGAAATACTTATTAAGATG

QA 3 624 3 624
DS 

RD RR2GP73TF 692 0 0
GG
AAACAAACAAATAAAAAA*CAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAATGGCGACGTCA
GGAACATACGTGATGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTACAAGAGGTGG
AGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTCACCATT
CACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACATGCGATGGG
AAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTGACGTTT
AGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCATCTTGGAGTTT
ATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGAGAAGCGCAAC
GATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTTGCTGACATG
GGCGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACCATCATCATCA
TAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACCCTCACCATGATCAATATCATCTCTA
TTACGAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGTGAAGTTTCAT
TTCTTTATAAGATCATGCTTTGATATGTT
A

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR2GP73JQ 691 0 0
GG
AAACAAACAAATAAAAAA*CAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAATGGCGACGTCA
GGAACATACGTGATGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTACAAGAGGTGG
AGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTCACCATT
CACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACATGCGATGGG
AAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTGACGTTT
AGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCATCTTGGAGTTT
ATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGAGAAGCGCAAC
GATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTTGCTGACATG
GGCGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACCATCATCATCA
TAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACCCTCACCATGATCAATATCATCTCTA
TTACGAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGTGAAGTTTCAT
TTCTTTATAAGATCATGCTTTGATATGTT

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR2D712TF 464 0 0
G
GGAACTACACATGCGATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATG
AGAAGAAAACGGTGACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGT
ATGACGTCCTCTTGGAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTA
TGATATGGGAGAAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCA
AGAGCATGGTTGCTGACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCAC
CAGCATCACCATCATCATCATAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACCCTCAC
CATGATCAATATCATCTCTATTACGAAATACTTATTAATATGCTTTTCAATTCAATAAAT
GTGGTCTTGTGAAGTTTCATTTCTTTATAAGATCATGCTTTGA

QA 2 464 2 464
DS 

RD RR2GY04JQ 668 0 0
GTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAATGGCGACGTCAGGAACATACGTGATGGAGGTT
CCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTACAAGAGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTC
CCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTCACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCT
CACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACATGCGATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAA
AGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTGACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTG
ATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCATCTTGGAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGC
TGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGAGAAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGC
AACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTTGCTGACATGGGCGACCATGTTCTCAAAGCT
TAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACCATCATCATCATAATCGCCATCCAAATCATCA
CCATCACAATCACCCTCACCATGATCAATATCATCTCTATTACGAAATACTTATTAAGAT
GCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGTGAAGTTTCATTTCTTTATAAGATCATGCTTT
GATATGTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2H671TF 709 0 0
GGATCAACCTAAACAAACAAATAAAAAA*CAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAAT
GGCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTA
CAAGAGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAA
TGTCACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACAC
ATGCGATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAGC
GGTGACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCAT
CTTGGAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGA
GAAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGT
TGCTGACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACC
ATCATCATCATAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACCCTCACCATGATCAAT
ATCATCTCTATTACGAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGT
GAAGTTTCATTTCTTTATAAGATCATGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2B337TF 763 0 0
GGATCAACCTAAACAAACAAATAAAAAA*CAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAAT
GGCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTA
CAAGAGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAA
TGTCACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACAC
ATGCGATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAAC
GGTGACGTTTATAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCAT
CTTGGAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGA
GAAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGT
TACTGACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACC
ATCATCATCATAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACCCTCACCATGATCAGT
ATCATCTCTATTACGAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGT
GAAGTTTCATTTCTTTATAAGATCATGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCATCGGCCGGTTT
GATATGTTATGCTTTGATATATTCTAGTGTTATTAAGTTTG
CC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2DK72TF 749 0 0
GGATCAACCTAAACAAACAAATAAAAAAACAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAGT
GGCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTA
CAAGAGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCCTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAA
TGTCACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACAC
ATGCGATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAAC
GGTGACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCAT
TTTGGGGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGA
GAAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGT
TGCTGACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACC
ATCATCATCATAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAACCACCCTCACCATGATCAAT
ATCATCTCTATTACGAAATACTTATTAAAATGCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGT
GAAGTTTCATTTCTTTATAAGATCATGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCATCGACCGGTTT
GATATGTTATGCTTTGATATATTCTAGTG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2DW05JQ 335 0 0
GATATGGGAGAAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAA
GAGCATGGTTGCTGACATGGACGACCATGTTTTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACC
AGCATCACCATCATCATCCTAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACCCTCACC
ATGATCAATATCATTTTTATTACGAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAATTCAATAAATG
TGGTCTTGTGAAGTTTCATTTCTTTATAAGATCATGCTTTGATATGTTTTTGTGGTCA*C
GACCGGTTTGATATGTTATGCTTTGATATATTCTA

QA 1 335 1 335
DS 

RD RR2EX52TF 767 0 0
GGATCAACCTAAACAAACAAATAAAAAA*CAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAAT
GGCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTA
CAAGAGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAA
TGTCACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACAC
ATGCGATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAAC
GGTGACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCAT
CTTGGAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGA
GAAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGT
TGCTGACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACC
ATCATCATCATAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACCCTCACCATGATCAAT
ATCATCTCTATTACGAAATACTTATTAAGATGCTTTTCA*TTCAATAAATGTGGTCTTGT
GAAGTTTCATTTCTTTATAAGATCATGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCATCGACCGGTTT
GATATGTTATGCTTTGATATATTCTAGTGTTATTAAGTTTGTCAAAA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2B337JQ 671 0 0
CGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTACAAGAGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCC
CGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTCACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTC
ACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACATGCGATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAA
GGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTGACGTTTATAGGACTTGAAGGTCACGTGA
TGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCATCTTGGAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCT
GTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGAGAAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCA
ACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTTACTGACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTT
AATTGTCATCATCATCACCAGCATCACCATCATCATCATAATCGCCATCCAAATCATCAC
CATCACAATCACCCTCACCATGATCAGTATCATCTCTATTACGAAATACTTATTAAGATG
CTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGTGAAGTTTCATTTCTTTATAAGATCATGCTTTG
ATATGTTCTTGTGGTCATCGGCCGGTTTGATATGTTATGCTTTGATATATTCTAGTGTTA
TTAAGTTTG
CC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2GD01TF 732 0 0
GG
AACCTAAACAAACAAATAAAAAA*CAGTCGAGGCTTTGTAGCGAGAGAGAGTAATGGCGA
CGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTACAAGA
GGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTCA
CCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACATGCG
ATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTGA
CGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCATCTTGG
AGTTTATTCCCAAGTCCGAAGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGAGAAGC
GCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTTGCTG
ACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACCATCAT
CATCATAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACCCTCACCATGATCAATATCAT
CTCTATTACGAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGTGAAGT
TTCATTTCTTTATAAGATCATGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCATCGACCGGTTTGATAT
GTTATGCTTT

QA 3 732 3 732
DS 



AS 3 12

CO CL271Contig1 489 7 5 U
GGGCCGAAACCTCAAGTGTTTTCTTACTCGCATTCGTTGCAATGACGAAGGGAACGGGAA
GTTTCGGAAAGAGAAGGAACAAGAGTCACACACTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGTT
TCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCCTACCCTGCCGCTCGCAAGAGGACCT
ACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGAAAGACTACAGGAACTGGGAGGATGAGGTATC
TTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACCGAAGCCAAGCCAA
GGGTCAAGTCAGCAGCGTCTTCGTAAGCTTAAACCGGTGCATTGATTAGTCGCGGGAAGA
GTTACAACTTTAGTTTTTGGGCTTCTGAGTTTGTTTGGAAGATTACTTTTTTATTTTATT
GAGCATCTGATAACTACTTTCCTTTGGTATCTTTTCACTTTCTTTTATATAAAATTTTGG
ACTTGGATG


BQ
30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 30 10 10 

AF RR2A718TF U 38
AF RR2B667JQ C 1
AF RR2B667TF U 1
AF RR2FS06JQ C 1
AF RR2FS06TF U 1
AF RR2FC87JQ C 2
AF RR2FC87TF U 2
BS 1 132 RR2B667TF
BS 133 133 RR2FS06TF
BS 134 486 RR2B667TF
BS 487 487 RR2FS06TF
BS 488 489 RR2FC87JQ

RD RR2A718TF 257 0 0
TGCAATGACTAAGGGAACGGGAAGTTTCGGAAAGAGAAGGAACAAGAGTCACACACTCTG
TGTGAGATGTGGCCGTCCCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCCTA
CCCTGCCGCTCGCAAGAGGACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGAAAGACTAC
AGGAACTGGGAGGATGAGGTATCTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAG
AGAAGGTACCGAAGCCA

QA 1 257 1 257
DS 

RD RR2B667JQ 486 0 0
GGGCCGAAACCTCAAGTGTTTTCTTACTCGCATTCGTTGCAATGACGAAGGGAACGGGAA
GTTTCGGAAAGAGAAGGAACAAGAGTCACACACTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGTT
TCCACATCCAGAGGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCCTACCCTGCCGCTCGCAAGAGGACCT
ACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGAAAGACTACAGGAACTGGGAGGATGAGGTATC
TTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACCGAAGCCAAGCCAA
GGGTCAAGTCAGCAGCGTCTTCGTAAGCTTAAACCGGTGCATTGATTAGTCGCGGGAAGA
GTTACAACTTTAGTTTTTGGGCTTCTGAGTTTGTTTGGAAGATTACTTTTTTATTTTATT
GAGCATCTGATAACTACTTTCCTTTGGTATCTTTTCACTTTCTTTTATATAAAATTTTGG
ACTTGG

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR2B667TF 486 0 0
GGGCCGAAACCTCAAGTGTTTTCTTACTCGCATTCGTTGCAATGACGAAGGGAACGGGAA
GTTTCGGAAAGAGAAGGAACAAGAGTCACACACTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGTT
TCCACATCCAGAGGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCCTACCCTGCCGCTCGCAAGAGGACCT
ACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGAAAGACTACAGGAACTGGGAGGATGAGGTATC
TTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACCGAAGCCAAGCCAA
GGGTCAAGTCAGCAGCGTCTTCGTAAGCTTAAACCGGTGCATTGATTAGTCGCGGGAAGA
GTTACAACTTTAGTTTTTGGGCTTCTGAGTTTGTTTGGAAGATTACTTTTTTATTTTATT
GAGCATCTGATAACTACTTTCCTTTGGTATCTTTTCACTTTCTTTTATATAAAATTTTGG
ACTTGG

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR2FS06JQ 489 0 0
GGGCCGAAACCTCAAGTGTTTTCTTACTCGCATTCGTTGCAATGACGAAGGGAACGGGAA
GTTTCGGAAAGAGAAGGAACAAGAGTCACACACTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGTT
TCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCCTACCCTGCCGCTCGCAAGAGGACCT
ACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGAAAGACTACAGGAACTGGGAGGGTGAGGTATC
TTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACCGAAGCCAAGCCAA
GGGTCAAGTCAGCAGCGTCTTCGTAAGCTTAAACCGGTGCATTGATTAGTCGCGGGAAGA
GTTACAACTTTAGTTTTTGGGCTTCTGAGTTTGTTTGGAAGATTACTTTTTTATTTTATT
GAGCATCTGATAACTACTTTCCTTTGGTATCTTTTCACTTTCTTTTATATAAAATTTTGG
ACTTGGA
CG

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR2FS06TF 489 0 0
GGGCCGAAACCTCAAGTGTTTTCTTACTCGCATTCGTTGCAATGACGAAGGGAACGGGAA
GTTTCGGAAAGAGAAGGAACAAGAGTCACACACTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGTT
TCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCCTACCCTGCCGCTCGCAAGAGGACCT
ACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGAAAGACTACAGGAACTGGGAGGGTGAGGTATC
TTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACCGAAGCCAAGCCAA
GGGTCAAGTCAGCAGCGTCTTCGTAAGCTTAAACCGGTGCATTGATTAGTCGCGGGAAGA
GTTACAACTTTAGTTTTTGGGCTTCTGAGTTTGTTTGGAAGATTACTTTTTTATTTTATT
GAGCATCTGATAACTACTTTCCTTTGGTATCTTTTCACTTTCTTTTATATAAAATTTTGG
ACTTGGA
CG

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR2FC87JQ 488 0 0
GGCCGAAACCTCAAGTGTTTTCTTACTCGCATTCGTTGCAATGACGAAGGGAACGGGAAG
TTTCGGAAAGAGAAGGAACAAGAGTCACACACTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGTTT
CCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCCTACCCTGCCGCTCGCAAGAGGACCTA
CAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGAAAGACTACAGGAACTGGGAGGATGAGGTATTT
TCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACCGAAGCCAAGCCAAG
GGTCAAGTCAGCAGCGTCTTCGTAAGCTTAAACCGGTGCATTGATTAGTCGCGGGAAGAG
TTACAACTTTAGTTTTTGGGCTTCTGAGTTTGTTTGGAAGATTACTTTTTTATTTTATTG
AGCATTTGATAACTACTTTCCTTTGGTATCTTTTCACTTTCTTTTATATAAAATTTTGGA
CTTGGATG

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2FC87TF 488 0 0
GGCCGAAACCTCAAGTGTTTTCTTACTCGCATTCGTTGCAATGACGAAGGGAACGGGAAG
TTTCGGAAAGAGAAGGAACAAGAGTCACACACTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGTTT
CCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCCTACCCTGCCGCTCGCAAGAGGACCTA
CAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGAAAGACTACAGGAACTGGGAGGATGAGGTATCT
TCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACCGAAGCCAAGCCAAG
GGTCAAGTCAGCAGCGTCTTCGTAAGCTTAAACCGGTGCATTGATTAGTCGCGGGAAGAG
TTACAACTTTAGTTTTTGGGCTTCTGAGTTTGTTTGGAAGATTACTTTTTTATTTTATTG
AGCATCTGATAACTACTTTCCTTTGGTATCTTTTCACTTTCTTTTATATAAAATTTTGGA
CTTGGA
TG

QA 1 486 1 486
DS 



CO CL271Contig2 479 3 1 U
GGACTTCTCAGAGACCTCTAAAGTTATCTCGTAACTCGCATCCGTTGCAATGACGAAGGG
AACGGGGAGTTTTGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCG
TCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAA
GAGGACCTACAACTGGAGTGTTAAGGCAATCCGTAGGAAGACAACAGGAACTGGAAGGAT
GAGGTATCTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGC
CAAGCCAAGGAACAAGTCTGCAGCTTCATCTGCTTAAACACTAGATTTATGGCTTATGAG
TTTGTTTGCAAAATCACTCTGTTTTATTATTCAGTATCTGATTACAATTTATCTTTTTGG
TGTGTTATCTACTCTCTATATAAACTTTTGGACTTGAATGAGATTTCTGTTAAGTTTGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2DW59TF U 1
AF RR2HB96TF U 1
AF RR2DW59JQ C 33
BS 1 479 RR2DW59TF

RD RR2DW59TF 479 0 0
GGACTTCTCAGAGACCTCTAAAGTTATCTCGTAACTCGCATCCGTTGCAATGACGAAGGG
AACGGGGAGTTTTGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCG
TCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAA
GAGGACCTACAACTGGAGTGTTAAGGCAATCCGTAGGAAGACAACAGGAACTGGAAGGAT
GAGGTATCTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGC
CAAGCCAAGGAACAAGTCTGCAGCTTCATCTGCTTAAACACTAGATTTATGGCTTATGAG
TTTGTTTGCAAAATCACTCTGTTTTATTATTCAGTATCTGATTACAATTTATCTTTTTGG
TGTGTTATCTACTCTCTATATAAACTTTTGGACTTGAATGAGATTTCTGTTAAGTTTGC

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR2HB96TF 479 0 0
GGACTTCTCAGAGACCTCTAAAGTTATCTCGTAACTCGCATCCGCTGCAATGACGAAGGG
AACGGGGAGTTTTGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCG
TCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAA
GAGGACCTACAACTGGAGTGTTAAGGCAATCCGTAGGAAGACAACAGGAACTGGAAGGAT
GAGGTATCTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGC
CAAGCCAAGGAACAAGTCTGCAGCTTCATCTGCTTAAACACTAGATTTATGGCTTATGAG
TTTGTTTGCAAAATCACTCTGTTTTATTATTCAGTATCTGATTGCAATTTATCTTTTTGG
TGTGTTATCTACTCTCTATATAAACTTTTGGACTTGAATGAGATTTCTGTTAAGTTTGC

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR2DW59JQ 447 0 0
A
ACTCGCATCCGTTGCAATGACGAAGGGAACGGGGAGTTTTGGAAAGAGGAGGAACAAGAG
TCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTC
CGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTACAACTGGAGTGTTAAGGCAATCCG
TAGGAAGACAACAGGAACTGGAAGGATGAGGTATCTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAA
GACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGTCTGCAGCTTCATCTGC
TTAAACACTAGATTTATGGCTTATGAGTTTGTTTGCAAAATCACTCTGTTTTATTATTCA
GTATCTGATTACAATTTATCTTTTTGGTGTGTTATCTACTCTCTATATAAACTTTTGGAC
TTGAATGAGATTTCTGTTAAGTTTGC

QA 2 447 2 447
DS 



CO CL271Contig3 312 2 2 U
AACCGCTCCCTTGTTCCTTGGCTTGGCTTCGGTACCTTCTCTGAAACCGGTCTTAAACCT
GCGAGGCACATTGCGAAAATACCTCATCCTTCCAGTTCCTGTAGTCTTTCTACGGATGGC
CTTCACACTCCAGTTATAGGTCCTCTTGCGAGCGGCGGGGTAAGCACAGGCGGAGCAACG
GCTCTTCTGGATGTGGAAACTGCGACGGCCACATCTCACACAGAGAGTGTGACTCTTGTT
CCTCCTCTTTCCAAAACTCCCCGTTCCCTTCGTCATTGCAAAGGATGCGAAATAACTTTA
GGTCTCTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2E779TF C 1
AF RR2E779JQ U 4
BS 1 9 RR2E779TF
BS 10 312 RR2E779JQ

RD RR2E779TF 312 0 0
AACCGCTCCCTTGTTCCTTGGCTTGGCTTCGGT*CCTTCTCTGAA*CCGGTCTTAAACCT
GCGAGGCACATTGCGAAGATACCTCA*CCTTCCAGTTCCTGTAGTCTTTCTACGGATGGC
CTTCACACTCCAGTTATAGGTCCTCTTGCGAGCGGCGGGGTAAGCACAGGCGGAGCAACG
GCTCTTCTGGATGTGGAAACTGCGACGGCCACATCTCACACAGAGAGTGTGACTCTTGTT
CCTCCTCTTTCCGAAACTCCCCGTTCCCTTCGTCATTGCAGAGGATGCGAAATAACTTTA
GGTCTCTCTCT
C

QA 1 311 1 311
DS 

RD RR2E779JQ 309 0 0
CCCTCC
CTTGTTCCTTGGCTTGGCTTCGGTACCTTCTCTGAAACCGGTCTTAAACCTGCGAGGCAC
ATTGCGAAAATACCTCATCCTTCCAGTTCCTGTAGTCTTTCTACGGATGGCCTTCACACT
CCAGTTATAGGTCCTCTTGCGAGCGGCGGGGTAAGCACAGGCGGAGCAACGGCTCTTCTG
GATGTGGAAACTGCGACGGCCACATCTCACACAGAGAGTGTGACTCTTGTTCCTCCTCTT
TCCAAAACTCCCCGTTCCCTTCGTCATTGCAAAGGATGCGAAATAACTTTAGGTCTCTCT
CTC

QA 7 309 7 309
DS 



AS 2 12

CO CL272Contig1 794 4 4 U
GGATATCAAACAGCCAACCAAAACCAAACATCTCTCTCTCCACCACTCAAAACCTCTCTC
TCTTGCTGCTTACAATGGCTTCCTTGCTCGATTCCGTCACCGTTACCCGCGTGTTTTCTC
TTCCGATCACTTCCTCAATTTCGTCTGCTTCAAAGGTTCCGTCAGTTTCCGCACGGCGGA
TTTCTCCGGAGTTCAGAGGTTTGAAAGCTTCACAACGGAGTTCGGTCACTAAGTCGGCGA
GTCTTGGTGAGAATCGTAGATCCAGATTGGCTCGTGGTGGTAGAATCGTCTGCGAGGCTC
AGGACGCCACTGCCGCCGCCGTGGAAGTACCAAACATCTCTGATTCAGAATGGCAAACAC
AGGTTCTCGAGTCAGACGTACCAGTATTGGTCGAGTTTTGGGCGCCATGGTGTGGACCTT
GCCGTATGATTCACCCCATTGTTGACCAACTGGCCAAGGATTTCGCGGGCAAGTTCAAAT
TCTACAAAATCAACACCGATGAGAGCCCAAACACAGCCAACCGTTACGGTATACGCAGCG
TTCCTACGGTGATCATATTCAAAGACGGTGAGAAGAAAGACAGTATCATCGGAGCTGTCC
CTAAAGAGACGTTGGAGAAAACTATAGAAAAATTCGTCGTCGAGTAACTAAAAAAAAAAA
CAAAACAAATTTCACTCATGTCTTCTGTGTTGTATAATTCTTCGTAAGGTTTCTTTTGAC
TATTTATGTTTCCATTCGCCTACTTGTCTTGTTTAGTATTATGAAAAAAGGGAATAACGA
ACAATAATTACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ66TF U 1
AF RR2AA03JQ C 5
AF RR2AA03TF U 5
AF RR2DZ66JQ C 342
BS 1 256 RR2DZ66TF
BS 257 709 RR2AA03TF
BS 710 720 RR2AA03JQ
BS 721 794 RR2DZ66JQ

RD RR2DZ66TF 272 0 0
GGATATCAAACAGCCAACCAAAACCAAACATCTCTCTCTCCACCACTCAAAACCTCTCTC
TCTTGCTGCTTACAATGGCTTCCTTGCTCGATTCCGTCACCGTTACCCGCGTGTTTTCTC
TTCCGATCACTTCCTCAATTTCGTCTGCTTCAAAGGTTCCGTCAGTTTCCGCACGGCGGA
TTTCTCCGGAGTTCAGAGGTTTGAAAGCTTCACAACGGAGTTCGGTCACTAAGTCGGCGA
GTCTTGGTGAGAATCG
AGATCCAGATTGGCTT

QA 1 256 1 256
DS 

RD RR2AA03JQ 717 0 0
GGA
AAACAGCCAACCAAAACCAAACATCTCTCTCTCCACCACTCAAAACCTCTCTCTCTTGCT
GCTTACAATGGCTTCCTTGCTCGATTCCGTCACCGTTACCCGCGTGTTTTCTCTTCCGAT
CACTTCCTCAATTTCGTCTGCTTCAAAGGTTCCGTCAGTTTCCGCACGGCGGATTTCTCC
GGAGTTCAGAGGTTTGAAAGCTTCACAACGGAGTTCGGTCACTAAGTCGGCGAGTCTTGG
TGAGAATCGTAGATCCAGATTGGCTCGTGGTGGTAGAATCGTCTGCGAGGCTCAGGACGC
CACTGCCGCCGCCGTGGAAGTACCAAACATCTCTGATTCAGAATGGCAAACACAGGTTCT
CGAGTCAGACGTACCAGTATTGGTCGAGTTTTGGGCGCCATGGTGTGGACCTTGCCGTAT
GATTCACCCCATTGTTGACCAACTGGCCAAGGATTTCGCGGGCAAGTTCAAATTCTACAA
AATCAACACCGATGAGAGCCCAAACACAGCCAACCGTTACGGTATACGCAGCGTTCCTAC
GGTGATCATATTCAAAGACGGTGAGAAGAAAGACAGTATCATCGGAGCTGTCCCTAAAGA
GACGTTGGAGAAAACTATAGAAAAATTCGTCGTCGAGTAACTAAAAAAAAAAACAAAACA
AATTTCACTCATGTCTTCTGTGTTGTATAATTCTTCGTAAGGTTTCTTTTGAC
T

QA 4 716 4 716
DS 

RD RR2AA03TF 705 0 0
GGA
AAACAGCCAACCAAAACCAAACATCTCTCTCTCCACCACTCAAAACCTCTCTCTCTTGCT
GCTTACAATGGCTTCCTTGCTCGATTCCGTCACCGTTACCCGCGTGTTTTCTCTTCCGAT
CACTTCCTCAATTTCGTCTGCTTCAAAGGTTCCGTCAGTTTCCGCACGGCGGATTTCTCC
GGAGTTCAGAGGTTTGAAAGCTTCACAACGGAGTTCGGTCACTAAGTCGGCGAGTCTTGG
TGAGAATCGTAGATCCAGATTGGCTCGTGGTGGTAGAATCGTCTGCGAGGCTCAGGACGC
CACTGCCGCCGCCGTGGAAGTACCAAACATCTCTGATTCAGAATGGCAAACACAGGTTCT
CGAGTCAGACGTACCAGTATTGGTCGAGTTTTGGGCGCCATGGTGTGGACCTTGCCGTAT
GATTCACCCCATTGTTGACCAACTGGCCAAGGATTTCGCGGGCAAGTTCAAATTCTACAA
AATCAACACCGATGAGAGCCCAAACACAGCCAACCGTTACGGTATACGCAGCGTTCCTAC
GGTGATCATATTCAAAGACGGTGAGAAGAAAGACAGTATCATCGGAGCTGTCCCTAAAGA
GACGTTGGAGAAAACTATAGAAAAATTCGTCGTCGAGTAACTAAAAAAAAAAACAAAACA
AATTTCACTCATGTCTTCTGTGTTGTATAATTCTTCGTAAGG

QA 4 705 4 705
DS 

RD RR2DZ66JQ 453 0 0
GATTCAGAATGGCAAACACAGGTTCTCGAGTCAGACGTACCAGTATTGGTCGAGTTTTGG
GCGCCATGGTGTGGACCTTGCCGTATGATTCACCCCATTGTTGACCAACTGGCCAAGGAT
TTCGCGGGCAAGTTCAAATTCTACAAAATCAACACCGATGAGAGCCCAAACACAGCCAAC
CGTTACGGTATACGCAGCGTTCCTACGGTGATCATATTCAAAGACGGTGAGAAGAAAGAC
AGTATCATCGGAGCTGTCCCTAAAGAGACGTTGGAGAAAACTATAGAAAAATTCGTCGTC
GAGTAACTAAAAAAAAAAACAAAACAAATTTCACTCATGCCTTCTGTGTTGTATAATTCT
TCGTAAGGTTTCTTTTGACTATTTATGTTTCCATTCGCCTACTTGTCTTGTTTAGTATTA
TGAAAAAAGGGAATAACGAACAATAATTACTCC

QA 1 453 1 453
DS 



CO CL272Contig2 729 8 10 U
GGATTCATATCAAACAGCCAACCAAAACCAAACATCTCTCTCTCCACCAATCAAAACCTC
TCTCTCTCGCTGCTTTCAATGGCTTCCTTGCTCGATTCCGTCACCGTTACCCGCGTGTTT
TCTCTCCCGATCACTTCCTCGATTTCGTTTGCTTCAAAGATTCCTTCAGTTTCCGCACGT
CGGATTTATCCCGTTCCGGAATTCAGAGGTTTGAAAGCTTCTCGACGGAGTTCGGTGACT
CAGTCGGCGAGTCTTGGTGAGAATCGTAGATCCCGATTCGCTCGTGGTGGTAGAATCGTC
TGCGAGGCTCAGGACACCACTGCCTCCGCCGTGGAAGTACCAAACATCTCTGATTCAGAA
TGGCAAACACAGGTTCTCGAGTCAGACGTACCAGTATTGGTCGAGTTTTGGGCACCATGG
TGTGGACCGTGCCGTATGATTCACCCCATTGTTGACCAACTGGCCAAGGATTTCACAGGC
AAGTTCAAATTCTACAAAATCAACACCGATGAGAGCCCAAATACAGCCAACCGTTACGGT
ATACGCAGCGTTCCTACGGTGATCATATTCAAAGACGGCGAGAAGAAAGATAGTATCATC
GGAGCTGTCCCTAAAGAGACGTTGGAGAAAACTATAGAAAAATTCGTCGTCGAGTAACTA
AAAAAAA*CAAAACAAATTTCACTCATGTCTTCTGTGTTGTATAATTCTTCGTAAGGTTT
CTTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2BI17TF U 22
AF RR2CE05JQ C 347
AF RR2CE05TF U 27
AF RR2ES73TF U 22
AF RR2F545TF U 1
AF RR2F545JQ C 1
AF RR2ES73JQ C 22
AF RR2BI17JQ C 354
BS 1 6 RR2F545JQ
BS 7 23 RR2F545TF
BS 24 168 RR2BI17TF
BS 169 169 RR2CE05TF
BS 170 222 RR2BI17TF
BS 223 712 RR2CE05TF
BS 713 714 RR2ES73TF
BS 715 716 RR2F545TF
BS 717 728 RR2F545JQ
BS 729 729 RR2BI17JQ

RD RR2BI17TF 201 0 0
GG
AAAACCAAACATCTCTCTCTCCACCAATCAAAACCTCTCTCTCTCGCTGCTTTCAATGGC
TTCCTTGCTCGATTCCGTCACCGTTACCCGCGTGTTTTCTCTCCCGATCACTTCCTCGAT
TTCGTTTGCTTCAAAGATTCCTTCAATTTCCGCACGTCGGATTTATCCCGTTCCGGAATT
CAGAGGTTTGAAAGCTTCT

QA 3 201 3 201
DS 

RD RR2CE05JQ 250 0 0
TTTT
TGATTCAGAATGGCAAACACAGGTTCTCGAGTCAGACGTACCAGTATTGGTCGAGTTTTG
GGCCCCATGGTGTGGACCGTGCCGTATGATTCACCCCATTGTTGACCAACTGGCCAAGGA
TTTCACAGGCAAGTTCAAATTTTACAAAATCAACACCGATGAGAGCCCAAATACAGCCAA
CCGTTACGGTATACGCAGCGTTCCTACGGTGATCATATTCAAAGACGGGGAGAAGAAAGA
TAGTAT

QA 5 250 5 250
DS 

RD RR2CE05TF 686 0 0
GGG
AAACATCTCTCTCTCCACCACTCAAAACCTCCCTCTCTCGCTGCTTTCAATGGCTTCCTT
GCTCGATTCCGTCACCGTTACCCGCGTGTTTTCTCTCCCGATCACTTCCTCGATTTCGTT
TGCTTCAAAGATTCCTTCAGTTTCCGCACGTCGGATTTATCCCGTTCCGGAATTCAGAGG
TTTGAAAGCTTCTCGACGGAGTTCGGTGACTCAGTCGGCGAGTCTTGGTGAGAATCGTAG
ATCCCGATTCGCTCGTGGTGGTAGAATCGTCTGCGAGGCTCAGGACACCACTGCCTCCGC
CGTGGAAGTACCAAACATCTCTGATTCAGAATGGCAAACACAGGTTCTCGAGTCAGACGT
ACCAGTATTGGTCGAGTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCGTGCCGTATGATTCACCCCAT
TGTTGACCAACTGGCCAAGGATTTCACAGGCAAGTTCAAATTCTACAAAATCAACACCGA
TGAGAGCCCAAATACAGCCAACCGTTACGGTATACGCAGCGTTCCTACGGTGATCATATT
CAAAGACGGCGAGAAGAAAGATAGTATCATCGGAGCTGTCCCTAAAGAGACGTTGGAGAA
AACTATAGAAAAATTCGTCGTCGAGTAACTAAAAAAAA*CAAAACAAATTTCACTCATGT
CTTCTGTGTTGTATAATTCTTCG

QA 4 686 4 686
DS 

RD RR2ES73TF 693 0 0
GG
AAAACCAAACATCTCTCTCTCCACCAATCAAAACCTCTCTCTCTCGCTGCTTTCAATGGC
TTCCTTGCTCGATTCCGTCACCGTTACCCGCGTGTTTTCTCTCCCGATCACTTCCTCGAT
TTCGTTTGCTTCAAAGATTCCTTCAGTTTCCGCACGTCGGATTTATCCCGTTCCGGAATT
CAGAGGTTTGAAAGCTTCTCGACGGAGTTCGGTGACTCAGTCGGCGAGTCTTGGTGAGAA
TCGTAGATCCCGATTCGCTCGTGGTGGTAGAATCGTCTGCGAGGCTCAGGACACCACTGC
CTCCGCCGTGGAAGTACCAAACATCTCTGATTCAGAATGGCAAACACAGGTTCTCGAGTC
AGACGTACCAGTATTGGTCGAGTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCGTGCCGTATGATTCA
CCCCATTGTTGACCAACTGGCCAAGGATTTCACAGGCAAGTTCAAATTCTACAAAATCAA
CACCGATGAGAGCCCAAATACAGCCAACCGTTACGGTATACGCAGCGTTCCTACGGTGAT
CATATTCAAAGACGGCGAGAAGAAAGATAGTATCATCGGAGCTGTCCCTAAAGAGACGTT
GGAGAAAACTATAGAAAAATTCGTCGTCGAGTAACTAAAAAAAA*CAAAACAAATTTCAC
TCATGTCTTCTGTGTTGTATAATTCTTCGTA

QA 3 693 3 693
DS 

RD RR2F545TF 727 0 0
GGATTC
ATATCAAACAGCCAACCAAAACCAAACATCTCTCTCTCCACCACTCAAAACCTCTCTCTC
TCGCTGCTTTCAATGGCTTCCTTGCTCGATTCCGTCACCGTTACCCGCGTGTTTTCTCTC
CCGATCACTTCCTCGATTTCGTTTGCTTCAAAGATTCCTTCAGTTTCCGCACGTCGGATT
TATCCCGTTCCGGAATTCAGAGGTTTGAAAGCTTCTCGACGGAGTTCGGTGACTCAGTCG
GCGAGTCTTGGTGAGAATCGTAGATCCCGATTCGCTCGTGGTGGTAGAATCGTCTGCGAG
GCTCAGGACACCACTGCCTCCGCCGTGGAAGTACCAAACATCTCTGATTCAGAATGGCAA
ACACAGGTTCTCGAGTCAGACGTACCAGTATTGGTCGAGTTTTGGGCACCATGGTGTGGA
CCGTGCCGTATGATTCACCCCATTGTTGACCAACTGGCCAAGGATTTCACAGGCAAGTTC
AAATTCTACAAAATCAACACCGATGAGAGCCCAAATACAGCCAACCGTTACGGTATACGC
AGCGTTCCTACGGTGATCATATTCAAAGACGGCGAGAAGAAAGATAGTATCATCGGAGCT
GTCCCTAAAGAGACGTTGGAGAAAACTATAGAAAAATTCGTCGTCGAGTAACTAAAAAAA
**CAAAACAAATTTCACTCATGTCTTCTGTGTTGTATAAT*CTTCGTAAG
TTTCTTTGACC

QA 7 716 7 716
DS 

RD RR2F545JQ 729 0 0
GGATTCATATCAAACAGCCAACCAAAACCAAACATCTCTCTCTCCACCACTCAAAACCTC
TCTCTCTCGCTGCTTTCAATGGCTTCCTTGCTCGATTCCGTCACCGTTACCCGCGTGTTT
TCTCTCCCGATCACTTCCTCGATTTCGTTTGCTTCAAAGATTCCTTCAGTTTCCGCACGT
CGGATTTATCCCGTTCCGGAATTCAGAGGTTTGAAAGCTTCTCGACGGAGTTCGGTGACT
CAGTCGGCGAGTCTTGGTGAGAATCGTAGATCCCGATTCGCTCGTGGTGGTAGAATCGTC
TGCGAGGCTCAGGACACCACTGCCTCCGCCGTGGAAGTACCAAACATCTCTGATTCAGAA
TGGCAAACACAGGTTCTCGAGTCAGACGTACCAGTATTGGTCGAGTTTTGGGCACCATGG
TGTGGACCGTGCCGTATGATTCACCCCATTGTTGACCAACTGGCCAAGGATTTCACAGGC
AAGTTCAAATTCTACAAAATCAACACCGATGAGAGCCCAAATACAGCCAACCGTTACGGT
ATACGCAGCGTTCCTACGGTGATCATATTCAAAGACGGCGAGAAGAAAGATAGTATCATC
GGAGCTGTCCCTAAAGAGACGTTGGAGAAAACTATAGAAAAATTCGTCGTCGAGTAACTA
AAAAAAA*CAAAACAAATTTCACTCATGTCTTCTGTGTTGTATAATTCTTCGTAAGGTTT
CTTTTGAC
C

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2ES73JQ 708 0 0
GG
AAAACCAAACATCTCTCTCTCCACCAATCAAAACCTCTCTCTCTCGCTGCTTTCAATGGC
TTCCTTGCTCGATTCCGTCACCGTTACCCGCGTGTTTTCTCTCCCGATCACTTCCTCGAT
TTCGTTTGCTTCAAAGATTCCTTCAGTTTCCGCACGTCGGATTTATCCCGTTCCGGAATT
CAGAGGTTTGAAAGCTTCTCGACGGAGTTCGGTGACTCAGTCGGCGAGTCTTGGTGAGAA
TCGTAGATCCCGATTCGCTCGTGGTGGTAGAATCGTCTGCGAGGCTCAGGACACCACTGC
CTCCGCCGTGGAAGTACCAAACATTTCTGATTCAGAATGGCAAACACAGGTTCTCGAGTC
AGACGTACCAGTATTGGTCGAGTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCGTGCCGTATGATTCA
CCCCATTGTTGACCAACTGGCCAAGGATTTCACAGGCAAGTTCAAATTCTACAAAATCAA
CACCGATGAGAGCCCAAATACAGCCAACCGTTACGGTATACGCAGCGTTCCTACGGTGAT
CATATTCAAAGACGGCGAGAAGAAAGATAGTATCATCGGAGCTGTCCCTAAAGAGACGTT
GGAGAAAACTATAGAAAAATTCGTCGTCGAGTAACTAAAAAAAAACAAAACAAATTTCAC
TCATGTCTTCTGTGTTGTATAATTCTTCGTAAGGTTTCTTTTGAC
C

QA 3 707 3 707
DS 

RD RR2BI17JQ 376 0 0
TTCAGAATGGCAAACACAGGTTCTCGAGTCAGACGTACCAGTATTGGTCGAGTTTTGGGC
ACCATGGTGTGGACCGTGCCGTATGATTCACCCCATTGTTGACCAACTGGCCAAGGATTT
CACAGGCAAGTTCAAATTCTACAAAATCAACACCGATGAGAGCCCAAATACAGCCAACCG
TTACGGTATACGCAGCGTTCCTACGGTGATCATATTCAAAGACGGCGAGAAGAAAGATAG
TATCATCGGAGCTGTCCCTAAAGAGACGTTGGAGAAAACTATAGAAAAATTCGTCGTCGA
GTAACTAAAAAAAAACAAAACAAATTTCACTCATGTCTTCTGTGTTGTATAATTCTTCGT
AAGGTTTCTTTTGACC

QA 1 376 1 376
DS 



AS 1 14

CO CL273Contig1 3171 14 32 U
GACAATAAAAAAAATCTGTATATTGAGAGAATATATCTTCTGACTCTTTGTATTCCAATA
GTTTATTGGAGTGGATTTTACGTTATTTATCATTATCATTTAGTTCAGTTTTAATTTTGT
TTAGTTTTCGTACAATTTCAATAAAAAAAGGAGTCTTTATGTCACGTTACCGAGGGCCTC
GTTTTAAAAAAATACGCCGTCTGGGGGCTTTACCGGGACTAACTAGTAAAAGGCCTAGGG
CAGGAAGCGATCTTAGAAACCAATCACGCTCCGGAAAAAAATCTCAATATCGTATTCGTT
TAGAAGAAAAACAAAAATTGCGTTTTCATTATGGTCTTACAGAACGCCAATTACTTAAAT
ATGTTCGTATCGCCGGAAAAGCCAAGGGGTCAACGGGTCAAGTTTTATTACAATTCTTGA
AATGCGTTTGGATAACATCCTTTTTCGGTTGGGTATGGCTTTGACTATTCCTCAAGCGCG
CCAATTAGTTAACCATGGACATATTTTAGTTAATGGTCGTATAGTTGATATACCAAGTTA
TCGATGCAAACCCCGAGATATTATTACAGTGAAGGATGAACAAAACTCTAGAACTTTGGT
TCAAAATCTTCTTGAGTCATCTGCCCCCGAGGAATTGCCAAACCATCTGACTCTTCACAC
ATTCCAATATGAAAGGGTTAGTCAATCAAATAATAGATAGGAAGTGCGTCGGTTTGAAAA
TAAATGAATTGCTTGTCGTAGAATATTACTCTCGCCAGACTTAAAAAACCTAAGTGAAGT
AAAAAAAATCACTAAAAACAAGAGTTCGGGCAACTCCCCTTTGCCCGCTTTTTTGATTAA
AACTAAAAAGGCACAAGGGAAGGGATTTTGTCGGGGAATCTTTTTCCTATTCATGCATCA
TAGATTGGTAGGGAGGTTTGGATCCCTTGTTTGCTCTTCCCAGCATTTTCCATAGCAAAG
AAATGTAGATTTTATATCGATTTTTTTTATTTGATTTGATACGTTGTGGTCAATCACGTA
AGATTGGTTATTTAGTTGAAAGTACGGAAAGAGAGGGATTCGAACCCTCGGTAAACAAAA
GCCTACATAACAGTTCCAATGTTACGCCTTCAACCACTCGGCCATCTCTCCGACATCAGG
ATTATGACTGAGTACCTGGGTGAATAGCGAGTTATTCATCGTTTTTTAGATTATGGTTAA
TAGATACCTTTTTTGATCGGAAAAATTGGAAGTAGATAGAATATTTTTTTATAAAAAACG
AGTCCGCTTTTATGTTAGTTCGTACTATAAAATTCCTTTGTTTGTGAGAAAATTTTCTCA
CAAAAGAAAAGTTAAAGGAAATAAAAAGAGTTATAAATGGATTACTACCTATGCCAAGAT
CGCGTATAAATGGAAATTTTATTGATAAAACCTTTACAATTGTAGCCGATATCTTATTAC
GAGTTATTCCGACAACTTCCGGAGAAAAAGAGGCATTTACTTATTACAGAGATGGGATGT
CGGCTCAATCTGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTATGCGAC
TAGAAATTGACCCCTATGATCGAAGTTATATACTCTATAATATAGGCCTTATCCACACAA
GTAATGGGGAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCGGGCATTAGAACGAAACCCCT
TTTTACCACAAGCTTTTAATAATATGGCTGTGATCTGTCATTACGTGCGACTATCTCCAC
TATAGAAAAAAAGAACGAACAGCTAGTCAATGAAATACTAGAAACAAAAAAAAAAAAGGC
TTTCTACATAAGCATCGTCCAAAACGATTTTTTATCAGCTGTAGCAAATAAATAAACTTC
ATGGATAGAAATATGAAGTGAAGACTAGATATGCCTAAATACTTTATTTCTATGGATAAA
AAAAGATTGAATTGATAGAGGAAGCACCGTAAAGATCAACTGGAAAGGTTTTGGACCGAT
ACAACAAGAGCTGTTTATTTATATCATAATATGAGATAAATCTTAGGAATCTACTTATGT
AATAGAGTGGATCCCCTAAGGTATTGAGCAGCGGTGTAGCATCAGATCCTAAAGACAGTA
AGTCTTTTTCTTTTTTATGAAGTATGAAAAAAAAGTCTTTTTCAACGATTCTATATAAAT
TTATATATGAAAGCGGGATAGTTACCTTTCAGAAAATTCTAATATCTAATAACAGTGGAC
ATGCCTTTTTTTTCTGAAGGTAGGAGAAAAGATAAAACTTATTAGATTAATTAATATATT
AATTAAATCAAAACGAAAGTTTGAAACTCATGTAATTACTCTCTTTTGTTTAATCCAAGA
AAAACCGAATGAATATCTATAAGAAATCTCATTCAATTAGACATTCAATTAGATATAAAG
TTAAAGTAGGTTAAAGTGAAAAAACTGGTACACCAAAACAAAAGAGTTGGTTGTCGAGCC
GTATGAGGTAGGAAACTCTCAAGTACGGTTCTCAGGGAGGGAATTGACCCGCCTATTCCG
ACCGTGGAGAACAGGCCATTCAACAAGGAGATTCTGAAATGGCGGAGGCTTGGTTTGCTC
AAGCCGCCGAGTATTGGAAACAGGCTATAACGCTTACTCCTGGTAATTATATTGAAGCAC
AGAATTGGTTGACGATCACGAGGCGCTTCGAATAAGAAATTTTTCTTTGTTTCTTTTTTT
TTTTATTCTATAATATATCTTTATTTGTTTTTACAATTAATTGTTTTTTAGTTTCTTGGC
CCTCTCGGTCAAATAAAACAGATTCTTTTTTCTATCAGAAGAACCAATCACAGAAAAAAA
TTTCATTATATCCTTTTCTCAAATCGTTCTATTTCATCTGGTATTCTCTAAGGATAAGTA
GTACATGAATATGAGAATATCTATATATCTATATCTAGTTTTTTCTATTTTTTTTTTCGA
CTATTAAAACGAATAAAAGGGATTTGAAAATGACTAAATATCAATACTAGAGTGTTTCTT
AGTAATGACTAATAAGTGGTTATTGAAATAGGATAATATCCTCTATTTAAAACATAAAAA
ATAGGCTATATTTCGGAACTTATAATTGAAATATGAATACACTAGGTTAGGTTATAAAAA
AAAAATTCTTTGTGTACCAATACCAATGTAAAGGTGCGAAAACGTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 20 20 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2F660TF U 1
AF RR2F660JQ C 347
AF RR2G073TF U 850
AF RR2G073JQ C 1122
AF RR2FB52TF U 1375
AF RR2AU14TF U 1753
AF RR2EV27TF U 2138
AF RR2GT09TF U 2168
AF RR2CC48TF U 2227
AF RR2FB52JQ C 2535
AF RR2AU14JQ C 2328
AF RR2EV27JQ C 2561
AF RR2GT09JQB C 2814
AF RR2CC48JQ C 2938
BS 1 737 RR2F660TF
BS 738 849 RR2F660JQ
BS 850 895 RR2G073TF
BS 896 896 RR2F660JQ
BS 897 1514 RR2G073TF
BS 1515 1515 RR2FB52TF
BS 1516 1584 RR2G073TF
BS 1585 2060 RR2FB52TF
BS 2061 2061 RR2AU14TF
BS 2062 2115 RR2FB52TF
BS 2116 2465 RR2AU14TF
BS 2466 2563 RR2EV27TF
BS 2564 2564 RR2GT09TF
BS 2565 2582 RR2EV27TF
BS 2583 2583 RR2GT09TF
BS 2584 2750 RR2EV27TF
BS 2751 2819 RR2GT09TF
BS 2820 2820 RR2CC48TF
BS 2821 2824 RR2GT09TF
BS 2825 2825 RR2CC48TF
BS 2826 2840 RR2GT09TF
BS 2841 2871 RR2CC48TF
BS 2872 2872 RR2AU14JQ
BS 2873 2917 RR2CC48TF
BS 2918 2934 RR2AU14JQ
BS 2935 2936 RR2FB52JQ
BS 2937 3124 RR2AU14JQ
BS 3125 3125 RR2EV27JQ
BS 3126 3160 RR2AU14JQ
BS 3161 3161 RR2EV27JQ
BS 3162 3170 RR2AU14JQ
BS 3171 3171 RR2CC48JQ

RD RR2F660TF 737 0 0
GACAATAAAAAAAATCTGTATATTGAGAGAATATATCTTCTGACTCTTTGTATTCCAATA
GTTTATTGGAGTGGATTTTACGTTATTTATCATTATCATTTAGTTCAGTTTTAATTTTGT
TTAGTTTTCGTACAATTTCAATAAAAAAAGGAGTCTTTATGTCACGTTACCGAGGGCCTC
GTTTTAAAAAAATACGCCGTCTGGGGGCTTTACCGGGACTAACTAGTAAAAGGCCTAGGG
CAGGAAGCGATCTTAGAAACCAATCACGCTCCGGAAAAAAATCTCAATATCGTATTCGTT
TAGAAGAAAAACAAAAATTGCGTTTTCATTATGGTCTTACAGAACGCCAATTACTTAAAT
ATGTTCGTATCGCCGGAAAAGCCAAGGGGTCAACGGGTCAAGTTTTATTACAATTCTTGA
AATGCGTTTGGATAACATCCTTTTTCGGTTGGGTATGGCTTTGACTATTCCTCAAGCGCG
CCAATTAGTTAACCATGGACATATTTTAGTTAATGGTCGTATAGTTGATATACCAAGTTA
TCGATGCAAACCCCGAGATATTATTACAGTGAAGGATGAACAAAACTCTAGAACTTTGGT
TCAAAATCTTCTTGAGTCATCTGCCCCCGAGGAATTGCCAAACCATCTGACTCTTCACAC
ATTCCAATATGAAAGGGTTAGTCAATCAAATAATAGATAGGAAGTGCGTCGGTTTGAAAA
TAAATGAATTGCTTGTC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2F660JQ 569 0 0
CCAATTACTTAAATATGTTCGTATCGCCGGAAAAGCCAAGGGGTCAACGGGTCAAGTTTT
ATTACAATTCTTGAAATGCGTTTGGATAACATCCTTTTTCGGTTGGGTATGGCTTTGACT
ATTCCTCAAGCGCGCCAATTAGTTAACCATGGACATATTTTAGTTAATGGTCGTATAGTT
GATATACCAAGTTATCGATGCAAACCCCGAGATATTATTACAGTGAAGGATGAACAAAAC
TCTAGAACTTTGGTTCAAAATCTTCTTGAGTCATCTGCCCCCGAGGAATTGCCAAACCAT
CTGACTCTTCACACATTCCAATATGAA*GGGTTAGTCAATCAAATAATAGATAGGAAGTG
CGTCGGTTTGAAAATAAATGAATTGCTTGTCGTAGAATATTACTCTCGCCAGACTTAAAA
AACCTAAGTGAAGTAAAAAAAATCACTAAAAACAAGAGTTCGGGCAACTCCCCTTTGCCC
GCTTTTTTGATTAAAACTAAAAAGGCACAAGGGAAGGGATTTTGTCGGGGAATCTTTTTC
CTATTCATGCATCATAGATTGGTAGGGAG

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2G073TF 735 0 0
GGCACAAGGGAAGGGATTTTGTCGGGGAATCTTTTTCCTATTCATGTATCATAGATTGGT
AGGGAGGTTTGGATCCCTTGTTTGCTCTTCCCAGCATTTTCCATAGCAAAGAAATGTAGA
TTTTATATCGATTTTTTTTATTTGATTTGATACGTTGTGGTCAATCACGTAAGATTGGTT
ATTTAGTTGAAAGTACGGAAAGAGAGGGATTCGAACCCTCGGTAAACAAAAGCCTACATA
ACAGTTCCAATGTTACGCCTTCAACCACTCGGCCATCTCTCCGACATCAGGATTATGACT
GAGTACCTGGGTGAATAGCGAGTTATTCATCGTTTTTTAGATTATGGTTAATAGATACCT
TTTTTGATCGGAAAAATTGGAAGTAGATAGAATATTTTTTTATAAAAAACGAGTCCGCTT
TTATGTTAGTTCGTACTATAAAATTCCTTTGTTTGTGAGAAAATTTTCTCACAAAAGAAA
AGTTAAAGGAAATAAAAAGAGTTATAAATGGATTACTACCTATGCCAAGATCGCGTATAA
ATGGAAATTTTATTGATAAAACCTTTACAATTGTAGCCGATATCTTATTACGAGTTATTC
CGACAACTTCCGGAGAAAAAGAGGCATTTACTTATTACAGAGATGGGATGTCGGCTCAAT
CTGAAAGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTG
ACCCCTATGATCGAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2G073JQ 660 0 0
CCATCTCTCCGACATCAGGATTATGACTGAGTACCTGGGTGAATAGCGAGTTATTCATCG
TTTTTTAGATTATGGTTAATAGATACCTTTTTTGATCGGAAAAATTGGAAGTAGATAGAA
TATTTTTTTATAAAAAACGAGTCCGCTTTTATGTTAGTTCGTACTATAAAATTCCTTTGT
TTGTGAGAAAATTTTCTCACAAAAGAAAAGTTAAAGGAAATAAAAAGAGTTATAAATGGA
TTACTACCTATGCCAAGATCGCGTATAAATGGAAATTTTATTGATAAAACCTTTACAATT
GTAGCCGATATCTTATTACGAGTTATTCCGACAACTTCCGGAGAAAAAGAGGCATTTACT
TATTACAGAGATGGGATGTCGGCTCAATCTGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAAT
TATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTGACCCCTATGATCGAAGTTATATACTCTATAAT
ATAGGCCTTATCCACACAAGTAATGGGGAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCGG
GCATTAGAACGAAACCCCTTTTTACCACAAGCTTTTAATAATATGGCTGTGATCTGTCAT
TACGTGCGACTATCTCCACTATAGAAAAAAAGAACGAACAGCTAGTCAATGAAATACTAG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2FB52TF 756 0 0
G
AAGATCGCGTATAAATGGAAATTTTATTGATAAAACCTTTACAATTGTAGCCGATATCTT
ATTACGAGTCATTCCGACAACTTCCGGAGAAAAAGAGGCATTTACTTATTACAGAGATGG
GATGTCGGCTCAAT*TGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTAT
GCGACTAGAAATTGACCCCTATGATCGAAGTTATATACTCTATAATATAGGCCTTATCCA
CACAAGTAATGGGGAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCGGGCATTAGAACGAAA
CCCCTTTTTACCACAAGCTTTTAATAATATGGCTGTGATCTGTCATTACGTGCGACTATC
TCCACTATAGAAAAAAAGAACGAACAGCTAGTCAATGAAATACTAGAAACAAAAAAAAAA
AAGGCTTTCTACATAAGCATCGTCCAAAACGATTTTTTATCAGCTGTAGCAAATAAATAA
ACTTCATGGATAGAAATATGAAGTGAAGACTAGATATGCCTAAATACTTTATTTCTATGG
ATAAAAAAAGATTGAATTGATAGAGGAAGCACCGTAAAGATCAACTGGAAAGGTTTTGGA
CCGATACAACAAGAGCTGTTTATTTATATCATAATATGAGATAAATCTTAGGAATCTACT
TATGTAATAGAGTGGATCCCCTAAG*TATTGAGCAGCGGTGTAGCATCAGATCCTAAAGA
CAGTAAGTCTTTTTCTTTTT
ATGAGTATGAAAAAA

QA 2 741 2 741
DS 

RD RR2AU14TF 713 0 0
GAACGAACAGCTAGTCAATGAAATACCAGAAACAAAAAAAAAA**GGCTTTCTACATAAG
CATCGTCCAAAACGATTTTTTATCAGCTGTAGCAAATAAATAAACTTCATGGATAGAAAT
ATGAAGTGAAGACTAGATATGCCTAAATACTTTATTTCTATGGATAAAAAAAGATTGAAT
TGATAGAGGAAGCACCGTAAAGATCAACTGGAAAGGTTTTGGACCGATACAACAAGAGCT
GTTTATTTATATCATAATATGAGATAAATCTTAGGAATCTACTTATGTAATAGAGTGGAT
CCCCTAAGGTATTGAGCAGCGGTGTAGCATCAGATCCTAAAGACAGTAAGTCTTTTTCTT
TTTTATGAAGTATGAAAAAAAAGTCTTTTTCAACGATTCTATATAAATTTATATATGAAA
GCGGGATAGTTACCTTTCAGAAAATTCTAATATCTAATAACAGTGGACATGCCTTTTTTT
TCTGAAGGTAGGAGAAAAGATAAAACTTATTAGATTAATTAATATATTAATTAAATCAAA
ACGAAAGTTTGAAACTCATGTAATTACTCTCTTTTGTTTAATCCAAGAAAAACCGAATGA
ATATCTATAAGAAATCTCATTCAATTAGACATTCAATTAGATATAAAGTTAAAGTAGGTT
AAAGTGAAAAAACTGGTACACCAAAACAAAAGAGTTGGTTGTCGAGCCGTATG

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2EV27TF 613 0 0
TTTTTCAACGATTCTATATAAATTTATATATGAAAGCGGGATAGTTACCTTTCAGAAAAT
TCTAATATCTAATAACAGTGGACATGCCTTTTTTTTCTGAAGGTAGGAGAAAAGATAAAA
CTTATTAGATTAATTAATATATTAATTAAATCAAAACGAAAGTTTGAAACTCATGTAATT
ACTCTCTTTTGTTTAATCCAAGAAAAACCGAATGAATATCTATAAGAAATCTCATTCAAT
TAGACATTCAATTAGATATAAAGTTAGAGTAGGTTAAAGTGAAAAAACTGGTACACCAAA
ACAAAAGAGTTGGTTGTCGAGCCGTATGAGGTAGGAAACTCTCAAGTACGGTTCTCAGGG
AGGGAATTGACCCGCCTATTCCGACCGTGGAGAACAGGCCATTCAACAAGGAGATTCTGA
AATGGCAGAGGCTTGGTTTGCTCAAACCGCCGAGTATTGGAAACAGGCTATAACGCTTAC
TCCTGGTAATTATATTGAAGCACAGAATTGGTTGACGATCACGAGGCGCTTCGAATAAGA
AATTTTTCTTTGTTTCTTTTTTTTTTTATTCTATAATATATCTTTATTTGTTTTTACAAT
TAATTGTTTTTTA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2GT09TF 673 0 0
G
GAAAGCGGGATAGTTACCTTTCAGAAAATTCTAATATCTAATAACAGTGGACATGCCTTT
TTTTTCTGAAGGTAGGAGAAAAGATAAAACTTATTAGATTAAT****ATATTAATTAAAT
CAAAACGAAAGTTTGAAACTCATGTAATTACTCTCTTTTGTTTAATCCAAGAAAAACCGA
ATGAATATCTATAAGAAATCTCATTCAATTAGACATTCAATTAGATATAAAGTTAAAGTA
GGTTAAAGTGAAAAAACTGGTACACCAAAACAAAAGAGTTGGTTGTCGAGCCGTATGAGG
TAGGAAACTCTCAAGTACGGTTCTCAGGGAGGGAATTGACCCGCCTATTCCGACCGTGGA
GAACAGGCCATTCAACAAGGAGATTCTGAAATGGCGGAGGCTTGGTTTGCTCAAGCCGCC
GAGTATTGGAAACAGGCTATAACGCTTACTCCTGGTAATTATATTGAAGCACAGAATTGG
TTGACGATCACGAGGCGCTTCGAATAAGAAATTTTTCTTTGTTTCTTTTTTTTTT*ATTC
TATAATATATCTTTATTTGTTTTTACAATTAATTGTTTTTTAGTTTCTTGGCCCTCTCGG
TCAAATAAAACAGATTCTTTTTTCTATCAGAAGAACCAATCACAGAAAAAA*TTTCGTTA
TATCCTTTTCTC

QA 2 673 2 673
DS 

RD RR2CC48TF 691 0 0
TTTTTTTCTGAAGGTAGGAGAAAAGATAAAACTTATTAGATTAATTAATATATTAATTAA
ATCAAAACGAAAGTTTGAAACTCATGTAATTACTCTCTTTTGTTTAATCCAAGAAAAACC
GAATGAATATCTATAAGAAATCTCATTCAATTAGACATTCAATTAGATATAAAGTTAAAG
TAGGTTAAAGTGAAAAAACTGGTACACCAAAACAAAAGAGTTGGTTGTCGAGCCGTATGA
GGTAGGAAACTCTCAAGTACGGTTCTCAGGGAGGGAATTGACCCGCCTATTCCGACCGTG
GAGAACAGGCCATTCAGCAAGGAGATTCTGAAATGGCGGAGGCTTGGTTTGCTCAAGCCG
CCGAGTATTGGAAACAGGCTATAACGCTTACTCCTGGTAATTATATTGAAGCACAGAATT
GGTTGACGATCACGAGGCGCTTCGAATAAGAAATTTTTCTTTGTTTCTTTTTTTTT**AT
TCTATAATATATCTTTATTTGTTTTTACAATTAATTGTTTTTTAGTTTCTTGGCCCTCTC
GGTCAAATAAAACAGATTCTTTTTTCTATCAGAAGAACCAATCACAGAAAAAAATTTCAT
TATATCCTTTTCTCAAATCGTTCTATTTCATCTGGTATTCTCTAAAGATAAGTAGTACAT
GAATATGAGAATATCTATATATCTATATCTA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2FB52JQ 581 0 0
GCCATTCAACAAGGAGATTCTGAAATGGCGGAGGCTTGGTTTGCTCAAGCCGCCGAGTGT
TGGAAACAGGCTATAACGCTTACTCCTGGTAATTATATTGAAGCACAGAATTGGTTGACG
ATCACGAGGCGCTTCGAATAAGAAATTTTTCTTTGTTTCTTTTTTTTTT*ATTCTATAAT
ATATCTTTATTTGTTTTTACAATTAATTGTTTTTTAGTTTCTTGGCCCTCTCGGTCAAAT
AAAACAGATTCTTTTTTCTATCAGAAGAACCAATCACAGAAAAAAATTTCATTATATCCT
TTTCTCAAATCGTTCTATTTCATCTGGTATTCTCTAAGGAT***TAGTACATGAATATGA
GAATATCTATATATCTATATCTAGTTTTTTCTATTTTTTTTTTCGACTATTAAAACGAAT
AAAAGGGATTTGAAAATGACTAAATATCAATACTAGAGTGTTTCTTAGTAATGACTAATA
AGTGGTTATTGAAATAGGATAATATCCTCTATTTAAAACATAAAAAATAGGCTATATTTC
GGAACTTATAATTGAAATATGAATACACTAGGTTAGGTTAT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2AU14JQ 843 0 0
GTTTAATCCAAGAAAAACCGAATGAATATCTATAAGAAATCTCATTCAATTAGACATTCA
ATTAGATATAAAGTTAAAGTAGGTTAAAGTGAAAAAACTGGTACACCAAAACAAAAGAGT
TGGTTGTCGAGCCGTATGAGGTAGGAAACTCTCAAGTACGGTTCTCAGGGAGGGAATTGA
CCCGCCTATTCCGACCGTGGAGAACAGGCCATTCAACAAGGAGATTCTGAAATGGCGGAG
GCTTGGTTTGCTCAAGCCGCCGAGTATTGGAAACAGGCTATAACGCTTACTCCTGGTAAT
TATATTGAAGCACAGAATTGGTTGACGATCACGAGGC**TTCGAATAAGAAATTTTTCTT
TGTTTCTTTTTTTTTTTATTCTATAATATATCTTTATTTGTTTTTACAATTAATTGTTTT
TTAGTTTCTTGGCCCTCTCGGTCAAATAAAACAGATTCTTTTTTCTATCAGAAGAACCAA
TCACAGAAAAAAATTTCATTATATCCTTTTCTCAAATCGTTCTATTTCATCTGGTATTCT
CTAAGGATAAGTAGTACATGAATATGAGAATATCTATATATCTATATCTAGTTTTTTCTA
TTTTTTT**TCGACTATTAAAACGAATAAAAGGGATTTGAAAATGACTAAATATCAATAC
TAGAGTGTTTCTTAGTAATGACTAATAAGTGGTTATTGAAATAGGATAATATCCTCTATT
TAAAACATAAAAAATAGGCTATATTTCGGAACTTATAATTGAAATATGAATACACTAGGT
TAGGTTATAAAAAAAAA*TTCTTTGTGTACCAATACCAATGTAAAGGTGCGAAGACGTTT
TTT

QA 1 843 1 843
DS 

RD RR2EV27JQ 610 0 0
GGCA
GAGGCTTGGTTTGCTCAAACCGCCGAGTATTGGAAACAGGCTATAACGCTTACTCCTGGT
AATTATATTGAAGCACAGAATTGGTTGACGATCACGAGGCGCTTCGAATAAGAAATTTTT
CTTTGTTTCTTTTTTTTTTTATTCTATAATATATCTTTATTTGTTTTTACAATTAATTGT
TTTTTAGTTTCTTGGCCCTCTCGGTCAAATAAAACAGATTCTTTTTTCTATCAGAAGAAC
CAATCACAGAAAAAAATTTCATTATATCCTTTTCTCAAATCGTTCTATTTCATCTGGTAT
TCTCTAAGGATAAGTAGTACATGAATATGAGAATATCTATATATCTATATCTAGTTTTTT
CTATTTTTTTT*TCGACTATTAAAACGAATAAAAGGGATTTGAAAATGACTAAATATCAA
TACTAGAGTGTTTCTTAGTAATGACTAATAAGTGGTTATTGAAATAGGATAATATCCTCT
ATTTAAAACATAAAAAATAGGCTATATTTCGGAACTTATAATTGAAATATGAATACACTA
GGTTAGGTTATAAAAAAAAAATTCTTTGTGTACCAATACCAATGTAAAGGTGCGAAAACG
TTTTTT

QA 5 610 5 610
DS 

RD RR2GT09JQB 357 0 0
G
AAAAAATTTCGTTATATCCTTTTCTCAAATCGTTCTATTTCATCTGGTATTCTCTAAGGA
TAAGTAGTACATGAATATGAGAATATCTATATATCTATATCTAGTTTTTTCTATTTTTTT
TTTCGACTATTAAAACGAATAAAAGGGATTTGAAAATGACTAAATATCAATACTAGAGTG
TTTCTTAGTAATGACTAATAAGTGGTTATTGAAATAGGATAATATCCTCTATTTAAAACA
TAAAAAATAGGCTATATTTCGGAACTTATAATTGAAATATGAATACACTAGGTTAGGTTA
TAAAAAAAAA*TTCTTTGTGTACCAATACCAATGTAAAGGTGCGAAAACGTTTTTT

QA 2 357 2 357
DS 

RD RR2CC48JQ 234 0 0
CGACTATTAAAACGAATAAAAGGGATTTGAAAATGACTAAATATCAATACTAGAGTGTTT
CTTAGTAATGACTAATAAGTGGTTATTGAAATAGGATAATATCCTCTATTTAAAACATAA
AAAATAGGCTATATTTCGGAACTTATAATTGAAATATGAATACACTAGGTTGGGTTATAA
AAAAAAAATTCTTTGTGTACCAATACCAATGTAAAGGTGCGAAAACGTTTTTTT

QA 1 234 1 234
DS 



AS 1 13

CO CL274Contig1 1272 13 22 U
GGAAAAACAAAACAAAAAAAAATGCTGAATGCACTTAGAAACTCTAACCTGACCCTTATC
ATTTTGATCTGCTCTGTCCTGTTAGCCTCAAGGCTATGCTCTGTGGATTCCTCTGTGTAC
GACCCAATCACAACCCTGAGAGAGCGGTTCAATAAGTGGCTTCAAACGCATAGCATATTA
TATGGAGGAAAGGAGGAGTGGATGCTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAACTG
ATAGACTACATCAATTCTCTCCACTTGCCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCGGAC
ATGACTAATGCTGAGTTTAGAGCTCATTTTCTTGGTTTGAACACGTCTTCCCTGAAGTTA
AACAGGGACCAAAGGCCGGTCTGTGACGCGGTAGGTAACGTGCCTGACGCTGTGGACTGG
AGGAAAGAAGGTGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGCG
TTCACTGCAGTGGCAGCTATTGAAGGCATCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAGTATCT
CTCTCAGAACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGT
GGATTAATGACAACAGCATATGAATACCTCATAGCCAATGGTGGACTAGTCACCGAGGCT
GACTATCCCTACACAGCCATACAGGGTACGTGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAACAAGGTA
GTTACGATACAAGGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCTACC
GCTCAACAACCGGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTTCAGCTTTACTCT
TCTGGTGTGTTCACAGGATACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTGGA
TATGGAGAAGAAGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTGGGGAACTGCTTGG
GGTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGACGGGTAAGTGTGGT
ATTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTTTAAAG
AGCCTTTTATCTCTGTATGAAAATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGTGA
AAATAAAGTAGTACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAACATGATTCCAAAG
ATAAGATGCGATTATAATAGAATCATGTGAGATTCACTTGAACAGTGCATTGATACTTTC
TCCTAGAAGCAT


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 35 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 50 35 50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 45 60 60 60 35 60 45 
60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE19TF U 2
AF RR2CR06TF U 1
AF RR2D767TF U 2
AF RR2AQ38TF U 2
AF RR2F063TF U 85
AF RR2H790TF U 6
AF RR2AD15TF U 218
AF RR2AQ38JQ C 457
AF RR2F063JQ C 360
AF RR2AD15JQ C 500
AF RR2EE19JQ C 850
AF RR2H723JQB C 673
AF RR2CR06JQ C 599
BS 1 74 RR2CR06TF
BS 75 75 RR2AQ38TF
BS 76 496 RR2CR06TF
BS 497 497 RR2AQ38TF
BS 498 636 RR2CR06TF
BS 637 637 RR2AQ38TF
BS 638 665 RR2CR06TF
BS 666 666 RR2AQ38TF
BS 667 685 RR2CR06TF
BS 686 687 RR2AQ38TF
BS 688 713 RR2CR06TF
BS 714 770 RR2AQ38TF
BS 771 771 RR2F063TF
BS 772 788 RR2AQ38TF
BS 789 789 RR2F063TF
BS 790 802 RR2AQ38TF
BS 803 818 RR2H790TF
BS 819 980 RR2AD15TF
BS 981 981 RR2F063JQ
BS 982 1001 RR2AD15TF
BS 1002 1233 RR2F063JQ
BS 1234 1272 RR2CR06JQ

RD RR2EE19TF 125 0 0
GG
AAAACAAAACAAAAAAAAATGCTTAATGCACTTAGAAACTCTAACCTGACCCTTATCATT
TTGATCTGCCCTGTCCTGTTAGCCTCAAGGCTATGCTCTGTGGATTCCTCTGTGTACGAC
CCA

QA 3 125 3 125
DS 

RD RR2CR06TF 715 0 0
GGAAAAACAAAACAAAAAAAAATGCTGAATGCACTTAGAAACTCTAACCTGACCCTTATC
ATTTTGATCTGCTCGGTCCTGTTAGCCTCAAGGCTATGCTCTGTGGATTCCTCTGTGTAC
GACCCAATCACAACCCTGAGAGAGCGGTTCAATAAGTGGCTTCAAACGCATAGCATATTA
TATGGAGGAAAGGAGGAGTGGATGCTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAACTG
ATAGACTACATCAATTCTCTCCACTTGCCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCGGAC
ATGACTAATGCTGAGTTTAGAGCTCATTTTCTTGGTTTGAACACGTCTTCCCTGAAGTTA
AACAGGGACCAAAGGCCGGTCTGTGACGCGGTAGGTAACGTGCCTGACGCTGTGGACTGG
AGGAAAGAAGGTGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGCG
TTCACTGCAGTGGCAGTTATTGAAGGCATCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAGTATCT
CTCTCAGAACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGT
GGATTAATGACAACAGCATATGAATACCTCATAGCCCATGGTGGACTAGTCACCGAGGCT
GACTACCCCTACACAGCCATACAGGC*ACGTGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAA
AA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2D767TF 749 0 0
GG
AAAACAAAACAAAAAAAAATGCTGAATGCACTTAGAAACTCTAACCTGACCCTTATCATT
TTGATCTGCTCTGTCCTGTTAGCCTCAAGGCTATGCTCTGTGGATTCCTCTGTGTACGAC
CCAATCACAACCCTGAGAGAGCGGTTCAATAAGTGGCTTCAAACGCATAGCATATTATAT
GGAGGAAAGGAGGAGTGGATGCTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAACTGATA
GACTACATCAATTCTCTCCACTTGCCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCGGACATG
ACTAATGCTGAGTTTAGAGCTCATTTTCTTGGTTTGAACACGTCTTCCCTGAAGTTAAAC
AGGGACCAAAGGCCGGTCTGTGACGCGGTAGGTAACGTGCCTGACGCTGTGGACTGGAGG
AAAGAAGGTGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGCGTTC
ACTGCAGTGGCAGCTATTGAAGGCATCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAGTATCTCTC
**AGAACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTGGA
TTAATGACAACAGCATATGAATACCTCATAGCCAATGGTGGACTAGTCACCGAGGCTGAC
TATCCCTACACAGCCATACAGGGTACGTGCGACCAAGAGAAGTCCAAAA*CAAG*TAGTT
ACGATACA
CGATACACAAAGTAGCACA

QA 3 730 3 730
DS 

RD RR2AQ38TF 801 0 0
GG
AAAACAAAACAAAAAAAAATGCTGAATGCACTTAGAAACTCTAACCTGACCCTTATCATT
TTGATCTGCTCTGTCCTGTTAGCCTCAAGGCTATGCTCTGTGGATTCCTCTGTGTACGAC
CCAATCACAACCCTGAGAGAGCGGTTCAATAAGTGGCTTCAAACGCATAGCATATTATAT
GGAGGAAAGGAGGAGTGGATGCTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAACTGATA
GACTACATCAATTCTCTCCACTTGCCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCGGACATG
ACTAATGCTGAGTTTAGAGCTCATTTTCTTGGTTTGAACACGTCTTCCCTGAAGTTAAAC
AGGGACCAAAGGCCGGTCTGTGACGCGGTAGGTAACGTGCCTGACGCTGTGGACTGGAGG
AAAGAAGGTGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGCGTTC
ACTGCAGTGGCAGCTATTGAAGGCATCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAGTATCTCTC
TCAGAACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTGGA
TTAATGACAACAGCATATGAATACCTCATAGCCAATGGTGGACTAGTCACCGAGGCTGAC
TATCCCTACACAGCCATACAGGGTACGTGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAACAAGGTAGTT
ACGATACAAGGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACA*GCCGCTACCGCT
CAACACCCGGTATCAGTTG

QA 3 801 3 801
DS 

RD RR2F063TF 717 0 0
GCCTCAAGGCTATGCTCTGTGGATTCCTCTGTGTACGACCCAATCACAACCCTGAGAGAG
CGGTTCAATAAGTGGCTTCAAACGCATAGCATATTATATGGAGGAAAGGAGGAGTGGATG
CTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAACTGATAGACTACATCAATTCTCTCCAC
TTGCCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCGGACATGACTAATGCTGAGTTTAGAGCT
CATTTTCTTGGTTTGAACACGTCTTCCCTGAAGTTAAACAGGGACCAAAGGCCGGTCTGT
GACGCGGTAGGTAACGTGCCTGACGCTGTGGACTGGAGGAAAGAAGGTGCAGTGACTCCT
GTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGCGTTCACTGCAGTGTCAGCTATTGAA
GGCATCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAGTATCTCTCTCAGAACAACAGCTCATAGAC
TGTGACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTGGATTAATGACAACAGCATATGAA
TACCTCATAGCCAATGGTGGACTAGTCACCGAGGCTGACTATCCCTACACAGCCATACAG
GGTACGTGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAACAAGGTAGTTACGATACAAGGATACACAAAG
GTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCTACCGCTCAACAACCGGTATCAGT
G

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2H790TF 813 0 0
GGA
AAAACAAAAAAAAATGCTGAATGCACTTAGAAACTCTAACCTGACCCTTATCATTTTGAT
CTGCTCTGTCCTGTTAGCCTCAAGGCTATGCTCTGTGGATTCCTCTGTGTACGACCCAAT
CACAACCCTGAGAGAGCGGTTCAATAAGTGGCTTCAAACGCATAGCATATTATATGGAGG
AAAGGAGGAGTGGATGCTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAACTGATAGACTA
CATCAATTCTCTCCACTTGCCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCGGACATGACTAA
TGCTGAGTTTAGAGCTCATTTTCTTGGTTTGAACACGTCTTCCCTGAAGTTAAACAGGGA
CCAAAGGCCGGTCTGTGACGCGGTAGGTAACGTGCCTGACGCTGTGGACTGGAGGAAAGA
AGGTGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGCGTTCACTGC
AGTGGCAGCTATTGAAGGCATCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAGTATCTCTCTCAGA
ACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTGGATTAAT
GACAACAGCATATGAATACCTCATAGCTAATGGTGGACTAGTCACCGAGGCTGACTATCC
CTACACAGCCATACAGGGTACGTGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAACAAG*TAGTTACGAT
ACA**GATACACAAAG*TAGCACAGAACGAG*CGAGTTTACAAGC*GCTACCGCTCA*CA
ACCGGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGG

QA 4 813 4 813
DS 

RD RR2AD15TF 787 0 0
G
ATACCAGTCTAATCTCCAACTGATAGACTACATCAATTCTCTCCACTTGCCCTTTAAGTT
AACAGACAACAGATTTGCGGACATGACTAATGCTGAGTTTAGAGCTCATTTTCTTGGTTT
GAACACGTCTTCCCTGAAGTTAAACAGGGACCAAAGGCCGGTCTGTGACGCGGTAGGTAA
CGTGCCTGACGCTGTGGACTGGAGGAAAGAAGGTGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGG
AAAATGCGGAGGTTGCTGGGCGTTCACTGCAGTGTCAGCTATTGAAGGCATCAACAAGAT
AAAGACAGGGAACTTAGTATCTCTCTCAGAACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCTC
TTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTGGATTAATGACAACAGCATATGAATACCTCATAGCCAA
TGGTGGGCTAGTCACCGAGGCTGACTATCCCTACACAGCCATACAGGGTACGTGCGACCA
AGAGAAGTCCAAAAACAAGGTAGTTACGATACAAGGATACACAAAGGTAGCACAGAACGA
GGCGAGTTTACAAGCCGCTACCGCTCAACAACCGGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGG
TTTCATCTTTCAGCTTTACTCTTCTGGTGTGTTCACAGGATACTGTGGAAATCATCTCAA
CCATGGAGTGACTGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAA
GAATTCGTGGGGAACTGCTTGGGGTGAACAGGGGTATGTAAG*ATGGAACGTGGTTATAG
TGA
GAG

QA 2 784 2 784
DS 

RD RR2AQ38JQ 744 0 0
GGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGCGTTCACTGCAGTGGCAGCTATTGAAGGCATCAACAAG
ATAAAGACAGGGAACTTAGTATCTCTCTCAGAACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGC
TCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTGGATTAATGACAACAGCATATGAATACCTCATAGCC
AATGGTGGACTAGTCACCGAGGCTGACTATCCCTACACAGCCATACAGGGTACGTGCGAC
CAAGAGAAGTCCAAAAACAAGGTAGTTACGATACAAGGATACACAAAGGTAGCACAGAAC
GAGGCGAGTTTACAAGCCGCTACCGCTCAACAACCGGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCT
GGTTTCATCTTTCAGCTTTACTCTTTTGGTGTGTTCACAGGATACTGTGGAAATCATCTC
AACCGTGGAGTGACTGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTG
AAGAATTCGTGGGGAACTGCTTGGGGTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTGGTTAT
AGTGAAGAGACGGGTAAGTGTGGTATTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTC
CAAGATTTTCTAGAAACTTTAAAGAGCCTTTTATCTCTGTATGAAAATCTGCAATAGCGC
AGATAAAATAATTATGATGTGTGAAAATAAAGTAGTACTAGAGATACTTGAGAACCAAGT
TATAATGCTAACATGATTCCAA
GG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2F063JQ 876 0 0
AAACAGGGACCAAAGGCCGGTCTGTGACGCGGTAGGTAACGTGC*TGACGCTGTGGACTG
GAGGAAAGAAGGTGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGC
GTTCACTGCAGTGTCAGCTATTGAAGGCATCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAGTATC
TCTCTCAGAACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGG
TGGATTAATGACAACAGCATATGAATACCTCATAGCCAATGGTGGACTAGTCACCGAGGC
TGACTATCCCTACACAGCCATACAGGGTACGTGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAACAAGGT
AGTTACGATACAAGGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCTAC
CGCTCAACAACCGGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTTCAGCTTTACTC
TTCTGGTGTGTTCACAGGATACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTGG
ATATGGAGAAGAAGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTGGGGAACTGCTTG
GGGTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGACGGGTAAGTGTGG
TATTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTTTAAA
GAGCCTTTTATCTCTGTATGAAAATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGTG
AAAATAAAGTAGTACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAACATGATTCCAAA
GATAAGATGCGATTATAATAGAATCATGTGAGAT
CC

QA 1 874 1 874
DS 

RD RR2AD15JQ 719 0 0
TTGAAGGCATCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAGTATCTCTCTCAGAACAACAGCTCA
TAGACTGTGACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTGGATTAATGACAACAGCAT
ATGAATACCTCATAGCCAATGGTGGGCTAGTCACCGAGGCTGACTATCCCTACACAGCCA
TACAGGGTACGTGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAACAAGGTAGTTACGATACAAGGATACA
CAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCTACCGCTCAACAACCGGTATCAG
TTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTTCAGCTTTACTCTTCTGGTGTGTTCACAGGAT
ACTGTGGAAATCATTTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGATGGGC
AAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTGGGGAACTGCTTGGGGTGAACAGGGGTATGTAA
GGATGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGACGGGTAAGTGTGGTATTGCTATGCTTGCAAGCT
ATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTTTAAAGAGCCTTTTATCTCTGTATG
AAAATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGTGAAAATAAAGTAGTACTAGAG
ATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAACATGATTCCAAAGATAAGATGCGATTATAAT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2EE19JQ 385 0 0
TTCACAGGATACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTGGATATGGGGAA
GAAGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTTGTGGGGAACTGCTTGGGGTGAACAG
GGGTATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGATGGGTAAGTGTGGTATTGTTATG
CTTGCAAGCTATCCTACGAAGTTAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTTTAAAGAGCTTTTTA
TCTCTGTATGAAAATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGTGAAAATAAAGT
AGTACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAACATGATTCCAAAGATAAGATGC
GATTATAATAGAATCATGTGAGAT
T

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR2H723JQB 568 0 0
ACAGCCACACAGGGTGCATGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAATAAGGTGGTTACAATACAA
GGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCTACCGCTCAACAACCA
GTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTTCAGCTTTACTCTTCTGGTGTGTTC
ACAGGCTACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTGGATATGGAGAAGAA
GATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTGGGGAACTGCTTGGGGTGAACAGGGG
TATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGACGGGTAAGTGTGGTATTGCTATGCTT
GCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTTTAAAGAGCCTTTTATCT
CTGTATGAAAATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGTGAAAATAAAGTAGT
ACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAACATGATTCCAAAGATAAGATGCGAT
TATAATAGAATCATGTGAGAT
TCACTCG

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2CR06JQ 674 0 0
GTGGATTAATGACAACAGCATATGAATACCTCATAGCCAATGGTGGACTAGTCACCGAGG
CTGACTACCCCTACACAGCCATACAGGGCACGTGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAACAAGG
TAGTTACGATACAAGGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCTA
CCGCTCAACAACCGGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTTCAGCTTTACT
CTTCTGGTGTGTTCACAGGATACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTG
GATATGGAGAAGAAGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTGGGGAACTGCTT
GGGGTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGACGGGTAAGTGTG
GTATTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTTTAA
AGAGCCTTTTATCTCTGTATGAAAATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGT
GAAAATAAAGTAGTACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAACATGATTCCAA
AGATAAGATGCGATTATAATAGAATCATGTGAGATTCACTTGAACAGTGCATTGATACTT
TCTCCTAGAAGCAT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 14

CO CL275Contig1 897 14 31 U
GGAAAAACAACAAGTATCGTGCTTGATTGGGAATTAGGGATTCAGGGAGGCGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGGTTCATTTCGATTTCTCTTCGAAAAATTAAATTAATCGAGAGATGGTGAG
GATGGTGGGACACTCCATTCACCC*ACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAA
ATGGCTTCAAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATC
TCTGCATGCGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCA
ACTCCTAAACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTC
AAGCTTGGTGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCA
CCGGTCGAACCATATATGCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGT
TTGTCTCTGTACCGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTC
TCTCAGTCTTCTCCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGC
AACTATATCATATATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAA
GACAAGGTGATTCTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTC
TAGTCTTACCTGTTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTA
AAGATTCTTGAAATGTACCGTTTCATTGTTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTAGT
ATTGTTGCTTTGGTTGTATTGTGATTTATGAATTAATAAAGGATTTATATTTAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 35 50 50 35 40 55 55 40 55 40 55 40 55 55 40 45 60 60 45 45 60 45 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 0 0 0 0 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 0 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 
60 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2C530TF U 1
AF RR2ED52TF U 128
AF RR2CR43JQ C 127
AF RR2BV48TF U 128
AF RR2CR43TF U 127
AF RR2FW33TF U 128
AF RR2FB57TF U 128
AF RR2FK05TF U 128
AF RR2CH39TF U 131
AF RR2BV48JQ C 143
AF RR2FK05JQ C 331
AF RR2CH39JQ C 179
AF RR2G881JQ C 206
AF RR2FB57JQ C 179
BS 1 127 RR2C530TF
BS 128 128 RR2ED52TF
BS 129 130 RR2C530TF
BS 131 132 RR2ED52TF
BS 133 134 RR2C530TF
BS 135 135 RR2ED52TF
BS 136 136 RR2C530TF
BS 137 137 RR2ED52TF
BS 138 138 RR2C530TF
BS 139 139 RR2ED52TF
BS 140 141 RR2C530TF
BS 142 143 RR2ED52TF
BS 144 144 RR2C530TF
BS 145 145 RR2ED52TF
BS 146 146 RR2C530TF
BS 147 148 RR2ED52TF
BS 149 149 RR2C530TF
BS 150 152 RR2ED52TF
BS 153 433 RR2C530TF
BS 434 437 RR2BV48TF
BS 438 484 RR2C530TF
BS 485 485 RR2ED52TF
BS 486 556 RR2C530TF
BS 557 557 RR2BV48TF
BS 558 656 RR2C530TF
BS 657 748 RR2ED52TF
BS 749 811 RR2BV48TF
BS 812 813 RR2CR43TF
BS 814 877 RR2FB57TF
BS 878 881 RR2CH39TF
BS 882 897 RR2BV48JQ

RD RR2C530TF 656 0 0
GGAAAAACAACAAGTATCGTGCTTGATTGGGAATTAGGGATTCAGGGAGGCGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGGTTCATTTCGATTTCTCTTCGAAAAATTAAATTAATCGAGAGATGGTGAG
GATGGTGAGAAGCTGCTTACAGTCGATGATGAAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAA
ATGGCTTCAAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATC
TCTGCATGCGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCA
ACTCCTAAACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTC
AAGCTTGGTGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCA
CCGGTCGAACCAT****GCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGT
TTGTTTCTGTACCGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTC
TCTCAGTCTTCTCCTCGATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGC
AACTATATCATATATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTG

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2ED52TF 621 0 0
GGACACTCCATTCACCC*ACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAAATGGCTT
CAAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATCTCTGCAT
GCGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCTA
AACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTG
GTGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCG
AACCAT****GCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTC
TGTACCGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGT
CTTCTCCTCGATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATA
TCATATATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACAAGG
TGATTCTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTT
ACCTGTTATGGAGTTCATTGG

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2CR43JQ 688 0 0
G
GGACACTCCATTCACCC*ACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAAATGGCTT
CAAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATCTCTGCAT
GCGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCGA
AACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTG
GTGTTTGCGCCAATATGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCG
AACCATATATGCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTC
TGTACCGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGT
CTTCTCCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATA
TCATATATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACAAGG
TGATTCTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTT
ACCTGTTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTC
TTGAAATGTACCGTTTCATTGTTTCC
G

QA 2 687 2 687
DS 

RD RR2BV48TF 684 0 0
GGACACTCCATTCACCC*ACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAAATGGCTT
CAAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATCTCTGCAT
GCGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCTA
AACCATCCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTG
GTGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCG
AACCATATATGCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTC
TGTACCGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGT
CTTCTCCTCAATGTTTGCAGCAAGCAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATA
TCATATATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACAAGG
TGATTCTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTT
ACCTGTTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTC
TTGAAATGTACCGTTTCATTGTTT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2CR43TF 688 0 0
G
GGACACTCCATTCACCC*ACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAAATGGCTT
CAAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATCTCTGCAT
GCGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCGA
AACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTG
GTGTCTGCGCCAATATGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCG
AACCATATATGCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTC
TGTACCGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGT
CTTCTCCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATA
TCATATATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACAAGG
TGATTCTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTT
ACCTGTTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTC
TTGAAATGTACCGTTTCATTGTTTCC
G

QA 2 687 2 687
DS 

RD RR2FW33TF 654 0 0
GGACACTCCATTCACCC*ACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAAATGGCTT
CAAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATCTCTGCAT
GCGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCTA
AACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTG
GTGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCG
AACCATATATGCCGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTC
TGTACCGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGT
CTTCTCCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATA
TCATATATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACAAAG
TGATTCTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTT
ACCTGTTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2FB57TF 750 0 0
GGACACTCCATTCACCC*ACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAAATGGCTT
CAAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATCTCTGCAT
GCGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCTA
AACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTG
GTGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCG
AACCAT****GCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTC
TGTACCGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGT
CTTCTCCTCGATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTACA
TCATATATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACAAGG
TGATTCTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTT
ACCTGTTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTC
TTGAAATGTGCCGTTTCATTGTTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTAGTATTGTTG
CTTTGGTTGTATTGTGATTTATGAATTAAT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2FK05TF 748 0 0
GGACACTCCATTCACCC*ACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAAATGGCTT
CAAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATCTCTGCAT
GCGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCTA
AACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTG
GTGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCG
AACCATATATGCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTC
TGTACCGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGT
CTTCTCCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATA
TCATATATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACAAGG
TGATTCTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTT
ACCTGTTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTC
TTGAAATGTACCGTTTCATTGTTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTAGTATTGTTG
CTTTGGTTGTATTGTGATTTATGA
TTAT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2CH39TF 755 0 0
G
ACTCCATTCACCC*ACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAAATGGCTTCAAG
CTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATCTCTGCATGCGG
TAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCTAAACC
AACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGGTGT
CTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCGAACC
AT****GCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGTA
CCGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTTAACCTTCCGATCTCTCTCAGTCTTC
TCCTCGATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCAT
ATATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACAAGGTGAT
TCTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCT
GTTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTCTTGA
AATGTACCGTTTCATTGTTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTAGTATTGTTGCTTT
GGTTGTATTGTGATTTATGA*TTAATAAAG
ATTT

QA 2 751 2 751
DS 

RD RR2BV48JQ 755 0 0
CCCACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAAATGGCTTCAAGCTCCATAACCC
TTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATCTCTGCATGCGGTAGCTGCACTC
CTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCTAAACCATCCCCAAGCC
CTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGGTGTCTGCGCCAATG
TGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCGAACCATATATGCTGT
ACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGTACCGCTCTTAAG
GCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGTCTTCTCCTCAATGTT
TGCAGCAAGCAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCATATATAATTTAA
ACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACAAGGTGATTCTATATACTT
TTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCTGTTATGGAGTT
CATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTCTTGAAATGTACCGTT
TCATTGTTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTAGTATTGTTGCTTTGGTTGTATTGT
GATTTATGAATTAATAAAGGATTTATATTTAAGTT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2FK05JQ 567 0 0
GGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGGTGTCTGCGCCAATGTGCTCAAC
GGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCGAACCATATATGCTGTACCCTCAT
TCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGTACCGCTCTTAAGGCTAACGT
TCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGTCTTCTCCTCAATGTTTGCAGCAA
ACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCATATATAATTTAAACACACTT
ATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACAAGGTGATTCTATATACTTTTAATATT
GTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCTGTTATGGAGTTCATTGGCT
CAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTCTTGAAATGTACCGTTTCATTGTT
TCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTAGTATTGTTGCTTTGGTTGTATTGTGATTTATG
AATTAATAAAGGATTTATATTTAAGT
T

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2CH39JQ 719 0 0
AAATGGCTTCAAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAA
TCTCTGCATGCGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGC
CAACTCCTAAACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCC
TCAAGCTTGGTGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGC
CACCGGTCGAACCAT****GCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCC
GTTTGTCTCTGTACCGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTTAACCTTCCGATC
TCTCTCAGTCTTCTCCTCGATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAA
GCAACTATATCATATATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAA
AAGACAAGGTGATTCTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTAT
TCTAGTCTTACCTGTTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCG
TAAAGATTCTTGAAATGTACCGTTTCATTGTTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTA
GTATTGTTGCTTTGGTTGTATTGTGATTTATGAATTAATAAAGGATTTATATTTAAGT
T

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2G881JQ 692 0 0
TCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATCTCTGCATGCGGTAGCTGCACTCCTT
GCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCTAAACCAACCCCAAGCCCTA
GCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGGTGTCTGCGCCAATGTGC
TCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCGAACCAT****GCTGTACC
CTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTTTCTGTACCGCTCTTAAGGCT
AACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGTCTTTTCCTCGATGTTTGC
AGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCATATATAATTTAAACA
CACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGGCAAGGTGATTCTATATACTTTTA
ATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCTGTTATGGAGTTCAT
TGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTCTTGAAATGTACCGTTTCA
CTGTTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTAGTATTGTTGCTTTGGTTGTATTGTGAT
TTATGAATTAATAAAGGATTTATATTTAAGT
C

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2FB57JQ 714 0 0
AAATGGCTTCAAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAA
TCTCTGCATGCGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGC
CAACTCCTAAACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCC
TCAAGCTTGGTGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGC
CACCGGTCGAACCAT****GCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCC
GTTTGTCTCTGTACCGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATC
TCTCTCAGTCTTCTCCTCGATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAA
GCAACTACATCATATATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAA
AAGACAAGGTGATTCTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTAT
TCTAGTCTTACCTGTTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCG
TAAAGATTCTTGAAATGTGCCGTTTCATTGTTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTA
GTATTGTTGCTTTGGTTGTATTGTGATTTATGAATTAATAAAGGATTTATAT
CT

QA 1 712 1 712
DS 



AS 2 14

CO CL276Contig1 660 3 2 U
ATTCCTAAAAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCTCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGCCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTTGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCCGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTT
CAAAAAGATAAATCTCTTCGTTGTGCTTTGTTCTGTTGCTTTCTATTGTTATTTTGTTTG
TGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTGTTATTTCATATTGAATGGGTTTTAATGTGAGG
GTTGAACTTGTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATAATGTAAACTAGATTTTGA
CCCGCCCTTAAAAGGACGGGTATATTTTTTGTTTTAAATATAATTTTTGATATTTTGTTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B370TF U 1
AF RR2FZ07TF U 1
AF RR2H186JQ C 1
BS 1 551 RR2B370TF
BS 552 660 RR2FZ07TF

RD RR2B370TF 551 0 0
ATTCCTAAAAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCTCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGCCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTTGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCCGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTT
CAAAAAGATAAATCTCTTCGTTGTGCTTTGTTCTGTTGCTTTCTATTGTTATTTTGTTTG
TGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTGTTATTTCATATTGAATGGGTTTTAATGTGAGG
GTTGAACTTGT

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2FZ07TF 660 0 0
ATTCCTAAAAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCTCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGCCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTTGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCCGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTT
CAAAAAGATAAATCTCTTCGTTGTGCTTTGTTCTGTTGCTTTCTATTGTTATTTTGTTTG
TGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTGTTATTTCATATTGAATGGGTTTTAATGTGAGG
GTTGAACTTGTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATAATGTAAACTAGATTTTGA
CCCGCCCTTAAAAGGACGGGTATATTTTTTGTTTTAAATATAATTTTTGATATTTTGTTT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2H186JQ 635 0 0
ATTCCTAAAAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCTCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGCCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTTGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCCGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTT
CAAAAAGATAAATCTCTTCGTTGTGCTTTGTTCTGTTGTTTTCTATTGTTATTTTGTTTG
TGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTGTTATTTCATATTGAATGGGTTTTAATGTGAGG
GTTGAACTTGTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATAATGTAAACTAGATTTTGA
CCCGCCCTTAAAAGGACGGGTATATTTTTTGTTTT

QA 1 635 1 635
DS 



CO CL276Contig2 606 11 4 U
ATTCCTACAAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCTCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGGCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTCGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCTGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTT
TTAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTGCTTTGTTTTGTTGTTTTCTATTGTTATTTTGTTTG
TGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTTCTATTTCATATTGAATGGTTTTT*AATGTGAG
GGTTGAACTTGTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATAATGTAAATGTGTGGTTG
ATAAAA


BQ
50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
40 10 10 10 10 

AF RR2EC88TF U 1
AF RR2D969JQ C 1
AF RR2D969TF U 1
AF RR2CQ41TF U 1
AF RR2CQ41JQ C 100
AF RR2B750TF U 1
AF RR2FU86JQ C 1
AF RR2DW76JQ C 9
AF RR2DW76TF U 1
AF RR2FU86TF U 1
AF RR2B750JQ C 76
BS 1 139 RR2B750TF
BS 140 140 RR2EC88TF
BS 141 602 RR2B750TF
BS 603 606 RR2FU86TF

RD RR2EC88TF 585 0 0
ATTCCTACAAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCTCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGGCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTCGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCTGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTT
TTAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTGCTTTGTTTTGTTGTTTTCTATTGTTATTTTGTTTG
TGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTTCTATTTCATATTGAATGGTTTTT*AATGTGAG
GGTTGAACTTGTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATAAT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2D969JQ 600 0 0
ATTCCTACAAGTTTCTATGGCTCCTAAGACTCTTGCAGTTACAGCTCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGGCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTCGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTTTTAATGGTCCTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCTGTCGATTTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTT
TTAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTGCTTTGTTTTGTAGTTTTCTATTGTTATTTTGTTTG
TGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTTCTATTTCATATTGAATGGCTTTT*AATGTGAG
GGTTGAACTTGTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATAATGTAAATGTGTGGTTG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2D969TF 600 0 0
ATTCCTACAAGTTTCTATGGCTCCTAAGACTCTTGCAGTTACAGCTCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGGCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTCGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCCTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCTGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTT
TTAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTGCTTTGTTTTGTAGTTTTCTATTGTTATTTTGTTTG
TGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTTCTATTTCATATTGAATGGCTTTT*AATGTGAG
GGTTGAACTTGTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATAATGTAAATGTGTGGTTG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2CQ41TF 600 0 0
ATTCCTACAAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCTCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGGCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTCGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCTGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTT
TTAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTGCTTTGTTTTGTTGTTTTCTATTGTTATTTTGTTTG
TGAGAAGAATGCAAATCTCCAACTTTTTCTATTTCATATTGAATGGTTTTT*AATGTGAG
GGTTGAACTTGTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATAATGTAAATGTGTGGTTG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2CQ41JQ 474 0 0
TCCACCAACTACTCCTAAAACCCCAAAATCTCCAAAGAAGGCCCCGGCGGTTAAACCCAC
TTGTCCTACCGACACACTTAAGCTCGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGT
TCTTGTTGGTTCTCCACCAAAGACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCT
TGAAGCTGCAGTTTGTCTTTGCACCGCTTTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAA
TGTTCCTGTCGATTTGAGCTTGTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTT
CCAATGTGCTTGAAGAGATTTTTAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTGCTTTGTTTTGTTGT
TTTCTATTGTTATTTTGTTTGTGAGAAGAATGCAAATCTCCAACTTTTTTTATTTCATAT
TGAATGGTTTTT*AATGTGAGGGTTGAACTTGTTAATGAAATCGTTTAATGTAA

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2B750TF 602 0 0
ATTCCTACAAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCTCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGACCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTCGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCTGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTT
TTAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTGCTTTGTTTTGTTGTTTTCTATTGTTATTTTGTTTG
TGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTTCTATTTCATATTGAATGGTTTTT*AATGTGAG
GGTTGAACTTGTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATAATGTAAATGTGTGGTTG
AT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2FU86JQ 602 0 0
ATTCCTACAAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCTCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGGCCCCGGCGGTTAAACCTACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTCGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCTGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTT
TTAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTGCTTTGTTTTGTTGTTTTCTATTGTTATTTTGTTTG
TGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTTTTATTTCATATTGAATGGTTTTTTAATGTGAG
GGTTGAACTTGTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATAATGTAAATGTGTGGTTG
AT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2DW76JQ 594 0 0
AAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCTCTTCTTCTCACACTTAATCTTC
TTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAACCCCAAAAT
CTCCAAAGAAGGCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAAGCTCGGTG
TTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAAGACCCCTT
GTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTGCACCGCTC
TTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCTGTCGATCTGAGCTTGTTATTGA
ACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTTTTAAAAGA
TAAATCTCTTGGTTGTACTTTGTTTTGTTGTTTTCTATTGTTATTTTGTTTGTGAGAAAA
ATGCAAATCTCCAACTTTTTCTATTTCATATTGAATGGTTTTT*AATGTGAGGGTTGAAC
TTGTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATAATGTAAATGTGTGGTTGAT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2DW76TF 602 0 0
ATTCCTACAAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCTCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGGCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTCGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCTGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTT
TTAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTACTTTGTTTTGTTGTTTTCTATTGTTATTTTGTTTG
TGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTTCTATTTCATATTGAATGGTTTTT*AATGTGAG
GGTTGAACTTGTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATAATGTAAATGTGTGGTTG
AT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2FU86TF 606 0 0
ATTCCTACAAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCTCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGGCCCCGGCGGTTAAACCTACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTCGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCTGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTT
TTAAAAGATAAATCTCTTGGTTGTGCTTTGTTTTGTTGTTTTCTATTGTTATTTTGTTTG
TGAGAAAAATGCAAATCTCCAACTTTTTCTATTTCATATTGAATGGTTTTTTAATGTGAG
GGTTGAACTTGTTAATGAAATCGTTTAATGTAATATCTTAATAATGTAAATGTGTGGTTG
ATAAAA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2B750JQ 527 0 0
CAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAACCCCAAAATCTCCAAA
GAAGACCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAAGCTCGGTGTTTGCGC
AGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTTTTGTTGGTTTTCCACCAAAGACCCCTTGTTGTGC
ACTTTTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTGCACCGCTTTTAAAGC
CAATATTTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCTGTCGATTTGAGCTTGTTATTGAACTATTG
TGGCAAGAAACTTCCTTATGGCTTCCAATGTGCTTGAAGAGATTTTTAAAAGATAAATCT
TTTGGTTGTGCTTTGTTTTGTTGTTTTTTATTGTTATTTTGTTTGTGAGAAAAATGCAAA
TCTCCAACTTTTTCTATTTCATATTGAATGGTTTTT*AATGTGAGGGTTGAACTTGTTAA
TGAAATCGTTTAATGTAATATTTTAATAATGTAAATGTGTGGTTGAT

QA 1 527 1 527
DS 



AS 2 14

CO CL277Contig1 849 7 5 U
GGGATAAGGTGTGTGTCTCTCTCACTTCCCCTCGTCATCGTCTGAGCTTACCAAAACTCC
GGTCAAATGGCGATGACGACTGCTACACTCTTCCATGCACTTGTTCCTTCCAACAGTTAC
AAATCCGGAGCTGTTTCCTCTTCGTTCGTCTCAGTTCCGTCTTCTTCGTCGTCTCTCCAA
TTCCGCTCGCTTGTCTCGGATTCAACGTCGGTTTATGCTCGGAGGAAGTTAACCGGAGAT
CTCAGAAGAGTATCCTTAACTGTCTCCGTCGCTGCAGCAACTGAACCTCTCACCGTCCTC
GTCACCGGTGCCGGTGGCAGAACAGGGCAAATCGTGTACAAGAAGTTGAAGGAGAGGTCG
GATCAGTTCGTGGCGAGAGGTTTGGTGAGGACGAAAGAGAGCAAGGAGAAGATCGGTGGA
GAGGAGGAAGTGTTCGTTGGAGACATTCGAGACCTTGAAGCCATTGCTCCTGCTGTTCAA
GGGATTGATGCTTTGGTCATTCTTACGAGCGCTGTACCGAAGATGAAACCTGGTTTTGAT
CCTAGCAAAGGAGAGAGGCCTGAGTTCTACTTTGAAGAAGGAGCTTATCCTGAACAGGTT
GATTGGATTGGTCAGAAGAATCAGATAGATGCCGCTAAAGCAGCTGGAGTTAAGCAGATT
GTTTTGGTCGGGTCGATGGGAGGAACAAACATAAACAACCCCTTGAATAGCATTGGCAAT
GCCAACATTCTGGTTTGGAGAGAAAGCTGAGCAGTACTTGGCTGACTCCGGTATCCGTAC
ACATCATCAGGCGGGTGGTCTGCAGACAAGGAAGTGGCATCCGGGACTAATTGTGGGAAA
AGATGACGA


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H550TF U 35
AF RR2A294TF U 1
AF RR2CN07TF U 4
AF RR2GH74TF U 4
AF RR2GZ81TF U 4
AF RR2AF59TF U 35
AF RR2F186TF U 35
BS 1 635 RR2A294TF
BS 636 706 RR2CN07TF
BS 707 716 RR2GZ81TF
BS 717 739 RR2AF59TF
BS 740 849 RR2F186TF

RD RR2H550TF 541 0 0
GG
ATCGTCTGAGCTTACCAAAACTCCGGTCAAATGGCGATGGCGACTGCTACACTCTTCCAT
GCACTTGTTCCTTCCAACAGTTACAAATCCGGAGCTGTTTCCTCTTCGTTCGTCTCAGTT
CCGTCTTCTTCGTCGTCTCTCCAATTCCGCTCGCTTGTCTCGGATTCAACGTCGGTTTAT
GCTCGGAGGAAGTTAACCGGAGATCTCAGAAGAGTATCCTTAACTGTCTCCGTCGCTGCA
GCAACTGAACCTCTCACCGTCCTCGTCACCGGTGCCGGTGGCAGAACAGGGTAAATCGTG
TACAAGAAGTTGAAGGAGAGGTCGGATCAGTTCGTGGCGAGAGGTTTGGTGAGGACGAAA
GAGAGCAAGGAGAAGATCGGTGGAGAGGAGGAAGTGTTCGTTGGAGACATTCGAGACCTT
GAAGCCATTGCTCCTGCTGTTCAAGGGATTGATGCTTTGGTCATTCTTACGAGCGCTGTA
CCGAAGATGAAACCTGGTTTTGATCCTAGCAAAGGAGAGAGGCCTGAGTTCTACTTTGA

QA 3 541 3 541
DS 

RD RR2A294TF 635 0 0
GGGATAAGGTGTGTGTCTCTCTCACTTCCCCTCGTCATCGTCTGAGCTTACCAAAACTCC
GGTCAAATGGCGATGACGACTGCTACACTCTTCCATGCACTTGTTCCTTCCAACAGTTAC
AAATCCGGAGCTGTTTCCTCTTCGTTCGTCTCAGTTCCGTCTTCTTCGTCGTCTCTCCAA
TTCCGCTCGCTTGTCTCGGATTCAACGTCGGTTTATGCTCGGAGGAAGTTAACCGGAGAT
CTCAGAAGAGTATCCTTAACTGTCTCCGTCGCTGCAGCAACTGAACCTCTCACCGTCCTC
GTCACCGGTGCCGGTGGCAGAACAGGGCAAATCGTGTACAAGAAGTTGAAGGAGAGGTCG
GATCAGTTCGTGGCGAGAGGTTTGGTGAGGACGAAAGAGAGCAAGGAGAAGATCGGTGGA
GAGGAGGAAGTGTTCGTTGGAGACATTCGAGACCTTGAAGCCATTGCTCCTGCTGTTCAA
GGGATTGATGCTTTGGTCATTCTTACGAGCGCTGTACCGAAGATGAAACCTGGTTTTGAT
CCTAGCAAAGGAGAGAGGCCTGAGTTCTACTTTGAAGAAGGAGCTTATCCTGAACAGGTT
GATTGGATTGGTCAGAAGAATCAGATAGATGCCGC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2CN07TF 705 0 0
GG
AAGGTGTGTGTCTCTCTCACTTCCCCTCGTCATCGTCTGAGCTTACCAAAACTCCGGTCA
AATGGCGATGACGACTGCTACACTCTTCCATGCACTTGTTCCTTCCAACAGTTACAAATC
CGGAGCTGTTTCCTCTTCGTTCGTCTCAGTTCCGTCTTCTTCGTCGTCTCTCCAATTCCG
CTCGCTTGTCTCGGATTCAATGTCGGTTTATGCTCGGAGGAAGTTAACCGGAGATCTCAG
AAGAGTATCCTTAACTGTCTCCGTCGCTGCAGCAACTGAACCTCTCACCGTCCTCGTCAC
CGGTGCCGGTGGCAGAACAGGGCAAATCGTGTACAAGAAGTTGAAGGAGAGGTCGGATCA
GTTCGTGGCGAGAGGTTTGGTGAGGACGAAAGAGAGCAAGGAGAAGATCGGTGGAGAGGA
GGAAGTGTTCGTTGGAGACATTCGAGACCTTGAAGCCATTGCTCCTGCTGTTCAAGGGAT
TGATGCTTTGGTCATTCTTACGAGCGCTGTACCGAAGATGAAACCTGGTTTTGATCCTAG
CAAAGGAGAGAGGCCTGAGTTCTACTTTGAAGAAGGAGCTTATCCTGAACAGGTTGATTG
GATTGGTCAGAAGAATCAGATAGATGCCGCTAAAGCAGCTGGAGTTAAGCAGATTGTTTT
GGTCGGGTCGATGGGAGGAACAAACATAAACAACCCCTTGA
TA

QA 3 703 3 703
DS 

RD RR2GH74TF 680 0 0
GG
AAGGTGTGTGTCTCTCTCACTTCCCCTCGTCATCGTCTGAGCTTACCAAA*CTCCGGTCA
AATGGCGATGACGACTGCTACACTCTTCCATGCACTTGTTCCTTCCAACAGTTACAAAAC
AGGAGCTGTGTCCTCTTCGTTAGTCTCAGTTCCGTCTTCTTCGTCGTCTCTCCAATTCCG
CTCGCTTGTCTCGGATTCAACGTCGGTTTATGCTCGGAGGAAGTTAACCGGAGATCTCAG
AAGAGTATCCTTAACTGTCTCCGCCGCCGCAGCAACTGAACCTCTCACCGTTCTCGTCAC
CGGTGCCGGTGGAAGAACAGGGCAAATCGTGTACAAGAAGTTGAAGGAGAGGTCGGATCA
GTTCGTGGCGAGAGGTTTGGTGAGGACGAAAGAGAGCAAGGAGAAGATCGGTGGAGAGGA
GGAAGTGTTCGTTGGAGACATTCGAGACCTTGAAGCCATTGCTCCTGCTGTTCAAGGGAT
TGATGCTTTGGTCATTCTTACGAGCGCTGTACCGAAGATGAA*CCTGGTTTTGATCCTAG
CAAAGGAGAGAGACCTGAGTTCTACTTTGAAGAAAGAGCTTATCCTGAACAGGTTGATTG
GATTGGTCAGAAGAATCAGATAGATGCCGCTAA*GCAGCTGGAGTTAAGCAGATTGTTTT
GGTCGGGTCGATGGGAGG

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR2GZ81TF 713 0 0
GG
AAGGTGTGTGTCTCTCTCACTTCCCCTCGTCATCGTCTGAGCTTACCAAAACTCCGGTCA
AATGGCGATGACGACTGCTACACTCTTCCATGCACTTGTTCCTTCCAACAGTTACAAATC
CGGAGCTGTTTCCTCTTCGTTCGTCTCAGTTCCGTCTTCTTCGTCGTCTCTCCAATTCCG
TTCGCTTGTCTCGGATTCAACGTCGGTTTATGCTCGGAGGAAGTTAACCGGAGATCTCAG
AAGAGTATCCTTAACTGTCTCCGTCGCTGCAGCAACTGAACCTCTCACCGTCCTCGTCAC
CGGTGCCGGTGGCAGAACAGGGCAAATCGTGTACAAGAAGTTGAAGGAGAGGTCGGATCA
GTTCGTGGCGAGAGGTTTGGTGAGGACGAAAGAGAGCAAGGAGAAGATCGGTGGAGAGGA
GGAAGTGTTCGTTGGAGACATTCGAGACCTTGAAGCCATTGCTCCTGCTGTTCAAGG*AT
TGATGCTTTGGTCATTCTTACGAGCGCTGTACCGAAGATGAAACCTGGTTTTGATCCTAG
CAAAGGAGAGAGGCCTGAGTTCTACTTTGAAGAAGGAGCTTATCCTGAACAGGTTGATTG
GATTGGTCAGAAGAATCAGATAGATGCCGCTAAAGCAGCTGGAGTTAAGCAGATTGTTTT
GGTCGGGTCGATGGGAGGAACAAACATAAACAACCCCTTGAATAGCATTGG

QA 3 713 3 713
DS 

RD RR2AF59TF 705 0 0
GG
ATCGTCTGAGCTTACCAAAACTCCGGTCAAATGGCGATGACGACTGCTACACTCTTCCAT
GCACTTGTTCCTTCCAACAGTTACAAATCCGGAGCTGTTTCCTCTTCGTTCGTCTCAGTT
CCGTCTTCTTCGTCGTCTCTCCAATTCCGCTCGCTTGTCTCGGATTCAACGTCGGTTTAT
GCTCGGAGGAAGTTAACCGGAGATCTCAGAAGAGTATCCTTAACTGTCTCCGTCGCTGCA
GCAACTGAACCTCTCACCGTCCTCGTCACCGGTGCCGGTGGCAGAACAGGGCAAATCGTG
TACAAGAAGTTGAAGGAGAGGTCGGATCAGTTCGTGGCGAGAGGTTTGGTGAGGACGAAA
GAGAGCAAGGAGAAGATCGGTGGAGAGGAGGAAGTGTTCGTTGGAGACATTCGAGACCTT
GAAGCCATTGCTCCTGCTGTTCAAGGGATTGATGCTTTGGTCATTCTTACGAGCGCTGTA
CCGAAGATGAAACCTGGTTTTGATCCTAGCAAAGGAGAGAGGCCTGAGTTCTACTTTGAA
GAAGGAGCTTATCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGTCAGAAGAATCAGATAGATGCCGCT
AAGGCAGCTGGAGTTAAGCAGATTGTTTTGGTCGGGTCGATGGGAGGAACAAACATAAAC
AACCCCTTGAATAGCATTGGCAATGCCAACATTCTGGTTTGGA

QA 3 705 3 705
DS 

RD RR2F186TF 815 0 0
GG
ATCGTCTGAGCGTACCAAAACTCCGGTCAAATGGCGATGACGACTGCTACACTCTTCCAT
GCACTTGTTCCTTCCAACAGTTACAAATCCGGAGCTGTTTCCTCTTCGTTCGTCTCAGTT
CCGTCTTCTTCGTCGTCTCTCCAATTCCGCTCGCTTGTCTCGGATTCAACGTCGGTTTAT
GCTCGGAGGAAGTTAACCGGAGATCTCAGAAGAGTATCCTTAACTGTCTCCGTCGCTGCA
GCAACTGAACCTCTCACCGTCCTCGTCACCGGTGCCGGTGGCAGAACAGGGCAAATCGTG
TACAAGAAGTTGAAGGAGAGGTCGGATCAGTTCGTGGTGAGAGGTTTGGTGAGGACGAAA
GAGAGCAAGGAGAAGATCGGTGGAGAGGAGGAAGTGTTCGTTGGAGACATTCGAGACCTT
GAAGCCATTGCTCCTGCTGTTCAAGGGATTGATGCTTTGGTCATTCTTACGAGCGCTGTA
CCGAAGATGAAACCTGGTTTTGATCCTAGCAAAGGAGAGAGGCCTGAGTTCTACTTTGAA
GAAGGAGCTTATCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGTCAGAAGAATCAGATAGATGCCGCT
AAGGCAGCTGGAGTTAAGCAGATTGTTTTGGTCGGGTCGATGGGAGGAACAAACATAAAC
AACCCCTTGAATAGCATTGGCAATGCCAACATTCTGGTTTGGAGAGAAAGCTGAGCAGTA
CTTGGCTGACTCCGGTATCCGTACACATCATCAGGCGGGTGGTCTGCAGACAAGGAAGTG
GCATCCGGGACTAATTGTGGGAAAAGATGACGA

QA 3 815 3 815
DS 



CO CL277Contig2 894 7 11 U
GATATCAAATTTCAAAGGCTTTTGATATTATCTAGAATCTTTAGAGTAAGACTACTTCAG
AAATATAGAAAGAGCCGATTCAGACGAGTGTATCTCACAAAATGTATTTATTATTCCTCG
AAGTCTCTAATCCTATGACTCTGCTACAAAGACAGAGTAACAGAAGATTAGAACCGAGCG
GTAACTTGAGCGAAAAGTGCCTTGAAATCCTTTGTTGGGGTGCCTGTTCCCTCAGGCTTT
GAGGCCAGATCAAGTGCTTTAAACTTTGCCTCCTCGAGCTGCAACGCCTGAACGCAGACT
TCTGCAACATCAGCCCTTGCTATTGTTCTCGTCTCCGTCTCGAGAATCTCGTCATCTTTT
CCCACAATTAGTTCCCGGATGCCACCTTCCTTGTCCTGCAGACCACCCGCCCT*GATGAT
GGTGTACGGAATACCGGAGTCAGCCAAGTACTGCTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAGAAT
GTTGGCATTGCCAATGCTATTCAAGGGGTTGTTTATGTTTGTTCCTCCCATCGACCCGAC
CAAAACAATCTGCTTAACTCCAGCTGCCTTAGCGGCATCTATCTGATTCTTCTGACCAAT
CCAATCAACCTGTTCAGGATAAGCTCCTTCTTCAAAGTAGAACTCAGGCCTCTCTCCTTT
GCTAGGATCAAAACCAGGTTTCATCTTCGGTACAGCGCTCGTAAGAATGACCAAAGCATC
AATCCCTTGAACAGCAGGAGCAATGGCTTCAAGGTCTCGAATGCCTCCAACGAACACTTC
CTCCTCTCCACCGATCTTCTCCTTGCTCTCTTTCGTCCTCACCAAACCTCTCGCCACGAA
CTGATCCGACCTCTCCTTCAACTTCTTGTACACGATTTGCCCTGTTCTGCCACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H550JQB U 13
AF RR2AF59JQ U 30
AF RR2F186JQ U 1
AF RR2CC35JQ U 1
AF RR2CC35TF C 400
AF RR2CN07JQ U 65
AF RR2A294JQ U 90
BS 1 412 RR2CC35JQ
BS 413 413 RR2AF59JQ
BS 414 737 RR2CC35JQ
BS 738 738 RR2AF59JQ
BS 739 753 RR2CC35JQ
BS 754 754 RR2AF59JQ
BS 755 769 RR2CC35JQ
BS 770 770 RR2CN07JQ
BS 771 782 RR2CC35JQ
BS 783 850 RR2CN07JQ
BS 851 894 RR2A294JQ

RD RR2H550JQB 361 0 0
CG
AAGGCTTTTGATATTATCTAGAATCTTTAGAGTAAGACTACTTCAGAAATATAGAAAGAG
CCGATTCAGACGAGTGTATCTCACAAAATGTATTTATTATTCCTCGAAGTCTCTAATCCT
ATGACTCTGCTACAAAGACAGAGTAACAGAAGATTAGAACCGAGCGGTAACTTGAGCGAA
AAGTGCCTTGAAATCCTTTGTTGGGGTGCCTGTTCCCTCAGGCTTTGAGGCCAGATCAAG
TGCTTTAAACTTTGCCTCCTCGAGCTGCAACGCCTGAACGCAGACTTCTGCAACATCAGC
CCTTGCTATTGTTCTCGTCTCCGTCTCGAGAATCTCGTCATCTTTTCCCACAATTAGTT

QA 3 361 3 361
DS 

RD RR2AF59JQ 737 0 0
ATCTAGAATCTTTAGAGTAAGACTACTTCAGAAATATAGAAAGAGCCGATTCAGACGAGT
GTATCTCACAAAATGTATTTATTATTCCTCGAAGTCTCTAATCCTATGACTCTGCTACAA
AGACAGAGTAACAGAAGATTAGAACCGAGCGGTAACTTGAGCGAAAAGTGCCTTGAAATC
CTTTGTTGGGGTGCCTGTTCCCTCAGGCTTTGAGGCCAGATCAAGTGCTTTAAACTTTGC
CTCCTCGAGCTGCAACGCCTGAACACAGACTTCTGCAACATCAGCCCTTGCTATTGTTCT
CGTCTCCGTCTCGAGAATCTCGTCATCTTTTCCCACAATTAGTTCCCGGATGCCACCTTC
CTTGTCCTGCAGACCACCCGCCCT*GATGATGGTGTACGGAATACCGGAGTCAGCCAAGT
ACTGCTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAGAATGTTGGCATTGCCAATGCTATTCAAGGGGT
TGTTTATGTTTGTTCCTCCCATCGACCCGACCAAAACAATCTGCTTAACTCCAGCTGCCT
TAGCGGCATCTATCTGATTCTTCTGACCAATCCAATCAACCTGTTCAGGATAAGCTCCTT
CTTCAAAGTAGAACTCAGGCCTCTCTCCTTTGCTAGGATCAAAACCAGGTTTCATCTTCG
GTACAGCGCTCGTAAGAATGACCAAAGCATCAATCCCTTGAACAGCAGGAGCAATGGCTT
CAAGGTCTCGAATGTCT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2F186JQ 728 0 0
GATATCAAATTTCAAAGGCTTTTGATATTATCTAGAATCTTTAGAGTAAGACTACTTCAG
AAATATAGAAAGAGCCGATTCAGACGAGTGTATCTCACAAAATGTATTTATTATTCCTCG
AAGTCTCTAATCCTATGACTCTGCTACAAAGACAGAGTAACAGAAGATTAGAACCGAGCG
GTAACTTGAGCGAAAAGTGCCTTGAAATCCTTTGTTGGGGTGCCTGTTCCCTCAGGCTTT
GAGGCCAGATCAAGTGCTTTAAACTTTGCCTCCTCGAGCTGCAACGCCTGAACGCAGACT
TCTGCAACATCAGCCCTTGCTATTGTTCTCGTCTCCGTCTCGAGAATCTCGTCATCTTTT
CCCACAATTAGTTCCCGGATGCCACCTTCCTTGTCCTGCAGACCACCCGCCCT*GATGAT
GGTGTACGGAATACCGGAGTCAGCCAAGTACTGCTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAGAAT
GTTGGCATTGCCAATGCTATTCAAGGGGTTGTTTATGTTTGTTCCTCCCATCGACCCGAC
CAAAACAATCTGCTTAACTCCAGCTGCCTTAGCGGCATCTATCTGATTCTTCTGACCAAT
CCAATCAACCTGTTCAGGATAAGCTCCTTCTTCAAAGTAGAACTCAGGCCTCTCTCCTTT
GCTAGGATCAAAACCAGGTTTCATCTTCGGTACAGCGCTCGTAAGAATGACCAAAGCATC
AATCCCTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2CC35JQ 782 0 0
GATATCAAATTTCAAAGGCTTTTGATATTATCTAGAATCTTTAGAGTAAGACTACTTCAG
AAATATAGAAAGAGCCGATTCAGACGAGTGTATCTCACAAAATGTATTTATTATTCCTCG
AAGTCTCTAATCCTATGACTCTGCTACAAAGACAGAGTAACAGAAGATTAGAACCGAGCG
GTAACTTGAGCGAAAAGTGCCTTGAAATCCTTTGTTGGGGTGCCTGTTCCCTCAGGCTTT
GAGGCCAGATCAAGTGCTTTAAACTTTGCCTCCTCGAGCTGCAACGCCTGAACGCAGACT
TCTGCAACATCAGCCCTTGCTATTGTTCTCGTCTCCGTCTCGAGAATCTCGTCATCTTTT
CCCACAATTAGTTCCCGGATGCCACCTTCCTTGTCCTGCAGACCACCCGCCCC*GATGAT
GGTGTACGGAATACCGGAGTCAGCCAAGTACTGCTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAGAAT
GTTGGCATTGCCAATGCTATTCAAGGGGTTGTTTATGTTTGTTCCTCCCATCGACCCGAC
CAAAACAATCTGCTTAACTCCAGCTGCCTTAGCGGCATCTATCTGATTCTTCTGACCAAT
CCAATCAACCTGTTCAGGATAAGCTCCTTCTTCAAAGTAGAACTCAGGCCTCTCTCCTTT
GCTAGGATCAAAACCAGGTTTCATCTTCGGTACAGCGCTCGTAAGAATGACCAAAGCATC
AATCCCTTGAACAGCAG*AGCAATGGCTTCAAG*TCTCGAATGCCTCCA*CGAACACTTC
CT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2CC35TF 392 0 0
AGACCACCCGCCCCCGATGATGGTGTACGGAATACCGGAGTCAGCCAAGTACTGCTCAGC
TTTCCTCTTCCAAACCAGAATGTTGGCATTGCCAATGCTATTCAAGGGGTTGTTTATGTT
TGTTCCTCCCATCGACCCGACCAAAACAATCTGCTTAACTCCAGCTGCCTTAGCGGCATC
TATCTGATTCTTCTGACCAATCCAATCAACCTGTTCAGGATAAGCTCCTTCTTCAAAGTA
GAACTCAGGCCTCTCTCCTTTGCTAGGATCAAAACCAGGTTTCATCTTCGGTACAGCGCT
CGTAAGAATGACCAAAGCATCAATCCCTTGAACAGCAGGAGCAATGGCTTCAAGGTCTCG
AATGCCTCCAACGAACACTTCCTCCTCTCCAC

QA 1 392 1 392
DS 

RD RR2CN07JQ 789 0 0
ATAGAAAGAGCCGATTCAGACGAGTGTATCTCACAAAATGTATTTATTATTCCTCGAAGT
CTCTAATCCTATGACTCTGCTACAAAGACAGAGTAACAGAAGATTAGAACCGAGCGGTAA
CTTGAGCGAAAAGTGCCTTGAAATCCTTTGTTGGGGTGCCTGTTCCCTCAGGCTTTGAGG
CCAGATCAAGTGCTTTAAACTTTGCCTCCTCGAGCTGCAACGCCTGAACGCAGACTTCTG
CAACATCAGCCCTTGCTATTGTTCTCGTCTCCGTCTCGAGAATCTCGTCATCTTTTCCCA
CAATTAGTTCCCGAATGCCACCTTCCTTGTCCTGCAGACCACCCGCCCT*GATGATGGTG
TACGGAATACCGGAGTCAGCCAAGTACTGCTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAGAATGTTG
GCATTGCCAATGCTATTCAAGGGGTTGTTTATGTTTGTTCCTCCCATCGACCCGACCAAA
ACAATCTGCTTAACTCCAGCTGCCTTAGCGGCATCTATCTGATTCTTCTGACCAATCCAA
TCAACCTGTTCAGGATAAGCTCCTTCTTCAAAGTAGAACTCAGGCCTCTCTCCTTTGCTA
GGATCAAAACCAGGTTTCATCTTCGGTACAGCGCTCGTAAGAATGACCAAAGCATCAATC
CCTTGAACAGCAGGAGCAATGGCTTCAAGGTCTCGAATGTCTCCAACGAACACTTCCTCC
TCTCCACCGATCTTCTCCTTGCTCTCTTTCGTCCTCACCAAACCTCTCGCCACGAACTGA
TCCGAC
TCT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2A294JQ 805 0 0
GTATCTCACAAAATGTATTTATTATTCCTCGAAGTCTCTAATCCTATGACTCTGCTACAA
AGACAGAGTAACAGAAGATTAGAACCGAGTGGTAACTTGAGCGAAAAGTGCCTTGAAATC
CTTTGTTGGGGTGCCTGTTCCCTCAGGCTTTGAGGCCAGATCAAGTGCTTTAAACTTTGC
CTCCTCGAGCTGCAACGCCTGAACGCAGACTTCTGCAACATCAGCCCTTGCTATTGTTCT
CGTCTCCGTCTCGAGAATCTCGTCATCTTTTCCCACAATTAGTTCCCGGATGCCACCTTC
CTTGTCCTGCAGACCACCCGCCCT*GATGATGGTGTACGGAATACCGGAGTCAGCCAAGT
ACTGCTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAGAATGTTGGCATTGCCAATGCTATTCAAGGGGT
TGTTTATGTTTGTTCCTCCCATCGACCCGACCAAAACAATCTGCTTAACTCCAGCTGCCT
TAGCGGCATCTATCTGATTCTTCTGACCAATCCAATCAACCTGTTCAGGATAAGCTCCTT
CTTCAAAGTAGAACTCAGGCCTCTCTCCTTTGCTAGGATCAAAACCAGGTTTCATCTTCG
GTACAGCGCTCGTAAGAATGACCAAAGCATCAATCCCTTGAACAGCAGGAGCAATGGCTT
CAAGGTCTCGAATGTCTCCAACGAACACTTCCTCCTCTCCACCGATCTTCTCCTTGCTCT
CTTTCGTCCTCACCAAACCTCTCGCCACGAACTGATCCGACCTCTCCTTCAACTTCTTGT
ACACGATTTGCCCTGTTCTGCCACC

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 14

CO CL278Contig1 831 14 11 U
GCGTGAAAGCGTGGCCTATCGATCCTTTAGACCTTCGGAATTTGAAGCTAGAGGTGTCAG
AAAAGTTACCACAGGGATAACTGGCTTGTGGCAGCCAAGCGTTCATAGCGACGTTGCTTT
TGGACCCTTCTCAACAAATATAAACACACTACTACTTCCTGAGCTTTTGTTTTAAAGATT
TCCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATCGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACT
TCCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTG
GTCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGC
CATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCG
CACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCC
TCAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTAT
CACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAA
CTTATTGTCTTGTTTTCTTGTTTCTTTTAATAAGTAATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTC
TTGGATT*AAAATAAATGGTGAACGTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGATTT*G
TGTGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCCTTTTGCTTCACTGTTCCTTCTTATCTTCGTTGTA
ACTTTTCTTTTGAATTTGATTAATAAAACTATCAATCGGTGTTGTCTAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 30 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 55 70 55 70 70 70 70 70 70 
70 70 55 55 55 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 60 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 55 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 35 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
0 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 45 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 45 80 80 65 45 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 40 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
30 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 10 10 10 

AF RR2AF11JQ C 123
AF RR2AF11TF U 123
AF RR2CE50TF U 1
AF RR2GE30TF U 122
AF RR2CE50JQ C 247
AF RR2B459JQ C 122
AF RR2DA56JQ C 158
AF RR2DA56TF U 148
AF RR2CK58JQ C 266
AF RR2B459TF U 122
AF RR2C108TF U 122
AF RR2G038TF U 176
AF RR2G889TF U 122
AF RR2CK58TF U 122
BS 1 121 RR2CE50TF
BS 122 122 RR2B459TF
BS 123 453 RR2CE50TF
BS 454 454 RR2DA56TF
BS 455 636 RR2CE50TF
BS 637 637 RR2DA56TF
BS 638 666 RR2CE50TF
BS 667 772 RR2DA56TF
BS 773 773 RR2B459TF
BS 774 828 RR2DA56TF
BS 829 831 RR2B459JQ

RD RR2AF11JQ 531 0 0
GACCCTTCTCAACAAATATAAACACACTACTACTTCCTGAGCTTTTGTTTTAAAGATTTC
CCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATCGCTCTTGCACTTTTCCTTTTTTTGAACTTC
CTTTTCTTCACTCACACTTTTGCTTTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGGT
CTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCCA
TGCTGTTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTTTCTGTACCGCA
CTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCCATTTATGTCAACGCACTCCTC
AATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTTTAAGTTGTATACTTATGA
CATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAACT
TATTGTCTTGTTTTCTTGTTTCTTTTAATAAGTAATTGCTTTTGTGTTTGT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2AF11TF 531 0 0
GACCCTTCTCAACAAATATAAACACACTACTACTTCCTGAGCTTTTGTTTTAAAGATTTC
CCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATCGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACTTC
CTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGGT
CTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCCA
TGCTGTTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGCA
CTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCCTC
AATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTATGA
CATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAACT
TATTGTCTTGTTTTCTTGTTTCTTTTAATAAGTAATTGCTTTTGTGTTTGT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2CE50TF 674 0 0
GCGTGAAAGCGTGGCCTATCGATCCTTTAGACCTTCGGAATTTGAAGCTAGAGGTGTCAG
AAAAGTTACCACAGGGATAACTGGCTTGTGGCAGCCAAGCGTTCATAGCGACGTTGCTTT
TTGACCCTTCTCAACAAATATAAACACACTACTACTTCCTGAGCTTTTGTTTTAAAGATT
TCCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATCGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACT
TCCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTG
GTCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGC
CATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCG
CACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAGCCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCC
TCAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTAT
CACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAA
CTTATTGTCTTGTTTTCTTGTTTCTTTTAATAAGTA*TTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTC
TTGGAT
AAAATAAA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2GE30TF 588 0 0
GGACCCTTCTCAACAAATATA**CACACTACTACTTCCTGAGCTTATGTTTTAAAGATTT
CCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATTGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACTT
CTTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGG
TCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCC
ATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGC
ACTCAAGGCTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCCT
CAATAATTGTGGCCATATTACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTATG
ACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAAC
TTATTGTCTTGTTTTCATGTTTCTTTTAATCAGCGATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCT
TGGATTTAAAATAAATGATGAACCTCACGTTCTCATGCAACAAGGGAT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2CE50JQ 506 0 0
TCTTCACTCACACTTCTGTTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGGTCTTT
GCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCCATGCT
GCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTTTCTGTACCGCACTCA
AGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAGCCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCCTCAATA
ATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTTTAAGTTGTATACTTATCACATA
TATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAACTTATT
GTCTTGTTTTCTTGTTTCTTTTAATAAGTAATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCTTGGAT
T*AAAATAAATGGTGAACGTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGATTT*GTGTGTG
TAATCGGCAAGTTCGTCCCCTTTTGC

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2B459JQ 710 0 0
GGACCCTTCTCAACAAATATAAACACACTACTACTTCCTGAGCTTTTGTTTTAAAGATTT
CCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATCGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACTT
CCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGG
TCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCC
ATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGC
ACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCCT
CAATATTTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTTTAAGTTGTATACTTATC
ACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAAC
TTATTGTCTTGGTTTCTTGTTTCTTTTAATAAGTAATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCT
TGGATT*AAAATAAATGGTGAACGTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGATTT*GT
GTGTGTAATCGGCAAGTTCG*CCCCTTTTGCTTCACTGTTCCTTCCTATCTTCGTTGTAA
CTTTTCTTTTGAATTTGATTAATAAAACTATCAATCGGTGTTGTCTAAAG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2DA56JQ 672 0 0
CT
TGAGCTTTTGTTTTAAAGATTTCCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATCGCTCTTG
CACTCTTCCTTTCTCTGAACTTCCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTC
CAAGAGATACCCTGCAGATTGGTCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATAT
TGGGATACTCACCTGTAAAGCCATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGG
CTGCAGCCTGTCTCTGTACCGCACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTC
CCATCTATGTCAACGCACTCCTCAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCAT
GCGTCTAAGTTGTATACTTATGACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATC
GTATGGTTTCAAATGCTTGAACTTATTGTCTTGTTTTCTTGTTTCTTTTAATAAGTAATT
GCTTTTGTGTTTGTAATTTTCTTGAATT*AAAATAAATGGTGAACGTCACGTTCTCATGC
AACAAGGGATTATGGATTT*GTGTGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCCTTTTGCTTCACTG
TTCCTTCTTATCTCCGTTGTAACTTTTCTTTTGAATTTGATTAATAAAACTATCAATCGG
TGTTGTCTA
T

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR2DA56TF 682 0 0
ACTACTACTTCCTGAGCTTTTGTTTTAAAGATTTCCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAA
GAATCGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACTTCCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTC
TGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGGTCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAG
TTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCCATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGG
TTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGCACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCA
AGCTTAACCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCCTCAATAATTGTGGCCATATAACTCCGA
CATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTATGACATATATATTAAGAGATGCCTAAAC
CACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAACTTATTGTCTTGTTTTCTTGTTTCTTT
TAATAAGTAATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCTTGAATT*AAAATAAATGGTGAACGTC
ACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGATTT*GTGTGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCCT
TTTGCTTCACTGTTCCTTCTTATCTCCGTTGTAACTTTTCTTTTGAATTTGATTAATAAA
ACTATCAATCGGTGTTGTCTA
T

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2CK58JQ 550 0 0
TCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGGTCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGT
AGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCCATGCTGCTCATTAATTGATGGCTT
GGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGCACTCAAGGTTAACATTCTTGGCAT
CAAGCTTAACCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCCTCAATAATTGTGGCCATATAACTCC
GACATTATACCCATGCGTTTAAGTTGTATACTTATGACATATATATTAAGAGATGCCTAA
ACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAACTTATTGTCTTGTTTTCTTGTTTCT
TTTAATAAGTAATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCTTGGATT*AAAATAAATGGTGAACG
TCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGATTT*GTGTGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCC
CTTTTGCTTCACTGTTCCTTCTTATCTTCGTTGTAACTTTTCTTTTGAATTTGATTAATA
AAACTATCAA

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2B459TF 710 0 0
GGACCCTTCTCAACAAATATAAACACACTACTACTTCCTGAGCTTTTGTTTTAAAGATTT
CCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATCGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACTT
CCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGG
TCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCC
ATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGC
ACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCCT
CAATATTTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTATC
ACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAAC
TTATTGTCTTGGTTTCTTGTTTCTTTTAATAAGTAATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCT
TGGATT*AAAATAAATGGTGAACGTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGATTT*GT
GTGTGTAATCGGCAAGTTCG*CCCCTTTTGCTTCACTGTTCCTTCCTATCTTCGTTGTAA
CTTTTCTTTTGAATTTGATTAATAAAACTATCAATCGGTGTTGTCTA
AAG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2C108TF 705 0 0
GGACCCTTCTCAACAAATATAAACACACTACTACTTCCTGAGCTTTTGTTTTAAAGATTT
CCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATCGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACTT
CCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGG
TCCTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCC
ATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGC
ACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCCT
CAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTATC
ACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAAC
TTATTGTCTTGTTTTCTTGTTTCTTTTAATAAGTAATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCT
TGGATT*AAAATAAATGGTGAACGTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGATTT*GT
GTGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCCTTTTGCTTCACTGTTCCTTCTTATCTTCGTTGTAA
CTTTTCTTTTGAATTTGATTAATAAA*CTATCAATCGGTGTTGTC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2G038TF 651 0 0
AGATTTCCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATCGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCT
GAACTTCCCCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCA
GATTGGTCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGT
AAAGCCATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTG
TGCCGCACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAACTTAACCTTCCCATCTATGTCAACGC
ACTCCTCAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATA
CTTATCACATATATATTGAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGC
TTGAACTTATTGTCTTGTTTTCATGTTTCTTTTAATCAGTGATTGCTTTTGTGTTTGTAA
TTTTCTTGGATTTAAAATAAATGATGAACGTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGG
TTTTGTGTGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCCTTTTGCTTCATTGTTCCTTCTTATCTTCG
TTGTAACGTTTCTTTTGAATTTGATTAATAAAACTATCAATCGGTGTTGTC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2G889TF 686 0 0
GGACCCCTCTCAACAAATATAAACACACTACTACTTCCTGAGCTTTTGTTTTAAAGATTT
CCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATCGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACTT
CCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGG
TCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCC
ATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTGCCGC
ACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAACTTAACCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCCT
CAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTATC
ACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAAC
TTATTGTCTTGTTTTCATGTTTCTTTTAATCAGTGATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCT
TGGATTTAAAATAAATGATGAACGTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGGTTT*GT
GTGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCCTTTTGCTTCATTGTTCCTTCTTATCTTCGTTGTAA
CGTTTCTTT*GAATTTGATTA
TAAAC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2CK58TF 705 0 0
GGACCCTTCTCAACAAATATAAACACACTACTACTTCCTGAGCTTTTGTTTTAAAGATTT
CCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATCGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACTT
CCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGG
TCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCC
ATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGC
ACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCCT
CAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTATG
ACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAAC
TTATTGTCTTGTTTTCTTGTTTCTTTTAATAAGTAATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCT
TGGATT*AAAATAAATGGTGAACGTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGATTT*GT
GTGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCCTTTTGCTTCACTGTTCCTTCTTATCTTCGTTGTAA
CTTTTCTTTTGAATTTGATTA*TAAA*CTATCAATCGGTGTTGTC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 10

CO CL279Contig1 1141 10 35 U
GGAAGACGCGGATCTTCTGTGAGATAGAGATCTAGAGGAAGAAGCAAGCAAAGCAATGGC
AGGCATGGGAGCAGGGCCAGATCACCTCTTCAATCTGAGAAACCAATTCTATCTGGGAGC
TTATCAAACGGCGATCAACAACAGCGAGATCCCTAACCTCTCGCCGGAGGACGCCGTGGA
ACGCGACTGCCTCGTCTTCCGATCTTACATCGCCCTCGGTAGCTATCAGCTCGTCATCAG
CGAGATCGATGAATCCGCCGCTACTCCACTGCAGGCAGTTAAGCTCCTCGCGATGTATCT
ATCGACTCCTGCAAATAAGGAATCAACGATTTCGAGCTTGAGGGAGTGGTTGGCAGATCC
AACAATAGGAAACAATGCGACTTTGCGACTGGTTGCTGGTGTTGTTTTCATGCATGAGGA
AGATTATAGTGAAGCTCTGAAGCACACTCATGCTGGAGGGACTATGGATCTGCATGCCTT
GAACGTCCAGATATTCATTAAGATGCATAGAACAGATTATGCTGAGAAGCAGCTTGGAGT
TATGCAGCAATATGACGAAGACCACACTCTCACTCAACTTGCTACCGCGTGGTTTAACCT
GGCAGTGGGTGGCTCGAAGATTCAGGAGGCTTATCTCATTTTCCAGGATTTTTGTGAGAA
GTATCCCATGACATGCTTGATCTTGAATGGCAAAGCAGTTTGCTGTATGCAAATGGGTAA
CTTTGATGAAGCTGAAACACTACTTCTTGAAGCACTCAATAAGGATGCTAAGGACCCAGA
AACTCTTGCAAACCTTGTCGTCTGCAGTCTTCATGTTGGCAAATCATCTTCACGTTACTT
AAGCCAGCTGAAACTATCACATCCAGAACATGTGCTCGTGAAGCGTGTATCATCAGCCGA
AGATAACTTCGAGAGAGCGGTTCAATCTGTGGCCTGAAGACTCTTTCATGGTTCAACAAC
CTGTGCAGGATCGGTTTGATTTATTACATATATTCCCGTGTTTGGTAAACCCACCAGAAT
AACTTTTTGTCTTGTCTTTTTATTTTTTAATCAGTATAAGGACACCAGATTTTGCCATTG
GGTTTGTTACATTTACCATTTCATTACTTCTAAATATAAATCTCCAACGTTCACTCTGTC
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 5 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RR2FV32TF U 11
AF RR2DQ17TF U 17
AF RR2G936TF U 139
AF RR2BI12TF U 1
AF RR2CG80TF U 54
AF RR2H470TF U 139
AF RR2DQ17JQ C 313
AF RR2BM84JQ C 525
AF RR2G936JQ C 393
AF RR2H470JQB C 565
BS 1 152 RR2BI12TF
BS 153 153 RR2DQ17TF
BS 154 180 RR2BI12TF
BS 181 181 RR2DQ17TF
BS 182 239 RR2BI12TF
BS 240 240 RR2FV32TF
BS 241 305 RR2BI12TF
BS 306 306 RR2DQ17TF
BS 307 333 RR2BI12TF
BS 334 334 RR2FV32TF
BS 335 360 RR2BI12TF
BS 361 361 RR2FV32TF
BS 362 378 RR2BI12TF
BS 379 379 RR2DQ17TF
BS 380 438 RR2BI12TF
BS 439 439 RR2DQ17TF
BS 440 459 RR2BI12TF
BS 460 460 RR2DQ17TF
BS 461 588 RR2BI12TF
BS 589 589 RR2DQ17TF
BS 590 621 RR2BI12TF
BS 622 622 RR2G936TF
BS 623 627 RR2BI12TF
BS 628 628 RR2G936TF
BS 629 651 RR2BI12TF
BS 652 652 RR2CG80TF
BS 653 725 RR2BI12TF
BS 726 744 RR2CG80TF
BS 745 745 RR2H470TF
BS 746 750 RR2CG80TF
BS 751 772 RR2H470TF
BS 773 773 RR2DQ17JQ
BS 774 897 RR2H470TF
BS 898 1076 RR2DQ17JQ
BS 1077 1141 RR2G936JQ

RD RR2FV32TF 543 0 0
GATCTTCT
GTGAGATAGAGATCTAGAGGAAGAAGCAAGCAAAGCAATGGCAGGCATGGGAGCAGGGCC
AGATCACCTCTTCAATCTGAGAAACCAATTCTATCTGGGAGCTTATCAAACGGCGATCAA
CAACAGCGAGATCCGTAACCTCTCGCCGGAGGACGCCGTGGAGCGCGACTGCCTCGTCTT
CCGATCTTACATCGCCCTCGGTAGCTATCAGCTCGTCATCAGCGAGATCGATGAATCCGC
CGCTACTCCACTGCAGGCAGTTAAGCTCCTCGCGATGTATCTATCGAGTCCTGCAAATAA
GGAATCAACGATTTCGAGCTTGAGGGAGTGGTTGGCAGATCCAACAATAGGAAACAATGC
TACTTTGCGACTGGTTGCTGGTGTTGTTTTCATGCATGAGGAAGATTATAGTGAAGCTCT
CAAGCACACCCATGCTGGAGGAACTATGGATCTGCATGCCTTGAACGTCCAGATATTCAT
TAAGATGCATAGAACAGATTATGCTGAGAAGCAGCTTGGAGTTATGCAGCAATAT

QA 9 543 9 543
DS 

RD RR2DQ17TF 605 0 0
GG
GTGAGATAGAGATCTAGAGGAAGAAG*AAG**AAGCAATGGCAGGCATGGGAGCAGGGCC
AGATCACCTCTTCAATCTGAGAAACCAATTCTATCTGGGAGCTTATCAAACGGCGATCAA
CAACAGCGAGATCCCTAACCTCTCGCCGGAGGACGCCGTGGAACGCGACTGCCTCGTCTT
CCGATCTTACATCGCCCTCGGTAGCTATCAGCTCGTCATCAGCGAGATCGATGAATCCGC
CGCTACTCCACTGCAGGCAGTTAAGCTCCTCGCGATGTATCTATCGACTCCTGCAAATAA
GGAATCAACGATTTCGAGCTTGAGGGAGTGGTTGGCAGATCCAACAATAGGAAACAATGC
GACTTTGCGACTGGTTGCTGGTGTTGTTTTCATGCATGAGGAAGATTATAGTGAAGCTCT
GAAGCACACTCATGCTGGAGGGACTATGGATCTGCATGCCTTGAACGTCCAGATAT**AT
TAAGATGCATAGAACAGATTATGCTGAGAAGCAGCTTGGAGTTATGCAGCAATATGACGA
AGACCACACTCTCACTCAACTTGCTACCGCGTGGTTTAACCTGGCAGTGGGTGGCTCGAA
GAT

QA 3 605 3 605
DS 

RD RR2G936TF 551 0 0
G
AACAGCGAGATCCCTAACCTCTCGCCGGAGGACGCCGTGGAACGCGACTGCCTCGTCTTC
CGATCTTACATCGCCCTCGGTAGCTATCAGCTCGTCATCAGCGAGATCGATGAATCCGCC
GCTACTCCACTGCAGGCAGTTAAGCTCCTCGCGATGTATCTATCGACTCCTGCAAATAAG
GAATCAACGATTTCGAGCTTGAGGGAGTGGTTGGCAGATCCAACAATAGGAAACAATGCG
ACTTTGCGACTGGTTGCTGGTGTTGTTTTCATGCATGAGGAAGATTATAGTGAAGCTCTG
AAGCACACTCATGCTGGAGGGACTATGGATCTGCATGCCTTGAACGTCCAGATATTCATT
AAGATGCATAGAACAGATTATGCTGAGAAGCAGCTTGGAGTTATGCAGCAATATGACGAA
GACCACACTCTCACTCAACTTGCTACCGCGTGGTTTAACCTGGCAGTGGGTGGCTCGAAG
ATTCAGGAGGCTTATCTCATTTTCCAGGATTTTTGTGAGAAGTATCCCATGACATGCTTG
ATCTTGAATG

QA 2 551 2 551
DS 

RD RR2BI12TF 725 0 0
GGAAGACGCGGATCTTCTGTGAGATAGAGATCTAGAGGAAGAAGCAAGCAAAGCAATGGC
AGGCATGGGAGCAGGGCCAGATCACCTCTTCAATCTGAGAAACCAATTCTATCTGGGAGC
TTATCAAACGGCGATCAACAACAGCGAGATCCGTAACCTCTCGCCGGAGGACGCCGTGGA
GCGCGACTGCCTCGTCTTCCGATCTTACATCGCCCTCGGTAGCTATCAGCTCGTCATCAA
CGAGATCGATGAATCCGCCGCTACTCCACTGCAGGCAGTTAAGCTCCTCGCGATGTATCT
ATCGAGTCCTGCAAATAAGGAATCAACGATTTCAAGCTTGAGGGAGTGGTTGGCAGATCC
GACAATAGGAAACAATGCTACTTTGCGACTGGTTGCTGGTGTTGTTTTCATGCATGAGGA
AGATTATAGTGAAGCTCTCAAGCACACTCATGCTGGAGGAACTATGGATCTGCATGCCTT
GAACGTCCAGATATTCATTAAGATGCATAGAACAGATTATGCTGAGAAGCAGCTTGGAGT
TATGCAGCAATATGACGAAGACCACACTCTCACTCAACTTGCTACCGCCTGGTTTAACCT
GGCAGTGGGTGGCTCGAAGATACAGGAAGCTTATCTCATTTTCCAGGATTTCTGTGAGAA
GTATCCCATGACATGCTTGATCTTGAATGGCAAAGCAGTTTGCTGTATGCAAATGGGTAA
CTTTG

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2CG80TF 700 0 0
CAATGGCAGGCATGGGAGCAGGTCCAGATCACCTCTTCAATCTGAGAAACCAATTCTATC
TGGGAGCTTACCAAACGGCGATCAACAACAGCGAGATCCGTAACCTCTCGCCTGAGGATG
CCGTGGAACGCGACTGCCTCGTCTTCCGATCTTACATCGCCCTCGGTAGCTATCAGCTCG
TCATCAGCGAGATCGATGAATCCGCCGCTACTCCACTGCAGGCAGTTAAGCTCCTCGCGA
TGTATCTATCGAGTCCTGCAAATAAGGAATCAACGATTTCAAGCT*GAGGGAGTGGTTGG
CAGATCCAACAATAGGAAACAATGCGACTTTGCGACTGGTTGCTGGTGTTGTTTTCATGC
ATGAGGAAGATTATAGTGAAGCTCTCAAGCACACTCATGCTGGAGGGACTATGGATCTGC
ATGCCTTGAACGTCCAGATATTCATTAAGATGCGTAGAACAGATTATGCTGAGAAGCAGC
TTGGGGTTATGCAGCAATATGACGAAGACCACACTCTCACTCAACTTGCTACCGCCTGGT
TTAACCTGGCAGTGGGTGGCTCGAAGATCCAGGAAGCTTATCTCATTTTCCAGGATTTTT
GTGAGAAGTATCCCATGACATGCTTGATCTTGA*TGGCAAAGCAGTTTGCTGTATTCAA*
TGGGTAACTTTGATGAAGCTGAAACACTACTCCTTGA
GCA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2H470TF 759 0 0
G
AACAGCGAGATCCCTAACCTCTCGCCGGAGGACGCCGTGGAACGCGACTGCCTCGTCTTC
CGATCTTACATCGCCCTCGGTAGCTATCAGCTCGTCATCAGCGAGATCGATGAATCCGCC
GCTACTCCACTGCAGGCAGTTAAGCTCCTCGCGATGTATCTATCGACTCCTGCAAATAAG
GAATCAACGATTTCGAGCTTGAGGGAGTGGTTGGCAGATCCAACAATAGGAAACAATGCG
ACTTTGCGACTGGTTGCTGGTGTTGTTTTCATGCATGAGGAAGATTATAGTGAAGCTCTG
AAGCACACTCATGCTGGAGGGACTATGGATCTGCATGCCTTGAACGTCCAGATATTCATT
AAGATGCATAGAACAGATTATGCTGAGAAGCAGCTTGGAGTTATGCAGCAATATGACGAA
GACCACACTCTCACTCAACTTGCTACCGCGTGGTTTAACCTGGCAGTGGGTGGCTCGAAG
ATTCAGGAGGCTTATCTCATTTTCCAGGATTTTTGTGAGAAGTATCCCATGACATGCTTG
ATCTTGAATGGCAAAGCAGTTTGCTGTATGCAAATGGGTAACTTTGATGAAGCTGAAACA
CTACTTCTTGAAGCACTCAATAAGGATGCTAAG*ACCCAGAAACTCTTGCAAACCTTGTC
GTCTGCAGTCTTCATGTTGGCAAATCATCTTCACGTTACTTAAGCCAGCTGAAACTATCA
CATCCAGAACATGTGCTCGTGAAGCGTGTATCATCAGC

QA 2 759 2 759
DS 

RD RR2DQ17JQ 764 0 0
AAATAAGGAATCAACGATTTCGAGCTTGAGGGAGTGGTTGGCAGATCCAACAATAGGAAA
CAATGCGACTTTGCGACTGGTTGCTGGTGTTGTTTTCATGCATGAGGAAGATTATAGTGA
AGCTCTGAAGCACACTCATGCTGGAGGGACTATGGATCTGCATGCCTTGAACGTCCAGAT
AT**ATTAAGATGCATAGAACAGATTATGCTGAGAAGCAGCTTGGAGTTATGCAGCAATA
TGACGAAGACCACACTCTCACTCAACTTGCTACCGCGTGGTTTAACCTGGCAGTGGGTGG
CTCGAAGATTCAGGAGGCTTATCTCATTTTCCAGGATTTTTGTGAGAAGTATCCCATGAC
ATGCTTGATCTTGAATGGCAAAGCAGTTTGCTGTATGCAAATGGGTAACTTTGATGAAGC
TGAAACACTACTTCTTGAAGCACTCAATAAGGATGCTAAGGACCCAGAAACTCTTGCAAA
CCTTGTCGTCTGCAGTCTTCATGTTGGCAAATCATTTTCACGTTACTTAAGCCAGCTGAA
ACTATCACATCCAGAACATGTGCTCGTGAAGCGTGTATCATCAGCCGAAGATAACTTCGA
GAGAGCGGTTCAATCTGTGGCCTGAAGACTCTTTCATGGTTCAACAACCTGTGCAGGATC
GGTTTGATTTATTACATATATTCCCGTGTTTGGTAAACCCACCAGAATAACTTTTTGTCT
TGTCTTTTTATTTTTTAATCAGTATAAGGACACCAGATTTTGCC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2BM84JQ 548 0 0
AGAAGCAGCTTGGAGTTATGCAGCAATATGACGAAGACCACACTCTCACTCAACTTGCTA
CCGCGTGGTTTAACCTGGCAGTGGGTGGCTCGAAGATTCAGGAGGCTTATCTCATTTTCC
AGGATTTTTGTGAGAAGTATCCCATGACATGCTTGATCTTGAATGGCAAAGCAGTTTGCT
GTATGCAAATGGGTAACTTTGATGAAGCTGAAACACTACTTCTTGAAGCACTCAATAAGG
ATGCTAAGGACCCAGAAACTCTTGCAAACCTTGTCGTCTGCAGTCTTCATGTTGGCAAAT
CATCTTCACGTTACTTAAGCCAGCTGAAACTATCACATCCAGAACATGTGCTCGTGAAGC
GTGTATCATCAGCCGAAGATAACTTCGAGAGAGCGGTTCAATCTGTGGCCTGAAGACTCT
TTCATGGTTCAACAACCTGTGCAGGATCGGTTTGATTTATTACATATATTCCCGTGTTTG
GTAAACCCACCAGAATAACTTTTTGTCTTGTCTTTTTATTTTTTAATCAGTATAAGGACA
CCAGATTT

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2G936JQ 749 0 0
TTGCTGGTGTTGTTTTCATGCATGAGGAAGATTATAGTGAAGCTCTGAAGCACACTCATG
CTGGAGGGACTATGGATCTGCATGCCTTGAACGTCCAGATATTCATTAAGATGCATAGAA
CAGATTATGCTGAGAAGCAGCTTGGAGTTATGCAGCAATATGACGAAGACCACACTCTCA
CTCAACTTGCTACCGCGTGGTTTAACCTGGCAGTGGGTGGCTCGAAGATTCAGGAGGCTT
ATCTCATTTTCCAGGATTTTTGTGAGAAGTATCCCATGACATGCTTGATCTTGAATGGCA
AAGCAGTTTGCTGTATGCAAATGGGTAACTTTGATGAAGCTGAAACACTACTTCTTGAAG
CACTCAATAAGGATGCTAAGGACCCAGAAACTCTTGCAAACCTTGTCGTTTGCAGTCTTC
ATGTTGGCAAATCATCTTCACGTTACTTAAGCCAGCTGAAACTATCACATCCAGAACATG
TGCTCGTGAAGCGTGTATCATCAGCCGAAGATAACTTCGAGAGAGCGGTTCAATCTGTGG
CCTGAAGACTCTTTCATGGTTCAACAACCTGTGCAGGATCGGTTTGATTTATTACATATA
TTCCCGTGTTTGGTAAACCCACCAGAATAACTTTTTGTCTTGTCTTTTTATTTTTTAATC
AGTATAAGGACACCAGATTTTGCCATTGGGTTTGTTACATTTACCATTTCATTACTTCTA
AATATAAATCTCCAACGTTCACTCTGTCG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2H470JQB 577 0 0
CACTCTCACTCAACTTGCTACCGCGTGGTTTAACCTGGCAGTGGGTGGCTCGAAGATTCA
GGAGGCTTATTTCATTTTCCAGGATTTTTGTGAGAAGTATCCCATGACATGCTTGATCTT
GAATGGCAAAGCAGTTTGCTGTATGCAAATGGGTAACTTTGATGAAGCTGAAACACTACT
TCTTGAAGCACTCAATAAGGATGCTAAGGACCCAGAAACTCTTGCAAACCTTGTCGTTTG
CAGTTTTCATGTTGGCAAATCATCTTCACGTTACTTAAGCCAGGTGAAACTATCACATCC
AGAACATGTGCTCGTGAAGGGTGTATCATCAGCCGAAGATAACTTCGAGAGAGCGGTTCA
ATCTGTGGCCTGAAGACTCTTTCATGGTTCAACAACCTGTGCAGGATCGGTTTGATTTAT
TACATATATTCCCGTGTTTGGTAAACCCACCAGAATAACTTTTTGTCTTGTCTTTTTATT
TTTTAATCAGTATAAGGACACCAGATTTTGCCATTGGGTTTGTTACATTTACCATTTCAT
TACTTCTAAATATAAATCTCCAACGTTCACTCTGTCG

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 14

CO CL280Contig1 1487 14 16 U
GGGGAGCTCGGGAAGCGCGGCTTCTGTAAAGCTCCGTCGCCGTATCCGAAGCTCAAAAAA
*GCTTCATCAATGGCGTCTCTTGTCCTACCTTCATCTAAACTTCTCCTCCATAGTCGAAC
CCAACACAATGTCCAACCATTTCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATTCTTCAT
CTCCTCACCGTCTCTCCGTCGTCAACACTCTACTTCCGCCTCAGCTTCCAAGAACCCATC
GGAAGCTCTCACGGCGGCGACGACGACGGAGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAGGCATTT
CAGCGAGGAGGAAGAAGCAGAAGAGGAAGTAGAGGAGGATATGTTGTGGATTCAGGAGAA
GGCGTTAGAACTTGTCCAGTTCACTGGTTCGGTGGCTCAGGCGCTTCCAGGTCCCCGAGT
TGGAAGCACCAAGTTGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTAACTTACGCCGGCGCCACTTT
AGCCACTGCCGTCGTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAA
ACTAGTGAATGAGAATGCAATGCTGTGTAGGTCTATCGACGAGCTGTTACAGAGAGAAGG
CACTGTGAGTAGCTTTGAGCTCAAGGCACTTGAAGAAAAGACGGAGTTTAACATGGAGGA
GATCTTGCGGAAGTACATTCACTACGCCTTGAATGAGAAACCGTTTAATCCTGACCTTGT
TGCAAGTCTTATACATATCAGAAGAGCTTCTGGTTTGAATGAGTCTCAGATTCCTGAGGT
TTTAAATGAGATCTCCCGTGGTATTGTTAAAGACAAAGGTCCTGTTGTGATGAATAAGCA
GGGGTTCACAGAGAAAGGGTTTAAGAGAAAACTAGCCGTGCAGACGCTTTTTGGAAAGAT
ATACTATCTTTCCGAGCTTCCTGACTTCTGCTTAAAAGACAACTCTTTGGTTGTCAAGGA
AATATTCGGTGTTACAGATGAAGACGCAGAGAAGCTGAGGATACAGGCGCTTGCTGAAGC
TGGAGACTTGGACTCACTTGAGAAAATGGTGGAGTTTGAGAAAGCGGCTGATTCTTCTTC
TTCTTCTTCTTCGGATAGAGAAGATTCAAATGAAGAAGATGACTCCACTACTTCTCCTTA
AAAGATTATATGTTCAAGGACCAACTTCAATACTAATAAAGATTTTTTCTTCTGATCTTT
ACTTAACCACAAACGTTTGTATCCAACAAACTAAGCTCTTATCTTTTGCTATAATGACAT
CTTCTGTAATAGAAATTCTAATATTGTAGAACAACAATACGAGCTGTGGCTTATATACAA
ACGAAAAGTTGTCTATGATGCTAACTCGCATAGATATGAAGAAAGGCTACAATAAGTTAA
TTTACTTGAATACTAATTGGAATTTTAATACATCTTAACTAAATAATTATTAATGTTTGC
TATTGAATAATTTAAATTATGAAATTGATAAAATAAATTATGAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H403TF U 1
AF RR2DV91TF U 11
AF RR2G296TF U 11
AF RR2CP14TF U 11
AF RR2FQ04TF U 6
AF RR2AH80TF U 2
AF RR2AP43TF U 11
AF RR2B268TF U 281
AF RR2DV91JQ C 544
AF RR2CP14JQ C 605
AF RR2FQ04JQ C 512
AF RR2H403JQB C 549
AF RR2AH80JQ C 494
AF RR2G296JQ C 949
BS 1 10 RR2H403TF
BS 11 12 RR2AP43TF
BS 13 60 RR2H403TF
BS 61 61 RR2AH80TF
BS 62 309 RR2H403TF
BS 310 310 RR2AH80TF
BS 311 640 RR2H403TF
BS 641 684 RR2AH80TF
BS 685 685 RR2AP43TF
BS 686 787 RR2AH80TF
BS 788 809 RR2AP43TF
BS 810 999 RR2B268TF
BS 1000 1158 RR2AH80JQ
BS 1159 1159 RR2CP14JQ
BS 1160 1333 RR2AH80JQ
BS 1334 1487 RR2G296JQ

RD RR2H403TF 640 0 0
GGGGAGCTCGATAAGCGCGGCTTCTGTAAAGCTCCGTCGCCGTATCCGAAGCTCAAAAAA
AGCTTCATCAATGGCGTCTCTTGTCCTACCTTCATCTAAACTTCTCCTCCATAGTCGAAC
CCAACACAATGTCCAACCATTTCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATTCTTCAT
CTCCTCACCGTCTCTCCGTCGTCAACACTCTACTTCCGCCTCAGCTTCCAAGAACCCATC
GGAAGCTCTCACGGCGGCGACGACGACGGAGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAGGCATTT
CAGCGAGGATGAAGAAGCAGAAGAGGAAGTAGAGGAGGATATGTTGTGGATTCAGGAGAA
GGCGTTAGAACTTGTCCAGTTCACTGGTTCGGTGGCTCAGGCGCTTCCAGGTCCCCGAGT
TGGAAGCACCAAGTTGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTAACTTACGCCGGCGCCACTTT
AGCCACTGCCGTCGTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAA
ACTAGTGAATGAGAATGCAATGCTGTGTAGGTCTATCGACGAGCTGTTACAGAGAGAAGG
CACTGTGAGTAGCTTTGAGCTCAAGGCACTTGAAGAAAAG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2DV91TF 609 0 0
GGAAGCGCGGCTTCTGTAAAGCTCCGTCGCCGTATCCGAAGCTCAAAAAA*GCTTCATCA
ATGGCGTCTCTTGTCCTACCTTCATCTAAACTTCTCCTCCATAGTCGAACCCAACACAAT
GTCCAACCATTTCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATCCTTCATCTCCTCACCG
TCTCTCCGTCGTCAACACTCTACTTCCGCCTCAGCTTCCAAGAACCCATCGGAAGCTCTC
ACGGCGGCGACGACGACGGAGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAGGCATTTCAGCGAGGAG
GAAGAAGCAGAAGAGGAAGTAGAGGAGGATATGTTGTGGATTCATGAGAAGGCGTTAGAA
CTTGTCCAGTTCACTGGTTCGGTGGCTCAGGCGCTTCCAGGTCCCCGAGTTGGAAGCACC
AAGTTGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTAACTTACGCCGGCGCCACTTTAGCCACTGCC
GTCGTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAAACTAGTGAAT
GAGAATGCAATGCTGTGTAGGTCTATCGACGAGCTGTTACAGAGAGAAGGCACTGTGAGT
AGCTTTGAG

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2G296TF 629 0 0
GGAAGCGCGGCTTCTGTAAAGCTCCGTCGCCGTATCCGAAGCTCAAAAAA*GCTTCATCA
ATGGCGTCTCTTGTCCTACCTTCATCTAAACTTCTCCTCCATAGTCGAACCCAACACAAT
GTCCAACCATTTCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATTCTTCATCTCCTCACCG
TCTCTCCGTCGTCAACACTCTACTTCCGCCTCAGCTTCCAAGAACCCATCGGAAGCTCTC
ACGGCGGCGACGACGACGGAGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAGGCATTTCAGCGAGGAG
GAAGAAGCAGAAGAGGAAGTAGAGGAGGATATGTTGTGGATTCAGGAGAAGGCGTTAGAA
CTTGTCCAGTTCACTGGTTCGGTGGCTCAGGCGCTTCCAGGTCCCCGAGTTGGAGGCACC
AAGTTGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTAACTTACGCCGGCGCCACTTTAGCCACTGCC
GTCGTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAAACTAGTGAAT
GAGAATGCAATGCTGTGTAGGTCTATCGACGAGCTGTTACAGAGAGAAGGCACTGTGAGT
AGCTTTGAGCTCAAGGCACTTGAAGAAAA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2CP14TF 777 0 0
GGAAGCGCGGCTTCTGTAAAGCTCCGTCGCCGTATCCGAAGCTCAAAAAA*GCTTCATCA
ATGGCGTCTCTTGTCCTACCTTCATCTAAACTTCTCCTCCATAGTCTAACCCAACACAAT
GTCCAGCCATTTCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATTCTTCATCTCCTCACCG
TCTCTCCGTCGTCAACACTCTACTTCCGCCTCAGCTTCCAAGAACCCATCGGAAGCTCTC
ACGGCGGCGACGACGACGGAGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAGGCATTTCAGCGAGGAG
GAAGAAGCAGAAGAGGAAGTAGAGGGGGATATGTTGTGGATTCAGGAGAAGGCGTTAGAA
CTTGTCCAGTTCACTGGTTCGGTGGCTCAGGCGCTTCCAGGTCCCCGAGTTGGAAGCACC
AAGTTGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTAACTTACGCCGGCGCCACTTTAGCCACTGCC
GTCGTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAAACTAGTGAAT
GAGAATGCAATGCTGTGTAGGTCTATCGACGAGCTGTTGCAGAGAGAAGGCACTGTGAGT
AGCTTTGAGCTCGAGGCACTTGAAGAAAAGACGGAGTTTAACATGGAGGAGATCTTGCGG
AAGTACATTCACTACGCCTTGAATGAGAAACCGTTTAATCCTGACCTTGTTGCAAGTCTT
ATACATATCAGAAGAGCTTCTGGTTTGA*TGAGTCTCAGATTC
TGAGTTTAATGAGA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2FQ04TF 760 0 0
GGTCGAT
AAGCGCGGCTTCTGTAAAGCTCCGTCGCCGTATCCGAAGCTCAAAAAA*GCTTCATCAAT
GGCGTCTCTTGTCCTACCTTCATCTAAACTTCTCCTCCATAGTCGAACCCAACACAATGT
CCAACCATTTCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATTCTTCATCTCCTCACCGTC
TCTCCGTCGTCAACACTCTACTTCCGCCTCAGCTTCCAAGAACCCATCGGAAGCTCTCAC
GGCGGCGACGACGACGGAGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAGGCATTTCAGCGAGGAGGA
AGAAGCAGAAGAGGAAGTAGAGGAGGATATGTTGTGGATTCAGGAGAAGGCGTTAGAACT
TGTCCAGTTCACTGGTTCGGTGGCTCAGGCGCTTCCAGGTCCCCGAGTTGGAAGCACCAA
GTTGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTAACTTACGCCGGCGCCACTTTAGCCACTGCCGT
CGTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAAACTAGTGAATGA
GAATGCAATGCTGTGTAGGTCTATCGACGAGCTGTTACAGAGAGAAGGCACTGTGAGTAG
CTTTGAGCTCAAGGCACTTGAAGAAAAGACGGAGTTTAACATGGAGGAGATCTTGCGGAA
GTACATTCACTACGCCTTGAATGAGAAACCGTTTAATCCTGACCTTGTTGCAAGTCTTAT
ACATATCAGAAGAGCTTCTGGTTTGA
TGAGTCT

QA 8 753 8 753
DS 

RD RR2AH80TF 786 0 0
GAGAGC
TCGATAAGCGCGGCTTCTGTAAAGCTCCGTCGCCGTATCCGAAGCTCAAAAAA*GCTTCA
TCAATGGCGTCTCTTGTCCTACCTTCATCTAAACTTCTCCTCCATAGTCGAACCCAACAC
AATGTCCAACCATTTCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATTCTTCATCTCCTCA
CCGTCTCTCCGTCGTCAACACTCTACTTCCGCCTCAGCTTCCAAGAACCCATCGGAAGTT
CTCACGGCGGCGACGACGACGGAGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAGGCATTTCAGCGAG
GAGGAAGAAGCAGAAGAGGAAGTAGAGGAGGATATGTTGCGGATTCAGGAGAAGGCGTTA
GAACTTGTCCAGTTCACTGGTTCGGTGGCTCAGGCGCTTCCAGGTCCCCGAGTTGGAAGC
ACCAAGTTGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTAACTTACGCCGGCGCCACTTTAGCCACT
GCCGTCGTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAA*CTAGTG
AATGAGAATGCAATGCTGTGTAGGTCTATCGACGAGCTGTTACAGAGAGAAGGCACTGTG
AGTAGCTTTGAGCTCAAGGCACTTGAAGAAAAGACGGAGTTTAACATGGAGGAGATCTTG
CGGAAGTACATTCACTATGCCTTGAATGAGAAACCGTTTAATCCTGACCTTGTTGCAAGT
CTTATACATATCAGAAGAGCTTCTGGTTTGAATGAGTCTCAGATTCCTGAGGTTTTAAAT

QA 7 786 7 786
DS 

RD RR2AP43TF 799 0 0
GGAAGCGCGGCTTCTGTAAAGCTCCGTCGCCGTATCCGAAGCTCAAAAA**GCTTCATCA
ATGGCGTCTCTTGTCCTACCTTCATCTAAACTTCTCCTCCATAGTCGAACCCAACACAAT
GTCCAACCATTTCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATTCTTCATCTCCTCACCG
TCTCTCCGTCGTCAACACTCTACTTCCGCCTCAGCTTCCAAGAACCCATCGGAAGCTCTC
ACGGCGGCGACGACGACGGAGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAGGCATTTCAGCGAGGAG
GAAGAAGCAGAAGAGGAAGTAGAGGAGGATATGTTGTGGATTCAGGAGAAGGCGTTAGAA
CTTGTCCAGTTCACTGGTTCGGTGGCTCAGGCGCTTCCAGGTCCCCGAGTTGGAAGCACC
AAGTTGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTAACTTACACCGGCGCCACTTTAGCCACTGCC
GTCGTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAAACTAGTGAAT
GAGAATGCAATGCTGTGTAGGTCTATCGACGAGCTGTTACAGAGAGAAGGCACTGTGAGT
AGCTTTGAGCTCAAGGCACTTGAAGAAAAGACGGAGTTTAACATGGAGGAGATCTTGCGG
AAGTACATTCACTACGCCTTGAATGAGAAACCGTTTAATCCTGACCTTGTTGCAAGTCTT
ATACATATCAGAAGAGCTTCTGGTTTGAATGAGTCTCAGATTCCTGAGGTTTTAAATGAG
ATCTCCCGTGGTATTGTTA

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2B268TF 722 0 0
CAGCCGGAGAAGAGGCATTTCAGCGAGGAGTAAGAAGCAGAAGAGGAAGTAGAGGAGGAT
ATGTTGTGGATTCAGGAGAAGGCGTTAGAACTTGTCCAGTTCACTGGTTCGGTGGCTCAG
GCGCTTCCAGGTCCCCGAGTTGGAAGCACCAAGTTGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTA
ACTTACGCCGGCGCCACTTTAGCCACTGCCGTCGTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCT
CCTAACGCACAACGCAAGAAACTAGTGAATGAGAATGCAATGCTGTGTAGGTCTATCGAC
GAGCTGTTACAGAGAGAAGGCACTGTGAGTAGCTTTGAGCTCAAGGCACTTGAAGAAAAG
ACGGAGTTTAACATGGAGGAGATCTTGCGGAAGTACATTCACTACGCCTTGAATGAGAAA
CCGTTTAATCCTGACCTTGTTGCAAGTCTTATACATATCAGAAGAGCTTCTGGTTTGAAT
GAGTCTCAGATTCCTGAGGTTTTAAATGAGATCTCCCGTGGTATTGTTAAAGACAAAGGT
CCTGTTGTGATGAATAAGCAGGGGTTCACAGAGAAAGGGTTTAAGAGAAAACTAGCCGTG
CAGACGCTTTTTGGAAAGATATACTATCTTTCCGAGCTTCCTGACTTCTGCTTAAAAGAC
AACTCTTTGGTTGTCAAGGAAATATTCGGTGTTACAGATGAAGACGCAGAGAAGCTGAG
ATA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2DV91JQ 665 0 0
AGTGAATGAGAATGCAATGCTGTGTAGGTCTATCGACGAGCTGTTACAGAGAGAAGGCAC
TGTGAGTAGCTTTGAGCTCAAGGCACTTGAAGAAAAGACGGAGTTTAACATGGAGGAGAT
CTTGCGGAAGTACATTCACTACGCCTTGAATGAGAAACCGTTTAATCCTGACCTTGTTGC
AAGTCTTATACATATCAGAAGAGCTTCTGGTTTGAATGAGTCTCAGATTCCTGAGGTTTT
AAATGAGATCTCCCGTGGTATTGTTAAAGACAAAGGTCCTGTTGTGATGAATAAGCAGGG
GTTCACAGAGAAAGGGTTTAAGAGAAAACTAGCCGTGCAGACGCTTTTTGGAAAGATATA
CTATCTTTCCGAGCTTCCTGACTTCTGCTTAAAAGACAACTCTTTGGTTGTCAAGGAAAT
ATTCGGTGTTACAGATGAAGACGCAGAGAAGCTGAGGATACAGGCGCTTGCTGAAGCTGG
AGACTTGGACTCACTTGAGAAAATGGTGGAGTTTGAGAAAGCGGCTGATTCTTCTTCTTC
TTCTTCTTCGGATAGAGAAGATTCAAATGAAGAAGATGACTCCACTACTTCTCCTTAAAA
GATTATATGTTCAAGGACCAACTTCAATACTAATAAAGATTTTTTCTTCTGATCTTTACT
TAACC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2CP14JQ 714 0 0
GTGAGTAGCTTTGAGCTCGAGGCACTTGAAGAAAAGACGGAGTTTAACATGGAGGAGATC
TTGCGGAAGTACATTCACTACGCCTTGAATGAGAAACCGTTTAATCCTGACCTTGTTGCA
AGTCTTATACATATCAGAAGAGCTTCTGGTTTGAATGAGTCTCAGATTCCTGAGGTTTTA
AATGAGATCTCCCGTGGTATTGTTAAAGACAAAGGTCCTGTTGTGATGAATAAGCAGGGG
TTCACAGAGAAAGGGTTTAAGAGAAAACTAGCCGTGCAGACGCTTTTTGGAAAGATATAC
TATCTTTCCGAGCTTCCTGACTTCTGCTTAAAAGACAACTCTTTGGTTGTCAAGGAAATA
TTCGGTGTTACAGATGAAGACGCAGAGAAGCTGAGGATACAGGCGCTTGCTGAAGCTGGA
GACTTGGACTCACTTGAGAAAATGGTGGAGTTTGAGAAAGCGGCTGATTCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCGGATAGAGAAGATTCAAATGAAGAAGATGACTCCACTACTTCTCCTTAAAAG
ATTATATGTTCAAGGACCAACTTCAATACTAATAAAGATTTTTTCTTCTGATCTTTACTT
AACCACAAACGTTTGTATCCAACAAACTAAGCTCTTATCTTTTGCTATAATGACATCTTC
TGTAATAGAAATTCTAATATTGTAGAACAACAATACGAGCTGTGGCTTATATAC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2FQ04JQ 807 0 0
TTCTCTTCTC*TAACGCACAACGCAAGAAACTAGTGAATGAGAATGCAATGCTGTGTAGG
TCTATCGACGAGCTGTTACAGAGAGAAGGCACTGTGAGTAGCTTTGAGCTCAAGGCACTT
GAAGAAAAGACGGAGTTTAACATGGAGGAGATCTTGCGGAAGTACATTCACTACGCCTTG
AATGAGAAACCGTTTAATCCTGACCTTGTTGCAAGTCTTATACATATCAGAAGAGCTTCT
GGTTTGAATGAGTCTCAGATTCCTGAGGTTTTAAATGAGATCTCCCGTGGTATTGTTAAA
GACAAAGGTCCTGTTGTGATGAATAAGCAGGGGTTCACAGAGAAAGGGTTTAAGAGAAAA
CTAGCCGTGCAGACGCTTTTTGGAAAGATATACTATCTTTCCGAGCTTCCTGACTTCTGC
TTAAAAGACAACTCTTTGGTTGTCAAGGAAATATTCGGTGTTACAGATGAAGACGCAGAG
AAGCTGAGGATACAGGCGCTTGCTGAAGCTGGAGACTTGGACTCACTTGAGAAAATGGTG
GAGTTTGAGAAAGCGGCTGATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGGATAGAGAAGATTCAAAT
GAAGAAGATGACTCCACTACTTCTCCTTAAAAGATTATATGTTCAAGGACCAACTTCAAT
ACTAATAAAGATTTTTTCTTCTGATCTTTACTTAACCACAAACGTTTGTATCCAACAAAC
TAAGCTCTTATCTTTTGCTATAATGACATCTTCTGTAATAGAAATTCTAATATTGTAGAA
CAACAATACGAGCTGTGGCTTATATAC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2H403JQB 719 0 0
ATGAGAATGCAATGCTGTGTAGGTCTATCGACGAGCTGTTACAGAGAGAAGGCACTGTGA
GTAGCTTTGAGCTCAAGGCACTTGAAGAAAAGACGGAGTTTAACATGGAGGAGATCTTGC
GGAAGTACATTCACTACGCCTTGAATGAGAAACCGTTTAATCCTGACCTTGTTGCAAGTC
TTATACATATCAGAAGAGCTTCTGGTTTGAATGAGTCTCAGATTCCTGAGGTTTTAAATG
AGATCTCCCGTGGTATTGTTAAAGACAAAGGTCCTGTTGTGATGAATAAGCAGGGGTTCA
CAGAGAAAGGGTTTAAGAGAAAACTAGCCGTGCAGACGCTTTTTGGAAAGATATACTATC
TTTCCGAGCTTCCTGACTTCTGCTTAAAAGACAACTCTTTGGTTGTCAAGGAAATATTCG
GTGTTACAGATGAAGACGCAGAGAAGCTGAGGATACAGGCGCTTGCTGAAGCTGGAGACT
TGGACTCACTTGAGAAAATGGTGGAGTTTGAGAAAGCGGCTGATTCTTCTTCTTCTTCTT
CTTCGGATAGAGAAGATTCAAATGAAGAAGATGACTCCACTACTTCTCCTTAAAAGATTA
TATGTTCAAGGACCAACTTCAATACTAATAAAGATTTTTTCTTCTGATCTTTACTTAACC
ACAAACGTTTGTATCCAACAAACTAAGCTCTTATCTTTTGCTATAATGACATCTTCTGT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2AH80JQ 841 0 0
GTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAAACTAGTGAATGAG
AATGCAATGCTGTGTAGGTCTATCGACGAGCTGTTACAGAGAGAAGGCACTGTGAGTAGC
TTTGAGCTCAAGGCACTTGAAGAAAAGACGGAGTTTAACATGGAGGAGATCTTGCGGAAG
TACATTCACTATGCCTTGAATGAGAAACCGTTTAATCCTGACCTTGTTGCAAGTCTTATA
CATATCAGAAGAGCTTCTGGTTTGAATGAGTCTCAGATTCCTGAGGTTTTAAATGAGATC
TCCCGTGGTATTGTTAAAGACAAAGGTCCTGTTGTGATGAATAAGCAGGGGTTCACAGAG
AAAGGGTTTAAGA*AAAACTAGCCGTGCAGACGCTTTTTGGAAAGATATACTATCTTTCC
GAGCTTCCTGACTTCTGCTTAAAAGACAACTCTTTGGTTGTCAAGGAAATATTCGGTGTT
ACAGATGAAGACGCAGAGAAGCTGAGGATACAGGCGCTTGCTGAAGCTGGAGACTTGGAC
TCACTTGAGAAAATGGTGGAGTTTGAGAAAGCGGCTGATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCG
GATAGAGAAGATTCAAATGAAGAAGATGACTCCACTACTTCTCCTTAAAAGATTATATGT
TCAAGAACCAACTTCAATACTAATAAAGATTTTTTCTTCTGATCTTTACTTAACCACAAA
CGTTTGTATCCAACAAACTAAGCTCTTATCTTTTGCTATAATGACATCTTCTGTAATAGA
AATTCTAATATTGTAGAACAACAATACGAGCTGTGGCTTATATACAAACGAAAAGTTGTC
C

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2G296JQ 539 0 0
GGTTGTCAAGGAAATATTCGGTGTTACAGATGAAGACGCAGAGAAGCTGAGGATACAGGC
GCTTGCTGAAGCTGGAGACTTGGACTCACTTGAGAAAATGGTGGAGTTTGAGAAAGCGGC
TGATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGGATAGAGAAGATTCAAATGAAGAAGATGACTCCAC
TACTTCTCCTTAAAAGATTATATGTTCAAGGACCAACTTCAATACTAATAAAGATTTTTT
CTTCTGATCTTTACTTAACCACAAACGTTTGTATCCAACAAACTAAGCTCTTATCTTTTG
CTATAATGACATCTTCTGTAATAGAAATTCTAATATTGTAGAACAACAATACGAGCTGTG
GCTTATATACAAACGAAAAGTTGTCTATGATGCTAACTCGCATAGATATGAAGAAAGGCT
ACAATAAGTTAATTTACTTGAATACTAATTGGAATTTTAATACATCTTAACTAAATAATT
ATTAATGTTTGCTATTGAATAATTTAAATTATGAAATTGATAAAATAAATTATGAATTC

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 14

CO CL281Contig1 654 14 34 U
GGACTTACTTTGGCAACAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAA
ACATGGCATCGTTTGCAACCATCGCCGCCGTTCAACCATCATCCGCCGTGAAAGGACTCG
GAGGAAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCGTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAAC
CCAAATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTG
ATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGTCAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTT
CTCCTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACGAAGA
GAGGTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTCTGCTTACTTATGTCAGTG
CTTCCTCAACTGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCG
GTCCACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCT
TCCCAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTATGTTAATTGCTTTG
CAAGCTACTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAATTTGCATTTCAAGTCTGCTAC


BQ
35 35 35 35 5 5 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 60 75 80 80 80 80 80 65 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 50 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 60 15 75 75 75 75 75 60 45 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 
75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 40 70 70 70 70 55 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 60 45 55 55 55 55 55 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 

AF RR2H844TF U 5
AF RR2CB42TF U 56
AF RR2C816JQ C 5
AF RR2A852JQ C 1
AF RR2FO39JQ C 144
AF RR2E532JQ C 56
AF RR2CC74TF U 1
AF RR2CC74JQ C 1
AF RR2A852TF U 1
AF RR2E532TF U 0
AF RR2CQ38TF U 13
AF RR2FO39TF U 1
AF RR2A280JQ C 5
AF RR2A280TF U 5
BS 1 82 RR2CC74TF
BS 83 83 RR2A852TF
BS 84 100 RR2CC74TF
BS 101 101 RR2A852TF
BS 102 106 RR2CC74TF
BS 107 107 RR2A852TF
BS 108 149 RR2CC74TF
BS 150 150 RR2A852TF
BS 151 160 RR2CC74TF
BS 161 161 RR2A852TF
BS 162 196 RR2CC74TF
BS 197 197 RR2A852TF
BS 198 201 RR2CC74TF
BS 202 202 RR2A852TF
BS 203 204 RR2CC74TF
BS 205 205 RR2A852TF
BS 206 268 RR2CC74TF
BS 269 269 RR2A852TF
BS 270 328 RR2CC74TF
BS 329 329 RR2A852TF
BS 330 342 RR2CC74TF
BS 343 343 RR2A852TF
BS 344 355 RR2CC74TF
BS 356 356 RR2A852TF
BS 357 401 RR2CC74TF
BS 402 402 RR2A852TF
BS 403 433 RR2CC74TF
BS 434 434 RR2A852TF
BS 435 478 RR2CC74TF
BS 479 479 RR2A852TF
BS 480 606 RR2CC74TF
BS 607 607 RR2A852TF
BS 608 641 RR2CC74TF
BS 642 654 RR2A852TF

RD RR2H844TF 221 0 0
GGACTTTGGCAACAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAACAT
GGCATCGTTTGCAACCATGGCTGCCGTTCAACCATCCTCCGCTGTGAAAGGACTCGGAGG
AAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCTTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAA
ATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACA

QA 1 221 1 221
DS 

RD RR2CB42TF 307 0 0
GAGAAACATGGCATCGTTTGCAACCATCGCCGCCGTTCAACCATCATCCGCCGTGAAAGG
ACTCGGAGGAAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCGTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTT
CAAACCCAAATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATA
CTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGTCAATGTGATTTGTATGGATCTGATGC
TCCTTCTCCTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCAC
GAAGAGA

QA 1 307 1 307
DS 

RD RR2C816JQ 549 0 0
GGACTTTGGCAACAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAACAT
GGCATCGTTTGCAACCATGGCTGCCGTTCAACCATCCTCCGCTGTGAAAGGACTCGGAGG
AAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTTTTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAA
ATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATTT
AGAAGATTTGGGTAACACA*CAG*ACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCC
TTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTTTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGAGG
TTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTCTGCTTACTTATGTCAGTGCTTC
CTCAACTGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCC
ACGTGGCAAGCTTTAAGTTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCCC
AAGTCTCTG

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2A852JQ 654 0 0
GGACTTACTTTGGCAACAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAA
ACATGGCATCGTTTGCAACCATCGCCGCCGTTCAACCATCATCCGCCGTGAAAGGACTCG
GAGGAAGCTCTCTCACCGGAGTTAAGCTCGTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAAC
CCAAATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTG
ATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGTCAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTT
CTCCTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACGAAGA
GAGGTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTCTGCTTACTTATGTCAGTG
CTTCCTCAACTGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCG
GTCCACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTCCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCT
TCCTAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTATGTTAATTGCTTTG
CAAGCTACTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAATTTGCATTTCAAGTCTGCTAC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2FO39JQ 509 0 0
AAGCTCGTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAAATCCACAAGAGCTGGTGCC
GTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACACA
ACAGGTCAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCACTTCAGAGC
AAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACGAAGAGAGGTTTGCTTCTCAAGTTTTTG
ATTCTTGGAGGAGGCTTTCTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCAACTGGTGATGTTCTT
CCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCACGTGGCAAGCTTTAAATT
AGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCCCAAGTTTCTGAACTCCTGTT
ACTGATCTATGTATATTGTGTTATGTTAATTGCTTTGCAAGCTACTGAATTGTAATGAAT
CGATGAAAAATTTGCATTTCAAGTCTGC
C

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2E532JQ 583 0 0
GAGAAACATGGCATCGTTTGCAACCATCGCCGCCGTTCAACCATCATCCGCCGTGAAAGG
ACTCGGAGGAAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCGTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTT
CAAACCCAAATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATA
CTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGTCAATGG*ATTTGTACGGATCTGATGC
TCCTTCTCCTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCAC
GAAGAGAGGTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTCTGCTTACTTATGT
CAGTGCTTCCTCAACTGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAA
GCTCGGTCCACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAAC
TTTCTTCCCAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTATGTTAATTG
CTTTGCAAGCTACTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAATTTGC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2CC74TF 643 0 0
GGACTTACTTTGGCAACAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAA
ACATGGCATCGTTTGCAACCATGGCCGCCGTTCAACCATCCTCCGCTGTGAAAGGACTCG
GAGGAAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCTTCATCAAGCCCTCTCGCCAAAGCTTCAAAC
CCAAATCCACAAGAGCCGGTGACGCGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTG
ATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTT
CTCCTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTTTTTGAGACATTTGTTGCTCCTTTCACAAAGA
GAGGTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTG
CTTCCTCAACTGGCGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTTG
GTCCACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCT
TCCCAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTATGTTAATTGCTTTG
CAAGCTGCTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAATTTGCATT
CC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2CC74JQ 644 0 0
GGACTTACTTTGGCAACAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAA
ACATGGCATCGTTTGCAACCATGGCCGCCGTTCAACCATCCTCCGCTGTGAAAGGACTCG
GAGGAAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCTTCATCAAGCCCTCTCGCCAAAGCTTCAAAC
CCAAATCCACAAGAGCCGGTGACGCGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTG
ATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTT
CTCCTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTTTTTGAGACATTTGTTGCTCCTTTCACAAAGA
GAGGTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTG
CTTCCTCAACTGGCGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTTG
GTCCACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCT
TCCCAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTATGTTAATTGCTTTG
CAAGCTGCTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAA
ATTTGCATTCC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2A852TF 654 0 0
GGACTTACTTTGGCAACAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAA
ACATGGCATCGTTTGCAACCATCGCCGCCGTTCAACCATCATCCGCCGTGAAAGGACTCG
GAGGAAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCGTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAAC
CCAAATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTG
ATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGTCAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTT
CTCCTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACGAAGA
GAGGTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTCTGCTTACTTATGTCAGTG
CTTCCTCAACTGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCG
GTCCACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTCCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCT
TCCTAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTATGTTAATTGCTTTG
CAAGCTACTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAATTTGCATTTCAAGTCTGCTAC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2E532TF 639 0 0
CGGGGGACTTACTTTGG
CAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAACATGGCATCGTTTGC
AACCATCGCCGCCGTTCAACCATCATCCGCCGTGAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTCAC
CGGAGCTAAGCTCGTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAAATCCACAAGAGC
TGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATTTAGAAGATTTGGG
TAACACAACAGGTCAATGG*ATTTGTACGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCACT
TCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACGAAGAGAGGTTTGCTTCTCAA
GTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTCTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCAACTGGTGA
TGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCACGTGGCAAGCT
TTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCCCAAGTCTCTGAAC
TCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTATGTTAATTGCTTTGCAAGCTACTGAATTGT
AATGAATCAATGAAAAATTTGC

QA 18 639 18 639
DS 

RD RR2CQ38TF 639 0 0
GG
AACAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAACATGGCATCGTTT
GCAACCATCGCCGCCGTTCAACCATCATCCGCCGTGAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTC
GCCGGAGCTAAGCTCGTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCGAACCCAAATCCACAAGA
GCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATTTAGAAGATTTG
GGTAACACAACAGGTCAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCA
CTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACGAAGAGAGGTTTGCTTCTC
AAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTCTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCAACTGGT
GATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCACGTGGCAAG
CTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCCCAAGTCTCTGA
ACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTATGTTAATTGCTTTGCAAGCTACTGAATT
GTAATGAATCAATGAAAA*TTTGCATTTCAAGTCTGC

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR2FO39TF 631 0 0
GGACTTACTTTGGCAACAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAA
ACATGGCATCGTTTGCAACCATCGCCGCCGTTCAACCATCATCCGCCGTGAAAGGACTCG
GAGGAAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCGTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAAC
CCAAATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTG
ATTTAGAAGATTTGGGTAACACAACAGGTCAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTT
CTCCTTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACGAAGA
GAGGTTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTCTGCTTACTTATGTCAGTG
CTTCCTCAACTGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCG
GTCCACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCT
TCCCAAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTATGTTAATTGCTTTG
CAAGCTACTGAATTGTAATGAATCGATGAAA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2A280JQ 650 0 0
GGACTTTGGCAACAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAACAT
GGCATCGTTTGCAACCATGGCTGCCGTTCAACCATCCTCCGCTGTGAAAGGACTCGGAGG
AAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCTTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAA
ATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATTT
AGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCC
TTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTTTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGAGG
TTTGCTTTTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTCTGCTTACTTATGTCAGTGCTTC
CTCAACTGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCC
ACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCCC
AAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTATGTTAATTGCTTTGCAAG
CTACTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAATTTGCATTTCAAGTCTGCTAC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2A280TF 650 0 0
GGACTTTGGCAACAACAACAAGGAGAGAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAACAT
GGCATCGTTTGCAACCATGGCTGCCGTTCAACCATCCTCCGCTGTGAAAGGACTCGGAGG
AAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCTTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAA
ATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATTT
AGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCC
TTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTTTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGAGG
TTTGCTTTTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTCTGCTTACTTATGTCAGTGCTTC
CTCAACTGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCC
ACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCCC
AAGTCTCTGAACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTATGTTAATTGCTTTGCAAG
CTACTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAATTTGCATTTCAAGTCTGCTAC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 12

CO CL282Contig1 967 12 37 U
GGATGTAAATTAGACAAATCACCAATAACTGTCTTGATAAGAGATGTTTAACAATCTACT
AAAGAACACTAAACCAAATGAAATGAGAAGGAGAATCTTACATAACCTTAAGAAAAATCC
TAAAAAGGAAAAAAAA*TTACACACTTGATGCATCATCAAAAAA*TTATTTACACATAAA
AAGAAACACAAACACAAATAAACACACACACTC**TTATGTTAAACTCTAAATAAAGATC
AGTTACTGCAGCTAAAACCATCACCTTTCATCATCTGAAGAAACTCTTTGTAATTAACTC
TACCATCACCATCAGCATCCACTTGCATAATCATCTTCTTGCAACCTTCTAATGTCTTAC
CTTGGTTGAGTCCCAAAGAACCCATCACAGACTTCAACTCCTCCACAGTGATAAACCCAT
CACCGTCCTGGTCAAACACGTTAAACGCGTCCTTCATGTCCTCTTCCTCTGTTTCACCAT
CCTTGTGGTGCTCATCCACAATGGAGCTGTACAGCGACTCGAACTCGTCTATGTCCACGC
ATCCATCACCGTTGGCGTCGATGTTGTGGATCATCTGAGTGAGGTCTTTGTCTGGTATGT
AGATTCCAAGATTCTCTAGCGAGTCGTTGAGCTCTTCTTTGGTGATCCGACCGTCTCCGT
TCTTGTCGAATGTCTGGAAAACACGTTTCAGCTCGGAAGGATCTGTTTTTCTCGTTGGAG
CAGAAGATGGTGACGGAGAGGGTAACATGGATGAGTTCATGTGGAGAGTTTTGTCGAACC
AAGAGAGAGTGAAGAGACTTCGCAGCTTCTTTGGTACTAAAGAGAGGAGAAAAGAGTTTA
AGAGATTGTAGAGAAGGAAGATTCTCACCATAACTATTGTAATAAAACTCTGCTTTTAAG
ATATCTGGTGAAAACAGAGAGGAGATTTGAGGAAACAGAGAGCTTAGAAACAGAGCTTTT
ATGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 5 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 20 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 10 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 65 65 65 65 65 
20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 40 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 

AF RR2H462JQB U 27
AF RR2F745JQ U 1
AF RR2EO07JQ U 12
AF RR2EN62JQ U 56
AF RR2AI07JQ U 40
AF RR2BN96JQ U 50
AF RR2AI07TF C 166
AF RR2F745TF C 260
AF RR2BN96TF C 278
AF RR2EN62TF C 183
AF RR2EO07TF C 183
AF RR2GZ48TF C 314
BS 1 157 RR2F745JQ
BS 158 158 RR2H462JQB
BS 159 164 RR2F745JQ
BS 165 165 RR2H462JQB
BS 166 218 RR2F745JQ
BS 219 219 RR2EO07JQ
BS 220 295 RR2F745JQ
BS 296 296 RR2EO07JQ
BS 297 391 RR2F745JQ
BS 392 392 RR2EO07JQ
BS 393 393 RR2F745JQ
BS 394 394 RR2H462JQB
BS 395 403 RR2F745JQ
BS 404 404 RR2EO07JQ
BS 405 451 RR2F745JQ
BS 452 452 RR2EO07JQ
BS 453 471 RR2F745JQ
BS 472 472 RR2EO07JQ
BS 473 496 RR2F745JQ
BS 497 497 RR2EO07JQ
BS 498 514 RR2F745JQ
BS 515 515 RR2EO07JQ
BS 516 556 RR2F745JQ
BS 557 557 RR2EO07JQ
BS 558 646 RR2F745JQ
BS 647 647 RR2EO07JQ
BS 648 648 RR2F745JQ
BS 649 649 RR2EO07JQ
BS 650 679 RR2F745JQ
BS 680 680 RR2H462JQB
BS 681 751 RR2F745JQ
BS 752 774 RR2EO07JQ
BS 775 816 RR2AI07JQ
BS 817 817 RR2BN96JQ
BS 818 907 RR2AI07TF
BS 908 908 RR2F745TF
BS 909 967 RR2AI07TF

RD RR2H462JQB 693 0 0
AG
CTGTCTTGATAAGAGATGTTTAACAATCTACTAAAGAACACTAAACCAAATGAAATGAGA
AGGAGAATCTTACATAACCTTAAGAAAAATCCTAAAAAGGAAAAAAAA*TTACACACTTG
ATGCATCATCAAAAAA*TTATTTACACATAAAAAGAAACACAAACACAAATAAACACACA
CACTC**TTACGTTAAACTCTAAATAAAGATCAGTTACTGCAGCTAAAACCATCACCTTT
CATCATCTGAAGAAACTCTTTGTAATTGACTCTACCATCACCATCAGCATCCACTTGCAT
AATCATCTTCTTGCAACCTTCTAATGTCTTACCTTGGTTGAGTCCCAAAGAACCCATCAC
AGATTTCAACTCCTCAACAGTGATAAACCCATCACCGTCCTGGTCAAACACGTTAAACGC
GTCTTTCATGTCCTCTTCCTCTGCTTCACCATCCTTGTGGTGCTCATCGACAATGGAGCT
GTACAGAGACTCGAACTCGTCTATGTCCACGCATCCATCACCGTTGGCATCGATGTTGTG
GATCATCTGAGTGAGGTCTTTGTCTGGTATGTAGATTCCAAGATTCTCTAGCGAGTCGTT
GAGCTCTTCTTTGGTGATTCTACCGTCTCCGTTCTTGTCGAATGTCTGGAAAACACGTTT
CAGCTCGGAAGGATCTGTTTTTCTCGTTGGA

QA 3 693 3 693
DS 

RD RR2F745JQ 751 0 0
GGATGTAAATTAGACAAATCACCAATAACTGTCTTGATAAGAGATGTTTAACAATCTACT
AAAGAACACTAAACCAAATGAAATGAGAAGGAGAATCTTACATAACCTTAAGAAAAATCC
TAAAAAGGAAAAAAAA*TTACACACTTGATGCATCATTAAAAAAATTATTTACACATAAA
AAGAAACACAAACACAAATAAACACACACACTC**TTACGTTAAACTCTAAATAAAGATC
AGTTACTGCAGCTAAAACCATCACCTTTCATCATCTGAAGAAACTCTTTGTAATTGACTC
TACCATCACCATCAGCATCCACTTGCATAATCATCTTCTTGCAACCTTCTAATGTCTTAC
CTTGGTTGAGTCCCAAAGAACCCATCACAGATTCCAACTCCTCAACAGTGATAAACCCAT
CACCGTCCTGGTCAAACACGTTAAACGCGTCTTTCATGTCCTCTTCCTCTGCTTCACCAT
CCTTGTGGTGCTCATCGACAATGGAGCTGTACAGAGACTCGAACTCGTCTATGTCCACGC
ATCCATCACCGTTGGCATCGATGTTGTGGATCATCTGAGTGAGGTCTTTGTCTGGTATGT
AGATTCCAAGATTCTCTAGCGAGTCGTTGAGCTCTTCTTTGGTGATTCTACCGTCTCCGT
TCTTGTCGAATGTCTGGAAGACACGTTTCAGCTCGGAAGGATCTGTTTTTCTCGTTGGAG
CAGAAGATGGTGACGGAGAGGGTAACATGGA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2EO07JQ 763 0 0
AG
ACAAATCACTAATAACTGTCTTGATAAGAGATGTTTAACAATCTACTAAAGAACACTAAA
CCAAATGAAATGAGAAGGAGAATCTTACATAACCTTAAGAAAAATCCTAAAAAGGAAAAA
AAA*TTACACACTTGATGCATCATCAAAAAA*CTATTTACACATAAAAAGAAACACAAAC
ACAAATAAACACACACACTC**TTATGTTAAACTCTAAATAAAGATCAGTTACTGCAGCT
AAAACCATCACCTCTCATCATCTGAAGAAACTCTTTGTAATTAACTCTACCATCACCATC
AGCATCCACTTGCATAATCATCTTCTTGCAACCTTCTAATGTCTTACCTTGGTTGAGTCC
CAAAGAACCCATCACAGACTTCAACTCCTCCACAGTGATAAACCCATCACCGTCCTGGTC
AAACACGTTAAACGCGTCCTTCATGTCCTCTTCCTCTGTTTCACCATCCTTGTGGTGCTC
ATCCACAATGGAGCTGTACAGCGACTCGAACTCCTCTATGTCCACGCATCCATCACCGTT
GGCGTCGATGTTGTG*ATCATCTGAGTGAGGTCTTTGTCCGGTATGTAGATTCCAAGATT
CTCTAGCGAGTCGTTGAGCTCTTCTTTGGTGATCCGACCGTCTCCGTTCTTGTCGAAGGT
CTGGAAAACACGTTTCAGCTCGGAAGGATCTGTTTTTCTCGTTGGAGCAGAAGATGGTGA
CGGAGAGGGTAACATGGATGAGTTCATGTGGAGAGTTTTGT

QA 3 763 3 763
DS 

RD RR2EN62JQ 669 0 0
CTACTAAAGAACACTAAACCGAATGAAATGAGAAGGAGAAACTTACATAACCTTAAGAAA
AATCCTAAAAAGGAAAAAAAAATTACACACTTGATGCATCATCAAAAAA*TTATTTACAC
ATAAAAAGAAACACAAACACAAATAAACACACACACTC**TTATGTTAAACTCTAAATAA
AGATCAGTTACTGCAGCTAAAACCATCACCTTTCATCATCTGAAGAAACTCTTTGTAATT
AACTCTACCATCACCATCAGCATCCACTTGCATAATCATCTTCTTGCAACCTTCTAATGT
CTTACCTTGGTTGAGTCCCAAAGAACCCATCACAGACTTCAACTCCTCCACAGTGATAAA
CCCATCACCATCCTGGTCAAACACGTTAAACGCGTCCTTCATGTCCTCTTCTTCTGTTTC
ACCATCCTTGTGGTGCTCATCCACAATGGAGATGTACAGCGACTCGAACTCGTCTATGTC
CACGCATCCATCACCGTTGGCGTCGATGTTGTGGATCATCTGAGTTAGGTCTTTGTCTGG
TATGTAGATTCCAAGATTCTCTAGCGAGTCGTTGAGCTCTTCTTTGGTGATCCGACCGTC
TCCGTTCTTGTCGAATGTCTGGAAAACACGTTTCAGCTCGGAAGGATCTGTTTTTCTCGT
TGGAGCAGA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2AI07JQ 778 0 0
AGAGATGTTTAACAATCTACTAAAGAACACTAAACCAAATGAAATGAGAAGGAGAATCTT
ACATAACCTTAAGAAAAATCCTAAAAAGGAAAAAAAA*TTACACACTTGATGCATCATCA
AAAAA*TTATTTACACATAAAAAGAAACACAAACACAAATAAACACGCACACTC**TTAC
GTTAAACTCTAAATAAAGATCAGTTACTGCAGCTAAAACCATCACCTTTCATCATCTGAA
GAAACTCTTTGTAATTGACTCTACCATCACCATCAGCATCCACTTGCATAATCATCTTCT
TGCAACCTTCTAATGTCTTACCTTGGTTGAGTCCCAAAGAACCCATCACAGATTTCAACT
CCTCAACAGTGATAAACCCATCACCGTCCTGGTCAAACACGTTAAACGCGTCCTTCATGT
CCCCTTCCTCTGCTTCACCATCCTTGTGGTGCTCATCGACAATGGAGCTGTACAGAGACT
CGAACTCGTCTATGTCCACGCATCCATCACCGTTGGCATCGATGTTGTGGATCATCTGAG
TGAGGTCTTTGTCTGGTATGTAGATTCCAAGATTCTCTAGCGAGTCGTTGAGCTCTTCTT
TGGTGATTCTACCGTCTCCGTTCTTGTCGAATGTCTGGAAAACACGTTTCAGCTCGGAAG
GATCTGTTTTTCTCGTTGGAGCAGAAGATGGTGACGGAGAGGGTAACATGGATGAGTTCA
TGTGGAGAGTTTTGTCGAACCAAGAGAGAGTGAAGAGACTTCGCAGCTTCTTTGGTA
A

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2BN96JQ 768 0 0
AACAATCTACTAAAGAACACTAAACCAAATGAAATGAGAAGGAGAAACTTACATAACCTT
AAGAAAAATCCTAAAAAGGAAAAAAAA*TTACACACTTGATGCATCATCAAAAAA*TTAT
TTACACATAAAAAGAAACACAAACACAAATAAACACACACACACCCTTATGTTAAACTCT
AAATAAAGATCAGTTACTGCAGCTAAAACCATCACCTTTCATCATCTGAAGAAACTCTTT
GTAATTAACTCTACCATCACCATCAGCATCCACTTGCATAATCATCTTCTTGCAACCTTC
TAATGTCTTACCTTGGTTGAGTCCCAAAGAACCCATCACAGACTTCAACTCCTCCACAGT
GATAAACCCATCACCATCCTGGTCAAACACGTTAAACGCGTCCTTCATGTCCTCTTCTTC
TGTTTCACCATCCTTGTGGTGCTCATCCACAATGGAGCTGTACAGCGACTCGAACTCGTC
TATGTCCACGCATCCATCACCGTTGGCGTCGATGTTGTGGATCATCTGAGTTAGGTCTTT
GTCTGGTATGTAGATTCCAAGATTCTCTAGCGAGTCGTTGAGCTCTTCTTTGGTGATCCG
GCCGTCTCCGTTCTTGTCGAATGTCTGGAAAACACGTTTCAGCTCGGAAGGATCTGTTTT
TCTCGCTGGAGCAGAGGATGGTGACGGAGAGGGTAACATGGATGAGTTCTTGTGGAGAGT
TTTGTCGAACCAAGAGAGAGTGAAGAGACTTCGCAGCTTCTTTGGTAC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2AI07TF 802 0 0
TTATTTACACATAAAAAGAAACACAAACACAAATAAACACGCACACTC**TTACGTTAAA
CTCTAAATAAAGATCAGTTACTGCAGCTAAAACCATCACCTTTCATCATCTGAAGAAACT
CTTTGTAATTGACTCTACCATCACCATCAGCATCCACTTGCATAATCATCTTCTTGCAAC
CTTCTAATGTCTTACCTTGGTTGAGTCCCAAAGAACCCATCACAGATTTCAACTCCTCAA
CAGTGATAAACCCATCACCGTCCTGGTCAAACACGTTAAACGCGTCCTTCATGTCCCCTT
CCTCTGCTTCACCATCCTTGTGGTGCTCATCGACAATGGAGCTGTACAGAGACTCGAACT
CGTCTATGTCCACGCATCCATCACCGTTGGCATCGATGTTGTGGATCATCTGAGTGAGGT
CTTTGTCTGGTATGTAGATTCCAAGATTCTCTAGCGAGTCGTTGAGCTCTTCTTTGGTGA
TTCTACCGTCTCCGTTCTTGTCGAATGTCTGGAAAACACGTTTCAGCTCGGAAGGATCTG
TTTTTCTCGTTGGAGCAGAAGATGGTGACGGAGAGGGTAACATGGATGAGTTCATGTGGA
GAGTTTTGTCGAACCAAGAGAGAGTGAAGAGACTTCGCAGCTTCTTTGGTAATAAAGAGA
GGAGAAAAGAGTTTAAGAGATTGTAGAGAAGGAAGATTCTCACCATAACTATTGTAATAA
AACTCTGCTTTTAAGATATCTGATGAAAACAGAGAGGAGATTTGAGGAAACAGAGAGCTT
AGAAACAGAGCTTTTATGGTCC

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2F745TF 708 0 0
CATCA
CTTTCATCATCTGAAGAAACTCTTTGTAATTGACTCTACCATCACCATCAGCATCCACTT
GCATAATCATCTTCTTGCAACTTTCTAATGTCTTAC*TTGGTTGAGTCCCAAAGAACCCA
TCACAGATTCCAACTCCTCAACAGTGATAAACCCATCACCGTCCTGGTCAAACACGTTAA
ACGCGTCTTTCATGTCCTCTTCCTCTGCTTCACCATCCTTGTGGTGCTCATCGACAATGG
AGCTGTACAGAGACTCGAACTCGTCTATGTCCACGCATCCATCACCGTTGGCATCGATGT
TGTGGATCATCTGAGTGAGGTCTTTGTCTGGTATGTAGATTCCAAGATTCTCTAGCGAGT
CGTTGAGCTCTTCTTTGGTGATTCTACCGTCTCCGTTCTTGTCGAATGTCTGGAAGACAC
GTTTCAGCTCGGAAGGATCTGTTTTTCTCGTTGGAGCAGAAGATGGTGACGGAGAGGGTA
ACATGGATGAGTTCATGTGGAGAGTTTTGTCGAACCAAGAGAGAGTGAAGAGACTTCGCA
GCTTCTTTGGTACTAAAGAGAGGAGAAAAGAGTTTAAGAGATTGTAGAGAAGGAAGATTC
TCACCATAACTATTGTAATAAAACTCTGCTTTTAAGATATCTGGTGAAAACAGAGAGGAG
ATTTGAGGAAACAGAGAGCTTAGAAACAGAGCTTTTATGGTCC

QA 6 708 6 708
DS 

RD RR2BN96TF 690 0 0
AAGAAACTCTTTGTAATTAACTCTACCATCACCATCAGCATCCACTTGCATAATCATCTT
CTTGCAACTTTCTAATGTCTTACCTTGGTTGAGTCCCAAAGAACCCATCACAGACTTCAA
CTCCTCCACAGTGATAAACCCATCACCATCCTGGTCAAACACGTTAAACGCGTCCTTCAT
GTCCTCTTCTTCTGTTTCACCATCCTTGTGGTGCTCATCCACAATGGAGCTGTACAGCGA
CTCGAACTCGTCTATGTCCACGCATCCATCACCGTTGGCGTCGATGTTGTGGATCATCTG
AGTTAGGTCTTTGTCTGGTATGTAGATTCCAAGATTCTCTAGCGAGTCGTTGAGCTCTTC
TTTGGTGATCCGGCCGTCTCCGTTCTTGTCGAATGTCTGGAAAACACGTTTCAGCTCGGA
AGGATCTGTTTTTCTCGCTGGAGCAGAGGATGGTGACGGAGAGGGTAACATGGATGAGTT
CTTGTGGAGAGTTTTGTCGAACCAAGAGAGAGTGAAGAGACTTCGCAGCTTCTTTGGTAC
TAAGGAGAGGAGAAAAGAGTTTAAGAGATTGTAGAGAAGGAAGATTCTCACCATAACTAT
TGCAATAAAACTCTGCTTTTAAGATATCTGGTGAAAACAGAGAGGAGATTTGAGGAAACA
GAGAGCTTAGAAACAGAGCTTTTATGGTCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2EN62TF 785 0 0
GAAACACAAACACAAATAAACACACACACTC**TTATGTTAA*CTCTAAATAAAGATCAG
TTACTGCAGCTAAAACCATCAC*TTTCATCATCTGAAGAAACTCTTTGTAATTAACTCTA
CCATCACCATCAGCATCCACTTGCATAATCATCTTCTTGCAACTTTCTAATGTCTTACCT
TGGTTGAGTCCCAAAGAACCCATCACAGACTTCAACTCCTCCACAGTGATAAACCCATCA
CCATCCTGGTCAAACACGTTAAACGCGTCCTTCATGTCCTCTTCTTCTGTTTCACCATCC
TTGTGGTGCTCATCCACAATGGAGATGTACAGCGACTCGAACTCGTCTATGTCCACGCAT
CCATCACCGTTGGCGTCGATGTTGTGGATCATCTGAGTTAGGTCTTTGTCTGGTATGTAG
ATTCCAAGATTCTCTAGCGAGTCGTTGAGCTCTTCTTTGGTGATCCGACCGTCTCCGTTC
TTGTCGAATGTCTGGAAAACACGTTTCAGCTCGGAAGGATCTGTTTTTCTCGTTGGAGCA
GAGGATGGTGACGGAGAGGGTAACATGGATGAGTTATTGTGGAGAGTTTTGTCGAACCAA
GAGAGAGTGAAGAGACTTCGCAGCTTCTTTGGTACTAAGGAGAGGAGAAAAGAGTTTAAG
AGATTGTAGAGAAGGAAGATTCTCACCATAACTATTGTAATAAAACTCTGCTTTTAAGAT
ATCTGGTGAAAACAGAGAGGAGATTTGAGGAAACAGAGAGCTTAGAAACAGAGCTTTTAT
GGTCC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2EO07TF 785 0 0
GAAACACAAACACAAATAAACACACACACTC**TTATGTTAA*CTCTAAATAAAGATCAG
T*ACTGCAGCTAAAACCATCACCTCTCATCATCTGAAGAAACTCTTTGTAAT*AACTCTA
CCATCACCATCAGCATCCACTTGCATAATCATCTTCTTGCAACCTTCTAATGTCTTACCT
TGGTTGAGTCCCAAAGAACCCATCACAGACTTCAACTCCTCCACAGTGATAAACCCATCA
CCGTCCTGGTCAAACACGTTAAACGCGTCCTTCATGTCCTCTTCCTCTGTTTCACCATCC
TTGTGGTGCTCATCCACAATGGAGCTGTACAGCGACTCGAACTCCTCTATGTCCACGCAT
CCATCACCGTTGGCGTCGATGTTGTG*ATCATCTGAGTGAGGTCTTTGTCCGGTATGTAG
ATTCCAAGATTCTCTAGCGAGTCGTTGAGCTCTTCTTTGGTGATCCGACCGTCTCCGTTC
TTGTCGAAGGTCTGGAAAACACGTTTCAGCTCGGAAGGATCTGTTTTTCTCGTTGGAGCA
GAAGATGGTGACGGAGAGGGTAACATGGATGAGTTCATGTGGAGAGTTTTGTCGAACCAA
GAGAGAGTGAAGAGACTTCGCAGCTTCTTTGGTACTAAAGAGAGGAGAAAAGAGTTTAAG
AGATTGTAGAGAAGGAAGATTCTCACCATAACTATTGTAATAAAACTCTGCTTTTAAGAT
ATCTGGTGAAAACAGAGAGGAGATTTGAGGAAACAGAGAGCTTAGAAACAGAGCTTTTAT
GGTCC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2GZ48TF 654 0 0
AGCATCCACTTGCATAATCATCTTCTTGCAAC*TTCTAATGTCTTACTTTGGTTGAGTCC
CAAAGAACCCATCACAGACTTCAACTCCTCCACAGTGATAAACCCATCACCGTCCTGGTC
AAACACGTTAAACGCGTCCTTCATGTCCTCTTCCTCTGTTTCACCATCCTTGTGGTGCTC
ATCCACAATGGAGCTGTACAGCGACTCGAACTCCTCTATGTCCACGCATCCATCACCGTT
GGCGTCGATGTTGTGGATCATCTGAGTGAGGTCTTTGTCCGGTATGTAGATTCCAAGATT
CTCTAGCGAGTCGTTGAGCTCTTCTTTGGTGATCCGACCGTCTCCGTTCTTGTCGAAGGT
CTGGAAAACACGTTTCAGCTCGGAAGGATCTGTTTTTCTCGTTGGAGCAGAAGATGGTGA
CGGAGAGGGTAACATGGATGAGTTCATGTGGAGAGTTTTGTCGAACCAAGAGAGAGTGAA
GAGACTTCGCAGCTTCTTTGGTACTAAAGAGAGGAGAAAAGAGTTTAAGAGATTGTAGAG
AAGGAAGATTCTCACCATAACTATTGTAATAAAACTCTGCTTTTAAGATATCTGGTGAAA
ACAGAGAGGAGATTTGAGGAAACAGAGAGCTTAGAAACAGAGCTTTTATGGTCC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 14

CO CL283Contig1 895 14 27 U
GGGGATTCCGAAACTCTTATCCTTCTGCAAACAGTAGGGAGCAAAAAAGTCTCATGATGG
CTACCACGTCATCATCTCCGCCGTGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTC
CTTGCACCACAGTTCAGTTCTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAA
CGGTAACCCGGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGAGACTGGGGGGCTCGAGACCCTT
ACCCGGAGGAGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGC
ACAAGATTCTGATTCCTAATGCCTCTGCTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTG
TGTCGCCTTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCT
TGGGGTGGAGTATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGG
TGAGGGATTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTT
CTGGTCATTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAGCTATCTA
CCTCTTCCATTGGTGGGCTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACA
TCAAGACTTCTGATCTTTCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTCTT
TTTTTTTGCTTATCTCATATTTGTGATATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATG
TATTCGTTGGTCTTTATGTTAAGTTATATAGAAACTATGTATTATTCATAATCATATTGG
AAAGCATTTTTTTAGCACAAAACACTACGATCATGTAATTCATAAGACATACATT


BQ
10 30 35 35 35 35 35 35 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 10 10 10 10 10 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 5 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 0 70 70 70 70 70 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 5 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 
70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 0 5 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 30 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP16TF U 8
AF RR2GG65TF U 8
AF RR2AK33TF U 1
AF RR2DE08TF U 3
AF RR2DK81TF U 8
AF RR2B790TF U 2
AF RR2E586TF U 2
AF RR2B790JQ C 2
AF RR2A535TF U 2
AF RR2AK33JQ C 116
AF RR2CP16JQ C 127
AF RR2GG65JQB C 334
AF RR2DK81JQ C 244
AF RR2E586JQ C 132
BS 1 8 RR2AK33TF
BS 9 9 RR2B790TF
BS 10 33 RR2AK33TF
BS 34 38 RR2GG65TF
BS 39 46 RR2AK33TF
BS 47 47 RR2GG65TF
BS 48 54 RR2AK33TF
BS 55 55 RR2GG65TF
BS 56 66 RR2AK33TF
BS 67 67 RR2GG65TF
BS 68 361 RR2AK33TF
BS 362 362 RR2GG65TF
BS 363 681 RR2AK33TF
BS 682 710 RR2E586TF
BS 711 711 RR2A535TF
BS 712 717 RR2E586TF
BS 718 718 RR2A535TF
BS 719 719 RR2E586TF
BS 720 720 RR2A535TF
BS 721 730 RR2E586TF
BS 731 731 RR2A535TF
BS 732 753 RR2E586TF
BS 754 783 RR2A535TF
BS 784 811 RR2B790JQ
BS 812 833 RR2AK33JQ
BS 834 856 RR2CP16JQ
BS 857 895 RR2E586JQ

RD RR2CP16TF 284 0 0
GG
GAAACTCTTATCCTTCTGCAAACA*****GAGCAAAACAGTCTCACGATGGCTACCACGT
CATCATCTCCGCCGTGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCCTTGCACCA
CAGTTCAGTTCTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTAACCC
GGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGAGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTACCCGGAGG
AGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAA

QA 3 284 3 284
DS 

RD RR2GG65TF 517 0 0
GG
GAAACTCTTATCCTTCTGCAAACAGTAGGGAGCAAAAAAGTCTCATGATGGCTACCACGT
CATCATCTCCGCCGTGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCCTTGCACCA
CTGTTCAGTTCTTTGGTTTCTCACGGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTAACCC
GGAACAATCTGGCGCGGGATTTTCTCGGGGACTGGGGAGCTCGAGACCCTTACCCGGAGG
AGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAGATTC
TGATTCCTAATGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTGTCGCCTT
CTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGA
GTATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATT
TTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCAT

QA 3 517 3 517
DS 

RD RR2AK33TF 681 0 0
GGGGATTCTGAAACTCTTATCCTTCTGCAAACA*****GAGCAAAACAGTCTCACGATGG
CTACCATGTCATCATCTCCGCCGTGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTC
CTTGCACCACAGTTCAGTTCTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAA
CGGTAACCCGGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGAGACTGGGGGGCTCGAGACCCTT
ACCCGGAGGAGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGC
ACAAGATTCTGATTCCTAATGCCTCTGCTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTG
TTTCGCCTTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCT
TGGGGTGGAGTATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGG
TGAGGGATTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTT
CTGGTCATTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAGCTATCTA
CCTCTTCCATTGGTGGGCTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACA
TCAAGACTTCTGATCTTTCCC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2DE08TF 701 0 0
GGATTCTGAAACTCTTATCCTTCTGCAAACA*****GAGCAAAACAGTCTCACGATGGCT
ACCACGTCATCATCTCCGCCGTGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCCT
TGCACCACAGTTCAGTTCTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACG
GTAACCCGGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGAGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTAC
CCGGAGGAGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCAC
AAGATTCTGATTCCTAATGCCTCTGCTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTT
TCGCCTTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTG
GGGTGGAGTATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTG
AGGGATTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCT
GGTCATTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAGCTATCTACC
TCTTCCATTGGTGGGCTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATC
AAGACTTCTGATCTTTCCCCTAG*AAAAGAGCTTGGGCGTA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2DK81TF 671 0 0
GG
GAAACTCTTATCCTTCTGCAAACAGTAGGGAGCAAAAAAGTCTCATGATGGCTACCACGT
CATCATCTCCGCCGTGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCCTTGCACCA
CTGTTCAGTTCTTTGGTTTCTCACGGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTAACCC
GGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGGGACTGGGGAGCTCGAGACCCTTACCCGGAGG
AGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAGATTC
TGATTCCTAATGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTGTCGCCTT
CTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGA
GCATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATT
TTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGTCATT
ACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAGCTATCTACCTCTTCCA
TTGGTGGGCTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGACTT
CTGATCTTT

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR2B790TF 680 0 0
GGGATTCCGAAACTCTTATCCTTCTGCAAACAGTAGGGAGCAAAAAAGTCTCATGATGGC
TACCACGTCATCATCTCCGCCGTGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCC
TTGCACCACTGTTCAGTTCTTTGGTTTCTCACGGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAAC
GGTAACCCGGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGGGACTGGGGAGCTCGAGACCCTTA
CCCGGAGGAGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCA
CAAGATTCTGATTCCTAATGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGT
GTCGCCTTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTT
GGGGTGGAGTATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGT
GAGGGATTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTACTGAAGCTTC
TGGTCATTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAGCTATCTAC
CTCTTCCATTGGTGGGCTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACAT
CAAGACTTCTGATCTTTCCC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2E586TF 752 0 0
GGGATTCTGAAACTCTTATCCTTCTGCAAACA*****GAGCAAAACAGTCTCACGATGGC
TACCACGTCATCATCTCCGCCGTGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCC
TTGCACCACAGTTCAGTTCTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAAC
GGTAACCCGGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGAGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTA
CCTGGAGGAGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCA
CAAGATTCTGATTCCTAATGCCTCTGCTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGT
TTCGCCTTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTT
GGGGTGGAGTATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAGGGT
GAGGGATTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTC
TGGTCATTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAGCTATCTAC
CTCTTCCATTGGTGGGCTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACAT
CAAGACTTCTGATCTTTCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACT*GTTCTT*TCT
TTTTTTGCT*ATCTCATATTTGTGATATTTTT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2B790JQ 811 0 0
GGGATTCCGAAACTCTTATCCTTCTGCAAACAGTAGGGAGCAAAAAAGTCTCATGATGGC
TACCACGTCATCATCTCCGCCGTGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCC
TTGCACCACTGTTCAGTTCTTTGGTTTCTCACGGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAAC
GGTAACCCGGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGGGACTGGGGAGCTCGAGACCCTTA
CCCGGAGGAGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCA
CAAGATTCTGATTCCTAATGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGT
GTCGCCTTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTT
GGGGTGGAGTATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGT
GAGGGATTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTACTGAAGCTTC
TGGTCATTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAGCTATCTAC
CTCTTCCATTGGTGGGCTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACAT
CAAGACTTCTGATCTTTCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTCTTT
TTTTTTGCTTATCTCATATTTGTGATATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATGT
ATTCGTTGGTCTTTATGTTAAGTTATATAG
G

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR2A535TF 782 0 0
GGGATTCC
GAAACTCTTATCCTTCTGCAAATAGTAGGGAGCAAAAAAGTCTCATGATGGCTACCATGT
CATCATCTCCGCCGTGTTATGTCTCCGTCTCATTCCTCCGTCAACTTCCTCCTTGCACCA
CTGTTCAGTTCTTTGGTTTCTCACGGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTAACCC
GGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGGGACTGGGGAGCTCGAGACCCTTACCCGGAGG
AGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAGATTC
TGATTCCTAATGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTGTCGCCTT
CTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGA
GTATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATT
TTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGTCATT
ACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAGCTATCTACCTCTTCCA
TTGGTGGGCTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGACTT
CTGATCTTTCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTCTTTTTTTTTGC
TTATCTCATATTTGTGATATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATGTAT

QA 9 782 9 782
DS 

RD RR2AK33JQ 718 0 0
TCCTCCTTGCACCACAGTTCAGTTCTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGG
GTTAACGGTAACCCGGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGAGACTGGGGGGCTCGAGA
CCCTTACCCGGAGGAGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCAC
TGAGCACAAGATTCTGATTCCTAATGCCTCTGCTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTC
CCCTGTTTCGCCTTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAA
GGTCTTGGGGTGGAGTATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTG
GAAGGTGAGGGATTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGA
AGCTTCTGGTCATTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAGCT
ATCTACCTCTTCCATTGGTGGGCTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGA
TGACATCAAGACTTCTGATCTTTCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTC
TTTCTTTTTTTTGCTTATCTCATATTTGTGATATTTTTGTATGATAACATATAATACACG
TGATGTATTCGTTGGTCTTTATGTTAAGTTATATAGAAACTATGTATTATTCATAATC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2CP16JQ 733 0 0
CCACAGTTCAGTTCTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTAA
CCCGGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGAGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTACCCGG
AGGAGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAGA
TTCTGATTCCTAATGCCTCTGCTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTTTCGC
CTTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGT
GGAGTATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGCCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGG
ATTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGTC
ATTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAGCTATCTACCTCTT
CCATTGGTGGGCTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGA
CTTCTGATCTTTCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTTCTTTTTTT
TGCTTATCTCATATTTGTGATATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATGCATTCG
TTGGTCTTTATGTTAAGTTATATAGAAACTATGTATTATTCATAATCATATTGGAAAGCA
TTTTTTTAGC
CCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2GG65JQB 525 0 0
CCCTTTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTGTCGCCTTTTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATG
ATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGAGTATAATGGAGGATGAAGCGGGTG
GTTTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATTTTGGGTGGGGCGTTGAACTCATTA
ACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTTTGGTCATTACCCTTCTTTCCATTTGGAAAGTC
CTACCCAAGTTAGAGCTGAGCTATTTACCTTTTCCATTGGTGGGCTGAGTATGAACGATT
TCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGACTTTTGATCTTTCCCCTAGGAAAAGAG
CTTGGGGGTAACAAACTTGTT*TTTCTTTTTTTTGCTTATTTCATATTTGTGATATTTTT
GTATGATAACATATAATACACGTGATGTATTCGTTGGTCTTTATGTTAAGTTATATAGAA
ACTATGTATTATTCATAATCATATTGGAAAGCATTTTTTTAGC
AC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2DK81JQ 613 0 0
CGGAGGAGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACA
AGATTCTGATTCCTAATGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTGT
CGCCTTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGG
GGTGGAGCATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGA
GGGATTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTG
GTCATTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAGCTATCTACCT
CTTCCATTGGTGGGCTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCA
AGACTTCTGATCTTTCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTCTTTTT
TTTTGCTTATCTCATATTTGTGATATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATGTAT
TCGTTGGTCTTTATGTTAAGTTATATAGAAACTATGTATTATTCATAATCATATTGGAAA
GCATTTTTTTAGC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2E586JQ 764 0 0
GTTCAGTTCTTCGGTTTCTCACCGACCCAGCGTAAACTGGGTGGGTTAACGGTAACCCGG
AACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGAGACTGGGGGGCTCGAGACCCTTACCTGGAGGAG
ATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACAAGATTCTG
ATTCCTAATGCCTCTGCTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTTTCGCCTTCT
CAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGAGT
ATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAGGGTGAGGGATTTT
GGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGTCATTAC
CCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAGCTATCTACCTCTTCCATT
GGTGGGCTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGACTTCT
GATCTTTCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTTCTTTTTTTTGCTT
ATCTCATATTTGTGATATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATGTGTTCGTTGGT
CTTTATGTTAAGTTATATAGAAACTATGTATTATTCATAATCATATTGGAAAGCATTTTT
TTAGCACAAAACACTACGATCATGTAATTCATAAGACATACATT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 13

CO CL284Contig1 878 13 28 U
GGATCAAAGAAAGGTAGAAGACATTTCTCTCGTCTCGGCCGCAGGAGAAAGGAAGGAAGC
AACTTCTGAGGTGAAGGAATGAAGCACAACAATGTCATCCCGAATGGTCACTTCAAGAAG
CACTGGCAGAACTATGTCAAGACTTGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGA
GCTGCGAGGCAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACTTCTGGACCTCTCCGT
CCTGTTGTGCACGGTCAGACACTCAAGTACAACATGAAGGTCAGAACCGGTAAAGGGTTC
ACTCTTGAAGAGCTCAAGGCTGCTGGAATCCCCAAGAAGTTGGCACCAACCATCGGTATT
TCTGTTGACCATCGCCGCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAATCCAATGTCCAGAGG
CTGAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCT
GGTGATTCTACTCCAGAGGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAGGGTGACTACATGCCA
ATTGTCCGTGAGAAGCCTGCAACGGAGCTTGTGAAGCTTACCGCTGAGATGAAATCGTTC
AAGGCTTATGACAAGATTCGTCTGGAGCGCACTAACCAGAGACATGCAGGTGCTAGAGCC
AAGAGAGCTGCCGATGCTGAGAAAGAGGAGAAGAAGTGAGGAGATCCTTCCTCTTTATCT
TGCCTTCATCGTTTTGATCTTAATCTTTGTGTATCAGACTCTGTTTTTGTTATCCTTGAA
AGATTTTGCTGCTACTTGCTTTTGAATTTTATGGAAAAGATCATTTCACACATGTCTCTA
CTTCCTAGAAGTTTATTGTAAGATTGAGATATCAGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 15 50 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 40 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 55 70 70 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 35 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 40 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 35 35 65 65 65 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
15 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ59TF U 17
AF RR2CB83TF U 1
AF RR2A894JQ C 69
AF RR2D758TF U 15
AF RR2F580TF U 17
AF RR2C719JQ C 437
AF RR2C719TF U 15
AF RR2A894TF U 17
AF RR2A494TF U 29
AF RR2A494JQ C 47
AF RR2EJ59JQ C 105
AF RR2F580JQ C 162
AF RR2D758JQ C 162
BS 1 188 RR2CB83TF
BS 189 189 RR2C719TF
BS 190 306 RR2CB83TF
BS 307 307 RR2C719TF
BS 308 343 RR2CB83TF
BS 344 344 RR2C719TF
BS 345 554 RR2CB83TF
BS 555 555 RR2C719TF
BS 556 645 RR2CB83TF
BS 646 648 RR2C719TF
BS 649 649 RR2A894TF
BS 650 694 RR2C719TF
BS 695 695 RR2A894TF
BS 696 720 RR2C719TF
BS 721 721 RR2A894TF
BS 722 734 RR2C719TF
BS 735 735 RR2A894TF
BS 736 770 RR2C719TF
BS 771 771 RR2A894TF
BS 772 780 RR2C719TF
BS 781 781 RR2A894TF
BS 782 786 RR2C719TF
BS 787 787 RR2A894TF
BS 788 800 RR2C719TF
BS 801 828 RR2A894TF
BS 829 829 RR2A494JQ
BS 830 831 RR2EJ59JQ
BS 832 878 RR2D758JQ

RD RR2EJ59TF 330 0 0
GG
AGACATTTCTCTCGTCTCGGCCGCAGGAGAAAGGAAGGAAGCAACTTCTGAGGTGAAGGA
ATGAAGCACAACAATGTCATCCCGAATGGTCACTTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATGTC
AAGACTTGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAGCTGCGAGGCAAAAGAAG
GCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACTTCTGGACCTCTCCGTCCTGTTGTGCACGGTCAG
ACACTCAAGTACAACATGAAGGTCAGAACCGGTAAAGGGTTCACTCTTGAAGAGCTCAAG
GCTGCTGGAATCCCCAAGAAGTTGGCAC

QA 3 330 3 330
DS 

RD RR2CB83TF 645 0 0
GGATCAAAGAAAGGTAGAAGACATTTCTCTCGTCTCGGCCGCAGGAGAAAGGAAGGAAGC
AACTTCTGAGGTGAAGGAATGAAGCACAACAATGTCATCCCGAATGGTCACTTCAAGAAG
CACTGGCAGAACTATGTCAAGACTTGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGA
GCTGCGAGTCAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACTTCTGGACCTCTCCGT
CCTGTTGTGCACGGTCAGACACTCAAGTACAACATGAAGGTCAGAACCGGTAAAGGGTTC
ACTCTTTAAGAGCTCAAGGCTGCTGGAATCCCCAAGAAGTTGGTACCAACCATCGGTATT
TCTGTTGACCATCGCCGCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAATCCAATGTCCAGAGG
CTGAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCT
GGTGATTCTACTCCAGAGGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAGGGTGACTACATGCCA
ATTGTCCGTGAGAATCCTGCAACGGAGCTTGTGAAGCTTACCGCTGAGATGAAATCGTTC
AAGGCTTATGACAAGATTCGTCTGGAGCGCACTAACCAGAGACAT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2A894JQ 556 0 0
AGGTGAAGGAATGAAGCACAACAATGTCATCCCGAATGGTCACTTCAAGAAGCACTGGCA
GAACTATGTCAAGACTTGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAGCTGCGAG
GCAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACTTCTGGACCTCTCCGTCCTGTTGT
GCACAGTCAGACACTCAAGTACAACATGAAGGTCAGAACCGGTAAAGGGTTCACTCTTGA
AGAGCTCAAGGCTGCTGGAATCCCCAAGAAGTTGGCACCAACCATCGGTATTTCTGTTGA
CCATCGCCGCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAATCCAATGTCCAGAGGCTGAAAAC
CTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTC
TACTCCAGAGGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAGGGTGACTACATGCCAATTGTCCG
TGAGAAGCCTGCAACGGAGCTTGTGAAGCTTACCGCTGAGATGAAATCGTTCAAGGCTTA
TGACAAGATTCGTCTG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2D758TF 677 0 0
GG
GAAGACATTTCTCTCGTCTCGGCCGCAGGAGGAAGGAAGGAAGCAACTTCTGAGGTGAAG
*AATGAAGCACAACAATGTCATCCCGAATGGTCACTTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATG
TCAAGACTTGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAGTTGCGAGGCAAAAGA
AGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACTTCTGGACCTCTCCGTCCTGTTGTGCACGGTC
AGACCCTCAAGTACAACATGAAGGTCCGAACCGGTAAAGGCTTCACTCTTGAAGAGCTCA
AGGCTGCTGGAATCCCCAAGAAGCTGGCACCAACCATTGGCATTTCTGTTGACCATCGCC
GCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAATCCAATGTCCAGAGGCTGAAAACCTACAAGG
CTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCTACTCCAG
AAGAGTTGTCCAATGCCACTCAAGTCCAGGGTGACTACATGCCTATTGTCCGTGAGAAGC
CTGCAACGGAGCTTGTGAAGCTTACCGCTGAGATGAGATCGTTCAAGGCTTATGACAAGA
TTCGTCTGGAGCGCACTAACAAGAGGCATGCACGTGCTAGAGCCAAGAGAGCTGCTGATG
CTGAGAAAGAGGAGA

QA 3 677 3 677
DS 

RD RR2F580TF 666 0 0
GG
AGACATTTCCCTCGTCTCGGCCGCAGGAGAAAGGAAGGAAGCAACTTCTGAGGTGAAGGA
ATGAAGCACAACAATGTCATCCCGAATGGTCACTTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATGTC
AAGACTTGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAGCTGCGAGGCAAAAGAAG
GCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACTTCTGGACCTCTCCGTCCTGTTGTGCACGGTCAG
ACACTCAAGTACAACATGAAGGTCAGAACCGGTAAAGGGTTCACTCTTGAAGAGCTCAAG
GCTGCTGGAATCCCCAAGAAGTTGGCACCAACCATCGGTATTTCTGTTGACCATCGCCGC
AAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAATCCAATGTCCAGAGGCTGAAAACCTACAAGGCT
AAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCTACTCCAGAG
GAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAGGGTGACTACACGCCAATTGTCCGTGAGAAGCCT
GCAACGGAGCTTGTGAAGCTTACCGCTGAGATGAAATCGTTCAAG*CTTATGACAAGATT
CGTCTGGAGCGCACTAACCAGATACATGCA*GTGCTAGAGCCAAGAGAGCTGCCGATGCT
GAGA

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR2C719JQ 250 0 0
CTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCTACTCCAG
AGGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAGGGTGACTACATGCCAATTGTCCGTGAGAAGC
CTGCAACGGAGCTTGTGAAGCTTACCGCTGAGATGAAATCGTTCAAGGCTTATGACAAGA
TTCGTCTGGAGCGCACTAACCAGAGACATGCAGGTGCTAGAGCCAAGAGAGCTGCCGATG
CTGAGAAAGA

QA 1 250 1 250
DS 

RD RR2C719TF 786 0 0
GG
GAAGACATTTCTCTCGTCTCGGCCGCAGGAGAAAGGAAGGAAGCAACTTCTGAGGTGAAG
GAATGAATCACAACAATGTCATCCCGAATGGTCACTTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATG
TCAAGACTTGGTTCAACCAGCCTGTCAGGAAAACCAGAAGAAGAGCTGCGAGGCAAAAGA
AGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACTTCTGGACCTCTCCGTCCTGTTGTGCACGGTC
AGACACTCAAGTACAACATGAAGGTCAGAACCGGTAAAGGGTTCACTCTTGAAGAGCTCA
AGGCTGCTGGAATCCCCAAGAAGTTGGCACCAACCATTGGTATTTCTGTTGACCATCGCC
GCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAATCCAATGTCCAGAGGCTGAAAACCTACAAGG
CTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCTACTCCAG
AGGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAGGGTGACTACATGCCAATTGTCCGTGAGAAGC
CTGCAACGGAGCTTGTGAAGCTTACCGCTGAGATGAAATCGTTCAAG*CTTATGACAAGA
TTCGTCTGGAGCGCACTAACCAGAGACATGCA*GTGCTAGAGCCAAGAGAGCTGCCGATG
CTGAGAAAGAGGAGAAGA*GTGAGGAGATCCTTCCTCTTTATCT*GCCTTCATCGTTT*G
ATCTTAATCTTTGTGTATCAGACTCTGTTTTTGT*ATCCTTGAA*GATTT*GCTGCTACT
TGCT

QA 3 786 3 786
DS 

RD RR2A894TF 812 0 0
GAAGACATTTCTCTCGTCTCGGCCGCAGGAGAAAGGAAGGAAGCAACTTCTGAGGTGAAG
GAATGAAGCACAACAATGTCATCCCGAATGGTCACTTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATG
TCAAGACTTGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAGCTGCGAGGCAAAAGA
AGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACTTCTGGACCTCTCCGTCCTGTTGTGCACAGTC
AGACACTCAAGTACAACATGAAGGTCAGAACCGGTAAAGGGTTCACTCTTGAAGAGCTCA
AGGCTGCTGGAATCCCCAAGAAGTTGGCACCAACCATCGGTATTTCTGTTGACCATCGCC
GCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAATCCAATGTCCAGAGGCTGAAAACCTACAAGG
CTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCTACTCCAG
AGGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAGGGTGACTACATGCCAATTGTCCGTGAGAAGC
CTGCAACGGAGCTTGTGAAGCTTACCGCTGAGATGAAATCGTTCAAGGCTTATGACAAGA
TTCGTCTGGAGCGCACTAACCAGAGACATGCAGGTGCTAGAGCCAAGAGAGCTGCCGATG
CTGAGAAAGAGGAGAAGAAGTGAGGAGATCCTTCCTCTTTATCTTGCCTTCATCGTTTTG
ATCTTAATCTTTGTGTATCAGACTCTGTTTTTGTTATCCTTGAAAGATTTTGCTGCTACT
TGCTTTTGAATTTTATGGAAAAGATCATTTCA

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR2A494TF 757 0 0
GGG
GTCTCGGCCGCAGGAGAAAGGAAGGAAGCAACTTCCGAGGTGAAGGAATGAAGCACAACA
ATGTCATCCCGAATGGTCACTTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATGTCAAGACTTGGTTCA
ACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAGCTGCGAGGCAAAAGAAGGCTGTGAAGATCT
TCCCCCGTCCCACTTCTGGACCTCTCCGTCCTGTTGTGCACGGTCAGACACTCAAGTACA
ACATGAAGGTCAGAACCGGTAAAGGGTTCACTCTTGAAGAGCTCAAGGCTGCTGGAATCC
CCAAGAAGTTGGCACCAACCATCGGTATTTCTGTTGACCATCGCCGCAAGAACAGATCTC
TCGAGGGTCTTCAATCCAATGTCCAGAGGCTGAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCT
TCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCTACTCCAGAGGAGTTGGCCAATG
CCCCTCAAGTCCAGGGTGACTACATGCCAATTGTCCGTGAGAAGCCTGCAACGGAGCTTG
TGAAGCTTACCGCTGAGATGAAATCGTTCAAGGCTTATGACAAGATTCGTCTGGAGCGCA
CTAACCAGAGACATGCAGGTGCTAGAGCCAAGAGAGCTGCCGATGCTGAGAAAGAGGAGA
AGAAGTGAGGAGATCCTTCCTCTTTATCTTGCCTTCATCGTTTTGATCTTAATCTTTGTG
TATCAGACTCTGTTTTTGTTATCCTTGAAAGATT

QA 4 757 4 757
DS 

RD RR2A494JQ 785 0 0
GAAAGGAAGGAAGCAACTTCCGAGGTGAAGGAATGAAGCACAACAATGTCATCCCGAATG
GTCACTTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATGTCAAGACTTGGTTCAACCAGCCTGCCAGGA
AAACCAGAAGAAGAGCTGCGAGGCAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACTT
CTGGACCTCTCCGTCCTGTTGTGCACGGTCAGACACTCAAGTACAACATGAAGGTCAGAA
CCGGTAAAGGGTTCACTCTTGAAGAGCTCAAGGCTGCTGGAATCCCCAAGAAGTTGGCAC
CAACCATCGGTATTTCTGTTGACCATCGCCGCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAAT
CCAATGTCCAGAGGCTGAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCA
GGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCTACTCCAGAGGAGTTGGCCAATGCCCCTCAAGTCCAGG
GTGACTACATGCCAATTGTCCGTGAGAAGCCTGCAACGGAGCTTGTGAAGCTTACCGCTG
AGATGAAATCGTTCAAGGCTTATGACAAGATTCGTCTGGAGCGCACTAACCAGAGACATG
CAGGTGCTAGAGCCAAGAGAGCTGCCGATGCTGAGAAAGAGGAGAAGAAGTGAGGAGATC
CTTCCTCTTTATCTTGCCTTCATCGTTTTGATCTTAATCTTTGTGTATCAGACTCTGTTT
TTGTTATCCTTGAAAGATTTTGCTGCTACTTGCTTTCGAATTTTATGGAAAAGATCATTT
CAC
GC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2EJ59JQ 727 0 0
TGGTCACTTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATGTCAAGACTTGGTTCAACCAGC*TGCCAG
GAAAACCAGAAGAAGAGCTGCGAGGCAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCAC
TTCTGGACCTCTCCGTCCTGTTGTGCACGGTCAGACACTCAAGTACAACATGAAGGTCAG
AACCGGTAAAGGGTTCACTCTTGAAGAGCTCAAGGCTGCTGGAATCCCCAAGAAGTTGGC
ACCAACCATCGGTATTTCTGTTGACCATCGCCGCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTCCA
ATCCAATGTCCAGAGGCTGAAAACCTAAAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGC
CAGGAAGGTCGAGGCTGGTGATTCTACTCCAGAGGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCA
GGGTGACTACATGCCAATTGTCCGTGAGAAGCCTGCAACGGAGCTTGTGAAGCTTACCGC
TGAGATGAAATCGTTCAAGGCTTATGACAAGATTCGTCTGGAGCGCACTAACCAGAGACA
TGCAGGTGCTAGAGCCAAGAGAGCTGCCGATGCTGAGAAAGAGGAGAAGAAGTGAGGAGA
TCCTTCCTCTTTATCTTGCCTTCATCGTTTTGATCTTAATCTTTGTGTATCAGACTCTGT
TTTTGTTATCCTTGAAAGATTTTGCTGCTACTTGCTTTTGAATTTTATGGAAAAGATCAT
TTCACAC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2F580JQ 670 0 0
CAGGAAAACCAGAAGAAGAGCTGCGAGGCAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCC
CACTTCTGGACCTCTCCGTCCTGTTGTGCACGGTCAGACACTCAAGTACAACATGAAGGT
CAGAACCGGTAAAGGGTTCACTCTTGAAGAGCTCAAGGCTGCTGGAATCCCCAAGAAGTT
GGCACCAACCATCGGTATTTCTGTTGACCATCGCCGCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCT
TCAATCCAATGTCCAGAGGCTGAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCG
TGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCTACTCCAGAGGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGT
CCAGGGTGACTACACGCCAATTGTCCGTGAGAAGCCTGCAACGGAGCTTGTGAAGCTTAC
CGCTGAGATGAAATCGTTCAAGGCTTATGACAAGATTCGTCTGGAGCGCACTAACCAGAT
ACATGCAGGTGCTAGAGCCAAGAGAGCTGCCGATGCTGAGAAAGAGGAGAAGAAGTGAGG
AGATCCTTCCTCTTTATCTTGCCTTCATCGTTTTGATCTTAATCTTTGTGTATCAGACTC
TGTTTTTGTTATCCTTGAAAGATTTTGCTGCTACTTGCTTTTGAATTTTATGGAAAAGAT
CATTTCACAC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2D758JQ 717 0 0
CAGGAAAACCAGAAGAAGAGTTGCGAGGCAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCC
CACTTCTGGACCTCTCCGTCCTGTTGTGCACGGTCAGACCCTCAAGTACAACATGAAGGT
CCGAACCGGTAAAGGCTTCACTCTTGAAGAGCTCAAGGCTGCTGGAATCCCCAAGAAGCT
GGCACCAACCATTGGCATTTCTGTTGACCATCGCCGCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCT
TCAATCCAATGTCCAGAGGCTGAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCG
TGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCTACTCCAGAAGAGTTGTCCAATGCCACTCAAGT
CCAGGGTGACTACATGCCTATTGTCCGTGAGAAGCCTGCAACGGAGCTTGTGAAGCTTAC
CGCTGAGATGAGATCGTTCAAGGCTTATGACAAGATTCGTTTGGAGCGCACTAACAAGAG
GCATGCAGGTGCTAGAGCCAAGAGAGCTGCTGATGCTGAGAAAGAGGAGAAGAAGTGAGG
AGATCGTTCCTCTTTATCTGTCCTTCATCGTTTTGATCTTAATCTTTGTGTATCAGACTC
TGTTTTTGCTATCCTTGAAAGATTTTGCTGCTACTTTCTTTTGAATTTTATGGAAAAGAT
CATTTCACACATGTCTCTACTTCCTAGAAGTTTATTGTAAGATTGAGATATCAGTAA

QA 1 717 1 717
DS 



AS 3 14

CO CL285Contig1 617 8 8 U
GGGAATTAAGAAAGAAAAAAATTCAAAGCCTGCCTTATCTTCTATTCACCCAACGATGGC
AACTATTGCTACTAACCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCCTCACAAGCGACAACCG
GTCGGCTCGTCTCGCCTGTCCTGTCCGTTTGAACAACCCGTGGAATCTTGGTCCAAGAGC
AACAAACCGCTTGGTGAGCTTTAGGCCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCGGA
TAAAGTGGAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCAGTGAGCGG
AGAGTGTGTAGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAG
AGACAAGAAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCTGA
GACCAACGAGTGCCGTACTTACGACAACTGAAACTTATCGTTCATGTTACAGGACTCCGT
CCATAAATTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAATACGATATGATGCCAAAG
CTGTATTTGAGACTTAAACAGCTCTGTAAACATTATAATTTGGTAATATTCATAAGCTAA
AATCAAAGGAAAAAAAA


BQ
20 20 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ58JQ C 6
AF RR2BZ58TF U 6
AF RR2C708JQ C 43
AF RR2CY72JQ C 1
AF RR2FS83JQ C -1
AF RR2FS83TF U -1
AF RR2CY72TF U 1
AF RR2C708TF U -4
BS 1 2 RR2CY72TF
BS 3 7 RR2FS83TF
BS 8 536 RR2BZ58TF
BS 537 571 RR2FS83TF
BS 572 572 RR2CY72TF
BS 573 584 RR2FS83TF
BS 585 598 RR2CY72TF
BS 599 617 RR2C708TF

RD RR2BZ58JQ 531 0 0
GG
AAGAAAGAAAAAAATTCAAAGCCTGCCTTATTTTTTATTCACCCAACGATGGCAACTATT
GCTACTAACCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCCTCACAAGCGACAACCGGTCGGCT
CGTCTCGCCTGTCCTGTCCGTTTGAACAACCCGTGGAATCTTGGTCCAAGAGCAACAAAC
CGCTTGGTGAGCTTTAGGCCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTG
GAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCAGTGAGCGGAGAGTGT
GTAGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAGAGACAAG
AAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCTGAGACCAAC
GAGTGCCGTACTTACGACAACTGAAACTTATCGTTCATGTTACAGGACTCCGTCCATAAA
TTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAATACGATATGATGCC

QA 3 531 3 531
DS 

RD RR2BZ58TF 531 0 0
GG
AAGAAAGAAAAAAATTCAAAGCCTGCCTTATCTTCTATTCACCCAACGATGGCAACTATT
GCTACTAACCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCCTCACAAGCGACAACCGGTCGGCT
CGTCTCGCCTGTCCTGTCCGTTTGAACAACCCGTGGAATCTTGGTCCAAGAGCAACAAAC
CGCTTGGTGAGCTTTAGGCCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTG
GAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCAGTGAGCGGAGAGTGT
GTAGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAGAGACAAG
AAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCTGAGACCAAC
GAGTGCCGTACTTACGACAACTGAAACTTATCGTTCATGTTACAGGACTCCGTCCATAAA
TTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAATACGATATGATGCC

QA 3 531 3 531
DS 

RD RR2C708JQ 494 0 0
TATTCACCCAACGATGGCAACTATTGCTACTAACCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGT
CCTCACGAGCGACAACCGGTCGGCTCGTTTCGCCTGTCCTGTCCGTTTGAACAACCCGTG
GAATCTTGGTCCAAGAGCAACAAACCGCTTGGTGAGCTTTAGGCCGGTTAAAGCAACACC
AGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTTGAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGTGC
TGGCGACCCAGTGAGCGGAGAGTGTGTAGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGC
AGCAGCTAGCCACGCTAGAGACAAGAAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATA
CTGCAAAGACAATCCTGAGACCAACGAGTGCCGTACTTACGACAACTGAAACTTATCGTT
CATGTTACAGGACTCCGTCCATAAATTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAA
TACGATATGATGCC

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2CY72JQ 598 0 0
GGGAATTAAGAAAGAAAAAAATTCAAAGCCTGCCTTATCTTCTATTCACCCAACGATGGC
AACTATTGCTACTAACCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCCTCACAAGCGACAACCG
GTCGGCTCGTCTCGCCTGTCCTGTCCGTTTGAACAACCCGTGGAATCTTGGTCCAAGAGC
AACAAACCGCTTGGTGAGCTTTAGGCCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCGGA
TAAAGTGGAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCAGTTAGCGG
AGAGTGTGTAGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAG
AGACAAGAAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCTGA
GACCAACGAGTGCCGTACTTACGACAACTGAAACTTATCGTTCATGTTACAGGACTCCGT
CCATAAATTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAATACGATATGATGCCAAAG
CTGTATTTGAGACTTAAACAGCTCTGTAAACATTATAATTTGGTAATATTCATAAGCT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2FS83JQ 586 0 0
GGGT
GAATTAAGAAAGAAAAAAATTCAAAGCCTGCCTTATCTTCTATTCACCCAACGATGGCAA
CTATTGCTACTAACCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCCTCACAAGCGACAACCGGT
CGGCTCGTCTCGCCTGTCCTGTCCGTTTGAACAACCCGTGGAATCTTGGTCCAAGAGCAA
CAAACCGCTTGGTGAGCTTTAGGCCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCGGATA
AAGTGGAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCAGTGAGCGGAG
AGTGTGTAGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAGAG
ACAAGAAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCTGAGA
CCAACGAGTGCCGTACTTACGACAACTGAAACTTATCGTTCATGTTACGGGACTCCGTCC
ATAAATTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAATACGATATGATGCCAAAGCT
GTATTTGAGACTTAAACAGCTCTGTAAACTTTATAATTTGGT

QA 5 586 5 586
DS 

RD RR2FS83TF 586 0 0
GGGT
GAATTAAGAAAGAAAAAAATTCAAAGCCTGCCTTATCTTCTATTCACCCAACGATGGCAA
CTATTGCTACTAACCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCCTCACAAGCGACAACCGGT
CGGCTCGTCTCGCCTGTCCTGTCCGTTTGAACAACCCGTGGAATCTTGGTCCAAGAGCAA
CAAACCGCTTGGTGAGCTTTAGGCCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCGGATA
AAGTGGAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCAGTGAGCGGAG
AGTGTGTAGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAGAG
ACAAGAAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCTGAGA
CCAACGAGTGCCGTACTTACGACAACTGAAACTTATCGTTCATGTTACGGGACTCCGTCC
ATAAATTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAATACGATATGATGCCAAAGCT
GTATTTGAGACTTAAACAGCTCTGTAAACTTTATAATTTGGT

QA 5 586 5 586
DS 

RD RR2CY72TF 598 0 0
GGGAATTAAGAAAGAAAAAAATTCAAAGCCTGCCTTATCTTCTATTCACCCAACGATGGC
AACTATTGCTACTAACCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCCTCACAAGCGACAACCG
GTCGGCTCGTCTCGCCTGTCCTGTCCGTTTGAACAACCCGTGGAATCTTGGTCCAAGAGC
AACAAACCGCTTGGTGAGCTTTAGGCCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCGGA
TAAAGTGGAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCAGTTAGCGG
AGAGTGTGTAGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAG
AGACAAGAAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCTGA
GACCAACGAGTGCCGTACTTACGACAACTGAAACTTATCGTTCATGTTACAGGACTCCGT
CCATAAATTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAATACGATATGATGCCAAAG
CTGTATTTGAGACTTAAACAGCTCTGTAAACATTATAATTTGGTAATATTCATAAGCT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2C708TF 622 0 0
GGGAAGT
GAATTAAGAAAGAAAAAAATTCAAAGCCTGCCTTATCTTCTATTCACCCAACGATGGCAA
CTATTGCTACTAACCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCCTCACGAGCGACAACCGGT
CGGCTCGTCTCGCCTGTCCTGTCCGTTTGAACAACCCGTGGAATCTTGGTCCAAGAGCAA
CAAACCGCTTGGTGAGCTTTAGGCCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCGGATA
AAGTTGAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCAGTGAGCGGAG
AGTGTGTAGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAGAG
ACAAGAAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCTGAGA
CCAACGAGTGCCGTACTTACGACAACTGAAACTTATCGTTCATGTTACAGGACTCCGTCC
ATAAATTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAATACGATATGATGCCAAAGCT
GTATTTGAGACTTAAACAGCTCTGTAAACATTATAATTTGGTAATATTCATAAGCTAAAA
TCAAAGGAAAAAAAA

QA 8 622 8 622
DS 



CO CL285Contig2 604 4 5 U
GGGGAATTAAGAAAAAAAAACATTCAAAGCCTGCCTTATCTTCTATTCACCCAACGATGG
CAACTATTGCTACTAGCCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCATCACCAGCAGCAAGA
GCCAACCAGCTCGTCTCGCCTGTCCGGTCCGCTTGAACAACCCGTGGAATCTTGGTTCGA
GAGCAAACCGCATGGTGTACCTTAGACCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCGG
ATAAAGTGGAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGCGCTGGCGACCCAGTGAGCG
GAGAGTGTGTAGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTA
GAGACAAGAAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCCG
AGACCAACGAGTGCCGTACTTACGACAACTGAGAACTTATCGTTAATGTTCCAGGACTCC
GTCCATAAATTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAAAATACAATATGATGTG
AAAGCTGTATTTGAGACTTAAACAGCTCTGTAAACATTATAATTTGGTAATATTCATAAG
CTAA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 

AF RR2E584TF U 1
AF RR2E584JQ C 1
AF RR2CZ74TF U 7
AF RR2CZ74JQ C 41
BS 1 1 RR2E584JQ
BS 2 114 RR2E584TF
BS 115 117 RR2CZ74TF
BS 118 288 RR2E584TF
BS 289 604 RR2CZ74TF

RD RR2E584TF 288 0 0
G
GGGAATTAAGAAAAAAAAACATTCAAAGCCTGCCTTATCTTCTATTCACCCAACGATGGC
AACTATTGCTACTAGCCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCATCACCAGCA***AGAG
CCAACCAGCTCGTCTCGCCTGTCCGGTCCGCTTGAACAACCCGTGGAATCTTGGTTCGAG
AGCAAACCGCATGGTGTACCTTAGACCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCGGA
TAAAGTGGAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGCGCTGGCG

QA 2 288 2 288
DS 

RD RR2E584JQ 603 0 0
GGGGAATTAAGAAAAAAAAACATTCAAAGCCTGCCTTATCTTCTATTCACCCAACGATGG
CAACTATTGCTACTAGCCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCATCACCAGCA***AGA
GCCAACCAGCTCGTCTCGCCTGTCCGGTCCGCTTGAACAACCCGTGGAATCTTGGTTCGA
GAGCAAACCGCATGGTGTACCTTAGACCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCGG
ATAAAGTGGAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGCGCTGGCGACCCAGTGAGCG
GAGAGTGTGTAGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTA
GAGACAAGAAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCCG
AGACCAATGAGTGCCGTACTTACGACAACTGAGAACTTATCGTTAATGTTCCAGGACTCC
GTCCATAAATTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAAAATACAATATGATGTG
AAAGCTGTATTTGAGACTTAAACAGCTCTGTAAACATTATAATTTGGTAATATTCATAAG
CT
C

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2CZ74TF 598 0 0
GG
AAGAAAAAAAAACATTCAAAGCCTGCCTTATCTTCTATTCACCCAACGATGGCAACTATT
GCTACTAGCCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCATCACCAGCAGCAAGAGCCAACCA
GCTCGTCTCGCCTGTCCGGTCCGCTTGAACAACCCGTGGAATCTTGGT*CGAGAGCAAAC
CGCATGGTGTACCTTAGACCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTG
GAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGCGCTGGCGACCCAGTGAGCGGAGAGTGT
GTAGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAGAGACAAG
AAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCCGAGACCAAC
GAGTGCCGTACTTACGACAACTGAGAACTTATCGTTAATGTTCCAGGACTCCGTCCATAA
ATTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAAAATACAATATGATGTGAAAGCTGT
ATTTGAGACTTAAACAGCTCTGTAAACATTATAATTTGGTAATATTCATAAGCTAA

QA 3 598 3 598
DS 

RD RR2CZ74JQ 562 0 0
TTCTATTCACCCAACGATGGCAACTATTGCTACTAGCCTTAACATCGCAACCCAACCAGC
CGTCATCACCAGCAGCAAGAGCCAACCAGCTCGTTTCGCCTGTCCGGTCCGCTTGAACAA
CCCGTGGAATTTTGGT*CGAGAGCAAACCGCATGGTGTACCTTAGACCGGTTAAAGCAAC
ACCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTGGAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTG
CGCTGGCGACCCAGTGAGCGGAGAGTGTGTAGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAG
CGCAGCAGCTAGCCACGCTAGAGACAAGAAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGA
ATACTGCAAAGACAATCCCGAGACCAACGAGTGCCGTACTTACGACAACTGAGAACTTAT
CGTTAATGTTCCAGGACTCCGTCCATAAATTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTA
GTAAAATACAATATGATGTGAAAGCTGTATTTGAGACTTAAACAGCTCTGTAAACATTAT
AATTTGGTAATATTCATAAGCT

QA 1 562 1 562
DS 



CO CL285Contig3 538 2 2 U
GGAAGAAAAAAAACATTCAAAGCCTGCCTTGTCTTCTATTCACCCAACGATGGCAACTAT
TGCTACTAGCCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCATCACCAGCAAGAGCCAACCAGC
TCGTCTCGCCTGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAATCTCGGTTCAAGAGCAACGAA
CCGCATGGTGAACTTTAGGCCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCAGATAAAGT
GGAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCAGTGAGCGGAGAGTG
TGTGGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAGAGACAA
GAAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCTGAGACCAA
CGAGTGCCGTACTTACGACAACTGAAACTTATCGTTCATGTTACAGTACTCCGTCCATAA
ATTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAATACGATATGATGTGAAAGCTGT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GE58JQ C 1
AF RR2GE58TF U 1
BS 1 5 RR2GE58JQ
BS 6 538 RR2GE58TF

RD RR2GE58JQ 538 0 0
GGAAGAAAAAAAACATTCAAAGCCTGCCTTGTCTTCTATTCACCCAACGATGGCAACTAT
TGCTACTAGCCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCATCACCAGCAAGAGCCAACCAGC
TCGTCTCGCCTGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAATCTCGGTTCAAGAGCAACGAA
CCGCATGGTGAACTTTAGGCCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCAGATAAAGT
GGAGAAGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCAGTGAGCGGAGAGTG
TGTGGCTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAGAGACAA
GAAGAAAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCTGAGACCAA
CGAGTGCCGTACTTACGACAACTGAAACTTATCGTTCATGTTACAGTACTCCGTCCATAA
ATTACATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAATACGATATGATGTGAAAGCTGT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2GE58TF 538 0 0
GGAAG
AAAAAAAACATTCAAAGCCTGCCTTGTCTTCTATTCACCCAACGATGGCAACTATTGCTA
CTAGCCTTAACATCGCAACCCAACCAGCCGTCATCACCAGCAAGAGCCAACCAGCTCGTC
TCGCCTGTCCGGTCCGTTTGAACAATCCGTGGAATCTCGGTTCAAGAGCAACGAACCGCA
TGGTGAACTTTAGGCCGGTTAAAGCAACACCAGAAGGAGTGATATCAGATAAAGTGGAGA
AGAGCATAAAAGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGACCCAGTGAGCGGAGAGTGTGTGG
CTGCGTGGGACGAGGTTGAGGAGCTCAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAGAGACAAGAAGA
AAGCTGAAGGCTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCTGAGACCAACGAGT
GCCGTACTTACGACAACTGAAACTTATCGTTCATGTTACAGTACTCCGTCCATAAATTAC
ATACAAAGCTTTGTTTTGGTCAGTTTAGTAATACGATATGATGTGAAAGCTGT

QA 6 538 6 538
DS 



AS 2 14

CO CL286Contig1 1155 12 14 U
GGAACCAAGGCTGCGGTTTGTGCAGCCAAAACCTTATCTTTATGAATATCATTTCAGAAT
CATTTTGTTCTTGAAGACAGTCCTAAAACTTTTCCCTTTCTTTACTTTCTTGCACAATAA
AGCTCACTGAGCTATTTCTTGTTTATGTCTCAATAAGCTCTTTGAGCATTCAATCTCTAT
TGTTTTGAGATTGTTATCATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTTTAACTTAACT
CTTCTACAGCTCCTGCTCAAGCTAACAAGTTCATTTATGTCTTTTTGAAGACCCAAGCAA
AGTGGGTTTGAAGAAATCTCAGTCACGTGACTGTTGTCTTATTTACATAATATCAGAGTC
TCCTTTTCTTGGTGACGACGAGAGGCAGAGACGCCGTAACGGCTAAAGGTGCGACCTTTG
AGTTCGTGAGAGCAACAAGGTCTCAATGAAAATCCAGATGTGAAAGGTAACGCTTATGTC
CTCTCTATATAGACATACCATGGAGTAGCTTACTGCCATAGCTTGAGAAGAACAGCTGTT
TTAGATTTAGAAGTATGGAACCGTGAAGCAGTACATGGG*TTTGGTGTGATAGTTATGGG
TTAATAGCTGCAAATTTCTAAAGCGCTCGCTAAGTGTTCGGTATATTGCCAAAGAGAAAG
GCATAATGGTAGAAGCAGTTTGTAGTTAGTTTAGTGATTGGTAGCAGAGAGTAAAAATGA
TTCTTTAGTTGTGGAAGAAGACTCACATTCATTATGAGACAGCTTAGGGGAGTTAAACGA
GGTAAAGAAACCCGGACTCTTCGTGAGATAAATAGGCTACAAAGATAGACCTGAATAGAT
CTCACACTATTGACTGATCTTATGGTGAAGTGAAGAAATTGACTACTTCAAATGAACACT
TCCAGCTCTCGTTCCTTTACCAAGCTGCTGCACTTGAGCTTCCAAACTTAGTTCCGCACC
TTACACTAAGTTTGCAGGGGAGTATTAGAGCACAAGCCCAAACCATTGAAGTCAAGCCCA
AAGCCATGTAGTCTATGTTTTCTATCAATTGATATAAATAGATGTCTAAGGTCATTGTAG
TAGACAACCAAGGCTGCGGTTTGTGCAGCCAAAACCTTATCTTTATGAATATCATTTCAG
AATCATTTTGTTCTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 30 50 50 50 55 
55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 55 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 20 65 65 65 65 
65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 35 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2AX15TFB U 384
AF RR2FK79TF U 1
AF RR2FR86TF U 1
AF RR2CL28TF U 23
AF RR2FS87TF U 1
AF RR2A272TF U 1
AF RR2AU74TF U 65
AF RR2CL28JQ C 399
AF RR2FK79JQ C 420
AF RR2A272JQ C 463
AF RR2FR86JQ C 422
AF RR2FS87JQ C 469
BS 1 43 RR2A272TF
BS 44 44 RR2FK79TF
BS 45 288 RR2A272TF
BS 289 289 RR2FK79TF
BS 290 378 RR2A272TF
BS 379 379 RR2FK79TF
BS 380 784 RR2A272TF
BS 785 815 RR2AU74TF
BS 816 816 RR2CL28JQ
BS 817 922 RR2AU74TF
BS 923 923 RR2CL28JQ
BS 924 938 RR2AU74TF
BS 939 1140 RR2CL28JQ
BS 1141 1155 RR2FR86JQ

RD RR2AX15TFB 253 0 0
GGCAGAGACGCCGTAACGGCTAAAGGTGCGACCTTTGAGTTCGTGAGAGCAACAAGGTCT
CAATGAAAATCCAGATGTGAAAGGTAACGCTTATGTCCTCTCTATATAGACATACCATGG
AGTAGCTTACTGCCATAGCTTGAGAAGAACAGCTGTTTTAGATTTAGAAGTATGGAACCG
TGAAGCAGTACATGGG*TTTGGTGTGATAGTTATGGGTTAATAGCTGCAAATTTCTAAAG
CGCTCGCTAAGTG

QA 1 253 1 253
DS 

RD RR2FK79TF 788 0 0
GGAACCAAGGCTGCGGTTTGTGCAGCCAAAACCTTATCTTTATGAATATCATTTCAGAAT
CATTTTGTTCTTGAAGACAGTCCTAAAACTTTTCCCTTTCTTTACTTTCTTGCACAATAA
AGCTCACTGAGCTATTTCTTGTTTATGTCTCAATAAGCTCTTTGAGCATTCAATCTCTAT
TGTTTTGAGATTGTTATCATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTTTAACTTAACT
CTTTTACAGCTCCTGCTCAAGCTAACAAGTTCATTTATGTCTTTTTGAAGACCCAAGCAA
AGTGGGTTTGAAGAAATCTCAGTCACGTGACTGTTGTCTTATTTACATAATATCAGAGTC
TCCTTTTCTTGGTGACGACGAGAGGCAGAGACGCCGTAACGGCTAAAGGTGCGACCTTTG
AGTTCGTGAGAGCAACAAGGTCTCAATGAAAATCCAGATGTGAAAGGTAACGCTTATGTC
CTCTCTATATAGACATACCATGGAGTAGCTTACTGCCATAGCTTGAGAAGAACAGCTGTT
TTAGATTTAGAAGTATGGAACCGTGAAGCAGTACATGGG*TTTGGTGTGATAGTTATGGG
TTAATAGCTGCAAATTTCTAAAGCGCTCGCTAAGTGTTCGGTATATTGCCAAAGAGAAAG
*CATAATGGTAGAAGCAGTTTGTAGTTAGTTTAGTGATTGGTAGCAGAGAGTAAAA*TGA
TTCTTTAGTTGTGGAG**AGACTCACATTCATTATGAGACAGCTTAGGG
AGTAAACGAGTAAGAACCC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2FR86TF 763 0 0
GGAACCAAGGCTGCGGTTTGTGCAGCCAAAACCTTATCTTTATGAATATCATTTCAGAAT
CATTTTGTTCTTGAAGACAGTCCTAAAACTTTTCCCTTTCTTTACTTTCTTGCACAATAA
AGCTCACTGAGCTATTTCTTGTTTATGTCTCAATAAGCTCTTTGAGCATTCAATCTCTAT
TGTTTTGAGATTGTTATCATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTTTAACTTAACT
CTTCTACAGCTCCTGCTCAAGCTAACAAGTTCGTTTATGTCTTTTTGAAGACCCAAGCAA
AGTGGGTTTGAAGAAATCTCAGTCACGTGACTGTTGTCTTATTTACATAATATCAGAGTC
TCCTTTTCTTGGTGACGACGAGAGGCAGAGACGCCGTAACGGCTAAAGGTGCGGCCTTTG
AGTTCGTGAGAGCAACAAGGTCTCAATGAAAATCCAGATGTGAAAGGTAACGCTTATGTC
CTCTCTATATAGACATACCATGGAGTAGCTTACTGCCATAGCTTGAGAAGAACAGCTGTT
TTAGATTTAGAAGTATGGAACCGTGAAGCAGTACATGGG*TTTGGTGTGATAGTTATGGG
TTAATAGCTGCAAATTTCTAAAGCGCTCGCTAAGTGTTCGGTATATTGCCAAAGAGAAAG
*CATAATGGTAGAAGCAGTTTGTAGTTAGTTTAGTGATTGGTAGCAGAGAGTAAAA*TGA
TTCTTTAGTTGTGGAG*AAGACTCACATTCATTATGAGACAGC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2CL28TF 702 0 0
AGCCA
AAAACCTTATCTTTATGAATATCATTTCAGAATCATTTTGTTCTTGAAGACAGTCCTAAA
ACTTTTCCCTTTCTTTACTTTCTTGCACAATAAAGCTCACTGAGCTATTTCTTGTTTATG
TCTCAATAAGCTCTTTGAGCATTCAATCTCTATTGTTTTGAGATTGTTATCATGGTATCA
GAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTTTAACTTAACTCTTCTACAGCTCCTGCTCAAGCTAACA
AGTTCGTTTATGTCTTTTTGAAGACCCAAGCAAAGTGGGTTTGAAGAAATCTCAGTCACG
TGACTGTTGTCTTATTTACATAATATCAGAGTCTCCTTTTCTTGGTGACGACGAGAGGCA
GAGACGCCGTAACGGCTAAAGGTGCGACCTTTGAGTTCGTGAGAGCAACAAGGTCTCAAT
GAAAATCCAGATGTGAAAGGTAACGCTTATGTCCTCTCTATATAGACATACCATGGAGTA
GCTTACTGCCATAGCTTGAGAAGAACAGCTGTTTTAGATTTAGAAGTATGGAACCGTGAA
GCAGTACATGGGGTTTGGTGTGATAGTTATGGGTTAATAGCTGCAAATTTCTAAAGCGCT
CGCTAAGTGTTCGGTATATTGCCAAAGAGAAAGGCATAATGGTAGAAGCAGTTTGTAGTT
AGTTTAGTGATTGGTAGCAGAGAGTAAAA*TGATTCT

QA 6 702 6 702
DS 

RD RR2FS87TF 764 0 0
GGAACCAAGGCTGCGGTTTGTGCAGCCAAAACCTTATCTTTATGAATATCATT*CAGAAT
CATTTTGTTCTTGAAGACAGTCCTAAAACTTTTCCCTTTCTTTACTTTCTTGCACAATAA
AGCTCACTGAGCTATTTCTTGTTTATGTCTCAATAAGCTCTTTGAGCATTCAATCTCTAT
TGTTTTGAGATTGTTATCATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTTTAACTTAACT
CTTCTACAGCTCCTGCTCAAGCTAACAAGTTCATTTATGTCTTTTTGAAGACCCAAGCAA
AGTGGGTTTGAAGAAATCTCAGTCACGTGACTGTTGTCTTATTTACATAATATCAGAGTC
TCCTTTTCTTGGTGACGACGAGAGGCAGAGACGCCGTAACGGCTAAAGGTGCGACCTTTG
AGTTCGTGAGAGCAACAAGGTCTCAATGAAAATCCAGATGTGAAAGGTAACGCTTATGTC
CTCTCTATATAGACATACCATGGAGTAGCTTACTGCCATAGCTTGAGAAGAACAGCTGTT
TTAGATTTAGAAGTATGGAACCGTGAAGCAGTACATGGG*TTTGGTGTGATAGTTATGGG
TTAATAGCTGCAAATTTCTAAAGCGCTCGCTAAGTGTTCGGTATATTGCCAAAGAGAAAG
GCATAATGGTAGAAGCAGTTTGTAGTTAGTTTAGTGATTGGTAGCAGAGAGTAAAA*TGA
TTCTTTAGTTGTGGAAGAAGACTCACATTCATTATGAGACAGCT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2A272TF 784 0 0
GGAACCAAGGCTGCGGTTTGTGCAGCCAAAACCTTATCTTTATTAATATCATTTCAGAAT
CATTTTGTTCTTGAAGACAGTCCTAAAACTTTTCCCTTTCTTTACTTTCTTGCACAATAA
AGCTCACTGAGCTATTTCTTGTTTATGTCTCAATAAGCTCTTTGAGCATTCAATCTCTAT
TGTTTTGAGATTGTTATCATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTTTAACTTAACT
CTTCTACAGCTCCTGCTCAAGCTAACAAGTTCATTTATGTCTTTTTGAGGACCCAAGCAA
AGTGGGTTTGAAGAAATCTCAGTCACGTGACTGTTGTCTTATTTACATAATATCAGAGTC
TCCTTTTCTTGGTGACGATGAGAGGCAGAGACGCCGTAACGGCTAAAGGTGCGACCTTTG
AGTTCGTGAGAGCAACAAGGTCTCAATGAAAATCCAGATGTGAAAGGTAACGCTTATGTC
CTCTCTATATAGACATACCATGGAGTAGCTTACTGCCATAGCTTGAGAAGAACAGCTGTT
TTAGATTTAGAAGTATGGAACCGTGAAGCAGTACATGGG*TTTGGTGTGATAGTTATGGG
TTAATAGCTGCAAATTTCTAAAGCGCTCGCTAAGTGTTCGGTATATTGCCAAAGAGAAAG
GCATAATGGTAGAAGCAGTTTGTAGTTAGTTTAGTGATTGGTAGCAGAGAGTAAAAATGA
TTCTTTAGTTGTGGAAGAAGACTCACATTCATTATGAGACAGCTTAGGGGAGTTAAACGA
GGTA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2AU74TF 874 0 0
GG
GTTCTTGAAGACAGTCCCAAAACTTTTCCCTTTCTTTACTTTCTTGCACAATAAAGCTCA
CTGAGCTATTTCTTGTTTATGTCTCAATAAGCTCTTTGAGCATTCAATCTCTATTGTTTT
GAGATTGTTATCATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTTTAACTTAACTCTTCTA
CAGCTCCTGCTCAAGCTAACAAGTTCGTTTATGTCTTTTTGAAGACCCAAGCAAAGTGGG
TTTGAAGAAATCTCAGTCACGTGACTGTTGTCTTATTTACATAATATCAGAGTCTCCTTT
TCTTGGTGACGACGAGAGGCAGAGACGCCGTAACGGCTAAAGGTGCGACCTTTGAGTTCG
TGAGAGCAACAAGGTCTCAACGAAAATCCAGATGTGAAAGGTAACGCTTATGCTCTCTCT
ATATAGACATACCATGGAGTAGCTTACTGCCATAGCTTGAGAAGAACAGCTGTTTTAGAT
TTAGAAGTATGGAACCGTGAAGCAGTACATGGG*TTTGGTGTGATAGTTATGGGTTAATA
GCTGCAAATTTCTAAAGCGCTCGCTAAGTGTTCGGTATATTGCCAAAGAGAAAGGCATAA
TGGTAGAAGCAGTTTGTAGTTAGTTTAGTGATTGGTAGCAGAGAGTAAAAATGATTCTTT
AGTTGTGGAAGAAGACTCACATTCATTATGAGACAGCTTAGGGGAGTTAAACGAGGTAAA
GAAACCCGGACTCTTCGTGAGATAAATAG*CTACAAAGATAGACCTGAATAGATCTCACA
CTATTGACTGATCTTATGGTGAAGTGAAGAAATTGACTACTTCAAATGAACACTTCCAGC
TCTCGTTCCTTTACCA*GCTGCTGCACTTGAG

QA 3 874 3 874
DS 

RD RR2CL28JQ 746 0 0
ACGGCTAAAGGTGCGAC*TTTGAGTTCGTGAGAGCAACAAGGTCTCAATGAAAATCCAGA
TGTGAAAGGTAACGCTTATGTCCTCTCTATATAGACATACCATGGAGTAGCTTACTGCCA
TAGCTTGAGAAGAACAGCTGTTTTAGATTTAGAAGTATGGAACCGTGAAGCAGTACATGG
G*TTTGGTGTGATAGTTATGGGTTAATAGCTGCAAATTTCTAAAGCGCTCGCTAAGTGTT
CGGTATATTGCCAAAGAGAAAGGCATAATGGTAGAAGCAGTTTGTAGTTAGTTTAGTGAT
TGGTAGCAGAGAGTAAAAATGATTCTTTAGTTGTGGAAGAAGACTCACATTCATTATGAG
ACAGCTTAGGGGAGTTAAACGAGGTAAAGAAACCCGGACTCTTCGTGAGATAAATAGGCT
ATAAAGATAGACCTGAATAGATCTCACACTATTGACTGATCTTATGGTGAAGTGAAGAAA
TTGACTACTTCAAATGAACACTTCCAGCTCTCGTTCCTTTACCAAGCTGCTGCACTTGAG
CTTCCAAACTTAGTTCCGCACCTTACACTAAGTTTGCAGGGGAGTATTAGAGCACAAGCC
CAAACCATTGAAGTCAAGCCCAAAGCCATGTAGTCTATGTTTTCTATCAATTGATATAAA
TAGATGTCTAAGGTCATTGTAGTAGACAACCAAGGCTGCGGTTTGTGCAGCCAAAACCTT
ATCTTTATGAATATCATTTCAG
AACC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2FK79JQ 721 0 0
GAGTTCGTGAGAGCAACAAGGTCTCAATGAAAATCCAGATGTGAAAGGTAACGCTTATGT
CCTCTCTATATAGACATACCATGGAGTAGCTTACTGCCATAGCTTGAGAAGAACAGCTGT
TTTAGATTTAGAAGTATGGAACCGTGAAGCAGTACATGGG*TTTGGTGTGATAGTTATGG
GTTAATAGCTGCAAATTTCTAAAGCGCTCGCTAAGTGTTCGGTATATTGCCAAAGAGAAA
GGCATAATGGTAGAAGCAGTTTGTAGTTAGTTTAGTGATTGGTAGCAGAGAGTAAAAATG
ATTCTTTAGTTGTGGAAGAAGACTCACATTCATTATGAGACAGCTTAGGGGAGTTAAACG
AGGTAAAGAAACCCGGACTCTTCGTGAGATAAATAGGCTACAAAGATAGACCTGAATAGA
TCTCACACTATTGACTGATCTTATGGTGAAGTGAAGAAATTGACTACTTCAAATGAGCAC
TTCCAGCTCTCGTTCCTTTACCAAGCTGCTGCACTTGAGCTTCCAAACTTAGTTCCGCAC
CTTACACTAAGTTTGCAGGGGAGTATTAGAGCACAAGCCCAAACCATTGAAGTCAAGCCC
AAAGCCATGTAGTCTATGTTTTCTATCAATTGATATAAATAGATGTCTAAGGTCATTGTA
GTAGACAACCAAGGCTGCGGTTTGTGCAGCCAAAACCTTATCTTTATGAATATCATTTCA
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2A272JQ 644 0 0
AAAGGTAACGCTTATGTCCTCTCTATATAGACATACCATGGAGTAGCTTACTGCCATAGC
TTGAGAAGAACAGCTGTTTTAGATTTAGAAGTATGGAACCGTGAAGCAGTACATGGG*TT
TGGTGTGATAGTTATGGGTTAATAGCTGCAAATTTCTAAAGCGCTCGCTAAGTGTTCGGT
ATATTGCCAAAGAGAAAGGCATAATGGTAGAAGCAGTTTGTAGTTAGTTTAGTGATTGGT
AGCAGAGAGTAAAAATGATTCTTTAGTTGTGGAAGAAGACTCACATTCATTATGAGACAG
CTTAGGGGAGTTAAACGAGGTAAAGAAACCCGGACTCTTCGTGAGATAAATAGGCTACAA
AGATAGACCTGAATAGATCTCACACTATTGACTGATCTTATGGTGAAGTGAAGAAATTGA
CTACTTCAAATGAACACTTCCAGCTCTCGTTCCTTTACCAAGCTGCTGCACTTGAGCTTC
CAAACTTAGTTCCGCACCTTACACTAAGTTTGCAGGGGAGTATTAGAGCACAAGCCCAAA
CCATTGAAGTCAAGCCCAAAGCCATGTAGTCTATGTTTTCTATCAATTGATATAAATAGA
TGTCTAAGGTCATTGTAGTAGACAACCAAGGCTGCGGTTTGTGC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2FR86JQ 734 0 0
GTTCGTGAGAGCAACAAGGTCTCAATGAAAATCCAGATGTGAAAGGTAACGCTTATGTCC
TCTCTATATAGACATACCATGGAGTAGCTTACTGCCATAGCTTGAGAAGAACAGCTGTTT
TAGATTTAGAAGTATGGAACCGTGAAGCAGTACATGGG*TTTGGTGTGATAGTTATGGGT
TAATAGCTGCAAATTTCTAAAGCGCTCGCTAAGTGTTCGGTATATTGCCAAAGAGAAAGG
CATAATGGTAGAAGCAGTTTGTAGTTAGTTTAGTGATTGGTAGCAGAGAGTAAAAATGAT
TCTTTAGTTGTGGAAGAAGACTCACATTCATTATGAGACAGCTTAGGGGAGTTAAACGAG
GTAAAGAAACCCGGACTCTTCGTGAGATAAATAGGCTACAAAGATAGACCTGAATAGATC
TCACACTATTGACTGATCTTATGGTGAAGTGAAGAAATTGACTACTTCAAATGAACACTT
CCAGCTCTCGTTCCTTTACCAAGCTGCTGCACTTGAGCTTCCAAACTTAGTTCCGCACCT
TACACTAAGTTTGCAGGGGAGTATTAGAGCACAAGCCCAAACCATTGAAGTCAAGCCCAA
AGCCATGTAGTCTATGTTTTCTATCAATTGATATAAATAGATGTCTAAGGTCATTGTAGT
AGACAACCAAGGCTGCGGTTTGTGCAGCCAAAACCTTATCTTTATGAATATCATTTCAGA
ATCATTTTGTTCTC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2FS87JQ 687 0 0
AACGCTTATGTCCTCTCTATATAGACATACCATGGAGTAGCTTACTGCCATAGCTTGAGA
AGAACAGCTGTTTTAGATTTAGAAGTATGGAACCGTGAAGCAGTACATGGG*TTTGGTGT
GATAGTTATGGGTTAATAGCTGCAAATTTCTAAAGCGCTCGCTAAGTGTTCGGTATATTG
CCAAAGAGAAAGGCATAATGGTAGAAGCAGTTTGTAGTTAGTTTAGTGATTGGTAGCAGA
GAGTAAAAATGATTCTTTAGTTGTGGAAGAAGACTCACATTCATTATGAGACAGCTTAGG
GGAGTTAAACGAGGTAAAGAAACCCGGACTCTTCGTGAGATAAATAGGCTACAAAGATAG
ACCTGAATAGATCTCACACTATTGACTGATCTTATGGTGAAGTGAAGAAATTGACTACTT
CAAATGAACACTTCCAGCTCTCGTTCCTTTACCAAGCTGCTGCACTTGAGCTTCCAAACT
TAGTTCCGCACCTTACACTAAGTTTGCAGGGGAGTATTAGAGCACAAGCCCAAACCATTG
AAGTCAAGCCCAAAGCCATGTAGTCTATGTTTTCTATCAATTGATATAAATAGATGTCTA
AGGTCATTGTAGTAGACAACCAAGGCTGCGGTTTGTGCAGCCAAAACCTTATCTTTATGA
ATATCATTTCAGAATCATTTTGTTC
AC

QA 1 685 1 685
DS 



CO CL286Contig2 698 2 7 U
GGAACCAAGGCTGCGGTTTGTGCAGCCAAAACCTTATCTTTATGAATATCATTTCAGAAT
CATTTTGTTCTTGAAGACAGTCCTAAAACTTTTCCCTTTCTTTACTTTCTTGCACAATAA
AGCTCACTGAGCTATTTCTTGTTTATGTCTCAATAAGCTCTTTGAGCATTCAATCTCTAT
TGTTTTGAGATTGTTATCATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTTTAACTTAACT
CTTCTACAGCTCCTGCTCAAGCTAACAAGTTCATTTATGTCTTTTTGAAGACCCAAGCAA
AGTGGGTTTGAAGAAATCTCAGTCACGTGACTGTTGTCTTATTTACATAATATCAGAGTC
TCCTTTTCTTGGTGACGACGAGAGGCAGAGACGCCGTAACGGCTAAAGGTGCGACCTTTG
AGTTCGTGAGAGCAACAAGGTCTCAATGAAAATCCAGATGTGAAAGCTCTCGTTCCTTTA
CCAAGCTGCTACACTTGAGCTTCCAAACTTAGTTCCGCACCTTACACTAAGTTTGCAGGG
GAGTATTAGAGCACAAGCCCAAACCATTGAAGTCAAGCCCAAAGCCATGTAGTCTATGTT
TTCTATCAATTGATATAAATAGATGTCTAAGGTCATTGTAGTAGACAACCAAGGCTGCGG
TTTGTGCAGCCAAACCTTATCTTTATGAATATCATTTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2D895TF U 1
AF RR2A486TF U 2
BS 1 247 RR2D895TF
BS 248 248 RR2A486TF
BS 249 272 RR2D895TF
BS 273 273 RR2A486TF
BS 274 688 RR2D895TF
BS 689 689 RR2A486TF
BS 690 698 RR2D895TF

RD RR2D895TF 698 0 0
GGAACCAAGGCTGCGGTTTGTGCAGCCAAAACCTTATCTTTATGAATATCATTTCAGAAT
CATTTTGTTCTTGAAGACAGTCCTAAAACTTTTCCCTTTCTTTACTTTCTTGCACAATAA
AGCTCACTGAGCTATTTCTTGTTTATGTCTCAATAAGCTCTTTGAGCATTCAATCTCTAT
TGTTTTGAGATTGTTATCATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTTTAACTTAACT
CTTCTACTGCTCCTGCTCAAGCTAACAAGTTCGTTTATGTCTTTTTGAAGACCCAAGCAA
AGTGGGTTTGAAGAAATCTCAGTCACGTGACTGTTGTCTTATTTACATAATATCAGAGTC
TCCTTTTCTTGGTGACGACGAGAGGCAGAGACGCCGTAACGGCTAAAGGTGCGACCTTTG
AGTTCGTGAGAGCAACAAGGTCTCAATGAAAATCCAGATGTGAAAGCTCTCGTTCCTTTA
CCAAGCTGCTACACTTGAGCTTCCAAACTTAGTTCCGCACCTTACACTAAGTTTGCAGGG
GAGTATTAGAGCACAAGCCCAAACCATTGAAGTCAAGCCCAAAGCCATGTAGTCTATGTT
TTCTATCAATTGATATAAATAGATGTCTAAGGTCATTGTAGTAGACAACCAAGGCTGCGG
TTTGTGCAGCCAAACCTTATCTTTATGA*TATCATTTC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2A486TF 695 0 0
GAACCAAGGCTGCGGTTTGTGCAGCCAAAACCTTATCTTTATGAATATCATTTCAGAATC
ATTTTGTTCTTGAAGACAGTCCTAAAACTTTTCCCTTTCTTTACTTTCTTGCACAATAAA
GCTCACTGAGCTATTTCTTGTTTATGTCTCAATAAGCTCTTTGAGCATTCAATCTCTATT
GTTTTGAGATTGTTATCATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTTTAACTTAACTC
TTCTACAGCTCCTGCTCAAGCTAACAAGTTCATTTATGTCTTTTTGAAGACCCAAGCAAA
GTGGGTTTGAAGAAATCTCAGTCACGTGACTGTTGTCTTATTTACATAATATCAGAGTCT
CCTTTTCTTGGTGACGACGAGAGGCAGAGACGCCGTAACGGCTAAAGGTGCGACCTTTGA
GTTCGTGAGAGCAACAAGGTCTCAATGAAAATCCAGATGTGAAAGCTCTCGTTCCTTTAC
CAAGCTGCTGCACTTGAGCTTCCAAACTTAGTTCCGCACCTTACACTAAGTTTGCAGGGG
AGTATTAGAGCACAAGCCCAAACCATTGAAGTCAAGCCCAAAGCCATGTAGTCTATGTTT
TCTATCAATTGATATAAATAGATGTCTAAGGTCATTGTAGTAGACAACCAAGGCTGCGGT
TTGTGCAGCCAAACCTTATCTTTATGAATATCATT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 2 14

CO CL287Contig1 691 9 11 U
TTTTTTTCTGCCCCTGACCTGTATACTGAGCTTCATCTCCTCCAATGGCTTCTTTGTCAG
CAACTTCTCTAAGCTTCAAAGCTCCCTCCATACAATCGACCAGAATCTCCCAGGTGTTGA
GGAAACCCTCGAGTTTTCAGTCTATCTCATTTGGTCGTTTCCAGTCTTCAAAGAGCCTTC
GTCTTCAAATCAGTTGCGCTGCAAAACCAGAGACAGTGCAGAAAGTGAGTGACATTGTAA
AGGAACAGTTGGCTTTGTCTGCTGACACTGCGCTCACTGCTGAGTCCAAGTTCTCTGCTC
TTGGCGCCGATTCTCTTGACACAGTGGAGATAGTGATGGCATTGGAGGAAAAGTTTAACA
TAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGA
TTGAGGATCTTGTTCAGAAGAAACCTGCGGCCTAAACTCCCCCGGTTTAACGCAAACCGG
CTTTCTTTTCCTTTTAGACCTTTCTTGGTTTCGGAGCATTTAATTAGACCGTATGTCATT
TTACTTTTCTTCTTCTGGAAGTTAAGATCATTGGATGTTGACTATGAGAAAACTTTTGTT
GGTACGTTGAGATTGATTTGATTGGTCTTTGATGACGAATATATAAACGTGATCTGTGTC
GCTACTACCACATGAATTTAGCTTTTCTATT


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM13JQ C 126
AF RR2BW38TF U 1
AF RR2DO36TF U 1
AF RR2DO36JQ C 44
AF RR2GT36TF U 9
AF RR2EL40JQ C 1
AF RR2EL40TF U 1
AF RR2EM13TF U 1
AF RR2GT36JQB C 317
BS 1 81 RR2BW38TF
BS 82 82 RR2DO36TF
BS 83 190 RR2BW38TF
BS 191 191 RR2DO36TF
BS 192 450 RR2BW38TF
BS 451 451 RR2DO36TF
BS 452 515 RR2BW38TF
BS 516 516 RR2DO36TF
BS 517 635 RR2BW38TF
BS 636 666 RR2EL40TF
BS 667 691 RR2EM13TF

RD RR2EM13JQ 425 0 0
CCCTCGAGTTTTCAGTCTATCTCATTTGGTCGTTTCCAGTCTTCAAAGAGCCTTCGTCTT
CAAATCAGTTGCGCTGCAAAACCAGAGACAGTGCAGAAAGTGAGTGACATTGTAAAGGAA
CAGTTGGCTTTGTCTGCTGACACTGCGCTCACTGCTGAGTCCAAGTTTTTTGCTCTTGGC
GCCGATTTTCTTGGCACAGTGGAGATAGTGATGGCATTGGAGGAAAAGTTTAACATAAGT
GTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGATTGAG
GATCTTGTTCAGAAGAAACCTGCGGCCTAAACTCCCCCGGTTTAACGCAAACCGGCTTTT
TTTTCCTTTTAGACCTTTTTTGGTTTCGGAGCATTTAATTAGACCGTATGTCATTTTACT
TTT
TT

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR2BW38TF 635 0 0
TTTTTTTCTGCCCCTGACCTGTATACTGAGCTTCATCTCCTCCAATGGCTTCTTTGTCAG
CAACTTCTCTAAGCTTCAAAGTTCCCTCCATACAATCGACCAGAATCTCCCAGGTGTTGA
GGAAACCCTCGAGTTTTCAGTCTATCTCATTTGGTCGTTTCCAGTCTTCAAAGAGCCTTC
GTCTTCAAATTAGTTGCGCTGCAAAACCAGAGACAGTGCAGAAAGTGAGTGACATTGTAA
AGGAACAGTTGGCTTTGTCTGCTGACACTGCGCTCACTGCTGAGTCCAAGTTCTCTGCTC
TTGGCGCCGATTCTCTTGACACAGTGGAGATAGTGATGGCATTGGAGGAAAAGTTTAACA
TAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGA
TTGAGGATCTTGTTCAGAAGAAACCTGCGGTCTAAACTCCCCCGGTTTAACGCAAACCGG
CTTTCTTTTCCTTTTAGACCTTTCTTGGTTTCGGATCATTTAATTAGACCGTATGTCATT
TTACTTTTCTTCTTCTGGAAGTTAAGATCATTGGATGTTGACTATGAGAAAACTTTTGTT
GGTACGTTGAGATTGATTTGATTGGTCTTTGATGA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2DO36TF 604 0 0
TTTTTTTCTGCCCCTGACCTGTATACTGAGCTTCATCTCCTCCAATGGCTTCTTTGTCAG
CAACTTCTCTAAGCTTCAAAGCTCCCTCCATACAATCGACCAGAATCTCCCAGGTGTTGA
GGAAACCCTCGAGTTTTCAGTCTATCTCATTTGGTCGTTTCCAGTCTTCAAAGAGCCTTC
GTCTTCAAATCAGTTGCGCTGCAAAACCAGAGACAGTGCAGAAAGTGAGTGACATTGTAA
AGGAACAGTTGGCTTTGTCTGCTGACACTGCGCTCACTGCTGAGTCCAAGTTCTCTGCTC
TTGGCGCCGATTCTCTTGACACAGTGGAGATAGTGATGGCATTGGAGGAAAAGTTTAACA
TAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGA
TTGAGGATCTTGTTCAGAAGAAACCTGCGGCCTAAACTCCCCCGGTTTAACGCAAACCGG
CTTTCTTTTCCTTTTAGACCTTTCTTGGTTTCGGAGCATTTAATTAGACCGTATGTCATT
TTACTTTTCTTCTTCTGGAAGTTAAGATCATTGGATGTTGACTATGAGAAAACTTTTGTT
GGTA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2DO36JQ 560 0 0
AATGGCTTCTTTGTCAGCAACTTCTCTAAGCTTCAAAGCTCCCTCCATACAATCGACCAG
AATCTCCCAGGTGTTGAGGAAACCCTCGAGTTTTCAGTCTATCTCATTTGGTCGTTTCCA
GTCTTCAAAGAGCCTTCGTCTTCAAATCAGTTGCGCTGCAAAACCAGAGACAGTGCAGAA
AGTGAGTGACATTGTAAAGGAACAGTTGGCTTTGTCTGCTGACACTGCGCTCACTGCTGA
GTCCAAGTTCTCTGCTCTTGGCGCCGATTCTCTTGACACAGTGGAGATAGTGATGGCATT
GGAGGAAAAGTTTAACATAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACGATTCA
AGAGGCGGCTGATTTGATTGAGGATCTTGTTCAGAAGAAACCTGCGGCCTAAACTCCCCC
GGTTTAACGCAAACCGGCTTTCTTTTCCTTTTAGACCTTTCTTGGTTTCGGAGCATTTAA
TTAGACCGTATGTCATTTTACTTTTCTTCTTCTGGAAGTTAAGATCATTGGATGTTGACT
ATGAGAAAACTTTTGTTGGT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2GT36TF 636 0 0
G
GCCCCTGACCTGTATACTGAGCTTCATCTCCTCCAATGGCTTCTTTGTCAGCAACTTCTC
TAAGCTTCAAAGCTCCCTCCATACAATCGACCAGAATCTCCCAGGTGTTGAGGAAACCCT
TGAGTTTTCAGTCTATCTCATTTGGTAGTTTCCAGTCTTCAAAGAGCCTTCGTCTTCAAA
TCAGTTGCGCTGCAAAACCAGAGACAGTGCAGAAAGTGAGTGACATTGTAAAGGAACAAT
TGGCTTTGTCTGCTGACACTGCGCTCACTGCTGAGTCCAAGTTCTCTGCTCTTGGCGCCG
ATTCTCTTGACACAGTGGAGATAGTGATGGCATTGGAGGAAAAGTTTAACATAAGTGTGG
AGGAAGCTGATGCTCAGAGCATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGATTGAGGATC
TTGTTCAGAAGAAACCTGCGGCCTAAACTCCCCCGGTTTAACGCAAACCGGCTTTCTTTT
CCTTT*AGACCTTTCTTGGTTTCGGAGCATTTAATTAGACCGTATGCCATTTTACTTTTC
TTCTTCTGGAAGTTAAGATCATTGGATGTTGACTATGAGAAAACTTTTGTTGGTACGTTG
AGATTGATTTGATTGGTCTTTGATGAAGAATATAT

QA 2 636 2 636
DS 

RD RR2EL40JQ 666 0 0
TTTTTTTCTGCCCCTGACCTGTATACTGAGCTTCATCTCCTCCAATGGCTTCTTTGTCAG
CAACTTCTCTAAGCTTCAAAGCTCCCTCCATACAATCGACCAGAATCTCCCAGGTGTTGA
GGAAACCCTCGAGTTTTCAGTCTATCTCATTTGGTCGTTTCCAGTCTTCAAAGAGCCTTC
GTCTTCAAATCAGTTGCGCTGCAAAACCAGAGACAGTGCAGAAAGTGAGTGACATTGTAA
AGGAACAGTTGGCTTTGTCTGCTGACACTGCGCTCACTGCTGAGTCCAAGTTCTCTGCTC
TTGGCGCCGATTCTCTTGACACAGTGGAGATAGTGATGGCATTGGAGGAAAAGTTTAGCA
TAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCTGAACATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGA
TTGAGGATCTTGTTCAGAAGAAACCTGCGGCCTAAACTCCCCCGGCTTAACGCAAACCGG
CTTTCTTTTCCTTTTAGACCTTTCTTGGTTTCGGAGCATTTAATTAGACCGTATGTCATT
TTACTTTTCTTCTTCTGGAAGTTAAGATCATTGGATGTTGACTATGAGAAAACTTTTGTT
GGTACGTTGAGATTGATTTGATTGGTCTTTGATGACGAATATATAAACGTGATCTGTGTC
GCT
ACT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2EL40TF 672 0 0
TTTTTTTCTGCCCCTGACCTGTATACTGAGCTTCATCTCCTCCAATGGCTTCTTTGTCAG
CAACTTCTCTAAGCTTCAAAGCTCCCTCCATACAATCGACCAGAATCTCCCAGGTGTTGA
GGAAACCCTCGAGTTTTCAGTCTATCTCATTTGGTCGTTTCCAGTCTTCAAAGAGCCTTC
GTCTTCAAATCAGTTGCGCTGCAAAACCAGAGACAGTGCAGAAAGTGAGTGACATTGTAA
AGGAACAGTTGGCTTTGTCTGCTGACACTGCGCTCACTGCTGAGTCCAAGTTCTCTGCTC
TTGGCGCCGATTCTCTTGACACAGTGGAGATAGTGATGGCATTGGAGGAAAAGTTTAGCA
TAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCTGAACATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGA
TTGAGGATCTTGTTCAGAAGAAACCTGCGGCCTAAACTCCCCCGGCTTAACGCAAACCGG
CTTTCTTTTCCTTTTAGACCTTTCTTGGTTTCGGAGCATTTAATTAGACCGTATGTCATT
TTACTTTTCTTCTTCTGGAAGTTAAGATCATTGGATGTTGACTATGAGAAAACTTTTGTT
GGTACGTTGAGATTGATTTGATTGGTCTTTGATGACGAATATATAAACGTGATCTGTGTC
GCTACT
AAAAAA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2EM13TF 691 0 0
TTTTTTTCTGCCCCTGACCTGTATACTGAGCTTCATCTCCTCCAATGGCTTCTTTGTCAG
CAACTTCTCTAAGCTTCAAAGCTCCCTCCATACAATCGACCAGAATCTCCCAGGTGTTGA
GGAAACCCTCGAGTTTTCAGTCTATCTCATTTGGTCGTTTCCAGTCTTCAAAGAGCCTTC
GTCTTCAAATCAGTTGCGCTGCAAAACCAGAGACAGTGCAGAAAGTGAGTGACATTGTAA
AGGAACAGTTGGCTTTGTCTGCTGACACTGCGCTCACTGCTGAGTCCAAGTTCTCTGCTC
TTGGCGCCGATTCTCTTGGCACAGTGGAGATAGTGATGGCATTGGAGGAAAAGTTTAACA
TAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGA
TTGAGGATCTTGTTCAGAAGAAACCTGCGGCCTAAACTCCCCCGGTTTAACGCAAACCGG
CTTTCTTTTCCTTTTAGACCTTTCTTGGTTTCGGAGCATTTAATTAGACCGTATGTCATT
TTACTTTTCTTCTTCTGGAAGTTAAGATCATTGGATGTTGACTATGAGAAAACTTTTGTT
GGTACGTTGAGATTGATTTGATTGGTCTTTGATGACGAATATATAAACGTGATCTGTGTC
GCTACTACCACATGAATTTAGCTTTTCTATT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2GT36JQB 347 0 0
TGACACAGTGGAGATAGTGATGGCATTGGAGGAAAAGTTTAACATAAGTGTGGAGGAAGC
TGATGCTCAGAGCATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGATTGAGGATTTTGTTCA
GAAGAAACCTGCGGCCTAAACTCCCCCGGTTTAACGCAAACCGGCTTTTTTTTCCTTT*A
GACCTTTTTTGGTTTCGGAGCATTTAATTAGACCGTATGCCATTTTACTTTTTTTTTTTT
GGAAGTTAAGATCATTGGATGTTGACTATGAGAAAACTTTTGTTGGTACGTTGAGATTGA
TTTGATTGGTCTTTGATGAAGAATATATAAACGTGATCTGTGTCGCT

QA 1 347 1 347
DS 



CO CL287Contig2 656 5 7 U
GGTAGCGACACAGAAGGCATTTATATATATTCGTCATCAAAGACCAATCAAATCAATCTC
AACGTACCAGCCAAAGTTTTCTCATAGTCAATAATATCCAATCTTAACTTCCAGAAGAAG
AAAAATAAATGACATACGGTCTAATTAAACCAAGAAAGGTCTAAAGGAAAAGAAAGCCGG
TTTGCGTTAAACCGGGGGAGTTTAGGCCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAA
ATCAGCCGCCTCTTGAATCGTCGTAATGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACTTATGTT
AAACTTTTCCTCCAATGCCATCACTATCTCCACTGTGTCAAGAGAATCGGCGCCAAGAGC
AGAGAACTTGGACTCAGCAGTGAGCGCAGTGTCAGCAGACAAAGCCAACTGTTCCTTTAC
AATGTCACTCACTTTCTGCACTGTCTCTGGTTTTGCAGCGCAACTGATTTGAAGACGAAG
GCTCTTTGAAGACTGGAAACGACCAAATGAGATAGACTGAAAACTCGAGGGTTTCCTCAA
CACCTGGGAGATTCTGGTCGATTGTATGGAGGGAGCTTTGAAGCTTAGAGAAGTTGCTGA
CAAAGAAGCCATTGGAGGAGATGAAGCTCAGTATACAGGTCAGGGGCAGAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G342JQ U 1
AF RR2A139JQ U 7
AF RR2A139TF C 7
AF RR2FP32JQ U 87
AF RR2FP32TF C 87
BS 1 363 RR2G342JQ
BS 364 364 RR2A139JQ
BS 365 578 RR2G342JQ
BS 579 579 RR2A139JQ
BS 580 647 RR2G342JQ
BS 648 649 RR2A139JQ
BS 650 656 RR2FP32JQ

RD RR2G342JQ 649 0 0
GGTAGCGACACAGAAGGCATTTATATATATTCGTCATCAAAGACCAATCAAATCAATCTC
AACGTACCAGCCAAAGTTTTCTCATAGTCAATAATATCCAATCTTAACTTCCAGAAGAAG
AAAAATAAATGACATACGGTCTAATTAAACCAAGAAAGGTCTAAAGGAAAAGAAAGCCGG
TTTGCGTTAAACCGGGGGAGTTTAGGCCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAA
ATCAGCCGCCTCTTGAATCGTCGTAATGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACTTATGTT
AAACTTTTCCTCCAATGCCATCACTATCTCCACTGTGTCAAGAGAATCGGCGCCAAGAGC
AGAAAACTTGGACTCAGCAGTGAGCGCAGTGTCAGCAGACAAAGCCAACTGTTCCTTTAC
AATGTCACTCACTTTCTGCACTGTCTCTGGTTTTGCAGCGCAACTGATTTGAAGACGAAG
GCTCTTTGAAGACTGGAAACGACCAAATGAGATAGACTGAAAACTCGAGGGTTTCCTCAA
CACCTGGGAGATTCTGGTCGATTGTATGGAGGGAGCTTCGAAGCTTAGAGAAGTTGCTGA
CAAAGAAGCCATTGGAGGAGATGAAGCTCAGTATACAGGTCAGGGGC
CC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2A139JQ 643 0 0
GACACAGAAGGCATTTA
TATATATTCGTCATCAAAGACCAATCAAATCAATCTCAACGTACCAGCCAAAGTTTTCTC
ATAGTCAATAATATCCAATCTTAACTTCCAGAAGAAGAAAAATAAATGACATACGGTCTA
ATTAAACCAAGAAAGGTCTAAAGGAAAAGAAAGCCGGTTTGCGTTAAACCGGGGGAGTTT
AGGCCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAAATCAGCCGCCTCTTGAATCGTCG
TAATGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACTTATGTTAAACTTTTCCTCCAATGCCATCA
CTATCTCCACTGTGTCAAGAGAATCGGCGCCAAGAGCAGAGAACTTGGACTCAGCAGTGA
GCGCAGTGTCAGCAGACAAAGCCAACTGTTCCTTTACAATGTCACTCACTTTCTGCACTG
TCTCTGGTTTTGCAGCGCAACTGATTTGAAGACGAAGGCTCTTTGAAGACTGGAAACGAC
CAAATGAGATAGACTGAAAACTCGAGGGTTTCCTCAACACCTGGGAGATTCTGGTCGATT
GTATGGAGGGAGCTTTGAAGCTTAGAGAAGTTGCTGACAAAGAAGCCATTGGAGGAGATG
AAGCTCAGTATACAGGTCAGGGGCAG

QA 18 643 18 643
DS 

RD RR2A139TF 643 0 0
GACACAGAAGGCATTTA
TATATATTCGTCATCAAAGACCAATCAAATCAATCTCAACGTACCAGCCAAAGTTTTCTC
ATAGTCAATAATATCCAATCTTAACTTCCAGAAGAAGAAAAATAAATGACATACGGTCTA
ATTAAACCAAGAAAGGTCTAAAGGAAAAGAAAGCCGGTTTGCGTTAAACCGGGGGAGTTT
AGGCCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAAATCAGCCGCCTCTTGAATCGTCG
TAATGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACTTATGTTAAACTTTTCCTCCAATGCCATCA
CTATCTCCACTGTGTCAAGAGAATCGGCGCCAAGAGCAGAGAACTTGGACTCAGCAGTGA
GCGCAGTGTCAGCAGACAAAGCCAACTGTTCCTTTACAATGTCACTCACTTTCTGCACTG
TCTCTGGTTTTGCAGCGCAACTGATTTGAAGACGAAGGCTCTTTGAAGACTGGAAACGAC
CAAATGAGATAGACTGAAAACTCGAGGGTTTCCTCAACACCTGGGAGATTCTGGTCGATT
GTATGGAGGGAGCTTTGAAGCTTAGAGAAGTTGCTGACAAAGAAGCCATTGGAGGAGATG
AAGCTCAGTATACAGGTCAGGGGCAG

QA 18 643 18 643
DS 

RD RR2FP32JQ 570 0 0
GTCAATAATATCCAATCTTAACTTCCAGAAGAAGAAAAATAAATGACATACGGTCTAATT
AAACCAAGAAAGGTCTAAAGGAAAAGAAAGCCGGTTTGCGTTAAACCGGGGGAGTTTAGG
CCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAAATCAGCCGCCTCTTGAATCGTCGTAA
TGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACTTATGTTAAACTTTTCCTCCAATGCCATCACTA
TCTCCACTGTGTCAAGAGAATCGGCGCCAAGAGCAGAAAACTTGGACTCAGCAGTGAGCG
CAGTGTCAGCAGACAAAGCCAACTGTTCCTTTACAATGTCACTCACTTTCTGCACTGTCT
CTGGTTTTGCAGCGCAACTGATTTGAAGACGAAGGCTCTTTGAAGACTGGAAACGACCAA
ATGAGATAGACTGAAAACTCGAGGGTTTCCTCAACACCTGGGAGATTCTGGTCGATTGTA
TGGAGGGAGCTTTGAAGCTTAGAGAAGTTGCTGACAAAGAAGCCATTGGAGGAGATGAAG
CTCAGTATACAGGTCAGGGGCAGAAAAAAA

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2FP32TF 570 0 0
GTCAATAATATCCAATCTTAACTTCCAGAAGAAGAAAAATAAATGACATACGGTCTAATT
AAACCAAGAAAGGTCTAAAGGAAAAGAAAGCCGGTTTGCGTTAAACCGGGGGAGTTTAGG
CCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAAATCAGCCGCCTCTTGAATCGTCGTAA
TGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACTTATGTTAAACTTTTCCTCCAATGCCATCACTA
TCTCCACTGTGTCAAGAGAATCGGCGCCAAGAGCAGAGAACTTGGACTCAGCAGTGAGCG
CAGTGTCAGCAGACAAAGCCAACTGTTCCTTTACAATGTCACTCACTTTCTGCACTGTCT
CTGGTTTTGCAGCGCAACTGATTTGAAGACGAAGGCTCTTTGAAGACTGGAAACGACCAA
ATGAGATAGACTGAAAACTCGAGGGTTTCCTCAACACCTGGGAGATTCTGGTCGATTGTA
TGGAGGGAGCTTTGAAGCTTAGAGAAGTTGCTGACAAAGAAGCCATTGGAGGAGATGAAG
CTCAGTATACAGGTCAGGGGCAGAAAAAAA

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 14

CO CL288Contig1 1320 14 21 U
GGTACCAGTTGTTGTTTTATTGAATTTGCCCCATTAATAGGCTCCCGATTTGACTTTGAT
CGTTATGGGCTAGTACCAAGATCAAGTCCTAGACAGGCGGACCTTATTTTAACAGCAGGT
ACAGTAACAATGAAAATGGCTCCTTCTTTAGTGAGATTATATGAACAAATGCCTGAACCA
AAGTATGTTATTGCTATGGGAGCGTGTACAATTACAGGGGGGATGTTCAGTACCGATTCT
TATAGTACTGTTCGAGGGGTTGATAAGCTAATTCCTGTAGATGTCTATTTGCCGGGTTGT
CCACCTAAACCAGAGGCTGTTATAGACGCTATAACAAAGCTTCGTAAGAAAATAGCTAGA
GAAATCTATAAGGATCGAATTAGACCTCAACGGGGTAATCGGTGTTTTACTACCAATCAC
AAGTTTTTTGTTGTACGCAGTACGCAGACTGGAAATTATGATCAAGAATTACTCTATCCA
CCATCATCTACTTCAGAGATCTCTACTGAAACATTTTTTAAATACAAAAGCCCAGTATCT
TCCCACGAATTAGTGAATTAGGGAGGATTTGAGAGAATAAGAAAAAAATCTTCATAAATT
AGAACTCATGGTAAATGTGAAAGACTTAAATTTATATAAAAAAGGTGTGGGGGAAATAAA
AAAGATGCAGGGCACTTTGTCCGTTTGGCTAGCCAAACGGGGGCTGGTTCATAGATCGTT
GGGCTTCGATTACCAAGGAATAGAGACTTTACAAATAAAGCCCGAAGATTGGCATTCTAT
TGCTGTAATTTTATATGTATATGGTTACAATTATTTACGTTCCCAATGTGCCTATGATGT
GGCACCAGGTGGCCTCTTAGCCAGTGTGTATCATCTTACGAGAATAGAATATGGTGTCAA
TCAAGCGGAAGAAGTTTGCATAAAAGTATTTACTCACAGGAGTAATCCCAGAATTCCATC
TGTTTTCTGGGTTTGGAAAAGTACGGATTTTCAAGAACGGGAATCTTATGATATGTTAGG
AATCACTTATGATAGCCATCCTCGGATGAAACGGATCTTAATGCCCGAAAGTTGGATAGG
GTGGCCTTTACGTAAGGATTATATTGCCCCCAATTTTTATGAAATACAAGATGCTTATTG
AATGATAAAAAATGAGTCTTAGTTTCTACAACTACGGACCTTCGCGGAATATTTTTAATT
CGATTCGTTTTTAGATCAAACAAACAGAAGAATAAAGGTCTTATTCATATTATTATAGAT
AGCTTAATCTCCAATTTGAAAGATACTTTTTTCCTAAAAGCCGAGCCAATAGGATGAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 

AF RR2CO64TF U 1
AF RR2FP59TF U 217
AF RR2A081TF U 378
AF RR2FL30JQ C 580
AF RR2CO64JQ C 705
AF RR2FL30TF U 580
AF RR2H386JQ C 727
AF RR2H386TF U 727
AF RR2FP59JQ C 833
AF RR2GH13JQB C 1017
AF RR2GH13TF U 1017
AF RR2DJ65JQ C 841
AF RR2DJ65TF U 841
AF RR2A081JQ C 963
BS 1 332 RR2CO64TF
BS 333 333 RR2FP59TF
BS 334 454 RR2CO64TF
BS 455 455 RR2FP59TF
BS 456 642 RR2CO64TF
BS 643 643 RR2FP59TF
BS 644 662 RR2CO64TF
BS 663 979 RR2FP59TF
BS 980 985 RR2A081TF
BS 986 986 RR2FL30TF
BS 987 1151 RR2A081TF
BS 1152 1152 RR2FL30TF
BS 1153 1176 RR2A081TF
BS 1177 1177 RR2FL30TF
BS 1178 1188 RR2A081TF
BS 1189 1210 RR2FL30TF
BS 1211 1211 RR2H386TF
BS 1212 1237 RR2FL30TF
BS 1238 1238 RR2H386TF
BS 1239 1291 RR2FL30TF
BS 1292 1320 RR2H386TF

RD RR2CO64TF 662 0 0
GGTACCAGTTGTTGTTTTATTGAATTTGCCCCATTAATAGGCTCCCGATTTGACTTTGAT
CGTTATGGGCTAGTACCAAGATCAAGTCCTAGACAGGCGGACCTTATTTTAACAGCAGGT
ACAGTAACAATGAAAATGGCTCCTTCTTTAGTGAGATTATATGAACAAATGCCTGAACCA
AAGTATGTTATTGCTATGGGAGCGTGTACAATTACAGGGGGGATGTTCAGTACCGATTCT
TATAGTACTGTTCGAGGGGTTGATAAGCTAATTCCTGTAGATGTCTATTTGCCGGGTTGT
CCACCTAAACCAGAGGCTGTTATAGACGCTATGACAAAGCTTCGTAAGAAAATAGCTAGA
GAAATCTATAAGGATCGAATTAGACCTCAACGGGGTAATCGGTGTTTTACTACCAATCAC
AAGTTTTTTGTTGTACGCAGTACGCAGACTGGAATTTATGATCAAGAATTACTCTATCCA
CCATCATCTACTTCAGAGATCTCTACTGAAACATTTTTTAAATACAAAAGCCCAGTATCT
TCCCACGAATTAGTGAATTAGGGAGGATTTGAGAGAATAAGAAAAAAATCTTCATAAATT
AGAACTCATGGTAAATGTGAAAGACTTAAATTTATATAAAAA*GGTGTGGGGGAAATAAA
AA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2FP59TF 763 0 0
GGGGGGATGTTCAGTACCGATTCTTATAGTACTGTTCGAGGGGTTGATAAGCTAATTCCT
GTAGATGTCTATTTGCCGGGTTGTCCACCTAAACCAGAGGCTGTTATAGACGCTATAACA
AAGCTTCGTAAGAAAATAGCTAGAGAAATCTATAAGGATCGAATTAGACCTCAACGGGGT
AATCGGTGTTTTACTACCAATCACAAGTTTTTTGTTGTACGCAGTACGCAGACTGGAAAT
TATGATCAAGAATTACTCTATCCACCATCATCTACTTCAGAGATCTCTACTGAAACATTT
TTTAAATACAAAAGCCCAGTATCTTCCCACGAATTAGTGAATTAGGGAGGATTTGAGAGA
ATAAGAAAAAAATCTTCATAAATTAGAACTCATGGTAAATGTGAAAGACTTAAATTTATA
TAAAAAAGGTGTGGGGGAAATAAAAAAGATGCAGGGCACTTTGTCCGTTTGGCTAGCCAA
ACGGGGGCTGGTTCATAGATCGTTGGGCTTCGATTACCAAGGAATAGAGACTTTACAAAT
AAAGCCCGAAGATTGGCATTCTATTGCTGTAATTTTATATGTATATGGTTACAATTATTT
ACGTTCCCAATGTGCCTATGATGTGGCACCAGGTGGCCTCTTAGCCAGTGTGTATCATCT
TACGAGAATAGAATATGGTGTCAATCAAGCGGAAGAAGTTTGCATAAAAGTATTTACTCA
CAGGAGTAATCCCAGAATTCCATCTGTTTTCTGGGTTTGGAAA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2A081TF 817 0 0
AATTAGACCTCAACGGGGTAATCGGTGTTTTACTACCAATCACAAGTTTTTTGTTGTACA
CAGTACGCAGACTGGAAATTATGATCAAGAATTACTCTATCCACCATCATCTACTTCAGA
GATCTCTACTGAAACATTTTTTAAATACAAAAGCCCAGTATCTTCCCACGAATTAGTGAA
TTAGGGAGGATTTGAGAGAATAAGAAAAAAATCTTCATAAATTAGAACTCATGGTAAATG
TGAAAGACTTAAATTTATATAAAAAAGGTGTGGGGGAAATAAAAAAGATGCAGGGCACTT
TGTCCGTTTGGCTAGCCAAACGGGGGCTGGTTCATAGATCGTTGGGCTTCGATTACCAAG
GAATAGAGACTTTACAAATAAAGCCCGAAGATTGGCATTCTATTGCTGTAATTTTATATG
TATATGGTTACAATTATTTACGTTCCCAATGTGCCTATGATGTGGCACCAGGTGGCCTCT
TAGCCAGTGTGTATCATCTTACGAGAATAGAATATGGTGTCAATCAAGCGGAAGAAGTTT
GCATAAAAGTATTTACTCACAGGAGTAATCCCAGAATTCCATCTGTTTTCTGGGTTTGGA
AAAGTACGTATTTTCAAGAACGGGAATCTTATGATATGTTAGGAATCACTTATGATAGCC
ATCCTCGGATGAAACGGATCTTAATGCCCGAAAGTTGGATAGGGTGGCCTTTACGTAAGG
ATTATATTGCCCCCAATTTTTATGAAATACAAGATGCTTATTGAATGATAAAAA*TGAGT
CTTAGTTTCTACAACTACG*ACCTTCGCGGA
TATTTT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2FL30JQ 741 0 0
G
GAAAAAAATCTTCATAAATTAGAACTCATGGTAAATGTGAAAGACTTAAATTTATATAAA
AAAGGTGTGGGGGAAATAAAAAAGATGCAGGGCACTTTGTCCGTTTGGCTAGCCAAACGG
GGGCTGGTTCATAGATCGTTGGGCTTCGATTACCAAGGAATAGAGACTTTACAAATAAAG
CCCGAAGATTGGCATTCTATTGCTGTAATTTTATATGTATATGGTTACAATTATTTACGT
TCCCAATGTGCCTATGATGTGGCACCAGGTGGCCTCTTAGCCAGTGTGTATCATCTTACG
AGAATAGAATATGGTGTCAATCAAGCGGAAGAAGTTTGCATAAAAGTATTTACTCACAGG
AGTAATCCCAGAATTCCATCTGTTTTCTGGGTTTGGAAAAGTACGGATTTTCAAGAACGG
GAATCTTATGATATGTTAGGAATCACTTATGATAGCCATCCTCGGATGAAACGGATCTTA
ATGCCCGAAAGTTGGATAGGGTGGCCTTTACGTAAGGATTATATTGCCCCCAATTTTTAT
GAAATACAAGATGCTTATTGAATGATAAAAAATGAGTCTTAGTTTCTACAACTACGGACC
TTCGCGGAATATTTTTAATTCGATTCGTTTCTAGATCAAACAAACAGAAGAATAAAGGTC
TTATTCATATTATTATAGATAGCTTAATCTCCAATTTGAAAGATACTTTTTTCCTAAAAG
CCGAGCCAATAGGATGAAC
C

QA 2 740 2 740
DS 

RD RR2CO64JQ 564 0 0
TGGTTCATAGATCGTTGGGCTTCGATTACCAAGGAATAGAGACTTTACAAATAAAGCCCG
AAGATTGGCATT**ATTGCTGTAATTTTATATGTATATGGTTACAATTATTTACGTTCCC
AATGTGCCTATGATGTGGCGCCAGGTGGCCTCTTAGCCAGTGTGTATCATCTTACGAGAA
TAGAATATGGTGTCAATCAAGCGGAAGAAGTTTGCATAAAAGTATTTACTCACAGGAGTA
ATCCCAGAATTCCATCTGTTTTCTGGGTTTGGAAAAGTACGGATTTTCAAGAACGGGAAT
CTTATGATATGTTAGGAATCACTTATGATAGCCATCCTCGGATGAAACGGATCTTAATGC
CCGAAAGTTGGATAGGGTGGCCTTTACGTAAGGATTATATTGCCCC*AATTTTTATGAAA
TACAAGATGCTTATTGAATGATAAAAAATGAGTCTTAGTTTCTACAACTACGGACCTTCG
CGGAATATTTTTAATTCGATTCGTTTTTAGATCAAACAAACAGAAGAATAAAGGTCTTAT
TCATATTATTATAGATAGCTTAAT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2FL30TF 727 0 0
G
GAAAAAAATCTTCATAAATTAGAACTCATGGTAAATGTGAAAGACTTAAATTTATATAAA
AAAGGTGTGGGGGAAATAAAAAAGATGCAGGGCACTTTGTCCGTTTGGCTAGCCAAACGG
GGGCTGGTTCATAGATCGTTGGGCTTCGATTACCAAGGAATAGAGACTTTACAAATAAAG
CCCGAAGATTGGCATTCTATTGCTGTAATTTTATATGTATATGGTTACAATTATTTACGT
TCCCAATGTGCCTATGATGTGGCACCAGGTGGCCTCTTAGCCAGTGTGTATCATCTTACG
AGAATAGAATATGGTGTCAATCAAGCGGAAGAAGTTTGCATAAAAGTATTTACTCACAGG
AGTAATCCCAGAATTCCATCTGTTTTCTGGGTTTGGAAAAGTACGGATTTTCAAGAACGG
GAATCTTATGATATGTTAGGAATCACTTATGATAGCCATCCTCGGATGAAACGGATCTTA
ATGCCCGAAAGTTGGATAGGGTGGCCTTTACGTAAGGATTATATTGCCCCCAATTTTTAT
GAAATACAAGATGCTTATTGAATGATAAAAAATGAGTCTTAGTTTCTACAACTACGGACC
TTCGCGGAATATTTTTAATTCGATTCGTTTCTAGATCAAACAAACAGAAGAATAAAG*TC
TTATTCATATTATTATAGATAGCTTAATCTCCAATTTGAAAGATACTTTTT
CCTAAAGCCGAGCCA

QA 2 712 2 712
DS 

RD RR2H386JQ 594 0 0
G
GATTACCAAGGAATAGAGACTTTACAAATAAAGCCCGAAGATTGGCATTCTATTGCTGTA
ATTTTATATGTATATGGTTACAATTATTTACGTTCCCAATGTGCCTATGATGTGGCACCA
GGTGGCCTCTTAGCCAGTGTGTATCATCTTACGAGAATAGAATATGGTGTCAATCAAGCG
GAAGAAGTTTGCATAAAAGTATTTACTCACAGGAGTAATCCCAGAATTCCATCTGTTTTC
TGGGTTTGGAAAAGTACGGATTTTCAAGAACGGGAATCTTATGATATGTTAGGAATCACT
TATGATAGCCATCCTCGGATGAAACGGATCTTAATGCCCGAAAGTTGGATAGGGTGGCCT
TTACGTAAGGATTATATTGCCCCCAATTTTTATGAAATACAAGATGCTTATTGAATGATA
AAAAATGAGTCTTAGTTTCTACAACTACGGACCTTCGCGGAATATTTTTAATTCGATTCG
TTTTTAGATCAAACAAACAGAAGAATAAAGGTCTTATTCATATTATTATAGATAGCTTAA
TCTCCAATTTGAAAGATACTTTTTTCCTAAAAGCCGAGCCAATAGGATGAACT

QA 2 594 2 594
DS 

RD RR2H386TF 594 0 0
G
GATTACCAAGGAATAGAGACTTTACAAATAAAGCCCGAAGATTGGCATTCTATTGCTGTA
ATTTTATATGTATATGGTTACAATTATTTACGTTCCCAATGTGCCTATGATGTGGCACCA
GGTGGCCTCTTAGCCAGTGTGTATCATCTTACGAGAATAGAATATGGTGTCAATCAAGCG
GAAGAAGTTTGCATAAAAGTATTTACTCACAGGAGTAATCCCAGAATTCCATCTGTTTTC
TGGGTTTGGAAAAGTACGGATTTTCAAGAACGGGAATCTTATGATATGTTAGGAATCACT
TATGATAGCCATCCTCGGATGAAACGGATCTTAATGCCCGAAAGTTGGATAGGGTGGCCT
TTACGTAAGGATTATATTGCCCCCAATTTTTATGAAATACAAGATGCTTATTGAATGATA
AAAAATGAGTCTTAGTTTCTACAACTACGGACCTTCGCGGAATATTTTTAATTCGATTCG
TTTTTAGATCAAACAAACAGAAGAATAAAGGTCTTATTCATATTATTATAGATAGCTTAA
TCTCCAATTTGAAAGATACTTTTTTCCTAAAAGCCGAGCCAATAGGATGAACT

QA 2 594 2 594
DS 

RD RR2FP59JQ 488 0 0
TATGATGTGGCACCAGGTGGCCTCTTAGCCAGTGTGTATCATCTTACGAGAATAGAATAT
GGTGTCAATCAAGCGGAAGAAGTTTGCATAAAAGTATTTACTCACAGGAGTAATCCCAGA
ATTCCATTTGTTTTTTGGGTTTGGAAAAGTACGGATTTTCAAGAACGGGAATTTTATGAT
ATGTTAGGAATCACTTATGATAGCCATCCTCGGATGAAACGGATTTTAATGCCCGAAAGT
TGGATAGGGTGGCCTTTACGTAAGGATTATATTGCCCCCAATTTTTATGAAATACAAGAT
GCTTATTGAATGATAAAAAATGAGTTTTAGTTTTTACAATTACGGACCTTCGCGGAATAT
TTTTAATTCGATTCGTTTTTAGATCAAACAAACAGAAGAATAAAGGTTTTATTCATATTA
TTATAGATAGCTTAATCTCCAATTTGAAAGATACTTTTTTCCTAAAAGCCGAGCCAATAG
GATGAACT

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2GH13JQB 304 0 0
G
AGGAATCACTTATGATAGCCATCCTCGGATGAAACGGATCTTAATGCCCGAAAGTTGGAT
AGGGTGGCCTTTACGTAAGGATTATATTGCCCCCAATTTTTATGAAATACAAGATGCTTA
TTGAATGATAAAAAATGAGTTTTAGTTTTTACAACTACGGACCTTCGCGGAATATTTTTA
ATTCGATTCGTTTTTAGATCAAACAAACAGAAGAATAAAGGTTTTATTCATATTATTATA
GATAGCTTAATCTCCAATTTGAAAGATACTTTTTTCCTAAAAGCCGAGCCAATAGGATGA
ACT

QA 2 304 2 304
DS 

RD RR2GH13TF 304 0 0
G
AGGAATCACTTATGATAGCCATCCTCGGATGAAACGGATCTTAATGCCCGAAAGTTGGAT
AGGGTGGCCTTTACGTAAGGATTATATTGCCCCCAATTTTTATGAAATACAAGATGCTTA
TTGAATGATAAAAAATGAGTCTTAGTTTCTACAACTACGGACCTTCGCGGAATATTTTTA
ATTCGATTCGTTTTTAGATCAAACAAACAGAAGAATAAAGGTCTTATTCATATTATTATA
GATAGCTTAATCTCCAATTTGAAAGATACTTTTTTCCTAAAAGCCGAGCCAATAGGATGA
ACT

QA 2 304 2 304
DS 

RD RR2DJ65JQ 480 0 0
GGCACCAGGTGGCCTTTTAGCCAGTGTGTATCATCTTACGAGAATAGAATATGGTGTCAA
TCAAGCGGAAGAAGTTTGCATAAAAGTATTTACTCACAGGAGTAATCCCAGAATTCCATC
TGTTTTCTGGGTTTGGAAAAGTACGGATTTTCAAGAACGGGAATCTTATGATATGTTAGG
AATCACTTATGATAGCCATCCTCGGATGAAACGGATCTTAATGCCCGAAAGTTGGATAGG
GTGGCCTTTACGTAAGGATTATATTGCCCCCAATTTTTATGAAATACAAGATGCTTATTG
AATGATAAAAAATGAGTCTTAGTTTCTACAACTACGGACCTTCGCGGAATATTTTTAATT
CGATTCGTTTTTAGATCAAGCAAACAGAAGAATAAAGGTCTTATTCATATTATTATAGAT
AGCTTAATCTCCAATTTGAAAGATACTTTTTTCCTAAAAGCCGAGCCAATAGGATGAACT

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2DJ65TF 480 0 0
GGCACCAGGTGGCCTCTTAGCCAGTGTGTATCATCTTACGAGAATAGAATATGGTGTCAA
TCAAGCGGAAGAAGTTTGCATAAAAGTATTTACTCACAGGAGTAATCCCAGAATTCCATC
TGTTTTCTGGGTTTGGAAAAGTACGGATTTTCAAGAACGGGAATCTTATGATATGTTAGG
AATCACTTATGATAGCCATCCTCGGATGAAACGGATCTTAATGCCCGAAAGTTGGATAGG
GTGGCCTTTACGTAAGGATTATATTGCCCCCAATTTTTATGAAATACAAGATGCTTATTG
AATGATAAAAAATGAGTCTTAGTTTCTACAACTACGGACCTTCGCGGAATATTTTTAATT
CGATTCGTTTTTAGATCAAGCAAACAGAAGAATAAAGGTCTTATTCATATTATTATAGAT
AGCTTAATCTCCAATTTGAAAGATACTTTTTTCCTAAAAGCCGAGCCAATAGGATGAACT

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2A081JQ 358 0 0
TTTTCTGGGTTTGGAAAAGTACGTATTTTCAAGAACGGGAATTTTATGATATGTTAGGAA
TCACTTATGATAGCCATCCTCGGATGAAACGGATTTTAATGCCCGAAAGTTGGATAGGGT
GGCCTTTACGTAAGGATTATATTGCCCCCAATTTTTATGAAATACAAGATGCTTATTGAA
TGATAAAAAATGAGTTTTAGTTTTTACAATTACGGACCTTCGCGGAATATTTTTAATTCG
ATTCGTTTTTAGATCAAACAAACAGAAGAATAAAGGTTTTATTCATATTATTATAGATAG
CTTAATTTCCAATTTGAAAGATACTTTTTTCCTAAAAGCCGAGCCAATAGGATGAACT

QA 1 358 1 358
DS 



AS 2 14

CO CL289Contig1 626 12 6 U
TTTTTTGCTTCTAACCTTCTAAGCGAAAATGGTGTTCAAGAGGTACGTGGAGATTGGGAG
AGTTGCACTTGTGAACTACGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATTGTCGACGTCGT
TGACCAGAACAGGGCTTTGGTTGACGCCCCAGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAA
GAGGTTGTCTCTCACCGATATCGTGATTGAGATCAACAGAGTCCCAAAGAAGAAGGCCTT
GATCGAGGCCATGGAGAAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAG
GAAGCTTATTGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTCGACAGGTTCAAGATCAT
GTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGA
GATCACTGCTTGATCCAATTGAGTATTATCTGCGTGTCTTTTTTTTCTTTGTATTTTGGA
TTGGCAAGTAGTGTTTTT*GGGAAGTCTCAGCATCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTT
AATTCCAAGTTTAAAACCTTCGAAATATTTAGTTTGTTATTTCATATTTAGCTCTATTTA
CCAAAGTTCCATTTGCTTTGTTAAAA


BQ
45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 40 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 60 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO89TF U 1
AF RR2BX09TF U 1
AF RR2B223JQ C 7
AF RR2B223TF U 7
AF RR2BX09JQ C 15
AF RR2FW77TF U 1
AF RR2GX71JQ C 257
AF RR2H994JQ C 102
AF RR2H994TF U 1
AF RR2CK34JQ C 1
AF RR2CK34TF U 1
AF RR2GX71TF U 1
BS 1 498 RR2BO89TF
BS 499 499 RR2BX09TF
BS 500 563 RR2BO89TF
BS 564 583 RR2BX09TF
BS 584 610 RR2CK34TF
BS 611 626 RR2GX71TF

RD RR2BO89TF 563 0 0
TTTTTTGCTTCTAACCTTCTAAGCGAAAATGGTGTTCAAGAGGTACGTGGAGATTGGGAG
AGTTGCACTTGTGAACTACGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATTGTCGACGTCGT
TGACCAGAACAGGGCTTTGGTTGACGCCCCAGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAA
GAGGTTGTCTCTCACCGATATCGTGATTGAGATCAACAGAGTCCCAAAGAAGAAGGCCTT
GATCGAGGCCATGGAGAAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAG
GAAGCTTATTGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTCGACAGGTTCAAGATCAT
GTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGA
GATCACTGCTTGATCCAATTGAGTATTATCTGCGTGTCTTTTTTTTCTTTGTATTTTGGA
TTGGCAAGTAGTGTTTTTTGGGAAGTCTCAGCATCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTT
AATTCCAAGTTTAAAACCTTCGA

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2BX09TF 583 0 0
TTTTTTGCTTCTAACCTTCTAAGCGAAAATGGTGTTCAAGAGGTACGTGGAGATTGGGAG
AGTTGCACTTGTGAACTACGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATTGTCGACGTCGT
TGACCAGAACAGGGCTTTGGTTGACGCCCCAGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAA
GAGGTTGTCTCTCACCGATATCGTGATTGAGATCAACAGAGTCCCAAAGAAGAAGGCCTT
GATCGAGGCCATGGAGAAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAG
GAAGCTTATTGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTCGACAGGTTCAAGATCAT
GTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGA
TATCACTGCTTGATCCAATTGAGTATTATCTGCGTGTCTTTTTTTTCTTTGTATTTTGGA
TTGGCAAGTAGTGTTTTT*GGGAAGTCTCAGCATCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTT
AATTCCAAGTTTAAAACCTTCGAAATATTTAGTTTGTTATTTC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2B223JQ 556 0 0
GCTTCTAACCTTCTAAGCGAAAATGGTATTCAAGAGGTACGTGGAGATTGGGAGAGTTGC
ACTTGTGAACTACGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATTGTCGACGTCGTTGACCA
GAACAGGGCTTTGGTTGACGCCCCAGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAAGAGGTT
GTCTCTCACCGATATCGTGATTGAGATCAACAGAGTCCCAAAGAAGAAGGCCTTGATCGA
GGCCATGGAGAAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCT
TATTGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTCGACAGGTTCAAGATCATGTTGGC
CAAAATCAAGAAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGAGATCAC
TGCTTGATCCAATTGAGTATTATCTGCGTGTCTTTTTTTTCTTTGTATTTTGGATTGGCA
AGTAGTGTTTTT*GGGAAGTCTCAGCATCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTTAATTCC
AAGTTTAAAACCTTCG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2B223TF 556 0 0
GCTTCTAACCTTCTAAGCGAAAATGGTATTCAAGAGGTACGTGGAGATTGGGAGAGTTGC
ACTTGTGAACTACGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATTGTCGACGTCGTTGACCA
GAACAGGGCTTTGGTTGACGCCCCAGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAAGAGGTT
GTCTCTCACCGATATCGTGATTGAGATCAACAGAGTCCCAAAGAAGAAGGCCTTGATCGA
GGCCATGGAGAAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCT
TATTGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTCGACAGGTTCAAGATCATGTTGGC
CAAAATCAAGAAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGAGATCAC
TGCTTGATCCAATTGAGTATTATCTGCGTGTCTTTTTTTTCTTTGTATTTTGGATTGGCA
AGTAGTGTTTTT*GGGAAGTCTCAGCATCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTTAATTCC
AAGTTTAAAACCTTCG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2BX09JQ 569 0 0
CCTTTTAAGCGAAAATGGTGTTCAAGAGGTACGTGGAGATTGGGAGAGTTGCACTTGTGA
ACTACGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATTGTGGACGTCGTTGACCAGAACAGGG
CTTTGGTTGACGCCCCAGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAAGAGGTTGTCTCTCA
CCGATATCGTGATTGAGATCAACAGAGTCCCAAAGAAGAAGGCCTTGATCGAGGCCATGG
AGAAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTTATTGTTC
AGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTCGACAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCA
AGAAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGATATCACTGCTTGAT
CCAATTGAGTATTATCTGCGTGTCTTTTTTTTCTTTGTATTTTGGATTGGCAAGTAGTGT
TTTT*GGGAAGTCTCAGCATCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTTAATTCCAAGTTTAA
AACCTTCGAAATATTTAGTTTGTTATTTC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2FW77TF 582 0 0
TTTTTTGCTTCTAACCTTCTAAGCGAAAATGGTGTTCAAGAGGTACGTGGAGATTGGGAG
AGTTGCACTTGTGAACTACGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATTGTCGACGTCGT
TGACCAGAACAGGGCTTTGGTTGACGCCCCAGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAA
GAGGTTGTCTCTCACCGATATCGTGATTGAGATCAACAGAGTCCCAAAGAAGAAGGCCTT
GATCGAGGCCATGGAGAAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAG
GAAGCTTATTGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTCGACAGGTTCAAGATCAT
GTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGA
GATCACTGCTTGATCCAATTGAGTATTATCTGCGTGTCTTTTTTTTCTTTGTATTTTGGA
TTGGCAAGTAGTGTTTTT*GGGAAGTCTCAGCATCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTT
AATTCCAAGTTTAAAACCTTCGAAATATTTAGTTTGTTATTT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2GX71JQ 314 0 0
AAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTTATTGTTCAG
AAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTCGACAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAAG
AAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGAGATCACTGCTTGATCC
AATTGAGTATTATCTGCGTGTCTTTTTTTTCTTTGTATTTTGGATTGGCAAGTAGTGTTT
TT*GGGAAATCACAGCATCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTTAATTCCAAGTTTAAAA
CCTTCGAAATATTT

QA 1 314 1 314
DS 

RD RR2H994JQ 494 0 0
TCGTCATTGTCGACGTCGTTGACCAGAACAGGGCTTTGGTTGACGCCCCAGACATGGAGA
GGATCCAGATGAACTTCAAGAGGTTGTCTCTCACCGATATCGTGATTGAGATCAACAGAG
TCCCAAAGAAGAAGGCCTTGATCGAGGCCATGGAGAAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGG
AGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTTATTGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATT
TCGACAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGC
TTGCAAAACTCAAGAAGGAGATCACTGCTTGATCCAATTGAGTATTATCTGCGTGTCTTT
TTTTTCTTTGTATTTTGGATTGACAAGTAGTGTTTTT*GGGAAGTCTCAGCATCATTATC
TACACTGTTGTCGGATCTTAATTCCAAGTTTAAAACCTTCGAAATATTTAGTTTGTTATT
TCATATTTAGCTCT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2H994TF 595 0 0
TTTTTTGCTTCTAACCTTCTAAGCGAAAATGGTGTTCAAGAGGTACGTGGAGATTGGGAG
AGTTGCACTTGTGAACTACGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATTGTCGACGTCGT
TGACCAGAACAGGGCTTTGGTTGACGCCCCAGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAA
GAGGTTGTCTCTCACCGATATCGTGATTGAGATCAACAGAGTCCCAAAGAAGAAGGCCTT
GATCGAGGCCATGGAGAAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAG
GAAGCTTATTGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTCGACAGGTTCAAGATCAT
GTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGA
GATCACTGCTTGATCCAATTGAGTATTATCTGCGTGTCTTTTTTTTCTTTGTATTTTGGA
TTGACAAGTAGTGTTTTT*GGGAAGTCTCAGCATCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTT
AATTCCAAGTTTAAAACCTTCGAAATATTTAGTTTGTTATTTCATATTTAGCTCT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2CK34JQ 610 0 0
TTTTTTGCTTCTAACCTTCTAAGCGAAAATGGTGTTCAAGAGGTACGTGGAGATTGGGAG
AGTTGCACTTGTGAACTACGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATTGTCGACGTCGT
TGACCAGAACAGGGCTTTGGTTGACGCCCCAGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAA
GAGGTTGTCTCTCACCGATATCGTGATTGAGATCAACAGAGTCCCAAAGAAGAAGGCCTT
GATCGAGGCCATGGAGAAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAG
GAAGCTTATTGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTCGACAGGTTCAAGATCAT
GTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGA
GATCACTGCTTGATCCAATTGAGTATCATCTGCGTGTCTTTTTTTTCTTTGTATTTTGGA
TTGGCAGGTAGTGTTTTT*GGGAAGTCTCAGCATCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTT
AATTCCAAGTTTAAAACCTTCGAAATATTTAGTTTGTTATTTCATATTTAGCTCTATTTA
CCAAAGTTCC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2CK34TF 610 0 0
TTTTTTGCTTCTAACCTTCTAAGCGAAAATGGTGTTCAAGAGGTACGTGGAGATTGGGAG
AGTTGCACTTGTGAACTACGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATTGTCGACGTCGT
TGACCAGAACAGGGCTTTGGTTGACGCCCCAGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAA
GAGGTTGTCTCTCACCGATATCGTGATTGAGATCAACAGAGTCCCAAAGAAGAAGGCCTT
GATCGAGGCCATGGAGAAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAG
GAAGCTTATTGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTCGACAGGTTCAAGATCAT
GTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGA
GATCACTGCTTGATCCAATTGAGTATCATCTGCGTGTCTTTTTTTTCTTTGTATTTTGGA
TTGGCAGGTAGTGTTTTT*GGGAAGTCTCAGCATCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTT
AATTCCAAGTTTAAAACCTTCGAAATATTTAGTTTGTTATTTCATATTTAGCTCTATTTA
CCAAAGTTCC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2GX71TF 626 0 0
TTTTTTGCTTCTAACCTTCTAAGCGAAAATGGTGTTCAAGAGGTACGTGGAGATTGGGAG
AGTTGCACTTGTGAACTACGGAAAAGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATTGTCGACGTCGT
TGACCAGAACAGGGCTTTGGTTGACGCCCCAGACATGGAGAGGATCCAGATGAACTTCAA
GAGGTTGTCTCTCACCGATATCGTGATTGAGATCAACAGAGTCCCAAAGAAGAAGGCCTT
GATCGAGGCCATGGAGAAGGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAG
GAAGCTTATTGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTCGACAGGTTCAAGATCAT
GTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGCGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGA
GATCACTGCTTGATCCAATTGAGTATTATCTGCGTGTCTTTTTTTTCTTTGTATTTTGGA
TTGGCAAGTAGTGTTTTT*GGGAAGTCTCAGCATCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTT
AATTCCAAGTTTAAAACCTTCGAAATATTTAGTTTGTTATTTCATATTTAGCTCTATTTA
CCAAAGTTCCATTTGCTTTGTTAAAA

QA 1 626 1 626
DS 



CO CL289Contig2 587 2 2 U
TTTTTTTTTGACAAACTAAATATTTCGAAGGTTTTAAACTTGGAATTAAGATCCGACAAC
AGTGTAGATAATGATGCTGAGATTTCCAAAAACACTAATTGCCAATCCAAAATACAAAAG
AAAAAAAAAGACACGCAGATAAATACTCAATTTGATCAAGCAGTGATCTCCTTCTTGAGT
TTTGCAAGCTCTTGCCTGGCAACGCCAGCTTTCTTGATTTTGGCCAACATGATCTTGAAC
CTTTCAAAATCATTGAGGCTAGCCCTACGCTTCTGCACGATAAGCTTCCTACCCCACGAG
CTCTTCTCCCACTTGTTCTTCACGTCAGCCTTCTCCATGGCCTCAATCAAAGCCTTCTTC
TTTGGGACTCTGTTGATCTCAATCACGATATCGGTAAGAGACAACCTCTTGAAGTTCATC
TGGATCCTCTCCATGTCTGGGGCGTCAACCAAAGCCCTGTTCTGGTCAACGACGTCGACA
ATGACGACGAGCTTTCCATGGTCTTTTCCGTAGTTCACAAGTGCAACTCTCCCAATCTCC
ACGTACCTCTTGAACACCATTTTCGCTTAGAAGGTTAGAAGCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EG69TF C 1
AF RR2EG69JQ U 10
BS 1 10 RR2EG69TF
BS 11 587 RR2EG69JQ

RD RR2EG69TF 587 0 0
TTTTTTTTTGACAAACTAAATATTTCGAAGGTTTTAAACTTGGAATTAAGATCCGACAAC
AGTGTAGATAATGATGCTGAGATTTCCAAAAACACTAATTGCCAATCCAAAATACAAAAG
AAAAAAAAAGACACGCAGATAAATACTCAATTTGATCAAGCAGTGATCTCCTTCTTGAGT
TTTGCAAGCTCTTGCCTGGCAACGCCAGCTTTCTTGATTTTGGCCAACATGATCTTGAAC
CTTTCAAAATCATTGAGGCTAGCCCTACGCTTCTGCACGATAAGCTTCCTACCCCACGAG
CTCTTCTCCCACTTGTTCTTCACGTCAGCCTTCTCCATGGCCTCAATCAAAGCCTTCTTC
TTTGGGACTCTGTTGATCTCAATCACGATATCGGTAAGAGACAACCTCTTGAAGTTCATC
TGGATCCTCTCCATGTCTGGGGCGTCAACCAAAGCCCTGTTCTGGTCAACGACGTCGACA
ATGACGACGAGCTTTCCATGGTCTTTTCCGTAGTTCACAAGTGCAACTCTCCCAATCTCC
ACGTACCTCTTGAACACCATTTTCGCTTAGAAGGTTAGAAGCAAAAA

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2EG69JQ 578 0 0
G
ACAAACTAAATATTTCGAAGGTTTTAAACTTGGAATTAAGATCCGACAACAGTGTAGATA
ATGATGCTGAGATTTCCAAAAACACTAATTGCCAATCCAAAATACAAAAGAAAAAAAAAG
ACACGCAGATAAATACTCAATTTGATCAAGCAGTGATCTCCTTCTTGAGTTTTGCAAGCT
CTTGCCTGGCAACGCCAGCTTTCTTGATTTTGGCCAACATGATCTTGAACCTTTCAAAAT
CATTGAGGCTAGCCCTACGCTTCTGCACGATAAGCTTCCTACCCCACGAGCTCTTCTCCC
ACTTGTTCTTCACGTCAGCCTTCTCCATGGCCTCAATCAAAGCCTTCTTCTTTGGGACTC
TGTTGATCTCAATCACGATATCGGTAAGAGACAACCTCTTGAAGTTCATCTGGATCCTCT
CCATGTCTGGGGCGTCAACCAAAGCCCTGTTCTGGTCAACGACGTCGACAATGACGACGA
GCTTTCCATGGTCTTTTCCGTAGTTCACAAGTGCAACTCTCCCAATCTCCACGTACCTCT
TGAACACCATTTTCGCTTAGAAGGTTAGAAGCAAAAA

QA 2 578 2 578
DS 



AS 2 13

CO CL290Contig1 858 11 30 U
GGAACACCGAGAGAGTCCGTTTTAGCACCAATAAGATTCTCTGTCTCTCCAATCCTCGTC
GTTCTGAAGAATCTCTGAGACCACTAACTCCAATGGCGGAATCTGCAGCTGCTCAAACTC
AATCGCTCTCCGAGCAATATCATTTGGAGAAAGAAGTGAAGCAAGACACAAGTGCTAAGC
CTGTC******GAGGTTGCTCCAGAGGTTACTACTCAAGCTGAAGAGGTCAGCACCGACA
AAGCCGGTGAAGAATCTCCTGCTGTTGAGGTTGAGGACAAGTCTGAGTCTCCTCCTGCT*
**TCTGAAGAGGCTCCTGCTGTGGCAGCAGAAGACAATGCTGATGAGGCTCCTGCT***G
CGGTTGAAGAAAGCAATGACGAGGAAAACGCTAGTGAAGAAGTTGCTGAGGAGACTCCTG
ATGAGATCAAGCTTGAGACAGCTCCTGCTGATTTCCGTTTCCCGACAACAAACCAAACAA
GGCATTGTTTCACTCGTTACATTGAATATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGACGACG
CTCCTGAATGTGATAAGTTTTCAAAGTTTTATCGATCCCTGTGCCCCGGCGAATGGGTTG
ATAAGTGGAACGAGCAAAGAGAGAATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTAAGATACTCCTG
CCTCAAGAAGAATTCTCTTTTTGATGTTACCTTCATAATGTCGCTCCAATTACACTGCAG
AGTTTAATAAGATTTTACTGAACCAGCACTTCTGGTTCTTCATCATAAGATGTGAGAATT
TAACAACTATAATCTCAAATTTTCTTTTCTTTTTATCTATATGCTCCATTCAAGTTTTGA
GGATCTTCTGATTCTGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 0 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 35 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 45 60 60 60 60 60 
60 25 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 45 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 25 60 60 60 60 60 45 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 40 40 25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK61TF U 25
AF RR2GH91JQB C 577
AF RR2D117TF U 25
AF RR2FK44TF U 25
AF RR2DD08TF U 25
AF RR2GI49TF U 22
AF RR2AS05TF U 1
AF RR2AS05JQ C 1
AF RR2AA64TF U 22
AF RR2G663TF U 25
AF RR2GK61JQ C 103
BS 1 23 RR2AS05TF
BS 24 24 RR2AA64TF
BS 25 25 RR2D117TF
BS 26 185 RR2AA64TF
BS 186 191 RR2DD08TF
BS 192 299 RR2AA64TF
BS 300 302 RR2DD08TF
BS 303 328 RR2AA64TF
BS 329 329 RR2DD08TF
BS 330 347 RR2AA64TF
BS 348 348 RR2DD08TF
BS 349 356 RR2AA64TF
BS 357 359 RR2DD08TF
BS 360 363 RR2AA64TF
BS 364 364 RR2DD08TF
BS 365 433 RR2AA64TF
BS 434 434 RR2DD08TF
BS 435 493 RR2AA64TF
BS 494 494 RR2DD08TF
BS 495 535 RR2AA64TF
BS 536 536 RR2DD08TF
BS 537 544 RR2AA64TF
BS 545 545 RR2DD08TF
BS 546 673 RR2AA64TF
BS 674 674 RR2DD08TF
BS 675 681 RR2AA64TF
BS 682 682 RR2DD08TF
BS 683 794 RR2AA64TF
BS 795 831 RR2AS05JQ
BS 832 858 RR2GK61JQ

RD RR2GK61TF 535 0 0
GGACCAATAAGATTCTCTGTCTCTCCAATCCTCGTCGTTCTGAAGAATCTCTGAGACCAC
TAACTCCAATGGCGGAATCTGCAGCTGCTCAAACTCAATCGCTCTCCGAGCAATATCATT
TGGAGAAAGAAGTGAAGCAAGACACAAGTGCTAAGCCTGTC******GAGGTTGCTCCAG
AGGTTACTACTCAAGCTGAAGAGGCCAGCACCGACAAAGCCGGTGAAGAATCTCCTGCTG
TTGAGGTTGAGGACAAGTCTGAGTCTCCTCCTGCT***TCTGAAGAGGCTCCTGCTGTGG
CAGCAGAAGACAATGCTGATGAGGCTCCTGCT***GCGGTTGAAGAAAGCAATGACGAGG
AAAACGCTAGTGAAGAAGTTGCTGAGGAGACTCCTGATGAGATCAAGCTTGAGACAGCTC
CTGCTGATTTCCGTTTCCCGACAACAAACCAAACAAGGCATTGTTTCACTCGTTACATTG
AATATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGACGACGCTCCTGAATGTGATAAGTT

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2GH91JQB 171 0 0
CCCTGTGCCCCGGCGAATGGGTTGATAAGTGGAACGAGCAAAGAGAGAATGGAACTTTCC
CTGGTCCTCTATAAGATACTCCTGCCTCAAGAAGAATTCTCTTTTTGATGTTACCTTCAT
AATGTCGCTCCAATTACATTGCAGAGTTTAATAAGATTTTATTGAACCAGC

QA 1 171 1 171
DS 

RD RR2D117TF 698 0 0
GGACCAATAAGATTCTCTGTCTCTCCAATCCTCGTCGTTCTGAAGAATCTCTGAGACCAC
TAACTCCAATGGCGGAATCTGCAGCTGCTCAAACTCAATCGCTCTCCGAGCAATATCATT
TGGAGAAAGAAGTGAAGCAAGACACAAGTGCTAAGCCTGTCCCTGTCGAGGTTGCTCCAG
AGGTTACTACTCAAGCTGAAGAGGTCAGCACCGACAAAGCCGGCGAAGAATCTCCTGCTG
TTGAGGTTGAGGACAAGTCTGAGTCTCCTCCTGCTACTTCTGAAGAGGCTCCTGCTGTGG
CAGCGGAAGACAATGCTGATGAGACTCCTGCTGCTGCGGCTGAAGAAAGCAATGACGAGG
AAAACGCTAGTGAAGAAGTTGCTGAGGAGACTCCTGATGATACCAAGCTGGAGACAGCTC
CTGCTGATTTCCGTTTCCCGACAACAAACCAAACAAGGCATTGTTTCACACGTTACATTG
AATATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGATGACGCTCCAGAATGTGATAAGTTTTCAA
AGTTTTATCGATCCCTGTGCCCCGGCGAATGGGTTGATAAGTGGAACGAGCAAAGAGAGA
ATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTAAGATACTCCTGCCTCAAGAAGAATCCTCTTTT*GA
TGTTACCTTCATAATGTCGCTCCAATTACACTGCAGAG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2FK44TF 758 0 0
GGACCAATAAGATTCTCTGTCTCTCCAATCCTCGTCGTTCTGAAGAATCTCTGAGACCAC
TAACTCCAATGGCGGAATCTGCAGCTGCTCAAACTCAATCGCTCTCCGAGCAATATCATT
TGGAGAAAGAAGTGAAGCAAGACACAAGTGCTAAGCCTGTCCCTGTCGAGGTTGCTCCAG
AGGTTACTACTCAAGCTGAAGAGGTCAGCACCGACAAAGCCGGCGAAGAATCTCCTGCTG
TTGAGGTTGAGGACAAGTCTGAGTCTCCTCCTGCTACTTCTGAAGAGGCTCCTGCTGTGG
CAGCGGAAGACAATGCTGATGAGACTCCTGCTGCTGCGGCTGAAGAAAGCAATGACGAGG
AAAACGCTAGTGAAGAAGTTGCTGAGGAGACTCCTGATGAGATCAAGCTGGAGACGGCTC
CTGCTGATTTCCGTTTCCCGACAACAAACCAAACAAGGCATTGTTTCACACGTTACATTG
AATATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGATGACGCTCCAGAATGTGATAAGTTTTCAA
AGTTTTATCGATCCCTGTGCCCCGGCGAATGGGTTGATAAGTGGAACGAGCAAAGAGAGA
ATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTAAGATACTCCTGCCTCAAGAAGAATCCTCTTTT*GA
TGTTACCTTCATAATGTCGCTCCAATTACACTGCAGAGTTTA*TAAGATTTTACTGAACC
AGCACTTCTGGTTCTTCATCATAAGATGTGAGA
TTTAC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2DD08TF 740 0 0
GGACCAATAAGATTCTCTGTCTCTCCAATCCTCGTCGTTCTGAAGAATCTCTGAGACCAC
TAACTCCAATGGCGGAATCTGCAGCTGCTCAAACTCAATCGCTCTCCGAGCAATATCATT
TGGAGAAAGAAGTGAAGCAAGACACAAGTGCTAAGCCTGTC******GAGGTTGCTCCAG
AGGTTACTACTCAAGCTGAAGAGGTCAGCACCGACAAAGCCGGTGAAGAATCTCCTGCTG
TTGAGGTTGAGGACAAGTCTGAGTCTCCTCCTGCT***TCTGAAGAGGCTCCTGCTGTGG
CAGCAGAAGACAATGCTGATGAGGCTCCTGCT***GCGGTTGAAGAAAGCAATGACGAGG
AAAACGCTAGTGAAGAAGTTGCTGAGGAGACTCCTGATGAGATCAAGCTTGAGACAGCTC
CTGCTGATTTCCGTTTCCCGACAACAAACCAAACAAGGCATTGTTTCACTCGTTACATTG
AATATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGACGACGCTCCTGAATGTGATAAGTTTTCAA
*GTTTTATCGATCCCTGTGCCCCGGCGAATGGGTTGATAAGTGGAACGAGCAAAGAGAGA
ATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTAAGATACTCCTGCCTCAAGAAGAATTCTCTTTTTGA
TGTTACCTTCATAATGTCGCTCCAATTACACTGCAGAGTTTAATA*GATTTTACTGAACC
AGCACTTCTGGTTCTTCATC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2GI49TF 736 0 0
GG
ATCACCAATAAGATTCTCTGTCTCTCCAATCCTCGTCGTTCTGAAGAATCTCTGAGACCA
CTAACTCCAATGGCGGAATCTGCAGCTGCTCAAACTCAATCGCTCTCCGAGCAATATCAT
TTGGAGAAAGAAGTGAAGCAAGACACAAGTGCTAAGCCTGTC******GAGGTTGCTCCA
GAGGTTACTACTCAAGCTGAAGAGGTCAGCACCGACAAAGCCGGTGAAGAATCTCCTGCT
GTTGAGGTTGAGGACAAGTCTGAGTCTCCTCCTGCT***TCTGAAGAGGCTCCTGCTGTG
GCAGCAGAAGACAATGCTGATGAGGCTCCTGCT***GCGGTTGAAGAAAGCAATGACGAG
GAAAACGCTAGTGAAGAAGTTGCTGAGGAGACTCCTGATGAGATCAAGCTTGAGACAGCT
CCTGCTGATTTCT*TTTCCCGACAACAAACCAAACAAGGCATTGTTTCACTCGTTACATT
GAATATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGACGACGCTCCTGGATGTGATAAGTTTTCA
AAGTTTTATCGATCCCTGTGCCCCGGCGAATGGGTTGATAAGTGGAACGAGCAAAGAGAG
AATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTAAGATACTCCTGCCTCAAGAAGAATTCTCTTTTTG
ATGTTACCTTCATAATGTCGCTCCAATTACACTGCAGAGTTTAATAAGATTTTACTGAAC
CAGCACTTCTGGTT

QA 3 736 3 736
DS 

RD RR2AS05TF 750 0 0
GGAACACCGAGAGAGTCCGTTTTATCACCAATAAGATTCTCTGTCTCTCCAATCCTCGTC
GTTCTGAAGAATCTCTGAGACCACTAACTCCAATGGCGGAATCTGCAGCTGCTCAAACTC
AATCGCTCTCCGAGCAATATCATTTGGAGAAAGAAGTGAAGCAAGACACAAGTGCTAAGC
CTGTC******GAGGTTGCTCCAGAGGTTACTACTCAAGCTGAAGAGGTCAGCACCGACA
AAGCCGGTGAATAATCTCCTGCTGTTGAGGTTGAGGACAAGTCTGAGTCTCCTCCTGCT*
**TCTGAAGAGGCTCCTGCTGTGGCAGCAGAAGACAATGCTGATGAGGCTCCTGCT***G
CGGTTGAAGAAAGCAATGACGAGGAAAACGCTAGTGAAGAAGTTGCTGAGGAGACTCCTG
ATGAGATCAAGCTTGAGACAGCTCCTGCTGATTTCCGTTTCCCGACAACAAACCAAACAA
GGCATTGTTTCACTCGTTACATTGAATATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGACGACG
CTCCTGAATGTGATAAGTTTTCAAAGTTTTATCGATCCCTGTGCCCCGGCGAATGGGTTG
ATAAGTGGAACGAGCAAAGAGAGAATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTAAGATACTCCTG
CCTCAAGAAGAATTCTCTTTTTGATGTTACCTTCATAATGTCGCTCCAATTACACTGCAG
AGTTTAATAAGATTTTACTGAACCAGCACT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2AS05JQ 831 0 0
GGAACACCGAGAGAGTCCGTTTTATCACCAATAAGATTCTCTGTCTCTCCAATCCTCGTC
GTTCTGAAGAATCTCTGAGACCACTAACTCCAATGGCGGAATCTGCAGCTGCTCAAACTC
AATCGCTCTCCGAGCAATATCATTTGGAGAAAGAAGTGAAGCAAGACACAAGTGCTAAGC
CTGTC******GAGGTTGCTCCAGAGGTTACTACTCAAGCTGAAGAGGTCAGCACCGACA
AAGCCGGTGAATAATCTCCTGCTGTTGAGGTTGAGGACAAGTCTGAGTCTCCTCCTGCT*
**TCTGAAGAGGCTCCTGCTGTGGCAGCAGAAGACAATGCTGATGAGGCTCCTGCT***G
CGGTTGAAGAAAGCAATGACGAGGAAAACGCTAGTGAAGAAGTTGCTGAGGAGACTCCTG
ATGAGATCAAGCTTGAGACAGCTCCTGCTGATTTCCGTTTCCCGACAACAAACCAAACAA
GGCATTGTTTCACTCGTTACATTGAATATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGACGACG
CTCCTGAATGTGATAAGTTTTCAAAGTTTTATCGATCCCTGTGCCCCGGCGAATGGGTTG
ATAAGTGGAACGAGCAAAGAGAGAATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTTTAAGATACTCCTG
CCTCAAGAAGAATTCTCTTTTTGATGTTACCTTCATAATGTCGCTCCAATTACACTGCAG
AGTTTAATAAGATTTTACTGAACCAGCACTTCTGGTTCTTCATCATAAGATGTGAGAATT
TAACAACTATAATCTCAAATTTTCTTTTCTTTTTATCTATATGCTCCATTC

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR2AA64TF 773 0 0
GG
ATCACCAATAAGATTCTCTGTCTCTCCAATCCTCGTCGTTCTGAAGAATCTCTGAGACCA
CTAACTCCAATGGCGGAATCTGCAGCTGCTCAAACTCAATCGCTCTCCGAGCAATATCAT
TTGGAGAAAGAAGTGAAGCAAGACACAAGTGCTAAGCCTGTCCCTGTCGAGGTTGCTCCA
GAGGTTACTACTCAAGCTGAAGAGGTCAGCACCGACAAAGCCGGTGAAGAATCTCCTGCT
GTTGAGGTTGAGGACAAGTCTGAGTCTCCTCCTGCTACTTCTGAAGAGGCTCCTGCTGTG
GCAGCGGAAGACAATGCTGATGAGACTCCTGCTGCTGCGGCTGAAGAAAGCAATGACGAG
GAAAACGCTAGTGAAGAAGTTGCTGAGGAGACTCCTGATGAGATCAAGCTGGAGACAGCT
CCTGCTGATTTCCGTTTCCCGACAACAAACCAAACAAGGCATTGTTTCACACGTTACATT
GAATATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGATGACGCTCCAGAATGTGATAAGTTTTCA
AAGTTTTATCGATCCCTGTGCCCCGGCGAATGGGTTGATAAGTGGAACGAGCAAAGAGAG
AATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTAAGATACTCCTGCCTCAAGAAGAATCCTCTTTT*G
ATGTTACCTTCATAATGTCGCTCCAATTACACTGCAGAGTTTAATAAGATTTTACTGAAC
CAGCACTTCTGGTTCTTCATCATAAGATGTGAGAATTTAACAACTATAATC

QA 3 773 3 773
DS 

RD RR2G663TF 762 0 0
GGACCAATAAGATTCTCTGTCTCTCCAATCCTCGTCGTTCTGAAGAATCTCTGAGACCAC
TAACTCCAATGGCGGAATCTGCAGCTGCTCAAACTCAATCGCTCTCCGAGCAATATCATT
TGGAGAAAGAAGTGAAGCAAGACACAAGTGCTAAGCCTGTC******GAGGTTGCTCCAG
AGGTTACTACTCAAGCTGAAGAGGTCAGCACCGACAAAGCCGGTGAAGAATCTCCTGCTG
TTGAGGTTGAGGACAAGTCTGAGTCTCCTCCTGCT***TCTGAAGAGGCTCCTGCTGTGG
CAGCAGAAGACAATGCTGATGAGGCTCCTGCT***GCGGTTGAAGAAAGCAATGACGAGG
AAAACGCTAGTGAAGAAGTTGCTGAGGAGACCCCTGATGAGATCAAGCTTGAGACAGCTC
CTGCTGATTTCCGTTTCCCGACAACAAACCAAACAAGGCATTGTTTCACTCGTTACATTG
AATATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGACGACGCTCCTGAATGTGATAAGTTTTCAA
AGTTTTATCGATCCCTGTGCCCCGGCGAATGGGTTGATAAGTGGAACGAGCAAAGAGAGA
ATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTAAGATACTCCTGCCTCAAGAAGAATTCTCTTTTTGA
TGTTACCTTCATAATGTCGCTCCAATTACACTGCAGAGTTTAATAAGATTTTACTGAACC
AGCACTTCTGGTTCT*CATCATAAGATGTGAGAATTT
TCAAC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2GK61JQ 756 0 0
CTGCAGCTGCTCAAACTCAATCGCTCTCCGAGCAATATCATTTGGAGAAAGAAGTGAAGC
AAGACACAAGTGCTAAGCCTGTC******GAGGTTGCTCCAGAGGTTACTACTCAAGCTG
AAGAGGCCAGCACCGACAAAGCCGGTGAAGAATCTCCTGCTGTTGAGGTTGAGGACAAGT
CTGAGTCTCCTCCTGCT***TCTGAAGAGGCTCCTGCTGTGGCAGCAGAAGACAATGCTG
ATGAGGCTCCTGCT***GCGGTTGAAGAAAGCAATGACGAGGAAAACGCTAGTGAAGAAG
TTGCTGAGGAGACTCCTGATGAGATCAAGCTTGAGACAGCTCCTGCTGATTTCCGTTTCC
CGACAACAAACCAAACAAGGCATTGTTTCACTCGTTACATTGAATATCACAGATGTGTAG
CTGCTAAGGGTGACGACGCTCCTGAATGTGATAAGTTTTCAAAGTTTTATCGATCCCTGT
GCCCCGGCGAATGGGTTGATAAGTGGAACGAGCAAAGAGAGAATGGAACTTTCCCTGGTC
CTCTCTAAGATACTCCTGCCTCAAGAAGAATTCTCTTCTTGATGTTACCTTCATAATGTC
GCTCCAATTACACTGCAGAGTTTAATAAGATTTTACTGAACCAGCACTTCTGGTTCTTCA
TCATAAGATGTGAGAATTTAACAACTATAATCTCAAATTTTCTTTTCTTTTTATCTATAT
GCTCCATTCAAGTTTTGAGGATCTTCTGATTCTGAT

QA 1 756 1 756
DS 



CO CL290Contig2 804 2 2 U
AGGGATCAACAAGATTCTCTGTCTCTCCGATCCTCGTCGCTCTGAAGAATCTCCGAGACC
ACTAACTCCAATGGCGGAATCTGCAGCTGCTCAAACTCAATCGCTCTCCTAGCAATATCA
TTTGGAGAAAGAAGTGAAGCAAGACACAAGTGCTAAGCCTGTCCCTGTCGAGGTTGCTCC
AGAGGTTACTACTCAAGCTGAAGAGGTCAGCACCGACAAAGCCGGTGAAGAATCTCCTGC
TGTTGAGGACAAGTCAGAGTCTCCTCCTGCTGTTGAGGAGGACAAGTCTGAGTCTCCTCC
TGCTTCTGAAGAGGCTCCTGCTGTGACAGCGGAAGACAATGCTGATGAGGCTCCTGCTGC
GGTTGAGGAAAGTAATGACGCTAGAGAAGAAGTTGCTGAGGAGACTCCTGATGAGATCAA
GCTTGAGACAGCTCCTGCTGATTTCCGTTTCCCGACAACAAACCAAACAAGGCACTGTTT
CACTCGTTACATTGAATATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGACGACGCTCCTGAATG
TGATAAGTTTTCAAAGTTTTATCGATCCCTGTGCCCCGGCGAATGGGTTGATAAGTGGAA
CGAGCAAAGAGAGGATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTAAAGATACTCCTGCCTCAAGAA
GAATCCTCTTTTGATGTTACCTTCATAATGTCGCTCCATTTACACTGCAGAGTTTAATAA
GATTTTACTGAACCAGCACTTCTGGTTCTTCATCATAAGATGTGAGAATTTAACAACTAT
AATCTCAAATTTTCTTTTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F021TF U 1
AF RR2F021JQ C 163
BS 1 783 RR2F021TF
BS 784 804 RR2F021JQ

RD RR2F021TF 783 0 0
AGGGATCAACAAGATTCTCTGTCTCTCCGATCCTCGTCGCTCTGAAGAATCTCCGAGACC
ACTAACTCCAATGGCGGAATCTGCAGCTGCTCAAACTCAATCGCTCTCCTAGCAATATCA
TTTGGAGAAAGAAGTGAAGCAAGACACAAGTGCTAAGCCTGTCCCTGTCGAGGTTGCTCC
AGAGGTTACTACTCAAGCTGAAGAGGTCAGCACCGACAAAGCCGGTGAAGAATCTCCTGC
TGTTGAGGACAAGTCAGAGTCTCCTCCTGCTGTTGAGGAGGACAAGTCTGAGTCTCCTCC
TGCTTCTGAAGAGGCTCCTGCTGTGACAGCGGAAGACAATGCTGATGAGGCTCCTGCTGC
GGTTGAGGAAAGTAATGACGCTAGAGAAGAAGTTGCTGAGGAGACTCCTGATGAGATCAA
GCTTGAGACAGCTCCTGCTGATTTCCGTTTCCCGACAACAAACCAAACAAGGCACTGTTT
CACTCGTTACATTGAATATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGACGACGCTCCTGAATG
TGATAAGTTTTCAAAGTTTTATCGATCCCTGTGCCCCGGCGAATGGGTTGATAAGTGGAA
CGAGCAAAGAGAGGATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTAAAGATACTCCTGCCTCAAGAA
GAATCCTCTTTTGATGTTACCTTCATAATGTCGCTCCATTTACACTGCAGAGTTTAATAA
GATTTTACTGAACCAGCACTTCTGGTTCTTCATCATAAGATGTGAGAATTTAACAACTAT
AAT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2F021JQ 642 0 0
CCCTGTCGAGGTTGCTCCAGAGGTTACTACTCAAGCTGAAGAGGTCAGCACCGACAAAGC
CGGTGAAGAATCTCCTGCTGTTGAGGACAAGTCAGAGTCTCCTCCTGCTGTTGAGGAGGA
CAAGTCTGAGTCTCCTCCTGCTTCTGAAGAGGCTCCTGCTGTGACAGCGGAAGACAATGC
TGATGAGGCTCCTGCTGCGGTTGAGGAAAGTAATGACGCTAGAGAAGAAGTTGCTGAGGA
GACTCCTGATGAGATCAAGCTTGAGACAGCTCCTGCTGATTTCCGTTTCCCGACAACAAA
CCAAACAAGGCACTGTTTCACTCGTTACATTGAATATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGG
TGACGACGCTCCTGAATGTGATAAGTTTTCAAAGTTTTATCGATCCCTGTGCCCCGGCGA
ATGGGTTGATAAGTGGAACGAGCAAAGAGAGGATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTAAAG
ATACTCCTGCCTCAAGAAGAATCCTCTTTTGATGTTACCTTCATAATGTCGCTCCATTTA
CACTGCAGAGTTTAATAAGATTTTACTGAACCAGCACTTCTGGTTCTTCATCATAAGATG
TGAGAATTTAACAACTATAATCTCAAATTTTCTTTTCTTTCC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 3 12

CO CL291Contig1 715 5 9 U
GAGAAAAAGATAGTAATAATCGAGGCAAATTTCTGAATCTCTCTGTCTGGATTGTTGCAT
CGTAAAGACAATGTAACTGTAGCTAAAACGCATGAAGAACACTCAAATAACGAACAAGAA
ACAGCCAAAAAAAGTCTGAGCAAAACACTGGGAGGGAAGAAAGTAGAAAAACTAATAGCC
ACCCTTGAGATCGTTGACGACATCGTAAGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACC
CTCAACCATGAATCCTGGTTTGGGTCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTTATCGTCTCACC
CTTGGCTTTGGCTGCAGCCTTGAGCTCATCGTTCTTCTTCTTCCTCAGCTTGAACTCTTC
TGCGCACCTTGACTGCTGCACGTGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTTATGATCCT
GTTGCCAATCTGTTTATTGACTTCGACACCGACAGCACGTTTGGTGACGTTCCAGACACG
ACCAGTACGACCATGGTAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTCACTTT
AACATCGACGTAATCGACAACCTTGAAGGTCCTGAGGTAAGTCGACAACGGAATTGTACC
CTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAGATCTCTTGTCCTAGCACGAACTCCATGACCCGC
CGGCATTTTTTTTCTCTCCAGTGGACGCGACAAGTGATAAACCTAAAATCGCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES47JQ U 205
AF RR2BQ41TF C 1
AF RR2BQ41JQ U 8
AF RR2GN80JQ U 12
AF RR2GN80TF C 197
BS 1 11 RR2BQ41TF
BS 12 466 RR2BQ41JQ
BS 467 467 RR2GN80JQ
BS 468 483 RR2BQ41JQ
BS 484 484 RR2GN80JQ
BS 485 556 RR2BQ41JQ
BS 557 557 RR2GN80JQ
BS 558 663 RR2BQ41JQ
BS 664 715 RR2GN80JQ

RD RR2ES47JQ 239 0 0
GTAAGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACCCTCAACCATGAATCCTGGTTTGGG
TCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTTATCGTCTCACCCTTGGCTTTGGCTGCAGCCTTGAG
CTCATCGTTCTTCTTCTTCCTCAGCTTGAACTCTTCTGCGCACCTTGACTGCTGCACGTG
CTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTTATGATCCTGTTGCCAATCTGTTTATTGACTT

QA 1 239 1 239
DS 

RD RR2BQ41TF 712 0 0
GAGAAAAAGATAGTAATAATCGAGGCAAATTTCTGAATCTCTCTGTCTGGATTGTTGCAT
CGTAAAGACAATGTAACTGTAGCTAAAACGCATGAAGAACACTCAAATAACGAACAAGAA
ACAGCCAAAAAAAGTCTGAGCAAAACACTGGGAGGGAAGAAAGTAGAAAAACTAATAGCC
ACCCTTGAGATCGTTGACGACATCGTAAGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACC
CTCAACCATGAATCCTGGTTTGGGTCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTTATCGTCTCACC
CTTGGCTTTGGCTGCAGCCTTGAGCTCATCGTTCTTCTTCTTCCTCAGCTTGAACTCTTC
TGCGCACCTTGACTGCTGCACGTGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTTATGATCCT
GTTGCCAATCTGTTTATTGACTTCGACACCGACAGCACGTTTGGTGGCGTTCCAGACACG
ACCGGTACGACCATGGTAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTCACTTT
AACATCGACGTAATCGCCAACCTTGAAGGTCCTGAGGTAAGTCGACAACGGAATTGTACC
CTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAGATCTCTTGTCCTAGCACGAACTCCATGACCCGC
CGGCATTTTTTTTCTCTCGAGTGGACGCGACAAGTGATAAACCTAAAAT
CCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2BQ41JQ 656 0 0
AGAT
AGTAATAATCGAGGCAAATTTCTGAATCTCTCTGTCTGGATTGTTGCATCGTAAAGACAA
TGTAACTGTAGCTAAAACGCATGAAGAACACTCAAATAACGAACAAGAAACAGCCAAAAA
AAGTCTGAGCAAAACACTGGGAGGGAAGAAAGTAGAAAAACTAATAGCCACCCTTGAGAT
CGTTGACGACATCGTAAGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACCCTCAACCATGA
ATCCTGGTTTGGGTCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTTATCGTCTCACCCTTGGCTTTGG
CTGCAGCCTTGAGCTCATCGTTCTTCTTCTTCCTCAGCTTGAACTCTTCTGCGCACCTTG
ACTGCTGCACGTGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTTATGATCCTGTTGCCAATCT
GTTTATTGACTTCGACACCGACAGCACGTTTGGTGGCGTTCCAGACACGACCGGTACGAC
CATGGTAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTCACTTTAACATCGACGT
AATCGCCAACCTTGAAGGTCCTGAGGTAAGTCGACAACGGAATTGTACCCTTCTTCCTGA
ACCCCCTCGCGAACAGATCTCTTGTCCTAGCACGAACTCCATGACCCGCCGG

QA 5 656 5 656
DS 

RD RR2GN80JQ 704 0 0
AGTAATAATCGAGGCAAATTTCTGAATCTCTCTGTCTGGATTGTTGCATCGTAAAGACAA
TGTAACTGTAGCTAAAACGCATGATGAACACTCAAATAACGAACAAGAA*CAGCCAAAAA
AAGTCTGAGCAAAACACTGGGAGGGAAGAAAGTAGAAAAACTAATAGCCACCCTTGAGAT
CGTTGACGACATCGTAAGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACCCTCAACCATGA
ATCCTGGTTTGGGTCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTTATCGTCTCACCCTTGGCTTTGG
CTGCAGCCTTGAGCTCATCGTTCTTCTTCTTCCTCAGCTTGAACTCTTCTGCGCACCTTG
ACTGCTGCACGTGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTTATGATCCTGTTGCCAATCT
GTTTATTGACTTCGACACCGACAGCACGTTTGGTGACGTTCCAGACACGACCAGTACGAC
CATGGTAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTCACTTTAACATCGACGT
AATCGACAACCTTGAAGGTCCTGAGGTAAGTCGACAACGGAATTGTACCCTTCTTCCTGA
ACCCCCTCGCGAACAGATCTCTTGTCCTAGCACGAACTCCATGACCCGCCGGCATTTTTT
TTCTCTCCAGTGGACGCGACAAGTGATAAACCTAAAATCGCCCC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2GN80TF 519 0 0
ACGACATCGTAAGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACCCTCAACCATGAATCCT
GGTTTGGGTCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTTATCGTCTCACCCTTGGCTTTGGCTGCA
GCCTTGAGCTCATCGTTCTTCTTCTTCCTCAGCTTGAACTCTTCTGCGCACCTTGACTGC
TGCACGTGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTTATGATCCTGTTGCCAATCTGTTTA
TTGACTTCGACACCGACAGCACGTTTGGTGACGTTCCAGACACGACCAGTACGACCATGG
TAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTCACTTTAACATCGACGTAATCG
ACAACCTTGAAGGTCCTGAGGTAAGTCGACAACGGAATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCC
CTCGCGAACAGATCTCTTGTCCTAGCACGAACTCCATGACCCGCCGGCATTTTTTTTCTC
TCCAGTGGACGCGACAAGTGATAAACCTAAAAT
CGCCCC

QA 1 513 1 513
DS 



CO CL291Contig2 648 5 3 U
TTTTTACTTGTAGCAGGAAAAAAA*GATGCCGGCAGGTCATGGAGTTCGTGCTAGGACAA
GAGATCTGTTCGCGAGAGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCCGTTGTCCACTTACCTCA
GGACCTTCAAGGTTGGCGACTACGTCGATGTTAAGGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTA
TGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAACGTGCTG
TCGGTGTCGAAGTCAATAAACAGATTGGCAACAGGATCATAAGGAAGAGGCTTCATGTGC
GTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCTAGGTGCGCAGAGGAGTTCAAGCTGAGGAAGAAGAAGA
ACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAAGGGTGAGACGATAAGCACCAAGAGGCAAC
CTAAAGGACCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTA
TCCCTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTTTCTACTTCCTTTCCCC
CCAGTGTTTTTTGTGTTTCGATTTTCCCTTCATATGTTTTGTAGCAACTTAAGACTTTCG
TCTTCAATCAAGAACATGATTTTATTATATAGCAGAAGTTTTGTTATT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR2G396TF U 1
AF RR2D408TF U 1
AF RR2G396JQ C 490
AF RR2DH33JQ C 1
AF RR2DH33TF U 1
BS 1 295 RR2D408TF
BS 296 296 RR2DH33TF
BS 297 648 RR2D408TF

RD RR2G396TF 579 0 0
TTTTTACTTGTAGCAGGAAAAAAA*GATGCCGGCGGGTCATGGAGTTCGCGCTAGGACAA
GAGATCTGTTCGCGAGAGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCCGTTGTCCACTTATCTCA
GGACCTTCAAGGTTGGCGACTACGTCGATGTTAAGGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTA
TGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAACGTGCTG
TCGGTGTCGAAGTCAATAAACAGATTGGCAACAGGATCATGAGGAAGAGGCTTCATGTGC
GTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCTAGGTGCGCAGAGGAGTTCAAGCTGAGGAAGAAGAAGA
ACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAAGGGTGAGACGATAAGCACCAAGAGGCAAC
CTAAAGGACCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTA
TCCCTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTTTCTACTTCCTTTCCCC
CCAGTGTTTTTTGTGTTTCGATTTTCCCTTCATATGTTT

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2D408TF 648 0 0
TTTTTACTTGTAGCAGGAAAAAAA*GATGCCGGCAGGTCATGGAGTTCGTGCTAGGACAA
GAGATCTGTTCGCGAGAGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCCGTTGTCCACTTACCTCA
GGACCTTCAAGGTTGGCGACTACGTCGATGTTAAGGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTA
TGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAACGTGCTG
TCGGTGTCGAAGTCAATAAACAGATTGGCAACAGGATCATAAGGAAGAGGCTTCACGTGC
GTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCTAGGTGCGCAGAGGAGTTCAAGCTGAGGAAGAAGAAGA
ACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAAGGGTGAGACGATAAGCACCAAGAGGCAAC
CTAAAGGACCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTA
TCCCTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTTTCTACTTCCTTTCCCC
CCAGTGTTTTTTGTGTTTCGATTTTCCCTTCATATGTTTTGTAGCAACTTAAGACTTTCG
TCTTCAATCAAGAACATGATTTTATTATATAGCAGAAGTTTTGTTATT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2G396JQ 141 0 0
ATGTCGTCAACGATTTCAAAGGAGGCTATTAGTTTTTTACTTCCTTTCCCCCCAGTGTTT
TTTGTGTTTCGATTTTCCCTTCATATGTTTTGTAGCAACTTAAGACTTTCGTTTTCAATC
AAGAACATGATTTTATTATA
C

QA 1 140 1 140
DS 

RD RR2DH33JQ 645 0 0
TTTTTACTTGTAGCAGGAAAAAAAAGATGCCGGCAGGTCATGGAGTTCGTGCTAGGACAA
GAGATCTGTTCGCGAGAGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCCGTTGTCCACTTACCTCA
GGACCTTCAAGGTTGGCGACTACGTCGATGTTAAGGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTA
TGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAACGTGCTG
TCGGTGTCGAAGTCAATAAACAGATTGGCAACAGGATCATAAGGAAGAGGCTTCATGTGC
GTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCTAGGTGCGCAGAGGAGTTCAAGCTGAGGAAGAAGAAGA
ACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAAGGGTGAGACGATAAGCACCAAGAGGCAAC
CTAAAGGACCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTA
TCCCTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTTTCTACTTCCTTTCCCC
CCAGTGTTTTTTGTGTTTCGATTTTCCCTTCATATGTTTTGTAGCAACTTAAGACTTTCG
TCTTCAATCAAGAACATGATTTTATTATATAGCAGAAGTTTTG
CT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2DH33TF 646 0 0
TTTTTACTTGTAGCAGGAAAAAAA*GATGCCGGCAGGTCATGGAGTTCGTGCTAGGACAA
GAGATCTGTTCGCGAGAGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCCGTTGTCCACTTACCTCA
GGACCTTCAAGGTTGGCGACTACGTCGATGTTAAGGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTA
TGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAACGTGCTG
TCGGTGTCGAAGTCAATAAACAGATTGGCAACAGGATCATAAGGAAGAGGCTTCATGTGC
GTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCTAGGTGCGCAGAGGAGTTCAAGCTGAGGAAGAAGAAGA
ACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAAGGGTGAGACGATAAGCACCAAGAGGCAAC
CTAAAGGACCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTA
TCCCTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTTTCTACTTCCTTTCCCC
CCAGTGTTTTTTGTGTTTCGATTTTCCCTTCATATGTTTTGTAGCAACTTAAGACTTTCG
TCTTCAATCAAGAACATGATTTTATTATATAGCAGAAGTTTTG
CTA

QA 1 643 1 643
DS 



CO CL291Contig3 690 2 9 U
ATTTTAGGTTTATCACTTTGTCGCGTCCACTCGAGAGGAAAAAATGCCGGCGGGTCATGG
AGTTCGTGCTAGGACAAGAGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCC
ATTGTCGACCTACCTCAGGACCTTCAAGGTTGGTGACTACGTTGATGTAAAAGTTAACGG
TGCGATCCACGAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGAA
CGTCACCAAACGTGCTGTCGGTGTCGAAGTAAACAAACAGATTGGCAACAGGATCATAAG
GAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGCGCAGAGGAGTTCAA
GCTGAGGAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAAGGGTGAGACAAT
AAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATACCTTG
GAGACTGTCACTCCTATCCCTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAGGGTGGCTATTAGTTT
TTCTACTTTTTTTTCCCAGTGTTTTGCTCAGACTTTTTGGCTGTTTCTTGTTCGCTATTT
GAGTGTTCTTCGTGCGTTTTAGCTACAGTTACATTGTCTTTAAGATGCAATCCAGACACA
GAGATTCAGAAATTTGTCTCGATTATTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E864TF U -4
AF RR2E864JQ C 1
BS 1 9 RR2E864JQ
BS 10 32 RR2E864TF
BS 33 33 RR2E864JQ
BS 34 110 RR2E864TF
BS 111 111 RR2E864JQ
BS 112 268 RR2E864TF
BS 269 269 RR2E864JQ
BS 270 330 RR2E864TF
BS 331 690 RR2E864JQ

RD RR2E864TF 335 0 0
GGGGCGATTTTAGG
TTATCACTTTGTCGCGTCCACTC*AGAGGAAAAAATGCCGGCGGGTCATGGAGTTCGTGC
TAGGACAAGAGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGG*TACAATTCCATTGTCGAC
CTACCTCAGGACCTTCAAGGTTGGTGACTACGTTGATGTAAAAGTTAACGGTGCGATCCA
CGAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAA
ACGTGCTGTCGGTGTCGAA*TAAACAAACAGATTGGCAACAGGATCATAAGGAAGAGGCT
TCATGTGCGTGTGGAGCACGT

QA 15 335 15 335
DS 

RD RR2E864JQ 690 0 0
ATTTTAGGTTTATCACTTTGTCGCGTCCACTCGAGAGGAAAAAATGCCGGCGGGTCATGG
AGTTCGTGCTAGGACAAGAGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCC
ATTGTCGACCTACCTCAGGACCTTCAAGGTTGGTGACTACGTTGATGTAAAAGTTAACGG
TGCGATCCACGAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGAA
CGTCACCAAACGTGCTGTCGGTGTCGAAGTAAACAAACAGATTGGCAACAGGATCATAAG
GAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGCGCAGAGGAGTTCAA
GCTGAGGAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAAGGGTGAGACAAT
AAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATACCTTG
GAGACTGTCACTCCTATCCCTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAGGGTGGCTATTAGTTT
TTCTACTTTTTTTTCCCAGTGTTTTGCTCAGACTTTTTGGCTGTTTCTTGTTCGCTATTT
GAGTGTTCTTCGTGCGTTTTAGCTACAGTTACATTGTCTTTAAGATGCAATCCAGACACA
GAGATTCAGAAATTTGTCTCGATTATTACC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 3 14

CO CL292Contig1 784 3 20 U
GAATCTTCACTACACGTATCATCAATCATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCC
GCCAAATTGGAAGAACAGAAGATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGTTGATGAC
AACGATGAGGACGACTCCGATGACGATGATAATGATGATGACGCAGAGGGACAAGAGGGA
GGCAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTCAAGCTTGGG
ATGAAACCTATCACTGGTGTCAGCCGTGTCACCGTCAAGAAGAGCAAGAACATCATGTTT
GTCATATCGAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCAGCATCAGACACGTACGTGATCTTTGGA
GAGGCAAAGATCGAGGACCTGAGCTCTCAGCTCCAGTCCCAGTCTGCAGAGCAGTTCAAG
GCTCCTGATCTCAGCAACGTGGTCTCGCAGGGTGAATCTT*CCTCGAGTGCTGCTGCGGT
GGTGCAAGATGATGATGAGGAGATTGACGAGG*AGGGTGTTGACTCAAAGGACATCGAGT
TGGTGATGACCCAAGCTGGAGTTCCTAGGCCAAAGGCTGTTAAGGCGCTTAAGGCTGCTG
ATGGGG*ATATTGTCTCTGCCATCATGGAACTTACCACCTAAATCAAAATCGTTTCAACT
TAATGTGCGTGTCAGAGTGATTCAGAAATTTTTGTTTTTCATGTTTCCTTGGAAGTGATT
TTCAATGTCGTATCAGTAAAAAACCTCATAGATTATTGAATTTCAGTTTGATTTGGTTTT
GAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2AB81TF U 1
AF RR2B320JQ C 360
AF RR2B320TF U 360
BS 1 402 RR2AB81TF
BS 403 403 RR2B320TF
BS 404 460 RR2AB81TF
BS 461 461 RR2B320TF
BS 462 512 RR2AB81TF
BS 513 513 RR2B320TF
BS 514 584 RR2AB81TF
BS 585 585 RR2B320TF
BS 586 592 RR2AB81TF
BS 593 593 RR2B320TF
BS 594 606 RR2AB81TF
BS 607 607 RR2B320TF
BS 608 698 RR2AB81TF
BS 699 699 RR2B320TF
BS 700 724 RR2AB81TF
BS 725 725 RR2B320TF
BS 726 728 RR2AB81TF
BS 729 729 RR2B320TF
BS 730 737 RR2AB81TF
BS 738 784 RR2B320TF

RD RR2AB81TF 737 0 0
GAATCTTCACTACACGTATCATCAATCATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCC
GCCAAATTGGAAGAACAGAAGATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGTTGATGAC
AACGATGAGGACGACTCCGATGACGATGATAATGATGATGACGCAGAGGGACAAGAGGGA
GGCAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTCAAGCTTGGG
ATGAAACCTATCACTGGTGTCAGCCGTGTCACCGTCAAGAAGAGCAAGAACATCATGTTT
GTCATATCGAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCAGCATCAGACACGTACGTGATCTTTGGA
GAGGCAAAGATCGAGGACCTGAGCTCTCAGCTCCAGTCCCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAG
GCTCCTGATCTCAGCAACGTGGTCTCGCAGGGTGAATCTTTCCTCGAGTGCTGCTGCGGT
GGTGCAAGATGATGATGAGGAGATTGACGAGGGAGGGTGTTGACTCAAAGGACATCGAGT
TGGTGATGACCCAAGCTGGAGTTCCTAGGCCAAAGGCTGTTAAG*CGCTTAACGCTGCTG
ATGGGGGATATTGTCTCTGCCATCATGGAACTTACCACCTAAATCAAAATCGTTTCAACT
TAATGTGCGTGTCAGAGTGATTCAGAAATTTTTGTTTTACATGTTTCCTTGGAAGTGATT
TTCA*TGTTGTATCAGT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2B320JQ 425 0 0
G
GAGGCAAAGATCGAGGACCTGAGCTTTCAGCTCCAGTCCCAGTCTGCAGAGCAGTTCAAG
GCTCCTGATCTCAGCAACGTGGTCTCGCAGGGTGAATCTT*CCTCGAGTGCTGCTGCGGT
GGTGCAAGATGATGATGAGGAGATTGACGAGG*AGGGTGTTGACTCAAAGGACATCGAGT
TGGTGATGACCCAAGCTGGAGTTCCTAGGCCAAAGGCTGTTAAGGCGCTTAAGGCTGCTG
ATGGGG*ATATTGTCTCTGCCATCATGGAACTTACCACCTAAATCAAAATCGTTTCAACT
TAATGTGCGTGTCAGAGTGATTCAGAAATTTTTGTTTTTCATGTTTCCTTGGAAGTGATT
TTCAATGTCGTATCAGTAAAAAACCTCATAGATTATTGAATTTCAGTTTGATTTGGTTTT
GAAT

QA 2 425 2 425
DS 

RD RR2B320TF 425 0 0
G
GAGGCAAAGATCGAGGACCTGAGCTCTCAGCTCCAGTCCCAGTCTGCAGAGCAGTTCAAG
GCTCCTGATCTCAGCAACGTGGTCTCGCAGGGTGAATCTT*CCTCGAGTGCTGCTGCGGT
GGTGCAAGATGATGATGAGGAGATTGACGAGG*AGGGTGTTGACTCAAAGGACATCGAGT
TGGTGATGACCCAAGCTGGAGTTCCTAGGCCAAAGGCTGTTAAGGCGCTTAAGGCTGCTG
ATGGGG*ATATTGTCTCTGCCATCATGGAACTTACCACCTAAATCAAAATCGTTTCAACT
TAATGTGCGTGTCAGAGTGATTCAGAAATTTTTGTTTTTCATGTTTCCTTGGAAGTGATT
TTCAATGTCGTATCAGTAAAAAACCTCATAGATTATTGAATTTCAGTTTGATTTGGTTTT
GAAT

QA 2 425 2 425
DS 



CO CL292Contig2 843 6 26 U
GGGATAGTCTCTTTTCTAGGGTTTTAAGGTTTCCGCACAGTTTCACGAATCTTCAACACA
CGTATCATCATGACGACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAACTGGAAGAGCAGAAG
ATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGTTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGAA
GACGATGATAATGATGATGATGCAGAGGGACAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGCAGA
AGTGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTGAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTC
AGCCGTGTCACCGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTG
TTCAAGAGTCCGGCGTCAGACACGTATGTGATCTTTGGAGAAGCAAAGATCGAGGACTTG
AGCTCTCAGCTCCAGTCCCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAACGTG
GTCTCACAGGGTGAGTCGTCCTCGAGTGCTGCTGCAGTGGTGCAAGATGATGATGAGGAG
ATTGACGAGG*AGGGTGTTGACTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGT
TCCTAGGCCAAGAGCCGTGAAGGCGCTTAAGGCTGCTGATGGGGATATTGTCTCTGCCAT
CATGGAACTTACCACCTAAATCAGAATCGTTTCAACTTAATGTGCGTGTGTCAGAGTGAT
TCAGAAATTTTTGTTTTTCATGTTTCCTTG*AAGTGATTTTCAGTGTTGTATCAGTAAAA
AACCTCATAGATTATTGAATTTCAGTTTGATTTGGTTTTGAATATTGGTAAGTGTTGGCG
ATT


BQ
10 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2CE26TF U 1
AF RR2CE26JQ C 2
AF RR2FD16JQ C 46
AF RR2FD16TF U 46
AF RR2BJ14TF U 1
AF RR2BJ14JQ C 84
BS 1 71 RR2CE26TF
BS 72 72 RR2FD16TF
BS 73 284 RR2CE26TF
BS 285 285 RR2FD16TF
BS 286 362 RR2CE26TF
BS 363 363 RR2FD16TF
BS 364 550 RR2CE26TF
BS 551 551 RR2FD16TF
BS 552 626 RR2CE26TF
BS 627 627 RR2FD16TF
BS 628 628 RR2BJ14TF
BS 629 683 RR2FD16TF
BS 684 684 RR2BJ14TF
BS 685 708 RR2FD16TF
BS 709 710 RR2BJ14TF
BS 711 750 RR2FD16TF
BS 751 751 RR2BJ14TF
BS 752 763 RR2FD16TF
BS 764 764 RR2BJ14TF
BS 765 781 RR2FD16TF
BS 782 782 RR2BJ14TF
BS 783 792 RR2FD16TF
BS 793 793 RR2BJ14TF
BS 794 818 RR2FD16TF
BS 819 820 RR2CE26JQ
BS 821 843 RR2BJ14JQ

RD RR2CE26TF 626 0 0
GGGATAGTCTCTTTTCTAGGGTTTTAAGGTTTCCGCACAGTTTCACGAATCTTCAACACA
CGTATCATCATAACGACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAACTGGAAGAGCAGAAG
ATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGTTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGAA
GACGATGATAATGATGATGATGCAGAGGGACAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGCAGA
AGTGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTGAAGCTTGGGATGAAGCCTATCACTGGTGTC
AGCCGTGTCACCGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTG
TTTAAGAGTCCGGCGTCAGACACGTATGTGATCTTTGGAGAAGCAAAGATCGAGGACTTG
AGCTCTCAGCTCCAGTCCCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAACGTG
GTCTCACAGGGTGAGTCGTCCTCGAGTGCTGCTGCAGTGGTGCAAGATGATGATGAGGAG
ATTGACGAGGGAGGGTGTTGACTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGT
TCCTAGGCCAAGAGCCGTGAAGGCGC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2CE26JQ 819 0 0
GGATAGTCTCTTTTCTAGGGTTT*AAGGTTTCCGCACAGTT*CACGAATCTTCAACACAC
GTATCATCATA*CGACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAACTGGAAGAGCAGAAGA
TCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGTTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGAAG
ACGATGATAATGATGATGATGCAGAGGGACAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGCAGAA
GTGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTGAAGCTTGGGATGAAGCCTATCACTGGTGTCA
GCCGTGTCACCGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGT
TTAAGAGTCCGGCGTCAGACACGTATGTGATCTTTGGAGAAGCAAAGATCGAGGACTTGA
GCTTTCAGCTCCAGTCCCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAACGTGG
TCTCACAGGGTGAGTCGTCCTCGAGTGCTGCTGCAGTGGTGCAAGATGATGATGAGGAGA
TTGACGAGG*AGGGTGTTGACTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTT
CCTAGGCCAAGAGCCGTGAAGGCGCTTAAGGCTGCTGATGGGGATATTGTCTCTGCCATC
ATGGAACTTACCACCTAAATCAGAATCGTTTCAACTTAATGTGCGTGGGTCAGAGTGATT
CAGAAATTTTTGTTTTTCATGTTTCCTTG*AAGTGATTTTCAGTGTTGTATCAGTAAAAA
ACCTCATAGATTATTGAATTTCAGTTTGATTTGGTTTTG

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2FD16JQ 775 0 0
GGACTACACGTATCATCA
ATCATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAACAGAAGATC
GATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGTTGATGACAACGAGGAGGATGACTCCGAAGAC
GATGATAATGATGACGACGCAGAGGGACAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAGAGCAGAAGT
GAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTGAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTCAGC
CGTGTCACCGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTCGTTATATCAAAACCTGATGTGTTC
AAGAGCCCAGCATCAGACACGTACGTGATCTTTGGAGAGGCAAAGATCGAGGACTTGAGC
TTTCAGCTCCAGTCCCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAAGCTCCCGATGTCAGCAACGTGGTC
TCACAGGGTGAATCGTCCTCAAGTGCTGCTGCAGTGGTGCAAGATGATGATGAGGAGATT
GATGAGG*AGGGTGTTGACTCAAAGGACATCGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTTCC
TAGGCCAAGGGCCGTGAAGGCGCTCAAGGCTGCTGATGGGGATATTGTCTCTGCCATCAT
GGAACTTACCACCTAAATCAAAATCGTTTCAACTTAATGTGCGTG**TCAGAGTGATTCA
GAAATTTTTGTTTTTCATGTTTCCTTGGAAGTGATTTTCAATGTTGTATCAGTAAAAAAC
CTCATAGATTATTGAATTTCAGTTTGATTTGGTTTTG

QA 19 775 19 775
DS 

RD RR2FD16TF 782 0 0
GGACTACACGTATCATCA
ATCATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAACAGAAGATC
GATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGTTGATGACAACGAGGAGGATGACTCCGAAGAC
GATGATAATGATGACGACGCAGAGGGACAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAGAGCAGAAGT
GAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTGAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTCAGC
CGTGTCACCGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTCGTTATATCAAAACCTGATGTGTTC
AAGAGCCCAGCATCAGACACGTACGTGATCTTTGGAGAGGCAAAGATCGAGGACTTGAGC
TCTCAGCTCCAGTCCCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAAGCTCCCGATGTCAGCAACGTGGTC
TCACAGGGTGAATCGTCCTCAAGTGCTGCTGCAGTGGTGCAAGATGATGATGAGGAGATT
GATGAGG*AGGGTGTTGACTCAAAGGACATCGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTTCC
TAGGCCAAGGGCCGTGAAGGCGCTCAAGGCTGCTGATGGGGATATTGTCTCTGCCATCAT
GGAACTTACCACCTAAATCAAAATCGTTTCAACTTAATGTGCGTG**TCAGAGTGATTCA
GAAATTTTTGTTTTTCATGTTTCCTTGGAAGTGATTTTCAATGTTGTATCAGTAAAAA*C
CTCATAGAT*ATTGAATTTCAGTTTGATTTGGTTT
GAAAAAAAA

QA 19 773 19 773
DS 

RD RR2BJ14TF 815 0 0
GGC
ATAGTCTCTTTTCTAGGGTTTTAAGGTTTCCGCACAGTTTCACGAATCTTCAACACACGT
ATCATCATGACGACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAACTGGAAGAGCAGAAGATC
GATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGTTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGAAGAC
GATGATAATGATGATGATGCAGAGGGACAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGCAGAAGT
GAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTGAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTCAGC
CGTGTCACCGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGTTC
AAGAGTCCGGCGTCAGACACGTATGTGATCTTTGGAGAAGCAAAGATCGAGGACTTGAGC
TCTCAGCTCCAGTCCCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAACGTGGTC
TCACAGGGTGAGTCGTCCTCGAGTGCTGCTGCAGTGGTGCAAGATGATGATGAGGAGATT
GACGAGG*AGGGTGTTGACTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTTCC
TAGGCCAAGAGCCGTGAAGGCGCTTAAGGCTGCTGATGGGGATATTGTCTCTGCCATCAT
GGAACTTACCACCTAAATCAGAATCGTTTCAACTTAATGTGCGTGTGTCAGAGTGATTCA
GAAATTTTTGTTTTTCATGTTTCCTTG*AAGTGATTTTCAGTGTTGTATCAGTAAAAAAC
CTCATAGATTATTGAATTTCAGTTTGATTTGG

QA 4 815 4 815
DS 

RD RR2BJ14JQ 760 0 0
GAAAGAGATCCTCGCCGCCAAACTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGATAAGCCTGAAGT
TGAGGACGTTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGAAGACGATGATAATGATGATGATGC
AGAGGGACAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAGAAGAGTCGCAAAGC
CATGCTGAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTCAGCCGTGTCACCGTCAAAAAGAG
CAAGAACATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGTCCGGCGTCAGACAC
GTATGTGATCTTTGGAGAAGCAAAGATCGAGGACTTGAGCTTTCAGCTCCAGTCCCAGGC
TGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAACGTGGTCTCACAGGGTGAGTCGTCCTC
GAGTGCTGCTGCAGTGGTGCAAGATGATGATGAGGAGATTGACGAGG*AGGGTGTTGACT
CAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTTCCTAGGCCAAGAGCCGTGAAGG
CGCTTAAGGCTGCTGATGGGGATATTGTTTCTGCCATCATGGAACTTACCACCTAAATCA
GAATCGTTTCAACTTAATGTGCGTGTGTCAGAGTGATTCAGAAATTTTTGTTTTTCATGT
TTCCTTG*AAGTGATTTTCAGTGTTGTATCAGTAAAAAACCTCATAGATTATTGAATTTC
AGTTTGATTTGGTTTTGAATATTGGTAAGTGTTGGCGATT

QA 1 760 1 760
DS 



CO CL292Contig3 842 5 12 U
GGATAGTCTCTTTTCTAGGGTTTTAAGGTTTCCGCACAGTTTCACGAATCTTCAACACAC
TTATCATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAACTGGAAGAGCAGAAGA
TCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGTTGATGACAACGAGGAGGATGACTCCGAAG
ACGATGATAATGATGATGATGCAGAGGGACAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGCAGAA
GTGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTGAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTCA
GCCGTGTCACCGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGT
TCAAGAGCCCGGCGTCAGACACGTATGTGATCTTTGGAGAGGCAAAAATCGAGGACTTGA
GCTCTCAGCTCCAGTCCCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAACGTTG
TCTCGCAGGGTGAATCTTCCTCGAGTGCTGCTGCAGTTGTGCAAGATGATGATGAGGAGA
TTGACGAGGAGGGTGTTGACTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTTC
CTAGGCCAAGGGCCGTGAAGGCGCTTAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCCATCA
TGGAACTTACCACCTAAAACCAAAATCGTTTCAACTTAATGTGCGTGTGTCAGAGTGATT
CAGAAATTTTTGTTTTTCATGTTTTCTTGGAAGTGATTTTCAATGTTGTATCAGTAAAAA
ACCTCATAGATTATTGAATTTCAGTTTTATTTGGTTTTGAATATTGGTAAGTGTTGGCGA
GT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2H475TF U 42
AF RR2DO56TF U 1
AF RR2CU77TF U 1
AF RR2H475JQB C 140
AF RR2CU77JQ C 20
BS 1 330 RR2CU77TF
BS 331 331 RR2H475TF
BS 332 609 RR2CU77TF
BS 610 610 RR2CU77JQ
BS 611 629 RR2CU77TF
BS 630 630 RR2CU77JQ
BS 631 693 RR2CU77TF
BS 694 694 RR2CU77JQ
BS 695 762 RR2CU77TF
BS 763 763 RR2CU77JQ
BS 764 780 RR2CU77TF
BS 781 842 RR2CU77JQ

RD RR2H475TF 564 0 0
GG
ACGAATCTTCAACACACTTATCATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAA
ACTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGTTGATGACAACGA
GGAGGATGACTCCGAAGACGATGGTAATGATGATGATGCAGAGGGACAAGAGGGAGGCAA
GTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTGAAGCTTGGGATGAA
ACCTATCACTGGTGTCAGCCGTGTCACCGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTTGTCAT
ATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCGGCGTCAGACACGTATGTGATCTTTGGAGAGGC
AAAAATCGAGGACTTGAGCTCTCAGCTCCAGTCCCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCC
TGATATCAGCAACGTTGTCTCGCAGGGTGAATCTTCCTCGAGTGCTGCTGCAGTTGTGCA
AGATGATGATGAGGAGATTGACGAGGAGGGTGTTGACTCAAAGGACATTGAGTTGGTGAT
GACCCAAGCAGGAGTTCCTAGG

QA 3 564 3 564
DS 

RD RR2DO56TF 606 0 0
GGATAGTCTCTTTTCTAGGGTTTTAAGGTTTCCGCACAGTTTCACGAATCTTCAACACAC
TTATCATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAACTGGAAGAGCAGAAGA
TCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGTTGATGACAACGAGGAGGATGACTCCGAAG
ACGATGATAATGATGATGATGCAGAGGGACAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGCAGAA
GTGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTGAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTCA
GCCGTGTCACCGTCAAAAAGAGCAAGAACATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGT
TCAAGAGCCCGGCGTCAGACACGTATGTGATCTTTGGAGAGGCAAAAATCGAGGACTTGA
GCTCTCAGCTCCAGTCCCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAACGTTG
TCTCGCAGGGTGAATCTTCCTCGAGTGCTGCTGCAGTTGTGCAAGATGATGATGAGGAGA
TTGACGAGGAGGGTGTTGACTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAG*AGTTC
CTAGGC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2CU77TF 780 0 0
GGATAGTCTCTTTTCTAGGGTTTTAAGGTTTCCGCACAGTTTCACGAATCTTCAACACAC
TTATCATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAACTGGAAGAGCAGAAGA
TCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGTTGATGACAACGAGGAGGATGACTCCGAAG
ACGATGATAATGATGATGATGCAGAGGGACAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGCAGAA
GTGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCCATGCTGAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTCA
GCCGTGTCACCGTCAAAAAGAGCAAGAACACCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGT
TCAAGAGCCCGGCGTCAGACACGTATGTGATCTTTGGAGAGGCAAAAATCGAGGACTTGA
GCTCTCAGCTCCAGTCCCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAACGTTG
TCTCGCAGGGTGAATCTTCCTCGAGTGCTGCTGCAGTTGTGCAAGATGATGATGAGGAGA
TTGACGAGGAGGGTGTTGACTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTTC
CTAGGCCAAAGGCCGTGAAGGCGCTTAAG*CTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCCATCA
TGGAACTTACCACCTAAAACCAAAATCGTTTCA*CTTAATGTGCGTGTGTCAGAGTGATT
CAGAAATTTTTGTTTTTCATGTTTTCTTGGAAGTGATTTTCA*TGTTGTATCAGTAAAAA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2H475JQB 680 0 0
AGTTGAGGACGTTGATGACAACGAGGAGGATGACTCCGAAGACGATGGTAATGATGATGA
TGCAGAGGGACAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAGAAGAGTCGCAA
AGCCATGCTGAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTCAGCCGTGTCACCGTCAAAAA
GAGCAAGAACATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCGGCGTCAGA
CACGTATGTGATCTTTGGAGAGGCAAAAATCGAGGACTTGAGCTTTCAGCTCCAGTCCCA
GGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAACGTTGTCTCGCAGGGTGAATTTTC
CTCGAGTGCTGCTGCAGTTGTGCAAGATGATGATGAGGAGATTGACGAGGAGGGTGTTGA
CTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTTCCTAGGCCAAGGGCCGTGAA
GGCGCTTAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTTTTTGCCATCATGGAACTTACCACCTAAAA
CCAAAATCGTTTCAACTTAATGTGCGTGTGTCAGAGTGATTCAGAAATTTTTGTTTTTCA
TGTTTTCTTGGAAGTGATTTTCAATGTTGTATCAGTAAAAAACCTCATAGATTATTGAAT
TTCAGTTTTATTTGGTTTTG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2CU77JQ 823 0 0
GTTTTAAGGTTTCCGCACAGTTTCACGAATCTTCAACACACTTATCATCATGACTAC*GA
AGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAACTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGATAAGCCTGA
AGTTGAGGACGTTGATGACAACGAGGAGGATGACTCCGAAGACGATGATAATGATGATGA
TGCAGAGGGACAAGAGGGAGGCAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAGAAGAGTCGCAA
AGCCATGCTGAAGCTTGGGATGAAACCTATCACTGGTGTCAGCCGTGTCACCGTCAAAAA
GAGCAAGAACACCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCGGCGTCAGA
CACGTATGTGATCTTTGGAGAGGCAAAAATCGAGGACTTGAGCTCTCAGCTCCAGTCCCA
GGCTGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCTGATATCAGCAACGTTGTCTCGCAGGGTGAATCTTC
CTCGAGTGCTGCTGCAGTTGTGCAAGATGATGATGAGGAGATTGACGAGGAGGGTGTTGA
CTCAAAGGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTTCCTAGGCCAAGGGCCGTGAA
GGCGCTTAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCCATCATGGAACTTACCACCTAAAA
CCAAAATCGTTTCAACTTAATGTGCGTGTGTCAGAGTGATTCAGAAATTTTTGTTTTTCA
TGTTTTCTTGGAAGTGATTTTCAATGTTGTATCAGTAAAAAACCTCATAGATTATTGAAT
TTCAGTTTTATTTGGTTTTGAATATTGGTAAGTGTTGGCGAGT

QA 1 823 1 823
DS 



AS 3 14

CO CL293Contig1 631 5 3 U
GGACCGAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGAT
CGGAGTTTTTTTATAGACTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATA
ATTAACAATAACATGGGGATGTCTAAAACTATTAAATTTATTTTCTCTCTAGCTCTTGTG
GTGTTCTTAGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTT
CATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAA
GAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGTGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCTGAAA
AAGTGAATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTTAAAATGGCATCCCCAT
ATTAATATCAAATGATTAATTTCATTCTTTTTTTATTTTAAACTCTGTTATTGGTTATAT
TGATTGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTTCTTCTA
TTTTAACAATCTTTTGAGCTATTTTCATTTTTTATCATTATAGTGAATGTTTTGCTACAT
GTTATCCATTATTATTTTAAATATATGGTAG


BQ
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A461JQ C 1
AF RR2EB15JQ C 1
AF RR2A461TF U 1
AF RR2EB15TF U 1
AF RR2CF71TF U -1
BS 1 536 RR2A461TF
BS 537 538 RR2EB15TF
BS 539 631 RR2CF71TF

RD RR2A461JQ 538 0 0
GGACCGAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGAT
CGGAGTTTTTTTATAGACTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATA
ATTAACAATAACATGGGGATGTCTAAAACTATTAAATTTATTTTCTCTCTAGCTCTTGTG
GTGTTCTTAGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTT
CATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAA
GAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGTGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCTGAAA
AAGTGAATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTTAAAATGGCATCCCCAT
ATTAATATCAAATGATTAATTTCATTCTTTTTTTATTTTAAACTCTGTTATTGGTTATAT
TGATTGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTTCT
CC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2EB15JQ 526 0 0
GGACCGAGAAAATTTCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGAT
CGGAGTTTTTTTATAGACTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATA
ATTAACAATAACATGGGGATGTCTAAAACTATTAAATTTATTTTCTCTCTAGCTCTTGTG
GTGTTCTTAGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTT
CATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAA
GAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGTGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCTGAAA
AAGTGAATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTTAAAATGGCATCCCCAT
ATTAATATCAAATAATTAATTTCATTCTTTTTTTGTTTTAAACTCTGTTATTGGTTATAT
TGATTGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTAT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2A461TF 538 0 0
GGACCGAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGAT
CGGAGTTTTTTTATAGACTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATA
ATTAACAATAACATGGGGATGTCTAAAACTATTAAATTTATTTTCTCTCTAGCTCTTGTG
GTGTTCTTAGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTT
CATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAA
GAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGTGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCTGAAA
AAGTGAATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTTAAAATGGCATCCCCAT
ATTAATATCAAATGATTAATTTCATTCTTTTTTTATTTTAAACTCTGTTATTGGTTATAT
TGATTGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTTCT
CC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2EB15TF 538 0 0
GGACCGAGAAAATTTCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGAT
CGGAGTTTTTTTATAGACTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATA
ATTAACAATAACATGGGGATGTCTAAAACTATTAAATTTATTTTCTCTCTAGCTCTTGTG
GTGTTCTTAGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTT
CATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAA
GAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGTGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCTGAAA
AAGTGAATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTTAAAATGGCATCCCCAT
ATTAATATCAAATAATTAATTTCATTCTTTTTTTGTTTTAAACTCTGTTATTGGTTATAT
TGATTGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTTCTTC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2CF71TF 633 0 0
GGCC
ACCGAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGATCG
GAGTTTTTTTATAGACTATTTATTTA****ATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATAAT
TAACAATAACATGGGGATGTCTAAAACTATTAAATTTATTTTCTCTCTAGCTCTTGTGGT
GTTCTTAGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTTCA
TCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAAGA
AGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGTGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCTGAAAAA
GTGAATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTTAAAATGGCATCCCCATAT
TAATATCAAATGATTAATTTCATTCTTTTTTTATTTTAAACTCTGTTATTGGTTATATTG
ATTGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTTCTTCTATT
TTAACAATCTTTTGAGCTATTTTCATTTTTTATCATTATAGTGAATGTTTTGCTACATGT
TATCCATTATTATTTTAAATATATGGTAG

QA 5 633 5 633
DS 



CO CL293Contig2 542 7 16 U
GGACCGAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGAT
CGGAGTTTTTTTATAAACTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATA
ATTAACAATAACATGGGGATGTCTAAAACTATTAAACTTATTTTCTCTCTAGCTCTTGTG
GTGTTCTTGGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTT
CATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAA
GAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGCGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCAGAAA
AAGTGAATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTTAAAATGGCATCCCCAT
ATTAATATCAAATGATTAATTTCATTCTTTTTTTATTTTAAACTATGTTATTGGTTATAT
AATTGATTGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATATGTTCTT
CT


BQ
25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 35 30 
30 25 

AF RR2AE58TF U 1
AF RR2D876TF U 1
AF RR2GS59TF U 1
AF RR2FI44TF U 1
AF RR2AE17JQ C -1
AF RR2AE17TF U -1
AF RR2F212TF U 14
BS 1 71 RR2AE58TF
BS 72 72 RR2AE17TF
BS 73 77 RR2AE58TF
BS 78 78 RR2AE17TF
BS 79 228 RR2AE58TF
BS 229 229 RR2D876TF
BS 230 355 RR2AE58TF
BS 356 356 RR2AE17TF
BS 357 464 RR2AE58TF
BS 465 465 RR2AE17TF
BS 466 509 RR2AE58TF
BS 510 532 RR2D876TF
BS 533 533 RR2AE17TF
BS 534 539 RR2D876TF
BS 540 541 RR2FI44TF
BS 542 542 RR2AE17TF

RD RR2AE58TF 509 0 0
GGACCGAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGAT
CGGAGTTTTTT*ATAAAGTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATA
ATTAACAATAACATGGGGATGTCTAAAACTATTAAACTTATTTTCTCTCTAGCTCTTGTG
GTGTTCTTGGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATCATGGTGCCCTT
CATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAA
GAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGCGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCTGAAA
AAGTGAATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTTAAAATGGCATCCCCAT
ATTAATATCAAATGATTAATTTCATTCTTTTTTTATTTTAAACTCTGTTATTGGTTATAT
AATTGATTGTTACCATATTAGTAATAATC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2D876TF 539 0 0
GGACCGAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGAT
CGGAGTTTTTT*ATAAAGTATTTATTCATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATA
ATTAACAATAACATGGGGATGTCTAAAACTATTAAACTTATTTTCTCTCTAGCTCTTGTG
GTGTTCTTGGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGGTACATAGATTATGGTGCCCTT
CATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAA
GAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGCGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCTGAAA
AAGTGAATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTTAAAATGGCATCCCCAT
ATTAATATCAAATGATTAATTTCATTCTTTTTTTATTTTAAACTCTGTTATTGGTTATAT
AATTGATTGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTTCT

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2GS59TF 538 0 0
GGACCGAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGAT
CGGAGTTTTTT*ATAAAGTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATA
ATTAACAATAACATGGGGATGTCTAAAACTATTAAACTTATTTTCTCTCTAGCTCTTGTG
GTGTTCTTGGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTT
CATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAA
GAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGCGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCTGAAA
AAGTGAATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTTAAAATGGCATCCCCAT
ATTAATATCAAATGATTAATTTCATTCTTTTTTTATTTTAAACTCTGTTATTGGTTATAT
AATTGATTGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTTC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2FI44TF 541 0 0
GGACCGAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGAT
CGGAGTTTTTT*ATAAAGTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATA
ATTAACAATAACATGGGGATGTCTAAAACTATTAAACTTATTTTCTCTCTAGCTCTTGTG
GTGTTCTTGGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTT
CATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCCGCAAGAAGCAA
GAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGCGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCTGAAA
AAGTGAATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTTAAAATGGCATCCCCAT
ATTAATATCAAATGATTAATTTCATTCTTTTTTTATTTTAAACTCTGTTATTGGTTATAT
AATTGATTGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTTCTT
C

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR2AE17JQ 544 0 0
GGACACA
GAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGATCGGGG
TTTTTTTATAAACTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATAATTAA
CAATAATATGGGGATGTCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTGGCTCTTGTGGTGTT
CTTGGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTTCATCA
TGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTTTGCAAGAAGCAAGAAGC
CAATCCATATGCGAGAGGTTGCGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCAGAAAAAGTG
AATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTTAAAATTGCATCCCTATATTAA
TATCAAATGATTCATTTCATTTTTTTTTTATTTTAAACTATGTTATTGGTTGTATAATTG
ATTGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATATGTTCTTCT

QA 8 544 8 544
DS 

RD RR2AE17TF 544 0 0
GGACACA
GAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGATCGGGG
TTTTTTTATAAACTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATAATTAA
CAATAATATGGGGATGTCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTGGCTCTTGTGGTGTT
CTTGGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTTCATCA
TGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAAGAAGC
CAATCCATATGCGAGAGGTTGCGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCAGAAAAAGTG
AATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTTAAAATTGCATCCCTATATTAA
TATCAAATGATTCATTTCATTTTTTTTTTATTTTAAACTATGTTATTGGTTGTATAATTG
ATTGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATATGTTCTTCT

QA 8 544 8 544
DS 

RD RR2F212TF 529 0 0
TCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGATCGGGGTTTTTTTA
TAAACTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATAATTAACAATAATA
TGGGGATTTCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTGGCTCTTGTGGTGTTCTTGGCTC
TAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTTCATCATGGAGATC
CCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAAGAAGCCAATCCAT
ATGCGAGAGGTTGCGAGACTGAAGAACGTTGCGACCGTGGCCAGAAAAAGTGAATCAACC
AAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTTAAAATTGCATCCCTATATTAATATCAAAT
GATTCATTTCATT*TTTTTTTATTTTAAACTATGTTATTGGTTGTATAATTGATTGTTAC
CATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATATGTTCTTCT

QA 1 529 1 529
DS 



CO CL293Contig3 534 2 1 U
GGACCGAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGAT
CGGGGTTTTTTTATAAAGTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATA
ATTAACAATAATATGGGGATATCTAAAACTATTAAAGTTATTTTTTCTCTGGCTCTTGTG
GTGTTCTTGGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTT
CATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAA
GAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGCGAGACTGAAGAACGTTGCCGTGGCCAGAAAAAG
TGAATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTAAAAATGGCATCCCTATATT
ATCAAATGATTAATTTCATTTTTTATTATTTTAAACTCTGTTATTGGTTGTATAAATGAT
TGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTTCTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D573JQ C 1
AF RR2D573TF U 1
BS 1 534 RR2D573TF

RD RR2D573JQ 534 0 0
GGACCGAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGAT
CGGGGTTTTTTTATAAAGTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATA
ATTAACAATAATATGGGGATATCTAAAACTATTAAAGTTATTTTTTCTCTGGCTCTTGTG
GTGTTCTTGGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTT
CATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAA
GAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGCGAGACTGAAGAACGTTGCCGTGGCCAGAAAAAG
TGAATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTAAAAATGGCATCCCTATATT
ATCAAATGATTAATTTCATTTTTTATTATTTTAAACTCTGTTATTGGTTGTATAAATGAT
TGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTTCTTC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2D573TF 534 0 0
GGACCGAGAAAATTCCAAATACAATTAAATATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTGAT
CGGGGTTTTTTTATAAAGTATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAACAACACAAATA
ATTAACAATAATATGGGGATATCTAAAACTATTAAAGTTATTTTTTCTCTGGCTCTTGTG
GTGTTCTTGGCTCTAGCAGCAACCAAGATAGAGGCAAGATACATAGATTATGGTGCCCTT
CATCATGGAGATCCCAGTTTCGGTTGTAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAAGAAGCAA
GAAGCCAATCCATATGCGAGAGGTTGCGAGACTGAAGAACGTTGCCGTGGCCAGAAAAAG
TGAATCAACCAAGTTAGAGCACCACTTTTTGGTTTATTTTAAAAATGGCATCCCTATATT
ATCAAATGATTAATTTCATTTTTTATTATTTTAAACTCTGTTATTGGTTGTATAAATGAT
TGTTACCATATTAGTAATAATCAATAAAATAATAAAATTTATTATTTGTTCTTC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 3 14

CO CL294Contig1 666 3 14 U
ATGCCAACAAAACACTTGTAAGCTTTATAAATCACGTAACATATAAGAAACATAGCTCTT
TTTTTCGGAACTAATAAGAAACATAGCTAAACAATAGAATAACATAAATTTAGGTCCAAA
CAAAGCATAAACATAACGTACCAACAGGCATACATATTTCATAGCAATCTTTCGAACAGA
TGCATAATATTCATAATAATCCGGTCAATTGAAAGTTTTGAAACCCTTAAATAGTACTCA
CACGTCTCTGTCCCTTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGTCGGTACG
GTAGTTGTAGATGGTCCATTTCATGCGAACCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGCATC
AAGGTCACGGAACTCATTCTGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGCACAGTACTTGGC
CTCCACAGAAGCTTGGCAGCCGTCGATGTGGAACCCTCTGTAGGAAGCTATGAAGGGTGC
ATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTCCTCTGGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAG
GCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACGCCTAGATCCTTAGCGTT
CTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAACAAAGAATACAATTTGGTAGAGATTCCAAAG
GATGGG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI11JQ U 176
AF RR2EI11TF C 1
AF RR2BD71JQ U 6
BS 1 5 RR2EI11TF
BS 6 38 RR2BD71JQ
BS 39 39 RR2EI11TF
BS 40 179 RR2BD71JQ
BS 180 196 RR2EI11JQ
BS 197 197 RR2BD71JQ
BS 198 233 RR2EI11JQ
BS 234 234 RR2BD71JQ
BS 235 292 RR2EI11JQ
BS 293 293 RR2BD71JQ
BS 294 309 RR2EI11JQ
BS 310 310 RR2BD71JQ
BS 311 337 RR2EI11JQ
BS 338 666 RR2BD71JQ

RD RR2EI11JQ 162 0 0
ACAA
ATGCATAATATTCATAAAAATCCGGTCAATTGAAAGTTTTGAAACCCTTAAATAATACTC
ACACGTCTCTGTCCCTTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGGCGGTAC
GGTAGTTGTAAATGGTCCATTTCATGCGAACCCATTTG

QA 5 162 5 162
DS 

RD RR2EI11TF 635 0 0
ATGCCAACAAAACACTTGTAAGCTTTATAAATCACGTAACATATAAGAAACATAGCTCTT
TTTTTCGGAACTAATAAGAAACATAGCTAAACAATAGAATAACATAAATTTAGGTCCAAA
CAAAGCATAAACATAACGTACCAACAGGCATACATATTTCATAGCAATCTTTCGAACAGA
TGCATAATATTCATAATAATCCGGTCAATTGAAAGTTTTGAAACCCTTAAATAGTACTCA
CACGTCTCTGTCCCTTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGTCGGTACG
GTAGTTGTAGATGGTCCATTTCATGCGAACCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGCATC
AAGGTCACGGAACTCATTCTGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGCACAGTACTTGGC
CTCCACAGAAGCTTGGCAGCCGTCGATGTGGAACCCTCTGTAGGAAGCTATGAAGGGTGC
ATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTCCTCTGGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAG
GCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACGCCTAGATCCTTAGCGTT
CTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAACAAAG
C

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2BD71JQ 661 0 0
AACAAAACACTTGTAAGCTTTATAAATCACGTAGCATATAAGAAACATAGCTCTTTTTTT
CGGAACTAATAAGAAACATAGCTAAACAATAGAATAACATAAATTTAGGTCCAAACAAAG
CATAAACATAACGTACCAACAGGCATACATATTTCATAGCAATCTTTCGAACAGATGCAT
AATATTCATAATAATCCGGTCAATTGAAAGTTTTGAAACCCTTAAATAGTACTCACACGT
CTCTGTCCCTTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGTCGGTACAGTAGT
TGTAGATGGTCCATTTCATGCGA*CCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGCATCAAGGT
CACGGAACTCATTCTGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGCACAGTACTTGGCCTCCA
CAGAAGCTTGGCAGCCGTCGATGTGGAACCCTCTGTAGGAAGCTATGAAGGGTGCATTAG
CCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTCCTCTGGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCG
AGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACGCCTAGATCCTTAGCGTTCTTGA
ACACACGGATTGGTATGTTGTCAACAAAGAATACAATTTGGTAGAGATTCCAAAGGATGG
G

QA 1 661 1 661
DS 



CO CL294Contig2 1175 8 14 U
GGACCACATCATTCACCATCATCACATCTCTCTCTCTCTCTTCAAACCAGCCATGGCTGT
TTCTTCAACTCCATGGGCTCTCATAGCTCTGTTTCTAATGGCCTCTTCTACTGTAATGGC
GATTCCTCCACGGAAGGCCATTGATGTGCCATTCGGCCGAAACTACGTCCCAACTTGGGC
TTTTGACCACCAGAAGCAACTCAATGGCGGTTCTGAACTCCAACTCATCCTCGACAAATA
CACTGGGACAGGGTTTCAATCCAAAGGGTCATATTTGTTCGGACATTTCAGTATGCACAT
AAAGCTGCCAGCTGGTGATACCGCTGGGGTCGTCACTGCATTTTATCTGTCGTCGACTAA
CAACGAGCATGACGAGATAGACTTCGAGTTTCTCGGGAACAGGACAGGCCAGCCAGCAAT
ATTGCAGACGAATGTGTTCACAGGAGGAAAGGGAAACAGAGAGCAACGCATTTATCTCTG
GTTCGACCCTTCAAAGGCTTATCATACTTACTCCATCCTCTGGAATCTCTACCAAATTGT
ATTCTTTGTTGACAACATACCAATCCGTGTGTTCAAGAACGCAAAGGATCTAGGAGTACG
TTTCCCATTCAACCAACCGATGAAGCTATACTCGAGCCTTTGGAACGCTGACGATTGGGC
CACCAGAGGAGGTCTAGAGAAAACCAATTGGGCTAATGCACCCTTCATAGCTTCCTACAG
AGGATTCCACATCGACGGCTGCCAAGCTTCCGTGGAGGCCAAGTACTGTGCTACCCAAGG
CCACATGTGGTGGGACCAGAATGAGTTCCGTGACCTTGATGCCGAACAATATCGTCGCCT
CAAATGGGTTCGCATGAAATGGACCATCTACAACTACTGTACCGACCGTACAAGGTTCCC
AGTTATGCCAGCCGAATGTAAAAGGGACAGAGACGTGTGAGTACTACTAAGGGTTTCAAA
CTTTCAATGGACCGGATTATTATGAATATCATGCATCTGTTCAAAAGATTGCTATGAAAT
ATGTATGCCTGTTGGTACGTTATGTTTATGCTTTGTTTGGACCTGAATTTATGTTATTAT
TCTATTGTTTAGCTATGTTTCTTATTAGTTCCAAAAAGAGAGCTATGTTTCTTGTATGCT
ACGTGATTTATAAAACTTACAAGTCTTTTGTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A225TF U 229
AF RR2GQ70TF U 42
AF RR2FW82TF U 12
AF RR2GD65TF U 1
AF RR2ED69TF U 8
AF RR2BD71TF U 12
AF RR2CD91TF U 423
AF RR2CD91JQ C 423
BS 1 208 RR2GD65TF
BS 209 209 RR2ED69TF
BS 210 585 RR2GD65TF
BS 586 586 RR2BD71TF
BS 587 644 RR2GD65TF
BS 645 645 RR2ED69TF
BS 646 671 RR2GD65TF
BS 672 672 RR2BD71TF
BS 673 684 RR2GD65TF
BS 685 723 RR2BD71TF
BS 724 724 RR2CD91TF
BS 725 733 RR2BD71TF
BS 734 1102 RR2CD91TF
BS 1103 1175 RR2CD91JQ

RD RR2A225TF 431 0 0
CCTCTACAAATACACTGGGACAGGGTTTCAATCCAAAGGGTCATATTTGTTCGGACATTT
CAGTATGCACATAAAGCTGCCAGCTGGTGATACCGCTGGGGTCGTCACTGCATTTTATCT
GTCGTCGACTAACAACGAGCATGACGAGATAGACTTCGAGTTTCTCGGGAACAGGACAGG
CCAGCCAGCAATATTGCAGACGAATGTGTTCACAGGAGGAAAGGGAAACAGAGAGCAACG
CATTTATCTCTGGTTCGACCCTTCAAAGGCTTATCATACTTACTCCATCCTCTGGAATCT
CTACCAAATTGTATTCTTTGTTGACAACATACCAATCCGTGTGTTCAAGAACGCAAAAGA
TCTAGGAGTACGTTTCCCATTCAACCAACCGATGAAGCTATACTCGAGCCTTTGGAACGC
TGACGATTGGG

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR2GQ70TF 614 0 0
G
CAAACCAGCCATGGCTGTTTCTTCAACTCCATGGGCTCTCATAGCTCTGTTTCTAATGGC
CTCTTCTACTGTAATGGCGATTCCTCCACGGAAGGCCATTGATGTGCCATTCGGCCGAAA
CTACGTCCCAACTTGGGCTTTTGACCACCAGAAGCAACTCAATGGCGGTTCTGAACTCCA
ACTCATCCTCGACAAATACACTGGGACAGGGTTTCAATCCAAAGGGTCATATTTGTTCGG
ACATTTCAGTATGCACATAAAGCTGCCAGCTGGTGATACCGCTGGGGTCGTCACTGCATT
TTATCTGTCGTCGACTAACAACGAGCATGACGAGATAGACTTCGAGTTTCTCGGGAACAG
GACAGGCCAGCCAGCAATATTGCAGACGAATGTGTTCACAGGAGGAAAGGGAAACAGAGA
GCAACGCATTTATCTCTGGTTCGACCCTTCAAAGGCTTATCATACTTACTTCATCCTCTG
GAATCTCTACCAAATTGTATTCTTTGTTGACAACATACCAATCCGTGTGTTCAAGAACGC
AAAAGATCTAGGAGTACGTTTCCCATTCAACCAACCGATGAAGCTATACTCGAGCCTTTG
GAACGCTGACGAT

QA 2 614 2 614
DS 

RD RR2FW82TF 652 0 0
GGACCATCATCACATCTCT
TCTCTCTCTCCTCAAACCAGCAATGGCTGTTTCTTCAAGTCCATGGGCTCTCATAGCTCT
GTTTCTGATGGCCTCTTCTACTGTAATGGCAATTCCTCCACGGAAGGCCATTGAAGTGCC
ATTCGGCCGAAACTACGTCCCAACTTGGGCTTTTGACCACCAGAAGCAACTCAATGGTGG
TTCTGAACTCCAACTCATCCTCGACAAATACACTGGGACAGGGTTTCAATCCAAAGGGTC
ATATTTGTTCGGACATTTCAGTATGCACATAAAGCTGCCAGCTGGTGATACCGCTGGGGT
CGTCACTGCATTTTATCTGTCGTCGACTAACAACGAGCATGACGAGATAGACTTCGAGTT
TCTCGGGAACAGGACAGGCCAGCCAGCAATATTGCAGACGAATGTGTTCACAGGAGGAAA
GGGAAACAGAGAGCAACGCATTTATCTCTGGTTCGACCCTTCAAAGGCTTATCATACTTA
CTCCATCCTTTGGAATCTCTACCAAATTGTATTCTTTGTTGACAACATACCAATCCGTGT
GTTCAAGAACGCTAAGGATCTAGGCGTACGTTTCCCATTCAACCAACCGATGAAGCTATA
CTCGAGCCTTTGGA*CGCTGACGATTGGGC
ACC

QA 20 649 20 649
DS 

RD RR2GD65TF 690 0 0
GGACCACATCATTCACCATCATCACATCTCTCTCTCTCTCTTCAAACCAGCCATGGCTGT
TTCTTCAACTCCATGGGCTCTCATAGCTCTGTTTCTAATGGCCTCTTCTACTGTAATGGC
GATTCCTCCACGGAAGGCCATTGATGTGCCATTCGGCCGAAACTACGTCCCAACTTGGGC
TTTTGACCACCAGAAGCAACTCAATGGCAGTTCTGAACTCCAACTCATCCTCGACAAATA
CACTGGGACAGGGTTTCAATCCAAAGGGTCATATTTGTTCGGACATTTCAGTATGCACAT
AAAGCTGCCAGCTGGTGATACCGCTGGGGTCGTCACTGCATTTTATCTGTCGTCGACTAA
CAACGAGCATGACGAGATAGACTTCGAGTTTCTCGGGAACAGGACAGGCCAGCCAGCAAT
ATTGCAGACGAATGTGTTCACAGGAGGAAAGGGAAACAGAGAGCAACGCATTTATCTCTG
GTTCGACCCTTCAAAGGCTTATCATACTTACTCCATCCTCTGGAATCTCTACCAAATTGT
ATTCTTTGTTGACAACATACCAATCCGTGTGTTCAAGAACGCAAAAGATCTAGGAGTACG
TTTCCCATTCAACCAACCGATGAAGCTATACTCGAGCCTTTGGA*CGCTGACGATTGGGC
CACCAGAGGAG*TCTAGAGAAAAC
AATTGG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2ED69TF 658 0 0
GTG
ATTCACCATCATCACATCTCTCTCTCTCT**TCAAACCAGCCATGGCTGTTTCTTCAACT
CCATGGGCTCTCATAGCTCTGTTTCTAATGGCCTCTTCTACTGTAATGGCGATTCCTCCA
CGGAAGGCCATTGATGTGCCATTCGGCCGAAACTACGTCCCAACTTGGGCTTTTGACCAC
CAGAAGCAACTCAATGGCGGTTCTGAACTCCAACTCATCCTCGACAAATACACTGGGACA
GGGTTTCAATCCAAAGGGTCATATTTGTTCGAACATTTCAGTATGCACATAAAGCTGCCA
GCTGGTGATACCGCTGGGGTCGTCACTGCATTTTATCTGTCGTCGACTAACAACGAGCAT
GACGAGATAGACTTCGAGTTTCTCGGGAACAGGACAGGCCAGCCAGCAATATTGCAGACG
AATGTGTTCACAGGAGGAAAGGGAAACAGAGAGCAACGCATTTATCTCTGGTTCGACCCT
TCAAAGGCTTATCATACTTACTCCATCCTCTGGAATCTCTACCAAATTGTATTCTTTGTT
GACAACATACCAATCCGTGTGTTCAAGAACGCAAAAGATCTAGGAGTACGTTTCCCATTC
AACCAACCGATGAAGCTATACTCGAGCCTTTGGAACGCTGACGATTGGGCCACCA

QA 4 658 4 658
DS 

RD RR2BD71TF 722 0 0
GGACCATCATCACATCTCT
TCTCTCTCTCTTCAAACCAGCAATGGCTGTTTCTTCAAGTCCATGGGCTCTCATAGCTCT
GTTTCTGATGGCCTCTTCTACTGTAATGGCAATTCCTCCACGGAAGGCCATTGATGTGCC
ATTCGGCCGAAACTACGTCCCAACTTGGGCTTTTGACCACCAGAAGCAACTCAATGGTGG
TTCTGAACTCCAACTCATCCTCGACAAATACACTGGGACAGGGTTTCAATCCAAAGGGTC
ATATTTGTTCGGACATTTCAGTATGCACATAAAGCTGCCAGCTGGTGATACCGCTGGGGT
CGTCACTGCATTTTATCTGTCGTCGACTAACAACGAGCATGACGAGATAGACTTCGAGTT
TCTCGGGAACAGGACAGGCCAGCCAGCAATATTGCAGACGAATGTGTTCACAGGAGGAAA
GGGAAACAGAGAGCAACGCATTTATCTCTGGTTCGACCCTTCAAAGGCTTATCATACTTA
CTCCATCCTTTGGAATCTCTACCAAATTGTATTCTTTGTTGACAACATACCAATCCGTGT
GTTCAAGAACGCTAAGGATCTAGGCGTACGTTTCCCATTCAACCAACCGATGAAGCTATA
CTCGAGCCTTTGGAACGCTGACGATTGGGCCACCAGAGGAGGTCTAGAGAAAACCAATTG
GGCTAATGCACCCTTCATAGCTTCCTACAGAGGGTTCCACATC

QA 20 722 20 722
DS 

RD RR2CD91TF 680 0 0
G
GCAGGCGAATGTGTTCACAGGAGGGAAGGGAAACAGAGAGCAACGCATTTATCTCTGGTT
CGACCCTTCAAAGGCTTATCATACTTACTCCATCCTCTGGAATCTCTACCAAATTGTATT
CTTTGTTGACAACATACCAATCCGTGTGTTCAAGAACGCAAAGGATCTAGGAGTACGTTT
CCCATTCAACCAACCGATGAAGCTATACTCGAGCCTTTGGAACGCTGACGATTGGGCCAC
CAGAGGAGGTCTAGAGAAAACCAATTGGGCTAATGCACCCTTCATAGCTTCCTACAGAGG
ATTCCACATCGACGGCTGCCAAGCTTCCGTGGAGGCCAAGTACTGTGCTACCCAAGGCCA
CATGTGGTGGGACCAGAATGAGTTCCGTGACCTTGATGCCGAACAATATCGTCGCCTCAA
ATGGGTTCGCATGAAATGGACCATCTACAACTACTGTACCGACCGTACAAGGTTCCCAGT
TATGCCAGCCGAATGTAAAAGGGACAGAGACGTGTGAGTACTACTAAGGGTTTCAAACTT
TCAATGGACCGGATTATTATGAATATCATGCATCTGTTCAAAAGATTGCTATGAAATATG
TATGCCTGTTGGTACGTTATGTTTATGCTTTGTTTGGACCTGAATTTATGTTATTATTCT
ATTGTTTAGCTATGTTTCT

QA 2 680 2 680
DS 

RD RR2CD91JQ 753 0 0
G
GCAGGCGAATGTGTTCACAGGAGGGAAGGGAAACAGAGAGCAACGCATTTATCTCTGGTT
CGACCCTTCAAAGGCTTATCATACTTACTCCATCCTCTGGAATCTCTACCAAATTGTATT
CTTTGTTGACAACATACCAATCCGTGTGTTCAAGAACGCAAAGGATCTAGGAGTACGTTT
CCCATTCAACCAACCGATGAAGCTATACTCGAGCCTTTGGAACGCTGACGATTGGGCCAC
CAGAGGAGGTCTAGAGAAAACCAATTGGGCTAATGCACCCTTCATAGCTTCCTACAGAGG
ATTCCACATCGACGGCTGCCAAGCTTCCGTGGAGGCCAAGTACTGTGCTACCCAAGGCCA
CATGTGGTGGGACCAGAATGAGTTCCGTGACCTTGATGCCGAACAATATCGTCGCCTCAA
ATGGGTTCGCATGAAATGGACCATCTACAACTACTGTACCGACCGTACAAGGTTCCCAGT
TATGCCAGCCGAATGTAAAAGGGACAGAGACGTGTGAGTACTACTAAGGGTTTCAAACTT
TCAATGGACCGGATTATTATGAATATCATGCATCTGTTCAAAAGATTGCTATGAAATATG
TATGCCTGTTGGTACGTTATGTTTATGCTTTGTTTGGACCTGAATTTATGTTATTATTCT
ATTGTTTAGCTATGTTTCTTATTAGTTCCAAAAAGAGAGCTATGTTTCTTGTATGCTACG
TGATTTATAAAACTTACAAGTCTTTTGTTGGC

QA 2 753 2 753
DS 



CO CL294Contig3 660 3 3 U
GCCAACAACAAAAGACTTGTAAGTTTTATAAATCACGTGACAGATAAGAAACGTAGCTCT
CTTTTCTGGAACTAATAAGAAACATAGCTAAACAATAGAATAATAACATAAATATAGGTC
CAACCAAAGCATAAACATAACGTACCAACAGGCATACATATTTCATAGCAATCTTTTAAA
AAGATGCATAATACTCATAATAATCCGGTCCATTGAGAGTTTTGAAACCTTAAATAGTAC
TCACACGTCTCTGTCCCGTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGTCGGT
ACAGTAGTTGTAGATGGTCCATTTCATGCGAACCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGC
ATCAAGGTCACGGAACTCATTCTGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGCACAGTACTT
GGCCTCCACGGAAGCTTGGCAGCCGTCGATGTGGAATACTCTGTAGGAAGCTATGAAGGG
TGCATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTCCTCTGGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCA
AAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACTCCTAGATCTTTTGC
GTTCTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAACAAAGAATACAATTTGGTAGAGATTCCA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A225JQ U 192
AF RR2AH84TF C 3
AF RR2GQ70JQ U 1
BS 1 457 RR2GQ70JQ
BS 458 458 RR2AH84TF
BS 459 660 RR2GQ70JQ

RD RR2A225JQ 102 0 0
TAC
TCATAATAATCCGGTCCATTGAGAGTTTTGAAACCTTAAATAGTACTCCCACGTCTCTGT
CCCGTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTAC

QA 4 102 4 102
DS 

RD RR2AH84TF 587 0 0
CAA
CAACAAAAGACTTGTAAGTTTTATAAATCACGTGACAGATAAGAAACGTAGCTCTCTTTT
CTGGAACTAATAAGAAACATAGCTAAACAATAGAATAATAACATAAATATAGGTCCAACC
AAAGCATAAACATAACGTACCAACAGGCATACATATTTTATAGCAATCTTTTAAAAAGAT
GCATAATACTCATAATAATCCGGTCCATTGAGAGTTTTGAAACCTTAAATAGTACTCACA
CGTCTCTGTCCCGTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGTCGGTACAGT
AGTTGTAGATGGTCCATTTCATGCGAACCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGCATCAA
GGTCACGGAACTCATTCTGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGCACAGTACTTGGCCT
CCACGGAAGCTTGGCAGCCGTCGATGTGGAATACTCTGTAGGAAGCTATGAAGGGTGCAT
TAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTCCTCTGGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGC
TCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACTCC
C

QA 4 586 4 586
DS 

RD RR2GQ70JQ 660 0 0
GCCAACAACAAAAGACTTGTAAGTTTTATAAATCACGTGACAGATAAGAAACGTAGCTCT
CTTTTCTGGAACTAATAAGAAACATAGCTAAACAATAGAATAATAACATAAATATAGGTC
CAACCAAAGCATAAACATAACGTACCAACAGGCATACATATTTCATAGCAATCTTTTAAA
AAGATGCATAATACTCATAATAATCCGGTCCATTGAGAGTTTTGAAACCTTAAATAGTAC
TCACACGTCTCTGTCCCGTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGTCGGT
ACAGTAGTTGTAGATGGTCCATTTCATGCGAACCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGC
ATCAAGGTCACGGAACTCATTCTGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGCACAGTACTT
GGCCTCCACGGAAGCTTGGCAGCCGTCGATGTGGAATCCTCTGTAGGAAGCTATGAAGGG
TGCATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTCCTCTGGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCA
AAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACTCCTAGATCTTTTGC
GTTCTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAACAAAGAATACAATTTGGTAGAGATTCCA

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 12

CO CL295Contig1 1109 12 19 U
CCCGAAGGCAAAAACAATTTGATTTCATTGACTGTTTTCCCCAAGTACACAAACATTCAC
ATATCCCACAATGAAACCAGAAATTAGGAAAGACAA**GGAATAAAACAGAGCATAGATT
TTAAAACCAAAGTTGCCAATTTTGTACATACATAATAACAATCATTTTGTAATTGCTATT
TTGTTTTGTGTGGCTAAATTCAAGCTGCACTTCGGAAGGAGCCGAGGGACTTGGAACCAG
AGGCCCTTAGGACGAATTGGTGATAAAATGCAGCTATGGCAGCTCCGATGAATGGTCCCA
CCCAGAAAATCCAGTGGTCATCCCACGGCTTGGACTCATTGTAGATAACCGCGGCTCCAA
AACTCCTGGCCGGGTTAATCCCGGTTCCGGTGATTGGAATAGTGGCCAAGTGAACCATGA
ACACGGCAAATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACGGGAACGTGGGAGTCTCGTGCGTTTC
TTTTGGGATCTGTAGCGGAGAAAACAGTGTAGACAAGGACAAAGGTTCCAATGATCTCTG
CAGCAAGTCCAGTCCATGTGCTGTATCCGTCAGCTAGAGAGTTTGCTCCTCCACCGTAAC
GTACGTAGTAAGAGCTTTGGAAAGCTTTGACGAAACCAACTCCACAAATAGCACCCAAAC
ACTGCGCCACCATGTATAGCACCGCTCTAACCAACGATACCTTCCTTGCCAAGAACAAGC
CGAACGTCACCGCAGGGTTTATGTGACCACCTGAGATACCGGCGGTGCAGTAGACAAGGA
TGAATATCATGCCACCGAAAGCCCATGAGATGCCGAGGATTCCGACACCTCCGCACTCGT
CGCCTCCGGCCTTAGTGTCGGACGAAATCTTGTAGCCGATGACAGTCAAAACAGTAACGT
ACAAGAAGAGGAGAGTGGCTACGAACTCGGCGATGACGGCTCTGTACAAAGACCACTTGG
TCAGCTCCTCCGCATCGAAAAACGGAGTTGGCGGTGGGTCTTCGTAGTCCCTCGCCGCGT
ATCCCTCTGCTCCTTCCACTTCTTTCGCCATTTAATATTTTTAATATATCAAGAATATGT
GTGTTTTGGTTATTGTTCCTGTTTTGTCC


BQ
10 10 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 20 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 

AF RR2CH80JQ U 21
AF RR2CH80TF C 21
AF RR2G972JQ U 1
AF RR2CJ27JQ U 2
AF RR2GO74JQ U 1
AF RR2EN16JQ U 2
AF RR2CR95JQ U 5
AF RR2EN16TF C 307
AF RR2GO74TF C 396
AF RR2FM10TF C 404
AF RR2CR95TF C 320
AF RR2CJ27TF C 399
BS 1 277 RR2G972JQ
BS 278 278 RR2CJ27JQ
BS 279 286 RR2G972JQ
BS 287 287 RR2CJ27JQ
BS 288 439 RR2G972JQ
BS 440 440 RR2GO74JQ
BS 441 497 RR2G972JQ
BS 498 499 RR2GO74JQ
BS 500 500 RR2EN16JQ
BS 501 511 RR2GO74JQ
BS 512 512 RR2EN16JQ
BS 513 555 RR2GO74JQ
BS 556 556 RR2CJ27JQ
BS 557 727 RR2GO74JQ
BS 728 735 RR2EN16JQ
BS 736 774 RR2CR95JQ
BS 775 1093 RR2EN16TF
BS 1094 1094 RR2GO74TF
BS 1095 1109 RR2EN16TF

RD RR2CH80JQ 214 0 0
GATTTCATTGACTGTTTTCCCCAAGTACACAAACATTCACATATCCCACAATGAAACCAG
AAATTAGGAAAGACAA**GGAATAAAACAGAGCATAGATTTTAAAACCAAAGTTGCCAAT
TTTGTACATACATAATAACAATCATTTTGTAATTGCTATTTTGTTTTGTGTGGCTAAATT
CAAGCTGCACTTCGGAAGGAGCCGAGGGACTTG
C

QA 1 213 1 213
DS 

RD RR2CH80TF 214 0 0
GATTTCATTGACTGTTTTCCCCAAGTACACAAACATTCACATATCCCACAATGAAACCAG
AAATTAGGAAAGACAA**GGAATAAAACAGAGCATAGATTTTAAAACCAAAGTTGCCAAT
TTTGTACATACATAATAACAATCATTTTGTAATTGCTATTTTGTTTTGTGTGGCTAAATT
CAAGCTGCACTTCGGAAGGAGCCGAGGGACTTG
C

QA 1 213 1 213
DS 

RD RR2G972JQ 497 0 0
CCCGAAGGCAAAAACAATTTGATTTCATTGACTGTTTTCCCCAAGTACACAAACATTCAC
ATATCCCACAATGAAACCAGAAATTAGGAAAGACAA**GGAATAAAACAGAGCATAGATT
TTAAAACCAAAGTTGCCAATTTTGTACATACATAATAACAATCATTTTGTAATTGCTATT
TTGTTTTGTGTGGCTAAATTCAAGCTGCACTTCGGAAGGAGCCGAGGGACTTGGAACCAG
AGGCCCTTAGGACGAATTGGTGATAAAATGCAGCTATCGCAGCTCCAATGAATGGTCCCA
CCCAGAAAATCCAGTGGTCATCCCACGGCTTGGACTCATTGTAGATAACCGCGGCTCCAA
AACTCCTGGCCGGGTTAATCCCGGTTCCGGTGATTGGAATAGTGGCCAAGTGAACCATGA
ACACGGCAAATCCAATTGGGAGTGGCGCCAACACGGGAACGTGGGAGTCTCGTGCGTTTC
TTTTGGGATCTGTAGCG

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2CJ27JQ 713 0 0
AA
GAAGGCAAAAACAATTTGATTTCATTAATTGTTTTCCCCGAGTACACAAACATTCACATA
TCCCACAATGAAGCCAGAAATTACGAAAGACAAAAGGAATAAAACAGAGCATAGATTTTA
AAACCAAAGTTGCCAATTTTGTACATACATAATAACAATCATTTTGTAATTGCTATTTTG
TTTTGTGTGGCTAAATTCAAGCCGCACTTCGGAAGGAGCCGAGGGACTTGGAACCAGAGG
CCCTTAGGACGAATTGGTGATAAAATGCAGCTATGGCAGCTCCGATGAATGGTCCCACCC
AAAAAATCCAGTGGTCATCCCACGGCTTGGACTCATTGTAAATAACCGCGGCTCCAAAAC
TCCTGGCCGGGTTAATCCCGGTTCCGGTGATTGGAATAGTGGCCAAGTGAACCATGAACA
CGGCAAATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACGGGAACGTGGGAGTCTCGTGCGTTTCTTT
TGGGATCTGTAGCGGAAAAAACAGTGTAAACAAGGACAAAGGTTCCAATGATCTCTGCAG
CAAGTCCAGTCCATGTGCTGTATCCGTCAGCTAGGGAGTTTGCTCCTCCACCGTAACGTA
CGTAGTAAGAGCTTTGGAAAGCTTTGACGAAACCAACTCCACAAATAGCACCCAAACACT
GCGCCACCATGTATAGCACCGCTCTAACCAACGATACCTTCCTTGCCAAGA

QA 3 713 3 713
DS 

RD RR2GO74JQ 727 0 0
CAC
GAAGGCAAAAACAATTTGATTTCATTGACTGTTTTCCCCAAGTACACAAACATTCACATA
TCCCACAATGAAACCAGAAATTAGGAAAGACAA**GGAATAAAACAGAGCATAGATTTTA
AAATCAAAGTTGCCAATTTTGTACATACATAATAACAATCATTTTGTAATTGCTATTTTG
TTTTGTGTGGCTAAATTCAAGCTGCACTTCGGAAGGAGCCGAGGGACTTGGAACCAGAGG
CCCTTAGGACGAATTGGTGATAAAATGCAGCTATCGCAGCTCCAATGAATGGTCCCACCC
AAAAAATCCAGTGGTCATCCCACGGCTTGGACTCATTGTAAATAACCGCGGCTCCAAAAC
TCCTGGCCGGGTTAATCCCGGTTCCGGTGATTGGAATAGTGGCCAAGTGAACCATGAACA
CGGCAAATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACGGGAACGTGGGAGTCTCGTGCGTTTCTTT
TGGGATCTGTAGCGGAAAAAACAGTGTAAACAAGGACAAAGGTTCCAATGATCTCTGCAG
CAAGTCCAGTCCCTGTGCTGTATCCGTCAGCTAGAGAGTTTGCTCCTCCACCGTAACGTA
CGTAGTAAGAGCTTTGGAAAGCTTTGACGAAACCAACTCCACAAATAGCACCCAAACACT
GCGCCACCATGTATAGCACCGCTCTAACCAACGATACCTTCCTTGCCAAGAACAAGCCGA
ACGT

QA 4 727 4 727
DS 

RD RR2EN16JQ 734 0 0
GA
GAAGGCAAAAACAATTTGATTTCATTGATTGTTTTCCCCGAGTACACAAACATTCACATA
TCCCACAATGAAGCCAGAAATTACGAAAGACAAAAGGAATAAAACAGAGCATAGATTTTA
AAACCAAAGTTGCCAATTTTGTACATACATAATAACAATCATTTTGTAATTGCTATTTTG
TTTTGTGTGGCTAAATTCAAGCCGCACTTCGGAAGGAGCCGAGGGACTTGGAACCAGAGG
CCCTTAGGACGAATTGGTGATAAAATGCAGCTATGGCAGCTCCGATGAATGGTCCCACCC
AGAAAATCCAGTGGTCATCCCACGGCTTGGACTCATTGTAGATAACCGCGGCTCCAAAAC
TCCTGGCCGGGTTAATCCCGGTTCCGGTGATTGGAATAGTGGCCAAGTGAACCATGAACA
CGGCAAATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACGGGAACGTGGGAGTCTCGTGCGTTTCTTT
TGGGATCTGTAGCGGAGAAAACAGTGTAGACAAGGACAAAGGTTCCAATGATCTCTGCAG
CAAGTCCAGTCCATGTGCTGTATCCGTCAGCTAGAGAGTTTGCTCCTCCACCGTAACGTA
CGTAGTAAGGGCTTTGGAAAGCTTTGACGAAACCAACTCCACAAATAGCACCCAAACACT
GCGCCACCATGTATAGCACCGCTCTAACCAACGATACCTTCCTTGCCAAGAACAAGCCGA
ACGTCACCGCAG

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR2CR95JQ 770 0 0
AAGGCAAAAACAATTTGATTTCATTGATTGTTTTCCCCGAGTACACAAACATTCACATAT
CCCACAATGAAGCCAGAAATTACGAAAGACAAAAGGAATAAAACAGAGCATAGATTTTAA
AACCAAAGTTGCCAATTTTGTACATACATAATAACAATCATTTTGTAATTGCTATTTTGT
TTTGTGTGGCTAAATTCAAGCCGCACTTCGGAAGGAGCCGAGGGACTTGGAACCAGAGGC
CCATAGGACGAATTGGTGATAAAATGCAGCTATGGCAGCTCCGATGAATGGTCCCACCCA
GAAAATCCAGTGGTCATCCCACGGCTTGGACTCATTGTAGATAACCGCGGCTCCAAAACT
CCTGGCCGGGTTAATCCCGGTTCCGGTGATTGGAATAGTGGCCAAGTGAACCATGAACAC
GGCAAATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACGGGAACGTGGGAGCCTCGTGCGTTTCTTTT
GGGATCTGTAGCGGAGAAAACAGTGTAGACAAGGACAAGGGTTCCAATGATCTCTGCAGC
AAGTCCAGTCCATGTGCTGTATCCGTCAGCTAGAGAGTTTGCTCCTCCACCGTAACGTAC
GTAGTAAGAGCTTTGGAAAGCTTTGACGAAACCAACTCCACAAATAGCACCCAAACACTG
CGCCACCATGTATAGCACCGCTCTAACCAACGATACCTTCCTTGCCAAGAACAAGCCGAA
CGTCACCGCAGGGTTTATGTGACCACCTGAGATACCGGCGGTGCAGTAGA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2EN16TF 803 0 0
AAATCCAGTG*TCATCCCACGGCTTGGACTCAT*GTAGATA*CCGCGGCTCCAAA*CTCC
TGGCCGGGT*AATCCCGGTTCCGGTGATTGGAATAGTGGCCAAGTGAACCATGAACACGG
CAAATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACGGGAACGTGGGAGTCTCGTGCGTTTCTTTTGG
GATCTGTAGCGGAGAAAACAGTGTAGACAAGGACAAAGGTTCCAATGATCTCTGCAGCAA
GTCCAGTCCATGTGCTGTATCCGTCAGCTAGAGAGTTTGCTCCTCCACCGTAACGTACGT
AGTAAGGGCTTTGGAAAGCTTTGACGAAACCAACTCCACAAATAGCACCCAAACACTGCG
CCACCATGTATAGCACCGCTCTAACCAACGATACCTTCCTTGCCAAGAACAAGCCGAACG
TCACCGCAGGGTTTATGTGACCACCTGAGATACCGGCGGTGCAGTAGACAAGGATGAATA
TCATGCCACCGAAAGCCCATGAGATGCCGAGGATTCCGACACCTCCGCACTCGTCGCCTC
CGGCCTTAGTGTCGGACGAAATCTTGTAGCCGATGACAGTCAAAACAGTAACGTACAAGA
AGAGGAGAGTGGCTACGAACTCGGCGATGACGGCTCTGTACAAAGACCACTTGGTCAGCT
CCTCCGCATCGAAAAACGGAGTTGGCGGTGGGTCTTCGTAGTCCCTCGCCGCGTATCCCT
CTGCTCCTTCCACTTCTTTCGCCATTTAATATTTTTAATATATCAAGAATATGTGTGTTT
TGGTTATCGTTCCTGTTTTGTCC

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2GO74TF 714 0 0
GGAATAGTGGCCAAGTGAACCATGAACACGGCAAATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACG
GGAACGTGGGAGTCTCGTGCGTTTCTTTTGGGATCTGTAGCGGAGAAAACAGTGTAGACA
AGGACAAAGGTTCCAATGATCTCTGCAGCAAGTCCAGTCCCTGTGCTGTATCCGTCAGCT
AGAGAGTTTGCTCCTCCACCGTAACGTACGTAGTAAGAGCTTTGGAAAGCTTTGACGAAA
CCAACTCCACAAATAGCACCCAAACACTGCGCCACCATGTATAGCACCGCTCTAACCAAC
GATACCTTCCTTGCCAAGAACAAGCCGAACGTCACCGCAGGGTTTATGTGACCACCTGAG
ATACCGGCGGTGCAGTAGACAAGGATGAATATCATGCCACCGAAAGCCCATGAGATGCCG
AGGATTCCGACACCTCCGCACTCGTCGCCTCCGGCCTTAGTGTCGGACGAAATCTTGTAG
CCGATGACAGTCAAAACAGTAACGTACAAGAAGAGGAGAGTGGCTACGAACTCGGCGATG
ACGGCTCTGTACAAAGACCACTTGGTCAGCTCCTCCGCATCGAAAAACGGAGTTGGCGGT
GGGTCTTCGTAGTCCCTCGCCGCGTATCCCTCTGCTCCTTCCACTTCTTTCGCCATTTAA
TATTTTTAATATATCAAGAATATGTGTGTTTTGGTTATTGTTCCTGTTTTGTCC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2FM10TF 706 0 0
GGCCAAGTGAACCATGAACACGGCAAATCCAATTGGAAGTGGTGCCAACACGGGAACGTG
GGAGTCTCGTGCGTTTCTTTTGGGATCTGTAGCGGAGAAAACAGTGTAGACAAGGACAAA
GGTTCCAATGATCTCTGCAGCAAGTCCAGTCCATGTGCTGTATCCGTCAGCTAGAGAGTT
TGCTCCTCCACCGTAACGTACGTAGTAAGAGCTTTGGAAAGCTTTGACGAAACCAACTCC
ACAAATAGCACCCAAACACTGCGCCACCATGTATAGCACCGCTCTAACCAACGATACCTT
CCTTGCCAAGAACAAGCCGAACGTCACCGCAGGGTTTATGTGACCACCTGAGATACCGGC
GGTGCAGTAGACAAGGATGAATATCATGCCACCGAAAGCCCATGAGATGCCGAGGATTCC
GACACCTCCGCACTCGTCGCCTCCGGCCTTAGTGTCGGACGAAATCTTGTAGCCGATGAC
AGTCAAAACAGTAACGTACAAGAAGAGGAGAGTGGCTACGAACTCGGCGATGACGGCTCT
GTACAAAGACCACTTGGTCAGCTCCTCCGCATCGAAAAACGGAGTTGGCGGTGGGTCTTC
GTAGTCCCTCGCCGCGTATCCCTCTGCTCCTTCCACTTCTTTCGCCATTTAATATTTTTA
ATATATCAAGAATATGTGTGTTTTGGTTATTGTTCCTGTTTTG
ACC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2CR95TF 790 0 0
CATCCCAC
GCTTGGACTCATTGTAGAAAACCGCGGCTCCAAAACTCCTG*CCGGGTTA*TCCCGGTTC
CGGTGATTGGAATAGTGGCCAAGTGAACCATGAACACGGCAAATCCAATTGGAAGTGGCG
CCAACACGGGAACGTGGGAG*CTCGTGCGTTTCTTTTGGGATCTGTAGCGGAGAAAACAG
TGTAGACAAGGACAAGGGTTCCAATGATCTCTGCAGCAAGTCCAGTCCATGTGCTGTATC
CGTCAGCTAGAGAGTTTGCTCCTCCACCGTAACGTACGTAGTAAGAGCTTTGGAAAGCTT
TGACGAAACCAACTCCACAAATAGCACCCAAACACTGCGCCACCATGTATAGCACCGCTC
TAACCAACGATACCTTCCTTGCCAAGAACAAGCCGAACGTCACCGCAGGGTTTATGTGAC
CACCTGAGATACCGGCGGTGCAGTAGACAAGGATAAATATCATGCCACCGAAAGCCCATG
AGATGCCGAGGATTCCGACACCTCCGCACTCGTCGCCTCCGGCCTTAGTGTCGGACGAAA
TCTTGTAGCCGATGACAGTCAAAACAGTAACGTACAAGAAGAGGAGAATGGCTACGAACT
CGGCGATGACGGCTCTGTACAAAGACCACTTGGTCAGCTCCTCCGCATCGAAAAACGGAG
TTGGCGGTGGGTCTTCGTAGTCCCTCGCCGCGTATCCCTCTGCTCCTTCCACTTCTTTCG
CCATTTAATATTTTTAATATATCAAGAATATGTGTGTTTTGGTTATTGTTCCTGTTTTGT
CC

QA 9 790 9 790
DS 

RD RR2CJ27TF 711 0 0
ATAGTGGCCAAGTGAACCATGAACACGGCAAATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACGGGA
ACGTGGGAGTCTCGTGCGTTTCTTTTGGGATCTGTAGCGGAGAAAACAGTGTAGACAAGG
ACAAAGGTTCCAATGATCTCTGCAGCAAGTCCAGTCCATGTGCTGTATCCGTCAGCTAGG
GAGTTTGCTCCTCCACCGTAACGTACGTAGTAAGAGCTTTGGAAAGCTTTGACGAAACCA
ACTCCACAAATAGCACCCAAACACTGCGCCACCATGTATAGCACCGCTCTAACCAACGAT
ACCTTCCTTGCCAAGAACAAGCCGAACGTCACCGCAGGGTTTATGTGACCACCTGAGATA
CCGGCGGTGCAGTAGACAAGGATGAATATCATGCCACCGAAAGCCCATGAGATGCCGAGG
ATTCCGACACCTCCGCACTCGTCGCCTCCGGCCTTAGTGTCGGACGAAATCTTGTAGCCG
ATGACAGTCAAAACAGTAACGTACAAGAAGAGGAGAGTGGCTACGAACTCGGCGATGACG
GCTCTGTACAAAGACCACTTAGTCAGCTCCTCCGCATCGAAAAACGGAGTTGGCGGTGGG
TCTTCGTAGTCCCTCGCCGCGTATCCCTCTGCTCCTTCCACTTCTTTCGCCATTTAATAT
TTTTAATATATCAAGAATATGTGTGTTTTGGTTATTGTTCCTGTTTTGTCC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 11

CO CL296Contig1 1436 11 18 U
GGAGAAAACAACAAAAAAAAAACAATAAAAAATAAAATAAATAAATAAATAAAAATGGGT
TCATATTTAGGAATTTATACAATTTTGGTTCTATGTTTGCTAAGATATTCAGCCAATGCT
GAGGTGTTCAACGCTGGTGGTCCTCCAAATTCTGATATCACCGCGGCAGTTCTTAAAGCA
TTCACATCGGCATGTCAAGCTCCGGCACCAAGCCAGGTGCTGATCCCAAAAGGTGACTTC
AAGCTTGGTGAGATCGCTATGACTGGTCCATGCAAATCTCCAATCGAGTTCACCTTGCAA
GGCAACGTCAAAGCTGACGGTGGCTCTACCCAGGGAAAGGATAGATGGGTTGTGTTCGAA
AAAATTAATGGTTTTAAGTTGAACGGAGGTGGAACATTTGACGGTGAAGGCAATGCAGCT
TGGAAAGCCAATAACTGCCACAAGACTTTTGAGTGCAAGAAGCTTCCCATCAGTGTGAGG
TTTGATTTTGTGGATAACGCTGATATAAGAGACGTAACCTCATTAGATGCCAAAAACTTC
CACTTCAACGTTATCAGCGGCAAGAACATGACATTTGATAACATCAAGATCATTGCTCCA
GCTGAAAGCCCCAACACTGACGGTATCCATTTGGGAAGATGTGAGGGAGTCAAGATCCTC
AACACTAAGATCGCCACAGGAGATGACTGCATCTCCGTGGGAGATGGGATGAAGAATCTC
CTCATTGAGAAAGTTGTGTGCGGTCCAGGACATGGAATCAGTGTTGGAAGCCTTGGAAGG
TACGGATGGGAGCAAGATGTAAATGATATTAAGGTTATGAACTGCACCCTCGTGGGAACC
GATAACGGTCTGAGGATCAAGACATGGCCCTCTGCGGCTTGCGCCACAACCGCTGCCGGT
ATTCATTTTGAGAATATCATCCTTGACAAAGTTAGCAACCCAATCCTCATTGACCAGGAG
TACTGCCCTTGGAACCAATGCAACAAGAACAAACCATCAACAATTAAGCTGGTGGACATT
GCCTTCAGGAATATTAGAGGAACATCAGGGAACAAGGACGCAGTGAAGCTATTGTGCAGC
AAGGGACATCCATGTGAGAATGTTGAGATTGGAGACATTAACATTGAGTACAAAGGACCT
GACGGTCCACCCACTTTCGAATGCACAAACGTCACACCTAAGCTTGTGGGAACCCAGAAC
CCAAAGGCTTGCGTTGGACCTGTCGTCAAGGCACCTGGGCAAGCGTAAAGTGTTGAAGCT
CAGATCAACACACTAGGGCTTTCACATCCAATTTTGTTTTTCCTTTTTTCGTACCCTTTT
TCAAGTCACGTAAGGGAGACTTTTACAAAGCTGTAACAAAAAAATGTTTCTATCCGATGC
CAACACATATAGATGTGTGAGTGCATTATGATTTAATAAAACTAAAAAGATTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 0 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW37TF U 1
AF RR2FN27TF U 14
AF RR2H036TF U 14
AF RR2AU06TF U -1
AF RR2H855TF U 6
AF RR2AU20TF U 357
AF RR2H855JQ C 874
AF RR2A528TF U 554
AF RR2AU06JQ C 569
AF RR2E719JQ C 782
AF RR2E719TF U 782
BS 1 14 RR2EW37TF
BS 15 15 RR2AU06TF
BS 16 679 RR2EW37TF
BS 680 680 RR2H036TF
BS 681 715 RR2EW37TF
BS 716 748 RR2AU06TF
BS 749 749 RR2H855TF
BS 750 775 RR2AU06TF
BS 776 874 RR2AU20TF
BS 875 875 RR2A528TF
BS 876 1025 RR2AU20TF
BS 1026 1142 RR2A528TF
BS 1143 1143 RR2E719TF
BS 1144 1171 RR2A528TF
BS 1172 1172 RR2E719TF
BS 1173 1332 RR2A528TF
BS 1333 1420 RR2E719TF
BS 1421 1436 RR2E719JQ

RD RR2EW37TF 715 0 0
GGAGAAAACAACAATAAAAAAACAATAAAAAATAAAATAAATAAATAAATAAAAATGGGT
TCATATTTAGGAATTTATACAATTTTGGTTCTATGTTTGCTAAGATATTCAGCCAATGCT
GAGGTGTTCAACGCTGGTGGTCCTCCAAATTCTGATATCACCGCGGCAGTTCTTAAAGCA
TTCACATCGGCATGTCAAGCTCCGGCACCAAGCCAGGTGCTGATCCCAAAAGGTGACTTC
AAGCTTGGTGAGATCGCTATGACTGGTCCATGCAAATCTCCAATCGAGTTCACCTTGCAA
GGCAACGTCAAAGCTGACGGTGGCTCTACCCAGGGAAAGGATAGATGGGTTGTGTTCGAA
AAAATTAATGGTTTTAAGTTGAACGGAGGTGGAACATTTGACGGTGAAGGCAATGCAGCT
TGGAAAGCCAATAACTGCCACAAGACTTTTGAGTGCAAGAAGCTTCCCATCAGTGTGAGG
TTTGATTTTGTGGATAACGCTGATATAAGAGACGTAACCTCATTAGATGCCAAAAACTTC
CACTTCAACGTTATCAGCGGCAAGAACATGACATTTGATAACATCAAGATCATTGCTCCA
GCTGAAAGCCCCAACACTGACGGTATCCATTTGGGAAGATGTGAGGGAGTCAAGATCCTC
AACACTAAGATCGCCACAG*AGATGACTGCATCTCCGTGGGAGATGGGATGAAGA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2FN27TF 676 0 0
GGAGAAAACA
AATAAAAAATAAAATAAATAAATAAATAAAAATGGGTTCATATTTAGGAATATATACAAT
TTTGGTTCTATGTTTGCTAGGATATTCAGCCAATGCCGAGGTGTTTAACGCTGGTGGTCC
TCCAAATTCTGATATTACCGCGGCAGTTCTTAAAGCATTCACATCGGCATGCCAAGCTCC
GGCACCAAGCCAGGTGCTGATCCCAAAAGGTGACTTCAAGCTTGGTGAGATCGCTATGAC
TGGTCCATGCAAATCTCCAATCGAGTTCACCTTGCAAGGCAACGTCAAAGCTGACGGTGG
CTCTACCCAGGGAAAGGATAGATGGGTTGTGTTCGAAAAAATTAATGGTTTTAAGTTGAA
CGGAGGTGGAACATTTGACGGTGAAGGCAATGCAGCTTGGAAAGCCAATAACTGCCACAA
GACTTTTGAGTGCAAGAAGCTTCCCATCAGTGTGAGGTTTGATTTTGTGGATAACGCTGA
TATAAGAGACGTAACCTCATTAGATGCCAAAAACTTCCACTTCAACGTTATCAGCGGCAA
GAACATGACATTTGATAACATCAAGATCATTGCTCCAGCTGAAAGCCCCAACACTGACGG
TATCCATTTGGGAAGATGTGAGGGAGTCAAGATCCTCAACACTAAGATCGCTACAG*AGA
TGACTG

QA 11 676 11 676
DS 

RD RR2H036TF 699 0 0
GGAGAAAACAAAAAT
AAAATAAAATAAATAAATAAATAAAAATGGGTTCATATTTAGGAATATATACAATTTTGG
TTCTATGTTTGCTAGGATATTCAGCCAATGCCGAGGTGTTTAACGCTGGTGGTCCTCCAA
ATTCTGATATTACCGCGGCAGTTCTTAAAGCATTCACATCGGCATGCCAAGCTCCGGCAC
CAAGCCAGGTGCTGATCCCAAAAGGTGACTTCAAGCTTGGTGAGATCGCTATGACTGGTC
CATGCAAATCTCCAATCGAGTTCACCTTGCAAGGCAACGTCAAAGCTGACGGTGGCTCTA
CCCAGGGAAAGGATAGATGGGTTGTGTTCGAAAAAATTAATGGTTTTAAGTTGAACGGAG
GTGGAACATTTGACGGTGAAGGCAATGCAGCTTGGAAAGCCAATAACTGCCACAAGACTT
TTGAGTGCAAGAAGCTTCCCATCAGTGCGAGGTTTGATTTTGTGGATAACGCTGATATAA
GAGACGTAACCTCATTAGATGCCAAAAACTTCCACTTCAACGTTATCAGCGGCAAGAACG
TGACATTTGATAACATCAAGATCATTGCTCCAGCTGAAAGCCCCAACACTGACGGTATCC
ATTTGGGAAGATGTGAGGGAGTCAAGATCCTCAACACTAAGATCGCCACAGGAGATGACT
GCATCTCCGTGGGAGATGGGATGA

QA 16 699 16 699
DS 

RD RR2AU06TF 777 0 0
GGAGAAAACAACAATA
AAAAAAAACAATAAAAAATAAAATAAATAAATAAATAAAAATGGGTTCATATTTAGGAAT
TTATACAATTTTGGTTCTATGTTTGCTAAGATATTCAACCAATGCTGAGGTGTTCAACGC
TGGTGGTCCTCCAAATTCTGATATCACCGCGGCAGTTCTTAAAGCATTCACATCGGCATG
TCAAGCTCCGGCACCAAGCCTGGTGCTGATCCCAAAAGGTGACTTCAAGCTTGGTGAGAT
CGCTATGACTGGTCCATGCAAATCTCCAATCGAGTTCACCTTGCAAGGCAACGTCAAAGC
TGACGGTGGCTCTACCCAGGGAAAGGATAGATGGGTTGTGTTCGAAAAAATTAATGGTTT
TAAGTTGAACGGAGGTGGAACATTTGACGGTGAAGGCAATGCAGCTTGGAAAGCCAATAA
CTGCCACAAGACTTTTGAGTGCAAGAAGCTTCCCATCAGTGTGAGGTTTGATTTTGTGGA
TAACGCTGATATAAGAGACGTAACCTCATTAGATGCCAAAAACTTCCACTTCAACGTTAT
CAGCGGCAAGAGCATGACATTTGATAACATCAAGATCATTGCTCCAGCTGAAAGCCCCAA
CACTGACGGTATCCATTTGGGAAGATGTGAGGGAGTCAAGATCCTCAACACTAAGATCGC
CACAGGAGATGACTGCATCTCCGTGGGAGATGGGATGAAGAATCTCCTCATTGAGAAAGT
TGTGTGCGGTCCAG*ACATGGAATCAGTGTTGGAAGCCTTG

QA 17 777 17 777
DS 

RD RR2H855TF 752 0 0
GGGAACAATA
AAAAAAACAATAAAAAATAAAATAAATAAATAGATAAAAATGGGTTCATATTTAGGAATT
TATACAATTTTGGTTCTATGTTTGCTAAGATATTCAGCCAATGCTGAGGTGTTCAACGCT
GGTGGTCCTCCAAATTCTGATATCACCGCGGCAGTTCTTAAAGCATTCACATCGGCATGT
CAAGCTCCGGCACCAAGCCAGGTGCTGATCCCAAAAGGTGACTTCAAGCTTGGTGAGATC
GCTATGACTGGTCCATGCAAATCTCCAATCGAGTTCACCTTGCAAGGCAACGTCAAAGCT
GACGGTGGCTCTACCCAGGGAAAGGATAGATGGGTTGTGTTCGAAAAAATTAATGGTTTT
AAGTTGAACGGAGGTGGAACATTTGACGGTGAAGGCAATGCAGCTTGGAAAGCCAATAAC
TGCCACAAGACTTTTGAGTGCAAGAAGCTTCCCATCAGTGTGAGGTTTGATTTTGTGGAT
AACGCTGATATAAGAGACGTAACCTCATTAGATGCCAAAAACTTCCACTTCAACGTTATC
AGCGGCAAGAACATGACATTTGATAACATCAAGATCATTGCTCCAGCTGAAAGCCCCAAC
ACTGACGGTATCCATTTGGGAAGATGTGAGGGAGTCAAGATCCTCAACACTAAGATCGCC
ACAG*AGATGACTGCATCTCCGTGGGAGATGGGATGAAGAATCTCCTCATTGAGAAAGTT
GTGTGCGGTCCAGGACATGGAA

QA 11 752 11 752
DS 

RD RR2AU20TF 669 0 0
G
GAAAAAATTAATGGTTTTAAGTTGAACGGAGGTGGAACATTTGACGGTGAAGGCAATGCA
GCTTGGAAAGCCAATAACTGCCACAAGACTTTTGAGTGCAAGAAGCTTCCCATCAGTGTG
AGGTTTGATTTTGTGGATAACGCTGATGTAAGAGACGTAACCTCATTAGATGCCAAAAAC
TTCCACTTCAACGTTATCAGCGGCAAGAACATGACATTTGATAACATCAAGATCATTGCT
CCAGCTGAAAGCCCCAACACTGACGGTATCCATTTGGGAAGATGTGAGGGAGTCAAGATC
CTCAACACTAAGATCGCCACAGGAGATGACTGCATCTCCGTGGGAGATGGGATGAAGAAT
CTCCTCATTGAGAAAGTTGTGTGCGGTCCAGGACATGGAATCAGTGTTGGAAGCCTTGGA
AGGTACGGATGGGAGCAAGATGTAAATGATATTAAGGTTATGAACTGCACCCTCGTGGGA
ACCGATAACGGTCTGAGGATCAAGACATGGCCCTCTGTGGCTTGCGCCACAACCGCTGCC
GGTATTCATTTTGAGAATATCATCCTTGACAAAGTTAGCAACCCAATCCTCATTGACCAG
GAGTACTGCCCTTGGAACCAATGCAACAAGAACAAACCATCAACAATTAAGCTGGTGGAC
ATTGCCTT

QA 2 669 2 669
DS 

RD RR2H855JQ 269 0 0
GCGGCTTGCGTCACAACCGCTGCCGGTATTCATTTTGAGAATATCATCCTTGACAAAGTT
AGCAACCCAATCCTCATTGACCAGGAGTACTGCCCTTGGAACCAATGCAACAAGAACAAA
CCATCAACAATTAAGCTGGTGGACATTGCCTTCAGGAATATTAGAGGAACATCAGGGAAC
AAGGACGCAGTGAAGTTATTGTGCAGCAAGGGACATCCATGTGAGAATGTTGAGATTGGA
GACATTAACATTGAGTACAAAGGACCTGA

QA 1 269 1 269
DS 

RD RR2A528TF 779 0 0
G
CAGCGGCAAGAACATGACATTTGATAACATCAAGATCATTGCTCCAGCTGAAAGCCCCAA
CACTGACGGTATCCATTTGGGAAGATGTGAGGGAGTCAAGATCCTCAACACTAAGATCGC
CACAGGAGATGACTGCATCTCCGTGGGAGATGGGATGAAGAATCTCCTCATTGAGAAAGT
TGTGTGCGGTCCAGGACGTGGAATCAGTGTTGGAAGCCTTGGAAGGTACGGATGGGAGCA
AGATGTAAATGATATTAAGGTTATGAACTGCACCCTCGTGGGAACCGATAACGGTCTGAG
GATCAAGACATGGCCCTCTGCGGCTTGCGCCACAACCGCTGCCGGTATTCATTTTGAGAA
TATCATCCTTGACAAAGTTAGCAACCCAATCCTCATTGACCAGGAGTACTGCCCTTGGAA
CCAATGCAACAAGAACAAACCATCAACAATTAAGCTGGTGGACATTGCCTTCAGGAATAT
TAGAGGAACATCAGGGAACAAGGACGCAGTGAAGCTATTGTGCAGCAAGGGACATCCATG
TGAGAATGTTGAGATTGGAGACATTAACATTGAGTACAAAGGACCTGATGGTCCACCCAC
TTTCGAATGCACAAACGCCACACCTAAGCTTGTGGGAACCCAGAACCCAAAGGCTTGCGT
TGGACCTGTCGTCAAGGCACCTGGGCAAGCGTAAAGTGTTGAAGCTCAGATCAACACACT
AGGGCTTTCACATCCAATTTTGTTTTTCCTTTTTTCGTACCCTTTTTCAAGTCACGTA

QA 2 779 2 779
DS 

RD RR2AU06JQ 855 0 0
TGACATTTGATAACATCAAGATCATTGCTCCAGCTGAAAGCCCCAACACTGACGGTATCC
ATTTGGGAAGATGTGAGGGAGTCAAGATCCTCAACACTAAGATCGCCACAGGAGATGACT
GCATCTCCGTGGGAGATGGGATGAAGAATCTCCTCATTGAGAAAGTTGTGTGCGGTCCAG
GACATGGAATCAGTGTTGGAAGCCTTGGAAGGTACGGATGGGAGCAAGATGTAAATGATA
TTAAGGTTATGAACTGCACCCTCGTGGGAACCGATAACGGTTTGAGGATCAAGACATGGC
CCTTTGCGGCTTGCGCCACAACCGCTGCCGGTATTCATTTTGAGAATATCATCCTTGACA
AAGTTAGCAACCCAATCCTCATTGACCAGGAGTACTGCCCTTGGAACCAATGCAACAAGA
ACAAACCATCAACAATTAAGCTGGTGGACATTGCCTTCAGGAATATTAGAGGAACATCAG
GGAACAAGGACGCAGTGAAGCTATTGTGCAGCAAGGGACATCCATGTGAGAATGTTGAGA
TTGGAGACATTAACATTGAGTACAAAGGACCTGATGGTCCACCCACTTTCGAATGCACAA
ACGTCACACCTAAGCTTGTGGGAACCCAGAACCCAAAGGCTTGCGTTGGACCTGTCGTCA
AGGCACCTGGGCAAGCGTAAAGTGTTGAAGCTCAGATCAACACACTAGGGCTTTCACATC
CAATTTTGTTTTTCCTTTTTTCGTACCCTTTTTCAAGTCACGTAAGGGAGACTTTTACAA
AGCTGTAACAAAAAA*TGTTTCTATCCGATGCCAACACATATAGATGTGTGAGTGCATTA
TGATTTAATAAA
ACT

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR2E719JQ 655 0 0
AG
GGATGGGAGCAAGATGTAAATGATATTAAGGTTATGAACTGCACCCTCGTGGGAACCGAT
AACGGTTTGAGGATCAAGACATGGCCTTTTGCGGCTTGCGCCACAACCGCTGCCGGTATT
CATTTTGATAATATCATCCTTGACAAAGTTAGCAACCCAATCCTCATTGACCAGGAGTAC
TGCCCTTGGAACCAATGCAACAAGAACAAACCATCAACAATTAAGCTGGTGGACATTGCC
TTCAGGAATATTAGAGGAACATCAGGGAACAAGGACGCAGTGAAGCTATTGTGCAGCAAG
GGACATCCATGTGAGAATGTTGAGATTGGAGACATTAACATTGAGTACAAAGGACCTGAC
GGTCCACCCACTTTCGAATGCACAAACGTCACACCTAAGCTTGTGGGAACCCAGAACCTA
AAGGCTTGCGTTGGACCTGTCGTCAAGGCACCTGGGCAAGCGTAAAGTGTTGAAGCTCAG
ATCAACACGCTAGGGCTTTCACATCCAATTTTGTTTTTCCTTTTTTCGTACCCTTTTTCA
AGTCACGTAAGGGAGACTTTTACAAAGCTGTAACAAAAAAATGTTTCTATCCGATGCCAA
CACATATAGATGTGTGAGTGCATTATGATTTAATAAAACTAAAAAGATTAATC

QA 3 655 3 655
DS 

RD RR2E719TF 652 0 0
AG
GGATGGGAGCAAGATGTAAATGATATTAAGGTTATGAACTGCACCCTCGTGGGAACCGAT
AACGGTCTGAGGATCAAGACATGGCCCTCTGCGGCTTGCGCCACAACCGCTGCCGGTATT
CATTTTGATAATATCATCCTTGACAAAGTTAGCAACCCAATCCTCATTGACCAGGAGTAC
TGCCCTTGGAACCAATGCAACAAGAACAAACCATCAACAATTAAGCTGGTGGACATTGCC
TTCAGGAATATTAGAGGAACATCAGGGAACAAGGACGCAGTGAAGCTATTGTGCAGCAAG
GGACATCCATGTGAGAATGTTGAGATTGGAGACATTAACATTGAGTACAAAGGACCTGAC
GGTCCACCCACTTTCGAATGCACAAACGTCACACCTAAGCTTGTGGGAACCCAGAACCTA
AAGGCTTGCGTTGGACCTGTCGTCAAGGCACCTGGGCAAGCGTAAAGTGTTGAAGCTCAG
ATCAACACGCTAGGGCTTTCACATCCAATTTTGTTTTTCCTTTTTTCGTACCCTTTTTCA
AGTCACGTAAGGGAGACTTTTACAAAGCTGTAACAAAAAAATGTTTCTATCCGATGCCAA
CACATATAGATGTGTGAGTGCATTATGATTTAATAAA
CTAAAAGATTATC

QA 3 639 3 639
DS 



AS 3 11

CO CL297Contig1 1012 6 23 U
TGACATTAGATATGCATTACATAGTTT*GTGTGTTTGGAACTAAAA*TAAAGCAGGTGTT
TTACAAACACTACTGTATATGACTTTTGATGGATTTCTCAAGTAAAATCACACATAAATG
AGAGAAGAGTTCATTCACTTATTCCGACCAATCAACATGAGTAAAGTGGGTATGCTCTGT
ACAGCTTAACACCCAGAAGATAATATGCTTACTTTTGAGTTGAGATTCTCAACGCCCTCA
CCAAAATCAAACTTCACCAGGAAGCATAGTATCTACTGGACCAAGATCACAGAAGGCAAT
GCCATCTCCAGTGAGGTGTGCAACACATTGCTTCTCAGCCAACAGTTCTGCTTCCGACTT
GGCGATTCGTTTGCGAAGGTAGTCATCAATTTCTACATCCTTGACAAGTTCATAATCTCC
ATCCCCCTTTGACCTGCATGGCATGCTGAAAACAAGGTCCTCAGCAATACCATAAGGATT
TCCATTTGTGTACACCCCAGTAGAAAACCAGTCACCCTCAGGAGTAGGAGTTACAAGAGA
CTTTATAGCATCAACAATGGAAACAGCTGTAGAAGCAGCAGAAGATCGACCCCATTTCTG
AATCAGTAAGCCACCTCTCTTCTGCACACTCTCAGTAAACCCCTCTTCTAACCATTTGTG
ATCTGTAATAACCTCCTTCACGGGCCGGCCATTGATTCTGGCATTCAAGAAGTCTGGCAC
CTGTGTAGTGGAGTGGTTTCCCCATATGGTCATATTAGAGACTTTGTCGTAGAAGACGCC
AGCTTTAAGAGCAAGCTGGCATTTGGAGGTGGAAGTTGCGTGGAGAGGTGGAGGAAGAAG
AAGAAGATGTCGAAACTGGTTTGAAAGATGCAACTTGGAGGAGAGGCGAAGCCCCCCAGA
CGAAGAAGAGTTGAGAAACGGCGACGTCGTCGTTTTGGGAGTTGAAAGCTCTGCCATGGC
CATTATCGCAACAGACTCAAACTCTGTGGAAAGACACAGAGGAGCGCGCCCC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC72JQ U 2
AF RR2FY39JQ U 2
AF RR2D354JQ U 203
AF RR2BY53JQ U 1
AF RR2F643JQ U 2
AF RR2BY53TF C 258
BS 1 27 RR2BY53JQ
BS 28 28 RR2EC72JQ
BS 29 29 RR2BY53JQ
BS 30 30 RR2EC72JQ
BS 31 31 RR2BY53JQ
BS 32 32 RR2EC72JQ
BS 33 46 RR2BY53JQ
BS 47 47 RR2EC72JQ
BS 48 56 RR2BY53JQ
BS 57 57 RR2EC72JQ
BS 58 91 RR2BY53JQ
BS 92 92 RR2EC72JQ
BS 93 144 RR2BY53JQ
BS 145 145 RR2EC72JQ
BS 146 171 RR2BY53JQ
BS 172 172 RR2EC72JQ
BS 173 433 RR2BY53JQ
BS 434 434 RR2EC72JQ
BS 435 501 RR2BY53JQ
BS 502 502 RR2EC72JQ
BS 503 669 RR2BY53JQ
BS 670 704 RR2F643JQ
BS 705 1012 RR2BY53TF

RD RR2EC72JQ 516 0 0
GACATTAGATATGCATTACATAGTTT*GTGTGTTTGGAACTAAAA*TAAAGCAGGTGTTT
TACAAACACTACTGTATATGACTTTTGATGGATTTCTCAAGTAAAATCACACATAAATGA
GAGAAGAGTTCATTCACTTATTCCGACCAATCAACATGAGTAAAGTGGGTATGCTCTGTA
CAGCTTAACACCCAGAAGATAATATGCTTACTTTTGAGTTGAGATTCTCAACGCCCTCAC
CAAAATCAAACTTCACCAGGAAGCATAGTATCTACTGGACCAAGATCACAAAAGGCAATG
CCATCTCCAGTGAGGTGTGCAACACATTGCTTCTCAGCCAACAGTTCTGCTTCCGACTTG
GCGATTCGTTTGCGAAGGTAGTCATCAATTTCTACATCCTTGACAAGTTCATAATCTCCA
TCCCCCTTTGACCTGCATGGCGTGCTGAAAACAAGGTCCTCAGCAATACCATAAGGATTT
CCATTTGTGTACACCCCAGTAGAAAACCAGTCACCC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2FY39JQ 515 0 0
GACATTAGATATGCATTACATAGTTT*GTGTGTTTGGAACTAAAA*TAAAGCAGGTGTTT
TACAAACACTACTGTATATGACTTTTGATGGATTTCTCAAGTAAAATCACACGTAAATGA
GAGAAGAGTTCATTCACTTATTCCGACCAATCAACATGAGTAAAGTGGGTATGCTCTGTA
CAGCTTAACACCCAGAAGATAATATGCTTACTTTTGAGTTGAGATTCTCAACGCCCTCAC
CAAAATCAAACTTCACCAGGAAGCATAGTATATACTGGACCAAGATCACAAAAGGCAATG
CCATCTCCAGTGAGGTGTGCAACACATTGCTTCTCAGCCAACAGTTCTGCTTCCGACTTG
GCGATTCGTTTGCGAAGGTAGTCATCAATTTCTACATCCTTGACAAGTTCATAATCTCCA
TCCCCCTTTGACCTGCATGGCATGCTGAAAACAAGGTCCTCAGCAATACCATAAGGATTT
CCATTTGTGTACACCCCAGTAGAAAACCAGTCACC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2D354JQ 315 0 0
ATATGCTTACTTTTGAGTTGAGATTCTCAACGCCCTCACCAAAATCAAACTTCACCAGGA
AGCATAGTATCTACTGGACCAAGATCACAGAAGGCAATGCCATCTCCAGTGAGGTGTGCA
ACACATTGCTTCTCAGCCAACAGTTCTGCTTCCGACTTGGCGATTCGTTTGCGAAGGTAG
TCATCAATTTCTACATCCTTGACAAGTTCATAATCTCCATCCCCCTTTGACCTGCATGGC
ATGCTGAAAACAAGGTCCTCAGCAATACCATAAGGATTTCCATTTGTGTACACCCCAGTA
GAAAACCAGTCACCC

QA 1 315 1 315
DS 

RD RR2BY53JQ 669 0 0
TGACATTAGATATGCATTACATAGTTTTGGGGGTTTGGAACTAAAAATAAAGCAGGGGTT
TTACAAACACTACTGTATATGACTTTTGATGAATTTCTCAAGTAAAATCACACATAAATG
AGAGAAGAGTTCATTCACTTATTCTGACCAATCAACATGAGTAAAGTGGGTGTGCTCTGT
ACAGCTTAACACCCAGAAGATAATATGCTTACTTTTGAGTTGAGATTCTCAACGCCCTCA
CCAAAATCAAACTTCACCAGGAAGCATAGTATCTACTGGACCAAGATCACAGAAGGCAAT
GCCATCTCCAGTGAGGTGTGCAACACATTGCTTCTCAGCCAACAGTTCTGCTTCCGACTT
GGCGATTCGTTTGCGAAGGTAGTCATCAATTTCTACATCCTTGACAAGTTCATAATCTCC
ATCCCCCTTTGACTTGCATGGCATGCTGAAAACAAGGTCCTCAGCAATACCATAAGGATT
TCCATTTGTGTACACCCCAGTCGAAAACCAGTCACCCTCAGGAGTAGGAGTTACAAGAGA
CTTTATAGCATCAACAATGGAAACAGCTGTAGAAGCAGCAGAAGATCGACCCCATTTCTG
AATCAGTAAGCCACCTCTCTTCTGCACACTCTCAGTAAACCCCTCTTCTAACCATTTGTG
ATCTGTAAT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2F643JQ 703 0 0
GACATTAGATATGAATTACATAGTTT*GTGTGTTTGGAACTAAAA*TAAAGCAGGTGTTT
TACAAACACTACTGTATATGACTTTTGATGGATTTCTCAAGTAAAATCACACATAAATGA
GAGAAGAGTTCATTCACTTATTCCGACCAATCGACATGAGTAAAGTGGGTATGCTCTGTA
CAGCTTAACACCCAGAAGATAATATGCTTACTTTTGAGTTGAGATTCTCAACGCCCTCAC
CAAAATCAAACTTCACCAGGAAGCATAGTATCTACTGGACCAAGATCACAAAAGGCAATG
CCATCTCCAGTGAGGTGTGCAACACATTGCTTCTCAGCCAACAGTTCTGCTTCCGACTTG
GCGATTCGTTTGCGAAGGTAGTCATCAATTTCTACATCCTTGACAAGTTCATAATCTCCA
TCCCCCTTTGACCTGCATGGCATGCTGAAAACAAGGTCCTCAGCAATACCATAAGGATTT
CCATTTGTGTACACCCCAGTAGAAAACCAGTCACCCTCAGGAGTAGGAGTTACAAGAGAC
TTTATAGCATCAACAATGGAAACAGCTGTAGAAGCAGCAGAAGATCGACCCCATTTCTGA
ATCAGTAAGCCACCTCTCTTCTGCACACTCTCAGTAAACCCCTCTTCTAACCATTTGTGA
TCTGTAATAACCTCCTTCACGGGCCGGCCATTGATTCTGGCAT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2BY53TF 755 0 0
CAGGAAGCATAGTATCTACTG*ACCAAGATCACAGAAGGCAATGCCATCTCCAGTGAG*T
GTGCAACACAT*GCTTCTCAGCCAACAGTTCTGCTTC*GACTTGGCGATTCGTTTGCGAA
GGTAGTCATCAATTTCTACATCCTTGACAAGTTCATAATCTCCATCCCCCTTTGACTTGC
ATGGCATGCTGAAAACAAGGTCCTCAGCAATACCATAAGGATTTCCATTTGTGTACACCC
CAGTCGAAAACCAGTCACCCTCAGGAGTAGGAGTTACAAGAGACTTTATAGCATCAACAA
TGGAAACAGCTGTAGAAGCAGCAGAAGATCGACCCCATTTCTGAATCAGTAAGCCACCTC
TCTTCTGCACACTCTCAGTAAACCCCTCTTCTAACCATTTGTGATCTGTAATAACCTCCT
TCACGGGCCGGCCATTGATTCTGGCATTCAAGAAGTCTGGCACCTGTGTAGTGGAGTGGT
TTCCCCATATGGTCATATTAGAGACTTTGTCGTAGAAGACGCCAGCTTTAAGAGCAAGCT
GGCATTTGGAGGTGGAAGTTGCGTGGAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAAGATGTCGAAACT
GGTTTGAAAGATGCAACTTGGAGGAGAGGCGAAGCCCCCCAGACGAAGAAGAGTTGAGAA
ACGGCGACGTCGTCGTTTTGGGAGTTGAAAGCTCTGCCATGGCCATTATCGCAACAGACT
CAAACTCTGTGGAAAGACACAGAGGAGCGCGCCCC

QA 1 755 1 755
DS 



CO CL297Contig2 1256 3 12 U
GGAGATTCGCCAATTCTCATTCATTCGATCTCTCTCTCTCGCTCTCTCTGACTTTGGCGC
GCTCCTCCCTGTGTCTTTCCACAGAGTGTGTCTGTTGCGATAATGGCCATGGCAGAGCTT
TCAACTCCCAAAACGACGTCGCCGTTTCGCAACTCTTCTTCGTCTGGGCTTCGCCTCTCC
TCTAAGTTGCATCTTTCAAACCAGTTTCGACATCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCACCTCTC
CACGCAACTTCCACCTCCAAAATATCTTGCTCTGTTTCTCAGAATAACCAAGCACCTGTA
GCGGTTCAAGATAATGGGCCGGTGAAGACGAAGAAAGAGTGTTTTGGAGTGTTCTGTCTC
ACCTATGACCTTAAAGCTGAAGAGGAGACGAAATCATGGAAGAAGATGATCAGTATTGCT
GTTTCAGGTGCTGCAGGCATGATATCTAACCACCTTCTCTTCAAACTTGCTTCAGGTGCA
GTGTTTGGACCAGACCAACCCATTGCTTTGAAACTTCTTGGATCAGAGAGATCAATCCAA
GCTCTCGAAGGCGTTGCAATGGAACTCGAGGATTCTTTGTTCCCGTTGCTGAGAGAAGTT
GATATAGGAACAGATCCATATGAAGTGTTCCAAGATGTGGAGTGGGCTCTTCTGATTGGT
GCAAAGCCTCGAGGCCCTGGAATGGAACGTGCTGCATTGTTGGATATTAATGGACAGATA
TCTGCTGAGCAGGGCAAAGCTCTTAACGCAGTTGCTTCTCCTAACGTCAAGGTCCTTGTA
GTTGGGAATCCTTGCAACACCAACGCCTTGATTTGTCTTAAAAACGCTCCCAACATTCCT
GCAAAGAACTTCCATGCTCTCACGAGGTTGGATGAGAATAGGGCCAAATGCCAGCTTGCT
CTTAAAGCTGGTGTCTTCTACGACAAAGTCTCTAATATGACCATATGGGGAAATCACTCC
ACTACACAGGTGCCAGACTTCTTGAATGCCAGAATCAATGGCCGGCCCGTGAAGGAGGTT
ATTACAGATCACAAATGGTTAGAAGAGGGGTTTACTGAGAGTGTCCAGAAGAGAGGTGGC
TTACTAATTCAGAAATGGGGTCGATCTTCGGCTGCTTCTACAGCTGTTTCAATTATTGAT
GCTATAAAGTCTCTTGTAACTCCTACTCCTGAGGGTGACTGGTTTTCTACTGGGGTGTAC
ACAAATGGAAATCCTTATGGTATTGCTGAGACCTTGTTTTCAGCATGCCATGCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC72TF U 1
AF RR2F643TF U 6
AF RR2D354TF U 546
BS 1 67 RR2EC72TF
BS 68 68 RR2F643TF
BS 69 177 RR2EC72TF
BS 178 179 RR2F643TF
BS 180 226 RR2EC72TF
BS 227 229 RR2F643TF
BS 230 318 RR2EC72TF
BS 319 319 RR2F643TF
BS 320 680 RR2EC72TF
BS 681 681 RR2D354TF
BS 682 704 RR2EC72TF
BS 705 1256 RR2D354TF

RD RR2EC72TF 712 0 0
GGAGATTCGCCAATTCTCATTCATTCGATCTCTCTCTCTCGCTCTCTCTGACTTTGGCGC
GCTCCTCTCTGTGTCTTTCCACAGAGTGTGTCTGTTGCGATAATGGCCATGGCAGAGCTT
TCAACTCCCAAAACGACGTCGCCGTTTCGCAACTCTTCTTCGTCTGGGCTTCGCCTC**C
TCTAAGTTGCATCTTTCAAACCAGTTTCGACATCTTCTTCTTCTTC***CTCCACCTCTC
CACGCAACTTCCACCTCCAAAATATCTTGCTCTGTTTCTCAGAATAACCAAGCACCTGTA
GCGGTTCAAGATAATGGGTCGGTGAAGACGAAGAAAGAGTGTTTTGGAGTGTTCTGTCTC
ACCTATGACCTTAAAGCTGAAGAGGAGACGAAATCATGGAAGAAGATGATCAGTATTGCT
GTTTCAGGTGCTGCAGGCATGATATCTAACCACCTTCTCTTCAAACTTGCTTCAGGTGCA
GTGTTTGGACCAGACCAACCCATTGCTTTGAAACTTCTTGGATCAGAGAGATCAATCCAA
GCTCTCGAAGGCGTTGCAATGGAACTCGAGGATTCTTTGTTCCCGTTGCTGAGAGAAGTT
GATATAGGAACAGATCCATATGAAGTGTTCCAAGATGTGGAGTGGGCTCTTCTGATTGGT
GCAAAGCCTCGAGGCCCTGGGATGGAACGTGCTGCATTGTTGGA
TATAACGG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2F643TF 671 0 0
GGA
GCCAATTCTCATTCATTCGATCTCTCTCTCTCGCTCTCTCTGACTTTGGCGCGCTCCTCC
CTGTGTCTTTCCACAGAGTGTGTCTGTTGCGATAATGGCCATGGCAGAGCTTTCAACTCC
CAAAACGACGTCGCCGTTTCGCAACTCTTCTTCGTCTGGGCTTCGCCTCTCCTCTAAGTT
GCATCTTTCAAACCAGTTTCGACATCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCACCTCTCCACGCAAC
TTCCACCTCCAAAATATCTTGCTCTGTTTCTCAGAATAACCAAGCACCTGTAGCGGTTCA
AGATAATGGGCCGGTGAAGACGAAGAAAGAGTGTTTTGGAGTGTTCTGTCTCACCTATGA
CCTTAAAGCTGAAGAGGAGACGAAATCATGGAAGAAGATGATCAGTATTGCTGTTTCAGG
TGCTGCAGGCATGATATCTAACCACCTTCTCTTCAAACTTGCTTCAGGTGCAGTGTTTGG
ACCAGACCAACCCATTGCTTTGAAACTTCTTGGATCAGAGAGATCAATCCAAGCTCTCGA
AGGCGTTGCAATGGAACTCGAGGATTCTTTGTTCCCGTTGCTGAGAGAAGTTGATATAGG
AACAGATCCATATGAAGTGTTCCAAGATGTGGAGTGGGCTCTTCTGATTGGTGCAAAGCC
TCGAG
CTG

QA 4 668 4 668
DS 

RD RR2D354TF 711 0 0
G
GAAGGCGTTGCAATGGAACTCGAGGATTCTTTGTTCCCGTTGCTGAGAGAAGTTGATATA
GGAACAGATCCATATGAAGTGTTCCAAGATGTGGAGTGGGCTCTTCTGATTGGTGCAAAG
CCTCGAGGCCCTGGAATGGAACGTGCTGCATTGTTGGATATTAATGGACAGATATCTGCT
GAGCAGGGCAAAGCTCTTAACGCAGTTGCTTCTCCTAACGTCAAGGTCCTTGTAGTTGGG
AATCCTTGCAACACCAACGCCTTGATTTGTCTTAAAAACGCTCCCAACATTCCTGCAAAG
AACTTCCATGCTCTCACGAGGTTGGATGAGAATAGGGCCAAATGCCAGCTTGCTCTTAAA
GCTGGTGTCTTCTACGACAAAGTCTCTAATATGACCATATGGGGAAATCACTCCACTACA
CAGGTGCCAGACTTCTTGAATGCCAGAATCAATGGCCGGCCCGTGAAGGAGGTTATTACA
GATCACAAATGGTTAGAAGAGGGGTTTACTGAGAGTGTCCAGAAGAGAGGTGGCTTACTA
ATTCAGAAATGGGGTCGATCTTCGGCTGCTTCTACAGCTGTTTCAATTATTGATGCTATA
AAGTCTCTTGTAACTCCTACTCCTGAGGGTGACTGGTTTTCTACTGGGGTGTACACAAAT
GGAAATCCTTATGGTATTGCTGAGACCTTGTTTTCAGCATGCCATGCAGT

QA 2 711 2 711
DS 



CO CL297Contig3 1272 2 4 U
GATGACCTTAAAGCTGAAGAGCAGACGAAGTCATGGAAGAAGATGATCAATATTGCAGTT
TCAGGTGCTGCAGGCATGATCTCAAACCACCTTCTCTTCAAACTTGCTTCAGGTGCAGTG
TTTGGACCAGATCAACCCATTGCTTTGAAACTACTCGGATCAGATAGATCAATCCAAGCT
CTCGAAGGTGTTGCGATGGAACTCGAGGATTCCTTGTTCCCCTTGTTGAGAGAAGTTGAT
ATAGGTACTGATCCATATGAAGTCTTCCGAGATGTGGACTGGGCTCTTCTCATTGGTGCA
AAACCTCGAGGCCCTGGAATGGAACGTGCTGCCTTGTTGGACATTAATGGTCAGATCTTT
GCTGAGCAGGGGAAAGCTCTTAACGCTGTTGCCTCTCCTAATGTCAAGGTTCTTGTAGTG
GGGAATCCTTGCAACACCAATGCCTTGATCTGTCTTAAAAATGCTCCCAACATTCCTGCA
AAGAACTTCCATGCGTTGACGAGGTTGGATGAGAATCGAGCAAAGTGTCAGCTTGCTCTT
AAAGCAGGCGTCTTCTACGACAAAGTATCTAATATGACCATATGGGGAAATCACTCCACG
ACTCAGGTGCCAGACTTCTTAAATGCAAGAATCAATGGCCGGCCGGTGAAGGAGGTTATT
ACAGATCACAAATGGTTAGAAGAGGGATTCACTGATAGTGTGCAGAAGAGAGGTGGCTTA
CTAATTCAGAAATGGGGTCGGTCTTCTGCTGCTTCTACCGCTGTTTCCATTGTTGATGCT
ATCAAGTCTCTTGTGACTCCTACTCCTGAGGGTGATTGGTTTTCAACTGGGGTGTACACA
AATGGGAACCCTTATGGTATTGCAGAGGACCTAGTCTTCAGCATGCCATGCCGGTCAAAG
GGAGATGGAGATTATGAGCTTGTCAAGGATGTAGAATTTGATGACTACCTTCGCAACCGA
ATCGCCAAGTCTGAGGCGGAACTGTTGGCTGAGAAGAAATGTGTTGCACACCTCACAGGA
GATGGCATAGCCTTTTGTGATCTTGGTCCGGTAGATACTATGCTTCCTGGTGAAGTTTGA
TTTTTGAGGGTGGTGAGCATCTCAAGTAAGCACTCTCTTCTGGGTTGTTAGCTGTACCCT
CATTACTCATGTTGATTGTTCGAATAAGTTAAAAGAAACACTTCATATTTATATAATGCA
ACCAAAAGTCATATACAGTAGTGTTTGTAAACTAGATAATGCCATATCTAATGTCAAACA
CAAACTGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F413TF U 1
AF RR2F413JQ C 480
BS 1 606 RR2F413TF
BS 607 607 RR2F413JQ
BS 608 638 RR2F413TF
BS 639 1272 RR2F413JQ

RD RR2F413TF 638 0 0
GATGACCTTAAAGCTGAAGAGCAGACGAAGTCATGGAAGAAGATGATCAATATTGCAGTT
TCAGGTGCTGCAGGCATGATCTCAAACCACCTTCTCTTCAAACTTGCTTCAGGTGCAGTG
TTTGGACCAGATCAACCCATTGCTTTGAAACTACTCGGATCAGATAGATCAATCCAAGCT
CTCGAAGGTGTTGCGATGGAACTCGAGGATTCCTTGTTCCCCTTGTTGAGAGAAGTTGAT
ATAGGTACTGATCCATATGAAGTCTTCCGAGATGTGGACTGGGCTCTTCTCATTGGTGCA
AAACCTCGAGGCCCTGGAATGGAACGTGCTGCCTTGTTGGACATTAATGGTCAGATCTTT
GCTGAGCAGGGGAAAGCTCTTAACGCTGTTGCCTCTCCTAATGTCAAGGTTCTTGTAGTG
GGGAATCCTTGCAACACCAATGCCTTGATCTGTCTTAAAAATGCTCCCAACATTCCTGCA
AAGAACTTCCATGCGTTGACGAGGTTGGATGAGAATCGAGCAAAGTGTCAGCTTGCTCTT
AAAGCAGGCGTCTTCTACGACAAAGTATCTAATATGACCATATGGGGAAATCACTCCACG
ACTCAG*TGCCAGACTTCTTAAATGCAAGAATCAATGG

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2F413JQ 793 0 0
AAAGAACTTCCATGCGTTGACGAGGTTGGATGAGAATCGAGCAAAGTGTCAGCTTGCTCT
TAAAGCAGGCGTCTTCTACGACAAAGTATCTAATATGACCATATGGGGAAATCACTCCAC
GACTCAGGTGCCAGACTTCTTAAATGCAAGAATCAATGGCCGGCCGGTGAAGGAGGTTAT
TACAGATCACAAATGGTTAGAAGAGGGATTCACTGATAGTGTGCAGAAGAGAGGTGGCTT
ACTAATTCAGAAATGGGGTCGGTCTTCTGCTGCTTCTACCGCTGTTTCCATTGTTGATGC
TATCAAGTCTCTTGTGACTCCTACTCCTGAGGGTGATTGGTTTTCAACTGGGGTGTACAC
AAATGGGAACCCTTATGGTATTGCAGAGGACCTAGTCTTCAGCATGCCATGCCGGTCAAA
GGGAGATGGAGATTATGAGCTTGTCAAGGATGTAGAATTTGATGACTACCTTCGCAACCG
AATCGCCAAGTCTGAGGCGGAACTGTTGGCTGAGAAGAAATGTGTTGCACACCTCACAGG
AGATGGCATAGCCTTTTGTGATCTTGGTCCGGTAGATACTATGCTTCCTGGTGAAGTTTG
ATTTTTGAGGGTGGTGAGCATCTCAAGTAAGCACTCTCTTCTGGGTTGTTAGCTGTACCC
TCATTACTCATGTTGATTGTTCGAATAAGTTAAAAGAAACACTTCATATTTATATAATGC
AACCAAAAGTCATATACAGTAGTGTTTGTAAACTAGATAATGCCATATCTAATGTCAAAC
ACAAACTGTTCCC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 2 10

CO CL298Contig1 970 8 7 U
GGACGGAGAAAACACACGCGCAAGAGTTTGAAGATCTGATACAGGAGAAGATAATTTTCT
CGGAAAATTCTGTCGTTCTCGGAGGGAAGATCCGTATATTCCATATCGGAATAGTGTTTT
GTTATTCTGCTGATCGGCGTCGGGTTGATCCATTTGGATACTTCGAAAGATGGATCCTAA
CCAGGCACCAGTTGAAAACTATGCGAACCCAAAGACGTGTCTCTTCCATGTTCTCTTCAA
GGGTGCTGCGTTGGCGTTTTACATTCTCTCGGCTCTCTTCTTCAACAGCTTTGTTATAAT
CTTTGTGGTGACTGTTCTTCTTGCTGCACTTGACTTCTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGG
GCGTATACTGGTTGGTCTCAGGTGGTGGAACGAGATCAATGACTTGGGTGAAAGTGTCTG
GAAGTTTGAGTCTCTTGACCAGGAGTCCTTGGCTCGGATGAACAAGAAAGACTCGTGGCT
TTTCTGGTGGACGCTTTACCTTGCAGCGGCTGCGTGGTTAGTCCTTGGGATATTTTCACT
GATAAGGTTTCAGGCCGACTATCTGCTTGTTGTCGGTGTTTGCTTGTCCCTTAACGTGGC
TAATATCATCGGTTTCACAAAGTGCAAGAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAACAGTTTGC
CTCACAGACAATCGCATCACGGTTCCAATCCACAGTACAATCTGCCTTCACCCTTGTCTG
AAAAGAAGAAAAGGTCATAGTGAGAGCAAAGACAGTGTACAAAAGAAGATTCCCCATAAG
CCACACCATGTTTTTTTTGACTGATTCGTTTTCTCAATATACTATTTTGTAAGGGATTAA
GAAAGAGATTTATTATATTATGTCTTCTTACATGTATTATCATTTTCGACTTGTCCTGTT
TAAGAAACTTTTTGAGGTTGTAAAACATTTTGAAAAAATCTCGATGTAGCTTTCACTTTA
GCTTGCTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED74TF U 3
AF RR2C483TF U 32
AF RR2EX80TF U 6
AF RR2B649TF U 1
AF RR2C483JQ C 114
AF RR2EX80JQ C 487
AF RR2ED74JQ C 200
AF RR2B649JQ C 148
BS 1 295 RR2B649TF
BS 296 296 RR2C483TF
BS 297 829 RR2B649TF
BS 830 916 RR2C483JQ
BS 917 936 RR2B649JQ
BS 937 937 RR2EX80JQ
BS 938 970 RR2B649JQ

RD RR2ED74TF 638 0 0
GGGGA
GAAAACACACGCGCAAGAGTTTGAAGATCTGATACAGGAGAAGATAATTTTCTCGGAAAA
TTCTGTCGTTCTCGGAGGGAAGATCCGTATATTCCATATCGGAATAGTGTTTTGTTATTC
TGCTGATCGGTGTCGGGTTGATCCATTTGGATACTTCGAAAGATGGATCCTAACCAGGCA
CCAGTTGAAAACTATGCGAACCCAAAGACGTGTCTCTTCCATGTTCTCTTCAAGGGTGCT
GCGTTGGCGTTTTACATTCTCTCGGCTCTCTTCTTCAACAGCTTTGTTATAATCTTTGTG
GTGACTGTTCTTCTTGCTGCACTTGACTTCTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGGGCGTATA
CTGGTTGGTCTCAGGTGGTGGAACGAGATCAATGACTTGGGTGAAAGTGTCTGGAAGTTT
GAGTCTCTTGACCAGGAGTCCTTGGCTCGGATGAACAAGAAAGACTCGTGGCTTTTCTGG
TGGACGCTTTACCTTGCAGCTGCTGCGTGGTTAGTCCTTGGGATATTTTCACTGATAAGG
TTTCAGGCCGACTATCTGCTTGTTGTCGGTGTTTGCTTGTCCCTTAACGTGGCTAATATC
ATCGGTTTCACAAAGTGCAAGAAAGATGCAAAG

QA 6 638 6 638
DS 

RD RR2C483TF 644 0 0
AGATCTGATACAGGAGAAGATAATTTTCTCGGAAAATTCTGTCGTTCTCGGAGGGAAGAT
CCGTATATTCCATATCGGAATAGTGTTTTGTTATTCTGCTGATCGGCGTCGGGTTGATCC
ATTTGGATACTTCGAAAGATGGATCCTAACCAGGCACCAGTTGAAAACTATGCGAACCCA
AAGACGTGTCTCTTCCATGTTCTCTTCAAGGGTGCTGCGTTGGCGTTTTACATTCTCTCG
GCTCTCTTCTTCAACAGCTTTGTTATAATCTTTGTGGTGACTGTTCTTCTTGCTGCACTT
GACTTCTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGGGCGTATACTGGTTGGTCTCAGGTGGTGGAAC
GAGATCAATGACTTGGGTGAAAGTGTCTGGAAGTTTGAGTCTCTTGACCAGGAGTCCTTG
GCTCGGATGAACAAGAAAGACTCGTGGCTTTTCTGGTGGACGCTTTACCTTGCAGCGGCT
GCGTGGTTAGTCCTTGGGATATTTTCACTGATAAGGTTTCAGGCCGACTATCTGCTTGTT
GTCGGTGTTTGCTTGTCCCTTAACGTGGCTAATATCATCGGTTTCACAAAGTGCAAGAA*
GATGCAAAGAA*CAGTTTCAACAGTTTGCCTCACAGACA
TCCAT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2EX80TF 721 0 0
GG
GAAAACACACGCGCAAGAGTTTGAAGATCTGATACAGGAGAAGATAATTTTCTCGGAAAA
TTCTGTCGTTCTCGGAGGGAAGATCCGTATATTCCATATCGGAATAGTGTTTTGTTATTC
TGCTGATCGGCGTCGGGTTGATCCATTTGGATACTTCGAAAGATGGATCCTAACCAGGCA
CCAGTTGAAAACTATGCGAACCCAAAGACGTGTCTCTTCCATGTTCTCTTCAAGGGTGCT
GCGTTGGCGTTTTACATTCTCTCGGCTCTCTTCTTCAACAGCTTTGTTATAATCTTTGTG
GTGACTGTTCTTCTTGCTGCACTTGACTTCTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGGGCGTATA
CTGGTTAGTCTCAGGTGGTGGAACGAGATCAATGACTTGGGTGAAAGTGTCTGGAAGTTT
GAGTCTCTTGACCAGGAGTCCTTGGCTCGGATGAACAAGAAAGACTCGTGGCTTTTCTGG
TTGACGCTTTACCTTGCAGCGGCTGCGTGGTTAGTCCTTGGGATATTTTCACTGATAAGG
TTTCAGGCCGACTATCTGCTTGTTGTCGGTGTTTGCTTGTCCCTTAACGTGGCTAATATC
ATCGGTTTCACAAAGTGCAAGAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAACAGTTTGCCTCACAG
ACAATCGCATCACGGTTCCAATCCACAGTACAATCTGCCTTCACCCTTGTCTGAAA
GAA

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR2B649TF 829 0 0
GGACGGAGAAAACACACGCGCAAGAGTTTGAAGATCTGATACAGGAGAAGATAATTTTCT
CGGAAAATTCTGTCGTTCTCGGAGGGAAGATCCGTATATTCCATATCGGAATAGTGTTTT
GTTATTCTGCTGATCGGCGTCGGGTTGATCCATTTGGATACTTCGAAAGATGGATCCTAA
CCAGGCACCAGTTGAAAACTATGCGAACCCAAAGACGTGTCTCTTCCATGTTCTCTTCAA
GGGTGCTGCGTTGGCGTTTTACATTCTCTCGGCTCTCTTCTTCAACAGCTTTGTTTTAAT
CTTTGTGGTGACTGTTCTTCTTGCTGCACTTGACTTCTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGG
GCGTATACTGGTTGGTCTCAGGTGGTGGAACGAGATCAATGACTTGGGTGAAAGTGTCTG
GAAGTTTGAGTCTCTTGACCAGGAGTCCTTGGCTCGGATGAACAAGAAAGACTCGTGGCT
TTTCTGGTGGACGCTTTACCTTGCAGCGGCTGCGTGGTTAGTCCTTGGGATATTTTCACT
GATAAGGTTTCAGGCCGACTATCTGCTTGTTGTCGGTGTTTGCTTGTCCCTTAACGTGGC
TAATATCATCGGTTTCACAAAGTGCAAGAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAACAGTTTGC
CTCACAGACAATCGCATCACGGTTCCAATCCACAGTACAATCTGCCTTCACCCTTGTCTG
AAAAGAAGAAAAGGTCATAGTGAGAGCAAAGACAGTGTACAAAAGAAGATTCCCCATAAG
CCACACCATGTTTTTTTTGACTGATTCGTTTTCTCAATATACTATTTTG

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2C483JQ 803 0 0
AGTG
TTTGTTATTCTGCTGATCGGCGTCGGGTTGATCCATTTGGATACTTCGAAAGATGGATCC
TAACCAGGCACCAGTTGAAAACTATGCGAACCCAAAGACGTGTCTCTTCCATGTTCTCTT
CAAGGGTGCTGCGTTGGCGTTTTACATTCTCTCGGCTCTCTTCTTCAACAGCTTTGTTAT
AATCTTTGTGGTGACTGTTCTTCTTGCTGCACTTGACTTCTGGGTGGTTAAGAATGTGAG
TGGGCGTATACTGGTTGGTCTCAGGTGGTGGAACGAGATCAATGACTTGGGTGAAAGTGT
CTGGAAGTTTGAGTCTCTTGACCAGGAGTCCTTGGCTCGGATGAACAAGAAAGACTCGTG
GCTTTTTTGGTGGACGCTTTACCTTGCAGCGGCTGCGTGGTTAGTCCTTGGGATATTTTC
ACTGATAAGGTTTCAGGCCGACTATCTGCTTGTTGTCGGTGTTTGCTTGTCCCTTAACGT
GGCTAATATCATCGGTTTCACAAAGTGCAAGAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAACAGTT
TGCCTCACAGACAATC*CATCACGGTTCCAATCCACAGTACAATCTGCCTTCACCCTTGT
CCGAAAAGAAGAAAAGGTCATAGTGAGAGCAAAGACAGTGTACAAAAGAAGATTCCCCAT
AAGCCCCACCATGTTTTTTTTGACTGATTCGTTTTCTCAATATACTATTTTGTAAGGGAT
TAAGAAAGAGATTTATTATATTATGTCTTCTTACATGTATTATCATTTTCGACTTGTCCT
GTTTAAGAAACTTTTTGAG

QA 5 803 5 803
DS 

RD RR2EX80JQ 468 0 0
GTT
GACGCTTTACCTTGCAGCGGCTGCGTGGTTAGTCCTTGGGATATTTTCACTGATAAGGTT
TCAGGCCGACTATCTGCTTGTTGTCGGTGTTTGCTTGTCCCTTAACGTGGCTAATATCAT
CGGTTTCACAAAGTGCAAGAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAACAGTTTGCCTCACAGAC
AATCGCATCACGGTTCCAATCCACAGTACAATCTGCCTTCACCCTTGTCTGAAAAGAAGA
AAAGGTCATAGTGAGAGCAAAGACAGTGTACAAAAGAAGATTCCCCATAAGCCACACCAT
GTTTTTTTTGACTGATTCGTTTTCTCAATATACTATTTTGTAAGGGATTAAGAAAGAGAT
TTATTATATTATGTCTTCTTGCATGTATTATCATTTTCGACTTGTCCTGTTTAAGAAACT
TTTTGAGGTTGTAAAACATTTTGAAAAAATCTCGATGTAGCTTTC

QA 4 468 4 468
DS 

RD RR2ED74JQ 722 0 0
TATGCGAACCCAAAGACGTGTCTCTTCCATGTTCTCTTCAAGGGTGCTGCGTTGGCGTTT
TACATTCTCTCGGCTCTCTTCTTCAACAGCTTTGTTATAATCTTTGTGGTGACTGTTCTT
CTTGCTGCACTTGACTTCTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGGGCGTATACTGGTTGGTCTC
AGGTGGTGGAACGAGATCAATGACTTGGGTGAAAGTGTCTGGAAGTTTGAGTCTCTTGAC
CAGGAGTCCTTGGCTCGGATGAACAAGAAAGACTCGTGGCTTTTCTGGTGGACGCTTTAC
CTTGCAGCTGCTGCGTGGTTAGTCCTTGGGATATTTTCACTGATAAGGTTTCAGGCCGAC
TATCTGCTTGTTGTCGGTGTTTGCTTGTCCCTTAACGTGGCTAATATCATCGGTTTCACA
AAGTGCAAGAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAACAGTTTGCCTCACAGACAATCGCATCA
CGGTCCCAATCCACAGTACAATCTGCCTTCACCCTTGTCTGAAAAGAAGAAAAGGTCATA
GTGAGAGCAAAGACAGTGTACAAAAGAAGATTCCCCATAAGCCACACCATGTTTTTTTTG
ACTGATTCGTTTTCTCAATATACTATTTTGTAAGGGATTAAGAAAGAGATTTATTATATT
ATGTCTTCTTACATGTATTATCATTTTCGACTTGTCCTGTTTAAGAAACTTTTTGAG
GTTGT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2B649JQ 823 0 0
ATCCATTTGGATACTTCGAAAGATGGATCCTAACCAGGCACCAGTTGAAAACTATGCGAA
CCCAAAGACGTGTCTCTTCCATGTTCTCTTCAAGGGTGCTGCGTTGGCGTTTTACATTCT
CTCGGCTCTCTTCTTCAACAGCTTTGTTTTAATCTTTGTGGTGACTGTTCTTCTTGCTGC
ACTTGACTTCTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGGGCGTATACTGGTTGGTCTCAGGTGGTG
GAACGAGATCAATGACTTGGGTGAAAGTGTCTGGAAGTTTGAGTCTCTTGACCAGGAGTC
CTTGGCTCGGATGAACAAGAAAGACTCGTGGCTTTTCTGGTGGACGCTTTACCTTGCAGC
GGCTGCGTGGTTAGTCCTTGGGATATTTTCACTGATAAGGTTTCAGGCCGACTATCTGCT
TGTTGTCGGTGTTTGCTTGTCCCTTAACGTGGCTAATATCATCGGTTTCACAAAGTGCAA
GAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAACAGTTTGCCTCACAGACAATCGCATCACGGTTCCA
ATCCACAGTACAATCTGCCTTCACCCTTGTCTGAAAAGAAGAAAAGGTCATAGTGAGAGC
AAAGACAGTGTACAAAAGAAGATTCCCCATAAGCCACACCATGTTTTTTTTGACTGATTC
GTTTTCTCAATATACTATTTTGTAAGGGATTAAGAAAGAGATTTATTATATTATGTCTTC
TTACATGTATTATCATTTTCGACTTGTCCTGTTTAAGAAACTTTTTGAGGTTGTAAAACA
TTTTGAAAAGATCTCGATGTAGCTTTCACTTTAGCTTGCTAAT

QA 1 823 1 823
DS 



CO CL298Contig2 741 2 6 U
GGAGAGGTGTTTCGTTTTCTCTGCTGATCAGCTTCGGATTGATTACTTTCGAAAGATGGA
TCCTAGCCAGGCACCAGTTGAAAACTATGCAAACCCAAATACATGTCTCTTCCATGTTCT
CTTCAAGGGTGCTGCGTTGGCGTTTTACATTCTATCGGCTCTCTTCTTCAACAGCTTTGT
CATCATCTTCGTCGTGACTGTTCTTCTTGCTGCGCTTGACTTCTGGGTGGTTAAGAATGT
GAGTGGCCGTATACTGGTTGGTCTCAGGTGGTGGAATGAGATCAATGACTTGGGAGAAAG
TGTCGGGAAATTTGAGTCTCTTGACCAGGAGTCCTTGGCTCGGATGAACAAGAAAGACTC
GTGGCTTTTCTGGTGGACGCTTTACCTTGCAGCAGCTGCGTGGTTGATCCTTGGGGTATT
TTCACTGATAAGGTTTCAGGCCGACTACCTGCTTGTTGTGGGCGTTTGCTTGTCCCTCAA
CGTGGCTAATATCATCGGCTTCACAAAGTGCAAGAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAGCA
GTTTGCCTCACAGACAATCGCATCAAGGTTCCAATCCACTGTACAATCTGCCTTCACACT
TGTTTGAAAAAAAAAAGGTTTTAGTGAGAGCAAAGACAGTGTACAAAGAAGATTTCCGCC
ATAAGCAACACCATGTTTTTTTTTTGACTGATTGTTTTTTCCACTACATATATTAAGGGA
TTTAAGAAAGAGGTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO90TF U 1
AF RR2FO90JQ C 585
BS 1 615 RR2FO90TF
BS 616 616 RR2FO90JQ
BS 617 684 RR2FO90TF
BS 685 685 RR2FO90JQ
BS 686 699 RR2FO90TF
BS 700 741 RR2FO90JQ

RD RR2FO90TF 710 0 0
GGAGAGGTGTTTCGTTTTCTCTGCTGATCAGCTTCGGATTGATTACTTTCGAAAGATGGA
TCCTAGCCAGGCACCAGTTGAAAACTATGCAAACCCAAATACATGTCTCTTCCATGTTCT
CTTCAAGGGTGCTGCGTTGGCGTTTTACATTCTATCGGCTCTCTTCTTCAACAGCTTTGT
CATCATCTTCGTCGTGACTGTTCTTCTTGCTGCGCTTGACTTCTGGGTGGTTAAGAATGT
GAGTGGCCGTATACTGGTTGGTCTCAGGTGGTGGAATGAGATCAATGACTTGGGAGAAAG
TGTCGGGAAATTTGAGTCTCTTGACCAGGAGTCCTTGGCTCGGATGAACAAGAAAGACTC
GTGGCTTTTCTGGTGGACGCTTTACCTTGCAGCAGCTGCGTGGTTGATCCTTGGGGTATT
TTCACTGATAAGGTTTCAGGCCGACTACCTGCTTGTTGTGGGCGTTTGCTTGTCCCTCAA
CGTGGCTAATATCATCGGCTTCACAAAGTGCAAGAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAGCA
GTTTGCCTCACAGACAATCGCATCAAGGTTCCAATCCACTGTACAATCTGCCTTCACACT
TGTTTGAAAAAAAAA*GGTTTTAGTGAGAGCAAAGACAGTGTACAAAGAAGATTTCCGCC
ATAAGCAACACCATGTTTTTTTTT*GACTGATTGTTTTT
TCTACTACATA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2FO90JQ 157 0 0
AATT
TGCCTTCACACTTGTTTGAAAAAAAAAAGGTTTTAGTGAGAGCAAAGACAGTGTACAAAG
AAGATTTCCGCCATAAGCAACACCATGTTTTTTTTTTGACTGATTGTTTTTTCCACTACA
TATATTAAGGGATTTAAGAAAGAGGTTTTTTTT

QA 5 157 5 157
DS 



AS 2 13

CO CL299Contig1 535 10 5 U
GGAACACAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAAT
TTGCTTTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTAGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAG
CCGATGCAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGA
AACCAAAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCC
GTCTTTGAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTTTTTCTAATCT
AAATAATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATGGTCTGCTAAAAGACGTTGG
TATCTCGTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGATT
CAGGAAATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATTTT
TATTTTAGTTTAATTATGTAAAGACTCAGATGATTGAATAACATAAAATTAACTT


BQ
25 25 25 25 25 30 0 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 40 40 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI14JQ C 1
AF RR2DI14TF U 1
AF RR2GC70JQ C 5
AF RR2GC70TF U 5
AF RR2B736TF U 14
AF RR2CU36TF U 7
AF RR2H195TF U 4
AF RR2DI50TF U 1
AF RR2BD69TF U 6
AF RR2BD69JQ C 400
BS 1 304 RR2DI14TF
BS 305 305 RR2DI50TF
BS 306 475 RR2DI14TF
BS 476 528 RR2DI50TF
BS 529 535 RR2BD69JQ

RD RR2DI14JQ 475 0 0
GGAACACAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAAT
TTGCTTTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTAGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAG
CCGATGCAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGA
AACCAAAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCC
GTCTTTGAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTTTTTCTAATCT
AAATTATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATGGTCTGCTAAAAGACGTTGG
TATCTCGTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGATT
CAGGAAATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTT

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2DI14TF 475 0 0
GGAACACAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAAT
TTGCTTTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTAGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAG
CCGATGCAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGA
AACCAAAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCC
GTCTTTGAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTTTTTCTAATCT
AAATTATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATGGTCTGCTAAAAGACGTTGG
TATCTCGTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGATT
CAGGAAATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTT

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2GC70JQ 470 0 0
GG
GAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAATTTGCTT
TCTTCTGTATCGTTT*GGTTTTTCTAGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGATG
CAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCCGCAGCTTGAAACCAA
AACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTTT
GAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTTTTTCTAATCTAAATAA
TACATAGAAAGTTCTTTACGGAAACAACTAGTATGGTCTGCTAAAAGACGTTGGTATTTC
GTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTTTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGATTCAGGAA
ATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTT

QA 3 470 3 470
DS 

RD RR2GC70TF 470 0 0
GG
GAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAATTTGCTT
TCTTCTGTATCGTTT*GGTTTTTCTAGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGATG
CAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCCGCAGCTTGAAACCAA
AACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTTT
GAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTTTTTCTAATCTAAATAA
TACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATGGTCTGCTAAAAGACGTTGGTATCTC
GTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGATTCAGGAA
ATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTT

QA 3 470 3 470
DS 

RD RR2B736TF 466 0 0
GG
AAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAATTTGCTTTCTTTTGTA
TCGTTTTGGTTTTTCTAGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGATGCAGCAGCAC
CAACATGCACTAGAGCACTACATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGAAACCAAAACGGTGCC
TAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTTTGAATTTTTC
AAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTTTTTCTAATCTAAATAATACATAGAA
AGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGGTATCTCGTGGAAGAG
CTCAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGATTCAGGAAATTCATATA
TGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTT
TAAA

QA 3 462 3 462
DS 

RD RR2CU36TF 469 0 0
GAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAATTTGCTT
TCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTAGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGATG
CAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGAAACCAA
AACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTTT
GAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTTTT*CTAATCTAAATAA
TACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATGGTCTGCTAAAAGACGTTGGTATCTC
GTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGATTCAGGAA
ATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTT

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR2H195TF 472 0 0
GG
ACAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAATTTGCT
TTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTAGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGAT
GCAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGAAACCA
AAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTT
TGAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTTTTTCTAATCTAAATA
ATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATGGTCTGCTAAAAGACGTTGGTATCT
CGTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGATTCAGGA
AATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTT

QA 3 472 3 472
DS 

RD RR2DI50TF 535 0 0
GGAACACAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAAT
TTGCTTTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTAGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAG
CCGATGCAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGA
AACCAAAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCC
GTCTTTGAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTTTTTCTAATCT
AAATAATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATGGTCTGCTAAAAGACGTTGG
TATCTCGTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGATT
CAGGAAATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATTTT
TATTTTAGTTTAATTATGTAAAGACTCAGATGATTGAATAACATAAAA
TTAACTT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2BD69TF 530 0 0
G
GAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAATTTGCTT
TCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTAGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGATG
CAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGAAACCAA
**CGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGCGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTTT
GAATTTTTCAAAGATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTTTTTCTAATCTAAATAA
TACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATGGTCTGCTAAAAGACGTTGGTATCTC
GTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTTTTCT***TATGACCTTTTACAATCGGATTCAGGAA
ATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATTTTTATTTT
AGTTTAATTATGTAAAGACTCAGATGATTGAATAACATAAAA
TTAACTT

QA 2 523 2 523
DS 

RD RR2BD69JQ 136 0 0
ATGC
CCTTTTACAATCGGATTCAGGAAATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAAT
TATTGAATGTTTATTTTTATTTTAGTTTAATTATGTAAAGACTCAGAGGATTGAATAACA
TAAAATTAACTT

QA 5 136 5 136
DS 



CO CL299Contig2 528 3 5 U
GGAACACAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAAT
TTGCTTTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAG
CCGATGCAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGA
AACCAAAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGCGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCC
GTCTTTGAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTATTCTAATCTA
AATAATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGGT
ATCTCGTGGAAGAGCTTAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTAGATTC
AATAAATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATTTTT
ATTTTAGTTTAATGATGTAAAGATTCAGATGATTGAATAAAATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF46TF U 1
AF RR2AT03TF U 5
AF RR2BW20TF U 5
BS 1 281 RR2FF46TF
BS 282 282 RR2AT03TF
BS 283 474 RR2FF46TF
BS 475 520 RR2AT03TF
BS 521 528 RR2BW20TF

RD RR2FF46TF 474 0 0
GGAACACAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAAT
TTGCTTTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAG
CCGATGCAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGA
AACCAAAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGCGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCC
GTCTTTGAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTCCAGTTTTATTCTAATCTA
AATAATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGGT
ATCTCGTGGAAGAGCTTAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTAGATTC
AATAAATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTT

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2AT03TF 519 0 0
G
ACAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAATTTGCT
TTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGAT
GCAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGAAACCA
AAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGCGACGCAATTTGTAACCCGAAACGCCGTCTT
TGAATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTATTCTAATCTAAATAA
TACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGGTATCTC
GTGGAAGAGCTTAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTAGATTCAATAA
ATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATTTTTATTTT
AGTTTAATGATGTAAAGATTCAGATGATTGAATAA
AAT

QA 2 516 2 516
DS 

RD RR2BW20TF 524 0 0
GGA
AAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAATTTGCTTT
CTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGATGC
AGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCTTGAAACCAAA
ACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGCGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTTTG
AATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTATTCTAATCTAAATAATA
CATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGGTATCTCGT
GGAAGAGCTTAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTAGATTCAATAAAT
TCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACGATTATTGAATGTTTATTTTTATTTTAG
TTTAATGATGTAAAGATTCAGATGATTGAATAAAATAAAAA

QA 4 524 4 524
DS 



AS 2 13

CO CL300Contig1 685 2 3 U
GACTGTCAAGAGATGAGGTTGGGATGAAGAGAAGGGAAGTCATGTTAAACATAGCTTCTT
CCTCTGCTTTCTTACTTCCATCCACCGTTTCACCTGCATTTGCAGAGACAAATGCTTCAG
AGGCTTTCCGCGTGTACACAGATGAAACAAACAAGTTCGAGATATCAATTCCACAAGACT
GGCAAGTCGGACAAGCAGCAGAACCCAACGGGTTCAAGTCAATCACAGCTTTCTACCCTG
AAGAAACTTCATCATACAATGTGAGCGTAGCGATCACTGGACTAGGTCCAGATTTCACTA
GGATGGAATCTTTTGGAAAGGTCGAAGCTTTCGCCGAAACACTGGTGAGTGGATTGGATA
GAAGCTGGCAGAAACCAGCAGGAGTTACTGCAAAGCTAGTTGATAGCACATCTTCCAAAG
GGTTCTATTACATTGAGTATACATTACAAAACCCTGGAGAAGCTCGTAAGCATTTGTACT
CTGCAATTGGGATGGCAACTAACGGTTGGTACAACCGTTTATACACTATCACTGGACAAT
TGAATGACGAAGAATCTGCTGATCAAAGCTCCAAGATCCAGAAGGCAGTCAAATCTTTCA
AATTCATCTGAGAATATCATTCCCCTCACATTGATAAAACATTTGTTTACTGAACAATTA
CTTCTTTCTATCAAATTCTTGAGAC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2A154JQ C 1
AF RR2A154TF U 1
BS 1 1 RR2A154JQ
BS 2 681 RR2A154TF
BS 682 685 RR2A154JQ

RD RR2A154JQ 685 0 0
GACTGTCAAGAGATGAGGTTGGGATGAAGAGAAGGGAAGTCATGTTAAACATAGCTTCTT
CCTCTGCTTTCTTACTTCCATCCACCGTTTCACCTGCATTTGCAGAGACAAATGCTTCAG
AGGCTTTCCGCGTGTACACAGATGAAACAAACAAGTTCGAGATATCAATTCCACAAGACT
GGCAAGTCGGACAAGCAGCAGAACCCAACGGGTTCAAGTCAATCACAGCTTTCTACCCTG
AAGAAACTTCATCATACAATGTGAGCGTAGCGATCACTGGACTAGGTCCAGATTTCACTA
GGATGGAATCTTTTGGAAAGGTCGAAGCTTTCGCCGAAACACTGGTGAGTGGATTGGATA
GAAGCTGGCAGAAACCAGCAGGAGTTACTGCAAAGCTAGTTGATAGCACATCTTCCAAAG
GGTTCTATTACATTGAGTATACATTACAAAACCCTGGAGAAGCTCGTAAGCATTTGTACT
CTGCAATTGGGATGGCAACTAACGGTTGGTACAACCGTTTATACACTATCACTGGACAAT
TGAATGACGAAGAATCTGCTGATCAAAGCTCCAAGATCCAGAAGGCAGTCAAATCTTTCA
AATTCATCTGAGAATATCATTCCCCTCACATTGATAAAACATTTGTTTACTGAACAATTA
CTTCTTTCTATCAAATTCTTGAGAC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2A154TF 685 0 0
G
ACTGTCAAGAGATGAGGTTGGGATGAAGAGAAGGGAAGTCATGTTAAACATAGCTTCTTC
CTCTGCTTTCTTACTTCCATCCACCGTTTCACCTGCATTTGCAGAGACAAATGCTTCAGA
GGCTTTCCGCGTGTACACAGATGAAACAAACAAGTTCGAGATATCAATTCCACAAGACTG
GCAAGTCGGACAAGCAGCAGAACCCAACGGGTTCAAGTCAATCACAGCTTTCTACCCTGA
AGAAACTTCATCATACAATGTGAGCGTAGCGATCACTGGACTAGGTCCAGATTTCACTAG
GATGGAATCTTTTGGAAAGGTCGAAGCTTTCGCCGAAACACTGGTGAGTGGATTGGATAG
AAGCTGGCAGAAACCAGCAGGAGTTACTGCAAAGCTAGTTGATAGCACATCTTCCAAAGG
GTTCTATTACATTGAGTATACATTACAAAACCCTGGAGAAGCTCGTAAGCATTTGTACTC
TGCAATTGGGATGGCAACTAACGGTTGGTACAACCGTTTATACACTATCACTGGACAATT
GAATGACGAAGAATCTGCTGATCAAAGCTCCAAGATCCAGAAGGCAGTCAAATCTTTCAA
ATTCATCTGAGAATATCATTCCCCTCACATTGATAAAACATTTGTTTACTGAACAATTAC
TTCTTTCTATCAAATTCTTG
AGAC

QA 2 681 2 681
DS 



CO CL300Contig2 888 11 14 U
GGGAAGCAGGACACATATCTTGAAACACATGGCAGCGATTTCTCCATGGTTTTCTACTCC
ACAGAGCTTCTCGAATCCCCGCGTTTCCACCCGATATA***GTTCAGCAAGATGCACATC
ACTTCCTCCTGCTGTCGTCTCTGCTCAGGAACATCATCAGATACTGTCAAGAGATGAGGT
TGGGATGAAGAGAAGGGAAGTCTTGTTAAACTTAGCTTCTTCCTCTGCTTTCTTACTTCC
ATTCACCGTTTCACCTGCATTTGCAGAGACAAATGCAACAGACGCTTTCCGTGTGTACAC
AGATGAAACAAACAAGTTCGAGATATCAATTCCACAAGACTGGCAAGTCGGACAAGCAGC
AGAACCTAACGGGTTCAAGTCAATCACAGCTTTTTACCCTGAAGAAACTTCATCGTACAA
TGTGAGCGTAGCGATCACTGGACTAGGTCCAGATTTCACTAGGATGGAATCTTTTGGAAA
GGTCGAAGCTTTTGCAGAGACACTGGTCAGTGGATTGGATAGAAGCTGGCAGAAACCAGC
AGGAGTAACTGCGAAGCTAGTTGATAGCACATCTTCCAAAGGGTTCTATTACATTGAGTA
TACATTACAAAACCCTGGAGAAGCTCGTAAGCATTTGTACTCTGCAATTGGGATGGCAAC
TAACGGTTGGTACAACCGTTTATACACTGTCACTGGACAATTTAATGATGAAGAATCCGC
TGATCAAAGCTCCAAGATCCAGAAGGCAGTCAAGTCTTTCAAATTCATCTGAGAATGTCA
TTTCCCTCGCATTGATTAAACATTTTGTTTACTGAACAATTACTTCTTTCAATCAAATTC
TTGGGATAAAAAAACTAACTCCATACTTTGAAGCTTCTGATAACAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 
65 65 65 50 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 45 60 60 60 60 60 30 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 45 60 60 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CH41TF U 2
AF RR2HB60TF U 6
AF RR2E322TF U 9
AF RR2CN93TF U 1
AF RR2F368TF U 14
AF RR2CH41JQ C 77
AF RR2CN93JQ C 42
AF RR2HB60JQ C 149
AF RR2E322JQ C 229
AF RR2EW22JQ C 262
AF RR2EW22TF U 262
BS 1 456 RR2CN93TF
BS 457 457 RR2CH41TF
BS 458 542 RR2CN93TF
BS 543 543 RR2CH41TF
BS 544 743 RR2CN93TF
BS 744 745 RR2F368TF
BS 746 752 RR2CN93TF
BS 753 753 RR2F368TF
BS 754 762 RR2CN93TF
BS 763 763 RR2F368TF
BS 764 774 RR2CN93TF
BS 775 775 RR2F368TF
BS 776 792 RR2CN93TF
BS 793 888 RR2EW22TF

RD RR2CH41TF 652 0 0
GGAAGCA
GGACACATATCTTGAAACACATGGCAGCGATTTCTCCATGGTTTTCTACTCCACAGAGCA
TCTCGAATCCCCGCGTTTCCACCCGATATA***GTTCAGCAAGATGCACATCACTTCCTC
CTGCTGTCGTCTCTGCTCAGGAACATCATCAGATACTGTCAAGAGATGAGGTTGGGATGA
AGAGAAGGGAAGTCTTGTTAAACTTAGCTTCTTCCTCTGCTTTCTTACTTCCATTCACCG
TTTCACCTGCATTTGCAGAGACAAATGCAACAGACGCTTTCCGTGTGTACACAGATGAAA
CAAACAAGTTCGAGATACCAATTCCACAAGACTGGCAAGTCGGACAATCAGCAGAACCTA
ACGGGTTCAAGTCAATCACAGCTTTTTACCCTGAAGAAACTTCATCGTACAATGTGAGCG
TAGCGATCACTGGACTAGGTCCAGATTTCACTAGGATGGAATCTTTTGGAAAGGTCGAAG
CTTTTGCAGAGACACTGGTCAGTGGATTGGATAGAAGCTGGCAGAAACCAGCAGGAGTAA
CTGCGAAGCTAGTTGATAGCACATCTTCCAAAGGGTTCTATTACATTGAGTATACATTAC
AAAACCCTGGAGAAGCTCGTAAGCATTTGTACTCTGCAATTGGGA

QA 8 652 8 652
DS 

RD RR2HB60TF 712 0 0
GGA
GGACACATATCTTGAAACACATGGCAGCGATTTCTCCATGGTTTTCTACTCCACAGAGCT
TCTCGAATCCCCGCGTTTCCACCCGATATA***GTTCAGCAAGATGCACATCACTTCCTC
CTGCTGTCGTCTCTGCTCAGGAACATCATCAGATACTGTCAAGAGATGAGGTTGGGATGA
AGAGAAGGGAAGTCTTGTTAAACTTAGCTTCTTCCTCTGCTTTCTTACTTCCATTCACCG
TTTCACCTGCATTTGCAGAGACAAATGCAACAGACGCTTTCCGTGTGTACACAGATGAAA
CAAACAAGTTCGAGATATCAATTCCACAAGACTGGCAAGTCGGACAAGCAGCAGAACCTA
ACGGGTTCAAGTCAATCACAACTTTTTACCCTGAAGAAACTTCATCGTACAATGTGAGCG
TAGCGATCGCTGGACTAGGTCCAGATTTCACTAGGATGGAATCTTTTGGAAAGGTCGAAG
CTTTTGCAGAGACACTGGTCAGTGGATTGGATAGAAGCTGGCAGAAACCAGCAGGAGTAA
CTGCGAAGCTAGTTGATAGCACATCTTCCAAAGGGTTCTATTACATTGAGTATACATTAC
AAAACCCTGGAGAAGCTCGTAAGCATTTGTACTCTGCAATTGGGATGGCAACTAGCGGTT
GGTACAACCGTTTATACACTGTCACTGGACAATTTAATGATGAAGAATC

QA 4 712 4 712
DS 

RD RR2E322TF 718 0 0
GGACACATATCTTGAAACACATGGCAGCGATTTCTCCATGGTTTTCTACTCCACAGAGCT
TCTCGAATCCCCGCGTTTCCACCCGATATACAGGTTCAGCAAGATGCACATCACTTCCTC
CTGCTGTCGTCTCTGCTCAGGAACATCATCAGATACTGTCAAGAGATGAGGTTGGGATGA
AGAGAAGGGAAGTCTTGTTAAACTTAGCTTCTTCCTCTGCTTTCTTACTTCCATTCACCG
TTTCACCTGCATTTGCAGAGACAAATGCAACAGACGCTTTCCGTGTGTACACAGATGAAA
CAAACAAGTTCGAGATATCAATTCCACAAGACTGGCAAGTCGGACAAGCAGCAGAACCTA
ACGGGTTCAAGTCAATCACAGCTTTTTACCCTGAAGAAACTTCATCGTACAATGTGAGCG
TAGCGATCACTGGACTAGGTCCAGATTTCACTAGGATGGAATCTTTTGGAAAGGTCGAAG
CTTTTGCAGAGACACTGGTCAGTGGATTGGATAGAAGCTGGCAGAAACCAGCAGGAGTAA
CTGCGAAGCTAGTTGATAGCACATCTTCCAAAGGGTTCTATTACATTGAGTATACATTGC
AAAACCCTGGAGAAGCTCGTAAGCATTTGTACTCTGCAATTGGGATGGCAACTAACGGTT
GGTACAACCGTTTATACACTGTCACTGGACAATTTAATGATGAAGAATCTGCTGATCA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2CN93TF 799 0 0
GGGAAGCAGGACACATATCTTGAAACACATGGCAGCGATTTCTCCATGGTTTTCTACTCC
ACAGAGCTTCTCGAATCCCCGCGTTTCCACCCGATATA***GTTCAGCAAGATGCACATC
ACTTCCTCCTGCTGTCGTCTCTGCTCAGGAACATCATCAGATACTGTCAAGAGATGAGGT
TGGGATGAAGAGAAGGGAAGTCTTGTTAAACTTAGCTTCTTCCTCTGCTTTCTTACTTCC
ATTCACCGTTTCACCTGCATTTGCAGAGACAAATGCAACAGACGCTTTCCGTGTGTACAC
AGATGAAACAAACAAGTTCGAGATATCAATTCCACAAGACTGGCAAGTCGGACAAGCAGC
AGAACCTAACGGGTTCAAGTCAATCACAGCTTTTTACCCTGAAGAAACTTCATCGTACAA
TGTGAGCGTAGCGATCACTGGACTAGGTCCAGATTTTACTAGGATGGAATCTTTTGGAAA
GGTCGAAGCTTTTGCAGAGACACTGGTCAGTGGATTGGATAGAAGCTGGCAGAAACCAGC
AGTAGTAACTGCGAAGCTAGTTGATAGCACATCTTCCAAAGGGTTCTATTACATTGAGTA
TACATTACAAAACCCTGGAGAAGCTCGTAAGCATTTGTACTCTGCAATTGGGATGGCAAC
TAACGGTTGGTACAACCGTTTATACACTGTCACTGGACAATTTAATGATGAAGAATCCGC
TGATCAAAGCTCCAAGATCCAGA**GCAGTCA*GTCTTTCAA*TTCATCTGAGA*TGTCA
TTTCCCTCGCAT
GATAAAC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2F368TF 788 0 0
GGG
ATCTTGAAGCACATGGTAGCGATTTCTCCATGGTTTTCTACTCCACAGAGCTTCTCGAAT
CCCCGCGTTTCCACCCGATATA***GTTCAGCAAGATGCACATCACTTCCTCCTGCTGTC
GTCTCTGCTCAGGAACATCATCAGATACTGTCAAGAGATGAGGTTGGGATGAAGAGAAGG
GAAGTCTTGTTAAACTTAGCTTCTTCCTCTGCTTTCTTACTTCCATTCACCGTTTCACCT
GCATTTGCAGAGACAAATGCAACAGACGCTTTCCGTGTGTACTTAGATGAAACAAACAAG
TTCGAGATATCAATTCCACAAGAGTGGCAAGTCGGACAAGCAGCAGAACCTAACGGGTTC
AAGTCAATCA**GCTTTTTACCCTGAAGAAACTTCATCGTACAATGTGAGCGTAGCGATC
ACTGGACTAGGTCCAGATTTCACTAGGATGGAATCTTTTGGAAAGGTCGAAGCTTTTGCA
GAGACACTGGTCAGTGGATTGGATAGAAGCTGGCAGAAACCAGCAGGAGTGACTGCAAAG
CTAGTTGATAGCAGATCTTCCAAAGGGTTCTATTACATTGAGTATACATTACAAAACCCT
GGAGAAGCTCGTAAGCATTTGTACTCTGCAATTGGGATGGTAACTAACGGTTGGTACAAC
CGTTTATACACTATCACTGGACAATTTAATGACGAAGACTCCGCTGATCAAAGCTCCAAG
ATCCAGAAGGCAGTCAAGTCTTTCAAATTCATCTGAGAATGTCATTCCCCTC
CATTCATAAAACA

QA 4 775 4 775
DS 

RD RR2CH41JQ 754 0 0
CCCCGCGTTTCCACCCGATATA***GTTCAGCAAGATGCACATCACTTCCTCCTGCTGTC
GTCTCTGCTCAGGAACATCATCAGATACTGTCAAGAGATGAGGTTGGGATGAAGAGAAGG
GAAGTCTTGTTAAACTTAGCTTCTTCCTCTGCTTTCTTACTTCCATTCACCGTTTCACCT
GCATTTGCAGAGACAAATGCAACAGACGCTTTCCGTGTGTACACAGATGAAACAAACAAG
TTCGAGATACCAATTCCACAAGACTGGCAAGTCGGACAATCAGCAGAACCTAACGGGTTC
AAGTCAATCACAGCTTTTTACCCTGAAGAAACTTCATCGTACAATGTGAGCGTAGCGATC
ACTGGACTAGGTCCAGATTTCACTAGGATGGAATCTTTTGGAAAGGTCGAAGCTTTTGCA
GAGACACTGGTCAGTGGATTGGATAGAAGCTGGCAGAAACCAGCAGGAGTAACTGCGAAG
CTAGTTGATAGCACATCTTCCAAAGGGTTCTATTACATTGAGTATACATTACAAAACCCT
GGAGAAGCTCGTAAGCATTTGTACTCTGCAATTGGGATGGCAACTAACGGTTGGTACAAC
CGTTTATACACTGTCACTGGACAATTTAATGATGAAGAATCCGCTGATCAAAGCTCCAAG
ATCCAGAAGGCAGTCAAGTCTTTCAAATTCATCTGAGAATGTCATTTCCCTCGCATTGAT
TAAACATTTTGTTTACTGAACAATTACTTCTT
CC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2CN93JQ 804 0 0
CTCCATGGTTTTCTACTCCACAGAGCTTCTCGAATCCCCGCGTTTCCACCCGATATA***
GTTCAGCAAGATGCACATCACTTCCTCCTGCTGTCGTCTCTGCTCAGGAACATCATCAGA
TACTGTCAAGAGATGAGGTTGGGATGAAGAGAAGGGAAGTCTTGTTAAACTTAGCTTCTT
CCTCTGCTTTCTTACTTCCATTCACCGTTTCACCTGCATTTGCAGAGACAAATGCAACAG
ACGCTTTCCGTGTGTACACAGATGAAACAAACAAGTTCGAGATATCAATTCCACAAGACT
GGCAAGTCGGACAAGCAGCAGAACCTAACGGGTTCAAGTCAATCACAGCTTTTTACCCTG
AAGAAACTTCATCGTACAATGTGAGCGTAGCGATCACTGGACTAGGTCCAGATTTTACTA
GGATGGAATCTTTTGGAAAGGTCGAAGCTTTTGCAGAGACACTGGTCAGTGGATTGGATA
GAAGCTGGCAGAAACCAGCAGTAGTAACTGCGAAGCTAGTTGATAGCACATCTTCCAAAG
GGTTCTATTACATTGAGTATACATTACAAAACCCTGGAGAAGCTCGTAAGCATTTGTACT
CTGCAATTGGGATGGCAACTAACGGTTGGTACAACCGTTTATACACTGTCACTGGACAAT
TTAATGATGAAGAATCCGCTGATCAAAGCTCCAAGATCCAGAAGGCAGTCAAGTCTTTCA
AATTCATCTGAGAATGTCATTTCCCTCGCATTGATTAAACATTTTGTTTACTGAACAATT
ACTTCTTTCAATCAAATTCTTGGG

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2HB60JQ 697 0 0
GAACATCATCAGATACTGTCAAGAGATGAGGTTGGGATGAAGAGAAGGGAAGTCTTGTTA
AACTTAGCTTCTTCCTCTGCTTTCTTACTTCCATTCACCGTTTCACCTGCATTTGCAGAG
ACAAATGCAACAGACGCTTTCCGTGTGTACACAGATGAAACAAACAAGTTCGAGATATCA
ATTCCACAAGACTGGCAAGTCGGACAAGCAGCAGAACCTAACGGGTTCAAGTCAATCACA
ACTTTTTACCCTGAAGAAACTTCATCGTACAATGTGAGCGTAGCGATCGCTGGACTAGGT
CCAGATTTCACTAGGATGGAATCTTTTGGAAAGGTCGAAGCTTTTGCAGAGACACTGGTC
AGTGGATTGGATAGAAGCTGGCAGAAACCAGCAGGAGTAACTGCGAAGCTAGTTGATAGC
ACATCTTCCAAAGGGTTCTATTACATTGAGTATACATTACAAAACCCTGGAGAAGCTCGT
AAGCATTTGTACTCTGCAATTGGGATGGCAACTAGCGGTTGGTACAACCGTTTATACACT
GTCACTGGACAATTTAATGATGAAGAATCCGCTGATCAAAGCTCCAAGATCCAGAAGGCA
GTCAAGTCTTTCAAATTCATCTGAGAATGTCATTTCCCTCGCATTGATTAAACATTTTGT
TTACTGAACAATTACTTCTTTCAATCAAATTCTTGGG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2E322JQ 619 0 0
TTTCTTACTTCCATTCACCGTTTCACCTGCATTTGCAGAGACAAATGCAACAGACGCTTT
CCGTGTGTACACAGATGAAACAAACAAGTTCGAGATATCAATTCCACAAGACTGGCAAGT
CGGACAAGCAGCAGAACCTAACGGGTTCAAGTCAATCACAGCTTTTTACCCTGAAGAAAC
TTCATCGTACAATGTGAGCGTAGCGATCACTGGACTAGGTCCAGATTTCACTAGGATGGA
ATCTTTTGGAAAGGTCGAAGCTTTTGCAGAGACACTGGTCAGTGGATTGGATAGAAGCTG
GCAGAAACCAGCAGGAGTAACTGCGAAGCTAGTTGATAGCACATCTTCCAAAGGGTTCTA
TTACATTGAGTATACATTGCAAAACCCTGGAGAAGCTCGTAAGCATTTGTACTCTGCAAT
TGGGATGGCAACTAACGGTTGGTACAACCGTTTATACACTGTCACTGGACAATTTAATGA
TGAAGAATCCGCTGATCAAAGCTCCAAGATCCAGAAGGCAGTCAAGTCTTTCAAATTCAT
CTGAGAATGTCATTTCCCTCGCATTGATTAAACATTTTGTTTACTGAACAATTACTTCTT
TCAATCAAATTCTTGGG
AG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2EW22JQ 627 0 0
G
GCAGAGACAAATGCAACAGACGCTTTCCGTGTGTACACAGATGAAACAAACAAGTTCGAG
ATATCAATTCCACAAGACTGGCAAGTCGGACAAGCAGCAGAACCTAACGGGTTCAAGTCA
ATCACAGCTTTTTACCCTGAAGAAACTTCATCGTACAATGTGAGCGTAGCGATCACTGGA
CTAGGTCCAGATTTCACTAGGATGGAATCTTTTGGAAAGGTCGAAGCTTTTGCAGAGACG
CTGGTCAGTGGATTGGATAGAAGCTGGCAGGAACCAGCAGGAGTAACTGCGAAGCTAGTT
GATAGCACATCTTCCAAAGGGTTCTATTACATTGAGTATACATTACAAAACCCTGGAGAA
GCTCGTAAGCATTTGTACTCTGCAATTGGGATGGCAACTAACGGTTGGTACAACCGTTTA
TACACTGTCACTGGACAATTTAATGATGAAGAATCCGCTGATCAAAGCTCCAAGATCCAG
AAGGCAGTCAAGTCTTTCAAATTCATCTGAGAATGTCATTTCCCTCGCATTGATTAAACA
TTTTGTTTACTGAACAATTACTTCTTTCAATCAAATTCTTGGGATAAAAAAACTAACTCC
ATACTTTGAAGCTTCTGATAACAATC

QA 2 627 2 627
DS 

RD RR2EW22TF 627 0 0
G
GCAGAGACAAATGCAACAGACGCTTTCCGTGTGTACACAGATGAAACAAACAAGTTCGAG
ATATCAATTCCACAAGACTGGCAAGTCGGACAAGCAGCAGAACCTAACGGGTTCAAGTCA
ATCACAGCTTTTTACCCTGAAGAAACTTCATCGTACAATGTGAGCGTAGCGATCACTGGA
CTAGGTCCAGATTTCACTAGGATGGAATCTTTTGGAAAGGTCGAAGCTTTTGCAGAGACG
CTGGTCAGTGGATTGGATAGAAGCTGGCAGGAACCAGCAGGAGTAACTGCGAAGCTAGTT
GATAGCACATCTTCCAAAGGGTTCTATTACATTGAGTATACATTACAAAACCCTGGAGAA
GCTCGTAAGCATTTGTACTCTGCAATTGGGATGGCAACTAACGGTTGGTACAACCGTTTA
TACACTGTCACTGGACAATTTAATGATGAAGAATCCGCTGATCAAAGCTCCAAGATCCAG
AAGGCAGTCAAGTCTTTCAAATTCATCTGAGAATGTCATTTCCCTCGCATTGATTAAACA
TTTTGTTTACTGAACAATTACTTCTTTCAATCAAATTCTTGGGATAAAAAAACTAACTCC
ATACTTTGAAGCTTCTGATAACAATC

QA 2 627 2 627
DS 



AS 1 14

CO CL301Contig1 1261 14 18 U
AGAACAGTTATCAGTTATCATATTATTTATTATTATTATCATCTTCAATAAACATAAATA
AACACACCACACTTTAAAACACCATTGACCAACAATTAACCACAAGACATCTTAATTATA
TCAACAA**************TAACTTATTGACGTATACACACAC**CACAACACACATT
TTTGTTTCTTTGCTTTCTCTCAAACTCAACTTTGTTTTTAGAAAGTCTCTACGGCTGCTG
TTGGGTTCAATTCTGTAACTGCATTTGCATTCTTCATTGCCTCGAACCGTGGCTCCTTAG
GCTGAAACTTGACCCC*AGCATAGAGCTTCATGTAGTCATCAAAAACAAAACTCGGGTAC
TCGGTTTCTTTGCAGACAAGCGATGAAGCTGGAGAGATCTCAGCATCGCTTCCCGGGTTG
TAGAAAGATGCAATGGACATTCTGTTTCCTTCTTTCTGAGTCACCACACGGTGCATCACA
CTCTTGTACCTGCCGTTGGTTATCACCTCAAGTTGGTCACCAAGATTGATGACAATAGAG
TGGTTGAGTGGAGGAACATCAATCCAGTCACCATCTTTAAGAAGCTGGAGACCACTGACC
TTGTCATCTTGAAACAACAAGATGATGCCTCCTGCATCAGTGTGGGCCCTAAGACCTTTG
ATCATCTCTGGCTTAGGACAAGCTGGATAATTGCTCACCTTAGTCCCAAAGGTTGGACCT
TTTGTTCCATGAAACACTTTCTTCAAGTACCCTTT*CTCTAATCCTAGATTTTCACACAA
TAGATCCAACAAATCCTCAGCAAGATTCTCCAATCTCTTCCCGAAATCTTTCATAGCCGT
CCGGTATTCATCAGACATATCAGGAATGTCGTAGAGATTGGACTGAGGGAGATGACGAAG
GTAGAAAGTGCTTTCCCAATCGACATCCTCAACTTCTCTCTCAAGATTTTCCAAACCTTT
GGACTTGAGCATGTCGTTGAACTTTTGTTCCATTGATTTCTTGTAATGCTCCTTTGTCAT
CTTCTCGACGTTGTCCATCAAATCATGTGGTAAACCATGGTTCACTATCTCAAAGAAGCC
CCAATTCTCACAAGCATTGTTGATCAAAGCCATGGTTTGGTCTCTCTCTTCACCAATGAG
CTTGGACAAGTCTACAACTGGAAACCTAATGTTCTTCTCCATCTCTCTCTC**TTCTTTG
AAAGTATTTGGTTGAAGTAGCTAGCTGTGTGTGTTGTTTGATTGTTTTGATGTGAGAGTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 30 50 50 50 30 30 30 50 50 50 50 50 50 30 
50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 20 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 65 65 65 65 70 70 60 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 60 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 80 80 
80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 15 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 60 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 40 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP06JQ U 179
AF RR2G587JQ U 12
AF RR2AJ96JQ U 13
AF RR2G282JQ U 87
AF RR2FU53JQ U 1
AF RR2AI09JQ U 17
AF RR2AF83JQ U 43
AF RR2BX39TF C 141
AF RR2AJ96TF C 453
AF RR2G282TF C 499
AF RR2FU53TF C 556
AF RR2G587TF C 505
AF RR2CP06TF C 502
AF RR2AF83TF C 459
BS 1 474 RR2FU53JQ
BS 475 475 RR2AJ96JQ
BS 476 613 RR2FU53JQ
BS 614 614 RR2G587JQ
BS 615 718 RR2FU53JQ
BS 719 719 RR2AI09JQ
BS 720 759 RR2FU53JQ
BS 760 808 RR2AI09JQ
BS 809 838 RR2AF83JQ
BS 839 921 RR2BX39TF
BS 922 1154 RR2AJ96TF
BS 1155 1155 RR2AF83TF
BS 1156 1165 RR2AJ96TF
BS 1166 1166 RR2AF83TF
BS 1167 1176 RR2AJ96TF
BS 1177 1177 RR2AF83TF
BS 1178 1194 RR2AJ96TF
BS 1195 1261 RR2AF83TF

RD RR2CP06JQ 385 0 0
TTTTTGTTTCTTTGCTTTCGCTCAAACTCAACTTTGTTTTTAGAAAGTCTCTACGGCTGC
TGTTGGGTTCAATTCTGTAACTGCATTTGCATTCTTCATTGCCTCGAACCGTGGCTCCTT
AGGCTGAAACTTGACCCC*AGCATAGAGCTTCATGTAGTCATCAAAAACAAAACTCGGGT
ACTCGGTTTCTTTGCAGACAAGCGATGTAGCTGGAGAGATCGCAGCATCGCTTCCCGGGT
TGTAGAAAGATGCAATGGACATTCTGTTTCCTTCTTGCTGAGTCACCACACGGTGCATCA
CACTCTTGTACCTGCCGTTGGTTATCACCTCAAGTTGGTCACCAAGATTGATGACAATAG
AGTGGTTGAGTGGAGGAACATCAAT

QA 1 385 1 385
DS 

RD RR2G587JQ 660 0 0
CGGTT
ATCATATTATTTATTATTATTATCATCTTCAATAAACATAAATAAACACACCACACTTTA
AAACACCATTGACCAACAATTAACCACAAGACATCTTAATTATATCAACAA*********
*****TAACTTATTGACGTATACACACAC**CACAACACACATTTTTGTTTCTTTGCTTT
CTCTCAAACTCAACTTTGTTTTTAGAAAGTCTCTACGGCTGCTGTTGGGTTCAATTCTGT
AACTGCATTTGCATTCTTCATTGCCTCGAACCGTGGCTCCTTAGGCTGAAACTTGACCCC
*AGCATAAAGCTTCATGTAGTCATCAAAAACAAAACTCGGGTACTCGGTTTCTTTGCAGA
CAAGCGATGAAGCTGGAGAGATCTCAGCATCGCTTCCCGGGTTGTAGAAAGATGCAATGG
ACATTCTGTTTCCTTCTTTCTGAGTCACCACACGGTGCGTCACACTCTTGTACCTGCCGT
TGGTTATCACCTCAAGTTGGTCACCAAGATTGATGACAATAGAGTGGTTGAGTGGAGGAA
CATCAATCCAGTCACCATCTTTAAGAAGCTGGAGACCACTGACCTTGTCATCTTGAAACA
ACAAGATGATGCCTCCTGCATCAGTGTGGGCCCTAAGACCTTTGATCATCTCTGG

QA 6 660 6 660
DS 

RD RR2AJ96JQ 649 0 0
GGTT
ATCATATTATTTATTATTATTATCATCTTCAATAAACATAAATAAACACACCACACTTTA
AAACACCATTGACCAACAATTAACCACAAGACATCTTAATTATATCAACAA*********
*****TAACTTATTGACGTATACACACAC**CACAACACACATTTTTGTTTCTTTGCTTT
CTCTCAAACTCAACTTTGTTTTTAGAAAGTCTCTACGGCTGCTGTTGGGTTCAATTCTGT
AACTGCATTTGCATTCTTCATTGCCTCGAACCGTGGCTCCTTAGGCTGAAACTTGACCCC
*AGCATAGAGCTTCATGTAGTCATCAAAAACAAAACTCGGGTACTCGGTTTCTTTGCAGA
CAAGCGATGAAGCTGGAGAGATCTCAGCATCGCTTCCCGGGTTGTAGAAAGATGCAATGG
ACATTCTGTTTCCTTCTTTCTGAGTCACCACACGGTGCATCACACTCTTGTACCTGCCGT
TGGTTATCACCTCAAGTTGGTCACCAAGATTGATGACAATAGAGTGGTTGAGTGGAGGAA
CATCAATCCAGTCACCATCTTTAAGAAGCTGGAGACCACTGACCTTGTCATCTTGAAACA
ACAAGATGATGCCTCCTGCATCAGTGTGGGCCCTAAGACCTTTGA

QA 5 649 5 649
DS 

RD RR2G282JQ 575 0 0
GT
CCAACAATTAACCACCAGACATCTTAATTATATCAACAATAATATCAGTCTTGTAACTTA
TTGACGTATACACACAC**CACAACACACATTTTTGTTTCTTTGCTTTCGCTCAAACTCA
ACTTTGTTTTTAGAAAGTCTCTACGGCTGCTGTTGGGTTCAATTCTGTAACTGCATTTGC
ATTCTTCATTGCCTCGAACCGTGGCTCCTTAGGCTGAAACTTGACCCC*AGCATAAAGCT
TCATGTAGTCATCAAAAACAAAACTCGGGTACTCGGTTTCTTTGCAAACAAGCGATGAAG
CTGGAAAGATCGCAGCATCCCTTCCCGGGTTGTAAAAAGATGCAATGGACATTCTGTTTC
CTTCTTGCTGAGTCACCACACGGTGCATCACACTCTTGTACCTGCCGTTGGTTATCACCT
CAAGTTGGTCACCAAGATTGATGACAATAAAGTGGTTGAGTGGAGGAACATCAATCCAGT
CACCATCTTTAAAAAGCTGGAAACCACTAACCTTGTCATCTTGAAACAACAAGATGATGC
TTCCTGCATCAGTGTGGGCCCTAAAACCTTTGA

QA 3 575 3 575
DS 

RD RR2FU53JQ 759 0 0
AGAACAGTTATCAGTTATCATATTATTTATTATTATTATCATCTTCAATAAACATAAATA
AACACACCACACTTTAAAACACCATTGACCAACAATTAACCACAAGACATCTTAATTATA
TCAACAA**************TAACTTATTGACGTATACACACAC**CACAACACACATT
TTTGTTTCTTTGCTTTCTCTCAAACTCAACTTTGTTTTTAGAAAGTCTCTACGGCTGCTG
TTGGGTTCAATTCTGTAACTGCATTTGCATTCTTCATTGCCTCGAACCGTGGCTCCTTAG
GCTGAAACTTGACCCC*AGCATAGAGCTTCATGTAGTCATCAAAAACAAAACTCGGGTAC
TCGGTTTCTTTGCAGACAAGCGATGAAGCTGGAGAGATCTCAGCATCGCTTCCCGGGTTG
TAGAAAGATGCAATGGACATTCTGTTTCCTTCTTTCTGAGTCACCACACGGTGCGTCACA
CTCTTGTACCTGCCGTTGGTTATCACCTCAAGTTGGTCACCAAGATTGATGACAATAGAG
TGGTTGAGTGGAGGAACATCAATCCAGTCACCATCTTTAAGAAGCTGGAGACCACTGACC
TTGTCATCTTGAA*CAACAAGATGATGCCTCCTGCATCAGTGTGGGCCCTAAGACCTTTG
ATCATCTCTGGCTTAGGACAAGCTGGATAATTGCTCACCTTAGTCCCAAAGGTTGGACAT
TTTGTTCCATGAAACACTTTCTTCAAGTACCCTTT*CTC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2AI09JQ 792 0 0
ATCATATTATTTATTATTATTATCATCTTCAATAAACATAAATAAACACACCACACTTTA
AAACACCATTGACCAACAATTAACCACAAGACATCTTAATTATATCAACAA*********
*****TAACTTATTGACGTATACACACAC**CACAACACACATTTTTGTTTCTTTGCTTT
CTCTCAAACTCAACTTTGTTTTTAAAAAGTCTCTACGGCTGCTGTTGGGTTCAATTCTGT
AACTGCATTTGCATTCTCCATTGCCTCGAACCGTGGCTCCTTAGGCTGAAACTTGACCCC
*AGCATAAAGCTTCATGTAGTCATCAAAAACAAAACTCGGGTACTCGGTTTCTTTGCAGA
CAAGCGATGAAGCTGGAGAGATCTCAGCATCGCTTCCCGGGTCGTAAAAAGATGCAATGG
ACATTCTGTTTCCTTCTTTCTGAGTCACCACACGGTGCATCACACTCTTGTACCTGCCGT
TGGTTATCACCTCAAGTTGGTCACCAAGATTGATGACAATAGAGTGGTTGAGCGGAGGAA
CATCAATCCAGTCACCATCTTTAAGAAGCTGGAGACCACTGACCTTGTCATCTTGAAACA
ACAAGATGATGCCTCCTGCATCAGTGTGGGCCCTAAGACCTTTGATCATCTCTGGCTTAG
GACAAGCTGGATAATTGCTCACCTTAGTCCCAAAGGTTGGACCTTTTGTTCCATGAAACA
CTTTCTTCAAGTACCCTTTTCTCTAATCCTAGATTTTCACACAATAGATCCAACAAATCC
TCAGCAAGATTC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2AF83JQ 796 0 0
CTTCAATAAACATAAATAAACACACCACACTTTAAAACACCATTGACCAACAATTAACCA
CCAGACATCTTAATTATATCAACAATAATATCAGTCTTGTAACTTATTGACGTATACACA
CACACCACAACACACATTTTTGTTTCTTTGCTTTCGCTCAAACTCAACTTTGTTTTTAGA
AAGTCTCTACGGCTGCTGTTGGGTTCAATTCTGTAACTGCATTTGCATTCTTCATTGCCT
CGAACCGTGGCTCCTTAGGCTGAAACTTGACCCC*AGCATAGAGCTTCATGTAGTCATCA
AAAACAAAACTCGGGTACTCGGTTTCTTTGCATACAAGCGATGAAGCTGGAGAGATCGCA
GCATCGCTTCCCGGGTTGTAGAAAGATGCAATGGACATTCTGTTTCCTTCTTGCTGAGTC
ACCACACGGTGCATCACACTCTTGTACCTGCCGTTGGTTATCACCTCAAGTTGGTCACCA
AGATTGATGACAATAGAGTGGTTGAGTGGAGGAACATCAATCCAGTCACCATCTTTAAGA
AGCTGGAGACCACTAACCTTGTCATCTTGAAACAACAAGATGATGCCTCCTGCATCAGTG
TGGGCCCTAAGACCTTTGATCATCTCTGGCTTAGGACAAGCTGGATAATTGCTCACCTTA
GTCCCAAAGGTTGGACCTTTTGTTCCATGAAACACTTTCTTCAAGTACCCTTT*CTCTAA
CCCTAGATTTTCACACAATAGATCCAACAAATCCTCAGCAAGATTCTCCAATCTCTTCCC
GAAATCTTTCATAGCC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2BX39TF 781 0 0
ACATACTTA
TGACGTATACACACAC**CACAACACACATTTT*GTTC**TTGCTT*CTCTCAAACTCAA
CTTTGTTTT*AGAAAGTCTCTACGGCTGCTGTTGGGTTCAATTCTGTAACTGCATTTGCA
TTCTTCATTGCCTAGAACCGTGGCTCCTTAGGCTGAAACTTGACCCCCAGCATAGAGCTT
CATGTAGTCATCAAAAACAAAACTCGGGTACTCGGTTTCTTTGCAGACAAGCGATGAAGC
TGGAGAGATCTCAGCATCGCTTCCCGGGTTGTAGAAAGATGCAATGGACATTCTGTTTCC
TTCTTTCTGAGTCACCACACGGTGCATCACACTCATGTACCTGCCGTTGGTTATCACCTC
AAGTTGGTCACCAAGATTGATGACAATAGAGTGGTTGAGTGGAGGAACATCAATCCAGTC
ACCATCTTTAAGAAGCTGGAGACCACTGACCTTGTCATCTTGAAACAACAAGATGATGCC
CCCTGCATCAGTGTGGGCCCTAAGACCTTTGATCATCTCTGGCTTAGGACAAGCTGGATA
ATTGCTCACCTTAGTCCCAAAGGTTGGACCTTTTGTTCCATGAAACACTTTCTTCAAGTA
CCCTTT*CTCTAATCCTAGATTTTCACACAATAGATCCAACAAATCCTCAGCAAGATTCT
CCAATCTCTTCCCAAAATCTTTCATGGCCGTCCGGTATTCATCAGACATATCAGGAATGT
CGTAGAGATTGGACTGAGGGAGATGACGAAGGTAGAAAGTGCTTTCCCAATC

QA 10 781 10 781
DS 

RD RR2AJ96TF 751 0 0
TTTCTGAGTCACCACACGGTGCATCACACTCTTGTACCTGCCGTTGGTTATCACCTCAAG
TTGGTCACCAAGATTGATGACAATAGAGTGGTTGAGTGGAGGAACATCAATCCAGTCACC
ATCTTTAAGAAGCTGGAGACCACTGACCTTGTCATCTTGAAACAACAAGATGATGCCTCC
TGCATCAGTGTGGGCCCTAAGACCTTTGATCATCTCTGGCTTAGGACAAGCTGGATAATT
GCTCACCTTAGTCCCAAAGGTTGGACCTTTTGTTCCATGAAACACTTTCTTCAAGTACCC
TTT*CTCTAATCCTAGATTTTCACACAATAGATCCAACAAATCCTCAGCAAGATTCTCCA
ATCTCTTCCCAAAATCTTTCATGGCCGTCCGGTATTCATCAGACATATCAGGAATGTCGT
AGAGATTGGACTGAGGGAGATGACGAAGGTAGAAAGTGCTTTCCCAATCGACATCCTCAA
CTTCTCTCTCAAGATTTTCCAAACCTTTGGACTTGAGCATGTCGTTGAACTTTTGTTCCA
TTGATTTCTTGTAATGCTCCTTTGTCATCTTCTCGACGTTGTCCATCAAATCATGTGGTA
AACCATGGTTCACTATCTCAAAGAAGCCCCAATTCTCACAAGCATTGTTGATCAAAGCCA
TGGTTTGGTCTCTCTCTTCACCAATGAGCTTGGACAAGTCTAAAACTGGAAACTTAATGT
TCTTGTCCATCTCTCTCTC**T
CTTCTTTCC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2G282TF 756 0 0
GT
TATCAC*TCAAGTTG*TCACCA*GATTGATGACA*TAGAGTGGT*GAGTGGAGGAACATC
AATCCAGTCACCATCTTTAAGAAGCTGGAGACCACTAACCTTGTCATCTTGAAACAACAA
GATGATGCTTC*TGCATCAGTGTGGGCCCTAAGACCTTTGATCATCTCTGGCTTAGGACA
AGCTGGATAATTGCTCACCTTAGTCCCAAAGGTTGGACCTTTTGTT**ATGAAACACTTT
CTTCAAGTACCCTTT*CTCTAACCCTAGATTTTCACACAATAGATCCAACAAATCCTCAG
CAAGATTCTCCAATCTCTTCCCGAAATCTTTCATAGCCGTCCGGTATTCATCAGACATAT
CAG*AATGTCGTAGAGATTGGACTGAGGGAGATGACGAAGGTAGAAAGTGCTTTCCCAAT
CGACATCCTCAACTTCTCTCTCAAGATTTTCCAAACCTTTGGACTTGAGCATGTCGTTGA
ACTTTTGTTCCATTGATTTCTTGTAATGTTCCTTTGTCATCTTCTCGACGTTGTCCATCA
AATCATGTGGTAAACCATGGTTCACTATCTCAAAGAAGCCCCAATTCTCACAAGCATTGT
TGATCAAAGCCATGGTTTGGTCTCTCTCTTCACCAATGAGCTTGGACAAGTCTACAACTG
GAAACCTAATGTTCTTCTCCATCTCTCTCTC**TTCTTTGAAAGTATTTGGTTGAAGTAG
CTAGCTGTGTGTGTTGTTTGATTGTTTTGAT
CCC

QA 3 753 3 753
DS 

RD RR2FU53TF 706 0 0
ACATCAATCCAGTCACCATCTTTAAGAAGCTGGAGACCACTGACCTTGTCATCTTGAA*C
AACAAGATGATGCCTCCTGCATCAGTGTGGGCCCTAAGACCTTTGATCATCTCTGGCTTA
GGACAAGCTGGATAATTGCTCACCTTAGTCCCAAAGGTTGGACATTTTGTTCCATGAAAC
ACTTTCTTCAAGTACCCTTT*CTCTAATCCTAGATTTTCACACAATAGATCCAACAAATC
CTCAGCAAGATTCTCCAATCTCTTCCCAAAATCTTTCATGGCCGTCCGGTATCCATCAGA
CATATCAGGAATGTCGTAGAGATTGGACTGAGGGAGATGACGAAGGTAGAAAGTGCTTTC
CCAATCGACATCCTCAACTTCTCTCTCAAGATTTTCCAAACCTTTGGACTTGAGCATGTC
GTTGAACTTTTGTTCCATTGATTTCTTGTAATGCTCCTTTGTCATCTTCTCGACGTTGTC
CATCAAATCATGTGGTAAACCATGGTTCACTATCTCAAAGAAGCCCCAATTCTCACAAGC
ATTGTTGATCAAAGCCATGGTTTGGTCTCTCTCTTCACCAATGAGCTTGGACAAGTCTAC
AACTGGAAACTTAATGTTCTTGTCCATCTCTCTCTCTCTTCTTTGAAAGTATTTGGTTGA
AGTAGCTAGCTGTGTGTGTTGTTTGATTGTTTTGAT
GTGAGAGTCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2G587TF 749 0 0
ACCTCAAGTTGGTCACCAAGATTGATGACAATAGAGTGGTTGAGTGGAGGAACATCAATC
CAGTCACCATCTTTAAGAAGCTGGAGACCACTGACTTTGTCATCTTGAAACAACAAGATG
ATGCCTCGTGCATCAGTGTGGGCCCTAAGACCTTTGATCATCTCTGGCTTAGGACAAGCT
GGATAATTGCTCACCTTAGTCCCAAAGGTTGGACCTTTTGTTCCATGAAACACTTTCTTC
AAGTACCCTTT*CTCTAATCCTAGATTTTCACACAATAGATCCAACAAATCCTCAGCAAG
ATTCTCCAATCTCTTCCCAAAATCTTTCATGGCCGTCCGGTATTCATCAGACATATCAGG
AATGTCGTAGAGATTGGACTGAGGGAGATGACGAAGGTAGAAAGTGCTTTCCCAATCGAC
ATCCTCAACTTCTCTCTCAAGATTTTCCAAACCTTTGGACTTGAGCATGTCGTTGAACTT
TTGTTCCATTGATTTCTTGTAATGCTCCTTTGTCATCTTCTCGACGTTGTCCATCAAATC
ATGTGGTAAACCATGGTTCACTATCTCAAAGAAGCCCCAATTCTCACAAGCATTGTTGAT
CAAAGCCATGGTTTGGTCTCTCTCTTCACCAATGAGCTTGGACAAGTCTACAACTGGAAA
CTTAATGTTCTTGTCCATCTCTCTCTCTCTTCTTTGAAAGTATTTGGTTGAAGTAGCTAG
CTGTGTGTGTTGTTTGATTGTTTTGAT
CC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2CP06TF 760 0 0
TATCA
CTCAAGTTGGTCACCAAGATTGATGACAATAGAGTGGTTGAGTGGAGGAACATCAATCCA
GTCACCATCTTTAAGAAGCTGGAGACCACTAACCTTGTCATCTTGAAACAACAAGATGAT
GCCTCCTGCATCAGTGTGGGCCCTAAGACCTTTGATCATCTCTGGCTTAGGACAAGCTGG
ATAATTGCTCACCTTAGTCCCAAAGGTTGGACCTTTTGTTCCATGAAACACTTTCTTCAA
GTACCCTTT*CTCTAGCCCTAGATTTTCACACAATAGATCCAACAAATCCTCAGCAAGAT
TCTCCAATCTCTTCCCGAAATCTTTCATAGCCGTCCGGTATTCATCAGACATATCAGGAA
TGTCGTAGAGATTGGACTGAGGGAGATGACGAAGGCAGAAAGTGCTTTCCCAATCGACAT
CCTCAACTTCTCTATCAAGATTTTCCAAACCTTTGGACTTGAGCATGTCGTTGAACTTTT
GTTCCATTGATTTCTTGTAATGTTCCTTTGTCATCTTCTCGACGTTGTCCATCAAATCAT
GTGGTAAACCATGGTTCACTATCTCAAAGAAGCCCCAATTCTCACAAGCATTGTTGATCA
AAGCCATGGTTTGGTCTCTCTCTTCACCAATGAGCTTGGACAAGTCTACAACTGGAAACC
TAATGTTCTTCTCCATCTCTCTCTC**TTCTTTGAAAGTATTTGGTTGAAGTAGCTAGCT
GTGTGTGTTGTTTGATTGTTTTGAT
GTGAGAGTCC

QA 6 750 6 750
DS 

RD RR2AF83TF 803 0 0
AGTCACCACACGGTGCATCACACTCTTGTACCTGCCGTTGGTTATCACCTCAAGTTGGTC
ACCAAGATTGATGACAATAGAGTGGTTGAGTGGAGGAACATCAATCCAGTCACCATCTTT
AAGAAGCTGGAGACCACTAACCTTGTCATCTTGAAACAACAAGATGATGCCTCCTGCATC
AGTGTGGGCCCTAAGACCTTTGATCATCTCTGGCTTAGGACAAGCTGGATAATTGCTCAC
CTTAGTCCCAAAGGTTGGACCTTTTGTTCCATGAAACACTTTCTTCAAGTACCCTTT*CT
CTAACCCTAGATTTTCACACAATAGATCCAACAAATCCTCAGCAAGATTCTCCAATCTCT
TCCCGAAATCTTTCATAGCCGTCCGGTATTCATCAGACATATCAGGAATGTCGTAGAGAT
TGGACTGAGGGAGATGACGAAGGTAGAAAGTGCTTTCCCAATCGACATCCTCAACTTCTC
TCTCAAGATTTTCCAAACCTTTGGACTTGAGCACGTCGTTGAACTTTTGTTCCATTGATT
TCTTGTAATGTTCCTTTGTCATCTTCTCGACGTTGTCCATCAAATCATGTGGTAAACCAT
GGTTCACTATCTCAAAGAAGCCCCAATTCTCACAAGCATTGTTGATCAAAGCCATGGTTT
GGTCTCTCTCTTCACCAATGAGCTTGGACAAGTCTACAACTGGAAACCTAATGTTCTTCT
CCATCTCTCTCTC**TTCTTTGAAAGTATTTGGTTGAAGTAGCTAGCTGTGTGTGTTGTT
TGATTGTTTTGATGTGAGAGTCC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 14

CO CL302Contig1 601 14 13 U
GGGAAGCAATATCATTTCAACCTTATCCTCCTCTACTCAAAAAGACATTCACGGCGATGG
CGTCGCTTTTACTCGGAGCTCCTCCGCGAGTCATCACCGTCGCAACATCTCCGAGGTTAT
TATCATCATCTCACTCGGAAACTCTCGGCGTCTCTTTCTCTTGCTTCACTCAGCAACTAT
CTCTCTCCGCTTCGTCATCATCCAGCTCAATTCCACTCGTGTACTGTGGCCGAGGTGACC
GCAAAACAGCGAGAGGAAAGCGCTTTAATCACTCTTTCGGGAATGCGAGGCCACGGAACA
AGAATAAAGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTCCCTCCTGCTCCACCGAGGAAGGATA
AGTTTGAGAACGACGAGAAGATCAAAATCGATATCGACGAGTCCCTCTTCTCCAACTAGA
GTCTTTCCTTCACTTCTTGTCACTGTAATTCTATTCGAACAGATGCTGCAACTCTTTGTT
TGTTATTAAACATCTCCTCTTTCTTGTTTTAATTGATAAATGTTTCGGTAATATGAGTGA
TTGAGTCTTAACTTCGTTTTATTAAAGAAAATCTAAAGAAAGTGTAGACATTGAAAGATT
T


BQ
10 35 35 35 35 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 
75 75 75 75 60 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2FK36JQ C 276
AF RR2CZ13JQ C 1
AF RR2H657JQB C 167
AF RR2DU35JQ C 156
AF RR2GN49JQ C 4
AF RR2GN49TF U 4
AF RR2H657TF U 6
AF RR2DU35TF U 2
AF RR2FK36TF U 2
AF RR2CZ13TF U 1
AF RR2DC33TF U 1
AF RR2EH41TF U 4
AF RR2F019JQ C 6
AF RR2F019TF U 6
BS 1 1 RR2CZ13JQ
BS 2 5 RR2DU35TF
BS 6 75 RR2GN49TF
BS 76 76 RR2H657TF
BS 77 120 RR2GN49TF
BS 121 121 RR2H657TF
BS 122 199 RR2GN49TF
BS 200 200 RR2H657TF
BS 201 519 RR2GN49TF
BS 520 528 RR2H657TF
BS 529 529 RR2DU35TF
BS 530 563 RR2EH41TF
BS 564 601 RR2F019TF

RD RR2FK36JQ 142 0 0
TTCGGGAATGGGAGGCCACGGAACAAGAATAAAGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTC
CCTCCTGCTCCACCGAGGAAGGATAAGTTTGAGAACGACGAGAAGATCAAAATCGATATC
GACGAGTCCCTCTTCTCCAACT

QA 1 142 1 142
DS 

RD RR2CZ13JQ 529 0 0
GGGAAGCAATATCATTTCAACCTTATCCTCCTCTACTCAAAAAGACATTCACGGCGATGG
CGTCGCTTTTACTCGGAGCTCCTCCGCGAGTCGTCACCGTCGCAACATCTCCGAGGTTAT
TATCATCATCTCACTCGGAAACTCTCGGCGTCTCTTTCTCTTGCTTCACTCAGCAACTAT
CTCTCTCCGCTTCGTCATCATCCAGCTCAATTCCACTCGTGTACTGTGGCCGAGGTGACC
GCAAAACAGCGAGAGGAAAGCGCTTTAATCACTCTTTCGGGAATGCGAGGCCACGGAACA
AGAATAAAGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTCCCTCCTGCTCCACCGAGGAAGGATA
AGTTTGAGAACGACGAGAAGATCAAAATCGATATCGACGAGTCCCTCTTCTCCAACTAGA
GTCTTTCCTTCACTTCTTGTCACTGTAATTCTATTCGAACAGATGCTGCAACTCTTTGTT
TGTTATTAAACATCTCCTCTTTCTTGTTTTAATTGATAAATGTTTCGGT

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2H657JQB 363 0 0
CACTCAGCAACTATCTCTCTCCGCTTCGTCATCATCCAGCTCAATTCCACTCGTGTACTG
TGGCCGAGGTGACCGCAAAACAGCGAGAGGAAAGCGCTTTAATCACTCTTTCGGGAATGC
GAGGCCACGGAACAAGAATAAAGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTCCCTCCTGCTCC
ACCGAGGAAGGATAAGTTTGAGAACGACGAGAAGATCAAAATCGATATCGACGAGTCCCT
CTTCTCCAACTAGAGTCTTTCCTTCACTTCTTGTCACTGTAATTCTATTCGAACAGATGC
TGCAACTCTTTGTTTGTTATTAAACATCTCCTCTTTCTTGTTTTAATTGATAAATGTTTC
GG
C

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR2DU35JQ 374 0 0
TTCTCTTGCTTCACTCAGCAACTATCTCTTTCCGCTTCGTCATCATCCAGCTCAATTCCA
CTCGTGTACTGTGGCCGAGGTGACCGCAAAACAGCGAGAGGAAAGCGCTTTAATCACTCT
TTCGGGAATGCGAGGCCACGGAACAAGAATAAAGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTC
CCTCCTGCTCCACCGAGGAAGGATAAGTTTGAGAACGACGAGAAGATCAAAATCGATATC
GACGAGTCCCTCTTCTCCAACTAGAGTCTTTCCTTCACTTCTTGTCACTGTAATTCTATT
CGAACAGATGCTGCAACTCTTTGTTTGTTATTAAACATCTCCTCTTTCTTGTTTTAATTT
ATAAATGTTTCGGT

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR2GN49JQ 516 0 0
GG
GCAATATCATTTCAACCTTATCCTCCTCTACTCAAAAAGACATTCACGGCGATGGCGTCG
CTTTTACTCGTAGCTCCTCCGCGAGTCATCACCGTCGCAACATCTCCGAGGTTATCATCA
TCATCTCACTCGGAAACTCTCGGCGTCTCTTTCTCTTGCTTCACTCAGCAACTATCTCTC
TCCGCTTCGTCATCGTCCAGCTCAATTCCACTCGTGTACTGTGGCCGAGGTGACCGCAAA
ACAGCGAGAGGAAAGCGCTTTAATCACTCTTTCGGGAATGCGAGGCCACGGAACAAGAAT
AAAGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTCCCTCCTGCTCCACCGAGGAAGGATAAGTTT
GAGAACGACGAGAAGATCAAAATCGATATCGACGAGTCCCTCTTCTCCAACTAGAGTCTT
TCCTTCACTTCTTGTCACTGTAATTCTATTCGAACAGATGCTGCAACTCTTTGTTTGTTA
TTAAACATCTCCTCTTTCTTGTTTTAATTGATAA

QA 3 516 3 516
DS 

RD RR2GN49TF 516 0 0
GG
GCAATATCATTTCAACCTTATCCTCCTCTACTCAAAAAGACATTCACGGCGATGGCGTCG
CTTTTACTCGTAGCTCCTCCGCGAGTCATCACCGTCGCAACATCTCCGAGGTTATCATCA
TCATCTCACTCGGAAACTCTCGGCGTCTCTTTCTCTTGCTTCACTCAGCAACTATCTCTC
TCCGCTTCGTCATCGTCCAGCTCAATTCCACTCGTGTACTGTGGCCGAGGTGACCGCAAA
ACAGCGAGAGGAAAGCGCTTTAATCACTCTTTCGGGAATGCGAGGCCACGGAACAAGAAT
AAAGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTCCCTCCTGCTCCACCGAGGAAGGATAAGTTT
GAGAACGACGAGAAGATCAAAATCGATATCGACGAGTCCCTCTTCTCCAACTAGAGTCTT
TCCTTCACTTCTTGTCACTGTAATTCTATTCGAACAGATGCTGCAACTCTTTGTTTGTTA
TTAAACATCTCCTCTTTCTTGTTTTAATTGATAA

QA 3 516 3 516
DS 

RD RR2H657TF 524 0 0
GG
AATATCATTTCAACCTTATCCTCCTCTACTCAAAAAGACATTCACGGCGATGGCGTCGCT
TTTACTCGGAGCTCCTCCGCGAGTCATCACCGTCGCAACATCTCCGAGGTTATTATCATC
ATCTCACTCGGAAACTCTCGGCGTCTCTTTCTCTTGCTTCACTCAGCAACTATCTCTCTC
CGCTTCGTCATCATCCAGCTCAATTCCACTCGTGTACTGTGGCCGAGGTGACCGCAAAAC
AGCGAGAGGAAAGCGCTTTAATCACTCTTTCGGGAATGCGAGGCCACGGAACAAGAATAA
AGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTCCCTCCTGCTCCACCGAGGAAGGATAAGTTTGA
GAACGACGAGAAGATCAAAATCGATATCGACGAGTCCCTCTTCTCCAACTAGAGTCTTTC
CTTCACTTCTTGTCACTGTAATTCTATTCGAACAGATGCTGCAACTCTTTGTTTGTTATT
AAACATCTCCTCTTTCTTGTTTTAATTGATAAATGTTTCGG
C

QA 3 523 3 523
DS 

RD RR2DU35TF 528 0 0
GGAAGCAATATCATTTCAACCTTATCCTCCTCTACTCAAAAAGACATTCACGGCGATGGC
GTCGCTTTTACTCGGAGCTCCTCCGCGAGTCATCACCGTCGCAACATCTCCGAGGTTATT
ATCATCATCTCACTCGGAAACTCTCGGCGTCTCTTTCTCTTGCTTCACTCAGCAACTATC
TCTCTCCGCTTCGTCATCATCCAGCTCAATTCCACTCGTGTACTGTGGCCGAGGTGACCG
CAAAACAGCGAGAGGAAAGCGCTTTAATCACTCTTTCGGGAATGCGAGGCCACGGAACAA
GAATAAAGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTCCCTCCTGCTCCACCGAGGAAGGATAA
GTTTGAGAACGACGAGAAGATCAAAATCGATATCGACGAGTCCCTCTTCTCCAACTAGAG
TCTTTCCTTCACTTCTTGTCACTGTAATTCTATTCGAACAGATGCTGCAACTCTTTGTTT
GTTATTAAACATCTCCTCTTTCTTGTTTTAATTTATAAATGTTTCGGT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2FK36TF 528 0 0
GGAAGCAATATCATTTCAACCTTATCCTCCTCTACTCAAAAAGACATTCACGGCGATGGC
GTCGCTTTTACTCGGAGCTCCTCCGCGAGTCATCACCGTCGCAACATCTCCGAGGTTATT
ATCATCATCTCACTCGGAAACTCTCGGCGTCTCTTTCTCTTGCTTCACTCAGCAACTATC
TCTCTCCGCTTCGTCATCATCCAGCTCAATTCCACTCGTGTACTGTGGCCGAGGTGACCG
CAAAACAGCGAGGGGAAAGCGCTTTAATCACTCTTTCGGGAATGCGAGGCCACGGAACAA
GAATAAAGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTCCCTCCTGCTCCACCGAGGAAGGATAA
GTTTGAGAACGACGAGAAGATCAAAATCGATATCGACGAGTCCCTCTTCTCCAACTAGAG
TCTTTCCTTCACTTCTTGTCACTGTAATTCTATTCGAACAGATGCTGCAACTCTTTGTTT
GTTATTAAACATCTCCTCTTTCTTGTTTTAATTGATAAATGTTTCGGT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2CZ13TF 529 0 0
G
GGAAGCAATATCATTTCAACCTTATCCTCCTCTACTCAAAAAGACATTCACGGCGATGGC
GTCGCTTTTACTCGGAGCTCCTCCGCGAGTCGTCACCGTCGCAACATCTCCGAGGTTATT
ATCATCATCTCACTCGGAAACTCTCGGCGTCTCTTTCTCTTGCTTCACTCAGCAACTATC
TCTCTCCGCTTCGTCATCATCCAGCTCAATTCCACTCGTGTACTGTGGCCGAGGTGACCG
CAAAACAGCGAGAGGAAAGCGCTTTAATCACTCTTTCGGGAATGCGAGGCCACGGAACAA
GAATAAAGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTCCCTCCTGCTCCACCGAGGAAGGATAA
GTTTGAGAACGACGAGAAGATCAAAATCGATATCGACGAGTCCCTCTTCTCCAACTAGAG
TCTTTCCTTCACTTCTTGTCACTGTAATTCTATTCGAACAGATGCTGCAACTCTTTGTTT
GTTATTAAACATCTCCTCTTTCTTGTTTTAATTGATAAATGTTTCGGT

QA 2 529 2 529
DS 

RD RR2DC33TF 530 0 0
G
GGAAGCAATATCATTTCAACCTTATCCTCCTCTACTCAAAAAGACATTCACGGCGATGGC
GTCGCTTTTACTCGGAGCTCCTCCGCGAGTCATCACCGTCGCAACATCTCCGAGGTTATT
ATCATCATCTCACTCGGAAACTCTCGGCGTCTCTTTCTCTTGCTTCACTCAGCAACTATC
TCTCTCCGCTTCGTCATCATCCAGCTCAATTCCACTCGTGTACTGTGGCCGAGGTGACCG
CAAAACAGCGAGAGGAAAGCGCTTTAATCACTCTTTCGGGAATGCGAGGCCACGGAACAA
GAATAAAGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTCCCTCCTGCTCCACCGAGGAAGGATAA
GTTTGAGAACGACGAGAAGATCAAAATCGATATCTACGAGTCCCTCTTCTCCAACTAGAG
TCTTTCCTTCACTTCTTGTCACTGTAATTCTATTCGAACAGATGCTGCAACTCTTTGTTT
GTTATTAAACATCTCCTCTTTCTTGTTTTAATTGATAAATGTTTCGGT
G

QA 2 529 2 529
DS 

RD RR2EH41TF 560 0 0
GG
GCAATATCATTTCAACCTTATCCTCCTCTACTCAAAAAGACATTCACGGCGATGGCGTCG
CTTTTACTCGGAGCTCCTCCGCGAGTCATCACCGTCGCAACATCTCCGAGGTTATTATCA
TCATCTCACTCGGAAACTCTCGGCGTCTCTTTCTCTTGCTTCACTCAGCAACTCTCTCTC
TCCACTTCGTCATCATCCAGCTCAATTCCACTCGTGTACTGTGGCCGAGGTGACCGCAAA
ACAGCGAGAGGAAAGCGCTTTAATCACTCTTTCGGGAATGCGAGGCCACGGAACAAGAAT
AAAGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTCCCTCCTGCTCCACCGAGGAAGGATAAGTTT
GAGAACGACGAGAAGATCAAAATCGATATCGACGAGTCCCTCTTCTCCAACTAGAGTCTT
TCCTTCACTTCTTGTCACTGTAATTCTATTCGAACAGATGCTGCAACTCTTTGTTTGTTA
TTAAACATCTCCTCTTTCTTGTTTTAATTGATAAATGTTTCGGTAATATGAGTGATTGAG
TCTTAACTTCGTTTTATT

QA 3 560 3 560
DS 

RD RR2F019JQ 596 0 0
GG
AATATCATTTCAACCTTATCCTCCTCTACTCAAAAAGACATTCACGGCGATGGCGTCGCT
TTTACTCGGAGCTCCTCCGCGAGTCATCACCGTCGCAACATCTCCGAGGTTATTATCATC
ATCTCACTCGGAAACTCTCGGCGTCTCTTTCTCTTGCTTCACTCAGCAACTATCTCTCTC
CGCTTCGTCATCATCCAGCTCAATTCCACTCGTGTACTGTGGCCGAGGTGACCGCAAAAC
AGCGAGAGGAAAGCGCTTTAATCACTCTTTCGGGAATGCGAGGCCACGGAACAAGAATAA
AGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTCCCTCCTGCTCCACCGAGGAAGGATAAGTTTGA
GAACGACGAGAAGATCGAAATCGATATCGACGAGTCCCTCTTCTCCAACTAGAGTCTTTC
CTTCACTTCTTGTCACTGTAATTCTATTCGAACAGATGCTGCAACTCTTTGTTTGTTATT
AAACATCTCCTCTTTCTTGTTTTAATTGATAAATGTTTCGGTAATATGAGTGATTGAGTC
TTAACTTCGTTTTATTAAAGAAAATCTAAAGAAAGTGTAGACATTGAAAGATTT

QA 3 596 3 596
DS 

RD RR2F019TF 596 0 0
GG
AATATCATTTCAACCTTATCCTCCTCTACTCAAAAAGACATTCACGGCGATGGCGTCGCT
TTTACTCGGAGCTCCTCCGCGAGTCATCACCGTCGCAACATCTCCGAGGTTATTATCATC
ATCTCACTCGGAAACTCTCGGCGTCTCTTTCTCTTGCTTCACTCAGCAACTATCTCTCTC
CGCTTCGTCATCATCCAGCTCAATTCCACTCGTGTACTGTGGCCGAGGTGACCGCAAAAC
AGCGAGAGGAAAGCGCTTTAATCACTCTTTCGGGAATGCGAGGCCACGGAACAAGAATAA
AGGAAGAGGGCCACAGAGAGTTCCTGTCCCTCCTGCTCCACCGAGGAAGGATAAGTTTGA
GAACGACGAGAAGATCGAAATCGATATCGACGAGTCCCTCTTCTCCAACTAGAGTCTTTC
CTTCACTTCTTGTCACTGTAATTCTATTCGAACAGATGCTGCAACTCTTTGTTTGTTATT
AAACATCTCCTCTTTCTTGTTTTAATTGATAAATGTTTCGGTAATATGAGTGATTGAGTC
TTAACTTCGTTTTATTAAAGAAAATCTAAAGAAAGTGTAGACATTGAAAGATTT

QA 3 596 3 596
DS 



AS 2 13

CO CL303Contig1 912 11 11 U
GGATCTGCCTCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAAAT
GGCTTTCTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGTGCGGTTTCTCAGACCGGTAA
TGTTCCAGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTCTCCGCTACATGTCGACCAAGCTTTTTGTCGG
TGGTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGTCATTGAGGGAGGCTTTTTCCAACTTTGGTGA
AGTGATTGACTCTAAGGTCATCGTTGATAGAGAAACTGGAAGGTCAAGGGGTTTTGGATT
TGTCAATTTCTCTGATGAGAGTGCTGCTAATGCTGCCATTTCCGAGATGGACGGAAAGGA
ACTGAATGGACGCAACATCCGAGTGAATGTTGCCAACGATAGACCAAGTGCTCCACGGGC
TTATGGAGGTGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTGGCTA
TGGAGGAGGTGGTGATGGTGGTTACTAAACAGGGGAGCTTCTTGTGAAAAGAAGAATTGA
TCCTTCTGTTTGTTTTGGACTTCCGCTGCTTGTTTTAAAAATTAAATTGAGTCTGGTGTT
TGTACCAAACTTTAATAGGATTTGTTTGAAACTCTTAAGTCATTACTCTTATCTAAGAGA
CGCCTTTTCACTCCGTTTGTGTTTGCTTCTAATATTGCCCGTGAATATCTCTCGAGGGAA
TCTGAATTGAGAATATGAGAAATTGTCATCTGTTTTAGAATTATAGTTCAACTGTTTGAT
TTTGACATTTACAAAGAGGAAGGTGTGAATTTTGTAAGAGGAAGTGTATTCTTCATTCTG
AATTTGCCTCTGTCAAAAGGATCCGAAGGATGTTGTCTTTTCGATATTGGGTTCAAGATC
AATGTATTTGAG


BQ
35 35 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 15 15 15 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV36TF U -2
AF RR2D183TF U 1
AF RR2FW13TF U 1
AF RR2GH45TF U 1
AF RR2AR02TF U 1
AF RR2AR02JQ C 10
AF RR2EE46TF U 1
AF RR2BG47TF U 1
AF RR2FW13JQ C 41
AF RR2GH45JQB C 139
AF RR2BG47JQ C 176
BS 1 63 RR2AR02TF
BS 64 64 RR2BG47TF
BS 65 100 RR2AR02TF
BS 101 101 RR2BG47TF
BS 102 436 RR2AR02TF
BS 437 437 RR2BG47TF
BS 438 533 RR2AR02TF
BS 534 536 RR2BG47TF
BS 537 669 RR2AR02TF
BS 670 780 RR2BG47TF
BS 781 912 RR2BG47JQ

RD RR2GV36TF 497 0 0
GGGGC
ATCTGCCTCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAAATGG
CTTTCTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGTGCGGTTTCTCAGACCGGTAATG
TTCCAGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTCTCCGCTACATGTCGACCAAGCTTTTTGTCGGTG
GTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGTCATTGAGGGAGGCTTTTTCCAACTTTGGTGAAG
TGATTGACTCTAAGGTCATCGTTGATAGAGAAACTGGAAGGTCAAGGGGTTTTGGATTTG
TCAATTTCTCTGATGAGAGTGCTGCTAATGCTGCCATTTCCGAGATGGACGGAAAGGAAC
TGAATGGACGCAACATCCGAGTGAATGTTGCCAACGATAGACCAAGTGCTCCACGGGCTT
ATGGAGGTGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTGGCTATG
GAGGAGGTGGTG

QA 6 497 6 497
DS 

RD RR2D183TF 526 0 0
GGATCTGCCTCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAAAT
GGCTTTCTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAATGTGCGGTTTCTCAGACCGGTAA
TGTTCCAGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTCTCCGCTACATGTCGACCAAGCTTTTTGTCGG
TGGTCTCTCATGGGGTACT**CGACCAGTCATTGAGGGAAGCTTTTTCCAACTTTGGTGA
AGTGATTGACTCTAAGGTCATCGTTGATAGAGAAACTGGAAGGTCAAGGGGTTTTGGATT
TGTCAATTTCTCTGATGAGAGTGCTGCTAATGCTGCCATTTCCGAGATGGACGGAAAGGA
ACTGAATGGACGCAACATCCGAGTGAATGTTGCCAACGATAGACCAAGTGCTCCACGGGC
TTATGGAGGTGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTGGCTA
TGGAGGAG*TGGTGATGGTGGTTACTAAACAGGGGAGCTTCTTGTG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2FW13TF 509 0 0
GGATCTGCCTCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAAAT
GGCTTTCTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGTGCGGTTTCTCAGACCGGTAA
TGTTCCAGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTCTCCGCTACATGTCGACCAAGCTTTTTGTCGG
TGGTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGTCATTGAGGGAGGCTTTTTCCAACTTTGGTGA
AGTGATTGACTCTAAGGTCATCGTTGATAGAGAAACTGGAAGGTCAAGGGGTTTTGGATT
TGTCAATTTCTCTGATGAGAGTGCTGCTAATGCTGCCATTTCCGAGATGGACGGAAAGGA
ACTGAATGGACGCAACATCCGAGTGAATGTTGCCAACGATAGACCAAGTGCTCCACGGGC
TTATGGAGGTGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTGGCTA
TGGAGGAGGTGGTGATGGTGGTTACTAAA

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2GH45TF 510 0 0
GGATCTGCCTCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAAAT
GGCTTTCTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGTGCGGTTTCTCAGACCGGTAA
TGTTCCAGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTCTCCGCTACATGTCGACCAAGCTTTTTGTCGG
TGGTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGTCATTGAGGGAGGCTTTTTCCAACTTTGGTGA
AGTGATTGACTCTAAGGTCATCGTTGATAGAGAAACTGGAAGGTCAAGGGGTTTTGGATT
TGTCAATTTCTCTGATGAGAGTGCTGCTAATGCTGCCATTTCCGAGATGGACGGAAAGGA
ACTGAATGGACGCAACATCCGAGTGAATGTTGCCAACGATAGACCAAGTGCTCCACGGGC
TTATGGAGGTGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTGGCTA
TGGAGGAGGTGGTGATGGTGGTTACTAAAC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2AR02TF 669 0 0
GGATCTGCCTCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAAAT
GGCCTTCTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGTTCGGTTTCTCAGACCGGTAA
TGTTCCAGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTCTCCGCTACATGTCGACCAAGCTTTTTGTCGG
TGGTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGTCATTGAGGGAGGCTTTTTCCAACTTTGGTGA
AGTGATTGACTCTAAGGTCATCGTTGATAGAGAAACTGGAAGGTCAAGGGGTTTTGGATT
TGTCAATTTCTCTGATGAGAGTGCTGCTAATGCTGCCATTTCCGAGATGGACGGAAAGGA
ACTGAATGGACGCAACATCCGAGTGAATGTTGCCAACGATAGACCAAGTGCTCCACGGGC
TTATGGAGGTGGTGGTAGCTACGGTGGAGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTGGCTA
TGGAGGAGGTGGTGATGGTGGTTACTAAACAGGGGAGCTTCTTGTGAAAAGAA***TTGA
TCCTTCTGTTTGTTTTGGACTTCCGCTGCTTGTTTTAAAAATTAAATTGAGTCTGGTGTT
TGTACCAAACTTTAATAGGATTTGTTTGAAACTCTTAAGTCATTACTCTTATCTAAGAGA
CGCCTTTTC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2AR02JQ 660 0 0
TCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAAATGGCCTTCTG
CAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGTTCGGTTTCTCAGACCGGTAATGTTCCAGT
TCAGTCTATGCTCGGTTCTTTCCGCTACATGTCGACCAAGCTTTTTGTCGGTGGTCTCTC
ATGGGGTACTGACGACCAGTCATTGAGGGAGGCTTTTTCCAACTTTGGTGAAGTGATTGA
CTCTAAGGTCATCGTTGATAGAGAAACTGGAAGGTCAAGGGGTTTTGGATTTGTCAATTT
TTTTGATGAGAGTGCTGCTAATGCTGCCATTTCCGAGATGGACGGAAAGGAACTGAATGG
ACGCAACATCCGAGTGAATGTTGCCAACGATAGACCAAGTGCTCCACGGGCTTATGGAGG
TGGTGGTAGCTACGGTGGAGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTGGCTATGGAGGAGG
TGGTGATGGTGGTTACTAAACAGGGGAGCTTCTTGTGAAAAGAA***TTGATCCTTCTGT
TTGTTTTGGACTTCCGCTGCTTGTTTTAAAAATTAAATTGAGTCTGGTGTTTGTACCAAA
CTTTAATAGGATTTGTTTGAAACTCTTAAGTCATTACTTTTATTTAAGAGACGCCTTTTC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2EE46TF 721 0 0
GGATCTGCCTCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAAAT
GGCTTTCTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGTGCGGTTTCTCAGACCGGTAA
TGTTCCAGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTCTCCGCTACATGTCGACCAAGCTTTTTGTCGG
TGGTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGTCATTGAGGGAGGCTTTTTCCAACTTTGGTGA
AGTGATTGACTCTAAGGTCATCGGTGATAGAGAAACTGGAAGGTCAAGGGGTTTTGGATT
TGTCAATTTCTCTGATGAGAGTGCTGCTAATGCTGCCATTTCCGAGATGGACGGAAAGGA
ACTGAATGGACGCAACATCCGAGTGAATGTTGCCAACGATAGACCAAGTGCTCCACGGGC
TTATGGAGGTGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTGGCTA
TGGAGGAGGTGGTGATGGTGGTTACTAAACAGGGGAGCTTCTTGTGAAAAGAAGAATTGA
TCCTTCTGTTTGTTTTGGACTTCCGCTGCTTGTTTTAAAAATTAAATTGAGTCTGGTGTT
TGTACCAAACTTTAATAGGATTTGTTTGAAACTCTTAAGTCATTACTCTTATCTAAGAGA
CGCCTTTTCGCTCCGTTTGTGTTTGCTTCTAATATTGCCCGTGA*TATCTCTCGAGGGA
TC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2BG47TF 780 0 0
GGATCTGCCTCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAAAT
GGCTTTCTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGTGCGGTTTCTCAGACCGGTAA
TGTTCCAGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTCTCCGCTACATGTCGACCAAGCTTTTTGTCGG
TGGTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGTCATTGAGGGAGGCTTTTTCCAACTTTGGTGA
AGTGATTGACTCTAAGGTCATCGTTGATAGAGAAACTGGAAGGTCAAGGGGTTTTGGATT
TGTCAATTTCTCTGATGAGAGTGCTGCTAATGCTGCCATTTCCGAGATGGACGGAAAGGA
ACTGAATGGACGCAACATCCGAGTGAATGTTGCCAACGATAGACCAAGTGCTCCACGGGC
TTATGGAGGTGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTGGCTA
TGGAGGAGGTGGTGATGGTGGTTACTAAACAGGGGAGCTTCTTGTGAAAAGAAGAATTGA
TCCTTCTGTTTGTTTTGGACTTCCGCTGCTTGTTTTAAAAATTAAATTGAGTCTGGTGTT
TGTACCAAACTTTAATAGGATTTGTTTGAAACTCTTAAGTCATTACTCTTATCTAAGAGA
CGCCTTTTCACTCCGTTTGTGTTTGCTTCTAATATTGCCCGTGAATATCTCTCGAGGGAA
TCTGAATTGAGAATATGAGAAATTGTCATCTGTTTTAGAATTATAGTTCAACTGTTTGAT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2FW13JQ 699 0 0
AAGCTTTACTCCCCAGAAATGGCTTTCTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGT
GCGGTTTCTCAGACCGGTAATGTTCCAGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTCTCCGCTACATG
TCGACCAAGCTTTTTGTCGGTGGTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGTCATTGAGGGAG
GCTTTTTCCAACTTTGGTGAAGTGATTGACTCTAAGGTCATCGTTGATAGAGAAACTGGA
AGGTCAAGGGGTTTTGGATTTGTCAATTTCTCTGATGAGAGTGCTGCTAATGCTGCCATT
TCCGAGATGGACGGAAAGGAACTGAATGGACGCAACATCCGAGTGAATGTTGCCAACGAT
AGACCAAGTGCTCCACGGGCTTATGGAGGTGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGCTAC
GGTGGAGGTGGTGGTGGCTATGGAGGAGGTGGTGATGGTGGTTACTAAACAGGGGAGCTT
CTTGTGAAAAGAAGAATTGATCCTTCTGTTTGTTTTGGACTTCCGCTGCTTGTTTTAAAA
ATTAAATTGAGTCTGGTGTTTGTACCAAACTTTAATAGGATTTGTTTGAAACTCTTAAGT
CATTACCCTTATCTAAGAGACGCCTTTTCACTCCGTTTGTGTTTGCTTCTAATATTGCCC
GTGAGTATCTCTCGAGGGAATCTGAATTGAGAATATGAG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2GH45JQB 601 0 0
GCTCGGTTCTCTCCGCTACATGTCGACCAAGCTTTTTGTCGGTGGTCTCTCATGGGGTAC
TGACGACCAGTCATTGAGGGAGGCTTTTTCCAACTTTGGTGAAGTGATTGACTCTAAGGT
CATCGTTGATAGAGAAACTGGAAGGTCAAGGGGTTTTGGATTTGTCAATTTCTCTGATGA
GAGTGCTGCTAATGCTGCCATTTCCGAGATGGACGGAAAGGAACTGAATGGACGCAACAT
CCGAGTGAATGTTGCCAACGATAGACCAAGTGCTCCACGGGCTTATGGAGGTGGTGGTGG
CTACGGTGGAGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTGGCTATGGAGGAGGTGGTGATGG
TGGTTACTAAACAGGGGAGCTTCTTGTGAAAAGAAGAATTGATCCTTCTGTTTGTTTTGG
ACTTCCGCTGCTTGTTTTAAAAATTAAATTGAGTCTGGTGTTTGTACCAAACTTTAATAG
GATTTGTTTGAAACTCTTAAGTCATTACCCTTATCTAAGAGACGCCTTTTCACTCCGTTT
GTGTTTGCTTCTAATATTGCCCGTGAGTATCTCTCGAGGGAATCTGAATTGAGAATATGA
G

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2BG47JQ 737 0 0
GTCGGTGGTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGTCATTGAGGGAGGCTTTTTCCAACTTT
GGTGAAGTGATTGACTCTAAGGTCATCGTTGATAGAGAAACTGGAAGGTCAAGGGGTTTT
GGATTTGTCAATTTCTCTGATGAGAGTGCTGCTAATGCTGCCATTTCCGAGATGGACGGA
AAGGAACTGAATGGACGCAACATCCGAGTGAATGTTGCCAACGATAGACCAAGTGCTCCA
CGGGCTTATGGAGGTGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGT
GGCTATGGAGGAGGTGGTGATGGTGGTTACTAAACAGGGGAGCTTCTTGTGAAAAGAAGA
ATTGATCCTTCTGTTTGTTTTGGACTTCCGCTGCTTGTTTTAAAAATTAAATTGAGTCTG
GTGTTTGTACCAAACTTTAATAGGATTTGTTTGAAACTCTTAAGTCATTACTCTTATCTA
AGAGACGCCTTTTCACTCCGTTTGTGTTTGCTTCTAATATTGCCCGTGAATATCTCTCGA
GGGAATCTGAATTGAGAATATGAGAAATTGTCATCTGTTTTAGAATTATAGTTCAACTGT
TTGATTTTGACATTTACAAAGAGGAAGGTGTGAATTTTGTAAGAGGAAGTGTATTCTTCA
TTCTGAATTTGCCTCTGTCAAAAGGATCCGAAGGATGTTGTCTTTTCGATATTGGGTTCA
AGATCAATGTATTTGAG

QA 1 737 1 737
DS 



CO CL303Contig2 657 2 2 U
GGATCTGCCTCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAATG
GCTTTTTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGTGCGGTTTCTCAGACTGGTAAT
GTTCCGGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTCTCCGCTACATGTCTACCAAGCTTTTTGTCGGT
GGTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGTCATTGAGGGAGGCTTTTTCCAACTTTGGTGAA
GTGATTGACTCTAAGGTCATCGTTGATAGAGAAACCGGGAGGTCGAGGGGTTTTGGATTT
GTCAACTTCTCTGATGAGAGTGCTGCTAATGCTGCCATTTCTGAGATGGACGGAAAGGAA
CTGAATGGACGCAACATCCGAGTGAATGTTGCCAACGATAGACCAAGTGCTCCACGGGCT
TATGGTGGAGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTGGCTATGGAGGAGGTGGTGATGGT
GGTTACTAAACAGGGGAGCTTCTTGTGAAAAGAAGAATTGATCCTTCTGTTTGTTTTGGA
CTTCCGCTTGTTGTTTTAAAAATTAAATTGAGTCTGGTGTTTGTACCAAACCTTAATAGG
ATTTGTTTGAAACTCTTAAAGTCATTACTCTTATCTAAGAGACGCCTTTTCACTCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G254TF U 1
AF RR2G254JQ C 1
BS 1 455 RR2G254TF
BS 456 657 RR2G254JQ

RD RR2G254TF 465 0 0
GGATCTGCCTCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAATG
GCTTTTTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGTGCGGTTTCTCAGACTGGTAAT
GTTCCGGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTCTCCGCTACATGTCTACCAAGCTTTTTGTCGGT
GGTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGTCATTGAGGGAGGCTTTTTCCAACTTTGGTGAA
GTGATTGACTCTAAGGTCATCGTTGATAGAGAAACCGGGAGGTCGAGGGGTTTTGGATTT
GTCAACTTCTCTGATGAGAGTGCTGCTAATGCTGCCATTTCTGAGATGGACGGAAAGGAA
CTGAATGGACGCAACATCCGAGTGAATGTTGCCAACGATAGACCAAGTGCTCCACGGGCT
TATGGTGGAGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGG
TGGCTATGGA

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR2G254JQ 657 0 0
GGATCTGCCTCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAATG
GCTTTTTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGTGCGGTTTCTCAGACTGGTAAT
GTTCCGGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTCTCCGCTACATGTCTACCAAGCTTTTTGTCGGT
GGTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGTCATTGAGGGAGGCTTTTTCCAACTTTGGTGAA
GTGATTGACTCTAAGGTCATCGTTGATAGAGAAACCGGGAGGTCGAGGGGTTTTGGATTT
GTCAACTTCTCTGATGAGAGTGCTGCTAATGCTGCCATTTCTGAGATGGACGGAAAGGAA
CTGAATGGACGCAACATCCGAGTGAATGTTGCCAACGATAGACCAAGTGCTCCACGGGCT
TATGGTGGAGGTGGTGGCTACGGTGGAGGTGGTGGTGGCTATGGAGGAGGTGGTGATGGT
GGTTACTAAACAGGGGAGCTTCTTGTGAAAAGAAGAATTGATCCTTCTGTTTGTTTTGGA
CTTCCGCTTGTTGTTTTAAAAATTAAATTGAGTCTGGTGTTTGTACCAAACCTTAATAGG
ATTTGTTTGAAACTCTTAAAGTCATTACTCTTATCTAAGAGACGCCTTTTCACTCAC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 14

CO CL304Contig1 1119 14 24 U
GGGAGATACACCATGGATAAGATAACGACATTGCTCTTTCCCTTGTTCACTCTCCTCCTC
ACGACATCTTTGTCTAAAGATCTCTGTCACAAAGATGACGAAAACACCCTCCTCAAGATC
AAGAAATCCCTTAACAACCCTTACACCATCATCTCCTGGGACCCCAAAGACGACTGCTGT
ACCTGGGTCTCCGTTGAGTGCGGTGACTCTACTGTTAACCACCGTGTCATCTCCCTATAT
ATATCAGACGACGATGTCTCCGCTCAGATCCCGCCTGAAGTAGGCGACTTATCGTATCTA
CAAACCCTCATATTCCGCAAACTCCCTAACCTCACCGGTGAAATCCAACCTACCATCGCC
AAGCTCAAGTATCTTCGTTTTCTCTGGCTCAGCTGGACCAACCTGACCGGTCCGGTTCCT
GAATTTTTGAGTCAGCTCAAGGATCTAGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCT
GGTTCCATACCCGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCAGGATTCTTGAACTAAGCAGG
AACAAGGTTACAGGTTCAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGTGTTACCTCCT
GAGCTTTTTCTATCGCACAACAAGCTATCAGGTTCGATACCAAAATCACTAGGCAACCTG
GATTTTTACCGGATTGATTTCTCCCGTAACAAGCTAGAAGGTGATGCTTCAATGATGTTT
GGAGACAAAAAGACGTCATGGTCCATTGATTTATCGAGAAACAAGTTCCAGTTTGATATT
TCCAAGGTTAATGTGGCTACGACAGTTAATTACTTAGACTTGAATCACAATAGGATCACA
GGGAGTATCCCGGTTCAATGGACCGAGCTTACTCTTCAGTCTTTCAATGTTAGCTATAAC
AAACTTTGTGGACGCATCCCCCAGGGAGGTGACCTTCAGAGATTTGATGCTTACGCATAT
TTACACAACAAGTGCCTATGTGATGCACCTCTTCCGAGTTGCAACGTGAAGATTCAAGCA
ACCGATCTTTATTTAAACTTACCATCAGAATAAAATCATGCATAATGACATCTGTATGTT
ATATTCAAAATGATTAATAAAAATGAAAAAATTTTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 60 60 15 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 
50 50 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB74TF U 1
AF RR2DM75TF U 2
AF RR2EF56TF U 6
AF RR2FN07TF U 6
AF RR2H784TF U 8
AF RR2AB24TF U 6
AF RR2C230TF U 311
AF RR2AB24JQ C 429
AF RR2FN07JQ C 424
AF RR2H784JQB C 721
AF RR2DM75JQ C 429
AF RR2EB74JQ C 463
AF RR2EF56JQ C 447
AF RR2C230JQ C 698
BS 1 281 RR2EB74TF
BS 282 282 RR2DM75TF
BS 283 520 RR2EB74TF
BS 521 521 RR2DM75TF
BS 522 612 RR2EB74TF
BS 613 646 RR2DM75TF
BS 647 647 RR2AB24TF
BS 648 652 RR2DM75TF
BS 653 653 RR2AB24TF
BS 654 699 RR2DM75TF
BS 700 700 RR2C230TF
BS 701 705 RR2DM75TF
BS 706 710 RR2AB24TF
BS 711 711 RR2C230TF
BS 712 829 RR2AB24TF
BS 830 1009 RR2C230TF
BS 1010 1010 RR2FN07JQ
BS 1011 1013 RR2C230TF
BS 1014 1014 RR2FN07JQ
BS 1015 1054 RR2C230TF
BS 1055 1055 RR2FN07JQ
BS 1056 1080 RR2C230TF
BS 1081 1093 RR2FN07JQ
BS 1094 1119 RR2C230JQ

RD RR2EB74TF 612 0 0
GGGAGATACACCATGGATAAGATAACGACATTGCTCTTTCCCTTGTTCACTCTCCTCCTC
ACGACATCTTTGTCTAAAGATCTCTGTCACAAAGATGACGAAAACACCCTCCTCAAGATC
AAGAAATCCCTTAACAACCCTTACACCATCATCTCCTGGGACCCCAAAGACGACTGCTGT
ACCTGGGTCTCCGTTGAGTGCGGTGACTCTACTGTTAACCACCGTGTCATCTCCCTATAT
ATATCAGACGACGATGTCTCCGCTCAGATCCCGCCTGAAGTCGGCGACTTATCGTATCTA
CAAACCCTCATATTCCGCAAACTCCCTAACCTCACCGGTGAAATCCAACCTACCATCGCC
AAGCTCAAGTATCTTCGTTTTCTCTGGCTCAGCTGGACCAACCTGACCGGTCCGGTTCCT
GAATTTTTGAGTCAGCTCAAGGATCTAGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCT
GGTTCCATACCCGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCACGATTCTTGAACTAAGCAGG
AACAAGGTTACAGGTTCAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGTGTTACCTCCT
GAGCTTTTTCTA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2DM75TF 704 0 0
GGAGAT
ACACCATGGATAAGATAACGACATTGCTCTTTCCCTTGTTCACTCTCCTCCTCACGACAT
CTTTGTCTAAAGATCTCTGTCACAAAGATGACGAAAACACCCTCCTCAAGATCAAGAAAT
CCCTTAACAACCCTTACACCATCATCTCCTGGGATCCCAAAGACGACTGCTGTACCTGGG
TCTCCGTTGAGTGCGGTGACTCTACTGTTAACCACCGTGTCATCTCCCTATATATATCAG
ACGACGATGTCTCCTCTCAGATCCCTCCTGAAGTAGGTGACTTATCGTATCTACAAACCC
TTATATTCCGCAAACTCCCTAATCTCACCGGTGAAATCCAACCTACCATCGCCAAGCTCA
AGTATCTTCGTTTTCTCTGGCTCAGCTGGACCAACCTGACCGGTCCGGTTCCTGAATTTT
TGAGTCAGCTCAAGGATCTAGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCTGGTTCCA
TACCCGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCAGGATTCTTGAACTAAGCAGGAACAAGG
TTACAGGTTCAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGTGTTACCTCCTGAGCTTT
TTCTATCGCACAACAAGCTATCAGGTTCGATACCAAAATTACTAG*CAACCTGGATTTTT
ACCGGATTGATTTCTCCCGTAACAAGCTAGAATGTGAT

QA 7 704 7 704
DS 

RD RR2EF56TF 670 0 0
GG
ACACCATGGATAAGATAACGACATTGCTCTTTCCCTTGTTCACTCTCCTCCTCACGACAT
CTTTGTCTAAAGATCTCTGTCACAAAGATGACGAAAACACCCTCCTCAAGATCAAGAAAT
CCCTTAACAACCCTTACACCATCATCTCCTGGGACCCCAAAGACGACTGCTGTACCTGGG
TCTCCGTTGAGTGCGGTGACTCTACTGTTAACCACCGTGTCATCTCCCTATACATATCAG
ACGACGATGTCTCCGCTCAGATCCCGCCTGAAGTCGGCGACTTATCGTATCTACAAACCC
TCATATTCCGCAAACTCCCTAACCTCACCGGTGAAATCCAACCTACCATCGCCAAGCTCA
AGTATCTTCGTTTTCTCTGGCTCAGCTGGACCAACCCGACCGGTCCGGTTCCTGAATTTT
TGAGTCAGCTCAAGGATCTAGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCTGGTTCCA
TACCCGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCAGGATTCTTGAACTAAGCAGGAACAAGG
TTACAGGTTCAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGTGCTACCTCCTGAGCTTT
TTCTATCGCACAACAAGCTATCACGTTCGATACCAAAATCACTAG*CAACCTGGATTTTT
ACCGGATT

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR2FN07TF 689 0 0
GG
ACACCATGGATAAGATAACGACATTGCTCTTTCCCTTGTTCACTCTCCTCCTCACGACAT
CTTTGTCTAAAGATCTCTGTCACAAAGATGACGAAAACACCCTCCTCAAGATCAAGAAAT
CCCTTAACAACCCTTACACCATCATCTCCTGGGACCCCAAAGACGACTGCTGTACCTGGG
TCTCCGTTGAGTGCGGTGACTCTACTGTTAACCACCGTGTCATCTCCCTATATATATCAG
ACGACGATGTCTCCGCTCAGATCCCGCCTGAAGTCGGCGACTTATCGTATCTACAAACCC
TCATATTCCGCAAACTCCCTAACCTCACCGGTGAAATCCAACCTACCATCGCCAAGCTCA
AGTATCTTCGTTTTCTCTGGCTCAGCTGGACCAACCTGACCGGTCCGGTTCCTGAATTTT
TGAGTCAGCTCAAGGATCTAGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCTGGTTCCA
TACCCGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCAGGATTCTTGAACTAAGCAGGAACAAGG
TTGCAGGTTCAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGTGTTACCTCCTGAGCTTT
TTCTATCGCACAACAAGCTATCAGGTTCGATACCAAAATCACTAGGCAACCTGGATTTTT
ACCGGATTGATTTCTCCCGTAACAAGC

QA 3 689 3 689
DS 

RD RR2H784TF 724 0 0
GG
ACCATGGATAAGATAACGACATTGCTCTTTCCCTTGTTCACTCTCCTCCTCACGACATCT
TTGTCTAAAGATCTCTGTCACAAAGATGACGAAAACACCCTCCTCAAGATCAAGAAATCC
CTTAACAACCCTTACACCATCATCTCCTGGGATCCCAAAGACGACTGCTGTACCTGGGTC
TCCGTTGAGTGCGGTGACTCTACTGTTAACCACCGTGTCATCTCCCTATATATATCAGAC
GACGATGTCTCCTCTCAGATCCCTCCTGAAGTAGGTGACTTATCGTATCTACAAACCCTT
ATATTCCGCAAACTCCCTAATCTCACCGGTGAAATCCAACCTACCATCGCCAAGCTCAAG
TATCTTCGTTTTCTCTGGCTCAGCTGGACCAACCTGACCGGTCCGGTTCCTGAATTTTTG
AGTCAGCTCAAGGATCTAGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCTGGTTCCATA
CCCGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCAGGATTCTTGAACTAAGCAGGAACAAGGTT
ACAGGTTCAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGTGTTACCTCCTGAGCTTTTT
CTATCGCACAACAAGCTATCAGGTTCGATACCAAAATCACTAGGCAACCTGGATTTTTAC
CGGATTGATTTCTCCCGTAACAAGCTAGAA*GTGATGCTTCGATGACGTTTGGAGACAAA
AA

QA 3 724 3 724
DS 

RD RR2AB24TF 824 0 0
GG
ACACCATGGATAAGATAACGACATTGCTCTTTCCCTTGTTCACTCTCCTCCTCACGACAT
CTTTGTCTAAAGATCTCTGTCACAAAGATGACGAAAACACCCTCCTCAAGATCAAGAAAT
CCCTTAACAACCCTTACACCATCATCTCCTGGGATCCCAAAGACGACTGCTGTACCTGGG
TCTCCGTTGAGTGCGGTGACTCTACTGTTAACCACCGTGTCATCTCCCTATATATATCAG
ACGACGATGTCTCCTCTCAGATCCCTCCTGAAGTAGGTGACTTATCGTATCTACAAACCC
TTATATTCCGCAAACTCCCTAATCTCACCGGTGAAATCCAACCTACCATCGCCAAGCTCA
AGTATCTTCGTTTTCTCTGGCTCAGCTGGACCAACCTGACCGGTCCGGTTCCTGAATTTT
TGAGTCAGCTCAAGGATCTAGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCTGGTTCCA
TACCCGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCAGGATTCTTGAACTAAGCAGGAACAAGG
TTACAGGTTCAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGTGTTACCTCCTGAGCTTT
TTCTATCGCACAACAAGCTATCAGGTTCGATACCAAAATCACTAGGCAACCTGGATTTTT
ACCGGATTGATTTCTCCCGTAACAAGCTAGAAAGTGATGCTTCGATGATGTTTGGAGACA
AAAAGACGTCATGGTCCATTGATTTATCGAGAAACAAGTTCCAGTTTGATATTTCCAAGG
TTAATGTGGCTACGACAGTTAATTACTTAGACTTGAATCACA

QA 3 824 3 824
DS 

RD RR2C230TF 770 0 0
G
ATTCCGCAAACTCCCTAACCTCACCGGTGAAATCCAACCTACCATCGCCAAGCTCAAGTA
TCTTCGTTTTCTCTGGCTCAGCTGGACCAACCTGACCGGTCCGGTTCCTGAATTTTTGAG
TCAGCTCAAGGATCTAGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCTGGTTCCATACC
CGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCAGGATTCTTGAACTAAGCAGGAACAAGGTTAC
AGGTTCAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGTGTTACCTCCTGAGCTTTTTCT
ATCGCACAACAAGCTATCAGGTTCGATACCAAAATCACTAGGCAACCTGGATTTTTACCG
GATTGATTTCTCCCGTAACAAGCTAGAAGGTGATGCTTCAATGATGTTTGGAGACAAAAA
GACGTCATGGTCCATTGATTTATCGAGAAACAAGTTCCAGTTTGATATTTCCAAGGTTAA
TGTGGCTACGACAGTTAATTACTTAGACTTGAATCACAATAGGATCACAGGGAGTATCCC
GGTTCAATGGACCGAGCTTACTCTTCAGTCTTTCAATGTTAGCTATAACAAACTTTGTGG
ACGCATCCCCCAGGGAGGTGACCTTCAGAGATTTGATGCTTACGCATATTTACACAACAA
GTGCCTATGTGATGCACCTCTTCCGAGTTGCAACGTGA*GAT*CAAGCAACCGATCTTTA
TTTAAACTTACCATCAGAATAAA*TCATGCATAATGACATCTGTATGTT

QA 2 770 2 770
DS 

RD RR2AB24JQ 594 0 0
GAGTCAGCTCAAGGATCTAGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCTGGTTCCAT
ACCCGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCAGGATTCTTGAACTAAGCAGGAACAAGGT
TACAGGTTCAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGTGTTACCTCCTGAGCTTTT
TCTATCGCACAACAAGCTATCAGGTTCGATACCAAAATCACTAGGCAACCTGGATTTTTA
CCGGATTGATTTCTCCCGTAACAAGCTAGAAGGTGATGCTTCGATGATGTTTGGAGACAA
AAAGACGTCATGGTCCATTGATTTATCGAGAAACAAGTTCCAGTTTGATATTTCCAAGGT
TAATGTGGCTACGACAGTTAATTACTTAGACTTGAATCACAATAGGATCACAGGGAGTAT
CCCGGTTCAATGGACCGAGCTTACTCTTCAGTCTTTCAATGTTAGCTATAACAAACTTTG
TGGACGCATCCCCCAGGGAGGTGACCTTCAGAGATTTGATGCTTACGCATATTTACACAA
CAAGTGCCTATGTGATGCACCTCTTCCGAGTTGCAACGTGAAGATTCAAGCAAC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2FN07JQ 670 0 0
TTTTTGAGTCAGCTCAAGGATCTAGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCTGGT
TCCATACCCGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCAGGATTCTTGAACTAAGCAGGAAC
AAGGTTGCAGGTTCAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGTGTTACCTCCTGAG
CTTTTTCTATCGCACAACAAGCTATCAGGTTCGATACCAAAATCACTAGGCAACCTGGAT
TTTTACCGGATTGATTTCTCCCGTAACAAGCTAGAAGGTGATGCTTCAATGATGTTTGGA
GACAAAAAGACGTCATGGTCCATTGATTTATCGAGAAACAAGTTCCAGTTTGATATTTCC
AAGGTTAATGTGGCTACGACAGTTAATTACTTAGACTTGAATCACAATAGGATCACAGGG
AGTATCCCGGTTCAATGGACCGAGCTTACTCTTCAGTCTTTCAATGTTAGCTATAACAAA
CTTTGTGGACGCATCCCCCAGGGAGGTGACCTTCAGAGATTTGATGCTTACGCATATTTA
CACAACAAGTGCCTATGTGATGCACCTCTTCCGAGTTGCAACGTGAAGATTCAAGCAACC
GATCTTTATTTAAACTTACCATCAGAATAAAATCATGCATAATGACATCTGTATGTTATA
TTCAAAATGA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2H784JQB 373 0 0
GGAGACAAAAAGACGTCATGGTCCATTGATTTATCGAGAAACAAGTTCCAGTTTGATATT
TCCAAGGTTAATGTGGTTACGACGGTTAATTACTTAGACTTGAATCACAATAGGATCACA
GGGAGTATCCCGGTTCAATGGACCGAGCTTACTCTTCAGTCTTTCAATGTTAGCTATAAC
AAACTTTGTGGACGCATCCCCCAGGGAGGTGACCTTCAGAGATTTGATGCTTACGCATAT
TTACACAACAAGTGCCTATGTGATGCACCTCTTCCGAGTTGCAACGTGAAGATTCAAGCA
ACCGATCTTTATTTAAACTTACCATCAGAATAAAATCATGCATAATGACATCTGTATGGT
ATATTCAAAATGA

QA 1 373 1 373
DS 

RD RR2DM75JQ 665 0 0
GAGTCAGCTCAAGGATCTAGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCTGGTTCCAT
ACCCGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCAGGATTCTTGAACTAAGCAGGAACAAGGT
TACAGGTTCAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGTGTTACCTCCTGAGCTTTT
TCTATCGCACAACAAGCTATCAGGTTCGATACCAAAATTACTAGGCAACCTGGATTTTTA
CCGGATTGATTTCTCCCGTAACAAGCTAGAAGGTGATGCTTCGATGATGTTTGGAGACAA
AAAGACGTCATGGTCCATTGATTTATCGAGAAACAAGTTCCAGTTTGATATTTCCAATGT
TAATGTGGCTACGACAGTTAATTACTTAGACTTGAATCACAATAGGATCACAGGGAGTAT
CCCGGTTCAATGGACCGAGCTTACTCTTCAGTCTTTCAATGTTAGCTATAACCAACTTTG
TGGACGCATCCCCCAGGGAGGTGACCTTCAGAGATTTGATGCTTACGCATATTTACACAA
CAAGTGCCTATGTGATGCACCTCTTCCGAGTTGCAACGTGAAGATTCAAGCAACCGATCT
TTATTTAAACTTACCATCAGAATAAAATCATGCATAATGACATCTGTATGGTATATTCAA
AATGA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2EB74JQ 631 0 0
TCCTTCAATGACCTCTCTGGTTCCATACCCGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCAGG
ATTCTTGAACTAAGCAGGAACAAGGTTACAGGTTCAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTT
AAAGGAGTGTTACCTCCTGAGCTTTTTCTATCGCACAACAAGCTATCAGGTTCGATACCA
AAATCACTAGGCAACCTGGATTTTTACCGGATTGATTTCTCCCGTAACAAGCTAGAAGGT
GATGCTTCAATGATGTTTGGAGACAAAAAGACGTCATGGTCCATTGATTTATCGAGAAAC
AAGTTCCAGTTTGATATTTCCAAGGTTAATGTGGCTACGACAGTTAATTACTTAGACTTG
AATCACAATAGGATCACAGGGAGTATCCCGGTTCAATGGACCGAGCTTACTTTTCATTCT
TTCAATGTTAGCTATAACAAACTTTGTGGACGCATCCCCCAGGGAGGTGACCTTCAGAGA
TTTGATACTTACGCATATTTACACAACAAGTGCCTATGTGATGCACCTCTTCCGAGTTGC
AACGTGAAGATTCAAGCAACCGATCTTTATTTAAACTTACCATCAGAATAAAATCATGCA
TAATGACATCTGTATGTTATATTCAAAATGA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2EF56JQ 647 0 0
AGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCTGGTTCCATACCCGGTTCTCTCTCTTT
GTTACCTAAACTCAGGATTCTTGAACTAAGCAGGAACAAGGTTACAGGTTCAATACCAGA
GTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGTGCTACCTCCTGAGCTTTTTCTATCGCACAACAAGCT
ATCAGGTTCGATACCAAAATCACTAGGCAACCTGGATTTTTACCGGATTGATTTCTCCCG
TAACAAGCTAGAAGGTGATGCTTCAATGATGTTTGGAGACAAAAAGACGTCATGGTCCAT
TGATTTATCGAGAAACAAGTTCCAGTTTGATATTTCCAAGGTTAATGTGGCTACGACAGT
TAATTATTTAGACTTGAATCACAATAGGATCACAGGGAGTATCCCGGTTCAATGGACCGA
GCTTACTCTTCAGTCTTTCAATGTTAGCTATAACAAACTTTGTGGACGCATCCCCCAGGG
AGGTGACCTTCAGAGATTTGATGCTTACGCATATTTACACAACAAGTGCCTATGTGATGC
ACCTCTTCCGAGTTGCAACGTGAAGATTCAAGCAACCGATCTTTATTTAAACTTACCATC
AGAATAAAATCATGCATAATGACATCTGTATGTTATATTCAAAATGA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2C230JQ 422 0 0
AAGGTGATGCTTCAATGATGTTTGGAGACAAAAAGACGTCATGGTCCATTGATTTATCGA
GAAACAAGTTCCAGTTTGATATTTCCAAGGTTAATGTGGGTACGACAGTTAATTACTTAG
ACTTGAATCACAATAGGATCACAGGGAGTATCCCGGTTCAATGGACCGAGCTTACTTTTC
AGTTTTTCAATGTTAGCTATAACAAACTTTGTGGACGCATCCCCCAGGGAGGTGACCTTC
AGAGATTTGATGCTTACGCATATTTACACAACAAGTGCCTATGTGATGCACCTTTTCCGA
GTTGCAACGTGAAGATTCAAGCAACCGATTTTTATTTAAACTTACCATCAGAATAAAATC
ATGCATAATGACATCTGTATGTTATATTCAAAATGATTAATAAAAATGAAAAAATTTTAA
TT

QA 1 422 1 422
DS 



AS 1 12

CO CL305Contig1 1023 12 10 U
GGAAAAAGGTTAATTTATATTTTGATGATTATCCATAAGAACCCTTCAAACGCTCCTCCC
ACTCAAGTCTCTCGTATCCTCTGTCTCTTGCTCATACTCTAGGGTTCTTCAGCTTCCTCA
CTCCGATCCGTTCTTCTTGTTTAATCAATCTCAGGTAAAAGATGCAAGCTGCGATTCGTT
CGTTTGTGTCCGGTGGGAACGCTGTCAAAGCGTCTCTGGTGCAACATCTCCGTGTGATTA
ACCCGGCGATTCAGCCTTTTTCTGTGTTTGGCACACGCTCCGAGTCAACTCAGTCATCTC
GTATGGAGGAGCATGGGTTCGAGAGCA*CAACCATCTCTGACGTTATGAACGCCAAAGGC
AAAAGTGCTGACGGATCTTGGCTTTGGTGTACTACTGATGACACTGTTTATGACGCTGTT
AAATCCATGACACAACACAATGTTGGTGCGTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAG
TCTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGGAGA
TCATCCAAATCAACAAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTG
ACACCAGAGACCAAGGTGTTACGTGCTATGCAGCTAATGACTGATAACCGGATTAGGCAC
ATTCCAGTGATCAAAGACAAGGGTATGGTGGG*AATGGTGTCGATTGGAGATGTGGTCCG
TGCAGTGGTGACTGAGCATCGCGAGGAGCTTAACCGCCTAAACGCGTTTATCCAGGGAGG
TTACTAAAATTGCAGACTGGTAAAGAGAAGTGTTACTTCCCGTGTGTTATATCCACTGCT
TGATGATCCTCTAAAGCTCTAAGATCGAATGTAATATGAAATCTTCTATGATGTTTGTTG
TTGTTATTGTTGTTCTTGTTGTTGTCTGTCGTTTCCATTGGTTAACTTGTCAAGACTTGG
TTTTTGAGCTACTCTGCAAGTGAGATAATAAAACCAAAGGACTCTTCTCTCTTATTGAAT
ATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 60 30 30 30 60 60 30 30 30 30 60 30 60 60 30 30 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 45 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 45 60 45 60 60 60 60 60 60 
60 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2EA82TF U 1
AF RR2CN23TF U 63
AF RR2AB21TF U 63
AF RR2BZ03TF U 63
AF RR2EM64TF U 74
AF RR2BZ03JQ C 257
AF RR2EM64JQ C 260
AF RR2GO53JQ C 408
AF RR2AO11JQ C 314
AF RR2EE88JQ C 516
AF RR2AO11TF U 314
AF RR2EA82JQ C 268
BS 1 358 RR2EA82TF
BS 359 359 RR2AB21TF
BS 360 558 RR2EA82TF
BS 559 596 RR2AB21TF
BS 597 597 RR2CN23TF
BS 598 692 RR2AB21TF
BS 693 693 RR2CN23TF
BS 694 889 RR2AB21TF
BS 890 1012 RR2AO11TF
BS 1013 1023 RR2EA82JQ

RD RR2EA82TF 558 0 0
GGAAAAAGGTTAATTTATATTTTGATGATTATCCATAAGAACCCTTCAAACGCTCCTCCC
ACTCAAGTCTCTCGTATCCTCTGTCTCTTGCTCATACTCTAGGGTTCTTCAGCTTCCTCA
CTCCGATCCGTTCTTCTTGTTTAATCAATCTCAGGTAAAAGATGCAAGCTGCGATTCGTT
CGTTTGTGTCCGGTGGGAACGCTGTCAAAGCGTCTCTGGTGCAACATCTCCGTGTGATTA
ACCCGGCGATTCAGCCTTTTTCTGTGTTTGGCACACGCTCCGAGTCAACTCAGTCATCTC
GTATGGAGGAGCATGGGTTCGAGAGCA*CAACCATCTCTGACGTTATGAACGCCAAAGAC
AAAAGTGCTGACGGATCTTGGCTTTGGTGTACTACTGATGACACTGTTTATGACGCTGTT
AAATCCATGACACAACACAATGTTGGTGCGTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAG
TCTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGGAGA
TCATCCAAATCAACAAAA

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2CN23TF 676 0 0
GG
AAGTCTCTCGTATCCTCTGTCTCTTGCTCATACTCTAGGGTTCTTCAGCTTCCTCACTCC
GATCCGTTCTTCTTGTTTAATCAATCTCAGGTAAAAGATGCAAGCTGCGATTCGTTCGTT
TGTGTCCGGTGGGAACGCTGTCAAAGCGTCTCTGGTGCAACATCTCCGTGTGATTAACCC
GTCGATTCAGCCTTTTTCTGTGTTTGGCACACGCTCCGAGTCAACTCAGTCATCTCGTAT
GGAGGAGCATGGGTTCGAGAGCA*CAACCATCTCTGACGTTATGAACGCCAAAGGCAAAA
GTGCTGACGGATCTTGGCTTTGGTGTACTACTGATGACACTGTTTATGACGCTGTTAAAT
CCATGACACAACACAATGTTGGTGCGTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAGTCTC
TTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGGAGATCAT
CCAAATCAACAAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACAC
CAGAGACCAAGGTGTTACGTGCTATGCAGCTAATGACTGATAACCGGATTAGGCACATTC
CAGTGATCAAAGACAAGGGTATGGTGGG*AATGGTGTCGATTGGAGATGTGGTCCGTGCA
GTGGTGACTGAGCA

QA 3 676 3 676
DS 

RD RR2AB21TF 827 0 0
GG
AAGTCTCTCGTATCCTCTGTCTCTTGCTCATACTCTAGGGTTCTTCAGCTTCCTCACTCC
GATCCGTTCTTCTTGTTTAATCAATCTCAGGTAAAAGATGCAAGCTGCGATTCGTTCGTT
TGTGTCCGGTGGGAACGCTGTCAAAGCGTCTCTGGTGCAACATCTCCGTGTGATTAACCC
GGCGATTCAGCCTTTTTCTGTGTTTGGCACACGCTCCGAGTCAACTCAGTCATCTCGTAT
GGAGGAGCATGGGTTCGAGAGCA*CAACCATCTCTGACGTTATGAACGCCAAAGGCAAAA
GTGCTGACGGATCTTGGCTTTGGTGTACTACTGATGACACTGTTTATGACGCTGTTAAAT
CCATGACACAACACAATGTTGGTGCGTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAGTCTC
TTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGGAGATCAT
CCAAATCAACAAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACTGTGACAC
CAGAGACCAAGGTGTTACGTGCTATGCAGCTAATGACTGATAACCGGATTAGGCACATTC
CAGTGATCAAAGACAAGGGTATGGTGGGGAATGGTGTCGATTGGAGATGTGGTCCGTGCA
GTGGTGACTGAGCATCGCGAGGAGCTTAACCGCCTAAACGCGTTTATCCAGGGAGGTTAC
TAAAATTGCAGACTGGTAAAGAGAAGTGTTACTTCCCGTGTGTTATATCCACTGCTTGAT
GATCCTCTAAAGCTCTAAGATCGAATGTAATATGAAATCTTCTAT

QA 3 827 3 827
DS 

RD RR2BZ03TF 794 0 0
GG
AAGTCTCTCGTATCCTCTGTCTCTTGCTCATACTCTAGGGTTCTTCAGCTTCCTCACTCC
GATCCGTTCTTCTTGTTTAATCAATCTCAGGTAAAAGATGCAAGCTGCGATTCGTTCGTT
TGTGTCCGGTGGGAACGCTGTCAAAGCGTCTCTGGTGCAACATCTCCGTGTGATTAACCC
GGCGATTCAGCCTTTTTCTGTGTTTGGCACACGCTCCGAGTCAACTCAGTCATCTCGTAT
GGAGGAGCATGGGTTCGAGAGCA*CAACCATCTCTGACGTTATGAACGCCAAAGGCAAAA
GTGCTGACGGATCTTGGCTTTGGTGTACTACTGATGACACTGTTTATGACGCTGTTAAAT
CCATGACACAACACAATGTTGGTGCGTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAGTCTC
TTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGGAGATCAT
CCAAATCAACAAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACAC
CAGAGACCAAGGTGTTACGTGCTATGCAGCTAACGACTGGTAACCGGATTAGGCACATTC
CAGTGATCAAAGACAAGG*TATGGTGGG**ATGGTGTCGATTGGAGATGTGGTCCGTGCA
GTGGTGACTGAGCATCGCGAGGAGCT*AACCGCCTAAACTCGTTTATCCAGGGAG*TTAC
TAAA*TTGCAGACTGGTAAAGAGA*GTGT*ACTTCCCGTGTGT*ATATC*ACTGCTTGAT
GATC
TCTAAGCC

QA 3 786 3 786
DS 

RD RR2EM64TF 770 0 0
GG
ATCCTCTGTCTCTTGCTCATACTCTAGGGTTCTTCAGCTTCCTCACTCCGATCCGTTCTT
CTTGTTTAATCAATCTCAGGTAAAAGATGCAAGCTGCGATTCGTTCGTTTGTGTCCGGTG
GGAACGCTGTCAAAGCGTCTCTGGTGCAACATCTCCGTGTGATTAACCCGGCGATTCAGC
CTTTTTCTGTGTTTGGCACACGCTCCGAGTCAACTCAGTCATCTCGTATGGAGGAGCATG
GGTTCGAGAGCA*CAACCATCTCTGACGTTATGAACGCCAAAGGCAAAAGTGCTGACGGA
TCTTGGCTTTGGTGTACTACTGTTGACACTGTTTATGACGCTGTTAAATCCATGACACAA
CACAATGTTGGTGCGTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAGTCTCTTGCTGGTATC
ATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGGAGATCATCCAAATCAACA
AAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAG
GTGTTACGCGCTATGCAGCTAATGACTGATAACCGGATTAGGCACATTCCAGTGATCAAA
GACAAGGGTATGGTGGG*AATGGTGTCGATTGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACTGA
GCATCGCGAGGAGCTTAACCGCCTAAACGCGTTTATCCAGGGAGGT*ACTAAAATTGCAG
ACTGGTAAAGAGA*GTGTTACTTCCCGTGTGT*ATATCCACTGCTTGA

QA 3 770 3 770
DS 

RD RR2BZ03JQ 757 0 0
TTTTTCTGTGTTTGGCACACGCTCCGAGTCAACTCAGTCATCTCGTATGGAGGAGCATGG
GTTCGAGAGCA*CAACCATCTCTGACGTTATGAACGCCAAAGGCAAAAGTGCTGACGGAT
CTTGGCTTTGGTGTACTACTGATGACACTGTTTATGACGCTGTTAAATCCATGACACAAC
ACAATGTTGGTGCGTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAGTCTCTTGCTGGTATCA
TTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGGAGATCATCCAAATCAACAA
AAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAGG
TGTTACGTGCTATGCAGCTAACGACTGGTAACCGGATTAGGCACATTCCAGTGATCAAAG
ACAAGGGTATGGTGGG*AATGGTGTCGATTGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACTGAG
CATCGCGAGGAGCTTAACCGCCTAAACTCGTTTATCCAGGGAGGTTACTAAAATTGCAGA
CTGGTAAAGAGAAGTGTTACTTCCCGTGTGTTATATCCACTGCTTGATGATCCTCTAAAG
CCCTAAGATCGAATGTAATATGAAATCTTCTATGATGTTTGTTGTTGTTATTGTTGTTCT
TGTTGTTGTCTGTCGTTTCCATTGGTTAACTTGTCAAGACTTGGTTTTTGAGCTACTCTG
CAAGTGAGATAATAAAACCAAAGGACTCTTCTC
CCTC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2EM64JQ 754 0 0
TTCTGTGTTTGGCACACGCTCCGAGTCAACTCAGTCATCTCGTATGGAGGAGCATGGGTT
CGAGAGCA*CAACCATCTCTGACGTTATGAACGCCAAAGGCAAAAGTGCTGACGGATCTT
GGCTTTGGTGTACTACTGTTGACACTGTTTATGACGCTGTTAAATCCATGACACAACACA
ATGTTGGTGCGTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAGTCTCTTGCTGGTATCATTA
CAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGGAGATCATCCAAATCAACAAAAG
TAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAGGTGT
TACGCGCTATGCAGCTAATGACTGATAACCGGATTAGGCACATTCCAGTGATCAAAGACA
AGGGTATGGTGGG*AATGGTGTCGATTGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACTGAGCAT
CGCGAGGAGCTTAACCGCCTAAACGCGTTTATCCAGGGAGGTTACTAAAATTGCAGACTG
GTAAAGAGAAGTGTTACTTCCCGTGTGTTATATCCACTGCTTGATGATCCTCTAAAGCTC
TAAGATCGAGTGTAATATGAAATCTTCTATGATGTTTGTTGTTGTTATTGTTGTTCTTGT
TGTTGTCTGTCGTTTCCATTGGTTAACTTGTCAAGACTTGGTTTTTGAGCTACTCTGCAA
GTGAGATAATAAAACCAAAGGACTCTTCTCTCT
C

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2GO53JQ 610 0 0
TTATGACGCTGTTAAGTCCATGACACAACACAATGTTGGTGCGTTGGTGGTTGTGAAACC
TGGTGAGCAACAGTCTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCAT
AGTGCAAGGGAGATCATCCAAATCAACAAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAA
GCTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTTACGTGCTATGCAGCTAATGACTGATAA
CCGGATTAGGCACATTCCAGTGATCAAAGACAAGGGTATGGTGGG*AATGGTGTCGATTG
GAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACTGAGCATCGCGAGGAGCTTAACCGCCTAAACGCGT
TTATCCAGGGAGGTTACTAAAATTGCAGACTGGTAAAGAGAAGTGTTACTTCCCGTGTGT
TATATCCATTGCTTGATGATCCTCTAAAGCTCTAAGATCGAATGTAATATGAAATCTTCT
ATGATGTTTGTTGTTGTTATTGTTGTTCTTGTTGTTGTCTGTCGTTTCCATTGGTTAACT
TGTCAAGACTTGGTTTTTGAGCTACTCTGCAAGTGAGATAATAAAACCAAAGGACTCTTC
TCTCT
TATCG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2AO11JQ 700 0 0
GGAAGTCTCTCGTATCCTCTGTCTCTGACGTTATGAACGCCAAAGGCAAAAGTGCTGACG
GATCTTGGCTTTGGTGTACTACTGATGACACTGTTTATGACGCTGTTAAATCCATGACAC
AACACAATGTTGGTGCGTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAGTCTCTTGCTGGTA
TCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGGAGATCATCCAAATCAA
CAAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCA
AGGTGTTACGTGCTATGCAGCTAATGACTGATAACCGGATTAGGCACATTCCATTGATCA
AAGACAAGGGTATGGTGGG*AATGGTGTCGATTGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACT
GAGCATCGCGAGGAGCTTAACCGCCTAAACGCGTTTATCCAGGGAGGTTACTAAAATTGC
AGACTGGTAAAGAGAAGTGTTACTTCCCGTGTGTTATATCCACTGCTTGATGATCCTCTA
AAGCTCTAAGATCGAATGTAATATGAAATCTTCTATGATGTTTGTTGTTGTTATTGTTGT
TCTTGTTGTTGTCTGTCGTTTCCATTGGTTAACTTGTCAAGACTTGGTTTTTGAGCTACT
CTGCAAGTGAGATAATAAAACCAAAGGACTCTTCTCTCT
C

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2EE88JQ 497 0 0
GCGAAAGATCATAGTGCAAGGGAGATCATCCAAATCAACAAAAGTAGGAGACATTATGAC
TGAAGAGAATGAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTTACGTGCTATGCAGCT
AATGACTGATAACCGGATTAGGCACATTCCAGTGATCAAAGACAAGGGTATGGTGGG*AA
TGGTGTCGATTGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACTGAGCATCGCGAGGAGCTTAACC
GCCTAAACGCGTTTATCCAGGGAGGTTACTAAAATTGCAGACTGGTAAAGAGAAGTGTTA
CTTCCCGTGTGTTATATCCACTGCTTGATGATCCTCTAAAGCTCTAAGATCGAATGTAAT
ATGAAATCTTCTATGATGTTTGTTGTTGTTATTGTTGTTCTTGTTGTTGTCTGTCGTTTC
CATTGGTTAACTTGTCAAGACTTGGTTTTTGAGCTACTCTGCAAGTGAGATAATAAAACC
AAAGGACTCTTCTCTCT

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2AO11TF 700 0 0
GGAAGTCTCTCGTATCCTCTGTCTCTGACGTTATGAACGCCAAAGGCAAAAGTGCTGACG
GATCTTGGCTTTGGTGTACTACTGATGACACTGTTTATGACGCTGTTAAATCCATGACAC
AACACAATGTTGGTGCGTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAGTCTCTTGCTGGTA
TCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGGAGATCATCCAAATCAA
CAAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCA
AGGTGTTACGTGCTATGCAGCTAATGACTGATAACCGGATTAGGCACATTCCATTGATCA
AAGACAAGGGTATGGTGGG*AATGGTGTCGATTGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACT
GAGCATCGCGAGGAGCTTAACCGCCTAAACGCGTTTATCCAGGGAGGTTACTAAAATTGC
AGACTGGTAAAGAGAAGTGTTACTTCCCGTGTGTTATATCCACTGCTTGATGATCCTCTA
AAGCTCTAAGATCGAATGTAATATGAAATCTTCTATGATGTTTGTTGTTGTTATTGTTGT
TCTTGTTGTTGTCTGTCGTTTCCATTGGTTAACTTGTCAAGACTTGGTTTTTGAGCTACT
CTGCAAGTGAGATAATAAAACCAAAGGACTCTTCTCTCT
C

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2EA82JQ 756 0 0
TTGGCACACGCTCCGAGTCAACTCAGTCATCTCGTATGGAGGAGCATGGGTTCGAGAGCA
*CAACCATCTCTGACGTTATGAACGCCAAAGACAAAAGTGCTGACGGATCTTGGCTTTGG
TGTACTACTGATGACACTGTTTATGACGCTGTTAAATCCATGACACAACACAATGTTGGT
GCGTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAGTCTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGA
GATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGGAGATCATCCAAATCAACAAAAGTAGGAGAC
ATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTTACGTGCT
ATGCAGCTAATGACTGATAACCGGATTAGGCACATTCCAGTGATCAAAGACAAGGGTATG
GTGGG*AATGGTGTCGATTGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACTGAGCATCGCGAGGA
GCTTAGCCGCCTAAACGCGTTTATCCAGGGAGGTTACTAAAATTGCAGACTGGTAAAGAG
AAGTGTTACTTCCCGTGTGTTATATCCACTGCTTGATGATCCTCTAAAGCTCTAAGATCG
AATGTAATATGAAATCTTCTATGATGTTTGTTGTTGTTATTGTTGTTCTTGTTGTTGTCT
GTCGTTTCCATTGGTTAACTTGTCAAGACTTGGTTTTTGAGCTACTCTGCAAGTGAGATA
ATAAAACCAAAGGACTCTTCTCTCTTATTGAATATT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 3 13

CO CL306Contig1 1113 9 21 U
ACACTTGAAGCAAAAACATTGGCTTTAGATTACTTTGGTTTCGCCATTGAACCCATACAA
CAATCAAAGGGGAAAAATTATACAGAGAGATATTTTTACTTAAGATGTCTCTAAAACTCA
CTTTTCGCAAGTAAAGGAAAGAAGCACATTTAGAATGCAGAAATGTAGCATAGTGCAAAA
CAACTATAGTGGAGGGTAGAAATAGGAAGAGACTGAAAAGCCGAGGAAGAGTAAGCCCCC
AACAGTAGCGACCGTGCGTTGTGAGATCCTTGAAGCCAGCATGCTTCCTCCTACAACCGC
CAGCGATGTACAAATTGTGTGTCCTACTGATGCCCCTATCGCCACTCCTATAGCGTTCTT
GTGCGTCGCCAAAGCTATTGTTGCAATCTGGCTACGGTCTCCCCATTCGGCTAGAAAGGT
TAAGATGAAGGACTCTAGAAATATTGGGGTACAAAATCTTGAGAAAAAGCGACGGAAGGG
TGTCTTCCCTTGGCCTGACTCAAGCTTCTCCTCAACTTCCTCCATTTCCTTCTTCTGATT
CGACTTTGAATCAGATGACCTCCAAGCAATGTAGAGAAGTCGTAGACCAAAAAATGCATA
GAGAACTGTAGCAGCGCTATTGGTGTGCTTCCTCGAAATCAAGTTTGGCACAATCCTACC
AAGTCCAGTGGAAAGTATGGTCATAACAAACAAAGCTGAAAGAGCACCAGACAAAACAGT
AGCTTTCGGGTGTCTCATAGCCATCAGTGCCGCTATTATGAAAGTCTCATCGCCAATCTC
GGTGACAAGTATCATGGAGAAACTCGAAAACAAAGCATCAAAGACACCAGGGCCAGTGCC
TTCGAGGTTGTTCAAACCAAGATTGTCATCAACTCCGATTCGATCAGTGCCAATCATTCC
ACGACGGCCAAGCTCTTTACCAGATCGTTCAGATTCCTGCGTCTCATTATCAACCCCAGA
ATCCTGCGCAGAGATGGCGGAAATGAAGATGAAGAAGAAGAAGACGAGAAGCAGGCGGCG
GGTGATGAAACCCATGAGGTGAT**GCGAGAGTAGAACAGATCTGTGATTGACCGACGAA
TACGTTTCAATTTCTAAATATGAGAAAGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2F648JQ U 1
AF RR2F895JQ U 7
AF RR2EC05JQ U 49
AF RR2H948JQ U 32
AF RR2B071JQ U 7
AF RR2BO34JQ U 8
AF RR2B071TF C 295
AF RR2EC05TF C 493
AF RR2BZ32TF C 498
BS 1 42 RR2F648JQ
BS 43 43 RR2B071JQ
BS 44 181 RR2F648JQ
BS 182 182 RR2B071JQ
BS 183 443 RR2F648JQ
BS 444 566 RR2B071JQ
BS 567 567 RR2BO34JQ
BS 568 608 RR2B071JQ
BS 609 609 RR2BO34JQ
BS 610 808 RR2B071JQ
BS 809 809 RR2BO34JQ
BS 810 810 RR2B071TF
BS 811 825 RR2BO34JQ
BS 826 910 RR2B071TF
BS 911 911 RR2EC05TF
BS 912 1069 RR2B071TF
BS 1070 1070 RR2EC05TF
BS 1071 1099 RR2B071TF
BS 1100 1100 RR2BZ32TF
BS 1101 1111 RR2EC05TF
BS 1112 1113 RR2BZ32TF

RD RR2F648JQ 443 0 0
ACACTTGAAGCAAAAACATTGGCTTTAGATTACTTTGGTTTC*CCATTGAACCCATACAA
CAATCAAAGGGGAAAAATTATACAGAGAGATATTTTTACTTAAGATGTCTCTAAAACTCA
CTTTTCGCAAGTAAAGGAAAGAAGCACATTTAGAATGCAGAAATGTAGCATAGTGCAAAA
CGACTATAGTGGAGGGTAGAAATAGGAAGAGACTGAAAAGCCGAGGAAGAGTAAGCCCCC
AACAGTAGCGACCGTGCGTTGTGAGATCCTTGAAGCCAGCATGCTTCCTCCTACAACCGC
CAGCGATGTACAAATTGTGTGTCCTACTGATGCCCCTATCGCCACTCCTATAGCGTTCTT
GTGCGTCGCCAAAGCTATTGTTGCAATCTGGCTACGGTCTCCCCATTCGGCTAGAAAGGT
TAAGATGAAGGACTCTAGAAATA

QA 1 443 1 443
DS 

RD RR2F895JQ 462 0 0
GG
AGCAAAAACATTGGCTTTAGATTACTTTGGTTTCGCCATTGAACCCATACAAGAATCAAA
GGGGAAAAATTATACAGAGAGATGTTTTTACTTAAGATGTCTCTAAAACTCACTTTTCGC
AAGTAAAGGAAAGAAGCACATTTAGAATGCAGAAATGTAGCATAGTGCAAAACAACTATA
GTGGAGGGTAGAAATAGGAAGAGACTGAAAAGCCGAGGAAGAGTAAGCCCCCAACAGTAG
CGACCGTGCGTTGTGAGATCCTTGAAGCCAGCATGCTTCCTCCTACAACCGCCAGCGATG
TACAAATTGTGTGTCCTACTGATGCCCCTATCGCCACTCCTATAGCGTTCTTGTGCGTCG
CCAAAGCTATTGTTGCAATCTGGCTACGGTCTCCCCATTCGGCTAGAAAGGTTAAGATGA
AGGACTCTAGAAATATTGGGGTACAAAATCTTGAGAAAAA

QA 3 462 3 462
DS 

RD RR2EC05JQ 581 0 0
GAACCCATACAACAATCAAAGGGGAAAAATTATACAGAGAGATATTTTTACTTAAGATGT
CTCTAAAACTCACTTTTCGCAAGTAAAGGAAAGAAGCACATTTAGAATGCAGAAATGTAG
CATAGTGCAAAACAACTATAGTGGAGGGTAGAAATAGGAAGAGACTGAAAAGCCGAGGAA
GAGTAAGCCCCCAACAGTAGCGACCGTGCGTTGTGAGATCCTTGAAGCCAACATGCTTCC
TCCTACAACCGCCAGCGATGTACAAATTGTGTGTCCTACTGATGCCCCTATCGCCACTCC
TATAGCGTTCTTGTGCGTCGCCAAAGCTATTGTTGCAATCTGGCTACGGTCTCCCCATTC
GGCTAGAAAGGTTAAGATGAAGGACTCTAGAAATATTGGGGTACAAAATCTTGAGAAAAA
GCGACGGAAGGGTGTCTTCCCTTGGCCTGACTCAAGCTTCTCCTCAACTTCCTCCATTTC
CTTCTTCTGATTCGACTTTGAATCAGATGACCTCCAAGCAATGTAGAGAAGTCGTAGACC
AAAAAATGCATAGAGAACTGTAGCAGCGCTATTGGTGTGCT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2H948JQ 691 0 0
C
CTTTGGTTTCGTCATCGAACCCATACAACAATCAAAGGGGAAAAATTATACAGAGAGATA
TTTTTACTTAAGATGTCTCTAAAACTCACTTCTCGCAAGTAAAGGAAAGAAGCACATTTA
GAATGCAGAAATGTAGCATAGTGCAAAACAACTACAGTGGAGGGTAGAAATAGGAAGAGA
CTGAAAAGCCGAGGAAGAGTAAGCCCCCAACAGTAGCGACCGTGCGTTGTGAGATCCTTG
AAGCCAGCATGCTTCCTCCTACAACCGCCAGCGATGTACAAATTGTGTGTCCTACTGATG
CCCCTATCGCCACTCCTATAGCGTTCTTGTGCGTCGCCAAAGCTATTGTTGCAATCTGGC
TACGGTCTCCCCATTCGGCTAGAAAGGTTAAGATGAAGGACTCTAGAAATATTGGGGTAC
AAAATCTTGAGAAAAAGCGACGGAAGGGTGTCTTCCCTTGGCCTGACTCAAGCTTCTCCT
CAACTTCCTCCATTTCCTTCTTCTGATTCGACTTTGAATCAGATGACCTCCAAGCAATGT
AGAGAAGTCGTAGACCAAAAAATGCATAGAGAACTGTAGCAGCGCTGTTAGTGTGCTTCC
TCGAAATCAAGTTTGGCACAATCCTACCAAGTCCAGTGGAAAGTATGGTCATAACAAACA
AAGCTGAAAGAGCACCAGACAAAACAGTAG

QA 2 691 2 691
DS 

RD RR2B071JQ 802 0 0
GA
AGCAAAAACATTGGCTTTAGATTACTTTGGTTTCGCCATTGAACCCATACAACAATCAAA
GGGGAAAAATTATACAGAGAGATATTTTTACTTAAGATGTCTCTAAAACTCACTTTTCGC
AAGTAAAGGAAAGAAGCACATTTAGAATGCAGAAATGTAGCATAGTGCAAAACAACTATA
GTGGAGGGTAGAAATAGGAAGAGACTGAAAAGCCGAGGAAGAGTAAGCCCCCAACAGTAG
CGACCGTGCGTTGTGAGATCCTTGAAGCCAGCATGCTTCCTCCTACAACCGCCAGCGATG
TACAAATTGTGTGTCCTACTGATGCCCCTATCGCCACTCCTATAGCGTTCTTGTGCGTCG
CCAAAGCTATTGTTGCAATCTGGCTACGGTCTCCCCATTCGGCTAGAAAGGTTAAGATGA
AGGACTCTAGAAATATTGGGGTACAAAATCTTGAGAAAAAGCGACGGAAGGGTGTCTTCC
CTTGGCCTGACTCAAGCTTCTCCTCAACTTCCTCCATTTCCTTCTTCTGATTCGACTTTG
AATCAGATGACCTCCAAG*AATGTAGAGAAGTCGTAGACCAAAAAATGCATAGAGAACTG
CAGCAGCGCTATTGGTGTGCTTCCTCGAAATCAAGTTTGGCACAATCCTACCAAGTCCAG
TGGAAAGTATGGTCATAACAAACAAAGCTGAAAGAGCACCAGACAAAACAGTAGCTTTCG
GGTGTCTCATAGCCATCAGTGCCGCTATTATGAAAGTCTCATCGCCAATCTCGGTGACAA
GTATCATGGAGAAACTCGAA

QA 3 802 3 802
DS 

RD RR2BO34JQ 818 0 0
G
AGCAAAAACATTGGCTTTAGATTACTTTGGTTTCGCCATTGAACCCATACAACAATCAAA
GGTGAAAAATTATACAGAGAGATATTTTTACTTAAGATGTCTCTAAAACTCACTTTTCGC
AAGTAAAGGAAAGAAGCACATTTAGAATGCAGAAATGTAGTATAGTGCAAAACAACTATA
GTGGAGGGTAGAAATAGGAAGAGACTGAAAAGCCGAGGAAGAGTAAGCCCCCAACAGTAG
CGACCGTGCGTTGTGAGATCCTTGAAGCCAGCATGCTTCCTCCTACAACCGCCAGCGATG
TACAAATTGTGTGTCCTACTGATGCCCCTATCGCCACTCCTATAGCGTTCTTGTGCGTCG
CCAAAGCTATTGTTGCAATCTGGCTACGGTCTCCCCATTCGGCTAGAAAGGTTAAGATGA
AGGACTCTAGAAATATTGGGGTACAAAATCTTGAGAAAAAGCGACGGAAGGGTGTCTTCC
CTTGGCCTGACTCAAGCTTCTCCTCAACTTCCTCCATTTCCTTCTTCTGATTCGACTTTG
AATCAGATGACCTCCAAGCAATGTAGAGAAGTCGTAGACCAAAAAATGCATAGAGAACTG
TAGCAGCGCTATTGGTGTGCTTCCTCGAAATCAAGTTTGGCACAATCCTACCAAGTCCAG
TGGAAAGTATGGTCATAACAAACAAAGCTGAAAGAGCACCAGACAAAACAGTAGCTTTCG
GGTGTCTCATAGCCATCAGTGCCGCTATTATGAAAGTCTCATCGCCAATCTCGGTGACAA
GTATCATGGAGAAACTCGAAA*CAAAGCATCAAAGAC

QA 2 818 2 818
DS 

RD RR2B071TF 808 0 0
AACCGCCAGCGATGTACAAATTGTGTGTC*TACTGATGCCCCTATCGCCACTCCTATAGC
GTTCTTGTGCGTCGCCAAAGCTATTGTTGCAATCTGGCTACGGTCTCCCCATTCGGCTAG
AAAGGTTAAGATGAAGGACTCTAGAAATATTGGGGTACAAAATCTTGAGAAAAAGCGACG
GAAGGGTGTCTTCCCTTGGCCTGACTCAAGCTTCTCCTCAACTTCCTCCATTTCCTTCTT
CTGATTCGACTTTGAATCAGATGACCTCCAAG*AATGTAGAGAAGTCGTAGACCAAAAAA
TGCATAGAGAACTGCAGCAGCGCTATTGGTGTGCTTCCTCGAAATCAAGTTTGGCACAAT
CCTACCAAGTCCAGTGGAAAGTATGGTCATAACAAACAAAGCTGAAAGAGCACCAGACAA
AACAGTAGCTTTCGGGTGTCTCATAGCCATCAGTGCCGCTATTATGAAAGTCTCATCGCC
AATCTCGGTGACAAGTATCATGGAGAAACTCGAAAACAAAGCATCAAA*ACACCAGGGCC
AGTGCCTTCGAGGTTGTTCAAACCAAGATTGTCATCAACTCCGATTCGATCAGTGCCAAT
CATTCCACGACGGCCAGGCTCTTTACCAGATCGTTCAGATTCCTGCGTCTCATTATCAAC
CCCAGAATCCTGCGCAGAGATGGCGGAAATGAAGATGAAGAAGAAGAAGACGAGAAGCAG
GCGGCGGGTGATGAAACCCATGAGGTGAT**GCGAGAGTAGAACAGATCTGTGATCGACC
GACGAATACGTTTCAATTTCTAAAT
CTC

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2EC05TF 621 0 0
GCG
TGACTCAAGCTTCTCCTCAACTTCCTCCATTTCCTTCTTCTGATTCGACTTTGAATCAGA
TGACCTCCAAGCAATGTAGAGAAGTCGTAGACCAAAAAATGCATAGAGAACTGTAGCAGC
GCTATTGGTGTGCTTCCTCGAAATCAAGTTTGGCACAATCCTACCAAGTCCAGTGGAAAG
TATGGTCATAACAAACAAAGCTGAAAGAGCACCAGACAAAACAGTAGCTTTCGGGTGTCT
CATAGCCATCAGTGCCGCTATTATGAAAGTCTCATCGCCAATCTCGGTGACAAGTATCAT
GGAGAAACTCGAAAACAAAGCATCAAAGACACCAGGGCCAGTGCCTTCGAGGTTGTTCAA
ACCAAGATTGTCATCAACTCCGATTCGATCAGTGCCAATCATTCCACGACGGCCAAGCTC
TTTACCAGATCGTTCAGATTCCTGCGTCTCATTATCAACCCCAGAATCCTGCGCAGAGAT
GGCGGAAATGAAGATGAAGAAGAAGAAGACGAGAGGCAGGCGGCGGGTGATGAAACCCAT
GAGGTGAT**GCGAGAGTAGAACAGATCTGTGATTGACCGACGAATACGTTTCAATTTCT
AAATCTGAGAAAGTAT
CC

QA 4 619 4 619
DS 

RD RR2BZ32TF 616 0 0
ACTCAAGCTTCTCCTCAACTTCCTCCATTTCCTTCTTCTGATTCGACTTTGAATCAGATG
ACCTCCAAGCAATGTAGAGAAGTCGTAGACCAAAAAATGCATAGAGAACTGTAGCAGCGC
TATTAGTGTGCTTCCTGGAAATTAAGTTTGGCACAATCCTACCAAGTCCAGTGGAAAGTA
TGGTCATAACAAACAAAGCTGAAAGAGCACCAGACAAAACAGTAGCTTTCGGGTATCGCA
TAGCCATCAGTGCCGCTATAATGAAAGTCTCATCGCCAATCTCGGTGACAAGTATCATGG
AGAAACTCGAAAACAAAGCATCAAAGACACCAGGGCCAGTGCCTTCGAGGTTGTTCAAAC
CAAGATTGTCATCAACTCCGATTCGATCAGTGCCAATCATTCCACGACGGCCAAGCTCTT
TACCAGATCGTTCAGATTCCTGCGTCTCATTATCAACCCCAGAATCCTGCGCAGAGATGG
CGGAAATGAAGATGAAGAAGAAGAAGACGAGAAGCAGGCGGCGGGTGATGAAACCCATGA
GGTGATATGCGAGAGTAGAACAGATCTGTGATTGACCGACGAATACGTTTCAATTTCTAA
ATATGAGAAAGTATCC

QA 1 616 1 616
DS 



CO CL306Contig2 1288 2 2 U
GACACAGCGTTCGGTTCAAATCCCACAAAGATCCCTGTTTCGCAGCAGCATCGCAAGGAT
TATTCACACGCTCACCCAATGCTTTTCTGAATCGTAACTCATCTGTTCTACTCTCGCATA
TCACCTCATGGGTTTCATCACCCGCCGCCTGCTTCTCGTCTTCTTCTTCTTCATCTTCAT
TTCCGCCATCTCTGCGCAGGATTCTGGGGTTGATAATGAGACGCAGGAATCTGAACGATC
TGGTAAAGAGCTTGGCCGTCGTGGAATGATTGGCACTGATCGAATCGGAGTTGATGACAA
TCTTGGTTTGAACAACCTCGAAGGCACTGGCCCTGGTGTCTTTGATGCTTTGTTTTCGAG
TTTCTCCATGATACTTGTCACCGAGATTGGCGATGAGACTTTCATAATAGCGGCACTGAT
GGCTATGCGACACCCGAAAGCTACTGTTTTGTCTGGTGCTCTTTCAGCTTTGTTTGTTAT
GACCATACTTTCCACTGGACTTGGTAGGATTGTGCCAAACTTGATTTCGAGGAAGCACAC
CAATAGCGCTGCTACAGTTCTCTATGCATTTTTTTTGGTCTACGACTTCTCTACATTGCT
TGGAGGTCATCTGATTCAAAGTCGAATCAGAAGAAAGAAATGGAGGAAGTTGAGGAGAAG
CTTGAGTCAGGCCAAGGGAAGACACCCTTCCGTCGCTTTTTCTCAAGATTTTGTACCCCA
ATATTTCTAGAGTCCTTCATCTTAACCTTTCTAGCCGAATGGGGAGACCGTAGCCAGATT
GCAACAATAGCTGTAAGAGAGAAGTCCTTTTCATCTTTCTCACATATATCTAACTTCTTT
CATACCTAACTCAGTCTTTGGACTTTGCCCGCTGAGATTTAAACTTGTGGGGTTATCAAA
ACAATCTACTTATGTCTCATGTGAAGTTGGCGACGCACAAGAACGCTATAGGAGTGGCGA
TAGGGGCATCAGTAGGACACACAATTTGTACATCGCTGGCGGTTGTAGGAGGAAGCATGT
TGGCTTCAAGGATCTCACAACGCACGGTCGCAACTGTTGGGGGCTTACTCTTCCTCGGCT
TCTCAGTCTCTTCCTATTTCTACCCTCCACTATAGTTGTTTTGCACTATGCTACATTTCT
GCATTCTAAATGTTGCTTCTTTCCTTTACTTGCGAAAAGTGAGTTTTAGAGACATTAAGT
AAAAATATCTCTCTGTATAATTTTTCCCCTTTGATTGTTGTATGGGTTCGATGACGAAAC
CAAAGTAATCCAAAGCCAATGTTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F648TF U 1
AF RR2BZ32JQ C 577
BS 1 666 RR2F648TF
BS 667 1288 RR2BZ32JQ

RD RR2F648TF 666 0 0
GACACAGCGTTCGGTTCAAATCCCACAAAGATCCCTGTTTCGCAGCAGCATCGCAAGGAT
TATTCACACGCTCACCCAATGCTTTTCTGAATCGTAACTCATCTGTTCTACTCTCGCATA
TCACCTCATGGGTTTCATCACCCGCCGCCTGCTTCTCGTCTTCTTCTTCTTCATCTTCAT
TTCCGCCATCTCTGCGCAGGATTCTGGGGTTGATAATGAGACGCAGGAATCTGAACGATC
TGGTAAAGAGCTTGGCCGTCGTGGAATGATTGGCACTGATCGAATCGGAGTTGATGACAA
TCTTGGTTTGAACAACCTCGAAGGCACTGGCCCTGGTGTCTTTGATGCTTTGTTTTCGAG
TTTCTCCATGATACTTGTCACCGAGATTGGCGATGAGACTTTCATAATAGCGGCACTGAT
GGCTATGCGACACCCGAAAGCTACTGTTTTGTCTGGTGCTCTTTCAGCTTTGTTTGTTAT
GACCATACTTTCCACTGGACTTGGTAGGATTGTGCCAAACTTGATTTCGAGGAAGCACAC
CAATAGCGCTGCTACAGTTCTCTATGCATTTTTTTTGGTCTACGACTTCTCTACATTGCT
TGGAGGTCATCTGATTCAAAGTCGAATCAGAAGAAAGAAATGGAGGAAGTTGAGGAGAAG
CTTGAG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2BZ32JQ 712 0 0
GGTCTACGACTTCTCTACATTGCTTGGAGGTCATCTGATTCAAAGTCGAATCAGAAGAAG
GAAATGGAGGAAGTTGAGGAGAAGCTTGAGTCAGGCCAAGGGAAGACACCCTTCCGTCGC
TTTTTCTCAAGATTTTGTACCCCAATATTTCTAGAGTCCTTCATCTTAACCTTTCTAGCC
GAATGGGGAGACCGTAGCCAGATTGCAACAATAGCTGTAAGAGAGAAGTCCTTTTCATCT
TTCTCACATATATCTAACTTCTTTCATACCTAACTCAGTCTTTGGACTTTGCCCGCTGAG
ATTTAAACTTGTGGGGTTATCAAAACAATCTACTTATGTCTCATGTGAAGTTGGCGACGC
ACAAGAACGCTATAGGAGTGGCGATAGGGGCATCAGTAGGACACACAATTTGTACATCGC
TGGCGGTTGTAGGAGGAAGCATGTTGGCTTCAAGGATCTCACAACGCACGGTCGCAACTG
TTGGGGGCTTACTCTTCCTCGGCTTCTCAGTCTCTTCCTATTTCTACCCTCCACTATAGT
TGTTTTGCACTATGCTACATTTCTGCATTCTAAATGTTGCTTCTTTCCTTTACTTGCGAA
AAGTGAGTTTTAGAGACATTAAGTAAAAATATCTCTCTGTATAATTTTTCCCCTTTGATT
GTTGTATGGGTTCGATGACGAAACCAAAGTAATCCAAAGCCAATGTTTTTGC

QA 1 712 1 712
DS 



CO CL306Contig3 654 2 14 U
GGACATAGCGTTCGGTTCAAATCCCACAAAGATCCCTGTTTCGCAGCAGCATCGCAAGGA
CTATTCACACGCTCTCTCCCAATGATTTTCTGAATCGTAACTCATCTGTTCTACTCTCGC
ATCACCTCATGGGTTTCATCACCCGCCGCCTGCTTCTCGTCTTCTTCCTCTTCATCTTCA
TTTCCGCCATCTCTGCGCAGGATTCTGGGGTTGATAATGAGACGCAGGAATCTGAACGAT
CTGGTAAAGAGCTCGGCCGTCGTGGAATGATTGGCACTGATCGAATCGGAGTTGATGACA
ATCTTGGTTTGAACAACCTCGAAGGCACTGGCCCTGGTGTCTTTGATGCTTTGTTTTCGA
GTTTCTCCATGATACTTGTCACCGAGATTGGCGATGAGACTTTCATAATAGCGGCACTGA
TGGCTATGAGACACCCGAAAGCTACTGTTTTGTCTGGTGCTCTTTCAGCTTTGTTTGTTA
TGACCATACTTTCCACTGGACTTGGTAGGATTGTGCCAAACTTGATTTCGAGGAAGCACA
CCAACAGCGCTGCTACAGTTCTCTATGCATTTTTTGGTCTACGACTTCTCTACATTGCTT
GGAGGTCATCTGATTCAAAGTCGAATCAGAAGAAAGAAATGGAGGAAGTTGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H948TF U 1
AF RR2F895TF U -3
BS 1 60 RR2H948TF
BS 61 61 RR2F895TF
BS 62 79 RR2H948TF
BS 80 80 RR2F895TF
BS 81 170 RR2H948TF
BS 171 173 RR2F895TF
BS 174 406 RR2H948TF
BS 407 407 RR2F895TF
BS 408 428 RR2H948TF
BS 429 429 RR2F895TF
BS 430 541 RR2H948TF
BS 542 542 RR2F895TF
BS 543 620 RR2H948TF
BS 621 654 RR2F895TF

RD RR2H948TF 620 0 0
GGACATAGCGTTCGGTTCAAATCCCACAAAGATCCCTGTTTCGCAGCAGCATCGCAAGGA
TTATTCACACGCTCTCTCCTAATGATTTTCTGAATCGTAACTCATCTGTTCTACTCTCGC
ATCACCTCATGGGTTTCATCACCCGCCGCCTGCTTCTCGTCTTCTTCCTC***ATCTTCA
TTTCCGCCATCTCTGCGCAGGATTCTGGGGTTGATAATGAGACGCAGGAATCTGAACGAT
CTGGTAAAGAGCTCGGCCGTCGTGGAATGATTGGCACTGATCGAATCGGAGTTGATGACA
ATCTTGGTTTGAACAACCTCGAAGGCACTGGCCCTGGTGTCTTTGATGCTTTGTTTTCGA
GTTTCTCCATGATACTTGTCACCGAGATTGGCGATGAGACTTTCATTATAGCGGCACTGA
TGGCTATGCGACACCCGAAAGCTACTGTTTTGTCTGGTGCTCTTTCAGCTTTGTTTGTTA
TGACCATACTTTCCACTGGACTTGGTAGGATTGTGCCAAACTTGATTTCGAGGAAGCACA
CTAACAGCGCTGCTACAGTTCTCTATGCATTTTTTGGTCTACGACTTCTCTACATTGCTT
GGAGGTCATCTGATTCAAAG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2F895TF 658 0 0
GGAGTTACAT
AGCGTTCGGTTCAAATCCCACAAAGATCCCTGTTTCGCAGCAGCATCGCAAGGACTATTC
ACACGCTCTCTCCCAATGATTTTCTGAATCGTAACTCATCTGTTCTACTCTCGCATCACC
TCATGGGTTTCATCACCCGCCGCCTGCTTCTCGTCTTCTTCTTCTTCATCTTCATTTCCG
CCATCTCTGCGCAGGATTCTGGGGTTGATAATGAGACGCAGGAATCTGAACGATCTGGTA
AAGAGCTTGGCCGTCGTGGAATGATTGGCACTGATCGAATCGGAGTTGATGACAATCTTG
GTTTGAACAACCTCGAAGGCACTGGCCCTGGTGTCTTTGATGCTTTGTTTTCGAGTTTCT
CCATGATACTTGTCACCGAGATTGGCGATGAGACTTTCATAATAGCGGCACTGATGGCTA
TGAGACACCCGAAAGCTACTGTTTTGTCTGGTGCTCTTTCAGCTTTGTTTGTTATGACCA
TACTTTCCACTGGACTTGGTAGGATTGTGCCAAACTTGATTTCGAGGAAGCACACCAATA
GCGCTGCTACAGTTCTCTATGCATTTTTTGGTCTACGACTTCTCTACATTGCTTGGAGGT
CATCTGATTCAAAGTCGAATCAGAAGAAAGAAATGGAGGAAGTTGAGG

QA 11 658 11 658
DS 



AS 1 14

CO CL307Contig1 664 14 4 U
GGAGAACCAAATATCCAAATCACTAAACCAATCTTCTTACAGACATAAAAAATGCAGGGA
GCTTTGTGCATCAAACCTACCATTGTTCCACTTTCTTCTCCAAAGCTCACTCTTCTTCTT
CCTCACATCATCTCCACCACCAAAGCTTCAAGACTCTCTTCTTCTCTCAGACTCAGACCA
AACTCATCATCACCTTCAACCTCTGATCCACTCACCGTAAACTACGATGACTCTCCCCTT
TCTGTTTTCCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGTTACGCATGTTCTGCTGACATT
TACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCTTCAGAGCCTGTA
GACCGAGAATACCTAGAGTATAACAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGAT
GATCTTGGAGGAGAATTCTGCGAACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAGAAAGA
AGAAGCCAGATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTA
ACCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCACTTAATCAATGAATGTGAATCAGACACAAG
TCCCGAAAGTCAATCAAAAGGTTAACATTGATGTTACTATCTTTTGGCACTTCATTTGAA
GATG


BQ
55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 
65 65 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 50 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 35 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 70 70 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2FM81TF U 217
AF RR2EF15JQ C 176
AF RR2G612JQ C 116
AF RR2EF15TF U 1
AF RR2FN96JQ C 1
AF RR2FN96TF U 1
AF RR2F964JQ C 1
AF RR2G612TF U 2
AF RR2F964TF U 1
AF RR2BJ50TF U 1
AF RR2E339TF U 1
AF RR2E339JQ C 164
AF RR2ES40TF U 1
AF RR2CO48TF U 1
BS 1 604 RR2BJ50TF
BS 605 605 RR2CO48TF
BS 606 615 RR2BJ50TF
BS 616 664 RR2CO48TF

RD RR2FM81TF 379 0 0
GTAAACTACGATGACTCTCCCCTTTCTGTTTTCCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGC
GGTTACGCATGTTCTGCTGACATTTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCA
CCTCCCGTGGCTTCAGAGCCTGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACAACCCCTAAACA
GTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGATGATCTTGGAGGAGAATTCTGCGAACCTGACTATCAA
AAAGATGTCTACTAGAAAGAAAGAAGAAGCCAGATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTT
GTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTAACCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCACTTAAT
CAATGAATGTGAATCAGAC

QA 1 379 1 379
DS 

RD RR2EF15JQ 398 0 0
GACCAAACTCATCATCACCTTCAACCTTTGATCCACTCACCGTAAACTACGATGACTCTC
CCCTTTCTGTTTTCCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGTTACGCATGTTTTGCTG
ACGTTTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCTTCAGAGC
CTGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTT
GTGATGATCTTGGAGGAGAATTCTGCGAACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAG
AAAGAAGAAGCCAGATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCT
CTGTAACCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCACTT

QA 1 398 1 398
DS 

RD RR2G612JQ 476 0 0
TTCTTCCTCACATCATCTCCACCACCAAAGCTTCAAGACTTTCTTCTTCTCTCAGACTCA
GGCCAAACTCATCATCACCTTCAACCTCTGATCCACTCACCGTAAACTACGATGGCTCTC
CCCTTTCTGTTT*CCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGTTACGCATGTTCTGCTG
ACATTTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCTTCAGAGC
CTGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAGCAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTT
GTGATGATCTTGGAGGAGAATTTTGCGAACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAG
AAAGAAGAAGCCAGATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCT
CTGTAACCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCACTTAATCAATGAATGTGAA
CC

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2EF15TF 573 0 0
GGAGAACCAAATATCCAAATCACTAAACCAATCTTCTTACAGACATAAAAAATGCAGGGA
GCTTTGTGCATCAAACCTACCATTGTTCCACTTTCTTCTCCAAAGCTCACTCTTCTTCTT
CCTCACATCATCTCCACCACCAAAGCTTCAAGACTCTCTTCTTCTCTCAGACTCAGACCA
AACTCATCATCACCTTCAACCTCTGATCCACTCACCGTAAACTACGATGACTCTCCCCTT
TCTGTTTTCCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGTTACGCATGTTCTGCTGACGTT
TACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCTTCAGAGCCTGTA
GACCGAGAATACCTAGAGTATAACAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGAT
GATCTTGGAGGAGAATTCTGCGAACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAGAAAGA
AGAAGCCAGATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTA
ACCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCACTT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2FN96JQ 572 0 0
GGAGAACCAAATATCCAAATCACTAAACCAATCTTCTTACAGACATAAAAAATGCAGGGA
GCTTTGTGCATCAAACCTACCATTGTTCCACTTTCTTCTCCAAAGCTCACTCTTCTTCTT
CCTCACATCATCTCCACCACCAAAGCTTCAAGACTCTCTTCTTCTCTCAGACTCAGACCA
AACTCATCATCACCTTCAACCTCTGATCCACTCACCGTAAACTACGATGACTCTCCCCTT
TCTGTTTTCCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGTTACGCATGTTCTGCTGACATT
TACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCTTCAGAGCCTGTA
GACCGAGAATACCTAGAGTATAACAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGAT
GATCTTGGAGGAGAATTCTGCGAACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAGAAAGA
AGAAGCCAGATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTA
ACCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCAC
C

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2FN96TF 572 0 0
GGAGAACCAAATATCCAAATCACTAAACCAATCTTCTTACAGACATAAAAAATGCAGGGA
GCTTTGTGCATCAAACCTACCATTGTTCCACTTTCTTCTCCAAAGCTCACTCTTCTTCTT
CCTCACATCATCTCCACCACCAAAGCTTCAAGACTCTCTTCTTCTCTCAGACTCAGACCA
AACTCATCATCACCTTCAACCTCTGATCCACTCACCGTAAACTACGATGACTCTCCCCTT
TCTGTTTTCCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGTTACGCATGTTCTGCTGACATT
TACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCTTCAGAGCCTGTA
GACCGAGAATACCTAGAGTATAACAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGAT
GATCTTGGAGGAGAATTCTGCGAACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAGAAAGA
AGAAGCCAGATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTA
ACCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCAC
C

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2F964JQ 596 0 0
GGAGAACCAAATATCCAAATCACTAAACCAATCTTCTTACAGACATAAAAAATGCAGGGA
GCTTTGTGCATCAAACCTACCATTGTTCCACTTTCTTCTCCAAAGCTCACTCTTCTTCTT
CCTCACATCATCTCCACCACCAAAGCTTCAAGACTCTCTTCTTCTCTCAGACTCAGACCA
AACTCATCATCACCTTCAACCTCTGATCCACTCACCGTAAACTACGATGACTCTCCCCTT
TCTGTTTTCCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGTTACGCATGTTCTGCTGACATT
TACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCTTCAGAGCCTGTA
GACCGAGAATACCTAGAGTATAGCAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGAT
GATCTTGGAGGAGAATTCTGCGAACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAGAAAGA
AGAAGCCAGATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTA
ACCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCACTTAATCAATGAATGTGAATCAGAC
G

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2G612TF 578 0 0
GG
GAACCAAATATCCAAATCACTAAACCAATCTTCTTACAGACATAAAAAATGCAGGGAGCT
TTGTGCATCAAACCTACCATTGTTCCACTTTCTTCTCCAAAGCTCACTCTTCTTCTTCCT
CACATCATCTCCACCACCAAAGCTTCAAGACTCTCTTCTTCTCTCAGACTCAGGCCAAAC
TCATCATCACCTTCAACCTCTGATCCACTCACCGTAAACTACGATGGCTCTCCCCTTTCT
GTTT*CCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGTTACGCATGTTCTGCTGACATTTAC
CCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCTTCAGAGCCTGTAGAC
CGAGAATACCTAGAGTATAGCAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGATGAT
CTTGGAGGAGAATTCTGCGAACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAGAAAGAAGA
AGCCAGATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTAACC
ACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCACTTAATCAA

QA 3 578 3 578
DS 

RD RR2F964TF 596 0 0
GGAGAACCAAATATCCAAATCACTAAACCAATCTTCTTACAGACATAAAAAATGCAGGGA
GCTTTGTGCATCAAACCTACCATTGTTCCACTTTCTTCTCCAAAGCTCACTCTTCTTCTT
CCTCACATCATCTCCACCACCAAAGCTTCAAGACTCTCTTCTTCTCTCAGACTCAGACCA
AACTCATCATCACCTTCAACCTCTGATCCACTCACCGTAAACTACGATGACTCTCCCCTT
TCTGTTTTCCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGTTACGCATGTTCTGCTGACATT
TACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCTTCAGAGCCTGTA
GACCGAGAATACCTAGAGTATAGCAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGAT
GATCTTGGAGGAGAATTCTGCGAACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAGAAAGA
AGAAGCCAGATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTA
ACCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCACTTAATCAATGAATGTGAATCAGAC
G

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2BJ50TF 615 0 0
GGAGAACCAAATATCCAAATCACTAAACCAATCTTCTTACAGACATAAAAAATGCAGGGA
GCTTTGTGCATCAAACCTACCATTGTTCCACTTTCTTCTCCAAAGCTCACTCTTCTTCTT
CCTCACATCATCTCCACCACCAAAGCTTCAAGACTCTCTTCTTCTCTCAGACTCAGACCA
AACTCATCATCACCTTCAACCTCTGATCCACTCACCGTAAACTACGATGACTCTCCCCTT
TCTGTTTTCCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGTTACGCATGTTCTGCTGACATT
TACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCTTCAGAGCCTGTA
GACCGAGAATACCTAGAGTATAACAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGAT
GATCTTGGAGGAGAATTCTGCGAACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAGAAAGA
AGAAGCCAGATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTA
ACCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCACTTAATCAATGAATGTGAATCAGACACAAG
TCCCTAAAGTCAATC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2E339TF 633 0 0
GGAGAACCAAATATCCAAATCACTAAACCAATCTTCTTACAGACATAAAAAATGCAGGGA
GCTTTGTGCATCAAACCTACCATTGTTCCACTTTCTTCTCCAAAGCTCACTCTTCTTCTT
CCTCACATCATCTCCACCACCAAAGCTTCAAGACTCTCTTCTTCTCTCAGACTCAGACCA
AACTCATCATCACCTTCAACCTCTGATCCACTCACCGTAAACTACGATGACTCTCCCCTT
TCTGTTTTCCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGTTACGCATGTTCTGCTGACATT
TACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCTTCAGAGCCTGTA
GACCGAGAATACCTAGAGTATAACAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGAT
GATCTTGGAGGAGAATTCTGCGAACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAGAAAGA
AGAAGCCATATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTA
GCCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCACTTAATCAATGAATGTGAATCAGACACAAG
TCCCGAAAGTCAATCAAAAGGTTAACATTGA
AA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2E339JQ 452 0 0
CTCTCAGACTCAGACCAAACTCATCATCACCTTCAACCTCTGATCCACTCACCGTAAACT
ACGATGACTCTCCCCTTTCTGTTTTCCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGTTACG
CATGTTCTGCTGACATTTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCACCTCCCG
TGGCTTCAGAGCCTGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACAACCCCAAAACAGTTTTCC
CCGCAGAGGCTTGTGATGATCTTGGAGGAGAATTCTGCGAACCTGACTATCAAAAAGATG
TCTACTAGAAAGAAAGAAGAAGCCATATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTTGTTGTAT
CTCTACTAGTCTCTGTAGCCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCACTTAATCAATGAA
TGTGAATCAGACACAAGTCCCGAAAGTCAATC

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2ES40TF 633 0 0
GGAGAACCAAATATCCAAATCACTAAACCAATCTTCTTACAGACATAAAAAATGCAGGGA
GCTTTGTGCATCAAACCTACCATTGTTCCACTTTCTTCTCCAAAGCTCACTCTTCTTCTT
CC**ACATCATCTCCACCACCAAAGCTTCAAGACTCTCTTCTCCTCTCAGACTCAGACCA
AACTCATCATCACCTTCAACCTCTGATCCACTCACCGTAAACTACTATGACTCTCCCCTT
TCTGTTTTCCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGTTACGCATGTTCTGCTGACATT
TACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCTTCAGAGCCTGTA
GACCGAGAATACCTAGAGTATAACAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGAT
GATCTTGGAGGAGAATTCTGCGAACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAGAAAGA
AGAAGCCAGATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTA
ACCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCACTTAATCAATGAATGTGAATCAGACACAAG
TCCCGAAAGTCAATCAAAAGGTTAACATTGA
TA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2CO48TF 664 0 0
GGAGAACCAAATATCCAAATCA**AAACCAATCTTCTTACAGACATAAAAAATGCAGGGA
GCTTTGTGCATCAAACCTACCATTGTTCCACTTTCTTCTCCAAAGCTCACTCTTCTTCTT
CCTCACATCATCTCCACCACCAAAGCTTCAAGACTCTCTTCTTCTCTCAGACTCAGGCCA
AACTCATCATCACCTTCAACCTCTGATCCACTCACCGTAAACTACGATGACTCTCCCCTT
TCTGTTTTCCCAGCTGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGTTACGCATGTTCTGCTGACATT
TACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCTTCAGAGCCTGTA
GACCGAGAATACCTAGAGTATAACAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGAT
GATCTTGGAGGAGAATTCTGCGAACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAGAAAGA
AGAAGCCAGATTTTATGTGATGTGAATATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTA
ACCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGCTTCACTTAATCAATGAATGTGAATCAGACACAAG
TCCCGAAAGTCAATCAAAAGGTTAACATTGATGTTACTATCTTTTGGCACTTCATTTGAA
GATG

QA 1 664 1 664
DS 



AS 2 13

CO CL308Contig1 740 9 47 U
GGGAATCCCTCTCTCT*ACAGCATCTGTGAAAAAACTATAACTTTACTTGATCCATGGGC
ATACTCGATCATCTATGGGATGATACCGTCGCTGGTCCTCGGCCAGAGAACGGCCTTGGC
AAGCTTCGTAAACACCATACCTTCAGTTTCCGACCTAGCTCCGGCAATGATCAACCTGAC
AGTGGAAACGTTAGATCGTACGATGAAGACTCGCCGGATGAGGGTGTGAAAGTGACACGC
AGCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCAACTCCGGTTTCACCGGCC
GGTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTG***********GAGGAAAGGAACCCTTTC
GGTTCAGGAGACGCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGCAGG***ATCAGAGAATG
GACCAAGGAACACTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGAAGAA
GAAGAGGAAACAGAGTAGCCCCTGAAGCGCTTTCGTTTTGACACATCAAGTGGTCTTTGC
ATGCAGAGCTCGTCTTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTTTGTTTATGCGTT
TGTGAGGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGTTTTTTTT*CTCTCTTTTTGTTCC
TTTTTATATGTCATCTCGTTTTCGCAATGCTTCTACGTGTCTGTACATATTTGCTGCAAT
GATAATAAACATATTAATGC


BQ
20 20 20 20 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 15 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 5 30 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 

AF RR2G555TF U 3
AF RR2BH95JQ C 169
AF RR2BH95TF U 2
AF RR2E182TF U 56
AF RR2CI43JQ C 1
AF RR2E182JQ C 151
AF RR2CI43TF U 1
AF RR2BL66JQ C 37
AF RR2BL66TF U 55
BS 1 4 RR2CI43TF
BS 5 7 RR2BH95TF
BS 8 8 RR2CI43TF
BS 9 14 RR2BH95TF
BS 15 17 RR2CI43TF
BS 18 20 RR2BH95TF
BS 21 21 RR2CI43TF
BS 22 27 RR2BH95TF
BS 28 28 RR2CI43TF
BS 29 31 RR2BH95TF
BS 32 32 RR2CI43TF
BS 33 36 RR2BH95TF
BS 37 37 RR2CI43TF
BS 38 44 RR2BH95TF
BS 45 46 RR2G555TF
BS 47 74 RR2BH95TF
BS 75 75 RR2E182TF
BS 76 104 RR2BH95TF
BS 105 105 RR2E182TF
BS 106 128 RR2BH95TF
BS 129 129 RR2E182TF
BS 130 140 RR2BH95TF
BS 141 141 RR2E182TF
BS 142 152 RR2BH95TF
BS 153 153 RR2E182TF
BS 154 202 RR2BH95TF
BS 203 203 RR2E182TF
BS 204 406 RR2BH95TF
BS 407 409 RR2E182TF
BS 410 410 RR2BH95TF
BS 411 411 RR2E182TF
BS 412 431 RR2BH95TF
BS 432 432 RR2E182TF
BS 433 496 RR2BH95TF
BS 497 497 RR2E182TF
BS 498 535 RR2BH95TF
BS 536 536 RR2E182TF
BS 537 599 RR2BH95TF
BS 600 600 RR2E182TF
BS 601 627 RR2BH95TF
BS 628 628 RR2E182TF
BS 629 642 RR2BH95TF
BS 643 643 RR2E182TF
BS 644 672 RR2BH95TF
BS 673 718 RR2E182TF
BS 719 723 RR2CI43TF
BS 724 740 RR2BL66TF

RD RR2G555TF 657 0 0
GG
ATCTCTCTCTTACACGACATCTGCGAAGAAACGATAACTTTACTTGATCCATGGGCATAC
TCGATCATCTCTGGGATGATACCGTCGCTGGTCCTCGGCCGGAGAACGGCCTTGGCAAGC
TTCGGAAACACCATACTTTCAGTTTCCGGCCTAGCTCCGGCAATGACCAACCTGACAGTG
GAAACGTTAGATCGTACGGTGAAGACTCGCCGGATGAGGGTGTGAAAGTGACACGCAGCA
TCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCAACTCCGGTTTCACCGGCCGGTT
CAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTGAGCAAACGCAGGAGGAAAGGAACCCTTTCGGTT
CAGGAGACGCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGCAGGCAGACCAGAGAATGGACC
AAGGAACTCTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGAAGAAGAAG
AGGAAACAGAGTCGCCCCTGAAGCGCTTTCGTTTTGACACATCAAGTGGTCGTTGCATGC
AGAGCTCGTCTTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTTTGTTTATGCGTGTGTG
AGGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTCCGTCTCTGTTTTTTCT*CTCTCTTTTTGTTC

QA 3 657 3 657
DS 

RD RR2BH95JQ 521 0 0
GATCAACCTGACAGTGGAAACGTTAGATCGTACGGTGAAGACTCGCCGGATGAGGGTGTG
AAAGTGACACGCAGCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCAACTCCG
GTTTCACCGGCCGGTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTTTCTG***********GAGGAA
AGGAACCCTTTCGGTTCAGGAGACGCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGCAGGCA
GACCAGAGAATGGACCAAGGAACTCTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTA
ACTAGAGAAGAAGAAGAGGAAACAGAGTCGCCCCTGAAGCGCTTTCGTTTTGACACATCA
AGTGGTCGTTGCATGCAGAGCTCGTCTTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTT
TGTTTATGCGTGTGTGAGGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTCCGTCTCTGTTTTTTCT*CTC
TCTTTTTGTTCCTTTTTATATGTCAGCTCGTTTTCGCAATG

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2BH95TF 671 0 0
GGA
ATCTCTCTCTTACACAACATCTGCGAAGAAACGATAACTT**CTTGATCCATGGGCATAC
TCGATCATCTCTGGGATGATACCGTCGCTGGTCCTCGGCCGGAGAACGGCCTTGGCAAGC
TTCGGAAACACCATACTTTCAGTTTCCGGCCTAGCTCCGGCAATGATCAACCTGACAGTG
GAAACGTTAGATCGTACGGTGAAGACTCGCCGGATGAGGGTGTGAAAGTGACACGCAGCA
TCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCAACTCCGGTTTCACCGGCCGGTT
CAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTG***********GAGGAAAGGAACCCTTTCGGTT
CAGGAGACGCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGCAGGCAGACCAGAGAATGGACC
AAGGAACTCTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGAAGAAGAAG
AGGAAACAGAGTCGCCCCTGAAGCGCTTTCGTTTTGACACATCAAGTGGTCGTTGCATGC
AGAGCTCGTCTTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTTTGTTTATGCGTGTGTG
AGGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTCCGTCTCTGTTTTTTCT*CTCTCTTTTTGTTCCTTTT
TATATGTC

QA 4 671 4 671
DS 

RD RR2E182TF 667 0 0
G
GGGCATACTCGATCATCTATGGGATGATACCGTCGCTGGTCCTCGGCCAGAGAACGGCCT
TGGCAAGCTTCGTAAACACCATACCTTCAGTTTCCGACCTAGCTCCGGCAATGATCAACC
TGACAGTGGAAACGTTAGATCGTACGATGAAGACTCGCCGGATGAGGGTGTGAAAGTGAC
ACGCAGCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCAACTCCGGTTTCACC
GGCCGGTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTG***********GAGGAAAGGAACCC
TTTCGGTTCAGGAGACGCTCGACTTCGGACG*GTTCGAGAAGGCAGCAGG***ATCAGAG
AATGGACCAAGGAACACTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGA
AGAAGAAGAGGAAACAGAGTAGCCCCTGAAGCGCTTTCGTTTTGACACATCAAGTGGTCT
TTGCATGCAGAGCTCGTCTTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTTTGTTTATG
CGTTTGTGAGGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGTTTTTTTTTCTCTCTTTTTG
TTCCTTTTTATATGTCATCTCGTTTTCGCAATGCTTCTACGTGTCTGTACATATTTGCTG
CA
TGAT

QA 2 663 2 663
DS 

RD RR2CI43JQ 740 0 0
GGGAATCCCTCTCTCT*ACAGCATCTGTGAAAAAACTATAACTTTACTTGATCCATGGGC
ATACTCGATCATCTATGGGATGATACCGTCGCTGGTCCTCGGCCAGAGAACGGCCTTGGC
AAGCTTCGTAAACACCATACCTTCAGTTTCCGACCTAGCTCCGGCAATGATCAACCTGAC
AGTGGAAACGTTAGATCGTACGATGAAGACTCGCCGGATGAGGGTGTGAAAGTGACACGC
AGCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCAACTCCGGTTTCACCGGCC
GGTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTG***********GAGGAAAGGAACCCTTTC
GGTTCAGGAGACGCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGCAGG***ATCAGAGAATG
GACCAAGGAACACTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGAAGAA
GAAGAGGAAACAGAGTAGCCCCTGAAGCGCCTTCGTTTTGACACATCAAGTGGTCTTTGC
ATGCAGAGCTCGTCTTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTTTGTTTATGCGTT
TGTGAGGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGTTTTTTTT*CTCTCTTTTTGTTCC
TTTTTATATGTCATCTCGTTTTCGCAATGCTTCTACGTGTCTGTACATATTTGCTGCAAT
GATAATAAACATATTAATGT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2E182JQ 590 0 0
CGACCTAGCTCCGGCAATGATCAACCTGACAGTGGAAACGTTAGATCGTACGATGAAGAC
TCGCCGGATGAGGGTGTGAAAGTGACACGCAGCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTAC
CAAGGCGGTTCAACTCCGGTTTCACCGGCCGGTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCT
G***********GAGGAAAGGAACCCTTTCGGTTCAGGAGACGCTCGACTTCGGACG*GT
TCGAGAAGGCAGCAGG***ATCAGAGAATGGACCAAGGAACACTCCTCCTACTTACGGCG
TGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGAAGAAGAAGAGGAAACAGAGTAGCCCCTGAAGCGC
TTTCGTTTTGACACATCAAGTGGTCTTTGCATGCAGAGCTCGTCTTTCTTCCTTTTGTAG
GCTAGAGAGGTTCTCTTTTGTTTATGCGTTTGTGAGGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTGCG
TCTCTGTTTTTTTTTCTCTCTTTTTGTTCCTTTTTATATGTCATCTCGTTTTCGCAATGC
TTCTACGTGTCTGTACATATTTGCTGCAATGATAATAAACATATTAATGT

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2CI43TF 723 0 0
GGGAATCCCTCTCTCT*ACAGCATCTGTGAAAAAACTATAACTTTACTTGATCCATGGGC
ATACTCGATCATCTATGGGATGATACCGTCGCTGGTCCTCGGCCAGAGAACGGCCTTGGC
AAGCTTCGTAAACACCATACCTTCAGTTTCCGACCTAGCTCCGGCAATGATCAACCTGAC
AGTGGAAACGTTAGATCGTACGATGAAGACTCGCCGGATGAGGGTGTGAAAGTGACACGC
AGCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCAACTCCGGTTTCACCGGCC
GGTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTG***********GAGGAAAGGAACCCTTTC
GGTTCAGGAGACGCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGCAGG***ATCAGAGAATG
GACCAAGGAACACTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGAAGAA
GAAGAGGAAACAGAGTAGCCCCTGAAGCGCCTTCGTTTTGACACATCAAGTGGTCTTTGC
ATGCAGAGCTCGTCTTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTTTGTTTATGCGTT
TGTGAGGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGTTTTTTTT*CTCTCTTTTTGTTCC
TTTTTATATGTCATCTCGTTTTCGCA*TGCTTCTACGTGTCTGTACATATTTGCTGCAAT
GAT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2BL66JQ 704 0 0
G
ATAACTTTACTTGATCCATGGGCATACTCGATCATCTATGGGA*GATACCGTCGCTGGTC
CTCGGCCAGAGAACGGCCTTGGCAAGCTTCGTAAACACCATACCTTCAGTTTCCGACCTA
GCTCCGGCAATGATCAACCTGACAGTGGAAACGTTAGATCGTACGATGAAGACTCGCCGG
ATGAGGGTGTGAAAGTGACACGCAGCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCG
GTTCAACTCCGGTTTCACCGGCCGGTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTG******
*****GAGGAAAGGAACCCTTTCGGTTCAGGAGACGCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAA
GGCAGCAGG***ATCAGAGAATGGACCAAGGAACACTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATC
TCTAATCTCTAACTAGAGAAGAAGAAGAGGAAACAGAGTAGCCCCTGAAGCGCTTTCGTT
TTGACACATCAAGTGGTCTTTGCATGCAGGGCTCGTCTTTCTTCCCTTTGTAGGCTAGAG
AGGTTCTCTTTTGTTTATGCGTTTGTGAGGCTGTTCCCGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGT
TTTTTTTTCTCTCTTTTTGTTCCTTTTTGTATGTCATCTCGTTTTCGCAATGCTTCTACG
TGTCTGTACATATTTGCTGCAATGATAATAAACATATTAATGC

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR2BL66TF 686 0 0
ATGGGCATACTCGATCATCTATGGGA*GATACCGTCGCTGGTCCTCGGCCAGAGAACGGC
CTTGGCAAGCTTCGTAAACACCATACCTTCAGTTTCCGACCTAGCTCCGGCAATGATCAA
CCTGACAGTGGAAACGTTAGATCGTACGATGAAGACTCGCCGGATGAGGGTGTGAAAGTG
ACACGCAGCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCAACTCCGGTTTCA
CCGGCCGGTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTG***********GAGGAAAGGAAC
CCTTTCGGTTCAGGAGACGCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGCAGG***ATCAG
AGAATGGACCAAGGAACACTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGA
GAAGAAGAAGAGGAAACAGAGTAGCCCCTGAAGCGCTTTCGTTTTGACACATCAAGTGGT
CTTTGCATGCAGGGCTCGTCTTTCTTCCCTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTTTGTTTA
TGCGTTTGTGAGGCTGTTCCCGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGTTTTTTTT*CTCTCTTTT
TGTTCCTTTTTGTATGTCATCTCGTTTTCGCA*TGCTTCTACGTGTCTGTACATATTTGC
TGCA*TGATAATAAACATATTAATGC

QA 1 686 1 686
DS 



CO CL308Contig2 766 4 7 U
GGGAATCTCTCTCTTACACAACATCTGCGAAGAAAAACATAACTTTTACTTGATCCATGG
GCATACTTGATCATCTCTGGGATGATACCGTCGCTGGTCCTCGGCCGGAGAACGGCCTTG
GCAAGCTTCGTAAACACCATACTTTCAGTTTCCGGCCTAGCTCCGGCAATGATCAATCTG
ACGGTGGAAGCGTGAGATCGTACGGTGAAGACTCGCCGGATGAGGGTGTGAAAGTGACAC
GCAGCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCAGCTCCGGTTTCTCCAG
CCGGTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTGGAGGGAAGGAACCCTTTCGGTTCAGGA
GACGCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGCAGGCAGATCAGAGAATGGACCAAGGA
ACTCTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGAAGAAGAAGAAGAA
ACAGAGTAGCCCCTGAAGGCTGAAGCGCTTTCGTTTTGACACATCAAGTTGGTCGCTGCA
TGCAGAGTTCGTCTTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTTTGTTTATGCGTTT
GTGAGGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGTTTTTTTTTTCTCTCTTTTTGTTTG
TTTTTATATGTCATCTCGTTTTCGCAATGCTTTTACGTGTCTGTACATATTTGCCGCAAT
GATAATAAACATATTAATGCAGATGCTTGACATTAGTTCTTTTTAT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ31TF U 1
AF RR2D463TF U 2
AF RR2FJ31JQ C 97
AF RR2D463JQ C 49
BS 1 644 RR2FJ31TF
BS 645 645 RR2FJ31JQ
BS 646 664 RR2FJ31TF
BS 665 665 RR2D463TF
BS 666 740 RR2FJ31TF
BS 741 757 RR2D463TF
BS 758 766 RR2D463JQ

RD RR2FJ31TF 740 0 0
GGGAATCTCTCTCTTACACAACATCTGCGAAGAAAAACATAACTTTTACTTGATCCATGG
GCATACTTGATCATCTCTGGGATGATACCGTCGCTGGTCCTCGGCCGGAGAACGGCCTTG
GCAAGCTTCGTAAACACCATACTTTCAGTTTCCGGCCTAGCTCCGGCAATGATCAATCTG
ACGGTGGAAGCGTGAGATCGTACGGTGAAGACTCGCCGGATGAGGGTGTGAAAGTGACAC
GCAGCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCAGCTCCGGTTTCTCCAG
CCGGTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTGGAGGGAAGGAACCCTTTCGGTTCAGGA
GACGCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGCAGGCAGATCAGAGAATGGACCAAGGA
ACTCTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGAAGAAGAAGAAGAA
ACAGAGTAGCCCCTGAAGGCTGAAGCGCTTTCGTTTTGACACATCAAGTTGGTCGCTGCA
TGCAGAGTTCGTCTTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTTTGTTTATGCGTTT
GTGAGGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGTTTTTTTTT*CTCTCTTTTTGTTTG
TTTT*ATATGTCATCTCGTTTTCGCAATGCTTTTACGTGTCTGTACATATTTGCCGCAAT
GATAATAAACATATTAATGC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2D463TF 756 0 0
GGA
ATCTCTCTCTTACACAACATCTGCGAAGAAAAACATAACTTTTACTTGATCCATGGGCAT
ACTTGATCATCTCTGGGATGATACCGTCGCTGGTCCTCGGCCGGAGAACGGCCTTGGCAA
GCTTCGTAAACACCATACTTTCAGTTTCCGGCCTAGCTCCGGCAATGATCAATCTGACGG
TGGAAGCGTGAGATCGTACGGTGAAGACTCGCCGGATGAGGGTGTGAAAGTGACACGCAG
CATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCAGCTCCGGTTTCTCCAGCCGG
TTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTGGAGGGAAGGAACCCTTTCGGTTCAGGAGACG
CTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGTAGGCAGATCAGAGAATGGACCAAGGAACTC
TCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGAAGAAGAAGAAGAAACAG
AGTAGCCCCTGAAGGCTGAAGCGCTTTCGTTTTGACACATCAAGTTGGTCGTTGCATGCA
GAGTTCGTCTTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTTTGTTTATGCGTTTGTGA
GGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGTTTTTTTTT*CTCTCTTTTTGTTTGTTTT
TATATGTCATCTCGTTTTCGCAATGCTTTTACGTGTCTGTACATATTTGCTGCAATGATA
ATAAACATATTAATGTAGATGCTTGACATTAGT

QA 4 756 4 756
DS 

RD RR2FJ31JQ 644 0 0
GTCCTCGGCCGGAGAACGGCCTTGGCAAGCTTCGTAAACACCATACTTTCAGTTTCCGGC
CTAGCTCCGGCAATGATCAATCTGACGGTGGAAGCGTGAGATCGTACGGTGAAGACTCGC
CGGATGAGGGTGTGAAAGTGACACGCAGCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAG
GCGGTTCAGCTCCGGTTTCTCCAGCCGGTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTTTCTGGAG
GGAAGGAACCCTTTCGGTTCAGGAGACGCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGCAG
GCAGATCAGAGAATGGACCAAGGAACTCTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTTTAATCT
CTAACTAGAGAAGAAGAAGAAGAAACAGAGTAGCCCCTGAAGGCTGAAGCGCTTTCGTTT
TGACACATCAAGTTGGTCGCTGCATGCAGAGTTCGTCTTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAG
AGGTTTTCTTTTGTTTATGCGTTTGTGAGGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGT
TTTTTTTTTCTCTCTTTTTGTTTGTTTTTATATGTCATCTCGTTTTCGCAATGCTTTTAC
GTGTCTGTACATATTTGCCGCAATGATAATAAACATATTAATGC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2D463JQ 718 0 0
AC
TGATCCATGGGCATACTTGATCATCTCTGGGATGATAC*GTCGCTGGTC*TCGGCCGGAG
AACGGCCTTGGCAAGCTTCGTAAACACCATACTTTCAGTTTCCGGCCTAGCTCCGGCAAT
GATCAATCTGACGGTGGAAGCGTGAGATCGTACGGTGAAGACTCGCCGGATGAGGGTGTG
AAAGTGACACGCAGCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCAGCTCCG
GTTTCTCCAGCCGGTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTGGAGGGAAGGAACCCTTT
CGGTTCAGGAGACGCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGTAGGCAGATCAGAGAAT
GGACCAAGGAACTCTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGAAGA
AGAAGAAGAAACAGAGTAGCCCCTGAAGGCTGAAGCGCTTTCGTTTTGACACATCAAGTT
GGTCGTTGCATGCAGAGTTCGTCTTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTTTGT
TTATGCGTTTGTGAGGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGTTTTTTTTTTCTCTC
TTTTTGTTTGTTTTTATATGTCATCTCGTTTTCGCAATGCTTTTACGTGTCTGTACATAT
TTGCTGCAATGATAATAAACATATTAATGTAGATGCTTGACATTAGTTCTTTTTAT

QA 3 718 3 718
DS 



AS 2 8

CO CL309Contig1 1268 5 24 U
GGCAGCTGGTTCAAAAGAGATGACAGTCAGAGACGCTCTAAACTCCGCAATTGATGAGGA
GATGTCTGCATATCCTAAAGTTTTTGTCATGGGTGAAGAGGTTGGACAATATCAAGGTGC
CTACAAGATCACTAAAGGCCTTTTGGAGAAGTATGTTCCTGAGAGAGTTTACGATACTCC
TATTACCGAGGCTGGATTTACTGGAATTGGAGTTGGTGCGGCCTATGCTGGCTTAAAACC
CGTTGTAGAATTTATGACGTTCAACTTTTCTATGCAGGCAATTGATCATATCATAAATTC
TGCTGCAAAGTCGAATTACATGTCTGCTGGACAGATAAATGTGCCCATCGTCTTTAGAGG
ACCCAATGGTGCTGCTGCTGGTGTTGGTGCTCAGCATTCTCAGTGCTATGCAGCATGGTA
CGCCTCAGTACCTGGTTTGAAAGTTCTCGCTCCATATTCAGCTGAAGATACTCGTGGTCT
TCTTAAAGCTGCCATTAGAGACCCTGACCCTGTTGTCTTCCTTGAAAACGAGTTACTATA
TGGTGAATCATTTCCAATTTCAGAAGAAGCACTTGATTCAAGTTTCTGTCTTCCCATAGG
AAAAGCCAAGATTGAACGAGAAGGAAAGGATGTAACAATAACAACTTTCTCGAAGATGGT
CGGGTTTGCCCTCAAGGCAGCTGAGAAGCTCGCAGAAGAGGGAATAAGTGCTGAGGTAAT
AAATCTGCGGTCAATCCGTCCGCTAGACAGAGCAACAATCAACGCGTCAGTGAGAAAAAC
AAGTAGATTGGTAACAGTTGAAGAAGGTTTCCCACAGCACGGAGTCTGTGCAGGAATCTG
TGCGTCGGTAGTGGAGGAGAGCTTTTCATACTTGGATGCACCGGTGGAGAGGATAGCAGG
AGCTGATGTTCCAATGCCTTACGCAGCTAACCTAGAGAGATTGGCTCTTCCTCAGGTAGA
GGATATCGTTCGAGCAGCAAAGAGAGCTTGTTTCAGATCCAAATAAACACAATGATCATC
GTTCCTCACAAACCAACCACACCCCAACACATTCCTTCTTTGAGAAAAAGGAAAATAAGA
AAAGAGGAGAAAATGATGTCTCTTTTGCCTACGTGATTTTTATTTGATCTTTTCCTACTA
TATCTTGTCAATCCTTCCTGCGGTCATCTTTTTGTCCTTCCCAAATTGAAAAATATTGAA
TATTTTGGGTTAATTGATAAATTGATCGAGAAAGCTAGTAAATGGCTTTTCTCTGTGGAA
TGTTGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2CZ89TF U 1
AF RR2E119TF U 340
AF RR2E119JQ C 840
AF RR2EX51JQ C 995
AF RR2EX51TF U 995
BS 1 421 RR2CZ89TF
BS 422 422 RR2E119TF
BS 423 423 RR2CZ89TF
BS 424 424 RR2E119TF
BS 425 447 RR2CZ89TF
BS 448 448 RR2E119TF
BS 449 455 RR2CZ89TF
BS 456 456 RR2E119TF
BS 457 492 RR2CZ89TF
BS 493 493 RR2E119TF
BS 494 600 RR2CZ89TF
BS 601 601 RR2E119TF
BS 602 636 RR2CZ89TF
BS 637 637 RR2E119TF
BS 638 663 RR2CZ89TF
BS 664 664 RR2E119TF
BS 665 676 RR2CZ89TF
BS 677 677 RR2E119TF
BS 678 696 RR2CZ89TF
BS 697 955 RR2E119TF
BS 956 956 RR2E119JQ
BS 957 1031 RR2E119TF
BS 1032 1267 RR2EX51TF
BS 1268 1268 RR2EX51JQ

RD RR2CZ89TF 697 0 0
GGCAGCTGGTTCAAAAGAGATGACAGTCAGAGACGCTCTAAACTCCGCAATTGATGAGGA
GATGTCTGCATATCCTAAAGTTTTTGTCATGGGTGAAGAGGTTGGACAATATCAAGGTGC
CTACAAGATCACTAAAGGCCTTTTGGAGAAGTATGTTCCTGAGAGAGTTTACGATACTCC
TATTACCGAGGCTGGATTTACTGGAATTGGAGTTGGTGCGGCCTATGCTGGCTTAAAACC
CGTTGTAGAATTTATGACGTTCAACTTTTCTATGCAGGCAATTGATCATATCATAAATTC
TGCTGCAAAGTCGAATTACATGTCTGCTGGACAGATAAATGTGCCCATCGTCTTTAGAGG
ACCCAATGGTGCTGCTGCTGGTGTTGGTGCTCAGCATTCTCAGTGCTATGCAGCATGGTA
CTCTTCAGTACCTGGTTTGAAAGTTCTTGCTCCAT*TTCAGCTGAAGATACTCGTGGTCT
TCTTAAAGCTGCTATTAGAGACCCTGACCCTGTTGTCTTCCTTGAAAACGAGTTACTATA
TGGTGAATCATTTCCAATTTCAGAAGAAGCACTTGATTCAAGTTTCTGTCTTCCCATAGG
CAAAGCCAAGATTGAACGAGAAGGAAAGGATGTAACCATAACAACTTTCTCGAAGATGGT
CGGTTTTGCCCTCAAG*CAGCTGAGAAGCTCGCAGA
G

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2E119TF 704 0 0
GGTA
CCCATCGTCTTTAGAGGACCCAATGGTGCTGCTGCTGGTGTTGGTGCTCAGCATTCTCAG
TGCTATGCAGCATGGTACGCCTCAGTTCCTGGTTTGAAAGTTCTCGCTCCATATTCAGCT
GAAGATGCTCGTGGTCTTCTTAAAGCTGCCATTAGAGACCCTGACCCTGTTGTCTTCCTT
GAAAACGAGTTACTATATGGTGAATCATTTCCAATTTCAGAAGAAGCACTTGATTCAAGT
TTCTGTCTTCCCATAGGAAAAGCCAAGATTGAACGAGAAGGAAAGGATGTAACAATAACA
ACTTTCTCGAAGATGGTCGGGTTTGCCCTCAAGGCAGCTGAGAAGCTCGCAGAAGAGGGA
ATAAGTGCTGAGGTAATAAATCTGCGGTCAATCCGTCCGCTAGACAGAGCAACAATCAAC
GCGTCAGTGAGAAAAACAAGTAGATTGGTAACAGTTGAAGAAGGTTTCCCACAGCACGGA
GTCTGTGCAGGAATCTGTGCGTCGGTAGTGGAGGAGAGCTTTTCATACTTGGATGCACCG
GTGGAGAGGATAGCAGGAGCTGATGTTCCAATGCCTTACGCAGCTAACCTAGAGAGATTG
GCTCTTCCTCAG*TAGAGGATATCGTTCGAGCAGCAAAGAGAGCTTGTTTCAGATCCAAA
TAAACACAATGATCATCGTTCCTCACAA
CCAACCACACCC

QA 5 692 5 692
DS 

RD RR2E119JQ 419 0 0
GTGCGTCGGTAGTGGAGGAGAGCTTTTCATACTTGGATGCACCGGTGGAGAGGATAGCAG
GAGCTGATGTTCCAATGCCTTACGCAGCTAACCTAGAGAGATTGGTTTTTCCTCAGGTAG
AGGATATCGTTCGAGCAGCAAAGAGAGCTTGTTTCAGATCCAAATAAACACAATGATCAT
CGTTCCTCACAAACCAACCACACCCCAACACATTCCTTTTTTGAGAAAAAGGAAAATAAG
AAAAGAGGGGAAAATGATGTTTTTTTTGCCTACGTGATTTTTATTTGATCTTTTCCTACT
ATATCTTGTCAATCCTTCCTGCGGTCATCTTTTTGTCCTTCCCAAATTGAAAAATATTGA
ATATTTTGGGTTAATTGATAAATTGATCGAGAAAGCTAGTAAATGGCTTTTTTCTGTGG

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR2EX51JQ 274 0 0
G
GATCCAAATAAACACAATGATCATCGTTCCTCACAAACCAACCACACCCCAACACATTCC
TTCTTTGAGAAAAAGGAAAATAAGAAAAGAGGAGAAAATGATGTCTCTTTTGCCTACGTG
ATTTTTATTTGATCTTTTCCTACTATATCTTGTCAATCCTTCCTGCGGTCATCTTTTTGT
CCTTCCCAAATTGAAAAATATTGAATATTTTGGGTTAATTGATAAATTGATCGAGAAAGC
TAGTAAATGGCTTTTCTCTGTGGAATGTTGTGG

QA 2 274 2 274
DS 

RD RR2EX51TF 274 0 0
G
GATCCAAATAAACACAATGATCATCGTTCCTCACAAACCAACCACACCCCAACACATTCC
TTCTTTGAGAAAAAGGAAAATAAGAAAAGAGGAGAAAATGATGTCTCTTTTGCCTACGTG
ATTTTTATTTGATCTTTTCCTACTATATCTTGTCAATCCTTCCTGCGGTCATCTTTTTGT
CCTTCCCAAATTGAAAAATATTGAATATTTTGGGTTAATTGATAAATTGATCGAGAAAGC
TAGTAAATGGCTTTTCTCTGTGGAATGTTGTG
G

QA 2 273 2 273
DS 



CO CL309Contig2 712 3 9 U
ATGAACTCTTTCACTAGACCCCAAAAGATGTATAATTTTCAATTCGCAAGACAAAAAGTT
AAAAATGAAAACCACAGGCCAAAGGATTAACCAATATCAAAAGAGATCAAATAAAATCAC
AAGGAACGGTTGTTTGTAGCAAAAAGAGACGCCATTTTTCTCCTTTTTTTCTTATTTTCC
TTCTCTTTAAAGATCAAAAGAAGAAATGTGTTGGGGGGTGGGTTTCTGAAGATGATCATT
TTCTTTATTTGGATCTGTAACAAGCTCTCTTGGCCGCTCGAACGATATCCTCTACCTGAG
GAAAAACCAATCTCTCTAGGTTAGCTGCGTAAGGCATTGGAACATCAGCTCCTGCTATCC
TCTCCACCGGTGCATCCAAGTATGAAAAGCTCCCCTCTACTACCGAAGCACAGATTTCAG
CACAGACTCCATGCTGAGGGAAACCTTCTTCAACTGTTACCAATCTACTTATCTTCCTCA
CTGAAGCATTGATGGTTGCTCTGTCTAGCGGACGGATCGACCGCAGATTTATTACCTCAG
CACTTATTCCCTCTTCTGCGAGCTTCTCAGCTGCCTTGAGGGCAAAACCGACCATCTTCG
AGAAAGTTGTAATGGTTACATCCTTTCCTTCTCGTTCAATCTTGGCTTTCCCTATGGGAA
GACAGAAACTTGAATCAAGTGCTTCTTCTGAAATTGGAAATGATTCACCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2DQ23JQ U 1
AF RR2FO31JQ U 66
AF RR2DQ23TF C 474
BS 1 81 RR2DQ23JQ
BS 82 82 RR2FO31JQ
BS 83 303 RR2DQ23JQ
BS 304 304 RR2FO31JQ
BS 305 305 RR2DQ23JQ
BS 306 306 RR2FO31JQ
BS 307 536 RR2DQ23JQ
BS 537 709 RR2FO31JQ
BS 710 712 RR2DQ23TF

RD RR2DQ23JQ 536 0 0
ATGAACTCTTTCACTAGACCCCAAAAGATGTATAATTTTCAATTCGCAAGACAAAAAGTT
AAAAATGAAAACCACAGGCCAGAGGATTAACCAATATCAAAAGAGATCAAATAAAATCAC
AAGGAACGGTTGTTTGTAGCAAAAAGAGACGCCATTTTTCTCCTTTTTTTCTTATTTTCC
TTCTCTTTAAAGATCAAAAGAAGAAATGTGTTGGGGGGTGGGTTTCTGAAGATGATCATT
TTCTTTATTTGGATCTGTAACAAGCTCTCTTGGCCGCTCGAACGATATCCTCTACCTGAG
GAAGAGCCAATCTCTCTAGGTTAGCTGCGTAAGGCATTGGAACATCAGCTCCTGCTATCC
TCTCCACCGGTGCATCCAAGTATGAAAAGCTCCCCTCTACTACCGAAGCACAGATTTCAG
CACAGACTCCATGCTGAGGGAAACCTTCTTCAACTGTTACCAATCTACTTATCTTCCTCA
CTGAAGCATTGATGGTTGCTCTGTCTAGCGGACGGATCGACCGCAGATTTATTACC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2FO31JQ 646 0 0
TGAAAACCACAGGCCAAAGGATTAACCAATATCAAAAGAGATCAAATAAAATCACAAGGA
ACGGTTGTTTGTAGCAAAAAGAGACGTCATTTTTCTCCTTTTTTTCTTATTTTCCTTCTC
TTTAAAGATCAAAAGAAGAAATGTGTTGGGGGGTGGGTTTCTGAAGATGATCATTTTCTT
TATTTGGATCTGTAACAAGCTCTCTTGGCCGCTCGAACGATATCCTCTACCTGAGGAAAA
ACCAATCTCTCTAGGTTAGCTGCGTAAGGCATTGGAACATCAGCTCCTGCTATCCTCTCC
ACCGGTGCATCCAAGTATGAAAAGCTCTCCTCTACTACCGAAGCACAGATTTCAGCACAG
ACTCCATGCTGAGGGAAACCTTCTTCAACTGTTACCAATCTACTTGTCTTCCTCACTGAA
GCATTGATGGTTGCTCTGTCTAGCGGACGGATCGACCGCAGATTTATTACCTCAGCACTT
ATTCCCTCTTCTGCGAGCTTCTCAGCTGCCTTGAGGGCAAAACCGACCATCTTCGAGAAA
GTTGTAATGGTTACATCCTTTCCTTCTCGTTCAATCTTGGCTTTCCCTATGGGAAGACAG
AAACTTGAATCAAGTGCTTCTTCTGAAATTGGAAATGATTCACC
GT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2DQ23TF 239 0 0
TTCCTCACTGAAGCATTGATGGTTGCTCTGTCTAGCGGACGGATCGACCGCAGATTTATT
ACCTCAGCACTTATTCCCTCTTCTGCGAGCTTGTCAGCTGCCTTGAGGGCAAAACCGACC
ATCTTCGAGAAAGTTGTAATGGTTACATCCTTTCCTTCTCGTTCAATCTTGGCTTTCCCT
ATGGGAAGACAGAAACTTGAATCAAGTGCTTCTTCTGAAATTGGAAATGATTCACCGTC

QA 1 239 1 239
DS 



AS 1 12

CO CL310Contig1 760 12 21 U
GGATCAACCAAAACAAACAAACAAAAAAGAGTCTAAGCCTTTAAACGAGAGAGAGAAATG
GCGACGTCGGGAACATACGTGACGGAGGTTCCATTGAAAGGGACGGTGGAGAAACACTAC
AAGAAGTGGAGAAGCGAGAACCATGCCATCCCGGAAGCCATCGGTCACCACATCCAAAAT
GTAACCATTCACGAAGGGGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGGACTACACA
TGCGATGGGAAGCCGGAGGTATTCAAGGAAAGGACAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACG
GTGACGTATAGAGGACTTGAAGGTCACGTAATGGAACAATTCAAGGTGTATGACGTCATC
TTTGAATTTAATCCGAAGTTGGAGGATGGCTGCGTCTGCAAAATCACTATGATATGGGAG
AAGCGTAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAAGTCGTCAAGAGCATGATT
GCTGACATGGACGACCACGTTCTCAAAGCTTAATCACCATCATCATCATCATCATCATCG
CCATCACAATCCACCATATCATTAATTCACCATCACAATCACCGTCACCATGATCAATAT
CATCTCCATTACAAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAGTTCAATAAATGGGGTCTTGCTG
AGTTTATTTCTTTGTAAGACCATGCTTTTATATGTACTCTTGTGTTCATCGACCGGTTTG
ATATGTTCTTGTTTACTTATCAATATATTCCAGTTTTATT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 35 65 65 65 65 35 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 20 20 20 20 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 
70 70 70 70 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2E987JQ C 124
AF RR2C970JQ C 69
AF RR2CP35TF U 1
AF RR2E987TF U 1
AF RR2ES84TF U 2
AF RR2C970TF U -3
AF RR2A795JQ C 431
AF RR2ER28TF U -4
AF RR2H776TF U -3
AF RR2DA44TF U 58
AF RR2DA44JQ C 69
AF RR2H776JQB C 70
BS 1 35 RR2CP35TF
BS 36 36 RR2ER28TF
BS 37 101 RR2CP35TF
BS 102 102 RR2ER28TF
BS 103 167 RR2CP35TF
BS 168 168 RR2ER28TF
BS 169 260 RR2CP35TF
BS 261 261 RR2ER28TF
BS 262 512 RR2CP35TF
BS 513 518 RR2ER28TF
BS 519 548 RR2CP35TF
BS 549 549 RR2ER28TF
BS 550 589 RR2CP35TF
BS 590 590 RR2ER28TF
BS 591 681 RR2CP35TF
BS 682 704 RR2E987TF
BS 705 705 RR2ER28TF
BS 706 711 RR2E987TF
BS 712 735 RR2ER28TF
BS 736 745 RR2DA44TF
BS 746 760 RR2DA44JQ

RD RR2E987JQ 459 0 0
AAGTGGAGAAGCGAGAACCATGCCATCCCGGAAGCCATCGGTCAGCACATCCAAAATGTA
ACCATTCACGAAGGGGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGGACTACACATGC
GATGGGAAGCCGGAGGTGTTCAAGGAAAGGACAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTG
ACGTATAGAGGACTTGAAGTTCACGTAATGGAACAATTCAAGGTGTATGACGTCATCTTT
GAATTTAATGCGAAGTTGGAGGATGGCTGCGTCTGCAAAATCACTATGATATGGGAGAAG
GGTAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTCGTCAAGAGCATGATTGCT
GACATGGACGACCACGTTTTCAAAGCTTA******ATCATCATCATCATCATCATCGCCA
TCACATTCCACCATATCATTAATTCACCATCACAATCAC

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR2C970JQ 476 0 0
GGGAACATACGTGACGGAGGTTCCATTGAAAGGGACGGTGGAGAAACACTACAAGAAGTG
GAGAAGCGAGAACCATGCCATCCCGGAAGCCATCGGTCACCACATCCAGAATGTAACCAT
TCACGAAGGGGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGGACTACACATGCGATGG
GAAGCCGGAGGTATTCAAGGAAAGGACAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTGACGTA
TAGAGGACTTGAAGGTCACGTAATGGAACAATTCAAGGTGTATGACGTCATCTTTGAATT
TAATCCGAAGTTGGAGGATGGCTGGGTCTGCAAAATCACTATGATATGGGAGAAGGGTAA
CGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAAGTCGTCAAGAGCATGATTGCTGACAT
GGACGACCACGTTCTCAAAGCTTAATCACCATCATCATCATCATCATCTTCGCCAT

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR2CP35TF 681 0 0
GGATCAACCAAAACAAACAAACAAAAAAGAGTCTAGGCCTTTAAACGAGAGAGAGAAATG
GCGACGTCGGGAACATACGTGACGGAGGTTCCATTGAAAGGCACGGTGGAGAAACACTAC
AAGAAGTGGAGAAGCGAGAACCATGCCATCCCGGAAGCCATCGGTCAGCACATCCAAAAT
GTAACCATTCACGAAGGGGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGGACTACACA
TGCGATGGGAAGCCGGAGGTGTTCAAGGAAAGGACAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACG
GTGACGTATAGAGGACTTGAAGGTCACGTAATGGAACAATTCAAGGTGTATGACGTCATC
TTTGAATTTAATCCGAAGTTGGAGGATGGCTGCGTCTGCAAAATCACTATGATATGGGAG
AAGCGTAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAAGTCGTCAAGAGCATGATT
GCTGACATGGACGACCACGTTCTCAAAGCTTA******ATCATCATCATCATCATCATCG
CCATCACATTCCACCATATCATTAATTCACCATCACAATCACCGTCACCGTGATCAATAT
CATCTCCATTACAAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAGTTCAATAAATGGGGTCTTGCTG
AGTTTATTTCTTTGTAAGACC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2E987TF 711 0 0
G
GATCAACCAAAACAAACAAACAAAAAAGAGTCTAGGCCTTTAAACGAGAGAGAGAAATGG
CGACGTCGGGAACATACGTGACGGAGGTTCCATTGAAAGGCACGGTGGAGAAACACTACA
AGAAGTGGAGAAGCGAGAACCATGCCATCCCGGAAGCCATCGGTCAGCACATCCAAAATG
TAACCATTCACGAAGGGGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGGACTACACAT
GCGATGGGAAGCCGGAGGTGTTCAAGGAAAGGACAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGG
TGACGTATAGAGGACTTGAAGTTCACGTAATGGAACAATTCAAGGTGTATGACGTCATCT
TTGAATTTAATGCGAAGTTGGAGGATGGCTGCGTCTGCAAAATCACTATGATATGGGAGA
AGCGTAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTCGTCAAGAGCATGATTG
CTGACATGGACGACCACGTTCTCAAAGCTTA******ATCATCATCATCATCATCATCGC
CATCACATTCCACCATATCATTAATTCACCATCACAATCACCGTCACCGTGATCAATATC
ATTTCCATTACAAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAGTTCAATAAATGGGGTCTTGCTGA
GTTTATTTCTTTGTAAGACCATGCTTTTATATGTACTCTTGTGGTCATCG

QA 2 711 2 711
DS 

RD RR2ES84TF 710 0 0
GATCAACCAAAACAAACAAACAAAAAAGAGTCTAGGCCTTTAAACGAGAGAGAGAAATGG
CGACGTCGGGAACATACGTGACGGAGGTTCCATTGAAAGGCACGGTGGAGAAACACTACA
AGAAGTGGAGAAGCGAGAACCATGCCATCCCGGAAGCCATCGGTCAGCACATCCAAAATG
TAACCATTCACGAAGGGGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGGACTACACAT
GCGATGGGAAGCCGGAGGTGTTCAAGGAAAGGACAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGG
TGACGTATAGAGGACTTGAAGGTCACGTAATGGAACAATTCAAAGTGTATGACGTCATCT
TTGAATTTAATCCGAAGTTTGAGGATGGCTGCGTCTGCAAAATCACTATGATATGGGAGA
AGCGTAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAAGTCGTCAAGAGCATGATTG
CTGACATGGACGACCACGTTCTCAAAGCTTA******ATCATCATCATCATCATCATCGC
CATCACATTCCACCATATCATTAATTCACCATCACAATCACCGTCACCGTGATCAATATC
ATCTCCATTACAAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAGTTCAATAAATGGGGTCTTGCTGA
GTTTATTTCTTTGTATGACCATGCTTTTATATGTACTCTTGTGGTCATCG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2C970TF 710 0 0
GGATCAACCAAAAC
AAACAAACAAACAAAAAAGAGTCTAAGCCTTTAAACGAGAGAGAGAAATGGCGACGTCGG
GAACATACGTGACGGAGGTTCCATTGAAAGGGACGGTGGAGAAACACTACAAGAAGTGGA
GAAGCGAGAACCATGCCATCCCGGAAGCCATCGGTCACCACATCCAGAATGTAACCATTC
ACGAAGGGGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGGACTACACATGCGATGGGA
AGCCGGAGGTATTCAAGGAAAGGACAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTGACGTATA
GAGGACTTGAAGGTCACGTAATGGAACAATTCAAGGTGTATGACGTCATCTTTGAATTTA
ATCCGAAGTTGGAGGATGGCTGCGTCTGCAAAATCACTATGATATGGGAGAAGCGTAACG
ATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAAGTCGTCAAGAGCATGATTGCTGACATGG
ACGACCACGTTCTCAAAGCTTAATCACCATCATCATCATCATCATCATCGCCATCACAAT
CCACCATATCATTAATTCACCATCACAATCACCGTCACCATGATCAATATCATCTCCATT
ACAAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAGTTCAATAAATGGGGTCTTGCTGAGTTTATTTC
TTTGTAAGACCATGCTTTTATATGTACTCTTGTGTT

QA 15 710 15 710
DS 

RD RR2A795JQ 266 0 0
ATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAAGTCGTCAAGAGCAAGATTGCTGACGTGG
ACGACCACGTTCTCAAAGCTTAATCACCATCATCATCATCATCATCATCGCCATCACAAT
CCACCATATCATTAATTCACCATCACAATCACCGTCACCATGATCAATATCATCTCCATT
ACAAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAGTTCAATAAATGGGGTCTTGCTGAGTTTATTTC
TTTGTAAGACCATGCTTTTATATGTA

QA 1 266 1 266
DS 

RD RR2ER28TF 740 0 0
GGCATCAACCAAAAC
AAACAAACAAACAAAAAAGAGCCTAAGCCTTTAAACGAGAGAGAGAAATGGCGACGTCGG
GAACATACGTGACGGAGGTTCCATTGAAAGGGACGGTGGAGAAACACTACAAGAAGTGGA
GAAGCGAGAACCATGCCATCCCGGAAGCCATCGGTCACCACATCCAAAATGTAACCATTC
ACGAAGGGGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGGACTACACATGCGATGGGA
AGCCGGAGGTATTCAAGGAAAGGACAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTGACGTATA
GAGGACTTGAAGGTCACGTAATGGAACAATTCAAGGTGTATGACGTCATCTTTGAATTTA
ATCCGAAGTTGGAGGATGGCTGCGTCTGCAAAATCACTATGATATGGGAGAAGCGTAACG
ATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAAGTCGTCAAGAGCATGATTGCTGACATGG
ACGACCACGTTCTCAAAGCTTAATCACCATCATCATCATCATCATCATCGCCATCACAAT
CCACCATATCATTAATTCACCATCACAATCACCGTCACCATGATCAATATCATCTCCATT
ACAAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAGTTCAATAAATGGGGTCTTGCTGAGTTTATTTC
TTTGTAAGACCATGCTTTTATATGTACTCTTGTGTTCATCGACCGGTTTGATATGTTCTT
GTTTA

QA 16 740 16 740
DS 

RD RR2H776TF 739 0 0
GGATCAACCAAAAC
AAACAAACAAACAAAAAAGAGTCTAAGCCTTTAAACGAGAGAGAGAAATGGCGACGTCGG
GAACATACGTGACGGAGGTTCCATTGAAAGGGACGGTGGAGAAACACTACAAGAAGTGGA
GAAGCGAGAACCATGCCATCCCGGAAGCCATCGGTCACCACATCCAAAATGTAACCATTC
ACGAAGGGGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGGACTACACATGCGATGGGA
AGCCGGAGGTATTCAAGGAAAGGACAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTGACGTATA
GAGGACTTGAAGGTCACGTAATGGAACAATTCAAGGTGTATGACGTCATCTTTGAATTTA
ATCCGAAGTTGGAGGATGGCTGCGTCTGCAAAACCACTATGATATGGGAGAAGCGTAACG
ATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAAGTCGTCAAGAGCATGATTGCTGACATGG
ACGACCACGTTCTCAAAGCTTAATCACCATCATCATCATCATCATCATCGCCATCACAAT
CCACCATATCATTAATTCACCATCACAATCACCGTCACCATGATCAATATCATCTCCATT
ACAAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAGTTCAATAAATGGGGTCTTGCTGAGTTTATTTC
TTTGTAAGAC*ATGCTTTTATATGTACTCTTGTGTTCATCGACCGGTTTGATATGTTCTT
GTTTA

QA 15 739 15 739
DS 

RD RR2DA44TF 688 0 0
ATGGCGACGTCGGGAACATACGTGACGGAGGTTCCATTGAAAGGGACGGTGGAGAAACAC
TACAAGAAGTGGAGAAGCGAGAACCATGCCATCCCGGAAGCCATCGGTCACCACGTCCAA
AATGTAACCATTCACGAAGGGGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGGACTAC
ACATGCGATGGGAAGCCGGAGGTATTCAAGGAAAGGACAGAGATAGACGATGAGAAGAAA
ACGGTGACGTATAGAGGACTTGAAGGTCACGTAATGGAACAATTCAAGGTGTATGACGTC
ATCTTTGAATTTAATCCGAAGTTGGAGGATGGCTGCGTCTGCAAAATCACTATGATATGG
GAGAAGCGTAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAAGTCGTCAAGAGCATG
ATTGCTGACATGGACGACCACGTTCTCAAAGCTTAATCACCATCATCATCATCATCATCA
TCGCCATCACAATCCACCATATCATTAATTCACCATCACAATCACCGTCACCATGATCAA
TATCATCTCCATTACAAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAGTTCAATAAATGGGGTCTTG
CTGAGTTTATTTCTTTGTAAGACCATGCTTTTATATGTACTCTTGTGTTCATCGACCGGT
TTGATATGTTCTTGTTTACTTATCAATA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2DA44JQ 692 0 0
GGGAACATACGTGACGGAGGTTCCATTGAAAGGGACGGTGGAGAAACACTACAAGAAGTG
GAGAAGCGAGAACCATGCCATCCCGGAAGCCATCGGTCACCACGTCCAAAATGTAACCAT
TCACGAAGGGGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGGACTACACATGCGATGG
GAAGCCGGAGGTATTCAAGGAAAGGACAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTGACGTA
TAGAGGACTTGAAGGTCACGTAATGGAACAATTCAAGGTGTATGACGTCATCTTTGAATT
TAATCCGAAGTTGGAGGATGGCTGCGTCTGCAAAATCACTATGATATGGGAGAAGCGTAA
CGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAAGTCGTCAAGAGCATGATTGCTGACAT
GGACGACCACGTTCTCAAAGCTTAATCACCATCATCATCATCATCATCATCGCCATCACA
ATCCACCATATCATTAATTCACCATCACAATCACCGTCACCATGATCAATATCATCTCCA
TTACAAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAGTTCAATAAATGGGGTCTTGCTGAGTTTATT
TCTTTGTAAGACCATGCTTTTATATGTACTCTTGTGTTCATCGACCGGTTTGATATGTTC
TTGTTTACTTATCAATATATTCCAGTTTTATT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2H776JQB 691 0 0
GGAACATACGTGACGGAGGTTCCATTGAAAGGGACGGTGGAGAAACACTACAAGAAGTGG
AGAAGCGAGAACCATGCCATCCCGGAAGCCATCGGTCACCACATCCAAAATGTAACCATT
CACGAAGGGGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGGACTACACATGCGATGGG
AAGCCGGAGGTATTCAAGGAAAGGACAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTGACGTAT
AGAGGACTTGAAGGTCACGTAATGGAACAATTCAAGGTGTATGACGTCATCTTTGAATTT
AATCCGAAGTTGGAGGATGGCTGCGTTTGCAAAACCACTATGATATGGGAGAAGCGTAAC
GATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAAGTCGTCAAGAGCATGATTGCTGACATG
GACGACCACGTTCTCAAAGCTTAATCACCATCATCATCATCATCATCATCGCCATCACAA
TCCACCATATCATTAATTCACCATCACAATCACCGTCACCATGATCAATATCATCTCCAT
TACAAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAGTTCAATAAATGGGGTCTTGCTGAGTTTATTT
CTTTGTAAGACCATGCTTTTATATGTACTCTTGTGTTCATCGACCGGTTTGATATGTTCT
TGTTTACTTATCAATATATTCCAGTTT
TATT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 2 14

CO CL311Contig1 582 5 5 U
GGACCAACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGTTG
GAGATCTTTACCCTTGCCTCTCCTACGTTGTTCAAGGCGGAAACGTACCAGCGAACTGCT
GCAACGGTATCAGGACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGCGTCT
GCCGTTGCATCAAAAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAATG
CTCAGTCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCA
ATTGCGACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGAAC
TAAATAAGAAGTCATTAATAAATTAGAACGAGTATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTT
GTGATGTATCGTCACTCCTATGTTTTTTGAAAGTTCTAATAAATTATCAACATGCACTTT
CTATGATATGAGACCAAAATATATATCAACAATTCTCGACGC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2DN69JQ C 4
AF RR2H935TF U 4
AF RR2E909TF U 15
AF RR2AN38JQ C 1
AF RR2DN69TF U 4
BS 1 5 RR2AN38JQ
BS 6 102 RR2DN69TF
BS 103 103 RR2H935TF
BS 104 578 RR2DN69TF
BS 579 582 RR2AN38JQ

RD RR2DN69JQ 253 0 0
GG
AACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATCTTACTAGCCTTGTTC
CTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTTTTGCAACGCAGTGGTTGGAGAT
CTTTACCCTTGCCTTTCCTACGTTGTTCAAGGCGGAAACGTACCAGCGAACTGCTGCAAC
GGTATCAGGACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGCGTCTGCCGT
TGCATCAAAAA

QA 3 253 3 253
DS 

RD RR2H935TF 525 0 0
GG
AACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAATAACATGAGATCTATCTTACTAGCCTTGTTC
CTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGTTGGAGAT
CTTTACCCTTGCCTCTCCTACGTTGTTCAAGGCGGAAACGTACCAGCGAACTGCTGCAAC
GGTATCAGGACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGCGTCTGCCAT
TGCATCAAAAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAATGCTCAG
TCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCAATTGC
GACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGAACTAAAT
AAGAAGTCATTAATAAATTAGAACGAGTATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTTGTGAT
GTATCGTCACTCCTATGTTTTTTGAAAGTTCTAATAAATTATC

QA 3 525 3 525
DS 

RD RR2E909TF 524 0 0
AAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATCTTACTAGCCTTGTTCCTAGTTCTT
GCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGTTGGAGATCTTTACCCT
TGCCTCTCCTACGTTGTTCAAGGCGGAAACGTACCAGCGAACTGCTGCAACGGTATCAGG
ACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGCGTCTGCCGTTGCATCAAA
AATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAATGCTCAGTCTCTGCCT
GCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCAATTGCGACAGTATC
AACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGAACTAAATAAGAAGTCA
TTAATAAATTAGAACGAGTATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTTGTGATGTATCGTCA
CTCCTATGTTTTTTGAAAGTTCTAATAAATTATCAACATGCACT

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2AN38JQ 582 0 0
GGACCAACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATCTTACTACCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGTTG
GAGATCTTTACCCTTGCCTCTCCTACGTTGTTCAAGGCGGAAACGTACCAGCGAACTGCT
GCAACGGTATCAGGACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGCGTCT
GCCGTTGCATCAAAAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAATG
CTCAGTCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCA
ATTGCTACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGAAC
TAAATAAGAAGTCATTAATAAATTAGAACGAGTATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTT
GTGATGTATCGTCACTCCTATGTTTTTTGAAAGTTCTAATAAATTATCAACATGCACTTT
CTATGATATGAGACCAAAATATATATCAACAATTCTCGACGC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2DN69TF 575 0 0
GG
AACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATCTTACTAGCCTTGTTC
CTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTTTTGCAACGCAGTGGTTGGAGAT
CTTTACCCTTGCCTCTCCTACGTTGTTCAAGGCGGAAACGTACCAGCGAACTGCTGCAAC
GGTATCAGGACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGCGTCTGCCGT
TGCATCAAAAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAATGCTCAG
TCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCAATTGC
GACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGAACTAAAT
AAGAAGTCATTAATAAATTAGAACGAGTATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTTGTGAT
GTATCGTCACTCCTATGTTTTTTGAAAGTTCTAATAAATTATCAACATGCACTTTCTATG
ATATGAGACCAAAATATATATCAACAATTCTCG

QA 3 575 3 575
DS 



CO CL311Contig2 549 9 8 U
GGAACCAAGGACAACAACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATC
TTACTAGCCTTGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAAC
GCAGTGGTTGGAGATCTTTACCCTTGCCTCTCCTACGTGGTTCAAGGCGGTAACGTCCCA
GCGAACTGCTGCAACGGTATCAGAACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGT
CAGGGAGTCTGCCGTTGCATCAAAAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAAC
CTCAACAATGCTCAGTCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGC
CCTTCCACCAACTGCGACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTA
CTACAAGAACTAAATAAGAAGTCATTAATAAATTAGAACGTATGGTTTGCTACTAGCTAC
GTTAATTTGTGATGTATCTATGTTTTTTGAAATTAAAGTTCTAATAAATTATCAACATGC
ACTTTCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 30 50 30 50 50 30 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 30 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
20 40 40 40 40 30 10 10 10 

AF RR2AU05JQ C 9
AF RR2G147TF U 9
AF RR2DL66TF U 5
AF RR2CI46TF U 1
AF RR2AU05TF U 9
AF RR2CJ76TF U 9
AF RR2CJ76JQ C 61
AF RR2D869TF U 9
AF RR2ER87TF U 9
BS 1 8 RR2CI46TF
BS 9 10 RR2AU05TF
BS 11 12 RR2CI46TF
BS 13 13 RR2AU05TF
BS 14 298 RR2CI46TF
BS 299 299 RR2AU05TF
BS 300 546 RR2CI46TF
BS 547 549 RR2AU05TF

RD RR2AU05JQ 253 0 0
GGACAACAACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATCTTACTAGC
CTTGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGT
TGGAGATCTTTACCCTTGTCTCTCCTACGTGGTTCAAGGCGGTAACGTCCCAGCGAACTG
CTGCAACGGTATCAGAACGCTCAGCAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGAGT
CTGCCGTTGCATC

QA 1 253 1 253
DS 

RD RR2G147TF 519 0 0
GGACAACAACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATCTTACTAGC
CTTGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGT
TGGAGATCTTTACCCTTGCCTCTCCTACGTGGTTCAAGGCGGTAACGTCCCAGCGAACTG
CTGCAACGGTATCAGAACGCTCAACAGTCGGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGAGT
CTGCCGTTGCATCAAAAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAA
TGCCCAGTCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCAC
CAACTGCGACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGA
ACTAAATAAGAAGTCATTAATAAATTAGAACGTATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTT
GTGATGTATCTATGTTTTTTGAAATTAAAGTTCTAA
ATT

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2DL66TF 534 0 0
GGAAAC
ACAACAACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGTTG
GAGATCTTTACCCTTGCCTCTCCTACGTGGTTCAAGGCGGTAACGTCCCAGCGAACTGCT
GCAACGGTATCAGAACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGAGTCT
GCCGTTGCATCAAAAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAATG
CTCAGTCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCA
ACTGCGACAGTATCAACTGATAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGAAC
TAAATAAGAATTCATTAATAAATTAGAACGTATGGTTTGCTACTATCTACGTTAATTTGT
GATGTATCTATGTTTTTTGAAATTAAAGTTCTAATAAATTATCAACAT

QA 7 534 7 534
DS 

RD RR2CI46TF 549 0 0
GGAACCAAACACGACAACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATC
TTACTAGCCTTGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAAC
GCAGTGGTTGGAGATCTTTACCCTTGCCTCTCCTACGTGGTTCAAGGCGGTAACGTCCCA
GCGAACTGCTGCAACGGTATCAGAACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGT
CAGGGAGTCTGCCGTTGCATCAAAAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAGC
CTCAACAATGCTCAGTCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGC
CCTTCCACCAACTGCGACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTA
CTACAAGAACTAAATAAGAAGTCATTAATAAATTAGAACGTATGGTTTGCTACTAGCTAC
GTTAATTTGTGATGTATCTATGTTTTTTGAAATTAAAGTTCTAATAAATTATCAACATGC
ACTTTC
TAA

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2AU05TF 541 0 0
GGACAACAACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATCTTACTAGC
CTTGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGT
TGGAGATCTTTACCCTTGTCTCTCCTACGTGGTTCAAGGCGGTAACGTCCCAGCGAACTG
CTGCAACGGTATCAGAACGCTCAGCAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGAGT
CTGCCGTTGCATCAAAAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAA
TGCTCAGTCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCAC
CAACTGCGACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGA
ACTAAATAAGAAGTCATTAATAAATTAGAACGTATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTT
GTGATGTATCTATGTTTTTTGAAATTAAAGTTCTAATAAATTATCAACATGCACTTTCTA
T

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR2CJ76TF 541 0 0
GGACAACAACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATCTTACTAGC
CTTGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGCCTTGCAACGCAGTGGT
TGGAGATCTTTACCCTTGCCTCTCCTACGTGGTTCAAGGCGGTAACGTCCCAGCGAACTG
CTGCAACGGTATCAGAACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGAGG
CTGCCGTTTCATCAAAAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAA
TGCTCAGTCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCAC
CAACTGCGACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGA
ACTAAATAAGAAGTCATTAATAAATTAGAACGTATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTT
GTGATGTATCTATGTTTTTTGAAATTAAAGTTCTAATAAATTATCAACATGCACTTTC
TAT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2CJ76JQ 485 0 0
TTACTAGCCTTGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGCCTTGCAAC
GCAGTGGTTGGAGATCTTTACCCTTGCCTTTCCTACGTGGTTCAAGGCGGTAACGTCCCA
GCGAACTGCTGCAACGGTATCAGAACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGT
CAGGGAGGCTGCCGTTTCATCAAAAATGCTATCGGAGGAGTTTCTTTTTTTTTTAACAAC
CTCAACAATGCTCAGTTTTTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGC
CCTTCCACCAACTGGGACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTA
CTACAAGAACTAAATAAGAAGTCATTAATAAATTAGAACGTATGGTTTGCTACTAGCTAC
GTTAATTTGTGATGTATCTATGTTTTTTGAAATTAAAGTTTTAATAAATTATCAACATGC
CCTTT

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2D869TF 538 0 0
GGACAACAACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATCTTACTAGC
CTTGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGT
TGGAGATCTTTACCCTTGCCTCTCCTACGTGGTTCAAGGCGGTAACGTCCCAGCGAACTG
CTGCAACGGTATCAGAACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGAGT
CTGCCGTTGCATCAAAAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAA
TGCTCAGTCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCAC
CAACTGCGACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGA
ACTAAATAAGAAGTCATTAATAAATTAGAACGTATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTT
GTGATGTATCTATGTTTTTTGAAATTAAAGTTCTAATAAATTATCAACATGCACTTTC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2ER87TF 538 0 0
GGACAACAACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATCTTACTAGC
CTTGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGT
TGGAGATCTTTACCCTTGCCTCTCCTACGTGGTTCAAGGCGGTAACGTCCCAGCGAACTG
CTGCAACGGTATCAGAACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGAGT
CTGCCGTTGCATCAAAAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAA
TGCTCAGTCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCAC
CAACTGCGACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGA
ACTAAATAAGAAGTCATTAATAAATTAGAACGTATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTT
GTGATGTATCTATGTTTTTTGAAATTAAAGTTCTAATAAATTATCAACATGCACTTTC

QA 1 538 1 538
DS 



AS 3 11

CO CL312Contig1 849 4 2 U
CAAAACCAAATAATAAGCTCTCAAGTCTTTTATTTCAAAATGTGCTGAAGCCGTTTATGA
AAAATTTCCACATTTGGGATACAAATTGCAGGTCACAAAGATGTAAACTAAGAAAGGATA
GCCATCACATCTGAAGCTCTCAGGGCGATGTAGTTGGAACCATCTTTGCCCTTGAAATCA
TTGCCGGCATACTTGGAGTAAAGAACTGTGCTTCCAGTCGATATTGCTAGTGGCTGACGC
TTACCTTCCTCATCTAGAGAACCTGGTCCAACTGCTATCACCGTGCCAATAGAAGGCTTC
TCTTTGGTAGTCTCGGTTAGCAACAACCCTCCAGCTGTTTTCTCCTCAGCCTCAGCAACC
TTAATAAAGACTCGGTCGTTCAATGGCTTGAGATCTTTGATGTCCTCGGTCTCAAGAAGG
CCAACAATATCATCTTCCTTGAGAATGAGATGTTTCACATCGTTGAACTCCACTTCGGTT
CCTGCGTATTTGGAGTAAATGATCTGTGCTCCAGTAGGGACATCGATATCGATTTTGTTC
TTCCCAATAGTTCTTCTCCTCTGCCTCCTTGGTCTTAACCAAAACTCGATCTCCCAATGG
CTTAATTGAAGTGTACTTGGGAGCAACAACGGAAGCAGCTCTGGCAACCAAAGAACGGAA
CTGAGTCTGCTTAAGGGTGCCTGGTTTCAAAGTTCCAAACTTGATGGCACTCGAAGCTCT
GAGTGAGGCTAAGCTCCTAGCTGACACAGTCACTGGTGATGCTGTGAGTTGAGTCGCCGC
CATTTCTGCTGTCTTGAGGATAAGAGAAGAAGGGGGGGGGGGCACTGTGACTTTGGAAGA
TAAAACCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW09JQ U 15
AF RR2DD60JQ U 351
AF RR2AB08JQ U 1
AF RR2AB08TF C 56
BS 1 809 RR2AB08JQ
BS 810 849 RR2AB08TF

RD RR2FW09JQ 480 0 0
AAGCTCTCAAGTCTTTTATTTCAAAATGTGCTGAAGCCGTTTATGAAAAATTTCCACATT
TGGGATACAAATTGCAGGTCACAAAGATGTAAACTAAGAAAGGATAGCCATCACATCTGA
AGCTCTCAGGGCGATGTAGTTGGAACCATCTTTGCCCTTGAAATCATTGCCGGCATACTT
GGAGTAAAGAACTGTGCTTCCAGTCGATATTGCTAGTGGCTGACGCTTACCTTCCTCATC
TAGAGAACCTGGTCCAACTGCTATCACCGTGCCAATAAAAGGCTTCTCTTTGGTAGTCTC
GGTTAGCAACAACCCTCCAGCTGTTTTCTCCTCAGCCTCAGCAACCTTAATAAAGACTCG
GTCGTTCAATGGCTTGAGATCTTTGATGTCCTCGGTCTCAAGAAGGCCAACAATATCATC
TTCCTTGAGAATGAAATGTTTCACATCGTTGAACTCCACTTCGGTTCCTGCGTATTTGGA

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2DD60JQ 196 0 0
CTCAGCAACCTTAATAAAAACTCGGTCGTTCAATGGCTTGAAATCTTTGATGTCCTCGGT
CTCAAAAAGGCCAACAATATCATCTTCCTTGAAAATGAAATGTTTCACATCGTTGAACTC
CACTTCGGTTCCTGCGTATTTGGAGTAAATGATCTGTGCTCCAGTAGGGACATCGATATC
GATTTTGTTCTTCCCA

QA 1 196 1 196
DS 

RD RR2AB08JQ 809 0 0
CAAAACCAAATAATAAGCTCTCAAGTCTTTTATTTCAAAATGTGCTGAAGCCGTTTATGA
AAAATTTCCACATTTGGGATACAAATTGCAGGTCACAAAGATGTAAACTAAGAAAGGATA
GCCATCACATCTGAAGCTCTCAGGGCGATGTAGTTGGAACCATCTTTGCCCTTGAAATCA
TTGCCGGCATACTTGGAGTAAAGAACTGTGCTTCCAGTCGATATTGCTAGTGGCTGACGC
TTACCTTCCTCATCTAGAGAACCTGGTCCAACTGCTATCACCGTGCCAATAGAAGGCTTC
TCTTTGGTAGTCTCGGTTAGCAACAACCCTCCAGCTGTTTTCTCCTCAGCCTCAGCAACC
TTAATAAAGACTCGGTCGTTCAATGGCTTGAGATCTTTGATGTCCTCGGTCTCAAGAAGG
CCAACAATATCATCTTCCTTGAGAATGAGATGTTTCACATCGTTGAACTCCACTTCGGTT
CCTGCGTATTTGGAGTAAATGATCTGTGCTCCAGTAGGGACATCGATATCGATTTTGTTC
TTCCCAATAGTTCTTCTCCTCTGCCTCCTTGGTCTTAACCAAAACTCGATCTCCCAATGG
CTTAATTGAAGTGTACTTGGGAGCAACAACGGAAGCAGCTCTGGCAACCAAAGAACGGAA
CTGAGTCTGCTTAAGGGTGCCTGGTTTCAAAGTTCCAAACTTGATGGCACTCGAAGCTCT
GAGTGAGGCTAAGCTCCTAGCTGACACAGTCACTGGTGATGCTGTGAGTTGAGTCGCCGC
CATTTCTGCTGTCTTGAGGATAAGAGAAG

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2AB08TF 794 0 0
TATGAAAAATTTCCACATT*GGGATACAAATTGCAGGTCACAAAGATGTAAACTAAGAAA
GGATAGCCATCACATCTGAAGCTCTCAGGGCGATGTAGTTGGAACCATCTTTGCCCTTGA
AATCATTGCCGGCATACTTGGAGTAAAGAACTGTGCTTCCAGTCGATATTGCTAGTGGCT
GACGCTTACCTTCCTCATCTAGAGAACCTGGTCCAACTGCTATCACCGTGCCAATAGAAG
GCTTCTCTTTGGTAGTCTCGGTTAGCAACAACCCTCCAGCTGTTTTCTCCTCAGCCTCAG
CAACCTTAATAAAGACTCGGTCGTTCAATGGCTTGAGATCTTTGATGTCCTCGGTCTCAA
GAAGGCCAACAATATCATCTTCCTTGAGAATGAGATGTTTCACATCGTTGAACTCCACTT
CGGTTCCTGCGTATTTGGAGTAGATGATCTGTGCTCCAGTAGGGACATCGATATCGATTT
TGTTCTTCCCAATAGTTCTTCTCCTCTGCCTCCTTGGTCTTAACCAAAACTCGATCTCCC
AATGGCTTAATTGAAGTGTACTTGGGAGCAACAACGGAAGCAGCTCTGGCAACCAAAGAA
CGGAACTGAGTCTGCTTAAGGGTGCCTGGTTTCAAAGTTCCAAACTTGATGGCACTCGAA
GCTCTGAGTGAGGCTAAGCTCCTAGCTGACACAGTCACTGGTGATGCTGTGAGTTGAGTC
GCCGCCATTTCTGCTGTCTTGAGGATAAGAGAAGAAGGGGGGGGGGGCACTGTGACTTTG
GAAGATAAAACCCT

QA 1 794 1 794
DS 



CO CL312Contig2 554 2 2 U
CTCAAGTCTTTTATTTCAGATTGTGCTGAAGCCGTTTATGAAAAATTTCCACATTTGGGA
CACAAATTGCAGGTCACAAAGATACAAACTAAGAAAGGATAGCCATCACATCCGAAGCTC
TCAGGGCGAAGTAGTTGGAACCATCTTTGCCCTTGAAGTCATTGCCAGCATACTTGGAGT
AAAGAACTGTGCTTCCAGTCGACATCGACAGTGGCTGACGCTTACCTTCCTCATCTAGAG
AACCTGGTCCAACTGCTATCACCGTGCCAATAGAAGGCTTCTCTTTGGTAGTCTCGGTTA
GCAACAAACCTCCAGCTGTTTTCTCCTCTGCCTCAGCAACCTTAATGAAGACTCGGTCAT
TCAATGGCTTGAGATCTTTGATGTCCTCCGTCTCAAGAAGGCCAACGATATCATCTTCCT
TGAGAATGAGATGCTTCACATCGTTGAACTCCACTTCGGTTCCTGCGTATTTGGAGTAGA
TGATCTGTGCTCCAGTAGGGACATCGATATCGATTTTGTTCTTTCCAATAGTTCGTCCTT
CACCCACAGCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2CX28TF C 1
AF RR2CX28JQ U 125
BS 1 124 RR2CX28TF
BS 125 554 RR2CX28JQ

RD RR2CX28TF 554 0 0
CTCAAGTCTTTTATTTCAGATTGTGCTGAAGCCGTTTATGAAAAATTTCCACATTTGGGA
CACAAATTGCAGGTCACAAAGATACAAACTAAGAAAGGATAGCCATCACATCCGAAGCTC
TCAGGGCGATGTAGTTGGAACCATCTTTGCCCTTGAAGTCATTGCCAGCATACTTGGAGT
AAAGAACTGTGCTTCCAGTCGACATCGACAGTGGCTGACGCTTACCTTCCTCATCTAGAG
AACCTGGTCCAACTGCTATCACCGTGCCAATAGAAGGCTTCTCTTTGGTAGTCTCGGTTA
GCAACAAACCTCCAGCTGTTTTCTCCTCTGCCTCAGCAACCTTAATGAAGACTCGGTCAT
TCAATGGCTTGAGATCTTTGATGTCCTCCGTCTCAAGAAGGCCAACGATATCATCTTCCT
TGAGAATGAGATGCTTCACATCGTTGAACTCCACTTCGGTTCCTGCGTATTTGGAGTAGA
TGATCTGTGCTCCAGTAGGGACATCGATATCGATTTTGTTCTTTCCAATAGTTCGTCCTT
CACCCACAGCAAT
C

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2CX28JQ 430 0 0
GGCGAAGTAGTTGGAACCATCTTTGCCCTTGAAGTCATTGCCAGCATACTTGGAGTAAAG
AACTGTGCTTCCAGTCGACATCGACAGTGGCTGACGCTTACCTTCCTCATCTAGAGAACC
TGGTCCAACTGCTATCACCGTGCCAATAGAAGGCTTCTCTTTGGTAGTCTCGGTTAGCAA
CAAACCTCCAGCTGTTTTCTCCTCTGCCTCAGCAACCTTAATGAAGACTCGGTCATTCAA
TGGCTTGAGATCTTTGATGTCCTCCGTCTCAAGAAGGCCAACGATATCATCTTCCTTGAG
AATGAGATGCTTCACATCGTTGAACTCCACTTCGGTTCCTGCGTATTTGGAGTAGATGAT
CTGTGCTCCAGTAGGGACATCGATATCGATTTTGTTCTTTCCAATAGTTCGTCCTTCACC
CACAGCAATC

QA 1 430 1 430
DS 



CO CL312Contig3 961 5 7 U
GGCCGTTTCTAGTCTATCTATCTAATCTCTTGTGCAACTTTTTAGGGTTTTATCTTCCAA
AGTCACAGTGCCCCCCTCCCCTTCTTCTCTTATCCTCAAGACAGCAGAAATGGCGGCGAC
TCAACTCACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCTAGGAGCTTAGCCTCACTCAGAGCTTC
GAGTGCCATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGCACCCTTAAGCAGACTCAGTTCCGTTC
TTTGGTTGCCAGAGCTGCTTCCGTTGTTGCTCCCAAGTACACTTCAATTAAGCCATTGGG
AGATCGAGTTTTGGTTAAGACCAAGGAGGCAGAGGAGAAGACTATGGGAGGTATCTTACT
TCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAGGGAGGTGAAGTCATTGCTGTGGGTGAAGGAAG
AACTATTGGGAAGAACAAAATCGATATCGATGTCCCTACTGGAGCACAGATCATCTACTC
CAAATACGCAGGAACCGAAGTGGAGTTCAACGATGTGAAACATCTCATTCTCAAGGAAGA
TGATATTGTTGGCCTTCTTGAGACCGAGGACATCAAAGATCTCAAGCCATTGAACGACCG
AGTCTTTATTAAGGTTGCTGAGGCTGAGGAGAAAACAGCTGGAGGGTTGTTGCTAACCGA
GACTACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGTTGGACCAGGTTCTCTAGA
TGAGGCAGGTAAGCGTCAGCCACTAGCAATATCGACTGGAAGCACAGTTCTTTACTCCAA
GTATGCCGGCAATGATTTCAAGGGCAAAGATGGTTCCAACTACATCGCCCTGAGAGCTTC
AGATGTGATGGCTATCCTTTCTTAGTTTACATCTTTGTGACCTGCAATTTGTATCCCAAA
TGTGGAAATTTTTCATAAACGGCTTCAGCACATTCTGAAATAAAAGACTTGAGAGCTTAT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2DD60TF U 39
AF RR2FW09TF U 1
AF RR2ES45TF U 39
AF RR2G506TF U 50
AF RR2GW18JQ C 166
BS 1 402 RR2FW09TF
BS 403 403 RR2DD60TF
BS 404 608 RR2FW09TF
BS 609 712 RR2ES45TF
BS 713 713 RR2G506TF
BS 714 722 RR2ES45TF
BS 723 961 RR2GW18JQ

RD RR2DD60TF 449 0 0
TTTTTAGGGTTTTATCTTCCAAAGTCACAGTGCCCCCCTCCCCTTCTTCTCTTATCCTCA
AGACAGCAGAAATGGCGGCGACTCAACTCACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCTAGGA
GCTTAGCCTCACTCAGAGCTTCGAGTGCCATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGCACCC
TTAAGCAGACTCAGTTCCGTTCTTTGGTTGCCAGAGCTGCTTCCGTTGTTGCTCCCAAGT
ACACTTCAATTAAGCCATTGGGAGATCGAGTTTTGGTTAAGACCAAGGAGGCAGAGGAGA
AGACTATGGGAGGTATCTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAGGGAGGTGAAG
TCATTGCTGTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGAACAAAATCGATATCGATGTCCCTA
CTGGAGCACAGATCATCTACTCCAAATAC

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2FW09TF 608 0 0
GGCCGTTTCTAGTCTATCTATCTAATCTCTTGTGCAACTTTTTAGGGTTTTATCTTCCAA
AGTCACAGTGCCCCCCTCCCCTTCTTCTCTTATCCTCAAGACAGCAGAAATGGCGGCGAC
TCAACTCACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCTAGGAGCTTAGCCTCACTCAGAGCTTC
GAGTGCCATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGCACCCTTAAGCAGACTCAGTTCCGTTC
TTTGGTTGCCAGAGCTGCTTCCGTTGTTGCTCCCAAGTACACTTCAATTAAGCCATTGGG
AGATCGAGTTTTGGTTAAGACCAAGGAGGCAGAGGAGAAGACTATGGGAGGTATCTTACT
TCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAGGGAGGTGAAGTCATCGCTGTGGGTGAAGGAAG
AACTATTGGGAAGAACAAAATCGATATCGATGTCCCTACTGGAGCACAGATCATCTACTC
CAAATACGCAGGAACCGAAGTGGAGTTCAACGATGTGAAACATCTCATTCTCAAGGAAGA
TGATATTGTTGGCCTTCTTGAGACCGAGGACATCAAAGATCTCAAGCCATTGAACGACCG
AGTCTTTA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2ES45TF 684 0 0
TTTTTAGGGTTTTATCTTCCAAAGTCACAGTGCCCCCC****CTTCTTCTCTTATCCTCA
AGACAGCAGAAATGGCGGCGACTCAACTCACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCTAGGA
GCTTAGCCTCACTCAGAGCTTCGAGTGCCATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGCACCC
TTAAGCAGACTCAGTTCCGTTCTTTGGTTGCCAGAGCTGCTTCCGTTGTTGCTCCCAAGT
ATACTTCAATTAAGCCATTGGGAGATAGAGTTTTGGTTAAGACCAAGGAGGCAGAGGAGA
AGACTATGGGAGGTATCTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAGGGAGGTGAAG
TCATTGCTGTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGAACAAAATCGATATCGATGTCCCTA
CTGGAGCACAGATCATCTACTCCAAATACGCAGGAACCGAAGTGGAGTTCAACGATGTGA
AGCATCTCATTCTCAAGGAAGATGATATTGTTGGCCTTCTTGAGACGGAGGACATCAAAG
ATCTCAAGCCATTGAACGACCGAGTCTTTATTAAGGTTGCTGAGGCTGAGGAGAAAACAG
CTGGAGGGTTGTTGCTAACCGAGACTACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAG
CAGTTGGACCAGGT*CTCTAGATG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2G506TF 673 0 0
GG
ATCTTCCAAAGTCACAGTGCCCCCCTCCCCTTCTTCTCTTATCCTCAAGACAGCAGAAAT
GGCGGCGACTCAACTCACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCTAGGAGCTTAGCCTCACT
CAGAGCTTCGAGTGCCATCAAGTTTGGGACTTTGAAACCAGGCACCCTTAAGCAGACTCA
GTTCCGTTCTTTGGTTGCCAGAGCTGCTTCCGTTGTTGCTCCCAAGTACACTTCAATTAA
GCCATTGGGAGATCGAGTTTTGGTTAAGACCAAGGAGGCAGAGGAGAAGGCTATGGGAGG
TATCTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAGGGAGGTGAAGTCATTGCTGTGGG
TGAAGGAAGAACTATTGGGAAGAACAAAATCGATATCGATGTCCCTACTGGAGCACAGAT
CATCTACTCCAAATACGCAGGAACCGAAGTGGAGTTCAACGATGTGAAACATCTCATTCT
CAAGGAAGATGATATTGTTGGCCTTCTTGAGACCGAGGACATCAAAGATCTCAAGCCATT
GAACGACCGAGTCTTTATTAAGGTTGCTGAGGCTGAGGAGAAAACAGCTGGAGGGTTGTT
GCTAACCGAGACTACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGTTGGACCACG
TTCTCTAGATG

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR2GW18JQ 796 0 0
CTCACTCAGAGCTTCGAGTGCCATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGCACC*TTAAGCA
GACTCAGTTCCGTTCTTTGGTTGCCAGAGCTGCTTCCGTTGTTGCTCCCAAGTACACTTC
AATTAAGCCATTGGGAGATCGAGTTTTGGTTAAGACCAAGGAGGCAGAGGAGAAGACTAT
GGGAGGTATCTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAGGGAGGTGAAGTCATTGC
TGTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGAACAAAATCGATATCGATGTCCCTACTGGAGC
ACAGATCATTTACTCCAAATACACAGGAACCGAAGTGGAGTTCAACGATGTGAAACATCT
CATTCTCAAGGAAGATGATATTGTTGGCCTTCTTGAGACCGAGGACATCAAAGATCTCAA
GCCATTGAACGACCGAGTCTTTATTAAGGTTGCTGAGGCTGAGGAGAAAACAGCTGGAGG
GTTGTTGCTAACCGAGACTACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGTTGG
ACCAGGTTCTCTAGATGAGGCAGGTAAGCGTCAGCCACTAGCAATATCGACTGGAAGCAC
AGTTCTTTACTCCAAGTATGCCGGCAATGATTTCAAGGGCAAAGATGGTTCCAACTACAT
CGCCCTGAGAGCTTCAGATGTGATGGCTATCCTTTCTTAGTTTACATCTTTGTGACCTGC
AATTTGTATCCCAAATGTGGAAATTTTTCATAAACGGCTTCAGCACATTCTGAAATAAAA
GACTTGAGAGCTTATT

QA 1 796 1 796
DS 



AS 3 13

CO CL313Contig1 752 2 4 U
GGAGAACGGTTTGGGTGTTTTCTCTCACTACTAAGCTAAACCCACCACCAACCCTTTTTG
GGGGATTCTAGTGAGAGAAAGAAGCTTTGAATCCTTCCCTTTTTTTTCGAAAAAAAAAGG
AATAGAATCTAGAAATTCGGATATGTCGAGCTCAGTATCCACTTCGTTGTGTTGTTCGTC
AACCCAGGTCAATAGGTTCGGTCTTAGGCCTCAAAGGTCGCTCCTTTACCAACCCACTTC
CTTTTCTTTCTCCAGAAGGAGAAGTCATGATGGTGTTGTGAAGGCCACAGCTCGTGTTGA
TAAGTATTCCAAGAGTGATATCATCGTCTCTCCCTCCATTCTCTCTGCTAATTTCGCCAA
ATTAGGCGAGCAGGTAAAAGCAGTAGAGTGTGCAGGTTGTGATTGGATCCATGTTGATGT
GATGGATGGTCGTTTTGTTCCCAACATCACTATTGGACCTCTCGTGGTTGATGCTTTGCG
TCCTGTTACTGATCTTCCTTTGGATGTTCATCTTATGATAGTGGAACCAGATCTGAGGGT
ACCAGATTTCATCAAAGCAGGTGCAGACATCGTCAGTGTACACTGTGAGCAGTCATCCAC
CATCCATTTGCACCGCACTGTCAATCAAATCAAAAGCTTAGGTGCTAAAGCCTGGGAGTT
GTTCTAAACCCTGGAACCCCATTGAGTGCTATAGAATATGTATTGGGAGGGGGGTGGGAT
CTGGTCTTGATAATGTCGGTCAACCCCGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A014TF U 1
AF RR2AA30TF U 60
BS 1 97 RR2A014TF
BS 98 98 RR2AA30TF
BS 99 626 RR2A014TF
BS 627 752 RR2AA30TF

RD RR2A014TF 626 0 0
GGAGAACGGTTTGGGTGTTTTCTCTCACTACTAAGCTAAACCCACCACCAACCCTTTTTG
GGGGATTCTAGTGAGAGAAAGAAGCTTTGAATCCTTCTCTTTTTTTTCGAAAAAAAAAGG
AATAGAATCTAGAAATTCGGATATGTCGAGCTCAGTATCCACTTCGTTGTGTTGTTCGTC
AACCCAGGTCAATAGGTTCGGTCTTAGGCCTCAAAGGTCGCTCCTTTACCAACCCACTTC
CTTTTCTTTCTCCAGAAGGAGAAGTCATGATGGTGTTGTGAAGGCCACAGCTCGTGTTGA
TAAGTATTCCAAGAGTGATATCATCGTCTCTCCCTCCATTCTCTCTGCTAATTTCGCCAA
ATTAGGCGAGCAGGTAAAAGCAGTAGAGTGTGCAGGTTGTGATTGGATCCATGTTGATGT
GATGGATGGTCGTTTTGTTCCCAACATCACTATTGGACCTCTCGTGGTTGATGCTTTGCG
TCCTGTTACTGATCTTCCTTTGGATGTTCATCTTATGATAGTGGAACCAGATCTGAGGGT
ACCAGATTTCATCAAAGCAGGTGCAGACATCGTCAGTGTACACTGTGAGCAGTCATCCAC
CATCCATTTGCACCGCACTGTCAATC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2AA30TF 693 0 0
GGGGGATTCTAGTGAGAGAAAGAAGCTTTGAATCTTTCCCTTTTTTTTCGAAAAAAAA*G
GAATAGAATCTAGAAATTCGGATATGTCGAGCTCAGTATCCACTTCGTTGTGTTGTTCGT
CAACCCAGGTCAATGGGTTCGGTCTTAGGCCTCAAAGGTCGCTCCTTTACCAACCCACTT
CCTTTTCTTTCTCCAGAAGGAGAAGTCATGATGGTGTTGTGAAGGCCACAGCTCGTGTTG
ATAAGTATTCCAAGAGTGATATCATCGTCTCTCCCTCCATTCTCTCTGCTAATTTCGCCA
AATTAGGCGAGCAGGTAAAAGCAGTAGAGTGTGCAGGTTGTGATTGGATCCATGTTGATG
TGATGGATGGTCGTTTTGTTCCCAACATCACTATTGGACCTCTCGTGGTTGATGCTTTGC
GTCCTGTTACTGATCTTCCTTTGGATGTTCATCTTATGATAGTGGAACCAGATCTGAGGG
TACCAGATTTCATCAAAGCAGGTGCAGACATCGTCAGTTTACACTGTGAGCAGTCATCCA
CCATCCATTTGCACCGCACTGTCAATCAAATCAAAAGCTTAGGTGCTAAAGCCTGGGAGT
TGTTCTAAACCCTGGAACCCCATTGAGTGCTATAGAATATGTATTGGGAGGGGGGTGGGA
TCTGGTCTTGATAATGTCGGTCAACCCCGGTTT

QA 1 693 1 693
DS 



CO CL313Contig2 1338 7 10 U
GGACACACGTGGCAGGAAAAAACATAATCTTCGAGATTTTCTTCCTTTTTTTTCCCTTTC
CCGGAAAAAAAATCAATTTTCTTGTTGAGTTGAGCCGAAGGAAGAAGAGAGATAGAACGA
TTTGGGTGTTTTCTCTCACTACTAAGCTAAACCCACCACCACCAACCCTTTTTGGGGGAT
TCTAGTGGGGAGAAAGAAGCTTGAATCTTACTCTTTATTTGAAAAAGAAGGAATAGAATC
TAGAAAATCGGAAATGTCGAGCTCAGTATCCACTTCGTTGTGCTGTTCGTCAACCCAGGT
CAATGGGTTCGGTCTTAGGCCTCAAAGGTCCCTCCTTTACCAACCCTCTTCCTTTTCTTC
TTTCTCCAGAAGGAGAACTCATGGTGTTGTGAAGGCCACAGCTCGTGTTGATAAGTATTC
CAAGAGTGATATCATCGTCTCTCCCTCCATTCTCTCTGCTAATTTCGCCAAACTAGGCGA
GCAGGTAAAAGCAGTAGAGTGTGCAGGTTGTGATTGGATCCATGTTGATGTGATGGATGG
TCGTTTTGTTCCCAACATCACTATTGGACCTCTTGTGGTTGATGCTTTGCGTCCTGTTAC
TGATCTTCCTTTGGATGTTCATCTTATGATAGTGGAACCAGATCTGAGGGTACCAGATTT
CATCAAAGCAGGTGCAGACATCGTCAGTGTACACTGTGAGCAGTCATCCACCATCCATTT
GCACCGCACTGTCAATCAAATCAAAAGCTTAGGTGCTAAAGCTGGAGTTGTTCTAAACCC
TGGAACCCCATTGAGTGCTATAGAATATGTATTGGAGGTGGTGGATCTGGTCTTGATAAT
GTCGGTCAACCCCGGTTTTGGTGGACAGAGCTTTATCGAAAGCCAAGTTAAGAAAATCTC
GGATTTGAGAAGAATGTGTGTCGAAAAGGGAGTAAACCCATGGATTGAAGTTGATGGTGG
TGTCACTCCAAAGAATGCATACAAGGTTATTGAGGCTGGAGCAAATGCTCTAGTAGCTGG
ATCAGCTGTGTTTGGAGCTAAAGACTATGAAGAAGCTATAAAAGGAATCAAGACCAGCAA
GAAGCCAGAAGCTGTGGCTGTGTAATGTGAAGCAACAAGCTAAAAAGATCATAAGACAGA
TCACCGAGATGTTTATGTTGTTGTTGTTGTCATTCACCAGATTCCATTCGACATAAAAAA
ATCCATAAGAATCAAACTCTCGATGGTTTTGAAGTAGCTCGTTTATACTCCTCCTGTGTA
TCATTGTCTTGTAGATTTGGGGATATGCAGATTCAATACATTATGCAATTAATAAGAAAT
AAGCTGTGCTACATATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 20 20 
20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2DC87TF U 1
AF RR2GJ31TF U 112
AF RR2DU53TF U 73
AF RR2FV93TF U 131
AF RR2A014JQ C 646
AF RR2AA30JQ C 455
AF RR2DV64JQ C 899
BS 1 107 RR2DC87TF
BS 108 108 RR2DU53TF
BS 109 667 RR2DC87TF
BS 668 752 RR2FV93TF
BS 753 753 RR2AA30JQ
BS 754 840 RR2FV93TF
BS 841 1328 RR2AA30JQ
BS 1329 1329 RR2DV64JQ
BS 1330 1334 RR2AA30JQ
BS 1335 1338 RR2DV64JQ

RD RR2DC87TF 667 0 0
GGACACACGTGGCAGGAAAAAACATAATCTTCGAGATTTTCTTCCTTTTTTTTCCCTTTC
CCGGAAAAAAAATCAATTTTCTTGTTGAGTTGAGCCGAAGGAAGAAGGGAGATAGAACGA
TTTGGGTGTTTTCTCTCACTACTAAGCTAAACCCACCACCACCAACCCTTTTTGGGGGAT
TCTAGTGGGGAGAAAGAAGCTTGAATCTTACTCTTTATTTGAAAAAGAAGGAATAGAATC
TAGAAAATCGGAAATGTCGAGCTCAGTATCCACTTCGTTGTGCTGTTCGTCAACCCAGGT
CAATGGGTTCGGTCTTAGGCCTCAAAGGTCCCTCCTTTACCAACCCTCTTCCTTTTCTTC
TTTCTCCAGAAGGAGAACTCATGGTGTTGTGAAGGCCACAGCTCGTGTTGATAAGTATTC
CAAGAGTGATATCATCGTCTCTCCCTCCATTCTCTCTGCTAATTTCGCCAAACTAGGCGA
GCAGGTAAAAGCAGTAGAGTGTGCAGGTTGTGATTGGATCCATGTTGATGTGATGGATGG
TCGTTTTGTTCCCAACATCACTATTGGACCTCTTGTGGTTGATGCTTTGCGTCCTGTTAC
TGATCTTCCTTTGGATGTTCATCTTATGATAGTGGAACCAGATCTGAGGGTACCAGATTT
CATCAAA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2GJ31TF 556 0 0
GG
AGAACGATTTGGGTGTTTTCTCTCACTACTAAGCTAAGCCCACCACCACCAACCCTTTTT
GGGGGATTCTAGTGGGGAGAAAGAAGCTTGAATCTTACTCTTTATTTGAAAAAGAAGGAA
TAGAATCTAGAAAATCGGAAATGTCGAGCTCAGTATCCACTTCGTTGTGCTGTTCGTCAA
CCCAGGTCAATGGGTTCGGTCTTAGGCCTCAAAGGTCCCTCCTTTACCAACCCTCTTCCT
TTTCTTCTTTCTCCAGAAGGAGAACTCATGGTGTTGTGAAGGCCACAGCTCGTGTTGATA
AGTATTCCAATAGTGATATCATCGTCTCTCCCTCCATTCTCTCTGCTAATTTCGCCAAAC
TAGGC***CAGGTAAAAGCAGTAGAGTGTGCAGGTTGTGATTGGATCCATGTTGATGTGA
TGGATGGTCGTTTTGTTCCCAACATCACTATTGGACCTCTTGTGGTTGATGCTTTGCGTC
CTGTTACTGATCTTCCTTTGGATGTTCATCTTATGATAGTGGAACCAGATCTGAGGGTAC
CAGATTTCATCAAA

QA 3 556 3 556
DS 

RD RR2DU53TF 595 0 0
GG
AATTTTCTTGTTGAGTTGAGCCGAAGGAAGAAGAGAGATAGAACGATTTGGGTGTTTTCT
CTCACTACTAAGCTAAACCCACCACCACCAACCCTTTTTGGGGGATTCTAGTGGGGAGAA
AGAAGCTTGAATCTTACTCTTTATTTGAAAAAGAAGGAATAGAATCTAGAAGATCGGAAA
TGTCGAGCTCAGTATCCACTTCGTTGTGCTGTTCGTCAACCCAGGTCAATGGGTTCGGTC
TTAGGCCTCAAAGGTCCCTCCTTTACCAACCCTCTTCCTTTTCTTCTTTCTCCAGAAGGA
GAACTCATGGTGTTGTGAAGGCCACAGCTCGTGTTGATAAGTATTCCAAGAGTGATATCA
TCGTCTCTCCCTCCATTCTCTCTGCTAATTTCGCCAAACTAGGCGAGCGGGTAAAAGCAG
TAGAGTGTGCAGGTTGTGATTGGATCCATGTTGATGTGATGGATGGTCGTTTTGTTCCCA
ACATCACTATTGGACCTCTTGTGGTTGATGCTTTGCGTCCTGTTACTGATCTTCCTTTGG
ATGTTCATCTTATGATAGTGGAACCAGATCTGAGGGTACCAGATTTCATCAAA

QA 3 595 3 595
DS 

RD RR2FV93TF 710 0 0
TTCTCTCACTACTAAGCTAAACCCACCACCACCAACCCTTTTTGGGGGATTCTAGTGGGG
AGAAAGAAGCTTGAATCTTACTCTTTATTTGAAAAAGAAGGAATAGAATCTAGAAAATCG
GAAATGTCGAGCTCAGTATCCACTTCGTTGTGCTGTTCGTCAACCCAGGTCAATGGGTTC
GGTCTTAGGCCTCAAAGGTCCCTCCTTTACCAACCCTCTTCCTTTTCTTCTTTCTCCAGA
AGGAGAACTCATGGTGTTGTGAAGGCCACAGCTCGTGTTGATAAGTATTCCAAGAGTGAT
ATCATCGTCTCTCCCTCCATTCTCTCTGCTAATTTCGCCAAACTAGGCGAGCAGGTAAAA
GCAGTAGAGTGTGCAGGTTGTGATTGGATCCATGTTGATGTGATGGATGGTCGTTTTGTT
CCCAACATCACTATTGGACCTCTTGTGGTTGATGCTTTGCGTCCTGTTACTGATCTTCCT
TTGGATGTTCATCTTATGATAGTGGAACCAGATCTGAGGGTACCAGATTTCATCAAAGCA
GGTGCAGACATCGTCAGTGTACACTGTGAGCAGTCATCCACCATCCATTTGCACCGCACT
GTCAATCAAATCAAAAGCTTAG*TGCTAAAGCTGGAGTTGTTCTAAACCCTGGAACCCCA
TTGAGTGCTATAGAATATGTATTGGAGGTGGTGGATCTGGTCTTGATAAT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2A014JQ 651 0 0
GAGGGTACCAGATTTCATCAAAGCAGGTGCAGACATCGTCAGTGTACACTGTGAGCAGTC
ATCCACCATCCATTTGCACCGCACTGTCAATCAAATCAAAAGCTTAGGTGCTAAAGCTGG
AGTTGTTTTAAACCCTGGAACCCCATTGAGTGCTATAGAATATGTATTGGAGGTGGTGGA
TTTGGTCTTGATAATGTCGGTCAACCCCGGTTTTGGTGGACAGAGCTTTATCGAAAGCCA
AGTTAAGAAAATTTTGGATTTGAGAAGAATGTGTGTCGAAAAGGGAGTAAACCCATGGAT
TGAAGTTGATGGTGGTGTCACTCCAAAGAATGCATACAAGGTTATTGAGGCTGGAGCAAA
TGCTTTAGTAGCTGGATCAGCTGTATTTGGAGCTAAAGACTATGAAGAAGCTATAAAAGG
AATCAAGACCAGCAAGAAGCCAGAAGCTGTGGCTGTGTAATGTGAAGCAACAAGCTAAAA
AGATCATAAGACAGATCACCGAGATGTTTATGTTGTTGTTGTTGTCATTCACCAGATTCC
ATTCGACATAAAAAAATCCATAAGAATCAAACTCTCGATGGTTTTGAAGTAGCTCGTTTA
TACTCCTCCTGTGTATCATTGTCTTGTAGATTTGGGGATATGCAGATTCAA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2AA30JQ 880 0 0
TCTGCTAATTTCGCCAAATTAGGCGAGCAGGTAAAAGCAGTAGAGTGTGCAGGTTGTGAT
TGGATCCATGTTGATGTGATGGATGGTCGTTTTGTTCCCAACATCACTATTGGACCTCTC
GTGGTTGATGCTTTGCGTCCTGTTACTGATCTTCCTTTGGATGTTCATCTTATGATAGTG
GAACCAGATCTGAGGGTACCAGATTTCATCAAAGCAGGTGCAGACATCGTCAGTTTACAC
TGTGAGCAGTCATCCACCATCCATTTGCACCGCACTGTCAATCAAATCAAAAGCTTAGGT
GCTAAAGCTGGAGTTGTTCTAAACCCTGGAACCCCATTGAGTGCTATAGAATATGTATTG
GAGGTGGTGGATCTGGTCTTGATAATGTCGGTCAACCCCGGTTTTGGTGGACAGAGCTTT
ATCGAAAGCCAAGTTAAGAAAATCTCGGATTTGAGAAGAATGTGTGTCGAAAAGGGAGTA
AACCCATGGATTGAAGTTGATGGTGGTGTCACTCCAAAGAATGCATACAAGGTTATTGAG
GCTGGAGCAAATGCTCTAGTAGCTGGATCAGCTGTGTTTGGAGCTAAAGACTATGAAGAA
GCTATAAAAGGAATCAAGACCAGCAAGAAGCCAGAAGCTGTGGCTGTGTAATGTGAAGCA
ACAAGCTAAAAAGATCATAAGACAGATCACCGAGATGTTTATGTTGTTGTTGTTGTCATT
CACCAGATTCCATTCGACATAAAAAAATCCATAAGAATCAAACTCTCGATGGTTTTGAAG
TAGCTCGTTTATACTCCTCCTGTGTATCATTGTCTTGTAGATTTGGGGATATGCAGATTC
AATACATTATGCAATTAATAAGAAATAAGCTGTGTTACAT

QA 1 880 1 880
DS 

RD RR2DV64JQ 440 0 0
TCGGATTTGAGAAGAATGTGTGTCGAAAAGGGAGTAAACCCATGGATTGAAGTTGATGGT
GGTGTCACTCCAAAGAATGCATACAAGGTTATTGAGGCTGGAGCAAATGCTCTAGTAGCT
GGATCAGCTGTGTTTGGAGCTAAAGACTATGAAGAAGCTATAAAAGGAATCAAGACCAGC
AAGAAGCCAGAAGCTGTGGCTGTGTAATGTGAAGCAACAAGCTAAAAAGATCATAAGACA
GATCACCGAGATGCTTATGTTGTTGTTGTTGTCATTCACCAGATTCCATTCGACATAAAA
AAATCCATAAGAATCAAACTCTCGATGGTTTTGAAGTAGCTCGTTTATACTCCTCCTGTG
TATCATTGTCTTGTAGATTTGGGGATATGCAGATTCAATACATTATGCAATTAATAAGAA
ATAAGCTGTGCTACATATGT

QA 1 440 1 440
DS 



CO CL313Contig3 782 4 6 U
GCATATGTAACACAGCTTATTTCTTATTAATTGCAAAATGTATTGAATCTGCATATCCTC
AAATCTACAAGACAATGATACACAGGAGTATAAACGAGCTACTTCAAAACTATTGAGAGT
TCGATTCTTATGGATTTTGATGGAATCTGGTGAATGACAACAACAACAACATAAACATCT
CGGTGATCTGTCTTATGACCATTTTAGCTTGTTGCTTCGCATTACACAGCCACAGCTTCT
GGCTTCTTGCTGGTCTTGATTCCTTTTATAGCTTCTTCATAGTCTTTAGCTCCAAACACA
GCTGATCCAGCTACTAGAGCATTTGCTCCAGCCTCAATAACCTTGTATGCATTCTTTGGA
GTGACACCACCATCAACTTCAATCCATGGGTTTACTCCCTTTTCGACACACATTCTTCTC
AAATCCGAAATTTTCTTAACTTGGCTTTCGATAAAGCTCTGTCCACCAAACCCGGGGTTG
ACCGACATTATCAAGACCAGATCCACCACCTCCAATACATATTCTATAGCACTCAATGGG
GTTCCAGGGTTTAGAACAACTCCAGCTTTAGCACCTAAGCTTTTGATTTGATTGACAGTG
CGGTGCAAATGGATGGTGGATGACTGCTCACAGTGTACACTGACGATGTCTGCACCTGCT
TTGATGAAATCTGGTACCCTCAGATCTGGTTCCACTATCATAAGATGAACATCCAAAGGA
AGATCAGTAACAGGACGCAAAGCATCAACCACAAGAGGTCCAATAGTGATGTTGGGAAAA
AA


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2DU53JQ U 5
AF RR2FV93JQ U 1
AF RR2DC87JQ U 29
AF RR2GJ31JQB U 1
BS 1 216 RR2FV93JQ
BS 217 217 RR2GJ31JQB
BS 218 253 RR2FV93JQ
BS 254 254 RR2GJ31JQB
BS 255 717 RR2FV93JQ
BS 718 782 RR2GJ31JQB

RD RR2DU53JQ 545 0 0
ATGTAACACAGCTTATTTCTTATTAATTGCAAAATGTATTGAATCTGCATATCCTCAAAT
CTACAAGACAATGATACACAGGAGTATAAACGAGCTACTTCAAAACTATTGAGAGTTCGA
TTCTTATGGATTTTGATGGAATCTGGTGAATGACAACAACAACAACATAAACATCTCGGT
GATCTGTCTTATGACCATTTTAGCTTGTTGCTTCGCATTACACAGCCACAGCTTCTGGCT
TCTTGCTGGTCTTGATTCCTTTTATAGCTTCTTCATAGTCTTTAGCTCCAAACACAGCTG
ATCCAGCTACTAGAGCATTTGCTCCAGCCTCAATAACCTTGTATGCATTCTTTGGAGTGA
CACCACCATCAACTTCAATCCATGGGCTTACTCCCTTTTCGACACACATTCTTCTCAAAT
CCGAGATTTTCTTAACTTGGCTTTCGATAAAGCTCTGTCCACCAAACCCGGGGTTGACCG
ACATTATCAAGACCAGATCCACCACCTCCAATACATATTCTATAGCACTCAATGGGGTTC
CAGGG

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2FV93JQ 717 0 0
GCATATGTAACACAGCTTATTTCTTATTAATTGCAAAATGTATTGAATCTGCATATCCTC
AAATCTACAAGACAATGATACACAGGAGTATAAACGAGCTACTTCAAAACTATTGAGAGT
TCGATTCTTATGGATTTTGATGGAATCTGGTGAATGACAACAACAACAACATAAACATCT
CGGTGATCTGTCTTATGACCATTTTAGCTTGTTGCTACGCATTACACAGCCACAGCTTCT
GGCTTCTTGCTGGCCTTGATTCCTTTTATAGCTTCTTCATAGTCTTTAGCTCCAAACACA
GCTGATCCAGCTACTAGAGCATTTGCTCCAGCCTCAATAACCTTGTATGCATTCTTTGGA
GTGACACCACCATCAACTTCAATCCATGGGTTTACTCCCTTTTCGACACACATTCTTCTC
AAATCCGAAATTTTCTTAACTTGGCTTTCGATAAAGCTCTGTCCACCAAACCCGGGGTTG
ACCGACATTATCAAGACCAGATCCACCACCTCCAATACATATTCTATAGCACTCAATGGG
GTTCCAGGGTTTAGAACAACTCCAGCTTTAGCACCTAAGCTTTTGATTTGATTGACAGTG
CGGTGCAAATGGATGGTGGATGACTGCTCACAGTGTACACTGACGATGTCTGCACCTGCT
TTGATGAAATCTGGTACCCTCAGATCTGGTTCCACTATCATAAGATGAACATCCAAA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2DC87JQ 723 0 0
AATTGCAAAATGTATTGAATCTGCATATCCTCAAATCTACAAGACAATGATACACAGGAG
TATAAACGAGCTACTTCAAAACTATTAAGAGTTCGATTCTTATGGATTTTGATGGAATCT
GGTGAATGACAACAACAACAACATAAACATCTCGGTGATCTGTCTTATGACCATTTTAGC
TTGTTGCTTCGCATTACACAGCCACAGCTTCTGGCTTCTTGCTGGTCTTGATTCCTTTTA
TAGCTTCTTCATAGTCTTTAGCTCCAAACACAGCTGATCCAGCTACTAGAGCATTTGCTC
CAGCCTCAATAACCTTGTATGCATTCTTTGGAGTGACACCACCATCAACTTCAATCCATG
GGTTTACTCCCTTTTCGACACACATTCTTCTCAAATCCGAGATTTTCTTAACTTGGCTTT
CGATAAAGCTCTGTCCACCAAACCCGGGGTTGACCGACATTATCAAGACCAGATCCACCG
CCTCCAATACATATTCTATAGCACTCAATGGGGTTCCAGGGTTTAGAACAACTCCAGCTT
TAGCACCTAAGCTTTTGGTTTGATTGACAGTGCGGTGCAAATGGATGGTGGATGACTGCT
CACAGTGTACACTGACGATGTCTGCACCTGCTTTGATGAAATCTGGTACCCTCAGATCTG
GTTCCACTATCATAAGATGAACATCCAAAGGAAGATCAGTAACAGGACGCAAAGCATCAA
CCA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2GJ31JQB 782 0 0
GCAT
ATGTAACACAGCTTATTTCTTATTAATTGCAAAATGTATTGAATCTGCATATCCTCAAAT
CTACAAGGCAATGATACACAGGAGTATAAACGAGCTACTTCAAAACTATTGAGAGTTCGA
TTCTTATGGATTTTGATGGAATCTGGTGAATGACAACAACAACAACATAAACATCTCGGT
GATCTGTCTTATGACCATTTTAGCTTGTTGCTTCGCATTACACAGCCACAGCTTCTGGCT
TCTTGCTGGTCTTGATTCCTTTTATAGCTTCTTCATAGTCTTTAGCTCCAAACACAGCTG
ATCCAGCTACTAGAGCATTTGCTCCAGCCTCAATAACCTTGTATGCATTCTTTGGAGTGA
CACCACCATCAACTTCAATCCATGGGTTTACTCCCTTTTCGACACACATTCTTCTCAAAT
CCGAAATTTTCTTAACTTGGCTTTCGATAAAGCTCTGTCCACCAAACCCGGGGTTGACCG
ACATTATCAAGACCAGATCCACCACCTCCAATACATATTCTATAGCACTCAATGGGGTTC
CAGGGTTTAGAACAACTCCAGCTTTAGCACCTAAGCTTTTGATTTGATTGACAGTGCGGT
GCAAATGGATGGTGGATGACTGCTCACAGTGTACACTGACGATGTCTGCACCTGCTTTGA
TGAAATCTGGTACCCTCAGATCTGGTTCCACTATCATAAGATGAACATCCAAAGGAAGAT
CAGTAACAGGACGCAAAGCATCAACCACAAGAGGTCCAATAGTGATGTTGGGAAAAAA

QA 5 782 5 782
DS 



AS 1 14

CO CL314Contig1 493 14 5 U
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTAAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TGAAATACATGAG


BQ
55 55 55 25 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 0 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 50 45 45 45 45 45 35 10 10 10 10 

AF RR2B421TF U 1
AF RR2FT71JQ C 0
AF RR2FT71TF U 0
AF RR2B611JQ C 1
AF RR2DU80TF U 127
AF RR2GH02TF U 1
AF RR2ET23TF U 4
AF RR2FX79JQ C 1
AF RR2BZ67TF U 3
AF RR2FQ52JQ C 1
AF RR2FQ52TF U 1
AF RR2FX79TF U 1
AF RR2B611TF U 1
AF RR2FR84TF U 1
BS 1 388 RR2B421TF
BS 389 389 RR2FT71TF
BS 390 437 RR2B421TF
BS 438 489 RR2DU80TF
BS 490 493 RR2FR84TF

RD RR2B421TF 437 0 0
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATC

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR2FT71JQ 438 0 0
AGGG
GAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATTCTG
CAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAG
ACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGACGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCTAAG
GAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAGGCC
ATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACGTTT
CCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTCGAA
GCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTAAATTTATTCAATATCTATCAAAGGGTTGTTGGCC
CTTGTCTCTTGATC

QA 5 438 5 438
DS 

RD RR2FT71TF 438 0 0
AGGG
GAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATTCTG
CAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAG
ACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGACGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCTAAG
GAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAGGCC
ATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACGTTT
CCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTCGAA
GCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTAAATTTATTCAATATCTATCAAAGGGTTGTTGGCC
CTTGTCTCTTGATC

QA 5 438 5 438
DS 

RD RR2B611JQ 491 0 0
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TGAAATACA
CG

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2DU80TF 365 0 0
G
AGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCTAAGGAAT
CTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAGGCCATCA
AGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACGTTTCCTT
TTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTCGAAGCCA
TTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTGGCCCTTG
TCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTTTGAAATA
CA
TG

QA 2 363 2 363
DS 

RD RR2GH02TF 483 0 0
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTT*ATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTACT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTAAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TGA

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR2ET23TF 479 0 0
GAAGTCGCAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATTCTG
CAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAG
ACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCTAAG
GAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAGGCC
ATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACGTTT
CCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTCGAA
GCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTGGCC
CTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTTTG

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR2FX79JQ 482 0 0
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTTTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TG

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR2BZ67TF 487 0 0
G
GAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATTCTG
CAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAG
ACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCTAAG
GAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAGGCC
ATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACGTTT
CCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTCGAA
GCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTAAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTGGCC
CTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTTTGA
AATACA

QA 2 487 2 487
DS 

RD RR2FQ52JQ 488 0 0
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTAAATTTATTCAATATCTGTCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TGAAATAC

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2FQ52TF 488 0 0
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTAAATTTATTCAATATCTGTCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TGAAATAC

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2FX79TF 482 0 0
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TG

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR2B611TF 491 0 0
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TGAAATACA
CG

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2FR84TF 493 0 0
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCGGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTAAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TGAAATACATGAG

QA 1 493 1 493
DS 



AS 4 13

CO CL315Contig1 698 2 2 U
GAGCCTCGAAACACACATACATAATCATCTTTCTCGTTTCGTTGGTCCTGGCGGCTTCCA
AGTGTTTTTACTTGTCGTAGGAGAAAATGCCGGCAGGTCATGGAGTTCGTGCGAGGACGA
GGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATCCCACTCTCGACCTACCTCA
GGACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTGAAAGTGAACGGAGCGATCCACAAGGGTA
TGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGCACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAGCGCGCCG
TCGGTGTCGAAGTTAACAAACAGATCGGGAACAGGATCATTAGGAAGAGGCTTCATGTGC
GTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCTAGGTGTGCCGAGGAGTTTAAGCTGAGGAAGAAGACGA
ACGATGAGCTCAAAGCCGCAGCTAAAGCCAAAGGCGAGACAATAAGCACCAAGAGGCAGC
CTAAAGGCCCCAAACCAGGGTTCATGGTTGAGGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTA
TCCCCTACGATGTCGTTAACTATCTCAAGGGAGGCTATTAGTTCTACTTTGTTCCCCCAG
TCTTTTGGAGCTTTCTTTCATATGTTTTGTAGCCACTCGAAACCTTTGTCTTCAAACCAA
AATCTGATTTTGAATGACAGATCTTTTGTTGTTTTGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B982JQ C 1
AF RR2B982TF U 1
BS 1 690 RR2B982TF
BS 691 698 RR2B982JQ

RD RR2B982JQ 698 0 0
GAGCCTCGAAACACACATACATAATCATCTTTCTCGTTTCGTTGGTCCTGGCGGCTTCCA
AGTGTTTTTACTTGTCGTAGGAGAAAATGCCGGCAGGTCATGGAGTTCGTGCGAGGACGA
GGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATCCCACTCTCGACCTACCTCA
GGACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTGAAAGTGAACGGAGCGATCCACAAGGGTA
TGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGCACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAGCGCGCCG
TCGGTGTCGAAGTTAACAAACAGATCGGGAACAGGATCATTAGGAAGAGGCTTCATGTGC
GTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCTAGGTGTGCCGAGGAGTTTAAGCTGAGGAAGAAGACGA
ACGATGAGCTCAAAGCCGCAGCTAAAGCCAAAGGCGAGACAATAAGCACCAAGAGGCAGC
CTAAAGGCCCCAAACCAGGGTTCATGGTTGAGGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTA
TCCCCTACGATGTCGTTAACTATCTCAAGGGAGGCTATTAGTTCTACTTTGTTCCCCCAG
TCTTTTGGAGCTTTCTTTCATATGTTTTGTAGCCACTCGAAACCTTTGTCTTCAAACCAA
AATCTGATTTTGAATGACAGATCTTTTGTTGTTTTGAT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2B982TF 698 0 0
GAGCCTCGAAACACACATACATAATCATCTTTCTCGTTTCGTTGGTCCTGGCGGCTTCCA
AGTGTTTTTACTTGTCGTAGGAGAAAATGCCGGCAGGTCATGGAGTTCGTGCGAGGACGA
GGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATCCCACTCTCGACCTACCTCA
GGACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTGAAAGTGAACGGAGCGATCCACAAGGGTA
TGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGCACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAGCGCGCCG
TCGGTGTCGAAGTTAACAAACAGATCGGGAACAGGATCATTAGGAAGAGGCTTCATGTGC
GTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCTAGGTGTGCCGAGGAGTTTAAGCTGAGGAAGAAGACGA
ACGATGAGCTCAAAGCCGCAGCTAAAGCCAAAGGCGAGACAATAAGCACCAAGAGGCAGC
CTAAAGGCCCCAAACCAGGGTTCATGGTTGAGGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTA
TCCCCTACGATGTCGTTAACTATCTCAAGGGAGGCTATTAGTTCTACTTTGTTCCCCCAG
TCTTTTGGAGCTTTCTTTCATATGTTTTGTAGCCACTCGAAACCTTTGTCTTCAAACCAA
AATCTGATTTTGAATGACAGATCTTTTGTT
GTTTTGAT

QA 1 690 1 690
DS 



CO CL315Contig2 664 2 4 U
GGGCGATTTTAGGTTTCACTTGACACATCCACCCAAGAGGAAAAATGCCGGCAGGTCATG
GAGTTCGTGCGAGGACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATCC
CACTCTCGACCTACCTCAGGACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTGAAAGTGAATG
GAGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGA
ACGTCACCAAGCGCGCCGTCGGTGTCGAAGTTAACAAACAGGTCGGGAACAGGATCATTA
GGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGTGCGGAGGAGTTCA
AACTGAGGAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAACCGCAGCCAAAGCCAGAGGCGAGACAA
TAAGCACCAAGAGACAGCCTAAAGGCCCCAAACCAGGGTTCATGGTTGAGGGTATGACCT
TGGAGACTGTTACTCCTATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGT
TCTACTTTCTTTCCCAGAGCTTTCCTTCATATGTTTTGTAGCTCTTTAATACTGAAGATG
ATTCTAAACAGCATGAGTTTTGTTATTGATACTTTTGTTTCTGCCAATATAAAATGTTCC
TTTT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2CG53JQ C 1
AF RR2CG53TF U 1
BS 1 2 RR2CG53JQ
BS 3 644 RR2CG53TF
BS 645 645 RR2CG53JQ
BS 646 664 RR2CG53TF

RD RR2CG53JQ 664 0 0
GGGCGATTTTAGGTTTCACTTGACACATCCACCCAAGAGGAAAAATGCCGGCAGGTCATG
GAGTTCGTGCGAGGACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATCC
CACTCTCGACCTACCTCAGGACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTGAAAGTGAATG
GAGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTTTGGA
ACGTCACCAAGCGCGCCGTCGGTGTCGAAGTTAACAAACAGGTCGGGAACAGGATCATTA
GGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGTGCGGAGGAGTTCA
AACTGAGGAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAACCGCAGCCAAAGCCAGAGGCGAGACAA
TAAGCACCAAGAGACAGCCTAAAGGCCCCAAACCAGGGTTCATGGTTGAGGGTATGACCT
TGGAGACTGTTACTCCTATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGT
TTTACTTTCTTTCCCAGAGCTTTCCTTCATATGTTTTGTAGCTCTTTAATACTGAAGATG
ATTCTAAACAGCATGAGTTTTGTTATTGATACTTTTGTTTCTGCCAATATAAAATGTTCC
TTTT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2CG53TF 664 0 0
GG
GCGATTTTAGGTTTCACTTGACACATCCACCCAAGAGGAAAAATGCCGGCAGGTCATGGA
GTTCGTGCGAGGACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATCCCA
CTCTCGACCTACCTCAGGACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTGAAAGTGAATGGA
GCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGAAC
GTCACCAAGCGCGCCGTCGGTGTCGAAGTTAACAAACAGGTCGGGAACAGGATCATTAGG
AAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGTGCGGAGGAGTTCAAA
CTGAGGAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAACCGCAGCCAAAGCCAGAGGCGAGACAATA
AGCACCAAGAGACAGCCTAAAGGCCCCAAACCAGGGTTCATGGTTGAGGGTATGACCTTG
GAGACTGTTACTCCTATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTC
TACTTTCTTTCCCAGAGCTTTCCTTCATATGTTTTGTAGCTCTTTAATACTGAAGATGAT
TCTAAACAGCATGAGTTTTGTTATTGATACTTTTGTTTCTGC*AATATAAAATGTTCCTT
TT

QA 3 664 3 664
DS 



CO CL315Contig3 634 6 4 U
TTTTCAATAACAAAAGATCTTTCATTCAAAATCAGAATTTGGTTTGAAGACAAAGGTTTC
AAGTTGCTACAAAACATATGAAAGAAAGCTCCAAAAGACTGGGGGAACAAAGTAGAACTA
ATAGCCTCCCTTGAGATCGTTAACGACATCGTAGGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGT
CATACCCTCGACCATGAACCCTGGTTTGGGGCCTTTAGGCTGTCTCTTGGTGCTTATCGT
CTCGCCTCTGGCTTTGGCTGCAGTTTTGAGTTCATCATTCTTCTTCTTCCTCAGCTTGAA
CTCCTCGGCACACCTTGACTGCTGCACATGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTAAT
GATCCTGTTCCCGATCTGCTTGTTCACTTCGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACATTCCA
GACACGACCGGTACGACCATGGTAGAACTTGTGGGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTT
CACTTTAACATCGACGTAGTCGCCGACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTCGAGAGTGGGAT
TGTACCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAGATCCCTCGTCCTCGCACGAACTCCATG
ACCTGCCGGCATTTTCTCCTACGACAAGTAAAAA


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR2DA22JQ U 30
AF RR2CJ85TF C 1
AF RR2FU27JQ U 3
AF RR2FU27TF C 3
AF RR2CJ85JQ U 5
AF RR2DA22TF C 380
BS 1 4 RR2CJ85TF
BS 5 441 RR2FU27JQ
BS 442 442 RR2CJ85JQ
BS 443 634 RR2FU27JQ

RD RR2DA22JQ 389 0 0
AATCAAAATTTGGTTTGAAAACAAAGGTTTCAAGTTGCTACAAAACATATGAAAGAAAGC
TCCAAAAGACTGGGGGAACAAAGTAAAACTAATAGCCTCCCTTGAGATCGTTAACGACAT
CGTAGGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACCCTCCACCATGAACCCTGGTTTGG
GGCCTTTAGGCTGTCTCTTGGTGCTTATCGTCTCGCCTCTGGCTTTGGCTGCAGTTTTGA
GTTCATCATTCTTCTTCTTCCTCAGCTTGAACTCCTCGGCACACCTTGACTGCTGCACAT
GCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTAATGATCCTGTTCCCGATCTGCTTGTTCACTT
CGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACATTC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2CJ85TF 634 0 0
TTTTCAATAACAAAAGATCTTTCATTCAAAATCAGAATTTGGTTTGAAGACAAAGGTTTC
AAGTTGCTACAAAACATATGAAAGAAAGCTCCAAAAGACTGGGGGAACAAAGTAGAACTA
ATAGCCTCCCTTGAGATCGTTAACGACATCGTAGGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGT
CATACCCTCGACCATGAACCCTGGTTTGGGGCCTTTAGGCTGTCTCTTGGTGCTTATCGT
CTCGCCTCTGGCTTTGGCTGCAGTTTTGAGTTCATCATTCTTCTTCTTCCTCAGCTTGAA
CTCCTCGGCACACCTTGACTGCTGCACATGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTAAT
CATCCTGTTCCCGATCTGCTTGTTCACTTCGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACATTCCA
GACACGACCGGTACGACCATGGTAGAACTTGTGGGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTT
CACTTTAACATCGACGTAGTCGCCGACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTCGAGAGTGGGAT
TGTACCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAGATCCCTCGTCCTCGCACGAACTCCATG
ACCTGCCGGCATTTTCTCCTACGACAAGTAAAAA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2FU27JQ 632 0 0
AT
CAATAACAAAAGATCTTTCATTCAAAATCAGAATTTGGTTTGAAGACAAAGGTTTCAAGT
TGCTACAAAACATATGAAAGAAAGCTCCAAAAGACTGGGGGAACAAAGTAGAACTAATAG
CCTCCCTTGAGATCGTTAACGACATCGTAGGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATA
CCCTCGACCATGAACCCTGGTTTGGGGCCTTTAGGCTGTCTCTTGGTGCTTATCGTCTCG
CCTCTGGCTTTGGCTGCAGTTTTGAGTTCATCATTCTTCTTCTTCCTCAGCTTGAACTCC
TCGGCACACCTTGACTGCTGCACATGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTAATGATC
CTGTTCCCGATCTGCTTGTTCACTTCGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACATTCCAGACA
CGACCGGTACGACCATGATAGAACTTGTGGGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTCACT
TTAACATCGACGTAGTCGCCGACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTCGAGAGTGGGATTGTA
CCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAGATCCCTCGTCCTCGCACGAACTCCATGACCT
GCCGGCATTTTCTCCTACGACAAGTAAAAA

QA 3 632 3 632
DS 

RD RR2FU27TF 632 0 0
AT
CAATAACAAAAGATCTTTCATTCAAAATCAGAATTTGGTTTGAAGACAAAGGTTTCAAGT
TGCTACAAAACATATGAAAGAAAGCTCCAAAAGACTGGGGGAACAAAGTAGAACTAATAG
CCTCCCTTGAGATCGTTAACGACATCGTAGGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATA
CCCTCGACCATGAACCCTGGTTTGGGGCCTTTAGGCTGTCTCTTGGTGCTTATCGTCTCG
CCTCTGGCTTTGGCTGCAGTTTTGAGTTCATCATTCTTCTTCTTCCTCAGCTTGAACTCC
TCGGCACACCTTGACTGCTGCACATGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTAATGATC
CTGTTCCCGATCTGCTTGTTCACTTCGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACATTCCAGACA
CGACCGGTACGACCATGATAGAACTTGTGGGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTCACT
TTAACATCGACGTAGTCGCCGACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTCGAGAGTGGGATTGTA
CCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAGATCCCTCGTCCTCGCACGAACTCCATGACCT
GCCGGCATTTTCTCCTACGACAAGTAAAAA

QA 3 632 3 632
DS 

RD RR2CJ85JQ 630 0 0
CAATAACAAAAGATCTTTCATTCAAAATCAGAATTTGGTTTGAAGACAAAGGTTTCAAGT
TGCTACAAAACATATGAAAGAAAGCTCCAAAAGACTGGGGGAACAAAGTAGAACTAATAG
CCTCCCTTGAGATCGTTAACGACATCGTAGGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATA
CCCTCGACCATGAACCCTGGTTTGGGGCCTTTAGGCTGTCTCTTGGTGCTTATCGTCTCG
CCTCTGGCTTTGGCTGCAGTTTTGAGTTCATCATTCTTCTTCTTCCTCAGCTTGAACTCC
TCGGCACACCTTGACTGCTGCACATGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTAATGATC
CTGTTCCCGATCTGCTTGTTCACTTCGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACATTCCAGACA
CGACCGGTACGACCATGGTAGAACTTGTGGGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTCACT
TTAACATCGACGTAGTCGCCGACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTCGAGAGTGGGATTGTA
CCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAGATCCCTCGTCCTCGCACGAACTCCATGACCT
GCCGGCATTTTCTCCTACGACAAGTAAAAA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2DA22TF 255 0 0
TTGTTCACTTCGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACATTCCAGACACGACCGGTACGACCA
TGGTAGAACTTGTGGGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTCACTTTAACATCGACGTAG
TCGCCGACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTCGAGAGTGGGATTGTACCCTTCTTCCTGGAC
CCCCTCGCGAACAGATCCCTCGTCCTCGCACGAACTCCATGACCTGCCGGCATTTTCTCC
TACGACAAGTAAAAA

QA 1 255 1 255
DS 



CO CL315Contig4 641 3 5 U
GGCTAGCGATTTTAGGTTTCACTTGACGCATCCACCCAAGACGAGGAGAAAATGCCGGCA
GGTCATGGAGTTCGTGCGAGGACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGT
ACAATCCCACTCTCGACCTACCTCAGGACATTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAG
GTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGT
GTCTGGAACGTCACCAAGCGTGCCGTCGGTGTCGAAGTCAACAAGCAGATTGGTAACAGA
ATCATCAGGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGTGCAGAG
GAGTTCAAACTTAGAATCAAGAAGAACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAGAGGC
GAGACAATAAGCACCAAGAGACAACCTAAAGGCCCCAAGCCAGGATTCATGGTTGAGGGT
ATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTATCCCCTGCGATGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGC
TATTAGTTCTACTTTCTTCCCCTTGTGTTTTTGGGCTTTCCTTCATATGTTTTGTAGCGA
CTTAAATACTGAAGATGATTTTAAACACCATGAGTTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2D920JQ C 1
AF RR2D920TF U 148
AF RR2FO76TF U 1
BS 1 5 RR2D920JQ
BS 6 144 RR2FO76TF
BS 145 145 RR2D920JQ
BS 146 150 RR2FO76TF
BS 151 641 RR2D920TF

RD RR2D920JQ 641 0 0
GGCTAGCGATTTTAGGTTTCACTTGACGCATCCACCCAAGACGAGGAGAAAATGCCGGCA
GGTCATGGAGTTCGTGCGAGGACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGT
ACAATCCCACTCTCGACCTACCTCAGGACATTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAG
GTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGT
GTCTGGAACGTCACCAAGCGTGCCGTCGGTGTCGAAGTCAACAAGCAGATTGGTAACAGA
ATCATCAGGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGTGCAGAG
GAGTTCAAACTTAGAATCAAGAAGAACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAGAGGC
GAGACAATAAGCACCAAGAGACAACCTAAAGGCCCCAAGCCAGGATTCATGGTTGAGGGT
ATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTATCCCCTGCGATGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGC
TATTAGTTCTACTTTCTTCCCCTTGTGTTTTTGGGCTTTCCTTCATATGTTTTGTAGCGA
CTTAAATACTGAAGATGATTTTAAACACCATGAGTTTTGTT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2D920TF 494 0 0
ACA
TTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAGGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTATGCCT
CACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAGCGTGCCGTCGGT
GTCGAAGTCAACAAGCAGATTGGTAACAGAATCATCAGGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTG
GAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGTGCAGAGGAGTTCAAACTTAGAATCAAGAAGAACGAT
GAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAGAGGCGAGACAATAAGCACCAAGAGACAACCTAAA
GGCCCCAAGCCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTATCCCC
TGCGATGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGCTATTAGTTCTACTTTCTTCCCCTTGTGTTT
TTGGGCTTTCCTTCATATGTTTTGTAGCGACTTAAATACTGAAGATGATTTTAAACACCA
TGAGTTTTGTT

QA 4 494 4 494
DS 

RD RR2FO76TF 641 0 0
GGCTA
GCGATTTTAGGTTTCACTTGACGCATCCACCCAAGACGAGGAGAAAATGCCGGCAGGTCA
TGGAGTTCGTGCGAGGACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAAT
CCCACTCTCGACCTACCTCGGGACATTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAGGTGAA
CGGTGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTCTG
GAACGTCACCAAGCGTGCCGTCGGTGTCGAAGTCAACAAGCAGATTGGTAACAGAATCAT
CAGGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGTGCAGAGGAGTT
CAAACCTAGAATCAAGAAGAACGATGAGCTCAAGGCCGCAGCCAAAGCCAGAGGCGAGAC
AATAAGCACCAAGAGACAACCTAAAGGCCCCAAGCCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGAC
CTTGGAGACTGTCACTCCTATCCCCTACGATGTCGTCAACGATCTCAAGGGTGGCTATTA
GTTCTACTTTCTTCCCCTTGTGTTTTTGGGCTTTCCTTCATATGTTTTGTAGCGACTTAA
ATACTGAAGATGATTTTAAACACCATGAGTTTTGTT

QA 6 641 6 641
DS 



AS 1 12

CO CL316Contig1 1298 12 25 U
GGATATCATACACCTTCACTCTCCAAAATATCAAATCCTCTTCCTACATATTCTCCCTTG
AGTATCATGAGACAGTCTTCGTAGAATAACTCATTTGAAGATAGCTAGTTGATGGAAAAC
ATGGGGGATTCGACCATAGGGCCGGGTCATCCGCATCTCCCTCCCGGGTTTCGGTTTCAC
CCGACCGACGAAGAACTTGTAGTTCATTACCTCAAGAAGAAAGCTGCTTCTATTCCACTT
CCGGTCTCAATCATCGCCGAGATTGATCTTTACAAGTTTGATCCTTGGGAGCTTCCAAGC
AAGGCAAGTTTTGGAGAACAAGAGTGGTACTTCTTTAGTCCTAGAGATCGGAAGTATCCC
AATGGCGTTAGGCCGAATCGGGCAGCAACTTCTGGTTACTGGAAAGCCACGGGAACCGAT
AAACCAATATTTACGTGCAATAGTCACAAGGTTGGGGTCAAGAAAGCGCTTGTATTCTAT
GGTGGAAAACCTCCTAAAGGGATTAAAACTGATTGGATCATGCATGAATATCGCCTCACT
GATGGTAATCTTAACACCGCTGCTAAGCCACCTGACTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCA
CTACGGCTAGACGATTGGGTTCTTTGTAGGATCTATAAGAAGAATAGTTCACAGAGACCA
ACAATGGAGAGAGTATTACTAAGAGAGGATCTCATGGAAGGAATGCTCTC**AAAATCAT
CTGCTAATTCATCTTCCACATCGGTCTTAGACAACAACAACAACAACAACAATAATAACA
ATGAAGAACACTTTTTCGATGGTATGGCCGTTTCATCGGACAAACGTTCGTTGTGTGGTC
AGTATCGTATAGGTCATGAGGCCACTGGATCATCTTCTTTCGGGTCATTCTTATCGAGCA
AGAGGTTCCATCATACGAGTGATCTCAATAATGATAACTACAATGTCTCATTTGTCTCGA
TGCTTAGTGAAATTCCTCAGAGTTCGGGGTTTCATGGAAATGGAGTCATCGATACGACGT
CGACTCTAGCTGATCATGGGGTTTTAAGACAGGCGTTTCAGCTTCCTAACATGAACTGGC
ACCCATAATCTACATAGCTATGTATGTATGTATTTATGCACACACATTATAGTTTATACA
GTATATATAGATAAATTCATATATACACACGTGATCTTACATATGTATACGTATCTGTTT
ACGTCAAGAAAGGTCATACGTCTCTTTCTACTCCATGGTTGCAAGATGTCTACTAATAAC
AGAAGCAGATTAATTACAACTACGAAAGTGTAATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 40 55 55 55 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H763TF U 1
AF RR2AY02TFB U 301
AF RR2DH71TF U 16
AF RR2BA42TF U 62
AF RR2AV12TF U 435
AF RR2DA59JQ C 498
AF RR2F142JQ C 551
AF RR2BA42JQ C 567
AF RR2DH71JQ C 568
AF RR2AY02JQ C 576
AF RR2BE62TF U 675
AF RR2H763JQB C 999
BS 1 255 RR2H763TF
BS 256 256 RR2DH71TF
BS 257 435 RR2H763TF
BS 436 436 RR2DH71TF
BS 437 464 RR2H763TF
BS 465 465 RR2DH71TF
BS 466 578 RR2H763TF
BS 579 579 RR2DH71TF
BS 580 596 RR2H763TF
BS 597 663 RR2DH71TF
BS 664 664 RR2BA42TF
BS 665 699 RR2DH71TF
BS 700 700 RR2BA42TF
BS 701 753 RR2DH71TF
BS 754 754 RR2BA42TF
BS 755 786 RR2DH71TF
BS 787 904 RR2BA42TF
BS 905 906 RR2AV12TF
BS 907 907 RR2BA42TF
BS 908 908 RR2AV12TF
BS 909 942 RR2BA42TF
BS 943 943 RR2AV12TF
BS 944 963 RR2BA42TF
BS 964 1191 RR2AV12TF
BS 1192 1298 RR2BE62TF

RD RR2H763TF 596 0 0
GGATATCATACACCTTCACTCTCCAAAATATCAAATCCTCTTCCTACATATTCTCCCTTG
AGTATCATGAGACAGTCTTCGTAGAATAACTCATTTGAAGATAGCTAGTTGATGGAAAAC
ATGGGGGATTCGACCATAGGGCCGGGTCATCCGCATCTCCCTCCCGGGTTTCGGTTTCAC
CCGACCGACGAAGAACTTGTAGTTCATTACCTCAAGAAGAAAGCTGCTTCTATTCCACTT
CCGGTCTCAATCATCACCGAGATTGATCTTTACAAGTTTGATCCTTGGGAGCTTCCAAGC
AAGGCAAGTTTTGGAGAACAAGAGTGGTACTTCTTTAGTCCTAGAGATCGGAAGTATCCC
AATGGCGTTAGGCCGAATCGGGCAGCAACTTCTGGTTACTGGAAAGCCACGGGAACCGAT
AAACCAATATTTACGCGCAATAGTCACAAGGTTGGGGTCAAGAAGGCGCTTGTATTCTAT
GGTGGAAAACCTCCTAAAGGGATTAAAACTGATTGGATCATGCATGAATATCGCCTCACT
GATGGTAATCTTAACACCGCTGCTAAGCCACCTGACTCGACCACGTCAAGGAAAAA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2AY02TFB 291 0 0
AAGGCAAGTTTTGGAGAACAAGAGTGGTACTTCTTTAGTCCTAGAGATCGGAAGTATCCC
AATGGCGTTAGGCCGAATCGGGCAGCAACTTCTGGTTACTGGAAAGTCACGGGAACCGAT
AAACCAATATTTACGTGCAATAGTCACAAGGGTGGGGTCAAGAAAGCGCTTGTATTCTAT
GGTGGAAAACCTCCTAAAGGGATTAAAACTGATTGGATCATGCATGAATATCGCCTCACT
GCTGGTAATCTTAACACCGCTGCTAAGCCACCTGACTCAACCACGTCAAGG

QA 1 291 1 291
DS 

RD RR2DH71TF 771 0 0
GGAC
TCTCCAAAATATCAAATCCTCTTCCTACATATTCTCCCTTGAGTATCATGAGACAGTCTT
CGTAGAATAACTCATTTGAAGATAGCTAGTTGATGGAAAACATGGGGGATTCGACCATAG
GGCCGGGTCATCCGCATCTCCCTCCCGGGTTTCGGTTTCACCCGACCGACGAAGAACTTG
TAGTTCATTACCTCAAGAAGAAAGCTGCTTCTATTCCACTTCCGGTCTCAACCATCGCCG
AGGTTGATCTTTACAAGTTTGATCCTTGGGAGCTTCCAAGCAAGGCAAGTTTTGGAGAAC
AAGAGTGGTACTTCTTTAGTCCTAGAGATCGGAAGTATCCCAATGGCGTTAGGCCGAATC
GGGCAGCAACTTCTGGTTACTGGAAAGCCACGGGAACCGATAAACCAATATTTACGTGCA
ATAGTCACAAGGTTGGGGTCAAGAAAGCGCTTGTATTCTATGGTGGAAAACCTCCTAAAG
GGATTAAAACTGATTGGATCATGCATGAATATCGCCTCACTGATGGTAATCTTAACACCG
CTGCTAAGCCACCTGACTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCACTACGGCTAGACGATTGGG
TTCTTTGTAGGATCTATAAGAAGAATAGTTCACAGAGACCAACAGTGGAGAGAGTATTAC
TAAGAGAGGATCTCATGGAAAGAATGCTCTC**AAAATCATCTGCTAATTCATCTTCCAC
ATCGGTCTTAGACA*CAACAACAACAACAACAATAATAACAATGAAG

QA 5 771 5 771
DS 

RD RR2BA42TF 902 0 0
GG
ATCATGAGACAGTCTTCGTAGAATAACTCATTTGAAGATAGCTAGTTGATGGAAAACATG
GGGGATTCGACCATAGGGCCGGGTCATCCGCATCTCCCTCCCGGGTTTCGGCTTCACCCG
ACCGACGAAGAACTTGTAGTTCATTACCTCAAGAAGAAAGCTGCTTCTATTCCACTTCCG
GTCTCAATCATCGCCGAGATTGATCTTTACAAGTTTGATCCTTGGGAGCTTCCAAGCAAG
GCAAGTTTTGGAGAACAAGAGTGGTACTTCTTTAGTCCTAGAGATCGGAAGTATCCCAAT
GGCGTTAGGCCGAATCGGGCAGCAACTTCTGGTTACTGGAAAGCCACGGGAACCGATAAA
CCAATATTTACGTGCAATAGTCACAAGGTTGGGGTCAAGAAAGCGCTTGTATTCTATGGT
GGAAAACCTCCTAAAGGGATTAAAACTGATTGGATCATGCATGAATATCGCCTCACTGAT
GGTAATCTTAACACCGCTGCTAAGCCACCTGACTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCACTA
CGGCTAGACGATTGGGTTCTTTGTAGGATCTATAAGAAGAATAGTTCACAGAGACCAACA
ATGGAGAGAGTATTACTAAGAGAGGATCTCATGGAAGGAATGCTCTC**AAAATCATCTG
CTAATTCATCTTCCACATCGGTCTTAGACAACAACAACAACAACAACAATAATAACAATG
AAGAACACTTTTTCGATGGTATGGCCGTTTCATCGGACAAACGTTCGTTGTGTGGTCAGT
ATCGTATAGGTCATGAGGCCACTGGATCATCTTCTTTCGGGTCATTCTTATCGAGCAAGA
G**TTCATCATACGAGTGATCTCAATAATGATAACTACA*TGTCTCATTTGTCTCGATGC

QA 3 902 3 902
DS 

RD RR2AV12TF 757 0 0
GTGCAATAGTCACAAGGTTGGGGTCAAGAAAGCGCTCGTATTCTATGGTGGAAAACCTCC
TAAAGGGATTAAAACTGATTGGATCATGCATGAATATCGCCTCACTGATGGTAATCTTAA
CACCGCTGCTAAGCCACCTGACTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCACTACGGCTAGACGA
TTGGGTTCTTTGTAGGATCTATAAGAAGAATAGTTCACAGAGACCAACAATGGAGAGAGT
ATTACTAAGAGAGGATCTCATGGAAGGAATGCTCTC**AAAATCATCTGCTAATTCATCT
TCCACATCGGTCTTAGACAACAACAACAACAACAACAATAATAACAATGAAGAACACTTT
TTCGATGGTATGGCCGTTTCATCGGACAAACGTTCGTTGTGTGGTCAGTATCGTATAGGT
CATGAGGCCACTGGATCATCTTCTTTCGGGTCATTCTTATCGAGCAAGAGGTTCCATCAT
ACGAGTGATCTCAATAATGATAACTACAATGTCTCATTTGTCTCGATGCTTAGTGAAATT
CCTCAGAGTTCGGGGTTTCATGGAAATGGAGTCATCGATACGACGTCGACTCTAGCTGAT
CATGGGGTTTTAAGACAGGCGTTTCAGCTTCCTAACATGAACTGGCACCCATAATCTACA
TAGCTATGTATGTATGTATTTATGCACACACATTATAGTTTATACAGTATATATAGATAA
ATTCATATATACACACGTGATCTTACATATGTATACG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2DA59JQ 769 0 0
AGGGATTAAAACTGATTGGATCATGCATGAATATCGCCTCACTGATGGTAATCTTAACAC
CGCTGCTAAGCCACCTGACTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCTCTACGGCTAGACGATTG
GGTTCTTTGTAGGATCTATAAGAAGAATAGTTCACAGAGACCAACAATGGAGAGAGTATT
ACTAAGAGAGGATCTCATGGAAGGAATGCTCTC**AAAATCATCTGCTAATTCATCTTCC
ACATCGGTCTTAGACA***ACAACAACAACAACAATAATAACAATGAAGAACACTTTTTC
GATGGCATGGCCGTTTCATCGGACAAACGTTCGTTGTGTGGTCAGTATCGTATAGGTCAT
GAGGCCACTGGATCATCTTCTTTCGGGTCATTCTTATCGAGCAAGAGGTTCCATCATACG
AGTGATCTCAATAATGATAACTACAATGTCTCATTTGTCTCGATGCTTAGTGAAATTCCT
CAGAGTTCGGGGTTTCATGGAAATGGAGTCATCGATACGACGTCGACTCTAGCTGATCAT
GGGGTTTTAAGACAGGCGTTTCAGCTTCCTAACATGAACTGGCACCCATAATCTACATAG
CTATGTATGTATGTATTTATGCACACACATTATAGTTTATACAGTATATATAGATAAATT
CATATATACACACGTGATTTTACATATGTATACGTATCTGTTTACGTCAAGAAAGGTCAT
ACGTCTCTTTCTACTCCATGGTTGCAAGATGTCTACTAATAACAGAAGC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2F142JQ 725 0 0
TTAACACCGCTGCTAAGCCAC*TGACTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCACTACGGCTAG
ACGATTGGGTTCTTTGTAGGATCTATAAGAAGAATAGTTCACAGAGACCAACAATGGAGA
GAGTATTACTAAGAGAGGATCTCATGGAAGGAATGCTCTC**AAAATCATCTGCTAATTC
ATCTTCCACATCGGTCTTAGACAACAACAACAACAACAACAATAATAACAATGAAGAACA
CTTTTTCGATGGTATGGCCGTTTCATCGGACAAACGTTCGTTGTGTGGTCAGTATCGTAT
AGGTCATGAGGCCACTGGATCATCTTCTTTCGGGTCATTCTTATCGAGCAAGAGGTTCCA
TCATACGAGTGATCTCAATAATGATAACTACAATGTCTCATTTGTCTCGATGCTTAGTGA
AATTCCTCAGAGTTCGGGGTTTCATGGAAATGGAGTCATCGATACGACGTCGACTCTAGC
TGATCATGGGGTTTTAAGACAGGCGTTTCAGCTTCCTAACATGAACTGGCACCCATAATC
TACATAGCTATGTATGTATGTATTTATGCACACACATTATAGTTTATACAGTATATATAG
ATAAATTCATATATACACACGTGATCTTACATATGTATACGTATCTGTTTACGTCAAGAA
AGGTCATACGTCTCTTTCTACTCCATGGTTGCAAGATGTCTACTAATAACAGAAGCAGAT
TAAT
C

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2BA42JQ 700 0 0
GCCACCTGACTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCACTACGGCTAGACGATTGGGTTCTTTG
TAGGATCTATAAGAAGAATAGTTCACAGAGACCAACAATGGAGAGAGTATTACTAAGAGA
GGATCTCATGGAAGGAATGCTCTC**AAAATCATCTGCTAATTCATCTTCCACATCGGTC
TTAGACAACAACAACAACAACAACAATAATAACAATGAAGAACACTTTTTCGATGGTATG
GCCGTTTCATCGGACAAACGTTCGTTGTGTGGTCAGTATCGTATAGGTCATGAGGCCACT
GGATCATCTTCTTTCGGGTCATTCTTATCGAGCAAGAGGTTCCATCATACGAGTGATCTC
AATAATGATAACTACAATGTCTCATTTGTCTCGATGCTTAGTGAAATTCCTCAGAGTTCG
GGGTTTCATGGAAATGGAGTCATCGATACGACGTCGACTCTAGCTGATCATGGGGTTTTA
AGACAGGCGTTTCGGCTTCCTAACATGAACTGGCACCCATAATCTACATAGCTATGTATG
TATGTATTTATGCACACACATTATAGTTTATACAGTATATATAGATAAATTCATATATAC
ACACGTGATCTTACATATGTATACGTATCTGTTTACGTCAAGAAAGGTCATACGTCTCTT
TCTACTCCATGGTTGCAAGATGTCTACTAATAACAGAAGC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2DH71JQ 710 0 0
GCCA
CTGACTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCACTACGGCTAGACGATTGGGTTCTTTGTAGGA
TCTATAAGAAGAATAGTTCACAGAGACCAACAGTGGAGAGAGTATTACTAAGAGAGGATC
TCATGGAAGGAATGCTCTC**AAAATCATCTGCTAATTCATCTTCCACATCGGTCTTAGA
CAACAACAACAACAACAACAATAATAACAATGAAGAACACTTTTTCGATGGTATGGCCGT
TTCATCGGACAAACGTTCGTTGTGTGGTCAGTATCGTATAGGTCATGAGGCCACTGGATC
ATCTTCTTTCGGGTCATTCTTATCGAGCAAGAGGTTCCATCATACGAGTGATCTCAATAA
TGATAACTACAATGTCTCATTTGTTTCGATGCTTAGTGAAATTCCTCAGAGTTCGGGGTT
TCATGGAAATGGAGTCATCGATACGACGTCGACTCTAGCTGATCATGGGGTTTTAAGACA
GGCGTTTCAGCTTCCTAACATGAACCGGCACCCATAATCTACATAGCTATGTATGTATGT
ATTTATGCACACGCATTATAGTTTATACAGTATATATAGATAAATTCATATATACACACG
TGATCTTACATATGTATACGTATCTGTTTACGTCAAGAAAGGTCATACGTCTCTTTCTAC
TCCATGGTTGCAAGATGTCTACTAATAACAGAAGCAGATTAATTAC

QA 5 710 5 710
DS 

RD RR2AY02JQ 702 0 0
CTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCACTACGGCTAGACGATTGGGTTCTTTGTAGGATCTA
TAAGAAGAATAGTTCACAGAGACCAACAATGGAGAGAGTATTACTAAGAGAGGATCTCAA
GGAAGGAATGCTCTC**AAAATCATCTGCTAATTCATCTTCCACATCGGTCTTAGACAAC
AACAACAACAACAACAACAATAACAATGAAGAACACTTTTTCGATGGTATGGCCGTTTCA
TCGGACAAACGTTCGTTGTGTGGTCAGTATCGTATAGGTCATGAGGCCACTGGATCATCT
TCTTTCGGGTCATTCTTATCGAGCAAGAGGTTCCATCATACGGGTGATCTCAATAATGAT
AACTACAATGTCTCATTTGTCTCGATGCTTAGTGAAATTCCTCAGAGTTCGGGGTTTCAT
GGAAATGGAGTCATCGATACGACGTCGACTCTAGCTGATCATGGGGTTTTAAGACAGGCG
TTTCAGCTTCCTAACATGAACTGGCACCCATAATCTACATAGCTATGTATGTATGTATTT
ATGCACACACATTATAGTTTATACAGTATATATAGATAAATTCATATATACACACGTGAT
CTTACATATGTATACGTATCTGTT*ACGTC**GAAAGGTCATACGTCTCTTTCTACTCCA
TGGTTGCAAGATGTCTACTAATAACAGAAGCAGATTAATTAC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2BE62TF 624 0 0
G
TTACTAAGAGAGGATCTCATGGAATGAATGCTCTCTCAAAATCATCTGCTAATTCATCTT
CCACATCGGTCTTAGACAACAACAACAACAACAACAATAATAACAATGAAGAACACTTTT
TCGATGGTATGGCCGTTTCATTGGACAAACGTTCGTTGTGTGGTCAGTATCGTATAGGTC
ATGAGGCCACTGGATCATCTTCTTTCGGGTCATTCTTATCGAGCAAGAGGTTCCATCATA
CGAGTGATCTCAATAATGATAACTACAATGTCTCATTTGTCTCGATGCTTAGTGAAATTC
CTCAGAGTTCGGGGTTTCATGGAAATGGAGTCATCGATACGACGTCGACTCTAGCTGATC
ATGGGGTTTTAAGACAGGCGTTTCAGCTTCCTAACATGAACTGGCACCCATAATCTACAT
AGCTATGTATGTATGTATTTATGCACACACATTATAGTTTATACAGTATATATAGATAAA
TTCATATATACACACGTGATCTTACATATGTATACGTATCTGTTTACGTCAAGAAAGGTC
ATACGTCTCTTTCTACTCCATGGTTGCAAGATGTCTACTAATAACAGAAGCAGATTAATT
ACAACTACGAAAGTGTAATTTTC

QA 2 624 2 624
DS 

RD RR2H763JQB 279 0 0
AATGGAGTCATCGATACGACGTCGACTCTAGCTGATCATGGGGTTTTAAGACAGGCGTTT
CAGCTTCCTAACATGAACTGGCACCCATAATCTACATAGCTATGTATGTATGTATTTATG
CACACACATTATAGTTTATACAGTATATATAGATAAATTCATATATACACACGTGATCTT
ACATATGTATACGTATCTGTTTACGTCAAGAAAGGTCATACGTCTCTTTCTACTCCATGG
TTGCAAGATGTCTACTAATAACAGAAGCAGATTAATTAC

QA 1 279 1 279
DS 



AS 1 12

CO CL317Contig1 897 12 12 U
GGACTGACGTCAATCTGATTTAAATTTCATAAGAGCCACAACATTTCACAAAAAAATAAT
GGCAACGACTGCATCTCCAATGGCGAGCCAGCTAAGAAGTAGCTTCTCTTCCGGTACTAA
TTTGAGGCGTATCGCTGTTCCTAAGGGCATCTCCGGCGCTCCTTTCAGCGTTTCACCGAC
CAAGAGAACGTTTTCTTTCACAGTCCGAGCTGTCCAGTCAGACAAGCCAACATTCCAAGT
GATCCAACCAATCAACGGCGATCCATTCATCGGAAGCTTAGAAACTCCAGTAACGTCAAG
CCCACTGATCGCGTGGTATCTCTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACAGCCGTCAACCCTCT
CCTCCGAGGTGTCGAAGTGGGTTTGGCTCATGGTTTCCTTTTAGTGGGCCCATTTGTCAA
AGCAGGCCCATTAAGGAACACTGCCTATGCTGGCTCCGCCGGATCTTTAGCCGCTGCTGG
GCTTGTAGTCATCCTCAGCATGTGCCTCACTATCTATGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAGG
AGAGCCGTCGATTGCACCAAGTTTGACTTTGACGGGGCGGAAGAAGCAACCGGACCAGCT
TCAGACAGCAGATGGATGGGCTAAGTTCACTGG*AGGGTTCTTCTTCGGAGGGATCTCTG
GTGTGACTTGGGCTTATTTCCTTCTCTACGTTCTTGACCTTCCTTACTTCGTCAAATGAA
TGTACTTAAAAATATGATCTTTCGCCAATCTTCTCGACCTTCAAATACTTTCTTGCATCA
TTGTTTTTTTT*ACTCTTGTCTTCATCAAGATTCTTGAATCTCCATGATGCTTAATGTAC
CATTTCAAAAAAAAAATTTGATGCTATTAGTATATTACTATGAATATTTTCCTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F138TF U 31
AF RR2F420TF U 4
AF RR2EZ41TF U 1
AF RR2FV24TF U 20
AF RR2BB84TF U 15
AF RR2F420JQ C 101
AF RR2BB84JQ C 107
AF RR2GU55JQB C 660
AF RR2FV24JQ C 324
AF RR2GU55TF U 173
AF RR2FD51JQ C 186
AF RR2EZ41JQ C 660
BS 1 305 RR2EZ41TF
BS 306 306 RR2F420TF
BS 307 352 RR2EZ41TF
BS 353 353 RR2F420TF
BS 354 612 RR2EZ41TF
BS 613 613 RR2BB84TF
BS 614 633 RR2EZ41TF
BS 634 634 RR2BB84TF
BS 635 643 RR2EZ41TF
BS 644 846 RR2BB84TF
BS 847 855 RR2GU55TF
BS 856 897 RR2EZ41JQ

RD RR2F138TF 388 0 0
AAA
AGCCACAACATTTCACAAAAAAATAATGGCAACGACTGCATCTCCAATGGCGAGCCAGCT
AAGAAGTAGCTTCTCTTCCGGTACTAATTTGAGGCGTATCGCTGTTCCTAAGGGCATCTC
CGGCGCTCCTTTCAGCGTTTCACCGACCAAGAGAACGTTTTCTTTCACAGTCCGAGCTGT
CCAGTCAGACAAGCCAACATTCCAAGTGATCCAACCAATCAACGGCGATCCATTCATCGG
AAGCTTAGAAACTCCAGTAACGTCAAGCCCACTGATCGCGTGGTATCTCTCCAACCTCCC
GGCTTACCGCACAGCCGTCAACCCTCTCCTCCGAGGTGTCGAAGTGGGTTTGGCTCATGG
TTTCCTTTTAGTGGGCCCATTTGTC

QA 4 388 4 388
DS 

RD RR2F420TF 527 0 0
GG
GACGTCAATCTGATTTAAATTTCATAAGAGCCACAACATTTCACAAAAAAATAATGGCAA
CGACTGCATCTCCAATGGCGAGCCAGCTAAGAAGTAGCTTCTCTTCCGGTACTAATTTGA
GGCGTATCGCTGTTTCTAAGGGCATCTCCGGCGCTCCTTTCAGCGTTTCACCGACCAAGA
GAACGTTTTCTTTCACAGTCCGAGCTGTCCAGTCAGACAAGCCAACATTCCAAGTGATCC
AACCAATCAACGGCGATCCATTCATCGGAAGCTTAGAAACTCCAGTAACGTCAAGCCCAC
TGATCGCGTGGTATCTCTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACAGCCGTCAACCCTCTCCTCC
GAGGTGTCGAAGTGGGTTTGGCTCATGGTTTCCTTTTAGTGGGCCCATTTGTCAAAGCAG
GCCCATTAAGGAACACTGCCTATGCTGGCTCCGCCGGATCTTTAGCCGCTGCTGGGCTTG
TAGTCATCCTCAGCATGTGCCTCACTATCTATGGAATCTCTTCGT

QA 3 527 3 527
DS 

RD RR2EZ41TF 643 0 0
GGACTGACGTCAATCTGATTTAAATTTCATAAGAGCCACAACATTTCACAAAAAAATAAT
GGCAACGACTGCATCTCCAATGGCGAGCCAGCTAAGAAGTAGCTTCTCTTCCGGTACTAA
TTTGAGGCGTATCGCTGTTCCTAAGGGCATCTCCGGCGCTCCTTTCAGCGTTTCACCGAC
CAAGAGAACGTTTTCTTTCACAGTCCGAGCTGTCCAGTCAGACAAGCCAACATTCCAAGT
GATCCAACCAATCAACGGCGATCCATTCATCGGAAGCTTAGAAACTCCAGTAACGTCAAG
CCCACCGATCGCGTGGTATCTCTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACAGCCGTCGACCCTCT
CCTCCGAGGTGTCGAAGTGGGTTTGGCTCATGGTTTCCTTTTAGTGGGCCCATTTGTCAA
AGCAGGCCCATTAAGGAACACTGCCTATGCTGGCTCCGCCGGATCTTTAGCCGCTGCTGG
GCTTGTAGTCATCCTCAGCATGTGCCTCACTATCTATGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAGG
AGAGCCGTCGATTGCACCAAGTTTGACTTTGACGGGGCGGAAGAAGCAACCGGACCAGCT
TCAGACAGCAGAGGGATGGGCTAAGTTCACTGGGAGGGTTCTT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2FV24TF 704 0 0
GG
AAATTTCATAAGAGCCACAACATTTCACAAAAAAATAATGGCAACGACTGCATCTCCAAT
GGCGAGCCAGCTAAGAAGTAGCTTCTCTTCCGGTACTAATTTGAGGCGTATCGCTGTTCC
TAAGGGCATCTCCGGCGCTCCTTTCAGCGTTTCACCGACCAAGAGAACGTTTTCTTTCAC
AGTCCGAGCTGTCCAGTCAGACAAGCCAACATTCCAAGTGATCCAACCAATCAACGGCGA
TCCATTCATCGGAAGCTTAGAAACTCCAGTAACGTCAAGCCCACTGATCGCGTGGTATCT
CTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACAGCCGTCAACCCTCTCCTCCGAGGTGTCGAAGTGGG
TTTGGCTCATGGTTTCCTTTTAGTGGGCCCATTTGTCAAAGCAGGCCCATTAAGGAACAC
TGCCTATGCTGGCTCCGCCGGATCTTTAGCCGCTGCCGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCAT
GTGCCTCACTATCTATGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAGGAGAGCCGTCGATTGCACCAAG
TTTGACTTTGACGGGGCGGAAGAAGCAACCGGACCAGCTTCAGACAGCAGATGGATGGGC
TAAGTTCACTGG*AGGGTTCTTCTTCGGAGGGATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTATTTCC
TTCTCTACGTTCTTGACCTTCCTTACTTCGTCAAATGAATGT

QA 3 704 3 704
DS 

RD RR2BB84TF 832 0 0
GGGATTT
AAATTTCATAAGAGCCACAACATTTCACAAAAAAATAATGGCAACGACTGCATCTCCAAT
GGCGAGCCAGCTAAGAAGTAGCTTCTCTTCCGGTACTAATTTGAGGCGTATCGCTGTTCC
TAAGGGCATCTCCGGCGCTCCTTTCAGCGTTTCACCGACCAATAGAACGTTTTCTTTCAC
AGTCCGAGCTGTCCAGTCAGACAAGCCAACATTCCAAGTGATCCAACCAATCAACGGCGA
TCCATTCATCGGAAGCTTAGAAACTCCAGTAACGTCAAGCCCACTGATCGCGTGGTATCT
CTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACAGCCGTCAACCCTCTCCTCCGAGGTGTCGAAGTGGG
TTTGGCTCATGGTTTCCTTTTAGTGGGCCCATTTGTCAAAGCAGGCCCATTAAGGAACAC
TGCCTATGCTGGCTCCGCCGGATCTTTAGCCGCTGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCAT
GTGCCTCACTATCTATGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAGGAGAGCCGTCGATTGCACCAAG
TTTGACTTTGACGGGGCGGAAGAAGCAACCGGACCAGCTTCAGACAGCAGATGGATGGGC
TAAGTTCACTGG*AGGGTTCTTCTTCGGAGGGATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTATTTCC
TTCTCTACGTTCTTGACCTTCCTTACTTCGTCAAATGAATGTACTTAAAAATATGATCTT
TCGCCAATCTTCTCGACCTTCAAATACTTTCTTGCATCATTGTTTTTTTT*ACTCTTGTC
TTCATCAAGATTCTTGAATCTCCATGATGCTTAATGTACCATTTC

QA 8 832 8 832
DS 

RD RR2F420JQ 746 0 0
AGCTTCTCTTCCGGTACTAATTTGAGGCGTATCGCTGTTTCTAAGGGCATCTCCGGCGCT
CCTTTCAGCGTTTCACCGACCAAGAGAACGTTTTCTTTCACAGTCCGAGCTGTCCAGTCA
GACAAGCCAACATTCCAAGTGATCCAACCAATCAACGGCGATCCATTCATCGGAAGCTTA
GAAACTCCAGTAACGTCAAGCCCACTGATCGCGTGGTATCTCTCCAACCTCCCGGCTTAC
CGCACAGCCGTCAACCCTCTCCTCCGAGGTGTCGAAGTGGGTTTGGCTCATGGTTTCCTT
TTAGTGGGCCCATTTGTCAAAGCAGGCCCATTAAGGAACACTGCCTATGCTGGCTCCGCC
GGATCTTTAGCCGCTGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCATGTGCCTCACTATCTATGGA
ATCTCTTCGTTCAAGGAAGGAGAGCCGTCGATTGCACCAAGTTTGACTTTGACGGGGCGG
AAGAAGCAACCGGACCAGCTTCAGACAGCAGATGGATGGGTTAAGTTCACTGG*AGGGTT
CTTCTTCGGAGGGATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTATTTCCTTCTCTACGTTCTTGACCT
TCCTTACTTCGTCAAATGAATGTACTTAAAAATATGATCTTTCGCCAATCTTCTCGACCT
TCAAATACTTTCTTGCATCATTGTTTTTTTT*ACTCTTGTCTTCATCAAGATTCTTGAAT
CTCCATGATGCTTAATGTACCATTTC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2BB84JQ 740 0 0
TCTTCCGGTACTAATTTGAGGCGTATCGCTGTTCCTAAGGGCATCTCCGGCGCTCCTTTC
AGCGTTTCACCGACCAATAGAACGTTTTCTTTCACAGTCCGAGCTGTCCAGTCAGACAAG
CCAACATTCCAAGTGATCCAACCAATCAACGGCGATCCATTCATCGGAAGCTTAGAAACT
CCAGTAACGTCAAGCCCACTGATCGCGTGGTATCTCTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACA
GCCGTCAACCCTCTCCTCCGAGGTGTCGAAGTGGGTTTGGCTCATGGTTTCCTTTTAGTG
GGCCCATTTGTCAAAGCAGGCCCATTAAGGAACACTGCCTATGCTGGCTCCGCCGGATCT
TTAGCCGCTGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCATGTGCCTCACTATCTATGGAATCTCT
TCGTTCAAGGAAGGAGAGCCGTCGATTGCACCAAGTTTGACTTTGACGGGGCGGAAGAAG
CAACCGGACCAGCTTCAGACAGCAGATGGATGGGCTAAGTTCACTGG*AGGGTTCTTCTT
CGGAGGGATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTATTTCCTTCTCTACGTTCTTGACCTTCCTTA
CTTCGTCAAATGAATGTACTTAAAAATATGATCTTTCGCCAATCTTCTCGACCTTCAAAT
ACTTTCTTGCATCATTGTTTTTTTT*ACTCTTGTCTTCATCAAGATTCTTGAATCTCCAT
GATGCTTAATGTACCATTTC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2GU55JQB 187 0 0
GGTGTGACTTGGGCTTATTTCCTTCTTTACGTTCTTGACCTTCCTTATTTCGTCAAATGA
ATGTACTTAAAAATATGATCTTTCGCCAATTTTCTCGACCTTAAAATACTTTCTTGCATC
ATTGTTTTTTTT*ACTCTTGTCTTCATCAAGATTCTTGAATCTCCATGATGCTTAATGTA
CCATTTC

QA 1 187 1 187
DS 

RD RR2FV24JQ 523 0 0
CCAACCTCCCGGCTTACCGCACAGCCGTCAACCCTCTCCTCCGAGGTGTCGAAGTGGGTT
TGGCTCATGGTTTCCTTTTAGTGGGCCCATTTGTCAAAGCAGGCCCATTAAGGAACACTG
CCTATGCTGGCTCCGCCGGATCTTTAGCCGCTGCCGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCATGT
GCCTCACTATTTATGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAGGAGAGCCGTCGATTGCACCAAGTT
TGACTTTGACGGGGCGGAAGAAGCAACCGGACCAGCTTCAGACAGCAGATGGATGGGCTA
AGTTCACTGG*AGGGTTCTTCTTCGGAGGGATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTATTTCCTT
CTCTACGTTCTTGACCTTCCTTACTTCGTCAAATGAATGTACTTAAAAATATGATCTTTC
GCCAATCTTCTCGACCTTCAAATACTTTCTTGCATCATTGTTTTTTTT*ACTCTTGTCTT
CATCAAGATTCTTGAATCTCCATGATGCTTAATGTACCATTTC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2GU55TF 683 0 0
G
CACCGACCAAGAGAACGTTTTCTTTCACAGTCCGAGCTGTCCAGTCAGACAAGCCAACAT
TCCAAGTGATCCAACCAATCAACGGCGATCCATTCATCGGAAGCTTAGAAACTCCAGTAA
CGTCAAGCCCACTGATCGCGTGGTATCTCTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACAGCCGTCA
ACCCTCTCCTCCGAGGTGTCGAAGTGGGTTTGGCTCATGGTTTCCTTTTAGTGGGCCCAT
TTGTCAAAGCAGGCCCATTAAGGAACACTGCCTATGCTGGCTCCGCCGGATCTTTAGCCG
CTGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCATGTGCCTCACTATCTATGGAATCTCTTCGTTCA
AGGAAGGAGAGCCGTCGATTGCACCAAGTTTGACTTTGACGGGGCGGAAGAAGCAACCGG
ACCAGCTTCAGACAGCAGATGGATGGGCCAAGTTCACTGG*AGGGTTCTTCTTCGGAGGG
ATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTATTTCCTTCTCTACGTTCTTGACCTTCCTTACTTCGTC
AAATGAATGTACTTAAAAATATGATCTTTCGCCAATCTTCTCGACCTTCAAATACTTTCT
TGCATCATTGTTTTTTT**ACTCTTGTCTTCATCAAGATTCTTGAATCTCCATGATGCTT
AATGTACCATTTCAAAAAAAAA

QA 2 683 2 683
DS 

RD RR2FD51JQ 661 0 0
GAACGTTTTCTTTCACAGTCCGAGCTGTCCAGTCAGACAAGCCAACATTCCAAGTGATCC
AACCAATCAACGGCGATCCATTCATCGGAAGCTTAGAAACTCCAGTAACGTCGAGCCCAC
TGATCGCGTGGTATCTCTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACAGCCGTCAACCCTCTCCTCC
GAGGTGTCGAAGTGGGTTTGGCTCATGGTTTCCTTTTAGTGGGCCCATTTGTCAAAGCAG
GCCCATTAAGGAACACTGCCTATGCTGGCTCCGCCGGATCTTTAGCCGCTGCTGGGCTTG
TAGTCATCCTCAGCATGTGCCTCACTATCTATGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAGGAGAGC
CGTCGATTGCACCAAGTTTGACTTTGACGGGGCGGAAGAAGCAACCGGACCAGCTTCAGA
CAGCAGAGGGATGGGCTAAGTTCACTGG*AGGGTTCTACTTCGGAGGGATCTCTGGTGTG
ACTTGGGCTTATTTCCTTCTCTACGTTCTTGACCTTCCTTACTTCGTCAAATGAATGTAC
TTAAAAATATGATCTTTCACCAATCTTCTCGACCTTCAAATACTTTCTTGCATCATTGTT
TTTTT**ACTCTTGTCTTCATCAAGATTCTTGAATCTCCATGATGCTTAATGTACCATTT
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2EZ41JQ 238 0 0
GGTGTGACTTGGGCTTATTTCCTTCTTTACGTTCTTGACCTTCCTTACTTCGTCAAATGA
ATGTACTTAAAAATATGATCTTTCACCAATCTTCTCGACCTTCAAATACTTTCTTGCATC
ATTGTTTTTTTTTACTCTTGTCTTCATCAAGATTCTTGAATCTCCATGATGCTTAATGTA
CCATTTCAAAAAAAAAATTTGATGCTATTAGTATATTACTATGAATATTTTCCTAGCC

QA 1 238 1 238
DS 



AS 1 13

CO CL318Contig1 1116 13 34 U
GGAACACTGCGAAGCTCTCCGCTAGTAGCTAAAGAGCGCTTAAAAAAAAAAAAGCTTTCA
CACACGAAAATTTCTCGGATCTGAGATCTTTGGATCCAAACATCGTTTTTTT*AATTCGA
AATCAAGGTAATAAGGAAAGCTTTGAGGGATCTTAGTCATGTCAAGAAGGCAAGTAGGAG
GTTCCACGAGGCGTGGAGGGGATAGTGGAAGCTTTCCATTTGTAGGAGCTTTGCACTCCA
AATCACGTTCCTCTCCTCTGCTTTCTATTTGCCTTGTTCTCGTGGGAGCATGTCTTCTCA
TTGGTTATGCTTTCAGTGGTCCAGGTTTGTTTAAAACCATCAGAGAAGTCAGCAAGATCA
CAGGGGACTATTCATGCACATCAGAAGTTCAAAGAGCCATTCCTATTCTCAAGAATGCTT
ACGGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTA
CTCTGTTGAGGGAAGAAGAGACTGAAGCATGGGGTGTTGAGCCATATGACGTAGAGGATG
CAGACTCCAAATGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCCTTGTACGTGTGGCCGACATCAAGT
TCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTTCTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATT
ACCTCTCACCAAAGTATCTGAACAAAACTGTTCCTGAACTTGCGCGGGTTGCTTCAGATG
GTGTCGTTCTCTTCGCAGGTAATCCTGGTAAGCAAAAGGCTAAAGCTGCAGAGTTGTCAA
AAGTGGGACGACCGGCTAAAATGCGTAGCTCGTCCTGGTGGAGCCGTTTCTTCTCACAGA
CGAACTTAGAGGAAAACGAAGCAGGAAGCAAGAAATTCGAAAAAGCAGCGTCCAAGATGT
CATACAAACCAGCTTGTCAAGTCTTCCACCTCAAGCCATTACATTAGAACGTTATTAGTA
TTATTATTACTTGTCTGCGAACCAAATATATCTTCCACTCTCTGTTATATGCCTTATTTG
CTCTATAGAAAGAAACAGATGTTCAAAAAAGAAATTGTATTCCATTCTCAACGTTTTGAT
TCATAAGTTAACTATTTAATAAATTAGCCTGCCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 
0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 0 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 5 65 50 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 0 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 60 60 10 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 5 30 30 30 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK10TF U 318
AF RR2C073TF U 28
AF RR2H235TF U 1
AF RR2F565TF U 58
AF RR2BI94TF U 29
AF RR2DT35TF U 72
AF RR2BS13TF U 28
AF RR2BI94JQ C 276
AF RR2G560JQ C 587
AF RR2F565JQ C 282
AF RR2BS13JQ C 331
AF RR2DT35JQ C 827
AF RR2H235JQ C 394
BS 1 45 RR2H235TF
BS 46 46 RR2BS13TF
BS 47 48 RR2H235TF
BS 49 49 RR2BS13TF
BS 50 111 RR2H235TF
BS 112 112 RR2BS13TF
BS 113 130 RR2H235TF
BS 131 131 RR2BS13TF
BS 132 217 RR2H235TF
BS 218 218 RR2BS13TF
BS 219 241 RR2H235TF
BS 242 242 RR2BS13TF
BS 243 337 RR2H235TF
BS 338 338 RR2BS13TF
BS 339 367 RR2H235TF
BS 368 368 RR2BS13TF
BS 369 732 RR2H235TF
BS 733 738 RR2BS13TF
BS 739 739 RR2BI94JQ
BS 740 758 RR2BS13TF
BS 759 759 RR2BI94JQ
BS 760 781 RR2BS13TF
BS 782 782 RR2BI94JQ
BS 783 800 RR2BS13TF
BS 801 801 RR2BI94JQ
BS 802 807 RR2BS13TF
BS 808 808 RR2BI94JQ
BS 809 819 RR2BS13TF
BS 820 883 RR2BI94JQ
BS 884 884 RR2BS13JQ
BS 885 1044 RR2BI94JQ
BS 1045 1083 RR2F565JQ
BS 1084 1108 RR2BS13JQ
BS 1109 1116 RR2H235JQ

RD RR2CK10TF 371 0 0
GGTCCAGGTTTGTTTAAAACCATCAGAGAAGTCAGCAAGATCACAGGTGACTATTCATGC
ACATCAGAAGTTCAAAGAGCCATTCCGCTTCTCAAGAATGCTTACGGAGATAGCATGCGG
AAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACTCTGTTGAAGGAAGAA
GAGACTGAAGCATGGGGTGTTGAACCGTATGATGTAGAGGATGCAGACTCCAACTGCAAA
AGTCTTTTGCGTAAAGGCCTTGTACGTGTGGCTGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTATCGG
TCTAAGTCATTTTCTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAAAGTAT
CTGAACAAA
CC

QA 1 369 1 369
DS 

RD RR2C073TF 652 0 0
GGA
AAAGAGCGCTTAAAAAGAAGAAAGCTTTCACACACGAAAATTTCTCGGATCTGAGATCTT
TGGATCCAAACATCGTTTTTTT*AATTCGAAATCAAGGTAATAAGGAAAGCTTTGAGGGA
TCTTAGTCATGTCAAGAAGGCAAGTAGGAGGTTCCACGAGGCGTGGAGGGGATAGTGGAA
GCTTTCCATTTGTAGGAGCTTTGCACTCTAAATCACGTTCCTCTCCTCTGCTTTCTATTT
GCCTTGTTCTCGTGGGAGCATGTCTTCTCATTGGTTATGCTTTCAGTGGTCCAGGTTTGT
TTAAAACCATCAGAGAAGTCAGCAAGATCACAGGTGACTATTCATGCACATCAGAAGTTC
AAAGAGCCATTCCGCTTCTCAAGAATGCTTACGGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACG
TGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACTCTGTTGAAGGAAGAAGAGACTGAAGCAT
GGGGTGTTGAACCGTGTGATGTAGAGGATGCAGACTCCAACTGCAAAAGTCTTTTGCGTA
AAGGCCTTGTACGTGTGGCTGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTT
CTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAAAGTATCT

QA 4 652 4 652
DS 

RD RR2H235TF 732 0 0
GGAACACTGCGAAGCTCTCCGCTAGTAGCTAAAGAGCGCTTAAAAGAAGAAAAGCTTTCA
CACACGAAAATTTCTCGGATCTGAGATCTTTGGATCCAAACATCGTTTTTT**AATTCGA
AATCAAGGTA*TAAGGAAAGCTTTGAGGGATCTTAGTCATGTCAAGAAGGCAAGTAGGAG
GTTCCACGAGGCGTGGAGGGGATAGTGGAAGCTTTCCGTTTGTAGGAGCTTTGCACTCCA
AGTCACGTTCCTCTCCTCTGCTTTCTATTTGCCTTGTTCTCGTGGGAGCATGTCTTCTCA
TTGGTTATGCTTTCAGTGGTCCAGGTTTGTTTAAAACTATCAGAGAAGTCAGCAAGATCA
CAGGGGATTATTCATGCACATCAGAAGTTCAAAGAGCCATTCCTATTCTCAAGAATGCTT
ACGGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTA
CTCTGTTGAGGGAAGAAGAGACTGAAGCATGGGGTGTTGAGCCATATGACGTAGAGGATG
CAGACTCCAAATGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCCTTGTACGTGTGGCCGACATCAAGT
TCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTTCTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATT
ACCTCTCACCAAAGTATCTGAACAAAACTGTTCCTGAACTTGCGCGGGTTGCTTCAGATG
GTGTCGTTCTCT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2F565TF 694 0 0
GG
ACACACGAAAATTTCTCGGATCTGAGATCTTTGGATCCAAACATCGTTTTTT**AATTCG
AAATCAAGGTA*TAAGGAAAGCTTTGAGGGATCTTAGTCATGTCAAGAAGGCAAGTAGGA
GGTTCCACGAGGCGTGGAGGGGATAGTGGAAGCTTTCCGTTTGTAGGAGCTTTGCACTCC
AAGTCACGTTCCTCTCCTCTGCTTTCTATTTGCCTTGTTCTCGTGGGAGCATGTCTTCTC
ATTGGTTATGCTTTCAGTGGTCCAGGTTTGTTTAAAACTATCAGAGAAGTCAGCAAGATC
ACAGGGGATTATTCATGCACATCAGAAGTTCAAAGAGCCATTCCTATTCTCAAGAATGCT
TACGGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCT
ACTCTGTTGAGGGAAGAAGAGACTGAAGCATGGGGTGTTGAGCCATATGACGTAGAGGAT
GCAGACTCCAAATGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCCTTGTACGTGTGGCCGACATCAAG
TTCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTTCTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGAT
TACCTCTCACCAAAGTATCTGAACAAAACTGTTCCTGAACTTGCGCGGGTTGCTTCAGAT
GGTGTCGTTCTCTTCGCAG*TAATCCTGGTAA

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR2BI94TF 706 0 0
GG
AAAGAGCGCTTAAAAGAAGAAAAGCTTTCACACACGAAAATTTCTCGGATCTGAGATCTT
TGGATCCAAACATCGTTTTTT**AATTCGAAATCAAGGTA*TAAGGAAAGCTTTGAGGGA
TCTTAGTCATGTCAAGAAGGCAAGTAGGAGGTTCCACGAGGCGTGGAGGGGATAGTGGAA
GCTTTCCGTTTGTAGGAGCTTTGCACTCCAAGTCACGTTCCCCTCCTCTGCTTTCTATTT
GCCTTGTTCTCGTGGGAGCATGTCTTCTCATTGGTTATGCTTTCAGTGGTCCAGGTTTGT
TTAAAACTATCAGAGAAGTCAGCAAGATCACAGGGGATTATTCATGCACATCAGAAGTTC
AAAGAGCCATTCCTATTCTCAAGAATGCTTACGGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACG
TGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACTCTGTTGAGGGAAGAAGAGACTGAAGCAT
GGGGTGTTGAGCCATATGACGTAGAGGATGCAGACTCCAAATGCAAAAGTCTTTTGCGTA
AAGGCCTTGTACGTGTGGCCGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTT
CTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAGAGTATCTGAACAAAACTG
TTCCTGAACTTGCGCGGGTTGCTTCAGATGGTGTCGTTCTCTTC

QA 3 706 3 706
DS 

RD RR2DT35TF 686 0 0
GG
CTCGGATCTGAGATCTTTGGATCCAAACATCGTTTTTTTTAATTCGAAATCAAGGTAATA
AGGAAAGCTTTGAGGGATCTTAGTCACGTCAAGAAGGCAAGTAGGAGGTTCCACGAGACG
TGGAGGGGATAGTGGAAGCTTTCCATTTGTAGGAGCTTTGCACTCTAAATCACGTTCCTC
TCCTCTGCTTTCTATTTGCCTTGTTCTCGTGGGAGCATGTCTTCTCATTGGTTATGCTTT
CAGTGGTCCAGGTTTGTTTAAAACCATCAGAGAAGTCAGCAAGATCACAGGTGACTATTC
ATGCACATCAGAAGTTCAAAGAGCCATTCCGCTTCTCAAGAATGCTTACGGAGATAGCAT
GCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACTCTGTTGAAGGA
AGAAGAGATTGAAGCATGGGGTGTTGAACCGTATGATGTAGAGGATGCAGACTCCAACTG
CAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCCTTGTACGTGTGGCTGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTA
CCGGTCTAAGTCATTTTCTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAAA
GTATCTGAACAAAACCGTTCCTGAACTTGCGCGGGTTGCTTCAGATGGTGTCGTTCTCTT
CGCAG*TAATCCTGGTAAGCAAAA

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR2BS13TF 792 0 0
GGA
AAAGAGCGCTTAAAAAGAAGAAAGCTTTCACACACGAAAATTTCTCGGATCTGAGATCTT
TGGATCCAAACATCGTTTTTTT*AATTCGAAATCAAGGTAATAAGGAAAGCTTTGAGGGA
TCTTAGTCATGTCAAGAAGGCAAGTAGGAGGTTCCACGAGGCGTGGAGGGGATAGTGGAA
GCTTTCCATTTGTAGGAGCTTTGCACTCTAAATCACGTTCCTCTCCTCTGCTTTCTATTT
GCCTTGTTCTCGTGGGAGCATGTCTTCTCATTGGTTATGCTTTCAGTGGTCCAGGTTTGT
TTAAAACCATCAGAGAAGTCAGCAAGATCACAGGTGACTATTCATGCACATCAGAAGTTC
AAAGAGCCATTCCGCTTCTCAAGAATGCTTACGGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACG
TGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACTCTGTTGAAGGAAGAAGAGACTGAAGCAT
GGGGTGTTGAACCGTATGATGTAGAGGATGCAGACTCCAACTGCAAAAGTCTTTTGCGTA
AAGGCCTTGTACGTGTGGCTGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTT
CTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAAAGTATCTGAACAAAACCG
TTCCCGAACTTGCGCGGGTTGCTTCAGATGGTGTCGTTCTCTTCGCAG*TAATCCTGGTA
AGCAAAAG*CTAAAGCTGCAGAGTTGTCAAA*GTGGGACGACCGGCTAAA*TGCGTA*CT
CGTCCTGGT

QA 4 792 4 792
DS 

RD RR2BI94JQ 769 0 0
GTTCTCGTGGGAGCATGTCTTCTCATTGGTTATGCTTTCAGTGGTCCAGGTTTGTTTAAA
ACTATCAGAGAAGTCAGCAAGATCACAGGGGATTATTCATGCACATCAGAAGTTCAAAGA
GCCATTCCTATTCTCAAGAATGCTTACGGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGT
CCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACTCTGTTGAGGGAAGAAGAGACTGAAGCATGGGGT
GTTGAGCCATATGACGTAGAGGATGCAGACTCCAAATGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGC
CTTGTACGTGTGGCCGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTTCTGTT
GTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAGAGTATCTGAACAAAACTGTTCCT
GAACTTGCGCGGGTTGCTTCAGATGGTGTCGTTCTCTTCGCAGGTAATCCTGGTAAGCAA
AAGGCTAAAGCTGCAGAGTTGTCAAAAGTGGGACGACCGGCTAAAATGCGTAGCTCGTCC
TGGTGGAGCCGTTTCTTCTCACAGACGAACTTAGAGGAAAACGAAGCAGGAAGCAAGAAA
TTCGAAAAGGCAGCGTCCAAGATGTCATACAAACCAGCTTGTCAAGTCTTCCACCTCAAG
CCATTACATTAGAACGTTATTAGTATTATTATTACTTGTCTGCGAACCAAATATATCTTC
CACTCTCTGTTATATGCCTTATTTGCTCTATAGAAAGAAACAGATGTTC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2G560JQ 492 0 0
GGCTGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTTCTGTTGTGATCGTCTC
GGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAAAGTATCTGAACAAAACCGTTCCTGAACTTGCGCG
GGTTGCTTCAGATGGTGTCGTTCTCTTCGCAGGTAATCCTGGTAAGCAAAAGGCTAAAGC
TGCAGAGTTGTCAAAAGTGGGACGACCGGCTAAAATGCGTAGCTCGTCCTGGTGGAACCG
TTTCTTTTCACAGACGAACTTAGAGGAAAACGAAGCAGGAAGCAAGAAATTCGAAAAAGC
AGCGTCCAAGATGTCATACAAACCAGCCTGTCAAGTCTTCCACCTCAAGCCATTACATTA
GAACGTTATTAGTATTATTATTACTTGTCTGCGAACCAAATATATCTTCCACTCTCTGTT
ATATGCCTTATTTGCTCTATAGAAAGAAACAGATGTTCAAAAAAGAAATTGTATTCCATT
CTCAACGTTTTG

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR2F565JQ 804 0 0
GTGGGAGCATGTCTTCTCATTGGTTATGCTTTCAGTGGTCCAGGTTTGTTTAAAACTATC
AGAGAAGTCAGCAAGATCACAGGGGATTATTCATGCACATCAGAAGTTCAAAGAGCCATT
CCTATTCTCAAGAATGCTTACGGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAA
ACATGCTCAGTGGTCTCTACTCTGTTGAGGGAAGAAGAGACTGAAGCATGGGGTGTTGAG
CCATATGACGTAGAGGATGCAGACTCCAAATGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCCTTGTA
CGTGTGGCCGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTTCTGTTGTGATC
GTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAAAGTATCTGAACAAAACTGTTCCTGAACTT
GCGCGGGTTGCTTCAGATGGTGTCGTTCTCTTCGCAGGTAATCCTGGTAAGCAAAAGGCT
AAAGCTGCAGAGTTGTCAAAAGTGGGACGACCGGCTAAAATGCGTAGCTCGTCCTGGTGG
AGCCGTTTCTTCTCACAGACGAACTTAGAGGAAAACGAAGCAGGAAGCAAGAAATTCGAA
AAGGCAGCGTCCAAGATGTCATACAAACCAGCTTGTCAAGTCTTCCACCTCAAGCCATTA
CATTAGAACGTTATTAGTATTATTATTACTTGTCTGCGAACCAAATATATCTTCCACTCT
CTGTTATATGCCTTATTTGCTCTATAGAAAGAAACAGATGTTCAAAAAAGAAATTGTATT
CCATTCTCAACGTTTTGATTCA
CG

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2BS13JQ 778 0 0
TTAAAACCATCAGAGAAGTCAGCAAGATCACAGGTGACTATTCATGCACATCAGAAGTTC
AAAGAGCCATTCCGCTTCTCAAGAATGCTTACGGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACG
TGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACTCTGTTGAAGGAAGAAGAGACTGAAGCAT
GGGGTGTTGAACCGTATGATGTAGAGGATGCAGACTCCAACTGCAAAAGTCTTTTGCGTA
AAGGCCTTGTACGTGTGGCTGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTT
CTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAAAGTATCTGAACAAAACCG
TTCCCGAACTTGCGCGGGTTGCTTCAGATGGTGTCGTTCTCTTCGCAGGTAATCCTGGTA
AGCAAAAGGCTAAAGCTGCAGAGTTGTCAAAAGTGGGACGACCGGCTAAAATGCGTAACT
CGTCCTGGTGGAACCGTTCCTTCTCACAGACGAACTTAGAGGAAAACGAAGCAGGAAGCA
AGAAATTCGAAAAAGCAGCGTCCAAGATGTCATACAAACCAGCTTGTCAAGTCTTCCACC
TCAAGCCATTACATTAGAACGTTATTAGTATTATTATTACTTGTCTGCGAACCAAATATA
TCTTCCACTCTCTGTTATATGCCTTATTTGCTCTATAGAAAGAAACAGATGTTCAAAAAA
GAAATTGTATTCCATTCTCAACGTTTTGATTCATAAGTTAACTATTTAATAAATTAGC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2DT35JQ 258 0 0
TTTCTTCTCACAGACGAACTTAGAGGAAAACGAAGCAGGAAGCAAGAAATTCGAAAAAGC
AGCGTCCAAGATGTCATACAAACCAGCTTGTCAAGTCTTCCACCTCAAGCCATCACATTA
GAACGTTATTAGTATTATTATTACTTGTTTGCGAACCAAATATATCTTCCACTCTCTGTT
ATATGCCTTATTTGCTCTATAGAAAGAAACAGATGTTCAAAAAAGAAATTGTATTCCATT
CTCAACGTTTTGATTCA
T

QA 1 257 1 257
DS 

RD RR2H235JQ 723 0 0
GAGCCATTCCTATTCTCAAGAATGCTTACGGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACGTGG
GTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACTCTGTTGAGGGAAGAAGAGACTGAAGCATGGG
GTGTTGAGCCATATGACGTAGAGGATGCAGACTCCAAATGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAG
GCCTTGTACGTGTGGCCGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTTCTG
TTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAAAGTATCTGAACAAAACTGTTC
CTGAACTTGCGCGGGTTGCTTCAGATGGTGTCGTTCTCTTCGCAGGTAATCCTGGTAAGC
AAAAGGCTAAAGCTGCAGAGTTGTCAAAAGTGGGACGACCGGCTAAAATGCGTAGCTCGT
CCTGGTGGAGCCGTTTCTTCTCACAGACGAACTTAGGGGAAAACGAAGCAGGAAGCAAGA
AATTCGAAAAGGCAGCGTCCAAGATGTCATACAAACCAGCTTGTCAAGTCTTCCACCTCA
AGCCATTACATTAGAACGTTATTAGTATTATTATTACTTGTCTGCGAACCAAATATATCT
TCCACTCTCTGTTATATGCCTTATTTGCTCTATAGAAAGAAACAGATGTTCAAAAAAGAA
ATTGTATTCCATTCTCAACGTTTTGATTCATAAGTTAACTATTTAATAAATTAGCCTGCC
TTT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 11

CO CL319Contig1 1354 11 15 U
GGAGAGCATAGCAGTGAGGGAACGAGCATGGCAGCTTTATCATCATCCTCTCTGTTTTTC
TCATCCAAAACAGCTATTCCGATCAATAATCTAACCCTCATCCCGCCGTCTCTCCACCGC
TTCTCTCTTCCCTCTTCATCATCTTCCTTTTCCTCTCTCTCTTCTTCTTCTTCTGCTTCT
CTCTTCACCACACACTCTCTGAAGAGTTCTCGAAGATCATCTCCTCAGGGATTCACCGTG
AAGGCTGAGAAGAAGAATGTGCTTATAGTCAACACCAACAGCGGCGGTCACGCCGTCATT
GGCTTTTACTTTGCCAAAGAGCTTCTCTCCGCCGGCCACGCCGTCACCATCATGACTGTC
GGAGAAGAATCTTCTGACAAGATGAAGAAACCTCCCTTCAGCCGTTTCTCCGAAATTGTA
AGCGGGGGAGGAAAGACGGTGTGGGGAAACCCAGCCGATGTTGCGACTGTGGTCGGAGGT
GAAACATTCGACGTTGTTCTTGACAACAATGGCAAGGACTTGGATACTGTCAGGCCAGTG
GTGGATTGGGCTAAAAGCTCAGGCGTGAAGCAGTTCTTGTTCATAAGCAGCGCAGGGATC
TACAAGTCCACCGAGGAACCTCCTCACGTTGAA*GGGGACGCAGTGAAAGGCGACGCA*G
TCACGTTGGAGTGGAGAAGTACTTGGCTGAAACCTTCGCCAACTGGGCCTCCTTTCGACC
ACAGTACATGATCGGTTCTGGCAACAACAAAGACTGCGAAGAATGGTTCTTCGACAGGAT
TGTGAGGGATAGACCAGTGCCAATCCCAGGATCAGGATTGCAGCTAACCAACATATCTCA
TGTCAGAGACTTGTCTTCCATGCTCACTTCAGCCGCGTCCAACCCTGACGCTGCCTCCTG
CAACATCTTCAACTGCCTTAGTGACAGAGCCGTTACTCTTGACGGTATGGCCAAGCTCTG
TGCTGCTGCTGCTGGCAAAACCGTTGAGATCGTGCATTACGACCCTAAAGCCATTGGGGT
TGACGCCAAGAAGGCTTTTCCATTCAGAAACATGCATTTCTACGCGGAACCAAGAGCAGC
AAAGGATAAATTAGGGTGGGAAAGTAAAACGAATCTACCTGAAGATCTCAAGGAGAGATT
TGAAGAGTATGTTAAGATTGGCAGAGACAAGAAGGAGATGAAGTTTGAATTAGATGACAA
GATTCTCGAAGCCCTCAAAACTCCAGTGGCCGCTTAATCATATACTTATCTTCCTCTGTA
ACTTCTAAAGCTATCCCTATATGTACTCTCTCTTTTTTTCCCTCGGCTCATATGAGATGA
ACATGATTTTCAGCTAAAAAGACCATTTAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 20 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 0 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2A831TF U 7
AF RR2B235TF U 1
AF RR2F947TF U 1
AF RR2CM53TF U 5
AF RR2GT43TF U 6
AF RR2AI06TF U 6
AF RR2B235JQ C 595
AF RR2D726JQ C 774
AF RR2D726TF U 757
AF RR2F947JQ C 705
AF RR2AI06JQ C 767
BS 1 249 RR2B235TF
BS 250 250 RR2F947TF
BS 251 364 RR2B235TF
BS 365 365 RR2F947TF
BS 366 396 RR2B235TF
BS 397 397 RR2F947TF
BS 398 422 RR2B235TF
BS 423 423 RR2F947TF
BS 424 655 RR2B235TF
BS 656 658 RR2AI06TF
BS 659 659 RR2CM53TF
BS 660 782 RR2AI06TF
BS 783 1334 RR2D726TF
BS 1335 1352 RR2F947JQ
BS 1353 1354 RR2AI06JQ

RD RR2A831TF 531 0 0
GGG
AGCAGTGAGGGAACAAGCATGGCAGCTTTATCATCATCCTCTCTGTTTTTCTCATCCAAA
ACAGCTATTCCGATCAATAATCTAACCCTCACCCCGCCGTCTCTCCACCGTTTCTCTCTT
CCCTCATCATCATCTTCCTTTTCCTCTCTCTCTTCTTCTTCTTCTGCTTCTCTCTTCACC
ACACACTCTCTGAAGAGTTCTCGAAGATCATCTCCTCAGGAATTCACCGTGAAGGCTGAG
AAGAAGAATGTGCTTATAGTCAACACCAACAGCGGCGGTCACGCCGTCATTGGCTTTTAC
TTTGCCAAAGAGCTTCTCTCCGCCGGCCATGCCGTCACCATTATGACTGTCGGAGAAGAA
TCTTCTGACAAAATGAAGAAAACTCCTTTCAGCCGTTTCTCCGAAATTGTAAGCGGCGGA
GGAAAGACGGTGTGGGGAAACCCAGCCGATGTTGCGACTGTGGTCGGAGGTGAAACATTC
GACGTTGTTCTTGACAACAATGGCAAGGATTTGGATACTGTCAGGCCA

QA 4 531 4 531
DS 

RD RR2B235TF 655 0 0
GGAGAGCATAGCAGTGAGGGAACGAGCATGGCAGCTTTATCATCATCCTCTCTGTTTTTC
TCATCCAAAACAGCTATTCCGATCAATAATCTAACCCTCATCCCGCCGTCTCTCCACCGC
TTCTCTCTTCCCTCTTCATCATCTTCCTTTTCCTCTCTCTCTTCTTCTTCTTCTGCTTCT
CTCTTCACCACACACTCTCTGAAGAGTTCTCGAAGATCATCTCCTCAGGGATTCACCGTG
AAGGCTGAGGAGAAGAATGTGCTTATAGTCAACACCAACAGCGGCGGTCACGCCGTCATT
GGCTTTTACTTTGCCAAAGAGCTTCTCTCCGCCGGCCACGCCGTCACCATCATGACTGTC
GGAGGAGAATCTTCTGACAAGATGAAGAAACCTCCCCTCAGCCGTTTCTCCGAAATTGTA
AGTGGGGGAGGAAAGACGGTGTGGGGAAACCCAGCCGATGTTGCGACTGTGGTCGGAGGT
GAAACATTCGACGTTGTTCTTGACAACAATGGCAAGGACTTGGATACTGTCAGGCCAGTG
GTGGATTGGGCTAAAAGCTCAGGCGTGAAGCAGTTCTTGTTCATAAGCAGCGCAGGGATC
TACAAGTCCACCGAGGAACCTCCTCACGTTGAA*GGGGACGCAGTGAAAGGCGAC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2F947TF 655 0 0
GGAGAGC
ATAGCAGTGAGGGAACGAGCATGGCAGCTTTATCATCATCCTCTCTGTTTTTCTCGTCCA
AAACAGCTATTCCGATCAATAATCTAACCCTCATCCCGCCGTCTCTCCACCGCTTCTCTC
TTCCCTCTTCTTCATCTTCCTTTTCCTCTCTCTCTTCTTCTTCTTCTGCTTCTCTCTTCA
CCACACACTCTCTGAAGAGTTCTCGAAGATCATCTCCTCAGGGATTCACCGTGAAGGCTG
AGAAGAAGAATGTGCTTATAGTCAACACCAACAGCGGCGGTCACGCCGTCATTGGCTTTT
ACTTTGCCAAAGAGCTTCTCTCCGCCGGCCACGCCGTCACCATCATGACTGTCGGAGAAG
AATCTTCTGACAAGATGAAGAAACCTCCCTTCAGCCGTTTCTCCGAAATTGTAAGCGGGG
GAGGAAAGACGGTGTGGGGAAACCCAGCCGATGTTGCGACTGTGGTCGGAGGTGAAACAT
TCGACGTTGTTCTTGACAACAATGGCAAGGACTTGGATACTGTCAGGCCAGTGGTGGATT
GGGCTAAAAGCTCAGGCGTGAAGCAGTTCTTGTTCATAAGCAGCGCAGGGATCTACAAGT
CCACCGAGGAACCTCCTCACGTTGAA*GGGGACGCAGTGAAAGGCGAC

QA 8 655 8 655
DS 

RD RR2CM53TF 689 0 0
GGGAG
AGCAGTGAGGGAACAAGCATGGCAGCTTTATCATCATCCTCTCTGTTTTTCTCATCCAAA
ACAGCTATTCCGATCAATAATCTAACCCTCACCCCGCCGTCTCTCCACCGTTTCTCTCTT
CCCTCATCATCATCTTCCTTTTCCTCTCTCTCTTCTTCTTCTTCTGCTTCTCTCTTCACC
ACACACTCTCTGAAGAGTTCTCGAAGATCATCTCCTCAGGAATTCACCGTGAAGGCTGAG
AAGAAGAATGTGCTTATAGTCAACACCAACAGCGGCGGTCACGCCGTCATTGGCTTTTAC
TTTGCCAAAGAGCTTCTCTCCGCCGGCCATGCCGTCACCATTATGACTGTCGGAGAAGAA
TCTTCTGACAAAATGAAGAAAACTCCCTTCCGCCGTTTCTCCGAAATTGTAAGCGGCGGA
GGAAAGACGGTGTGGGGAAACCCAGCCGATGTTGCGACTGTGGTCGGAGGTGAAACATTC
GACGTTGTTCTTGACAACAATGGCAAGGATTTGGATACTGTCAGGCCAGTGGTGGATTGG
GCTAAAAGCTCAGGCGTGAAGCAGTTCTTGTTCATAAGCAGCGCAGGGATCTACAAGTCC
ACCGAACA*CCTCCTCACGTTGAA*GGGGACGCAGTGAAAGCCGACGCA*GTCACGTTGG
AGTCGAGAAGTACTTAGCTGAAAC

QA 6 689 6 689
DS 

RD RR2GT43TF 725 0 0
GG
ATAGCAGTGAGGGAACGAGCATGGCAGCTTTATCATCATCCTCTCTGTTTTTCTCATCCA
AAACAGCTATTCCGATCAATAATCTAACCCTCATCCCGCCGTCTCTCCACCGCTTCTCTC
TTCCCTCTTCATCATCTTCCTTTTCCTCTCTCTCTTCTTCTTCTTCTGCTTCTCTCTTCA
CCACACACTCTCTGAAGAGTTCTCGAAGATCATCTCCTCAGGGATTCACCGTGAAGGCTG
AGAAGAAGAATGTGCTTATAGTCAACACCAACAGCGGCGGTCACGCCGTCATTGGCTTTT
ACTTTGCCAAAGAGCTTCTCTCCGCCGGCCACGCCGTCACCATCATGACTGTCGGAGAAG
AATCTTCTGACAAGATGAAGAAACCTCCCTTCAGCCGTTTCTCCGAAATTGTAAGTGGGG
GAGGAAAGACGGTGTGGGGAAACCCAGCCGATGTTGCGACTGTGGTCGGAGGTGAAACAT
TCGACGTTGTTCTGGACAACAATGTCAAGGACTTGGATACTGTCAGGCCAGTGGTGGATT
GGGCTAAAAGCTCACGCGTGAAGCAGTTCTTGTTCATAAGCAGCGCAGGGATCTACAAGT
CCACCGAGGAACCTCCTCACGTTGAA**GGGACGCAGTGAAAG*CGACGCA*GTCACGTT
GGAGTGGAGAAGTACTTGGCTGAAACCTTCGCCA*CTGGGCCTCCTTTCGAC*ACAGTAC
ATG

QA 3 725 3 725
DS 

RD RR2AI06TF 777 0 0
GG
ATAGCAGTGAGGGAACGAGCATGGCAGCTTTATCATCATCCTCTCTGTTTTTCTCATCCA
AAACAGCTATTCCGATCAATAATCTAACCCTCATCCCGCCGTCTCTCCACCGCTTCTCTC
TTCCCTCTTCATCATCTTCCTTTTCCTCTCTCTCTTCTTCTTCTTCTGCTTCTCTCTTCA
CCACACACTCTCTGAAGAGTTCTCGAAGATCATCTCCTCGGGGATTCACCGTGAAGGCTG
AGAAGAAGAATGTGCTTATAGTCAACACCAACAGCGGCGGTCACGCCGTCATTGGCTTTT
ACTTTGCCAAAGAGCTTCTCTCCGCCGGCCACGCCGTCACCATCATGACTGTCGGAGAAG
AATCTTCTGACAAGATGAAGAAACCTCCCTTCAGCCGTTTCTCCGAAATTGTAAGTGGGG
GAGGAAAGACGGTGTGGGGAAACCCAGCCGATGTTGCGACTGTGGTCGGAGGTGAAACAT
TCGACGTTGTTCTTGACAACAATGGCAAGGACTTGGATACTGTCAGGCCAGTGGTGGATT
GGGCTAAAAGCTCAGGCGTGAAGCAGTTCTTGTTCATAAGCAGCGCAGGGATCTACAAGT
CCACCGAGGAACCTCCTCACGTTGAAAGGGGACGCAATGAAAGGCGACGCACGTCACGTT
GGAGTGGAGAAGTACTTGGCTGAAACCTTCGCCAACTGGGCCTCCTTTCGACCACAGTAC
ATGATCGGTTCTGGCAACAACAAAGACTGCGAAGAATGGTTCTTCGACAGGATTG

QA 3 777 3 777
DS 

RD RR2B235JQ 741 0 0
GGGATCTACAAGTCCACCGAGGAACCTCCTCACGTTGAA*GGGGACGCAGTGAAAGGCGA
CGCAGGTCACGTTGGAGTGGAGAAGTACTTGGCTGAAACCTTCGCCAACTGGGCCTCCTT
TCGACCACAGTACATGATCGGTTCTGGCAACAACAAAGACTGCGAAGAATGGTTCTTCGA
CAGGATTGTGAGGGATAGACCAGTGCCAATCCCAGGATCAGGATTGCAGCTAACCAACAT
ATCTCATGTCAGAGACTTGTCTTCCATGCTCACTTCAGCTGTGTCCAACCCTGACGCTGC
CTCCTGCAACATCTTCAACTGCCTTAGTGACAGAGCCGTTACTCTTGACGGTATGGCCAA
GCTCTGTGCTGCTGCTGCTGGCAAAACCGTTGAGATCGTGCATTACGACCCTAAAGCCAT
TGGGGTTGACGCCAAGAAGGCTTTTCCATTCAGAAACATGCATTTTTACGCGGAACCAAG
AGCAGCAAAGGATAAATTAGGGTGGGAAAGTAAAACGAATCTACCTGAAGATCTCAAGGA
GAGATTTGAAGAGTATGTTAAGATTGGCAGAGACAAGAAGGAGATGAAGTTTGAATTAGA
TGACAAGATTCTCGAAGCCCTCAAAACTCCAGTGGCCGCTTAATCATATACTCATCTTCC
TCTGTAACTTCTAAAGCTATCCCTATATGTACTCTCTCTTTTTTTCCCTCGGCTCATATG
AGATGAACATGATTTTCAGC
T

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2D726JQ 562 0 0
ACAGGATTGTGAGGGATAGACCAGTGCCAATCCCAGGATCAGGATTGCAGCTAACCAACA
TATCTCATGTCAGAGACTTGTCTTCCATGCTCACTTCAGCCGCGTCCAACCCTGACGCTG
CCTCCTGCAACATCTTCAACTGCCTTAGTGACAGAGCCGTTACTCTTGACGGTATGGCCA
AGCTCTGTGCTGCTGCTGCTGGCAAAACCGTTGAGATCGTGCATTACGACCCTAAAGCCA
TTGGGGTTGACGCCAAGAAGGCTTTTCCATTCAGAAACATGCATTTCTACGCGGAACCAA
GAGCAGCAAAGGATAAATTAGGGTGGGAAAGTAAAACGAATCTACCTGAAGATCTCAAGG
AGAGATTTGAAGAGTATGTTAAGATTGGCAGAGACAAGAAGGAGATGAAGTTTGAATTAG
ATGACAAGATTCTCGAAGCCCTCAAAACTCCAGTGGCCGCTTAATCATATACTTATCTTC
CTCTGTAACTTCTAAAGCTATCCCTATATGTACTCTCTCTTTTTTTCCCTCGGCTCATAT
GAGATGAACATGATTTTCAGC
C

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2D726TF 579 0 0
G
GAAGAATGGTTCTTCGACAGGATTGTGAGGGATAGACCAGTGCCAATCCCAGGATCAGGA
TTGCAGCTAACCAACATATCTCATGTCAGAGACTTGTCTTCCATGCTCACTTCAGCCGCG
TCCAACCCTGACGCTGCCTCCTGCAACATCTTCAACTGCCTTAGTGACAGAGCCGTTACT
CTTGACGGTATGGCCAAGCTCTGTGCTGCTGCTGCTGGCAAAACCGTTGAGATCGTGCAT
TACGACCCTAAAGCCATTGGGGTTGACGCCAAGAAGGCTTTTCCATTCAGAAACATGCAT
TTCTACGCGGAACCAAGAGCAGCAAAGGATAAATTAGGGTGGGAAAGTAAAACGAATCTA
CCTGAAGATCTCAAGGAGAGATTTGAAGAGTATGTTAAGATTGGCAGAGACAAGAAGGAG
ATGAAGTTTGAATTAGATGACAAGATTCTCGAAGCCCTCAAAACTCCAGTGGCCGCTTAA
TCATATACTTATCTTCCTCTGTAACTTCTAAAGCTATCCCTATATGTACTCTCTCTTTTT
TTCCCTCGGCTCATATGAGATGAACATGATTTTCAGC
C

QA 2 578 2 578
DS 

RD RR2F947JQ 650 0 0
GGGCCTCCTTTCGACCACAGTACATGATCGGTTCTGGCAACAACAAAGACTGCGAAGAAT
GGTTCTTCGACAGGATTGTGAGGGATAGACCAGTGCCAATCCCAGGATCAGGATTGCAGC
TAACCAACATATCTCATGTCAGAGACTTGTCTTCCATGCTCACTTCAGCTGTGTCCAACC
CTGACGCTGCCTCCTGCAACATCTTCAACTGCCTTAGTGACAGAGCCGTTACTCTTGACG
GTATGGCCAAACTCTGTGCTGCTGCTG***GCAAAACCGTTGAGATCGTGCATTACGACC
CTAAAGCCATTGGGGTTGACGCCAAGAAGGCTTTTCCATTCAGAAACATGCATTTCTACG
CGGAACCAAGAGCAGCAAAGGATAAATTAGGGTGGGAAAGTAAAACGAATCTACCTGAAG
ATCTCAAGGAGAGATTTGAAGAGTATGTTAAGATTGGCAGAGACAAGAAGGAGATGAAGT
TTGAATTAGATGACAAGATTCTCGAAGCCCTCAAAACTCCAGTGGCCGCTTAATCATATA
CTTATCTTCCTCTGTAACTTCTAAAGCTATCCCTATATGTACTCTCTCTTTTTTTCCCTC
GGCTCATATGAGATGAACATGATTTTCAGCTAAAAAGACCATTTAAAT
TC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2AI06JQ 588 0 0
TTCTTCGACAGGATTGTGAGGGATAGACCAGTGCCAATCCCAGGATCAGGATTGCAACTA
ACCAACATATCTCATGTCAGAGACTTGTCTTCCATGCTCACTTCAGCTGTGTCCAACCCT
GACGCTGCCTCCTGCAACATCTTCAACTGCCTTAGTGACAGAGCCGTTACTCTTGACGGT
ATGGCCAAGCTCTGTGCTGCTGCTGCTGGCAAAACCGTTGAGATCGTGCATTACGACCCT
AAAGCCATTGGGGTTGACGCCAAGAAGGCTTTTCCATTCAGAAACATGCATTTCTACGCG
GAACCAAGAGCAGCAAAGGATAAATTAGGGTGGGAAAGTAAAACGAATCTACCTGAAGAT
CTCAAGGAGAGATTTGAAGAGTATGTTAAGATTGGCAGAGACAAGAAGGAGATGAAGTTT
GAATTAGATGACAAGATTCTCGAAGCCCTCAAAACTCCAGTGGCCGCTTAATCATATACT
TATCTTCCTCTGTAACTTCTAAAGCTATCCCTATATGTACTCTCTCTTTTTTTCCCTCGG
CTCATATGAGATGAACATGATTTTCAGCTAAAAAGACCATTTAAATCC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 2 13

CO CL320Contig1 740 5 9 U
GGAGCTAAATCACACCAAAAACCCTAATCTCTCAAATCTTCTCCCCCAAACACCAAAAGA
AAAAAAATGGGTAACCCTAAAGTTTTCTTTGACATGAGCGTCGGCGACAAACCCGCTGGC
CGCATCGTGATGGAGCTTTACGCCGACACGACCCCCGACACCGCCGAGAATTTCCGTGCC
CTCCGCACCGGCGAGAAGGGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCG
GCCTTCCACCGCGTGATCCCTAAGTTCATGTGCCAGGGAGGAGATTTCACCGCCGGGAAC
GGAACCGGAGGAGAGTCGATCTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAAAACTTTGCCAAGAAA
CACACCGGTCCGGGCATCCTGTCCATGGCTAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAG
TTTTTCATCTGCACTGAGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAG
GTTGTTGAAGGGATGGATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGG
ACCTCGAAGAAGGTTGTGATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGAGGGGAAGTG
TGAGAGAGAGTGAGAGGTTGATCCAATGGTAGCTTTGTGTTTTTTCTGTTGTGTTTCTTT
TCTTTGTTCGCGTTCTTCGTTTGGATCTTTGTGTTCCTGTGGCTACCATTGAATAAAAAT
GATAATGATTAATCTTAGTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR2F595TF U 1
AF RR2AF67JQ C 1
AF RR2F595JQ C 134
AF RR2AF67TF U 1
AF RR2F505TF U 421
BS 1 114 RR2F595TF
BS 115 115 RR2AF67TF
BS 116 183 RR2F595TF
BS 184 184 RR2AF67TF
BS 185 280 RR2F595TF
BS 281 281 RR2AF67TF
BS 282 631 RR2F595TF
BS 632 736 RR2AF67TF
BS 737 740 RR2F505TF

RD RR2F595TF 631 0 0
GGAGCTAAATCACACCAAAAACCCTAATCTCTCAAATCTTCTCCCCCAAACACCAAAAGA
AAAAAAATGGGTAACCCTAAAGTTTTCTTTGACATGAGCGTCGGCGACAAACCCACTGGC
CGCATCGTGATGGAGCTTTACGCCGACACGACCCCCGACACCGCCGAGAATTTCCGTGCC
CTCTGCACCGGCGAGAAGGGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCG
GCCTTCCACCGCGTGATCCCTAAGTTCATGTGCCAGGGAGTAGATTTCACCGCCGGGAAC
GGAACCGGAGGAGAGTCGATCTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAAAACTTTGCCAAGAAA
CACACCGGTCCGGGCATCCTGTCCATGGCTAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAG
TTTTTCATCTGCACTGAGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAG
GTTGTTGAAGGGATGGATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGG
ACCTCGAAGAAGGTTGTGATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGAGGGGAAGTG
TGAGAGAGAGTGAGAGGTTGATCCAATGGTA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2AF67JQ 736 0 0
GGAGCTAAATCACACCAAAAACCCTAATCTCTCAAATCTTCTCCCCCAAACACCAAAAGA
AAAAAAATGGGTAACCCTAAAGTTTTCTTTGACATGAGCGTCGGCGACAAACCCGCTGGC
CGCATCGTGATGGAGCTTTACGCCGACACGACCCCCGACACCGCCGAGAATTTCCGTGCC
CTCCGCACCGGCGAGAAGGGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCG
GCCTTCCACCGCGTGATCCCTAAGTTCATGTGCCAGGGAGGAGATTTCACCGCCGGGAAC
GGAACCGGAGGAGAGTCGATCTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAAAACTTTGCCAAGAAA
CACACCGGTCCGGGCATCCTGTCCATGGCTAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAG
TTTTTCATCTGCACTGAGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAG
GTTGTTGAAGGGATGGATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGG
ACCTCGAAGAAGGTTGTGATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGAGGGGAAGTG
TGAGAGAGAGTGAGAGGTTGATCCAATGGTAGCTTTGTGTTTTTTCTGTTGTGTTTCTTT
TCTTTGTTCGCGTTCTTCGTTTGGATCTTTGTGTTCCTGTGGCTACCATTGAATAAAAAT
GATAATGATTAATCTT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2F595JQ 603 0 0
AGCTTTACGCCGACACGACCCCCGACACCGCCGAGAATTTCCGTGCCCTCTGCACCGGCG
AGAAGGGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCACCGCG
TGATCCCTAAGTTCATGTGCCAGGGAGTAGATTTCACCGCCGGGAACGGAACCGGAGGAG
AGTCGATCTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAAAACTTTGCCAAGAAACACACCGGTCCGG
GCATCCTGTCCATGGCTAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTTCATCTGCA
CTGAGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTTGAAGGGA
TGGATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGACCTCGAAGAAGG
TTGTGATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGAGGGGAAGTGTGAGAGAGAGTGA
GAGGTTGATCCAATGGTAGCTTTGTGTTTTTTCTGTTGTGTTTCTTTTCTTTGTTCGCGT
TCTTCGTTTGGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTACCATTGAATAAAAATGATAATGATTAAT
CTT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2AF67TF 736 0 0
GGAGCTAAATCACACCAAAAACCCTAATCTCTCAAATCTTCTCCCCCAAACACCAAAAGA
AAAAAAATGGGTAACCCTAAAGTTTTCTTTGACATGAGCGTCGGCGACAAACCCGCTGGC
CGCATCGTGATGGAGCTTTACGCCGACACGACCCCCGACACCGCCGAGAATTTCCGTGCC
CTCCGCACCGGCGAGAAGGGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCG
GCCTTCCACCGCGTGATCCCTAAGTTCATGTGCCAGGGAGGAGATTTCACCGCCGGGAAC
GGAACCGGAGGAGAGTCGATCTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAAAACTTTGCCAAGAAA
CACACCGGTCCGGGCATCCTGTCCATGGCTAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAG
TTTTTCATCTGCACTGAGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAG
GTTGTTGAAGGGATGGATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGG
ACCTCGAAGAAGGTTGTGATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGAGGGGAAGTG
TGAGAGAGAGTGAGAGGTTGATCCAATGGTAGCTTTGTGTTTTTTCTGTTGTGTTTCTTT
TCTTTGTTCGCGTTCTTCGTTTGGATCTTTGTGTTCCTGTGGCTACCATTGAATAAAAAT
GATAATGATTAATCTT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2F505TF 320 0 0
TTTTTCATCTGCACTGAGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAG
GTTGTTGAAGGGATGGATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGG
ACCTCGAAGAAGGTTGTGATCGCTGACT*TGGTCAGCTTTAGATCTGGTGAGGGGAAGTG
TGAGAGAGAGTGAGAGGTTGATCCAATGGTAGCTTTGTGTTTTTTCTGTTGTGTTTCTTT
TCTTTGTTCGCGTTCTTCGTTTGGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTACCATTGAATAAAAAT
GATAATGATTAATCTTAGTT

QA 1 320 1 320
DS 



CO CL320Contig2 728 8 5 U
GGAGCTAAATCACACCAAAAACCCTAATCTCTCAAATCTTCTCCAAACAAAAAAAAA*TG
GCTAACCCTAGAGTTTTCTTCGACATGAGCGTGGGCGACAAACCCGCCGGCCGCATCGTG
ATGGAGCTTTACGCCGACACAACCCCCGACACCGCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACC
GGCGAGAAGGGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCAC
CGCGTGATCCCCAAGTTCATGTGCCAGGGAGGTGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGA
GGAGAGTCGATCTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAGAACTTTGTCAAGAAACACACCGGT
CCGGGCATCCTGTCCATGGCTAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTTCATC
TGCACTGAGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTTGAA
GGGATGGATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGACCTCGAAG
AAGGTTGTGATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGAGAGAAAGTGCGAGAGAGA
G**TGGTTGATCCAATGGTAGCTTTGTTCTGTTGTGTTTTTTTT*CTTTTGTTCCCGTTC
TTCGTTTGGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTACCATTGAATAATAATGATAATGATTAATCT
TAGTTATT


BQ
25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 40 40 40 
30 10 10 10 

AF RR2AR89JQ C 1
AF RR2H795JQB C 76
AF RR2BH26JQ C 5
AF RR2H795TF U 10
AF RR2GD40JQ C 28
AF RR2BH26TF U 5
AF RR2GD40TF U 1
AF RR2AR89TF U 1
BS 1 6 RR2GD40TF
BS 7 11 RR2BH26TF
BS 12 724 RR2H795TF
BS 725 725 RR2BH26TF
BS 726 728 RR2AR89JQ

RD RR2AR89JQ 728 0 0
GGAGCTAAATCACACCAAAAACCCTAATCTCTCAAATCTTCTCCAAACAAAAAAAAAATG
GCTAACCCTAGAGTTTTCTTCGACATGAGCGTGGGCGACAAACCCGCCGGCCGCATCGTG
ATGGAGCTTTACGCCGACACAACCCCCGACACCGCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACC
GGCGAGAAGGGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCAC
CGCGTGATCCCCAAGTTCATGTGCCAGGGAGGTGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGA
GGAGAGTCGATTTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAGAACTTTGTCAAGAAACACACCGGT
CCGGGCATCCTGTCCATGGCTAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTTCATC
TGCACTGAGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTTGAA
GGGATGGATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGACCTCGAAG
AAGGTTGTGATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGAGAGAAAGTGCGAGAGAGA
GAGTGGTTGATCCAATGGTAGCTTTGTTCTGTTGTGTTTTTTTT*CTTTTGTTCCCGTTC
TTCGTTTGGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTACCATTGAATAATAATGATAATGATTAACCT
TAGTTATT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2H795JQB 650 0 0
TTCTTCGACATGAGCGTGGGCGACAAACCCGCCGGCCGCATCGTGATGGAGCTTTACGCC
GACACAACCCCCGACACCGCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACCGGCGAGAAGGGAGTC
GGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCACCGCGTGATCCCCAAG
TTCATGTGCCAGGGAGGTGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGAGGAGAGTCGATCTAC
GGCATGAAGTTCAAGGACGAGAACTTTGTCAAGAAACACACCGGTCCGGGCATCCTGTCC
ATGGCTAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTTCATCTGCACTGAGAAGACG
TCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTTGAAGGGATGGATGTCGTT
AGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGACCTCGAAGAAGGTTGTGATCGCT
GACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGAGAGAAAGTGCGAGAGAGAG**TGGTTGATCCAA
TGGTAGCTTTGTTCTGTTGTGTTTTTTTT*CTTTTGTTCCCGTTCTTCGTTTGGATCTTT
GTGTTTCTGTGGCTACCATTGAATAATAATGATAATGATTAATCTTAGT
C

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2BH26JQ 721 0 0
GG
AAATCACACCAAAAACCCTAATCTCTCAAATCTTCTCCAAACAAAAAAAA**TGGCTAAC
CCTAGAGTTTTCTTCGACATGAGCGTGGGCGACAAACCCGCCGGCCGCATCGTGATGGAG
CTTTACGCCGACACAACCCCCGACACCGCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACCGGCGAG
AAGGGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCACCGCGTG
ATCCCCAAGTTCATGTGCCAGGGAGGTGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGAGGAGAG
TCGATCTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAGAACTTTGTCAAGAAACACACCGGTCCGGGC
ATCCTGTCTATGGCTAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTTCATCTGCACT
GAGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTTGAAGGGATG
GATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGGCCTCGAAGAAGGTT
GTGATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGAGAGAAAGTGCGAGAGAGAG**TGG
TTGATCCAATGGTAGCTTTGTTCTGTTGTGTTTTTTTT*CTTTTGTTCCCGTTCTTCGTT
TGGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTACCATTGAATAATAATGATAATGATTAATCTTAGTT

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR2H795TF 716 0 0
GG
ACACCAAAAACCCTAATCTCTCAAATCTTCTCCAAACAAAAAAAAA*TGGCTAACCCTAG
AGTTTTCTTCGACATGAGCGTGGGCGACAAACCCGCCGGCCGCATCGTGATGGAGCTTTA
CGCCGACACAACCCCCGACACCGCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACCGGCGAGAAGGG
AGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCACCGCGTGATCCC
CAAGTTCATGTGCCAGGGAGGTGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGAGGAGAGTCGAT
CTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAGAACTTTGTCAAGAAACACACCGGTCCGGGCATCCT
GTCCATGGCTAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTTCATCTGCACTGAGAA
GACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTTGAAGGGATGGATGT
CGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGACCTCGAAGAAGGTTGTGAT
CGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGAGAGAAAGTGCGAGAGAGAG**TGGTTGAT
CCAATGGTAGCTTTGTTCTGTTGTGTTTTTTTT*CTTTTGTTCCCGTTCTTCGTTTGGAT
CTTTGTGTTTCTGTGGCTACCATTGAATAATAATGATAATGATTAATCTTAGT
C

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR2GD40JQ 695 0 0
TCTCTCAAATCTTCTCCAAACAAAAAAAAA*TGGCTAACCCTAGAGTTTTCTTCGACATG
AGCGTGGGCGACAAACCCGCCGGCCGCATCGTGATGGAGCTTTACGCCGACACAACCCCC
GACACCGCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACCGGCGAGAAGGGAGTCGGCAAATCCGGA
AAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCACCGCGTGATCCCCAAGTTCATGTGCCAG
GGAGGTGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGAGGAGAGTCGATTTACGGCATGAAGTTC
AAGGACGAGAACTTTGTCAAGAAACACACCGGTCCGGGCATCCTGTCCATGGCTAACGCT
GGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTTCATCTGCACTGAGAAGACGTCGTGGCTCGAT
GGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTTGAAGGGATGGATGTCGTTAGGAACATTGAG
AAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGACCTCGAAGAAGGTTGTGATCGCTGACTGTGGTCAG
CTTTAGATCTGGTGAGAGAAAGTGCGAGAGAGAG**TGGTTGATCCAATGGTAGCTTTGT
TCTGTTGTGTTTTTTTT*CTTTTGTTCCCGTTCTTCGTTTGGATCTTTGTGTTTCTGTGG
CTACCATTGAATAATAATGATAATGATTAATCTT
C

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2BH26TF 721 0 0
GG
AAATCACACCAAAAACCCTAATCTCTCAAATCTTCTCCAAACAAAAAAAA**TGGCTAAC
CCTAGAGTTTTCTTCGACATGAGCGTGGGCGACAAACCCGCCGGCCGCATCGTGATGGAG
CTTTACGCCGACACAACCCCCGACACCGCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACCGGCGAG
AAGGGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCACCGCGTG
ATCCCCAAGTTCATGTGCCAGGGAGGTGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGAGGAGAG
TCGATCTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAGAACTTTGTCAAGAAACACACCGGTCCGGGC
ATCCTGTCTATGGCTAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTTCATCTGCACT
GAGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTTGAAGGGATG
GATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGGCCTCGAAGAAGGTT
GTGATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGAGAGAAAGTGCGAGAGAGAG**TGG
TTGATCCAATGGTAGCTTTGTTCTGTTGTGTTTTTTTTTCTTTTGTTCCCGTTCTTCGTT
TGGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTACCATTGAATAATAATGATAATGATTAATCTTAGTT

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR2GD40TF 727 0 0
GGAGCTAAATCACACCAAAAACCCTAATCTCTCAAATCTTCTCCAAACAAAAAAAAA*TG
GCTAACCCTAGAGTTTTCTTCGACATGAGCGTGGGCGACAAACCCGCCGGCCGCATCGTG
ATGGAGCTTTACGCCGACACAACCCCCGACACCGCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACC
GGCGAGAAGGGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCAC
CGCGTGATCCCCAAGTTCATGTGCCAGGGAGGTGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGA
GGAGAGTCGATCTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAGAACTTTGTCAAGAAACACACCGGT
CCGGGCATCCTGTCCATGGCTAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTTCATC
TGCACTGAGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTTGAA
GGGATGGATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGACCTCGAAG
AAGGTTGTGATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGAGAGAAAGTGCGAGAGAGA
G**TGGTTGATCCAATGGTAGCTTTGTTCTGTTGTGTTTTTTTT*CTTTTGTTCCCGTTC
TTCGTTTGGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTAC*ATTGAATAATAATGATAATGATTAATCT
T
CAAAAA

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2AR89TF 728 0 0
GGAGCTAAATCACACCAAAAACCCTAATCTCTCAAATCTTCTCCAAACAAAAAAAAAATG
GCTAACCCTAGAGTTTTCTTCGACATGAGCGTGGGCGACAAACCCGCCGGCCGCATCGTG
ATGGAGCTTTACGCCGACACAACCCCCGACACCGCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACC
GGCGAGAAGGGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCAC
CGCGTGATCCCCAAGTTCATGTGCCAGGGAGGTGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGA
GGAGAGTCGATCTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAGAACTTTGTCAAGAAACACACCGGT
CCGGGCATCCTGTCCATGGCTAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTTCATC
TGCACTGAGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTTGAA
GGGATGGATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGACCTCGAAG
AAGGTTGTGATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGAGAGAAAGTGCGAGAGAGA
GAGTGGTTGATCCAATGGTAGCTTTGTTCTGTTGTGTTTTTTTT*CTTTTGTTCCCGTTC
TTCGTTTGGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTACCATTGAATAATAATGATAATGATTAACCT
TAGTT
ATT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 2 12

CO CL321Contig1 953 6 21 U
GGATGCTCCAATCTCTCTCTCTTCTCTTCTTCCTCTTTGCTAACAAAGCATCATCCCTTT
TTTGCTGAAGACGGAGAAGCTCCATGACGAAGCAGCACGCGAACTGGTCTCCTTACGATA
ACAATGGAGGAACATGTGTGGCCATAGCTGGATCGGATTACTGCGTTATCGCCGCCGATA
CTCGTATGTCTACCGGTTACAGTATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAG
CAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGCTTTCAGGCTGATGTGAAAGCATTGCAGAAAG
TTTTGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTG
CGATGGCTCAGCTTCTCTCTAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGCAT
TTAATGTTCTAGGAGGGCTTGACGAGGAAGGTAAAGGTTGTGTCTTTACTTATGATGCTG
TTGGTTCGTATGAGAAAGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTAATCATGC
CTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCTCTTCTGCTGCCTGCACAGGATGCTA
TCACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGCCA
CTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCGATGGCA
TCAGGACCGAAGTCATGGACTTGAGGAAAGACTAAGCAGAGCATATGAATGTTGTGAACA
CTCTCACCTTCGTCCGTTTTTTTCTTATTCGCATCTCAACATTAGTTCCCCTTGGTTATC
TTGTACTGTATTATTGGCTTAATGTATTACAGTAATCAACTCATGCTTGAAGTTTCCTTT
ATGACAAAGTTCTTTTGGAGAGTTTTAATAACAATATTCGATTTCTTAGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 20 20 
20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F562TF U 1
AF RR2C986TF U 9
AF RR2F935TF U 58
AF RR2F935JQ C 282
AF RR2FZ55JQ C 358
AF RR2F562JQ C 344
BS 1 61 RR2F562TF
BS 62 63 RR2C986TF
BS 64 266 RR2F562TF
BS 267 267 RR2C986TF
BS 268 364 RR2F562TF
BS 365 365 RR2C986TF
BS 366 465 RR2F562TF
BS 466 466 RR2C986TF
BS 467 513 RR2F562TF
BS 514 616 RR2C986TF
BS 617 617 RR2F935TF
BS 618 706 RR2C986TF
BS 707 724 RR2F935TF
BS 725 725 RR2F935JQ
BS 726 748 RR2F935TF
BS 749 749 RR2F935JQ
BS 750 777 RR2F935TF
BS 778 778 RR2F935JQ
BS 779 797 RR2F935TF
BS 798 926 RR2F935JQ
BS 927 953 RR2F562JQ

RD RR2F562TF 513 0 0
GGATGCTCCAATCTCTCTCTCTTCTCTTCTTCCTCTTTGCTAACAAAGCATCATCCCTTT
TG*GCTGAAGACGGAGAAGCTCCATGACGAAGCAGCACGCGAACTGGTCTCCTTACGATA
ACAATGGAGGAACATGTGTGGCCATAGCTGGATCGGATTACTGCGTTATCGCCGCCGATA
CTCGTATGTCTACCGGTTACAGTATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAG
CAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTAGCTTTCAGGCTGATGTGAAAGCATTGCAGAAAG
TTTTGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTG
CGATTGCTCAGCTTCTCTCTAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGCAT
TTAATGTTCTAGGAGGGCTTGACGAGGAAGGTAAAGGTTGTGTCTCTACTTATGATGCTG
TTGGTTCGTATGAGAAAGTTGGATACAGTGCTC

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2C986TF 698 0 0
GGATCTCTCTCCAC
TCTCTTCTTCCTCTTTGCTAACAAAGCATCATTCCTTTTTTGCTGAAGACGGAGAAGCTC
CATGACGAAGCAGCACGCGAACTGGTCTCCTTACGATAACAATGGAGGAACATGTGTGGC
CATAGCTGGATCGGATTACTGCGTTATCGCCGCCGATACTCGTATGTCTACCGGTTACAG
TATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTC
CTCTGGCTTTCAGGCTGATGTGAAAGCATTGCAGAAAGTTTTGAAATCAAGGCACTTGGT
TTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCGATGGCTCAGCTTCTCTCTAA
CACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGCATTTAATGTTCTAGGAGGGCTTGA
CGAGGAAGGTAAAGGTTGTGTCTTTACTTATGATGCTGTTGGTTCGTATGAGAAAGTTGG
ATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTAATCATGCCTTTCCTTGACAATCAACTCAA
GAGTCCCAGCCCTCTTCTGCTGCCTGCACAGGATGCTATCACACCCCTTTCCGA*CTTGA
AGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGG
AGACAAGCTTGAGATCATGATTCT

QA 15 698 15 698
DS 

RD RR2F935TF 740 0 0
T
TTTTTGCTGAAGACGGAGAAGCTCCATGACGAAGCAGCACGCGAACTGGTCTCCTTACGA
TAACAATGGAGGAACATGTGTGGCCATAGCTGGATCGGATTACTGCGTTATCGCCGCCGA
TACTCGTATGTCTACCGGCTACAGTATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACT
AGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGCTTTCAGGCTGATGTGAAAGCATTGCAGAA
AGTTTTGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCC
TGCGATGGCTCAGCTTCTCTCTAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGC
ATTTAATGTTCTAGGAGGGCTTGACGAGGAAGGTAAAGGTTGTGTCTTTACTTATGATGC
TGTTGGTTCGTATGAGAAAGTTGGATACAGTGCTCAAGGCTCTGGTTCCACTCTAATCAT
GCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCTCTTCTGCTGCCTGCACAGGATGC
TATCACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGC
CACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCGATGG
CATCAG*ACCGAAGTCATGGACTTGAGGAA*GACTAAGCAGAGCATATGAATGTTGTGA*
CACTCTCACCTTCGTCCGT

QA 2 740 2 740
DS 

RD RR2F935JQ 645 0 0
GTGAAAGCATTGCAGAAAGTTTTGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAAC
AAGCAGATGAGCTGTCCTGCGATGGCTCAGCTTCTCTCTAACACGCTTTACTTCAAGCGC
TTTTTTCCTTACTATGCATTTAATGTTCTAGGAGGGCTTGACGAGGAAGGTAAAGGTTGT
GTCTTTACTTATGATGCTGTTGGTTCGTATGAGAAAGTTGGATACAGTGCTCAAGGCTCT
GGTTCCACTCTAATCATGCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCTCTTCTG
CTGCCTGCACAGGATGCTATCACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAG
ACTGTTTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATG
ATTCTCAAGGCCGATGGCATCAGGACCGAAGTCATGGACTTGAGGAAAGACTAAGCAGAG
CATATGAATGTTGTGAACACTCTCACCTTCGTCCGTTTTTTTCTTATTCGCATCTCAACA
TTAGTTCCCCTTGGTTATCTTGTACTGTATTATTGGCTTAATGTATTACAGTAATCAACT
CATGCTTGAAGTTTCCTTTATGACAAAGTTCTTTTGGAGAGTTTT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2FZ55JQ 569 0 0
CTGCGATGGCTCAGCTTCTCTCTAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTTCCTTACTATG
CATTTAATGTTCTAGGAGGGCTTGACGAGGAAGGTAAAGGTTGTGTCTTTACTTATGATG
CTGTTGGTTCGTATGAGAAAGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTAATCA
TGCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCTCTTCTGCTGCCTGCACAGGATG
CTATCACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTG
CCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCGATG
GCATCAGGACCGAAGTCATGGACTTGAGGAAAGACTAAGCAGAGCATATGAATGTTGTGA
ACACTCTCACCTTCGTCCGTTTTTTTCTTATTCGCATCTCAACATTAGTTCCCCTTGGTT
ATCTTGTACTGTATTATTGGCTTAATGTATTACAGTAATCAACTCATGCTTGAAGTTTCC
TTTATGACAAAGTTCTTTTGGAGAGTTTT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2F562JQ 610 0 0
GCAGATGAGCTGTCCTGCGATTGCTCAGCTTCTCTCTAACACGCTTTACTTCAAGCGCTT
TTTTCCTTACTATGCATTTAATGTTCTAGGAGGGCTTGACGAGGAAGGTAAAGGTTGTGT
CTCTACTTATGATGCTGTTGGTTCGTATGAGAAAGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGG
TTCCACTCTAATCATGCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCTCTTCTGCT
GCCTGCACAGGATGCTATCACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGAC
TGTTTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGAT
TCTCAAGGCCGATGGCATCAGGACCGAAGTCATGGACTTGAGGAAAGACTAAGCAGAGCA
TATGAATGTTGTGAACACTCTCACCTTCGTCCGTTTTTTTCTTATTCGCATCTCAACATT
AGTTCCCCTTGGTTATCTTGTACTGTATTATTGGCTTAATGTATTACAGTAATCAACTCA
TGCTTGAAGTTTCCTTTATGACAAAGTTCTTTTGGAGAGTTTTAATAACAATATTCGATT
TCTTAGCTAC

QA 1 610 1 610
DS 



CO CL321Contig2 982 6 7 U
GAATCTCTCTTCTCTGCCAATTCTCGAGTCTCTTCTTCCTCTTTGCTAACAAAGCATCCC
TTTTTGCTGAAGACGGAGAAGCTCCATGACGAAGCAGCACGCGAACTGGTCTCCTTACGA
TAACAATGGAGGAACATGTGTGGCTATAGCTGGATCGGATTACTGCGTTATCGCCGCCGA
TACTCGTATGTCTACCGGTTACAGTATTCCCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACT
AGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGGTTTCAGGCTGATGTGAAAGCATTGCAGAA
AGTTTTGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCGGATGAGCTGTCC
TGCGATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGC
CTTTAACGTTCTTGGAGGGCTTGATGAGGAGGGAAAAGGGTGCGTCTTTACGTATGATGC
TGTTGGTTCTTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTAATCAT
GCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCACTTCTGCTACCCGCACAGGATGC
TATCACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGC
CACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCGATGG
CATCAGGACTGAGGTCATGGACTTGAGGAAAGACTAAGCAGCATATGAATGTTGTGAACA
CTCTCAACTTCGTCCGTTTTTTTTCTTATTCGCATCTCAACATTAGTTCCCCTTGGTTAT
CTTGAACTGTATTATTAGCTTAATGTATTACAGTAATCAACTCATGCTTGAAGTTTCCTT
TATGACAAAGTACTTTTGGAGAGTTTTAATAACAACTGGATTTTGACCCGCCTTTTTTAA
GGGCGGGTATATTTTTTGTTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS58TF U 1
AF RR2DU58TF U 33
AF RR2GP21TF U 1
AF RR2GS58JQB C 195
AF RR2GP21JQ C 362
AF RR2DU58JQ C 210
BS 1 712 RR2GP21TF
BS 713 713 RR2GS58JQB
BS 714 725 RR2GP21TF
BS 726 726 RR2GS58JQB
BS 727 745 RR2GP21TF
BS 746 873 RR2GS58JQB
BS 874 982 RR2DU58JQ

RD RR2GS58TF 649 0 0
GAATCTCTCTTCTCTGCCAATTCTCGAGTCTCTTCTTCCTCTTTGCTAACAAAGCATCCC
TTTTTGCTGAAGACGGAGAAGCTCCATGACGAAGCAGCACGCGAACTGGTCTCCTTACGA
TAACAATGGAGGAACATGTGTGGCTATAGCTGGATCGGATTACTGCGTTATCGCCGCCGA
TACTCGTATGTCTACCGGTTACAGTATTCCCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACT
AGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGGTTTCAGGCTGATGTGAAAGCATTGCAGAA
AGTTTTGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCGGATGAGCTGTCC
TGCGATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGC
CTTTAACGTTCTTGGAGGGCTTGATGAGGAGGGAAAAGGGTGCGTCTTTACGTATGATGC
TGTTGGTTCTTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTAATCAT
GCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCACTTCTGCTACCCGCACAGGATGC
TATCACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2DU58TF 676 0 0
TTCTTCCTCTTTGCTAACAAAGCATCCCTTTTTGCTGAAGACGGAGAAGCTCCATGACGA
AGCAGCACGCGAACTGGTCTCCTTACGATAACAATGGAGGAACATGTGTGGCTATAGCTG
GATCGGATTACTGCGTTATCGCCGCCGATACTCGTATGTCTACCGGTTACAGTATTCTCA
CTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGGT
TTCAGGCTGATGTGAAAGCATTGCAGAAAGTTTTGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGC
ATCAGCATAACGAGCAGATGAGCTGTCCTGCGATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTTT
ACTTCAAGCGCTTTTT*CCTTACTATGCCTTTAACGTTCTTGGAGGGCTTGATGAGGAGG
GAAAAGGGTGCGTCTTTACGTATGATGCTGTTGGTTCTTATGAGAAGGTTGGATACAGTG
CTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTAATCATGCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCA
GCCCACTTCTGCTACCCGCACAGGATGCTATCACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAGTTG
ACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGC
TTGAGATCATGATTCT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2GP21TF 745 0 0
GAATCTCTCTTCTCTGCCAATTCTCGAGTCTCTTCTTCCTCTTTGCTAACAAAGCATCCC
TTTTTGCTGAAGACGGAGAAGCTCCATGACGAAGCAGCACGCGAACTGGTCTCCTTACGA
TAACAATGGAGGAACATGTGTGGCTATAGCTGGATCGGATTACTGCGTTATCGCCGCCGA
TACTCGTATGTCTACCGGTTACAGTATTCCCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACT
AGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGGTTTCAGGCTGATGTGAAAGCATTGCAGAA
AGTTTTGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCGGATGAGCTGTCC
TGCGATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGC
CTTTAACGTTCTTGGAGGGCTTGATGAGGAGGGAAAAGGGTGCGTCTTTACGTATGATGC
TGTTGGTTCTTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTAATCAT
GCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCACTTCTGCTACCCGCACAGGATGC
TATCACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGC
CACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAG*CCGATGG
CATCACGACTGAGGTCATGGACTTG

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2GS58JQB 680 0 0
CCGGTTACAGTATTCCCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAGCAGACAAAGCTG
TGCTCTCTTCCTCTGGGTTTCAGGCTGATGTGAAAGCATTGCAGAAAGTTTTGAAATCAA
GGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCGGATGAGCTGTCCTGCGATGGCTCAGC
TTCTCTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGCCTTTAACGTTCTTG
GAGGGCTTGATGAGGAGGGAAAAGGGTGCGTCTTTACGTATGATGCTGTTGGTTCTTATG
AGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTAATCATGCCTTTCCTTGACA
ATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCACTTCTGCTACCCGCACAGGATGCTATCACACCCCTTT
CCGAACTTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATA
TCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCGATGGCATCAGGACTGAGG
TCATGGACTTGAGGAAAGACTAAGCAGCATATGAATGTTGTGAACACTCTCAACTTCGTC
CGTTTTTTTTCTTATTCGCATCTCAACATTAGTTCCCCTTGGTTATCTTGAACTGTATTA
TTAGCTTAATGTATTACAG
C

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2GP21JQ 513 0 0
GCGATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGCC
TTTAACGTTCTTGGAGGGCTTGATGAGGAGGGAAAAGGGTGCGTCTTTACGTATGATGCT
GTTGGTTCTTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTAATCATG
CCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCACTTCTGCTACCCGCACAGGATGCT
ATCACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGCC
ACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCGATGGC
ATCAGGACTGAGGTCATGGACTTGAGGAAAGACTAAGCAGCATATGAATGTTGTGAACAC
TCTCAACTTCGTCCGTTTTTTTTCTTATTCGCATCTCAACATTAGTTCCCCTTGGTTATC
TTGAACTGTATTATTAGCTTAATGTATTACAG
C

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2DU58JQ 773 0 0
TCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTG
GGTTTCAGGCTGATGTGAAAGCATTGCAGAAAGTTTTGAAATCAAGGCACTTGGTTTATC
AGCATCAGCATAACGAGCAGATGAGCTGTCCTGCGATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGC
TTTACTTCAAGCGCTTTTT*CCTTACTATGCCTTTAACGTTCTTGGAGGGCTTGATGAGG
AGGGAAAAGGGTGCGTCTTTACGTATGATGCTGTTGGTTCTTATGAGAAGGTTGGATACA
GTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTAATCATGCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTC
CCAGCCCACTTCTGCTACCCGCACAGGATGCTATCACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAG
TTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACA
AGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCGATGGCATCAGGACTGAGGTCATGGACTTGAGGA
AAGACTAAGCAGCATATGAATGTTGTGAACACTCTCAACTTCGTCCGTTTTTTTTCTTAT
TCGCATCTCAACATTAGTTCCCCTTGGTTATCTTGAACTGTATTATTAGCTTAATGTATT
ACAGTAATCAACTCATGCTTGAAGTTTCCTTTATGACAAAGTACTTTTGGAGAGTTTTAA
TAACAACTGGATTTTGACCCGCCTTTTTTAAGGGCGGGTATATTTTTTGTTGG

QA 1 773 1 773
DS 



AS 2 13

CO CL322Contig1 1790 9 11 U
GGATAGGAGAATGGATCAAACCAAAGGAAAAGTTTGTGTTACTGGAGCTTCAGGATTCTT
AGCTTCTTGGCTTGTGAAGAGGCTTCTCCTTGAGGGGTATGAAGTTACAGGAACAGTCAG
AGATCCAGGGAATGAGAAGAAGCTTGCACACCTTTGGAAACTGGAAGGGGCAAAGGAGAG
ACTAAGGTTGGTTAAGGCTGATTTAATGGAAGAAGGAAGTTTTGATAACGCTATAATGGG
ATGCCAAGGAGTTTTCCATACTGCTTCTCCTGTTCTCAAACCTACCTCTAATCCAGAGGA
GGAGATTTTGAAACCAGCTATAGAGGGCACACTGAATGTACTGAGATCATGCAGGAAGAA
TCAGTCTTTGAAGCGTGTGGTTCTCACCTCATCCTCTTCAACAGTCAGGATCAGAGATGA
TTTTGATCCTAACATCCCACTTGATGAATCAATTTGGACCTCTGTTGAACTTTGCAAGCG
TTTCCAGGTGTGGTATGCTTTATCAAAGACATTAGCCGAGCAAGCTGCATGGAAATACTG
TGAAGAGAATGGTCTTGACCTTGTCACTGTTCTACCATCCTTCCTCGTTGGACCAAGCCT
GCCTCCTGATCTGTGTTCTACAGCATCCGATGTCCTTGGGTTGCTGAAAGGAGAAACAGA
GAAGTTCCAGTGGCATGGACAGATGGGGTATGTTCATATCGATGATGTGGCAAGAACCCA
CATTCTTGTTTTCGAACACGAAGCAGCTCAAGGAAGATACATTTGCAGCTCTAAAGTTGT
CTCTCTAGAGGAACTGGTTTCCTTCTTATCCACACGTTACCCATCACTCCCTATCCCCAA
GAGGTTTGAGGAACTATATAGGCTGCATTACAACTTGGACACTTCGAAGATAAAGAGTCT
TGGGCTCGAGTTCAAGTCCCTTGAAGAGATGTTTGATGACTGCATTGCCTCACTTCTGGA
GCAAGGCTATTTATCTCATGTAGTTTCTTAACTCTTTAGACTCGTGAACAAGATATGTTT
ATTAACAATAAACCAGTATAAGTGGAAAACGTGTAGACAAAGGTAAAGAATGAATGATCT
TATATATAAAATGCAATGTTTCAACAATATAGCTTCACTTTCAGACAGTAATGTATATCA
AATATACACGAAATACAAAATCGCAATTGTTCAGAAGCAGCTTTATCTCTGTGCTAGAAT
AGTGGTGGATCTTTGTTGTCAGACAAAGTTCAGAGATGTTTTTTAATACTATCGTAGCTT
CCCTGCTGAGTGCAAATATACTGAAACAGAGACAACCGTTGAGCCCAAAAAGAAGGCAAG
TGAGAGATGAAAATTGAAGAGGAATACAGAGACAACCGCCGTGAGAAGCATCGCCACTGA
TGTTGAATACACCTTTACGATATTGTCTGCATATTTCATCACCATTGACACAGCAATGCC
ACTGAGAGCATGGTTAAGAATCATGAGTACTGTGATGAATGAGTAACCATGGAAGAACCC
CTTATTAGCAACGGCATCGAAATCTTGGATCACTATAGCAACAGCATTGAAAGCCATCCC
AAAGACATATAGCCAGAAGTTTTGTACATTTATATTCCTTGAAGGCCGCTTCTTTATAAT
AGCCTCTGTGTACACTCCGGCGAAACCACTTAAAAGAGCCATAATAATTGCCATAATCCA
ACCGGGAAGAGATGTCTGAAGTACACGATCAGAATTTGAATTCAACTGAGCAGTGGTGCA
TCCACAGCACAATAGGATGAAGCCTGCCCACTGAATCTCGCTCAACTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H508TF U 22
AF RR2C067TF U 1
AF RR2FG74TF U 1
AF RR2C067JQ C 399
AF RR2FG74JQ C 433
AF RR2H508JQB C 411
AF RR2EX86JQ U 1061
AF RR2H933JQ U 1062
AF RR2CP70JQ U 1062
BS 1 735 RR2C067TF
BS 736 736 RR2C067JQ
BS 737 754 RR2C067TF
BS 755 755 RR2C067JQ
BS 756 765 RR2C067TF
BS 766 791 RR2FG74TF
BS 792 1061 RR2C067JQ
BS 1062 1184 RR2EX86JQ
BS 1185 1185 RR2H933JQ
BS 1186 1733 RR2EX86JQ
BS 1734 1790 RR2CP70JQ

RD RR2H508TF 365 0 0
CAAAGGAAAAGTTTGTGTTACTGGAGCTTCAGGATTCTTAGCTTCTTGGCTTGTGAAGAG
GCTTCTCCTTGAGGGGTATGAAGTTACGGGAACATTCAGAGATCCAGGGAATGAGAAGAA
GCTTGCACACCTTTGGAAACTGGAAGGGGCAAAGGAGAGACTAAGGTTGGTTAAGGCTGA
TTTAATGGAAGAAGGAAGTTTTGATAACGCTATAATGGGATGCCAAGGAGTTTTCCATAC
CGCTTCTCCTGTTCTCAAACCTACCTCTAATCCAGAGGAGGATATTTTGAAACCAGCTAT
AGAGGGCACACTGAATGTACTGAGATCATGCAGGAAGAATCAGTCTTTGAAGCGTGTGGT
TCTCA

QA 1 365 1 365
DS 

RD RR2C067TF 765 0 0
GGATAGGAGAATGGATCAAACCAAAGGAAAAGTTTGTGTTACTGGAGCTTCAGGATTCTT
AGCTTCTTGGCTTGTGAAGAGGCTTCTCCTTGAGGGGTATGAAGTTACAGGAACAGTCAG
AGATCCAGGGAATGAGAAGAAGCTTGCACACCTTTGGAAACTGGAAGGGGCAAAGGAGAG
ACTAAGGTTGGTTAAGGCTGATTTAATGGAAGAAGGAAGTTTTGATAACGCTATAATGGG
ATGCCAAGGAGTTTTCCATACTGCTTCTCCTGTTCTCAAACCTACCTCTAATCCAGAGGA
GGAGATTTTGAAACCAGCTATAGAGGGCACACTGAATGTACTGAGATCATGCAGGAAGAA
TCAGTCTTTGAAGCGTGTGGTTCTCACCTCATCCTCTTCAACAGTCAGGATCAGAGATGA
TTTTGATCCTAACATCCCACTTGATGAATCAATTTGGACCTCTGTTGAACTTTGCAAGCG
TTTCCAGGTGTGGTATGCTTTATCAAAGACATTAGCCGAGCAAGCTGCATGGAAATACTG
TGAAGAGAATGGTCTTGACCTTGTCACTGTTCTACCATCCTTCCTCGTTGGACCAAGCCT
GCCTCCTGATCTGTGTTCTACAGCATCCGATGTCCTTGGGTTGCTGAAAGGAGAAACAGA
GAAGTTCCAGTGGCATGGACAGATGGGGTATGTTCATATCGATGATGTGGCAAGAACCCA
CATTCTTGTTTTCGA*CACGAAGCAGCTCAAGGA*GATACATTTG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2FG74TF 795 0 0
GGATAGGAGAATGGATCAAACCAAAGGAAAAGTTTGTGTTACTGGAGCTTCAGGATTCTT
AGCTTCTTGGCTTGTGAAGAGGCTTCTCCTTGAGGGGTATGAAGTTACAGGAACAGTCAG
AGATCCAGGGAATGAGAAGAAGCTTGCACACCTTTGGAAACTGGAAGGGGCAAAGGAGAG
ACTAAGGTTGGTTAAGGCTGATTTAATGGAAGAAGGAAGTTTTGATAACGCTATAATGGG
ATGCCAAGGAGTTTTCCATACTGCTTCTCCTGTTCTCAAACCTACCTCTAATCCAGAGGA
GGAGACTTTGAAACCAGCTATAGAGGGCACACTGAATGTACTGAGATCATGCAGGAAGAA
TCAGTCTTTGAAGCGTGTGGTTCTCACCTCATCCTCTTCAACAGTCAGGATCAGAGATGA
TTTTGATCCTAACATCCCACTTGATGAATCAATTTGGACCTCTGTTGAACTTTGCAAGCG
TTTCCAGGTGTGGTATGCTTTATCAAAGACATTAGCCGAGCAAGCTGCATGGAAATACTG
TGAAGAGAATGGTCTTGACCTTGTCACTGTTCTACCATCCTTCCTCGTTGGACCAAGCCT
GCCTCCTGATCTGTGTTCTACAGCATCCGATGTCCTTGGGTTGCTGAAAGGAGAAACAGA
GAAGTTCCAGTGGCATGGACAGATGGGGTATGTTCATATCGATGATGTGGCAAGAACC*A
CATTCTTGTTTTCGA*CACGAAGCAGCTCAAGGA*GATACATTTGCAGCTCTAAAGTTGT
CTCTCTAGAGG
GACT

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2C067JQ 690 0 0
CAACAGTCAGGATCAGAGATGATTTTGATCCTAACATCCCACTTGATGAATCAATTTGGA
CCTCTGTTGAACTTTGCAAGCGTTTCCAGGTGTGGTATGCTTTATCAAAGACATTAGCCG
AGCAAGCTGCATGGAAATACTGTGAAGAGAATGGTCTTGACCTTGTCACTGTTCTACCAT
CCTTCCTCGTTGGACCAAGCCTGCCTCCTGATCTGTGTTCTACAGCATCCGATGTCCTTG
GGTTGCTGAAAGGAGAAACAGAGAAGTTCCAGTGGCATGGACAGATGGGGTATGTTCATA
TCGATGATGTGGCAAGAACCCACATTCTTGTTTTCGAACACGAAGCAGCTCAAGGAAGAT
ACATTTGCAGCTCTAAAGTTGTCTCTCTAGAGGAACTGGTTTCCTTCTTATCCACACGTT
ACCCATCACTCCCTATCCCCAAGAGGTTTGAGGAACTATATAGGCTGCATTACAACTTGG
ACACTTCGAAGATAAAGAGTCTTGGGCTCGAGTTCAAGTCCCTTGAAGAGATGTTTGATG
ACTGCATTGCCTCACTTCTGGAGCAAGGCTATTTATCTCATGTAGTTTCTTAACTCTTTA
GACTCGTGAACAAGATATGTTTATTAACAATAAACCAGTATAAGTGGAAAACGTGTAGAC
AAAGGTAAAGAATGAATGATCTTATATATA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2FG74JQ 656 0 0
CATCCCACTTGATGAATCAATTTGGACCTCTGTTGAACTTTGCAAGCGTTTCCAGGTGTG
GTATGCTTTATCAAAGACATTAGCCGAGCAAGCTGCATGGAAATACTGTGAAGAGAATGG
TCTTGACCTTGTCACTGTTCTACCATCCTTCCTCGTTGGACCAAGCCTGCCTCCTGATCT
GTGTTCTACAGCATCCGATGTCCTTGGGTTGCTGAAAGGAGAAACAGAGAAGTTCCAGTG
GCATGGACAGATGGGGTATGTTCATATCGATGATGTGGCAAGAACCCACATTCTTGTTTT
CGAACACGAAGCAGCTCAAGGAAGATACATTTGCAGCTCTAAAGTTGTCTCTCTAGAGGG
ACTGGTTTCCTTCTTATCCACACGTTACCCATCACTCCCTATCCCCAAGAGGTTTGAGGA
ACTATATAGGCTGCATTACAACTTGGACACTTCGAAGATAAAGAGTCTTGGGCTCGAGTT
CAAGTCCCTTGAAGAGATGTTTGATGACTGCATTGCCTCACTTCTGGAGCAAGGCTATTT
ATCTCATGTAGTTTCTTAACTCTTTAGACTCGTGAACAAGATATGTTTATTAACAATAAA
CCAGTATAAGTGGAAAACGTGTAGACAAAGGTAAAGAATGAATGATCTTATATATA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2H508JQB 719 0 0
TCAGAGATGATTTTGATCCTAACATCCCACTTGATGAATCAATTTGGACCTCTGTTGAAC
TTTGCAAGCGTTTCCAGGTGTGGTATGCTTTATCAAAGACATTAGCCGAGCAAGCTGCAT
GGAAATACTGTGAAGAGAATGGTCTTGACCTTGTCACTGTTCTACCATCCTTCCTCGTTG
GACCAAGCCTGCCTCCTGATCTGTGTTCTACAGCATCCGATGTCCTTGGGTTGCTGAAAG
GAGAAACAGAGAAGTTCCAGTGGCATGAACAGATGGGGTATGTTCATATCGATGATGTGG
CAAGAACCCACATTCTTGTTTTCGAACACGAAGCAGCTCAAGGAAGATACATTTGCAGCT
CTAAAGTTGTCTCTCTAGAGGAACTGGTTTCCTTTTTATCCACACGTTACCCATCACTCC
CTATCCCCAAGAGGTTTGAGGAACTATATAGGCTGCATTACAACTTGGACACTTCGAAGA
TAAAGAGTCTTGGGCTCGAGTTCAAGTCCCTTGAAGAGATGTTTGATGACTGCATTGCCT
CACTTCTGGAGCAAGGCTATTTATCTCATGTAGTTTCTTAACTCTTTAGACTCGTGAACA
AGATATGTTTATTAACAATAAACCAGTATAAGTGGAAAACGTGTAGACAAAGGTAAAGAA
TGAATGATCTTATATATAAAATGCAATGTTCCAACAATATAGCTTCACTTTCAGACAG
G

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2EX86JQ 673 0 0
G
GGTAAAGAATGAATGATCTTATATATAAAATGCAATGTTTCAACAATATAGCTTCACTTT
CAGACAGTAATGTATATCAAATATACACGAAATACAAAATCGCAATTGTTCAGAAGCAGC
TTTGTCTCTGTGCTAGAATAGTGGTGGATCTTTGTTGTCAGACAAAGTTCAGAGATGTTT
TTTAATACTATCGTAGCTTCCCTGCTGAGTGCAAATATACTGAAACAGAGACAACCGTTG
AGCCCAAAAAGAAGGCAAGTGAGAGATGAAAATTGAAGAGGAATACAGAGACAACCGCCG
TGAGAAGCATCGCCACTGATGTTGAATACACCTTTACGATATTGTCTGCATATTTCATCA
CCATTGACACAGCAATGCCACTGAGAGCATGGTTAAGAATCATGAGTACTGTGATGAATG
AGTAACCATGGAAGAACCCCTTATTAGCAACGGCATCGAAATCTTGGATCACTATAGCAA
CAGCATTGAAAGCCATCCCAAAGACATATAGCCAGAAGTTTTGTACATTTATATTCCTTG
AAGGCCGCTTCTTTATAATAGCCTCTGTGTACACTCCGGCGAAACCACTTAAAAGAGCCA
TAATAATTGCCATAATCCAACCGGGAAGAGATGTCTGAAGTACACGATCAGAATTTGAAT
TCAACTGAGCAG

QA 2 673 2 673
DS 

RD RR2H933JQ 659 0 0
GGTAAAGAATGAATGATCTTATATATAAAATGCAATGTTTCAACAATATAGCTTCACTTC
CAGACAGTAATGTATATCAAATATACACGAAATACAAAATCGCAATTGTTCAGAAGCAGC
TTTATCTCTGTGCTAGAATAGTGGTGGATCTTTGTTGTCAGACAAAGTTCAGAGATGTTT
TTTAATACTATCGTAGCTTCCCTGCTGAGTGCAAATATACTGAAACAGAGACAACCGTTG
AGCCCAAAAAGAAGGCAAGTGAGAGATGAAAATTGAAGAGGAATACAGAGACAACCGCCG
TGAGAAGCATCGCCACTGATGTTGAATACACCTTTACGATATTGTCTGCATATTTCATCA
CCATTGACACAGCAATGCCACAGAGAGCATGGTTAAAAATCATGAGTACTGTGATGAATG
AGTAACCATGGAAGAACCCCTTATTAGCAACGGCATCGAAATCTTGGATCACTATAGCAA
CAGCATTGAAAGCCATCCCAAAGACATATAGCCAGAAGTTTTGTACATTTATATTCCTTG
AAGGCCGCTTCTTTATAATAGCCTCTGTGTACACTCCGGCGAAACCACTTAAAAGAGCCA
TAATAATTGCCATAATCCAACCGGGAAGAGATGTCTGAAGTACACGATCAGAATTTGAA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2CP70JQ 729 0 0
GGTAAAGAATGAATGATCTTATATATAAAATGCAATGTTTCAACAATATAGCTTCACTTT
CAGACAGTAATGTATATCAAATATACACGAAACACAAAATCGCAATTGTTCAAAAGCAGC
TTTATCTCTGTGCTAGAATAGTGGTGGATCTTTGTTGTCAGACAAAGTTCAGAGAT*TTT
TTTAATACTATCGTAGCTTCCCGGCTGAGTGCAAATATACTGAAACAGAGACAACCGTTG
AGCCCAAAAAGAAGGCAAGTGAGAGATGAAAATTGAAGAGGAATACAGAGACAACCGCAG
TGAGAAGCATTGCCACTGATGTTGAATAAACCTTGACGATATTGTCTGCATATTTCATCA
CCACTGACACAGCAATGCCACTGAGAGCATGGTTAAGAATCATGAGTACTGTTATGAATG
AGTAACCATGGAAGAATCCCTTATTAGCAACGGCATCGAAATCTTGGATCACTATAGCAA
CAGCATTGAAAGCCATCCCAAAGACATATAGCCAGAAGTTCTGTACATTTATATTCCTTG
AAGGCCGCTTTTTAATAATAGCCTCTGTGTACACTCCGGCGAAACCACTTAAAAGAGCCA
TAATAATTGCCATAATCCAACCGGGAAGAGATGTCTGAAGTACACGATCAGAATTTGAAT
TCAACTGAGCAGTGGTGCATCCACAGCACAATAGGATGAAGCCTGCCCACTGAATCTCGC
TCAACTTTT

QA 1 729 1 729
DS 



CO CL322Contig2 843 4 7 U
GGGTTGGGAGCAGAGATCAGATCAGAGAGAGCTCCTTCATCATCAACAATGGAATACCGC
AAAATCAAAGATGACGACGAGGACGATCACGACGACGTCGCTTCTGATCTCGAGAGCTTG
AAGGGAAAATCTCACACCGTTGCTTCGAGTAACATTGCTCTGGCTACTCTTGGTGGT***
GGATCCACTGAGCGTACAAACTGGAAACGAAAGGGTGTAGTCACATGTGCACTCACTATT
CTCACGAGTTCTCAAGCCATACTCATCGTTTGGTCCAAGCGAGCTGGCAAGTATGAGTAC
AGTGTTACCACCGCCAACTTCTTGGTTGAGACTCTGAAATGTGCGTTGTCTCTACTTGCA
TTGACAAGAATATGGAACAACGATGGTGTTACTGACGACAATAGGTTAAGCACAACATAT
GACGAAGTTAAAGTCTTTCCCATTCCTGCTGCTTTGTATCTTTTCAAGAATCTCTTACAG
TATTATATTTTTGCATACGTAGACGCCCCAGGCTATCAGATATTGAAGAATCTGAACATC
ATAAGTACTGGTGTCTTGTACAGAATTATACTGAAGAAAAAGTTGAGCGAGATTCAGTGG
GCAGGCTTCATCCTATTGTGCTGTGGATGCACCACTGCTCAGTTGAATTCAAATTCTGAT
CGTGTACTTCAGACATCTCTTCCCGGTTGGATTATGGCAATTATTATGGCTCTTTTAAGT
GGTTTCGCCGGAGTGTACACAGAGGCTATTATAAAGAAGCGGCCTTCAAGGAAATAATGT
ACAAACTTCTGGCTATATGTCTTTGGGATGGCTTTCATGCTGTTGCTATAGTGATCCAAG
ATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX85TF U 94
AF RR2H933TF U 8
AF RR2CP70TF U 19
AF RR2EX86TF U 1
BS 1 257 RR2EX86TF
BS 258 258 RR2CP70TF
BS 259 394 RR2EX86TF
BS 395 397 RR2CP70TF
BS 398 492 RR2EX86TF
BS 493 493 RR2CP70TF
BS 494 843 RR2EX86TF

RD RR2EX85TF 284 0 0
GACGTCGCTTCTGATCTCGAGAGCTTGAAGGGAAAATCTCACACCGTTGCTTCGAGTAAC
ATTGCTCTGGCTACTCATGGTGGT***GGATCCACTGAGCGTACAAACTGGAAACGAAAG
GGTGTAGTCACATGTGCACTCACTATTCTCACGAGTTCTCAAGCTATACTCATCGTTTGG
TCCAAGCGAGCTGGCAAGTATGAGTACAGTGTTACCACCGCCAACTTCTTGGTTGAGACT
CTGAAATGTGCGTTGTCTCTACTTGCATTGACAAGAATATGGAA

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2H933TF 673 0 0
GG
GCAGAGATCAGATCAGAGAGAGCTTCTTCATCATCAACAATGGAATACCGCAAAATCAAA
GATGACGACGAGGACGATCACGACGACGTCGCTTCTGATCTCGAGAGCTTGAAGGGAAAA
TCTCACACCGTTGCTTCGAGTAACATTGCTCTGGCTACTCTTGGTGGT***GGATCCACT
GAGCGTACAAACTGGAAACGAAAGGGTGTAGTCACATGTGCACTCACTATTCTCACGAGT
TCTCAAGCCATACTCATCGTTTGGTCCAAGCGAGCTGGCAAGTATGGGTACAGTGTTACC
ACCGCCAACTTCTTGGTTGAGACTCTGAAATGTGCGTTGTCTCTACTTGCATTGACAAGA
ATATGGAACAACGATGGTGTTACTGACGACAATAGGTTAAGCACAACATATGACGAAGTT
AAAGTCTTTCCCATTCCTGCTGCTTTGTATCTTTTCAAGAATCTCTTACAGTATTATATT
TTTGCATACGTAGACGCCCCAGGCTATCAGATATTGAAGAATCTGAACATCATAAGTACT
GGTGTCTTGTACAGAATTATACTGAAGAAAAAGTTGAGCGAGATTCAGTGGGCAGGCTTC
ATCCTATTGTGCTGTGGATGCACCACTGCTCAGTTGAATTCAAATTCTGATCGTGTACTT
CAGACATCTCT

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR2CP70TF 720 0 0
GGAGATCAGAGAGGTG
CTTCATCATCAACAATGGAATACCGCAAAATCAAAGATGACGACGAGGACGATCACCACG
ACGTCGCTTCTGATCTCGAGAGCTTGAAGGGAAAATCTCACACCGTTGCTTCGAGTAACA
TTGCTCTCGCTAGTCTTGGTGGTGGTGGATCCACTGAGCGTACAAACTGGAAACGAAAGG
GTGTAGTCACATGTGCACTCACTATTCTCACGAGTTCTCAAGCCATACTCATCGTTTGGT
CCAAGCGAGCTGGCAAGTATGAGTACAGTGTTACCACCGCCAACTTTCTGGTTGAGACTC
TGAAATGTGCCTTATCTCTGCTTGCATTGACAAGAATATGGAACAACGAAGGTGTTACTG
ACGACAATAGGTTAAGCACAACATATGACGAAGTTAAAGTCTTTCCCATTCCTGCTGCTT
TGTATCTTTTCAAGAATCTCTTACAGTATTATATTTTTGCATACGTAGACGCCCCGGGCT
ATCAGATATTGAAGAACCTGAACATCATTAGTACTGGTGTCTTGTACAGAATTATACTGA
AGAAAAAGTTGAGCGAGATTCAGTGGGCAGGCTTCATCCTATTGTGCTGTGGATGCACCA
CTGCTCAGTTGAATTCAAATTCTGATCGTGTACTTCAGACATCTCTTCCCGGTTGGATTA
TGGCAATTATTATGGCTCTTTTAAGTGGTTTCGCCG
AGTGTACA

QA 17 712 17 712
DS 

RD RR2EX86TF 843 0 0
GGGTTGGGAGCAGAGATCAGATCAGAGAGAGCTCCTTCATCATCAACAATGGAATACCGC
AAAATCAAAGATGACGACGAGGACGATCACGACGACGTCGCTTCTGATCTCGAGAGCTTG
AAGGGAAAATCTCACACCGTTGCTTCGAGTAACATTGCTCTGGCTACTCTTGGTGGT***
GGATCCACTGAGCGTACAAACTGGAAACGAAAGGGTGTAGTCACATGTGCACTCACTATT
CTCACGAGTTCTCAAGCTATACTCATCGTTTGGTCCAAGCGAGCTGGCAAGTATGAGTAC
AGTGTTACCACCGCCAACTTCTTGGTTGAGACTCTGAAATGTGCGTTGTCTCTACTTGCA
TTGACAAGAATATGGAACAACGATGGTGTTACTG***ACAATAGGTTAAGCACAACATAT
GACGAAGTTAAAGTCTTTCCCATTCCTGCTGCTTTGTATCTTTTCAAGAATCTCTTACAG
TATTATATTTTTCCATACGTAGACGCCCCAGGCTATCAGATATTGAAGAATCTGAACATC
ATAAGTACTGGTGTCTTGTACAGAATTATACTGAAGAAAAAGTTGAGCGAGATTCAGTGG
GCAGGCTTCATCCTATTGTGCTGTGGATGCACCACTGCTCAGTTGAATTCAAATTCTGAT
CGTGTACTTCAGACATCTCTTCCCGGTTGGATTATGGCAATTATTATGGCTCTTTTAAGT
GGTTTCGCCGGAGTGTACACAGAGGCTATTATAAAGAAGCGGCCTTCAAGGAAATAATGT
ACAAACTTCTGGCTATATGTCTTTGGGATGGCTTTCATGCTGTTGCTATAGTGATCCAAG
ATT

QA 1 843 1 843
DS 



AS 1 11

CO CL323Contig1 977 11 5 U
GGACACATTCAAAACCAACTCTCAAAAACTGAGAGTAGACGAGAGAGAGCAACAAAATGT
CCATATCCATGGCGCTATTCTCTCCTCCGATCACTTCGTCACTCCAAAACCCTAATCTCA
CCCCCAAGATCTCACTCTCACTCTCTCTCCTCTCCACAAAGCGCTTCTCCCTCCTCTCCG
TCACTCGCTCTTCCTCCTCCGACAACGGTGCGTCAACGCCCGATTCCGCTGCAGTCTCTG
CTACAACAGTCGAGATTCCGAAGCCTGTAGAGGAAGCACCGGTCAAATCTCCGCCAGCAG
AAAGCTCCTCCGCGTCGGAAGACGGAGGAGAAGAGACTGATCTGCCAACAACAACCACAA
CGGAGATCAAGTTTCAGGATGCGAAGTGGGTTAAAGGGACTTGGGATCTCAAACAGTTCG
AGAAAGACGGGAAAACAGATTGGGATTCTGTTATCGTCGCTGAGGCAAAGAGGAGGAAGT
GGCTTGAAGATAACCCAGAAACAACTACTAACGCCGAGCCTGTTCTCTTCGATACCTCGA
TCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGCGATACCATCTACCAGAAGCTGAACTCCTCAATG
GCCGTGCTGCGATGATAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGATAGTCTTACCGGAGTAG
GACTTGTTGATCAAATGGGAAACTTCTTCTGCAAAACGCTCTTGTTTGTGGCTGTGTCCG
GAGTTCTTTTCATCCGCAAGAACGAAGATTTAGATAAGCTCAAGGGTCTGATCGAAGAGA
CGACGTTGTATGACAAGCAGTGGCAAGCGGCTTGGAAAGAGCCGGAATCATCATCATCAT
CATCAACGGTTTCTTCAAAGAAGTGAACAGAAACTTTCTCGCTTTTTGTTTCCTCTTTGT
TATGTGATGTTTGTGGATCAGTGATAATTTCTTTATTGTATTACTGATCTTGAGATAGTG
ACATCTATCTGGCTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 35 65 65 65 50 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 55 40 
40 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 25 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 50 50 
50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DT94TF U 56
AF RR2GE91TF U 12
AF RR2FK09TF U 1
AF RR2F906TF U 15
AF RR2BE37TF U 1
AF RR2GR92TF U 57
AF RR2EQ59TF U 1
AF RR2AA43TF U 87
AF RR2FK09JQ C 308
AF RR2F906JQ C 332
AF RR2D114JQ C 454
BS 1 516 RR2BE37TF
BS 517 517 RR2DT94TF
BS 518 805 RR2BE37TF
BS 806 885 RR2AA43TF
BS 886 977 RR2FK09JQ

RD RR2DT94TF 602 0 0
GGG
GTCCATATCCATGGCGCTATTCTCTCCTCCGATCACTTCGTCACTCCAAAACCCTAATCT
CACCCCCAAGATCTCACTCTCACTCTCTCTCCTCTCCACAAAGCGCTTCTCCCTCCTCTC
CGTCACTCGCTCTTCCTCCTCCGACAACGGTGCGTCAACGCCCGATTCCGCTGCAGTCTC
TGCTACAACAGTCGAGATTCCGAAGCCTGTAGAGGAAGCACCGGTCAAATCTCCGCCAGC
AGAAAGCTCCTCCGCGTCGGAAGACGGAGGAGAAGAGACTGATCTGCCAACAACAACCAC
AACGGAGATCAAGTTTCAGGATGCGAAGTGGGTTAAAGGGACTTGGGATCTCAAACAGTT
CGAGAAAGACGGGAAAACAGATTGGGATTCTGTTATCGTCGCTGAGGCAAAGAGGAGGAA
GTGGCTTGAAGATAACCCAGAAACAACTACTAACGCCGAGCCTGTTCTCTTCGATACCTC
TATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGCGATACCATCTACCAGAAGCTGAACTCCTCAA
TGGCCGTGCTGCGATGATAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGATAGTCTTACCGGAG

QA 4 602 4 602
DS 

RD RR2GE91TF 647 0 0
GG
ACCAACTCTCAAAAACTGAGAGTAGACGAGAGAGAGCAACAAAATGTCCATATCCATGGC
GCTATTCTCTCCTCCGATCACTTCGTCACTCCAAAACCCTAATCTCACCCCCAAGATCTC
ACTCTCACTCTCTCTCCTCTCCACAAAGCGCTTCTCCCTCCTCTCCGTCACTCGCTCTTC
CTCCTCCGACAACGGTGCGTCAACGCCCGATTCCGCTGCAGTCTCTGCTACAACAGTCGA
GATTCCGAAGCCTGTAGAGGAAGCACCGGTCAAATCTCCGCCAGCAGAAAGCTCCTCCGC
GTCGGAAGACGGAGGAGAAGAGACTGATCTGCCAACAACAACCACAACGGAGATCAAGTT
TCAGGATGCGAAGTGGGTTAAAGGGACTTGGGATCTCAAACAGTTCGAGAAAGACGGGAA
AACAGATTGGGATTCTGTTATCGTCGCTGAGGCAAAGAGGAGGAAGTGGCTTGAAGATAA
CCCAGAAACAACTACTAACGCCGAGCCTGTTCTCTTCGATACCTCGATCATTCCATGGTG
GACATGGATGAAGCGATACCATCTACCAGAAGCTGAACTCCTCAATGGCCGTGCTGCGAT
GATAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGATAGTCTTACCGGAGT

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR2FK09TF 718 0 0
GGACACATTCAAAACCAACTCTCAAAAACTGAGAGTAGACGAGAGAGAGCAACAAAATGT
CCATATCCATGGCGCTATTCTCTCCTCCGATCACTTCGTCACTCCAAAACCCTAATCTCA
CCCCCAAGATCTCACTCTCACTCTCTCTCCTCTCCACAAAGCGCTTCTCCCTCCTCTCCG
TCACTCGCTCTTCCTCCTCCGACAACGGTGCGTCAACGCCCGATTCCGCTGCAGTCTCTG
CTACAACAGTCGAGATTCCGAAGCCTGTAGAGGAAGCACCGGTCAAATCTCCGCCAGCAG
AAAGCTCCTCCGCGTCGGAAGACGGAGGAGAAGAGACTGATCTGCCAACAACAACCACAA
CGGAGATCAAGTTTCAGGATGCGAAGTGGGTTAAAGGGACTTGGGATCTCAAACAGTTCG
AGAAAGACGGGAAAACAGATTGGGATTCTGTTATCGTCGCCGAGGCAAAGAGGAGGAAGT
GGCTTGAAGATAACCCAGAAACAACTACTAACGCCGGGCCTGTTCTCTTCGATACCTCGA
TCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGCGATACCATCTACCAGAAGCTGAGTTCCTCAATG
GCCGTGCTGCGATGATAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGATAGTCTTACCGGAGTAG
*ACTTGTTGATCAA*TGGGAAACTTCTTCTGCAAA*CGCTCTTGTTTGTGGCTGTGTC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2F906TF 712 0 0
GG
AACTCTCAAAAACTGAGAGTAGACGAGAGAGAGCAACAAAATGTCCATATCCATGGCGCT
ATTCTCTCCTCCGATCACTTCGTCACTCCAAAACCCTAATCTCACCCCCAAGATCTCACT
CTCACTCTCTCTCCTCTCCACAAAGCGCTTCCCCCTCCTCTCCGTCACTCGCTCTTCCTC
CTCCGACAACGGTGCGTCAACGCCCGATTCCGCTGCAGTCTCTGCTACAACAGTCGAGAT
TCCGAAGCCTGTAGAGGAAGCACCGGTCAAATCTCCGCCAGCAGATAGCTCCTCCGCGTC
GGAAGACGGAGGAGAAGAGACTGATCTGCCAACAACAACCACAACGGAGATCAAGTTTCA
GGATGCGAAGTGGGTTAAAGGGACTTGGGATCTCAAACAGTTCGAGAAAGACGGGAAAAC
AGATTGGGATTCTGTTATCGTCGCTGAGGCAAAGAGGAGGAAGTGGCTTGAAGATAACCC
AGAAACAACTACTAACGCCGAGCCTGTTCTCTTCGATACCTCGATCATTCCATGGTGGGC
ATGGATGAAGCGATACCATCTACCAGAAGCTGAACTCCTCAATGGCCGTGCTGCGATGAT
AGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGATAGTCTTACCGGAGTATGATTTGTTGATCAAAT
GGGAAACTTCTTCTGTAAA*CGCTCTTGTTTGTGGCTGTGTCCGGAGTTC

QA 3 712 3 712
DS 

RD RR2BE37TF 811 0 0
GGACACATTCAAAACCAACTCTCAAAAACTGAGAGTAGACGAGAGAGAGCAACAAAATGT
CCATATCCATGGCGCTATTCTCTCCTCCGATCACTTCGTCACTCCAAAACCCTAATCTCA
CCCCCAAGATCTCACTCTCACTCTCTCTCCTCTCCACAAAGCGCTTCTCCCTCCTCTCCG
TCACTCGCTCTTCCTCCTCCGACAACGGTGCGTCAACGCCCGATTCCGCTGCAGTCTCTG
CTACAACAGTCGAGATTCCGAAGCCTGTAGAGGAAGCACCGGTCAAATCTCCGCCAGCAG
AAAGCTCCTCCGCGTCGGAAGACGGAGGAGAAGAGACTGATCTGCCAACAACAACCACAA
CGGAGATCAAGTTTCAGGATGCGAAGTGGGTTAAAGGGACTTGGGATCTCAAACAGTTCG
AGAAAGACGGGAAAACAGATTGGGATTCTGTTATCGTCGCTGAGGCAAAGAGGAGGAAGT
GGCTTGAAGATAACCCAGAAACAACTACTAACGCCGGGCCTGTTCTCTTCGATACCTCGA
TCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGCGATACCATCTACCAGAAGCTGAACTCCTCAATG
GCCGTGCTGCGATGATAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGATAGTCTTACCGGAGTAG
GACTTGTTGATCAAATGGGAAACTTCTTCTGCAAAACGCTCTTGTTTGTGGCTGTGTCCG
GAGTTCTTTTCATCCGCAAGAACGAAGATTTAGATAAGCTCAAGGGTCTGATCGAAGAGA
CGACGTTGTATGACAAGCAGTGGCA
GCGGCT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2GR92TF 737 0 0
GG
GTCCATATCCATGGCGCTATTCTCTCCTCCGATCACTTCGTCACTCCAAAACCCTAATCT
CACCCCCAAGATCTCACTCTCACTCTCTCTCCTCTCCACAAAGCGCTTCTCCCTCCTCTC
CGTCACTCGCTCTTCCTCCTCCGACAACGGTGCGTCAACGCCCGATTCCGCTGCAGTCTC
TGCTACAACAGTCGAGATTCCGAAGCCTGTAGAGGAAGCACCGGTCAAATCTCCGCCAGC
AGAAAGCTCCTCCGCGTCGGAAGACGGAGGAGAAGAGACTGATCTGCCAACAACAACCAC
AACGGAGATCAAGTTTCAGGATGCGAAGTGGGTTAAAGGGACTTGGGATCTCAAACAGTT
CGAGAAAGACGGGAAAACAGATTGGGATTCTGTTATCGTCGCTGAGGCAAAGAGGAGGAA
GTGGCTTGAAGATAACCCAGAAACAACTACTAACGCCGAGCCTGTTCTCTTCGATACCTC
GATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGCGATACCATCTACCAGAAGCTGAACTCCTCAA
TGGCCGTGCTGCGATGATAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGATAGTCTTACCGGAGT
AGGACTTGTTGATCAAATGGGAAACTTCTTCTGCAAAACGCTCTTGTTTGTGGCTGTGTC
CGGAGTTCTTTTCATCCGCAAGAACGAAGATTTAGATAAGCTCAAGGGTCTGATCGAAGA
GACGACGTTGTATGA

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR2EQ59TF 784 0 0
GGACACATTCAAAACCAACTCTCAAAAACTGAGAGTAGACGAGAGAGAGCAACAAAATGT
CCATATCCATGGCGCTATTCTCTCCTCCGATCACTTCGTCACTCCAAAACCCTAATCTCA
CCCCCAAGATCTCACTCTCACTCTCTCTCCTCTCCACAAATCGCTTCTCCCTCCTCTCCG
TCACTCGCTCTTCCTCCTCCGACAACGGTGCGTCAACGCCCGATTCCGCTGCAGTCTCTG
CTACAACAGTCGAGATTCCGAAGCCTGTAGAGGAAGCACCGGTCAAATCTCCGCCAGCAG
AAAGCTCCTCCGCGTCGGAAGACGGAGGAGAAGAGACTGATCTGCCAACAACAACCACAA
CGGAGATCAGGTTTCAGGATGCGAAGTGGGTTAAAGGGACTTGGGATCTCAAACAGTTCG
AGAAAGACGGGAAAACAGATTGGGATTCTGTTATCGTCGCTGAGGCAAAGAGGAGGAAGT
GGCTTGAAGATAACCCAGAAACAACTACTAACGCCGAGCCTGTTCTCTTCGATACCTCGA
TCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGCGATACCATCTACCAGAAGCTGAACTCCTCAATG
GCCGTGCTGCGATGATAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGATAGTCTTACCGGAGTAG
GACTTGTTGATCAAATGGGAAACTTCTTCTGCAAA*CGCTCTTGTTTGTGGCTGTGTCCG
GAGTTCTTTTCATCCGCAAGAACGAAGATT*AGATAAGCTCAAGGGTCTGATCGAAGAGA
CGAC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2AA43TF 799 0 0
G
CGATCACCTCGTCACTCCAAAACCCTAATCTCACCCCCAAGATCTCACTCTCACTCTCTC
TCCTCTCCACAAAGCGCTTCTCCCTCCTCTCCGTCACTCGCTCTTCCTCCTCCGACAACG
GTGCGTCAACGCCCGATTCCGCTGCAGTCTCTGCTACAACAGTCGAGATTCCGAAGCCTG
TAGAGGAAGCACCGGTCAAATCTCCGCCAGCAGAAAGCTCCTCCGCGTCGGAAGACGGAG
GAGAAGAGACTGATCTGCCAACAACAACCACAACGGAGATCAAGTTTCAGGATGCGAAGT
GGGTTAAAGGGACTTGGGATCTCAAACAGTTCGAGAAAGACGGGAAAACAGATTGGGATT
CTGTTATCGTCGCTGAGGCAAAGAGGAGGAAGTGGCTTGAAGATAACCCAGAAACAACTA
CTAACGCCGAGCCTGTTCTCTTCGATACCTCGATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGC
GATACCATCTACCAGAAGCTGAACTCCGCAATGGCCGTGCTGCGATGATAGGGTTCTTCA
TGGCTTACTTTGTTGATAGTCTTACCGGAGTAGGACTTGTTGATCAAATGGGAAACTTCT
TCTGCAAAACGCTCTTGTTTGTGGCTGTGTCCGGAGTTCTTTTCATCCGCAAGAACGAAG
ATTTAGATAAGCTCAAGGGTCTGATCGAAGAGACGACGTTGTATGACGAGCAGTGGCAAG
CGGCTTGGAAAGAGCCGGAATCATCATCATCATCATCAACGGTTTCTTCAAAGAAGTGAA
CAGAAACTTTCTCGCTTT

QA 2 799 2 799
DS 

RD RR2FK09JQ 670 0 0
CTCCGCGTCGGAAGACGGAGGAGAAGAGACTGATCTGCCAACAACAACCACAACGGAGAT
CAAGTTTCAGGATGCGAAGTGGGTTAAAGGGACTTGGGATCTCAAACAGTTCGAGAAAGA
CGGGAAAACAGATTGGGATTCTGTTATCGTCGCCGAGGCAAAGAGGAGGAAGTGGCTTGA
AGATAACCCAGAAACAACTACTAACGCCGGGCCTGTTCTCTTCGATACCTCGATCATTCC
ATGGTGGGCATGGATGAAGCGATACCATCTACCAGAAGCTGAGTTCCTCAATGGCCGTGC
TGCGATGATAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGATAGTCTTACCGGAGTAGGACTTGT
TGATCAAATGGGAAACTTTTTTTGCAAAACGCTCTTGTTTGTGGCTGTGTCCGGAGTTCT
TTTCATCCGCAAGAACGAAGATTTAGATAAGCTCAAGGGTCCGATCGAAGAGACGACGTT
GTATGACAAGCAGTGGCAAGCGGCTTGGAAAGAGCCGGAATCATCATCATCATCATCAAC
GGTTTCTTCAAAGAAGTGAACAGAAACTTTCTCGCTTTTTGTTTCCTCTTTGTTATGTGA
TGTTTGTGGATCAGTGATAATTTCTTTATTGTATTACTGATCTTGAGATAGTGACATCTA
TCTGGCTTTG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2F906JQ 646 0 0
AGAGACTGATCTGCCAACAACAACCACAACGGAGATCAAGTTTCAGGATGCGAAGTGGGT
TAAAGGGACTTGGGATCTCAAACAGTTCGAGAAAGACGGGAAAACAGATTGGGATTCTGT
TATCGTCGCTGAGGCAAAGAGGAGGAAGTGGCTTGAAGATAACCCAGAAACAACTACTAA
CGCCGAGCCTGTTCTCTTCGATACCTCGATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGCGATA
CCATCTACCAGAAGCTGAACTCCTCAATGGCCGTGCTGCGATGATAGGGTTCTTCATGGC
TTACTTTGTTGATAGTCTTACCGGAGTAGGATTTGTTGATCAAATGGGAAACTTCTTCTG
TAAAACGCTCTTGTTTGTGGCTGTGTCCGGAGTTCTTTTCATCCGCAAGAACGAAGATTT
AGATAAGCTCAAGGGTCTGATCGAAGAGACGACGTTGTATGACAAGCAGTGGCAAGCGGC
TTGGAAAGAGCCGGAATCATCATCATCATCATCAACGGTTTCTTCAAAGAAGTGAACAGA
AACTTTCTCGCTTTTTGTTTCCTCTTTGTTATGTGATGTTTGTGGATCAGTGATAATTTC
TTTATTGTATTACTGATCTTGAGATAGTGACATCTATTTGGCTTTG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2D114JQ 509 0 0
TCGTTT
CTGAGGCAAAGAGGAGGAAGTGGCTTGAAGATAACCCAGAAACAACTACTAACGACGAGC
CTGTTTTCTTCGATACCTCCATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGAGATACCATCTAC
CAGAAGCTGAACTCCTCAATGGCCGTGCTGCGATGATAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTG
TTGATAGTCTTACCGGAGTAGGACTTGTTGATCAAATGGGAAACTTCTTCTGCAAAACGC
TCTTGTTTGTGGCTGTATCCGGAGTTCTTTTCATTCGCAAGAACGAAGATTTAGATAAGC
TCAAGGGTCTGATCGAAGAGACGACGTTGTATGACAAGCAGTGGCAAGCGGCTTGGAAAG
AGCCGGAATCATCATCATCATCATCGACCGTTTCTTCAAAGAAGTGAACAGAAGCTTTCT
CGCTTTTTGTTTCCTCTTTGTTATGTGATGTTTGTGGATCAGTGATAATTTCTTTATTGT
ATTACTGATCTTGAGATAGTGAC

QA 7 509 7 509
DS 



AS 3 13

CO CL324Contig1 681 3 6 U
CAATACAAAACTTTCCAAGTTTTATTATGCAATCAGAACGATCCTCAGAAAAAAAGATAA
TTATTTCTCATTAAACAAGCTACTCATTTCCCCAGAGAAAAAAATAACTTAAAAACATTG
CAGATATAGATAGAAAGATAGATGGGGGACAAGAGATACACATGTGACATGTGCAACTTC
ATTACACCATGAGGCCCTCAGGTGCAGCAGCAGCAGCAGCCTTAGGTTTAGGCTTATCAA
CAACGATAGCCTGAGTGGTCAGCACCATCCCTGCAACCGAAGCAGCGTTCTGAAGCGCAC
ATCTGGTCACTTTAGCTGGATCAATCACTCCAGCTTCCAACAGATTCTCATAGGTATCAG
TCATGGCGTTGTACCCTAGCTCCCATTCACTGAACATAATCTTCTCCACCACAACTTCTC
CTTCAATCCCAGCGTTCTGCGCAATAAGCGCTGCTGGTGCCACCAATGCCTTCTGTACTA
TATCAGCTCCAAAACGTTCATCAGCGTCCTCAAACGTCTCCTTAATGGCAGGGATAACAG
TGGAGAGATGCACCAGAGTCGCACCACCACCGGGGACTATCCCTTCTTCGATAGCAGCAA
ACGTCGCGTTCTTTGCGTCCTCGATACGAAGCTTACGGTCCTCCAGCTCGGTCTCAGTCG
CTGCTCCGACTTTAATGACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP43TF C 1
AF RR2B963JQ U 135
AF RR2ET06JQ U 89
BS 1 88 RR2CP43TF
BS 89 419 RR2ET06JQ
BS 420 420 RR2B963JQ
BS 421 492 RR2ET06JQ
BS 493 493 RR2B963JQ
BS 494 681 RR2ET06JQ

RD RR2CP43TF 458 0 0
CAATACAAAACTTTCCAAGTTTTATTATGCAATCAGAACGATCCTCAGAAAAAAAGATAA
TTATTTCTCATTAAACAAGCTACTCATTTCCCCAGAGAAAAAA*TAACTTAAAAACATTG
CAGATATAGATAGAAAGATAGATGGGGGACAAGAGATACACATGTGACATGTGCAACTTC
ATTACACCATGAGGCCCTCAGGTGCAGCAGCAGCAGCAGCCTTAGGTTTAGGCTTATCAA
CAACGATAGCCTGAGTGGTCAGCACCATCCCTGCAACCGAAGCAGCGTTCTGAAGCGCAC
ATCTGGTCACTTTAGCTGGATCAATCACTCCAGCTTCCAACAGATTCTCATAGGTATCAG
TCATGGCGTTGTACCCTAGCTCCCATTCACTGAACATAATCTTCTCCACCACAACTTCTC
CTTCAATCCCAGCGTTCTGCGCAATAAGCGCTGCTGG
C

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR2B963JQ 409 0 0
AAGATAGAGGGGGGACAAGAAATACACATGTGACATGTGCAACTTCATTACACCATGAGG
CCCTCAGGTGCAGCAGCAGCAGCAGCCTTAGGTTTAGGCTTATCAACAACGATAGCCTGA
GTGGTCAGCACCATCCCTGCAACCGAAGCAGCGTTCTGAAGCGCACATCTGGTCACTTTA
GCTGGATCAATCACTCCAGCTTCCAACAAATTCTCATAGGTATCAGTCAGGGCGTTGTAC
CCTACCTCCCATTCACTGAACATAATCTTCTCCACCACAACTTCTCCTTCAATCCCAGCG
TTCTGCGCAATAAGCGCTGCTGGTGCCACCAATGCCTTCTGTACTATATCAGCTCCAAAA
CGTTCATCAGCGTCCTCAAACGTCTCCTTAATGGCAGGGATAACAGTGG

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR2ET06JQ 593 0 0
TCCCCAGAGAAAAAAATAACTTAAAAACATTGCAGATATAGATAGAAAGATAGATGGGGG
ACAAGAGATACACATGTGACATGTGCAACTTCATTACACCATGAGGCCCTCAGGTGCAGC
AGCAGCAGCAGCCTTAGGTTTAGGCTTATCAACAACGATAGCCTGAGTGGTCAGCACCAT
CCCTGCAACCGAAGCAGCGTTCTGAAGCGCACATCTGGTCACTTTAGCTGGATCAATCAC
TCCAGCTTCCAACAGATTCTCATAGGTATCAGTCATGGCGTTGTACCCTAGCTCCCATTC
ACTGAACATAATCTTCTCCACCACAACTTCTTCTTCAATCCCAGCGTTCTGCGCAATAAG
CGCTGCTGGTGCCACCAATGCCTTCTGTACTATATCAGCTCCAAGACGTTCATCAGCGTC
CTCAAACGTCTCCTTAATGGCAGGGATAACAGTGGAGAGATGCACCAGAGTCGCACCACC
ACCGGGGACTATCCCTTCTTCGATAGCAGCAAACGTCGCGTTCTTTGCGTCCTCGATACG
AAGCTTACGGTCCTCCAGCTCGGTCTCAGTCGCTGCTCCGACTTTAATGACGG

QA 1 593 1 593
DS 



CO CL324Contig2 1382 3 13 U
GCAAACACGGATTGCTGAGCGTCACTTCCGGCGCCAATCCCGTCTCCCTCAAGCGAGGAA
TCGATAAAACCGTTCAAGGTTTGATCGAAGAGCTCGAGAAGAGAGCTAGACCAGTCAAAG
GCGGTAGCGACATCAGAGCCGTGGCCACAATCTCAGCTGGAAACGATGAGCTTGTCGAAG
CGATGATCGCTGACGCCATCGACAAAGTCGGACCTGATGGTGTTCTCTCCATCGAGTCTT
CGTCCTCTTTTGAAACCACCGTTGAAGTCGAAGAAGGGATGGAGATTGACAGAGGCTACA
TCTCTCCTCAGTTCGTTACAAACCCTGAGAAGCTACTGGTTGAGTTCGAGAACGCGAGAG
TGTTGATCACTGATCAGAAGATCACTGCCATCAAAGACATCATCCCAATCTTGGAGAAGA
CCACTCAGCTTCGTGCTCCGCTGCTGATCATCGCTGAGGATGTTACAGGCGAGGCTTTAG
CAACTCTCGTCGTGAACAAACTCCGTGGTGTTCTCAACGTTGTCGCCGTCAAGGCTCCAG
GGTTTGGAGAAAGGAGGAAAGCCATGCTTCAAGATATCGCAATCTTGACGGGAGCTGAGT
ACCAAGCACTTGACATGGGCCTGCTGGTGGAGAACACAACCATAGATCAGTTGGGTATCG
CTCGTAAAGTGACCATAAGCAAAGACTCGACCACGCTTATAGCAGATGCGGCTTCCAAGG
ACGAGTTGCAAGCTCGTATCTCTCAGCTGAAGAAGGAACTGTTCGAGACTGACTCTGTGT
ACGACTCGGAGAAGCTCGCTGAGAGAATAGCCAAACTCTCTGGTGGTGTTGCCGTCATTA
AAGTCGGAGCAGCGACTGAAACCGAGCTCGAGGACCGTAAGCTTCGTATCGAGGACGCGA
AGAACGCGACGTTTGCTGCTATCGAGGAAGGGATAGTCCCCGGTGGTGGTGCGACTCTGG
TGCATCTCTCCACTGTTATCCCTGCCATTAAGGAGACGTTTGAGGACGCTGATGAACGTC
TGGGAGCTGATATAGTACAGAAGGCATTGGTGGCACCAGCAGCGCTTATTGCGCGGAACG
CTGGGATTGAAGGAGAAGTTGTGGTGGAGAAGATTATGTTCAGTGAATGGGAGCTAGGGT
ACAACGCCATGACTGATACCTATGGGAATCTGTTGGAAGCTGGAGTGATTGATCCGGCTA
AAGTGACGAGATGTGCGCTTCAGAACGCTGCTTCGGTTGCACGGATGGTGCTGACCACTC
AGCTATCGTTGTTGACAAGCCTAACCTAAGCTGCTGCTGCTGCTGCACCTGAGGCCTCAT
GGTGTATGAAGTTGCACATGTGTATCTCTGTTCCCATCTATCGATCTGCAATGTTTTAAG
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2E137TF U 1
AF RR2GV67TF U 491
AF RR2D849TF U 595
BS 1 750 RR2E137TF
BS 751 751 RR2GV67TF
BS 752 755 RR2E137TF
BS 756 756 RR2GV67TF
BS 757 792 RR2E137TF
BS 793 793 RR2GV67TF
BS 794 806 RR2E137TF
BS 807 807 RR2D849TF
BS 808 814 RR2E137TF
BS 815 815 RR2GV67TF
BS 816 836 RR2E137TF
BS 837 985 RR2GV67TF
BS 986 1382 RR2D849TF

RD RR2E137TF 836 0 0
GCAAACACGGATTGCTGAGCGTCACTTCCGGCGCCAATCCCGTCTCCCTCAAGCGAGGAA
TCGATAAAACCGTTCAAGGTTTGATCGAAGAGCTCGAGAAGAGAGCTAGACCAGTCAAAG
GCGGTAGCGACATCAGAGCCGTGGCCACAATCTCAGCTGGAAACGATGAGCTTGTCGAAG
CGATGATCGCTGACGCCATCGACAAAGTCGGACCTGATGGTGTTCTCTCCATCGAGTCTT
CGTCCTCTTTTGAAACCACCGTTGAAGTCGAAGAAGGGATGGAGATTGACAGAGGCTACA
TCTCTCCTCAGTTCGTTACAAACCCTGAGAAGCTACTGGTTGAGTTCGAGAACGCGAGAG
TGTTGATCACTGATCAGAAGATCACTGCCATCAAAGACATCATCCCAATCTTGGAGAAGA
CCACTCAGCTTCGTGCTCCGCTGCTGATCATCGCTGAGGATGTTACAGGCGAGGCTTTAG
CAACTCTCGTCGTGAACAAACTCCGTGGTGTTCTCAACGTTGTCGCCGTCAAGGCTCCAG
GGTTTGGAGAAAGGAGGAAAGCCATGCTTCAAGATATCGCAATCTTGACGGGAGCTGAGT
ACCAAGCACTTGACATGGGCCTGCTGGTGGAGAACACAACCATAGATCAGTTGGGTATCG
CTCGTAAAGTGACCATAAGCAAAGACTCGACCACGCTTATAGCAGATGCGGCTTCCAAGG
ACGAGTTGCAAGCTCGTATCTCTCAGCTGA*GAAG*AACTGTTCGAGACTGACTCTGTGT
ACGACTCGGAGA*GCTCGCTGAGAGA*TAGCCAA*CTCTCTGGTGGTGTTGCCGTC

QA 1 836 1 836
DS 

RD RR2GV67TF 495 0 0
G
GTGAACAAACTCCGTGGTGTTCTCAACGTTGTCGCCGTCAAGGCTCCAGGGTTTGGAGAA
AGGAGGAAAGCTATGCTTCAAGATATCGCAATCTTGACGGGAGCTGAGTACCAAGCACTT
GACATGGGCCTGCTGGTGGAGAACACAACCATAGATCAGTTGGGTATCGCTCGTAAAGTG
ACCATAAGCAAAGACTCGACCACGCTTATAGCAGATGCGGCTTCCAAGGACGAGTTGCAA
GCTCGTATCTCTCAGCTGAAGAAGGAACTGTTCGAGACTGACTCTGTGTACGACTCGGAG
AAGCTCGCTGAGAGAGTAGCCAAACTCTCTGGTGGTGTTGCCGTCATTAAAGTCGGAGCA
GCGACTGAAACCGAGCTCGAGGACCGTAAGCTTCGTATCGAGGACGCGAAGAACGCGACG
TTTGCTGCTATCGAGGAAGGGATAGTCCCCGGTGGTGGTGCGACTCTGGTGCATCTCTCC
ACTGTTATCCCTGC

QA 2 495 2 495
DS 

RD RR2D849TF 788 0 0
GG
GAGTACCAAGCACTTGACATGGGCCTGCTGGTGGAGAACACAACCATAGATCAGTTGGGT
ATTGCTCGTAAAGTGACCATAAGCAAAGACTCGACCACGCTTATAGCAGATGTGGCTTCC
AAGGACGAGTTGCAAGCTCGTATCTCTCAGCTGAAGAAGGAACTGTTCGAGACTGACTCT
GTGTACGACTCGGAGAAGCTCGCTGAGAGAATAGCCAAACTCTCTGGTGGTGTTGCCGTC
ATTAAAGTCGGAGCAGCGACTGAAACCGAGCTCGAGGACCGTAAGCTTCGTATCGAGGAC
GCGAAGAACGCGACGTTTGCTGCTATCGAGGAAGGGATAGTCCCCGGTGGTGGTGCGACT
CTGGTGCATCTCTCCACTGTTATCCCTGCCATTAAGGAGACGTTTGAGGACGCTGATGAA
CGTCTGGGAGCTGATATAGTACAGAAGGCATTGGTGGCACCAGCAGCGCTTATTGCGCGG
AACGCTGGGATTGAAGGAGAAGTTGTGGTGGAGAAGATTATGTTCAGTGAATGGGAGCTA
GGGTACAACGCCATGACTGATACCTATGGGAATCTGTTGGAAGCTGGAGTGATTGATCCG
GCTAAAGTGACGAGATGTGCGCTTCAGAACGCTGCTTCGGTTGCACGGATGGTGCTGACC
ACTCAGCTATCGTTGTTGACAAGCCTAACCTAAGCTGCTGCTGCTGCTGCACCTGAGGCC
TCATGGTGTATGAAGTTGCACATGTGTATCTCTGTTCCCATCTATCGATCTGCAATGTTT
TAAGTT

QA 3 788 3 788
DS 



CO CL324Contig3 1181 7 7 U
CGATACTAAACTTCCCAAGTTTTATTATGCAAAATCAGAACAATCCTTACTCAAAAAAAA
AAA*GATAATTATTTCTCATTAAACAAACTCATTTCCCCCAGAGAAAAAATAACTTAAAA
ACATTGCAGATCGATAGATGGGGAACAAGAGATACACATGTGCAACTTCATTACACCATG
AGGCCCTCAGGTGCAGCAGCAGCAGCAGCCTTAGGTTTAGGCTTGTCAACAACGATAGCC
TGAGTGGTCAGCACCATCCCTGCAACCGAAGCAGCGTTCTGAAGCGCACATCTCGTCACT
TTAGCCGGATCAATCACTCCAGCTTCCAACAGATTCTCATAGGTATCAGTCATGGCGTTG
TACCCTAGCTCCCATTCACTGAACATAATCTTCTCCACCACAACTTCTCCTTCAATCCCA
GCGTTCTGCGCAATAAGCGCTGCTGGTGCCACCAATGCCTTCTGTACTATATCAGCTCCC
AGACGTTCATCAGCGTCCTCAAACGTCTCCTTAATGGCAGGGATAACAGTGGAGAGATGC
ACCAGAGTCGCACCACCACCGGGGACTATCCCTTCCTCGATAGCAGCAAACGTCGCGTTC
TTCGCGTCCTCGATACGGAGCTTACGGTCCTCCAACTCAGTTTCAGTCGCTGCTCCGACT
TTAATGACGGCGACACCACCAGAGAGTTTGGCTATTCTCTCAGCGAGCTTCTCCGAGTCG
TACACAGAGTCAGTCTCGAACAGTTCCTTCTTCAGCTGAGAGATACGAGCTTGCAACTCG
TCCTTGGAAGCCGCATCCGCGATGAGCGTAGTCGAGTCTTTGCTTATGGTCACTTTACGA
GCGATACCCAACTGATCTATGGTTGTGTTCTCCACCAGCAGGCCCATGTCAAGTGCTTGG
TACTCAGCTCCTGTCAAGATAGCGATATCTTGAAGCATAGCTTTCCTCCTCTCTCCAAAT
CCAGGAGCTTCCACGGCGACAACGTTGAGAACACCACGGAGTTTGTTCACGACGAGAGTC
GCTAAGGCCTCTCCTGTAACATCCTCTGCGATGATCAGCAGTGGAGCACGAAGCTGAGTG
GTCTTCTCCAAGATTGGGATGATGTCTTTGATGGCAGTGATCTTCTGATCAGTGATCAAC
ACTCTAGCATTCTCGAACTCAACAAGTAGCTTCTCAGGGTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 
30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 20 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E137JQ U 28
AF RR2H768JQB U 1
AF RR2D849JQ U 3
AF RR2EZ57JQ U 54
AF RR2C236JQ U 5
AF RR2EZ57TF C 450
AF RR2H768TF C 455
BS 1 62 RR2H768JQB
BS 63 63 RR2D849JQ
BS 64 687 RR2H768JQB
BS 688 723 RR2D849JQ
BS 724 825 RR2C236JQ
BS 826 955 RR2EZ57TF
BS 956 1181 RR2H768TF

RD RR2E137JQ 626 0 0
A
GCAAAATCAGAACAATCCTTACTCAAAAAAAAAAA*GATAATTATTTCTCATTAAACAAA
CTCATTTCCCCCAGAGAAAAAATAACTTAAAAACATTGCAGATCGATAGATGGGGAACAA
GAGATACACATGTGCAACTTCATTACACCATGAGGCCCTCAGGTGCAGCAGCAGCAGCAG
CCTTAGGTTTAGGCTTGTCAACAACGATAGCCTGAGTGGTCAGCACCATCCCTGCAACCG
AAGCAGCGTTCTGAAGCGCACATCTCGTCACTTTAGCCGGATCAATCACTCCAGCTTCCA
ACAGATTCTCATAGGTATCAGTCATGGCGTTGTACCCTAGCTCCCATTCACTGAACATAA
TCTTATCCACCGCAACTTCTCCTTCAATCCCAGCGTTCTGCGCAATAAGCGCTGCTGGTG
CCACCAATGCCTTCTGTACTATATCAGCTCCCAGACGTTCATCAGCGTCCTCAAACGTCT
CCTTAATGGCAGGGATAACAGTGGAGAGATGCACCAGAGTCGCACCACCACCGGGGACTA
TCCCTTCCTCGATAGCAGCAAACGTCGCGTTCTTCGCGTCCTCGATACGAAGCTTACGGT
CCTCGAGCTCGGTTTCAGTCGCTGC

QA 2 626 2 626
DS 

RD RR2H768JQB 687 0 0
CGATACTAAACTTCCCAAGTTTTATTATGCAAAATCAGAACAATCCTTACTCAAAAAAAA
AA**GATAATTATTTCTCATTAAACAAACTCATTTCCCCCAGAGAAAAAATAACTTAAAA
ACATTGCAGATCGATAGATGGGGAACAAGAGATACACATGTGCAACTTCATTACACCATG
AGGCCCTCAGGTGCAGCAGCAGCAGCAGCCTTAGGTTTAGGCTTGTCAACAACGATAGCC
TGAGTGGTCAGCACCATCCCTGCAACCGAAGCAGCGTTCTGAAGCGCACATCTCGTCACT
TTAGCCGGATCAATCACTCCAGCTTCCAACAGATTCTCATAGGTATCAGTCATGGCGTTG
TACCCTAGCTCCCATTCACTGAACATAATCTTCTCCACCACAACTTCTCCTTCAATCCCA
GCGTTCTGCGCAATAAGCGCTGCTGGTGCCACCAATGCCTTCTGTACTATATCAGCTCCC
AGACGTTCATCAGCGTCCTCAAACGTCTCCTTAATGGCAGGGATAACAGTGGAGAGATGC
ACCAGAGTCGCACCACCACCGGGGACTATCCCTTCCTCGATAGCAGCAAACGTCGCGTTC
TTCGCGTCCTCGATACGGAGCTTACGGTCCTCCAACTCAGTTTCAGTCGCTGCTCCGACT
TTAATGACGGCGACACCACCAGAGAGT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2D849JQ 721 0 0
ATA
CTAAACTTCCCAAGTTTTATTATGCAAAATCAGAACAATCCTTACTCAAAAAAAAAAAAG
ATAATTATTTCTCATTAAACAAACTCATTTCCCCCAGAGAAAAAATAACTTAAAAACATT
GCAGATCGATAGATGGGGAACAAGAGATACACATGTGCAACTTCATTACACCATGAGGCC
CTCAGGTGCAGCAGCAGCAGCAGCCTTAGGTTTAGGCTTGTCAACAACGATAGCCTGAGT
GGTCAGCACCATCCCTGCAACCGAAGCAGCGTTCTGAAGCGCACATCTCGTCACTTTAGC
CGGATCAATCACTCCAGCTTCCAACAGATTCCCATAGGTATCAGTCATGGCGTTGTACCC
TAGCTCCCATTCACTGAACATAATCTTCTCCACCACAACTTCTCCTTCAATCCCAGCGTT
CCGCGCAATAAGCGCTGCTGGTGCCACCAATGCCTTCTGTACTATATCAGCTCCCAGACG
TTCATCAGCGTCCTCAAACGTCTCCTTAATGGCAGGGATAACAGTGGAGAGATGCACCAG
AGTCGCACCACCACCGGGGACTATCCCTTCCTCGATAGCAGCAAACGTCGCGTTCTTCGC
GTCCTCGATACGAAGCTTACGGTCCTCGAGCTCGGTTTCAGTCGCTGCTCCGACTTTAAT
GACGGCAACACCACCAGAGAGTTTGGCTATTCTCTCAGCGAGCTTCTCCGAGTCGTAC

QA 4 721 4 721
DS 

RD RR2EZ57JQ 677 0 0
CGAAC
AAAAAAAATAATTATTTCTCATTAAACAAACTCATTTCCCCCAGAGAAAAAATAACTTAA
AAACATTGCAGATCGATAGATGGGGAACAAGAGATACACATGTGCAACTTCATTACACCA
TGAGGCCCTCAGGTGCAGCAGCAGCAGCAGCCTTAGGTTTAGGCTTATCAACAACGATAG
CCTGAGTGGTCAGCACCATCCCTGCAACCGAAGCAGCGTTCTGAAGCGCACATCTCGTCA
CTTTAGCCGGATCAATCACTCCAGCTTCCAACAGATTCTCATAGGTATCAGTCATTGCGT
TGTACCCTAGCTCCCAT**ACTGAACATAATCTTCTCCACCACAACTTCTCCTTCAATCC
CAGCGTTCTGCGCAATAAGTGCTGCTGGTGCCACCAATGCCTTTTGTACTATATCAGCTC
CCAAACGTTCATCAGCGTCCTCAAACGTCTCCTTAATGGCAGGGATGACAGTGGAGAGAT
GCACCAGAGTCGCACCACCACCGGGGACTATCCCTTCCTCGATAGCAGCAAACGTCGCGT
TCTTCGCGTCCTCGATACGGAGCTTACGGTCCTCCAACTCAGTTTCAGTCGCTGCTCCGA
CTTTAATGACGGCGACACCACCAGAGAGTTTGGCTATTCTCTCAGCGAGCTTCTCCGAGT
CGTACACAGAGT

QA 6 677 6 677
DS 

RD RR2C236JQ 821 0 0
C
CTAAACTTCCCAAGTTTTATTATGCAAAATCAGAACAATCCTTACTCAAACAAAAAAA**
ATAATTATTTCTCATTAAACAAACTCATTTCCCCCAGAGAAAAAATAACTTAAAAACATT
GCAGATCGATAGATGGGGAACAAGAGATACACATGTGCAACTTCATTACACCATGAGGCC
CTCAGGTGCAGCAGCAGCAGCAGCCTTAGGTTTAGGCTTATCAACAACGATAGCCTGAGT
GGTCAGCACCATCCCTGCAACCGAAGCAGCGTTCTGAAGCGCACATCTCGTCACTTTAGC
CGGATCAATCACTCCAGCTTCCAACAGATTCTCATAGGTATCAGTCATTGCGTTGTACCC
TAGCTCCCATTCACTGAACATAATCTTCTCCACCACAACTTCTCCTTCAATACCAGCGTT
CTGCGCAATAAGTGCTGCTGGTGCCACCAATGCCTTTTGTACTATATCAGCTCCCAAACG
TTCATCAGCGTCCTCAAACGTCTCCTTAATGGCAGGGATGACAGTGGAGAGATGCACCAG
AGTCGCACCACCACCGGGGACTATCCCTTCCTCGATAGCAGCAAGCGTCGCGTTCTTCGC
GTCCTCGATACGGAGCTTACGGTCCTCCAACTCAGTTTCAGTCGCTGCTCCGACCTTAAT
GACGGCGACACCACCAGAGAGTTTGGCTATTCTCTCAGCGAGCTTCTCCGAGTCGTACAC
AGAGTCAGTCTCGAACAGTTCCTTCTTCAGCTGAGAGATACGAGCTTGCAACTCGTCCTT
GGAAGCCGCATCCGCGATGAGCGTAGTCGAGTCTTTGCTT

QA 2 821 2 821
DS 

RD RR2EZ57TF 509 0 0
CACCAATGCCTTTTGTACTATATCAGCTCCCAAACGTTCATCAGCGTCCTCAAACGTCTC
CTTAATGGCAGGGATGACAGTGGAGAGATGCACCAGAGTCGCACCACCACCGGGGACTAT
CCCTTCCTCGATAGCAGCAAACGTCGCGTTCTTCGCGTCCTCGATACGGAGCTTACGGTC
CTCCAACTCAGTTTCAGTCGCTGCTCCGACTTTAATGACGGCGACACCACCAGAGAGTTT
GGCTATTCTCTCAGCGAGCTTCTCCGAGTCGTACACAGAGTCAGTCTCGAACAGTTCCTT
CTTCAGCTGAGAGATACGAGCTTGCAACTCGTCCTTGGAAGCCGCATCCGCGATGAGCGT
AGTCGAGTCTTTGCTTATGGTCACTTTACGAGCGATACCCAACTGATCTATGGTTGTGTT
CTCCACCAGCAGGCCCATGTCAAGTGCTTGGTACTCAGCTCCTGTCAAGATAGCGATATC
TTGAAGCATAGCTTTCCTCCTCTCTC
TCC

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2H768TF 727 0 0
AATG
CTTCTGTACTATATCAGCTCCCAGACGTTCATCAGCGTC*TCAAACGTCTC*TTAATGGC
AGGGATAACAGTGGAGAGATGCACCAGAGTCGCACCACCACCGGGGACTATCCCTTCCTC
GATAGCAGCAAACGTCGCGTTCTTCGCGTCCTCGATACGGAGCTTACGGTCCTCCAACTC
AGTTTCAGTCGCTGCTCCGACTTTAATGACGGCGACACCACCAGAGAGTTTGGCTATTCT
CTCAGCGAGATTCTCCGAGTCGTACACAGAGTCAGTCTCGAACAGTTCCTTCTTCAGCTG
AGAGATACGAGCTTGCAACTCGTCCTTGGAAGCCGCATCCGCGATGAGCGTAGTCGAGTC
TTTGCTTATGGTCACTTTACGAGCGATACCCAACTGATCTATGGTTGTGTTCTCCACCAG
CAGGCCCATGTCAAGTGCTTGGTACTCAGCTCCTGTCAAGATAGCGATATCTTGAAGCAT
AGCTTTCCTCCTCTCTCCAAATCCAGGAGCTTCCACGGCGACAACGTTGAGAACACCACG
GAGTTTGTTCACGACGAGAGTCGCTAAGGCCTCTCCTGTAACATCCTCTGCGATGATCAG
CAGTGGAGCACGAAGCTGAGTGGTCTTCTCCAAGATTGGGATGATGTCTTTGATGGCAGT
GATCTTCTGATCAGTGATCAACACTCTAGCATTCTCGAACTCAACAAGTAGCTTCTCAGG
GTC

QA 5 727 5 727
DS 



AS 2 13

CO CL325Contig1 934 9 24 U
GGATGAAATGTCTATATATATTATTATTGTGTGTG**GTAATAATGACTTTTAACAATCA
TTTACAGTCATTTCACGGATTATTTTCTAAAGAATTATTTCGTAAAGAATTATTCGTTAT
ATCTTATAGCAGTATAAGATAAGTTCTATATTGGCGTACAATTGATTTCTTCACCATCCT
TGTCTTCATCCTCCATCATCACCAGGTTCTCTATGGTCTCGAGGAACGCCGTGACTTTCA
CCAAGCTCTTCTCATCAAGCCTGGGGACCGTGTGGCCTTTAGGATGATGGACTACCACCG
GATTCTTGAATGACTCTATCAGCTTGATTCCGTAAGGTTTCAAGAAATCAGTCTCTCCTA
GAAAGTGTAGGGAGGGAGTATCAATGGAAGGCGAATAAGCATCCTCCACAACCTCGGTAG
ATCTAAACATAGCTCCTCCAATAATGATGATAAACTTGATCTTTGGCACTTTCTGGAGTG
CAAGTCCCTTAGCTTGTAGTCCTGGTAAGCCCCCAGACAACATTCCCCCCTGAGAGAAGC
CAATGAGACCATCAAAGGGACCAAGCTTGATCATACGATCTTCCAAATACTCTAAACAGT
TCTCAAAATTCTCATACTCAGTGAACTCCTTGTTGAATTGGAACCACTCGTAATAAGGAG
GATCGAAGATTCCGTCGACATCAGATTTGCCTTGACAAGGAAATGGTGCGTCTAGGAACA
CGAGATCGAGTCTGTCGATAATAGCTTTAGGCCATCTGTGAAGCTGTATCTTCATTATCT
CTCCGCTCGTACGGAACCCATGGAGACATAGAAACCTTGGCTTCCTCACTATTGATCCTC
CTTCGCTTCCCATTTGTTTTTTTTTTCAAGACAATAAGTTCACAGTTTGGTCTTTGTTGT
GATAAAGCTCTGTCTTCTTCTTGCTTGCTCTTCC


BQ
25 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 40 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH72JQ U 1
AF RR2AH38JQ U 1
AF RR2FT35JQ U 1
AF RR2EL71JQ U 1
AF RR2EV88JQ U 1
AF RR2G974TF C 2
AF RR2B537JQ U 1
AF RR2B537TF C 90
AF RR2EV88TF C 274
BS 1 35 RR2B537JQ
BS 36 37 RR2CH72JQ
BS 38 73 RR2B537JQ
BS 74 74 RR2CH72JQ
BS 75 101 RR2B537JQ
BS 102 102 RR2CH72JQ
BS 103 141 RR2B537JQ
BS 142 142 RR2CH72JQ
BS 143 176 RR2B537JQ
BS 177 177 RR2CH72JQ
BS 178 214 RR2B537JQ
BS 215 215 RR2CH72JQ
BS 216 262 RR2B537JQ
BS 263 263 RR2CH72JQ
BS 264 280 RR2B537JQ
BS 281 281 RR2CH72JQ
BS 282 310 RR2B537JQ
BS 311 311 RR2CH72JQ
BS 312 496 RR2B537JQ
BS 497 497 RR2CH72JQ
BS 498 865 RR2B537JQ
BS 866 866 RR2EV88TF
BS 867 926 RR2B537TF
BS 927 934 RR2EV88TF

RD RR2CH72JQ 682 0 0
GGATGAAATGTCTATATATATTATTATTGTGTGTG**GTAATAATGACTTTTAACAATCA
TTTACAGTCATTTCACGGATTATTTTCTAAAGAATTATTTCGTAAAGAATTATTCGTTAT
ATCTTATAGCAGTATAAGATAAGTTCTATATTGGCGTACAATTGATTTCTTCACCATCCT
TGTCTTCATCCTCCATCATCACCAGGTTCTCTATGGTCTCGAGGAACGCCGTGACTTTCA
CCAAGCTCTTCTCATCAAGCCTGGGGACCGTGTGGCCTTTAGGATGATGGACTACCACCG
GATTCTTGAATGACTCTATCAGCTTGATTCCGTAAGGTTTCAAGAAATCAGTCTCTCCTA
GAAAGTGTAGGGAGGGAGTATCAATGGAAGGCGAATAAGCATCCTCCACAACCTCGGTAG
ATCTAAACATAGCTCCTCCAATAATGATGATAAACTTGATCTTTGGCACTTTCTGGAGTG
CAAGTCCCTTAACTTGTAGTCCTGGTAAGCCCCCAGACAACATTCCCCCCTGAGAGAAGC
CAATGAGACCATCAAAGGGACCAAGCTTGATCATACGATCTTCCAAATACTCTAAACAGT
TCTCAAAATTCTCATACTCAGTGGACTCCTTGTTGAATTGGAACCACTCGTAATAAGGAG
GATCGAAGATTCCGTCGACATC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2AH38JQ 680 0 0
GA
ATGAAATGTCTATATATATTATTATTGTGTGTG**GTAATAATGACTTTTAACAGTCATT
TACAGTCATTTCACGGATTATTTTCTAAAGAATTATTTCGTAAAGAATTATTCGTTATAT
CTTATAGCAGTATAAGATAAGTTCTATATTGGCGTACAATTGATTTCTTCACCATCCTTG
TCTTCATCCTCCATCATCACCAGGTTCTCTATGGTCTCGAGGAACGCCGTGACTTTCACC
AAGCTCTTCTCATCAAGCCTGGGGACCGTGTGGCCTTTAGGATGATGGACTACCACCGGA
TTCTTGAATGACTCTATCAGCTTGATTCCGTAAGGTTTCAAGAAATCAGTCTCTCCTAGA
AAGTGTAGGGAGGGAGTATCAATGGAAGGCGAATAAGCATCCTCCACAACCTCGGTAGAT
CTAAACATAGCTCCTCCAATAATGATGATAAACTTGATCTTTGGCACTTTCTGGAGTGCA
AGTCCCTTAGCTTGTAGTCCTGGTAAGCCCCCAGACAACATTCCCCCCTGAGAGAAGCCA
ATGAGACCATCAAAGGGACCAAGCTTGATCATACGATCTTCCAAATACTCTAAACAGTTC
TCAAAATTCTCATACTCAGTGAACTCCTTGTTGAATTGGAACCACTCGTAATAAGGAGGA
TCGAAGATTCCGTCGACA

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR2FT35JQ 719 0 0
GGATGAAATGTCTATATATATTATTATTGTGTGTG**GTAATAATGACTTTTAACAATCA
TTTACAGTCATTTCGCGGATTATTTTCTAAAGAATTATTTCGTAAAGAATTATTCGTTAT
ATCTTATAGCAGTATAAGATAAGTTCTATATTGGCGTACAATTGATTTCTTCACCATCCT
TGTCTTCATCCTCCATCATCACCAGGTTCTCTATGGTCTCGAGGAACGCCGTGACTTTCA
CCAAGCTCTTCTCATCAAGCCTGGGGACCGTGTGGCCTTTAGGATGATGGACTACCACCG
GATTCTTGAATGACTCTATCAGCTTGATTCCGTAAGGTTTCAAGAAATCAGTCTCTCCTA
GAAAGTGTAGGGAGGGAGTATCAATGGAAGGCGAGTAAGCATCCTCCACAACCTCGGTAG
ATCTAAACATAGCTCCTCCAATAATGATGATAAACTTGATCTTTGGCACTTTCTGGAGTG
CAAGTCCCTTAGCTTGTAGTCCTGGTAAGCCCCCAGACAACATTCCCCCCTGAGAGAAGC
CAATGAGACCATCAAAGGGACCAAGCTTGATCATACGATCTTCCAAATACTCTAAACAGT
TCTCAAAATTCTCATACTCAGTGAACTCCTTGTTGAATTGGAACCACTCGTAATAAGGAG
GATCGAAGATTCCGTCGACATCAGATTTGCCTTGACAAGGAAATGGTGCGTCTAGGAAC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2EL71JQ 767 0 0
GGATGAAATGTCTATATATATTATTATTGTGTGTG**GTAATAATGACTTTTAACAATCA
TTTACAGTCATTTCACGGATTATTTTCTAAAGAATTATTTCGTAAAGAATTATTCGTTAT
ATCTTATAGCAGTATAAGATAAGTTCTATATTGGCGTACAATTGATTTCTTCACCATCCT
TGTCTTCATCCTCCATCATCACCAGGTTCTCTATGGTCTCGAGGAACGCCGTGACTTTCA
CCAAGCTCTTCTCATCAAGCCTGGGGACCGTGTGGCCTTTAGGATGGTGGACTACCACCG
GATTCTTGAATGACTCTATCAGCTTGATTCCGTAAGGTTTCAAGAAATCAGTCTCTCCTA
GGAAGTGTAGGGAGGGAGTATCAATGGAAGGCGAATAAGCATCCTCCACAACCTCGGTAG
ATCTAAACATAGCTCCTCCAATAATGATGATAAACTTGATCTTTGGCACTTTCTGGAGTG
CAAGTCCCTTAGCTTGTAGTCCTGGTAAGCCCCCAGACAACATTCCCCCCTGAGAGAAGC
CAATGAGACCATCAAAGGGACCAAGCTTGATCATACGATCTTCCAAATACTCTAAACAGT
TCTCAAAATTCTCATACTCAGTGAACTCCTTGTTGAATTGGAACCACTCGTAATAAGGAG
GATCGAAGATTCCGTCGACATCAGATTTGCCTTGACAAG*AAATGGTGCGTCTAGGAACA
CGAGATCGAGTCTGTCGATAATAGCTTTAGGCCATCTGTGAAGCTGT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2EV88JQ 746 0 0
GA
ATGAAATGTCTATATATATTATTATTGTGTGTGTGGTAATAATGACTTTTAACAATCATT
TACAGTCATTTTACGGATTATTTTCTAAAGAATTATTTCATAAAGAATTATTCGTTATAT
CTTATAGCAGTATAAGATAAGTTCTATATTGGCGTACAATTGATTTCTTCACCACCCTTG
TCTTCATCCTCCATCATCACCAGGTTCTCTATAGTCTCGAGGAACGCCGTGACTTTCACC
AAGCTCTTCTCATCAAGCCTAGGGACCGTGTGGCCTTTGGGATGATGGACTACCACCGGA
TTCTTGAACGACTCTATCAGCTTGATTCCGTAAGGTTTCAAGAAATCAGTCTCTCCTAGA
AAGTGTAGGGAGGGAGTATCAATGGAAGGCGAATAAGCATCCTCCACAACCTCGGTAGAT
CTAAACATAGCTCCTCCAATAATGATGATAAACTTGATCTTTGGCACTTTCTGGAGTGCA
AGCCCCTTAGCTTGCAGTCCTGGTAAGCCCCCAGACAACATTCCCCCCTGAGAGAAGCCA
ATGAGACCATCAAAGGGACCAAGCTTGATCATACGATCTTCCAAATACTCTAAACAGTTC
TCAAAATTCTCATACTCAGTGAACTCCTTGTTGAATTGGAACCACTCGTAATAAGGAGGA
TCGAAGATTCCGTCGACATCAGATTTGCCTTGACAAGGAAATGGTGCGTCTAGGAACACG
AGATCGAGTCTGTCGATAATAGCT

QA 3 746 3 746
DS 

RD RR2G974TF 799 0 0
A
ATGAAATGTCTATATATATTATTAT*GTGTGTG***TAATAATGACTTT*AACAATCATT
TACAGTCATTTCACGGATTATTT*CTAAAGAATTATTTCGTAAAGAATTATTCGTTATAT
CTTATAGCAGTATAAGATAAGTTCTATATTGGCGTACAATTGATTTCTTCACCATC*TTG
TCTTCATCCTCCATCATCACCAGGTTCTCTATGGTCTCGAGGAACGCCGTGACTTTCACC
AAGCTCTTCTCATCAAGCCTGGGGACCGTGTGGCCTTTAGGATGATGGACTGCCACCGGA
TTCTTGTATGACTCTATCAGCTTGATTCCGTAAGGTTTCAAGAAATCAGTCTCTCCTAGA
AAGTGTAGGGAGGGAGTATCAATGGAAGGCGAATAAGCATCCTCCACAACCTCGGTAGAT
CTAAACATAGCTCCTCCAATAATGATGATAAACTTGATCTTTGGCACTTTCTGGAGTGCA
AGTCCCTTAGCTTGTAGTCCTGGTAAGCCCCCAGACAACATTCCCCCCTGAGAGAAGCCA
ATGAGACCATCAAAGGGACCAAGCTTGATCATACGATCTTCCAAATACTCTAAACAGTTC
TCAAAATTCTCATACTCAGTGAACTCCTTGTTGAATTGGAACCACTCGTAATAAGGAGGA
TCGAAGATTCCGTCGACATCAGATTTGCCTTGACAAGGAAATGGTGCGTCTAGGAACACG
AGATCGAGTCTGTCGATAATAGCTTTAGGCCATCTGTGAAGCTGTATCTTCATTATATCT
CCGCTCGTACGGAACCC
C

QA 2 798 2 798
DS 

RD RR2B537JQ 879 0 0
GGATGAAATGTCTATATATATTATTATTGTGTGTGTGGTAATAATGACTTTTAACAATCA
TTTACAGTCATTTTACGGATTATTTTCTAAAGAATTATTTCATAAAGAATTATTCGTTAT
ATCTTATAGCAGTATAAGATAGGTTCTATATTGGCGTACAATTGATTTCTTCACCACCCT
TGTCTTCATCCTCCATCATCACCAGGTTCTCTATAGTCTCGAGGAACGCCGTGACTTTCA
CCAAGCTCTTCTCATCAAGCCTAGGGACCGTGTGGCCTTTGGGATGATGGACTACCACCG
GATTCTTGAACGACTCTATCAGCTTGATTCCGTAAGGTTTCAAGAAATCAGTCTCTCCTA
GAAAGTGTAGGGAGGGAGTATCAATGGAAGGCGAATAAGCATCCTCCACAACCTCGGTAG
ATCTAAACATAGCTCCTCCAATAATGATGATAAACTTGATCTTTGGCACTTTCTGGAGTG
CAAGTCCCTTAGCTTGCAGTCCTGGTAAGCCCCCAGACAACATTCCCCCCTGAGAGAAGC
CAATGAGACCATCAAAGGGACCAAGCTTGATCATACGATCTTCCAAATACTCTAAACAGT
TCTCAAAATTCTCATACTCAGTGAACTCCTTGTTGAATTGGAACCACTCGTAATAAGGAG
GATCGAAGATTCCGTCGACATCAGATTTGCCTTGACAAGGAAATGGTGCGTCTAGGAACA
CGAGATCGAGTCTGTCGATAATAGCTTTAGGCCATCTGTGAAGCTGTATCTTCATTATCT
CTCCGCTCGTACGGAACCCATGGAGACATAGAAACCTTGGCTTCCTCACTATTGATCCTC
CTTCGCTTCCCATTTGTTTTTTTTT
CAAGACAATAAGTT

QA 1 865 1 865
DS 

RD RR2B537TF 840 0 0
AAGAATTATTTCATAAAGAATTATTCGTTATATCTTATAGCAGTATAAGATAGGTTCTAT
ATTGGCGTACAATTGATTTCTTCACCACCCTTGTCTTCATCCTCCATCATCACCAGGTTC
TCTATAGTCTCGAGGAACGCCGTGACTTTCACCAAGCTCTTCTCATCAAGCCTAGGGACC
GTGTGGCCTTTGGGATGATGGACTACCACCGGATTCTTGAACGACTCTATCAGCTTGATT
CCGTAAGGTTTCAAGAAATCAGTCTCTCCTAGAAAGTGTAGGGAGGGAGTATCAATGGAA
GGCGAATAAGCATCCTCCACAACCTCGGTAGATCTAAACATAGCTCCTCCAATAATGATG
ATAAACTTGATCTTTGGCACTTTCTGGAGTGCAAGTCCCTTAGCTTGCAGTCCTGGTAAG
CCCCCAGACAACATTCCCCCCTGAGAGAAGCCAATGAGACCATCAAAGGGACCAAGCTTG
ATCATACGATCTTCCAAATACTCTAAACAGTTCTCAAAATTCTCATACTCAGTGAACTCC
TTGTTGAATTGGAACCACTCGTAATAAGGAGGATCGAAGATTCCGTCGACATCAGATTTG
CCTTGACAAGGAAATGGTGCGTCTAGGAACACGAGATCGAGTCTGTCGATAATAGCTTTA
GGCCATCTGTGAAGCTGTATCTTCATTATCTCTCCGCTCGTACGGAACCCATGGAGACAT
AGAAACCTTGGCTTCCTCACTATTGATCCTCCTTCGCTTCCCATTTGTTTTTTTTT*CAA
GACAATAAGTTCACAGTTTGGTCTTTGTTGTGATAAAGCTCTGTCTTCTTCTTGCTT
CCC

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR2EV88TF 661 0 0
TGG
CTTTGGGATGATGGACTACCACCGGATTCTTGAACGACTCTATCAGCTTGATTCCGTAAG
GTTTCAAGAAATCAGTCTCTCCTAGAAAGTGTAGGGAGGGAGTATCAATGGAAGGCGAAT
AAGCATCCTCCACAACCTCGGTAGATCTAAACATAGCTCCTCCAATAATGATGATAAACT
TGATCTTTGGCACTTTCTGGAGTGCAAGCCCCTTAGCTTGCAGTCCTGGTAAGCCCCCAG
ACAACATTCCCCCCTGAGAGAAGCCAATGAGACCATCAAAGGGACCAAGCTTGATCATAC
GATCTTCCAAATACTCTAAACAGTTCTCAAAATTCTCATACTCAGTGAACTCCTTGTTGA
ATTGGAACCACTCGTAATAAGGAGGATCGAAGATTCCGTCGACATCAGATTTGCCTTGAC
AAGGAAATGGTGCGTCTAGGAACACGAGATCGAGTCTGTCGATAATAGCTTTAGGCCATC
TGTGAAGCTGTATCTTCATTATCTCTCCGCTCGTACGGAACCCATGGAGACATAGAAACC
TTGGCTTCCTCACTATTGATCCTCCTTCGCTTCCCATTTGTTTTTTTTTTCAAGACAATA
AGTTCACAGTTTGGTCTTTGTTGTGATAAAGCTCTGTCTTCTTCTTGCTTGCTCTTCC

QA 4 661 4 661
DS 



CO CL325Contig2 698 4 12 U
GGAAGCTAGAAGAAGACAGAGCTTTATCACAGGAGAGACCAAAACTGTGAACGTTTGTCT
GAAATAAAAAAGAAACAAATGGGAAGCGAAGGAGGATCGGTAGCGAGGAAACCAAGGTTT
CTGTGTCTCCATGGGTTCCGTACGAGCGGAGAGATAATGAAGATACAGCTTCACAGATGG
CCTAAAGCTATTATCGACAGACTCGATCTCGTGTTCCTAGACGCACCATTTCCTTGTCAA
GGCAAATCTGATGTCGACGGAATCTTCGATCCTCCTTATTACGAGTGGTTCCAATTCAAC
AAGGAGTTCACTGAGTATGAGAATTTTGAGAACTGTTTAGAGTATTTGGAAGATCGTATG
ATCAAGCTTGGTCCCTTTGATGGTCTCATTGGCTTCTCTCAGGGGGGAATGTTGTCTGGG
GGCTTACCAGGACTACAAGCTAAGGGACTTGCACTCCAGAAAGTGCCAAAGATCAAGTTT
ATCATCATTATTGGAGGAGCTATGTTTAGATCTACCGAGGTTGTGGAGGATGCTTATTCG
CCTTCCATTGATACTCCCTCCCTACACTTTCTAGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTAC
GGAATCAAGCTGATAGAGTCATTCAAGAATCCGGTGGTAGTCCATCATCCTAAAGGCCAC
ACGGTCCCCAGGCTTGATGAGAAGAGCTTGGTGAAAGT


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL71TF U 1
AF RR2AH38TF U 1
AF RR2CH72TF U -4
AF RR2FT35TF U 1
BS 1 64 RR2EL71TF
BS 65 66 RR2CH72TF
BS 67 107 RR2EL71TF
BS 108 108 RR2CH72TF
BS 109 232 RR2EL71TF
BS 233 233 RR2CH72TF
BS 234 569 RR2EL71TF
BS 570 570 RR2CH72TF
BS 571 644 RR2EL71TF
BS 645 645 RR2CH72TF
BS 646 650 RR2EL71TF
BS 651 698 RR2CH72TF

RD RR2EL71TF 650 0 0
GGAAGCTAGAAGAAGACAGAGCTTTATCACAGGAGAGACCAAAACTGTGAACGTTTGTCT
GAAA**AAAAAGAAACAAATGGGAAGCGAAGGAGGATCGGTAGCGAGAAAACCAAGGTTT
CTGTGTCTCCATGGGTTCCGTACGAGCGGAGAGATAATGAAGATACAGCTTCACAGATGG
CCTAAAGCTATTATCGACAGACTCGATCTCGTGTTCCTAGACGCACCATTTC*TTGTCAA
GGCAAATCTGATGTCGACGGAATCTTCGATCCTCCTTATTACGAGTGGTTCCAATTCAAC
AAGGAGTTCACTGAGTATGAGAATTTTGAGAACTGTTTAGAGTATTTGGAAGATCGTATG
ATCAAGCTTGGTCCCTTTGATGGTCTCATTGGCTTCTCTCAGGGGGGAATGTTGTCTGGG
GGCTTACCAGGACTACAAGCTAAGGGACTTGCACTCCAGAAAGTGCCAAAGATCAAGTTT
ATCATCATTATTGGAGGAGCTATGTTTAGATCTACCGAGGTTGTGGAGGATGCTTATTCG
CCTTCCATTGATACTCCCTCCCTACACTTCCTAGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTAC
GGAATCAAGCTGATAGAGTCATTCAAGAATCCGGTGGTAGTCCACCATCC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2AH38TF 651 0 0
GG
AAGCTAGAAGAAGACAGAGCTTTATCACAGGAGAGACCAAAACTGTGAACGTTTGTCTGA
AATAAAAAAGAAACAAATGGGAAGCGAAGGAGGATCGGTAGCGAGGAAACCAAGGTTTCT
GTGTCTCCATGGGTTCCGTACGAGCGGAGAGATAATGAAGATACAGCTTCACAGATGGCC
TAAAGCTATTATCGACAGACTCGATCTCGTGTTCCTAGACGCACCATTTCCTTGTCAAGG
CAAATCTGATGTCGACGGAATCTTCGATCCTCCTTATTACGAGTGGTTCCAATTCAACAA
GGAGTTCACTGAGTATGAGAATTTTGAGAACTGTTTAGAGTATTTGGAAGATCGTATGAT
CAAGCTTGGTCCCTTTGATGGTCTCATTGGCTTCTCTCAGGGGGGAATGTTGTCTGGGGG
CTTACCAGGACTACAAGCTAAGGGACTTGCACTCCAGAAAGTGCCAAAGATCAAGTTTAT
CATCATTATTGGAGGAGCTATGTTTAGATCTACCGAGGTTGTGGAGGATGCTTATTCGCC
TTCCATTGATACTCCCTCCCTACACTTTCTAGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTACGG
AATCAAGCTGATAGAGTCATTCAAGAATCCGGTGGTAGTCCATCATCCT

QA 3 651 3 651
DS 

RD RR2CH72TF 703 0 0
GGAAAGC
AAGCTAGAAGAAGACAGAGCTTTATCACAGGAGAGACCAAAACTGTGAACGTTTGTCTGA
AATAAAAAAGAAACAAATGGGAAGCGAAGGAGGATCGGTAGCGAGGAAACCAAGGTTTCT
GTGTCTCCATGGGTTCCGTACGAGCGGAGAGATAATGAAGATACAGCTTCACAGATGGCC
TAAAGCTATTATCGACAGACTCGATCTCGTGTTCCTAGACGCACCATTTCCTTGTCAAGG
CAAATCTGATGTCGACGGAATCTTCGATCCTCCTTATTACGAGTGGTTCCAATTCAACAA
GGAGTCCACTGAGTATGAGAATTTTGAGAACTGTTTAGAGTATTTGGAAGATCGTATGAT
CAAGCTTGGTCCCTTTGATGGTCTCATTGGCTTCTCTCAGGGGGGAATGTTGTCTGGGGG
CTTACCAGGACTACAAGCTAAGGGACTTGCACTCCAGAAAGTGCCAAAGATCAAGTTTAT
CATCATTATTGGAGGAGCTATGTTTAGATCTACCGAGGTTGTGGAGGATGCTTATTCGCC
TTCCATTGATACTCCCTCCCTACACTTTCTAGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTACGG
AATCAAGCTGATAGAGTCATTCAAGAATCCGGTGGTAGTCCATCATCCTAAAGGCCACAC
GGTCCCCAGGCTTGATGAGAAGAGCTTGGTGAAAGT

QA 8 703 8 703
DS 

RD RR2FT35TF 690 0 0
GG
AAGCTAGAAGAAGACAGAGCTTTATCACAGGAGAGACCAAAACTGTGAACGTTTGTCTAA
AATAAAAAAGAAACAAATGGGAAGCGAAGGAGGATCGGTAGCGAGGAAACCAAGGTTTCT
GTGTCTCCATGGGTTCCGTACGAGCGGAGAGATAATGAAGATACAGCTTCACAGATGGCC
TAAAGCTATTATCGACAGACTCGATCTCGTGTTCCTAGACGCACCATTTCCTTGTCAAGG
CAAATCTGATGTCGACGGAATCTTCGATCCTCCTTATTACGAGTGGTTCCAATTCAACAA
GGAGTTCACTGAGTATGAGAATTTTGAGAACTGTTTAGAGTATTTGGAAGATCGTATGAT
CAAGCTTGGTCCCTTTGATGGTCTCATTGGCTTCTCTCAGGGGGGAATGTTGTCTGGGGG
CTTACCAGGACTACAAGCTAAGGGACTTGCACTCCAGAAAGTGCCAAAGATCAAGTTTAT
CATCATTATTGGAGGAGCTATGTTTAGATCTACCGAGGTTGTGGAGGATGCTTACTCGCC
TTCCATTGATACTCCCTCCCTACACTTTCTAGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTACGG
AATCAAGCTGATAGAGTCATTCAAGAATCCGGTGGTAGTCCATCATCCTAAAGGCCACAC
GGTCCCCAGGCTTGATGAGAAGAGCTTG

QA 3 690 3 690
DS 



AS 2 13

CO CL326Contig1 841 2 6 U
GAAAATTGTAAGAGCTGTGAATTTATTTCTCGATTGTTGCTGTTTTTAAGCTCTTTAACT
TTCAAAAAGCTTCGTTTTGGAGGAAACAATGAACAAACTCACCTTATATAGGTCTTTGGT
CAGTTATTGACCTTTATTATGTCTTAAGGACACAATAACGCAGAGAAAAAAAACATATAA
ATTTGTTTTATGCCCTTTGTTCCACGTAAGACCCCGAGAGTCCTGAGGTTCCAAGAACGG
TAACCTTTCCCCATTCTGAACCAAGCCCGCTGCATCTCATCTTCAAGTGGATCATCTTTG
TTCCCAACTCCATCTCAACCTTCTTCTTCAAGTAAACTTCTTCAGGTCCAAAAGCATCTA
GGTAGGTAGTATACCTTTGATAAGCAAGACGCAGCGCTTTGGTTATATCTTCAGGTAAGG
TCTTCACATTCTCACCACTCATTCCAATGCTATCATCGATCTCCATCTTTAAGGAAGTGA
GAATCCCACCAAATTCCTCAACAGCCTCAGCTGCTCTGAACACATTCATCAAAGCCTCTT
GTCCTTCCTTGTCATCTGTGTTTTTCGAGACTGCGTTTTTGGCGTCTTTAACAACAGCAG
AAGGTAGCGCTGCCCAATCTGCCGCCATCAATTCTCTGAAAGCGTTCAGAATATCACTGT
CTCTGATCTCAGGCATGTGAGACACATCTTCGCTAAAGCTGCGCACTTGTCCAATATTCA
TTGCTCTAGGATACCGAGAATCGTAAGGAGTTCGATTAGAAGGAAACGAAGAAACAGCGA
AGAATCCTCGCGTTGAGAGGAAACGATGGCGCAACAGCTGACTGGGAGCGGTGGTTCTGG
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2GI16JQB U 1
AF RR2AL47TF C 201
BS 1 433 RR2GI16JQB
BS 434 434 RR2AL47TF
BS 435 662 RR2GI16JQB
BS 663 663 RR2AL47TF
BS 664 710 RR2GI16JQB
BS 711 841 RR2AL47TF

RD RR2GI16JQB 710 0 0
GAAAATTGTAAGAGCTGTGAATTTATTTCTCGATTGTTGCTGTTTTTAAGCTCTTTAACT
TTCAAAAAGCTTCGTTTTGGAGGAAACAATGAACAAACTCACCTTATATAGGTCTTTGGT
CAGTTATTGACCTTTATTATGTCTTAAGGACACAATAACGCAGAGAAAAAAAACATATAA
ATTTGTTTTATGCCCTTTGTTCCACGTAAGACCCCGAGAGTCCTGAGGTTCCAAGAACGG
TAACCTTTCCCCATTCTGAACCAAGCCCGCTGCATCTCATCTTCAAGTGGATCATCTTTG
TTCCCAACTCCATCTCAACCTTCTTCTTCAAGTAAACTTCTTCAGGTCCAAAAGCATCTA
GGTAGGTAGTATACCTTTGATAAGCAAGACGCAGCGCTTTGGTTATATCTTCAGGTAAGG
TCTTCACATTCTCCCCACTCATTCCAATGCTATCATCGATCTCCATCTTTAAGGAAGTGA
GAATCCCACCAAATTCCTCAACAGCCTCAGCTGCTCTGAACACATTCATCAAAGCCTCTT
GTCCTTCCTTGTCATCTGTGTTTTTCGAGACTGCGTTTTTGGCGTCTTTAACAACAGCAG
AAGGTAGCGCTGCCCAATCTGCCGCCATCAATTCTCTGAAAGCGTTCAGAATATCACTGT
CTTTGATCTCAGGCATGTGAGACACATCTTCGCTAAAGCTGCGCACTTGT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2AL47TF 641 0 0
TCCACGTAAGACCCCGAGAGTC*TGAGGTTCCAAGAACGGTAACCTTTCCCCATTCTGAA
CCAAGCCCGCTGCATCTCATCTTCAAGTGGATCATCTTTGTTCCCAACTCCATCTCAACC
TTCTTC***AAGTAAACTTCTTCAGGTCCAAAAGCATCTAGGTAGGTAGTATACCTTTGA
TAAGCAAGACGCAGCGCTTTGGTTATATCTTCAGGTAAGGTCTTCACATTCTCACCACTC
ATTCCAATGCTATCATCGATCTCCATCTTTAAGGAAGTGAGAATCCCACCAAATTCCTCA
ACAGCCTCAGCTGCTCTGAACACATTCATCAAAGCCTCTTGTCCTTCCTTGTCATCTGTG
TTTTTCGAGACTGCGTTTTTGGCGTCTTTAACAACAGCAGAAGGTAGCGCTGCCCAATCT
GCCGCCATCAATTCTCTGAAAGCGTTCAG**TATCACTGTCTCTGATCTCAGGCATGTGA
GACACATCTTCGCTAAAGCTGCGCACTTGTCCAATATTCATTGCTCTAGGATACCGAGAA
TCGTAAGGAGTTCGATTAGAAGGAAACGAAGAAACAGCGAAGAATCCTCGCGTTGAGAGG
AAACGATGGCGCAACAGCTGACTGGGAGCGGTGGTTCTGGA

QA 1 641 1 641
DS 



CO CL326Contig2 978 11 12 U
GGATTCTCCGAAGGTTGAGAGAGAGAGAGAGCTTTCGCATTACAGCAGATTTGAGAAGAG
CGAAAAATCTAAGATGGCATTTCTGAGATCCCTCTGCCGTACCGCTGCGGCGGCCACCGT
CGCTACGCTCCGATCATCCAGATCCGCCGCTCCCAGTCATCTATTGCGCCATCGTTTCCT
CTCAACGCGAGGATTCTTCGCTGTTTCTTCGTTTCCTTCTAATCGAACTCCTTACGATTC
TCGGTATCCTCGAGCAATGGATATTGGACAAGTGCGCAGCTTTAGCGAAGATGTGTCTCA
CATGCCTGAGATCAAAGACAGTGATATTCTGAAAGCTTTCAGAGAATTGATGGCTGCAGA
TTGGGCAGCGCTACCTTCTGCTGTTGTTAAAGACGCCAAAAACGCAGTCTCGAAAAACAC
AGATGACAAGGAAGGGCAAGAGGCTTTGATGAATGTGTTCAGAGCAGCTGAGGCGGTTGA
GGAATTTGGTGGGATTCTCACTTCCTTAAAGATGGAGATCGATGATAGCATTGGAATGAG
TGGGGAGAATGTGAAGACCTTACCTGAAGATATAACCAAGGCGCTGCGTCTTGCTTATCA
AAGGTATACTACCTACCTAGATGCTTTT*GGACCTGAAGAAGTTTACTTGAAGAAGAAGG
TTGAGACGGAGTTGGGAACAAAGATGATCCACTT*GAAGATGAGATGCAGCGGGCTTGGT
TCAGAATGGGGAAAGGTTACCGTTCTTGGAACCTCAGGACTCTCGGGGTCTTACGTGGAG
CAAAGGGCATAAAACAAATTTTATATGTTTTTTTCTGCGTTATTGTGTCCTTAAGACATA
ATAAAGGTCAATAACTGACCAAAGACCTATGTAAGGTGAGTTTGTTCATTGTTTCCTCCA
AAACAAAGCTTTTGAAAGTTAGAGCTTAAAAACAGCACCAATTGAAAAATAAATTCACAG
CTCCGACAATTTTTAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 10 35 10 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 30 
20 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 20 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 35 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 65 65 50 65 
65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 25 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 5 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 15 
60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 35 35 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 25 25 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI16TF U 16
AF RR2H806TF U 1
AF RR2FH65TF U 45
AF RR2BB28TF U 24
AF RR2AO56TF U 29
AF RR2BW76TF U 37
AF RR2BI92JQ C 251
AF RR2BI92TF U 251
AF RR2BB28JQ C 83
AF RR2H806JQ C 301
AF RR2AO56JQ C 224
BS 1 285 RR2H806TF
BS 286 286 RR2GI16TF
BS 287 659 RR2H806TF
BS 660 660 RR2BB28TF
BS 661 661 RR2AO56TF
BS 662 731 RR2H806TF
BS 732 757 RR2BB28TF
BS 758 758 RR2BI92TF
BS 759 840 RR2BB28TF
BS 841 899 RR2BI92TF
BS 900 942 RR2BB28JQ
BS 943 978 RR2AO56JQ

RD RR2GI16TF 582 0 0
GGGAGACTT
GAGAGAGCTTTCGCATTACAGCAGATTTGAGAACAACGAAAAATCTAAGATGGCATTTCT
GAGATCCCTCTGCCGTACCGCTGCGGCGGCCACCGTGGCGACGCTCCGATCATCCAGATC
CACCGCTCCCAGTCAGCTGTTGCGCCATCGTTTCCTCTCAACGCGAGGATTCTTCGCTGT
TTCTTCGTTTCCTTCTAATCGAACTCCTTACGATTCTCGGTATCCTAGAGCAATGAATAT
TGGACAAGTGCGCAGCTTTAGCGAAGATGTGTCTCACATGCCTGAGATCAAAGACAGTGA
TATTCTGAACGCTTTCAGAGAATTGATGGCGGCAGATTGGGCAGCGCTACCTTCTGCTGT
TGTTAAAGACGCCAAAAACGCAGTCTCGAAAAACACAGATGACAAGGAAGGACAAGAGGC
TTTGATGAATGTGTTCAGAGCAGCTGAGGCTGTTGAGGAATTTGGTGGGATTCTCACTTC
CTTAAAGATGGAGATCGATGATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATGTGAAGACCTTACC
TGAAGATATAACCAAAGCGCTGCGTCTTGCTTA

QA 10 582 10 582
DS 

RD RR2H806TF 731 0 0
GGATTCTCCGAAGGTTGAGAGAGAGAGAGAGCTTTCGCATTACAGCAGATTTGAGAAGAG
CGAAAAATCTAAGATGGCATTTCTGAGATCCCTCTGCCGTACCGCTGCGGCGGCCACCGT
CGCTACGCTCCGATCATCCAGATCCGCCGCTCCCAGTCATCTATTGCGCCATCGTTTCCT
CTCAACGCGAGGATTCTTCGCTGTTTCTTCGTTTCCTTCTAATCGAACTCCTTACGATTC
TCGGTATCCTCGAGCAATGGATATTGGACAAGTGCGCAGCTTTAGTGAAGATGTGTCTCA
CATGCCTGAGATCAAAGACAGTGATATTCTGAAAGCTTTCAGAGAATTGATGGCTGCAGA
TTGGGCAGCGCTACCTTCTGCTGTTGTTAAAGACGCCAAAAACGCAGTCTCGAAAAACAC
AGATGACAAGGAAGGGCAAGAGGCTTTGATGAATGTGTTCAGAGCAGCTGAGGCGGTTGA
GGAATTTGGTGGGATTCTCACTTCCTTAAAGATGGAGATCGATGATAGCATTGGAATGAG
TGGGGAGAATGTGAAGACCTTACCTGAAGATATAACCAAGGCGCTGCGTCTTGCTTATCA
AAGGTATACTACCTACCTAGATGCTTTT*GGACCTGAAGAAGTTTACTTGAAGAAGAAGT
*TGAGACGGAGTTGGGAACAAAGATGATCCACTT*GAAGATGAGATGCAGCGGGCTTGGT
TCAGAATGGGG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2FH65TF 694 0 0
GG
AGATTTGAGAACAACGAAAAATCTAAGATGGCATTTCTGAGATCCCTCTGCCGTACCGCT
GCGGCGGCCACCGTGGCGACGCTCCGATCATCCAGATCCACCGCTCCCAGTCAGCTGTTG
CGCCATCGTTTCCTCTCAACGCGAGGATTCTTCGCTGTTTCTTCGTTTCCTTCTAATCGA
ACTCCTTACGATTCTCGGTATCCTAGAGCAATGAATATTGGACAAGTGCGCAGCTTTAGC
GAAGATGTGTCTCACATGCCTGAGATCAAAGACAGTGATATTCTGAACGCTTTCAGAGAA
TTGATGGCGGCAAATTGGGCAGCGCTACCTTCTGCTGTTGTTAAAGACGCCAAAAACGCA
GTCTCGAAAAACACAGATGACAAGGAAGGACAAGAGGCTTTGATGAATGTGTTCAGAGCA
GCTGAGGCTGTTGAGGAATTTGGTGGGATTCTCACTTCCTTAAAGATGGAGATCGATGAT
AGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATGTGAAGACCTTACCTGAAGATATAACCGAAGCGCTG
CGTCTTGCTTATCAAAGGTATACTACCTACCTAGATGCTTTT*GGACCTGAAGAAGTTTA
CTTGAAGAAGAAGGTTGAGATGGAGTTGGGAACAAAGATGATCCACTT*GAAGATGAGAT
GCAGCGGGCTTGGTTCAGA*TGGGGAAAGGT
A

QA 3 693 3 693
DS 

RD RR2BB28TF 817 0 0
GGAGAGA
GCTTTCGCATTACAGCAGATTTGAGAAGAGCGAAAAATCTAAGATGGCATTTCTGAGATC
CCTCTGCCGTACCGCTGCGGCGGCCACCGTCGCTACGCTCCGATCATCCAGATCCGCCGT
TCCCAGTCATCTATTGCGCCATCGTTTCCTCTCAACGCGAGGATTCTTCGCTGTTTCTTC
GTTTCCTTCTAATCGAACTCCTTACGATTCTCGGTATCCTCGAGCAATGGATATTGGACA
AGTGCGCAGCTTTAGTGAAGATGTGTCTCACATGCCTGAGATCAAAGACAGTGATATTCT
GAAAGCTTTCAGAGAATTGATGGCTGCAGATTGGGCAGCGCTACCTTCCGCTGTTGTTAA
AGACGCCAAAAACGCAGTCTCGAAAAGCACAGATGACAAGGAAGGGCAAGAGGCTTTGAT
GAATGTGTTCAGAGCAGCTGAGGCGGTTGAGGAATTTGGTGGGATTCTCACTTCCTTAAA
GATGGAGATCGATGATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATGTGAAGACCTTGCCTGAAGA
TATAACCAAGGCGCTGCGTCTTGCTTATCAAAGGTATACTACCTACCTAGATGCTTTTTG
GACCTGAAGAAGTTTACTTGAAGAAGAAGGCTGAGACGGAGTTGGGAACAAAGATGATCC
ACTTTGAAGATGAGATGCCGCGGGCTTGGTTCAGAATGGGGAAAGGTTACCGTTCTTGGA
ACCTCAG*ACTCTCGGGGTCTTACGTGGAGCAAAGGGCATAAAACAAATTTTATATGTTT
TTTTCTGCGTTATTGTGTCCTTAAGACATA

QA 8 817 8 817
DS 

RD RR2AO56TF 812 0 0
GG
GCTTTCGCATTACAGCAGATTTGAGAAGAGCGAAAAATCTAAGATGGCATTTCTGAGATC
CCTCTGCCGTACCGCTGCGGCGGCCTCCGTCGCTACGCTCCGATCATCCAGATCCGCCGC
TCCCAGTCATCTATTGCGCCATCGTTTCCTCTCAACGCGAGGATTCTTCGCTGTTTCTTC
ATTTCCTTCTA***GAACTCCTTATGATTCTCGGTATCCTCGAGCAATGAATATTGGACA
AGTGCGCAGCTTTAGCGAAGATGTGTCTCACATGCCTGAAATCAAAGACAATGATATTCT
GAAAGCTTTCAGAGAATTGATGGCTGCAGATTGGGCAGCGCTACCTTCTGCTGTTGTTAA
AGACGCCAAAAACGCAGTCTCGAAAAACACAGATGACAAGGAAGGGCAAGAGGCCTTGAT
GAATGTGTTCAGAGCAGCTGAGGCTGTTGAGGAATTTGGTGGGATTCTCACTTCCTTAAA
GATGGAGATCGATGATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATGTGAAGACCTTACCTGAAGA
TATAACCAAAGCGCTGCGTCTTGCTTATCAAAGGTATACTACCTACCTAGATGCTTTTTG
GACCTGAAGAAGTTTACTTGAAGAAGAAAGTTGAGACGGAGTTGGGAACAAAGATGATCC
ACTT*GAAGATGAGATGCAGCGGGCTTGGTTCAGAATGGGGAAAGGTTACCGTTCTTGGA
ACCTCAG*ACTCTCGGGGTCTTACGTGGAGCAAAGGGCATAAAACAAATTT*ATATGTTT
TTTTCTGCGTTATTGTGTCCTTGAGACA
AT

QA 3 810 3 810
DS 

RD RR2BW76TF 752 0 0
GG
ATTACAGCAGATT*GAGAAGAGCGAAAAATCTAAGATGGCATTTCTGAGATCCCTCTGCC
GTACTGCTGCGGCGGCCTCCGCCGCTACGCTCCGATCATCCAGATCCGCCGCTCCCAGTC
AGCTGTTGCGCCATCGTTTCCTCTCAACGCGAGGATACTTCGCTGTTTCTTCGTTTCCTT
CTAA*CGAACTCCTTACGATTCTCGGTATCCTCGAGCAATGGATATTGGACAAGTGCGCA
GCTTTAGCGAAGATGTGTCTCACATGCCTGAAATCAAAGACAGTGATATTCTGAAAGCTT
TCAGGGAATTGATGGCGGCAGATTGGGCAGCGCTACCTTCTGCTGTTGTTAAAGACGCCA
AAAACGCAGTCTCGAAAAACACAGATGACAAGGAAGGGCAAGAGGCCCTGATGAATGTGT
TCAGAGCAGCTGAGACTGTTGAGGAATTTGGTGGGATTCTCACTTCCTTAAAGATGGAGA
TCGATGATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATGTGAAGACCTTACCTGAAGATATAACCA
AGGCGCTGCGTCTTGCTTATCAAAGGTATACTACCTACCTTGATGCTTTT*GGACCTGAA
GAAGTTTACTTGAAGAAGAAGGTTGAGATGGAGTTGGGAACAAAGATGATCCACTT*GAA
GATGAGATGCAGCGGGCTTGGTTCAGAATGGGGAAAGGTA**CATTCTTGGAAC*TCAG*
ACTCTCGGGGTCTTACGTGGAGCAAAG
AGC

QA 3 749 3 749
DS 

RD RR2BI92JQ 649 0 0
G
GAGCAATGGATATTGGACAAGTGCGCAGCTTTAGTGAAGATGTGTCTCACATGCCTGAGA
TCAAAGACAGTGATATTCTGAAATCTTTCAGAGAATTGATGGCTGCAGATCGGGCAGCGC
TACCTTCTGCTGTTGTTAAAGACGCCAAAAACGCAGTCTCGAAAAACACAGATGACAAGG
AAGGGCAAGAGGCTTTGATGAATGTGTTCAGAGCAGCTGAGGCGGTTGAGGAATTTGGTG
GGATTCTCACTTCCTTAAAGATGGAGATCGATGATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATG
TGAAGACCTTACCTGAAGATATAACCAAGGCGCTGCGTCTTGCTTATCAAAGGTATACTA
CCTACCTAGATGCTTTT*GGACCTGAAGAAGTTTACTTGAAGAAGAAGGTTGAGACGGAG
TTGGGAACAAAGATGATCCACTT*GAAGATGAGATGCAGCGGGCTTGGTTCAGAATGGGG
AAAGGTTACCGTTCTTGGAACCTCAGGACTCTCGGGGTCTTACGTGGAGCAAAGGGCATA
AAACAAATTTTATATGTTTTTTTCTGCGTTATTGTGTCCTTAAGACATAATAAAGGTCAA
TAACTGACCAAAGACCTATGTAAGGTGAGTTTGTTCATTGTTTCCTCC

QA 2 649 2 649
DS 

RD RR2BI92TF 649 0 0
G
GAGCAATGGATATTGGACAAGTGCGCAGCTTTAGTGAAGATGTGTCTCACATGCCTGAGA
TCAAAGACAGTGATATTCTGAAATCTTTCAGAGAATTGATGGCTGCAGATCGGGCAGCGC
TACCTTCTGCTGTTGTTAAAGACGCCAAAAACGCAGTCTCGAAAAACACAGATGACAAGG
AAGGGCAAGAGGCTTTGATGAATGTGTTCAGAGCAGCTGAGGCGGTTGAGGAATTTGGTG
GGATTCTCACTTCCTTAAAGATGGAGATCGATGATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATG
TGAAGACCTTACCTGAAGATATAACCAAGGCGCTGCGTCTTGCTTATCAAAGGTATACTA
CCTACCTAGATGCTTTT*GGACCTGAAGAAGTTTACTTGAAGAAGAAGGTTGAGACGGAG
TTGGGAACAAAGATGATCCACTT*GAAGATGAGATGCAGCGGGCTTGGTTCAGAATGGGG
AAAGGTTACCGTTCTTGGAACCTCAGGACTCTCGGGGTCTTACGTGGAGCAAAGGGCATA
AAACAAATTTTATATGTTTTTTTCTGCGTTATTGTGTCCTTAAGACATAATAAAGGTCAA
TAACTGACCAAAGACCTATGTAAGGTGAGTTTGTTCATTGTTTCCTCC

QA 2 649 2 649
DS 

RD RR2BB28JQ 862 0 0
CTGAGATCCCTCTGCCGTACCGCTGCGGCGGCCACCGTCGCTACGCTCCGATCATCCAGA
TCCGCCGTTCCCAGTCATCTATTGCGCCATCGTTTCCTCTCAACGCGAGGATTCTTCGCT
GTTTCTTCGTTTCCTTCTAATCGAACTCCTTACGATTCTCGGTATCCTCGAGCAATGGAT
ATTGGACAAGTGCGCAGCTTTAGTGAAGATGTGTCTCACATGCCTGAGATCAAAGACAGT
GATATTCTGAAAGCTTTCAGAGAATTGATGGCTGCAGATTGGGCAGCGCTACCTTCCGCT
GTTGTTAAAGACGCCAAAAACGCAGTCTCGAAAAGCACAGATGACAAGGAAGGGCAAGAG
GCTTTGATGAATGTGTTCAGAGCAGCTGAGGCGGTTGAGGAATTTGGTGGGATTCTCACT
TCCTTAAAGATGGAGATCGATGATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATGTGAAGACCTTG
CCTGAAGATATAACCAAGGCGCTGCGTCTTGCTTATCAAAGGTATACTACCTACCTAGAT
GCTTTT*GGACCTGAAGAAGTTTACTTGAAGAAGAAGGCTGAGACGGAGTTGGGAACAAA
GATGATCCACTT*GAAGATGAGATGCCGCGGGCTTGGTTCAGAATGGGGAAAGGTTACCG
TTCTTGGAACCTCAGGACTCTCGGGGTCTTACGTGGAGCAAAGGGCATAAAACAAATTTT
ATATGTTTTTTTCTGCGTTATTGTGTCCTTAAGACATAATAAAGGTCAATAACTGACCAA
AGACCTATGTAAGGTGAGTTTGTTCATTGTTTCCTCCAAAACAAAGCTTTTGAAAGTTAG
AGCTTAAAAACAGCACCAAT
TG

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR2H806JQ 614 0 0
CATGCCTGAGATCAAAGACAGTGATATTCTGAAAGCTTTCAGAGAATTGATGGCTGCAGA
TTGGGCAGCGCTACCTTCTGCTGTTGTTAAAGACGCCAAAAACGCAGTCTCGAAAAACAC
AGATGACAAGGAAGGGCAAGAGGCTTTGATGAATGTGTTCAGAGCAGCTGAGGCGGTTGA
GGAATTTGGTGGGATTCTCACTTCCTTAAAGATGGAGATCGATGATAGCATTGGAATGAG
TGGGGAGAATGTGAAGACCTTACCTGAAGATATAACCAAGGCGCTGCGTCTTGCTTATCA
AAGGTATACTACCTACCTAGATGCTTTT*GGACCTGAAGAAGTTTACTTGAAGAAGAAGG
TTGAGACGGAGTTGGGAACAAAGATGATCCACTT*GAAGATGAGATGCAGCGGGCTTGGT
TCAGAATGGGGAAAGGTTACCGTTCTTGGAACCTCAGGACTCTCGGGGTCTTACGTGGAG
CAAAGGGCATAAAACAAAAT**ATATGTTTTTTTTTGCGTTATTGTGTCCTTAAGACATA
ATAAAGGTCAATAACTGACCAAAGACCTATGTAAGGTGAGTTTGTTCATTGTTTCCTCCA
AAACAAAGCTTTT
G

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2AO56JQ 755 0 0
A
GAACTCCTTATGATTCTCGGTATCCTCGAGCAATGAATATTGGACAAGTGCGCAGCTTTA
GCGAAGATGTGTCTCACATGCCTGAAATCAAAGACAATGATATTCTGAAAGCTTTCAGAG
AATTGATGGCTGCAGATTGGGCAGCGCTACCTTCTGCTGTTGTTAAAGACGCCAAAAACG
CAGTCTCGAAAAACACAGATGACAAGGAAGGGCAAGAGGCCTTGATGAATGTGTTCAGAG
CAGCTGAGGCTGTTGAGGAATTTGGTGGGATTCTCACTTCCTTAAAGATGGAGATCGATG
ATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATGTGAAGACCTTACCTGAAGATATAACCAAAGCGC
TGCGTCTTGCTTATCAAAGGTATACTACCTACCTAGATGCTTTT*GGACCTGAAGAAGTT
TACTTGAAGAAGAAGGTTGAGACGGAGTTGGGAACAAAGATGATCCACTT*GAAGATGAG
ATGCAGCGGGCTTGGTTCAGAATGGGGAAAGGTTACCGTTCTTGGAACCTCAGGACTCTC
GGGGTCTTACGTGGAGCAAAGGGCATAAAACAAATTT*ATATGTTTTTTTCTGCGTTATT
GTGTCCTTGAGACA**ATAAAGGTCAATAACTGACCAAAGACCTATATAAGGTGAGTTTG
TT****GTTTCCTCCAGAACAAAGCTTTTGAAAGTTAGAGCTTAAAAACAGCACCAATTG
AAAAATAAATTCACAGCTCCGACAATTTTTAAAC

QA 2 755 2 755
DS 



AS 2 13

CO CL327Contig1 866 11 17 U
GGACATCAGAAAATCCAAAAATAAAAAATATCAGAGAGAGGTCGCTGCAAAAAAATCCAA
ATCAAATCTCCCCAGATTTAAAGAAGATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAGACTGCTCCCT
TCTTTGGCTTCCTCGGCGCTGCCGCCGCCCTAGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATG
GAACTGCGAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGACCTGAGTTGGTGA
TGAAGTCTATTGTCCCCGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTATGGGCTCATCATCG
CTGTTATCATCAGTACCGGTATCAACCCAAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGAT
ACGCGCACCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCGGCTGGAATGGCCA
TTGGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCGTGG
GGATGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGGTCTCATTGTAGGCA
TTATCTTATCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAACAGAACAAACGTCAG
CTGATGATTAATTTTTTTTTCGTGTGTGGAATGTCTCAATTGCTCTCATCTGTTTGTTTG
GGGTTGCCACCTCTGCTCCTTCCTTCCGATGGGTGCTTGAGTGTAGGATGTTGTTATTTG
TTTGGTTGGGTAATAATAAGACAAGTGTGCATGTTTTGTATTCTTTGTATTTGTCTTGAG
GAACTTGATGATATTTTGTTTGTAAAGAAGTTTGCTTCTGAAACCATCTTCGAGTGTTGT
TATGATATTCATCTATATTTGGTGTC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ23TF U 58
AF RR2CR71TF U 1
AF RR2AJ53TF U 57
AF RR2C711TF U 1
AF RR2H482TF U 6
AF RR2B033TF U 1
AF RR2B033JQ C 1
AF RR2CR71JQ C 216
AF RR2H482JQB C 139
AF RR2AJ53JQ C 191
AF RR2C711JQ C 259
BS 1 126 RR2CR71TF
BS 127 127 RR2C711TF
BS 128 525 RR2CR71TF
BS 526 526 RR2C711TF
BS 527 584 RR2CR71TF
BS 585 585 RR2C711TF
BS 586 678 RR2CR71TF
BS 679 729 RR2C711TF
BS 730 732 RR2H482TF
BS 733 733 RR2B033TF
BS 734 756 RR2H482TF
BS 757 757 RR2B033TF
BS 758 782 RR2H482TF
BS 783 783 RR2B033TF
BS 784 803 RR2H482TF
BS 804 853 RR2B033JQ
BS 854 866 RR2AJ53JQ

RD RR2EZ23TF 476 0 0
GG
AATCAAATCTCCCCAGATTTAAAGAAGATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAGACTGCTCCC
TTCTTTGGCTTCCTCGGCGCTGCCGCCGCCCTAGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTAT
GGAACTGCGAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGACCTGAGTTGGTG
ATGAAGTCTATTGTCCCCGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTATGGGCTCATCATC
GCTGTTATCATCAGTACCGGTATCAACCCAAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGA
TACGCGCACCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCGGCTGGAATGGCC
ATTGGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCGTG
GGGATGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGGTCTCATT

QA 3 476 3 476
DS 

RD RR2CR71TF 678 0 0
GGACATCAGAAAATCCAAAAATAAAAAATATCAGAGAGAGGTCGCTGCAAAAAAATCCAA
ATCAAATCTCCCCAGATTTAAAGAAGATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAGACTGCTCCCT
TCTTTGTCTTCCTCGGCGCTGCCGCCGCCCTAGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATG
GAACTGCGAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGACCTGAGTTGGTGA
TGAAGTCTATTGTCCCCGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTATGGGCTCATCATCG
CTGTTATCATCAGTACCGGTATCAACCCAAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGAT
ACGCGCACCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCGGCTGGAATGGCCA
TTGGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCGTGG
GGATGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGTTCTCATTGTAGGCA
TTATCTTATCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAA*CAGAACAAACGTCAG
CTGATGATTAATTTTTTTTTCGTGTGTGGAATGTCTCAATTGCTCTCATCTGTTTGTTTG
GGGTTGCCACCTCTGCTC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2AJ53TF 636 0 0
GG
AAATCAAATCTCCCCAGATTTAAAGAAGATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAGACTGCTCC
CTTCTTTGGCTTCCTCGGCGCTGCCGCCGCCCTAGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTA
TGGAACTGCGAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGACCTGAGTTGGT
GATGAAGTCTATTGTCCCCGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTATGGGCTCATCAT
CGCTGTTATCATCAGTACCGGTATCAACCCAAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGG
ATACGCGCACCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCGGCTGGAATGGC
CATTGGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCGT
GGGGATGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGGTCTCATTGTAGG
CATTATCTTATCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAACAGAACAAACGTC
AGCTGATGATTAATTTTTTTTTCGTGTGTGGAATGTCTCAATTGCTCTCATCTGTTTGTT
TGGGGTTGCCACCTCTGCTCCTTCCTTCCGATGG

QA 3 636 3 636
DS 

RD RR2C711TF 729 0 0
GGACATCAGAAAATCCAAAAATAAAAAATATCAGAGAGAGGTCGCTGCAAAAAAATCCAA
ATCAAATCTCCCCAGATTTAAAGAAGATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAGACTGCTCCCT
TCTTTGGCTTCCTCGGCGCTGCCGCCGCCCTAGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATG
GAACTGCGAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGACCTGAGTTGGTGA
TGAAGTCTATTGTCCCCGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTATGGGCTCATCATCG
CTGTTATCATCAGTACCGGTATCAACCCAAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGAT
ACGCGCACCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCGGCTGGAATGGCCA
TTGGAATCGTCGGAGGTGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCGTGG
GGATGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGGTCTCATTGTAGGCA
TTATCTTATCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAACAGAACAAACGTCAG
CTGATGATTAATTTTTTTTTCGTGTGTGGAATGTCTCAATTGCTCTCATCTGTTTGTTTG
GGGTTGCCACCTCTGCTCCTTCCTTCCGATGGGTGCTTGAGTGTAGGATGTTGTTATTTG
TTTGGTTGG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2H482TF 798 0 0
GG
AGAAAATCCAAAAATAAAAAATATCAGAGAGAGGTCGCTGCAAAAAAATCCAAATCAAAT
CTCCCCAGATTTAAAGAAGATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAGACTGCTCCCTTCTTTGG
CTTCCTCGGCGCTGCCGCCGCCCTAGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATGGAACTGC
GAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGACCTGAGTTGGTGATGAAGTC
TATTGTCCCCGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTATGGGCTCATCATCGCTGTTAT
CATCAGTACCGGTATCAACCCAAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGATACGCGCA
CCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCGGCTGGAATGGCCATTGGAAT
CGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCGTGGGGATGAT
TCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGGTCTCATTGTAGGCATTATCTT
ATCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAACAGAACAAACGTCAGCTGATGA
TTAATTTTTTTTTCGTGTGTGGAATGTCTCAATTGCTCTCATCTGTTTGTTTGGGGTTGC
CACCTCTGCTCCTTCCTTCCGATGGGTGCTTGAGTGTAG*ATGTTGTTATTTGTTTGGTT
GGGTA*TAATAAGACAAGTGTGCATGTTT*GTATTCTTTGTATTTGTCTTGAGGA*CTTG
ATGATATTTTGTTTGT

QA 3 798 3 798
DS 

RD RR2B033TF 798 0 0
GGACATCAGAAAATCCAAAAATAAAAAATATCAGAGAGAGGTCGCTGCAAAAAAATCCAA
ATCAAATCTCCCCAGATTTAAAGAAGATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAGACTGCTCCCT
TCTTTGTCTTCCTCGGCGCTGCCGCCGCCCTAGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATG
GAACTGCGAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGACCTGAGTTGGTGA
TGAAGTCTATTGTCCCCGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTATGGGCTCATCATCG
CTGTTATCATCAGTACCGGTATCAACCCAAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGAT
ACGCGCACCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCGGCTGGAATGGCCA
TTGGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCGTGG
GGATGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGTTCTCATTGTAGGCA
TTATCTTATCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAACAGAACAAACGTCAG
CTGATGATTAATTTTTTTTTCGTGTGTGGAATGTCTCAATTGCTCTCATCTGTTTGTTTG
GGGTTGCCACCTCTGCTCCTTCCTTCCGATGGGTGCTTGAGTGTAGGATGTTGTTATTTG
TTTGGTTGGGTAATAATAAGACAAGTGTGCATGTTTTGTATTCTTTGTATTTGTCTTGAG
GAACTTGATGATATTTTG

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2B033JQ 854 0 0
GGACATCAGAAAATCCAAAAATAAAAAATATCAGAGAGAGGTCGCTGCAAAAAAATCCAA
ATCAAATCTCCCCAGATTTAAAGAAGATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAGACTGCTCCCT
TCTTTGTCTTCCTCGGCGCTGCCGCCGCCCTAGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATG
GAACTGCGAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGACCTGAGTTGGTGA
TGAAGTCTATTGTCCCCGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTATGGGCTCATCATCG
CTGTTATCATCAGTACCGGTATCAACCCAAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGAT
ACGCGCACCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCGGCTGGAATGGCCA
TTGGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCGTGG
GGATGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGTTCTCATTGTAGGCA
TTATCTTATCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAACAGAACAAACGTCAG
CTGATGATTAATTTTTTTTTCGTGTGTGGAATGTCTCAATTGCTCTCATCTGTTTGTTTG
GGGTTGCCACCTCTGCTCCTTCCTTCCGATGGGTGCTTGAGTGTAGGATGTTGTTATTTG
TTTGGTTGGGTAATAATAAGACAAGTGTGCATGTTTTGTATTCTTTGTATTTGTCTTGAG
GAACTTGATGATATTTTGTTTGTAAAGAAGTTTGCTTCTGAAACCATCTTCGAGTGTTGT
TATGATATTCATC
T

QA 1 853 1 853
DS 

RD RR2CR71JQ 639 0 0
GGAGTGATGAGAC*TGAGTTGGTGATGAAGTCTATTGTCCCCGTGGTTATGGCTGGTGTG
TTGGGTATCTATGGGCTCATCATCGCTGTTATCATCAGTACCGGTATCAACCCAAAGGCT
AAGTCTTACTACCTCTTTGATGGATACGCGCACCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTC
GCTGGTCTCTCGGCTGGAATGGCCATTGGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAAT
GCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCGTGGGGATGATTTTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTT
GCTCTCTATGTTCTCATTGTAGGCATTATCTTATCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCA
GAATGAGAAACAGAACAAACGTCAGCTGATGATTAATTTTTTTTTCGTGTGTGGAATGTC
TCAATTGCTCTCATCTGTTTGTTTGGGGTTGCCACCTCTGCTCCTTCCTTCCGATGGGTG
CTTGAGTGTAGGATGTTGTTATTTGTTTGGTTGGGTAATAATAAGACAAGTGTGCATGTT
TTGTATTCTTTGTATTTGTCTTGAGGAACTTGATGATATTTTGTTTGTAAAGAAGTTTGC
TTCTGAAACCATCTTCGAGTGTTGTTATGATATTCATC
T

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2H482JQB 716 0 0
CTGCCGCCGCCCTAGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATGGAACTGCGAAGAGTGGTG
TTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGACCTGAGTTGGTGATGAAGTCTATTGTCCCCG
TGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTATGGGCTCATCATCGCTGTTATCATCAGTACCG
GTATCAACCCAAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGATACGCGCACCTCTCCTCTG
GTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCGGCTGGAATGGCCATTGGAATCGTCGGAGATG
CTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCGTGGGGATGATTCTTATCCTCA
TCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGGTCTCATTGTAGGCATTATCTTATCCTCTCGAG
CTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAACAGAACAAACGTCAGCTGATGATTAATTTTTTT
TTCGTGTGTGGAATGTCTCAATTGCTCTCATCTGTTTGTTTGGGGTTGCCACCTCTGCTC
CTTCCTTCCGATGGGTGCTTGAGTGTAGGATGTTGTTATTTGTTTGGTTGGGTAATAATA
AGACAAGTGTGCATGTTTTGTATTCTTTGTATTTGTCTTGAGGAACTTGATGATATTTTG
TTTGTAAAGAAGTTTGCTTCTGAAACCATCTTCGAGTGTTGTTATGATATTCATC
C

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2AJ53JQ 676 0 0
GAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGACCTGAGTTGGTGATGAAGTCTAT
TGTCCCCGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTATGGGCTCATCATCGCTGTTATCAT
CAGTACCGGTATCAACCCAAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGATACGCGCACCT
CTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCGGCTGGAATGGCCATTGGAATCGT
CGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCGTGGGGATGATTCT
TATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGGTCTCATTGTAGGCATTATCTTATC
CTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAACAGAACAAACGTCAGCTGATGATTA
ATTTTTTTTTCGTGTGTGGAATGTCTCAATTGCTCTCATCTGTTTGTTTGGGGTTGCCAC
CTCTGCTCCTTCCTTCCGATGGGTGCTTGAGTGTAGGATGTTGTTATTTGTTTGGTTGGG
TAATAATAAGACAAGTGTGCATGTTTTGTATTCTTTGTATTTGTCTTGAGGAACTTGATG
ATATTTTGTTTGTAAAGAAGTTTGCTTCTGAAACCATCTTCGAGTGTTGTTATGATATTC
ATCTATATTTGGTGTC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2C711JQ 592 0 0
TGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTATGGGCTCATCATCGCTGTTATCATCAGTACCG
GTATCAACCCAAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGATACGCGCACCTCTCCTCTG
GTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCGGCTGGAATGGCCATTGGAATCGTCGGAGGTG
CTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCGTGGGGATGATTCTTATCCTCA
TCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGGTCTCATTGTAGGCATTATCTTATCCTCTCGAG
CTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAACAGAACAAACGTCAGCTGATGATTAATTTTTTT
TTCGTGTGTGGAATGTCTCAATTGCTCTCATCTGTTTGTTTGGGGTTGCCACCTCTGCTC
CTTCCTTCCGATGGGTGCTTGAGTGTAGGATGTTGTTATTTGTTTGGTTGGGTAATAATA
AGACAAGTGTGCATGTTTTGTATTCTTTGTATTTGTCTTGAGGAACTTGATGATATTTTG
TTTGTAAAGAAGTTTGCTTCTGAAACCATCTTCGAGTGTTGTTATGATATTC

QA 1 592 1 592
DS 



CO CL327Contig2 773 2 2 U
GGAAATCAAATCTCCCCAGATTTAAAGAAGATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAGACTGCT
CCCTTCTTTGGCTTCCTCGGCGCTGCCGCCGCCCTAGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCT
TATGGAACAGCGAAGAGTGGTGTTGGCGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGACCTGAGTTG
GTGATGAAGTCCATTGTCCCCGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTATGGACTCATC
ATCGCTGTTATCATCAGTACCGGTATCAACCCAAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGAT
GGATACGCGCACCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCAGCTGGAATG
GCCATTGGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTC
GTGGGGATGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTATATGGTCTCATTGTA
GGCATTATCTTATCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAACAAAACAAACG
TCAGGTGATGATTATTTTTTTTTCGTGTGTGGGATGTCTCACTTGCTCTCATCTATTTGT
TTTTGGTTGCCATCTATGCTCCTTCCTTCCAATGGGTGCTTGAGTGTAGGATGTTGTTAT
TTGTTTGGATGGGTTGGGTAATAATAAGACAAGTGTGCATGTTTTGTATTCTTTGTATTT
GTCTTGAGGAACTTGATGATATTTTGTTTGTAAAGAAGTTTGCTTCTGAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA57TF U 1
AF RR2HA57JQ C 99
BS 1 645 RR2HA57TF
BS 646 773 RR2HA57JQ

RD RR2HA57TF 645 0 0
GGAAATCAAATCTCCCCAGATTTAAAGAAGATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAGACTGCT
CCCTTCTTTGGCTTCCTCGGCGCTGCCGCCGCCCTAGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCT
TATGGAACAGCGAAGAGTGGTGTTGGCGTGGCTTCCATGGGAGTGATGAGACCTGAGTTG
GTGATGAAGTCCATTGTCCCCGTGGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTATGGACTCATC
ATCGCTGTTATCATCAGTACCGGTATCAACCCAAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGAT
GGATACGCGCACCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCAGCTGGAATG
GCCATTGGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTC
GTGGGGATGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTATATGGTCTCATTGTA
GGCATTATCTTATCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAACAAAACAAACG
TCAGGTGATGATTATTTTTTTTTCGTGTGTGGGATGTCTCACTTGCTCTCATCTATTTGT
TTTTGGTTGCCATCTATGCTCCTTCCTTCCAATGGGTGCTTGAGT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2HA57JQ 675 0 0
CTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATGGAACAGCGAAGAGTGGTGTTGGCGTGGCTTCCAT
GGGAGTGATGAGACCTGAGTTGGTGATGAAGTCCATTGTCCCCGTGGTTATGGCTGGTGT
GTTGGGTATCTATGGACTCATCATCGCTGTTATCATCAGTACCGGTATCAACCCAAAGGC
TAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGATACGCGCACCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCT
CGCTGGTCTTTCAGCTGGAATGGCCATTGGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAA
TGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCGTGGGGATGATTTTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACT
TGCTCTATATGGTCTCATTGTAGGCATTATTTTATCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGC
AGAATGAGAAACAAAACAAACGTCAGGTGATGATTATTTTTTTTTCGTGTGTGGGATGTC
TCACTTGCTTTCATCTATTTGTTTTTGGTTGCCATCTATGCTCCTTCCTTCCAATGGGTG
CTTGAGTGTAGGATGTTGTTATTTGTTTGGATGGGTTGGGTAATAATAAGACAAGTGTGC
ATGTTTTGTATTCTTTGTATTTGTCTTGAGGAACTTGATGATATTTTGTTTGTAAAGAAG
TTTGCTTCTGAAACC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 12

CO CL328Contig1 921 12 11 U
AACCACAATGGTTTTTTGGTAGTTTCCACTGTTTTATTTCACAATATTTATTCTTCTTGT
TTGGTAAAAATCAAATTTCATCCAGAAGTAGTGATCTCAAGGAGTGGTTCTACGATTAAA
CCGGGATGCGATAGTTATTCTACTTAGATCCGGATTACAGAGAAAAAAACAATAACTTGG
ATAGAAGCAGATGATGTTGATGGATTAGATTAATCCATCCTTCCCTTTAGGATCCTCTCT
TTAATCTCAGTAGGTGTTACAACGTAAACATGGCCTCCCCAACCACTTAGACAATCACGG
TCAACTGACGAGAGAAGCGCTTGCGATATCGTCTCAAACAGTTCCTCCGCTTCCATATCA
GGCTTGTACATTGCTTCGCAGGCACCATACAATGATTCTGAAGCAGTTCCAGATACAACA
AAATCTTTAGCCAGCTCCTTGGCACCAATGGAGTCCATGGTGCAGATGAAGGGCTTGTCA
TCTTCTCCCAAGCCAGCAATCACTGGTTGGCATAAGTAAGGACCAAATCTCTTCTCGTAA
AGAATGGCAGAGACGAGACTAGCGAAAGTTTCAGGCTTCATGTCTCTCTCTTCACGAAGT
TGGTACAGCTTATGACGAAACACCAACCGCTGGTACAGTGTTTGGACATCGGTGGCGAGA
CCAGAGAGTCCGATGAAGACGCGATCGTGGATCTTGGAGATTCTCTGGAAATCGGTGGCG
ATCGTCTGTAGCTGCACACCGAGCCTACGATCACTGGCGATGGCGAAGCAGTTCTTCCCT
ACCATAGCTACAACTGCACTTCCATTGTACTCGAAGATCGACATCGGAAGATTAGATTAG
GGTTTGGAACGGAGAAGAAATCTAAGACGGAGGAGAGAGAGTAAGTAAAGTCGACGGTGG
CTTGGAAGAAACTCCAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2D067JQ U 118
AF RR2FH71JQ U 1
AF RR2AX29JQ U 18
AF RR2AX29TFB C 18
AF RR2DZ36JQ U 90
AF RR2F753JQ U 18
AF RR2H067JQ U 81
AF RR2FH71TF C 106
AF RR2D067TF C 525
AF RR2F753TF C 650
AF RR2DZ36TF C 639
AF RR2H067TF C 662
BS 1 197 RR2FH71JQ
BS 198 198 RR2AX29JQ
BS 199 317 RR2FH71JQ
BS 318 318 RR2AX29JQ
BS 319 433 RR2FH71JQ
BS 434 434 RR2AX29JQ
BS 435 556 RR2FH71JQ
BS 557 590 RR2AX29JQ
BS 591 766 RR2F753JQ
BS 767 786 RR2H067JQ
BS 787 921 RR2FH71TF

RD RR2D067JQ 265 0 0
G
AACCGGGATGCGATAGTTATTCTACTTAGATCCGGATTACAGAGAAAAAAACAATAACTT
GGATAGAAGCAGATGATGTTGATGGATTAGATTAATCCATCCTTCCCTTTAGGATCCTCT
CTTTAATCTCAGTAGGTGTTACAACGTAAACATGGCCTCCCCAACCACTTAAACAATCAC
GGTCAACTGACGAGAGAAGTGCTTGCGATATCGTCTCAAACAGTTCCTCCGCTTCCATAT
CAGGCTTGTACATTGCTTCCCAGG

QA 2 265 2 265
DS 

RD RR2FH71JQ 556 0 0
AACCACAATGGTTTTTTGGTAGTTTCCACTGTTTTATTTCACAATATTTATTCTTCTTGT
TTGGTAAAAATCAAATTTCATCCAGAAGTAGTGATCTCAAGGAGTGGTTCTACGATTAAA
CCGGGATGCGATAGTTATTCTACTTAGATCCGGATTACAGAGAAAAAAACAATAACTTGG
ATAGAAGCAGATGATGTCGATGGATTAGATTAATCCATCCTTCCCTTTAGGATCCTCTCT
TTAATCTCAGTAGGTGTTACAACGTAAACATGGCCTCCCCAACCACTTAGACAATCACGG
TCAACTGACGAGAGAAGTGCTTGCGATATCGTCTCAAACAGTTCCTCCGCTTCCATATCA
GGCTTGTACATTGCTTCGCAGGCACCATACAATGATTCTGAAGCAGTTCCAGATACAACA
AAATCTTTAGCCAACTCCTTGGCACCAATGGAGTCCATGGTGCAGATGAAGGGCTTGTCA
TCTTCTCCCAAGCCAGCAATCACTGGTTGGCATAAGTAAGGACCAAATCTCTTCTCGTAA
AGAATGGCAGAGACGA

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2AX29JQ 574 0 0
GG
TAGTTTCCACTGTTTTATTTCACAATATTTATTCTTCTTGTTTGGTAAAAATCAAATTTC
ATCCAGAAGTAGTGATCTCAAGGAGTGGTTCTACGATTAAACCGGGATGCGATAGTTAGT
CTACTTAGATCCGGATTACAGAGAAAAAAACAATAACTTGGATAGAAGCAGATGATGTTG
ATGGATTAGATTAATCCATCCTTCCCTTTAGGATCCTCTCTTTAATCTCAGTAGGTGTTA
CAACGTAAACATGGCCTCCCCAACCACTTAGACAATCACGGTCAACTGACGAGAGAAGCG
CTTGCGATATCGTCTCAAACAGTTCCTCCGCTTCCATATCAGGCTTGTACATTGCTTCGC
AGGCACCATACAATGATTCTGAAGCAGTTCCAGATACAACAAAATCTTTAGCCAGCTCCT
TGGCACCAATGGAGTCCATGGTGCAGATGAAGGGCTTGTCATCTTCTCCCAAGCCAGCAA
TCACTGATTGGCATAAGTAAGGACCAAATCTCTTCTCGTAAAGAATGGCAGAGACGAGAC
TAGCGAAAGTTTCAGGCTTCATGTCTCTCTC
C

QA 3 573 3 573
DS 

RD RR2AX29TFB 574 0 0
GG
TAGTTTCCACTGTTTTATTTCACAATATTTATTCTTCTTGTTTGGTAAAAATCAAATTTC
ATCCAGAAGTAGTGATCTCAAGGAGTGGTTCTACGATTAAACCGGGATGCGATAGTTAGT
CTACTTAGATCCGGATTACAGAGAAAAAAACAATAACTTGGATAGAAGCAGATGATGTTG
ATGGATTAGATTAATCCATCCTTCCCTTTAGGATCCTCTCTTTAATCTCAGTAGGTGTTA
CAACGTAAACATGGCCTCCCCAACCACTTAGACAATCACGGTCAACTGACGAGAGAAGCG
CTTGCGATATCGTCTCAAACAGTTCCTCCGCTTCCATATCAGGCTTGTACATTGCTTCGC
AGGCACCATACAATGATTCTGAAGCAGTTCCAGATACAACAAAATCTTTAGCCAGCTCCT
TGGCACCAATGGAGTCCATGGTGCAGATGAAGGGCTTGTCATCTTCTCCCAAGCCAGCAA
TCACTGATTGGCATAAGTAAGGACCAAATCTCTTCTCGTAAAGAATGGCAGAGACGAGAC
TAGCGAAAGTTTCAGGCTTCATGTCTCTCTC
C

QA 3 573 3 573
DS 

RD RR2DZ36JQ 459 0 0
AGTGATCTCAAGGAGTGGTTCTACGATTAAACCGGGATGCGATAGTTATTCTACTTAGAT
CCGGATTACAGAGAAAAAAACAATAACTTGGATAGAAGCAGATGATGTTGATGGATTAGA
TTAATCCATCCTTCCCTTTAGGATCCTCTCTTTAATCTCAGTAGGTGTTACAACGTAAAC
ATGGCCTCCCCAACCACTTAAACAATCACGGTCAACTGACGAGAGAAGCGCTTGCGATAT
CGTCTCAAACAGTTCCTCCGCTTCCATATCAGGCTTGTACATTGCTTCGCAGGCACCATA
CAATGATTCTGAAGCAGTTCCAGATACAACAAAATCTTTAGCCAGCTCCTTGGCACCAAT
GGAGTCCATGGTGCAGATGAAGGGCTTGTCATCTTCTCCCAAGCCAGCAATCACTGGTTG
GCATAAGTAAGGACCAAATCTCTTCTCGTAAAGAATGGC

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR2F753JQ 749 0 0
GA
TAGTTTCCACTGTTTTATTTCACAATATTTATTCTTCTTGTTTGGTAAAAATCAAATTTC
ATCCAGAAGTAGTGATCTCAAGGAGTGGTTCTACGATTAAACCGGGATGCGATAGTTATT
CTACTTAGATCCGGATTACAGAGAAAAAAACAATAACTTGGATAGAAGCAGATGATGTTG
ATGGATTAGATTAATCCATCCTTCCCTTTAGGATCCTCTCTTTAATCTCAGTAGGTGTTA
CAACGTAAACATGGCCTCCCCAACCACTTAGACAATCACGGTCAACTGACGAGAGAAGCG
CTTGCGATATCGTCTCAAACAGTTCCTCCGCTTCCATATCAGGCTTGTACATTGCTTCGC
AGGCACCATACAATGATTCTGAAGCAGTTCCAGATACAACAAAATCTTTAGCCAGCTCCT
TGGCATCAATGGAGTCCATGGTGCAGATGAAGGGCTTGTCATCTTCTCCCAAGCCAGCAA
TCACTGGTTGGCATAAGTAAGGACCAAATCTCTTCTCGTAAAGAATGGCAGAGACGAGAC
TAGCGAAAGTTTCAGGCTTCATGTCTCTCTCTTCACGAAGTTGGTACAGCTTATGACGAA
ACACCAACCGCTGGTACAGTGTTTGGACATCGGTGGCGAGACCAGAGAGTCCGATGAAGA
CGCGATCGTGGATCTTGGAGATTCTCTGGAAATCGGTGGCGATCGTCTGTAGCTGCACAC
CGAGCCTACGATCACTGGCGATGGCGA

QA 3 749 3 749
DS 

RD RR2H067JQ 706 0 0
TCCAGAAGTAGTGATCTCAAGGAGTGGTTCTACGATTAAACCGGGATGCGATAGTTATTC
TACTTAGATCCGGATTACAGAGAAAAAAACAATAACTTGGATAGAAGCAGATGATGTTGA
TGGATTAGATTAATCCATCCTTCCCTTTAGGATCCTCTCTTTAATCTCAGTAGGTGTTAC
AACGTAAACATGGCCTCCCCAACCACTTAGACAATCACGGTCAACTGACGAGAGAAGCGC
TTGCGATATCGTCTCAAACAGTTCCTCCGCTTCCATATCAGGCTTGTACATTGCTTCGCA
GGCACCATACAATGATTCTGAAGCAGTTCCAGATACAACAAAATCTTTAGCCAGCTCCTT
GGCACCAATGGAGTCCATGGTGCAGATGAAGGGCTTGTCATCTTCTCCCAAGCCAGCAAT
CACTGGTTGGCATAAGTAAGGACCAAATCTCTTCTCGTAAAGAATGGCAGAAACGAGACT
AGCGAAAGTTTCAGGCTTCATGTCTCTCTCTTCACGAAGTTGGTACAGCTTATGACGAAA
CACCAACCGCTGGTACAGTGTTTGGACATCGGTGGCGAGACCAGAGAGTCCGATGAAGAC
GCGATCGTGGATCTTGGAGATTCTCTGGAAATCGGTGGCGATCGTCTGTAGCTGCACACC
GAGCCTACGATCACTGGCGATGGCGAAGCAGTTCTTCCCTACCATA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2FH71TF 816 0 0
GGGGTCTACGA
TAAACCGGGATGCGATAGTA**TCTACTTAGATCCGGAT*ACAGAGAAAAAAACAATAAC
TTGGATAGAAGCAGATGATGTCGATGGATTAGATTAATCCATCCTTCCCTTTAGGATCCT
CTCTTTA*TCTCAGTAGGTGTTACAACGTAGACATGGCCTCCCCAACCACTTAGACAATC
ACGGTCAACTGACGAGAGAAGTGCTTGCGATATCGTCTCAAACAGTTCCTCCGCTTCCAT
ATCAGGCTTGTACATTGCTTCGCAGGCACCATACAATGATTCTGAAGCAGTTCCAGATAC
AACAAAATCTTTAGCCAACTCCTTGGCACCAATGGAGTCCATGGTGCAGATGAAGGGCTT
GTCATCTTCTCCCAAGCCAGCAATCACTGGTTGGCATAAGTAAGGACCAAATCTCTTCTC
GTAAAGAATGGCAGAGACGAGACTAGCGAAAGTTTCAGGCTTCATGTCTCTCTCTTCACG
AAGTTGGTACAGCTTATGACGAAACACCAACCGCTGGTACAGTGTTTGGACATCGGTGGC
GAGACCAGAGAGTCCGATGAAGACGCGATCGTGGATCTTGGAGATTCTCTGGAAATCGGT
GGCGATCGTCTGTAGCTGCACACCGAGCCTACGATCACTGGAGATGGCGAAGCAGTTCTT
CCCTACCATAGCTACAACTGCACTTCCATTGTACTCGAAGATCGACATCGGAAGATTAGA
TTAGGGTTTGGAACGGAGAAGAAATCTAAGACGGAGGAGAGAGAGTAAGTAAAGTCGACG
GTGGCTTGGAAGAAACTCCAGCTCC

QA 12 816 12 816
DS 

RD RR2D067TF 397 0 0
CAAA
CTCTTCTCGTAAAGAATGGCAGAGACGAGACTAGCGAAAGTTTCAGGCTTCATGTCTCTC
TCTTCACGAAGTTGGTACAGCTTATGACGAAACACCAACCGCTGGTACAGTGTTTGGACA
TCGGTGGCGAGACCAGAGAGTCCGATGAAGACGCGATCGTGGATCTCGGAGATTCTCTGG
AAATCGGTGGCGATCGTCTGTAGCTGCACACCGAGACTACGATCACTGGCGATGGCGAAG
CAGTTCTTCCCTACCATAGCTACAACTGCACTTCCATTGTACTCGAAGATCGACATCGGA
AGATTAGGTTAGGGTTTGGAACGGAGAAGAAATCTAAGACGGAGGAGAGAGAGTAAGTAA
AGTCGACGGTGGCTTGGAAGAAACTCCAGCTCC

QA 5 397 5 397
DS 

RD RR2F753TF 272 0 0
CGGTGGCGAG*CCAGAGAGTCCGA*GAAGACGCGATCGTGGATCTTGGAGATTCTCTGGA
AATCGGTGGCGATCGTCTGTAGCTGCACACCGAGCCTACGATCACTGGCGATGGCGAAGC
AGTTCTTCCCTACCATAGCTACAACTGCACTTCCATTGTACTCGAAGATCGACATCGGAA
GATTAGATTAGGGTTTGGAACGGAGAAGAAATCTAAGACGGAGGAGAGAGAGTAAGTAAA
GTCGACGGTGGCTCGGAAGAAACTCCAGCTCC

QA 1 272 1 272
DS 

RD RR2DZ36TF 283 0 0
TGTTTGGACATCGGTGGCGAGACCAGAGAGTCCGATGAAGACGCGATCGTGGATCTTGGA
GATTCTCTGGAAATCGGTGGCGATCGTCTGTAGCTGCACACCGAGCCTACGATCACTGGC
GATGGCGAAGCAGTTCTTCCCTACCATAGCTACAACTGCACTTCCATTGTACTCGAAGAT
CGACATCGGAAGATTAGATTAGGGTTTGGAACGGAGAAGAAATATAAGACGGAGGAGAGA
GAGTAAGTAAAGTCGACGGTGGCTTGGAAGAAACTCCAGCTCC

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR2H067TF 260 0 0
CAGAGAGTCCGATGAAGACGCGATCGTGGATCTTGGAGATTCTCTGGAAATCGGTGGCGA
TCGTCTGTAGCTGCACACCGAGCCTACGATCACTGGCGATGGCGAAGCAGTTCTTCCCTA
CCATAGCTACAACTGCACTTCCATTGTACTCGAAGATCGACATCGGAAGATTAGATTAGG
GTTTGGAACGGAGAAGAAATCTAAGACGGAGGAGAGAGAGTAAGTAAAGTCGACGGTGGC
TCGGAAGAAACTCCAGCTCC

QA 1 260 1 260
DS 



AS 1 13

CO CL329Contig1 1454 13 26 U
TTTTTATTAAAACTCGTAGAATCTATGGTTCTACCTTACTTACCTACATCACACACAACT
AAAAAAAGCAAATAGATTTTTTGTAATTTCGGTTGAAATAATGAAAAAGAAGTTTATTCT
TCTTTTCATTTCAATATTTTTTAAGAATAAAATATTGGATTTTTAAACAGAAAGAAAACG
ATGGTGTACAAAGGCAATAGAAGATTGATTTCGTAATGACTGGACTCTGGGACGGAAGGA
TTCGAACCTCCGAATAGCGGGACCAAAACCCGTTGCCTTACCGCTTGGCTACGCCCCATT
TTTATTTTTATTCAAGACTATTAAAAGAGTAATATTGCTGTTGGTTGTTCGCCAATTCAA
TTTCAGCCCAAATGAAATATAGATTACATTGGTGCTATAGTTTTGACACGTGTAGATAGC
AAATCAAACTGACTTTATTGATCATTACATAGAATTCAATTAAGATATTGTATGAAAATA
TTATTTCTTTAATTCTCATAAGAGAATGAAAGGATTTTTGATTGAGTAAGTTCAACAAAG
TCTTTTTAGACTATCTTTATTTATTTATTTTTTCCTTATATAAAAAATATATTAATAACT
CAATCAAAATTAAATTATCCACAAGAACACCAATTTTTGTTATGCTTAATATATTTAATT
TGATCTGTATTTGTTTTAATTCGGCCCTTTTTTCAAGCACTTTTTTAGTCGCCAAATTGC
CGGAGGCCTACGCCTTTTTGAATCCAATCATAGATGTTATGCCCGTAATACCTCTTTTCT
TTCTTCTCTTAGCCTTTGTTTGGCAAGCAGCTGTAAGTTTTCGATGAAATTATTAATACT
GTCTTAGACAAATTCACGATTTTGATTCTTGCAACAATTCAAAAGATTCAAAAATCTTGA
CGTAGGAAAGAACTCTCAATTCAAACATTGAATTTTTTT*GGTAGCCATACTAAATCTGG
ATCATTTGATTTCCTCAGTTTTATCCTCTTTTCTCTAAATGAAAGAACTTAATTAGATTC
GAGTTCACTCACAAAAAAAATATCTAGATATTTAGTATAAAAATAGAGAATCTATTCTCT
TTTTTTTTCCAAAAAAAA*GTAAGATCTTGGAGATTGTGTAATGCTTACTCTCAAACTTT
TTGTATACACTGTAGTTATATTCTTTGTTTCTCTCTTCATATTTGGATTCCTATCTAATG
ATCCAGGACGTAATCCGGGACGTGAAGAATAAAAAACCTTTCTTTTTTATTACTTTATTT
AATATTTAATTAGTGAAAATGTGCGAATTTTATTAGCATTTTATCTATTTCACATCATCA
AAAAGCGGAAGGGAAAGAGAGGGATTCGAACCCTCGGTACGATTAACTCGTACAATGGAT
TAGCAATCCAACGCTTTAGTCCACTCAGCCATCTCTCCTAATCGAAAAGGGATACTTATT
AGGTTCCATTAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 45 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 45 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DP43TF U 1
AF RR2D816TF U 313
AF RR2FN11JQ C 473
AF RR2FN11TF U 473
AF RR2D816JQ C 315
AF RR2DP43JQ C 365
AF RR2H503TF U 473
AF RR2C429TF U 468
AF RR2EY12TF U 472
AF RR2EM88TF U 568
AF RR2EM88JQ C 735
AF RR2EY12JQ C 846
AF RR2H503JQB C 1089
BS 1 320 RR2DP43TF
BS 321 321 RR2D816TF
BS 322 351 RR2DP43TF
BS 352 352 RR2D816TF
BS 353 552 RR2DP43TF
BS 553 998 RR2D816TF
BS 999 999 RR2FN11TF
BS 1000 1011 RR2D816TF
BS 1012 1012 RR2FN11TF
BS 1013 1038 RR2D816TF
BS 1039 1063 RR2H503TF
BS 1064 1088 RR2EY12TF
BS 1089 1089 RR2EM88TF
BS 1090 1131 RR2EY12TF
BS 1132 1132 RR2EM88TF
BS 1133 1151 RR2EY12TF
BS 1152 1235 RR2EM88TF
BS 1236 1236 RR2EM88JQ
BS 1237 1247 RR2EM88TF
BS 1248 1248 RR2EM88JQ
BS 1249 1266 RR2EM88TF
BS 1267 1267 RR2EM88JQ
BS 1268 1286 RR2EM88TF
BS 1287 1338 RR2EM88JQ
BS 1339 1340 RR2EY12JQ
BS 1341 1454 RR2EM88JQ

RD RR2DP43TF 552 0 0
TTTTTATTAAAACTCGTAGAATCTATGGTTCTACCTTACTTACCTACATCACACACAACT
AAAAAAAGCAAATAGATTTTTTGTAATTTCGGTTGAAATAATGAAAAAGAAGTTTATTCT
TCTTTTCATTTCAATATTTTTTAAGAATAAAATATTGGATTTTTAAACAGAAAGAAAACG
ATGGTGTACAAAGGCAATAGAAGATTGATTTCGTAATGACTGGACTCTGGGACGGAAGGA
TTCGAACCTCCGAATAGCGGGACCAAAACCCGTTGCCTTACCGCTTGGCTACGCCCCATT
TTTATTTTTATTCAAGACTACTAAAAGAGTAATATTGCTGTTGGTTGTTCGTCAATTCAA
TTTCAGCCCAAATGAAATATAGATTACATTGGTGCTATAGTTTTGACACGTGTAGATAGC
AAATCAAACTGACTTTATTGATCATTACATAGAATTCAATTAAGATATTGTATGAAAATA
TTATTTCTTTAATTCTCATAAGAGAATGAAAGGATTTTTGATTGAGTAAGTTCAACAAAG
TCTTTTTAGACT

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2D816TF 726 0 0
GG
AGACTATTAAAAGAGTAATATTGCTGTTGGTTGTTCGCCAATTCAATTTCAGCCCAAATG
AAATATAGATTACATTGGTGCTATAGTTTTGACACGTGTAGATAGCAAATCAAACTGACT
TTATTGATCATTACATAGAATTCAATTAAGATATTGTATGAAAATATTATTTCTTTAATT
CTCATAAGAGAATGAAAGGATTTTTGATTGAGTAAGTTCAACAAAGTCTTTTTAGACTAT
CTTTATTTATTTATTTTTTCCTTATATAAAAAATATATTAATAACTCAATCAAAATTAAA
TTATCCACAAGAACACCAATTTTTGTTATGCTTAATATATTTAATTTGATCTGTATTTGT
TTTAATTCGGCCCTTTTTTCAAGCACTTTTTTAGTCGCCAAATTGCCGGAGGCCTACGCC
TTTTTGAATCCAATCATAGATGTTATGCCCGTAATACCTCTTTTCTTTCTTCTCTTAGCC
TTTGTTTGGCAAGCAGCTGTAAGTTTTCGATGAAATTATTAATACTGTCTTAGACAAATT
CACGATTTTGATTCTTGCAACAATTCAAAAGATTCAAAAATCTTGACGTAGGAAAGAACT
CTCAATTCAAACATTGAATTTTTTT*GGTAGCCATACTAAATCTGGATCATTTGATTTCC
TCAGTTTTATCCTCTTTTCTCTAA*TGAAAGAACTTA*TTAGATTCGAGTTCACTCACAA
AAAA

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR2FN11JQ 560 0 0
G
GAAAATATTATTTCTTTAATTCTCATAAGAGAATGAAAGGATTTTTGATTGAGTAAGTTC
AACAAAGTCTTTTTAGACTATCTTTATTTATTTATTTTTTCCTTATATAAAAAATATATT
AATAACTCAATCAAAATTAAATTATCCACAAGAACACCAATTTTTGTTATGCTTAATATA
TTTAATTTGATCTGTATTTGTTTTAATTCGGCCCTTTTTTCAAGCACTTTTTTAGTCGCC
AAATTGCCGGAGGCCTACGCCTTTTTGAATCCAATCATAGATGTTATGCCCGTAATACCT
CTTTTCTTTCTTTTCTTAGCCTTTGTTTGGCAAGCAGCTGTAAGTTTTCGATGAAATTAT
TAATACTGTCTTAGACAAATTCACGATTTTGATCCTTGCAACAATTCAAAAGATTCAAAA
ATCTTGACGTAGGAAAGAACTCTCAATTCAAACATTGAATTTTTTT*GGTAGCCATACTA
AATCTGGATCATTTGATTTCCTCAGTTTTATCCTCTTTTCTCTAAATGAAAGAACTTAAT
TAGATTCGAGTTCACTCAC

QA 2 560 2 560
DS 

RD RR2FN11TF 560 0 0
G
GAAAATATTATTTCTTTAATTCTCATAAGAGAATGAAAGGATTTTTGATTGAGTAAGTTC
AACAAAGTCTTTTTAGACTATCTTTATTTATTTATTTTTTCCTTATATAAAAAATATATT
AATAACTCAATCAAAATTAAATTATCCACAAGAACACCAATTTTTGTTATGCTTAATATA
TTTAATTTGATCTGTATTTGTTTTAATTCGGCCCTTTTTTCAAGCACTTTTTTAGTCGCC
AAATTGCCGGAGGCCTACGCCTTTTTGAATCCAATCATAGATGTTATGCCCGTAATACCT
CTTTTCTTTCTTCTCTTAGCCTTTGTTTGGCAAGCAGCTGTAAGTTTTCGATGAAATTAT
TAATACTGTCTTAGACAAATTCACGATTTTGATCCTTGCAACAATTCAAAAGATTCAAAA
ATCTTGACGTAGGAAAGAACTCTCAATTCAAACATTGAATTTTTTT*GGTAGCCATACTA
AATCTGGATCATTTGATTTCCTCAGTTTTATCCTCTTTTCTCTAAATGAAAGAACTTAAT
TAGATTCGAGTTCACTCAC

QA 2 560 2 560
DS 

RD RR2D816JQ 718 0 0
AGACTATTAAAAGAGTAATATTGCTGTTGGTTGTTCGCCAATTCAATTTCAGCCCAAATG
AAATATAGATTACATTGGTGCTATAGTTTTGACACGTGTAGATAGCAAATCAAACTGACT
TTATTGATCATTACATAGAATTCAATTAAGATATTGTATGAAAATATTATTTCTTTAATT
CTCATAAGAGAATGAAAGGATTTTTGATTGAGTAAGTTCAACAAAGTCTTTTTAGACTAT
CTTTATTTATTTATTTTTTCCTTATATAAAAAATATATTAATAACTCAATCAAAATTAAA
TTATCCACAAGAACACCAATTTTTGTTATGCTTAATATATTTAATTTGATCTGTATTTGT
TTTAATTCGGCCCTTTTTTCAAGCACTTTTTTAGTCGCCAAATTGCCGGAGGCCTACGCC
TTTTTGAATCCAATCATAGATGTTATGCCCGTAATACCTCTTTTCTTTCTTTTCTTAGCC
TTTGTTTGGCAAGCAGCTGTAAGTTTTCGATGAAATTATTAATACTGTCTTAGACAAATT
CACGATTTTGATTCTTGCAACAATTCAAAAGATTCAAAAATCTTGACGTAGGAAAGAACT
CTCAATTCAAACATTGAATTTTTTT*GGTAGCCATACTAAATCTGGATCATTTGATTTCC
TCAGTTTTATCCTCTTTTCTCTAAATGAAAGAACTTAATTAGATTCGAGTTCACTCAC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2DP43JQ 668 0 0
AGCCCAAATGAAATATAGATTACATTGGTGCTATAGTTTTGACACGTGTAGATAGCAAAT
CAAACTGACTTTATTGATCATTACATAGAATTCAATTAAGATATTGTATGAAAATATTAT
TTCTTTAATTCTCATAAGAGAATGAAAGGATTTTTGATTGAGTAAGTTCAACAAAGTCTT
TTTAGACTATCTTTATTTATTTATTTTTTCCTTATATAAAAAATATATTAATAACTCAAT
CAAAATTAAATTATCCACAAGAACACCAATTTTTGTTATGCTTAATATATTTAATTTGAT
CTGTATTTGTTTTAATTCGGCCCTTTTTTCAAGCACTTTTTTAGTCGCCAAATTGCCGGA
GGCCTACGCCTTTTTGAATCCAATCATAGATGTTATGCCCGTAATACCTCTTTTCTTTTT
TTTCTTAGCCTTTGTTTGGCAAGCAGCTGTAAGTTTTCGATGAAATTATTAATACTGTCT
TAGACAAATTCACGATTTTGATTCTTGCAACAATTCAAAAGATTCAAAAATCTTGACGTA
GGAAAGAACTCTCAATTCAAACATTGAATTTTTTT*GGTAGCCATACTAAATCTGGATCA
TTTGGTTTCCTCAGTTTTATCCTCTTTTCTCTAAATGAAAGAACTTAATTAGATTCGAGT
TCACTCAC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2H503TF 591 0 0
G
GAAAATATTATTTCTTTAATTCTCATAAGAGAATGAAAGGATTTTTGATTGAGTAAGTTC
AACAAAGTCTTTTTAGACTATCTTTATTTATTTATTTTTTCCTTATATAAAAAATATATT
AATAACTCAATCAAAATTAAATTATCCACAAGAACACCAATTTTTGTTATGCTTAATATA
TTTAATTTGATCTGTATTTGTTTTAATTCGGCCCTTTTTTCAAGCACTTTTTTAGTCGCC
AAATTGCCGGAGGCCTACGCCTTTTTGAATCCAATCATAGATGTTATGCCCGTAATACCT
CTTTTCTTTCTTCTCTTAGCCTTTGTTTGGCAAGCAGCTGTAAGTTTTCGATGAAATTAT
TAATACTGTCTTAGACAAATTCACGATTTTGATTCTTGCAACAATTCAAAAGATTCAAAA
ATCTTGACGTAGGAAAGAACTCTCAATTCAAACATTGAATTTTTTT*GGTAGCCATACTA
AATCTGGATCATTTGATTTCCTCAGTTTTATCCTCTTTTCTCTAAATGAAAGAACTTAAT
TAGATTCGAGTTCACTCACAAAAAAAATATCTAGATATTTAGTATAAAAA

QA 2 591 2 591
DS 

RD RR2C429TF 565 0 0
GGAAAAA
AAAATATTATTTCTTTAATTCTCATAAGAGAATGAAAGGATTTTTGATTGAGTAAGTTCA
ACAAAGTCTTTTTAGACTATCTTTATTTATTTATTTTTTCCTTATATAAAAAATATATTA
ATAACTCAATCAAAATTAAATTATCCACAAGAACACCAATTTTTGTTATGCTTAATATAT
TTAATTTGATCTGTATTTGTTTTAATTCGGCCCTTTTTTCAAGCACTTTTTTAGTCGCCA
AATTGCCGGAGGCCTACGCCTTTTTGAATCCAATCATAGATGTTATGCCCGTAATACCTC
TTTTCTTTCTTCTCTTAGCCTTTGTTTGGCAAGCAGCTGTAAGTTTTCGATGAAATTATT
AATACTGTCTTAGACAAATTCACGATTTTGATTCTTGCAACAATTCAAAAGATTCAAAAA
TCTTGACGTAGGAAAGAACTCTCAATTCAAACATTGAATTTTTTT*GGTAGCCATACTAA
ATCTGGATCATTTGATTTCCTCAGTTTTATCCTCTTTTCTCTAAATGAAAGAACTTAATT
AGATTCGAGTTCACTCAC

QA 8 565 8 565
DS 

RD RR2EY12TF 680 0 0
GGA
AAAATATTATTTCTTTAATTCTCATAAGAGAATGAAAGGATTTTTGATTGAGTAAGTTCA
ACAAAGTCTTTTTAGACTATCTTTATTTATTTATTTTTTCCTTATATAAAAAATATATTA
ATAACTCAATCAAAATTAAATTATCCACAAGAACACCAATTTTTGTTATGCTTAATATAT
TTAATTTGATCTGTATTTGTTTTAATTCGGCCCTTTTTTCAAGCACTTTTTTAGTCGCCA
AATTGCCGGAGGCCTACGCCTTTTTGAATCCAATCATAGATGTTATGCCCGTAATACCTC
TTTTCTTTCTTCTCTTAGCCTTTGTTTGGCAAGCAGCTGTAAGTTTTCGATGAAATTATT
AATACTGTCTTAGACAAATTCACGATTTTGATTCTTGCAACAATTCAAAAGATTCAAAAA
TCTTGACGTAGGGAAGAACTCTCAATTCAAACATTGAATTTTTTT*GGTAGCCATACTAA
ATCTGGATCATTTGATTTCCTCAGTTTTATCCTCTTTTCTCTAAATGAAAGAACTTAATT
AGATTCGAGTTCACTCACAAAAAAAATATCTAGATATTTAGTATAAAAATAGAGAATCTA
TTCTCTTTTTTTTTTCAAAAAAAA*GTAAGATCTTGGAGATTGTGTAATGCTTACTCCCA
AACTTTTTGTATACACT

QA 4 680 4 680
DS 

RD RR2EM88TF 719 0 0
TTTTTTCCTTATATAAAAAATATATTAATAACTCAATCAAAATTAAATTATCCACAAGAA
CATCAATTTTTGTTATGCTTAATATATTTAATTTGATCTGTATTTGTTTTAATTCGGCCC
TTTTTTCAAGCACTTTTTTAGTCGCCAAATTGCCGGAGGCCTACGCCTTTTTGAATCCAA
TCATAGATGTTATGCCCGTAATACCTCTTTTCTTTCTTCTCTTAGCCTTTGTTTGGCAAG
CAGCTGTAAGTTTTCGATGAAATTATTAATACTGTCTTAGACAAATTCACGATTTTGATT
CTTGCAACAATTCAAAAGATTCAAAAATCTTGACGTAGGAAAGAACTCTCAATTCAAACA
TTGAATTTTTTTTGGTAGCCATACTAAATCTGGATCATTTGATTTCCTCAGTTTTATCCT
CTTTTCTCTAAATGAAAGAACTTAATTAGATTCGAGTTCACTCACAAAAAAAATATCTAG
ATATTTAGTATAAAAATAGAGAATCTATTCTCTTTTTTTTTC**AAAAAAA*GTAAGATC
TTGGAGATTGTGTAATGCTTACTCTCAAACTTTTTGTATACACTGTAGTTATATTCTTTG
TTTCTCTCTTCATATTTGGATTCCTATCTAATGATCCAGGACGTAATCCGGGACGTGAAG
AATAAAAA*CCTTTCTTTTT*ATTACTTTATTTAATATT*AATTAGTGAAAATGTGCGA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2EM88JQ 720 0 0
TTTTTGAATCCAATCATAGATGTTATGCCCGTAATACCTCTTTTCTTTCTTCTCTTAGCC
TTTGTTTGGCAAGCAGCTGTAAGTTTTCGATGAAATTATTAATACTGTCTTAGACAAATT
CACGATTTTGATTCTTGCAACAATTCAAAAGATTCAAAAATCTTGACGTAGGAAAGAACT
CTCAATTCAAACATTGAATTTTTTTTGGTAGCCATACTAAATCTGGATCATTTGATTTCC
TCAGTTTTATCCTCTTTTCTCTAAATGAAAGAACTTAATTAGATTCGAGTTCACTCACAA
AAAAAATATCTAGATATTTAGTATAAAAATAGAGAATCTATTCTCTTTTTTTTTC**AAA
AAAA*GTAAGATCTTGGAGATTGTGTAATGCTTACTCTCAAACTTTTTGTATACACTGTA
GTTATATTCTTTGTTTCTCTCTTCATATTTGGATTCCTATCTAATGATCCAGGACGTAAT
CCGGGACGTGAAGAATAAAAAACCTTTCTTTTTTATTACTTTATTTAATATTTAATTAGT
GAAAATGTGCGAATTTTATTAGCATTTTATCTATTTCACATCATCAAAAAGCGGAAGGGA
AAGA**GGGATTCGAACCCTCGGTACGATTAACTCGTACAATGGATTAGCAATCCAACGC
TTTAGTCCACTCAGCCATCTCTCCTAATCGAAAAGGGATACTTATTAGGTTCCATTAGAC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2EY12JQ 609 0 0
AGACAAATTCACGATTTTGATTCTTGCAACAATTCAAAAGATTCAAAAATCTTGACGTAG
GGAAGAACTCTCAATTCAAACATTGAATTTTTTT*GGTAGCCATACTAAATCTGGATCAT
TTGATTTCCTCAGTTTTATCCTCTTTTCTCTAAATGAAAGAACTTAATTAGATTCGAGTT
CACTCACAAAAAAAATATCTAGATATTTAGTATAAAAATAGAGAATCTATTCTCTTTTTT
TTTTCAAAAAAAAAGTAAGATCTTGGAGATTGTGTAATGCTTACTCCCAAACTTTTTGTA
TACACTGTAGTTATATTCTTTGTTTCTCTCTTCATATTTGGATTCCTATCTAATGATCCA
GGACGTAATCCGGGACGTGAAGAATAAAAAACCTTTCTTTTTTATTACTTTATTTAATAT
TTAATTAGTGAAAATGTGCGAATTTTATTAGCATTTTATCTATTTCACATCATCAAAAAG
CGGAAGGGAAAGAGAGGGATTCGAACCCTCGGTACGATTAACTCGTACAATGGATTAGCA
ATCCAACGCTTTAGTCCACTCAGCCATCTCTCCTAATCGAAAAGGGATACTTATTAGGTT
CCATTAGAC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2H503JQB 366 0 0
CAAA
AAAAAAAGTAAGATCTTGGAGATTGTGTAATGCTTACTCTCAAACTTTTTGTATACACTG
TAGTTATATTCTTTGTTTCTCTCTTCATATTTGGATTCCTATCTAATGATCCAGGACGTA
ATCCGGGACGTGAAGAATAAAAAACCTTTCTTTTTTATTACTTTATTTAATATTTAATTA
GTGAAAATGTGCGAATTTTATTAGCATTTTATCTATTTCACATCATCAAAAAGCGGAAGG
GAAAGAGAGGGATTCGAACCCTCGGTACGATTAACTCGTACAATGGATTAGCAATCCAAC
GCTTTAGTCCACTCAGCCATCTCTCCTAATCGAAAAGGGATACTTATTAGGTTCCATTAG
AC

QA 5 366 5 366
DS 



AS 2 13

CO CL330Contig1 650 10 18 U
GGAACCAAAACTCCTCTCTGAGTACACTTATTTTCAAACCTCAAACTGTTTTGAGATATT
TAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTGGATAATAGTATCCCAAACAAAACATGGCTAAGTCATAT
GGAGCTCTCTTCCTCCTGGCCCTCATTGTCTTCTCCTTGCTTCAAACCATGGTTATGGCC
TCAAGTGGATCTAGAGTGAAGTATGACCCGAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTGAAACGT
TCCCAATGCCCCAAGGAATGCGATAGGAGGTGTAGCCAGACACAGTACCACAACGCTTGC
ATTTTGTTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAGTGTTTGTGTGTGCCACCAGGGTACTATGGA
AACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAGGGTGGACCAAAATGC
CCTTAAACCCTCTCCTAATCCTTTTGATATATTGTTCCTTTTTATAATAAAAATTATCTG
*ATGATAGTTTTATTCACTTTTGATCAATGGTTGTTATTTCGTTTCTATCTTATTTTATT
CCTAATGTTGTAAGTTATGTCACTCCTTTGGGATTTTGTTTCAAATCCTAGAAAAAAAAC
GGAGAGTGGCCTATGAATGAGATATTTTCTTAAATATTTTTACGTGTTTC


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX88TFB U 405
AF RR2F353TF U 187
AF RR2DR92TF U 1
AF RR2AX88JQ C 1
AF RR2BC56JQ C 1
AF RR2FO04TF U 1
AF RR2BC56TF U 1
AF RR2DR92JQ C 1
AF RR2GL34JQ C 229
AF RR2GL34TF U 229
BS 1 92 RR2FO04TF
BS 93 93 RR2BC56TF
BS 94 186 RR2FO04TF
BS 187 225 RR2F353TF
BS 226 226 RR2FO04TF
BS 227 305 RR2F353TF
BS 306 306 RR2FO04TF
BS 307 376 RR2F353TF
BS 377 377 RR2FO04TF
BS 378 404 RR2F353TF
BS 405 480 RR2AX88TFB
BS 481 481 RR2F353TF
BS 482 559 RR2AX88TFB
BS 560 565 RR2F353TF
BS 566 632 RR2FO04TF
BS 633 635 RR2BC56TF
BS 636 641 RR2GL34TF
BS 642 650 RR2DR92JQ

RD RR2AX88TFB 155 0 0
GGGTGGACCAAAATGCCCTTAAACCCTCTCCTAATCCTTTTGATATATTGTTCCTTTTTA
TAATAAAAATTATCTGGATGATAGTTTTATTCACTTTTGATCAATGGTTGTTATTTCGTT
TCTATCTTATTTTATTCCTAATGTTGTAAGTTATG

QA 1 155 1 155
DS 

RD RR2F353TF 379 0 0
GGATCTAGAGTGAAGTATGACCCGAAACGTTATGGACCACGAAGCCTGAAACGTTCCCAA
TGCCCCAAGGAATGCGATAGGAGGTGTAGCCAGACACAGTACCACAACGCTTGCATTTTT
TTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAGTGTTTGTGTGTGCCACCAGGGTACTATGGAAACAAA
CAAGTTTGCTTTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAGGGTGGACCAAAATGCCCTTAA
ACCCTCTCCTAATCCTTTTGATATATTGTTCCTTTTTATAATAAAAATTATCTG*ATGAT
AGTTTTATTCACTTTTGATCAATGGTTGTTATTTCGTTTCTATCTTATTTTATTCCTAAT
GTTGTAAGTTATGTCACTC

QA 1 379 1 379
DS 

RD RR2DR92TF 587 0 0
GGAACCAAAACTCCTCTCTGAGTACACTTATTTTCAAACCTCAAACTGTTTTGAGATATT
TAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTGGATAATAGTATCCCAAACAAAACATGGCTAAGTCATAT
GGAGCTCTCTTCCTCCTGGCCCTCATTGTCTTCTCCTTGCTTCAAACCATGGTTATGGCC
TCAAGTGGATCTAGAGTGAAGTATGACCCAAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTGAAACGT
TCCCAATGCCCCAAGGAATGCGATAGGAGGTGTAGCCAGACACAGTACCACAACGCTTGC
ATTTTGTTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAGTGTTTGCGTGTGCCACCAGGGTACTATGGA
AACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAGCAACTGGAAAACTCAACAGGGTGGACCAAAATGC
CCTTAAACCCTCTCCTAATCCTTTTGATATATTGTTCCTTTTTATAATAAAAATTATCTG
*ATGATAGTTTTATTCACTTTTGATCAATGGTTGTTATTTCGTTTCTATCTTATTTTATT
CCTAATGTTGTAAGTTATGTCACTCCTTTGGGATTTTGTTTCAAATC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2AX88JQ 631 0 0
GGAACCAAAACTCCTCTCTGAGTACACTTATTTTCAAACCTCAAACTGTTTTGAGATATT
TAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTGGATAATAGTATCCCAAACAAAACATGGCTAAGTCATAT
GGAGCTCTCTTCCTCCTGGCCCTCATTGTCTTCTCCTTGCTTCAAACCATGGTTATGGCC
TCAAGTGGATCTAGAGTGAAGTATGACCCGAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTGAAACGT
TCCCAATGCCCCAAGGAATGCGATAGGAGGTGTAGCCAGACACAGTACCACAACGCTTGC
ATTTTGTTTTGCAACAAATGCTGCAGAAAGTGTTTGTGTGTGCCACCAGGGTACTATGGA
AACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAGGGTGGACCAAAATGC
CCTTAAACCCTCTCCTAATCCTTTTGATATATTGTTCCTTTTTATAATAAAAATTATCTG
*ATGATAGTTTTATTCACTTTTGATCAATGGTTGTTATTTCGTTTCTATCTTATTTTATT
CCTAATGTTGTAAGTTATGTCACTCCTTTGGGATTTTGTTTCAAATCCTAGAAAAAAAAC
GGAGAGTGGCCTATGAATGAGATATTTTCTT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2BC56JQ 635 0 0
GGAACCAAAACTCCTCTCTGAGTACACTTATTTTCAAACCTCAAACTGTTTTGAGATATT
TAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTGGATAATAGTATCCCAAACAAAACATGGCTAAGTCATAT
GGAGCTCTCTTCCTCCTGGCCCTCATTGTCTTCTCCTTGCTTCAAACCATGGTTATGGCC
TCAAGTGGATCTAGAGTGAAGTATGACCCGAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTGAAACGT
TCCCAATGCCCCAAGGAATGCGATAGGAGGTGTAGCCAGACACAGTACCACAACGCTTGC
ATTTTGTTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAGTGTTTGTGTGTGCCACCAGGGTACTATGGA
AACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAGGGTGGACCAAAATGC
CCTTAAACCCTCTCCTAATCCTTTTGATATATTGTTCCTTTTTATAATAAAAATTATCTG
*ATGATAGTTTTATTCACTTTTGATCAATGGTTGTTATTTCGTTTCTATCTTATTTTATT
CCTAATGTTGTAAGTTATGTCACTCCTTTGGGATTTTGTTTCAAATCCTAGAAAAAAA*C
GGAGAGTGGCCTATGAATGAGATATTTTCTTAAAT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2FO04TF 632 0 0
GGAACCAAAACTCCTCTCTGAGTACACTTATTTTCAAACCTCAAACTGTTTTGAGATATT
TAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTGGATAATAGTACCCCAAACAAAACATGGCTAAGTCATAT
GGAGCTCTCTTCCTCCTGGCCCTCATTGTCTTCTCCTTGCTTCAAACCATGGTTATGGCC
TCAAGTGGATCTAGAGTGAAGTATGACCCGAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTGAAACGT
TCCCAATGCCCCAAGGAATGCGATAGGAGGTGTAGCCAGACACAGTACCACAACGCTTGC
ATTTTGTTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAGTGTTTGTGTGTGCCACCAGGGTACTATGGA
AATAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAGGGTGGACCAAAATGC
CCTTAAACCCTCTCCTAATCCTTTTGATATATTGTTCCTTTTTATAATAAAAATTATCTG
*ATGATAGTTTTATTCACTTTTGATCAATGGTTGTTATTTCGTTTCTATCTTATTTTATT
CCTAATGTTGTAAGTTATGTCACTCCTTTGGGATTTTGTTTCAAATCCTAGAAAAAAAAC
GGAGAGTGGCCTATGAATGAGATATTTTCTTA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2BC56TF 635 0 0
GGAACCAAAACTCCTCTCTGAGTACACTTATTTTCAAACCTCAAACTGTTTTGAGATATT
TAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTGGATAATAGTATCCCAAACAAAACATGGCTAAGTCATAT
GGAGCTCTCTTCCTCCTGGCCCTCATTGTCTTCTCCTTGCTTCAAACCATGGTTATGGCC
TCAAGTGGATCTAGAGTGAAGTATGACCCGAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTGAAACGT
TCCCAATGCCCCAAGGAATGCGATAGGAGGTGTAGCCAGACACAGTACCACAACGCTTGC
ATTTTGTTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAGTGTTTGTGTGTGCCACCAGGGTACTATGGA
AACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAGGGTGGACCAAAATGC
CCTTAAACCCTCTCCTAATCCTTTTGATATATTGTTCCTTTTTATAATAAAAATTATCTG
*ATGATAGTTTTATTCACTTTTGATCAATGGTTGTTATTTCGTTTCTATCTTATTTTATT
CCTAATGTTGTAAGTTATGTCACTCCTTTGGGATTTTGTTTCAAATCCTAGAAAAAAA*C
GGAGAGTGGCCTATGAATGAGATATTTTCTTAAAT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2DR92JQ 650 0 0
GGAACCAAAACTCCTCTCTGAGTACACTTATTTTCAAACCTCAAACTGTTTTGAGATATT
TAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTGGATAATAGTATCCCAAACAAAACATGGTTAAGTCATAT
GGAGCTCTCTTCCTCCTGGCCCTCATTGTCTTCTCCTTGCTTCAAACCATGGTTATGGCC
TCAAGTGGATCTAGAGTGAAGTATGACCCAAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTGAAACGT
TCCCAATGCCCCAAGGAATGCGATAGGAGGTGTAGCCAGACACAGTACCACAACGCTTGC
ATTTTGTTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAGTGTTTGCGTGTGCCACCAGGGTACTATGGA
AACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAGCAACTGGAAAACTCAACAGGGTGGACCAAAATGC
CCTTAAACCCTCTCCTAATCCTTTTGATATATTGTTCCTTTTTATAATAAAAATTATCTG
*ATGATAGTTTTATTCACTTTTGATCAATGGTTGTTATTTCGTTTCTATCTTATTTTATT
CCTAATGTTGTAAGTTATGTCACTCCTTTGGGATTTTGTTTCAAATCCTAGAAAAAAAAC
GGAGAGTGGCCTATGAATGAGATATTTTCTTAAATATTTTTACGTGTTTC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2GL34JQ 413 0 0
G
GCCTGAAACGTTCCCAATGCCCCAAGGAATGCGATAGGAGGTGTAGCCAGACACAGTACC
ACAACGCTTGCATTTTGTTTTGCAACAAATGCTGCAGAAAGTGTTTGTGTGTGCCACCAG
GGTACTATGGAAACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAGGGTG
GACCAAAATGCCCTTAAACCCTCTCCTAATCCTTTTGATATATTGTTCCTTTTTATAATA
AAAATTATCTG*ATGATAGTTTTATTCACTTTTGATCAATGGTTGTTATTTCGTTTCTAT
CTTATTTTATTCCTAATGTTGTAAGTTATGTCACTCCTTTGGGATTTTGTTTCAAATCCT
AGAAAAAAAACGGAGAGTGGCCTATGAATGAGATATTTTCTTAAATATTTTT

QA 2 413 2 413
DS 

RD RR2GL34TF 413 0 0
G
GCCTGAAACGTTCCCAATGCCCCAAGGAATGCGATAGGAGGTGTAGCCAGACACAGTACC
ACAACGCTTGCATTTTGTTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAGTGTTTGTGTGTGCCACCAG
GGTACTATGGAAACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAGGGTG
GACCAAAATGCCCTTAAACCCTCTCCTAATCCTTTTGATATATTGTTCCTTTTTATAATA
AAAATTATCTG*ATGATAGTTTTATTCACTTTTGATCAATGGTTGTTATTTCGTTTCTAT
CTTATTTTATTCCTAATGTTGTAAGTTATGTCACTCCTTTGGGATTTTGTTTCAAATCCT
AGAAAAAAAACGGAGAGTGGCCTATGAATGAGATATTTTCTTAAATATTTTT

QA 2 413 2 413
DS 



CO CL330Contig2 1104 3 6 U
GCATTATATTAATCATCTCACATACTTTCCTGTTGAATTTATAAAGACAATGTGATTCAG
TCATGGGTGTGGTACTTTAAAGACTACCTTGTTTATGAGATTAAAACGTTCTTGAACTCT
ATTTGGTCTTTAGGTTATGGCCTCAAGTGGATCTAGAGTGAAGTATGACCCGGTAAGCCT
TACATTTCAAACTGAATGACTTTAAATTAATATTCTCACCTATCTATCTCTTAACAAATG
TGATTAATGACTTTCTACTTTTTGGATAATATTCAGAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTG
AAACGTTCCCGTAAGTGTTTACTTCACAGTTTCTTCATAAATAATCTGGATTAAAAATTT
AAAACCTATTTGATAAGTGAAAAACGGTTAGAACAAGTTGAAAGTGGATGGATGATTGGT
AAGTGGACTGTTTGGTCAGATCCGCAAGACTCTCAATCAATTTATTTATTGGCTAATTTA
CCCGTGAATAATGGGCCAAGAGTCAAAGCAACCCACTGTCTTGGGACCACCCATAAACGG
GCAAAAAGACATGAACGTTTCTTTGTTTTTTTCAGTATATTCAGTTAATTTTTTTTCTTG
GACAACAGTAGATTCAGTTAATTTACATCTAAAACATGTGATGGTGTAAAATGAACAGAA
TGCCCCAAGGAATGCGATAGGAGGTGTAGCCAGACACAGTACCACAACGCTTGCATTTTG
TTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAGTGTTTGTGTGTGCCACCAGGGTACTATGGAAACAAA
CAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAGGGTGGACCAAAATGCCCTTAA
ACCCTCTCCTAATCCTTTTGATATATTGTTCCTTTTTATAATAAAAATTATCTGATGATA
GTTTTATTCACTTTTGATCAATGGTTGTTATTTCGTTTCTATCTTATTTTATTCCTAATG
TTGTAAGTTATGTCACTCCTTTGGGATTTTGTTTCAAATCCTAGAAAAAAAACGGAGAGT
GGCCTATGAATGAGATATTTTCTTAAATATTTTTACGCGTTTCAAAAAATTTCCCCAAAC
AAATACAGAATCTCATACTTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG39TF U 1
AF RR2BG39JQ C 196
AF RR2GL33TF U 688
BS 1 820 RR2BG39TF
BS 821 821 RR2GL33TF
BS 822 830 RR2BG39TF
BS 831 831 RR2GL33TF
BS 832 876 RR2BG39TF
BS 877 1104 RR2GL33TF

RD RR2BG39TF 876 0 0
GCATTATATTAATCATCTCACATACTTTCCTGTTGAATTTATAAAGACAATGTGATTCAG
TCATGGGTGTGGTACTTTAAAGACTACCTTGTTTATGAGATTAAAACGTTCTTGAACTCT
ATTTGGTCTTTAGGTTATGGCCTCAAGTGGATCTAGAGTGAAGTATGACCCGGTAAGCCT
TACATTTCAAACTGAATGACTTTAAATTAATATTCTCACCTATCTATCTCTTAACAAATG
TGATTAATGACTTTCTACTTTTTGGATAATATTCAGAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTG
AAACGTTCCCGTAAGTGTTTACTTCACAGTTTCTTCATAAATAATCTGGATTAAAAATTT
AAAACCTATTTGATAAGTGAAAAACGGTTAGAACAAGTTGAAAGTGGATGGATGATTGGT
AAGTGGACTGTTTGGTCAGATCCGCAAGACTCTCAATCAATTTATTTATTGGCTAATTTA
CCCGTGAATAATGGGCCAAGAGTCAAAGCAACCCACTGTCTTGGGACCACCCATAAACGG
GCAAAAAGACATGAACGTTTCTTTGTTTTTTTCAGTATATTCAGTTAATTTTTTTTCTTG
GACAACAGTAGATTCAGTTAATTTACATCTAAAACATGTGATGGTGTAAAATGAACAGAA
TGCCCCAAGGAATGCGATAGGAGGTGTAGCCAGACACAGTACCACAACGCTTGCATTTTG
TTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAGTGTTTGTGTGTGCCACCAGGGTACTATGGAAACAAA
CAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAGG*TGGACCAAA*TGCCCTTAA
ACCCTCTCCTAATCCTTTTGATATATTGTTCCTTTT

QA 1 876 1 876
DS 

RD RR2BG39JQ 868 0 0
ATGACTTTAAATTAATATTCTCACCTATCTATCTCTTAACAAATGTGATTAATGACTTTC
TACTTTTTGGATAATATTCAGAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTGAAACGTTCCCGTAAG
TGTTTACTTCACAGTTTCTTCATAAATAATCTGGATTAAAAATTTAAAACCTATTTGATA
AGTGAAAAACGGTTAGAACAAGTTGAAAGTGGATGGATGATTGGTAAGTGGACTGTTTGG
TCAGATCCGCAAGACTCTCAATCAATTTATTTATTGGCTAATTTACCCGTGAATAATGGG
CCAAGAGTCAAAGCAACCCACTGTCTTGGGACCACCCATAAACGGGCAAAAAGACATGAA
CGTTTCTTTGTTTTTTTCAGTATATTCAGTTAATTTTTTTTCTTGGACAACAGTAGATTC
AGTTAATTTACATCTAAAACATGTGATGGTGTAAAATGAACAGAATGCCCCAAGGAATGC
GATAGGAGGTGTAGCCAGACACAGTACCACAACGCTTGCATTTTGTTCTGCAACAAATGC
TGCAGAAAGTGTTTGTGTGTGCCACCAGGGTACTATGGAAACAAACAAGTTTGCTCTTGC
TACAACAACTGGAAAACTCAACAGGGTGGACCAAAATGCCCTTAAACCCTCTCCTAATCC
TTTTGATATATTGTTCCTTTTTATAATAAAAATTATCTGATGATAGTTTTATTCACTTTT
GATCAATGGTTGTTATTTCGTTTCTATCTTATTTTATTCCTAATGTTGTAAGTTATGTCA
CTCCTTTGGGATTTTGTTTCAAATCCTAGAAAAAAAACGGAGAGTGGCCTATGAATGAGA
TATTTTCTTAAATATTTTTACGTGTTTC

QA 1 868 1 868
DS 

RD RR2GL33TF 417 0 0
G
GCCAGACACAGTACCACAACGCTTGCATTTTGTTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAGTGTT
TGTGTGTGCCACCAGGGTACTATGGAAACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGA
AAACTCAACAGGGTGGACCAAAATGCCCTTAAACCCTCTCCTAATCCTTTTGATATATTG
TTCCTTTTTATAATAAAAATTATCTGATGATAGTTTTATTCACTTTTGATCAATGGTTGT
TATTTCGTTTCTATCTTATTTTATTCCTAATGTTGTAAGTTATGTCACTCCTTTGGGATT
TTGTTTCAAATCCTAGAAAAAAAACGGAGAGTGGCCTATGAATGAGATATTTTCTTAAAT
ATTTTTACGCGTTTCAAAAAATTTCCCCAAACAAATACAGAATCTCATACTTAGCC

QA 2 417 2 417
DS 



AS 2 10

CO CL331Contig1 1119 8 19 U
GTCAGTACTAACCACCAAGTTTATGTATTAATATATTCTCACAAAATAAAAATAAAATAC
ATTACTGCCTCAAATTGATTTATATGTATAGGGTTCCAATATACATCTGAGAATCGGGAA
CGACCAACACATATTTCAGTTATATCAAAACTGAAATAACCGTGTATGGCTTATTTGCAA
ATATATTCGAATTAAAATTTTCAGTAAAAGATAAAGCACTGATTATAACAGTTTTTT*AT
ATTCTCACGTGATAAAAAGTATGTTTTGTATATCAACACCTTGTATTTGTTTAGACGTTA
GGGCTCTAAACAAATACAATCTATTCTTCAGAATTTGGAGGCAATATCGCTTCTTTTGCC
TCGGCTGCTTTCTCTCCAATGTATATAGCCGTTTTTTTGCTCATATCCGTCGCCAACTCT
TTGGCTTCACCAGCTTTTTCGATGATGAAATCTTTAGCTTCACCTGTTTTTTCAACTACG
AAATCTTTGGCTTTCTCTGTAATTGAAACAGCTTCTTCCTCCATCACTTTGGCTTTTTCC
GCCACAAAATCTGAAGCTGTGTGAGCATTTTCAGTCACCATGTCCATGGCTACACCAGCT
TTCTCCATAAAATAGTGTTTTGCTCTTTGTATGTGATCTAAAACCTCTTGTCCTTCATGT
GCAGTCAAGTGTCCAACTTCGCTTCCTTTCTCCTTCACGTACTCGGAAGCTTTCTCTGAG
GCATCATCGAGCCATTTTGGATCTAGCTTTGAGTTGCCATCATCACCTTTCACGGCGGCC
ATGACCCACGACTTCTTGCGCTGAGGTGAAATGATCACATTCTTCCAGCCAACTCTCATA
TATATACGGCCGACGCTGCTTCTCCTTCTGATCGAGACAGTAGAACCCAATCCACTAAGC
ATAGCTCCGGAGATCAAAGTTGCCATGAGGCCACCTCTTGCCTTTTCTCTCAGAGGCTGG
CGTGGAATAGTTTCTAACCAGTTAGAATGTAATGACATCCAATTTGTTTCGTTCCAGATA
CGCTGGAGAAGTAGAAACATAAACAGACTATGAGATGCTTACAAAAATCGAATGTTTAGG
ATAGAGGGGAGAAATACATGTCATGCCGGTCGCATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 45 45 30 30 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 5 5 5 20 20 5 20 20 5 20 5 20 20 5 5 5 5 20 5 20 5 20 5 5 20 20 5 5 20 5 20 20 0 15 15 0 0 15 0 0 0 0 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ33JQ U 67
AF RR2B359JQ U 1
AF RR2BW35JQ U 48
AF RR2D454JQ U 23
AF RR2CH03JQ U 206
AF RR2BW35TF C 330
AF RR2H595TF C 435
AF RR2CH03TF C 344
BS 1 62 RR2B359JQ
BS 63 63 RR2D454JQ
BS 64 624 RR2B359JQ
BS 625 627 RR2D454JQ
BS 628 696 RR2B359JQ
BS 697 697 RR2D454JQ
BS 698 801 RR2B359JQ
BS 802 831 RR2D454JQ
BS 832 832 RR2CH03JQ
BS 833 844 RR2D454JQ
BS 845 986 RR2CH03JQ
BS 987 987 RR2BW35TF
BS 988 1010 RR2CH03JQ
BS 1011 1060 RR2BW35TF
BS 1061 1061 RR2CH03TF
BS 1062 1063 RR2BW35TF
BS 1064 1065 RR2CH03TF
BS 1066 1068 RR2BW35TF
BS 1069 1119 RR2CH03TF

RD RR2FZ33JQ 624 0 0
GCCTCAAATTGATTTATATGTATAGGGTTCCAATATACATCTGAGAATCGGGAACGACCA
ACACATATTTCAGTTATATCAAAACTGAAATAACCGTGTATGGCTTATTTGCAAATATAT
TCGAATTAAAATTTTCAGTAAAAGATAAAGCACTGATTATAACAGTTTTTT*ATATTCTC
ACGTGATAAAAAGTATGTTTTGTATATCAACACCTTGTATTTGTTTAGACGTTAGGGCTC
TAAACAAATACAATCTATTCTTCAGAATTTGGAGGCAATATCGCTTCTTTTGCCTCGGCT
GCTTTCTCTCCAATGTATATAGCCGTTTTTTTGCTCATATCCGTCGCCAACTCTTTGGCT
TCACCAGCTTTTTCGATGATGAAATCTTTAGCTTCACCTGTTTTTTCAACTACGAAATCT
TTGGCTTTCTCTGTAATTGAAACAGCTTCTTCCTCCATCACTTTGGCTTTTTCCGCCACA
AAATCTGAAGCTGTGTGAGCATTTTCAGTCACCATGTCCATGGCTACACCAGCTTTCTCC
ATAAAATAGTGTTTTGCTCTTTGTATGTGATCTAAAACCTCTTGTCCTTCATGTGCAGTC
AAGTGTCCAACTTCGCTTCCTTTC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2B359JQ 801 0 0
GTCAGTACTAACCACCAAGTTTATGTATTAATATATTCTCACAAAATAAAAATAAAATAC
ATCACTGCCTCAAATTGATTTATATGTATAGGGTTCCAATATACATCTGAGAATCGGGAA
CGACCAACACATATTTCAGTTATATCAAAACTGAAATAACCGTGTATGGCTTATTTGCAA
ATATATTCGAATTAAAATTTTCAGTAAAAGATAAAGCACTGATTATAACAGTTTTTT*AT
ATTCTCACGTGATAAAAAGTATGTTTTGTATATCAACACCTTGTATTTGTTTAGACGTTA
GGGCTCTAAACAAATACAATCTATTCTTCAGAATTTGGAGGCAATATCGCTTCTTTTGCC
TCGGCTGCTTTCTCTCCAATGTATATAGCCGTTTTTTTGCTCATATCCGTCGCCAACTCT
TTGGCTTCACCAGCTTTTTCGATGATGAAATCTTTAGCTTCACCTGTTTTTTCAACTACG
AAATCTTTGGCTTTCTCTGTAATTGAAACAGCTTCTTCCTCCATCACTTTGGCTTTTTCC
GCCACAAAATCTGAAGCTGTGTGAGCATTTTCAGTCACCATGTCCATGGCTACACCAGCT
TTCTCCATAAAATAGTGTTTTGCT***TGTATGTGATCTAAAACCTCTTGTCCTTCATGT
GCAGTCAAGTGTCCAACTTCGCTTCCTTTCTCCTTCGCGTACTCGGAAGCTTTCTCTGAG
GCATCATCGAGCCATTTTGGATCTAGCTTTGAGTTGCCATCATCACCTTTCACGGCGGCC
ATGACCCACGACTTCTTGCGC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2BW35JQ 771 0 0
AAAAATAAAATACATTACTGCCTCAAATTGATTTATATGTATAGGGTTCCAATATACATC
TGAGAATCGGGAACGACCAACACATATTTCAGTTATATCAAAACTGAAATAACCGTGTAT
GGCTTATTTGCAAATATATTCGAATTAAAATTTTCAGTAAAAGATAAAGCACTGATTATA
ACAGTTTTTT*ATATTCTCACGTGATAAAAAGTATGTTTTGTATATCAACACCTTGTATT
TGTTTAGACGTTAGGGCTCTAAACAAATACAATCTATTCTTCAGAATTTGGAGGCAATAT
CGCTTCTTTTGCCTCGGCTGCTTTCTCTCCAATGTATATAGCCGTTTTTTTGCTCATATC
CGTCGCCAACTCTTTGGCTTCACCAGCTTTTTCGATGATGAAATCTTTAGCTTCACCTGT
TTTTTCAACTACGAAATCTTTGGCTTTCTCTGTAATTGAAACAGCTTCTTCCTCCATCAC
TTTGGCTTTTTCCGCCACAAAATCTGAAGCTGTGTGAGCATTTTCAGTCACCATGTCCAT
GGCTACACCAGCTTTCTCCATAAAATAGTGTTTTGCTCTTTGTATGTGATCTAAAACCTC
TTGTCCTTCATGTGCAGTCAAGTGTCCAACTTCGCTTCCTTTCTCCTTCACGTACTCGGA
AGCTTTCTCTGAGGCATCGTCGAGCCATTTTGGATCTAGCTTTGAGTTGCCATCATCACC
TTTCACGGCGGCCATGACCCACGACTTCTTGCGCTGAGGTGAA
TGATCACA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2D454JQ 822 0 0
G
TGTATTAATATATTCTCACAAAATAAAAATAAAATACATTACTGCCTCAAATTGATTTAT
ATGTATAGGGTTCCAATATACATCTGAGAATCGGGAACGACCAACACATATTTCAGTTAT
ATCAAAACTGAAATAACCGTGTATGGCTTATTTGCAAATATATTCGAATTAAAATTTTCA
GTAAAAGATAAAGCACTGATTATAACAGTTTTTTTATATTCTCACGTGATAAAAAGTATG
TTTTGTATATCAACACCTTGTATTTGTTTAGACGTTAGGGCTCTAAACAAATACAATCTA
TTCTTCGGAATTTGGAGGCAATATCGCTTCTTTTGCCTCGGCTGCTTTCTCTCCAATGTA
TATAGCCGTTTTTTTGCTCATATCCGTCGCCAACTCTTTGGCTTCACCAGCTTTTTCGAT
GATGAAATCTTTAGCTTCACCTGTCTTTTCGACTACGAAATCTTTGGCTTTCTCTGTAAT
TGAAACAGCTTCTTCCTCCATCACTTTGGCTTTTTCCGCCACAAAATCTGAAGCTGTGTG
AGCATTTTCAGTCACCATGTCCATGGCTACACCAGCTTTCTCCATAAAATAGTGTTTTGC
TCTTTGTATGTGATCTAAAACCTCTTGTCCTTCATGTGCA*TCAAGTGTCCAACTTCGCT
TCCTTTCTCCTTCACGTACTCGGAAGCTTTCTCTGAGGCATCATCGAGCCATTTTGGATC
TAGCTTTGAGTTGCCATCATCACCTTTCACGGCGGCCATGACCCACGACTTCTTGCGCTG
AGGTGAAATGATCACATTCTTCCAGCCA*CTCTCATATATA

QA 2 822 2 822
DS 

RD RR2CH03JQ 805 0 0
AAAAGATAAAGCACTGATTATAACAGTTTTTT*ATATTCTCACGTGATAAAAAGTATGTT
TTGTATATCAACACCTTGTATTTGTTTAGACGTTAGGGCTCTAAACAAATACAATCTATT
CTTCAGAATTTGGAGGCAATATCGCTTCTTTTGCCTCGGCTGCTTTCTCTCCAATGTATA
TAGCCGTTTTTTTGCTCATATCCGTCGCCAACTCTTTGGCTTCACCAGCTTTTTCGATGA
TGAAATCTTTAGCTTCACCTGTTTTTTCAACTACGAAATCTTTGGCTTTCTCTGTAATTG
AAACAGCTTCTTCCTCCACCACTTTGGCTTTTTCCGCCACAAAATCTGAAGCTGTGTGAG
CATTTTCAGTCACCATGTCCATGGCTACACCAGCTTTCTCCATAAAATAGTGTTTTGCTC
TTTGTATGTGATCTAAAACCTCTTGTCCTTCATGTGCAGTCAAGTGTCCAACTTCGCTTC
CTTTCTCCTTCACGTACTCGGAAGCTTTCTCTGAGGCATCATCGAGCCATTTTGGATCTA
GCTTTGAGTTGCCATCATCACCTTTCACGGCGGCCATGACCCACGACTTCTTGCGCTGAG
GTGAAATGATCACATTCTTCCAGCCAACTCTCATATATATACGGCCGACGCTGCTTCTCC
TTCTGATCGAGACAGTAGAACCCAATCCACTAAGCATAGCTCCGGAGATCAAAGTTGCCA
TGAGGCCACCTCTTGCCTTTTCTCTCAGAGGCTGGCGTGGAATAGTTTCTAACCAGTTAG
A*TGTAATGACATCCAATTTGTTTC

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2BW35TF 740 0 0
CAG
ATTTGGAGGCAATATCGCT*CTTTG**CTCGGCTGCTTTCTCTCCAATGTATATAGCG**
TTTTTTGCTCATATCCGTCGCCAACTCTTTGGCTTCACCAGCTTTTTCGATGATGAAATC
TTTAGCTTCACCTGT*TTTTCAACTACGAAATCTTTGGCTTTCTCTGTAATTGAAACAGC
TTCTTCCTCCATCACTTTGGCTTTTTCCGCCACAAAATCTGAAGCTGTGTGAGCATTTTC
AGTCACCATGTCCATGGCTACACCAGCTTTCTCCATAAAATAGTGTTTTGCTCTTTGTAT
GTGATCTAAAACCTCTTGTCCTTCATGTGCAGTCAAGTGTCCAACTTCGCTTCCTTTCTC
CTTCACGTACTCGGAAGCTTTCTCTGAGGCATCGTCGAGCCATTTTGGATCTAGCTTTGA
GTTGCCATCATCACCTTTCACGGCGGCCATGACCCACGACTTCTTGCGCTGAGGTGAAAT
GATCACATTCTTCCAGCCAACTCTCATATATATACGGCCGACGCTGCTTCTCCTTCTGAT
CGAGACAGTAGAACCCAATCCACTAAGCATAGCTCCGGAGATCAAAGTTGCCATGAGGCC
ACCTCTTGCCTTTTCTCTCAGAGGCTGGCGTGGAATAGTTTCTAACCAGTTAGAATGTAA
TGACATCCAATTTGTTTCGTTCCAGATACGCTGGAGAAGTAGAAACATAAACAGACTATG
AGATGCTTGCATGAAT
C

QA 4 739 4 739
DS 

RD RR2H595TF 623 0 0
TTTTTCGATGATGAAATCTTTAGCTTCACCTGTTTTTTCAACTACGAAATCTTTGGCTTT
CTCTGTAATTGAAACAGCTTCTTCCTCCATCACTTTGGCTTTTTCCGCCACAAAATCTGA
AGCTGTGTGAGCATTTTCAGCCACCATGTCCATGGCTACACCAGCTTTCTCCATAAAATA
GTGTTTTGCTCTTTGTATGTGATCTAAAACCTCTTGTCCTTCATGTGCAGTCAAGTGTCC
AACTTCGCTTCCTTTCTCCTTCACGTACTCGGAAGCTTTCTCTGAGGCATCATCGAGCCA
TTTTGGATCTAGCTTTGAGTTGCCATCATCACCTTTCACGGCGGCCATGACCCACGACTT
CTTGCGCTGAGGTGAAATGATCACATTCTTCCAGCCAACTCTCATATATATACGGCCGAC
GCTGCTTCTCCTTCTGATCGAGACAGTAGAACCCAATCCACTAAGCATAGCTCCGGAGAT
CAAAGTTGCCATGAGGCCACCTCTTGCCTTTTCTCTCAGAGGCTGGCGTGGAATAGTTTC
TAACCAGTTAGAATGTAATGACATCCAATTTGTTTCGTTCCAGATACGCTGGAGAAGTAG
AAACATAAACAGACTATGAGATG

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2CH03TF 776 0 0
CAATATCGCTC
TTTG*CTCGGCTGCTTTCTCTCCAATGTATATAGCCG*TTTTTTGCTCATATCCGTCGCC
AACTCTTTGGCTTCACCAGCTTTT*CGATGATGAAATCTTTAGCTTCACCTGT*TTTTCA
ACTACGAAATCTTTGGCTTTCTCTGTAATTGAAACAGCTTCTTCCTCCACCACTTTGGCT
TTTTCCGCCACAAAATCTGAAGCTGTGTGAGCATTTTCAGTCACCATGTCCATGGCTACA
CCAGCTTTCTCCATAAAATAGTGTTTTGCTCTTTGTATGTGATCTAAAACCTCTTGTCCT
TCATGTGCAGTCAAGTGTCCAACTTCGCTTCCTTTCTCCTTCACGTACTCGGAAGCTTTC
TCTGAGGCATCATCGAGCCATTTTGGATCTAGCTTTGAGTTGCCATCATCACCTTTCACG
GCGGCCATGACCCACGACTTCTTGCGCTGAGGTGAAATGATCACATTCTTCCAGCCAACT
CTCATATATATACGGCCGACGCTGCTTCTCCTTCTGATCGAGACAGTAGAACCCAATCCA
CTAAGCATAGCTCCGGAGATCAAAGTTGCCATGAGGCCACCTCTTGCCTTTTCTCTCAGA
GGCTGGCGTGGAATAGTTTCTAACCAGTTAGAATGTAATGACATCCAATTTGTTTCGTTC
CAGATACGCCGTTCAA*TATATACTAGGATAAAGCATATGGTGTTTAGAAAGGTCGAATG
TTTAGGATAGAGGGGAGAAATACATGTCATGCCGGTCGCATGTCC

QA 12 776 12 776
DS 



CO CL331Contig2 747 2 12 U
GGGTTTATTCATGCAAGCATCTCATAGTCTGTTTATGTTGCTACTTCAGCGTATCTGAGT
ACACTTGGCAAACCAGGAACGAAACAAATTGGATGTCATTACATTCTAACTGAGAAAAGG
CAAGAGGTGGCCTCATGGCAACTTTGATCTCCGGAGCTGTGCTTAGTGGATTGGGTTCTA
CTGTCTCGATCAGCAGGAGAAGCAGCGTCGGCCGTATAGATATGAGAGTTGGTTGGAAGA
ATGTGATCATTTCACCTCAGCGCAAGAAGTCGTGGGTCATGGCCGTGAAAGGTGATGATG
GCAACTCAAAGCTAGATCCAAATTGGCTCGATGATGCCTCAGAGAAAGCTTCCGAGTACG
TGAAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTGGACACTTGACTGCACATGAAGGACAAGAGGTTTTAG
ATCACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTATGGAGAAAGCTGGCGTAGCCATGGACATGG
TGACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGG
AAGAAGCTGTTTCAATTACAGAGAAAGCCAAAGATTTCGTAGTTGAAAAAACAGGTGAAG
CTATGGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGCGACAGATATGAGCA
AAAAACGGCTATATACATTGGAGAGAAAGCAGCCGAGGCAAAAGAAGCGATATTGCCTCC
AAATTCTGAAGAATAGATTGTATTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D966TF U 1
AF RR2F372TF U 5
BS 1 255 RR2D966TF
BS 256 256 RR2F372TF
BS 257 523 RR2D966TF
BS 524 524 RR2F372TF
BS 525 539 RR2D966TF
BS 540 540 RR2F372TF
BS 541 590 RR2D966TF
BS 591 591 RR2F372TF
BS 592 594 RR2D966TF
BS 595 595 RR2F372TF
BS 596 622 RR2D966TF
BS 623 747 RR2F372TF

RD RR2D966TF 627 0 0
GGGTTTATTCATGCAAGCATCTCATAGTCTGTTTATGTTGCTACTTCAGCGTATCTGAGT
ACACTTGGCAAACCAGGAACGAAACAAATTGGATGTCATTACATTCTAACTGAGAAAAGG
CAAGAGGTGGCCTCATGGCAACTTTGATCTCCGGAGCTGTGCTTAGTGGATTGGGTTCTA
CTGTCTCGATCAGCAGGAGAAGCAGCGTCGGCCGTATAGATATGAGAGTTGGTTGGAAGA
ATGTGATCATTTCACTTCAGCGCAAGAAGTCGTGGGTCATGGCCGTGAAAGGTGATGATG
GCAACTCAAAGCTAGATCCAAATTGGCTCGATGATGCCTCAGAGAAAGCTTCCGAGTACG
TGAAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTGGACACTTGACTGCACATGAAGGACAAGAGGTTTTAG
ATCACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTATGGAGAAAGCTGGCGTAGCCATGGACATGG
TGACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGGAAAA*GCCAAAGTGATGGAG*
AAGAAGCTGTTTCAATTACAGAGAAAGCCAAAGATTTCGTAGTTGAAAAA*CAG*TGAAG
CTATGGATTTCATCATCGAAAA
GCTGG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2F372TF 743 0 0
GGAA
TCATGCAAGCATCTCATTGTCTGTTTATGTTGCTACTTCAGCGTATCTGAGTACA*TTGG
CAAACCAGGAACGAAACAAATTGGATGTCATTACATTCTAACTGAGAAAAGTCAAGAGGT
GGCCTCATGGCAACTTTGATCTCCGGAGCTGTGCTTAGTGGATTGGGTTCTACTGTCTCG
ATCAGCAGGAGAAGCAGCGTCGGCCGTATAGATATGAGAGTTGGTTGGAAGAATGTGATC
ATTTCACCTCAGCGCAAGAAGTCGTGGGTCATGGCCGTGAAAGGTGATGATGGCAACTCA
AAGCTAGATCCAAATTGGCTCGATGATGCCTCAGAGAAAGCTTCCGAGTACGTGAAGGAG
AAAGGAAGCGAAGTTTGACACTTGACTGCACATGAAGGACAAGAGGTTTTAGATCACATA
CAAAGAGCAAAACACTACTTTATGGAGAAAGCTGGCGTAGCCATGGACATGGTGACTGAA
AATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGCGGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAAGAAGCT
GTTTCAATTACAGAGAAAGCCAAAGATTTCGTAGTTGAAAAAACAGGTGAAGCTATGGAT
TTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGAGTTGGCGACAGATATGAGCAAAAAACGG
CTATATACATTGGAGAGAAAGCAGCCGAGGCAAAAGAAGCGATATTGCCTCCAAATTCTG
AAGAATAGATTGTATTTGT

QA 5 743 5 743
DS 



AS 1 13

CO CL332Contig1 1031 13 11 U
GGTACTATGAATCTTTCATATAGATCAGAAGTGCAATGACTTGACTAACAGTTTTTGAGT
TTCGTCTCTTTATAAAACAACAATATACAAATAATTTAATTCATAACAGTAACGTAACTG
ATACTATACACCAAAGTTATAACATCATTGGTTTATTAAACAGCCATAAGAAAATTGTAT
TCGCCGCAAACTAATCTCCATCAATGTGATCATTGTGATGTAAATGCTGAGAAGACGTTA
CAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATCGGATCTTGACTAGCACTG
TAAGTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTAATC
TCTTTAGTCCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGGGTC
GAACCATAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATACTG
TGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCAACGTCTACCTTCAGCCCA
GCCCATCAACACTAATTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCGTGA
CCCTGCGTCGTACCAGGAGTAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGTAT
TAAAATACCGGTTACTGCTAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGTGCAAA
CCATCTGAGGGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATCGAAACCGAAATCACCAGG
AAGACTACCATCGAGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAACCACATAGGACGGTCCGG
AGGAAGTGGTTCACAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACGAACCACCACCAAACGCTC
GCTCGTTCTTCCATCGACACGTGATGAGAACGCTCCTCGTGCATTTTGTACTCTGCTCGT
GGATAAAGCGAGTGTGGAAGTGAGAGAAGACGCAATGGCTAAAGCCATCTTTGGAAAATG
TTCTTGTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 50 65 
65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 55 40 55 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 10 10 

AF RR2CZ37JQ U 53
AF RR2FR46JQ U 1
AF RR2A801JQ U 23
AF RR2CG79JQ U 74
AF RR2BP73JQ U 63
AF RR2AF21JQ U 47
AF RR2FS40JQ U 57
AF RR2AF21TF C 185
AF RR2CG79TF C 610
AF RR2BP73TF C 216
AF RR2FS40TF C 234
AF RR2FR46TF C 236
AF RR2A801TF C 245
BS 1 379 RR2FR46JQ
BS 380 380 RR2A801JQ
BS 381 754 RR2FR46JQ
BS 755 799 RR2AF21JQ
BS 800 803 RR2FS40JQ
BS 804 804 RR2AF21TF
BS 805 830 RR2FS40JQ
BS 831 831 RR2AF21TF
BS 832 840 RR2FS40JQ
BS 841 1029 RR2AF21TF
BS 1030 1031 RR2A801TF

RD RR2CZ37JQ 551 0 0
TTTTGAGTTTCGTCTCTTTATAAAACAACAATATACAAATAATTTAATTCATAACAGTAA
CGTAACTGATACTATACACCAAAGGTATAACATCATTGGTTTCTTAAACAGCCATAAAAA
AATTGTATTCGCCGCAAACTAATCTCCATCAATGTGATCATTGTGATGTAAATGCTGAAA
AAACGTTACAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATCGGATCTTGAC
TAGCACTGTAAGTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGT
TTTTAATCTCTTTAGTCCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATC
ATCGGGTCGAACCATAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGC
GGATACTGTGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCTCAACGTCTACCT
TCAGCCCAGCCCATCAACACTAATTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATAC
TCGCGTGACCC

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2FR46JQ 754 0 0
GGTACTATGAATCTTTCATATAGATCAGAAGTGCAATGACTTGACTAACAGTTTTTGAGT
TTCGTCTCTTTATAAAACAACAATATACAAATAATTTAATTCATAACAGTAACGTAACTG
ATACTATACACCAAAGTTATAACATCATTGGTTTATTAAACAGCCATAAGAAAATTGTAT
TCGCCGCAAACTAATCTCCATCAATGTGATCATTGTGATGTAAATGCTGAGAAGACGTTA
CAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATCGGATCTTGACTAGCACTG
TAAGTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTAATC
TCTTTAGTCCTCATAACCACGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGGGTC
GAACCATAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATACTG
TGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCAACGTCTACCTTCAGCCCA
GCCCATCAACACTAATTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCGTGA
CCCTGCGTCGTACCAGGAGTAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGTAT
TAAAATACCGGTTACTGCTAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGTGCAAA
CCATCTGAGGGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2A801JQ 712 0 0
GG
TCAGAAGTGCAATGACTTGACTAACAGTTTTTGAGTTTCGTCTCTTTATAAAACAACAAT
ATACAAATAATTTAATTCATAACAGTAACGTAACTGATACTATACACCAAAGTTATAACA
TCATTGGTTTATTAAACAGCCATAAGAAAATTGTATTCGCCGCAAACTAATCTCCATCAA
TGTGATCATTGTGATGTAAATGCTGAGAAGACGTTACAGTGACCAGGATCAGCGAGATGA
GCCATGAGATTCTCAATCGGATCTTGACTAGCACTGTAAGTAGCTTGGAAACAGAACCCA
ACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTAATCTCTTTAGTCCTCATAACCATGACC
GGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGGGTCGAACCATAAACCTCCCGGGTAACC
AACATTCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATACTGTGGCTCTATGTCAACCGAACCCGG
TTTGATAAAATCAGCCCAACGTCTACCTTCAGCCCAGCCCATCAACACTAATTGGACCAC
AAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCGTGACCCTGCGTCGTACCAGGAGTAATT
CTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGTATTAAAATACCGGTTACTGCTAGCAT
GGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGTGCAAACCATCTGAGGGTTT

QA 3 712 3 712
DS 

RD RR2CG79JQ 687 0 0
AAAACAACAATATACAAATAATTTAATTCATAACAGTAACGTAACTGATACTATACACCA
AAGTTATAACATCGTTGGTTTATTAAACAGCCATAAGAAAATTGTATTCGCCGCAAACTA
ATCTCCATCAATGTGATCATTGTGATGTAAATGCTGAGAAGACGTTACAGTGACCAGGAT
CAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATCGGATCTTGACTAGCACTGTAAGTAGCTTGGA
AACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTAATCTCTTTAGTCCTCA
TAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGGGTCGAACCATAAACCT
CCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATACTGTGGCTCTATGTCA
ACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCAACGTCTACCTTCAGCCCAGCCCATCAACACT
AATTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCGTGACCCTGCGTCGTAC
CAGGAGTAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGTATTAAAATACCGGTT
ACTGCTAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGTGCAAACCATCTGAGGGTT
TCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2BP73JQ 717 0 0
CGTCTCTTTATAAAACAACAATATACAAATAATTTAATTCATAACAGTAACGTAACTGAT
ACTATACACCAAAGTTATAACATCATTGGTTTATTAAACAGCCATAAGAAAATTGTATTC
GCCGCAAACTAATCTCCATCAATGTGATCATTGTGATGTAAATGCTGAGAAGACGTTACA
GTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATCGGATCTTGACTAGCACTGTA
AGTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTAATCTC
TTTAGTCCTCATAACCATGGCCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGGGTCGA
ACCATAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATACTGTG
GCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCAACGTCTACCTTCAGCCAAGC
CCATCAACACTAATTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCGTGACC
CTGCGTCGTACCAGGAGTAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGTATTA
AAATACCGGTTACTGCTAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGTGCAAACC
ATCTGAGGGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATCGAAACCGAAATCACCAG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2AF21JQ 753 0 0
AACAGT
TTTTGAGTTTCGTCTCTTTATAAAACAACAATATACAAATAATTTAATTCATAACAGTAA
CGTAACTGATACTATACACCAAAGTTATAACATCATTGGTTTATTAAACAGCCATAAGAA
AATTGTATTCGCCGCAAACTAATCTCCATCAATGTGATCATTGTGATGTAAATGCTGAGA
AGACGTTACAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATCGAATCTTGAC
TAGCACTGTAAGTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGT
TTTTAATCTCTTTAGTCCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATC
ATCGGGTCGAACCATAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGC
GGATACTGTGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCAACGTCTACCT
TCAGCCCAGCCCATCAACACTAATTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATAC
TCGCGTGACCCTGCGTCGTACCAGGAGTAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACAT
TCCGGTATTAAAATACCGGTTACTGCTAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCT
TGTGCAAACCATCTGAGGGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATCGAAACCGAAA
TCACCAGGAAGACTACCATCGAGCCAT

QA 7 753 7 753
DS 

RD RR2FS40JQ 784 0 0
GAGTTTCGTCTCTTTATAAAACAACAATATACAAATAATTTAATTCATAACAGTAACGTA
ACTGATACTATACACCAAAGTTATAACATCATTGGTTTATTAAACAGCCATAAGAAAATT
GTATTCGCCGCAAACTAATCTCCATCAATGTGATCATTGTGATGTAAATGCTGAGAAGAC
GTTACAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTC**AATCGGATCTTGACTAGC
ACTGTAAGTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTT
AATCTCTTTAGTCCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCG
GGTCGAACCATAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGAT
ACTGTGACTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCAACGTCTACCTTCAG
CCCAGCCCATCAACACTAATTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGC
GTGACCCTGCGTCGTACCAGGAGTAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCG
GTATTAAAATACCGGTTACTGCTAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGTG
CAAACCATCTGAGGGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATCGAAACCGAAATCAC
CAGGAAGACTACCATCGAGCCATTCAG*AGGAGAAGTACCAGGGAACCACATAG*ACGGT
CCGG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2AF21TF 846 0 0
CGCAAACTAATCTCCATCAATGTGATCATTGTGATGTAAATGCTGAGAAGACGTTACAGT
GACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATCGAATCTTGACTAGCACTGTAAG
TAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTAATCTCTT
TAGTCCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCCCACATCATCGGGTCGAAC
CATAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATACTGTGGC
TCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCAACGTCTACCTTCAGCCCAGCCC
ATCAACACTAATTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCGTGACCCT
GCGTCGTACCAGGAGTAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGTATTAAA
ATACCGGTTACTGCTAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGTGCAAACCAT
CTGAGGGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATCGAAACCGAAATCACCAGGAAGA
CTACCATCGAGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAACCACATAGGACGGTCCGGAGGA
AGTGGTTCACAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACGAACCACCACCAAACGCTCGCTC
GTTCTTCCATCGACACGTGATGAGAACGCTCCTCGTGCATTTTGTACTCTGCTCGTGGAT
AAAGCGAGTGTGGAAGTGAGAGAAGACGCAATGGCTAAAGCCATCTTTGGAAAATGTTCT
TGTCC
C

QA 1 845 1 845
DS 

RD RR2CG79TF 420 0 0
GTACCAGGAGTAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGTATTAAAATACC
GGTTAATGCTAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGTGCAAACCATATGAG
GGTTTCCGGATCAGACCTTAGACCAAGAGGATAGAAACTGAAATCACCAGGAAGACTACC
ATCGAGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAACCACATAGGACGGTCCGGAGGAAGTGG
TTCACAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACGAACCACCACCAAACGCTCGCTCGTTCT
TCCATCGACACGTGATGAGAACGCTCCTCGTGCATTTTGTACTCTGCTCGTGGATAAAGC
GAGTGTGGAAGTGAGAGAAGACGCAATGGCTAAAGCCATCCTTGGAAAATGTTCTTGTCC

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR2BP73TF 812 0 0
GTGATGT
AATGCTGAGAAGACGT*ACAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGAT*CTCAATC
GGATCTTGACTAGCACTGTAAGTAGCT*GGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCT
A*CCGTCCGTTTTTAATCTCTTTAGTCCTCATAACCATGGCCGGATCAGGAGAACCTCTC
CCCC*ACATCATCGGGTCGAACCATAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATT
CACCTTGTGCGGATACTGTGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCA
ACGTCTACCTTCAGCCAAGCCCATCAACACTAATTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATC
CGCGAAATACTCGCGTGACCCTGCGTCGTACCAGGAGTAATTCTCGATGAAACCTAACCG
CTCCAGACATTCCGGTATTAAAATACCGGTTACTGCTAGCATGGCCCACCGGCTATGTAT
GAGCTCAGCTTGTGCAAACCATCTGAGGGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATC
GAAACCGAAATCACCAGGAAGACTACCATCGAGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAA
CCACATAGGACGGTCCGGAGGAAGTGGTTCACAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACG
AACCACCACCAAACGCTCGCTCGTTCTTCCATCGACACGTGATGAGAACGCTCCTCGTGC
ATTTTGTACTCTGCTCGTGGATAAAGCGAGTGTGGAAGTGAGAGAAGACGCAATGGCTAA
AGCCATCTTTGGAAAATGTTCTT
CC

QA 8 810 8 810
DS 

RD RR2FS40TF 796 0 0
AGACG
TACAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGAT***CAATCGGATCTTGACTAGCAC
TGTAAGTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTAA
TCTCTTTAGTCCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGGG
TCGAACCATAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATAC
TGTGACTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCAACGTCTACCTTCAGCC
CAGCCCATCAACACTAATTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCGT
GACCCTGCGTCGTACCAGGAGTAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGT
ATTAAAATACCGGTTACTGCTAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGTGCA
AACCATCTGAGGGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATCGAAACCGAAATCACCA
GGAAGACTACCATCGAGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAACCACATAGGACGGTCC
GGAGGAAGTGGTTCACAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACGAACCACCACCAAACGC
TCGCTCGTTCTTCCATCGACACGTGATGAGAACGCTCCTCGTGCATTTTGTACTCTGCTC
GTGGATAAAGCGAGTGTGGAAGTGAGAGAAGACGCAATGGCTAAAGCCATCTTTGGAAAA
TGTTCTTGTCC

QA 6 796 6 796
DS 

RD RR2FR46TF 794 0 0
ACG
TACAGTGACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGAT*CTCAATCGGATCTTGACTAGCAC
TGTAAGTAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTAA
TCTCTTTAGTCCTCATAACCACGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCCCACATCATCGGG
TCGAACCATAAACCTCCCGGGTAACCAACATCCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATAC
TGTGGCTCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCAACGTCTACCTTCAGCC
CAGCCCATCAACACTAATTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCGT
GACCCTGCGTCGTACCAGGAGTAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGT
ATTAAAATACCGGTTACTGCTAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGTGCA
AACCATCTGAGGGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATCGAAACCGAAATCACCA
GGAAGACTACCATCGAGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAACCACATAGGACGGTCC
GGAGGAAGTGGTTCACAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACGAACCACCACCAAACGC
TCGCTCGTTCTTCCATCGACACGTGATGAGAACGCTCCTCGTGCATTTTGTACTCTGCTC
GTGGATAAAGCGAGTGTGGAAGTGAGAGAAGACGCAATGGCTAAAGCCATCTTTGGAAAA
TGTTCTTGTCC

QA 4 794 4 794
DS 

RD RR2A801TF 787 0 0
GACCAGGATCAGCGAGATGAGCCATGAGATTCTCAATCGGATCTTGACTAGCACTGTAAG
TAGCTTGGAAACAGAACCCAACGAAAGCAAGCATCGCTAACCGTCCGTTTTTAATCTCTT
TAGTCCTCATAACCATGACCGGATCAGGAGAACCTCTCCCCC*ACATCATCGGGTCGAAC
CATAAACCTCCCGGGTAACCAACATTCGGTTTAGGATTCACCTTGTGCGGATACTGTGGC
TCTATGTCAACCGAACCCGGTTTGATAAAATCAGCCCAACGTCTACCTTCAGCCCAGCCC
ATCAACACTAATTGGACCACAAATAAGGTAGTGGAATCCGCGAAATACTCGCGTGACCCT
GCGTCGTACCAGGAGTAATTCTCGATGAAACCTAACCGCTCCAGACATTCCGGTATTAAA
ATACCGGTTACTGCTAGCATGGCCCACCGGCTATGTATGAGCTCAGCTTGTGCAAACCAT
CTGAGGGTTTCCGGATCAGACCCTAGACCAAGAGGATCGAAACCGAAATCACCAGGAAGA
CTACCATCGAGCCATTCAGGAGGAGAAGTACCAGGGAACCACATAGGACGGTCCGGAGGA
AGTGGTTCACAGACGCTAGAAACTTCTTTGCCGGCACGAACCACTACCAAACGCTCGCTC
GTTCTTCCATCGACACGTGATGAGAACGCTCCTCGTGCATTTTGTACTCTGCTCGTGGAT
AAAGCGAGTGTGGA*GTGAGAGAAGACGCAATGGCTAAAGCCATCTTTGGAAAATGTTCT
TGTCCCC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 11

CO CL333Contig1 1902 11 16 U
CTCTGGAGTTCTTGGTGTGTACAACTGCCAAGGAGCAGCTTGGAGTAGCACGGAAAGGAA
AAACATCTTCCACCAGACACAAACTGATTGCATCACCGGCTCCATTCGTGGTCGTGATGT
TCATTTGATATCCGAGGCTTCCACTGATCCAAAGACCTGGAACGGAGACTGTGCTGTTTA
CTCCCAAAGCAGAGGAGAACTCAGCGTTATGCCATACAATGTGTCTCTACCGATCTCACT
GAAGATCCGTGAGCATGAGATCTTCACTGTGAGTCCCATTACTCACCTAGCTAGTGATGG
TGTCTCATTTGCTCCGCTCGGTCTTGTAAACATGTACAATTCGGGAGGAGCTATCGAAGG
ACTTAGATATGACGTTGAGGAGATGAAAGTGGTAATGGAAGTCAAAGGGTGTGGTAAATT
CGGAGCTTACTCATCTGTGAAGCCTAAGAGATGTGTTGTTGAGTCAAATGAAGTTGCATT
TGAGTATGATGCCTCCTCTGGTTTGGTCACTTTTGAGTTGGAAAAGATGCCTTCAGAGAC
CGAACGATTACATGCAATGGAAATTGAGTTATGATTTGATGAATTACAATATGATGAATC
ACAATTTGATGTATCAACACGGATATTACAATTTGATGTAACAACACGGTTATTAAAATT
TCTTTCCATGTGATACAAACAAAGTAATAATAATATTTTTTTTAGTTCAAAAGAATTACA
GATATATATTTATTGGTTTAACAACTAACATGGTCACGCCAGTCCAAGAACAAGAGAGCA
GCCGCATAGTGAGACAAGGCACCCAACAAAACAAACACATGGAAGATCTGATGACTATGT
CCCACACGATCAAACCAACCCGGTTTAAACCTCTCAGGCACTCTCCCTACATAGAACCCT
GTCCCAACAAGATAAAACACTGCCATAGCCAGCTCGTACATGAGCGTCACGTTCCTTTGC
GGGTTTCCCCAGTTAACCACTAGCGCATGGACAGCTGGGACTATTCCGAAGAGCCCCATG
GAGGCAAAAAGCAAAGCGCGAAAACCTCGGTACTTGGGAGAGGAGAGTGAGGGAGTGAAG
AGTGTTATGATTGTGAAGATTCCCATAGAGGTGATGCCTGTGAGGTAGATGACGTACCAA
CGAGGAGTGCATTGGAAGATGTAGTACATTGCTGGGAAGAAGGAAGTGATGATCATGACG
GCTATACCGGTATAGTCTATGCGGAGGAGGAAGAGGTTAAGGTCTTTGGAGTGGCAGCAG
AAGAGGTGACAAATGCTGCTTGAGAGTAGGCAGAACATTGAGCCCGCTAAGAATACAAAG
AATGGCCATCTTGTTACATTCCCTGGACTCTTTGCATCCACGGGGAATAACTTATCGTGA
TGCATAACGTTGGCGACAGTAAGTGCCACAAATAAGATGAAACCTAGTAAATGTGTCCAA
ACGTTGAGGGACTCATTGTGGAAACTGAAGACGCTGAAGAAAGCATCTCTAATGGACCAA
TCAGCTCTGTAATAATTCAATATAAATTCGTTATCCTTCATGTAATCTGGAAGTTCGCTA
AACGACATTAACTGACGTCGCCGTCTTGTCGTCTTCTGCGGTTTCTTCTTCATGGTTTCG
TCTCCATCTTGACCATCTCCAGGGACGATCTTGCTCTTGCATTTGCTGTTACCGCAAGTC
ACCGTCTCTGCTTCGTCTTTCTGATCATCTTGGTCCATATGAGACCTAATGTTGATTATT
TAAGACAATAACACTTTCTTTATGGTTCAAAGATCAATGGAAATAGAAGAGGGGTGTGAT
AGAAGATCTGAGATATGAGAGGAAAATATATAAATGAAAAAGATTGTTATTGAAGCTATA
TTAACGTGTGAATTTAAATCTTAGGAGTGAGAGAGAAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN59JQ C 1
AF RR2GM16JQ U 635
AF RR2G860JQ U 655
AF RR2CM09JQ U 551
AF RR2DF66JQ U 623
AF RR2G490JQ U 691
AF RR2E408JQ U 655
AF RR2G490TF C 698
AF RR2E408TF C 1107
AF RR2G860TF C 1265
AF RR2GM16TF C 1335
BS 1 550 RR2EN59JQ
BS 551 688 RR2CM09JQ
BS 689 689 RR2GM16JQ
BS 690 1010 RR2CM09JQ
BS 1011 1011 RR2DF66JQ
BS 1012 1194 RR2CM09JQ
BS 1195 1195 RR2GM16JQ
BS 1196 1342 RR2CM09JQ
BS 1343 1358 RR2DF66JQ
BS 1359 1368 RR2G490TF
BS 1369 1535 RR2E408TF
BS 1536 1536 RR2G860TF
BS 1537 1612 RR2E408TF
BS 1613 1613 RR2G860TF
BS 1614 1800 RR2E408TF
BS 1801 1902 RR2GM16TF

RD RR2EN59JQ 707 0 0
CTCTGGAGTTCTTGGTGTGTACAACTGCCAAGGAGCAGCTTGGAGTAGCACGGAAAGGAA
AAACATCTTCCACCAGACACAAACTGATTGCATCACCGGCTCCATTCGTGGTCGTGATGT
TCATTTGATATCCGAGGCTTCCACTGATCCAAAGACCTGGAACGGAGACTGTGCTGTTTA
CTCCCAAAGCAGAGGAGAACTCAGCGTTATGCCATACAATGTGTCTCTACCGATCTCACT
GAAGATCCGTGAGCATGAGATCTTCACTGTGAGTCCCATTACTCACCTAGCTAGTGATGG
TGTCTCATTTGCTCCGCTCGGTCTTGTAAACATGTACAATTCGGGAGGAGCTATCGAAGG
ACTTAGATATGACGTTGAGGAGATGAAAGTGGTAATGGAAGTCAAAGGGTGTGGTAAATT
CGGAGCTTACTCATCTGTGAAGCCTAAGAGATGTGTTGTTGAGTCAAATGAAGTTGCATT
TGAGTATGATGCCTCCTCTGGTTTGGTCACTTTTGAGTTGGAAAAGATGCCTTCAGAGAC
CGAACGATTACATGCAATGGAAATTGAGTTATGATTTGATGAATTACAATATGATGAATC
ACAATTTGATGTATCAACACGGATATTACAATTTGATGTAACAACACGGTTATTAAAATT
TCTTTCCATGTGATACAAACAAAGTAATAATAATATTTTTTTTAGTT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2GM16JQ 606 0 0
GATGTAACAACACGGTTATTAAAATTTCTTTCCATGTGATACAAACAAAGTAATAATAAT
ATTTTTTTTAGTTCAAAAGAATTACAGATATATATTTATTGGTTTAACAACTAACATGGT
CACGCCAGTCCAAGAACAAGAGAGCGGCCGCATAGTGAGACAAGGCACCCAACAAAACAA
ACACATGGAAGATCTGATGACTATGTCCCACACGATCAAACCAACCCGGTTTAAACCTCT
CAGGCACTCTCCCTACATAGAACCCTGTCCCAACAAGATAAAACACTGCCATAGCCAGCT
CGTACATGAGCGTCACGTTCCTTTGCGGGTTTCCCCAGTTAACCACTAGCGCATGGACAG
CTGGGACTATTCCGAAAAGCCCCATGGAGGCAAAAAGCAAAGCGCGAAAACCTCGGTACT
TGGGAGAGGAGAGTGAGGGAGTGAAGAGTGTTATGATTGTGAAGATTCCCATAGAGGTGA
TGCCTGTGAGGTAGATGACGTACCAACGAGGAGTGCATTGGAAGATGTAGTACATTGCTG
GGAAGAAGGAAGTGATGATCATGACGGCTATACCGGTATAGTCTATGCGGAGGAGGAAGA
GGTTAA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2G860JQ 660 0 0
AAAATTTCTTTCCATGTGATACAAACAAAGTAATAATAATATTTTTTTTAGTTCAAAAGA
ATTACAGATATATATTTATTGGTTTAACAACTAACATGGTCACGCCAGTCCAAGAACAAG
AGAGCAGCCGCATAGTGAGACAAGGCACCCAAAAAAACAAACACATGGAAGATCTGATGA
CTATGTCCCACACGATCAAACCAACCCGGTTTAAACCTCTCAGGCACTCTCCCTACATAG
AACCCTGTCCCAACAAGATAAAACACTGCCATAGCCAGCTCGTACATGAGCGTCACGTTC
CTTTGCGGGTTTCCCCAGTTAACCACTAGCGCATGGACAGCTGGGACTATTCCGAAGAGC
CCCATGGAGGCAAAAAGCAAAGCGCGAAAACCTCGGTACTTGGGAGAGGAGAGTGAGGGA
GTGAAGAGTGTTATGATTGTGAAGATTCCCATAGAGGTGATGCCTGTGAGGTAGATGACG
TACCAACGAGGAGTGCATTGGAAGATGTAGTACATTGCTGGGAAGAAGGAAGTGATGATC
ATGACGGCTATACCGGTATAGTCTATGCGGAGGAGGAAGAGGTTAAGGTCTTTGGAGTGG
CAGCAGAAGAGGTGACAAATGCTGCTTGAGAGTAGGCAGAACATTGAGCCCGCTAAGAAT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2CM09JQ 792 0 0
CATGCAATGGAAATTGAGTTATGATTTGATGAATTACAATATGATGAATCACAATTTGAT
GTATCAACACGGATATTACAATTTGATGTAACAACACGGTTATTAAAATTTCTTTCCATG
TGATACAAACAAAGTAATGATAATATTTTTTTTAGTTCAAAAGAATTACAGATATATATT
TATTGGTTTAACAACTAACATGGTCACGCCAGTCCAAGAACAAGAGAGCAGCCGCATAGT
GAGACAAGGCACCCAACAAAACAAACACATGGAAGATCTGATGACTATGTCCCACACGAT
CAAACCAACCCGGTTTAAACCTCTCAGGCACTCTCCCTACATAGAACCCTGTCCCAACAA
GATAAAACACTGCCATAGCCAGCTCGTACATGAGCGTCACGTTCCTTTGCGGGTTTCCCC
AGTTAACCACTAGCGCATGGACAGCTGGGACTATTCCGAAAAGCCCCATGGAGGCAAAAA
GCAAAGCGCGAAAACCTCGGTACTTGGGAGAGGAGAGTGAGGGAGTGAAGAGTGTTATGA
TTGTGAAGATTCCCATAGAGGTGATGCCTGTGAGGTAGATGACGTACCAACGAGGAGTGC
ATTGGAAGATGTAGTACATTGCTGGGAAGAAGGAAGTGATGATCGTGACGGCTATACCGG
TATAGTCTATGCGGAGGAGGAAGAGGTTAAGGTCTTTGGAGTGGCAGCAGAAGAGGTGAC
AAATGCTGCTTGAGAGTAGGCAGAACATTGAGCCCGCTAAGAATACAAAGAATGGCCATC
TTGTTACATTCC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2DF66JQ 736 0 0
ATATTACAATTTGATGTAACAACACGGTTATTAAAATTTCTTTCCATGTGATACAAACAA
AGTAATAATAATATTTTTTTTAGTTCAAAAGAATTACAGATATATATTTATTGGTTTAAC
AACTAACATGGTCACGCCAGTCCAAGAACAAGAGAGCAGCCGCATAGTGAGACAAGGCAC
CCAACAAAACAAACACATGGAAGATCTGATGACTATGTCCCACACGATCAAACCAACCCG
GTTTAAACCTCTCAGGCACTCTCCCTACATAGAACCCTGTCCCAACAAGATAAAACACTG
CCATAGCCAGCTCGTACATGAGCGTCACGTTCCTTTGCGGGTTTCCCCAGTTAACCACTA
GAGCATGGACAGCTGGGACTATTCCGAAGAGCCCCATGGAGGCAAAAAGCAAAGCGCGAA
AACCTCGGTACTTGGGAGAGGAGAGTGAGGGAGTGAAGAGTGTTATGATTGTGAAGATTC
CCATAGAGGTGATGCCTGTGAGGTAGATGACGTACCAACGAGGAGTGCATTGGAAGATGT
AGTACATTGCTGGGAAGAAGGAAGTGATGATCATGACGGCTATACCGGTATAGTCTATGC
GGAGGAGGAAGAGGTTAAGGTATTTGGAGTGGCAGCAGAAGAGGTGACAAATGCTGCTTG
AGAGTAGGCAGAACATTGAGCCCGCTAAGAATACAAAGAATGGCCATCTTGTTACATTCC
CTGGACTCTTTGCATC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2G490JQ 663 0 0
ATAATA
TTTTTTTAGTTCAAAAGAATTACAGATATATATTTATTGGTTTAACAACTAACATGGTCA
CGCCAGTCCAAGAACAAGAGAGCAGCCGCATAGTGAGACAAGGCACCCAACAAAACAAAC
ACATGGAAGATCTGATGACTATGTCCCACACGATCAAACCAACCCGGTTTAAACCTCTCA
GGCACTCTCCCTACATAGAACCCTGTCCCAACAAGATAAAACACTGCCATAGCCAGCTCG
TACATGAGCGTCACGTTCCTTTGCGGGTTTCCCCAGTTAACCACTAGCGCATGGACAGCT
GGGACTATTCCGAAGAGCCCCATGGAGGCAAAAAGCAAAGCGCGAAAACCTCGGTACTTG
GGAGAGGAGAGTGAGGGAGTGAAGAGTGTTATGATTGTGAAGATTCCCATAGAGGTGATG
CCTGTGAGGTAGATGACGTACCAACGAGGAGTGCATTGGAAGATGTAGTACATTGCTGGG
AAGAAGGAAGTGATGATCATGACGGCTATACCGGTATAGTCTATGCGGAGGAGGAAGAGG
TTAAGGTCTTTGGAGTGGCAGCAGAAGAGGTGACAAATGCTGCTTGAGAGTAGGCAGAAC
ATTGAGCCCGCTAAGAATACAAAGAATGGCCATCTTGTTACATTCCCTGGACTCTTT

QA 7 663 7 663
DS 

RD RR2E408JQ 686 0 0
AAAATTTCTTTCCATGTGATACAAACAAAGTAATAATAATATTTTTTTTAGTTCAAAAGA
ATTACGGATATATATTTATTGGTTTAACAACTAACATGGTCACGCCAGTCCAAGAACAAG
AGAGCAGCCGCATAGTGAGACAAGGCACCCAACAAAACAAACACATGGAAGATCTGATGA
CTATGTCCCACACGATCAAACCAACCCGGTTTAAACCTCTCAGGCACTCTCCCTACATAG
AACCCTGTCCCAACAAGATAAAACACTGCCATAGCCAGCTCGTACATGAGCGTCACGTTC
CTTTGCAGGTTTCCCCAGTTAACCACTAGCGCATGGACAGCTGGGACTATTCCGAAGAGC
CCCATGGAGGCAAAAAGCAAAGCGCGAAAACCTCGGTACTTGGGAGAGGAGAGTGAGGGA
GTGAAGAGTGTTATGATTGTGAAGATTCCCATAGAGGTGATGCCTGTGAGGTAGATGACG
TACCAACGAGGAGTGCATTGGAAGATGTAGTACATTGCTGGGAAGAAGGAAGTGATGATC
ATGACGGCTATACCGGTATAGTCTATGCGGAGGAGGAAGAGGTTAAGGTCTTTGGAGTGG
CAGCAGAAGAGGTGACAAATGCTGCTTGAGAGTAGGCAGAACATTGAGCCCGCTAAGAAT
ACAAAGAATGGCCATCTTGTTACATT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2G490TF 672 0 0
TTTTTTAGTTCAAAAGAATTACAGATATATATTTATTGGTTTAACAACTAACATGGTCAC
GCCAGTCCAAGAACAAGAGAGCAGCCGCATAGTGAGACAAGGCACCCAACAAAACAAACA
CATGGAAGATCTGATGACTATGTCCCACACGATCAAACCAACCCGGTTTAAACCTCTCAG
GCACTCTCCCTACATAGAACCCTGTCCCAACAAGATAAAACACTGCCATAGCCAGCTCGT
ACATGAGCGTCACGTTCCTTTGCGGGTTTCCCCAGTTAACCACTAGCGCATGGACAGCTG
GGACTATTCCGAAGAGCCCCATGGAGGCAAAAAGCAAAGCGCGAAAACCTCGGTACTTGG
GAGAGGAGAGTGAGGGAGTGAAGAGTGTTATGATTGTGAAGATTCCCATAGAGGTGATGC
CTGTGAGGTAGATGACGTACCAACGAGGAGTGCATTGGAAGATGTAGTACATTGCTGGGA
AGAAGGAAGTGATGATCATGACGGCTATACCGGTATAGTCTATGCGGAGGAGGAAGAGGT
TAAGGTCTTTGGAGTGGCAGCAGAAGAGGTGACAAATGCTGCTTGAGAGTAGGCAGAACA
TTGAGCCCGCTAAGAATACAAAGAATGGCCATCTTGTTACATTCCCTGGACTCTTTGCAT
CCACGGGGAAT
C

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2E408TF 696 0 0
CATAGAGTGATGCTGTGA
GTAGATGACGTACCAACGAGGAGTGCATTGGAAGATGTAGTACATTGCTGGGAAGAAGGA
AGTGATGATCATGACGGCTATACCGGTATAGTCTATGCGGAGGAGGAAGAGGTTAAGGTC
TTTGGAGTGGCAGCAGAAGAGGTGACAAATGCTGCTTGAGAGTAGGCAGAACATTGAGCC
CGCTAAGAATACAAAGAATGGCCATCTTGTTACATTCCCTGGACTCTTTGCATCCACGGG
GAATAACTTATCGTGATGCATAACGTTGGCGACAGTAAGTGCCACAAATAAGATGAAACC
TAGTAAATGTGTCCAAACGTTGAGGGACTCATTGTGGAAACTGAAGACGCTGAAGAAAGC
ATCTCTAATGGACCAATCAGCTCTGTAATAATTCAATATAAATTCGTTATCATTCATGTA
ATCTGGAAGTTCGCTAAACGACATTAACTGACGTCGCCGTCTTGTCGTCTTCTGCGGTTT
CTTCTTCACGGTTTCGTCTCCATCTTGACCATCTCCAGGGACGATCTTGCTCTTGCATTT
GCTGTTACCGCAAGTCACCGTCTCTGCTTCGTCTTTCTGATCATCTTGGTCCATATGAGA
CCTAATGTTGATTATTTAAGACAATAACACTTTCTTTATGGTTCAAAGATCAATGGAAAT
AGAAGAGGGGTGTGAT
CC

QA 19 694 19 694
DS 

RD RR2G860TF 538 0 0
GGTGACAAATGCTGCTTGAGAGTAGGCAGAACATTGAGCCCGCTAAGAATACAAAGAATG
GCCATCTTGTTACATTCCCTGGACTCTTTGCATCCACGGAGAATAACTTATCGTGATGCA
TAACGTTGGCGACAGTAAGTGCCACAAATAAGATGAAACCTAGTAAATGTGTCCAAACGT
TGAGGGACTCATTGCGGAAACTGAAGACGCTGAAGAAAGCATCTCTAATGGACCAATCAG
CTCTGTAATAATTCAATATAAATTCGTTATCCTTCATGTAATCTGGAAGTTCGCTAAACG
ACATTAACTGACGTCGCCGTCTTGTCGTCTTCTGCGGTTTCTTCTTCATGGTTTCGTCTC
CATCTTGACCATCTCCAGGGACGATCTTGCTCTTGCATTTGCTGTTACCGCAAGTCACCG
TCTCTGCTTCGTCTTTCTGATCATCTTGGTCCATATGAGACCTAATGTTGATTATTTAAG
ACAATAACACTTTCTTTATGGTTCAAAGATCAATGGAAATAGAAGAGGGGTGTGAT
CC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2GM16TF 568 0 0
TACATTCCCTGGACTCTTTGCATCCACGGGGAATAACTTATCGTGATGCATAACGTTGGC
GACAGTAAGTGCCACAAATAAGATGAAACCTAGTAAATGTGTCCAAACGTTGAGGGACTC
ATTGTGGAAACTGAAGACGCTGAAGAAAGCATCTCTAAAGGACCAATCAGCTCTGTAATA
ATTCAATATAAATTCGTTATCCTTCATGTAATCTGGAAGTTCGCTAAACGACATTAACTG
ACGTCGCCGTCTTGTCGTCTTC*GCGGTTTCTTCTTCATGGTTTCGTCTCCATCTTGACC
ATCTCCAGGGACGATCTTGCCCTTGCATTTGCTGTTACCGCAAGTCACCGTCTCTGCTTC
GTCTTTCTGATCATCTTGGTCCATATGAGACCTAATGTTGATTATTTAAGACAATAACAC
TTTCTTTATGGTTCAAAGATCAATGGAAATAGAGGAGGGGTGTGATAGAAGATCTGAGAT
ATGAGAGGAAAATATATAAATGAAAAAGATTGTTATTGAAGCTATATTAACGTGTGAATT
TAAATCTTAGGAGTGAGAGAGAAGATCC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 2 12

CO CL334Contig1 772 2 1 U
GGACAAAACACACAACTAAAACCCCAACGACAGAGCTAAGAAACAGAGATGGGTCTGGTC
ACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATGTGCCAAGAGAAA
ATAAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCCATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACATA
GAAGAGGTTGGGTATGATAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGCTGAAGCAGAAACAGAGCATC
ACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCGTG
GTCCAAACCGGCAAGATCAAGAAGCTCAGTGGAGTTAAGTCCAAGGAGCTTCTTATCTGG
GTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACTTATATGTCACCAACC
ACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCGGAGGAAGTGGAACCTGCC
AAGGAAGAAACCGCCAAGGAGAAGAGCTGTGAAGCAACCGAGGAGGCCGCCAAGGATGAA
CCTGCCAAAGAGGCTGCCAAGGAAGAATCTACCAAGGAGGCTGTTGCCGTCAAGGAGGCC
TAATCAAGCTTCTTGCTTCTTCTACAGTTAAGTGTTTCGCACTGCTCTTACTGTCATCTA
TTACCTACCACTCGTTGCTGCTTGTTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTGTT
CTACAAATATTACCGTATAATCATTTATAAACTACATTGAAGTTGGTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BE60TF U 1
AF RR2BE60JQ C 265
BS 1 772 RR2BE60TF

RD RR2BE60TF 772 0 0
GGACAAAACACACAACTAAAACCCCAACGACAGAGCTAAGAAACAGAGATGGGTCTGGTC
ACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATGTGCCAAGAGAAA
ATAAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCCATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACATA
GAAGAGGTTGGGTATGATAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGCTGAAGCAGAAACAGAGCATC
ACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCGTG
GTCCAAACCGGCAAGATCAAGAAGCTCAGTGGAGTTAAGTCCAAGGAGCTTCTTATCTGG
GTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACTTATATGTCACCAACC
ACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCGGAGGAAGTGGAACCTGCC
AAGGAAGAAACCGCCAAGGAGAAGAGCTGTGAAGCAACCGAGGAGGCCGCCAAGGATGAA
CCTGCCAAAGAGGCTGCCAAGGAAGAATCTACCAAGGAGGCTGTTGCCGTCAAGGAGGCC
TAATCAAGCTTCTTGCTTCTTCTACAGTTAAGTGTTTCGCACTGCTCTTACTGTCATCTA
TTACCTACCACTCGTTGCTGCTTGTTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTGTT
CTACAAATATTACCGTATAATCATTTATAAACTACATTGAAGTTGGTTTTGT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2BE60JQ 508 0 0
AAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCGTGGTCCAAACCGGCAAGATCAAGAAG
CTCAGTGGAGTTAAGTCCAAGGAGCTTCTTATCTGGGTCACTATCAGTGAGATCTATACA
GAGGAGAAAGAGAAGATCACTTATATGTCACCAACCACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTC
TCAGCTTTCATAGTCCCGGAGGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAGAAACCGCCAAGGAGAAG
AGCTGTGAAGCAACCGAGGAGGCCGCCAAGGATGAACCTGCCAAAGAGGCTGCCAAGGAA
GAATCTACCAAGGAGGCTGTTGCCGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTTGCTTCTTCTA
CAGTTAAGTGTTTCGCACTGCTCTTACTGTCATCTATTACCTACCACTCGTTGCTGCTTG
TTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTGTTCTACAAATATTACCGTATAATCAT
TTATAAACTACATTGAAGTTGGTTTTGT

QA 1 508 1 508
DS 



CO CL334Contig2 832 10 11 U
GGACACAGCACACAACTAAAACCCCCCACAACAGAGCTAAGAAACAGAGATGGGTCTGGT
CACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATGTGCCAAGAGAA
GATAAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCCATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACAT
AGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGTTGAAGCAGAAACAGAGCAT
CACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCGT
GGTCCAAACCGGCAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTTAAGTCTAAGGAGCTTCTTATCTG
GGTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAAC
CACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGC
CAAAGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGCAGTGAAGCCACCGAGGAGGCTGCCAAGGAAGA
ACATACCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTTCCGTCAAGGAGGC
CTAATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGAAGTGTGCT
TCAACAATTTAAACCGACCATTGAGAGTTTGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATCTAT
TACCTACCACTCGTTGCTGCTTGTTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTGTTC
TACAAATATTACCGTATAATTATTTATAAACTATCATTGAAGTTGGTTCTTT


BQ
10 20 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 
55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E961TF U 1
AF RR2G666JQ C 383
AF RR2CR37TF U 1
AF RR2CV35TF U 1
AF RR2DG75TF U 1
AF RR2BF68TF U 3
AF RR2CV35JQ C 45
AF RR2BF68JQ C 98
AF RR2CR37JQ C 61
AF RR2E961JQ C 237
BS 1 44 RR2CR37TF
BS 45 46 RR2E961TF
BS 47 712 RR2CR37TF
BS 713 713 RR2CV35TF
BS 714 756 RR2CR37TF
BS 757 757 RR2DG75TF
BS 758 774 RR2CR37TF
BS 775 791 RR2DG75TF
BS 792 812 RR2BF68TF
BS 813 823 RR2CV35JQ
BS 824 832 RR2CR37JQ

RD RR2E961TF 594 0 0
G
GACACAGCACACAACTAAAACCCCCCACAACAGAGCTAAGAAACAGAGATGGGTCTGGTC
ACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATAAGATGTGCCAAGGGAAG
ATAAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCCATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACATA
GAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGTTGAAGCAGAAACAGAGCATC
ACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCGTG
GTCCAAACCGGCAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTTAAGTCTAAGGAGCTTCTTATCTGG
GTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAACC
ACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCC
AAAGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGCAGTGAAGCCACCGAGGAGGCTGCCAAGGAAGAA
CATACCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTTCCGTCAA

QA 2 594 2 594
DS 

RD RR2G666JQ 220 0 0
ACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAACCACACTTTCCAGGACTTTCCCT
GTTTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAAGAAGAACCTGCCAAGGAG
AAGAGCAGTGAAGCCACCGAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACATACCAAGGAGGCTGCCAAG
GAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTTCCGTCAAGGAGGCCT

QA 1 220 1 220
DS 

RD RR2CR37TF 774 0 0
GGACACAGCACACAACTAAAACCCCCCACAACAGAGCTAAGAAA**GAGATGGGTCTGGT
CACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATGTGCCAAGAGAA
GATAAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCCATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACAT
AGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGTTGAAGCAGAAACAGAGCAT
CACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCGT
GGTCCAAACCGGCAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTTAAGTCTAAGGAGCTTCTTATCTG
GGTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAAC
CACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGC
CAAAGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGCAGTGAAGCCACCGAGGAGGCTGCCAAGGAAGA
ACATACCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTTCCGTCAAGGAGGC
CTAATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGAAGTGTGCT
TCAACAATTTAAACCGACCATTGAGAGTTTGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCCCATCTAT
TACCTACCACTCGTTGCTGCTTGTTTTTACCTGTAA*AAGATGTCAACATCATC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2CV35TF 744 0 0
G
GACACAGCACACAACTAAAACCCCCCACAACAGAGCTAAGAAACAGAGATGGGTCTGGTC
ACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATGTGCCAAGAGAAG
ATAAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCCATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACATA
GAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGTTGAAGCAGAAACAGAGCATC
ACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCGTG
GTCCAAACCGGCAAGATCAAGAAGCTCTCTGGAGTTAAGTCTAAGGAGCTTCTTATCTGG
GTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAACC
ACACTCTCCAGGACGTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCC
AAAGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGCAGTGAAGCCACCGAGGAGGCTGCCAAGGAAGAA
CATACCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTTCCGTCAAGGAGGCC
TAATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGAAGTGTGCTT
CAACAATTTAAACCGACCATTGAGAGTTTGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATCTATT
ACCTACCACTCGTTGCTGCTTGT

QA 2 744 2 744
DS 

RD RR2DG75TF 791 0 0
GC
ACACAGCACACAACTAAAACCCCCCACAACAGAGCTAAGAAACAGAGATGGGTCTGGTCA
CAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATGTGCCAAGAGAAGA
TAAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCCATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACATAG
AAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGTTGAAGCAGAAACAGAGCATCA
CCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCGTGG
TCCAAACCGGCAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTTAAGTCTAAGGAGCTTCTTATCTGGG
TCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAACCA
CACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCA
AAGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGCAGTGAAGCCACCGAGGAGGCTGCCAAGGAAGAAC
ATACCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTTCCGTCAAGGAGGCCT
AATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGAAGTGTGCTTC
AACAATTTAAACCGACCATTGAGAGTTTGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATCTATTA
CCTACCACTCGTTGCTGCTTGTTTT*ACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTGTTCTA
CAAATATTA

QA 3 791 3 791
DS 

RD RR2BF68TF 810 0 0
GG
ACAGCACACAACTAAAACCCCCCACAACAGAGCTAAGAAACAGAGATGGGTCTGGTCGCA
GAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATGTTCCAAGAGAAGATA
AAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCCATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACATAGAA
GAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGTTGAAGCAGAAACAGAGCATCACC
CACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCGTGGTC
CAAACCGGCAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTTAAGTCTAAGGAGCTTCTTATCTGGGTC
ACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAACCACA
CTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAA
GAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGCAGTGAAGCCACCGAGGAGGCTTCCAAGGAAGAACAT
ACCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTTCCGTCAAGGAGGCCTAA
TCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGAAGTGTGCTTCAA
CAATTTAAACCGACCATTGAGAGTTTGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCATCTATTACC
TACCACTCGTTGCTGCTTGTTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTGTTCTACA
AATATTACCGTATAATTATTTATAAACT

QA 3 810 3 810
DS 

RD RR2CV35JQ 781 0 0
CAGAGATGGGTCTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATG
AGATGTGCCAAGAGAAGATAAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCCATGCCCAATGGCTTAC
TACCTTTGAAGGACATAGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGTTGA
AGCAGAAACAGAGCATCACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTTTCCTATGGAA
CCGAAGTCACTGCCGTGGTCCAAACCGGCAAGATCAAGAAGCTCTCTGGAGTTAAGTTTA
AGGAGCTTCTTATTTGGGTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCA
CCTTTATGTCACCAACCACACTCTCCAGGACGTTCCCTGTTTCAGCTTTCATAGTCCCAG
AGGAAGTGGAACCTGCCAAAGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGCAGTGAAGCCACCGAGG
AGGCTGCCAAGGAAGAACATACCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTG
TTTCCGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAA
TCTTTTGAAGTGTGCTTCAACAATTTAAACCGACCATTGAGAGTTTGTGTTTCTCACTGC
TCTTACTCTCATCTATTACCTACCACTCGTTGCTGCTTGTTTTTACCTGTAATAAGATGT
CAACATCATCCTGTTCTACAAATATTACCGTATAATTATTTATAAACTATCATTGAAGT
CG

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2BF68JQ 715 0 0
GGAGATGAGATGTTCCAAGAGAAGATAAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCCATGCCCAAT
GGCTTACTACCTTTGAAGGACATAGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTG
TGGTTGAAGCAGAAACAGAGCATCACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCC
TATGGAACCGAAGTCACTGCCGTGGTCCAAACCGGCAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTT
AAGTCTAAGGAGCTTCTTATCTGGGTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAG
AAGATCACCTTTATGTCACCAACCACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTTTCAGCTTTCATA
GTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGCCAAAGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGCAGTGAAGCC
ACCGAGGAGGCTTCCAAGGAAGAACATACCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAA
GAGGCTGTTTCCGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGAT
ACCGAAATCTTTTGAAGTGTGCTTCAACAATTTAAACCGACCATTGAGAGTTTGTGTTTC
TCACTGCTCTTACTCTCATCTATTACCTACCACTCGTTGCTGCTTGTTTTTACCTGTAAT
AAGATGTCAACATCATCCTGTTCTACAAATATTACCGTATAATTATTTATAAACT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2CR37JQ 772 0 0
CACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATGTGCCAAGAGAA
GATAAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCCATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACAT
AGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGTTGAAGCAGAAACAGAGCAT
CACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCGT
GGTCCAAACCGGCAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTTAAGTCTAAGGAGCTTCTTATCTG
GGTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAAC
CACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCTGC
CAAAGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGCAGTGAAGCCACCGAGGAGGCTGCCAAGGAAGA
ACATACCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTTCCGTCAAGGAGGC
CTAATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGAAGTGTGCT
TCAACAATTTAAACCGACCATTGAGAGTTTGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCCCATCTAT
TACCTACCACTCGTTGCTGCTTGTTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTGTTC
TACAAATATTACCGTATAATTATTTATAAACTATCATTGAAGTTGGTTCTTT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2E961JQ 588 0 0
GCATCACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTG
CCGTGGTCCAAACCGGCAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTTAAGTCTAAGGAGCTTCTTA
TCTGGGTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCAC
CAACCACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAAC
CTGCCAAAGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGCAGTGAAGCCACCGAGGAGGCTGCCAAGG
AAGAACATACCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTTCCGTCAAGG
AGGCCTAATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGAAGTG
TGCTCCAACAATTTAAACCGACCATTGAGAGTTTGTGTTTCTCACTGCTCTTACTCTCAT
CTATTACCTACCACTCGTTGCTGCTTGTTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCT
GTTCTACAAATATTACCGTATAATTATTTATAAACTATCATTGAAGT
C

QA 1 587 1 587
DS 



AS 3 11

CO CL335Contig1 989 2 2 U
GGATAGAGAGGGATAGCAGCATCATTAAGTGATTTCACATTCCTCCCTAAGAACATTTTA
TCCTCTGCTTTTTTGAACCTATCATCACGCTAAAGGAAGAAGACGAGATGGCCACGGAAT
CGTACGAAGCCGCCATTAAAGGACTGAACGATCTTCTCAGTAAGAAAACAGATCTGGGGA
ACGTCGCCGCGGAGAAGATCAAAGTGTTGACTCAGGAGCTCAAGGAGCTCGATTCCTCCA
ACAACGACGCCGTTGAACGCATCAAATCCGGTTTCACCCACTTCAAAACCGAGAAATACT
TGAAGAATGATGCTCTTTTCAGTGATCTCGCCAAGGGTCAGAGCCCAAAGTTTCTGGTAT
TCGCTTGTTCGGATTCTCGAGTTTGTCCATCTAACATTTTGAATTTCCAACCTGGCGAGG
CCTTTGTCGTCAGAAACATTGCTAACATGGTTCCACCTTTCGACCAGAAGAGACATTCGG
GAGTTGGAGCCGCCGTTGAATACGCAGTTGTACATAGCTGTTGTGGTGGCATTAAAGGAC
TCATGTCCATTGAAGATGATGCTGCACCAACTCAGAGTGACTTCATAGAGAACTGGGTGA
AGATAGGTGCACCAGCAAGGAACGAGATCAAGGAAGAGAATCAAGACCTAAGCTACGACG
ATCAGTGCAACGTGTGTGAGAAGGAAGCTGTGAATGTGTCGCTTGGGAACTTGCTTTCGT
ACCCGTTTGTGAGAGCTGCAGTGGTGAAGAACACACTTGCAATCAGAGGAGCTCACTACA
ATTTCGTCAAAGGCACATTTGATCTATGGGAGCTCGATTTCAAGACCACTCCAGCTTATG
CCTTCTCTTGAACATATATACTCTGCTGTTTTTCTCACGAAAAGCTTTTGACTCATCTTT
TCTTATTTCAAACTTCCAACTTTTGCTGCTTCTGTTTCAAAAAAAGCTGTAAACAATAAA
ACACATCATATGAATCTTCTGTTCAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH56TF U 1
AF RR2AH56JQ C 186
BS 1 788 RR2AH56TF
BS 789 989 RR2AH56JQ

RD RR2AH56TF 788 0 0
GGATAGAGAGGGATAGCAGCATCATTAAGTGATTTCACATTCCTCCCTAAGAACATTTTA
TCCTCTGCTTTTTTGAACCTATCATCACGCTAAAGGAAGAAGACGAGATGGCCACGGAAT
CGTACGAAGCCGCCATTAAAGGACTGAACGATCTTCTCAGTAAGAAAACAGATCTGGGGA
ACGTCGCCGCGGAGAAGATCAAAGTGTTGACTCAGGAGCTCAAGGAGCTCGATTCCTCCA
ACAACGACGCCGTTGAACGCATCAAATCCGGTTTCACCCACTTCAAAACCGAGAAATACT
TGAAGAATGATGCTCTTTTCAGTGATCTCGCCAAGGGTCAGAGCCCAAAGTTTCTGGTAT
TCGCTTGTTCGGATTCTCGAGTTTGTCCATCTAACATTTTGAATTTCCAACCTGGCGAGG
CCTTTGTCGTCAGAAACATTGCTAACATGGTTCCACCTTTCGACCAGAAGAGACATTCGG
GAGTTGGAGCCGCCGTTGAATACGCAGTTGTACATAGCTGTTGTGGTGGCATTAAAGGAC
TCATGTCCATTGAAGATGATGCTGCACCAACTCAGAGTGACTTCATAGAGAACTGGGTGA
AGATAGGTGCACCAGCAAGGAACGAGATCAAGGAAGAGAATCAAGACCTAAGCTACGACG
ATCAGTGCAACGTGTGTGAGAAGGAAGCTGTGAATGTGTCGCTTGGGAACTTGCTTTCGT
ACCCGTTTGTGAGAGCTGCAGTGGTGAAGAACACACTTGCAATCAGAGGAGCTCACTACA
ATTTCGTC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2AH56JQ 804 0 0
GCCGCGGAGAAGATCAAAGTGTTGACTCAGGAGCTCAAGGAGCTCGATTCCTCCAACAAC
GACGCCGTTGAACGCATCAAATCCGGTTTCACCCACTTCAAAACCGAGAAATACTTGAAG
AATGATGCTCTTTTCAGTGATCTCGCCAAGGGTCAGAGCCCAAAGTTTCTGGTATTCGCT
TGTTCGGATTCTCGAGTTTGTCCATCTAACATTTTGAATTTCCAACCTGGCGAGGCCTTT
GTCGTCAGAAACATTGCTAACATGGTTCCACCTTTCGACCAGAAGAGACATTCGGGAGTT
GGAGCCGCCGTTGAATACGCAGTTGTACATAGCTGTTGTGGTGGCATTAAAGGACTCATG
TCCATTGAAGATGATGCTGCACCAACTCAGAGTGACTTCATAGAGAACTGGGTGAAGATA
GGTGCACCAGCAAGGAACGAGATCAAGGAAGAGAATCAAGACCTAAGCTACGACGATCAG
TGCAACGTGTGTGAGAAGGAAGCTGTGAATGTGTCGCTTGGGAACTTGCTTTCGTACCCG
TTTGTGAGAGCTGCAGTGGTGAAGAACACACTTGCAATCAGAGGAGCTCACTACAATTTC
GTCAAAGGCACATTTGATCTATGGGAGCTCGATTTCAAGACCACTCCAGCTTATGCCTTC
TCTTGAACATATATACTCTGCTGTTTTTCTCACGAAAAGCTTTTGACTCATCTTTTCTTA
TTTCAAACTTCCAACTTTTGCTGCTTCTGTTTCAAAAAAAGCTGTAAACAATAAAACACA
TCATATGAATCTTCTGTTCAAATC

QA 1 804 1 804
DS 



CO CL335Contig2 1146 5 18 U
GGACATCGTAGAGAGAGATAGCAGCATCATTAAGTGATTTCACATTCCTCCATAAGAACA
TTTTATCCTCTGCTTTTTTTGAACCTATCCTCACGCTAAGGAAGAAGACGAGATGGCCAC
GGAATCGTACGAAGCCGCCATTAAAGGACTGAACGATCTTCTCAGTAAGAAAACAGATCT
GGGGAACGTCGCCGCGGAGAAGATCAAAGTGTTGACTCAGGAGCTCAAGGAGCTCGATTC
CTCCAACAACGACGCCGTTGAACGCATCAAATCCGGTTTCACCCACTTCAAAACCGAAAA
ATACCTGAAGAATGATGCTCTTTTCAGTGACCTCGCCAAGGGTCAGAGCCCAAAGTTTCT
GGTATTCGCTTGTTCGGATTCTCGAGTTTGTCCATCTCACATTTTGAATTTCCAACCTGG
CGAGGCCTTTGTCGTCAGAAACATTGCTAACATGGTTCCACCTTTCGACCAGAAGAGACA
TTCGGGAGTTGGAGCCGCCGTTGAATACGCAGTTGTACATCTCAAGGTGGAGAACATTGT
GGTGATAGGACATAGCTGTTGTGGTGGCATTAAGGGACTCATGTCCATTGAAGATGATGC
TGCACCAACTCATAGTGACTTCATAGAGAACTGGGTGAAGATAGGTGCACCAGCAAGGAA
CAAGATCAAGGAAGAGAATCAAGACCTAAGCTACGACGATCAGTGCAACATGTGTGAGAA
GGAAGCTGTAAATGTGTCGCTTGGGAACTTGCTTTCGTACCCGTTTGTGAGAGCTGCAGT
GGTGAAGAACACACTTGCAATCAGAGGAGCTCACTACAATTTCGTCAAAGGCACATTTGA
ACTCTGGGAGCTTGATTTCAAGACCACCCCAGCTTATGCCTTCTCTTGAATATATATACT
CTTTGCTGTTTTTCTCACAGAAAAGCTTTAAATCATCTTTTTCCTATTTCTCATGTTGAT
TCCGGTCTCAACTTCTTTTCTTATTTCAAACTTCCAACTTTTTGCTGCTTCTGTTTAAAA
AAAGCTGTAAACAATAAAACACATCATACGAATCTTCTGTTCAAATCAAGAAAGACCCGC
TGGTTATCAGGGGACTGGTTATGTATCTCTATGTGTATGCAAAAACTTTTCAGCATTGAT
CATAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ62TF U 1
AF RR2H904TF U 21
AF RR2GL28TF U 3
AF RR2GL28JQ C 315
AF RR2B154JQ C 434
BS 1 270 RR2DZ62TF
BS 271 297 RR2GL28TF
BS 298 298 RR2H904TF
BS 299 300 RR2GL28TF
BS 301 301 RR2H904TF
BS 302 304 RR2GL28TF
BS 305 305 RR2H904TF
BS 306 720 RR2GL28TF
BS 721 721 RR2GL28JQ
BS 722 746 RR2GL28TF
BS 747 747 RR2GL28JQ
BS 748 788 RR2GL28TF
BS 789 789 RR2GL28JQ
BS 790 799 RR2GL28TF
BS 800 800 RR2GL28JQ
BS 801 821 RR2GL28TF
BS 822 1110 RR2GL28JQ
BS 1111 1146 RR2B154JQ

RD RR2DZ62TF 270 0 0
GGACATCGTAGAGAGAGATAGCAGCATCATTAAGTGATTTCACATTCCTCCATAAGAACA
TTTTATCCTCTGCTTTTTTTGAACCTATCCTCACGCTAAGGAAGAAGACGAGATGGCCAC
GGAATCGTACGAAGCCGCCATTAAAGGACTGAACGATCTTCTCAGTAAGAAAACAGATCT
GGGGAACGTCGCCGCGGAGAAGATCAAAGTGTTGACTCAGGAGCTCAAGGAGCTCGATTC
CTCCAACAACGACGCCGTTGAACGCATCAA

QA 1 270 1 270
DS 

RD RR2H904TF 723 0 0
A
CAGCATCATTAAGTGATTTCACATTCCTCCATAAGAACATTTTATCCTCTGCTTTTTTTG
AACCTATCCTCACGCTAAGGAAGAAGACGAGATGGCCACGGAATCGTACGAAGCCGCCAT
TAAAGGACTGAACGATCTTCTCAGTAAGAAAACAGATCTGGGGAACGTCGCCGCGGAGAA
GATCAAAGTGTTGACTCAGGAGCTCAAGGAGCTCGATTCCTCCAACAACGACGCCGTTGA
ACGCATCAAATCCGGTTTCACCCACTTCAAAACCGAAAAATACCTGAAGAATGATGCTCT
TTTCAGTGACCTCGCCAAGGGTCAGAGCCCAAAGTTTCTGGTATTCGCTTGTTCGGATTC
TCGAGTTTGTCCATCTCACATTTTGAATTTCCAACCTGGCGAGGCCTTTGTCGTCAGAAA
CATTGCTAGCATGGTTCCACCTTTCGACCAGAAGGGACATTCGGGAGTCGGTGCCGCCGT
TGAATACGCAGTTGTACATCTCAAGGTGGAGAACATTGTGGTGATGGGCCATAGCTGTTG
TGGTGGCATTAAGGGACTCATGTCCATTGAAGATGATGCTGCACCAACTCAGAGTGACTT
CATAGAGAACTGGGTGAAGATAGGTGCACCAGCAAGGAACAAGATCAAG*AAGAGAATCA
AGACCTAAGCTACGACGATCAGTGCAACATGTGTGAGAAAGAAGCTGTGAGTGTGTCGCT
TG

QA 2 723 2 723
DS 

RD RR2GL28TF 821 0 0
GGATCA
TAGAGAGAGATAGCAGCATCATTAAGTGATTTCACATTCCTCCATAAGAACATTTTATCC
TCTGCTTTTTTTGAACCTATCCTCACGCTAAGGAAGAAGACGAGATGGCCACGGAATCGT
ACGAAGCCGCCATTAAAGGACTGAACGATCTTCTCAGTAAGAAAACAGATCTGGGGAACG
TCGCCGCGGAGAAGATCAAAGTGTTGACTCAGGAGCTCAAGGAGCTCGATTCCTCCAACA
ACGACGCCGTTGAACGCATCAAATCCGGTTTCACCCACTTCAAAACCGAGAAGTACTTGA
AGAATGATGCTCTTTTCAGTGACCTCGCCAAGGGTCAGAGCCCAAAGTTTCTGGTATTCG
CTTGTTCGGATTCTCGAGTTTGTCCATCTCACATTTTGAATTTCCAACCTGGCGAGGCCT
TTGTCGTCAGAAACATTGCTAACATGGTTCCACCTTTCGACCAGAAGAGACATTCGGGAG
TTGGAGCCGCCGTTGAATACGCAGTTGTACATCTCAAGGTGGAGAACATTGTGGTGATAG
GACATAGCTGTTGTGGTGGCATTAAGGGACTCATGTCCATTGAAGATGATGCTGCACCAA
CTCATAGTGACTTCATAGAGAACTGGGTGAAGATAGGTGCACCAGCAAGGAACAAGATCA
AGGAAGAGAATCAAGACCTAAGCTACGACGATCAGTGCAACATGTGTGAGAA*GAAGCTG
TAAATGTGTCGCTTGGGA*CTTGCTTTCGTACCCGTTTGTGAGAGCTGCAGTGGTGAAGA
*CACACTTGCA*TCAGAGGAGCTCACTACAATT
CG

QA 7 819 7 819
DS 

RD RR2GL28JQ 796 0 0
ATGCTCTTTTCAGTGACCTCGCCAAGGGTCAGAGCCCAAAGTTTCTGGTATTCGCTTGTT
CGGATTCTCGAGTTTGTCCATCTCACATTTTGAATTTCCAACCTGGCGAGGCCTTTGTCG
TCAGAAACATTGCTAACATGGTTCCACCTTTCGACCAGAAGAGACATTCGGGAGTTGGAG
CCGCCGTTGAATACGCAGTTGTACATCTCAAGGTGGAGAACATTGTGGTGATAGGACATA
GCTGTTGTGGTGGCATTAAGGGACTCATGTCCATTGAAGATGATGCTGCACCAACTCATA
GTGACTTCATAGAGAACTGGGTGAAGATAGGTGCACCAGCAAGGAACAAGATCAAGGAAG
AGAATCAAGACCTAAGCTACGACGATCAGTGCAACATGTGTGAGAAGGAAGCTGTAAATG
TGTCGCTTGGGAACTTGCTTTCGTACCCGTTTGTGAGAGCTGCAGTGGTGAAGAACACAC
TTGCAATCAGAGGAGCTCACTACAATTTCGTCAAAGGCACATTTGAACTCTGGGAGCTTG
ATTTCAAGACCACCCCAGCTTATGCCTTCTCTTGAATATATATACTCTTTGCTGTTTTTC
TCACAGAAAAGCTTTAAATCATCTTTTTCCTATTTCTCATGTTGATTCCGGTCTCAACTT
CTTTTCTTATTTCAAACTTCCAACTTTTTGCTGCTTCTGTTTAAAAAAAGCTGTAAACAA
TAAAACACATCATACGAATCTTCTGTTCAAATCAAGAAAGACCCGCTGGTTATCAGGGGA
CTGGTTATGTATCTCT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2B154JQ 713 0 0
GTCAGAAACATTGCTAACATGGTTCCACCTTTCGACCAGAAGAGACATTCGGGAGTTGGA
GCCGCCGTTGAATACGCAGTTGTACATCTCAAGGTGGAGAACATTGTGGTGATAGGACAT
AGCTGTTGTGGTGGCATTAAGGGACTCATGTCCATTGAAGATGATGCTGCACCAACTCAT
AGTGACTTCATAGAGAACTGGGTGAAGATAGGTGCACCAGCAAGGAACAAGATCAAGGAA
GAGAATCAAGACCTAAGCTACGACGATCAGTGCAACATGTGTGAGAAGGAAGCTGTAAAT
GTGTCGCTTGGGAACTTGCTTTCGTACCCGTTTGTGAGAGCTGCAGTGGTGAAGAACACA
CTTGCAATCAGAGGAGCTCACTACAATTTCGTCAAAGGCACATTTGAACTCTGGGAGCTT
GATTTCAAGACCACCCCAGCTTATGCCTTCTCTTGAATATATATACTCTTTGCTGTTTTT
CTCACAGAAAAGCTTTAAATCATCTTTTTCCTATTTCTCATGTTGATTCCGGTCTCAACT
TCTTTTCTTATTTCAAACTTCCAACTTTTTGCTGCTTCTGTTTAAAAAAAGCTGTAAACA
ATAAAACACATCATACGAATCTTCTGTTCAAATCAAGAAAGACCCGCTGGTTATCAGGGG
ACTGGTTATGTATCTCTATGTGTATGCAAAAACTTTTCAGCATTGATCATAAG

QA 1 713 1 713
DS 



CO CL335Contig3 749 4 6 U
CGTGATAAAGTAACCAGTGGGTCTTTCTTGATTTGAACAGAAGATTCATATTATGTGTTT
TATTGTTTACAGCTTTTTTGAAACAGAAGCAGCAAAAA*GTTGGAAGTTTGAAATAAGAA
AAGATTAGTCAAAAGCTTTTCGTGAGAAAAACAGCAGAATATATATGTTCAAGAGAAGGC
ATAAGCTGGAGTGGTCTTGAAATCGAGCTCCCATAGATCAAACGTGCCTTTCACGAAATT
GTAGTGAGCTCCTCTTATTGCAAGCGTGTTCTTCACCACTGCAGCTCTCACAAACGGGTA
CGAAAGCAAGTTCCCAAGCGACACATTCACAGCTTCCTTCTCACACATGTTGCACTGATC
GTCGTAGCTTAGGTCTTGATTCTCTTCCTTGATCTTGTTCCTTGCTGGTGCACCTATCTT
CACCCAGTTCTCTATGAAGTCACTCTGAGTTGGTGCAGCATCATCTTCAATGGACATGAG
TCCCTTAATGCCACCACAACAGCTATGGCCTATCACCACAATGTTCTCCACCTTGAGATG
TACAACTGCGTATTCAACGGCGGCACCGACTCCCGAATGTCCCTTCTGGTCGAAAGGTGG
AACCATGCTAGCAATGTTTCTGACGACAAAGGCCTCGCCAGGTTGGAAATTCAAAATGTG
AGATGGACAAACTCGAGAATCCGAACAAGCGAATACCAGAAACTTTGGGCTCTGACCCTT
GGCGAGGTCACTGAAAAGAGCATCATTCT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ62JQ U 4
AF RR2GS64TF C 1
AF RR2H410JQB U 30
AF RR2H904JQ U 30
BS 1 3 RR2GS64TF
BS 4 287 RR2DZ62JQ
BS 288 288 RR2H410JQB
BS 289 540 RR2DZ62JQ
BS 541 621 RR2H410JQB
BS 622 749 RR2H904JQ

RD RR2DZ62JQ 537 0 0
GATAAAGTAACCAGTGGGTCTTTCTTGATTTGAACAGAAGATTCATATTATGTGTTTTAT
TGTTTACAGCTTTTTTGAAACAGAAGCAGCAAAAA*GTTGGAAGTTTGAAATAAGAAAAG
ATTAGTCAAAAGCTTTTCGTGAGAAAAACAGCAGAATATATATGTTCAAGAGAAGGCATA
AGCTGGAGTGGTCTTGAAATCGAGCTCCCATAGATCAAACGTGCCTTTCACGAAATTGTA
GTGAGCTCCTCTTATTGCAAGCGTGTTCTTCACCACTGCAGCTCCCACAAACGGGTACGA
AAGCAAGTTCCCAAGCGACACATTCACAGCTTCCTTCTCACACATGTTGCACTGATCGTC
GTAGCTTAGGTCTTGATTCTCTTCCTTGATCTTGTTCCTTGCTGGTGCACCTATCTTCAC
CCAGTTCTCTATGAAGTCACTCTGAGTTGGTGCAGCATCATCTTCAATGGACATGAGTCC
CTTAATGCCACCACAACAGCTATGGCCTATCACCACAATGTTCTCCACCTTGAGATG

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2GS64TF 660 0 0
CGTGATAAAGTAACCAGTGGGTCTTTCTTGATTTGAACAGAAGATTCATATGATGTGTTT
TATTGTTTACAGCTTTTTTGAAACAGAAGCAGCAAAAAAGTTGGAAGTTTGAAATAAGAA
AAGATGAGTCAAAAGCTTTTCGTGAGAAAAACAGCAGAGTATATATGTTCAAGAGAAGGC
ATAAGCTGGAGTGGTCTTGAAATCGAGCTCCCATAGATCAAATGTGCCTTTGACGAAATT
GTAGTGAGCTCCTCTGATTGCAAGTGTGTTCTTCACCACTGCAGCTCTCACAAACGGGTA
CGAAAGCAAGTTCCCAAGCGACACATTCACAGCTTCCTTCTCACACATGTTGCACTGATC
GTCGTAGCTTAGGTCTTGATTCTCTTCCTTGATCTTGTTCCTTGCTGGTGCACCTATCTT
CACCCAGTTCTCTATGAAGTCACTCTGAGTTGGTGCAGCATCATCTTCAATGGACATGAG
TCCTTTAATGCCACCACAACAGCTATGTCCTATCACCACAATGTTCTCCACCTTGAGATG
TACAACTGCGTATTCAACGGCGGCTCCAACTCCCGAATGTCTCTTCTGGTCGAAAGGTGG
AACCATGTTAGCAATGTTTCTGACGACAAAGGCCTCGCCAGGTTGGAAATTCAAAATGT
C

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2H410JQB 592 0 0
GATTTGAACAGAAGATTCATATTATGTGTTTTATTGTTTACAGCTTTTTTGAAACAGAAG
CAGCAAAAA*GTTGGAAGTTTGAAATAAGAAAAGATTAGTCAAAAGCTTTTCGTGAGAAA
AACAGCAGAATATATATGTTCAAGAGAAGGCATAAGCTGGAGTGGTCTTGAAATCGAGCT
CCCATAGATCAAACGTGCCTTTCACGAAATTGTAGTGAGCTCCTCTTATTGCAAGCGTGT
TCTTCACCACTGCAGCTCTCACAAACGGGTACGAAAGCAAGTTCCCAAGCGACACACTCA
CAGCTTCCTTCTCACACATGTTGCACTGATCGTCGTAGCTTAGGTCTTGATTCTCTTCCT
TGATCTTGTTCCTTGCTGGTGCACCTATCTTCACCCAGTTCTCTATGAAGTCACTCTGAG
TTGGTGCAGCATCATCTTCAATGGACATGAGTCCCTTAATGCCACCACAACAGCTATGGC
CCATCACCACAATGTTCTCCACCTTGAGATGTACAACTGCGTATTCAACGGCGGCACCGA
CTCCCGAATGTCCCTTCTGGTCGAAAGGTGGAACCATGCTAGCAATGTTTCT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2H904JQ 720 0 0
GATTTGAACAGAAGATTCATATTATGTGTTTTATTGTTTACAGCTTTTTTGAAACAGAAG
CAGCAAAAA*GTTGGAAGTTTGAAATAAGAAAAGATTAGTCAAAAGCTTTTCGTGAGAAA
AACAGCAGAATATATATGTTCAAGAGAAGGCATAAGCTGGAGTGGTCTTGAAATCGAGCT
CCCATAGATCAAACGTGCCTTTCACGAAATTGTAGTGAGCTCCTCTTATTGCAAGCGTGT
TCTTCACCACTGCAGCTCTCACAAACGGGTACGAAAGCAAGTTCCCAAGCGACACACTCA
CAGCTTCCTTCTCACACATGTTGCACTGATCGTCGTAGCTTAGGTCTTGATTCTCTTCCT
TGATCTTGTTCCTTGCTGGTGCACCTATCTTCACCCAGTTCTCTATGAAGTCACTCTGAG
TTGGTGCAGCATCATCTTCAATGGACATGAGTCCCTTAATGCCACCACAACAGCTATGGC
CCATCACCACAATGTTCTCCACCTTGAGATGTACAACTGCGTATTCAACGGCGGCACCGA
CTCCCGAATGTCCCTTCTGGTCGAAAGGTGGAACCATGCTAGCAATGTTTCTGACGACAA
AGGCCTCGCCAGGTTGGAAATTCAAAATGTGAGATGGACAAACTCGAGAATCCGAACAAG
CGAATACCAGAAACTTTGGGCTCTGACCCTTGGCGAGGTCACTGAAAAGAGCATCATTCT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 2 13

CO CL336Contig1 1228 11 10 U
GGGTAGTCAGATTAGTCACTCTTCGAAAAATCCCCAAATTTCGGAAGGATAAGCCTCGCC
GGTGACGAAATTAGGGTTTCGTTGAACAAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCG
GCTTCTTCTCTCAGGTTCACAGCTGGATTCGTCTCCGCGAGTCCCAACGCCTCCTCTTTC
GATTCTCAGAAGCTTTCTCTCCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCAAGGAAGACGAAGAAGTTA
GTTAGCGAGAGAAAGAAGTGGAAGAGCT***CAACTCCGAAGGCTGTGTACTCCGGCAAT
CTATGGACACCGGAGACTCCTTCGCCGCAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTACAA
GTGCCTTCTTCGCCTTACTTTCCTGTGTACGCTCAAGGACAAGGACCTCCTCCTATGGTT
CAAGAGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGCTGTGGT
GGTGCTGTGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTGTACCTTGATGCT
GTTGATCCCACTAAGGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCTGG*TGGATCAGTTACAGC
TGGCATGGCTATATTCGATACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTT*GTG
TCGGTCTAGCTGCTAGTATGGGAGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACTAAAGGGAAAAGAT
ACAGTCTGCCAAACTCAAGGATAATGATCCATCAGCCGCTTGGTGGAGCTCAAGGTGGCC
AAACCGATATCGACATTCAGGCAAACGAAATGCTGCATCACAAGGCAAACCTAAACGGTT
ACCTCGCTTACCAAACTGGTCAAAGCCTTGAGAGGATAAACCAAGACACAGACCGTGATT
TCTTCATGAGCGCTAAAGAAGCAAAAGATTACGGGCTTATCGATGGGGTTATCATGAACC
CTCTTAAAGCTCTTCAGCCACTTGCAGCAGCTTGATCGATCGCCTGAAGGTAATGTTTCG
GCTTGGCACTTCTATTTTTGATGGGCCTTTTCTGAACTTAAGGTTTCCATTAAATGTGCC
TTTTCTTCTAGAATGAAATCAAAATCAGTAGCTGATACATACATGAAAAACAAGTACAGT
TCTTTCTCTGCTGTTTTATTGAAAAACAATGACGTTTGTAATGTTTTGATCCTTTGTAAT
CGAATTATTGGCCATCATTATTTCTGCC


BQ
10 25 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 10 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 10 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D285TF U 424
AF RR2H607TF U 2
AF RR2GQ31TF U 4
AF RR2BX21TF U 1
AF RR2CJ21TF U -2
AF RR2B222TF U 1
AF RR2AF31TF U 1
AF RR2CA62TF U 550
AF RR2CA62JQ C 528
AF RR2BX21JQ C 490
AF RR2B222JQ C 708
BS 1 739 RR2AF31TF
BS 740 740 RR2CA62TF
BS 741 774 RR2AF31TF
BS 775 775 RR2CA62TF
BS 776 800 RR2AF31TF
BS 801 801 RR2CA62TF
BS 802 824 RR2AF31TF
BS 825 999 RR2CA62TF
BS 1000 1206 RR2BX21JQ
BS 1207 1228 RR2B222JQ

RD RR2D285TF 209 0 0
GAGG
GTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGCTGTGGTGGTGCTG
TGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTTGATGCTGTTGATC
CCACTAACGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCTGG*TGGATCTGTTACAGCTGGTATG
GCTATATTTGACACTATGAGGCATA

QA 5 209 5 209
DS 

RD RR2H607TF 702 0 0
GGTAGTCAGATTAGTCACTCTTCGAAAAATCCCCAAATTTCGGAAGGATAAGCCTCGCCG
GTGACGAAATTAGGGTTTCGTTGAACGAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCGG
CTACGTCTCTCAGGTTTACAGCTGGATTCGTCTCCGCGAGTCCCAACGCCTCCTCTTTCG
ATTCTCAGAAGCTTTCTCTTCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCGAGGAAGACGAAGAAGTTAG
TTAGCGAGAGAAAGAATTGGAAGAGCTCATCAACTCCGAAGGCTGTATACTCCGGAAATG
TATGGACACCGGAGACTCCTTCGCCGCAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTACAAG
TGCCTTCTTCGCCTTACTTTCCTGTGTACGCTCAAGGACAAGGACCACCTCCTATGGTGC
AAGAGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGCTGTGGTG
GTGCTGTGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTTGATGCTG
TTGATCCCACTAAGGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCTGG*TGGATCTGTTACAGCT
GGTATGGCTATATTTGACACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTT*GTGT
CGGTCTAGCTGCTAGTATGGGAGCATTTCTGCTTAGTGCTGG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2GQ31TF 690 0 0
TAGTCAGATTAGTCACTCTTCGAAAAATCCCCAAATTTCGGAAGGATAAGCCTCGCCGGT
GACGAAATTAGGGTTTCGTTGAACGAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCGGCT
ACGTCTCTCAGGTTTACAGCTGGATTCGTCTCCGCGAGTCCCAACGCCTCCTCTTTCGAT
TCTCAGAAGCTTTCTCTTCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCGAGGAAGACGAAGAAGTTAGTT
AGCGAGAGAAAGAATTGGAAGAGCTCATCAACTCCGAAGGCTGTATACTCCGGAAATGTA
TGGACACCGGAGACTCCTTCGCCGCAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTACAAGTG
CCTTCTTCGCCTTACTTTCCTGTGTACGCTCAAGGACAAGGACCACCTCCTATGGTGCAA
GAGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGCTGTGGTGGT
GCTGTGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTTGATGCTGTT
GATCCCACTAAGGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCTGGGTGGATCTGTTACAGCTGG
TATGGCTATATTTGACACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTT*GTGTCG
GTCTAGCTGCTAGTATGGGAGCATTTCTGC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2BX21TF 713 0 0
G
GGTAGTCAGATTAGTCACTCTTCGAAAAATCCCCAAATTTCGGAAGGATAAGCCTCGCCG
GTGACGAAATTAGGGTTTCGTTGAACAAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCGG
CTTCTTCTCTCAGGTTCACAGCTGGATTCGTCTCCGCGAGTCCCAACGCCTCCTCTTTCG
ATTCTCAGAAGCTTTCTCTCCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCAAGGAAGACGAAGAAGTTAG
TTAGCGAGAGAAAGAAGTGGAAGAGCT***CAACTCCGAAGGCTGTGTACTCCGGCAATC
TATGGACACCGGAGACTCCTTCGCCGCAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTACAAG
TGCCTTCTTCGCCTTACTTTCCTGTGTACGCTCAAGGACAAGGACCTCCTCCTATGGTTC
AAGAGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGCTGTGGTG
GTGCTGTGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTGTACCTTGATGCTG
TTGATCCCACTAAGGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCTGG*TGGATCAGTTACAGCT
GGCATGGCTATATTCGATACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTT*GTGT
CGGTCTAGCTGCTAGTATGGGAACATTTCTGCTTAGTGCTGGAACTAAAGG
A

QA 2 712 2 712
DS 

RD RR2CJ21TF 733 0 0
GGACT
GTAGTCAGATTAGTCACTCTTCGAAAAATCCCCAAATTTCGGAAGGATAAGCCTCGCCGG
TGACGAAATTAGGGTTTCGTTGAACAAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCGGC
TTCTTCTCTCAGGTTCACAGCTGGATTCGTCTCCGCGAGTCCCGACGCCTCCTCTTTCGA
TTCTCAGAAGCTTTCTCTCCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCAAGGAAGACGAAGAAGTTAGT
TAGCGAGAGAAAGAAGTGGAAGAGCT***CAACTCCGAAGGCTGTGTACTCCGGCAATCT
ATGGACACCGGAGACTCCTTCGCCGCAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTACAAGT
GCCTTCTTCGCCTTACTTTCCTGTGTACGCTCAAGGACAAGGACCTCCTCCTATGGTTCA
AGAGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGCTGTGGTGG
TGCTGTGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTGTACCTTGATGCTGT
TGATCCCACTAAGGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCTGG*TGGATCAGTTACAGCTG
GCATGGCTATATTCGATACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTT*GTGTC
GGTCTAGCTGCTAGTATGGGAGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACTAAAGG*AAAAGATAC
AGTCTGCC

QA 6 733 6 733
DS 

RD RR2B222TF 735 0 0
G
GGTAGTCAGATTAGTCACTCTTCGAAAAATCCCCAAATTTCGGAAGGATAAGCCTCGCCG
GTGACGAAATTAGGGTTTCGTTGAACAAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCGG
CTTCTTCTCTCAGGTTCACAGCTGGATTCGTCTCCGCGAGTCCCAACGCCTCCTCTTTCG
ATTCTCAGAAGCTTTCTCTCCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCAAGGAAGACGAAGAAGTTAG
TTAGCGAGAGAAAGAAGTGGAAGAGCT***CAACTCCGAAGGCTGTGTACTCCGGCAATC
TATGGACACCGGAGACTCCTTCGCCGCAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTACAAG
TGCCTTCTTCGCCTTACTTTCCTGTGTACGCTCAAGGACAAGGACCTCCTCCTATGGTTC
AAGAGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGCTGTGGTG
GTGCTGTGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTGTACCTTGATGCTG
TTGATCCCACTAAGGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCTGG*TGGATCAGTTACAGCT
GGCATGGCTATATTCGATACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTTTGTGT
CGGTCTAGCTGCTAGTATGGGAGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACTAAAGGGAAAAGATA
CAGTCTGCCAAACT

QA 2 735 2 735
DS 

RD RR2AF31TF 831 0 0
GGGTAGTCAGATTAGTCACTCTTCGAAAAATCCCCAAATTTCGGAAGGATAAGCCTCGCC
GGTGACGAAATTAGGGTTTCGTTGAACAAGAAGATGGCTCACGCTTGCGTCTCCACATCG
GCTTCTTCTCTCAGGTTCACAGCTGGATTCGTCTCCGCGAGTCCCAACGCCTCCTCTTTC
GATTCTCAGAAGCTTTCTCTCCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCAAGGAAGACGAAGAAGTTA
GTTAGCGAGAGAAAGAAGTGGAAGAGCT***CAACTCCGAAGGCTGTGTACTCCGGCAAT
CTATGGACACCGGAGACTCCTTCGCCGCAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTACAA
GTGCCTTCTTCGCCTTACTTTCCTGTGTACGCTCAAGGACAAGGACCTCCTCCTATGGTT
CAAGAGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGCTGTGGT
GGTGCTGTGGATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTGTACCTTGATGCT
GTTGATCCCACTAAGGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCTGG*TGGATCAGTTACAGC
TGGCATGGCTATATTCGATACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTT*GTG
TCGGTCTAGCTGCTAGTATGGGAGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACTAAAGGGAAAAGAT
ACAGTCTGCCAAACTCAAG*ATAATGATCCATCAGCCGCTTGGTGGAGCTCAAG*TGGCC
AAACCGATATCGACATTCAG*CAAACGAAATGCTGCATCACAAG
CAAACCT

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2CA62TF 450 0 0
ACTAAGGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCTGG*TGGATCAGTTACAGCTGGCATGGC
TATATTCGATACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTT*GTGTCGGTCTAG
CTGCTAGTATGGGAGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACTAAAGGGAAAAGATACAGTCTGC
CAAACTCAAGGATAATGATCCATCAGCCGCTTGGTGGAGCTCAAGGTGGCCAAACCGATA
TCGACATTCAGGCAAACGAAATGCTGCATCACAAGGCAAACCTAAACGGTTACCTCGCTT
ACCAAACTGGTCAAAGCCTTGAGAGGATAAACCAAGACACAGACCGTGATTTCTTCATGA
GCGCTAAAGAAGCAAAAGATTACGGGCTTATCGATGGGGTTATCATGAACCCTCTTAAAG
CTCTTCAGCCACTTGCAGCAGCTTGATCGA

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR2CA62JQ 602 0 0
GTACCTTGATGCTGTTGATCCCACTAAGGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCTGG*TG
GATCAGTTACAGCTGGCATGGCTATATTCGATACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCT
CCACTGTTT*GTGTCGGTCTAGCTGCTAGTATGGGAGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACT
AAAGGGAAAAGATACAGTCTGCCAAACTCAAGGATAATGATCCATCAGCCGCTTGGTGGA
GCTCAAGGTGGCCAAACCGATATCGACATTCAGGCAAACGAAATGCTGCATCACAAGGCA
AACCTAAACGGTTACCTCGCTTACCAAACTGGTCAAAGCCTTGAGAGGATAAACCAAGAC
ACAGACCGTGATTTCTTCATGAGCGCTAAAGAAGCAAAAGATTACGGGCTTATCGATGGG
GTTATCATGAACCCTCTTAAAGCTCTTCAGCCACTTGCAGCAGCTTGATCGATCGCCTGA
AGGTAATGTTTCGGCTTGGCACTTCTATTTTTGATGGGCCTTTTCTGAACTTAAGGTTTC
CATTAAATGTGCCTTTTCTTCTAGAATGAAATCAAAATCAGTAGCTGATACATACATGAA
AA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2BX21JQ 717 0 0
GATGATGATATGGCCAACATAATCGTGGCTCAGCTTCTGTACCTTGATGCTGTTGATCCC
ACTAAGGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCTGG*TGGATCAGTTACAGCTGGCATGGC
TATATTCGATACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTT*GTGTCGGTCTAG
CTGCTAGTATGGGAACATTTCTGCTTAGTGCTGGAACTAAAGGGAAAAGATACAGTCTGC
CAAACTCAAGGATAATGATCCATCAGCCGCTTGGTGGAGCTCAAGGTGGCCAAACCGATA
TCGACATTCAGGCAAACGAAATGCTGCATCACAAGGCAAACCTAAACGGTTACCTCGCTT
ACCAAACTGGTCAAAGCCTTGAGAGGATAAACCAAGACACAGACCGTGATTTCTTCATGA
GCGCTAAAGAAGCAAAAGATTACGGGCTTATCGATGGGGTTATCATGAACCCTCTTAAAG
CTCTTCAGCCACTTGCAGCAGCTTGATCGATCGCCTGAAGGTAATGTTTCGGCTTGGCAC
TTCTATTTTTGATGGGCCTTTTCTGAACTTAAGGTTTCCATTAAATGTGCCTTTTCTTCT
AGAATGAAATCAAAATCAGTAGCTGATACATACATGAAAAACAAGTACAGTTCTTTCTCT
GCTGTTTTATTGAAAAACAATGACGTTTGTAATGTTTTGATCCTTTGTAATCGAATT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2B222JQ 521 0 0
AAAGGGAAAAGATACAGTCTGCCAAACTCAAGGATAATGATCCATCAGCCGCTTGGTGGA
GCTCAAGGTGGCCAAACCGATATGGACATTCAGGCAAACGAAATGCTGCATCACAAGGCA
AACCTAAACGGTTACCTCGCTTACCAAACTGGTCAAAGCCTTGAGAGGATAAACCAAGAC
ACAGACCGTGATTTTTTCATGAGCGCTAAAGAAGCAAAAGATTACGGGCTTATCGATGGG
GTTATCATGAACCCTCTTAAAGCTTTTCAGCCACTTGCAGCAGCTTGATCGATCGCCTGA
AGGTAATGTTTCGGCTTGGCACTTCTATTTTTGATGGGCCTTTTTTGAACTTAAGGTTCC
CATTAAATGTGCCTTTTTTTCTAGAATGAAATCAAAATCAGTAGCTGATACATACATGAA
AAACAAGTACAGTTCTTTTTCTGCTGTTTTATTGAAAAACAATGACGTTTGTAATGTTTT
GATCCTTTGTAATCGAATTATTGGCCATCATTATTTCTGCC

QA 1 521 1 521
DS 



CO CL336Contig2 572 2 3 U
GAATACTCGTAGGCAGAAATAATGATGGCCAATAATTCGATTACAAAGGATCAAAACATT
ACAAACGTCATTGTTTTTCAATAAAACAGCAAAAAAAGAACTTTACTTGTTTTTCATGTA
TGTATCAGCTACTGATTTTGATTTCATTCTAAAAAAAAAGGCACATTTAATGGAAACCTT
AAGTTCAAAAAAGGCCCATCAAAAATAAAAGTGCCAAGCCGAAACATTACCTTCAGGCGA
TCGATCAAGCTGCTGGAAGTGGCTGAAAAGCTTTAAAAGGGTTCATGATAACACCATCGA
TAAGCCCGTAATCTTTTGCTTCTTTAGCGCTCATGAAAAAATCACGGTCTGTGTCTTGGT
TTATCCTCTCAAGGCTTTGACCAGTTTGGTAAGCGAGGTAACCGTTGAGGTTTGCCTTGT
GATGCAGCATTTCATTTGCCTGAATGTCGATATCGGTTTGGCCACCTTGAGCTCCACCAA
GAGGCTGATGGATCATTATCCTTGAGTTTGGTAGACTGTATCTTTTCCCCTTGGTTCCAG
CACTAAGCAGAAATGCTCCCATACTAGCAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H607JQB U 24
AF RR2GQ31JQ U 1
BS 1 81 RR2GQ31JQ
BS 82 82 RR2H607JQB
BS 83 572 RR2GQ31JQ

RD RR2H607JQB 217 0 0
GG
TGGCCAATAATTCGATTACAAAGGATCAAAACATTACAAACGTCATTGTTTTTCAATAAA
ACAGCAGAAAAAGAACTTTACTTGTTTTTCATGTATGTATCAGCTACTGATTTTGATTTC
ATTCTAAAAGAAAAGGCACATTTAATGGAAACCTTAAGTTCAGAAAAGGCCCATCAAAAA
TAAAAGTGCCAAGCCGAAACATTACCTTCAGGCGA

QA 3 217 3 217
DS 

RD RR2GQ31JQ 572 0 0
GAATACTCGTAGGCAGAAATAATGATGGCCAATAATTCGATTACAAAGGATCAAAACATT
ACAAACGTCATTGTTTTTCAA*AAAACAGCAAAAAAAGAACTTTACTTGTTTTTCATGTA
TGTATCAGCTACTGATTTTGATTTCATTCTAAAAAAAAAGGCACATTTAATGGAAACCTT
AAGTTCAAAAAAGGCCCATCAAAAATAAAAGTGCCAAGCCGAAACATTACCTTCAGGCGA
TCGATCAAGCTGCTGGAAGTGGCTGAAAAGCTTTAAAAGGGTTCATGATAACACCATCGA
TAAGCCCGTAATCTTTTGCTTCTTTAGCGCTCATGAAAAAATCACGGTCTGTGTCTTGGT
TTATCCTCTCAAGGCTTTGACCAGTTTGGTAAGCGAGGTAACCGTTGAGGTTTGCCTTGT
GATGCAGCATTTCATTTGCCTGAATGTCGATATCGGTTTGGCCACCTTGAGCTCCACCAA
GAGGCTGATGGATCATTATCCTTGAGTTTGGTAGACTGTATCTTTTCCCCTTGGTTCCAG
CACTAAGCAGAAATGCTCCCATACTAGCAGCT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 13

CO CL337Contig1 1019 13 29 U
GGACTGTCTCCTCCAGCAAATAAAAACCATAAAAAGGCGAGATTTTTCACGGAATCTCCG
ATCTTTAATTCTTCTTCATCGCTTTGATCGTCATCACACAGATCCTCCATTCTCTTTCGT
TCCTCCTTGGAGGATCAGATCTTGGAAGGTCCTCAGCTCAAGGAGAGGAGAAGAAGAAGG
AGAGTAAAGGGAGAGACTTTTGAAGGATGTCTTCATTCACAGGAACTCAGCAGAAATGCA
AGGCTTGCGAGAAGACTGTGTACCCTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGTGTTAGCTATC
ACAAGTCTTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGTAGATATTCAT
CGATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTCTTCAAGGAGTCTGGTA
GCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCTGAGAAATCAAGTCCTGAGCTGA
CAAGGACACCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCACACAAGAGAAATGCGCCACTT
GCAGTAAAACTGTGTATCCTATCGAAAAGGTCACAGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGT
CCTGCTTCAAATGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTACGCAGCTCTTG
AAGGAATCCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAAAAGGGAAGCTACA
ACCACTTGATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCGGCAGCCGCAGTCGCTGCCGGTA
CACCTGCAGCCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAAACTCAAATAATCCTCTCTCCTCTCTAGT
CTAAATTGAAACTTCAATGCCAAACTGATTCAGTTTGTTTTCTCATTTTGTGTCTTTGTG
TATGAGTGTGTAATCTATCTATCCTTTGATGTTCTTTGCTTCCATTAATCTCTTCTAAAG
CTTGATTGTTGTCGTGATTTGGTATCTCTATAAAAAAAAACTGAGACTTTCCTTTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 25 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 60 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 
65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 
35 50 50 50 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C917TF U 51
AF RR2GW44TF U 47
AF RR2F890TF U 65
AF RR2GI18TF U 51
AF RR2F170TF U 51
AF RR2A034TF U 1
AF RR2A433TF U 51
AF RR2A034JQ C 130
AF RR2ES53TF U 280
AF RR2C917JQ C 504
AF RR2ES53JQ C 281
AF RR2A433JQ C 311
AF RR2C686TF U 455
BS 1 50 RR2A034TF
BS 51 52 RR2A433TF
BS 53 63 RR2A034TF
BS 64 64 RR2A433TF
BS 65 181 RR2A034TF
BS 182 182 RR2A433TF
BS 183 253 RR2A034TF
BS 254 254 RR2A433TF
BS 255 264 RR2A034TF
BS 265 265 RR2A433TF
BS 266 533 RR2A034TF
BS 534 534 RR2A433TF
BS 535 721 RR2A034TF
BS 722 722 RR2A433TF
BS 723 812 RR2A034TF
BS 813 813 RR2A433TF
BS 814 821 RR2A034TF
BS 822 822 RR2A433TF
BS 823 831 RR2A034TF
BS 832 832 RR2A433TF
BS 833 850 RR2A034TF
BS 851 860 RR2A433TF
BS 861 861 RR2ES53TF
BS 862 870 RR2A433TF
BS 871 943 RR2ES53TF
BS 944 994 RR2C686TF
BS 995 995 RR2A433JQ
BS 996 1000 RR2C686TF
BS 1001 1019 RR2A433JQ

RD RR2C917TF 656 0 0
GGAATCTCCGATCTTTAATTCTTCTTCATCGCTTTGATCGTCATCACACAGATCCTCCAT
TCTCTTTCGTTCCTCCTTGGAGGATCAGATCTTGGAAGGTCCTCAGCTCAAGGAGAGGAG
AAGAAGAAGGAGAGTAAAGGGAGAGACTTTTGAAGGATGTCTTCTTTCACAGGAACTCAG
CAGAAATGCAAGGCTTGCGAGAAGACTGTGTACCCTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGT
GTTAGCTATCACAAGGCTTGCTTCAAATGCACTCACCGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGT
AGATATTCATCAATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCCTTATGAGCAGCTCTTCAAG
GAGTCTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCTGAGAAATCAAGT
CCTGAGCTGACAAGGACCCCTAGCCGAGCTGCTGGTATGTTCTCAGGCACACAAGAAAAA
TGCGCCACTTGCAGTAAAACTGTCTATCCTATCGAAAAGGTAACAGTGGAGAGCCAGACA
TATCACAAGTCCTGCTTCAAGTGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTAC
GCAGCTCTTGAAGGGATCCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2GW44TF 654 0 0
GGACCC
AATCTCCGATCTTTAATTCTTCTTCATCGCTTTGATCGTCATCACACAGATCCTCCATTC
TCTTTCGTTCCTCCTTGGAGGATCAGATCTTGGAAGGTCCTCAGCTCAAGGAGAGGAGAA
GAAGAAGGAGAGTAAAGGGAGAGACTTTTGAAGGATGTCTTCTTTCACAGGAACTCAGCA
GAAATGCAAGGCTTGCGAGAAGACTGTGTACCCTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGTGT
TAGCTATCACAAGGCTTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGTAG
ATATTCATCAATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTCTTCAAGGA
GTCTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCTGAGAAATCAAGTCC
TGAGCTGACAAGGACCCCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCACACAGGAAAAATG
CGCCACTTGCAGTAAAACTGTCTATCCTATCGAAAAGGTAACAGTGGAGAGCCAGACATA
TCACAAGTCCTGCTTCAAGTGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTACGC
AGCTCTTGAAGGGATCCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTT

QA 7 654 7 654
DS 

RD RR2F890TF 710 0 0
GG
AATTCTTCTTCATCGCTTTGATCGTCATCACACAGATCCTCCATTCTCTTTCGTTCCTCC
TTGGAGGATCAGATCTTGGAAGGTCCTCAGCTCAAGGAGAGGAGAAGAAGAAGGAGAGTA
AAGGGAGAGACTTTTGAAGGATGTCTTCTTTCACAGGAACTCAGCAGAAATGCAAGGCTT
GCGAGAAGACTGTGTACCCTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGTGTTAGCTATCACAAGG
CTTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGTAGATATTCATCAATGG
AAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTCTTCAAGGAGTCTGGTAGCTTCA
CCAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCTGAGAAATCAAGTCCTGAGCTGACAAGGA
CCCCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCACACAAGAAAAATGCGCCACTTGCAGTA
AAACTGTCTATCCTATCGAAAAGGTAACAGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGTCCTGCT
TCAAGTGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTACGCAGCTCTTGAAGGGA
TCCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAAAAGGGAAGTTACAACCACT
TGATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCGGCAGCCGCAGTCGCTG

QA 3 710 3 710
DS 

RD RR2GI18TF 724 0 0
GGAATCTCCGATCTTTAATTCTTCTTCATCGCTTTGATCGTCATCACACAGATCCTCCAT
TCTCTTTCGTTCCTCCTTGGAGGATCAGATCTTGGAAGGTCCTCAGCTCAAGGAGAGGAG
AAGAAGAAGGAGAGTAAAGGGAGAGACTTTTGAAGGATGTCTTCATTCACAGGAACTCAG
CAGAAATGCAAGGCTTGCGAGAAGACTGTGTACCCTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGT
GTTAGCTATCACAAGTCTTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGT
AGATATTCATCGATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAATCCTCATTATGAGCAGCTCTTCAAG
GAGTCTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCTGAGAAATCAAGT
CCTGAGCTGACAAGGACACCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCACACAAGAGAAA
TGCGCCACTTGCAGTAAAACTGTGTATCCTATCGAAAAGGTCACAGTAGAGAGCCAGACA
TATCACAAGTCCTGCTTCAAATGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTAC
GCAGCTCTTGAAGGAATCCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAAAAG
GGAAGCTACAACCACTTGATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCGGCAGCCGCAGTC
GCTG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2F170TF 762 0 0
GGAATCTCCGATCTTTAATTCTTCTTCATCGCTTTGATCGTCATCACACAGATCCTCCAT
TCTCTTTCGTTCCTCCTTGGAGGATCAGATCTTGGAAGGTCCTCAGCTCAAGGAGAGGAG
AAGAAGAAGGAGAGTAAAGGGAGAGACTTTTGAAGGATGTCTTCATTCACAGGAACTCAG
CAGAAATGCAGGGCTTGCGAGAAGACCGTGTACCCTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGT
GTTAGCTATCACAAGTCTTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGT
AGATATTCATCGATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTCTTCAAG
GAGTCTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCTGAGAAATCAAGT
CCTGAGCTGACAAGGACACCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCACACAAGAGAAA
TGCGCCACTTGCAGTAAAACTGTGTATCCTATCGAAAAGGTCACAGTGGAGAGCCAGACA
TATCACAAGTCCTGCTTCAAATGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTAC
GCAGCTCTTGAAGGAATCCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAAAAG
GGAAGCTACAACCACTTGATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCGGCAGCCGCAGTC
GCTGCCGGTACACCTGCAGCCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2A034TF 866 0 0
GGACTGTCTCCTCCAGCAAATAAAAACCATAAAAAGGCGAGATTTTTCACCCAATCTCCG
ATCCTTAATTCTTCTTCATCGCTTTGATCGTCATCACACAGATCCTCCATTCTCTTTCGT
TCCTCCTTGGAGGATCAGATCTTGGAAGGTCCTCAGCTCAAGGAGAGGAGAAGAAGAAGG
AAAGTAAAGGGAGAGACTTTTGAAGGATGTCTTCATTCACAGGAACTCAGCAGAAATGCA
AGGCTTGCGAGAATACTGTGTACCTTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGTGTTAGCTATC
ACAAGTCTTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGTAGATATTCAT
CGATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTCTTCAAGGAGTCTGGTA
GCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCTGAGAAATCAAGTCCTGAGCTGA
CAAGGACACCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCACACAAGAGAAATGCTCCACTT
GCAGTAAAACTGTGTATCCTATCGAAAAGGTCACAGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGT
CCTGCTTCAAATGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTACGCAGCTCTTG
AAGGAATCCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAAAAGGGAAGCTACA
ATCACTTGATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCGGCAGCCGCAGTCGCTGCCGGTA
CACCTGCAGCCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAA*CTCAAATA*TCCTCTCTC*TCTCTAGT
CTAAATTGAA
CTTCATGCAAACTGAT

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR2A433TF 820 0 0
GGAATCTCCGATCTTTAATTCTTCTTCATCGCTTTGATCGTCATCACACAGATCCTCCAT
TCTCTTTCGTTCCTCCTTGGAGGATCAGATCTTGGAAGGTCCTCAGCTCAAGGAGAGGAG
AAGAAGAAGGAGAGTAAAGGGAGAGACTTTTGAAGGATGTCTTCATTCACAGGAACTCAG
CAGAAATGCAAGGCTTGCGAGAAGACTGTGTACCCTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGT
GTTAGCTATCACAAGTCTTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGT
AGATATTCATCGATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTCTTCAAG
GAGTCTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCTGAGAAATCAAGT
CCTGAGCTGACAAGGACACCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCACACAAGAGAAA
TGCGCCACTTGCAGTAAAACTGTGTATCCTATCGAAAAGGTCACAGTGGAGAGCCAGACA
TATCACAAGTCCTGCTTCAAATGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTAC
GCAGCTCTTGAAGGAATCCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAAAAG
GGAAGCTACAACCACTTGATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCGGCAGCCGCAGTC
GCTGCCGGTACACCTGCAGCAGCCGTTCCTGAATCTTAAAAAACTCAAATAATCCTCTCT
CCTCTCTAGTCTAAATTGAAACTTCAATGC*AAACTGATT

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR2A034JQ 715 0 0
GAGGATCAGATCTTGGAAGGTC*TCAGCTCAAGGAGAGGAGAAGAAGAAGGAAAGTAAAG
GGAGAGACTTTTGAAGGATGTCTTCATTCACAGGAACTCAGCAGAAATGCAAGGCTTGCG
AGAATACTGTGTACCTTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGTGTTAGCTATCACAAGTCTT
GCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGTAGATATTCATCGATGGAAG
GTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTCTTCAAGGAGTCTGGTAGCTTCACCA
AGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCTGAGAAATCAAGTCCTGAGCTGACAAGGACAC
CTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCACACAAGAGAAATGCTCCACTTGCAGTAAAA
CTGTGTATCCTATCGAAAAGGTCACAGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGTCCTGCTTCA
AATGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTACGCAGCTCTTGAAGGAATCC
TCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAAAAGGGAAGCTACAATCACTTGA
TCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCGGCAGCCGCAGTCGCTGCCGGTACACCTGCAG
CCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAAACTCAAATAATCCTCTCTCCTCTCTAGTCTAA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2ES53TF 664 0 0
G
AGCTGATGGTGTTAGCTATCACAAGTCTTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCT
TCAGCTGAGTAGATATTCATCGATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCA
GCTCTTCAAGGAGTCTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCAGTTAAACCGGCTGA
GAAATCAAGTCCTGAGCTGACAAGGACACCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCAC
ACAAGAGAAATGCGCCACTTGCAGTAAAACTGTGTATCCTATCGAAAAGGTCACAGTGGA
GAGCCAGACATATCACAAGTCCTGCTTCAAATGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCACC
ATCAAACTACGCAGCTCTTGAAGGAATCCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTT
CAAGGAAAAGGGAAGCTACAACCACTTGATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCGGC
AGCCGCAGTCGCTGCCGGTACACCTGCAGCCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAAACTCAAAT
AATCCTCTCTCCTCTCTAGTCTAAATTGAAACTTCAATGCCAAACTGATTCAGTTTGTTT
TCTCATTTTGTGTCTTTGTGTATGAGTGTGTAATCTATCTATCCTTTGATGTTCTTTGCT
TCC

QA 2 664 2 664
DS 

RD RR2C917JQ 414 0 0
GGTATGTTTTCAGGCACACAAGAAAAATGCGCCACTTGCAGTAAAACTGTTTATCCTATC
GAAAAGGTAACAGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGTCCTGCTTCAAGTGCTCACACGGA
GGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTACGCAGCTCTTGAAGGGATCCTTTACTGCAAGCAC
CATTTCGTTCAGCTTTTCAAGGAAAAGGGAAGTTACAACCACTTGATCAAATTTGCTTCC
ATCAAACGTTTTGCGGCAGCCGCAGTCGCTGCCGGTACACCTGCAGCCGCCGTTCCTGAA
TTTTAAAAAACTCAAATAATCCTCTTTCCTCTTTAGTTTAAATTGAAACTTCAATGCCAA
ACTGATTCAGTTTGTTTTCTCATTTTGTGTCTTTGTGTATGAGTGTGTAATCTA

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR2ES53JQ 663 0 0
AGCTGATGGTGTTAGCTATCACAAGTCTTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCT
TCAGCTGAGTAGATATTCATCGATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCA
GCTCTTCAAGGAGTCTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCAGTTAAACCGGCTGA
GAAATCAAGTCCTGAGCTGACAAGGACACCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCAC
ACAAGAGAAATGCGCCACTTGCAGTAAAACTGTGTATCCTATCGAAAAGGTCACAGTGGA
GAGCCAGACATATCACAAGTCCTGCTTCAAATGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCACC
ATCAAACTACGCAGCTCTTGAAGGAATCCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTT
CAAGGAAAAGGGAAGCTACAACCACTTGATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCGGC
AGCCGCAGTCGCTGCCGGTACACCTGCAGCCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAAACTCAAAT
AATCCTCTCTCCTCTCTAGTCTAAATTGAAACTTCAATGCCAAACTGATTCAGTTTGTTT
TCTCATTTTGTGTCTTTGTGTATGAGTGTGTAATCTATCTATCCTTTGATGTTCTTTGCT
TCC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2A433JQ 709 0 0
CTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGCTGAGTAGATATTCATCGATGGAAGG
TGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTCTTCAAGGAGTCTGGTAGCTTCACCAA
GAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCTGAGAAATCAAGTCCTGAGCTGACAAGGACACC
TAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGCACACAAGAGAAATGCGCCACTTGCAGTAAAAC
TGTGTATCCTATCGAAAAGGTCACAGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGTCCTGCTTCAA
ATGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCACCATCAAACTACGCAGCTCTTGAAGGAATCCT
CTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAAAAGGGAAGCTACAACCACTTGAT
CAAATTTGCTTCCATCAAACGCTTTGCGGCAGCCGCAGTCGCTGCCGGTACACCTGCAGC
AGCCGTTCCTGAATCTTAAAAAACTCAAATAATCCTCTCTCCTCTCTAGTCTAAATTGAA
ACTTCAATGC*AAACTGATTCAGTTTGTTTTCTCATTTTGTGTCTTTGTGTATGAGTGTG
TAATCTATCTATCCTTTGATGTTCTTTGCTTCCATTAATCTCTTCTAAAGCTTGATTGTT
GTCGTGATTTGGTATCTCTATAAAAAAAAACTGAGACTTTCCTTTTTTG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2C686TF 546 0 0
GGCTGAGTAATCAAGTCCTGAGCTGACAAGGACACCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTC
AGGCACACAAGAGAAATGCGCCACTTGCAGTAAAACTGTGTATCCTATCGAAAAGGTCGC
AGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGTCCTGCTTCAAATGCTCACACGGAGGCTGCCCTAT
CTCACCATCAAACTACGCAGCTCTTGAAGGAATCCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCA
GCTTTTCAAGGAAAAGGGAAGCTACAACCACTTGATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTC
TGCGGCAGCCGCAGTCGCTGCCGGTACACCTGCAGCCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAAAC
TCAAATAACCCTCTCTCCTCTCTAGTCTAAATTGAAACTTCAATGCCAAACTGATTCAGT
TTGTTTTCTCATTTTGTGTCTTTGTGTATGAGTGTGTAATCTATCTATCCTTTGATGTTC
TTTGCTTCCATTAATCTCTTCTAAAGCTTGATTGTTGTCGTGATTTGGTATCTCTATAAA
GAAAAA

QA 1 546 1 546
DS 



AS 2 12

CO CL338Contig1 818 9 14 U
GGCTCAACATTAATAAATCTTAAATCATTTAGGATTATATAGCTTCCAAATAACGCCGAG
GAAAAAGGAAAAGAGTCATATTCGAAGAAAACATAATATATTCACCC*TCTCTGCGTCTC
CTTTCAGCAGTAATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGT
CCATGATGACTGCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCAT
TGTTTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTAT
TCAAACCTATGAGGACTTTGCTGCGAGTCTTCCAGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTA
TGATTTTGATTTTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCTTG
GTGTCCTGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTT
CAAGCGTGAACTTGATGGAATTCAGGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGA
TCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAACAAATATCTCTCTCTCTC**TTTGA
ATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTTA
TTCTATCTTATCTGGTCTTGTCTTCTGTGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTCTATTT
GAAAATTATCCCAAAGTTTGTGCTGTGTGTGTTGCATCCTTTGTGTAAAGATGATTCCTC
TGAGCGTCCTTTGTTCTGCTTTGTTACATGGTGGATAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 15 55 55 15 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 0 45 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP37TF U 76
AF RR2B067JQ C 1
AF RR2FS35JQ C 215
AF RR2FS35TF U 67
AF RR2GS43TF U 130
AF RR2B067TF U 1
AF RR2BO68JQ C 67
AF RR2BO68TF U 67
AF RR2AH63TF U 102
BS 1 66 RR2B067TF
BS 67 77 RR2FS35TF
BS 78 224 RR2DP37TF
BS 225 225 RR2FS35TF
BS 226 575 RR2DP37TF
BS 576 592 RR2FS35TF
BS 593 593 RR2GS43TF
BS 594 595 RR2FS35TF
BS 596 596 RR2GS43TF
BS 597 732 RR2FS35TF
BS 733 734 RR2BO68TF
BS 735 735 RR2AH63TF
BS 736 755 RR2BO68TF
BS 756 818 RR2AH63TF

RD RR2DP37TF 500 0 0
GG
ATATTCGAAGAAAACATAATATATTCACCC*TCTCTGCGTCTCCTTTCAGCAGTAATCTC
GTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGC
TAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGATGACACACCGTTTCATTGTTTACAAGATCGAGG
AGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAACCTATGAGGACT
TTGCTGCGAGTCTTCCAGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTTTGATTTTGTCA
CTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCTTGGTGTCCTGACGTAGCAA
AGGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATG
GAATTCAGGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAA
GCCGTGTCAATTAAAAAA

QA 3 500 3 500
DS 

RD RR2B067JQ 734 0 0
GGCTCAACATTAATAAATCTTAAATCATTTAGGATTATATAGCTTCCAAATAACGCCGAG
GAAAAAGGAAAAGAGTCATATTCGAAGAAAACATAATATATTCACCC*TCTCTGCGTCTC
CTTTCAGCAGTAATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGT
CCATGATGACTGCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCAT
TGTTTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTAT
TCAAACCTATGAGGACTTTGCTGCGAGTCTTCCAGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTA
TGATTTTGATTTTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCTTG
GTGTCCTGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTT
CAAGCGTGAACTTGATGGAATTCAGGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGA
TCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAACAAATATCTCTCTCTCTC**TTTGA
ATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAAAA*CATAACGCCCTTTTA
TTCTATCTTATCTGGTCTTGTCTTCTGTGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTCTATTT
GAAAATTATCCC
AA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2FS35JQ 518 0 0
AAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTG
GTTGTTGAGAAGGTTGGTGAACCTATCCAAACCTATGAGGACTTTGCTGCTAGCCTTCCA
GCTGAAGAGTGCCGATATGCAATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGCGGAGAATTGCCAG
AAGAGCAAGATTTTTTTCATTGCATGGTGTCCTGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATG
ATTTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGGAATTCAGGTGGAGCTT
CAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAA
ACAAATATCTCTCTCTCT****TTGAATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGTGAC
TGTTATAAAAACATAACGCCCTTTTATTCTATCTTATCTGGTCTTGTCTTCTGTGTCTTT
GTTACCCAACAGTGTTTCGTCTATTTGAAAATTATCCC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2FS35TF 666 0 0
GGAAAAGAGTCATATTCGAAGAAAACATA***TATTCACCCCTCTCTGCGTCTCCTTTCA
GCAGTAATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGA
TGACTGCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTA
CAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAGGTTGGTGAACCTATCCAAAC
CTATGAGGACTTTGCTGCTAGCCTTCCAGCTGAAGAGTGCCGATATGCAATTTATGATTT
CGACTTTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCATGGTGTCC
TGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCG
TGAACTTGATGGAATTCAGGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGA
TGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAACAAATATCTCTCTCTCT****TTGAATAAGC
TTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTTATTCTAT
CTTATCTGGTCTTGTCTTCTGTGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTCTATTTGAAAAT
TATCCC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2GS43TF 602 0 0
GG
AATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGT*GTCCATGATGACT
GCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTACAAGA
TCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAGGTTGGTGAACCTATCCAAACCTATG
AGGACTTTGCTGCTAGCCTTCCAGCCGAAGAGTGCCGATATGCAATTTATGATTTCGACT
TTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCATGGTGTCCTGACG
TAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAAC
TTGATGGAATTCAGGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTT
TCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAACAAATATCTCTCTCTCTCTCTTTGAATAAGCTTCTT
TGGCTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTTATTCTATCTTAT
CTGGTCTTGTCTTCTGTGTCTTTGTTACC*AACAGTGTTTCGTCTATTTGAAAATTATCT

QA 3 602 3 602
DS 

RD RR2B067TF 732 0 0
GGCTCAACATTAATAAATCTTAAATCATTTAGGATTATATAGCTTCCAAATAACGCCGAG
GAAAAAGGAAAAGAGTCATATTCGAAGAAAACATAATATATTCACCC*TCTCTGCGTCTC
CTTTCAGCAGTAATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGT
CCATGATGACTGCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCAT
TGTTTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTAT
TCAAACCTATGAGGACTTTGCTGCGAGTCTTCCAGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTA
TGATTTTGATTTTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCTTG
GTGTCCTGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTT
CAAGCGTGAACTTGATGGAATTCAGGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGA
TCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAACAAATATCTCTCTCTCTC**TTTGA
ATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAAAA*CATAACGCCCTTTTA
TTCTATCTTATCTGGTCTTGTCTTCTGTGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTCTATTT
GAAAATTATCCC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2BO68JQ 689 0 0
GGAAAAGAGTCATATTCGAAGAAAACATAATATATTCACCC*TCTCTGCGTCTCCTTTCA
GCAGTAATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGA
TGACTGCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTA
CAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAAC
CTATGAGGACTTTGCTGCGAGTCTTCCAGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTT
TGATTCTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCTTGGTGTCC
TGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTAT*CGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCG
TGAACTTGACGGAATTCAGGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGA
TGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAACAAATATCTCTCTCTCTC**TTTGAATAAGC
TTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTTATTCTAT
CTTATCTGGTCTTGTCTTCTGTGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTCTATTTGAAAAT
TATCTCAAAGTTTGTGCTGTGTGTGTTGC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2BO68TF 689 0 0
GGAAAAGAGTCATATTCGAAGAAAACATAATATATTCACCC*TCTCTGCGTCTCCTTTCA
GCAGTAATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGA
TGACTGCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTA
CAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAAC
CTATGAGGACTTTGCTGCGAGTCTTCCAGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTT
TGATTCTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCTTGGTGTCC
TGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTAT*CGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCG
TGAACTTGACGGAATTCAGGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGA
TGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAACAAATATCTCTCTCTCTC**TTTGAATAAGC
TTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTTATTCTAT
CTTATCTGGTCTTGTCTTCTGTGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTCTATTTGAAAAT
*ATCTCAA*GTTTGTGCTGTGTGTGTTGC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2AH63TF 717 0 0
GG
ACCC*TCTCTGCGTCTCCTTTCAGCAGTAATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCG
GCGTCGGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAG
AGGACACACCGTTTCATTGTTTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAG
AAGGTTGGTGAACCTATTCAAACCTATGAGGACTTTGCTGCGAGTCTTCCAGCTGAAGAG
TGCCGATATGCCATTTATGATTTTGATTTTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAG
ATTTTCTTCATTGCTTGGTGTCCTGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCG
AGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGGAATTCAGGTGGAGCTTCAAGCAACC
GATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAACAAATATC
TCTCTCTCTC**TTTGAATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAAA
AACATAACGCCCTTTTATTCTATCTTATCTGGTCTTGTCTTCTGTGTCTTTGTTACCCAA
CAGTGTTTCGTCTATTTGAAAATTATCTCAAAGTTTGTGCTGTGTGTGTTGCATCCTTTG
TGTAAAGATGATTCCTCTGAGCGTCCTTTGTTCTGCTTTGTTACATGGTGGATAA

QA 3 717 3 717
DS 



CO CL338Contig2 676 3 14 U
GGATTCGAAGAAAACATAATATATTCACCCTCTCTGCGTCTCCTCTCAGCAGTAATCTCG
CCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCT
AAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGGGGACACACCGTTTCATTGTTTACAAGATCGAGGA
GAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAACCTATGAGGACTT
TGCTGCGAGTCTTCCAGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTTTGATTTTGTCAC
TGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCTTGGTGTCCTGACGTAGCAAA
GGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGG
AATTCATGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAG
CCGTGTCAATTAAAAAACAAATATCTCTCTATCTCTCTCTCTTTGAATAAGCTTCTTTGG
CTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATTCTATCTATCTATC
CGGTCTTGTCTTCTGTGTCTTTGTTACCCAAACATTGTTTCGTCTATTTGAAAATTATCT
CATGTTGAAAAAAAAA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT26TF U 1
AF RR2EC64TF U 2
AF RR2EC64JQ C 89
BS 1 60 RR2GT26TF
BS 61 61 RR2EC64TF
BS 62 145 RR2GT26TF
BS 146 146 RR2EC64TF
BS 147 326 RR2GT26TF
BS 327 327 RR2EC64TF
BS 328 426 RR2GT26TF
BS 427 427 RR2EC64TF
BS 428 510 RR2GT26TF
BS 511 511 RR2EC64TF
BS 512 571 RR2GT26TF
BS 572 653 RR2EC64TF
BS 654 654 RR2EC64JQ
BS 655 676 RR2EC64TF

RD RR2GT26TF 571 0 0
GGATTCGAAGAAAACATAATATATTCACCCTCTCTGCGTCTCCTCTCAGCAGTAATCTCG
TCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCT
AAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTACAAGATCGAGGA
GAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAACCTATGAGGACTT
TGCTGCGAGTCTTCCAGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTTTGATTTTGTCAC
TGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGAATTTCTTCATTGCTTGGTGTCCTGACGTAGCAAA
GGTGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGG
AATTCAGGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAG
CCGTGTCAATTAAAAAACAAATATCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGAATAAGCTTCTTTGG
CTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAAAAA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2EC64TF 675 0 0
G
ATTCGAAGAAAACATAATATATTCACCCTCTCTGCGTCTCCTCTCAGCAGTAATCTCGCC
TTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTAA
GGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGGGGACACACCGTTTCATTGTTTACAAGATCGAGGAGA
AGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAACCTATGAGGACTTTG
CTGCGAGTCTTCCAGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTTTGATTTTGTCACTG
CGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCTTGGTGTCCTGACGTAGCAAAGG
TGAGAAGCAAGATGATCTATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGGAA
TTCATGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAGCC
GTGTCAATTAAAAAACAAATATCTCTCTATCTCTCTCTCTTTGAATAAGCTTCTTTGGCT
CTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATTCTATCTATCTATCCG
GTCTTGTCTTCTGTGTCTTTGTTACCCAAACATTGTTTCGTCTATTTGAAA*TTATCTCA
TGTTGAAAAAAAAA

QA 2 675 2 675
DS 

RD RR2EC64JQ 579 0 0
TCGGGAATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGGGG
ACACACCGTTTCATTGTTTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAG
GTTGGTGAACCTATTCAAACCTATGAGGACTTTGCTGCGAGTCTTCCAGCTGAAGAGTGC
CGATATGCCATTTATGATTTTGATTTTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATT
TTTTTCATTGCTTGGTGTCCTGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATTTATGCGAGC
TCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGGAATTCATGTGGAGCTTCAAGCAACCGAT
CCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAACAAATATCTCT
CTATCTCTCTCTCTTTGAATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGTGACTGTTATAA
AAACATAACGCCCTTTATTCTATCTATCTATCCGGTCTTGTTTTCTGTGTCTTTGTTACC
CAAACATTGTTTCGTCTATTTGAAAATTATCTCA
TGTTG

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 13

CO CL339Contig1 1408 13 24 U
GGACATCATCTCATAAACGAAAAACCACATAGTCCGAGATTTAATTGTTTCTCATTACAA
CCTTCTTGTCAGTTTTTTTCTGTAACCATGAGTCTTCTGACCGATCTCATTAACCTTGAC
CTCTCAGACAACACTGAGAAAATCATTGCCGAATACATATGGGTTGGTGGTTCAGGAATG
GACATGAGAAGCAAAGCTAGGACTCTCTCTGGACCTGTGACCGATCCATCACAGCTCCCA
AAATGGAACTATGATGGTTCAAGCACTGGCCAAGCTCCTGGTGAAGACAGTGAAGTGATC
TTATACCCTCAAGCGATTTTCAAAGATCCGTTCCGTAGAGGCAACCACATTCTTGTCATG
TGTGATACTTACACCCCTGCGGGTGAACCAATTCCTACGAACAAGAGACATGCTGCTGCT
CAGATCTTTAGCCACCCTGATGTTGAAGCTGAAGTGCCATGGTATGGAATCGAACAAGAG
TACACTCTCTTGCAGAAGGATGTGAAGTGGCCTGTTGGATGGCCCATTGGTGGCTTCCCT
GGCCCTCAGGGACCATACTACCGCAGTGTTGGAGCTTACAAATCTTTTGGAAGAGACATT
GTTGATGCTCACTACAAGGCTTGTTTGTATGCCGGAATTAACATCAGTGGGATCAATGGA
GAAGTCATGCCTGGTCAGTGGGAGTTCCAAGTCGGACCATCGGTTGGTATCTCAGCCGCT
GATGAAGTGTGGATCGCTCGTTACATTTTGGAGAGGATCACAGAGATTGCTGG*TGTGGT
TGTATCTTTTGACCCAAAACCAATTCCTGGTGACTGGAACGGAGCTGGTGCTCACACCAA
CTACAGTACTAAGTCGATGAGGGAGGAAGGAGGATACGAGATAATCAAGAAGGCAATCGA
TAAGCTCGGACTGAGACACAAGGAGCACATTTCTGCTTACGGTGAAGGCAACGAGCGCCG
TCTCACCGGACACCATGAAACTGCTGACATCAACACTTTCAAATGGGGTGTTGCAAACCG
TGGAGCATCAATCCGAGTAGGACGTGACACGGAGAAGGAAGGGAAAGGATACTTTGAGGA
TAGGAGGCCAGCTTCCAACATGGACCCTTACATTGTTACTTCCATGGTTGCAGAGACTAC
TATCCTTTGGAATCCTTGAAGAAATATGCCAATAATATAACTTGAATCTT*****TTGGG
GTTTCAAGTTTGTGTTTTCTATAATTATTTAAGCAATTACCGGGTTGATGTTACCGGGGT
TTGTGGTTTGGGGCCTTTCTTTTAATCTCTTTGTGTTTTGGGGTTTGTGATTGGAGCAAA
ACCTGATTTGCTCTGTTTCTTTGACCTTTTATTTGACCCCTTAAAATTTGTATTAATAAG
ACGATCTGAAAAGGCCTTTTCATGTTTC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2F628TF U 1
AF RR2EE64TF U 3
AF RR2A121TF U 3
AF RR2A050TF U 148
AF RR2A121JQ C 471
AF RR2A050JQ C 713
AF RR2DP24TF U 760
AF RR2AB72TF U 578
AF RR2AB72JQ C 643
AF RR2F628JQ C 709
AF RR2EQ55JQ C 886
AF RR2EQ55TF U 886
AF RR2EE64JQ C 749
BS 1 71 RR2F628TF
BS 72 72 RR2A121TF
BS 73 146 RR2F628TF
BS 147 147 RR2A121TF
BS 148 149 RR2F628TF
BS 150 150 RR2A121TF
BS 151 242 RR2F628TF
BS 243 243 RR2A121TF
BS 244 248 RR2F628TF
BS 249 249 RR2A121TF
BS 250 449 RR2F628TF
BS 450 450 RR2A121TF
BS 451 494 RR2F628TF
BS 495 701 RR2A121TF
BS 702 702 RR2A050TF
BS 703 773 RR2A121TF
BS 774 774 RR2AB72TF
BS 775 794 RR2A121TF
BS 795 1034 RR2AB72TF
BS 1035 1035 RR2DP24TF
BS 1036 1340 RR2AB72TF
BS 1341 1396 RR2EQ55TF
BS 1397 1406 RR2F628JQ
BS 1407 1408 RR2EE64JQ

RD RR2F628TF 494 0 0
GGACATCATCTCATAAACGAAAAACCACATAGTCCGAGATTTAATTGTTTCTCATTACAA
CCTTCTTGTCA*TTTTTTTCTGTAACCATGAGTCTTCTGACCGATCTCATTAACCTTGAC
CTCTCAGACAACACTGAGAAAATCATCGCTGAATACATATGGGTTGGTGGTTCAGGAATG
GACATGAGAAGCAAAGCTAGGACTCTCTCTGGACCTGTGACCGATCCATCACAGCTCCCA
AAGTGGAATTATGATGGTTCAAGCACTGGCCAAGCTCCTGGTGAAGACAGTGAAGTGATC
TTATACCCTCAAGCGATTTTCAAAGATCCGTTCCGTAGAGGCAACCACATTCTTGTCATG
TGTGATACTTACACCCCTGCGGGTGAACCAATTCCTACGAACAAGAGACATGCTGCTGCT
CAGATCTTTAGCCACCCTGATGTTGAAGCGGAAGTGCCATGGTATGGAATCGAACAAGAG
TACACTCTCTTGCA

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2EE64TF 743 0 0
GG
ATCATCTCATAAACGAAAAACCACATAGTCCGAGATTTAATTGTTTCTCATTACAACCTT
CTTGTCAGTTTTTTTCTGTAACCATGAGTCTTCTGACCGATCTCATTAACCTTGACCTCT
CAGACAACACTGAGAAAATCATTGCCGAATACATATGGGTTGGTGGTTCAGGAATGGACA
TGAGAAGCAAAGCTAGGACTCCCTCTGGACCTGTGACCGATCCATCACAGCTCCCAAAAT
GGAACTATGATGGTTCAAGCACCGGCCAAGCTCCTGGTGAAGACAGTGAAGTGATCTTAT
ACCCTCAAGCGATTTTCAAAGATCCGTTCCGTAGAGGCAACCACATTTTTGTCATGTGTG
ATACTTACACCCCTGCGGGTGAACCAATTCCTACGAACAAGAGACATGCTGCTGCTCAGA
TCTTTAGCCACCCTGATGTTGTAGCTGAAGTGCCATGGTATGGAATCGAACAAGAGTACA
CTCTCTTGCAGAAGGATGTGAAGTGGCCTGTTGGATGGCCCATTGGTGGCTTCCCTGGCC
CTCAGGGACCATGCTACTGCAGTGTTGGAGCTGACAAATCTTTTGGAAGAGACATTGTTG
ATGCTCACTACAAG*CTTGTTTGTATGCCGGAATTAACATCAGTGGGATCAGTGGAGAAG
TCATGCCTGGTCAGTGGGAGTTCCAAGTCGGAC*ATCTGTTGGTATCTCAGCCGCTGATG
AAGTGTG*ATCGCTCGTTACA

QA 3 743 3 743
DS 

RD RR2A121TF 792 0 0
GG
ATCATCTCATAAACGAAAAACCACATAGTCCGAGATTTAATTGTTTCTCATTACAACCTT
CTTGTCAGTTTTTTTCTGTAACCATGAGTCTTCTGACCGATCTCATTAACCTTGACCTCT
CAGACAACACTGAGAAAATCATTGCCGAATACATATGGGTTGGTGGTTCAGGAGTGGACA
TGAGAAGCAAAGCTAGGACTCTCTCTGGACCTGTGACCGATCCATCACAGCTCCCAAAAT
GGAACTATGATGGTTCAAGCACTGGCCAAGCTCCTGGTGAAGACAGTGAAGTGATCTTAT
ACCCTCAAGCGATTTTCAAAGATCCGTTCCGTAGAGGCAACCACATTTTTGTCATGTGTG
ATACTTACACCCCTGCGGGTGAACCAATTCCTACGAACAAGAGACATGCTGCTGCTCAGA
TCTTTAGCCACCCTGATGTTGTAGCTGAAGTGCCATGGTATGGAATCGAACAAGAGTACA
CTCTCTTGCAGAAGGATGTGAAGTGGCCTGTTGGATGGCCCATTGGTGGCTTCCCTGGCC
CTCAGGGACCATACTACCGCAGTGTTGGAGCTTACAAATCTTTTGGAAGAGACATTGTTG
ATGCTCACTACAAGGCTTGTTTGTATGCCGGAATTAACATCAGTGGGATCAATGGAGAAG
TCATGCCTGGTCAGTGGGAGTTCCAAGTCGGACCATCTGTTGGTATCTCAGCCGCTGATG
AAGTGTGGATCGCTCGTTACATTTTGGAGAGGATCACAGAGATTGCTGGGTGTGGTTGTA
TCTTTTGACC

QA 3 792 3 792
DS 

RD RR2A050TF 647 0 0
GCT
GAATACATATGGGTTGGTGGTTCAGGAATGGACGTGAGAAGCAAAGCTAGGACTCTCTCT
GGACCTGTGACCGATCCATCACAGCTCCCAAAGTGGAATTATGATGGTTCAAGCACTGGC
CAAGCTCCTGGTGAAGACAGTGAAGTGATCTTATACCCTCAAGCGATTTTCAAAGATCCG
TTCCGTAGAGGCAACCACATTCTTGTCATGTGTGATACTTACACCCCTGCGGGTGAACCA
ATTCCTACGAACAAGAGACATGCTGCTGCTCAGATCTTTAGCCACCCTGATGTTGAAGCT
GAAGTGCCATGGTATGGAATCGAACAAGAGTACACTCTCTTGCAGAAGGATGTGAAGTGG
CCTGTTGGATGGCCCATTGGTGGCTTCCCTGGCTCTCAGGGACCATACTACTGCAGTGTT
GGAGCTGACAAATCTTTTGGAAGAGACATTGTTGATGCCCACTACAAGGCTTGTTTGTAT
GCCGGAATTAACATCAGTGGGATCAATGGAGAAGTCATGCCTGGTCAGTGGGAGTTCCAA
GTCGGACCATCGGTTGGTATCTCAGCCGCTGATGAAGTGTGGATCGCTCGTTACATTTTG
GAGAGGATCACAGAGATTGCTGGGTGTGGTTGTATCTTTTGACC

QA 4 647 4 647
DS 

RD RR2A121JQ 774 0 0
TCG
ACAAGAGTACACTCTCT*GCAGA**GATGTGAAGTGGC*TGT*GGATGGCCCATTGGTGG
CTTCCCTGGCCCTCAGGGACCATACTACCGCAGTGTTGGAGCTTACAAATCTTTTGGAAG
AGACATTGTTGATGCTCACTACAAGGCTTGTTTGTATGCCGGAATTAACATCAGTGGGAT
CAATGGAGAAGTCATGCCTGGTCAGTGGGAGTTCCAAGTCGGACCATCTGTTGGTATCTC
AGCCGCTGATGAAGTGTGGATCGCTCGTTACATTTTGGAGAGGATCACAGAGATTGCTGG
*TGTGGTTGTATCTTTTGACCCAAAACCAATTCCTGGTGACTGGAACGGAGCTGGTGCTC
ACACCAACTACAGTGCTAAGTCGATGAGGGAGGAAGGAGGATACGAGATAATCAAGAAGG
CAATCGATAAGCTCGGACTGAGACACAAGGAGCACATTTTTGCTTATGGTGAAGGAAACG
AGCGCCGTCTCACAGGACACCATGAAACTGCTGACATCAACACTTTCAAATGGGGTGTTG
CAAACCGTGGAGCATCAATCCGAGTAGGACGTGACACGGAGAAGGAAGGGAAAGGATACT
TTGAGGATAGGAGGCCAGCTTCCAACATGGACCCTTACATTGTTACTTCCATGGTTGCAG
AGACTACTATCCTTTGGAATCCTTGAAGAAATATGACAATAATATAACTTGAATCTTGTT
CTTTGGGGTTTCAAGTTTGTGTTTTCTATAATTATTTAAGCAATTACCGGG

QA 4 774 4 774
DS 

RD RR2A050JQ 599 0 0
CAGCCGCTGATGAAGTGTGGATCGCTCGTTACATTTTGGAGAGGATCACAGAGATTGCTG
G*TGTGGTTGTATCTTTTGACCCAAAACCAATTCCTGGTGACTGGAACGGAGCTGGTGCT
CACACCAACTACAGTACTAAGTCGATGAGGGAGGAAGGAGGATACGAGATAATCAAGAAG
GCAATCGATAAGCTCGGACTGAGACACAAGGAGCACATTTCTGCTTACGGTGAAGGCAAC
GAGCGCCGTCTCACCGGACACCATGAAACTGCTGACATCAACACTTTCAAATGGGGTGTT
GCAAACCGTGGAGCATCAATCCGAGTAGGACGTGACACGGAGAAGGAAGGGAAAGGATAC
TTTGAGGATAGGAGGCCAGCTTCCAACATGGACCCTTACATTGTTACTTCCATGGTTGCA
GAGACTACTATCCTTTGGAATCCTTGAAGAAATATGCCAATAATATAACTTGAATCTT**
***TTGGGGTTTCAAGTTTGTGTTTTCTATAATTATTTAAGCAATTACCGGGTTGATGTT
ACCGGGGTTTGTGGTTTGGGGCCTTTCTTTTAATCTCTTTGTGTTTTGGGGTTTGTGAT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2DP24TF 517 0 0
G
CAGAGATTGCTGG*TGTGGTTGTATCTTTTGACCCAAAACCAATTCCTGGTGACTGGAAC
GGAGCTGGTGCTCACACCAACTACAGTACTAAGTCGATGAGGGAGGATG*AGGATACGAG
ATAATCAAGAAGGCAATCGATAAGCTCGGACTGAGACACAAGGAGCACATTTCTGCTTAC
GGTGAAGGCAACGAGCGCCGTCTCACCGGACACCATGAAACTGCTGACATCAACACTTTC
AAATGGGGTGTTGCAAACCGTGGAGCATCAATCCGAGTAGGACGTGGCACGGAGAAGGAA
GGGAAAGGATACTTTGAGGATAGGAGGCCAGCTTCCAACATGGACCCTTACATTGTTACT
TCCATGGTTGCAGAGACTACTATCCTTTGGAATCCTTGAAGAAATATGCCAATAATATAA
CTTGAATCTT*****TTGGGGTTTCAAGTTTGTGTTTTCTATAATTATTTAAGCAATTAC
CGGGTTGATGTTACCGGGGTTTGTGGTTTGGGGCCT

QA 2 517 2 517
DS 

RD RR2AB72TF 763 0 0
G
CAAATCTTTTGGAAGAGACATTGTTGATGCCCACTACAAGGCTTGTTTGTATGCCGGAAT
TAACATCAGTGGGATCAATGGAGAAGTCATGCCTGGTCAGTGGGAGTTCCAAGTCGGACC
ATCGGTTGGTATCTCAGCCGCTGATGAAGTGTGGATCGCTCGTTACATTTTGGAGAGGAT
CACAGAGATTGCTGG*TGTGGTTGTATCTTTTGACCCAAAACCAATTCCTGGTGACTGGA
ACGGAGCTGGTGCTCACACCAACTACAGTACTAAGTCGATGAGGGAGGAAGGAGGATACG
AGATAATCAAGAAGGCAATCGATAAGCTCGGACTGAGACACAAGGAGCACATTTCTGCTT
ACGGTGAAGGCAACGAGCGCCGTCTCACCGGACACCATGAAACTGCTGACATCAACACTT
TCAAATGGGGTGTTGCAAACCGTGGAGCATCAATCCTAGTAGGACGTGACACGGAGAAGG
AAGGGAAAGGATACTTTGAGGATAGGAGGCCAGCTTCCAACATGGACCCTTACATTGTTA
CTTCCATGGTTGCAGAGACTACTATCCTTTGGAATCCTTGAAGAAATATGCCAATAATAT
AACTTGAATCTT*****TTGGGGTTTCAAGTTTGTGTTTTCTATAATTATTTAAGCAATT
ACCGGGTTGATGTTACCGGGGTTTGTGGTTTGGGGCCTTTCTTTTAATCTCTTTGTGTTT
TGGGGTTTGTGATTGGAGCAAAACCTGATTTGCTCTGTTTCT

QA 2 763 2 763
DS 

RD RR2AB72JQ 740 0 0
ATCAGTGGGATCAATGGAGAAGTCATGCCTGGTCAGTGGGAGTTCCAAGTCGGACCATCG
GTTGGTATCTCAGCCGCTGATGAAGTGTGGATCGCTCGTTACATTTTGGAGAGGATCACA
GAGATTGCTGG*TGTGGTTGTATCTTTTGACCCAAAACCAATTCCTGGTGACTGGAACGG
AGCTGGTGCTCACACCAACTACAGTACTAAGTCGATGAGGGAGGAAGGAGGATACGAGAT
AATCAAGAAGGCAATCGATAAGCTCGGACTGAGACACAAGGAGCACATTTCTGCTTACGG
TGAAGGCAACGAGCGCCGTCTCACCGGACACCATGAAACTGCTGACATCAACACTTTCAA
ATGGGGTGTTGCAAACCGTGGAGCATCAATCCTAGTAGGACGTGACACGGAGAAGGAAGG
GAAAGGATACTTTGAGGATAGGAGGCCAGCTTCCAACATGGACCCTTACATTGTTACTTC
CATGGTTGCAGAGACTACTATCCTTTGGAATCCTTGAAGAAATATGCCAATAATATAACT
TGAATCTT*****TTGGGGTTTCAAGTTTGTGTTTTCTATAATTATTTAAGCAATTACCG
GGTTGATGTTACCGGGGTTTGTGGTTTGGGGCCTTTCTTTTAATCTCTTTGTGTTTTGGG
GTTTGTGATTGGAGCAAAACCTGATTTGCTCTGTTTCTTTGACCTTTTATTTGACCCCTT
AAAATTTGTATTAATAAGAC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2F628JQ 700 0 0
ATCTCAGCCGCTGATGAAGTGTGGATCGCTCGTTACATTTTGGAGAGGATCACAGAGATT
GCTGG*TGTGGTTGTATCTTTTGACCCAAAACCAATTCCTGGTGACT**AACGGAGCTGG
TGCTCACACCAACTACAGTACTAAGTCGATGAGGGAGGAAGGAGGATACGAGATAATCAA
GAAGGCAATCGATAAGCTCGGACTGAGACACAAGGAGCACATTTCTGCTTACGGTGAAGG
CAACGAGCGCCGTCTCACCGGACACCATGAAACTGCTGACATCAACACTTTCAAATGGGG
TGTTGCAAACCGTGGAGCGTCAATCCGAGTAGGACGTGACACGGAGAAGGAAGGGAAAGG
ATACTTTGAGGATAGGAGGCCAGCTTCCAACATGGACCCTTACATTGTTACTTCCATGGT
TGCAGAGACTACTATCCTTTGGAATCCTTGAAGAAATATGCCAATAATATAACTTGAATC
TT*****TTGGGGTTTCAAGTTTGTGTTTTCTATAATTATTTAAGCAATTACCGGGTTGA
TGTTACCGGGGTTTGTGGTTTGGGGCCTTTCTTTTAATCTCTTTGTGTTTTGGGGTTTGT
GATTGGAGCAAAACCTGATTTGCTCTGTTTCTTTGACCTTTTATTTGACCCCTTAAAATT
TGTATTAATAAGACGATCTGAAAAGGCCTTTTCATGTT
GC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2EQ55JQ 511 0 0
G
AAGAAGGCAATCGATAAGCTCGGACTGAGACACAAGGAGCACATTTCTGCTTACGGTGAA
GGCAACGAGCGCCGTCTCACCGGACACCATGAAACTGCTGACATCAACACTTTCAAATGG
GGTGTTGCAAACCGTGGAGCATCAATCCGAGTAGGACGTGACACGGAGAAGGAAGGGAAA
GGATACTTTGAGGATAGGAGGCCAGCTTCCAACATGGACCCTTACATTGTTACTTCCATG
GTTGCAGAGACTACTATCCTTTGGAATCCTTGAAGAAATATGCCAATAATATAACTTGAA
TCTT*****TTGGGGTTTCAAGTTTGTGTTTTCTATAATTATTTAAGCAATTACCGGGTT
GATGTTACCGGGGTTTGTGGTTTGGGGCCTTTCTTTTAATCTCTTTGTGTTTTGGGGTTT
GTGATTGGAGCAAAACCTGATTTGCTCTGTTTCTTTGACCTTTTATTTGACCCCTTAAAA
TTTGTATTAATAAGACGATCTGAAAAGGCC

QA 2 511 2 511
DS 

RD RR2EQ55TF 511 0 0
G
AAGAAGGCAATCGATAAGCTCGGACTGAGACACAAGGAGCACATTTCTGCTTACGGTGAA
GGCAACGAGCGCCGTCTCACCGGACACCATGAAACTGCTGACATCAACACTTTCAAATGG
GGTGTTGCAAACCGTGGAGCATCAATCCGAGTAGGACGTGACACGGAGAAGGAAGGGAAA
GGATACTTTGAGGATAGGAGGCCAGCTTCCAACATGGACCCTTACATTGTTACTTCCATG
GTTGCAGAGACTACTATCCTTTGGAATCCTTGAAGAAATATGCCAATAATATAACTTGAA
TCTT*****TTGGGGTTTCAAGTTTGTGTTTTCTATAATTATTTAAGCAATTACCGGGTT
GATGTTACCGGGGTTTGTGGTTTGGGGCCTTTCTTTTAATCTCTTTGTGTTTTGGGGTTT
GTGATTGGAGCAAAACCTGATTTGCTCTGTTTCTTTGACCTTTTATTTGACCCCTTAAAA
TTTGTATTAATAAGACGATCTGAAAAGGCC

QA 2 511 2 511
DS 

RD RR2EE64JQ 660 0 0
TGGAGAGGATCACAGAGATTGCTGG*TGTGGTTGTATCTTTTGACCCAAAACCAATTCCT
GGTGACTGGAACGGAGCTGGTGCTCACACCAACTACAGTACTAAGTCGATGAGGGAGGAA
GGAGGATACGAGATAATCAAGAAGGCAATCGATAAGCTCGGACTGAGACACAAGGAGCAC
ATTTCTGCTTATGGTGAAGGAAACGAGCGCCGTCTCACAGGACACCATGAAACTGCTGAC
ATCAACACTTTCAAATGGGGTGTTGCAAACCGTGGAGCATCAATCCTAGTAGGACGTGAC
ACGGAGAAGGAAGGGAAAGGATACTTTGAGGATAGGAGGCCAGCTTCCAACATGGACCCT
TACATTGTTACTTCCATGGTTGCAGAGACTACTATCCTTTGGAATCCTTGAAGAAATATG
ACAATAATATAACTTGAATCTTGTTCTTTGGGGTTTCAAGTTTGTGTTTTCTATAATTAT
TTAAGCAATTACCGGGTTGATGTTACCGGGGTTTGTGGTTTGGGGCCTTTCTTTTAATCT
CTTTGTGTTTTGGGGTTTGTGATTGGAGCAAAACCTGATTTGCTCTGTTTCTTTGAACTT
TTATTTGACCCCTTAAAATTTGTATTAATAAGACGATCTGAAAAGGCCTTTTCATGTTTC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 2 11

CO CL340Contig1 724 6 13 U
CAAATCTCAAGAACTGAAAGTAAAGAGCAATAGATATGATGATTGGGTCAAGAAAACATG
AAACGGGAAATGACTGTCTAACTTTGCAAGTCTTTTAACTCGGGCGCAAAATCCATAACG
AACAAAACGGCATATTATCTATAAAAGATAGCAAACGCAACAAAAAAATCTACCACCCTT
TTACATCATCTCACACAAAGACAAGTATAACCGGGCAAGATGATTCTCTCGAAGCTCAGT
AAAAGAATCCAAGCACCTTTCCACCAACATTCTTCCTCCTGGCTTCTTCGTGGTCCATGA
TACCGGCGGAGGTCGTAAGAACAATGTAGCCAAACTGTCTGGAAGGAAGAAGACGTGCGG
TCCATCCTTCGATCTCCTTAACTCCGACATCGAAGCGGGGACTGATGACACCGCATTTGT
TCAGCCTTCCGTTGAGCTCAACAACAATCTTACCAGACCTGTGGTCATCAACGTACTCGA
ACTCGCCAATGTACCCGTGTTTCTGCATGACAGTGAGAACCTTGATGATGACCTTGGAAG
AAGGCCTGATCATCACCTGCCTCTTCCCTCTCTTCTCCGCGTTGTACATGCTCTTAAACG
CATCGTTTAGCACACTGATCCTCACCATCCTTCAAAAACTCAGAGAAGCTTGAAATTTGA
AATCGAAGTTGGTAGCCGCACAAATCTCTTTCTGCTAAAACGTCCCAGGAATTAAGTTGA
GCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2F823JQ U 103
AF RR2A086JQ U 37
AF RR2BM92TF C 1
AF RR2ED28JQ U 13
AF RR2ED28TF C 21
AF RR2A086TF C 6
BS 1 13 RR2BM92TF
BS 14 36 RR2ED28JQ
BS 37 57 RR2A086JQ
BS 58 58 RR2ED28JQ
BS 59 127 RR2A086JQ
BS 128 128 RR2ED28JQ
BS 129 306 RR2A086JQ
BS 307 307 RR2ED28JQ
BS 308 337 RR2A086JQ
BS 338 338 RR2ED28JQ
BS 339 633 RR2A086JQ
BS 634 706 RR2ED28JQ
BS 707 724 RR2A086TF

RD RR2F823JQ 283 0 0
GGCGCAAAATCCATAACAAAAAAAACGGCATATTATCTATAAAAGATAGCAAACGCAACA
AAAAAATCTACCACCCTTTTACATCATCTCACACAAAGACAAGTATAACCGGGCAAGATG
ATTCTCTCGAAGCTCAGTAAAAGAATCCAAGCACCTTTCCACCAACATTCTTCCTCCTGG
CTTCTTCGTGGTCCATGATACCGGCGGAGGTCGTAAGAACAATGTAGCCAAACTGTCTGG
AAGGAAGAAGACGTGCGGTCCATCCTTCGATCTCCTTAACTCC

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR2A086JQ 597 0 0
TGATGATTGGGTCAAGAAAACTTGAAACGGGAAATGACTGTCTAACTTTGCAAGTCTTTT
AACTCGGGCGCAAAATCCATAACGAACAAAAGGGCATATTATCTATAAAAGATAGCAAAC
GCAACAAAAAAATCTACCACCCTTTTACATCATCTCACACAAAGACAAGTATAACCGGGC
AAGATGATTCTCTCGAAGCTCAGTAAAAGAATCCAAGCACCTTTCCACCAACATTCTTCC
TCCTGGCTTCTTCGTGGTCCATGATACCGGAGGAGGTCGTAAGAACAATGTAGCCAAACT
GGCTGGAAGGAAGAAGACGTGCGGTCCATCCTTCGATCTCCTTAACTCCGACATCGAAGC
GGGGACTGATGACACCGCATTTGTTCAGCCTTCCGTTGAGCTCAACAACAATCTTACCAG
ACCTGTGGTCATCAACGTACTCGAACTCGCCAATGTACCCGTGTTTCTGCATGACAGTGA
GAACCTTGATGATGACCTTGGAAGAAGGCCTGATCATCACCTGCCTCTTCCCTCTCTTCT
CCGCGTTGTACATGCTCTTAAACGCATCGTTTAGCACACTGATCCTCACCATCCTTC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2BM92TF 701 0 0
CAAATCTCAAGAACTGAAAGTAAAGAGCAATAGATATGATGATTGGGTCAAGAAAACATG
AAACGGGAAATGACTGTCTAACTTTGCAAGTCTTTTAACTCGGGCGCAAAATCCATAACG
AACAAAACGGCATATTATCTATAAAAGATAGCAAACGCAACAAAAAAATCTACCACCCTT
TTACATCATCTCACACAAAGACAAGTATAACCGGGCAAGATGATTCTCTCGAAGCTCAGT
AAGAGAATCCAAGCACCTTTCCACCAACATTCTTCCTCCTGGCTTCTTCGTGGTCCATGA
TACCGGCGGAGGTCGTAAGAACAATGTAGCCAAACTGTCTGGAAGGAAGAAGACGTGCGG
TCCATCCTTCGATCTCCTTAACTCCGACATCGAAGCGGGGACTGATGACACCGCATTTGT
TCAGCCTTCCGTTGAACTCAACAACAATCTTACCAGACCTGTGGTCATCAACGTACTCGA
ACTCGCCAATGTACCCGTGTTTCTGCATGACAGTGAGAACCTTGATGATGACCTTGGAAG
AAGGCCTGATCATCACCTGCCTCTTCCCTCTCTTCTCCGCGTTGTACATGCTCTTAAACG
CATCGTTTAGCACACTGATCCTCACCATCCTTCAAAAACTCAGAGAAGCTTGAAATTTGA
AATCGAAGTTGGTAGCCGCACAAATCGTTTTCTGCTAAAA
A

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2ED28JQ 694 0 0
G
CTGAAAGTAAAGAGCAATAGATATGATGATTGGGTCAAGAAAACATGAAACGGGAAATGA
CTGTCTAACTTTGCAAGTCTTTTAACTCGGGCGCAAAATCCATAACGAACAAAACGGCAT
ATTATCTATAAAAGATAGCAAACGCAACAAAAAAATCTACCACCCTTTTACATCATCTCA
CACAAAGACAAGTATAACCGGGCAAGATGATTCTCTCGAAGCTCAGTAAAAGAATCCAAG
CACCTTTCCACCAACATTCTTCCTCCTGGCTTCTTCGTGGTCCATGATACCGGCGGAGGT
CGTAAGAACAATGTAGCCAAACTGTCTGGAAGGAAGAAGACGTGCGGTCCATCCTTCGAT
CTCCTTAACTCCGACATCGAAGCGGGGACTGATGAC**CGCATTTGTTCAGCCTTCCGTT
GAGCTCAACAACAATCTTACCAGACCTGTGGTCATCAACGTACTCGAACTCGTCAATGTA
CCCGTGTTTCTGCATGACAGTGAGAACCTTGATGATGACCTTGGAAGAAGGCCTGATCAT
CACCTGCCTCTTCCCTCTCTTCTCCGCGTTGTACATGCTCTTAAACGCATCGTTTAGCAC
ACTGATCCTCACCATCCTTCAAAAACTCAGAGAAGCTTGAAATTTGAAATCGAAGTTGGT
AGCCGCACAAATCTCTTTCTGCTAAAACGTCCC

QA 2 694 2 694
DS 

RD RR2ED28TF 686 0 0
TAAAGAGCAATAGATATGATGATTGG*TCAAGAAAACATGAAACGGGAAATGACTGTCTA
ACTTTGCAAGTCTTTTAACTCGGGCGCAAAATCCATAACGAACAAAACGGCATATTATCT
ATAAAAGATAGCAAACGCAACAAAAAAATCTACCACCCTTTTACATCATCTCACACAAAG
ACAAGTATAACCGGGCAAGATGATTCTCTCGAAGCTCAGTAAAAGAATCCAAGCACCTTT
CCACCAACATTCTTCCTCCTGGCTTCTTCGTGGTCCATGATACCGGCGGAGGTCGTAAGA
ACAATGTAGCCAAACTGTCTGGAAGGAAGAAGACGTGCGGTCCATCCTTCGATCTCCTTA
ACTCCGACATCGAAGCGGGGACTGATGAC**CGCATTTGTTCAGCCTTCCGTTGAGCTCA
ACAACAATCTTACCAGACCTGTGGTCATCAACGTACTCGAACTCGTCAATGTACCCGTGT
TTCTGCATGACAGTGAGAACCTTGATGATGACCTTGGAAGAAGGCCTGATCATCACCTGC
CTCTTCCCTCTCTTCTCCGCGTTGTACATGCTCTTAAACGCATCGTTTAGCACACTGATC
CTCACCATCCTTCAAAAACTCAGAGAAGCTTGAAATTTGAAATCGAAGTTGGTAGCCGCA
CAAATCTCTTTCTGCTAAAACGTCCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2A086TF 719 0 0
GTCAAGAA
CTGAAAGTAAAGAGCAATAGATATGATGATTGGGTCAAGAAAACATGAAACGGGAAATGA
CTGTCTAACTTTGCAAGTCTTTTAACTCGGGCGCAAAATCCATAACGAACAAAACGGCAT
ATTATCTATAAAAGATAGCAAACGCAACAAAAAAATCTACCACCCTTTTACATCATCTCA
CACAAAGACAAGTATAACCGGGCAAGATGATTCTCTCGAAGCTCAGTAAAAGAATCCAAG
CACCTTTCCACCAACATTCTTCCTCCTGGCTTCTTCGTGGTCCATGATACCGGAGGAGGT
CGTAAGAACAATGTAGCCAAACTGTCTGGAAGGAAGAAGACGTGCGGTCCATCCTTCGAT
CTCCTTAACTCCGACATCGAAGCGGGGACTGATGACACCGCATTTGTTCAGCCTTCCGTT
GAGCTCAACAACAATCTTACCAGACCTGTGGTCATCAACGTACTCGAACTCGCCAATGTA
CCCGTGTTTCTGCATGACAGTGAGAACCTTGATGATGACCTTGGAAGAAGGCCTGATCAT
CACCTGCCTCTTCCCTCTCTTCTCCGCGTTGTACATGCTCTTAAACGCATCGTTTAGCAC
ACTGATCCTCACCATCCTTCAAAAACTCAGAGAAGCTTGAAATTTGAAATCGAAGTTGGT
AGCCGCACAAATCTCTTTCTGCTAAAACGTCGAAGGAATTAAGTTGAGCCC

QA 9 719 9 719
DS 



CO CL340Contig2 735 5 6 U
GGGACGTTTTAGCGGAAAGAGATTCGTGCGGCTACCAACTTCGATTTCAAATTTCAAGCT
TCTCTGAGTTTTTGAAAGGATGGTGAGGATCAGCGTGCTAAACGATGCGTTTAAGAGCAT
GTACAATGCGGAGAAGAGAGGGAAGAGGCAGGTGATGATCAGGCCTTCTTCCAAGGTCAT
CATCAAGGTTCTCACTGTCATGCAGAAACACGGTTACATTGGTGAGTTCGAGTACGTTGA
TGACCACAGGTCTGGTAAGATTGTTGTTGAGCTTAACGGAAGGCTGAACAAATGTGGTGT
CATCAGTCCTCGCTTCGATGTCGGAGTTAAGGAGATCGAAGGATGGACCGCACGTCTTCT
TCCTTCCAGACAGTTTGGCTACATTGTGCTTACAACCTCCGCCGGTATCATGGACCACGA
AGAAGCCAGGAGGAAGAATGTTGGTGGCAAGGTCCTTGGATTCTTTTACTGAGCTTCGAG
AGAATCATCTTGCCCGGTTATACTTGTCTTTGTGTGAGATGATGTAATAGGGTGGTAGAT
TTTTTTGTTGCGTTTGCTATCTTATAGATAATTTGCCGTTTTGTTCGTTATGGATTTTGC
GCCGAAGTTAAAAGACTTGCAAAGTTAGACAGTTATTTCCAGTTCATGTTTTCTTGACCC
ATATCTATTGCTCTTTATCTTCAGTTCTTGAGATTTGTGGCTCTTTGTTTCGTTCTTCTA
CTGAGATAATTGTTT


BQ
20 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS15JQ C 1
AF RR2BS15TF U 1
AF RR2AN88JQ C 164
AF RR2AN88TF U 9
AF RR2HA78TF U 2
BS 1 209 RR2BS15TF
BS 210 210 RR2HA78TF
BS 211 389 RR2BS15TF
BS 390 390 RR2HA78TF
BS 391 659 RR2BS15TF
BS 660 735 RR2HA78TF

RD RR2BS15JQ 659 0 0
GGGACGTTTTAGCGGAAAGAGATTCGTGCGGCTACCAACTTCGATTTCAAATTTCAAGCT
TCTCTGAGTTTTTGAAAGGATGGTGAGGATCAGCGTGCTAAACGATGCGTTTAAGAGCAT
GTACAATGCGGAGAAGAGAGGGAAGAGGCAGGTGATGATCAGGCCTTCTTCCAAGGTCAT
CATCAAGGTTCTCACTGTCATGCAGAAACGCGGTTACATTGGTGAGTTCGAGTACGTTGA
TGACCACAGGTCTGGTAAGATTGTTGTTGAGCTTAACGGAAGGCTGAACAAATGTGGTGT
CATCAGTCCTCGCTTCGATGTCGGAGTTAAGGAGATCGAAGGATGGACCGCACGTCTTCT
TCCTTCCAGACAGTTTGGCTACATTGTGCCTACAACCTCCGCCGGTATCATGGACCACGA
AGAAGCCAGGAGGAAGAATGTTGGTGGCAAGGTCCTTGGATTCTTTTACTGAGCTTCGAG
AGAATCATCTTGCCCGGTTATACTTGTCTTTGTGTGAGATGATGTAATAGGGTGGTAGAT
TTTTTTGTTGCGTTTGCTATCTTATAGATAATTTGCCGTTTTGTTCGTTATGGATTTTGC
GCCGAAGTTAAAAGACTTGCAAAGTTAGACAGTTATTTCCAGTTCATGTTTTCTTGACC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2BS15TF 659 0 0
GGGACGTTTTAGCGGAAAGAGATTCGTGCGGCTACCAACTTCGATTTCAAATTTCAAGCT
TCTCTGAGTTTTTGAAAGGATGGTGAGGATCAGCGTGCTAAACGATGCGTTTAAGAGCAT
GTACAATGCGGAGAAGAGAGGGAAGAGGCAGGTGATGATCAGGCCTTCTTCCAAGGTCAT
CATCAAGGTTCTCACTGTCATGCAGAAACGCGGTTACATTGGTGAGTTCGAGTACGTTGA
TGACCACAGGTCTGGTAAGATTGTTGTTGAGCTTAACGGAAGGCTGAACAAATGTGGTGT
CATCAGTCCTCGCTTCGATGTCGGAGTTAAGGAGATCGAAGGATGGACCGCACGTCTTCT
TCCTTCCAGACAGTTTGGCTACATTGTGCCTACAACCTCCGCCGGTATCATGGACCACGA
AGAAGCCAGGAGGAAGAATGTTGGTGGCAAGGTCCTTGGATTCTTTTACTGAGCTTCGAG
AGAATCATCTTGCCCGGTTATACTTGTCTTTGTGTGAGATGATGTAATAGGGTGGTAGAT
TTTTTTGTTGCGTTTGCTATCTTATAGATAATTTGCCGTTTTGTTCGTTATGGATTTTGC
GCCGAAGTTAAAAGACTTGCAAAGTTAGACAGTTATTTCCAGTTCATGTTTTCTTGACC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2AN88JQ 523 0 0
CCTTCTTCCAAGGTCATCATCAAGGTTCTCACTGTCATGCAGAAACACGGTTACATTGGT
GAGTTCGAGTACGTTGATGACCCCAGGTTTGGTAAGATTGTTGTTGAGCTTAACGGAAGG
CTGAACAAATGTGGTGTCATCAGTCCTCGCTTCGATGTCGGAGTTAAGGAGATCGAAGGA
TGGACCGCACGTTTTTTTCCTTCCAGACAGTTTGGCTACATTGTGCTTACAACCTCCGCC
GGTATCATGGACCACGAAGAAGCCAGGAGGAAGAATGTTGGTGGCAAGGTCCTTGGATTT
TTTTACTGAGCTTCGAGAGAATCATCTTGCCCGGTTATACTTGTCTTTGTGTGAGATGAT
GTAATAGGGTGGTAGATTTTTTTGTTGCGTTTGCTATTTTATAGATAATTTGCCGTTTTG
TTCGTTATGGATTTTGCGCCGAAGTTAAAAGACTTGCAAAGTTAGACAGTTATTTCCAGT
TCATGTTTTCTTGACCCATATTTATTGCTCTTTATTTTCAGT
T

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2AN88TF 677 0 0
TTAGCGGAAAGAGATTCGTGCGGCTACCAACTTCGATTTCAAATTTCAAGCTTCTCTGAG
TTTTTGAAAGGATGGTGAGGATCAGCGTGCTAAACGATGCGTTTAAGAGCATGTACAATG
CGGAGAAGAGAGGGAAGAGGCAGGTGATGATCAGGCCTTCTTCCAAGGTCATCATCAAGG
TTCTCACTGTCATGCAGAAACACGGTTACATTGGTGAGTTCGAGTACGTTGATGACCACA
GGTCTGGTAAGATTGTTGTTGAGCTTAACGGAAGGCTGAACAAATGTGGTGTCATCAGTC
CTCGCTTCGATGTCGGAGTTAAGGAGATCGAAGGATGGACCGCACGTCTTCTTCCTTCCA
GACAGTTTGGCTACATTGTGCTTACAACCTCCGCCGGTATCATGGACCACGAAGAAGCCA
GGAGGAAGAATGTTGGTGGCAAGGTCCTTGGATTCTTTTACTGAGCTTCGAGAGAATCAT
CTTGCCCGGTTATACTTGTCTTTGTGTGAGATGATGTAATAGGGTGGTAGATTTTTTTGT
TGCGTTTGCTATCTTATAGATAATTTGCCGTTTTGTTCGTTATGGATTTTGCGCCGAAGT
TAAAAGACTTGCAAAGTTAGACAGTTATTTCCAGTTCATGTTTTCTTGACCCATATCTAT
TGCTCTTTATCTTCAGT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2HA78TF 734 0 0
GGACGTTTTAGCGGAAAGAGATTCGTGCGGCTACCAACTTCGATTTCAAATTTCAAGCTT
CTCTGAGTTTTTGAAAGGATGGTGAGGATCAGCGTGCTAAACGATGCGTTTAAGAGCATG
TACAATGCGGAGAAGAGAGGGAAGAGGCAGGTGATGATCAGGCCTTCTTCCAAGGTCATC
ATCAAGGTTCTCACTGTCATGCAGAAACACGGTTACATTGGTGAGTTCGAGTACGTTGAT
GACCACAGGTCTGGTAAGATTGTTGTTGAGCTTAACGGAAGGCTGAACAAATGTGGTGTC
ATCAGTCCTCGCTTCGATGTCGGAGTTAAGGAGATCGAAGGATGGACCGCACGTCTTCTT
CCTTCCAGACAGTTTGGCTACATTGTGCTTACAACCTCCGCCGGTATCATGGACCACGAA
GAAGCCAGGAGGAAGAATGTTGGTGGCAAGGTCCTTGGATTCTTTTACTGAGCTTCGAGA
GAATCATCTTGCCCGGTTATACTTGTCTTTGTGTGAGATGATGTAATAGGGTGGTAGATT
TTTTTGTTGCGTTTGCTATCTTATAGATAATTTGCCGTTTTGTTCGTTATGGATTTTGCG
CCGAAGTTAAAAGACTTGCAAAGTTAGACAGTTATTTCCAGTTCATGTTTTCTTGCCCCA
TATCTATTGCTCTTTATCTTCAGTTCTTGAGATTTGTGGCTCTTTGTTTCGTTCTTCTAC
TGAGATAATTGTTT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 10

CO CL341Contig1 1055 10 9 U
GGACAGACAAAACCCTTTCCTCCTCCCATTTCATCGCAGAGAGAGAGAGATTCAGACACA
AAAAATGCTTCTCAAATCAGCTTCTGCTTTCTCCCTCGTGAACATCCATGGAGTCGAGAA
GGACATCTCTCCTCTCTTCTCCTCCTCATCGTCGAGTCTTCCCGTTTCTTCGGGAAAATC
ACGAAACCTCTCCTTCTCTGTTTCTGCCTCTACGCAAACCCTAAGCGGCGTCGTTTTCGA
GCCGTTTGAGGAGGTGAAGAAGGAGCTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCACAGCTCTCGCT
TGCTCGCCATCTGTACTCCCCAGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGATCAATGTGGA
GTACAACGTGTCGTATGTGTATCACGCCTTGTACGCTTACTTCGATCGTGATAACGTTGC
TCTCAAAGGCCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGTGACCACGCTGA
GATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGAATTAAGTTACAGCCTATGGTGAT
GCCTCAGTCTGAGTTTGATCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCCATGGAGCTGGC
TCTGTCATTGGAGAAGTTGGTCAATGAGAAGCTCCTCAACGTGCACAGTGTGGCTTCGAA
GAACGATGATGTGCAGCTGGCAGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTTGAACGAACAGGTCGA
AGCGATTAAGAAAATCTCTGAATATGTGGCTCAGCTCAGAAGACTCGGCCAAGGACATGG
AACATGGCATTTCGATCAAGAGCTTCTGGAAGCTACTGCTGCTTAATCTAGTTTTGGGTG
TAGTGCTGTTGCTGCTGCTTAATCTATTTTGGTTGTAATCTCTTATAAACTCTTGTTGTT
TGATCAGTTTTGTTTCTGGAATATTAAGCCTCCTTTAGTCTTGTTTACAAAAGTTGTTTT
GAGTAGACAACATCTTTTACTATATCAATGGTTGAGTGATTGAATATTTGTTGTGCAAGA
AGACAGTGTTGAAATGCTAAAGAAGCTTGACCCTT


BQ
10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC14TF U -2
AF RR2A750TF U 2
AF RR2E239TF U 1
AF RR2F229TF U 1
AF RR2BG93TF U 1
AF RR2BG93JQ C 225
AF RR2DC14JQ C 318
AF RR2F229JQ C 387
AF RR2A750JQ C 313
AF RR2E239JQ C 440
BS 1 78 RR2BG93TF
BS 79 79 RR2A750TF
BS 80 446 RR2BG93TF
BS 447 447 RR2A750TF
BS 448 773 RR2BG93TF
BS 774 774 RR2F229TF
BS 775 868 RR2BG93TF
BS 869 968 RR2BG93JQ
BS 969 1055 RR2A750JQ

RD RR2DC14TF 615 0 0
GGCTC
ACAGACAAAACCCTTTCCTCCTCCCATTTCATCGCAGAGAGAGAGAGATTCAGACACAAA
AAATGCTTCTCAAATCAGCTTCTGCTTTCTCCCTCGTGAACATCCATGGAGTCGAGAAGG
ACATCTCTCCTCTCTTCTCCTCCTCATCGTCGAGTCTTCCCGTTTCTTCGGGAAAATCAC
GAAACCTCTCCTTCTCTGTTTCTGCCTCTACGCAAACCCTAAGCGGCGTCGTTTTCGAGC
CGTTTGAGGAGGTGAAGAAGGAGCTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCACAGCTCTCGCTTG
CTCGCCATCTGTACTCCCCAGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGATCAATGTGGAGT
ACAACGTGTCGTATGTGTATCACGCCTTGTACGCTTACTTCGATCGTGATAACGTTGCTC
TCAAAGGCCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGTGACCACGCTGAGA
TGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGAATTAAGTTACAGCCTATGGTGATGC
CTCAGTCTGAGTTTGATCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCCATGGAGCTGGCTC
TGTCATTGGA

QA 6 615 6 615
DS 

RD RR2A750TF 711 0 0
GACAGACAAAACCCTTTCCTCCTCCCATTTCATCGCAGAGAGAGAGAGATTCAGACACAA
AAAATGCTTCTCAAATCAGCTTCTGCTTTCTCCCTCGTGAACATCCATGGAGTCGAGAAG
GACATCTCTCCTCTCTTCTCCTCCTCATCGTCGAGTCTTCCCGTTTCTTCGGGAAAATCA
CGAAACCTCTCCTTCTCTGTTTCTGCCTCTACGCAAACCCTAAGCGGCGTCGTTTTCGAG
CCGTTTGAGGAGGTGAAGAAGGAGCTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCACAGCTCTCGCTT
GCTCGCCATCTGTACTCCCCAGAGTGCGAAGCCGCCGTGAACGAGCAGATCAATGTGGAG
TACAACGTGTCGTATGTGTATCACGCCTTGTACGCTTACTTCGATCGTGATAACGTTGCT
CTCAAAGGCCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGTGACCACACTGAG
ATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGAATTAAGTTACAGCCTATGGTGATG
CCTCAGTCTGAGTTTGATCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCCCTATGCCATGGAGCTGGCT
CTGTCATTGGAGAAGTTGGTCAATGAGAAGCTCCTCAACGTGCACAGTGTGGCTTCGAAG
AACGATGATGTGCAGCTGGCAGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTTGAACGAA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2E239TF 707 0 0
G
GACAGACAAAACCCTTTCCTCCTCCCATTTCATCGCAGAGAGAGAGAGATTCAGACACAA
AAAATGCTTCTCAAATCAGCTTCTGCTTTCTCCCTCGTGAACATCCATGGAGTCGAGAAG
GACATCTCTCCTCTCTTCTCCTCCTCATCGTCGAGTCTTCCCGTTTCTTCGGGAAAATCA
CGAAACCTCTCCTTCTCTGTTTCTGCCTCTACGCAAACCCTAAGCGGCGTCGTTTTCGAG
CCGTTTGAGGAGGTGAAGAAGGAGCTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCACAGCTCTCGCTT
GCTCGCCATCTGTACTCCCCAGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGATCAATGTGGAG
TACAACGTGTCGTATGTGTATCACGCCTTGTACGCTTACTTCGATCGTGATAACGTTGCT
CTCAAAGGCCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGTGACCACGCTGAG
ATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGAATTAAGTTACAGCCTATGGTGATG
CCTCAGTCTGAGTTTGATCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCCATGGAGCTGGCT
CTGTCATTGGAGAAGTTGGTCAATGAGAAGCTCCTCAACGTGCACAGTGTGGCTTCGAAG
AACGATGATGTGCAGCTGGCAGATTTCATTGAGAGCGAGTTTT
GAA

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR2F229TF 821 0 0
G
GACAGACAAAACCCTTTCCTCCTCCCATTTCATCGCAGAGAGAGAGAGATTCAGACACAA
AAAATGCTTCTCAAATCAGCTTCTGCTTTCTCCCTCGTGAACATCCATGGAGTCGAGAAG
GACATCTCTCCTCTCTTCTCCTCCTCATCGTCGAGTCTTCCCGTTTCTTCGGGAAAATCA
CGAAACCTCTCCTTCTCTGTTTCTGCCTCTACGCAAACCCTAAGCGGCGTCGTTTTCGAG
CCGTTTGAGGAGGTGAAGAAGGAGCTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCACAGCTCTCGCTT
GCTCGCCATCTGTACTCCCCAGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGATCAATGTGGAG
TACAACGTGTCGTATGTGTATCACGCCTTGTACGCTTACTTCGATCGTGATAACGTTGCT
CTCAAAGGCCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTTTGGAAGAACGTGACCACGCTGAG
ATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGAATTAAGTTACAGCCTATGGTGATG
CCTCAGTCTGAGTTTGATCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCCATGGAGCTGGCT
CTGTCATTGGAGAAGTTGGTCAATGAGAAGCTCCTCAACGTGCACAGTGTGGCTTCGAAG
AACGATGATGTGCAGCTGGCAGATTTCATTGAG*GCGAGTTTT*GAACGAACAGGTCGAA
GCGATTAAGAAA*TCTCTGA***TGTGGCTCAGCTCAGAAGACTCGGCCAAGGACATGGA
ACATGGCATTTCGATCAAGAGCTTCTGGA*GCTACTGCTG

QA 2 821 2 821
DS 

RD RR2BG93TF 868 0 0
GGACAGACAAAACCCTTTCCTCCTCCCATTTCATCGCAGAGAGAGAGAGATTCAGACACA
AAAAATGCTTCTCAAATCGGCTTCTGCTTTCTCCCTCGTGAACATCCATGGAGTCGAGAA
GGACATCTCTCCTCTCTTCTCCTCCTCATCGTCGAGTCTTCCCGTTTCTTCGGGAAAATC
ACGAAACCTCTCCTTCTCTGTTTCTGCCTCTACGCAAACCCTAAGCGGCGTCGTTTTCGA
GCCGTTTGAGGAGGTGAAGAAGGAGCTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCACAGCTCTCGCT
TGCTCGCCATCTGTACTCCCCAGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGATCAATGTGGA
GTACAACGTGTCGTATGTGTATCACGCCTTGTACGCTTACTTCGATCGTGATAACGTTGC
TCTCAAAGGCCTTGCCAAGTTTTTCATGGACTCGAGTGTGGAAGAACGTGACCACGCTGA
GATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGAATTAAGTTACAGCCTATGGTGAT
GCCTCAGTCTGAGTTTGATCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCCATGGAGCTGGC
TCTGTCATTGGAGAAGTTGGTCAATGAGAAGCTCCTCAACGTGCACAGTGTGGCTTCGAA
GAACGATGATGTGCAGCTGGCAGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTTGAACGAACAGGTCGA
AGCGATTAAGAAAATCTCTGAATATGTGGCTCAGCTCAGAAGACTCGGCCAAG*ACATGG
AACATGGCATTTCGATCAAGAGCTTCTGGAAGCTACTGCTGCTTAATCTAGTTTTGGGTG
TAGTGCTGTTGCTGCTGCTTAATCTATT

QA 1 868 1 868
DS 

RD RR2BG93JQ 744 0 0
GCGGCGTCGTTTTCGAGCCGTTTGAGGAGGTGAAGAAGGAGCTCGATCTCGTCCCTTCGA
GTCCACAGCTCTCGCTTGCTCGCCATCTGTACTCCCCAGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATG
AGCAGATCAATGTGGAGTACAACGTGTCGTATGTGTATCACCCCTTGTACGCTTACTTCG
ATCGTGATAACGTTGCTCTCAAAGGCCTTGCCAAGTTTTTCATGGACTCGAGTGTGGAAG
AACGTGACCACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGAATTAAGT
TACAGCCTATGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTGATCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCT
ATGCCATGGAGCTGGCTCTGTCATTGGAGAAGTTGGTCAATGAGAAGCTCCTCAACGTGC
ACAGTGTGGCTTCGAAGAACGATGATGTGCAGCTGGCAGATTTCATTGAGAGCGAGTTTT
TGAACGAACAGGTCGAAGCGATTAAGAAAATCTCTGAATATGTGGCTCAGCTCAGAAGAC
TCGGCCAAGGACATGGAACATGGCATTTCGATCAAGAGCTTCTGGAAGCTACTGCTGCTT
AATCTAGTTTTGGGTGTAGTGCTGTTGCTGCTGCTTAATCTATTTTGGTTGTAATCTCTT
ATAAACTCTTGTTGTTTGATCAGTTTTGTTTCTGGAATATTAAGCCTCCTTTAGTCTTGT
TTACAAAAGTTGTTTTGAGTAGAC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2DC14JQ 685 0 0
CCCCAGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGATCAATGTGGAGTACAACGTGTCGTATG
TGTATCACGCCTTGTACGCTTACTTCGATCGTGATAACGTTGCTCTCAAAGGCCTTGCCA
AGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGTGACCACGCTGAGATGTTGATGGAGTATC
AGAACAAACGTGGTGGGAGAATTAAGTTACAGCCTATGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTG
ATCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCCATGGAGCTGGCTCTGTCATTGGAGAAGT
TGGTCAATGAGAAGCTCCTCAACGTGCACAGTGTGGCTTCGAAGAACGATGGTGTGCAGC
TGGCAGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTTGAACGAACAGGTCGAAGCGATTAAGAAAATCT
CTGAATATGTGGCTCAGCTCAGAAGACTCGGCCAAGGACATGGAACATGGCATTTCGATC
AAGAGCTTCTGGAAGCTACTGCTGCTTAATCTAGTTTTGGGTGTAGTGCTGTTGCTGCTG
CTTAATCTATTTTGGTTGTAATCTCTTATAAACTCTTGTTGTTTGATCAGTTTTGTTTCT
GGAATATTAAGCCTCCTTTAGTCTTGTTTACAAAAGTTGTTTTGAGTAGACAACATCTTT
TACTATATCAATGGTTGAGTGATTG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2F229JQ 616 0 0
CCTTGTACGCTTACTTCGATCGTGATAACGTTGCTCTCAAAGGCCTTGCCAAGTTTTTCA
AGGACTCGAGTTTGGAAGAACGTGACCACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAGAACAAAC
GTGGTGGGAGAATTAAGTTACAGCCTATGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTGATCACGCTG
AGAAAGGAGATGCTCTTTATGCCATGGAGCTGGCTCTGTCATTGGAGAAGTTGGTCAATG
AGAAGCTCCTCAACGTGCACAGTGTGGCTTCGAAGAACGATGATGTGCAGCTGGCAGATT
TCATTGAG*GCGAGTTTTTGAACGAACAGGTCGAAGCGATTAAGAAAATCTCTGAA**TG
TGGCTCAGCTCAGAAGACTCGGCCAAGGACATGGAACATGGCATTTCGATCAAGAGCTTT
TGGAAGCTACTGCTGCTTAATCTAGTTTTGGGTGTAGTGCTGTTGCTGCTGCTTAATCTA
TTTTGGTTGTAATCTCTTATAAACTCTTGTTGTTTGATCAGTTTTGTTTCTGGAATATTA
AGCCTCCTTTAGTCTTGTTTACAAAAGTTGTTTTGAGTAGACAACATCTTTTACTATATC
AATGGTTGAGTGATTG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2A750JQ 743 0 0
GTACTCCCCAGAGTGCGAAGCCGCCGTGAACGAGCAGATCAATGTGGAGTACAACGTGTC
GTATGTGTATCACGCCTTGTACGCTTACTTCGATCGTGATAACGTTGCTCTCAAAGGCCT
TGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGTGACCACACTGAGATGTTGATGGA
GTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGAATTAAGTTACAGCCTATGGTGATGCCTCAGTCTGA
GTTTGATCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCCCTATGCCATGGAGCTGGCTCTGTCATTGGA
GAAGTTGGTCAATGAGAAGCTCCTCAACGTGCACAGTGTGGCTTCGAAGAACGATGATGT
GCAGCTGGCAGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTTGAACGAACAGGTCGAAGCGATTAAGAA
AATCTCTGAATATGTGGCTCAGCTCAGAAGACTCGGCCAAGGACATGGAACATGGCATTT
CGATCAAGAGCTTCTGGAAGCTACTGCTGCTTAATCTAGTTTTGGGTGTAGTGCTGTTGC
TGCTGCTTAATCTATTTTGGTTGTAATCTCTTATAAACTCTTGTTGTTTGATCAGTTTTG
TTTCTGGAATATTAAGCCTCCTTTAGTCTTGTTTACAAAAGTTGTTTTGAGTAGACAACA
TCTTTTACTATATCAATGGTTGAGTGATTGAATATTTGTTGTGCAAGAAGACAGTGTTGA
AATGCTAAAGAAGCTTGACCCTT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2E239JQ 599 0 0
TTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGTGACCACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAG
AACAAACGTGGTGGGAGAATTAAGTTACAGCCTATGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTGAT
CACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCCATGGAGCTGGCTCTGTCATTGGAGAAGTTG
GTCAATGAGAAGCTCCTCAACGTGCACAGTGTGGCTTCGAAGAACGATGATGTGCAGCTG
GCAGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTTGAACGAACAGGTCGAAGCGATTAAGAAAATCTCT
GAATATGTGGCTCAGCTCAGAAGACTCGGCCAAGGACATGGAACATGGCATTTCGATCAA
GAGCTTCTGGAAGCTACTGCTGCTTAATCTAGTTTTGGGTGTAGTGCTGTTGCTGCTGCT
TAATCTATTTTGGTTGTAATCTCTTATAAACTCTTGTTGTTTGATCAGTTTTGTTTCTGG
AATATTAAGCCACCTTTAGTCTTGTTTACAAAAGTTGTTTTGAGTAGACAACATCTTTTA
CTATATCAATGGTTGAGTGATTGAATATTTGTTGTGCAAGAAGACAGTGTTGAAATGC
C

QA 1 598 1 598
DS 



AS 3 13

CO CL342Contig1 856 4 24 U
GGAAGTCACACAAGAAATACAAACACCATGGGTAACAATAAGCCACTGTCATTCATCTCT
TTGTTCCTTCTCGTGTCAGCTGTTGCAATATCAACTGGAGATGAAGTGGAACCCGTCAAG
GACACAAATGGAAACCCACTTAAGAGTCAAACCCAGTACTTCATCCAACCAGGTTCAGAC
AAGAAAGGAGGCGGTCTTGTCCCAGCAAGCACCGACTTAACTCACTTGTGTCCATTAGGT
ATTGTCCAAACACTCCTTCCATTTCAGCCAAGCCTTCCTGTAAATTTCTCCAATCCATCT
TCCCAAAATGATGATGTATTGACAACAAACACCGATCTAATTATCGAGTTCCAGTCTCCA
ATATGGCTCTGCCCTTCTTCAAAGATATGGAAAGTCGATACCTCCTCAAGTTCTGACAAG
AACTATGTAACCACTGGTGGTAGCTCCAGCACAAGAGAGAGCTTTTTCAGGATTCAGAAA
TATGGAAACGATCAGAACACTTACAAGCTAGTTCACTACGAGAGTGACACGGTTATTAAA
GGTATTGGTGCGACCACCGGGTTTTTCGGAGCACCCATTCTTGTTCTCAACGATGATAAT
GATGATAAGAATGTTTTCCCTGTTAAGTTCCGTGAGGTTGACACATCCAAAGAGAATGTG
TTTGCGAAGGGTCTTAGGATGTTCCCTTCCTTTTGAGTTATACTTCGATGGTGTTTAATA
AGTTGTGTTATGTAAAATAATGGGTTGAAACAATACCACTAAACCATCTTTTGGTTTGAT
GTAATACAAAAGTTAAGGCCTTTGCTTTTGGTTTTAAGGGTCTTTGTTCTTTATGAGGAT
CCTTCTTTTTTTTAAG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN18TF U 1
AF RR2AC40TF U 1
AF RR2EN18JQ C 118
AF RR2AC40JQ C 1
BS 1 10 RR2EN18TF
BS 11 12 RR2AC40TF
BS 13 15 RR2EN18TF
BS 16 16 RR2AC40TF
BS 17 51 RR2EN18TF
BS 52 52 RR2AC40TF
BS 53 93 RR2EN18TF
BS 94 94 RR2AC40TF
BS 95 168 RR2EN18TF
BS 169 169 RR2AC40TF
BS 170 270 RR2EN18TF
BS 271 271 RR2AC40TF
BS 272 298 RR2EN18TF
BS 299 299 RR2AC40TF
BS 300 368 RR2EN18TF
BS 369 369 RR2AC40TF
BS 370 467 RR2EN18TF
BS 468 468 RR2AC40TF
BS 469 528 RR2EN18TF
BS 529 529 RR2AC40TF
BS 530 607 RR2EN18TF
BS 608 608 RR2AC40TF
BS 609 673 RR2EN18TF
BS 674 856 RR2AC40JQ

RD RR2EN18TF 673 0 0
GGAAGTCACATTAGATATACAAACACCATGGGTAACAATAAGCCACTGTCACTCATCTCT
TTGTTCCTTCTCGTGTCAGCTGTTGCAATATCAGCTGGAGATGAAGTGGAACCCGTCAAG
GACACAAATGGAAACCCACTTAAGAGTCAAACCCAGTACTTCATCCAATCAGGTTCAGAC
AAGAAAGGAGGCGGTCTTGTCCCAGCAAGCACCGACTTAACTCACTTGTGTCCATTAGGT
ATTGTCCAAACACTCCTTCCATTTCAGCCAGGCCTTCCTGTAAATTTCTCCAATCCATTT
TCCCAAAATGATGATGTATTGACAACAAACACCGATCTAATTATCGAGTTCCAGTCTCCA
ATATGGCTTTGCCCTTCTTCAAAGATATGGAAAGTCGATACCTCCTCAAGTTCTGACAAG
AACTATGTAACCACTGGTGGTAGCTCCAGCACAAGAGAGAGCTTTTTTAGGATTCAGAAA
TATGGAAACGATCAGAACACTTACAAGCTAGTTCACTACGAGAGTGACTCGGTTATTAAA
GGTATTGGTGCGACCACCGGGTTTTTCGGAGCACCCATTCTTGTTCTCAACGATGATAAT
GATGATATGAATGTTTTCCCTGTTAAGTTCCGTGAGGTTGACACATCCAAAGAGAATGTG
TTTGCGAAGGGTC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2AC40TF 669 0 0
GGAAGTCACACAAGAAATACAAACACCATGGGTAACAATAAGCCACTGTCATTCATCTCT
TTGTTCCTTCTCGTGTCAGCTGTTGCAATATCAACTGGAGATGAAGTGGAACCCGTCAAG
GACACAAATGGAAACCCACTTAAGAGTCAAACCCAGTACTTCATCCAACCAGGTTCAGAC
AAGAAGGGAGGCGGTCTTGTCCCAGCAAGCACCGACTTAACTCACTTGTGTCCATTAGGT
ATTGTCCAAACACTCCTTCCATTTCAGCCAAGCCTTCCTGTAAATTTCTCCAATCCATCT
TCCCAAAATGATGATGTATTGACAACAAACACCGATCTAATTATCGAGTTCCAGTCTCCG
ATATGGCTCTGCCCTTCTTCAAAGATATGGAAAGTCGATACCTCCTCAAGTTCTGACAAG
AACTATGTAACCACTGGTGGTAGCTCCAGCACGAGGGAGAGCTTTTTCAGGATTCAGAAA
TATGGAAACGATCAGAACACTTACAAGCTAGTTCACTACGAGAGTGACACGGTTATTAAA
GGTATTGGTGCGACCACCGGGTTTTTCGGAGCACCCATTCTTGTTCTCAACGATGATAAT
GATGATAAGAATGTTTTCCCTGTTAAGTTCCGTGAGGTTGACACATCCAAAGAGAATGTG
TTTGCGAA
A

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2EN18JQ 689 0 0
AAGGACACAAATGGAAACCCACTTAAGAGTCAAACCCAGTACTTCATCCAATCAGGTTCA
GACAAGAAAGGAGGCGGTCTTGTCCCAGCAAGCACCGACTTAACTCACTTGTGTCCATTA
GGTATTGTCCAAACACTCCTTCCATTTCAGCCAGGCCTTCCTGTAAATTTCTCCAATCCA
TTTTCCCAAAATGATGATGTATTGACAACAAACACCGATCTAATTATCGAGTTCCAGTCT
CCAATATGGCTTTGCCCTTCTTCAAAGATATGGAAAGTCGATACCTCCTCAAGTTCTGAC
AAGAACTATGTAACCACTGGTGGTAGCTCCAGCACAAGAGAGAGCTTTTTTAGGATTCAG
AAATATGGAAACGATCAGAACACTTACAAGCTAGTTCACTACGAGAGTGACTCGGTTATT
AAAGGTATTGGTGCGACCACCGGGTTTTTCGGAGCACCCATTCTTGTTCTCAACGATGAT
AATGATGATATGAATGTTTTCCCTGTTAAGTTCCGTGAGGTTGACACATCCAAAGAGAAT
GTGTTTGCGAAGGGTCTTAGGATGTTCCCTTCCTTTTGAGTTATACTTCGATGGTGTTTA
ATAAGTTGTGTTATGTAAAATAATGGGTTGAAACAATACCACTAAACCATCTTTTGGTTT
GATGTAATA*AAAAGTTAAGG
TCTTTGCT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2AC40JQ 856 0 0
GGAAGTCACACAAGAAATACAAACACCATGGGTAACAATAAGCCACTGTCATTCATCTCT
TTGTTCCTTCTCGTGTCAGCTGTTGCAATATCAACTGGAGATGAAGTGGAACCCGTCAAG
GACACAAATGGAAACCCACTTAAGAGTCAAACCCAGTACTTCATCCAACCAGGTTCAGAC
AAGAAGGGAGGCGGTCTTGTCCCAGCAAGCACCGACTTAACTCACTTGTGTCCATTAGGT
ATTGTCCAAACACTCCTTCCATTTCAGCCAAGCCTTCCTGTAAATTTCTCCAATCCATCT
TCCCAAAATGATGATGTATTGACAACAAACACCGATCTAATTATCGAGTTCCAGTCTCCG
ATATGGCTCTGCCCTTCTTCAAAGATATGGAAAGTCGATACCTCCTCAAGTTCTGACAAG
AACTATGTAACCACTGGTGGTAGCTCCAGCACGAGGGAGAGCTTTTTCAGGATTCAGAAA
TATGGAAACGATCAGAACACTTACAAGCTAGTTCACTACGAGAGTGACACGGTTATTAAA
GGTATTGGTGCGACCACCGGGTTTTTCGGAGCACCCATTCTTGTTCTCAACGATGATAAT
GATGATAAGAATGTTTTCCCTGTTAAGTTCCGTGAGGTTGACACATCCAAAGAGAATGTG
TTTGCGAAGGGTCTTAGGATGTTCCCTTCCTTTTGAGTTATACTTCGATGGTGTTTAATA
AGTTGTGTTATGTAAAATAATGGGTTGAAACAATACCACTAAACCATCTTTTGGTTTGAT
GTAATACAAAAGTTAAGGCCTTTGCTTTTGGTTTTAAGGGTCTTTGTTCTTTATGAGGAT
CCTTCTTTTTTTTAAG

QA 1 856 1 856
DS 



CO CL342Contig2 901 5 6 U
GGGCCTCAAGTCACACAAAAAATACAAACACCATGGGTAACAATAAGCCACTGTCATTCA
TCTCTTTGTTCCTTCTCGTGTCAGCTGTTGCAATATCAGCTGGAGATGAAGTGGAACCCG
TCAAGGACATAAATGGAAACCCGCTTAATAGTCAAACCCAGTACTTCATCCAACCAGGTT
CAGACAAGAAAGGAGGCGGTCTTGTCCCAGCAAGCACCGACTTAACTCACTTGTGTCCAT
TAGGTATTGTCCAAACACTCCTTCCATTTCAGCCAGGCCTTCCTGTAAATTTCTCCAATC
CATCTTCCCAAAATAATGATGTATTGACAACAAACACCGATCTAATTATCGAGTTCCAGT
CTCCAATATGGCTCTGCCCTTCTTCAAAGATATGGAAAGTCGATACCTCCTCAAGTTCTG
ACAAGAACTATGTAACCACTGGTGGTAGCTCCAGCTCGAGGGAGAGCTTTTTCAGGATTC
AGAAATATGGAAACGATCAGAACACTTACAAGCTAGTTCACTACGAGAGTGACTCGGCTA
TAAAAGGTATTGGTGCGACCACCGGTTTATTCGGAGCACCTTATCTTGTTCTTGAAGATG
ATAATAATGATAAAAATGTTTTCCCTGTTAAGTTCCGTGAGGTTGACACGTCCACAGAGA
ATGTGTTTGCGAAGGGTCTTAGGATGTTCCCTTCCTTCTGAGTTATACTTCGATGGTGTT
TAATAAGTTGTATTATGTAAAATAATGGGTTGAAACAATACCACTAAACCATCTTTTGGT
TTGATGTAATAAAAAGTTAAGGGTCTTTGCTTTTGGTTTTAAGGGTCTTTGTTCTTTATG
AGGATCCTTCTTTTTCTTAAGAAACCAAACTCTTGTTAAATTTAAGCAAACCAGTGCTGC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2AE37TF U 1
AF RR2C921TF U 6
AF RR2C921JQ C 42
AF RR2GV10TF U 509
AF RR2GV10JQB C 540
BS 1 148 RR2AE37TF
BS 149 149 RR2C921TF
BS 150 420 RR2AE37TF
BS 421 421 RR2C921TF
BS 422 678 RR2AE37TF
BS 679 901 RR2GV10TF

RD RR2AE37TF 678 0 0
GGGCCTCAAGTCACACAAAAAATACAAACACCATGGGTAACAATAAGCCACTGTCATTCA
TCTCTTTGTTCCTTCTCGTGTCAGCTGTTGCAATATCAGCTGGAGATGAAGTGGAACCCG
TCAAGGACATAAATGGAAACCCGCTTAAGAGTCAAACCCAGTACTTCATCCAACCAGGTT
CAGACAAGAAAGGAGGCGGTCTTGTCCCAGCAAGCACCGACTTAACTCACTTGTGTCCAT
TAGGTATTGTCCAAACACTCCTTCCATTTCAGCCAGGCCTTCCTGTAAATTTCTCCAATC
CATCTTCCCAAAATAATGATGTATTGACAACAAACACCGATCTAATTATCGAGTTCCAGT
CTCCAATATGGCTCTGCCCTTCTTCAAAGATATGGAAAGTCGATACCTCCTCAAGTTCTG
GCAAGAACTATGTAACCACTGGTGGTAGCTCCAGCTCGAGGGAGAGCTTTTTCAGGATTC
AGAAATATGGAAACGATCAGAACACTTACAAGCTAGTTCACTACGAGAGTGACTCGGCTA
TAAAAGGTATTGGTGCGACCACCGGTTTATTCGGAGCACCTTATCTTGTTCTTGAAGATG
ATAATAATGATAAAAATGTTTTCCCTGTTAAGTTCCGTGAGGTTGACACGTCCACAGAGA
ATGTGTTTGCGAAGGGTC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2C921TF 665 0 0
GGAAGC
CACACAAAAAATACAAACACCATGGGTAACAATAAGCCACTGTCATTCATCTCTTTGTTC
CTTCTCGTGTCAGCTGTTGCAATATCAGCTGGAGATGAAGTGGAACCCGTCAAGGACATA
AATGGAAACCCGCTTAATAGTCAAACCCAGTACTTCATCCAACCAGGTTCAGACAAGAAA
GGAGGCGGTCTTGTCCCAGCAAGCACCGACTTAACTCACTTGTGTCCATTAGGTATTGTC
CAAACACTCCTTCCATTTCAGCCAGGCCTTCCTGTAAATTTCTCCAATCCATCTTCCCAA
AATAATGATGTATTGACAACAAACACCGATCTAATTATCGAGTTCCAGTCTCCAATATGG
CTCTGCCCTTCTTCAAAGATATGGAAAGTCGATACCTCCTCAAGTTCTGACAAGAACTAT
GTAACCACTGGTGGTAGCTCCAGCTCGAGGGAGAGCTTTTTCAGGATTCAGAAATATGGA
AACGATCAGAACACTTACAAGCTAGTTCACTACGAGAGTGACTCGGCTATAAAAGGTATT
GGTGCGACCACCGGTTTATTCGGAGCACCTTATCTTGTTCTTGAAGATGATAATAATGAT
AAAAATGTTTTCCCTGTTAAGTTCCGTGAGGTTGACACGTCCACAGAGAATGTGTTTGC

QA 7 665 7 665
DS 

RD RR2C921JQ 712 0 0
AATAAGCCACTGTCATTCATCTCTTTGTTCTTTCTCGTGTCAGCTGTTGCAATATCAGCT
GGAGATGAAGTGGAACCCGTCAAGGACATAAATGGAAACCCGCTTAATAGTCAAACCCAG
TACTTCATCCAACCAGGTTCAGACAAGAAAGGAGGCGGTCTTGTCCCAGCAAGCACCGAC
TTAACTCACTTGTGTCCATTAGGTATTGTCCAAACACTCCTTCCATTTCAGCCAGGCCTT
CCTGTAAATTTCTCCAATCCATCTTCCCAAAATAATGATGTATTGACAACAAACACCGAT
CTAATTATCGAGTTCCAGTCTCCAATATGGCTCTGCCCTTCTTCAAAGATATGGAAAGTC
GATACCTCCTCAAGTTCTGACAAGAACTATGTAACCACTGGTGGTAGCTCCAGCTCGAGG
GAGAGCTTTTTCAGGATTCAGAAATATGGAAACGATCAGAACACTTACAAGCTAGTTCAC
TACGAGAGTGACTCGGCTATAAAAGGTATTGGTGCGACCACCGGTTTATTCGGAGCACCT
TATCTTGTTCTTGAAGATGATAATAATGATAAAAATGTTTTCCCTGTTAAGTTCCGTGAG
GTTGACACGTCCACAGAGAATGTGTTTGCGAAGGGTCTTAGGATGTTCCCTTCCTTCTGA
GTTATACTTCGATGGTGTTTAATAAGTTGTATTATGTAAAATAATGGGTTGA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2GV10TF 393 0 0
G
AAGCTAGTTCACTACGAGAGTGACTCGGCTATAAAAGGTATTGGTGCGACCACCGGTTTA
TTCGGAGCACCTTATCTTGTTCTTGAAGATGATAATAATGATAAAAATGTTTTCCCTGTT
AAGTTCCGTGAGGTTGACACGTCCACAGAGAATGTGTTTGCGAAGGGTCTTAGGATGTTC
CCTTCCTTCTGAGTTATACTTCGATGGTGTTTAATAAGTTGTATTATGTAAAATAATGGG
TTGAAACAATACCACTAAACCATCTTTTGGTTTGATGTAATAAAAAGTTAAGGGTCTTTG
CTTTTGGTTTTAAGGGTCTTTGTTCTTTATGAGGATCCTTCTTTTTCTTAAGAAACCAAA
CTCTTGTTAAATTTAAGCAAACCAGTGCTGCC

QA 2 393 2 393
DS 

RD RR2GV10JQB 362 0 0
ATAAAAGGTATTGGTGCGACCACCGGTTTATTCGGAGCACCTTATCTTGTTCTTGAAGAT
GATAATAATGATAAAAATGTTTTCCCTGTTAAGTTCCGTGAGGTTGACACGTCCACAGAG
AATGTGTTTGCGAAGGGTCTTAGGATGTTCCCTTCCTTCTGAGTTATACTTCGATGGTGT
TTAATAAGTTGTATTATGTAAAATAATGGGTTGAAACAATACCACTAAACCATCTTTTGG
TTTGATGTAATAAAAAGTTAAGGGTCTTTGCTTTTGGTTTTAAGGGTCTTTGTTCTTTAT
GAGGATCCTTCTTTTTCTTAAGAAACCAAACTCTTGTTAAATTTAAGCAAACCAGTGCTG
CC

QA 1 362 1 362
DS 



CO CL342Contig3 898 4 7 U
GGAAGTCACATAAGATATACAAACACCATGGGTAACAATAAGCCACTGTCATTCATCTCT
TTGTTCCTACTCGTGTCAGCTGTTGCAATATCAGCTGGAGATGAAGTGGAACCCGTCAAG
GACACAAATGGAAACCCACTTAAGAGTCAAACCCAGTACTTCATCCAACCAGGTTCAGAC
AAGAAAGGAGGCGGTCTTGTCCCAGCAAGCACCGACTTAACTCACTTGTGTCCATTAGGT
ATTGTCCAAACACTCCTTCCATTTCAGCCAGGCCTTCCTGTAAATTTCTCCAATCCATCT
TCCCAAAATGATGATGTATTGACAACAAACACCGATCTAATTATCGAGTTCCAGTCTCCG
ATATGGCTCTGCCCTTCTTCAAAGATATGGAAGGTCGATACCTCCTCAAGTTCAGACAAG
AACTACGTAATCACTGGAGGTAGCTCCAGCACGAGAGAGAGCTTTTTTAGGATTCAGAAA
TATGGAAAAGATGAAAACACTTACAAGCTAGTTCACTACGAGAGTGACTCCGCTATAAAA
GGTATTGGTGCGACTACCGGTTTATTCGGAGCACCTTATCTTGTTCTAGAAGATGATAAT
AATGATGATAAAAATGTTTTCCCAGTTAAGTTCCGTGAGGTTGACACGTCCACAGAGAAT
GTGTTTGCGAAGGGTCTTAGGATGTTCCCTTCCTTTTGAGTTATAAAGAGTTCTCCGATG
GTGTTTAATAAGTTGCATTATGTAAAATAATGGGTTGAAAGAATACCCCTAAACCATCTT
TTGGTTTGATGTAATAAAAAGTTGAAATGTGTATTTGATTTTGGTTTTAGAGGGTCTTTG
TTCTTTATGAGGATCCTTCTTTTTTTCTTAAGAAACCAAACTCTTGTTAAATTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN29TF U 1
AF RR2CM72TF U 2
AF RR2FN29JQ C 339
AF RR2CM72JQ C 177
BS 1 154 RR2FN29TF
BS 155 155 RR2CM72TF
BS 156 613 RR2FN29TF
BS 614 614 RR2CM72TF
BS 615 635 RR2FN29TF
BS 636 667 RR2CM72TF
BS 668 898 RR2CM72JQ

RD RR2FN29TF 635 0 0
GGAAGTCACATAAGATATACAAACACCATGGGTAACAATAAGCCACTGTCATTCATCTCT
TTGTTCCTACTCGTGTCAGCTGTTGCAATATCAGCTGGAGATGAAGTGGAACCCGTCAAG
GACACAAATGGAAACCCACTTAAGAGTCAAACCCGGTACTTCATCCAACCAGGTTCAGAC
AAGAAAGGAGGCGGTCTTGTCCCAGCAAGCACCGACTTAACTCACTTGTGTCCATTAGGT
ATTGTCCAAACACTCCTTCCATTTCAGCCAGGCCTTCCTGTAAATTTCTCCAATCCATCT
TCCCAAAATGATGATGTATTGACAACAAACACCGATCTAATTATCGAGTTCCAGTCTCCG
ATATGGCTCTGCCCTTCTTCAAAGATATGGAAGGTCGATACCTCCTCAAGTTCAGACAAG
AACTACGTAATCACTGGAGGTAGCTCCAGCACGAGAGAGAGCTTTTTTAGGATTCAGAAA
TATGGAAAAGATGAAAACACTTACAAGCTAGTTCACTACGAGAGTGACTCCGCTATAAAA
GGTATTGGTGCGACTACCGGTTTATTCGGAGCACCTTATCTTGTTCTAGAAGATGATAAT
AATGATGATAAAA*TGTTTTCCCAGTTAAGTTCCG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2CM72TF 666 0 0
GGAAGTCACATAAGAT
TACAAACACCATGGGTAACAATAAGCCACTGTCATTCATCTCTTTGTTCCTTCTCGTGTC
AGCTGTTGCAATATCAGCTGGAGATGAAGTGGAACCCGTCAAGGACACAAATGGAAACCC
ACTTAAGAGTCAAACCCAGTACTTCATCCAACCAGGTTCAGACAAGAAAGGAGGCGGTCT
TGTCCCAGCAAGCACCGACTTAACTCACTTGTGTCCATTAGGTATTGTCCAAACACTCCT
TCCATTTCAGCCAGGCCTTCCTGTAAATTTCTCCAATCCATCTTCCCAAAATGATGATGT
ATTGACAACAAACACCGATCTAATTATCGAGTTCCAGTCTCCGATATGGCTCTGCCCTTC
TTCAAAGATATGGAAGGTCGATACCTCCTCAAGTTCAGACAAGAACTACGTAATCACTGG
AGGTAGCTCCAGCACGAGAGAGAGCTTTTTTAGGATTCAGAAATATGGAAAAGATGAAAA
CACTTACAAGCTAGTTCACTACGAGAGTGACTCCGCTATAAAAGGTATTGGTGCGACTAC
CGGTTTATTCGGAGCACCTTATCTTGTTCTAGAAGATGATAATAATGATGATAAAAATGT
TTTCCCTGTTAAGTTCCGTGAGGTTGACACGTCCACAGAGAATGTGTTTG

QA 17 666 17 666
DS 

RD RR2FN29JQ 490 0 0
AATTATCGAGTTCCAGTTTCCGATATGGTTCTGCCCTTCTTCAAAGATATGGAAGGTCGA
TACCTCCTCAAGTTCAGACAAGAACTACGTAATCACTGGAGGTAGCTCCAGCACGAGAGA
GAGCTTTTTTAGGATTCAGAAATATGGAAAAGATGAAAACACTTACAAGCTAGTTCACTA
CGAGAGTGATTCCGCTATAAAAGGTATTGGTGGGACTACCGGTTTATTCGGAGCACCTTA
TCTTGTTTTAGAAGATGATAATAATGATGATAAAAATGTTTTCCCAGTTAAGTTCCGTGA
GGTTGACACGTCCACAGAGAATGTGTTTGGGAAGGGTCTTAGGATGTTCCCTTCCTTTTG
AGTTATAAAGAGTTTTCCGATGGTGTTTAATAAGTTGCATTATGTAAAATAATGGGTTGA
AAGAATACCCCTAAACCATCTTTTGGTTTGATGTAATAAAAAGTTGAAATGTGTATTTGA
TTTTGGTTTT

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR2CM72JQ 722 0 0
AGACAAGAAAGGAGGCGGTCTTGTCCCAGCAAGCACCGACTTAACTCACTTGTGTCCATT
AGGTATTGTCCAAACACTCCTTCCATTTCAGCCAGGCCTTCCTGTAAATTTCTCCAATCC
ATCTTCCCAAAATGATGATGTATTGACAACAAACACCGATCTAATTATCGAGTTCCAGTT
TCCGATATGGCTCTGCCCTTCTTCAAAGATATGGAAGGTCGATACCTCCTCAAGTTCAGA
CAAGAACTACGTAATCACTGGAGGTAGCTCCAGCACGAGAGAGAGCTTTTTTAGGATTCA
GAAATATGGAAAAGATGAAAACACTTACAAGCTAGTTCACTACGAGAGTGACTCCGCTAT
AAAAGGTATTGGTGCGACTACCGGTTTATTCGGAGCACCTTATCTTGTTCTAGAAGATGA
TAATAATGATGATAAAAATGTTTTCCCTGTTAAGTTCCGTGAGGTTGACACGTCCACAGA
GAATGTGTTTGCGAAGGGTCTTAGGATGTTCCCTTCCTTTTGAGTTATAAAGAGTTCTCC
GATGGTGTTTAATAAGTTGCATTATGTAAAATAATGGGTTGAAAGAATACCCCTAAACCA
TCTTTTGGTTTGATGTAATAAAAAGTTGAAATGTGTATTTGATTTTGGTTTTAGAGGGTC
TTTGTTCTTTATGAGGATCCTTCTTTTTTTCTTAAGAAACCAAACTCTTGTTAAATTTAA
GC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 10

CO CL343Contig1 1065 10 15 U
CCACGAGAATATCTTCTCCCTTTTTGCATTTTTATTTAAAATTAATAAAAACAAAAAGAA
AAAGAGCTAAAAATTATAAAATACACACCATATTTCTATATATACATATACATATAAGGT
AAATATTTTTTGCTCATTCTAAACTGTTTAACTATATTATTTCTTAATTTAAAAAAAAAA
ACTGGTTATGTGAAGAAAATGTTGAGTGATCATCAATCAAGCACACAAGTATTTATTGAA
GCATAACAGTTTTATTCCAAACTTCGGTCTTAAATCTTAAGTAGTCTTTTGCTCACACAA
GGCGTCTGCATAGAGTGAGACCATCTCCAACGGAGATCTGAGAGATTTCTACTCGAGGAT
CCAAAGCCAATTTCTTATTAAATTCTATAACAGCCGCTCTTGATTCCCTCATAAACTCAG
GAACGTTCTCTTCTTCCTCGACCACAAAACTAAACCACAAGGTGTTGTCGAATGCAATGA
TTCCTCCAACCTTCACCAATTTCAGAAATCTCTCAAGGAAGTTCACGTAGTTTGGCTTGT
CAGCGTCAGCAAATATGAAATCAAACTCCTGATT***GTCGTTAACCAATTTGTCTAAGA
CCTCCAGACCATCGCAATAGATGAAATTGATCTTGTGATCAACACCTGCTTTCTTCAGAA
ACTCTAATCCCACTTCATAGGCTTCCTTGTCAATATCTATTGCAGTAATGCGACCATCTT
CAGGCAAAGCAAGGGCCGTGGTGAGAAGAGAGTAACCAGTGAAAACACCAAGCTCAAGAG
TGTTCTTAGCGTTTATGATTTTTAAAAGCATCGATAGAAAAATGCCCTCATCAACTGGAA
TAACCATTTCGATTAAGTTGCCAAATTTCTCTTCTGTGACTTTCCGAAGCTCCTTGAGCA
GCTCATGTTCTCTTGGATACGCTGACGTTTCCAAGATATACTGTCTCAGAGCTTCGCTCT
TGAGGATCCCTTTGGGAGGTAGTTCATCCGCCATCTCTCAGTCTGGCGATTGTGAGGAGT
ATTGAGGTGTCTTTGTAATAAAGAGAGATGTTATACTTTGGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F378JQ U 315
AF RR2GS60JQB U 1
AF RR2AH47JQ U 208
AF RR2CA12JQ U 238
AF RR2BB19JQ U 203
AF RR2GS60TF C 495
AF RR2F378TF C 289
AF RR2CA12TF C 319
AF RR2AH47TF C 275
AF RR2F779TF C 635
BS 1 220 RR2GS60JQB
BS 221 221 RR2BB19JQ
BS 222 261 RR2GS60JQB
BS 262 262 RR2BB19JQ
BS 263 328 RR2GS60JQB
BS 329 329 RR2BB19JQ
BS 330 574 RR2GS60JQB
BS 575 577 RR2BB19JQ
BS 578 691 RR2GS60JQB
BS 692 721 RR2BB19JQ
BS 722 722 RR2AH47JQ
BS 723 1007 RR2BB19JQ
BS 1008 1008 RR2GS60TF
BS 1009 1059 RR2BB19JQ
BS 1060 1065 RR2F779TF

RD RR2F378JQ 284 0 0
GTGAGACCATCTCCAACGGAAATCTGAAAGATTTCTACTCGAGGATCCAAAGCCAATTTC
TTATTAAATTCTATAACAGCCGCTCTTGATTCCCTCATAAACTCAGGAACGTTCTCTTCT
TCCTCGACCACAAAACTAAACCACAAGGGGTTGTCGAATGCAATGATTCCTCCAACCTTC
ACCAATTTCAAAAATCTCTCAAGGAAGTTCACGTAGTTTGGCTTGTCAGCGTCAGCAAAT
ATGAAATCAAACTCCTGATT***GTCGTTAACCAATTTGTCTAA

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2GS60JQB 691 0 0
CCACGAGAATATCTTCTCCCTTTTTGCATTTTTATTTAAAATTAATAAAAACAAAAAGAA
AAAGAGCTAAAAATTATAAAATACACACCATATTTCTATATATACATATACATATAAGGT
AAATATTTTTTGCTCATTCTAAACTGTTTAACTATATTATTTCTTAATTTAAAAAAAAAA
ACTGGTTATGTGAAGAAAATGTTGAGTGATCATCAATCAAACACACAAGTATTTATTGAA
GCATAACAGTTTTATTCCAAAGTTCGGTCTTAAATCTTAAGTAGTCTTTTGCTCACACAA
GGCGTCTGCATAGAGTGAGACCATCTCCGACGGAGATCTGAGAGATTTCTACTCGAGGAT
CCAAAGCCAATTTCTTATTAAATTCTATAACAGCCGCTCTTGATTCCCTCATAAACTCAG
GAACGTTCTCTTCTTCCTCGACCACAAAACTAAACCACAAGGTGTTGTCGAATGCAATGA
TTCCTCCAACCTTCACCAATTTCAGAAATCTCTCAAGGAAGTTCACGTAGTTTGGCTTGT
CAGCGTCAGCAAATATGAAATCAAACTCCTGATTCTTGTCGTTAACCAATTTGTCTAAGA
CCTCCAGACCATCGCAATAGATGAAATTGATCTTGTGATCAACACCTGCTTTCTTCAGAA
ACTCTAATCCCACTTCATAGGCTTCCTTGTC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2AH47JQ 685 0 0
GATCATCAATCAAGCACACAAGTATTTATTGAAGCATAACAGTTTTATTCCAAACTTCGG
TCTTAAATCTTAAGTAGTCTTTTGCTCACACAAGGCGTCTGCATAGAGTGAGACCGTCTC
CAACGGAGATCTGAGAGATTTCTACTCGAGGATCCAAAGCCAATTTCTTATTAAATTCTA
TAACAGCCGCTCTTGATTCCCTCATAAACTCAGGAACATTCTCTTCTTCCTCAACCACAA
AACTAAACCACAAAGTGTTGTCGAATGCAATGATTCCTCCAACCTTCACCAATTTCAGAA
ATCTCTCAAGGAAGTTCACGTAGTTTGGCTTGTCAGCGTCAGCAAATATGAAATCAAACT
CCTGATT***GTCGTTAACCAATTTGTCTAAAACCTCCAGACCATCGCAATAGATGAAAT
TGATCTTGTGATCAACACCTGCTTTCTTCAGAAACTCTAATCCCACTTCATAGGCTTCCT
TGTCAATATCTATTGCAGTAATGCGACCATCTTCAGGCAAAGCAAGGGCCGTGGTGAGAA
GAGAGTAACCAGTGAAAACACCAAGCTCAAGAGTGTTCTTAGCGTTTATGATTTTTAAAA
GCATCGATAGAAAAATGCCCTCATCAACTGGAATAACCATTTCGATTAAGTTGCCAAATT
TCTCTTCTGTGACTTTCCGAAGCTC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2CA12JQ 647 0 0
GAAGCATAACAGTTTTATTCCAAAGTTCGGTCTTAAATCTTAAGTAGTCTTTTGCTCACA
CAAGGCGTCTGCATAGAGTGAGACCATCTCCAACGGAGATCTGAGAGATTTCTACTCGAG
GATCCAAAGCCAATTTCTTATTAAATTCTATAACAGCCGCTCTTGATTCCCTCATAAACT
CAGGAACGTTCTCTTCTTCCTCGACCACAAAACTAAACCACAAGGTGTTGTCGAATGCAA
TGATTCCTCCAATCTTCACCAATTTCAAAAATCTCTCAAGGAAGTTCACGTAGTTTGGCT
TGTCAGCGTCAGCAAATATGAAATCAAACTCCTGATT***GTCGTTAACCAATTTGTCTA
AAACCTCCAAACCATCGCAATAAATGAAATTGATCTTGTGATCAACACCTGCTTTCTTCA
AAAACTCTAATCCCACTTCATAGGCTTCCTTGTCAATATCTATTGCAGTAATGCGACCAT
CTTCAGGCAAAGCAAGGGCCGTGGTGAGAAGAGAGTAACCAGTGAAAACACCAAGCTCAA
GAGTGTTCTTAGCGTTTATGATTTTTAAAAGCATCGATAGAAAAATGCCCTCATCAACTG
GAATAACCATTTCGATTAAGTTGCCAAATTTCTCTTCTGTGACTTTC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2BB19JQ 862 0 0
TGAGT
GATCATCAATCAAGCACACAAGTATTTATTGAAGCATAACAGTTTTATTCCAAACTTCGG
TCTTAAATCTTAAGTAGTCTTTTGCTCACACAAGGCGTCTGCATAGAGTGAGACCATCTC
CAACGGAGATCTGAGAGATTTCTACTCGAGGATCCAAAGCCAATTTCTTATTAAATTCTA
TAACAGCCGCTCCTGATTCCCTCATAAACTCAGGAACATTCTCTTCTTCCTCAACCACAA
AACTAAACCACAAAGTGTTGTCGAATGCAATGATTCCTCCAACCTTCACCAATTTCAGAA
ATCTCTCAAGGAAGTTCACGTAGTTTGGCTTGTCAGCGTCAGCAAATATGAAATCAAACT
CCTGATT***GTCGTTAACCAATTTGTCTAAGACCTCCAGACCATCGCAATAGATGAAAT
TGATCTTGTGATCAACACCTGCTTTCTTCAGAAACTCTAATCCCACTTCATAGGCTTCCT
TGTCAATATCTATTGCAGTAATGCGACCATCTTCGGGCAAAGCAAGGGCCGTGGTGAGAA
GAGAGTAACCAGTGAAAACACCAAGCTCAAGAGTGTTCTTAGCGTTTATGATTTTTAAAA
GCATCGATAGAAAAATGCCCTCATCAACTGGAATAACCATTTCGATTAAGTTGCCAAATT
TCTCTTCTGTGACTTTCCGAAGCTCCTTGAGCAGCTCATGTTCTCTTGGATACGCTGACG
TTTCCAAGATATACTGTCTCAGAGCTTCGCTCTTGAGGATCCCTTTGGGAGGTAGTTCAT
CCGCCATCTCTCAGTCTGGCAATTGTGAGGAGTATTGAGGTGTCTTTGTAATAAAGAGAG
ATGTTATACTTT
GGTCA

QA 6 857 6 857
DS 

RD RR2GS60TF 568 0 0
ACCAATTTCAGAAATCTCTCAAGGAAGTTCACGTAGTTTGGCTTGTCAGCGTCAGCAAAT
ATGAAATCAAACTCCTGATTCTTGTCGTTAACCAATTTGTCTAAGACCTCCAGACCATCG
CAATAGATGAAATTGATCTTGTGATCAACACCTGCTTTCTTCAGAAACTCTAATCCCACT
TCATAGGCTTCCTTGTCAATATCTATTGCAGTAATGCGACCATCTTCAGGCAAAGCAAGG
GCCGTGGTGAGAAGAGAGTAACCAGTGAAAACACCAAGCTCAAGAGTGTTCTTAGCGTTT
ATGATTTTTAAAAGCATCGATAGAAAAATGCCCTCATCAACTGGAATAACCATTTCGATT
AAGTTGCCAAATTTCTCTTCTGTGACTTTCCGAAGCTCCTTGAGCAGCTCATGTTCTCTT
GGATACGCTGACGTTTCCAAGATATACTGTCTCAGAGCTTCGCTCTTGAGGATCCCTTTG
GGAGGTAGTTCATCCGCCATCTCTCAGTCTGGCGATTGTGAGGAGTATTGAGGTGTCTTT
GTAATAAAGAGAGATGTTATACTTT
CCC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2F378TF 773 0 0
TTGCTCACACAAGGCGTCTGCATAGAGTGAGACCATCTCCAACGGAGATCTGAGAGATTT
CTACTCGAGGATCCAAAGCCAATTTCTTATTAAATTCTATAACAGCCGCTCTTGATTCCC
TCATAAACTCAGGAACGTTCTCTTCTTCCTCGACCACAAAACTAAACCACAAGGTGTTGT
CGAATGCAATGATTCCTCCAACCTTCACCAATTTCAGAAATCTCTCAAGGAAGTTCACGT
AGTTTGGCTTGTCAGCGTCAGCAAATATGAAATCAAACTCCTGATT***GTCGTTAACCA
ATTTGTCTAAGACCTCCAGACCATCGCAATAGATGAAATTGATCTTGTGATCAACACCTG
CTTTCTTCAGAAACTCTAATCCAGCTTCATAGGCTTCCTTGTAAATATCTATTGCAGTAA
TGCGACCATCTTCAGGCAAAGCAAGGGCCGTGGTGAGAAGAGAGTAACCAGTGAAAACAC
CAAGCTCAAGAGTGTTCTTAGCGTTTATGATTTTTAAAAGCATCGATAGAAAAATGCCCT
CATCAACTGGAATAACCATTTCGATTAAGTTGCCAAATTTCTCTTCTGTGACTTTCCGAA
GCTCCTTGAGCAGCTCATGTTCTCTTGGATACGCTGACGTTTCCAAGATATACTGTCTCA
GAGCTTCGCTCTTGAGGATCCCTTTGGGAGGTAGTTCATCCGCCATCTCTCAGTCTGGCG
ATTGTGAGGAGTATTGAGGTGTCTTTGTAATAAAGAGAGATGTTATACTTT
CC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2CA12TF 738 0 0
GACCATCTCCAACGGAGATCTGAGAGATTTCTACTCGAGGATCCAAAGCCAATTTCTTAT
TAAATTCTATAACAGCCGCTCTTGATTCCCTCATAAACTCAGGAACGTTCTCTTCTTCCT
CGACCACAAAACTAAACCACAAGGTGTTGTCGAATGCAATGATTCCTCCAATCTTCACCA
ATTTCAGAAATCTCTCAAGGAAGTTCACGTAGTTTGGCTTGTCAGCGTCAGCAAATATGA
AATCAAACTCCTGATT***GTCGTTAACCAATTTGTCTAAGACCTCCAGACCATCGCAAT
AGATGAAATTGATCTTGTGATCAACACCTGCTTTCTTCAGAAACTCTAATCCCACTTCAT
AGGCTTCCTTGTCAATATCTATTGCAGTAATGCGACCATCTTCAGGCAAAGCAAGGGCCG
TGGTGAGAAGAGAGTAACCAGTGAAAACACCAAGCTCAAGAGTGTTCTTAGCGTTTATGA
TTTTTAAAAGCATCGATAGAAAAATGCCCTCATCAACTGGAATAACCATTTCGATTAAGT
TGCCAAATTTCTCTTCTGTGACTTTCCGAAGCTCCTTGAGCAGCTCATGTTCTCTTGGAT
ACGCTGACGTTTCCAAGATATACTGTCTCAGAGCTCCGCTCTTGAGGATCCCTTTGGGAG
GTAGTTCATCCGCCATCTCTCAGTCTGGCGATTGTGAGGAGTATTGAGGTGTCTTTGTAA
TAAAGAGAGATGTTAT
CC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2AH47TF 782 0 0
TCTTAAGTAGTCTTT*GCTCACACAAGGCGTCTGCATAGAGTGAGACCGTCTCCAACGGA
GATCTGAGAGATTTCTACTCGAGGATCCAAAGCCAATTTCTTATTAAATTCTATAACAGC
CGCTCTTGATTCCCTCATAAACTCAGGAACATTCTCTTCTTCCTCAACCACAAAACTAAA
CCACAAAGTGTTGTCGAATGCAATGATTCCTCCAACCTTCACCAATTTCAGAAATCTCTC
AAGGAAGTTCACGTAGTTTGGCTTGTCAGCGTCAGCAAATATGAAATCAAACTCCTGATT
***GTCGTTAACCAATTTGTCTAAGACCTCCAGACCATCGCAATAGATGAAATTGATCTT
GTGATCAACACCTGCTTTCTTCAGAAACTCTAATCCCACTTCATAGGCTTCCTTGTCAAT
ATCTATTGCAGTAATGCGACCATCTTCAGGCAAAGCAAGGGCCGTGGTGAGAAGAGAGTA
ACCAGTGAAAACACCAAGCTCAAGAGTGTTCTTAGCGTTTATGATTTTTAAAAGCATCGA
TAGAAAAATGCCCTCATCAACTGGAATAACCATTTCGATTAAGTTGCCAAATTTCTCTTC
TGTGACTTTCCGAAGCTCCTTGAGCAGCTCATGTTCTCTTGGATACGCTGACGTTTCCAA
GATATACTGTCTCAGAGCTTCGCTCTTGAGGATCCCTTTGGGAGGTAGTTCATCCGCCAT
CTCTCAGTCTGGCGATTGTGAGGAGTATTGAGGTGTCTTTGTAATAAAGAGAGATGTTAT
CC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2F779TF 431 0 0
GTGATCAACACCTGCTTTCTTCAGAAACTCTAATCCCACTTCATAGGCTTCCTTGTCAAT
ATCTATTGCAGTAATGCGACCATCTTCAGGCAAAGCAAGGGCCGTGGTGAGAAGAGAGTA
ACCAGTGAAAACACCAAGCTCAAGAGTGTTCTTAGCGTTTATGATTTTTAAAAGCATCGA
TAGAAAAATGCCCTCATCAACTGGAATAACCATTTCGATTAAGTTGCCAAATTTCTCTTC
TGTGACTTTCCGAAGCTCCTTGAGCAGCTCATGTTCTCTTGGATACGCTGACGTTTCCAA
GATATACTGTCTCAGAGCTTCGCTCTTGAGGATCCCTTTGGGAGGTAGTTCATCCGCCAT
CTCCCAGTCTGGTGATTGTGAGGAGTATTGAGGTGTCTTTGTAATAAAGAGAGATGTTAT
ACTTTGGTCCC

QA 1 431 1 431
DS 



AS 2 13

CO CL344Contig1 1075 5 9 U
GGGCTTAACATTTCTTGGTCTTGAAGCAGAGTAAAAAAAAAAGCTTGGGCTAAAAAGATG
GCGTCTTTGGGTGTGTCGGAAATGCTTGGTACGCCCCTTAACTTCAGGGCAGTGTCAAGA
CCGTCTGCTCCATTGGCGTCAAGTCCCGCCACGTTCAAGACAGTTGCTCTGTTCTCCAAG
AAGAAGCCAGCTCCTCCTCCAAAGGCCAAGACCGTCTCTGCTGCCAACGACGAGCTCGCC
AAGTGGTATGGTCCTGACAGGAGAATTTTCTTGCCGGATGGTCTTTTGGACAGATCAGAA
GTCCCAGAGTACTTGAACGGTGAAGTTGCTGGAGACTATGGCTATGACCCATTTGGTCTT
GGCAAGAAACCTGAGAACTTTGCTAAATACCAAGCCTTTGAACTGATCCACGCGCGATGG
GCTATGTTGGGAGCAGCTGGTTGCATCATCCCTGAAGCCTTAAACAAATATGGCGCTAAC
TGTGGCCCTGAAGCCGTCTGGTTTAAGACTGGTGCTCTGCTTCTTGATGGAAACACATTG
AGCTACTTTGGCAAGAACATCCCAATCAACCTTGTTCTCGCTGTAGTTGCTGAGGTTGTT
CTCCTTGGTGGAGCTGAGTACTACCGAATCATCAATGGATTGGACTTCGAAGACAAGCTT
CACCCAGGAGGTCCATTTGATCCTTTGGGACTTGCTAAAGACCCTGAACAAGCAGCTCTT
CTCAAGGTTAAAGAGATCAAGAACGGGAGATTAGCCATGTTTTCCATGTTCGCTTTCTTC
ATCCAAGCTTATGTTACCGGAGAAGGTCCTGTTGAGAACCTTTCAAAGCATCTAAGTGAT
CCTTTCGGAAACAATTTGCTTACCGTCATCGCTGGAACTGCTGAGAGAGCTCCCACTCTC
TAAAGACATTTCACATTTTAAGCAGCTTCGAAGATGCTTTGTACACTTTGTTTGATGAGA
GTTTCTGTTGACATTGTGAAAAAAAACTTCCATCTGCATCTTCTCGATATATTCCGATGG
TACTTAATTATTGCTTCTAATGGATAACCATCTGATGGTGCATTCGCGTTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG71TF U 1
AF RR2DX23TF U 146
AF RR2DG21TF U 27
AF RR2DX23JQ C 516
AF RR2EG71JQ C 516
BS 1 606 RR2EG71TF
BS 607 607 RR2DX23TF
BS 608 634 RR2EG71TF
BS 635 635 RR2DX23TF
BS 636 666 RR2EG71TF
BS 667 831 RR2DX23JQ
BS 832 832 RR2EG71JQ
BS 833 986 RR2DX23JQ
BS 987 1075 RR2EG71JQ

RD RR2EG71TF 666 0 0
GGGCTTAACATTTCTTGGTCTTGAAGCAGAGTAAAAAAAAAAGCTTGGGCTAAAAAGATG
GCGTCTTTGGGTGTGTCGGAAATGCTTGGTACGCCCCTTAACTTCAGGGCAGTGTCAAGA
CCGTCTGCTCCATTGGCGTCAAGTCCCGCCACGTTCAAGACAGTTGCTCTGTTCTCCAAG
AAGAAGCCAGCTCCTCCTCCAAAGGCCAAGACCGTCTCTGCTGCCAACGACGAGCTCGCC
AAGTGGTATGGTCCTGACAGGAGAATTTTCTTGCCGGATGGTCTTTTGGACAGATCAGAA
GTCCCAGAGTACTTGAACGGTGAAGTTGCTGGAGACTATGGCTATGACCCATTTGGTCTT
GGCAAGAAACCTGAGAACTTTGCTAAATACCAAGCCTTTGAACTGATCCACGCGCGATGG
GCTATGTTGGGAGCAGCTGGTTGCATCATCCCTGAAGCCTTAAACAAATATGGCGCTAAC
TGTGGCCCTGAAGCCGTCTGGTTTAAGACTGGTGCTCTGCTTCTTGATGGAAACACATTG
AGCTACTTTGGCAAGAACATCCCAATCAACCTTGTTCTCGCTGTAGTTGCTGAGGTTGTT
CTCCTTAGTGGAGCTGAGTACTACCGAATCATCAGTGGATTGGACTTCGAAGACAAGCTT
CACCCA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2DX23TF 518 0 0
G
CGCCACGTTCAAGACAGTTGCTCTGTTCTCCAAGAAGAAGCCAGCTCCTCCTCCAAAGGC
CAAGACCGTCTCTGCTGCCAACGACGAGCTCGCCAAGTGGTATGGTCCTGACAGGAGAAT
TTTCTTGCCGGATTGTCTTTTGGACAGATCAGAAGTCCCAGAGTACTTGAACGGTAAAGT
TGCTGGAGACTATGGCTATGACCCATTTGGTCTTGGCAAGAAACCTGAGAACTTTGCTAA
ATACCAAGCCTTTGAACTGATCCACGCGCGATGGGCTATGTTGGGAGCAGCTGGTTGCAT
CATCCCTGAAGCCTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCCGAAGCCGTCTGGTTTAA
GACTGGTGCTCTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAGCTACTTTGGCAAGAACATCCCAAT
CAACCTTGTTCTCGCTGTAGTTGCTGAGGTTGTTCTCCTTGGTGGAGCTGAGTACTACCG
AATCATCAATGGATTGGACTTCGAAGACAAGCTTCAC

QA 2 518 2 518
DS 

RD RR2DG21TF 640 0 0
GGAGTA
AAAAAAAAAAGCTTGGGCTAAAAAGATGGCGTCTTTGGGTGTGTCGGAAATGCTTGGTAC
GCCCCTTAACTTCAGGGCAGTGTCAAGACCGTCTGCTCCATTGGCGTCAAGTCCCGCCAC
GTTCAAGACAGTTGCTCTGTTCTCCAAGAAGAAGCCAGCTCCTCCTCCAAAGACCAAGAC
CGTCTCTGCTGCCAACGACGAGCTCGCCAAGTGGTATGGTCCTGACAGGAGAATTTTCTT
GCCGGATGGTCTTTTGGACAGATCAGAAGTCCCAGAGTACTTGAACGGTGAAGTTGCTGG
AGACTATGGCTATGACCCATTTGGTCTTGGCAAGAAACCTGAGAACTTTGCTAAATACCA
AGCCTTTGAACTGATCCACGCGCGATGGGCTATGTTGGGAGCAGCTGGTTGCATCATCCC
TGAAGCCTTAAACAAATACGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCCGTCTGGTTTAAGACTGG
TGCTCTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAGCTACTTTGGCAAGAACATCCCAATCAACCC
TGTTCTCGCTGTAGTTGCTGAGGTTGTTCTCCTTGGTGGAGCTGAGTACTACCGAATCAT
CAATGGATTGGACTTCGAAGACAATCTTCACCCA

QA 7 640 7 640
DS 

RD RR2DX23JQ 471 0 0
TCTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAGCTACTTTGGCAAGAACATCCCAATCAACCTTGT
TCTCGCTGTAGTTGCTGAGGTTGTTCTCCTTGGTGGAGCTGAGTACTACCGAATCATCAA
TGGATTGGACTTCGAAGACAAGCTTCACCCAGGAGGTCCATTTGATCCTTTGGGACTTGC
TAAAGACCCTGAACAAGCAGCTCTTCTCAAGGTTAAAGAGATCAAGAACGGGAGATTAGC
CATGTTTTCCATGTTCGCTTTCTTCATCCAAGCTTATGTTACCGGAGAAGGTCCTGTTGA
GAACCTTTCAAAGCATTTAAGTGATCCTTTCGGAAACAATTTGCTTACCGTCATCGCTGG
AACTGCTGAGAGAGCTCCCACTCTCTAAAGACATTTCACATTTTAAGCAGCTTCGAAGAT
GCTTTGTACACTTTGTTTGATGAGAGTTTCTGTTGACATTGTGAAAAAAAA

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR2EG71JQ 560 0 0
TCTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAGCTACTTTGGCAAGAACATCCCAATCAACCTTGT
TCTCGCTGTAGTTGCTGAGGTTGTTCTCCTTAGTGGAGCTGAGTACTACCGAATCATCAG
TGGATTGGACTTCGAAGACAAGCTTCACCCAGGAGGTCCATTTGATCCTTTGGGACTTGC
TAAAGACCCTGAACAAGCAGCTCTTCTCAAGGTTAAAGAGATCAAGAACGGGAGATTAGC
CATGTTTTCCATGTTCGCTTTCTTCATCCAAGCTTATGTTACCGGAGAAGGTCCTGTTGA
GAACCTTTCAAAGCATCTAAGTGATCCTTTCGGAAACAATTTGCTTACCGTCATCGCTGG
AACTGCTGAGAGAGCTCCCACTCTCTAAAGACATTTCACATTTTAAGCAGCTTCGAAGAT
GCTTTGTACACTTTGTTTGATGAGAGTTTCTGTTGACATTGTGAAAAAAAACTTCCATCT
GCATCTTCTCGATATATTCCGATGGTACTTAATTATTGCTTCTAATGGATAACCATCTGA
TGGTGCATTCGCGTTTTGGC

QA 1 560 1 560
DS 



CO CL344Contig2 1033 8 25 U
GGACTTAACTTAGCATTTCCTTGTCTTGAAATTCTGCGCTAAGATGGCATCTTTGGGTGT
GTCGGAAATGCTTGGTACGCCCCTTAACTTCAGGGCAGTGACGAGATCGTCTGCTCCATT
GGCATCCAACCCCGCCACGTTCAAGACAGTTGCTCTGTTCTCCAAGAAGAAGCCAGCTCC
TCCTCCCAAGGCCAAGACCGTCTCTGCTGCCAACGACGAGCTCTCCAAGTGGTATGGTCC
TGACAGGAGAATCTTCTTGCCTGATGGTCTTTTGGACAGATCAGAGATCCCAGAGTACTT
AAACGGTGAAGTTGCTGGAGATTATGGTTATGACCCTTTTGGACTTGGAAAGAAGCCTGA
GAACTTTGCTAAATACCAAGCCTTTGAACTGATCCACGCCAGATGGGCTATGTTGGGAGC
AGCTGGTTGCATCATCCCTGAAGCCTTAAACAAATATGGCGCTGACTGTGGCCCTGAAGC
CGTCTGGTTTAAGACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAGCTACTTTGGCAA
GAACATCCCAATCAACCTTGTTCTCGCTGTAGTTGCTGAGGTTGTTCTCCTTGGTGGAGC
TGAGTACTACCGAATCACCAATGGATTGGACTTCGAGGACAAGCTTCACCCAGGAGGTCC
ATTTGATCCTTTGGGACTTGCTAAAGACCCTGAACAAGGAGCTCTTCTCAAGGTTAAGGA
GATCAAGAACGGGAGACTAGCCATGTTTTCCATGTTCGCTTTCTTCATCCAAGCTTATGT
TACCGGAGAAGGTCCTGTTGAGAACCTTTCAAAGCATTTAAGTGATCCTTTTGGCAACAA
TTTGCTTACCGTCATCGCTGGAACTGCTGAGAGAGCTCCCACTCTCTAAGTGGTTTCTAG
TGTTAATGATCTTTCAAACTGCTTTGTACACTTGGTTTGATGAGAGTTTCTATTGACATT
GTGATAAAACAATTATCTTTTTATTCATTCCAACAGTGGATATATATTTGGGCTTAATGA
AGGAATTTGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 10 40 40 10 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G670TF U 1
AF RR2DB88TF U 5
AF RR2BZ77TF U 5
AF RR2DZ11TF U 283
AF RR2DB88JQ C 276
AF RR2BZ77JQ C 396
AF RR2A723TF U 457
AF RR2DZ11JQ C 872
BS 1 124 RR2G670TF
BS 125 125 RR2BZ77TF
BS 126 620 RR2G670TF
BS 621 621 RR2BZ77TF
BS 622 656 RR2G670TF
BS 657 657 RR2DZ11TF
BS 658 689 RR2G670TF
BS 690 690 RR2DB88TF
BS 691 698 RR2BZ77TF
BS 699 699 RR2DZ11TF
BS 700 712 RR2BZ77TF
BS 713 713 RR2DZ11TF
BS 714 718 RR2BZ77TF
BS 719 719 RR2DZ11TF
BS 720 728 RR2BZ77TF
BS 729 729 RR2A723TF
BS 730 748 RR2BZ77TF
BS 749 817 RR2A723TF
BS 818 818 RR2DB88JQ
BS 819 849 RR2A723TF
BS 850 850 RR2DB88JQ
BS 851 979 RR2A723TF
BS 980 980 RR2BZ77JQ
BS 981 1011 RR2A723TF
BS 1012 1033 RR2DZ11JQ

RD RR2G670TF 693 0 0
GGACTTAACTTAGCATTTCCTTGTCTTGAAATTCTGCGCTAAGATGGCATCTTTGGGTGT
GTCGGAAATGCTTGGTACGCCCCTTAACTTCAGGGCAGTGACGAGATCGTCTGCTCCATT
GGCACCCAACCCCGCCACGTTCAAGACAGTTGCTCTGTTCTCCAAGAAGAAGCCAGCTCC
TCCTCCCAAGGCCAAGACCGTCTCTGCTGCCAACGACGAGCTCTCCAAGTGGTATGGTCC
TGACAGGAGAATCTTCTTGCCTGATGGTCTTTTGGACAGATCAGAGATCCCAGAGTACTT
AAACGGTGAAGTTGCTGGAGATTATGGTTATGACCCTTTTGGACTTGGAAAGAAGCCTGA
GAACTTTGCTAAATACCAAGCCTTTGAACTGATCCACGCCAGATGGGCTATGTTGGGAGC
AGCTGGTTGCATCATCCCTGAAGCCTTAAACAAATATGGCGCTGACTGTGGCCCTGAAGC
CGTCTGGTTTAAGACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAGCTACTTTGGCAA
GAACATCCCAATCAACCTTGTTCTCGCTGTAGTTGCTGAGGTTGTTCTCCTTGGTGGAGC
TGAGTACTACCGAATCACCAGTGGATTGGACTTCGAGGACAAGCTTCACCCAGGAG*TCC
ATTTGATCCTTTGGGACTTGCTAAAGACC
TGAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2DB88TF 704 0 0
GG
AACTTAGCATTTCCTTGTCTTGAAATTCTGCGCTAAGATGGCATCTTTGGGTGTGTCGGA
AATGCTTGGTACGCCCCTTAACTTCAGGGCAGTGACGAGATCGTCTGCTCCATTGGCATC
CAACCCCGCCACGTTCAAGACGGTTGCTCTGTTCTCCAAGAAGAAGCCAGCTCCTCCTCC
CAAGGCCAAGACCGTCTCTGCTGCCAACGACGAGCTCTCCAAGTGGTATGGTCCTGACAG
GAGAATCTTCTTGCCTGATGGTCTTTTGGACAGATCAGAGATCCCAGAGTACTTAAACGG
TGAAGTTGCTGGAGATTATGGTTATGACCCTTTTGGACTTGGAAAGAAGCCTGAGAACTT
TGCTAAATACCAAGCCTTTGAACTGATCCACGCCAGATGGGCTATGTTGGGAGCAGCTGG
TTGCATCATCCCTGAAGCCTTAAACAAATATGGCGCTGACTGTGGCCCTGAAGCCGTCTG
GTTTAAGACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAGCTACTTTGGCAAGAACAT
CCCAATCAACCTTGTTCTCGCTGTAGTTGCTGAGGTTGTTCTCCTTGGTGGAGCTGAGTA
CTACCGAATCACCAATGGATTGGACTTCGAGGACAAGCTTCACCCAGGAG*TCCATTTGA
TCCTTTGGGACTTGCTAAAGACCCTGAACAAG*AGCTCTTCT

QA 3 704 3 704
DS 

RD RR2BZ77TF 745 0 0
GG
AACTTAGCATTTCCTTGTCTTGAAATTCTGCGCTAAGATGGCATCTTTGGGTGTGTCGGA
AATGCTTGGTACGCCCCTTAACTTCAGGGCAGTGACGAGATCGTCTGCTCCATTGGCATC
CAACCCCGCCACGTTCAAGACAGTTGCTCTGTTCTCCAAGAAGAAGCCAGCTCCTCCTCC
CAAGGCCAAGACCGTCTCTGCTGCCAACGACGAGCTCTCCAAGTGGTATGGTCCTGACAG
GAGAATCTTCTTGCCTGATGGTCTTTTGGACAGATCAGAGATCCCAGAGTACTTAAACGG
TGAAGTTGCTGGAGATTATGGTTATGACCCTTTTGGACTTGGAAAGAAGCCTGAGAACTT
TGCTAAATACCAAGCCTTTGAACTGATCCACGCCAGATGGGCTATGTTGGGAGCAGCTGG
TTGCATCATCCCTGAAGCCTTAAACAAATATGGCGCTGACTGTGGCCCTGAAGCCGTCTG
GTTTAAGACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAGCTACTTTGGCAAGAACAT
CCCAATCAACCTTGTTCTCGCTGTAGTTGCTGAGGTTGTTCTCCTTGGTGGAGCTGAGTA
CTACCGAATCACCAATGGATTGGACTTCGAGGACAAGCTTCACCCAGGAG*TCCATTTGA
TCCTTTGGGACTTGCTAAAGACC*TGAACAAG*AGCTCTTCTCAAG*TTAAG*AGATCAA
GA*CGGGAGACTAGCCATGTTT
C

QA 3 744 3 744
DS 

RD RR2DZ11TF 440 0 0
G
GAGATCCCAGAGTACTTAAACGGTGAAGTTGCTGGAGATTATGGTTATGACCCTTTTGGA
CTTGGAAAGAAGCCTGAGAACTTTGCTAAATACCAAGCCTTTGAACTGATCCACGCCAGA
TGGGCTATGTTGGGAGCAGCTGGTTGCATCATCCCTGAAGCCTTAAACAAATATGGCGCT
AACTGTGGCCCTGAAGCCGTCTGGTTTAAGACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACA
TTGAGCTACTTTGGCAAGAACATCCCAATCAACCTTGTCCTCGCTGTAGTTGCTGAGGTT
GTTCTCCTTGGTGGAGCTGAGTACTACCGAATAACCAATGGATTGGACTTTGAGGACAAG
CTTCACCCAGGAGGTCCATTTGATCCATTGGGACTTGCTAAAGACCCTGAACAAGGAGCT
CTTCTCAAGGTTAAGGAGA

QA 2 440 2 440
DS 

RD RR2DB88JQ 700 0 0
ACAGATCAGAGATCCCAGAGTACTTAAACGGTGAAGTTGCTGGAGATTATGGTTATGACC
CTTTTGGACTTGGAAAGAAGCCTGAGAACTTTGCTAAATACCAAGCCTTTGAACTGATCC
ACGCCAGATGGGCTATGTTGGGAGCAGCTGGTTGCATCATCCCTGAAGCCTTAAACAAAT
ATGGCGCTGACTGTGGCCCTGAAGCCGTCTGGTTTAAGACTGGTGCTTTGCTTCTTGATG
GAAACACATTGAGCTACTTTGGCAAGAACATCCCAATCAACCTTGTTCTCGCTGTAGTTG
CTGAGGTTGTTTTCCTTGGTGGAGCTGAGTACTACCGAATCACCAATGGATTGGACTTCG
AGGACAAGCTTCACCCAGGAGGTCCATTTGATCCTTTGGGACTTGCTAAAGACCCTGAAC
AAGGAGCTTTTTTCAAGGTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGACTAGCCATGTTTTCCATGT
TCGCTTTCTTCATCCAAGCTTATGTTACCGGAGAAGGTCCTGTTGAGAACCTTTCAAAGC
ATTTAAGTGATCCTTTTGGCAACAATTTGCTTACCGTCATCGCTGGAACTGCTGAGAGAG
CTCCCACTCTCTAAGTGGTTTCTAGCGTTAATGATCTTTCAAACTGCTTTGTACACTTGG
TTTGATGAGAGTTTCTATTGACATTGTGATAGAACAATTA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2BZ77JQ 604 0 0
ACGCCAGATGGGCTATGTTGGGAGCAGCTGGTTGCATCATCCCTGAAGCCTTAAACAAAT
ATGGCGCTGACTGTGGCCCTGAAGCCGTTTGGTTTAAGACTGGTGCTTTGCTTCTTGATG
GAAACACATTGAGCTACTTTGGCAAGAACATCCCAATCAACCTTGTTCTCGCTGTAGTTG
CTGAGGTTGTTTTCCTTGGTGGAGGTGAGTACTACCGAATCACCAATGGATTGGACTTCG
AGGACAAGCTTCACCCAGGAGGTCCATTTGATCCTTTGGGACTTGCTAAAGACCCTGAAC
AAGGAGCTTTTTTCAAGGTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGACTAGCCATGTTTTCCATGT
TCGCTTTTTTCATCCAAGCTTATGTTACCGGAGAAGGTCCTGTTGAGAACCTTTCAAAGC
ATTTAAGTGATCCTTTTGGCAACAATTTGCTTACCGTCATCGCTGGAACTGCTGAGAGAG
CTCCCACTCTTTAAGTGGTTTTTAGTGTTAATGATCTTTCAAACTGCTTTGTACACTCGG
TTTGATGAGAGTTTCTATTGACATTGTGATAAAACAATTATTTTTTTATTCATTCCAACA
GTGG

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2A723TF 564 0 0
G
GGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCCGTCTGGTTTAAGACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGA
AACACATTGAGCTACTTTGGCAAGAACATCCCAATCAACCTTGTCCTCGCTGTAGTTGCT
GAGGTTGTTCTCCTTGGTGGAGCTGAGTACTACCGAATAACCAATGGATTGGACTTTGAG
GACAAGCTTCACCCAGGAGGTCCATTTGATCCATTGGGACTTGCTAAAGACCCTGAACAA
GGAGCTCTTCTCAAGGTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGACTAGCCATGTTTTCCATGTTC
GCTTTCTTCATCCAAGCTTATGTTACCGGAGAAGGTCCTGTTGAGAACCTTTCAAAGCAT
CTAAGTGATCCTTTTGGCAACAATTTGCTTACTGTCATCGCTGGAACTGCTGAGAGAGCT
CCCACTCTCTAAGTGGTTTCTAGTGTTAATGATCTTTCAAACTGCTTTGTACACTTGGTT
TGATGAGAGTTTCTATTGACATTGTGATAAAACAATTATCTTCTTATTCATTCCAACAGT
GGATATATATTTGG
ACGCTAAAC

QA 2 555 2 555
DS 

RD RR2DZ11JQ 162 0 0
AGAGCTCCCACTCTCTAAGTGGTTTCTAGTGTTAATGATCTTTCAAACTGCTTTGTACAC
TTGGTTTGATGAGAGTTTCTATTGACATTGTGATAAAACAATTATCTTTTTATTCATTCC
AACAGTGGATATATATTTGGGCTTAATGAAGGAATTTGCTTC

QA 1 162 1 162
DS 



AS 3 7

CO CL345Contig1 940 3 8 U
GGCAAAATATGAAGCATACATATATATGTCTATCTATACAAAAACCAATTCAAGGGGCAA
ACATTAGAATGATAATGATGATAGGACAATAAAAGCAAAAGGCAGTACCAATGTACCTAG
TGAGAAAGATGCATTCTCAAGAGAGTTTTTAAAATTTTTTATGAGTTTAGCATTTGAAGC
CGTGGCAAACTGAGAGGACGATAATGAGAATCAAGGCGACAATGATGGCGAGAACTATGA
GTTTTATCTTCATGTTTTGAAGCCACATCTTTCTTCTCATCTGCGTCCCCGTTGATCTGA
AATCTTGTGCCTGTGAGCGTAGATTCTCGGTTTTGTCCACCAGAAGCTCAATCTTCTCAC
CACGGTCAAGAACCTTCTCGATGTTCTCCATCATAACACCCTTAACTTCAGACACTTGCG
CCTTCACCTTAGCGAGCTTGCTAATCTCATCAGGATGATCCATACAATACTGCATGTGCT
CCTTCAGCTTAAACCCAAACTCTTTATTCAAGCTGTTTGCTTGAGCAGTGGCAGCCTTCC
CACCACCATATCTCTTGTTAAAATCCTCCTTCACTCTCTCCAAAAACGCCATCGGAATCT
GCCTCCCAGCAGATTCAACCGCAACCACACAATACGTGAATCCATCTTCGACGAGGTAGT
TGAAGGTGTGGCCGTTGCAGTTGTAAGTGAACTTGTTGTTGGAAGAGGGGAGCTTCTGGA
GGCACTGTGCAGCGATGGATGTGAAGTTGCCTTTGAAATCAGTGAACTCCACCAGGATCA
CCGTCCCTCGAGCCACGAAACTGTAGATCAACGATTGTTGCTGCGCCATTTTTTTTCAAA
CCCTAAATCCTCGATTCGATTCGGCTCGATCCGATCCCACCGACTCTAATCAGAGGATTT
TAATGGTGCTGCTGCTGTCGCGAGAAAACTAGAGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO92JQ U 1
AF RR2GL43JQ U 72
AF RR2GL43TF C 538
BS 1 294 RR2DO92JQ
BS 295 295 RR2GL43JQ
BS 296 491 RR2DO92JQ
BS 492 492 RR2GL43JQ
BS 493 543 RR2DO92JQ
BS 544 544 RR2GL43JQ
BS 545 648 RR2DO92JQ
BS 649 940 RR2GL43TF

RD RR2DO92JQ 648 0 0
GGCAAAATATGAAGCATACATATATATGTCTATCTATACAAAAACCAATTCAAGGGGCAA
ACATTAGAATGATAATGATGATAGGACAATAAAAGCAAAAGGCAGTACCAATGTACCTAG
TGAGAAAGATGCATTCTCAAGAGAGTTTTTAAAATTTTTTATGAGTTTAGCATTTGAAGC
CGTGGCAAACTGAGAGGACGATAATGAGAATCAAGGCGACAATGATGGCGAGAACTATGA
GTTTTATCTTCATGTTTTGAAGCCACATCTTTCTTCTCATCTGCGTCCCCGTTGTTCTGA
AATCTTGTGCCTGTGAGCGTAGATTCTCGGTTTTGTCCACCAGAAGCTCAATCTTCTCAC
CACGGTCAAGAACCTTCTCGATGTTCTCCATCATAACACCCTTAACTTCAGACACTTGCG
CCTTCACCTTAGCGAGCTTGCTAATCTCATCAGGATGATCCATACAATACTGCATGTGCT
CCTTCAGCTTAGACCCAAACTCTTTATTCAAGCTGTTTGCTTGAGCAGTGGCAGCCTTCC
CACTACCATATCTCTTGTTAAAATCCTCCTTCACTCTCTCCAAAAACGCCATCGGAATCT
GCCTCCCAGCAGATTCAACCGCAACCACACAATACGTGAATCCATCTT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2GL43JQ 577 0 0
ATAATGATGATAGGACAATAAAAGCAAAAGGCAGTACCAATGTACCTAGTGAGAAAGATG
CATTCTCAAGAGAGTTTTTAAAATTTTTTATGAGTTTAGCATTTGAAGCCGTGGCAAACT
GAGAGGACGATAATGAGAATCAAGGCGACAATGATGGCGAGAACTATGAGTTTTATCTTC
ATGTTTTGAAGCCACATCTTTCTTCTCATCTGCGTCCCCGTTGATCTGAAATCTTGTGCC
TGTGAGCGTAGATTCTCGGTTTTGTCCACCAGAAGCTCAATCTTCTCACCACGGTCAAGA
ACCTTCTCGATGTTCTCCATCATAACGCCCTTAACTTCAGACACTTGCGCCTTCACCTTA
GCGAGCTTGCTAATCTCATCAGGATGATCCATACAATACTGCATGTGCTCCTTCAGCTTA
AACCCAAACTCTTTATTCAAGCTGTTTGCTTGAGCAGTGGCAGCCTTCCCACCACCATAT
CTCTTGTTAAAATCCTCCTTCACTCTCTCCAAAAACGCCATCGGAATCTGCCTCCCAGCA
GATTCAACCGCAACCACACAATACGTGAATCCATCTT

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2GL43TF 403 0 0
TCCCACCACCATATCTCTTGTTAAAATCCTCCTTCACTCTCTCCAAAAACGCCATCGGAA
TCTGCCTCCCAGCAGATTCAACCGCAACCACACAATACGTGAATCCATCTTCGACGAGGT
AGTTGAAGGTGTGGCCGTTGCAGTTGTAAGTGAACTTGTTGTTGGAAGAGGGGAGCTTCT
GGAGGCACTGTGCAGCGATGGATGTGAAGTTGCCTTTGAAATCAGTGAACTCCACCAGGA
TCACCGTCCCTCGAGCCACGAAACTGTAGATCAACGATTGTTGCTGCGCCATTTTTTTTC
AAACCCTAAATCCTCGATTCGATTCGGCTCGATCCGATCCCACCGACTCTAATCAGAGGA
TTTTAATGGTGCTGCTGCTGTCGCGAGAAAACTAGAGATCTCC

QA 1 403 1 403
DS 



CO CL345Contig2 1147 2 6 U
ATATAAAAAAACAAATGGTAAATAAATATTGAACAAGTCATACTCCAAATTTGCTAGGAA
AATATAACAATACAAATGAAAATTATCTAAGGAATAAAAACTTATAAAAATACAAACTCA
TCTGACATAGCATGTGCACAACATCTTTACTGCTGCTAAAAGACCGGAGACCAGACTCAT
GGTTTCTTTATTCTGCTTATTTTGGATGAGCTTCCACAAAAATAAGTACTACCATGAATG
GATATTCTCATTTGAATTAACGGCTGTGACTGCTTGCATTTCTCCATCAAGCTCACCGAT
CATGTAACCATCACATTTATAATAAACACCATTGCTTATCTTTTTGTCCTTTCAATCCAG
ATTCCCGATTCAAAAGACTTGTAAACATATTTTATGTGTGATCATGTTGGCTCCCCTTTG
ACTTGTAAATATCCCTTGAATTGGTTTTCGGCTATGATATTCTTTGTATATTATGCAAGC
AATATAGCAAAATATGAAGCATACATATATATGTCTATCTATACAAAAACCAATTCAAGG
GGCAAACATTAGAATGATAATGATGATAGGACAATAAAAGCAAAAGGCAGTACCAATGTA
CCGAGTGAGAAAGATCCATTCTCAAGAGAGTTTTTGAATTTTTTTCTGAGTTTAGCATTT
GAAGCCGTGGCAAACTGAGAGGACGATAATGAGAATCAAGGCGACAATGATGGCGAGAAC
TATGAGTTTTATCTTCATGTTTTGAAGCCACATCTTTCTTCTCATCTGCGTCCCCGTTGT
TCTGAAATCTTGTGCCTGTGAACGAAGGTTCTCGGTTTTGTCCACCAGAAGCTCAATCTT
CTCACCACGGTCAAGAACCTTCTCGATGTTCTCCATCATAACACCCTTAACTTCAGACAC
CTGCGCCTTCACCTTAGCAAGCTTGCTAATCTCATCAGGATGATCCATACAATACTGCAT
TTGCTCCTTCAGCTTAGACCTTCAAAAGCAACCAAAAAAACAGAGTCAGTCCAAAAAGAG
TAATGAGAAAGAGAGAGAGAGAAAAAAAAAGAGTACCCAAACTCTTTATTCAAGCTGTTA
GCTTGAGCAGTGGCAGCCTTCCCACCACCATATCTCTTGTTAAAATCCTCCTTCACTCTC
TCCAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM04JQ U 1
AF RR2ED85JQ U 450
BS 1 602 RR2FM04JQ
BS 603 603 RR2ED85JQ
BS 604 615 RR2FM04JQ
BS 616 616 RR2ED85JQ
BS 617 629 RR2FM04JQ
BS 630 1147 RR2ED85JQ

RD RR2FM04JQ 629 0 0
ATATAAAAAAACAAATGGTAAATAAATATTGAACAAGTCATACTCCAAATTTGCTAGGAA
AATATAACAATACAAATGAAAATTATCTAAGGAATAAAAACTTATAAAAATACAAACTCA
TCTGACATAGCATGTGCACAACATCTTTACTGCTGCTAAAAGACCGGAGACCAGACTCAT
GGTTTCTTTATTCTGCTTATTTTGGATGAGCTTCCACAAAAATAAGTACTACCATGAATG
GATATTCTCATTTGAATTAACGGCTGTGACTGCTTGCATTTCTCCATCAAGCTCACCGAT
CATGTAACCATCACATTTATAATAAACACCATTGCTTATCTTTTTGTCCTTTCAATCCAG
ATTCCCGATTCAAAAGACTTGTAAACATATTTTATGTGTGATCATGTTGGCTCCCCTTTG
ACTTGTAAATATCCCTTGAATTGGTTTTCGGCTATGATATTCTTTGTATATTATGCAAGC
AATATAGCAAAATATGAAGCATACATATATATGTCTATCTATACAAAAACCAATTCAAGG
GGCAAACATTAGAATGATAATGATGATAGGACAATAAAAGCAAAAGGCAGTACCAATGTA
CCTAGTGAGAAAGATGCATTCTCAAGAGA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2ED85JQ 698 0 0
C
GCTATGATATTCTTTGTATATTATGCAAGCAATATAGCAAAATATGAAGCATACATATAT
ATGTCTATCTATACAAAAACCAATTCAAGGGGCAAACATTAGAATGATAATGATGATAGG
ACAATAAAAGCAAAAGGCAGTACCAATGTACCGAGTGAGAAAGATCCATTCTCAAGAGAG
TTTTTGAATTTTTTTCTGAGTTTAGCATTTGAAGCCGTGGCAAACTGAGAGGACGATAAT
GAGAATCAAGGCGACAATGATGGCGAGAACTATGAGTTTTATCTTCATGTTTTGAAGCCA
CATCTTTCTTCTCATCTGCGTCCCCGTTGTTCTGAAATCTTGTGCCTGTGAACGAAGGTT
CTCGGTTTTGTCCACCAGAAGCTCAATCTTCTCACCACGGTCAAGAACCTTCTCGATGTT
CTCCATCATAACACCCTTAACTTCAGACACCTGCGCCTTCACCTTAGCAAGCTTGCTAAT
CTCATCAGGATGATCCATACAATACTGCATTTGCTCCTTCAGCTTAGACCTTCAAAAGCA
ACCAAAAAAACAGAGTCAGTCCAAAAAGAGTAATGAGAAAGAGAGAGAGAGAAAAAAAAA
GAGTACCCAAACTCTTTATTCAAGCTGTTAGCTTGAGCAGTGGCAGCCTTCCCACCACCA
TATCTCTTGTTAAAATCCTCCTTCACTCTCTCCAAAA

QA 2 698 2 698
DS 



CO CL345Contig3 824 2 18 U
TAGTTACTTCTTGGCGAGACAAAGCCCATTTAATTTAAAAATCGACCGGATCGAGAGGAT
TTAGGGTTTGTGAAAGAAATGGCGGAGCAGCAGCAATCGTTGATCTACAGCTTCGTGGCA
CGCGGGACGGTGATCCTCGCGGAGTTCACTGATTTCAAAGGAAACTTCACCTCCGTCGCC
GCGCAGTGCCTCCAGAAGCTCCCTTCGTCCAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGACGGT
CACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGCTTCACGTACTGTGTTGTTGCGGTTGATTCT
GCTGGGAGACAGATTCCGATGGCGTTTTTGGAGAGAGTGAAGGAGGATTTTAACAAGAGA
TATGGTGGTGGAAAGGCTGCTACTGCTCACCCTAACAGTTTGAATAAAGAGTTTGGGTCT
AAGCTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCT
AAGGTGAAGGCTCAAGTCTCTGAAGTTAAGGGTGTTATGATGGAAAATATCGAGAAGGTT
CTTGACCGTGGTGAGAAAATTGAGCTTCTGGTAGACAAAACCGAGAACCTTCGCTCTCAG
GCACAAGACTTCAGAACAACGGGGACACAGATGAGAAAGGAAGATGTGGCTTCAGAACAT
GAAAATAAAGCTCATAGTTCTCGCCATCATCGTCGCACTCATTCTTATAATCGTGCTCTC
AGTTTGCCATGGCTTCAAGTGTTAGAAGCACACTAAAAAAAAAATCAAAAACACTCTTTG
AGATCTTTCTCACTCGGTCATCATATTGATTCTAATGTTACCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT92TF U 1
AF RR2BV82JQ C 265
BS 1 308 RR2FT92TF
BS 309 309 RR2BV82JQ
BS 310 389 RR2FT92TF
BS 390 390 RR2BV82JQ
BS 391 428 RR2FT92TF
BS 429 429 RR2BV82JQ
BS 430 447 RR2FT92TF
BS 448 448 RR2BV82JQ
BS 449 478 RR2FT92TF
BS 479 479 RR2BV82JQ
BS 480 572 RR2FT92TF
BS 573 573 RR2BV82JQ
BS 574 664 RR2FT92TF
BS 665 665 RR2BV82JQ
BS 666 666 RR2FT92TF
BS 667 667 RR2BV82JQ
BS 668 702 RR2FT92TF
BS 703 824 RR2BV82JQ

RD RR2FT92TF 702 0 0
TAGTTACTTCTTGGCGAGACAAAGCCCATTTAATTTAAAAATCGACCGGATCGAGAGGAT
TTAGGGTTTGTGAAAGAAATGGCGGAGCAGCAGCAATCGTTGATCTACAGCTTCGTGGCA
CGCGGGACGGTGATCCTCGCGGAGTTCACTGATTTCAAAGGAAACTTCACCTCCGTCGCC
GCGCAGTGCCTCCAGAAGCTCCCTTCGTCCAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGACGGT
CACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGCTTCACGTACTGTGTTGTTGCGGTTGATTCT
GCTGGGAGGCAGATTCCGATGGCGTTTTTGGAGAGAGTGAAGGAGGATTTTAACAAGAGA
TATGGTGGTGGAAAGGCTGCTACTGCTCAGCCTAACAGTTTGAATAAAGAGTTTGGGTCT
AAGCTGAAGGAGCACATGCAGTATTGTGTGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGTT
AAGGTGAAGGCTCAAGTCTCTGAAGTTAAGGGTGTTATGATGGAAAATATCGAGAAGGTT
CTTGACCGTGGTGAGAAAATTGAGCTTCTGGTTGACAAAACCGAGAACCTTCGCTCTCAG
GCACAAGACTTCAGAACAACGGGGACACAGATGAGAAAGGAAGATGTGGCTTCAGAACAT
GAAAGTTAAGCTCATAGTTCTCGCCATCATCGTCGCACTCAT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2BV82JQ 560 0 0
GATGGCTTCACGTACTGTGTTGTTGCGGTTGATTCTGCTGGGAGACAGATTCCGATGGCG
TTTTTGGAGAGAGTGAAGGAGGATTTTAACAAGAGATATGGTGGTGGGAAGGCTGCTACT
GCTCACCCTAACAGTTTGAATAAAGAGTTTGGGTCTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGTAT
TGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTGAAGGCTCAAGTCTCTGAA
GTTAAGGGTGTTATGATGGAAAATATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTGAG
CTTCTGGTAGATAAAACCGAGAACCTTCGCTTTCAGGCACAAGACTTCAGAACAACGGGG
ACACAGATGAGAA*GGAAGATGTGGCTTCAGAACATGAAGATAAAGCTCATAGTTCTCGC
CATCATCGTCGCACTCATTCTTATAATCGTGCTCTCAGTTTGCCATGGCTTCAAGTGTTA
GAAGCACACTAAAAAAAAAATCAAAAACACTCTTTGAGATCTTTCTCACTCGGTCATCAT
ATTGATTCTAATGTTACCGC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 2 13

CO CL346Contig1 734 3 9 U
GGACTTTTCTCTCCCACTCTTTTACAACTCACATTGCATATCCTTTTCTCTATATATTAC
TTCACCTAAACCACTATTCACAACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCACAAGCC
TTCCTTTTGCTCACATTGTCTATGGTTTTAGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATG
ATGGCTCCTTCTGGCTCCATGGCCATGCCGCCAATGCCTAGCGGCGGATCTCCAATGCCA
ATGATGACTCCACCACCTATGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCG
CCTATGCCTATGGCTCCTCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACA
CCACCTATGTCCATGACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACAAACTCCTATGGCCCCA
AGCCCAGAAACAATCCCTGATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGGATTCTTCT
CCTTCTCCTGGACCTATGCCACCGGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCGTTCAATGTA
AGAAACGACGTCGTAGCACTTTCGTTACTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGAT
TATTATCAAACTGGACAGCATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTCTCGAGCCAT
TAGTTTTCAACGGTTTATCATATTTGAATTTGTCTTTGATATGTACGGTTCAGACATTTG
TTTGCTTAATAAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A180JQ C 1
AF RR2EQ65TF U 80
AF RR2A180TF U 1
BS 1 650 RR2A180TF
BS 651 651 RR2EQ65TF
BS 652 669 RR2A180TF
BS 670 670 RR2EQ65TF
BS 671 687 RR2A180TF
BS 688 688 RR2EQ65TF
BS 689 693 RR2A180TF
BS 694 694 RR2EQ65TF
BS 695 734 RR2A180TF

RD RR2A180JQ 593 0 0
GGACTTTTCTCTCCCACTCTTTTACAACTCACATTGCATATCCTTTTCTCTATATATTAC
TTCACCTAAACCACTATTCACAACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCACAAGCC
TTCCTTTTGCTCACATTGTCTATGGTTTTAGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATG
ATGGCTCCTTCTGGCTCCATGGCCATGCCGCCAATGCCTAGCGGCGGATCTCCAATGCCA
ATGATGACTCCACCACCTATGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCG
CCTATGCCTATGGCTCCTCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACA
CCACCTATGTCCATGACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACAAACTCCTATGGCCCCA
AGCCCAGAAACAATCCCTGATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGGATTCTTCT
CCTTCTCCTGGACCTATGCCCCCGGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCGTTCAATGTA
AGAAACGACGTCGTAGCACTTTCGTTACTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2EQ65TF 650 0 0
GG
AACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCACAAGCCTTCCTTTTGCTCACATTGTCT
ATGGTTTTCGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTGGCTCCATG
GCCATGCCACCAATGCCTAGCGGCGGTTCTCCAATGCCAATGATGACTCCACCACCTATG
CCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCGCCTATGCCTATGGCTCCTCCA
CCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACACCACCTATATCCATGACTCCA
TCTTCAAGTCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCAAGCCCAGAAACAATCCCTGAT
ATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGGATTCTTCTCCTTCTCCTGGACCTATGCCA
CCGGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCATTCAATGTAGGAAACGACGTTGTAGCACTT
TCGTTACTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGATTATTATCAAACTGGACAGCAT
CGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTCTCGAGCCATTAGTTTTCGACGGTTTATCAT
ATTTGAATTTGTCTTTGATATGTACGGTTCAGACATTT
GTTTACTTAA

QA 3 640 3 640
DS 

RD RR2A180TF 734 0 0
GGACTTTTCTCTCCCACTCTTTTACAACTCACATTGCATATCCTTTTCTCTATATATTAC
TTCACCTAAACCACTATTCACAACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCACAAGCC
TTCCTTTTGCTCACATTGTCTATGGTTTTAGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATG
ATGGCTCCTTCTGGCTCCATGGCCATGCCGCCAATGCCTAGCGGCGGATCTCCAATGCCA
ATGATGACTCCACCACCTATGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCG
CCTATGCCTATGGCTCCTCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACA
CCACCTATGTCCATGACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACAAACTCCTATGGCCCCA
AGCCCAGAAACAATCCCTGATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGGATTCTTCT
CCTTCTCCTGGACCTATGCCACCGGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCGTTCAATGTA
AGAAACGACGTCGTAGCACTTTCGTTACTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGAT
TATTATCAAACTGGACAGCATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCAT
TAGTTTTCATCGGTTTATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTTG
TTTGCTTAATAAGT

QA 1 734 1 734
DS 



CO CL346Contig2 841 10 9 U
GGACTTTTCTCTCCCACTCTTTTACAACTCACATTGCATATCCTTTCTCTATATATTACT
TCACCTAAACCACTATTCACAACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCAGGAGCCT
TCCTTTTGCTCACATTGTCTATGGTTTTAGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGA
TGGCTCCTTCTGGCTCCATGTCCATGCCGCCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAA
TGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCGCCTATGCCTATGGCTCCTCCACCTA
TGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACACCACCTATGTCCATGACTCCATCTT
CAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCAAGTCCAGAAACAATCCCTGATATGG
CTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGAATTCTTCTCCTTCTCCGGGACCTATGCCACCCG
CAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCATTCAATGTAAGAAACGACGTCGTAGCACTTTCGT
TCCTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGATTATTATCAAACTGGTCAACATCGTG
TTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCATTAGTTTTCGTCGGTTTATCATATTT
GAGTTTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTTTGTTTTTAATAAGTTTTATCATTGAC
TCTAGTTGATGTATGTGATGTAAATTCATTTTTATCCAATTTTTCACAGACAAATTATCA
GTAACGCAATATAATCAATATAGCTCGTTGTTAATGAATGATATCAATGTATATGGTTCA
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 35 35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2H439TF U 84
AF RR2GH50TF U 95
AF RR2B379TF U 1
AF RR2B379JQ C 62
AF RR2CH12TF U 79
AF RR2CH12JQ C 95
AF RR2EZ51TF U 96
AF RR2GY32TF U 96
AF RR2GY32JQ C 96
AF RR2H439JQB C 544
BS 1 503 RR2B379TF
BS 504 504 RR2H439TF
BS 505 722 RR2B379TF
BS 723 741 RR2CH12TF
BS 742 742 RR2EZ51TF
BS 743 765 RR2CH12TF
BS 766 771 RR2EZ51TF
BS 772 814 RR2GY32JQ
BS 815 841 RR2H439JQB

RD RR2H439TF 561 0 0
GG
AAACACACACATAACCATGGCCTCCTCAGGAGCCTTCCTTTTGCTCACATTGTCTATGGT
TTTAGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTGGCTCCATGTCCAT
GCCGCCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTAT
GGCTCCACCGCCTATGCCTATGGCTCCTCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTC
CATGGCAACACCACCTATGTCCATGACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCC
TATGGCCCCAAGTCCAGAAACAATCCCTGATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAAT
GAATTCTTCTCCTTCTCCGGGACCTATGCCACCCGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGC
ATTCAATGTAAGAAACGACGTCGTAGCACTTTCGTTCCTTATTGCAGCTCATTTGCTTCT
CGTTTGAGATTATTATCAAACTGGTCAACATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTT
TTCGAGCCATTAGTTTTCG

QA 3 561 3 561
DS 

RD RR2GH50TF 626 0 0
CATAACCATGGCCTCTTCAGGAGCCTTCCTTTTGCTCATATTGTCTATGGTTTTAGTTCA
TTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTGGCTCCATGTCCATGCCGCCAAT
GCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACC
GCCTATGCCTATGGCTCCTCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAAC
ACCACCTATGTCCATGACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCC
AAGTCCAGAAACAATCCCTGATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGAATTCTTC
TCCTTCTCCGGGACCTATGCCACCCGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCATTCAATGT
AAGAAACGACGTCGTAGCACTTTCGTTCCTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGA
TTATTATCAAACTGGTCAACATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCA
TTAGTTTTCGTCGGTTTATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTT
TGTTTTTAATAAGTTTTATCATTGAC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2B379TF 722 0 0
GGACTTTTCTCTCCCACTCTTTTACAACTCACATTGCATATCCTTTCTCTATATATTACT
TCACCTAAACCACTATTCACAACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCAGGAGCCT
TCCTTTTGCTCACATTGTCTATGGTTTTAGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGA
TGGCTCCTTCTGGCTCCATGTCCATGCCGCCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAA
TGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCGCCTATGCCTATGGCTCCTCCACCTA
TGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACACCACCTATGTCCATGACTCCATCTT
CAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCAAGTCCAGAAACAATCCCTGATATGG
CTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGAATTCTTCTCCTTCTCCGGGACCTATGCCACCCG
CAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAACATTCAATGTAAGAAACGACGTCGTAGCACTTTCGT
TCCTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGATTATTATCAAACTGGTCAACATCGTG
TTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCATTAGTTTTCGTCGGTTTATCATATTT
GAGTTTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTTTGTTTTTAATAAGTTTTATCATTGAC
TC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2B379JQ 661 0 0
TCA
CTAAACCACTATTCACAACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCAGGAGCCTTCCT
TTTGCTCACATTGTCTATGGTTTTAGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGC
TCCTTCTGGCTCCATGTCCATGCCGCCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAATGAT
GACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCGCCTATGCCTATGGCTCCTCCACCTATGGC
TATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACACCACCTATGTCCATGACTCCATCTTCAAG
CCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCAAGTCCAGAAACAATCCCTGATATGGCTTC
ACCACCTATGATGCCAGGAATGAATTCTTCTCCTTCTCCGGGACCTATGCCACCCGCAAC
GTCCTCGCCAGATTCCGGAACATTCAATGTAAGAAACGACGTCGTAGCACTTTCGTTCCT
TATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGATTATTATCAAACTGGTCAACATCGTGTTCG
TGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCATTAGTTTTCGTCGGTTTATCATATTTGAGT
TTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTTTGTTTTTAATAAGTTTTATCATTGACTC

QA 4 661 4 661
DS 

RD RR2CH12TF 687 0 0
GG
AACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCAGGAGCCTTCCTTTTGCTCACAGTGTCT
ATGGTTTTAGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTGGCTCCATG
TCCATGCCGCCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAATGATGACTCCCCCACCTATG
CCTATGGCTCCACCGCCTATGCCTATGGCTCCTCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCT
ATGTCCATGGCAACACCACCTATGTCCATGACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCA
ACTCCTATGGCCCCAAGTCCAGAAACAATCCCTGATATGGCTTCACCACCTATGATGCCA
GGAATGAATTCTTCTCCTTCTCCGGGACCTATGCCACCCGCAACGTCCTCGCCAGATTCC
GGAGCATTCAATGTAAGAAACGACGTCGTAGCACTTTCGTTCCTTATTGCAGCTCATTTG
CTTCTCGTTTGAGATTATTATCAAACTGGTCAACATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCAT
TATTTTTCGAGCCATTAGTTTTCGTCGGTTTGTCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTA
CGGTTCAGACATTTTGTTTTTAATAGGTTTTATCATTGACTCTAGTTGATGTATGTGATG
TTAATTCATTTTTATCCAATTTTTC

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR2CH12JQ 677 0 0
CATAACCATGGCCTCTTCAGGAGCCTTCCTTTTGCTCACAGTGTCTATGGTTTTAGTTCA
TTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTGGCTCCATGTCCATGCCGCCAAT
GCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACC
GCCTATGCCTATGGCTCCTCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAAC
ACCACCTATGTCCATGACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCC
AAGTCCAGAAACAATCCCTGATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGAATTCTTC
TCCTTCTCCGGGACCTATGCCACCCGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCATTCAATGT
AAGAAACGACGTCGTAGCACTTTCGTTCCTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGA
TTATTATCAAACTGGTCAACATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCA
TTAGTTTTCGTCGGTTTGTCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTT
TGTTTTTAATAGGTTTTATCATTGACTCTAGTTGATGTATGTGATGTTAATTCATTTTTA
TCCAATTTTTCACAGAC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2EZ51TF 676 0 0
ATAACCATGGCCTCTTCAGGAGCCTTCCTTTTGCTCACATTGTCTATGGTTTTAGTTCAT
TTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTGGCTCCATGTCCATGCCGCCAATG
CCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCG
CCTATGCCTATGGCTCCTCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACA
CCACCTATGTCCATGACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCA
AGTCCAGAAACAATCCCTGATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGAATTCTTCT
CCTTCTCCGGGACCTATGCCACCCGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCATTCAATGTA
AGAAACGACGTCGTAGCACTTTCGTTCCTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGAT
TATTATCAAACTGGTCAACATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCAT
TAGTTTTCGTCGGTTTATCATATTCGAGTTTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTTT
GTTTTTAATAAGTTTTATCATTGACTCTAGTTGATGTTTGTGATGTAAATTCATTTTTAT
CCAATTTTCCACAGAC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2GY32TF 681 0 0
ATAACCATGGCCTCTTCAGGAGCCTTCCTTTTGCTCACATTGTCTATGGTTTTAGTTCAT
TTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTGGCTCCATGTCCATGCCGCCAATG
CCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCG
CCTATGCCTATGGCTCCTCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACA
CCACCTATGTCCATGACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCA
AGTCCAGAAACAATCCCTGATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGAATTCTTCT
CCTTCTCCGGGACCTATGCCACCCGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCATTCAATGTA
AGAAACGACGTCGTAGCACTTTCGTTCCTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGAT
TATTATCAAACTGGTCAACATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCAT
TAGTTTTCGTCGGTTTATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTTT
GTTTTTAATAAGTTTTATCATTGACTCTAGTTGATGTATGTGATGTAAATTCATTTTTAT
CCAATTTTTCACAGAC
AAATT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2GY32JQ 722 0 0
ATAACCATGGCCTCTTCAGGAGCCTTCCTTTTGCTCACATTGTCTATGGTTTTAGTTCAT
TTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTGGCTCCATGTCCATGCCGCCAATG
CCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCG
CCTATGCCTATGGCTCCTCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACA
CCACCTATGTCCATGACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCA
AGTCCAGAAACAATCCCTGATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGAATTTTTCT
CCTTTTCCGGGACCTATGCCACCCGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCATTCAATGTA
AGAAACGACGTCGTAGCACTTTCGTTCCTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGAT
TATTATCAAACTGGTCAACATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCAT
TAGTTTTCGTCGGTTTATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTTT
GTTTTTAATAAGTTTTATCATTGACTCTAGTTGATGTATGTGATGTAAATTCATTTTTAT
CCAATTTTTCACAGACAAATTATCAGTAACGCAATATAATCAATATAGCTCGTTGTTAA
CGT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2H439JQB 298 0 0
TTATTGCAGCTCATTTGCTTTTCGTTTGAGATTATTATCAAACTGGTCAACATCGTGTTC
GTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCATTAGTTTTCGTCGGTTTATCATATTTGAG
TTTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTTTGTTTTTAATAAGTTTTATCATTGACTCT
AGTTGATGTATGTGATGTAAATTCATTTTTATCCAATTTTTCACAGACAAATTATCAGTA
ACGCAATATAATCAATATAGCTCGTTGTTAATGAATGATATCAATGTATATGGTTCAC

QA 1 298 1 298
DS 



AS 2 11

CO CL347Contig1 1665 7 21 U
GGATTCTGATTTTCAGTACGAATACGAACCGTGAAAGCGTGGCCTATCGATCCTTTAGAC
CTTCGGAATTTGAAGCTAGAGGTGTCAGAAAAGTTACCACAGGGATAACTGGCTTGTGGC
AGCCAAGCGTTCATAGCGACGTTGCTTTTTGATCCTTCGATGTCGGCTCTTCCTATCATT
GTGAAGCAGAATTCACCAAGTGTTGGATTGTTCACCCACCAATAGGGAACGTGAGCTGGG
GTTAGACCGTCGTGAGACAGGTTAGTTTTACCCTACTGATGCCCGCGTCGCGATAGTAAT
TCAACCTAGTACGAGAGGAACCGTTGATTCGCACAATTGGTCATCGCGCTTGGTTGAAAA
GCCAGTGGCGCGAAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAACGCCTCTAAGTCAGAATCC
GGGCTAGAAGCGACGCATGCGCCCGCCGCCCGATTGCCGACCCTCAGTAGGAGCTTCGGC
TCCCAAAGGCACGTGTCGTTGGCTAAGTCCGTTCGGTGGAAGCGCCGTTCGGACCGCCTT
GAATTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCAGACGACTTAAATACGCGAC
GGGGTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCCACTGAGATTCAGCCCTTTG
TCGCTAAGATTCGACCCTCCCCCCTTTTCTTTCATTGTTCCTCCCCAAAACGTCAAAAAC
AAAAAACCCAAAAAAATTCTAAGTTTATAAGAAAACGTTGTGCGAGGTTCCAGTTTTTTA
CTTGGTGAAAATCACTTTCGCACCAAAATTTCAGTATGATCTTTTTCGTACTTAACAAGA
GAAATGATTTTATCCAGCCAAGGACTGACCATGCTTGACTCTATAGTCCACGAAAACTCG
AACCATCTGCACTGTTAGTACATGGACAATCCTTGGAAATACCGGAAGGATTCAAAGACT
GTCCAGACTTGAAGATATCTAGTCCACGAGTCATCAGTACTACTAACAGTACTTCATCCG
GGAAGGATTTAATCCAGCGAAAAGACTGGTTTATCGATCCAACAGACGGACAGTCTATGA
AAACTCTAGCAAACAGATAGTCCGAATCAACCGGGAAGAATAACAAATTTCATGGACCAG
ACTGACATACTGATGCCCACGACTGGGTGTACTGATGGGACCATCAGGTTGTGAAAATAC
CCCGTAGACTGTCGTGCACGTCCGTGAAGGCAAAAAAAAAAAAAAATCTCATGTACCGAT
CACCCACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACAGTCAGGGTGTGAAAATACTC
CGCAGACTGCCGTGAACGTCCGTGAAGGCAAAAAAAAAAAAAAAATCTCATGTACTGATC
ACCTCACGGGTGGACAGTCAGGGTGTGAAATTACCCCGCAGACTGTCGTGAACGTCCGTG
AAGGCAAAAAAAAAAATCTCATGTACTGATCACCCACTCATCACCCACGACTGGGTGTAC
TGATGGGACCATCAGGTTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTCGTGAACGTCCGTGAAGGCA
AAAAAAAAAAAATTCTCATGTACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACAGTCA
GGGTGTGAAAATACTCCGCAGACTGTCGTGAACGTCCGTGAAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV42JQ C 1
AF RR2CV42TF U 1
AF RR2GD56TF U 25
AF RR2AJ66TF U 474
AF RR2AJ66JQ C 639
AF RR2CS66TF U 956
AF RR2CS66JQ C 1347
BS 1 591 RR2CV42TF
BS 592 592 RR2GD56TF
BS 593 611 RR2CV42TF
BS 612 612 RR2GD56TF
BS 613 664 RR2CV42TF
BS 665 683 RR2GD56TF
BS 684 684 RR2AJ66TF
BS 685 687 RR2GD56TF
BS 688 688 RR2AJ66TF
BS 689 698 RR2GD56TF
BS 699 699 RR2AJ66TF
BS 700 709 RR2GD56TF
BS 710 1187 RR2AJ66TF
BS 1188 1188 RR2CS66TF
BS 1189 1201 RR2AJ66TF
BS 1202 1571 RR2CS66TF
BS 1572 1572 RR2CS66JQ
BS 1573 1622 RR2CS66TF
BS 1623 1623 RR2CS66JQ
BS 1624 1652 RR2CS66TF
BS 1653 1665 RR2CS66JQ

RD RR2CV42JQ 673 0 0
GGATTCTGATTTTCAGTACGAATACGAACCGTGAAAGCGTGGCCTATCGATCCTTTAGAC
CTTCGGAATTTGAAGCTAGAGGTGTCAGAAAAGTTACCACAGGGATAACTGGCTTGTGGC
AGCCAAGCGTTCATAGCGACGTTGCTTTTTGATCCTTCGATGTCGGCTCTTCCTATCATT
GTGAAGCAGAATTCACCAAGTGTTGGATTGTTCACCCACCAATAGGGAACGTGAGCTGGG
GTTAGACCGTCGTGAGACAGGTTAGTTTTACCCTACTGATGCCCGCGTCGCGATAGTAAT
TCAACCTAGTACGAGAGGAACCGTTGATTCGCACAATTGGTCATCGCGCTTGGTTGAAAA
GCCAGTGGCGCGAAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAACGCCTCTAAGTCAGAATCC
GGGCTAGAAGCGACGCATGCGCCCGCCGCCCGATTGCCGACCCTCAGTAGGAGCTTCGGC
TCCCAAAGGCACGTGTCGTTGGCTAAGTCCGTTCGGTGGAAGCGCCGTTCGGACCGCCTT
GAATTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCAGACGACTTAAATACGCGAC
GGGGTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCCACTGAGATTCAGCCCTTTG
TCGCTAAGATTCG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2CV42TF 664 0 0
GGATTCTGATTTTCAGTACGAATACGAACCGTGAAAGCGTGGCCTATCGATCCTTTAGAC
CTTCGGAATTTGAAGCTAGAGGTGTCAGAAAAGTTACCACAGGGATAACTGGCTTGTGGC
AGCCAAGCGTTCATAGCGACGTTGCTTTTTGATCCTTCGATGTCGGCTCTTCCTATCATT
GTGAAGCAGAATTCACCAAGTGTTGGATTGTTCACCCACCAATAGGGAACGTGAGCTGGG
GTTAGACCGTCGTGAGACAGGTTAGTTTTACCCTACTGATGCCCGCGTCGCGATAGTAAT
TCAACCTAGTACGAGAGGAACCGTTGATTCGCACAATTGGTCATCGCGCTTGGTTGAAAA
GCCAGTGGCGCGAAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAACGCCTCTAAGTCAGAATCC
GGGCTAGAAGCGACGCATGCGCCCGCCGCCCGATTGCCGACCCTCAGTAGGAGCTTCGGC
TCCCAAAGGCACGTGTCGTTGGCTAAGTCCGTTCGGTGGAAGCGCCGTTCGGACCGCCTT
GAATTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCAGACGACTTAA*TACGCGAC
GGGGTATTGTA*GTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCCACTGAGATTCAGCCCTTTG
TCGC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2GD56TF 693 0 0
GA
AACCGTGAAAGCGTGGCCTATCGATCCTTTAGACCTTCGGAATTTGAAGCTAGAGGTGTC
AGAAAAGTTACCACAGGGATAACTGGCTTGTGGCAGCCAAGCGTTCATAGCGACGTTGCT
TTTTGATCCTTCGATGTCGGCTCTTCCTATCATTGTGAAGCAGAATTCACCAAGTGTTGG
ATTGTTCACCCACCAATAGGGAACGTGAGCTGGGTTTAGACCGTCGTGAGACAGGTTAGT
TTTACCCTACTGATGCCCGCGTCGCGATAGTAATTCAACCTAGTACGAGAGGAACCGTTG
ATTCGCACAATTGGTCATCGCGCTTGGTTGAAAAGCCAGTGGCGCGAAGCTACCGTGCGC
TGGATTATGACTGAACGCCTCTAAGTCAGAATCCGGGCTAGAAGCGACGCATGCGCCCGC
CGCCCGATTGCCGACCCTCAGTAGGAGCTTCGGCTCCCAAAGGCACGTGTCGTTGGCTAA
GTCCGTTCGGTGGAAGCGCCGTTCGGACCGCCTTGAATTATAATTACCACCGAGCGGCGG
GTAGAATCCTTTGCAGACGACTTAAATACGCGACGGGGTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCC
TTGCTGCCACGATCCACTGAGATTCAGCCCTTTGTCGCTAAGATTCGACCCTCCCCCTTT
TCCTTTCATTGTGCCTCCCCAAA
CGTCAAAA

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR2AJ66TF 728 0 0
G
TTCGGCTCCCAAAGGCACGTGTCGTTGGCTCAGTCCGTTCGGTGGAAGCGCCGTTCGGAC
CGCCTTGAATTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCAGACGACTTAAATA
CGCGACGGGGTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCCACTGAGATTCAGC
CCTTTGTCGCTAAGATTCGACCCTCCCCCCTTTTCTTTCATTGTTCCTCCCCAAAACGTC
AAAAACAAAAAACCCAAAAAAATTCTAAGTTTATAAGAAAACGTTGTGCGAGGTTCCAGT
TTTTTACTTGGTGAAAATCACTTTCGCACCAAAATTTCAGTATGATCTTTTTCGTACTTA
ACAAGAGAAATGATTTTATCCAGCCAAGGACTGACCATGCTTGACTCTATAGTCCACGAA
AACTCGAACCATCTGCACTGTTAGTACATGGACAATCCTTGGAAATACCGGAAGGATTCA
AAGACTGTCCAGACTTGAAGATATCTAGTCCACGAGTCATCAGTACTACTAACAGTACTT
CATCCGGGAAGGATTTAATCCAGCGAAAAGACTGGTTTATCGATCCAACAGACGGACAGT
CTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCCGAATCAACCGGGAAGAATAACAAATTTCATG
GACCAGACTGACATACTGATGCCCACGACTGGGTGTACTGATGGGACCATCAG*TTGTGA
AAATACC

QA 2 728 2 728
DS 

RD RR2AJ66JQ 593 0 0
TCCACTGAGATTCAGCCCTTTGTCGCTAAGATTCGACCCTCCCCCCTTTTCTTTCATTGT
TCCTCCCCAAAACGTCAAAAACAAAAAACCCAAAAAAATTTTAAGTTTATAAGAAAACGT
TGTGGGAGGTTCCAGTTTTTTACTTGGTGAAAATCACTTTCGCACCAAAATTTCAGTATG
ATTTTTTTCGTACTTAACAAGAGAAATGATTTTATCCAGCCAAGGACTGACCATGCTTGA
CTTTATAGTCCACGAAAACTCGAACCATTTGCACTGTTAGTACATGGACAATCCTTGGAA
ATACCGGAAGGATTCAAAGACTGTCCAGACTTGAAGATATTTAGTCCACGAGTCATCAGT
ACTACTAACAGTACTTCATCCGGGAAGGATTTAATCCAGGGAAAAGACTGGTTTATCGAT
CCAACAGACGGACAGTTTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCCGAATCAACCGGGAAG
AATAACAAATTTCATGGACCAGACTGACATACTGATGCCCACGACTGGGTGTACTGATGG
GACCATCAGGTTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTCGTGCACGTCCGTGAAGGC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2CS66TF 697 0 0
G
GACTGTCCAGACTTGAAGATATCTAGTCCACGAGTCATCAGTACTACTAACAGTACTTCA
TCCGGGAAGGATTTAATCCAGCAAAAAGACTGGTTTATCGATCCAACAGACGGACAGTCT
ATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCCGAATCAACCGGGAAGAATAACAAATTTCATGGA
CCAGACTGACATACTGATGCCCACGACTGGGTGTACTGATGGGACCATCAGGTTGTGAAA
ATACCCCGTAGACTGTCGTGCACGTCCGTGAAGGCAAAAAAAAAAAAAAATCTCATGTAC
CGATCACCCACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACAGTCAGGGTGTGAAAAT
ACTCCGCAGACTGCCGTGAACGTCCGTGAAGGCAAAAAAAAAAAAAAAATCTCATGTACT
GATCACCTCACGGGTGGACAGTCAGGGTGTGAAATTACCCCGCAGACTGTCGTGAACGTC
CGTGAAGGCAAAAAAAAAAATCTCATGTACTGATCACCCACTCATCACCCACGACTGGGT
GTACTGATGGGACCATCAGGTTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTCGTGAACGTCCGTGAA
GGCAAAAAAAAAAAA*TTCTCATGTACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACA
GTCAGG*TGTGAAAATACTCCGCAGACTGTCGTGAA

QA 2 697 2 697
DS 

RD RR2CS66JQ 319 0 0
GGCAAAAAAAAAAAAAAAATTTCATGTACTGATCACCTCACGGGTGGACAGTCAGGGTGT
GAAATTACCCCGCAGACTGTCGTGAACGTCCGTGAAGGCAAAAAAAAAAATTTCATGTAC
TGATCACCCACTCATCACCCACGACTGGGTGTACTGATGGGACCATCAGGTTGTGAAAAT
ACCCCGTAGACTGTCGTGAACGTCCGTGAAGGCAAAAAAAAAAAAATTCTCATGTACTGA
TCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACAGTCAGGGTGTGAAAATACTCCGCAGACTGT
CGTGAACGTCCGTGAAGAC

QA 1 319 1 319
DS 



CO CL347Contig2 742 4 6 U
GGCGACGGGGTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCCACTGAGATTCAGC
CCTTTGTCTCTAAGATTCGACACTCCCCCCCTTTCCTTTCATTGTGCCTCCCCAAAACGT
CAAAAACAAAAAACCCAAAAAAAATTCTAAGTTTATAAGAAAATGTTGTGCGAGGTTCCA
GTTTTTTACTTGGTGAAAATCACTCTCGCACCAAAATTTCAGTATGTTCTTTCGTACTTA
ACGAGAGAAATGATTTTATCCAGCCAAGGACTGACCACATGCTTGACTCTAGTCCACGAA
AACTCGAACCATCAGCACTGTTAGTACATGGACAATCCTTGGAAATACCGGAAGGATTCA
AAGACTGTCCAGACTTGAAGATATCTAGTCCACGAGCCATCAGTACTACTAACAGTACTT
CATCCGGGAAGGATTCAATCCAGCAAAAAGACTGGTTTATCGATCCAACAGACAGACAGT
CTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCCGAATCAACCGGGAAGAAAAAAAAAATTCATG
GACCAGACTGACATATTGATGCCCACGGATGTGTGTACTGATGGGACCATCAGGGTGTGA
AAATACCCCGTAGACTGTCCTGAACGTTCGTGAAGGCAAAAAAAAAAAAATCTCATGTAC
TGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACCATCAGGGTGTGAAAATACCCCGTAGAC
TGTCCTGAACGTCCGTGAAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F785TF U 1
AF RR2DZ05TF U 150
AF RR2AM88TF U 201
AF RR2AM88JQ C 233
BS 1 353 RR2F785TF
BS 354 354 RR2DZ05TF
BS 355 449 RR2F785TF
BS 450 588 RR2DZ05TF
BS 589 732 RR2AM88TF
BS 733 742 RR2AM88JQ

RD RR2F785TF 449 0 0
GGCGACGGGGTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCCACTGAGATTCAGC
CCTTTGTCTCTAAGATTCGACACTCCCCCCCTTTCCTTTCATTGTGCCTCCCCAAAACGT
CAAAAACAAAAAACCCAAAAAAAATTCTAAGTTTATAAGAAAATGTTGTGCGAGGTTCCA
GTTTTTTACTTGGTGAAAATCACTCTCGCACCAAAATTTCAGTATGTTCTTTCGTACTTA
ACGAGAGAAATGATTTTATCCAGCCAAGGACTGACCACATGCTTGACTCTAGTCCACGAA
AACTCGAACCATCAGCACTGTTAGTACATGGACAATCCTTGGAAATACCGGAAAGATTCA
AAGACTGTCCAGACTTGAAGATATCTAGTCCACGAGCCATCAGTACTACTAACAGTACTT
CATCCGGGAAGGATTCAATCCAGCAAAAA

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2DZ05TF 439 0 0
G
GTTTATAAGAAAATGTTGTGCGAGGTTCCAGTTTTTTACTTGGTGAAAATCACTCTCGCA
CCAAAATTTCAGTATGTTCTTTCGTACTTAACGAGAGAAATGATTTTATCCAACCAAGGA
CTGACCACATGCTTGACTCTAGTCCACGAAAACTCGAACCATCAGCACTGTTAGTACATG
GACAATCCTTGGAAATACCGGAAGGATTCAAAGACTGTCCAGACTTGAAGATATCTAGTC
CACGAGCCATCAGATCTACTAACAGTACTTCATCCGGGAAGGATTCAATCCAGCAAAAAG
ACTGGTTTATCGATCCAACAGACAGACAGTCTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCCG
AATCAACCGGGAAGAAAAAAAAAATTCATGGACCAGACTGACATATTGATGCCCACGGAT
GTGTGTACTGATGGGACC

QA 2 439 2 439
DS 

RD RR2AM88TF 542 0 0
CACTCTCGCACCAAAATTTCAGTATGTTCTTTCGTACTTAACGAGAGAAATGATTTTATC
CAGCCAAGGACTGACCACATGCTTGACTCTAGTCCACGAAAACTCGAACCATCAGCACTG
TTAGTACATGGACAATCCTTGGAAATACCGGAAGGATTCAAAGACTGTCCAGACTTGAAG
ATATCTAGTCCACGAGCCATCAGTACTACTAACAGTACTTCATCCGGGAAGGATTCAATC
CAGCAAAAAGACTGGTTTATCGATCCAACAGACAGACAGTCTATGAAAACTCTAGCAAAC
AGATAGTCCGAATCAACCGGGAAGAAAAAAAAAATTCATGGACCAGACTGACATATTGAT
GCCCACGGATGTGTGTACTGATGGGACCATCAGGGTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTCC
TGAACGTTCGTGAAGGCAAAAAAAAAAAAATCTCATGTACTGATCACCCACGGCTGGGTG
TACTGATGGGACCATCAGGGTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTCCTGAACGT
CCGTGAAGGG

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2AM88JQ 510 0 0
CGTACTTAACGAGAGAAATGATTTTATCCAGCCAAGGACTGACCACATGCTTGACTTTAG
TCCACGAAAACTCGAACCATCAGCACTGTTAGTACATGGACAATCCTTGGAAATACCGGA
AGGATTCAAAGACTGTCCAGACTTGAAGATATTTAGTCCACGAGCCATCAGTACTACTAA
CAGTACTTCATCCGGGAAGGATTCAATCCAGCAAAAAGACTGGTTTATCGATCCAACAGA
CAGACAGTTTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCCGAATCAACCGGGAAGAAAAAAAA
AATTCATGGACCAGACTGACATATTGATGCCCACGGATGTGTGTACTGATGGGACCATCA
GGGTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTCCTGAACGTTCGTGAAGGCAAAAAAAAAAAAATC
TCATGTACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACCATCAGGGTGTGAAAATACC
CCGTAGACTGTCCTGAACGTCCGTGAAGGG

QA 1 510 1 510
DS 



AS 2 12

CO CL348Contig1 923 4 21 U
GGGAAGCGTACAGTCTCTCCTCTCTTCACGTCTCTGATCACTCCCAAATTCGAAATATCT
CAAAATTTCGATTTTTTTTTTTTTAAATTAAAATTTCAGAAAAAAAACAACTGGTTCTGG
CTATTTACAGTGTTACTTATCTATCTGGTGAATGGTGATTGATTGTTTGTGAGTCTGATT
CAATTCTAGTGGGGAAGAGATGGTGTTCTTGAGCTGGGGCCGTCCATCTACCGAGCAACA
ACAACAAGTTATCAACAAATCAGGAACGTTCAATTACGACAGCAAGTACAGAGGAGCTTC
GTCTAGAACAGCATCTAAACTAAAAGAAGATTCAGAAGTCAACAAAGATGGGTTCTTCAT
CAACCACTCTCGTGTCCTAGTTGGTTCTGGTAAAGAGAGTTACGACAAGGGGAAACAAGC
TCTTCAGAACTGGAAGCACATTGGTATGGATTGGGCATTTGTTGATCCCAAAACTCCGGT
TGAAACCGGTAAGAAGTTTTGCGTATGTGTGAAAGAAGTTCTTCCGTGGGTGATGTTTCC
TCTTCAAGTGGCTTACGTGGACGAAAGCAAGAAGTCTAGGAAAGGTCCCGCGCATTTCGG
TTACGGATGCGGCACTCTCGAGGGACATTTACTAGCTGGAGAAGAGCGGTTTTCGATTGA
GTTGGATGGAGATGGTAAAGTGTGGTATGAGGTAACGTCCTTGTCAAAGCCAGCTCATTT
CTTGTCCTTCCTTGGTTATCCTTATGTCAAGCTCAGGCAGAAGCACTTTGCTCATCATTC
TTCTGATGCTGTCCTTAAACATCTTACTGCTTCTTCATCTTCTTGAAAATGATATGAGGA
TATATTTAAGTTGTATATTTGTTTACAATGAAACAGTGTTGCATCTTTTCCTCTCTCATA
TATATAAAATTGAATAGAAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 15 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DB06TF U 1
AF RR2G168TF U 181
AF RR2CK77TF U 174
AF RR2CK77JQ C 175
BS 1 307 RR2DB06TF
BS 308 308 RR2CK77TF
BS 309 311 RR2DB06TF
BS 312 312 RR2CK77TF
BS 313 585 RR2DB06TF
BS 586 586 RR2CK77TF
BS 587 597 RR2DB06TF
BS 598 598 RR2CK77TF
BS 599 602 RR2DB06TF
BS 603 603 RR2CK77TF
BS 604 606 RR2DB06TF
BS 607 608 RR2CK77TF
BS 609 631 RR2DB06TF
BS 632 828 RR2CK77TF
BS 829 829 RR2CK77JQ
BS 830 838 RR2CK77TF
BS 839 839 RR2CK77JQ
BS 840 888 RR2CK77TF
BS 889 890 RR2CK77JQ
BS 891 907 RR2CK77TF
BS 908 923 RR2CK77JQ

RD RR2DB06TF 631 0 0
GGGAAGCGTACAGTCTCTCCTCTCTTCACGTCTCTGATCACTCCCAAATTCGAAATATCT
CAAAATTTCGATTTTTTTTTTTTTAAATTAAAATTTCAGAAAAAAAACAACTGGTTCTGG
CTATTTACAGTGTTACTTATCTATCTGGTGAATGGTGATTGATTGTTTGTGAGTCTGATT
CAATTCTAGTGGGGAAGAGATGGTGTTCTTGAGCTGGGGCCGTCCATCTACCGAGCAACA
ACAACAAGTTATCAACAAATCAGGAACGTTCAATTACGACAGCAAGTACAGAGGAGCTTC
GTCTAGATCAGTATCTAAACTAAAAGAAGATTCAGAAGTCAACAAAGATGGGTTCTTCAT
CAACCACTCTCGTGTCCTAGTTGGTTCTGGTAAAGAGAGTTACGACAAGGGGAAACAAGC
TCTTCAGAACTGGAAGCACATTGGTATGGATTGGGCATTTGTTGATCCCAAAACTCCGGT
TGAAACCGGTAAGAAGTTTTGCGTATGTGTGAAAGAAGTTCTTCCGTGGGTGATGTTTCC
TCTTCAAGTGGCTTACGTGGACGAAAGCAAGAAGTCTAGGAAAGGCCCCGCGCATTTTGG
TTTCGGGAGCGGCACTCTCGAGGGACATTTA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2G168TF 572 0 0
GG
ATTCTAGTGGGGAAGAGATGGTGTTCTTGAGCTGGGGCCGTCCATCTACCGAGCAACAAC
AACAAGTTATCAACAAATCAGGAACGTTCAATTACGACAGCAAGTACAGAGGAGCTTCGT
CTAGAACAGCATCTAAACTAAAAGAAGATTCAGAAGTCAACAAAGATGGGTTCTTCATCA
ACCACTCTCGTGTCCTAGTTGGTTCTGGTAAAGAGAGTTACGACAAGGGGAAACAAGCTC
TTCAGAACTGGAAGCACATTGGTATGGATTGGGCATTTGTTGATCCCAAAACTCCGGTTG
AAACCGGTAAGAAGTTTTGCGTATGTGTGAAAGAAGTTCTTCCGTGGGTGATGTTTCCTC
TTCAAGTGGCTTACGTGGACGAAAGCAAGAAGTCTAGGAAAGGTCCCGCGCATTTCGGTT
ACGGATGCGGCACTCTCGAGGGACATTTACTAGCTGGAGAAGAGCGGTTTTCGATTGAGT
TGGATGGAGATGGTAAAGTGTGGTATGAGATAACGTCCTTGTCAAAGCCAGCTCATTTCT
TGTCCTTCCTTGGTTATCCTTATGTCAAGC

QA 3 572 3 572
DS 

RD RR2CK77TF 734 0 0
GGCT
ATTCAATTCTAGTGGGGAAGAGATGGTGTTCTTGAGCTGGGGCCGTCCATCTACCGAGCA
ACAACAACAAGTTATCAACAAATCAGGAACGTTCAATTACGACAGCAAGTACAGAGGAGC
TTCGTCTAGAACAGCATCTAAACTAAAAGAAGATTCAGAAGTCAACAAAGATGGGTTCTT
CATCAACCACTCTCGTGTCCTAGTTGGTTCTGGTAAAGAGAGTTACGACAAGGGGAAACA
AGCTCTTCAGAACTGGAAGCACATTGGTATGGATTGGGCATTTGTTGATCCCAAAACTCC
GGTTGAAACCGGTAAGAAGTTTTGCGTATGTGTGAAAGAAGTTCTTCCGTGGGTGATGTT
TCCTCTTCAAGTGGCTTACGTGGACGAAAGCAAGAAGTCTAGGAAAGGTCCCGCGCATTT
CGGTTACGGATGCGGCACTCTCGAGGGACATTTACTAGCTGGAGAAGAGCGGTTTTCGAT
TGAGTTGGATGGAGATGGTAAAGTGTGGTATGAGGTAACGTCCTTGTCAAAGCCAGCTCA
TTTCTTGTCCTTCCTTGGTTATCCTTATGTCAAGCTCAGGCAGAAGCACTTTGCTCATCA
TTCTTCTGATGCTGTCCTTAAACATCTTACTGCTTCTTCATCTTCTTGAAA*TGATATGA
G*ATATATTTAAGTTGTATATTTGTTTACAATGAAACAGTGTTGCATCTTT**CTCTCTC
ATATATATAA

QA 5 734 5 734
DS 

RD RR2CK77JQ 749 0 0
GGCTATTCAA
TCTAGTGGGGAAGAGATGGTGTTCTTGAGCTGGGGCCGTCCATCTACCGAGCAACAACAA
CAAGTTATCAACAAATCAGGAACGTTCAATTACGACAGCAAGTACAGAGGAGCTTCGTCT
AGAACAGCATCTAAACTAAAAGAAGATTCAGAAGTCAACAAAGATGGGTTCTTCATCAAC
CACTCTCGTGTCCTAGTTGGTTCTGGTAAAGAGAGTTACGACAAGGGGAAACAAGCTCTT
CAGAACTGGAAGCACATTGGTATGGATTGGGCATTTGTTGATCCCAAAACTCCGGTTGAA
ACCGGTAAGAAGTTTTGCGTATGTGTGAAAGAAGTTCTTCCGTGGGTGATGTTTCCTCTT
CAAGTGGCTTACGTGGACGAAAGCAAGAAGTCTAGGAAAGGTCCCGCGCATTTCGGTTAC
GGATGCGGCACTCTCGAGGGACATTTACTAGCTGGAGAAGAGCGGTTTTCGATTGAGTTG
GATGGAGATGGTAAAGTGTGGTATGAGGTAACGTCCTTGTCAAAGCCAGCTCATTTCTTG
TCCTTCCTTGGTTATCCTTATGTCAAGCTCAGGCAGAAGCACTTTGCTCATCATTCTTCT
GATGCTGTCCTTAAACATCTTACTGCTTCTTCATCTTCTTGAAAATGATATGAGGATATA
TTTAAGTTGTATATTTGTTTACAATGAAACAGTGTTGCATCTTTTCTTCTCTCATATATA
TAAAATTGAATAGAAGTTG

QA 11 749 11 749
DS 



CO CL348Contig2 990 8 10 U
GGGACAGTCTCTCGTCTCTTCACGTTTCTGATCACTCCCAAATTCGAAATATCTCAAATT
TTCGATTTTTAAAATTAAAATTTCAAAAAAAAAACAACAACTGGTTCTGGCTATTTACAG
TGTTATTTATCTATCTGGTCACTGTTTGTGGGTCTGATTCAATTCTAGTGGGGAAGAGAT
GGTGTTCTTGAGCTGGGGCCGTCCATCTACCGAGCAACAACAACAAGTTATCAACAAATC
AGGAACGTTCAATTACGACAGCAAGTACAGAGGAGCTTCGTCTAGAACAGCATCTAAACT
AAAAGAAGATTCAGAAGTCAACAAAGATGGGTTCTTCATCAACCACTCTCGTGTCTTAGT
GGGTTCTGGTAAAGAGAGTTACGACAAGGGGAAACAAGCTCTTCAGAACTGGAAGCACAT
TGGTATGGATTGGGCATTTGTTGATCCCAAAACTCCGGTTGAAACCGGTAAGAAGTTTTG
CGTATGTTTGAAAGAAGTTGTTCCATGGGTGATGCTTCCTCTTCAAGTGGCTTACGTGGA
CGAAAGCAAGAAGTCTAGGAAAGGCCCCGCGCGTTTCGGTTACGGATGCGGCACCCTCGA
GGGACATTTACTAGCTGGAGAAGAGCGGTTTTCGATTGAGCTGGATGGAGATGGTAAAGT
GTGGTATGAGATAACGTCCTTGTCAAAGCCCGCTCATTTCTTGTCCTTCCTTGGTTATCC
TTATGTCAAGCTCAGGCAGAAGCACTTTGCTCATCATTCTTCTGATGCTGTCCTTAAACA
TCTTACTGCTTCTTCAAAATGATATGAA*GATATATTTAAGTTGTATGCTTACAATAAAA
CAGTGTTGCATCTTTTCTTGTCTCATATATATATTGAATAGAAGTTCTTATGGATGCATA
ATCTTATTAGCACAATTTGTTGAAGAGAATGGTTTCTGGTCGAGGCTTGAGAAGTACTAA
CTCTCGGGCGATAAAATATCATTGATTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 30 30 15 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH43TF U 1
AF RR2AB80TF U 155
AF RR2DB06JQ C 137
AF RR2A570JQ C 143
AF RR2CI80TF U 165
AF RR2AB80JQ C 155
AF RR2A570TF U 143
AF RR2FH43JQ C 262
BS 1 147 RR2FH43TF
BS 148 148 RR2A570TF
BS 149 176 RR2FH43TF
BS 177 177 RR2CI80TF
BS 178 735 RR2FH43TF
BS 736 736 RR2CI80TF
BS 737 772 RR2FH43TF
BS 773 866 RR2CI80TF
BS 867 893 RR2A570TF
BS 894 990 RR2FH43JQ

RD RR2FH43TF 778 0 0
GGGACAGTCTCTCGTCTCTTCACGTTTCTGATCACTCCCAAATTCGAAATATCTCAAATT
TTCGATTTTTAAAATTAAAATTTCAAAAAAAAAACAACAACTGGTTCTGGCTATTTACAG
TGTTATTTATCTATCTGGTCACTGTTTATGGGTCTGATTCAATTCTAGTGGGGAAGGGAT
GGTGTTCTTGAGCTGGGGCCGTCCATCTACCGAGCAACAACAACAAGTTATCAACAAATC
AGGAACGTTCAATTACGACAGCAAGTACAGAGGAGCTTCGTCTAGAACAGCATCTAAACT
AAAAGAAGATTCAGAAGTCAACAAAGATGGGTTCTTCATCAACCACTCTCGTGTCTTAGT
GGGTTCTGGTAAAGAGAGTTACGACAAGGGGAAACAAGCTCTTCAGAACTGGAAGCACAT
TGGTATGGATTGGGCATTTGTTGATCCCAAAACTCCGGTTGAAACCGGTAAGAAGTTTTG
CGTATGTTTGAAAGAAGTTGTTCCATGGGTGATGCTTCCTCTTCAAGTGGCTTACGTGGA
CGAAAGCAAGAAGTCTAGGAAAGGCCCCGCGCGTTTCGGTTACGGATGCGGCACCCTCGA
GGGACATTTACTAGCTGGAGAAGAGCGGTTTTCGATTGAGCTGGATGGAGATGGTAAAGT
GTGGTATGAGATAACGTCCTTGTCAAAGCCCGCTCATTTCTTGTCCTTCCTTGGTTATCC
TTATGTCAAGCTCAG*CAGAAGCACTTTGCTCATCATTCTTCTGATGCTGTC
TTAAAC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2AB80TF 662 0 0
G
GATTCGATTCTAGTGGGGAAGAGATGGTGTTCTTGAGCTGGGGCCGTCCATCTACCGAGC
AACAACAACAAGTTATCAACAAATCAGGAACGTTCAATTACGACAGCAAGTACAGAGGAG
CTTCGTCTAGAACAGCATCTAAACTAAAAGAAGGTTCAGAAGTCAACAAAGATGGGTTCT
TCATCAACCACTCTCGTGTCTTAGTGGGTTCTGGTAAAGAGAGTTACGACAAGGGGAAAC
AAGCTCTTCAGAACTGGAAGCACATTGGTATGGATTGGGCATTTGTTGATCCCAAAACTC
CGGTTGAAACCGGTAAGAAGTTTTGCTTATGTTTGAAAGAAGTTGTTCCATGGGTGATGC
TTCCTCTTCAAGTGGCTTACGTGGACGAAAGCAAGAAGTCTAGGAAAGGCCCCGCGCGTT
TCGGTTACGGATGCGGCACCCTCGAGGGACATTTACTAGCTGGAGAAGAGCGGTTTTCGA
TTGAGCTGGATGGAGATGGTAAAGTGTGGTATGAGATAACGTCCTTGTCAAAGCCCGCTC
ATTTCTTGTCCTTCCTTGGTTATCCTTATGTCAAGCTCAGGCAGAAGCACTTTGCTCATC
ATTCTTCTGATGCTGTCCTTAAACATCTTACTGCTTCTTCAAAATGACATGAA*GATATA
T

QA 2 662 2 662
DS 

RD RR2DB06JQ 758 0 0
ATTGATT
GTTTGTGAGTCTGATTCAATTCTAGTGGGGAAGAGATGGTGTTCTTGAGCTGGGGCCGTC
CATCTACCGAGCAACAACAACAAGTTATCAACAAATCAGGAACGTTCAATTACGACAGCA
AGTACAGAGGAGCTTCGTCTAGATCAGTATCTAAACTAAAAGAAGATTCAGAAGTCAACA
AAGATGGGTTCTTCATCAACCACTCTCGTGTCCTAGTTGGTTCTGGTAAAGAGAGTTACG
ACAAGGGGAAACAAGCTCTTCAGAACTGGAAGCACATTGGTATGGATTGGGCATTTGTTG
ATCCCAAAACTCCGGTTGAAACCGGTAAGAAGTTTTGCGTATGTGTGAAAGAAGTTCTTC
CGTGGGTGATGTTTCCTCTTCAAGTGGCTTACGTGGACGAAAGCAAGAAGTCTAGGAAAG
GCCCCGCGCATTTTGGTTTCGGGAGCGGCACTCTCGAGGGACATTTACTAGCTGGAGAAG
AGCGGTTTTCGATTGAGCTGGATGGAGAGGGTAAAGTGTGGTATGAGATAACGTCCTTGT
CAAAGCCGGCTCATTTCTTGTCCTTCCTTGGTTATCCTTATGTTAAGCTCAGGCAGAAGC
ACTTTGCTCATCATTCTTCTGATGCTGTCCTTAAACATCTTAGTGCTTCTTCATCTTCTT
CAAAATGATATATTTAAGTTGTATGCTTACAATAAAACAGTGTTGCATCTTTTCTTGTCT
CATATATATATTGAATAGAAGTTCTTATGG
C

QA 8 757 8 757
DS 

RD RR2A570JQ 755 0 0
G
GTTTGTGGGTCTGATTCAATTCTAGTGGGGAAGAGATGGTGTTCTTGAGCTGGGGCCGTC
CATCTACCGAGCAACAACAACAAGTTATCAACAAATCAGGAACGTTCAATTACGACAGCA
AGTACAGAGGAGCTTCGTCTAGAACAGCATCTAAACTAAAAGAAGATTCAGAAGTCAACA
AAGATGGGTTCTTCATCAACCACTCTCGTGTCTTAGTGGGTTCTGGTAAAGAGAGTTACG
ACAAGGGGAAACAAGCTCTTCAGAACTGGAAGCACATTGGTATGGATTGGGCATTTGTTG
ATCCCAAAACTCCGGTTGAAGCCGGTAAGAAGTTTTGCGTATGTTTGAAAGAAGTTGTTC
CATGGGTGATGCTTCCTCTTCAAGTGGCTTACGTGGACGAAAGCAAGAAGTCTAGGAAAG
GCCCCGCGCGTTTCGGTTACGGATGCGGCACCCTCGAGGGACATTTACTAGCTGGAGAAG
AGCGGTTTTCGATTGAGCTGGATGGAGATGGTAAAGTGTGGTATGAGATAACGTCCTTGT
CAAAGCCCGCTCATTTCTTGTCCTTCCTTGGTTATCCTTATGTCAAGCTCAGGCAGAAGC
ACTTTGCTCATCACTCTTCTGATGCTGTCCTTAAACATCTTACTGCTTCTTCAAAATGAT
ATGAA*GATATATTTAAGTTGTATGCTTACAATAAAACAGTGTTGCATCTTTTCTTGTCT
CATATATATATTGAATAGAAGTTCTTATGG
ATGC

QA 2 751 2 751
DS 

RD RR2CI80TF 702 0 0
GG
AGTGGGGAAGAGATGGTGTTCTTGAGCTGGGGCCGTCCATCCACCGAGCAACAACAACAA
GTTATCAACAAATCAGGAACGTTCAATTACGACAGCAAGTACAGAGGAGCTTCGTCTAGA
ACAGCATCTAAACTAAAAGAAGATTCAGAAGTCAACAAAGATGGGTTCTTCATCAACCAC
TCTCGTGTCTTAGTGGGTTCTGGTAAAGAGAGTTACGACAAGGGGAAACAAGCTCTTCAG
AACTGGAAGCACATTGGTATGGATTGGGCATTTGTTGATCCCAAAACTCCGGTTGAAACC
GGTAAGAAGCTTTGCGTATGTTTGAAAGAAGTTGTTCCATGGGTGATGCTTCCTCTTCAA
GTGGCTTACGTGGACGAAAGCAAGAAGTCTAGGAAAGGCCCCGCGCGTTTCGGTTACGGA
TGCGGCACCCTCGAGGGACATTTACTAGCTGGAGAAGAGCGGTTTTCGATTGAGCTGGAT
GGAGATGGTAAAGTGTGGTATGAGATAACGTCCTTGTCAAAGCCCGCTCATTTCTTGTCC
TTCCTTGGTTATCCTTATGTCAAGCTCAGGCAGAAGCACTTTGCTCATCATTCTTCTGAT
GCTGTCCTTAAACATCTTACTGCTTCTTCAAAATGATATGAA*GATATATTTAAGTTGTA
TGCTTACAATAAAACAGTGTTGCATCTTTTCTTGTCTCAT

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR2AB80JQ 737 0 0
G
GATTCGATTCTAGTGGGGAAGAGATGGTGTTCTTGAGCTGGGGCCGTCCATCTACCGAGC
AACAACAACAAGTTATCAACAAATCAGGAACGTTCAATTACGACAGCAAGTACAGAGGAG
CTTCGTCTAGAACAGCATCTAAACTAAAAGAAGGTTCAGAAGTCAACAAAGATGGGTTCT
TCATCAACCACTCTCGTGTCTTAGTGGGTTCTGGTAAAGAGAGTTACGACAAGGGGAAAC
AAGCTCTTCAGAACTGGAAGCACATTGGTATGGATTGGGCATTTGTTGATCCCAAAACTC
CGGTTGAAACCGGTAAGAAGTTTTGCTTATGTTTGAAAGAAGTTGTTCCATGGGTGATGC
TTCCTCTTCAAGTGGCTTACGTGGACGAAAGCAAGAAGTCTAGGAAAGGCCCCGCGCGTT
TCGGTTACGGATGCGGCACCCTCGAGGGACATTTACTAGCTGGAGAAGAGCGGTTTTCGA
TTGAGCTGGATGGAGATGGTAAAGTGTGGTATGAGATAACGTCCTTGTCAAAGCCCGCTC
ATTTCTTGTCCTTCCTTGGTTATCCTTATGTCAAGCTCAGGCAGAAGCACTTTGCTCATC
ATTCTTCTGATGCTGTCCTTAAACATCTTACTGCTTCTTCAAAATGACATGAA*GATATA
TTTAAGTTGTATGCTTACAATAAAACAGTGTTGCATCTTTTCTTGTCTCATATATATATT
GAATAGAAGTTCTTAT

QA 2 737 2 737
DS 

RD RR2A570TF 754 0 0
G
GTTTGTGGGTCTGATTCAATTCTAGTGGGGAAGAGATGGTGTTCTTGAGCTGGGGCCGTC
CATCTACCGAGCAACAACAACAAGTTATCAACAAATCAGGAACGTTCAATTACGACAGCA
AGTACAGAGGAGCTTCGTCTAGAACAGCATCTAAACTAAAAGAAGATTCAGAAGTCAACA
AAGATGGGTTCTTCATCAACCACTCTCGTGTCTTAGTGGGTTCTGGTAAAGAGAGTTACG
ACAAGGGGAAACAAGCTCTTCAGAACTGGAAGCACATTGGTATGGATTGGGCATTTGTTG
ATCCCAAAACTCCGGTTGAAGCCGGTAAGAAGTTTTGCGTATGTTTGAAAGAAGTTGTTC
CATGGGTGATGCTTCCTCTTCAAGTGGCTTACGTGGACGAAAGCAAGAAGTCTAGGAAAG
GCCCCGCGCGTTTCGGTTACGGATGCGGCACCCTCGAGGGACATTTACTAGCTGGAGAAG
AGCGGTTTTCGATTGAGCTGGATGGAGATGGTAAAGTGTGGTATGAGATAACGTCCTTGT
CAAAGCCCGCTCATTTCTTGTCCTTCCTTGGTTATCCTTATGTCAAGCTCAGGCAGAAGC
ACTTTGCTCATCACTCTTCTGATGCTGTCCTTAAACATCTTACTGCTTCTTCAAAATGAT
ATGAA*GATATATTTAAGTTGTATGCTTACAATAAAACAGTGTTGCATCTTTTCTTGTCT
CATATATATATTGAATAGAAGTTCTTATGG
ATG

QA 2 751 2 751
DS 

RD RR2FH43JQ 729 0 0
CAAGTACAGAGGAGCTTCGTCTAGAACAGCATCTAAACTAAAAGAAGATTCAGAAGTCAA
CAAAGATGGGTTCTTCATCAACCACTCTCGTGTCTTAGTGGGTTCTGGTAAAGAGAGTTA
CGACAAGGGGAAACAAGCTCTTCAGAACTGGAAGCACATTGGTATGGATTGGGCATTTGT
TGATCCCAAAACTCCGGTTGAAACCGGTAAGAAGTTTTGCGTATGTTTGAAAGAAGTTGT
TCCATGGGTGATGCTTCCTCTTCAAGTGGCTTACGTGGACGAAAGCAAGAAGTCTAGGAA
AGGCCCCGCGCGTTTCGGTTACGGATGCGGCACCCTCGAGGGACATTTACTAGCTGGAGA
AGAGCGGTTTTCGATTGAGCTGGATGGAGATGGTAAAGTGTGGTATGAGATAACGTCCTT
GTCAAAGCCCGCTCATTTCTTGTCCTTCCTTGGTTATCCTTATGTCAAGCTCAGGCAGAA
GCACTTTGCTCATCATTCTTCTGATGCTGTCCTTAAACATCTTACTGCTTCTTCAAAATG
ATATGAA*GATATATTTAAGTTGTATGCTTACAATAAAACAGTGTTGCATCTTTTCTTGT
CTCATATATATATTGAATAGAAGTTCTTATGGATGCATAATCTTATTAGCACAATTTGTT
GAAGAGAATGGTTTCTGGTCGAGGCTTGAGAAGTACTAACTCTCGGGCGATAAAATATCA
TTGATTGTC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 2 12

CO CL349Contig1 1140 6 20 U
AGGGATCTCAAGACAAGGAAAAAACTCGAGAAACCAAACACAGTAGACATGAGTTTGAAT
CTCGTATCATCGTCTTCAACCTCAAACCATGTTTTCCTTTCGAATCCGATTCGGTCAGGG
AGAGAACTGAATATCTTAAGCCGACACCAGAGAATCCCAAAAAGAGCGAAACCCTTTTGC
GTTAGGTCTTCGATAAACTTGTCTGGACCCAAACCCAGACAAACCCTGTCTAGTAACTGG
GATGTGTCTAAATTCTCCGTTGATGCCGTTGCTCAATCTCCTTCTCGTCTCCCCAGCTTC
GAGGAACTCGACACCACAAACATGCTTCTCCGTCAAAGAATCGTCTTCCTCGGTTCTCAG
GTAGATGATATGACAGCAGATTTGGTGATAAGTCAGCTCTTGTTACTAGATGCTCAGGAC
TCTGAGAGAGACATCACGCTCTTTATCAATTCACCCGGTGGTTCCATCACTGCTGGGATG
GGAATATATGATGCAATGAAACAATGCAAGGCAGACGTTTCGACTGTTTGCTTAGGACTA
GCTGCATCCATGGGTGCGTTTCTCCTTACTTCTGGTTCCAAAGGCAAACGTTTCTGCATG
CCTAACTCTAAAGTTATGATCCATCAACCACTTGGTTCCGCCGGAGGCAAAGCAACGGAA
ATGAGCATTCGCGTTAGAGAAATGATGTACCACAAGATTAAACTCAACAAAATCTTCTCT
AGAATCACCGGGAAGCCCGAATCAGAGATTGAAGGTGACACAGACCGTGACTACTTCTTG
AATCCATGGGAGGCCAAAGAGTATGGATTGGTAGACGCTGTAATCGATGATGGCAAACCG
GGACTAGTCGCACCAATAGGAGATGGTACTCCTCCACCAAACACCAAAGTGTGGGATTTT
TGGAAAGTTGAAGGAACCAAGAACGATAATAAAGATTTGCCAACCGAGCAATCCGTCATA
CAGAATGGCTCCGCCACTCCTGAATAGAAAATGTTGTTCCCGCCTTTACTGTTTCTTTTT
TAAATTATTTATGTTTTAATGTGCTAGCTGCAACCATAACAATGCGTTTTCTGTGTTTGT
ACCATTTCTCGGATAGATTTTTGGAGTTATTTGAAGACAGAAAAAAAGATTAGTTGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 0 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D167TF U 1
AF RR2CD17TF U 55
AF RR2FV94TF U 55
AF RR2BH38TF U 33
AF RR2GS15TF U 670
AF RR2D167JQ C 418
BS 1 77 RR2D167TF
BS 78 78 RR2FV94TF
BS 79 158 RR2D167TF
BS 159 159 RR2FV94TF
BS 160 210 RR2D167TF
BS 211 211 RR2FV94TF
BS 212 218 RR2D167TF
BS 219 219 RR2FV94TF
BS 220 347 RR2D167TF
BS 348 348 RR2FV94TF
BS 349 394 RR2D167TF
BS 395 395 RR2BH38TF
BS 396 431 RR2D167TF
BS 432 432 RR2BH38TF
BS 433 506 RR2D167TF
BS 507 753 RR2BH38TF
BS 754 754 RR2GS15TF
BS 755 853 RR2BH38TF
BS 854 1013 RR2GS15TF
BS 1014 1140 RR2D167JQ

RD RR2D167TF 506 0 0
AGGGATCTCAAGACAAGGAAAAAACTCGAGAAACCAAACACAGTAGACATGAGTTTGAAT
CTCGTATCATCGTCTTCTACCTCAAACCATGTTTTCCTTTCGAATCCGATTCGGTCAGGG
AGAGAACTGAATATCTTAAGCCGACACCAGAGAATCCCCAAAAGAGCGAAACCCTTTTGC
GTTAGGTCTTCGATAAACTTGTCTGGACCCCAACCCAGGCAAACCCTGTCTAGTAACTGG
GATGTGTCTAAATTCTCCGTTGATGCCGTTGCTCAATCTCCTTCTCGTCTCCCCAGCTTC
GAGGAACTCGACACCACAAACATGCTTCTCCGTCAAAGAATCGTCTTTCTCGGTTCTCAG
GTAGATGATATGACAGCAGATTTGGTGATAAGTCGGCTCTTGTTACTAGATGCTCAGGAC
TCTGAGAGAGATATCACGCTCTTTATCAATTCACCCGGTGGTTCCATCACTGCTGGGATG
GGAATATATGATGCAATGAAACAATG

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2CD17TF 705 0 0
TTGAATCTCGTATCATCGTCTTCAACCTCAAACCATGTTTTCCTTTCGAATCCGATTCGG
TCAGGGAGAGAACTGAATATCTTAAGCCGACACCAGAGAATCCCAAAAAGAGCGAAACCC
TTTTGCGTTAGTTCTTCGCTGAACTTGTCTGGACCCAGACCCAGACAAACCCTGTCTAGT
AACTGGGATGTATCTAAATTCTCCGTTGATGCCGTTGCTCAATCCCCTTCTCGTCTCCCC
AGCTTCGAGGAACTCGACACCACAAACATGCTTCTCCGTCAAAGAATCGTCTTCCTCGGT
TCTCAGGTAGATGATATGACAGCAGATTTGGTGATAAGTCAGCTCTTGTTACTAGATGCT
CAGGACTCTGAGAGAGACATCACGCTCTTTATCAATTCACCTGGTGGTTCTATCACTGCT
GGGATGGGAATATATGATGCGATGAAACAATGCAAGGCCGACGTTTCGACTGTTTGCCTA
GGGCTAGCTGCATCCATGGGTGCGTTTCTCCTTGCTTCTGGTTCCAAAGGGAAACGGTTC
TGCATGCCTAACTCTAAAGTTATGATCCATCAGCCACTTGGTTCCGCCGGAGGCAAAGCA
ACGGAAATGAGCATTCGCGTAAGAGAAATGATGTACCACAAGATTAAACTTAACAAAATC
TTCTCTAGAATCACCGGGAAGCCCGAATCAGAGATTGAA*GTGAC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2FV94TF 736 0 0
TTGAATCTCGTATCATCGTCTTCAACCTCAAACCATGTTTTCCTTTCGAATCCGATTCGG
TCAGGGAGAGAACTGAATATCTTAAGCCGACACCAGAGAATCCCAAAAAGAGCGAAACCC
TTTTGCGTTAGTTCTTCGCTGAACTTGTCTGGACCCAGACCCAGACAAACCCTGTCTAGT
AACTGGGATGTGTCTAAATTCTCCGTTGATGCCGTTGCTCAATCTCCTTCTCGTCTCCCC
AGCTTCGAGGAACTCGACACCACAAACATGCTTCTCCGTCAAAGAATCGTCTTCCTCGGT
TCTCAGGTAGATGATATGACAGCAGATTTGGTGATAAGTCAGCTCTTGTTACTAGATGCT
CAGGACTCTGAGAGAGACATCACGCTCTTTATCAATTCACCTGGTGGTTCTATCACTGCT
GGGATGGGAATATATGATGCGATGAAACAATGCAAGGCCGACGTTTCGACTGTTTGCCTA
GGGCTAGCTGCATCCATGGGTGCGTTTCTCCTTGCTTCTGGTTCCAAAGGGAAACGGTTC
TGCATGCCTAACTCTAAAGTTATGATCCATCAGCCACTTGGTTCCGCCGGAGGCAAAGCA
ACGGAAATGAGCATTCGCGTAAGAGAAATGATGTACCACAAGATTAAACTTAACAAAATC
TTCTCTAGAATCACCGGGAAGCCCGAATCAGAGATTGAA*GTGACACAGACCGTGATTAC
TTCTTGAATCCATGGG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2BH38TF 822 0 0
GGA
AAACACAGTAGACATGAGTTTGAATCTCGTATCATCGTCTTCTACCTCAAACCATGTTTT
CCTTTCGAATCCGATTCGGTCAGGGAGAGAACTGAATATCTTAAGCCGACACCAGAGAAT
CCCCAAAAGAGCGAAACCCTTTTGCGTTAGGTCTTCGATAAACTTGTCTGGACCCCAACC
CAGGCAAACCCTGTCTAGTAACTGGGATGTGTCTAAATTCTCCGTTGATGCCGTTGCTCA
ATCTCCTTCTCGTCTCCCCAGCTTCGAGGAACTCGACACCACAAACATGCTTCTCCGTCA
AAGAATCGTCTTTCTCGGTTCTCAGGTAGATGATATGACAGCAGATTTGGTGATAAGTCA
GCTCTTGTTACTAGATGCTCAGGACTCTGAGAGAGACATCACGCTCTTTATCAATTCACC
CGGTGGTTCCATCACTGCTGGGATGGGAATATATGATGCAATGAAACAATGCAAGGCAGA
CGTTTCGACTGTTTGCTTAGGACTAGCTGCATCCATGGGTGCGTTTCTCCTTACTTCTGG
TTCCAAAGGCAAACGTTTCTGCATGCCTAACTCTAAAGTTATGATCCATCAACCACTTGG
TTCCGCCGGAGGCAAAGCAACGGAAATGAGCATTCGCGTTAGAGAAATGATGTACCACAA
GATTAAACTCAACAAAATCTTCTCTAGAATCACCGGGAAGCCCGAATCAGAGATTGAAAG
TGACACAGACCGTGACTACTTCTTGAATCCATGGGAGGCCAAAGAGTATGGATTGGTAGA
CGCTGTAATCGATGATGGCAAACCGGGACTAGTCGCAC
A

QA 4 821 4 821
DS 

RD RR2GS15TF 344 0 0
G
GCGTTAGAGAAATGATGTACCACAAGATTAAACTCGACAAAATCTTCTCTAGAATCACCG
GGAAGCCCGAATCAGAGATTGAAGGTGACACAGACCGTGACTACTTCTTGAATCCATGGG
AGGCCAAAGAGTATGGATTGGTAGACGCTGTAATCGATGATGGCAAACCGGGACTAGTCG
CACCAATAGGAGATGGTACTCCTCCACCAAACACCAAAGTGTGGGATTTTTGGAAAGTTG
AAGGAACCAAGAACGATAATAAAGATTTGCCAACCGAGCAATCCGTCATACAGAATGGCT
CCGCCACTCCTGAATAGAAAATGTTGTTCCCGCCTTTACTGTT

QA 2 344 2 344
DS 

RD RR2D167JQ 723 0 0
GACTCTGAGAGAGATATCACGCTCTTTATCAATTCACCCGGTGGTTCCATCACTGCTGGG
ATGGGAATATATGATGCAATGAAACAATGCAAGGCAGACGTTTCGACTGTTTGCTTAGGA
CTAGCTGCATCCATGGGTGCGTTTCTCCTTACTTCTGGTTCCAAAGGCAAACGTTTCTGC
ATGCCTAACTCTAAAGTTATGATCCATCAACCACTTGGTTCCGCCGGAGGCAAAGCAACG
GAAATGAGCATTCGCGTTAGAGAAATGATGTACCACAAGATTAAACTCAACAAAATCTTC
TCTAGAATCACCGGGAAGCCCGAATCAGAGATTGAAGGTGACACAGACCGTGACTACTTC
TTGAATCCATGGGAGGCCAAAGAGTATGGATTGGTAGACGCTGTAATCGATGATGGCAAA
CCGGGACTAGTCGCACCAATAGGAGATGGTACTCCTCCACCAAACACCAAAGTGTGGGAT
TTTTGGAAAGTTGAAGGAACCAAGAACGATAATAAAGATTTGCCAACCGAGCAATCCGTC
ATACAGAATGGCTCCGCCACTCCTGAATAGAGATTGTTGTTGCCGCCTTTACTGTTTCTT
TTTTAAATTATTTATGTTTTAATGTGCTAGCTGCAACCATAACAATGCGTTTTCTGTGTT
TGTACCATTTCTCGGATAGATTTTTGGAGTTATTTGAAGACAGAAAAAAAGATTAGTTGT
TGT

QA 1 723 1 723
DS 



CO CL349Contig2 1168 6 14 U
GGGAAACCAAACACAGTAGAGATGAGTTTGAATCTCGTATCATCGTCTTCAACCTCTAAC
CATGTTTCCCTTTTGAATCCGATTCGGTCAGGGAGAGAACTGAGTATCTTAAGCCGACAC
CATAGAATCCCTAAAAGAGCGAAACCCTTTTGCGTTAGGTCTTCGATAAACTTGTCTGGA
CCCCAACGCAGACAAACCCTGTCTAGTAACTGGGATGTGTCTAAATTCTCCGTTGATGCC
GTTGCTCAATCTCCTTCTCGTCTCCCCAGCTTCGAGGAACTCGACACCACAAACATGCTT
CTCCGTCAAAGAATCGTCTTCCTCGGTTCTCAGGTAGATGATATGACAGCAGATTTGGTG
ATAAGTCAGCTCTTGTTACTAGATGCTCAGGACTCTGAGAGAGACATCACGCTCTTTATC
AATTCACCCGGTGGTTCCATCACTGCTGGGATGGGAATATATGATGCAATGAAACAATGC
AAGGCAGACGTTTCGACTGTTTGCTTAGGACTAGCTGCATCCATGGGTGCGTTTCTCCTT
ACTTCTGGTTCCAAAGGCAAACGTTTCTGCATGCCTAACTCTAAAGTTATGATCCATCAA
CCACTTGGTTCCGCCGGAGGCAAAGCAACGGAAATGAGCATTCGCGTTAGAGAAATGATG
TACCACAAGATTAAACTCAACAAAATCTTCTCTAGAATCACCGGGAAGCCCGAATCAGAG
ATTGAAG*TGACACAGACCGTGATTACTTCTTGAATCCATGGGAGGCGAAAGAGTACGGA
TTGGTAGACGCTGTAATCGATGATGGCAAAACGGGATTAGTGGCACCAATTGGAGATGGT
ACTCCTCCACCTAACACCAAAGTGTGGGATTTTTGGAAAGTTGAAGGAACCAAGAACGAT
AATAAAGATTTGCCGACCGAGCAATCCGTCGTACAGAATGGCTCCGCCACTCCTGAATAG
AGAATGTTGTTGCCGCCTTTACTGTTTCTTTTTAAATTATTTATGTTTTAATGTGCTAGC
TGCAACCATAACAATGCGTTTTCTGTGTTTGTACCATTTCTCGGATAGATTTTTGGAGTT
ATTTGAAGACAGAAAAAAAGATTAGTTGTTGTAGGACAGAAGGTGCACCAGCTACATTGA
TCAGCTTCGGAGAGTTTGTTTGAGAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 5 10 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B952TF U 193
AF RR2FH83TF U 1
AF RR2BT56TF U 12
AF RR2D508TF U 4
AF RR2FV94JQ C 408
AF RR2CD17JQ C 378
BS 1 238 RR2FH83TF
BS 239 239 RR2D508TF
BS 240 706 RR2FH83TF
BS 707 707 RR2D508TF
BS 708 743 RR2FH83TF
BS 744 744 RR2CD17JQ
BS 745 767 RR2D508TF
BS 768 768 RR2CD17JQ
BS 769 771 RR2D508TF
BS 772 772 RR2CD17JQ
BS 773 776 RR2D508TF
BS 777 777 RR2CD17JQ
BS 778 781 RR2D508TF
BS 782 1168 RR2CD17JQ

RD RR2B952TF 487 0 0
CAAACCCTGTCTAGTAACTGGGATGTGTCTAAATTCTCCGTTGATGCCGTTGCTCAATCT
CCTTCTCGTCTCCCCAGCTTCGAGGAACTCGACACCACAAACATGCTTCTCCGTCAAAGA
ATCGTCTTCCTCGGTTCTCAGGTAGATGATATGACAGCAGATTTGGTGATAAGTCAGCTC
TTGTTACTAGATGCTCAGGACTCTGAAAGAGACATCACGCTCTTTATCAATTCACCCGGT
GGTTCCATCACTGCTGGGATGGGAATATATGATGCAATGAAACAATGCAAGGCAGACGTT
TCGACTGTTTGCTTAGGACTAGCTGCATCCATGGGTGCGTTTCTCCTTACTTCTGGTTCC
AAAGGCAAACGTTTCTGCATGCCTAACTCTAAAGTTATGATCCATCAACCACTTGGTTCC
GCCGGAGGCAAAGCAACGGAAATGAGCATTCGCGTTAGAGAAATGATGTACCACAAGATT
AAACTCA

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR2FH83TF 743 0 0
GGGAAACCAAACACAGTAGAGATGAGTTTGAATCTCGTATCATCGTCTTCAACCTCTAAC
CATGTTTCCCTTTTGAATCCGATTCGGTCAGGGAGAGAACTGAGTATCTTAAGCCGACAC
CATAGAATCCCTAAAAGAGCGAAACCCTTTTGCGTTAGGTCTTCGATAAACTTGTCTGGA
CCCCAACGCAGACAAACCCTGTCTAGTAACTGGGATGTGTCTAAATTCTCCGTTGATGTC
GTTGCTCAATCTCCTTCTCGTCTCCCCAGCTTCGAGGAACTCGACACCACAAACATGCTT
CTCCGTCAAAGAATCGTCTTCCTCGGTTCTCAGGTAGATGATATGACAGCAGATTTGGTG
ATAAGTCAGCTCTTGTTACTAGATGCTCAGGACTCTGAGAGAGACATCACGCTCTTTATC
AATTCACCCGGTGGTTCCATCACTGCTGGGATGGGAATATATGATGCAATGAAACAATGC
AAGGCAGACGTTTCGACTGTTTGCTTAGGACTAGCTGCATCCATGGGTGCGTTTCTCCTT
ACTTCTGGTTCCAAAGGCAAACGTTTCTGCATGCCTAACTCTAAAGTTATGATCCATCAA
CCACTTGGTTCCGCCGGAGGCAAAGCAACGGAAATGAGCATTCGCGTTAGAGAAATGATG
TACCACAAGATTAAACTCAACAAAATCTTCTCTAGAATCACCGGGA*GCCCGAATCAGAG
ATTGAAG*TGACACAGACCGTGA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2BT56TF 732 0 0
CACAGTAGAGATGAGTTTGAATCTCGTATCATCGTCTTCAACCTCTAACCATGTTTCCCT
TTTGAATCCGATTCGGTCAGGGAGAGAACTGAGTATCTTAAGCCGACACCATAGAATCCC
TAAAAGAGCGAAACCCTTTTGCGTTAGGTCTTCGATAAACTTGTCTGGACCCCAACGCAG
ACAAACCCTGTCTAGTAACTGGGATGTGTCTAAATTCTCCGTTGATGCCGTTGCTCAATC
TCCTTCTCGTCTCCCCAGCTTCGAGGAACTCGACACCACAAACATGCTTCTCCGTCAAAG
AATCGTCTTCCTCGGTTCTCAGGTAGATGATATGACAGCAGATTTGGTGATAAGTCAGCT
CTTGTTACTAGATGCTCAGGACTCTGAGAGAGACATCACGCTCTTTATCAATTCACCCGG
TGGTTCCATCACTGCTGGGATGGGAATATATGATGCAATGAAACAATGCAAGGCAGACGT
TTCGACTGTTTGCTTAGGACTAGCTGCATCCATGGGTGCGTTTCTCCTTACTTCTGGTTC
CAAAGGCAAACGTTTCTGCATGCCTAACTCTAAAGTTATGATCCATCAACCACTTGGTTC
CGCCGGAGGCAAAGCAACGGAAATGAGCATTCGCGTTAGAGAAATGATGTACCACAAGAT
*AAACTCAACAAA*TCTTCTCTAGA*TCACCGGGAAGCC*GAATCAGAGATTGAAG*TGA
CACAGACCGTGA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2D508TF 779 0 0
GGACC
AAACACAGTAGAGATGAGTTTGAATCTCGTATCATCGTCTTCAACCTCTAACCATGTTTC
CCTTTTGAATCCGATTCGGTCAGGGAGAGAACTGAGTATCTTAAGCCGACACCATAGAAT
CCCTAAAAGAGCGAAACCCTTTTGCGTTAGGTCTTCGATAAACTTGTCTGGACCCCAACG
CAGACAAACCCTGTCTAGTAACTGGGATGTGTCTAAATTCTCCGTTGATGCCGTTGCTCA
ATCTCCTTCTCGTCTCCCCAGCTTCGAGGAACTCGACACCACAAACATGCTTCTCCGTCA
AAGAATCGTCTTCCTCGGTTCTCAGGTAGATGATATGACAGCAGATTTGGTGATAAGTCA
GCTCTTGTTACTAGATGCTCAGGACTCTGAGAGAGACATCACGCTCTTTATCAATTCACC
CGGTGGTTCCATCACTGCTGGGATGGGAATATATGATGCAATGAAACAATGCAAGGCAGA
CGTTTCGACTGTTTGCTTAGGACTAGCTGCATCCATGGGTGCGTTTCTCCTTACTTCTGG
TTCCAAAGGCAAACGTTTCTGCATGCCTAACTCTAAAGTTATGATCCATCAACCACTTGG
TTCCGCCGGAGGCAAAGCAACGGAAATGAGCATTCGCGTTAGAGAAATGATGTACCACAA
GATTAAACTCAACAAAATCTTCTCTAGAATCACCGGGAAGCCCGAATCAGAGATTGAAG*
TGACACAGACCGTGACTACTTCTTGAATCCATGGGAGGCCAAATAGTATGGAT
G

QA 6 778 6 778
DS 

RD RR2FV94JQ 658 0 0
CACGCTCTTTATCAATTCACCTGGTGGTTCTATCACTGCTGGGATGGGAATATATGATGC
GATGAAACAATGCAAGGCCGACGTTTCGACTGTTTGCCTAGGGCTAGCTGCATCCATGGG
TGCGTTTCTCCTTGCTTCTGGTTCCAAAGGGAAACGGTTCTGCATGCCTAACTCTAAAGT
TATGATCCATCAGCCACTTGGTTCCGCCGGAGGCAAAGCAACGGAAATGAGCATTCGCGT
AAGAGAAATGATGTACCACAAGATTAAACTTAACAAAATCTTCTCTAGAATCACCGGGAA
GCCCGAATCAGAGATTGAAGGTGACACAGACCGTGATTACTTCTTGAATCCATGGGAGGC
GAAAGAGTACGGATTGGTAGACGCTGTAATCGATGATGGCAAAACGGGATTAGTGGCACC
AATTGGAGATGGTACTCCTCCACCTAACACCAAAGTGTGGGATTTTTGGAAAGTTGAAGG
AACCAAGAACGATAATAAAGATTTGCCGACCGAGCAATCCGTCGTACAGAATGGCTCCGC
CACTCCTGAATAGAGAATGTTGTTGCCGCCTTTACTGTTTCTTTTTAAATTATTTATGTT
TTAATGTGCTAGCTGCAACCATAACAATGCGTTTTCTGTGTTTGTAC
CATTTCTCGGA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2CD17JQ 791 0 0
ACTAGATGCTCAGGACTCTGAGAGAGACATCACGCTCTTTATCAATTCACCTGGTGGTTC
TATCACTGCTGGGATGGGAATATATGATGCGATGAAACAATGCAAGGCCGACGTTTCGAC
TGTTTGCCTAGGGCTAGCTGCATCCATGGGTGCGTTTCTCCTTGCTTCTGGTTCCAAAGG
GAAACGGTTCTGCATGCCTAACTCTAAAGTTATGATCCATCAGCCACTTGGTTCCGCCGG
AGGCAAAGCAACGGAAATGAGCATTCGCGTAAGAGAAATGATGTACCACAAGATTAAACT
TAACAAAATCTTCTCTAGAATCACCGGGAAGCCCGAATCAGAGATTGAAGGTGACACAGA
CCGTGATTACTTCTTGAATCCATGGGAGGCGAAAGAGTACAGATTGGTAGACGCTGTAAT
CGATGATGGCAAAACGGGATTAGTGGCACCAATTGGAGATGGTACTCCTCCACCTAACAC
CAAAGTGTGGGATTTTTGGAAAGTTGAAGGAACCAAGAACGATAATAAAGATTTGCCGAC
CGAGCAATCCGTCGTACAGAATGGCTCCGCCACTCCTGAATAGAGAATGTTGTTGCCGCC
TTTACTGTTTCTTTTTAAATTATTTATGTTTTAATGTGCTAGCTGCAACCATAACAATGC
GTTTTCTGTGTTTGTACCATTTCTCGGATAGATTTTTGGAGTTATTTGAAGACAGAAAAA
AAGATTAGTTGTTGTAGGACAGAAGGTGCACCAGCTACATTGATCAGCTTCGGAGAGTTT
GTTTGAGAGAA

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 12

CO CL350Contig1 1100 12 30 U
GGGACCAAACATCCTCTCAAATTCGCTTCTAGGGTTTCCCTAAATTCTCAAACTTTCTCT
CCAATTTCGACTTCTTGAAACCATGGTTCGTTGTAGCAACAACCTCGTTGGTATACTCAA
CTTCATCGTCTTCCTCCTCTCTATTCCCATCTTAGCTGGAGGAATCTGGCTCAGCCAAAA
CGGCTCAACGGAGTGTGAGCGTTTCCTCGACAAACCCGTGATCGCTCTCGGAGTTTTCCT
CATGGTTGTAGCAATCGCTGGTTTGATTGGTTCCTGTTGCAGAGTCACATGGCTTCTCTG
GACTTACCTCTTTGTCATGTTCCTCTTGATTCTCCTCGTCTTCTCAGTTACGGTTTTCGC
CTTTGTCGTTACTAACAAAGGCGCCGGCGAGAAGGTTTCTGGGAGAGGGTATAAAGAGTA
TAGACTTGGAGATTACTCTAACTGGTTGCAGAAACGTGTGGACAGCGACAAGAACTGGAA
TAAGATTAGGAGTTGTCTCGTTGACAGCAAGGTTTGTTCTAAGCTTGAAGCTAAGCTTGT
TAATGTTCCTGTCACCAACTTCTACAACCAACATCTTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTG
CAAACCCTCAGAACAATGCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGACCAAGACGGC
TGGAACACATGCTAATCCAGACTGCCAAAGCTGGGACAACGCACCAAACAAGCTCTGCTT
CGATTGCCAATCTT*GCAAGGCGGGTCTTCTCGACAACGTCAAGAGCGCATGGAAGAAAG
TTGCAGTGGTCAACAGCATCTTCCTTGTCTTCCTTATCATTGTCTACTCTGTTGGTTGCT
GTGCTTTTAGGAACAACAAGAGAGATGACAGTCATGGCTATGGATATAAGCCTTGAAGGC
TTTTGAGTGTTTTAAAACAGAGATTCGTTCATTGTTCTTTATGACACGCAGCGCTGGAGT
TTGCTTTTATGTTTTTATGGATTTAACATCTTGGTGTTTTGAGACCTATTGCTTGTACAG
CTCTCTTATGATACTTGTTAGTGTGTTCTGGCTAAACCATGATATTGTTTTATTATATGT
TCTTTTTTTCCATTTTTCTC


BQ
10 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 25 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 50 65 65 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 30 60 60 60 45 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G791TF U 1
AF RR2EV91TF U 2
AF RR2AB29TF U 2
AF RR2G448TF U 2
AF RR2AC68TF U 2
AF RR2A022TF U -3
AF RR2FP93TF U 1
AF RR2FP93JQ C 273
AF RR2FA79JQ C 391
AF RR2AB29JQ C 312
AF RR2EV91JQ C 350
AF RR2G448JQ C 521
BS 1 104 RR2G791TF
BS 105 106 RR2AB29TF
BS 107 207 RR2G791TF
BS 208 208 RR2AB29TF
BS 209 251 RR2G791TF
BS 252 252 RR2AB29TF
BS 253 345 RR2G791TF
BS 346 346 RR2AB29TF
BS 347 348 RR2G791TF
BS 349 349 RR2AB29TF
BS 350 384 RR2G791TF
BS 385 385 RR2AB29TF
BS 386 568 RR2G791TF
BS 569 569 RR2AB29TF
BS 570 654 RR2G791TF
BS 655 734 RR2AB29TF
BS 735 735 RR2AC68TF
BS 736 759 RR2AB29TF
BS 760 770 RR2AC68TF
BS 771 771 RR2A022TF
BS 772 787 RR2AC68TF
BS 788 788 RR2A022TF
BS 789 795 RR2AC68TF
BS 796 796 RR2A022TF
BS 797 800 RR2AC68TF
BS 801 801 RR2A022TF
BS 802 832 RR2AC68TF
BS 833 1004 RR2FP93JQ
BS 1005 1087 RR2AB29JQ
BS 1088 1100 RR2G448JQ

RD RR2G791TF 654 0 0
GGGACCAAACATCCTCTCAAATTCGCTTCTAGGGTTTCCCTAAATTCTCAAACTTTCTCT
CCAATTTCGACTTCTTGAAACCATGGTTCGTTGTAGCAACAACCCTGTTGGTATACTCAA
CTTCATCGTCTTCCTCCTCTCTATTCCCATCTTAGCTGGAGGAATCTGGCTCAGCCAAAA
CGGCTCAACGGAGTGTGAGCGTTTCCTGGACAAACCCGTGATCGCTCTCGGAGTTTTCCT
CATGGTTGTAGTAATCGCTGGTTTGATTGGTTCCTGTTGCAGAGTCACATGGCTTCTCTG
GACTTACCTCTTTGTCATGTTCCTCTTGATTCTCCTCGTCTTCTCCGTAACGGTTTTCGC
CTTTGTCGTTACTAACAAAGGCGCAGGCGAGAAGGTTTCTGGGAGAGGGTATAAAGAGTA
TAGACTTGGAGATTACTCTAACTGGTTGCAGAAACGTGTGGACAGCGACAAGAACTGGAA
TAAGATTAGGAGTTGTCTCGTTGACAGCAAGGTTTGTTCTAAGCTTGAAGCTAAGCTTGT
TAATGTTCCTGTCACCAACTTCTACAACGAACATCTTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTG
CAAACCCTCAGAACAATGCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGACCAA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2EV91TF 650 0 0
GGACCAAACATCCTCTCAAATTCGCTTCTAGGGTTTCCCTAAATTCTCAAACTTTCTCTC
CAATTTCGACTTCTTGAAACCATGGTTCGTTGTAGCAACAACCTTGTTGGTATACTCAAC
TTCATCGTCTTCCTCCTCTCTATTCCCATCTTAGCTGGAGGAATCTGGCTCAGCCAAAAC
GGCTCAACGGAGTGTGAGCGTTTCCTGGACAAACCCGTGATCGCTCTCGGAGTTTTCCTC
ATGGTTGTAGCAATCGCTGGTTTGATTGGTTCCTGTTGCAGAGTCACATGGCTTCTCTGG
ACTTACCTCTTTGTCATGTTCCTCTTGATTCTCCTCGTCTTCTCCGTAACGGTTTTCGCC
TTTGTCGTTACTAACAAAGGCGCAGGCGAGAAGGTTTCTGGGAGAGGGTATAAAGAGTAT
AGACTTGGAGATTACTCTAACTGGTTGCAGAAACGTGTGGACAGCGACAAGAACTGGAAT
AAGATTAGGAGTTGTCTCGTTGACAGCAAGGTTTGTTCTAAGCTTGAAGCTAAGCTTGTT
AATGTTCCTGTCACCAACTTCTACAACGAACATCGTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTGC
AAACCCTCAGAACAATGCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGAC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2AB29TF 758 0 0
GGACCAAACATCCTCTCAAATTCGCTTCTAGGGTTTCCCTAAATTCTCAAACTTTCTCTC
CAATTTCGACTTCTTGAAACCATGGTTCGTTGTAGCAACAACCTCGTTGGTATACTCAAC
TTCATCGTCTTCCTCCTCTCTATTCCCATCTTAGCTGGAGGAATCTGGCTCAGCCAAAAC
GGCTCAACGGAGTGTGAGCGTTTCCTCGACAAACCCGTGATCGCTCTCGGAGTTTTCCTC
ATGGTTGTAGCAATCGCTGGTTTGATTGGTTCCTGTTGCAGAGTCACATGGCTTCTCTGG
ACTTACCTCTTTGTCATGTTCCTCTTGATTCTCCTCGTCTTCTCAGTTACGGTTTTCGCC
TTTGTCGTTACTAACAAAGGCGCCGGCGAGAAGGTTTCTGGGAGAGGGTATAAAGAGTAT
AGACTTGGAGATTACTCTAACTGGTTGCAGAAACGTGCGGACAGCGACAAGAACTGGAAT
AAGATTAGGAGTTGTCTCGTTGACAGCAAGGTTTGCTCTAAGCTTGAAGCTAAGCTTGTT
AATGTTCCTGTCACCAACTTCTACAACCAACATCTTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTGC
AAACCCTCAGAACAATGCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGACCAAGACGGCT
GGAACACATGCTAATCCAGACTGCCAAAGCTGGGACAACGCACCAAACAAGCTCTGCTTC
GATTGCCAATCTTTGCAAGGCGGGTCTTCTCGACAACG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2G448TF 732 0 0
GGACCAAACATCCTCTCAAATTCGCTTCTAGGGTTTCCCTAAATTCTCAAACTTTCTCTC
CAATTTCGACTTCTTGAAACCATGGTTCGTTGTAGCATCAACCTCGTTGGTATACTCAAC
TTCATCGTCTTCCTCCTCTCTATTCCCATCTTAGCTGGAGGGATCTGGCTCAGCCAAAAC
GGCTCAACGGAGTGTGAGCGTTTCCTCGACAAACCCGTGATCGCTCTCGGAGTTTTCCTC
ATGGTTGTAGCAATCGCTGGTTTGATTGGTTCCTGTTGCAGAGTCACATGGCTTCTCTGG
ACTTACCTCTTTGTCATGTTCCTCTTGATTCTCCCCGTCTTCTCAGTTACGGTTTTCGCC
TTTGTCGTTACTAACAAAGGCGCCGGCGAGAAGGTTTCTGGGAGAGGGTATAAAGAGTAT
AGACTTGGAGATTACTCTAACTGGTTGCAGAAACGTGTGGACAGCGACAAGAACTGGAAT
AAGATTAGGAGTTGTCTCGTTGACAGCAAGGTTTGTTCTAAGCTTGAAGCTAAGCTTGTT
AATGTTCCTGTCACCAACTTCTACAACCAACATCTTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTGC
AAACCCTCAGAACAATGCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGAC*AAGACGGCT
GGAACACATGCTAATCCAGACTGCCAAAGCTGGGACAACGCACCAAACAAGCTCTGCTTC
GATTGCCA
TCTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2AC68TF 831 0 0
GGACCAAACATCCTCTCAAATTCGCTTCTAGGGTTTCCCTAAATTCTCAAACTTTCTCTC
CAATTTCGACTTCTTGAAACCATGGTTCGTTGTAGCAACAACCTTGTTGGTATACTCAAC
TTCATCGTCTTCCTCCTCTCTATTCCCATCTTAGCTGGAGGAATCTGGCTCAGCCAAAAC
GGCTCAACGGAGTGTGAGCGTTTCCTGGACAAACCCGTGATCGCTCTCGGAGTTTTCCTC
ATGGTTGTAGCAATCGCTGGTTTGATTGGTTCCTGTTGCAGAGTCACATGGCTTCTCTGG
ACTTACCTCTTTGTCATGTTCCTCTTGATTCTCCTCGTCTTCTCCGTAACGGTTTTCGCC
TTTGTCGTTACTAACAAAGGCGCAGGCGAGAAGGTTTCTGGGAGAGGGTATAAAGAGTAT
AGACTTGGAGATTACTCTAACTGGTTGCAGAAACGTGTGGACAGCGACAAGAACTGGAAT
AAGATTAGGAGTTGTCTCGTTGACAGCAAGGTTTGTTCTAAGCTTGAAGCTAAGCTTGTT
AATGTTCCTGTCACCAACTTCTACAACGAACATCTTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTGC
AAACCCTCAGAACAATGCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGACCAAGACGGCT
GGACCACATGATAATCCAGACTGCCAAAGCTGGGACAACGCACCAAACAAGCTCTGCTTC
GATTGCCAATCTT*GCAAGGCGGGTCTTCTCGACAACGTCAAGAGCGCACGGAAGAAAGT
TGCAGTAGTCAACATCATCGTCCTTGTCTTCCTTATCATTGTCTACTCTGT

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR2A022TF 810 0 0
GGAATTC
ACCAAACATCCTCTCAAATTCGCTTCTAGGGTTTCCCTAAATTCTCAAACTTTCTCTCCA
ATTTCGACTTCTTGAAACCATGGTTCGTTGTAGCAACAACCTCGTTGGTATACTCAACTT
CATCGTCTTCCTCCTCTCTATTCCCATCTTAGCTGGAGGAATCTGGCTCAGCCAAAACGG
CTCAACGGAGTGTGAGCGTTTCCTCGACAAACCCGTGATCGCTCTCGGAGTTTTCCTCAT
GGTTGTAGCAATCGCTGGTTTGATTGGTTCCTGTTGCAGAGTCACATGGCTTCTCTGGAC
TTACCTCTTTGTCATGTTCCTCTTGATTCTCCTCGTCTTCTCAGTTACGGTTTTCGCCTT
TGTCGTTACTAACAAAGGCGCCGGCGAGAAGGTTTCTGGGAGAGGGTATAAAGAGTATAG
ACTTGGAGATTACTCTAACTGGTTGCAGAAACGTGTGGACAGCGACAAGAACTGGAATAA
GATTAGGAGTTGTCTCGTTGACAGCAAGGTTTGTTCTAAGCTTGAAGCTAAGCTTGTTAA
TGTTCCTGTCACCAACTTCTACAACCAACATCTTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTGCAA
ACCCTCAGAACAATGCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGACCAAGACGGCTGG
AACACGTGCTAATCCAGACTGCCAAAGCTGGGACAACGCACCAAACAAGCTCTGCTTCGA
TTGCCAATCTT*GCAAGGCGGGTCTTCTCGACAACGTCAAGAGCGCATGGAAGAAAGTTG
CAGTGGTCAACAGCATCTTCCTT

QA 8 810 8 810
DS 

RD RR2FP93TF 790 0 0
GGC
ACCAAACATCCTCTCAAATTCGCTTCTAGGGTTTCCCTAAATTCTCAAACTTTCTCTCCA
ATTTCGACTTCTTGAAACCATGGTTCGTTGTAGCAACAACCTCGTTGGTATACTCAACTT
CATCGTCTTCCTCCTCTCTATTCCCATCTTAGCTGGAGGAATCTGGCTCAGCCAAAACGG
CTCAACGGAGTGTGAGCGTTTCCTCGACAAACCCGTGATCGCTCTCGGAGTTTTCCTCAT
GGTTGTAGCAATCGCTGGTTTGATTGGTTCCTGTTGCAGAGTCACATGGCTTCTCTGGAC
TTACCTCTTTGTCATGTTCCTCTTGATTCTCCTTGTCTTCTCAGTTACGGTTTTCGCCTT
TGTCGTTACTAACAAAGGCGCCGGCGAGAAGGTTTCTGGGAGAGGGTATAAAGAGTATAG
ACTTGGAGATTACTCTAACTGGTTGCAGAAACGTGTGGACAGCGACAAGAACTGGAATAA
GATTAGGAGTTGTCTCGTTGACAGCAAGGTTTGTTCTAAGCTTGAAGCTAAGCTTGTTAA
TGTTCCTGTCACCAACTTCTACAACCAACATCTTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTGCAA
ACCCTCAGAACAATGCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGACCAAGACGGCTGG
AACACATGCTAATCCAGACTGCCAAAGCTGGGACA*CGCACCAAACAAGCTCTGCTTCGA
TTGCCAATCTT*GCAAGGCGGGTCTTCTCGACA*CGTCA*GAGCGCATGGAAGAAAGTTG
CAGTGGT

QA 4 790 4 790
DS 

RD RR2FP93JQ 734 0 0
CCTGTTGCAGAGTCACATGGCTTCTCTGGACTTACCTCTTTGTCATGTTCCTCTTGATTC
TCCTTGTCTTCTCAGTTACGGTTTTCGCCTTTGTCGTTACTAACAAAGGCGCCGGCGAGA
AGGTTTCTGGGAGAGGGTATAAAGAGTATAGACTTGGAGATTACTCTAACTGGTTGCAGA
AACGTGTGGACAGCGACAAGAACTGGAATAAGATTAGGAGTTGTCTCGTTGACAGCAAGG
TTTGTTCTAAGCTTGAAGCTAAGCTTGTTAATGTTCCTGTCACCAACTTCTACAACCAAC
ATCTTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTGCAAACCCTCAGAACAATGCCAATTTACTTACA
TAAGTGCCACAAACTGGACCAAGACGGCTGGAACACATGCTAATCCAGACTGCCAAAGCT
GGGACAACGCACCAAACAAGCTCTGCTTCGATTGCCAATCTT*GCAAGGCGGGTCTTCTC
GACAACGTCAAGAGCGCATGGAAGAAAGTTGCAGTGGTCAACAGCATCTTCCTTGTCTTC
CTTATCATTGTCTACTCTGTTGGTTGCTGTGCTTTTAGGAACAACAAGAGAGATGACAGT
CATGGCTATGGATATAAGCCTTGAAGGCTTTTGAGTGTTTTAAAACAGAGATTCGTTCAT
TGTTCTTTATGACACGCAGCGCTGGAGTTTGCTTTTATGTTTTTATGGATTTAACATCTT
GGTGTTTTGAGA
TC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2FA79JQ 684 0 0
GAAGGTTTCTGGGAGAGGGTATAAAGAGTATAGACTTGGAGATTACTCTAACTGGTTGCA
GAAACGTGTGGACAGCGACAAGAACTGGAATAAGATTAGGAGTTGTCTCGTTGACAGCAA
GGTTTGTTCTAAGCTTGAAGCTAAGTTTGTTAATGTTCCTGTCACCAACTTCTACAACCA
ACATCTTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTGCAAACCCTCAGAACAATGCCAATTTACTTA
CATAAGTGCCACAAACTGGACCAAGACGGCTGGAACACATGCTAATCCAGACTGCCAAAG
CTGGGACAACGCACCAAACAAGCTCTGCTTCGATTGCCAATCTT*GCAAGGCGGGTCTTC
TCGACAACGTCAAGAGCGCATGGAAGAAAGTTGCAGTGGTCAACAGCATCTTCCTTGTCT
TCCTTATCATTGTCTACTCTGTTGGTTGCTGTGCTTTTAGGAACAACAAGAGAGATGACA
GTCATGGCTATGGATATAAGCCTTGAAGGCTTTTGAGTGTTTTAAAACAGAGATTCGTTC
ATTGTTCTTTATGACACGCAGCGCTGGAGTTTGCTTTTATGTTTTTATGGATTTAACATC
TTGGTGTTTTGAGACCTATTGCTTGTACAGCTCTCTTATGATACTTGTTAGTGTGTTCTG
GCTAAACCATGATATTGTTTTATT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2AB29JQ 780 0 0
TTGTCATGTTCCTCTTGATTCTCCTCGTCTTCTCAGTTACGGTTTTCGCCTTTGTCGTTA
CTAACAAAGGCGCCGGCGAGAAGGTTTCTGGGAGAGGGTATAAAGAGTATAGACTTGGAG
ATTACTCTAACTGGTTGCAGAAACGTGCGGACAGCGACAAGAACTGGAATAAGATTAGGA
GTTGTCTCGTTGACAGCAAGGTTTGCTCTAAGCTTGAAGCTAAGCTTGTTAATGTTCCTG
TCACCAACTTCTACAACCAACATCTTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTGCAAACCCTCAG
AACAATGCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGACCAAGACGGCTGGAACACATG
CTAATCCAGACTGCCAAAGCTGGGACAACGCACCAAACAAGCTCTGCTTCGATTGCCAAT
CTT*GCAAGGCGGGTCTTCTCGACAACGTCAAGAGCGCATGGAAGAAAGTTGCAGTGGTC
AACAGCATCTTCCTTGTCTTCCTTATCATTGTCTACTCTGTTGGTTGCTGTGCTTTTAGG
AACAACAAGAGAGATGACAGTCATGGCTATGGATATAAGCCTTGAAGGCTTTTGAGTGTT
TTAAAACAGAGATTCGTTCATTGTTCTTTATGACACGCAGCGCTGGAGTTTGCTTTTATG
TTTTTATGGATTTAACATCTTGGTGTTTTGAGACCTATTGCTTGTACAGCTCTCTTATGA
TACTTGTTAGTGTGTTCTGGCTAAACCATGATATTGTTTTATTATATGTTCTTTTT
TTCC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2EV91JQ 741 0 0
ACGGTTTTCGCCTTTGTCGTTACTAACAAAGGCGCAGGCGAGAAGGTTTCTGGGAGAGGG
TATAAAGAGTATAGACTTGGAGATTACTCTAACTGGTTGCAGAAACGTGTGGACAGCGAC
AAGAACTGGAATAAGATTAGGAGTTGTCTCGTTGACAGCAAGGTTTGTTCTAAGCTTGAA
GCTAAGCTTGTTAATGTTCCTGTCACCAACTTCTACAACGAACATCGTACTGCCCTTCAG
TCTGGTTGCTGCAAACCCTCAGAACAATGCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGG
ACCAAGACGGCTGGACCACATGATAATCCAGACTGCCAAAGCTGGGACAACGCACCAAAC
AAGCTCTGCTTCGATTGCCAATCTT*GCAAGGCGGGTCTTCTCGACAACGTCAAGAGCGC
ATGGAAGAAAGTTGCAGTAGTCAACATCATCGTCCTTGTCTTCCTTATCATTGTCTACTC
TGTTGGTTGTTGTGCTTTTAGGAACAACAAGAGAGATGACAGTTATGGCTATGGATATAA
GCCTTGAAGGCTTTTAAGGGTTTTAAAACAGAGATTCGTTCATTGTTCTTTATTACACGC
AGTACTGGAGTTTGCCTT*ATGTTTT*ATGGATTTA*CATCTTGGTGTTTTGAGACCTAT
TGCTTGTACAGCTCTCTTATGATACTTGTTAGTGTGTTCTGGCTAAACCATGATATTGTT
TTATTATATGTTCTTTTT
CTC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2G448JQ 580 0 0
AAGCTTGAAGCTAAGCTTGTTAATGTTCCTGTCACCAACTTCTACAACCAACATCTTACT
GCCCTTCAGTCTGGTTGCTGCAAACCCTCAGAACAATGCCAATTTACTTACATAAGTGCC
ACAAACTGGACCAAGACGGCTGGAACACATGCTAATCCAGACTGCCAAAGCTGGGACAAC
GCACCAAACAAGCTCTGCTTCGATTGCCAATCTT*GCAAGGCGGGTCTTCTCGACAACGT
CAAGAGCGCATGGAAGAAAGTTGCAGTGGTCAACAGCATCTTCCTTGTCTTCCTTATCAT
TGTCTACTCTGTTGGTTGCTGTGCTTTTAGGAACAACAAGAGAGATGACAGTCATGGCTA
TGGATATAAGCCTTGAAGGCTTTTGAGTGTTTTAAAACAGAGATTCGTTCATTGTTCTTT
ATGACACGCAGCGCTGGAGTTTGCTTTTATGTTTTTATGGATTTAACATCTTGGTGTTTT
GAGACCTATTGCTTGTACAGCTCTCTTATGATACTTGTTAGTGTGTTCTGGCTAAACCAT
GATATTGTTTTATTATATGTTCTTTTTTTCCATTTTTCTC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 12

CO CL351Contig1 874 12 11 U
GGAAATCAGATCTAACAAGAAGAAAACAGTAAGCACTTTCAAAGAAAATTAATTATGGCA
GCAATGAAGCAATCTCTTGTTCTTTCCATATTGATACTACTATCATCATCATTTGCACCA
ATCCATGCCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCG
CCGGGACCATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCTCTCG
TACCTTACCCCTGGATCAAATGATACCAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAA
TCTGTTGTACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATG
GGTATTGCAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTT
CTTCCTCCCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCA
GTTTCTCCATCAGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCT
TCTCCAACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCACC
AACCACCTCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACAT
TTTGGCTTTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCAAATATTTTTTTACTGAATTTT
TTTTCTTCTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGATTTCAAGACCGATGCTGTTTTTAA
TTTGATGTTCTTTGTTAATCAAATTAATATATTTTTTTTTTTAAATCATGCAACATTGAT
ATAGACCTGCTGGGGTTTTGTTGCTGTTTCAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 
65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 20 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 45 60 60 60 60 35 10 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B979TF U 6
AF RR2GV62TF U 6
AF RR2DQ35TF U 1
AF RR2CM08TF U 1
AF RR2C171TF U 59
AF RR2FR12TF U 6
AF RR2FL64JQ C 200
AF RR2CM08JQ C 103
AF RR2DQ35JQ C 117
AF RR2FR12JQ C 117
AF RR2GV62JQB C 82
AF RR2C171JQ C 47
BS 1 274 RR2CM08TF
BS 275 276 RR2B979TF
BS 277 431 RR2CM08TF
BS 432 432 RR2B979TF
BS 433 662 RR2CM08TF
BS 663 663 RR2C171TF
BS 664 707 RR2CM08TF
BS 708 708 RR2FR12TF
BS 709 709 RR2C171JQ
BS 710 757 RR2CM08TF
BS 758 874 RR2C171JQ

RD RR2B979TF 491 0 0
GG
AGATCTAACAAGAAGAAAACAGTAAGCACTTTCAAAGAAAATTAATTATGGCAGCAATGA
AGCAATCTCTTGTTCTTTCCATATTGATACTACTATCATCATCATTTGCACCAATCCCTG
CCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCGCCGGGAC
CATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCTCTCGTACCTTA
CCCCTGGATCAAATGATACCAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAATCTGTTG
TACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATGGGTATTG
CAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTCCTC
CCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTTCTC
CATCAGCTG

QA 3 491 3 491
DS 

RD RR2GV62TF 697 0 0
GG
AGATCTAACAAGAAGAAAACAGTAAGCACTTTCAAAGAAAATTAATTATGGCAGCAATGA
AGCAATCTCTTGTTCTTTCCATATTGATACTACTATCATCATCATTTGCACCAATCCATG
CCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCGCCGGGAC
CATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCTCTCGTACCTTA
CCCCTGGATCAAATGATACCAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAATCTGTTG
TACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATGGGTATTG
CAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTCCTC
CCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCACCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTTCTC
CATCAGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCTTCTCCAA
CTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACC*CCTCCCTCGAGTTCTGGCACCAACCACC
TCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACATTTTGGCT
TTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCAAAT

QA 3 697 3 697
DS 

RD RR2DQ35TF 719 0 0
GGAAATC
AGATCTAACAAGAAGAAAACAGTAAGCACTTTCAAAGAAAATTAATTATGGCAGCAATGA
AGCAATCTCTTGTTCTTTCCATATTGATACTACTATCATCATCATTTGCACCAATCCATG
CCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCGCCGGGAC
CATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCTCTCGTACCTTA
CCCCTGGATCAAATGATACCAAGCCCA**AAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAATCTGTTG
TACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATGGGTATTG
CAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTCCTC
CCCACTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTTCTC
CATCAGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCTTCTCCAA
CTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACTTCCCTCGAGTTCTGGCACCAACCACC
TCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACATTT*GGCT
TTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCAAATATTTTTCTACTGAATTT

QA 8 719 8 719
DS 

RD RR2CM08TF 757 0 0
GGAAATCAGATCTAACAAGAAGAAAACAGTAAGCACTTTCAAAGAAAATTAATTATGGCA
GCAATGAAGCAATCTCTTGTTCTTTCCATATTGATACTACTATCATCATCATTTGCACCA
ATCCATGCCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCG
CCGGGACCATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCTCTCG
TACCTTACCCCTGGATCAAATGATACCAAGCCCA**AAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAA
TCTGTTGTACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATG
GGTATTGCAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTT
CTTCCTCCCCACTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCA
GTTTCTCCATCAGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCT
TCTCCAACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCACC
AACCACCTCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACAT
TT*GGCTTTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCAAATATTTT*CTACTGAATTTT
TTTTCTTCTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGAT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2C171TF 682 0 0
GG
GCAATGAAGCAATCTCTTGTTCTTTCCATATTGATACTACTATCATCATCATTTGCACCA
ATCCATGCCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCG
CCGGGACCATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCTCTCG
TACCTTACCCCTGGATCAAATGATACCAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAA
TCTGTTGTACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATG
GGTATTGCAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTT
CTTCCTCCCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCA
GTTTCTCCATCAGCTGCAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCT
TCTCCAACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCACC
AACCACCTCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACAT
TTTGGCTTTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCAATATTTTT*CTACTGA*TTTT
TTTTCTTCTACTGAAT
GGAC

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR2FR12TF 727 0 0
GG
AGATCTAACAAGAAGAAAACAGTAAGCACTTTCAAAGAAAATTAATTATGCCAGCAATGA
AGCAATCTCTTGTTCTTTCCATATTGATACTACTATCATCATCATTTGCACCAATCCATG
CCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCGCCGGGAC
CATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCTCTCGTACCTTA
CCCCTGGATCAAATGATACCAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAATCTGTTG
TACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATGGGTATTG
CAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTCCTC
CCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTTCTC
CATCAGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCTTCTCCAA
CTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCACCAACCACC
TCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACATTTTGGCT
TTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCAAATATTTTTCTACTGAATTTTTTTTCTT
CTACT

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR2FL64JQ 627 0 0
ATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCTCTCGTACCTTACCCTTGGATCAA
ATGATACCAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAATCTGTTGTACAATATAATC
CTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATGGGTATTGCAGTGAATAACA
CAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTCCTCCCCATTGTACTA
TACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTTCTCCATCAGCTGTAA
CACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATCTTCTCCAACTTTGGCTGACT
CGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCACCAACCACCTCTCAGTTTCAA
CATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTTACATTTTGGCTTTTTCTAATTAA
TTTCAGCTTTCACGTTTCCAAATATTTTTTTACTGAATTTTTTTTCTTCTACTGAATTGG
ACATTATATGTTCGTGATTTCAAGACCGATGCTGTTTTTAATTTGATGTTCTTTGTTAAT
CAAATTAATATATTTTTTTTTT
AAATC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2CM08JQ 725 0 0
TCATCATCATTTGCACCAATCCATGCCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCA
CCGGTAGCAACTCCAGCGCCGGGACCATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGC
ATGATGGATTGTCTCTCGTACCTTACCCCTGGATCAAATGATACCAAGCCCA**AAAGCG
TGTTGCGGGGGAATCCAATCTGTTGTACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTA
GCGAGTAGCAAAGATATGGGTATTGCAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACG
ATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTCCTCCCCACTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCT
ACTCCTGGTATGTCTTCAGTTTCTCCATCAGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCA
GCCCAGTCACCCACATTTTCTCCAACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCT
CCCTCGAGTTCTGGCACCAACCACCTCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATAT
TTCTTCTATAACTTACATTT*GGCTTTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCAAAT
ATTTTTTTACTGAATTTTTTTTCTTCTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGATTTCAA
GACCGATGCTGTTTTTAATTTGATGTTCTTTGTTAATCAAATTAATATATTTTTTTTTT
TAAACC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2DQ35JQ 710 0 0
ACCAATCCATGCCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCC
AGCGCCGGGACCATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCT
CTCGTACCTTACCCCTGGATCAAATGATACCAAGCCCA**AAAGCGTGTTGCGGGGGAAT
CCAATCTGTTGTACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGA
TATGGGTATTGCAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCC
CGTTCTTCCTCCCCACTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTC
TTCAGTTTCTCCATCAGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCAC
ATTTTCTCCAACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACTTCCCTCGAGTTCTGG
CACCAACCACCTCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTT
ACATTT*GGCTTTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCAAATATTTTTTTACTGAA
TTTTTTTTCTTCTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGATTTCAAGACCGATGCTGTTT
TTAATTTGATGTTCTTTGTTAATCAAATTAATATATTTTTTTTTT
AAACC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2FR12JQ 710 0 0
ACCAATCCATGCCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCC
AGCGCCGGGACCATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCT
CTCGTACCTTACCCCTGGATCAAATGATACCAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAAT
CCAATCTGTTGTACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGA
TATGGGTATTGCAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCC
CGTTCTTCCTCCCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTC
TTCAGTTTCTCCATCAGCTGTAACACCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCAC
ATCTTCTCCAACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGG
CACCAACCACCTCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTCTTCTATAACTT
ACATTTTGGCTTTTTCTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCAAATATTTTTTTACTGAA
TTTTTTTTCTTCTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGATTTCAAGACCGATGCTGTTT
TTAATTTGATGTTCTTTGTTAATCAAATTAATATATTTTTTTTTT
AAATC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2GV62JQB 739 0 0
CTTTCCATATTGATACTACTATCATCATCATTTGCACCAATCCATGCCCGCAACAAACCA
CATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCGCCGGGACCATCAAATTCTGAT
TGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCTCTCGTACCTTACCCCTGGATCAAAT
GATACCAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAATCTGTTGTACAATATAATCCT
GATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATGGGTATTGCAGTGAATAACACA
AGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTTCTTCCTCCCCATTGTACTATA
CTGGACGCGCCGAGTGCACCTACTCCTGGTATGTCTTCAGTTTCTCCATCAGCTGTAACA
CCTATGACTCCACCGTCTTCAGCCCAGTCACCCACATTTTCTCCAACTTTGGCTGACTCG
CCGGGCATGACTGCACC*CCTCCCTCGAGTTCTGGCACCAACCACCTCTCAGTTTCAACA
TTGACCTTCGTTTTCATATATTTTTTCTATAACTTACATTTTGGCTTTTTCTAATTAATT
TCAGCTTTCACGTTTCCAAATATTTTTTTACTGAATTTTTTTTCTTCTACTGAATTGGAC
ATTATATGTTCGTGATTTCAAGACCGATGCTGTTTTTAATTTGATGTTCTTTGTTAATCA
AATTAATATATTTTTTTTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2C171JQ 828 0 0
AGAAATTAATTATG
GCAATGAAGCAATCTCTTGT*CTTTCCATATTGATACTACTATCATCATCATTTGCACCA
ATCCATGCCCGCAACAAACCACATCCGGCAAACTCTCCCCCACCGGTAGCAACTCCAGCG
CCGGGACCATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTTATATTTGGCATGATGGATTGTCTCTCG
TACCTTACCCCTGGATCAAATGATACCAAGCCCACGAAAGCGTGTTGCGGGGGAATCCAA
TCTGTTGTACAATATAATCCTGATTGTGTTTGCATCGGCTTAGCGAGTAGCAAAGATATG
GGTATTGCAGTGAATAACACAAGAGCTCTTGCCATGCCTACGATTTGCAAGCTCCCCGTT
CTTCCTCCCCATTGTACTATACTGGACGCGCCGAGTGCATCTACTCCTGGTATGTCTTCA
GTTTCTCCATCAGCTGCAACACCTATGACTCCACCGTTTTCAGCCCAGTCACCCACATTT
TCTCCAACTTTGGCTGACTCGCCGGGCATGACTGCACCACCTCCCTCGAGTTCTGGCACC
AACCACCTCTCAGTTTCAACATTGACCTTCGTTTTCATATATTTTTTCTATAACTTACAT
TTTGGCTTTTTTTAATTAATTTCAGCTTTCACGTTTCCAAATATTTTTTTACTGAATTTT
TTTTCTTCTACTGAATTGGACATTATATGTTCGTGATTTCAAGACCGATGCTGTTTTTAA
TTTGATGTTCTTTGTTAATCAAATTAATATATTTTTTTTTTTAAATCATGCAACATTGAT
ATAGACCTGCTGGGGTTTTGTTGCTGTTTCAGGG

QA 15 828 15 828
DS 



AS 1 13

CO CL352Contig1 853 13 31 U
GGATTCATCTCAGAGTATTACTTTGATCATTTTCATATTCTCATAAAACCTAGCAAACGT
TTTCTTGATAATAACTATGGCCGAAGAAACCAAGAACGTAGTTCATGAGCAAGATGTGCC
AAAGGTAACGACCGAGGAATCATCAGCCGAGGTTACCGATCGTGGACTGTTCGATTTCTT
GGGGAAGAAGAAGGAGGAAACAAAACCAGAGGAGACCATCGACACTGAGTTTGAACATAA
GGTTCATATCTCAGAACCGGTGGTGGTGTCTGAGGTTAAACACGAGGAGGAAGAGAAAAA
GCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGA
AGAAGGTGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGACTACTACTAC
TACCACTGTTGAAGGAGAGGTGAAAACTGACGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCT
GAAGGAGAAGCTTCCAGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGC
CGCACCGGTTGTTACTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCACCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTT
GG*AGAAGATCAAGGAGAAGCTCCCAGGGTACCATCCCAAGACCGTAGATGAGGTGAAGA
AGGAAAAGGAATCTGATTAATGATGATGGTGTGTTTTTGTGATGAGTGGTGATCATCCTT
TTGCTTTTGTGTTGTTTTAAGTTTGTTGGCTTTTATGTTGTTCCTTTTTTTT*CAGTTTC
CCTATTATTCTGTCTTTGTTATGTTTTGTATATGATATCAAGATGTTTTAATGTTATAAA
TGTTTTTTTTTTG


BQ
30 30 30 35 35 35 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 30 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 35 35 65 65 65 65 65 65 65 70 30 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 30 45 5 
75 75 75 35 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 
70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 40 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 25 55 50 50 50 50 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2DQ26TF U 1
AF RR2EF19TF U 1
AF RR2FN94TF U 1
AF RR2C760TF U 5
AF RR2EC26TF U 5
AF RR2H982TF U 10
AF RR2A584TF U 10
AF RR2BC92JQ C 1
AF RR2BC92TF U 1
AF RR2H982JQ C 103
AF RR2C760JQ C 274
AF RR2EC26JQ C 268
AF RR2FN94JQ C 151
BS 1 3 RR2EF19TF
BS 4 241 RR2DQ26TF
BS 242 242 RR2EF19TF
BS 243 357 RR2DQ26TF
BS 358 358 RR2EF19TF
BS 359 371 RR2DQ26TF
BS 372 372 RR2EF19TF
BS 373 398 RR2DQ26TF
BS 399 399 RR2EF19TF
BS 400 410 RR2DQ26TF
BS 411 411 RR2EF19TF
BS 412 427 RR2DQ26TF
BS 428 474 RR2EF19TF
BS 475 475 RR2C760TF
BS 476 553 RR2EF19TF
BS 554 554 RR2C760TF
BS 555 576 RR2EF19TF
BS 577 577 RR2C760TF
BS 578 654 RR2EF19TF
BS 655 655 RR2A584TF
BS 656 660 RR2EF19TF
BS 661 661 RR2A584TF
BS 662 662 RR2BC92TF
BS 663 721 RR2A584TF
BS 722 785 RR2BC92TF
BS 786 788 RR2BC92JQ
BS 789 820 RR2BC92TF
BS 821 821 RR2BC92JQ
BS 822 830 RR2BC92TF
BS 831 835 RR2BC92JQ
BS 836 853 RR2H982JQ

RD RR2DQ26TF 427 0 0
GAT
TTCATCTCAGAGTATTACTTTGATCATTTTCATATTCTCATAAAACCTAGCAAACGTTTT
CTTGATAATAACTATGGCCGAAGAAACCAAGAACGTAGTTCATGAGCAAGATGTGCCAAA
GGTAACGACCGAGGAATCATCAGCCGAGGTTACCGATCGTGGACTGTTCGATTTCTTGGG
GAAGAAGAAGGAGGAAACAAAACCAGAGGAGACCATCGACACTGAGTTTGAACATAAGAT
TCATATCTCAGAACCGGTGGTGGTGTCTGAGGTTAAACACGAGGAGGAAGAGAAAAAGCA
TAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGATGAAGA
AGGTGAAG*TGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGG*CAAGAAGAAGA*TACTACTACTAC
CACT

QA 4 427 4 427
DS 

RD RR2EF19TF 660 0 0
GGATTCATCTCAGAGTATTACTTTGATCATTT*CACATTCTCATAAAACCTAGCAAACGT
TTTCTTGATAATAACTATGGCCGAAGAAACCAAGAACGTAGTTCATGAGCAAGATGTGCC
AAAGGTAACGACCGAGGAATCATCAGCCGAGGTTACCGATCGTGGACTGTTCGATTTCTT
GGGGAAGAAGAAGGAGGAAACAAAACCAGAGGAGACCATTGACACTGAGTTTGAACATAA
GGTTCATATCTCAGAACCGGTGGTGGTGCCTGAGGTTAAACACGAGGAGGAAGAGAAAAA
GCACAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGA
AGAAGGTGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGACTACTACCAG
TACAACTGTTGAAGGAGAGGTGAAAACTGACGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGACAAGCT
GAAGGAGAAGCTTCCAGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGC
CGCACCGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTT
GG*AGAAGATCAAGGAGAAGCTCCCAGGGTACCATCCCAAGACCGTAGATGAGGCGAAGA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2FN94TF 659 0 0
GGATTCATCTCAGAGTATTACTTTGATCATTT*CACATTCTCATAAAACCTAGCAAACGT
CTTCTTGATAATAACTACGGCCGAAGAAACCAAGAACGTAGTTCATGAGCAAGATGTGCC
AAAGGTAACGACCGAGGAATCATCAGCCGAGGTTACCGATCGTGGACTGTTCGATTTCTT
GGGGAAGAAGAAGGAGGAAACAAAACCAGAGGAGACCATTGACACTGAGTTTGAACATAA
GGTTCATATCTCAGAAC***TGGTGGTGCCTGAGGTTAAACACGAGGAGGAAGAGAAAAA
GCACAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGA
AGAAGGTGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGACTACTACTAG
TACAACTGTTGAAGGAGAGGTGAAAACTGACGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGACAAGCT
GAAGGAGAAGCTTCCAGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGC
CGCACCGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTT
GG*AGAAGATCAAGGAGAAGCTCCCAGGGTACCATCCCAAGACCGTAGATGAG
CGAAGA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2C760TF 631 0 0
GG
ATCTCAGAGTATTACTTTGATCATTTTCATATTCTCATAAAACCTAGCAAACGTTTTCTT
GATAATAACTATGGCCGAAGAAACCAAGAACGTAGTTCATGAGCAAGATGTGCCAAAGGT
AACGATCGAGGAATCATCAGCCGAGGTTACCGATCGTGGACTGTTCGATTTCTTGGGGAA
GAAGAAGGAGGAAACAAAACCAGAGGAGACCATCGACACTGAGTTTGAACATAAGGTTCA
TATCTCAGAACCGGTGGTGGTGTCTGAGGTTAAACACGAGGAGGAAGAGAAAAAGCATAG
TCTCCTCGAGAAGCTTCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGG
TGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGACTACTACTACTACCAC
TGTTGAAGGAGAGGTGAAAACTGACGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAGGGA
GAAGCTTCCAGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGCCGCACC
GGTTGTTACTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCACCCGGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGG*AGA
AGATCAAGGAGAAGCTCCCGGGGTACCAT

QA 3 631 3 631
DS 

RD RR2EC26TF 657 0 0
GG
ATCTCAGAGTATTACTTTGATCATTTTCATATTC*CATAAAACCTAGCAAACGTTTTCTT
GATAATAACTATGGCCGAAGAAACCAAGAACGTAGTTCATGAGCAAGATGTGCCAAAGGT
AACGACCGAGGAATCATCAGCCGAGGTTACCAATCGTGGACTGTTCGATTTCTTGGGGAA
GAAGAAGGAGGAAACAAAACCAGAGGAGACCATCGACACTGAGTTTGAACATAAGGTTCA
TATCTCAGAACCGGTGGTGGTGTCTGAGGTTAAACACGAGGAGGAAGAGAAAAAGCATAG
TCTCCTCGAGAAGCTTCACCGAAGCGACAGCCCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGG
TGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGACTACTACTACTACCAC
TGTTGAAGGAGAGGTGAAAACTGACGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGA
GAAGCTTCCAGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGCCGCACC
GGTTGTTACTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCACCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTTGG*AGA
AGATCAAGGAGAAGCTCCCAGGGTACCATCCCAAGACCGTAGATGAG
TGAAGAAG

QA 3 649 3 649
DS 

RD RR2H982TF 647 0 0
GG
AGAGTATTACTTTGATCATTTTCATATTCTCATAAAACCTAGCAAACGTTTTCTTGATAA
TAACTATGGCCGAAGAAACCAAGAACGTAGTTCATGAGCAAGATGTGCCAAAGGTAACGA
CCGAGGAATCATCAGCCGAGGTTACCGATCGTGGACTGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGA
AGGAGGAAACAAAACCAGAGGAGACCATCGACACTGAGTTTGAACATAAGGTTCATATCT
CAGAACCGGTGGTGGTGTCTGAGGTTAAACACGAGGAGGAAGAGAAAAAGCATAGTCTCC
TCGAGAAGCTTCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAG
ATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGACTACTAC***TACCACTGTTG
AAGGAGAGGTGAAAACTGACGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGC
TTCCAGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGCCGCACCGGTTG
TTACTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCACCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTTGG*AGAAGATC
AAGGAGAAGCTCCCAGGGTACCATCCCAAGACCGTAGATGAGGTG

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR2A584TF 712 0 0
GG
AGAGTATTACTTTGATCATTTTCATATTCTCATAAAACCTAGCAAACGTTTTCTTGATAA
TAACTATGGCCGAAGAAACCAAGAACGTAGTTCATGAGCAAGATGTGCCAAAGGTAACGA
CCGAGGAATCATCAGCCGAGGTTACCGATCGTGGACTGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGA
AGGAGGAAACAAAACCAGAGGAGACCATCGACACTGAGTTTGAACATAAGGTTCATATCT
CAGAACCGGTGGTGGTGTCTGAGGTTAAACACGAGGAGGAAGAGAAAAAGCATAGTCTCC
TCGAGAAGCTTCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAG
ATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGACTACTACTACTACCACTGTTG
AAGGAGAGGTGAAAACTGACGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGC
TTCCAGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGCCGCACCGGTTG
TTACTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCACCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTTGG*AGAAGATC
GAGGAGAAGCTCCCAGGGTACCATCCCAAGACCGTAGATGAGGTGAAGAAAGAAAAGGAA
TCTGATTAATGATGATGGTGTGTTTTTGTGATGAGTGGTGATCATCCTTT

QA 3 712 3 712
DS 

RD RR2BC92JQ 835 0 0
GGATTCATCTCAGAGTATTACTTTGATCATTTTCATATTCTCATAAAACCTAGCAAACGT
TTTCTTGATAATAACTATGGCCGAAGAAACCAAGAACGTAGTTCATGAGCAAGATGTGCC
AAAGGTAACGACCGAGGAATCATCAGCCGAGGTTACCGATCGTGGACTGTTCGATTTCTT
GGGGAAGAAGAAGGAGGAAACAAAACCAGAGGAGACCATCGACACTGAGTTTGAACATAA
GGTTCATATCTCAGAACCGGTGGTGGTGTCTGAGGTTAAACACGAGGAGGAAGAGAAAAA
GCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGA
AGAAGGTGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGACTACTACTAC
TACCACTGTTGAAGGAGAGGTGAAAACTGACGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCT
GAAGGAGAAGCTTCCAGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGC
CGCACCGGTTGTTACTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCACCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTT
GG*AGAAGATCAAGGAGAAGCTCCCAGGGTGCCATCCCAAGACCGTAGATGAGGTGAAGA
AGGAAAAGGAATCTGATTAATGATGATGGTGTGTTTTTGTGATGAGTGGTGATCATCCTT
TTGCTTTTGTGTTGTTTTAAGTTTGTTGGCTTTTATGTTGTTCCTTTTTTTT*CAGTTTC
CCTATTATTCTGTCTTTGTTATGTTTTGTATATGATATCAAGATGTTTTAATGTT

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR2BC92TF 834 0 0
GGATTCATCTCAGAGTATTACTTTGATCATTTTCATATTCTCATAAAACCTAGCAAACGT
TTTCTTGATAATAACTATGGCCGAAGAAACCAAGAACGTAGTTCATGAGCAAGATGTGCC
AAAGGTAACGACCGAGGAATCATCAGCCGAGGTTACCGATCGTGGACTGTTCGATTTCTT
GGGGAAGAAGAAGGAGGAAACAAAACCAGAGGAGACCATCGACACTGAGTTTGAACATAA
GGTTCATATCTCAGAACCGGTGGTGGTGTCTGAGGTTAAACACGAGGAGGAAGAGAAAAA
GCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGAAGCGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGA
AGAAGGTGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGACTACTACTAC
TACCACTGTTGAAGGAGAGGTGAAAACTGACGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCT
GAAGGAGAAGCTTCCAGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGC
CGCACCGGTTGTTACTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCACCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTT
GGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTCCCAGGGTGCCATCCCAAGACCGTAGATGAGGTGAAGA
AGGAAAAGGAATCTGATTAATGATGATGGTGTGTTTTTGTGATGAGTGGTGATCATCCTT
TTGCTTTTGTGTTGTTTTAAGTTTGTTGGCTTTTATGTTGTTCCTTTTTTTT*CAGTTTC
CCTATA**TCTGTCTTTGTTATGTTTTGTATATGATATCA*GATGTTTTA
TGTA

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR2H982JQ 751 0 0
TCATGAGCAAGATGTGCCAAAGGTAACGACCGAGGAATCATCAGCCGAGGTTACCGATCG
TGGACTGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAGGAGGAAACAAAACCAGAGGAGACCATCGA
CACTGAGTTTGAACATAAGGTTCATATCTCAGAACCGGTGGTGGTGTCTGAGGTTAAACA
CGAGGAGGAAGAGAAAAAGCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGAAGCGACAGCTTTTC
TAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGACAA
GAAGAAGACTACTAC***TACCACTGTTGAAGGAGAGGTGAAAACTGACGAGGAGAAGAA
AGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCAGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGC
CTCACCCGCCGCTGCTGCCGCACCGGTTGTTACTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCACCCGGC
GGAGAAGAAGGGGATCTTGG*AGAAGATCAAGGAGAAGCTCCCAGGGTACCATCCCAAGA
CCGTAGATGAGGTGAAGAAGGAAAAGGAATTTGATTAATGATGATGGTGTGTTTTTGTGA
TGAGTGGTGATCATCCTTTTGCTTTTGTGTTGTTTTAAGTTTGTTGGCTTTTATGTTGTT
CCTTTTTTTT*CAGTTTCCCTATTATTCTGTCTTTGTTATGTTTTGTATATGATATCAAG
ATGTTTTAATGTTATAAATGTTTTTTTTTTG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2C760JQ 579 0 0
GGTTAAACACGAGGAGGAAGAGAAAAAGCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGAAGCGA
CAGCTTTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAA
GAAGGACAAGAAGAAGACTACTACTACTACCACTGTTGAAGGAGAGGTGAAAACTGACGA
GGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAGGGAGAAGCTTCCAGGACACGGAAAGAAGCC
TGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGCCGCACCGGTTGTTACTCCTCCGGTGGAGGAAGC
GCACCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTTGG*AGAAGATCAAGGAGAAGCTCCCGGGGTACC
ATCCCAAGACCGTAGATGAGGTGAAGAAGGAAAAGGAATTTGATTAATGATGATGGTGTG
TTTTTGTGATGAGTGGTGATCATCCTTTTGCTTTTGTGTTGTTTTAAGTTTGTTGGCTTT
TATGTTGTTCCTTTTTTTT*CAGTTTCCCTATTATTCTGTCTTTGTTATGTTTTGTATAT
GATATCAAGATGTTTTAATGTTATAAATGTTTTTTT
TTT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2EC26JQ 585 0 0
GTCTGAGGTTAAACACGAGGAGGAAGAGAAAAAGCATAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCG
AAGCGACAGCCCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGATGGTGTGAAGAGGAA
GAAGAAGAAGGACAAGAAGAAGACTACTACTACTACCACTGTTGAAGGAGAGGTGAAAAC
TGACGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCAGGACACGGAAA
GAAGCCTGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGCCGCACCGGTTGTTACTCCTCCGGTGGA
GGAAGCGCACCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTTGG*AGAAGATCAAGGAGAAGCTCCCAG
GGTACCATCCCAAGACCGTAGATGAGGTGAAGAAGGAAAAGGAATCTGATTAATGATGAT
GGTGTGTTTTTGTGATGAGTGGTGATCATCCTTTTGCTTTTGTGTTGTTTTAAGTTTGTT
GGCTTTTATGTTGTTCCTTTTTTTT*CAGTTTCCCTATTATTCTGTCTTTGTTATGTTTT
GTATATGATATCAAGATGTTTTAATGTTATAAATGTTTTTTT
TTG

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2FN94JQ 699 0 0
GGTTACCGATCGTGGACTGTTCGATTTCTTGGGGAAGAAGAAGGAGGAAACAAAACCAGA
GGAGACCATTGACACTGAGTTTGAACATAAGGTTCATATCTCAGAAC***TGGTGGTGCC
TGAGGTTAAACACGAGGAGGAAGAGAAAAAGCACAGTCTCCTCGAGAAGCTTCACCGAAG
CGACAGCTCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAA
GAAGAAGGACAAGAAGAAGACTACTACTAGTACAACTGTTGAAGGAGAGGTGAAAACTGA
CGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGACAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCAGGACACGGAAAGAA
GCCTGAAGATGCCTCACCCGCCGCTGCTGCCGCACCGGTTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGA
AGCGCATCCGGCGGAGAAGAAGGGGATCTTGG*AGAAGATCAAGGAGAAGCTCCCAGGGT
ACCATCCCAAGACCGTAGATGAGGCGAAGAAGGAAAAGGAACCTGATTAATGATGATGGT
GTGTTTTTGTGATGAGTGGTGATCATCCTTTTGCTTTTGTGTTGTTTTAAGTTTGTTGGC
TTTTATGTTGTTTCTTTTTTTTTCAGTTTCCCTATTATTCTGTCTTTGTTATGTTTTGTA
TATGATATCAAGATGTTTTAATGTTATAAATGTTTTTTT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 2 12

CO CL353Contig1 888 9 27 U
GGGTACTCTTGGAAGATTCAAGACCAAACGCTTGCACTTCCCACAGGGAAGGGAATTAAG
AAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTTTAACACTCACA
TCATCTATCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTCATCGTCATTCTCG
TGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTGCCAGCAGAAACAGAGGAGCTTCACCGCCGCG
AAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCGCCACGATTCTCTCTCTGACG
CCTCTGGATGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAGACCCTCTCTGC
GAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCGGTGAC
AAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGACGGAACG
TTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCACTTACTATGCGGATTGGTGTCGGCAAG
GTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTCCTATGCGAGTA
GG****GGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGCCTGC
AGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATGATATCAA
TTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCGTTCTGTAAAG
GAAGAAAAAAAA**CTATGTATATGATATATATCACCAGATTCTGGATTTT*ATCATCTG
TAAACATTGACATTCTCCAACTTAAACCCAACGAGTAGCTTGCTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 0 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 5 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 20 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM11TF U 47
AF RR2AV30TF U 59
AF RR2FM53TF U 59
AF RR2FV10TF U 47
AF RR2BB32TF U 1
AF RR2AK48TF U 47
AF RR2AF27TF U 51
AF RR2FV10JQ C 359
AF RR2FM53JQ C 256
BS 1 46 RR2BB32TF
BS 47 48 RR2AK48TF
BS 49 208 RR2BB32TF
BS 209 209 RR2FV10TF
BS 210 221 RR2BB32TF
BS 222 222 RR2AK48TF
BS 223 244 RR2BB32TF
BS 245 245 RR2AK48TF
BS 246 308 RR2BB32TF
BS 309 309 RR2FV10TF
BS 310 383 RR2BB32TF
BS 384 384 RR2FV10TF
BS 385 587 RR2BB32TF
BS 588 588 RR2FV10TF
BS 589 602 RR2BB32TF
BS 603 606 RR2AK48TF
BS 607 655 RR2BB32TF
BS 656 656 RR2AK48TF
BS 657 748 RR2BB32TF
BS 749 749 RR2AK48TF
BS 750 831 RR2BB32TF
BS 832 832 RR2AF27TF
BS 833 854 RR2BB32TF
BS 855 855 RR2AF27TF
BS 856 875 RR2AK48TF
BS 876 882 RR2AF27TF
BS 883 888 RR2FM53JQ

RD RR2GM11TF 612 0 0
GGAAGGGAATTAAGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGA
CTTTAACACTCACATCATCTATCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTT
CATCGTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTTCCAGCAGAAACAGAGGA
GCTTCACCGCCGCGAAGAAGAATGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCGCCACGA
TTCTCTCTCTGACGCCTCTGGACGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTG
GAGACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGACTTGGATTCTGCGATATCGCTG
TTGGGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGT
TTGCAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAATCGTGCAAGACCACTTACTATGCGGA
TTGGTGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTAC
CCCCTATGCGAGTAGG****GGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTAT
GGACCTGAGCCT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2AV30TF 719 0 0
AGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTCTAACACTCA
CATCATCTATCTATACGCGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTCTTCGTCATTCT
CGTGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTGCCAGCAGAAACAGAGGAGCTTCACCGCCG
GGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCGCCACGATTCTCTCTCTGA
CGCCTCTGGATGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAGACCCTCTCT
GCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCGGTG
ACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGACGGAA
CGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCACTTACTATGCGGATTGGTGTCGGCA
AGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTCCTATGCGAG
TAGG****GGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGCCT
GCAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATGATATC
AATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCGTTCTGTA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2FM53TF 672 0 0
AGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTCTAACACTCA
CATCATCTATCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTT**TCTTCTTCGTCATTCT
CGCGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTGCCAGCAGAAACAGAGGAGCTTCACCGCCG
GGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCGCCACGATTCTCTCTCTGA
CGCCTCTGGATGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAGACCCTCTCT
GCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCGGTG
ACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTCGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGACGGAA
CGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCACTTACTATGCGGATTGGTGTCGGCA
AGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTCCTATGCGAG
TAGG****GGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGCCT
GCAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAACGCCACTTTGCTCTATGATATT
AATTTTGTTGA
A

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2FV10TF 736 0 0
GGAAGGGAATTAAGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGA
CTCTAACACTCACATCATCTATCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTT
C***GTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTGCCAGCAGAAACAGAGGA
GCTTCACCGCCGGGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCGCCACGA
TTCTCTCTCTGACGCCTCTGGATGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACACCACTGTTG
GAGACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTG
TTGGGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGT
TTGCAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCACTTACTATGCGGA
TTGGTGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTAC
CTCCTATGCGAGTAGG****GGGGAAGCGTAAGCTTCAGAT*CCACCTAAGTTAGCTTAT
GGACCTGAGCCTGCAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTG
CTCTATGATATCAATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAAT
TTCGTTCTGTAAAGGA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2BB32TF 855 0 0
GGGTACTCTTGGAAGATTCAAGACCAAACGCTTGCACTTCCCACAGATAAGGGAATTAAG
AAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTTTAACACTCACA
TCATCTATCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTCATCGTCATTCTCG
TGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTTCCAGCAGAAACATAGGAGCTTCACCGCCGCG
AAGACGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCGCCACGATTCTCTCTCTGACG
CCTCTGGACGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAGACCCTCTCTGC
GAATACAGCTACGCAAAATCAGGACTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCGGTGAC
AAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGACGGAACG
TTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCACTTACTATGCGGATTGGTGTCGGCAAG
GTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCCCCTATGCGAGTA
GGCAAGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGTCTGC
AGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATGATATCAA
TTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACGCAAGATGAAGCTCTAATTTCGTTCTGTAAAG
GAAGAAAAAAAA**CTATGTATATGATATATATCACCAGATTCTGGATTTTTATCATCTG
TAAACATTGACATTT

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR2AK48TF 829 0 0
GGAAGGGAATTAAGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGA
CTTTAACACTCACATCATCTATCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTT
CATCGTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTTCCAGCAGAAACAGAGGA
GCTTCACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCGCCACGA
TTCTCTCTCTGACGCCTCTGGACGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTG
AAGACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGACTTGGATTCTGCGATATCGCTG
TTGGGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGT
TTGCAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACC**TTACTATGCGGA
TTGGTGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTAC
CCCCTATGCGAGTAGG****GGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTAT
GGACCTGAACCTGCAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTG
CTCTATGATATCAATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAAT
TTCGTTCTGTAAAGGAAGAAAAAAAAA*CTATGTATATGATATACATCACCAGATTCTGG
ATTTTTATCATCTGTAAACATTGACATTTTCCAACTTAAACCCAACGAG

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2AF27TF 832 0 0
GGGAATTAAGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTTT
AACACTCACATCATCTATCTTTACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTCTTC
GTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTGCCAGCAGAAACAGAGGAGCTT
CACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCGCCACGATTCT
CTCTCTGACGCCTCTGGACTCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAGA
CCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGACTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGG
GTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGC
AGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCACTTACTATGCGGATTGG
TGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTCC
TATGCGAGTAGG****GGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGAC
CTGAGCCTGCAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCT
ATGATATCAATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCG
TTCTGTAAAGGACGAAAAAAAA**CTATGTATATGATATATATCAACAGATTGTGGATTT
T*ATCATCTGTAAACATTGACATTCTCCAACTTAAACCCAACGAGTAGCTTG

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR2FV10JQ 500 0 0
GCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCGGTG
ACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGACGGAA
CGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCACTTACTATGCGGATTGGTGTCGGCA
AGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTCCTATGCGAG
TAGG****GGGGAAGCGTAAGCTTCAGAT*CCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGCCT
GCAGGGTGCTTTTTTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATGATATC
AATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCGTTCTGTAA
AGGAAGAAAAAAAAAACTATGTATATGATATATATCAAC*GATTGTGGATTTT*ATCATC
TGTAAACATTGACATT
CTCC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2FM53JQ 633 0 0
GGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCGCCACGATTCTCTCTCTGACGCCTCTGGATGCAGAC
GCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAGACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCA
AAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGC
GTACTCGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACC
TATAAGCGTGCAAGACCACTTACTATGCGGATTGGTGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTA
GACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTCCTATGCGAGTAGG****GGGGAAGCG
TAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGCCTGCAGGGTGCTTTTCTGG
TGACTGTAACATACCTGGCAACGCCACTTTGCTCTATGATATTAATTTTGTTGAAATCTA
CCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCGTTCTGTAAAGGAAGAAGAAAAA**C
TATGTATATGATATATATCACCAGATTCTGGATTTT*ATCATCTGTAAACATTGACATTC
TCCAACTTAAACCCAACGAGTAGCTTGCTTTTG

QA 1 633 1 633
DS 



CO CL353Contig2 641 3 12 U
GCCGAGGTCATAACTCAACCATATTTTACACAGAGGAAATGTCTTGTTCTTCAAGAGCAA
GCTACTCGTTGGGTTTAAGTTGGAAAATGTCAATGTTTACAGATGATAAAAATCCAGAAT
CTGGTGATATATATCATATACATAGTTTTTTTTTCTTCCTTTACAGAACGAAATTAGAGC
TTCATCTTGTGTTACTTCCGGGGTAGATCTCAACAAAATTGATATCATAGAGCAAAGTTG
CATTGCCAGGTATGTTACAGTCACCAGAAAAGCACCCTGCAGGCTCAGGTCCATAAGCTA
ACTTAGGTGGAATCTGAAGCTTACGCTTCCCCCCTACTCGCATAGGGGGTACTCCTTCGC
CTCCAAGAATCCCTTGGTCTAGACCCCTTATAACCTTGCCGACACCAATCCGCATAGTAA
GTGGTCTTGCACGCTTATAGGTACTGTCAAACAACGTTCCGTCTGCAAACCTCGCCGTAT
AGTGAACATTGACAAGTACGCCACGAGGAGCTTTGTCACCGAACCCAACAGCGATATCGC
AGAATCCAAGTCCTGATTTTGCGTAGCTGTATTCGCAGAAAGGGTCTCCAACAGTGGCGT
AGTACTCTATCCTCGTGGCGTCTGCGTCCAGAGGCGTCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2GM11JQ U 1
AF RR2AK48JQ U 43
AF RR2GM68JQ U 45
BS 1 56 RR2GM11JQ
BS 57 57 RR2AK48JQ
BS 58 207 RR2GM11JQ
BS 208 208 RR2AK48JQ
BS 209 433 RR2GM11JQ
BS 434 434 RR2AK48JQ
BS 435 576 RR2GM11JQ
BS 577 579 RR2AK48JQ
BS 580 580 RR2GM68JQ
BS 581 587 RR2AK48JQ
BS 588 588 RR2GM68JQ
BS 589 641 RR2AK48JQ

RD RR2GM11JQ 576 0 0
GCCGAGGTCATAACTCAACCATATTTTACACAGAGGAAATGTCTTGTTCTTCAAGAACAA
GCTACTCGTTGGGTTTAAGTTGGAAAATGTCAATGTTTACAGATGATAAAAATCCAGAAT
CTGGTGATATATATCATATACATAGTTTTTTTTTCTTCCTTTACAGAACGAAATTAGAGC
TTCATCTTGTGTTACTTCCGGGGTAGACCTCAACAAAATTGATATCATAGAGCAAAGTTG
CATTGCCAGGTATGTTACAGTCACCAGAAAAGCACCCTGCAGGCTCAGGTCCATAAGCTA
ACTTAGGTGGAATCTGAAGCTTACGCTTCCCCCCTACTCGCATAGGGGGTACTCCTTCGC
CTCCAAGAATCCCTTGGTCTAGACCCCTTATAACCTTGCCGACACCAATCCGCATAGTAA
GTGGTCTTGCACGATTATAGGTACTGTCAAACAACGTTCCGTCTGCAAACCTCGCCGTAT
AGTGAACATTGACAAGTACGCCACGAGGAGCTTTGTCACCGAACCCAACAGCGATATCGC
AGAATCCAAGTCCTGATTTTGCGTAGCTGTATTCGC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2AK48JQ 599 0 0
CTC
GTTCTTCAAGAGCAAGCTACTCGTTGGGTTTAAGTTGGAAAATGTCAATGTTTACAGATG
ATAAAAATCCAGAATCTGGTGATGTATATCATATACATAGTTTTTTTTTCTTCCTTTACA
GAACGAAATTAGAGCTTCATCTTGTGTTACTTCCGGGGTAGATCTCAACAAAATTGATAT
CATAAAGCAAAGTTGCATTGCCAGGTATGTTACAGTCACCAAAAAAGCACCCTGCAGGTT
CAGGTCCATAAGCTAACTTAGGTGGAATCTGAAGCTTACGCTTCCCCCCTACTCGCATAG
GGGGTACTCCTTCGCCTCCAAAAATCCCTTGGTCTAAACCCCTTATAACCTTGCCGACAC
CAATCCGCATAGTAAG**GTCTTGCACGCTTATAGGTACTGTCAAACAACGTTCCGTCTG
CAAACCTCGCCGTATAGTGAACATTGACAAGTACGCCACGAGGAGCTTTGTCACCGAACC
CAACAGCGATATCGCAAAATCCAAGTCCTGATTTTGCGTAGCTGTATTCGCAGAGAGGGT
CTTCAACAGTGGCGTAGTACTCTATCCTCGTGGCGTCTGCGTCCAGAGGCGTCAGA

QA 4 599 4 599
DS 

RD RR2GM68JQ 594 0 0
GGTTCTTCAAG
AGCAAGCTACTCGCTGGGTTTAAGTTGGAAAATGTCAATGTTTACAGATGATAAAAATCC
AGAATCTGGTGATATATATCGTATACATAGTTTTTTTTTCTTCCTTTACAGAACGAAATT
AGAGCTTCATCTTGTGTTACTTCCGGGGTAGATCTCAACAAAATTGATATCATAGAGCAA
AGTTGCATTGCCAGGTATGTTACAGTCACCAGAAAAGCACCCTGCAGGCTCAGGTCCATA
AGCTAACTTAGGTGGAATCTGAAGCTTACGCTTCCCCCCTACTCGCATAGGGGGTACTCC
TTCGCCTCCAAGAATCCCTTGGTCTAGACCCCTTATAACCTTGCCGACACCAATCCGCAT
AGTAAGTGGTCTTGCACGCTTATAGGTACTGTCAAACAACGTTCCGTCTGCAAACCTCGC
CGTATAGTGAACATTGACAAGTACGCCACGAGGAGCTTTGTCACCGAACCCAACAGCGAT
ATCGCAGAATCCAAGTCCTGATTTTGCGTAGCTGTATTCGCAGAAAGGGTCTCCAACAGT
GGCGTAGTACTCTATCCTCGTGGCGTCTGCGTCCAGAGGCGTC

QA 12 594 12 594
DS 



AS 4 12

CO CL354Contig1 710 2 6 U
GGACTCTCAACCCTATCTCTTCCTCCATGGCTGCTTCAGCTTCGTCCCTCGCTCTCTCCA
CCTTCAACCCTAAATCCCTTCCTTTCTCCATCTCCAGACCCGCCTCCACTCCCTTCCTCC
CTCCTTCCCTCTCCTTCAAACTCAACCACCAATCCATTTCCCTCTCCGTCTCCGCCGCGT
CTCGCTTCGTCCGTAATGTTGCCGTCACAGATGACTTCAGCGTAGAAGAAGAAGATGGAG
TTTTCTCCGATGACGCTCCTCAGCAGCAGGAACAATCCTTCTCTGCTGACCTTAAACTCT
TCGTCGGTAACCTCCCCTTCGACGTCGACAGTGCTCAGCTCGCTCAGCTCTTCGAGAGCG
CCGGAAATGTCGAGATGGTTGAGGTGATATATGACAAAGTGACAGGACGAAGCAGAGGTT
TCGGGTTCGTGACAATGTCTTCAGTGTCTGAAGTTGAAGCAGCTGAGCAGCAGTTCAATG
GCTATGAGTTAGATGGTAGAGCCTTGAGAGTTAATGCGGGTCCTCCTCCACCGAAGAGGG
AAGACTCCTTCTCCAGAGGACCCAGAAGCAGCTTTGGAAGCTCCGGTTCTGGATATGGTG
GTGGTGGTGGGTGGTGGTGCTGGTTCAGAAACCGTGTTTATGTCGGCAACCTATCTTGGG
GAGTCGATGACATGGCTCTCGAGAGTTGTTCGGGGAGCAGGAAAAGTAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX47TF U 1
AF RR2D646TF U 1
BS 1 231 RR2BX47TF
BS 232 234 RR2D646TF
BS 235 577 RR2BX47TF
BS 578 578 RR2D646TF
BS 579 600 RR2BX47TF
BS 601 710 RR2D646TF

RD RR2BX47TF 600 0 0
GGACTCTCAACCCTATCTCTTCCTCCATGGCTGCTTCAGCTTCGTCCCTCGCTCTCTCCA
CCTTCAACCCTAAATCCCTTCCTTTCTCCATCTCCAGACCCGCCTCCACTCCCTTCCTCC
CTCCTTCCCTCTCCTTCAAACTCAACCACCAATCCATTTCCCTCTCCGTCTCCGCCGCGT
CTCGCTTCGTCCGTAATGTTGCCGTCACAGATGACTTCAGCGTAGAAGAAG***ATGGAG
TTTTCTCCGATGACGCTCCTCAGCAGCAGGAACAATCCTTCTCTGCTGACCTTAAACTCT
TCGTCGGTAACCTCCCCTTCGACGTCGACAGTGCTCAGCTCGCTCAGCTCTTCGAGAGCG
CCGGAAATGTCGAGATGGTTGAGGTGATATATGACAAAGTGACAGGACGAAGCAGAGGTT
TCGGGTTCGTGACAATGTCTTCAGTGTCTGAAGTTGAAGCAGCTGAGCAGCAGTTCAATG
GCTATGAGTTAGATGGTAGAGCCTTGAGAGTTAATGCGGGTCCTCCTCCACCGAAGAGGG
AAGACTCCTTCTCCAGAGGACCCAGAAGCAGCTTTGGGAGCTCCGGTTCTGGATATGGTG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2D646TF 710 0 0
GGACTCTCAACCCTATCTCTTCCTCCATGGCTGCTTCAGCTTCGTCCCTCGCT*TCTCCA
CCTTCAACCCTAAATCCCTTCCTTTCTCCATC**CAGACCCGCCTCCACTCCCTTCCTCC
CTCCTTCCCTCTCCTTCAAACTCAACCACCAATCCATTTCCCTCTCCGTCTCCGCCGCGT
CTCGCTTCGTCCGTAATGTTGCCGTCACAGATGACTTCAGCGTAGAAGAAGAAGATGGAG
TTTTCTCCGATGACGCTCCTCAGCAGCAGGAACAATCCTTCTCTGCTGACCTTAAACTCT
TCGTCGGTAACCTCCCCTTCGACGTCGACAGTGCTCAGCTCGCTCAGCTCTTCGAGAGCG
CCGGAAATGTCGAGATGGTTGAGGTGATATATGACAAAGTGACAGGACGAAGCAGAGGTT
TCGGGTTCGTGACAATGTCTTCAGTGTCTGAAGTTGAAGCAGCTGAGCAGCAGTTCAATG
GCTATGAGTTAGATGGTAGAGCCTTGAGAGTTAATGCGGGTCCTCCTCCACCGAAGAGGG
AAGACTCCTTCTCCAGAGGACCCAGAAGCAGTTTTGGAAGCTCCGGTTCTGGATATGGTG
GTGGTGGTGGGTGGTGGTGCTGGTTCAGAAACCGTGTTTATGTCGGCAACCTATCTTGGG
GAGTCGATGACATGGCTCTCGAGAGTTGTTCGGGGAGCAGGAAAAGTAGC

QA 1 710 1 710
DS 



CO CL354Contig2 1213 6 2 U
GGGTGAAAAGACTTAAATTAGACTGTTAAACAGAGAAGCATTCATTATGAAGAGACCACA
AAATAGAGAGAAACCCGAATCAAACCAGAGCTAAGTAGTCAATGGCAGCACACAGACAGA
CGAGAACATGTTTTTCAATCGTAACCTTTACTTAATATGTTACTAATAAAAAGACCACTC
GTGCATCCATTGCATAACAAACATAGGTGAAGAGCTTAGTACGGTCCAAAACAGCCATCC
TCTCACATAACTCTATATTCTTCGAAGCGCCCTCCAGAAAATGCGTTTATGAGATTAGGA
AGGGTGGTGATCAAAACTGGCGCCTTGGAGGCCTAGCCTCAGCTTCAGAGACTCTTATTT
GTCTACCGTCCAAATCGGCACCATTCAAGTTTCTGATGGCATTTTGGACCTCTTGAGCAG
AGTTGTATGTCACAAACCCAAAACCCTTAGATCGACCACTGTCCCTGTCGTAAATGACTC
TAGCCTCAGCCACCTTTCCCTGCTCCCCGAACAAACTCTCGAGAGCCATGTCATCCACTC
CCCAAGATAGGTTGCCGACGTAAACACGGTTTCCTGAACCAGAACCACCACCACCACCAC
CATATCCAGAACCGGAGCTTCCAAAGCTGCTTCTGGGTCCTCTGGAGAAGGAGTCTTCCC
TCTTCGGTGGAGGAGGACCCGCATTAACTCTCAAGGCTCTACCATCCAACTCATAGCCAT
TAAACTGTTGGGCAGCTGCCTCAACTTCAGAGACTGAAGACATAGTCACGAACCCAAAAC
CCC*TGCTTCGTCCTGTCACTTTGTCATAGATTACCTCAACCATCTCGACATTTCCGGCG
CTCTCGAAGAGCTGAGCGAGCTGAGCACTGTCGACGTCGAAGGGGAGGTTACCGACGAAG
AGTTTGAGGTCAGCAGAGAAGGATTGCTCCTGCTGCGAAGGAGAGTCATCGGAGAAAACT
CCGTCTTCTTCTTCTACGCTGAAGTCATCTGTGACGGCAACATTACGGACGAAGCGAGAC
GCGGCGGAGACGGAGAGGGAAATGGATTGGTGGTTGAGTTTGAAGGAGAGGGAAGGAGGG
AGGAAGGGAATGGAGGCGGGTTTGGAGATGGAGAAAGGAAGGGATTTAGGGTTGAAGGTG
GAGAGAGCGAGGGACGACGCTGAAGCAGCCATGGAGGAAGCAGGAGAGGAGATAGAGATA
GGGTTGAGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DH25JQ U 28
AF RR2A935JQ U 40
AF RR2C069JQ U 1
AF RR2BX37TF C 569
AF RR2C069TF C 600
AF RR2A935TF C 603
BS 1 769 RR2C069JQ
BS 770 1213 RR2BX37TF

RD RR2DH25JQ 232 0 0
AAACAGAGAAGCATTCATTATGAAGAGACCACAAAATAGAGAGAAACCCGAATCAAACCA
AAGCTAAGTAGTCAATGGCAGCACACTGACAGACGAGAACATGTTTTTCAATCATAACCT
TTACTTAATATGTTACTAATAAAAAGACCACTCGTGCATCCATTGCATAACAAACATAGG
TGAAGAGCTTCGTACGGTCCAAAACAGCCATCCTCTCACATAACTCTATATT

QA 1 232 1 232
DS 

RD RR2A935JQ 593 0 0
ATTCATTATGAAGAGACCACAAAATAGAGAGAAACCCGAATCAAACCAGAGCTAAGTAGT
CAATGGCAGCACACAGACAGACGAGAACATGTTTTTCAATCGTAACCTTTACTTAATATG
TTACTAATAAAAAGACCACTCGTGCATCCATTGCATAACAAACATAGGTGAAGAGCTTAG
TACGGTCCAAAACAGCCATCCTCTCACATAACTCTATATTCTTCGAAGCGCCCTCCAGAA
AATGCGTTTATGAGATTAGGAAGGGTGGTGATCAAAACTGGCGCCTTGGAGGCCTAGCCT
CAGCTTCAGAGACTCTTATTTGTCTACCGTCCAAATCGGCACCATTCAAGTTTCTGATGG
CATTTTGGACCTCTTGAGCAGAGTTGTATGTCACAAACCCAAAACCCTTAGATCGACCAC
TGTCCCTGTCGTAAATGACTCTAGCCTCAGCCACCTTTCCCTGCTCTCCGAACAAACTCT
CGAGAGCCATGTCATCCACTCCCCAAGATAGGTTGCCGACGTAAACACGGTTTCCTGAAC
CAGAACCACCACCACCACCACCATATCCGGAACCGGAGCTTCCAAAGCTGC
TT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2C069JQ 769 0 0
GGGTGAAAAGACTTAAATTAGACTGTTAAACAGAGAAGCATTCATTATGAAGAGACCACA
AAATAGAGAGAAACCCGAATCAAACCAGAGCTAAGTAGTCAATGGCAGCACACAGACAGA
CGAGAACATGTTTTTCAATCGTAACCTTTACTTAATATGTTACTAATAAAAAGACCACTC
GTGCATCCATTGCATAACAAACATAGGTGAAGAGCTTAGTACGGTCCAAAACAGCCATCC
TCTCACATAACTCTATATTCTTCGAAGCGCCCTCCAGAAAATGCGTTTATGAGATTAGGA
AGGGTGGTGATCAAAACTGGCGCCTTGGAGGCCTAGCCTCAGCTTCAGAGACTCTTATTT
GTCTACCGTCCAAATCGGCACCATTCAAGTTTCTGATGGCATTTTGGACCTCTTGAGCAG
AGTTGTATGTCACAAACCCAAAACCCTTAGATCGACCACTGTCCCTGTCGTAAATGACTC
TAGCCTCAGCCACCTTTCCCTGCTCCCCGAACAAACTCTCGAGAGCCATGTCATCCACTC
CCCAAGATAGGTTGCCGACGTAAACACGGTTTCCTGAACCAGAACCACCACCACCACCAC
CATATCCAGAACCGGAGCTTCCAAAGCTGCTTCTGGGTCCTCTGGAGAAGGAGTCTTCCC
TCTTCGGTGGAGGAGGACCCGCATTAACTCTCAAGGCTCTACCATCCAACTCATAGCCAT
TAAACTGTTGGGCAGCTGCCTCAACTTCAGAGACTGAAGACATAGTCAC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2BX37TF 645 0 0
CACGGTTTCTGAACCAGAA
CCACCACCACCACCATATCCAGAACCGGAGCTTCCAAAGCTGCTTCTGGGTCCTCTGGAG
AAGGAGTCTTCCCTCTTCGGTGGAGGAGGACCCGCATTAACTCTCAAGGCTCTACCATCC
AACTCATAGCCATTAAACTGTTGGGCAGCTGCCTCAACTTCAGAGACTGAAGACATAGTC
ACGAACCCAAAACCCC*TGCTTCGTCCTGTCACTTTGTCATAGATTACCTCAACCATCTC
GACATTTCCGGCGCTCTCGAAGAGCTGAGCGAGCTGAGCACTGTCGACGTCGAAGGGGAG
GTTACCGACGAAGAGTTTGAGGTCAGCAGAGAAGGATTGCTCCTGCTGCGAAGGAGAGTC
ATCGGAGAAAACTCCGTCTTCTTCTTCTACGCTGAAGTCATCTGTGACGGCAACATTACG
GACGAAGCGAGACGCGGCGGAGACGGAGAGGGAAATGGATTGGTGGTTGAGTTTGAAGGA
GAGGGAAGGAGGGAGGAAGGGAATGGAGGCGGGTTTGGAGATGGAGAAAGGAAGGGATTT
AGGGTTGAAGGTGGAGAGAGCGAGGGACGACGCTGAAGCAGCCATGGAGGAAGCAGGAGA
GGAGATAGAGATAGGGTTGAGAGTCC

QA 20 645 20 645
DS 

RD RR2C069TF 614 0 0
CCATATCCAGAACCGGAGCTTCCAAAGCTGCTTCTGGGTCCTCTGGAGAAGGAGTCTTCC
CTCTTCGGTGGAGGAGGACCCGCATTAACTCTCAAGGCTCTACCATCCAACTCATAGCCA
TTAAACTGTTGGGCAGCTGCCTCAACTTCAGAGACTGAAGACATAGTCACGAACCCAAAA
CCCC*TGCTTCGTCCTGTCACTTTGTCATAGATTACCTCAACCATCTCGACATTTCCGGC
GCTCTCGAAGAGCTGAGCGAGCTGAGCACTGTCGACGTCGAAGGGGAGGTTACCGACGAA
GGGTTTGAGGTCAGCAGAGAAGGATTGCTCCTGCTGCGAAGGAGAGTCATCGGAGAAAAC
TCCGTCTTCTTCTTCTACGCTGAAGTCATCTGTGACGGCAACATTACGGACGAAGCGAGA
CGCGGCGGAGACGGAGAGGGAAATGGATTGGTGGTTGAGTTTGAAGGAGAGGGAAGGAGG
GAGGAAGGGAATGGAGGCGGGTTTGGAGATGGAGAAAGGAAGGGATTTAGGGTTGAAGGT
GGAGAGAGCGAGGGACGACGCTGAAGCAGCCATGGAGGAAGCAGGAGAGGAGATAGAGAT
AGGGTTGAGAGTCC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2A935TF 611 0 0
TATCCAGAACCGGAGCTTCCAAAGCTGCTTCTGGGTCCTCTGGAGAAGGAGTCTTCCCTC
TTCGGTGGAGGAGGACCCGCATTAACTCTCAAGGCTCTACCATCCAACTCATAGCCATTA
AACTGTTGGGCAGCTGCCTCAACTTCAGAGACTGAAGACATAGTCACGAACCCAAAACCC
CCTGCTTCGTCCTGTCACTTTGTCATAGATTACCTCAACCATCTCGA*ATTTTCGGCGCT
CTCGAAGAGCTGAGCGAGCTGAGCACTATCGACGTCGAAGGGGAGGTTACCGACGAAGAG
TTCGAGGTCAGCAGAGAAGGATTGCTCCTGCTGCGAAGGAGAGTCATCGGAGAAAACTCC
GTCTTCTTCTTCTACGCTGAAGTCATCTGTGACGGCAACATTACGGACGAAGCGAGACGC
GGCGGAGACGGAGAGGGAAATGGATTGGTGGTTGAGTTTGAAGGAGAGGGAAGGAGGGAG
GAAGGGAATGGAGGCGGGTTTGGAGATGGAGAAAGGAAGGGATTTAGGGTTGAAGGTGGA
GAGAGCGAGGGACGACGCTGAAGCAGCCATGGAGGAAGCAGGAGAGGAGATAGAGATAGG
GTTGAGAGTCC

QA 1 611 1 611
DS 



CO CL354Contig3 1064 2 2 U
GGACTCTCAACCCTATCTCTTCCTCCATGGCTGCCTCAGCTTCGTCTCTCGCTCTCTCCA
CCTTCAACCCTAAATCCCTTCCTTTCTCCATCTCCAGACCCGCCTCCACTCCCTTCCTCC
CTCCTTCCCTCTCCTTCAAACTCAACTCCCAATCCATTTCCCTCTCCGTCTCCGCCGCGT
CTCGCTTCGTCCGTAATGTTGCCGTCACAGATGACTTCAGCGTAGAAGAAGAAGATGGAG
TTTTCTCCGATGACGCTCCTCCGCAGCAGGAGCAATCCTTCTCTGCTGACCTTAAACTCT
TCGTCGGTAACCTCCCCTTCGACGTCGACAGTGCTCAGCTCGCTCAGCTCTTCGAGAGCG
CCGGAAATGTCGAGATGGTTGAGGTGATATATGACAAAGTGACAGGACGAAGCAGAGGTT
TCGGGTTCGTGACTATGTCTTCAGTGTCTGAAGTTGAAGCAGCTGAGCAGCAGTTCAATG
GCTATGAGTTAGATGGTGGTGGTGGTGGTGCTGGTTCAGGAAACCGTGTTTACGTCGGCA
GCCTATCTTGGGGAGTCGATGACATGGCTCTCGAGAGTTTGTTCGGGGAGCAGGGAAAGG
TATCTGAGGCTAGAGTCATCTACGACAGGGACAGTGGTCGATCTAAGGGTTTTGGGTTTG
TGACCTACAACTCTGCTCAAGAGGTCCAAAATGCCATCAGAAACTTGAATGGTGCCGATT
TGGACGGTAGACAAATAAGAGTCTCTGAAGCTGAGGCTAGGCCTCCAAGGCGCCAGTTTT
GATCACCACCCTTCCTATTCTCATAAACGCATTTTCTGTGAGAGGATGGCTGTTTTGGAC
CGTACGAAGCTCTTCACCTATGTTTGTTATGCAATGGATGCACGAGTGGTCTTTTTATTA
GTAACATATTAAGTAAAGGTTATGATTGAAAAACATGTTCTCGTCTGTCTGTGTGCTGCC
ATTGACTACTTAGCTTTGGTTTGATTCGGGGTTCTCTCTATTTTGTGGTCTCTTCATAAT
GAATGCTTCTCTGTTTAACAGTCTAATTTAAGTCTTTTCACCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CN86TF U 1
AF RR2CN86JQ C 366
BS 1 601 RR2CN86TF
BS 602 1064 RR2CN86JQ

RD RR2CN86TF 604 0 0
GGACTCTCAACCCTATCTCTTCCTCCATGGCTGCCTCAGCTTCGTCTCTCGCTCTCTCCA
CCTTCAACCCTAAATCCCTTCCTTTCTCCATCTCCAGACCCGCCTCCACTCCCTTCCTCC
CTCCTTCCCTCTCCTTCAAACTCAACTCCCAATCCATTTCCCTCTCCGTCTCCGCCGCGT
CTCGCTTCGTCCGTAATGTTGCCGTCACAGATGACTTCAGCGTAGAAGAAGAAGATGGAG
TTTTCTCCGATGACGCTCCTCCGCAGCAGGAGCAATCCTTCTCTGCTGACCTTAAACTCT
TCGTCGGTAACCTCCCCTTCGACGTCGACAGTGCTCAGCTCGCTCAGCTCTTCGAGAGCG
CCGGAAATGTCGAGATGGTTGAGGTGATATATGACAAAGTGACAGGACGAAGCAGAGGTT
TCGGGTTCGTGACTATGTCTTCAGTGTCTGAAGTTGAAGCAGCTGAGCAGCAGTTCAATG
GCTATGAGTTAGATGGTGGTGGTGGTGGTGCTGGTTCAGGAAACCGTGTTTACGTCGGCA
GCCTATCTTGGGGAGTCGATGACATGGCTCTCGAGAGTTTGTTCGGGGAGCAGGGAAAGG
T
ATC

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2CN86JQ 699 0 0
AATGTCGAGATGGTTGAGGTGATATATGACAAAGTGACAGGACGAAGCAGAGGTTTCGGG
TTCGTGACTATGTCTTCAGTGTCTGAAGTTGAAGCAGCTGAGCAGCAGTTCAATGGCTAT
GAGTTAGATGGTGGTGGTGGTGGTGCTGGTTCAGGAAACCGTGTTTACGTCGGCAGCCTA
TCTTGGGGAGTCGATGACATGGCTCTCGAGAGTTTGTTCGGGGAGCAGGGAAAGGTATCT
GAGGCTAGAGTCATCTACGACAGGGACAGTGGTCGATCTAAGGGTTTTGGGTTTGTGACC
TACAACTCTGCTCAAGAGGTCCAAAATGCCATCAGAAACTTGAATGGTGCCGATTTGGAC
GGTAGACAAATAAGAGTCTCTGAAGCTGAGGCTAGGCCTCCAAGGCGCCAGTTTTGATCA
CCACCCTTCCTATTCTCATAAACGCATTTTCTGTGAGAGGATGGCTGTTTTGGACCGTAC
GAAGCTCTTCACCTATGTTTGTTATGCAATGGATGCACGAGTGGTCTTTTTATTAGTAAC
ATATTAAGTAAAGGTTATGATTGAAAAACATGTTCTCGTCTGTCTGTGTGCTGCCATTGA
CTACTTAGCTTTGGTTTGATTCGGGGTTCTCTCTATTTTGTGGTCTCTTCATAATGAATG
CTTCTCTGTTTAACAGTCTAATTTAAGTCTTTTCACCCT

QA 1 699 1 699
DS 



CO CL354Contig4 741 2 4 U
GGACTCTCAACCCTATCTCTTCCTCCATGGCTGCTTCAGCTTCGTCCCTCGCTCTCTCCA
CCTTCAACCCTAAATCCCTTCCTTTCTCCATCTCCAGACCCGCCTCCACTCCCTTCCTCC
CTCCTTCCCTCTCCTTCAAACTCAACCACCAATCCATTTCCCTCCTCCACCGAAGAGGGA
AGCTCCGGTTCTGGATATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCTGGTTCAGGAAACCGTGTT
TATGTCGGCAACCTATCTTGGGGAGTCGATGACATGGCTCTCGAGAGTTTGTTCGGGGAG
CAGGGAAAAGTAGCTGAGGCTAGAGTCATCTACGACAGGGACAGTGGTCGATCTAAGGGT
TTTGGGTTTGTGACGTACAACTCTGCTCAAGAGGTCCAAAATGCCATCAGAAACTTGAAT
GGTGCCGATTTGGACGGTAGACAAATAAGAGTCTCTGAAGCTGAGGCTAGGCCTCCAAGG
CGCCAGTTTTGATCACCACCCTTCTGGAGGGCGCTTCGAAGAATATAGAGTTATGTGAGA
GGATGGCTGTTTTGGACCGTACGAAGCTCTTCACCTATGTTTGTTATGCAATGGATGCAC
GAGTGGTCTTTTTATTAGTAACATATTAAGTAAAGGTTATGATTGAAAAACATATTCTCG
TCTGTCTGTGTGCTGCCATTGACTACTTAGCTTTGGTTTGATTCGGGTTTCTCTCTATTT
TGTGGTCTCTTCATAATGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX59TF U 1
AF RR2CX59JQ C 126
BS 1 720 RR2CX59TF
BS 721 721 RR2CX59JQ
BS 722 730 RR2CX59TF
BS 731 741 RR2CX59JQ

RD RR2CX59TF 730 0 0
GGACTCTCAACCCTATCTCTTCCTCCATGGCTGCTTCAGCTTCGTCCCTCGCTCTCTCCA
CCTTCAACCCTAAATCCCTTCCTTTCTCCATCTCCAGACCCGCCTCCACTCCCTTCCTCC
CTCCTTCCCTCTCCTTCAAACTCAACCACCAATCCATTTCCCTCCTCCACCGAAGAGGGA
AGCTCCGGTTCTGGATATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCTGGTTCAGGAAACCGTGTT
TATGTCGGCAACCTATCTTGGGGAGTCGATGACATGGCTCTCGAGAGTTTGTTCGGGGAG
CAGGGAAAAGTAGCTGAGGCTAGAGTCATCTACGACAGGGACAGTGGTCGATCTAAGGGT
TTTGGGTTTGTGACGTACAACTCTGCTCAAGAGGTCCAAAATGCCATCAGAAACTTGAAT
GGTGCCGATTTGGACGGTAGACAAATAAGAGTCTCTGAAGCTGAGGCTAGGCCTCCAAGG
CGCCAGTTTTGATCACCACCCTTCTGGAGGGCGCTTCGAAGAATATAGAGTTATGTGAGA
GGATGGCTGTTTTGGACCGTACGAAGCTCTTCACCTATGTTTGTTATGCAATGGATGCAC
GAGTGGTCTTTTTATTAGTAACATATTAAGTAAAGGTTATGATTGAAAAACATATTCTCG
TCTGTCTGTGTGCTGCCATTGACTACTTAGCTTTGGTTTGATTCGGGTTTCTCTCTATTT
*GTGGTCTCT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2CX59JQ 616 0 0
TCCCTCTCCTTCAAACTCAACCACCAATCCATTTCCCTCCTCCACCGAAGAGGGAAGCTC
CGGTTCTGGATATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCTGGTTCAGGAAACCGTGTTTATGT
CGGCAACCTATCTTGGGGAGTCGATGACATGGCTCTCGAGAGTTTGTTCGGGGAGCAGGG
AAAAGTAGCTGAGGCTAGAGTCATTTACGACAGGGACAGTGGTCGATCTAAGGGTTTTGG
GTTTGTGACGTACAACTCTGCTCAAGAGGTCCAAAATGCCATCAGAAACTTGAATGGTGC
CGATTTGGACGGTAGACAAATAAGAGTCTCTGAAGCTGAGGCTAGGCCTCCAAGGCGCCA
GTTTTGATCACCACCCTTCTGGAGGGCGCTTCGAAGAATATAGAGTTATGTGAGAGGATG
GCTGTTTTGGACCGTACGAAGCTCTTCACCTATGTTTGTTATGCAATGGATGCACGAGTG
GTCTTTTTATTAGTAACATATTAAGTAAAGGTTATGATTGAAAAACATATTCTCGTCTGT
CTGTGTGCTGCCATTGACTACTTAGCTTTGGTTTGATTCGGGTTTCTCTCTATTTTGTGG
TCTCTTCATAATGAAT

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 10

CO CL355Contig1 1076 10 30 U
GGATTCTGAATCTTCGAAAAGTCGATCGGGAGGAAAAAAAAAAAAATCAACGGCCGATTC
TGACGATTCATCTCCGCCGAGCAGATCTGTGAATTGATTCTCGTCTATTACTACTCGATG
GCTGCTCCTCCTGCTAGAGCCCGTGCTGATTACGATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATC
GGAGACAGCGGTGTGGGTAAAAGTTGCCTCCTTCTACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACC
ACCAGTTTCATTACAACTATTGGTATTGATTTCAAGATACGGACTATTGAGCTAGATGGG
AAGAGAATCAAGCTGCAAATCTGGGATACTGCTGGACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACA
ACTGCATACTACCGTGGAGCCATGGGCATCTTGCTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCA
TCTTTCAACAATATCAGGAACTGGATCCGTAACATTGAGCAGCACGCGTCTGATAATGTC
AACAAGATTCTAGTGGGGAACAAGGCTGATATGGATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAA
GCGAAGGGCCAAGCTCTTGCAGATGAATACGGAATGAAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAG
ACTAACCTAAACGTTGAGGAAGTTTTCTTTTCAATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTT
GCAGATACCGATGCAAAGGCTGAGCCACAAACAATCAAAATCAACCAAACCGATCAGGGT
GCAGGGACATCTCAAGCTACTCAGAAATCAGCATGTTGTGGTTAGTAGAAAACTGGTCCC
TTACACCACCATCGAAGGAGAGAATCTGGCTTCTGAAAAAGAAAAAGGAAGAAAATCTTC
TAAATGCGATGGTGTTTTCTACGTATTCTTTTACAATTCTCTGTTTCCCCCTAACGGGTA
TAGTGTGAAAGACACATGTTTCTGGTATGGACTCCCTCACATCAGACTTGACTTGTGATA
ATATCAGATTTTCTCACTCACACTCCAACCGCATCTTTTTCTATTTGATCTTGCTGTGAA
ACTGGTACCACTTGTGATATTTGCAGCAACTGTTATGAATTTGTATATACATGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 5 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 0 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 40 
40 40 40 40 40 10 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN94TF U 33
AF RR2E629TF U 30
AF RR2EO49TF U 17
AF RR2CS45TF U 25
AF RR2DB16TF U 1
AF RR2EA16TF U 8
AF RR2EA16JQ C 216
AF RR2AN94JQ C 334
AF RR2DA57JQ C 337
AF RR2CS45JQ C 398
BS 1 40 RR2DB16TF
BS 41 41 RR2EO49TF
BS 42 122 RR2DB16TF
BS 123 124 RR2EA16TF
BS 125 440 RR2DB16TF
BS 441 441 RR2EO49TF
BS 442 467 RR2DB16TF
BS 468 468 RR2EO49TF
BS 469 491 RR2DB16TF
BS 492 492 RR2EO49TF
BS 493 678 RR2DB16TF
BS 679 679 RR2EA16JQ
BS 680 693 RR2DB16TF
BS 694 694 RR2EA16TF
BS 695 698 RR2DB16TF
BS 699 699 RR2EO49TF
BS 700 703 RR2DB16TF
BS 704 704 RR2EO49TF
BS 705 718 RR2DB16TF
BS 719 719 RR2EA16JQ
BS 720 725 RR2DB16TF
BS 726 726 RR2EA16JQ
BS 727 727 RR2EA16TF
BS 728 746 RR2DB16TF
BS 747 747 RR2EA16JQ
BS 748 771 RR2DB16TF
BS 772 772 RR2AN94JQ
BS 773 979 RR2EA16JQ
BS 980 997 RR2AN94JQ
BS 998 1076 RR2CS45JQ

RD RR2AN94TF 130 0 0
C
AAAAAAAAAAAAATCAACGGCCGATTCTGACGATTCATCTCCGCCGAGCAGATCTGTGAA
TTGATTCTCGTCTATTACTACTCCATGGCTGCTCCTCCTGCTAGAGCCCGTGCTGATTAC
GATTACCTC

QA 2 130 2 130
DS 

RD RR2E629TF 197 0 0
CAAA
AAAAAAAAAAAAATCAACGGCCGATTCTGACGATTCATCTCCGCCGAGCAGATCTGTGAA
TTGATTCTCGTCTTTTACTACTCGATGGCTGCTCCTCCTGCTAGAGCCCGTGCTGATTAC
GATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATCGGAGACAGCGGTGTGGGTAAAAGTTGCCTCCTT
CTACGTTTCTCTG

QA 5 197 5 197
DS 

RD RR2EO49TF 702 0 0
GGGGATCGGGAGGTAAC
AAAAAAAAAAAAATCAACGGCCGATTCTGACGATTCATCTCCGCCGAGCAGATCTGTGAA
TTGATTCTCGTCTATTACTACTCGATGGCTGCTCCTCCTGCTAGAGCCCGTGCTGATTAC
GATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATCGGAGACAGCGGTGTGGGTAAAAGTTGCCTCCTT
CTACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACCACCAGTTTCATTACAACTATTGGTATTGATTTC
AAGATACGGACTACTGAGCTAGATGGGAAGAGAATCAAGCTGCAAATCTGGGATACTGCT
GGACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAACTGCATACTACCGTGGAGCCATGGGCATCTTG
CTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAATATCAGGAACTGGATCCGTAAC
ATTGAGCAGCACGCGTCTGATAATGTCAACAAGATTCTAGTGGGGAACAAGGCTGATATG
GATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGAAGGGCCAAGCTCTTGCAGATGAATACGGA
ATGAAGTTTTTCGACACTAGTGCCAAGACTAACCTAAACGTTGAGGAAGTTTTCTTTTCA
ATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTGCAGATACCGATGCAAAG*CTGAGCCACAAACA
ATCAAAATCAACCAAACCGATCAGG

QA 18 702 18 702
DS 

RD RR2CS45TF 650 0 0
GGAGGTAAC
AAAAAAAAAAAAATCAACGGCCGATTCTGACGATTCATCTCCGCCGAGCAGATCTGTGAA
TTGATTCTCGTCTATTACTACTCGATGGCTGCTCCTCCTGCTAGAGCCCGTGCTGATTAC
GATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATCGGAGACAGCGGTGTGGGTAAAAGTTGCCTCCTT
CTACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACCACCAGTTTCATTACAACTATTGGTATTGATTTC
AAGATACGGACTATTGAGCTAGATGGGAAGAGAATCAAGCTGCAAATCTGGGATACTGCT
GGACAGGAGCGGTTCAGGACTACCACAACTGCATACTACCGTGGAGCCATGGGCATCTTG
CTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAATATCGGGAACTGGATCCGTAAC
ATTGAGCAGCACGCGTCTGATAATGTCAACAAGATTCTAGTGGGGAACAAGGCTGATATG
GATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGAAGGGCCAAGCTCTTGCAGATGAATACGGA
ATGAAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACCTAAACGTTGAGGAAGTTTTCTTTTCA
ATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTGCAGATACCGATGC

QA 10 650 10 650
DS 

RD RR2DB16TF 771 0 0
GGATTCTGAATCTTCGAAAAGTCGATCGGGAGGAAAAAAATAAAAATCAACGGCCGATTC
TGACGATTCATCTCCGCCGAGCAGATCTGTGAATTGATTCTCGTCTATTACTACTCGATG
GCCACTCCTCCTGCTAGAGCCCGTGCTGATTACGATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATC
GGAGACAGCGGTGTGGGTAAAAGTTGCCTCCTTCTACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACC
ACCAGTTTCATTACAACTATTGGTATTGATTTCAAGATACGGACTATTGAGCTAGATGGG
AAGAGAATCAAGCTGCAAATCTGGGATACTGCTGGACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACA
ACTGCATACTACCGTGGAGCCATGGGCATCTTGCTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCA
TCTTTCAACAATATCAGGAATTGGATCCGTAACATTGAGCAGCACGCTTCTGATAATGTC
AACAAGATTCTTGTGGGGAACAAGGCTGATATGGATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAA
GCGAAGGGCCAAGCTCTTGCAGATGAATACGGAATGAAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAG
ACTAACCTAAACGTTGAGGAAGTTTTCTTTTCAATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTT
GCAGATACCGATGCAAAG*CTGAGCCACAAACA*TCAA*ATCA*CCAAACCGATCAGG*T
GCAGG*TCATCTCAAGCTACTCAGAA*TCAGCATGTTGTGGTTAGTAGAAA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2EA16TF 754 0 0
GG
ATCTTCGAAAAGTCGATCGGGAGGAAAAAAATAAAAATCAACGGCCGATTCTGACGATTC
ATCTCCGCCGAGCAGATCTGTGAATTGATTCTCGTCTATTACTACTCGATGGCTGCTCCT
CCTGCTAGAGCCCGTGCTGATTACGATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATCGGAGACAGC
GGTGTGGGTAAAAGTTGCCTCCTTCTACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACCACCAGTTTC
ATTACAACTATTGGTATTGATTTCAAGATACGGACTATTGAGCTAGATGGGAAGAGAATC
AAGCTGCAAATCTGGGATACTGCTGGACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAACTGCATAC
TACCGTGGAGCCATGGGCATCTTGCTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCCTTCAAC
AATATCAGGAATTGGATCCGTAACATTGAGCAGCACGCTTCTGATAATGTCAACAAGATT
CTTGTGGGGAACAAGGCTGATATGGATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGAAGGGC
CAAGCTCTTGCAGATGAATACGGAATGAAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACCTA
AACGTTGAGGAAGTTTTCTTTTCAATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTGCAGATACC
GATGCAAAG*CTGAGC*ACAAACAATCAAGATCA*CCAAACCGATCAGG*TGCAGG*ACA
TCTCA*GCTACTCAGAA*TCAGCATGTTGTGG

QA 3 754 3 754
DS 

RD RR2EA16JQ 766 0 0
ACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACCACCAGTTTCATTACAACTATTGGTATTGATTTCAA
GATACGGACTATTGAGCTAGATGGGAAGAGAATCAAGCTGCAAATCTGGGATACTGCTGG
ACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAACTGCATACTACCGTGGAGCCATGGGCATCTTGCT
TGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCCTTCAACAATATCAGGAATTGGATCCGTAACAT
TGAGCAGCACGCTTCTGATAATGTCAACAAGATTCTTGTGGGGAACAAGGCTGATATGGA
TGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGAAGGGCCAAGCTCTTGCAGATGAATACGGAAT
GAAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACCTAAACGTTGAGGAAGTTTTCTTTTCAAT
TGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTGCAGATACCGATGCAAAGGCTGAGCCACAAACAAT
CAAGATCAACCAAACCGATCAGGGTGCAGGGACATCTCAAGCTACTCAGAAATCAGCATG
TTGTGGTTAGTAGAAAGCTGGTCCCTTACACCACCATCGAAGGAGAGAATCTGGCTTCTG
AAAAAGAAAAAGGAAGAAAATCTTCTAAATGCGATGGTGTTTTCTACGTATTCTTTTACA
ATTCTCTGTTTCCCCCTAACGGGTATAGTGTGAAAGACACATGTTTCTGGTATGGACTCC
CTCACATCAGACTTGACTTGTGATAATATCAGATTTTCTCACTC
TC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2AN94JQ 664 0 0
GGACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAACTGCATACTACCGTGGAGCCATAGGCATCTTG
CTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAATATCAGGAACTGGATCCGTAAC
ATTGAGCAGCACGCGTCTGATAATGTCAACAAGATTCTAGTGGGGAACAAGGCTGATATG
GATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGAAGGGCCAAGCTCTTGCAGATGAATACGGA
ATGAATTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACCTAAACGTTGAGGAAGTTTTCTTTTCA
ATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTGCAGATACCGATGCAAAGGTTGAGCCACAAACA
ATCAAAATCAACCAAACCGATCAGGGTGCAGGGACATCTCAAGCTACTCAGAAATCAGCA
TGTTGTGGTTAGTAGAAAACTGGTCCCTTACACCACCATCGAAGGAGATAATCTGGCTTC
TGAAAAAGAAAAAGGAAGAAAATCTTCTAAATGCGATGGTGTTTTCTACGTATTCTTTTA
CAATTCTCTGTTTCCCCCTAACGGGTATAGTGTGAAGGACACATGTTTCTGGTATGGACT
CCCTCACATCAGACTTGACTTGTGATAATATCAGATTTTCTCACTCACACTCCAACCGCA
TCTT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2DA57JQ 650 0 0
CAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAACTGCATACTACCGTGGAGCCATGGGCATCTTGCTT
GTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAATATCAGGAATTGGATCCGTAACATT
GAGCAGCACGCTTCTGATAATGTCAACAAGATTCTTGTGGGGAACAAGGCTGATATGGAT
GAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGAAGGGCCAAGCTCTTGCAGATGAATACGGAATG
AAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACCTAAACGTTGAGGAAGTTTTCTTTTCAATT
GGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTGCAGATACCGATGCAAAGGCTGAGCCACAAACAATC
AAGATCAACCAAACCGATCAGGGTGCAGGGACATCTCAAGCTACTCAGAAATCAGCATGT
TGTGGTTAGTAGAAAACTGGTCCCTTACACCACCATCGAAGGAGAGAATCTGGCTTCTGA
AAAAGAAAAAGGAAGAAAATCTTCTAAATGCGATGGTGTTTTCTACGTATTCTTTTACAA
TTCTCTGTTTCCCCCTAACGGGTATAGTGTGAAAGACACATGTTTCTGGTATGGACTCCC
TCACATCAGACTTGACTTGTTATAATATCAGATTTTCTCACTCACACTCC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2CS45JQ 679 0 0
TGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAATATCGGGAACTGGATCCGTAACATTG
AGCAGCACGCGTCTGATAATGTCAACAAGATTCTAGTGGGGAACAAGGCTGATATGGATG
AAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGAAGGGCCAAGCTCTTGCAGATGAATACGGAATGA
AGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACCTAAACGTTGAGGAAGTTTTCTTTTCAATTG
GTAAAGACATTAAGCAAAGACTTGCAGATACCGATGCAAAGGCTGAGCCACAAACAATCA
AAATCAACCAAACCGATCAGGGTGCAGGGACATCTCAAGCTACTCAGAAATCAGCATGTT
GTGGTTAGTAGAAAACTGGTCCCTTACACCACCATCGAAGGAGATAATCTGGCTTCTGAA
AAAGAAAAAGGAAGAAAATCTTCTAAATGCGATGGTGTTTTCTACGTATTCCTTTACAAT
TCTCTGTTTCCCCCTAACGGGTATAGTGTGAAGGACACATGTTTCTGGTATGGACTCCCT
CACATCAGACTTGACTTGTGATAATATCAGATTTTCTCACTCACACTCCAACCGCATCTT
TTTCTATTTGATCTTGCTGTGAAACTGGTACCACTTGTGATATTTGCAGCAACTGTTATG
AATTTGTATATACATGACC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 2 13

CO CL356Contig1 1306 10 26 U
GGACCCATCACACACTCCTCTCAAAACAGAGAAACGAAAAAAAAAAAGAAACATTCCAAG
AATATCTTTAGAGATTTCAAGAAAAATGGGATCAACGGCAGAGACACAGATAACTCCGGT
CCAAGTCACCGACGACGAAGCCGCTCTCTTTGCCATGCAGCTAGCCAGCGCCTCCGTTCT
TCCGATGGTTTTGAAGTCCGCGCTAGACCTTGATCTCCTCGAGATCATGGCCAATAACTC
TTCTCCAATGTCTCCCTCTGAGATTGCTTCTAAACTTCAGACCAAAAACCCCGAAGCTCC
GGTCATGCTCGACCGTATCCTCCGTCTTCTCACGTCTTACTCCATCCTCACCTGCTCCAA
CCGTACTACTCCCGGCGGTGACGGCGTCGAGAGGATTTACGGGCTTGGTCCGGTTTGCAA
GTACTTGACCAAGAACGAAGATGGTGTCTCGATAGCTGCTCTTTGTCTTATGAACCAAGA
CAAGGTTCTCATGGAAAGCTGGTACCATTTGAAAGATGCAATTCTTGATGGTGGGATTCC
ATTCAACAAGGCTTATGGAATGACCGCTTTTGAGTACCACGGTAAGGACCTAAGGTTCAA
CACGGTCTTTAACAACGGAATGTCTAACCATTCAACCATCACAATGAAGAAGATTCTTGA
GACCTATAAGGGTTTTGAGGAATTGACTTCTTTGGTTGATGTTGGTGGTGGTATTGGTGC
CACTCTCAAAATGATTGTCTCTAAGTACCCTAACCTTAAAGGCATCAACTTTGATCTCCC
CCATGTCATTGAAGAAGCTACTTCTCATCCCGGTATTGAACACGTTGGAGGAGATATGTT
TGTAAGTGTCCCTAAAGGTGATGCCATTTTCATGAAGTGGATATGCCACGACTGGAGTGA
TGAACACTGTGTGAAATTCCTGAAGAACTGCTACAAGGCGCTTCCAGAGGATGGAAAAGT
GATACTAGCAGAGTGTATACTTCCAGAGACACCAGACTCCAGCCTCTCGACCAAACAAGT
GGTCCATGTTGATTGCATTATGTTGGCTCACAACCCTGGAGGCAAAGAACGGACTGAGAA
AGAGTTTGAAGCATTAGCTAAAGAATCAGGCTTCAAAGGCATCAAAGTTGCCTGCAATGC
TTTTGGTGTTTACGTTATTGAGCTGCTCAAAAAGATGTAAAAACTCACACAGGCACAAAT
CCATGTAATGATGATTTTATATGTAAGCATTTCTCCCATGTTTACGTGTACTTCACCACC
TTTGTTTTAAAACCATGATGTTTAATAAAGGTCTGTTAAGAGATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C842TF U 217
AF RR2BQ58TF U 1
AF RR2FU43TF U 1
AF RR2CU24TF U 21
AF RR2FO95TF U 1
AF RR2EV74JQ C 808
AF RR2EV74TF U 406
AF RR2EF75TF U 480
AF RR2EF75JQ C 802
AF RR2BQ58JQ C 599
BS 1 45 RR2BQ58TF
BS 46 46 RR2FO95TF
BS 47 47 RR2FU43TF
BS 48 68 RR2BQ58TF
BS 69 69 RR2FO95TF
BS 70 192 RR2BQ58TF
BS 193 193 RR2FO95TF
BS 194 204 RR2BQ58TF
BS 205 205 RR2FO95TF
BS 206 216 RR2BQ58TF
BS 217 217 RR2FO95TF
BS 218 234 RR2BQ58TF
BS 235 235 RR2FO95TF
BS 236 246 RR2BQ58TF
BS 247 247 RR2FO95TF
BS 248 255 RR2BQ58TF
BS 256 256 RR2FO95TF
BS 257 315 RR2BQ58TF
BS 316 316 RR2FO95TF
BS 317 661 RR2BQ58TF
BS 662 727 RR2FO95TF
BS 728 728 RR2EF75TF
BS 729 781 RR2FO95TF
BS 782 1059 RR2EV74TF
BS 1060 1103 RR2EF75TF
BS 1104 1306 RR2BQ58JQ

RD RR2C842TF 366 0 0
CCTCGAGATCATGGCCAATAACTCTTCTCCAATGTCTCCCTCTGAGATTGCTTCTAAACT
TCAGACCAAAAACCCCGAAGCTCCGGTCATGCTCGACCGTATCCTCCGTCTTCTCACGTC
TTACTCCATCCTCACCTGCTCCAACCGTACTACTCCCGGCGGTGACGGCGTCGAGAGGAT
TTACGGGCTTGGTCCGGTTTGCGAGTACTTGACCAAGAACGAAGATGGTGTCTCGATAGC
CGCTCTTTGTCTTATGAACCAAGACAAGGTTCTCATGGAAAGCTGGTACCATTTGAAAGA
TGCAATTCTTGATGGTGGGATTCCATTCAACAAGGCTTATGGAATGACCGCTTTTGGGTA
CCACGG

QA 1 366 1 366
DS 

RD RR2BQ58TF 661 0 0
GGACCCATCACACACTCCTCTCAAAACAGAGAAACGAAAAAAAAA**GAAACATTCCAAG
AATATCTT*AGAGATTTCAAGAAAAATGGGATCAACGGCAGAGACACAGATAACTCCGGT
CCAAGTCACCGACGACGAAGCCGCTCTCTTTGCCATGCAGCTAGCCAGCGCCTCCGTTCT
TCCGATGGTTTTAAAGTCCGCGCTTGACCTTGATCTTCTCGAGATCATGGCCAAGAACTC
TTCTCCGATGTCTCCTTCTGAGATTGCTTCTAAACTTCAGACCAAAAACCCCGAAGCTCC
GGTCATGCTCGACCGAATCCTCCGTCTTCTCACGTCTTACTCCATCCTCACCTGCTCCAA
CCGTACTACTCCCGGCGGTGACGGCGTCGAGAGGATTTACGGGCTTGGTCCGGTTTGCAA
GTACTTGACCAAGAACGAAGATGGTGTCTCGATAGCTGCTCTTTGTCTTATGAACCAAGA
CAAGGTTCTCATGGAAAGCTGGTACCATTTGAAAGATGCAATTCTTGATGGTGGGATTCC
ATTCAACAAGGCTTATGGAATGACCGCTTTTGAGTACCACGGTAAGGACCTAAGGTTCAA
CACGGTCTTTAACAACGGAATGTCTAACCATTCAACCATCACAATGAAGAAGATTCTTGA
G

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2FU43TF 665 0 0
GGACCCATCACACACTCCTCTCAAAACAGAGAAACGAAAAAAAAAAAGAAACATTCCAAG
AATATCTTTAGAGATTTCAAGAAAAATGGGATCAACGGCAGAGACACAGATAACTCCGGT
CCAAGTCACCGACGACGAAGCCGCTCTCTTTGCCATGCAGCTAGCCAGCGCCTCCGTTCT
TCCGATGGTTTTGAAGTCCGCGCTAGACCTTGATCTCCTCGAGATCATGGCCAATAACTC
TTCTCCAATGTCTCCCTCTGAGATTGCTTCTAAACTTCAGACCAAAAACCCCGAAGCTCC
GGTCATGCTCGACCGTATCCTCCGTCTTCTCACGTCTTACTCCATCCTCACCTGCTCCAA
CCGTACTACTCCCGGCGGTGACGGCGTCGAGAGGATTTACGGGCTTGGTCCGGTTTGCAA
GTACTTGACCAAGAACGAAGATGGTGTCTCGATAGCTGCTCTTTGTCTTATGAACCAAGA
CAAGGTTCTCATGGAAAGCTGGTACCATTTGAAAGATGCAATTCTTGATGGTGGGATTCC
ATTCAACAAGGCTTATGGAATGACCGCTTTTGAGTACCATGGTAAGGACCTAAGGTTCAA
CACGGTCTTTAACAACGGAATGTCTAACCATTCAACCATCACAATGAAGAAGATTCTTGA
GACCT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2CU24TF 687 0 0
TCAAAACAGAGAAACGAAAAAAAAAAAGAAACATTCCAAGAATATCTTTAGAGATTTCAA
GAAAAATGGGATCAACGGCAGAGACACAGATAACTCCGGTCCAAGTCACCGACGACGAAG
CCGCTCTCTTTGCCATGCAGCTAGCCAGCGCCTCCGTTCTTCCGATGGTTTTGAAGTCCG
CGCTAGACCTTGATCTCCTCGAGATCATGGCCAATAACTCTTCTCCAATGTCTCCCTCTG
AGATTGCTTCTAAACTTCAGACCAAAAACCCCGAAGCTCCGGTCATGCTCGACCGTATCC
TCCGTCTTCTCACGTCTTACTCCATCCTCACCTGCTCCAACCGTACTACTCCCGGCGGTG
ACGGCGTCGAGAGGATTTACGGGCTTGGTCCGGTTTGCAAGTACTTGACCAAGAACGAAG
ATGGTGTCTCGATAGCTGCTCTTTGTCTTATGAACCAAGACAAGGTTCTCATGGAAAGCT
GGTACCATTTGAAAGATGCAATTCTTGATGGTGGGATTCCATTCAACAAGGCTTATGGAA
TGACCGCTTTTGAGTACCACGGTAAGGACCTAAGGTTCAACACGGTCTTTAACAACGGAA
TGTCTAACCATTCAACCATCACAATGAAGAAGATTCTTGAGACCTATAAAGGTTTTGAGG
AATTGACTTCTTTGGTTGATGTT
TGGT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2FO95TF 784 0 0
GGACCCATCACACACTCCTCTCAAAACAGAGAAACGAAAAAAAAAA*GAAACATTCCAAG
AATATCTTTAGAGATTTCAAGAAAAATGGGATCAACGGCAGAGACACAGATAACTCCGGT
CCAAGTCACCGACGACGAAGCCGCTCTCTTTGCCATGCAGCTAGCCAGCGCCTCCGTTCT
TCCGATGGTTTTGAAGTCCGCGCTAGACCTTGATCTCCTCGAGATCATGGCCAATAACTC
TTCTCCAATGTCTCCCTCTGAGATTGCTTCTAAACTTCAGACCAAAAACCCCGAAGCTCC
GGTCATGCTCGACCGTATCCTCCGTCTTCTCACGTCTTACTCCATCCTCACCTGCTCCAA
CCGTACTACTCCCGGCGGTGACGGCGTCGAGAGGATCTACGGGCTTGGTCCGGTTTGCAA
GTACTTGACCAAGAACGAAGATGGTGTCTCGATAGCTGCTCTTTGTCTTATGAACCAAGA
CAAGGTTCTCATGGAAAGCTGGTACCATTTGAAAGATGCAATTCTTGATGGTGGGATTCC
ATTCAACAAGGCTTATGGAATGACCGCTTTTGAGTACCACGGTAAGGACCTAAGGTTCAA
CACGGTCTTTAACAACGGAATGTCTAACCATTCAACCATCACAATGAAGAAGATTCTTGA
GACCTATAAGGGTTTTGAGGAATTGACTTCTTTGGTTGATGTTGGTGGTGGTATTGGTGC
CACTCTC*AAATGATTGTCTCTAAGTACCCTAACCTTAAAGGCATCAACTTTGATCTCCC
C
ATG

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2EV74JQ 119 0 0
TCCCGGTATTGAACACGTTGGAGGAGATATGTTTGTAAGTGTCCCTAAAGGTGATGCCAT
TTTCATGAAGTGGATATGCCACGACTGGAGTGATGAACACTGTGTGAAATTCCTGAAGA

QA 1 119 1 119
DS 

RD RR2EV74TF 654 0 0
G
GGTCCGGTTTGCAAGTACTTGACCAAGAACGAAGATGGTGTCTCGATAGCTGCTCTTTGT
CTTATGAACCAAGACAAGGTTCTCATGGAAAGCTGGTACCATTTGAAAGATGCAATTCTT
GATGGTGGGATTCCATTCAACAAGGCTTATGGAATGACCGCTTTTGAGTACCACGGTAAG
GACCTAAGGTTCAACACGGTCTTTAACAACGGAATGTCTAACCATTCAACCATCACAATG
AAGAAGATTCTTGAGACCTATAAGGGTTTTGAGGAATTGACTTCTTTGGTTGATGTTGGT
GGTGGTATTGGTGCCACTCTCGAAATGATTGTCTCTAAGTACCCTAACCTTAAAGGCATC
AACTTTGATCTCCCCCATGTCATTGAAGAAGCTACTTCTCATCCCGGTATTGAACACGTT
GGAGGAGATATGTTTGTAAGTGTCCCTAAAGGTGATGCCATTTTCATGAAGTGGATATGC
CACGACTGGAGTGATGAACACTGTGTGAAATTCCTGAAGAACTGCTACAAGGCGCTTCCA
GAGGATGGAAAAGTGATACTAGCAGAGTGTATACTTCCAGAGACACCAGACTCCAGCCTC
TCGACCAAACAAGTGGTCCATGTTGATTGCATTATGTTGGCTCACAACCCTGG

QA 2 654 2 654
DS 

RD RR2EF75TF 626 0 0
G
CAAGGTTCTCATGGAAAGCTGGTACCATTTGAAAGATGCAATTCTTGATGGTGGGATTCC
ATTCAACAAGGCTTATGGAATGACCGCTTTTGAGTACCACGGTAAGGACCTAAGGTTCAA
CACGGTCTTTAACAACGGAATGTCTAACCATTCAACCATCACAATGAAGAAGATTCTTGA
GACCTATAAGGGTTTTGAGGAATTGACTTCTTTGGTTGATGTTGGTGGTGGTATTGGTGC
CACTCTCAAAATGATTGTCTCTAAGTACCCTAACCTTAAAGGCATCAACTTTGATCTCCC
CCATGTCATTGAAGAAGCTACTTCTCATCCCGGTATTGAACACGTTGGAGGAGATATGTT
TGTAAGTGTCCCTAAAGGTGATGCCATTTTCATGAAGTGGATATGCCACGACTGGAGTGA
TGAACACTGTGTGAAATTCCTGAAGAACTGCTACAAGGCGCTTCCAGAGGATGGAAAAGT
GATACTAGCAGAGTGTATACTTCCAGAGACACCAGACTCCAGCCTCTCGACCAAACAAGT
GGTCCATGTTGATTGCATTATGTTGGCTCACAACCCTGGAGGCAAAGAACGGACTGAGAA
AGAGTTTGAAGCATTAGCTAAAG
AA

QA 2 624 2 624
DS 

RD RR2EF75JQ 437 0 0
TTCTCATCCCGGTATTGAACACGTTGGAGGAGATATGTTTGTAAGTGTCCCTAAAGGTGA
TGCCATTTTCATGAAGTGGATATGCCACGACTGGAGTGATGAACACTGTGTGAAATTCCT
GAAGAACTGCTACAAGGCGCTTCCAGAGGATGGAAAAGTGATACTAGCAGAGTGTATACT
TCCAGAGACACCAGACTCCAGCCTTTCGACCAAACAAGTGGTCCATGTTGATTGCATTAT
GTTGGCTCACAACCCTGGAGGCAAAGAACGGACTGAGAAAGAGTTTGAAGCATTAGCTAA
AGAATCAGGCTTCAAAGGCATCAAAGTTGCCTGCAATGCTTTTGGTGTTTACGTTATTGA
GCTGCTCAAAAAGATGTAAAAACTCACACAGGCACAAATCCATGTAATGATGATTTTATA
TGTAAGCATT
TTTCCCA

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2BQ58JQ 708 0 0
AACACGGTCTTTAACAACGGAATGTCTAACCATTCAACCATCACAATGAAGAAGATTCTT
GAGACCTATAAGGGTTTTGAGGAATTGACTTCTTTGGTTGATGTTGGTGGTGGTATTGGT
GCCACTCTCAAAATGATTGTCTCTAAGTACCCTAACCTTAAAGGCATCAACTTTGATCTC
CCCCATGTCATTGAAGAAGCTACTTTTCATCCCGGTATTGAACACGTTGGAGGAGATATG
TTTGTAAGTGTCCCTAAAGGTGATGCCATTTTCATGAAGTGGATATGCCACGACTGGAGT
GATGAACACTGTGTGAAATTCCTGAAGAACTGCTACAAGGCGCTTCCAGAGGATGGAAAA
GTGATACTAGCAGAGTGTATACTTCCAGAGACACCAGACTCCAGCCTCTCGACCAAACAA
GTGGTCCATGTTGATTGCATTATGTTGGCTCACAACCCTGGAGGCAAAGAACGGACTGAG
AAAGAGTTTGAAGCATTAGCTAAAGAATCAGGCTTCAAAGGCATCAAAGTTGCCTGCAAT
GCTTTTGGTGTTTACGTTATTGAGCTGCTCAAAAAGATGTAAAAACTCACACAGGCACAA
ATCCATGTAATGATGATTTTATATGTAAGCATTTCTCCCATGTTTACGTGTACTTCACCA
CCTTTGTTTTAAAACCATGATGTTTAATAAAGGTCTGTTAAGAGATTG

QA 1 708 1 708
DS 



CO CL356Contig2 638 3 5 U
CGATCTCTTAATAAACCTTTATTAAACATCATGGTTTTAAAACAAAGGTGGTGAAGTACA
CGTAGACATGGGAGCAATGCTTACATATAAAATCATCATTACATGGATTTGTGCCTGTGT
GTATGTTTACATCTTTTTGAGCAGCTCAATAACGTAAACACAAAAAGCATTGCAGGCAAC
TTTGATGCCTTTGAAGCCTGATGCTTTACCTAATGCCTCGAACTCTTTCTCAGTTCGTTC
TTTGCCTCCTGGATTGTGAGCCAGCATAATGCAATCAACATGGACTACTTGTTTGGTCGA
GAGGCTGGAGTCTGGTGTCTCTGGAAGTATACACTCTGCTAGTATCACTTTTCCATCCTC
TGGAAGCGCCTTGTAGCAATTCTTCAGGAATCTCACACAGTATTCATCACTCCAGTCGTG
GCATATCCACTTCATGAAAATGGCATCACCTTTAGGGACACTTACAAACATATCTCCTCC
AACGTGTTCAATACCGGGATGAGAAGTAGCTTCTTCAATGACATGGGGGAGATCAAAGTT
GATGCCTTTAAGGTTAGGGTACTTAGAGACAATCATTTTGAGAGTGGCACCAATACCACC
ACCAACATCAACCAAAGAAGTCAATTCCTCAAAACCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C842JQ U 249
AF RR2FO95JQ U 63
AF RR2CU24JQ U 1
BS 1 378 RR2CU24JQ
BS 379 379 RR2FO95JQ
BS 380 401 RR2CU24JQ
BS 402 402 RR2FO95JQ
BS 403 638 RR2CU24JQ

RD RR2C842JQ 129 0 0
CTGGA
TTGTGAGCCAGCATAATGCAATCAACATGGACTACTTGTTTGGTCGAGAGGCTGGAGTCT
GGGGTCTCTGGAAGTATACACTCTGCTAGTATCACTTTTCCATCCTCTGGAAGCGCCTTG
TAGC

QA 6 129 6 129
DS 

RD RR2FO95JQ 443 0 0
TAAACATGGGAGC
AATGCTTACATATAAAATCATCATTACATGGATTTGTGCCTGTGTGTATGTTTACATCTT
TTTGAGCAGCTCAATAACGTAAACACCAAAAGCATTGCAGGCAACTTTGATGCCTT*GAA
GCCTGATGCTTTACCTAATGCCTCGAACTCTTTCTCAGTTCGTTCTTTGCCTCCTGGATT
GTGAGCCAGCATAATGCAATCAACATGGACTACTTGTTTGGTCGAAAGGCTGGAGTCTGG
TGTCTCTGGAAGTATACACTCTGCTAGTATCACTTTTCCATCCTCTGGAAGCGCCTTGTA
ACAATTCTTCAGGAATCTCACACAGTATTCATCACTCCAGTCGTGGCATATCCACTTCAT
GAAAATGGCATCACCTTTAGGGACACTTACAAACATATCTCCTCCAACGTGTTCAATACC
GGGATGAGAA

QA 14 443 14 443
DS 

RD RR2CU24JQ 638 0 0
CGATCTCTTAATAAACCTTTATTAAACATCATGGTTTTAAAACAAAGGTGGTGAAGTACA
CGTAGACATGGGAGCAATGCTTACATATAAAATCATCATTACATGGATTTGTGCCTGTGT
GTATGTTTACATCTTTTTGAGCAGCTCAATAACGTAAACACAAAAAGCATTGCAGGCAAC
TTTGATGCCTTTGAAGCCTGATGCTTTACCTAATGCCTCGAACTCTTTCTCAGTTCGTTC
TTTGCCTCCTGGATTGTGAGCCAGCATAATGCAATCAACATGGACTACTTGTTTGGTCGA
GAGGCTGGAGTCTGGTGTCTCTGGAAGTATACACTCTGCTAGTATCACTTTTCCATCCTC
TGGAAGCGCCTTGTAGCAGTTCTTCAGGAATCTCACACAGTGTTCATCACTCCAGTCGTG
GCATATCCACTTCATGAAAATGGCATCACCTTTAGGGACACTTACAAACATATCTCCTCC
AACGTGTTCAATACCGGGATGAGAAGTAGCTTCTTCAATGACATGGGGGAGATCAAAGTT
GATGCCTTTAAGGTTAGGGTACTTAGAGACAATCATTTTGAGAGTGGCACCAATACCACC
ACCAACATCAACCAAAGAAGTCAATTCCTCAAAACCCT

QA 1 638 1 638
DS 



AS 2 10

CO CL357Contig1 924 7 13 U
GGGACTCATTTGTCTCTCTTCTACCCCCTCCGCGCCGCGCTCTCTGTCTCACTTCCACTC
AAAGAGAAATGGCTGAATCCAAGGTGGTGGTTCCAGAGTCTGTGCTAAAGAAGATCAAGA
GGGAAGAGGAATGGGCATTGACCAAGAAACAGGAAGCTGCAGCTGCTAAGAAGAAGAGTG
TTGAGACCAGGAAGCTTATCTTCAAAAGAGCTGAGCAATATGCTAAAGAATACGCCGAGC
AGGATAACGAGTTGATCCGTTTGAAGCGTGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTATGTTG
ACCCTGAGGCTAAATTGCTCTTTATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGACCCAA
AAACCAAGAAGATTCTGCAGCTCTTGCGTTTAAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTA
AGGTGAACAAGGCAACAATCAACATGTTGCGTCGTGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGAT
ACCCAAACTTGAAGAGTGTCAAAGAGCTAATCTACAAGAGGGGTTTTGGAAAGCTGAACC
ACCAGAGGATAGCACTCACTGACAACTCCATAGTGAATGAAGCTCTAGGAAAGCACAACA
TCATCTGCGTTGAGGATCTGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAGGAAG
CCAACAACTTCCTCTGGCCATTCCAGTTGAAGGCACCACTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGA
GGAACCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGAAACAGAGAGAATTTCATCAACGAGCTTG
TCAGGAGGATGAACTGATGAATGCCTCCATTCTTTTATCTTCCCCATCTCATAGTTTTTT
TTTGTTTGGATCTGAGCGTTTTGTTTTGACCGTGTAATCTTAGTCGAATATAGGCTTTGA
TTAATAAACTTTGTTTTGTTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
0 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E060TF U 1
AF RR2FW19TF U 1
AF RR2EU82TF U 1
AF RR2C820TF U 32
AF RR2C820JQ C 158
AF RR2CT96JQ C 615
AF RR2E060JQ C 266
BS 1 123 RR2E060TF
BS 124 124 RR2EU82TF
BS 125 652 RR2E060TF
BS 653 692 RR2EU82TF
BS 693 693 RR2C820JQ
BS 694 738 RR2EU82TF
BS 739 739 RR2C820JQ
BS 740 750 RR2EU82TF
BS 751 753 RR2C820TF
BS 754 767 RR2C820JQ
BS 768 842 RR2E060JQ
BS 843 843 RR2CT96JQ
BS 844 924 RR2E060JQ

RD RR2E060TF 652 0 0
GGGACTCATTTGTCTCTCTTCTACCCCCTCCGCGCCGCGCTCTCTGTCTCACTTCCACTC
AAAGAGAAATGGCTGAATCCAAGGTGGTGGTTCCAGAGTCTGTGCTAAAGAAGATCAAGA
GGGGAGAGGAATGGGCATTGACCAAGAAACAGGAAGCTGCAGCTGCTAAGAAGAAGAGTG
TTGAGACCAGGAAGCTTATCTTCAAAAGAGCTGAGCAATATGCTAAAGAATACGCCGAGC
AGGATAACGAGTTGATCCGTTTGAAGCGTGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTATGTTG
ACCCTGAGGCTAAATTGCTCTTTATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGACCCAA
AAACCAAGAAGATTCTGCAGCTCTTGCGTTTAAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTA
AGGTGAACAAGGCAACAATCAACATGTTGCGTCGTGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGAT
ACCCAAACTTGAAGAGTGTCAAAGAGCTAATCTACAAGAGGGGTTTTGGAAAGCTGAACC
ACCAGAGGATAGCACTCACTGACAACTCCATAGTGAATGAAGCTCTAGGAAAGCACAACA
TCATCTGCGTTGAGGATCTGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2FW19TF 717 0 0
GGGACTCATTTGTCTCTCTTCTACCCCCTCCGCGCCGCGCTCTCTGTCTCACTTCCACTC
AAAGAGAAATGGCTGAATCCAAGGTGGTGGTTCCAGAGTCTGTGCTAAAGAAGATCAAGA
GGGAAGAGGAATGGGCATTGACCAAGAAACAGGAAGCTGCAGCTGCTAAGAAGAAGAGTG
TTGAGACCAGGAAGCTTATCTTCAAAAGAGCTGAGCAGTATGCCAAAGAATACGCCGAGA
AGGACAATGAGTTGATCCGTTTGAAGCGTGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTATGTTG
ACCCTGAGGCTAAATTGCTCTTTATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGACCCAA
AAACCAAGAAGATTCTGCAGCTCTTGCGTTTAAGACAAA*CTTCAATGGTGTGTTCTTTA
AGGTGAACAAGGCAACAATCAACATGTTGCGTCGTGTTGAACCTTACGTGACTTACGGAT
ACCCAAACTTGAAGAGTGTGAAGGAGCTAATCTACAAGAGGGGTTTTGGAAAGCTGAACC
ACCAGAGGATAGCACTCACTGACAACTCCATAGTGAATGAAGCTCTAGGAAAGCACAACA
TCATCTGCGTTGAGGATCTGATCCACGAGATCATGACTGTTGGACCTCACTTCAAG*AAG
CCAACAACTTCCTTTGGCCATTCCAGTTGAAG*CACCACTCGGTGGCCTTAAGA
GAG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2EU82TF 750 0 0
GGGACTCATTTGTCTCTCTTCTACCCCCTCCGCGCCGCGCTCTCTGTCTCACTTCCACTC
AAAGAGAAATGGCTGAATCCAAGGTGGTGGTTCCAGAGTCTGTGCTAAAGAAGATCAAGA
GGGAAGAGGAATGGGCATTGACCAAGAAACAGGAAGCTGCAGCTGCTAAGAAGAAGAGTG
TTGAGACCAGGAAGCTTATCTTCAAAAGAGCTGAGCAATATGCTAAAGAATACGCCGAGC
AGGATAACGAGTTGATCCGTTTGAAGCGTGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTTTATGTTG
ACCCTGAGGCTAAATTGCTCTTTATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGACCCAA
AAACCAAGAAGATTCTGCAGCTCTTGCGTTTAAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTA
AGGTGAACAAGGCAACAATCAACATGTTGCGTCGTGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGAT
ACCCAAACTTGAAGAGTGTCAAAGAGCTAATCTACAAGAGGGGTTTTGGAAAGCTGAACC
ACCAGAGGATAGCACTCACTGACAACTCCATAGTGAATGAAGCTCTAGGAAAGCACAACA
TCATCTGCGTTTAGGATCTGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAGGAAG
CCAACAACTTCCTCTGGCCATTCCAGTTGAAG*CACCACTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGA
GGAACCACTACGTTGAAG*TGGTGATGCTG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2C820TF 730 0 0
GG
GCCGCGCTCTCTGTCTCACTTCCACTCAAAGAGAA*TGGCTGAATCCAAGGCGGTGGTTC
CAGAGTCTGTGCTAAAGAAGATCAGGAGGGAAGAGGAATGGGCATTGACCAAGAAACAGG
AAGCTGCAGCTGCTAAGAAGAAGAGTGTTGAGACCAGGAAGCTTATCTTCAAAAGAGCTG
AGCAATATGCTAAAGAATACGCCGAGCGGGATAACGAGTTGATCCGTTTGAAGCGTGAGG
CTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTATGTTGACCCTGAGGCTAAATTGCTCTTTATCATTCGTA
TCCGTGGAATCAACGCTATTGACCCAAAAACCAAGAAGATTCTGCAGCTCTTGCGTTTAA
GACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACAATCAACATGTTGCGTC
GTGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGATACCCAAACTTGAAGAGTGTCAAAGAGCTAATCT
ACAAGAGGGGTTTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATAGCACTCATTGACAACTCCATAG
TGAATGAAGCTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTTGAGGATCTGATCCACGAGATCA
TGACCGTTGGACCTCACTTCAAGGAAGCCAACAACTTCCTCTGGCCATTCCAGTTGAAG*
CACCACTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAG*AACCACTACGTTGAAG*TGGTGATGCTGGAA
CAGAGAGA

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR2C820JQ 610 0 0
TGCAGCTGCTAAGAAGAAGAGTGT*GAGACCAGGAAGCTTATCTTCAAAAGAGCTGAGCA
ATATGCTAAAGAATACGCCGAGCGGGATAACGAGTTGATCCGTTTGAAGCGTGAGGCTAA
GTTGAAAGGAGGGTTCTATGTTGACCCTGAGGCTAAATTGCTCTTTATCATTCGTATCCG
TGGAATCAACGCTATTGACCCAAAAACCAAGAAGATTCTGCAGCTCTTGCGTTTAAGACA
AATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACAATCAACATGTTGCGTCGTGT
TGAGCCTTACGTGACTTACGGATACCCAAACTTGAAGAGTGTCAAAGAGCTAATTTACAA
GAGGGGTTTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATAGCACTCATTGACAACTCCATAGTGAA
TGAAGCTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTTGAGGATCTGATCCACGAGATCATGAC
CGTTGGACCTCACTTCAAGGAAGCCAACAACTTCCTCTGGCCATTCCAGTTGAAGGCACC
ACTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGGAACCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGAAACAG
AGAGAATTTC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2CT96JQ 263 0 0
GATT
TGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAGGAAGCCAACAACTTCCTCTGGC
CATTCCAGTTGAAGGCACCACTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGGAACCACTACGTTGAAG
GTGGTGATGCTGGAAACAGAGAGAATTTCATCAACGAGCTTGTCAGGAGGATGAACTGAT
GAATGCCTCCATTCTTTTATCTTCCCCATTTCATAGTTTTTTTTTGTTTGGATCTGAGCG
TTTTGTTTTGACCGTGT
AA

QA 5 261 5 261
DS 

RD RR2E060JQ 659 0 0
GCGTGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTATGTTGACCCTGAGGCTAAATTGCTCTTTAT
CATTCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGACCCAAAAACCAAGAAGATTCTGCAGCTCTT
GCGTTTAAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACAATCAACAT
GTTGCGTCGTGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGATACCCAAACTTGAAGAGTGTCAAAGA
GCTAATCTACAAGAGGGGTTTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATAGCACTCACTGACAA
CTCCATAGTGAATGAAGCTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTTGAGGATCTGATCCA
CGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAGGAAGCCAACAACTTCCTCTGGCCATTCCA
GTTGAAGGCACCACTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGGAACCACTACGTTGAAGGTGGTGA
TGCTGGAAACAGAGAGAATTTCATCAACGAGCTTGTCAGGAGGATGAACTGATGAATGCC
TCCATTCTTTTATCTTCCCCATCTCATAGTTTTTTTT*GTTTGGATCTGAGCGTTTTGTT
TTGACCGTGTAATCTTAGTCGAATATAGGCTTTGATTAATAAACTTTGTTTTGTTTTTT

QA 1 659 1 659
DS 



CO CL357Contig2 1062 3 19 U
GATCTAAGTAGTTTTAATTAAATGCTTAGAAAAAACAAACTGGTCACCAGTCAGGGAACA
TGCCAGTTCAAGAACAATCTAACACTTTGTTGAGAAGAACATTATGTAAAAACCACAAAC
TTGGCAAACAGAGCAAACTAATCAAAGCCTAATCTCCAACAAAGATCACACGGTCTCTGA
TACAAGGAAAAAAAAACCTCAGATCCAACCAAAAATCTATGAAATGGGGAAAAGATAAAG
AAGGAAGCTTCCATCATCAATTCATCCTCCTGACAAGCTCGTTGATGAAATTCTCCCTGT
TTCCGGCATCACCACCTTCAACGTAATGGTTCCTCTTCTTCTTAAGTCCACCGAGTGCTG
CCTTCAACTGGAATGGCCAAAGGAAGTTGTTGGCTTCTTTGAAGTGAGGTCCAACGGTCA
TGATCTCGTGGATCAGATCCTCCACACAGATGATCTCGTGCTTGCCTAGACCTTCAGCGA
CTATCGAGTTGTCTGTAAGTGCTATCCTCTGGTGGTTCAGCTTTCCATAACCCCTCTTGT
AGATCAGCTCCTTGACACTCTTCAAGTTTGGGTATCCGTAAGTCACGTAAGGTTCAACAC
GACGCAACATGTCGGTTGTTGCCTTGTTCACCTTGAGGAACACACCATTGAAGATTTGTC
TCAAACGCAGGAGCTGTAGAATTTTCTTGGTTTTCGGGTCAATGGCATTGATACCACGGA
TACGAATGATAAGGAGAAGTTTGGCCTCTGGATCAACGTAGAACCCTCCTTTCAACTTAG
CCTCTCGCTTCAAACGGATCAACTCATTATCCTTCTCGGCGTATTCTTTGGCGTACTGCT
CAGCTCTCTTGAAGATAAGCTTGCGGGTCTCAACGCTCTTCTTCTTAGCAGCTTCAGCTT
CTTGTTTCTTGGCCAATGCCCATTCCTCTTCCCTCTTGATCTTCTTTAGCACAGACTCTG
GAACCACCATCTTGGACTCAGACATGTCTCCGAAACAGTATGACACGAAGAGTGTGCCTG
TAATAGAGATGCGAAGTTAGGGTTTACGAGGAAGGTCGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX83JQ U 1
AF RR2EX35JQ U 69
AF RR2EX35TF C 403
BS 1 74 RR2FX83JQ
BS 75 75 RR2EX35JQ
BS 76 208 RR2FX83JQ
BS 209 209 RR2EX35JQ
BS 210 232 RR2FX83JQ
BS 233 233 RR2EX35JQ
BS 234 254 RR2FX83JQ
BS 255 257 RR2EX35JQ
BS 258 361 RR2FX83JQ
BS 362 362 RR2EX35JQ
BS 363 493 RR2FX83JQ
BS 494 494 RR2EX35JQ
BS 495 612 RR2FX83JQ
BS 613 613 RR2EX35JQ
BS 614 614 RR2FX83JQ
BS 615 615 RR2EX35JQ
BS 616 631 RR2FX83JQ
BS 632 703 RR2EX35JQ
BS 704 1062 RR2EX35TF

RD RR2FX83JQ 642 0 0
GATCTAAGTAGTTTTAATTAAATGCTTAGAAAAAACAAACTGGTCACCAGTCAGGGAACA
TGCCAGTTCAAGAAGAATCTAACACTTTGTTGAGAAGAACATTATGTAAAAACCACAAAC
TTGGCAAACAGAGCAAACTAATCAAAGCCTAATCTCCAACAAAGATCACACGGTCTCTGA
TACAAGGAAAAAAAAACCTCAGATCCAATCAAAAATCTATGAAATGGGGAAATGATAAAG
AAGGAAGCTTCCAT***CAATTCATCCTCCTGACAAGCTCGTTGATGAAATTCTCCCTGT
TTCCGGCATCACCACCTTCAACGTAATGGTTCCTCTTCTTCTTAAGTCCACCGAGTGCTG
CTTTCAACTGGAATGGCCAAAGGAAGTTGTTGGCTTCTTTGAAGTGAGGTCCAACGGTCA
TGATCTCGTGGATCAGATCCTCCACACAGATGATCTCGTGCTTGCCTAGACCTTCAGCGA
CTATCGAGTTGTCAGTAAGTGCTATCCTCTGGTGGTTCAGCTTTCCATAACCCCTCTTGT
AGATCAGCTCCTTGACACTCTTCAAGTTTGGGTATCCGTAAGTCACGTAAGGTTCAACAC
GACGCAACATGTTGATTGTTGCCTTGTTCAC
TTGTCTCAAAC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2EX35JQ 641 0 0
GC
AGAACAATCTAACACTTTGTTGAGAAGAACATTATGTAAAAACCACAAACTTGGCAAACA
GAGCAAACTAATCAAAGCCTAATCTCCAACAAAGATCACACGGTCTCTGATACAAGGGAA
AAAAAACCTCAGATCCAACCAAAAATCTATGAAATGGGGAAAAGATAAAGAAGGAAGCTT
CCATCATCAATTCATCCTCCTGACAAGCTCGTTGATGAAATTCTCCCTGTTTCCGGCATC
ACCACCTTCAACGTAGTGGTTTCTCTTCTTCTTAAGTCCACCGAGTGGTGCCTTTAACTG
GAATGGCCAAAGGAAGTTGTTGGCTTCTTTGAAGTGAGGTCCAACGGTCATGATCTCGTG
GATCAGATCCTCCACACAGATGATCTCGTGCTTGCCTAGACCTTCAGCGACTATCGAGTT
GTCTGTAAGTGCTATCCTCTGGTGGTTCAGCTTTCCATAACCCCTCTTGTAGATCAGCTC
CTTGACACTCTTCAAGTTTGGGTATCCGTAAGTCACGTAAGGTTCAACACGACGCAACAT
GTCGGTTGTTGCCTTGTTCACCTTGAGGAACACACCATTGAAGATTTGTCTCAAACGCAG
GAGCTGTAGAATTTTCTTGGTTTTCGGGTCAAT
GGCATT

QA 3 635 3 635
DS 

RD RR2EX35TF 660 0 0
AGTGAGGTCCAACGGTCATGATCTCGTGGATCAGATCCTCCACACAGATGATCTCGTGCT
TGCCTAGACCTTCAGCGACTATCGAGTTGTCTGTAAGTGCTATCCTCTGGTGGTTCAGCT
TTCCATAACCCCTCTTGTAGATCAGCTCCTTGACACTCTTCAAGTTTGGGTATCCGTAAG
TCACGTAAGGTTCAACACGACGCAACATGTCGGTTGTTGCCTTGTTCACCTTGAGGAACA
CACCATTGAAGATTTGTCTCAAACGCAGGAGCTGTAGAATTTTCTTGGTTTTCGGGTCAA
TGGCATTGATACCACGGATACGAATGATAAGGAGAAGTTTGGCCTCTGGATCAACGTAGA
ACCCTCCTTTCAACTTAGCCTCTCGCTTCAAACGGATCAACTCATTATCCTTCTCGGCGT
ATTCTTTGGCGTACTGCTCAGCTCTCTTGAAGATAAGCTTGCGGGTCTCAACGCTCTTCT
TCTTAGCAGCTTCAGCTTCTTGTTTCTTGGCCAATGCCCATTCCTCTTCCCTCTTGATCT
TCTTTAGCACAGACTCTGGAACCACCATCTTGGACTCAGACATGTCTCCGAAACAGTATG
ACACGAAGAGTGTGCCTGTAATAGAGATGCGAAGTTAGGGTTTACGAGGAAGGTCGATCC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 2 12

CO CL358Contig1 666 6 6 U
TTTTATGGGAGAACAGTCTTGAGCAATGATATTGATAAAAATTGTTCTTTCGGAGAAAAA
GACAAAAGACTAAAAACAGCACATTGGTTTCATCAAAAGTAGTAGAAGAACTAAAAACAA
CATTCAGATCTTCAAATTTCAACTGCAATACGTCCAGCAACCTGGTCCAAATCCCGTTGT
CCACTTGAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCC
AACTGCTGGAGAATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGA
CTGCCGTTTCTCTTGCTTCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCTACTCCAAGACCTCCC
CTCAGGTATACCTTCCTTGCCATAGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATAA
GGGGCAAGCTCCTTCAACTTCCCGGTCTTCACAATGTCTGTCCATGATGGAAGCTCGATC
TTGCCAGATCGCTTGAGGTGAGAAGCGTAAGCCTTGACAAAGTCATGTGGAGAGACGTCT
TTCACTGTTTTACTGGTTGCCATTGCTTAAAAAATTAAAGCTAACAGAAATCAGCGATCT
TCGTCTGTTGATTTGGCCTCAAGGCAGCTGAATCTTCTCACGTTTACTCCCCCACAAAGG
CTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 30 20 20 20 20 

AF RR2C115TF C 1
AF RR2C115JQ U 5
AF RR2B830JQ U 7
AF RR2B830TF C 7
AF RR2B521JQ U 7
AF RR2B521TF C 7
BS 1 6 RR2C115TF
BS 7 103 RR2C115JQ
BS 104 104 RR2B830JQ
BS 105 635 RR2C115JQ
BS 636 636 RR2B830JQ
BS 637 666 RR2C115JQ

RD RR2C115TF 666 0 0
TTTTATGGGAGAACAGTCTTGAGCAATGATATTGATAAAAATTGTTCTTTCGGAGAAAAA
GACAAAAGACTAAAAACAGCACATTGGTTTCATCAAAAGTAGTGGAAGAACTAAAAACAA
CATTCAGATCTTCAAATTTCAACTGCAATACGTCCAGCAACCTGGTCCAAATCCCGTTGT
CCACTTGAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCC
AACTGCTGGAGAATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGA
CTGCCGTTTCTCTTGCTTCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCTACTCCAAGACCTCCC
CTCAGGTATACCTTCCTTGCCATAGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATAA
GGGGCAAGCTCCTTCAACTTCCCGGTCTTCACAATGTCTGTCCATGATGGAAGCTCGATC
TTGCCAGATCGCTTGAGGTGAGAAGCGTAAGCCTTGACAAAGTCATGTGGAGAGACGTCT
TTCACTGTTTTACTGGTTGCCATTGCTTAAAAAATTAAAGCTAACAGAAATCAGCGATCT
TCGTCTGTTGATTTGGCCTCAAGGCAGCTGAATCTGCTCACGTTTACTCCCCCACAAAGG
CTAGCC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2C115JQ 662 0 0
AT
GGGAGAACAGTCTTGAGCAATGATATTGATAAAAATTGTTCTTTCGGAGAAAAAGACAAA
AGACTAAAAACAGCACATTGGTTTCATCAAAAGTAGTGGAAGAACTAAAAACAACATTCA
GATCTTCAAATTTCAACTGCAATACGTCCAGCAACCTGGTCCAAATCCCGTTGTCCACTT
GAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGC
TGGAGAATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTGCCG
TTTCTCTTGCTTCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCTACTCCAAGACCTCCCCTCAGG
TATACCTTCCTTGCCATAGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATAAGGGGCA
AGCTCCTTCAACTTCCCGGTCTTCACAATGTCTGTCCATGATGGAAGCTCGATCTTGCCA
GATCGCTTGAGGTGAGAAGCGTAAGCCTTGACAAAGTCATGTGGAGAGACGTCTTTCACT
GTTTTACTGGTTGCCATTGCTTAAAAAATTAAAGCTAACAGAAATCAGCGATCTTCGTCT
GTTGATTTGGCCTCAAGGCAGCTGAATCTGCTCACGTTTACTCCCCCACAAAGGCTAGCC

QA 3 662 3 662
DS 

RD RR2B830JQ 659 0 0
GGGAGAACAGTCTTGAGCAATGATATTGATAAAAATTGTTCTTTCGGAGAAAAAGACAAA
AGACTAAAAACAGCACATTGGTTTCATCAAAAGTAGTAGAAGAACTAAAAACAACACTCA
GATCTTCAAATTTCAACTGCAATACGTCCAGCAACCTGGTCCAAATCCCGTTGTCCACTT
GAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGC
TGGAGAATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGGAATGTGGTGGGCGACTGCCG
TTTCTCTTGCTTCCACCATAGATTCTATGGAAAGCACCTACTCCAAGACCTCCCCTCAGG
TATACCTTCCTTGCCATAGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATAAGGGGCA
AGCTCCTTCAACTTCCCGGTCTCCACAATGTCTGTCCATGATGGAAGCTCGATCTTGCCA
GATCGCTTGAGGTGAGAAGCGTAAGCCTTGACAAAGTCATGTGGAGAGACGTCTTTCACT
GTTTTACTGGTTGCCATTGCTTAAAAAATTAAAGCTAACAGAAATCAGCGATCTTCGTCT
GTTGATTTGGCCTCAAGGCAGCTGAATCTTCTCACGTTTACTCCCCCACAAGGGCT
CCC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2B830TF 659 0 0
GGGAGAACAGTCTTGAGCAATGATATTGATAAAAATTGTTCTTTCGGAGAAAAAGACAAA
AGACTAAAAACAGCACATTGGTTTCATCAAAAGTAGTAGAAGAACTAAAAACAACACTCA
GATCTTCAAATTTCAACTGCAATACGTCCAGCAACCTGGTCCAAATCCCGTTGTCCACTT
GAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGC
TGGAGAATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGGAATGTGGTGGGCGACTGCCG
TTTCTCTTGCTTCCACCATAGATTCTATGGAAAGCACCTACTCCAAGACCTCCCCTCAGG
TATACCTTCCTTGCCATAGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATAAGGGGCA
AGCTCCTTCAACTTCCCGGTCTCCACAATGTCTGTCCATGATGGAAGCTCGATCTTGCCA
GATCGCTTGAGGTGAGAAGCGTAAGCCTTGACAAAGTCATGTGGAGAGACGTCTTTCACT
GTTTTACTGGTTGCCATTGCTTAAAAAATTAAAGCTAACAGAAATCAGCGATCTTCGTCT
GTTGATTTGGCCTCAAGGCAGCTGAATCTTCTCACGTTTACTCCCCCACAAGGGCT
CCC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2B521JQ 657 0 0
GGGAGAACAGTCTTGAGCAATGATATTGATAAAAATTGTTCTTTCGGAGAAAAAGACAAA
AGACTAAAAACAGCACATTGGTTTCATCAAAAGTAGTAGAAGAACTAAAAACAACATTCA
GATCTTCAAATTTCAACTGCAATACGTCCAGCAACCTGGTCCAAATCCCGTTGTCCACTT
GAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGC
TGGAGAATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTGCCG
TTTCTCTTGCTTCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCTACTCCAAGACCTCCCCTCAGG
TATACCTTCCTTGCCATAGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATAAGGGGCA
AGCTCCTTCAACTTCCCGGTCTTCACAATGTCTGTCCATGATGGAAGCTCGATCTTGCCA
GATCGCTTGAGGTGAGAAGCGTAAGCCTTGACAAAGTCATGTGGAGAGACGTCTTTCACT
GTTTTACTGGTTGCCATTGCTTAAAAAATTAAAGCTAACAGAAATCAGCGATCTTCGTCT
GTTGATTTGGCCTCAAGGCAGCTGAATCTTCTCACGTTTACTCCCCCACAAAGGC
CC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2B521TF 657 0 0
GGGAGAACAGTCTTGAGCAATGATATTGATAAAAATTGTTCTTTCGGAGAAAAAGACAAA
AGACTAAAAACAGCACATTGGTTTCATCAAAAGTAGTAGAAGAACTAAAAACAACATTCA
GATCTTCAAATTTCAACTGCAATACGTCCAGCAACCTGGTCCAAATCCCGTTGTCCACTT
GAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGC
TGGAGAATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTGCCG
TTTCTCTTGCTTCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCTACTCCAAGACCTCCCCTCAGG
TATACCTTCCTTGCCATAGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATAAGGGGCA
AGCTCCTTCAACTTCCCGGTCTTCACAATGTCTGTCCATGATGGAAGCTCGATCTTGCCA
GATCGCTTGAGGTGAGAAGCGTAAGCCTTGACAAAGTCATGTGGAGAGACGTCTTTCACT
GTTTTACTGGTTGCCATTGCTTAAAAAATTAAAGCTAACAGAAATCAGCGATCTTCGTCT
GTTGATTTGGCCTCAAGGCAGCTGAATCTTCTCACGTTTACTCCCCCACAAAGGC
CC

QA 1 655 1 655
DS 



CO CL358Contig2 677 6 15 U
CTCAAAGAAGGTTTCTTTAACATTATGGGAACAGTCTTGAGCAATGATATTGATAAAAAA
TTGTTCTCTGGGAGACAAAAAACTAAAAACAGCACATTGGTTTCATCAAAAGTAGTAGAA
GAAGTAAAAACAACATTCAGATCTTCAAATTTCAACTGCAATACGTCCAGCAACCTGGTC
CAAATCCCGTTGTCCACTTGAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAAT
GTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGAATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAA
ATGTGGTGGGCGACTCCCGTTCCTCTTGCTGCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCTAC
TCCAAGACCTCCCCTCAGGTATACCTTCCTTGCCATCGATGCAGCTCTGATGTAGTACCA
ATCAGGATCATAAGGGGCAAGCTCCTTCAACTTCCCGGTCTTCACAATATCTGTCCATGA
TGGAAGCTCGATCTTGCCAGATCGCTTGAGGTGAGAAGCGTAAGCCTTGACAAAGTCATG
TGGAGAGACGTCTTTCACTGTTTTACCGGTCGCCATTGCTTTAAAAAAAGAAGCTAACAG
AAATCAGCGATCTTCGTCTGGTGATTTTGCCCTAGGCAGCTCAATCTTCTCACGTTTACT
CTCCACAAAGGCTAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FI43JQ U 1
AF RR2FI43TF C 1
AF RR2C431TF C 9
AF RR2H641JQB U 25
AF RR2H641TF C 17
AF RR2DO55JQ U 27
BS 1 139 RR2FI43JQ
BS 140 140 RR2H641JQB
BS 141 263 RR2FI43JQ
BS 264 264 RR2H641JQB
BS 265 266 RR2FI43JQ
BS 267 267 RR2H641JQB
BS 268 297 RR2FI43JQ
BS 298 298 RR2H641JQB
BS 299 324 RR2FI43JQ
BS 325 326 RR2H641JQB
BS 327 339 RR2FI43JQ
BS 340 340 RR2H641JQB
BS 341 489 RR2FI43JQ
BS 490 589 RR2H641JQB
BS 590 677 RR2DO55JQ

RD RR2FI43JQ 489 0 0
CTCAAAGAAGGTTTCTTTAACATTATGGGAACAGTCTTGAGCAATGATATTGATAAAAAA
TTGTTCTCTGGGAGACAAAAAACTAAAAACAGCACATTGGTTTCATCAAAAGTAGTAGAA
GAAGTAAAAACAACATTCAAATCTTCAAATTTCAACTGCAATACGTCCAGCAACCTGGTC
CAAATCCCGTTGTCCACTTGAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAAT
GTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAAAACGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAAAA
ATGTGGTGGGCGACTCCCGTTCCT**TGCTGCCACCATAAATTCTACGGAAAGCACCTAC
TCCAAGACCTCCCCTCAGGTATACCTTCCTTGCCATCGATGCAGCTCTGATGTAGTACCA
ATCAGGATCATAAGGGGCAAGCTCCTTCAACTTCCCGGTCTTCACAATATCTGTCCATGA
TGGAAGCTC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2FI43TF 489 0 0
CTCAAAGAAGGTTTCTTTAACATTATGGGAACAGTCTTGAGCAATGATATTGATAAAAAA
TTGTTCTCTGGGAGACAAAAAACTAAAAACAGCACATTGGTTTCATCAAAAGTAGTAGAA
GAAGTAAAAACAACATTCAGATCTTCAAATTTCAACTGCAATACGTCCAGCAACCTGGTC
CAAATCCCGTTGTCCACTTGAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAAT
GTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGAACGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAA
ATGTGGTGGGCGACTCCCGTTCCT**TGCTGCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCTAC
TCCAAGACCTCCCCTCAGGTATACCTTCCTTGCCATCGATGCAGCTCTGATGTAGTACCA
ATCAGGATCATAAGGGGCAAGCTCCTTCAACTTCCCGGTCTTCACAATATCTGTCCATGA
TGGAAGCTC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2C431TF 581 0 0
AGGTTTCTTTAACATTATGGGAACAGTCTTGAGCAATGATATTGATAAAAAATTGTTCTC
TGGGAGACAAAAAACTAAAAACAGCACATTGGTTTCATCAAAAGTAGTAGAAGAAGTAAA
AACAACATTCAGATCTTCAAATTTCAACTGCAATACG*CCAGCAACCTGGTCCAAATCCC
GTCGTCCACTTGAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAG
TCTCCAACTGCTGGAGAATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTG
GGCGACTCCCGTTCCTCTTGCTGCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCTACTCCAAGAC
CTCCCCTCAGGTATACCTTCCTTGCCATCGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGAT
CATAAGGGGCAAGCTCCTTCAACTTCCCGGTCTTCACAATATCTGTCCATGATGGAAGCT
CGATCTTGCCAGATCGCTTGAGGTGAGAAGCGTAAGCCTTGACAAAGTCATGTGGAGAGA
CGTCTTTCACTGTTTTACCGGTCGCCATTGCTTTAAAAAAA

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2H641JQB 565 0 0
ATGGGAACAGTCTTGAGCAATGATATTGATAAAAAATTGTTCTATGGGAGACAAAAAACT
AAAAACAGCACATTGGTTTCATCAAAAGCAGTAGAAGAAGTAAAAACAACATTCAGATCT
TCAAATTTCAACTGCAATACGTCCAGCAACCTGGTCCAAATCCCGTTGTCCACTTGAAGT
GATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAG
AATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTCCCGTTCCT
CTTGCTGCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCTACTCCAAGACCTCCCCTCAGGTATAC
CTTCCTTGCCATCGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATAAGGGGCAAGCTC
CTTCAACTTTCCGGTCTTCACAATATCTGTCCATGATGGAAGCTCGATCTTGCCAGATCG
CTTGAGGTGAGAAGCGTAAGCCTTGACAAAGTCATGTGGAGAGACGTCTTTCACTGTTTT
ACCGGTCGCCATTGCTTTAAAAAAA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2H641TF 661 0 0
TTTTTT
TTATGGGAACAGTCTTGAGCAATGATATTGATAAAAAATTGTTCTATGGGAGACAAAAAA
CTAAAAACAGCACATTGGTTTCATCAAAAGCAGTAGAAGAAGTAAAAACAACATTCAGAT
CTTCAAATTTCAACTGCAATACGTCCAGCAACCTGGTCCAAATCCCGTTGTCCACTTGAA
GTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGCTGG
AGAATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTCCCGTTC
CTCTTGCTGCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCTACTCCAAGACCTCCCCTCAGGTAT
ACCTTCCTTGCCATCGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATAAGGGGCAAGC
TCCTTCAACTTCCCGGTCTTCACAATATCTGTCCATGATGGAAGCTCGATCTTGCCAGAT
CGCTTGAGGTGAGAAGCGTAAGCCTTGACAAAGTCATGTGGAGAGACGTCTTTCACTGTT
TTACCGGTCGCCATTGCTTTAAAAAAAGAAGCTAACAGAAATCAGCGATCTTCGTCTGGT
GATTTTGCCCTAGGCAGCTCAATCTTCTCACGTTTACTCTCCACAAAGGCTAGCC

QA 7 661 7 661
DS 

RD RR2DO55JQ 651 0 0
GGGAACAGTCTTGAGCAATGATATTGATAAAAAATTGTTCTCTGGGAGACAAAAAACTAA
AAACAGCACATTGGTTTCATCAAAAGTAGTAGAAGAAGTAAAAACAACATTCAGATCTTC
AAATTTCAACTGCAATACGTCCAGCAACCTGGTCCAAATCCCGTTGTCCACTTGAAGTGA
TTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGAA
TGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTCCCGTTCCTCT
TGCTGCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCTACTCCAAGACCTCCCCTCAGGTATACCT
TCCTTGCCATCGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATAAGGGGCAAGCTCCT
TCAACTTCCCGGTCTTCACAATATCTGTCCATGATGGAAGCTCGATCTTGCCAGATCGCT
TGAGGTGAGAAGCGTAAGCCTTGACAAAGTCATGTGGAGAGACGTCTTTCACTGTTTTAC
CGGTCGCCATTGCTTTAAAAAAAGAAGCTAACAGAAATCAGCGATCTTCGTCTGGTGATT
TTGCCCTAGGCAGCTCAATCTTCTCACGTTTACTCTCCACAAAGGCTAGCC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 3 12

CO CL359Contig1 905 4 18 U
GGGAAAGCAAACGTATCACTAATATAAATTGGAAAGCAGATTTGGTCCATGAGTAGTTTT
ACAAAGGCACAAATCCAAAGAGAGAGTATTTTTTTTGATGCCATGAATATAAACATCAAA
AGTTTAATCAGCCGAACATTATTTGACAAGAAACAAAGACACAATACAGTAGACAGAAGA
GTACTTTACTTATTCCAGACTTAGAGCGGCGTCAAACCAACCACACCGCATGCCAGTCTC
CCGCCTGCGTTACCAGTGGTCAGACTAAGCTCATGCCCACCCTTTCCGAGATCATCCTGA
AGCTCGTGAACCACAAAGGCTCTTCCGACAACAGAGTTAGGACCAGTCAGAGGAATCTGA
TTGTCCACAAGTGTTGTTTCCGCCACGCCTTCGGCATTGGCAATGATGTTTCCCAGGTCA
CCCGCATGACGGATCACGTCTTGAGGAGCTCCGTGTGTCATGTTGTTAGGGTTGAAATGT
GGTCCTGTTGAGACGCATCCATTTGTTGTATCACCAAACTCATGGAGGTGAAAGCCATGA
GGCCCTGGAGTGAGACCAGTGATACGAACGTTCACTGTTGTAGGGCCTGTGTCTTCTTGA
ATGAGAGTAACAACTCCTTCGACGTCGGAGTTACTACCCTTGAGCACTGCAACGGCTTTC
TTCGCGGTGGAAACTACTGTTAGCCATTTCTTCGAGGCCGAGAAGGTAACCGGTTGGGGA
CGGTTGAGGTTGAGAGACACGCCGCGGAAAGAGGAACGGAGTGGTGGGTTGGGGTTGGAT
GACGGAGAAATGAGAAGGCGATGATGACAAGGAGATGAGAAGGAGAGGATGGTGTGAGCA
GACATTGGCTCCTGCTGCTTTTGTGGGGTTTGGAACCAAGTGTGTGATTGGGTAAATGTG
AGATC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2B385JQ U 1
AF RR2AZ18JQ U 3
AF RR2B385TF C 105
AF RR2AZ18TFB C 147
BS 1 51 RR2B385JQ
BS 52 52 RR2AZ18JQ
BS 53 67 RR2B385JQ
BS 68 68 RR2AZ18JQ
BS 69 101 RR2B385JQ
BS 102 102 RR2AZ18JQ
BS 103 217 RR2B385JQ
BS 218 218 RR2AZ18JQ
BS 219 289 RR2B385JQ
BS 290 290 RR2AZ18JQ
BS 291 392 RR2B385JQ
BS 393 393 RR2AZ18JQ
BS 394 599 RR2B385JQ
BS 600 767 RR2AZ18JQ
BS 768 841 RR2B385TF
BS 842 842 RR2AZ18TFB
BS 843 883 RR2B385TF
BS 884 905 RR2AZ18TFB

RD RR2B385JQ 599 0 0
GGGAAAGCAAACGTATCACTAATATAAATTGGAAAGCAGATTTGGTCCATGGGTAGTTTT
ACAAAGGTACAAATCCAAAGAGAGAGTATTTTTTTTGATGCTATGAATATAAACATCAAA
AGTTTAATCAGCCGAACATTATTTGACAAGAAACAAAGACACAATACAGTAGACAGAAGA
GTACTTTACTTATTCCAGACTTAGAGCGGCGTCAAACTAACCACACCGCATGCCAGTCTC
CCGCCTGCGTTACCAGTGGTCAGACTAAGCTCATGCCCACCCTTTCCGAAATCATCCTGA
AGCTCGTGAACCACAAAGGCTCTTCCGACAACAGAGTTAGGACCAGTCAGAGGAATCTGA
TTGTCCACAAGTGTTGTTTCCGCCACGCCTTCCGCATTGGCAATGATGTTTCCCAGGTCA
CCCGCATGACGGATCACGTCTTGAGGAGCTCCGTGTGTCATGTTGTTAGGGTTGAAATGT
GGTCCTGTTGAGACGCATCCATTTGTTGTATCACCAAACTCATGGAGGTGAAAGCCATGA
GGCCCTGGAGTGAGACCAGTGATACGAACGTTCACTGTTGTAGGGCCTGTGTCTTCTTG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2AZ18JQ 765 0 0
GG
AAGCAAACGTATCACTAATATAAATTGGAAAGCAGATTTGGTCCATGAGTAGTTTTACAA
AGGCACAAATCCAAAGAGAGAGTATTTTTTTTGATGCCATGAATATAAACATCAAAAGTT
TAATCAGCCGAACATTATTTGACAAGAAACAAAGACACAATACAGTAGACAGAAGAGTAC
TTTACTTATTCCAGACTTAGAGCGGCGTCAAACCAACCACACCGCATGCCAGTCTCCCGC
CTGCGTTACCAGTGGTCAGACTAAGCTCATGCCCACCCTTTCCGAGATCATCCTGAAGCT
CGTGAACCACAAAGGCTCTTCCGACAACAGAGTTAGGACCAGTCAGAGGAATCTGATTGT
CCACAAGTGTTGTTTCCGCCACGCCTTCGGCATTGGCAATGATGTTTCCCAGGTCACCCG
CATGACGGATCACGTCTTGAGGAGCTCCGTGTGTCATGTTGTTAGGGTTGAAATGTGGTC
CTGTTGAGACGCATCCATTTGTTGTATCACCAAACTCATGGAGGTGAAAGCCATGAGGCC
CTGGAGTGAGACCAGTGATACGAACGTTCACTGTTGTAGGGCCTGTGTCTTCTTGAATGA
GAGTAACAACTCCTTCGACGTCGGAGTTACTACCCTTGAGCACTGCAACGGCTTTCTTCG
CGGTGGAAACTACTGTTAGCCATTTCTTCGAGGCCGAGAAGGTAACCGGTTGGGGACGGT
TGAGGTTGAGAGACACGCCGCGGAAAGAGGAACGGAGTGGTGG

QA 3 765 3 765
DS 

RD RR2B385TF 788 0 0
GAATATAAACATCAAAAGTTTAATCAGCCGAACATTATTTGACAAGAAACAAAGACACAA
TACAGTAGACAGAAGAGTACTTTACTTATTCCAGACTTAGAGCGGCGTCAAACTAACCAC
ACCGCATGCCAGTCTCCCGCCTGCGTTACCAGTGGTCAGACTAAGCTCATGCCCACCCTT
TCCGAGATCATCCTGAAGCTCGTGAACCACAAAGGCTCTTCCGACAACAGAGTTAGGACC
AGTCAGAGGAATCTGATTGTCCACAAGTGTTGTTTCCGCCACGCCTTCGGCATTGGCAAT
GATGTTTCCCAGGTCACCCGCATGACGGATCACGTCTTGAGGAGCTCCGTGTGTCATGTT
GTTAGGGTTGAAATGTGGTCCTGTTGAGACGCATCCATTTGTTGTATCACCAAACTCATG
GAGGTGAAAGCCATGAGGCCCTGGAGTGAGACCAGTGATACGAACGTTCACTGTTGTAGG
GCCTGTGTCTTCTTGAATGAGAGTAACAACTCCTTCGACGTCGGAGTTACTACCCTTGAG
CACTGCAACGGCTTTCTTCGCGGTGGAAACTACTGTTAACCATTTCTTCGAGGCCGAGAA
GGTAACCGGTTGAGGACGGTTGAGGTTGAGAGACACGCCGCGGAAAGAGGAACGGAGTGG
TGGGTTGGGGTTGGATGACGGAGAAATGAGAAGGCGATGATGACAAGGAGATGAGAAGGA
GAGGATGGTGTGAGCAGCCATTGGCTCCTGCTGCTTTTGTGGGGTTTGGAACCAAGTGT
GTGATTGCC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2AZ18TFB 759 0 0
CAAGAAACAAAGACACAATACAGTAGACAGAAGAGTACTTTACTTATTCCAGACTTAGAG
CGGCGTCAAACCAACCACACCGCATGCCAGTCTCCCGC*TGCGTTACCAGTGGTCAGACT
AAGCTCATGCCCACCCTTTCCGAGATCATCCTGAAGCTCGTGAACCACAAAGGCTCTTCC
GACAACAGAGTTAGGACCAGTCAGAGGAATCTGATTGTCCACAAGTGTTGTTTCCGCCAC
GCCTTCGGCATTGGCAATGATGTTTCCCAGGTCACCCGCATGACGGATCACGTCTTGAGG
AGCTCCGTGTGTCATGTTGTTAGGGTTGAAATGTGGTCCTGTTGAGACGCATCCATTTGT
TGTATCACCAAACTCATGGAGGTGAAAGCCATGAGGCCCTGGAGTGAGACCAGTGATACG
AACGTTCACTGTTGTAGGGCCTGTGTCTTCTTGAATGAGAGTAACAACTCCTTCGACGTC
GGAGTTACTACCCTTGAGCACTGCAACGGCTTTCTTCGCGGTGGAAACTACTGTTAGCCA
TTTCTTCGAGGCCGAGAAGGTAACCGGTTGGGGACGGTTGAGGTTGAGAGACACGCCGCG
GAAAGAGGAACGGAGTGGTGGGTTGGGGTTGGATGACGGAGAAATGAGAAGGCGATGATG
ACAAGGAGATGAGAAGGAGAGGATGGTGTGAGCAGACATTGGCTCCTGCTGCTTTTGTGG
GGTTTGGAACCAAGTGTGTGATTGGGTAAATGTGAGATC

QA 1 759 1 759
DS 



CO CL359Contig2 792 3 7 U
GGAATCACACACTTGGTTCCAAACCCCCAAAAAAGCAGCAGGAGCCAATGGCTGCTCACA
CCATCCTCTCCTTCTCATCTCCTTGTCATCATCGCCTTCTCATTTCTCCGTCATCCAACC
CCAACCCACCACTCCGTTCCTCTTTCCACGGCGTGTCTCTCAACCTCCACCGTCCCCAAC
CGGTTACATTCTCGGCCTCGAAGAAATGGCTAACAGTCGTTTCCGCCGCGAAGAAAGCCG
TGGCAGTGCTCAAGGGTAACTCCGACGTCGAAGGAGTTGTTACTCTCACTCAAGAAGACA
CAGGTCCAACAACAGTGAATGTTCGTATCACTGGTCTCACTCCAGGGCCGCATGGCTTTC
ACCTCCATGAGTTTGGTGATACAACAAATGGATGCATCTCAACAGGACCACATTTCAACC
CTAACAACATGACACACGGAGCTCCTCAAGACGAGATCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAA
ACATTATTGCCAACGCCGATGGCGTGGCAGAAACAACACTTGTGGACAATCAGATTCCTC
TGACTGGTCCTAACTCTGTTGTCGGAAGAGCCTTTGTGGTTCACGAGCTTCAGGATGATC
TCGGAAAGGGTGGGCATGAGCTTAGTCTGACCACTGGTAACGCAGGCGGGAGACTGGCAT
GCGGTGTGGTTGGTTTGACGCCGCTCTAAGTCTGGAATAAGTAAAGTACTCTTCTGTCTA
CTGTATTGTGTCTTGTTTCTCGTCAAATAATGTTTGGCTGATTAAACTTTTGATGTTTAT
ATTCATAGCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H823TF U 1
AF RR2CK37TF U 7
AF RR2CK37JQ C 86
BS 1 60 RR2H823TF
BS 61 61 RR2CK37TF
BS 62 241 RR2H823TF
BS 242 645 RR2CK37TF
BS 646 646 RR2CK37JQ
BS 647 777 RR2CK37TF
BS 778 792 RR2CK37JQ

RD RR2H823TF 245 0 0
GGAATCACACACTTGGTTCCAAACCCCCAAAAAAGCAGCAGGAGCCAATGGCTGCTCACA
TCATCCTCTCCTTCTCATCTCCTTGTCATCATCGCCTTCTCATTTCTCCGTCATCCAACC
CCAACCCACCACTCCGTTCCTCTTTCCACGGCGTGTCTCTCAACCTCCACCGTCCCCAAC
CGGTTACATTCTCGGCCTCGAAGAAATGGCTAACAGTCGTTTCCGCCGCGAAGAAAGCCG
T
GGCA

QA 1 241 1 241
DS 

RD RR2CK37TF 775 0 0
GG
ACACTTGGTTCCAAACCCCCAAAAAAGCAGCAGGAGCCAATGGCTGCTCACACCATCCTC
TCCTTCTCATCTCCTTGTCATCATCGCCTTCTCATTTCTCCGTCATCCAACCCCAACCCA
CCACTCCGTTCCTCTTTCCACGGCGTGTCTCTCAACCTCCACCGTCCCCAACCGGTTACA
TTCTCGGCCTCGAAGAAATGGCTAACAGTCGTTTCCGCCGCGAAGAAAGCCGTGGCAGTG
CTCAAGGGTAACTCCGACGTCGAAGGAGTTGTTACTCTCACTCAAGAAGACACAGGTCCA
ACAACAGTGAATGTTCGTATCACTGGTCTCACTCCAGGGCCGCATGGCTTTCACCTCCAT
GAGTTTGGTGATACAACAAATGGATGCATCTCAACAGGACCACATTTCAACCCTAACAAC
ATGACACACGGAGCTCCTCAAGACGAGATCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATTATT
GCCAACGCCGATGGCGTGGCAGAAACAACACTTGTGGACAATCAGATTCCTCTGACTGGT
CCTAACTCTGTTGTCGGAAGAGCCTTTGTGGTTCACGAGCTTCAGGATGATCTCGGAAAG
GGTGGGCATGAGCTTAGTCTGACCACTGGTAACGCAG*CGGGAGACTGGCATGCGGTGTG
GTTGGTTTGACGCCGCTCTAAGTCTGGAATAAGTAAAGTACTCTTCTGTCTACTGTATTG
TGTCTTGTTTCTCGTCAAATAATGTTTGGCTGATTAAACTTTTGATGTT
ATAT

QA 3 771 3 771
DS 

RD RR2CK37JQ 707 0 0
TCATCATCGCCTTCTCATTT*TCCGTCATCCAACCCCAACCCACCACTCCGTTCCTCTTT
CCACGGCGTGTCTCTCAACCTCCACCGTCCCCAACCGGTTACATTCTCGGCCTCGAAGAA
ATGGCTAACAGTCGTTTCCGCCGCGAAGAAAGCCGTGGCAGTGCTCAAGGGTAACTCCGA
CGTCGAAGGAGTTGTTACTCTCACTCAAGAAGACACAGGTCCAACAACAGTGAATGTTCG
TATCACTGGTCTCACTCCAGGGCCGCATGGCTTTCACCTCCATGAGTTTGGTGATACAAC
AAATGGATGCATCTCAACAGGACCACATTTCAACCCTAACAACATGACACACGGAGCTCC
TCAAGACGAGATCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATTATTGCCAACGCCGATGGCGT
GGCAGAAACAACACTTGTGGACAATCAGATTCCTCTGACTGGTCCTAACTCTGTTGTCGG
AAGAGCCTTTGTGGTTCACGAGCTTCAGGATGATCTCGGAAAGGGTGGGCATGAGCTTAG
TCTGACCACTGGTAACGCAGGCGGGAGACTGGCATGCGGTGTGGTTGGTTTGACGCCGCT
CTAAGTCTGGAATAAGTAAAGTACTCTTCTGTCTACTGTATTGTGTCTTGTTTCTCGTCA
AATAATGTTTGGCTGATTAAACTTTTGATGTTTATATTCATAGCATC

QA 1 707 1 707
DS 



CO CL359Contig3 948 5 10 U
GGCCCAATCACTTCTTCCAAACGACATCCCATGGCTGCTCCTCACACCTTCCTCTCCTTC
TCATCCCCTCCGCGCCTCCTCCTCGTTTCTCCTTCCTCCACTCTCCGCTCCTCTTTCGGC
GGCGTCTCTCTCACCAACCTCCGCCGTCCCCAATCTGCTTCCTTCTCCGCCTCGAAGAAG
ACATCGCTGACTGTCGTCTCCGCCGCGAAGAAAGCTGTTGCTGTGCTCAAGGGTAACTCC
GATGTCGAAGGAGTTGTTACTTTGACTCAAGACGACTCAGGTCCGACAAAAGTGAATGTT
CGTATCACCGGTCTCACTCCAGGGCCTCATGGCTTTCACCTCCATGAGTTTGGTGATACA
ACAAATGGTTGCATCTCAACAGGGCCACATTTCAACCCTAACAACATGACACACGGAGCT
CCTCAAGACGAGATCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATTATTGCCAACGCCGATGGC
GTGGCAGAAACAACACTTGTGGACAATCAGATTCCTCTGACTGGTCCTAACTCTGTTGTT
GGAAGAGCCTTTGTGGTTCACGAGCTTAAGGATGACCTCGGAAAGGGCGGGCATGAGCTT
AGCCTGACCACTGGAAATGCAGGCGGGAGATTGGCATGCGGTGTGGTTGGTTTGACGCCG
CTCTAAGTATGGGGCTAAGTAACGTACTTTGGTGTCTACTGTGTTGTTCTTGTCTGTTGG
ATCAGATGTCAAATAATGTTGGCTGAGAATAATCTTTGGATGTTTCTCTTGCTGGAGTTG
TGTGCCTTTGTAAACGTGTTTGTTACTTTTGGTTTAAATCTTGCATTCGATCGTTTTAGA
TCATTGTTTTGCTTTTGCTATTACTTTCCTTTTACCAAGCTAAAGATTCGTGCTTAGATT
TTGGTTTTAGGTAAGAAGGTAAACGGAAGTTAAGATATTTTTTAATGG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H863TF U 1
AF RR2GK72TF U 4
AF RR2D634TF U 2
AF RR2D634JQ C 84
AF RR2GK72JQ C 312
BS 1 454 RR2H863TF
BS 455 455 RR2D634TF
BS 456 489 RR2H863TF
BS 490 490 RR2D634TF
BS 491 566 RR2H863TF
BS 567 748 RR2D634TF
BS 749 751 RR2D634JQ
BS 752 785 RR2D634TF
BS 786 835 RR2D634JQ
BS 836 948 RR2GK72JQ

RD RR2H863TF 566 0 0
GGCCCAATCACTTCTTCCAAACGACATCCCATGGCTGCTCCTCACACCTTCCTCTCCTTC
TCATCCCCTCCGCGCCTCCTCCTCGTTTCTCCTTCCTCCACTCTCCGCTCCTCTTTCGGC
GGCGTCTCTCTCACCAACCTCCGCCGTCCCCAATCTGCTTCCTTCTCCGCCTCGAAGAAG
ACATCGCTGACTGTCGTCTCCGCCGCGAAGAAAGCTGTTGCTGTGCTCAAGGGTAACTCC
GATGTCGAAGGAGTTGTTACTTTGACTCAAGACGACTCAGGTCCGACAAAAGTGAATGTT
CGTATCACCGGTCTCACTCCAGGGCCTCATGGCTTTCACCTCCATGAGTTTGGTGATACA
ACAAATGGTTGCATCTCAACAGGGCCACATTTCAACCCTAACAACATGACACACGGAGCT
CCTCAAGACGAGATCCGTCATGCGGGTGACCTGGAAAACATTATTGCCAACGCCGATGGC
GTGGCAGAA*CAACACTTGTGGACAATCAGATTCCTCTGACTGGTCCTAACTCTGTTGTT
GGAAGAGCCTTTGTGGTTCACGAGCT

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2GK72TF 563 0 0
GG
AATCACTTCTTCCAAACGACATCCCATGGCTGCTCCTCACACCTTCCTCTCCTTCTCATC
CCCTCCGCGCCTCCTCCTCTTCTCTCCTTCATCCACTCTCCGCTCCTCTTTCGGCGGCGT
CTCTCTCATCAACCCCCGCCGTCCCCAATCTGCTTCCTTCTCCGCCTCGAAGAAGAAATC
GCTGACTGTCGTCTCCGCCGCGAAGAAAGCTGTTGCTGTGCTCAAGGGTAACTCCGATGT
CCAAGGAGTTGTTACTTTGACTCAAGACGACTCAGGTCCGACAAAAGTGAATGTTCGTAT
CACCGGTCTCACTCCAGGGCCTCATGGCTTTCACCTCCATGAGTTTGGTGATACAACAAA
TGGTTGCATCTCAACAGGGCCACATTTCAACCCTAACAACATGACACACGGAGCTCCTCA
GGACGAGATCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATTATTGCCAACGCCGATGGCGTGGC
AGAAACAACACTTGTGGACAATCAGATTCCTCTGACTGGTCCTAATTCTGTTGTTGGGAG
AGCCTTTGTGGTTCACGAGCT

QA 3 563 3 563
DS 

RD RR2D634TF 787 0 0
GGCC
AATCACTTCTTCCAAACGACATCCCATGGCTGCTCCTCACACCTTCCTCTCCTTCTCATC
CCCTCCGCGCCTCCTCCTCGTTTCTCCTTCCTCCACTCTCCGCTCCTCTTTCGGCGGCGT
CTCTCTCACCAACCTCCGCCGTCCCCAATCTGCTTCCTTCTCCGCCTCGAAGAAGACATC
GCTGACTGTCGTCTCCGCCGCGAAGAAAGCTGTTGCTGTGCTCAAGGGTAACTCCGATGT
CGAAGGAGTTGTTACTTTGACTCAAGACGACTCAGGTCCGACAAAAGTGAATGTTCGTAT
CACCGGTCTCACTCCAGGGCCTCATGGCTTTCACCTCCATGAGTTTGGTGATACAACAAA
TGGTTGCATCTCAACAGGGCCACATTTCAACCCTAACAACATGACACACGGAGCTCCTCA
AGACGAGATCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATTATTGCCAACGCCGATGGCGTGGC
AGAAACAACACTTGTGGACAATCAGATTCCTCTGACTGGTCCTAACTCTGTTGTTGGAAG
AGCCTTTGTGGTTCACGAGCTTAAGGATGACCTCGGAAAGGGCGGGCATGAGCTTAGCCT
GACCACTGGAAATGCAGGCGGGAGATTGGCATGCGGTGTGGTTGGTTTGACGCCGCTCTA
AGTATGGGGCTAAGTAACGTACTTTGGTGTCTACTGTGTTGTTCTTGTCTGTTGGATCAG
ATGTCAAATAATGTTGGCTGAGAT**ATCTTTGGATGTTTCTCTTGCTGGAGTTGTGTGC
TTT

QA 5 784 5 784
DS 

RD RR2D634JQ 754 0 0
CGTT
TCTCCTTCCTCCACTCTCCGCTCCTCTTTCGGCGGCGTCTCTCTCACCAACCTCCGCCGT
CCCCAATCTGCTTCCTTCTCCGCCTCGAAGAAGACATCGCTGACTGTCGTCTCCGCCGCG
AAGAAAGCTGTTGCTGTGCTCAAGGGTAACTCCGATGTCGAAGGAGTTGTTACTTTGACT
CAAGACGACTCAGGTCCGACAAAAGTGAATGTTCGTATCACCGGTCTCACTCCAGGGCCT
CATGGCTTTCACCTCCATGAGTTTGGTGATACAACAAATGGTTGCATCTCAACAGGGCCA
CATTTCAACCCTAACAACATGACACACGGAGCTCCTCAAGACGAGATCCGTCATGCGGGT
GACCTGGGAAACATTATTGCCAACGCCGATGGCGTGGCAGAAACAACACTTGTGGACAAT
CAGATTCCTCTGACTGGTCCTAACTCTGTTGTTGGAAGAGCCTTTGTGGTTCACGAGCTT
AAGGATGACCTCGGAAAGGGCGGGCATGAGCTTAGCCTGACCACTGGAAATGCAGGCGGG
AGATTGGCATGCGGTGTGGTTGGTTTGACGCCGCTCTAAGTATGGGGCTAAGTAACGTAC
TTTGGTGTCTACTGTGTTGTTCTTGTCTGTTGGATCAGATGTCAAATAATGTTGGCTGAG
AATAATCTTTGGATGTTTCTCTTGCTGGAGTTGTGTGCCTTTGTAAACGTGTTTGTTACT
TTTGGTTTAAATCTTGCATTCGATCGTT
GT

QA 5 752 5 752
DS 

RD RR2GK72JQ 637 0 0
TCTCACTCCAGGGCCTCATGGCTTTCACCTCCATGAGTTTGGTGATACAACAAATGGTTG
CATCTCAACAGGGCCACATTTCAACCCTAACAACATGACACACGGAGCTCCTCAGGACGA
GATCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATTATTGCCAACGCCGATGGCGTGGCAGAAAC
AACACTTGTGGACAATCAGATTCCTCTGACTGGTCCTAATTCTGTTGTTGGGAGAGCCTT
TGTGGTTCACGAGCTTAAGGATGACCTCGGAAAGGGCGGGCATGAGCTTAGCCTGACCAC
TGGAAATGCAGGCGGGAGATTGGCATGCGGTGTGGTTGGTTTGACGCCGCTCTAAGTCTG
GGGCTAAGTAACGTACTTTGGTGTTTACTGTGTTGTTCTTGTCTGTTGGATCAGATGTCA
AATAATGTTGGCTGAGAATAATCTTTGGATGTTTCTCTTGCTGGAGTTGTGTGCCTTTGT
AAACGTGTTTGTTACTTTTGGTTTAAATCTTGCATTCGATCGTTTTAGATCATTGTTTTG
CTTTTGCTATTACTTTCCTTTTACCAAGCTAAAGATTCGTGCTTAGATTTTGGTTTTAGG
TAAGAAGGTAAACGGAAGTTAAGATATTTTTTAATGG

QA 1 637 1 637
DS 



AS 2 13

CO CL360Contig1 689 7 6 U
GGGGAAATGTTGAAGACGCATATATAAACTTCTGGGAGATTAAAAGCCCCCCTAGTCTTT
GCGAGATTCAGCTGCTGCGTTGGGCAAAACTCCTGTTGTGGAACAGTAGCCATGGCGACA
GGTAAAACAGTGAAAGACGTCTCGCCTCATGACTTCGTCAAGGCTTACGCTTCTCATCTC
AAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGACTGGTAAGCTG
AAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATCTATGGCAAGG
AAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGTGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTACGGTGGAAGC
AAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGTTGCACGTCAC
ATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGA
ATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGCTGAAATT
TGAAGATCTCAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGAAACCAATGTCCTGTT
TTTAGTCCTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCTGAAGACTTGC
TCTCATAATGTTCAGAACTTGTTCATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR2BU22TF U 1
AF RR2BU22JQ C 79
AF RR2CV09JQ C 50
AF RR2DB46TF U 58
AF RR2H378JQ C 52
AF RR2H378TF U 52
AF RR2CV09TF U 50
BS 1 411 RR2BU22TF
BS 412 412 RR2DB46TF
BS 413 652 RR2BU22TF
BS 653 664 RR2DB46TF
BS 665 687 RR2H378TF
BS 688 689 RR2CV09JQ

RD RR2BU22TF 657 0 0
GGGGAAATGTTGAAGACGCATATATAAACTTCTGGGAGATTAAAAGCCCCCCTAGTCTTT
GCGAGATTCAGCTGCTGCGTTGGGCAAAACTCCTGTTGTGGAACAGTAGCCATGGCGACA
GGTAAAACAGTGAAAGACGTCTCGCCTCATGACTTCGTCAAGGCTTACGCTTCTCATCTC
AAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGACTGGTAAGCTG
AAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATCTATGGCAAGG
AAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGTGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTACGGTGGAAGC
AAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGTTACACGTCAC
ATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGA
ATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGCTGAAATT
TGAAGATCTCAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGAAACCAATGTCCTGTT
TTTAGTCCTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCTGA
GAAAA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2BU22JQ 573 0 0
GTTGGGCAAAACTCCTGTTGTGGAACAGTAGCCATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGAC
GTCTCGCCTCATGACTTCGTCAAGGCTTACGCTTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATC
GAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTAT
GATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATTTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGA
GGTTTTGGTGTTGGTGCTTTCCGTAGAATTTACGGTGGAAGCAAGAGAAACGGCAGTCGC
CCACCACATTTTTGCAAAAGCAGCGGTGGCGTTACACGTCACATTTTCCAGCAGTTGGAG
ACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAA
CGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGCTGAAATTTGAAGATCTCAATCTTGT
TTTTTTTAGTTTTTTTACTACTTTTGAAACCAATGTCCTGTTTTTAGTCCTTTTATTTTT
TACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCTG

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2CV09JQ 640 0 0
GGCT
AGTCTTTGCGAGATTCAGCTGCTGCGTTGGGCAAAACTCCTGTTGTGGAACAGTAGCCAT
GGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGACGTCTCGCCTCATGACTTCGTCAAGGCTTACGCTTC
TCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGACTGG
TAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATCTAT
GGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGTGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTACGG
TGGAAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGTTGC
ACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGG
AAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGC
TGAAATTTGAAGATCTCAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGAAACCAATG
TCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCTGAA
GACTTGCTCTCATAATGTTCAGAACTTGTTCATCAT

QA 5 640 5 640
DS 

RD RR2DB46TF 607 0 0
TTTGCGAGATTCAGCTGCTGCGTTGGGCAAAACTCCTGTTGTGGAACAGTAGCCATGGCG
ACAGGTAAAACAGTGAAAGACGTCTCGCCTCATGACTTCGTCAAGGCTTACGCTTCTCAT
CTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGACTGGTAAG
CTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATCTATGGCA
AGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGTGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTACGGTGGA
AGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGTTGCACGT
CACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGA
AGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGCTGAA
ATTTGAAGATCTCAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGAAACCAATGTCCT
GTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCTGAAGACT
TGCTCTC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2H378JQ 637 0 0
GG
AGTCTTTGCGAGATTCAGCTGCTGCGTTGGGCAAAACTCCTGTTGTGGAACAGTAGCCAT
GGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGACGTCTCGCCTCATGACTTCGTCAAGGCTTACGCTTC
TCATCTCAACCGATCTGGCAATATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGACTGG
TAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATCTAT
GGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGTGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTACGG
TGGAAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGTTGC
ACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGG
AAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGGCCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGC
TGAAATTTGAAGATCTCAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGAAACCAATG
TCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCTGAA
GACTTGCTCTCATAATGTTCAGAACTTGTTCATC
C

QA 3 636 3 636
DS 

RD RR2H378TF 637 0 0
GG
AGTCTTTGCGAGATTCAGCTGCTGCGTTGGGCAAAACTCCTGTTGTGGAACAGTAGCCAT
GGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGACGTCTCGCCTCATGACTTCGTCAAGGCTTACGCTTC
TCATCTCAACCGATCTGGCAATATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGACTGG
TAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATCTAT
GGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGTGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTACGG
TGGAAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGTTGC
ACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGG
AAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGGCCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGC
TGAAATTTGAAGATCTCAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGAAACCAATG
TCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCTGAA
GACTTGCTCTCATAATGTTCAGAACTTGTTCATC
C

QA 3 636 3 636
DS 

RD RR2CV09TF 640 0 0
GGCT
AGTCTTTGCGAGATTCAGCTGCTGCGTTGGGCAAAACTCCTGTTGTGGAACAGTAGCCAT
GGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGACGTCTCGCCTCATGACTTCGTCAAGGCTTACGCTTC
TCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGACTGG
TAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATCTAT
GGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGTGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTACGG
TGGAAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGTTGC
ACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGG
AAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGC
TGAAATTTGAAGATCTCAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGAAACCAATG
TCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCTGAA
GACTTGCTCTCATAATGTTCAGAACTTGTTCATC
AT

QA 5 638 5 638
DS 



CO CL360Contig2 745 6 17 U
GGAGTCCTTGCGAGAGTGGCGGAGAGAGTTTATTCAGCTGAACCCTCCCTCCTGTTGTTG
AACAATAGCCATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAA
GGCGTACGCTTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACAT
TGTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAG
AGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGCGTTGGTGCTTTCCG
TAGAATCTACGGTGGAAGCAAAAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAG
CGGTGGCGTTGCACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGA
CACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGG
ACGTATTGCAGCTGAAATTTGAAGATCTGAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTGCTT
TTGAAACCAATGTCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAAT
ATCATTGCTGAAGACTTGCTCTCATAATGTTCAGAACCTGTTCATCTTTTTTTTTGTTGG
CTTTTTTGAACATCTAACCATCATCAATCAATAAATGCTAGTAAATGATTTAGCGGAAAG
CTAGCTTCCAAAGAAGCTTTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET11TF U 8
AF RR2EV01TF U 1
AF RR2ET11JQ C 105
AF RR2BF87TF U 9
AF RR2FL62TF U 8
AF RR2FL62JQ C 117
BS 1 87 RR2EV01TF
BS 88 88 RR2ET11TF
BS 89 310 RR2EV01TF
BS 311 311 RR2ET11TF
BS 312 334 RR2EV01TF
BS 335 335 RR2ET11TF
BS 336 456 RR2EV01TF
BS 457 457 RR2ET11TF
BS 458 464 RR2EV01TF
BS 465 465 RR2ET11TF
BS 466 606 RR2EV01TF
BS 607 607 RR2FL62TF
BS 608 621 RR2EV01TF
BS 622 666 RR2FL62TF
BS 667 667 RR2FL62JQ
BS 668 738 RR2FL62TF
BS 739 745 RR2FL62JQ

RD RR2ET11TF 560 0 0
GG
GCGAGAGTGGCGGAGAGAGTTTATTCAGCTGAACCCTCCCTCCTGTTGTTGAACAATAGC
CATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGATGTCTCTCTTCATGACTTCGTCAAGGCGTACGC
TTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGAC
TGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATC
TATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGCGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTA
CGGTGGAAGCAAAAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGT
TGCACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGG
AGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGC
AGCTGAAATTTGAAGATCTGAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTGCTTTTGAAACCA
ATGTCCTGTTTTTAGTCC

QA 3 560 3 560
DS 

RD RR2EV01TF 623 0 0
GGAGTCCTTGCGAGAGTGGCGGAGAGAGTTTATTCAGCTGAACCCTCCCTCCTGTTGTTG
AACAATAGCCATGGCGACAGGTAAAACGGTGAAAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAA
GGCGTACGCTTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACAT
TGTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAG
AGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGCGTTGGTGCTTTCCG
TAGAATCTACTGTGGAAGCAAAAGAAACGGCAGTTGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAG
CGGTGGCGTTGCACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGA
CACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAGCGGGATT*GGACCAGGTTGCTGG
ACGTATTGCAGCTGAAATTTGAAGATCTGAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTGCTT
TTGAAACCAATGTCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAAT
ATCATTACTGAAGACTTGCTC
AC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2ET11JQ 521 0 0
T
TCATGACTTCGTCAAGGCGTACGCTTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCC
CCCATGGACAGACATTGTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGA
TTGGTACTACATCAGAGCTGCATTTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGG
CGTTGGTGCTTTCCGTAGAATTTACGGTGGAAGCAAAAGAAACGGCAGTCGCCCACCACA
TTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGTTGCACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAA
CATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTT
GGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGCTGAAATTTGAAGATCTGAATCTTGTTTTTTTTA
GTTCTTCTACTGCTTTTGAAACCAATGTCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTACTCTCA
AGAACCATTATCAATATCATTGCTGAAGACTTGCTCTCA
C

QA 2 520 2 520
DS 

RD RR2BF87TF 639 0 0
G
GCGAGAGTGGCGGAGAGAGTTTATTCAGCTGAACCCTCCCTCCTGTTGTTGAACAATAGC
CATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAAGGCGTACGC
TTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGAC
TGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATC
TATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGCGTTGGTGCTTTCCGTGGAATCTA
CGGTGGAAGCAAAAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGT
TGCACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGG
AGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGC
AGCTGAAATTTGAAGATCTGAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTGCTTTTGAAACCA
ATGTCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCT
GAAGACTTGCTCTCATAATGTTCAGAACCTGTTCATC
T

QA 2 638 2 638
DS 

RD RR2FL62TF 731 0 0
GG
GCGAGAGTGGCGGAGAGAGTTTATTCAGCTGAACCCTCCCTCCTGTTGTTGAACAATAGC
CATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAAGGCGTACGC
TTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGAC
TGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATC
TATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGCGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTA
CGGTGGAAGCAAAAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGT
TGCACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGG
AGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGC
AGCTGAAATTTGAAGATCTGAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTGCTTTTGAAACCA
ATGTCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCT
GAAGACTTGCTCTCATAATGTTCAGAACCTGTTCATCTTTTTTTTTGTTGGCTTTTT*GA
ACATCTAACCATCATCAATCAATAAATGCTAGTAAATGATTTAGCGGAAAGCTAGCTTCC
AAAGAAGCT

QA 3 731 3 731
DS 

RD RR2FL62JQ 629 0 0
TCAAGGCGTACGCTTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAG
ACATTGTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGATCCTGATTGGTACTACA
TCAGAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGCGTTGGTGCTT
TCCGTAGAATTTACGGTGGAAGCAAAAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAA
GCAGCGGTGGCGTTGCACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGA
TTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTG
CTGGACGTATTGCAGCTGAAATTTGAAGATCTGAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACT
GCTTTTGAAACCAATGTCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTACTCTCAAGAACCATTAT
CAATATCATTGCTGAAGACTTGCTCTCATAATGTTCAGAACCTGTTCATCTTTTTTTTTG
TTGGCTTTTTTGAACATCTAACCATCATCAATCAATAAATGCTAGTAAATGATTTAGCGG
AAAGCTAGCTTCCAAAGAAGCTTTTTATC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 2 10

CO CL361Contig1 1288 5 14 U
CAAGACAGGAAACGATCGAATTTGTAGACCTAATTGACATACAGGGTCCATTGATAGAAA
GAAATCCAACTGATTCAGGAACAAGAAACGGTCTCATCAACGAACACACAACTCATCAGA
AACAAGAAAATGACAAAACAGAGATCGATCAATATCAAAAGAACTTAACGTTACATTGCA
A**ATATAAAAAATTAAA*CTCTTTAACAAGCTTTACAGCTACGCCTGCAGTTTCCAGGG
AGCTCTGGGGTTCCCACCATATACTCTGGGTTCTTTGCGCATTCTCCAAGCACTGCCCAT
CTTTCACAGCTCTCGTTTGCATCCGAACAGCTACCATCATGCGTCACAATCTTATCGAAC
GAGTCCACGTGGATCCACTTGGTCGCTGACCATTTCTCTCCTTCGATCACAGGACAGCCT
CCGTGAAGGCTCAAAGTATCTGGGGTTGCGTCTTGGTGGAGGTTGAAGAACAACAGTGCA
TCTCCTTTCTTCGGTTTCACAGCAATTCCTTTCTTTGCACAATCAGAAAGGTCGTCCTTG
TTTACAGAAAGCTTGAGGCGGGAAGACTCCACTGCATCAGGGAAAACAGTTTCTCCACCC
TTTGTGACATTGGAAAGATACATGAGAACGGTTGCTATACGGTGTCCACCGCGGGCGATG
TTGACTTTGTCGTGGAAGTAGTCAAAGTGAGCGTCATATTTCTGACCGTGCTCATATCTC
AGCACCTGAAGATCCTCCCCGTTTTCTTTTGGGAGGAATGTCCATGTGGAGAGCTTGTCC
TCTATACCGGAAACAATAGGATCCTTTCCTTTGGAGATAAACGTGCCGGAGCTGGTCCGA
ACGTCACTGACTTGACTCTCTCCATTGTCGTTATCAGCAACCGCAGATCTCTGCAGATTC
TCTTTCGCAA*GGGAGATCAAATGATCACATTCCAGGTCCGTTAGAAAACCTCCATACAC
AAATGCCCTGGGTTTTGAAGAAACTTGTTTGACTTTAGAAGGGTTGATGATAGAACTTGG
AGAACTAATCAGAGAAGTCGATGACTGAATCAGGACAAGGAAGACTGCTACGAACATCAA
CATCAATCCGCGGCCAGACATCGTCATTAGCTCTTGGGTCCAAAAAGAAGCGTAGAGAGA
TCGAAAACTGGGAATGATTTCCTTTTTTTTTTTCAGGAAAATAATAAAGAAGGAAAATTT
TAATTTTCTAGTCTCCAGAAAATGTCAACGGTCGTGAAGAGTTGATGGCTCTACTACCTA
AAGAGATGGCGGCGACATGCGCACGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI96JQ U 52
AF RR2AG05JQ U 1
AF RR2BJ06JQ U 54
AF RR2CI96TF C 469
AF RR2AG05TF C 543
BS 1 178 RR2AG05JQ
BS 179 179 RR2CI96JQ
BS 180 256 RR2AG05JQ
BS 257 257 RR2CI96JQ
BS 258 371 RR2AG05JQ
BS 372 372 RR2CI96JQ
BS 373 793 RR2AG05JQ
BS 794 910 RR2BJ06JQ
BS 911 911 RR2CI96TF
BS 912 928 RR2BJ06JQ
BS 929 1094 RR2CI96TF
BS 1095 1095 RR2AG05TF
BS 1096 1172 RR2CI96TF
BS 1173 1288 RR2AG05TF

RD RR2CI96JQ 667 0 0
CGATAGAAAGAAATCCA
ACTGATCCAGGAACAAGAAACGGTCTCATCAACGAACACACAACTCATCAGAAACAAGAA
AATGACAAAACAGAGATCGATCAATATCAAAAGAACTTAACGTTACATTGCAA**ATATA
AAAAATAAAAACTCTTTAACAAGCTTTACAGCTACGCCTGCAGTTTCCAGGGAGCTCTGG
GGTTCCCACCATATACTCTGGGTTCTTTGCGCATTCTCCAAGCACTGCCCATCTTTCACA
GCTCTCGTTTGCATCCGAACAGCTACCATCATGCGTCACAATCTTATCGAACAAGTCCAC
GTGGATCCACTTGGTCGCTGACCATTTCTCTCCTTCGATCACAGGACAACCTCCGTGAAG
GCTCAAAGTATCTGGAGTTGCGTCTTGGTGGAGGTTGAAGAACAACAGTGCATCTCCTTT
CTTCGGTTTCACAGCAATTCCTTTCTTTGCACAATCAGAAAGGTCGTCCTTGTTTACAGA
AAGCTTGAGGCGGGAAGACTCCACTGCATCAGGGAAAACAGTTTCTCCACCCTTTGTGAC
ATTGGAAAGATACATGAGAACGGTTGCTATACGGTGTCCACCGCGGGCGATGTTGACTTT
GTCGTGGAAGTAGTCAAAGTGAGCGTCATATTTCTGACCGTGCTCATATC

QA 18 667 18 667
DS 

RD RR2AG05JQ 793 0 0
CAAGACAGGAAACGATCGAATTTGTAGACCTAATTGACATACAGGGTCCATTGATAGAAA
GAAATCCAACTGATTCAGGAACAAGAAACGGTCTCATCAACGAACACACAACTCATCAGA
AACAAGAAAATGACAAAACAGAGATCGATCAATATCAAAAGAACTTAACGTTACATTGAA
A**ATATAAAAAATTAAA*CTCTTTAACAAGCTTTACAGCTACGCCTGCAGTTTCCAGGG
AGCTCTGGGGTTCCCAGCATATACTCTGGGTTCTTTGCGCATTCTCCAAGCACTGCCCAT
CTTTCACAGCTCTCGTTTGCATCCGAACAGCTACCATCATGCGTCACAATCTTATCGAAC
GAGTCCACGTGAATCCACTTGGTCGCTGACCATTTCTCTCCTTCGATCACAGGACAGCCT
CCGTGAAGGCTCAAAGTATCTGGGGTTGCGTCTTGGTGGAGGTTGAAGAACAACAGTGCA
TCTCCTTTCTTCGGTTTCACAGCAATTCCTTTCTTTGCACAATCAGAAAGGTCGTCCTTG
TTTACAGAAAGCTTGAGGCGGGAAGACTCCACTGCATCAGGGAAAACAGTTTCTCCACCC
TTTGTGACATTGGAAAGATACATGAGAACGGTTGCTATACGGTGTCCACCGCGGGCGATG
TTGACTTTGTCGTGGAAGTAGTCAAAGTGAGCGTCATATTTCTGACCGTGCTCATATCTC
AGCACCTGAAGATCCTCCCCGTTTTCTTTTGGGAGGAATGTCCATGTGGAGAGCTTGTCC
TCTATACCGGAAA

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2BJ06JQ 875 0 0
GGTAGAAAAAACCTG
ACTGATTCAAGAACAAGAGATGGTCTCATCAACGAACACACAACTCATCAGAAACAAGAA
AATGACAAAACAGAG******CGATATCAAAAGAACTTAATGTTACATTGCAATAAGAAA
AAAAATTAAA*CTCTTTAACAAGCTTTACAGCTACGCCTGCAGTTTCCAGGGAGCTCTGG
AGTTCCCACCATATACTCTGGGTTCTTTGCGCATTTTCCAAGCACTGCCCATCTTTCACA
GCTCTCATTTGCATCCGAACAGCTACCATCATGCGTCACAATCTTATCGAACGAGTCTAC
GTGGATCCACTTGGTCGCTGACCATTTCTCTCCTTCGATCACAGGACAGCCTCCGTGAAG
GCTCAAGGTGTCTGGGGTTGCGTCTTGGTGGAGGTTGAAGAACAACAGTGCATCTCCTTT
CTTCGGTTTCACAGCAATTCCTTTCTTTGCACAATCAGAAAGGTCGTCCTTGTTTACAGA
AAGCTTGAGGCGGGAAGACTCCACAGCATCAGGGAAAACAGTTTCTCCACCCTTTGTGAC
ATTGGAAAGATACATGAGAACGGTTGCTATACGGTGTCCACCACGGGCGATGTTGACTTT
GTCGTGGAAATAGTCAAAGTGAGCGTCATATTTCTGACCGTGCTCATATCTCAGCACCTG
AAGATCCTCCCCGTTTTCTTTTGGGAGGAATGTCCATGTGGAGAGCTTGTCCTCTATACC
GGAAACAATAGGATCCTTTCCTTTGGAGATAAACGTGCCGGAGCTGGTCCGAACGTCACT
GACTTGACTCTCTCCATTGTCGTTATCAGCAACCGCAGATCTCTGCAGATTCTCTTTCGC
AAAGGGAGATCAAATGATCA

QA 16 875 16 875
DS 

RD RR2CI96TF 708 0 0
AACAACAGTGCATCTCCTTTCTTCGGTTTCACAGCAATTCCTTTCTTTGCACAATCAGAA
AGGTCGTC*TTGTTTACAGAAAGCTTGAGGCGGGAAGACTCCACTGCATCAGGGAAAACA
GTTTCTCCACCCTTTGTGACATTGGAAAGATACATGAGAACGGTTGCTATACGGTGTCCA
CCGCGGGCGATGTTGACTTTGTCGTGGAAGTAGTCAAAGTGAGCGTCATATTTCTGACCG
TGCTCATATCTCAGCACCTGAAGATCCTCCCCGTTTTCTTTTGGGAGGAATGTCCATGTG
GAGAGCTTGTCCTCTATACCAGAAACAATAGGATCCTTTCCTTTGGAGATAAACGTGCCG
GAGCTGGTCCGAACTTCACTGACTTGACTCTCTCCATTGTCGTTATCAGCAACCGCAGAT
CTCTGTAGATTCTCTTTTGCAA*GGGAGATCAAATGATCACATTCCAGGTCCGTTAGAAA
ACCTCCATACACAAATGCCCTGGGTTTTGAAGAAACTTGTTTGACTTTAGAAGGGTTGAT
GATAGAACTTGGAGAACTAATCAGAGAAGTCGATGACTGAATCAGGACAAGGAAGACTGC
TACGAACATCAACATCAATCCGCGGCGAGACATCGTCATTAGCTCTTGGGTCCAAAAAGA
AGCGTAGAGAGATCGAAAACTGGGAATGATTTCCTTTTTTTTTT
CCCC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2AG05TF 746 0 0
TACAGAAAGCTTGAGGCGGGAAGACTCCACTGCATCAGGGAAAACAGTTTCTCCACCCTT
TGTGACATTGGAAAGATACATGAGAACGGTTGCTATACGGTGTCCACCGCGGGCGATGTT
GACTTTGTCGTGGAAGTAGTCAAAGTGAGCGTCATATTTCTGACCGTGCTCATATCTCAG
CACCTGAAGATCCTCCCCGTTTTCTTTTGGGAGGAATGTCCATGTGGAGAGCTTGTCCTC
TATACCGGAAACAATAGGATCCTTTCCTTTGGAGATAAACGTGCCGGAGCTGGTCCGAAC
GTCACTGACTTGACTCTCTCCATTGTCGTTATCAGCAACCGCAGATCTCTGCAGATTCTC
TTTCGCAA*GGGAGATCAAATGATCACATTCCAGGTCCGTTAGAAAACCTTCATACACAA
ATGCCCTGGGTTTTGAAGAAACTTGTTTGACTTTAGAAGGGTTGATGATAGAGCTTGGAG
AACTAATCAGAGAAGTCGATGACTGAATCAGGACAAGGAAGACTGCTACGAACATCAACA
TCAATCCGCGGCCAGACATCGTCATTAGCTCTTGGGTCCAAAAAGAAGCGTAGAGAGATC
GAAAACTGGGAATGATTTCCTTTTTTTTTTTCAGGAAAATAATAAAGAAGGAAAATTTTA
ATTTTCTAGTCTCCAGAAAATGTCAACGGTCGTGAAGAGTTGATGGCTCTACTACCTAAA
GAGATGGCGGCGACATGCGCACGTCC

QA 1 746 1 746
DS 



CO CL361Contig2 1040 5 20 U
GGAAACAAAAAAAAGAAAGCTATTCCCAGTTTTAGATCTCTCTAAGCGACTGAGTTACTA
ATGTCGATGTCCCGCGGTGGAGTGTTGTTGCTACTCTTCACCATCTTCCTCGTCCAGCTT
CAGTCTTCTACCTCTCTGATCAGTTCTCCAAGTTCTATCATCAACCCTTCAAAAGTCAAA
CAGGTTTCTTCAAAACCCAGGGCATTTGTGTATGAAGGTTTTCTAACGGACTTGGAATGT
GATCATCTGATCTCACTTGCGAAAGAGAATCTGCAGAGATCTGCCGTTGCTGACAACGAC
AATGGAGAGAGTCAAGTTAGTGATGTTCGGACCAGCTCCGGCACGTTTATCTCCAAAGGA
AAGGATCCTATTGTTTCTGGTATAGAGGACAAGCTCTCCACATGGACATTCCTCCCAAAA
GAGAATGGAGAAGACCTTCAGGTGTTGAGATATGAGCACGGTCAGAAATATGACGCACAC
TTTGACTACTTTCACGACAAAGTCAACATCGCCCGTGGTGGACACCGCATAGCAACGGTT
CTCATGTATCTATCAAATGTCACAAAGGGTGGAGAAACTGTCTTCCCTAATGCAATGGAA
TCTTCTCGCCGCAAGCTTTCTGTAAACAAAGACGATCTTTCTGATTGTGCAAAGAAAGGA
ATCGCTGTGAAACCGAGGAAAGGAGATGCGTTGTTGTTCTTTAACCTCCACGAAGACGCA
ACTCCAGATGTATTGAGCCTTCATGGAGGTTGTCCTGTGATTGAAGGAGAGAAATGGTCA
GCAACTAAGTGGATCCACGTGGACTCGTTCGATAAGATTGTGACGCATGATGGTAGCTGT
ACGGATGTAAACGAGAGCTGTGAAAGGTGGGCAGTGCTTGGAGAATGCGCAAAGAACCCA
GAGTATATGGTGGGAACTCCAGAGCTCCCTGGAAACTGTAGGCGTAGCTGTAAAACTTGT
TAATTAAAGAGTTTAAAATTATCTTCTCTATGTACCATTAAGTACTTGTTATCTTGATTG
AGCTTCATTTTCTGAGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2EB04TF U 1
AF RR2CQ88TF U 2
AF RR2FV26TF U 20
AF RR2FV26JQ C 223
AF RR2EB04JQ C 394
BS 1 260 RR2EB04TF
BS 261 261 RR2CQ88TF
BS 262 269 RR2EB04TF
BS 270 270 RR2CQ88TF
BS 271 284 RR2EB04TF
BS 285 285 RR2CQ88TF
BS 286 293 RR2EB04TF
BS 294 294 RR2CQ88TF
BS 295 419 RR2EB04TF
BS 420 594 RR2CQ88TF
BS 595 595 RR2FV26TF
BS 596 673 RR2CQ88TF
BS 674 750 RR2FV26TF
BS 751 751 RR2FV26JQ
BS 752 797 RR2FV26TF
BS 798 798 RR2EB04JQ
BS 799 954 RR2FV26JQ
BS 955 955 RR2EB04JQ
BS 956 1039 RR2FV26JQ
BS 1040 1040 RR2EB04JQ

RD RR2EB04TF 419 0 0
GGAAACAAAAAAAAGAAAGCTATTCCCAGTTTTAGATCTCTCTAAGCGACTGAGTTACTA
ATGTCGATGTCCCGCGGTGGAGTGTTGTTGCTACTCTTCACCATCTTCCTCGTCCAGCTT
CAGTCTTCTACCTCTCTGATCAGTTCTCCAAGTTCTATCATCAACCCTTCAAAAGTCAAA
CAGGTTTCTTCAAAACCCAGGGCATTTGTGTATGAAGGTTTTCTAACGGACTTGGAATGT
GATCATCTGATCTCACTTGCAAAAGAGAACCTGCAGAGATCTGCGGTTGCTGATAACGAC
AATGGAGAGAGTCAAGTTAGTGATGTTCGGACCAGCTCCGGCACGTTTATCTCCAAAGGA
AAGGATCCTATTGTTTCTGGTATAGAGGACAAGCTCTCCACATGGACATTCCTCCCAAA

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR2CQ88TF 672 0 0
GGAAAC
AAAAAAAGAAAGCTATTCCCAGTTTTAGATCTCTCTAAGCGACTGAGTTACTAATGTCGA
TGTCCCGCGGTGGAGTGTTGTTGCTACTCTTCACCATCTTCCTCGTCCAGCTTCAGTCTT
CTACCTCTCTGATCAGTTCTCCAAGTTCTATCATCAACCCTTCAAAAGTCAAACAGGTTT
CTTCAAAACCCAGGGCATTTGTGTATGAAGGTTTTCTAACGGACTTGGAATGTGATCATC
TGATCTCACTTGCGAAAGAGAATCTGCAGAGATCTGCCGTTGCTGACAACGACAATGGAG
AGAGTCAAGTTAGTGATGTTCGGACCAGCTCCGGCATGTTTATCTCCAAAGGAAAGGATC
CTATTGTTTCTGGTATAGAGGACAAGCTCTCCACATGGACATTCCTCCCAAAAGAGAATG
GAGAAGACCTTCAGGTGTTGAGATATGAGCACGGTCAGAAATATGACGCACACTTTGACT
ACTTTCACGACAAAGTCAACATCGCCCGTGGTGGACACCGCATAGCAACGGTTCTCATGT
ATCTATCAAATGTCACAAAGGGTGGAGAAACTGTCTTCCCTAATGCAGTGGAATCTTCTC
GCCGCAAGCTTTCTGTAAACAAAGACGATCTTTCTGATTGTGCAAAGAAAGGAATCGCTG
TGAAAC

QA 7 672 7 672
DS 

RD RR2FV26TF 778 0 0
GG
ATTCCCAGTTTTAGATCTCTCTAAGCGACTGAGTTACTAATGTCGATGTCCCGCGGTGGA
GTGTTGTTGCTACTCTTCACCATCTTCCTCGTCCAACTTCAGTCTTCTACCTCTCTGATC
AGTTCTCCAAGTTCTATCATCAACCCTTCAAAAGTCAAACAGGTTTCTTCAAAACCCAGG
GCATTTGTGTATGAAGGTTTTCTAACGGACTTGGAATGTGATCATCTGATCTCACTTGCG
AAAGAGAATCTGCAGAGATCTGCCGTTGCTGACAACGACAATGGAGAGAGTCAAGTTAGT
GATGTTCGGACCAGCTCCGGCACGTTTATCTCCAAAGGAAAGGATCCTATTGTTTCTGGT
ATAGAGGACAAGCTCTCCACATGGACATTCCTCCCAAAAGAGAATGGAGAAGACCTTCAG
GTGTTGAGATGTGAGCACGGTCAGAAATATGACGCACACTTTGACTACTTTCACGACAAA
GTCAACATCGCCCGTGGTGGACACCGCATAGCAACGGTTCTCATGTATCTATCAAATGTC
ACAAAGGGTGGAGAAACTGTCTTCCCTAATGCAATGGAATCTTCTCGCCGCAAGCTTTCT
GTAAACAAAGACGATCTTTCTGATTGTGCAAAGAAAGGAATCGCTGTGAAACCGAGGAAA
GGAGATGCGTTGTTGTTCTTTAACCTCCACGAAGACGCAACTCCAGATGTATTGAGCCTT
CATGGAGGT*GTCCTGTGATTGAAGGAGAGAAATGGTCAGCAACTAAGTGGATCCA

QA 3 778 3 778
DS 

RD RR2FV26JQ 818 0 0
CTAACGGACTTGGAATGTGATCATCTGATCTCACTTGCGAAAGAGAATCTGCAGAGATCT
GCCGTTGCTGACAACGACAATGGAGAGAGTCAAGTTAGTGATGTTCGGACCAGCTCCGGC
ACGTTTATCTCCAAAGGAAAGGATCCTATTGTTTCTGGTATAGAGGACAAGCTCTCCACA
TGGACATTCCTCCCAAAAGAGAATGGAGAAGACCTTCAGGTGTTGAGATGTGAGCACGGT
CAGAAATATGACGCACACTTTGACTACTTTCACGACAAAGTCAACATCGCCCGTGGTGGA
CACCGCATAGCAACGGTTCTCATGTATCTATCAAATGTCACAAAGGGTGGAGAAACTGTC
TTCCCTAATGCAATGGAATCTTCTCGCCGCAAGCTTTCTGTAAACAAAGACGATCTTTCT
GATTGTGCAAAGAAAGGAATCGCTGTGAAACCGAGGAAAGGAGATGCGTTGTTGTTCTTT
AACCTCCACGAAGACGCAACTCCAGATGTATTGAGCCTTCATGGAGGTTGTCCTGTGATT
GAAGGAGAGAAATGGTCAGCAACTAAGTGGATCCATGTGGACTCGTTCGATAAGATTGTG
ACGCATGATGGTAGCTGTACGGATGTAAACGAGAGCTGTGAAAGGTGGGCAGTGCTTGGA
GAATGCGCAAAGAACCCAGAGTATATGGTGGGAACTCCAGAGCTCCCTGGAAACTGTAGG
CGTAGCTGTAAAGCTTGTTAATTAAAGAGTTTAAAATTATCTTCTCTATGTACCATTAAG
TACTTGTTATCTTGATTGAGCTTCATTTTCTGAGTTT
G

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2EB04JQ 647 0 0
CTCTCCACATGGACATTCCTCCCAAAAGAAAATGGAGAAGACCTTCAGGTGTTGAGATAT
GAACACGGTCAGAAATATGACGCACACTTTGACTACTTTCACGACAAAGTCAACATCGCC
CGTGGTGGACACCGCATAGCAACGGTTCTCATGTATCTATCAAATGTCACAAAGGGTGGA
GAAACTGTCTTCCCTAATGCAGTGGAATCTTCTCGCCGCAAGCTTTCTGTAAACAAAGAC
GATCTTTCTGATTGTGCAAAGAAAGGAATCGCTGTGAAACCGAGGAAAGGAGATGCACTG
TTGTTCTTTAACCTCCACGAAGACGCAACTCCAGATACATTGAGCCTTCACGGAGGTTGT
CCTGTGATTGAAGGAGAGAAATGGTCAGCAACTAAGTGGATCCACGTGGACTCGTTCGAT
AAGATTGTGACGCATGATGGTAGCTGTACGGATGTGAACGAGAGCTGTGAAAGGTGGGCA
GTGCTTGGAGAATGCGCAAAGAACCCAGAGTATATGGTGGGAACTCCAGAGCTCCCTGGA
AACTGTAGGCGTAGCTGTAAAACTTGTTAATTAAAGAGTTTAAAATTATCTTCTCTATGT
ACCATTAAGTACTTGTTATCTTGATTGAGCTTCATTTTCTGAGTTTC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 2 12

CO CL362Contig1 976 3 2 U
GGACTTCTGCAACTTTATCCACTCGGAGCCTCGACCATGGCATCTCCTTCACTTCTGCAC
TCTTCAGCTTCGTCGCTTCACTGCCGTTTCCCATCGCTAGCAATTCCAACCTCCGCACCT
CCTCCGCCTCAGAGGAACTTGTTGAAAGTCTCGGCGTCGGGAACAGTGCTGGTGGAGAAA
TCAGAGGCGGAGAAAGTGCAGCGCCTCAAAAGCGCTTACCTAGAGAGAATCATCCCCGCC
CTCAAAGATGAGTTCAAATACATCAACATTCACCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATTGTG
GTGAATTGTGGTATAGGAGATGCAGCGCAGAACGACAAAGGATTGGAGGCAGCAATGAAA
GACATAGCGCTGATAACAGGGCAGAAGCCTGTGAAGACAAGAGCTAGAGCTTCCATTGCT
ACTTTCAAGATTAGGGAAGATCAACCTCTTGGGATTGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTG
ATGTACTCGTTCCTGGACCGTCTGATAAATTTAGCACTGCCAAGAACAAGAGATTTCCAA
GGTGTGAGTCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAGACCAA
AGCGTTTTCCCTGAAATCAGGTTTGATGCGATAGGGAAGGCAAGAGGAATGGATGTATGC
ATAAGCACAACGGCTAAAACAGATGACGAAGGACAGAGACTGTTGGTTCTGATGGGAATG
CCTTTCAGGGAAGGAAGCAGCGCCAACACAGGAGGGGCGATAGTGAGGAAGAAGAAACTT
AAGTCTCATCATTTTGATGCTAAAAGCAAAGGCAAGGGAAAGAGATGAATGAAAGAAAGA
TGATTTTCATTTGTATTTGTCTTCGTGTATGTTATGTTGATGGATTAATCTTTTGCTGCC
CATGTTTATTACTCCTCCCTTGTGATAGTGTTTGTTAATCCTTTCTGATAAAACAAATCC
AATTTGGAAGAGAGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG67TF U 1
AF RR2C149TF U 1
AF RR2CO04JQ C 521
BS 1 595 RR2C149TF
BS 596 976 RR2CO04JQ

RD RR2EG67TF 205 0 0
GGACTTCTGCAACTTTATCCACTCGGAGCCTCGACCATGGCATCTCCTTCACTTCTGCAC
TCTTCAGCTTCGTCGTTTCACTGCCGTTTCCCATCGCTAGCAATTCCAACCTCCGCACCT
CCTCCGCCTCAGAGGAACTTGTTGAAAGTCTCGGCGTCGGGAATAGTGCTGGTGGAGAAA
TCAGAGGCGGAGAAAGTGCAGCGCC

QA 1 205 1 205
DS 

RD RR2C149TF 595 0 0
GGACTTCTGCAACTTTATCCACTCGGAGCCTCGACCATGGCATCTCCTTCACTTCTGCAC
TCTTCAGCTTCGTCGCTTCACTGCCGTTTCCCATCGCTAGCAATTCCAACCTCCGCACCT
CCTCCGCCTCAGAGGAACTTGTTGAAAGTCTCGGCGTCGGGAACAGTGCTGGTGGAGAAA
TCAGAGGCGGAGAAAGTGCAGCGCCTCAAAAGCGCTTACCTAGAGAGAATCATCCCCGCC
CTCAAAGATGAGTTCAAATACATCAACATTCACCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATTGTG
GTGAATTGTGGTATAGGAGATGCAGCGCAGAACGACAAAGGATTGGAGGCAGCAATGAAA
GACATAGCGCTGATAACAGGGCAGAAGCCTGTGAAGACAAGAGCTAGAGCTTCCATTGCT
ACTTTCAAGATTAGGGAAGATCAACCTCTTGGGATTGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTG
ATGTACTCGTTCCTGGACCGTCTGATAAATTTAGCACTGCCAAGAACAAGAGATTTCCAA
GGTGTGAGTCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2CO04JQ 456 0 0
CAAGAACAAGAGATTTCCAAGGTGTGAGTCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACA
GCATTGGTGTCAAAGACCAAAGCGTTTTCCCTGAAATCAGGTTTGATGCGATAGGGAAGG
CAAGAGGAATGGATGTATGCATAAGCACAACGGCTAAAACAGATGACGAAGGACAGAGAC
TGTTGGTTCTGATGGGAATGCCTTTCAGGGAAGGAAGCAGCGCCAACACAGGAGGGGCGA
TAGTGAGGAAGAAGAAACTTAAGTCTCATCATTTTGATGCTAAAAGCAAAGGCAAGGGAA
AGAGATGAATGAAAGAAAGATGATTTTCATTTGTATTTGTCTTCGTGTATGTTATGTTGA
TGGATTAATCTTTTGCTGCCCATGTTTATTACTCCTCCCTTGTGATAGTGTTTGTTAATC
CTTTCTGATAAAACAAATCCAATTTGGAAGAGAGCC

QA 1 456 1 456
DS 



CO CL362Contig2 1000 9 37 U
GGGAGAGCTCTCACTTCGGACTTCTGCAACTTTATCCACTCGGAGCCTCGACCATGGCAT
CTCCTTCACTTCTGCACTCTTCCGCTTCGTCGTTTCACTGCCGTTTCCCATCGCTAGCAA
TTCCATCCTCCGCACCTCCGCCTCAGAGGAACTCGTTGAAAGTCTCGGCGTCGGGAACAG
TGCTGGTGGAGAAATCTGAGTCGGAGAAAGTGCAGCGCCTCAAAAGCGCTTACCTCGAGA
GAATCATTCCCGCCCTCAAAGATGAGTTCAAATACATCAACATTCACCAGGTTCCAAAGG
TTCAGAAGATAGTGGTGAATTGTGGAATAGGAGATGCAGCGCAGAACGACAAAGGATTGG
AGGCAGCGATGAAAGACATAGCGCTTATAACAGGGCAGAAACCTGTCAAGACAAGAGCTA
GAGCTTCCATTGCTACTTTCAAGATTAGGGAAGATCAACCTCTTGGGATCGCCGTCACTC
TCAGAGGAGACGTGATGTACTCGTTCCTGGACCGTCTGATCAATTTAGCACTTCCAAGAA
CAAGAGATTTCCAAGGTGTGAGTCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCATTG
GTGTCAAAGACCAAAGCGTTTTCCCTGAAATCAGGTTTGATGCGATAGGGAAGGCAAGAG
GAATGGATGTATGCATAAGCACAACGGCTAAAACAGATGACGAAGGACAGAGACTGTTGG
CTCTGATGGGAATGCCTTTCAGGGAAGGAAGCAGCGCCAACACAGGAGGGGCGATAGTGA
GGAAGAAGAAACTTAAGTCTCATCATTTTGATGCTAAAAGCAAAGGCAAGGGAAAGAGAT
GAATGAAAGAAAGATGATTTTCATTTGTATTTGTCTTCATGTACGTTATGTTGATGGATT
AATCTTTTGCTGCCCATGTTATATTACTCCTCCCTTGTGATAGTGTTTGTTAATCCTCTC
TGATAAAACAAATCCAATTTGGAAGAGTCAATTGATTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 20 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 20 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E495TF U 1
AF RR2H211TF U 4
AF RR2E413TF U 18
AF RR2EA18TF U 18
AF RR2C513TF U 11
AF RR2CO04TF U 19
AF RR2C513JQ C 591
AF RR2EA18JQ C 205
AF RR2C149JQ C 238
BS 1 17 RR2E495TF
BS 18 19 RR2E413TF
BS 20 88 RR2E495TF
BS 89 89 RR2EA18TF
BS 90 284 RR2E495TF
BS 285 310 RR2H211TF
BS 311 311 RR2EA18TF
BS 312 319 RR2H211TF
BS 320 320 RR2EA18TF
BS 321 334 RR2H211TF
BS 335 335 RR2EA18TF
BS 336 352 RR2H211TF
BS 353 353 RR2EA18TF
BS 354 355 RR2H211TF
BS 356 356 RR2EA18TF
BS 357 367 RR2H211TF
BS 368 368 RR2EA18TF
BS 369 385 RR2H211TF
BS 386 386 RR2EA18TF
BS 387 400 RR2H211TF
BS 401 401 RR2EA18TF
BS 402 406 RR2H211TF
BS 407 407 RR2EA18TF
BS 408 520 RR2H211TF
BS 521 521 RR2EA18TF
BS 522 542 RR2H211TF
BS 543 543 RR2EA18TF
BS 544 580 RR2H211TF
BS 581 581 RR2EA18TF
BS 582 583 RR2H211TF
BS 584 584 RR2EA18TF
BS 585 609 RR2H211TF
BS 610 705 RR2CO04TF
BS 706 706 RR2EA18JQ
BS 707 738 RR2CO04TF
BS 739 987 RR2EA18JQ
BS 988 1000 RR2C149JQ

RD RR2E495TF 284 0 0
GGGAGAGCTCTCACTTCTCACTTCTGCAACTTTATCCACTCGGAGCCTCGACCATGGCAT
CTCCTTCACTTCTGCACTCTTCCGCTTCTTCGTTTCACTGCCGTTTCCCATCGCTAGCAA
TTCCATCCTCCGCACCTCCGCCTCAGAGGAACTCGTTGAAAGTCTCGGCGTCGGGAACAG
TGCTGGTGGAGAAATCTGAGTCGGAGAAAGTGCAGCGCCTCAAAAGCGCTTACCTCGAGA
GAATCATTCCCGCCCTCAAAGATGAGTTCAAATACATCAACATT

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2H211TF 606 0 0
GGAGCTCTC
ACTTCTCACTTCTGCAACTTTATCCACTCGGAGCCTCGACCATGGCATCTCCTTCACTTC
TGCACTCTTCCGCTTCTTCGTTTCACTGCCGTTTCCCATCGCTAGCAATTCCATCCTCCG
CACCTCCGCCTCAGAGGAACTCGTTGAAAGTCTCGGCGTCGGGAACAGTGCTGGTGGAGA
AATCTGAGTCGGAGAAAGTGCAGCGCCTCAAAAGCGCTTACCTCGAGAGAATCATTCCCG
CCCTCAAAGATGAGTTCAAATACATCAACATTCACCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATTG
TGGTGAACTGTGGAATAGGAGACGCAGCGCAGAACGACAAGGGTTTGGAGGCAGCAATGA
AAGACATAGCGCTGATAACAGGGCAGAAGCCTGTGAAGACAAGAGCTAGAGCTTCCATTG
CTACTTTCAAGATTAGGGAAGATCAACCTCTTGGGATCGCCGTCACTCTCAGAGGAGACG
TGATGTACTCGTTCCTGGACCGTCTGATAAATTTAGCACTTCCAAGAACACGAGATTTCC
AAGGTGTGAGTCCCAGTAGCTTTGATGGGAATGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAG

QA 10 606 10 606
DS 

RD RR2E413TF 592 0 0
GGACTTCTGCAACTTTATCCACTCGGAGCCTCGACCATGGCATCTCCTTCACTTCTGCAC
TCTTCCGCTTCTTCGTTTCACTGCCGTTTCCCATCGCTAGCAATTCCATCCTCCGCACCT
CCGCCTCAGAGGAACTCGTTGAAAGTCTCGTCGTCGGGAACAGTGCTGGTGGAGAAATCT
GAGTCGGAGAAAGTGCAGCGCCTCAAAAGCGCTTACCTCGAGAGAATCATTCCCGCCCTC
AAAGATGAGTTCAAATACATCAACATTCACCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATTGTGGTG
AACTGTGGAATAGGAGACGCAGCACAGAACGACAAGGGTTTGGAGGCAGCAATGAAAGAC
ATAGCGCTGATAACAGGGCAGAAGCCTGTGAAGACAAGAGCTAGAGCTTCCATTGCTACT
TTCAAGATTAGGGAAGATCAACCTCTTGGGATCGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTGATG
TACTCGTTCCTGGATCGTCTGATAAATTTAGCACTTCCAAGAACACGAGATTTCCAAGGT
GTGAGTCCCAGTAGTTTTGATGGGAATGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAG

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2EA18TF 592 0 0
GGACTTCTGCAACTTTATCCACTCGGAGCCTCGACCATGGCATCTCCTTCACTTCTGCAC
TCTTCCGCTTCGTCGTTTCACTGCCGTTTCCCATCGCTAGCAATTCCATCCTCCGCACCT
CCGCCTCAGAGGAACTCGTTGAAAGTCTCGGCGTCGGGAACAGTGCTGGTGGAGAAATCT
GAGTCGGAGAAAGTGCAGCGCCTCAAAAGCGCTTACCTCGAGAGAATCATTCCCGCCCTC
AAAGATGAGTTCAAATACATCAACATTCACCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATAGTGGTG
AATTGTGGAATAGGAGATGCAGCGCAGAACGACAAAGGATTGGAGGCAGCGATGAAAGAC
ATAGCGCTTATAACAGGGCAGAAACCTGTCAAGACAAGAGCTAGAGCTTCCATTGCTACT
TTCAAGATTAGGGAAGATCAACCTCTTGGGATCGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTGATG
TACTCGTTCCTGGACCGTCTGATCAATTTAGCACTTCCAAGAACAAGAGATTTCCAAGGT
GTGAGTCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAG

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2C513TF 599 0 0
GGACTTCTC
ACTTCTGCAACTTTATCCACTCGGAGCCTCGACCATGGCATCTCCTTCACTTCTGCACTC
TTCCGCTTCGTCGTTTCACTGCCGTTTCCCATCGCTAGCAATTCCATCCTCCGCACCTCC
GCCTCAGAGGAACTCGTTGAAAGTCTCGGCGTCGGGAACAGTGCTGGTGGAGAAATCTGA
GTCGGAGAAAGTGCAGCGCCTCAAAAGCGCTTACCTCGAGAGAATCATTCCCGCCCTCAA
AGATGAGTTCAAATACATCAACATTCACCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATAGTGGTGAA
TTGTGTAATAGGAGATGCAGCGCAGAACGACAAAGGATTGGAGGCAGCGATGAAAGACAT
AGCGCTTATAACAGGGCAGAAACCTGTCAAGACAAGAGCTAGAGCTTCCATTGCTACTTT
CAAGATTAGGGAAGATCAACCTCTTGGGATCGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTGATGTA
CTCGTTCCTGGACCGTCTGATCAATTTAGCACCTCCAAGAACAAGAGATTTCCAAGGTGT
GAGTCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGTATTGGTGTCAAAG

QA 10 599 10 599
DS 

RD RR2CO04TF 720 0 0
GACTTCTGCAACTTTATCCACTCGGAGCCTCGACCATGGCATCTCCTTCACTTCTGCACT
CTTCCGCTTCGTCGTTTCACTGCCGTTTCCCATCGCTAGCAATTCCATCCTCCGCACCTC
CGCCTCAGAGGAACTCGTTGAAAGTCTCGGCGTCGGGAACAGTGCTGGTGGAGAAATCTG
AGTCGGAGAAAGTGCAGCGCCTCAAAAGCGCTTACCTCGAGAGAATCATTCCCGCCCTCA
AAGATGAGTTCAAATACATCAACATTCACCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATAGTGGTGA
ATTGTGGAATAGGAGATGCAGCGCAGAACGACAAAGGATTGGAGGCAGCGATGAAAGACA
TAGCGCTTATAACAGGGCAGAAACCTGTCAAGACAAGAGCTAGAGCTTCCATTGCTACTT
TCAAGATTAGGGAAGATCAACCTCTTGGGATCGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTGATGT
ACTCGTTCCTGGACCGTCTGATCAATTTAGCACTTCCAAGAACAAGAGATTTCCAAGGTG
TGAGTCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAGACCAAAGCG
TTTTCCCTGAAATCAGGTTTGATGCGATAGGGAAGGCAAGAGGAATGGATGTATGCATAA
GCACAACGGCTAAAACAGATGACGAAG*ACAGAGACTGTTGGCTCTGATGGGAATGCCTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2C513JQ 167 0 0
TACAGTATTGGTGTCAAAGACCAAAGCGTTTTCCCTGAAATCAGGTTTGATGCGATAGGG
AAGGCAAGAGGAATGGATGTATGCATAAGCACAACGGCTAAAACAGATGACGAAGGACAG
AGACTGTTGGCTCTGATGGGAATGCCTTTCAGGGAAGGAAGCAGCGC

QA 1 167 1 167
DS 

RD RR2EA18JQ 787 0 0
AGAAAGTGCAGCGCCTCAAAAGCGCTTACCTCGAGAGAATCATTCCCGCC*TCAAAGATG
AGTTCAAATACATCAACATTCACCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATAGTGGTGAATTGTG
GAATAGGAGATGCAGCGCAGAACGACAAAGGATTGGAGGCAGCGATGAAAGACATAGCGC
TTATAACAGGGCAGAAACCTGTCAAGACAAGAGCTAGAGCTTCCATTGCTACTTTCAAGA
TTAGGGAAGATCAACCTCTTGGGATCGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTGATGTACTCGT
TCCTGGACCGTCTGATCAATTTAGCACTTCCAAGAACAAGAGATTTCCAAGGTGTGAGTC
CCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAGACCAAAGCGTTTTCC
CTGAAATCAGGTTTGATGCGATAGGGAAGGCAAGAGGAATGGATGTATGCATAAGCACAA
CGGCTAAAACAGATGACGAAGGACAGAGACTGTTGGCTCTGATGGGAATGCCTTTCAGGG
AAGGAAGCAGCGCCAACACAGGAGGGGCGATAGTGAGGAAGAAGAAACTTAAGTCTCATC
ATTTTGATGCTAAAAGCAAAGGCAAGGGAAAGAGATGAATGAAAGAAAGATGATTTTCAT
TTGTATTTGTCTTCATGTACGTTATGTTGATGGATTAATCTTTTGCTGCCCATGTTATAT
TACTCCTCCCTTGTGATAGTGTTTGTTAATCCTCTCTGATAAAACAAATCCAATTTGGAA
GAG
AGTC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2C149JQ 763 0 0
AGAGAATCATCCCCGCC*TCAAAGATGAGTTCAAATACATCAACATTCACCAGGTTCCAA
AGGTTCAGAAGATTGTGGTGAATTGTGGTATAGGAGATGCAGCGCAGAACGACAAAGGAT
TGGAGGCAGCAATGAAAGACATAGCGCTGATAACAGGGCAGAAGCCTGTGAAGACAAGAG
CTAGAGCTTCCATTGCTACTTTCAAGATTAGGGAAGATCAACCTCTTGGGATTGCCGTCA
CTCTCAGAGGAGACGTGATGTACTCGTTCCTGGACCGTCTGATAAATTTAGCACTGCCAA
GAACAAGAGATTTCCAAGGTGTGAGTCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCA
TTGGTGTCAAAGACCAAAGCGTTTTCCCTGAAATCAGGTTTGATGCGATAGGGAAAGCAA
GAGGAATGGATGTATGCATAAGCACAACGGCAAAAACAGATGACGAAGGACAGAGACTGC
TGGCTCTGATGGGAATGCCTTTCAGGGAAGGAAGCAGCGCCAACACAGGAGGGGCGATAG
TGAGGAAGAAGAAACTTAAGTCTCATCATTTTGATGCTAAAAGCAAAGGCAAGGGAAAGA
GATGAATGAAAGAAAGATGATTTTCATTTGTATTTGTCTTCATGTA*****TGTTGATGG
ATTAATCTTTTGCTGCCCATGTTATATTACTCCTCCCTTGTGATAGTGTTTGTTAATCCT
CTCTGATAAAACAAATCCAATTTGGAAGAGTCAATTGATTCTT

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 13

CO CL363Contig1 829 13 35 U
ATTTTCTGGATAGAGAAGAAATGACCTCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCAC
CAAGTGAGCAAAGGAAAAGCAGAAGTTATGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCCA
TTAACTTGAGAAGCAAACAAAAGGTTTCTGATCACGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTT
CTTGTGGTAGAAGAGACGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACG
TTTCAGCATTTGCCGAAACAAGTTCTTGCGAATTCTCTGTGTCTCCTTCTGGTCTTGCCT
TCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGTCCAGCAGCTGTTAAAGGGCAGCTAATCAAGGCAC
ATTATGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTTGATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGC
CTCTAACTTTCCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATTAAAGGTTGGGACCAGGGAATCATTG
GCTCTGATGGAGTTCCTGCTATGCTTACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAG
AACTCGCGTATGGTGATCGAGGCGCAGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAG
CTTCGGTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAGAGAGCTTTTTGCTTT
TCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTTGAAAATATACTCTATTTGTAATCAAGTGA
ATATTTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTGTTTCGTTCATATAAATTTACAAACACGTACAAT
CACAAGTGAGATGTTTCGGATCTATAATGATAAATTGTTTAAGGGTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 40 40 40 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 10 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 55 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 40 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 40 40 40 40 40 40 35 35 35 5 5 5 5 5 5 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2D378TF U 11
AF RR2GB40TF U 15
AF RR2A111TF U 10
AF RR2CI76TF U 4
AF RR2AA93TF U 6
AF RR2GB40JQ C 1
AF RR2A111JQ C 10
AF RR2CI76JQ C 41
AF RR2H794TF U 10
AF RR2AA93JQ C 63
AF RR2H794JQB C 331
AF RR2CN45JQ C 97
AF RR2CN45TF U 97
BS 1 11 RR2GB40JQ
BS 12 73 RR2CI76TF
BS 74 74 RR2AA93TF
BS 75 77 RR2CI76TF
BS 78 78 RR2AA93TF
BS 79 87 RR2CI76TF
BS 88 88 RR2AA93TF
BS 89 118 RR2CI76TF
BS 119 119 RR2AA93TF
BS 120 146 RR2CI76TF
BS 147 147 RR2AA93TF
BS 148 154 RR2CI76TF
BS 155 155 RR2AA93TF
BS 156 196 RR2CI76TF
BS 197 197 RR2AA93TF
BS 198 268 RR2CI76TF
BS 269 269 RR2AA93TF
BS 270 328 RR2CI76TF
BS 329 329 RR2AA93TF
BS 330 364 RR2CI76TF
BS 365 365 RR2AA93TF
BS 366 508 RR2CI76TF
BS 509 509 RR2AA93TF
BS 510 518 RR2CI76TF
BS 519 519 RR2AA93TF
BS 520 535 RR2CI76TF
BS 536 536 RR2AA93TF
BS 537 691 RR2CI76TF
BS 692 692 RR2AA93TF
BS 693 709 RR2CI76TF
BS 710 738 RR2H794TF
BS 739 739 RR2CN45TF
BS 740 782 RR2H794TF
BS 783 806 RR2CN45TF
BS 807 829 RR2AA93JQ

RD RR2D378TF 376 0 0
GGAGAGAA
AAATGACCTCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAAAGGAAAA
GCAGAAGTTATGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAGAAGCAAAC
AAAAGGTTTCTGATCACGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGG*AGAAGAGACG
CAATTATTGGTTT*GGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTTGCCGAAA
CAAGTTCTTGCGAATTCTCTGTGTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGG*AGTTG
GATATGGTCCAGCAGCTGTTAAAGGGCAGCTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAA*TTGG
AGAATGGG

QA 9 376 9 376
DS 

RD RR2GB40TF 549 0 0
GAAGAAATGACCTCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAAAGG
AAAAGCAGAAGTTATGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAGAAGC
AAACAAAAGGTTTCTGATCACGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGAAGA
GACGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTTGCC
GAAACAAGTTCTTGCGAATTCTCTGTGTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTA
GTTGGATATGGTCCAGCAGCTGTTAAAGGGCAGCTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAG
TTGGAGAATGGGAAAGTCTTTGATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTTCCGT
ATAGGTGTTGGTGAGGTGATTAAAGGTTGGGACCAGGGAATCATTGGCTCTGATGGAGTT
CCTGCTATGCTTACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTATGGT
GATCGAGGC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2A111TF 636 0 0
GG
AGAGAAGAAATGACCTCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAA
AGGAAAAGCAGAAGTTATGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAGA
AGCAAACAAAAGGTTTCTGATCACGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGA
AGAGACGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTT
GCCGAAACAAGTTCTTGCGAATTCTCTGTGTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAG
GTAGTTGGATATGGTCCAGCAGCTGTTAAAGGACAGCTAATCAAGGCACATTATGTGGGG
AAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTTGATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTTC
CGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATTAAAGGTTGGGACCAGGGAATCATTGGCTCTGATGGA
GTTCCTGCTATGCTTACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTAT
GGTGATCGAGGCGCAGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTT
CTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAG

QA 3 636 3 636
DS 

RD RR2CI76TF 706 0 0
GGCTGGAT
AGAGAAGAAATGACCTCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAA
AGAAAAGGCAGAAGTTTTGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCAATTAACTTGAGA
AGCAAACAAAAGGTTCCTGATCATGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGA
AGAGAAGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTT
GCCGAAACAAGTTCTTGTGAATTCTCTGTGTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAG
GTAGTTGGATATGGTCCCGCAGCTGTTAAAGGGCAGCTAATCAAGGCACATTACGTGGGG
AAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTTGATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTTC
CGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATTAAAGGTTGGGACCAGGGAATCATTGGCTCTGATGGA
GTTCCTGCTATGCTTACCGGAGGGAAATGGACATTAAAGATTCCCCCAGAACTCGCGTAT
GGTGATCGAGGCGCAGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTT
CTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAGAGAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTCTTT
GCTGAGCCACCATCTTCTTT*AAAATATACTCTATTTG

QA 9 706 9 706
DS 

RD RR2AA93TF 703 0 0
CTGGAT
AGAGAAGAAATGACCTCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAA
AGGAAAAGCAGAAGTTATGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAGA
AGCAAACAAAAGGTTTCTGATCACGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGA
AGAGACGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTT
GCCGAAACAAGTTCTTGCGAATTCTCTGTGTCACCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAG
GTAGTTGGATATGGTCCAGCAGCTGTTAAAGGGCAGCTAATCAAGGCACATTATGTGGGG
AAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTTGATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTTC
CGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATTAAAGGTTGGGACCAGGGAATCATTGGCTCTGATGGA
GTTCCTGCTATGCTTACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTAT
GGTGATCGAGGCGCAGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTT
CTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAGAGAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTCTTT
GCTGAGCCACCATCTTCTTTGAAAATATACTCTATTT

QA 7 703 7 703
DS 

RD RR2GB40JQ 740 0 0
ATTTTCTGGATAGAGAAGAAATGACCTCTTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCAC
CAAGTGAGCAAAGGAAAAGCAGAAGTTATGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCCA
TTAACTTGAGAAGCAAACAAAAGGTTTCTGATCACGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTT
CTTGTGGTAGAAGAGACGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACG
TTTCAGCATTTGCCGAAACAAGTTCTTGCGAATTCTCTGTGTCTCCTTCTGGTCTTGCCT
TCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGTCCAGCAGCTGTTAAAGGGCAGCTAATCAAGGCAC
ATTATGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTTGATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGC
CTCTAACTTTCCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATTAAAGGTTGGGACCAGGGAATCATTG
GCTCTGATGGAGTTCCTGCTATGCTTACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAG
AACTCGCGTATGGTGATCGAGGCGCAGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAG
CTTCGGTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAGAGAGCTTTTTGCTTT
TCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTTGAAAATATACTCTATTTGTAATCAAGTGA
ATATTTTCTGGCTCTTTT
CC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2A111JQ 746 0 0
GG
AGAGAAGAAATGACCTCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAA
AGGAAAAGCAGAAGTTATGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAGA
AGCAAACAAAAGGTTTCTGATCACGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGA
AGAGACGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTT
GCCGAAACAAGTTCTTGCGAATTCTCTGTGTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAG
GTAGTTGGATATGGTCCAGCAGCTGTTAAAGGACAGCTAATCAAGGCACATTATGTGGGG
AAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTTGATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTTC
CGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATTAAAGGTTGGGACCAGGGAATCATTGGCTCTGATGGA
GTTCCTGCTATGCTTACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTAT
GGTGATCGAGGCGCAGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTT
CTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAGAGAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTCTTT
GCTGAGCCACCATCTTCTTTGAAAATATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGG
CTCTTTTTCAAACTTGTTTCGT
CC

QA 3 744 3 744
DS 

RD RR2CI76JQ 719 0 0
TGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAAAGAAAAGGCAGAAGTTTTGTGAGCAGTAG
CTTAACCAAAGCAGATGCAATTAACTTGAGAAGCAAACAAAAGGTTCCTGATCATGAGTT
AAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGAAGAGAAGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTG
TATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTTGCCGAAACAAGTTCTTGTGAATTCTCTGT
GTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGTCCCGCAGCTGTTAA
AGGGCAGCTAATCAAGGCACATTACGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTTGATAG
TAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTTCCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATTAAAGG
TTGGGACCAGGGAATCATTGGCTCTGATGGAGTTCCTGCTATGCTTACCGGAGGGAAATG
GACATTAAAGATTCCCCCAGAACTCGCGTATGGTGATCGAGGCGCAGGTTGCAAAGGAGG
CTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGC
TTGAGAGAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTTAAAAATATA
CTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTGTTTCGTTCATAT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2H794TF 773 0 0
GG
AGAGAAGAAATGACCTCCCTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAA
AGGAAAAGCAGAAGTTATGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAGA
AGCAAACAAAAGGTTTCTGATCACGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGA
AGAGACGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTT
GCCGAAACAAGTTCTTGCGAATTCTCTGTGTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAG
GTAGTTGGATATGGTCCAGCAGCTGTTAAAGGGCAGCTAATCAAGGCACATTATGTGGGG
AAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTTGATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTTC
CGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATTAAAGGTTGGGACCAGGGAATCATTGGCTCTGATGGA
GTTCCTGCTATGCTTACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTAT
GGTGGTCGAGGCGCGGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTT
CTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAGAGAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTCTTT
GCTGAGCCACCATCTTCTTTGAAA*TATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGG
CTCTTTT*CAAACTTGTTTCGTTCATATAAATTTACAAACACGTACAATCA

QA 3 773 3 773
DS 

RD RR2AA93JQ 767 0 0
AGTGAGCAAAGGAAAAGCAGAAGTTATGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCCATT
AACTTGAGAAGCAAACAAAAGGTTTCTGATCACGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCT
TGTGGTAGAAGAGACGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACGTT
TCAGCATTTGCCGAAACAAGTTCTTGCGAATTCTCTGTGTCACCTTCTGGTCTTGCCTTC
TGTGATAAGGTAGTTGGATATGGTCCAGCAGCTGTTAAAGGGCAGCTAATCAAGGCACAT
TATGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTTGATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCT
CTAACTTTCCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATTAAAGGTTGGGACCAGGGAATCATTGGC
TTTGATGGAGTTCCTGCTATGCTTACTGGAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAA
CTCGCGTATGGTGATCGAGGCGCAGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCT
TCGGTTTTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAGAGAGCTTTTTGCTTTTC
TTTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTTGAAAATATACTCTATTTGTAATCAAGTGAAT
ATTTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTGTTTCGTTCATATAAATTTACAAACACGTACAATCA
CAAGTGAGATGTTTCGGATCTATAATGATAAATTGTTTAAGGGTAAG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2H794JQB 453 0 0
CAGCTGTTAAAGGGCAGCTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAG
TCTTTGATAGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTTCCGTATAGGTGTTGGTGAGG
TGATTAAAGGTTGGGACCAGGGAATCATTGGTTCTGATGGAGTCCCTGCTATGCTTACTG
GAGGGAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTATGGTGGTCGAGGCGCGGGTT
GCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCA
TAGGTAAAGCTTGAGAGAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTT
TGAAAATATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTGTTT
CGTTCATATAAATTTACAAACACGTACAATCA
C

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2CN45JQ 730 0 0
GG
AGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAGAAGCAAACAAAAGGTTTCTGATCATGAG
TTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGAAGAGAAGCAATTATTGGTTTTGGTGTC
TGTATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTTGCCGAAACAAGTTCTTGTGAATTCTCT
GTGTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGCCCTGCAGCTGTT
AAAGGGCAGCTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTTGAT
AGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTTCCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATTAAG
GGTTGGGACCAGGGAATCATTGGCTCTGATGGAGTTCCTGCTATGCTTACTGGGGGGAAA
CGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTATGGTGATCGAGGCGCAGGTTGCAAAGGA
GGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAA
GCTTGAGAGAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTTGAAAATA
TACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTGTTTCGCTCATA
TAAA*******ACACGTACAACCACAAGTGAGATGTTTCGGATCTATAATGATAAATTGT
TTAAGGGT

QA 3 730 3 730
DS 

RD RR2CN45TF 713 0 0
GG
AGCTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAGAAGCAAACAAAAGGTTTCTGATCATGAG
TTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGAAGAGAAGCAATTATTGGTTTTGGTGTC
TGTATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTTGCCGAAACAAGTTCTTGTGAATTCTCT
GTGTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGCCCTGCAGCTGTT
AAAGGGCAGCTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTTGAT
AGTAGCTATAATCGGGGAAAGCCTCTAACTTTCCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATTAAG
GGTTGGGACCAGGGAATCATTGGCTCTGATGGAGTTCCTGCTATGCTTACTGGGGGGAAA
CGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTATGGTGATCGAGGCGCAGGTTGCAAAGGA
GGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAA
GCTTGAGAGAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTTGAAA*TA
TACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTCAA*CTTGTTTCGCTCATA
TAAA********CACGTACAACCACAAGTGAGATGTTTCGGATCTATA
TGA

QA 3 710 3 710
DS 



AS 1 12

CO CL364Contig1 844 12 22 U
AGACAAACAGCTCATGATCATTCTTATTTCTTGAAAGTCTTGACTTGTGAATAGGTCAAG
ATGGTAAAACTAAAACAACATTGGTTGACAAGTTATGAGGGGCAGAATCATACAAACTCA
CTTTTACATAAAACAAATGGGGTACAAAGAAACAGAGAGTTGTGAAATGATCTTTTGCTT
AAAAGATGATAGCCCAAACGGGGAAGACGACGAGAGCAATGATCCCAAGGGTGTTGGAGA
TGCCATTAGCTTTAGTGAATGCGTTTTTGAATCCACCAGAAGCTCTAATGTGTTCTTGAA
GCAAGTAACCTCCAATCCCTAAGCATATAAGTAAGCCGACCCAGTTGTCTCTGAATGTGT
AGGCTATTAGATTCGGAGCCACCACGATGAGTAGGACCGCAGCAGCCGGTAACTCAAACC
ATTCTCGGAAGTGTTTAGGGAAGAAGAGTTGTAGAACAACAGCTACAATCGCAATCCATT
TACCAACTTCTCCTCTGAAAAGGCTAAAGATGACAGAAGGAAGGCTGAAGAAGATGTAAG
GAATCAAAAGTGATGTGAGCATATTGGTCTTCCAGTTAGTTCGGTCCAAGACCAACAAGT
ATATGGCTGCGACTGAAGCAACCCACTCGAGGATGGAAGTACCAAAGCCTAAACCGGTGA
GCATGAAAGTGTGATTAGCAAGGTTCTTAGCAGCGGTGGCGAGCTCGTTGAGATCTGTTC
CAAGCATGTTTTGAAGGGTTCCCTGGTCACTCCTCCTCATCGCCGTGAAAGTCATTTACT
TCGCCGGAGGAAGAGAAAAAGTTAGCAACTTTGAAAATTCGAGGGTAGAGAGAGATGATT
GTCC


BQ
10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 20 40 40 40 40 40 
40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 30 45 45 45 5 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 30 30 55 55 55 55 55 15 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 35 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 40 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 50 65 65 50 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 

AF RR2H608JQB U 1
AF RR2ER14JQ U 223
AF RR2GS87JQB U 1
AF RR2AX48JQ U 1
AF RR2DN20JQ U 2
AF RR2CV21JQ U 4
AF RR2FA84TF C 38
AF RR2FM46TF C 144
AF RR2FM46JQ U 109
AF RR2CV21TF C 88
AF RR2DN20TF C 436
AF RR2GS87TF C 180
BS 1 96 RR2AX48JQ
BS 97 97 RR2GS87JQB
BS 98 103 RR2AX48JQ
BS 104 104 RR2GS87JQB
BS 105 150 RR2AX48JQ
BS 151 152 RR2GS87JQB
BS 153 215 RR2AX48JQ
BS 216 216 RR2GS87JQB
BS 217 330 RR2AX48JQ
BS 331 331 RR2GS87JQB
BS 332 333 RR2AX48JQ
BS 334 334 RR2GS87JQB
BS 335 337 RR2AX48JQ
BS 338 338 RR2GS87JQB
BS 339 621 RR2AX48JQ
BS 622 622 RR2DN20JQ
BS 623 685 RR2AX48JQ
BS 686 686 RR2DN20JQ
BS 687 760 RR2AX48JQ
BS 761 777 RR2DN20JQ
BS 778 778 RR2CV21JQ
BS 779 844 RR2FM46JQ

RD RR2H608JQB 205 0 0
G
GACAAACAGCTCATGATCATTCTTATTTCTTGAAAGTCTTGACTTGTGAATAGGTCAAGA
TGGTAAAACTAAAACAACATTGGTTGACAAGTTATTAGGGGCGGAATCATACAAACTCAC
TTTTACATAAAACAAATGGGGTACAAAGA**CAGAGAGTTGTGAAATGATCTTTTGCTTA
AAAGATGATAGCCCAAACGGGGAA

QA 2 205 2 205
DS 

RD RR2ER14JQ 307 0 0
TCCCAAGGGTGTTGGAAATGCCATTAGCTTTAGTGAATGCGTTTTTGAATCCACCAAAAG
CTCTAATGTGTTCTTGAAGCAAGTAACCTCCAATCCCTAAGCATATAAATAGGCCAACCC
AGTTGTCTCTGAATGTGTAGGCTATTAAATTCGGAGCCACCACGATGAGTAGGACCGCAG
CAGCCGGTAACTCAAACCATTCTCGGAAGTGTTTAGGGAAAAAAAGTTGTAGAACAACAG
CTACAATCGCAATCCATTTACCAACTTCTCCTCTGAAAAGGCTAAAGATGACAGAAGGAA
GGCTGAA

QA 1 307 1 307
DS 

RD RR2GS87JQB 610 0 0
G
GACAAACAGCTCATGATCATTCTTATTTCTTGAAAGTCTTGACTTGTGAATAGGTCAAGA
TGGTAAAACTAAAACAACATTGGTTGACAAGTTATGAGGGGCAGAATCATACAAACTCAC
TTTTACATAAAACAAATGGGGTACAAAGAAACAGAGAGTTGTGAAATGATCTTTTGCTTA
AAAGATGATAGCCCAAACGGGGTAGACGACGAGAGCAATGATCCCAAGGGTGTTGGAGAT
GCCATTAGCTTTAGTGAATGCGTTTTTGAATCCACCAGAAGCTCTAATGTGTTCTTGAAG
CAAGTAACCTCCAATCCCTAAGCATATAAGTAAGCCGACCCAGTTGTCTCTGAATGTGTA
GGCTATTAGATTCGGAGCCACCCCGATGAGTAGGACCGCAGCAACCGGTAACTCAAACCA
TTCTCGGAAGTGTTTAGGGAAGAAGAGTTGTAGAACAACAGCTACAATCGCAATCCATTT
ACCAACTTCTCCTCTGAAAAGGCTAAAGATGACAGAAGGAAGGCTGAAGAAGATGTAAGG
AATCAAAAGTGATGTGAGCATATTGGTCTTCCAGTTAGTTCGGTCCAAGACCAACAAGTA
TATGGCTGC

QA 2 610 2 610
DS 

RD RR2AX48JQ 760 0 0
AGACAAACAGCTCATGATCATTCTTATTTCTTGAAAGTCTTGACTTGTGAATAGGTCAAG
ATGGTAAAACTAAAACAACATTGGTTGACAAGTTATTAGGGGCGGAATCATACAAACTCA
CTTTTACATAAAACAAATGGGGTACAAAGA**CAGAGAGTTGTGAAATGATCTTTTGCTT
AAAAGATGATAGCCCAAACGGGGAAGACGACGAGAACAATGATCCCAAGGGTGTTGGAGA
TGCCATTAGCTTTAGTGAATGCGTTTTTGAATCCACCAGAAGCTCTAATGTGTTCTTGAA
GCAAGTAACCTCCAATCCCTAAGCATATAAATAGGCCAACCCAGTTGTCTCTGAATGTGT
AGGCTATTAGATTCGGAGCCACCACGATGAGTAGGACCGCAGCAGCCGGTAACTCAAACC
ATTCTCGGAAGTGTTTAGGGAAGAAGAGTTGTAGAACAACAGCTACAATCGCAATCCATT
TACCAACTTCTCCTCTGAAAAGGCTAAAGATGACAGAAGGAAGGCTGAAGAAGATGTAAG
GAATCAAAAGTGATGTGAGCATATTGGTCTTCCAGTTAGTTCGGTCCAAGACCAACAAGT
ATATGGCTGCGACTGAAGCAATCCACTCGAGGATGGAAGTACCAAAGCCTAAACCGGTGA
GCATGAAAGTGTGATTAGCAAGGTTATTAGCAGCGGTGGCGAGCTCGTTGAGATCTGTTC
CAAGCATGTTTTGAAGGGTTCCCTGGTCACTCCTCCTCAT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2DN20JQ 776 0 0
GACAAACAGCTCATGATCATTCTTATTTCTTGAAAGTCTTGACTTGTGAATAGGTCAAGA
TGGTAAAACTAAAACAACATTGGTTGACAAGTTATGAGGGGCAGAATCATACAAACTCAC
TTTTACATAAAACAAATGGGGTACAAAGAAACAGAGAGTTGTGAAATGATCTTTTGCTTA
AAAGATGATAGCCCAAACGGGGTAGACGACGAGAGCAATGATCCCAAGGGTGTTGGAGAT
GCCATTAGCTTTAGTGAATGCGTTTTTGAATCCACCAGAAGCTCTAATGTGTTCTTGAAG
CAAGTAACCTCCAATCCCTAAGCATATAAGTAAGCCGACCCAGTTGTCTCTGAATGTGTA
GGCTATTAGATTCGGAGCCACCACGATGAGTAGGACCGCAACAGCCGGTAACTCAAACCA
TTCTCGGAAGTGTTTAGGGAAGAAGAGTTGTAGAACAACAGCTACAATCGCAATCCATTT
ACCAACTTCTCCTCTGAAAAGGCTAAAGATGACAGAAGGAAGGCTGAAGAAGATGTAAGG
AATCAAAAGTGATGTGAGCATATTGGTCTTCCAGTTAGTTCGGTCCAAGACCAACAAGTA
TATGGCTGCGACTGAAGCAACCCACTCGAGGATGGAAGTACCAAAGCCTAAACCGGTGAG
CATGAAAGTGTGATTAGCAAGGTTCTTAGCAGCGGTGGCGAGCTCGTTGAGATCTGTTCC
AAGCATGTTTTGAAGG*TTCCCTGGTCACTCCTCCTCATCGCCGTGAAAGTCATTT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2CV21JQ 775 0 0
CT
AACAGCTCATGATCATTCTTATTTCTTGAAAGTCTTGACTTGTGAATAGGTCAAGATGGT
AAAACTAAAACAACATTGGTTGACAAGTTATGAGGGGCAGAATCATACAAACTCACTTTT
ACATAAAACAAATGGGGTACAAAGAAACAGAGAGTTGTGAAATGATCTTTTGCTTAAAAG
ATGATAGCCCAAACGGGGTAGACGACGAGAGCAATGATCTCAAGGGTGTTGGAGATGCCA
TTAGCTTTAGTGAATGCGTTTTTGAATCCACCAGAAGCTCTAATGTGTTCTTGAAGCAAG
TAACCTCCAATCCCTAAGCATATAAGTAAGCCGACCCAGTTGTCTCTGAATGTGTAGGCT
ATTAGATTCGGAGCCACCACGATGAGTAGGACCGCAGCAGCCGGTAACTCAAACCATTCT
CGGAAGTGTTTAGGGAAGAAGAGTTGTAGAACAACAGCTACAATCGCAATCCATTTACCA
ACTTCTCCTCTGAAAAGGCTAAAGATGACAGAAGGAAGGCTGAAGAAGATGTAAGGAATC
AAAAGTGATGTGAGCATATTGGTCTTCCAGTTAGTTCGGTCCAAGACCAACAAGTATATG
GCTGCGACTGAAGCAACCCACTCGAGGATGGAAGTACCAAAGCCTAAACCGGTGAGCATG
AAAGTGTGATTAGCAAGGTTCTTAGCAGCGGTGGCGAGCTCGTTGAGATCTGTTCCAAGC
ATGTTTTGAAGG*TTCCCTGGTCACTCCTCCTCATCGCCGTGAAAGTCATTTA

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR2FA84TF 807 0 0
TCTTGACTTGTGAACAG*TCAAGAGGGTAAAACTAAA*CAACATTGGT*GACAAGTTATG
AGTGGCGGAATCATACAAACTCACTTTTACATAAA*CAAATGGGGTACAAAGAAACAGAG
**TTGTGAAATGATCTTTTGCTTAAAAGATGATAGCCCAAACGGGGAAGACGACGAGAGC
AATGATCCCAAGGGTGTTGGAGATGCCATTAGCTTTAGTGAATGCGTTTTTGAATCCACC
AGAAGCTCTAATGTGTTCTTGAAGCAAGTAACCTCCAATCCCTAAGCATATAAGTAAGCC
GACCCAGTTGTCTCTGAATGTGTAGGCTATTAGATTCAGAGCCACCACGATGAGTAGGAC
CGCAGCAGCCGGTAACTCAAACCATTCTCGGAAGTGTTTAGGGAAGAAGAGTTGTAGAAC
AACAGCTACAATCGCAATCCATTTACCAACTTCTCCTCTGAAAAGGCTAAAGATGACAGA
AGGAAGGCTGAAGAAGATGTAAGGAATCAAAAGTGATGTGAGCATATTGGTCTTCCAGTT
AGTTCGGTCCAAGACCAACAAGTATATGGCTGCGACTGAAGCAACCCACTCGAGGATGGA
AGTACCAAAGCCTAAACCGGTGAGCATGAAAGTGTGATTAGCAAGGTTCTTAGCAGCGGT
GGCGAGCTCGTTGAGATCTGTTCCAAGCATGTTTTGAAGGGTTCCCTGGTCACTCCTCCT
CATCGCCGTGAAAGTCATTTACTTCGCCGGAGGAAGAGAAAAAGTTAGCAACTTTGAAAA
TTCGAGGGTAGAGAGAGATGATTGTCC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2FM46TF 701 0 0
ACAAAGAAACAGAG**TTGTGAAATGATCTTTTGCTTAAAAGATGATAGCCCAAACGGGG
AAGACGACGAGAGCAATGATCCCAAGGGTGTTGGAGATGCCATTAGCTTTAGTGAATGCG
TTTTTGAATCCACCAGAAGCTCTAATGTGTTCTTGAAGCAAGTAACCTCCAATCCCTAAG
CATATAAGTAAGCCGACCCAGTTGTCTCTGAATGTGTAGGCTATTAGATTCGGAGCCACC
ACGATGAGTAGGACCGCAGCAGCCGGTAACTCAAACCATTCTCGGAAGTGTTTAGGGAAG
AAGAGTTGTAGAACAACAGCTACAATCGCAATCCATTTACCAACTTCTCCTCTGAAAAGG
CTAAAGATGACAGAAGGAAGGCTGAAGAAGATGTAAGGAATCAAAAGTGATGTGAGCATA
TTGGTCTTCCAGTTAGTACGGTCCAAGACCAACAAGTATATGGCTGCGACTGAAGCAACC
CACTAGAGGATGGAAGTACCAAAGCCTAAACCGGTGAGCATGAAAGTGTGATTAGCAAGG
TTCTTAGCAGCGGTGGCGAGCTCGTTGAGATCTGTTCCAAGCATGTTTTGAAGGGTTCCC
TGGTCACTCCTCCTCATCGCCGTGAAAGTCATTTACTTCGCCGGAGGAAGAGAAAAAGTT
AGCAACTTTGAAAATTCGAGGGTAGAGAGAGATGATTGTCC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2FM46JQ 736 0 0
CATACAAACTCACTTTTACATAAAACAAATGGGGTACAAAGAAACAGAG**TTGTGAAAT
GATCTTTTGCTTAAAAGATGATAGCCCAAACGGGGAAGACGACGAGAGCAATGATCCCAA
GGGTGTTGGAGATGCCATTAGCTTTAGTGAATGCGTTTTTGAATCCACCAAAAGCTCTAA
TGTGTTCTTGAAGCAAGTAACCTCCAATCCCTAAGCATATAAGTAAGCCGACCCAGTTGT
CTCTGAATGTGTAGGCTATTAAATTCGGAGCCACCACGATGAGTAGGACCGCAGCAGCCG
GTAACTCAAACCATTCTCGGAAGTGTTTAGGGAAAAAAAGTTGTAAAACAACAGCTACAA
TCGCAATCCATTTACCAACTTCTCCTCTGAAAAGGCTAAAGATGACAGAAGGAAGGCTGA
AAAAAATGTAAGGAATCAAAAGTGATGTGAGCATATTGGTCTTCCAGTTAGTACGGTCCA
AGACCAACAAGTATATGGCTGCGACTGAAGCAACCCACTAGAGGATGGAAGTACCAAAGC
CTAAACCGGTGAGCATGAAAGTGTGATTAGCAAGGTTCTTAGCAGCGGTGGCGAGCTCGT
TGAGATCTGTTCCAAGCATGTTTTGAAGGGTTCCCTGGTCACTCCTCCTCATCGCCGTGA
AAGTCATTTACTTCGCCGGAGGAAGAGAAAAAGTTAGCAACTTTGAAAATTCGAGGGTAG
AGAGAGATGATTGTCC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2CV21TF 757 0 0
ACAAGTTATGAGGGGCAGAATCATACAAACTCACTTTTACATAAAACAAATGGGGTACAA
AGAAACAGAGAGTTGTGAAATGATCTTTTGCTTAAAAGATGATAGCCCAAACGGGGTAGA
CGACGAGAGCAATGATCTCAAGGGTGTTGGAGATGCCATTAGCTTTAGTGAATGCGTTTT
TGAATCCACCAGAAGCTCTAATGTGTTCTTGAAGCAAGTAACCTCCAATCCCTAAGCATA
TAAGTAAGCCGACCCAGTTGTCTCTGAATGTGTAGGCTATTAGATTCGGAGCCACCACGA
TGAGTAGGACCGCAGCAGCCGGTAACTCAAACCATTCTCGGAAGTGTTTAGGGAAGAAGA
GTTGTAGAACAACAGCTACAATCGCAATCCATTTACCAACTTCTCCTCTGAAAAGGCTAA
AGATGACAGAAGGAAGGCTGAAGAAGATGTAAGGAATCAAAAGTGATGTGAGCATATTGG
TCTTCCAGTTAGTTCGGTCCAAGACCAACAAGTATATGGCTGCGACTGAAGCAACCCACT
CGAGGATGGAAGTACCAAAGCCTAAACCGGTGAGCATGAAAGTGTGATTAGCAAGGTTCT
TAGCAGCGGTGGCGAGCTCGTTGAGATCTGTTCCAAGCATGTTTTGAAGGGTTCCCTGGT
CACTCCTCCTCATCGCCGTGAAAGTCATTTACTTCGCCGGAGGAAGAGAAAAAGTTAGCA
ACTTTGAAAATTCGAGGGTAGAGAGAGATGATTGTCC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2DN20TF 408 0 0
TTA
GGAAGAAGAGTTGTAGA*CAACAGCTACAATCGCAATCCATTTACAAA*TTCTC*TCTGA
AAAG*CTAAAGATGACAGAAGGAAGGCTGAAGAAGATGTAAG*AATCAAAAGTGATGTGA
GCATATTGGTCTTCCAGTTAGTTCGGTCCAAGACCAACAAGTATATGGCTGCGACTGAAG
CAACCCACTCGAGGATGGAAGTACCAAAGCCTAAACCGGTGAGCATGAAAGTGTGATTAG
CAAGGTTCTTAGCAGCGGTGGCGAGCTCGTTGAGATCTGTTCCAAGCATGTTTTGAAGGG
TTCCCTGGTCACTCCTCCTCATCGCCGTGAAAGTCATTTACTTCGCCGGAGGAAGAGAAA
AAGTTAGCAACTTTGAAAATTCGAGGGTAGAGAGAGATGATTGTC

QA 4 408 4 408
DS 

RD RR2GS87TF 665 0 0
TT
AAAGATGATAGCCCAAACGGGGTAGACGACGAGAGCAATGATCCCAAGGGTGTTGGAGAT
GCCATTAGCTTTAGTGAATGCGTTTTTGAATCCACCAGAAGCTCTAATGTGTTCTTGAAG
CAAGTAACCTCCAATCCCTAAGCATATAAGTAAGCCGACCCAGTTGTCTCTGAATGTGTA
GGCTATTAGATTCGGAGCCACCACGATGAGTAGGACCGCAGCAACCGGTAACTCAAACCA
TTCTCGGAAGTGTTTAGGGAAGAAGAGTTGTAGAACAACAGCTACAATCGCAATCCATTT
ACCAACTTCTCCTCTGAAAAGGCTAAAGATGACAGAAGGAAGGCTGAAGAAGATGTAAGG
AATCAAAAGTGATGTGAGCATATTGGTCTTCCAGTTAGTTCGGTCCAAGACCAACAAGTA
TATGGCTGCGACTGAAGCAACCCACTCGAGGATGGAAGTACCAAAGCCTAAACCGGTGAG
CATGAAAGTGTGATTAGCGAGGTTCTTAGCAGCGGTGGCGAGCTCGTTGAGATCTGTTCC
AAGCATGTTTTGAAGGGTTCCCTGGTCACTCCTCCTCATCGCCGTGAAGGTCATTTACTT
CGCCGGAGGAAGAGAAAAAGTTAGCAACTTTGAAAATTCGAGGGTAGAGAGAGATGATTG
TCC

QA 3 665 3 665
DS 



AS 1 8

CO CL365Contig1 1391 8 12 U
ATGGTTTATAATCAGTTTCTTGTGTATTGAATGTAATAACAGGATAAAACTTAAAATTCA
TAATCAGTTTTGTTCACATACACTCTCTCTTGCATAGAACATATATACGTTTATATGTAA
AGGACACCAAAAAACAAAAACTCTTATAATTTTCATAGCTCGAAACGTACAACAGTTTTG
ATTCCGATGGTGACCACATAGTTTACTACGTACTATCATCAATCACTGGTGGTAAGTGCC
ATTCTTTCTTTCTGAGCTTCTGATGGCAGCTTAACATCGGTTGCTAATCCAATGGCTTGG
AGGAATCTAACGACGTAC*AAGTCATATCAAATTGCCACCATTCAAGTCCATGTCGAGCA
GAGAACTCGAAAGCATGGTGATTGTTGTGCCATCCTTCTCCAAATGCTAGAGCTGCTACC
CACCAGTTGTTCTTAGACAAATCTCCAGTGTTCCAAGCTTGGTTTCCCCAAACGTGACAA
GCCGAGTTTACAAGCCACGTTATGTGATATACCCATACTATTCTTACACCCATTCCCCAA
ACGATGAAGGGGAAGCCACCCGTTGCGTAAAGAGCCACCGCCAGAGCAACCGGATGCCAA
ATGTAGGTGTTTTTAAGGAACTGATAGAACGACTGCTTCTCCAAGTCCCCAACATTATTA
GCCTCTCCAACCCTTTGCGTGATAGTATTGGTATCAAACATCCAATTCATGTGACTAAAC
CAAAACCCTTCAAGCGGGCTATGAGGATCTTTGTCTGAATCACAAAACTGATGATGGTAC
CTATGCGTACTCACCCAATCAATAGGGTGCCCCTGAAGAGCCTGAGCTCCACAATAAGCA
AACAAGTACTCAAGCCACTTGGGAAGCTTGAAGCTCCTATGAGTAAGATTCCTATGAAAA
GACAGAGTGATCCCCAGAAGACCCGTCACAATATAAAGCGCAAAAGCAACCGAAACAGCT
CTCCAGTTAAACTGAAACGGAGCCAAAAGGCTAAGCAGATGCATGGAGACAACCACAGCA
ACAGCGCCGAAATCCATCGAAGTCCACTCTCTCTCCCACCAAACCGCTTTGTCCTTCTTC
TGCTTCACCATCACATCCGAAAGCATTATCCTTCTGTAATCTCCCTCAGACTCCTCCGAC
GCTGAAGCAGCAGCGGCGGCGGCGACATCTCTCTTCGGACCCTTGAGTGCGTAGGAGGAG
ACGAGGAGGCTCGGGAGGGTGAAAGGAGCGAGCTTTTGGTTGTGGGTGAGTGAGATTCCG
GCGAGATTCAACGAGGGCGGTGCGGTTAGAGGTCGTGGAGGAGAGGAGAGGAAGAAAGGT
TTGGGCTTTGTTAAGGGAGAGGTCAGAAGAGACGCCATTGTTGTCGCCGAGAAGGAGAAG
GAGAGAGTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD30JQ U 1
AF RR2FD30TF C 1
AF RR2C184JQ U 403
AF RR2D190JQ U 38
AF RR2BY34JQ U 39
AF RR2C184TF C 818
AF RR2BY34TF C 731
AF RR2D190TF C 817
BS 1 362 RR2FD30JQ
BS 363 363 RR2BY34JQ
BS 364 407 RR2FD30JQ
BS 408 435 RR2D190JQ
BS 436 436 RR2BY34JQ
BS 437 801 RR2D190JQ
BS 802 1030 RR2BY34TF
BS 1031 1031 RR2D190TF
BS 1032 1081 RR2BY34TF
BS 1082 1084 RR2D190TF
BS 1085 1368 RR2BY34TF
BS 1369 1391 RR2D190TF

RD RR2FD30JQ 407 0 0
ATGGTTTATAATCAGTTTCTTGTGTATTGAATGTAATAACAGGATAAAACTTAAAATTCA
TAATCAGTTTTGTTCACATACACTCTCTCTTGCATAGAACATATATACGTTTATATGTAA
AGGACACCAAAAAACAAAAACTCTTATAATTTTCATAGCTCGAAACGTACAACAGTTTTG
ATTCCGATGGTGACCACATAGTTTACTACGTACTATCATCAATCACTGGTGGTAAGTGCC
ATTCTTTCTTTCTGAGCTTCTGATGGCAGCTTAACATCGGTTGCTAATCCAATGGCTTGG
AGGAATCTAACGACGTAC*AAGTCATATCAAATTGCCACCATTCAAGTCCATGTCGAGCA
GAAAACTCGAAAGCATGGTGATTGTTGTGCCATCCTTCTCCAAATGC

QA 1 407 1 407
DS 

RD RR2FD30TF 407 0 0
ATGGTTTATAATCAGTTTCTTGTGTATTGAATGTAATAACAGGATAAAACTTAAAATTCA
TAATCAGTTTTGTTCACATACACTCTCTCTTGCATAGAACATATATACGTTTATATGTAA
AGGACACCAAAAAACAAAAACTCTTATAATTTTCATAGCTCGAAACGTACAACAGTTTTG
ATTCCGATGGTGACCACATAGTTTACTACGTACTATCATCAATCACTGGTGGTAAGTGCC
ATTCTTTCTTTCTGAGCTTCTGATGGCAGCTTAACATCGGTTGCTAATCCAATGGCTTGG
AGGAATCTAACGACGTAC*AAGTCATATCAAATTGCCACCATTCAAGTCCATGTCGAGCA
GAGAACTCGAAAGCATGGTGATTGTTGTGCCATCCTTCTCCAAATGC

QA 1 407 1 407
DS 

RD RR2C184JQ 221 0 0
AATACTAA
AGCTGCTACCCACCAGTTGTTCTTAGACAAATCTCCAGTGTTCCAAGCTTGGTTTCCCCA
AACGTGACAAGCCGAGTTTACAAGCCACGTTATGTGATATACCCATACTATTCTTACCCC
CATTCCCCAAACGATGAAGGGGAAGCCACCCGTTGCGTAAAGAGCCACCGCCAGAGCAAC
CGGATGCCAAATGTAGGTGTTTTTAAGGAACTG

QA 9 221 9 221
DS 

RD RR2D190JQ 771 0 0
AA
CAGGATAAAACTTAAAATTCATAATCAGTTTTGTTCACATACACTCTCTCTTGCATAGAA
CATATATACGTTTATATGTAAAGGACACCAAAAAACAAAAACTCTTATAATTTTCATAGC
TCGAAACGTACAACAGTTTTGATTCCGATGGTGACCACATAGTTTACTACGTACTATCAT
CAATCACTGGTGGTAAGTGCCATTCTTTTTTTCTGAGCTTCTGATGGCAGCTTAACATCG
GTTGCTAATCCAATGGCTTGGAGGAATCTAACGACGTACCAAGTCATATCAAATTGCCAC
CATTCAAGTCCATGTCGAGCAGAAAACTCGAAAGCATGGTGATTGTTGTGCCATCCTTCT
CCAAATGCTAGAGCTGCTACCCACCAGTTGTTCTTAAACAAATCTCCAGTGTTCCAAGCT
TGGTTTCCCCAAACGTGACAAGCCGAGTTTACAAGCCACGTTATGTGATATACCCATACT
ATTCTTACACCCATTCCCCAAACGATGAAGGGGAAGCCACCCGTTGCGTAAAGAGCCACC
GCCAGAGCAACCGGATGCCAAATGTAGGTGTTTTTAAGGAACTGATAGAACGACTGCTTC
TCCAAGTCCCCAACATTATTAGCCTCTCCAACCCTTTGCGTGATAGTATTGGTATCAAAC
ATCCAATTCATGTGACTAAACCAAAACCCTTCAAGCGGGCTATGAGGATCTTTGTCTGAA
TCACAAAACTGATGATGGTACCTATGCGTACTCACCCAATCA
ATAGGGT

QA 3 764 3 764
DS 

RD RR2BY34JQ 763 0 0
G
CAGGATAAAACTTAAAATTCATAATCAGTTTTGTTCACATACACTCTCTCTTGCATAGAA
CATATATACGTTTATATGTAAAGGACACCAAAAAACAAAAACTCTTATAATTTTCATAGC
TCGAAACGTACAACAGTTTTGATTCCGATGGTGACCACATAGTTTACTACGTACTATCAT
CAATCACTGGTGGTAAGTGCCATTCTTTCTTTCTGAGCTTCTGATGGCAGCTTAACATCG
GTTGCTAATCCAATGGCTTGGAGGAATCTAACGACGTACCAAGTCATATCAAATTGCCAC
CATTCAAGTCCATGTCGAGCAGAGAACTCGAAAGCATGGTGATTGTTGTGCCATCCTTCT
CCAAATGCTAGAGCTGCTACCCACCAGTTGTTCTTAGACAAATCTCCAGTGTTCCAAGCT
TGGTTTCCCCAAACGTGACAAGCCGAGTTTACAAGCCACGTTATGTGATATACCCATACT
ATTCTTACACCCATTCTCCAAACGATGAAGGGGAAGCCACCCGTTGCGTAAAGAGCCACC
GCCAGAGCAACCGGATGCCAAATGTAGGTGTTTTTAAGGAACTGATAGAACGGCTGCTTC
TCCAAGTCCCCAACATTATTAGCCTCTCCAACCCTTTGCGTGATAGTATTGGTATCAAAC
ATCCAATTCATGTGACTAAACCAAAACCCTTCAAGCGGGCTATGAGGATCTTTGTCTGAA
TCACAAAACTGATGATGGTACCTATGCGTACTCACCCAATCA

QA 2 763 2 763
DS 

RD RR2C184TF 314 0 0
GAGCCTGAGCTCCACAATAAGCAAACAAGTACTCAAGCCACTTGG*AAGCTTGAAGCTCC
TATGAGTCAGATTCCTATGAAAAGACAGAGTGATCCCCAGAAGACCAGTCACAATATAAA
GCGCAAAAGCAACGGAAACAGCTCTCCAGTTAAAGTGAAACGGAGCCAAAAGGGTAAGCA
GATGCATGGAGACAACCACAGCAGCAGCGCCGAAATCCATTGAAGTCCACTCTCTCTCCC
ACCAAACCGCTTTGTCCTTCTTCTTCTTCACCATCACATCCGAAAGCATTATCCTTCTGT
AATCTCCCTCAGAC

QA 1 314 1 314
DS 

RD RR2BY34TF 640 0 0
CAAGCGGGCTATGAGGATCTTTGTCTGAATCACAAAACTGATGATGGTACCTATGCGTAC
TCACCCAATCAATAGGGTGCCCCTGAAGAGCCTGAGCTCCACAATAAGCAAACAAGTACT
CAAGCCACTTGGGAAGCTTGAAGCTCCTATGAGTAAGATTCCTATGAAAAGACAGAGTGA
TCCCCAGAAGACCCGTCACAATATAAAGCGCAAAAGCAACCGAAACAGCTCTCCAGTTAA
ACTGAAACGGAGCCAAAAGGCTAAGCAGATGCATGGAGACAACCACAGCAACAGCGCCGA
GATCCATCGAAGTCCACTCTCTCTCCCACCAAACCGCTTTGTCCTTCTTCT***TCACCA
TCACATCCGAAAGCATTATCCTTCTGTAATCTCCCTCAGACTCCTCCGACGCTGAAGCAG
CAGCGGCGGCGGCGACATCTCTCTTCGGACCCTTGAGTGCGTAGGAGGAGACGAGGAGGC
TCGGGAGGGTGAAAGGAGCGAGCTTTTGGTTGTGGGTGAGTGAGATTCCGGCGAGATTCA
ACGAGGGCGGTGCGGTTAGAGGTCGTGGAGGAGAGGAGAGGAAGAAAGGTTTGGGCTTTG
TTAAGGGAGAGGTCAGAAGAGACGCCATTGTTGTCGCC
CC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2D190TF 575 0 0
AGAGCATGAGCTCCACAATAAGCAAACAAGTACTCAAGCCACTTGGGAAGCTTGAAGCTC
CTATGAGTAAGATTCCTATGAAAAGACAGAGTGATCCCCAGAAGACCCGTCACAATATAA
AGCGCAAAAGCAACCGAAACAGCTCTCCAGTTAAACTGAAACGGAGCCAAAAGGCTAAGC
AGATGCATGGAGACAACCACAGTAACAGCGCCGAAATCCATCGAAGTCCACTCTCTCTCC
CACCAAACCGCTTTGTCCTTCTTCTGCTTCACCATCACATCCGAAAGCATTATCCTTCTG
TAATCTCCCTCAGACTCCTCCGACGCTGAAGCAGCAGCGGCGGCGGCGACATCTCTCTTC
GGACCCTTGAGTGCGTAGGAGGAGACGAGGAGGCTCGGGAGGGTGAAAGGAGCGAGCTTT
TGGTTGTGGGTGAGTGAGATTCCGGCGAGATTCAACGAGGGCGGTGCGGTTAGAGGTCGT
GGAGGAGAGGAGAGGAAGAAAGGTTTGGGCTTTGTTAAGGGAGAGGTCAGAAGAGACGCC
ATTGTTGTCGCCGAGAAGGAGAAGGAGAGAGTTCC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 12

CO CL366Contig1 758 12 5 U
ATCCAATATTTATTGTTTTCAACCAACTCTGTTATTCATTGAAATAGAAAAGTTTGCTCT
GTTTTT**TTTTGTCTTAAA*TCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCAC
ACACAAACGATACACAAACTAGCCAGGTCTAGAGGTTAGAACCTCCTTATTACATCACTC
TCTTCCTCGAATAGCAACAGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGACC
TCCTGCGTTTCCAGTAGCCAAGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTC
TGCGTGGACAACAACAGCCCTTCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCT
GTCAGTGATTGTGAAGGTGGCAGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCC
AGCATGACGATTAGCATCCTCTGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGG
ACCGGTGGACATGCAACCATTAGTGGTGTCACCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGGAG
ACCAGGCTTAAGGCCAGAAACAGTTCCAGTCACAGTGGTGGAACCGTTTCCTTCCTGGGT
GAAGAAGATGGTCCCCTTGACACCCTCGCTACTGTTCAACACTGCAACTCCCTTGCCCAT
AGTATGTATCCTTTGTGATCTCAGGGTACCCCTTTTGGAAATGAATGAAGATGAAATGCC
CTGGAACTGAATTAATGCTTAGCTTTGTGGTTGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 40 40 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 50 50 50 25 40 55 30 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 45 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H507JQB U 20
AF RR2DU71JQ U 20
AF RR2D805JQ U 20
AF RR2F333JQ U 20
AF RR2HA81JQ U 20
AF RR2GC68JQ U 1
AF RR2GC68TF C 3
AF RR2HA81TF C 64
AF RR2F333TF C 68
AF RR2H507TF C 90
AF RR2D805TF C 74
AF RR2FB28TF C 74
BS 1 71 RR2GC68JQ
BS 72 72 RR2DU71JQ
BS 73 717 RR2GC68JQ
BS 718 752 RR2HA81TF
BS 753 758 RR2D805TF

RD RR2H507JQB 172 0 0
CAACCAACTCTGTTATTCATTGAAATAAAAAAGTTTGCTCTGTTTTT**TTT*GTCTTAA
A*TCATATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACACAAAC
TAGCCAGGTCTAGAGGTTAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAA

QA 1 172 1 172
DS 

RD RR2DU71JQ 172 0 0
CAACCAACTCTGTTATTCATTGAAATAGAAAAGTTTGCTCTGTTTTT**TTTTGTCTTAA
A*TCATATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACACAAAC
TAGCCAGGTCTAGAGGTTAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAA

QA 1 172 1 172
DS 

RD RR2D805JQ 542 0 0
CAACCGACTCTGTTATTCATTGAAATAGAAAAGTTTTCTCTGTTTTTCTTTTTGTCTTAA
AATCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACACAAAC
TAGCCAGGTCTAGAGGTAAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAATAGCAACA
GCTTATCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGACCTCCTGCGTTTCCAGTAGCC
AAGCTGAATTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCC
CTTCCAACAATAAAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGATTGTGAAGGTG
GCAGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAAATCTCCAGCATGACGATTAGCATCC
TCCGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGGACATGCAACCA
TTAGTGGTGTCACCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCTTAAGGCCAGAA
AC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2F333JQ 588 0 0
CAACCAACTCTGTTATTCATTGAAATAGAAAAGTTTGCTCTGTTTTT**TTTTGTCTTAA
A*TCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACACAAAC
TAGCCAGGTCTAGAGGTTAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAATAGCAACA
GCTTAACCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGACCTCCTGCGTTTCCAGTAGCC
AAGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCTGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCC
CTTCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGATTGTGAAGGTG
GCAGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGACGATTAGCATCC
TCTGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGGACATGCAACCA
TTAGTGGTGTCACCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCTTAAGGCCAGAA
ACAGTTCCAGTCACAGTGGTGGAACCGTTTCCTTCCTGGGTGAAGAAG

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2HA81JQ 627 0 0
CG
ACCAACTCTGTTATTCATTGAAATAGAAAAGTTTGCTCTGTTTTT***TTTGTCTTAAA*
TCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACACAAACTA
GCCAGGTCTAGAGGTTAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAATAGCAACAGC
TTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGACCTCCTGCGTTTCCAGTAGCCAA
GCTGAGTTCATGGTCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCCT
TCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGATTGTGAAGGTGGC
AGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGACGATTAGCATCCTC
TGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGGACATGCAACCATT
AGTGGTGTCACCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCTTAAGGCCAGAAAC
AGTTCCAGTCACAGTGGTGGAGCCGTTTCCTTCCTGGGTGAAGAAGATGGTCCCCTTGAC
ACCCTCGCTACTGTTCAACACTGCA

QA 3 627 3 627
DS 

RD RR2GC68JQ 719 0 0
ATCCAATATTTATTGTTTTCAACCAACTCTGTTATTCATTGAAATAGAAAAGTTTGCTCT
GTTTTT**TTT*GTCTTAAA*TCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCAC
ACACAAACGATACACAAACTAGCCAGGTCTAGAGGTTAGAACCTCCTTATTACATCACTC
TCTTCCTCGAATAGCAACAGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGACC
TCCTGCGTTTCCAGTAGCCAAGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTC
TGCGTGGACAACAACAGCCCTTCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCT
GTCAGTGATTGTGAAGGTGGCAGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCC
AGCATGACGATTAGCATCCTCTGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGG
ACCGGTGGACATGCAACCATTAGTGGTGTCACCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGGAG
ACCAGGCTTAAGGCCAGAAACAGTTCCAGTCACAGTGGTGGAACCGTTTCCTTCCTGGGT
GAAGAAGATGGTCCCCTTGACACCCTCGCTACTGTTCAACACTGCAACTCCCTTGCCCAT
AGTATGTATCCTTTGTGATCTCAGGGTACCCCTTTTGGAAATGAATGAAGATGAAAT
CC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2GC68TF 717 0 0
ATCCAATATTTATG
TTTCAACCAACTCTGTTATTCAT*GAAATAGAAAAGTTTGCTCTGTTTTT****TTGTCT
TAAA*TCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACACA
AACTAGCCAGGTCTAGAGGTTAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAATAGCA
ACAGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGACCTCCTGCGTTTCCAGTA
GCCAAGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACA
GCCCTTCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGATTGTGAAG
GTGGCAGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGACGATTAGCA
TCCTCTGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGGACATGCAA
CCATTAGTGGTGTCACCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCTTAAGGCCA
GAAACAGTTCCAGTCACAGTGGTGGAACCGTTTCCTTCCTGGGTGAAGAAGATGGTCCCC
TTGACACCCTCGCTACTGTTCAACACTGCAACTCCCTTGCCCATAGTATGTATCCTTTGT
GATCTCAGGGTACCCCTTTTGGAAATGAATGAAGATGAAAT
CC

QA 15 715 15 715
DS 

RD RR2HA81TF 691 0 0
TTT**TTTTGTCTTAAA*TCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACA
CAAACGATACACAAACTAGCCAGGTCTAGAGGTTAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCT
TCCTCGAATAGCAACAGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGACCTCC
TGCGTTTCCAGTAGCCAAGCTGAGTTCATGGTCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGC
GTGGACAACAACAGCCCTTCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTC
AGTGATTGTGAAGGTGGCAGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGC
ATGACGATTAGCATCCTCTGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACC
GGTGGACATGCAACCATTAGTGGTGTCACCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGGAGACC
AGGCTTAAGGCCAGAAACAGTTCCAGTCACAGTGGTGGAGCCGTTTCCTTCCTGGGTGAA
GAAGATGGTCCCCTTGACACCCTCGCTACTGTTCAACACTGCAACTCCCTTGCCCATAGT
ATGTATCCTTTGTGATCTCAGGGTACCCCTTTTGGAAATGAATGAAGATGAAGTGCCCTG
GAACTGAATTAATGCTTAGCTTTGTGGTT
CC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2F333TF 690 0 0
TTTTTGTCTTAAA*TCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAA
CGATACACAAACTAGCCAGGTCTAGAGGTTAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCT
CGAATAGCAACAGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGACCTCCTGCG
TTTCCAGTAGCCAAGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCTGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGG
ACAACAACAGCCCTTCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTG
ATTGTGAAGGTGGCAGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGA
CGATTAGCATCCTCTGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTG
GACATGCAACCATTAGTGGTGTCACCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGC
TTAAGGCCAGAAACAGTTCCAGTCACAGTGGTGGAACCGTTTCCTTCCTGGGTGAAGAAG
ATGGTCCCCTTGACACCCTCGCTACTGTTCAACACTGCAACTCCCTTGCCCATAGTATGT
ATCCTTTGTGATCTCAGGGTACCCCTTTTGGAAATGAATGAAGATGAAATGCCCTGGAAC
TGAATTAATGCTTAGCTTTGTGGTT
GGTCC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2H507TF 665 0 0
ATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACACAAACTAGCCAGGTC
TAGAGGTTAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAATAGCAACAGCTTAGCCCT
GAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGACCTCCTGCGTTTCCAGTAGCCAAGCTGAGTT
CATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCCTTCCCACAA
CAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGATTGTGAAGGTGGCAGTTCCAT
CATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGACGATTAGCATCCTCTGGTGCAC
CGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGGACATGCAACCATTAGTGGTGT
CACCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGTTTAAGGCCAGAAACAGTTCCAG
TCACAGTGGTGGAACCGTTTCCTTCCTGGGTGCAGAAGATGGTCCCCTTGACACCCTCGC
TGCTGTTCAACACTGCAACTCCCTTGCCCATAGTATGTATCCTTTGTGATCTCAGGGTAC
CCCTTTTGGAAATGAATGAAGATGAAATGCC*TGGAACTGAATTAATGCTTAGCTTTGTG
GTT
CC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2D805TF 685 0 0
TCTTA
AAATCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACACAAA
CTAGCCAGGTCTAGAGGTAAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAATAGCAAC
AGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGACCTCGTGCGTTTCCAGTAGC
CAAGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGC
CCTTCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGATTGTGAAGGT
GGCAGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGACGATTAGCATC
CTCCGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGGACATGCAACC
ATTAGTGGTGTCACCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCTTAAGGCCAGA
AACAGTTCCAGTCACAGTGGTGGCACCGTTTCCTTCCTGGGTGAAGAAGATGGTCCCCTT
AACACCCTCGCTGCTGTTCAACACTGCAACTCCCTTGCCCATAGTATGTATCCTTTGTGA
TCTCAGGGTACCCCTTTTGGAAATGAATGAAGATGAAATGCCCTGGAACTGAATTAATGC
TTAGCTTTGTGGTTGGTTCC

QA 6 685 6 685
DS 

RD RR2FB28TF 684 0 0
TCTTA
AAATCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACACAAA
CTAGCCAGGTCTAGAGGTAAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAATAGCAAC
AGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGACCTCCTGCGTTTCCAGTAGC
CAAGCTGAGTTTATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCGTCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGC
CCTTCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGATTGTGAAGGT
GGCAGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGACGATTAGCATC
CTCCGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGGACATGCAACC
ATTAGTGGTGTCACCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCTTAAGGCCAGA
AACAGTTCCAGTCACAGTGGTGGCACCGTTTCCTTCCTGGGTGAAGAAGATGGTCCCCTT
AACACCCTCGCTGCTGTTCAACACTGCAACTCCCTTGCCCATAGTATGTATCCTTTGTGA
TCTCAGGGTACCCCTTTTGGAAATGAATGAAGATGAAATGCCCTGGAACTGAATTAATGC
TTAGCTTTGTGGTT
GGTCC

QA 6 679 6 679
DS 



AS 3 11

CO CL367Contig1 561 3 9 U
GGTTGGGTCAGACCTCCACAAGAGGATCCAGACTTTTATTAATATAATGATATTACAAAA
CTATTAAAGATAAGAAAGCTAAATCCAAATAAACAAGGGAAACATCCGTTGTCTATCTAT
TAACATTATTCAAGTACTGAAAATGAAAAAAACAACGAGAAATTATTTAGTAATAAAGGG
TCTCGCTGCTGTTGAAAGGGCCAGGTTCAGGGGCTTGTATACTTCAAGTTCCGGCCAACC
TTGTGAAGTCAATCGGTGGAATGTTTCTACCACCGATTGGGGTTGTAGCCTTGATTTTGT
CCTTGGAGTTTATCCCACCGGAAAAGTTATAACCTTCCCATCCGGCACCCTTGTGGCTGG
ACAATTCGAACCGTGTGGGTGTGCCGGAAATCAGTTTAATACGACCATACGTGGCTGCAG
GTGCATTCTTTTTTCCAGCTCTGTTTATAGTCCATTTCCACGTGAAGGTGACTCCTGCCC
CGTCGTGGAATCCGTGCGGAATATCAAGCCGGATCTTCTCGCCCTTTGGAGCATATTCGG
GGTGAGTGATCGTACCAGTGA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA36JQ U 5
AF RR2ED01JQ U 178
AF RR2EM28JQ U 1
BS 1 122 RR2EM28JQ
BS 123 123 RR2DA36JQ
BS 124 211 RR2EM28JQ
BS 212 212 RR2ED01JQ
BS 213 279 RR2EM28JQ
BS 280 280 RR2ED01JQ
BS 281 314 RR2EM28JQ
BS 315 315 RR2ED01JQ
BS 316 561 RR2EM28JQ

RD RR2DA36JQ 149 0 0
GGGTCAGACCTCCACAAGAGGATCCAGACTTTTATTAATATAATGATATTACAAAACTAT
TAAAGATAATAAAGCTAAATCCAAATAAACAAGGGAAACATCCGTTGTCTATCTATTAAC
ATTATTCAAGTACTGAAAATGAAAAAAA
A

QA 1 148 1 148
DS 

RD RR2ED01JQ 183 0 0
GGGTCCCC
CTGCTGTTGAAAGGGCCAGGTTCAGGGGCTTGTATACTTCAAGTTCCGGCCAACCTTGTG
AAGTCAATCTGTGGAATGTTTCTACCCCCGATTGGGGTTGTAGCCTTGATTTTGTCCTTG
GAGTTTATCCCACCGGAAAAGTTATAACCTTCCCATCCGGCACCCTTGTGGCTGG

QA 9 183 9 183
DS 

RD RR2EM28JQ 561 0 0
GGTTGGGTCAGACCTCCACAAGAGGATCCAGACTTTTATTAATATAATGATATTACAAAA
CTATTAAAGATAAGAAAGCTAAATCCAAATAAACAAGGGAAACATCCGTTGTCTATCTAT
TAGCATTATTCAAGTACTGAAAATGAAAAAAACAACGAGAAATTATTTAGTAATAAAGGG
TCTCGCTGCTGTTGAAAGGGCCAGGTTCAGGTGCTTGTATACTTCAAGTTCCGGCCAACC
TTGTGAAGTCAATCGGTGGAATGTTTCTACCACCGATTGTGGTTGTAGCCTTGATTTTGT
CCTTGGAGTTTATCTCACCGGAAAAGTTATAACCTTCCCATCCGGCACCCTTGTGGCTGG
ACAATTCGAACCGTGTGGGTGTGCCGGAAATCAGTTTAATACGACCATACGTGGCTGCAG
GTGCATTCTTTTTTCCAGCTCTGTTTATAGTCCATTTCCACGTGAAGGTGACTCCTGCCC
CGTCGTGGAATCCGTGCGGAATATCAAGCCGGATCTTCTCGCCCTTTGGAGCATATTCGG
GGTGAGTGATCGTACCAGTGA

QA 1 561 1 561
DS 



CO CL367Contig2 1020 4 19 U
GGACACATCATCCATTAACCTTCGCTCAACAGATATAAGCCATCATGCCTGAGTGGTTCA
CCCAACTCGAAGAGGTCGCGTACTCCGTAGTGGAATATATCCCACTAGTCGGCACCGTGT
ACTCTCTAAAACGAGCCACTATCGCATACAACGCGAGGGATTGGACGCGACATTGGCAGT
CCCTCGGCAACTTCCTCGAGAGCTCCGTTCGCGATGTCATTCTCTTGAAAGACATTGCCG
AACCCACCACAGTCGCCCTTATACACACCATGGCCGAGTCGTTGACCGACAAAATGATTG
AGATCTACCATCGCGAGCCCAAAAGGCCTGAGGTCAAAATCACCCAGAAGCTGGATAAAC
AACTCGGACATGTACTCATCGCTGAGTCCTCAAAGGGCAGGTCCAAGCGTGAAGTCTTCG
GCGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCACGGCGCTGTCTTCACTTGTACGCTCACTC
ACCCCGAATATGCTCCAAAGGGCGAGAAGATCCGGCTTGATATTCCGCACGGATTCCACG
ACGGGGCAGGAGTCACCTTCACGTGGAAATGGACTATAAACAGAGCTGGAAAAAAGAATG
CACCTGCAGCCACGTATGGTCGTATTAAACTGATCTCCGGCACACCCACACGGTTCGAAT
TGTCCAGCCACAAGGGTGCCGGATGGGAAGGTTATAACTTTTCCGGTGAGATAAACTCCA
AGGACAAAATCAAGGCTACAACCACAGTCGGTGGTAGAAACATTCCACCGATTGACTTCA
CAAGGTTGGCCGGAACTTGAAGTATACAAGCACCTGAACCTGGCCCTTTCAACAGCAGCG
AGACCCTCTACTACTAAATAATTTCTCGTTGTTTTTTCATTTTCAGTACTTGAATAATGC
TAATAGATAGACAACGGATTTTTCCTTTGTTTATTTGGATTATAAGCTTATTATCTTTAA
TATTTGTAATATTTTTATATTAATAAAAGTCTGGATCCTTTTGTGGGGTCTGACCCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB41TF U 48
AF RR2EM28TF U 1
AF RR2BZ34TF U 273
AF RR2BZ34JQ C 286
BS 1 237 RR2EM28TF
BS 238 238 RR2CB41TF
BS 239 312 RR2EM28TF
BS 313 313 RR2BZ34TF
BS 314 382 RR2EM28TF
BS 383 383 RR2BZ34TF
BS 384 452 RR2EM28TF
BS 453 453 RR2BZ34TF
BS 454 467 RR2EM28TF
BS 468 468 RR2BZ34TF
BS 469 473 RR2EM28TF
BS 474 474 RR2BZ34TF
BS 475 734 RR2EM28TF
BS 735 735 RR2BZ34TF
BS 736 746 RR2EM28TF
BS 747 747 RR2BZ34TF
BS 748 762 RR2EM28TF
BS 763 968 RR2BZ34TF
BS 969 1020 RR2BZ34JQ

RD RR2CB41TF 347 0 0
T
CTGAGTGGTTCACCCAACTCGAAGAGGTCGCGTACTCCGTAGTGGAATATATCCCACTAG
TCGGCACCGTGTACTCTCTAAAACGAGCCACTATCGCATACAACGCGAGGGGTTGGACGC
GACATTGGCAGTCCCTCGGCAACTTCCTCGAGAGCTCCGTTCGCGATGTCATTCTCTTGA
AAGACATTGCCGAACCCACCACAGTCGCCCTTATACACACCATGGCCGAGTCGTTGACCG
ACAAAATGATTGAGATCTACCATCACGAGCCCAAAAGGCCTGAGGTCAAAATCACCCAGA
AGCTGGATAAACAACTCGGACATGTACTCATCGCCGAGTCCTCAAA

QA 2 347 2 347
DS 

RD RR2EM28TF 762 0 0
GGACACATCATCCATTAACCTTCGCTCAACAGATATAAGCCATCATGCCTGAGTGGTTCA
CCCAACTCGAAGAGGTCGCGTACTCCGTAGTGGAATATATCCCACTAGTCGGCACCGTGT
ACTCTCTAAAACGAGCCACTATCGCATACAACGCGAGGGATTGGACGCGACATTGGCAGT
CCCTCGGCAACTTCCTCGAGAGCTCCGTTCGCGATGTCATTCTCTTGAAAGACATTGTCG
AACCCACCACAGTCGCCCTTATACACACCATGGCCGAGTCGTTGACCGACAAAATGATTG
AGATCTACCATCACGAGCCCAAAAGGCCTGAGGTCAAAATCACCCAGAAGCTGGATAAAC
AACTCGGACATGTACTCATCGCCGAGTCCTCAAAGGGCAGGTCCAAGCGTGAAGTCTTCG
GCGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCACAGCGCTGTCTTCACTGGTACGATCACTC
ACCCCGAATATGCTCCAAAGGGCGAGAAGATCCGGCTTGATATTCCGCACGGATTCCACG
ACGGGGCAGGAGTCACCTTCACGTGGAAATGGACTATAAACAGAGCTGGAAAAAAGAATG
CACCTGCAGCCACGTATGGTCGTATTAAACTGATCTCCGGCACACCCACACGGTTCGAAT
TGTCCAGCCACAAGGGTGCCGGATGGGAAGGTTATAACTTTTCCGGTGAGATAAACTCCA
AGGACAAAATCAAG*CTACAACCACAATCGGTGGTAGAAACA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2BZ34TF 701 0 0
GCCGAGTCGTTGACCGACAAAATGATTGAGATCTACCATCGCGAGCCCAAAAGGCCTGAG
GTCAAAATCACCCAGAAGCTGGATAAACAACTCGGACATGTACTCATCGCTGAGTCCTCA
AAGGGCAGGTCCAAGCGTGAAGTCTTCGGCGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCAC
GGCGCTGTCTTCACTTGTACGCTCACTCACCCCGAATATGCTCCAAAGGGCGAGAAGATC
CGGCTTGATATTCCGCACGGATTCCACGACGGGGCAGGAGTCACCTTCACGTGGAAATGG
ACTATAAACAGAGCTGGAAAAAAGAATGCACCTGCAGCCACGTATGGTCGTATTAAACTG
ATCTCCGGCACACCCACACGGTTCGAATTGTCCAGCCACAAGGGTGCCGGATGGGAAGGT
TATAACTTTTCCGGTGAGATAAACTCCAAGGACAAAATCAAGGCTACAACCACAGTCGGT
GGTAGAAACATTCCACCGATTGACTTCACAAGGTTGGCCGGAACTTGAAGTATACAAGCA
CCTGAACCTGGCCCTTTCAACAGCAGCGAGACCCTCTACTACTAAATAATTTCTCGTTGT
TTTTTCATTTTCAGTACTTGAATAATGCTAATAGATAGACAACGGATTTTTCCTTTGTTT
ATTTGGATTATAAGCTTATTATCTTTAATATTTGTA
TATTT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2BZ34JQ 735 0 0
CCGACAAAATGATTGAGATCTACCATCGCGAGCCCAAAAGGCCTGAGGTCAAAATCACCC
AGAAGCTGGATAAACAACTCGGACATGTACTCATCGCTGAGTCCTCAAAGGGCAGGTCCA
AGCGTGAAGTCTTCGGCGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCACGGCGCTGTCTTCA
CTTGTACGCTCACTCACCCCGAATATGCTCCAAAGGGCGAGAAGATCCGGCTTGATATTC
CGCACGGATTCCACGACGGGGCAGGAGTCACCTTCACGTGGAAATGGACTATAAACAGAG
CTGGAAAAAAGAATGCACCTGCAGCCACGTATGGTCGTATTAAACTGATTTCCGGCACAC
CCACACGGTTCGAATTGTCCAGCCACAAGGGTGCCGGATGGGAAGGTTATAACTTTTCCG
GTGAGATAAACTCCAAGGACAAAATCAAGGCTACAACCACAGTCGGTGGTAGAAACATTC
CACCGATTGACTTCACAAGGTTGGCCGGAACTTGAAGTATACAAGCACCTGAACCTGGCC
CTTTCAACAGCAGCGAGACCCTCTACTACTAAATAATTTCTCGTTGTTTTTTCATTTTCA
GTACTTGAATAATGCTAATAGATAGACAACGGATTTTTCCTTTGTTTATTTGGATTATAA
GCTTATTATCTTTAATATTTGTAATATTTTTATATTAATAAAAGTCTGGATCCTTTTGTG
GGGTCTGACCCAACC

QA 1 735 1 735
DS 



CO CL367Contig3 693 4 7 U
GGGTCAGACCCCACAAAAGGATCCAGACTTTTATTAATATAAAAATATTACAAATATTAA
AGATAATAAGCTTATAATCCAAATAAACAAAGGAAAAATCCGTTGTCTATCTATTAGCAT
TATTCAAGTACTGAAAATGAAAAAAACAACGAGAAATTATTTAGTAGTAGAGGTTCTCGC
TGCTGTTGAAAGGGCCAGGTTCAGGTGCTTGTATACTTCAAGTTCCGGCCAACCTTGTGA
AGTCAATCGGAGTTTTTGTACCACCGACTGTGGTTGTAGCTTTGATTTTGTCCTTGGAGA
TTACCTCACCCGAAAAGTCATAACCTGCCACTCCGGCACCCTTGAGGTTGTACAATTCGA
ACTTTGTGGGTGTGCCGGAGATCAGTTTAATACGACCATACGAGGCTTCAGGTACATTCT
TTTTTCCATAGTAGTTTGTAGTCCATTTACACGTGAAGGTGACTCGTGCCCCGTCGTGCA
ATCCGTGCGGAATATCAAGCCGGATCTTCTCGCCCCTTGGAGCATATTGGGGGTGAGTGA
GCGTACCAGTGAAGACAGCGCCGTGAAAGTGGTGCACACCCTTGGCTTTGCCGCCGAAGA
CTTCACGCTTGGACCTGCCCTTTGAGGACTCGGCGATGAGTACATGTCCGAGTTGTTTAT
CCAGCTTCTGGGTGATTTTGACCTCAGGCCTTC


BQ
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV91JQB U 1
AF RR2CB41JQ U 178
AF RR2GV91TF C 1
AF RR2AD35TF C 3
BS 1 146 RR2GV91JQB
BS 147 177 RR2GV91TF
BS 178 205 RR2CB41JQ
BS 206 206 RR2GV91TF
BS 207 376 RR2CB41JQ
BS 377 428 RR2GV91TF
BS 429 693 RR2AD35TF

RD RR2GV91JQB 146 0 0
GGGTCAGACCCCACAAAAGGATCCAGACTTTTATTAATATAAAAATATTACAAATATTAA
AGATAATAAGCTTATAATCCAAATAAACAAAGGAAAAATCCGTTGTCTATCTATTAGCAT
TATTCAAGTACTGAAAATGAAAAAAA

QA 1 146 1 146
DS 

RD RR2CB41JQ 199 0 0
CGCTGCTGTTGAAAGGGCCAGGTTCAGGGGCTTGTATACTTCAAGTTCCGGCCAACCTTG
TGAAGTCAATCGGAGTTTTTGTACCACCGACTGTGGTTGTAGCTTTGATTTTGTCCTTGG
AGATTACCTCACCCGAAAAGTCATAACCTGCCACTCCGGCACCCTTGAGGTTGTACAATT
CGAACTTTGTGGGTGTGCC

QA 1 199 1 199
DS 

RD RR2GV91TF 439 0 0
GGGTCAGACCCCACAAAAGGATCCAGACTTTTATTAATATAAAAATATTACAAATATTAA
AGATAATAAGCTTATAATCCAAATAAACAAAGGAAAAATCCGTTGTCTATCTATTAGCAT
TATTCAAGTACTGAAAATGAAAAAAACAACGAGAAATTATTTAGTAGTAGAGGTTCTCGC
TGCTGTTGAAAGGGCCAGGTTCAGGTGCTTGTATACTTCAAGTTCCGGCCAACCTTGTGA
AGTCAATCGGAGTTTTTGTACCACCGACTGTGGTTGTAGCTTTGATTTTGTCCTTGGAGA
TTACCTCACCCGAAAAGTCATAACCTGCCACTCCGGCACCCTTGAGGTTGTACAATTCGA
ACTTTGTGGGTGTGCCGGAGATCAGTTTAATACGACCATACGAGGCTTCAGGTACATTCT
TTTTTCCA
TAGTAGTTTGC

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR2AD35TF 691 0 0
GTCAGACCCCACAAAAGGATCCAGACTTTTATTAATATAAAAATATTACAAATATTAAAG
ATAATAAGCTTATAATCCAAATAAACAAAGGAAAAATCCGTTGTCTATCTATTAGCATTA
TTCAAGTACTGAAAATGAAAAAAACAACGAGAAATTATTTAGTAGTAGAGGTTCTCGCTG
CTGTTGAAAGGGCCAGGTTCAGGTGCTTGTATACTTCAAGTTCCGGCCAACCTTGTGAAG
TCAATCGGAGTTTTTGTAACACCGACTGTGGTTGTAGCTTTGATTTTGTCCTTGGAGATT
ACCTCACCCGAAAAGTCATAACCTGCCACTCCGGCACCCTTGAGGTTGTACAATTCGAAC
TTTGTGGGTGTGCCGGAGATCAGTTTAATACGACCATACGAGGCTTCAGGTACATTCTTT
TTTCCATAGTAGTTTGTAGTCCATTTACACGTGAAGGTGACTCGTGCCCCGTCGTGCAAT
CCGTGCGGAATATCAAGCCGGATCTTCTCGCCCCTTGGAGCATATTGGGGGTGAGTGAGC
GTACCAGTGAAGACAGCGCCGTGAAAGTGGTGCACACCCTTGGCTTTGCCGCCGAAGACT
TCACGCTTGGACCTGCCCTTTGAGGACTCGGCGATGAGTACATGTCCGAGTTGTTTATCC
AGCTTCTGGGTGATTTTGACCTCAGGCCTTC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 11

CO CL368Contig1 1298 11 16 U
GGAAGATCGTAACGACTAAACGAAAAA*GAAAAACTCAAGAGACGAGAAAGAGAGAGTGA
TGGAGAGGATTGTCGAGGTAGCGTATGGAGCATCCGTGAAAGCAGTTTTAACGTTGTTGG
AGAAGAATCTGTTGCCAGATGTTGTCATAAGGCTACTAACGAGGCTGCTTCTCGCCGGTC
GACTCCGTTCCGGTTACAAACCCACGGCGGAGCTGCAACTTTCTGATCTACTCCGTTTCG
TCAACTCTATAAAAGAGATGCCTATAGCGATCAATACCGAGAAGCCGAAGACGCAACACT
ATGAACTACCAACGGCTTTCTTCGAACTTGTTCTTGGAAGAAACATGAAATACAGCTCAT
GTTATTTCCCAAAGGATTCAAGTAGCTTAGAAGAAGCAGAGGAAGCAATATTGGCTCTAT
ATTGCGAAAGAGCCAAAGTGGAAGATGGACAAAGTGTTCTCGATGTCGGATGTGGCTGGG
GATCTTTGTCTTTGTACATTGCCCGCAAGTATAGCAATTGCAAGTTAACCGGTCTTTGTA
ACTCAAAGACACAGAAAGCATTTATTGACGACCAATGCAGGAAACTCAGCATTAAAAATA
TTGAAATCATTGTTGGCGATATTAGCACTTTTGAGCATGAAGGGACCTACGATCGAGTAT
TCTCCATCGAAATGTTTGAGCATATGAAAAACTATGGAGAGCTTCTGAAGAAAATTGGAA
GGTGGATGAAGGAAGATAGTCTTCTGTTTGTTCATTATTTCTGCCATAAGACATTTGCTT
ACCACTTTGAGGATCTGCATGACGATGACTGGATCACAAGATATTTCTTTAGTGGAGGAA
CAATGCCATCGGCGAATCTTTTCCTCTATTTCCAAGACAATGTTTCGATTGTGGATCATT
GGCTCCTAAACGGAAAGCATTATGCAAGAACCAGTGAAGAGTGGCTCAAAAGAATGGACA
AGGAGATAGTTGCAATAAGGGAGATAATGGAAATGACTTATGGGAAAGAGGAGGCAGTGA
AGTGGATGGTTTACTGGAGAACCTTCTTCATGGCAGTTGCTGAGCTTTTTGGATACAACA
ATGGAGAAGAGTGGATGATTTCACACTTCCTATTCAAGAAGAAATGATTATATCTATCTT
CTGCTAGTAATCAGTTTATGTTTTATCTTTGAAGTTCTGTGAGCCAAATAAAGTATAAAA
CATTATCCTCCTACTTTAATTGATTGTCTTCCTAGGTAATCAATCGTATGCTTTCCTATG
AAAAAAAGAAGCTCAATGGATATTAATTTGTTTTCCCC


BQ
25 25 25 25 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
15 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY20TF U 3
AF RR2CR80TF U 1
AF RR2FC68TF U 1
AF RR2BE88TF U 7
AF RR2C165TF U 1
AF RR2FO44TF U 1
AF RR2BE88JQ C 418
AF RR2FC68JQ C 567
AF RR2DT30JQ C 449
AF RR2GY20JQ C 464
AF RR2FO44JQ C 813
BS 1 683 RR2C165TF
BS 684 685 RR2CR80TF
BS 686 690 RR2C165TF
BS 691 691 RR2BE88JQ
BS 692 708 RR2C165TF
BS 709 709 RR2FO44TF
BS 710 721 RR2C165TF
BS 722 722 RR2BE88JQ
BS 723 726 RR2C165TF
BS 727 860 RR2BE88JQ
BS 861 861 RR2FC68JQ
BS 862 1039 RR2BE88JQ
BS 1040 1040 RR2FC68JQ
BS 1041 1237 RR2BE88JQ
BS 1238 1260 RR2GY20JQ
BS 1261 1298 RR2FO44JQ

RD RR2GY20TF 574 0 0
GG
GATCGTAACGACTAAACGAAAAA*GAAAAACTCAAGAGACGAGAAAGAGAGAGTGATGGA
GAGGATTGTCGAGGTAGCGTATGGAGCATCCGTGAAAGCAGTTTTAACGTTGTTGGAGAA
GAATCTGTTGCCAGATGTTGTCGTAAGGCTACTAACGAGGCTGCTTCTCGCCGGTCGACT
CCGTTCCGGTTACAAACCCACGGCGGAGCTGCAACTTTCTGATCTACTCCGTTTCGTCAA
CTCTATAAAAGAGATGCCTATAGCGATCAATACCGAGAAGCCGAAGACGCAACACTATGA
ACTACCAACGGCTTTCTTCGAACTTGTTCTTGGAAGAAACATGAAATACAGCTCATGTTA
TTTCCCAAAGGATTCAAGTAGCTTAGAAGAAGCAGAGGAAGCAATATTGGCTCTATATTG
CGAAAGAGCCAAAGTGGAAGATGGACAAAGTGTTCTCGATGTCGGATGTGGCTGGGGATC
TTTGTCTTTGTACATTGCCCGCAAGTATAGCAATTGCAAGTTAACCGGTCTTTGTAACTC
AAAGACACAGAAAGCATTTATTGACGACCAAT

QA 3 574 3 574
DS 

RD RR2CR80TF 714 0 0
GGAAGATCGTAACGACTAAAAAAAAAAAGAAAAACTCAAGAGACGAGAAAGAGAGAGTGA
TGGAGAGGATTGTCGAGGTAGCGTATGGAGCATCCGTGAAAGCAGTTTTAACGTTGTTGG
AGAAGAATCTGTTGCCAGATGTTGTCATAAGGCTACTAACGAGGCTGCTTCTCGCCGGTC
GACTCCGTTCCGGTTACAAACCCACGGCGGAGCTGCAACTTTCTGATCTACTCCGTTTCG
TCAACTCTATAAAAGAGATGCCTATAGCGATCAATACCGAGAAGCCGAAGACGCAACACT
ATGAACTACCAACGGCTTTCTTCGAACTTGTTCTTGGAAGAAACATGAAATACAGCTCAT
GTTATTTCCCAAAGGATTCAAGTAGCTTAGAAGAAGCAGAGGAAGCAATATTGGCTCTAT
ATTGCGAAAGAGCCAAAGTGGAAGATGGACAAAGTGTTCTCGATGTCGGATGTGGCTGGG
GATCTTTGTCTTTGTACATTGCCCGCAAGTATAGCAATTGCAAGTTAACCGGTCTTTGTA
ACTCAAAGACACAGAAAGCATTTATTGACGACCAATGCAGGAAACTCAGCATTAAAAATA
TTGAAATCATTGTTGGCGATATTAGCACTTTTGAGCATGAAGG*ACCTACGATCGAGTAT
TCTCCATCGAAATGTTTGAGCATATGAAAA*CTATGGAGAGCT
CTGAGAAATTG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2FC68TF 724 0 0
GGAAGATCGTAACGACTAAACGAAAAA*GAAAAACTCAAGAGACGAGAAAGAGAGAGTGA
TGGAGAGGATTGTCGAGGTAGCGTATGGAGCATCCGTGAAAGCAGTTTTAACGTTGTTGG
AGAAGAATCTGTTGCCAGATGTTGTCATAAGGCTACTAACGAGGCTGCTTCTCGCCGGTC
GACTCCGTTCCGGTTACAAACCCACGGCGGAGCTGCAACTTTCTGATCTACTCCGTTTCG
TCAATTCTATAAAAGAGATGCCTATAGCGATCAATACCGAGAAGCCGAAGACGCAACACT
ATGAACTACCAACGGCTTTCTTCGAACTTGTTCTTGGAAGAAACATGAAATACAGCTCAT
GTTATTCCCCAAAGGATTCAAGTAGCTTAGAAGAAGCAGAGGAAGCAATATTGGCTCTAT
ATTGCGAAAGAGCCAAAGTGGAAGATGGACAAAGTGTTCTCGATGTCGGATGTGGCTGGG
GATCTTTGTCTTTGTACATTGCCCGCAAGTATAGCAATTGCAAGTTAACCGGTCTTTGTA
ACTCAAAGACACAGAAAGCATTTATTGACGACCAATGCAGGAAACTCAGCATTAAAAATA
TTGAAATCATTGTTGGCGATATTAGCACTTTTGAGCATGAAGGGACCTACGATCGAGTAT
TCTCCATCGAAATGTTTGAGCATATGAAAA*CTATGGAGAGCTTCTGA
GAAATTGGAAGTGGAT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2BE88TF 680 0 0
GG
GTAACGACTAAACGAAGAA*GAAAAACTCAAGAGACGAGAAAGAGAGAGTGATGGAGAGG
ATTGTCGAGGTAGCGTATGGAGCATCCGTGAAAGCAGTTTTAACGTTGTTGGAGAAGAAT
CTGTTGCCAGATGTTGTCATAAGGCTACTAACGAGGCTGCTTCTCGCCGGTCGACTCCGT
TCCGGTTACAAACCCACGGCGGAGCTGCAACTTTCTGATCTACTCCGTTTCGTCAACTCT
ATAAAAGAGATGCCTATAGCGATCAATACCGAGAAGCCGAAGACGCAACACTATGAACTA
CCAACGGCTTTCTTCGAACTTGTTCTTGGAAGAAACATGAAATACAGCTCATGTTATTTC
CCAAAGGATTCAAGTAGCTTAGAAGAAGCAGAGGAAGCAATATTGGCTCTATATTGCGAA
AGAGCCAAAGTGGAAGATGGACAAAGTGTTCTCGATGTCGGATGTGGCTGGGGATCTTTG
TCTTTGTACATTGCCCGCAAGTATAGCAATTGCAAGTTAACCGGTCTTTGTAACTCAAAG
ACACAGAGAGCATTTATTGACGACCAATGCAGGAAACTCAGCATTAAAAATATTGAAATC
ATTGTTGGCGATATTAGCACTTTTGAGCATGAAGGGACCTACGATCGAGTATTCTCCATC
GAAATGTTTGAGCATATG

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR2C165TF 729 0 0
GGAAGATCGTAACGACTAAACGAAAAA*GAAAAACTCAAGAGACGAGAAAGAGAGAGTGA
TGGAGAGGATTGTCGAGGTAGCGTATGGAGCATCCGTGAAAGCAGTTTTAACGTTGTTGG
AGAAGAATCTGTTGCCAGATGTTGTCATAAGGCTACTAACGAGGCTGCTTCTCGCCGGTC
GACTCCGTTCCGGTTACAAACCCACGGCGGAGCTGCAACTTTCTGATCTACTCCGTTTCG
TCAACTCTATAAAAGAGATGCCTATAGCGATCAATACCGAGAAGCCGAAGACGCAACACT
ATGAACTACCAACGGCTTTCTTCGAACTTGTTCTTGGAAGAAACATGAAATACAGCTCAT
GTTATTTCCCAAAGGATTCAAGTAGCTTAGAAGAAGCAGAGGAAGCAATATTGGCTCTAT
ATTGCGAAAGAGCCAAAGTGGAAGATGGACAAAGTGTTCTCGATGTCGGATGTGGCTGGG
GATCTTTGTCTTTGTACATTGCCCGCAAGTATAGCAATTGCAAGTTAACCGGTCTTTGTA
ACTCAAAGACACAGAAAGCATTTATTGACGACCAATGCAGGAAACTCAGCATTAAAAATA
TTGAAATCATTGTTGGCGATATTAGCACTTTTGAGCATGAAGGGACCTACGATCGAGTAT
TCTCCATCGAAATGTTTGAGCAT**GAAAA*CTATGGAGAGCTTCTGA*GAAAATTGGAA
G*TGGA
TGA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2FO44TF 725 0 0
GGAAGATCGTAACGACTAAACGAAAAA*GAAAAACTCAAGAGACGAGAAAGAGAGAGTGA
TGGAGAGGATTGTCGAGGTAGCGTATGGAGCATCCGTGAAAGCAGTTTTAACGTTGTTGG
AGAAGAATCTGTTGCCAGATGTTGTCATAAGGCTACTAACGAGGCTGCTTCTCGCCGGTC
GACTCCGTTCCGGTTACAAACCCACGGCGGAGCTGCAACTTTCTGATCTACTCCGTTTCG
TCAACTCTATAAAAGAGATGCCTATAGCGATCAATACCGAGAAGCCGAAGACGCAACACT
ATGAACTACCAACGGCTTTCTTCGAACTTGTTCTTGGAAGAAACATGAAATACAGCTCAT
GTTATTTCCCAAAGGATTCAAGTAGCTTAGAAGAAGCAGAGGAAGCAATATTGGCTCTAT
ATTGCGAAAGAGCCAAAGTGGAAGATGGACAAAGTGTTCTCGATGTCGGATGTGGCTGGG
GATCTTTGTCTTTGTACATTGCCCGCAAGTATAGCAATTGCAAGTTAACCG*TCTTTGTA
ACTCAAAGACACAGAAAGCATTTATTGACGACCAATGCAGGAAACTCAGCATTAAAAATA
TTGAAATCATTGTTGGCGATATTAGCACTTTTGAGCATGAAGGGACCTACGATCGAGTAT
TCTCCATCGAAATGTTTGAGCATATGAAAA*CTATGGAGAGCTTCTGAAGAAAATTGGAA
G
TGGA

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2BE88JQ 820 0 0
TATATTGCGAAAGAGCCAAAGTGGAAGATGGACAAAGTGTTCTCGATGTCGGATGTGGCT
GGGGATCTTTGTCTTTGTACATTGCCCGCAAGTATAGCAATTGCAAGTTAACCGGTCTTT
GTAACTCAAAGACACAGAGAGCATTTATTGACGACCAATGCAGGAAACTCAGCATTAAAA
ATATTGAAATCATTGTTGGCGATATTAGCACTTTTGAGCATGAAGGGACCTACGATCGAG
TATTCTCCATCGAAATGTTTGAGCATATGAAAAACTATGGAGAGCTTCTGAAGAAAATTG
GAAGGTGGATGAAGGAAGATAGTCTTCTGTTTGTTCATTATTTCTGCCATAAGACATTTG
CTTACCACTTTGAGGATCTGCATGACGATGACTGGATCACAAGATATTTCTTTAGTGGAG
GAACAATGCCATCGGCGAATCTTCTCCTCTATTTCCAAGACAATGTTTCGATTGTGGATC
ATTGGCTCCTAAACGGAAAGCATTATGCAAGAACCAGTGAAGAGTGGCTCAAAAGAATGG
ACAAGGAGATAGTTGCAATAAGGGAGATAATGGAAATGACTTATGGGAAAGAGGAGGCAG
TGAAGTGGATGGTTTACTGGAGGACCTTCTTCATGGCAGTTGCTGAGCTTTTTGGATACA
ACAATGGAGAAGAGTGGATGATTTCACACTTCCTATTCAAGAAGAAATGATTATATCTAT
CTTCTGCTAGTAATCAGTTTATGTTTTATCTTTGAAGTTCTGTGAGCCAAATAAAGTATA
AAACATTATCCTCCTACTTTAATTGATTGTCTTCCTAGGT

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR2FC68JQ 646 0 0
GACGACCAATGCAGGAAACTCAGCATTAAAAATATTGAAATCATTGTTGGCGATATTAGC
ACTTTTGAGCATGAAGGGACCTACGATCGAGTATTCTCCATCGAAATGTTTGAGCATATG
AAAAACTATGGAGAGCTTCTGAAGAAAATTGGAAGGTGGATGAAGGAAGATAGTCTTCTG
GTTGTTCATTATTTCTGCCATAAGACATTTGCTTACCACTTTGAGGATCTGCATGACGAT
GACTGGATCACAAGATATTTCTTTAGTGGAGGAACAATGCCATCGGCGAATCTTTTCCTC
TATTTCCAAGACAATGTTTCGATTGTGGATCATTGGCTCCTAAACGGAAAGCATTATGCA
AGAACCAGTGAAGAGTGGCTCAAAAGAATGGACAAGGAGATAGTTGCAATAAGGGAGATA
ATGGAAATGACTTATGGGAAAGAGGAGGCAGTGAAGTGGATGGTTTACTGGAGAACCTTC
TTCATGGCAGTTGCTGAGCTTTTTGGATACAACAATGGAGAAGAGTGGATGATTTCACAC
TTCCTATTCAAGAAGAAATGATTATATCTATCTTCTGCTAGTAATCAGTTTATGTTTTAT
CTTTGAAGTTCTGTGAGCCAAATAAAGTATAAAACATTATCCTCC
C

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2DT30JQ 769 0 0
ACAAAGTGTTCTCGATGTCGGATGTGGCTGGGGATCTTTGTCTTTGTACATTGCCCGCAA
GTATAGCAATTGCAAGTTAACCGGTCTTTGTAACTCAAAGACACAGAAAGCATTTATTGA
CGACCAATGCAGGAAACTCAGCATTAAAAATATTGAAATCATTGTTGGCGATATTAGCAC
TTTTGAGCATGAAGGGACCTACGATCGAGTATTCTCCATCGAAATGTTTGAGCATATGAA
AAACTATGGAGAGCTTCTGAAGAAAATTGGAAGGTGGATGAAGGAAGATAGTCTTCTGTT
TGTTCATTATTTCTGCCATAAGACATTTGCTTACCACTTTGAGGATCTGCATGACGATGA
CTGGATCACAAGATATTTCTTTAGTGGAGGAACAATGCCATCGGCGAATCTTCTCCTCTA
TTTCCAAGACAATGTTTCGATTGTGGATCATTGGCTCCTAAACGGAAAGCATTATGCAAG
AACCAGTGAAGAGTGGCCCAAAAGAATGGACAAGGAGATAGTTGCAATAAGGGAGATAAT
GGAAATGACTTATGGGAAAGAGGAGGCAGTGAAGTGGATGGTTTACTGGAGAACCTTCTT
CATGGCAGTTGCTGAGCTTTTTGGATACAACAATGGAGAAGAGTGGATGATTTCACACTT
CCTATTCAAGAAGAAATGATTATATCTATCTTCTGCTAGTAATCAGTTTATGTTTTATCT
TTGAAGTTCTGTGAGCCAAATAAAGTATAAAACATTATCCTCCTACTTT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2GY20JQ 797 0 0
TGTCGGATGTGGCTGGGGATCTTTGTCTTTGTACATTGCCCGCAAGTATAGCAATTGCAA
GTTAACCGGTCTTTGTAACTCAAAGACACAGAAAGCATTTATTGACGACCAATGCAGGAA
ACTCAGCATTAAAAATATTGAAATCATTGTTGGCGATATTAGCACTTTTGAGCATGAAGG
GACCTACGATCGAGTATTCTCCATCGAAATGTTTGAGCATATGAAAAACTATGGAGAGCT
TCTGAAGAAAATTGGAAGGTGGATGAAGGAAGATAGTCTTCTGTTTGTTCATTATTTCTG
CCATAAGACATTTGCTTACCACTTTGAGGATTTGCATGACGATGACTGGATCACAAGATA
TTTCTTTAGTGGAGGAACAATGCCATCGGCGAATTTTTTCCTCTATTTCCAAGACAATGT
TTCGATTGTGGATCATTGGCTCCTAAACGGAAAGCATTATGCAAGAACCAGTGAAGAGTG
GCTCAAAAGAATGGACAAGGAGATAGTTGCAATAAGGGAGATAATGGAAATGACTTATGG
GAAAGAGGAGGCAGTGAAGTGGATGGTTTACTGGAGAACCTTCTTCATGGCAGTTGCTGA
GCTTTTTGGATACAACAATGGAGAAGAGTAGATGATTTCACACTTCCTATTCAAGAAGAA
ATGATTATATCTATCTTCTGCTAGTAATCAGTTTATGTTTTATCTTTGAAGTTCTGTGAG
CTAAATAAAGTATAAAACATTATCCTCCTACTTTAATTGATTGTCTTCCTAGGTAATCAA
TCGTATGCTTTCCTATG

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2FO44JQ 486 0 0
ATCACAAGATATTTCTTTAGCGGAGGAACAATGCCATCGGGGAATTTTTTCCTCTATTTC
CAAGACAATGTTTCGATTGTGGATCATTGGCTCCTAAACGGAAAGCATTATGCAAGAACC
AGTGAAGAGTGGCTCAAAAGAATGGACAAGGAGATAGTTGCAATAAGGGAGATAATGGAA
ATGACTTATGGGAAAGAGGAGGCAGTGAAGTGGATGGTTTACTGTAGAACCTTTTTCATG
GCAGTTGCTGAGCTTTTTGGATACAACAATGGAGAAGAGTGGATGATTTCACACTTCCTA
TTCAAGAAGAAATGATTATATTTATTTTTTGCTAGTAATCAGTTTATGTTTTATCTTTGA
AGTTTTGTGAGCCAAATAAAGTATAAAACATTATCCTCCTACTTTAATTGATTGTTTTCC
TAGGTAATCAATCGTATGCTTTCCTATGAAAAAAAGAAGCTCAATGGATATTAATTTGTT
TTCCCC

QA 1 486 1 486
DS 



AS 2 10

CO CL369Contig1 1031 8 25 U
GGAAGAAAGGTGAACAACAGAGTGAACCGCTGCTTGAGCCGTCGGAG**ATTCATTCACC
TGCTGCAGACATGGCAAGGGGATTGAAGAAACATCTCAAGAGGCTTAATGCCCCAAAGCA
TTGGATGCTTGACAAACTTGGTGGTGCCTTTGCCCCCAAGCCATCTTCTGGACCACACAA
GTCCAGGGAGTGCCTTCCCCTTGTCCTTATCATCCGTAATAGGTTGAAGTATGCTTTGAC
ATACCGTGAGGTGATTTCTATCTTGATGCAAAGGCATATCCAAGTTGATGGGAAAGTCAG
AACTGACAAGACATACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTGTCTATCCCAAAGACAAATGA
GAACTTCCGTCTGCTGTATGACACCAAGGGACGCTTCCGTCTTCACTCCATCAGGGACGA
GGAAGCAAAGTTCAAGCTGTGCAAAGTGAGAACTATCCAGCTTGGTCAGAAGGGAATCCC
TTACCTCAACACATACGATGGTCGCACCATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAAGCCCAA
CGACACCATCAAGCTAGACCTCGAGGAGAACAAGGTTGTGGAGTTTATCAAGTTTGATGT
AGGAAACGTTGTGATGGTGACTGGAGGAAGAAACAGAGGTCGTGTTGGTGTGATCAAGAA
CCGTGAGAAACACAAGGGAAGCTTCGAGACCATCCACATTCAAGACTCAACGGGACATGA
GTTTGCAACGAGGTTAGGGAATGTGTTCACGCTCGGGAAAGGAACAAAGCCGTGGGTGTC
TCTTCCAAAGGGTAAAGGTATTAAGCTTACCATCATTGAGGAAGCTAGGAAGAGGCTTTC
TGCTCAACAAGCTGCTTGAAACTGTTTTTTTTTTGTTTCCTCTGTTTCAGAAAACCTATG
TTCTGTTTTTTTTT**TGTATCTTGCTATTGAGTTCCTTGTTCTTATTAGACTTTCATGT
CTTTGATTGCTGCTATTGAGTTCCTTAGTTAATTCTTATACATTGAGTAAAATGTTTGCT
TCATCAGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 0 40 40 0 40 40 0 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 0 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 5 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR43TF U 1
AF RR2FV64TF U 56
AF RR2DS44TF U 30
AF RR2CS21TF U 31
AF RR2FC10TF U 71
AF RR2FC10JQ C 210
AF RR2FV64JQ C 323
AF RR2DS44JQ C 371
BS 1 435 RR2BR43TF
BS 436 436 RR2CS21TF
BS 437 465 RR2BR43TF
BS 466 466 RR2CS21TF
BS 467 498 RR2BR43TF
BS 499 499 RR2CS21TF
BS 500 600 RR2BR43TF
BS 601 601 RR2CS21TF
BS 602 634 RR2BR43TF
BS 635 663 RR2DS44TF
BS 664 664 RR2FV64TF
BS 665 675 RR2DS44TF
BS 676 676 RR2CS21TF
BS 677 714 RR2DS44TF
BS 715 715 RR2FC10TF
BS 716 726 RR2DS44TF
BS 727 727 RR2FC10TF
BS 728 728 RR2DS44TF
BS 729 763 RR2FC10TF
BS 764 764 RR2FC10JQ
BS 765 810 RR2FC10TF
BS 811 811 RR2FC10JQ
BS 812 822 RR2FC10TF
BS 823 971 RR2FC10JQ
BS 972 1031 RR2DS44JQ

RD RR2BR43TF 634 0 0
GGAAGAAAGGTGAACAACAGAGTGAACCGCTGCTTGAGCCGTCGGAG**ATTCATTCACC
TGCTGCAGACATGGCAAGGGGATTGAAGAAACATCTCAAGAGGCTTAATGCCCCAAAGCA
TTGGATGCTTGACAAACTTGGTGGTGCCTTTGCCCCCAAGCCATCTTCTGGACCACACAA
GTCCAGGGAGTGCCTTCCCCTTGTCCTTATCATCCGTAATAGGTTGAAGTATGCTTTGAC
ATACCGTGAGGTGATTTCTATCTTGATGCAAAGGCATATCCAAGTTGATGGGAAAGTCAG
AACTGACAAGACATACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTGTCTATCCCAAAGACAAATGA
GAACTTCCGTCTGCTGTATGACACCAAGGGACGCTTCCGTCTTCACTCCATCAGGGACGA
GGAAGCAAAGTTCAAACTGTGCAAAGTGAGAACTATCCAGCTTGGACAGAAGGGAATCCC
TTACCTCAACACATACGACGGTCGCACCATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAAGCCCAA
CGACACCATCAAGCTAGACCTCGAGGAGAACAAGGTTGTGGAGTTTATCAAGTTTGATGT
TGGAAACGTTGTGATGGTGACTGGAGGAAGAAAC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2FV64TF 617 0 0
GG
ACCTGCCGCAGACATGGCAAGGGGATTGAAGAAACATCTCAAGAGGCTTAATGCCCCAAA
GCATTGGATGCTTGACAAACTTGGTGGTGCCTTTGCCCCCAAGCCATCTTCTGGACCACA
CAAGTCCAGGGAGTGCCTTCCCCTTGTCCTTATCATCCGTAATAGGTTGAAGTATGCTTT
GACATACCGTGAGGTGATTTCTATCTTGATGCAAAGGCATATCCAAGTTGATGGGAAAGT
CAGAACTGACAAGACATACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTGTCTATCCCAAAGACAAA
TGAGAACTTCCGTCTGCTGTATGACACCAAGGGACGCTTCCGTCTTCACTCCATCAGGGA
CGAGGAAGCAAAGTTCAAGCTGTGCAAAGTGAGAACTATCCAGCTTGGTCAGAAGGGAAT
CCCTTACCTCAACACATACGATGGTCGCACCATCCGTTACCCCGACCCGCTTATCAAGCC
CAACGACACCATCAAGCTAGACCTCGAGGAGAACAAGGTTGTGGAGTTTATCAAGTTTGA
TGTAGGAAACGTTGTGATGGTGACTGGAGGAAGAAACAGAGGTCGTGTTGGTGTGATCAA
GAACCGTGAGAAACA

QA 3 617 3 617
DS 

RD RR2DS44TF 699 0 0
GG
GCTTGAGCCGTCGGAG**ATTCATTCACCTGCTGCAGACATGGCAAGGGGATTGAAGAAA
CATCTCAAGAGGCTTAATGCCCCAAAGCATTGGATGCTTGACAAACTTGGTGGTGCCTTT
GCCCCCAAGCCATCTTCTGGACCACACAAGTCCAGGGAGTGCCTTCCCCTTGTCCTTATC
ATCCGTAATAGGTTGAAGTATGCTTTGACATACCGTGAGGTGATTTCTATCTTGATGCAA
AGGCATATCCAAGTTGATGGGAAAGTCAGAACTGACAAGACATACCCTGCTGGTTTCATG
GACGTTGTGTCTATCCCAAAGACAAATGAGAACTTCCGTCTGCTGTATGACACCAAGGGA
CGCTTCCGTCTTCACTCCATCAGGGACGAGGAAGCAAAGTTCAAACTGTGCAAAGTGAGA
ACTATCCAGCTTGGACAGAAGGGAATCCCTTACCTCAACACATACGACGGTCGCACCATC
CGTTACCCCGACCCGCTCATCAAGCCCAACGACACCATCAAGCTAGACCTCGAGGAGAAC
AAGGTTGTGGAGTTTATCAAGTTTGATGTTGGAAACGTTGTGATGGTGACTGGAGGAAGA
AACAGAGGTCGTGTTGGTGTGATCAAGAACCGGGAGAAACACAAAGGAAGCTTCGAGACC
ATCCACATTCAAGACTCAACGGGGCATGAGTTTGCCA

QA 3 699 3 699
DS 

RD RR2CS21TF 698 0 0
G
GCTTGAGCCGTCGGAGAGATTCATTCACCTGCTGCAGACATGGCAAGGGGATTGAAGAAA
CATCTCAAGAGGCTTAATGCCCCAAAGCATTGGATGCTTGACAAACTTGGTGGTGCCTTT
GCCCCCAAGCCATCTTCTGGACCACACAAGTCGAGAGAGTGCCTTCCCCTTGTCCTTATC
ATCCGTAACAGGTTTAAGTATGCTTTGACATACCGTGAGGTGATTTCTATCTTGATGCAA
AGGCATATCCAAGTCGATGGGAAAGTCAGAACTGACAAGACATACCCTGCTGGTTTCATG
GATGTTGTGTCTATCCCAAAGACAAATGAGAACTTCCGTCTGCTGTATGACACCAAGGGA
CGCTTCCGTCTTCACTCCATCAGAGACGAGGAAGCAAAGCTCAAGCTGTGCAAAGTGAGA
ACTATCCAGCTTGGTCAGAAGGGAATCCCTTACCTGAACACATACGATGGTCGCACCATC
CGTTACCCCGACCCGCCCATCAAGCCCGACGACACCATCAAGCTAGACCTCGAGGAGAAC
AAGGTTGTGGAGTTTATCAAGTTTGATGTAGGAAACGTTGTGATGGTGACTGGAGGAAGA
AACAGAGGTCGTGTTGGTGTGATCAAGAACCGGGAGAAACACAAGGGAAGCTTCGAGACC
ATCCACATTCAAGACTCAACGGGGCATGAGTTTGCCA

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR2FC10TF 759 0 0
ATGGCAAGGGGATTGAAGAAACATCTCAAGAGGCTTAATGCCCCAAAGCATTGGATGCTT
GACAAACTTGGTGGTGCCTTTGCCCCCAAGCCATCTTCTGGACCACACAAGTCCAGGGAG
TGCCTTCCCCTTGTCCTTATCATCCGTAATAGGTTGAAGTATGCTTTGACATACCGTGAG
GTGATTTCTATCTTGATGCAAAGGCATATCCAAGTTGATGGGAAAGTCAGAACTGACAAG
ACATACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTGTCTATCCCAAAGACAAATGAGAACTTCCGT
CTGCTGTATGACACCAAGGGACGCTTCCGTCTTCACTCCATCAGGGACGAGGAAGCAAAG
TTCAAGCTGTGCAAAGTGAGAACTATCCAGCTTGGTCAGAAGGGAATCCCTTACCTCAAC
ACATACGATGGTCGCACCATCCGTTACCCCGACCCGCTTATCAAGCCCAACGACACCATC
AAGCTAGACCTCGAGGAGAACAAGGTTGTGGAGTTCATCAAGTTTGATGTAGGAAACGTT
GTGATGGTGACTGGAGGAAGAAACAGAGGTCGTGTTGGTGTGATCAAGAACCGTGAGAAA
CACAAGGGAAGCTTCGAGACCATCCACATTCAAGACTCTACTGGATATGAGTTTGCAACG
AGGTTAGGGAATGTGTTCACGCTCGGGAAAGGA*CAAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCAAAG
GGTAAAGGTATTAAGCTTAC*ATCATTGAGGA
GCTAGGA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2FC10JQ 765 0 0
TCATCCGTAATAGGTTGAAGTATGCTTTGACATACCGTGAGGTGATTTCTATCTTGATGC
AAAGGCATATCCAAGTTGATGGGAAAGTCAGAACTGACAAGACATACCCTGCTGGTTTCA
TGGATGTTGTGTCTATCCCAAAGACAAATGAGAACTTCCGTCTGCTGTATGACACCAAGG
GACGCTTCCGTCTTCACTCCATCAGGGACGAGGAAGCAAAGTTCAAGCTGTGCAAAGTGA
GAACTATCCAGCTTGGTCAGAAGGGAATCCCTTACCTCAACACATACGATGGTCGCACCA
TCCGTTACCCCGACCCGCTTATCAAGCCCAACGACACCATCAAGCTAGACCTCGAGGAGA
ACAAGGTTGTGGAGTTCATCAAGTTTGATGTAGGAAACGTTGTGATGGTGACTGGAGGAA
GAAACAGAGGTCGTGTTGGTGTGATCAAGAACCGTGAGAAACACAAGGGAAGCTTCGAGA
CCATCCACATTCAAGACTTTACTGGATATGAGTTTGCAACGAGGTTAGGGAATGTGTTCA
CGCTCGGGAAAGGAACAAAGCCGTGGGTGTTTCTTCCAAAGGGTAAAGGTATTAAGCTTA
CCATCATTGAGGAAGCTAGGAAGAGGCTTTCTGCTCAACAAGCTGCTTGAAACTGTTTTT
TTTTTGTTTCCTCTGTTTCAGAAAACCTATGTTCTGTTTTTTTTT**TGTATCTTGCTAT
TGAGTTCCTTGTTCTTATTAGACTTTCATGTCTTTGATTGCT
GCC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2FV64JQ 668 0 0
GGTTTCATGGATGTTGTGTCTATCCCAAAGACAAATGAGAACTTCCGTCTGCTGTATGAC
ACCAAGGGACGCTTCCGTCTTCACTCCATCAGGGACGAGGAAGCAAAGTTCAAGCTGTGC
AAAGTGAGAACTATCCAGCTTGGTCAGAAGGGAATCCCTTACCTCAACACATACGATGGT
CGCACCATCCGTTACCCCGACCCGCTTATCAAGCCCAACGACACCATCAAGCTAGACCTC
GAGGAGAACAAGGTTGTGGAGTTTATCAAGTTTGATGTAGGAAACGTTGTGATGGTGACT
GGAGGAAGAAACAGAGGTCGTGTTGGTGTGATCAAGAACCGTGAGAAACACAAGGGAAGC
TTCGAGACCATCCACATTCAAGACTCTACTGGACATGAGTTTGCAACGAGGTTAGGGAAT
GTGTTCACGCTCGGGAAAGGAACAAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCAAAGGGTAAAGGTATT
AAGCTTACCATCATTGAGGAAGCTAGGAAGAGGCTTTCTGCTCAACAAGCTGCTTGAAAC
TGTTTTTTTTTTGTTTCCTCTGTTTCAGAAAACCTATGTTCTGTTTTTTTTT***GTATC
TTGCTATTGAGTTCCTTGTTCTTATTAGACTTTCATGTCTTTGATTGCT
GCTATTGAGTTCCTTATTT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2DS44JQ 661 0 0
CTGCTGTATGACACCAAGGGACGCTTCCGTCTTCACTCCATCAGGGACGAGGAAGCAAAG
TTCAAACTGTGCAAAGTGAGAACTATCCAGCTTGGACAGAAGGGAATCCCTTACCTCAAC
ACATACGACGGTCGCACCATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAAGCCCAACGACACCATC
AAGCTAGACCTCGAGGAGAACAAGGTTGTGGAGTTTATCAAGTTTGATGTTGGAAACGTT
GTGATGGTGACTGGAGGAAGAAACAGAGGTCGTGTTGGTGTGATCAAGAACCGGGAGAAA
CACAAGGGAAGCTTCGAGACCATCCACATTCAAGACTCAACGGGGCATGAGTTTGCCACG
AGGTTAGGGAATGTGTTCACGCTTGGGAAAGGAACAAAGCCGTGGGTGTTTCTTCCAAAG
GGTAAAGGTATTAAGCTTACCATCATTGAGGAAGCTAGGAAGAGGCTTTTTGCTCAACAA
GCTGCTTGAAACTGTTTTTTTT******CCTCTGTTTCAGAAAACATATGCTCTGTTTTT
TTTTTTTGTATCTTGCTATTGAGATCATTATTCTCA**AGACTTTCATGTCTTTGATTGC
TGCTATTGAGTTCCTTAGTTAATTCTTATACATTGAGTAAAATGTTTGCTTCATCAGGTT
T

QA 1 661 1 661
DS 



CO CL369Contig2 776 2 6 U
GAAGCAAACCTTTTCCTCAATGTATAAGAATTAAACAAGGAACTCAATAGCAATCAAAGA
CATGAAAGTCTAAGAATAAGGAACTCAATAGCAAGATACAAAACAAAAACAGAGCATAGG
TTTTCTGAAACAGAGGAAAAAAAAGTTTCAAGCAGCTTGTTGAGCAGAAAGCCTCTTCCT
AGCTTCCTCAATGATGGTAAGTTTAATACCTTTACCCTTTGGAAGAAACACCCACGGCTT
TGTTCCTTTCCCGAGAGTGAACACATTCCCTAACCTAGTGGAAAACTCATGCCCCGTTGA
GTCTTGAATGTGGACGGTCTCGAAGCTTCCCTTGTGTTTCTCCCGGTTCTTGATCACACC
AACACGACCTCTGTTTCTTCCTCCAGTCACCATCACAACGTTTCCTACATCAAACTTGAT
AAACTCCACAACCTTGTTCTCCTCGAGGTCTAGCTTGATGGTGTCGTCGGGCTTGATGAG
CGGGTCGGGGTAACGGATGGTGCGACCATCGTATGTGTTCAGGTAAGGGATTCCCTTCTG
ACCAAGCTGGATAGTTCTCACTTTGCACAGCTTGAGCTTTGCTTCCTCGTCTCTGATGGA
GTGAAGACGGAAGCGTCCCTTGGTGTCATACAGCAGACGGAAGTTCTCATTTGTCTTTGG
GATAGACACAACATCCATGAAACCAGCAGGGTATGTCTTGTCAGTTCTGACTTTCCCATC
GACTTGGATATGCCTTTGCATCAAGATAGAAATCACCTCACGGTATGTCAAAGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G475JQ U 1
AF RR2CS21JQ U 15
BS 1 143 RR2G475JQ
BS 144 144 RR2CS21JQ
BS 145 467 RR2G475JQ
BS 468 468 RR2CS21JQ
BS 469 493 RR2G475JQ
BS 494 776 RR2CS21JQ

RD RR2G475JQ 493 0 0
GAAGCAAACCTTTTCCTCAATGTATAAGAATTAAACAAGGAACTCAATAGCAATCAAAGA
CATGAAAGTCTAAGAATAAGGAACTCAATAGCAAGATACAAAACAAAAACAGAGCATAGG
TTTTCTGAAACAGAGGAAAAAAA*GTTTCAAGCAGCTTGTTGAGCAGAAAGCCTCTTCCT
AGCTTCCTCAATGATGGTAAGTTTAATACCTTTACCCTTTGGAAGAAACACCCACGGCTT
TGTTCCTTTCCCGAGAGTGAACACATTCCCTAACCTAGTGGAAAACTCATGCCCCGTTGA
GTCTTGAATGTGGACGGTCTCGAAGCTTCCCTTGTGTTTCTCCCGGTTCTTGATCACACC
AACACGACCTCTGTTTCTTCCTCCAGTCACCATCACAACGTTTCCTACATCAAACTTGAT
AAACTCCACAACCTTGTTCTCCTCGAGGTCTAGCTTGATGGTGTCGTTGGGCTTGATGAG
CGGGTCGGGGTAA

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR2CS21JQ 762 0 0
C
CTCAATGTATAAGAATTAAACAAGGAACTCAATAGCAATCAAAGACATGAAAGTCTAAGA
ATAAGGAACTCAATAGCAAGATACAAAACAAAAACAGAGCATAGGTTTTCTGAAACAGAG
GAAAAAAAAGTTTCAAGCAGCTTGTTGAGCAGAAAGCCTCTTCCTAGCTTCCTCAATGAT
GGTAAGTTTAATACCTTTACCCTTTGGAAGAGACACCCACGGCTTTGTTCCTTTCCCGAG
AGTGAACACATTCCCTAACCTAGTGGCAAACTCATGCCCCGTTGAGTCTTGAATGTGGAT
GGTCTCGAAGCTTCCCTTGTGTTTCTCCCGGTTCTTGATCACACCAACACGACCTCTGTT
TCTTCCTCCAGTCACCATCACAACGTTTCCTACATCAAACTTGATAAACTCCACAACCTT
GTTCTCCTCGAGGTCTAGCTTGATGGTGTCGTCGGGCTTGATGGGCGGGTCGGGGTAACG
GATGGTGCGACCATCGTATGTGTTCAGGTAAGGGATTCCCTTCTGACCAAGCTGGATAGT
TCTCACTTTGCACAGCTTGAGCTTTGCTTCCTCGTCTCTGATGGAGTGAAGACGGAAGCG
TCCCTTGGTGTCATACAGCAGACGGAAGTTCTCATTTGTCTTTGGGATAGACACAACATC
CATGAAACCAGCAGGGTATGTCTTGTCAGTTCTGACTTTCCCATCGACTTGGATATGCCT
TTGCATCAAGATAGAAATCACCTCACGGTATGTCAAAGCAT

QA 2 762 2 762
DS 



AS 1 12

CO CL370Contig1 631 12 11 U
GGATCCAACTAAGTTACACTACAAGCCTACAAACTCAAGACACATTGATTGGCAAGTCTT
TACATACCAAATTTCTTTTAAAGGTTTTTACACACGAAGAATTCCAAAATGGCTAGGGTC
CAAGGTCTAGTGCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAGTTATGTTAACTGAGAGC
CGAGTCGAAAGAAAAGAGTCAAAAAGCTTGGGGCTTGACTTAGGTGGGATTGGGGTCGGT
CTGGGCGTTGGATTGGGGATTGGTATTGGCGGCGGGGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCA
GGTTCTGGTTCAGGCTCATCATCTAGTTCTAGCTCTAGCTCGTCATCAAGTTCGAGTTCT
AGTGGTTCGGGTGGTCGATCGGGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATTTGCTGGATCTAGG
GCTGGATCAGGATCTGGTAACTAAATAATTGGTACGATTTATTTCCTACTTAAAGTGTGA
ACCAAAAAGTGTGTGTGTTTATGCTGTTGGTTTGTCGTGTGTGTGTGTACGAAGTTTGAT
GAATAAAATGTTGTCATAAGCTATGTTTTGTTTGAGTCTGTATGTTTCCATACAAGTCTA
AATTGTGATATAATATCTTTAAATTTAGATC


BQ
45 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ87TF U 1
AF RR2GK68TF U 3
AF RR2CN69JQ C 1
AF RR2CN69TF U 1
AF RR2B103JQ C 1
AF RR2DZ87JQ C 191
AF RR2CE95TF U 2
AF RR2BW12JQ C 1
AF RR2CE95JQ C 2
AF RR2GK68JQ C 3
AF RR2BW12TF U 1
AF RR2B103TF U 1
BS 1 47 RR2DZ87TF
BS 48 48 RR2CN69TF
BS 49 162 RR2DZ87TF
BS 163 163 RR2CN69TF
BS 164 198 RR2DZ87TF
BS 199 422 RR2CN69TF
BS 423 423 RR2CE95TF
BS 424 563 RR2CN69TF
BS 564 617 RR2CE95TF
BS 618 624 RR2B103TF
BS 625 631 RR2B103JQ

RD RR2DZ87TF 204 0 0
GGATCCAACTAAGTTACACTACAAGCCTACAAACTCAAGACACATTGGTTGGCAAGTCTT
TACATACCAAATTTCTTTTAAAGGTTTTTACACACGAAGAATTCCAAAATGGCTAGGGTC
CAAGGTCTAGTGCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAATTATGTTAACTGAGAGC
CGAGTCGAAAGAAAAGAG
CAAAAA

QA 1 198 1 198
DS 

RD RR2GK68TF 187 0 0
GG
CCAACTAAGTTACACTACAAGCCTACAAACTCAAGACACATTGATTGGCAAGTCTTTACA
TACCAAATTTCTTTTAAAGGTTTTTACACACGAAGAATTCCAAAATGGCTAGGGTCCAAG
GTCTAGTGCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAGTTATGTTAACTGAGAGCCGAG
TCGAA

QA 3 187 3 187
DS 

RD RR2CN69JQ 564 0 0
GGATCCAACTAAGTTACACTACAAGCCTACAAACTCAAGACACATTGATTGGCAAGTCTT
TACATACCAAATTTCTTTTAAAGGTTTTTACACACGAAGAATTCCAAAATGGCTAGGGTC
CAAGGTCTAGTGCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAGTTATGTTAACTGAGAGC
CGAGTCGAAAGAAAAGAGTCAAAAAGCTTGGGGCTTGACTTAGGTGGGATTGGGGTCGGT
CTGGGCGTTGGATTGGGGATTGGTATTGGCGGCGGGGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCA
GGTTCTGGTTCAGGCTCATCATCTAGTTCTAGCTCTAGCTCGTCATCAAGTTCGAGTTCT
AGTGGTTCGGGTGGTCGATCGGGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATTTGCTGGATCTAGG
GCCGGATCAGGATCTGGTAACTAAATAATTGGTACGATTTATTTCCTACTTAAAGTGTGA
ACCAAAAAGTGTGTGTGTTTATGCTGTTGGTTTGTCGTGTGTGTGTGTACGAAGTTTGAT
GAATAAAATGTTGTCATAAGCTA
C

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2CN69TF 564 0 0
GGATCCAACTAAGTTACACTACAAGCCTACAAACTCAAGACACATTGATTGGCAAGTCTT
TACATACCAAATTTCTTTTAAAGGTTTTTACACACGAAGAATTCCAAAATGGCTAGGGTC
CAAGGTCTAGTGCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAGTTATGTTAACTGAGAGC
CGAGTCGAAAGAAAAGAGTCAAAAAGCTTGGGGCTTGACTTAGGTGGGATTGGGGTCGGT
CTGGGCGTTGGATTGGGGATTGGTATTGGCGGCGGGGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCA
GGTTCTGGTTCAGGCTCATCATCTAGTTCTAGCTCTAGCTCGTCATCAAGTTCGAGTTCT
AGTGGTTCGGGTGGTCGATCGGGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATTTGCTGGATCTAGG
GCCGGATCAGGATCTGGTAACTAAATAATTGGTACGATTTATTTCCTACTTAAAGTGTGA
ACCAAAAAGTGTGTGTGTTTATGCTGTTGGTTTGTCGTGTGTGTGTGTACGAAGTTTGAT
GAATAAAATGTTGTCATAAGCTA
C

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2B103JQ 631 0 0
GGATCCAACTAAGTTACACTACAAGCCTACAAACTCAAGACACATTGGTTGGCAAGTCTT
TACATACCAAATTTCTTTTAAAGGTTTTTACACACGAAGAATTCCAAAATGGCTAGGGTC
CAAGGTCTAGTGCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAATTATGTTAACTGAGAGC
CGAGTCGAAAGAAAAGAGTCAAAAAGCTTGGGGCTTGACTTAGGTGGGATTGGGGTCGGT
CTGGGCGTTGGATTGGGGATTGGTATTGGCGGCGGGGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCA
GGTTCTGGTTCAGGCTCATCATCTAGTTCTAGCTCTAGCTCGTCATCAAGTTCGAGTTCT
AGTGGTTCGGGTGGTCGATCGGGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATTTGCTGGATCTAGG
GCTGGATCAGGATCTGGTAACTAAATAATTGGTACGATTTATTTCCTACTTAAAGTGTGA
ACCAAAAAGTGTGTGTGTTTATGCTGTTGGTTTGTCGTGTGTGTGTGTACGAAGTTGGAT
GAATAAAATGTTGTCATAAGCTATGCTTTGTTTGAGTCTGTATGTTTCTATACAAGTCTA
AATTGTGATATAATATCTTTAAATTTAGATC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2DZ87JQ 421 0 0
GAAAAGAGTCAAAAAGCTTGGGGCTTGACTTAGGTGGGATTGGGGTCGGTCTGGGCGTTG
GATTGGGGATTGGTATTGGCGGCGGGGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCAGGTTCTGGTT
CAGGCTCATCATCTAGTTCTAGCTCTAGCTCGTCATCAAGTTCGAGTTCTAGTGGTTCGG
GTGGTCGATCGGGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATTTGCTGGATCTAGGGCTGGATCAG
GATCTGGTAACTAAATAATTGGTACGATTTATTTCCTACTTAAAGTGTGGACCAAAAAGT
GTGTGTGTTTATGCTGTTGGTTTGTCGTGTGTGTGTGTACGAAGTTGGATGAATAAAATG
TTGTCATAAGCTATGTTTTGTTTGAGTCTGTATGTTTCTATACAAGTCTAAATTGTGATA
T

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR2CE95TF 623 0 0
GATCCAACTAAGTTACACTACAAGCCTACAAACTCAAGACACATTGATTGGCAAGTCTTT
ACATACCAAATTTCTTTTAAAGGTTTTTACACACGAAGAATTCCAAAATGGCTAGGGTCC
AAGGTCTAGTGCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAGTTATGTTAACTGAGAGCC
GAGTCGAAAGAAAAGAGTCAAAAAGCTTGGGGCTTGACTTAGGTGGGATTGGGGTCGGTC
TGGGCGTTGGATTGGGGATTGGTATTGGCGGCGGGGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCAG
GTTCTGGTTCAGGCTCATCATCTAGTTCTAGCTCTAGCTCGTCATCAAGTTCGAGTTCTA
GTGGTTCGGGTGGTCGATCGGGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATTTGCTGGATCTAGGG
CTGGATCAGGATCTGGTAACTAAATAATTGGTACGATTTATTTCCTACTTAAAGTGTGAA
CCAAAAAGTGTGTGTGTTTATGCTGTTGGTTTGTCGTGTGTGTGTGTACGAAGTTTGATG
AATAAAATGTTGTCATAAGCTATGTTTTGTTTGAGTCTGTATGTTTCCATACAAGTCTAA
ATTGTGATATAATATC
TTTAAAT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2BW12JQ 617 0 0
GGATCCAACTAAGTTACACTGCAAGCCTACAAACTCAAGACACATTGATTGGCAAGTCTT
TACATACCAAATTTCTTTTAAAGGTTTTTACACACGAAGAATTCCAAAATGGCTAGGGTC
CAAGGTCTAGTGCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAGTTATGTTAACTGAGAGC
CGAGTCGAAAGAAAAGAGTCAAAAAGCTTGGGGCTTGACTTAGGTGGGATTGGGGTCGGT
CTGGGCGTTGGATTGGGGATTGGTATTGGCGGCGGGGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCA
GGTTCTGGTTCAGGCTCATCATCTAGTTCTAGCTCTAGCTCGTCATCAAGCTCGAGTTCT
AGTGGTTCGGGTGGTCGATCGGGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATTTGCTGGATCTAGG
GCTGGATCAGGATCTGGTAACTAAATAATTGGTACGATTTATTTCCTACTTAAAGTGTGA
ACCAAAAAGTGTGTGTGTTTATGCTGTTGGTTTGTCGTGTGTGTGTGTACGAAGTTTGAT
GAATAAAATGTTGTCATAAGCTATGTTTTGTTTGAGTCTGTATGTTTCCATACAAGTCTA
AATTGTGATATAATATC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2CE95JQ 616 0 0
GATCCAACTAAGTTACACTACAAGCCTACAAACTCAAGACACATTGATTGGCAAGTCTTT
ACATACCAAATTTCTTTTAAAGGTTTTTACACACGAAGAATTCCAAAATGGCTAGGGTCC
AAGGTCTAGTGCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAGTTATGTTAACTGAGAGCC
GAGTCGAAAGAAAAGAGTCAAAAAGCTTGGGGCTTGACTTAGGTGGGATTGGGGTCGGTC
TGGGCGTTGGATTGGGGATTGGTATTGGCGGCGGGGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCAG
GTTCTGGTTCAGGCTCATCATCTAGTTCTAGCTCTAGCTCGTCATCAAGTTCGAGTTCTA
GTGGTTCGGGTGGTCGATCGGGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATTTGCTGGATCTAGGG
CTGGATCAGGATCTGGTAACTAAATAATTGGTACGATTTATTTCCTACTTAAAGTGTGAA
CCAAAAAGTGTGTGTGTTTATGCTGTTGGTTTGTCGTGTGTGTGTGTACGAAGTTTGATG
AATAAAATGTTGTCATAAGCTATGTTTTGTTTGAGTCTGTATGTTTCCATACAAGTCTAA
ATTGTGATATAATATC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2GK68JQ 605 0 0
GG
CCAACTAAGTTACACTACAAGCCTACAAACTCAAGACACATTGATTGGCAAGTCTTTACA
TACCAAATTTCTTTTAAAGGTTTTTACACACGAAGAATTCCAAAATGGCTAGGGTCCAAG
GTCTAGTGCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAGTTATGTTAACTGAGAGCCGAG
TCGAAAGAAAAGAGTCAAAAAGCTTGGGGCTTGACTTAGGTGGGATTGGGGTCGGTCTGG
GCGTTGGATTGGGGATTGGTATTGGCGGCGGGGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCAGGTT
CTGGTTCAGGCTCATCATCTAGTTCTAGCTCTAGCTCGTCATCAAGTTCGAGTTCTAGTG
GTTCGGGTGGTCGATCGGGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATTTGCTGGATCTAGGGCTG
GATCAGGATCTGGTAACTAAATAATTGGTACGATTTATTTCCTACTTAAAGTGTGAACCA
AAA*GTGTGTGTGTTTATGCTGTTGGTTTGTCGTGTGTGTGTGTACGAAGTTTGATGAAT
AAAATGTTGTCATAAGCTATGTTTTGTTTGAGTCTGTATGTTTCCATACAAGTCTAAATT
GTG

QA 3 605 3 605
DS 

RD RR2BW12TF 617 0 0
GGATCCAACTAAGTTACACTGCAAGCCTACAAACTCAAGACACATTGATTGGCAAGTCTT
TACATACCAAATTTCTTTTAAAGGTTTTTACACACGAAGAATTCCAAAATGGCTAGGGTC
CAAGGTCTAGTGCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAGTTATGTTAACTGAGAGC
CGAGTCGAAAGAAAAGAGTCAAAAAGCTTGGGGCTTGACTTAGGTGGGATTGGGGTCGGT
CTGGGCGTTGGATTGGGGATTGGTATTGGCGGCGGGGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCA
GGTTCTGGTTCAGGCTCATCATCTAGTTCTAGCTCTAGCTCGTCATCAAGCTCGAGTTCT
AGTGGTTCGGGTGGTCGATCGGGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATTTGCTGGATCTAGG
GCTGGATCAGGATCTGGTAACTAAATAATTGGTACGATTTATTTCCTACTTAAAGTGTGA
ACCAAAAAGTGTGTGTGTTTATGCTGTTGGTTTGTCGTGTGTGTGTGTACGAAGTTTGAT
GAATAAAATGTTGTCATAAGCTATGTTTTGTTTGAGTCTGTATGTTTCCATACAAGTCTA
AATTGTGATATAATATC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2B103TF 631 0 0
GGATCCAACTAAGTTACACTACAAGCCTACAAACTCAAGACACATTGGTTGGCAAGTCTT
TACATACCAAATTTCTTTTAAAGGTTTTTACACACGAAGAATTCCAAAATGGCTAGGGTC
CAAGGTCTAGTGCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAATTATGTTAACTGAGAGC
CGAGTCGAAAGAAAAGAGTCAAAAAGCTTGGGGCTTGACTTAGGTGGGATTGGGGTCGGT
CTGGGCGTTGGATTGGGGATTGGTATTGGCGGCGGGGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCA
GGTTCTGGTTCAGGCTCATCATCTAGTTCTAGCTCTAGCTCGTCATCAAGTTCGAGTTCT
AGTGGTTCGGGTGGTCGATCGGGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATTTGCTGGATCTAGG
GCTGGATCAGGATCTGGTAACTAAATAATTGGTACGATTTATTTCCTACTTAAAGTGTGA
ACCAAAAAGTGTGTGTGTTTATGCTGTTGGTTTGTCGTGTGTGTGTGTACGAAGTTGGAT
GAATAAAATGTTGTCATAAGCTATGCTTTGTTTGAGTCTGTATGTTTCTATACAAGTCTA
AATTGTGATATAATATCTTTAAAT
TTAGATC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 2 11

CO CL371Contig1 621 9 5 U
GGAATATAAGTTGGCCGTCATATAAGATTAGTTTCTTCTTCCTCCTCTGAAGCCGAAGAC
GAAGACGAAGAAGAATCATCCCTAGTTTTTTGGTGGCAAGCGACTCGCTACAATGACAAA
GGGAACAGGAAGTTTTGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACACTCTGTGTGAGATGTGG
TCGTCGTAGCTTCCACATCCAGAAGAGTCGCTGCTCCGCCTGCGCTTACCCCGCCGCTCG
CAAGAGGACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCAGGAGGAAGACAACCGGAACCGGTAG
GATGAGGTATCTCAAAAATGTTCCCCGCCGTTTCAAGACTGGTTTCAGAGAAGGTACTGA
AGCCAAGCCAAGGAACAAGGGAGCATCAGCTTCCTCAGCCTAAAAGAATATCCTCAGTTC
TCGAGTTTAAACGCAGGAAGAAGACTTGGCACTTTTCGCTCTTATCTAATTTTGAGATTT
TGCTATTCCTGAAATACAATTTATGTTTTTGTTTCATGTTTTGAACCTGGATCATCCCTT
CATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTTTCTTTCTTTGCCTAATTACGTTCATCCAAGTGCTCG
TGTAGATTTCTATTGTGTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C538TF U 86
AF RR2C538JQ C 1
AF RR2A515TF U 47
AF RR2AW90TFB U 439
AF RR2DH89TF U 446
AF RR2DH89JQ C 53
AF RR2F946JQ C 47
AF RR2F946TF U 47
AF RR2H751TF U 54
BS 1 48 RR2C538JQ
BS 49 366 RR2A515TF
BS 367 367 RR2F946TF
BS 368 590 RR2A515TF
BS 591 621 RR2H751TF

RD RR2C538TF 233 0 0
TTTTTTGGTGGCAAGCGACTCGCTACAATGACAAAGGGAACAGGAAGTTTTGGAAAGAGG
AGGAACAAGAGTCACACACTCTGTGTGAGATGTGGTCGTCGTAGCTTCCACATCCAGAAG
AGTCGCTGCTCCGCCTGCGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTACAACTGGAGTGTG
AAGGCAATCAGGAGGAAGACAACCGGAACCGGTAGGATGAGGTATCTCAAAAA

QA 1 233 1 233
DS 

RD RR2C538JQ 464 0 0
GGAATATAAGTTGGCCGTCATATAAGATTAGTTTCTTCTTCCTCCTCTGAAGCCGAAGAC
GAAGACGAAGAAGAATCATCCCTAGTTTTTTGGTGGCAAGCGACTCGCTACAATGACAAA
GGGAACAGGAAGTTTTGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACACTCTGTGTGAGATGTGG
TCGTCGTAGCTTCCACATCCAGAAGAGTCGCTGCTCCGCCTGCGCTTACCCCGCCGCTCG
CAAGAGGACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCAGGAGGAAGACAACCGGAACCGGTAG
GATGAGGTATCTCAAAAATGTTCCCCGCCGTTTCAAGACTGGTTTCAGAGAAGGTACTGA
AGCCAAGCCAAGGAACAAGGGAGCTTCAGCTTCCTCAGCCTAAAAGAATATCCTCAGTTC
TCGAGTTTAAACGCAGGAAGAAGACTTGGCACTTTTCGCTCTTA

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2A515TF 544 0 0
GG
GAAGCCGAAGACGAAGACGAAGAAGAATCATCCCTAGTTTTTTGGTGGCAAGCGACTCGC
TACAATGACAAAGGGAACAGGAAGTTTTGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACACTCTG
TGTGAGATGTGGTCGTCGTAGCTTCCACATCCAGAAGAGTCGCTGCTCCGCCTGCGCTTA
CCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCAGGAGGAAGACAAC
CGGAACCGGTAGGATGAGGTATCTCAAAAATGTTCCCCGCCGTTTCAAGACTGGTTTCAG
AGAAGGTACTGAAGCCAAACCAAGGAACAAGGGAGCATCAGCTTCCTCAGCCTAAAAGAA
TATCCTCAGTTCTCGAGTTTAAACGCAGGAAGAAGACTTGGCACTTTTCGCTCTTATCTA
ATTTTGAGATTTTGCTATTCCTGAAATACAATTTATGTTTTTGTTTCATGTTTTGAACCT
GGATCATCCCTTCATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTTTCTTTCTTTGCCTAATTACGTTCA
TC

QA 3 544 3 544
DS 

RD RR2AW90TFB 138 0 0
AGAAGACTTGGCACTTTTCGCTCTTATCTAATTTTGAGATTCTGCTATTCCTGAAATACA
ATTTATGTTTTTGTTTCATGTTTTGAACCTGGATAATCCCTTCATTTTGCAACTTTCAAA
AGTCTTTCTTTCTTTGCC

QA 1 138 1 138
DS 

RD RR2DH89TF 131 0 0
TTGGCACTTTTCGCTCTTATCTAATTTTGAGATTTTGCTATTCCTGAAATACAATTTATG
TTTTTGTTTCATGTTTTGAACCTGGATCATCCCTTCATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTTT
CTTTCTTTGCC

QA 1 131 1 131
DS 

RD RR2DH89JQ 524 0 0
GG
GAAGACGAAGACGAAGAAGAATCATCCCTAGTTTTTTGGTGGCAAGCGACTCGCTACAAT
GACAAAGGGAACAGGAAGTTTTGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACACTCTGTGTGAG
ATGTGGTCGTCGTAGCTTCCACATCCAGAAGAGTCGCTGCTCCGCCTGCGCTTACCCCGC
CGCTCGCAAGAGGACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCAGGAGGAAGACAACCGGAAC
CGGTAGGATGAGGTATCTCAAAAATGTTCCCCGCCGTTTCAAGACTGGTTTCAGAGAAGG
TACTGAAGCCAAGCCAGGGAACAAGGGAGCATCAGCTTCCTCAGCCTAAAAGAATATCCT
CAGTTCTCGAGTTTAAACGCAGGAAGAAGACTTGGCACTTTTCGCTCTTATCTAATTTTG
AGATTTTGCTATTCCTGAAATACAATTTATGTTTTTGTTTCATGTTTTGAACCTGGATCA
TCCCTTCATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTTTCTTTCTTTGCC

QA 3 524 3 524
DS 

RD RR2F946JQ 531 0 0
GG
GAAGCCGAAGACGAAGACGAAGAAGAATCATCCCTAGTTTTTTGGTGGCAAGCGACTCGC
TACAATGACAAAGGGAACAGGAAGTTTTGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACACTCTG
TGTGAGATGTGGTCGTCGTAGCTTCCACATCCAGAAGAGTCGCTGCTCCGCCTGCGCTTA
CCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCAGGAGTAAGACAAC
CGGAACCGGTAGGATGAGGTATTTCAAAAATGTTCCCCGCCGTTTCAAGACTGGTTTCAG
AGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGGGAGCATCAGCTTCCTCAGCCTAAAAGAA
TATCCTCAGTTCTCGAGTTTAAACGCAGGAAGAAGACTTGGCACTTTTCGCTTTTATCTA
ATTTTGAGATTTTGCTATTCCTGAAATACAATTTATGTTTTTGTTTCATGTTTTGAACCT
GGATCATCCCTTCATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTTTCTTTCTTTGCCT

QA 3 531 3 531
DS 

RD RR2F946TF 531 0 0
GG
GAAGCCGAAGACGAAGACGAAGAAGAATCATCCCTAGTTTTTTGGTGGCAAGCGACTCGC
TACAATGACAAAGGGAACAGGAAGTTTTGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACACTCTG
TGTGAGATGTGGTCGTCGTAGCTTCCACATCCAGAAGAGTCGCTGCTCCGCCTGCGCTTA
CCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCAGGAGTAAGACAAC
CGGAACCGGTAGGATGAGGTATCTCAAAAATGTTCCCCGCCGTTTCAAGACTGGTTTCAG
AGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGGGAGCATCAGCTTCCTCAGCCTAAAAGAA
TATCCTCAGTTCTCGAGTTTAAACGCAGGAAGAAGACTTGGCACTTTTCGCTCTTATCTA
ATTTTGAGATTTTGCTATTCCTGAAATACAATTTATGTTTTTGTTTCATGTTTTGAACCT
GGATCATCCCTTCATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTTTCTTTCTTTGCCT

QA 3 531 3 531
DS 

RD RR2H751TF 568 0 0
G
GAAGACGAAGACGAGGAAGAATCATCCCTAGTTTTTTGGTGGCAAGCGACTCGCTACAAT
GACAAAGGGAACAGGAAGTTTTGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACACTCTGTGTGAG
ATGTGGTCGTCGTAGCTTCCACATCCAGAAGAGTCGCTGCTCCGCCTGCGCTTACCCCGC
CGCTCGCAAGAGGACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCAGGAGGAAGACAACCGGAAC
CGGTAGGATGAGGTATCTCAAAAATGTTCCCCGCCGTTTCAAGACTGGTTTCAGAGAAGG
TACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGGGAGCATCAGCTTCCTCAGCCTAAAAGAATATCCT
CAGTTCTCGAGTTTAAACGCAGGAAGAAGACTTGGCACTTTTCGCTCTTATCTAATTTTG
AGATTTTGCTATTCCCGAAATACAATTTATGTTTTTGTTTCATGTTTTGAACCTGGATCA
TCCCTTCATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTTTCTTTCTTTGCCTAATTACGTTCATCCAAG
TGCTCGTGTAGATTTCTATTGTGTACT

QA 2 568 2 568
DS 



CO CL371Contig2 546 2 1 U
GGCTTCTTCCTTCTCTGAAGCCGAAGACGAAGAAGAATCATCCCTAGTTTTTTGGTGGCA
AGCGACTCGCTACAATGACAAAGGGAACAGGAAGTTTTGGAAAGAGGAGGGACAAGAGTC
ACACACTGTGTGTGAGATGTGGTCGTCGTAGCTTCCACATCCAGAAGAGTCGCTGCTCTG
CCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCCATCAGGA
GGAAGACAACCGGAACCGGTAGGATGAGATACCTCAAAAATGTTCCCCGCCGTTTCAAGA
CTGGTTTCAGAGAAGGCACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGGGAGCATCAGCTTCTTCAG
CCTAAAAGAACATCCTCAGTTCCAGTTTAAACGCAGGAAGACTTGGCAGCACTTTTCGCT
CTATCTAATTTTCAGATTGCTATTCCTGAATACATTTATGTTTTTGTTTCAAGTTTTGGA
CCTGGATCATCCCTTCTCATTTTGCAACTTTCAAAAATCTTTTCTTTGCCTAATTACATT
CCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2DL41TF U 1
AF RR2DL41JQ C 48
BS 1 546 RR2DL41TF

RD RR2DL41TF 546 0 0
GGCTTCTTCCTTCTCTGAAGCCGAAGACGAAGAAGAATCATCCCTAGTTTTTTGGTGGCA
AGCGACTCGCTACAATGACAAAGGGAACAGGAAGTTTTGGAAAGAGGAGGGACAAGAGTC
ACACACTGTGTGTGAGATGTGGTCGTCGTAGCTTCCACATCCAGAAGAGTCGCTGCTCTG
CCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCCATCAGGA
GGAAGACAACCGGAACCGGTAGGATGAGATACCTCAAAAATGTTCCCCGCCGTTTCAAGA
CTGGTTTCAGAGAAGGCACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGGGAGCATCAGCTTCTTCAG
CCTAAAAGAACATCCTCAGTTCCAGTTTAAACGCAGGAAGACTTGGCAGCACTTTTCGCT
CTATCTAATTTTCAGATTGCTATTCCTGAATACATTTATGTTTTTGTTTCAAGTTTTGGA
CCTGGATCATCCCTTCTCATTTTGCAACTTTCAAAAATCTTTTCTTTGCCTAATTACATT
CCATCC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2DL41JQ 499 0 0
TTTTTTGGTGGCAAGCGACTCGCTACAATGACAAAGGGAACAGGAAGTTTTGGAAAGAGG
AGGGACAAGAGTCACACACTGTGTGTGAGATGTGGTCGTCGTAGCTTCCACATCCAGAAG
AGTCGCTGCTCTGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTACAACTGGAGTGTG
AAGGCCATCAGGAGGAAGACAACCGGAACCGGTAGGATGAGATACCTCAAAAATGTTCCC
CGCCGTTTCAAGACTGGTTTCAGAGAAGGCACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGGGAGCA
TCAGCTTCTTCAGCCTAAAAGAACATCCTCAGTTCCAGTTTAAACGCAGGAAGACTTGGC
AGCACTTTTCGCTCTATCTAATTTTCAGATTGCTATTCCTGAATACATTTATGTTTTTGT
TTCAAGTTTTGGACCTGGATCATCCCTTCTCATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTTTTCTTT
GCCTAATTACATTCCATCC

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 8

CO CL372Contig1 901 8 21 U
GGAAAAACACTTTTCACCAAGCTTTCGAAGGACTACATCAATCAATGGCGTCCTCTCCCA
TTTCCCCTGCTACTCAGCTTGGTTCGAGCAGAAGTGCTACTATGTTGGCCATGTCGCGTG
GGATGATGTTTGTGAAGCCAGCGAGGACGAGTCACCAGATGGTGAGGAAGGAGAAGATTG
GTCTGAGAATCGCTTGTCAGGCGACGAGTATACCAGCAGACAACGTTCCAGACATGGAAA
AGAGGAAAACTTTGAATCTTCTTCTTGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTACTGGCTTCATGC
TTGTCCCTTACGCTACCTTCTTCGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGGTGGTGGTACTC
CAGCCAAGGATGCACTTGGAAACGATGTCATTGCCGCAGAATGGCTTAAGACTCATGGTG
CTGGTGATCGAACCTTGACTCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTAGTTGTGGAGA
ACGACAAGACACTAGCGACCTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTAGGATGTGTTG
TGCCGTGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGATCCCAATACAATG
CACAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGCACATGCGGATA
TTGATGATGGTGGAAAGGTTGTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACTGACTTCAGGACTGGTG
ATGCCCCTTGGTGGTCTTAAATCTCTCTTACAACAAACTCTTTTTGTGGGGG*AGAAGAA
TGGGGATGGCTGTCTTTTTGTGTTTGAATGTTATTATAATGTAAAAGCTGTGTGTAATCT
CTCATACATTTCATGGCAAATTACTTTGTGAATTCTTGCCTCTTTATATGAATTTTATGT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 10 45 45 45 45 45 50 20 50 50 50 50 50 20 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 5 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 5 45 45 45 45 
45 5 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW02TF U 17
AF RR2CA03TF U 1
AF RR2D882TF U 62
AF RR2AW28TFB U 201
AF RR2B027TF U 356
AF RR2DW02JQ C 490
AF RR2CA57TF U 179
AF RR2AW28JQ C 6
BS 1 147 RR2CA03TF
BS 148 148 RR2DW02TF
BS 149 156 RR2CA03TF
BS 157 157 RR2DW02TF
BS 158 265 RR2CA03TF
BS 266 266 RR2DW02TF
BS 267 293 RR2CA03TF
BS 294 294 RR2DW02TF
BS 295 394 RR2CA03TF
BS 395 395 RR2AW28TFB
BS 396 406 RR2CA03TF
BS 407 407 RR2AW28TFB
BS 408 601 RR2CA03TF
BS 602 602 RR2AW28TFB
BS 603 655 RR2CA03TF
BS 656 656 RR2AW28TFB
BS 657 667 RR2CA03TF
BS 668 668 RR2AW28TFB
BS 669 708 RR2CA03TF
BS 709 873 RR2B027TF
BS 874 901 RR2AW28JQ

RD RR2DW02TF 558 0 0
GGA
AGCTTTCGAAGGACTACATCAATCAATGGCGTCCTCTCCCATTTCCCCTGCTACTCAGCT
TGGTTCGAGCAGAAGTGCCACTATGTTGGCCATGTCGCGTGGGATGATGTTTGTGAAGCC
AACGAGGACGAGTCACCAGATGGTGAGGAAGGAGAAGATTGGTGTGAGAATTGCTTGTCA
GGCGACGAGTATACCAGCAGACAACGTTCCAGACATGGAAAAGAGGAAAACTTTGAATCT
TCTTCTTGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTACTGGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTT
CTTTGCTCCTCCTGGATCAGGAGGTGGAGGTGGTGGTACACCAGCCAAGGATGCACTTGG
AAACGATGTCATTGCAGCAGAATGGCTCAAGACTCATGGTGCTGGTGATCGAACCTTAAC
CCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTAGTTGTGGAGAACGACAAGACACTAGCAAC
GTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTTGGATGTGTTGTGCCATGGAACAAAGCTGA
GAACAAGTTCCTATG

QA 4 558 4 558
DS 

RD RR2CA03TF 708 0 0
GGAAAAACACTTTTCACCAAGCTTTCGAAGGACTACATCAATCAATGGCGTCCTCTCCCA
TTTCCCCTGCTACTCAGCTTGGTTCGAGCAGAAGTGCTACTATGTTGGCCATGTCGCGTG
GGATGATGTTTGTGAAGCCAGCGAGGATGAGTCACCGGATGGTGAGGAAGGAGAAGATTG
GTCTGAGAATCGCTTGTCAGGCGACGAGTATACCAGCAGACAACGTTCCAGACATGGAAA
AGAGGAAAACTTTGAATCTTCTTCTCGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTACTGGCCTCATGC
TTGTCCCTTACGCTACCTTCTTCGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGGTGGTGGTACTC
CAGCCAAGGATGCACTTGGAAACGATGTCATTGCAGCAGAATGGCTCAAGACTCATGGTG
CTGGTGATCGAACCTTGACTCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTAGTTGTGGAGA
ACGACAAGACACTAGCGACCTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTAGGATGTGTTG
TGCCGTGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGATCCCAATACAATG
CTCAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGCACATGCCGATA
TTGATGACGGTGGAAAGGTTGTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACTGACT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2D882TF 613 0 0
TTC
CCCTGCTACTCAGCTTGGTTCGAGCAGAAGTGCTACTATGTTGGCCATGTCGCGTGGGAT
GATGTTTGTGAAGCCAGCGAGGATGAGTCACCAGATGGTGAGGAAGGAGAAGATTGGTCT
GAGAATCGCTTGTCAGGCGACGAGTATACCAGCAGACAACGTTCCAGACATGGAAAAGAG
GAAAACTTTGAATCTTCTTCTCGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTACTGGCTTCATGCTTGT
CCCTTACGCTACCTTCTTCGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGGTGGTGGTACTCCAGC
CAAGGATGCACTTGGAAACGATGTCATTGCAGCAGAATGGCTCAAGACTCATGGTGCTGG
TGATCGAACCTTGACTCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTAGTTGTGGAGAACGA
CAAGACACTAGCGACCTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTAGGATGTGTTGTGCC
GTGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGATCCCAATACAATGCTCA
AGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGCACATGCCGATATTGA
TGA
CGTGGAA

QA 4 606 4 606
DS 

RD RR2AW28TFB 473 0 0
GG
GACGAGTATACCAGCAGACAACGTTCCAGACATGGAAAAGATGAAAACTTTGAATCTTCT
TCTTGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTACTGGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTTCTT
CGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGGTGGTGGTACTCCAGCCAAGGATGCACTTGGAAA
CGATGTCATTGCCGCAGAATGGCTTAAGACTCATGGTGCTGGTGATCGAACCTTGACTCA
AGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTAGTTGTGGAGAACGGCAAGACTCTAGCGACCTA
CGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTAGGATGTGTTGTGCCGTGGAACAAAGCTGAGAA
CAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGATCCCAATACAATGCACGAGGCAGAGTCGTTAGAGG
TCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGCACATGCGGATATCGATGATGGTGG

QA 3 473 3 473
DS 

RD RR2B027TF 519 0 0
TACTCCAGCCAAGGATGCACTTGGAAACGATGTCATTGCCGCAGAATGGCTTAAGACTCA
TGGTGCTGGTGATCGAACCTTGACTCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTAGTTGT
GGAGAACGACAAGACACTAGCGACCTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTAGGATG
TGTTGTGCCGTGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGATCCCAATA
CAATGCACAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGCACGTGC
GGATATCGATGATGGTGGAAAGGTTGTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACTGACTTCAGGAC
TGGTGATGCCCCTTGGTGGTCTTAAATCTCTCTTACAACAAACTCTTTTTGTGGGGG*AG
AAGAATGGGGATGGCTGTCTTTTTGTGTTTGAATGTTATTATAATGTAAAAGCTGTGTGT
AATCTCTCATACATTTCATGGCAAATTACTTTGTGAAT
T

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2DW02JQ 368 0 0
CACTAGCAACGTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTTGGATGTGTTGTGCCATGGA
ACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGATCCCAATACAATGCTCAAGGCA
GAGTCGTTAGAGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGCACATGCCGATATTGATGATG
GTGGAAAGGTTGTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACTGACTTCAGGACTGGTGATGCCCCTT
GGTGGTCTTAAATCTCTCTTACAACAA*CTCTTTTTGTGGGGGGAGAAGAATGTGGATGG
CTGTCTTTTTGTGTTTGAATGTTATTATAATGTAAAAGCTGTGTGTAATCAATCATACAT
TTCATGGC

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR2CA57TF 706 0 0
G
GGTCTGAGAATCGCTTGTCAGGCGACGAGTATACCAGCAGACAACGTTCCAGACATGGAA
AAGAGGAAAACTTTGAATCTTCTTCTTGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTACTGGATTCATG
CTTGTCCCTTACGCTACCTTCTTTGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGGTGGTGGTACT
CCAGCCAAGGATGCACTTGGAAACGATGTCATTGCCGCAGAATGGCTTAAGACTCATGGT
GCTGTTGATCGAACCTTGACTCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTAGTTGTGGAG
AACGACAAGACACTAGCGACCTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTAGGATGTGTT
GTGCCGTGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGATCCCAATACAAT
GCACAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCTCCATTATCGCTTGCGTTGGCACATGCGGAT
ATTGATGATGGTGGAAAGGTTGTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACTGACTTCAGGACTGGT
GATGCCCCTTGGTGGTCTTAAATCTCTCTTACAACAA*TTCTTTTTGTGGGG**AGAAGA
ATGGGGATGGCTGTCTTTTTGTGTTTGAATGTTATTATAATGTAAAGGCTGTGTGTAATC
**TCATACATTTCATGGCAAATTACTCTGTGAAT
CTGCCTCTTTA

QA 2 695 2 695
DS 

RD RR2AW28JQ 896 0 0
AAACCCTTTCACAT
AGCTTTCCAAGGACTACATCAATCAATGGCGTCCTCTCCCATT**CCCTGCTACTCAGCT
TGGTTCGAGCAGAAGTGCTACTATGTTGGCCATGTCGCGTGGGATGATGTTTGTGAAGCC
AGCGAGGACGAGTCACCAGATGGTGAGGAAGGAGAAGATTGGTCTGAGAATCGCTTGTCA
GGCGACGAGTATACCAGCAGACAACGTTCCAGACATGGAAAAGATGAAAACTTTGAATCT
TCTTCTTGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTACTGGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTT
CTTCGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGGTGGTGGTACTCCAGCCAAGGATGCACTTGG
AAACGATGTCATTGCCGCAGAATGGCTTAAGACTCATGGTGCTGGTGATCGAACCTTGAC
TCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTAGTTGTGGAGAACGGCAAGACTCTAGCGAC
CTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTAGGATGTGTTGTGCCGTGGAACAAAGCTGA
GAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGATCCCAATACAATGCACGAGGCAGAGTCGTTAG
AGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGCACATGCGGATATCGATGATGGTGGAAAGGT
TGTGTTTGTTCCATGGGTCGAAACTGACTTCAGGACTGGTGATGCCCCTTGGTGGTCTTA
AATCTCTCTTACAACAAACTCTTTTTGTGGGGG*AGAAGAATGGGGATGGCTGTCTTTTT
GTGTTTGAATGTTATTATAATGTAAAAGCTGTGTGTAATCTCTCACACATTTCATGGCAA
ATTACTTTGTGAATTCTTGCCTCTTTATATGAATTTTATGTT

QA 15 896 15 896
DS 



AS 1 12

CO CL373Contig1 502 12 4 U
GGAGTCACAAGTTTCCTTTACAAATTATAAGTTCGTTTTCCAAGAGGAGATAAGAAAATG
TCTAGCAACAGTCAGAGTATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAAACCCAGGAG
AAGGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCTAATGCTGCTCAATCTGCCAAGGAATCTTTG
TCAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAAGCACAGGGTGCGACTGAGGCAATTAAGGAA
AAGACGGGCTTGGGCAAATGAGAACGCCCGTTCCGAATAAGAATTTACGTTTTTATTCCT
ACCATACTATTACTAATAATTAGATAGGTTTATCTATCTAAAGCCTAAGATTAAGGATTT
CAAACGAAGCCGTTTAGGCAAAATCTTTTCTGGATTATCTAAGATATTCAATATCAATCC
AAGGGTTGTTGACTCTTATCTTTTGATTAATATGTAGCCTTGCAGTTATTTGATATTTCT
ATATAATTTAATAAAAATATGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 10 10 10 10 

AF RR2FR21JQ C 14
AF RR2FR21TF U 14
AF RR2BX17JQ C 333
AF RR2GW03JQ C 1
AF RR2BX17TF U 333
AF RR2CN20JQ C 14
AF RR2CN20TF U 14
AF RR2GQ75JQ C 14
AF RR2GQ75TF U 14
AF RR2EG63JQ C 14
AF RR2EG63TF U 14
AF RR2GW03TF U 1
BS 1 13 RR2GW03TF
BS 14 333 RR2FR21TF
BS 334 498 RR2BX17TF
BS 499 502 RR2GW03JQ

RD RR2FR21JQ 319 0 0
TCCTTTACAAATTATAAGTTCGTTTTCCAAGAGGAGATAAGAAAATGTTTAGCAACAGTC
AGAGTATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAAACCCAGGAGAAGGCAAGCAACC
TGATGGACAAGGCCTTTAATGCTGCTCAATTTGCCAAGGAATTTTTGTCAGAGGGTGGAC
AGCAGCTGAAGCAGAAAGCACAGGGTGGGACTGAGGCAATTAAGGAAAAGACGGGCTTGG
GCAAATGAGAACGCCCGTTCCGAATAAGAATTTACGTTTTTATTCCTACCATACTATTAC
TAATAATTAGATAGGTTTA

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR2FR21TF 424 0 0
TCCTTTACAAATTATAAGTTCGTTTTCCAAGAGGAGATAAGAAAATGTCTAGCAACAGTC
AGAGTATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAAACCCAGGAGAAGGCAAGCAACC
TGATGGACAAGGCCTCTAATGCTGCTCAATCTGCCAAGGAATCTTTGTCAGAGGGTGGAC
AGCAGCTGAAGCAGAAAGCACAGGGTGCGACTGAGGCAATTAAGGAAAAGACGGGCTTGG
GCAAATGAGAACGCCCGTTCCGAATAAGAATTTACGTTTTTATTCCTACCATACTATTAC
TAATAATTAGATAGGTTTATCTATCTAAAGCCTAAGATTAAGGATTTCAAACGAAGCCGT
TTAGGCAAAATCTTTTCTGGATTATCTAAGATATTCAATATCAATCCAAGGGTTGTTGAC
TCTT

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR2BX17JQ 104 0 0
G
CTATTTAAAGCCTAAGATTAAGGATTTCAAACGAAGCCGTTTAGGCAAAATTTTTTTTGG
ATTATTTAAGATATTCAATATCAATCCAAGGGTTGTTGACTCT

QA 2 104 2 104
DS 

RD RR2GW03JQ 502 0 0
GGAGTCACAAGTTTCCTTTACAAATTATAAGTTCGTTTTCCAAGAGGAGATAAGAAAATG
TCTAGCAACAGTCAGAGTATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAAACCCAGGAG
AAGGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCTAATGCTGCTCAATCTGCCAAGGAATCTTTG
TCAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAAGCACAGGGTGCGACTGAGGCAATTAAGGAA
AAGACGGGCTTGGGCAAATGAGAACGCCCGTTCCGAATAAGAATTTACGTTTTTATTCCT
ACCATACTATTACTAATAATTAGATAGGTTTATCTATCTAAAGCCTAAGATTAAGGATTT
CAAACGAAGTCGTTTAGGCAAAATCTTTTCTGGATTATCTAAGATATTCAATATCAATCC
AAGGGTTGTTGACTCTTATCTTTTGATTAATATGTAGCCTTGCAGTTATTTGATATTTCT
ATGTAATTTAATAAAAATATGT

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR2BX17TF 166 0 0
G
CTATCTAAAGCCTAAGATTAAGGATTTCAAACGAAGCCGTTTAGGCAAAATCTTTTCTGG
ATTATCTAAGATATTCAATATCAATCCAAGGGTTGTTGACTCTTATCTTTTGATTAATAT
GTAGCCTTGCAGTTATTTGATATTTCTATATAATTTAATAAAAAT

QA 2 166 2 166
DS 

RD RR2CN20JQ 484 0 0
TCCTTTACAAATTATAAGTTCGTTTTCCAAGAGGAGATAAGAAAATGTCTAGCAACAGTC
AGAGTATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAAACCCAGGAGAAGGCAAGCAACC
TGATGGACAAGGCCTCTAATGCTGCTCAATCTGCCAAGGAATCTTTGTCAGAGGGTGGAC
AGCAGCTGAAGCAGAAAGCACAGGGTGCGACTGAGGCAATTAAGGAAAAGACGGGCTTGG
GCAAATGAGAACGCCCGTTCCGAATAAGAATTTACGTTTTTATTCCTACCATACTATTAC
TAATAATTAGATAGGTTTATCTATCTAAAGCCTAAGATTAAGGATTTCAAACGAAGCCGT
TTAGGCAAAATCTTTTCTGGATTATCTAAGATATTCAATATCAATCCAAGGGTTGTTGAC
TCTTATCTTTTGATTAATATGTAGCCTTGCAGTTATTTGATATTTCTATATAATTTAATA
AAAA

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2CN20TF 485 0 0
TCCTTTACAAATTATAAGTTCGTTTTCCAAGAGGAGATAAGAAAATGTCTAGCAACAGTC
AGAGTATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAAACCCAGGAGAAGGCAAGCAACC
TGATGGACAAGGCCTCTAATGCTGCTCAATCTGCCAAGGAATCTTTGTCAGAGGGTGGAC
AGCAGCTGAAGCAGAAAGCACAGGGTGCGACTGAGGCAATTAAGGAAAAGACGGGCTTGG
GCAAATGAGAACGCCCGTTCCGAATAAGAATTTACGTTTTTATTCCTACCATACTATTAC
TAATAATTAGATAGGTTTATCTATCTAAAGCCTAAGATTAAGGATTTCAAACGAAGCCGT
TTAGGCAAAATCTTTTCTGGATTATCTAAGATATTCAATATCAATCCAAGGGTTGTTGAC
TCTTATCTTTTGATTAATATGTAGCCTTGCAGTTATTTGATATTTCTATATAATTTAATA
AAAAT

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2GQ75JQ 485 0 0
TCCTTTACAAATTATAAGTTCGTTTTCCAAGAGGAGATAAGAAAATGTCTAGCAACAGTC
AGAGTATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAAACCCAGGAGAAGGCAAGCAACC
TGATGGACAAGGCCTCTAATGCTGCTCAATCTGCCAAGGAATCTTTGTCAGAGGGTGGAC
AGCCGCTGAAGCAGAAAGCACAGGGTGCGACTGAGGCAATTAAGGAAAAGACGGGCTTGG
GCAAATGAGAACGCCCGTTCCGAATAAGAATTTACGTTTTTATTCCTACCATACTATTAC
TAATAATTAGATAGGTTTATCTATCTAAAGCCTAAGATTAAGGATTTCAAACGAAGCCGT
TTAGGCAAAATCTTTTCTGGATTATTTAAGATATTCAATATCAATCCAAGGGTTGTTGAC
TCTTATCTTTTGATTAATATGTAGCCTTGCAGTTATTTGATATTTCTATATAATTTAATA
AAAAT

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2GQ75TF 485 0 0
TCCTTTACAAATTATAAGTTCGTTTTCCAAGAGGAGATAAGAAAATGTCTAGCAACAGTC
AGAGTATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAAACCCAGGAGAAGGCAAGCAACC
TGATGGACAAGGCCTCTAATGCTGCTCAATCTGCCAAGGAATCTTTGTCAGAGGGTGGAC
AGCCGCTGAAGCAGAAAGCACAGGGTGCGACTGAGGCAATTAAGGAAAAGACGGGCTTGG
GCAAATGAGAACGCCCGTTCCGAATAAGAATTTACGTTTTTATTCCTACCATACTATTAC
TAATAATTAGATAGGTTTATCTATCTAAAGCCTAAGATTAAGGATTTCAAACGAAGCCGT
TTAGGCAAAATCTTTTCTGGATTATCTAAGATATTCAATATCAATCCAAGGGTTGTTGAC
TCTTATCTTTTGATTAATATGTAGCCTTGCAGTTATTTGATATTTCTATATAATTTAATA
AAAAT

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2EG63JQ 485 0 0
TCCTTTACAAATTATAAGTTCGTTTTCCAAGAGGAGATAAGAAAATGTCTAGCAACAGTC
AGAGTATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAAACCCAGGAGAAGGCAAGCAACC
TGATGGACAAGGCCTCTAATGCTGCTCAATCTGCCAAGGAATCTTTGTCAGAGGGTGGAC
AGCAGCTGAAGCAGAAAGCACAGGGTGCGACTGAGGCAATTAAGGAAAAGACGGGCTTGG
GCAAATGAGAACGCCCGTTCCGAATAAGAATTTACGTTTTTATTCCTACCATACTATTAC
TAATAATTAGATAGGTTTATCTATCTAAAGCCTAAGATTAAGGATTTCAAACGAAGCCGT
TTAGGCAAAATCTTTTCTGGATTATCTAAGATATTCAATATCAATCCAAGGGTTGTTGAC
TCTTATCTTTTGATTAATATGTAGCCTTGCAGTTATTTGATATTTCTATATAATTTAATA
AAAAT

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2EG63TF 485 0 0
TCCTTTACAAATTATAAGTTCGTTTTCCAAGAGGAGATAAGAAAATGTCTAGCAACAGTC
AGAGTATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAAACCCAGGAGAAGGCAAGCAACC
TGATGGACAAGGCCTCTAATGCTGCTCAATCTGCCAAGGAATCTTTGTCAGAGGGTGGAC
AGCAGCTGAAGCAGAAAGCACAGGGTGCGACTGAGGCAATTAAGGAAAAGACGGGCTTGG
GCAAATGAGAACGCCCGTTCCGAATAAGAATTTACGTTTTTATTCCTACCATACTATTAC
TAATAATTAGATAGGTTTATCTATCTAAAGCCTAAGATTAAGGATTTCAAACGAAGCCGT
TTAGGCAAAATCTTTTCTGGATTATCTAAGATATTCAATATCAATCCAAGGGTTGTTGAC
TCTTATCTTTTGATTAATATGTAGCCTTGCAGTTATTTGATATTTCTATATAATTTAATA
AAAAT

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2GW03TF 502 0 0
GGAGTCACAAGTTTCCTTTACAAATTATAAGTTCGTTTTCCAAGAGGAGATAAGAAAATG
TCTAGCAACAGTCAGAGTATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAAACCCAGGAG
AAGGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCTAATGCTGCTCAATCTGCCAAGGAATCTTTG
TCAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAAGCACAGGGTGCGACTGAGGCAATTAAGGAA
AAGACGGGCTTGGGCAAATGAGAACGCCCGTTCCGAATAAGAATTTACGTTTTTATTCCT
ACCATACTATTACTAATAATTAGATAGGTTTATCTATCTAAAGCCTAAGATTAAGGATTT
CAAACGAAGTCGTTTAGGCAAAATCTTTTCTGGATTATCTAAGATATTCAATATCAATCC
AAGGGTTGTTGACTCTTATCTTTTGATTAATATGTAGCCTTGCAGTTATTTGATATTTCT
ATGTAATTTAATAAAAAT
ATGT

QA 1 498 1 498
DS 



AS 2 9

CO CL374Contig1 1558 7 18 U
GGACACATTCCCCTTCATCTCCATTTCTCACACTTAAAAAGGCATAAGAAAGAACAATGG
CGAAAAAGTTGGATGCTCAAGGTGGCCGCGGAGGAGAGCTATGGGACGATGGTGGTGTTT
ATGAGAACATCAAGAAAGTGTACGTCGGTCAAGGTGACTCTGGTGTGGTTTACGTCAAGT
TTGATTACGAGAAAGACGGCAAGATCGTATCACTCGAACATGGGAAGAAGACACTTCTTG
ATCCAGAGGAGTTTGAGCTTGATCCAGAAGATTACATCACATCCGTGAAAGTGTACTACG
AAAAGCCCTTTGGAACGCCAGTGGAGATCATCACGGCTCTTATCTTCAAAACATTCAAAG
GCAAAGTTTCTCAGCCTTTTGGATTAGCTTCTGGAACAGAAGCCGAGCTTGGAGGTGGCA
AGATCGTCGGATTCCATGGAAGTTCCAGTGATGCTATTCATTCCCTGGGGGCTTATATAA
CACCGCCAACTACTCCGGTGACTCCACCGGCGTCAGGTGGTCCGACCAAACTGGAAGCTC
AAGGTGGTCGTGGAGGAGAGTTATGGGACGATGGTGGTGTTTATGAGAATGTCAAGAAAG
TGTATGTTGGACAAGGTGACTCTGGTGTGGTTTATGTCAAGTTTGATTATGAGAAAGATG
GGAAGATTGTATCACTCGAACATGGTAAAAAGACGTTACTTGACCCAGAGGAGTTTGAGC
TTGATTCAGATGATTACATAACATCTGTGAAAGTTTACTACGAGAAACTCTTTGGAACAC
CAACAGAGATCATCACGGCTCTTATCTTCAAGACATTCAAGGGAAAAGTTTCTCAGCCAT
TTGGAATGGCCTCTGGACAAGAAGCAGAGCTAGGAGGTGGCAAAATCGTTGGATTCCATG
GAAGTGCAAGCGACGTGATCCACTCTCTTGGAGCTTATATTGCTCCTACGTCAACACCAG
TGACTCCCGTCGATACTATTCCAGCACAAGGTGGAGACGCTGGAGTTAAGTGGGACGATG
GTGTTCATGATGATGTGAAGAAGATATATGTAGGACAAGGTGACTCTTGTGTGACTTATT
TCGAGGCTGAGTATGTAAATGCTTCAAAGCCTGTCCTTGGAAGTGTTCATGGGAAGAAGT
CATTGCTTGATGCTGAAGAGTTTGTGCTTGAAGATGGTGAATATGTCACAGGTGTGATAG
GCTACTATGACAAGATTTATGGTGTCGATGCACCGGCCATCATCTGTCTTAAATTCAAGA
CAAACAAGAGAATTTCTGACCCGTATGGAATGGACTCAGGAACTGAATTCGTGCTGGAGA
AGAAAGACCACAAGGTCGTTGGGTTCTATGGACAAGCTGGTGAGTTTCTTTACAAGATCG
GAGTTAGAGTGGCGCCCATAGCCATCTGATGCAGAACCAATCTTATATTGTGTATGAATA
AGATTATCATGTGAACTTATGGAGTTGCATGGTCTATTGTTGTTGTTTTTGGTTTGTCTT
ATATCTTAATGTACGTTTGTCTTGTCTATTGGCTATCTAAATAAAGGAGGGTTCTTCT


BQ
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 25 25 25 

AF RR2AE55TF U 1
AF RR2FU16TF U 1
AF RR2GH16TF U 554
AF RR2FU16JQ C 673
AF RR2AD95JQ C 853
AF RR2GL53JQ C 777
AF RR2BZ22TF U 1229
BS 1 306 RR2AE55TF
BS 307 307 RR2FU16TF
BS 308 579 RR2AE55TF
BS 580 580 RR2FU16TF
BS 581 608 RR2AE55TF
BS 609 609 RR2FU16TF
BS 610 685 RR2AE55TF
BS 686 686 RR2FU16TF
BS 687 688 RR2AE55TF
BS 689 689 RR2FU16TF
BS 690 796 RR2AE55TF
BS 797 797 RR2GH16TF
BS 798 802 RR2AE55TF
BS 803 1055 RR2GH16TF
BS 1056 1229 RR2FU16JQ
BS 1230 1548 RR2BZ22TF
BS 1549 1549 RR2FU16JQ
BS 1550 1558 RR2BZ22TF

RD RR2AE55TF 806 0 0
GGACACATTCCCCTTCATCTCCATTTCTCACACTTAAAAAGGCATAAGAAAGAACAATGG
CGAAAAAGTTGGATGCTCAAGGTGGCCGCGGAGGAGAGCTATGGGACGATGGTGGTGTTT
ATGAGAACATCAAGAAAGTGTACGTCGGTCAAGGTGACTCTGGTGTGGTTTACGTCAAGT
TTGATTACGAGAAAGACGGCAAGATCGTATCACTCGAACATGGGAAGAAGACACTTCTTG
ATCCAGAGGAGTTTGAGCTTGATCCAGAAGATTACATCACATCCGTGAAAGTGTACTACG
AAAAGCTCTTTGGAACGCCAGTGGAGATCATCACGGCTCTTATCTTCAAAACATTCAAAG
GCAAAGTTTCTCAGCCTTTTGGATTAGCTTCTGGAACAGAAGCCGAGCTTGGAGGTGGCA
AGATCGTCGGATTCCATGGAAGTTCCAGTGATGCTATTCATTCCCTGGGGGCTTATATAA
CACCGCCAACTACTCCGGTGACTCCACCGGCGTCAGGTGGTCCGACCAAACTGGAAGCTC
AAGGTGGTCGTGGAGGAGAGTTATGGGACGATGGTGGTGCTTATGAGAATGTCAAGAAAG
TGTATGTTTGACAAGGTGACTCTGGTGTGGTTTATGTCAAGTTTGATTATGAGAAAGATG
GGAAGATTGTATCACTCGAACATGGAAAGAAGACGTTACTTGACCCAGAGGAGTTTGAGC
TTGATTCAGATGATTACATAACATCTGTGAAAGTTTACTACGAGAAACTCTTTGGAACAC
CAACAGAGATCATCACCGCTCT
ATCT

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2FU16TF 794 0 0
GGACGCATTCCCCTTCATCTCCATTTCTCACACTTAAAAAGGCTTAAGAAAGAACAATGG
CGAAAAAGTTGGATGCTCAAGGTGGGCGCGGAGGAGAGCTATGGGACGATGGTGGTGTTT
ATGAGAACGTCAAGAAAGTGTATGTCGGTCAAGGTGACTCTGGTGTGGTTTACGTCAAGT
TTGATTACGAGAAAGACGGCAAGATCGTATCACTCGAACATGGGAAGAAGACACTTCTTG
ATCCAGAGGAGTTTGAGCTTGATCCAGAAGATTACATCACATCCGTGAAAGTGTACTACG
AAAAGCCCTTTGGAACGCCAGTGGAGATCATCACGGCTCTTATCTTCAAAACATTCAAAG
GCAAAGTTTCTCAGCCTTTTGGATTAGCTTCTGGAACAGAAGCCGAGCTTGGAGGTGGCA
AGATCGTCGGATTCCATGGAAGTTCCAGTGATGCTATTCATTCCCTGGGGGCTTATATAA
CACCGCCAACTACTCCGGTGACTCCACCGGCGTCAGGTGGTCCGACCAAGCTGGAAGCTC
AAGGTGGTCGTGGAGGAGAGTTATGGGACGATGGTGGTGTTTATGAGAATGTCAAGAAAG
TGTATGTTGGACAAGGTGACTCTGGTGTGGTTTATGTCAAGTTTGATTATGAGAAAGATG
GGAAGATTGTATCACTCGAACATGGTAAAAAGACGTTACTTGACCCAGAGGAGTTTGAGC
TTGATTCAGATGATTACATAACATCTGTGAAAGTTTACTACGAGAA*CTCTTTGGAACAC
CAACAGAGATCATC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2GH16TF 502 0 0
G
GGAGAGTTATGGGACGATGGTGGTGTTTATGAGAATGTCAAGAAAGTGTATGTTGGACAA
GGTGACTCTGGTGTGGTTTATGTCAAGTTTGATTATGAGAAAGATGGGAAGATTGTATCA
CTCGAACATGGTAAAAAGACGTTACTTGACCCAGAGGAGTTTGAGCTTGATTCAGATGAT
TACATAACATCTGTGAAAGTTTACTACGAGAAACTCTTTGGAACACCAACAGAGATCATC
ACGGCTCTTATCTTCAAGACATTCAAGGGAAAAGTTTCTCAGCCATTTGGAATGGCCTCT
GGACAAGAAGCAGAGCTAGGAGGTGGCAAAATCGTTGGATTCCATGGAAGTGCAAGCGAC
GTGATCCACTCTCTTGGAGCTTATATTGCTCCTACGTCAACACCAGTGACTCCCGTCGAT
ACTATTCCAGCACAAGGTGGAGACGCTGGAGTTAAGTGGGACGATGGTGTTCATGATGAT
GTGAAGAAGATATATGTAGGA

QA 2 502 2 502
DS 

RD RR2FU16JQ 886 0 0
CACTCGAACATGGTAA*AAGACGTTACTTGACCCAGAGGAGTTTGAGCTTGATTCAGATG
ATTACATAACATCTGTGAAAGTTTACTACGAGAAACTCTTTGGAACACCAACAGAGATCA
TCACGGCTCTTATCTTCAAGACATTCAAGGGAAAAGTTTCTCAGCCATTTGGGATGGCCT
CTGGACAAGAAGCAGAGCTAGGAGGTGGCAAAATCGTTGGATTCCATGGAAGTGCAAGCG
ACGTGATCCACTCTCTTGGAGCTTATATTGCTCCTACGTCAACACCAGTGACTCCCGTCG
ATACTATTCCAGCACAAGGTGGAGACGCTGGAGTTAAGTGGGACGATGGTGTTCATGATG
ATGTGAAGAAGATATATGTAGGACAAGGTGACTCTTGTGTGACTTATTTCGAGGCTGAGT
ATGTAAATGCTTCAAAGCCTGTCCTTGGAAGTGTTCATGGGAAGAAGTCATTGCTTGATG
CTGAAGAGTTTGTGCTTGAAGATGGTGAATATGTCACAGGTGTGATAGGCTACTATGACA
AGATTTATGGTGTCGATGCACCGGCCATCATCTGTCTTAAATTCAAGACAAACAAGAGAA
TTTCTGACCCGTATGGAATGGACTCAGGAACTGAATTCGTGCTGGAGAAGAAAGACCACA
AGGTCGTTGGGTTCTATGGACAAGCTGGTGAGTTTCTTTACAAGATCGGAGTTAGAGTGG
CGCCCATAGCCATCTGATGCAGAACCAATCTTATATTGTGTATGAATAAGATTATCATGT
GAACTTATGGAGTTGCATGGTCTATTGTTGTTGTTTTTGGTTTGTCTTATATCTTAATGT
ACGTTTGTCTTGTCTATTGGCTATCTAAATAAAGGAGGGTTCTTCT

QA 1 886 1 886
DS 

RD RR2AD95JQ 705 0 0
CTGGACAAGAAGCAGAGCTAGGAGGTGGCAAAATCGTTGGATTCCATGGAAGTGCAAGCG
ACGTGATCCACTCTCTTGGAGTTTATATTGCTCCTACGTCAACACCAGTGACTCCCGTCG
ATACTATTCCAGCACAAGGTGGAGACGCTGGAGTTAAGTGGGACGATGGTGTTCATGATG
ATGTGAAGAAGATATATGTAGGACAAGGTGACTCTTGTGTGACTTATTTCGAGGCTGAGT
ATGTAAATGCTTCAAAGCCTGTCCTTGGAAGTGTTCATGGGAAGAAGTCATTGCTTGATG
CTGAAGAGTTTGTGCTTGAAGATGGTGAATATGTCACAGGTGCGATAGGCTACTATGACA
AGATTTACGGTGTTGATGCACCGGCCATCATCTGTCTTAAATTCAAGACAAACAAGAGAA
TTTCTGACCCGTATGGAATGGACTCAGGAACTGAATTCGTGCTGGAGAAGAAAGACCACA
AGGTCGTTGGGTTCTATGGACAAGCTGGTGAGTTTCTTTACAAAATCGGAGTTAGAGTGG
CGCCCATAGCCAACTGATGCAGAACCAATCTTATATTGTGTATGAATAAGATTATCATGT
GAACTTATGGATTTGCATGATCTATTGTTGTTGTTTTTGGTTTATCTTATATCTTAATGT
ACGTTTGTCTTGTCTATTGGCTATCTAAATAAAGGAGGGTTCT
CC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2GL53JQ 782 0 0
ACACCAACAGAGATCATCACGGCTCTTATCTTCAAGACATTCAAGGGAAAAGTTTCTCAG
CCATTTGGAATGGCCTCTGGACAAGAAGCAGAGCTAGGAGGTGGCAAAATCGTTGGATTC
CATGGAAGTGCAAGCGACGTGATCCACTCTCTTGGAGCTTATATTGCTCCTACGTCAACA
CCAGTGACTCCCGTCGATACTATTCCAGCACAAGGTGGAGACGCTGGAGTTAAGTGGGAC
GATGGTGTTCATGATGATGTGAAGAAGATATATGTAGGACAAGGTGACTCTTGTGTGACT
TATTTCGAGGCTGAGTATGTAAATGCTTCAAAGCCTGTCCTTGGAAGTGTTCATGGGAAG
AGGTCATTGCTTGATGCTGAAGAGTTTGTGCTTGAAGATGGTGAATATGTCACAGGTGTG
ATAGGCTACTATGACAAGATTTATGGTGTCGATGCACCGGCCATCATCTGTCTTAAATTC
AAGACAAACAAGAGAATTTCTGACCCGTATGGAATGGACTCAGGAACTGAATTCGTGCTG
GAGAAGAAAGACCACAAGGTCGTTGGGTTCTATGGACAAGCTGGTGAGTTTCTTTACAAG
ATCGGAGTTAGAGTGGCGCCCATAGCCATCTGATGCAGAACCAATCTTATATTGTGTATG
AATAAGATTATCATGTGAACTTATGGAGTTGCATGGTCTATTGTTGTTGTTTTTGGTTTG
TCTTATATCTTAATGTACGTTTGTCTTGTCTATTGGCTATCTAAATAAAGGAGGGTTCTT
CT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2BZ22TF 330 0 0
G
GCACCGGCCATCATCTGTCTTAAATTCAAGACAAACAAGAGAATTTCTGACCCGTATGGA
ATGGACTCAGGAACTGAATTCGTGCTGGAGAAGAAAGACCACAAGGTCGTTGGGTTCTAT
GGACAAGCTGGTGAGTTTCTTTACAAGATCGGAGTTAGAGTGGCGCCCATAGCCATCTGA
TGCAGAACCAATCTTATATTGTGTATGAATAAGATTATCATGTGAACTTATGGAGTTGCA
TGGTCTATTGTTGTTGTTTTTGGTTTGTCTTATATCTTAATGTACGTTTGTCTTGTCTAT
TGGCTATCTAAATAAAGGATGGTTCTTCT

QA 2 330 2 330
DS 



CO CL374Contig2 922 2 8 U
CTTCATCTCCATTTCTCACACTTAAAAAGGCTTAAGAAAGAACAATGGCGAAAAAGTTGG
ATGCTCAAGGTGGCCGCGGAGGAGAGCTATGGGACGATGGTGGTGTTTATGAGAACGTCA
AGAAAGTGTATGTCGGTCAAGGTGACTCTGGTGTGGTTTACGTCAAGTTTGATTACGAGA
AAGACGGCAAGATCGTATCACTCGAACATGGGAAGAAGCAGAGCTAGGAGGTGGCAAAAT
CGTTGGATTCCATGGAAGTGCAAGCGACGTGATCCACTCTCTTGGAGCTTATATTGCTCC
TACGTCAACACCAGTGACTCCCGTCGATACTATTCCAGCACAAGGTGGAGACGCTGGAGT
TAAGTGGGACGATGGTGTTCATGATGATGTGAAGAAGATATATGTAGGACAAGGTGACTC
TTGTGTGACTTATTTCGAGGCTGAGTATGTAAATGCTTCAAAGCCTGTCCTTGGAAGTGT
TCATGGGAAGAAGTCATTGCTTGATGCTGAAGAGTTTGTGCTTGAAGATGGTGAATATGT
CACAGGTGTGATAGGCTACTATGACAAGATTTATGGTGTCGATGCACCGGCCATCATCTG
TCTTAAATTCAAGACAAACAAGAGAATTTCTGACCCGTATGGAATGGACTCACGAACTGA
ATTCGTGCTGGAGAAGAAAGACCACAAGGTGTTGGGTTCTATGGACAAGCTGGTGAGTTT
CTTTACAAGATCGGAGTTAGAGTGGCGCCCATAGCCATCTGATGCAGAACCAATCTTATA
TTGTGTATGAATAAGATTATCATGTGAACTTATGGAGTTGCATGGTCTATTGTTGTTGTT
TTTGGTTTGTCTTATATCTTAATGTACGTTTGTCTTGTCTATTGGCTATCTAAATAAAGG
AGGGTTCTTCTATTGTTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C072TF U 1
AF RR2C072JQ C 85
BS 1 678 RR2C072TF
BS 679 679 RR2C072JQ
BS 680 688 RR2C072TF
BS 689 689 RR2C072JQ
BS 690 707 RR2C072TF
BS 708 708 RR2C072JQ
BS 709 718 RR2C072TF
BS 719 922 RR2C072JQ

RD RR2C072TF 718 0 0
CTTCATCTCCATTTCTCACACTTAAAAAGGCTTAAGAAAGAACAATGGCGAAAAAGTTGG
ATGCTCAAGGTGGCCGCGGAGGAGAGCTATGGGACGATGGTGGTGTTTATGAGAACGTCA
AGAAAGTGTATGTCGGTCAAGGTGACTCTGGTGTGGTTTACGTCAAGTTTGATTACGAGA
AAGACGGCAAGATCGTATCACTCGAACATGGGAAGAAGCAGAGCTAGGAGGTGGCAAAAT
CGTTGGATTCCATGGAAGTGCAAGCGACGTGATCCACTCTCTTGGAGCTTATATTGCTCC
TACGTCAACACCAGTGACTCCCGTCGATACTATTCCAGCACAAGGTGGAGACGCTGGAGT
TAAGTGGGACGATGGTGTTCATGATGATGTGAAGAAGATATATGTAGGACAAGGTGACTC
TTGTGTGACTTATTTCGAGGCTGAGTATGTAAATGCTTCAAAGCCTGTCCTTGGAAGTGT
TCATGGGAAGAAGTCATTGCTTGATGCTGAAGAGTTTGTGCTTGAAGATGGTGAATATGT
CACAGGTGTGATAGGCTACTATGACAAGATTTATGGTGTCGATGCACCGGCCATCATCTG
TCTTAAATTCAAGACAAACAAGAGAATTTCTGACCCGTATGGAATGGACTCACGAACTGA
ATTCGTGCTGGAGAAGAA*GACCACAAG*TGTTGGGTTCTATGGACA*GCTGGTGAGT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2C072JQ 838 0 0
AGCTATGGGACGATGGTGGTGTTTATGAGAACGTCAAGAAAGTGTATGTCGGTCAAGGTG
ACTCTGGTGTGGTTTACGTCAAGTTTGATTACGAGAAAGACGGCAAGATCGTATCACTCG
AACATGGGAAGAAGCAGAGCTAGGAGGTGGCAAAATCGTTGGATTCCATGGAAGTGCAAG
CGACGTGATCCACTCTCTTGGAGCTTATATTGCTCCTACGTCAACACCAGTGACTCCCGT
CGATACTATTCCAGCACAAGGTGGAGACGCTGGAGTTAAGTGGGACGATGGTGTTCATGA
TGATGTGAAGAAGATATATGTAGGACAAGGTGACTCTTGTGTGACTTATTTCGAGGCTGA
GTATGTAAATGCTTCAAAGCCTGTCCTTGGAAGTGTTCATGGGAAGAAGTCATTGCTTGA
TGCTGAAGAGTTTGTGCTTGAAGATGGTGAATATGTCACAGGTGTGATAGGCTACTATGA
CAAGATTTATGGTGTCGATGCACCGGCCATCATCTGTCTTAAATTCAAGACAAACAAGAG
AATTTCTGACCCGTATGGAATGGACTCAGGAACTGAATTCGTGCTGGAGAAGAAAGACCA
CAAGGTGTTGGGTTCTATGGACAAGCTGGTGAGTTTCTTTACAAGATCGGAGTTAGAGTG
GCGCCCATAGCCATCTGATGCAGAACCAATCTTATATTGTGTATGAATAAGATTATCATG
TGAACTTATGGAGTTGCATGGTCTATTGTTGTTGTTTTTGGTTTGTCTTATATCTTAATG
TACGTTTGTCTTGTCTATTGGCTATCTAAATAAAGGAGGGTTCTTCTATTGTTATTTT

QA 1 838 1 838
DS 



AS 2 11

CO CL375Contig1 786 3 1 U
GGTTAATATACTTTTGTTTGGGTTTATTAGAATATTTTTGATTCTTTTCATTGGAAACAA
GAAGCAAATTACATTATATTACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCGAGACACGTCTTTTGT
TTTCTGATTTTGTAGTTTTAAAATGAGGAAACTAGAACATCATCATCGGAAGTATTTATA
CCTCTAAAGACGTTCCTGTCTGAAGGCAGACCGGCTACAACACCGTGTTCGATTCCACAT
TCGTTCGTTCCCCTCTTGATCTTGAAGTAACCATCATCACCCCAGCTTCGGTTCCATTGA
TTTGCAAGCAACCAATAGTCTTCGCCATCATCAGAAGTTCCCCAGCCAATAAGCTTGACA
GCATGACCTCCAATGTTAGCACCTGTTATGTGCTTGTACACTCCAGATTTGTAATGCGCA
AAGTCCTCGTAAACGGTAAAGGCAACCTCAACAGGTCCGTTTGTGTAAACTTCAGCCATA
ATGTCTTGAGGGTCATGCCTGACTTTGTAGGCGCTAACACCATAGTGTTTTGATTCACGC
CAAAGCTGGTTTCCACTAACACATTTCCTCACACATTTTGGTGTAGGGTATGCGGGTTCG
CATCCCGGGTGTGAGCATACAGTATTGTCAAAGTATGGATCACACTCTTCGGTGACTACA
CCGTGGTGCTTAAAGTATCGCCAGGCGGAAATAGGGTAGCCACCATTACAGCCTTGACCG
CAAAGGAATCCACAACATGCTAAGAGATCATTGACTGATAAAGAAATATTCATGTTATAT
TTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK51TF C 261
AF RR2BK51JQ U 336
AF RR2A763JQ U 1
BS 1 786 RR2A763JQ

RD RR2BK51TF 143 0 0
CC
TGAAGTAACCATCATCACCCCAGCTTCGGTTCCATTGATTTGCAAGCAACCAATAGTCTT
CGCCATCATCAGAAGTTCCCCAGCCAATAAGCTCGACAGCATGACCTCCAATGTTAGCAC
CTGTTATGTGCTTGTACACTC

QA 3 143 3 143
DS 

RD RR2BK51JQ 126 0 0
AGTTCCCCAGCCAATAAGCTTGACAGCATGACCTCCAATGTTAGCACCTGTTATGTGCTT
GTACACTCCAGATTTGTAATGCGCAAAGTCCTCGTAAACGGTAAAGGCAACCTCAACAGG
TCCGTT

QA 1 126 1 126
DS 

RD RR2A763JQ 786 0 0
GGTTAATATACTTTTGTTTGGGTTTATTAGAATATTTTTGATTCTTTTCATTGGAAACAA
GAAGCAAATTACATTATATTACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCGAGACACGTCTTTTGT
TTTCTGATTTTGTAGTTTTAAAATGAGGAAACTAGAACATCATCATCGGAAGTATTTATA
CCTCTAAAGACGTTCCTGTCTGAAGGCAGACCGGCTACAACACCGTGTTCGATTCCACAT
TCGTTCGTTCCCCTCTTGATCTTGAAGTAACCATCATCACCCCAGCTTCGGTTCCATTGA
TTTGCAAGCAACCAATAGTCTTCGCCATCATCAGAAGTTCCCCAGCCAATAAGCTTGACA
GCATGACCTCCAATGTTAGCACCTGTTATGTGCTTGTACACTCCAGATTTGTAATGCGCA
AAGTCCTCGTAAACGGTAAAGGCAACCTCAACAGGTCCGTTTGTGTAAACTTCAGCCATA
ATGTCTTGAGGGTCATGCCTGACTTTGTAGGCGCTAACACCATAGTGTTTTGATTCACGC
CAAAGCTGGTTTCCACTAACACATTTCCTCACACATTTTGGTGTAGGGTATGCGGGTTCG
CATCCCGGGTGTGAGCATACAGTATTGTCAAAGTATGGATCACACTCTTCGGTGACTACA
CCGTGGTGCTTAAAGTATCGCCAGGCGGAAATAGGGTAGCCACCATTACAGCCTTGACCG
CAAAGGAATCCACAACATGCTAAGAGATCATTGACTGATAAAGAAATATTCATGTTATAT
TTGATG

QA 1 786 1 786
DS 



CO CL375Contig2 1352 8 17 U
GGGAAAAACAAATAGATGATTCGTCTCTCTCTATCTAAAAATCTAAGCCTTTTGTGTCTT
TCTCTCTCTGATTAGAAAAAAAGTCTTCTATCCTTTCCAAATTCTTGGCAAATCATTGTT
TGATTCTGGAATTGTATCGAAGAGAGAGAGAAGAGGGAGATTCATGGCTAATAATCATAG
CATGCTCTACTTAGCATCTGTTATCTTGCTTGTAGGGATTATCAGTTCATCATTCAACAT
GCAGGGCATTGCAGCAGAAAATCTTTCCAAGCAGAAACTCACCTCACGAATTCTTCAGGA
AGAGATTGTAAAGGAAGTCAATGAGAATCCAAACGCTGGATGGAAAGCTGCTCTCAATGA
TCGCTTTGCTAATGCCACCGTTGCAGAGTTTAAGCGCCTCCTCGGTGTTAAGCCAACACC
AAAGAATGAATACTTAGGTGGTGTACCTGTTGTCACACATGACACATCTCTCAAGCTTCC
AAGAGAATTTGATGCTAGAACCGCCTGGTCACAGTGCACCAGCATTGGAAGGATCCTAGA
TCAGGGCCACTGTGGTTCTTGCTGGGCATTTGGTGCTGTGGAATCATTGTCTGACAGATT
CTGCATCAAATATAACATGAATATTTCTTTATCAGTCAATGATCTATTAGCATGTTGTGG
ATTCCTTTGCGGTCAAGGCTGTAACGGTGGCCACCCTATTTCCGCATGGCTGTACTTTAA
GCACCACGGTGTAGTCACTGAAGAGTGTGATCCATACTTTGACAAGACCGGATGCTCACA
CCCGGGATGTGAACCAGCATGGTCTACACCAAAATGTGTGAAGAAATGTGTTGGTGGAAA
CCAGCTTTGGGATGAATCAAAACACTATGGAGTTAGCGCTTACAGAGTCAGTCATGACCC
TCAAGACATTATGGCAGAAGTTTACAAAAACGGACCTGTTGAGGTTGCCTTTACCGTTTA
CGAGGACTTTGCACATTACAAATCTGGAGTGTACAAACACATAACAGGTAGTAACATTGG
AGGTCATGCTGTTAAGCTTATTGGCTGGGGAACTTCTGATGATGGCGAAGATTATTGGTT
GCTTGCAAATCAATGGAACCGAAGCTGGGGTGATGATGGTTACTTCAAGATTAAGAGAGG
AACAAACGAATGTGGCATCGAACACGGTGCTGTAGCCGGTTTACCTTCAGACAAGAACAT
AGTTAGAGGTATTAATACTTCGGATGATGTTCTAATTTCTTCGTTTTAAAGCTAAAATCA
AGATGCGCTCTCTCAACTCTCTGTAACATATGTAACAAGCCACTGTATTATTGTTTCCAA
TGAAAGAATCAAAAGACTTTATAAACCCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2A683TF U 261
AF RR2H861TF U 1
AF RR2CN31TF U 113
AF RR2GC01TF U 113
AF RR2CN31JQ C 546
AF RR2A683JQ C 597
AF RR2GC01JQ C 648
AF RR2H861JQ C 604
BS 1 535 RR2H861TF
BS 536 536 RR2CN31TF
BS 537 677 RR2H861TF
BS 678 678 RR2CN31TF
BS 679 755 RR2H861TF
BS 756 756 RR2CN31TF
BS 757 782 RR2H861TF
BS 783 783 RR2CN31TF
BS 784 788 RR2H861TF
BS 789 813 RR2CN31TF
BS 814 814 RR2GC01TF
BS 815 846 RR2CN31TF
BS 847 873 RR2GC01TF
BS 874 1317 RR2CN31JQ
BS 1318 1318 RR2A683JQ
BS 1319 1348 RR2CN31JQ
BS 1349 1352 RR2A683JQ

RD RR2A683TF 344 0 0
ATCTTTCCAAGCAGAAACTCACCTCACGAATTCTTCAGGAAGAGATTGTAAAGGAAGTCA
ATGAGAATCCAAACGCTGGATGGAAAGCTGCTCTCAATGATCGCTTTGCTAATGCCACCG
TTGCAGAGTTTAAGCGCCTCCTCGGTGTTAAGCCAACACCAAAGAATGAATACTTAGGTG
GTGTACCTGTTGTCACACATGACACATCTCTCAAGCTTCCAAGAGAATTTGATGCTAGAA
CCGCCTGGTCACAGTGCACCAGCATTGGAAGGATCCTAGATCAGGGCCACTGTGGTTCTT
GCTGGGCATTTGGTGCTGTGGAATCATTGTCTGACAGATTCTGC

QA 1 344 1 344
DS 

RD RR2H861TF 788 0 0
GGGAAAAACAAATAGATGATTCGTCTCTCTCTATCTAAAAATCTAAGCCTTTTGTGTCTT
TCTCTCTCTGATTAGAAAAAAAGTCTTCTATCCTTTCCAAATTCTTGGCAAATCATTGTT
TGATTCTGGAATTGTATCGAAGAGAGAGAGAAGAGGGAGATTCATGGCTAATAATCATAG
CATGCTCTACTTAGCATCTGTTATCTTGCTTGTAGGGATTATCAGTTCATCATTCAACAT
GCAGGGCATTGCAGCAGAAAATCTTTCCAAGCAGAAACTCACCTCACGAATTCTTCAGGA
AGAGATTGTAAAGGAAGTCAATGAGAATCCAAACGCTGGATGGAAAGCTGCTCTCAATGA
TCGCTTTGCTAATGCCACCGTTGCAGAGTTTAAGCGCCTCCTCGGTGTTAAGCCAACACC
AAAGAATGAATACTTAGGTGGTGTACCTGTTGTCACACATGACACATCTCTCAAGCTTCC
AAGAGAATTTGATGCTAGAACCGCCTGGTCACAGTGCACCAGCATTGGAAGGATCTTAGA
TCAGGGCCACTGTGGTTCTTGCTGGGCATTTGGTGCTGTGGAATCATTGTCTGACAGATT
CTGCATCAAATATAACATGAATATTTCTTTATCAGTCAATGATCTATTAGCATGTTGTGG
ATTCCTTTGCGGTCAAG*CTGTAACGGTGGCCACCCTATTTCCGCATGGCTGTACTTTAA
GCACCACGGTGTAGTCACTGAAGAGTGTGATCCATCCTTTGACAAGACCGGATGCTCACA
CCTGGGAT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2CN31TF 734 0 0
GG
ATTGTTTGATTCTGGAATTGTATCGAAGAGAGAGAGAAGAGGGAGATTCATGGCTAATAA
TCATAGCATGCTCTACTTAGCATCTGTTATCTTGCTTGTAGGGATTATCAGTTCATCATT
CAACATGCAGGGCATTGCAGCAGAAAATCTTTCCAAGCAGAAACTCACCTCACGAATTCT
TCAGGAAGAGATTGTAAAGGAAGTCAATGAGAATCCAAACGCTGGATGGAAAGCTGCTCT
CAATGATCGCTTTGCTAATGCCACCGTTGCAGAGTTTAAGCGCCTCCTCGGTGTTAAGCC
AACACCAAAGAATGAATACTTAGGTGGTGTACCTGTTGTCACACATGACACATCTCTCAA
GCTTCCAAGAGAATTTGATGCTAGAACCGCCTGGTCACAGTGCACCAGCATTGGAAGGAT
CCTAGATCAGGGCCACTGTGGTTCTTGCTGGGCATTTGGTGCTGTGGAATCATTGTCTGA
CAGATTCTGCATCAAATATAACATGAATATTTCTTTATCAGTCAATGATCTATTAGCATG
TTGTGGATTCCTTTGCGGTCAAGGCTGTAACGGTGGCCACCCTATTTCCGCATGGCTGTA
CTTTAAGCACCACGGTGTAGTCACTGAAGAGTGTGATCCATACTTTGACAAGACCGGATG
CTCACACCCGGGATGTGAACCAGCATGGTCTACACCAAA*TGTGTGAAGAAATGTGTTGG
TGGAAACCAGCT

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR2GC01TF 762 0 0
GG
ATTGTTTGATTCTGGAATTGTATCGAAGAGAGAGAGAAGAGGGAGATTCATGGCTAATAA
TCATAGCATGCTCTACTTAGCATCTGTTATCTTGCTTGTAGGGATTATCAGTTCATCATT
CAACATGCAGGGCATTGCAGCAGAAAATCTTTCCAAGCAGAAACTCACCTCACGAATTCT
TCAGGAAGAGATTGTAAAGGAAGTCAATGAGAATCCAAACGCTGGATGGAAAGCTGCTCT
CAATGATCGCTTTGCTAATGCCACCGTTGCAGAGTTTAAGCGCCTCCTCGGTGTTAAGCC
AACACCAAAGAATGAATACTTAGGTGGTGTACCTGTTGTCACACATGACACATCTCTCAA
GCTTCCAAGAGAATTTGATGCTAGAACCGCCTGGTCACAGTGCACCAGCATTGGAAGGAT
CCTAGATCAGGGCCACTGTGGTTCTTGCTGGGCATTTGGTGCTGTGGAATCATTGTCTGA
CAGATTCTGCATCAAATATAACATGAATATTTCTTTATCAGTCAATGATCTATTAGCATG
TTGTGGATTCCTTTGCGGTCAAGGCTGTAACGGTGGCCACCCTATTTCCGCATGGCTGTA
CTTTAAGCACCACGGTGTAGTCACTGAAGAGTGTGATCCATACTTTGACAAGACCGGATG
CTCACACCCGGGATGTGAACCAGCATGGTCTACACCAAAATGTGTGAAGAAATGTGTTGG
TGGAAAC*AGCTTTGGGATGAATCAAAACACTATGGAGT
A

QA 3 761 3 761
DS 

RD RR2CN31JQ 803 0 0
GCCACTGTGGTTCTTGCTGGGCATTTGGTGCTGTGGAATCATTGTCTGACAGATTCTGCA
TCAAATATAACATGAATATTTCTTTATCAGTCAATGATCTATTAGCATGTTGTGGATTCC
TTTGCGGTCAAGGCTGTAACGGTGGCCACCCTATTTCCGCATGGCTGTACTTTAAGCACC
ACGGTGTAGTCACTGAAGAGTGTGATCCATACTTTGACAAGACCGGATGCTCACACCCGG
GATGTGAACCAGCATGGTCTACACCAAAATGTGTGAAGAAATGTGTTGGTGGAAACCAGC
TTTGGGATGAATCAAAACACTATGGAGTTAGCGCTTACAGAGTCAGTCATGACCCTCAAG
ACATTATGGCAGAAGTTTACAAAAACGGACCTGTTGAGGTTGCCTTTACCGTTTACGAGG
ACTTTGCACATTACAAATCTGGAGTGTACAAACACATAACAGGTAGTAACATTGGAGGTC
ATGCTGTTAAGCTTATTGGCTGGGGAACTTCTGATGATGGCGAAGATTATTGGTTGCTTG
CAAATCAATGGAACCGAAGCTGGGGTGATGATGGTTACTTCAAGATTAAGAGAGGAACAA
ACGAATGTGGCATCGAACACGGTGCTGTAGCCGGTTTACCTTCAGACAAGAACATAGTTA
GAGGTATTAATACTTCGGATGATGTTCTAATTTCTTCGTTTTAAAGCTAAAATCAAGATG
CGCTCTCTCAACTCTCTGTAACATATGTAACAAGCCACTGTATTATTGTTTC*AATGAAA
GAATCAAAAGACTTTATAAACCC

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2A683JQ 756 0 0
GATTCTGCATCAAATATAACATGAATATTTCTTTATCAGTCAATGATCTATTAGCATGTT
GTGGATTCCTTTGCGGTCAAGGCTGTAACGGTGGCCACCCTATTTCCGCATGGCTGTACT
TTAAGCACCACGGTGTAGTCACTGAAGAGTGTGATCCATACTTTGACAAGACCGGATGCT
CACACCCGGGATGTGAACCAGCATGGTCTACACCAAAATGTGTGAAGAAATGTGTTGGTG
GAAACCAGCTTTGGGATGAATCAAAACACTATGGAGTTAGCGCTTACAGAGTCAGTCATG
ACCCTCAAGACATTATGGCAGAAGTTTACAAAAACGGACCTGTTGAGGTTGCCTTTACCG
TTTACGAGGACTTTGCACATTACAAATCTGGAGTGTACAAACACATAACAGGTAGTAACA
TTGGAGGTCATGCTGTTAAGCTTATTGGCTGGGGAACTTCTGATGATGGCGAAGATTATT
GGTTGCTTGCAAATCAATGGAACCGAAGCTGGGGTGATGATGGTTACTTCAAGATTAAGA
GAGGAACAAACGAATGTGGCACCGAACACGGTGCTGTAGCCGGTTTACCTTCAGACAAGA
ACATAGTTAGAGGTATTAATACTTCGGATGATGTTCTAATTTCTTCGTTTTAAAGCTAAA
ATCAAGATGCGCTCTCTCAACTCTCTGTAACATATGTAACAAGCCACTGTATTATTGTTT
CCAATGAAAGAATCAAAAGACTTTATAAACCCAACC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2GC01JQ 701 0 0
TAGCATGTTGTGGATTCCTTTGCGGTCAAGGCTGTAACGGTGGCCACCCTATTTCCGCAT
GGCTGTACTTTAAGCACCACGGTGTAGTCACTGAAGAGTGTGATCCATACTTTGACAAGA
CCGGATGCTCACACCCGGGATGTGAACCAGCATGGTCTACACCAAAATGTGTGAAGAAAT
GTGTTGGTGGAAACCAGCTTTGGGATGAATCAAAACACTATGGAGTTAGCGCTTACAGGG
TCAGTCATGACCCTCAAGACATTATGGCAGAAGTTTACAAAAACGGACCTGTTGAGGTTG
CCTTTACCGTTTACGAGGACTTTGCACATTACAAATCTGGAGTGTACAAACACATAACAG
GTAGTAACATTGGAGGTCATGCTGTTAAGCTTATTGGCTGGGGAACTTCTGATGATGGCG
AAGATTATTGGTTGCTTACAAATCAATGGAACCGAAGCTGGGGTGATGATGGTTACTTCA
AGATTAAGAGAGGAACAAACGAATGTGGCATCGAACACGGTGCTGTAGCCGGTTTACCTT
CAGACAAGAACATAGTTAGAGGTATTAATACTTCGGATGATGTTCTAATTTCTTCGTTTT
AAAGCTAAAATCAAGATGCGCTCTCTCAACTCTCTGTAACAT*TGTAACAAGCCACTGTA
TTATTGTTTCCAATGAAAGAATCAAAAGACTTTATAAACCC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2H861JQ 745 0 0
CATCAAATATAACATGAATATTTCTTTATCAGTCAATGATCTATTAGCATGTTGTGGATT
CCTTTGCGGTCAAGGCTGTAACGGTGGCCACCCTATTTCCGCATGGCTGTACTTTAAGCA
CCACGGTGTAGTCACTGAAGAGTGTGATCCATCCTTTGACAAGACCGGATGCTCACACCT
GGGATGTGAACCAGCATGGTCTACACCAAAATGTGTGAAGAAATGTGTTGGTGGAAACCA
GCTTTGGGATGAATCAAAACACTATGGAGTTAGCGCTTACAGAGTCAGTCATGACCCGCA
AGACATTATGGCAGAAGTTTACAAAAACGGACCTGTTGAGGTTGCCTTTACCGTTTACGA
GGACTTTGCACATTACAAATCTGGAGTGTACAAACACATAACAGGTAGTAACATTGGAGG
TCATGCTGTTAAGCTTATTGGCTGGGGAACTTCTGATGATGGCGAAGATTATTGGTTGCT
TGCAAATCAATGGAACCGAAGCTGGGGTGGTGATGGTTACTTCAAGATTAAGAGAGGAAC
AAACGAATGTGGCATCGAACACGGTGCTGTAGCCGGTTTACCTTCAGACAAGAACATAGT
TAGAGGTATTAATACTTCGGATGATGCTCTAATTTCTTCGTTTTAAAGCTAAAATCAAGA
TGCGCTCTCTCAACTCTCTGTAACATATGTAACAAGCCACTGTATTATTGTTTCCAATGA
AAGAATCAAAAGACTTTATAAACCC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 12

CO CL376Contig1 972 12 11 U
GGAGTGTCAGAGCCGAAACAACGTAGCCAAAAAGAAAAGAAAAAGG*CAACAAAG*AAAA
TGTCTGTCTTCTTACGCGGAGGAATCGCTGGAGGATTTCTTATCCGTAGTCGTGACTCCT
CAGCCGTCATCACAAAACAACGACGAATCTCATCTGTTGGAGCCGTAACAGGACCAAGCG
TGAATCCAACGGCAGCCATTGAACAACGTGCCACATGGCTACCTGGTCTCGAACCTCCAC
CTTACCTCGACGGAAAGTTAGCTGGAGACTACGGGTTTGACCCGCTCGGGTTAGGAGAAG
ATCCGAAAAGCTTGAAATGGTATGTTCAAGCAGAGCTTGTCCATGCTCGTTTCGCCATGC
TTGGTGTTGCCGGAATACTCTTCACAGATCTACTTCGTACCACGGGGATTAGCAACTTAC
CGGTTTGGTACGAAGCTGGAGCAACGAAATTTGATTTTGCCAGCACAAAGACTCTCATTG
TTGTACAGTTTCTACTCATGGGGTTTGCTGAGACCAAAAGGTATATGGACTTCGTCTCAC
CAGGATCTCAAGCCGCAGAAGGATCTTTCTTTGGACTTGAAGCAGCACTCGAAGGGCTCG
AGCCCGGATATCCTGGAGGGCCGCTCTTGAATCCACTAGGACTTGCTAAGGATATCAAGA
ACGCTAATGACTGGAAGCTTAAGGAGATCAAGAATGGTCGTCTAGCAATGATGGCGATGC
TAGGGTTCTTTGTTCAAGCCTCTGTGACTCACACTGGTCCTATCGATAACCTTGTCGAGC
ATCTCTCTAATCCGTGGCATAAGACCATCATTCAAACCCTCTTCACCTCTGCTTCTTAGT
TACATTTCATGTAGCAAATTCAATATACTGCTGGAGAAGTGTATCAATTACCTTTAAAAA
GTACAACAAATCTAACCACTCTTTTTAACATTAATCATAACAAAATAAAAATCCAATACT
GGAGTCTGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 45 45 45 45 45 30 45 45 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 25 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW41TF U 6
AF RR2H220TF U 1
AF RR2DC62TF U 19
AF RR2FS34TF U 7
AF RR2B213TF U 17
AF RR2B321TF U 23
AF RR2H220JQ C 168
AF RR2FS34JQ C 407
AF RR2B213JQ C 174
AF RR2DC62JQ C 183
AF RR2FW41JQ C 407
AF RR2B321JQ C 160
BS 1 264 RR2H220TF
BS 265 265 RR2FW41TF
BS 266 588 RR2H220TF
BS 589 683 RR2FS34TF
BS 684 684 RR2B213TF
BS 685 689 RR2FS34TF
BS 690 690 RR2B213TF
BS 691 780 RR2FS34TF
BS 781 862 RR2B213TF
BS 863 865 RR2B321TF
BS 866 972 RR2B321JQ

RD RR2FW41TF 506 0 0
GGG
AGAGCCGAAACAACGTAGCCAAAAAGAAAAGAAAAAGG*CAACAAAG*AAAATGTCTGTC
TTCTTACGCGGAGGAATCGCTGGAGGATTTCTCATCCGTAGTCGTGACTCCTCAGCCGTC
ATCACAAAACAACGACGAATCTCATCTGTTGGAGCCGTAACAGGACCAAGCGTGAATCCA
ACGGCAGCCATTGAACAACGTGCCACATGGCTACCTGGTCTCGAACCTCCACCTTACCTC
GACGGAAAGTTAGCTGGAGACTACGGGTTTGACCCGCTCGGGTTAGGAGAAGATCCGAAA
AGCTTGAAATGGTATGTTCAAGCAGAGCTTGTCCATGCTCGTTTCGCCATGCTTGGTGTT
GCCGGAATACTCTTCACAGATCTACTTCGTACCACGGGGATTAGCAACTTACCGGTTTGG
TACGAAGCTGGAGCGACGAAATTTGATTTTGCCAGCACAAAGACTCTCATTGTTGTACAG
TTTCTACTCATGGGGTTTGCTGA

QA 4 506 4 506
DS 

RD RR2H220TF 588 0 0
GGAGTGTCAGAGCCGAAACAACGTAGCCAAAAAGAAAAGAAAAAGG*CAACAAAG*AAAA
TGTCTGTCTTCTTACGCGGAGGAATCGCTGGAGGATTTCTTATCCGTAGTCGTGACTCCT
CAGCCGTCATCACAAAACAACGACGAATCTCATCTGTTGGAGCCGTAACAGGACCAAGCG
TGAATCCAACGGCAGCCATTGAACAACGTGCCACATGGCTACCTGGTCTCGAACCTCCAC
CTTACCTCGACGGAAAGTTAGCTGAAGACTACGGGTTTGACCCGCTCGGGTTAGGAGAAG
ATCCGAAAAGCTTGAAATGGTATGTTCAAGCAGAGCTTGTCCATGCTCGTTTCGCCATGC
TTGGTGTTGCCGGAATACTCTTCACAGATCTACTTCGTACCACGGGGATTAGCAACTTAC
CGGTTTGGTACGAAGCTGGAGCAACGAAATTTGATTTTGCCAGCACAAAGACTCTCATTG
TTGTACAGTTTCTACTCATGGGGTTTGCTGAGACCAAAAGGTATATGGACTTCGTCTCAC
CAGGATCTCAAGCCGCAGAAGGATCTTTCTTTGGACTTGAAGCAGCAC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2DC62TF 619 0 0
G
AACGTAGCCAAAAAGAAAAGAAAAAGG*CAACAAAG*AAAATGTCTGTCTTCTTACGCGG
AGGAATCGCTGGAGGATTTCTTATCCGTAGTCGTGACTCCTCAGCCGTCATTACAAAACA
ACGACGAATCTCATCTGTTGGAGCCATAACAGGACCAAGCGTGAATCCAACGGCAGCCAT
TGAACAACGTGCCACATGGCTACCTGGTCTCGAACCTCCACCTTACCTCGACGGAAAGTT
AGCTGGAGACTACGGGTTTGACCCGCTCGGGTTAGGAGAAGACCCGAAAAGCTTGAAATG
GTATGTTCAAGCAGAGCTTGTCCATGCTCGTTTCGCCATGCTTGGTGTTGCCGGAATACT
CTTCACAGATCTACTTCGTACCACGGGGATTAGCAACTTACCGGTTTGGTACGAAGCTGG
AGCAACGAAATTTGATTTTGCCAGCACAAAGACTCTCATTGTTGTACAGTTTCTACTCAT
GGGGTTTGCTGAGACCAAAAGGTATATGGACTTCGTCTCACCAGGATCTCAAGCCGCAGA
AGGATCTTTCTTTGGACTTGAAGCAGCACTCGAAGGGCTCGAGCCCGGATATCCTGGAGG
GCCGCTCTTGAATCCACT

QA 2 619 2 619
DS 

RD RR2FS34TF 774 0 0
GG
AGAGCCGAAACAACGTAGCCAAAAAGAAAAGAAAAAGG*CAACAAAG*AAAATGTCTGTC
TTCTTACGCGGAGGAATCGCTGGAGGATTTCTTATCCGTAGTCGTGACTCCTCAGCCGTC
ATCACAAAACAACGACGAATCTCATCTGTTGGAGCCGTAACAGGACCAAGCGTGAATCCA
ACGGCAGCCATTGAACAACGTGCCACATGGCTACCTGGTCTCGAACCTCCACCTTACCTC
GACGGAAAGTTAGCTGGAGACTACGGGTTTGACCCGCTCGGGTTAGGAGAAGATCCGAAA
AGCTTGAAATGGTATGTTCAAGCAGAGCTTGTCCATGCTCGTTTCGCCATGCTTGGTGTT
GCCGGAATACTCTTCACAGATCTACTTCGTACCACGGGGATTAGCAACTTACCGGTTTGG
TACGAAGCTGGAGCAACGAAATTTGATTTTGCCAGCACAAAGACTCTCATTGTTGTACAG
TTTCTACTCATGGGGTTTGCTGAGACCAAAAGGTATATGGACTTCGTCTCACCAGGATCT
CAAGCCGCAGAAGGATCTTTCTTTGGACTTGAAGCAGCACTCGAAGGGCTCGAGCCCGGA
TATCCTGGAGGGCCGCTCTTGAATCCACTAGGACTTGCTAAGGATATCAAGAACGCTAAT
GACTGGAAGCTTAAG*AGATCGAGAATGGTCGTCTAGCAATGATGGCGATGCTAGGGTTC
TTTGTTCAAGCCTCTGTGACTCACACTGGTCCTATCGATAACCTTGTCGAGC

QA 3 774 3 774
DS 

RD RR2B213TF 851 0 0
GGG
AACGTAGCCAAAAAGAAAAAAAAAACAACAACAGAGCAAAATGTCTGTCTTCTTACGCGG
AGGAATCGCGGGAGGATTTCTTATCCGTAGTCGTGACTCCTCAGCCGTCATCACAAAACA
ACGACGAATCTCATCCGTTGGAGCCGTAACAGGACCAAGCGTCAATCCAACGGCAGCCAT
TCCACAACGTGCCACATGGCTACCTGGTCTCGAACCTCCACCTTACCTCGACGGAAAGTT
AGCGGGAGACTACGGGTTTGACCCGCTCGGGTTAGGAGAAGATCCGAAAAGCTTGAAATG
GTATGTTCAAGCAGAGCTTGTCCATGCTCGTTTCGCCATGCTTGGTGTTGCCGGAATACT
CTTCACGGACTTACTTCGTACCACAAGGATAAGCAACTTACCGGTTTGGTACGAAGCTGG
AGCAACGAAATTTGATTTTGCCAGCACAAAGACTCTCATTGTTGTACAGTTTCTACTCAT
GGGGTTTGCTGAGACCAAAAGGTGTATGGACTTCGTCTCACCAGGATCTCAAGCCGCAGA
AGGTTCTTTCTTTGGACTTGAAGAAGCACTCGAAGGGCTCGAGCCCGGATATCCTGGAGG
ACCGCTCTTGAATCCACTAGGACTTGCTAAGGATATCAAGAACGCTAATGACTGGAAGCT
TAAGGAGATCAAGAATGGTCGTCTAGCAATGATGGCGATGCTAGGGTTCTTTGTTCAAGC
CTCTGTGACTCACACTGGTCCTATCGATAACCTTGTCGAGCATCTCTCTAATCCGTGGCA
TAAGACCATCATTCAAACCCTCTTCACCTCTGCTTCTTAGTTACATTTCATGTAGCAAAT
TCA
TATAC

QA 4 846 4 846
DS 

RD RR2B321TF 843 0 0
GG
AGCCAAAAAGAAAAGAAAAAGG*CAACAAAG*AAAATGTCTGTCTTCTTACGCGGAGGAA
TCGCTGGAGGATTTCTTATCCGTAGTCGTGACTCCTCAGCCGTCATCACAAAACAACGAC
GAATCTCATCTGTTGGAGCCGTAACAGGACCAAGCGTGAATCCAACGGCAGCCATTGAAC
AACGTGCCACATGGCTACCTGGTCTCGAACCTCCACCTTACCTCGACGGAAAGTTAGCTG
GAGACTACGGGTTTGACCCGCTCGGGTTAGGAGAAGATCCGAAAAGCTTGAAATGGTATG
TTCAAGCAGAGCTTGTCCATGCTCGTTTCGCCATGCTTGGTGTTGCCGGAATACTCTTCA
CAGATCTACTTCGTACCACGGGGATTAGCAACTTACCGGTTTGGTACGAAGCTGGAGCAA
CGAAATTTGATTTTGCCAGCACAAAGACTCTCATTGTTGTACAGTTTCTACTCATGGGGT
TTGCTGAGACCAAAAGGTATATGGACTTCGTCTCACCAGGATCTCAAGCCGCAGAAGGAT
CTTTCTTTGGACTTGAAGCAGCACTCGAAGGGCTCGAGCCCGGATATCCTGGAGGGCCGC
TCTTGAATCCACTAGGACTTGCTAAGGATATCAAGAACTCTAATGACTGGAAGCTTAAGG
AGATCAAGAATGGTCGTCTAGCAATGATGGCGATGCTAGGGTTCTTTGTTCAAGCCTCTG
TGACTCACACTGGTCCTATCGATAACCTTGTCGAGCATCTCTCTAATCCGTGGCATAAGA
CCATCATTCAAACCCTCTTCACCTCTGCTTCTTAGTTACATTTCATGTAGCAAATTCAAT
A

QA 3 843 3 843
DS 

RD RR2H220JQ 705 0 0
ACAGGACCAAGCGTGAATCCAACGGCAGCCATTGAACAACGTGCCACATGGCTACCTGGT
CTCGAACCTCCACCTTACCTCGACGGAAAGTTAGCTGAAGACTACGGGTTTGACCCGCTC
GGGTTAGGAGAAGATCCGAAAAGCTTGAAATGGTATGTTCAAGCAGAGCTTGTCCATGCT
CGTTTCGCCATGCTTGGTGTTGCCGGAATACTCTTCACAGATCTACTTCGTACCACGGGG
ATTAGCAACTTACCGGTTTGGTACGAAGCTGGAGCAACGAAATTTGATTTTGCCAGCACA
AAGACTCTCATTGTTGTACAGTTTCTACTCATGGGGTTTGCTGAGACCAAAAGGTATATG
GACTTCGTCTCACCAGGATCTCAAGCCGCAGAAGGATCTTTCTTTGGACTTGAAGCAGCA
CTCGAAGGGCTCGAGCCCGGATATCCTGGAGGGCCGCTCTTGAATCCACTAGGACTTGCT
AAGGATATCAAGAACGCTAATGACTGGAAGCTTAAGGAGATCAAGAATGGTCGTCTAGCA
ATGATGGCGATGCTAGGGTTCTTTGTTCAAGCCTCTGTGACTCACACTGGTCCTATCGAT
AACCTTGTCGAGCATCTCTCTAATCCGTGGCATAAGACCATCATTCAAACCCTCTTCACC
TCTGCTTCTTAGTTACATTTCATGTAGCAAATTCAATATACTGCT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2FS34JQ 532 0 0
GATTAGCAACTTACCGGTTTGGTACGAAGCTGGAGCAACGAAATTTGATTTTGCCAGCAC
AAAGACTCTCATTGTTGTACAGTTTTTACTCATGGGGTTTGCTGAGACCAAAAGGTATAT
GGACTTCGTCTCACCAGGATCTCAAGCCGCAGAAGGATCTTTCTTTGGACTTGAAGCAGC
ACTCGAAGGGCTCGAGCCCGGATATCCTGGAGGGCCGCTCTTGAATCCACTAGGACTTGC
TAAGGATATCAAGAACGCTAATGACTGGAAGCTTAAGGAGATCGAGAATGGTCGTCTAGC
AATGATGGCGATGCTAGGGTTCTTTGTTCAAGCCTCTGTGACTCACACTGGTCCTATCGA
TAACCTTGTCGAGCATCTCTTTAATCCGTGGCATAAGACCATCATTCAGACCCTCTTCAC
CTCTGCTTTTTAGTTACATTTCATGTAGCAAATTCAATATACTGCTGGAGAAGTGTATCA
ATTACCTTTAAAAAGTACAACAAATCTAACCACTCTTTTTAACATTAATCAT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2B213JQ 756 0 0
CCAAGCGTCAATCCAACGGCAGCCATTCCACAACGTGCCACATGGCTACCTGGTCTCGAA
CCTCCACCTTACCTCGACGGAAAGTTAGCGGGAGACTACGGGTTTGACCCGCTCGGGTTA
GGAGAAGATCCGAAAAGCTTGAAATGGTATGTTCAAGCAGAGCTTGTCCATGCTCGTTTC
GCCATGCTTGGTGTTGCCGGAATACTCTTCACGGACTTACTTCGTACCACAAGGATAAGC
AACTTACCGGTTTGGTACGAAGCTGGAGCAACGAAATTTGATTTTGCCAGCACAAAGACT
CTCATTGTTGTACAGTTTCTACTCATGGGGTTTGCTGAGACCAAAAGGTGTATGGACTTC
GTCTCACCAGGATCTCAAGCCGCAGAAGGTTCTTTCTTTGGACTTGAAGAAGCACTCGAA
GGGCTCGAGCCCGGATATCCTGGAGGACCGCTCTTGAATCCACTAGGACTTGCTAAGGAT
ATCAAGAACGCTAATGACTGGAAGCTTAAGGAGATCAAGAATGGTCGTCTAGCAATGATG
GCGATGCTAGGGTTCTTTGTTCAAGCCTCTGTGACTCACACTGGTCCTATCGATAACCTT
GTCGAGCATCTCTCTAATCCGTGGCATAAGACCATCATTCAAACCCTCTTCACCTCTGCT
TCTTAGTTACATTTCATGTAGCAAATTCAATATACTGCTGGAGAAGTGTATCAATTACCT
TTAAAAAGTACAACAAATCTAACCACTCTTTTT
AAC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2DC62JQ 744 0 0
AATCCAACGGCAGCCATTGAACAACGTGCCACATGGCTACCTGGTCTCGAACCTCCACCT
TACCTCGACGGAAAGTTAGCTGGAGACTACGGGTTTGACCCGCTCGGGTTAGGAGAAGAC
CCGAAAAGCTTGAAATGGTATGTTCAAGCAGAGCTTGTCCATGCTCGTTTCGCCATGCTT
GGTGTTGCCGGAATACTCTTCACAGATCTACTTCGTACCACGGGGATTAGCAACTTACCG
GTTTGGTACGAAGCTGGAGCAACGAAATTTGATTTTGCCAGCACAAAGACTCTCATTGTT
GTACAGTTTCTACTCATGGGGTTTGCTGAGACCAAAAGGTATATGGACTTCGTCTCACCA
GGATCTCAAGCCGCAGAAGGATCTTTCTTTGGACTTGAAGCAGCACTCGAAGGGCTCGAG
CCCGGATATCCTGGAGGGCCGCTCTTGAATCCACTAGGACTTGCTAAGGATATCAAGAAC
GCTAATGACTGGAAGCTTAAGGAGATCAAGAATGGTCGTCTAGCAATGATGGCGATGCTA
GGGTTCTTTGTTCAAGCCTCTGTGACTCACACTGGTCCTATCGATAACCTTGTCGAGCAT
CTCTCTAATCCGTGGCATAAGACCATCATTCAAACCCTCTTCACCTCTGCTTCTTAGTTA
CATTTCATGTAGCAAATTCAATATACTGCTGGAGAAGTGTATCAATTACCTTTAAAAAGT
ACAACAAATCTAACCACTCTTTTT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2FW41JQ 519 0 0
GATTAGCAACTTACCGGTTTGGTACGAAGCTGGAGCGACGAAATTTGATTTTGCCAGCAC
AAAGACTCTCATTGTTGTACAGTTTCTACTCATGGGGTTTGCTGAGACCAAAAGGTATAT
GGACTTCGTCTCACCAGGATCTCAAGCCGCAGAAGGATCTTTCTTTGGACTTGAAGCAGC
ACTCGAAGGGCTCGAGCCCGGATATCCTGGAGGGCCGCTCTTGAATCCACTAGGACTTGC
TAAGGATATCAAGAACGCTAATGACTGGAAGCTTAAGGAGATCAAGAATGGTCGTCTAGC
AATGATGGCGATGCTAGGGTTCTTTGTTCAAGCCTCTGTGACTCACACTGGTCCTATCGA
TAACCTTGTCGAGCATCTCTCTAATCCGTGGCATAAGACCATCATTCAAACCCTCTTCAC
CTCTGCTTCTTAGTTACATTTCATGTAGCAAATTCAATATACTGCTGGAGAAGTGTATCA
ATTACCTTTAAAAAGTACAACAAATCTAACCACTCTTTT

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2B321JQ 813 0 0
GAGCCGTAACAGGACCAAGCGTGAATCCAACGGCAGCCATTGAACAACGTGCCACATGGC
TACCTGGTCTCGAACCTCCACCTTACCTCGACGGAAAGTTAGCTGGAGACTACGGGTTTG
ACCCGCTCGGGTTAGGAGAAGATCCGAAAAGCTTGAAATGGTATGTTCAAGCAGAGCTTG
TCCATGCTCGTTTCGCCATGCTTGGTGTTGCCGGAATACTCTTCACAGATCTACTTCGTA
CCACGGGGATTAGCAACTTACCGGTTTGGTACGAAGCTGGAGCAACGAAATTTGATTTTG
CCAGCACAAAGACTCTCATTGTTGTACAGTTTCTACTCATGGGGTTTGCTGAGACCAAAA
GGTATATGGACTTCGTCTCACCAGGATCTCAAGCCGCAGAAGGATCTTTCTTTGGACTTG
AAGCAGCACTCGAAGGGCTCGAGCCCGGATATCCTGGAGGGCCGCTCTTGAATCCACTAG
GACTTGCTAAGGATATCAAGAACTCTAATGACTGGAAGCTTAAGGAGATCAAGAATGGTC
GTCTAGCAATGATGGCGATGCTAGGGTTCTTTGTTCAAGCCTCTGTGACTCACACTGGTC
CTATCGATAACCTTGTCGAGCATCTCTCTAATCCGTGGCATAAGACCATCATTCAAACCC
TCTTCACCTCTGCTTCTTAGTTACATTTCATGTAGCAAATTCAATATACTGCTGGAGAAG
TGTATCAATTACCTTTAAAAAGTACAACAAATCTAACCACTCTTTTTAACATTAATCATA
ACAAAATAAAAATCCAATACTGGAGTCTGGTTC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 2 11

CO CL377Contig1 733 3 4 U
GGACGTGCTCCAGCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGTAACTATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTAGTCGGCGAGTACGGTCTCCGCAACAAGCGTGAG
CTCTGGAGAGTCCAGTACTCTCTGAGCCGCATCCGTAACGCCGCGAGAGATCTTCTGACT
CTCGACGAGAGGAATCCCAAGAGGATCTTTGAGGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAAC
CGGTACGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGGTG
GAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCT
ATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTG
AACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACC
AGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCC
AAGAAAGCCTGCTTTTTGGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAAT
TTCGTTTTCAGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGTCGAACCTTTCTCGAGTTATAT
TTTATTTTGAGAC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D025TF U 1
AF RR2A663JQ C 1
AF RR2A663TF U 1
BS 1 250 RR2D025TF
BS 251 251 RR2A663TF
BS 252 514 RR2D025TF
BS 515 733 RR2A663TF

RD RR2D025TF 514 0 0
GGACGTGCTCCAGCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGTAACTATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTAGTCGGCGAGTACGGTCTCCGCAACAAGCGTGAG
CTCTGGAGAGTCCAGTACTCTCTGAGCCGCATCCGTAACGCCGCGAGAGATCTTCTGACT
CTCGACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTTGAGGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAAC
CGGTACGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGGTG
GAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCT
ATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTG
AACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2A663JQ 733 0 0
GGACGTGCTCCAGCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGTAACTATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTAGTCGGCGAGTACGGTCTCCGCAACAAGCGTGAG
CTCTGGAGAGTCCAGTACTCTCTGAGCCGCATCCGTAACGCCGCGAGAGATCTTCTGACT
CTCGACGAGAGGAATCCCAAGAGGATCTTTGAGGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAAC
CGGTACGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGGTG
GAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCT
ATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTG
AACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACC
AGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCC
AAGAAAGCCTGCTTTTTGGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAAT
TTCGTTTTCAGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGTCGAACCTTTCTCGAGTTATAT
TTTATTTTGAGAC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2A663TF 733 0 0
GGACGTGCTCCAGCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGTAACTATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTAGTCGGCGAGTACGGTCTCCGCAACAAGCGTGAG
CTCTGGAGAGTCCAGTACTCTCTGAGCCGCATCCGTAACGCCGCGAGAGATCTTCTGACT
CTCGACGAGAGGAATCCCAAGAGGATCTTTGAGGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAAC
CGGTACGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGGTG
GAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCT
ATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTG
AACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACC
AGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCC
AAGAAAGCCTGCTTTTTGGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAAT
TTCGTTTTCAGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGTCGAACCTTTCTCGAGTTATAT
TTTATTTTGAGAC

QA 1 733 1 733
DS 



CO CL377Contig2 883 8 14 U
GGACGTGCTCCAGCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGTAACTATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTAGTCGGCGAGTACGGTCTCCGCAACAAGCGTGAG
CTCTGGAGAGTCCAGTACTCTCTGAGCCGCATCCGTAACGCCGCGAGAGATCTTCTGACT
CTCGACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTTGAGGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAAC
CGGTACGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGGTG
GAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCT
ATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTG
AACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACC
AGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCC
AAGAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAATCCCCCAACTCTCAC
CGCCTGCTTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAATTTCGT
TTTCAGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGTCGAACCTTTCTCGAGTTATATTTTAT
TTTGAGACAAAAAATAATCGTCCTTTTGCTAAAGCTTAAATGTCTTGTGGGCCTAATGGT
TGCTTATGTAATAACGCAACCTCTTTAGGGTTATTACATTAGT


BQ
10 10 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 20 20 20 20 20 20 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E024TF U 1
AF RR2DZ73TF U 3
AF RR2F335TF U -4
AF RR2D292TF U -1
AF RR2F335JQ C 113
AF RR2D025JQ C 206
AF RR2D292JQ C 245
AF RR2DZ73JQ C 347
BS 1 172 RR2E024TF
BS 173 173 RR2F335TF
BS 174 598 RR2E024TF
BS 599 599 RR2F335TF
BS 600 720 RR2E024TF
BS 721 749 RR2F335TF
BS 750 755 RR2D292TF
BS 756 760 RR2F335JQ
BS 761 761 RR2D025JQ
BS 762 784 RR2F335JQ
BS 785 785 RR2D025JQ
BS 786 793 RR2F335JQ
BS 794 809 RR2D025JQ
BS 810 883 RR2DZ73JQ

RD RR2E024TF 720 0 0
GGACGTGCTCCAGCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGTAACTATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTAGTCGGCGAGTACGGTCTCCGCAACAGGCGTGAG
CTCTGGAGAGTCCAGTACTCTCTGAGCCGCATCCGTAACGCCGCGAGAGATCTTCTGACT
CTCGACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTTGAGGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAAC
CGGTACGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGGTG
GAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCT
ATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTG
AACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACC
AGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTAC
AAGAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAATCCCCCAACTCTCAC
CGCCTGCTTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAATTTCGT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2DZ73TF 702 0 0
GG
GTGCTCCAGCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCACGTTT
GCTACTACCGTAACTATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGTCCTTTCGAGAAGGAGC
GTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTAGTCGGCGAGTACGGTCTCCGCAACAAGCGTGAGCTCT
GGAGAGTCCAGTACTCTCTGAGCCGCATCCGTAACGCCGCGAGAGATCCTCTGACTCTCG
ACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTTGAGGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAATCGGT
ACGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGGTGGAGA
ACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCC
ATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAGTTGGTGAACT
TTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACCAGTC
CCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAAGAACGAGAAGCCTGCGTCCAAGA
AAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAATCCCCCAACTCTCACCGCC
TGCTTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTT*GATATCTTT

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR2F335TF 754 0 0
GGGTTCT
ACGTGCTCCAGCTCTCGAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAGCATGGTGCACGT
TTGCTACTACCGTAACTATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGTCCTTTCGAGAAGGA
GCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTAGTCGGCGAGTACGGTCTCCGCAACAAGCGTGAGCT
CTGGAGAGTCCAGTACTCTCTGAGCCGCATCCGTAACGCCGCGAGAGATCTTCTGACTCT
CGACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTTGAGGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAACCG
GTACGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGGTGGA
GAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTAT
CCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAA
CATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACCAG
TCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAA
GAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACG*TGATGACGAAGAGTAATCCCCCAACTCTCACCG
CCTGCTTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAATTTCGTTT
TCAGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTG

QA 8 754 8 754
DS 

RD RR2D292TF 757 0 0
GGCT
ACGTGCTCCAGCTCTCAAGATCGCTGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCACGT
TTGCTACTACCGTAACTATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGTCCTTTCGAGAAGGA
GCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTAGTCGGCGAGTACGGTCTCCGCAACAAGCGTGAGCT
CTGGAGAGTCCAGTACTCTCTGAGCCGCATCCGTAACGCCGCGAGAGATCTTCTGACTCT
CGACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTTGAGGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAACCG
GTACGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGGTGGA
GAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTAT
CCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAA
CATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACCAG
TCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAA
GAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAATCCCCCAACTCTCACCG
CCTGCTTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAATTTCGTTT
TCAGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGTC

QA 5 757 5 757
DS 

RD RR2F335JQ 688 0 0
TCGAGAAGGAGCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTAGTCGGCGAGTACGGTCTCCGCAACA
AGCGTGAGCTCTGGAGAGTCCAGTACTCTCTGAGCCGCATCCGTAACGCCGCGAGAGATC
TTCTGACTCTCGACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTTGAGGGAGAGGCGCTGCTAAGGA
AGATGAACCGGTACGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCT
TGACGGTGGAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGG
CTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGC
AATTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTG
CATTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGT
CTGCGTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAATCCCCCA
ACTCTCACCGCCTGCTTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTG
AATTTCGTTTTCAGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGTCGAACCCTTCTCGAGTTA
TATTTTATTTTGGGACAAAAA
ATGATCG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2D025JQ 604 0 0
GCCGCATCCGTAACGCCGCGAGAGATCTTCTGACTCTCGACGAGAAGAATCCCAAGAGGA
TCTTTGAGGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAACCGGTACGGACTTCTCGACGAGAGCC
AGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGGTGGAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTC
AGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCA
GGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGAC
TTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAG
GAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTG
ACGGTGATGACGAAGAGTAGTCCCCCAACTCTCACCGCCTGCTTTTTAGCTATGAAGCAC
TCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAATTTCGTTTTCAGACGATTGTTTTGTGGTTTC
TTTGTGTGTCGAACCTTTCTCGAGTTATATTTTATTTTGAGACAAAAAATAATCGTCCTT
TTGC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2D292JQ 544 0 0
ACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTTGAGGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAACCGGT
ACGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTTTTGGCCTTGACGGTGGAGA
ACTTTCTCGAGCGTCGTTTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCC
ATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAACA
TTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACCAGTC
CCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAAGA
AAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAATCCCCCAACTCTCACCGCC
TGCTTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTTAGTTTTGAATTTCGTTTTC
AGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGTCGAACCTTTCTCGAGTTATATTTTATTTTG
AGA
C

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2DZ73JQ 537 0 0
TGGCCTTGACGGTGGAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTCAAGTCTG
GTATGGCTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTG
GAAAGCAGTTGGTGAACTTTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCG
ACTTTGCATTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACG
AGAAGCCTGCGTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAAT
CCCCCAACTCTCACCGCCTGCTTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTTA
GTTTTGAATTTCGTTTTCAGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGTCGAACCTTTCTC
GAGTTATATTTTATTTTGAGACAAAAA*TGATCGTCCTTTTGCTAAAGCTTAAATGTCTT
GTGGGCCTAATGGTTGCTTATGTAATAACGCAACCTCTTTAGGGTTATTACATTAGT

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 10

CO CL378Contig1 893 10 17 U
GGGAATACACAGAGCCTGGGAGGAAGTCTTACCAGTTACGCTGTAGGAGAGCTAGAGAAA
AGTGTCCATGGCGACAATAGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCCAAATT
CAAAGTCCTTTCTCTTAAGGGAGCTTCTTCTTCGTCGTCATCATCATCTCCAACTTCTTC
TTCCTTGTCCACTCGTCGTGGTGCGTCGGCTACTGTCTGCTCCTCCCTCAGCTTCTCTCA
GAGCGTTTCTCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGGACAGAAGAATCCAGC
GAGGCAATTGATTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAG
AGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTAC
TCGTATGAAGAAGGTTTTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACC
TGACGAAATTGTTACCGTGGAGAAACTCATCGGAGAGGCTTATTCTGCAATTGACAAAGC
AGTGAAGGTTAGAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAG
GAGGAAAAAGGCCGTTGAGATCCACCACGGCTGGTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAGC
AACAGAAGCTGTGACCATGGCTGCGTGACAGAGATAATGGAAAATTCGTTTTTCTTATAA
GAGATCATATTTGAAAAAGATGTGAAAATTGCTTTCAAAATCAAATATGTTTATTTCATG
TATAATTCATTTCGACTTCAGTTTCTTCTTCCGTACTGTTGAGGCTAAGCATGTTGACTT
CTTCTTCCTTCGGCTTGACCTTAATCTGGTTTAGTAAGATCTCAGTCCTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB88TF U 5
AF RR2EH19TF U 1
AF RR2FS93TF U 11
AF RR2GC71TF U 16
AF RR2FS93JQ C 158
AF RR2BC67TF U 5
AF RR2BC67JQ C 20
AF RR2DI69TF U 52
AF RR2EH19JQ C 188
AF RR2DI69JQ C 231
BS 1 441 RR2EH19TF
BS 442 442 RR2CB88TF
BS 443 610 RR2EH19TF
BS 611 611 RR2FS93TF
BS 612 719 RR2EH19TF
BS 720 720 RR2FS93TF
BS 721 737 RR2EH19TF
BS 738 738 RR2BC67TF
BS 739 747 RR2EH19TF
BS 748 748 RR2BC67TF
BS 749 759 RR2EH19TF
BS 760 805 RR2BC67TF
BS 806 836 RR2DI69TF
BS 837 857 RR2EH19JQ
BS 858 858 RR2DI69JQ
BS 859 875 RR2EH19JQ
BS 876 893 RR2DI69JQ

RD RR2CB88TF 697 0 0
GGACACA
GAGCCTGGGAGGAAGTCTTACCAGTTACGCTGTAGGAGAGCTAGAGAAAAGTGTCCATGG
CGACAATAGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCCAAATTCAAAGTCCTTT
CTCTTAAGGGAGCTTCTTCTTCGTCGTCATCATCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTCCA
CTCGTCGTGGTGCGTCGGCTACTGTCTGCTCCTCCCTCAGCTTCTCTCAGAGCGTTTCTC
AATGTGTCGCCTTCTCCTCCGG*AATCTATGGGGACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATTGA
TTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCAAG
CCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTACTCGTATGAAGA
AGGTTTTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAAATTG
TTACCGTGGAGAAACTCATCGGAGAGGCTTATTCTGCAATTGACAAAGCAGTGAAGGTTA
GAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAAAAG*
CCGTTGAGATCCACCACGGCTGGTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAGCAACAGAAGCTG
TGAC*ATGGCTGCGTGACAGAGATAATGGA

QA 8 697 8 697
DS 

RD RR2EH19TF 761 0 0
GGGAATACACAGAGCCTGGGAGGAAGTCTTACCAGTTACGCTGTAGGAGAGCTAGAGAAA
AGTGTCCATGGCGACAATAGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCCAAATT
CAAAGTCCTTTCTCTTAAGGGAGCTTCTTCTTCGTCGTCATCATCATCTCCAACTTCTTC
TTCCTTGTCCACTCGTCGTGGTGCGTCGGCTACTGTCTGCTCCTCCCTCAGCTTCTCTCA
GAGCGTTTCTCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGGACAGAAGAATCCAGC
GAGGCAATTGATTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAG
AGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTAC
TCGTATGAAGAAGGTTTTGGATGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACC
TGACGAAATTGTTACCGTGGAGAAACTCATCGGAGAGGCTTATTCTGCAATTGACAAAGC
AGTGAAGGTTAGAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAG
GAGGAAAAAG*CCGTTGAGATCCACCACGGCTGGTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAGC
AACAGAAGCTGTGACCATGGCTGCGTGACAGAGATAATGGAAAATTCGTTTTTCTTATA*
GAGATCATATTTGAAAA*GATGTGAAA*TTGCTTTCAAA
TC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2FS93TF 733 0 0
G
GAGCCTGGGAGGAAGTCTTACCAGTTACGCTGTAGGAGAGCTAGAGAAAAGTGTCCATGG
CGACAATAGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCCAAATTCAAAGTCCTTT
CTCTTAAGGGAGCTTCTTCTTCGTCGTCATCATCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTCCA
CTCGTCGTGGTGCGTCGGCTACTGTCTGCTCCTCCCTCAGCTTCTCTCAGAGCGTTTCTC
AATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGGACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATTGA
TTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCAAG
CCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTACTCGTATGAAGA
AGGTTTTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAAATTG
TTACCGTGGAGAAACTCATCGGAGAGGCTTATTCTGCAATTGACAAAGCAGTGAAGGTTA
GAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAAAAGG
CCGTTGAGATCCACCACGGCTGGTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAGCAACAGAAGCTG
TGACCATGGCTGCGTGACAGAGATAATGGAAAATTCGTTTTTCTTATAAGAGATCATATT
TGAAAA*GATGT

QA 2 733 2 733
DS 

RD RR2GC71TF 716 0 0
GG
GGGAGGAAGTCTTACCAGTTACGCTGTAGGAGAGCTAGAGAAAAGTGTCCATGGCGACAA
TAGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCCAAATTCAAAGTCCTTTCTCTTA
AGGGAGCTTCTTCTTCGTCGTCATCATCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTCCACTCGTC
GTGGTGCGTCGGCTACTGTCTGCTCCTCCCTCAGCTTCTCTCAGAGCGTTTCTCAATGTG
TCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGGACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATTGATTGTGT
GTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCAAGCCGAGA
AGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTACTCGTATGAAGAAGGTTT
TGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAAATTGTTACCG
TGGAGAAACTCATCGGAGAGGCTTATTCTGCAATTGACAAAGCAGTGAAGGTTAGAGCGC
TACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAAAAGGCCGTTG
AGATCCACCACGGCTGGTACGTGCCAGACACAGCAGTAGCAGCAACAGAAGCTGTGACCA
TGGCTGCGTGACAGAGACAATGGAAAATTCGTTTTTCTTATAAGAGATCATATT

QA 3 716 3 716
DS 

RD RR2FS93JQ 624 0 0
TCATCATCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTCCACTCGTCGTGGTGCGTCGGCTACTGTC
TGCTCCTCCCTCAGCTTCTCTCAGAGCGTTTCTCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAAT
CTATGGGGACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATTGATTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAG
AAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAG
TCTAAGAAATCTGAAGCCCGTACTCGTATGAAGAAGGTTTTGGAAGCACTCGATGGGCTC
AAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAAATTGTTACCGTGGAGAAACTCATCGGAGAG
GCTTATTCTGCAATTGACAAAGCAGTGAAGGTTAGAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCG
CGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAAAAGGCCGTTGAGATCCACCACGGCTGGTAC
GTGCCAGACACAGCAGCAGCAGCAACAGAAGCTGTGACCATGGCTGCGTGACAGAGATAA
TGGAAAATTCGTTTTTCTTATAAGAGATCATATTTGAAAAAGATGTGAAAATTGCTTTCA
AAATCAAATATGTTTATTTCATG
C

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2BC67TF 803 0 0
GGACACA
GAGCCTGGGAGGAAGTCTTACCAGTTACGCTGTAGGAGAGCTAGAGAAAAGTGTCCATGG
CGACAATAGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCCAAATTCAAAGTCCTTT
CTCTTAAGGGAGCTTCTTCTTCGTCGTCATCATCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTCCA
CTCGTCGTGGTGCGTCGGCTACTGTCTGCTCCTCCCTCAGCTTCTCTCAGAGCGTTTCTC
AATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGGACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATTGA
TTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCAAG
CCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCCGAAGCCCGTACTCGTATGAAGA
ATGTTTTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAAATTG
TTACCGTGGAGAAACTCATCGGAGAGGCTTATTCTGCAATTGACAAAGCAGTGAAGGTTA
GAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAAAAGG
CCGTTGAGATCCACCACGGCTGGTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAGCAACAGAAGCTG
TGACCATGGCTGCG**ACAGAGATAATGGAAAATTCGTTTTTCTTATAAGAGATCATATT
TGAAAAAGATGTGAAAATTGCTTTCAAAATCAAATATGTTTATTTCATGTATAATTCATT
TCGACTTCAGTTTC
CT

QA 8 801 8 801
DS 

RD RR2BC67JQ 788 0 0
GAGGAAGTCTTACCAGTTACGCTGTAGGAGAGCTAGAGAAAAGTGTCCATGGCGACAATA
GTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATTCCAAATTCAAAGTCCTTTCTCTTAAG
GGAGCTTCTTCTTCGTCGTCATCATCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTCCACTCGTCGT
GGTGCGTCGGCTACTGTCTGCTCCTCCCTCAGCTTCTCTCAGAGCGTTTCTCAATGTGTC
GCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGGACAGAAGAATCCAGCGAGGCAATTGATTGTGTGT
GAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCAAGCCGAGAAG
AGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCCGAAGCCCGTACTCGTATGAAGAATGTTTTG
GAAGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAAATTGTTACCGTG
GAGAAACTCATCGGAGAGGCTTATTCTGCAATTGACAAAGCAGTGAAGGTTAGAGCGCTA
CACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAAAAGGCCGTTGAG
ATCCACCACGGCTGGTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAGCAACAGAAGCTGTGACCATG
GCTGCG**ACAGAGATAATGGAAAATTCGTTTTTCTTATAAGAGATCATATTTGAAAAAG
ATGTGAAAATTGCTTTCAAAATCAAATATGTTTATTTCATGTATAATTCATTTCGACTTC
AGTTTC
CT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2DI69TF 786 0 0
GG
AGAGAAAAGTGTCCATGGCGACAATAGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCGACCCTCAATT
CCAAATTCAAAGTCCTTTCTCTTAAGGGAGCTTCTTCTTCGTCGTCATCATCATCTCCAA
CTTCTTCTTCCTTGTCCACTCGTCGTGGTGCGTCGGCTACTGTCTGCTCCTCCCTCAGCT
TCTCTCAGAGCGTTTCTCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGGACAGAAGA
ATCCAGCGAGGCAATTGATTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTG
CAAAGAGAGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTGAAG
CCCGTACTCGTATGAAGAAGGTTTTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATG
CGCAACCTGACGAAATTGTTACCGTGGAGAAACTCATCGGAGAGGCTTATTCTGCAATTG
ACAAAGCAGTGAAGGTTAGAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGGAGTCTCGCT
TGGCTAGGAGGAAAAAGGCCGTTGAGATCCACCACGGCTGGTACGTGCCAGACACAGCAG
CAGCAGCAACAGAAGCTGTGACCATGGCTGCGTGACAGAGATAATGGAAAATTCGTTTTT
CTTATAAGAGATCATATTTGAAAA*GATGTGAAAATTGCTTTCAAA*TCAAATATGTTTA
TTTCATGTATAATTCATTTCGACTTCAGTTTCTTCTTCCGTACTGTTGAGGCTAAGCATG
TTG
T

QA 3 785 3 785
DS 

RD RR2EH19JQ 688 0 0
TCCACTCGTCGTGGTGCGTCGGCTACTGTCTGCTCCTCCCTCAGCTTCTCTCAGAGCGTT
TCTCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGGACAGAAGAATCCAGCGAGGCAA
TTGATTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGC
CAAGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTACTCGTATG
AAGAAGGTTTTGGATGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAA
ATTGTTACCGTGGAGAAACTCATCGGAGAGGCTTATTCTGCAATTGACAAAGCAGTGAAG
GTTAGAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAA
AAGGCCGTTGAGATCCACCACGGCTGGTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAGCAACAGAA
GCTGTGACCATGGCTGCGTGACAGAGATAATGGAAAATTCGTTTTTCTTATAAGAGATCA
TATTTGAAAAAGATGTGAAAATTGCTTTCAAAATCAAATATGTTTATTTCATGTATAATT
CATTTCGACTTCAGTTTCTTCTTCCGTACTGTTGAGGCTAAGCATGTTGACTTCTTCTTC
CTTCGGCTTGCCCTTAATCTGGTTTAGT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2DI69JQ 663 0 0
GCTTCTCTCAGAGCGTTTCTCAATGTGTCGCCTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGGACAGA
AGAATCCAGCGAGGCAATTGATTGTGTGTGAAGCTGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAG
CTGCAAAGAGAGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAACAAGTCTAAGAAATCTG
AAGCCCGTACTCGTATGAAGAAGGTTTTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAG
ATGCGCAACCTGACGAAATTGTTACCGTGGAGAAACTCATCGGAGAGGCTTATTCTGCAA
TTGACAAAGCAGTGAAGGTTAGAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGGAGTCTC
GCTTGGCTAGGAGGAAAAAGGCCGTTGAGATCCACCACGGCTGGTACGTGCCAGACACAG
CAGCAGCAGCAACAGAAGCTGTGACCATGGCTGCGTGACAGAGATAATGGAAAATTCGTT
TTTCTTATAAGAGATCATATTTGAAAAAGATGTGAAAATTGCTTTCAAAATCAAATATGT
TTATTTCATGTATAATTCATTTCGACTTCAGTTTCTTCTTCCGTACTGTTGAGGCTAAGC
ATGTTGTCTTCTTCTTCCTTCGGCTTGACCTTAATCTGGTTTAGTAAGATCTCAGTCCTT
GGC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 3 12

CO CL379Contig1 598 5 12 U
TCATCAACTCAGCGGCTCCTATCTTCTGTCTTCTCTGCTTAAGGAACTTGAAAAGAAAAG
TAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAG
ACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCCAAGAATGTCAAAAACCTT
GAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGACAAGAGATTGAGAGTCAAAGGA
CCAGTGAGGATGCCAACTAAAGTTCTCAAGATTACCACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAA
GGAACCAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATCTGTTC
AGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTC
GAGGTCACCATTGCTGATTCTTAGATGCATGCTTTTTTAATTTACAAAACTTGTCTTTGA
ATTCCAACGACATCTCAGCTTTTT****GTTCGTTACATGGTTCAGACTTTTGTTTTCTT
CATTTATATGTTATCCTTTTTGAGTTTATTTTTGTTGAACATCTTATTCTGTTTTGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 5 35 35 5 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BZ39TF U 1
AF RR2E776TF U 1
AF RR2E776JQ C 56
AF RR2FC08TF U 1
AF RR2FC08JQ C 25
BS 1 24 RR2BZ39TF
BS 25 25 RR2E776TF
BS 26 68 RR2BZ39TF
BS 69 69 RR2E776TF
BS 70 204 RR2BZ39TF
BS 205 205 RR2E776TF
BS 206 404 RR2BZ39TF
BS 405 405 RR2E776TF
BS 406 484 RR2BZ39TF
BS 485 485 RR2E776TF
BS 486 560 RR2BZ39TF
BS 561 598 RR2FC08TF

RD RR2BZ39TF 562 0 0
TCATCAACTCAGCGGCTCCTATCTCCTGTCTTCTCTGCTTAAGGAACTTGAAAAGAAAAG
TAGAAGATGGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAG
ACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCCAAGAATGTCAAAAACCTT
GAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCTGTGGAGCAAAAGACAAGAGATTGAGAGTCAAAGGA
CCAGTGAGGATGCCAACTAAAGTTCTCAAGATTACCACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAA
GGAACCAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATCTGTTC
AGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAACCTGGTGTTGAGGTC
GAGGTCACCATTGCTGATTCTTAGATGCATGCTTTTTTAATTTACAAAACTTGTCTTTGA
ATTCTAACGACATCTCAGCTTTTT****GTTCGTTACATGGTTCAGACTTTTGTTTTCTT
CATTTATATGTTATCCTTTT
GA

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2E776TF 579 0 0
TCATCAACTCAGCGGCTCCTATCTTCTGTCTTCTCTGCTTAAGGAACTTGAAAAGAAAAG
TAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAG
ACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCCAAGAATGTCAAAAACCTT
GAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGACAAGAGATTGAGAGTCAAAGGA
CCAGTGAGGATGCCAACTAAAGTTCTCAAGATTACCACAAGGAAAGCT**TTGTGGTGAA
GGAACCAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATCTGTTC
AGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTC
GAGGTCACCATTGCTGATTCTTAGATGCATGCTTTTTTAATTTACAAAACTTGTCTTTGA
ATTCCAACGACATCTCAGCTTTTT****GTTCGTTACATGGTTCAGACTTTTGTTTTCTT
CATTTATATGTTATCCTTTT
GAGTTTTTTTAAAAAAAAA

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2E776JQ 516 0 0
AAAAGTAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTG
AGGAGACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTTTTTCCTCCAAGAATGTCAAAA
ACCTTGAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGACAAGAGATTGAGAGTCA
AAGGACCAGTGAGGATGCCAACTAAAGTTTTCAAGATTACCACAAGGAAAGCT**TTGTG
GTGAAGGAACCAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGGGTGTGATCGATC
TGTTCAGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTG
AGGTCGAGGTCACCATTGCTGATTTTTAGATGCATGCTTTTTTAATTTACAAAACTTGTT
TTTGAATTCCAACGACATTTCAGCTTTTT****GTTCGTTACATGGTTCAGACTTTTGTT
TTTTTCATTTATATGTTATCCTTTT
GAGTTTTTTTT

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR2FC08TF 598 0 0
TCATCAACTCAGCGGCTCCTATCTTCTGTCTTCTCTGCTTAAGGAACTTGAAAAGAAAAG
TAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAG
ACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCCAAGAATGTCAAAAACCTT
GAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGACAAGAGATTGAGAGTCAAAGGA
CCAGTGAGGATGCCAACCAAAGTTCTCAAAATTACCACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAA
GGAACCAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATCTGTTC
AGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTC
GAAGTCACCATTGCTGATTCTTAGATTCATGCTTTTTTAATTTACAAAACTTGTCTTTGA
ATTCCAGCGTCTTCTCAGCTTTTTGCTTGTTTGTTACATGGTTTAGACTTTTGTTTTCTT
CCTATATATGTTGTCCTTTTTGAGTTTATTTTTGTTGAACATCTTATTCTGTTTTGCT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2FC08JQ 574 0 0
T
CTGTCTTCTCTGCTTAAGGAACTTGAAAAGAAAAGTAGAAGATAGCTATGGCATACGCAC
CACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAGACACAAGAGCAGATTCACAAGATCA
GAATCACTCTCTCCTCCAAGAATGTCAAAAACCTTGAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCC
GTGGAGCAAAAGACAAGAGATTGAGAGTCAAAGGACCAGTGAGGATGCCAACCAAAGTTC
TCAAAATTACCACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAAGGAACCAACACATGGGACAGATTTG
AGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATCTGTTCAGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGA
TCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTCGAAGTCACCATTGCTGATTCTTAGA
TTCATGCTTTTTTAATTTACAAAACTTGTCTTTGAATTCCAGCGTCTTCTCAGCTTTTTG
CTTGTTTGTTACATGGTTTAGACTTTTGTTTTCTTCCTATATATGTTGTCCTTTTTGAGT
TTATTTTTGTTGAACATCTTATTCTGTTTTGCT

QA 2 574 2 574
DS 



CO CL379Contig2 633 3 5 U
TCATCAACTCAGCGGCTCCTATCTTCCGTCTTCTCTGATTAAGGAACTTGAAAAGAAAAG
TAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAG
ACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCCAAGAATGTCAAAAACCTT
GAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGATAAGAGATTGAGAGTCAAAGGA
CCAGTGAGGATGCCAACCAAAGTTCTCAAGATTACCACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAA
GGAACCAACACATGGGACAGATTTGAACTCCGTGCGCACAAGCGTGTGATCGATCTGTTC
AGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTC
GAGGTCACCATTGCTGATTCTTAGATGCATGCTTTTTTAATTTACAAAACTTGTCTTTGA
ATTCCAGCGACTATTCAGCTTTTTGTTTGTTTCAGACTTTTTGTTTTCTTCCTATATATG
TTATCCTTTTGAGTTTATTTTTGTTGAACATCTGATTCTGTTTTGCTATGGCCTTGGGCC
TTAATATTATTTAGACATTTGAATTATAAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FE53JQ C 37
AF RR2FE53TF U 1
AF RR2CJ52TF U 1
BS 1 326 RR2CJ52TF
BS 327 327 RR2FE53TF
BS 328 334 RR2CJ52TF
BS 335 335 RR2FE53TF
BS 336 633 RR2CJ52TF

RD RR2FE53JQ 530 0 0
GATTG
AGGAACTTGAAAAGAAAAGTAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGG
AAAGGCAGGATTTGAGGAGACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTTTCCTC
CAAGAATGTCAAAAACCTTGAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGATAA
GAGATTGAGAGTCAAAGGACCAGTGAGGATGCCAACCAAAGTTTTCAAGATTACCACAAG
GAAAGCTCCTTGTGGTGAAGGAACCAACACATGGGACAGATTTGAACTCCGTGCGCACAA
GCGTGTGATCGATCTGTTCAGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCAT
TGAGCCTGGTGTTGAGGTCGAGGTCACCATTGCTGATTTTTAGATGCATGCTTTTTTAAT
TTACAAAACTTGTCTTTGAATTCCAGCGACTATTCAGCTTTTTGTTTGTTTCAGACTTTT
TGTTTTCTTCCTATATATGTTATCCTTTTGAGTTTATTTTTGT
CG

QA 6 528 6 528
DS 

RD RR2FE53TF 566 0 0
TCATCAACTCAGCGGCTCCTATCTTCCGTCTTCTCTGATTGAGGAACTTGAAAAGAAAAG
TAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAG
ACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCCAAGAATGTCAAAAACCTT
GAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGATAAGAGATTGAGAGTCAAAGGA
CCAGTGAGGATGCCAACCAAAGTTCTCAAGATTACCACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAA
GGAACCAACACATGGGACAGATTTGAACTCCGTGCGCACAAGCGTGTGATCGATCTGTTC
AGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTC
GAGGTCACCATTGCTGATTCTTAGATGCATGCTTTTTTAATTTACAAAACTTGTCTTTGA
ATTCCAGCGACTATTCAGCTTTTTGTTTGTTTCAGACTTTTTGTTTTCTTCCTATATATG
TTATCCTTTTGAGTTTATTTTTGT
CG

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2CJ52TF 633 0 0
TCATCAACTCAGCGGCTCCTATCTTCCGTCTTCTCTGATTAAGGAACTTGAAAAGAAAAG
TAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAG
ACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCCAAGAATGTCAAAAACCTT
GAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGATAAGAGATTGAGAGTCAAAGGA
CCAGTGAGGATGCCAACCAAAGTTCTCAAGATTACCACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAA
GGAACCAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATCTGTTC
AGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTC
GAGGTCACCATTGCTGATTCTTAGATGCATGCTTTTTTAATTTACAAAACTTGTCTTTGA
ATTCCAGCGACTATTCAGCTTTTTGTTTGTTTCAGACTTTTTGTTTTCTTCCTATATATG
TTATCCTTTTGAGTTTATTTTTGTTGAACATCTGATTCTGTTTTGCTATGGCCTTGGGCC
TTAATATTATTTAGACATTTGAATTATAAAAAA

QA 1 633 1 633
DS 



CO CL379Contig3 579 4 6 U
TCATCAACTCAGCGGCTCCTATCTTCCGTCTTCTCTACTTAAGGAACTTGAAAAGAAAAG
TAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAG
ACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCCAAGAACGTCAAAAACCTT
GAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGACAAGAGATTGAGAGTAAAAGGA
CCAGTGAGGATGCCAACCAAAGTTCTCAAGATTACCACTAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAA
GGAACCAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATTTGTTC
AGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTC
GAAGTCACCATTGCTGATTCTTAGATTCATGCTTTTTTAATTTACAAAACTTGTCTTCGA
ATTCCAACGACTTCTCAGCTTTTTGCTTGTTTGTTACATGGTTCAGACTTTTGTTTTCTT
ATATGTTATCCTTTCGAGTTTATTTTTGTTGAACATCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2FW94JQ C 56
AF RR2FW94TF U 1
AF RR2E447TF U 1
AF RR2E447JQ C 56
BS 1 36 RR2E447TF
BS 37 37 RR2FW94TF
BS 38 233 RR2E447TF
BS 234 234 RR2FW94TF
BS 235 578 RR2E447TF
BS 579 579 RR2E447JQ

RD RR2FW94JQ 474 0 0
AAAAGTAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTG
AGGAGACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCCAAGAACGTCAAAA
ACCTTGAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGACAAGAGATTGAGAGTAA
AAGGACCAGTGAGGATGCCAACCAAAGTTCTCAAGATTACCACTAGGAAAGCTCCTTGTG
GTGAAGGAACCAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATT
TGTTCAGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTG
AGGTCGAAGTCACCATTGCTGATTCTTAGATTCATGCTTTTTTAATTTACAAAACTTGTC
TTCGAATTCCAACGACTTCTCAGCTTTTTGCTTGTTTGTTACATGGTTCAGACT

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2FW94TF 529 0 0
TCATCAACTCAGCGGCTCCTATCTTCCGTCTTCTCTACTTAAGGAACTTGAAAAGAAAAG
TAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAG
ACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCCAAGAACGTCAAAAACCTT
GAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGACAAGAGATTGAGAGTAAAAGGA
CCAGTGAGGATGCCAACCAAAGTTCTCAAGATTACCACTAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAA
GGAACCAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATTTGTTC
AGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTC
GAAGTCACCATTGCTGATTCTTAGATTCATGCTTTTTTAATTTACAAAACTTGTCTTCGA
ATTCCAACGACTTCTCAGCTTTTTGCTTGTTTGTTACATGGTTCAGACT

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2E447TF 578 0 0
TCATCAACTCAGCGGCTCCTATCTTCCGTCTTCTCTGCTTAAGGAACTTGAAAAGAAAAG
TAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAG
ACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCCAAGAACGTCAAAAACCTT
GAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGACAAGAGATTGAGAGTCAAAGGA
CCAGTGAGGATGCCAACCAAAGTTCTCAAGATTACCACTAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAA
GGAACCAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATTTGTTC
AGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTC
GAAGTCACCATTGCTGATTCTTAGATTCATGCTTTTTTAATTTACAAAACTTGTCTTCGA
ATTCCAACGACTTCTCAGCTTTTTGCTTGTTTGTTACATGGTTCAGACTTTTGTTTTCTT
ATATGTTATCCTTTCGAGTTTATTTTTGTTGAACATCT

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2E447JQ 524 0 0
AAAAGTAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTG
AGGAGACACAAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTTTCCTCCAAGAACGTCAAAA
ACCTTGAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCAAAAGACAAGAGATTGAGAGTCA
AAGGACCAGTGAGGATGCCAACCAAAGTTTTCAAGATTACCACTAGGAAAGCTCCTTGTG
GTGAAGGAACCAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATT
TGTTCAGCTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTG
AGGTCGAAGTCACCATTGCTGATTTTTAGATTCATGCTTTTTTAATTTACAAAACTTGTT
TTCGAATTCCAACGACTTTTCAGCTTTTTGCTTGTTTGTTACATGGTTCAGACTTTTGTT
TTTTTATATGTTATCCTTTCGAGTTTATTTTTGTTGAACATCTT

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 9

CO CL380Contig1 1103 9 3 U
GTAGATAAACTATTTTTATTCATTAGTAATTGATCATCTTTTTATTTAGTACACTGCAGG
TATAGAAGAAGCTCCTTATCTATAGAGCAACTAGGAAGTGTGAGAGACATAGAGATGATC
CCGAAGAGGAAAAAGTGTTTCATGCATCAGCAAGTCTCTTCTTCTGACTCTGAGAGGAGA
GGCTTGAGCGGAGGAAATCTTGTTTTGCAGGGTTCTTGACAGTCCCACTAATGAATCTCT
GGTACCATTTGCCAGATTCTTTGAGGTTTCTGTCGTTGAGATCAGCCCAATTAACATAAC
TAAGTCCAAATCTGACGGTAAAGCCTTTACAGAATTCATAATTATCACCAAGGGCCCATG
CAAAGTATCCTCTCACGTTAATACCCTTCTCGTTGATGACCTTACGAAGAAAACATAGAT
GACTACAGAGATAATCAATTCGCCTGTAATCCGCAATAGCCTGCTCACGGTTTTCTGAAT
CGGGCGTACTAAATCCGTTCTCGGTGACATAGATTAAAGGGTTGCCGTATTTGGTTTTGA
AGTAGTCCATTACGTAATAAATTCCTTTTGGGTAGTAATAGCTGTTGCCGTTGTCTTTGT
CTTCAACGAACAGTGGACCAATAAATTCACCACGTGAATTTTTATATGAGAGCTTTACGC
CAGCGTCATCCTGGGCAGTGTGTTTCGGTGAAGGATAGGTGTTAGGTTTCGGCTGAGCGT
ACTGAGTGACGTAATAGTTGAGACCAAGAAAATCATATGAACGGGCAACGAGTGCGGCTT
CTTCCTCGGTAAAGTTGGGAAGCCGACTACCCACAATCTGCCTCATGATATCTGGGTATC
TACCCTTTGTTAGAGGCTCATCCCAAATGTTAACACCACGACCTCTCCCTCCTTCGATCT
GGTACGCTGAAGATGCAACACCGAAGATGAAGTCTTTTGGGAAATTTTTACTGCTTAAAC
GAGCAGTGTTACTACATGTGAATGGTTCATTCTCTTCGCAAGTAATTTCTTCGTAAGCTT
TGCAACTCGCAGCAGCTAATAGAAAAACTAAAGCGAGTCCATGAAGAAGCTTCATGGTTA
AATCTGTTGATGTATGTGTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS28JQ U 260
AF RR2CH63JQ U 116
AF RR2D814TF C 13
AF RR2CH63TF C 13
AF RR2CW02JQ U 21
AF RR2FN16JQ U 1
AF RR2CZ73JQ U 39
AF RR2AX62JQ U 21
AF RR2CW02TF C 448
BS 1 773 RR2FN16JQ
BS 774 859 RR2AX62JQ
BS 860 1103 RR2CW02TF

RD RR2BS28JQ 151 0 0
TTTGAGGTTTCTGTCGTTGAGATCAGCCCAATTAACATAACTAAGTCCAAATCTGACGGT
AAAGCCTTTACAGAATTCATAATTATCACCAAGGGCCCATGCAAAGTATCCTCTCACGTT
AATACCCTTCTCGTTGATGACCTTACGAAGA

QA 1 151 1 151
DS 

RD RR2CH63JQ 392 0 0
TGATCCCGAAGAGGAAAAAGTGTTTCATGCATCAGCAAGTCTCTTCTTCTGACTCTGAAA
GGAGAGGCTTGAGCGGAGGAAATCTTGTTTTGCAGGGTTCTTGACAGTCCCACTAATGAA
TCTCTGGTACCATTTGCCAGATTCTTTGAGGTTTCTGTCGTTGAGATCAGCCCAATTAAC
ATAACTAAGTCCAAATCTGACGGTAAAGCCTTTACAGAATTCATAATTATCACCAAGGGC
CCATGCAAAGTATCCTCTCACGTTAATACCCTT*TCGTTGATGACCTTACGAAGAAAACA
TAGATGACTACAGAGATAATCAATTCGCCTGTAATCCGCAATAGCCTGCTCACGGTTTTC
TGAATCGGGCGTACTAAATCCGTTCTCGGTGA

QA 1 392 1 392
DS 

RD RR2D814TF 555 0 0
TTTTTATTCATTAGTAATTGATCATCTTTTTATTTAGTACACTGCAGGTATAGAAGAAGC
TCCTTATCTATAGAGCAACTAGGAAGTGTGAGAGACATAGAGATGATCCCGAAGAGGAAA
AAGTGTTTCATGCATCAGCAAGTCTCTTCTTCTGACTCTGAGAGGAGAGGCTTGAGCGGA
GGAAATCTTGTTTTGCAGGGTTCTTGACAGTCCCACTAATAAATCTCTGGTACCATTTGC
CAGATTCTTTGAGGTTTCTGTCGTTGAGATCAGCCCAATTAACATAACTAAGTCCAAATC
TGACGGTAAAGCCTTTACAGAATTCATAATTATCACCAAGGGCCCATGCAAAGTATCCTC
TCACGTTAATACCCTTCTCGTTGATGACCTTACGAAGAAAACATAGATGACTACAGAGAT
AATCAATTCGCCTGTAATCCGCAATAGCCTGCTCACGGTTTTCTGAATCGGGCGTACTAA
ATCCGTTCTCGGTGACATAGATTAAAGGGTTGCCGTATTTGGTTTTGAAGTAGTCCATTA
CGTAATAAATTCCT
C

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2CH63TF 603 0 0
TTTTTATTCATTAGTAATTGATCATCTTTTTATTTAGTACACTGCAGGTATAGAAGAAGC
TCCTTATCTATAGAGCAACTAGGAAGTGTGAGAGACATAGAGATGATCCCGAAGAGGAAA
AAGTGTTTCATGCATCAGCAAGTCTCTTCTTCTGACTCTGAGAGGAGAGGCTTGAGCGGA
GGAAATCTTGTTTTGCAGGGTTCTTGACAGTCCCACTAATGAATCTCTGGTACCATTTGC
CAGATTCTTTGAGGTTTCTGTCGTTGAGATCAGCCCAATTAACATAACTAAGTCCAAATC
TGACGGTAAAGCCTTTACAGAATTCATAATTATCACCAAGGGCCCATGCAAAGTATCCTC
TCACGTTAATACCCTT*TCGTTGATGACCTTACGAAGAAAACATAGATGACTACAGAGAT
AATCAATTCGCCTGTAATCCGCAATAGCCTGCTCACGGTTTTCTGAATCGGGCGTACTAA
ATCCGTTCTCGGTGACATAGATTAAAGGGTTGCCGTATTTGGTTTTGAAGTAGTCCATTA
CGTAATAAATTCCTTTTGGGTAGTAATAGCTGTTGCCGTTGTCTTTGTCTTCAACGAACA
GT
C

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2CW02JQ 669 0 0
CATTAGTAATTGATCATCTTTTTATTTAGTACACTGCAGGTATAGAAGAAGCTCCTTATC
TATAGAGCAACTAGGAAGTGTGAGAGACATAGAGATGATCCCGAAGAGGAAAAAGTGTTT
CATGCATCAGCAAGTCTCTTCTTCTGACTCTGAGAGGAGAGGCTTGAGCGGAGGAAATCT
TGTTTTGCAGGGTTCTTGACAGTCCCACTAATGAATCTCTGGTACCATTTGCCAGATTCT
TTGAGGTTTCTGTCGTTGAGATCAGCCCAATTAACATAACTAAGTCCAAATCTGACGGTA
AAGCCTTTACAGAATTCATAATTATCACCAAGGGCCCATGCAAAGTATCCTCTCACGTTA
ATACCCTTCTCGTTGATGACCTTACGAAGAAAACATAGATGACTACAGAGATAATCAATT
CGCCTGTAATCCGCAATAGCCTGCTCACGGTTTTCTGAATCGGGCGTACTAAATCCGTTC
TCGGTGACATAAATTAAAGGGTTGCCGTATTTGGTTTTGAAGTAGTCCATTACGTAATAA
ATTCCTTTTGGGTAGTAATAGCTGTTGCCGTTGTCTTTGTCTTCAACGAACAGTGGACCA
ATAAATTCACCACGTGAATTTTTATATGAGAGCTTTACGCCAGCGTCATCCTGGGCAGTG
TGTTTCGGT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2FN16JQ 773 0 0
GTAGATAAACTATTTTTATTCATTAGTAATTGATCATCTTTTTATTTAGTACACTGCAGG
TATAGAAGAAGCTCCTTATCTATAGAGCAACTAGGAAGTGTGAGAGACATAGAGATGATC
CCGAAGAGGAAAAAGTGTTTCATGCATCAGCAAGTCTCTTCTTCTGACTCTGAGAGGAGA
GGCTTGAGCGGAGGAAATCTTGTTTTGCAGGGTTCTTGACAGTCCCACTAATGAATCTCT
GGTACCATTTGCCAGATTCTTTGAGGTTTCTGTCGTTGAGATCAGCCCAATTAACATAAC
TAAGTCCAAATCTGACGGTAAAGCCTTTACAGAATTCATAATTATCACCAAGGGCCCATG
CAAAGTATCCTCTCACGTTAATACCCTTCTCGTTGATGACCTTACGAAGAAAACATAGAT
GACTACAGAGATAATCAATTCGCCTGTAATCCGCAATAGCCTGCTCACGGTTTTCTGAAT
CGGGCGTACTAAATCCGTTCTCGGTGACATAGATTAAAGGGTTGCCGTATTTGGTTTTGA
AGTAGTCCATTACGTAATAAATTCCTTTTGGGTAGTAATAGCTGTTGCCGTTGTCTTTGT
CTTCAACGAACAGTGGACCAATAAATTCACCACGTGAATTTTTATATGAGAGCTTTACGC
CAGCGTCATCCTGGGCAGTGTGTTTCGGTGAAGGATAGGTGTTAGGTTTCGGCTGAGCGT
ACTGAGTGACGTAATAGTTGAGACCAAGAAAATCATATGAACGGGCAACGAGT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2CZ73JQ 792 0 0
TTTTTATTTAGTACACTGCAGGTATAGAAGAAGCTCCTTATCTATAGAGCAACTAGGAAG
TGTGAGAGACATAGAGATGATCCCGAAGAGGAAAAAGTGTTTCATGCATCAGCAAGTCTC
TTCTTCTGACTCTGAGAGGAGAGGCTTGAGCGGAGGAAATCTTGTTTTGCAGGGTTCTTG
ACAGTCCCACTAATGAATCTCTGGTACCATTTGCCAGATTCTTTGAGGTTTCTGTCGTTG
AGATCAGCCCAATTAACATAACTAAGTCCAAATCTGACGGTAAAGCCTTTACAGAATTCA
TAATTATCACCAAGGGCCCATGCAAAGTATCCTCTCACGTTAATACCCTTCTCGTTGATG
ACCTTACGAAGAAAACATAGATGACTACAGAGATAATCAATTCGCCTGTAATCCGCAATA
GCCTGCTCACGGTTTTCTGAATCGGGCGTACTAAATCCGTTCTCGGTGACATAGATTAAA
GGGTTGCCGTATTTGGTTTTGAAGTAGTCCATTACGTAATAAATTCCTTTTGGGTAGTAA
TAGCTGTTGCCGTTGTCTTTGTCTTCAACGAACAGTGGACCAATAAATTCACCACGTGAA
TTTTTATATGAGAGCTTTACGCCAGCGTCATCCTGGGCAGTGTGTTTCGGTGAAGGATAG
GTGTTAGGTTTCGGCTGAGCGTACTGAGTGACGTAATAGTTGAGACCAAGAAAATCATAT
GAACGGGCAACGAGTGCGGCTTCTTCCTCGGTAAAGTTGGGAAGCCGACTACCCACAATC
TGCCTCATGATA

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2AX62JQ 857 0 0
CATTAGTAATTGATCATCTTTTTATTTAGTACACTGCAGGTATAGAAGAAGCTCCTTATC
TATAGAGCAACTAGGAAGTGTGAGAGACATAGAGATGATCCCGAAGAGGAAAAAGTGTTT
CATGCATCAGCAAGTCTCTTCTTCTGACTCTGAGAGGAGAGGCTTGAGCGGAGGAAATCT
TGTTTTGCAGGGTTCTTGACAGTCCCACTAATGAATCTCTGGTACCATTTGCCAGATTCT
TTGAGGTTTCTGTCGTTGAGATCAGCCCAATTAACATAACTAAGTCCAAATCCGACAGTA
AAGCCTTTACAGAATTCATAATTATCACCAAGGGCCCATGCAAAGTATCCTCTCATGTCA
ATACCCTTCTCGTTGATGACCTTACGAAGAAAACATAGATGACTACAGAGATAATCAATT
CGCCTGTAATCCGCAATAGCCTGCTCACGGTTTTCTGAATCGGGCGTACTAAATCCGTTC
TCGGTGACATAGATTAAAGGGTTGCCGTATTTGGTTTTGAAGTAGTCCATTACGTAATAA
ATTCCTTTTGGGTAGTAATAGCTGTTGCCGTTGTCTTTGCCTTCAACGAACAGTGGACCA
ATAAATTCACCACGTGAATTTTTAT**GAGAGCTTTACGCCAGCGTCATCCTGGGCAGTG
TGTTTCGGTGAAGGATAGGTGTTAGGTTTCGGCTGAGCGTACTGAGTGACGTAATAGTTG
AGACCAAGAAAATCATATGAACGGGCAACGAGTGCGGCTTCTTCCTCGGTAAAGTTGGGA
AGCCGACTACCCACAATCTGCCTCATGATATCTGGGTATCTACCCTTTGTTAGAGGCTC
CATGTACCATCCATGGGA

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR2CW02TF 656 0 0
AATCCGCAATAGC*TGCTCACGGTTTTCTGAATCGGGCGTACTAAATCCGTTCTCGGTGA
CATAGATTAAAGGGTTGCCGTATTTGGTTTTGAAGTAGTCCATTACGTAATAAATTCCTT
TTGGGTAGTAATAGCTGTTGCCGTTGTCTTTGTCTTCAACGAACAGTGGACCAATAAATT
CACCACGTGAATTTTTATATGAGAGCTTTACGCCAGCGTCATCCTGGGCAGTGTGTTTCG
GTGAAGGATAGGTGTTAGGTTTCGGCTGAGCGTACTGAGTGACGTAATAGTTGAGACCAA
GAAAATCATATGAACGGGCAACGAGTGCGGCTTCTTCCTCGGTAAAGTTGGGAAGCCGAC
TACCCACAATCTGCCTCATGATATCTGGGTATCTACCCTTTGTTAGAGGCTCATCCCAAA
TGTTAACACCACGACCTCTCCCTCCTTCGATCTGGTACGCTGAAGATGCAACACCGAAGA
TGAAGTCTTTTGGGAAATTTTTACTGCTTAAACGAGCAGTGTTACTACATGTGAATGGTT
CATTCTCTTCGCAAGTAATTTCTTCGTAAGCTTTGCAACTCGCAGCAGCTAATAGAAAAA
CTAAAGCGAGTCCATGAAGAAGCTTCATGGTTAAATCTGTTGATGTATGTGTTGTC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 2 12

CO CL381Contig1 551 4 2 U
CAAAACATCAATAGGAAGCAAGATCGATGTTGCTGACACAAGTGAAGAACAAAAACAAGT
TTCCATCAAACAACAAAGCTGAAACAGAGTTTCTAGTAGAACGATTTTTGAAAGGTAACT
TAAACTTTGATGGCGTACTTCCTGATTGGGAAATACATTTCCTTCTTCTTCTCACGTTCA
GTCTTCAACGAGAGCTGATGCTTGGTGAGGCGCCTGCGGATAGCACGGGTCTTCTTGGGA
CGTAGATCAAGAGGGAGGAACTTCTTGTTCTTGTATGCTTCTCTGAGAGCAGACTTCTGC
TTCTGAGATGTCACTGTCAAGACCTGAGCAATGGATTTGCGGACAACCTTGATTTTGGAG
AGCTTGTTGGGAGCACCACCGGTGACTTTAGCGACACGGAGGAGAGCGAGCTCAGCCTTA
AGATCCTGAAGCTGATTCTGGAGATCGCTCTTCGACTTGTCCCTCAGTTCGTGAACCTTA
ATCCTCGCCATCGTTAGCTTCACTCGTGTTCACCTGCTGCGCCGCTACTACTCTTTTAAA
GTTTGGCTCCC


BQ
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C484TF C 1
AF RR2GS63JQB U 1
AF RR2GS63TF C 1
AF RR2C484JQ U 5
BS 1 532 RR2GS63JQB
BS 533 551 RR2C484JQ

RD RR2C484TF 551 0 0
CAAAACATCAATAGGAAGCAAGATCGATGTTGCTGACACAAGTGAAGAACAAAAACAAGT
TTCCATCAAACAACAAAGCTGAAACAGAGTTTCTAGTAGAACGATTTTTGAAAGGTAACT
TAAACTTTGATGGCGTACTTCCTGATTGGGAAATACATTTCCTTCTTCTTCTCACGTTCA
GTCTTCAACGAGAGCTGATGCTTGGTGAGGCGCCTGCGGATAGCACGGGTCTTCTTGGGA
CGTAGATCAAGAGGGAGGAACTTCTTGTTCTTGTATGCTTCTCTGAGAGCAGACTTCTGC
TTCTGAGATGTCACTGTCAAGACCTGAGCAATGGATTTGCGGACGACCTTGATTTTGGAG
AGCTTGTTGGGAGCACCACCGGTGACTTTAGCGACACGGAGGAGAGCGAGCTCAGCCTTA
AGATCCTGAAGCTGATTCTGGAGATCGCTCTTCGACTTGTCCCTCAGTTCGTGAACCTTA
ATCCTCGCCATCGTTAGCTTCACTCGTGTTCACCTGCTGCGCCGCTACTACTCT
TTTAAAGTTTGGCTCCC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2GS63JQB 532 0 0
CAAAACATCAATAGGAAGCAAGATCGATGTTGCTGACACAAGTGAAGAACAAAAACAAGT
TTCCATCAAACAACAAAGCTGAAACAGAGTTTCTAGTAGAACGATTTTTGAAAGGTAACT
TAAACTTTGATGGCGTACTTCCTGATTGGGAAATACATTTCCTTCTTCTTCTCACGTTCA
GTCTTCAACGAGAGCTGATGCTTGGTGAGGCGCCTGCGGATAGCACGGGTCTTCTTGGGA
CGTAGATCAAGAGGGAGGAACTTCTTGTTCTTGTATGCTTCTCTGAGAGCAGACTTCTGC
TTCTGAGATGTCACTGTCAAGACCTGAGCAATGGATTTGCGGACAACCTTGATTTTGGAG
AGCTTGTTGGGAGCACCACCGGTGACTTTAGCGACACGGAGGAGAGCGAGCTCAGCCTTA
AGATCCTGAAGCTGATTCTGGAGATCGCTCTTCGACTTGTCCCTCAGTTCGTGAACCTTA
ATCCTCGCCATCGTTAGCTTCACTCGTGTTCACCTGCTGCGCCGCTACTACT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2GS63TF 532 0 0
CAAAACATCAATAGGAAGCAAGATCGATGTTGCTGACACAAGTGAAGAACAAAAACAAGT
TTCCATCAAACAACAAAGCTGAAACAGAGTTTCTAGTAGAACGATTTTTGAAAGGTAACT
TAAACTTTGATGGCGTACTTCCTGATTGGGAAATACATTTCCTTCTTCTTCTCACGTTCA
GTCTTCAACGAGAGCTGATGCTTGGTGAGGCGCCTGCGGATAGCACGGGTCTTCTTGGGA
CGTAGATCAAGAGGGAGGAACTTCTTGTTCTTGTATGCTTCTCTGAGAGCAGACTTCTGC
TTCTGAGATGTCACTGTCAAGACCTGAGCAATGGATTTGCGGACAACCTTGATTTTGGAG
AGCTTGTTGGGAGCACCACCGGTGACTTTAGCGACACGGAGGAGAGCGAGCTCAGCCTTA
AGATCCTGAAGCTGATTCTGGAGATCGCTCTTCGACTTGTCCCTCAGTTCGTGAACCTTA
ATCCTCGCCATCGTTAGCTTCACTCGTGTTCACCTGCTGCGCCGCTACTACT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2C484JQ 547 0 0
ACATCAATAGGAAGCAAGATCGATGTTGCTGACACAAGTGAAGAACAAAAACAAGTTTCC
ATCAAACAACAAAGCTGAAACAGAGTTTCTAGTAGAACGATTTTTGAAAGGTAACTTAAA
CTTTGATGGCGTACTTCCTGATTGGGAAATACATTTCCTTCTTCTTCTCACGTTCAGTCT
TCAACGAGAGCTGATGCTTGGTGAGGCGCCTGCGGATAGCACGGGTCTTCTTGGGACGTA
GATCAAGAGGGAGGAACTTCTTGTTCTTGTATGCTTCTCTGAGAGCAGACTTCTGCTTCT
GAGATGTCACTGTCAAGACCTGAGCAATGGATTTGCGGACGACCTTGATTTTGGAGAGCT
TGTTGGGAGCACCACCGGTGACTTTAGCGACACGGAGGAGAGCGAGCTCAGCCTTAAGAT
CCTGAAGCTGATTCTGGAGATCGCTCTTCGACTTGTCCCTCAGTTCGTGAACCTTAATCC
TCGCCATCGTTAGCTTCACTCGTGTTCACCTGCTGCGCCGCTACTACTCTTTTAAAGTTT
GGCTCCC

QA 1 547 1 547
DS 



CO CL381Contig2 666 8 5 U
GGCCCAGCCAACTTTTAAAAGAGAGTAGTAGCGGCGCAGCAAGGTGAACACGAGTGAAGC
TCACGATGGCGAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTCCAGA
ATCAGCTTCAGGATCTTAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTG
GTGCTCCCAACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCCGCAAATCCATTGCTCAGGTCTTGA
CAGTGACATCTCAGAAGCAGAAGTCTGCTCTCAGGGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCA
TTCCTCTTGATCTCCGTCCAAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGGCGCCTAACCAAACATC
AGCTCTCGTTGAAGACTGAACGTGAAAAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGT
ACGCCATCAAAGTTTAAGTTACCTGTCTTTTAAAAAAAAAA*TCTTTCTACTAGAAACTC
TGTTTCAGCTTTGTTGTTTGATGGAAACTTGTTTTTGTTCTTCACTTGTGTCAGCAAAAT
GGATCATGGTTCCTATTGATGTTTTGAAAATCCTATCTTTGCAAGTTTTGTTTGCTTTAG
TGAAAAAACACGCCCGTCCTTAACTTTCTTTTGCTATTCTGGCTTTGATTCATTAATTTG
AAACTT


BQ
10 10 10 10 10 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2FD18JQ C 9
AF RR2FD18TF U 9
AF RR2C163JQ C 4
AF RR2C163TF U 4
AF RR2G930JQ C 2
AF RR2G930TF U 2
AF RR2FZ06TF U 1
AF RR2FZ06JQ C 87
BS 1 461 RR2FZ06TF
BS 462 462 RR2FD18TF
BS 463 607 RR2FZ06TF
BS 608 608 RR2FZ06JQ
BS 609 666 RR2FZ06TF

RD RR2FD18JQ 558 0 0
G
AACTTTTAAAAGAGAGTAGTAGCGGCGCAGCAAGGTGAACACGAGTGAAGCTCACGATGG
CGAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTCCAGAATCAGCTTC
AGGATCTTAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTACTCCCA
ACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCCGCAAATCCATTGCTCAGGTCTTGACAGTGATAT
CTCAGAAGCAGAAGTCTGCTCTCAGGGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATTCCTCTTG
ATCTCCGTCCAAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGGCGCCTAACCAAACATCAGCTCTCGT
TGAAGACTGAACGTGAAAAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGTACGCCATCA
AAGTTTAAGTTACCTGTCTTTTAAAAAAAAA**TCTTTTTACTAGAAACTCTGTTTCAGC
TTTGTTGTTTGATGGAAACTTGTTTTTGTTCTTCACTTGTGTCAGCAAAATGCATCATGG
TTCCTATTGATGTTTTG

QA 2 558 2 558
DS 

RD RR2FD18TF 558 0 0
G
AACTTTTAAAAGAGAGTAGTAGCGGCGCAGCAAGGTGAACACGAGTGAAGCTCACGATGG
CGAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTCCAGAATCAGCTTC
AGGATCTTAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTACTCCCA
ACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCCGCAAATCCATTGCTCAGGTCTTGACAGTGATAT
CTCAGAAGCAGAAGTCTGCTCTCAGGGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATTCCTCTTG
ATCTCCGTCCAAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGGCGCCTAACCAAACATCAGCTCTCGT
TGAAGACTGAACGTGAAAAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGTACGCCATCA
AAGTTTAAGTTACCTGTCTTTTAAAAAAAAA**TCTTTCTACTAGAAACTCTGTTTCAGC
TTTGTTGTTTGATGGAAACTTGTTTTTGTTCTTCACTTGTGTCAGCAAAATGCATCATGG
TTCCTATTGATGTTTTG

QA 2 558 2 558
DS 

RD RR2C163JQ 563 0 0
GG
AGCCAACTTTTAAAAGAGAGTAGTAGCGGCGCAGCAAGGTGAACACGAGTGAAGCTCACG
ATGGCGAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTCCAGAATCAG
CTTCAGGATTTTAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCT
CCCAACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCCGCAAATCCATTGCTCAGGTCTTGACAGTG
ACATCTCAGAAGCAGAAGTCTGCTCTCAGGGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATTCCT
CTTGATCTCCGTCCAAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGGCGCCTAACCAAACATCAGCTC
TCGTTGAAGACTGAACGTGAAAAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGTACGCC
ATCAAAGTTTAAGTTACCTGTCTTTTAAAAAAAAA**TCTTTTTACTAGAAACTCTGTTT
CAGCTTTGTTGTTTGATGGAAACTTGTTTTTGTTCTTCACTTGTGTCAGCAAAATGGATC
ATGGTTCCTATTGATGTTTTG

QA 3 563 3 563
DS 

RD RR2C163TF 563 0 0
GG
AGCCAACTTTTAAAAGAGAGTAGTAGCGGCGCAGCAAGGTGAACACGAGTGAAGCTCACG
ATGGCGAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTCCAGAATCAG
CTTCAGGATCTTAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCT
CCCAACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCCGCAAATCCATTGCTCAGGTCTTGACAGTG
ACATCTCAGAAGCAGAAGTCTGCTCTCAGGGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATTCCT
CTTGATCTCCGTCCAAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGGCGCCTAACCAAACATCAGCTC
TCGTTGAAGACTGAACGTGAAAAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGTACGCC
ATCAAAGTTTAAGTTACCTGTCTTTTAAAAAAAAA**TCTTTCTACTAGAAACTCTGTTT
CAGCTTTGTTGTTTGATGGAAACTTGTTTTTGTTCTTCACTTGTGTCAGCAAAATGGATC
ATGGTTCCTATTGATGTTTTG

QA 3 563 3 563
DS 

RD RR2G930JQ 581 0 0
GGCC
AGCCAACTTTTAAAAGAGAGTAGTAGCGGCGCAGCAAGGTGAACACGAGTGAAGCTCACG
ATGGCGAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCAAAGAGCGATCTCCAGAATCAG
CTTCAGGATCTTAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCT
CCCAACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCCGCAAATCCATTGCTCAGGTCTTGACAGTG
ACATTTCAGAAGCAGAAGTCTGCTTTCAGGGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATTCCT
CTTGATCTCCGTCCAAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGGCGCCTAACCAAACATCAGCTC
TCGTTGAAGACTGAACGTGAAAAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGTACGCC
ATCAAAGTTTAAGTTACCTGTCTTTTAAAAAAAAAA*TCTTTCTACTAGAAACTCTGTTT
CAGCTTTGTTGTTTGATGGAAACTTGTTTTTGTTCTTCACTTGTGTCAGCAAAATGGATC
ATGGTTCCTATTGATGTTTTGAAAATCCTATCTTTGC

QA 5 581 5 581
DS 

RD RR2G930TF 581 0 0
GGCC
AGCCAACTTTTAAAAGAGAGTAGTAGCGGCGCAGCAAGGTGAACACGAGTGAAGCTCACG
ATGGCGAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCAAAGAGCGATCTCCAGAATCAG
CTTCAGGATCTTAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCT
CCCAACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCCGCAAATCCATTGCTCAGGTCTTGACAGTG
ACATCTCAGAAGCAGAAGTCTGCTCTCAGGGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATTCCT
CTTGATCTCCGTCCAAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGGCGCCTAACCAAACATCAGCTC
TCGTTGAAGACTGAACGTGAAAAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGTACGCC
ATCAAAGTTTAAGTTACCTGTCTTTTAAAAAAAAAA*TCTTTCTACTAGAAACTCTGTTT
CAGCTTTGTTGTTTGATGGAAACTTGTTTTTGTTCTTCACTTGTGTCAGCAAAATGGATC
ATGGTTCCTATTGATGTTTTGAAAATCCTATCTTTGC

QA 5 581 5 581
DS 

RD RR2FZ06TF 666 0 0
GGCCCAGCCAACTTTTAAAAGAGAGTAGTAGCGGCGCAGCAAGGTGAACACGAGTGAAGC
TCACGATGGCGAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTCCAGA
ATCAGCTTCAGGATCTTAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTG
GTGCTCCCAACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCCGCAAATCCATTGCTCAGGTCTTGA
CAGTGACATCTCAGAAGCAGAAGTCTGCTCTCAGGGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCA
TTCCTCTTGATCTCCGTCCAAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGGCGCCTAACCAAACATC
AGCTCTCGTTGAAGACTGAACGTGAAAAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGT
ACGCCATCAAAGTTTAAGTTACCTGTCTTTTAAAAAAAAAAATCTTTCTACTAGAAACTC
TGTTTCAGCTTTGTTGTTTGATGGAAACTTGTTTTTGTTCTTCACTTGTGTCAGCAAAAT
GGATCATGGTTCCTATTGATGTTTTGAAAATCCTATCTTTGCAAGTTTTGTTTGCTTTAG
TGAAAAA*CACGCCCGTCCTTAACTTTCTTTTGCTATTCTGGCTTTGATTCATTAATTTG
AAACTT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2FZ06JQ 580 0 0
GAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTCCAGAATCAGCTTCAGGATCTTAAGGCTGAG
CTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCTCCCAACAAGCTCTCCAAAATC
AAGGTTGTCCGCAAATCCATTGCTCAGGTCTTGACAGTGACATCTCAGAAGCAGAAGTCT
GCTCTCAGGGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATTCCTCTTGATCTCCGTCCAAAGAAG
ACCCGTGCTATCCGCAGGCGCCTAACCAAACATCAGCTCTCGTTGAAGACTGAACGTGAA
AAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGTACGCCATCAAAGTTTAAGTTACCTGT
CTTTTAAAAAAAAAAATCTTTCTACTAGAAACTCTGTTTCAGCTTTGTTGTTTGATGGAA
ACTTGTTTTTGTTCTTCACTTGTGTCAGCAAAATGGATCATGGTTCCTATTGATGTTTTG
AAAATCCTATCTTTGCAAGTTTTGTTTGCTTTAGTGAAAAAACACGCCCGTCCTTAACTT
TCTTTTGCTATTCTGGCTTTGATTCATTAATTTGAAACTT

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 11

CO CL382Contig1 1197 11 13 U
CCCGAGATGGAACAAACTTCCTTTATTGAAATGGATTACACACACATCAAAGAAAAAACA
ACATTACAAGAAACGTTACTTAAAACACTTATTCAAAGGTCGCCAGAGGCACGAGGAGAC
TTCACATAACAAATTTAAAAGATAGATATAATAGCTTATTTTAGATGCACGGAATGGAAG
CAAAGTGAAAGATGTCATATGATCAGTTGGTGACTGGCATCACATAGACTCCAAGCTGAT
GAAGCAGGTCACTGACTTTTCCATGGAATCCCACGATCTTGTGGCCTTCCTCTTTTAGCT
CAAAGGCTGTGCCAGCTTCAAGTCCAAATGGAGTAGATGTTTGCTTATTAGTCTTGAACC
TAAGCATATTTATGACCATTGCATCACTCCCAAAGATTTTATCGTAGGTGCCTTGGACAG
CCGTGATGTACTCACTTGGATAGTCAAGTTCGAACTCTTCGAATCCGAGTAGAGTACTCG
TTCCATGTTCAGCTCCGACGATGTCCTCAGCGCCTTTGTCGTACACAAACTTAACGACTG
ATATACCATCTTCGGCCTGTCCTACGTACACCTTCTTAACACTATCGTAAGCACCATCAT
CCCATGCAGTTCCTGCATCAGCACCAAGTGCCGGCAGCTTCTTGGCAGGGGTCAACGGGG
TTGAAGTCAACGGAGCAAAGTAAGCTCCAAGAGAGTTGACACAGTCTCCGGCAAACCCAT
GAAAGCCAATGATCTTCTTGTCTTGAACTTGGAGAGTGAAATGAGTACCGTCATCGTATC
CAATGACATCAGAGGTTTTCTTGTTGGATATGAACTTAAGCCCTTGAATGAAACCATCAG
GGTTATACCAACCTTCTACAGAAACTAGATGCTCCTCTGGATGGTTAATAACAAACGGAT
CAGCTGCCATACTACGGCCTTTGACTCCGCGAAGAGGGGCTTCTTCGGTTTGTCCGTTCT
TCACATAATCAAACTTGACGTATTGAATGCCGATTCCACCTGCTCCGACCTGAATCTTGG
TTACGGCATCGTGTTCGGATCCATCGTCCCATTGAATACCTCCTTTCCCTCCTTGTGCTT
CCACCTTTTGGGCCATCTTTGTTTGCTTTAC*****GATCA*ATATTAAAAGTAACCTTC
AAAGGGAGAGTAGATTGTTACAGGTGCTATGATCAATTGCAGAGAACTCTACGTGCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 35 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 10 10 25 25 25 10 10 25 10 25 10 25 25 10 10 10 25 10 10 25 25 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B121JQ U 168
AF RR2GI40JQB U 9
AF RR2E195JQ U 2
AF RR2BV73JQ U 1
AF RR2BB47JQ U 9
AF RR2AR69JQ U 1
AF RR2A352TF C 108
AF RR2BB47TF C 397
AF RR2GI40TF C 894
AF RR2AR69TF C 517
AF RR2E195TF C 566
BS 1 59 RR2AR69JQ
BS 60 60 RR2E195JQ
BS 61 466 RR2AR69JQ
BS 467 467 RR2E195JQ
BS 468 805 RR2AR69JQ
BS 806 846 RR2A352TF
BS 847 907 RR2BB47TF
BS 908 908 RR2AR69TF
BS 909 914 RR2BB47TF
BS 915 915 RR2GI40TF
BS 916 1057 RR2BB47TF
BS 1058 1058 RR2GI40TF
BS 1059 1197 RR2BB47TF

RD RR2B121JQ 127 0 0
CACGGAATGGAAGCAAAGTGAAAGATGTCATATGATCAGTTGGTGACTGGCATCACATAG
ACTCCAAGCTGATGAAGCAGGTCACTGACTTTTCCATGGAATCCCACGATCTTGTGGCCT
TCCTCTT

QA 1 127 1 127
DS 

RD RR2GI40JQB 465 0 0
GGAACAAACTTCCTTTATTGAAATGGATTACACACACATCAAAGAAAAAACAACATTACA
AGAAACGTTACTTAAAACACTTATTCAAAGGTCGCCAGAGGCACGAGGAGACTTCACATA
ACAAATTTAAAAGATAGATATAATAGCTTATTTTAGATGCACGGAATGGAAGCAAAGTGA
AAGATGTCATATGATCAGTTGGTGACTGGCATCACATAGACTCCAAGCTGATGAAGCAGG
TCACTGACTTTTCCATGGAATCCCACGATCTTGTGGCCTTCCTCTTTTAGCTCAAAGGCT
GTGCCAGCTTCAAGTCCAAATGGAGTAGATGTTTGCTTATTAGTCTTGAACCTAAGCATA
TTTATGACCATTGCATCACTCCCAAAGATTTTATCGTAGGTGCCTTGGACAGCCGTGATG
TACTCACTTGGATAGTCAAGTTCGAACTCTTCGAATCCGAGTAGA

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2E195JQ 573 0 0
CCGAGAT
GGAACAAACTTCCTTTATTGAAATGGATTACACACACATCAAAGAAAAAACAACATTACA
AGAAACGTTACTTAAAACACTTATTCAAAGGTCGCCAGAGGCACGAGGAGACTTCACATA
ACAAATTTAAAAGATAGATATAATAGCTTATTTTAGATGCACGGAATGGAAGCAAAGTGA
AAGATGTCATATGATCAGTTGGTGACTGGCATCACATAGACTCCAAGCTGATGAAGCAGG
TCGCTGACTTTTCCATGGAATCCCACGATCTTGTGGCCTTCCTCTTTTAGCTCAAAGGCT
GTGCCAGCTTCAAGTCCAAATGGAGTAGATGTTTGCTTATTAGTCTTGAACCTAAGCATA
TTTATGACCATTGCATCACTCCCAAAGATTTTATCGTAGGTGCCTTGGACAGCCGTGATG
TACTCACTTGGATAGTCAAGTTCGAACTCTTCGAATCCGAGTAGAGTACTCGTTCCATGT
TCAGCTCCGACGATGTCCTCAGCGCCCTTGTCGTACACAAACTTGACGACTGATATACCA
TCTTCGGCCTGTCCTACGTACACCTT

QA 8 573 8 573
DS 

RD RR2BV73JQ 654 0 0
C
CCGAGATGGAACAAACTTCCTTTATTGAAATGGATTACACACACATCAAAGAAAAAACGA
CATTACAAGAAACGTTACTTAAAACACTTATTCAAAGGTCGCCAGAGGCACGAGGAGACT
TCACATAACAAATTTAAAAGATAGATATAATAGCTTATTTTAGATGCACGGAATGGAAGC
AAAGTGAAAGATGTCATATGATCAGTTGGTGACTGGCATCACATAGACTCCAAGCTGATG
AAGCAGGTCACTGACTTTTCCATGGAATCCCACGATCTTGTGGCCTTCCTCTTTTAGCTC
AAAGGCTGTGCCAGCTTCAAGTCCAAATGGAGTAGATGTTTGCTTATTAGTCTTGAACCT
AAGCATATTTATGACCATTGCATCACTCCCAAAGATTTTATCGTAGGTGCCTTGGACAGC
CGTGATGTACTCACTTGGATAGTCAAGTTCGAACTCTTCGAATCCAAGTAGAGTACTCGT
TCCATGTTCAGCTCCGACGATGTCCTCAGCGCCTTTGTCGTACACAAACTTAACGACTGA
TATACCATCTTCGGCCTGTCCTACGTACACCTTCTTAACACTATCGTAAGCACCATCATC
CCATGCAGTTCCTGCATCAGCACCAAGTGCCGGCAGCTTCTTGGCAGGG
TCAA

QA 2 650 2 650
DS 

RD RR2BB47JQ 771 0 0
GGAACAAACTTCCTTTATTGAAATGGATTACACACACATCAAAGAAAAAACAACATTACA
AGAAACGTTACTTAAAACACTTATTCAAAGGTCGCCAGAGGCACGAGGAGACTTCACATA
ACAAATTTAAAAGATAGATATAATAGCTTATTTTAGATGCACGGAATGGAAGCAAAGTGA
AAGATGTCATATGATCAGTTGGTGACTGGCATCACATAGACTCCAAGCTGATGAAGCAGG
TCACTGACTTTTCCATGGAATCCCACGATCTTGTGGCCTTCCTCTTTTAGCTCAAAGGCT
GTGCCAGCTTCAAGTCCAAATGGAGTAGATGTTTGCTTATTAGTCTTGAACCTAAGCATA
TTTATGACCATTGCATCACTCCCAAAGATTTTATCGTAGGTGCCTTGGACAGCCGTGATG
TACTCACTTGGATAGTCAAGTTCGAACTCTTCGAATCCGAGTAGAGTACTCGTTCCATGT
TCAGCTCCGACGATGTCCTCAGCGCCTTTGTCGTACACAAACTTAACGACTGATATACCA
TCTTCGGCCTGTCCTACGTACACCTTCTTAACACTATCGTAAGCACCATCATCCCATGCA
GTTCCTGCATCAGCACCAAGTGCCGGCAGCTTCTTGGCAGGGGTCAACGGGGTTGAAGTC
AACGGAGCAAAGTAAGCTCCAAGAGAGTTGACACAGTCTCCGGCAAACCCATGAAAGCCA
ATGATCTTCTTGTCTTGAACTTGGAGAGTGAAATGAGTACCGTCATCGTAT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2AR69JQ 805 0 0
CCCGAGATGGAACAAACTTCCTTTATTGAAATGGATTACACACACATCAAAGAAAAAACG
ACATTACAAGAAACGTTACTTAAAACACTTATTCAAAGGTCGCCAGAGGCACGAGGAGAC
TTCACATAACAAATTTAAAAGATAGATATAATAGCTTATTTTAGATGCACGGAATGGAAG
CAAAGTGAAAGATGTCATATGATCAGTTGGTGACTGGCATCACATAGACTCCAAGCTGAT
GAAGCAGGTCACTGACTTTTCCATGGAATCCCACGATCTTGTGGCCTTCCTCTTTTAGCT
CAAAGGCTGTGCCAGCTTCAAGTCCAAATGGAGTAGATGTTTGCTTATTAGTCTTGAACC
TAAGCATATTTATGACCATTGCATCACTCCCAAAGATTTTATCGTAGGTGCCTTGGACAG
CCGTGATGTACTCACTTGGATAGTCAAGTTCGAACTCTTCGAATCCAAGTAGAGTACTCG
TTCCATGTTCAGCTCCGACGATGTCCTCAGCGCCTTTGTCGTACACAAACTTAACGACTG
ATATACCATCTTCGGCCTGTCCTACGTACACCTTCTTAACACTATCGTAAGCACCATCAT
CCCATGCAGTTCCTGCATCAGCACCAAGTGCCGGCAGCTTCTTGGCAGGGGTCAACGGGG
TTGAAGTCAACGGAGCAAAGTAAGCTCCAAGAGAGTTGACACAGTCTCCGGCAAACCCAT
GAAAGCCAATGATCTTCTTGTCTTGAACTTGGAGAGTGAAATGAGTACCGTCATCGTATC
CAATGACATCAGAGGTTTTCTTGTT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2A352TF 739 0 0
GGCACGAGGAGACTTCACATAACAAATT*AAAAGATAGATATCATAGCTTATTT*AGATG
CACGGAATGGAAGCAAAGTGAAAGATGTCATATGATCAGTTGGTGACTGGCATCACATAG
ACTCCAAGCTGATGAAGCAGGTCACTGACTTTTCCATGGAATCCCACGATCTTGTGGCCT
TCCTCTTTTAGCTCAAAGGCTGTGCCAGCTTCAAGTCCAAATGGAGTAGATGTTTGCTTA
TTAGTCTTGAACCTAAGCATATTTATGACCATTGCATCACTCCCAAAGATTTTATCGTAG
GTGCCTTGGACAGCCGTGATGTACTCACTTGGATAGTCAAGTTCGAACTCTTCGAATCCG
AGTAGAGTACTCGTTCCATGTTCAGCTCCGACGATGTCCTCAGCGCCTTTGTCGTACACA
AACTTAACGACTGATATAACATCTTCGGCCTGTCCTACGTACACCTTCTTAACACTATCG
TAAGCGCCATCATCCCATGCAGTTCCTGCATCAGCACCAAGTGCCGGCAGCTTCTTGGCA
GGGGTCAACGGGGTTGAAGTCAACGGAGCAAAGTAAGCTCCAAGAGAGTTGACACAGTCT
CCGGCAAACCCATGAAAGCCAATGATCTTCTTGTCTTGAACTTGGAGAGTGAAATGAGTA
CCGTCATCGTATCCAATGACATCAGAGGTTTTCTTGTTGGATATGAACTTAAGCCCTTGA
ATGAAACCATCAGGGTTAT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2BB47TF 801 0 0
TTTTATCGTAGGTGC*TTGGACAGCCGTGATGTACTCACTTGGATAGTCAAGTTCGAACT
CTTCGAATCCGAGTAGAGTACTCGTTCCATGTTCAGCTCCGACGATGTCCTCAGCGC*TT
TGTCGTACACAAACTTAACGACTGATATACCATCTTCGGCCTGTCCTACGTACACCTTCT
TAACACTATCGTAAGCACCATCATCCCATGCAGTTCCTGCATCAGCACCAAGTGCCGGCA
GCTTCTTGGCAGGGGTCAACGGGGTTGAAGTCAACGGAGCAAAGTAAGCTCCAAGAGAGT
TGACACAGTCTCCGGCAAACCCATGAAAGCCAATGATCTTCTTGTCTTGAACTTGGAGAG
TGAAATGAGTACCGTCATCGTATCCAATGACATCAGAGGTTTTCTTGTTGGATATGAACT
TAAGCCCTTGAATGAAACCATCAGGGTTATACCAACCTTCTACAGAAACTAGATGCTCCT
CTGGATGGTTAATAACAAACGGATCAGCTGCGATACTAAGGCCTTTGACTCCGCGAAGAG
GGGCTTCTTCGGTTTGTCCGTTCTTCACATAATCAAACTTGACGTATTGAATGCCGATTC
CACCTGCTCCGACCTGAATCTTGGTTACGGCATCGTGTTCGGATCCATCGTCCCATTGAA
TGCCTCCTTTCCCTCCTTGTGCTTCCACCTTTTGGGCCATCTTTGTTTGCTTTAC*****
GATCA*ATATTAAAAGTAACCTTCAAAGGGAGAGTAGATTGTTACAGGTGCTATGATCAA
TTGCAGAGAACTCTACGTGCC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2GI40TF 279 0 0
AACGGATCAGCTGCGATA*TACGGCCTTTGACTCCGCGAAGAGGGGCTTCTTCGGTTTGT
CCGTTCTTCACATAATCAAACTTGA*GTATTGAATGCCGATTCCACCTGCTCCGACCTGA
ATCTTGGTTACGGCATCGTGTTCGGATCCATCGTCCCATTGAATACCTCCTTGCCCTCCT
TGTGCTTCCACCTTTTGGGCCATCTTTGTTTGCTTTAC*****GATCA*ATATTAAAAGT
AACCTTCAAAGGGAGAGTAGATTGTTACAGGTGCTAT
CC

QA 1 277 1 277
DS 

RD RR2AR69TF 625 0 0
TGTCGTACACAAACTTAACGACTGATATACCATCTTCGGCCTGTCCTACGTACACCTTCT
TAACACTATCGTAAGCACCATCATCCCATGCAGTTCCTGCATCAGCACCAAGTGCCGGCA
GCTTCTTGGCAGGGGTCAACGGGGTTGAAGTCAACGGAGCAAAGTAAGCTCCAAGAGAGT
TGACACAGTCTCCGGCAAACCCATGAAAGCCAATGATCTTCTTGTCTTGAACTTGGAGAG
TGAAATGAGTACCGTCATCGTATCCAATGACATCAGAGGTTTTCTTGTTGGATATGAACT
TAAGCCCTTGAATGAAACCATCAGGGTTATACCAACCTTCTACAGAAACTAGATGCTCCT
CTGGATGGTTAATAACAAACGGATCAGCTGCCATACTACGGCCTTTGACTCCGCGAAGAG
GGGCTTCTTCGGCTTGTCCGTTCTTCACATAATCAAACTTGACGTATTGAATGCCGATTC
CACCTGCTCCGACCTGAATCTTGGTTACGGCATCGTGTTCGGATCCATCGTCCCATTGAA
TACCTCCTTTCCCTCCTTGTGCTTCCACCTTTTGGGCCATCTTTGTTTGCTTCAAAGGGA
GAGTAGATTGTTACAGGTGCTATCC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2E195TF 607 0 0
GTACACTTTCTTAACACTATCGTAAGCACCATCATCCCATGCAGTTCCTGCATCAGCACC
AAGTGCCGGCAGCTTCTTGGCAGGGGTCAACGGGGTTGAAGTCAACGGAGCAAAGTAAGC
TCCAAGAGAGTTGACACAGTCTCCGGCAAACCCATGAAAGCCAATGATCTTCTTGTCTTG
AACTTGGAGAGTGAAATGAGTACCGTCATCGTATCCAATGACATCAGAGGTTTTCTTGTT
GGATATGAACTTAAGCCCTTGAATGAAACCATCAGGGTTATACCAACCTTCTACAGAAAC
TAGATGCTCCTCTGGATGGTTAATAACAAACGGATCAGCTGCCATACTACGGCCTTTGAC
TCCGCGAAGAGGGGCTTCTTCGGTTTGTCCGTTCTTCACATAATCAAACTTGACGTATTG
AATGCCGATTCCACCTGCTCCGACCTGAATCTTGGTTACGGCATCGTGTTCGGATCCATC
GTCCCATTGAATACCTCCTTTCCCTCCTTGCGCTTCCACCTTTTGGGCCATCTTTGTTTG
CTTTAC*****GATCA*ATATTAAAAGTAACCTTCAAAGGGAGAGTAGATTGTTACAGGT
GCTAT
CC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 3 12

CO CL383Contig1 833 7 4 U
GGATAACTAAAGACGCAAAAAACTCTTGCGCCGCCCGCGTCCGTCTCTCTTCACTTGTTA
TCTTCTTCCAACTCCTTCGTAGGGAAACAGGAACCCTAATCATCAAATCTCAAGATGAAT
CGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCGCACTGGCGGAAAGGGTACTGTTAGA
AGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACTACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACC
TTAAAGAGAATTGGAGTTAACTCCATTCCAGCTATTGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGAT
GATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCCTAAAGTGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGG
GTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGATATCCTTCCTCAGATTCTCAGC
CATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAA
ACTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCGGCTACCATTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGAT
GTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCT
G***CTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGAGACCACAACAACAACAAAAACAGCACTTTG
GATTATTACATATCTTTATAATTTTGCTAGTTCGCTCTATCCTCTTTTTGTAGTGTTTCC
TACCAGATTCTTGTTTCCCAGATAATGATTTAAAAGTTTCTATCCAATTGATCTGTTTTA
TGCGTTTGCTTGACTCTATCTTCTCTATCTATGTCACTTGTATCATGGATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 15 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA90TF U 35
AF RR2AB12TF U 1
AF RR2CO37TF U 31
AF RR2CV24JQ C 605
AF RR2CV24TF U 39
AF RR2DA90JQ C 81
AF RR2ED20TF U 35
BS 1 592 RR2AB12TF
BS 593 593 RR2DA90TF
BS 594 779 RR2AB12TF
BS 780 833 RR2ED20TF

RD RR2DA90TF 612 0 0
GG
GCGTCCGTCTCTCTTCACTTGTTATCTTCTTCCAACTCCTTCGTAGGGAAACAGGAACCC
TAATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCGC
ACTGGCGGAAAGGGTACTGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACTACT
GATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGAGAATTGGAGTTAACTCCATTCCAGCTATT
GAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCCTAAAGTGCAA
GCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAA
GATATCCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAAGAAG
CTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAAACTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCGGCTACCATTCAA
GAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCC
GCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTG***CTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGAGACCAC
AACA
CACAAA

QA 3 606 3 606
DS 

RD RR2AB12TF 780 0 0
GGATAACTAAAGACGCAAAAAACTCTTGCGCCGCCCGCGTCCGTCTCTCTTCACTTGTTA
TCTTCTTCCAACTCCTTCGTAGGGAAACAGGAACCCTAATCATCAAATCTCAAGATGAAT
CGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCGCACTGGCGGAAAGGGTACTGTTAGA
AGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACTACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACC
TTAAAGAGAATTGGAGTTAACTCCATTCCAGCTATTGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGAT
GATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCCTAAAGTGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGG
GTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGATATCCTTCCTCAGATTCTCAGC
CATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAA
ACTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCGGCTACCATTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGAT
GTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGCAGCTGCT
G***CTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGAGACCACAACAACAACAAAAACAGCACTTTG
GATTATTACATATCTTTATAATTTTGCTAGTTCGCTCTATCCTCTTTTTGTAGTGTTTCC
TACCAGATTCTTGTTTCCCAGATAATGATTTAAAAGTTTCTATCCAATTGATCTGTTTT
A

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2CO37TF 751 0 0
GGGCCC
GCGTCCGTCTCTCTTCACTTGTTATCTTCTTCCA*CTCCTTCGTAGGAAAACAGGAACCC
TAATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCGC
ACTGGCGGAAAGGGTACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACTACC
GATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGAGAATTGGAGTTAACTCCATTCCAGCTATT
GAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCCTAAAGTGCAA
GCTGCAGTTGGTGCAAATACATGGGTTGTTAGTGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAA
GATATCCTTCCTCAGATTCTTAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAAGAAG
CTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAAACTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCGGCTACCATTCAA
GAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCC
GCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGAGACCAC
AACAACAACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTTTGCTTGTTCGCT
CTATCCTCTTTTTGTAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCC*AGATA*TGATTTAAA*G
TTT*TATCCAATTGATCTGTTTT
CT

QA 7 749 7 749
DS 

RD RR2CV24JQ 124 0 0
TTTTTTT
TTAAGACAAAAGGGGGGGGGACCACAACAACAACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACAT
ATCTTTAAAATTTTGCTTGTTCGCTCTATCCTCTTTTTGTAGTGTTTCCTACCAGAT

QA 8 124 8 124
DS 

RD RR2CV24TF 724 0 0
GTCCGTCTCTCTTCACTTGTTATCTTCTTCCA*CTCCTTCGTAGGAAAACAGGAACCCTA
ATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCGCAC
TGGCGGAAAGGGTACAGTTAGAAGAAAGAAGGAGGCTGTGCACAAGACCAATACTACCGA
TGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGAGAATTGGAGTTAACTCCATTCCAGCTATTGA
AGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCCTAAAGTGCAAGC
TGCAGTTGGTGCAAATACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGA
TATCCTTCCTCAGATTCTTAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAAGAAGCT
AGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAAACTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCGGCTACCATTCAAGA
GGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCCGC
CGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGAGACCACAA
CAACAACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTTTGCTTGTTCGCTCT
ATCCTCTTTTTGTAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCCCAGATAATGATTTAAA
AGTTTTTA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2DA90JQ 708 0 0
AGGGAAACAGGAACCCTAATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGAT
GGCTAACACTGTCCGCACTGGCGGAAAGGGTACTGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCA
CAAGACCAATACTACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGAGAATTGGAGTTAA
CTCCATTCCAGCTATTGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCAT
CAACCCTAAAGTGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCA
GACCAAAAAATTGGAAGATATCCTTCCTCAGATTTTCAGCCATCTCGGACCAGACAACAT
GGAGAATTTGAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAAACTCCTGGTGGAGGTAATGT
CCCGGCTACCATTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGG
TGAGACTTTCGAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTG***CTTCTTCTTAAGACAA
AAGAGCGAGAGACCACAACAACAACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATA
ATTTTGCTAGTTCGCTCTATCCTCTTTTTGTAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCCCA
GATAATGATTTAAAAGTTTCTATCCAATTGATCTGTTTT
ATGCGTTTG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2ED20TF 799 0 0
GG
GCGTCCGTCTCTCTTCACTTGTTATCTTCTTCCAACTCCTTCGTAGGGAAACAGGAACCC
TAATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCGC
ACTGGCGGAAAGGGTACTGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACTACT
GATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGAGAATTGGAGTTAACTCCATTCCAGCTATT
GAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCCTAAAGTGCGA
GCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAA
GATATCCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAAGAAG
CTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAAACTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCGGCTACCATTCAA
GAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCC
GCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTG***CTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGAGACCAC
AACAACAACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTTTGCTAGTTCGCT
CTATCCTCTTTTTGTAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCC*AGATAATGATTTAAA*G
TTTCTATCCAATTGATCTGTTTTATGCGTTTGCTTGACTCTATCTTCTCTATCTATGTCA
CTTGTATCATGGATTTC

QA 3 799 3 799
DS 



CO CL383Contig2 703 3 1 U
GGGCCCGCGTCTATAGTCAGTCACTTGTTATCTCCTTCCACTCTCTGAAGAAACCAGAAC
CCTAATCATCAAATCTCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGT
CCGCACTGGCGGAAAGGGTACTGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATAC
TACTGATGACAAGAAGCTCCAAAGCACTCTCAAGAGAATTGGAGTTAACTCTATTCCTGC
TATTGAAGAAGTAAACATCTTCAAGGATGATGTTGTCATTCAGTTCATCAACCCTAAAGT
GCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATT
GGAAGATATCCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAACCTGAA
GAAGTTAGCAGAGTAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCAGCAACCAT
TCAAGAGGATGATGAGGACGATGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGA
AGCTGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTCCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGACC
ACAACAACAACAACAAAACCGCACTTGAATTATTACATATCTTTATAATTTTGCTTGTTC
GCTCTATCCTCTTTTTTGTAGTGCTTCCGACCAGATTCTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY59TF U 5
AF RR2CB21JQ C 4
AF RR2CB21TF U 1
BS 1 703 RR2CB21TF

RD RR2DY59TF 284 0 0
GG
GCGTCTATAGTCAGTCACTTGTTATCTCCTTCCACTCTCTGAAGAAACCAGAACCCTAAT
CATCAAATCTCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCGCAC
TGGCGGAAAGGGTACTGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACTACTGA
TGACAAGAAGCTCCAAAGCACTCTCAAGGGAATTGGAGTTAACTCTATTCCTGCTATTGA
AGAAGTAAACATCTTCAAGGATGATGTTGTCATTCAGTTCAT

QA 3 284 3 284
DS 

RD RR2CB21JQ 570 0 0
CCC
GCGTCTATAGTCAGTCACTTGTTATCTCCTTCCACTCTCTGAAGAAACCAGAACCCTAAT
CATCAAATCTCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCGCAC
TGGCGGAAAGGGTACTGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACTACTGA
TGACAAGAAGCTCCAAAGCACTCTCAAGAGAATTGGAGTTAACTCTATTCCTGCTATTGA
AGAAGTAAACATCTTCAAGGATGATGTTGTCATTCAGTTCATCAACCCTAAAGTGCAAGC
TGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGA
TATCCTTCCTCAGATTTTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAACCTGAAGAAGTT
AGCAGAGTAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCAGCAACCATTCAAGA
GGATGATGAGGACGATGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCTGC
CGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTCC

QA 4 570 4 570
DS 

RD RR2CB21TF 703 0 0
GGGCCCGCGTCTATAGTCAGTCACTTGTTATCTCCTTCCACTCTCTGAAGAAACCAGAAC
CCTAATCATCAAATCTCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGT
CCGCACTGGCGGAAAGGGTACTGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATAC
TACTGATGACAAGAAGCTCCAAAGCACTCTCAAGAGAATTGGAGTTAACTCTATTCCTGC
TATTGAAGAAGTAAACATCTTCAAGGATGATGTTGTCATTCAGTTCATCAACCCTAAAGT
GCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATT
GGAAGATATCCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAACCTGAA
GAAGTTAGCAGAGTAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCAGCAACCAT
TCAAGAGGATGATGAGGACGATGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGA
AGCTGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTCCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGACC
ACAACAACAACAACAAAACCGCACTTGAATTATTACATATCTTTATAATTTTGCTTGTTC
GCTCTATCCTCTTTTTTGTAGTGCTTCCGACCAGATTCTTGTT

QA 1 703 1 703
DS 



CO CL383Contig3 730 2 3 U
GGGCGTCTCTAGTCAGTCACTTGTTATCTCCTTCCACTCTCTGAAGAAACCAGAACCCTA
ATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGACGTTGATGAAGATGTCTAACACTGTCCGCAC
TGGCGGAAAGGGCACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACTAATACTACTGA
TGACAAGAAGCTCCAAAGCACTCTCAAGAGAATTGGAGTTAACTCTATTCCAGCTATTGA
AGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCACTAATCCTAAGGTTCAAGC
TGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGA
TATTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAAAACCTGAAGAAGCT
AGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGGGGAGGTAATGTCCCAGCAACCATTCAAGA
GGATGATGAGGACGATGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCCGC
TGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTCCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGACCACAACA
ACAACAACAACAAAACCGCACTTGAATTATTACATATCTTTATAATTTTGCTTGTTCGCT
CTATCTTCTTTTTGTAGTGCTCCCGACCAGATTCTTGTTTCCCAGATAATGATTTAAGGT
TTTATATCCG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G091TF U 1
AF RR2G091JQ C 1
BS 1 2 RR2G091JQ
BS 3 711 RR2G091TF
BS 712 730 RR2G091JQ

RD RR2G091TF 711 0 0
GG
GCGTCTCTAGTCAGTCACTTGTTATCTCCTTCCACTCTCTGAAGAAACCAGAACCCTAAT
CATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGACGTTGATGAAGATGTCTAACACTGTCCGCACTG
GCGGAAAGGGCACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACTAATACTACTGATG
ACAAGAAGCTCCAAAGCACTCTCAAGAGAATTGGAGTTAACTCTATTCCAGCTATTGAAG
AAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCACTAATCCTAAGGTTCAAGCTG
CAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGATA
TTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAAAACCTGAAGAAGCTAG
CAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGGGGAGGTAATGTCCCAGCAACCATTCAAGAGG
ATGATGAGGACGATGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCCGCTG
CTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTCCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGACCACAACAAC
AACAACAACAAAACCGCACTTGAATTATTACATATCTTTATAATTTTGCTTGTTCGCTCT
ATCTTCTTTTTGTAGTGCTCCCGACCAGATTCTTGTTTCCCAGATAATG

QA 3 711 3 711
DS 

RD RR2G091JQ 730 0 0
GGGCGTCTCTAGTCAGTCACTTGTTATCTCCTTCCACTCTCTGAAGAAACCAGAACCCTA
ATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGACGTTGATGAAGATGTCTAACACTGTCCGCAC
TGGCGGAAAGGGCACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACTAATACTACTGA
TGACAAGAAGCTCCAAAGCACTCTCAAGAGAATTGGAGTTAACTCTATTCCAGCTATTGA
AGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCACTAATCCTAAGGTTCAAGC
TGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGA
TATTCTTCCTCAGATTTTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAAAACCTGAAGAAGCT
AGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGGGGAGGTAATGTCCCAGCAACCATTCAAGA
GGATGATGAGGACGATGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCCGC
TGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTCCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGACCACAACA
ACAACAACAACAAAACCGCACTTGAATTATTACATATCTTTATAATTTTGCTTGTTCGCT
CTATCTTCTTTTTGTAGTGCTCCCGACCAGATTCTTGTTTCCCAGATAATGATTTAAGGT
TTTATATCCG

QA 1 730 1 730
DS 



AS 3 10

CO CL384Contig1 793 3 16 U
ACGATCTTCAATCATAATAATTATATATAAATTATTAAAGGGAATTGTGAGCCCTAGGAC
AAGGTACAAGGGTTAATGAAACCAAAATTACGCAAGTCACATCTCAGAAGAGAGGACTCT
TGGAAAAATATAACCAACGCAAATAGCAAAAAATACACCGAGATACATTCTCTCGGTGAA
TAAGTATATACGTATATAGTTTTTAGTTTTAAACTACATTTATATTGAAGCCGCAACAGC
GGGAGGTGGGAGAAGCCACTTGGATCCTTCAATATAGCCGAGGGTAAGGAAACGGTTAGC
TACAGTAGTGTCAATCTTTTGTGTAAATGGAACTCTCTTGTCTGTCTGTGCTCCTTCTCC
TACGCACTTGTACTCTCCATAGAACACGGTCTTGTCATGTGCGGCTATCTTGTTTTCTTG
CCATCCAGATGGGTTGACTACGCTGGTCATCTCGGTGTAGGCGTAGACAACCTTAGGGTG
GCTCATCCATGCCCTACCCAAATAGATTCCTTGACCAACTCCAGTCACCTTGCAATGCAC
GAAAGAGTATCCGGTCTTCTCGTCTGCGGTCTTTCCCGCATGCGCTGTTATCACTCTAAT
GCCATCTCCCACCACGTGCAATTGTGTACCCAAGTAAAGAGAGGTCCCGCTTCCGAAGAT
GAAATCGAATGTCCCTTCGACGTAACAATCCTTGAAGAAATGGTTTCCGGTATCGTCACA
AATTGTGTCTTGGAATCCGTAGAATTTACAGTTGTAGAAAGCAGCCTTGTTTCCAGAGAT
TCTCATAGATACC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G355JQ U 3
AF RR2BO87JQ U 1
AF RR2G355TF C 58
BS 1 98 RR2BO87JQ
BS 99 99 RR2G355JQ
BS 100 104 RR2BO87JQ
BS 105 105 RR2G355JQ
BS 106 161 RR2BO87JQ
BS 162 162 RR2G355JQ
BS 163 273 RR2BO87JQ
BS 274 274 RR2G355JQ
BS 275 277 RR2BO87JQ
BS 278 278 RR2G355JQ
BS 279 465 RR2BO87JQ
BS 466 466 RR2G355JQ
BS 467 480 RR2BO87JQ
BS 481 481 RR2G355JQ
BS 482 671 RR2BO87JQ
BS 672 793 RR2G355TF

RD RR2G355JQ 656 0 0
GATCTTCAATCATAATAATTATATATAAATTATTAAAGGGAATTGTGAGCCCTAGGACAA
GGTACAAGGGTTAATGAAACCAAAATTACGCAAGTCACATCTCAAAAGAGAGGACTCTTG
GAAAAATATAACCAACGCAAATAGCAAAAAATACACCGAGATACATTCTCTCGGTGAATA
AGTATATACGTATATAGTTTTTAGTTTTAAACTACATTTATATTGAAGCCGCAACAGCGG
GAGGTGGGAGAAGCCACTTGGATCCTTCAATATAGCCGAGGGTAAGGAAACGGTTAGCTA
CAGTAGTGTCAATCTTTTGTGTAAATGGAACTCTCTTGTCTGTCTGTGCTCCTTCTCCTA
CGCACTTGTACTCTCCATAGAACACGGTCTTGTCATGTGCGGCTATCTTGTTTTCTTGCC
ATCCAGATGGGTTGACTACGCTGGTCATCTCGGTGTAGGCGTAGACAACCTTAGGGTGGC
TCATCCATGCCCTACCCAAATAGATTCCTTGACCAACTCCAGTCACCTTGCAATGCACGA
AAGAGTATCCGGTCTTCTCGTCTGCGGTCTTTCCCGCATGCGCTGTTATCACTCTAATGC
CATCTCCCACCACGTGCAATTGTGTACCCAAGTAAAGAGAGGTCCCGCTTCCGAAG

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2BO87JQ 671 0 0
ACGATCTTCAATCATAATAATTATATATAAATTATTAAAGGGAATTGTGAGCCCTAGGAC
AAGGTACAAGGGTTAATGAAACCAAAATTACGCAAGTCTCATCTAAGAAGAGAGGACTCT
TGGAAAAATATAACCAACGCAAATAGCAAAAAATACACCGATATACATTCTCTCGGTGAA
TAAGTATATACGTATATAGTTTTTAGTTTTAAACTACATTTATATTGAAGCCGCAACAGC
GGGAGGTGGGAGAAGCCACTTGGATCCTTCAATGTAGTCGAGGGTAAGGAAACGGTTAGC
TACAGTAGTGTCAATCTTTTGTGTAAATGGAACTCTCTTGTCTGTCTGTGCTCCTTCTCC
TACGCACTTGTACTCTCCATAGAACACGGTCTTGTCATGTGCGGCTATCTTGTTTTCTTG
CCATCCAGATGGGTTGACTACGCTGGTCATCTCGGTGTAGGCGTAAACAACCTTAGGGTG
ACTCATCCATGCCCTACCCAAATAGATTCCTTGACCAACTCCAGTCACCTTGCAATGCAC
GAAAGAGTATCCGGTCTTCTCGTCTGCGGTCTTTCCCGCATGCGCTGTTATCACTCTAAT
GCCATCTCCCACCACGTGCAATTGTGTACCCAAGTAAAGAGAGGTCCCGCTTCCGAAGAT
GAAATCGAATG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2G355TF 736 0 0
GACAAGGTACAAGGGT
TAATGAAACCAAAATTACGCAAGTCACATCTCAGAAGAGAGGACTCTTGGAAAAATATAA
CCAACGCAAATAGCAAAAAATACACCGAGATACATTCTCTCGGTGAATAAGTATATACGT
ATATAGTTTTTAGTTTTAAACTACATTTATATTGAAGCCGCAACAGCGGGAGGTGGGAGA
AGCCACTTGGATCCTTCAATATAGCCGAGGGTAAGGAAACGGTTAGCTACAGTAGTGTCA
ATCTTTTGTGTAAATGGAACTCTCTTGTCTGTCTGTGCTCCTTCTCCTACGCACTTGTAC
TCTCCATAGAACACGGTCTTGTCATGTGCGGCTATCTTGTTTTCTTGCCATCCAGATGGG
TTGACTACGCTGGTCATCTCGGTGTAGGCGTAGACAACCTTAGGGTGGCTCATCCATGCC
CTACCCAAATAGATTCCTTGACCAACTCCAGTCACCTTGCAATGCACGAAAGAGTATCCG
GTCTTCTCGTCTGCGGTCTTTCCCGCATGCGCTGTTATCACTCTAATGCCATCTCCCACC
ACGTGCAATTGTGTACCCAAGTAAAGAGAGGTCCCGCTTCCGAAGATGAAATCGAATGTC
CCTTCGACGTAACAATCCTTGAAGAAATGGTTTCCGGTATCGTCACAAATTGTGTCTTGG
AATCCGTAGAATTTACAGTTGTAGAAAGCAGCCTTGTTTCCAGAGATTCTCATAGATACC

QA 17 736 17 736
DS 



CO CL384Contig2 765 4 10 U
GGATTAAGAAAAACAAAAAAAAA*CTACAAAAAAATATAAATTTTTCTTTTTAATTTTAA
TAAAACAAAAAAA*TAAAACAAAAATAAAACAATGAGATGCACAAACGTGTCCATTTTAT
TAGCCTTGGTGATGGTGTTTGTTACACCGATGGTGTTGGCAGATGATGTAACACCAATTC
CAGAGGCCAAAGTTCAAGTGGAGCAGTGGTTCAAGACCAACGTAGCTCCTTTGCCTTCGC
GTAAAGGTCTAGATCCTGCTCTCGTAGCTGCTGAGGCTGAGCCACGTACCATCACCGTGG
ATCCAAAGGGAGGTGAATTCAAAACACTAACGGACGCAATAAAGAGCGTTCCTGCAGCGA
ACACAAAGCGTGTGATCATCAAGATAGCCCCTGGCGAATACAGAGAGAAGGTCACCATCG
ACAGAAACAAACCCTTCATTACATTGATGGGAGATCCCAAGGCCATGCCGGTTATTACTT
TCGACGGTACTGCCGCAAAGTTCGGTACCGTAGATAGTGCCACACTCATTATCTTATCCG
ACTATTTCATGGCTGTCAACATCGTCGTTAAGAATACAGCGCCGGCACCGGATGGTAAAG
CGAAGGGAGCACAAGCTTTATCTATGAGAATCTCTGGAAACAAGGCTGCTTTCTACAACT
GTAAATTCTACGAATTCCAAGACACAATTTGTGACGATACCGGAAACCATTTCTTCAAGG
ATTGTTACGTCGAAGGACATTCGATTTCATCTTCGAAGCGGGACT


BQ
20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS85TF U 1
AF RR2G913TF U 1
AF RR2CT63TF U 1
AF RR2CQ21TF U 2
BS 1 34 RR2CT63TF
BS 35 35 RR2GS85TF
BS 36 73 RR2CT63TF
BS 74 74 RR2GS85TF
BS 75 578 RR2CT63TF
BS 579 579 RR2GS85TF
BS 580 672 RR2CT63TF
BS 673 673 RR2CQ21TF
BS 674 740 RR2CT63TF
BS 741 765 RR2CQ21TF

RD RR2GS85TF 639 0 0
GGATTAAGAAAAACAAAAAAAAA*CTACAAAAAAATATAAATTTTTCTTTTTAATTTTAA
TAAAACAAAAAAA*TAAAACAAAAATAAAACAATGAGATGCACAAACGTGTCCATTTTAT
TAGCCTTGGTGATGGTGTTTGTTACACCGATGGTGTTGGCAGATGATGTAACACCAATTC
CAGAGGCCAAAGTTCAAGTGGAGCAGTGGTTCAAGACCAACGTAGCTCCTTTGCCTTCGC
GTAAAGGTCTAGATCCTGCTCTCGTAGCTGCTGAGGCTGAGCCACGTACCATCACCGTGG
ATCCAAAGGGAGGTGAATTCAAAACACTAACGGACGCAATAAAGAGCGTTCCTGCAGCGA
ACACAAAGCGTGCGATCATCAAGATAGCCCCTGGCGAATACAGAGAGAAGGTCACCATCG
ACAGAAACAAACCCTTCATTACATTGATGGGAGATCCCAAGGCCATGCCGGTTATTACTT
TCGACGGTACTGCCGCAAAGTTCGGTACCGTAGATAGTGCCACACTCATTATCTTATCCG
ACTATTTCATGGCTGTCAACATCGTCGTTAAGAATACAGCGCCGGCACCGGATGGTAAAG
CGAAGGGAGCACAAGCTTTATCTATGAGAATCTCTGGAA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2G913TF 638 0 0
GGATTAAGAAAAACAAAAAAAAAACTACAAAAAAATATAAATTTTTCTTTTTAATTTTAA
TAAAACAAAAAAA*TAAAACAAAAATAAAACAATGAGATGCACAAACGTGTCCATTTTAT
TAGCCTTGGTGATGGTGTTTGTTACACCGATGGTGTTGGCAGATGATGTAACACCAATTC
CAGAGGCCAAAGTTCAAGTGGAGCAGTGGTTCAAGACCAACGTAGCTCCTTTGCCTTCGC
GTAAAGGTCTAGATCCTGCTCTCGTAGCTGCTGAGGCTGAGCCACGTACCATCACCGTGG
ATCCAAAGGGAGGTGAATTCAAAACACTAACGGACGCAATAAAGAGCGTTCCTGCAGCGA
ACACAAAGCGTGTGATCATCAAGATAGCCCCTGGCGAATACAGAGAGAAGGTCACCATCG
ACAGAAACAAACCCTTCATTACATTGATGGGAGATCCCAAGGCCATGCCGGTTATTACTT
TCGACGGTACTGCCGCAAAGTTCGGTACCGTAGATAGTGCCACACGCATTATCTTATCCG
ACTATTTCATGGCTGTCAACATCGTCGTTAAGAATACAGCGCCGGCACCGGATGGTAAAG
CGAAGGGAGCACAAGCTTTATCTATGAGAATCTCTGGA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2CT63TF 741 0 0
GGATTAAGAAAAACAAAAAAAAA*CTACAAAAAA*TATAAATTTTTCTTTTTAATTTTAA
TAAAACAAAAAAAATAAAACAAAAATAAAACAATGAGATGCACAAACGTGTCCATTTTAT
TAGCCTTGGTGATGGTGTTTGTTACACCGATGGTGTTGGCAGATGATGTAACACCAATTC
CAGAGGCCAAAGTTCAAGTGGAGCAGTGGTTCAAGACCAACGTAGCTCCTTTGCCTTCGC
GTAAAGGTCTAGATCCTGCTCTCGTAGCTGCTGAGGCTGAGCCACGTACCATCACCGTGG
ATCCAAAGGGAGGTGAATTCAAAACACTAACGGACGCAATAAAGAGCGTTCCTGCAGCGA
ACACAAAGCGTGTGATCATCAAGATAGCCCCTGGCGAATACAGAGAGAAGGTCACCATCG
ACAGAAACAAACCCTTCATTACATTGATGGGAGATCCCAAGGCCATGCCGGTTATTACTT
TCGACGGTACTGCCGCAAAGTTCGGTACCGTAGATAGTGCCACACTCATTATCTTATCCG
ACTATTTCATGGCTGTCAACATCGTCGTTAAGAATACAACGCCGGCACCGGATGGTAAAG
CGAAGGGAGCACAAGCTTTATCTATGAGAATCTCTGGAAACAAGGCTGCTTTCTACAACT
GTAAATTCTACGGATTCCAAGACACAATTTGTGACGATACCGGAAACCATTTCTTCAAGG
ATTGTTACGTCGAAGGACAT
T

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2CQ21TF 764 0 0
GATTAAGAAAAACAAAAAAAA**CTACAAAAAA*TATAAATTTTTCTTTTTAATTTTAAT
AAAACAAAAAAA*TAAAACAAAAATAAAACAATGAGATGCACAAACGTGTCCATTTTATT
AGCCTTGGTGATGGTGTTTGTTACACCGATGGTGTTGGCAGATGATGTAACACCAATTCC
AGAGGCCAAAGTTCAAGTGGAGCAGTGGTTCAAGACCAACGTAGCTCCTTTGCCTTCGCG
TAAAGGTCTAGATCCTGCTCTCGTAGCTGCTGAGGCTGAGCCACGTACCATCACCGTGGA
TCCAAAGGGAGGTGAATTCAAAACACTAACGGACGCAATAAAGAGCGTTCCTGCAGCGAA
CACAAAGCGTGTGATCATCAAGATAGCCCCTGGCGAATACAGAGAGAAGGTCACCATCGA
CAGAAACAAACCCTTCATTACATTGATGGGAGATCCCAAGGCCATGCCGGTTATTACTTT
CGACGGTACTGCCGCAAAGTTCGGTACCGTAGATAGTGCCACACTCATTATCTTATCCGA
CTATTTCATGGCTGTCAACATCGTCGTTAAGAATACAGCGCCGGCACCGGATGGTAAAGC
GAAGGGAGCACAAGCTTTATCTATGAGAATCTCTGGAAACAAG*CTGCTTTCTACAACTG
TAAATTCTACGAATTCCAAGACACAATTTGTGACGATACCGGAAAC*ATTTCTTCA*GGA
TTGTTACGTCGAAGGACATTCGATTTCATCTTCGAAGCGGGACT

QA 1 764 1 764
DS 



CO CL384Contig3 691 3 2 U
CGATCTTTCAATCATAATAATAATATATAATTAATTAAAGGGAACTGGGACCCCTGAACA
AGATACAAGGGTTATGAATTGTCGTAATGAAACCAAAATTACGCAAGTCTCATCTAAAAA
GAGAGGACTCTTGGAAAAATATAACCAACGCAAATAGCAAAAAAAA*CACCGATATACAT
TCTCTCGGTGAATAAGTATATACGTATATATTTTTTAGTTTTAAACTAGATTCATATTGA
AGCCGCAACAGCGGGAGGTGGGAGAAGCCACTTGGATCCTTCAATGTAGCCGAGGGTAAG
GAAACGGTTAGCTACAGTAGTGTCAATCTTTTGTGTAAATGGAACTCTCTTGTCTGTCTG
TGCTCCTTCTCCTACGCACTTGTACTCTCCATAAAACACGGTCTTGTCATGTGCGGCTAT
CTTGTTTTCTTGCCATCCAGATGGGTTGACTACGCTGGTCATCTCGGTGTAGGCGTAGAC
AACCTTAGGGTGACTCATCCATGCCCTACCCAAATAGATTCCTTGACCAACTCCAGTCAC
CTTGCAATGCACGAAAGAGTATCCGGTCTTCTCGTCTGCGGTCTTTCCCGCATGCGCTGT
TATCACTCTAATGCCATCTCCCACCACGTGCAATTGTGTACCCAAGTAAAGAGAGGTCCC
GCTTCCGAAGATGAAATCGAATGTCCCTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT63JQ U 141
AF RR2G913JQ U 1
AF RR2FE89JQ U 27
BS 1 458 RR2G913JQ
BS 459 691 RR2FE89JQ

RD RR2CT63JQ 122 0 0
ATAACCAACGCAAATAGCAAAAAAAAACACCGATATACATTCTCTCGGTGAATAAGTATA
TACGTATATAGTTTTTAGTTTTAAACTAGATTCATATTGAAGCCGCAACAGCGGGAGGTG
GG

QA 1 122 1 122
DS 

RD RR2G913JQ 458 0 0
CGATCTTTCAATCATAATAATAATATATAATTAATTAAAGGGAACTGGGACCCCTGAACA
AGATACAAGGGTTATGAATTGTCGTAATGAAACCAAAATTACGCAAGTCTCATCTAAAAA
GAGAGGACTCTTGGAAAAATATAACCAACGCAAATAGCAAAAAAAA*CACCGATATACAT
TCTCTCGGTGAATAAGTATATACGTATATATTTTTTAGTTTTAAACTAGATTCATATTGA
AGCCGCAACAGCGGGAGGTGGGAGAAGCCACTTGGATCCTTCAATGTAGCCGAGGGTAAG
GAAACGGTTAGCTACAGTAGTGTCAATCTTTTGTGTAAATGGAACTCTCTTGTCTGTCTG
TGCTCCTTCTCCTACGCACTTGTACTCTCCATAAAACACGGTCTTGTCATGTGCGGCTAT
CTTGTTTTCTTGCCATCCAGATGGGTTGACTACGCTGG

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2FE89JQ 665 0 0
ATAATTAATTAAAGGGAACTGGGACCCCTGAACAAGATACAAGGGTTATGAATTGTCGTA
ATGAAACCAAAATTACGCAAGTCTCATCTAAAAAGAGAGGACTCTTGGAAAAATATAACC
AACGCAAATAGCAAAAAAAA*CACCGATATACATTCTCTCGGTGAATAAGTATATACGTA
TATATTTTTTAGTTTTAAACTAGATTCATATTGAAGCCGCAACAGCGGGAGGTGGGAGAA
GCCACTTGGATCCTTCAATGTAGCCGAGGGTAAGGAAACGGTTAGCTACAGTAGTGTCAA
TCTTTTGTGTAAATGGAACTCTCTTGTCTGTCTGTGCTCCTTCTCCTACGCACTTGTACT
CTCCATAGAACACGGTCTTGTCATGTGCGGCTATCTTGTTTTCTTGCCATCCAGATGGGT
TGACTACGCTGGTCATCTCGGTGTAGGCGTAGACAACCTTAGGGTGACTCATCCATGCCC
TACCCAAATAGATTCCTTGACCAACTCCAGTCACCTTGCAATGCACGAAAGAGTATCCGG
TCTTCTCGTCTGCGGTCTTTCCCGCATGCGCTGTTATCACTCTAATGCCATCTCCCACCA
CGTGCAATTGTGTACCCAAGTAAAGAGAGGTCCCGCTTCCGAAGATGAAATCGAATGTCC
CTTCG

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 10

CO CL385Contig1 576 10 10 U
AGGGAGAAAACACATTCTAATTTTGCGATTAAATCCAGAGAATCTCCAAAACATTTCAAA
ACAGAGAAAGGAAAATGCTTCCGAATATCAAAAATACAAAATAACAAACTAGTGGACATA
AACCACAGCTACTTCAAAAGCTTGTTCAGAACTTCAGATGTTACTCGGATACATGAAGAC
TCTGACCCTCATCCCCATGGACTTAGGAGGCAAGTTGGATGTGAATTTGGCACGGACAAC
ACCGCTGTTACCATGAGGCCTTGTAACTTTTCCCCAGATGCAGCGGTAATGGCTACCGTT
CTTCTTGGTCTTAGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGTACCATGTCACCTC
CTCTGTAGTGTTGACTCCCTCGATCTGGATAAGGGATGTGTTTGGGTACTGGTTAGACTT
CGACCTTTTGTATCCCAAGATGGTTCCCCTGACGTAGAGTCTGACACGTTCTCCTTGGCG
TCCCTTCACCATTTTCGCGTCGGCTGATAAACGCAAAGTCTGCTGCTAGTGATGAAAACG
GAGAAGCCAAACACTAAAACATAACCACGAGTTTCC


BQ
10 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GO17JQ U 1
AF RR2GO17TF C 1
AF RR2GV56JQB U 2
AF RR2GV56TF C 2
AF RR2EG95JQ U 3
AF RR2EA23JQ U 2
AF RR2B249JQ U 2
AF RR2B249TF C 2
AF RR2EG95TF C 3
AF RR2EA23TF C 2
BS 1 48 RR2GO17JQ
BS 49 49 RR2EA23JQ
BS 50 378 RR2GO17JQ
BS 379 379 RR2EA23JQ
BS 380 415 RR2GO17JQ
BS 416 416 RR2EA23JQ
BS 417 456 RR2GO17JQ
BS 457 457 RR2EA23JQ
BS 458 517 RR2GO17JQ
BS 518 576 RR2EA23JQ

RD RR2GO17JQ 517 0 0
AGGGAGAAAACACATTCTAATTTTGCGATTAAATCCAGAGAATCTCCATAACATTTCAAA
ACAGAGAAAGGAAAATGCTTCCGAATATCAAAAATACAAAATAACAAACTAGTGGACATA
AACCACAGCTACTTCAAAAGCTTGTTCAGAACTTCAGATGTTACTCGGATACATGAAGAC
TCTGACCCTCATCCCCATGGACTTAGGAGGCAAGTTGGATGTGAATTTGGCACGGACAAC
ACCGCTGTTACCATGAGGCCTTGTAACTTTTCCCCAGATGCAGCGGTAATGGCTACCGTT
CTTCTTGGTCTTAGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGTACCATGTCACCTC
CTCTGTAGTGTTGACTCCTTCGATCTGGATAAGGGATGTGTTTGGGTACTGGTTAAACTT
CGACCTTTTGTATCCCAAGATGGTTCCCCTGACGTAAAGTCTGACACGTTCTCCTTGGCG
TCCCTTCACCATTTTCGCGTCGGCTGATAAACGCAAA

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2GO17TF 517 0 0
A
GGGAGAAAACACATTCTAATTTTGCGATTAAATCCAGAGAATCTCCATAACATTTCAAAA
CAGAGAAAGGAAAATGCTTCCGAATATCAAAAATACAAAATAACAAACTAGTGGACATAA
ACCACAGCTACTTCAAAAGCTTGTTCAGAACTTCAGATGTTACTCGGATACATGAAGACT
CTGACCCTCATCCCCATGGACTTAGGAGGCAAGTTGGATGTGAATTTGGCACGGACAACA
CCGCTGTTACCATGAGGCCTTGTAACTTTTCCCCAGATGCAGCGGTAATGGCTACCGTTC
TTCTTGGTCTTAGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGTACCATGTCACCTCC
TCTGTAGTGTTGACTCCTTCGATCTGGATAAGGGATGTGTTTGGGTACTGGTTAGACTTC
GACCTTTTGTATCCCAAGATGGTTCCCCTGACGTAGAGTCTGACACGTTCTCCTTGGCGT
CCCTTCACCATTTTCGCGTCGGCTGATAAACGCAAA

QA 2 517 2 517
DS 

RD RR2GV56JQB 493 0 0
AGGAGAAAACACATTCTAATTTTGCGATTAAATCCAGAGAATCTCCATAACATTTCAAAA
CAGAGAAAGGAAAATGCTTCCGAATATCAAAAATACAAAATAACAAACTAGTGGACATAA
ACCACAGCTACTTCAAAAGCTTGTTCAGAACTTCAGATGTTACTCGGATACATGAAGACT
CTGACCCTCATCCCCATGGACTTAGGAGGCAAGTTGGATGTGAATTTGGCACGGACAACA
CCGCTGTTACCATGAGGCCTTGTAACTTTTCCCCAGATGCAGCGGTAATGGCTACCGTTC
TTCTTGGTCTTAGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGTACCATGTCACCTCC
TCTGTAGTGTTGACTCCTTCCATCTGGATAAGGGATGTGTTTGGGTACTGGTTAGACTTC
GACCTTTTGTATCCCAAGATGGTTCCCCTGACGTAGAGTCTGACACGTTCTCCTTGGCGT
CCCTTCACCATTT

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR2GV56TF 528 0 0
AGGAGAAAACACATTCTAATTTTGCGATTAAATCCAGAGAATCTCCATAACATTTCAAAA
CAGAGAAAGGAAAATGCTTCCGAATATCAAAAATACAAAATAACAAACTAGTGGACATAA
ACCACAGCTACTTCAAAAGCTTGTTCAGAACTTCAGATGTTACTCGGATACATGAAGACT
CTGACCCTCATCCCCATGGACTTAGGAGGCAAGTTGGATGTGAATTTGGCACGGACAACA
CCGCTGTTACCATGAGGCCTTGTAACTTTTCCCCAGATGCAGCGGTAATGGCTACCGTTC
TTCTTGGTCTTAGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGTACCATGTCACCTCC
TCTGTAGTGTTGACTCCTTCGATCTGGATAAGGGATGTGTTTGGGTACTGGTTAGACTTC
GACCTTTTGTATCCCAAGATGGTTCCCCTGACGTAGAGTCTGACACGTTCTCCTTGGCGT
CCCTTCACCATTTTCGCGTCGGCTGATAAACGCAAAGTCTGCTGCT
CC

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2EG95JQ 524 0 0
GGAGAAAACACATTCTAATTTTGCGATTAAATCCAGAGAATCTCCAAAACATTTCAAAAC
AGAGAAAGGAAAATGCTTCCGAATATCAAAAATACAAAATAACAAACTAGTGGACATAAA
CCACAGCTACTTCAAAAGCTTGTTCAGAACTTCAGATGTTACTCGGATACATGAAGACTC
TGACCCTCATCCCCATGGACTTAGGAGGCAAGTTGGATGTGAATTTGGCACGGACAACAC
CGCTGTTACCATGAGGCCTTGTAACTTTTCCCCAGATGCAGCGGTAATGGCTACCGTTCT
TCTTGGTCTTAGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGTACCATGTCACCTCCT
CTGTAGTGTTGACTCCCTCGATCTGGATAAGGGATGTGTTTGGGTACTGGTTAGACTTCG
ACCTTTTGTATCCCAAGATGGTTCCCCTGACGTAGAGTCTGACACGTTCTCCTTGGCGTC
CCTTCACCATTTTCGCGTCGGCTGATAAACGCAAAGTCTGCTGC

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2EA23JQ 575 0 0
GGGAGAAAACACATTCTAATTTTGCGATTAAATCCAGAGAATCTCCAAAACATTTCAAAA
CAGAGAAAGGAAAATGCTTCCGAATATCAAAAATACAAAATAACAAACTAGTGGACATAA
ACCACAGCTACTTCAAAAGCTTGTTCAGAACTTCAGATGTTACTCGGATACATGAAGACT
CTGACCCTCATCCCCATGGACTTAGGAGGCAAGTTGGATGTGAATTTGGCACGGACAACA
CCGCTGTTACCATGAGGCCTTGTAACTTTTCCCCAGATGCAGCGGTAATGGCTACCGTTC
TTCTTGGTCTTAGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGTACCATGTCACCTCC
TCTGTAGTGTTGACTCCCTCGATCTGGATAAGGGATGTGTTTGGGTACTGGTTAGACTTC
GACCTTTTGTATCCCAAGATGGTTCCCCTGACGTAGAGTCTGACACGTTCTCCTTGGCGT
CCCTTCACCATTTTCGCGTCGGCTGATAAACGCAAAGTCTGCTGCTAGTGATGAAAACGG
AGAAGCCAAACACTAAAACATAACCACGAGTTTCC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2B249JQ 543 0 0
C
GGAGAAAACACATTCTAATTTTGCGATTAAATCCAGAGAATCTCCAAAACATTTCAAAAC
AGAGAAAGGAAAATGCTTCCGAATATCAAAAATACAAAATAACAAACTAGTGGACATAAA
CCACAGCTACTTCAAAAGCTTGTTCAGAACTTCAGATGTTACTCGGATACATGAAGACTC
TGACCCTCATCCCCATGGACTTAGGAGGCAAGTTGGATGTGAATTTGGCACGGACAACAC
CGCTGTTACCATGAGGCCTTGTAACTTTTCCCCAGATGCAGCGGTAATGGCTACCGTTCT
TCTTGGTCTTAGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGTACCATGTCACCTCCT
CTGTAGTGTTGACTCCCTCGATCTGGATAAGGGATGTGTTTGGGTACTGGTTAGACTTCG
ACCTTTTGTATCCCAAGATGGTTCCCCTGACGTAGAGTCTGACACGTTCTCCTTGGCGTC
CCTTCACCATTTTCGCGTCGGCTGATAAACGCAAAGTCTGCTGCTAGTGATGAAAACGGA
CC

QA 2 541 2 541
DS 

RD RR2B249TF 543 0 0
C
GGAGAAAACACATTCTAATTTTGCGATTAAATCCAGAGAATCTCCAAAACATTTCAAAAC
AGAGAAAGGAAAATGCTTCCGAATATCAAAAATACAAAATAACAAACTAGTGGACATAAA
CCACAGCTACTTCAAAAGCTTGTTCAGAACTTCAGATGTTACTCGGATACATGAAGACTC
TGACCCTCATCCCCATGGACTTAGGAGGCAAGTTGGATGTGAATTTGGCACGGACAACAC
CGCTGTTACCATGAGGCCTTGTAACTTTTCCCCAGATGCAGCGGTAATGGCTACCGTTCT
TCTTGGTCTTAGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGTACCATGTCACCTCCT
CTGTAGTGTTGACTCCCTCGATCTGGATAAGGGATGTGTTTGGGTACTGGTTAGACTTCG
ACCTTTTGTATCCCAAGATGGTTCCCCTGACGTAGAGTCTGACACGTTCTCCTTGGCGTC
CCTTCACCATTTTCGCGTCGGCTGATAAACGCAAAGTCTGCTGCTAGTGATGAAAACGGA
CC

QA 2 541 2 541
DS 

RD RR2EG95TF 548 0 0
GGAGAAAACACATTCTAATTTTGCGATTAAATCCAGAGAATCTCCAAAACATTTCAAAAC
AGAGAAAGGAAAATGCTTCCGAATATCAAAAATACAAAATAACAAACTAGTGGACATAAA
CCACAGCTACTTCAAAAGCTTGTTCAGAACTTCAGATGTTACTCGGATACATGAAGACTC
TGACCCTCATCCCCATGGACTTAGGAGGCAAGTTGGATGTGAATTTGGCACGGACAACAC
CGCTGTTACCATGAGGCCTTGTAACTTTTCCCCAGATGCAGCGGTAATGGCTACCGTTCT
TCTTGGTCTTAGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGTACCATGTCACCTCCT
CTGTAGTGTTGACTCCCTCGATCTGGATAAGGGATGTGTTTGGGTACTGGTTAGACTTCG
ACCTTTTGTATCCCAAGATGGTTCCCCTGACGTAGAGTCTGACACGTTCTCCTTGGCGTC
CCTTCACCATTTTCGCGTCGGCTGATAAACGCAAAGTCTGCTGCTAGTGATGAAAACGGA
GAAGCCCC

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2EA23TF 575 0 0
GGGAGAAAACACATTCTAATTTTGCGATTAAATCCAGAGAATCTCCAAAACATTTCAAAA
CAGAGAAAGGAAAATGCTTCCGAATATCAAAAATACAAAATAACAAACTAGTGGACATAA
ACCACAGCTACTTCAAAAGCTTGTTCAGAACTTCAGATGTTACTCGGATACATGAAGACT
CTGACCCTCATCCCCATGGACTTAGGAGGCAAGTTGGATGTGAATTTGGCACGGACAACA
CCGCTGTTACCATGAGGCCTTGTAACTTTTCCCCAGATGCAGCGGTAATGGCTACCGTTC
TTCTTGGTCTTAGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGTACCATGTCACCTCC
TCTGTAGTGTTGACTCCCTCGATCTGGATAAGGGATGTGTTTGGGTACTGGTTAGACTTC
GACCTTTTGTATCCCAAGATGGTTCCCCTGACGTAGAGTCTGACACGTTCTCCTTGGCGT
CCCTTCACCATTTTCGCGTCGGCTGATAAACGCAAAGTCTGCTGCTAGTGATGAAAACGG
AGAAGCCAAACACTAAAACATAACCACGAGTTTCC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 2 10

CO CL386Contig1 788 8 20 U
TTTTTAAACAGGGGTTCAATACTATGAAACCAATGAAAATGCAAGCAGTTCTCATCATCC
TGGTTTTCTCCGGTTTAGTGGCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCG
GGAGCCAAGGCTGGGAACAATCCGTTGACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAATCTTTCA
AAGTCGGAGACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTAGAGCTGGGAA
GCGAAGCGGCATACAAGAGTTGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGTTCTGGGA
ACGACGTCGTTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAGGGC
ATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAACGTTGTCTCTGCTGACTCCACCGCCGTTT
CCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGTTCTGACTCAGATTCGGGTTCGAACAGCGGCTCATCTC
CGGGTTCGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCA
TTGGATATATATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATGGG*TCTTGTCTGGG*CTTTCTGAGG
ATTAAGGCTTTT*GTATTTGTTGCATCGAGGAATATATTTT*GGGAGGGGAGAATATAAA
TAAATTTTCGAATTATTAATCCGTATTTGTTGTATTTTGCGAATTTGCGTCATTATGTAT
TTCGAATATTGCATTTCTGATTTTGTTATTATATCCCTATTTCTCAGTTACTATGGTTTT
CTCACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 5 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2D073TF U 1
AF RR2AX73TFB U 278
AF RR2B832TF U 6
AF RR2B832JQ C 7
AF RR2D073JQ C 162
AF RR2BF51TF U 6
AF RR2BF51JQ C 29
AF RR2BK94JQ C 121
BS 1 20 RR2D073TF
BS 21 21 RR2B832TF
BS 22 22 RR2D073TF
BS 23 24 RR2B832TF
BS 25 343 RR2D073TF
BS 344 344 RR2B832TF
BS 345 544 RR2D073TF
BS 545 577 RR2B832TF
BS 578 578 RR2BF51TF
BS 579 589 RR2B832TF
BS 590 590 RR2BF51TF
BS 591 612 RR2B832TF
BS 613 613 RR2BF51TF
BS 614 641 RR2B832TF
BS 642 642 RR2B832JQ
BS 643 728 RR2B832TF
BS 729 729 RR2BF51TF
BS 730 771 RR2B832TF
BS 772 781 RR2BF51TF
BS 782 788 RR2BK94JQ

RD RR2D073TF 544 0 0
TTTTTAAACAGGGGTTCAATTCACTGAAACCAATGAAAATGCAAGCAGTTCTCATCATCC
TGGTTTTCTCCGGTTTAGTGGCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCG
GGAGCCAAGGCTGGGAACAATCCGTTGACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAATCTTTCA
AAGTCGGAGACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTAGAGCTGGGAA
GCGAAGCGGCATACAAGAGTTGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGTTCTGGGA
ACGACGTCGTTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCGTGTGGGACCCCAGGGC
ATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAACGTTGTCTCTGCTGACTCCACCGCCGTTT
CCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGTTCTGACTCAGATTCGGGTTCGAACAGCGGCTCATCTC
CGGGTTCGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCA
TTGG

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2AX73TFB 342 0 0
TGTAAATTCCTTAAGTTCTGGGAACGACGTCGTTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTA
TTTCGCATGTGGGACCCCAGGGCATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAACGTTGT
CTCTGCTGACTCCACCGCCGTTTCCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGTTCTGACTCAGATTC
GGGTTCGAACGGCGGCTCATCTCCGGGTTCGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTC
GGGTCATGGGTTACGTGTTTCCATTGGATATATATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATGGG
*TCCTGTCTGGG*CTTTCTGAG*ATTAAGGCTTTT*GTATTT

QA 1 342 1 342
DS 

RD RR2B832TF 767 0 0
A
AACAGGGGTTCAATACTATGAAACCAATGAAAATGCAAGCAGTTCTCATCATCCTGGTTT
TCTCCGGTTTAGTGGCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCGGGAGCC
AAGGCTGGGAACAATCCGTTGACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAATCTTTCAAAGTCG
GAGACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACATAGCGTTGTAGAGCTGGGAAGCGAAG
CGGCATACAAGAGTTGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGTTCTGGGAACGACG
TCGTTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTCCGCATGTGGGACCCCAGGGCATTGCG
AATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAACGTTGTCTCTGCTGACTCCACCGCCGTTTCCTCTC
CGGGTTCGGATTCAAGTTCTGACTCAGATTCGGGTTCGAACAGCGGCTCATCTCCGGGTT
CGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCATTGGAT
ATATATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATGGGGTCTTGTCTGGGGCTTTCTGAGGATTAAG
GCTTTTTGTATTTGTTGCATCGAGGAATATATTTTGGGGAGGGGAGAATATAAATAAATT
TTCGAATTATTAATCCGTATTTGTTGTATTTTGCGAATTTGCGTCATTATGTATTTCGAA
TACTGCATTTCTGATTTTGTTATTATATCCCTATTTCTCAGTTAC
C

QA 2 766 2 766
DS 

RD RR2B832JQ 766 0 0
AACAGGGGTTCAATACTATGAAACCAATGAAAATGCAAGCAGTTCTCATCATCCTGGTTT
TCTCCGGTTTAGTGGCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCGGGAGCC
AAGGCTGGGAACAATCCGTTGACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAATCTTTCAAAGTCG
GAGACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACATAGCGTTGTAGAGCTGGGAAGCGAAG
CGGCATACAAGAGTTGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGTTCTGGGAACGACG
TCGTTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTCCGCATGTGGGACCCCAGGGCATTGCG
AATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAACGTTGTCTCTGCTGACTCCACCGCCGTTTCCTCTC
CGGGTTCGGATTCAAGTTCTGACTCAGATTCGGGTTCGAACAGCGGCTCATCTCCGGGTT
CGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCATTGGAT
ATATATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATGGG*TCTTGTCTGGG*CTTTCTGAGGATTAAG
GCTTTT*GTATTTGTTGCATCGAGGAATATATTTT*GGGAGGGGAGAATATAAATAAATT
TTCGAATTATTAATCCGTATTTGTTGTATTTTGCGAATTTGCGTCATTATGTATTTCGAA
TACTGCATTTCTGATTTTGTTATTATATCCCTATTTCTCAGTTAC
C

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2D073JQ 586 0 0
ACGTCCGATAAATCTTTCAAAGTCGGAGACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACAC
AGCGTTGTAGAGCTGGGAAGCGAAGCGGCATACAAGAGTTGTGACCTGGGAACACCTGTA
AATTCCTTAAGTTCTGGGAACGACGTCGTTAAGCTTTTTAAAACCGGTGCTCGTTATTTC
GCGTGTGGGACCCCAGGGCATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAACGTTGTTTCT
GCTGACTCCACCGCCGTTTCCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGTTCTGACTCAGATTCGGGT
TCGAACAGCGGCTCATCTCCGGGTTCGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGT
CATGGGTTACGTGTTTCCATTGGATATATATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATGGG*TCT
TGTCTGGG*CTTTCTGAGGATTAAGGCTTTT*GTATTTGTTGCATCGAGGAATATATTTT
*GGGAGGGGAGAATATAAATAAATTTTCGAATTATTAATCCGTATTTGTTGGATTTTGCG
AATTTGCGTCATTATGTATTTCGAATATTGCATTTCTGATTTTGTT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2BF51TF 778 0 0
A
AACAGGGGTTCAATTCACTGAAACCAATGAAAATGCAAGCAGTTCTCATCATCCTGGTTT
TCTCCGGTTTAGTGGCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCGGGAGCC
AAGGCTGGGAACAATCCGTTGACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAATCTTTCAAAGTCG
GAGACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTAGAGCTGGGAAGCGAAG
CGGCATACAAGAGTTTTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGTTCTGGGAACGACG
TCGTTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAGGGCATTGCG
AATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAACGTTGTCTCTGCTGACTCCACCGCCGTTTCCTCTC
CGGGTTCGGATTCAAGTTCTGACACAGATTCGGGTTCGAACAGCGGCTCATCTCCGGGTT
CGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCATTGGAT
ATATATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATGGG*TCTTGTCTGGG*CTTTCTGAGGATTAAG
GCTTTT*GTATTTGTTGCATCGAGGAATATATTTTTGGGAGGGGAGAATATAAATAAATT
TTCGAATTATTAATCCGTATTTGTTGTATTTTGCGAATTTGCGTCATTATGTATTTCGAA
TATTGCATTTCTGATTTTGTTATTATATCCCTATTTCTCAGTTACTATGGTTTTC
CC

QA 2 776 2 776
DS 

RD RR2BF51JQ 755 0 0
ACCAATGAAAATGCAAGCAGTTCTCATCATCCTGGTTTTCTCCGGTTTAGTGGCAGTTAA
GACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCGGGAGCCAAGGCTGGGAACAATCCGTTGA
CTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAATCTTTCAAAGTCGGAGACCAACTTGTTTTTAAGTA
TTCCGGACTACACAGCGTTGTAGAGCTGGGAAGCGAAGCGGCATACAAGAGTTTTGACCT
GGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGTTCTGGGAACGACGTCGTTAAGCTTTCTAAAACCGG
TGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAGGGCATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGT
CAACGTTGTTTCTGCTGACTCCACCGCCGTTTCCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGTTCTGA
CACAGATTCGGGTTCGAACAGCGGCTCATCTCCGGGTTCGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAG
TTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCATTGGATATATATTGGCCGTTGGATCGTT
GGTTATGGG*TCTTGTCTGGG*CTTTCTGAGGATTAAGGCTTTT*GTATTTGTTGCATCG
AGGAATATATTTT*GGGAGGGGAGAATATAAATAAATTTTCGAATTATTAATCCGTATTT
GTTGTATTTTGCGAATTTGCGTCATTATGTATTTCGAATATTGCATTTCTGATTTTGTTA
TTATATCCCTATTTCTCAGTTACTATGGTTTTC
CC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2BK94JQ 668 0 0
GGAGCCAAGGCTGGGAACAATCCGTTGACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAGTCTTTCA
AAGACGGAGACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTAGAGCTGGGAA
GCGAAGCGGCATACAAGAGTTGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGTTCTGGGA
ACGACGTCGTTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAGGCC
ATTGCGAATCAGCCATGAAGGTTAAAGTCAACGTTGTTTCTGCTGACTCCACCGCCGTTT
CCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGTTCTGACTCAGATTCGGGTTCGAACAGCGGCTCATCTC
CGGGTTCGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCA
TTGGATATATATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATGGG*TCTTGTCTGGG*CTTTCTGAGG
ATTAAGGCTTTT*GTATTTGTTGCATCGAGGAATATATTTT*GGGAGGGGAGAATATAAA
TAAATTTTCGAATTATTAATCCGTATTTGTTGTATTTTGCGAATTTGCGTCATTATGTAT
TTCGAATATTGCATTTCTGATTTTGTTATTATATCCCTATTTCTCAGTTACTATGGTTTT
CTCACCCC

QA 1 668 1 668
DS 



CO CL386Contig2 879 2 3 U
TCGCATACGCCGGGGATAGTATTTTCAAATGGGTCAATTCACTAAAACCAATGAAAATGC
AAGCAGTTCTCATCATCCTGGTTATCTCCGGTTTACTTGCAGTTAAGACAACGTTAGCAG
CACAACATGTGATAGGCGGGAGCCAAGGCTGGGAACAATCCGTTGACTTTGATTCTTGGA
CGTCCGATAAATCTTTCAAAGTCGGAGACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACACA
GCGTTGTAGAGCTGGGAAGCGAAGCGGCATACAAGAGCTGTGACCTGGGAACACCTGTAA
ATTCCTTAAGCTCGGGGAACGACGTCGTTAAGCTTTCCAAAACCGGTGCGCGTTATTTCG
CATGTGGGACCCCAGGGCATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAACGTTGTCTCTG
CTGACTCCACCGCCGTTTCCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTT
CGAACAGCGGCTCATCTCCGGGTTCGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGAGTT
CGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCATTGGATATATATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATGG
GTGTTGTCTGGGCTTTCTGAGGATTAAAAGGCTTTTGTATTGTTGCATCGAGGAATATAT
TTTGGGAGGGGAGAATATAAATAAATTTTCGAATTATTAATCCGTATTTGTTGTATTTTG
CGAATTTGCGTTATTTCGAATATTGCATTTCTGATTTTGTTATTATATCCCTATTTCTCA
GTTACTATGGTTTTCTCACCCTCTTGTTCACTTGATTGGTCCGGTTGGAATATTTTTTTT
GTAAAAAAGAATATTCTCTATTTTGCCTTTTTAATATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E954TF U 32
AF RR2E954JQ C 1
BS 1 33 RR2E954JQ
BS 34 627 RR2E954TF
BS 628 879 RR2E954JQ

RD RR2E954TF 596 0 0
GT
TCAATTCACTAAAACCAATGAAAATGCAAGCAGTTCTCATCATCCTGGTTATCTCCGGTT
TACTTGCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCGGGAGCCAAGGCTGGG
AACAATCCGTTGACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAATCTTTCAAAGTCGGAGACCAAC
TTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTAGAGCTGGGAAGCGAAGCGGCATACA
AGAGCTGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGCTCGGGGAACGACGTCGTTAAGC
TTTCCAAAACCGGTGCGCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAGGGCATTGCGAATCAGGCA
TGAAGGTTAAAGTCAACGTTGTCTCTGCTGACTCCACCGCCGTTTCCTCTCCGGGTTCGG
ATTCAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACAGCGGCTCATCTCCGGGTTCGGGCTCGA
GCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCATTGGATATA
TATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATGGGTGTTGTCTGGGCTTTCTGAGGATTAA

QA 3 596 3 596
DS 

RD RR2E954JQ 879 0 0
TCGCATACGCCGGGGATAGTATTTTCAAATGGGTCAATTCACTAAA*CCAATGAAAATGC
AAGCAGT*CTCATCATCCTGGTTATCTCCGGTTTACTTGCAGTTAAGACAACGTTAGCAG
CACAACATGTGATAGGCGGGAGCCAAGGCTGGGAACAATCCGTTGACTTTGATTCTTGGA
CGTCCGATAAATCTTTCAAAGTCGGAGACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACACA
GCGTTGTAGAGCTGGGAAGCGAAGCGGCATACAAGAGCTGTGACCTGGGAACACCTGTAA
ATTCCTTAAGCTCGGGGAACGACGTCGTTAAGCTTTCCAAAACCGGTGCGCGTTATTTCG
CATGTGGGACCCCAGGGCATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAACGTTGTCTCTG
CTGACTCCACCGCCGTTTCCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTT
CGAACAGCGGCTCATCTCCGGGTTCGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGAGTT
CGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCATTGGATATATATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATGG
GTGTTGTCTGGGCTTTCTGAGGATTAAAAGGCTTTTGTATTGTTGCATCGAGGAATATAT
TTTGGGAGGGGAGAATATAAATAAATTTTCGAATTATTAATCCGTATTTGTTGTATTTTG
CGAATTTGCGTTATTTCGAATATTGCATTTCTGATTTTGTTATTATATCCCTATTTCTCA
GTTACTATGGTTTTCTCACCCTCTTGTTCACTTGATTGGTCCGGTTGGAATATTTTTTTT
GTAAAAAAGAATATTCTCTATTTTGCCTTTTTAATATGC

QA 1 879 1 879
DS 



AS 2 7

CO CL387Contig1 934 3 2 U
GGACTCATCATCAAAACAAAACCTTTTCTATTTGATTTTTTGTTTGGTTCTTCTTCATCT
CTCTCTCTCGATTAGATCTCTGAATACAAAGATCATAAAAGTTTATTTGAAGACGACTTA
GGCATGTTTTTGTTTGATTGGTTCTATGGAATCCTGGCGACGTTAGGTCTGTGGCAGAAA
GAGGCGAAGATCTTGTTTCTCGGGCTCGACAATGCCGGGAAAACAACTCTGCTTCACATG
CTCAAAGACGAGAGATTAGTTCAGCACCAGCCAACACAGCATCCAACATCTGAGGAACTG
AGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCCTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGG
GTCTGGAAAGACTACTATGCCAAGGTTGATGCTGTTGTGTACCTAGTGGATGCCTACGAC
AAGGAGAGATTTGTAGAGTCGAAAAGAGAGCTTGACGCTCTCTTATCTGATGAAGCATTA
GCAAGTGTCCCTTTCCTGATCCTTGGAAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCCTCTGAA
GATGAGCTTAGGTATCATTTGGGTCTCACCAATTTCACTACCGGTAAAAGCAATGTGAGT
CTTGGAGAATCTGGCGTTCGTCCGCTCGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGCAAAATG
GGATATGGTGAGGGCTTCAAATGGCTGTCTTACTACATCAAGTGAGAAGGAAACCAATCA
AAGCATATTGGTGATTTGCTTCACGGTTTTATGAATCAGACATCTCATTTTTTTCTTCCT
CATTGAAAAGACATAAAACTGTTTCTCTCTTGTAGTTTCCTCTTTTAAGTTCTAATGTAT
GTTAAGTCGATGGCTTACAACTTTAAAAACAAAAATGTGTTTCTGATTGTGAAGTAGTAA
TCACTATGATATCAAAGAATACCAGCTACTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI77TF U 1
AF RR2EU27TF U 23
AF RR2A775JQ C 332
BS 1 653 RR2CI77TF
BS 654 934 RR2A775JQ

RD RR2CI77TF 660 0 0
GGACTCATCATCAAAACAAAACCTTTTCTATTTGATTTTTTGTTTGGTTCTTCTTCATCT
CTCTCTCTCGATTAGATCTCTGAATACAAAGATCATAAAAGTTTATTTGAAGACGACTTA
GGCATGTTTTTGTTTGATTGGTTCTATGGAATCCTGGCGACGTTAGGTCTGTGGCAGAAA
GAGGCGAAGATCTTGTTTCTCGGGCTCGACAATGCCGGGAAAACAACTCTGCTTCACATG
CTCAAAGACGAGAGATTAGTTCAGCACCAGCCAACACAGCATCCAACATCTGAGGAACTG
AGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCCTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGG
GTCTGGAAAGACTACTATGCCAAGGTTGATGCTGTTGTGTACCTAGTGGATGCCTACGAC
AAGGAGAGATTTGTAGAGTCGAAAAGAGAGCTTGACGCTCTCTTATCTGATGAAGCATTA
GCAAGTGTCCCTTTCCTGATCCTTGGAAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCCTCTGAA
GATGAGCTTAGGTATCATTTGGGTCTCACCAATTTCACTACCGGTAAAAGCAATGTGAGT
CTTGGAGAATCTGGCGTTCGTCCGCTCGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCG
TAAATGG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2EU27TF 604 0 0
CTTTTCTATTTGATTTTTTGTTTGGTTCTTCTTCATCTCTCTCTCTCGATTAGATCTCTG
AATACAAAGATCATAAAAGTTTATTTGAAGACGACTTAGGCATGTTTTTGTTTGATTGGT
TCTATGGAATCCTGGCGACGTTAGGTCTGTGGCAGAAAGAGGCGAAGATCTTGTTTCTCG
GGCTCGACAATGCCGGGAAAACAACTCTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTAGTTC
AGCACCAGCCAACACAGCATCCAACATCTGAGGAACTGAGCATTGGCAAAATCAAGTTCA
AGGCCTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAAAGACTACTATGCCA
AGGTTGATGCTGTTGTGTACCTAGTGGATGCCTACGACAAGGAGAGATTTGTAGAGTCGA
AAAGAGAGCTTGACGCTCTCTTATCTGATGAAGCATTAGCAAGTGTCCCTTTCCTGATCC
TTGGAAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCCTCTGAAGATGAGCTTAGGTATCATTTGG
GTCTCACCAATTTCACTACCGGTAAAAGCAATGTGAGTCTTGGAGAATCTGGCGTTCGTC
CGCT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2A775JQ 603 0 0
ACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAAAGACTACTATGCCAAGGTTGATG
CTGTTGTGTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGATTTGTGGAGTCAAAAAGAGAGC
TTGACGCTCTCTTATCTGATGAAGCATTAGCAAGTGTCCCTTTCCTTATCCTTGGAAACA
AGATTGATATTCCTTATGCAGCCTCTGAAGATGAGCTCAGGTATCACTTGGGTCTCACCA
ATTTCACAACTGGTAAAAGCAATGTGAGTCTTGGAGAATCCGGCGTTCGTCCGCTCGAGG
TCTTCATGTGCAGCATCGTCCGCAAAATGGGATATGGTGAGGGCTTCAAATGGCTGTCTT
ACTACATCAAGTGAGAAGGAAACCAATCAAAGCATATTGGTGATTTGCTTCACGGTTTTA
TGAATCAGACATCTCATTTTTTTCTTCCTCATTGAAAAGACATAAAACTGTTTCTCTCTT
GTAGTTTCCTCTTTTAAGTTCTAATGTATGTTAAGTCGATGGCTTACAACTTTAAAAACA
AAAATGTGTTTCTGATTGTGAAGTAGTAATCACTATGATATCAAAGAATACCAGCTACTT
CTC

QA 1 603 1 603
DS 



CO CL387Contig2 937 4 15 U
AGCTGGTGTTCTTTGATATCATAGTGATTACTACTTCACAATCAGAAACACATTTTTGTT
TTAAGAGTTGTAAGCCATCGACTTAACATACATTAGAACTTTAGAACTTAAACAGGAAAC
TACAAGAAGAGAAACAGTTTTACGTCTTTTCAATGAG*****AAAAAATGAGATGTCTGA
TTTATAAAACCGTGAAGCAACGCAAATCACCAATATGCTTTGATTGGTTTCCT**CTCAC
TTGATGTAGTAAGACAGCCATTTGAAGCCCTCACCATATCCCATTTTGCGGACGATGCTG
CACATGAAGACCTCGAGCGGACGAACGCCAGATTCTCCAAGACTCACATTGCTTTTACCA
GTAGTGAAATTGGTGAGACCCAAATGATACCTAAGCTCATCTTCAGAGGCTGCATAAGGA
ATATCAATCTTGTTTCCAAGGATAAGGAAAGGGACACTTGCTAATGCTTCATCAGATAAG
AGAGCGTCAAGCTCTCTTTTCGACTCCACAAATCTCTCCTTGTCGTAAGCATCCACTAGG
TACACAACAGCATCAACCTTGGCATAGTAGTCTTTCCAGACCCTACGGGCAATCTGATGG
CCACCCAAGTCAAAGGCCTTGAACTTGATTTTGCCAATGCTCAGTTCCTCAGATGTTGGA
TGCTGTGTTGGCTGGTGCTGAACTAATCTCTCGTCTTTGAGCATGTGAAGCAGAGTTGTT
TTCCCGGCATTGTCGAGCCCGAGAAACAAGATCTTCGCCTCTTTCTGCCACAGACCTAAC
GTCGCCAGGATTCCATAGAACCAATCGAACAAAAACATGACTTAAGTCGTCTTCAAATAA
ACTTTTATGATCTCTGTATTCAGAGATCTAATCGAGAGAGAGAAGAAGAACCAAACAAAA
AATCAAATAGAAAAGGTTTTGTTTTGATGATGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU27JQ U 1
AF RR2CI77JQ U 66
AF RR2C004TF C 200
AF RR2A775TF C 127
BS 1 188 RR2EU27JQ
BS 189 189 RR2CI77JQ
BS 190 235 RR2EU27JQ
BS 236 238 RR2A775TF
BS 239 359 RR2EU27JQ
BS 360 360 RR2A775TF
BS 361 443 RR2EU27JQ
BS 444 444 RR2A775TF
BS 445 506 RR2EU27JQ
BS 507 507 RR2A775TF
BS 508 527 RR2EU27JQ
BS 528 528 RR2A775TF
BS 529 768 RR2EU27JQ
BS 769 803 RR2CI77JQ
BS 804 937 RR2A775TF

RD RR2EU27JQ 768 0 0
AGCTGGTGTTCTTTGATATCATAGTGATTACTACTTCACAATCAGAAACACATTTTTGTT
TTAAGAGTTGTAAGCCATCGACTTAACATACATTAGAACTTTAGAACTTAAACAGGAAAC
TACAAGAAGAGAAACAGTTTTACGTCTTTTCAATGAG*****AAAAAATGAGATGTCTGA
TTTATAAA*CCGTGAAGCAACGCAAATCACCAATATGCTTTGATTGGTTTCCT*****AC
TTGATGTAGTAAGACAGCCATTTGAAGCCCTCACCATATCCCATTTTGCGGACGATGCTG
CACATGAAGACCTCGAGCGGACGAACGCCAGATTCTCCAAGACTCACATTGCTTTTACCG
GTAGTGAAATTGGTGAGACCCAAATGATACCTAAGCTCATCTTCAGAGGCTGCATAAGGA
ATATCAATCTTGTTTCCAAGGATCAGGAAAGGGACACTTGCTAATGCTTCATCAGATAAG
AGAGCGTCAAGCTCTCTTTTCGACTCTACAAATCTCTCCTTGTCGTAGGCATCCACTAGG
TACACAACAGCATCAACCTTGGCATAGTAGTCTTTCCAGACCCTACGGGCAATCTGATGG
CCACCCAAGTCAAAGGCCTTGAACTTGATTTTGCCAATGCTCAGTTCCTCAGATGTTGGA
TGCTGTGTTGGCTGGTGCTGAACTAATCTCTCGTCTTTGAGCATGTGAAGCAGAGTTGTT
TTCCCGGCATTGTCGAGCCCGAGAAACAAGATCTTCGCCTCTTTCTGC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2CI77JQ 738 0 0
G
GTTGTAAGCCATCGACTTAACATACATTAGAACTTTAGAACTTAAACAGGAAACTACAAG
AAGAGAAACAGTTTTACGTCTTTTCAATGAG*****AAAAAATGAGATGTCTGATTTATA
AAACCGTGAAGCAACGCAAGTCACCAATATGCTTTGATTGGTTTCCT*****ACTTGATG
TAGTAAGACAGCCATTTGAAGCCCTCACCATATCCCATTTTACGGACGATGCTGCACATG
AAGACCTCGAGCGGACGAACGCCAGATTCTCCAAGACTCACATTGCTTTTACCGGTAGTG
AAATTGGTGAGACCCAAATGATACCTAAGCTCATCTTCAGAGGCTGCATAAGGAATATCA
ATCTTGTTTCCAAGGATCAGGAAAGGGACACTTGCTAATGCTTCATCAGATAAGAGAGCG
TCAAGCTCTCTTTTCGACTCTACAAATCTCTCCTTGTCGTAGGCATCCACTAGGTACACA
ACAGCATCAACCTTGGCATAGTAGTCTTTCCAGACCCTACGGGCAATCTGATGGCCACCC
AAGTCAAAGGCCTTGAACTTGATTTTGCCAATGCTCAGTTCCTCAGATGTTGGATGCTGT
GTTGGCTGGTGCTGAACTAATCTCTCGTCTTTGAGCATGTGAAGCAGAGTTGTTTTCCCG
GCATTGTCGAGCCCGAGAAACAAGATCTTCGCCTCTTTCTGCCACAGACCTAACGTCGCC
AGGATTCCATAGAACCA

QA 2 738 2 738
DS 

RD RR2C004TF 694 0 0
AA
GCAAATCACCAATATGCTTTGATTGGTTTCTT**CTCACTTGATGTAGTAAGACAGCCAT
TTGAAGCCCTCACCATATCCCATTTTGCGGACGATGCTGCACATGAAGACCTCGAGCGGA
CGAACGCCGGATTCTCCAAGACTCACATTGCTTTTACCAGTTGTGAAATTGGTGAGACCC
AAGTGATACCTGAGCTCATCTTCAGAGGCTGCATAAGGAATATCAATCTTGTTTCCAAGG
ATAAGGAAAGGGACACTTGCTAATGCTTCATCAGATAAGAGAGCGTCAAGCTCTCTTTTT
GACTCCACAAATCTCTCCTTGTCGTAAGCATCCACTAGGTACACAACAGCATCAACCTTG
GAATAGTAGTCTTTCCAGACCCTACGGGCAATCTGATGGCCACCCAAGTCAAAGGCCTTG
AACTTGATTTTGCCAATGCTCAGTTCCTCAGATGTTGGATGCTGTGTTGGCTGGTGCTGA
ACTAATCTCTCGTCTTTGAGCATGTGAAGCAGAGTTGTTTTTCCGGCATTGTCGAGCCCG
AGAAACAAGATCTTCGCCTCTTTCTGCCACAGACCTAACGTCGCCAGGATTCCATAGAAC
CAATCGAACAAAAACATGACTTAAGTCGTCTTCAAATAAACTTTTATGATCTCTGTATTC
AGAGATCTAATCGAGAGAGAGA
AGAAGAACCC

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR2A775TF 811 0 0
G
AGAGAAACAGTTTTATGTCTTTTCAATGAGGAAGAAAAAAATGAGATGTCTGATTCATAA
AACCGTGAAGCAA*****ATCACCAATATGCTTTGATTGGTTTCCTTTCTCACTTGATGT
AGTAAGACAGCCATTTGAAGCCCTCACCATATCCCATTTTGCGGACGATGCTGCACATGA
AGACCTCGAGCGGACGAACGCCGGATTCTCCAAGACTCACATTGCTTTTACCAGTTGTGA
AATTGGTGAGACCCAAGTGATACCTGAGCTCATCTTCAGAGGCTGCATAAGGAATATCAA
TCTTGTTTCCAAGGATAAGGAAAGGGACACTTGCTAATGCTTCATCAGATAAGAGAGCGT
CAAGCTCTCTTTTTGACTCCACAAATCTCTCCTTGTCGTAAGCATCCACTAGGTACACAA
CAGCATCAACCTTGGCATAGTAGTCTTTCCAGACCCTACGGGCAATCTGATGGCCACCCA
AGTCAAAGGCCTTGAACTTGATTTTGCCAATGCTCAGTTCCTCAGATGTTGGATGCTGTG
TTGGCTGGTGCTGAACTAATCTCTCGTCTTTGAGCATGTGAAGCAGAGTTGTTTTTCCGG
CATTGTCGAGCCCGAGAAACAAGATCTTCGCCTCTTTCTGCCACAGACCTAACGTCGCCA
GGATTCCATAGAACCAATCGAACAAAAACATGACTTAAGTCGTCTTCAAATAAACTTTTA
TGATCTCTGTATTCAGAGATCTAATCGAGAGAGAGAAGAAGAACCAAACAAAAAATCAAA
TAGAAAAGGTTTTGTTTTGATGATGAGTCC

QA 2 811 2 811
DS 



AS 1 12

CO CL388Contig1 815 12 4 U
GGATCTTCTCTACATTTATTAGTTTCTTTGAGAAAAAA*TGAAATTCTTCATTTGTATTC
TTGCGTTACAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGATTTCTTCTACTTTG
TTGTACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATAGTTGTTGCTATCCGAAAACCG
GGAAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGAT
GGCCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGATGA
GCAACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACTTCT
GGACACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACGATT
ATTTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCAATG
CTGGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCAAAG
AAGCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATAGCCAAC
TTTATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTA
TGCTACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAGATCTCGCGGCTGA
TTTTTTATTTTATTTACATAAACAGTATTGTACTTATTTGGTTTCTGTTTGTGTTTCTGC
AACTTCTAATTGCAATAAAAATGTATGATCCCATG


BQ
25 25 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 45 60 60 60 65 65 65 65 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2FZ77TF U 1
AF RR2H720TF U 1
AF RR2FH53TF U 1
AF RR2AW50TFB U 63
AF RR2CX93TF U -3
AF RR2FU71TF U 1
AF RR2AV46TF U -3
AF RR2AW50JQ C -3
AF RR2FZ77JQ C 174
AF RR2H720JQB C 178
AF RR2CX93JQ C 48
AF RR2FH53JQ C 6
BS 1 549 RR2FH53TF
BS 550 752 RR2FU71TF
BS 753 760 RR2AV46TF
BS 761 815 RR2AW50JQ

RD RR2FZ77TF 275 0 0
GGATCTTCTCTACATTTATTAGTTTCTTTGAGAAAAAA*TGAAATTCTTCATTTGTATTC
TTGCGTTACAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGATTTCTTCTACTTTG
TTGTACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATAGTTGTTGCTATCCGAAAACCG
GGAAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGAT
GGCCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTG
TG

QA 1 273 1 273
DS 

RD RR2H720TF 377 0 0
GGATCTTCTCTACATTTATTAGTTTCTTTGAGAAAAAA*TGAAATTCTTCATTTGTATTC
TTGCGTTACAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGATTTCTTCTACTTTG
TTGTACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATAGTTGTTGCTATCCGAAAACCG
GGAAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGAT
GGCCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGATGA
GCAACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACTTCT
GGACACACGAATGGGAG

QA 1 377 1 377
DS 

RD RR2FH53TF 549 0 0
GGATCTTCTCTACATTTATTAGTTTCTTTGAGAAAAAA*TGAAATTCTTCATTTGTATTC
TTGCGTTACAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGATTTCTTCTACTTTG
TTGTACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATAGTTGTTGCTATCCGAAAACCG
GGAAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGAT
GGCCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGATGA
GCAACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACTTCT
GGACACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACGATT
ATTTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCAATG
CTGGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCAAAG
AAGCAATTG

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2AW50TFB 631 0 0
GG
GTTACAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGATTTCTTCTACTTTGTTGT
ACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATAGTTGTTGCTATCCGAAAACCGGGAA
ACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGATGGCC
TCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGATGAGCAA
CTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACTTCTGGAC
ACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACGATTATTT
TGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCAATGCTGG
TATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCAAAGAAGC
AATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATAGCCAACTTTA
TCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTATGCT
ACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCA
TT

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR2CX93TF 672 0 0
GGATTC
ATCTTCTCTACATTTATTAGTTTCTTTGAGAAAAGA*TGAAATTCTTCATTTGTATTCTT
GCGTTACAACAACCGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGATTTCCTCTACTTTGTT
GTACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATAGTTGTTGCTATCCGAAAACCGGG
AAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGATGG
CCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGATGAGC
AACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACTTCTGG
ACACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACGATTAT
TTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCAATGCT
GGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCAAAGAA
GCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATAGCCAACTT
TATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTATG
CTACAT

QA 7 672 7 672
DS 

RD RR2FU71TF 752 0 0
GGATCTTCTCTACATTTATTAGTTTCTTTGAGAAAAAA*TGAAATTCTTCATTTGTATTC
TTGCGTTATAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGATTTCTTCTACTTTG
TTGTACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATAGTTGTTTCTACCCGAAAACCG
GGAAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGAT
GGCCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGATGA
GCAACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACTTCT
GGACACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACGATT
ATTTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCAATG
CTGGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCAAAG
AAGCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATAGCCAAC
TTTATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTA
TGCTACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAGATCTCGCGGCTGA
TTTTTTATTTTATTTACATAAACAGTATTGTA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2AV46TF 764 0 0
GGATTC
ATCTTCTCTACATTTATTAGTTTCTTTGAGAAAAAA*TGAAATTCTTCATTTGTATTCTT
GCGTTACAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGATTTCTTCTACTTTGTT
GTACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATAGTTGTTGCTATCCGAAAACCGGG
AAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGATGG
CCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGATGAGC
AACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACTTCTGG
ACACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACGATTAT
TTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCAATGCT
GGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCAAAGAA
GCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATAGCCAACTT
TATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTATG
CTACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAGATCTCGCGGCTGATT
TTTTATTTTATTTACATAAACAGTATTGTACTTATTTG

QA 7 764 7 764
DS 

RD RR2AW50JQ 819 0 0
GGATTC
ATCTTCTCTACATTTATTAGTTTCTTTGAGAAAAAAATGAAATTCTTCATTTGTATTCTT
GCGTTACAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGATTTCTTCTACTTTGTT
GTACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATAGTTGTTGCTATCCGAAAACCGGG
AAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGATGG
CCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGATGAGC
AACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACTTCTGG
ACACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACGATTAT
TTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCAATGCT
GGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCAAAGAA
GCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATAGCCAACTT
TATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTATG
CTACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAGATCTCGCGGCTGATT
TTTTATTTTATTTACATAAACAGTATTGTACTTATTTGGTTTCTGTTTGTGTTTCTGCAA
CTTCTAATTGCAATAAAAATGTATGATCCCATG

QA 7 819 7 819
DS 

RD RR2FZ77JQ 639 0 0
AAAACCGGGAAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACT
GGTGGATGGCCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGAT
CTGATGAGCAACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTG
CACTTCTGGACACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAA
CACGATTATTTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTT
ACCAATGCTGGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTG
ATCAAAGAAGCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAAT
GGCCAACTTTATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGT
CCTGTTATGCTACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAGATCTCG
CGGCTGATTTTTTATTTTATTTACATAAACAGTATTGTACTTATTTGGTTTCTGTTTGTG
TTTCTGCAACTTCTAATTGCAATAAAAATGTATGATCCC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2H720JQB 635 0 0
CCGGGAAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTG
GATGGCCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGA
TGAGCAACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACT
TCTGGACACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACG
ATTATTTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCA
ATGCTGGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCA
AAGAAGCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATGGCC
AACTTTATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTG
TTATGCTACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAGATCTCGCGGC
TGATTTTTTATTTTATTTACATAAACAGTATTGTACTTATTTGGTTTCTGTTTGTGTTTC
TGCAACTTCTAATTGCAATAAAAATGTATGATCCC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2CX93JQ 754 0 0
TTCATTTGTATTCTTGCGTTACAACAACCGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGAT
TTCCTCTACTTTGTTGTACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATAGTTGTTGC
TATCCGAAAACCGGGAAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTAC
AAAACTGGTGGATGGCCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTA
TCTGATCTGATGAGCAACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGAT
GGTGTGCACTTCTGGACACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTC
GACCAACACGATTATTTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCAT
GCCCTTACCAATGCTGGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAG
AGAGTGATCAAAGAAGCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCG
CATAATAGCCAACTTTATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATC
AACTGTCCTGTTATGCTACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAG
ATCTCGCGGCTGATTTTTTATTTTATTTACATAAACAGTATTGTACTTATTTGGTTTCTG
TTTGTGTTTCTGCAACTTCTAATTGCAATAAAAA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2FH53JQ 807 0 0
TTCTCTACATTTATTAGTT*CTTTGAGAAAAAA*TGAAATTCTTCATTTGTATTCTTGCG
TTACAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGATTTCTTCTACTTTGTTGTA
CAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATAGTTGTTGCTATCCGAAAACCGGGAAA
CCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGATGGCCT
CAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGATGAGCAAC
TTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACTTCTGGACA
CACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACGATTATTTT
GAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCAATGCTGGT
ATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCAAAGAAGCA
ATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATAGCCAACTTTAT
CAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTATGCTA
CATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAGATCTCGCGGCTGATTTTT
TATTTTATTTACATAAACAGTATTGTACTTATTTGGTTTCTGTTTGTGTTTCTGCAACTT
CTAATTGCAATAAAAATGTATGATCCC

QA 1 807 1 807
DS 



AS 2 12

CO CL389Contig1 699 4 4 U
GGAAAGGCAAAAAGCGGATCTTCTTCTCCTCACAAATCAAGAGTAGTGAGTTCCAAAAGA
GATTCAAAAGTCGCCGAGGGCACAATGGCGTCTCTCTCCATGGCTTCCGTTAACATCAGC
TTCTCTCCTTTACGCTCCTCTCCAAAGGTTTCCGTTCAATTCGCTCGGTCGAGTCTTGCT
CTTGCCTCAACTCACTGCATTTCTGGACTTCGTGCGGTTCTTCCCCAGAAGAAGATATCC
ACTCTTGTCTCTCCCAGTTCTCAAAGGCTTCAGACTCTCACCGTTTTCGCTCATAAGGGC
TACAAGATGAAGACCCACAAGGCGTCAGCGAAGCGGTTCAGGGTGACGGGTAGGGGGAAG
ATAGTGAGGAGGAGATCCGGGAAGCAGCACTTGTTAGCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAG
CTCCGTCTTTCCAAAATGCATGAAGTGAGCCGCAGTGACTATGACAATGTGATCGGCGCT
CTTCCCTACCTGAAAGTCAACCGAAAGGCGACTTAAGCAGAGCCGGCTTGATCCTTTTCT
TACCTGCATTTCTCTTTTTGTAATCTAAGTTATGATAATACTCTCTTTTGTTTTGTGATT
TTTTTGGTCAATTAGTTGATCCTTCTTCCACCTTCTCGTTTTCTTGTCTTGCGTAAATGT
GCAAGACTTTCATGACAAACTGTTATAGGTGTAACATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP55TF U 16
AF RR2EO03TF U 1
AF RR2EZ17TF U 16
AF RR2EZ17JQ C 311
BS 1 15 RR2EO03TF
BS 16 17 RR2CP55TF
BS 18 680 RR2EO03TF
BS 681 699 RR2EZ17JQ

RD RR2CP55TF 615 0 0
GGATCTTCTTCTCCTCACAAATCAAGAGTAGTGAGTTCCAAAAGAGATTCAAAAGTCGCC
GAGGGCACAATGGCGTCTCTCTCCATGGCTTCCGTTAACATCAGCTTCTCTCCTTTACGC
TCCTCTCCAAAGGTTTCCGTTCAATTCGCTCGGTCGAGTCTTGCTCTTGCCTCAACTCAC
TGCATTTCTGGACTTCGTGCGGTTCTTCCCCAGAAGAAGATATCCACTCTTGTCTCTCCC
AGTTCTCAAAGGCTTCAGACTCTCACCGTTTTCGCTCATAAGGGCTACAAGATGAAGACC
CACAAGGCGTCAGCGAAGCGGTTCAGGGTGACGGGTAGGGGGAAGATAGTGAGGAGGAGA
TCCGGGAAGCAGCACTTGTTAGCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAGCTCCGTCTTTCCAAA
ATGCATGAAGTGAGCCGCAGTGACTATGACAATGTGATCGGCGCTCTTCCCTACCTGAAA
GTCAACCGAAAGGCGACTTAAGCAGAGCCGGCTTGATCCTTTTCTTACCTGCATTTCTCT
TTTTGTAATCTAAGTTATGATAATACTCTCTTTTGTTTTGTGATTTTTT*GGTCAATTAG
TTGATCCTTCTTCCA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2EO03TF 680 0 0
GGAAAGGCAAAAAGCTTATCTTCTTCTCCTCACAAATCAAGAGTAGTGAGTTCCAAAAGA
GATTCAAAAGTCGCCGAGGGCACAATGGCGTCTCTCTCCATGGCTTCCGTTAACATCAGC
TTCTCTCCTTTACGCTCCTCTCCAAAGGTTTCCGTTCAATTCGCTCGGTCGAGTCTTGCT
CTTGCCTCAACTCACTGCATTTCTGGACTTCGTGCGGTTCTTCCCCAGAAGAAGATATCC
ACTCTTGTCTCTCCCAGTTCTCAAAGGCTTCAGACTCTCACCGTTTTCGCTCATAAGGGC
TACAAGATGAAGACCCACAAGGCGTCAGCGAAGCGGTTCAGGGTGACGGGTAGGGGGAAG
ATAGTGAGGAGGAGATCCGGGAAGCAGCACTTGTTAGCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAG
CTCCGTCTTTCCAAAATGCATGAAGTGAGCCGCAGTGACTATGACAATGTGATCGGCGCT
CTTCCCTACCTGAAAGTCAACCGAAAGGCGACTTAAGCAGAGCCGGCTTGATCCTTTTCT
TACCTGCATTTCTCTTTTTGTAATCTAAGTTATGATAATACTCTCTTTTGTTTTGTGATT
TTTTTGGTCAATTAGTTGATCCTTCTTCCACCTTCTCGTTTTCTTGTCTTGCGTAAATGT
GCAAGACTTTCATGACAAAC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2EZ17TF 657 0 0
GGATCTTCTTCTCCTCACAAATCAAGAGTAGTGAGTTCCAAAAGAGATTCAAAAGTCGCC
GAGGGCACAATGGCGTCTCTCTCCATGGCTTCCGTTAACATCAGCTTCTCTCCTTTACGC
TCCTCTCCAAAGGTTTCCGTTCAATTCGCTCGGTCGAGTCTTGCTCTTGCCTCAACTCAC
TGCATTTCTGGACTTCGTGCGGTTCTTCCCCAGAAGAAGATATCCACTCTTGTCTCTCCC
AGTTCTCAAAGGCTTCAGACTCTCACCGTTTTCGCTCATAAGGGCTACAAGATGAAGACC
CACAAGGCGTCAGCGAAGCGGTTCAGGGTGACGGGTAGGGGGAAGATAGTGAGGAGGAGA
TCCGGGAAGCAGCACTTGTTAGCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAGCTCCGTCTTTCCAAA
ATGCATGAAGTGAGCCGCAGTGACTATGACAATGTGATCGGCGCTCTTCCCTACCTGAAA
GTCAACCGAAAGGCGACTTAAGCAGAGCCGGCTTGATCCTTTTCTTACCTGCATTTCTCT
TTTTGTAATCTAAGTTATGATAATACTCTCTTTTGTTTTGTGATTTTTTTGGTCAATTAG
TTGATCCTTCTTCCACCTTCTCGTTTTCTTGTCTTGCGTAAATGTGCAAGACTTTCA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2EZ17JQ 389 0 0
AGACCCACAAGGCGTCAGCGAAGCGGTTCAGGGTGACGGGTAGGGGGAAGATAGTGAGGA
GGAGATCCGGGAAGCAGCACTTGTTAGCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAGCTCCGTCTTT
CCAAAATGCATGAAGTGAGCCGCAGTGACTATGACAATGTGATCGGCGCTCTTCCCTACC
TGAAAGTCAACCGAAAGGCGACTTAAGCAGAGCCGGCTTGATCCTTTTTTTACCTGCATT
TCTCTTTTTGTAATTTAAGTTATGATAATACTCTCTTTTGTTTTGTGATTTTTTTGGTCA
ATTAGTTGATCCTTCTTCCACCTTCTCGTTTTCTTGTCTTGCGTAAATGTGCAAGACTTT
CATGACAAACTGTTATAGGTGTAACATAT

QA 1 389 1 389
DS 



CO CL389Contig2 690 8 4 U
GGTGGAAGAAGGATCAACTAATTGACCAAAAAATCACAAAACAAAAGAGAGTATTATCAT
AACTTAGATTACAAAATGAGAAATGCAGGTAAGAAAAGGAATCAAGCCGGCTCTGCTTAA
GTCGCCTTTCGGTTGACTTTGAGGTAGGGAAGAGCCCCGATCACATTGTCATAGTCACTG
CGGTTCACTTCATGCATTTTGGAAAGACGGAGCTTCCTCTTGTTATTCTTCTTAGCTAAC
AAGTGCTGCTTCCCGGATCTCCTCCTCACTATCTTCCCCCTACCCGTCACCCTGAACCGC
TTCGCTGAGGCCTTGTGGGTCTTCATCTTGTATCCCTTATGAGCGAAAACGGTGAGAGTC
TGAAGCCTTTGGGAACTGGGAGAGACAACAGTTGATATCTTCTGAGGAAGAACCGCACGA
AGCCCAGAAATGCAGTGAGTTGAGGCAAGAGCAAGACTCGACCGAGCGAATTGAAGGGAA
ACCTTTGGAGACGAGCGTAAAGGAGAGAACCTGATGTTAACGGGAGCCATGGAGAGAGAC
GCCATTGTGCCCTCGGCGACTTTTGAATCTCTTTTGGAACTCACTACTCGGATTTGTGAG
AAGAAGAAGATCCGCTTTTTGCCTTTGCCCAGAGATATAAGAGTGAACGGATATGGTAGG
CAAGCACGGACATTTGGGGTTTCGTTTCCC


BQ
25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC83JQ U 19
AF RR2G324JQ U 1
AF RR2GY48JQ U 1
AF RR2GY48TF C 1
AF RR2G324TF C 24
AF RR2DG37JQ U 4
AF RR2DG37TF C 4
AF RR2EC83TF C 113
BS 1 526 RR2G324JQ
BS 527 595 RR2GY48JQ
BS 596 613 RR2DG37JQ
BS 614 690 RR2EC83TF

RD RR2EC83JQ 221 0 0
TAATTGACCAAAAAATCACAAAACAAAAGAGAGTATTATCATAACTTAGATTACAAAATG
AGAAATGCAGGTAAAAAAAGGAATCAAGCCGGCTCTGCTTAAATCGCCTTTCGGTTGACT
TTGAGGTAGGGAAGAGCCCCGATCACATTGTCATAGTCACTGCGGTTCACTTCATGCATT
TTGGAAAGACGGAGCTTCCTCTTGTTATTCTTCTTAGCTAA

QA 1 221 1 221
DS 

RD RR2G324JQ 526 0 0
GGTGGAAGAAGGATCAACTAATTGACCAAAAAATCACAAAACAAAAGAGAGTATTATCAT
AACTTAGATTACAAAATGAGAAATGCAGGTAAGAAAAGGAATCAAGCCGGCTCTGCTTAA
GTCGCCTTTCGGTTGACTTTGAGGTAGGGAAGAGCCCCGATCACATTGTCATAGTCACTG
CGGTTCACTTCATGCATTTTGGAAAGACGGAGCTTCCTCTTGTTATTCTTCTTAGCTAAC
AAGTGCTGCTTCCCGGATCTCCTCCTCACTATCTTCCCCCTACCCGTCACCCTGAACCGC
TTCGCTGAGGCCTTGTGGGTCTTCATCTTGTATCCCTTATGAGCGAAAACGGTGAGAGTC
TGAAGCCTTTGGGAACTGGGAGAGACAACAGTTGATATCTTCTGAGGAAGAACCGCACGA
AGCCCAGAAATGCAGTGAGTTGAGGCAAGAGCAAGACTCGACCGAGCGAATTGAAGGGAA
ACCTTTGGAGACGAGCGTAAAGGAGAGAACCTGATGTTAACGGGAG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2GY48JQ 598 0 0
GGTGGAAGAAGGATCAACTAATTGACCAAAAAATCACAAAACAAAAGAGAGTATTATCAT
AACTTAGATTACAAAATGAGAAATGCAGGTAAGAAAAGGAATCAAGCCGGCTCTGCTTAA
GTCGCCTTTCGGTTGACTTTGAGGTAGGGAAGAGCCCCGATCACATTGTCATAGTCACTG
CGGTTCACTTCATGCATTTTGGAAAGACGGAGCTTCCTCTTGTTATTCTTCTTAGCTAAC
AAGTGCTGCTTCCCGGATCTCCTCCTCACTATCTTCCCCCTACCCGTCACCCTGAACCGC
TTCGCTGAGGCCTTGTGGGTCTTCATCTTGTATCCCTTATGAGCGAAAACGGTGAGAGTC
TGAAGCCTTTGGGAACTGGGAGAGACAACAGTTGATATCTTCTGAGGAAGAACCGCACGA
AGCCCAGAAATGCAGTGAGTTGAGGCAAGAGCAAGACTCGACCGAGCGAATTGAAGGGAA
ACCTTTGGAGACGAGCGTAAAGGAGAGAACCTGATGTTAACGGGAGCCATGGAGAGAGAC
GCCATTGTGCCCTCGGCGACTTTTGAATCTCTTTTGGAACTCACTACTCGGATTT
TCC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2GY48TF 598 0 0
GGTGGAAGAAGGATCAACTAATTGACCAAAAAATCACAAAACAAAAGAGAGTATTATCAT
AACTTAGATTACAAAATGAGAAATGCAGGTAAGAAAAGGAATCAAGCCGGCTCTGCTTAA
GTCGCCTTTCGGTTGACTTTGAGGTAGGGAAGAGCCCCGATCACATTGTCATAGTCACTG
CGGTTCACTTCATGCATTTTGGAAAGACGGAGCTTCCTCTTGTTATTCTTCTTAGCTAAC
AAGTGCTGCTTCCCGGATCTCCTCCTCACTATCTTCCCCCTACCCGTCACCCTGAACCGC
TTCGCTGAGGCCTTGTGGGTCTTCATCTTGTATCCCTTATGAGCGAAAACGGTGAGAGTC
TGAAGCCTTTGGGAACTGGGAGAGACAACAGTTGATATCTTCTGAGGAAGAACCGCACGA
AGCCCAGAAATGCAGTGAGTTGAGGCAAGAGCAAGACTCGACCGAGCGAATTGAAGGGAA
ACCTTTGGAGACGAGCGTAAAGGAGAGAACCTGATGTTAACGGGAGCCATGGAGAGAGAC
GCCATTGTGCCCTCGGCGACTTTTGAATCTCTTTTGGAACTCACTACTCGGATTT
TCC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2G324TF 575 0 0
GACCAAAAAATCACAAAACAAAAGAGAGTATTATCATAACTTAGATTACAAAATGAGAAA
TGCAGGTAAGAAAAGGAATCAAGCCGGCTCTGCTTAAGTCGCCTTTCGGTTGACTTTGAG
GTAGGGAAGAGCCCCGATCACATTGTCATAGTCACTGCGGTTCACTTCATGCATTTTGGA
AAGACGGAGCTTCCTCTTGTTATTCTTCTTAGCTAACAAGTGCTGCTTCCCGGATCTCCT
CCTCACTATCTTCCCCCTACCCGTCACCCTGAACCGCTTCGCTGAGGCCTTGTGGGTCTT
CATCTTGTATCCCTTATGAGCGAAAACGGTGAGAGTCTGAAGCCTTTGGGAACTGGGAGA
GACAACAGTTGATATCTTCTGAGGAAGAACCGCACGAAGCCCAGAAATGCAGTGAGTTGA
GGCAAGAGCAAGACTCGACCGAGCGAATTGAAGGGAAACCTTTGGAGACGAGCGTAAAGG
AGAGAACCTGATGTTAACGGGAGCCATGGAGAGAGACGCCATTGTGCCCTCGGCGACTTT
TGAATCTCTTTTGGAACTCACTACTCGGATTT
TCC

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2DG37JQ 610 0 0
GGAAGAAGGATCAACTAATTGACCAAAAAATCACAAAACAAAAGAGAGTATTATCATAAC
TTAGATTACAAAATGAGAAATGCAGGTAAGAAAAGGAATCAAGCCGGCTCTGCTTAAGTC
GCCTTTCGGTTGACTTTGAGGTAGGGAAGAGCCCCGATCACATTGTCATAGTCACTGCGG
TTCACTTCATGCATTTTGGAAAGACGGAGCTTCCTCTTGTTATTCTTCTTAGCTAACAAG
TGCTGCTTCCCGGATCTCCTCCTCACTATCTTCCCCCTACCCGTCACCCTGAACCGCTTC
GCTGAGGCCTTGTGGGTCTTCATCTTGTATCCCTTATGAGCGAAAACGGTGAGAGTCTGA
AGCCTTTGGGAACTGGGAGAGACAACAGTTGATATCTTCTGAGGAAGAACCGCACGAAGC
CCAGAAATGCAGTGAGTTGAGGCAAGAGCAAGACTCGACCGAGCGAATTGAAGGGAAACC
TTTGGAGACGAGCGTAAAGGAGAGAACCTGATGTTAACGGAAGCCATGGAGAGAGACGCC
ATTGTGCCCTCGGCGACTTTTGAATCTCTTTTGGAACTCACTACTCGGATTTGTGAGAAG
AAGAAGATCC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2DG37TF 610 0 0
GGAAGAAGGATCAACTAATTGACCAAAAAATCACAAAACAAAAGAGAGTATTATCATAAC
TTAGATTACAAAATGAGAAATGCAGGTAAGAAAAGGAATCAAGCCGGCTCTGCTTAAGTC
GCCTTTCGGTTGACTTTGAGGTAGGGAAGAGCCCCGATCACATTGTCATAGTCACTGCGG
TTCACTTCATGCATTTTGGAAAGACGGAGCTTCCTCTTGTTATTCTTCTTAGCTAACAAG
TGCTGCTTCCCGGATCTCCTCCTCACTATCTTCCCCCTACCCGTCACCCTGAACCGCTTC
GCTGAGGCCTTGTGGGTCTTCATCTTGTATCCCTTATGAGCGAAAACGGTGAGAGTCTGA
AGCCTTTGGGAACTGGGAGAGACAACAGTTGATATCTTCTGAGGAAGAACCGCACGAAGC
CCAGAAATGCAGTGAGTTGAGGCAAGAGCAAGACTCGACCGAGCGAATTGAAGGGAAACC
TTTGGAGACGAGCGTAAAGGAGAGAACCTGATGTTAACGGAAGCCATGGAGAGAGACGCC
ATTGTGCCCTCGGCGACTTTTGAATCTCTTTTGGAACTCACTACTCGGATTTGTGAGAAG
AAGAAGATCC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2EC83TF 578 0 0
CTGCTTAAGTCGCCTTTCGGTTGACTTTGAGGTAGGGAAGAGCCCCGATCACATTGTCAT
AGTCACTGCGGTTCACTTCATGCATTTTGGAAAGACGGAGCTTCCTCTTGTTATTCTTCT
TAGCTAACAAGTGCTGCTTCCCGGATCTCCTCCTCACTATCTTCCCCCTACCCGTCACCC
TGAACCGCTTCGCTGAGGCCTTGTGGGTCTTCATCTTGTATCCCTTATGAGCGAACACGG
TGAGAGTCTGAAGCCTTTGGGAACTGGGAGAGACAACAGTTGATATCTTCTGAGGAAGAA
CCGCACGAAGCTCAGAAATGCAGTGAGTTGAGGCAAGAGCAAGACTCGACCGAGCGAATT
GAAGGGAAACCTTTGGAGACGAGCGTAAAGGAGAGAACCTGATGTTAACGGAAGCCATGG
AGAGAGACGCCATTGTGCCCTCGGCGACTTTTGAATCTCTTTTGGAACTCACTACTCGGA
TTTGTGAGAAGAAGAAGATAAGCTTTTTGCCTTTGCCCAGAGATATAAGAGTGAACGGAT
ATGGTAGGCAAGCACGGACATTTGGGGTTTCGTTTCCC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 2 12

CO CL390Contig1 974 6 30 U
GGGCTCACAAACTTCACCGTCTGGATCAGAGCTACACTCGCAAACTCCAAACATGGCGAG
AGGTTTAAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCCCCTAAGCATTGGATGCTCGACAAACT
TGGTGGTGCTTTTGCCCCCAAGCCATCATCTGGACCACACAAGTCTAGAGAGTGCCTTCC
CCTCGTTCTTATCATTAGGAACAGGTTGAAGTACGCTCTTACCTACCGTGAAGTCATCTC
CATCTTGATGCAGAGGCATATCCAGGTTGACGGCAAAGTCAGGACCGACAAGACCTACCC
CGCTGGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCCCCAAGACTAACGAGAACTTCCGTCTTCTCTA
TGACACCAAGGGTCGTTTCCGTCTTCACTCCATCAGGGATGAGGAAGCTAAGTTTAAGCT
TTGCAAGGTCCGAACTATCCAGTTGGGACAAAAGGGCATTCCTTACCTCAACACATACGA
CGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCGCTCATCAAGCCCAACGACACCATCAAGCTCGA
TCTCGAGGAGAACAAGATTGTTGAGTTCATCAAGTTCGATGTCGGCAACGTTGTGATGGT
TACCGGAGGAAGGAACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGAAGCATAAGGG
AAGCTTCGAGACGATCCACATCCAGGACTCGACGGGACATGAGTTTGCGACGAGGTTGGG
*TAATGTGTTCACCCTTGGCAAAGGAACAAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCCAA*GGGTAAA
GGTATTAAGCTTACCATCATTGAGGAAGCCAAGAAGAGGCTTGCTGGTCAACAGGCTGCT
TGACTTTGTTATTTTTCCAGCTCTTTGTTATGTCTTTGTAGACGTCTTTATGTTTTCGTA
GACTCGCTTTGCTTCTTTTTTTTGTTTTGGAACTTGTGTTATTTTCTCTGTTTCAAGAAT
TCAACAAAAACTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 25 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 5 40 25 40 40 40 5 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E023TF U 3
AF RR2CR58TF U 1
AF RR2FO57TF U 2
AF RR2BD12TF U 111
AF RR2DN50TF U 151
AF RR2DN50JQ C 234
BS 1 77 RR2CR58TF
BS 78 78 RR2FO57TF
BS 79 392 RR2CR58TF
BS 393 395 RR2FO57TF
BS 396 577 RR2CR58TF
BS 578 578 RR2FO57TF
BS 579 614 RR2CR58TF
BS 615 615 RR2FO57TF
BS 616 659 RR2CR58TF
BS 660 660 RR2FO57TF
BS 661 666 RR2CR58TF
BS 667 667 RR2DN50TF
BS 668 693 RR2CR58TF
BS 694 694 RR2DN50TF
BS 695 696 RR2FO57TF
BS 697 697 RR2DN50TF
BS 698 714 RR2FO57TF
BS 715 715 RR2DN50TF
BS 716 721 RR2FO57TF
BS 722 723 RR2BD12TF
BS 724 746 RR2FO57TF
BS 747 747 RR2BD12TF
BS 748 765 RR2FO57TF
BS 766 772 RR2BD12TF
BS 773 773 RR2DN50TF
BS 774 831 RR2BD12TF
BS 832 834 RR2DN50TF
BS 835 835 RR2DN50JQ
BS 836 849 RR2DN50TF
BS 850 974 RR2DN50JQ

RD RR2E023TF 650 0 0
GG
TCACAAACTTCACCGTCTGGATCATAGCTACACTCGCAAACTCCAAACATGGCGAGAGGT
TTAAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCCCCTAAGCATTGGATGCTCGACAAACTTGGT
GGTGCTTTTGCCCCCAAGCCATCATCTGGACCACACAAGTCTAGAGAGTGCCTTCCCCTC
GTTCTTATCATTAGGAACAGGTTGAAGTACGCTCTTACCTACCGTGAAGTCATCTCCATC
TTGATGCAGAGGCATATCCAGGTTGACGGCAAAGTCAGGACCGACAAGACCTACCCCGCT
GGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCCCCAAGACTAACGAGAACTTCCGTCTTCTCTATGAC
ACCAAGGGTCGTTTCCGTCTTCACTCCATCAGGGATGAGGAAGCTAAGTTTAAGCTTTGC
AAGGTCCGAACTATCCAGTTGGGACAAAAGGGCATTCCTTACCTCAACACATACGACGGT
CGCACCATCCGTTACCCTGACCCGCTCATCAAGCCCAACGACACCATCAAGCTCGATCTC
GAGGAGAACAAGATTGTTGAGTTCATCAAGTTCGATGTCGGCAACGTTGTGATGGTTACC
GGAGGAAGGAACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGAAG

QA 3 650 3 650
DS 

RD RR2CR58TF 693 0 0
GGGCTCACAAACTTCACCGTCTGGATCAGAGCTACACTCGCAAACTCCAAACATGGCGAG
AGGTTTAAAGAAGCATCCGAAGAGGCTCAATGCCCCTAAGCATTGGATGCTCGACAAACT
TGGTGGTGCTTTTGCCCCCAAGCCATCATCTGGACCACACAAGTCTAGAGAGTGCCTTCC
CCTCGTTCTTATCATTAGGAACAGGTTGAAGTACGCTCTTACCTACCGTGAAGTCATCTC
CATCTTGATGCAGAGGCATATCCAGGTTGACGGCAAAGTCAGGACCGACAAGACCTACCC
CGCTGGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCCCCAAGACTAACGAGAACTTCCGTCTTCTCTA
TGACACCAAGGGTCGTTTCCGTCTTCACTCCA***GGGATGAGGAAGCTAAGTTTAAGCT
TTGCAAGGTCCGAACTATCCAGTTGGGACAAAAGGGCATTCCTTACCTCAACACATACGA
CGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCGCTCATCAAGCCCAACGACACCATCAAGCTCGA
TCTCGAGGAGAACAAGATTGTTGAGTTCATCAAGTTCAATGTCGGCAACGTTGTGATGGT
TACCGGAGGAAGGA*CAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGAAGCATAAGG*
AAGCTTTGAGACGATCCACATCCAGGACTCGAC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2FO57TF 764 0 0
GGC
TCACAAACTTCACCGTCTGGATCAGAGCTACACTCGCAAACTCCAAACATGGCGAGAGGT
TTAAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCCCCTAAGCATTGGATGCTCGACAAACTTGGT
GGTGCTTTTGCCCCCAAGCCATCATCTGGACCACACAAGTCTAGAGAGTGCCTTCCCCTC
GTTCTTATCATTAGGAACAGGTTGAAGTACGCTCTTACCTACCGTGAAGTCATCT**ATC
TTGATGCAGAGGCATATCCAGGTTGACGGCAAAGTCAGGACCGACAATACCTACCCCGCT
GGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCCCCAAGACTAACGAGAACTTCCGTCTTCTCTATGAC
ACCAAGGGTCGTTTCCGTCTTCACTCCATCAGGGATGAGGAAGCTAAGTTTAAGCTTTGC
AAGGTCCGAACTATCCAGTTGGGACAAAAGGGCATTCCTTACCTCAACACATACGACGGT
CGCACCATCCGTTACCCTGACCCGCTCATCAAGCCCAACGACACCATCAAGCTCGATCTC
GAGGAGAACAAGATTGTTGAGTTCATCAAGTTCGATGTCGGCAACGTTGTGATGGTTACC
GGAGGAAGGAACAGAGTGCGTGTTGGTGTGATTAGGAACCGTGAGAAGCATAAGGGAAGC
TTTGAGACGATCCACATCCAGGACTCGACTGGGCATGAGTTTGCGACGAGATTGGG**TA
TGTGTTCACCCTTGGCAAAGGA*CAAAGCCGTGGGTGTCTC

QA 4 764 4 764
DS 

RD RR2BD12TF 721 0 0
TCGACAAACTTGGTGGTGCTTTTGCCCCCAAGCCATCATCTGGACCACACAAGTCTAGAG
AGTGCCTTCCCCTCGTTCTTATCATTAGGAACAGGTTGAAGTACGCTCTTACCTACCGTG
AAGTCATCTCCATCTTGATGCAGAGGCATATCCAGGTTGACGGCAAAGTCAGGACCGACA
AGACCTACCCCGCTGGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCCCCAAGACTAACGAGAACTTCC
GTCTTCTCTATGACACCAAGGGTCGTTTCCGTCTTCACTCCATCAGGGATGAGGAAGCTA
GGTTTAAGCTTTGCAAGGTCCGAACTATCCAGTTGGGACAAAAGGGCATTCCTTACCTCA
ACACATACGACGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCGCTCATCAAGCCCAACGACACCA
TCAAGCTCGATCTCGAGGAGAACAAGATTGTTGAGTTCATCAGGTTCGATGTCGGCAACG
TTGTGATGGTTACCGGAGGAAGGAACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTGAGAACCGTGAGA
AGCATAAGGGAAGCTTTGAGACGATCCACATCCAGGACTCGACTGGGCATGAGTTTGCGA
CGAGATTGGGGTAATGTGTTCACCCTTGGCAAAGGAACAAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCC
AAAGGGTAAAGGTATTAAGCTTACCATCATTGAGGAAGCCAAGAAGAGGCTTGCTGGTCA
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2DN50TF 702 0 0
G
GGACCACACAAGTCTAGAGAGTGCCTTCCCCTCGTTCTT**CATCAGGAACAGGTTGAAG
TATGCTCTTACCTATCGTGAAGTCATCTCCATCTTGATGCAGAGGCATATCCAGGTTGAC
GGCAAAGTCAGGACCGACAAGACCTACCCCGTTGGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCCCC
AAGACTAACGAGAACTTCCGTCTTCTCTATGACACCAAGGGTCGTTTCCGTCTTCACTCC
ATCAGGGATGAGGAAGCAAAGTTTAAGCTTTGCAAGGTCCGAACTATCCAGTTGGGACAA
AAGGGCATTCCTTACCTCAACACATACGACGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCGCTC
ATCAAGCCCAACGACACCATCAAGCTCGATCTTGAGGAGAACAAGATTGTTGAGTTCATC
AAGTTCGATGTCGGCAACGTTGTGATGGTTACCGGAGGGAGAAACAGGGGGCGTGTTGGT
GTGATTAAGAACCGTGAGAAGCATAAGGGAAGCTTCGAGACGATCCACATCCAGGACTCG
ACGGGACATGAGTTTGCGACGAGGTTGGG*TAATGTGTTCACCCTTGGCAAAGGAACAAA
GCCGTGGGTGTCTCTTCCCAA*GGGTAAAGGTATTAAGCTTACCATCATTGAG*AAGCCA
AGAAGAGGCTTGCTGGTCAACAG*CTGCTTGACTTTGT
TAT

QA 2 699 2 699
DS 

RD RR2DN50JQ 741 0 0
TCATCTCCATCTTGATGCAGAGGCATATCCAGGTTGACGGCAAAGTCAGGACCGACAAGA
CCTACCCCGTTGGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCCCCAAGACTAACGAGAACTTCCGTC
TTCTCTATGACACCAAGGGTCGTTTCCGTCTTCACTCCATCAGGGATGAGGAAGCAAAGT
TTAAGCTTTGCAAGGTCCGAACTATCCAGTTGGGACAAAAGGGCATTCCTTACCTCAACA
CATACGACGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCGCTCATCAAGCCCAACGACACCATCA
AGCTCGATCTTGAGGAGAACAAGATTGTTGAGTTCATCAAGTTCGATGTCGGCAACGTTG
TGATGGTTACCGGAGGGAGAAACAGGGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGAAGC
ATAAGGGAAGCTTCGAGACGATCCACATCCAGGACTCGACGGGACATGAGTTTGCGACGA
GGTTGGG*TAATGTGTTCACCCTTGGCAAAGGAACAAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCCAA*
GGGTAAAGGTATTAAGCTTACCATCATTGAGGAAGCCAAGAAGAGGCTTGCTGGTCAACA
GGCTGCTTGACTTTGTTATTTTTCCAGCTCTTTGTTATGTCTTTGTAGACGTCTTTATGT
TTTCGTAGACTCGCTTTGCTTCTTTTTTTTGTTTTGGAACTTGTGTTATTTTCTCTGTTT
CAAGAATTCAACAAAAACTCC

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL390Contig2 793 6 15 U
AACTTCAATGAAAACAAAACAAAACTAAAGAACATGTGATGTTTGAAGTTTTTGTTGAAT
TCTTGAAACAGAGAAAATAACACAAGTTCCAAAACAAAAAGAAGCAAAGCGAGTCTACGA
AAACGTAAAAACGTCTAAAAGGACATAATAAAAGAGCTGGAAAAATCACAAAATCAAGCA
GCCTGTTGACCAGCAAGCCTCTTCTTGGCTTCCTCAATGATGGTAAGCTTAATACCTTTA
CCCTTGGGAAGAGACACCCACGGCTTTGTTCCTTTGCCAAGGGTGAACACATTACCCAAT
CTCGTCGCAAACTCATGCCCAGTCGAGTCCTGGATGTGGATCGTCTCAAAGCTTCCCTTA
TGCTTCTCACGGTTCTTAATCACACCAACACGCCCTCTGTTCCTTCCTCCGGTAACCATC
ACAACGTTGCCGACATCGAACTTGATGAACTAAACAATCTTGTTCTCCTCGAGATCGAGC
TTGATGGTGTCGTTGGGCTTGATGAGCGGGTCAGGGTAACGGACGGTGCGACCGTCGTAT
GTGTTGAGGTAAGGAATGCCCTTTTGTCCCAACTGGATAGTTCGGACCTTGCAAAGCTTA
AACTTAGCTTCCTCATCCCTGATGGAGTGAAGACGGAAACGACCCTTGGTGTCATAGAGA
AGACGGAAGTTCTCGTTAGTCTTGGGGATAGAGACAACATCCATGAAACCAGCGGGGTAG
GTCTTGTCGGTCCTGACTTTGCCGTCAACCTGGATATGCCTCTGCATCAAGATGGAGATG
ACCTCACGGTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 
25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2E023JQ U 1
AF RR2BD12JQ U 40
AF RR2CR58JQ U 45
AF RR2FO57JQ U 45
AF RR2AI48JQ U 41
AF RR2AI48TF C 80
BS 1 169 RR2E023JQ
BS 170 170 RR2BD12JQ
BS 171 250 RR2E023JQ
BS 251 376 RR2BD12JQ
BS 377 377 RR2AI48JQ
BS 378 441 RR2BD12JQ
BS 442 442 RR2AI48JQ
BS 443 451 RR2BD12JQ
BS 452 452 RR2AI48JQ
BS 453 523 RR2BD12JQ
BS 524 524 RR2AI48JQ
BS 525 603 RR2BD12JQ
BS 604 604 RR2AI48JQ
BS 605 771 RR2BD12JQ
BS 772 793 RR2AI48JQ

RD RR2E023JQ 250 0 0
AACTTCAATGAAAACAAAACAAAACTAAAGAACATGTGATGTTTGAAGTTTTTGTTGAAT
TCTTGAAACAGAGAAAATAACACAAGTTCCAAAACAAAAAGAAGCAAAGCGAGTCTACGA
AAACGTAAAAACGTCTAAAAGGACATAATAAAAGAGCTGGAAAAATCACGAAATCAAGCA
GCCTGTTGACCAGCAAGCCTCTTCTTGGCTTCCTCAATGATGGTAAGCTTAATACCTTTA
CCCTTGGGAA

QA 1 250 1 250
DS 

RD RR2BD12JQ 732 0 0
TGTTT
GAAGTTTTTGTTGAATTCTTGAAACAGAGAAAATAACACAAGTTCCAAAACAAAAAGAAG
CAAAGCGAGTCTACGAAAACGTAAAAACGTCTAAAAGGACATAATAAAAGAGCTGGAAAA
ATCACAAAATCAAGC***CTGTTGACCAGCAAGCCTCTTCTTGGCTTCCTCAATGATGGT
AAGCTTAATACCTTTACCCTTGGGAAGAGACACCCACGGCTTTGTTCCTTTGCCAAGGGT
GAACACATTACCCAATCTCGTCGCAAACTCATGCCCAGTCGAGTCCTGGATGTGGATCGT
CTCAAAGCTTCCCTTATGCTTCTCACGGTTCTCAATCACACCAACACGCCCTCTGTTCCT
TCCTCCGGTAACCATCACAACGTTGCCGACATCGAACCTGATGAACTCAACAATCTTGTT
CTCCTCGAGATCGAGCTTGATGGTGTCGTTGGGCTTGATGAGCGGGTCAGGGTAACGGAT
GGTGCGACCGTCGTATGTGTTGAGGTAAGGAATGCCCTTTTGTCCCAACTGGATAGTTCG
GACCTTGCAAAGCTTAAACCTAGCTTCCTCATCCCTGATGGAGTGAAGACGGAAACGACC
CTTGGTGTCATAGAGAAGACGGAAGTTCTCGTTAGTCTTGGGGATAGAGACAACATCCAT
GAAACCAGCGGGGTAGGTCTTGTCGGTCCTGACTTTGCCGTCAACCTGGATATGCCTCTG
CATCAAG

QA 6 732 6 732
DS 

RD RR2CR58JQ 724 0 0
GAAGTTTTTGTTGAATTCTTGAAACAGAGAAAATAACACAAGTTCCAAAACAAAAAGAAG
CAAAGCGAGTCTACGAAAACGTAAAAACGTCTAAAAGGACATAATAAAAGAGCTGGAAAA
ATCACAAAATCGAGCAGCCTGTTGACCAGCAAGCCTCTTCTTGGCTTCCTCAATGATGGT
AAGCTTAATACCTTTACCCTTGGGAAGAGACACCCACGGCTTTGTTCCTTTGCCAAGGGT
GAACACATTACCCAATCTCGTCGCAAACTCATGCCCAGTCGAGTCCTGGATGTGGATCGT
CTCAAAGCTTCCCTTATGCTTCTCACGGTTCTTAATCACACCAACACGCCCTCTGTTCCT
TCCTCCGGTAACCATCACAACGTTGCCGACATTGAACTTGATGAACTCAACAATCTTGTT
CTCCTCGAGATCGAGCTTGATGGTGTCGTTGGGCTTGATGAGCGGGTCAGGGTAACGGAT
GGTGCGACCGTCGTATGTGTTGAGGTAAGGAATGCCCTTTTGTCCCAACTGGATAGTTCG
GACCTTGCAAAGCTTAAACTTAGCTTCCTCATCCCTG***GAGTGAAGACGGAAACGACC
CTTGGTGTCATAGAGAAGACGGAAGTTCTCGTTAGTCTTGGGGATAGAGACAACATCCAT
GAAACCAGCGGGGTAGGTCTTGTCGGTCCTGACTTTGCCGTCAACCTGGATATGCCTCTG
CATC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2FO57JQ 738 0 0
GAAGTTTTTGTTGAATTCTTGAAACAGAGAAAATAACACAAGTTCCAAAACAAAAAGAAG
CAAAGCGAGTCTACGAAAACGTAAAAACGTCTAAAAGGACATAATAAAAGAGCTGGAAAA
ATCACAAAATCAAGCAGCCTGTTGACCAGCAAGCCTCTTCTTGGCTTCCTCAATGATGGT
AAGCTTAATACCTTTACCCTTGGGAAGAGACACCCACGGCTTTGTTCCTTTGCCAAGGGT
GAACACATTACCCAATCTCGTCGCAAACTCATGCCCAGTCGAGTCCTGGATGTGGATCGT
CTCAAAGCTTCCCTTATGCTTCTCACGGTTCCTAATCACACCAACACGCACTCTGTTCCT
TCCTCCGGTAACCATCACAACGTTGCCGACATCGAACTTGATGAACTCAACAATCTTGTT
CTCCTCGAGATCGAGCTTGATGGTGTCGTTGGGCTTGATGAGCGGGTCAGGGTAACGGAT
GGTGCGACCGTCGTATGTGTTGAGGTAAGGAATGCCCTTTTGTCCCAACTGGATAGTTCG
GACCTTGCAAAGCTTAAACTTAGCTTCCTCATCCCTGATGGAGTGAAGACGGAAACGACC
CTTGGTGTCATAGAGAAGACGGAAGTTCTCGTTAGTCTTGGGGATAGAGACAACATCCAT
GAAACCAGCGGGGTAGGTATTGTCGGTCCTGACTTTGCCGTCAACCTGGATATGCCTCTG
CATCAAGAT
AGATGACTT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2AI48JQ 753 0 0
GTTT
GAAGTTTTTGTTGAATTCTTGAAACAGAGAAAATAACACAAGTTCCAAAACAAAAAGAAG
CAAAGCGAGTCTACGAAAACGTAAAAACGTCTAAAAGGACATAATAAAAGAGCTGGAAAA
ATCACAAAATCAAGCAGCCTGTTGACCAGCAAGCCTCTTCTTGGCTTCCTCAATGATGGT
AAGCTTAATACCTTTACCCTTGGGAAGAGACACCCACGGCTTTGTTCCTTTGCCAAGGGT
GAACACATTACCCAATCTCGTCGCAAACTCATGCCCAGTCGAGTCCTGGATGTGGATCGT
CTCAAAGCTTCCCTTATGCTTCTCACGGTTCTTAATCACACCAACACGCCCTCTGTTCCT
TCCTCCGGTAACCATCACAACGTTGCCGACATCGAACTTGATGAACTAAACAATCTTGTT
CTCCTCGAGATCGAGCTTGATGGTGTCGTTGGGCTTGATGAGCGGGTCAGGGTAACGGAC
GGTGCGACCGTCGTATGTGTTGAGGTAAGGAATGCCCTTTTGTCCCAACTGGATAGTTCG
GACCTTGCAAAGCTTAAACTTAGCTTCCTCATCCCTGATGGAGTGAAGACGGAAACGACC
CTTGGTGTCATAGAGAAGACGGAAGTTCTCGTTAGTCTTGGGGATAGAGACAACATCCAT
GAAACCAGCGGGGTAGGTCTTGTCGGTCCTGACTTTGCCGTCAACCTGGATATGCCTCTG
CATCAAGATGGAGATGACCTCACGGTAGC

QA 5 753 5 753
DS 

RD RR2AI48TF 714 0 0
ACACAAGTTCCAAAACAAAAAGAAGCAAAGCGAGTCTACGAAAACGTAAAAACGTCTAAA
AGGACATAATAAAAGAGCTGGAAAAATCACAAAATCAAGCAGCCTGTTGACCAGCAAGCC
TCTTCTTGGCTTCCTCAATGATGGTAAGCTTAATACCTTTACCCTTGGGAAGAGACACCC
ACGGCTTTGTTCCTTTGCCAAGGGTGAACACATTACCCAATCTCGTCGCAAACTCATGCC
CAGTCGAGTCCTGGATGTGGATCGTCTCAAAGCTTCCCTTATGCTTCTCACGGTTCTTAA
TCACACCAACACGCCCTCTGTTCCTTCCTCCGGTAACCATCACAACGTTGCCGACATCGA
ACTTGATGAACTAAACAATCTTGTTCTCCTCGAGATCGAGCTTGATGGTGTCGTTGGGCT
TGATGAGCGGGTCAGGGTAACGGACGGTGCGACCGTCGTATGTGTTGAGGTAAGGAATGC
CCTTTTGTCCCAACTGGATAGTTCGGACCTTGCAAAGCTTAAACTTAGCTTCCTCATCCC
TGATGGAGTGAAGACGGAAACGACCCTTGGTGTCATAGAGAAGACGGAAGTTCTCGTTAG
TCTTGGGGATAGAGACAACATCCATGAAACCAGCGGGGTAGGTCTTGTCGGTCCTGACTT
TGCCGTCAACCTGGATATGCCTCTGCATCAAGATGGAGATGACCTCACGGTAG
C

QA 1 713 1 713
DS 



AS 2 12

CO CL391Contig1 626 7 9 U
GGACTCATCATTCCACACACATCTAATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATG
GCTGGTCTAATGAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATC
ACATCGAACGCGGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACGCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGC
TACCTAGCCCAGGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTA
AACAACCTGGCCCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCC
GCTAACGCCTTCCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGA
GTCAATATCCCTTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCG
GTCGGATGAAGCTAATGCGGACGTTTCAAATATCATGTAATGGATGAGAGAGTACTAAAA
TAAGATGTTTCAGTGGTTGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTC
ATGCTCCTATCACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAG
ATCTAAGGTTTACGTTTCGTTGTTAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 

AF RR2H421JQB C 349
AF RR2CG65TF U 1
AF RR2H421TF U 1
AF RR2C013JQ C 12
AF RR2H702JQB C 255
AF RR2H702TF U 12
AF RR2C013TF U 12
BS 1 14 RR2CG65TF
BS 15 15 RR2H421TF
BS 16 71 RR2CG65TF
BS 72 72 RR2H421TF
BS 73 507 RR2CG65TF
BS 508 508 RR2H421TF
BS 509 601 RR2CG65TF
BS 602 622 RR2H421TF
BS 623 626 RR2C013JQ

RD RR2H421JQB 236 0 0
AAGGCATGTGGAGTCAATATCCCTTACAAGATCAGCAAAAGCCCCAACTGCAACAGTGTG
AAATGAGCTGCGGTCGGATGAAGCTAATGCGGACGTTTCAAATATCATGTAATGGATGAG
AGAGTACTAAAATAAGATGTTTCAGTGGTTGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTT
TTTTATGTTGTCATGCTCCTATCACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAAC

QA 1 236 1 236
DS 

RD RR2CG65TF 601 0 0
GGACTCATCATTCCGCACACATCTAATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATG
GCTGGTCTAAT*AAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATC
ACATCGAACGCGGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACGCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGC
TACCTAGCCCAGGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTA
AACAACCTGGCCCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCC
GCTAACGCCTTCCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGA
GTCAATATCCCTTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCG
GTCGGATGAAGCTAATGCGGACGTTTCAAATATCATGTAATGGATGAGAGAGTACTAAAA
TAAGATGTTTCAGTGGTTGTTGTTTTTCGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTC
ATGCTCCTATCACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAG
A

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2H421TF 625 0 0
GGACTCATCATTCCACACACATCTAATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATG
GCTGGTCTAATGAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATC
ACATCG***GCGGCTCTGAATTGTGGCACCGTTAACGCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGC
TACCTAGCCCAGGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTA
AACAACCTGGCCCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCC
GCTAACGCCTTCCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGA
GTCAATATCCCTTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCG
GTCGGATGAAGCTAATGCGGACGTTTCAAATATCATGTAATGGATGAGAGAGTACTAAAA
TAAGATGTTTCAGTGGTTGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTC
ATGCTCCTATCACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAG
ATCTAAGGTTTACGTTTCGTTG
TTA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2C013JQ 615 0 0
TCCACACACATCTAATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATGGCTGGTCTAAT
GAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATCACATCGAACGC
GGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACGCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGCTACCTAGCCCA
GGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTAAACAACCTGGC
CCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCCGCTAACGCCTT
CCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCC
TTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATGAAG
CTAATGCGGACGTTTCAAATATCATGTAATGGATGAGAGAGTACTAAAATAAGATGTTTC
AGTGGTTGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCCTATC
ACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAGATCTAAGGTTT
ACGTTTCGTTGTTAG

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2H702JQB 370 0 0
TACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCCGCTAACGCCTTCCC
TAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCCTTA
CAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATGAAGCTA
ATGCGGACGTTTCAAATATCATGTAATGGATGAGAGAGTACTAAAATAAGATGTTTCAGT
GGTTGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGTTTTCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCCTATCACT
TTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAGATCTAAGGTTTACG
TTTCGTTG
CC

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR2H702TF 613 0 0
TCCACACACATCTAATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATGGCTGGTCTAAT
GAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATCACATCGAACGC
GGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACGCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGCTACCTAGCCCA
GGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTAAACAACCTGGC
CCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCCGCTAACGCCTT
CCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCC
TTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATGAAG
CTAATGCGGACGTTTCAAATATCATGTAATGGATGAGAGAGTACTAAAATAAGATGTTTC
AGTGGTTGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGTTTTCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCCTATC
ACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAGATCTAAGGTTT
ACGTTTCGTTG
CC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2C013TF 615 0 0
TCCACACACATCTAATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATGGCTGGTCTAAT
GAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATCACATCGAACGC
GGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACGCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGCTACCTAGCCCA
GGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTAAACAACCTGGC
CCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCCGCTAACGCCTT
CCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCC
TTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATGAAG
CTAATGCGGACGTTTCAAATATCATGTAATGGATGAGAGAGTACTAAAATAAGATGTTTC
AGTGGTTGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCCTATC
ACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAGATCTAAGGTTT
ACGTTTCGTTG
TTAG

QA 1 611 1 611
DS 



CO CL391Contig2 619 5 2 U
GGACTCATCATTCCACACACATTTCATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATG
GCTGGTCTAATGAAGTTGGCATGTTTGGTCTTGGCCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATC
ACATCGAACGCGGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACTCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGC
TACCTAGCCCAGGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTA
AACAACCTGGCCCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCC
GCTAACGCCTTCCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGA
GTCAATATCCCTTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCG
GTCGGATGAGGCTAATGCGGACGCTTCAAATATTATGTAATGGATGAGAGAATGCTAAAA
TAAGATGTTTAAGTGGTTGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGCTTCCTGTCTTTTATGTTGTC
ATGCTCCTAGTACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAG
ATCTAAGGTTTAAGTTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 5 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H248JQ C 223
AF RR2DG09JQ C 139
AF RR2DG09TF U 1
AF RR2H248TF U 1
AF RR2F461TF U 12
BS 1 611 RR2DG09TF
BS 612 619 RR2H248TF

RD RR2H248JQ 154 0 0
AGGGGG
GTTATTAATTTAAACAACCTGGCCCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGC
CTTGTAGGAGCCGCTAACGCCTTCCCTAGTTTCAACGCTGCCCGGGCAGCTGGACTTCCT
AAGGCATGGGGAGTCAATATCCCTTACA

QA 7 154 7 154
DS 

RD RR2DG09JQ 455 0 0
AACTGTGGCACCGTTAACTCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGCTACCTAGCCCAGGGTGCG
CCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTATTAATTTAAACAACCTGGCCCGTACA
ACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCCGCTAACGCCTTCCCTAGT
TTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCCTTACAAA
ATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATGAGGCTAATGC
GGACGCTTCAAATATTATGTAATGGATGAGAGAATGCTAAAATAAGATGTTTAAGTGGTT
GTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGCTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCCTAGTACTTTGG
TCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGA

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR2DG09TF 611 0 0
GGACTCATCATTCCACACACATTTCATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATG
GCTGGTCTAATGAAGTTGGCATGTTTGGTCTTGGCCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATC
ACATCGAACGCGGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACTCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGC
TACCTAGCCCAGGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTA
AACAACCTGGCCCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCC
GCTAACGCCTTCCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGA
GTCAATATCCCTTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCG
GTCGGATGAGGCTAATGCGGACGCTTCAAATATTATGTAATGGATGAGAGAATGCTAAAA
TAAGATGTTTAAGTGGTTGTTGTTTTTAGAGTTTTTCAGCTTCCTGTCTTTTATGTTGTC
ATGCTCCTAGTACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAG
ATCTAAGGTTT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2H248TF 619 0 0
GGACTCATCATTCCACACACATCTAATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATG
GCTGGTCTAATGAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATC
ACATCGAACGCGGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACGCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGC
TACCTAGCCCAGGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTA
AACAACCTGGCCCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCC
GCTAACGCCTTCCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGA
GTCAATATCCCTTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCG
GTCGGATGAGGCTAATGCGGACGCTTCAAATATTATGTAATGGATGAGAGAATGCTAAAA
TAAGATGTTTAAGTGGTTGTT***TTTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTC
ATGCTCCTAGTACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAG
ATCTAAGGTTTAAGTTTTT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2F461TF 601 0 0
TCCACACACATTTCATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATGGCTGGTCTAAT
GAAGTTGGCATGTTTGGTCTTGGCCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATCACATCGAACGC
GGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACTCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGCTACCTAGCCCA
GGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTAAACAACCTGGC
CCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCCGCTAACGCCTT
CCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCC
TTACAAGGTCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATGAGG
CTAATGCGGACGCTTCAAATATTATGTAATGGATGAGAGAATGCTAAAATAAGATGTTTA
AGTGGTTGTT***TTTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCCTAGT
ACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAGATCTAAAGTTT
A

QA 1 601 1 601
DS 



AS 2 11

CO CL392Contig1 824 4 8 U
ATCCACCAATATCTATTATTTTATTGAGTTTGGAGACATATTCAACGATTAATAATCTCC
ATAAACATGGTCGCTTATTATTAATGATGATTCTCGGTCTGTAATCAAATTTTACCCAAG
GATAAGACAGGACACACACGACTTGAGTCCGTTGCTCAGAAACTCGTCATTACCGACAAA
AGACACAAAACACATGACGAAGTGAAGAAAGAGAAGATAAAAACCACTGGTTTATCAGTC
GCTGGTACTGAGGACACAACGAAGGCAAGTGCCTTCATGCAACAGGTCAAAAGCCTTGTT
GATCTCTCCCAAGGGCATGTTGTGCGTTACGTACTCATCCACTTTTATCTCCTTGTTCAT
ATACTTCTCCACAAGCCAAGGAACTTGGGTTCGACTCTTGAAACCACCAAAAGCTGTTCC
TTTCCATACACGGCCAGTCACGAGTTGGAACGGTCGGGTTGATATCTCTTGTCCTGATGC
TGCAACACCAACTATAACCGAAGTTCCCCATCCCTTGTGACAGCACTCCAATGCGGCTCT
CATCACGGAGACATTCCCAATACACTCAAAGCTGTAGTCAACACCGCCATCAGTGAGATC
AACAATCACTTCCTGTATAGGCTTTTGGTGGTCCTTTGGGTTCACAAACTCATTAACACC
AAACTTCTTTGCAGTTTCATACTTCTTGCTGTCGATATCAATGCCAATGATCCTTGTAGC
ACCAGCAGTTTTGGCACCCTCAGCAACAGCAAGGCCCACGGTCCCAAGACCAAAAATGGC
AACATTTGAGCCAGGCTCTACTTTAGCAGTGTTCCAAACAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F731JQ U 54
AF RR2F731TF C 54
AF RR2CR20JQ U 1
AF RR2FP48JQ U 59
BS 1 158 RR2CR20JQ
BS 159 159 RR2F731JQ
BS 160 314 RR2CR20JQ
BS 315 315 RR2F731JQ
BS 316 329 RR2CR20JQ
BS 330 330 RR2F731JQ
BS 331 719 RR2CR20JQ
BS 720 824 RR2FP48JQ

RD RR2F731JQ 409 0 0
AATCTCCATAAACATGGTCGCTTATTATTAATGATGATTCTCGGTCTGTAATCAAATTTT
ACCCAAGGATAAGACAGGACACACACGACTTGAGTCCGTTGCTCAGAAACTCGTCATTAC
CGACAAAAGACACAAAACACATGACGAAGTGAAGAAAGAGAAGATAAAAACCACTGGTTT
ATCAGTCGCTGGTACTGAGGACACAACGAAGGCAAGTGCCTTCATGCAACAGGTCAAAAG
CCTTGTTGATCTCTCCCAAGGGCATGTTGTGCGTTACGTACTCATCCACTTTTATCTCCT
TGTTCATATACTTCTCCACAAGCCAAGGAACTTGGGTTCGACTCTTGAAACCACCAAAAG
CTGTTCCTTTCCATACACGGCCAGTCACGAGTTGGAACGGTCGGGTTG
C

QA 1 408 1 408
DS 

RD RR2F731TF 409 0 0
AATCTCCATAAACATGGTCGCTTATTATTAATGATGATTCTCGGTCTGTAATCAAATTTT
ACCCAAGGATAAGACAGGACACACACGACTTGAGTCCGTTGCTCAGAAACTCGTCATTAC
CGACAAAAGACACAAAACACATGACGAAGTGAAGAAAGAGAAGATAAAAACCACTGGTTT
ATCAGTCGCTGGTACTGAGGACACAACGAAGGCAAGTGCCTTCATGCAACAGGTCAAAAG
CCTTGTTGATCTCTCCCAAGGGCATGTTGTGCGTTACGTACTCATCCACTTTTATCTCCT
TGTTCATATACTTCTCCACAAGCCAAGGAACTTGGGTTCGACTCTTGAAACCACCAAAAG
CTGTTCCTTTCCATACACGGCCAGTCACGAGTTGGAACGGTCGGGTTG
C

QA 1 408 1 408
DS 

RD RR2CR20JQ 719 0 0
ATCCACCAATATCTATTATTTTATTGAGTTTGGAGACATATTCAACGATTAATAATCTCC
ATAAACATGGTCGCTTATTATTAATGATGATTCTCGGTCTGTAATCAAATTTTACCCAAG
GATAAGACAGGACACACACGACTTGAGTCCGTTGCTCAAAAACTCGTCATTACCGACAAA
AGACACAAAACACATGACGAAGTGAAGAAAGAGAAGATAAAAACCACTGGTTTATCAGTC
GCTGGTACTGAGGACACAACGAAGGCAAGTGCCTTCATGCAACAGGTCAAAAGCCTTGTT
GATCTCTCCCAAGGTCATGTTGTGCGTTATGTACTCATCCACTTTTATCTCCTTGTTCAT
ATACTTCTCCACAAGCCAAGGAACTTGGGTTCGACTCTTGAAACCACCAAAAGCTGTTCC
TTTCCATACACGGCCAGTCACGAGTTGGAACGGTCGGGTTGATATCTCTTGTCCTGATGC
TGCAACACCAACTATAACCGAAGTTCCCCATCCCTTGTGACAGCACTCCAATGCGGCTCT
CATCACGGAGACATTCCCAATACACTCAAAGCTGTAGTCAACACCGCCATCAGTGAGATC
AACAATCACTTCCTGTATAGGCTTTTGGTGGTCCTTTGGGTTCACAAACTCATTAACACC
AAACTTCTTTGCAGTTTCATACTTCTTGCTGTCGATATCAATGCCAATGATCCTTGTAG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2FP48JQ 766 0 0
CCATAAACATGGTCGCTTATTATTAATGATGATTCTCGGTCTGTAATCAAATTTTACCCA
AGGATAAGACAGGACACACACGACTTGAGTCCGTTGCTCAAAAACTCGTCATTACCGACA
AAAGACACAAAACACATGACGAAGTGAAGAAAAAGAAAATAAAAACCACTGGTTTATCAG
TCGCTGGTACTGAGGACACAACGAAGGCAAGTGCCTTCATGCAACAGGTCAAAAGCCTTG
TTGATCTCTCCCAAGGTCATGTTGTGCGTTATGTACTCATCCACTTTTATCTCCTTGTTC
ATATACTTCTCCACAAGCCAAGGAACTTGGGTTCGACTCTTGAAACCACCAAAAGCTGTT
CCTTTCCATACACGGCCAGTCACGAGTTGGAACGGTCGGGTTGATATCTCTTGTCCTGAT
GCTGCAACACCAACTATAACCGAAGTTCCCCATCCCTTGTGACAGCACTCCAATGCGGCT
CTCATCACGGAGACATTCCCAATACACTCAAAGCTGTAGTCAACACCGCCATCAGTGAGA
TCAACAATCACTTCCTGTATAGGCTTTTGGTGGTCCTTTGGGTTCACAAACTCATTAACA
CCAAACTTCTTTGCAGTTTCATACTTCTTGCTGTCGATATCAATGCCAATGATCCTTGTA
GCACCAGCAGTTTTGGCACCCTCAGCAACAGCAAGGCCCACGGTCCCAAGACCAAAAATG
GCAACATTTGAGCCAGGCTCTACTTTAGCAGTGTTCCAAACAGCTC

QA 1 766 1 766
DS 



CO CL392Contig2 1423 7 18 U
GGGGAGAAGAAAAGAAAAGAAGATACAACACCGCAACACCTAACTAACAGTGCCTACCAG
TCTCTCTCTCTCTCTCACAATCTATCCTGGTGCGTGCGTCAATGGCGACTCAAGGACAGG
TTATCACATGCAAAGCTGCGGTGGCATACGAGGCGAACAAACCACTGGTGATCGAAGATG
TGCAGGTGGCTCCCCCTCAGGCCGGTGAGGTTCGGATCAAGATCCTCTTCACCGCTCTCT
GTCACACCGACGCCTACACTTGGAGCGGCAAGGATCCCGAAGGTCTCTTTCCTTGTATCC
TCGGTCACGAGGCTGCTGGGATTGTTGAGAGTGTTGGTGAAGGTGTAACTGAAGTTCAAC
CTGGGGATCATGTGATCCCTTGTTACCAAGCCGAGTGCCGTGAATGCAAGTTCTGCAAAT
CTGGAAAGACTAACCTCTGCGGCAAGGTCCGATCCGCTACTGGTGTTGGGGTCATGATGA
ACGACCGTAAGAGCCGCTTCTCCGTTAATGGCAAACCCATTTATCACTTCATGGGTACCT
CCACCTTTAGTCAGTACACTGTTGTTCATGATGTTAGTGTCGCCAAGATTGATCCTCACG
CTCCTTTGGACAAAGTCTGCCTTCTTGGTTGTGGTGTTCCCACTGGCCTTGGAGCAGTTT
GGAACACTGCAAAAGTAGAGCCTGGCTCAAATGTTGCCATTTTTGGTCTTGGGACCGTGG
GGCTTGCTGTTGCTGAGGGTGCGAAAACAGCTGGTGCTACAAGGATCATTGGCATTGATA
TCGACAGCAAGAAGTATGAAACTGCAAAGAAGTTTGGTGTTAATGAGTTTGTGAACCCAA
AGGACCACCAAAAGCCTATACAGGAAGTGATTGTTGATCTCACTGATGGCGGTGTTGACT
ACAGCTTTGAGTGTATTGGGAATGTCTCCGTGATGAGAGCCGCATTGGAGTGCTGTCACA
AGGGATGGGGAACTTCGGTTATAGTTGGTGTTGCAGCATCAGGACAAGAGATATCAACCC
GACCGTTCCAACTCGTGACTGGCCGTGTATGGAAAGGAACAGCTTTTGGTGGTTTCAAGA
GTCGAACCCAAGTTCCTTGGCTTGTGGAGAAGTATATGAACAAGGAGATAAAAGTGGATG
AGTACATAACGCACAACATGACCTTGGGAGAGATCAACAAGGCTTTTGACCTGTTGCATG
AAGGTACTTGCCTTCGTTGTGTCCTCAGTACCAGCGACTGATAAACCAATGGTTTTTATC
TTCTCTTTCTCCACTTCTGTCATGTGTTTTGTGTCTTTTGTTGGTAATGACAAGTTTTTG
AGCAACGGACTCAAGTCGTGTGTGTCCTGTCTTATCCTTCGGTAAAATTTGATTAAAGAC
CGAGAATCATCATAAATAATAAGCGACCGTGTTTATGGAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2E426TF U 40
AF RR2DK26TF U 1
AF RR2AI27TF U 38
AF RR2CR20TF U 299
AF RR2AI27JQ C 555
AF RR2DK26JQ C 631
AF RR2E426JQ C 669
BS 1 571 RR2DK26TF
BS 572 572 RR2AI27TF
BS 573 717 RR2DK26TF
BS 718 741 RR2AI27TF
BS 742 742 RR2CR20TF
BS 743 743 RR2AI27JQ
BS 744 748 RR2CR20TF
BS 749 749 RR2AI27JQ
BS 750 932 RR2CR20TF
BS 933 968 RR2AI27JQ
BS 969 969 RR2DK26JQ
BS 970 1039 RR2AI27JQ
BS 1040 1040 RR2DK26JQ
BS 1041 1317 RR2AI27JQ
BS 1318 1318 RR2DK26JQ
BS 1319 1381 RR2AI27JQ
BS 1382 1418 RR2DK26JQ
BS 1419 1423 RR2E426JQ

RD RR2E426TF 240 0 0
GG
AACTAACAGTGCCTACCAGTCTCTCTCTCTCTCTCACAATCTATCCTGGTGCGTGCGTCA
ATGGCGACTCAAGGACAGGTTATCACATGCAAAGCTGCGGTGGCATACGAGGCGAACAAA
CCACTGGTGATCGAAGATGTGCAGGTGGCTCCCCCTCAGGCCGGTGAGGTTCGGATCAAG
ATCCTCTTCACCGCTCTCTGTCACACCGACGCCTACACTTGGAGCGGCAAGGATCCCG

QA 3 240 3 240
DS 

RD RR2DK26TF 717 0 0
GGGGAGAAGAAAAGAAAAGAAGATACAACACCGCAACACCTAACTAACAGTGCCTACCAG
TCTCTCTCTCTCTCTCACAATCTATCCTGGTGCGTGCGTCAATGGCGACTCAAGGACAGG
TTATCACATGCAAAGCTGCGGTGGCATACGAGGCGAACAAACCACTGGTGATCGAAGATG
TGCAGGTGGCTCCCCCTCAGGCCGGTGAGGTTCGGATCAAGATCCTCTTCACCGCTCTCT
GTCACACCGACGCCTACACTTGGAGCGGCAAGGATCCCGAAGGTCTCTTTCCTTGTATCC
TCGGTCACGAGGCTGCTGGGATTGTTGAGAGTGTTGGTGAAGGTGTAACTGAAGTTCAAC
CTGGGGATCATGTGATCCCTTGTTACCAAGCCGAGTGCCGTGAATGCAAGTTCTGCAAAT
CTGGAAAGACTAACCTCTGCGGCAAGGTCCGATCCGCTACTGGTGTTGGGGTCATGATGA
ACGACCGTAAGAGCCGCTTCTCCGTTAATGGCAAACCCATTTATCACTTCATGGGTACCT
CCACCTTTAGTCAGTACACTGTTGTTCATGACGTTAGTGTCGCCAAGATTGATCCTCACG
CTCCTTTGGACAAAGTCTGCCTTCTTGGTTGTGGTGTTCCCACTGGCCTTGGAGCAGTTT
GGAACACTGCAAAAGTAGAGCCTGGCTCAAATGTTGCCATTTTTGGTCTTGGGACCG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2AI27TF 704 0 0
GGCT
AACTAACAGTGCCTACCAGTCTCTCTCTCTCTCTCACAATCTATCCTGGTGCGTGCGTCA
ATGGCGACTCAAGGACAGGTTATCACGTGCAAAGCTGCGGTGGCATACGAGGCGAACAAA
CCACTGGTGATCGAAGATGTGCAGGTGGCTCCCCCTCAGGCCGGTGAGGTTCGGATCAAG
ATCCTCTTCACCGCTCTCTGTCACACCGACGCCTACACTTGGAGCGGCAAGGATCCCGAA
GGTCTCTTTCCTTGTATCCTCTGTCACGAGGCTGCTGGGATTGTTGAGAGTGTTGGTGAA
GGTGTAACTGAAGTTCAACCTGGGGATCATGTGATCCCTTGTTACCAAGCCGAGTGCCGT
GAATGCAAGTTCTGCAAATCTGGAAAGACTAACCTCTGCGGCAAGGTCCGATCCGCTACT
GGTGTTGGGGTCATGATGAACGACCGTAAGAGCCGCTTCTCCGTTAATGGCAAACCCATT
TATCACTTCATGGGTACCTCCACCTTTAGTCAGTACACTGTTGTTCATGATGTTAGTGTC
GCCAAGATTGATCCTCACGCTCCTTTGGACAAAGTCTGCCTTCTTGGTTGTGGTGTTCCC
ACTGGCCTTGGAGCAGTTTGGAACACTGCAAAAGTAGAGCCTGGCTCAAATGTTGCCATT
TTTGGTCTTGGGACCGTGGGGCTTGCTGTTGCTGAGGGTG

QA 5 704 5 704
DS 

RD RR2CR20TF 634 0 0
GCTCG
GTCACGAGGCTGCTGGGATTGTTGAGAGTGTTGGTGAAGGTGTAAGTGAAGTTCAACCAG
GGGATCATGTCATCCCTTGTTACCAAGCGGAGTGCCGTGAATGCAAGTTCTGCAAATCTG
GAAAGACTAACCTCTGCGGCAAGGTTCGTTCCGCTACTGGTGTTGGGGTCATGATGAACG
ACCGTAAGAGCCGCTTCTCGGTTAATGGAAAACCCATTTATCACTTCATGGGTACCTCCA
CCTTTAGTCAGTACACCGTTGTTCATGATGTTAGTGTCGCCAAGATTGATCCTCACGCTC
CTTTGGACAAAGTCTGCCTTCTTGGTTGTGGTGTTCCCACTGGCCTTGGAGCTGTTTGGA
ACACTGCTAAAGTAGAGCCTGGCTCAAATGTTGCCATTTTTGGTCTTGGGACCGTGGGCC
TTGCTGTTGCTGAGGGTGCCAAAACTGCTGGTGCTACAAGGATCATTGGCATTGATATCG
ACAGCAAGAAGTATGAAACTGCAAAGAAGTTTGGTGTTAATGAGTTTGTGAACCCAAAGG
ACCACCAAAAGCCTATACAGGAAGTGATTGTTGATCTCACTGATGGCGGTGTTGACTACA
GCTTTGAGTGTATTGGGAATGTCTCCGTG

QA 6 634 6 634
DS 

RD RR2AI27JQ 827 0 0
TACACTGTTGTTCATGATGTTAGTGTCGCCAAGATTGATCCTCACGCTCCTTTGGACAAA
GTCTGCCTTCTTGGTTGTGGTGTTCCCACTGGCCTTGGAGCAGTTTGGAACACTGCAAAA
GTAGAGCCTGGCTCAAATGTTGCCATTTTTGGTCTTGGGACCGTGGGGCTTGCTGTTGCT
GAGGGTGCGAAAACAGCTGGTGCTACAAGGATCATTGGCATTGATATCGACAGCAAGAAG
TATGAAACTGCAAAGAAGTTTGGTGTTAATGAGTTCGTGAACCCAAAGGACCACCAAAAG
CCTATACAGGAAGTGATTGTTGATCTCGCTGATGGCGGTGTTGACTACAGCTTTGAGTGT
ATTGGGAATGTCTCCGTGATGAGAGCCGCATTGGAGTGCTGTCACAAGGGATGGAGAACT
TCGGTTATAGTTGGTGTTGCAGCATCAGGACAAGAGATATCAACCCGACCGTTCCAACTC
GTGACGGGCCGTGTATGGAAAGGAACAGCTTTTGGTGGTTTCAAGAGTCGAACCCAAGTT
CCTTGGCTTGTGGAGAAGTATATGAACAAGGAGATAAAAGTGGATGAGTACATAACGCAC
AACATGACCTTGGGAGAGATCAACAAGGCTTTTGACCTGTTGCATGAAGGTACTTGCCTT
CGTTGTGTCCTCAGTACCAGCGACTGATAAACCAATGGTTTTTATCTTCTCTTTCTCCAC
TTCTGTCATGTGTTTTGTGTCTTTTGTTGGTAATGACAAGTTTCTGAGCAACGGACTCAA
GTCGTGTGTGTCCTGTCTTATCCTTCGGTAAAATTTGATTAAAGACC

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2DK26JQ 788 0 0
GTGGTGTTCCCACTG*CCTTGGAGCAGTTTGGAACACTGCAAAAGTAGAGCCTGGCTCAA
ATGTTGCCATTTTTGGTCTTGGGACCGTGGGGCTTGCTGTTGCTGAGGGTGCGAAAACAG
CTGGTGCTACAAGGATCATTGGCATTGATATCGACAGCAAGAAGTATGAAACTGCAAAGA
AGTTTGGTGTTAATGAGTTTGTGAACCCAAAGGACCACCAAAAGCCTATACAGGAAGTGA
TTGTTGATCTCACTGATGGCGGTGTTGACTACAGCTTTGAGTGTATTGGGAATGTCTCCG
TGATGAGAGCCGCATTGGAGTGCTGTCACAAGGGATGGGGAACTTCGGTTATAGTTGGTG
TTGCAGCATCAGGACAAGAGATATCAACCCGACCGTTCCAACTCGTGACTGGCCGTGTAT
GGAAAGGAACAGCTTTTGGTGGTTTCAAGAGTCGAACCCAAGTTCCTTGGCTTGTGGAGA
AGTATATGAACAAGGAGATAAAAGTGGATGAGTACATAACGCACAACATGACCTTGGGAG
AGATCAACAAGGCTTTTGACCTGTTGCATGAAGGTACTTGCCTTCGTTGTGTCCTCAGTA
CCAGCGACTGATAAACCAATGGTTTTTATTTTCTCTTTCTCCACTTCTGTCATGTGTTTT
GTGTCTTTTGTTGGTAATGACAAGTTTTTGAGCAACGGACTCAAGTCGTGTGTGTCCTGT
CTTATCCTTCGGTAAAATTTGATTAAAGACCGAGAATCATCATAAATAATAAGCGACCGT
GTTTATGG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2E426JQ 755 0 0
GCAAAAGTAGAGCCTGGCTCAAATGTTGCCATTTTTGGTCTTGGGACCGTGGGGCTTGCT
GTTGCTGAGGGTGTGAAAACAGCTGGTGCTACAAGGATCATTGGCATTGATATCGACAGC
AAGAAGTATGAAACTGCAAAGAAGTTTGGTGTTAATGAGTTTGTGAACCCAAAGGACCAC
CAAAAGCCTATACAGGAAGTGATTGTTGATCTCACTGATGGCGGTGTTGACTACAGCTTT
GAGTGTATTGGGAATGTCTCCGTGATGAGAGCCGCATTGGAGTGTTGTCACAAGGGATGG
GGAACTTCGGTTATAGTTGGTGTTGCAGCATCAGGACAAGAGATATCAACCCGACCGTTC
CAACTCGTGACTGGCCGTGTATGGAAAGGAACAGCTTTTGGTGGTTTCAAGAGTCGAACC
CAAGTTCCTTGGCTTGTGGAGAAGTATATGAACAAGGAGATAAAAGTGGATGAGTACATA
ACGCACAACATGACCTTGGGAGAGATCAACAAGGCTTTTGACCTGTTGCATGAAGGTACT
TGCCTTCGTTGTGTCCTCAGTACCAGCGACTGATAAACCAATGGTTTTTATCTTCTCTTT
CTCCACTTCTGTCATGTGTTTTGTGTCTTTTGTTGGTAATGACAAGTTTTTGAGCAACGG
ACTCAAGTCGTGTGTGTCCTGTCTTATCCTTCGGTAAAATTTGATTAAAGACCGAGAATC
ATCATAAATAATAAGCGACCGTGTTTATGGAGATT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 11

CO CL393Contig1 1288 11 13 U
GCGAATCTCGTGTGCTTAACTGAGCAGGTATTATGTCCAGACTAGACACATCTTATCTTT
GGAATCCTGTAAACAGCACCCTGGTTCTCAATTATCTCTAGTACTTTATTTCACATTGGT
AATTATTTTAGCTGCGCTATTGCAGATTGTCATATAGAGACAATTTTCATGTTAATTCTC
TGTTAACGAAAAAGAAAAGGCTCTCTTAATCTTCTGGAGTTTCGTGGATTCACTGCAAGG
GATAGCTTGCCAGCATAGTAATACCACATTTACCCCTGTCTTTACGATAACCACGTTCCA
TCCGTATGTAGCCTTCTTCACCCCAACCAGTTCCCCATGTATTCTTCACGATCCAGTACT
TTTGACCGTCTTCTTCTCCATATCCAATAACAGTCACAGCATGGTTGAAACTTGACCCAC
AGTAACCTGTGAAAATACCAGAAGAGTAGAACTGAAAGATAAACCCATCAGCGTCGATTC
CAACTGACACTGGTTGTTGAGCAGTAGCGACTTGTAAGCTCTCCTCGTTCGGTGCTACCT
TTTGGTATCCTGTAATTGTAACGATCTTATTTTTGGATTTTTCTTGGTCGCACCCGGTAC
CATCTGTGGCTGTGTATGGGTAGTCGTCCAAGGCGACAAGTCCACCATTAGCTATGAGGT
ATTCATAAGCTGTTTCCATTAATCCACCACTACACCCTTTGTTGTAACTGCCGGTATCAC
AATCTATGAGTTGTTGTTCTGAGAGAGTTACTAAATTCCCTGTGTTTATCTTGTTGATTC
CTTCAATAGCTGAAACTGTGGCGAAAGCCCAGCAGCCTCCACATTTTCCTTGATCTCTAA
TAGGAGTCACAGCACCTTCTCTCCTCCAGTCCACAGCGGCCGGCACATTGCCTGATGGGT
CACAAGCCGGCACATGATCGCTGTTTAAACTCGAGGAGGACATGTTCAATCCGAGAAAAT
TGGCCTTAAACTCAGAGTTGGTCATGTCAGCAAATCTATTTTCCGCTAAGTTAAAGGTCA
AGTGGAGGGAGTTGACATAGTCAATCCACTGGAGATTAGACTGGTATATCCCAAACCTAA
ACATCCACTCATCCTTTTCTGCATATGATTTTCCGTGGTATTGAAGCCATTCTCCGAACT
GCTTCTTCATCAGGGTGTTGTGTGGGTTGTACCCAGAAGAATTGACGGAACACAGCCTTG
AAGCTATCAGCACAAAGCAAATCAAAACGACAAGGGTCAGGTTAGCATTTCTTAGTACAT
TCAACATCTTTGTCTGTTTTAAGTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 55 55 
55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2E978JQ U 61
AF RR2GM25JQ U 71
AF RR2FE82JQ U 1
AF RR2G969JQ U 61
AF RR2C062JQ U 83
AF RR2GO86JQ U 83
AF RR2GO86TF C 603
AF RR2C062TF C 557
AF RR2E978TF C 591
AF RR2G969TF C 599
AF RR2FE82TF C 684
BS 1 325 RR2FE82JQ
BS 326 326 RR2E978JQ
BS 327 362 RR2FE82JQ
BS 363 363 RR2E978JQ
BS 364 549 RR2FE82JQ
BS 550 550 RR2E978JQ
BS 551 729 RR2FE82JQ
BS 730 818 RR2G969JQ
BS 819 819 RR2C062JQ
BS 820 837 RR2G969JQ
BS 838 839 RR2C062JQ
BS 840 1285 RR2C062TF
BS 1286 1288 RR2FE82TF

RD RR2E978JQ 573 0 0
GGAATCCTGTAAACAGCACCCTGGTTCTCAATTATCTCTAGTACTTTATTTCACATTGGT
AATTATTTTAGCTGCCCTATTGCAAATTGTCATATAAAGACAATTTTCATGTTAATTCTC
TGTTAACAAAAAAAAAAAGGCTCTCTTAATCTTCTGGAGTTTCGTGGATTCACTGCAAGG
GATAGCTTGCCAGCATAGTAATACCACATTTACCCCTGTCTTTACAATAACCACGTTCCA
TCCGTATGTAGCCTTCTTCACCCCAACCAGTTCCCCATGTATTCTTCACGATCCAGTACT
TTTGACCGTCTTCTTCTCCATATCCAATAACAGTCACAGCATGGTTGAAACTTGACCCAC
AGTAACCTGTGAAAATACCAAAAAAGTAAAACTGAAAGATAAACCCATCAGCGTCGATTC
CAACTGACACTGGTTGTTGAGCAGTAGCGACTTGTAAGCTCTCCTCGTTCGGTGCTACCT
TTTGGTATCCTGTAATTGTAACGATCTTATTTTTGGATTTTTCTTGGTCGCACCCGGTAC
CATCTGTGGCTGTGTATGGGTAGTCGTCCAAGG

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2GM25JQ 620 0 0
AAACAGCACCCTGGTTCTCAATTATCTCTAGTACTTTATTTCACATTGGTAATTATTTTA
GCTGCGCTATTGCAGATTGTCATATAGAGACAATTTTCATGTTAATTCTCTGTTAACGAA
AAAGAAAAGGCTCTCTTAATCTTCTGGAGTTTCGTGGATTCACTGCAAGGGATAGCTTGC
CAGCATAGTAATACCACATTTACCCCTGTCTTTACGATAACCACGTTCCATCCGTATGTA
GCCTTCTTCACCCCAACCAGTTCCCCATGTATTCCTCACGATCCAGTACTTTTGACCGTC
TTCTTCTCCATATCCAATAACAGTCACAGCATGGTTGAGACTTGACCCACAGTAACCTGT
GAAAATACCAGAAGAGTAGAACTGAAAGATAAACCCATCAGCGTCGATTCCAACTGACAC
TGGTTGTTGAGCAGTAGCGACTTGTAAGCTCTCCTCGTTCGGTGCTACCTTTTGGTATCC
TGTAATTGTAACGATCTTATTTTTGGATTTTTCTTGGTCGCACCCGGTACCATCTGTGGC
TGTGTATGGGTAGTCGTCCAAGGCGACAAGTCCACCATTAGCTATGAGGTATTCATAAGC
TGTTTCCATTAATCCACCAC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2FE82JQ 729 0 0
GCGAATCTCGTGTGCTTAACTGAGCAGGTATTATGTCCAGACTAGACACATCTTATCTTT
GGAATCCTGTAAACAGCACCCTGGTTCTCAATTATCTCTAGTACTTTATTTCACATTGGT
AATTATTTTAGCTGCGCTATTGCAGATTGTCATATAGAGACAATTTTCATGTTAATTCTC
TGTTAACGAAAAAGAAAAGGCTCTCTTAATCTTCTGGAGTTTCGTGGATTCACTGCAAGG
GATAGCTTGCCAGCATAGTAATACCACATTTACCCCTGTCTTTACGATAACCACGTTCCA
TCCGTATGTAGCCTTCTTCACCCCA*CCAGTTCCCCATGTATTCTTCACGATCCAGTACT
TTCGACCGTCTTCTTCTCCATATCCAATAACAGTCACAGCATGGTTGAAACTTGACCCAC
AGTAACCTGTGAAAATACCAGAAGAGTAGAACTGAAAGATAAACCCATCAGCGTCGATTC
CAACTGACACTGGTTGTTGAGCAGTAGCGACTTGTAAGCTCTCCTCGTTCGGTGCTACCT
TTTGGTATCATGTAATTGTAACGATCTTATTTTTGGATTTTTCTTGGTCGCACCCGGTAC
CATCTGTGGCTGTGTATGGGTAGTCGTCCAAGGCGACAAGTCCACCATTAGCTATGAGGT
ATTCATAAGCTGTTTCCATTAATCCACCACTACACCCTTTGTTGTAACTGCCGGTATCAC
AATCTATGA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2G969JQ 777 0 0
GGAATCCTGTAAACAGCACCCTGGTTCTCAATTATCTCTAGTACTTTATTTCACATTGGT
AATTATTTTAGCTGCGCTATTGCAGATTGTCATATAGAGACAATTTTCATGTTAATTCTC
TGTTAACGAAAAAGAAAAGGCTCTCTTAATCTTCTGGAGTTTCGTGGATTCACTGCAAGG
GATAGCTTGCCAGCATAGTAATACCACATTTACCCCTGTCTTTACGATAACCACGTTCCA
TCCGTATGTAGCCTTCTTCACCCCAACCAGTTCCCCATGTATTCTTCACGATCCAGTACT
TTTGACCGTCTTCTTCTCCATATCCAATAACAGTCCCAGCATGGTTGAAACTTGACCCAC
AGTAACCTGTGAAAATACCAGAAGAGTAGAACTGAAAGATAAACCCATCAGCGTCGATTC
CAACTGACACTGGTTGTTGAGCAGTAGCGACTTGTAAGCTCTCCTCGTTCGGTGCTACCT
TTTGGTATCCTGTAATTGTAACGATCTTATTTTTGGATTTTTCTTGGTCGCACCCGGTAC
CATCTGTGGCTGTGTATGGGTAGTCGTCCAAGGCGACAAGTCCACCATTAGCTATGAGGT
ATTCATAAGCTGTTTCCATTAATCCACCACTACACCCTTTGTTGTAACTGCCGGTATCAC
AATCTATGAGTTGTTGTTCTGAGAGAGTTACTAAATTCCCTGTGTTTATCTTGTTGATTC
CTTCAATAGCTGAAACTGTGGCGAAAGCCCAGCAGCCTACACATTTTCCTTGATCTC

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2C062JQ 757 0 0
GGTTCTCAATTATCTCTAGTACTTTATTTCACATTGGTAATTATTTTAGCTGCGCTATTG
CAGATTGTCATATAGAGACAATTTTCATGTTAATTCTCTGTTAACGAAAAAGAAAAGGCT
CTCTTAATCTTCTGGAGTTTCGTGGATTCACTGCAAGGGATAGCTTGCCAGCATAGTAAT
ACCACATTTACCCCTGTCTTTACGATAACCACGTTCCATCCGTATGTAGCCTTCTTCACC
CCAACCAGTTCCCCATGTATTCTTCACGATCCAGTACCTTTGACCGTCTTCTTCTCCATA
TCCAATAACAGTCACAGCATGGTTGAGACTTGACCCACAGTAACCTGTGAAAATACCAGA
AGAGTAGAACTGAAAGATAAACCCATCAGCGTCGATTCCAACTGACACTGGTTGTTGAGC
AGTAGCGACTTGTAAGCTCTCCTCGTTCGGTGCTACCTTTTGGTATCCTGTAATTGTAAC
GATCTTATTTTTGGATTTTTCTTGGTCGCACCCGGTACCATCTGTGGCTGTGTATGGGTA
GTCGTCCAAGGCGACAAGTCCACCACTAGCTATGAGGTATTCATAAGCTGTTTCCATTAA
TCCACCACTACACCCTTTGTTGTAACTGCCGGTATCACAATCTATGAGTTGTTGTTCTGA
GAGAGTTACTAAATTCCCTGTGTTTATCTTGTTGATTCCTTCAATAGCTGAAACTGTGGC
GAAAGCCCAGCAGCCTCCACATTTTCCTTGATCTCTA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2GO86JQ 742 0 0
GGTTCTCAATTATCTCTAGTACTTTATTTCACATTGGTAATTATTTTAGCTGCGCTATTG
CAGATTGTCATATAGAGACAATTTTCATGTTAATTCTCTGTTAACGAAAAAGAAAAGGCT
CTCTTAATCTTCTGGAGTTTCGTGGATTCACTGCAAGGGATAGCTTGCCAGCATAGTAAT
ACCACATTTACCCCTGTCTTTACGATAACCACGTTCCATCCGTATGTAGACTTCTTCACC
CCAACCAGTTTCCCATGTATTCTTCACGATCCAGTACTTTTGACCGTCTTCTTCTCCATA
TCCAATAACAGTCACAGCATGGTTGAGACTTGACCCACAGTAACCTGTGAAAATACCAGA
AGAGTAGAACTGAAAGATAAACCCATCAGCGTCGATTCCAACTGACACTGGTTGTTGAGC
AGTAGCGACTTGTAAGCTCTCCTCGTTCGGTGCTACCTTTTGGTATCCTGTAATTGTAAC
GATCTTATTTTTGGATTTTTCTTGGTCGCACCCGGTACCATCTGTGGCTGTGTATGGGTA
GTCGTCCAAGGCGACAAGTCCACCATTAGCTATGAGGTATTCATAAGCTGTTTCCATTAA
TCCACCACTACACCCTTTGTTGTAACTGCCGGTATCACAATCTATGAGTTGTTGTTCTGA
GAGAGTTACTAAATTCCCTGTGTTTATCTTGTTGATTCCTTCAATAGCTGAAACTGTGGC
GAAAGCCCAGCAGCCTCCACAT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2GO86TF 251 0 0
TCTGTGGCTGTGTATGGGTAGTCGTCCAAGGCGACAAGTCCACCATTAGCTATGAGGTAT
TCATAAGCTGTTTCCATTAATCCACCACTACACCCTTTGTTGTAACTGCCGGTATCACAA
TCTATGAGTTGTTGTTCTGAGAGAGTTACTAAATTCCCTGTGTTTATCTTGTTGATTCCT
TCAATAGCTGAAACTGTGGCGAAAGCCCAGCAGCCTCCACATTTTCCTTGATCTCTAATA
GGAGTCACAGC

QA 1 251 1 251
DS 

RD RR2C062TF 731 0 0
TGTAACGATCTTATTTT*GGATTTT*CTTG*TCGCACCCGGTACCATCTGTGGCTGTGTA
TGGGTAGTCGTCCAAGGCGACAAGTCCACCACTAGCTATGAGGTATTCATAAGCTGTTTC
CATTAATCCACCACTACACCCTTTGTTGTAACTGCCGGTATCACAATCTATGAGTTGTTG
TTCTGAGAGAGTTACTAAATTCCCTGTGTTTATCTTGTTGATTCCTTCAATAGCTGAAAC
TGTGGCGAAAGCCCAGCAGCCTCCACATTTTCCTTGATCTCTAATAGGAGTCACAGCACC
TTCTCTCCTCCAGTCCACAGCGGCCGGCACATTGCCTGATGGGTCACAAGCCGGCACATG
ATCGCTGTTTAAACTCGAGGAGGACATGTTCAATCCGAGAAAATTGGCCTTAAACTCAGA
GTTGGTCATGTCAGCAAATCTATTTTCCGCTAAGTTAAAGGTCAAGTGGAGGGAGTTGAC
ATAGTCAATCCACTGGAGATTAGACTGGTATATCCCAAACCTAAACATCCACTCATCCTT
TTCTGCATATGATTTTCCGTGGTATTGAAGCCATTCTCCGAACTGCTTCTTCATCAGGGT
GTTGTGTGGGTTGTACCCAGAAGAATTGACGGAACACAGCCTTGAAGCTATCAGCACAAA
GCAAATCAAAACGACAAGGGTCAGGTTAGCATTTCTTAGTACATTCAACATCTTTGTCTG
TTTTAAGTT
CC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2E978TF 692 0 0
GCA
CCGGTACCATCTGTGGCTGTGTATGGGTAGTCGTCCAAGGCGACTAGTCCACCATTAGCT
ATGAGGTATTCATAAGCTGTTTCCATTAATCCACCACTACACCCTTTGTTGTAACTGCCG
GTATCACAATCTATGAGTTGTTGTTCTGAGAGAGTTACTAAATTCCCTGTGTTTATCTTG
TTGATTCCTTCAATAGCTGAAACTGTGGCGAAAGCCCAGCAGCCTCCACATTTTCCTTGA
TCTCTAATAGGAGTCACAGCACCTTCTCTCCTCCAGTCCACAGCGGCCGGCACATTGCCT
GATGGGTCACAAGCCGGCACATGATCGCTGTTTAAACTCGAGGAGGACATGTTCAATCCG
AGAAAATTGGCCTTAAACTCAGAGTTGGTCATGTCAGCAAATCTATTTTCCGCTAAGTTA
AAGGTCAAGTGGAGGGAGTTGACATAGTCAATCCACTGGAGATTAGACTGGTATATCCCA
AACCTAAACATCCACTCATCCTTTTCTGCATATGATTTTCCGTGGTATTGAAGCCATTCT
CCGAACTGCTTCTTCATCAGGGTGTTGTGTGGGTTGTACCCAGAAGAATTGACGGAACAC
AGCCTTGAAGCTATCAGCACAAAGCAAATCAAAACGACAAGGGTCAGGTTAGCATTTCTT
AGTACATTCAACATCTTTGTCTGTTTT
CC

QA 4 690 4 690
DS 

RD RR2G969TF 689 0 0
ACCATCTGTGGCTGTGTATGGGTAGTCGTCCAAGGCGACAAGTCCACCATTAGCTATGAG
GTATTCATAAGCTGTTTCCATTAATCCACCACTACACCCTTTGTTGTAACTGCCGGTATC
ACAATCTATGAGTTGTTGTTCTGAGAGAGTTACTAAATTCCCTGTGTTTATCTTGTTGAT
TCCTTCAATAGCTGAAACTGTGGCGAAAGCCCAGCAGCCTACACATTTTCCTTGATCTCT
AATAGGAGTCACAGCACCTTCTCTCCTCCAGTCCACAGCGGCCGGCACATTGCCTGATGG
GTCACAAGCCGGCACATGATCGCTGTTTAAACTCGAGGAGGACATGTTCAATCCGAGAAA
ATTGGCCTTAAACTCAGAGTTGGTCATGTCAGCAAATCTATTTTCCGCTAAGTTAAAGGT
CAAGTGGAGGGAGTTGACATAGTCAATCCACTGGAGATTAGACTGGTATATCCCAAACCT
AAACATCCACTCATCCTTTTCTGCATATGATTTTCCGTGGTATTGAAGCCATTCTCCGAA
CTGCTTCTTCATCAGGGTGTTGTGTGGGTTGTACCCAGAAGAATTGACGGAACACAGCCT
TGAAGCTATCAGCACAAAGCAAATCAAAACGACAAGGGTCAGGTTAGCATTTCTTAGTAC
ATTCAACATCTTTGTCTGTTTTAAGTT
CC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2FE82TF 605 0 0
CCACCACTACACCCTTTGTTGTAACTGCCGGTATCACAATCTATGAGTTGTTGTTCTGAG
AGAGTTACTAAATTCCCTGTGTTTATCTTGTTGATTCCTTCAATAGCTGAAACTGTGGCG
AAAGCCCAGCAGCCTCCACATTTTCCTTGATCTCTAATAGGAGTCACAGCACCTTCTCTC
CTCCAGTCCACAGCGGCCGGCACATTGCCTGATGGGTCACAAGCCGGCACATGATCGCTG
TTTAAACTCGAGGAGGACATGTTCAATCCGAGAAAATTGGCCTTAAACTCAGAGTTGGTC
ATGTCAGCAAATCTATTTTCCGCTAAGTTAAAGGTCAAGTGGAGGGAGTTGACATAGTCA
ATCCACTGGAGATTAGACTGGTATATCCCAAACCTAAACATCCACTCATCCTTTTCTGCA
TATGATTTTCCGTGGTATTGAAGCCATTCTCCGAACTGCTTCTTCATCAGGGTGTTGTGT
GGGTTGTACCCAGAAGAATTGACGGAACACAGCCTTGAAGCTATCAGCACAAAGCAAATC
AAAACGACAAGGGTCAGGTTAGCATTTCTTAGTACATTCAACATCTTTGTCTGTTTTAAG
TTGCC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 12

CO CL394Contig1 1167 12 23 U
GGAAATAAAAAGAGTTATAGAATGGATTACTACCTATGCCAAGATCGCGTATAAATGGAA
ATTTTATTGATAAAACCTTTACAATTGTAGCCGATATCTTATTACGAGTCATTCCGACAA
CTTCCGGAGAAAAAGAGGCATTTACTTATTACAGAGATGGTGCGATTTGATTATCATTAT
CATTTTTTTATTTCTCACCGATTTGGAATAAAAAAAACGAGTATTGAAAAAAATCTACGC
TTTTGAAGGTGAAGTTTATAATATAAAAAAGCAATCCCTTCTGTCATGTATCCACGATTA
GTGCAGCCTTAGATGCTTCAATTATGAATTCGAGTATTGAGCAAAAGGTTTTTACCTACG
GTTCCCGTATTACAGATCAATCCTACTAGACTAATACAATATACGAATAGGAGGCACAGG
GGAAGAAGCACTACGCCGAGAAATCAACAACACGAAAACTTTCTTCAAAACGATTCCTTT
TCTTTCTTCTTCTTTGGGATTGGGACTAATTAAAATGGTTGGAACAATAAACATCCATCT
CGTCCGTACTTTGGATACCCGTATAACCATTGAAGACTGTTGAAGTGACTAATTCCTGGA
AATTTAGGGGCGTTGAGAACAAAGAAATTTTTAGAGTTTCCTTTTTTATTTTTATCTAGT
ATGAATCCACTTGGTAGTAAGAAAAGATCTTTTACAAGAAGGTTGGCTAGGGATTTCTTG
TAAAAACATTAGCCCCGCTTAGTTCATAATGACATCAAATTTTTCCATATCCATATATTT
ATTATTTTCATTATGCACCTAAAGGAGGAGCCGTATGAGATGAAAATCTCACATACGGTT
CTGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAATGACGACCGTAACGGATGTCGGCTCAATCTGAA
GGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTGACCCC
TATGATCGAAGTTATATACTCTATAATATAGGCCTTATCCACACAAGTAATGGGGAACAT
ACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCGGGCATTAGAACGAAACCCCTTTTTACCACAAGCT
TTTAATAATATGGCTGTGATCTGTCATTACGTGCGACTATCTCCACTATAGAAAAAAAGA
ACGAACAGCTAGTCAATGAAATACTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 20 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 
25 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 30 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 60 60 45 60 60 60 60 60 25 45 60 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 

AF RR2GS30TF U 1
AF RR2FL53TF U 234
AF RR2BO01TF U 235
AF RR2E104TF U 235
AF RR2B858TF U 273
AF RR2B858JQ C 284
AF RR2FL53JQ C 508
AF RR2GS30JQB C 430
AF RR2BO01JQ C 569
AF RR2FU07JQ C 768
AF RR2FU07TF U 768
AF RR2E104JQ C 595
BS 1 325 RR2GS30TF
BS 326 326 RR2FL53TF
BS 327 375 RR2GS30TF
BS 376 376 RR2FL53TF
BS 377 699 RR2GS30TF
BS 700 878 RR2FL53TF
BS 879 879 RR2BO01TF
BS 880 900 RR2FL53TF
BS 901 901 RR2B858TF
BS 902 959 RR2FL53TF
BS 960 960 RR2BO01TF
BS 961 972 RR2FL53TF
BS 973 973 RR2B858TF
BS 974 983 RR2FL53TF
BS 984 991 RR2BO01TF
BS 992 992 RR2FU07TF
BS 993 993 RR2E104TF
BS 994 994 RR2BO01TF
BS 995 999 RR2E104TF
BS 1000 1000 RR2B858TF
BS 1001 1016 RR2E104TF
BS 1017 1042 RR2B858TF
BS 1043 1167 RR2FU07TF

RD RR2GS30TF 699 0 0
GGAAATAAAAAGAGTTATAGAATGGATTACTACCTATGCCAAGATCGCGTATAAATGGAA
ATTTTATTGATAAAACCTTTACAATTGTAGCCGATATCTTATTACGAGTCATTCCGACAA
CTTCCGGAGAAAAAGAGGCATTTACTTATTACAGAGATGGTGCGATTTGATTATCATTAT
CATTTTTTTATTTCTCACCGATTTGGAATAAAAAAAACGAGTATTGAAAAAAATCTACGC
TTTTGAAGGTGAAGTTTATAATATAAAAAAGCAATCCCTTCTGTCATGTATCCACGATTA
GTGCAGCCTTAGATGCTTCAATTATTAATTCGAGTATTGAGCAAAAGGTTTTTACCTACG
GTTCCCGTATTACAGGTCAATCCTACTAGACTAATACAATATACGAATAGGAGGCACAGG
GGAAGAAGCACTACGCCGAGAAATCAACAACACGAAAACTTTCTTCAAAACGATTCCTTT
TCTTTCTTCTTCTTTGGGATTGGGACTAATTAAAATGGTTGGAACAATAAACATCCATCT
CGTCCGTACTTTGGATACCCGTATAACCATTGAAGACTGTTGAAGTGACTAATTCCTGGA
AATTTAGGGGCGTTGAGAACAAAGAAATTTTTAGAGTTTCCTTTTTTATTTTTATCTAGT
ATGAATCCACTTGGTAGTAAGAAAAGATCTTTTACAAGA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2FL53TF 750 0 0
GC
TACGCTTTTGAAGGTGAAGTTTATAATATAAAAAAGCAATCCCTTCTGTCATGTATCCAC
GATTAGTGCAGCCTTAGATGCTTCAATTATGAATTCGAGTATTGAGCAAAAGGTTTTTAC
CTACGGTTCCCGTATTACAGATCAATCCTACTAGACTAATACAATATACGAATAGGAGGC
ACAGGGGAAGAAGCACTACGCCGAGAAATCAACAACACGAAAACTTTCTTCAAAACGATT
CCTTTTCTTTCTTCTTCTTTGGGATTGGGACTAATTAAAATGGTTGGAACAATAAACATC
CACCTCGTCCGTACTTTGGATACCCGTATAACCATTGAAGACTGTTGAAGTGACTAATTC
CTGGAAATTTAGGGGCGTTGAGAACAAAGAAATTTTTAGAGTTTCCTTTTTTATTTTTAT
CTAGTATGAATCCACTTGGTAGTAAGAAAAGATCTTTTACAATAAGGTTGGCTAGGGATT
TCTTGTAAAAACATTAGCCCCGCTTAGTTCATAATGACATCAAATTTTTCCATATCCATA
TATTTATTATTTTCATTATGCACCTAAAGGAGGAGCCGTATGAGATGAAAATCTCACATA
CGGTTCTGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAATGACGACCGTAGCGGATGTCGGCTCAAT
CTGAA*GAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTG
ACCC*TATGATCGAAGT*ATATACTCTA

QA 3 750 3 750
DS 

RD RR2BO01TF 761 0 0
G
TACGCTTTTGAAGGTGAAGTTTATAATATAAAAAAGCAATCCCTTCTGTCATGTATCCAC
GATTAGTGCAGCCTTAGATGCTTCAATTATGAATTCGAGTATTGAGCAAAAGGTTTTTAC
CTACGGTTCCCGTATTACAGATCAATCCTACTAGACTAATACAATGTACGAATAGGAGGC
ACAGGGGAAGAAGCACTACGCCGAGAAATCAACAACACGAAAACTTTCTTCAAAACGATT
CCTTTTCTTTCTTCTTCTTTGGGATTGGGACTAATTAAAATGGTTGGAACAATAAACATC
CATCTCGTCCGTACTTTGGATACCCGTATAACCATTGAAGACTGTTGAAGTGACTAATTC
CTGGAAATTTAGGGGCGTTGAGAACAAAGAAATTTTTAGAGTTTCCTTTTTTATTTTTAT
CTAGTATGAATCCACTTGGTAGTAAGAAAAGATCTTTTACAAGAAGGTTGGCTAGGGATT
TCTTGTAAAAACATTAGCCCCGCTTAGTTCATAATGACATCAAATTTTTCCATATCCATA
TATTTATTATTTTCATTATGCACCTAAAGGAGGAGCCGTATGAGATGAAAATCTCACATA
CGGTTCTGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAATGACGACCGTAACGGATGTCGGCTCAAT
CTGAA*GGAATTATGCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTG
ACCCCTATGATCGAAGT*ATATACTCTATAATATAG*GC
T

QA 2 760 2 760
DS 

RD RR2E104TF 789 0 0
G
TACGCTTTTGAAGGTGAAGTTTATAATATAAAAAAGCAATCCCTTCTGTCATGTATCCAC
GATTAGTGCAGCCTTAGATGCTTCAATTATGAATTCGAGTATTGAGCAAAAGGTTTTTAC
CTACGGTTCCCGTATTACAGATCAATCCTACTAGACTAATACAATATACGAATAGGAGGC
ACAGGGGAAGAAGCACTACGCCGAGAAATCAACAACACGAAAACTTTCTTCAAAACGATT
CCTTTTCTTTCTTCTTCTTTGGGATTGGGACTAATTAAAATGGTTGGAACAACAAACATC
CATCTCGTCCGTACTTTGGATACCCGTATAACCATTGAAGACTGTTGAAGTGACTAATTC
CTGGAAATTTAGGGGCGTTGAGAACAAAGAAATTTTTAGAGTTTCCTTTTTTATTTTTAT
CTAGTATGAATCCACTTGGTAGTAAGAAAAGATCTTTTACAAGAAGGTTGGCTAGGGATT
TCTTGTAAAAACATTAGCCCCGCTTAGTTCATAATGACATCAAATTTTTCCATATCCATA
TATTTATTATTTTCATTATGCACCTAAAGGAGGAGCCGTATGAGATGAAAATCTCACATA
CGGTTCTGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAATGACGACCGTAACGGATGTCGGCTCAAT
CTGAAAGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTG
ACCCCTATGATCGAAGT*ATATACTCTATA*TATAG*CCTTATC*ACACAAGTAATGGGG
A
CATACAA

QA 2 782 2 782
DS 

RD RR2B858TF 770 0 0
G
ATCCCTTCTGTCATGTATCCACGATTAGTGCAGCCTTAGATGCTTCAATTATGAATTCGA
GTATTGAGCAAAAGGTTTTTACCTACGGTTCCCGTATTACAAATCAATCCTACTAGACTA
ATACAATATACGAATAGGAGGCACAGGGGAAGAAGCACTACGCCGAGAAATCAACAACAC
GAAAACTTTCTTCAAAACGATTCCTTTTCTTTCTTCTTCTTTGGGATTGGGACTAATTAA
AATGGTTGGAACAATAAACATCCATCTCGTCCGTACTTTGGATACCCGTATAACCATTGA
AGACTGTTGAAGTGACTAATTCCTGGAAATTTAGGGGCGTTGAGAACAAAGAAATTTTTA
GAGTTTCCTTTTTTATTTTTATCTAGTATGAATCCACTTGGTAGTAAGAAAAGATCTTTT
ACAAGAAGGTTGGCTAGGGATTTCTTGTAAAAACATTAGCCCCGCTTAGTTCATAATGAC
ATCAAATTTTTCCATATCCATATATTTATTATTTTCATTATGCACCTAAAGGAGGAGCCG
TATGAGATGAAAATCTCACATACGGTTCTGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAATGACGA
CCGTAACGGATGTCGGCTCAATCTGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATTATTAT
GAAGCTATGCGACTAGAAATTGACCCCTATGATCGAAGTTATATACTCTATAATATAG*C
CTTATCCACACAAGTAATGGGGAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATT

QA 2 770 2 770
DS 

RD RR2B858JQ 848 0 0
TCATGTATCCACGATTAGTGCAGC*TTAGATGCTTCAATTATGAATTCGAGTATTGAGCA
AAAGGTTTTA**CTACGGTTCCCGTATTACAAATCAATCCTACTAGACTAATACAATATA
CGAATAGGAGGCACAGGGGAAGAAGCACTACGCCGAGAAATCAACAACACGAAAACTTTC
TTCAAAACGATTCCTTTTCTTTCTTCTTCTTTGGGATTGGGACTAATTAAAATGGTTGGA
ACAATAAACATCCATCTCGTCCGTACTTTGGATACCCGTATAACCATTGAAGACTGTTGA
AGTGACTAATTCCTGGAAATTTAGGGGCGTTGAGAACAAAGAAATTTTTAGAGTTTCCTT
TTTTATTTTTATCTAGTATGAATCCACTTGGTAGTAAGAAAAGATCTTTTACAAGAAGGT
TGGCTAGGGATTTCTTGTAAAAACATTAGCCCCGCTTAGTTCATAATGACATCAAATTTT
TCCATATCCATATATTTATTATTTTCATTATGCACCTAAAGGAGGAGCCGTATGAGATGA
AAATCTCACATACGGTTTTGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAATGACGACCGTAACGGA
TGTCGGCTCAATTTGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTATGC
GACTAGAAATTGACCCCTATGATCGAAGTTATATACTCTATAATATAGGCCTTATCCACA
CAAGTAATGGGGAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCGGGCATTAGAACGAAACC
CCTTTTTACCCCAAGCTTTTAATAATATGGCTGTGATCTGTCATTACGTGCGACTATCTC
CACTATAG

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR2FL53JQ 609 0 0
AATTAAAATGGTTGGAACAATAAACATCCACCTCGTCCGTACTTTGGATACCCGTATAAC
CATTGAAGACTGTTGAAGTGACTAATTCCTGGAAATTTAGGGGCGTTGAGAACAAAGAAA
TTTTTAGAGTTTCCTTTTTTATTTTTATCTAGTATGAATCCACTTGGTAGTAAGAAAAGA
TCTTTTACAATAAGGTTGGCTAGGGATTTTTTGTAAAAACATTAGCCCCGCTTAGTTCAT
AATGACATCAAATTTTTCCATATCCATATATTTATTATTTTCATTATGCACCTAAAGGAG
GAGCCGTATGAGATGAAAATTTCACATACGGTTTTGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAA
TGACGACCGTAGCGGATGTCGGCTCAATTTGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAAT
TATTATGAAGCTATGGGACTAGAAATTGACCCCTATGATTGAAGTTATATACTTTATAAT
ATAGGCCTTATCCACACAAGTAATGGGGAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCGG
GCATTAGAACGAAACCCCTTTTTACCACGAGCTTTTAATAATATGGCTGTAATCTGTCAT
TACGTG
GGA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2GS30JQB 736 0 0
ACTACGCCGAGAAATCAACAACACGAAAACTTTCTTCAAAACGATTCCTTTTCTTTCTTC
TTCTTTGGGATTGGGACTAATTAAAATGGTTGGAACAATAAACATCCATCTCGTCCGTAC
TTTGGATACCCGTATAACCATTGAAGACTGTTGAAGTGACTAATTCCTGGAAATTTAGGG
GCGTTGAGAACAAAGAAATTTTTAGAGTTTCCTTTTTTATTTTTATCTAGTATGAATCCA
CTTGGTAGTAAGAAAAGATCTTTTACAAGAAGGTTGGCTAGGGATTTCTTGTAAAAACAT
TAGCCCCGCTTAGTTCATAATGACATCAAATTTTTCCATATCCACATATTTATTATTTTC
ATTATGCACCTAAAGGAGGAGCCGTATGAGATGAAAATCTCACATACGGTTCTGAAACGG
AGAATTCGTTAAAGCGAATGACGACCGTAACGGATGTCGGCTCAATCTGAAGGAAATTAT
GCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTGACCCCTATGATCGA
AGTTATATACTCTATAATATAGGCCTTATCCACACAAGTAATGGGGAACATACCAAAGCT
TTAGAATATTATTTTCGGGCATTAGAACGAAACCCCTTTTTACCACAAGCTTTTAATAAT
ATGGCTGTGATCTGTCATTACGTGCGACTATCTCCACTATAGAAAAAAAGAACGAACAGC
TAGTCAATGAAATACT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2BO01JQ 599 0 0
ATTGAAGACTGTTGAAGTGACTAATTCCTGGAAATTTAGGGGCGTTGAGAACAAAGAAAT
TTTTAGAGTTTCCTTTTTTATTTTTATCTAGTATGAATCCACTTGGTAGTAAGAAAAGAT
CTTTTACAAGAAGGTTGGCTAGGGATTTCTTGTAAAAACATTAGCCCCGCTTAGTTCATA
ATGACATCAAATTTTTCCATATCCATATATTTATTATTTTCATTATGCACCTAAAGGAGG
AGCCGTATGAGATGAAAATCTCACATACGGTTCTGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAAT
GACGACCGTAACGGATGTCGGCTCAATCTGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATT
ATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTGACCCCTATGATCGAAGTTATATACTCTATAATA
TAGGCCTTATCCACACAAGTAATGGGGAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCGGG
CATTAGAACGAAACCCCTTTTTACCACAAGCTTTTAATAATATGGCTGTGATCTGTCATT
ACGTGCGACTATCTCCACTATAGAAAAAAAGAACGAACAGCTAGTCAATGAAATACTAG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2FU07JQ 400 0 0
G
ATCCATATATTTATTATTTTCATTATACACCTAAAGGAGGAGCCGTATGAGATGAAAATC
TCACATACGGTTCTGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAATGACGACCGTAACGGATGTCG
GCTCAATCTGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTATGCGACTA
GAAATTGACCCCTATGATCGAAGTTATATACTCTATAATATAGGCCTTATCCACACAAGT
AATGGGGAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCGGGCATTAGAACGAAACCCCTTT
TTACCACAAGCTTTTAATAATATGGCTGTGATCTGTCATTACGTGCGACTATCTCCACTA
TAGAAAAAAAGAACGAACAGCTAGTCAATGAAATACTAG

QA 2 400 2 400
DS 

RD RR2FU07TF 400 0 0
G
ATCCATATATTTATTATTTTCATTATACACCTAAAGGAGGAGCCGTATGAGATGAAAATC
TCACATACGGTTCTGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAATGACGACCGTAACGGATGTCG
GCTCAATCTGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTATGCGACTA
GAAATTGACCCCTATGATCGAAGTTATATACTCTATAATATAGGCCTTATCCACACAAGT
AATGGGGAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCGGGCATTAGAACGAAACCCCTTT
TTACCACAAGCTTTTAATAATATGGCTGTGATCTGTCATTACGTGCGACTATCTCCACTA
TAGAAAAAAAGAACGAACAGCTAGTCAATGAAATACTAG

QA 2 400 2 400
DS 

RD RR2E104JQ 573 0 0
CCTGGAAATTTAGGGGCGTTGAGAACAAAGAAATTTTTAGAGTTTCCTTTTTTATTTTTA
TCTAGTATGAATCCACTTGGTAGTAAGAAAAGATCTTTTACAAGAAGGTTGGCTAGGGAT
TTCTTGTAAAAACATTAGCCCCGCTTAGTTCATAATGACATCAAATTTTTCCATATCCAT
ATATTTATTATTTTCATTATGCACCTAAAGGAGGAGCCGTATGAGATGAAAATCTCACAT
ACGGTTCTGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGAATGACGACCGTAACGGATGTCGGCTCAA
TCTGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAATTATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATT
GACCCCTATGATCGAAGTTATATACTCTATAATATAGGCCTTATCCACACAAGTAATGGG
GAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCGGGCATTAGAACGAAACCCCTTTTTACCA
CAAGCTTTTAATAATATGGCTGTGATCTGTCATTACGTGCGACTATCTCCACTATAGAAA
AAAAGAACGAACAGCTAGTCAATGAAATACTAG

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 9

CO CL395Contig1 1362 9 25 U
GGAGCCTCAAAGGACATCGTGAAAAACAGAACACGATCGCTTTAAGGCTCAAAGTCGAGT
TCATCGAAAGTTTTCAGACAGAAGCTAGAGATGGAAGTTTCCGGCGTCGTTCTCCGACAG
ATTCCGTGCGTCTCAAGCTCCGTCACCGATTGCCGTTTCTCCGGTCTCCGATTTTCCGGC
AACACGAGGACGACGACGGTCGGATTTCGGACGAGGAGATTCAGAGGAATCATGTGTGAT
AACGAGTTTTCCGATAAAGGGCACATGAGTTACTATTCTGGGACGACGACGACGAGATGC
GGCGGTGAGGGGAAGGATAAGGTGAAGGTTATGGAGAAGGAGAAGAAGAAGGAGATGAAG
AAGAAAGCTAAGGTTCTTAAAGCTCTTTCTAAGAACTTGAATATGTTTTCAAGCATAGGG
TTTGGTCTTGATCCAGAGGCCGGTTTGGTTGCTGAGATTCAGAACAAGACAATCTCGGAA
GCAACGGAGATTCTGGTTAAGCAGCTGGATCAGTTGAAAGCAGAGGAGAAGCTGTTGAAG
AAACAGAGAAAAGAAGAAAAGGCAAAAGCTAAAGCTTTGAAGATGATGACTGAGATGGAC
TCTGAATCTTCTTCTTCTTCGTCTGAATCAAGTGACAGTGATTGTGGGAAAGGGAAAGTT
GTTGACATGAGCTCTTTCAGAAACAAGGCGATTCTTGAGCCGTTACAACCAGAGTCTGGA
GTAGCAACCCTTCCTAGAATCCAAGAAGATTCTTGCAAGAACACCGGTGAAGCGTTGAAG
CTCGCTCTGCTGCAATCAGCTGCTGCATCCACGGCCTTTCCCTCAATTGTTAATCCTGGA
TTGCCATTGAAGACGGTGGAAGCAGTTCCTGTTGTTGGATTGCCGTCGAAGAGAGTAGAA
GTCTGTATGGGAGGAAAGTGCAAGAAATCAGGAGGAGCTGTGTTGTTGGATGAGTTTCAG
AAGGCGATGACGGGGATGGAAGGATCTGCTGTGGCATGCAAGTGCATGGGGAAGTGTAGA
GATGGTCCAAACGTTAGAGTGGTGAACGAGACCGATGCTGTGATGACGGATTCAGTTAGA
ACACCTTCCAAGACCGTTTGTGTAGGAGTTGGGTTGCAGGATGTGGAAACTATTGTCACA
AGTTTTTTTGGTGAATAATGCAGGAGAGAAGGTTTTGGATCATGCCTCGTATGG*AAAGT
GTTTAAACATATGATCAAATTGATATATGCATAGTGTGGTGTTCTTTTTCTCATTGTACA
TAAATGTCTTCGTGTGCATTTTCGAGTGGAACATTGATAATATAAACCTCTTTTCTGTAC
TTTGGTCTTGACAAAGAAACCTACGTTGCAATATGGCTAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 15 0 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN03TF U 1
AF RR2EG22TF U 19
AF RR2E274TF U 49
AF RR2AB88TF U 75
AF RR2CN08JQ C 452
AF RR2BI85TF U 561
AF RR2AB88JQ C 619
AF RR2EG22JQ C 647
AF RR2E274JQ C 789
BS 1 231 RR2AN03TF
BS 232 232 RR2EG22TF
BS 233 562 RR2AN03TF
BS 563 563 RR2EG22TF
BS 564 683 RR2AN03TF
BS 684 687 RR2E274TF
BS 688 688 RR2AB88TF
BS 689 746 RR2E274TF
BS 747 747 RR2AB88TF
BS 748 749 RR2BI85TF
BS 750 757 RR2E274TF
BS 758 760 RR2AB88TF
BS 761 794 RR2E274TF
BS 795 795 RR2AB88TF
BS 796 809 RR2E274TF
BS 810 843 RR2AB88TF
BS 844 848 RR2BI85TF
BS 849 849 RR2CN08JQ
BS 850 910 RR2BI85TF
BS 911 911 RR2CN08JQ
BS 912 1194 RR2BI85TF
BS 1195 1195 RR2CN08JQ
BS 1196 1315 RR2BI85TF
BS 1316 1317 RR2AB88JQ
BS 1318 1362 RR2E274JQ

RD RR2AN03TF 683 0 0
GGAGCCTCAAAGGACATCGTGAAAAACAGAACACGATCGCTTTAAGGCTCAAAGTCGAGT
TCATCGAAAGTTTTCAGACAGAAGCTAGAGATGGAAGTTTCCGGCGTCGTTCTCCGACAG
ATTCCGTGCGTCTCAAGCTCCGTCACCGATTGCCGTTTCTCCGGTCTCCGATTTTCCGGC
AACACGAGGACGACGACGGTCGGATTTCGGACGAGGAGATTCAGAGGAATCGTGTGTGAT
AACGAGTTTTCCGATAAAGGGCACATGAGTTACTATTCTGGGACGACGACGACGAGATGC
GGCGGTGAGGGGAAGGATAAGGTGAAGGTTATGGAGAAGGAGAAGAAGAAGGAGATGAAG
AAGAAAGCTAAGGTTCTTAAAGCTCTTTCTAAGAACTTGAATATGTTTTCAAGCATAGGG
TTTGGTCTTGATCCAGAGGCCGGTTTGGTTGCTGAGATTCAGAACAAGACAATCTCGGAA
GCAACGGAGATTCTGGTTAAGCAGCTGGATCAGTTGAAAGCAGAGGAGAAGCTGTTGAAG
AAACAGAGAAAAGAAGAAAAGGTAAAAGCTAAAGCTTTGAAGATGATGACTGAGATGGAC
TCTGAATCTTCTTCTTCTTCGTCTGAATCAAGTGACAGTGATTGTGGGAAAGGGAAAGTT
GTTGACATGAGCTCTTTCAGAAA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2EG22TF 665 0 0
GG
GAAAAACAGAACACGATCGCTTTAAGGCTCAAAGTCGAGTTCATCGAAAGTTTTCAGACA
GAAGCTAGAGATGGAAGTTTCCGGCGTCGTTCTCCGACAGATTCCGTGCGTCTCAAGCTC
CGTCACCGATTGCCGTTTCTCCGGTCTCCGATTTTCCGGCAACACGAGGACGACGACGGT
CGGATTTCGGACGAGGAGATTCAGAGGAATCAT*TGTGATAACGAGTTTTCCGATAAAGG
GCACATGAGTTACTATTCTGGGACGACGACGACGAGATGCGGCGGTGAGGGGAAGGATAA
GGTGAAGGTTATGGAGAAGGAGAAGAAGGAGGAGATGAAGAAGAAAGCTAAGGTTCTTAA
AGCTCTTTCTAAGAACTTGAATATGTTTTCAAGCATAGGGTTTGGTCTTGATCCAGAGGC
CGGTTTGGTTGCTGAGATTCGGAACAAGACAATCTCGGAAGCAACGGAGATTCTGGTTAA
GCAGCTGGATCAGTTGAAAGCAGAGGAGAAGCTGTTGAAGAAACAGAGAAAAGAAGAAAA
GGCAAAAGCTAAAGCTTTGAAGATGATGACTGAGATGGACTCTGAATCTTCTTCTTCTTC
GTCTGAATCAAGTGACAGTGATTGTGGGAAAGGGAAAATTGTTGACATGAGCTCTTTCAG
AAA

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR2E274TF 762 0 0
GG
AAAGTCGAGTTCATCGAAAGTTTTCAGACAGAAGCTAGAGATGGAAGTTTCCGGCGTCGT
TCTCCGACAGATTCCGTGCGTCTCAAGCTCCGTCACCGATTGCCGTTTCTCCGGTCTCCG
ATTTTCCGGCAACACGAGGACGACGACGGTCGGATTTCGGACGAGGAGATTCAGAGGAAT
CATGTGTGATAACGAGTTTTCCGATAAAGGGCACATGAGTTACTATTCTGGGACGACGAC
GACGAGATGCGGCGGTGAGGGGAAGGATAAGGTGAAGGTTATGGAGAGGGAGAAGAAGAA
GGAGATGAAGAAGAAAGCTAAGGTTCTTAAAGCTCTTTCTAAGAACTTGAATATGTTTTC
AAGCATAGGGTTTGGTCTTGATCCAGAGGCCGGTTTGGTTGCTGAGATTCAGAACAAGAC
AATCTCGGAAGCAACGGAGATTCTGGTTAAGCAGCTGGATCAGTTGAAAGCAGAGGAGAA
GCTGTTGAAGAAACAGAGAAAAGAAGAAAAGGCAAAAGCTAAAGCTTTGAAGATGATGAC
TGAGATGGACTCTGAATCTTCTTCTTCTTCGTCTGAATCAAGTGACAGTGATTGTGGGAA
AGGGAAAGTTGTTGACATGAGCTCTTTCAGAAACAAG*CGATTCTTGAGCCGTTACAACC
AGAGTCTGGAGTAGCAACCCTTCCTAGAATCCAAGAGA*TTCTTGCA**GACACCGGTGA
AGCGTTGAAGCTCGCTCTGCTGCA*TCAGCTGCTGCATC
A

QA 3 761 3 761
DS 

RD RR2AB88TF 769 0 0
G
AGACAGAAGCTAGAGATGGAAGTTTCCGGCGTCGTTCTCCGACAGATTCCGTGCGTCTCA
AGCTCCGTCACCGATTGCCGTTTCTCCGGTCTCCGATTTTCCGGCAACACGAGGACGACG
ACGGTCGGATTTCGGACGAGGAGATTCAGAGGAATCATGTGTGATAACGAGTTTTCCGAT
AAAGGGCACATGAGTTACTATTCTGGGACGACGACGACGAGATGCGGCGGTGAGGGGAAG
GATAAGGTGAAGGTTATGGAGAAGGAGAAGAAGAAGGAGATGAAGAAGAAAGCTAAGGTT
CTTAAAGCTCTTTCTAAGAACTTGAATATGTTTTCAAGCATAGGGTTTGGTCTTGATCCA
GAGGCCGGTTTGGTTGCTGAGATTCAGAACAAGACAATCTCGGAAGCAACGGAGATTCTG
GTTAAGCAGCTGGATCAGTTGAAAGCAGAGGAGAAGCTGTTGAAGAAACAGAGAAAAGAA
GAAAAGGCAAAAGCTAAAGCTTTGAAGATGATGACCTAGATGGACTCTGAATCTTCTTCT
TCTTCGTCTGAATCAAGTGACAGTGATTGTGGGAAAGGGAAAGTTGTTGACATGAGCTCT
TTCAGAAACAAGGCGATTCTTGAGCCGTTACAACCAGAGTCTGGAGTAGCAACCCTTCCT
AGAATCCAAGAAAGTTCTTGCAAGAACACCGGTGAGGCGTTGAAGCTCGCTCTGCTGCAA
TCAGCTGCTGCATCCACGGCCTTTCCCTCAATTGTTAATCCTGGATTG

QA 2 769 2 769
DS 

RD RR2CN08JQ 801 0 0
CTGAGATTCAGAACAAGACAATCTCGGAAGCAACGGAGATTCTGGTTAAGCAGCTGGATC
AGTTGAAAGCAGAGGAGAAGCTGTTGAAGAAACAGAGAAAAGAAGAAAAGGCAAAAGCTA
AAGCTTTGAAGATGATGACTGAGATGGACTCTGAATCTTCTTCTTCTTCGTCTGAATCAA
GTGACAGTGATTGTGGGAAAGGGAAAGTTGTTGACATGAGCTCTTTCAGAAACAAGGCGA
TTCTTGAGCCGTTACAACCAGAGTCTGGAGTAGCAACCCTTCCTAGAATCCAAGAAGATT
CTTGCAAGAACACCGGTGAAGCGTTGAAGCTCGCTCTGCTGCAATCAGCTGCTGCATCCA
CGGCCTTTCCCTCAATTGTTAATCCTGGATTGCCATTGAAGACGGTGGAAGCAGTTCCTG
TTGTTGGATTGCCGTCGAAGAGAGTAGAAGTCTGTATGGGAGGAAAGTGCAAGAAATCAG
GAGGAGCTGTGTTGTTGGATGATTTTCAGAAGGCGATGACGGGGATGGAAGGATCTGCTG
TGGCATGCAAGTGCATGGGGAAGTGTAGAGATGGTCCAAACGTTAGAGTGGTGAACGAGA
CCGATGCTGTGATGACGGATTCAGTTAGAACACCTTCCAAGACCGTTTGTGTAGGAGTTG
GGTTGCAGGATGTGGAAACTATTGTCACAAGTTTTTTTGGTGAATAATGCAGGAGAGAAG
GTTTTGGATCATGCCTCGTATGG*AAAGTGTTTAAACATATGATCAAATTGATATATGCA
TAGTGTGGTGTTCTTTTTC
CC

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2BI85TF 755 0 0
GGCAAAAGCTAAAGCTTTGAAGATGATGACTGAGATGGACTCTGAATCTTCTTCTTCTTC
GTCTGAATCAAGTGACAGTGATTGTGGGAAAGGGAAAGTTGTTGACATGAGCTCTTTCAG
AAACAAGGCGATTCTTGAGCCGTTACAACCAGAGTCTGGAGTAGCAACCCTTCCTAGAAT
CCAAGAAGATTCTTGCAAGAACACCGGTGAAGCGTTGAAGCTCGCTCTGCTGCAATCAGC
TGCTGCATCCACGGCCTTTCCCTCAATTGTTAATCCTGGATTGCCATTAAAGACGGTGGA
AGCAGTTCCTGTTGTTGGATTGCCGTCGAAGAGAGTAGAAGTCTGTATGGTAGGAAAGTG
CAAGAAATCAGGAGGAGCTGTGTTGTTGGATGAGTTTCAGAAGGCGATGACGGGGATGGA
AGGATCTGCTGTGGCATGCAAGTGCATGGGGAAGTGTAGAGATGGTCCAAACGTTAGAGT
GGTGAACGAGACCGATGCTGTGATGACGGATTCAGTTAGAACACCTTCCAAGACCGTTTG
TGTAGGAGTTGGGTTGCAGGATGTGGAAACTATTGTCACAAGTTTTTTTGGTGAATAATG
CAGGAGAGAAGGTTTTGGATCATGCCTCGTATGGGAAAGTGTTTAAACATATGATCAAAT
TGATATATGCATAGTGTGGTGTTCTTTTTCTCATTGTACATAAATGTCTTCGTGTGCATT
TTCGAGTGGAACATTGATAATATAAACCTCTTTTC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2AB88JQ 700 0 0
TCGTCTGAATCAAGTGACAGTGATTGTGGGAAAGGGAAAGTTGTTGACATGAGCTCTTTC
AGAAACAAGGCGATTCTTGAGCCGTTACAACCAGAGTCTGGAGTAGCAACCCTTCCTAGA
ATCCAAGAAGGTTCTTGCAAGAACACCGGTGAGGCGTTGAAGCTCGCTTTGCTGCAATCA
GCTGCTGCATCCACGGCCTTTCCCTCAATTGTTAATCCTGGATTGCCATTGAAGACGGTG
GAGGCAGTTCCTGTTGTTGGATTGCCGTCGAAGAGAGTAGAAGTCTGTATGGGAGGAAAG
TGCAAGAAATCAGGAGGAGCTGTGTTGTTGGATGAGTTTCAGAAGGCGATGACGGGGATG
GAAGGATTTGCTGTGGCATGCAAGTGCATGGGGAAGTGTAGAGATGGTCCAAACGTTAGA
GTGGTGAACGAGACCGATGCTGTGATGACGGATTCAGTTAGAACCCCTTCCAAGACCGTT
TGTGTAGGAGTTGGGTTGCAGGATGTGGAAACTATTGTCACAAGTTTTTTTGGTGAATAA
TGCAGGAGAGAAGGTTTTGGATCATGCCTCGTATGG*AAAGTGTTTAAACATATGATCAA
ATTGATATATGCATAGTGTGGTGTTCTTTTTCTCATTGTACATAAATGTCTTCGTGTGCA
TTTTCGAGTGGAACATTGATAATATAAACCTCTTTTCTG
T

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2EG22JQ 672 0 0
GGAAAGGGAAAATTGTTGACATGAGCTCTTTCAGAAACAAGGCGATTCTTGAGCCGTTAC
AACCAGAGTCTGGAGTAGCAACCCTTCCTAGAATCCAAGAAGATTCTTGCAAGAACACCG
GTGAAGCGTTGAAGCTCGCTCTGCTGCAATCAGCTGCTGCATCCACGGCCTTTCCCTCAA
TTGTTAATCCTGGATTGCCATTGAAGACGGTGGAAGCAGTTCCTGTTGTTGGATTGCCGT
CGAAGAGAGTAGAAGTCTGTATGGGAGGAAAGTGCAAGAAATCAGGAGGAGCTGTGTTGT
TGGATGAGTTTCAGAAGGCGATGACGGGGATGGAAGGATCTGCTGTGGCATGCAAGTGCA
TGGGGAAGTGTAGAGATGGTCCAAACGTTAGAGTGGTGAACGGGACCGATGCTGTGATGA
CGGATTCAGTTAGAACACCTTCCAAGACCGTTTGTGTAGGAGTTGGGTTGCAGGATGTGG
AAACTATTGTCACAAGTTTTTTTGGTGAATAATGCAGGAGAGAAGGTTTTGGATCATGCC
TCGTATGG*AAAGTGTTTAAACATATGATCAAATTGATATATGCATAGTGTGGTGTTCTT
TTTCTCATTGTACATAAATGTCTTCGTGTGCATTTTCGAGTGGAACATTGATAATATAAA
CCTCTTTTCTG
T

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2E274JQ 574 0 0
GCTGCAATCAGCTGCTGCATCCACGGCCTTTCCCTCAATTGTTAATCCTGGATTGCCATT
GAAGACGGTGGAAGCAGTTCCTGTTGTTGGATTGCCGTCGAAGAGAGTAGAAGTCTGTAT
GGGAGGAAAGTGCAAGAAATCAGGAGGAGCTGTGTTGTTGGATGAGTTTCAGAAGGCGAT
GACGGGGATGGAAGGATCTGCTGTGGCATGCAAGTGCATGGGGAAGTGTAGAGATGGTCC
AAACGTTAGAGTGGTGAACGAGACCGATGCTGTGATGACGGATTCAGTTAGAACACCTTC
CAAGACCGTTTGTGTAGGAGTTGGGTTGCAGGATGTGGAAACTATTGTCACAAGTTTTTT
TGGTGAATAATGCAGGAGAGAAGGTTTTGGATCATGCCTCGTATGG*AAAGTGTTTAAAC
ATATGATCAAATTGATATATGCATAGTGTGGTGTTCTTTTTCTCATTGTACATAAATGTC
TTCGTGTGCATTTTCGAGTGGAACATTGATAATATAAACCTCTTTTCTGTACTTTGGTCT
TGACAAAGAAACCTACGTTGCAATATGGCTAACG

QA 1 574 1 574
DS 



AS 2 11

CO CL396Contig1 1288 2 2 U
GGGGAACTAAAAGGGTTTTCAGTGGACTATCCTAACGATAGTATTACGGCCGTTAGTGGA
ACCTACAAACATATTTTCACCTATGATACGACTCTCATCACATCGCTTTACTTCACAACC
TCCAAAGGATTTACCTCTCCGTTATTCGACATCGACAGTGAGAAGAGGGAACAGAATTCG
AGTTCAAAGGTGAAAATGGTGGAAAACTTATTGGGTTCCATGGACGTGGTGGTAATGCCA
TTGATGCCATTGGAGCATACTTTGACACCGGTTCACGAGATGGTGATGCGGGCAAGCCTA
GTACCAACGATCCGAAACCTAAACCTGTTGATGTCCCCGGGAAGAAGGGACCGCTCGGTG
GTGAAAAGGGAAATGTATTCGACGATGTTGGTTTCGAAGGTGTGAAGAAAGTAACTGTCG
GAGCAGATGACTATAGCATTACTTATATCAAGATCGAATACTTAAAGGACGGCAAAGTTG
AGATCCTTGAGCACGGGACAGCTCGCGGGAAGCTAGAAGAGTTTTCGGTTGACTATCCAA
ACGATAGTATCACGGAAGTTGGTGGAAGCTACAAAAAAGTTTACAACTATGACACCACGC
TCATCACATCGCTTTACTTCACAACCTCCAAAGGTTACACCTCTCCGTTCTTCGGCAAGA
AGTATGATACGGCAACAGAGTTCGAGTTCAAAGGTGAAAATGGAGGCAAGCTTATAGGAT
TCCATGGACGTGGTGGGAATGCTATTGATGCCATCGGAGCTTATTTCGACACCGGCTCTG
GTGGCCCTGACGGCAGTGGAGGTGGATCCAACAGCGGTTCTAGTCCTCAAAAACTTGACG
CACAAGGAGGCAAGGGAGGCAACCAATGGGACGACAGTGGTGATCACGATGGTGTGACCA
AGATACATGTTGCAGTTGGTCGAGCGATTGAACAAACCAGGTTCGATTATGTCGAGAAGG
GACAGATAAAGGAAGGAACCGCCCATGGTGTGAAAGGAGCTAGATCTTCCATCAAAACTT
TTGAGATAAGTCATCCCGACGAGTACCTCGTCTCCGTTAAGGGTTGGGCTGATTCATCCA
ACAAGATTGCCGGAATTGAGTTCATAACTAATAAAAAGCCTTCAGAATATTACGGGTTTG
AAAAACTTCCCGGAGAAGAAGGTACAGATATTTTACTTGAAGTGAAAGACAAGAAGATTG
TCGGCTTTCATGGCTTCGCAGACACTCAGCTCAACTCTCTCGGAGCTTACTTTGCTCCCA
TCGCCTCGACTCCGTTGAACCAAGCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO22TF U 1
AF RR2C341TF U 552
BS 1 629 RR2BO22TF
BS 630 1288 RR2C341TF

RD RR2BO22TF 629 0 0
GGGGAACTAAAAGGGTTTTCAGTGGACTATCCTAACGATAGTATTACGGCCGTTAGTGGA
ACCTACAAACATATTTTCACCTATGATACGACTCTCATCACATCGCTTTACTTCACAACC
TCCAAAGGATTTACCTCTCCGTTATTCGACATCGACAGTGAGAAGAGGGAACAGAATTCG
AGTTCAAAGGTGAAAATGGTGGAAAACTTATTGGGTTCCATGGACGTGGTGGTAATGCCA
TTGATGCCATTGGAGCATACTTTGACACCGGTTCACGAGATGGTGATGCGGGCAAGCCTA
GTACCAACGATCCGAAACCTAAACCTGTTGATGTCCCCGGGAAGAAGGGACCGCTCGGTG
GTGAAAAGGGAAATGTATTCGACGATGTTGGTTTCGAAGGTGTGAAGAAAGTAACTGTCG
GAGCAGATGACTATAGCATTACTTATATCAAGATCGAATACTTAAAGGACGGCAAAGTTG
AGATCCTTGAGCACGGGACAGCTCGCGGGAAGCTAGAAGAGTTTTCGGTTGACTATCCAA
ACGATAGTATCACGGAAGTTGGTGGAAGCTACAAAAAAGTTTACAACTATGACACCACGC
TCATCACATCGCTTTACTTCACAACCTCC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2C341TF 737 0 0
G
CGGAAGTTGGTGGAAGCTACAAAAAAGTTTACAACTATGACACCACGCTCATCACATCGC
TTTACTTCACAACCTCCAAAGGTTACACCTCTCCGTTCTTCGGCAAGAAGTATGATACGG
CAACAGAGTTCGAGTTCAAAGGTGAAAATGGAGGCAAGCTTATAGGATTCCATGGACGTG
GTGGGAATGCTATTGATGCCATCGGAGCTTATTTCGACACCGGCTCTGGTGGCCCTGACG
GCAGTGGAGGTGGATCCAACAGCGGTTCTAGTCCTCAAAAACTTGACGCACAAGGAGGCA
AGGGAGGCAACCAATGGGACGACAGTGGTGATCACGATGGTGTGACCAAGATACATGTTG
CAGTTGGTCGAGCGATTGAACAAACCAGGTTCGATTATGTCGAGAAGGGACAGATAAAGG
AAGGAACCGCCCATGGTGTGAAAGGAGCTAGATCTTCCATCAAAACTTTTGAGATAAGTC
ATCCCGACGAGTACCTCGTCTCCGTTAAGGGTTGGGCTGATTCATCCAACAAGATTGCCG
GAATTGAGTTCATAACTAATAAAAAGCCTTCAGAATATTACGGGTTTGAAAAACTTCCCG
GAGAAGAAGGTACAGATATTTTACTTGAAGTGAAAGACAAGAAGATTGTCGGCTTTCATG
GCTTCGCAGACACTCAGCTCAACTCTCTCGGAGCTTACTTTGCTCCCATCGCCTCGACTC
CGTTGAACCAAGCAGA

QA 2 737 2 737
DS 



CO CL396Contig2 959 9 22 U
CTAATAACGCAAAACCCCTTTTATTAAATTCCACAAGCGACAACACAAACATCACACTCC
ACAAACATCACACTCAAGCACAAACAGAAAAACATAGCCATCAAGAGGCCTCAATCCACC
AGTAGGCCTCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACAAG
CTTTTCATTTGGTGACTGGTGCAACATAGACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCTT
TCCCATGGAACCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGCTCAACATATTCTCCACCGG
TCATTCCAAATGGTTGTG***ATACTAGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCA
CTGTCACACCGCGTCCCTCTGCATGGATCTTATCATAGTAGACACCCACGGACGTAATGT
ACTCACCATCCGTAAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCCGATTGTTTTCCATGACCAT
CGCCAACAACTTTCTGAGAGCCATTCTCGTACTCGACCGCCACGAAAGATACACCATCAT
TGTTCTGTCCTACTTGTATTTTCTTAACGCCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTC
CTTCATCACCACCTACTGCTGTTAGCTTCTTGCTTGGTTTCAACGGAGTTGAGGCGATGG
GAGCAAAGTAAGCTCCGAGAGAGTTGAGCTGAGTGTCTGCGAAGCCATGAAAGCCGACAA
TCTTCTTGTCTTTCACTTCGAGTAAAATATCTGTACCTTCTTCTCCAGGAAATTTTTCAA
ACCCATAATACTCTGAAGGCTTTTTGTTAGTTATGAACTGAATTCCGGCAATCTTGTTGG
ATGAATCAGACCAACCCTTCACGGAGACGAGGTACTCGTCGGGATGACTTATCTCAAAAG
TTTTGATGGAAGATCTAGCTCCTTTCACACCATGGGCGGTTCCTTCCTCTATCTGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 55 55 30 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 15 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 15 55 30 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 5 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC29JQ U 1
AF RR2GT69JQB U 2
AF RR2DC29TF C 22
AF RR2EJ73JQ U 126
AF RR2BO22JQ U 7
AF RR2C341JQ U 5
AF RR2BH28JQ U 5
AF RR2GT69TF C 274
AF RR2EJ73TF C 279
BS 1 10 RR2DC29JQ
BS 11 11 RR2GT69JQB
BS 12 208 RR2DC29JQ
BS 209 209 RR2BH28JQ
BS 210 460 RR2DC29JQ
BS 461 461 RR2GT69JQB
BS 462 482 RR2DC29JQ
BS 483 483 RR2GT69JQB
BS 484 493 RR2DC29JQ
BS 494 494 RR2GT69JQB
BS 495 619 RR2DC29JQ
BS 620 643 RR2BH28JQ
BS 644 644 RR2C341JQ
BS 645 738 RR2BH28JQ
BS 739 766 RR2GT69TF
BS 767 767 RR2EJ73TF
BS 768 771 RR2GT69TF
BS 772 772 RR2EJ73TF
BS 773 790 RR2GT69TF
BS 791 791 RR2EJ73TF
BS 792 798 RR2GT69TF
BS 799 959 RR2EJ73TF

RD RR2DC29JQ 620 0 0
CTAATAACGCGAAACCCCTTTTATTAAATTCCACAAGCGACAACACAAACATCACACTCC
ACAAACATCACACTCAAGCACAAACAGAAAAACATAGCCATCAAGAGGCCTCAATCCACC
AGTAGGCCTCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACAAG
CTTTTCATTTGGTGACTGGTGCAACATAAACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCTT
TCCCATGGAACCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGCTCAACATATTCTCCACCGG
TCATTCCAAATGGTTGTG***ATACTAGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCA
CTGTCACACCGCGTCCCTCTGCATGGATCTTATCATAGTAGACACCCACGGACGTAATGT
ACTCACCATCCGTAAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCAGATTGTTTTCCATGACCAT
CGTCAACAACTTTTTGAGAGCCATTCTCGTACTCGACCGCCACGAAAGATACACCATCAT
TGTTCTGTCCTACTTGTATTTTCTTAACGCCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTC
CTTCATCACCACCTACTGC
C

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2GT69JQB 618 0 0
AATA
AACGCAAAACCCCTTTTATTAAATTCCACAAGCGACAACACAAACATCACACTCCACAAA
CATCACACTCAAGCACAAACAGAAAAACATAGCCATCAAGAGGCCTCAATCCACCAGTAG
GCCTCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACAAGCTTTT
CATTTGGTGACTGGTGCAACATAAACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCTTTCCCA
TGGAACCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGCTCAACATATTCTCCACCGGTCACT
CCAAATGGTTGTG***ATACTAGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCACTGTC
ACACCGCGTCCCTCTGCATGGGTTTTATCATAGTAGACACCAACAGACGTAATGTACTCA
CCATTCGTGAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCCGATTGTTTTCCATGACCATCGCCA
ACAACTTTCTGAGAGCCATTCTCGTACTCGACCGCCACGAAAGATACACCATCATTGTTC
TGTCCTACTTGTATTTTCTTAACGCCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCCTTCA
TCACCACCTACTGC

QA 5 618 5 618
DS 

RD RR2DC29TF 599 0 0
TATTAAATTCCACAAGCGACAACACAAACATCACACTCCACAAACATCACACTCAAGCAC
AAACAGAAAAACATAGCCATCAAGAGGCCTCAATCCACCAGTAGGCCTCTGACATAACTT
TATTCATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACAAGCTTTTCATTTGGTGACTGGTG
CAACATAGACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCTTTCCCATGGAACCCAACGATCT
TGTTACCTTCTTCCTTAAGCTCAACATATTCTCCACCGGTCATTCCAAATGGTTGTG***
ATACTAGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCACTGTCACACCGCGTCCCTCTG
CATGGATCTTATCATAGTAGACACCCACGGACGTAATGTACTCACCATCCGTAAGCTCAA
ACGTTTCAACTCCAAGCGCAGATTGTTTTCCATGACCATCGTCAACAACTTTTTGAGAGC
CATTCTCGTACTCGACCGCCACGAAAGATACACCATCATTGTTCTGTCCTACTTGTATTT
TCTTAACGCCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCCTTCATCACCACCTACTGC
C

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2EJ73JQ 495 0 0
GCCTCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACAAGCTTTT
CATTTGGTGACTGGTGCAACATAGACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCTTTCCCA
TGGAACCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGCTCAACATATTCTCCACCGGTCATT
CCAAATGGTTGTG***ATACTAGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCACTGTC
ACACCGCGTCCCTCTGCATGGATCTTATCATAGTAGACACCCACGGACGTAATGTACTCA
CCATCCGTAAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCAAATTGTTTTCCATGACCATCGCCA
ACAACTTTTTGAGAGCCATTCTCGTACTCGACCGCCACGAAAGATACACCATCATTGTTC
TGTCCTACTTGTATTTTCTTAACGCCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCCTTCA
TCACCACCTACTGCT

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR2BO22JQ 631 0 0
C
CGCAAAACCCCTTTTATTAAATTCCACAAGCGACAACACAAACATCACACTCCACAAACA
TCACAC**AAGCACAAACAGAAAAACATTGCCATCAAGAGGCCTCAATCCACCAGTAGGC
CTCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACAAGCTTTTCA
TTTGGTGACTGGTGCAACATAGACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCTTTCCCATG
GAACCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGTTCAACGTATTCTCCACCGGTCATTCC
AAATAGTTGTGGGGATACTTGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCACTGTCAC
ACCGCGTCCCTCTGCATGGATCTTATCATAGTAGACACCCACGGACGTAATGTACTCACC
ATCCTTAAGCTCAAACGTTTCAACTCCGAGCGCCGATTGTTTTCCATGACCATCGCCAAC
AACTTTCTGAGAGCCATTCTCGTACTCGACCGCCACGAAAGATACACCATCATTGTTCTG
TCCTACTTGTATTTTCTTAACGCCGTCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCCTTCATC
ACCACCTACTGCTGTTAGCTTCTTGCTTGG

QA 2 631 2 631
DS 

RD RR2C341JQ 693 0 0
A
AACGCAAAACCCCTTTTATTAAATTCCACAAGCGACAACACAAACATCACACTCCACAAA
CATCACAC**AAGCACAAACAGAAAAACATTGCCATCAAGAGGCCTCAATCCACCAGTAG
GCCTCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACAAGCTTTT
CATTTGGTGACTGGTGCAACATAAACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCTTTCCCA
TGGAACCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGTTCAACGTATTCTCCACCGGTCATT
CCAAATGGTTGTGGGGATACTTGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCACTGTC
ACACCGCGTCCCTCTGCATGGATCTTATCATAGTAAACACCCACGGACGTAATGTACTCA
CCATCCTTAAGCTCAAACGTTTCAACTCCGAGCGCCGATTGTTTTCCATGACCATCGCCA
ACAACTTTCTGAAAGCCATTCTCGTACTCGACCGCCACGAAAGATACACCATCATTGTTC
TGTCCTACTTGTATTTTCTTAACGCCGTCGAGAGCACCATCATCCCATGAAGCTCCTTCA
TCACCACCTACTGCTGTTAGCTTCTTGCTTGGTTTCAACGGAGTCGAGGCGATGGGAGCA
AAGTAAGCTCCGAGAGAGTTGAGCTGAGTGTC

QA 2 693 2 693
DS 

RD RR2BH28JQ 734 0 0
A
AACGCAAAACCCCTTTTATTAAATTCCACAAGCGACAACACAAACATCACACTCCACAAA
CATCACACTCAAGCACAAACAGAAAAACATAGCCATCAAGAGGCCTCAATCCACCAGTAG
GCCCCTGACATAACTTTATTCATATTTGGAAATCAAAGAACCAACCCACAACAAGCTTTT
CATTTGGTGACTGGTGCAACATAGACTCCAATTTGATGAACCCAATCGCTAGCTTTCCCA
TGGAACCCAACGATCTTGTTACCTTCTTCCTTAAGCTCAACATATTCTCCACCGGTCATT
CCAAATGGTTGTG***ATACTAGCTTGTTAGTCTTGAATACCAAAGACGTCACCACTGTC
ACACCGCGTCCCTCTGCATGGATTTTATCATAGTAGACACCAACAGACGTAATGTACTCA
CCATTCGTGAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGCGCCGATTGTTTTCCATGACCATCGCCA
ACAACTTTCTGAGAGCCATTCTCGTACTCGACCGCCACGAAAGATACACCATCATTGTTC
TGTCCTACTTGTATTTTCTTAACGCCGCCGAAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCCTTCA
TCACCACCTACTGCTGTTAGCTTCTTGCTTGGTTTCAATGGAGTTGAGGCGATGGGAGCA
AAGTAAGCTCCGAGAGAGTTGAGCTGAGTGTCTGCGAAGCCATGAAAGCCGACAATCTTC
TTGTCTTTCACTT

QA 2 734 2 734
DS 

RD RR2GT69TF 540 0 0
CT
TTAAGCTCAACATATTCTCCACCGGTCACTCCAAATGGTTGTG***ATACTAGCTTGTTA
GTCTTGAATACCAAAGACGTCACCACTGTCACACCGCGTCCCTCTGCATGGGTTTTATCA
TAGTAGACACCAACAGACGTAATGTACTCACCATTCGTGAGCTCAAACGTTTCAACTCCA
AGCGCCGATTGTTTTCCATGACCATCGCCAACAACTTTCTGAGAGCCATTCTCGTACTCG
ACCGCCACGAAAGATACACCATCATTGTTCTGTCCTACTTGTATTTTCTTAACGCCGTCG
AAAGCACCATCATCCCATGAAGCTCCTTCATCACCACCTACTGCTGTTAGCTTCTTGCTT
GGTTTCAATGGAGTTGAGGCGATGGGAGCAAAGTAAGCTCCGAGAGAGTTGAGCTGAGTG
TCTGCGAAGCCATGAAAGCCGACAATCTTCTTGTCTTTCACTTCGAGTAAAATATCTGTA
CCTTCTTCTCCGGGAAGTTTTTCAAACCCATAATATTCTGAAG
TCCTTGTGTTGGTTC

QA 3 525 3 525
DS 

RD RR2EJ73TF 681 0 0
AGCTCAACATATTCTCCACCGGTCATTCCAAATGGTTGTG***ATACTAGCTTGTTAGTC
TTGAATACCAAAGACGTCACCACTGTCACACCGCGTCCCTCTGCATGGATCTTATCATAG
TAGACACCCACGGACGTAATGTACTCACCATCCGTAAGCTCAAACGTTTCAACTCCAAGC
GCAGATTGTTTTCCATGACCATCGCCAACAACTTTTTGAGAGCCATTCTCGTACTCGACC
GCCACGAAAGATACACCATCATTGTTCTGTCCTACTTGTATTTTCTTAACGCCGTCGAAA
GCACCATCATCCCATGAAGCTCCTTCATCACCACCTACTGCTGTTAGCTTCTTGCTTGGT
TTCAACGGAGTTGAGGCGATGGGAGCAAAGTAAGCTCCGAGAGCGTTGAGCTGAGTGTCT
GCGAAGCCATGAAAGCCGACAATCTTCTTGTCTTTCACTTCGGGTAAAATATCTGTACCT
TCTTCTCCAGGATATTTTTCAAACCCGTAATACTCTGAAGGCTTTTTGTTAGTTATGAAC
TGAATTCCGGCAATCTTGTTGGATGAATCAGACCAACCCTTCACGGAGACGAGGTACTCG
TCGGGATGACTTATCTCAAAAGTTTTGATGGAAGATCTAGCTCCTTTCACACCATGGGCG
GTTCCTTCCTCTATCTGTCCC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 12

CO CL397Contig1 983 12 36 U
GGATCCAAAATCTCTTCTGTGGGTAGAATCAACTCTGTCTTAAGCCAATCTCTCTGTCTC
TCTCTCTCTTTGTCTCTGTGCTCAGAGAGAGAAATGGCAGCTTCAACACTAACACTTCCC
TGCTTCAAACTCTACGATCAACCAACCCTCCTCCTTCGCTGCAACAAATCATCTAACCAA
ACACTTCTTAGATTCAACTTGTCGCCTCCAAAGCCTCTCTTGATCTCCTCACGTGACAAC
AACAGTTCTCAGCGATTCAAAGCCCTGCCTGAGACCATTGCCGTCAAACAGGACGACACA
ACTGCTGATGACGACAATCCTCCTGCGACCATCAACACTAAGCTCTACTTTGGGAACCTG
CCTTACAATGTTGACAGTGCAACGCTCGCTCAGATCATCCAAGACTTCGCAAACCCCGAG
CTCGTCGAGGTTCTTTACAACAGAGACACAGGACAGAGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACA
ATGAGCAACGTGGAAGACTGCAACGTCATCATTGAGAACCTCGATGGAACTGAGTATCTT
GGTAGGACTTTGAAGGTGAACTTTGCAGACAAACCAAAACCAAACAAAGAACCTCTGTAT
CCAGAAACAGAGTACAAGCTGTTTGTTGGTAACTTGTCGTGGACAGTCACTTCGGAGTCA
TTAGCTGGAGCGTTTCGAGAGTGCGGAGAAGTGGTTGGTGCCAGAGTTGTGTATGATGGA
GACACCGGGAAGTCGAGAGGTTATGGCTTTGTATGTTACTCCTCCCAAGCTGAAATGGAA
ACCGCCCTTGAGTCGCTGGATGGGCTTGAGCTGGAGGGTCGGGCCATTCGAGTAAACCTG
GCTCAGGGGAAGAAATACTGATACCTTGAAATAACATTTTGAGATTTTCATCGTTAGAGA
TTATGTTTCAATTTTGAACTAAAAAAAA**TCAATATATTTTGTATGGTTTAAGGTTTGG
TAGTAACTAATATAATCAGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 35 35 50 50 50 50 50 35 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 40 55 55 40 55 55 
55 55 40 55 55 5 55 55 55 55 55 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 40 40 25 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET03TF U 70
AF RR2DD74TF U 70
AF RR2EM61TF U 19
AF RR2AN61TF U 1
AF RR2D627TF U 76
AF RR2AY33TFB U 17
AF RR2DJ91TF U 157
AF RR2AN61JQ C 157
AF RR2DJ91JQ C 521
AF RR2EM61JQ C 430
AF RR2D627JQ C 428
AF RR2ET03JQ C 325
BS 1 60 RR2AN61TF
BS 61 61 RR2AY33TFB
BS 62 282 RR2AN61TF
BS 283 283 RR2D627TF
BS 284 315 RR2AN61TF
BS 316 316 RR2D627TF
BS 317 353 RR2AN61TF
BS 354 354 RR2D627TF
BS 355 383 RR2AN61TF
BS 384 384 RR2D627TF
BS 385 600 RR2AN61TF
BS 601 601 RR2D627TF
BS 602 713 RR2AN61TF
BS 714 714 RR2D627TF
BS 715 725 RR2AN61TF
BS 726 726 RR2D627TF
BS 727 734 RR2AN61TF
BS 735 735 RR2D627TF
BS 736 741 RR2AN61TF
BS 742 742 RR2D627TF
BS 743 774 RR2AN61TF
BS 775 775 RR2D627TF
BS 776 782 RR2AN61TF
BS 783 783 RR2D627TF
BS 784 785 RR2AN61TF
BS 786 786 RR2D627TF
BS 787 791 RR2AN61TF
BS 792 792 RR2D627TF
BS 793 817 RR2AN61TF
BS 818 822 RR2DJ91TF
BS 823 823 RR2AN61JQ
BS 824 848 RR2DJ91TF
BS 849 914 RR2AN61JQ
BS 915 915 RR2ET03JQ
BS 916 944 RR2AN61JQ
BS 945 983 RR2ET03JQ

RD RR2ET03TF 354 0 0
GG
GTCTCTGTGCTCAGAGAGAGAAATGGCAGCTTCAACACTAACACTTCCCTGCTTCAAACT
CTACGATCAACCAACCCTCCTCCTTCGCTGCAACAAATCATCTAACCAAACACTTCTTAG
ATTCAACTTGTCGCCTCCAAAGCCTCTCTTGATCTCCTCACGTGACAACAACAGTTCTCA
GCGATTCAAAGCCCTGCCTGAGACCATTGCCGTCAAACAGGACGACACAACTGCTGATGA
CGACAATCCTCCTGCGACCATCAACACTAAGCTCTACTTTGGGAACCTGCCTTACAATGT
TGACAGTGCA*CGCTCGCTCAGATCATCCAA*ACTTCGCAAACCC
GAGCTCG

QA 3 347 3 347
DS 

RD RR2DD74TF 509 0 0
GG
GTCTCTGTGCTCAGAGAGAGAAATGGCAGCTTCAACACTAACACTTCCCTGCTTCAAACT
CTACGATCAACCAACCCTCCTCCTTCGCTGCAACAAATCATCTAACCAAACACTTCTTAG
ATTCAACTTGTCGCCTCCAAAGCCTCTCTTGATCTCCTCACGTGACAACAACAGTTCTCA
GCGATTCAAAGCCCTGCCTGAGACCATTGCCGTCAAACAGGACGACACAACTGCTGATGA
CGACAATCCTCCTGCGACCATCAACACTAAGCTCTACTTTGGGAACCTGCCTTACAATGT
TGACAGTGCAACGCTCGCTCAGATCATCCAAGACTTCGCAAACCCCGAGCTCGTCGAGGT
TCTTTACAACAGAGACACAGGACAGAGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAACGT
GGAAGACTGCAACGTCATCATTGAGAACCTCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACTTT
GAAGGTGAACTTTGCAGACAAACCAAA

QA 3 509 3 509
DS 

RD RR2EM61TF 730 0 0
GG
GGGTAGAATCAACTCTGTCTTAAGCCAATCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTTTGTCTCTGTG
CTCAGAGAGAGAAATGGCAGCTTCAACACTAACACTTCCCTGCTTCAAACTCTACGATCA
ACCAACCCTCCTCCCTCGCTGCAACAAATCATCTAACCAAACACTTCTTAGATTCAACTT
GTCGCCTCCAAAGCCTCTCTTGATCTCCTCACGTGACAACAACAGTTCTCAGCGATTCAA
AGCCCTGCCTGGGACCATTGCCGTCAAGCAGGACGACACAACTGCTGATGACGACAATCC
TCCTGCGACCATCAACACTAAGCTCTACTTTGGGAACCTGCCTTACAATGTTGACAGTGC
AACGCTCGCTCAGATCATCCAAGACTTCGCAAACCCCGAGCTCGTCGAGGTTCTTTACAA
CAGAGACACAGGACAGAGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAACGTGGAAGACTG
CAACGTCATCATTGAGAACCTCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACTTTGAAGGTGAA
CTTTGCAGACAAACCAAAACCAAACAAAGAACCTCTGTATCCAGAAACAGAGTACAAGCT
GTTTGTTGGTAACTTGTCGTGGACAGTCACTTCGGAGTCATTAGCTGGAGCGTTTCGAGA
GTGCGGAGAAGTGGTTGGTGCCAGAGTTGTGTATGATGGAGACACCGGGAAGTCGAGAGG
TTATGGCT

QA 3 730 3 730
DS 

RD RR2AN61TF 817 0 0
GGATCCAAAATCTCTTCTGTGGGTAGAATCAACTCTGTCTTAAGCCAATCTCTCTGTCTC
CCTCTCTCTTTGTCTCTGTGCTCAGAGAGAGAAATGGCAGCTTCAACACTAACACTTCCC
TGCTTCAAACTCTACGATCAACCAACCCTCCTCCTTCGCTGCAACAAATCATCTAACCAA
ACACTTCTTAGATTCAACTTGTCGCCTCCAAAGCCTCTCTTGATCTCCTCACGTGACAAC
AACAGTTCTCAGCGATTCAAAGCCCTGCCTGAGACCATTGCCCTCAAACAGGACGACACA
ACTGCTGATGACGACGATCCTCCTGCGACCATCAACACTAAGCTCTACTTTGGAAACCTG
CCTTACAATGTTGACAGTGCAACACTCGCTCAGATCATCCAAGACTTCGCAAACCCCGAG
CTCGTCGAGGTTCTTTACAACAGAGACACAGGACAGAGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACA
ATGAGCAACGTGGAAGACTGCAACGTCATCATTGAGAACCTCGATGGAACTGAGTATCTT
GGTAGGACTTTGAAGGTGAACTTTGCAGACAAACCAAAACCAAACAAAGAACCTCTGTAT
ACAGAAACAGAGTACAAGCTGTTTGTTGGTAACTTGTCGTGGACAGTCACTTCGGAGTCA
TTAGCTGGAGCGTTTCGAGAGTGCGGAGAAGTGGTTGGTGCCAGAGTTGTGTACGATGGA
GACACTGGGAAGTCAAGAGGT*ATGGCTTTGTATGTTACTCCTCCCAAGCTGAA*TGGAA
AC*GCTCTTGA*TCGCTGGATGGGCTTGAGCTGGAGG

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2D627TF 737 0 0
GG
GTGCTCAGAGAGAGAAATGGCAGCTTCAACACTAACACTTCCCTGCTTCAAACTCTACGA
TCAACCAACCCTCCTCCTTCGCTGCAACAAATCATCTAACCAAACACTTCTTAGATTCAA
CTTGTCGCCTCCAAAGCCTCTCTTGATCTCCTCACGTGACAACAACAGTTCTCAGCGATT
CAAAGCCCTGCCTGAGACCATTGCCGTCAAACAGGACGACACAACTG***ATGACTACAA
TCCTCCTGCGACCATCAACACTAAGCTCTACTTTGGGAACCTGCCTTACAATGTTGACAG
TGCAACGCTCGCTCAGATCATCCAAGACTTCGCAAACCCCGAGCTCGTCGAGGTTCTTTA
CAACAGAGACACAGGACAGAGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAACGTGGAAGA
CTGCAACGTCATCATTGAGAACCTCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACTTTGAAGGT
GAACTTTGCAGACAAACCAAAACCAAACAAAGAACCTCTGTATCCAGAAACAGAGTACAA
GCTGTTTGTTGGTAACTTGTCGTGGACAGTCACTTCGGAGTCATTAGCTGGAGCGTTTCG
AGAGTGCGGAGAAGTGGTTGGTGCCAGAGTTGTGTATGATGGAGACACCGGGAAGTCGAG
AGGTTATGGCTTTGTATGTTACTCCTCCCAAGCTGAAATGGAAACCGCCCTTGAGTCGCT
GGATGGGCTTGAGCT

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR2AY33TFB 776 0 0
GGGT
GGGTAGAATCAACTCTGTCTTAAGCCAATCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTTTGTCTCTGTG
CTCAGAGAGAGAAATGGCAGCTTCAACACTAACACTTCCCTGCTTCAAACTCTACGATCA
ACCAACCCTCCTCCTTCGCTGCAACAAATCATCTAACCAAACACTTCTTAGATTCAACTT
GTCGCCTCCAAAGCCTCTCTTGATCTCCTCACGTGACAACAACAGTTCTCAGCGATTCAA
AGCCCTGCCTGAGACCATTGCCGTCAAACAGGACGACACAACTGCTGATGACGACAATCC
TCCTGCGACCATCAACACTAAGCTCTACTTTGGGAACCTGCCTTACAATGTTGACAGTGC
AATGCTCGCTCAGATCATCCAAGACTTCGCAAACCCCGAGCTCGTCGAGGTTCTTTACAA
CAGAGACACAGGACAGAGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAACGTGGAAGACTG
CAACGTCATCATTGAGAACCTCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACTTTGAAGGTGAA
CTTTGCAGACAAACCAAAACCAAACAAAGAACCTCTGTATCCAGAAACAGAGTACAAGCT
GTTTGTTGGTAACTTGTCGTGGACAGTCACTTCGGAGTCATTAGCTGGAGCGTTTCGAGA
GTGCGGAGAAGTGGTTGGTGCCAGAGTTGTGTATGATGGAGACACCGGGAAGTCGAGAGG
TTATGGCTTTGTATGTTACTCCTCCCAAGCTGAAATGGAAACCGCCCTTGAG

QA 5 776 5 776
DS 

RD RR2DJ91TF 693 0 0
G
GCTGCAACAAATCATCTAACCAAACACTTCTTAGATTCAACTTGTCGCCTCCAAAGCCTC
TCTTGATCTCCTCACGTGACAACAACAGTTCTCAGCGATTCAAAGCCCTGCCTGAGACCA
TTGCCCTCAAACAGGACGACACAACTGCTGATGACGACGATCCTCCTGCGACCATCAACA
CTAAGCTCTACTTTGGGAACCTGCCTTACAAGGTTGACAGTGCAACACTCGCTCAGATCA
TCCAAGACTTCGCAAACCCCGAGCTCGTCGAGGTTCTTTACAACAGAGACACAGGACAGA
GTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAACGTGGAAGACTGCAACGTCATCATTGAGA
ACCTCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACTTCGAAGGTGAACTTTGCAGACAAACCAA
AACCAAACAAAGAACCTCTGTATCCAGAAACAGAGTACAAGCTGTTTGTTGGTAACTTGT
CGTGGACAGTCACTTCGGAGTCATTAGCTGGAGCGTTTCGAGAGTGCGGAGAAGTGGTTG
GTGCCAGAGTTGTGTACGATGGAGACACTGGGAAGTCAAGAGGTTATGGCTTTGTATGTT
ACTCCTCCCAAGCTGAAATGGAAACCGCTCTTGAATCGCTGGATGGGCTTGAGCTGGAGG
GTCGGTCCATTCGAGTAAACCTGGCTCAGGG
A

QA 2 692 2 692
DS 

RD RR2AN61JQ 789 0 0
CGCTGCAACAAATCATCTAACCAAACACTTCTTAGATTCAACTTGTCGCCTCCAAAGCCT
CTCTTGATCTCCTCACGTGACAACAACAGTTCTCAGCGATTCAAAGCCCTGCCTGAGACC
ATTGCCCTCAAACAGGACGACACAACTGCTGATGACGACGATCCTCCTGCGACCATCAAC
ACTAAGCTCTACTTTGGAAACCTGCCTTACAATGTTGACAGTGCAACACTCGCTCAGATC
ATCCAAGACTTCGCAAACCCCGAGCTCGTCGAGGTTCTTTACAACAGAGACACAGGACAG
AGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAACGTGGAAGACTGCAACGTCATCATTGAG
AACCTCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACTTTGAAGGTGAACTTTGCAGACAAACCA
AAACCAAACAAAGAACCTCTGTATACAGAAACAGAGTACAAGCTGTTTGTTGGTAACTTG
TCGTGGACAGTCACTTCGGAGTCATTAGCTGGAGCGTTTCGAGAGTGCGGAGAAGTGGTT
GGTGCCAGAGTTGTGTACGATGGAGACACTGGGAAGTCAAGAGGTTATGGCTTTGTATGT
TACTCCTCCCAAGCTGAAATGGAAACCGCTCTTGAATCGCTGGATGGGCTTGAGCTGGAG
GGTCGGGCCATTCGAGTAAACCTGGCTCAGGGGAAGAAATACTGATACCTTGAAATAACA
TTTTGAGATTTTCATCGTTAGAGATTATGTTTCAATTT*GAACTAAAAAAAA**TCAATA
TATTTTGT
T

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2DJ91JQ 431 0 0
TCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACTTCGAAGGTGAACTTTGCAGACAAACCAAAAC
CAAACAAAGAACCTCTGTATCCAGAAACAGAGTACAAGCTGTTTGTTGGTAACTTGTCGT
GGACAGTCACTTCGGAGTCATTAGCTGGAGCGTTTCGAGAGTGCGGAGAAGTGGTTGGTG
CCAGAGTTGTGTACGATGGAGACACTGGGAAGTCAAGAGGTTATGGCTTTGTATGTTACT
CCTCCCAAGCTGAAATGGAAACCGCTCTTGAATCGCTGGATGGGCTTGAGCTGGAGGGTC
GGTCCATTCGAGTAAACCTGGCTCAGGGGAAGAAATACTGATACCTTGAAATAACATTTC
GAGATTTTCATCGTTAGAGATTATGTTTCAATTT*GAACTAAAAAAAA**TCAATATATT
TTGTA
AGGTCT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR2EM61JQ 522 0 0
GTTCTTTACAACAGAGACACAGGACAGAGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAAC
GTGGAAGACTGCAACGTCATCATTGAGAACCTCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACT
TTGAAGGTGAACTTTGCAGACAAACCAAAACCAAACAAAGAACCTCTGTATCCAGAAACA
GAGTACAAGCTGTTTGTTGGTAACTTGTCGTGGACAGTCACTTCGGAGTCATTAGCTGGA
GCGTTTCGAGAGTGCGGAGAAGTGGTTGGTGCCAGAGTTGTGTATGATGGAGACACCGGG
AAGTCGAGAGGTTATGGCTTTGTATGTTACTCCTCCCAAGCTGAAATGTAAACCGCCCTT
GAGTCGCTGGATGGGCTTGAGCTGGAGGGT*GGGCCATTCGAGTAAACCTGGCTCAGGGG
AAGAAATACTGATACCTTGAAATAACATTTTGAGATTTTCATCGTTAGAGATTATGTTTC
AATTTTGAACTAAAAAAAAAATCAATATATTTTGTA
TGGTTT

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2D627JQ 523 0 0
AGGTTCTTTACAACAGAGACACAGGACAGAGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCA
ACGTGGAAGACTGCAACGTCATCATTGAGAACCTCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGA
CTTTGAAGGTGAACTTTGCAGACAAACCAAAACCAAACAAAGAACCTCTGTATCCAGAAA
CAGAGTACAAGCTGTTTGTTGGTAACTTGTCGTGGACAGTCACTTCGGAGTCATTAGCTG
GAGCGTTTCGAGAGTGCGGAGAAGTGGTTGGTGCCAGAGTTGTGTATGATGGAGACACCG
GGAAGTCGAGAGGTTATGGCTTTGTATGTTACTCCTCCCAAGCTGAAATGGAAACCGCCC
TTGAGTCGCTGGATGGGCTTGAGCTGGAGGGTCGGGCCATTCGAGTAAACCTGGCTCAGG
GGAAGAAATACTGATACCTTGAAATAACATTTTGAGATTTTCATCGTTAGAGATTATGTT
TCAATTTTGAACTAAAAAAAA**TCAATATATTTTGTA
TGGGT

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2ET03JQ 659 0 0
GCGACCATCAACACTAAGCTCTACTTTGGGAACCTGCCTTACAATGTTGACAGTGCAACG
CTCGCTCAGATCATCCAAGACTTCGCAAACCCCGAGCTCGTCGAGGTTCTTTACAACAGA
GACACAGGACAGAGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAACGTGGAAGACTGCAAC
GTCATCATTGAGAACCTCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACTTTGAAGGTGAACTTT
GCAGACAAACCAAAACCAAACAAAGAACCTCTGTATCCAGAAACAGAGTACAAGCTGTTT
GTTGGTAACTTGTCGTGGACAGTCACTTCGGAGTCATTAGCTGGAGCGTTTCGAGAGTGC
GGAGAAGTGGTTGGTGCCAGAGTTGTGTATGATGGAGACACCGGGAAGTCGAGAGGTTAT
GGCTTTGTATGTTACTCCTCCCAAGCCGAAATGGAAACCGCCCTTGAGTCGCTGGATGGG
CTTGAGCTGGAGGGTCGGGCCATTCGAGTAAACCTGGCTCAGGGGAAGAAATACTGATAC
CTTGAAATAACATTTTGAGATTTTCATCGTTAGAGATTATGTTTCAATTTTGAACTAAAA
AAAAA*TCAATATATTTTGTATGGTTTAAGGTTTGGTAGTAACTAATATAATCAGCACC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 2 9

CO CL398Contig1 677 2 7 U
GGAACATAAATCAAGAACATATCATTTCTTTGTAAGACCAATGGCGAACTCGACGATTCT
TCTTGATTACTGGCCAAGCATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGG
TGTTGTGTTCGAGGCCAGAGAAGAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAG
TAATCCGATTCACAAGAAGGTCCCGGTTCTGATACACAACGGTAAACCAGTATGCGAGTC
TCTCAACGTTGTCCAGTACGTGGACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTC
TGATCCTTACGGGAAAGCTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAG
TGATGCCCAATTCAAGATATGGGGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGGA
GTTTATTGAGGCAGTGAAGATTCTTGAAGCGGAGCTTGGAGACAAACCTTACTTTGGTGG
AGATACCTTTGGCTATGTAGACATTTCACTGATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCATA
TGAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCCAA
GAGATGTATGGAGAAAGAGAGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGACCAAGAGAAAATTGTTGC
GTACGCCGCTGAGTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2D671TF U 1
AF RR2GY94TF U 6
BS 1 597 RR2D671TF
BS 598 598 RR2GY94TF
BS 599 603 RR2D671TF
BS 604 604 RR2GY94TF
BS 605 614 RR2D671TF
BS 615 615 RR2GY94TF
BS 616 677 RR2D671TF

RD RR2D671TF 677 0 0
GGAACATAAATCAAGAACATATCATTTCTTTGTAAGACCAATGGCGAACTCGACGATTCT
TCTTGATTACTGGCCAAGCATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGG
TGTTGTGTTCGAGGCCAGAGAAGAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAG
TAATCCGATTCACAAGAAGGTCCCGGTTCTGATACACAACGGTAAACCAGTATGCGAGTC
TCTCAACGTTGTCCAGTACGTGGACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTC
TGATCCTTACGGGAAAGCTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAG
TGATGCCCAATTCAAGATATGGGGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGGA
GTTTATTGAGGCAGTGAAGATTCTTGAAGCGGAGCTTGGAGACAAACCTTACTTTGGTGG
AGATACCTTTGGCTATGTAGACATTTCACTGATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCATA
TGAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCTAA
GAGGTGTATGGAGAGAGAGAGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGACCAAGAGAAAATTGTTGC
GTACGCCGCTGAGTTTA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2GY94TF 670 0 0
GG
AAATCAAGAACATATCATTTCTTTGTAAGACCAATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGAT
TACTGGCCAAGCATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTTGTG
TTCGAGGCCAGAGAAGAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCG
ATTCACAAGAAGGTCCCGGTTCTGATACACAACGGTAAACCAGTATGCGAGTCTCTCAAC
GTTGTCCAGTACGTGGACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCT
TACGGGAAAGCTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCC
*AATTCAAGATATGGGGAAAGAAAGGTGAGGAGCAAGCAGCAGGGGTGAAGGAGTTTATT
GAGGCAGTGAAGATTCTTGAAGCGGAGCTTGGAGACAAACCTTACTTTGGTGGAGATACC
TTTGGCTATGTAGACATTTCACTGATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCATATGAGAAG
TTTGGTAACTTCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCCAAGAGATGT
ATGGAGAAAGAGAGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGACCAAGAGAAAATTGTTGCGTACGCC
GCTGAGTT

QA 3 670 3 670
DS 



CO CL398Contig2 908 7 24 U
AGGAAACAAACTTTATTTTAAAATGCACTACTTAGGATCCAATACAAACCACCACACAAA
CACTGACGCTTGCCCTCACGTATTATTAGGAAACACACAGAAACCAAAGCTAAAAGAGAA
CGAAGGCAGAGCACACCATCATCGGAAACAGAAGACACAACACAAGGTTTTATTCAGCAG
TATCAGAGATTATTCTTCCTAAACTCAGCGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTGGTCAGGG
AGAGACTTAGACACGCTCTCTTTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTTGGA
CTCTCTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAGAAT
GTAATCAGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTCCACCAAAGTAAGGTTTGTCTCCA
AGCTCAGCTTCGAGAATCTTCGCTGCCTCAATAAACTCCTTCACCCCTGCTGCTTGTTCC
TCACCTTTCTTTCCCCATATCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAATCA
GCCCAAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTAAGGATCAGATGGGAAGAATGGGTTCTTGTCA
GACCAAGCCTCGTCCACGTACTGGACAACATTGAGGGACTCGCATACCGGTTTACCGTTG
TGGATCAGAACCGGGACCTTCTTGTGAATCGGATTACTTTGGAGGAGCAAAGGGCTCTTG
TTCGTGAGATCCTCTTCTCTGGCCTCGAACTCCACACATTTCTCCCTCAACGCGACTCTA
GCCCTCATACAGAACATGCTTGGCCAGTAATCAAGAAGAATCGTCGAGTTCGCCATTGGT
TTAGATCACTAAAGCTCACAAAGAAATGATATGTTCTTGAGTGAACAATAGAGGCAGTGT
GTGGTTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 15 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 25 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BB90JQ U 246
AF RR2DE11JQ U 1
AF RR2DJ34JQ U 2
AF RR2F616JQ U 2
AF RR2BB90TF C 102
AF RR2DE11TF C 750
AF RR2AV32TF C 196
BS 1 72 RR2DE11JQ
BS 73 73 RR2DJ34JQ
BS 74 153 RR2DE11JQ
BS 154 154 RR2DJ34JQ
BS 155 176 RR2DE11JQ
BS 177 177 RR2F616JQ
BS 178 457 RR2DE11JQ
BS 458 458 RR2DJ34JQ
BS 459 623 RR2DE11JQ
BS 624 629 RR2DJ34JQ
BS 630 630 RR2F616JQ
BS 631 635 RR2DJ34JQ
BS 636 636 RR2F616JQ
BS 637 647 RR2DJ34JQ
BS 648 648 RR2F616JQ
BS 649 736 RR2DJ34JQ
BS 737 738 RR2F616JQ
BS 739 739 RR2BB90TF
BS 740 809 RR2F616JQ
BS 810 810 RR2BB90TF
BS 811 829 RR2F616JQ
BS 830 830 RR2BB90TF
BS 831 857 RR2F616JQ
BS 858 908 RR2BB90TF

RD RR2BB90JQ 327 0 0
CTTAAACACGCTCCCTTTCTGCATACACCTCTTAACCCAAGCAATCAGTTTTGGACTCTC
TGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAAAATGTAAT
CAGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTCCACCAAAGTAAGGTTTGTCTCCAAGCTC
AGCTTCCAAAATCTTCCCTGCCTCAATAAACTCCTTCACCCCTGCTGCTTGTTCCTCACC
TTTCTTTCCCCATATCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAATCAGCCCA
AAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTAAGG

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR2DE11JQ 623 0 0
AGGAAACAAACTTTATTTTAAAATGCACTACTTAGGATCCAATACAAACCACCACACAAA
CACTGACGCTTGTCCTCACGTATTATTAGGAAACACACAGAAACCAAAGCTAAAAGAGAA
CGAAGGCAGAGCACACCATCATCGGAAACAGAAAACACAACACAAGGTTTTATTCAACAG
TATCAGAGATTATTCTTCCTAAACTCAGCGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTGGTCAGGG
AGAGACTTAGACACGCTCTCTTTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTTGGA
CTCTCTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAGAAT
GTAATCAGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTCCACCAAAGTAAGGTTTGTCTCCA
AGCTCAGCTTCGAGAATCTTCGCTGCCTCAATAAACTACTTCACCCCTGCTGCTTGTTCC
TCACCTTTCTTTCCCCATATCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAATCA
GCCCAAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTAAGGATCAGATGGGAAGAATGGGTTCTTGTCA
GACCAAGCCTCGTCCACGTACTG

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2DJ34JQ 735 0 0
GGAAACAAACTTTATTTTAAAATGCACTACTTAGGATCCAATACAAACCACCACACAAAC
ACTGACGCTTGCCCTCACGTATTATTAGGAAACACACAGAAACCAAAGCTAAAAGAGAAC
GAAGGCAGAGCACACCATCATCGGAAACAGAAGACACAACACAAGGTCTTATTCA***GT
ATCAGAGATTATTCTTCCTAAACTCAGCGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTGGTCAGGGA
GAGACTTAAACACGCTCTCTTTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTTGGAC
TCTCTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAGAATG
TAATCAGTGCAATGTCTACATAGCCAAATGTATCTCCACCAAAGTAAGGTTTGTCTC***
GCTCAGCTTCAAGAATCTTCACTGCCTCAATAAACTCCTTCGCCCCTGCTGCTTGTTCCT
CACCTTTCTTTCCCCATATCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAATCAG
CCCAAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTAAGGATCAGAAGGGAAGAATGGGTTCTTGTCAG
ACCAAGCCTCGTCCACGTACTGGACAACGTTGAGAGACTCGCATACTGGTTTACCGTTGT
GGATCAGAACCGGGACCTTCTTGTGAATCGGATTACTTTGGAGGAGCAAAGGGCTCTTGT
TCGTGAGATCCTCTT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2F616JQ 856 0 0
GGAAACAAACTTTATTTTAAAATGCACTACTTAGGATCCAATACAAACCACCACACAAAC
ACTGACGCTTGCCCTCACGTATTATTAGGAAACACACAGAAACCAAAGCTAAAAGAGAAC
GAAGGCAGAGCACACCATCATCGGAAACAGAAGACACAACACAAGGTTTTATTCAGCAGT
ATCAGAGATTATTCTTCCTAAACTCAGCGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTGGTCAGGGA
GAGACTTAGACACGCTCTCTTTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTTGGAC
TCTCTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAGAATG
TAATCAGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTCCACCAAAGTAAGGTTTGTCTCCAA
GCTCAGCTTCGAGAATCTTCGCTGCCTCAATAAACTCCTTCACCCCTGCTGCTTGTTCCT
CACCTTTCTTTCCCCATATCCTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAATCAG
CCCAAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTAAGGATCAGATGGGAAGAATGGGTTCTTGTCAG
ACCAAGCCTCGTCTACGTACTGGACAACATTGAGGGACTCGCATACCGGTTTACCGTTGT
GGATCAGAACCGGGACCTTCTTGTGAATCGGATTACTTTGGAGGAGCAAAGGGCTCTTGT
TCGTGAGATCCTCTTCTATGGCCTCGAACTCCACACATTTCTCCCTCAACGCGACTCTAG
CCCTCATACAGAACATGCTTGGCCAGTA*TCAAGAAGAATCGTCGAGT*CGCCATTGGTT
TAGATCACTAAAGCTC

QA 1 856 1 856
DS 

RD RR2BB90TF 807 0 0
AACCAAAGCTAAAAGAGAACGAAGGCAGAGCACACCATCATCGGAAACAGAAGACACAAC
ACAAGGTTTTATTCAGCAGTATCAGAGATTATTCTTCCTAAACTCAGCGACGTACGCAAC
AATTTTCTCTTGGTCAGGGAGAGACTTAGACACGCTCCCTTTCTGCATACACCTCTTAGC
CCAAGCAATCAGTTTTGGACTCTCTGCCTCGATGCTGAAGTTACCAAACTTCTCATATGC
TCCGAACCAACTGTAGAATGTAATCAGTGCAATGTCTACATAGCCAAAGGTATCTCCACC
AAAGTAAGGTTTGTCTCCAAGCTCAGCTTCGAGAATCTTCGCTGCCTCAATAAACTCCTT
CACCCCTGCTGCTTGTTCCTCACCTTTCTTTCCCCATATCTTGAATTGGGCATCACTAAA
CTTCTTGTCCACGAAATCAGCCCAAAACCTAGCCTGAGCTTTCCCGTAAGGATCAGATGG
GAAGAATGGGTTCTTGTCAGACCAAGCCTCGTCCACGTACTGGACAACATTGAGGGACTC
GCATACCGGTTTACCGTTGTGGATCAGAACCGGGACCTTCTTGTGAATCGGATTACTTTG
GAGGAGCAAAGGGCTCTTGTTCGTGAGATCCTCTTCTCTGGCCTCGAACTCCACACATTT
CTCCCTCAACGCGACTCTAGCCCTCATACAGAACATGCTTGGCCAGTAATCAAGAAGAAT
CGTCGAGTTCGCCATTGGTTTAGATCACTAAAGCTCACAAAGAAATGATATGTTCTTGAG
TGAACAATAGAGGCAGTGTGTGGTTCC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2DE11TF 159 0 0
CTCCACACATTTCTCCCTCAACGCGACTCTAGCCCTCATACAGAACATGCTTGGCCAGTA
ATCAAGAAGAATCGTCGAGTTCGCCATTGGTTTAGATCACTAAAGCTCACAAAGAAATGA
TATGTTCTTGAGTGAACAATAGAGGCAGTGTGTGGTTCC

QA 1 159 1 159
DS 

RD RR2AV32TF 713 0 0
CTT
CTAAACTCAGCGGCGTACGCAACAATTTTCTCTTGGTCAGGGAGAGACTTAGACACGCTC
TCTTTCTGCATACAC*TCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTTGGACTCTCTGCCTCGATGCTG
AAGTTACCAAACTTCTCATATGCTCCGAACCAACTGTAGAATGTAATCAGTGCAATGTCT
ACATAGCCAAATGTATCTCCACCAAAGTAAGGTTTGTCTCCAAGCTCAGCTTCAAGAATC
TTCACTGCCTCAATAAACTCCTTCACCCCTGCTGCTTGTTCCTCACCTTTCTTTCCCCAT
ATCTTGAATTGGGCATCACTAAACTTCTTGTCCACGAAATCAGCCCAAAACCTAGCCTGA
GCTTTCCCGTAAGGATCAGATGGGAAGAATGGGTTCTTGTCAGACCAAGCCTCGTCCACG
TACTGGACAACATTGAGGGACTCGCATACCGGTTTACCGTTGTGGATCAGAACCGGGACC
TTCTTGTGAATCGGATTACTTTGGAGGAGCAAAGGGCTCTTGTTCGTGAGATCCTCTTCT
CTGGACTAGAACTCCACACCTTTCTCCCTCAACGCGACTCTAGCCCTCATACAGAACATG
CTTGGCCAGTAATCAAGAAGAATCGTCGAGTTCGCCATTGGTTTAGATCACTAAAGCTCA
CAAAGAAATGATATGTTCTTGAGTGAACAATAGAGGCAGTGTGTGGTTCC

QA 4 713 4 713
DS 



AS 2 10

CO CL399Contig1 908 6 38 U
AGAAGAGACATAGAAGAAGAGTTTATAAAAAGAGAAGTGTA**GTACAAGAGATTTAGCT
TTAAGGAGTGTAGCAGAAACACAATAGGTTGTTCCATCACATCATAACAAGCAAGAAGAA
AGGAGAAAGAAGTAAATCACATTCTGGAATAACCAAAGCCATTATCATACTGAGTCATGA
ACTCGTCGTTGAACTTCTTGAAACTGTCCATGATCTCCGGCATCTCCTCTTCCGCAGGCA
AGATCGTTGTCCTCAGATGGAACACACCTTCTTTCTGTCCAAATCCAGAGCCAGGCACAG
TGGAGATTCCTGTGGCTTCTAAGAGCTTGAGACAGTAGAAAACATCTGGCACTTTTCCTG
CTTGCTTCGCAGCTTGGAGAGCTCCCGTTGGTAACCGTATTTGAGGAAACGAATACATTG
CACCTTCTGTGAAATTGCAGACAACGTTCTTGCAGCTGTTGAATCCATCAGTCATGATCT
TTGCTCTTCTTCTCAAAGATTCAAGAATCCCCTTGCTTTCACGAGCAAATTGATCATATG
AGATGTCTCCAGGCTTTGGAGGACTAACCATCAAACCCATAAAGATCTGTGCAGAGACGT
TTGGACTGAGAGCAATTGAAGCAACCTTGTATATCTCTTCAACAACCCTGGGAGGGATGT
TAGTCATCTCAAAGTATCCACCTCTCTGTCCACACTCTCCCCAATAACCTTTAGAGACAG
TGTGGAAAGACACAAGCTGGACTTCCTTGTTGAACGGCGAACCCATCTCCATCAAAACCT
TCTTGGAGCTGATAAAGGGACGCTCATCCTGGTATATGTTCTGCTGATAAACCTCGTCTC
CCAGAAGAACCAGTTTCTCGTTGTAACAGAACCTCAGTATCTCTTTTAAGTTAGCTTCGC
TTAGACAC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2H172JQ U 6
AF RR2BC93JQ U 1
AF RR2GA66JQ U 6
AF RR2CS67JQ U 12
AF RR2H172TF C 80
AF RR2CS67TF C 165
BS 1 37 RR2BC93JQ
BS 38 38 RR2GA66JQ
BS 39 41 RR2BC93JQ
BS 42 43 RR2GA66JQ
BS 44 75 RR2BC93JQ
BS 76 76 RR2GA66JQ
BS 77 99 RR2BC93JQ
BS 100 100 RR2GA66JQ
BS 101 111 RR2BC93JQ
BS 112 112 RR2GA66JQ
BS 113 126 RR2BC93JQ
BS 127 127 RR2GA66JQ
BS 128 184 RR2BC93JQ
BS 185 185 RR2GA66JQ
BS 186 205 RR2BC93JQ
BS 206 206 RR2GA66JQ
BS 207 226 RR2BC93JQ
BS 227 227 RR2GA66JQ
BS 228 409 RR2BC93JQ
BS 410 410 RR2GA66JQ
BS 411 508 RR2BC93JQ
BS 509 509 RR2GA66JQ
BS 510 523 RR2BC93JQ
BS 524 524 RR2GA66JQ
BS 525 526 RR2BC93JQ
BS 527 527 RR2GA66JQ
BS 528 529 RR2BC93JQ
BS 530 530 RR2GA66JQ
BS 531 532 RR2BC93JQ
BS 533 533 RR2GA66JQ
BS 534 598 RR2BC93JQ
BS 599 599 RR2GA66JQ
BS 600 619 RR2BC93JQ
BS 620 620 RR2GA66JQ
BS 621 743 RR2BC93JQ
BS 744 776 RR2GA66JQ
BS 777 852 RR2H172TF
BS 853 908 RR2CS67TF

RD RR2H172JQ 632 0 0
AGACATAGAAGAAGAGTTTATAAAAAGAGAAGTGTA**GTACAAGAGATTTAGCTTTAAG
GAGTGTAGCAGAAACACAATAGGTTGTTCCATCACATCATAACAAGCAAGAAGAAAGGAG
AAAGAAGTAAATCACATTCTGGAATAACCAAAGCCATTATCATACTGAGTCATGAACTCG
TCGTTGAACTTCTTGAAACTGTCCATGATCTCCGGCATCTCCTCTTCCGCAGGCAAGATC
GTTGTCCTCAGATGGAACACACCTTCTTTCTGTCCAAATCCAGAGCCAGGCACAGTGGAG
ATTCCTGTGGCTTCTAAGAGCTTGAGACAGTAGAAAACATCTGGCACTTTTCCTGCTTGC
TTCGCAGCTTGGAGAGCTCCCGTTGGTAACCGTATTTGAGGAAACGAATACATTGCACCT
TCTGTGAGATTGCAGACAACGTTCTTGCAGCTGTTGAATCCATCAGTCATGATCTTTGCT
CTTCTTCTCAAAGATTCAAGAATCCCCTTGCTTTCACGAGCAAATTGATCATATGAGATG
TCTCCAGGCTTTGGAGGACTAACCATCAAACCCATAAAGATCTGTGCAGAGACGTTTGGA
CTGAGAGCAATTGAAGCAACCTTGTATATCTC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2BC93JQ 743 0 0
AGAAGAGACATAGAAGAAGAGTTTATAAAAAGAGAAGAGTATAGTACAAGAGATTTAGCT
TTAAGGAGTGTAGCAAAAACACAATAGGTTGTTCCATCATATCATAACAAG*AAGAAGAA
AGGAGATAGAAGTAAATCACATTCTGGAATAACCAAAGCCATTATCATACTGAGTCATGA
ACTCATCGTTGAACTTCTTGAAACTATCCATGATCTCCGGCATCTCTTCTTCCGCAGGCA
AGATCGTTGTCCTCAGATGGAACACACCTTCTTTCTGTCCAAATCCAGAGCCAGGCACAG
TGGAGATTCCTGTGGCTTCTAAGAGCTTGAGACAGTAGAAAACATCTGGCACTTTTCCTG
CTTGCTTCGCAGCTTGGAGAGCTCCCGTTGGTAACCGTATTTGAGGAAATGAATACATTG
CACCTTCTGTGAAATTGCAGACAACGTTCTTGCAGCTGTTGAATCCATCAGTCATGATCT
TTGCTCTTCTTCTCAAAGATTCAAGAATACCCTTGCTTTCACGGGCGAACTGGTCATATG
AGATGTCTCCAGGCTTTGGAGGACTAACCATCAAACCCATAAAGATCTGTGCAGAGACAT
TTGGACTGAGAGCAATTGATGCAACCTTGTATATCTCTTCAACAACCCTGGGAGGGATGT
TAGTCATCTCAAAGTATCCACCTCTCTGTCCACACTCTCCCCAATAACCTTTAGAGACAG
TGTGGAAAGACACAAGCTGGACT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2GA66JQ 773 0 0
AGACATAGAAGAAGAGTTTATAAAAAGAGAAGTGTA**GTACAAGAGATTTAGCTTTAAG
GAGTGTAGCAGAAACACAATAGGTTGTTCCATCACATCATAACAAGCAAGAAGAAAGGAG
AAAGAAGTAAATCACATTCTGGAATAACCAAAGCCATTATCATACTGAGTCATGAACTCG
TCGTTGAACTTCTTGAAACTGTCCATGATCTCCGGCATCTCCTCTTCCGCAGGCAAGATC
GTTGTCCTCAGATGGAACACACCTTCTTTCTGTCCAAATCCAGAGCCAGGCACAGTGGAG
ATTCCTGTGGCTTCTAAGAGCTTGAGACAGTAGAAAACATCTGGCACTTTTCCTGCTTGC
TTCGCAGCTTGGAGAGCTCCCGTTGGTAACCGTATTTGAGGAAACGAATACATTGCACCT
TCTGTGAGATTGCAGACAACGTTCTTGCAGCTGTTGAATCCATCAGTCATGATCTTTGCT
CTTCTTCTCAAAGATTCAAGAATCCCCTTGCTTTCACGAGCAAATTGATCATATGAGATG
TCTCCAGGCTTTGGAGGACTAACCATCAAACCCATAAAGATCTGTGCAGAGACGTTTGGA
CTGAGAGCAATTGAAGCAACCTTGTATATCTCTTCAACAACCCTGGGAGGGATGTTAGTC
ATCTCAAAGTATCCACCTCTCTGTCCACACTCTCCCCAATAACCTTTAGAGACAGTGTGG
AAAGACACAAGCTGGACTTCCTTGTTGAACGGCGAACCCATCTCCATCAAA
CC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2CS67JQ 723 0 0
G
GAAGAAGAGTTTATAAAAAGAGAAGTGTA**GTACAAGAGATTTAGCTTTAAGGAGTGTA
GCAGAAACACAATAGGTTGTTCCATCATATCATAACAAGCAAGAAGAAAGGAGAAAGAAG
TAAATCACATTCTGGAATAACCAAAGCCATTATCATACTGAGTCATGAACTCGTCGTTGA
ACTTCTTGAAACTGTCCATGATCTCCGGCATCTCCTCTTCCGCAGGCAAGATCGTTGTCC
TCAGATGGAACACACCTTCTTTCTGTCCAAATCCAGAGCCAGGCACAGTGGAGATTCCTG
TGGCTTCTAAGAGCTTGAGACAGTAGAAAACATCTGGCACTTTTCCTGCTTGCTTCGCAG
CTTGGAGAGCTCCCGTTGGTAACCGTATTTGAGGAAACGAATACATTGCACCTTCTGTGA
AATTGCAGACAACGTTCTTGCAGCTGTTGAATCCATCAGTCATGATCTTTGCTCTTCTTC
TCAAAGATTCAAGAATCCCCTTGCTTTCACGAGCAAATTGATCATATGAGATGTCTCCAG
GCTTTGGAGGACTAACCATCAAACCCATAAAGATCTGTGCAGAGACGTTTGGACTGAGAG
CAATTGAAGCAACCTTGTATATCTCTTCAACAACCCTGGGAGGGATGTTAGTCATCTCAA
AGTATCCACCTCTCTGTCCACACTCTCCCCAATAACCTTTGGAGACAGTGTGGAAAGACA
CA

QA 2 723 2 723
DS 

RD RR2H172TF 775 0 0
CACAATAGGTTGTTCCATCACATCATAACAAGCAAGAAGAAAGGAGAAAGAAGTAAATCA
CAT*CTGGAATAACCAAAGCCATTATCATACTGAGTCATGAACTCGTCGTTGAACTTCTT
GAAACTGTCCATGATCTCCGGCATCTCCTCTTCCGCAGGCAAGATCGTTGTCCTCAGATG
GAACACACTTTCTTTCTGTCCAAATCCAGAGCCAGGCACAGTGGAGATTCCTGTGGCTTC
TAAGAGCTTGAGACAGTAGAAAACATCTGGCACTTTTCCTGCTTGCTTCGCAGCTTGGAG
AGCTCCCGTTGGTAACCGTATTTGAGGAAACGAATACATTGCACCTTCTGTGAGATTGCA
GACAACGTTCTTGCAGCTGTTGAATCCATCAGTCATGATCTTTGCTCTTCTTCTCAAAGA
TTCAAGAATCCCCTTGCTTTCACGAGCAAATTGATCATATGAGATGTCTCCAGGCTTTGG
AGGACTAACCATCAAACCCATAAAGATCTGTGCAGAGACGTTTGGACTGAGAGCAATTGA
AGCAACCTTGTATATCTCTTCAACAACCCTGGGAGGGATGTTAGTCATCTCAAAGTATCC
ACCTCTCTGTCCACACTCTCCCCAATAACCTTTAGAGACAGTGTGGAAAGACACAAGCTG
GACTTCCTTGTTGAACGGCGAACCCATCTCCATCAAAACCTTCTTGGAGCTGATAAAGGG
ACGCTCATCCTGGTATATGTTCTGCTGATAAACCTCGTCTCCCAGAAGAACCA
GC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2CS67TF 744 0 0
TCATACTGAGTCATGAACTCGTCGTTGAACTTCTTGAAACTGTCCATGATCTCCGGCATC
TCCTCTTCCGCAGGCAAGATCGTTGTCCTCAGATGGAACACACTTTCTTTCTGTCCAAAT
CCAGAGCCAGGCACAGTGGAGATTCCTGTGGCTTCTAAGAGCTTGAGACAGTAGAAAACA
TCTGGCACTTTTCCTGCTTGCTTCGCAGCTTGGAGAGCTCCCGTTGGTAACCGTATTTGA
GGAAACGAATACATTGCACCTTCTGTGAAATTGCAGACAACGTTCTTGCAGCTGTTGAAT
CCATCAGTCATGATCTTTGCTCTTCTTCTCAAAGATTCAAGAATCCCCTTGCTTTCACGA
GCAAATTGATCATATGAGATGTCTCCAGGCTTTGGAGGACTAACCATCAAACCCATAAAG
ATCTGTGCAGAGACGTTTGGACTGAGAGCAATTGAAGCAACCTTGTATATCTCTTCAACA
ACCCTGGGAGGGATGTTAGTCATCTCAAAGTATCCACCTCTCTGTCCACACTCTCCCCAA
TAACCTTTGGAGACAGTGTGGAAAGACACAAGCTGGACTTCCTTGTTGAACGGCGAACCC
ATCTCCATCAAAACCTTCTTGGAGCTGATAAAGGGACGCTCATCCTGGTATATGTTCTGC
TGATAAACCTCGTCTCCCAGAAGAACCAGTTTCTCGTTGTAACAGAACCTCAGTATCTCT
TTTAAGTTAGCTTCGCTTAGACAC

QA 1 744 1 744
DS 



CO CL399Contig2 974 4 32 U
ATGATTTTATATAATTTGCAGTTGAGAAAAAAGGAAGTAAAGAGAGAAAGTTTATATAAG
ATAGAGAAGAAAGAGTACTACAGAGATTTAGCTTTTTAAAAGAGTGTAGCAGAAGAACAC
AATAGTTGTTCCATCATCATCATAACAAGACGAGAGAAGTAAATTACATTCTGGAATAAC
CAAAGCTATTCTCATACTGAGTCATGAACTCGTCGTTGAACTTCTTGAAACTGTCCATGA
TCTCTGGCATCTCTTCTTCCGCAGGCAAGATCGTTGTCCTCAGATGGAACACACCTTCTT
TCTGTCCAAAGCCAGAGCCAGGCACTGTGGAGATTCCTGTGGCTTCTAAGAGCTTCAAAC
AGTAGAAAACATCTGGCACTTTTCCTGCTTGTTTAGCAGCTTGGAGAGCACCCGGAGGTA
ACCGGATTTGAGGAAACGAATACATCGCACCTTCTGTGAAATTGCAGACAACGTTTTTGC
AGCTGTTGAATCCATCAGTCATGATCCTTGCTCTTCTTCTCAAAGATTCAAGAATCCCCT
TGCTTTCACGGGCGAACTGGTCATATGAAATGTCTCCAGGCTTTGGAGGACTAACCATCA
AACCCATAAAGATCTGCGCAGAGACATTCGGACTCAGGGCGATCGATGCAACCTTGTATA
TCTCTTCAACAACCCTGGG*AGGGATGTTGGTCATCTCAAAGTAACCACCTCGCTGTCCA
CACTCTCCCCAATAACCTTTAGAGACAGTGTGGAAAGATACAAGCTGGACTTCTTTGCTG
AACGGCGAAACCATATCCATCAACACCTTCTTGGAGCTGATAAAAGGACGCTCATCCTGG
TATATGTTCTGCTGATAAACCTCATCTCCCAGAAGAACCAACTTCTCGCTATAACAGAAC
CTCAATATCTCTCTTAAGTTAGCTTCACTTAGACACTGACCAGTTGGGTTCCCGGGGTTA
ATGATCACCATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 5 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ18JQ U 31
AF RR2EZ86JQ U 30
AF RR2E545JQ U 1
AF RR2EZ86TF C 504
BS 1 39 RR2E545JQ
BS 40 40 RR2EZ86JQ
BS 41 89 RR2E545JQ
BS 90 90 RR2EZ86JQ
BS 91 107 RR2E545JQ
BS 108 108 RR2EZ86JQ
BS 109 150 RR2E545JQ
BS 151 151 RR2EZ86JQ
BS 152 164 RR2E545JQ
BS 165 165 RR2EZ86JQ
BS 166 306 RR2E545JQ
BS 307 307 RR2EZ86JQ
BS 308 309 RR2E545JQ
BS 310 311 RR2EZ86JQ
BS 312 385 RR2E545JQ
BS 386 386 RR2EZ86JQ
BS 387 422 RR2E545JQ
BS 423 423 RR2EZ86JQ
BS 424 424 RR2E545JQ
BS 425 425 RR2EZ86JQ
BS 426 445 RR2E545JQ
BS 446 446 RR2EZ86JQ
BS 447 623 RR2E545JQ
BS 624 624 RR2EZ86JQ
BS 625 679 RR2E545JQ
BS 680 680 RR2EZ86JQ
BS 681 722 RR2E545JQ
BS 723 723 RR2EZ86JQ
BS 724 731 RR2E545JQ
BS 732 732 RR2EZ86JQ
BS 733 869 RR2E545JQ
BS 870 974 RR2EZ86TF

RD RR2FZ18JQ 480 0 0
AAA
GAAGTAAAGAGAGAAAGTTTATATAAGATAGAGAAGAAAGAGTACTACAGAGATTTAGCT
TTT**AAAGAGTGTAGCAGAAGAACACAATAGTTGTTCCATCATCATCATAACAAGACGA
GAGAAGTAAATTACATTCTGGAATAACCAAAGCTATTCTCATACTGAGTCATGAACTCGT
CGTTGAACTTCTTGAAACTGTCCATGATCTCTGGCATCTCTTCTTCCGCAGGCAAGATCG
TTGTCCTCAGATGGAACACACCTTCTTTCTGTACAAAGCCAGAGCCAGGCACTGTGGAGA
TTCCTGTGGCTTCTAAGAGCTTCAAACAGTAGAAAACATCTGGCACTTTTCCTGCTTGTT
TAGCAGCTTGGAGAGCACCCGGAGGTAACCGGATTTGAGGAAACGAATACATCGCACCTT
CTGTGAAATTGCAGACAACGTTTTTGCAGCTGTTGAATCCATCAGTCATGATC
CTTG

QA 4 476 4 476
DS 

RD RR2EZ86JQ 706 0 0
AAAA
GAAGTAAAGAGAGAAAGTTTATATAAGATAGAGAAGAAAGAGTACTACAGAGATTTAGCT
TTTTAAA*GAGTGTAGCAGAAGAACACAATAGTTGTTCCATCATCATCATAACAAGACGA
GAGAAGTAAATTACATTCTGGAATAACCAAAGCTATTCTCATACTGAGTCATGAACTCGT
CGTTGAACTTCTTGAAACTGTCCATGACCTCTGGCATCTCTTCTTCCGCAAGCAAGATCG
TTGTCCTCAGATGGAACACACCTTCTTTCTGTCCAAAGCCAGAGCCAGGCACTGTGGAGA
TTCCTGTGGCTTCTAAGAGCTTCAAACAGTAGAAAACATCTGGCACTTTTCCTGCTTGTT
TAGCAGCTTGGAGAGCACCCGGAGGTAACCGGATTTGAGGAAACGAATACATCGCACCTT
CTGTGAAATTGCAGACAACGTTTTTGCAGCTGTTGAATCCATCAGTCATGATCCTTGCTC
TTCTTCTCAAAGATTCAAGAATCCCCTTGCTTTCACGGGCGAACTGGTCATATGAAATGT
CTCCAGGCTTTGGAGGACTAACCATCAAACCCATAAAGATCTGCGCAGAGACATTCGGAC
TCAGGGCGATCGATGCAACCTTGTATATCTCTTCAACAACCCTGGG*AGGGATGTTGGTC
ATCTCAAAGTAACCACCTCGCTGTCCACACTCTCCCCAATAA

QA 5 706 5 706
DS 

RD RR2E545JQ 869 0 0
ATGATTTTATATAATTTGCAGTTGAGAAAAAAGGAAGTACAGAGAGAAAGTTTATATAAG
ATAGAGAAGAAAGAGTACTACAGAGATTTCGCTTTTTAAAAGAGTGTCGCAGAAGAACAC
AATAGTTGTTCCATCATCATCATAACAAGAAGAGAGAAGTAAATCACATTCTGGAATAAC
CAAAGCTATTCTCATACTGAGTCATGAACTCGTCGTTGAACTTCTTGAAACTGTCCATGA
TCTCTGGCATCTCTTCTTCCGCAGGCAAGATCGTTGTCCTCAGATGGAACACACCTTCTT
TCTGTCAAA**CCAGAGCCAGGCACTGTGGAGATTCCTGTGGCTTCTAAGAGCTTCAAAC
AGTAGAAAACATCTGGCACTTTTCCGGCTTGTTTAGCAGCTTGGAGAGCACCCGGAGGTA
ACTGTATTTGAGGAAACGAATACATTGCACCTTCTGTGAAATTGCAGACAACGTTTTTGC
AGCTGTTGAATCCATCAGTCATGATCCTTGCTCTTCTTCTCAAAGATTCAAGAATCCCCT
TGCTTTCACGGGCGAACTGGTCATATGAAATGTCTCCAGGCTTTGGAGGACTAACCATCA
AACCCATAAAGATCTGCGCAGAGGCATTCGGACTCAGGGCGATCGATGCAACCTTGTATA
TCTCTTCAACAACCCTGGGGAGGGATGTTGGTCATCTCAAAGTAACCACCTCGCTGTCCA
CATTCTCCCCAGTAACCTTTAGAGACAGTGTGGAAAGATACAAGCTGGACTTCTTTGCTG
AACGGCGAAACCATATCCATCAACACCTTCTTGGAGCTGATAAAAGGACGCTCATCCTGG
TATATGTTCTGCTGATAAACCTCATCTCC

QA 1 869 1 869
DS 

RD RR2EZ86TF 471 0 0
ATCC
TTGCTCTTCTTCTCAAAGATTCAAGAATCCCCTTGCTTTCACGGGCGAACTGGTCATATG
AAATGTCTCCAGGCTTTGGAGGACTAACCATCAAACCCATAAAGATCTGCGCAGAGACAT
TCGGACTCAGGGCGATCGATGCAACCTTGTATATCTCTTCAACAACCCTGGG*AGGGATG
TTGGTCATCTCAAAGTAACCACCTCGCTGTCCACACTCTCCCCAATAACCTTTCGAGACA
GTGTGGAAAGATACAAGCTGGACTTCTTTGCTGAACGGCGAACCCATATCCATCAACACC
TTCTTGGAGCTGATAAAAGGACGCTCATCCTGGTATATGTTCTGCTGATAAACCTCATCT
CCCAGAAGAACCAACTTCTCGCTATAACAGAACCTCAATATCTCTCTTAAGTTAGCTTCA
CTTAGACACTGACCAGTTGGGTTCCCGGGGTTAATGATCACCATTGC

QA 5 471 5 471
DS 



AS 2 7

CO CL400Contig1 883 3 10 U
GATGACATAAAAGTGTATTATTTATAAACATGGAAGCAAATACAAAGCAGGAAGATCTGA
TTCCTCGAAGCAGATTGTTTCTTCCTTTTTTATATTCATTAGTATTAAAAAAAAAAAGAG
ATTATTTATTGCATCTCCACGTCCTCAGTCTGTGTCGCTACATAAACCATATTCTCCAGC
ATTTTGATTTATTACATTACATA**ACATTATATTTCTTATTTTATTCTAGTGTTCGATC
CTTCACACATATATAGGAGGATGTTCATACATATTTAGTCACAGAAATGACTTCAAACTC
AACTCCCACGTAAAGCTTATCCTTCACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCAT
GAACTCATCAAAACCCTTATCGGCATCATATTCTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTT
CTCAACATGATTGCGGTTAACTTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTC
CGCCTTTGGTTCATTGTTGATAAACCCTTCTCCCACTAAATACACAGAGAATGATTCGTC
TGCTTCCCTAAAACCACTTGGATGAACTTCAATTCTCCATTTGCGGTTTCCAACGACAAA
TGGATTGGAGAGATGACTTTGCCATTGAGAGGCTTCTCAATTAGGCTATAACATTCAGCT
GTTCCAGGTCTCTCAGTTTCCTGGTCAGGAAGAGTGGCACCGAACATACAACAATCTTCA
ATAAGGAACCCTTCGCTCTTAAGACCACACAGTGACATCAACGTTATTCCTTGTAGAATC
GGATTTGGTGATGCATCAAATTCCATTATTACATTGTTTTTGGGGTACCATTCTGGCTTT
AACTGACTTACGATATAGACCTGAAACTTGAGCTTAACGTCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW11JQ U 153
AF RR2E181JQ U 1
AF RR2B050JQ U 42
BS 1 47 RR2E181JQ
BS 48 48 RR2B050JQ
BS 49 116 RR2E181JQ
BS 117 117 RR2B050JQ
BS 118 170 RR2E181JQ
BS 171 171 RR2B050JQ
BS 172 542 RR2E181JQ
BS 543 543 RR2B050JQ
BS 544 608 RR2E181JQ
BS 609 883 RR2B050JQ

RD RR2GW11JQ 382 0 0
TGTCGCTACATAAACCATATTCTCCAGCATTTTGATTTATTACATTACATATAACATTAT
ATTTCTTATTTTATTCTAGTGTTCGATCCTTCACACATATATAGGAGGATGTTCATACAT
ATTTAGTCACAGAAATGACTTCAAACTCAACTCCCACGTAAAGCTTATCCTTCACCAAAT
AAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCATGAACTCATCAAAACCCTTATCGGCATCATATT
CTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTTCTCAACATGATTGCGGTTAACTTGATCCAATA
CTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTCCGCCTTTGGTTCATTGTTGATAAACCCTTCTC
CCACTAAATACACAGAGAATGA

QA 1 382 1 382
DS 

RD RR2E181JQ 611 0 0
GATGACATAAAAGTGTATTATTTATAAACATGGAAGCAAATACAAAGTAGGAAGATCTGA
TTCCTCGAAGCAGATTGTTTCTTCCTTTTTTATATTCATTAGTATTAAAAAAAAAA*GAG
ATTATTTATTGCATCTCCACGTCCTCAGTCTGTGTCGCTACATAAACCATTTTCTCCAGC
ATTTTGATTTATTACATTACATA**ACATTATATTTCTTATTTTATTCTAGTGTTCGATC
CTTCACACATATATAGGAGGATGTTCATACATATTTAGTCACAGAAATGACTTCAAACTC
AACTCCCACGTAAAGCTTATCCTTCACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCAT
GAACTCATCAAAACCCTTATCGGCATCATATTCTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTT
CTCAACATGATTGCGGTTAACTTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTC
CGCCTTTGGTTCATTGTTGATAAACCCTTCTCCCACTAAATACACAGAGAATGATTCGTC
TGTTTCCCTAAAACCACTTGGATGAACTTCAATTCTCCATTTGCGGTTTCCAACGACAAA
TGGATTGG
GGA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2B050JQ 842 0 0
ACAAAGCAGGAAGATCTGATTCCTCGAAGCAGATTGTTTCTTCCTTTTTTATATTCATTA
GTATTAAAAAAAAAAAGAGATTATTTATTGCATCTCCACGTCCTCAGTCTGTGTCGCTAC
ATAAACCATATTCTCCAGCATTTTGATTTATTACATTACATA**ACATTATATTTCTTAT
TTTATTCTAGTGTTCGATCCTTCACACATATATAGGAGGATGTTCATACATATTTAGTCA
CAGAAATGACTTCAAACTCAACTCCCACGTAAAGCTTATCCTTCACCAAATAAGGTTCAC
AAAGTTTCGACAGAGGCATGAACTCATCAAAACCCTTATCGGCATCATATTCTTCTCGAA
CCAAACACGAATCTGTTTTCTCAACATGATTGCGGTTAACTTGATCCAATACTCTCAGCT
TAAATTTCACGAAAGTCTCCGCCTTTGGTTCATTGTTGATAAGCCCTTCTCCCACTAAAT
ACACAGAGAATGATTCGTCTGCTTCCCTAAAACCACTTGGATGAACTTCAATTCTCCATT
TGCGGTTTCCAACGACAAATGGATTGGAGAGATGACTTTGCCATTGAGAGGCTTCTCAAT
TAGGCTATAACATTCAGCTGTTCCAGGTCTCTCAGTTTCCTGGTCAGGAAGAGTGGCACC
GAACATACAACAATCTTCAATAAGGAACCCTTCGCTCTTAAGACCACACAGTGACATCAA
CGTTATTCCTTGTAGAATCGGATTTGGTGATGCATCAAATTCCATTATTACATTGTTTTT
GGGGTACCATTCTGGCTTTAACTGACTTACGATATAGACCTGAAACTTGAGCTTAACGTC
TA

QA 1 842 1 842
DS 



CO CL400Contig2 1077 4 22 U
GGGTGCATATAAGCCTCACAGAAGAAAAAACTTAAGTTCATATCATTTGCAGCTTGTTAA
CATGTTACGACGACGACTAATACCCACTGAAAGTAACATGTTACGACGACCAATACCCAT
TGAAAAGATGGTGCAAGAGTTCAAGAAGAATCACCCAAATTCTCACTTGCTCAAGATAGA
CAATTTCTCTTTAGTCACAAAGTATGGGGTTGCTCGTGTCGAATCTTCTGATTTTGATAT
CTGTGGTCGCAAATGGAAAATCAATGTGGAGTATGACAAGAATGCAGAGCATGTCTCCAT
TTACTTAGAGAATCAAGATCCAGTAGACGTTAAGCTCAAGTTTCAGGTCTATGTCGTAAG
TCAGTTAAAGCCAGAATGGTACCCCAAAAACAATGTAATAATGGAATTTGATGCATCACC
AAATCCGATTCTACAAGGAATAACATTGATGTCACTGTGTGGTCTTAAGAGCGAAGGGTT
CCTTATTGAAGATTGTTGTATGTTCGGTGCCACTCTTCCTGACCAGGAAACTGAGAGACC
TGGAACAGCTGAATGTTATAGCCTAATTGAGAAGCCTCTCAATGGCAAAGTCACTTGGAT
GATGACCAAGTTCTCCTCTTTCGACCCTGAACAGGCTCATCTCTCCAATCCATTTGTCGT
TGGAAACCGCAAATGGAGAATTGAAGTTCATCCAAGTGGTTTTAGGGAAACAGACGAATC
ATTCTCTGTGTATTTAGTGGGAGAAAGGTTTATCAACAATGAACCAAAGGCGGAGACTTT
CGTGAAATTTAAGCTGAGAGTATTGGATCAAGTTAACCGCAATCATGTTGAGAAAACAGA
TTCGTGTTTGGTTCGAGAAGAATATGATGCCGATAAGGGTTTTGATGAGTTCATGCCTCT
GTCGAAACTTTGTGAACCTTATTTGGTGAAGGATAAGCTTTACGTGGGAGTTGAGTTTGA
AGTCATTTCTGTGACTAAATATGTATGAACATCCTCCTATATATGTGTGAAGGATCGAAC
ACTAGAATAAAATAAGAAATATAATGCTATGTAATGTAATAAATCAAAATGCTGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 15 15 15 15 
15 30 30 15 15 0 30 15 30 15 30 30 15 30 30 15 30 15 30 15 15 15 15 30 30 30 15 15 15 30 30 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B050TF U 9
AF RR2GW11TF U 9
AF RR2E181TF U 1
AF RR2FF66JQ C 308
BS 1 164 RR2E181TF
BS 165 165 RR2B050TF
BS 166 179 RR2E181TF
BS 180 180 RR2B050TF
BS 181 605 RR2E181TF
BS 606 606 RR2GW11TF
BS 607 643 RR2E181TF
BS 644 644 RR2GW11TF
BS 645 709 RR2E181TF
BS 710 710 RR2FF66JQ
BS 711 734 RR2E181TF
BS 735 735 RR2FF66JQ
BS 736 741 RR2E181TF
BS 742 742 RR2FF66JQ
BS 743 744 RR2E181TF
BS 745 745 RR2FF66JQ
BS 746 758 RR2E181TF
BS 759 759 RR2FF66JQ
BS 760 769 RR2E181TF
BS 770 770 RR2FF66JQ
BS 771 786 RR2E181TF
BS 787 1077 RR2FF66JQ

RD RR2B050TF 624 0 0
GG
AAGCCTCACAGAAGAAAAAACTTAAGTTCATATCATTTGCAGCTTGTTAACATGTTACGA
CGACGACTAATACCCACTGAAAGTAACATGTTACGACGACCAATACCCATTGAAAAGATG
GTGCAAGAGTTCAAGAAGAATCACCCAAATTCTCACTTGCTCAAGATAGACAATTTCTCT
TTAGTCACAAAGTATGGGGTTGCTCGTGTCGAATCTTCTGATTTTGATATCTGTGGTCGC
AAATGGAAAATCAATGTGGAGTATGACAAGAATGCAGAGCATGTCTCCATTTACTTAGAG
AATCAAGATCCAGTAGACGTTAAGCTCAAGTTTCAGGTCTATATCGTAAGTCAGTTAAAG
CCAGAATGGTACCCCAAAAACAATGTAATAATGGAATTTGATGCATCACCAAATCCGATT
CTACAAGGAATAACGTTGATGTCACTGTGTGGTCTTAAGAGCGAAGGGTTCCTTATTGAA
GATTGTTGTATGTTCGGTGCCACTCTTCCTGACCAGGAAACTGAGAGACCTGGAACAGCT
GAATGTTATAGCCTAATTGAGAAGCCTCTCAATGGCAAAGTCATCTCTCCAAT***CCAT
TTGTCGT*TGGAAACCGCAAAT

QA 3 624 3 624
DS 

RD RR2GW11TF 675 0 0
GG
AAGCCTCACAGAAGAAAAAACTTAAGTTCATATCATTTGCAGCTTGTTAACATGTTACGA
CGACGACTAATACCCACTGAAAGCAACATGTTACGACGACCAATACCCATTGAAAAGATG
GTGCAAGAGTTCAAGAAGAATCACCCAAATTCTCACTTGCTCAAGATAGACAATTTCTCT
TTAGTCACAAAGCATGGGGTTGCTCGTGTCGAATCTTCTGATTTTGATATCTGTGGTCGC
AAATGGAAAATCAATGTGGAGTATGACAAGAATGCAGAGCATGTCTCCATTTACTTAGAG
AATCAAGATCCAGTAGACGTTAAGCTCAAGTTTCAGGTCTATGTCGTAAGTCAGTTAAAG
CCAGAATGGTACCCCAAAAACAATGTAATAATGGAATTTGATGCATCACCAAATCCGGTT
CTACAAGGAATAAAATTGATGTCACTGTGTGGTCTTAAGAGCGAAGGGTTTCTTATTGAA
GATTGTTGTATGTTCGGTGCCACTCTTCCTGACCAGGAAACTGAGAGACCTGGAACAGCT
GAATGTTATAGCCTAATTGAGAAGCCTCTTAATGGCAAAGTCACTTGGATGATGACCAAG
TTCTCCTCTTTCGACCCTGAAAAGGCTCATCTCTCCAATCCATTTGTCGTTGGAAACCGC
AAATGGAGAATTG

QA 3 675 3 675
DS 

RD RR2E181TF 787 0 0
GGGTGCATATAAGCCTCACAGAAGAAAAAACTTAAGTTCATATCATTTGCAGCTTGTTAA
CATGTTACGACGACGACTAATACCCACTGAAAGTAACATGTTACGACGACCAATACCCAT
TGAAAAGATGGTGCAAGAGTTCAAGAAGAATCACCCAAATTCTCGCTTGCTCAAGATAGG
CAATTTCTCTTTAGTCACAAAGTATGGGGTTGCTCGTGTCGAATCTTCTGATTTTGATAT
CTGTGGTCGCAAATGGAAAATCAATGTGGAGTATGACAAGAATGCAGAGCATGTCTCCAT
TTACTTAGAGAATCAAGATCCAGTAGACGTTAAGCTCAAGTTTCAGGTCTATGTCGTAAG
TCAGTTAAAGCCAGAATGGTACCCCAAAAACAATGTAATAATGGAATTTGATGCATCACC
AAATCCGATTCTACAAGGAATAACATTGATGTCACTGTGTGGTCTTAAGAGCGAAGGGTT
CCTTATTGAAGATTGTTGTATGTTCGGTGCCACTCTTCCTGACCAGGAAACTGAGAGACC
TGGAACAGCTGAATGTTATAGCCTAATTGAGAAGCCTCTCAATGGCAAAGTCACTTGGAT
GATGATCAAGTTCTCCTCTTTCGACCCTGAACAGGCTCATCTCCCCAATCCATTTGTCGT
TGGAAACCGCAAATGGAGAATTGAAGTTCATCCAAGTGGTTTTAGGGAA*CAGACGAATC
ATTCTCTGTGTATT*AGTGGG*GAGAGGTTTATCAACA*TGAACCAAAG*CGGAGACTTT
CGTGAA
T

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2FF66JQ 770 0 0
GAGAATCAAGATCCAGTAGACGTTAAGCTCAAGTTTCAGGTCTATGTCGTAAGTCAGTTA
AAGCCAGAATGGTACCCCAAAAACAATGTAATAATGGAATTTGATGCATCACCAAATCCG
ATTCTGCAAGGAATAACATTGATGTCACTGTGTGGTCTTAAGAGCGAAGGGTTCCTTATT
GAAGATTGCTGTATGTTCGGTGCCACTCTTCCTGACCAGGAAACTGAGAGACCTGGAACA
GCTGAATGTTATAGCCTAATTGAGAAGCCTCTCAATGGCAAAGTCACTTGGATGATGACC
AAGTTCTCCTCTTTCGACCCTGAACAGGCTCATCTCTCCAATCCATTTGTCGTTGGAAAC
CGCAAATGGAGAATTGAAGTTCATCCAAGTGGTTTTAGGGAAACAGACGAATCATTCTCT
GTGTATTTAGTGGGAGAAGGGTTTATCAACAATGAACCAAAGGCGGAGACTTTCGTGAAA
TTTAAGCTGAGAGTATTGGATCAAGTTAACCGCAATCATGTTGAGAAAACAGATTCGTGT
TTGGTTCGAGAAGAATATGATGCCGATAAGGGTTTTGATGAGTTCATGCCTCTGTCGAAA
CTTTGTGAACCTTATTTGGTGAAGGATAAGCTTTACGTGGGAGTTGAGTTTGAAGTCATT
TCTGTGACTAAATATGTATGAACATCCTCCTATATATGTGTGAAGGATCGAACACTAGAA
TAAAATAAGAAATATAATGCTATGTAATGTAATAAATCAAAATGCTGGAG

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 12

CO CL401Contig1 739 12 8 U
GGATCGCTGACTTATTTTGCGAGCAAACAAAACATTTGGAGATCAACGAGCATAGTAGAT
CCATGGCGATATCTCATGTCCAGCCTCTTTTCCTCGCATCACTCTTCTTCTTACCTGCTT
TGTACGCCATCGATTTCGAATATTGCAAAGATAAACCAAATAAGTTCGGTAACGTAACTG
ATGTGACGGTCACCTATACGGACGATAACAGATGTACGGTATACGTTTCCGTTGACACAA
ACAAGGACATAAACCTTGATGACGGAATTGCAATGCTAGATCTTGCAAACGGCGACAGTA
AACCCACGGGCGGAAACTTTTACCGGCTTGTTGACTGTGCGCCTTTCCCTATTGGACTTG
GCGAACACCTCGTTTTAACGTTTGATGACCTTATTTTGCAACACGAGGGTCACGTGAGAT
ATGATAAGGGTATTTTACTTTTGGCTACTTTCGATGAACAAGTTGCAATGTGTATCAACT
TCAATCTGAATGGTTCCTCAGAATCAGCAGCAGTCTCCGCATAATCAAGTACTTGGCTGG
TGATTTTTTTTTCTTTCCTTAAGAAAAAAAATCACATGTGTGTCTCTCTCTATTTGGCTA
CCCTTTTATGTGTTGTCCAACAAATAAAACAAAACCTATAAACCATTGTTTGATGTCTCT
CTGTTGTAATTTTATTTTGATTTATGTGAACTTGAATGTCGTTTTGTTTGTTTCGTTTTG
GATCCAAGATGAATTTTCG


BQ
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 
10 50 35 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 45 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 10 60 60 60 60 60 60 60 0 45 60 65 65 65 65 65 65 15 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 
70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 55 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G063TF U 1
AF RR2EJ09TF U 1
AF RR2GX96TF U 1
AF RR2GX96JQ C 108
AF RR2FN19TF U 1
AF RR2G063JQ C 300
AF RR2FN19JQ C 284
AF RR2EJ09JQ C 113
AF RR2B932JQ C 1
AF RR2B932TF U 1
AF RR2B896JQ C 1
AF RR2B896TF U 1
BS 1 32 RR2EJ09TF
BS 33 33 RR2GX96TF
BS 34 338 RR2EJ09TF
BS 339 339 RR2GX96TF
BS 340 624 RR2EJ09TF
BS 625 639 RR2GX96TF
BS 640 712 RR2FN19TF
BS 713 739 RR2B896TF

RD RR2G063TF 571 0 0
GGATCGCTGACTTATTTTGCGAGCAAACAAAACATTTGGAGATCAACGAGCATAGTAGAT
CCTTGGCGATATCTCATGTCCAGCCTCTTTTCCTCGCATCACTCTTCTTCTTACCTGCTT
TGTACGCCATCGATTTCGAATATTGCAAAGATATACCAAATAAGTTCGGTAACGTAACTG
ATGTGACGGTCACCTATACGGACGATAACAGATGTACGGTATACGTTTCCGTTGACACAA
T*AGGGACATAAACCTTGATGACGGAATTGCAATGCTAGATCTTGCAAACGGCGACAGTA
AACCCACGGGCGGAAACTTTTACCGGCTTGTTGACTGTGCGCCTTTCCCTATTGGACTTG
GCGAACACCTCGTTTTAACGTTTGATGACCTTATTTTGCAACACGAGGGTCACGTGAGAT
ATGATAAGGGTATTTTACTTTTGGCTACTTTCGATGAACAAGTTGCAATGTGTATCAACT
TCAATCTGAATGGTTCCTCAGAATCAGCAGCAGTCTCCGCATAATCAAGTACTTGGCTGG
TGATTTTTTTT*CTTTCCTTAAGAAAAAAAA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2EJ09TF 624 0 0
GGATCGCTGACTTATTTTGCGAGCAAACAAAATATTTGGAGATCAACGAGCATAGTAGAT
CCATGGCGATATCTCATGTCCAGCCTCTTTTCCTCGCATCACTCTTCTTCTTACCTGCTT
TGTACGCCATCGATTTCGAATATTGCAAAGATAAACCAAATAAGTTCGGTAACGTAACTG
ATGTGACGGTCACCTATACGGACGATAACAGATGTACGGTATACGTTTCCGTTGACACAA
ACAAGGACATAAACCTTGATGACGGAATTGCAATGCTAGATCTTGCAAACGGCGACAGTA
AACCCACGGGCGGAAACTTTTACCGGCTTGTTGACTGTTCGCCTTTCCCTATTGGACTTG
GCGAACACCTCGTTTTAACGTTTGATGACCTTATTTTGCAACACGAGGGTCACGTGAGAT
ATGATAAGGGTATTTTACTTTTGGCTACTTTCGATGAACAAGTTGCAATGTGTATCAACT
TCAATCTGAATGGTTCCTCAGAATCAGCAGCAGTCTCCGCATAATCAAGTACTTGGCTGG
TGATTTTTTTTTCTTTCCTTAAGAAAAAAAATCACATGTGTGTCTCTCTCTATTTGGCTA
CCCTTTTATGTGTTGTCCAACAAA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2GX96TF 639 0 0
GGATCGCTGACTTATTTTGCGAGCAAACAAAACATTTGGAGATCAACGAGCATCGTAGAT
TCATGGCGATATCTCATGTCCAGCCTCTTTTCCTCGCATCACTCTTCTTCTTACCTGCTT
TGTACGCCATCGATTTCGAATATTGCAAAGATAAACCAAATAAGTTCGGTAACGTAACTG
ATGTGACAGTCACCTATACGGACGATAACAGATGTACGGTATACGTTTCCGTTGACACAA
ACAAGGACATAAACCCTGATGACGGAATTGCATTGCTAGAACTTGCAAAGGGCGACAGTA
AACCCACGGGGGGGAACTTTTACCGGCTTCTTGACTGTGCGCCTTTCCCTATTGGACTTG
GCGAACACCTCGTTTTAACGTTTGATGACCTTATTTTGCAACACGAGGGTGACGTGAGAT
ATGATAAGGGTATTTTACTTTTGGCTACTTTCGATGAAAAAGTTGCAATGTGTATCAACT
TCAATCTGAATGGTTCCTCAGAATCAGCAGCAGTCTCCGCATAATCAAGTACTTGGCTGG
TGATTTTTTTTTCTTTCCTTCAGAAAAAAA*TCACATGTGTGTCTCTCTCTATTTGGCTA
CCCTTTTTTGTGTTGTCCAACAAATAAAACAAAACCTAT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2GX96JQ 605 0 0
TTCTTACCTGCTTTGTACGCCATCGATTTCGAATATTGCAAAGATAAACCAAATAAGTTC
GGTAACGTAACTGATGTGACAGTCACCTATACGGACGATAACAGATGTACGGTATACGTT
TCCGTTGACACAAACAAGGACATAAACCCTGATGACGGAATTGCATTGCTAGAACTTGCA
AAGGGCGACAGTAAACCCACGGGGGGGAACTTTTACCGGCTTCTTGACTGTGCGCCTTTC
CCTATTGGACTTGGCGAACACCTCGTTTTAACGTTTGATGACCTTATTTTGCAACACGAG
GGTGACGTGAGATATGATAAGGGTATTTTACTTTTGGCTACTTTCGATGAAAAAGTTGCA
ATGTGTATCAACTTCAATCTGAATGGTTCCTCAGAATCAGCAGCAGTCTCCGCATAATCA
AGTACTTGGCTGGTGATTTTTTTTTCTTTCCTTCAGAAAAAAA*TCACATGTGTGTCTCT
CTCTATTTGGCTACCCTTTTTTGTGTTGTCCAACAAATAAAACAAAACCTATAAACCATT
GTTTGATGTCTCTCTGTTGTAATTTTGTTTTGATTTATGTGAACTTGAATGTCGTTTTGT
TTGTT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2FN19TF 721 0 0
GGATCGCTGACTTATTTTGCGAGCAAACAAAACATTTGGAGATCAACGAGCATAGTAGAT
CCATGGCGATATCTCATGTCCAGCCTCTTTTCCTCGCATCACTCTTCTTCTTACCTGCTT
TGTACGCCATCGATTTCGAATATTGCAAAGATAAACCAAATAAGTTCGGTAACGTAACTG
ATGTGACGGTCACCTATACGGACGATAACAGATGTACGGTATACGTTTCCGTTGACACAA
ACAAGGACATAAACCTTGATGACGGAATTGCAATGCTAGATCTTGCAAACGGCGACAGTA
AACCCACGGGCGGAAACTTTTACCGGCTTGTTGACTGTGCGCCTTTCCCTATTGGACTTG
GCGAACACCTCGTTTTAACGTTTGATGACCTTATTTTGCAACACGAGGGTCACGTGAGAT
ATGATAAGGGTATTTTACTTTTGGCTACTTTCGATGAACAAGTTGCAATGTGTATCAACT
TCAATCTGAATGGTTCCTCAGAATCAGCAGCAGTCTCCGCATAATCAAGTACTTGGCTGG
TGATTTTTTTTTCTTTCCTTAAGAAAAAAAATCACATGTGTGTCTCTCTCTATTTGGCTA
CCCTTTTATGTGTTGTCCAACAAATAAAACAAAACCTATAAACCATTGTTTGATGTCTCT
CTGTTGTAATTTTATTTTGATTTATGTGAACTTGAATGTCGTTTTGTTTGTT
AAAAAAAAA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2G063JQ 409 0 0
AAC
CCCACGGGCGGAAACTTTTACCGGCTTGTTGACTGTGCGCCTTTCCCTATTGGACTTGGC
GAACACCTCGTTTTAACGTTTGATGACCTTATTTTGCAACACGAGGGTCACGTGAGATAT
GATAAGGGTATTTTACTTTTGGCTACTTTCGATGAACAAGTTGCAATGTGTATCAACTTC
AATCTGAATGGTTCCTCAGAATCAGCAGCAGTCTCCGCATAATCAAGTACTTGGCTGGTG
ATTTTTTTT*CTTTCCTTAAGAAAAAAAATCACATGTGTGTCTCTCTCTATTTGGCTACC
CTTTTATGTGTTGTCCAACAAATAAAACAAAACCTATAAACCATTGTCTGATGTCTCTCT
GTTGTAATTTTATTTTGATTTATGTGAACTTGAATGTCGTTTTG
GT

QA 4 407 4 407
DS 

RD RR2FN19JQ 429 0 0
TGCAAACGGCGACAGTAAACCCACGGGCGGAAACTTTTACCGGCTTGTTGACTGTGCGCC
TTTCCCTATTGGACTTGGCGAACACCTCGTTTTAACGTTTGATGACCTTATTTTGCAACA
CGAGGGTCACGTGAGATATGATAAGGGTATTTTACTTTTGGCTACTTTCGATGAACAAGT
TGCAATGTGTATCAACTTCAATTTGAATGGTTCCTCAGAATCAGCAGCAGTTTCCGCATA
ATCAAGTACTTGGCTGGTGATTTTTTTTTCTTTCCTTAAGAAAAAAAATCACATGTGTGT
CTCTCTCTATTTGGCTACCCTTTTATGTGTTGTCCAACAAATAAAACAAAACCTATAAAC
CATTGTTTGATGTCTTTCTGTTGTAATTTTATTTTGATTTATGTGAACTTGAATGTCGTT
TTGTTTGTT

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR2EJ09JQ 601 0 0
ACCTGCTTTGTACGCCATCGATTTCGAATATTGCAAAGATAAACCAAATAAGTTCGGTAA
CGTAACTGATGTGACGGTCACCTATACGGACGATAACAGATGTACGGTATACGTTTCCGT
TGACACAAACAAGGACATAAACCTTGATGACGGAATTGCAATGCTAGATTTTGCAAACGG
GGACAGTAAACCCACGGGGGGAAACTTTTACCGGCTTGTTGACTGTTCGCCTTTCCCTAT
TGGACTTGGGGAACACCTCGTTTTAACGTTTGATGACCTTATTTTGCAACACGAGGGTCA
CGTGAGATATGATAAGGGTATTTTACTTTTGGCTACTTTCGATGAACAAGTTGCAATGTG
TATCAACTTCAATTTGAATGGTTCCTCAGAATCAGCAGCAGTTTCCGCATAATCAAGTAC
TTGGCTGGTGATTTTTTTTTTTTTCCTTAAGAAAAAAAATCACATGTGTGTCTCTCTCTA
TTTGGCTACCCTTTTATGTGTTGTCCAACAAATAAAACAAAACCTATAAACCATTGTTTG
ATGTCTTTCTGTTGTAATTTTATTTTGATTTATGTGAACTTGAATGTCGTTTTGTTTGTT
T

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2B932JQ 708 0 0
GGATCGCTGACTTATTTTGCGAGCAAACAAAACATTTGGAGATCAACGAGCATAGTAGAT
CCATG*CGATATCTCATGTCCAGCCTCTTTTCCTCGCATCACTCTTCTTCTTACCTGCTT
TGTACGCCATCGATTTCGAATATTGCAAAGATAAACCAAATAAGTTCGGTAACGTAACTG
ATGTGACGGTCACCTATACGGACGATAACAGATGTACGGTATACGTTTCCGTTGACACAA
ACAAGGACATAAACCTTGATGACGGAATTGCGATGCTAGATCTTGCAAACGGCGACAGTA
AACCCACGGGCGGAAACTTTTACCGGCTTGTTGACTGTGCGCCTTTCCCTATTGGATTTG
GCGAACACCTCGTTTTAACGTTTGATGACCTTATTTTGCAACACGAGGGTCACGTGAGAT
ATGATAAGGGTATTTTACTTTTGGCTACTTTCGATGAACAAGTTGCAATGTGTATCAACT
TCAATCTGAATGGTTCCTCAGAATCAGCAGCAGTCTCCGCATAATCAAGTACTTGGCTGG
TGATTTTTTTTTCTTTCCTTAAGAAAAAAAATCACATGTGTGTCTCTCTCTATTTGGCTA
CCCTTTTATGTGTTGTCCAACAAATAAAACAAAACCTATAAACCATTGTTTGATGTCTCT
CTGTTGTAATTTTATTTTGATTTATGTGAACTTGAATGTCGTTTTGTT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2B932TF 708 0 0
GGATCGCTGACTTATTTTGCGAGCAAACAAAACATTTGGAGATCAACGAGCATAGTAGAT
CCATG*CGATATCTCATGTCCAGCCTCTTTTCCTCGCATCACTCTTCTTCTTACCTGCTT
TGTACGCCATCGATTTCGAATATTGCAAAGATAAACCAAATAAGTTCGGTAACGTAACTG
ATGTGACGGTCACCTATACGGACGATAACAGATGTACGGTATACGTTTCCGTTGACACAA
ACAAGGACATAAACCTTGATGACGGAATTGCGATGCTAGATCTTGCAAACGGCGACAGTA
AACCCACGGGCGGAAACTTTTACCGGCTTGTTGACTGTGCGCCTTTCCCTATTGGATTTG
GCGAACACCTCGTTTTAACGTTTGATGACCTTATTTTGCAACACGAGGGTCACGTGAGAT
ATGATAAGGGTATTTTACTTTTGGCTACTTTCGATGAACAAGTTGCAATGTGTATCAACT
TCAATCTGAATGGTTCCTCAGAATCAGCAGCAGTCTCCGCATAATCAAGTACTTGGCTGG
TGATTTTTTTTTCTTTCCTTAAGAAAAAAAATCACATGTGTGTCTCTCTCTATTTGGCTA
CCCTTTTATGTGTTGTCCAACAAATAAAACAAAACCTATAAACCATTGTTTGATGTCTCT
CTGTTGTAATTTTATTTTGATTTATGTGAACTTGAATGTCGTTTTGTT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2B896JQ 739 0 0
GGATCGCTGACTTATTTTGCGAGCAAACAAAACATTTGGAGATCAACGAGCATCGTAGAT
TCATGGCGATATCTCATGTCCAGCCTCTTTTCCTCGCATCACTCTTCTTCTTACCTGCTT
TGTACGCCATCGATTTCGAATATTGCAAAGATAAACCAAATAAGTTCGGTAACGTAACTG
ATGTGACGGTCACCTATACGGACGATAACAGATGTACGGTATACGTTTCCGTTGACACAA
ACAAGGACATAAACCTTGATGACGGAATTGCATTGCTAGAGCTTGCAAAGGGCGACAGTA
AACCCACGGGGGGGAACTTTTACCGGCTTCTTGACTGTACGCCTTTCCCTATTGGACTTG
GCGAACACCTCGTTTTAACGTTTGATGACCTTATTTTGCAACACGAGGGTGACGTGAGAT
ATGATAAGGGTATTTTACTTTTGGCTACTTTCGATGAAAAAGTTGCAATGTGTATCAACT
TCAATCTGAATGGTTCCTCAGAATCAGCAGCAGTCTCCGCATAATCAAGTACTTGGCTGG
TGATTTTTTTTTCTTTCCTTCAGAAAAAAA*TCACATGTGCGTCTCTCTCTATTTGGCTA
CCCTTTTTTGTGTTGTCCAACAAATAAAACAAAACCTATAAACCATTGTTTGATGTCTCT
CTGTTGTAATTTTGTTTTGATTTATGTGAACTTGAATGTCGTTTTGTTTGTTTCGTTTTG
GATCCAAGATGAATTTTCG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2B896TF 739 0 0
GGATCGCTGACTTATTTTGCGAGCAAACAAAACATTTGGAGATCAACGAGCATCGTAGAT
TCATGGCGATATCTCATGTCCAGCCTCTTTTCCTCGCATCACTCTTCTTCTTACCTGCTT
TGTACGCCATCGATTTCGAATATTGCAAAGATAAACCAAATAAGTTCGGTAACGTAACTG
ATGTGACGGTCACCTATACGGACGATAACAGATGTACGGTATACGTTTCCGTTGACACAA
ACAAGGACATAAACCTTGATGACGGAATTGCATTGCTAGAGCTTGCAAAGGGCGACAGTA
AACCCACGGGGGGGAACTTTTACCGGCTTCTTGACTGTACGCCTTTCCCTATTGGACTTG
GCGAACACCTCGTTTTAACGTTTGATGACCTTATTTTGCAACACGAGGGTGACGTGAGAT
ATGATAAGGGTATTTTACTTTTGGCTACTTTCGATGAAAAAGTTGCAATGTGTATCAACT
TCAATCTGAATGGTTCCTCAGAATCAGCAGCAGTCTCCGCATAATCAAGTACTTGGCTGG
TGATTTTTTTTTCTTTCCTTCAGAAAAAAA*TCACATGTGCGTCTCTCTCTATTTGGCTA
CCCTTTTTTGTGTTGTCCAACAAATAAAACAAAACCTATAAACCATTGTTTGATGTCTCT
CTGTTGTAATTTTGTTTTGATTTATGTGAACTTGAATGTCGTTTTGTTTGTTTCGTTTTG
GATCCAAGATGAATTTTCG

QA 1 739 1 739
DS 



AS 2 10

CO CL402Contig1 1440 7 28 U
GGATAACATAAACAAACGCTCTTACGAATTATAAAAATTAATAATATAAATTCTCTGAAT
TTTCCTTTTTCAATTTCGCGCGGTTAAGGATGGCTAAGAACGTTCTGGTAACCGGCGGCG
CTGGCTACATCGGGAGCCACACGGTGCTTCAACTTCTCAACGGCGGTTACTCCGTCGTAG
TTGTCGACAATCACGACAATTCGTCCGCTGCGTCTCTCCACCGAGTCAAAAAACTCGCCG
GCGATAACGGAAACCGCCTCTCCTTTCATGAGGTGGATCTCAGAGACCGGCCTGCGCTTG
AGAAGATTTTCTCTGAAACTAAGTTTGATGCAGTGATACACTTTGCTGGACTTAAAGCAG
TAGGTGAGAGTGTTGAGAAGCCTTTGCTTTATTATAATAATAACCTTTTTGGCACTGTCA
TTCTTTTGGAGGTTATGTCCAAATACGGCTGCAAAAATCTTGTGTTTTCGTCATCAGCTA
CTGTCTATGGCTGGCCTAAAGAGGTTCCTTGCACCGAGGAGTCCCCAATCTCTGCAACCA
ACCCTTACGGCCGTACCAAGCTTTTTATCGAAGAGATTTGCCGGGATGTGCATCGTTCTG
ACCCGGAATGGAAGATCATATTGCTTAGATACTTCAACCCTGTTGGTGCACATCCTAGTG
GTTACATTGGTGAAGATCCTCTTGGAGTTTCAAACAATCTCATGCCTTATGTCCAGCAAG
TTGCGGTTGGCCGGAGACCTCACCTCACCGTCTTTGGAACCGACTACAAGACAAAGGATG
GTACAGGGGTTAGAGATTACATTCATGTGATTGATTTAGCAGATGGACACATAGCAGCTC
TCCGCAAGCTAGATGATCCCAAAATCAGTTGTGAGGTATACAATCTTGGAACTGGTAATG
GAACGTCAGTTCTTGAGATGGTAGCTGCCTTTGAGAAGGCATCCGGAAAGAAAATCCCGC
TGGTGTTGGCTGGACGACGTCCTGGAGACGCTGAGATTGTTTTCGCCTCAACAGAGAAAG
CAGAACGCGAGCTTAATTGGAAGGCTAAGTATGGGATCGAAGACATGTGTAGGGATCTAT
GGAACTGGGCCAGCAATAATCCTTACGGCTACGCCTCCTCGAATGGCTCCTCTTAATTCT
TGTTCTTTTCTCTTTGCAGTAGTTATTCATTTTTATAAAACACATAAGAAAATGCTGATC
AGAACCCACAGTTTACAAGGGATTACTCCTAATTTATCATAGCAGTTCTTGATATTTAAA
TCGTCATTTCTACTCTTAGTATATAGTTTTTACTCGTTTTTGTTATGTTTCTTAAAATTG
ATTAATGTAATCATTCAGATATTTTCTGTTTACTATGCTTATTCAGTCCTCCCTACCATT
GTAACTTGTAATACAATGTCCTCATTCAACCTATGAAAGCTTGTAATTATATTTGCAATC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2CO41TF U 1
AF RR2G333TF U 3
AF RR2AY04TFB U 487
AF RR2A545TF U 336
AF RR2DP33JQ C 659
AF RR2AY04JQ C 607
AF RR2A545JQ C 688
BS 1 80 RR2CO41TF
BS 81 81 RR2G333TF
BS 82 526 RR2CO41TF
BS 527 527 RR2A545TF
BS 528 529 RR2CO41TF
BS 530 530 RR2A545TF
BS 531 571 RR2CO41TF
BS 572 572 RR2A545TF
BS 573 626 RR2CO41TF
BS 627 627 RR2A545TF
BS 628 662 RR2CO41TF
BS 663 663 RR2G333TF
BS 664 678 RR2CO41TF
BS 679 689 RR2G333TF
BS 690 690 RR2A545TF
BS 691 724 RR2G333TF
BS 725 725 RR2A545TF
BS 726 733 RR2G333TF
BS 734 734 RR2A545TF
BS 735 743 RR2G333TF
BS 744 744 RR2A545TF
BS 745 758 RR2G333TF
BS 759 759 RR2A545TF
BS 760 771 RR2G333TF
BS 772 1024 RR2A545TF
BS 1025 1025 RR2AY04JQ
BS 1026 1046 RR2A545TF
BS 1047 1440 RR2AY04JQ

RD RR2CO41TF 678 0 0
GGATAACATAAACAAACGCTCTTACGAATTATAAAAATTAATAATATAAATTCTCTGAAT
TTTCCTTTTTCAATTTCGCGTGGTTAAGGATGGCTAAGAACGTTCTGGTAACCGGCGGCG
CTGGCTACATCGGGAGCCACACGGTGCTTCAACTTCTCAACGGCGGTTACTCCGTCGTAG
TTGTCGACAATCACGACAATTCGTCCGCTGCGTCTCTCCACCGAGTCAAAAAACTCGCCG
GCGATAACGGAAACCGCCTCTCCTTTCATGAGGTGGATCTCAGAGACCGGCCTGCGCTTG
AGAAGATTTTCTCTGAAACTAAGTTTGATGCAGTGATACACTTTGCTGGACTTAAAGCAG
TAGGTGAGAGTGTTGAGAAGCCTTTGCTTTATTATAATAATAACCTTTTTGGCACTGTCA
TTCTTTTGGAGGTTATGTCCAAATACGGCTGCAAAAATCTTGTGTTTTCGTCATCAGCTA
CTGTCTATGGCTGGCCTAAAGAGGTTCCTTGCACCGAGGAGTCCCCGATTTCTGCAACCA
ACCCTTACGGCCGTACCAAGCTTTTTATCGAGGAGATTTGCCGGGATGTGCATCGTTCTG
ACCCGGAATGGAAGATCATATTGCTTCGATACTTCAACCCTGTTGGTGCACATCCTAGTG
GT*ACATTGGTGAAGATC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2G333TF 769 0 0
GG
AACATAAACAAACGCTCTTACGAATTATAAAAATTAATAATATAAATTCTCTGAATTTTC
CTTTTTCAATTTCGCGCGGTTAAGGATGGCTAAGAACGTTCTGGTAACCGGCGGCGCTGG
CTACATCGGGAGCCACACGGTGCTTCAACTTCTCAACGGCGGTTACTCCGTCGTAGTTGT
CGACAATCACGACAATTCGTCCGCTGCGTCTCTCCACCGAGTCAAAAAACTCGCCGGCGA
TAACGGAAACCGCCTCTCCTTTCATGAGGTGGATCTCAGAGACCGGCCTGCGCTTGAGAA
GATTTTCTCTGAAACTAAGTTTGATGCAGTGATACACTTTGCTGGACTTAAAGCAGTAGG
TGAGAGTGTTGAGAAGCCTTTGCTTTATTATAATAATAACCTTTTTGGCACTGTCATTCT
TTTGGAGGTTATGTCCAAATACGGCTGCAAAAATCTTGTGTTTTCGTCATCAGCTACTGT
CTATGGCTGGCCTAGAGAGGTTCCTTGCACCGAGGAGTCCCCGATTTCTGCAACCAACCC
TTACGGCCGTACCAAGCTTTTTATCGAGGAGATTTGCCGGGATGTGCATCGTTCTGACCC
GGAATGGAAGATCATATTGCTTCGATACTTCAACCCTGTTGGTGCACATCCTAGTGGTTA
CATTGGTGAAGATCCTCTTGGAGTTCCAAACAATCTCATGCCTTATGTCCAGCAAGTTGC
AGTTGGCCG*AGACCTCAC*TCACCGTCTTTGGA*CCGACTACAAGA

QA 3 769 3 769
DS 

RD RR2AY04TFB 534 0 0
ATGGCTGGGCTAAAGAGGTTCCTTGGACCGAGGAGTCCCCAATCTCTGCAACCAACCCTG
ATGGCCGTACCAAGCTTTTTATCGAAGAGATTTGCCGGGATGTGCATCGTTCTGACCCGG
AATGGAAGATCATATTGCTTAGATACTTCAACCCTGTTGGTGCACATCCTAGTGGTTACA
TTGGTGAAGATCCTCTTGGAGTTTCAAACAATCTCATGCCTTATGTCCAGCAAGTTGCGG
TTGGCCGGAGACCTCACCTCACCGTCTTTGGAACCGACTACAAGACAAAGGATGGTACAG
GGGTTAGAGATTACATTCATGTGATTGATTTAGCAGATGGACACATAGCAGCTCTCCGCA
AGCTAGATGATCCCAAAATCAGTTGTGAGGTATACAATCTTGGAACTGGTAATGGAACGT
CAGTTCTTGAGATGGTAGCTGCCTTTGAGAAGGCATCCGGAAAGAAAATCCCGCTGGTGT
TGGCTGGACGACGTCCTGGAGACGCTGAGATTGTTTTCGCCTCAACAGAGAAAG

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2A545TF 711 0 0
GG
ACACTTTGCTGGACTTAAAGCAGTAGGTGAGAGTGTTGAGAAGCCTTTGCTCTATTATAA
TAATAACCTTTTTGGCACTGTCATTCTTTTGGAGGTTATGTCCAAATACGGCTGCAAAAA
TCTTGTGTTTTCATCATCAGCTACTGTCTATGGCTGGCCTAAAGAGGTTCCTTGCACCGA
GGAGTCCCCAATCTCTGCAACCAACCCTTATGGCCGTACCAAGCTTTTTATCGAAGAGAT
TTGCCGGGATGTGCATCGTTCTGACCCGGAATGGAAGATCATATTGCTTAGATACTTCAA
CCCTGTTGGTGCACATCCTAGTGGTTACATTGGTGAAGATCCTCTTGGAGTTTCAAACAA
TCTCATGCCTTATGTCCAGCAAGTTGCGGTTGGCCGGAGACCTCACCTCACCGTCTTTGG
AACCGACTACAAGACAAAGGATGGTACAGGGGTTAGAGATTACATTCATGTGATTGATTT
AGCAGATGGACACATAGCAGCTCTCCGCAAGCTAGATGATCCCAAAATCAGTTGTGAGGT
ATACAATCTTGGAACTGGTAATGGAACGTCAGTTCTTGAGATGGTAGCTGCCTTTGAGAA
GGCATCCGGAAAGAAAATCCCGCTGGTGTTGGCTGGACGACGTCCTGGAGACGCTGAGAT
TGTTTTCGCCTCAACAGAGAAAGCAGA*CGCGAGCTTAATTGGAAGGCT

QA 3 711 3 711
DS 

RD RR2DP33JQ 693 0 0
TGGTTACATTGGTGAAGATCCTCTTGGAGTTCCAAACAATCTCATGCCTTATGTCCAGCA
AGTTGCGGTTGGCCGGAGACCTCACCTCACCGTCTTTGGAACCGACTACAAGACAAAGGA
TGGTACAGGGGTTAGAGATTACATTCATGTGATTGATTTAGCAGATGGACACATAGCAGC
TCTCCGCAAGCTAGATGATCCCAAAATCAGTTGTGAGGTATACAATCTTGGAACTGGTAA
TGGAACGTCAGTTCTTGAGATGGTAGCTGCCTTTGAGAAGGCATCCGGAAAGAAAATCCC
GCTGGTGTTGGCTGGACGACGTCCTGGAGACGCTGAGATTGTTTTCGCCTCAACAGAGAA
AGCAGAACGCGAGCTTAATTGGAAGGCTAAGTATGGGATCGAAGACATGTGTAGGGATCT
ATGGAACTGGGCCAGCAATAATCCTTACGGCTACGCCTCCTCGAATGGCTCCTCTTAATT
CTTGTTCTTTTCTCTTTGCAGTAGTTATTCATTTTTATAAAACACATAAGAAAATGCTGA
TCAGAACCCACAGTTTACAAGGGATTACTCCTAATTTATCATAGCAGTTCTTGATATTTA
AATCGTCATTTCTACTCTTAGTATATAGTTTTTACTCGTTTTTGTTATGTTTCTTAAAAT
TGATTAATGTAATCATTCAGATATTTTCTGTTT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2AY04JQ 834 0 0
AATGGAAGATCATATTGCTTAGATACTTCAACCCTGTTGGTGCACATCCTAGTGGTTACA
TTGGTGAAGATCCTCTTGGAGTTTCAAACAATCTCATGCCTTATGTCCAGCAAGTTGCGG
TTGGCCGGAGACCTCACCTCACCGTCTTTGGAACCGACTACAAGACAAAGGATGGTACAG
GGGTTAGAGATTACATTCATGTGATTGATTTAGCAGATGGACACATAGCAGCTCTCCGCA
AGCTAGATGATCCCAAAATCAGTTGTGAGGTATACAATCTTGGAACTGGTAATGGAACGT
CAGTTCTTGAGATGGTAGCTGCCTTTGAGAAGGCATCCGGAAAGAAAATCCCGCTGGTGT
TGGCTGGACGACGTCCTGGAGACGCTGAGATTGTTTTCGCCTCAACAGAGAAAGCAGAAC
GCGAGCTTAATTGGAAGGCTAAGTATGGGATCGAAGACATGTGTAGGGATCTATGGAACT
GGGCCAGCAATAATCCTTACGGCTACGCCTCCTCGAATGGCTCCTCTTAATTCTTGTTCT
TTTCTCTTTGCAGTAGTTATTCATTTTTATAAAACACATAAGAAAATGCTGATCAGAACC
CACAGTTTACAAGGGATTACTCCTAATTTATCATAGCAGTTCTTGATATTTAAATCGTCA
TTTCTACTCTTAGTATATAGTTTTTACTCGTTTTTGTTATGTTTCTTAAAATTGATTAAT
GTAATCATTCAGATATTTTCTGTTTACTATGCTTATTCAGTCCTCCCTACCATTGTAACT
TGTAATACAATGTCCTCATTCAACCTATGAAAGCTTGTAATTATATTTGCAATC

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR2A545JQ 753 0 0
TTTCAAACAATCTCATGCCTTATGTCCAGCAAGTTGCGGTTGGCCGGAGACCTCACCTCA
CCGTCTTTGGAACCGACTACAAGACAAAGGATGGTACAGGGGTTAGAGATTACATTCATG
TGATTGATTTAGCAGATGGACACATAGCAGCTCTCCGCAAGCTAGATGATCCCAAAATCA
GTTGTGAGGTATACAATCTTGGAACTGGTAATGGAACGTCAGTTCTTGAGATGGTAGCTG
CCTTTGAGAAGGCATCCGGAAAGAAAATCCCGCTGGTGTTGGCTGGACGACGTCCTGGAG
ACGCTGAGATTGTTTTCGCCTCAACAGAGAAAGCAGAACGCGAGCTTAATTGGAAGGCTA
AGTATGGGATCGAAGACATGTGTAGGGATCTATGGAACTGGGCCAGCAATAATCCTTACG
GCTACGCCTCCTCGAATGGCTCCTCTTAATTCTTGTTCTTTTCTCTTTGCAGTAGTTATT
CATTTTTATAAAACACATAAGAAAATGCTGATCAGAACCCACAGTTTACAAGGGATTACT
CCTAATTTATCATAGCAGTTCTTGATATTTAAATCGTCATTTCTACTCTTAGTATATAGT
TTTTACTCGTTTTTGTTATGTTTCTTAAAATTGATTAATGTAATCATTCAGATATTTTCT
GTTTACTATGCTTATTCAGTCCTCCCTACCATTGTAACTTGTAATACAATGTCCTCATTC
AACCTATGAAAGCTTGTAATTATATTTGCAATC

QA 1 753 1 753
DS 



CO CL402Contig2 671 3 4 U
AGTTTGAATGAGGACATTGTTGTATTACAACTTGCAATGGTTGGGAGATCGAATTACAGG
GGCTGAAAAAGCATAGTAAACAGAAAATATCTGAATGATTACATCTATCAATTTTAAGAA
ATATAACAAAAACAAGTAAAAACTATATACTAAGAGTAGAAATGACGATTTAAATATCAA
GAACTGCTATGATAATTAGTAGTAATCCCTTGTAAACTGCGGGTTCTGATCAGCATTTTC
TTGTGTTCATAAAAATGAATAACTACTGCAAAGAGAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAACAAG
AATTAAGAAGAGCCATTGGCGGAGGCGTAACCGTAAGGATTATTGCTGGCCCAGTTCCAT
AAATCCCTACACAAGTCTTCGATCCCATACTTGGCCTTCCAATTAAGCTCGCGTTCTGCT
TTCTCCGTTGAGGCGAAAACAATCTCAGCGTCTCCAGGACGTCGTCCAGCCAACACCAAA
GGGATTTTCTTTCCGGATGCCTTCTCAAAGGCAGCTACCATCTCAAGAACTGACGTTCCA
TTACCAGTTCCAAGATTGTATACCTCACAACTGATTTTGGGATCATCTAGCTTGCGGAGA
GCTGCTATGTGTCCATCTGCTAAATCAATCACATGAATGTAATCTCTCACCCCTGTACCA
TCCATTGTCTT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G333JQ U 1
AF RR2CO41JQ U 386
AF RR2H253JQ U 1
BS 1 373 RR2G333JQ
BS 374 374 RR2H253JQ
BS 375 598 RR2G333JQ
BS 599 671 RR2H253JQ

RD RR2G333JQ 598 0 0
AGTTTGAATGAGGACATTGTTGTATTACAACTTGCAATGGTTGGGAGATCGAATTACAGG
GGCTGAAAAAGCATAGTAAACAGAAAATATCTGAATGATTACATCTATCAATTTTAAGAA
ATATAACAAAAACAAGTAAAAACTATATACTAAGAGTAGAAATGACGATTTAAATATCAA
GAACTGCTATGATAATTAGTAGTAATCCCTTGTAAACTGCGGGTTCTGATCAGCATTTTC
TTGTGTTCATAAAAATGAATAACTACTGCAAAGAGAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAACAAG
AATTAAGAAGAGCCATTGGCGGAGGCGTAACCGTAAGGATTATTGCTGGCCCAGTTCCAT
AAATCCCTACACATGTCTTCGATCCCATACTTGGCCTTCCAATTAAGCTCGCGTTCTGCT
TTCTCCGTTGAGGCGAAAACAATCTCAGCGTCTCCAGGACGTCGTCCAGCCAACACCAAA
GGGATTTTCTTTCCGGATGCCTTCTCAAAGGCAGCTACCATCTCAAGAACTGACGTTCCA
TTACCAGTTCCAAGATTGTATACCTCACAACTGATTTTGGGATCATCTAGCTTGCGGA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2CO41JQ 196 0 0
CATACTTGGCCTTCCAATTAAGCTCGCGTTCTGCTTTCTCCGTTGAGGCGAAAACAATCT
CAGCGTCTCCAGGACGTCGTCCAGCCAACACCAAAGGGATTTTCTTTCCGGATGCCTTCT
CAAAGGCAGCTACCATCTCAAGTACTGACGTTCCATTACCAGTTCCAAGATTGTATACCT
CACAACTGATTTTGGG

QA 1 196 1 196
DS 

RD RR2H253JQ 671 0 0
G
GTTTGAATGAGGACATTGTTGTATTACAACTTGCAATGGTTGGGAGATCGAATTACAGGG
GCTGAAAAAGCATAGTAAACAGAAAATATCTGAATGATTACATCTATCAATTTTAAGAAA
TATAACAAAAACAAGTAAAAACTATATACTAAGAGTAGAAATGACGATTTAAATATCAAG
AACTGCTATGATAATTAGTAGTAATCCCTTGTAAACTGTGGGTTCTGATCAGCATTTTCT
TGTGTTCATAAAAATGAATAACTACTGCAAAGAGAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAACAAGA
ATTAAGAAGAGCCATTGGCGGAGGCGTAGCCGTAAGGATTATTGCTGGCCCAGTTCCATA
GATCCCTACACAAGTCTTCGATCCCATACTTGGCCTTCCAATTAAGCTCGCGTTCTGCTT
TCTCCGTTGAGGCGAAAACAATCTCAGCGTCTCCAGGACGTCGTCCAGCCAACACCAAAG
GGATTTTCTTTCCGGATGCCTTCTCAAAGGCAGCTACCATCTCAAGAACTGACGTTCCAT
TACCAGTTCCAAGATTGTATACCTCACAACTGATTTTGGGATCATCTAGCTTGCGGAGAG
CTGCTATGTGTCCATCTGCTAAATCAATCACATGAATGTAATCTCTCACCCCTGTACCAT
CCATTGTCTT

QA 2 671 2 671
DS 



AS 2 12

CO CL403Contig1 955 7 11 U
GGTAGTAAGATATTTTCTAAATGAAAATATTACTCAGGTCAAAGGTTTGTGAGTAAACAA
AACTAAACGCTTAAAAATACCCTCAGCCAAAAGTGGTTAAGCAACACCAGTTTCTAAAGA
GAGTACAACAACCATAGATTAAGCAGCAGCAGCAGTTTATTAGAGATACAACCAAAAATA
GCTTAAGCAGCAGCAGTTTATTAGAGAAGCTCCTGATCGAAATGCCATGTCCCATGTCCT
TTGCCGAGTCTTCTGAGCTGAGAGACATATTCAGAGATTTTCTTAATTGCTTCAACCTGT
TCGTTCAAAAACTCGCTCTCAATGAAATCAGCCAACTGGACATCATCGTTCTTGGAAGCC
ACACTGTGCAGGTTTAGGAGTTTTTCATTGACCAGTTTTTCCAATGATAGAGCCAACTCC
ATGGCATAGAGAGCATCTCCTTTCTCAGCGTGGTCAAACTCAGACTGAGGCATCACCATA
GGCTGTAGCTTAACCCTCCCACCACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCAGCGTGG
TCTCGTTCTTCCACACTCGAGTCCTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCAACGTTG
TCACGGTCAAAGTAAGCGTACAAAGCGTGATACACATAAGACACGTTGTATTCAACATTG
ATCTGCTCATTCACGGCGGCTTCGCACTCAGGGGAGTACATATGTCGAGCAAGCGAGATC
TGCGGACTCGAAGGGACGAGATCGAGTTCCTTCTTCACTTCCACAAACGGCTCGAAAACG
ACGCCGCTTAGTGGCTGCGTTGAGGCGCGAACAGAGAAAGGAGAGGTTTTTCCCGGAGGT
GA*AGAGAGGAGAGATGTCCTTCTTCACCCCGTGAACGTTCATGAGCGAGAACGTAGAAG
CAGCTTTGAGAAGCATTTTTGAATCTCTCTGTCTGCAGCGAAGAAATGGGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2H231JQ U 17
AF RR2EP38JQ U 1
AF RR2FV09JQ U 69
AF RR2B257JQ U 16
AF RR2BO31JQ U 55
AF RR2B257TF C 177
AF RR2FV09TF C 217
BS 1 152 RR2EP38JQ
BS 153 155 RR2H231JQ
BS 156 274 RR2EP38JQ
BS 275 275 RR2H231JQ
BS 276 729 RR2EP38JQ
BS 730 880 RR2B257JQ
BS 881 891 RR2BO31JQ
BS 892 892 RR2B257TF
BS 893 906 RR2BO31JQ
BS 907 950 RR2B257TF
BS 951 955 RR2FV09TF

RD RR2H231JQ 671 0 0
CTAAATGAAAATATTACTCAGGTCAAAGGTTTGTGAGTAAACAAAACTAAACGCTTAAAA
ATAACCTCAGCCAAAAGTGGTTAAGCAACACCAGTTTCTAAAGAGAGTACAACAACCATA
GATTAAGCAGCAGCAGCAGTTTATTAGAGATACAACCAAAAATAGCTTAAGCAGCAGCAG
TTTATTAGAGAAGCTCCTGATCGAAATGCCATGTCCCATGTCCTTTGCCGAGTCTTCTGA
GCTGAGAGACATATTCAGAGATTTTCTTAATTGCTTCAACCTGTTCGTTCAAAAACTCGC
TCTCAATGAAATCAGCCAACTGGACATCATCGTTCTTGGAAGCCACACTGTGCAGGTTTA
GGAGTTTTTCATTGACCAGTTTTTCCAATGATAGAGCCAACTCCATGGCATAGAGAGCAT
CTCCTTTCTCAGCGTGGTCAAACTCAGACTGAGGCATCACCATAGGCTGTAGCTTAACCC
TCCCACCACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCAGCGTGGTCTCGTTCTTCCACAC
TCGAGTCCTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCAACGTTGTCACGGTCAAAGTAAG
CGTACAAAGCGTGATACACATAAGACACGTTGTATTCAACATTGATCTGCTCATTCACGG
CGGCTACGCAC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2EP38JQ 729 0 0
GGTAGTAAGATATTTTCTAAATGAAAATATTACTCAGGTCAAAGGTTTGTGAGTAAACAA
AACTAAACGCTTAAAAATACCCTCAGCCAAAAGTGGTTAAGCAACACCAGTTTCTAAAGA
GAGTACAACAACCATAGATTAAGCAGCAGCAG***TTTATTAGAGATACAACCAAAAATA
GCTTAAGCAGCAGCAGTTTATTAGAGAAGCTCCTGATCGAAATGCCATGTCCCATGTCCT
TTGCCGAGTCTTCTGAGCTGAGAGACATATTCAGCGATTTTCTTAATTGCTTCAACCTGT
TCGTTCAAAAACTCGCTCTCAATGAAATCAGCCAACTGGACATCATCGTTCTTGGAAGCC
ACACTGTGCAGGTTTAGGAGTTTTTCATTGACCAGTTTTTCCAATGATAGAGCCAACTCC
ATGGCATAGAGAGCATCTCCTTTCTCAGCGTGGTCAAACTCAGACTGAGGCATCACCATA
GGCTGTAGCTTAACCCTCCCACCACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCAGCGTGG
TCTCGTTCTTCCACACTCGAGTCCTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCAACGTTG
TCACGGTCAAAGTAAGCGTACAAAGCGTGATACACATAAGACACGTTGTATTCAACATTG
ATCTGCTCATTCACGGCGGCTTCGCACTCAGGGGAGTACATATGTCGAGCAAGCGAGATC
TGCGGACTC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2FV09JQ 658 0 0
GCTTAAAAATACCCTCAGCCAAAAGTGGTTAAGCAACACCAGTTTCTAAAGAGAGTACAA
CAACCATAGATTAAGCAGCAGCAGCAGTTTATTAGAGATACAACCAAAAATAGCTTAAGC
AGCGGCAGTTTATTAGAGAAGCTCCTGATCGAAATGCCATGTCCCATGTCCTTTGCCGAG
TCTTCTGAGCTGAGAGACATATTCAGAGATTTTCTTAATTGCTTCAACCTGTTCGTTCAA
AAACTCGCTCTCAATGAAATCAGCCAACTGGACATCATCGTTCTTGGAAGCCACACTGTG
CAGGTTTAGGAGTTTTTCATTGACCAGTTTTTCCAATGATAGAGCCAACTCCATGGCATA
GAGAGCATCTCCTTTCTCAGCGTGGTCAAACTCAGACTGAGGCATCACCATAGGCTGTAG
CTTAACCCTCCCACCACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCAGCGTGGTCTCGTTC
TTCCACACTCGAGTCCTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCAACGTTGTCACGGTC
AAAGTAAGCGTACAAAGCGTGATACACATAAGACACGTTGTATTCAACATTGATCTGCTC
ATTCACGGCGGCTTCGCACTCAGGGGAGTACATATGTCGAGCAAGCGAGATCTGCGGA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2B257JQ 865 0 0
C
CTAAATGAAAATATTACTCAGGTCAAAGGTTTGTGAGTAAACAAAACTAAACGCTTAAAA
ATACCCTCAGCCAAAAGTGGTTAAGCAACACCAGTTTCTAAAGAGAGTACAACAACCATA
GATTAAGCAGCAGCAGCAGTTTATTAGAGATACAACCAAAAATAGCTTAAGCAGCAGCAG
TTTATTAGAGAAGCTCCTGATCGAAATGCCATGTCCCATGTCCTTTGCCGAGTCTTCTGA
GCTGAGAGACATATTCAGAGATTTTCTTAATTGCTTCAACCTGTTC****AAAAACTCGC
TCTCAATGAAATCAGCCAACTGGACATCATCGTTCTTGGAAGCCACACTGTGCAGGTTTA
GGAGTTTTTCATTGACCAGTTTTTCCAATGATAGAGCCAACTCCATGGCATAGAGAGCAT
CTCCTTTCTCAGCGTGGTCAAACTCAGACTGAGGCATCACCATAGGCTGTAGCTTAACCC
TCCCACCACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCAGCGTGGTCTCGTTCTTCCACAC
TCGAGTCCTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCAACGTTGTCACGGTCAAAGTAAG
CGTACAAAGCGTGATACACATAAGACACGTTGTATTCAACATTGATCTGCTCATTCACGG
CGGCTTCGCACTCAGGGGAGTACATATGTCGAGCAAGCGAGATCTGCGGACTCGAAGGGA
CGAGATCGAGTTCCTTCTTCACTTCCACAAACGGCTCGAAAACGACGCCGCTTAGTGGCT
GCGTTGAGGCGCGAACAGAGAAAGGAGAGGTTTTTCCCGGAGGTGA*AGAGAGGAGAGAT
GTCCTTCTTCACCCCGTGAACGTT

QA 2 865 2 865
DS 

RD RR2BO31JQ 852 0 0
AAACAAAACTAAACGCTTAAAAATACCCTCAGCCAAAAGTGGTTAAGCAACACCAGTTTC
TAAAGAGAGTACAACAACCATAGATTAAGAAGCAGCAGCAGTTTATTAGAGATACAACCA
AAAATAGCTTAAGCAGCAGCAGTTTATTAGAGAAGCTCCTGATCGAAATGCCATGTCCCA
TGTCCTTTGCCGAGTCTTCTGAGCTGAGAGACATATTCAGAGATTTTCTTAATTGCTTCA
ACCTGTTCGTTCAAAAACTCGCTCTCAATGAAATCAGCCAACTGGACATCATCGTTCTTG
GAAGCCACACTGTGCAGGTTTAGGAGTTTTTCATTGACCAGTTTTTCCAATGATAGAGCC
AACTCCATGGCATAGAGAGCATCTCCTTTCTCAGCGTGGTCAAACTCAGACTGAGGCATC
ACCATAGGCTGTAGCTTAACCCTCCCAC*ACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCA
GCGTGGTCTCGTTCTTCCACACTCGAGTCCTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCA
ACGTTGTCACGGTCAAAGTAAGCGTACAAAGCGTGATACACATAAGACACGTTGTATTCA
ACATTGATCTGCTCATTCACGGCGGCTTCGCACTCAGGGGAGTACATATGTCGAGCAAGC
GAGATCTGCGGACTCGAAGGGACGAGATCGAGTTCCTTCTTCACTTCCACAAACGGCTCG
AAAACGACGCCGCTTAGTGGCTGCGTTGAGGCGCGAACAGAGAAAG*AGAGGTTTTTCCC
GGAGGTGAGAGAGAGGAGAGATGTCCTTCTTCACCCCGTGA*CGTTCATGAGCGAGA*CG
TAGAAGCAGCTT

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR2B257TF 774 0 0
AATAGCTTA*GCAGCAGCAGTTTATTAGAGAAGCTC*TGATCGAAATGCCATGTCCCATG
TCCTTTGCCGAGTCTTCTGAGCTGAGAGACATATTCAGAGATTTTCTTAATTGCTTCAAC
CTGTTC****AAAAACTCGCTCTCAATGAAATCAGCCAACTGGACATCATCGTTCTTGGA
AGCCACACTGTGCAGGTTTAGGAGTTTTTCATTGACCAGTTTTTCCAATGATAGAGCCAA
CTCCATGGCATAGAGAGCATCTCCTTTCTCAGCGTGGTCAAACTCAGACTGAGGCATCAC
CATAGGCTGTAGCTTAACCCTCCCACCACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCAGC
GTGGTCTCGTTCTTCCACACTCGAGTCCTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCAAC
GTTGTCACGGTCAAAGTAAGCGTACAAAGCGTGATACACATAAGACACGTTGTATTCAAC
ATTGATCTGCTCATTCACGGCGGCTTCGCACTCAGGGGAGTACATATGTCGAGCAAGCGA
GATCTGCGGACTCGAAGGGACGAGATCGAGTTCCTTCTTCACTTCCACAAACGGCTCGAA
AACGACGCCGCTTAGTGGCTGCGTTGAGGCGCGAACAGAGAA*GGAGAGGTTTTTCCCGG
AGGTGA*AGAGAGGAGAGATGTCCTTCTTCACCCCGTGAACGTTCATGAGCGAGAACGTA
GAAGCAGCTTTGAGAAGCATTTTTGAATCTCTCTGTCTGCAGCGAAGAAATGGG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2FV09TF 739 0 0
TCGAAATGCCATGTCCCATGTCCTTTGCCGAGTCTTCTGAGCTGAGAGACATATTCAGAG
ATTTTCTTAATTGCTTCAACCTGTTCGTTCAAAAACTCGCTCTCAATGAAATCAGCCAAC
TGGACATCATCGTTCTTGGAAGCCACACTGTGCAGGTTTAGGAGTTTTTCATTGACCAGT
TTTTCCAATGATAGAGCCAACTCCATGGCATAGAGAGCATCTCCTTTCTCAGCGTGGTCA
AACTCAGACTGAGGCATCACCATAGGCTGTAGCTTAACCCTCCCACCACGTTTGTTCTGA
TACTCCATCAACATCTCAGCGTGGTCTCGTTCTTCCACACTCGAGTCCTTGAAAAACTTG
GCAAGACCTTTGAGAGCAACGTTGTCACGGTCAAAGTAAGCGTACAAAGCGTGATACACA
TAAGACACGTTGTATTCAACATTGATCTGCTCATTCACGGCGGCTTCGCACTCAGGGGAG
TACATATGTCGAGCAAGCGAGATCTGCGGACTCGAAGGGACGAGATCGAGTTCCTTCTTC
ACTTCCACAAACGGCTCGAAAACGACGCCGCTTAGTGGCTGCGTTGAGGCGCGAACAGAG
AA*GGAGAGGTTTTTCCCGGAGGTGA*AGAGAGGAGAGATGTCCTTCTTCACCCCGTGAA
CGTTCATGAGCGAGAACGTAGAAGCAGCTTTGAGAAGCATTTTTGAATCTCTCTGTCTGC
AGCGAAGAAATGGGAAAAA

QA 1 739 1 739
DS 



CO CL403Contig2 813 5 17 U
TTTTTCCCATTTCTTCGCTGCAGACAGAGAGA******TTCAAAAATGCTTCTCAAAGCT
GCTTCTACGTTCTCGCTCATGAACGTTCACGGGGTGAAGAAGGACATCTCTCCTCTCT**
TCACCTCCGGGAAAAACCTCTCCTTCTCTGTTCGCGCCTCAACGCAGCCACTAAGCGGCG
TCGTTTTCGAGCCGTTTGTGGAAGTGAAGAAGGAACTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCGC
AGATCTCGCTTGCTCGACATATGTACTCCCCTGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGA
TCAATGTTGAATACAACGTGTCTTATGTGTATCACGCTTTGTACGCTTACTTTGACCGTG
ACAACGTTGCTCTCAAAGGTCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGAG
ACCACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGGGTTAAGCTACAGC
CTATGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTGACCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCCA
TGGAGTTGGCTCTATCATTGGAAAAACTGGTCAATGAAAAACTCCTAAACCTGCACAGTG
TGGCTTCCAAGAACGATGATGTCCAGTTGGCTGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTG*AACG
AACAGTTGAAGCAATTAAG*AAATCTCTGATATGTCTCTCAGCTCAGAGACTCGGCAAAG
ACATGGGACATGGCATTTCGATCAGAGCTCTCTA*TAACTGCTGCTGCTAAGCTATTTTT
GGTGTATCTCTAATAACTGCTGCTGCTTATCTA


BQ
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO31TF U 1
AF RR2C593TF U 3
AF RR2EP38TF U 1
AF RR2H231TF U 1
AF RR2EI40TF U 1
BS 1 26 RR2EP38TF
BS 27 27 RR2BO31TF
BS 28 32 RR2EP38TF
BS 33 38 RR2BO31TF
BS 39 92 RR2EP38TF
BS 93 93 RR2BO31TF
BS 94 112 RR2EP38TF
BS 113 113 RR2BO31TF
BS 114 654 RR2EP38TF
BS 655 656 RR2BO31TF
BS 657 679 RR2EP38TF
BS 680 680 RR2BO31TF
BS 681 685 RR2EP38TF
BS 686 686 RR2BO31TF
BS 687 754 RR2EP38TF
BS 755 755 RR2H231TF
BS 756 813 RR2EP38TF

RD RR2BO31TF 706 0 0
TTTTTCCCATTTCTTCGCTGCAGACAGAGAGA******TTCAAAAATGCTTCTCAAAGCT
GCTTCTACGTTCTCGCTCATGAACGTTCACGGGGTGAAGAAGGACATCTCTCCTCTCTCT
TCACCTCCGGGAAAAACCTCTCCTTCTCTGTTCGCGCCTCAACGCAGCCACTAAGCGGCG
TCGTTTTCGAGCCGTTTGTGGAAGTGAAGAAGGAACTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCGC
AGATCTCGCTTGCTCGACATATGTACTCCCCTGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGA
TCAATGTTGAATACAACGTGTCTTATGTGTATCACGCTTTGTACGCTTACTTTGACCGTG
ACAACGTTGCTCTCAAAGGTCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGAG
ACCACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTG*TGGGAGGGTTAAGCTACAGC
CTATGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTGACCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCCA
TGGAGTTGGCTCTATCATTGGAAAA*CTGGTCAATGAAAA*CTCCTAAACCTGCACAGTG
TGGCTTCCAAGAACGATGATGTCCAGTTGGCTGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTG**ACG
A*CAGTTGAAGCAATTAG**AAATCTCTGATATGTCTCTCAGCTCA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2C593TF 728 0 0
TTTCCCATTTCTTCGCTGCAGACAAAGAGAGAAAGATTCAAAAATGCTTCTCAAAGCTGC
TTCTACGTTCTCGCTCATGAACGTTCACGGTGTGAAGAAGGACATCTCTCTTCTCT**TC
ACCTCCGGGAAAAACCTCTCCTTCTCTGTTCGCGCCTCAACGCAGCCACTAAGCGGCGTC
GTTTTCGAGCCGTTTGTGGAAGTGAAGAAGGAACTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCGCAG
ATCTCGCTTGCTCGACATATGTACTCCCCTGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGATC
AATGTTGAATACAACGTGTCTTATGTGTATCACGCTTTGTACGCTTACTTTGACCGTGAC
AACGTTGCTCTCAAAGGTCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGAGAC
CACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGGGTTAAGCTACAGCCT
ATGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTGACCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCCATG
GAGTTGGCTCTATCATTGGAAAAACTGGTCAATGAAAA*CTCCTAAACCTGCACAGTGTG
GCTTCCAAGAACGATGATGTCCAGTTGGCTGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTG**ACGAA
CAGTTGAAGCAATTAAG*AAATCTCTGATATGTCTCTCAGCTCAGAGACTCGGCAAAGAC
ATGGGACA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2EP38TF 813 0 0
TTTTTCCCATTTCTTCGCTGCAGACAAAGAGAGAAAGATTCAAAAATGCTTCTCAAAGCT
GCTTCTACGTTCTCGCTCATGAACGTTCACGGTGTGAAGAAGGACATCTCTCTTCTCT**
TCACCTCCGGGAAAAACCTCTCCTTCTCTGTTCGCGCCTCAACGCAGCCACTAAGCGGCG
TCGTTTTCGAGCCGTTTGTGGAAGTGAAGAAGGAACTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCGC
AGATCTCGCTTGCTCGACATATGTACTCCCCTGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGA
TCAATGTTGAATACAACGTGTCTTATGTGTATCACGCTTTGTACGCTTACTTTGACCGTG
ACAACGTTGCTCTCAAAGGTCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGAG
ACCACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGGGTTAAGCTACAGC
CTATGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTGACCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCCA
TGGAGTTGGCTCTATCATTGGAAAAACTGGTCAATGAAAAACTCCTAAACCTGCACAGTG
TGGCTTCCAAGAACGATGATGTCCAGTTGGCTGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTTGAACG
AACAGTTGAAGCAATTAAGAAAATCGCTGATATGTCTCTCAGCTCAGAGACTCGGCAAAG
ACATGGGACATGGCATTTCGATCAGAGCTCTCTAATAACTGCTGCTGCTAAGCTATTTTT
GGTGTATCTCTAATAACTGCTGCTGCTTATCTA

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2H231TF 806 0 0
TTTTTCCCATTTCTTCGCTGCAGACAGAGAGA******TTCAAAAATGCTTCTCAAAGCT
GCTTCTACGTTCTCGCTCATGAACGTTCACGGGGTGAAGAAGGACATCTCTCCTCTCT**
TCACCTCCGGGAAAAACCTCTCCTTCTCTGTTCGCGCCTCAACGCAGCCACTAAGCGGCG
TCGTTTTCGAGCCGTTTGTGGAAGTGAAGAAGGAACTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCGC
AGATCTCGCTTGCTCGACATATGTACTCCCCTGAGTGCGTAGCCGCCGTGAATGAGCAGA
TCAATGTTGAATACAACGTGTCTTATGTGTATCACGCTTTGTACGCTTACTTTGACCGTG
ACAACGTTGCTCTCAAAGGTCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGAG
ACCACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGGGTTAAGCTACAGC
CTATGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTGACCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCCA
TGGAGTTGGCTCTATCATTGGAAAAACTGGTCAATGAAAAACTCCTAAACCTGCACAGTG
TGGCTTCCAAGAACGATGATGTCCAGTTGGCTGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTTGAACG
AACAGTTGAAGCAATTAAGAAAATCTCTGATATGTCTCTCAGCTCAGAGACTCGGCAAAG
ACATGGGACATGGCATTTCGATCAGAGCTCTCTA*TAACTGCTGCTGCTAAGCTATTTTT
GGTGTATCTCTA*TAACTGCTGCTGC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2EI40TF 795 0 0
TTTTTCCCATTTCTTCGCTGCAGACAGAGAGA******TTCAAAAATGCTTCTCAAAGCT
GCTTCTACGTTCTCGCTCATGAACGTTCACGGGGTGAAGAAGGACATCTCTCCTCTCT**
TCACCTCCGGGAAAAACCTCTCCTTCTCTGTTCGCGCCTCAACGCAGCCACTAAGCGGCG
TCGTTTTTGAGCCGTTTGTGGAAGTGAAGAAGGAACTCGATCTCGTCCCTTCGAGTCCGC
AGATCTCGCTTGCTCGACATATGTACTCCCCTGAGTGCGAAGCCGCCGTGAATGAGCAGA
TCAATGTTGAATACAACGTGTCTTATGTGTATCACGCTTTGTACGCTTACTTTGACCGTG
ACAACGTTGCTCTCAAAGGTCTTGCCAAGTTTTTCAAGGACTCGAGTGTGGAAGAACGAG
ACCACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGGGTTAAGCTACAGC
CTATGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTGACCACGCTGAGAAAGGAGATGCTCTCTATGCCA
TGGAGTTGGCTCTATCATTGGAAAAACTGGTCAATGAAAAACTCCTAAACCTGCACAGTG
TGGCTTCCAAGAACGATGATGTCCAGTTGGCTGATTTCATTGAGAGCGAGTTTTG*AACG
AACAGTTGAAGCAATTAAG*AAATCTCTGATATGTCTCTCAGCTCAGAGACTCGGCAAAG
ACATGGGACATGGCATTTCGATCAGAGCTCTCTA*TAACTGCTGCTGCTAAGCTATTTT*
GGTGTATCTCTA
TAA

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 11

CO CL404Contig1 1398 11 13 U
GGACCACCACTTCACTCTCTACCCCGAATACTTGATATCTTGGAGATGGCAGGCAAGTTT
AGTTTTGTGAGTGTCATGGGAGCACTATTGGTGTTAACCATCTTCCATGATCCGATCATC
GTCAACGCCGGCCAAGGTGTTCCGAATGTAGCACTGTTCACTTTTGGGGACTCTTACTAC
GACGTTGGAAACAAAGCGTTTCTAACCAAAAAACTCCCTCCACAAACCTTGTGGCCTTAC
GGCAAGTCCCGCGACGACCCCAACGGCAAGTTTTCAGACGGCTACATCGTCCCCGACTTC
ATCGCTGAATTCATGTCCATTCCAAACGGAATCCCGCCGGCGCTTAAACCTGGTGCTAAT
TTTTCACGTGGAGCTAGCTTTGCCGTCGCCGACGCTTCTATTCTTGGGGCTCCTGCGGAA
AGTATGACACTGACTCAACAAGTGAACAAATTCAGAAGTATGATATCAACTTGGTCCGAC
GACTACATCGAGCAATCATTGTTTATGATATATATCGGGACAGAAGATTATTTGAACTTC
ATCAAGGCCAATCCCACTGCGGATGGTTCTGCTCAACAAGCTTTTGTCACTTCCGTCACG
AACAAATTAAAGACCGACATCAACTTGTTATACACCTTGGGAGCTAGTAAATTCGCAGTT
CCAACGCTAGCACCATTGGG*TTGCTTACCGATCGTGAGACAAGAATACAAAA*CTGGCA
ACGACTGTTACGAGCCACTCAACAATTTGGCCAAACAACACAACGAGAAGATCGGTCCGA
TGTTGAACGAGTTTGCTAAAAAACCCAACGGCGGTTTTCAGTTCACCGTCTTAGATTTCT
ACAATGCAGTTCTCCGCAGGACAATAAGGCATACTGCCTTCCGGTTTTATGTTACCAACA
CATCGTGCTGCGGGGTAGGGACTCACAACGCGTATGGTTGTGGAATGGCTAACGTGCACT
CGAAGCTGTGTGAGTACCAAAGATCTTACTTCTTCTTTGACGGACGTCACAACACTGAGA
AAGCTCAGGAAGAAATCGCTCATATTTTCTATGGAGCCAATACTAACGTGGTCCAACCAA
TGACCATACGTGAGCTAATCGTTTATCCGGCTAAGGAGAACATGCTTGAGTTTTGGGAAC
CCAACAACCTATCTACTCGTCGTCGACGTTCATCTCGTGATAACCTCGATTTATCAGCTT
ATTATTAGCTGGATGAAATATAATTGTGCTGAATCTTTCGTTATGTATGTGAGTCTACGA
ATATTGTATCCTAGCTGTAATGCTTGGTAACTATGTTTGTGCCGTCGAATAAATTGCGTG
ATATGTATTTGTATGTTTTCTAATCTACGGAAAATATAATAAAAAGGGTATTACAATTCC
CTTAGTATTAAAGAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG16TF U 1
AF RR2A812TF U 1
AF RR2A812JQ C 640
AF RR2EC86JQ C 660
AF RR2EC86TF U 660
AF RR2CD82TF U 679
AF RR2DG16JQ C 640
AF RR2CD82JQ C 679
AF RR2FK04JQ C 891
AF RR2H736TF U 1166
AF RR2AT07TF U 915
BS 1 23 RR2A812TF
BS 24 24 RR2DG16TF
BS 25 701 RR2A812TF
BS 702 702 RR2EC86TF
BS 703 771 RR2A812TF
BS 772 1126 RR2EC86TF
BS 1127 1127 RR2CD82TF
BS 1128 1228 RR2EC86TF
BS 1229 1229 RR2CD82TF
BS 1230 1325 RR2EC86TF
BS 1326 1346 RR2CD82TF
BS 1347 1386 RR2H736TF
BS 1387 1398 RR2FK04JQ

RD RR2DG16TF 577 0 0
GGACCACCGCTTCACTCTCTACCCCGAATACTTGATATCTTGGAGATGGCTGGCAAGTTT
AGTTTTGTGAGTGTCATGGGAGCACTATTGGTGTTAACCATCTTCCATGATCCGATCATC
GTCAACGCCGGCCAAGGTGTTCCGAATGTAGCACTGTTCACTTTTGGGGACTCTTACTAC
GACGTTGGAAACAAAGCGTTTCTAACCAAAAAACTCCCTCCACAAACCTTGTGGCCTTAC
GGCAAGTCCCGCGACGACCCCAACGGCAAGTTTTCAGACGGCTACATCGTCCCCGACTTC
ATCGCTGAATTCATGTCCATTCCAAACGGAATCCCGCCGGCGCTTAAACCTGGTGCTAAT
TTTTCACGTGGAGCTAGCTTTGCCGTCGCCGACGCTTCTATTCTTGGGGCTCCTGCGGAA
AGTATGACACTGACTCAACAAGTGAACAAGTTCAGAAGTATGATATCAACTTGGTCCGAC
GACTACATCGAGCAATCATTGTTTATGATATATATCGGGACAGAAGATTATTTGAACTTC
ATCAAGGCCAATCCCACTGCGGATGGTTCTGCTCAAC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2A812TF 771 0 0
GGACCACCACTTCACTCTCTACCTCGAATACTTGATATCTTGGAGATGGCAGGCAAGTTT
AGTTTTGTGAGTGTCATGGGAGCACTATTGGTGTTAACCATCTTCCATGATCCGATCATC
GTCAACGCCGGCCAAGGTGTTCCGAATGTAGCACTGTTCACTTTTGGGGACTCTTACTAC
GACGTTGGAAACAAAGCGTTTCTAACCAAAAAACTCCCTCCACAAACCTTGTGGCCTTAC
GGCAAGTCCCGCGACGACCCCAACGGCAAGTTTTCAGACGGCTACATCGTCCCCGACTTC
ATCGCTGAATTCATGTCCATTCCAAACGGAATCCCGCCGGCGCTTAAACCTGGTGCTAAT
TTTTCACGTGGAGCTAGCTTTGCCGTCGCCGACGCTTCTATTCTTGGGGCTCCTGCGGAA
AGTATGACACTGACTCAACAAGTGAACAAATTCAGAAGTATGATATCAACTTGGTCCGAC
GACTACATCGAGCAATCATTGTTTATGATATATATCGGGACAGAAGATTATTTGAACTTC
ATCAAGGCCAATCCCACTGCGGATGGTTCTGCTCAACAAGCTTTTGTCACTTCCGTCACG
AACAAATTAAAGACCGACATCAACTTGTTATACACCTTGGGAGCTAGTAAATTCGCAGTT
CCAACGCTAGCACCATTGGG*TTGCTTACCGATCGTGAGACGAGAATACAAAA*CTGGCA
ACGACTGTTACGAGCCACTCAACAATTTGGCCAAACAACACAACGAGAAGA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2A812JQ 500 0 0
GGAGCTAGTAAATTCGCAGTTCCAACGCTAGCACCATTGGGGTTGCTTACCGATCGTGAG
ACGAGAATACAAAAACTGGCAACGACTGTTACGAGCCACTCAACAATTTGGCCAAACAAC
ACAACGAGAAGATCGGTCCGATGTTGAACGAGTTTGCTAAAAAACCCAACGGCGGTTTTC
AGTTCACCGTCTTAGATTTCTACAATGCTGTTCTCCGCAGGACAATAAGGCATACTGCCT
TCCGGTTTTATGTTACCAACGCATCGTGCTGCGGGGTAGGGACTCACAACGCGTATGGTT
GTGGAATGGCTAACGTGCACTCGAAGCTGTGTGAGTACCAAAGATCTTACTTCTTCTTTG
ACGGACGTCACAACACTGAGAAAGCTCAGGAAGAAATCGCTCATATTTTCTATGGAGCCA
ATACTAACGTGGTCCAACCAATGACCATACGTGAGCTAATCGTTTATCCGGCTAAGGAGA
ACATGCTTGAGTTTTGGGAA

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2EC86JQ 667 0 0
GG
CAACGCTAGCACCATTGGG*TTGCTTACCGATCGTGAGACAAGAATACAAAA*CTGGCAA
CGACTGTTACGAGCCACTCAACAATTTGGCCAAACAACACAACGAGAAGATCGGTCCGAT
GTTGAACGAGTTTGCTAAAAAACCCAACGGCGGTTTTCAGTTCACCGTCTTAGATTTCTA
CAATGCAGTTCTCCGCAGGACAATAAGGCATACTGCCTTCCGGTTTTATGTTACCAACAC
ATCGTGCTGCGGGGTAGGGACTCACAACGCGTATGGTTGTGGAATGGCTAACGTGCACTC
GAAGCTGTGTGAGTACCAAAGATCTTACTTCTTCTTTGACGGACGTCACAACACTGAGAA
AGCTCAGGAAGAAATCGCTCATATTTTCTATGGAGCCAATACTAACGTGGTCCAACCAAT
GACCATACGTGAGCTAATCGTTTATCCGGCTAAGGAGAACATGCTCGAGTTTTGGGAACC
CAACAACCTATCTACTCGTCGTCGACGTTCATCTCGTGATAACCTCGATTTATCAGCTTA
TTATTAGCTGGATGAAATATAATTGTGTTGAATCTTTCGTTATGTATGTGAGTCTACGAA
TATTGTATCCTAGCTGTAATGCTTGGTAACTATGTTTGTGCCGTCGAATAAATTGCGTGA
TATG
C

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR2EC86TF 667 0 0
GG
CAACGCTAGCACCATTGGG*TTGCTTACCGATCGTGAGACAAGAATACAAAA*CTGGCAA
CGACTGTTACGAGCCACTCAACAATTTGGCCAAACAACACAACGAGAAGATCGGTCCGAT
GTTGAACGAGTTTGCTAAAAAACCCAACGGCGGTTTTCAGTTCACCGTCTTAGATTTCTA
CAATGCAGTTCTCCGCAGGACAATAAGGCATACTGCCTTCCGGTTTTATGTTACCAACAC
ATCGTGCTGCGGGGTAGGGACTCACAACGCGTATGGTTGTGGAATGGCTAACGTGCACTC
GAAGCTGTGTGAGTACCAAAGATCTTACTTCTTCTTTGACGGACGTCACAACACTGAGAA
AGCTCAGGAAGAAATCGCTCATATTTTCTATGGAGCCAATACTAACGTGGTCCAACCAAT
GACCATACGTGAGCTAATCGTTTATCCGGCTAAGGAGAACATGCTCGAGTTTTGGGAACC
CAACAACCTATCTACTCGTCGTCGACGTTCATCTCGTGATAACCTCGATTTATCAGCTTA
TTATTAGCTGGATGAAATATAATTGTGTTGAATCTTTCGTTATGTATGTGAGTCTACGAA
TATTGTATCCTAGCTGTAATGCTTGGTAACTATGTTTGTGCCGTCGAATAAATTGCGTGA
TATG
C

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR2CD82TF 668 0 0
GGGTTGCTTACCGATCGTGAGACAAGAATACAAAA*CTGGCAACGACTGTTACGAGCCAC
TCAACAATTTGGCCAAACAACACAACGAGAAGATCGGTCCGATGTTGAACGAGTTTGCTA
AAAAACCCAACGGCGGTTTTCAGTTCACCGTCTTAGATTTCTACAATGCAGTTCTCCGCA
GGACAATAAGGCATACT*CCTTCCGGTTTTATGTTACCAACACATCGTGCTGCGGGGTAG
GGACTCACAACGCGTATGGTTGTGGAATGGCTAACGTGCACTCGAAGCTGTGTGAGTACC
AAAGATCTTACTTCTTCTTTGACGGACGTCACAACACTGAGAAAGCTCAGGAAGAAATCG
CTCATATTTTCTGTGGAGCCAATACTAACGTGGTCCAACCAATGACCATACGTGAGCTAA
TCGTTTATCCGGCTAAGGAGAACATGCTTGAGTTTTGGGAACCCAACAACCTATCTACTC
GTCGTCGACGTTCATCTCGTGATAACCTCGATTTATCAGCTTATTATTAGCTGGATGAAA
TATAATTGTGCTGAATCTTTCGTTATGTATGTGAGTCTACGAATATTGTATCCTAGCTGT
AATGCTTGGTAACTATGTTTGTGCCGTCGA*TAAATTGCGTGATATGTATTTGTATGTTT
TCTAATCT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2DG16JQ 750 0 0
GGAGCTAGTAAATTCGCAGTTCCAACGCTAGCACCATTGGG*TTGCTTACCGATCGTGAG
ACAAGAATACAAAA*CTGGCAACGACTGTTACGAGCCACTCAACAATTTGGCCAAACAAC
ACAACGAGAAGATCGGTCCGATGTTGAACGAGTTTGCTAAAAAACCCAACGGCGGTTTTC
AGTTCACCGTCTTAGATTTCTACAATGCAGTTCTCCGCAGGACAATAAGGCATACTGCCT
TCCGGTTTTATGTTACCAACACATCGTGCTGCGGGGTAGGGACTCACAACGCGTATGGTT
GTGGAATGGCTAACGTGCACTCGAAGCTGTGTGAGTACCAAAGATCTTACTTCTTCTTTG
ACGGACGTCACAACACTGAGAAAGCTCAGGAAGAAATCGCTCATATTTTCTATGGAGCCA
ATACTAACGTGGTCCAACCAATGACCATACGTGAGCTAATCGTTTATCCGGCTAAGGAGA
ACATGCTTGAGTTTTGGGAACCCAACAACCTATCTACTCGTCGTCGACGTTCATCTCGTG
ATAACCTCGATTTATCAGCTTATTATTAGCTGGATGAAATATAATTGTGCTGAATCTTTC
GTTATGTATGTGAGTCTACGAATATTGTATCCTAGCTGTAATGCTTGGTAACTATGTTTG
TGCCGTCGAATAAATTGCGTGATATGTATTTGTATGTTTTCTAATCTACGGAAAATATAA
TAAAAAGGGTATTACAATTCCCTTAGT
ATT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2CD82JQ 709 0 0
GGGTTGCTTACCGATCGTGAGACAAGAATACAAAA*CTGGCAACGACTGTTACGAGCCAC
TCAACAATTTGGCCAAACAACACAACGAGAAGATCGGTCCGATGTTGAACGAGTTTGCTA
AAAAACCCAACGGCGGTTTTCAGTTCACCGTCTTAGATTTCTACAATGCAGTTCTCCGCA
GGACAATAAGGCATACT*CCTTCCGGTTTTATGTTACCAACACATCGTGCTGCGGGGTAG
GGACTCACAACGCGTATGGTTGTGGAATGGCTAACGTGCACTCGAAGCTGTGTGAGTACC
AAAGATCTTACTTCTTCTTTGACGGACGTCACAACACTGAGAAAGCTCAGGAAGAAATCG
CTCATATTTTCTGTGGAGCCAATACTAACGTGGTCCAACCAATGACCATACGTGAGCTAA
TCGTTTATCCGGCTAAGGAGAACATGCTTGAGTTTTGGGAACCCAACAACCTATCTACTC
GTCGTCGACGTTCATCTCGTGATAACCTCGATTTATCAGCTTATTATTAGCTGGATGAAA
TATAATTGTGCTGAATCTTTCGTTATGTATGTGAGTCTACGAATATTGTATCCTAGCTGT
AATGCTTGGTAACTATGTTTGTGCCGTCGA*TAAATTGCGTGATATGTATTTGTATGTTT
TCTAATCTACGGAAAATATAATAAAAAGGGTATTACAATTCCCTTAGT
G

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2FK04JQ 508 0 0
GTTACCAACACATCGTGCTGCGGGGTAGGGACTCACAACGCGTATGGTTGTGGAATGGCT
AACGTGCACTCGAAGCTGTGTGAGTACCAAAGATCTTACTTCTTCTTTGACGGACGTCAC
AACACTGAGAAAGCTCAGGAAGAAATCGCTCATATTTTCTATGGAGCCAATACTAACGTG
GTCCAACCAATGACCATACGTGAGCTAATCGTTTATCCGGCTAAGGAGAACATGCTTGAG
TTTTGGGAACCCAACAACCTATCTACTCGTCGTCGACGTTCATCTCGTGATAACCTCGAT
TTATCAGCTTATTATTAGCTGGATGAAATATAATTGTGCTGAATCTTTCGTTATGTATGT
GAGCCTACGAATATTGTATCCTAGCTGTAATGCTTGGTAACTATGTTTGTGCCGTCGAAT
AAATTGCGTGATATGTATTTGTATGTTTTCTAATCTACGGAAAATATAATAAAAAGGGTA
TTACAATTCCCTTAGTATTAAAGAAAAA

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2H736TF 221 0 0
G
CGTTCATCTCGTGATAACCTCGATTTATCAGCTTATTATTAGCTGGATGAAATATAATTG
TGCTGAATCTTTCGTTATGTATGTGAGCCTACGAATATTGTATCCTAGCTGTAATGCTTG
GTAACTATGTTTGTGCCGTCGAATAAATTGCGTGATATGTATTTGTATGTTTTCTAATCT
ACGGAAAATATAATAAAAAGGGTATTACAATTCCCTTAGT

QA 2 221 2 221
DS 

RD RR2AT07TF 475 0 0
GTAGGGACTCACAACGCGTATGGTTGTGGAATGGCTAACGTGCACTCGAAGCTGTGTGAG
TACCAAAGATCTTACTTCTTCTTTGACGGACGTCACAACACTGAGAAAGCTCAGGAAGAA
ATCGCTCATATTTTCCATGGAGCCAATACTAACGTGGTCCAACCAATGACCATACGTGAG
CTAATCGTTTATCCGGCTAAGGAGAACATGCTTGAGTTTTGGGAACCCAACAACCTATCT
ACTCGTCGTCGACGTTCATCTCGTGATAACCTCGATTTATTAGCTTATTATTAGCTGGAT
GAAATATAATTGTGCTGAATCTTTCGTTATGTATGTGAGCCTACGAATATTGTATCCTAG
CTGTAATGCTTGGTAACTATGTTTGTGCCGTCGAATAAATTGCGTGATATGTATTTGTAT
GTTTTCTAATCTACGGAAAATATAATAAAAAGGGTATTACAATTCCCTTAGT
ATT

QA 1 472 1 472
DS 



AS 2 12

CO CL405Contig1 694 3 4 U
GGGACTCATTGTTGTATGGAGCCATACATAATAGCGGCAAACAGACAACTAAGTGCCATG
CATCCTATCTATAGGCTTTTGTTTCCCCACTTCCGCTACACCATGGAGATCAACGCTCGT
ACACGCCAAAGTCTCGTCAACGCAGGTGGAATCATCGAGACTTCTTTCTGGCCTGGCAAG
TATTCATTAGAGCTAAGTTCAGACGTCTATGGTAAACTATGGAGGTTCGACAAGGAAGCT
TTCCCAACCGACCAACCACTACAAGGATAAAAATGCCAGTGGAAGAGCCGACAGAGGAAG
AACTTAAAGAGTTCTATGAGGAACCAGAGAAGGTGTTGCTCAAGACATTCCCGTCGAGGA
AGCAGGCGACGCAAGTGATGGTGACTCTGGATCTACTATCGACCCATTCACCAGACGAAG
AGTACTTGGGAGAAGAGCCAGAAGCATCTTGGATAGACGAACCTGTCATCTTTGCTGTAT
ATAAAAAATTCAAAGGCAGGCTCCAATATCTAGAAGGCGTAATAGATGAGAGGAACGTGG
ATGTTTCTCTAAGGAACAGAGCTGGAGCAGGTGTTGTCAAGTACGAGCTTTTGAAGCCCA
TCTCTGAACCTGGTCTTACCGGAATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATATGAACATCAG
AACATGTATTTACTTGCTAAGTCATTTGAGTATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2AY82TFB U 259
AF RR2BR57JQ C 1
AF RR2BR57TF U 1
BS 1 258 RR2BR57TF
BS 259 442 RR2AY82TFB
BS 443 691 RR2BR57TF
BS 692 694 RR2BR57JQ

RD RR2AY82TFB 184 0 0
CTACAAGGATAAAAATGCCAGTGGAAGAGCCGACAGAGGAAGAACTTAAAGAGTTCTATG
AGGAACCAGAGAAGGTGTTGCTCAAGACATTCCCGTCGAGGAAGCAGGCGACGCAAGTGA
TGGTGACTCTGGATCTACTATCGACCCATTCACCAGACGAAGAGTACTTGGGAGAAGAGC
CAGA

QA 1 184 1 184
DS 

RD RR2BR57JQ 694 0 0
GGGACTCATTGTTGTATGGAGCCATACATAATAGCGGCAAACAGACAACTAAGTGCCATG
CATCCTATCTATAGGCTTTTGTTTCCCCACTTCCGCTACACCATGGAGATCAACGCTCGT
ACACGCCAAAGTCTCGTCAACGCAGGTGGAATCATCGAGACTTCTTTCTGGCCTGGCAAG
TATTCATTAGAGCTAAGTTCAGACGTCTATGGTAAACTATGGAGGTTCGACAAGGAAGCT
TTCCCAACCGACCAACCACTACAAGGATAAAAATGCCAGTGGAAGAGCCGACAGAGGAAG
AACTTAAAGAGTTCTATGAGGAACCAGAGAAGGTGTTGCTCAAGACATTCCCGTCGAGGA
AGCAGGCGACGCAAGTGATGGTGACTCTGGATCTACTATCGACCCATTCACCAGACGAAG
AGTACTTGGGAGAAGAGCCAGAAGCATCTTGGATAGACGAACCTGTCATCTTTGCTGTAT
ATAAAAAATTCAAAGGCAGGCTCCAATATCTAGAAGGCGTAATAGATGAGAGGAACGTGG
ATGTTTCTCTAAGGAACAGAGCTGGAGCAGGTGTTGTCAAGTACGAGCTTTTGAAGCCCA
TCTCTGAACCTGGTCTTACCGGAATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATATGAACATCAG
AACATGTATTTACTTGCTAAGTCATTTGAGTATC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2BR57TF 691 0 0
GGGACTCATTGTTGTATGGAGCCATACATAATAGCGGCAAACAGACAACTAAGTGCCATG
CATCCTATCTATAGGCTTTTGTTTCCCCACTTCCGCTACACCATGGAGATCAACGCTCGT
ACACGCCAAAGTCTCGTCAACGCAGGTGGAATCATCGAGACTTCTTTCTGGCCTGGCAAG
TATTCATTAGAGCTAAGTTCAGACGTCTATGGTAAACTATGGAGGTTCGACAAGGAAGCT
TTCCCAACCGACCAACCACTACAAGGATAAAAATGCCAGTGGAAGAGCCGACAGAGGAAG
AACTTAAAGAGTTCTATGAGGAACCAGAGAAGGTGTTGCTCAAGACATTCCCGTCGAGGA
AGCAGGCGACGCAAGTGATGGTGACTCTGGATCTACTATCGACCCATTCACCAGACGAAG
AGTACTTGGGAGAAGAGCCAGAAGCATCTTGGATAGACGAACCTGTCATCTTTGCTGTAT
ATAAAAAATTCAAAGGCAGGCTCCAATATCTAGAAGGCGTAATAGATGAGAGGAACGTGG
ATGTTTCTCTAAGGAACAGAGCTGGAGCAGGTGTTGTCAAGTACGAGCTTTTGAAGCCCA
TCTCTGAACCTGGTCTTACCGGAATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATATGAACATCAG
AACATGTATTTACTTGCTAAGTCATTTGAGT

QA 1 691 1 691
DS 



CO CL405Contig2 905 9 16 U
GCAGACGTCTATGGTAAACTATGGAGGTTCGACAAGGAAGCTTTACCTGCAGACCTCATC
AACAGGGGGCTGGCTGTGGAAGATGAGAACGCGGAACATGGGGTGCGGCTGACAATACCA
GACTACCCATTTGCGAATGACGGTCTAATTCTGTGGGATGCACTAAAGGAATGGGTCACA
GACTATGTGAAGCACTATTATCCAGATGCAGGACTGATCGTGTCGGATGAGGAACTCCAA
GAATGGTGGAGTGAAGTGAAGAACATAGGGCATGGAGACAAGAAAGACGAACCATGGTGG
CCTGAGCTCAAAACACAAGATGACTTGATTGGCGTGGTGACTACGATCGCGTGGGTGGCT
TCAGGTCACCATGCAGCCGTAAACTTTGGACAGTACGGGTATGGAGGGTACTTTCCCAAC
CGACCAACCACTACAAGGATAAAAATGCCAGTGGAAGAGCCGACAGAGGAAGAACTTAAA
GAGTTCTATGAGGAACCAGAGAAGGTGTTGCTCAAGACATTCCCGTCGAGGAAGCAGGCG
ACGCAAGTGATGGTGACTCTGGATCTACTATCGACCCATTCACCAGACGAAGAGTACTTG
GGAGAAGAGCCAGAAGCATCTTGGATAGACGAACCTGTCATCTTTGCTGCATATGAAAAA
TTCAAAGGCAGGCTCCAATATCTAGAAGGCGTAATAGATGAGAGGAACGTGGATGTTTCT
CTAAAGAACAGAGCTGGAGCAGGTGTTGTCAAGTACGAGCTTTTGAAGCCCATCTCTGAA
CCTGGTCTTACCGGAATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATATGAACATCAGAACATGTA
TTTACTTGCTAAGTCATTTGAGTATCAACAATAAGAAATAAAACAACCAGATCTTTTGCT
TACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 

AF RR2FP39TF U 61
AF RR2EF92TF U 1
AF RR2CI29TF U 231
AF RR2CN77TF U 229
AF RR2FP39JQ C 97
AF RR2CN77JQ C 229
AF RR2DB08JQ C 583
AF RR2DB08TF U 583
AF RR2EF92JQ C 374
BS 1 137 RR2EF92TF
BS 138 138 RR2FP39TF
BS 139 432 RR2EF92TF
BS 433 433 RR2CI29TF
BS 434 550 RR2EF92TF
BS 551 551 RR2CI29TF
BS 552 688 RR2EF92TF
BS 689 689 RR2DB08TF
BS 690 727 RR2EF92TF
BS 728 728 RR2DB08TF
BS 729 742 RR2EF92TF
BS 743 743 RR2DB08TF
BS 744 746 RR2EF92TF
BS 747 747 RR2DB08TF
BS 748 763 RR2EF92TF
BS 764 905 RR2DB08TF

RD RR2FP39TF 141 0 0
G
ACAGGGGGCTGGCTGTGGAAGATGAGAACGCGGAACATGGGGTGCGGCTGACAATACCAG
ACTACCCATTTGCGAATGACGGTCTAATTCTGTGGGATGCACTAAAGGAATGGGTCACAG
ACTATGTGAAGCACTATTAT

QA 2 141 2 141
DS 

RD RR2EF92TF 781 0 0
GCAGACGTCTATGGTAAACTATGGAGGTTCGACAAGGAAGCTTTACCTGCAGACCTCATC
AACAGGGGGCTGGCTGTGGAAGATGAGAACGCGGAACATGGGGTGCGGCTGACAATACCA
GACTACCCATTTGCGAACGACGGTCTAATTCTGTGGGATGCACTAAAGGAATGGGTCACA
GACTATGTGAAGCACTATTATCCAGATGCAGGACTGATCGTGTCGGATGAGGAACTCCAA
GAATGGTGGAGTGAAGTGAAGAACATAGGGCATGGAGACAAGAAAGACGAACCATGGTGG
CCTGAGCTCAAAACACAAGATGACTTGATTGGCGTGGTGACTACGATCGCGTGGGTGGCT
TCAGGTCACCATGCAGCCGTAAACTTTGGACAGTACGGGTATGGAGGGTACTTTCCCAAC
CGACCAACCACTTCAAGGATAAAAATGCCAGTGGAAGAGCCGACAGAGGAAGAACTTAAA
GAGTTCTATGAGGAACCAGAGAAGGTGTTGCTCAAGACATTCCCGTCGAGGAAGCAGGCG
ACGCAAGTGACGGTGACTCTGGATCTACTATCGACCCATTCACCAGACGAAGAGTACTTG
GGAGAAGAGCCAGAAGCATCTTGGATAGACGAACCTGTCATCTTTGCTGCATATGAAAAA
TTCAAAGGCAGGCTCCAATATCTAGAAG*CGTAATAGATGAGAGGAACGTGGATGTTTCT
CTAAAGA*CAGAGCTGGAGCAG*TGT*GTCAAGTACGAGCTTT
GAGCCATCTCTGACCTGT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2CI29TF 642 0 0
GGAACTCCAAGAATGGTGGAGTGAAGTGAAGAACATAGGGCATGGAGACAAGAAAGACGA
ACCATGGTGGCCTGAGCTCAAAACACAAGATGACTTGATTGGCGTGGTGACTACGATCGC
GTGGGTGGCTTCAGGTCACCATGCAGCCGTAAACTTTGGACAGTACGGGTATGGAGGGTA
CTTTCCCAACCGACCAACCACTACAAGGATAAAAATGCCAGTGGAAGAGCCGACAGAGGA
AGAACTTAAAGAGTTCTATGAGGAACCAGAGAAGGTGTTGCTCAAGACATTCCCGTCGAG
GAAGCAGGCGACGCAAGTGATGGTGACTCTGGATCTACTATCGACCCATTCACCAGACGA
AGAGTACTTGGGAGAAGAGCCAGAAGCATCTTGGATAGACGAACCTGTCATCTTTGCTGC
ATATGAAAAATTCAAAGGCAGGCTCCAATATCTAGAAGGCGTAATAGATGAGAGGAACGT
GGATGTTTCTCTAAAGAACAGAGCTGGAGCAGGTGTTGTCAAGTACGAGCTTTTGAAGCC
CATCTCTGAACCTGGTCTTACCGGAATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATATGAACATC
AGAACATGTATTTACTTGCTAAGTCATTTGAGTGTCAACAAT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2CN77TF 650 0 0
GAGGAACTCCAAGAATGGTGGAGTGAAGTGAAGAACATAGGGCATGGAGACAAGAAAGAC
GAACCATGGTGGCCTGAGCTCAAAACACAAGATGACTTGATTGGCGTGGTGACTACGATC
GCGTGGGTGGCTTCAGGTCACCATGCAGCCGTAAACTTTGGACAGTACGGGTATGGAGGG
TACTTTCCCAACCGACCAACCACTACAAGGATAAAAATGCCAGTGGAAGAGCCGACAGAG
GAAGAACTTAAAGAGTTCTATGAGGAACCAGAGAAGGTGTTGCTCAAGACATTCCCGTCG
AGGAAGCAGGCGACGCAAGTGATGGTGACTCTGGATCTACTATCGACCCATTCACCAGAC
GAAGAGTACTTGGGAGAAGAGCCAGAAGCATCTTGGATAGACGAACCTGTCATCTTTGCT
GCATATGAAAAATTCAAAGGCAGGCTCCAATATCTAGAAGGCGTAATAGATGAGAGGAAC
GTGGATGTTTCTCTAAAGAACAGAGCTGGAGCAGGTGTTGTCAAGTACGAGCTTTTGAAG
CCCATCTCTGAACCTGGTCTCACCGGAATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATATGAACA
TCAGAACATGTATTTACTTGCTAAGTCATTTGAGTATCAACAATAAGAAA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2FP39JQ 809 0 0
ACAT
GGGTGCGGCTGACAATACCAGACTACCCATTTGCGAATGACGGTCTAATTCTGTGGGATG
CACTAAAGGAATGGGTCACAGACTATGTGAAGCACTATTATCCAGATGCAGGACTGATCG
TGTCGGATGAGGAACTCCAAGAATGGTGGAGTGAAGTGAAGAACATAGGGCATGGAGACA
AGAAAGACGAACCATGGTGGCCTGAGCTCAAAACACAAGATGACTTGATTGGCGTGGTGA
CTACGATCGCGTGGGTGGCTTCAGGTCACCATGCAGCAGTAAACTTTGGACAGTACGGGT
ATGGAGGGTACTTTCCCAACCGACCAACCACTACAAGGATAAAAATGCCAGTGGAAGAGC
CGACAGAGGAAGAACTTAAAGAGTTTTATGAGGAACCAGAGAAGGTGTTGCTCAAGACAT
TCCCGTCGAGGAAGCAGGCGACGCAAGTGATGGTGACTCTGGATCTACTATCGACCCATT
CACCAGACGAAGAGTACTTGGGAGAAGAGCCAGAAGCATCTTGGATAGACGAACCTGTCA
TCTTTGCTGCATATGAAAAATTCAAAGGCAGGCTCCAATATCTAGAAGGCGTAATAGATG
AGAGGAACGTGGATGTTTCTCTAAAGAACAGAGCTGGAGCAGGTGTTGTCAAGTACGAGC
TTTTGAAGCCCATCTCCGAACCTGGTCTTACCGGAATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTA
TATGAACATCAGAACATGTATTTACTTGCTAAGTCATTTGAGTGTCAACAATAAGAAATA
AAACAACCAGATCTTTTGCTTACCC

QA 5 809 5 809
DS 

RD RR2CN77JQ 677 0 0
GAGGAACTCCAAGAATGGTGGAGTGAAGTGAAGAACATAGGGCATGGAGACAAGAAAGAC
GAACCATGGTGGCCTGAGCTCAAAACACAAGATGACTTGATTGGCGTGGTGACTACGATC
GCGTGGGTGGCTTCAGGTCACCATGCAGCCGTAAACTTTGGACAGTACGGGTATGGAGGG
TACTTTCCCAACCGACCAACCACTACAAGGATAAAAATGCCAGTGGAAGAGCCGACAGAG
GAAGAACTTAAAGAGTTCTATGAGGAACCAGAGAAGGTGTTGCTCAAGACATTCCCGTCG
AGGAAGCAGGCGACGCAAGTGATGGTGACTCTGGATCTACTATCGACCCATTCACCAGAC
GAAGAGTACTTGGGAGAAGAGCCAGAAGCATCTTGGATAGACGAACCTGTCATCTTTGCT
GCATATGAAAAATTCAAAGGCAGGCTCCAATATCTAGAAGGCGTAATAGATGAGAGGAAC
GTGGATGTTTCTCTAAAGAACAGAGCTGGAGCAGGTGTTGTCAAGTACGAGCTTTTGAAG
CCCATCTCTGAACCTGGTCTCACCGGAATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATATGAACA
TCAGAACATGTATTTACTTGCTAAGTCATTTGAGTATCAACAATAAGAAATAAAACAACC
AGATCTTTTGCTTACCC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2DB08JQ 323 0 0
G
CAGACGAAGAGTACTTGGGAGAAGAGCCAGAAGCATCTTGGATAGACGAACCTGTCATCT
TTGCTGCATGTGAAAAATTCAAAGGCAGGCTCCAATATCTAGAAGGCGTAATAGATGAGA
GGAACGTGGATGTTTCTCTAAAGAACAGAGCTGGAGCAGGTGTTGTCAAGTACGAGCTTT
TGAAGCCCATCTCTGAACCTGGTCTTACCGGAATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATAT
GAACATCAGAACATGTATTTACTTGCTAAGTCATTTGAGTATCAACAATAAGAAATAAAA
CAACCAGATCTTTTGCTTACCC

QA 2 323 2 323
DS 

RD RR2DB08TF 323 0 0
G
CAGACGAAGAGTACTTGGGAGAAGAGCCAGAAGCATCTTGGATAGACGAACCTGTCATCT
TTGCTGCATGTGAAAAATTCAAAGGCAGGCTCCAATATCTAGAAGGCGTAATAGATGAGA
GGAACGTGGATGTTTCTCTAAAGAACAGAGCTGGAGCAGGTGTTGTCAAGTACGAGCTTT
TGAAGCCCATCTCTGAACCTGGTCTTACCGGAATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATAT
GAACATCAGAACATGTATTTACTTGCTAAGTCATTTGAGTATCAACAATAAGAAATAAAA
CAACCAGATCTTTTGCTTACCC

QA 2 323 2 323
DS 

RD RR2EF92JQ 528 0 0
CAGCCGTAAACTTTGGACAGTACGGGTATGGAGGGTACTTTCCCAACCGACCAACCACTT
CAAGGATAAAAATGCCAGTGGAAGAGCCGACAGAGGAAGAACTTAAAGAGTTCTATGAGG
AACCAGAGAAGGTGTTGCTCAAGACATTCCCGTCGAGGAAGCAGGCGACGCAAGTGACGG
TGACTCTGGATCTACTATCGACCCATTCACCAGACGAAGAGTACTTGGGAGAAGAGCCAG
AAGCATTTTGGATAGACGAACCTGTCATTTTTGCTGCATATGAAAAATTCAAAGGCAGGC
TCCAATATCTAGAAGGCGTAATAGATGAGAGGAACGTGGATGTTTCTCTAAAGAACAGAG
CTGGAGCAGGTGTTGTCAAGTACGAGCTTTTGAAGCCCATCTCTGAACCTGGTCTTACCG
GAATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATATGAACATCAGAACATGTATTTACTTGCTAAG
TCATTTGAGTGTCAACAATAAGAAATAAAACAACCAGATCTTTTGCTT

QA 1 528 1 528
DS 



AS 3 11

CO CL406Contig1 641 3 2 U
TTCATGTTCGAAGCAACTGCATATAAATGGCAAACAGCCGAAAAGAGTAAGCAAGCAGGA
ATCACAAATCATCAAAGCATATATGCAACAAGTTCATAGGATATTCAGAACCCACTCAAC
ATGGAAAGAGTTTTGATCCAATGTTTTTTTTTTTGACATACTCCAACGTGTTGGAAAGAC
AGATTAGTAGCGGTATTTGGTGGAGTAATCTTTAGGAGCAATCACGAGCCCACGACCTTT
CCTTGCACCACGGAAGACGGTCTCGATGATATCGATAAACTCCTGCTTGTCCTTCATAGC
CCAATTGATCTTGTTGTTGTTACCAGTTCCAAGATCGATCATAATGTGTTTGTTCCTAAA
GAAAAACATGACCGTGGAAGGATCGTAAAGCTCGTACATGGTGTTGAAGTCTGGAACCTC
AGTTATGTCCACCAGATATATCACCGCAAAGTTCTTTATCGTCTCAGCAACTGATGCCAG
CACCTCATCCATCTGCATACAGGTTTCATCCCAATCATGGCCGAAACGTATGACCACGAG
ACGCTCTTCCTCAGCTAGAATCGCTTGATCAACAGCCCAGCCGGAATGCAAGTGCGGTAG
AAGATACGACATAGTTTCCTCTCTCTCTCTAGAAACGATCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD36JQ U 230
AF RR2BP94TF C 1
AF RR2BP94JQ U 3
BS 1 2 RR2BP94TF
BS 3 641 RR2BP94JQ

RD RR2FD36JQ 137 0 0
CCACGACCTTTCCTTGCACCACGGAAGACGGTCTCGATGATATCGATAAACTCCTGCTTG
TCCTTCATAGCCCAATTGATCTTGTTGTTGTTACCGGTTCCAAGATCGATCATAATGTGT
TTGTTCCTAAAGAA
AAA

QA 1 134 1 134
DS 

RD RR2BP94TF 641 0 0
TTCATGTTCGAAGCAACTGCATATAAATGGCAAACAGCCGAAAAGAGTAAGCAAGCAGGA
ATCACAAATCATCAAAGCATATATGCAACAAGTTCATAGGATATTCAGAACCCACTCAAC
ATGGAAAGAGTTTTGATCCAATGTTTTTTTTTTTGACATACTCCAACGTGTTGGAAAGAC
AGATTAGTAGCGGTATTTGGTGGAGTAATCTTTAGGAGCAATCACGAGCCCACGACCTTT
CCTTGCACCACGGAAGACGGTCTCGATGATATCGATAAACTCCTGCTTGTCCTTCATAGC
CCAATTGATCTTGTTGTTGTTACCAGTTCCAAGATCGATCATAATGTGTTTGTTCCTAAA
GAAGAACATGACCGTGGAAGGATCGTAGAGCTCGTACATGGTGTTGAAGTCTGGAACCTC
AGTTATGTCCACCAGATATATCACCGCAAAGTTCTTTATCGTCTCAGCAACTGATGCCAG
CACCTCATCCATCTGCATACAGGTTTCATCCCAATCATGGCCGAAACGTATGACCACGAG
ACGCTCTTCCTCAGCTAGAATCGCTTGATCAACAGCCCAGCCGGAATGCAAGTGCGGTAG
AAGATACGACATAGTTTCCTCTCTCTCT
CTAGAAACGATCC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2BP94JQ 639 0 0
CATGTTCGAAGCAACTGCATATAAATGGCAAACAGCCGAAAAGAGTAAGCAAGCAGGAAT
CACAAATCATCAAAGCATATATGCAACAAGTTCATAGGATATTCAGAACCCACTCAACAT
GGAAAGAGTTTTGATCCAATGTTTTTTTTTTTGACATACTCCAACGTGTTGGAAAGACAG
ATTAGTAGCGGTATTTGGTGGAGTAATCTTTAGGAGCAATCACGAGCCCACGACCTTTCC
TTGCACCACGGAAGACGGTCTCGATGATATCGATAAACTCCTGCTTGTCCTTCATAGCCC
AATTGATCTTGTTGTTGTTACCAGTTCCAAGATCGATCATAATGTGTTTGTTCCTAAAGA
AAAACATGACCGTGGAAGGATCGTAAAGCTCGTACATGGTGTTGAAGTCTGGAACCTCAG
TTATGTCCACCAGATATATCACCGCAAAGTTCTTTATCGTCTCAGCAACTGATGCCAGCA
CCTCATCCATCTGCATACAGGTTTCATCCCAATCATGGCCGAAACGTATGACCACGAGAC
GCTCTTCCTCAGCTAGAATCGCTTGATCAACAGCCCAGCCGGAATGCAAGTGCGGTAGAA
GATACGACATAGTTTCCTCTCTCTCTCTAGAAACGATCC

QA 1 639 1 639
DS 



CO CL406Contig2 696 4 17 U
GGGAAGGAGATCAGAGTTTTCGAGAAAGCGCGAGAGGG*********GATGTCGTATCTT
CTACCGCATCTACACTCCGGTTGGGCCGTCGATCAGGCGATTCTAGCTGAGGAAGAGCGT
CTCGTCGTCATACGTTTCGGCCACGATTGGGATGAGACTTGTATGCAGATGGATGAGGTG
CTTGCATCAGTTGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCAGTGATATATCTGTTGGACATCACT
GAGGTTCCGGACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCATCCACGGTCATGTTCTTC
TCTATGAACAAGCACATTATGATCGATCTTGGAACTGGTAACAACAACAAGATCAATTGG
GCTATGAAGGACAAGCAGGAGTCCATCGATATCATTGAAACCGTCTTCCGCGGTGCAAGG
AAAGGTCGTGGGCTGGTGATTGCTCCTAAAGATTACTCTACAAAATACCGCTACTAACCA
ACCGGTCTTGCCAAAAACATTGGATCGAAGACTCTTATATCGAGTGATTCTGATCATTTG
AAATATATATCCTATGAACTTGTGATTTGTTATTCCGGATTTGCCTGCTCTCTCT**ATC
GGCTCTTTGCCATTTATGTGTGTGTATAAGTGCTTCAAACTTCAGTGAAATGATATTATT
TAGAAGCCAAATATTGTGTTTATTTAGTATTAAGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E087TF U 1
AF RR2F883TF U 6
AF RR2F883JQ C 6
AF RR2AN66TF U 6
BS 1 5 RR2E087TF
BS 6 7 RR2F883TF
BS 8 38 RR2E087TF
BS 39 47 RR2F883TF
BS 48 228 RR2E087TF
BS 229 229 RR2F883TF
BS 230 301 RR2E087TF
BS 302 302 RR2F883TF
BS 303 304 RR2E087TF
BS 305 305 RR2F883TF
BS 306 382 RR2E087TF
BS 383 383 RR2F883TF
BS 384 584 RR2E087TF
BS 585 585 RR2F883TF
BS 586 595 RR2E087TF
BS 596 597 RR2F883TF
BS 598 696 RR2E087TF

RD RR2E087TF 696 0 0
GGGAAACAGATCAGAGTTTTCGAGAAAGCGCGAGAGGGAGACGAGACGATGTCGTATCTT
CTACCGCATCTACACTCCGGTTGGGCCGTCGATCAGGCGATTCTAGCTGAGGAAGAGCGT
CTCGTCGTCATACGTTTCGGCCACGATTGGGATGAGACTTGTATGCAGATGGATGAGGTG
CTTGCATCAGTTGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCAGTGATATATCTGGTGGACATCACT
GAGGTTCCGGACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCATCCACGGTCATGTTCTTC
TTTAGGAACAAGCACATTATGATCGATCTTGGAACTGGTAACAACAACAAGATCAATTGG
GCTATGAAGGACAAGCAGGAGTTCATCGATATCATTGAAACCGTCTTCCGCGGTGCAAGG
AAAGGTCGTGGGCTGGTGATTGCTCCTAAAGATTACTCTACAAAATACCGCTACTAACCA
ACCGGTCTTGCCAAAAACATTGGATCGAAGACTCTTATATCGAGTGATTCTGATCATTTG
AAATATATATCCTATGAACTTGTGATTTGTTATTCCGGATTTGCTTGCTCTCTCTCTATC
GGCTCTTTGCCATTTATGTGTGTGTATAAGTGCTTCAAACTTCAGTGAAATGATATTATT
TAGAAGCCAAATATTGTGTTTATTTAGTATTAAGTA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2F883TF 668 0 0
GGAGATCAGAGTTTTCGAGAAAGCGCGAGAGGG*********GATGTCGTATCTTCTACC
GCATCTACACTCCGGTTGGGCCGTCGATCAGGCGATTCTAGCTGAGGAAGAGCGTCTCGT
CGTCATACGTTTCGGCCACGATTGGGATGAGACTTGTATGCAGATGGATGAGGTGCTTGC
ATCAGTTGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCAGTGATATATCTGTTGGACATCACTGAGGT
TCCGGACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCATCCACGGTCATGTTCTTCTCTAT
GAACAAGCACATTATGATCGATCTTGGAACTGGTAACAACAACAAGATCAATTGGGCTAT
GAAGGACAAGCAGGAGTCCATCGATATCATTGAAACCGTCTTCCGCGGTGCAAGGAAAGG
TCGTGGGCTGGTGATTGCTCCTAAAGATTACTCTACAAAATACCGCTACTAACCAACCGG
TCTTGCCAAAAACATTGGATCGAAGACTCTTATATCGAGTGATTCTGATCATTTGAAATA
TATATCCTATGAACTTGTGATTTGTTATTCCGGATTTGCCTGCTCTCTCT**ATCGGCTC
TTTGCCATTTATGTGTGTGTATAAGTGCTTCAAACTTCAGTGAAATGATATTATTTAGAA
G
CCAAAAA

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2F883JQ 663 0 0
GGAGATCAGAGTTTTCGAGAAAGCGCGAGAGGG*********GATGTCGTATCTTCTACC
GCATCTACACTCCGGTTGGGCCGTCGATCAGGCGATTCTAGCTGAGGAAGAGCGTCTCGT
CGTCATACGTTTCGGCCACGATTGGGATGAGACTTGTATGCAGATGGATGAGGTGCTTGC
ATCAGTTGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCAGTGATATATCTGTTGGACATCACTGAGGT
TCCGGACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCATCCACGGTCATGTTCTTCTCTAT
GAACAAGCACATTATGATCGATCTTGGAACTGGTAACAACAACAAGATCAATTGGGCTAT
GAAGGACAAGCAGGAGTCCATCGATATCATTGAAACCGTCTTCCGCGGTGCAAGGAAAGG
TCGTGGGCTGGTGATTGCTCCTAAAGATTACTCTACAAAATACCGCTACTAACCAACCGG
TCTTGCCAAAAACATTGGATCGAAGACTCTTATATCGAGTGATTCTGATCATTTGAAATA
TATATCCTATGAACTTGTGATTTGTTATTCCGGATTTGCCTGCTCTCTCT**ATCGGCTC
TTTGCCATTTATGTGTGTGTATAAGTGCTTCAAACTTCAGTGAAATGATATTATTTAGAA
G
CC

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2AN66TF 661 0 0
GG
AGATCAGAGTTTTCGAGAAAGCGCGAGAGGGAGACGAGACGATGTCGTATCTTCTACCGC
ATCTACACTCCGGTTGGGCCGTCGATCAGGCGATTCTAGCTGAGGAAGAGCGTCTCGTCG
TCATACGTTTCGGCCACGATTGGGATGAGACTTGTATGCAGATGGATGAGGTGCTTGCAT
CAGTTGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCAGTGATATATCTGGTGGACATCACTGAGGTTC
CGGACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCATCCACGGTCATGTTCTTCTTTAGGA
ACAAGCACATTATGATCGATCTTGGAACTGGTAACAACAACAAGATCAATTGGGCTATGA
AGGACAAGCAGGAGTTCATCGATATCATTGAAACCGTCTTCCGCGGTGCAAGGAAAGGTC
GTGGGCTGGTGATTGCTCCTAAAGATTACTCTACAAAATACCGCTACTAACCAACCGGTC
TTGCCAAAAACATTGGATCGAAGACTCTTATATCGAGTGATTCTGATCATTTGAAATATA
TATCCTATGAACTTGTGATTTGTTATTCCGGATTTGCTTGCTCTCTCTCTATCGGCTCTT
TGCCATTTATGTGTGTGTATAAGTGCTTCAAACTTCAGTGAAATGATATTATTTAGAAG

QA 3 661 3 661
DS 



CO CL406Contig3 669 4 2 U
GGTGAGTGAAGATTGAAACGAATCGAAATCGTTTCTAGAGAGAGAGGAAACGATGTCGTA
TCTTCTACCGCACTTGCATTCCGGCTGGGCTGTTGATCAGGCGATTCTAGCTGAGGAAGA
GCGTCTAGTGGTCATACGTTTCGGCCATGATTGGGATGAAACCTGTATGCAGATGGATGA
GGTGCTGGCGTCAGTTGCTGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATATCTGGTGGACAT
AACTGAGGTTCCAGACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCTTCCACGGTCATGTT
CTTCTTCAGGAACAAACACATTATGATCGATCTTGGAACTGGTAACAACAACAAGATCAA
CTGGGCTATGAAGGACAAGCAGGAGTTTATCGATATCATCGAGACCGTCTTTCGTGGTGC
AAGGAAAGGTCGTGGGCTCGTGATTGCTCCAAAAGATTACTCCACCAAATACCGCTACTA
ATCGATCGGTCTTTCCAACACATTTGGAGTTTGTTAAACAAAAACATTGGATCAAAACTC
TTTCCATGTTGAGTGGTTCTGAATATCCTATGAACTTGTTGCATATATGCTTTGATGATT
TGTGATTCCTGCTTGCTTACTCTTTTCGGCTGTTTGCCATTTACAACGTATGCAGTTGCT
TCCAACATG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2G736TF U 1
AF RR2GW14JQ C 1
AF RR2GW14TF U 1
AF RR2G736JQ C 93
BS 1 622 RR2G736TF
BS 623 669 RR2GW14TF

RD RR2G736TF 622 0 0
GGTGAGTGAAGATTGAAACGAATCGAAATCGTTTCTAGAGAGAGAGGAAACGATGTCGTA
TCTTCTACCGCACTTGCATTCCGGCTGGGCTGTTGATCAGGCGATTCTAGCTGAGGAAGA
GCGTCTAGTGGTCATACGTTTCGGCCATGATTGGGATGAAACCTGTATGCAGATGGATGA
GGTGCTGGCGTCAGTTGCTGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATATCTGGTGGACAT
AACTGAGGTTCCAGACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCTTCCACGGTCATGTT
CTTCTTCAGGAACAAACACATTATGATCGATCTTGGAACTGGTAACAACAACAAGATCAA
CTGGGCTATGAAGGACAAGCAGGAGTTTATCGATATCATCGAGACCGTCTTTCGTGGTGC
AAGGAAAGGTCGTGGGCTCGTGATTGCTCCAAAAGATTACTCCACCAAATACCGCTACTA
ATCGATCGGTCTTTCCAACACATTTGGAGTTTGTTAAACAAAAACATTGGATCAAAACTC
TTTCCATGTTGAGTGGTTCTGAATATCCTATGAACTTGTTGCATATATGCTTTGATGATT
TGTGATTCCTGCTTGCTTACTC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2GW14JQ 669 0 0
GGTGAGTGAAGATTGAAACGAATCGAAATCGTTTCTAGAGAGAGAGGAAACGATGTCGTA
TCTTCTACCGCACTTGCATTCCGGCTGGGCTGTTGATCAGGCGATTCTAGCTGAGGAAGA
GCGTCTAGTGGTCATACGTTTCGGCCATGATTGGGATGAAACCTGTATGCAGATGGATGA
GGTGCTGGCGTCAGTTGCTGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATATTTGGTGGACAT
AACTGAGGTTCCAGACTTCAACACCATGTACGAGCTTTACGATCCTTCCACGGTCATGTT
TTTCTTCAGGAACAAACACATTATGATCGATCTTGGAACTGGTAACAACAACAAGATCAA
CTGGGCTATGAAGGACAAGCAGGAGTTTATCGATATCATCGAGACCGTCTTTCGTGGTGC
AAGGAAAGGTCGTGGGCTCGTGATTGCTCCAAAAGATTACTCCACCAAATACCGCTACTA
ATCGATCGGTCTTTCCAACACATTTGGAGTTTGTTAAACAAAAACATTGGATCAAAACTC
TTTCCATGTTGAGTGGTTTTGAATATCCTATGAACTTGTTGCATATATGCTTTGATGATT
TGTGATTCCTGCTTGCTTACTCTTTTCGGCTGTTTGCCATTTACAACGTATGCAGTTGCT
TCCAACATG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2GW14TF 669 0 0
GGTGAGTGAAGATTGAAACGAATCGAAATCGTTTCTAGAGAGAGAGGAAACGATGTCGTA
TCTTCTACCGCACTTGCATTCCGGCTGGGCTGTTGATCAGGCGATTCTAGCTGAGGAAGA
GCGTCTAGTGGTCATACGTTTCGGCCATGATTGGGATGAAACCTGTATGCAGATGGATGA
GGTGCTGGCGTCAGTTGCTGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATATCTGGTGGACAT
AACTGAGGTTCCAGACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCTTCCACGGTCATGTT
CTTCTTCAGGAACAAACACATTATGATCGATCTTGGAACTGGTAACAACAACAAGATCAA
CTGGGCTATGAAGGACAAGCAGGAGTTTATCGATATCATCGAGACCGTCTTTCGTGGTGC
AAGGAAAGGTCGTGGGCTCGTGATTGCTCCAAAAGATTACTCCACCAAATACCGCTACTA
ATCGATCGGTCTTTCCAACACATTTGGAGTTTGTTAAACAAAAACATTGGATCAAAACTC
TTTCCATGTTGAGTGGTTCTGAATATCCTATGAACTTGTTGCATATATGCTTTGATGATT
TGTGATTCCTGCTTGCTTACTCTTTTCGGCTGTTTGCCATTTACAACGTATGCAGTTGCT
TCCAACATG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2G736JQ 577 0 0
TTGATCAGGCGATTCTAGCTGAGGAAGAGCGTCTAGTGGTCATACGTTTCGGCCATGATT
GGGATGAAACCTGTATGCAGATGGATGAGGTGCTGGCGTCAGTTGCTGAGACGATAAAGA
ACTTTGCGGTGATATATCTGGTGGACATAACTGAGGTTCCAGACTTCAACACCATGTACG
AGCTCTACGATCCTTCCACGGTCATGTTCTTCTTCAGGAACAAACACATTATGATCGATC
TTGGAACTGGTAACAACAACAAGATCAACTGGGCTATGAAGGACAAGCAGGAGTTTATCG
ATATCATCGAGACCGTCTTTCGTGGTGCAAGGAAAGGTCGTGGGCTCGTGATTGCTCCAA
AAGATTACTCCACCAAATACCGCTACTAATCGATCGGTCTTTCCAACACATTTGGAGTTT
GTTAAACAAAAACATTGGATCAAAACTCTTTCCATGTTGAGTGGTTTTGAATATCCTATG
AACTTGTTGCATATATGCTTTGATGATTTGTGATTCCTGCTTGCTTACTCTTTTCGGCTG
TTTGCCATTTACAACGTATGCAGTTGCTTCCAACATG

QA 1 577 1 577
DS 



AS 2 10

CO CL407Contig1 767 4 14 U
GCAATATAGTTTTCATTCTCTGAATAGTCTCGTCTTGTGTTTATTGCTCTGGCGAGACAC
ACTTATTGTTAACAAACATTTGAAGAAGATTTGATTATGTTTTGTACATTGTACTAGAAG
GAAGTAAAGAGAGAAGATGATGGATCCCTTTGACTTGAGTGATGAGGCCAACATCTAAAA
CCTTTTACTCTCGTCAACCCATCACCTTTGGTCTCCAACCAGCAATCACATCCTCTGTTT
GCGCCTCTGTATTCTTGAATGATTCCCTCGAGAACACATTCTCCATGTAGGATTTAAGGA
AAGGAAGTGAATCTGGAACAGACCAGTTCTTGAAATGTCCCAGTGCAATCTTCATGTGGT
ATAATTTTGGTGCCAAGGACAAATCAGCTGCTGAGATCTTCTCTCCGTTTATGTAAGGTC
CATTTTCTTTGAGATAATCGTTGAATGTACTAAGCTCATCTAGTAACACTTGCTCGGTTC
CATCTCCTGAATCTTTGCTCTTGAGAAAACCGATAAATGTGGAGAAGATCTTCGACCCAA
CTGAAGCCTTTTCGGGTGGGGTTGCTAGAGGAGGCTCAGGGTACTTGTCTTCCAAAGACT
GTGTTATGACATCAGAATCCGGAACCCATTTCTCATCAAACTTCACCACTGGGACTTTAC
CTTCTGCACTAATTTGCAAGAACCACTCTGGCTTGTTACTCAAATCCACCATTTTCATGC
CATAAGGTACATGCTTCTCCTCCATCGTCAGCAACACCCTTTGGCAA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 10 

AF RR2CN73JQ U 5
AF RR2FN50JQ U 1
AF RR2H103JQ U 87
AF RR2H103TF C 87
BS 1 4 RR2FN50JQ
BS 5 30 RR2CN73JQ
BS 31 31 RR2FN50JQ
BS 32 54 RR2CN73JQ
BS 55 55 RR2FN50JQ
BS 56 56 RR2CN73JQ
BS 57 57 RR2FN50JQ
BS 58 75 RR2CN73JQ
BS 76 76 RR2FN50JQ
BS 77 116 RR2CN73JQ
BS 117 117 RR2FN50JQ
BS 118 719 RR2CN73JQ
BS 720 720 RR2H103JQ
BS 721 767 RR2CN73JQ

RD RR2CN73JQ 763 0 0
TATAGTTTTCATTCTCTGAATAGTCTTGTCTTGTGTTTATTGCTCTGGCGCGCCACACTT
ATTGTTAACAA*CATTTGAAGAAGATTTGATTATGTTTTGTACATTGTACTAAAAGGAAG
TAAAGAGAGAAGATGATGGATCCCTTTGACTTGAGTGATGAGGCCAACATCTAAAACCTT
TTACTCTCGTCAACCCATCACCTTTGGTCTCCAACCAGCAATCACATCCTCTGTTTGCGC
CTCTGTATTCTTGAATGATTCCCTCGAGAACACATTCTCCATGTAGGATTTAAGGAAAGG
AAGTGAATCTGGAACAGACCAGTTCTTGAAATGTCCCAGTGCAATCTTCATGTGGTATAA
TTTTGGTGCCAAGGACAAATCAGCTGCTGAGATCTTCTCTCCGTTTATGTAAGGTCCATT
TTCTTTGAGATAATCGTTGAATGTACTAAGCTCATCTAGTAACACTTGCTCGGTTCCATC
TCCTGAATCTTTGCTCTTGAGAAAACCGATAAATGTGGAGAAGATCTTCGACCCAACTGA
AGCCTTTTCGGGTGGGGTTGCTAGAGGAGGCTCAGGGTACTTGTCTTCCAAAGACTGTGT
TATGACATCAGAATCCGGAACCCATTTCTCATCAAACTTCACCACTGGGACTTTACCTTC
TGCACTAATTTGCAAGAACCACTCTGGCTTGTTACTCAAATCCACCATTTTCATGTCATA
AGGTACATGCTTCTCCTCCATCGTCAGCAACACCCTTTGGCAA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2FN50JQ 766 0 0
GCAATATAGTTTTCATTCTCTGAATAGTCTCGT*****GTTTATTGCTCTGGCGAGACAC
ACTTATTGTTAACAAACATTTGAAGAAGATTTGATTATGTTTTGTACATTGTACTAGAAG
GAAGTAAAGAGAGAAGATGATGGATCCCTTTGACTTGAGTGATGAGGCCAACATCTAAAA
CCTTTTATTCTCTTCAACCCATCACCTTTGGTCTCCAACCAGCAATCACATCCTCTGTTT
GCGCCTCTGTGTTCTTGAATGATTCCCTCGAGAACACATTCTCCATGTAGGATTTAAGGA
AAGGAAGTGAATCTGGAACAGACCAGTTCTTGAAATGTCCCAGTGCAATCTTCATGTGGT
ATAATTTTGGTGCCAAGGACAAATCAGCTGCTGAGATCTTCTCTCCGTTTATGTAAGGTC
CATTTTCTTTGAGATAATCGTTGAATGTACTAAGCTCATCTAGTAACACTTGCTCAGTTC
CATCTCCTGAATCTTTGCTCTTGAGAAAACCGATAAACGTGGAGAAGATCTTTGACCCAA
CTGAAGCCTTTTCGGGTGGAGTTGCTAGAGGAGGCTCAGGGTACTTGTCTTCCAAAGTTT
GTGTTATGACATCAGAATCCGGAACCCATTTCTCATCAAACTTCACCACTGGGACTTTAC
CTTCTGCACTAATTTGCAAGAACCACTCAGGCTTGTTACTCAAATCCACCATTTTCATGT
CATAAGGTACATGCTTCTCCTCCATGGTCAGCAACACCCTTTGGCA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2H103JQ 693 0 0
AGATTTGATTATGTTTTGTACATTGTACTAGAAGGAAGTAAAGAGAGAAGATGATGGATC
CCTTTGACTTGAGTGATGAGGCCAACATCTAAAACCTTTTACTCTCGTCAACCCATCACC
TTTGGTCTCCAACCAGCAATCACATCCTCTGTTTGCGCCTCTGTATTCTTGAATGATTCC
CTCGAGAACACATTCTCCATGTAGGATTTAAGGAAAGGAAGTGAATCTGGAACAGACCAG
TTCTTGAAATGTCCCAGTGCAATCTTCATGTGGTATAATTTTGGTGCCAAGGACAAATCA
GCTGCTGAGATCTTCTCTCCGTTTATGTAAGGTCCATTTTCTTTGAGATAATCGTTGAAT
GTACTAAGCTCATCTAGTAACACTTGCTCGGTTCCATCTCCTGAATCTTTGCTCTTGAGA
AAACCGATAAATGTGGAGAAGATCTTCGACCCAACTGAAGCCTTTTCGGGTGGGGTTGCT
AGAGGAGGCTCAGGGTACTTGTCTTCCAAAGACTGTGTTATGACATCAGAATCCGGAACC
CATTTCTCATCAAACTTCACCACTGGGACTTTACCTTCTGCACTAATTTGCAAGAACCAC
TCTGGCTTGTTACTCAAATCCACCATTTTCATGCCATAAGGTACATGCTTCTCCTCCATC
GTCAGCAACACCCTTTG
TTCTTGTCAATTCTCC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2H103TF 693 0 0
AGATTTGATTATGTTTTGTACATTGTACTAGAAGGAAGTAAAGAGAGAAGATGATGGATC
CCTTTGACTTGAGTGATGAGGCCAACATCTAAAACCTTTTACTCTCGTCAACCCATCACC
TTTGGTCTCCAACCAGCAATCACATCCTCTGTTTGCGCCTCTGTATTCTTGAATGATTCC
CTCGAGAACACATTCTCCATGTAGGATTTAAGGAAAGGAAGTGAATCTGGAACAGACCAG
TTCTTGAAATGTCCCAGTGCAATCTTCATGTGGTATAATTTTGGTGCCAAGGACAAATCA
GCTGCTGAGATCTTCTCTCCGTTTATGTAAGGTCCATTTTCTTTGAGATAATCGTTGAAT
GTACTAAGCTCATCTAGTAACACTTGCTCGGTTCCATCTCCTGAATCTTTGCTCTTGAGA
AAACCGATAAATGTGGAGAAGATCTTCGACCCAACTGAAGCCTTTTCGGGTGGGGTTGCT
AGAGGAGGCTCAGGGTACTTGTCTTCCAAAGACTGTGTTATGACATCAGAATCCGGAACC
CATTTCTCATCAAACTTCACCACTGGGACTTTACCTTCTGCACTAATTTGCAAGAACCAC
TCTGGCTTGTTACTCAAATCCACCATTTTCATGCCATAAGGTACATGCTTCTCCTCCATC
GTCAGCAACACCCTTTG
TTCTTGTCAATTCTCC

QA 1 677 1 677
DS 



CO CL407Contig2 1003 6 11 U
GGGTCGGAGAATTGACAAGAACAGAGAAAAGATAATAAAATGATAAGCCTTAGGTTTCAA
CCAAGCACCGCCGGTGTTCTGTCGGCGTCAGTCAGCGGCACCGGATTGATCAAGCGGTGC
GGTTTGACTAAACCGAGAAGAACCGCCCGGTTCGGAACGATGGCTATGGCGGCTGCTCCT
CTCGAAATCTGCGTCAAAGCATCCATCACCACACCCAACAAGCTCGGAGACTGTCCTTTT
TGCCAAAGGGTGTTGCTGACCATGGAGGAGAAGCATGTACCTTATGACATGAAAATGGTA
GATTTGAGTAACAAGCCAGAGTGGTTCTTGCAAATTAGTGCAGAAGGTAAAGTCCCAGTG
GTGAAGTTTGATGGGAAATGGGTTCCGGATTCTGATGTCATAACACAAGCTTTGGAAGAC
AAGTACCCTGAGCCTCCTCTAGCAACTCCACCCGAAAAGGCTTCAGTTGGGTCAAAGATC
TTCTCCACGTTTATTGGTTTTCTCAAGAGCAAAGATTCAGGAGATGGAACTGAGCAAGTG
CTACTAGATGAGCTTAGTACATTCAACGAGTATCTCAAAGAAAATGGACCTTACATAAAC
GGAGAGAAGATCTCAGCAGCTGATTTGTCCTTGGCACCAAAGTTATACCACATGAAGATT
GCACTGGGACATTTCAAGAACTGGTCTGTTCCAGATTCACTTCCTTTCCTTCAATCCTAC
ATGGAGAATGTGTTCTCGAGGGAATCATTCAAGAACACAGAGGCGCAAACAGAGGATGTG
ATTGCTGGTTGGAGACCAAAGGTGATGGGTTGAAAAGAGTAAAAGGTTTAAGATGTTGGC
CTCTCATCACTCAAGTCAAGGGATCCATCATCTTCTCTCTTACTTCCTTCTTAGTACAAT
GTAAAAAACATAATCAAATCTTCTTCAAATGTTTGTTAACAATAAGTGTGGCGCGCCAGA
GCAATAAACAGAACGACTATTCAGAGAATGAAAACTATATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH02TF U 1
AF RR2AL89TF U 39
AF RR2C623TF U 17
AF RR2AL89JQ C 142
AF RR2C623JQ C 335
AF RR2DH02JQ C 528
BS 1 200 RR2DH02TF
BS 201 201 RR2AL89TF
BS 202 203 RR2DH02TF
BS 204 204 RR2C623TF
BS 205 664 RR2DH02TF
BS 665 762 RR2C623TF
BS 763 763 RR2AL89JQ
BS 764 790 RR2C623TF
BS 791 959 RR2AL89JQ
BS 960 990 RR2C623JQ
BS 991 1003 RR2DH02JQ

RD RR2DH02TF 664 0 0
GGGTCGGAGAATTGACAAGAACAGAGAAAAGATAATAAAATGATAAGCCTTAGGTTTCAA
CCAAGCACCGCCGGTGTTCTGTCGGCGTCAGTCAGCGGCACCGGATTGATCAAGCGGTGC
GGTTTGACTAAACCGAGAAGAACCGCCCGGTTCGGAACGATGGCTATGGCGGCTGCTCCT
CTCGAAATCTGCGTCAAAGCTTCTATCACCACACCCAACAAGCTCGGAGACTGTCCTTTT
TGCCAAAGGGTGTTGCTGACCATGGAGGAGAAGCATGTACCTTATGACATGAAAATGGTA
GATTTGAGTAACAAGCCAGAGTGGTTCTTGCAAATTAGTGCAGAAGGTAAAGTCCCAGTG
GTGAAGTTTGATGGGAAATGGGTTCCGGATTCTGATGTCATAACACAAGCTTTGGAAGAC
AAGTACCCTGAGCCTCCTCTAGCAACTCCACCCGAAAAGGCTTCAGTTGGGTCAAAGATC
TTCTCCACGTTTATTGGTTTTCTCAAGAGCAAAGATTCAGGAGATGGAACTGAGCAAGTG
CTACTAGATGAGCTTAGTACATTCAACGAGTATCTCAAAGAAAATGGACCTTACATAAAC
GGAGAGAAGATCTCAGCAGCTGATTTGTCCTTGGCACCAAAGTTATACCACATGAAGATT
GCAC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2AL89TF 721 0 0
AATGATAAGCCTTAGGTTTCAACCAAGCACCGCCGGTGTTCTGTCGGCGTCAGTCAGCGG
CACCGGATTGATCAAGCGGTGCGGTTTGACTAAACCGAGAAGAACCGCCCGGTTCGGAAC
GATGGCTATGGCGGCTGCTCCTCTCGAAATCTGCGTCAAAGCATCCATCACCACACCCAA
CAAGCTCGGAGACTGTCCTTTTTGCCAAAGGGTGTTGCTGACCATGGAGGAGAAGCATGT
ACCTTATGACATGAAAATGGTAGATTTGAGTAACAAGCCAGAGTGGTTCTTGCAAATTAG
TGCAGAAGGTAAAGTCCCAGTGGTGAAGTTTGATGGGAAATGGGTTCCGGATTCTGATGT
CATAACACAAGCTTTGGAAGACAAGTACCCTGAGCCTCCTCTAGCAACTCCACCCGAAAA
GGCTTCAGTTGGGTCAAAGATCTTCTCCACGTTTATTGGTTTTCTCAAGAGCAAAGATTC
AGGAGATGGAACTGAGCAAGTGCTACTAGATGAGCTTAGTACGTTCAACGAGTATCTCAA
AGAAAATGGACCTTACATAAACGGAGAGAAGATCTCAGCAGCTGATTTGTCCTTGGCACC
AAAGTTATACCACATGAAGATTGCACTGGGACATTTCAAGAACTGGTCTGTTCCAGATTC
ACTTCCTTTCCTTCAATCCTACATGGAGAATGTGTTCTCGAGGGAATCATTCAAGAACAC
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2C623TF 774 0 0
GG
GAACAGAGAAAAGATAATAAAATGATAAGCCTTAGGTTTCAACCAAGCACCGCCGGTGTT
CTGTCGGCGTCAGTCAGCGGCACCGGATTGATCAAGCGGTGCGGTTTGACTAAACCGAGA
AGAACCGCCCGGTTCGGAACGATGGCTATGGCGGCTGCTCCTTTCGAAATCTGCGTCAAA
GCTTCCATCACCACACCCAACAAGCTCGGAGACTGTCCTTTTTGCCAAAGGGTGTTGCTG
ACCATGGAGGGGAAGTATGTACCTTATGACATGAAAATGGTAGATTTGAGTAACAAGCCA
GAGTGGTTCTTGCAAATTAGTGCAGAAGGTAAAGTCCCAGTGGTGAAGTTTGATGGGAAA
TGGGTTCCGGATTCTGATGTCATAACACAAGCTTTGGAAGACAAGTACCCTGAGCCTCCT
CTAGCAACTCCACCCGAAAAGGCTTCAGTTGGGTCAAAGATCTTCTCCACGTTTATTGGT
TTTCTCAAGAGCAAAGATTCAGGAGATGGAACTGAGCAAGTGCTACTAGATGAGCTTAGT
ACATTCAACGAGTATCTCAAAGAAAATGGACCTTACATAAACGGAGAGAAGATCTCAGCA
GCTGATTTGTCCTTGGCACCAAAGTTATACCACATGAAGATTGCACTGGGACATTTCAAG
AACTGGTCTGTTCCAGATTCACTTCCTTTCCTTCAATCCTACATGGAGAATGTGTTCTCG
AGGGAATCATTCAAGAACACAGAG*CGCAAACAGAGGATGTGATTGCTGGTT

QA 3 774 3 774
DS 

RD RR2AL89JQ 818 0 0
ACCGCCCGGTTCGGAACGATGGCTATGGCGGCTGCTCCTCTCGAAATCTGCGTCAAAGCA
TCCATCACCACACCCAACAAGCTCGGAGACTGTCCTTTTTGCCAAAGGGTGTTGCTGACC
ATGGAGGAGAAGCATGTACCTTATGACATGAAAATGGTAGATTTGAGTAACAAGCCAGAG
TGGTTCTTGCAAATTAGTGCAGAAGGTAAAGTCCCAGTGGTGAAGTTTGATGGGAAATGG
GTTCCGGATTCTGATGTCATAACACAAGCTTTGGAAGACAAGTACCCTGAGCCTCCTCTA
GCAACTCCACCCGAAAAGGCTTCAGTTGGGTCAAAGATCTTCTCCACGTTTATTGGTTTT
CTCAAGAGCAAAGATTCAGGAGATGGAACTGAGCAAGTGCTACTAGATGAGCTTAGTACG
TTCAACGAGTATCTCAAAGAAAATGGACCTTACATAAACGGAGAGAAGATCTCAGCAGCT
GATTTGTCCTTGGCACCAAAGTTATACCACATGAAGATTGCACTGGGACATTTCAAGAAC
TGGTCTGTTCCAGATTCACTTCCTTTCCTTCAATCCTACATGGAGAATGTGTTCTCGAGG
GAATCATTCAAGAACACAGAGGCGCAAACAGAGGATGTGATTGCTGGTTGGAGACCAAAG
GTGATGGGTTGAAAAGAGTAAAAGGTTTAAGATGTTGGCCTCTCATCACTCAAGTCAAGG
GATCCATCATCTTCTCTCTTACTTCCTTCTTAGTACAATGTAAAAAACATAATCAAATCT
TCTTCAAATGTTTGTTAACAATAAGTGTGGCGCGCCAG

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2C623JQ 656 0 0
TTAGTGCAGAAGGTAAAGTCCCAGTGGTGAAGTTTGATGGGAAATGGGTTCCGGATTCTG
ATGTCATAACACAAGCTTTGGAAGACAAGTACCCTGAGCCTCCTCTAGCAACTCCACCCG
AAAAGGCTTCAGTTGGGTCAAAGATCTTCTCCACGTTTATTGGTTTTCTCAAGAGCAAAG
ATTCAGGAGATGGAACTGAGCAAGTGCTACTAGATGAGCTTAGTACATTCAACGAGTATC
TCAAAGAAAATGGACCTTACATAAACGGAGAGAAGATCTCAGCAGCTGATTTGTCCTTGG
CACCAAAGTTATACCACATGAAGATTGCACTGGGACATTTCAAGAACTGGTCTGTTCCAG
ATTCACTTCCTTTCCTTCAATCCTACATGGAGAATGTGTTCTCGAGGGAATCATTCAAGA
ACACAGAGGCGCAAACAGAGGATGTGATTGCTGGTTGGAGACCAAAGGTGATGGGTTGAA
AAGAGTAAAAGGTTTAAGATGTTGGCCTCTCATCACTCAAGTCAAGGGATCCATCATCTT
CTCTCTTACTTCCTTCTTAGTACAATGTAAAAAACATAATCAAATCTTCTTCAAATGTTT
GTTAACAATAAGTGTGGCGCGCCAGAGCAATAAACAGAACGACTATTCAGAGAATG

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2DH02JQ 476 0 0
AACTGAGCAAGTGCTACTAGATGAGCTTAGTACATTCAACGAGTATCTCAAAGAAAATGG
ACCTTACATAAACGGAGAGAAGATCTCAGCAGCTGATTTGTCCTTGGCACCAAAGTTATA
CCACATGAAGATTGCACTGGGACATTTCAAGAACTGGTCTGTTCCAGATTCACTTCCTTT
CCTTCAATCCTACATGGAGAATGTGTTCTCGAGGGAATCATTCAAGAACACAGAGGCGCA
AACAGAGGATGTGATTGCTGGTTGGAGACCAAAGGTGATGGGTTGAAAAGAGTAAAAGGT
TTAAGATGTTGGCCTCTCATCACTCAAGTCAAGGGATCCATCATCTTCTTTCTTACTTCC
TTCTTAGTACAATGTAAAAAACATAATCAAATTTTCTTCAAATGTTTGTTAACAATAAGT
GTGGCGCGCCAGAGCAATAAACAGAACGACTATTCAGAGAATGAAAACTATATTGC

QA 1 476 1 476
DS 



AS 1 12

CO CL408Contig1 741 12 7 U
CTGATTCTTGATCTTCTTTACTCTGTCTTATTAGAGCTCAGGAAATTATCCATATATATA
TGTAGCCACATATTTTTCACCATTACATAAAATGTATTAATAAAAAGACTTTTTCCTTTT
AGTTTGATAAAACTATTAAGTTATACACAATTAGAATATATGCTATATGTTTGGACCATG
CTCGGCTAATCTCCCTTATCCTGGGGGTGTAGCTCCTCCTGCTGCGGGTGCAGGTGCTGC
TCCTCCTGCCGCAGGTACCGCCCCACCCGTTGGTACACCTTTGAGTAGATTTTTT*AACC
ATTCTGGGATATTTCCGGACGTCTGAACTCCACCACCTGGTTTATTTCCAAATGTTCCAG
AAAATGATTTTCCTCCCCATGATCCTCCAAAGCCACCTGAAAACTTAAACATTTTCAATG
GTGTTTGGGCTAAGCGGGCCAACGAAGTTCCTTCCGCTGTCTTGATGAGCCCCAAGATGA
GACTAATGGCGGTGATTCCGAGGGTGGCACCGGCCGTTAGCCCAGAGGCTAGGAGAGTAG
TGGCTATAGTGGCGGGAAGGAGAATTGGACTGAATATGAGGAAAAGCGGTGTGGATACAA
CTAATGCCACGGCTGAACCGGCGAGTGTTAGACACGCAAATGCAAATAAGACTACAGAAG
TCACGGAAGCAACAACAACCTTAATAACATCCAACAATGTGCTGAGAAAAGAGAACATTT
TGTACAAAATTCTGGATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 65 35 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 45 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 

AF RR2EZ95JQ U 10
AF RR2GB74JQ U 1
AF RR2AV22JQ U 85
AF RR2EZ95TF C 16
AF RR2EG91JQ U 34
AF RR2EG91TF C 34
AF RR2A425JQ U 36
AF RR2EB94TF C 434
AF RR2A425TF C 327
AF RR2GB74TF C 215
AF RR2AV22TF C 85
AF RR2EB94JQ U 36
BS 1 211 RR2GB74JQ
BS 212 212 RR2EZ95JQ
BS 213 537 RR2GB74JQ
BS 538 538 RR2EG91JQ
BS 539 596 RR2GB74JQ
BS 597 722 RR2EG91JQ
BS 723 741 RR2A425JQ

RD RR2EZ95JQ 527 0 0
GGTCTT
CTTTACTCTGTCTTATTAGAGCTCAGGAAATTATCCATATATATATGTAGCCACATATTT
TTCACCATTACATAAAATGTATTAATAAAAAGACTTTTTCCTTTTAGTTTGATAAAACTA
TTAAGTTATACACAATTAGAATATATGCTATATGTTTGGACCATGCTCGGCTAATCTCCC
TTATCCTGGGGGTGTAGCTCCTCCTGCTGCGGGTGCAGGTGCTGCTCCTCCTGCCGCAGG
TACCGCCCCACCCGTTGGTACACCTTTGAGTAGATTTTTT*AACCATTCTGGGATATTTC
CGGACGTCTGAACTCCACCACCTGGTTTATTTCCAAATGTTCCAGAAAATGATTTTCCTC
CCCATGATCCTCCAAAGCCACCTGAAAACTTAAACATTTTCAATGGTGTTTGGGCTAAGC
GGGCCAACGAAGTTCCTTCCGCTGTCTTGATGAGCCCCAAGATGAGACTAATGGCGGTGA
TTCCGAGGGTGGCACCGGCCGTTAGCCCAGAGGCTAGGAGA

QA 7 527 7 527
DS 

RD RR2GB74JQ 596 0 0
CTGATTCTTGATCTTCTTTACTCTGTCTTATTAGAGCTCAGGAAATTATCCATATATATA
TGTAGCCACATATTTTTCACCATTACATAAAATGTATTAATAAAAAGACTTTTTCCTTTT
AGTTTGATAAAACTATTAAGTTATACACAATTAGAATATATGCTATATGTTTGGACCATG
CTCGGCTAATCTCCCTTATCCTGGGGGTGTAACTCCTCCTGCTGCGGGTGCAGGTGCTGC
TCCTCCTGCCGCAGGTACCGCCCCACCCGTTGGTACACCTTTGAGTAGATTTTTT*AACC
ATTCTGGGATATTTCCGGACGTCTGAACTCCACCACCTGGTTTATTTCCAAATGTTCCAG
AAAATGATTTTCCTCCCCATGATCCTCCAAAGCCACCTGAAAACTTAAACATTTTCAATG
GTGTTTGGGCTAAGCGGGCCAACGAAGTTCCTTCCGCTGTCTTGATGAGCCCCAAGATGA
GACTAATGGCGGTGATTCCGAGGGTGGCACCGGCCGTTAGCCCAGAGGCTAGGAGAGCAG
TGGCTATAGTGGCGGGAAGGAGAATTGGACTGAATATGAGGAAAAGCGGTGTGGAT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2AV22JQ 543 0 0
G
CATAAAATGTATTAATAAAAAGACTTTTTCCTTTTAGTTTGATAAAACTATTAAGTTATA
CACAATTAGAATATATGCTATATGTTTGGACCATGCTCGGCTAATCTCCCTTATCCTGGG
GGTGTAGCTCCTCCTGCTGCGGGTGCAGGTGCTGCTCCTACTGCCGCAGGTACTGCCCCA
CCCGTTGGTACACCTTTGAGTAGATTTTTT*AACCATTCTGGGATATTTCCGGACGTCTG
AACTCCACCACCTGGTTTATTTCCAAATGTTCCAGAAAATGATTTTCCTCCCCATGATCC
TCCAAAGCCACCTGAAAACTTAAACATTTTCAATGGTGTTTGGGCTAAGCGGGCCAACGA
AGTTCCTTCCGCTGTCTTGATGAGCCCCAAGATGAGACTAATGGCGGTGATTCCGAGGGT
GGCACCGGCCGTTAGCCCAGAGGCTAGGAAAGTAGTGGCTATAGTGGCGGGAAGGAGAAT
TGGACTGAATATGAGGAAAAGCGGTGTGGATACAACTAATGCCACGGCTGAACCGGCGAG
TG

QA 2 543 2 543
DS 

RD RR2EZ95TF 726 0 0
CTTTACTCTGTCTTATTAGAGCTCAGGAAATTATCCATATATATATGTAGCCACATATTT
TTCACCATTACATAAAATGTATTAATAAAAAGACTTTTTCCTTTTAGTTTGATAAAACTA
TTAAGTTATACACAATTAGAATATATGCTATATGTTTGGACCATGCTCGGCTAATCTCCC
TTATCCTGGGGGTGTAGCTCCTCCTGCTGCGGGTGCAGGTGCTGCTCCTCCTGCCGCAGG
TACCGCCCCACCCGTTGGTACACCTTTGAGTAGATTTTTT*AACCATTCTGGGATATTTC
CGGACGTCTGAACTCCACCACCTGGTTTATTTCCAAATGTTCCAGAAAATGATTTTCCTC
CCCATGATCCTCCAAAGCCACCTGAAAACTTAAACATTTTCAATGGTGTTTGGGCTAAGC
GGGCCAACGAAGTTCCTTCCGCTGTCTTGATGAGCCCCAAGATGAGACTAATGGCGGTGA
TTCCGAGGGTGGCACCGGCCGTTAGCCCAGAGGCTAGGAGAGTAGTGGCTATAGTGGCGG
GAAGGAGAATTGGACTGAATATGAGGAAAAGCGGTGTGGATACAACTAATGCCACGGCTG
AACCGGCGAGTGTTAGACACGCAAATGCAAATAAGACTACAGAAGTCACGGAAGCAACAA
CAACCTTAATAACATCTAACAATGTGCTGAGAAAAGAGAACATTTTGTACAAAATTCTGG
ATTTCC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2EG91JQ 689 0 0
GAGCTCAGGAAATTATCCATATATATATGTAGCCACATATTTTTCACCATTACATAAAAT
GTATTAATAAAAAGACTTTTTCCTTTTAGTTTGATAAAACTATTAAGTTATACACAATTA
GAATATATGCTATATGTTTGGACCATGCTCGGCTAATCTCCCTTATCCTGGGGGTGTAGC
TCCTCCTGCTGCGGGTGCAGGTGCTGCTCCTCCTGCCGCAGGTACCGCCTCACCCGTTGG
TACACCTTTGAGTAGATTTTTTTAACCATTCTGGGATATTTCCGGACGTCTGAACTCCAC
CACCTGGTTTATTTCCAAATGCTCCAGAAAATGATTTTCCTCCCCATGATCCTCCAAAGC
CACCTGAAAACTTAAACATTTTCAATGGTGTTTGGGCTAAGCGGGCCAACGAAGTTCCTT
CCGCTGTCTTGATGAGCCCCAAAATGAGACTAATGGCGGTGATTCCGAGGGTGGCACCGG
CCGTTAGCCCAGAGGCTAGGAAAGTAGTGGCTATAGTGGCGGGAAGGAGAATTGGACTGA
ATATGAGGAAAAGCGGTGTGGATACAACTAATGCCACGGCTGAACCGGCGAGTGTTAGAC
ACGCAAATGCAAATAAGACTACAGAAGTCACGGAAGCAACAACAACCTTAATAACATCCA
ACAATGTGCTGAGAAAAGAGAACATTTTG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2EG91TF 708 0 0
GAGCTCAGGAAATTATCCATATATATATGTAGCCACATATTTTTCACCATTACATAAAAT
GTATTAATAAAAAGACTTTTTCCTTTTAGTTTGATAAAACTATTAAGTTATACACAATTA
GAATATATGCTATATGTTTGGACCATGCTCGGCTAATCTCCCTTATCCTGGGGGTGTAGC
TCCTCCTGCTGCGGGTGCAGGTGCTGCTCCTCCTGCCGCAGGTACCGCCTCACCCGTTGG
TACACCTTTGAGTAGATTTTTTTAACCATTCTGGGATATTTCCGGACGTCTGAACTCCAC
CACCTGGTTTATTTCCAAATGCTCCAGAAAATGATTTTCCTCCCCATGATCCTCCAAAGC
CACCTGAAAACTTAAACATTTTCAATGGTGTTTGGGCTAAGCGGGCCAACGAAGTTCCTT
CCGCTGTCTTGATGAGCCCCAAAATGAGACTAATGGCGGTGATTCCGAGGGTGGCACCGG
CCGTTAGCCCAGAGGCTAGGAGAGTAGTGGCTATAGTGGCGGGAAGGAGAATTGGACTGA
ATATGAGGAAAAGCGGTGTGGATACAACTAATGCCACGGCTGAACCGGCGAGTGTTAGAC
ACGCAAATGCAAATAAGACTACAGAAGTCACGGAAGCAACAACAACCTTAATAACATCCA
ACAATGTGCTGAGAAAAGAGAACATTTTGTACAAAATTCTGGATTTCC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2A425JQ 706 0 0
GCTCAGGAAATTATCCATATATATATGTAGCCACATATTTTTCACCATTACATAAAATGT
ATTAATAAAAAGACTTTTTCCTTTTAGTTTGATAAAACTATTAAGTTATACACAATTAGA
ATATATGCTATATGTTTGGACCATGCTCGGCTAATCTCCCTTATCCTGGGGGTGTAGCTC
CTCCTGCTGCGGGTGCTGGTGCTGCTCCTCCTGCCGCAGGTACCGCCCCACCCGTTGGTA
CACCTTTGAGTAGATTTTTT*AACCATTCTGGGATATTTCCGGACGTCTGAACTCCACCA
CCTGGTTTATTTCCAAATGTTCCAGAAAATGATTTTCCTCCCCATGATCCTCCAAAGCCA
CCTGAAAACTTAAACATTTTCAATGGTGTTTGGGCTAAGCGGGCCAACGAAGTTCCTTCC
GCTGTCTTGATGAGCCCCAAGATGAGACTAATGGCGGTGATTCCGAGGGTGGCACCGGCC
GTTAGCCCAGAGGCTAGGAGAGTAGTGGCTATAGTGGCGGGAAGGAGAATTGGACTGAAT
ATGAGGAAAAGCGGTGTGGATACAACTAATGCCACGGCTGAACCGGCGAGTGTTAGACAC
GCAAATGCAAATAAGACTACAGAAGTCACGGAAGCAACAACAACCTTAATAACATCCAAC
AATGTGCTGAGAAAAGAGAACATTTTGTACAAAATTCTGGATTTCC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2EB94TF 308 0 0
GCGGGCCAACGAAGTTCCTTCCGCTGTCTTGATGAGCCCCAAGATGAGACTAATGGCGGT
GATTCCGAGGGTGGCACCGGCCGTTAGCCCAGAGGCTAGGAGAGTAGTGGCTATAGTGGC
GGGAAGGAGAATTGGACTGAATATGAGGAAAAGCGGTGTGGATACAACTAATGCCACGGC
TGAACCGGCGAGTGTTAGACACGCAAATGCAAATAAGACTACAGAAGTCACGGAAGCAAC
AACAACCTTAATAACATCCAACAATGTGCTGAGAAAAGAGAACATTTTGTACAAAATTCT
GGATTT
TC

QA 1 306 1 306
DS 

RD RR2A425TF 415 0 0
ACTCCACCACCTGGTTTATTTCCAAATGTTCCAGAAAATGATTTTCCTCCCCATGATCCT
CCAAAGCCACCTGAAAACTTAAACATTTTCAATGGTGTTTGGGCTAAGCGGGCCAACGAA
GTTCCTTCCGCTGTCTTGATGAGCCCCAAGATGAGACTAATGGCGGTGATTCCGAGGGTG
GCACCGGCCGTTAGCCCAGAGGCTAGGAGAGTAGTGGCTATAGTGGCGGGAAGGAGAATT
GGACTGAATATGAGGAAAAGCGGTGTGGATACAACTAATGCCACGGCTGAACCGGCGAGT
GTTAGACACGCAAATGCAAATAAGACTACAGAAGTCACGGAAGCAACAACAACCTTAATA
ACATCCAACAATGTGCTGAGAAAAGAGAACATTTTGTACAAAATTCTGGATTTCC

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR2GB74TF 527 0 0
TCCTCC
GCTGCGGGTGCAGGTGCTGCTCCTCCTGCCGCAGGTACCGCCCCACCCGTTGGTACACCT
TTGAGTAGATTTTTT*AACCATTCTGGGATATTTCCGGACGTCTGAACTCCACCACCTGG
TTTATTTCCAAATGTTCCAGAAAATGATTTTCCTCCCCATGATCCTCCAAAGCCACCTGA
AAACTTAAACATTTTCAATGGTGTTTGGGCTAAGCGGGCCAACGAAGTTCCTTCCGCTGT
CTTGATGAGCCCCAAGATGAGACTAATGGCGGTGATTCCGAGGGTGGCACCGGCCGTTAG
CCCAGAGGCTAGGAGAGCAGTGGCTATAGTGGCGGGAAGGAGAATTGGACTGAATATGAG
GAAAAGCGGTGTGGATACGACTAATGCCACGGCTGAACCGGCGAGTGTTAGACACGCAAA
TGCAAATAAGACTACAGAAGTCACGGAAGCAACAACAACCTTAATAACATCCAACAATGT
GCTGAGAAAAGAGAACATTTTGTACAAAATTCTGGATTTCC

QA 7 527 7 527
DS 

RD RR2AV22TF 657 0 0
G
CATAAAATGTATTAATAAAAAGACTTTTTCCTTTTAGTTTGATAAAACTATTAAGTTATA
CACAATTAGAATATATGCTATATGTTTGGACCATGCTCGGCTAATCTCCCTTATCCTGGG
GGTGTAGCTCCTCCTGCTGCGGGTGCAGGTGCTGCTCCTACTGCCGCAGGTACTGCCCCA
CCCGTTGGTACACCTTTGAGTAGATTTTTT*AACCATTCTGGGATATTTCCGGACGTCTG
AACTCCACCACCTGGTTTATTTCCAAATGTTCCAGAAAATGATTTTCCTCCCCATGATCC
TCCAAAGCCACCTGAAAACTTAAACATTTTCAATGGTGTTTGGGCTAAGCGGGCCAACGA
AGTTCCTTCCGCTGTCTTGATGAGCCCCAAGATGAGACTAATGGCGGTGATTCCGAGGGT
GGCACCGGCCGTTAGCCCAGAGGCTAGGAGAGTAGTGGCTATAGTGGCGGGAAGGAGAAT
TGGACTGAATATGAGGAAAAGCGGTGTGGATACAACTAATGCCACGGCTGAACCGGCGAG
TGTTAGACACGCAAATGCAAATAAGACTACAGAAGTCACGGAAGCAACAACAACCTTAAT
AACATCCAACAATGTGCTGAGAAAAGAGAACATTTTGTACAAAATTCTGGATTTCC

QA 2 657 2 657
DS 

RD RR2EB94JQ 706 0 0
GCTCAGGAAATTATCCATATATATATGTAGCCACATATTTTTCACCATTACATAAAATGT
ATTAATAAAAAGACTTTTTCCTTTTATTTTGATAAAACTATTAAGTTATACACAATTAGA
ATATATGCTATATGTTTGGACCATGCTCGGCTAATCTCCCTTATCCTGGGGGTGTAGCTC
CTCCTGCTGCGGGTGCAGGTGCTGCTCCTCCTGCCGCAGGTACCGCCCCACCCGTTGGTA
CACCTTTGAGTAGATTTTTT*AACCATTCTGGGATATTTCCGGACGTCTGAACTCCACCA
CCTGGTTTATTTCCAAATGTTCCAGAAAATGATTTTCCTCCCCATGATCCTCCAAAGCCA
CCTGAAAACTTAAACATTTTCAATGGTGTTTGGGCTAAGCGGGCCAACGAAGTTCCTTCC
GCTGTCTTGATGAGCCCCAAGATGAGACTAATGGCGGTGATTCCGAGGGTGGCACCGGCC
GTTAGCCCAGAGGCTAGGAGAGTAGTGGCTATAGTGGCGGGAAGGAGAATTGGACTGAAT
ATGAGGAAAAGCGGTGTGGATACAACTAATGCCACGGCTGAACCGGCGAGTGTTAGACAC
GCAAATGCAAATAAGACTACAGAAGTCACGGAAGCAACAACAACCTTAATAACATCCAAC
AATGTGCTGAGAAAAGAGAACATTTTGTACAAAATTCTGGATTT
TC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 2 9

CO CL409Contig1 717 2 8 U
AGGTAGAAAAGAAGCCAAATAACATTACAGAATCACTAGGCATCGTTTTGCGATTCAGAT
ATAAAAGGAGAAACAAGTTTTAGATAGGTAGCAAAGTAGACCGAATCAGAACATGAGAGA
AAGTGTAGCCATATTACATTACATGTTCTCTGGTTGTTTTGGTGTCTCTCTATAACCTGG
CCGAAGGACGTGGAGTGTCCCATTCGGTGGTGATGTGGTTACGGGTGATTTCCTTGAGAG
ACCTGCACCCACTTAACGCCATTGTCAGCTCGAACTCATCACGTAGCATTTGAAGCACTT
TTCTGACTCCAGCCTCTCCTTCAGCAGCAAGTGAGAATACCACTGGTCTTCCAATAAATA
TCCCGGAGGCTCCAAGAGCAAGTGCCTTGAAAACATCTGTGCCACGTCTAACACCACCAT
CCAAGAAGACAGGGATACGTCCTTGTGTCGCTTTGACAACCTCTTCCAGGGCTGAGATTG
TTGCTGGGACATAGTCAAGCTGACGAGCTCCATGGTTTGACACAATGATCCCAGCTGCTC
CAGCTTGAACCGCTATCCTTGCATCCTCTCCTGTAATAACACCCTTGACAAGAATTGGCA
TTTTGGTAATTGTCTGGAGCCACTGGACATCCTTCCAGCTCAAGGTACAGTCAATTTGAC
CAGCAACATATGAAGCCAAGCCAGAGTCATTGGCCTCGTCCATCTTTCCGAGGTCAA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ84JQ U 1
AF RR2GR90JQ U 2
BS 1 193 RR2BJ84JQ
BS 194 194 RR2GR90JQ
BS 195 201 RR2BJ84JQ
BS 202 202 RR2GR90JQ
BS 203 648 RR2BJ84JQ
BS 649 649 RR2GR90JQ
BS 650 662 RR2BJ84JQ
BS 663 717 RR2GR90JQ

RD RR2BJ84JQ 662 0 0
AGGTAGAAAAGAAGCCAAATAACATTACAGAATCACTAGGCATCGTTTTGCGATTCAGAT
ATAAAAGGAGAAACAAGTTTTAGATAGGTAGCAAAGTAGACCGAATCAGAACATGAGAGA
AAGTGTAGCCATATTACATTACATGTTCTCTGGTTGTTTTGGTGTCTCTCTATAACCTGG
CCGAAGGACGTGGGGTGTCCCGTTCGGTGGTGATGTGGTTACGGGTGATTTCCTTGAGAG
ACCTGCACCCACTTAACGCCATTGTCAGCTCGAACTCATCACGTAGCATTTGAAGCACTT
TTCTGACTCCAGCCTCTCCTTCAGCAGCAAGTGAGAATACCACTGGTCTTCCAATAAATA
TCCCGGAGGCTCCAAGAGCAAGTGCCTTGAAAACATCTGTGCCACGTCTAACACCACCAT
CCAAGAAGACAGGGATACGTCCTTGTGTCGCTTTGACAACCTCTTCCAGGGCTGAGATTG
TTGCTGGGACATAGTCAAGCTGACGAGCTCCATGGTTTGACACAATGATCCCAGCTGCTC
CAGCTTGAACCGCTATCCTTGCATCCTCTCCTGTAATAACACCCTTGACAAGAATTGGCA
TTTTGGTAATTGTCTGGAGCCACTGGACATCCTTCCAGCTCAAGGTACGGTCAATTTGAC
CA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2GR90JQ 716 0 0
GGT
AGAAAAGAAGCCAAATAACATTACAGAATCACTAGGCATCGTTTTGCGATTCAGATATAA
AAGGAGAAACAAGTTTTAGATAGGTAGCAAAGTAGACCGAATCAGAACATGAGAGAAAGT
GTAGCCATATTACATTACATGTTCTCTGGTTGTTTTGGTGTCTCTCTATAACCTGGCCGA
AGGACGTGGAGTGTCCCATTCGGTGGTGATGTGGTTACGGGTGATTTCCTTGAGAGACCT
GCACCCACTTAACGCCATTGTCAGCTCGAACTCATCACGTAGCATTTGAAGCACTTTTCT
GACTCCAGCCTCTCCTTCAGCAGCAAGTGAGAATACCACTGGTCTTCCAATAAATATCCC
GGAGGCTCCAAGAGCAAGTGCCTTGAAAACATCTGTGCCACGTCTAACACCACCATCCAA
GAAGACAGGGATACGTCCTTGTGTCGCTTTGACAACCTCTTCCAGGGCTGAGATTGTTGC
TGGGACATAGTCAAGCTGACGAGCTCCATGGTTTGACACAATGATCCCAGCTGCTCCAGC
TTGAACCGCTATCCTTGCATCCTCTCCTGTAATAACACCCTTGACAAGAATTGGCATTTT
GGTAATTGTCTGGGGCCACTGGACATCCTTCCAGCTCAAGGTACAGTCAATTTGACCAGC
AACATATGAAGCCAAGCCAGAGTCATTGGCCTCGTCCATCTTTCCGAGGTCAA

QA 4 716 4 716
DS 



CO CL409Contig2 1425 7 42 U
TTTTTTCATCTGTTTACAGAATCCACAAGCTAAAAAGTTAACCCATCACAACATATTAAC
GTTGAGATATATAAAATTATATAAGGTTTCTTTACCACTCACAACTTTCATTCTCTCCGG
AGAGCTTAGTTCCCCGTCAAAGATTAACATCTGAAAATGGAGATCACAAACGTTACCGAG
TATGAAGCGATAGCAAAGGAGAAGTTGCCAAAGATGGTATACGACTACTATGCCTCTGGA
GCAGAGGACCAATGGACTCTTCAAGAGAACCGAAACGCTTTTGCAAGGATCCTCTTTCGT
CCACGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGACAACAACCATCTTGGGGTTCAAG
ATCTCCATGCCCATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAGAAGATGGCTCACCCGGAAGGA
GAATATGCTACGGCTAGAGCTGCCTCTGCTGCTGGAACCATCATGACGCTATCTTCATGG
GCTACTTCCAGTGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGGCCAGGGATTCGTTTTTTCCAGCTC
TATGTATACAAGAACAGGAACGTCGTTGAGCAGCTCGTGAGAAGAGCTGAGAGAGCAGGG
TTCAAAGCCATTGCCCTCACTGTAGACACCCCAAGGCTAGGTCGCAGAGAGTCTGATATC
AAGAACAGATTTACTTTGCCTCCAAACCTGACATTGAAGAACTTTGAAGGTCTTGACCTC
GGAAAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGTTGCTGGTCAAATTGAC
CGTACCTTGAGCTGGAGGGATGTCCAGTGGCTCCAGACAATTACCAAAATGCCGATTCTT
GTCAAGGGTGTTATTACAGGAGAGGATGCAA*GGATAGCGGTTCAAGCTGGAGCAGCCGG
GATCATTGTGTCAAACCATGGAGCTCGCCAGCTTGACTATGTCCCAGCAACAATCTCAGC
CCTGGAAGAGGTTGTCAAAGCGACACAAGGACGTATCCCTGTCTTCTTGGATGGTGGTGT
TCGACGTGGCACCGATGTTTTCAAGGCACTTGCTCTTGGAGCCTCCGGGATATTTATTGG
AAGACCAGTGGTATTCTCACTTGCTGCTGAAGGAGAGGCTGGAGTCAGAAAAGTGCTTCA
AATGCTACGTGATGAGTTCGAGCTGACAATGGCGTTAAGTGGGTGCAGGTCTCTCAAGGA
AATCACCCGTAACCACATCACCACCGAATGGGACACTCCACGTCCTTCCGCCAGGTTATA
GAGAGACACCAAAAACAACCAGAGAACATGTTATTGTAATGGCTACACTTTCTCTCATAT
TCTGATCGGGTCTACTTTGCTACCTATCTAAAACTTGTCTCTCCTTTATGTCTGAATCGC
AAAACGATGCCTAGTGATTCTGTAATGTTATTTGGCTTCTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 5 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 5 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR90TF U 1
AF RR2ET29TF U 108
AF RR2AF14TF U 108
AF RR2B733TF U 111
AF RR2BJ84TF U 404
AF RR2B733JQ C 577
AF RR2ET29JQ C 836
BS 1 116 RR2GR90TF
BS 117 117 RR2AF14TF
BS 118 191 RR2GR90TF
BS 192 192 RR2ET29TF
BS 193 251 RR2GR90TF
BS 252 252 RR2ET29TF
BS 253 263 RR2GR90TF
BS 264 264 RR2ET29TF
BS 265 283 RR2GR90TF
BS 284 284 RR2AF14TF
BS 285 614 RR2GR90TF
BS 615 615 RR2ET29TF
BS 616 653 RR2GR90TF
BS 654 654 RR2ET29TF
BS 655 683 RR2GR90TF
BS 684 684 RR2ET29TF
BS 685 697 RR2GR90TF
BS 698 698 RR2AF14TF
BS 699 707 RR2GR90TF
BS 708 708 RR2AF14TF
BS 709 735 RR2GR90TF
BS 736 796 RR2AF14TF
BS 797 798 RR2B733TF
BS 799 833 RR2AF14TF
BS 834 834 RR2B733TF
BS 835 847 RR2AF14TF
BS 848 871 RR2B733TF
BS 872 872 RR2BJ84TF
BS 873 896 RR2B733TF
BS 897 897 RR2BJ84TF
BS 898 898 RR2B733JQ
BS 899 927 RR2BJ84TF
BS 928 928 RR2B733JQ
BS 929 1021 RR2BJ84TF
BS 1022 1022 RR2B733JQ
BS 1023 1032 RR2BJ84TF
BS 1033 1033 RR2B733JQ
BS 1034 1109 RR2BJ84TF
BS 1110 1307 RR2B733JQ
BS 1308 1308 RR2ET29JQ
BS 1309 1407 RR2B733JQ
BS 1408 1425 RR2ET29JQ

RD RR2GR90TF 751 0 0
TTTTTTCATCTGTTTACAGAATCCACAAGCTAAAAAGTTAACCCATCACAACATATTAAC
GTTGAGATATATAAAATTATATAAGGTTTCTTTACCACTCACAACTTTCATTCTCTTCGG
AGAGCTTAGTTCCCCGTCAAAGATTAACATCTGAAAATGGAGATCACAAACGTTACCGAG
TATGAAGCGATTGCAAAGGAGAAGTTGCCAAAGATGGTATACGACTACTATGCCTCTGGA
GCAGAGGACCAGTGGACTCTTCAGGAGAACCGAAACGCTTTTGTAAGGATCCTCTTTCGT
CCACGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGACAACAACCATCTTGGGGTTCAAG
ATCTCCATGCCCATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAGAAGATGGCTCACCCGGAAGGA
GAATATGCTACGGCTAGAGCTGCCTCTGCTGCTGGAACCATCATGACGCTATCTTCATGG
GCTACTTCCAGTGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGGCCAGGGATTCGTTTTTTCCAGCTC
TATGTATACAAGAACAGGAACGTCGTTGAGCAGCTCGTGAGAAGAGCTGAGAGAGCAGGG
TTCAAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACACCCCAAGGCTAGGTCGCAGAGAGTCCGATATC
AAGAACAGATTTACTTTGCCTCCCAACCTGACATTGA*GAACTTTGA*GGTCTTGACCTC
GGAAAGATGGACGAG
CCATGACTCTGGCTGG

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2ET29TF 688 0 0
GG
ATTCTCTCCGGAGAGCTTAGTTCCC*GTCAAAGATTAACATCTGAAAATGGAGATCACAA
ACGTTACCGAGTATGAAGCGATAGCAAAGGAGAAGTTGCCTAAGATGGTATACGACTACT
ATGCCTCTGGTGCAGAGGACCAATGGACTCTTCAAGAGAACCGAAACGCTTTTGCAAGGA
TCCTCTTTCGTCCTCGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGACAACAACCATCT
TGGGGTTCAAGATCTCCATGCCGATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAGAAGATGGCTC
ACCCGGAAGGAGAATATGCTACGGCTAGAGCTGCCTCTGCTGCTGGAACCATCATGACGC
TATCTTCATGGGCTACTTCCAGCGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGGCCAGGGATTCGTT
TTTTCCAGCTCTATGTATACAAGAACAGGAACGTCGTTGAGCAGCTGGTGAGAAGAGCTG
AGAGAGCAGGGTTCAAAGCCATTGCCCTCACTGTAGACACCCCAAGGCTAGGTCGCAGAG
AGTCTGATATCAAGAACAGATTTACTTTGCCTCCAAACCTGACATTGAAGAACTTTGAAG
GTCTTGACCTCGGAAAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGTTGCTG
GTCAAATTGACCGTACCTTGAGCTGG

QA 3 688 3 688
DS 

RD RR2AF14TF 747 0 0
GG
ATTCTCTCCGGAGAGCTTAGTTCCCCGTCAAAGATTAACATCTGAAAATGGAGATCACAA
ACGTTACCGAGTATGAAGCGATTGCAAAGGAGAAGTTGCCAAAGATGGTATACGACTACT
ATGCCTCTGGAGCAGAGGACCAGTGGACTCTTCAGGAGAACCGAAACGCTTTTGCAAGGA
TCCTCTTTCGTCCACGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGACAACAACCATCT
TGGGGTTCAAGATCTCCATGCCCATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAGAAGATGGCTC
ACCCGGAAGGAGAATATGCTACGGCTAGAGCTGCCTCTGCTGCTGGAACCATCATGACGC
TATCTTCATGGGCTACTTCCAGTGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGGCCAGGGATTCGTT
TTTTCCAGCTCTATGTATACAAGAACAGGAACATCGTTGAGCAGTTCGTGAGAAGAGCTG
AGAGAGCAGGGTTCAAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACACCCCAAGGCTAGGTCGCAGAG
AGTCCGATATCAAGAACAGATTTACTTTGCCTCCCAACCTGACATTGAAGAACTTTGAAG
GTCTTGACCTCGGAAAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGTTGCTG
GTCAAATTGACCGTACCTTGAGCTGGAAAGATGTCCAGTGGCTCCAGACAATTACCAAAA
TGCCAATTCTTGTCAAGG
TGTTATT

QA 3 740 3 740
DS 

RD RR2B733TF 786 0 0
GG
CTCTCCGGAGAGCTTAGTTCCC*GTCAAAGATTAACATCTGAAAATGGAGATCACAAACG
TTACCGAGTATGAAGCGATAGCAAAGGAGAAGTTGCCTAAGATGGTATACGACTACTATG
CCTCTGGTGCAGAGGACCAATGGACTCTTCAAGAGAACCGAAACGCTTTTGCAAGGATCC
TCTTTCGTCTTCGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGACAACAACCATCTTGG
GGTTCAAGATCTCCATGCCGATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAGAAGATGGCTCACC
CGGAAGGAGAATATGCTACAGCTAGAGCTGCCTCTGCTGCTGGAACCATCATGACGCTAT
CTTCATGGGCTACTTCCAGCGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGGCCAGGGATTCGTTTTT
TCCAGCTCTATGTATACAAGAACAGGAACGTCGTTGAGCAGCTGCTGAGAAGAGCTGAGA
GAGCAGGGTTCAAAGCCATTGCCCTCACTGTAGACACCCCAAGGCTAGGTCGCAGAGAGT
CTGATATCAAGAACAGATTTACTTTGCCTCCAAACCTGACATTGAAGAACTTTGAAGGTC
TTGACCTCGGAAAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGTTGCTGGTC
AAATTGACCGTACCTTGAGCTGGAGGGATGTCCAGTGGCTCCAGACAATTACCAAAATGC
CGATTCTTGTCAAGGGTGTTATTACAGGAGAGGATGCAAAGGATAGCGGTTCAAGCTGGA
GCAG

QA 3 786 3 786
DS 

RD RR2BJ84TF 706 0 0
G
GGCTCACCCGGAAGGAGAATATGCTACGGCTAGAGCTGCCTCTGCTGCTGGAACCATCAT
GACGCTATCTTCATGGGCTACTTCCAGTGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGGCCAGGGAT
TCGTTTTTTCCAGCTCTATGTATACAAGAACAGGAACGTCGTTGAGCAGCTCGTGAGAAG
AGCTGAGAGAGCAGGGTTCAAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACACCCCAAGGCTAGGTCG
CAGAGAGTCCGATATCAAGAACAGATTTACTTTGCCTCCCAACCTGACATTGAAGAACTT
TGAAGGTCTTGACCTCGGAAAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGT
TGCTGGTCAAATTGACCGTACCTTGAGCTGGAAGGATGTCCAGTGGCTCCAGACAATTAC
CAAAATGCCAATTCTTGTCAAGGGTGTTATTACAGGAGAGGATGCAA*GGATAGCGGTTC
AAGCTGGAGCAGCTGGGATCATTGTGTCAAACCATGGAGCTCGTCAGCTTGACTATGTCC
CAGCAACAATCTCAGCCCTGGAAGAGGTTGTCAAAGCGACACAAGGACGTATCCCTGTCT
TCTTGGATGGTGGTGTTAGACGTGGCACAGATGTTTTCAAGGCACTTGCTCTTGGAGCCT
CCGGGATATTTATTGGAAGACCAGTGGTATTCTCACTTGCTGCTG

QA 2 706 2 706
DS 

RD RR2B733JQ 832 0 0
C
TGAGAAGAGCTGAGAGAGCAGGGTTCAAAGCCATTGCCCTCACTGTAGACACCCCAAGGC
TAGGTCGCAGAGAGTCTGATATCAAGAACAGATTTACTTTGCCTCCAAACCTGACATTGA
AGAACTTTGAAGGTCTTGACCTCGGAAAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGGCTTGGCTT
CATATGTTGCTGGTCAAATTGACCGTACCTTGAGCTGGAGGGATGTCCAGTGGCTCCAGA
CAATTACCAAAATGCCGATTCTTGTCAAGGGTGTTATTACAGGAGAGGATGCAA*GGATA
GCGGTTCAAGCTGGAGCAGCCGGGATCATTGTGTCAAACCATGGAGCTCGCCAGCTTGAC
TATGTCCCAGCAACAATCTCAGCCCTGGAAGAGGTTGTCAAAGCGACACAAGGACGTATC
CCTGTCTTCTTGGATGGTGGTGTTCGACGTGGCACCGATGTTTTCAAGGCACTTGCTCTT
GGAGCCTCCGGGATATTTATTGGAAGACCAGTGGTATTCTCACTTGCTGCTGAAGGAGAG
GCTGGAGTCAGAAAAGTGCTTCAAATGCTACGTGATGAGTTCGAGCTGACAATGGCGTTA
AGTGGGTGCAGGTCTCTCAAGGAAATCACCCGTAACCACATCACCACCGAATGGGACACT
CCACGTCCTTCCGCCAGGTTATAGAGAGACACCAAAAACAACCAGAGAACATGTTATTGT
AATGGCTACATTTTCTCTCATATTCTGATCGGGTCTACTTTGCTACCTATCTAAAACTTG
TCTCTCCTTTATGTCTGAATCGCAAAACGATGCCTAGTGATTCTGTAATG
C

QA 2 831 2 831
DS 

RD RR2ET29JQ 590 0 0
TTCTTGTCAAGGGTGTTATTACAGGAGAGGATGCAA*GGATAGCGGTTCAAGCTGGAGCA
GCCGGGATCATTGTGTCAAACCATGGAGCTCGCCAGCTTGACTATGTCCCAGCAACAATC
TCAGCCCTGGAAGAGGTTGTCAAAGCGACACAAGGACGTATCCCTATCTTCTTGGATGGT
GGTGTTCGACGTGGCACCGATGTTTTCAAGGCACTTGCTCTTGGAGCCTCCGGGATATTT
ATTGGAAGACCAGTGGTATTCTCACTTGCTGCTGAAGGAGAGGCTGGAGTCAGAAAAGTG
CTTCAAATGCTACGTGATGAGTTCGAGCTGACAATGGCGTTAAGTGGGTGCAGGTCTCTC
AAGGAAATCACCCGTAACCACATCACCACCGAATGGGACACTCCACGTCCTTCCGCCAGG
TTATAGAGAGACACCAAAAACAACCAGAGAACATGTTATTGTAATGGCTACACTTTCTCT
CATATTCTGATCGGGTTTACTTTGCTACCTATCTAAAACTTGTTTCTCCTTTATGTTTGA
ATCGCAAAACGATGCCTAGTGATTCTGTAATGTTATTTGGCTTCTTTTCT

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 10

CO CL410Contig1 1063 10 25 U
GGGAACTTTTCAAACAATTTTAGCAAAAAGGCACTCTAAAACAATAAACTATATATATAA
ACTGCATATATCTGTTCAAATATCCAAATCCTTCTCTCTTAGATAAACATCGATCCCAAC
AAATCATCTACTATAATAACCCACTTTGAGAAA*TATAATCCAAAATGATGTACTCTTCA
TCGTCTGTACTAAAACGCCTCATTTTGATCAATTTCTTGGCCATACAACTACTCCTTATA
AGCGGTGAATTGCCCTTAAACACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCTTGGTTAGT
CAAGGAAAATACAAGCCGGGAAGTGAATACGAGAGAGATGTAAATACTATGATCAAAATG
TTCTACAGTGGCAGTTACAAAGGTTTCTACCTGTTAGGTTTTGGTGCTTTCTCCACTATC
CTCCAGTGCCGCGCCGATTCCTACGGGACCAAGTGCCACGACTGCTTTGCCACCGCCCTC
GCTGTGCTTCGTAGGAAATGTCCGTGGTACAAGGG*CATGATAATTTGGTTTGACCAATG
TCTTCTGGCCTTTAGTTCTATAGATTCTCTTGGGAAGATCGATTACGACAATAACTTTTG
TATGTCCAACGCGAAGAAGTTGGGAGGAGATAAGCTTGCTTTTTCTAGGACTTTGAATAC
TCTCATGGACAATCTGACGACTTTAGCCACCACCACTAAAAGTAAAGATAATTACACAAT
GTTCTCTGCGGGGG*AGACGTGGTACAAGGGTGATAGGATGTATGGAATGGTACAGTGTA
CATATGACCTAACACCAAGAGCTTGTAAGGAGTGTTTGGTCATTAATGGCTTGCGTTTTA
AAGATTGTTTGAGTGATAAACGAGGAGCAAGATTTGTGGGTGGGACCTGTACTTTTAGGT
TTGAGTTTTACCCTTTTATTTCTAAGCCGGTCCGAAATATTTAATGAGCT*****AATGT
TACACTTTTTGTATGAATTTTTTCAGTCAAAAATTTATGTAACATCACGTGCTACTCTTG
TTTAATGTATTTAAACAATAGAACAACAAAATAATGTTTGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 30 55 40 55 
30 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 15 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2C701TF U 84
AF RR2CD64TF U 1
AF RR2ED77TF U 6
AF RR2GO20TF U 84
AF RR2GY90TF U 80
AF RR2FJ23TF U 201
AF RR2C701JQ C 640
AF RR2CD64JQ C 239
AF RR2GO20JQ C 268
AF RR2GY90JQ C 296
BS 1 87 RR2CD64TF
BS 88 88 RR2ED77TF
BS 89 120 RR2CD64TF
BS 121 121 RR2ED77TF
BS 122 153 RR2CD64TF
BS 154 154 RR2ED77TF
BS 155 710 RR2CD64TF
BS 711 711 RR2GY90TF
BS 712 718 RR2CD64TF
BS 719 719 RR2GY90TF
BS 720 722 RR2CD64TF
BS 723 723 RR2GY90TF
BS 724 750 RR2CD64TF
BS 751 757 RR2GY90TF
BS 758 758 RR2FJ23TF
BS 759 803 RR2GY90TF
BS 804 898 RR2FJ23TF
BS 899 899 RR2CD64JQ
BS 900 982 RR2FJ23TF
BS 983 983 RR2CD64JQ
BS 984 992 RR2FJ23TF
BS 993 993 RR2CD64JQ
BS 994 1012 RR2FJ23TF
BS 1013 1030 RR2CD64JQ
BS 1031 1063 RR2GO20JQ

RD RR2C701TF 286 0 0
GGAAT
TCCTTCTCTCTTAGATAAACATCGATCCCAACGAATCATCTACTATAATAACCCACTTTG
AGAAAATATAATCCAAAATGATGTACTCTTCATCGTCTGTACTAAAACGCCTCATTTTGA
TCAATTTCTTGGCCATACAACTACTCCTTATAAGCGGTGAATTGCCCTTAAACACGACCA
ATGCGTATCTCAACCACAAATGCTTGTTTAGTCAAGGAAAATACAAGCCGGGAAGTGAAT
ACGAGAGAGATGTAAATACTATGATCAAAATGTTCTACAGT

QA 6 286 6 286
DS 

RD RR2CD64TF 759 0 0
GGGAACTTTTCAAACAATTTTAGCAAAAAGGCACTCTAAAACAATAAACTATATATATAA
ACTGCATATATCTGTTCAAATATCCAATTCCTTCTCTCTTAGATAAACATCGATCCCAAC
GAATCATCTACTATAATAACCCACTTTGAGAAAATATAATCCAAAATGATGTACTCTTCA
TCGTCTGTACTAAAACGCCTCATTTTGATCAATTTCTTGGCCATACAACTACTCCTTATA
AGCGGTGAATTGCCCTTAAACACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCTTGGTTAGT
CAAGGAAAATACAAGCCGGGAAGTGAATACGAGAGAGATGTAAATACTATGATCAAAATG
TTCTACAGTGGCAGTTACAAAGGTTTCTACCTGTTAGGTTTTGGTGCTTTCTCCACTATC
CTCCAGTGCCGCGCCGATTCCTACGGGACCAAGTGCCACGACTGCTTTGCCACCGCCCTC
GCTGTGCTTCGTAGGAAATGTCCGTGGTACAAGGG*CATGATAATTTGGTTTGACCAATG
TCTTCTGGCCTTTAGTTCTATAGATTCTCTTGGGAAGATCGATTACGACAATAACTTTTG
TATGTCCAACGCGAAGAAGTTGGGAGGAGATAAGCTTGCTTTTTCTAGGACTTTGAATAC
TCTCATGGACAATCTGACGACTTTAGCCACCACCACTAAAAGTAAAGATA*TTACACA*T
GT*CTCTGCGGGGG*AGACGTGGTACAAGG
TGATAGATA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2ED77TF 746 0 0
T
TTTTCAAGCAATTTTAGCAAAAAGGCACTCTAAAACAATAAACTATATATATAAACTGCA
TATATCTGTTCAAATATCCAAATCCTTCTCTCTTAGATAAACATCGATCCCAACAAATCA
TCTACTATAATAACCCACTTTGAGAAA*TATAATCCAAAATGATGTACTCTTCATCGTCT
GTACTAAAACGCCTCATTTTGATCAATTTCTTGGCCATACAACTACTCCTTATAAGCGGT
GAATTGCCCTTAAACACGACCAATGCTTATCTCAACCACAAATGCTTGGTTAGTCAAGGA
AAATACAAGCCGGGAAGTGAATACGAGAGAGATGTAAATACTATGATCAAAATGTTCTAC
AGTGGCAGTTACAAAGGTTTCTACCTGTTAGGTTTTGGTGCTTTCTCCACTATCCTCCAG
TGCCGCGCCGATTCCTACGGGACCAAGTGCCACGACTGCTTTGCCACCGCCCTCGCTGTG
CTTCGTAGGAAATGTCCGTGGTACAAGGG*CATGATAATTTGGTTTGACCAATGTCTTCT
GGCCTTTAGTTCTATAGATTCTCTTGGGAAGATCGATTACGACAATAACTTTTGTATGTC
CAACGCGAAGAAGTTGGGAGGAGATAAGCTTGCTTTTTCTAGGACTTTGAATACTCTCAT
GGACAATCTGACGACTTTAGCCACCACCACTAAAAGTAAAGATA*TTACACA*TGT*CTC
TGCGGGG**AGACGTGGTACA
GGTG

QA 2 742 2 742
DS 

RD RR2GO20TF 667 0 0
CCAAATCCTTCTCTCTTAGATAAACATCGATCCCAACAAATCATCTACTATAATAACCCA
CTTTGAGAAA*TATAATCCAAAATGATGTACTCTTCATCGTCTGTACTAAAACGCCTCAT
TTTGATCAATTTCTTGGCCATACAACTACTCCTTATAAGCGGTGAATTGCCCTTAAACAC
GACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCTTGGTTAGTCAAGGAAAATACAAGCCGGGAAG
TGAATACGAGAGAGATGTAAATACTATGATCAAAATGTTCTACAGTGGCAGTTACAAAGG
TTTCTACCTGTTAGGTTTTGGTGCTTTCTCCACTATCCTCCAGTGCCGCGCCGATTCCTA
CGGGACCAAGTGCCACGACTGCTTTGCCACCGCCCTCGCTGTGCTTCGTAGGAAATGTCC
GTGGTACAAGGGGCATGATAATTTGGTTTGACCAATGTCTTCTGGCCTTTAGTTCTATAG
ATTCTCTTGGGAAGATCGATTACGACGATAACTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTGG
GAGGAGATAAGCTTGCTTTTTCTAGGACTTTGAATACTCTCATGGACAATCTGACGACTT
TAGCCACCACCACTAAAAGTAAAGATAATTACACAATGTTCTCTGCGGGGGGAGACGTGG
TACAAGG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2GY90TF 724 0 0
GGAT
CCAAATCCTTCTCTCTTAGATAAACATCGATCCCAACAAATCATCTACTACAATAACCCA
CTTTGAGAAA*TATAATCCAAAATGATGTACTCTTCATCGTCTGTACTAAAACGCCTCAT
TTTGATCAATTTCTTGGCCATACAACTACTCCTTATAAGCGGTGAATTGCCCTTAAACAC
GACCAATGCGTATCTCAACCACGAATGCTTGGTTAGTCAAGGAAAATACAAGCCGGGAAG
TGAATACGAGAGAGATGTAAATACTATGATCAAAATGTTCTACAGTGGCAGTTACAAAGG
TTTCTACCTGTTAGGTTTTGGTGCTTTCTCCACTATCCTCCAGTGCCGCGCCGATTCCTA
CGGGACCAAGTGCCACGACTGCTTTGCCACCGCCCTCGCTGTGCTTCGTAGGAAATGTCC
GTGGTACAAGGG*CATGATAATTTGGTTTGACCAATGTCTTCTGGCCTTTAGTTCTATAG
ATTCTCTTGGGAAGATCGATTACGACAATAACTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTGG
GAGGAGATAAGCTTGCCTTTTCTAGGACTTTGAATACTCTCATGGACAATCTGACGACTT
TAGCCACCACCACTAAAAGTAAAGATAATTACACAATGTTCTCTGCGGGGG*AGACGTGG
TACAAGGGTGATAG*ATGTATGGAATGGTACAGTGTACATATGACCTAACACCAAGAGCT

QA 5 724 5 724
DS 

RD RR2FJ23TF 812 0 0
G
ATTTTGATCAATTTCTTGGCCATACAACTACTCCTTATAAGCGGTGAATTGCCCTTAAAC
ACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCTTGGTTAGTCAAGGAAAATACAAGCCGGGA
AGTGAATACGAGAGAGATGTAAATACTATGATCAAAATGTTCTACAGTGGCAGTTACAAA
GGTTTCTACCTGTTAGGTTTTGGTGCTTTCTCCACTATCCTCCAGTGCCGCGCCGATTCC
TACGGGACCAAGTGCCACGACTGCTTTGCCACCGCCCTCGCTGTGCTTCGTAGGAAATGT
CCGTGGTACAAGGG*CATGATAATTTGGTTTGACCAATGTCTTCTGGCCTTTAGTTCTAT
AGATTCTCTTGGGAAGATCGATTACGACAATAACTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTT
GGGAGGAGATAAGCTTGCTTTTTCTAGGACTTTGAATACTCTCATGGACAATCTGACGAC
TTTAGCCACCACCACTAAAAGTAAAGATAATTACACAATGTTCTCTGCGGGGG*AGACGT
GGTACAAGGGTGATAGGATGTATGTAATGGTACAGTGTACATATGACCTAACACCAAGAG
CTTGTAAGGAGTGTTTGGTCATTAATGGCTTGCGTTTTAAAGATTGTTTGAGTGATAAAC
GAGGAGCAAGATTTGTGGGTGGGACCTGTACTTTTAG*TTTGAGTTTTACCCTTTTATTT
CTAAGCCGGTCCGAAATATTTAATGAGCT*****AATGTTACACTTTTTGTATGAATTTT
T*CAGTCAAAA*TTTATGTAACATCACGTGC

QA 2 812 2 812
DS 

RD RR2C701JQ 349 0 0
TTTTTCTAGGACTTTGAATACTCTCATGGACAATCTGACGACTTTAGCCACCACCACTAA
AAGTAAAGATAATTACACAATATTCTCTGCGGGGG*AGACGTGGTACAAGGGTGATAGGA
TATATGGAATGGTACAGTGTACATATGACCTAACACCAAGAGCTTGTAAGGAGTGTTTGG
TCATTAATGGCTTGTGTTTTAAAGATTGTTTGAGTGATAAACGAGGAGCAAGATTTGTGG
GTGGGACATGTACTTTTAGGTTTGAGTTTTACCCTTTTATTTCTGAGCCGGTCCGAAATA
TTTAATGAGCTAAATAAATGTTACACTTTTTGTATGAATTTTTTCAG
GC

QA 1 347 1 347
DS 

RD RR2CD64JQ 796 0 0
TAAGCGGTGAATTGCCCTTAAACACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCTTGGTTA
GTCAAGGAAAATACAAGCCGGGAAGTGAATACGAGAGAGATGTAAATACTATGATCAAAA
TGTTCTACAGTGGCAGTTACAAAGGTTTCTACCTGTTAGGTTTTGGTGCTTTCTCCACTA
TCCTCCAGTGCCGCGCCGATTCCTACGGGACCAAGTGCCACGACTGCTTTGCCACCGCCC
TCGCTGTGCTTCGTAGGAAATGTCCGTGGTACAAGGG*CATGATAATTTGGTTTGACCAA
TGTCTTCTGGCCTTTAGTTCTATAGATTCTCTTGGGAAGATCGATTACGACAATAACTTT
TGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTGGGAGGAGATAAGCTTGCTTTTTCTAGGACTTTGAAT
ACTCTCATGGACAATCTGACGACTTTAGCCACCACCACTAAAAGTAAAGATAATTACACA
ATGTTCTCTGCGGGGG*AGACGTGGTACAAGGGTGATAGGATATATGGAATGGTACAGTG
TACATATGACCTAACACCAAGAGCTTGTAAGGAGTGTTTGGTCATTAATGGCTTGCGTTT
TAAAGATTGTTTGAGTGATAAACGAGGAGCAAGATTTGTGGGTGGGACATGTACTTTTAG
GTTTGAGTTTTACCCTTTTATTTCTGAGCCGGTCCGAAATATTTAATGAGCTAAATAAAT
GTTACACTTTTTGTATGAATTTTTTCAGTCAAAAATTTATGTAACATCACGTGCTACTCT
TGTTTAATGTAT
GTTC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2GO20JQ 796 0 0
AATGCGTATCTCAACCACAAATGCTTGGTTAGTCAAGGAAAATACAAGCCGGGAAGTGAA
TACGAGAGAGATGTAAATACTATGATCAAAATGTTCTACAGTGGCAGTTACAAAGGTTTC
TACCTGTTAGGTTTTGGTGCTTTCTCCACTATCCTCCAGTGCCGCGCCGATTCCTACGGG
ACCAAGTGCCACGACTGCTTTGCCACCGCCCTCGCTGTGCTTCGTAGGAAATGTCCGTGG
TACAAGGG*CATGATAATTTGGTTTGACCAATGTCTTCTGGCCTTTAGTTCTATAGATTC
TCTTGGGAAGATCGATTACGACGATAACTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTGGGAGG
AGATAAGCTTGCTTTTTCTAGGACTTTGAATACTCTCATGGACAATCTGACGACTTTAGC
CACCACCACTAAAAGTAAAGATAATTACACAATGTTCTCTGCGGGGG*AGACGTGGTACA
AGGGTGATAGGATGTATGGAATGGTACAGTGTACATATGACCTAACACCAAGAGCTTGTA
AGGAGTGTTTGGTCATTAATGGCTTGCGTTTTAAAGATTGTTTGAGTGATAAACGAGGAG
CAAGATTTGTGGGTGGGACCTGTACTTTTAGGTTTGAGTTTTACCCTTTTATTTCTAAGC
CGGTCCGAAATATTTAATGAGCT*****AATGTTACACTTTTTGTATGAATTTTTTCAGT
CAAAAATTTATGTAACATCACGTGCTACTCTTGTTTAATGTATTTAAACAATAGAACAAC
AAAATAATGTTTGAGT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2GY90JQ 768 0 0
TTAGTCAAGGAAAATACAAGCCGGGAAGTGAATACGAGAGAGATGTAAATACTATGATCA
AAATGTTCTACAGTGGCAGTTACAAAGGTTTCTACCTGTTAGGTTTTGGTGCTTTCTCCA
CTATCCTCCAGTGCCGCGCCGATTCCTACGGGACCAAGTGCCACGACTGCTTTGCCACCG
CCCTCGCTGTGCTTCGTAGGAAATGTCCGTGGTACAAGGG*CATGATAATTTGGTTTGAC
CAATGTCTTCTGGCCTTTAGTTCTATAGATTCTCTTGGGAAGATCGATTACGACAATAAC
TTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTGGGAGGAGATAAGCTTGCCTTTTTTAGGACTTTG
AATACTTTCATGGACAATCTGACGACTTTAGCCACCACCACTAAAAGTAAAGATAATTAC
ACAATGTTTTTTGCGGGGG*AGACGTGGTACAAGGGTGATAGGATGTATGGAATGGTACA
GTGTACATATGACCTAACACCAAGAGCTTGTAAGGAGTGTTTGGTCATTAATGGCTTGCG
TTTTAAAGATTGTTTGAGTGATAAACGAGGAGCAAGATTTGTGGGTGGGACCTGTACTTT
TAGGTTTGAGTTTTACCCTTTTATTTTTAAGCCGGTCCGAAATATTTAATGAGCT*****
AATGTTACACTTTTTGTATGAATTTTTTCAGTCAAAAATTTATGTAACATCACGTGCTAC
TCTTGTTTAATGTATTTAAACAATAGAACAACAAAATAATGTTTGAGT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 2 10

CO CL411Contig1 725 7 5 U
GGGCCGAAAACCCTTGCGCAGTCGTCCTCTATTTTTCTTGTGTTCAACTCTCCAGCGATC
CTCACTTCTTGAAAGACGGCTTACCTCTTTTACGAATATCATCTCTGCAAATCACAATGT
CTTTGGTCGCAAATGAGGAGTTTCAGCATATTCTCCGTGTGCTAAACACAAATGTTGATG
GTAAGCAGAAGATAATGTTTGCCCTTACCTCTATCAAAGGTATTGGGAGGCGATTGGCTA
ACATCGTCTGCAAGAAGGCTGATGTCGACATGAACAAAAGGGCTGGTGAGTTATCTGCTG
CTGAGATCGACAACCTGATGACAATTGTCGCTAACCCGAAGCAGTACAAGATCCCAGACT
GGTTCCTGAACAGACAGAAGGATTACAAAGACGGGAAGTACTCTCAAGTTGTCTCCAATG
CCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGACCTTGAACGTCTCAAGAAAATCAGGAACCATCGTG
GTCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTTCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGCCGCA
GAGGAAAGACTGTTGGTGTGTCAAAGAAGCGTTAAGCAAGCCTATTGGTGTTTCTAGTTG
CTGCTTTACTGGATATGTTTCACAAGAATCGATTTTAATTTATGTTTCTTCTTCGAACTA
GTTTGTGAGACACCTTTTGAATCTAGTTTTGAGACCTTTTCAATCTTATGATCTGTCTTT
GTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 

AF RR2FA52JQ C 306
AF RR2H511TF U 32
AF RR2C750TF U 354
AF RR2HB33TF U 38
AF RR2BN77TF U 1
AF RR2BN77JQ C 38
AF RR2H511JQB C 123
BS 1 431 RR2BN77TF
BS 432 432 RR2H511TF
BS 433 699 RR2BN77TF
BS 700 702 RR2HB33TF
BS 703 725 RR2BN77TF

RD RR2FA52JQ 144 0 0
ATCGACAACCTGATGACAATTGTCGCTAACCCGAAGCAGTACAAGATCCCAGACTGGTTC
CTGAACAGACAGAAGGATTACAAAGACGGGAAGTACTCTCAAGTTGTCTCCAATGCCCTT
GACATGAAGCTCAGGGATGACCTT

QA 1 144 1 144
DS 

RD RR2H511TF 579 0 0
TTTTTC
TTGTGTTCAACTCTCCAGCGATCCTCACTTCTTGAAAGACGGCTTACCTCTTTTACGAAT
ATCATCTCTGCAAATCACAATGTCTTTGGTCGCAAATGAGGAGTTTCAGCATATTCTCCG
TGTGCTAAACACAAATGTTGATGGTAAGCAGAAGATAATGTTTGCCCTTACCTCTATCAA
AGGTATTGGGAGGCGATTGGCTAACATCGTCTGCAAGAAGGCTGATGTCGACATGAACAA
AAGGGCTGGTGAGTTATCTGCTGCTGAGATCGACAACCTGATGACAATTGTCGCTAACCC
GAAGCAGTACAAGATCCCAGACTGGTTCCTGAACAGACAGAAGGATTACAAAGACGGGAA
GTACTCTCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGACCTTGAACGTCT
CAAGAAAATCAGGAACCATCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTTCGTGGACA
ACACACCAAGACAACTGGCCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTGTCAAAGAAGCGTTAAGC
AAGCCTATTGGTGTTTCTAGTTGCTGCTTTACT

QA 7 579 7 579
DS 

RD RR2C750TF 342 0 0
CCAGACTGGTTCCTGAACAGACAGAAGGATTACAAAGACGGGAAGTACTCTCAAGTTGTC
TCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGACCTTGAACGTCTCAAGAAAATCAGGAAC
CATCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTTCGTGGACAACACACCAAGACAACT
GGCCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTGTCAAAGAAGCGTTAAGCAAGCCTATTGGTGTTT
CTAGTTGCTGCTTTACTGGATATGTTTCACAAGAATCGATTTTAATTTATGTTTCTTCTT
CGAACTAGTTTGTGAGACACCTTTTGAATCTAGTTTTGAGAC

QA 1 342 1 342
DS 

RD RR2HB33TF 665 0 0
GG
GTGTTCAACTCTCCAGCGATCCTCACTTCTTGAAAGACGGCTTACCTCTTTTACGAATAT
CATCTCTGCAAATCACAATGTCTTTGGTCGCAAATGAGGAGTTTCAGCATATTCTCCGTG
TGCTAAACACAAATGTTGATGGTAAGCAGAAGATAATGTTTGCCCTTACCTCTATCAAAG
GTATTGGGAGGCGATTGGCTAACATCGTCTGCAAGAAGGCTGATGTCGACATGAACAAAA
GGGCTGGTGAGTTATCTGCTGCTGAGATCGACAACCTGATGACAATTGTCGCTAACCCGA
AGCAGTACAAGATCCCAGACTGGTTCCTGAACAGACAGAAGGATTACAAAGACGGGAAGT
ACTCTCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGACCTTGAACGTCTCA
AGAAAATCAGGAACCATCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTTCGTGGACAAC
ACACCAAGACAACTGGCCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTGTCAAAGAAGCGTTAAGCAA
GCCTATTGGTGTTTCTAGTTGCTTCTTTACTGGATATGTTTCACAAGAATCGATTTTAAT
TTATGTTTCTTCTTCGAACTAGTTTGTGAGACACCTTTTGAATCTAGTTTTGAGACCTTT
TCA

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR2BN77TF 725 0 0
GGGCCGAAAACCCTTGCGCAGTCGTCCTCTATTTTTCTTGTGTTCAACTCTCCAGCGATC
CTCACTTCTTGAAAGACGGCTTACCTCTTTTACGAATATCATCTCTGCAAATCACAATGT
CTTTGGTCGCAAATGAGGAGTTTCAGCATATTCTCCGTGTGCTAAACACAAATGTTGATG
GTAAGCAGAAGATAATGTTTGCCCTTACCTCTATCAAAGGTATTGGGAGGCGATTGGCTA
ACATCGTCTGCAAGAAGGCTGATGTCGACATGAACAAAAGGGCTGGTGAGTTATCTGCTG
CTGAGATCGACAACCTGATGACAATTGTCGCTAACCCGAAGCAGTACAAGATCCCAGACT
GGTTCCTGAACAGACAGAAGGATTACAAAGACGGGAAGTACTCTCAAGTTGTCTCCAATG
CCCTTGACATGTAGCTCAGGGATGACCTTGAACGTCTCAAGAAAATCAGGAACCATCGTG
GTCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTTCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGCCGCA
GAGGAAAGACTGTTGGTGTGTCAAAGAAGCGTTAAGCAAGCCTATTGGTGTTTCTAGTTG
CTGCTTTACTGGATATGTTTCACAAGAATCGATTTTAATTTATGTTTCTTCTTCGAACTA
GTTTGTGAGACACCTTTTGAATCTAGTTTTGAGACCTTT**CATCTTATGATCTGTCTTT
GTGAA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2BN77JQ 686 0 0
TT
GTGTTCAACTCTCCAGCGATCCTCACTTCTTGAAAGACGGCTTACCTCTTTTACGAATAT
CATCTCTGCAAATCACAATGTCTTTGGTCGCAAATGAGGAGTTTCAGCATATTCTCCGTG
TGCTAAACACAAATGTTGATGGTAAGCAGAAGATAATGTTTGCCCTTACCTCTATCAAAG
GTATTGGGAGGCGATTGGCTAACATCGTTTGCAAGAAGGCTGATGTCGACATGAACAAAA
GGGCTGGTGAGTTATCTGCTGCTGAGATCGACAACCTGATGACAATTGTCGCTAACCCGA
AGCAGTACAAGATCCCAGACTGGTTCCTGAACAGACAGAAGGATTACAAAGACGGGAAGT
ACTCTCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGTAGCTCAGGGATGACCTTGAACGTCTCA
AGAAAATCAGGAACCATCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTTCGTGGACAAC
ACACCAAGACAACTGGCCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTGTCAAAGAAGCGTTAAGCAA
GCCTATTGGTGTTTCTAGTTGCTGCTTTACTGGATATGTTTCACAAGAATCGATTTTAAT
TTATGTTTCTTCTTCGAACTAGTTTGTGAGACACCTTTTGAATCTAGTTTTGAGACCTTT
TCAATCTTATGATCTGTCTTTG
TG

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR2H511JQB 600 0 0
TTGGTCGCAAATGAGGAGTTTCAGCATATTCTCCGTGTGCTAAACACAAATGTTGATGGT
AAGCAGAAGATAATGTTTGCCCTTACCTCTATCAAAGGTATTGGGAGGCGATTGGCTAAC
ATCGTCTGCAAGAAGGCTGATGTCGACATGAACAAAAGGGCTGGTGAGTTATCTGCTGCT
GAGATCGACAACCTGATGACAATTGTCGCTAACCCGAAGCAGTACAAGATCCCAGACTGG
TTCCTGAACAGACAGAAGGATTACAAAGACGGGAAGTACTCTCAAGTTGTCTCCAATGCC
CTTGACATGAAGCTCAGGGATGACCTTGAACGTCTCAAGAAAATCAGGAACCATCGTGGT
CTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTTCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGCCGCAGA
GGAAAGACTGTTGGTGTGTCAAAGAAGCGTTAAGCAAGCCTATTGGTGTTTCTAGTTGCT
GCTTTACTGGATACGTTTCACAAGAATCGATTTTAATTTATGTTTCTTCTTCGAACTAGT
TTGTAAGACACCTTTTGAATCTAGTTTTGAGACCTTTTCAATCTTATGATCTGTCTTTG
C

QA 1 599 1 599
DS 



CO CL411Contig2 727 3 11 U
TTTTTCTTCTGTTCAACTCTGCAGCGATCGTCACTGCTCGAAAGAACGGCTTGCCTCTTT
TCCGAATCTCATCTCTGCAAATCATAATGTCTTTGGTCGCAAATGAGGAGTTTCAGCATA
TTCTCCGTGTGCTCAACACAAATGTTGATGGTAAGCAGAAGATAATGTTTGCCCTTACCT
CTATCAAAGGTATTGGGAGGCGATTGGCTAACATCGTCTGCAAGAAGGCTGATGTCGACA
TGAACAAAAGGGCTGGTGAGTTATCTGCTGCTGAGATCGACAACCTGATGACAATTGTCG
CTAACCCGAAGCAGTACAAGATCCCAGACTGGTTCCTGAACAGGCAGAAGGATTACAAAG
ACGGGAAGTACTCTCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGAAATGAAGCTCAGGGATGACCTTG
AACGTCTCAAGAAAATCAGGAACCATCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTTC
GTGGACAACACACCAAGACAACTGGCCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTGTCAAAGAAGC
GTTAAGCAAGCCTATTGGTGTTGCTAGTTACTTCTTTACTGGATATGCTTCTCAAGAATC
GATTTTAATTTATGTTTTCTTCTTCGAACTAGTTTGTGAGACACCTTTTGAATCTAGTTT
TGAGACCTTTTCAATCTTATGATCCGTCTTTGTGACCATTTGTTACACATGTGCCTACTC
TCTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A273JQ C 125
AF RR2A273TF U 9
AF RR2CL88TF U 1
BS 1 38 RR2CL88TF
BS 39 39 RR2A273TF
BS 40 206 RR2CL88TF
BS 207 207 RR2A273TF
BS 208 243 RR2CL88TF
BS 244 244 RR2A273TF
BS 245 397 RR2CL88TF
BS 398 398 RR2A273TF
BS 399 455 RR2CL88TF
BS 456 456 RR2A273TF
BS 457 727 RR2CL88TF

RD RR2A273JQ 325 0 0
CCGTGTGCTCAACACAAATGTTGATGGTAAGCAGAAGATAATGTTTGCCCTTACCTCTAT
CAAAGGTATTGGGAGGCGATTGGCTAACATCGTCTGCAAGAAGGCTGATGTCGACATGAA
CAAAAGGGCTGGTGAGTTATCTGCTGCTGAGATCGACAACCTGATGACAATTGTCGCTAA
CCCGAAGCAGTACAAGATCCCAGACTGGTTCCTGAACAGGCAGAAGGATTACAAAGACGG
GAAGTACTCTCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGAAATGAAGCTCAGGGATGACCTTGAACG
TCTCAAGAAAATCAGGAACCATCGT

QA 1 325 1 325
DS 

RD RR2A273TF 648 0 0
GG
GTTCAACTCTGCAGCGATCGTCACTGCTCGAAAGAACGGCTTGCCTCTTTTCCGAATCTC
ATCTCTGCAAATCATAATGTCTTTGGTCGCAAATGAGGAGTTTCAGCATATTCTCCGTGT
GCTCAACACAAATGTTGATGGTAAGCAGAAGATAATGTTTGCCCTTACCTCTATCAAAGG
TATTGGGAGGCGATTGGCTAACATCGTCTGCAAGAAGGCTGATGTCGACATGAACAAAAG
GGCTGGTGAGTTATCTGCTGCTGAGATCGACAACCTGATGACAATTGTCGCTAACCCGAA
GCAGTACAAGATCCCAGACTGGTTCCTGAACAGGCAGAAGGATTACAAAGACGGGAAGTA
CTCTCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGAAATGAAGCTCAGGGATGACCTTGAACGTCTCAA
GAAAATCAGGAACCATCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTTCGTGGACAACA
CACCAAGACAACTGGCCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTGTCAAAGAAGCGTTAAGCAAG
CCTATTGGTGTTGCTAGTTACTTCTTTACTGGATATGCTTCTCAAGAATCGATTTTAATT
TATGTTTTCTTCTTCGAACTAGTTTGTGAGACACCTTTTGAATCTA

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR2CL88TF 727 0 0
TTTTTCTTCTGTTCAACTCTGCAGCGATCGTCACTGCTTGAAAGAACGGCTTGCCTCTTT
TCCGAATCTCATCTCTGCAAATCATAATGTCTTTGGTCGCAAATGAGGAGTTTCAGCATA
TTCTCCGTGTGCTCAACACAAATGTTGATGGTAAGCAGAAGATAATGTTTGCCCTTACCT
CTATCAAAGGTATTGGGAGGCGATTGTCTAACATCGTCTGCAAGAAGGCTGATGTCGACA
TGAGCAAAAGGGCTGGTGAGTTATCTGCTGCTGAGATCGACAACCTGATGACAATTGTCG
CTAACCCGAAGCAGTACAAGATCCCAGACTGGTTCCTGAACAGGCAGAAGGATTACAAAG
ACGGGAAGTACTCTCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGACCTTG
AACGTCTCAAGAAAATCAGGAACCATCGTGGTCTGGGACACTACTGGGGTCTCCGTGTTC
GTGGACAACACACCAAGACAACTGGCCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTGTCAAAGAAGC
GTTAAGCAAGCCTATTGGTGTTGCTAGTTACTTCTTTACTGGATATGCTTCTCAAGAATC
GATTTTAATTTATGTTTTCTTCTTCGAACTAGTTTGTGAGACACCTTTTGAATCTAGTTT
TGAGACCTTTTCAATCTTATGATCCGTCTTTGTGACCATTTGTTACACATGTGCCTACTC
TCTTCTC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 11

CO CL412Contig1 1576 11 20 U
GAACAAGCTCTCAATTATCTACTTATAGTTTTAGAGAATTTGTGTGCTTGGGAGTCCCTG
ATGATTAAATAAACCAAGGATTTTACCATGACTGCAATTTTAGAGAGACGCGAAAGCGAA
AGCCTATGGGGTCGCTTCTGTAACTGGATAACTAGTACTGAAAACCGTCTTTACATTGGA
TGGTTTGGTGTTTTGATGATTCCTACCTTATTGACCGCAACTTCCGTTTTTATTATCGCA
TTCATTGCTGCTCCTCCAGTAGATATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGATCTCTT
CTTTACGGAAACAATATTATTTCAGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTG
CATTTTTATCCGATCTGGGAAGCTGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGTGGTCCT
TATGAACTAATTGTTCTACACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGG
GAACTTAGTTTCCGTCTGGGTATGCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTT
GCAGCTGCTACTGCTGTTTTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGT
ATGCCTCTAGGAATCTCTGGTACTTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAAC
ATTCTTATGCACCCATTTCACATGTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCCCTATTT
AGTGCTATGCATGGTTCTTTGGTAACTTCTAGTTTGATCAGGGAAACCACAGAAAATGAA
TCTGCTAATGAAGGGTACAGATTCGGTCAAGAAGAAGAAACACAGGAGAGAGTTTGTTGA
TCTCGACCTCGCTCCACCCCCGACAGAGAACTATAAGGGTCACCAACAATCCTGAAGAAT
CAGCGCCACTCTCCTCCTTCTCGCTTTGCTCTCGGAACCTTTTGGATAAAAGATAAGATG
AGCAGTGAAGTTGGTAGAGTATACCGTGACCTTCTTAAAGCAGTGGTGAAACATGTTGGC
AAAGAAGACCACAAGTCTCATTTCATAGACTTTGTCAAGCACGAGTTTCGCAATAACGCA
AACTCACTAGACAAAATCAACCTTGCCCGCAACTACGCTTATCTTCTTAATAGCATTCAC
TCTCACAAGGATCTGTTGTTCTCATACAACATTGCAGTTGACAGAACTGAAGAAATGAAA
CGAGTTCTTGGGAAGTCTGCAGCTAGTGTAGGCCTTCGTCTTCCCGAGGTTTACCAGCCT
TGATCATGCAAATGCATAATAAGCCACTCTGGTGTCTTCATTTCCTTATTAGACATATCT
TGGTTAACTGGAATAAGTGGTATCCTGTTTGTATCCAGGGCAGCTCTTTTGCATTAAGAC
ATCTGTGAATCTGTGATGCATGCATGGATTTACAAATTTTCCTTGTGTTGTTTACACATA
CGTTTGGGGACAAAAGTATGGTACCAAGAACATATTCAGGTTCTTGATCTATATACAATA
TGTTGTATCAAACCACCAAAGTGAAAGAAGCGATGACAAACTGTGATATAATAAAGATCT
TCATTTCTAAGCAAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA32TF U 1
AF RR2G808TF U 1
AF RR2EQ45JQ C 72
AF RR2EQ45TF U 72
AF RR2G808JQ C 324
AF RR2EH68JQ C 114
AF RR2EH68TF U 114
AF RR2AP68TF U 138
AF RR2EP95JQ C 854
AF RR2EP95TF U 809
AF RR2AP68JQ C 733
BS 1 413 RR2EA32TF
BS 414 414 RR2G808TF
BS 415 673 RR2EA32TF
BS 674 674 RR2G808TF
BS 675 688 RR2EA32TF
BS 689 689 RR2EQ45TF
BS 690 706 RR2EA32TF
BS 707 707 RR2EQ45TF
BS 708 719 RR2EA32TF
BS 720 744 RR2G808TF
BS 745 745 RR2EQ45TF
BS 746 757 RR2G808TF
BS 758 762 RR2EQ45TF
BS 763 763 RR2AP68TF
BS 764 805 RR2EH68TF
BS 806 874 RR2AP68TF
BS 875 1479 RR2EP95TF
BS 1480 1480 RR2AP68JQ
BS 1481 1549 RR2EP95TF
BS 1550 1576 RR2AP68JQ

RD RR2EA32TF 723 0 0
GAACAAGCTCTCAATTATCTACTTATAGTTTTAGAGAATTTGTGTGCTTGGGAGTCCCTG
ATGATTAAATAAACCAAGGATTTTACCATGACTGCAATTTTAGAGAGACGCGAAAGCGAA
AGCCTATGGGGTCGCTTCTGTAACTGGATAACTAGTACTGAAAACCGTCTTTACATTGGA
TGGTTTGGTGTTTTGATGATTCCTACCTTATTGACCGCAACTTCCGTTTTTATTATCGCA
TTCATTGCTGCTCCTCCAGTAGATATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGATCTCTT
CTTTACGGAAACAATATTATTTCAGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTG
CATTTTTATCCGATCTGGGAAGCTGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGCGGTCCT
TATGAACTAATTGTTCTACACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGG
GAACTTAGTTTCCGTCTGGGTATGCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTT
GCAGCTGCTACTGCTGTTTTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGT
ATGCCTCTAGGAATCTCTGGTACTTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAAC
ATTCTTATGCACC*ATTTCACATGTTAG*TGTAGCTGGTGTATTCG*CGGCTCCCTATT
AGTG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2G808TF 757 0 0
GAACAAGCTCTCAATTATCTACTTATAGTTTTAGAGAATTTGTGTGCTTGGGAGTCCCTG
ATGATTAAATAAACCAAGGATTTTACCATGACTGCAATTTTAGAGAGACGCGAAAGCGAA
ATCCTATGGGGTCGCTTCTGTAACTGGATAACTAGTACTGAAAACCGTCTTTACATTGGA
TGGTTTGGTGTTTTGATGATTCCTACCTTATTGACCGCAACTTCCGTTTTTATTATCGCA
TTCATTGCTGCTCCTCCAGTAGATATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGATCTCTT
CTTTACGGAAACAATATTATTTCAGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTG
CATTTTTATCCGATCTGGGAAGCTGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGTGGTCCT
TATGAACTAATTGTTCTACACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGG
GAACTTAGTTTCCGTCTGGGTATGCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTT
GCAGCTGCTACTGCTGTTTTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGT
ATGCCTCTAGGAATCTCTGGTACTTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAAC
ATTCTTATGCACCCATTTCACATGTTAG*TGTAGCTGGTGTATTCG*CGGCTCCCTATTT
AGTGCTATGCATGGTTCTTTGGTA*CTTCTAGTTTGA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2EQ45JQ 692 0 0
G
ACCAAGGATTTTACCATGACTGCAATTTTAGAGAGACGCGAAAGCGAAAGCCTATGGGGT
CGCTTCTGTAACTGGATAACTAGTACTGAAAACCGTCTTTACATTGGATGGTTTGGTGTT
TTGATGATTCCTACCTTATTGACCGCAACTTCCGTTTTTATTATCGCATTCATTGCTGCT
CCTCCAGTAGATATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGATCTCTTCTTTACGGAAAC
AATATTATTTCAGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTGCATTTTTATCCG
ATCTGGGAAGCTGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGTGGTCCTTATGAACTAATT
GTTCTACACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGGGAACTTAGTTTC
CGTCTGGGTATGCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTTGCAGCTGCTACT
GCTGTTTTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGTATGCCTCTAGGA
ATCTCTGGTACTTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAACATTCTTATGCAC
CCATTTCACATGTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCCCTATTTAGTGCTATGCAT
GGTTCTTTGGTAACTTCTAGTTTGATCAGGG

QA 2 692 2 692
DS 

RD RR2EQ45TF 699 0 0
G
ACCAAGGATTTTACCATGACTGCAATTTTAGAGAGACGCGAAAGCGAAAGCCTATGGGGT
CGCTTCTGTAACTGGATAACTAGTACTGAAAACCGTCTTTACATTGGATGGTTTGGTGTT
TTGATGATTCCTACCTTATTGACCGCAACTTCCGTTTTTATTATCGCATTCATTGCTGCT
CCTCCAGTAGATATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGATCTCTTCTTTACGGAAAC
AATATTATTTCAGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTGCATTTTTATCCG
ATCTGGGAAGCTGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGTGGTCCTTATGAACTAATT
GTTCTACACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGGGAACTTAGTTTC
CGTCTGGGTATGCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTTGCAGCTGCTACT
GCTGTTTTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGTATGCCTCTAGGA
ATCTCTGGTACTTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAACATTCTTATGCAC
CCATTTCACATGTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCCCTATTTAGTGCTATGCAT
GGTTCTTTGGTAACTTCTAGTTTGATCAGG
AAAAAAAA

QA 2 691 2 691
DS 

RD RR2G808JQ 449 0 0
AGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTGCATTTTTATCCGATCTGGGAAGC
TGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGTGGTCCTTATGAACTAATTGTTCTACACTT
TTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGGGAACTTAGTTTCCGTCTGGGTAT
GCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTTGCAGCTGCTACTGCTGTTTTCTT
GATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGTATGCCTCTAGGAATCTCTGGTAC
TTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAACATTCTTATGCACCCATTTCACAT
GTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCCCTATTTAGTGCTATGCATGGTTCTTTGGT
AACTTCTAGTTTGATCAGGGAAACCACAG

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2EH68JQ 695 0 0
G
AGCGAAAGCCTATGGGGTCGCTTCTGTAACTGGATAACTAGTACTGAAAACCGTCTCTAC
ATTGGATGGTTTGGTGTTTTGATGATTCCTACCTTATTGACCGCAACTTCCGTTTTTATT
ATCGCATTCATTGCTGCTCCTCCAGTAGATATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGA
TCTCTTCTTTACGGAAACAATATTATTTCAGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATT
GGTTTGCATTTTTATCCGATCTGGGAAGCTGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGT
GGTCCTTATGAACTAATTGTTCTACACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGT
GAGTGGGAACTTAGTTTCCGTCTGGGTATGCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCT
CCTGTTGCAGCTGCTACTGCTGTTTTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCT
GATGGTATGCCTCTAGGAATCTCTGGTACTTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAG
CACAACATTCTTATGCACCCATTTCACATGTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCC
CTATTTAGTGCTATGCATGGTTCTTTGGTAACTTCTAGTTTGATCAGGGAAACCACAGAA
AATGAATCTGCTAATGAAGGGTACAGATTCGGTC

QA 2 695 2 695
DS 

RD RR2EH68TF 694 0 0
G
AGCGAAAGCCTATGGGGTCGCTTCTGTAACTGGATAACTAGTACTGAAAACCGTCTCTAC
ATTGGATGGTTTGGTGTTTTGATGATTCCTACCTTATTGACCGCAACTTCCGTTTTTATT
ATCGCATTCATTGCTGCTCCTCCAGTAGATATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGA
TCTCTTCTTTACGGAAACAATATTATTTCAGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATT
GGTTTGCATTTTTATCCGATCTGGGAAGCTGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGT
GGTCCTTATGAACTAATTGTTCTACACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGT
GAGTGGGAACTTAGTTTCCGTCTGGGTATGCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCT
CCTGTTGCAGCTGCTACTGCTGTTTTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCT
GATGGTATGCCTCTAGGAATCTCTGGTACTTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAG
CACAACATTCTTATGCACCCATTTCACATGTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCC
CTATTTAGTGCTATGCATGGTTCTTTGGTAACTTCTAGTTTGATCAGG*AAACCACAGAA
AATGAATCTGCTAATGAAGGGTACAGATTCG
TC

QA 2 692 2 692
DS 

RD RR2AP68TF 737 0 0
G
TGTAACTGGATAACTAGTACTGAAAACCGTCTTTACATTGGATGGTTTGGTGTTTTGATG
ATTCCTACCTTATTGACCGCAACTTCCGTTTTTATTATCGCATTCATTGCTGCTCCTCCA
GTAGATATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGATCTCTTCTTTACGGAAACAATATT
ATTTCAGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTGCATTTTTATCCGATCTGG
GAAGCTGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGTGGTCCTTATGAACTAATTGTTCTA
CACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGGGAACTTAGTTTCCGTCTG
GGTATGCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTTGCAGCTGCTACTGCTGTT
TTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGTATGCCTCTAGGAATCTCT
GGTACTTTCAATTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAACATTCTTATGCACCCATTT
CACATGTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCCCTATTTAGTGCTATGCATGGTTCT
TTGGTAACTTCTAGTTTGATCAGGGAAACCACAGAAAATGAATCTGCTAATGAAGGGTAC
AGATTCGGTCAAGAAGAAGAAACACAGGAGAGAGTTTGTTGATCTCGACCTCGCTCCACC
CCCGACAGAGAACTAT

QA 2 737 2 737
DS 

RD RR2EP95JQ 696 0 0
CCACCCCCGACAGAGAACTATAAGGGTCACCAACAATCCTGAAGAATCAGCGCCACTCTC
CTCCTTCTCGCTTTGCTCTCGGAACCTTTTGGATAAAAGATAAGATGAGCAGTGAAGTTG
GTAGAGTATACCGTGACCTTCTTAAAGCAGTGGTGAAACATGTTGGCAAAGAAGACCACA
AGTCTCATTTCATAGACTTTGTCAAGCACGAGTTTCGCAATAACGCAAACTCACTAGACA
AAATCAACCTTGCCCGCAACTACGCTTATCTTCTTAATAGCATTCACTCTCACAAGGATC
TGTTGTTTTCATACAACATTGCAGTTGACAGAACTGAAGAAATGAAACGAGTTCTTGGGA
AGTCTGCAGCTAGTGTAGGCCTTCGTCTTCCCGAGGTTTACCAGCCTTGATCATGCAAAT
GCATAATAAGCCACTCTGGTGTTTTCATTTCCTTATTAGACATATCTTGGTTAACTGGAA
TAAGTGGTATCCTGTTTGTATCCAGGGCAGCTCTTTTGCATTAAGACATCTGTGAATCTG
TGATGCATGCATGGATTTACAAATTTTCCTTGTGTTGTTTACACATACGTTTGGGGACAA
AAGTATGGTACCAAGAACATATTCAGGTTCTTGATCTATATACAATATGTTGTATCAAAC
CACCAAAGTGAAAGAAGCGATGACAAACTGTGATAT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2EP95TF 744 0 0
GGGTCGTGC
AAACACAGGAGAGAGTTTGTTGATCTCGACCTCGCTCCACCCCCGACAGAGAACTATAAG
GGTCACCAACAATCCTGAAGAATCAGCGCCACTCTCCTCCTTCTCGCTTTGCTCTCGGAA
CCTTTTGGATAAAAGATAAGATGAGCAGTGAAGTTGGTAGAGTATACCGTGACCTTCTTA
AAGCAGTGGTGAAACATGTTGGCAAAGAAGACCACAAGTCTCATTTCATAGACTTTGTCA
AGCACGAGTTTCGCAATAACGCAAACTCACTAGACAAAATCAACCTTGCCCGCAACTACG
CTTATCTTCTTAATAGCATTCACTCTCACAAGGATCTGTTGTTCTCATACAACATTGCAG
TTGACAGAACTGAAGAAATGAAACGAGTTCTTGGGAAGTCTGCAGCTAGTGTAGGCCTTC
GTCTTCCCGAGGTTTACCAGCCTTGATCATGCAAATGCATAATAAGCCACTCTGGTGTCT
TCATTTCCTTATTAGACATATCTTGGTTAACTGGAATAAGTGGTATCCTGTTTGTATCCA
GGGCAGCTCTTTTGCATTAAGACATCTGTGAATCTGTGATGCATGCATGGATTTACAAAT
TTTCCTTGTGTTGTTTACACATACGTTTGGGGACAAAAGTATGGTACCAAGAACATATTC
AG*TTCTTGATCTATATACAATATGTTGTATCAAACCACCAAAGTGAAAGAAGCGATGAC
AAACTGTGATAT
AAT

QA 10 741 10 741
DS 

RD RR2AP68JQ 844 0 0
GGTTCTTTGGTAACTTCTAGTTTGATCAGGGAAACCACAGAAAATGAATCTGCTAATGAA
GGGTACAGATTCGGTCAAGAAGAAGAAACACAGGAGAGAGTTTGTTGATCTCGACCTCGC
TCCACCCCCGACAGAGAACTATAAGGGTCACCAACAATCCTGAAGAATCAGCGCCACTCT
CCTCCTTCTCGCTTTGCTCTCGGAACCTTTTGGATAAAAGATAAGATGAGCAGTGAAGTT
GGTAGAGTATACCGTGACCTTCTTAAAGCAGTGGTGAAACATGTTGGCAAAGAAGACCAC
AAGTCTCATTTCATAGACTTTGTCAAGCACGAGTTTCGCAATAACGCAAACTCACTAGAC
AAAATCAACCTTGCCCGCAACTACGCTTATCTTCTTAATAGCATTCACTCTCACAAGGAT
CTGTTGTTCTCATACAACATTGCGGTTGACAGAACTGAAGAAATGAAACGAGTTCTTGGG
AAGTCTGCAGCTAGTGTAGGCCTTCGTCTTCCCGAGGTTTACCAGCCTTGATCATGCAAA
TGCGTAATAAGCCACTCTGGTGTCTTCATTTCCTTATTAGACATATCTTGGTTAACTGGA
ATAAGTGGTATCCTGTTTGTATCCAGGGCAGCTCTTTTGCATTAAGACATCTGTGAATCT
GTGATGCATGCATGGATTTACAAATTTTCCTTGTGTTGTTTACACATACGTTTGGGGACA
AAAGTATGGTACCAAGAACATATTCAGGTTCTTGATCTATATACAATATGTTGTATCAAA
CCACCAAAGTGAAAGAAGCGATGACAAACTGTGATATAATAAAGATCTTCATTTCTAAGC
AAAC

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 12

CO CL413Contig1 713 12 17 U
GGAGAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGT
ATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCG
ACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAG
GGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTG
AAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAG
ATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCAC
CGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGTTCAGCTCTTCAAGAACGCTACTGTTTCTTTTT
T*GCTGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTT
ACAATGATGTTTTGATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTTAATCTTTTGTCAGAGTTG
CTTATGTTTGTGTCTTTTCACTATTATCGTTTAAAGTATTACCCGTTATCGAA


BQ
40 40 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 15 65 65 65 35 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 50 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 35 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 50 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 0 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2BY02JQ C 1
AF RR2AG38TF U 1
AF RR2FA55JQ C 481
AF RR2BY02TF U 1
AF RR2FA55TF U -2
AF RR2AG38JQ C 88
AF RR2E517JQ C 1
AF RR2FU38JQ C 4
AF RR2FU38TF U 4
AF RR2H177TF U 1
AF RR2D193TF U -2
AF RR2E517TF U 1
BS 1 14 RR2AG38TF
BS 15 15 RR2BY02TF
BS 16 215 RR2AG38TF
BS 216 216 RR2BY02TF
BS 217 275 RR2AG38TF
BS 276 276 RR2FU38TF
BS 277 305 RR2AG38TF
BS 306 306 RR2FU38TF
BS 307 427 RR2AG38TF
BS 428 428 RR2BY02TF
BS 429 567 RR2AG38TF
BS 568 568 RR2FU38TF
BS 569 626 RR2AG38TF
BS 627 674 RR2FU38TF
BS 675 677 RR2E517TF
BS 678 678 RR2E517JQ
BS 679 713 RR2E517TF

RD RR2BY02JQ 579 0 0
GGAGAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGT
ATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCG
ACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAG
GGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTG
AAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTTAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAG
ATTCCCGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCAC
CGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGTTCAGCTCTTCAAGAACGCTACTGTTTCTTTTT
TTGCTGTCTTATCTATGAACCTAGTTTTTATGTTTCTCA

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2AG38TF 626 0 0
GGAGAGGAAACAATTTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGT
ATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCG
ACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAG
GGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGCGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTG
AAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTTAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAG
ATTCCCGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCAC
CGTCTTGTTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGTTCAGCTCTTCAAGAACGCTACTGTTTCTTTTT
T*GCTGTCTTATCTATGAACCTAGTTTTTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTT
ACAATGATGTTTTGATGATTTCAAGG

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2FA55JQ 146 0 0
AA
TACTGCTTTTACTCTTGTGGCTTAGTTCAGCTCTTCAAGAACGCTACTGTTTCTTTTTT*
GCTGTTTTATCTATGAACCTAGTTTTTATGTTTTTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTAC
AATGATGTTTTGATGATTTCAAGG

QA 3 146 3 146
DS 

RD RR2BY02TF 626 0 0
GGAGAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGT
ATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCG
ACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAG
GGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTG
AAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTTAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAG
ATTCCCGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCAC
CGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGTTCAGCTCTTCAAGAACGCTACTGTTTCTTTTT
TTGCTGTCTTATCTATGAACCTAGTTTTTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTT
ACAATGATGTTTTGATGATTTCAAGG

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2FA55TF 629 0 0
GGAGC
AGAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGTAT
GCATTCCAGAGGAAAGGGCATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCGAC
ATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGG
TTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAA
GAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTTAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAGAT
TCCCGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAG
GAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCG
TCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTAC
TACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGTTCAGCTCTTCAAGAACGCTACTGTTTCTTTTTT*
GCTGTCTTATCTATGAACCTAGTTTTTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTAC
AATGATGTTTTGATGATTTCAAGG

QA 6 629 6 629
DS 

RD RR2AG38JQ 539 0 0
GCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCGACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGAT
GTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACACCATTTCAGATTGGTGTG
ATTTTTCGCGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTG
CGTATTCTTAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAGATTCCCGAGGATCTGTACCACTTGATC
AAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAG
TTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGTCTTGTTCGTTACTACAAGAAGACC
AAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAG
TTCAGCTCTTCAAGAACGCTACTGTTTCTTTTTT*GCTGTCTTATCTATGAACCTAGTTT
TTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTACAATGATGTTTTGATGATTTCAAGG

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2E517JQ 711 0 0
GGAGAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGT
ATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTACCGTACAAGCGTTCACCTCCG
ACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAG
GGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTG
AAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAG
ATTCCTGAGGATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCAC
CGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGTTCAGCTCTTCAAGAACGCTACTGTTTCTTTTT
T*GCTGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTT
ACAATGATGTTTTGATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTTAATCTTTTGTCAGAGTTG
CTTATGTTTGTGTCTTTTCACTATTATCGTTTAAAGTATTACCCGTTATCG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2FU38JQ 671 0 0
GG
GGAAACAATCTCATAGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGTATGCA
TTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTTCGACATG
GCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCAATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTT
GACACCATCTCAGATTGGTGTGATCCTTCGTGACTC**ACGGTATCCCTCAGGTGAAGAG
TGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAGATTCC
TGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAA
CAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGTCT
TGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACTAC
TGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGTTCAGCTCTTCAAGAACGCTACTGTTTCTTTTTT*GCT
GTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTACAAT
GATGTTTTGATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTTAATCTTTTGTCAGAGTTGCTTAT
GTTTGTGTC

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR2FU38TF 671 0 0
GG
GGAAACAATCTCATAGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGTATGCA
TTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTTCGACATG
GCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCAATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTT
GACACCATCTCAGATTGGTGTGATCCTTCGTGACTC**ACGGTATCCCTCAGGTGAAGAG
TGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAGATTCC
TGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAA
CAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGTCT
TGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACTAC
TGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGTTCAGCTCTTCAAGAACGCTACTGTTTCTTTTTT*GCT
GTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTACAAT
GATGTTTTGATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTTAATCTTTTGTCAGAGTTGCTTAT
GTTTGTGTC

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR2H177TF 676 0 0
GGAGAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGT
ATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTACCGTACAAGCGCTCACCTCCG
ACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGACGTTGATGAGTCAATCTGCAAGTTTGCGAAGAAG
GGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTG
AAGAGTGTTACCGGAAACAAGTTCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAG
ATTCCTGAGGATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCAC
CGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCTTCTACTCTTGTGACTTAGTTCAGCTCTTCAAGAACGCTACTGTTTCTTTTT
T*GCTGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTT
ACAATGATGTTTTGATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTTAATCTTTTGTCAGAGTTG
CTTATGTTTGTGTC
TT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2D193TF 675 0 0
GGAGC
AGAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGTAT
GCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTACCGTACAAGCGTTCACCTCCGAC
ATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGG
TTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAA
GAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAGAT
TCCTGAGGATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAG
GAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCG
CCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTAC
TACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGTTCAGCTCTTCAAGAACGCTACTGTTTCTTTTTT*
GCTGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTAC
AATGATGTTTTGATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTTAATCTTTTGTCAGAGTTGCT
TATGTTTGTG

QA 6 675 6 675
DS 

RD RR2E517TF 713 0 0
GGAGAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGT
ATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTACCGTACAAGCGTTCACCTCCG
ACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAG
GGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTG
AAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAG
ATTCCTGAGGATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCAC
CGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGTTCAGCTCTTCAAGAACGCTACTGTTTCTTTTT
T*GCTGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTT
ACAATGATGTTTTGATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTTAATCTTTTGTCAGAGTTG
CTTATGTTTGTGTCTTT*CACTATTATCGTTTAAAGTATTACCCGTTATCGAA

QA 1 713 1 713
DS 



AS 2 12

CO CL414Contig1 693 10 19 U
GGAAGTCTCACCAGACAATCTAATAGGTGACCTTGAGAAAGAAAACAACGGGACAAATAA
TGGTAACGGAGGAAATTGAGGTAGACGTGGAGATCAAATCTCCGGCTAATAAGTTCCACA
TGTTCGTCGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTACATTCAGGGATGTGATT
TGCTCGAAGGGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAATCTTGTGGAAACTACTTTTTGATG
GAGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAGGCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTC
AGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGTACAACAGCCTCTCGAAAACGATGA
AGGTGAGCCCTAACCATGGAGGACCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTATGAGA
GGATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGCAGCTCCAGTTCTTGGTCGAAGTGACTA
AACAGGTCGACGGATACCTCTTATCTGAGGAATAAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATATCTA
AATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTAAGTAATAGAG
GACTCCTCTTGTGTATTTGTATGTGTTTCTCAATAATGTGACATTTATCGGATCTAAAAG
CAAAATATATATATATATATATCGTGTGTTTGT


BQ
35 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 
60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 40 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 40 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 15 30 30 30 30 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO92JQ C 102
AF RR2CP04JQ C 272
AF RR2A559JQ C 2
AF RR2A559TF U 2
AF RR2EO92TF U 1
AF RR2D250JQ C 1
AF RR2CP04TF U 8
AF RR2AD11TF U 1
AF RR2D250TF U 1
AF RR2AD11JQ C 1
BS 1 1 RR2EO92TF
BS 2 90 RR2A559TF
BS 91 91 RR2EO92TF
BS 92 167 RR2A559TF
BS 168 169 RR2EO92TF
BS 170 215 RR2A559TF
BS 216 216 RR2CP04TF
BS 217 415 RR2A559TF
BS 416 416 RR2CP04TF
BS 417 475 RR2A559TF
BS 476 476 RR2CP04TF
BS 477 494 RR2A559TF
BS 495 495 RR2EO92TF
BS 496 535 RR2A559TF
BS 536 536 RR2CP04TF
BS 537 614 RR2A559TF
BS 615 615 RR2CP04TF
BS 616 655 RR2A559TF
BS 656 693 RR2AD11JQ

RD RR2EO92JQ 381 0 0
CCGGCTAATAAGTTCCACATGTTCGTCGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGC
TACATTCAGGGATGTGATTTGCTCGAAGGGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAGTCTTG
TGGAAACTACTCTTTGATGGAGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAGGCGATGGAT
TTTGAGAAGAATGTTATTCAGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGTACAAC
AGCCTCTCGAAAACGATGAAGGTGAGCCCTAACCATGGAGGACCAGGAAGCACGGTAAAG
TGGAACGTGAAGTACGAGAGGATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGCAGCTCCAG
TTCTTGGTCGAAGTAACTAAA

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR2CP04JQ 384 0 0
GGG
GATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTCAGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTTTTAAGACAGT
GTACAACAGCCTTTCGAAAACGATGAAGGTGAGCCCTAACCATGGAGGACCAGGAAGCAC
GGTAAAGTGGAACGTGAAGTATGAGAGGATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGCA
GCTCCAGTTTTTGGTCGAAGTGACTAAACAGGTCGACGGATACCTTTTATTTGAGGAATA
AAGCCTTTTCGGGTTGGCAATATTTAAATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGT
GGAAGAGTTATTGTTAAGTAATAGAGGACTCCTTTTGTGTATTTGTATGTGTTTTTCAAT
AAAGTGACATTTATCG
AATTT

QA 4 379 4 379
DS 

RD RR2A559JQ 654 0 0
GAAGTCTCACCAGACAATCTAATAGGTGACCTTGAGAAAGAAAACAACGGGACAAATAAT
GGTAACGGAGGAAATTGAGGTAGACGTGGGGATCAAATCTCCGGCTAATAAGTTCCACAT
GTTCGTCGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTACATT**GGGATGTGATTT
GCTCGAAGGGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAGTCTTGTGGAAACTACTTTTTGATGG
AGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAGGCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTCA
GTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGTACAACAGCCTCTCGAAAACGATGAA
GGTGAGCCCTAACCATGGAGGACCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTACGAGAG
GATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGCAGCTCCAGTTCTTGGTCGAAGTAACTAA
ACAGGTCGACGGACACCTCTTATCTGAGGAATAAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATTTCTAA
ATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTAAGTAATAGAGG
ACTCCTCTTGTGTGTTTGTATGTGTTTCTCAATAATGTGACATTTATCGGATCT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2A559TF 654 0 0
GAAGTCTCACCAGACAATCTAATAGGTGACCTTGAGAAAGAAAACAACGGGACAAATAAT
GGTAACGGAGGAAATTGAGGTAGACGTGGGGATCAAATCTCCGGCTAATAAGTTCCACAT
GTTCGTCGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTACATT**GGGATGTGATTT
GCTCGAAGGGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAGTCTTGTGGAAACTACTTTTTGATGG
AGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAGGCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTCA
GTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGTACAACAGCCTCTCGAAAACGATGAA
GGTGAGCCCTAACCATGGAGGACCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTACGAGAG
GATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGCAGCTCCAGTTCTTGGTCGAAGTAACTAA
ACAGGTCGACGGACACCTCTTATCTGAGGAATAAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATTTCTAA
ATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTAAGTAATAGAGG
ACTCCTCTTGTGTGTTTGTATGTGTTTCTCAATAATGTGACATTTATCGGATCT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2EO92TF 655 0 0
GGAAGTCTCACCAGACAATCTAATAGGTGACCTTGAGAAAGAAAACAACGGGACAAATAA
TGGTAACGGAGGAAATTGAGGTAGACGTGGAGATCAAATCTCCGGCTAATAAGTTCCACA
TGTTCGTCGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTACATTCAGGGATGTGATT
TGCTCGAAGGGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAGTCTTGTGGAAACTACTCTTTGATG
GAGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAGGCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTC
AGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGTACAACAGCCTCTCGAAAACGATGA
AGGTGAGCCCTAACCATGGAGGACCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTACGAGA
GGATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGCAGCTCCAGTTCTTGGTCGAAGTAACTA
AACAGGTCGACGGATACCTCTTATCTGAGGAATAAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATTTCTA
AATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTAAGTAATAGAG
GACTCCTCTTGTGTGTTTGTATGTGTTTCTCAATAATGTGACATTTATCGGATCT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2D250JQ 650 0 0
GGAAGTCTCACCAGACAATCTAATAGGTGACCTTGAGAAAGAAAACAACGGGACAAATAA
TGGTAACGGAGGAAATTGAGGTAGACGTGGAGATCAAATCTCCGGCTAATAAGTTCCACA
TGTTCGTCGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTACATTCAGGGATGTGATT
TGCTCGAAGGGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAATTTTGTGGAAACTACTTTTTGATG
GAGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAGGCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTC
AGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGTACAACAGCCTCTCGAAAACGATGA
AGGTGAGCCCTAACCATGGAGGACCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTATGAGA
GGATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGCAGCTCCAGTTTTTGGTCGAAGTGACTA
AACAGGTCGACGGATACCTCTTATTTGAGGAATAAAGCCTTTTCGGGTTGGCAATATCTA
AATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTAAGTAATAGAG
GACTCCTCTTGTGTATTTGTATGTGTTTCTCAATAATGTGACATTTATCG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2CP04TF 645 0 0
GG
ACCAGACAATCTAATAGGTGACCTTGAGAAAGAAAACAACGGGACAAATAATGGTAACGG
AGGAAATTGAGGTAGACGTGGAGATCAAATCTCCGGCTAATAAGTTCCACATGTTCGTCG
GAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTACATTCAGGGATGTGATTTGCTCGAAG
GGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAATCTTGTGGAAACTACTTTTTGATGGAGAGGAAA
TAGTGTCAAAAGATATGATCGAGGCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTCAGTTGAGAG
TGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGTACAACAGCCTCTCGAAAACGATGAAGGTGAGCC
CTAACCATGGAGGACCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTATGAGAGGATTGATG
AGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGCAGCTCCAGTTCTTGGTCGAAGTGACTAAACAGGTCG
ACGGATACCTCTTATCTGAGGAATAAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATATCTAAATAATTAA
TGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTAAGTAATAGAGGACTCCTCT
TGTGTATTTGTATGTGTTTCTCAATAAAGTGACATTTATCG
AA

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR2AD11TF 645 0 0
GGAAGTCTCACCAGACAATCTAATAGGTGACCTTGAGAAAGAAAACAACGGGACAAATAA
TGGTAACGGAGGAAATTGAGGTAGACGTGGAGATCAAATCTCCGGCTAATAAGTTCCACA
TGTTCGTCGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTACATTCAGGGATGTGATT
TGCTCGAAGGGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAATCTTGTGGAAACTACTTTTTGATG
GAGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAGGCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTC
AGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGTACAACAGCCTCTCGAAAACGATGA
AGGTGAGCCCTAACCATGGAGGACCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTATGAGA
GGATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGCAGCTCCAGTTCTTGGTCGAAGTGACTA
AACAGGTCGACGGATACCTCTTATCTGAGGAATAAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATATCTA
AATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTAAGTAATAGAG
GACTCCTCTTGTGTATTTGTATGCGTTTCTCAATAATGTGACATT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2D250TF 650 0 0
GGAAGTCTCACCAGACAATCTAATAGGTGACCTTGAGAAAGAAAACAACGGGACAAATAA
TGGTAACGGAGGAAATTGAGGTAGACGTGGAGATCAAATCTCCGGCTAATAAGTTCCACA
TGTTCGTCGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTACATTCAGGGATGTGATT
TGCTCGAAGGGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAATCTTGTGGAAACTACTTTTTGATG
GAGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAGGCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTC
AGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGTACAACAGCCTCTCGAAAACGATGA
AGGTGAGCCCTAACCATGGAGGACCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTATGAGA
GGATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGCAGCTCCAGTTCTTGGTCGAAGTGACTA
AACAGGTCGACGGATACCTCTTATCTGAGGAATAAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATATCTA
AATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTAAGTAATAGAG
GACTCCTCTTGTGTATTTGTATGTGTTTCTCAATAATGTGACATTTATCG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2AD11JQ 693 0 0
GGAAGTCTCACCAGACAATCTAATAGGTGACCTTGAGAAAGAAAACAACGGGACAAATAA
TGGTAACGGAGGAAATTGAGGTAGACGTGGAGATCAAATCTCCGGCTAATAAGTTCCACA
TGTTCGTCGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTACATTCAGGGATGTGATT
TGCTCGAAGGGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAATCTTGTGGAAACTACTTTTTGATG
GAGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAGGCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTC
AGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGTACAACAGCCTCTCGAAAACGATGA
AGGTGAGCCCTAACCATGGAGGACCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTATGAGA
GGATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGCAGCTCCAGTTCTTGGTCGAAGTGACTA
AACAGGTCGACGGATACCTCTTATCTGAGGAATAAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATATCTA
AATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTAAGTAATAGAG
GACTCCTCTTGTGTATTTGTATGCGTTTCTCAATAATGTGACATTTATCGAATCTAAAAG
CAAAATATATATATATATATATCGTGTGTTTGT

QA 1 693 1 693
DS 



CO CL414Contig2 863 2 2 U
GGACCAGACAATCTAATAGGTGACCTTGAGAAAGAAAACAACGGGACAAATAATGGTAAC
GGAGGAAATTGAGGTAGACGTGGAGATCAAATCTCCGGCTAATAAGTTCCACATGTTCGT
CGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTACATTCAGGGATGTGATTTGCTCGA
AGGGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAGTCTTGTGGAAACTACTTTTTGGTAATGGCAT
AACTACATCCTTTTTAAAGTTTATTTATCAATTTGTTTTCGTCCTATTCTTCTTTGATTT
AAATGCGAAGATCTTTTTTTTTGTTGTTGTTGAAAATGATGGTGAGATCATACAAGGACT
TGGTAGTTGGAACATAAGATTTTAAAGATTTTCTGTTTTGCTTGTTTCTTTGATTTCAAT
CCCAAGAAAACATGTTTTGGTTTAGATGGAGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAG
GCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTCAGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACA
GTGTACAACAGCCTCTCGAAAACGATGAAGGTGAGCCCTAACCATGGAGGACCAGGAAGC
ACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTACGAGAGGATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGG
CAGCTCCAGTTCTTGGTCGAAGTAACTAAACAGGTCGACGGATACCTCTTATTTGAGGAA
TAAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATTTCTAAATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGT
GTGGAAGAGTTATTGTTAAGTAATAGAGGACTCCTCTTGTGTGTTTGTATGTGTTTCTCA
ATAATGTGACATTTATCGGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT90TF U 1
AF RR2DT90JQ C 112
BS 1 691 RR2DT90TF
BS 692 863 RR2DT90JQ

RD RR2DT90TF 691 0 0
GGACCAGACAATCTAATAGGTGACCTTGAGAAAGAAAACAACGGGACAAATAATGGTAAC
GGAGGAAATTGAGGTAGACGTGGAGATCAAATCTCCGGCTAATAAGTTCCACATGTTCGT
CGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTACATTCAGGGATGTGATTTGCTCGA
AGGGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAGTCTTGTGGAAACTACTTTTTGGTAATGGCAT
AACTACATCCTTTTTAAAGTTTATTTATCAATTTGTTTTCGTCCTATTCTTCTTTGATTT
AAATGCGAAGATCTTTTTTTTTGTTGTTGTTGAAAATGATGGTGAGATCATACAAGGACT
TGGTAGTTGGAACATAAGATTTTAAAGATTTTCTGTTTTGCTTGTTTCTTTGATTTCAAT
CCCAAGAAAACATGTTTTGGTTTAGATGGAGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAG
GCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTCAGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACA
GTGTACAACAGCCTCTCGAAAACGATGAAGGTGAGCCCTAACCATGGAGGACCAGGAAGC
ACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTACGAGAGGATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGG
CAGCTCCAGTTCTTGGTCGAAGTAACTAAAC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2DT90JQ 752 0 0
CATGTTCGTCGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTACATTCAGGGATGTGA
TTTGCTCGAAGGGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAGTCTTGTGGAAACTACTTTTTGG
TAATGGCATAACTACATCCTTTTTAAAGTTTATTTATCAATTTGTTTTCGTCCTATTCTT
CTTTGATTTAAATGCGAAGATCTTTTTTTTTGTTGTTGTTGAAAATGATGGTGAGATCAT
ACAAGGACTTGGTAGTTGGAACATAAGATTTTAAAGATTTTCTGTTTTGCTTGTTTCTTT
GATTTCAATCCCAAGAAAACATGTTTTGGTTTAGATGGAGAGGAAATAGTGTCAAAAGAT
ATGATCGAGGCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTCAGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCT
CTTAAGACAGTGTACAACAGCCTCTCGAAAACGATGAAGGTGAGCCCTAACCATGGAGGA
CCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTACGAGAGGATTGATGAGAACGTTGCTCAC
CCTGAGAGGCAGCTCCAGTTTTTGGTCGAAGTAACTAAACAGGTCGACGGATACCTCTTA
TTTGAGGAATAAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATTTCTAAATAATTAATGCTTCACATACAA
CATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTAAGTAATAGAGGACTCCTCTTGTGTGTTTGTATG
TGTTTCTCAATAATGTGACATTTATCGGATCT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 2 10

CO CL415Contig1 1294 8 22 U
GGAACCCAAAACAACAAAAGAAGAATTAAAAGAAAGAAAAAAGACATTTTCATCTCTCTC
TTCTTGAAAGCAATGGATCGGCAAAACTCCGATGACATCATGAAGTTTCTTGACGGAATG
GCTAGCTCCGACGATGTTTTATTTGGTTTTCTCGACGAAGGAAACCATTCACCGGAGGAT
TACCATGATTCCGGTAGCTTCGCCGGCGGCGAAGAATCCGATGCTGACAACGATGCCGCC
GCCGGTTGCAATTCCGAAGAGAGCAAAACCTTTTGGCATGAACAAGAACAACTTCTCCAG
GCGACACTGTATAGAACAAGTTCAGTTGAGACAAAGATTCGACAAGCAACAAAAGAAGCG
TTGAAAGAAGTGAGATCAAAGGGTTTGCAATGTGTTTGCCGGAGACCGATGATCGGCGGT
TGCCGTAGCTGTTTGCGCGGTGAAGTGGCTAGCCGTCTCCGAGATGCCGGCTATGATTGC
GTCATTTGCAAATCCAAGTGGAGAAGCAATCACGAGATTCCTGCAGGTGAGCATGAATAT
TTGGAAATCGTGGACAAATCTGGATCAAAGAAAGGCGAGATCCGTGTGGTGATTGAGCTA
TCTTTTAGGGCGGAGTTTGAGATGGCGAGAGGTAGTGAGGAGTACAAGCGACTTATTGGA
ATATTACCTGAAGTGTACGTCGGGAAAACAGAGAGGCTAAAATCGCTGATAAAAATATTG
TGCACGGCGGCTAAAAAGTGTATGAAAGACAAGAAAATGCACATGGGTCCTTGGAGAAAA
CACAAGTACATGCAAGCCAAATGGCACGGTACCTGCGAAAGAAAATCCGTGAACCTTTCT
CCGGACACTGAGACGCAGAAGGAGGAGGAGGATAAGAGTATGATGGCGAAGCATAGGGTT
TCTATGTTGAATTATGG*TATTTTTGGTGATTTATCCGCCGGAATGGGCCGTCCAGCCGC
CGTCGCGGTCGTGTGATTATATATGTATACATAGACGTACGAATACGATAAGTAAATTAG
GTGGAGATTAAGTGAATGAGTTTCACATTGAGAGTTTGCGTGGAATTGTCTCAGCGATGA
TTTTGTTTGCCCAAACAGGGCAACTCCTTGGACCCATTGTAGTATACACAACGTTGTTCT
AATTGAGATAAATTTAAATTGGTCTCTTTAACTCCTTTTGCTTTAGTATCTTAAATGGAG
TTCTAAACAACATAAGACTACTATATTAATAGGCCTAGTATTAATATTAATTTTTGATGT
TTGACAGGTTAATCATCATAATTTTTTGTTACAG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 35 35 50 35 35 50 50 50 20 50 50 50 50 50 20 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 35 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK38TF U 1
AF RR2ES92TF U 1
AF RR2GV20TF U 334
AF RR2C935TF U 279
AF RR2C935JQ C 284
AF RR2ES92JQ C 356
AF RR2BG64JQ C 525
AF RR2CK38JQ C 496
BS 1 107 RR2CK38TF
BS 108 108 RR2ES92TF
BS 109 461 RR2CK38TF
BS 462 462 RR2ES92TF
BS 463 575 RR2CK38TF
BS 576 576 RR2ES92TF
BS 577 609 RR2CK38TF
BS 610 610 RR2ES92TF
BS 611 687 RR2CK38TF
BS 688 688 RR2ES92TF
BS 689 690 RR2C935TF
BS 691 714 RR2ES92TF
BS 715 715 RR2C935TF
BS 716 736 RR2ES92TF
BS 737 737 RR2C935TF
BS 738 753 RR2ES92TF
BS 754 917 RR2C935TF
BS 918 918 RR2C935JQ
BS 919 955 RR2C935TF
BS 956 1019 RR2C935JQ
BS 1020 1169 RR2ES92JQ
BS 1170 1294 RR2CK38JQ

RD RR2CK38TF 691 0 0
GGAACCCAAAACAACAAAAGAAGAATTAAAAGAAAGAAAAAAGACATTTTCATCTCTCTC
TTCTTGAAAGCAATGGATCGGCAAAACTCCGATGACATCATGAAGTT*CTTGACGGAATG
GCTAGCTCCGACGATGTTTTATTTGGTTTTCTCGACGAAGGAAACCATTCACCGGAGGAT
TACCATGATTCCGGTAGCTTCGCCGGCGGCGAAGAATCCGATGCTGACAACGATGCCGCC
GCCGGTTGCAATTCCGAAGAGAGCAAAACCTTTTGGCATGAACAAGAACAACTTCTCCAG
GCGACACTGTATAGAACAAGTTCAGTTGAGACAAAGATTCGACAAGCAACAAAAGAAGCG
TTGAAAGAAGTGAGATCAAAGGGTTTGCAATGTGTTTGCCGGAGACCGATGATCGGCGGT
TGCCGTAGCTGTTTGCGCGGTGAAGTGGCTAGCCGTCTCCGGGATGCCGGCTATGATTGC
GTCATTTGCAAATCCAAGTGGAGAAGCAATCACGAGATTCCTGCAGGTGAGCATGAATAT
TTGGAAATCGTGGACAAATCTGGATCAAAGAAAGGTGAGATCCGTGTGGTGATTGAGCTA
TCTTTTAGG*CGGAGTTTGAGATGGCGAGAGGTAGTGAGGAGTACAAGCGACTTATTGGA
ATATTACCTGAAGTGTACGTCGGGAAA
CAGA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2ES92TF 753 0 0
G
GAACCCAAAACAACAAAAGAAGAATTAAAAGAAAGAAAAAAGACATTTTCATCTCTCTCT
TCTTGAAAGCAATGGATCGGCAAAACTCCGATGACATCATGAAGTTTCTTGACGGAATGG
CTAGCTCCGACGATGTTTTATTTGGTTTTCTCGACGAAGGAAACCATTCACCGGAGGATT
ACCATGATTCCGGTAGCTTCGCCGGCGGCGAAGAATCCGATGCTGACAACGATGCCGCCG
CCGGTTGCAATTCCGAAGAGAGCAAAACCTTTTGGCATGAACAAGAACAACTTCTCCAGG
CGACACTGTATAGAACAAGTTCAGTTGAGACAAAGATTCGACAAGCAACAAAAGAAGCGT
TGAAAGAAGTGAGATCAAAGGGTTTGCAATGTGTTTGCCGGAGACCGATGATCGGCGGTT
GCCGTAGCTGTTTGCGCGGTGAAGTGGCTAGCCGTCTCCGAGATGCCGGCTATGATTGCG
TCATTTGCAAATCCAAGTGGAGAAGCAATCACGAGATTCCTGCAGGTGAGCATGAATATT
TGGAAATCGTGGACAAATCTGGATCAAAGAAAGGCGAGATCCGTGTGGTGATTGAGCTAT
CTTTTAGGGCGGAGTTTGAGATGGCGAGAGGTAGTGAGGAGTACAAGCGACTTATTGGAA
TATTACCTGAAGTGTACGTCGAAAACA**GAGAGGCTAAAATCGCTGATAAAA*TATTGT
GCACGGCGGCTAAAA*GTGTATGAAAGACAAG

QA 2 753 2 753
DS 

RD RR2GV20TF 557 0 0
G
AGATTCGACAAGCAACAAAAGAAGCGTTGAAAGAAGTGAGATCAAAGGGTTTGCAATGTG
TTTGCCGGAGACCGATGATCGGCGGTTGCCGTAGCTGTTTGCGCGGTGAAGTGGCTAGCC
GTCTCCGAGATGCCGGCTATGATTGCGTCATTTGCAAATCCAAGTGGAGAAGCAATCACG
AGATTCCTGCAGGTGAGCATGAATATTTGGAAATCGTGGACAAATCTGGATCAAAAAAAG
GCGAGATCCGTGTGGTGATTGAGCTATCTTTTAGGGCGGAGTTTGAGATGGCGAGAGGTA
GTGAGGAGTACAAGCGACTTATTGGAATATTACCTGAAGTGTACGTCGGGAAAACAGAGA
GGCTAAAATCGCTGATAAAAATATTGTGCACGGCGGCTAAAAAGTGTATGAAAGACAAGA
AAATGCACATGGGTCCTTGGAGAAAACACAAGTACATGCAAGCCAAATGGCACGGTACCT
GCGAAAGAAAATCCGTGAACCTTTCTCCGGACACTGAGACGCAGAAAGAGGAGGAGGATT
AGAGTGTGATGGCGAA

QA 2 557 2 557
DS 

RD RR2C935TF 677 0 0
G
GAACAAGAACAACTTCTCCAGGCGACACTGTATAGAACAAGTTCAGTTGAGACAAAGATT
CGACAAGCAACAAAAGAAGCGTTGAAAGAAGTGAGATCAAAGGGTTTGCAATGTGTTTGC
CGGAGACCGATGATCGGCGGTTGCCGTAGCTGTTTGCGCGGTGAAGTGGCTAGCCGTCTC
CGAGATGCCGGCTATGATTGCGTCATTTGCAAATCCAAGTGGAGAAGCAATCACGAGATT
CCTGCAGGTGAGCATGAATATTTGGAAATCGTGGACAAATCTGGATCAAAGAAAGGCGAG
ATCCGTGTGGTGATTGAGCTATCTTTTAGGGCGGAGTTTGAGATGGCGAGAGGTAGTGAG
GAGTACAAGCGACTTATTGGAATATTACCTGAAGTGTACGTCGGGAAAACAGAGAGGCTA
AAATCGCTGATAAAAATATTGTGCACGGCGGCTAAAAAGTGTATGAAAGACAAGAAAATG
CACATGGGTCCTTGGAGAAAACACAAGTACATGCAAGCCAAATGGCACGGTACCTGCGAA
AGAAAATCCGTGAACCTTTCTCCGGACACTGAGACGCAGAAGGAGGAGGAGGATAAGAGT
ATGATGGCGAAGCATAGGGTTTCTATGTTGAATTATGGGTATTTTTGGTGATTTATCCGC
CGGAATGGGCCGTCCA

QA 2 677 2 677
DS 

RD RR2C935JQ 736 0 0
AAGAACAACTTCTCCAGGCGACACTGTATAGAACAAGTTCAGTTGAGACAAAGATTCGAC
AAGCAACAAAAGAAGCGTTGAAAGAAGTGAGATCAAAGGGTTTGCAATGTGTTTGCCGGA
GACCGATGATCGGCGGTTGCCGTAGCTGTTTGCGCGGTGAAGTGGCTAGCCGTCTCCGAG
ATGCCGGCTATGATTGCGTCATTTGCAAATCCAAGTGGAGAAGCAATCACGAGATTCCTG
CAGGTGAGCATGAATATTTGGAAATCGTGGACAAATCTGGATCAAAGAAAGGCGAGATCC
GTGTGGTGATTGAGCTATCTTTTAGGGCGGAGTTTGAGATGGCGAGAGGTAGTGAGGAGT
ACAAGCGACTTATTGGAATATTACCTGAAGTGTACGTCGGGAAAACAGAGAGGCTAAAAT
CGCTGATAAAAATATTGTGCACGGCGGCTAAAAAGTGTATGAAAGACAAGAAAATGCACA
TGGGTCCTTGGAGAAAACACAAGTACATGCAAGCCAAATGGCACGGTACCTGCGAAAGAA
AATCCGTGAACCTTTCTCCGGACACTGAGACGCAGAAGGAGGAGGAGGATAAGAGTATGA
TGGCGAAGCATAGGGTTTCTATGTTGAATTATGG*TATTTTTGGTGATTTATCCGCCGGA
ATGGGCCGTCCAGCCGCCGTCGCGGTCGTGTGATTATATATGTATACATAGACGTACGAA
TACGATAAGTAAATTA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2ES92JQ 818 0 0
AAAAAGCGTGAA
AAGTGAGATCAAAGGGTT*GCAATGTGTT*GCCGGAGACCGATGATCGGCGGTTGCCGTA
GCTGTTTGCGCGGTGAAGTGGCTAGCCGTCTCCGAGATGCCGGCTATGATTGCGTCATTT
GCAAATCCAAGTGGAGAAGCAATCACGAGATTCCTGCAGGTGAGCATGAATATTTGGAAA
TCGTGGACAAATCTGGATCAAAGAAAGGCGAGATCCGTGTGGTGATTGAGCTATCTTTTA
GGGCGGAGTTTGAGATGGCGAGAGGTAGTGAGGAGTACAAGCGACTTATTGGAATATTAC
CTGAAGTGTACGTCGA*AAAACAGAGAGGCTAAAATCGCTGATAAAAATATTGTGCACGG
CGGCTAAAAAGTGTATGAAAGACAAGAAAATGCACATGGGTCCTTGGAGAAAACACAAGT
ACATGCAAGCCAAATGGCACGGTACCTGCGAAAGAAAATCCGTGAACCTTTCTCCGGACA
CTGAGACGCAGAAGGAGGAGGAGGATAAGAGTATGATGGCGAAGCATAGGGTTTCTATGT
TGAATTATGG*TATTTTTGGTGATTTATCCGCCGGAATGGGCCGTCCAGCCGCCGTCGCG
GTCGTGTGATTATATATGTATACATAGACGTACGAATACGATAAGTAAATTAGGTGGAGA
TTAAGTGAATGAGTTTCACATTGAGAGTTTGCGTGGAATTGTCTCAGCGATGATTTTGTT
TGCCCAAACAGGGCAACTCCTTGGACCCATTGTAGTATACACAACGTTGTTCTAATTGAG
ATAAATTTAAATTGGTCTCTTT
AACC

QA 13 814 13 814
DS 

RD RR2BG64JQ 645 0 0
AGGTGAGCATGAATATTTGGAAATCGTGGACAAA*****AAAAAAAAAAGGCTAGATCCG
TGTGGTGATTGAGCTATCTTTTAGGGCGGAGTTTGAGATGACGATAGGTAGTGAGGAGTA
CAAGCGACTTATTGGAATATTACCTGAAGTGTACGTCGGGAAAACAGAGAGGCTAAAATC
GCTGATAAAAATATTGTGCACGGCGGCTAAAAAGTGTATGAAAGACAAGAAAATGCACAT
GGGTCCTTGGAGAAAACACAAGTACATGCAAGCCAAATGGCACGGTACCTGCGAAAGAAA
ATCCGTGAACCTTTCTCCGGACACTGAGACGCAGAAGGAGGAGGAGGATAAGAGTGTGAT
GGCGAAGCATAGGGTTTCTATGTTGAATTATGG*TATTTTTGGTGATTTATCCGCCGGAA
TGGGCCGTCCAGCCGCCGTCGCGGTCGTGTGATTATATATGTATACATAGACGTACGAAT
ACGATAAGTAG**TAGGTGGAGATTAAGTGAATGAGTTTCACATTGAGAGTTTGCGTGGA
ATTGTCTCAGCGATGATTTTGTTTGCCCAAACAGGGCAACTCCTTGGACCCATTGTAGTA
TACACAACGTTGTTCTAATTGAGATAAATTTAAATTGGTCTCTTT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2CK38JQ 799 0 0
AAGTGGAGAAGCA*TCACGAGATTCCTGCAGGTGAGCATGAATATTTGGAAATCGTGGAC
AAATCTGGATCAAAGAAAGGTGAGATCCGTGTGGTGATTGAGCTATCTTTTAGGGCGGAG
TTTGAGATGGCGAGAGGTAGTGAGGAGTACAAGCGACTTATTGGAATATTACCTGAAGTG
TACGTCGGGAAAACAGAGAGGCTAAAATCGCTGATAAAAATATTGTGCACGGCGGCTAAA
AAGTGTATGAAAGACAAGAAAATGCACATGGGTCCTTGGAGAAAACATAAGTACATGCAA
GCCAAATGGCACGGTACCTGCGAAAGAAAATCCGTGAACCTTTCTCCGGACACTGAGACG
CAGAAGGAGGAGGAGGATAAGAGTATGATGGCGAAGCATAGGGTTTCTATGTTGAATTAT
GG*TATTTTTGGTGATTTATCCGCCGGAATGGGCCGTCCAGCCGCCGTCGCGGTCGTGTG
ATTATATATGTATACATAGACGTACGAATACGATAAGTAAATTAGGTGGAGATTAAGTGA
ATGAGTTTCACA**GAG***TTGCGTGGAATTGTCTCAGCGATGATTTTGTTTGCCCAAA
CAGGGCAACTCCTTGGACCCATTGTAGTATACACAACGTTGTTCTAATTGAGATAAATTT
AAATTGGTCTCTTTAACTCCTTTTGCTTTAGTATCTTAAATGGAGTTCTAAACAACATAA
GACTACTATATTAATAGGCCTAGTATTAATATTAATTTTTGATGTTTGACAGGTTAATCA
TCATAATTTTTTGTTACAG

QA 1 799 1 799
DS 



CO CL415Contig2 644 2 3 U
GGAGTTAAAGAGACCAATTTAAATTTATCTCAATTAAAACAACGTTGTGTATACTACAAT
GGGTCCAAGGAGTTGCCCTGTTTGGGCAAACAAAATCATCGCTGAAACAATTCCACGCAA
ACTCTCAATGTGAAACTCATTCACTTAATCTCCACCTAATTTACTTATCGTATTCGTACG
TCTATGTATACATATATAATCACACGACCGCGACGGCGGCTGGACGGCCCATTCCGGCGG
ATAAATCACCAAAAATACCATAATTCAACATAGAAACCCTATGCTTCGCCATCACACTCT
AATCCTCCTCCTCCTTCTGCGTCTCAGTGTCCGGAGAAAGGTTCACGGATTTTCTTTCGC
AGGTACCGTGCCATTTGGCTGGCATGTACTTGTGTTTTCTCCAAGGACCCATGTGCATTT
TCTTGTCTTTCATACACTTTTTAGCCGCCGTGCACAATATTTTTATCAGCGATTTTAGCC
TCTCTGTTTTCCCGACGTACACTTCAGGTAATATTCCAATAAGTCGCTTGTACTCCTCAC
TACCTCTCGCCATCTCAAACTCCGCCCTAAAAGATAGCTCAATCACCACACGGATCTCGC
CTTTTTTTGATCCAGATTTGTCCACGATTTCCAAATATTCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV20JQB U 1
AF RR2GL38JQ U 10
BS 1 380 RR2GV20JQB
BS 381 381 RR2GL38JQ
BS 382 644 RR2GV20JQB

RD RR2GV20JQB 644 0 0
GGAGTTAAAGAGACCAATTTAAATTTATCTCAATTAAAACAACGTTGTGTATACTACAAT
GGGTCCAAGGAGTTGCCCTGTTTGGGCAAACAAAATCATCGCTGAAACAATTCCACGCAA
ACTCTCAATGTGAAACTCATTCACTTAATCTCCACCTAATTTACTTATCGTATTCGTACG
TCTATGTATACATATATAATCACACGACCGCGACGGCGGCTGGACGGCCCATTCCGGCGG
ATAAATCACCAAAAATACCATAATTCAACATAGAAACCCTATGCTTCGCCATCACACTCT
AATCCTCCTCCTCCTTCTGCGTCTCAGTGTCCGGAGAAAGGTTCACGGATTTTCTTTCGC
AGGTACCGTGCCATTTGGCTTGCATGTACTTGTGTTTTCTCCAAGGACCCATGTGCATTT
TCTTGTCTTTCATACACTTTTTAGCCGCCGTGCACAATATTTTTATCAGCGATTTTAGCC
TCTCTGTTTTCCCGACGTACACTTCAGGTAATATTCCAATAAGTCGCTTGTACTCCTCAC
TACCTCTCGCCATCTCAAACTCCGCCCTAAAAGATAGCTCAATCACCACACGGATCTCGC
CTTTTTTTGATCCAGATTTGTCCACGATTTCCAAATATTCATGC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2GL38JQ 615 0 0
GG
GACCAATTTAAATTTATCTCAATTAGAACAACGTTGTGTATACTACAATGGGTCCAAGGA
GTTGCCCTGTTTGGGCAAACAAAATCATCGCTGAAACAATTCCACGCAAACTCTCAATGT
GAAACTCATTCACTTAATCTCCACCTAATTTACTTATCGTATTCGTACGTCTATGTATAC
ATATATAATCACACGACCGCGACGGCGGCTGGACGGCCCATTCCGGCGGATAAATCACCA
AAAATACCATAATTCAACATAGAAACCCTATGCTTCGCCATCACACTCTTATCCTCCTCC
TCCTTCTGCGTCTCAGTGTCCGGAGAAAGGTTCACGGATTTTCTTTCGCAGGTACCGTGC
CATTTGGCTGGCATGTACTTGTGTTTTCTCCAAGGACCCATGTGCATTTTCTTGTCTTTC
ATACACTTTTTAGCCGCCGTGCACAATATTTTTATCAGCGATTTTAGCCTCTCTGTTTTC
CCGACGTACACTTCAGGTAATATTCCAATAAGTCGCTTGTACTCCTCACTACCTCTCGCC
ATCTCAAACTCCGCCCTAAAAGATAGCTCAATCACCACACGGATCTCGCCTTTTTTTGAT
CCAGATTTGTCCA

QA 3 615 3 615
DS 



AS 2 12

CO CL416Contig1 643 2 1 U
GCGACCGCTATGTTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCAGTTCCATTCCTCTTCTTTTTCCCTC
AAACCGACACAGTTTTATGGCAAGACACAACAGTAGCTCCACCACAAAATCTTCATCACC
CCGAGTTACCAATCTACACCTTCCCGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACG
CCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTTGAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAGTTCGCAGTT
CTGAACACTGGTATCTACGAGTGCAGATCGTGTGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGT
GATCCGTCGTACCCGATCCCTCCTGGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGA
TGTCCAACTTGTGGAGCAGCTCAGAGTTTCTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCTGGT
TTTGCTCAGAATCAACAATATGGGCATGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACT
GCTTTGATCTTCGGGAGTCTCTTGCTCTTTTTCTTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATC
CAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTTTACTATTATTATGCTAATCATGTTGTTATCCATCAT
ACACCACTAGTCTCCTTTTTACTCTGATGAGATGTTTGCTATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F944JQ C 1
AF RR2F944TF U 1
BS 1 643 RR2F944TF

RD RR2F944JQ 643 0 0
GCGACCGCTATGTTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCAGTTCCATTCCTCTTCTTTTTCCCTC
AAACCGACACAGTTTTATGGCAAGACACAACAGTAGCTCCACCACAAAATCTTCATCACC
CCGAGTTACCAATCTACACCTTCCCGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACG
CCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTTGAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAGTTCGCAGTT
CTGAACACTGGTATCTACGAGTGCAGATCGTGTGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGT
GATCCGTCGTACCCGATCCCTCCTGGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGA
TGTCCAACTTGTGGAGCAGCTCAGAGTTTCTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCTGGT
TTTGCTCAGAATCAACAATATGGGCATGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACT
GCTTTGATCTTCGGGAGTCTCTTGCTCTTTTTCTTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATC
CAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTTTACTATTATTATGCTAATCATGTTGTTATCCATCAT
ACACCACTAGTCTCCTTTTTACTCTGATGAGATGTTTGCTATT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2F944TF 643 0 0
GCGACCGCTATGTTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCAGTTCCATTCCTCTTCTTTTTCCCTC
AAACCGACACAGTTTTATGGCAAGACACAACAGTAGCTCCACCACAAAATCTTCATCACC
CCGAGTTACCAATCTACACCTTCCCGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACG
CCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTTGAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAGTTCGCAGTT
CTGAACACTGGTATCTACGAGTGCAGATCGTGTGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGT
GATCCGTCGTACCCGATCCCTCCTGGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGA
TGTCCAACTTGTGGAGCAGCTCAGAGTTTCTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCTGGT
TTTGCTCAGAATCAACAATATGGGCATGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACT
GCTTTGATCTTCGGGAGTCTCTTGCTCTTTTTCTTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATC
CAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTTTACTATTATTATGCTAATCATGTTGTTATCCATCAT
ACACCACTAGTCTCCTTTTTACTCTGATGAGATGTTTGCTATT

QA 1 643 1 643
DS 



CO CL416Contig2 796 10 9 U
GGATGGAGAGAATTTTGGTCCACGTGGTGCCACGATACTTTTCAAAAATCTTATCCAAGC
CTTGGTACCTCTTCGTCCTCCCCTTCTCCAATGGATCCCTTTCTTCTCTCCAAACAATGA
ACAAACCAAAAAA*TTTAAACCAATAAAAACATGGCGACCGCTATGTTCTCCTTCTCTCC
TATCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAGAC
ACAACAGCAGCTTCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATCTACACCTTCCCG
CTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACGACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTTGA
GACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAGTTCGCAGTTCTGAACACTGGAATCTACGAGTGCAG
ATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGATCCCTCCTGG
GTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGTCCAACTTGTGGAGCAGCTCAGAG
TTTCTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACAATATGGGCT
TGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTCCT
CTTTTTCTTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTGTTTTA
CTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCCTTAGTCTCCTTTTTATAAAC
GGAAGCTACATTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 35 35 20 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 20 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 15 55 15 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR2CA45JQ C 111
AF RR2A181JQ C 294
AF RR2FY15TF U 1
AF RR2FY15JQ C 339
AF RR2A181TF U 117
AF RR2DX85TF U 114
AF RR2F733TF U 110
AF RR2CA45TF U 111
AF RR2BZ89JQ C 117
AF RR2BZ89TF U 117
BS 1 665 RR2FY15TF
BS 666 666 RR2F733TF
BS 667 718 RR2FY15TF
BS 719 719 RR2F733TF
BS 720 761 RR2FY15TF
BS 762 784 RR2F733TF
BS 785 785 RR2BZ89TF
BS 786 791 RR2F733TF
BS 792 796 RR2CA45TF

RD RR2CA45JQ 528 0 0
G
AAACAATGAACAAACCAAAAAA*TTTAAACCAATAAAAACATGGCGACCGCTATGTTCTC
CTTCTCTCCTATCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTA
TGGCAAGACACAACAGCAGCTTCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATCTAC
ACCTTCCCGCTTTTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACGACGCCTGAACTCGAAGAAGA
TGCGGTTGAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAGTTCGCAGTTCTGAACACTGGAATCTA
CGAGTGCAGATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGAT
CCCTCCTGGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGTCCAACTTGTGGAGC
AGCTCAGAGTTTCTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACA
ATATGGGCTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTT

QA 2 528 2 528
DS 

RD RR2A181JQ 397 0 0
CTTCCCGCTTTTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACGACGCCTGAACTCGAAGAAGATT
CGGTTGAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAGTTCGCAGTTCTGAACACTGGAATTTACG
AGTGCAGATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGATCC
CTCCTGGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGTCCAACTTGTGGAGCAG
CTCAGAGTTTCTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACAAT
ATGGGCTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGTTCTTCGGGAGTC
TCCTCCTCTTTTTCTTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTT

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR2FY15TF 761 0 0
GGATGGAGAGAATTTTGGTCCACGTGGTGCCACGATACTTTTCAAAAATCTTATCCAAGC
CTTGGTACCTCTTCGTCCTCCCCTTCTCCAATGGATCCCTTTCTTCTCTCCAAACAATGA
ACAAACCAAAAAA*TTTAAACCAATAAAAACATGGCGACCGCTATGTTCTCCTTCTCTCC
TATCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAGAC
ACAACAGCAGCTTCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATCTACACCTTCCCG
CTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACGACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTTGA
GACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAGTTCGCAGTTCTGAACACTGGAATCTACGAGTGCAG
ATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGATCCCTCCTGG
GTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGTCCAACTTGTGGAGCAGCTCAGAG
TTTCTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACAATATGGGCT
TGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTCCT
CTTTT*CTTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTGTTT*A
CTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCCT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2FY15JQ 429 0 0
AACTCGAAGAAGATGCGGTTGAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAGTTCGCAGTTCTGA
CCACTGGAATCTACGAGTGCAGATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATC
CGTCGTACCCGATCCCTCCTGGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGTC
CAACTTGTGGAGCAGCTCAGAGTTTTTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCTGGTTTTG
CTCAGAATCAACAATATGGGCTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTT
TGATCTTCGGGAGTCTCCTCCTCTTTTTCTTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAAT
AGAGCGCGTTTCATGTGTTTTACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACAC
CCT
TAGTCC

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR2A181TF 636 0 0
AG
GAACAAACCAAAAAAATTTAAACCAATAAAAACATGGCGACCGCTATGTTCTCCTTCTCT
CCTATCGCTCAGTTCCATTCTTCTT***TTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAG
ACACAACAGCAGCTTCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATCTACACCTTCC
CGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACGACGCCTGAACTCGAAGAAGATTCGGTT
GAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAGTTCGCAGTTCTGAACACTGGAATCTACGAGTGC
AGATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGATCCCTCCT
GGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGTCCAACTTGTGGAGCAGCTCAG
AGTTTCTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACAATATGGG
CTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTC
CTCTTTTTCTTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTGTTT
TACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTA
CC

QA 3 634 3 634
DS 

RD RR2DX85TF 659 0 0
GG
AATGAACAAACCAAAATA**TTAAACCAATAAAAACATGGCGACCGCTATGTTCTCCTTC
TCTCCTCTCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAAACCGACACAGTTTTATGGC
AAGACACAACAGCAGCTCCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATCTACACCT
TCCCGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCG
GTTGAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAGTTCGCAGTTCTGAACACTGGTATCTACGAG
TGCAGATCGTGTGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGATCCCT
CCTGGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGTCCAACTTGTGGAGCAGCT
CAGAGTTTCTTCGAGAGTAAAATGATTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACAATAT
GGGCTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTC
TTGCTCTTTTTCTTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGCTTCATGTT
TTTTACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCACTAGTCTCCTTT

QA 3 659 3 659
DS 

RD RR2F733TF 683 0 0
GG
AAACAACGAACAAACCAAAAAA*TTTAAACCAATAAAAACATGGCGACCGCTATGTTCTC
CTTCTCTCCTATCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTA
TGGCAAGACACAACAGCAGCTTCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATCTAC
ACCTTCCCGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACGACGCCTGAACTCGAAGAAGA
TGCGGTTGAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAGTTCGCAGTTCTGAACACTGGAATCTA
CGAGTGCAGATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGAT
CCCTCCTGGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGTCCAACTTGTGGAGC
AGCTCAGAGTTTCTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCTGGCTTTGCTCAGAATCAACA
ATATGGGCTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAG
CCTCCTCCTCTTTTTCTTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCA
TGTGTTTTACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCCTTAGTCTCCTT
TTTATAAACGGAATCTACAT
T

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR2CA45TF 686 0 0
G
AAACAATGAACAAACCAAAAAA*TTTAAACCAATAAAAACATGGCGACCGCTATGTTCTC
CTTCTCTCCTATCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTA
TGGCAAGACACAACAGCAGCTTCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATCTAC
ACCTTCCCGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACGACGCCTGAACTCGAAGAAGA
TGCGGTTGAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAGTTCGCAGTTCTGAACACTGGAATCTA
CGAGTGCAGATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGAT
CCCTCCTGGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGTCCAACTTGTGGAGC
AGCTCAGAGTTTCTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACA
ATATGGGCTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAG
TCTCCTCCTCTTTTTCTTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCA
TGTGTTTTACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCCTTAGTCTCCTT
TTTATAAACGGAATCTACATTATAC

QA 2 686 2 686
DS 

RD RR2BZ89JQ 675 0 0
GG
GAACAAACCAAAATA**TTAAACCAATAAAAACATGGCGACCGCTATGTTCTCCTTCTCT
CCTCTCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAAACCGACACAGTTTTATGGCAAG
ACACAACCGCAGCTCCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATCTACACCTTCC
CGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTT
GAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAGTTCGCAGTTCTGAACACTGGTATCTACGAGTGC
AGATCGTGTGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGATCCCTCCT
GGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGTCCAACTTGTGGAGCAGCTCAG
AGTTTCTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACAATATGGG
CTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCTTG
CTCTTTTTCTTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTT
TACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCACTAGTCTCCTTTTTATAA
ACGGAAGCTACAT

QA 3 675 3 675
DS 

RD RR2BZ89TF 675 0 0
GG
GAACAAACCAAAATA**TTAAACCAATAAAAACATGGCGACCGCTATGTTCTCCTTCTCT
CCTCTCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAAACCGACACAGTTTTATGGCAAG
ACACAACCGCAGCTCCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATCTACACCTTCC
CGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTT
GAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAGTTCGCAGTTCTGAACACTGGTATCTACGAGTGC
AGATCGTGTGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGATCCCTCCT
GGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGTCCAACTTGTGGAGCAGCTCAG
AGTTTCTTCGAGAGTAAAATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACAATATGGG
CTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCTTG
CTCTTTTTCTTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTT
TACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCACTAGTCTCCTTTTTATAA
ACGGAAGCTACAT

QA 3 675 3 675
DS 



AS 1 12

CO CL417Contig1 813 12 16 U
GGATACAAGGAGCATTCTTCCTTCCTGGAATCGGCTACTGTTTCGATTGAGAAGAAGCAA
TCACGAAGATGGCGAGATCAACCTCCATTCTCTTCCTCACACTATTCATTTTCGCTGCTC
TGGCTTCAGTCCAGGCAAAGGAAGATCCGAAGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATG
TTGAGATTGATGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTTGTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTC
CCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCG
GGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAATTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCC
AGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGGATGGGTGGAGAATCAATCTATGGTCAGAAGT
TTGCTGATGAGAACTTTAAGCTCAAGCATACCGGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACT
CTGGAGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTTTCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAG
ATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTTCAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTG
AAGCCGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCAAAGTCGTTATTGCAGACAGTGGAG
AGCTTCCTCTCTAAACCCTAAGCACTTCTTCTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTT*A
AGTTGTTCTGTATGTTAAACACTCTCGAATGCTATACATCCGAACAAAAACACTTCAGTT
TCAGAGCCTTTTTTAATAAATCATTTTTTAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ63JQ C 507
AF RR2EC87TF U 1
AF RR2HB92TF U 38
AF RR2A667TF U 33
AF RR2B892TF U 32
AF RR2FL19TF U 32
AF RR2FQ63TF U 33
AF RR2C412JQ C 73
AF RR2EC87JQ C 85
AF RR2FL19JQ C 118
AF RR2HB92JQ C 88
AF RR2B892JQ C 91
BS 1 32 RR2EC87TF
BS 33 33 RR2B892TF
BS 34 222 RR2EC87TF
BS 223 223 RR2B892TF
BS 224 448 RR2EC87TF
BS 449 449 RR2B892TF
BS 450 674 RR2EC87TF
BS 675 718 RR2B892TF
BS 719 719 RR2FL19TF
BS 720 769 RR2B892TF
BS 770 770 RR2C412JQ
BS 771 795 RR2B892TF
BS 796 798 RR2C412JQ
BS 799 806 RR2FL19TF
BS 807 807 RR2EC87JQ
BS 808 813 RR2B892JQ

RD RR2FQ63JQ 148 0 0
TTTTTCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAA
GTAGTTCAAGGAATGGATGTTGTTTACAAGATTGAAGCCGAGGGGAAGCAAAGTGGAACT
CCTAAGAGCAAAGTCGTTATTGCAGACA

QA 1 148 1 148
DS 

RD RR2EC87TF 680 0 0
GGATACAAGGAGCATTCTTCCTTCCTGGAATCTGCTACTGTTTCGATTGAGAAGAAGCAA
TCACGAAGATGGCGAGATCAACCTCCATTCTCTTCCTCACACTATTCATTTTCGCTGCTC
TGGCTTCAGTCCAGGCAAAGGAAGATCCGAAGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATG
TTGAGATTGATGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTTGTTATTGGCCCATTCGGCAAGACAGTTC
CCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCG
GGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAATTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCC
AGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGGATGGGTGGAGAATCAATCTATGGTCAGAAGT
TTGCTGATGAGAACTTTAAGCTCAAGCACACCGGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACT
CTGGAGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTTTCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAG
ATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTTCAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTG
AAGCCGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCAAAGTCGTTATTGCAGACAGTGGAG
AGCTTCCTCTCTAA
CCCTAA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2HB92TF 661 0 0
GG
GTTTCGATTGAGAAGAAGCAATCACGAAGATGGCGAGATCAACCTCCATTCTCTTCCTCA
CACTATTCATTTTCGCTGCTCTGGCTTCAGTCCAGGCAAAGGAAGATCCGAAGGAGATCA
CTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGATGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTTGTTATTG
GCCTATTCGGCAAGACAGTTCCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGCACTGGGG
AGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAATTCCATAGAA
TCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGGATGGGTGGAG
AATCAATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTTAAGCTCAAGCATACCGGACCAG
GTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGAGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTTTCATCACGA
CGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTTCAAGGAA
TGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCCGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCAAAG
TCGTTATTGCAGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAACCCTAAGCACTTCTTCTTCATGA

QA 3 661 3 661
DS 

RD RR2A667TF 733 0 0
GGCTACTGTTTCGATTGAGAAGAAGCAATCACGAAGATGGCGTGATCAACCTCCATTCTC
TTCCTCACACTACTCATTTTCGCTGCTCTGGCTTCAGTCCAGGCAAAGGAAGATCCGAAG
GAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGATGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTT
GTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGC
ACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAATTC
CATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGGATG
GGTGGAGAATCAATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGGGAACTTTAAGCTCAAGCATACC
GGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGAGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTTTC
ATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTT
CAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCCGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAG
AGCAA*GTCGTTATTGCAGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAACCCTAAGCACTTCTTCT
TCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTT*AAGTTGTTCTGTATGTTAAACACTCTCGAATGC
TATACATCCGAAC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2B892TF 780 0 0
G
GGCTACTGTTTCGATTGAGAAGAAGCAATCACGAAGATGGCGAGATCAACCTCCATTCTC
TTCCTCACACTATTCATTTTCGCTGCTCTGGCTTCAGTCCAGGCAAAGGAAGATCCGAAG
GAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGATGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTT
GTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGC
ACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAATTC
CATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGGATG
GGTGGAGAATCAATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTTAAGCTCAAGCATACC
GGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGAGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTTTC
ATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTT
CAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCCGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAG
AGCAAAGTCGTTATTGCAGACATTGGAGAGCTTCCTCTCTAAACCCTAAGCACTTCTTCT
TCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTTTAAGTTGTTCTGTATGTTAAACACTCTCGAATGC
TATACATCCGAACAAAA*CACTTCAGTTTCAGAGCCTTTTTTA
TAATCATTTTCTAAAT

QA 2 764 2 764
DS 

RD RR2FL19TF 787 0 0
G
GGCTACTGTTTCGATTGAGAAGAAGCAATCACGAAGATGGCGAGATCAACCTCCATTCTC
TTCCTCACACTATTCATTTTCGCTGCTCTGGCTTCAGTCCAGGCAAAGGAAGATCCGAAG
GAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGATGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTT
GTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGC
ACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAATTC
CATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGGATG
AGTGGAGAATCAATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTTAAGCTCAAGCATACC
GGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGAGAGGACACAAACGGTTCGCAGCTTTTC
ATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTT
CAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCCGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAG
AGCAAAGTCGTTATTGCAGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAACCCTAAGCACTTCTTCT
TCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTT*AAGTTGTTCTGTATGTTAAACACTCTCGAATGC
TATACATCCGAACAAAA*CACTTCAGTTTCAGAGCCTTTTTAA**TAATCATTT
CTAATAAAAAAA

QA 2 775 2 775
DS 

RD RR2FQ63TF 763 0 0
GGCTACTGTTTCGATTGAGAAGAAGCGATCACGAAGATGGCGAGATCAACCTCCATTCTC
TTCCTCACACTATTCATTTTCGCTGCTCTGGCTTCAGTCCAGGCAAAGTAAGATCCGAAG
GAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGATGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTT
GTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGC
ACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAATTC
CATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGGATG
GGTGGAGAATCAATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTTAAGCTCAAGCATACC
GGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGAGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTTTC
ATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTAGTT
CAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCCGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAG
AGCAAAGTCGTTATTGCAGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAA*CCCTAAGCACTTCTTCT
TCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTT*AAGTTGTTCTGTATGTTAAACACTCTCGAATGC
TATACATCCGAACAAAA*CACTTCAGTTTCAGAGCCTTTTT
AA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2C412JQ 734 0 0
CGAGATCAACCTCCATTCTCTTCCTCACACTATTCATTTTCGCTGCTCTGGCTTCAGTCC
AGGCAAAGGAAGATCCGAAGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGATG
GCAAAGAAGCTGGTCGAGTTGTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCCAAAACTGCAG
AAAACTTCAGAGCTCTTTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTAC
ACTACAAGGGGAGCAAATTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACT
TCACCCACGGAAACGGGATGGGTGGAGAATCAATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGA
ACTTTAAGCTCAAGCATACCGGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGAGAGGACA
CAAACGGTTCGCAGTTTTTCATCACGACGGTGACAACAAGCCGGTTAGATGGAAGGCATG
TGGTGTTTGGGAAAGTGGTTCAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCCGAGGGGA
AGCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCAAAGTCGTTATTGCAGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCT
AAACCCTAAGCACTTTTTTTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTT*AAGTTGTTCTGTA
TGTTAAACACTCTCGAATGCTATACATCCGAACAAAAACACTTCAGTTTCAGAGCCTTTT
TTAATAAATCATTT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2EC87JQ 725 0 0
CCATTCTCTTCCTCACACTATTCATTTTCGCTGCTCTGGCTTCAGTCCAGGCAAAGGAAG
ATCCGAAGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGATGGCAAAGAAGCTG
GTCGAGTTGTTATTGGCCCATTCGGCAAGACAGTTCCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAG
CTCTTTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGA
GCAAATTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAA
ACGGGATGGGTGGAGAATCAATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTTAAGCTCA
AGCACACCGGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGAGAGGACACAAACGGTTCGC
AGTTTTTCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGA
AAGTGGTTCAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCCGAGGGGAAGCAAAGTGGAA
CTCCTAAGAGCAAAGTCGTTATTGCAGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAACCCTAAGCA
CTTCTTCTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTT*AAGTTGTTCTGTATGTTAAACACTC
TCGAATGCTATACATCCGAACAAAAACACTTCAGTTTCAGAGCCTTTTTTAATAAATCAT
TTT
CT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2FL19JQ 692 0 0
CTCTGGCTTCAGTCCAGGCAAAGGAAGATCCGAAGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCG
ATGTTGAGATTGATGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTTGTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAG
TTCCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGA
GCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAATTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGA
TCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGGATGAGTGGAGAATCAATCTATGGTCAGA
AGTTTGCTGATGAGAACTTTAAGCTCAAGCATACCGGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAA
ACTCTGGAGAGGACACAAACGGTTCGCAGCTTTTCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGT
TAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTTCAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGA
TTGAAGCCGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCAAAGTCGTTATTGCAGACAGTG
GAGAGCTTCCTCTCTAAACCCTAAGCACTTCTTCTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTT
T*AAGTTGTTCTGTATGTTAAACACTCTCGAATGCTATACATCCGAACAAAAACACTTCA
GTTTCAGAGCCTTTTTTAATAAATCATTTT
CT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2HB92JQ 722 0 0
TTCTCTTCCTCACACTATTCATTTTCGCTGCTCTGGCTTCAGTCCAGGCAAAGGAAGATC
CGAAGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGATGGCAAAGAAGCTGGTC
GAGTTGTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTC
TTTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCA
AATTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACG
GGATGGGTGGAGAATCAATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTTAAGCTCAAGC
ATACCGGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGAGAGGACACAAACGGTTCGCAGT
TTTTCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAG
TGGTTCAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCCGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTC
CTAAGAGCAAAGTCGTTATTGCAGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAACCCTAAGCACTT
TTTCTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTT*AAGTTGTTCTGTATGTTAAACACTCTCG
AATGCTATACATCCGAACAAAAACACTTCAGTTTCAGAGCCTTTTTTAATAAATCATTTT
CT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2B892JQ 723 0 0
TCTTCCTCACACTATTCATTTTCGCTGCTCTGGCTTCAGTCCAGGCAAAGGAAGATCCGA
AGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGATGGCAAAGAAGCTGGTCGAG
TTGTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTT
GCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAAT
TCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGGA
TGGGTGGAGAATCAATTTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTTAAGCTCAAGCATA
CCGGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTTTGGAGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTT
TCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGG
TTCAAGGAATGGATGTTGTTTACAAGATTGAAGCCGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTA
AGAGCAAAGTCGTTATTGCAGACATTGGAGAGCTTCCTCTTTAAACCCTAAGCACTTTTT
TTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTTTAAGTTGTTCTGTATGTTAAACACTCTCGAAT
GCTATACATCCGAACAAAAACACTTCAGTTTCAGAGCCTTTTTTAATAAATCATTTTTTA
AAT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 3 10

CO CL418Contig1 1028 4 8 U
GGAGTAATCCCATCGAGCACGCTACTCCATACGCTATCTCCATCGTCTCCTCCCATTCAC
CGCCTCTATCTCCATCACTCTCAGATTCTCCCTTCTTCTCCTCTGTCGCTCAAGCTCCAT
CCCAAAACGATATCTTTACAGATACATGGCAGGATTTTGGCTTTTCGATCTGCAGAACTT
GCTGCTAGAGGCTTACCGCTTCTGAAGAAGCTACCGAGCAAAGGATCTACCTTTCTGCTG
GGTCAGAGCTTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACAGCTGGCAGCAGCGTCAGAAACCGTG
AAGCCTGAACCTATTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTGAACTAGGGATTCAGCTTTCTTAC
TTGCTGTTGCTACTTGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATGTCATCCGCCAAGTACTT
GTCCGCAGAGAACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAGCGGGGAT
GCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTCGGTGCAGTGATGCTGAGACGCAAATTTTATCCA
GCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGG*ACGGTGACGATCAAGATCT
TGCTCAGGTCTACAACGCTCTCGGAGTGAGTTACGTCCGAGAGGACAAACTGGACAAAGG
AATCGCTCAGTTTGAGATGG*CGGTGAAGATTCAGCCTGGTT*ATGTAACGGCTTGGAAC
AACCTTGGAGATGCTTACGAGAAGAAGAAGGAGCTGCCTTTGGCGTTGAAAGCGTTTGAA
GAGGTTTTGTTGTTTGATCCGAACAACAAGGTGGCTCGGCCTCGAAGAGATGCGTTGAAG
GATCGCGTTAAGCTCTATAAAGACGTTGTGGCGGTTAAGTCCAAGAAACGGTGACGAAGA
AACCAATAAACGGTGATGTTATTTTGTAAGGACATTTTGTGTTACTATTATGAATATGAA
AACTTGTTTCCTGCTTTTGTTTACTCTTAAACAATAAAATCACTCATCTTATTATTCGGA
AATCGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2AN29TF U 1
AF RR2B044TF U -12
AF RR2B044JQ C 237
AF RR2AN29JQ C 138
BS 1 19 RR2AN29TF
BS 20 20 RR2B044TF
BS 21 133 RR2AN29TF
BS 134 134 RR2B044TF
BS 135 750 RR2AN29TF
BS 751 751 RR2AN29JQ
BS 752 770 RR2AN29TF
BS 771 1028 RR2AN29JQ

RD RR2AN29TF 778 0 0
GGAGTAATCCCATCGAGCATGCTACTCCATACGCTATCTCCATCGTCTCCTCCCATTCAC
CGCCTCTATCTCCATCACTCTCAGATTCTCCCTTCTTCTCCTCTGTCGCTCAAGCTCCAT
CCCAAAACGATATTTTTACAGATACATGGCAGGATTTTGGCTTTTCGATCTGCAGAACTT
GCTGCTAGAGGCTTACCGCTTCTGAAGAAGCTACCGAGCAAAGGATCTACCTTTCTGCTG
GGTCAGAGCTTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACAGCTGGCAGCAGCGTCAGAAACCGTG
AAGCCTGAACCTATTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTGAACTAGGGATTCAGCTTTCTTAC
TTGCTGTTGCTACTTGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATGTCATCCGCCAAGTACTT
GTCCGCAGAGAACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAGCGGGGAT
GCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTCGGTGCAGTGATGCTGAGACGCAAATTTTATCCA
GCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGG*ACGGTGACGATCAAGATCT
TGCTCAGGTCTACAACGCTCTCGGAGTGAGTTACGTCCGAGAGGACAAACTGGACAAAGG
AATCGCTCAGTTTGAGATGG*CGGTGAAGATTCAGCCTGGTT*ATGTAACGGCTTGGAAC
AACCTTGGAGATGCTTACGAGAAGAAGAAG*AGCTGCCTTTGGCGTTGAA
GCGTTTGA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2B044TF 758 0 0
TTTTCAGACTTTCCGAGTA
ATCTCATCGAGCACGCTACTCCATACGCTATCTCCATCGTCTCCTCCCATTCACCGCCTC
TATCTCCATCACTCTCAGATTCTCCCTTCTTCTCCTCTGTCGCTCAAGCTCCATCCCAAA
ACGATATCTTTACAGATACATGGCAGGATTTTGGCTTTTCGATCTGCAGAACTTGCTGCT
AGAGGCTTACCGCTTCTGAAGAAGCTACCGAGCAAAGGATCTACCTTTCTGCTGGGTCAG
AGCTTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACAGCTGGCAGCAGCGTCAGAAACCGTGAAGCCT
GAACCTATTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTGAACTAGGGATTCAGCTTTCTTACTTGCTG
TTGCTACTTGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATGTCATCCGCCAAGTACTTGTCCGC
AGAGAACTTGACCTCTCTGTCAAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAGCGGGGATGCAAGT
GCAACAGAGCTCTTTGAGCTCGGTGCAGTGATGCTGAGACGCAAATTTTATCCAGCAGCC
AACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGGGACGGTGACGATCAAGATCTTGCTCA
CGTCTACAACGCTCTCGGAGTGAGTTACGTCCGAGAGGACAAACTGGACAAAGGAATCGC
TCAGTTTGAGATGGGCGGTGAAGATTCAGCCTGGTTTATGTAACGGCTTGGAACAACCTT
GGAGATGCTTACGAGAAGA

QA 20 758 20 758
DS 

RD RR2B044JQ 781 0 0
GCTGGGTCAGAGCTTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACAGCTGGCAGCAGCGTCAGAAAC
CGTGAAGCCTGAACCTATTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTGAACTAGGGATTCAGCTTTC
TTACTTGCTGTTGCTACTTGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATGTCATCCGCCAAGT
ACTTGTCCGCAGAGAACTTGACCTCTCTGTCAAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAGCGG
GGATGCAAGTGCAACAGAGCTCTTTGAGCTCGGTGCAGTGATGCTGAGACGCAAATTTTA
TCCAGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGG*ACGGTGACGATCAAG
ATCTTGCTCAGGTTTACAACGCTCTCGGAGTGAGTTACGTCCGAGAGGACAAACTGGACA
AAGGAATCGCTCAGTTTGAGATGG*CGGTGAAGATTCAGCCTGGTT*ATGTAACGGCTTG
GAACAACCTTGGAGATGCTTACGAGAAGAAGAAGGAGCTGCCTTTGGCGTTGAAAGCGTT
TGAAGAGGTTTTGTTGTTTGATCCGAACAACAAGGTGGCTCGGCCTCGAAGAGATGCGTT
GAAGGATCGCGTTAAGCTCTATAAAGACGTTGTGGCGGTTAAGTCCAAGAAACGGTGACG
AAGAAACCAATAAACGGTGATGTTATTTTGTAAGGACATTTTGTGTTACTATTATGAATA
TGAAAACTTGTTTCCTGCTTTTGTTTACTCTTAAACAATAAAATCACTCAT
TATTATTCGG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2AN29JQ 891 0 0
A
CAGATACATGGCAGGATTT*GGCTTT*CGATCTGCAGAACTTGCTGCTAGAGGCTTACCG
CTTCTGAAGAAGCTACCGAGCAAAGGATCTACCTTTCTGCTGGGTCAGAGCTTGTTGATG
GTCTCTGCTTATCCACAGCTGGCAGCAGCGTCAGAAACCGTGAAGCCTGAACCTATTTAC
GAAGTTGGAGAGTTGTTTGAACTAGGGATTCAGCTTTCTTACTTGCTGTTGCTACTTGGT
TTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATGTCATCCGCCAAGTACTTGTCCGCAGAGAACTTGAC
CTCTCTGCCAAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAGCGGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTC
TTTGAGCTCGGTGCAGTGATGCTGAGACGCAAATTTTATCCAGCAGCCAACAAGTTCTTG
CTTCAAGCCATCCAGAAATGGG*ACGGTGACGATCAAGATCTTGCTCAGGTCTACAACGC
TCTCGGAGTGAGTTACGTCCGAGAGGACAAACTGGACAAAGGAATCGCTCAGTTTGAGAT
GG*CGGTGAAGATTCAGCCTGGTT*ATGTAACGGCTTGGAACAACCTTGGAGATGCTTAC
GAGAAGAAGAAGGAGCTGCCTTTGGCGTTGAAAGCGTTTGAAGAGGTTTTGTTGTTTGAT
CCGAACAACAAGGTGGCTCGGCCTCGAAGAGATGCGTTGAAGGATCGCGTTAAGCTCTAT
AAAGACGTTGTGGCGGTTAAGTCCAAGAAACGGTGACGAAGAAACCAATAAACGGTGATG
TTATTTTGTAAGGACATTTTGTGTTACTATTATGAATATGAAAACTTGTTTCCTGCTTTT
GTTTACTCTTAAACAATAAAATCACTCATCTTATTATTCGGAAATCGATT

QA 2 891 2 891
DS 



CO CL418Contig2 996 4 12 U
CCGAATAATAAGATGAGTGATTTTATTGTTTAAGAGTAACACAAAATGTCCTTACAAAAT
AAAACATAAGAGAGAGACAACCGTTTATTGGTTTCTTCGTCACCGTTTCTTGGACTTAAC
CGCCACAACGTCTTTGTAGAGCTTAACGCGATCCTTCAACGCATCTCTTCGAGGCCGAGC
CACCTTGTTGTTAGGATCAAACAACAAAACCTCTTCAAACGCTTTCAACGCCAAAGGCAG
CTCCTTCTTCTTCTCGTAAGCATCTCCAAGGTTGTTCCAAGCCGTTACATAACCAGGCTG
AATCTTCACCGCCATCTCAAACTGAGCGATTCCTTTGTCCAGTTTGTCCTCTCGGACATA
ACTCACTCCAAGAGCGTTGTAGACCTGAGCAAGATCTTGATCGTCACCATCCCATTTCTG
GATGGCTTGAAGCAAGAACTTGTTGGCTGCAGGATAAAATTTGCGTCTCAGCATCACTGC
ACCGAGCTCAAAGAGCTCTGTTGCACTTGCATCCCCGCTCCTAACTTGTTCCTGTAGTTC
TTTGGCAGAGAGGTCAAGTTCTCTGCGGACAAGTACTTGGCGAATCACATAGAAAGTACC
AACTCCGAGCAAACCCAGTAGCAACAGCAAGTAAGAAAGCTGGATACCTAGTTCAAACAA
CTCTCCAACTTCGTAAATTGGTTCAGGCTTCACGATCTCTGCAGCTGCTGCCAGCTGTGG
ATAAGCAGAGACCATCAACAAGCTCTGACCCAGCAGAAAGGTAGATCCTTTGCTCCGTAG
CTTCTTCAAAAGCGGTAAGCCTCTAGCAGCAAGTTCTGCAGATCGAAAAGCCAAAATCCT
GCCATGTATCTGCCTGTAAAGAAATCGTTTTGGGATGGAGCTTGAGCGACACAGGAGAAG
AAGGGAGAATCTGAGAGTGATGGAGATAGAGGCGGTGAATGGGAGGAGACGATGGAGATA
ACGTATGGAGTAGCATGCTCGATGAGATTACTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ61JQ U 7
AF RR2EX67JQ U 7
AF RR2CL19JQ U 1
AF RR2CL19TF C 311
BS 1 135 RR2CL19JQ
BS 136 136 RR2EX67JQ
BS 137 192 RR2CL19JQ
BS 193 193 RR2EX67JQ
BS 194 237 RR2CL19JQ
BS 238 238 RR2EX67JQ
BS 239 255 RR2CL19JQ
BS 256 256 RR2EX67JQ
BS 257 790 RR2CL19JQ
BS 791 791 RR2CL19TF
BS 792 828 RR2CL19JQ
BS 829 996 RR2CL19TF

RD RR2EZ61JQ 463 0 0
AATAAGATGAGTGATTTTATTGTTTAAGAGTAACACAAAATGTCCTTACAAAATAAAACA
TAAGAGGGAGACAACCGTTTATTGGTTTCTTCGTCACCGTTTCTTGGACTTAACCGCCAC
AACGTCTTTGTAGAGCTTAACGCGATCCTTCAACGCATCTCTTCGAGGCCGAGCCACCTT
GTTGTTAGGATCAAACAACAAAACCTCTTCAAACGCTTTCAACGCCAAAGGCAGCTCCTT
CTTCTTCTCGTAAGCATCTCCAAGGTTGTTCCAAGCCGTTACATAACCAGGCTGAATCTT
CACCGCCATCTCAAACTGAGCGATTCCTTTGTCCAGTTTGTCCTCTCGGACATAACTCAC
TCCGAGAGCGTTGTAGACCTGAGCAAGATCTTGATCGTCACCATCCCATTTCTGGATGGC
TTGAAGCAAGAACTTGTTGGCTGCAGGATAAAATTTGCGTCTC

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2EX67JQ 528 0 0
AATAAGATGAGTGATTTTATTGTTTAAGAGTAACACAAAATGTCCTTACAAAATAAAACA
TAAGAGAGAGACAACCGTTTATTGGTTTCTTCGTCACCGTTTCTTGGACTTAACCGCCAC
AACGTCTTTGTAGAGCTTAACGCGATCCTTCAACGCATCTCTTCGAGGCCGAGCCACCTT
GTTGTTAGGATCAAACAACAAAACCTCTTCAAACGCTTTCAACGCCAAAGGCAGCTCCTT
CTTCTTCTCGTAAGCATCTCCAAGGTTGTTCCAAGCCGTTACATAACCAGGCTGAATCTT
CACCGCCATCTCAAACTGAGCGATTCCTTTGTCCAGTTTGTCCTCTCGGACATAACTCAC
TCCGAGAGCGTTGTAGACCTGAGCAAGATCTTGATCGTCACCATCCCATTTCTGGATGGC
TTGAAGCAAGAACTTGTTGGCTGCAGGATAAAATTTGCGTCTCAGCATCACTGCACCGAG
CTCAAACAGCTCTGTTGCACTTGCATCCCCGCTCCTTACTTGTTCCTG

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2CL19JQ 836 0 0
CCGAATAATAAGATGAGTGATTTTATTGTTTAAGAGTAACACAAAATGTCCTTACAAAAT
AAAACATAAGAGAGAGACAACCGTTTATTGGTTTCTTCGTCACCGTTTCTTGGACTTAAC
CGCCACAACGTCTTTATAGAGCTTAACGCGATCCTTCAACGCATCTCTTCGAGGCCGAGC
CACCTTGTTGTTCGGATCAAACAACAAAACCTCTTCAAACGCTTTCAACGCCAAAGGAAG
CTCCTTCTTCTTCTCATAAGCATCTCCAAGGTTGTTCCAAGCCGTTACATAACCAGGCTG
AATCTTCACCGCCATCTCAAACTGAGCGATTCCTTTGTCCAGTTTGTCCTCTCGGACATA
ACTCACTCCAAGAGCGTTGTAGACCTGAGCAAGATCTTGATCGTCACCATCCCATTTCTG
GATGGCTTGAAGCAAGAACTTGTTGGCTGCAGGATAAAATTTGCGTCTCAGCATCACTGC
ACCGAGCTCAAAGAGCTCTGTTGCACTTGCATCCCCGCTCCTAACTTGTTCCTGTAGTTC
TTTGGCAGAGAGGTCAAGTTCTCTGCGGACAAGTACTTGGCGAATCACATAGAAAGTACC
AACTCCGAGCAAACCCAGTAGCAACAGCAAGTAAGAAAGCTGGATACCTAGTTCAAACAA
CTCTCCAACTTCGTAAATTGGTTCAGGCTTCACGATCTCTGCAGCTGCTGCCAGCTGTGG
ATAAGCAGAGACCATCAACAAGCTCTGACCCAGCAGAAAGGTAGATCCTTTGCTCCGTAG
CTTCTTCAAA*GCGGTAAGCCTCTAGCAGCAAGTTCTGCAGATCGAAA
GCAAAATC

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2CL19TF 686 0 0
GCCATCTCAAACTGAGCGATTC*TTTGTCCAGTTTGTCCTCTCGGACATAACTCACTCCA
AGAGCGTTGTAGAC*TGAGCAAGATCTTGATCGTCACCATCCCATTTCTGGATGGCTTGA
AGCAAGAACTTGTTGGCTGCAGGATAAAATTTGCGTCTCAGCATCACTGCACCGAGCTCA
AAGAGCTCTGTTGCACTTGCATCCCCGCTCCTAACTTGTTCCTGTAGTTCTTTGGCAGAG
AGGTCAAGTTCTCTGCGGACAAGTACTTGGCGAATCACATAGAAAGTACCAACTCCGAGC
AAACCCAGTAGCAACAGCAAGTAAGAAAGCTGGATACCTAGTTCAAACAACTCTCCAACT
TCGTAAATTGGTTCAGGCTTCACGATCTCTGCAGCTGCTGCCAGCTGTGGATAAGCAGAG
ACCATCAACAAGCTCTGACCCAGCAGAAAGGTAGATCCTTTGCTCCGTAGCTTCTTCAAA
AGCGGTAAGCCTCTAGCAGCAAGTTCTGCAGATCGAAAAGCCAAAATCCTGCCATGTATC
TGCCTGTAAAGAAATCGTTTTGGGATGGAGCTTGAGCGACACAGGAGAAGAAGGGAGAAT
CTGAGAGTGATGGAGATAGAGGCGGTGAATGGGAGGAGACGATGGAGATAACGTATGGAG
TAGCATGCTCGATGAGATTACTCTCC

QA 1 686 1 686
DS 



CO CL418Contig3 762 2 16 U
GGGCACACTCGTGGATTTTCAGACTTTCAGAGTAATCTCATCGGGACCTTTATGATCTCA
TCGAGCATGCTACTCCATACGTTATCTCCATCATCTCCTCCCATTCACCGCCTCTATCTC
CACCACTCTCAGATTCTCCCTTCTTCTCCTGTGTCGCTCAAGCTCCATCCCAAAACCATA
TCTTTACAGATACATGGCAGGACTAAAGCAGAACTTGCTGCTAGAGGCTTACCGGTTTTG
AAAAAAGCTTCTTTGAAGAAGCTACCGAGCAAAGGATCCACCTTTCTGCTGGGCCAGAGC
TTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACAGCTGGCAGCAGCGTCAGAGATCGTGAAGCCTGAA
CCGGTTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTGAACTAGGGATTCAGCTTTCTTACTTGCTGTTG
CTACTGGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATGTGATTCGCCAAGTACTTGTCCGCAGA
GAACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAGCGGGGATGCAAGTGCA
ACAGAGCTATTTGAGCTCGGTGCAGTGATGCTGAGACGCAAATTTTATCCTGCAGCCAAC
AAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGGATGGTGACGATCAAGATCTTGCTCACGTC
TACAACGCTCTCGGAGTGAGTTATGTCCGAGAGGACAAACTGGACAAAGGAATCGCTCAG
TTTGAGATGGCGGTGAAGATTCAGCCTGGTTATGTAACGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX67TF U 1
AF RR2AM23TF U 27
BS 1 66 RR2EX67TF
BS 67 67 RR2AM23TF
BS 68 473 RR2EX67TF
BS 474 474 RR2AM23TF
BS 475 548 RR2EX67TF
BS 549 549 RR2AM23TF
BS 550 656 RR2EX67TF
BS 657 657 RR2AM23TF
BS 658 698 RR2EX67TF
BS 699 699 RR2AM23TF
BS 700 711 RR2EX67TF
BS 712 712 RR2AM23TF
BS 713 732 RR2EX67TF
BS 733 733 RR2AM23TF
BS 734 756 RR2EX67TF
BS 757 762 RR2AM23TF

RD RR2EX67TF 771 0 0
GGGCACACTCGTGGATTTTCAGACTTTCAGAGTAATCTCATCGGGACCTTTATGATCTCA
TCGAGCGTGCTACTCCATACGTTATCTCCATCATCTCCTCCCATTCACCGCCTCTATCTC
CACCACTCTCAGATTCTCCCTTCTTCTCCTGTGTCGCTCAAGCTCCATCCCAAAACCATA
TCTTTACAGATACATGGCAGGACTAAAGCAGAACTTGCTGCTAGAGGCTTACCGGTTTTG
AAAAAAGCTTCTTTGAAGAAGCTACCGAGCAAAGGATCCACCTTTCTGCTGGGCCAGAGC
TTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACAGCTGGCAGCAGCGTCAGAGATCGTGAAGCCTGAA
CCGGTTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTGAACTAGGGATTCAGCTTTCTTACTTGCTGTTG
CTACTGGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTTTCTATGTGATTCGCCAAGTACTTGTTCGCAGA
GAACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACTACAGGAACAAGTAAGGAGCGGGGATGCAAGTGCA
ACAGAGCTGTTTGAGCTCGGTGCAGTGATGCTGAGACGCAAATTTTATCCTGCAGCCAAC
AAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAATGGGATGGTGACGATCAAGATCTTGCTCAGGTC
TACAACGCTCTCGGAGTGAGTTATGTCCGAGAGGACAA*CTGGACAAAGGA*TCGCTCAG
TTTGAGATGGCG*TGAAGATTCAGCCTGGTTATGTA
CGGCTGGACACCTTG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2AM23TF 736 0 0
GG
AGAGTAATCTCATCGGGACCTTTATGATCTCATCGAGCATGCTACTCCATACGTTATCTC
CATCATCTCCTCCCATTCACCGCCTCTATCTCCACCACTCTCAGATTCTCCCTTCTTCTC
CTGTGTCGCTCAAGCTCCATCCCAAAACCATATCTTTACAGATACATGGCAGGACTAAAG
CAGAACTTGCTGCTAGAGGCTTACCGGTTTTGAAAAAAGCTTCTTTGAAGAAGCTACCGA
GCAAAGGATCCACCTTTCTGCTGGGCCAGAGCTTGTTGATGGTCTCTGCTTATCCACAGC
TGGCAGCAGCGTCAGAGATCGTGAAGCCTGAACCGGTTTACGAAGTTGGAGAGTTGTTTG
AACTAGGGATTCAGCTTTCTTACTTGCTGTTGCTACTGGGTTTGCTCGGAGTTGGTACTT
TCTATGTGATTCGCCAAGTACTTGTCCGCAGAGAACTTGACCTCTCTGCCAAAGAACTAC
AGGAACAAGTAAGGAGCGGGGATGCAAGTGCAACAGAGCTATTTGAGCTCGGTGCAGTGA
TGCTGAGACGCAAATTTTATCCTGCAGCCAACAAGTTCTTGCTTCAAGCCATCCAGAAAT
GGGATGGTGACGATCAAGATCTTGCTCACGTCTACAACGCTCTCGGAGTGAGTTATGTCC
GAGAGGACAAACTGGACAAAGGAATCGCTCAGTTTGAGATGGCGGTGAAGATTCAGCCTG
GTTATGTAACGGCT

QA 3 736 3 736
DS 



AS 2 12

CO CL419Contig1 856 9 18 U
GGAACACAACTCACTCAAAACCCTAAAACACACCCAAACAAAGCAATCAAAATGAAGAAA
CCTTCAGTGACCCCTTTCCTCATCACTCTCCTGTTGGCTGCAGCTGTCTGCACCCACGGC
AAAGAAGTGGTGAAGGACTCCAACGGGAATCCAGTTAAGATCGGTGCCAAATACTTCATC
CAGCCGGTTAAGAGCAACGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAACATACTTCCGTTT
TGTCCACTTGGCATCACCCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTCCCAGTTATCTTC
GGATATTATCCACCTTTTGTCGGCACAGACTACATTGTCACATCTACCACTATAAACATC
CAGTTCCATTCCGACATCTGGCCTGTATGCAACGAGCTTTCCAAGTTATGGGCAGTCGAT
GTTTCCTCATCCGCTGCCAAGGAGCCTGCCGTTATCATCGGTGGTGAACGGACGGCTCCA
AACAGCTTGTTTAAGATAGAAAAAGATGCAGGAGCACACACTTACAAGTTGACCACCTCA
TATGGAACCGTTGGAACTACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCACCACAGCTACTTGTCACC
AATGATGAGGCTAAGACCTTACTCGTCAAGTTCGTGAAGGTTGATGATGATGCTACTAAG
GCTACTACTTCTTCTTCACGTGTTGAGAAGCTAGGTCTGAGGATGTTCCCATTCTACTAG
TGTCAAGATCATGTAATTTAAAAA**GCCTGAGACTCGTCCATGGCCAAAAATAATGGGT
TGAGATAATACCCGCAC**ATATGTGTGTATGTGAACTTTGTTTAGTTTTAATAACAAGT
CGAATAGATTTGTACT


BQ
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 10 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 10 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 0 45 40 5 40 40 40 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP12TF U 1
AF RR2H654TF U 0
AF RR2EU75TF U 1
AF RR2CF55TF U 1
AF RR2A688TF U 1
AF RR2A104TF U 110
AF RR2H654JQB C 112
AF RR2DI63JQ C 670
AF RR2DI63TF U 670
BS 1 733 RR2A688TF
BS 734 734 RR2DI63TF
BS 735 737 RR2A688TF
BS 738 738 RR2DI63TF
BS 739 744 RR2A688TF
BS 745 745 RR2DI63TF
BS 746 746 RR2A104TF
BS 747 766 RR2A688TF
BS 767 767 RR2DI63TF
BS 768 771 RR2A688TF
BS 772 772 RR2DI63TF
BS 773 797 RR2A688TF
BS 798 799 RR2DI63TF
BS 800 801 RR2A104TF
BS 802 802 RR2DI63TF
BS 803 824 RR2A104TF
BS 825 841 RR2DI63TF
BS 842 856 RR2DI63JQ

RD RR2BP12TF 655 0 0
GGAACACAACTCACTCAAAACCCTAAAACACACCCAAACAAAGCAATCAAAATGAAGAAA
CCTTCAGTGACCCCTTTCCTCATCACTCTCCTGTTGGCTGCAGCTGTCTGCACCCACGGC
AAAGAAGTGGTGAAGGACTCCAACGGGAATCCAGTTAAGATCGGTGCCAAATACTTCATC
CAGCCGGTTAAGAGCAACGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAACATACTTCCGTTT
TGTCCACTTGGCATCACCCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTCCCAGTTATCTTC
GGATATTATCCACCTTTTGTCGGCACAGACTACATTGTCACATCTATCACTATAAACATC
CAGTTCCATTCCGACATCTGGCCTGTATGCAACGAGCTTTCCAAGTTATGGGCAGTCGAT
GTTTCCTCATCCGCTGCCAAGGAGCCTGCCGTTATCATCTGTGGTGAACGGACGGCTCCA
AACAGCTTGTTTAAGATAGAAAAAGATGCAGGAGCACACACTTACAAGTTGACCACCTCA
TATGGAACCGTTGGAACTACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCACCACAGCTACTCGTCACC
AATGATGAGGCTAAGACCTTACTCGTCAAGTTCGTGAAG*TTGATGATGATGCTA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2H654TF 685 0 0
GAC
AACACAACTCACTCAAAACCCTAAAACACACCCAAACAAAGCAATCAAAATGAAGAAACC
TTCAGTGACCCCTTTCCTCATCACTCTCCTGCTGGCTGCAGCTGTCTGCACCCACGGCAA
AGAAGTGGTGAAGGACTCCAACGGGAATCCAGTAAAGATCGGTGCCAAATACTTCATCCA
GCCGGTTAAGAGCAACGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAACATACTTCCGTTTTG
TCCACTTGGCATCACCCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTCCCAGTTATCTTCGG
ATATTATCCACCTTTTGTCGGCACAGACTACATTGTCTCATCTACCACTATAAACATCCA
GTTCCATTCCGACATCTGGCCTGTATGCAACGAGCTTTCCAAGTTATGGGCAGTCGATGT
TTCCTCATCCGCTGCCAAGAAGCCTGCCGTTATCATCGGCGGTGAACGGACGGCTCCAAA
CAGCTTGTTTAAGATAGAGAAAGATGCAGGAGCACACACTTACAAGTTGACCACCTCATA
TGGAACCGTTGGAACTACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCGCCACAGCTACTTGTCACAAA
TGATGAGGCTAAGACCTTACTCGTCAAGTTCGTGAAGGTTGATGATGATGCTACTA*GGC
TACTACTTCTTCTTCACGTGTT

QA 4 685 4 685
DS 

RD RR2EU75TF 737 0 0
GGAACACAACTCACTCAAAACCCTAAAACACACCCAAACAAAACAATCAAAATGAAGAAA
CCTTCAGTGACCCCTTTCCTCATCACTCTCCTGTTGGCTGCAGCTGTCTGCACCCACGGC
AAAGAAGTGGTGAAGGACTCCAACGGGAATCCAGTTAAGATCGGTGCCAAATACTTCATC
CAGCCGGTTAAGAGCAACGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAACATACTTCCGTTT
TGTCCACTTGGCATCACCCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTCCCAGTTATCTTC
GGATATTATCCACCTTTTGTCGGCACAGACTACATTGTCACATCTACCACTATAAACATC
CAGTTCCATTCCGACATCTGGCCTGTATGCAACGAGCTTTCCAAGTTATGGGCAGTCGAT
GTTTCCTCATCCGCTGCCAAGGAGCCTGCCGTTATCATCGGTGGCGAACGGACGGCTCCA
AACAGCTTGTTTAAGATAGAAAAAGATGCAGGAGCACACACTTACAAGTTGACCACCTCA
TATGGAACCGTTGGAACTACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCACCACAGCTACTTGTCACC
AATGATGAGGCTAAGACCTTACTCGTCAAGTTCGTGAAAGTTGATGATGATGCTACTAAG
*CTACTACTTCTTCTTCACGTGTTGAGAAGCTAGGTCTGAG*ATGTTCCCATTCTACTAG
TGTCA*GATCATGAAAT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2CF55TF 732 0 0
GGAACACAACTCACTCAAAACCCTAAAACACACCCAAACAAAGCAATCAAAATGAAGAAA
CCTTCAGTGACCCCTTTCCTCATCACTCTCCTGTTGGCTGCAGCTGTCTGCACCCACGGC
AAAGAAGTGGTGAAGGACTC*AACGGGAATCCAGTTAAGATCGGTGCCAAATACTTCATC
CAGCCGGTTAAGAGCAACGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAACATACTTCCGTTT
TGTCTACTTGGCATCACCCAAACACTTCTTCCCTGCCAACCGGGCCTCCCAGCTATCTTC
GGATATTATCCACCTTTTGCCGGCACAGACTACATTGTCACATCTACCACTATAAACATC
CAGTTCCATTCCGACATCTGGCCTGTATGCAACGAGCTTTCCAAGTTATGGGCAGTCGAT
GTTTCCTCATCCGCTGCCAAGGAGCCTGCCGTTATCATCGGTGGTGAACGGACGGCTCCA
AACAGCTTGTTTAAGATAGAAAAAGATGCAGGAGCACACACTTACAAGTTGACCACCTCA
TATGGAACCGTTGGAACTACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCACCACAGCTACTTGTCACC
AATGATGAGGCTAAGACCCTACTCGTCAAGTTCGTGAAGGTTGATGATGATGCTACTAAG
GCTACTACTTCTTCTTCACGTGTTGAGAAGCTAGGTCTGAGGATGTTCCCATTCTACTAG
TGTCAAGATCAT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2A688TF 798 0 0
GGAACACAACTCACTCAAAACCCTAAAACACACCCAAACAAAGCAATCAAAATGAAGAAA
CCTTCAGTGACCCCTTTCCTCATCACTCTCCTGTTGGCTGCAGCTGTCTGCACCCACGGC
AAAGAAGTGGTGAAGGACTCCAACGGGAATCCAGTTAAGATCGGTGCCAAATACTTCATC
CAGCCGGTTAAGAGCAACGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAACATACTTCCGTTT
TGTCCACTTGGCATCACCCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTCCCAGTTATCTTC
GGATATTATCCACCTTTTGTCGGCACAGACTACATTGTCACATCTACCACTATAAACATC
CAGTTCCATTCCGACATCTGGCCTGTATGCAACGAGCTTTCCAAGTTATGGGCAGTCGAT
GTTTCCTCATCCGCTGCCAAGGAGCCTGCCGTTATCATCGGTGGTGAACGGACGGCTCCA
AACAGCTTGTTTAAGATAGAAAAAGATGCAGGAGCACACACTTACAAGTTGACCACCTCA
TATGGAACCGTTGGAACTACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCACCACAGCTACTTGTCACC
AATGATGAGGCTAAGACCTTACTCGTCAAGTTCGTGAAGGTTGATGATGATGCTACTAAG
GCTACTACTTCTTCTTCACGTGTTGAGAAGCTAGGTCTGAGGATGTTCCCATTCTACTAG
TGTCAAGATCATGAAATGTAAAAAAAGCCTGAGACTCGTCCATGGCTAAAA*TAATGGGT
TGAGATAATACCCGCACG

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2A104TF 715 0 0
GCACCCACGGCAAAGAAGTGGTGAAGGACTCCAACGGGAATCCAGTTAAGATCGGTGCCA
AATACTTCATCCAGCCGGTTAAGAGCAACGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAACA
TACTTCCGTTTTGTCCACTTGGCATCACCCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTCC
CAGTTATCTTCGGATATTATCCACCTTTTGTCGGCACAGACTACATTGTCACATCTACCA
CTATAAACATCCAGTTCCATTCCGACATCTGGCCTGTATGCAACGAGCTTTCCAAGTTAT
GGGCAGTCGATGTTTCCTCATCCGCTGCCAAGGAGCCTGCCGTTATCATCGGTGGTGAAC
GGACGGCTCCAAACAGCTTGTTTAAGATAGAAAAAGATGCAGGAGCACACACTTACAAGT
TGACCACCTCATATGGAACCGTTGGAACTACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCACCACAGC
TACTTGTCACCAATGATGAGGCTAAGACCTTACTCGTCAAGTTCGTGAAGGTTGATGATG
ATGCTACTAAGGCTACTACTTCTTCTTCACGTGTTGAGAAGCTAGGTCTGAGGATGTTCC
CATTCTACTAGTGTCAAGATCATGAAATGTAAAAAA*GCCTGAGACTCGTCCATGGCTAA
AA*TAATGGGTTGAGATA*TACCCGCACGCATGTGTGTGTATGTGAACTTTGTTT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2H654JQB 742 0 0
ACCCACGGCAAAGAAGTGGTGAAGGACTCCAACGGGAATCCAGTAAAGATCGGTGCCAAA
TACTTCATCCAGCCGGTTAAGAGCAACGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAACATA
CTTCCGTTTTGTCCACTTGGCATCACCCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTCCCA
GTTATCTTCGGATATTATCCACCTTTTGTCGGCACAGACTACATTGTCTCATCTACCACT
ATAAACATCCAGTTCCATTCCGACATCTGGCCTGTATGCAACGAGCTTTCCAAGTTATGG
GCAGTCGATGTTTCCTCATCCGCTGCCAAGAAGCCTGCCGTTATCATCGGCGGTGAACGG
ACGGCTCCAAACAGCTTGTTTAAGATAGAGAAAGATGCAGGAGCACACACTTACAAGTTG
ACCACCTCATATGGAACCGTTGGAACTACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCGCCACAGCTA
CTTGTCACAAATGATGAGGCTAAGACCTTACTCGTCAAGTTCGTGAAGGTTGATGATGAT
GCTACTAAGGCTACTACTTTTTCTTCACGTGTTGAGAAGTTAGGTCTGAGGATGTTCCCA
TTTTACTAGTGTCAAGATCGTGTAATTTAAAAA**GCCTGAGACTCGTCCATGGCCAAAA
ATAATGGGTTGAGATAATACCCGCAC**ATATGTGTGTATGTGAACTTTGTTTAGTTTTA
ATAACAAGTC
GAATAGATTTGT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2DI63JQ 187 0 0
G
CTTCTTCACGTGTTGAGAAGTTAGGTCTGAGGATGTTCCCATTCTACTAGTGTCAAGATC
GTGTAATTTAAAAA**GCCTGAGACTCATCCATGGCCAAAAATAATGGGTTGAGATAATA
CCCGCAC**ATATGTGTGTATGTGAACTTTGTTTAGTTTTAATAACAAGTCGAATAGATT
TGTACT

QA 2 187 2 187
DS 

RD RR2DI63TF 187 0 0
G
CTTCTTCACGTGTTGAGAAGTTAGGTCTGAGGATGTTCCCATTCTACTAGTGTCAAGATC
GTGTAATTTAAAAA**GCCTGAGACTCATCCATGGCCAAAAATAATGGGTTGAGATAATA
CCCGCAC**ATATGTGTGTATGTGAACTTTGTTTAGTTTTAATAACAAGTC
GAATAGATTTGTACT

QA 2 172 2 172
DS 



CO CL419Contig2 661 3 6 U
AAAGCGCTGAAAAGCACAAATTTACTTGACTTGTTATTAAACTAAACAAAGTTCACATAC
ACACACATGCGTGCGGGTATTATCTCAACCCATTATTTTTAGCCATGGACGAGTCTCAGG
CTTTTTTTACATTTCATGATCTTGACACTAGTAAAATGGGAACATCCTCAAACCTAGCTT
CTCAACACGTGAAAAAAAAGTAGTAGCCTTAGTAGCATCATCATCAACCTTCACGAACTT
GACGAGTAAGGTCTTAGCCTCATCATTGGTGACAAGTAGCTGTGGTGCACTCAACCAAGC
CCCTGGGGTAGTTCCAACGGTTCCATATGAGGTGGTCAACTTGTAAGTGTGTGCTCCTGC
ATCTTTTTCTATCTTAAACAAGCTGTTTGGAGCCGTCCGTTCACCACCGATGATAACGGC
AGGCTCCTTGGCAGCGGATGAGGAAACATCGACTGCCCATAACTTGGAAAGCTCGTTGCA
TACAGGCCAGATGTCGGAATGGAACTGGATGTTTATAGTGATAGATGTGACAATGTAGTC
TGTGCCGACAAAAGGTGGATAATATCCGAAGATAACTGGGAGGCCCGGTTGGTAGGGAAG
AAGTGTTTGGGTGATGCCAAGTGGACAAAACGGAAGTATGTTAATGGCGGCTGGAACAAG
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2CF55JQ U 1
AF RR2EU75JQ U 22
AF RR2BP12JQ U 13
BS 1 248 RR2CF55JQ
BS 249 249 RR2BP12JQ
BS 250 332 RR2CF55JQ
BS 333 333 RR2BP12JQ
BS 334 486 RR2CF55JQ
BS 487 661 RR2BP12JQ

RD RR2CF55JQ 486 0 0
AAAGCGCTGAAAAGCACAAATTTACTTGACTTGTTATTAAACTAAACAAAGTTCACATAC
ACACACATGCGTGCGGGTATTATCTCAACCCATTATTTTTAGCCATGGACGAGTCTCAGG
CTTTTTTTACATTTCATGATCTTGACACTAGTAAAATGGGAACATCCTCAAACCTAGCTT
CTCAACACGTGAAAAAAAAGTAGTAGCCTTAGTAGCATCATCATCAACCTTCACGAACTT
GACGAGTAGGGTCTTAGCCTCATCATTGGTGACAAGTAGCTGTGGTGCACTCAACCAAGC
CCCTGGGGTAGTTCCAACGGTTCCATATGAGGGGGTCAACTTGTAAGTGTGTGCTCCTGC
ATCTTTTTCTATCTTAAACAAGCTGTTTGGAGCCGTCCGTTCACCACCGATGATAACGGC
AGGCTCCTTGGCAGCGGATGAGGAAACATCGACTGCCCATAACTTGGAAAGCTCGTTGCA
TACAGG

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR2EU75JQ 515 0 0
TTACTT
GACTTGTTATTAAACTAAACAAAGTTCACATACACACACATGCGTGCGGGTATTATCTCA
ACCCATTATTTTTAGCCATGGACGAATCTCAGGCTTTTTTTACATTTCATGATCTTGACA
CTAGTAAAATGGGAACATCCTCAAACCTAGCTTCTCAACACGTGAAAAAAAAGTAGTAGC
CTTAGTAGCATCATCATCAACCTTCACGAACTTGACGAGTAAGGTCTTAGCCTCATCATT
GGTGACAAGTAGCTGTGGTGCACTCAACCAAGCCCCTGGGGTAGTTCCAACGGTTCCATA
TGAGGTGGTCAACTTGTAAGTGTGTGCTCCTGCATCTTTTTCTATCTTAAACAAGCTGTT
TGGAGCCGTCCGTTCCCCACCGATGATAACGGCAGGCTCCTTGGCAGCGGATGAGGAAAC
ATCCACTGCCCATAACTTGGAAAGCTCGTTGCATACAGGCCAGATGTCGGAATGGAACTG
GATGTTTATAGTGGTAGATGTGACAATGT

QA 7 515 7 515
DS 

RD RR2BP12JQ 649 0 0
GGCACAAATTTACTT
GACTTGTTATTAAACTAAACAAAGTTCACATACACACACATGCGTGCGGGTATTATCTCA
ACCCATTATTTTTAGCCATGGACGAGTCTCAGGCTTTTTTTACATTTCATGATCTTGACA
CTAGTAGAATGGGAACATCCTCAGACCTAGCTTCTCAACGCGTGAAGAAGAAGTAGTAGC
CTTAGTAGCATCATCATCAACCTTCACGAACTTGACGAGTAAGGTCTTAGCCTCATCATT
GGTGACGAGTAGCTGTGGTGCACTCAACCAAGCCCCTGGGGTAGTTCCAACGGTTCCATA
TGAGGTGGTCAACTTGTAAGTGTGTGCTCCTGCATCTTTTTCTATCTTAAACAAGCTGTT
TGGAGCCGTCCGTTCACCACAGATGATAACGGCAGGCTCCTTGGCAGCGGATGAGGAAAC
ATCGACTGCCCATAACTTGGAAAGCTCGTTGCATACAGGCCAGATGTCGGAATGGAACTG
GATGTTTATAGTGATAGATGTGACAATGTAGTCTGTGCCGACAAAAGGTGGATAATATCC
GAAGATAACTGGGAGGCCCGGTTGGTAGGGAAGAAGTGTTTGGGTGATGCCAAGTGGACA
AAACGGAAGTATGTTAATGGCGGCTGGAACAAGA

QA 16 649 16 649
DS 



AS 1 12

CO CL420Contig1 1650 12 25 U
GGGTCTCTCTTTCTCTCTGTGTGGCTAAAGCCATTTCTCTCTTCTGCGTAAGTAGTCAAA
ATGGCATCCGTTGCTCTTCGAAACCCTAACTCCAAGCGTCTACTCCCCTTCTCCACTCAG
ATCTACTCTCGCTGCGGTGGTAGTTCCATCTCTTCCTCTCCCTCGATCTCTCACTCCATC
GGAGGAGGAGATGATCTCTCTCCCTCGACCTTCGGAGCTTCTCTCTTGAGATCCATGGCC
ACCTTTACTCGAAATAAACCTCATGTGAATGTCGGAACGATTGGTCATGTAGATCACGGG
AAGACCACTTTGACTGCTGCTATTACAAAGGTTCTTGCTGAGGAAGGCAAAGCTAAAGCT
ATTGCCTTTGATGAAATTGATAAAGCTCCTGAGGAGAAGAAGAGAGGAATCACTATTGCA
ACTGCTCATGTGGAGTATGAGACAGCTAAGCGTCACTATGCTCATGTTGATTGCCCTGGT
CACGCTGATTATGTTAAGAATATGATTACGGGAGCTGCACAAATGGATGGTGGGATTCTT
GTGGTTTCAGGACCAGATGGACCCATGCCTCAGACCAAGGAACATATTCTACTTGCCCGT
CAGGTTGGTGTTCCATCACTTGTGTGCTTCTTGAACAAAGTCGATGTGGTGGATGATCCA
GAGTTGTTGGAGCTTGTTGAGATGGAACTACGTGAACTTCTCAGCTTCTACAAGTTTCCT
GGTGATGATATCCCCATCATCCGGG*ATCTGCTCTGTCTGCACTTCAGGGCACAAACGAT
GAAATTGGAAGGCAGGCTATCTTAAAGCTAATGGATGCTGTTGATGAGTACATACCTGAC
CCTGTTCGTGTGCTCGACAAACCTTTCTTGATGCCTATTGAAGATGTTTTCTCAATCCAA
GGACGTGGAACTGTTGCAACCGGTCGTATTGAACAAGGAGTCATCAAAGTCGGTGAAGAA
GTTGAGATATTGGGTTTAAAAGACGGACCTCCAATGAAATCAACTGTAACTGGGGTCGAG
ATGTTCAAGAAGATTCTGGATAATGGACAGGCTGGTGATAACGTAGGACTTCTTCTGCGT
GGGCTCAAGAGAGAAGACATTCAGCGTGGAATGGTGATTGCTAAGCCTGGTTCATGCAAG
ACGTACAAGAAGTTTGAAGCAGAGATATACGTGCTCACCAAGGACGAAGGTGGACGTCAC
ACTGCTTTTCTCTCAAACTACAGGCCTCAGTTTTACTTGAGGACTGCAGATATCACTGGA
AGAGTGGAGTTACCAGAAGAGGTGAAGATGGTTATGCCTGGTGACAATGTCACTGCAGTG
TTTGAGCTTATCATGCCTGTCCCACTCGAAATAGGTCAAAGATTTGCCCTGAGGGAAGGA
GGTAGAACAGTTGGAGCTGGTGTTGTATCAAAAGTGATGACTTGAAAAGTTCTCAGAAGG
CAATCTCTAGGAACCATCAATGATGTTATTTTTTTTCTTTTGCTCCGCTGCTTTGAGATT
TCAACTATATCAAATAACAGAGGGAGAAACATAGTTTAAGTTTCCAACTCTTGATTTGTT
GCTTCCTACTCTGTGAAAAACTATTAAAGTCACTTCCAGTTCTCACTTTCTGAATTGTTC
CTAGCAATTTGATTTCGAATGTTATTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2BL28TF U 17
AF RR2BM13TF U 1
AF RR2H617TF U 67
AF RR2H182TF U 67
AF RR2GH62TF U 342
AF RR2HA36TF U 342
AF RR2F828JQ C 934
AF RR2F828TF U 914
AF RR2BM13JQ C 879
AF RR2BL28JQ C 885
AF RR2DV19TF U 980
AF RR2DV19JQ C 1287
BS 1 316 RR2BM13TF
BS 317 317 RR2BL28TF
BS 318 602 RR2BM13TF
BS 603 603 RR2H182TF
BS 604 734 RR2BM13TF
BS 735 735 RR2H182TF
BS 736 760 RR2BM13TF
BS 761 769 RR2H182TF
BS 770 770 RR2GH62TF
BS 771 775 RR2H182TF
BS 776 776 RR2GH62TF
BS 777 791 RR2H182TF
BS 792 932 RR2GH62TF
BS 933 984 RR2HA36TF
BS 985 985 RR2F828TF
BS 986 1066 RR2HA36TF
BS 1067 1067 RR2F828TF
BS 1068 1093 RR2HA36TF
BS 1094 1193 RR2F828TF
BS 1194 1194 RR2DV19TF
BS 1195 1544 RR2F828TF
BS 1545 1579 RR2DV19TF
BS 1580 1580 RR2BM13JQ
BS 1581 1647 RR2DV19TF
BS 1648 1650 RR2DV19JQ

RD RR2BL28TF 626 0 0
GG
GTGTGGCTAAAGCCATTTCTCTCTTCTGCGTAAGTAGTCAAAATGGCATCCGTTGCTCTT
CGAAACCCTAACTCCAAGCGTCTACTCCCCTTCTCCACTCAGATCTACTCTCGCTGCGGT
GGTAGTTCCATCTCTTCCTCTCCCTCGATCTCTCACTCCATCGGAGGAGGAGATGATCTC
TCTCCCTCGACCTTCGGAGCTTCTCTCTTGAGATCCATGGCCACCTTTACTCGAAATAAA
CCTCATGTGAATGTCGGAACGATTGGTCATGTAGATCACGGGAAGACCACTTTGACTGCT
GCTATTACAAAGGTTCTTGCTGAGGAAGGCAAAGCTAAAGCTATTGCCTTTGATGAAATT
GATAAAGCTCCTGAGGAGAAGAAGAGAGGAATCACTATTGCAACTGCTCATGTGGAGTAT
GAGACAGCTAAGCGTCACTATGCTCATGTTGATTGCCCTGGTCACGCTGATTATGTTAAG
AATATGATTACGGGAGCTGCACAAATGGATGGTGGGATTCTTGTGGTTTCAGGACCAGAT
GGACCCATGCCTCAGACCAAGGAACATATTCTACTTGCCCGTCACGTTGGTGTTCCATCA
CTTGTGTGCTTCTTGA
CAAAGTCG

QA 3 618 3 618
DS 

RD RR2BM13TF 760 0 0
GGGTCTCTCTTTCTCTCTGTGTGGCTAAAGCCATTTCTCTCTTCTGCGTAAGTAGTCAAA
ATGGCATCCGTTGCTCTTCGAAACCCTAACTCCAAGCGTCTACTCCCCTTCTCCACTCAG
ATCTACTCTCGCTGCGGTGGTAGTTCCATCTCTTCCTCTCCCTCGATCTCTCACTCCATC
GGAGGAGGAGATGATCTCTCTCCCTCGACCTTCGGAGCTTCTCTCTTGAGATCCATGGCC
ACCTTTACTCGAAATAAACCTCATGTGAATGTCGGAACGATTGGTCATGTAGATCACGGG
AAGACCACTTTGACTG*TGCTATTACAAAGGTTCTTGCTGAGGAAGGCAAAGCTAAAGCT
ATTGCCTTTGATGAAATTGATAAAGCTCCTGAGGAGAAGAAGAGAGGAATCACTATTGCA
ACTGCTCATGTGGAGTATGAGACAGCTAAGCGTCACTATGCTCATGTTGATTGCCCTGGT
CACGCTGATTATGTTAAGAATATGATTACGGGAGCTGCACAAATGGATGGTGGGATTCTT
GTGGTTTCAGGACCAGATGGACCCATGCCTCAGACCAAGGAACATATTCTACTTGCCCGT
CA*GTTGGTGTTCCATCACTTGTGTGCTTCTTGAACAAAGTCGATGTGGTGGATGATCCA
GAGTTGTTGGAGCTTGTTGAGATGGAACTACGTGAACTTCTCAGCTTCTACAAGTTTCCT
GGTGATGATATCCC*ATCATCCGGG*ATCTGCTCTGTCTG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2H617TF 717 0 0
G
CCGTTGCTCTTCGAAACCCTAACTCCAAGCGTCTACTCCCCTTCTCCACTCAGATCTACT
CTCGCTGCGGTGGTAGTTCCATCTCTTCCTCTCCCTCGATCTCTCACTCCATCGGAGGAG
GAGATGATCTCTCTCCCTCGACCTTCGGAGCTTCTCTCTTGAGATCCATGGCCACCTTTA
CTCGAAATAAACCTCATGTGAATGTCGGAACGATTGGTCATGTAGATCACGGGAAGACCA
CTTTGACTGCTGCTATTACAAAGGTTCTTGCTGAGGAAGGCAAAGCTAAAGCTATTGCCT
TTGATGAAATTGATAAAGCTCCTGAGGAGAAGAAGAGAGGAATCACTATTGCAACTGCTC
ATGTGGAGTATGAGACAGCTAAGCGTCACTATGCTCATGTTGATTGCCCTGGTCACGCTG
ATTATGTTAAGAATATGATTACGGGAGCTGCACAAATGGATGGTGGGATTCTTGTGGTTT
CAGGACCAGATGGACCCATGCCTCAGACCAAGGAACATATTCTACTTGCCCGTCAGGTTG
GTGTTCCATCACTTGTGTGCTTCTTGAACAAAGTCGATGTGGTGGATGATCCAGAGTTGT
TGGAGCTTGTTGAGATGGAACTACGTGAACTTCTCAGCTTCTACAAGTTTCCTGGTGATG
ATATCCCCATCATCCGGG*ATCTGCTCTGTCTGCACTTCAGG*CACAA
ACGATGAA

QA 2 709 2 709
DS 

RD RR2H182TF 739 0 0
G
CCGTTGCTCTTCGAAACCCTAACTCCAAGCGTCTACTCCCCTTCTCCACTCAGATCTACT
CTCGCTGCGGTGGTAGTTCCATCTCTTCCTCTCCCTCGATCTCTCACTCCATCGGAGGAG
GAGATGATCTCTCTCCCTCGACCTTCGGAGCTTCTCTCTTGAGATCCATGGCCACCTTTA
CTCGAAATAAACCTCATGTGAATGTCGGAACGATTGGTCATGTAGATCACGGGAAGACCA
CTTTGACTGCTGCTATTACAAAGGTTCTTGCTGAGGAAGGCAAAGCTAAAGCTATTGCCT
TTGATGAAATTGATAAAGCTCCTGAGGAGAAGAAGAGAGGAATCACTATTGCAACTGCTC
ATGTGGAGTATGAGACAGCTAAGCGTCACTATGCTCATGTTGATTGCCCTGGTCACGCTG
ATTATGTTAAGAATATGATTACGGGAGCTGCACAAATGGATGGTGGGATTCTTGTGGTTT
CAGGACCAGATGGACCCATGCCTCAGACCAAGGAACATATTCTACTTGCCCGTCAGGTTG
GTGTTCCATCACTTGTGTGCTTCTTGAACAAAGTCGATGTGGTGGATGATCCAGAGTTGT
TGGAGCTTGTTGAGATGGAACTACGTGAACTTCTCAGCTTCTACAAGTTTCCTGGTGATG
ATATCCCCATCATCCGGG*ATCTGCTCTGTCTGCACTTCAGG*CACAA*CGATGAAATTG
GAAG
CAGCTATCTTAAAG

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR2GH62TF 591 0 0
GGAAGGCAAAGCTAAAGCTATTGCCTTTGATGAAATTGATAAAGCTCCTGAGGAGAAGAA
GAGAGGAATCACTATTGCAACTGCTCATGTGGAGTATGAGACAGCTAAGCGTCACTATGC
TCATGTTGATTGCCCTGGTCACGCTGATTATGTTAAGAATATGATTACGGGAGCTGCACA
AATGGATGGTGGGATTCTTGTGGTTTCAGGACCAGATGGACCCATGCCTC*GACCAAGGA
ATATATTCTACTTGCCCGTCAGGTTGGTGTTCCATCACTTGTGTGCTTCTTGAACAAAGT
CGATGTGGTGGATGATCCAGAGTTGTTGGAGCTTGTTGAGATGGAACTACGTGAACTTCT
CAGCTTCTACAAGTTTCCTGGTGATGATATCCCCATCATCCGGGGATCTGCTCTGTCTGC
ACTTCAGGGCACAAACGATGAAATTGGAAGGCAGGCTATCTTAAAGCTAATGGATGCTGT
TGATGAGTACATACCTGACCCTGTTCGTGTGCTCGACAAACCTTTCTTGATGCCTATTGA
AGATGTTTTCTCAATCCAAGGACGTGGAACTGTTGCAACCGGTCGTATTGA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2HA36TF 752 0 0
GGAAGGCAAAGCTAAAGCTATTGCCTTTGATGAAATTGATAAAGCTCCTGAGGAGAAGAA
GAGAGGAATCACTATTGCAACTGCTCATGTGGAGTATGAGACAGCTAAGCGTCACTATGC
TCATGTTGATTGCCCTGGTCACGCTGATTATGTTAAGAATATGATTACGGGAGCTGCACA
AATGGATGGTGGGATTCTTGTGGTTTCAGGACCAGATGGACCCATGCCTC*GACCAAGGA
ATATATTCTACTTGCCCGTCAGGTTGGTGTTCCATCACTTGTGTGCTTCTTGAACAAAGT
CGATGTGGTGGATGATCCAGAGTTGTTGGAGCTTGTTGAGATGGAACTACGTGAACTTCT
CAGCTTCTACAAGTTTCCTGGTGATGATATCCCCATCATCCGGGGATCTGCTCTGTCTGC
ACTTCAGGGCACAAACGATGAAATTGGAAGGCAGGCTATCTTAAAGCTAATGGATGCTGT
TGATGAGTACATACCTGACCCTGTTCGTGTGCTCGACAAACCTTTCTTGATGCCTATTGA
AGATGTTTTCTCAATCCAAGGACGTGGAACTGTTGCAACCGGTCGTATTGAACAAGGAGT
CATCAAAGTCGGTGAAGAAGTTGAGATATTGGGTTTAAAAGACAGACCTCCAATGAAATC
AACTGTAACTGGGGTCGAGATGTTCAAGAAGATTCTGGATAATGGACAGGCTGGTGATAA
CGTAG*ACTTCTTCTGCGTGGGCTCAAGAGAG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2F828JQ 611 0 0
CAAGGAGTCATCAAAGTAGGTGAAGAAGTTGAGATATTGGGTTTAAAAGACGGACCTCCA
ATGAAATCAACTGTAACTGGGGTCGAGATGTTCAAGAAGATTCTGGATAATGGACAGGCT
GTTGATAACGTAGGACTTCTTCTGCGTGGGCTCAAGAGAGAAGACATTCAGCGTGGAATG
GTGATTGCTAAGCCTGGTTCATGCAAGACGTACAAGAAGTTTGAAGCAGAGATATACGTG
CTCACCAAGGACGAAGGTGGGCGTCACACTGCTTTTCTCTCAAACTACAGGCCTCAGTTT
TACTTGAGGACTGCAGATATCACTGGAAGAGTGGAGTTACCAGAAGAGGTGAAGATGGTT
ATGCCTGGTGACAATGTCACTGCAGTGTTTGAGCTTATCATGCCTGTCCCACTCGAAATA
GGTCAAAGATTTGCCCTGAGGGAAGGAGGTAGAACAGTTGGAGCTGGTGTTGTATCAAAA
GTGATGACTTGAAAAGTTCTCAGAAGGCAATCTCTAGGAACCATCAATGATGTTATTTTT
TTTCTTTTGCTCCGCTGCTTTGAGATTTCAACTATATCAAATAACAGAGGGAGAAACATA
GTTTAAGTTTC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2F828TF 631 0 0
G
TGCAACCGGTCGTATTGAACAAGGAGTCATCAAAGTAGGTGAAGAAGTTGAGATATTGGG
TTTAAAAGACGGACCTCCAATGAAATCAACTGTAACTGGGGTCGAGATGTTCAAGAAGAT
TCTGGATAATGGACAGGCTGTTGATAACGTAGGACTTCTTCTGCGTGGGCTCAAGAGAGA
AGACATTCAGCGTGGAATGGTGATTGCTAAGCCTGGTTCATGCAAGACGTACAAGAAGTT
TGAAGCAGAGATATACGTGCTCACCAAGGACGAAGGTGGGCGTCACACTGCTTTTCTCTC
AAACTACAGGCCTCAGTTTTACTTGAGGACTGCAGATATCACTGGAAGAGTGGAGTTACC
AGAAGAGGTGAAGATGGTTATGCCTGGTGACAATGTCACTGCAGTGTTTGAGCTTATCAT
GCCTGTCCCACTCGAAATAGGTCAAAGATTTGCCCTGAGGGAAGGAGGTAGAACAGTTGG
AGCTGGTGTTGTATCAAAAGTGATGACTTGAAAAGTTCTCAGAAGGCAATCTCTAGGAAC
CATCAATGATGTTATTTTTTTTCTTTTGCTCCGCTGCTTTGAGATTTCAACTATATCAAA
TAACAGAGGGAGAAACATAGTTTAAGTTTC

QA 2 631 2 631
DS 

RD RR2BM13JQ 730 0 0
TGAAGA
TGTTTTCTCAATCCAAGGACGTGGAACTGTTGCAACCGGTCGTATTGAACAAGGAGTCAT
CAAAGTCGGTGAAGAAGTTGAGATATTGGGTTTAAAAGACGGACCTCCAATGAAATCAAC
TGTAACTGGGGTCGAGATGTTCAAGAAGATTCTGGATAATGGACAGGCTGGTGATAACGT
AGGACTTCTTCTGCGTGGGCTCAAGAGAGAAGACATTCAGCGTGGAATGGTGATTGTTAA
GCCTGGTTCATGCAAGACGTACAAGAAGTTTGAAGCAGAGATATACGTGCTCACCAAGGA
CGAAGGTGGACGTCACACTGCTTTTCTCTCAAACTACAGGCCTCAGTTTTACTTGAGGAC
TGCAGATATCACTGGAAGAGTGGAGTTACCAGAAGAGGTGAAGATGGTTATGCCTGGTGA
CAATGTCACTGCAGTGTTTGAGCTTATCATGCCTGTCCCACTCGAAATAGGTCAAAGATT
TGCCCTGAGGGAAGGAGGTAGAACAGTTGGAGCTGGTGTTGTATCAAAAGTGATGACTTG
AAAAGTTCTCAGAAGGCAATCTCTAGGAACCATCAATGATGTTATTTTTTTTCTTTTGCT
CCGCTGCTTTGAGATTTCAACTATATCAAATAACAGAGGGAGAAACATAGTTTAAGTTTC
CAACTCTTGATTTGTTGCTTCCTACTCTGTGAAAAACTATTAAAGTCACTTCCAGTTCTC
ACTT

QA 7 730 7 730
DS 

RD RR2BL28JQ 696 0 0
TGTTTTCTCAATCCAAGGACGTGGAACTGTTGCAACCGGTCGTATTGAACAAGGAGTCAT
CAAAGTCGGTGAAGAAGTTGAGATATTGGGTTTAAAAGACGGACCTCCAATGAAATCAAC
TGTAACTGGGGTCGAGATGTTCAAGAAGATTCTGGATAATGGACAGGCTGGTGATAACGT
AAGACTTCTTCTGCGTGGGCTCAAGAGAGAAGACATTCAGCGTGGAATGGTGATTGCTAA
GCCTGGTTCATGCAAGACGTACAAGAAGTTTGAAGCAGAGATATACGTGCTCACCAAGGA
CGAAGGTGGACGTCACACTGCTTTTCTCTCAAACTACAGGCCTCAGTTTTACTTGAGGAC
TGCAGATATCACTGGAAGAGTAGAGTTACCAGAAGAGGTGAAGATGGTTATGCCTGGTGA
CAATGTCACCGCAGTTTTCGAGCTTATTATGCCTGTCCCACTCGAAATAGGTCAAAGATT
TGCCCTGAGGGAAGGAGGGAGAACAGTTGGAGCTGGTGTTGTATCAAAAGTGATGACTTG
AATAGTTCTCAGAAGGCA*TCTCTAGGAACAATCAATGATGTTATTTTTTTTCTTTTGCT
CCGCTGCTTTGAGATTTCAACTATATCAAATAACAGAGGGAGAAACATAGTTTGAGTTTC
CAACTCTTGATTTGTTGCTTCCTACTCTGTGAAAA
A

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2DV19TF 668 0 0
AAGACGGACCTCCAATGAAATCAACTGTAACTGGGGTCGAGATGTTCAAGAAGATTCTGG
ATAATGGACAGGCTGGTGATAACGTAGGACTTCTTCTGCGTGGGCTCAAGAGAGAAGACA
TTCAGCGTGGAATGGTGATTGCTAAGCCTGGTTCATGCAAGACGTACAAGAAGTTTGAAG
CAGAGATACACGTGCTCACCAAGGACGAAGGTGGACGTCACACTGCTTTTCTCTCAAACT
ACAGGCCTCAGTTTTACTTGAGGACTGCAGATATCACTGGAAGAGTGGAGTTACCAGAAG
AGGTGAAGATGGTTATGCCTGGTGACAATGTCACTGCAGTGTTTGAGCTTATCATGCCTG
TCCCACTCGAAATAGGTCAA*GATTTGCCCTGAGGGAAGGAGGTAGAACAGTTGGAGCTG
GTGTTGTATCAAAAGTGATGACTTGAAAAGTTCTCAGAAGGCAATCTCTAGGAACCATCA
ATGATGTTATTTTTTTTCTTTTGCTCCGCTGCTTTGAGATTTCAACTATATCAAATAACA
GAGGGAGAAACATAGTTTAAGTTTCCAACTCTTGATTTGTTGCTTCCTACTCTGTGAAAA
*CTATTAAAGTCACTTCCAGTTCTCACTTTCTGAATTGTTCCTAGCAATTTGATTTCGAA
TGTTATTG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2DV19JQ 364 0 0
GATGGTTATGCCTGGTGACAATGTCACTGCAGTGTTTGAGCTTATCATGCCTGTCCCACT
CGAAATAGGTCAA*GATTTGCCCTGAGGGAAGGAGGTAGAACAGTTGGAGCTGGTGTTGT
ATCAAAAGTGATGACTTGAAAAGTTCTCAGAAGGCAATCTCTAGGAACCATCAATGATGT
TATTTTTTTTCTTTTGCTCCGCTGCTTTGAGATTTCAACTATATCAAATAACAGAGGGAG
AAACATAGTTTAAGTTTCCAACTCTTGATTTGTTGCTTCCTACTCTGTGAAAAACTATTA
AAGTCACTTCCAGTTCTCACTTTCTGAATTGTTCCTAGCAATTTGATTTCGAATGTTATT
GACC

QA 1 364 1 364
DS 



AS 2 10

CO CL421Contig1 1008 2 6 U
GGATTATTAACTGAAGAACCCAATCTTATCCGCGAAATCAAAAGACAGCAGCAGAGGAGA
GAAACACAAACAAACATGGCGGTTCTCTGTTCGTCTTCAACAGTTATACTCCCTTCGGTG
AAAACCTCTGGTGGTAACAGAAGGTCTCCGTTTCTAGGCTTCTCTCTAGCTGCTATCTCG
AAACCGTCGGTGCGAGTCGGCATTTACGCGAACACGAAGAGGGGATTGCAGGTGAAGTGC
GAAGCGGAGGAGCAGGGTACTACTGCTACTACTTCCTCCCCTGTTCCGGCGAATCAACGG
TGGATGTTCGACGAAGAAGAAGCTAATGGCCCTGACATTTGGAACACAACGTGGTATCCA
AAGGCTTCAGACCATGTGAACACGGACAAGCCTTGGTATGTTGTCGATGCAACTGACAAG
ATTCTCGGTAGATTGGCATCCACCATTGCTAATCACATCCGTGGGAAGAACCTTGCCTCC
TACACTCCCAGTGTCGACATGGGAGCCTTTGTGATTGTGGTGAATGCTGAGAAAGTTGCT
GTGTCTGGAAAGAAGAGGGACCAGAAGCTTTACAGGAGGCATTCGGGACGACCTGGTGGT
ATGACAGTGGAAACTTTTGATCAGTTGCAGCAGAGGATCCCTGAAAGAATCATTGAGCAC
GCTGTTCGTGGAATGCTTCCAAAGGGACGGCTTGGGAGAGCGCTGTTCAATCACCTGAAA
GTGTACAAAGGCCCAGAGCATCCTCATGAGGCGCAGAAGCCGCTTGATCTGCCCATCAGG
GACAAGAGAATACAGCTGCAGAAATAGAAACACCATGGAATATCTCTACTAAGCTACCAT
TATCGCCAAGCTCATTAGAGTTTTTTTCTTCTTCTCCGGTTTCTCTAGTTTCACATCTCA
AAATCAGAGGAGACTTTGCAGATACTTGTTTCTATTACTTGCTTCTATCAACTCTATGCT
TTAAAACCTTTGTAATGTGAAATAATCTTCTATTCAGATTTTTGCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT40TF U 1
AF RR2CT40JQ C 265
BS 1 280 RR2CT40TF
BS 281 281 RR2CT40JQ
BS 282 648 RR2CT40TF
BS 649 649 RR2CT40JQ
BS 650 678 RR2CT40TF
BS 679 1008 RR2CT40JQ

RD RR2CT40TF 678 0 0
GGATTATTAACTGAAGAACCCAATCTTATCCGCGAAATCAAAAGACAGCAGCAGAGGAGA
GAAACACAAACAAACATGGCGGTTCTCTGTTCGTCTTCAACAGTTATACTCCCTTCGGTG
AAAACCTCTGGTGGTAACAGAAGGTCTCCGTTTCTAGGCTTCTCTCTAGCTGCTATCTCG
AAACCGTCGGTGCGAGTCGGCATTTACGCGAACACGAAGAGGGGATTGCAGGTGAAGTGC
GAAGCGGAGGAGCAGGGTACTACTGCTACTACTTCCTCCCTTGTTCCGGCGAATCAACGG
TGGATGTTCGACGAAGAAGAAGCTAATGGCCCTGACATTTGGAACACAACGTGGTATCCA
AAGGCTTCAGACCATGTGAACACGGACAAGCCTTGGTATGTTGTCGATGCAACTGACAAG
ATTCTCGGTAGATTGGCATCCACCATTGCTAATCACATCCGTGGGAAGAACCTTGCCTCC
TACACTCCCAGTGTCGACATGGGAGCCTTTGTGATTGTGGTGAATGCTGAGAAAGTTGCT
GTGTCTGGAAAGAAGAGGGACCAGAAGCTTTACAGGAGGCATTCGGGACGACCTGGTGGT
ATGACAGTGGAAACTTTTGATCAGTTGCAGCAGAGGATCCCTGAAAGA*TCATTGAGCAC
GCTGTTCGTGGAATGCTT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2CT40JQ 744 0 0
G
CTACTACTTCCTCCCCTGTTCCGGCGAATCAACGGTGGATGTTCGACGAAGAAGAAGCTA
ATGGCCCTGACATTTGGAACACAACGTGGTATCCAAAGGCTTCAGACCATGTGAACACGG
ACAAGCCTTGGTATGTTGTCGATGCAACTGACAAGATTCTCGGTAGATTGGCATCCACCA
TTGCTAATCACATCCGTGGGAAGAACCTTGCCTCCTACACTCCCAGTGTCGACATGGGAG
CCTTTGTGATTGTGGTGAATGCTGAGAAAGTTGCTGTGTCTGGAAAGAAGAGGGACCAGA
AGCTTTACAGGAGGCATTCGGGACGACCTGGTGGTATGACAGTGGAAACTTTTGATCAGT
TGCAGCAGAGGATCCCTGAAAGAATCATTGAGCACGCTGTTCGTGGAATGCTTCCAAAGG
GACGGCTTGGGAGAGCGCTGTTCAATCACCTGAAAGTGTACAAAGGCCCAGAGCATCCTC
ATGAGGCGCAGAAGCCGCTTGATCTGCCCATCAGGGACAAGAGAATACAGCTGCAGAAAT
AGAAACACCATGGAATATCTCTACTAAGCTACCATTATCGCCAAGCTCATTAGAGTTTTT
TTCTTCTTCTCCGGTTTCTCTAGTTTCACATCTCAAAATCAGAGGAGACTTTGCAGATAC
TTGTTTCTATTACTTGCTTCTATCAACTCTATGCTTTAAAACCTTTGTAATGTGAAATAA
TCTTCTATTCAGATTTTTGCTGC

QA 2 744 2 744
DS 



CO CL421Contig2 976 8 7 U
AGCAGCAAAAGAACTGAATAAAAGATTATTTCACATTACAAACCTTTTAAAGCATAGAGT
TGATAGAAACGAGCAATAGAAACAAGAATCAGCAAAGTCTCCTCTGGTTTTGAGATGATG
AAACTACAAAAACCCGAGAAGAAAAACCTCAATGCCCTTGGCGACAATGGTAGCTTAGTA
GAGATACTCCATGGTGTTTCTATTTCTGCAGCTGTATTCTCTTGTCCCTGATGGGCAGAT
CAAGCGGCTTCTGTGCCTCATGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACACCTTCAGGTGATTGA
ACAGAGCTCTCCCAAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATGCTCAATGATTC
TTTCAGGGATCCTCTGCTGTAACTGATCAAATGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCGTC
CCGAATGCCTCCTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTCAG
CATTCACCACAATCACAAAGGCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGAGGCAAGGTTCT
TCCCACGGATGTGATTAGCTATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCTTGTCAGTTGCAT
CGACAACATACCAGGGCTTGTCCGTGTTCACATGGTCCGAAGCCTTTGGATACCACGTTG
TGTTCCAAATGTCAGGGCCATTAGCTTCTTCTTCGTCGAACATCCACCGTTGATTCGCCG
GAACAAGGGATGTAGTAGTAGAAATAGTACCCTGCTCCTCCGCTTCGCACTTCACCTGCA
ATCCCCTCTTCGTGTTCGCGTAAATGCCGACTCTTGCCGATGGTTTCGAGATAGCAGTTA
GAGAGAAGCCGAGAAACGGAGACCTTCTGTTACTTCCGGAGGGTTTCACCGAAGAAGAAG
GGAGTATAACTGTTGAAGACGAACAGAGAACCGCCATGTTTGTTTGTGTGTTCTCTCCTC
TGCTGCTCTCTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV13JQB U 1
AF RR2DB32JQ U 1
AF RR2DB32TF C 1
AF RR2DD41JQ U 16
AF RR2GV13TF C 50
AF RR2B514JQ U 180
AF RR2DD41TF C 99
AF RR2B514TF C 161
BS 1 312 RR2DB32JQ
BS 313 313 RR2GV13JQB
BS 314 607 RR2DB32JQ
BS 608 641 RR2DD41JQ
BS 642 693 RR2B514JQ
BS 694 767 RR2DD41TF
BS 768 976 RR2B514TF

RD RR2GV13JQB 457 0 0
AGCAGCAAAAGAA
CTGAATAAAAGATTATTTCACATTACAAACCTTTTAAAGCATAGAGTTGATAGAAACGAG
CAATAGAAACAAGAATCAGCAAAGTCTCCTCTGGTTTTGAGATGATGAAACTACAAAAAC
CCGAGAAGAAAAACCTCGATGCCCTTGGCGACAATGGTAGCTTAGTAGAGATACTCCATG
GTGTTTCTATTTCTGCAGCTGTATTCTCTTGTCCCTGATGGGCAGATCAAGCGGCTTCTG
TGCCTCATGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACACCTTCAGGTGATTGAACAGAGCTCTCCC
AAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATGCTCAATGATTCTTTCAGGGATCCT
CTGCTGTAACTGATCAAATGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCGTCCCGAATGCCTCCT
GTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTT

QA 14 457 14 457
DS 

RD RR2DB32JQ 608 0 0
AGCAGCAAAAGAACTGAATAAAAGATTATTTCACATTACAAACCTTTTAAAGCATAGAGT
TGATAGAAACGAGCAATAGAAACAAGAATCAGCAAAGTCTCCTCTGGTTTTGAGATGATG
AAACTACAAAAACCCGAGAAGAAAAACCTCAATGCCCTTGGCGACAATGGTAGCTTAGTA
GAGATACTCCATGGTGTTTCTATTTCTGCAGCTGTATTCTCTTGTCCCTGATGGGCAGAT
CAAGCGGCTTCTGTGCCTCATGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACACCTTCAGGTGATTGA
ACAGAGCTCTCCTAAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATGCTCAATGATTC
TTTCAGGGATCCTCTGCTGTAACTGATCAAATGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCGTC
CCGAATGCCTCCTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTCAG
CATTCACCACAATCACAAAGGCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGAGGCAAGGTTCT
TCCCACGGATGTGATTAGCTATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCTTGTCAGTTGCAT
CGACAAC
C

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2DB32TF 608 0 0
AGCAGCAAAAGAA
CTGAATAAAAGATTATTTCACATTACAAACCTTTTAAAGCATAGAGTTGATAGAAACGAG
CAATAGAAACAAGAATCAGCAAAGTCTCCTCTGGTTTTGAGATGATGAAACTACAAAAAC
CCGAGAAGAAAAACCTCAATGCCCTTGGCGACAATGGTAGCTTAGTAGAGATACTCCATG
GTGTTTCTATTTCTGCAGCTGTATTCTCTTGTCCCTGATGGGCAGATCAAGCGGCTTCTG
TGCCTCATGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACACCTTCAGGTGATTGAACAGAGCTCTCCT
AAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATGCTCAATGATTCTTTCAGGGATCCT
CTGCTGTAACTGATCAAATGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCGTCCCGAATGCCTCCT
GTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTCAGCATTCACCACAAT
CACAAAGGCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGAGGCAAGGTTCTTCCCACGGATGTG
ATTAGCTATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCTTGTCAGTTGCATCGACAAC
C

QA 14 607 14 607
DS 

RD RR2DD41JQ 626 0 0
GG
ATAAAAGATTATTTCACATTACAAACCTTTTAAAGCATAGAGTTGATAGAAACGAGCAAT
AGAAACAAGAATCAGCAAAGTCTCCTCTGGTTTTGAGATGATGAAACTACAAAAACCCGA
GAAGAAAAACCTCAATGCCCTTGGCGACAATGGTAGCTTAATAGAGATACTCCATGGTGT
TTCTATTTCTGCAGCTGTATTCTCTTGTCCCTGATGGGCAGATCAAGCGGCTTCTGTGCC
TCATGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACACCTTCAGGTGATTGAACAGAGCTCTCCCAAGC
CGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATGCTCAATGATTCTTTCAGGGATCCTCTGC
TGTAACTGATCAAATGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCGTCCCGAATGCCTCCTGTAC
AGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTCAGCATTCACCACAATCACA
AAGGCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGAGGCAAGGTTCTTCCCACGGATGTGATTA
GCTATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCTTGTCAGTTGCATCGACAACATACCAGGGC
TTGTCCGTGTTCACATGGTCCGAA

QA 3 626 3 626
DS 

RD RR2GV13TF 603 0 0
AAGCATAGAGTTGATAGAAACGAGCAATAGAAACAAGAATCAGCAAAGTCTCCTCTGGTT
TTGAGATGATGAAACTACAAAAACCCGAGAAGAAAAACCTCGATGCCCTTGGCGACAATG
GTAGCTTAGTAGAGATACTCCATGGTGTTTCTATTTCTGCAGCTGTATTCTCTTGTCCCT
GATGGGCAGATCAAGCGGCTTCTGTGCCTCATGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACACCTT
CAGGTGATTGAACAGAGCTCTCCCAAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATG
CTCAATGATTCTTTCAGGGATCCTCTGCTGTAACTGATCAAATGTTTCCACTGTCATACC
ACCAGGTCGTCCCGAATGCCTCCTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGC
AACTTTCTCAGCATTCACCACAATCACAAAGGCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGA
GGCAAGGTTCTTCCCACGGATGTGATTAGCTATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCTT
GTCAGTTGCATCGACAACATACCAGGGCTTGTCCGTGTTCACATGGTCCGAAGCCTTTGG
AT
C

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2B514JQ 514 0 0
AGAGATACTCCATGGGGTTTCTATTTCTGCAGCTGTATTCTCTTGTCCCTGATGGGCAGA
TCAAGCGGCTTATGTGCCTCATGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACACCTTCAGGGGATTG
AACAGAGCTCTCCCAAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATGCTCAATGATT
CTTTCAGGGATCCTCTGCTGTAACTGATCAAATGTTTCCAATGTCATACCACCAGGTCGT
CCCGAATGCCTCCTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTCA
GCATTCACCACAATCACAAAGGCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGAGGCAAGGTTC
TTCCCGCGGATGTGATTAGCTATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCTTGTCAGTTGCA
TCGACAACATACCAGGGCTTGTCCGTGTTCACATGGTCCGAAGCCTTTGGATACCACGTT
GTGTTCCAAATGTCAGGGCCATTAGCTTCTTCTT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2DD41TF 681 0 0
GTCTCTCTGG
TTTGAGATGATGAAACTACAAAA*CCCGAGAAGAAAAAC*TCAATGCCCTTGGCGACAAT
GGTAGCTTAGTAGAGATACTCCATGGTGTTTCTATTTCTGCAGCTGTATTCTCTTGTCCC
TGATGGGCAGATCAAGCGGCTTCTGTGCCTCATGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACACCT
TCAGGTGATTGAACAGAGCTCTCCCAAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCAT
GCTCAATGATTCTTTCAGGGATCCTCTGCTGTAACTGATCAAATGTTTCCACTGTCATAC
CACCAGGTCGTCCCGAATGCCTCCTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAG
CAACTTTCTCAGCATTCACCACAATCACAAAGGCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGG
AGGCAAGGTTCTTCCCACGGATGTGATTAGCTATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCT
TGTCAGTTGCATCGACAACATACCAGGGCTTGTCCGTGTTCACATGGTCCGAAGCCTTTG
GATACCACGTTGTGTTCCAAATGTCAGGGCCATTAGCTTCTTCTTCGTCGAACATCCACC
GTTGATTCGCCGGAACAAGGGATGTAGTAGTAGAAATAGTACCCTGCTCCTCCGCTTCG
CACTTCACCTGC

QA 11 669 11 669
DS 

RD RR2B514TF 816 0 0
GCGACAATGGTAGCTTAGTAGAGATACTCCATGGTGTTTCTATTTCTGCAGCTGTATTCT
CTTGTCCCTGATGGGCAGATCAAGCGGCTTATGTGCCTCATGAGGATGCTCTGGGCCTTT
GTACACCTTCAGGTGATTGAACAGAGCTCTCCCAAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACG
AACAGCATGCTCAATGATTCTTTCAGGGATCCTCTGCTGTAACTGATCAAATGTTTCCAA
TGTCATACCACCAGGTCGTCCCGAATGCCTCCTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCC
AGACACAGCAACTTTCTCAGCATTCACCACAATCACAAAGGCTCCCATGTCGACACTGGG
AGTGTAGGAGGCAAGGTTCTTCCCGCGGATGTGATTAGCTATGGTGGATGCCAATCTACC
GAGAATCTTGTCAGTTGCATCGACAACATACCAGGGCTTGTCCGTGTTCACATGGTCCGA
AGCCTTTGGATACCACGTTGTGTTCCAAATGTCAGGGCCATTAGCTTCTTCTTCGTCGAA
CATCCACCGTTGATTCGCCGGAACAAGGGATGTAGTAGTAGAAATAGTACCCTGCTCCTC
CGCTTCGCACTTCACCTGCAATCCCCTCTTCGTGTTCGCGTAAATGCCGACTCTTGCCGA
TGGTTTCGAGATAGCAGTTAGAGAGAAGCCGAGAAACGGAGACCTTCTGTTACTTCCGGA
GGGTTTCACCGAAGAAGAAGGGAGTATAACTGTTGAAGACGAACAGAGAACCGCCATGTT
TGTTTGTGTGTTCTCTCCTCTGCTGCTCTCTTTTCC

QA 1 816 1 816
DS 



AS 2 11

CO CL422Contig1 726 7 8 U
CTCTCAAGTCTCAAGTCCAACGCTTCAGACACAGTTTACCTACCACTTCCGACAAAAACT
CTTTTATACCTTCTCCGCCGACATCTCCTCCATGGCTCCGATTGCTGTCGGCGATGTTGT
ACCTGAAGGAACTATCTCCTTCTTCGACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCA
CGCCCTCGCCGCCGGTAAGAAGGTCATCCTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTTACCCCCAC
CTGCAGTATGAAGCATGTTCCTGGATTCATTGAGAAAGCAGAAGAGCTGAAGTCAAAGGG
TGTTGACGAGATCATTTGCTTTAGTGTGAATGATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAA
GACGTACCCGGAAAACAAGCATGTCAAGTTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAA
GCTTCTTGGACTCGAGCTTGACCTCACGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGTCAAGGAGATT
TGCTCTGTTGCTCGATAACCTCAAGGTCACTGTTGCCAAGGTTGAATCTGGCGGCGAGTT
CACTGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAATGCTCTCTAAGAAACTATATCATTTGTGTT
TATGTAGAACCGCTGCATGTGATAGCAAAGAGTGTATCTCTTGGCCTTATTTCTGACAAT
GAATTAGGCATAATAATAAAGCGGTTTTAAGTTGCTTATTTAATAATAAAGTATTGTTTT
TTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 10 40 40 40 
40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ23TF U 25
AF RR2CS82TF U 1
AF RR2H883TF U 25
AF RR2DI92TF U 4
AF RR2DI92JQ C 475
AF RR2CS82JQ C 146
AF RR2H883JQ C 29
BS 1 433 RR2CS82TF
BS 434 434 RR2H883TF
BS 435 476 RR2CS82TF
BS 477 477 RR2H883TF
BS 478 605 RR2CS82TF
BS 606 606 RR2H883TF
BS 607 667 RR2CS82TF
BS 668 726 RR2H883JQ

RD RR2DZ23TF 282 0 0
GG
AGACACAGTTTACCCACCACTTCCGACAAAAACTCTTTTATACCTTCTCCGCCGACATCT
CCTCCATGGCTCCGATTGCTGTCGGCGATGTTGTACCTGAAGGAACTATCTCCTCCTTCG
ACGAGAACGATCAGCTCCAGGCTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCCGGTAAGAAGGTCA
TCCTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTTACCCCCACCTGCAGTATGAAGCATGTTCCTGGAT
TCATTGAGAAAGCAGAAGAGCTGAAGTCAAAGGGTGTTGA

QA 3 282 3 282
DS 

RD RR2CS82TF 679 0 0
CTCTCAAGTCTCAAGTCCAACGCTTCAGACACAGTTTACCTACCACTTCCGACAAAAACT
CTTTTATACCTTCTCCGCCGACATCTCCTCCATGGCTCCGATTGCTGTCGGCGATGTTGT
ACCTGAAGGAACTATCTCCTTCTTCGACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCA
CGCCCTCGCCGCCGGTAAGAAGGTCATCCTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTTACCCCCAC
CTGCAGTATGAAGCATGTTCCTGGATTCATTGAGAAAGCAGAAGAGCTGAAGTCAAAGGG
TGTTGACGAGATCATTTGCTTTAGTGTGAATGATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAA
GACGTACCCGGAAAACAAGCATGTCAAGTTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAA
GCTTCTTGGACTCAAGCTTGACCTCACGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGTCAAGGATATT
TGCTCTGTTGCTCGATAACCTCAAGGTCACTGTTGCCAAGGTTGAATCTGGCGGCGAGTT
CACTGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAATGCTCTCTAAGAAACTATATCATTTGTGTT
TATGTCGAACCGCTGCATGTGATAGCAAAGAGTGTATCTCTTGGCCTTATTTCTGACAAT
GAATTAG
CATATAATAAAG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2H883TF 640 0 0
GG
AGACACAGTTTACCTACCACTTCCGACAAAAACTCTTTTATACCTTCTCCGCCGACATCT
CCTCCATGGCTCCGATTGCTGTCGGCGATGTTGTACCTGAAGGAACTATCTCCTTCTTCG
ACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCCGGTAAGAAGGTCA
TCCTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTTACCCCCACCTGCAGTATGAAGCATGTTCCAGGAT
TCATTGAGAAAGCAGAAGAGCTGAAGTCAAAGGGTGTTGACGAGATCATTTGCTTTAGTG
TGAATGATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACGTACCCGGAAAACAAGCATGTCA
AGTTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGTTTCTTGGACTCGAGCTTGACCTCA
CGGACAAGGGTCTTGGTAATAGGTCAAGGAGATTTGCTCTGTTGCTCGATAACCTCAAGG
TCACTGTTGCCAAGGTTGAATCTGGCGGCGAGTTCACTGTTTCCAGCGCCGATGATATCC
TCAATGCTCTCTAAGAAACTATATCATTTGTGTTTATGTAGAACCGCTGCATGTGATAGC
AAAGAGTGTATCTCTTGGCCTTATTTCTGACAATGAAT

QA 3 640 3 640
DS 

RD RR2DI92TF 660 0 0
GG
AAGTCTCAAGTCCAACGCTTCAGACACAGTTTACCTACCACTTCCGACAAAAACTCTTTT
ATACCTTCTCCGCCGACATCTCCTCCATGGCTCCGATTGCTGTCGGCGATGTTGTACCTG
AAGGAACTATCTCCTTCTTCGACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCCC
TCGCCGCCGGTAAGAAGGTCATCCTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTTACCCCCACCTGCA
GTATGAAGCATGTTCCTGGATTCATTGAGAAAGCAGAAGAGCTGAAGTCAAAGGGTGTTG
ACGAGATCATTTGCTTTAGTGTGAATGATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACGT
ACCCGGAAAACAAGCATGTCAAGTTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGCTTC
TTGGACTCGAGCTTGACCTCACGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGTCAAGGAGATTTGCTC
TGTTGCTCGATAACCTCAAGGTCACTGTTGCCAAGGTTGAATCTGGCGGCGAGTTCACTG
TTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAATGCTCTCTAAGAAACTATATCATTTGTGTTTATGT
AGAACCGCTGCATGTGATAGCAAAGAGTGTATCTCTTGGCCTTATTTCTGACAATGAA

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR2DI92JQ 246 0 0
GAGATTTGTTTTGTTGCTCGATAACCTCAAGGTCACTGTTGCCAAGGTTGAATCTGGCGG
GGAGTTCACTGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAATGCTCTTTAAGAAACTATATCATT
TGTGTTTATGTAGAACCGCTGCATGTGATAGCAAAGAGTGTATCTCTTGGCCTTATTTCT
GACAATGAATTAGGCATAATAATAAAGCGGTTTTAAGTTGCTTATTTAATAATAAAGTAT
TG
TTTT

QA 1 242 1 242
DS 

RD RR2CS82JQ 551 0 0
GACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCCGGTAAGAAGGTC
ATCCTTTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTTACCCCCACCTGCAGTATGAAGCATGTTCCTGGA
TTCATTGAGAAAGCAGAAGAGCTGAAGTCAAAGGGTGTTGACGAGATCATTTGCTTTAGT
GTGAATGATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACGTACCCGGAAAACAAGCATGTC
AAGTTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGCTTCTTGGACTCAAGCTTGACCTC
ACGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGTCAAGGATATTTGCTCTGTTGCTCGATAACCTCAAG
GTCACTGTTGCCAAGGTTGAATCTGGCGGCGAGTTCACTGTTTCCAGCGCCGATGATATC
CTCAATGCTCTCTAAGAAACTATATCATTTGTGTTTATGTCGAACCGCTGCATGTGATAG
CAAAGAGTGTATCTCTTGGCCTTATTTCTGACAATGAATTAGGCATAATAATAAAGCGGT
TTTAAGTTGC
G

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2H883JQ 698 0 0
ACACAGTTTACCTACCACTTCCGACAAAAACTCTTTTATACCTTCTCCGCCGACATCTCC
TCCATGGCTCCGATTGCTGTCGGCGATGTTGTACCTGAAGGAACTATCTCCTTCTTCGAC
GAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCCGGTAAGAAGGTCATC
CTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTTACCCCCACCTGCAGTATGAAGCATGTTCCAGGATTC
ATTGAGAAAGCAGAAGAGCTGAAGTCAAAGGGTGTTGACGAGATCATTTGCTTTAGTGTG
AATGATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACGTACCCGGAAAACAAGCATGTCAAG
TTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGTTTCTTGGACTCGAGCTTGACCTCACG
GACAAGGGTCTTGGTAATAGGTCAAGGAGATTTGCTCTGTTGCTCGATAACCTCAAGGTC
ACTGTTGCCAAGGTTGAATCTGGCGGCGAGTTCACTGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTC
AATGCTCTCTAAGAAACTATATCATTTGTGTTTATGTAGAACCGCTGCATGTGATAGCAA
AGAGTGTATCTCTTGGCCTTATTTCTGACAATGAATTAGGCATAATAATAAAGCGGTTTT
AAGTTGCTTATTTAATAATAAAGTATTGTTTTTTTGTT

QA 1 698 1 698
DS 



CO CL422Contig2 725 4 2 U
GGAAGTCTCAAGTCCAACGCTTCAGACACACAGTTTACCTACCACTTCCGACAAGACTTT
TATACTTTCTCCGCCGAGATCTCCTCCATGGCTCCGATTGCTGTCGGCGATGTTGTACCT
GAAGGAACTATCTCCTTCTTCGACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCC
CTCGCCGCCGGTAAGAAGGTCATCCTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTCACCCCCACCTGC
AGTATGAAGCATGTGCCTGGATTCATTGAGAAGGCAGAGGAGCTGAAGTCAAAGGGTGTT
GACGAGATCATTTGCTTTAGTGTGAATGATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACG
TACCCGGAAAACAAGCATGTCAAGTTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGCTT
CTTGGACTCGAGCTTGACCTCACGGACAAGGGTCTTGGTGTTAGGTCAAGGAGATTTGCT
CTGTTGCTCGATAACCTCAAGGTCACTGTTGCCAACGTTGAATCTGGCGGCGAGTTCACT
GTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGCTCTCTAAGAAACTATACTATCTGTGTGTATG
CGGAACCCGCTGCATGTGCTAGTAAAGAGTGTACCTCTGGCCTTTTCTGACAATGAATTA
GGCATAATAATAAAGCGGTTTTAAGTTGCTTATTTAATAATAAACTATTGGGTTTTTTTG
TTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2DZ91TF U 8
AF RR2EP01TF U 1
AF RR2EP01JQ C 136
AF RR2DZ91JQ C 153
BS 1 691 RR2EP01TF
BS 692 725 RR2DZ91JQ

RD RR2DZ91TF 287 0 0
GG
AAGTCCGACGCTTCAGACACACAGTTTACCTACCACTTCCGACAAGACTTTTATACTTTC
TCCGCCGAGATCTCCTCCATGGCTCCGATTGCTGTCGGCGATGTTGTATCTGAAGGAACT
ATCTCCTTCTTCGACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCC
GGTAAGAAGGTCATCCTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTCACCCCCACCTGCAGTATGAAG
CATGTGCCTGGATTCATTGAGAAGGCAGAGGAGCTGAAGTCAAAG

QA 3 287 3 287
DS 

RD RR2EP01TF 691 0 0
GGAAGTCTCAAGTCCAACGCTTCAGACACACAGTTTACCTACCACTTCCGACAAGACTTT
TATACTTTCTCCGCCGAGATCTCCTCCATGGCTCCGATTGCTGTCGGCGATGTTGTACCT
GAAGGAACTATCTCCTTCTTCGACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCC
CTCGCCGCCGGTAAGAAGGTCATCCTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTCACCCCCACCTGC
AGTATGAAGCATGTGCCTGGATTCATTGAGAAGGCAGAGGAGCTGAAGTCAAAGGGTGTT
GACGAGATCATTTGCTTTAGTGTGAATGATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACG
TACCCGGAAAACAAGCATGTCAAGTTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGCTT
CTTGGACTCGAGCTTGACCTCACGGACAAGGGTCTTGGTGTTAGGTCAAGGAGATTTGCT
CTGTTGCTCGATAACCTCAAGGTCACTGTTGCCAACGTTGAATCTGGCGGCGAGTTCACT
GTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGCTCTCTAAGAAACTATACTATCTGTGTGTATG
CGGAACCCGCTGCATGTGCTAGTAAAGAGTGTACCTCTGGCCTTTTCTGACAATGAATTA
GGCATAATAATAAAGCGGTTTTAAGTTGCTT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2EP01JQ 556 0 0
TTCTTCGACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCCGGTAAG
AAGGTCATCCTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTCACCCCCACCTGCAGTATGAAGCATGTG
CCTGGATTCATTGAGAAGGCAGAGGAGCTGAAGTCAAAGGGTGTTGACGAGATCATTTGC
TTTAGTGTGAATGATCCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACGTACCCGGAAAACAAG
CATGTCAAGTTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGCTTCTTGGACTCGAGCTT
GACCTCACGGACAAGGGTCTTGGTGTTAGGTCAAGGAGATTTGCTCTGTTGCTCGATAAC
CTCAAGGTCACTGTTGCCAACGTTGAATCTGGCGGCGAGTTCACTGTTTCCAGCGCCGAT
GATATCCTCAAGGCTCTCTAAGAAACTATACTATCTGTGTGTATGCGGAACCCGCTGCAT
GTGCTAGTAAAGAGTGTACCTCTGGCCTTTTCTGACAATGAATTAGGCATAATAATAAAG
CGGTTTTAAGTTGCTT

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2DZ91JQ 573 0 0
TCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCCGGTAAGAAGGTCATCCTCTTCGG
TGTCCCTGGTGCTTTCACCCCCACCTGCAGTATGAAGCATGTGCCTGGATTCATTGAGAA
GGCAGAGGAGCTGAAGTCAAAGGGTGTTGACGAGATCATTTGCTTTAGTGTGAATGATCC
GTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACGTACCTGGAAAACAAGCATGTCAAGTTTGTGGC
AGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGCTTCTTGGACTCGAGCTTGACCTCACGGACAAGGG
TCTTGGTGTTAGGTCAAGGAGATTTGCTCTGTTGCTCGATAACCTCAAGGTCACTGTTGC
CAACGTTGAATCTGGCGGCGAGTTCACTGTTTCCAGCGCCGATGATATCCTCAAGGCTCT
CTAAGAAACTATACTATCTGTGTGTATGTGGAACCCGCTGCATGTGCTAGTAAAGAGTGT
ACCTCTGGCCTTTTCTGACAATGAATTAGGCATAATAATAAAGCGGTTTTAAGTTGCTTA
TTTAATAATAAACTATTGGGTTTTTTTGTTGCC

QA 1 573 1 573
DS 



AS 2 11

CO CL423Contig1 955 9 14 U
GGGGCGGATCAAAATCCATTTGCTTCATTTCGCGTTTTGTTGCGTCTTTCGTCAGATCTG
CTCCATTTCTGGATAAGCATCTCTCATCTTCTTCCCATGGACGTAGGCGGAGGAGGTGAT
AGTGGTTCAGTGGCAACCCCGGTTCAACAGAAAGCACACGAGGCGTGGAGGATCTACCAG
CATTACCTCGACAAGACCACGCCTCACGCTACTTACAGGTGGATCGGGACTCTCGTCGTG
GCCCTCGCCTACTGTTTGAGGGTTTACTACATCCAGGGATTCTACATCATCGCTTACGGT
CTCGGAATCTACCTCTTGAATCTCCTCATCGGGTTCTTGTCCCCTCTCGTTGATCCCGAG
GCTGCTGGTGGGGAATCTGATGGACCTTCGCTTCCTACTAGAGGCTCTGATGAGTTCAAG
CCTTTCATCCGCCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCGATGACAAAGGCGTTCTGT
ATTGCGTTTGTGATGACGTTCTTCTCGGTGTTTGACGTGCCTGTGTTCTGGCCTATCCTG
CTTTGCTATTGGATCGTTCTCTTTGTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGATC
AAGTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGAAATATGGTGGACGAAGCGGCAGC
GGCCCACGTAATGCGGACTGATCTGACCAACTTTTTATGATGAATGTTGGCCATTGCAAA
AGAACAAAACATTTGTTTTTTTTT*CTTAGAAAATCATTTTGGACTATTTTTACATTTGA
CAAAAGTTATGTAGCTACAAGGGAAGGATTTAGAGGAAAAAACAAACGAAAGGTGGAATT
AAAATTTGTTTTAGCTTTAGCAGTAATATTGTTCGTTGCAATAGTGTCACCTTCTATAGT
TATATGATTTGTTCTGTTGCTCTTATACCTTTCAAAATTATTAAGAACACTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 15 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 0 10 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C879JQ C 590
AF RR2C240TF U 61
AF RR2C061TF U 25
AF RR2BG85TF U 1
AF RR2HA55TF U 66
AF RR2C240JQ C 74
AF RR2E059TF U 178
AF RR2E059JQ C 414
AF RR2HA55JQ C 238
BS 1 53 RR2BG85TF
BS 54 54 RR2C061TF
BS 55 744 RR2BG85TF
BS 745 745 RR2HA55TF
BS 746 797 RR2BG85TF
BS 798 821 RR2E059TF
BS 822 822 RR2C240JQ
BS 823 832 RR2E059TF
BS 833 833 RR2C240JQ
BS 834 857 RR2E059TF
BS 858 860 RR2C240JQ
BS 861 861 RR2HA55JQ
BS 862 879 RR2C240JQ
BS 880 955 RR2HA55JQ

RD RR2C879JQ 131 0 0
CCCACATGATCAAGTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGAAATATGGTGGAC
GAAGCGGCAGCGGCCCACGTAATGCGGACTGTTCTGACCAACTTTTTATGATGAATGTTG
GCCATTGCAAA

QA 1 131 1 131
DS 

RD RR2C240TF 641 0 0
CTCCATTTC
TGGATAAGCATCTCTCATCTTCTTCCCATGGACGTAGGCGGAGGAGGTGATAGTGGTTCA
GTGGCAACCCCGGTTCAACAGAAAGCACACGAGGCGTGGAGGATCTACCAGCATTACCTC
GACAAGACCACGCCTCACGCTACTTACAGGTGGATCGGGACTCTCGTCGTGGCCCTCGCC
TACTGTTTGAGGGTTTACTACATCCAGGGATTCTACATCATCGCTTACGGTCTCGGAATC
TACCTCTTGAATCTCCTCATCGGGTTCTTGTCCCCTCTCGTTGATCCCGAGGCTGCTGGT
GGGGAATCTGATGGACCTTCGCTTCCTACTAGAGGCTCTAATGAGTTCAAGCCTTTCATC
CGCCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCGATGACAAAGGCGTTCTGTATTGCGTTT
GTGATGACGTTCTTCTCGGTGTTTGACGTGCCTGTGTTCTGGCCTATCCTGCTTTACTAT
TGGATCGTTCTCTTTGTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGATCAAGTACAAG
TACATCCCTTTCAGCTTCGGCAGACAGAAATATGGTGGACGAAGCGGCAGCGGCCCACGT
AATGCGGACTGATCTGACCAACTTTTTATGAT

QA 10 641 10 641
DS 

RD RR2C061TF 697 0 0
GAT
TTTCGCGTTTTGTTGCGTCTTTCGTCAGATCTGCTCCATTTCTGGATAAGCATCTCTCAT
CTTCTTCCCATGGACGTAGGCGGAGGAGGTGATAGTGGTTCAGTGGCGACCCCGGTTCAA
CAGAAAGCACACGAGGCGTGGAGGATCTACCAGCATTACCTCGACAAGACCACGCCTCAC
GCTACTTACAGGTGGATCGGGACTCTCGTCGTGGCCCTCGCCTACTGTTTGAGGGTTTAC
CACATCCAGGGATTCTACATCATCGCTTACGGTCTCGGGATCTACCTCTTGAATCTCCTC
ATCGGGTTCTTGTCCCCTCTCGTTGATCCAGAGGCTGCTGGTGGGGGATCTGATGGACCT
TCGCTTCCTACTAGAGGCTCTGATGAGTTCAAGCCTTTCATCCGCCGTCTCCCTGAGTTC
AAGTTCTGGTATTCGGTGACAAAGGCGTTCTGTATTGCGTTTGTGATGACGTTCTTCTCG
GTGTTTGACGTGCCTGTGTTCTGGCCTATCCTGCTTTGCTATTGGATCGTTCTCTTTGTT
CTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGATCAAGTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTC
GGCAAACAGAAATATGGTGGACGAAGCGGCAGCGGCCCACGTAATGCGGACTGATCTGAC
CAA*TTTTTATGATGAATGTTGGCCATTGCAAA
C

QA 4 696 4 696
DS 

RD RR2BG85TF 797 0 0
GGGGCGGATCAAAATCCATTTGCTTCATTTCGCGTTTTGTTGCGTCTTTCGTCGGATCTG
CTCCATTTCTGGATAAGCATCTCTCATCTTCTTCCCATGGACGTAGGCGGAGGAGGTGAT
AGTGGTTCAGTGGCAACCCCGGTTCAACAGAAAGCACACGAGGCGTGGAGGATCTACCAG
CATTACCTCGACAAGACCACGCCTCACGCTACTTACAGGTGGATCGGGACTCTCGTCGTG
GCCCTCGCCTACTGTTTGAGGGTTTACTACATCCAGGGATTCTACATCATCGCTTACGGT
CTCGGAATCTACCTCTTGAATCTCCTCATCGGGTTCTTGTCCCCTCTCGTTGATCCCGAG
GCTGCTGGTGGGGAATCTGATGGACCTTCGCTTCCTACTAGAGGCTCTGATGAGTTCAAG
CCTTTCATCCGCCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCGATGACAAAGGCGTTCTGT
ATTGCGTTTGTGATGACGTTCTTCTCGGTGTTTGACGTGCCTGTGTTCTGGCCTATCCTG
CTTTGCTATTGGATCGTTCTCTTTGTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGATC
AAGTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGAAATATGGTGGACGAAGCGGCAGC
GGCCCACGTAATGCGGACTGATCTGACCAACTTTTTATGATGAATGTTGGCCATTGCAAA
AGAACAAAACATTTGTTTTTTTTTTCTTAGAAAATCATTTTGGACTATTTTTACATTTGA
CAAAAGTTATGTAGCTA

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2HA55TF 732 0 0
TTTT
TGGATAAGCATCTCTCATCTTCTTCCCATGGACGTAGGCGGAGGAGGTGATAGTGGTTCA
GTGGCAACCCCGGTTCAACAGAAAGCACACGAGGCGTGGAGGATCTACCAGCATTACCTC
GACAAGACTACGCCTCACGCTACTTACAGGTGGATCGGGACTCTCGTCGTGGCCCTCGCC
TACTGTTTGAGGGTTTACTACATCCAGGGATTCTACATCATCGCTTACGGTCCCGGGATC
TACCTGCTGAATCTCCTCATCGGGTTCTTGTCCCCTCTCGTTGATCCAGAGGCTGCTGGT
GGGGGATCTGATGGACCTTCGCTTCCTACTAGAGGCTCTGATGAGTTCAAGCCTTTCATC
CGCCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCGATGACAAAGGCGTTCTGTATTGCGTTT
GTGATGACGTTCTTCTCGGTGTTTGACGTGCCTGTGTTCTGGCCTATCCTGCTTTGCTAT
TGGATCGTTCTCTTTGTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGATCAAGTACAAG
TACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGAAATATGGTGGACGAAGCGGCAGCGGCCCACGT
AATGCGGACTGATCTGACCAA**TTTTATGATGAATGTTGGCCATTGCAAAC*AACAAAA
CATTTGTTTTTTTTT****AGAAAATCATTTTGGACTATTTT*ACATTTGACAAA*GTTA
TGCAGCTA

QA 5 732 5 732
DS 

RD RR2C240JQ 806 0 0
TAAGCATCTCTCATCTTCTTCCCATGGACGTAGGCGGAGGAGGTGATAGTGGTTCAGTGG
CAACCCCGGTTCAACAGAAAGCACACGAGGCGTGGAGGATCTACCAGCATTACCTCGACA
AGACCACGCCTCACGCTACTTACAGGTGGATCGGGACTCTCGTCGTGGCCCTCGCCTACT
GTTTGAGGGTTTACTACATCCAGGGATTCTACATCATCGCTTACGGTCTCGGAATCTACC
TCTTGAATCTCCTCATCGGGTTCTTGTCCCCTCTCGTTGATCCCGAGGCTGCTGGTGGGG
AATCTGATGGACCTTCGCTTCCTACTAGAGGCTCTAATGAGTTCAAGCCTTTCATCCGCC
GTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCGATGACAAAGGCGTTCTGTATTGCGTTTGTGA
TGACGTTCTTCTCGGTGTTTGACGTGCCTGTGTTCTGGCCTATCCTGCTTTACTATTGGA
TCGTTCTCTTTGTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGATCAAGTACAAGTACA
TCCCTTTCAGCTTCGGCAGACAGAAATATGGTGGACGAAGCGGCAGCGGCCCACGTAATG
CGGACTGATCTGACCAACTTTTTATGATGAATGTTGGCCATTGCAAAAGAACAAAACATT
TGTTTTTTTTTT*TTAGAAAATCATTTTGGACTATTTTTACATTTGACAAAAGTTATGTA
GCTACAAGGGAAGGATTTAGAGGAAAAAACAAACGAAAGGTGGAATTAAAATTTGTTTTA
GCTTTAGTAGTAATATTGTTCGTTGC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2E059TF 690 0 0
G
AGCATTACCTCGACAAGACCACGCCTCACGCTACTTACAGGTGGATCGGGACTCTCGTCG
TGGCCCTCGCCTACTGTTTGAGGGTTTACTACATCCAGGGATTCTACATTATCGCTTACG
GTCTCGGAATCTACCTCTTGAATCTCCTCATCGGGTTCTTGTCCCCTCTCGTTGATCCCG
AGGCTGCTGGTGGGGAATCTGATGGACCTTCGCTTCCTACTAGAGGCTCTGATGAGTTCA
AGCCTTTCATCCGCCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCGATGACAAAGGCGTTCT
GTATTGCGTTTGTGATGACGTTCTTCTCGGTGTTTGACGTGCCTGTGTTCTGGCCTATCC
TGCTTTGCTATTGGATCGTTCTCTTTGTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGA
TCAAGTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGAAATATGGTGGACGAAGCGGCA
GCGGCCCACGTAATGCGGACTGATCTGACCAACTTTTTATGATGAATGTTGGCCATTGCA
AAAGAACAAAACATTTGTTTTTTTTC*CTTAGAAAATCATTTTGGACTATTTTTACATTT
GACAAAAGTTACGTAGCTACAAGGGAAGGATTTAGAGGAAAAA*CAAACGAAAG*TGGAA
TTAAAATTTGTTTTAGCTT
TAAAAAAAAA

QA 2 680 2 680
DS 

RD RR2E059JQ 445 0 0
GTTCAAGCCTTTCATCCGCCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTTTGGTATTCGATGACAAAGGC
GTTCTGTATTGCGTTTGTGATGACGTTCTTCTCGGTGTTTGACGTGCCTGTGTTTTGGCC
TATCCTGCTTTGCTATTGGATCGTTCTCTTTGTTCTCACCATGAGACGCCAGATTTCCCA
CATGATCAAGTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGAAATATGGTGGACGAAG
CGGCAGCGGCCCACGTAATGCGGACTGATTTGACCAACTTTTTATGATGAATGTTGGCCA
TTGCAAAAGAACAAAACATTTGTTTTTTTTC*CTTAGAAAATCATTTTGGACTATTTTTA
CATTTGACAAAAGTTACGTAGCTACAAGGGAAGGATTTAGAGGAAAAAACAAACGAAAGG
TGGAATTAAAATTTGTTTTAGCTT
T

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR2HA55JQ 718 0 0
GTGGCCCTCGCCTACTGTTTGAGGGTTTACTACATCCAGGGATTCTACATCATCGCTTAC
GGTCCCGGGATCTACCTGCTGAATCTCCTCATCGGGTTCTTGTCCCCTCTCGTTGATCCA
GAGGCTGCTGGTGGGGGATCTGATGGACCTTCGCTTCCTACTAGAGGCTCTGATGAGTTC
AAGCCTTTCATCCGCCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCGATGACAAAGGCGTTC
TGTATTGCGTTTGTGATGACGTTCTTCTCGGTGTTTGACGTGCCTGTGTTCTGGCCTATC
CTGCTTTGCTATTGGATCGTTCTCTTTGTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATG
ATCAAGTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGAAATATGGTGGACGAAGCGGC
AGCGGCCCACGTAATGCGGACTGATCTGACCAA**TTTTATGATGAATGTTGGCCATTGC
AAAACAACAAAACATTTGTTTTTTTTT***TAGAAAATCATTTTGGACTATTTTTACATT
TGACAAAAGTTATGCAGCTACAAGGGAAGGTTTTAGAGGAAAAAACAAACGAAAGATGGA
ATTAAAATTTGTTTTAGCTT*AGCAGTAATATTGTTCGTTGCAATAGTGTCACCTTCTAT
AGTTATATGATTTGTTCTGTTGCTCTTATACCTTTCAAAATTATTAAGAACACTTTCC

QA 1 718 1 718
DS 



CO CL423Contig2 750 2 4 U
GATTTCGCGTTTTGCGTCTTTCGTCAGATCTGCTCCATTTTTGGATAAGCATCTCTCATC
TTCTTCCCATGGACGTAGGCGGAGGAGGTGATAGTGGTTCAGTGGCAACCCCGGTTCAAC
AGAAAGCACACGAGGCGTGGAGGATCTACCAGCATTACCTCGACAAGACTACGCCTCACG
CTACTTACAGGTGGATCGGGACTCTCGTCGTGGCCCTCGCCTACTGTTTGAGGGTTTACT
ACATCCAGGGATTCTACATCATCGCTTACGGTCTCGGGATCTACCTGCTGAGTTCAAGCC
TTTCATCCGCCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCGATGACAAAGGCGTTCTGTAT
TGCGTTTGTGATGACGTTCTTCTCGGTGTTTGACGTGCCTGTGTTCTGGCCTATCCTGCT
TTGCTATTGGATCGTTCTCTTTGTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGATCAA
GTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGAAATATGGTGGACGAAGCGGCAGCGG
CCCACGTAATGCGGACTGATCTGACCAATTTTATGATGAATGTTGGCCATTGCAAAACAA
CAAAACATTTGTTTTTTTTTAGAAAATCATTTTGGACTATCTTTACATTTGACAAAAGTT
ATGCAGCTACAAGGGAAGGATTTAGAGGAAAAAACAAACGAAAGATGGAATTAAAATTTG
TTTTAGCTTAGCAGTAATATTGTTCGTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D228TF U 1
AF RR2D228JQ C 1
BS 1 619 RR2D228TF
BS 620 620 RR2D228JQ
BS 621 669 RR2D228TF
BS 670 750 RR2D228JQ

RD RR2D228TF 669 0 0
GATTTCGCGTTTTGCGTCTTTCGTCAGATCTGCTCCATTTTTGGATAAGCATCTCTCATC
TTCTTCCCATGGACGTAGGCGGAGGAGGTGATAGTGGTTCAGTGGCAACCCCGGTTCAAC
AGAAAGCACACGAGGCGTGGAGGATCTACCAGCATTACCTCGACAAGACTACGCCTCACG
CTACTTACAGGTGGATCGGGACTCTCGTCGTGGCCCTCGCCTACTGTTTGAGGGTTTACT
ACATCCAGGGATTCTACATCATCGCTTACGGTCTCGGGATCTACCTGCTGAGTTCAAGCC
TTTCATCCGCCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCGATGACAAAGGCGTTCTGTAT
TGCGTTTGTGATGACGTTCTTCTCGGTGTTTGACGTGCCTGTGTTCTGGCCTATCCTGCT
TTGCTATTGGATCGTTCTCTTTGTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGATCAA
GTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGAAATATGGTGGACGAAGCGGCAGCGG
CCCACGTAATGCGGACTGATCTGACCAATTTTATGATGAATGTTGGCCATTGCAAAACAA
CAAAACATTTGTTTTTTTT*AGAAAATCATTTTGGACTATCTTTACATTTGACAAAAGTT
ATGCAGCTA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2D228JQ 750 0 0
GATTTCGCGTTTTGCGTCTTTCGTCAGATCTGCTCCATTTTTGGATAAGCATCTCTCATC
TTCTTCCCATGGACGTAGGCGGAGGAGGTGATAGTGGTTCAGTGGCAACCCCGGTTCAAC
AGAAAGCACACGAGGCGTGGAGGATCTACCAGCATTACCTCGACAAGACTACGCCTCACG
CTACTTACAGGTGGATCGGGACTCTCGTCGTGGCCCTCGCCTACTGTTTGAGGGTTTACT
ACATCCAGGGATTCTACATCATCGCTTACGGTCTCGGGATCTACCTGCTGAGTTCAAGCC
TTTCATCCGCCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCGATGACAAAGGCGTTCTGTAT
TGCGTTTGTGATGACGTTCTTCTCGGTGTTTGACGTGCCTGTGTTCTGGCCTATCCTGCT
TTGCTATTGGATCGTTCTCTTTGTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGATCAA
GTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGAAATATGGTGGACGAAGCGGCAGCGG
CCCACGTAATGCGGACTGATCTGACCAATTTTATGATGAATGTTGGCCATTGCAAAACAA
CAAAACATTTGTTTTTTTTTAGAAAATCATTTTGGACTATCTTTACATTTGACAAAAGTT
ATGCAGCTACAAGGGAAGGATTTAGAGGAAAAAACAAACGAAAGATGGAATTAAAATTTG
TTTTAGCTTAGCAGTAATATTGTTCGTTGC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 11

CO CL424Contig1 1275 11 21 U
AATAGTTAAATACTACTCCATCCGATACAAATGTCTTAATCAAAAACCAAAAGCACAAAG
TAATAATAGTTAAATACTACTCCATCCGATACAAATGTCTTAATCAGAGACCAAAAGCAC
ACAACACATAAGCATCACTAATAAATAGTTAAAATACTACCACAATCCAATACGCATGTT
CAAATATCTTAAATTACTAAATAGAGTTGGTAAGTCAACTCGTGGGGGAAGAGCGGAGGC
CACGGTTCTTGTACGTCTGATACCACCTAGGACTAGACAACCTCCACAGCTTAGGAACTC
CTAAGCGACGCTTAAGCTTTTGGGATCCCTTCTTAGAAGCTGTCGAAGCCGCCGTTGCTG
CTTCTTCTGCAATCCAGCAATCACCTTGGATGCTCAATGTTCCGGTAGACTGGTTGATAA
CTCGTCTCACAACAGCTTGGTAGTGATAAGGCTCACAAGTCCTAGCCTTGGCCAAGTCCT
TGTATGCTATGTAGATGACCGCAGCTTCAGACTTGAGACTTGGGGGCTCCTTGTCATCTA
GAGACTCAATGGCTACTTGGACAATCTCCAAGTCAAACTTGGAGAGATCCCTAGCAGTAA
TCCACCTATGGGAAGTACAGATTGCAAGTTCCACGTACAAAGAAATCCAATCACACTGCA
ACTCAGATTCATTCAACATGTAAAAACGCTGCTTTGTGCCACTGAAAGAGGAGGGCCATG
GAATAGACTTGGTCCCGTTCCAGCCCTGCAATCTGTCTGGGAAGGTTGTAGACACTGGCT
CGGAATGTGGACGTAAGAAAGGAGTTGACTCCTTCTTTGAACTCTCGGTTCCTTGAGGTC
TAGAGATGGGGCATGTCAAATCCAAAATGCCAAGATCTTCTTCCTCTACGAGAACCTGAA
AGATCTGCTGGAAACCGGTAGATGGAAGACGCGCAACCAAGGTCATGTAGTAAGGAGATG
CAGCACCACGCATGCTGAATTTCATTAAGCTATCTAGCTCAAAGTTTGTCCCCTCTAACC
AGTTGTAGCGATGAAGGCCGAGCTTGGCATAAAGATTCGCCAAGGCGCAGTTAGGGTATA
TACGCCCTTCACCACATTCCACACGTATCCAGCCAAAGTCCCAACGTCTTGGTGGAAACC
CCTCCGGGAAGTTGAAAAAATCCAGCTCTTCCCTTCGTACACAACTCTGACTCATCTCCT
TAGTATGTTCTCCAGCGAACGACTCGTCTTCCTCAAGTCGGAAGGTTGCTGGTTACACAC
AATGCGGCTATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 20 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AV72JQ U 1
AF RR2EM50JQ U 283
AF RR2BP84JQ U 110
AF RR2H804JQ U 58
AF RR2B658JQ U 52
AF RR2F076JQ U 49
AF RR2F076TF C 403
AF RR2AV72TF C 544
AF RR2B658TF C 425
AF RR2EM50TF C 532
AF RR2H804TF C 597
BS 1 106 RR2AV72JQ
BS 107 107 RR2F076JQ
BS 108 153 RR2AV72JQ
BS 154 155 RR2F076JQ
BS 156 222 RR2AV72JQ
BS 223 223 RR2F076JQ
BS 224 241 RR2AV72JQ
BS 242 242 RR2F076JQ
BS 243 275 RR2AV72JQ
BS 276 276 RR2F076JQ
BS 277 285 RR2AV72JQ
BS 286 286 RR2F076JQ
BS 287 335 RR2AV72JQ
BS 336 336 RR2F076JQ
BS 337 343 RR2AV72JQ
BS 344 913 RR2F076JQ
BS 914 1118 RR2F076TF
BS 1119 1253 RR2B658TF
BS 1254 1257 RR2EM50TF
BS 1258 1258 RR2H804TF
BS 1259 1275 RR2EM50TF

RD RR2AV72JQ 343 0 0
AATAGTTAAATACTACTCCATCCGATACAAATGTCTTAATCAAAAACCAAAAGCACAAAG
TAATAATAGTTAAATACTACTCCATCCGATACAAATGTCTTAATCAAAGACCAAAAGCAC
ACAACACATAAGCATCACTAATAAATAGTTAAA**ACTACCACAATCCAATACGCATGTT
CAAATATCTTAAATTACTAAATAGAGTTGGTAAGTCAACTCGGGGGGGAAGAGCGGAGGC
CCCGGTTCTTGTACGTCTGATACCACCTAGGACTAAACAACCTCCCCAGCTTAGGAACTC
CTAAGCGACGCTTAAGCTTTTGGGATCCCTTCTTAAAAGCTGT

QA 1 343 1 343
DS 

RD RR2EM50JQ 210 0 0
TCCACAGCTTAAGAACTCCTAAGCGACGCTTAAGCTTTTGGGATCCCTTCTTAAAAGCTG
TCGAAACCGCCGTTGCTGCTTCTTCTGCAATCCAGCAATCACCTTGGATGCTCAATGTTC
CGGTAGACTGGTTGATAACTCGTCTCACAACAGCTTGGTAGTGATAAGGGTCACAAGTCC
TAACCTTGGCCAAGTCCTTGTATGCTATGT

QA 1 210 1 210
DS 

RD RR2BP84JQ 433 0 0
ACCAAAAA
CACACAACACATAAGCATCACTAATAAATAGTTAAAATACTACCACAATCCAATACGCAT
GTTCAAATGTCTTAAATTACTAAATAGAGTTGGTAAGTCAACTCGTGGGGGAAGAGCGGA
GGCCACGGTTCTTGTACGTCTGATACCACCTAGGACTAGACAACCTCCACAGCTTAGGAA
CTCCTAAGCGACGCTTAAGCTTTTGGGATCCCTTCTTAGAAGCTGTCGAAGCCGCCGTTG
CTGCTTCTTCTGCAATCCAGCAATCACCTTGGATGCTCAATGTTCCGGTAGACTGGTTGA
TAACTCGTCTCACAACAGCTTGGTAGTGATAAGGCTCACAAGTCCTAACCTTGGCCAAGT
CCTTGTATGCTATGTAAATGACCGCAGCTTCAGACTTGAGACTTGGGGGCTCCTTATCAT
CTAGA

QA 9 433 9 433
DS 

RD RR2H804JQ 739 0 0
G
AGTAATAATAGTTAAATACTACTCCATCCGATACAAATGTCTTAATCAGAGACCGAAAGC
ACACAACACATAAGCATCACTAATAAATAGTTAAAATACTACCACAATCCAATACGCATG
TTCAAATATCTTAAATTACTAAATAGAGTTGGTAAGTCAACTCGTGGGGGAAGAGCGGAG
GCCACGGTTCTTGTACGTCTGATACCACCTAGGACTAGACAACCTCCACAGCTTAGGAAC
TCCTAAGCGACGCTTAAGCTTTTGGGATCCCTTCTTAGAAGCTGTCGAAGCCGCCGTTGC
TGCTTCTTCTGCAATCCAGCAATCACCTTGGATGCTCAATGTTCCGGTAGACTGGTTGAT
AACTCGTCTCACAACAGCTTGGTAGTGATAAGGCTCACAAGTCCTAGCCTTGGCCAAGTC
CTTGTATGCTATGTAGATGACCGCAGCTTCAGACTTGAGACTTGGGGGCTCCTTGTCATC
TAGAGACTCAATGGCTACTTGGACAATCTCCAAGTCAAACTTGGAGAGATCCCTAGCAGT
AATCCACCTATGGGAAGTACAGATTGCAAGTTCCACGTACAAAGAAATCCAATCACACTG
CAACTCAGATTCATTCAACATGTAAAAACGCTGCTTTGTGCCACTGAAAGAGGAGGGCCA
TGGAATAGACTTGGTCCCGTTCCAGCCCTGCAATCTGTCTGGGAAGGTTGTAGACACTGG
CTCGGAATGTGGACGTAA

QA 2 739 2 739
DS 

RD RR2B658JQ 823 0 0
GGCACAA
AGTAATAATAGTTAAATACTACTCCATCCGATACAAATGTCTTAATCAGAGACCAAAAGC
ACACAACACATAAGCATCACTAATAAATAGTTAAAATACTACCACAATCTAATACGCATG
TTCAAATATCTTAAATTACTAAATAGAGTTGGTAAGTCAACTCGTGGGGGAAGAGCGGAG
GCCACGGTTCTTGTACGTCTGATACCACCTAGGACTAGACAACCTCCACAGCTTAGGAAC
TCCTAAGCGACGCTTAAGCTTTTGGGATCCCTTCTTAGAAGCTGTCGAAGCCGCCGTTGC
TGCTTCTTCTGCAATCCAGCAATCACCTTGGATGCTCAATGTTCCGGTAGACTGGTTGAT
AACTCGTCTCACAACAGCTTGGTAGTGATAAGGCTCACAGGTCCTAGCCTTGGCCAAGTC
CTTGTATGCTATGTAGATGACCGCAGCTTCAGACTTGAGACTTGGGGGCTCCTTGTCATC
TAGAGACTCAATGGCTACTTGGACAATCTCCAAGTCAAACTTGGAGAGATCCCTAGCAGT
AATCCACCTATGGGAAGTACAGATTGCAAGTTCCACGTACAAAGAAATCCAATCACATTG
CAATTCAGATTCATTCAACATGTAAAAACGCTGCTTTGTGCCACTGAAAGAGGAGGGCCA
TGGAATAGACTTGGTCCCGTTCCAGCCCTGCAATCTGTCTGGGAAGGTTGTAGACACTGG
CTCGGAATGTGGACGAAAGAAAGGAGTTGACTCCTTCTTTGAACTCTCGGTTCCTTGAGG
TCTAGAGATGGGGCATGTCAAATCCAAAATGCCAAG

QA 8 823 8 823
DS 

RD RR2F076JQ 871 0 0
AAAA
GCACAAAGTAATAATAGTTAAATACTACTCCATCCGATACAAATGTCTTAATCAGAGACC
GAAAGCACACAACACATAAGCATCACTAATAAATAGTTAAAATACTACCACAATCCAATA
CGCATGTTCAAATATCTTAAATTACTAAATAGAGTTGGTAAGTCAACTCGTGGGGGAAGA
GCGGAGGCCACGGTTCTTGTACGTCTGATACCACCTAGGACTAGACAACCTCCACAGCTT
AGGAACTCCTAAGCGACGCTTAAGCTTTTGGGATCCCTTCTTAGAAGCTGTCGAAGCCGC
CGTTGCTGCTTCTTCTGCAATCCAGCAATCACCTTGGATGCTCAATGTTCCGGTAGACTG
GTTGATAACTCGTCTCACAACAGCTTGGTAGTGATAAGGCTCACAAGTCCTAGCCTTGGC
CAAGTCCTTGTATGCTATGTAGATGACCGCAGCTTCAGACTTGAGACTTGGGGGCTCCTT
GTCATCTAGAGACTCAATGGCTACTTGGACAATCTCCAAGTCAAACTTGGAGAGATCCCT
AGCAGTAATCCACCTATGGGAAGTACAGATTGCAAGTTCCACGTACAAAGAAATCCAATC
ACACTGCAACTCAGATTCATTCAACATGTAAAAACGCTGCTTTGTGCCACTGAAAGAGGA
GGGCCATGGAATAGACTTGGTCCCGTTCCAGCCCTGCAATCTGTCTGGGAAGGTTGTAGA
CACTGGCTCGGAATGTGGACGTAAGAAAGGAGTTGACTCCTTCTTTGAACTCTCGGTTCC
TTGAGGTCTAGAGATGGGGCATGTCAAATCCAAAATGCCAAGATCTTCTTCCTCTACGAG
AACCTGAAAGATCTGCTGGAA
CCGGTA

QA 5 865 5 865
DS 

RD RR2F076TF 717 0 0
CGGTAGACTGGTTGATAACTCGTCTCACAACAGCTTGGTAGTGATAAGGCTCACAAGTCC
TAGCCTTGGCCAAGTCCTTGTATGCTATGTAGATGACCGCAGCTTCAGACTTGAGACTTG
GGGGCTCCTTGTCATCTAGAGACTCAATGGCTACTTGGACAATCTCCAAGTCAAACTTGG
AGAGATCCCTAGCAGTAATCCACCTATGGGAAGTACAGATTGCAAGTTCCACGTACAAAG
AAATCCAATCACACTGCAACTCAGATTCATTCAACATGTAAAAACGCTGCTTTGTGCCAC
TGAAAGAGGAGGGCCATGGAATAGACTTGGTCCCGTTCCAGCCCTGCAATCTGTCTGGGA
AGGTTGTAGACACTGGCTCGGAATGTGGACGTAAGAAAGGAGTTGACTCCTTCTTTGAAC
TCTCGGTTCCTTGAGGTCTAGAGATGGGGCATGTCAAATCCAAAATGCCAAGATCTTCTT
CCTCTACGAGAACCTGAAAGATCTGCTGGAAACCGGTAGATGGAAGACGCGCAACCAAGG
TCATGTAGTAAGGAGATGCAGCACCACGCATGCTGAATTTCATTAAGCTATCTAGCTCAA
AGTTTGTCCCCTCTAACCAGTTGTAGCGATGAAGGCCGAGCTTGGCATAAAGATTCGCCA
AGGCGCAGTTAGGGTATATACGCCCTTCACCACATTCCACACGTATCCAGCCAAAG
C

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2AV72TF 599 0 0
ACTCAATGGCTACTTGGACAATCTCCAAGTCAAACTTGGAGAGATCCCTAGCAGTAATCC
ACCTATGGGAAGTACAGATTGCAAGTTCCACGTACAAAGAAATCCAATCACACTGCAACT
CAGATTCATTCAACATGTAAAAACGCTGCTTTGTGCCACTGAAAGAGGAGGGCCATGGAA
TAGACTTGGTCCCGTTCCAGCCCTGCAATCTGTCTGGGAAGGTTGTAGACACTGGCTCGG
AATGTGGACGTAAGAAAGGAGTTGACTCCTTCTTTGAACTCTCGGTTCCTTGAGGTCTAG
AGATGGGGCATGTCAAATCCAAAATGCCAAGATCTTCTTCCTCTACGAGAACCTGAAAGA
TCTGCTGGAAACCGGTAGATGGAAGACGCGCAACCAAGGTCATGTAGTAAGGAGATGCAG
CACCACGCATGCTGAATTTCATTAAGCTATCTAGCTCAAAGTTTGTCCCCTCTAACCAGT
TGTAGCGATGAAGGCCGAGCTTGGCATAAAGATTCGCCAAGGCGCAGTTAGGGTATATAC
GCCCTTCACCACATTCCACACGTATCCAGCCAAAGTCCCAACGTCTTGGTGGAAACCCC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2B658TF 829 0 0
TCTCACAACAGCTTGGTAGTGATAAGGCTCACAGGTCCTAGC*TTGGCCAAGTC*TTGTA
TGCTATGTAGATGACCGCAGCTTCAGACTTGAGACTTGGGGGCTCCTTGTCATCTAGAGA
CTCAATGGCTACTTGGACAATCTCCAAGTCAAACTTGGAGAGATCCCTAGCAGTAATCCA
CCTATGGGAAGTACAGATTGCAAGTTCCACGTACAAAGAAATCCAATCACATTGCAATTC
AGATTCATTCAACATGTAAAAACGCTGCTTTGTGCCACTGAAAGAGGAGGGCCATGGAAT
AGACTTGGTCCCGTTCCAGCCCTGCAATCTGTCTGGGAAGGTTGTAGACACTGGCTCGGA
ATGTGGACGAAAGAAAGGAGTTGACTCCTTCTTTGAACTCTCGGTTCCTTGAGGTCTAGA
GATGGGGCATGTCAAATCCAAAATGCCAAGATCTTCTTCCTCTACGAGAACCTGAAAGAT
CTGCTGGAAACCGGTAGATGGAAGACGCGCAACCAAGGTCATGTAGTAAGGAGATGCAGC
ACCACGCATGCTGAATTTCATTAAGCTATCTAGCTCAAAGTTTGTCCCCTCTAACCAGTT
GTAGCGATGAAGGCCGAGCTTGGCATAAAGATTCGCCAAGGCGCAGTTAGGGTATATACG
CCCTTCACCACATTCCACACGTATCCAGCCAAAGTCCCAACGTCTTGGTGGAAACCCCTC
CGGGAAGTTGAAAAAATCCAGCTCTTCCCTTCGTACACAACTCTGACTCATCTCCTTAGT
ATGTTCTCCAGCGAACGACTCGTCTTCCTCAAGTCGGAAGGTTGCTGGT

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2EM50TF 744 0 0
TGTCATCTAGAGACTCAATGGCTACTTGGACA*TCTCCAAGTCAAACTTGGAGAGATCCC
TAGCAGTA*TCCAC*TATGGGAAGTACAGATTGCAAGTTCCACGTACAAAGAAATCCAAT
CACATTGCAACTCAGATTCATTCAACATGTAAAAACGCTGCTTTGTGCCACTGAAAGAGG
AGGGCCATGGAATAGACTTGGTCCCGTTCCAGCCCTGCAATCTGTCTGGGAAGGTTGTAG
ACACTGGCTCGGAATGTGGACGTAAGAAAGGAGTTGACTCCTTCTTTGAACCCTCGGTTC
CTTGAGGTCTAGAGATGGGGCATGTCAAATCCAAAATGCCAAGATCTTCTTCCTCTACGA
GAACCTGAAAGATCTGCTGGAAACCGGTAGATGGAAGACGCGCAACCAAGGTCATGTAGT
AAGGAGATGCAGCACCACGCATGCTGAATTTCATTAAGCTATCTAGCTCAAAGTTTGTCC
CCTCTAACCAGTTGTAGCGATGAAGGCCGAGCTTGGCATAAAGATTCGCCAAGGCGCAGT
TAGGGTATATACGCCCTTCACCACATTCCACACGTATCCAGCCAAAGTCCCAACGTCTTG
GTGGAAACCCCTCCGGGAAGTTGAAAAAATCCAGCTCTTCCCTTCGTACACAACTCTGAC
TCATCTCATTAGTATGTTCTCCAGCGAACGACTCGTCTTCCTCAAGTCGGAAGGTTGCTG
GTTACATACAATGCGGCTATCTCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2H804TF 679 0 0
CAGTATCCA
CTATGGGAAGTACAGATTGCAAGTTCCACGTACAAAGAAATCCAATCACACTGCAACTCA
GATTCATTCAACATGTAAAAACGCTGCTTTGTGCCACTGAAAGAGGAGGGCCATGGAATA
GACTTGGTCCCGTTCCAGCCCTGCAATCTGTCTGGGAAGGTTGTAGACACTGGCTCGGAA
TGTGGACGTAAGAAAGGAGTTGACTCCTTCTTTGAACTCTCGGTTCCTTGAGGTCTAGAG
ATGGGGCATGTCAAATCCAAAATGCCAAGATCTTCTTCCTCTACGAGAACCTGAAAGATC
TGCTGGAAACCGGTAGATGGAAGACGCGCAACCAAGGTCATGTAGTAAGGAGATGCAGCA
CCACGCATGCTGAATTTCATTAAGCTATCTAGCTCAAAGTTTGTCCCCTCTAACCAGTTG
TAGCGATGAAGGCCGAGCTTGGCATAAAGATTCGCCAAGGCGCAGTTAGGGTATATACGC
CCTTCACCACATTCCACACGTATCCAGCCAAAGTCCCAACGTCTTGGTGGAAACCCCTCC
GGGAAGTTGAAAAAATCCAGCTCTTCCCTTCGTACACAACTCTGACTCATCTCCTTAGTA
TGTTCTCCAGCGAACGACTCGTCTTCCTCAAGTCGGAAGGTTGCTGGTTACACACAATGC
GGCTATCTCC

QA 10 679 10 679
DS 



AS 1 11

CO CL425Contig1 857 11 10 U
GGATATGAATCATTTCTGCAAGATCATAAAAACTGAATATCAAACTAGCTGCTTGTAAAC
ATCTACACTCTCAACCTCAAGCACACAAAATAAAAAAAGAAATGGGAACAGAGATGGTAA
TGGTTCACGAGGTTCCTTTTCCTCCACAGATCATCACTTCCAAGCCCCTCTCTCTTCTTG
GACAAGGCATCACTGACATCGAGATCCATTTTCTCCAAGTGAAGTTCACGGCCATAGGAG
TTTACCTAGATCCATCAGATGTTAAAACCCATCTTGACAAATGGAAAGGCAAGACCGGAA
AGGATCTCGCCGGCGATGACGACTTCTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAG
TTATAAGAGTGGTGGTGATAAAAGAAATAAAAGGAGCTCAGTACGGAGTGCAGCTAGAGA
ATGCGGTGAGAGATCGTTTGGCTGCTGAGGATAAGTACGAGGAGGAAGAAGAAACCGAGC
TCGAGAAAGTTGTTGGATTTTTT*CAGTCTAAGTACTTCAAGACTCATTCTATCATTACT
TACCGTTTCGCAGCCAAAGATGGCATTTGCGAGATCGGATTTGAGACGGAAGGTAAAGAA
GAGGAGAAATTGAAAGTAGAGAATGCTAATGTGGTGGGGATGATGCAGAAGTGGTACTTG
TCTGGAAGTAGAGGAGTTTCACCGTCCACCATCGTCTCCCTCGCCGATTCTCTGTCCGCA
GTTTTAACCTAAAACTACTTATATAAGCACCTATCATCTTGTTGCCCCCAAAAAAAGCAC
CTAGCATCTATGTGTGTTTTATGTTGTTGTATTATGCCGTTCTTAAGCGAGACATCGTGT
TAATTGGTTATCTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 35 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 50 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 55 40 55 50 35 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK81TF U 10
AF RR2C969TF U 5
AF RR2CY29TF U 10
AF RR2D085TF U 10
AF RR2GY93TF U 10
AF RR2D085JQ C 324
AF RR2EN72TF U 1
AF RR2CY29JQ C 142
AF RR2C969JQ C 146
AF RR2GY93JQ C 216
AF RR2FK81JQ C 109
BS 1 13 RR2EN72TF
BS 14 14 RR2FK81TF
BS 15 231 RR2EN72TF
BS 232 232 RR2FK81TF
BS 233 361 RR2EN72TF
BS 362 362 RR2FK81TF
BS 363 700 RR2EN72TF
BS 701 701 RR2GY93TF
BS 702 755 RR2EN72TF
BS 756 857 RR2FK81JQ

RD RR2FK81TF 629 0 0
GAT
TTTCTGCAAGATCATAAAAACTGAATATCAAACTAGCTGCTTGTAAACATCTACACTCTC
AACCTCAAGCACACAAAATAAAAAAAGAAATGGGAACAGAGATGGTAATGGTTCACGAGG
TTCCTTTTCCTCCACAGATCATCACTTCCAAGCCCCTCTCTCTTCTTGGACAAGGCATCA
CTGACATCGAGATCCATTTTCTCCAAGTGAAGTTCACGGCCATAGGAGTTTACCTAGATC
CATCAGATGTTAAAACCCATCTTGACAAATGGAAAGGCAAGACCGGAAAGGATCTCGCCG
GCGATGACGACTTCTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAGTTATAAGAGTGG
TGGTGATAAAAGAAATAAAAGGAGCTCAGTACGGAGTGCAGCTAGAGAATGCGGTGAGAG
ATCGTTTGGCTGCTGAGGATAAGTACGAGGAGGAAGAAGAAACCGAGCTCGAGAAAGTTG
TTGGATTTTTT*CAGTCTAAGTACTTCAAGACTCATTCTATCATTACTTACCGTTTCGCA
GCCAAAGATGGCATTTGCGAGATCGGATTTGAGACGGAAGGTAAAGAAGAGGAGAAATTG
AAAGTAGAGA*TGCTAATGTGGTGGG

QA 4 629 4 629
DS 

RD RR2C969TF 629 0 0
GGGAATC
ATTTCTGCAAGATCATAAAAACTGAATATCAAACTAGCTGCTTGTAAACATCTACACTCT
CAACCTCAAGCACACAAAATAAAAAAAGAAATGGGAACAGAGATGGTAATGGTTCACGAG
GTTCCTTTTCCTCCACAGATCATCACTTCCAAGCCCCTCTCTCTTCTTGGACAAGGCATC
ACTGACATCGAGATCCATTTTCTCCAAGTGAAGTTCACGGCCATAGGAGTTTACCTAGAT
CCATCAGATGTTAAAACCCATCTTGACAAATGGAAAGGCAAGACCGGAAAGGATCTCGCC
GGCGATGACGACTTCTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAGTTATAAGAGTG
GTGGTGATAAAAGAAATAAAAGGAGCTCAGTACGGAGTGCAGCTAGAGAATGCGGTGAGA
GATCGTTTGGCTGCTGAGGATAAGTACGAGGAGGAAGAAGAAACCGAGCTCGAGAAAGTT
GTTGGATTTTTT*CAGTCTAAGTACTTCAAGACTCATTCTATCATTACTTACCGTTTCGC
AGCCAAAGATGGCATTTGCGAGATCGGATTTGAGACGGAAGGTAAAGAAGAGGAGAAATT
GAAAGTAGAGAATGCTAATGTG

QA 8 629 8 629
DS 

RD RR2CY29TF 600 0 0
GGA
TTTCTGCAAGATCATAAAAACTGAATATCAAACTAGCTGCTTGTAAACATCTAC*CTCTC
AACCTCAAGCACACAAAATAAAAAAAGAAATGGGAACAGAGATGGTAATGGTTCACGAGG
TTCCTTTTCCTCCACAGATCATCACTTCCAAGCCCCTCTCTCTTCTTGGACAAGGCATCA
CTGACATCGAAATCCATTTTCTCCAAGTGAAGTTCACGGCCATAGGAGTTTACCTAGACC
CATCAGATGTTAAAACCCATCTTGACAAATGGAAAGGCAAGACCGGAAAGGAACTCGCCG
GCGATGACGACCTCTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAGTTATAAGAGTGG
TGGTGATAAAAGAAATAAAGGGAGCTCAGTACGGAGTGCAGCTAGAGAATGCGGTGAGAG
AACGTTTGGCTGCTGAGGATAAGTACGAGGAGGAAGAAGAAACCGAGCTCGAGAAAGTTG
TTGGATTTTTTTCAGTCTAAGTACTTCAAGACTCATTCTATCATTACTTACCGTTTCGCA
GCCAAAGATGGCATTTGCGAGATCGGATTTGAGACGGAAGGTAAAGAAGAGGA
AAAA

QA 4 596 4 596
DS 

RD RR2D085TF 621 0 0
GAT
TTTCTACAAGATCATAAAAACTGAATATCAAACTAGCTGCTTGTAAACATCTACACTCTC
AACCTCAAGCACACAAAATAAAAAAAGAAATGGGAACAGAGATGGTAATGGTTCACGAGG
TTCCTTTTCCTCCACAGATCATCACTTCCAAGCCCCTCTCTCTTCTTGGACAAGGCATCA
CTGACATCGAGATCCATTTTCTCCAAGTGAAGTTCACGGCCATAGGAGTTTACCTAGATC
CATCAGATGTTAAAACCCATCTTGACAAATGGAAAGGCAAGACCGGAAAGGATCTCGCCG
GCGATGACGACTTCTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAGTTATAAGATTGG
TGGTGATAAAAGAAATAAAAGGAGCTCAGTACGGAGTGCAGCTAGAGAATGCGGTGAGAG
ATCGTT*GGCTGCTGAGGATAAGTACGAGGAGGAAGAAGAAACCGAGCTCGAGAAAGTTG
TTGGATTTTTT*CAGTCTAAGTACTTCAAGACTCATTCTATCATTACTTACCGTTTCGCA
GCCAAAGATGGCATT*GCGAGATCGGATTTGAGACGGAAGGTAAAGAAGAGGAGAAATTG
AAAGTAGAGAATGCTAAT

QA 4 621 4 621
DS 

RD RR2GY93TF 709 0 0
GGA
TTTCTGCAAGATCATAAAAACTGAATATCAAACTAGCTGCTTGTAAACATCTACACTCTC
AACCTCAAGCACACAAAATAAAAAAAGAAATGGGAACAGAGATGGTAATGGTTCACGAGG
TTCCTTTTCCTTCACAGATCATCACTTCCAAGCCCCTCTCTCTTCTTGGACAAGGCATCA
CTGACATCGAGATCCATTTTCTCCAAGTGAAGTTCACGGCCATAGGAGTTTACCTAGATC
CATCAGATGTTAAAACCCATCTTGACAAATGGAAAGGCAAGACCGGAAAGGATCTCGCCG
GCGATGACGACTTCTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAGTTATAAGAGTGG
TGGTGATAAAAGAAATAAAAGGAGCTCAGTACGGAGTGCAGCTAGAGAATGCGGTGAGAG
ATCGTTTGGCTGCTGAGGATAAGTACGAGGAGGAAGAAGAAACCGAGCTCGAGAAAGTTG
TTGGATTTTTT*CAGTCTAAGTACTTCAAGACTCATTCTATCATTACTTACCGTTTCGCA
GCCAAAGATGGCATTTGCGAGATCGGATTTGAGACGGAAGGTAAAGAAGAGGAGAAATTG
AAAGTAGAGAATGCTAATGTGGTGGGGATGATGCAGAAGTGGTACTTGTCTGGAAGTAGA
GGAGTTTCACCGTCCACCATCGTCTCCCTCGCCGATTCTCTGTCCG

QA 4 709 4 709
DS 

RD RR2D085JQ 366 0 0
TTT
TTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAGTTATAAGATTGGTGGTGATAAAAGAA
ATAAAAGGAGCTCAGTACGGAGTGCAGCTAGAGAATGCGGTGAGAGATCGTT*GGCTGCT
GAGGATAAGTACGAGGAGGAAGAAGAAACCGAGCTCGAGAAAGTTGTTGGATTTTTT*CA
GTTTAAGTACTTCAAGACTCATTTTATCATTACTTACCGTTTCGCAGCCAAAGATGGCAT
T*GCGAGATCGGATTTGAGACGGAAGGTAAAGAAGAGGAGAAATTGAAAGTAGGGAATGC
TAATGTGGGGGGGATGATGCAGAAGTGGTACTTGTTTGGAAGTAGAGGAGTTTCCCCGTC
C
CC

QA 4 364 4 364
DS 

RD RR2EN72TF 755 0 0
GGATATGAATCATCTCTGCAAGATCATAAAAACTGAATATCAAACTAGCTGCTTGTAAAC
ATCTACACTCTCAACCTCAAGCACACAAAATAAAAAAAGAAATGGGAACAGAGATGGTAA
TGGTTCACGAGGTTCCTTTTCCTCCACAGATCATCACTTCCAAGCCCCTCTCTCTTCTTG
GACAAGGCATCACTGACATCGAGATCCATTTTCTCCAAGTGAAGTTCACGGTCATAGGAG
TTTACCTAGATCCATCAGATGTTAAAACCCATCTTGACAAATGGAAAGGCAAGACCGGAA
AGGATCTCGCCGGCGATGACGACTTCTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAG
TCATAAGAGTGGTGGTGATAAAAGAAATAAAAGGAGCTCAGTACGGAGTGCAGCTAGAGA
ATGCGGTGAGAGATCGTTTGGCTGCTGAGGATAAGTACGAGGAGGAAGAAGAAACCGAGC
TCGAGAAAGTTGTTGGATTTTTT*CAGTCTAAGTACTTCAAGACTCATTCTATCATTACT
TACCGTTTCGCAGCCAAAGATGGCATTTGCGAGATCGGATTTGAGACGGAAGGTAAAGAA
GAGGAGAAATTGAAAGTAGAGAATGCTAATGTGGTGGGGATGATGCAGAAGTGGTACTTG
TCTGGAAGTAGAGGAGTTTCACCGTCCACCATCGTCTCCCCCGCCGATTCTCTGTCCGCA
GTTTTAACCTAAAACTACTTATATAAGCACCTATC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2CY29JQ 603 0 0
CTCCACAGATCATCACTTCCAAGCCCCTCTCTCTTCTTGGACAAGGCATCACTGACATCG
AAATCCATTTTCTCCAAGTGAAGTTCACGGCCATAGGAGTTTACCTAGATCCATCAGATG
TTAAAACCCATCTTGACAAATGGAAAGGCAAGACCGGAAAGGATCTCGCCGGCGATGACG
ACCTTTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAGTTATAAGAGTGGTGGTGATAA
AAGAAATAAAGGGAGCTCAGTACGGAGTGCAGCTAGAGAATGCGGTGAGAGATCGTTTGG
CTGCTGAGGATAAGTACGAGGAGGAAGAAGAAACCGAGCTCGAGAAAGTTGTTGGATTTT
TTTCAGTCTAAGTACTTCAAGACTCATTCTATCATTACTTACCGTTTCGCAGCCAAAGAT
GGCATTTGCGAGATCGGATTTGAGACGGAAGGTAAAGAAGAGGAAAAATTGAAAGTAGAG
AATGCTAATG*GGTGGGGATGATGCAGAAGTGGTACTTGTCTGGAAGTAGAGGAGTTTCA
CCGTCCACCATCGTCTCCCTCGCCGATTCTCTGTCCGCAGTTTTAATCTAAAACTACTTA
TAT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2C969JQ 625 0 0
ACAGATCATCACTTCCAAGCCCCTCTCTCTTCTTGGACAAGGCATCACTGACATCGAGAT
CCATTTTCTCCAAGTGAAGTTCACGGCCATAGGAGTTTACCTAGATCCATCAGATGTTAA
AACCCATCTTGACAAATGGAAAGGCAAGACCGGAAAGGATCTCGCCGGCGATGACGACTT
TTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAGTTATAAGAGTGGTGGTGATAAAAGA
AATAAAAGGAGCTCAGTACGGAGTGCAGCTAGAGAATGCGGTGAGAGATCGTTTGGCTGC
TGAGGATAAGTACGAGGAGGAAGAAGAAACCGAGCTCGAGAAAGTTGTTGGATTTTTT*C
AGTCTAAGTACTTCAAGACTCATTCTATCATTACTTACCGTTTCGCAGCCAAAGATGGCA
TTTGCGAGATCGGATTTGAGACGGAAGGTAAAGAAGAGGAGAAATTGAAAGTAGAGAATG
CTAATGTGGTGGGGATGATGCAGAAGTGGTACTTGTCTGGAAGTAGAGGAGTTTCACCGT
CCACCATCGTCTCCCTCGCCGATTCTCTGTCCGCAGTTTTAACCTAAAACTACTTATATA
AGCCCCTATCATCTTGTTGCCCCCA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2GY93JQ 614 0 0
CAAGTGAAGTTCACGGCCATAGGAGTTTACCTAGATCCATCAGATGTTAAAACCCATCTT
GACAAATGGAAAGGCAAGACCGGAAAGGATCTCGCCGGCGATGACGACTTCTTCGACGCC
CTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAGTTATAAGAGTGGTGGTGATAAAAGAAATAAAAGGA
GCTCAGTACGGAGTGCAGCTAGAGAATGCGGTGAGAGATCGTTTGGCTGCTGAGGATAAG
TACGAGGAGGAAGAAGAAACCGAGCTCGAGAAAGTTGTTGGATTTTTT*CAGTTTAAGTA
CTTCAAGACTCATTTTATCATTACTTACCGTTTCGCAGCCAAAGATGGCATTTGCGAGAT
CGGATTTGAGACGGAAGGTAAAGAAGAGGAGAAATTGAAAGTAGAGAATGCTAATGTGGT
GGGGATGATGCAGAAGTGGTACTTGTTTGGAAGTAGAGGAGTTTCACCGTCCACCATCGT
CTCCCTCGCCGATTTTCTGTCCGCAGTTTTAACCTAAAACTACTTATATAAGCACCTATC
ATCTTGTTGCCCCCAAAAAAAGCCCCTAGCATCTATGTGTGTTTTATGTTGTTGTATTAT
GCCGTTTTTAAG
GG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2FK81JQ 749 0 0
CAGAGATGGTAATGGTTCACGAGGTTCCTTTTCCTCCACAGATCATCACTTCCAAGCCCC
TCTCTCTTCTTGGACAAGGCATCACTGACATCGAGATCCATTTTCTCCAAGTGAAGTTCA
CGGCCATAGGAGTTTACCTAGATCCATCAGATGTTAAAACCCATCTTGACAAATGGAAAG
GCAAGACCGGAAAGGATCTCGCCGGCGATGACGACTTCTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGG
AGATTGAGAAAGTTATAAGAGTGGTGGTGATAAAAGAAATAAAAGGAGCTCAGTACGGAG
TGCAGCTAGAGAATGCGGTGAGAGATCGTTTGGCTGCTGAGGATAAGTACGAGGAGGAAG
AAGAAACCGAGCTCGAGAAAGTTGTTGGATTTTTT*CAGTCTAAGTACTTCAAGACTCAT
TCTATCATTACTTACCGTTTCGCAGCCAAAGATGGCATTTGCGAGATCGGATTTGAGACG
GAAGGTAAAGAAGAGGAGAAATTGAAAGTAGAGAATGCTAATGTGGTGGGGATGATGCAG
AAGTGGTACTTGTCTGGAAGTAGAGGAGTTTCACCGTCCACCATCGTCTCCCTCGCCGAT
TCTCCGTCCGCAGTTTTAACCTAAAACTACTTATATAAGCACCTATCATCTTGTTGCCCC
CAAAAAAAGCACCTAGCATCTATGTGTGTTTTATGTTGTTGTATTATGCCGTTCTTAAGC
GAGACATCGTGTTAATTGGTTATCTTTAC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 12

CO CL426Contig1 787 12 19 U
GGGAGTAGAAAAAAAAGTGAGAGAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCC
TAGTAACCATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGAG
GAGGATCTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATT
TCGCGACAGGGAAGGCACCAAGTCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAA
AAGAGAAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAG
CTTTTAAG*GATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAGCTTCCAACTTCTTGTCAG
CTCCACAACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCA
GAGGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCCACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGA
AAGTCTCCGGCAGCTCCAGCGACGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGAT
GGTCACGCCGTAATGGCTCTAGCCTTAACTTCGATGACAGTCTCCTTCCTCTCGACCTTG
CCTTGGATGGGTTTGGCCTAGACTGTAGTCACGTGATGCTTTGCCAAGGCACGTGACATT
AGGGGAATGTAATCTTTCTTTCTTTATTGTGTGGAGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACT
ATCTTGTCGAGTGTGTTTCTTGCTTCGGACCATTTGTTTTAATGAATGAACTTTCCCGCC
TTAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 70 70 70 40 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 25 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 50 50 65 
50 35 50 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 30 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA78TF U 1
AF RR2C462TF U 56
AF RR2H154TF U 5
AF RR2EF04TF U 3
AF RR2G132TF U 191
AF RR2AS04TF U 6
AF RR2EA78JQ C 83
AF RR2G132JQ C 210
AF RR2EF04JQ C 214
AF RR2BR40JQ C 246
AF RR2BR40TF U 246
AF RR2H154JQ C 214
BS 1 199 RR2EA78TF
BS 200 200 RR2EF04TF
BS 201 296 RR2EA78TF
BS 297 297 RR2EF04TF
BS 298 504 RR2EA78TF
BS 505 505 RR2EF04TF
BS 506 520 RR2EA78TF
BS 521 521 RR2EF04TF
BS 522 596 RR2EA78TF
BS 597 611 RR2EF04TF
BS 612 612 RR2C462TF
BS 613 648 RR2EF04TF
BS 649 649 RR2AS04TF
BS 650 672 RR2EF04TF
BS 673 703 RR2AS04TF
BS 704 704 RR2G132TF
BS 705 772 RR2AS04TF
BS 773 780 RR2BR40TF
BS 781 787 RR2H154JQ

RD RR2EA78TF 596 0 0
GGGAGTAGAAAAAAAAGTGAGAGAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCC
TAGTAACCATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGAG
GAGGATCTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATT
TCGCGACAGGGAAGGCACCGAGTCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAA
AAGAGAAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGAGAAG
CTTTTAAG*GATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAGCTTCCAACTTCTTGTCAG
CTCCACAACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCA
GAGGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCCACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGA
AAGTCTCCGGCAGCTCCAGCGACGCCTAGCGAGAAAGCAG*ATCAGCTTCCATAAAAGAT
GGTCACGCCGTAATGGCTCTAGCCTTAACTTCGATGACAGTCTCCTTCCTCTCGAC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2C462TF 603 0 0
CTTCCTAGTAACCATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGC
GGGAGGAGGATCTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTT
GGATTTCGCGACAGGGAAGGCACCAAGTCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGG
AATAAAAGAGAAAGAACCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGG
ACAAGCTTTTAAG*GATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAGCTTCCAACTTCTT
GTCAGCTCCACAACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCT
CACCAGAGGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCCACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGG
GAGGAAAGTCTCCGGCAGCTCCAGCGACGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAA
AAGATGGTCACGCCGTAATGGCTCTAGCCTTAACTTCGATGACAGTCTCCTTCCTCTCGA
CCTGCCTTGGGATGGGTTTGGCCTAGACTGTAGTCACGTGATGCTTTGCCAAG*CACGTG
ACA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2H154TF 638 0 0
GG
AGAAAAAAAAGTGAGAGAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCCTAGTAA
CCATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGAGGAGGAT
CTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTTCGCGA
CAGGGAAGGCACCAAGTCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAGA
AAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTA
AG*GATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAGCTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCAC
AACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCA
GCCGTATTCACAAGCAATGCCACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGAAAGTCT
CCGGCAGCTCCAGCGACGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTCAC
GCCGTAATGGCTCTAGCCTTAACTTCGATGACAGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCCTTGG
ATGGGTTTGGCCTAGACTGTAGTCACGTGATGCTTT

QA 3 638 3 638
DS 

RD RR2EF04TF 670 0 0
GGGT
AGAAAAAAAAGTGAGAGAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCCTAGTAA
CCATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGAGGAGGAT
CTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTTCGCGA
CAGGGAAGGCACCAAGTCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAGA
AAGGTCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTA
AG*GATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAGCTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCAC
AACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCA
GCCGTATTCACAAGCAATGCCACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGAAAGTCT
CCGGCAGCTCCAGCGACGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTCAC
GCCGTAATGGCTCTAGCCTTAACTTCGATGACAGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCCTTGG
ATGGGATTGGCCTAGACTGTAGTCACGTGATGCTTTGCCAAG*CACGTGACATTAGGGGA
ATGTAA

QA 5 670 5 670
DS 

RD RR2G132TF 516 0 0
GAAGGCACCAAGTCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAGAAAGA
TCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTAAGAG
ATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAGCTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCACAACG
CTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCAGCCG
TATTCACAAGCAATGCCACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGAAAGTCTCCGG
CAGCTCCAGCGACGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTCACGCCG
TAATGGCTCTAGCCTTAACTTCGATGACAGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCCCTGGATGG
GTTTGGCCTAG*CTGTAGTCACGTGATGCTTTGCCAAG*CACGTGACATTAGGG*AATGT
AATCTTTCTTTCTTTATTGTGTGGAGCTTTTGTCTC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2AS04TF 767 0 0
G
AGAAAAAAAAGTGAGAGAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCCTAGTAA
CCATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGAGGAGGAT
CTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTTCGCGA
CAGGGAAGGCACCAAGTCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAGA
AAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTA
AG*GATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAGCTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCAC
AACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCG
GCCGTATTCACAAGCAATGCCACGTCAACAACAACACCGACGGCACCGGGAGGAAAGTCT
CCGGCAGCTCCAGCGACGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTCAC
GCCGTAATGGCTCTAGCCTTAACTTCGATGACAGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCCTTGG
ATGGGTTTGGCCTAGACTGTAGTCACGTGATGCTTTGCCAAGGCACGTGACATTAGGGGA
ATGTAATCTTTCTTTCTTTATTGTGTGGAGCTTTTGTTTCAAAATTTTAAGACTATCTTG
TCGAGTGTGTTTCTTGCTTCGGACCATTTGTTTTAATGAATGAACT

QA 2 767 2 767
DS 

RD RR2EA78JQ 697 0 0
CTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGAGGAGGATCTTTGTTAGACGAATG
TAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTTCGCGACAGGGAAGGCACCGAG
TCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAGAAAGATCCAAAGTGTTT
GTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTAAG*GATCTTGGTATTC
AAGAAGCCAAACTCATTCAGCTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCACAACGCTAGCATCTCCA
ACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCAGCCGTATTCACAAGCA
ATGCCACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGAAAGTCTCCGGCAGCTCCAGCGA
CGCCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTCACGCCGTAATGGCTCTAG
CCTTAACTTCGATGACAGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCCTTGGATGGGTTTGGCCTAGA
CTGTAGTCACGTGATGCTTTGCCAAGGCACGTGACATTAGGGGAATGTAATCTTTCTTTC
TTTATTGTGTGGAGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACTATCTTGTCGAGTGTGTTTCTTG
CTTCGGACCATTTGTTTTAATGAATGAACTTTCCCGC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2G132JQ 570 0 0
AAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAGAAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTC
TTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTAAG*GATCTTGGTATTCAAGAAGC
CAAACTCATTCAGCTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCACAACGCTAGCATCTCCAACTGTCC
AAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCCAC
GTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGAAAGTTTCCGGCAGCTCCAGCGACGTCTAG
CGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTCACGCCGTAATGGCTCTAGCCTTAAC
TTCGATGACAGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCCCTGGATGGGTTTGGCCTAGGCTGTAGT
CACGTGATGCTTTGCCAAGGCACGTGACATTAGGGGAATGTAATCTTTCTTTCTTTATTG
TGTGGAGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACTATCTTGTCGAGTGTGTTTCTTGCTTCGGA
CCATTTGTTTTAATGAATGAACTTTCCCGC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2EF04JQ 568 0 0
AGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAGAAAGGTCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGA
TACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTAAG*GATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAA
CTCATTCAGCTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCACAACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAA
CTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCCACGTCA
ACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGAAAGTTTCCGGCAGCTCCAGCGACGTCTAGCGAG
AAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTCACGCCGTAATGGCTCTAGCCTTAACTTCG
ATGACAGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCCTTGGATGGGATTGGCCTAGACTGTAGTCACG
TGATGCTTTGCCAAGGCACGTGACATTAGGGGAATGTAATCTTTCTTTCTTTATTGTGTG
GAGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACTATCTTGTCGAGTGTGTTTCTTGCTTCGGACCAT
TTGTTTTAATGAATGAACTTTCCCGCC
T

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2BR40JQ 536 0 0
G
AAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTA
AG*GATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAGCTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCAC
AACGCTAGCATCTCCAACCGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCA
GCCGTATTCACAAGCAATGCCACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGAAAGTTT
CCGGCAGCTCCAGCGACGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTCAC
GCCGTAATGGCTCTAGCCTTAACTTCGATGACAGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCCTTGG
ATGGGTTTGGCCTAGACTGTAGTCACGTGATGCTTTGCCAAGGCACGTGACATTAGGGGA
ATGTAATCTTTCTTTCTTTATTGTGTGGAGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACTATCTTG
TCGAGTGTGTTTCTTGCTTCGGACCATTTGTTTTAATGAATGAACTTTCCCGCC
G

QA 2 535 2 535
DS 

RD RR2BR40TF 536 0 0
G
AAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTA
AG*GATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAGCTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCAC
AACGCTAGCATCTCCAACCGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCA
GCCGTATTCACAAGCAATGCCACGTCAACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGAAAGTCT
CCGGCAGCTCCAGCGACGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTCAC
GCCGTAATGGCTCTAGCCTTAACTTCGATGACAGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCCTTGG
ATGGGTTTGGCCTAGACTGTAGTCACGTGATGCTTTGCCAAGGCACGTGACATTAGGGGA
ATGTAATCTTTCTTTCTTTATTGTGTGGAGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACTATCTTG
TCGAGTGTGTTTCTTGCTTCGGACCATTTGTTTTAATGAATGAACTTTCCCGCC
G

QA 2 535 2 535
DS 

RD RR2H154JQ 574 0 0
AGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAGAAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGA
TACAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTAAG*GATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAA
CTCATTCAGCTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCACAACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAA
CTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCCACGTCA
ACAACAACACCGATGGCACCGGGAGGAAAGTTTCCGGCAGCTCCAGCGACGTCTAGCGAG
AAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTCACGCCGTAATGGCTCTAGCCTTAACTTCG
ATGACAGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCCTTGGATGGGTTTGGCCTAGACTGTAGTCACG
TGATGCTTTGCCAAGGCACGTGACATTAGGGGAATGTAATCTTTCTTTCTTTATTGTGTG
GAGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACTATCTTGTCGAGTGTGTTTCTTGCTTCGGACCAT
TTGTTTTAATGAATGAACTTTCCCGCCTTAATCC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 2 12

CO CL427Contig1 806 3 17 U
ACCTCCCTTTATTACAACATTTGATATTTATAAAGCAGAGTTTTTATTAGAACCAAAAGA
CATTGAACTGAAAACAAACAACCCGCACAGTACACAAAGCCTCACACACAAACCCCAAAT
TAACATCACAACAACAAACAAACCACATCTCATTGTTTCTTTTCTTTCTAAACCGGCAAT
GCATATTTCTCAAAAACTTCCTTCCACGCAGCACGGTTACTAATCTTATCCCACCACGCG
CTCACATGCTTCCTATCTTTGATCATATAAGCCTTCCCAATAGCACCCACGAGGTACTCG
GTGAAGGGAAGGTGAGCCAAATCAGCTAGACTCACGAAATATCCAGCCAAGTATTCGTTC
TTTGAAAGCTGTGCTTAGTACACGTCAAGCACTTCAGCAAGCTTCTCTTCACTCTCTTTT
ATAACTTTCGCATCAGCAGGAAGGCCCATGAGTGGTGCAAAGACAATGTTCAGCGTTAGT
GATAGTAGTGGTGGATGGTAGCTTGTTGCTTCCACGTCAAGCCATTGCTCTACTTGTCCT
CTCTCTTCAATTGTCTTTCCCAACAAGTCTGGTCCTTGTGATCTGTATTTCTCTGCTATG
TACCTCATGATGGCACGCGACTCAAAGATTTTGTAGTCACCGTCGACGAGCACAGGGATC
TTACCGAACGGCTGAATGGCAATATACTCAGGCTGCCTCTGCTCTCCTTTCAAGAGATCG
ACATTGACAGTCTCGAACTCTATTCCCTTCTCCACTAACGTCACCACAGCTCTCTTGGAA
GATGCGAATAAAGGCGATAGATTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV76JQB U 1
AF RR2DI29JQ U 30
AF RR2DI29TF C 42
BS 1 76 RR2GV76JQB
BS 77 77 RR2DI29JQ
BS 78 84 RR2GV76JQB
BS 85 85 RR2DI29JQ
BS 86 340 RR2GV76JQB
BS 341 341 RR2DI29JQ
BS 342 376 RR2GV76JQB
BS 377 377 RR2DI29JQ
BS 378 429 RR2GV76JQB
BS 430 430 RR2DI29JQ
BS 431 481 RR2GV76JQB
BS 482 482 RR2DI29JQ
BS 483 523 RR2GV76JQB
BS 524 524 RR2DI29JQ
BS 525 687 RR2GV76JQB
BS 688 783 RR2DI29JQ
BS 784 806 RR2DI29TF

RD RR2GV76JQB 687 0 0
ACCTCCCTTTATTACAACATTTGATATTTATAAAGCAGAGTTTTTATTAGAACCAAAAGA
CATTGAACTGAAAACAGACAACCCACACAGTACACAAAGCCTCACACACAAACCCCAAAT
TAACATCACAACAACAAACAAACCACATCTCATTGTTTCTTTTCTTTCTAAACCGGCAAT
GCATATTTCTCAAAAACTTCCTTCCACGCAGCACGGTTACTAATCTTATCCCACCACGCG
CTCACATGCTTCCTATCTTTGATCATATAAGCCTTCCCAATAGCACCCACGAGGTACTCG
GTGAAGGGAAGGTGAGCCAAATCAGCTAGACTCACGAAATCTCCAGCCAAGTATTCGTTC
TTTGAAAGCTGTGCTTCGTACACGTCAAGCACTTCAGCAAGCTTCTCTTCACTCTCTTTT
ATAACTTTCTCATCAGCAGGAAGGCCCATGAGTGGTGCAAAGACAATGTTCAGCGTTAGT
GCTAGTAGTGGTGGATGGTAGCTTGTTGCTTCCACGTCAAGCCGTTGCTCTACTTGTCCT
CTCTCTTCAATTGTCTTTCCCAACAAGTCTGGTCCTTGTGATCTGTATTTCTCTGCTATG
TACCTCATGATGGCACGCGACTCAAAGATTTTGTAGTCACCGTCGACGAGCACAGGGATC
TTACCGAACGGCTGAATGGCAATATAC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2DI29JQ 754 0 0
ATAAAGCAGAGTTTTTATTAGAACCAAAAGACATTGAACTGAAAACAAACAACCCGCACA
GTACACAAAGCCTCACACACAAACCCCAAATTAACATCACAACAACAAACAAACCACATC
TCATTGTTTCTTTTCTTTCTAAACCGGCAATGCATATTTCTCAAAAACTTCCTTCCACGC
AGCACGGTTACTAATCTTATCCCACCACGCGCTCACATGCTTCCTATCTTTGATCATATA
AGCCTTCCCAATAGCACCCACGAGGTACTCGGTGAAGGGAAGGTGAGCCAAATCAGCTAG
ACTCACGAAATATCCAGCCAAGTATTCGTTCTTTGAAAGCTGTGCTTAGTACACGTCAAG
CACTTCAGCAAGCTTCTCTTCACTCTCTTTTATAACTTTCGCATCAGCAGGAAGGCCCAT
GAGTGGTGCAAAGACAATGTTCAGCGTTAGTGATAGTAGTGGTGGATGGTAGCTTGTTGC
TTCCACGTCAAGCCATTGCTCTACTTGTCCTCTCTCTTCAATTGTCTTTCCCAACAAGTC
TGGTCCTTGTGATCTGTATTTCTCTGCTATGTACCTCATGATGGCACGCGACTCAAAGAT
TTTGTAGTCACCGTCGACGAGCACAGGGATCTTACCGAACGGCTGAATGGCAATATACTC
AGGCTGCCTCTGCTCTCCTTTCAAGAGATCGACATTGACAGTCTCGAACTCTATTCCCTT
CTCCACTAACGTCACCACAGCTCTCTTGGAAGAT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2DI29TF 765 0 0
TTTTTTTAGAACCAAAAGACAT*GAACTGAAAACAAACAACCCGCACAGTACACAAAGC*
TCACACACAAACCCCAAATTAACATCACAACAACAAACAAACCACATCTCATTGTTC**T
TTCTTTCTAAACCGGCAATGCATATTTCTCAGAAACTTCCTTCCACGCAGCACGGTTACT
AATCTTATCCCACCACGCGCTCACATGCTTCCTATCTTTGATCATATAAGCCTTCCCAAT
AGCACCCACGAGGTACTCGGTGAAGGGAAGGTGAGCCAAATCAGCTAGACTCACGAAATA
TCCAGCCAAGTATTCGTTCTTTGAAAGCTGTGCTTAGTACACGTCAAGCACTTCAGCAAG
CTTCTCTTCACTCTCTTTTATAACTTTCGCATCAGCAGGAAGGCCCATGAGTGGTGCAAA
GACAATGTTCAGCGTTAGTGATAGTAGTGGTGGATGGTAGCTTGTTGCTTCCACGTCAAG
CCATTGCTCTACTTGTCCTCTCTCTTCAATTGTCTTTCCCAACAAGTCTGGTCCTTGTGA
TCTGTATTTCTCTGCTATGTACCTCATGATGGCACGCGACTCAAAGATTTTGTAGTCACC
GTCGACGAGCACAGGGATCTTACCGAACGGCTGAATGGCAATATACTCAGGCTGCCTCTG
CTCTCCTTTCAAGAGATCGACATTGACAGTCTCGAACTCTATTCCCTTCTCCACTAACGT
CACCACAGCTCTCTTGGA*GATGCGAATAAAGGCGATAGATTGTC

QA 1 765 1 765
DS 



CO CL427Contig2 835 9 31 U
GGGAGGGAAGAAATAAGGATAGGGAAGAAAGAAGAAGAAGAAAGAAAAGATGGTGTTGAC
AATCTATGCGCCTTTATTCGCATCTTCCAAGAGAGCTGTGGTGACGTTAGTGGAGAAGGG
AGTAGAGTTCGAGACTGTCAATGTCGATCTCTTGAAAGGAGAGCAGAGGCAGCCTGAGTA
TATTGCCATTCAGCCTTTCGGTAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACAAAATCTT
TGAGTCGCGTGCCATCATGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGGGCCAGACTT
GTTGGGAAAGACAATTGAAGAGAGGGGACAAGTGGAACAATGGCTTGACGTGGAAGCAAC
AAGCTACCATCCACCACTACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATGGG
CCTTCCTGCTGATGAGAAAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTTGA
CGTGTACGAGGCACAGCTTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTAGC
TGATTTAGCTCACCTTCCCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGGCTTATAT
GATCAAAGATAGGAAGCATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACCGTGCTGCGTG
GAAGGAAGTTTCTGAGAAATATGCATTGCCGGTTTAGGAAGAAAAAAACAATGAGATGTG
GTTTGTTTGTTGTTGTGATGTTGATTTGGGGTTTGTGTGAGGCTTTCTGTACTGTGTGGG
TGTCTGGTTTCAGTTTAATGTCTTTTGGTTCTAATAAAAACTCTGTTTTATAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 30 15 30 15 15 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 20 20 20 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
25 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 
50 50 35 50 25 50 50 35 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 40 40 40 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2D817TF U 11
AF RR2GV76TF U 1
AF RR2AM85TF U 16
AF RR2D668TF U 17
AF RR2CT34TF U 11
AF RR2D817JQ C 40
AF RR2CT34JQ C 48
AF RR2AM85JQ C 59
AF RR2D668JQ C 231
BS 1 17 RR2GV76TF
BS 18 18 RR2AM85TF
BS 19 19 RR2GV76TF
BS 20 20 RR2AM85TF
BS 21 21 RR2GV76TF
BS 22 23 RR2AM85TF
BS 24 29 RR2GV76TF
BS 30 31 RR2AM85TF
BS 32 61 RR2GV76TF
BS 62 62 RR2AM85TF
BS 63 195 RR2GV76TF
BS 196 196 RR2AM85TF
BS 197 291 RR2GV76TF
BS 292 292 RR2AM85TF
BS 293 324 RR2GV76TF
BS 325 325 RR2AM85TF
BS 326 333 RR2GV76TF
BS 334 334 RR2AM85TF
BS 335 336 RR2GV76TF
BS 337 337 RR2AM85TF
BS 338 340 RR2GV76TF
BS 341 341 RR2AM85TF
BS 342 489 RR2GV76TF
BS 490 490 RR2AM85TF
BS 491 546 RR2GV76TF
BS 547 547 RR2AM85TF
BS 548 662 RR2GV76TF
BS 663 663 RR2AM85TF
BS 664 695 RR2GV76TF
BS 696 831 RR2D817JQ
BS 832 835 RR2AM85JQ

RD RR2D817TF 649 0 0
GGGAACT
GATAGGGAAGAAAGAAGAAGAAGAAAGAAAAGATGGTGTTGACAATCTATGCGCCTTTAT
TCGCATCTTCCAAGAGAGCTGTGGTGACGTTAGTGGAGAAGGGAGTAGAGTTCGAGACTG
TCAATGTCGATCTCTTGAAAGGAGAGCAGAGGCAGCCTGAGTATATTGCCATTCAGCCTT
TCGGTAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACAAAATCTTTGAGTCGCGTGCCATCA
TGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGGGCCAGACTTGTTGGGAAAGACAATTG
AAGAGAGGGGACAAGTGGAACAATGGCTTGACGTGGAAGCAACAAGCTACCATCCACCAC
TACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATGGGCCTTCCTGCTGATGAGA
AAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTTGACGTGTACGAGGCACAGC
TTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTAGCCGATTTAGCTCACCTTC
CCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGGCTTATATGATCAAAGATAGGAAGC
ATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACCGTGCTGCGT

QA 8 649 8 649
DS 

RD RR2GV76TF 695 0 0
GGGAGGGAAGAAATAAGAAGAAAGAAGAAGAAAGAAGAAGAAAGAAAAGATGGTGTTGAC
AGTCTATGCGCCTTTATTCGCATCTTCCAAGAGAGCTGTGGTGACGTTAGTGGAGAAGGG
AGTAGAGTTCGAGACTGTCAATGTCGATCTCTTGAAAGGAGAGCAGAGGCAGCCTGAGTA
TATTGCCATTCAGCCGTTCGGTAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACAAAATCTT
TGAGTCGCGTGCCATCATGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGGACCAGACTT
GTTGGGAAAGACAATTGAAGAGAGAGGACAAGTAGAGCAACGGCTTGACGTGGAAGCAAC
AAGCTACCATCCACCACTACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATGGG
CCTTCCTGCTGATGAGAAAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTTGA
CGTGTACGAAGCACAGCTTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTAGC
TGATTTGGCTCACCTTCCCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGGCTTATAT
GATCAAAGATAGGAAGCATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACCGTGCTGCGTG
GA*GGAAGTTTCTGAGAAATATGCATTGCCGGTTT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2AM85TF 675 0 0
GG
GATAGGGAAGAAAGAAGAAGAAGAAAGAAAAGATGGTGTTGACAATCTATGCGCCTTTAT
TCGCATCTTCCAAGAGAGCTGTGGTGACGTTAGTGGAGAAGGGAGTAGAGTTCGAGACTG
TCAATGTCGATCTCTTGAAAGGAGAGCAGAGGCAGCCTGAGTATATTGCCATTCAGCCTT
TCGGTAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACAAAATCTTTGAGTCGCGTGCCATCA
TGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGGGCCAGACTTGTTGGGAAAGACAATTG
AAGAGAGGGGACAAGTGGAACAATGGCTTGACGTGGAAGCAACAAGCTACCATCCACCAC
TACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATGGGCCTTCCTGCTGATGAGA
AAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTTGACGTGTACGAGGCACAGC
TTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTAGCTGATTTAGCTCACCTTC
CCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGGCTTATATGATCAAAGATAGGAAGC
ATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACCGTGCTGCGTGGAAGGAAGTTTCTGAGA
AATATGCATTGCC

QA 3 675 3 675
DS 

RD RR2D668TF 671 0 0
G
GATAGGGAAGAAAGAAGAAGAAGAAAGAAAAGATGGTGTTGACAATCTATGCGCCTTTAT
TCGCATCTTCCAAGAGAGCTGTGGTGACGTTAGTGGAGAAGGGAGTAGAGTTCGAGACTG
TCAATGTCAATCTCTTGAAAGGAGAGCAGAGGCAGCCTGAGTATATTGCCATTCAGCCTT
TCGGTAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGGCTACAAAATCTTTGAGTCGCGTGCCATCA
TGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGGGCCAGACTTGTTGGGAAAGACAATTG
AAGAGAGGGGACAAGTGGAACAATGGCTTGACGTGGAAGCAACAAGCTACCATCCACCAC
TACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATGGGCCTTCCTGCTGATGAGA
AAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTTGACGTGTACGAGGCACAGC
TTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTAGCTGATTTAGCTCACCTTC
CCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGGCTTATATGATCAAAGATAGGAAGC
ATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACCGTGCTGCGTGGAAG*AAGTTTCTGAGA
AATATGCATT

QA 2 671 2 671
DS 

RD RR2CT34TF 675 0 0
GGGAACT
GATAGGGAAGAAAGAAGAAGAAGAAAGAAAAGATGGTGTTGACAATCTATGCGCCTTTAT
TCGCATCTTCCAAGAGAGCTGTGGTGACGTTAGTGGAGAAGGGAGTAGAGTTCGAGGC**
*CAATGTCGATCTCTTGAAAGGAGAGCAGAGGCAGCCTGAGTATATTGCCATTCAGCCTT
TCGGTAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACAAAATCTTTGAGTCGCGTGCCATCA
TGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGGGCCAGACTTGTTGGGAAAGACAATTG
AAGAGAGGGGACAAGTGGAACAATGGCTTGACGAGGAAGCAACAAGCTACCATCCACCAC
TACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATGGGCCTTCCTGCTGATGAGA
AAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTTGACGTGTACGAGGCACAGC
TTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTAGCTGATTTAGCTCACCTTC
CCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGGCTTATATGATCAAAGATAGGAAGC
ATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACCGTGCTGCGTGGAAG*AAGTTTCTGAGA
AATATGCA

QA 8 675 8 675
DS 

RD RR2D817JQ 792 0 0
GAAAGAAAAGATGGTGTTGACAATCTATGCGCCTTTATTCGCATCTTCCAAGAGAGCTGT
GGTGACGTTAGTGGAGAAGGGAGTAGAGTTCGAGACTGTCAATGTCGATCTCTTGAAAGG
AGAGCAGAGGCAGCCTGAGTATATTGCCATTCAGCCTTTCGGTAAGATCCCTGTGCTCGT
CGACGGTGACTACAAAATCTTTGAGTCGCGTGCCATCATGAGGTACATAGCAGAGAAATA
CAGATCACAAGGGCCAGACTTGTTGGGAAAGACAATTGAAGAGAGGGGACAAGTGGAACA
ATGGCTTGACGTGGAAGCAACAAGCTACCATCCACCACTACTAGCACTAACGCTGAACAT
TGTCTTTGCACCACTCATGGGCCTTCCTGCTGATGAGAAAGTTATAAAAGAGAGTGAAGA
GAAGCTTGCTGAAGTGCTTGACGTGTACGAGGCACAGCTTTCAAAGAACGAATACTTGGC
TGGAGATTTCGTGAGTCTAGCCGATTTAGCTCACCTTCCCTTCACCGAGTACCTCGTGGG
TGCTATTGGGAAGGCTTATATGATCAAAGATAGGAAGCATGTGAGCGCGTGGTGGGATAA
GATTAGTAACCGTGCTGCGTGGAAGGAAATTTTTGAGAAATATGCATTGCCGGTTTAGGA
AGAAAAAAACAATGAGATGTGGTTTGTTTGTTGTTGTGATGTTGATTTGGGGTTTGTGTG
AGGCTTTCTGTACTGTGTGGGTGTCTGGTTTCAGTTTAATGTCTTTTGGTTCTAATAAAA
ACTCTGTTTTAT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2CT34JQ 784 0 0
AGATGGTGTTGACAATCTATGCGC*TTTATTCGCATCTTCCAAGAGAGCTGTGGTGACGT
TAGTGGAGAAGGGAGTAGAGTTCGAGGC***CAATGTCGATCTCTTGAAAGGAGAGCAGA
GGCAGCCTGAGTATATTGCCATTCAGCCTTTCGGTAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTG
ACTACAAAATCTTTGAGTCGCGTGCCATCATGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCAC
AAGGGCCAGACTTGTTGGGAAAGACAATTGAAGAGAGGGGACAAGTGGAACAATGGCTTG
ACGAGGAAGCAACAAGCTACCATCCACCACTACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTG
CACCACTCATGGGCCTTCCTGCTGATGAGAAAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTG
CTGAAGTGCTTGACGTGTACGAGGCACAGCTTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATT
TCGTGAGTCTAGCTGATTTAGCTCACCTTCCCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTG
GGAAGGCTTATATGATCAAAGATAGGAAGCATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTA
ACCGTGCTGCGTGGAAGGAAGTTTCTGAGAAATATGCATTGCCGGTTTAGGAAGAAAAAA
ACAATGAGATGTGGTTTGTTTGTTGTTGTGATGTTGATTTGGGGTTTGTGTGAGGCTTTC
TGTACTGTGTGGGTGTCTGGTTTCAGTTTAATGTCTTTTGGTTCTAATAAAAACTCTGTT
TTAT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2AM85JQ 777 0 0
ACAATCTATGCGCCTTTATTCGCATCTTCCAAGAGAGCTGTGGTGACGTTAGTGGAGAAG
GGAGTAGAGTTCGAGACTGTCAATGTCGATCTCTTGAAAGGAGAGCAGAGGCAGCCTGAG
TATATTGCCATTCAGCCTTTCGGTAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACAAAATC
TTTGAGTCGCGTGCCATCATGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGGGCCAGAC
TTGTTGGGAAAGACAATTGAAGAGAGGGGACAAGTGGAACAATGGCTTGACGTGGAAGCA
ACAAGCTACCATCCACCACTACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATG
GGCCTTCCTGCTGATGAGAAAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTT
GACGTGTACGAGGCACAGCTTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTA
GCTGATTTAGCTCACCTTCCCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGGCTTAT
ATGATCAAAGATAGGAAGCATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACCGTGCTGCG
TGGAAGGAAGTTTCTGAGAAATATGCATTGCCGGTTTAGGAAGAAAAAAACAATGAGATG
TGGTTTGTTTGTTGTTGTGATGTTGATTTGGGGTTTGTGTGAGGCTTTCTGTACTGTGTG
GGTGTCTGGTTTCAGTTTAATGTCTTTTGGTTCTAATAAAAACTCTGTTTTATAAAT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2D668JQ 601 0 0
ACAAAATCTTTGAGTCGCGTGCCATCATGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAG
GGCCAGACTTGTTGGGAAAGACAATTGAAGAGAGGGGACAAGTGGAACAATGGCTTGACG
TGGAAGCAACAAGCTACCATCCACCACTACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCAC
CACTCATGGGCCTTCCTGCTGATGAGAAAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTG
AAGTGCTTGACGTGTACGAGGCACAGCTTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCG
TGAGTCTAGCTGATTTAGCTCACCTTCCCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGA
AGGCTTATATGATCAAAGATAGGAAGCATGTGAGCGCGTGGTGGGATAAGATTAGTAACC
GTGCTGCGTGGAAGGAAGTTTTTGAGAAATATGCATTGCCGGTTTAGGAAGAAAAAAACA
ATGAGATGTGGTTTGTTTGTTGTTGTGATGTTGATTTGGGGTTTGTGTGAGGCTTTCTGT
ACTGTGTGGGTGTCTGGTTTCAGTTTAATGTCTTTTGGTTCTAATAAAAACTCTGTTTTA
T

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 10

CO CL428Contig1 1038 10 27 U
AATAAAGCTACTTTTCATTTGTCAATCAAAAGATCTTTTAATAAGTTTAGATAACAGAGC
CAGTTTGAGGTCCAATAAGACCAACAACCTCATCCCAAAGACCTTGACTTTGTACAACCG
AACCAAGCTCAACAACACTCAAGCCACAAGCAGCTACAGTCCAGTACCCACCCAACACCT
CTGCTCTCAACTGCTCTTTCTCCCAACCACAGTACCCATCAAAGAATCTCATCTCACTTC
TCCCCACCAGCTTCCTCTTCACCATCTCTGCAGCCAACCCTACACTCTCTCTCGTCCCGT
AGTACAACCCTTTCATCACCTCTTTGAACGCGGCTCCGCTCTTCTCAACCTCGTTGCCGT
TCCTTGGACTCACCAGGAACAACCCTTCTTCCAGAGGTCCACCAAAGAA*GAGACTCTTG
TCTGAAAACGTTCCC*GCCATGTCTAGGACCGTTGATTTGGTGGTCTCTTTGATTGACAT
GAGCGAGGGACGGTTGAGGATGACTCCTATAGGACCTGAGGGTCCAACAGAGAGGAGGAG
GATCACCGTCTTTTCGAAGATGTGGACTCCGTCTAGCTTCTCTGTTGCTAGCAGGAGACA
CCCTGTCTCTGGCTCTAGTATCTTGTGTGCCCATTTGTTCCCAGTTGTGATCAGTGATGA
TGATAGTGACGAGTTCTTCTCAGGGGTTGCAGCTTGCTCTCCAGCTACAAGCCTTGCCCT
GAACTCTCTCCAGTCAGCAGCATCTGATGTAGAACTGTTAACACTATCCTTGAAGAGATC
AGCATCATCCTCCAGTGGCTTCCATGAATCCGAAAGAGAACAATTCACAGAGGTTGGAGA
AGCAACCTTCCTGGTGAGAAACTGGCAGGAGTTTCTCCTTGGGTAACAAGAAAAGATTCT
GGTTTTGATGAATGGGGGGACAAACTCTTTGACACCAGAGACTGATCTTGAGGTAAGAAA
AGAAACATCCATGTCTCTCTTTGTTGTACCTTCTTTTGTTTCTCTGACTCAGTTCACTTT
AGTTCCTCTGAAGAGCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 
35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 50 50 50 50 50 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 30 15 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA80JQ U 1
AF RR2GU05JQB U 1
AF RR2BN20JQ U 16
AF RR2B090JQ U 20
AF RR2BK21JQ U 21
AF RR2AH31JQ U 21
AF RR2B090TF C 394
AF RR2BK21TF C 356
AF RR2DA80TF C 389
AF RR2GU05TF C 625
BS 1 412 RR2DA80JQ
BS 413 413 RR2BN20JQ
BS 414 502 RR2DA80JQ
BS 503 522 RR2GU05JQB
BS 523 558 RR2BN20JQ
BS 559 559 RR2B090JQ
BS 560 563 RR2BN20JQ
BS 564 564 RR2B090JQ
BS 565 570 RR2BN20JQ
BS 571 571 RR2AH31JQ
BS 572 590 RR2BN20JQ
BS 591 591 RR2AH31JQ
BS 592 600 RR2BN20JQ
BS 601 601 RR2AH31JQ
BS 602 674 RR2BN20JQ
BS 675 675 RR2AH31JQ
BS 676 699 RR2BN20JQ
BS 700 700 RR2AH31JQ
BS 701 727 RR2BN20JQ
BS 728 728 RR2B090JQ
BS 729 796 RR2BN20JQ
BS 797 830 RR2B090JQ
BS 831 867 RR2AH31JQ
BS 868 868 RR2BK21TF
BS 869 891 RR2AH31JQ
BS 892 1029 RR2BK21TF
BS 1030 1038 RR2GU05TF

RD RR2DA80JQ 502 0 0
AATAAAGCTACTTTTCATTTGTCAATCAAAAGATCTTTTAATAAGTTTAGATAACAGAGC
CAGTTTGAGGTCCAATAAGACCAACAACCTCATCCCAAAGACCTTGACTTTGTACAACCG
AACCAAGCTCAACAACACTCAAGCCACAAGCAGCTACAGTCCAGTACCCACCCAACACCT
CTGCTCTCAACTGCTCTTTCTCCCAACCACAGTACCCATCAAAGAATCTCATCTCACTTC
TCCCCACCAGCTTCCTCTTCACCATCTCTGCAGCCAACCCTACACTCTCTCTCGTCCCGT
AGTACAACCCTTTCATCACCTCTTTGAACGCGGCTCCGCTCTTCTCAACCTCGTTGCCGT
TCCTTGGACTCACCAGGAACAACCCTTCTTCCAGAGGTCCACCAAAGAA*GAAACTCTTG
TCTGAAAACGTTCCC*GCCATGTCTAGGACCGTTGATTTGGTGGTCTCTTTGATTGACAT
GAGCGAGGGACGGTTGAGGATG

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR2GU05JQB 522 0 0
AATAAAGCTACTTTTCATTTGTCAATCAAAAGATCTTTTAATAAGTTTAGATAACAGAGC
CAGTTTGAGGTCCAATAAGACCAACAACCTCATCCCAAAGACCTTGACTTTGTACAACCG
AACCAAGCTCAACAACACTCAAGCCACAAGCAGCTACAGTCCAGTACCCACCCAACACCT
CTGCTCTCAACTGCTCTTTCTCCCAACCACAGTACCCATCAAAGAATCTCATCTCACTTC
TCCCCACCAGCTTCCTCTTCACCATCTCTGCAGCCAACCCTACACCCTCTCTCGTCCCGT
AGTACAACCCTTTCATCACCTCTTTGAACGCGGCTCCGCTCTTCTCAACCTCGTTGCCGT
TCCTTGGACTCACCACGAACAACCCTTCTTCCAGAGGTCCACCAAAGAA*AAAACTCTTG
TCTGAAAACGTTCCC*GCCATGTCTAGGACCGTTGATTTGGTGGTCTCTTTGATTGACAT
GAGCGAGGGACGGTTGAGGATGACTCCTATAGGACCTGAGGG

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2BN20JQ 781 0 0
CATTT
GTCAATCAAAAGATCTTTTAATAAGTTTAGATAACAGAGCCAGTTTGAGGTCCAATAAGA
CCAACAACCTCATCCCAAAGACCTTGACTTTGTACAACCGAACCAAGCTCAACAACACTC
AAGCTACAAGCAGCTACAGTCCAGTACCCACCCAATACCTCTGCTTTCAACTGCTCTTTC
TCCCAACCACAGTACCCATCAAAGAATCTCATCTCACTTCTCCCAACCAACTTCCTCTTC
ACCATCTCTGCAGCCAACCCCACACTCTCTCTCGTCCCATAGTACAATCCTTTCATCACC
TCTTTGAACGCTGCTCCGCTCTTCTCAACCTCGTTGCCGTTCCTTGGACTCACCAGGAAC
AACCCTTCTTCCAGAGGTCCACCAAAGAA*AAGGCTCTTGTCTGAAAACGTTCCC*GCCA
TGTCTAGGACCGTTGATTTTGTGGTCTCCTTGATTGACATGAGCGAGGGACGGTTGAGGA
TGACTCCTATAGGACCTGAGGGTCCAACAGAGAGGAGGAGGATCACCGTCTTTTCGAAAA
TGTAGACTCCTTCTAGCTTCTCTGTTGCTATCAGGAGACATCCTGTCTCTGGCTCTAGTA
TCTTGTGTGCCCATTTGTTCCCAGTTGTGATCAGTGATGATGATAGTGACGAGTCCTTCT
CAGGGGTTGCAGCTTGCTCACCAGCTACAAGCCTTGCCCTGAACTCTATCCAGTCAGCAG
CATCTGATGTAGAACTGTTAACACTATCCTTGAAGAGATCAGCATCATCCTCCAGT

QA 6 781 6 781
DS 

RD RR2B090JQ 811 0 0
C
GTCAATCAAAAGATCTTTTAATAAGTTTAGATAACAGAGCCAGTTTGAGGTCCAATAAGA
CCAACAACCTCATCCCAAAGACCTTGACTTTGTACAACCGAACCAAGCTCAACAACACTC
AAGCTACAAGCAGCTACAGTCCAGTACCCACCCAATACCTCTGCTTTCAACTGCTCTTTC
TCCCAACCACAGTACCCATCAAAGAATCTCATCTCACTTCTCCCAACCAACTTCCTCTTC
ACCATCTCTGCAGCCAACCCCACACTCTCTCTCGTCCCATAGTACAATCCTTTCATCACC
TCTTTGAACGCTGCTCCGCTCTTCTCAACCTCGTTGCCGTTCCTTGGACTCACCAGGAAC
AACCCTTCTTCCAAAGGTCCACCAAAGAA*GAGGCTCTTGTCTGAAAACGTTCCC*GCCA
TGTCTAGGACCGTTGATTTTGTGGTCTCCTTGATTGACATGAGCGAGGGACGGTTGAGGA
TGACTCCTATAGGACCTGAGGGTCCAACAGAGAGGAGGAGGATCACCGTCTTTTCGAAGA
TGTGGACTCCTTCTAGCTTCTCTGTTGCTATCAGGAGACATCCTGTCTCTGGCTCTAGTA
TCTTGTGTGCCCATTTGTTCCCAGTTGTGATCAGCGATGATGATAGTGACGAGTCCTTCT
CAGGGGTTGCAGCTTGCTCACCAGCTACAAGCCTTGCCCTGAACTCTCTCCAGTCAGCAG
CATCTGATGTAGAACTGTTAACACTATCCTTGAAGAGATCAGCATCATCCTCCAGTGGCT
TCCATGAATCCGAAAGAGAACAATTCACAG

QA 2 811 2 811
DS 

RD RR2BK21JQ 776 0 0
GC
CAATCAAAAGATCTTTTAATAAGTTTAGATAACAGAGCCAGTTTGAGGTCCAATAAGACC
AACAACCTCATCCCAAAGACCTTGACTTTGTACAACCGAACCAAGCTCAACAACACTCAA
GCCACAAGCAGCTACAGTCCAGTACCCACCCAACACCTCTGCTCTCAACTGCTCTTTCTC
CCAACCACAGTACCCATCAAAGAATCTCATCTCACTTCTCCCCACCAGCTTCCTCTTCAC
CATCTCTGCAGCCAACCCTACACTCTCTCTCGTCCCGTAGTACAACCCTTTCATCACCTC
TTTGAACGCGGCTCCGCTCTTCTCAACCTCGTTGCCGTTCCTTGGACTCACCAGGAACAA
CCCTTCTTCCAGAGGTCCACCAAAGAA*GAGACTCTTGTCTGAAAACGTTCCC*GCCATG
TCTAGGACCGTTGATTTGGTGGTCTCTTTGATTGACATGAGCGAGGGACGGTTGAGGATG
ACTCCTATAGGACCTGAGGGTCCAACAGAGAGGAGGAGGATCACCGTCTTTTCGAAGATG
TGGACTCCGTCTAGCTTCTCTGTTGCTAGCAGGAGACACCCTGTCTCTGGCTCTAGTATC
TTGTGTGCCCATTTGTTCCCAGTTGTGATCAGTGATGATGATAGTGACGAGTTCTTCTCA
GGGGTTGCAGCTTGCTCTCCAGCTACAAGCCTTGCCCTGAACTCTCTCCAGTCAGCAGCA
TCTGATGTAGAACTGTTAACACTATCCTTGAAGAGATCAGCATCATCCTCCAGT

QA 3 776 3 776
DS 

RD RR2AH31JQ 871 0 0
GTCAATCAAAAGATCTTTTAATAAGTTTAGATAACAGAGCCAGTTTGAGGTCCAATAAGA
CCAACAACCTCATCCCAAAGACCTTGACTTTGTACAACCGAACCAAGCTCAACAACACTC
AAACCACAAGCAGCTACAGTCCAGTACCCACCCAACACCTCTGCTCTCAACTGCTCTTTC
TCCCAACCACAGTACCCATCAAAGAATCTCATCTCACTTCTCCCCACCAGCTTCCTCTTC
ACCATCTCTGCAGCCAACCCTACACTCTCTCTCGTCCCGTAGTACAACCCTTTCATCACC
TCTTTGAACGCGGCTCCGCTCTTCTCAACCTCGTTGCCGTTCCTTGGACTCACCAGGAAC
AACCCTTCTTCCAGAGGTCCACCAAAGAA*GAGACTCTTGTCTGAAAACGTTCCC*GCCA
TGTCTAGGACCGTTGATTTGGTGGTCTCTTTGATTGACATGAGCGAGGGACGGTTGAGGA
TGACTCCTATAGGACCTGAGGGTCCAACAGAGAGGAGGAGGATCACCGTCTTTTCGAAGA
TGTGGACTCCGTCTAGCTTCTCTGTTGCTAGCAGGAGACACCCTGTCTCTGGCTCTAGTA
TCTTGTGTGCCCATTTGTTCCCAGTTGTGATCAGTGATGTTGATAGTGACGAGTTCTTCT
CAGGGGTTGCAGCTTGGTCTCCAGCTACAAGCCTTGCCCTGAACTCTCTCCAGTCAGCAG
CATCTGATGTAGAACTGTTAACACTATCCTTGAAGAGATCAGCATCATCCTCCAGTGGCT
TCCATGAATCCGAAAGAGAACAATTCACAGAGGTTGGAGAAGCAACCTTCCTGGTGAGAA
ACTGGCAAGAGTTTCTCCTTGGGTAACAAGA

QA 1 871 1 871
DS 

RD RR2B090TF 562 0 0
A
AGGTCCACCAAAGAAAGAGGCTCTTGTCTGAAAACGTTCCCCGCCATGTCTAGGACCGTT
GATTTTGTGGTCTCCTTGATTGACATGAGCGAGGGACGGTTGAGGATGACTCCTATAGGA
CCTGAGGGTCCAACAGAGAGGAGGAGGATCACCGTCTTTTCGAAGATGTGGACTCCTTCT
AGCTTCTCTGTTGCTATCAGGAGACATCCTGTCTCTGGCTCTAGTATCTTGTGTGCCCAT
TTGTTCCCAGTTGTGATCAGCGATGATGATAGTGACGAGTCCTTCTCAGGGGTTGCAGCT
TGCTCACCAGCTACAAGCCTTGCCCTGAACTCTCTCCAGTCAGCAGCATCTGATGTAGAA
CTGTTAACACTATCCTTGAAGAGATCAGCATCATCCTCCAGTGGCTTCCATGAATCCGAA
AGAGAACAATTCACAGAGGTTGGAGAAGCAACCTTCCTGGTGAGGAACTGGCAGGAGTTT
CTCCTTGGGTAACGAGAAAAGATTCTGGTTTTGATGAATGGGGGGACAAACTCTTTGACA
CCAGAGACTGATCTTGAG
TAA

QA 2 559 2 559
DS 

RD RR2BK21TF 676 0 0
TTGCCGTTC
TGGACTCACCAGGAACAACC*TTCTTCCAGAGGTCCACCAAAGAA*GAGACTCTTGTCTG
AAAACGTTCCC*GCCATGTCTAGGACCGTTGATTTGGTGGTCTCTTTGATTGACATGAGC
GAGGGACGGTTGAGGATGACTCCTATAGGACCTGAGGGTCCAACAGAGAGGAGGAGGATC
ACCGTCTTTTCGAAGATGTGGACTCCGTCTAGCTTCTCTGTTGCTAGCAGGAGACACCCT
GTCTCTGGCTCTAGTATCTTGTGTGCCCATTTGTTCCCAGTTGTGATCAGTGATGATGAT
AGTGACGAGTTCTTCTCAGGGGTTGCAGCTTGCTCTCCAGCTACAAGCCTTGCCCTGAAC
TCTCTCCAGTCAGCAGCATCTGATGTAGAACTGTTAACACTATCCTTGAAGAGATCAGCA
TCATCCTCCAGTGGCTTCCATGAATCCGAAAGAGAACAATTCACAGAGGTTGGAGAAGCA
ACCTTCCTGGTGAGAAACTGGCAGGAGTTTCTCCTTGGGTAACAAGAAAAGATTCTGGTT
TTGATGAATGGGGGGACAAACTCTTTGACACCAGAGACTGATCTTGAGGTAAGAAAAGAA
ACATCCATGTCTCTCTTTGTTGTACCTTCTTTTGTTTCTCTGACTCAGTTCACTTTAGTT
CCTCT
CC

QA 10 674 10 674
DS 

RD RR2DA80TF 643 0 0
TTCCAGAGGTCCACCAAAGAA*GAGACTCTTGTCTGAAAACGTTCCC*GCCATGTCTAGG
ACCGTTGATTTGGTGGTCTCTTTGATTGACATGAGCGAGGGACGGTTGAGGATGACTCCT
ATAGGACCTGAGGGTCCAACAGAGAGGAGGAGGATCACCGTCTTTTCGAAGATGTGGACT
CCGTCTAGCTTCTCTGTTGCTAGCAGGAGACACCCTGTCTCTGGCTCTAGTATCTTGTGT
GCCCATTTGTTCCCAGTTGTGATCAGTGATGATGATAGTGACGAGTTCTTCTCAGGGGTT
GCAGCTTGCTCTCCAGCTACAAGCCTTGCCCTGAACTCTCTCCAGTCAGCAGCATCTGAT
GTAGAACTGTTAACACTATCCTTGAAGAGATCAGCATCATCCTCCAGTGGCTTCCATGAA
TCCGAAAGAGAACAATTCACAGAGGTTGGAGAAGCAACCTTCCTGGTGAGAAACTGGCAG
GAGTTTCTCCTTGGGTAACAAGAAAAGATTATGGTTTTGATGAATGGGGGGACAAACTCT
TTGACACCAGAGACTGATCTTGAGGTAAGAAAAGAAACATCCATGTCTCTCTTTGTTGTA
CCTTCTTTTGTTTCTCTGACTCAGTTCACTTTAGTTCCTCT
CC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2GU05TF 414 0 0
GTGTGCCCATTTGTTCCCAGTTGTGATCAGTGATGATGATAGTGACGAGTTCTTCTCAGG
GGTTGCAGCTTGCTCTCCAGCTACAAGCCTTGCCCTGAACTCTCTCCAGTCAGCAGCATC
TGATGTAGAACTGTTAACACTATCCTTGAAGAGATCAGCATCATCCTCCAGTGGCTTCCA
TGAATCCGAAAGAGAACAATTCACAGAGGTTGGAGAAGCAACCTTCCTGGTGAGAAACTG
GCAGGAGTTTCTCCTTGGGTAACAAGAAAAGATTCTGGTTTTGATGAATGGGGGGACAAA
CTCTTTGACACCAGAGACTGATCTTGAGGTAAGAAAAGAAACATCCATGTCTCTCTTTGT
TGTACCTTCTTTTGTTTCTCTGACTCAGTTCACTTTAGTTCCTCTGAAGAGCCC

QA 1 414 1 414
DS 



AS 3 10

CO CL429Contig1 1577 5 14 U
GGATATTTGTCAACTCTTCCTTTGCCATTTGTTGCAAACACTCAAGTCTTCTGAAATCAG
ACTTAGAGTCTTCTTCAAGTTCCAGGGATCCAAATGGCGCAGATATTGGCAGCTTCTCCA
ACATGTCAGATGAGATTGGCTAAACCCAGCTCCATTGCATCGTCAAAGTTATGGAACTCG
GTTGTGTTGAAACAGAAGAAACAGAGCAGCAGCAGCAAAGTCAGAAGCATCAAAGTGATG
GCTCTCCAATCTGATAACAGTACAATCAACAGAGTTGAGAGTCTTCTCAATCTAGACACC
AAACCTTTTACTGACCGGATCATCGCTGAGTACATCTGGATTGGCGGATCTGGAATTGAC
CTTAGGAGCAAGTCAAGGACTCTTGAAAAGCCTGTGGAAGATCCTTCTGAGCTTCCCAAG
TGGAACTATGATGGTTCAAGTACCGGACAAGCACCTGGTGAAGATAGTGAAGTGATTCTC
TATCCGCAAGCTATCTTCAGAGATCCTTTCCGTGGAGGCAATAACATATTGGTTATCTGT
GATACCTACACACCAGCTGGTGAGCCAATTCCGACAAACAAACGTGCAAGAGCTGCTGAG
ATTTTCAGCAACAAGAAGGTCAATGAAGAGATTCCATGGTTTGGCATCGAACAAGAGTAC
ACTTTACTTCAGCCAAACGTGAACTGGCCTTTGGGTTGGCCCGTTGGAGCATATCCTGGT
CCTCAGGGTCCTTACTACTGTGGAGTTGGAGCTGAAAAGTCTTGGGGACGTGACATTTCA
GATGCTCATTACAAAGCTTGTTTGTATGCTGGAATTAACATCAGTGGTACTAATGGTGAA
TTTATGCCAGGACAGTGGGAATTCCAAGTTGGCCCGAGCGTAGGAATCGAAGCAGGTGAT
CATGTTTGGTGTGCTAGATACCTTCTTGAGAGAATCACAGAACAAGCTGGTGTCGTCCTA
ACCCTTGATCCCAAACCGATTGAGGGTGACTGGAACGGTGCGGGTTGCCATACCAATTAC
AGTACAAAGAGCATGAGAGAGGATGGAGGATTTGAAGTGATTAAAAAGGCCATCTTGAAC
CTCTCGCTTCGTCACATGGAGCACATCAGTGCCTACGGTGAAGGCAATGAGAGAAGGTTG
ACCGGAAAGCACGAGACAGCCAGTATCGACCAATTCTCATGGGGCGTGGCTAACCGTGGA
TGCTCAATTCGTGTTGGACGTGATACCGAGAAGAAAGGAAAAGGTTACTTGGAAGATAGG
CGTCCAGCGTCTAACATGGACCCATACATTGTGACTTCACTGTTGGCAGAGACCACACTT
CTCTGGGAGCCAACCCTTGAGGCTGAAGCACTTGCTGCTCAGAAGCTTTCTTTGAAAGTT
TAATTTATTCCTGAACACGCATGTCTATTTATGTGATCTTCCCCGGATCATAAATGCTGT
TTAGAACACTGGTTCGGATTAAGACATTCTTATCTCCTTTTTTTCATTTGCACTGTTGAA
AAAAAAAACAGAATTTCATGGGGAGTGTTCACCCTTTTCTATTGGTTATTTATGGTCTAA
CTGTAAGATCTTGTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A539TF U 1
AF RR2FH18TF U 29
AF RR2BH96TF U 10
AF RR2A539JQ C 755
AF RR2BH96JQ C 851
BS 1 526 RR2A539TF
BS 527 527 RR2FH18TF
BS 528 722 RR2A539TF
BS 723 824 RR2BH96TF
BS 825 970 RR2A539JQ
BS 971 972 RR2BH96JQ
BS 973 1257 RR2A539JQ
BS 1258 1258 RR2BH96JQ
BS 1259 1320 RR2A539JQ
BS 1321 1321 RR2BH96JQ
BS 1322 1415 RR2A539JQ
BS 1416 1416 RR2BH96JQ
BS 1417 1471 RR2A539JQ
BS 1472 1577 RR2BH96JQ

RD RR2A539TF 722 0 0
GGATATTTGTCAACTCTTCCTTTGCCATTTGTTGCAAACACTCAAGTCTTCTGAAATCAG
ACTTAGAGTCTTCTTCAAGTTCCAGGGATCCAAATGGCGCAGATATTGGCAGCTTCTCCA
ACATGTCAGATGAGATTGGCTAAACCCAGCTCCATTGCATCGTCAAAGTTATGGAACTCG
GTTGTGTTGAAACAGAAGAAACAGAGCAGCAGCAGCAAAGTCAGAAGCATCAAAGTGATG
GCTCTCCAATCTGATAACAGTACAATCAACAGAGTTGAGAGTCTTCTCAATCTAGACACC
AAACCTTTTACTGACCGGATCATCGCTGAGTACATCTGGATTGGCGGATCTGGAATTGAC
CTTAGGAGCAAGTCAAGGACTCTTGAAAAGCCTGTGGAAGATCCTTCTGAGCTTCCCAAG
TGGAACTATGATGGTTCAAGTACCGGACAAGCACCTGGTGAAGATAGTGAAGTGATTCTC
TATCCGCAAGCTATCTTCAGAGATCCTTTCCGTGGAGGCAATAACAAATTGGTTATCTGT
GATACCTACACACCAGCTGGTGAGCCAATTCCGACAAACAAACGTGCAAGAGCTGCTGAG
ATTTTCAGCAACAAGAAGGTCAATGAAGAGATTCCATGGTTTGGCATCGAACAAGAGTAC
ACTTTACTTCAGCCAAACGTGAACTGGCCTTTGGGTTGGCCCGTTGGAGCATATCCTGGT
CC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2FH18TF 694 0 0
GG
GTTGCAAACACTCAAGTCTTCTGAAATCAGACTTAGAGTCTTCTTCAAGTTCCAGGGATC
CAAATGGCGCAGATATTGGCAGCTTCTCCAACATGTCAGATGAGATTGGCTAAACCCAGC
TCCATTGCATCGTCAAAGTTATGGAACTCGGTTGTGTTGAAACAGAAGAAACAGAGCAGC
AGCAGCAAAGTCAGAAGCATCAAAGTGATGGCTCTCCAATCTGATAACAGTACAATCAGC
AGAGTTGAGAGTCTTCTCAATCTAGACACCAAACCTTTTACTGACCGGATCATCGCTGAG
TACATCTGGATTGGCGGATCTGGAATTGACCTTAGGAGCAAGTCAAGGACTCTTGAAAAG
CCTGTGGAAGATCCTTCTGAGCTTCCCAAGTGGAACTATGATGGTTCAAGTACCGGACAA
GCACCTGGTGAAGATAGTGAAGTGATTCTCTATCCGCAAGCTATCTTCAGAGATCCTTTC
CGTGGAGGCAATAACATATTGGTTATCTGTGATACCTACACACCAGCTGGTGAGCCAATT
CCGACAAACAAACGTGCAAGAGCTGCTGAGATTTTCAGCAACAAGAAGGTCAATGAAGAG
ATTCCATGGTTTGGCGTCGAACAAGAGTACACTTTACTTCAGCCAAACGTGAACTGGCCT
TTGGGTTGGCCCGTTGGAGCATATCCTGGTCC

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR2BH96TF 815 0 0
GG
AACTCTTCCTTTGCCATTTGTTGCAAACACTCAAGTCTTCTGAAATCAGACTTAGAGTCT
TCTTCAAGTTCCAGGGATCCAAATGGCGCAGATATTGGCAGCTTCTCCAACATGTCAGAT
GAGATTGGCTAAACCCAGCTCCATTGCATCGTCAAAGTTATGGAACTCGGTTGTGTTGAA
ACAGAAGAAACAGAGCAGCAGCAGCAAAGTCAGAAGCATCAAAGTGATGGCTCTCCAATC
TGATAACAGTACAATCAACAGAGTTGAGAGTCTTCTCAATCTAGACACCAAACCTTTTAC
TGACCGGATCATCGCTGAGTACATCTGGATTGGCGGATCTGGAGTTGACCTTAGGAGCAA
GTCAAGGACTCTTGAAAAGCCTGTGGAAGATCCTTCTGAGCTTCCCAAGTGGAACTATGA
TGGTTCAAGTACCGGACAAGCACCTGGTGAAGATAGTGAAGTGATTCTCTATCCGCAAGC
TATCTTCAGAAATCCTTTCCGTGGAGGCAATAACATATTGGTTATCTGTGATACCTACAC
ACCAGCTGGTGAGCCAATTCCGACAAACAAACGTGCAAGAGCTGCTGAGATTTTCAGCAA
CAAGAAGGTCAATGAAGAGATTCCATGGTTTGGCATCGAACAAGAGTACACTTTACTTCA
GCCAAACGTGAACTGGCCTTTGGGTTGGCCCGTTGGAGCATATCCTGGTCCTCAGGGTCC
TTACTACTGTGGAGTTGGAGCTGAAAAGTCTTGGGGACGTGACATTTCAGATGCTCATTA
CAAAGCTTGTTTGTATGCTGGAATTAACATCAG

QA 3 815 3 815
DS 

RD RR2A539JQ 724 0 0
AAAAGTCT
TGGGGACGTGACATTTCAGATGCTCATTACAAAGCTTGTTTGTATGCTGGAATTAACATC
AGTGGTACTAATGGTGAATTTATGCCAGGACAGTGGGAATTCCAAGTTGGCCCGAGCGTA
GGAATCGAAGCAGGTGATCATGTTTGGTGTGCTAGATACCTTCTTGAGAGAATCACAGAA
CAAGCTGGTGTCGTCCTAACCCTTGATC**AAACCGATTGAGGGTGACTGGAACGGTGCG
GGTTGCCATACCAATTACAGTACAAAGAGCATGAGAGAGGATGGAGGATTTGAAGTGATT
AAAAAGGCCATCTTGAACCTCTCGCTTCGTCACATGGAGCACATCAGTGCCTACGGTGAA
GGCAATGAGAGAAGGTTGACCGGAAAGCACGAGACAGCCAGTATCGACCAATTCTCATGG
GGCGTGGCTAACCGTGGATGCTCAATTCGTGTTGGACGTGATACCGAGAAGAAAGGAAAA
GGTTACTTGGAAGATCGGCGTCCAGCGTCTAACATGGACCCATACATTGTGACTTCACTG
TTGGCAGAGACCACACTTTTCTGGGAGCCAACCCTTGAGGCTGAAGCACTTGCTGCTCAG
AAGCTTTCTTTGAAAGTTTAATTTATTCCTGAACACGCATGTCTATTTATGTGGTCTTCC
CCGGATCATAAATGCTGTTTAGAACACTGGTTCGGATTAAGACATTCTT
ATCTCCC

QA 9 717 9 717
DS 

RD RR2BH96JQ 727 0 0
GACAGTGGGAATTCCAAGTTGGCCCGAGCGTAGGAATCGAAGCAGGTGATCATGTTTGGT
GTGCTAGATACCTTCTTGAGAGAATCACAGAACAAGCTGGTGTCGTCCTAACTCTTGATC
CCAAACCGATTGAGGGTGACTGGAACGGTGCTGGTTGCCATACCAATTACAGTACAAAGA
GCATGAGAGAGGATGGAGGATTTGAGGTGATTAAAAAGGCCATCTTGAACCTCTCGCTTC
GTCACATGGAGCACATCAGTGCCTACGGTGAAGGCAATGAGAGAAGGTTGACCGGAAAGC
ACGAGACAGCCAGTATCGACCAATTCTCATGGGGCGTGGCTAACCGTGGATGCTCAATTC
GTGTTGGACGTGATACCGAGAAGAAAGGAAAAGGTTACTTGGAAGATAGGCGTCCAGCGT
CTAACATGGACCCATACATTGTGACTTCACTGTTGGCAGAGACCACACTTCTCTGGGAGC
CAACCCTTGAGGCTGAAGCACTTGCTGCTCAGAAGCTTTCTTTGAAAGTTTAATTTATTC
TTGAACACGCATGTCTATTTATGTGATCTTCCCGGGATCATAAATGTTGTTTAGAACACT
GGTTTGGATTAAGACATTCTTATCTCCTTTTTTTCATTTGCACTGTTGAAAAAAAAAACA
GAATTTCATGGGGAGTGTTCACCCTTTTCTATTGGTTATTTATGGTCTAACTGTAAGATC
TTGTCCT

QA 1 727 1 727
DS 



CO CL429Contig2 755 3 2 U
GATGAACACTGCCCATCATGAAGTTTTGAGTATTTTCAACAATGCAAATGAAAAAAAAGA
AAACACAGAATGTATTGTCCGAACCAACATTTTATAGCAACATTTATGATCGCGGCAGGG
CTACATAGTTAATTTAAACATTCAAAGAAAGCTTTTGAGCTGCAAGTGCTTCAGCCTCAA
GGGTCGGCTCCCAGAGAAGAGTGGTCTCTGCCAAGAGTGAAGTCACAATGTATGGGTCCA
TGTTTGATGCTGGACGTCGATCTTCCAAGTAACCTTTTCCTTTCTTCTCGGTATCACGTC
CCACACGAATTGAGCATCCACGGTTAGCCACGCCCCATGAGAATTGGTCGATACTAGCTG
TCTCGTGCTTTTCGGTCAACCTTCTCTCATTGCCTTCACCGTATGCACTGATGTGCTCCA
TGTGACGAAGCGAGAGGTTCAAGATGGCCTTTTTAATCACCTCAAATCCTCCTTCCTCTC
TCATGCTTTTAGTACTGTAATTGGTATGGCAACCAGCACCGTTCCAGTCTCCCTCTATTG
GTTTGGGATCAAGTGTTAAGACAACACCAGCTTGTTCTGTGATTCTCTCAAGAAGGTATC
TTGCGCACCAAACACGATCACCTGCTTCGATTCCTACGCTCGGGCCAACTTGGAATTCCC
ACTGTCCTGGCATAACTTCACCATTAGTACCACTGATGTTAATTCCAGCATATAAACAAG
CTTTGTAATGAGCATCTGAAATGTCACGTCCCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2CP15JQ U 1
AF RR2CP15TF C 26
AF RR2GQ65JQ U 77
BS 1 752 RR2CP15JQ
BS 753 755 RR2GQ65JQ

RD RR2CP15JQ 752 0 0
GATGAACACTGCCCATCATGAAGTTTTGAGTATTTTCAACAATGCAAATGAAAAAAAAGA
AAACACAGAATGTATTGTCCGAACCAACATTTTATAGCAACATTTATGATCGCGGCAGGG
CTACATAGTTAATTTAAACATTCAAAGAAAGCTTTTGAGCTGCAAGTGCTTCAGCCTCAA
GGGTCGGCTCCCAGAGAAGAGTGGTCTCTGCCAAGAGTGAAGTCACAATGTATGGGTCCA
TGTTTGATGCTGGACGTCGATCTTCCAAGTAACCTTTTCCTTTCTTCTCGGTATCACGTC
CCACACGAATTGAGCATCCACGGTTAGCCACGCCCCATGAGAATTGGTCGATACTAGCTG
TCTCGTGCTTTTCGGTCAACCTTCTCTCATTGCCTTCACCGTATGCACTGATGTGCTCCA
TGTGACGAAGCGAGAGGTTCAAGATGGCCTTTTTAATCACCTCAAATCCTCCTTCCTCTC
TCATGCTTTTAGTACTGTAATTGGTATGGCAACCAGCACCGTTCCAGTCTCCCTCTATTG
GTTTGGGATCAAGTGTTAAGACAACACCAGCTTGTTCTGTGATTCTCTCAAGAAGGTATC
TTGCGCACCAAACACGATCACCTGCTTCGATTCCTACGCTCGGGCCAACTTGGAATTCCC
ACTGTCCTGGCATAACTTCACCATTAGTACCACTGATGTTAATTCCAGCATATAAACAAG
CTTTGTAATGAGCATCTGAAATGTCACGTCCC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2CP15TF 719 0 0
TTTGAGTA
TTTCAACAATGCAAATGAAAAAAA*GAAAACACAGAATGTAT*GTCCGAACCAACATTTT
ATAGCAACATTTATGATCGCGGCAGGGCTACATAGTTAATTTAAACATTCAAAGAAAGCT
TTTGAGCTGCAAGTGCTTCAGCCTCAAGGGTCGGCTCCCAGAGAAGAGTGGTCTCTGCCA
AGAGTGAAGTCACAATGTATGGGTCCATGTTTGATGCTGGACGTCGATCTTCCAAGTAAC
CTTTTCCTTTCTTCTCGGTATCACGTCCCACACGAATTGAGCATCCACGGTTAGCCACGC
CCCATGAGAATTGGTCGATACTAGCTGTCTCGTGCTTTTCGGTCAACCTTCTCTCATTGC
CTTCACCGTATGCACTGATGTGCTCCATGTGACGAAGCGAGAGGTTCAAGATGGCCTTTT
TAATCACCTCAAATCCTCCTTCCTCTCTCATGCTTTTAGTACTGTAATTGGTATGGCAAC
CAGCACCGTTCCAGTCTCCCTCTATTGGTTTGGGATCAAGTGTTAAGACAACACCAGCTT
GTTCTGTGATTCTCTCAAGAAGGTATCTTGCGCACCAAACACGATCACCTGCTTCGATTC
CTACGCTCGGGCCAACTTGGAATTCCCACTGTCCTGGCATAACTTCACCATTAGTACCAC
TGATGTTAATTCCAGCATATAAACAAGCTTTGTAATGAGCATCTGAAATGT

QA 9 719 9 719
DS 

RD RR2GQ65JQ 679 0 0
GTCCGAACCAACATTTTATAACAACATTTATGATCGCGGCAGGGCTACATAGTTAATTTA
AACATTCAAAGAAAGCTTTTGAGCTGCAAGTGCTTCAGCCTCAAGGGTCGGCTCCCAGAG
AAGAGTGGTCTCTGCCAAGAGTGAAGTCACAATGTATGGGTCCATGTTTGATGCTGGACG
TCGATCTTCCAAGTAACCTTTTCCTTTCTTCTCGGTATCACGTCCCACACGAATTGAGCA
TCCACGGTTAGCCACGCCCCATGAGAATTGGTCGATACTAGCTGTCTCGTGCTTTCCGGT
CAACCTTCTCTCATTGCCTTCACCGTATGCACTGATGTGCTCCATGTGACGAAGCGAGAG
GTTCAATATGGCCTTTTTAATCACCTCAAATCCTCCTTCCTCTCTCATGCTTTTAGTACT
GTAATTGGTATGGCAACCAGCACCGTTCCAGTCTCCCTCTATTGGTTTGGGATCAAGTGT
TAAGACAACACCAGCTTGTTCTGTGATTCTCTCAAGAAGGTATCTTGCACACCAAACATG
ATCACCTGCTTCGATTCCTACGCTCGGGCCAACTTGGAATTCCCACTGTCCTGGCATAAC
TTCACCATTAGTACCACTGATGTTAATTCCAGCATATAAACAAGCTTTGTAATGAGCATC
TGAAATGTCACGTCCCCAT

QA 1 679 1 679
DS 



CO CL429Contig3 510 2 1 U
GAGAGAGGATGGAGGATTTGAAGTGATTAAAAAGGCCATCTTGAACCTCTCGCTTCGTCA
CATGGAGCACATCAGTGCCTACGGTGAAGGCAATGAGAGAAGGTTGACCGGAAAGCACGA
GACAGCCAGTATCGACCAATTCTCATGGGGCGTGGCTAACCGTGGATGCAATTCGTGTTG
GACGTGATACCGAGAAGAAAGGAAAAGGTTACTTGGAAGATCGGCGTCCAGCGTCTAACA
TGGACCCATACATTGTGACTTCACTGTTGGCAGAGACCACACTTCTCTGGGAGCCAACCC
TTGAGGCTGAAGCACTTGCTGCTCAGAAGCTTTCTTTGAAAGTTTAATTTATTCCTGAAC
ACGCATGTCTATTTATGTGGTCTTCCCCGGATCATAAATGCTGTTTAGAACACTGGTTCG
GATTAAGACATTCTTGCCTCCTTTTTTTTCATTTGCACTGTTGAAAAACAAGAATTTCAT
GGGCAATCATCATTTTCTATTGGTTATTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DF40JQ C 1
AF RR2DF40TF U 1
BS 1 510 RR2DF40TF

RD RR2DF40JQ 510 0 0
GAGAGAGGATGGAGGATTTGAAGTGATTAAAAAGGCCATCTTGAACCTCTCGCTTCGTCA
CATGGAGCACATCAGTGCCTACGGTGAAGGCAATGAGAGAAGGTTGACCGGAAAGCACGA
GACAGCCAGTATCGACCAATTCTCATGGGGCGTGGCTAACCGTGGATGCAATTCGTGTTG
GACGTGATACCGAGAAGAAAGGAAAAGGTTACTTGGAAGATCGGCGTCCAGCGTCTAACA
TGGACCCATACATTGTGACTTCACTGTTGGCAGAGACCACACTTCTCTGGGAGCCAACCC
TTGAGGCTGAAGCACTTGCTGCTCAGAAGCTTTCTTTGAAAGTTTAATTTATTCCTGAAC
ACGCATGTCTATTTATGTGGTCTTCCCCGGATCATAAATGCTGTTTAGAACACTGGTTCG
GATTAAGACATTCTTGCCTCCTTTTTTTTCATTTGCACTGTTGAAAAACAAGAATTTCAT
GGGCAATCATCATTTTCTATTGGTTATTCG

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2DF40TF 510 0 0
GAGAGAGGATGGAGGATTTGAAGTGATTAAAAAGGCCATCTTGAACCTCTCGCTTCGTCA
CATGGAGCACATCAGTGCCTACGGTGAAGGCAATGAGAGAAGGTTGACCGGAAAGCACGA
GACAGCCAGTATCGACCAATTCTCATGGGGCGTGGCTAACCGTGGATGCAATTCGTGTTG
GACGTGATACCGAGAAGAAAGGAAAAGGTTACTTGGAAGATCGGCGTCCAGCGTCTAACA
TGGACCCATACATTGTGACTTCACTGTTGGCAGAGACCACACTTCTCTGGGAGCCAACCC
TTGAGGCTGAAGCACTTGCTGCTCAGAAGCTTTCTTTGAAAGTTTAATTTATTCCTGAAC
ACGCATGTCTATTTATGTGGTCTTCCCCGGATCATAAATGCTGTTTAGAACACTGGTTCG
GATTAAGACATTCTTGCCTCCTTTTTTTTCATTTGCACTGTTGAAAAACAAGAATTTCAT
GGGCAATCATCATTTTCTATTGGTTATTCG

QA 1 510 1 510
DS 



AS 3 9

CO CL430Contig1 1120 4 3 U
AAAAGTATCATATTGTTTTTTGTTTATATAAAAAAAGAAGAGAATAAAACAGTGTCTTGA
GAAAGAACTTTCAGACAAGTAAAAAGACAAACAGAAACATAGGGACATGAATGAAGTTTT
ATTTTGTTCTAAAGAAAAAACATACACAAGGCAACAGTTTCACAACTCAAAAAACCAGCT
CAGGTCTGGTTCTTAGCACTACTGAAGCTTCTTGATCCCAGGGAAGGAAGGAAGGATCGA
GATGAGAGCATCATTGTATCCTACAGGCTCTCCATCCTCTCGGAGTATTTTGACAACCTC
GCCAGTAACGTCAGACTCGATAGGGAATTGGCCACCGAGTTGTTCAATGTAGCAAAGAAC
TTGACCTTCTTTCACTTGGTCTTTCTCTTTACATGACGAAGGAGTACGTTTACCCTTTAT
GGTTTTGGATCTCCTAAAGAACCCTACTTTTGGAGATTGGAGAACCACCAAACCCTGATC
AGCAGCTGAGGATGTTGGTTTTATGATAGCCAGTGAAGTAGAGGAAGCTGATCCATTCAA
ATCAACACTCTCCGTGGTTGCATTTGCAGAAACGGCAGCAGGAATGGGTTGAGGTTGTGG
TGGGCTACTATTGTTGTCAGCTAAGTTCCTTGCTACATATAGGCGGAAACCCCCCAGTTT
CAGTTCAAACTCTGCAATTGATGAGGAGTCGTATATTTCAGTTACAAGAGCTTCCACCTC
AGAGGGCTTGGGAACGAGCTGAGCGTTCAACGGAGATGGCTTCGCCGTCTCAGCATCTTC
TACTTCTAAGGTAACTGCAGATTCAGCAGGTGTGACAGTAGACACTGGGACAGCTTTCAC
AGATCCAAGAGTTGTCCTGAGACTCAAGTACTTAACCGGCCTTTGACCAATCAACACTCT
TTGATGGCATGGTATCTGTAAGCTTCCAGATCTTCTTACTCTACTGAGGTCTACTGCTGA
GATTTTAATCTTAGGAACTCCTAGGCTACAGGAAGCCATGGAGGCAATGGATTCGAGACA
GAGAATGTAAGGCAGAGAGGGATTGAGATTATGAAACCGATGCCGATAACGATACGAACG
AGGGGGAAGTGAGAGAATGACAATCAAATCAAATCAAAAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB79JQ U 4
AF RR2DY13JQ U 1
AF RR2FZ22TF C 372
AF RR2BX96TF C 838
BS 1 673 RR2DY13JQ
BS 674 1087 RR2FZ22TF
BS 1088 1120 RR2BX96TF

RD RR2GB79JQ 613 0 0
AGTATCATATTGTTTTTTGTTTATATAAAAAAAGAAGAGAATAAAACAGTGTCTTGAGAA
AGAACTTTCAGACAAGTAAAAAGACAAACAGAAACATAGGGACATGAATGAAGTTTTATT
TTGTTCTAAAGAAAAAACATACACAAGGCAACAGTTTCACAACTCAAAAAACCAGCTCAG
GTCTGGTTCTTAGCACTACTGAAGCTTCTTGATCCCAGGGAAGGAAGGAAGGATCGAGAT
GAGAGCATCATTGTATCCTACAGGCTCTCCATCCTCTCGGAGTATTTTGACAACCTCGCC
AGTAACGTCAGACTCGATAGGGAATTGGCCACCGAGTTGTTCAATGTAGCAAAGAACTTG
ACCTTCTTTCACTTGGTCTTTCTCTTTACATGACGAAGGAGTACGTTTACCCTTTATGGT
TTTGGATCTCCTAAAGAACCCTACTTTTGGAGATTGGAGAACCACCAAACCCTGATCAGC
AGCTGAGGATGTTGGTTTTATGATAGCCAGTGAAGTAGAGGAAGCTGATCCATTCAAATC
AACACTCTCCGTGGTTGCATTTGCAGAAACGGCAGCAGGAATGGGTTGAGGTTGTGGTGG
GCTACTATTGTTG

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2DY13JQ 673 0 0
AAAAGTATCATATTGTTTTTTGTTTATATAAAAAAAGAAGAGAATAAAACAGTGTCTTGA
GAAAGAACTTTCAGACAAGTAAAAAGACAAACAGAAACATAGGGACATGAATGAAGTTTT
ATTTTGTTCTAAAGAAAAAACATACACAAGGCAACAGTTTCACAACTCAAAAAACCAGCT
CAGGTCTGGTTCTTAGCACTACTGAAGCTTCTTGATCCCAGGGAAGGAAGGAAGGATCGA
GATGAGAGCATCATTGTATCCTACAGGCTCTCCATCCTCTCGGAGTATTTTGACAACCTC
GCCAGTAACGTCAGACTCGATAGGGAATTGGCCACCGAGTTGTTCAATGTAGCAAAGAAC
TTGACCTTCTTTCACTTGGTCTTTCTCTTTACATGACGAAGGAGTACGTTTACCCTTTAT
GGTTTTGGATCTCCTAAAGAACCCTACTTTTGGAGATTGGAGAACCACCAAACCCTGATC
AGCAGCTGAGGATGTTGGTTTTATGATAGCCAGTGAAGTAGAGGAAGCTGATCCATTCAA
ATCAACACTCTCCGTGGTTGCATTTGCAGAAACGGCAGCAGGAATGGGTTGAGGTTGTGG
TGGGCTACTATTGTTGTCAGCTAAGTTCCTTGCTACATATAGGCGGAAACCCCCCAGTTT
CAGTTCAAACTCT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2FZ22TF 721 0 0
CTTCACTTGTC
TTCTCTTTACATGACGAAGGAGTACGTTTACCCTTTATGGTTTTGGATCTCCTAAAGAAC
CCTACTTTTGGAGATTGGAGAACCACCAAACCCTGATCAGCAGCTGAGGATGTTGGTTTT
ATGATAGCCAGAGAAGTAGAGGAAGCTGATCCATTTGAATCAACACTCTCCGTGGTTGCA
TTTGCAGAAACGGCAGCAGGAATGGGCTGAGGTTGTGGTGGGCTACTGTTGTTGTCAGCT
AAGTTCCTTGCTATGTATAGGCGGAAACCCCCCAGTTTCAGTTCAAACTCTGCAATTGAT
GAGGAGTCGTATATTTCAGTTACAAGAGCTTCCACCTCAGAGGGCTTGGGAACGAGCTGA
GCGTTCAACGGAGATGGCTTCGCCGTCTCAGCATCTTCTACTTCTAAGGTAACTGCAGAT
TCAGCAGGTGTGACAGTAGACACTGGGACAGCTTTCACAGATCCAAGAGTTGTCCTGAGA
CTCAAGTACTTAACCGGCCTTTGACCAATCAACACTCTTTGATGGCATGGTATCTGTAAG
CTTCCAGATCTTCTTACTCTACTGAGGTCTACTGCTGAGATTTTAATCTTAGGAACTCCT
AGGCTACAGGAAGCCATGGAGGCAATGGATTCGAGACAGAGAATGTAAGGCAGAGAGGGA
TTGAGATTATGAAACCGATGCCGATAACGATACGAACGAGGGGGA
AGTCC

QA 12 716 12 716
DS 

RD RR2BX96TF 283 0 0
CACAGATCCAAGAGTTGTCCTGAGACTCAAGTACTTAACCGGCCTTTGACCAATCAACAC
TCTTTGATTGCATGGTATCTGTAAGCTTCCAGATCTTCTTACTCTACTGAGGTCTACTGC
TGAGATTTTAATCTTAGGAACTCCTAGGCTACAGGAAGCCATGGAGGCAATGGATTCGAG
ACAGAGAATGTAAGGCAGAGAGGGATTGAGATTATGAAACCGATGCCGATAACGATACGA
ACGAGGGGGAAGTGAGAGAATGACAATCAAATCAAATCAAAAA

QA 1 283 1 283
DS 



CO CL430Contig2 690 2 6 U
GATCGAACGAGCGAACCCAACCAACCAAGTACCCAACCAACCCGAGCGTTCACCTCAATT
TTTTTTCTTTTTGATTTGATTGTCACTCTCTCACTCCCCCTCGTTCGTATCGTTATCGGC
ATCGGTTTCATAATTTCAATCCCTCTCTGCCTTACATTCTCTGTCTCGAATCCATTGCCT
CCATGGCTTCCTGTAGCCTAGGAGTCCCTAAGATTAAAATCTCAGCAGTAGACCTCAGTA
GGTTAAGATCTGGAAGCTTACAGCTACCATGCAATCAAAGAGCGTTGATTGGTCAAAGGC
CGGTTAAGTACTTGAGTCTCAGGACAACTCTTGGATCTGTGAAAGCTGTCCAAGTGTCTA
CTGTCACACCTGCTGAATCTGCAGCTACTGTTGAATTAGAAGATGCTGAGACGGCGAAGC
CATCTCCGTTGAACGCTCAGCTCGTTCCCAAGCCCTCTGAGGTGGAAGCTCTTGTAACTG
AAATATGCGATTCCTCATCAATTGCAGAGTTTGAACTGAAACTGGGGGGTTTCCGCCTAT
ATGTAGCAAGGAACTTAGCTGACAACAATAGTAGCCCACCACAACCTCAACCCATTCCTG
CTGCCGTTTCTGCAAATGCAACCACGGAGAGTGTTGATTTGAATGGATCAGCTTCCTCTA
CTTCACTGGCTATCATAAAACCAACATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY13TF U 1
AF RR2GB79TF U 73
BS 1 85 RR2DY13TF
BS 86 86 RR2GB79TF
BS 87 438 RR2DY13TF
BS 439 439 RR2GB79TF
BS 440 568 RR2DY13TF
BS 569 690 RR2GB79TF

RD RR2DY13TF 568 0 0
GATCGAACGAGCGAACCCAACCAACCAAGTACCCAACCAACCCGAGCGTTCACCTCAATT
TTTTTTCTTTTTGATTTGATTGTCATTCTCTCACTCCCCCTCGTTCGTATCGTTATCGGC
ATCGGTTTCATAATTTCAATCCCTCTCTGCCTTACATTCTCTGTCTCGAATCCATTGCCT
CCATGGCTTCCTGTAGCCTAGGAGTCCCTAAGATTAAAATCTCAGCAGTAGACCTCAGTA
GGTTAAGATCTGGAAGCTTACAGCTACCATGCAATCAAAGAGCGTTGATTGGTCAAAGGC
CGGTTAAGTACTTGAGTCTCAGGACAACTCTTGGATCTGTGAAAGCTGTCCAAGTGTCTA
CTGTCACACCTGCTGAATCTGCAGCTACTGTTGAATTAGAAGATGCTGAGACGGCGAAGC
CATCTCCGTTGAACGCTCGGCTCGTTCCCAAGCCCTCTGAGGTGGAAGCTCTTGTAACTG
AAATATGCGATTCCTCATCAATTGCAGAGTTTGAACTGAAACTGGGGGGTTTCCGCCTAT
ATGTAGCAAGGAACTTAGCTGACAACAA

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2GB79TF 618 0 0
GATTTGATTGTCACTCTCTCACTCCCCCTCGTTCGTATCGTTATCGGCATCGGTTTCATA
ATTTCAATCCCTCTCTGCCTTACATTCTCTGTCTCGAATCCATTGCCTCCATGGCTTCCT
GTAGCCTAGGAGTCCCTAAGATTAAAATCTCAGCAGTAGACCTCAGTAGGTTAAGATCTG
GAAGCTTACAGCTACCATGCAATCAAAGAGCGTTGATTGGTCAAAGGCCGGTTAAGTACT
TGAGTCTCAGGACAACTCTTGGATCTGTGAAAGCTGTCCAAGTGTCTACTGTCACACCTG
CTGAATCTGCAGCTACTGTTGAATTAGAAGATGCTGAGACGGCGAAGCCATCTCCGTTGA
ACGCTCAGCTCGTTCCCAAGCCCTCTGAGGTGGAAGCTCTTGTAACTGAAATATGCGATT
CCTCATCAATTGCAGAGTTTGAACTGAAACTGGGGGGTTTCCGCCTATATGTAGCAAGGA
ACTTAGCTGACAACAATAGTAGCCCACCACAACCTCAACCCATTCCTGCTGCCGTTTCTG
CAAATGCAACCACGGAGAGTGTTGATTTGAATGGATCAGCTTCCTCTACTTCACTGGCTA
TCATAAAACCAACATCCT

QA 1 618 1 618
DS 



CO CL430Contig3 1028 3 2 U
AAGTATCATAGTTGTTTTTTGTTTATATAAAGAAAAAGAACAGAATAAAACAGTGTCTTG
AGAAAGAACTTTCAGACAAGTAAAAAGACAAAACAGAAACATAGGGACGTGAATGAAGTT
TTATTTGTCCTAAAGAAAAAAACATACACAAGGCACAAGTTTCACAACTCAAAAAACCAG
CTCAGGTCTGGTTCTTAGTACTACTGAAGCTTCTTGATCCCAAGGAAGGAAGGAAGGATC
GAGATGAGAGCATCATTGTATCCTACAGGCTCTCCATCTTCTCGGAGTATTTTGACAACC
TCGCCAGTAACATCAGACTCGATAGGGAATTGGCCACCGAGTTGTTCAATGTAGCAAAGA
ACTTGACCTTCTTTCACTTGGTCTTTCTCTTTACATGACGAAGGAGTACGTTTACCCTTT
ATGGTTTTGGATCTCCTAAAGAACCCTACTTTTGGAGATTGGAGAACCACCAAACCCTGA
TCAGCAGCTGAGGATGTTGGTTTTATGATAGCCAGAGAAGTAGATGAAGCTGATCCATTC
GAATCAACACTCTCCGTGGTTGCATTTGCAGAAACGGCAGCAGGAATGGGCTGAGGTTGT
GGTGGGCTAGTGTTGTTGTCAGCTAAGTTCCTTGCTACATATAGGCGGAAACCCCCCAGT
TTCAGTTCAAACTCTGCAATTGATGGGGAATCGCATATTTCAGTGACAAGAGCTTCCACC
TCAGAGGGCTTGGGAACGAGCTGAGTGTTCAACGGAGAAGGCTTCGCCGTCTCAGCATCT
TCTACTTTTACAGTAGCTGCAGATTCAGCAGGTGTGACAGTAGACACTTGGACAGCTTTC
ACAGATCCAAGAGTTGTCCTGAGACTCAAGTAATTAACCGGCCTTTGACCAATCAACACT
CTTTGATTGCATGGCATCTGTAAGCTTCCAGATCTCACCCTACTGAGGTCTACTGCTGAG
ATTTTAATCTTAGGAACTCCTAGGCTACAGGAAGCCATGGAGGAAATGGATTCGAGACAG
AGAATGTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC07JQ U 2
AF RR2E366JQ U 1
AF RR2E366TF C 239
BS 1 653 RR2E366JQ
BS 654 1028 RR2E366TF

RD RR2GC07JQ 354 0 0
AGTATCATAGTTGTTTTTTGTTTATATAAAGAAAAAGAACAGAATAAAACAGTGTCTTGA
GAAAGAACTTTCAGACAAGTAAAAAGACAAAACAGAAACATAGGGACGTGAATGAAGTTT
TATTTGTTCTAAAGAAAAAAACATACACAAGGCACAAGTTTCACAACTCAAAAAACCAGC
TCAGGTCTGGTTCTTAGTACTACTGAAGCTTCTTGATCCCAAGGAAGGAAGGAAGGATCG
AGATGAGAGCATCATTGTATCCTACAGGCTCTCCATCTTCTCGGAGTATTTTGACAACCT
CGCCAGTAACATCAGACTCGATAGGGAATTGGCCACCGAGTTGTTCAATGTAGC

QA 1 354 1 354
DS 

RD RR2E366JQ 653 0 0
AAGTATCATAGTTGTTTTTTGTTTATATAAAGAAAAAGAACAGAATAAAACAGTGTCTTG
AGAAAGAACTTTCAGACAAGTAAAAAGACAAAACAGAAACATAGGGACGTGAATGAAGTT
TTATTTGTCCTAAAGAAAAAAACATACACAAGGCACAAGTTTCACAACTCAAAAAACCAG
CTCAGGTCTGGTTCTTAGTACTACTGAAGCTTCTTGATCCCAAGGAAGGAAGGAAGGATC
GAGATGAGAGCATCATTGTATCCTACAGGCTCTCCATCTTCTCGGAGTATTTTGACAACC
TCGCCAGTAACATCAGACTCGATAGGGAATTGGCCACCGAGTTGTTCAATGTAGCAAAGA
ACTTGACCTTCTTTCACTTGGTCTTTCTCTTTACATGACGAAGGAGTACGTTTACCCTTT
ATGGTTTTGGATCTCCTAAAGAACCCTACTTTTGGAGATTGGAGAACCACCAAACCCTGA
TCAGCAGCTGAGGATGTTGGTTTTATGATAGCCAGAGAAGTAGATGAAGCTGATCCATTC
GAATCAACACTCTCCGTGGTTGCATTTGCAGAAACGGCAGCAGGAATGGGCTGAGGTTGT
GGTGGGCTAGTGTTGTTGTCAGCTAAGTTCCTTGCTACATATAGGCGGAAACC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2E366TF 790 0 0
TCGAGATGAGAGCATCAT*GTATCCTACAG*CTCTCCATCT*CTCGGAGTATTT*GACA*
CCTCGCCAGTAACATCAGACTCGATAGGGAAT*GGCCACCGAGTTGTTCAATGTAGCAAA
GAACTTGACTTTCTTTCACTTGGTCTTTCTCTTTACATGACGAAGGAGTACGTTTACCCT
TTATGGTTTTGGATCTCCTAAAGAACCCTACTTTTGGAGATTGGAGAACCACCAAACCCT
GATCAGCAGCTGAGGATGTTGGTTTTATGATAGCCAGAGAAGTAGATGAAGCTGATCCAT
TCGAATCAACACTCTCCGTGGTTGCATTTGCAGAAACGGCAGCAGGAATGGGCTGAGGTT
GTGGTGGGCTAGTGTTGTTGTCAGCTAAGTTCCTTGCTACATATAGGCGGAAACCCCCCA
GTTTCAGTTCAAACTCTGCAATTGATGGGGAATCGCATATTTCAGTGACAAGAGCTTCCA
CCTCAGAGGGCTTGGGAACGAGCTGAGTGTTCAACGGAGAAGGCTTCGCCGTCTCAGCAT
CTTCTACTTTTACAGTAGCTGCAGATTCAGCAGGTGTGACAGTAGACACTTGGACAGCTT
TCACAGATCCAAGAGTTGTCCTGAGACTCAAGTAATTAACCGGCCTTTGACCAATCAACA
CTCTTTGATTGCATGGCATCTGTAAGCTTCCAGATCTCACCCTACTGAGGTCTACTGCTG
AGATTTTAATCTTAGGAACTCCTAGGCTACAGGAAGCCATGGAGGAAATGGATTCGAGAC
AGAGAATGTC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 10

CO CL431Contig1 1250 10 21 U
GATAATAGAAATAATAAAAATACAAGATATTCTAAGATATCTTTAGAATTCAGAATATAA
CAATAACAGGTACAAATATTAAATTGAGGTACCCCATTTTATGACAACTTTCAACAACTT
ACCCTCTATTTTCGTGCCTTTAGTAGGCCTAGTCTTTCCGGCACTTGCAATGGCTTCTTT
ATTTCTTCATATTCAAAAAAATAAGATTTTTTAGATCGGATGAGACCGAATCGTATAAAT
CCCTTTTTTATTTTAAAAACTTCGATTTGATAAGACCCATTTGGTAGAATATTTATAACA
CATAGATTCCTACAAACATAACTAAAAAAAGCTTTTATGCATGTGTAAACGTATTATATG
GGGTAACTCAATTTGCGCTCTTTTGAAAAAATGGATCATCATTGGACCGCTGTATGAAAT
TCAAGTCAATGTATTTAATT*GTATGTATATAGTTATCAATGTATTTATTTGTATGTATA
TAGTTATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTTATTATTTTAGATATAAACAATTATA
TAAATTACTCCTAAAGTAAAGGTTCACAATAAAATAGTTATAGTTGATGAGAGTTACTTT
GAAAACAAAAAAAGGAAAGTCATATTTTCTCAATTCCAAAAAATTGTATAACTGGATCTA
ATATATATGAGTTGGCGATCAGAATCTCTATGGATAGAATTTATAACGGGGTCTCGAAAA
ACAAGTAATTTCTGCTGGGCCTTTATCCTATTTTTAGGTTCATTGGGATTCTTATTGGTT
GGAACTTCCAGTTATCTTGGTAGAAATTTTATATCGTTAGTTGCGTCTCAGGAAATCATT
TTTTTTTCCACAAGGGATTGTGATGTCCTTCTATGGGATCGCGGGTCTCTTTATTAGTTG
CTATTTGTGGTGCACTATTTTGTGGAATGTGGGTAGTGGTTATGATCTTTTCGACCGAAA
AGAAGGGATAGTACGTATTTTTCGTTGGGGATTTCCTGGAAAAAGCCGTCGCATCTTTTT
ACGATTCCTTATGAAAGATATTCAGTCGACCAGAATCGAAGTTAAAGAGGGTGTTTCTGC
CCGGCGTGTCCTTTATATGGAAATTCGAGGTCAAGGGGCTATTCCTTTAATTCGTACTGA
TGAGAATTTTACTACACGAGAAATTGAGCAAAAGCTGCTGAATTGGCTTACTTCTTGCGT
ACCAATTGAAGTATTTTGAAATGATTCTTTAAAGTTTAAAGACTAATCCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD42TF U 345
AF RR2CD50JQ C 1
AF RR2CD50TF U 1
AF RR2AE08JQ C 28
AF RR2FJ29JQ C 355
AF RR2FJ29TF U 355
AF RR2AE08TF U 28
AF RR2BR65TF U 209
AF RR2D017TF U 525
AF RR2BX79TF U 585
BS 1 173 RR2CD50TF
BS 174 174 RR2AE08TF
BS 175 440 RR2CD50TF
BS 441 441 RR2FJ29TF
BS 442 461 RR2CD50TF
BS 462 462 RR2FJ29TF
BS 463 601 RR2CD50TF
BS 602 606 RR2AE08TF
BS 607 667 RR2BR65TF
BS 668 668 RR2D017TF
BS 669 698 RR2BR65TF
BS 699 699 RR2D017TF
BS 700 720 RR2BR65TF
BS 721 721 RR2D017TF
BS 722 757 RR2BR65TF
BS 758 758 RR2D017TF
BS 759 769 RR2BR65TF
BS 770 770 RR2D017TF
BS 771 801 RR2BR65TF
BS 802 1094 RR2D017TF
BS 1095 1250 RR2BX79TF

RD RR2GD42TF 229 0 0
GTAAACGTATTATATGGGGTAACTCAATTTGCGCTCTTTTGAAAAAATGGATCATCATTG
CACCGCTGTATGAAATTCAAGTCAATGTATTTAATT*GTATGTATATAGTTATCAATGTA
TTTATTTGTATGTATATAGTTATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTTATTATTTTA
GATATAAACAATTATATAAATTACTCCTAAAGTAAAGGTTCCCAATAAA

QA 1 229 1 229
DS 

RD RR2CD50JQ 601 0 0
GATAATAGAAATAATAAAAATACAAGATATTTTAAGATATCTTTAGAATTCAGAATATAA
CAATAACAGGTACAAATATTAAATTGAGGTACCCCATTTTATGACAACTTTCAACAACTT
ACCCTCTATTTTCGTGCCTTTAGTAGGCCTAGTCTTTCCGGCACTTGCAATGGTTTCTTT
ATTTCTTCATATTCAAAAAAATAAGATTTTTTAGATCGGATGAGACCGAATCGTATAAAT
CCCTTTTTTATTTTAAAAACTTCGATTTGATAAGACCCATTTGGTAGAATATTTATAACA
CATAGATTCCTACAAACATAACTAAAAAAAGCTTTTATGCATGTGTAAACGTATTATATG
GGGTAACTCAATTTGCGCTCTTTTGAAAAAATGGATCATCATTGGACCGCTGTATGAAAT
TCAAGTCAATGTATTTAATT*GTATGTATATAGTTATCAAT*TATTTATTTGTATGTATA
TAGTTATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTTATTATTTTAGATATAAACAATTATA
TAAATTACTCCTAAAGTAAAGGTTCACAATAAAATAGTTATAGTTGATGAGAGTTACTTT
G

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2CD50TF 601 0 0
GATAATAGAAATAATAAAAATACAAGATATTCTAAGATATCTTTAGAATTCAGAATATAA
CAATAACAGGTACAAATATTAAATTGAGGTACCCCATTTTATGACAACTTTCAACAACTT
ACCCTCTATTTTCGTGCCTTTAGTAGGCCTAGTCTTTCCGGCACTTGCAATGGTTTCTTT
ATTTCTTCATATTCAAAAAAATAAGATTTTTTAGATCGGATGAGACCGAATCGTATAAAT
CCCTTTTTTATTTTAAAAACTTCGATTTGATAAGACCCATTTGGTAGAATATTTATAACA
CATAGATTCCTACAAACATAACTAAAAAAAGCTTTTATGCATGTGTAAACGTATTATATG
GGGTAACTCAATTTGCGCTCTTTTGAAAAAATGGATCATCATTGGACCGCTGTATGAAAT
TCAAGTCAATGTATTTAATTTGTATGTATATAGTTATCAAT*TATTTATTTGTATGTATA
TAGTTATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTTATTATTTTAGATATAAACAATTATA
TAAATTACTCCTAAAGTAAAGGTTCACAATAAAATAGTTATAGTTGATGAGAGTTACTTT
G

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2AE08JQ 579 0 0
GATTT
TAAGATATCTTTAGAATTCAGAATATAACAATAACAGGTACAAATATTAAATTGAGGTAC
CCCATTTTATGACAACTTTCAACAACTTACCCTCTATTTTTGTGCCTTTAGTAGGCCTAG
TCTTTCCGGCACTTGCAATGGCTTCTTTATTTCTTCATATTCAAAAAAATAAGATTTTTT
AGATCGGATGAGACCGAATCGTATAAATCCCTTTTTTATTTTAAAAACTTCGATTTGATA
AGACCCATTTGGTAGAATATTTATAACACATAGATTCCTACAAACACAACTAAAAAAAGC
TTTTATGCATGTGTAGACGTATTATATGGGGTAACTCAATTTGCGCTCTTTTGAAAAAAT
GGATCATCATTGGACCGCTGTATGAAATTCAAGTCAATGTATTTAATT*GTATGTATATA
GTTATCAATGTATTTATTTGTATGTATATAGTTATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGAT
GTTATTATTTTAGATATAAACAATTATATAAATTACTCCTAAAGTAAAGGTTCACAATAA
AATAGTTATAGTTGATGAGAGTTACTTTGAAAAC

QA 6 579 6 579
DS 

RD RR2FJ29JQ 247 0 0
G
ATATGGGGTAACTCAATTTGCGCTCTTTTGAAAAAATGGATCATCATTGGACCGCTGTAT
GAAATTCAAGTCAATGTATTTAATT*GTATGTATATAGTTATCAATGTATTTATTTGTAT
GTATATAGTTATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTTATTATTTTAGATATAAACAA
TTATATAAATTACTCCTAAAGTAAAGGTTCACAATAAAATAGTTATAGTTGATGAGAGTT
ACTTTG

QA 2 247 2 247
DS 

RD RR2FJ29TF 247 0 0
G
ATATGGGGTAACTCAATTTGCGCTCTTTTGAAAAAATGGATCATCATTGGACCGCTGTAT
GAAATTCAAGTCAATGTATTTAATT*GTATGTATATAGTTATCAATGTATTTATTTGTAT
GTATATAGTTATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTTATTATTTTAGATATAAACAA
TTATATAAATTACTCCTAAAGTAAAGGTTCACAATAAAATAGTTATAGTTGATGAGAGTT
ACTTTG

QA 2 247 2 247
DS 

RD RR2AE08TF 579 0 0
GATTC
TAAGATATCTTTAGAATTCAGAATATAACAATAACAGGTACAAATATTAAATTGAGGTAC
CCCATTTTATGACAACTTTCAACAACTTACCCTCTATTTTTGTGCCTTTAGTAGGCCTAG
TCTTTCCGGCACTTGCAATGGCTTCTTTATTTCTTCATATTCAAAAAAATAAGATTTTTT
AGATCGGATGAGACCGAATCGTATAAATCCCTTTTTTATTTTAAAAACTTCGATTTGATA
AGACCCATTTGGTAGAATATTTATAACACATAGATTCCTACAAACACAACTAAAAAAAGC
TTTTATGCATGTGTAGACGTATTATATGGGGTAACTCAATTTGCGCTCTTTTGAAAAAAT
GGATCATCATTGGACCGCTGTATGAAATTCAAGTCAATGTATTTAATT*GTATGTATATA
GTTATCAATGTATTTATTTGTATGTATATAGTTATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGAT
GTTATTATTTTAGATATAAACAATTATATAAATTACTCCTAAAGTAAAGGTTCACAATAA
AATAGTTATAGTTGATGAGAGTTACTTTGAAAAC

QA 6 579 6 579
DS 

RD RR2BR65TF 593 0 0
TTTAGAT
TCGGATGAGACCGAATCGTATAAATCCCTTTTTTATTTTAAAAACTTCGATTTGATAAGA
CCCATTTGGTAGAATATTTATAACACATAGATTCCTACAAACATAACTAAAAAAAGCTTT
TATGCATGTGTAAACGTATTATATGGGGTAACTCAATTTGCGCTCTTTTGAAAAAATGGA
TCATCATTGGACCGCTGTATGAAATTCAAGTCAATGTATTTAATT*GTATGTATATAGTT
ATCAATGTATTTATTTGTATGTATATAGTTATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTT
ATTATTTTAGATATAAACAATTATATAAATTACTCCTAAAGTAAAGGTTCACAATAAAAT
AGTTATAGTTGATGAGAGTTACTTTGAAAACAAAAAAAGGAAAGTCATATTTTCTCAATT
CCAAAAAATTGTATAACTGGATCTAATATATACGAGTTGGCGATCAGAATCTCTATGGAT
AGA*TTTATAACGGGGTCTCGAAAA*CAAGTAATTTCTGCTGGGCCTTTATCCTATTTTT
AG*TTCATTGGGAT*CTTATTGGTTGGAACTTCCAGTTATCTTGGT

QA 8 593 8 593
DS 

RD RR2D017TF 570 0 0
GATATAAACAATTATATAAATTACTCCTAAAGTAAAGGTTCACAATAAAATAGTTATAGT
TGATGAGAGTTACTTTGAAAACAAAAAAAGGAAAGTCATATTTTCTCAATTCCAAAAAAT
TGTATAACTGGATCTAATATATATGAGTTGGCGATCAGAATCTCTATGGATAGAATCTAT
AACGGGGTCTCGAAAAACAAGTAATTTCTGCTGGGCCTTTATCCTATTTTTAGGTTCATT
GGGATTCTTATTGGTTGGAACTTCCAGTTATCTTGGTAGAAATTTTATATCGTTAGTTGC
GTCTCAGGAAATCATTTTTTTTTCCACAAGGGATTGTGATGTCCTTCTATGGGATCGCGG
GTCTCTTTATTAGTTGCTATTTGTGGTGCACTATTTTGTGGAATGTGGGTAGTGGTTATG
ATCTTTTCGACCGAAAAGAAGGGATAGTACGTATTTTTCGTTGGGGATTTCCTGGAAAAA
GCCGTCGCATCTTTTTACGATTCCTTATGAAAGATATTCAGTCGACCAGAATCGAAGTTA
AAGAGGGTGTTTCTGCCCGGCGTGTCCTTT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2BX79TF 666 0 0
G
GATGAGAGTTACTTTGAAAACAAAAAAAGGAAAGTCATATTTTCTCAATTCCAAAAAATT
GTATAACTGGATCTAATATATATGAGTTGGCGATCAGAATCTCTATGGATAGAATTTATA
ACGGGGTCTCGAAAAACAAGTAATTTCTGCTGGGCCTTTATCCTATTTTTAGGTTCATTG
GGATTCTTATTGGTTGGAACTTCCAGTTATCTTGGTAGAAATTTTATATCGTTAGTTGCG
TCTCAGGAAATCATTTTTTTT*CCACAAGGGATTGTGATGTCTTTCTATGGGATCGCGGG
TCTCTTTATTAGTTGCTATTTGTGGTGCACTATTTTGTGGAATGTGGGTAGTGGTTATGA
T*TTTTCGACCGAAAAGAAGGGATAGTACGTATTTTTCGTTGGGGATTTCCTGGAAAAAG
CCGTCGCATCTTTTTACGATTCCTTATGAAAGATATTCAGTCGATCAGAATCGAAGTTAA
AGAGGGTGTTTCTGCCCGGCGTGTCCTTTATATGGAAATTCGAGGTCAAGGGGCTATTCC
TTTAATTCGTACTGATGAGAATTTTACTACACGAGAAATTGAGCAAAAGCTGCTGAATTG
GCTTACTTCTTGCGTACCAATTGAAGTATTTTGAAATGATTCTTTAAAGTTTAAAGACTA
ATCCT

QA 2 666 2 666
DS 



AS 1 10

CO CL432Contig1 919 10 21 U
AGGGGACTCGACCTCGAAGCTAAATTAGAATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
GTCTGGCGATTGAGGTGTGTGGTAGCGAGTGATCATCATCATCATCAT******GTTCGT
GATTGATTGGTTCTATGGCGTTCTCGCTTCGCTAGGTTTATGGCAGAAAGAGGCTAAGAT
CTTGTTCCTCGGGCTCGATAACGCCGGCAAAACCACCTTGCTTCACATGCTCAAAGACGA
GAGGTTGGTGCAGCACCAGCCGACGCAGCATCCAACGTCTGAAGAACTGAGCATTGGCAA
AATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGCGGTCATCAGATTGCTCGCAGGGTCTGGAAGGA
TTACTACGCTAAGGTGGATGCTGTGGTCTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGCGATT
TGCAGAATCGAAAAAGGAACTGGACGCGCTTCTCTCAGACGAATCTCTAGCCACCGTTCC
GTTCCTCATCCTAGGAAACAAGATAGACATACCATACGCTGCATCAGAGGACGAGCTCCG
TTACCATCTCGGCCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAATCTAGTCGACTC
CAACGTAAGACCATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAAGATGGGTTATGGCGA
AGGCTTCAAATGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACTACTAAGCCAAGTCTCCAACAACCA
CATCATGGCCTTGTTATTGCTAAACCATAAGTTCCCAGCTTTGTCTCTCTTGTCTTGCTT
TTTTCATGTTTTGTAAGAAATGTCGTGAAACTTAGCTTCTCGTTGCTCTGGTTTGTTTCT
TTGTAGTGATTTTTTTTTT*AAATAACATTACATGTTTCGTAATTTATACTATTAAATAA
GGTAAAAATGTTAGGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 
60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 45 30 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C828TF U 84
AF RR2C828JQ C 260
AF RR2EW35TF U 1
AF RR2G766TF U 21
AF RR2AU30TF U 23
AF RR2DS40TF U 426
AF RR2EW35JQ C 243
AF RR2AO84TF U 47
AF RR2AU30JQ C 23
AF RR2EL77JQ C 289
BS 1 37 RR2EW35TF
BS 38 41 RR2G766TF
BS 42 60 RR2EW35TF
BS 61 61 RR2AU30TF
BS 62 108 RR2EW35TF
BS 109 114 RR2G766TF
BS 115 480 RR2EW35TF
BS 481 481 RR2G766TF
BS 482 660 RR2EW35TF
BS 661 662 RR2G766TF
BS 663 663 RR2DS40TF
BS 664 716 RR2G766TF
BS 717 717 RR2DS40TF
BS 718 783 RR2G766TF
BS 784 784 RR2DS40TF
BS 785 800 RR2G766TF
BS 801 859 RR2DS40TF
BS 860 860 RR2AU30JQ
BS 861 881 RR2DS40TF
BS 882 912 RR2AU30JQ
BS 913 919 RR2EL77JQ

RD RR2C828TF 450 0 0
AGCGAGTGATCATCATCATCATCAT******GTTCGTGATTGATTGGTTCTATGGCGTTC
TCGCTTCGCTAGGTTTATGGCAGAAAGAGGCTAAGATCTTGTTCCTCGGGCTCGATAACG
CCGGCAAAACCACCTTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGGTTGGTGCAGCACCAGCCGA
CGCAGCATCCAACATCTGAAGAACTGAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGATT
TGGGCGGTCATCAGATTGCTCGCAGGGTCTGGAAGGATTACTACGCTAAGGTGGATGCTG
TGGTCTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGCGATTTGCAGAATCGAAAAAGGAACTGG
ACGCGCTTCTCTCAGACGAATCTCTAGCCACCGTTCCGTTCCTCATCCTAGGAAACAAGA
TAGACATACCATACGCTGCATCAGAGGACG

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR2C828JQ 312 0 0
CCGACGCAGCATCCAACATCTGAAGAACTGAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTT
GATTTGGGCGGTCATCAGATTGCTCGCAGGGTCTGGAAGGATTATTACGCTAAGGTGGAT
GCTGTGGTCTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGCGATTTGCAGAATCGAAAAAGGAA
CTGGACGCGCTTTTTTCAGACGAATCTCTAGCCACCGTTCCGTTCCTCATCCTAGGAAAC
AAGATAGACATACCATACGCTGCATCAGAGGACGAGCTCCGTTACCATTTCGGCCTCTCC
AACTTCACCACG

QA 1 312 1 312
DS 

RD RR2EW35TF 660 0 0
AGGGGACTCGACCTCGAAGCTAAATTAGAATCCTCTCAAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTGGCGATTGAGGTGTGTGGTAGCGAGTGATCATCATCATCATCATCATCATGTTCGT
GATTGATTGGTTCTATGGCGTTCTCGCTTCGCTAGGTTTATGGCAGAAAGAGGCTAAGAT
CTTGTTCCTCGGGCTCGATAACGCCGGCAAAACCACCTTGCTTCACATGCTCAAAGACGA
GAGGTTGGTGCAGCACCAGCCGACGCAGCATCCAACGTCTGAAGAACTGAGCATTGGCAA
AATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGCGGTCATCAGATTGCTCGCAGGGTCTGGAAGGA
TTACTACGCTAAGGTGGATGCTGTGGTCTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGCGATT
TGCAGAATCGAAAAAGGAACTGGACGCGCTTCTCTCAGACGAATCTCTAGCCACCGTTCC
CTTCCTCATCCTAGGAAACAAGATAGACATACCATACGCTGCATCAGAGGACGAGCTCCG
TTACCATCTCGGCCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAATCTAGTCGACTC
CAACGTAAGACCATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAAGATGGGTTATGGCGA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2G766TF 780 0 0
GGAGAATCCTCTCAAGA
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGGCGATTGAGGTGTGTGGTAGCGAGTGATCATC
ATCATCATCAT******GTTCGTGATTGATTGGTTCTATGGCGTTCTCGCTTCGCTAGGT
TTATGGCAGAAAGAGGCTAAGATCTTGTTCCTCGGGCTCGATAACGCCGGCAAAACCACC
TTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGGTTGGTGCAGCACCAGCCGACGCAGCATCCAACA
TCTGAAGAACTGAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGCGGTCATCAG
ATTGCTCGCAGGGTCTGGAAGGATTACTACACTAAGGTGGATGCTGTGGTCTACCTAGTG
GATGCTTACGACAAGGAGCGATTTGCAGAATCGAAAAAGGAACTGGACGCGCTTCTCTCA
GAAGAATCTCTAGCCACCGTTCCGTTCCTCATCCTAGGAAACAAGATAGACATACCATAC
GCTGCATCAGAGGACGAGCTCCGTTACCATCTCGGCCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAG
GGTAAAGTGAATCTAGTCGACTCCAACGTAAGACCATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATC
GTCAGGAAGATGGGTTATGGCGAAG*CTTCAAATGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACTA
CTAAGCCAAGTCTCCAACA*CCACATCATGGCCTTGTTATTGCTAAACCATAAGTTCCCA
GCTTTGTCTCTCTTGTCTTGCTTTTT*CATGTTTTGTAAGAAA

QA 18 780 18 780
DS 

RD RR2AU30TF 771 0 0
GGCTCTCAAGATCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTGGCGATTGAGGTGTGTGGTAGCGAGTGATCATC
ATCATCATCAT******GTTCGTGATTGATTGGTTCTATGGCGTTCTCGCTTCGCTAGGT
TTATGGCAGAAAGAGGCTAAGATCTTGTTCCTCGGGCTCGATAACGCCGGCAAAACCACC
TTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGGTTGGTGCAGCACCAGCCGACGCAGCATCCAACG
TCTGAAGAACTTAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGCGGTCATCAG
ATTGCTCGCAGGGTCTGGAAGGATTACTACGCTAAGGTGGATGCTGTGGTCTACCTAGTG
GATGCTTACGACAAGGAGCGATTTGCAGAATCGAAAAAGGAACTGGACGCGCTTCTCTCA
GACGAATCTCTAGCCACCGTTCCGTTCCTCGTCCTAGGAAACAAGATAGACATACCATAC
GCTGCGTCAGAGGACGAGCTCCGTTACCATCTCGGCCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAG
GGTAAAGTGAATCTAGTCGACTCCAACGTAAGACCATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATC
GTCAG*AAGATGGGTTATGGCGAAAGCTTCAAATGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACTA
CTAAGCCAAGTCTCCAACAACCACATCATGGCCTTGTTATTGCTAAACCATAAGTTCCCA
GCTTTGTCTCTCTTGTCTTGCTTTTTTCATGTTTTG

QA 16 771 16 771
DS 

RD RR2DS40TF 456 0 0
AATCGAAAAAGGAACTGGACGCGCTTCTCTCAGACGAATCTCTAGCCACCGTTCCGTTCC
TCATCCTAGGAAACAAGATAGACATACCATACGCTGCATCAGAGGACGAGCTCCGTTACC
ATCTCGGCCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAATCTAGTCGACTCCAACG
TAAGACCATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAAGATGGGTTACGGCGAAGGCT
TCAAATGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACTACTAAGCCAAGTCTCCAACAACCACATCA
TGGCCTTGTTATTGCTAAACCATAAGTTCCCAGCTTTGTCTCTCTTGTCTTGCTTTTTTC
ATGTTTTGTAAGAAATGTCGTGAAACTTAGCTTCTCGTTGCTCTGGTTTGTTTCTTTGTA
GTGATTTTTTTTTTTAAATAACATTACATGTTTCGT

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR2EW35JQ 639 0 0
GGTTGGTGCAGCACCAGCCGACGCAGCATCCAACGTCTGAAGAACTGAGCATTGGCAAAA
TCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGCGGTCATCAGATTGCTCGCAGGGTCTGGAAGGATT
ACTACGCTAAGGTGGATGCTGTGGTCTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGCGATTTG
CAGAATCGAAAAAGGAACTGGACGCGCTTCTCTCAGACGAATCTCTAGCCACCGTTCCCT
TCCTCATCCTAGGAAACAAGATAGACATACCATACGCTGCATCAGAGGACGAGCTCCGTT
ACCATCTCGGCCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAATCTAGTCGACTCCA
ACGTAAGACCATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAAGATGGGTTATGGCGAAG
GCTTCAAATGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACTATTAAGCCAAGTCTCCAACAACCACA
TCATGGCCTTGTTATTGCTAAACCATAAGTTCCCAGCTTTGTCTCTCTTGTCTTGCTTTT
TTCATGTTTTGTAAGAAATGTCGTGAAACTTAGCTTCTCGTTGCTCTGGTTTGTTTCTTT
GTAGTGATTTTTTTTT**AAATAACATTACATGTTTCGT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2AO84TF 807 0 0
GG
CTCTCTCTCTCTGTCCGGCGATTGAGGTGTGTGGTAGCGAGTGATCATCATCATCATCAT
******GTTCGTGATTGATTGGTTCTATGGCGTTCTCGCTTCGCTAGGTTTATGGCAGAA
AGAGGCTAAGATCTTGTTCCTCGGGCTCGATAACGCCGGCAAAACCACCTTGCTTCACAT
GCTCAAAGACGAGAGGTTGGTGCAGCACCAGCCGACGCAGCATCCAACGTCTGAAGAACT
TAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGCGGTCATCAGATTGCTCGCAG
GGTCTGGAAGGATTACTACGCTAAGGTGGATGCTGTGGTCTACCTAGTGGATGCTTACGA
CAAGGAGCGATTTGCAGAATCGAAAAAGGAACTGGACGCGCTTCTCTCAGACGAATCTCT
AGCCACCGTTCCGTTCCTCATCCTAGGAAACAAGATAGACATACCATACGCTGCATCAGA
GGACGAGCTCCGTTACCATCTCGGCCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAA
TCTAGTCGACTCCAACGTAAGACCATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAAGGT
GGGTTATGGCGAAGGCTTCAAATGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACTACTAAGCCAAGT
CTCCAACAACCACATCATGGCCTTGTTATTGCTAAACCATAAGTTCCCAGCTTTGTCTCT
CTTGTCTTGCTTTTTTCATGTTTTGTAAGAAATGTCGTGAAACTTAGCTTCTCGTTGCTC
TGGTTTGTTTCTTTGTAGTGATTTT

QA 3 807 3 807
DS 

RD RR2AU30JQ 895 0 0
GGCTCTCAAAATCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTGGCGATTGAGGTGTGTGGTAGCGAGTGATCATC
ATCATCATCAT******GTTCGTGATTGATTGGTTCTATGGCGTTCTCGCTTCGCTAGGT
TTATGGCAGAAAGAGGCTAAGATCTTGTTCCTCGGGCTCGATAACGCCGGCAAAACCACC
TTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGGTTGGTGCAGCACCAGCCGACGCAGCATCCAACG
TCTGAAGAACTTAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGCGGTCATCAG
ATTGCTCGCAGGGTCTGGAAGGATTACTACGCTAAGGTGGATGCTGTGGTCTACCTAGTG
GATGCTTACGACAAGGAGCGATTTGCAGAATCGAAAAAGGAACTGGACGCGCTTCTCTCA
GACGAATCTCTAGCCACCGTTCCGTTCCTCGTCCTAGGAAACAAGATAGACATACCATAC
GCTGCGTCAGAGGACGAGCTCCGTTACCATCTCGGCCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAG
GGTAAAGTGAATCTAGTCGACTCCAACGTAAGACCATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATC
GTCAGGAAGATGGGTTATGGCGAAGGCTTCAAATGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACTA
CTAAGCCAAGTCTCCAACAACCACATCATGGCCTTGTTATTGCTAAACCATAAGTTCCCA
GCTTTGTCTCTCTTGTCTTGCTTTTTTCATGTTTTGTAAGAAATGTCGTGAAACTTAGCT
TCTCGTTGCTCTGGTTTGTTTCTTTGTAGTGATTTTTTTTTT*AAATAACATTACATGTT
TCGTAATTTATACTATTAAATAAGGTAAAAATGTT
TGGGT

QA 16 890 16 890
DS 

RD RR2EL77JQ 631 0 0
GAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGCGGTCATCAGATTGCTCGCAG
GGTCTGGAAGGATTACTACGCTAAGGTGGATGCTGTGGTCTACCTAGTGGATGCTTACGA
CAAGGAGCGATTTGCAGAATCGAAAAAGGAACTGGACGCGCTTCTCTCAGACGAATCTCT
AGCCACCGTTCCCTTCCTCATCCTAGGAAACAAGATAGACATACCATACGCTGCATCAGA
GGACGAGCTCCGTTACCATCTCGGCCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAA
TCTAGTCGACTCCAACGTAAGACCATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCGTGAAGAT
GGGTTATGGCGAAGGCTTCAAATGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACTACTAAGCCAAGT
CTCCAACAACCACATCATGGCCTTGTTATTGCTAAACCATAAGTTCCCAGCTTTGTCTCT
CTTGTCTTGCTTTTTTCATGTTTTGTAAGAAATGTCGTGAAACTTAGCTTCTCGTTGCTC
TGGTTTGTTTCTTTGTAGTGATTTTTTTTTT*AAATAACATTACATGTTTCGTAATTTAT
ACTATTAAATAAGGTAAAAATGTTAGGTTTT

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 11

CO CL433Contig1 665 11 7 U
GGATCAATACAAGTTGTAATCTCTAAGTACATTTTGTGACCAAACAAGTAATCAGTGTTA
AAATGGAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTTTTTTCATGGTGCATA
ATCAAGTCGAAGCAAACGTTTGTTGCCCGACCAGGGCAGCCAGCTTAGTGGTTCGTGAAT
GTGTTCTTATTAAACCGAACAAGGTTTGTGCACAACTTAGTGGATGCATAGTCGTTCCTG
GGTATAAATGTATTAAGAAATATCCATATGGCCTTTACAACTCTGGTGAAACTGTCAATG
AATACTGCAAGTTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCCAGGACT
TCGATGCAGGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTCATT
TCTGCACCAAGGGATCAGCTATTGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCATAATCTA
TGTATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATG
TTAGACTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGTCGTAGAAGCCTAGAAGGTCATCTA
TCCCTATATTGTTTATCCCTTCTACTTGCTATATATATATAT**GAAAAATTTACACTTA
GAGCC


BQ
30 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 0 65 65 65 65 65 65 
65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 
65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 5 5 0 0 0 0 0 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 35 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2AQ15TF U 50
AF RR2BY24JQ C 1
AF RR2H544JQB C 130
AF RR2CN88TF U 2
AF RR2EY78TF U 1
AF RR2H544TF U 1
AF RR2BY24TF U 1
AF RR2BW55JQ C 4
AF RR2BW55TF U 4
AF RR2F153TF U 4
AF RR2F153JQ C 25
BS 1 1 RR2EY78TF
BS 2 353 RR2CN88TF
BS 354 354 RR2EY78TF
BS 355 650 RR2CN88TF
BS 651 657 RR2EY78TF
BS 658 658 RR2BY24TF
BS 659 665 RR2F153JQ

RD RR2AQ15TF 531 0 0
AATCAGTGTTAAAATGGAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTTTTTT
CATGGTGCATAATCAAGTCGAAGCAAACGTTTGTTGCCCGACCAGGGCAGCCAGCTTAGT
GGTTCGTGAATGTGTTCTTATTAAACCGAACAAGGTTTGTGCACAACTTAGTGGATGCAT
AGTCGTTCCTGGGTATAAATGTATTAAGAAATATCCATATGGCCTTTACAACTCTGGTGA
AACTGTCAATGAATACTGCAAGTTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCAC
TCTCAAGGACTTCAATGCAGGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGC
ATGTTCTCATTTCTGCACCAAGGGATCAGCTATTGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATA
TCCATAATCTATGTATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTAT
GTGACAAAATGTTAGACTCTTGTTCTATTTCCTGGCTTTCTATGTGTCGTA

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2BY24JQ 658 0 0
GGATCAATACAAGTTGTAATCTCTAAGTACATTTTGTGACCAAACAAGTAATCAGTGTTA
AAATGGAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTTTTTTCATGGTGCATA
ATCAAGTCGAAGCAAACGTTTGTTGCCCGACCAGGGCAGCCAGCTTAGTGGTTCGTGAAT
GTGTTCTTATTAAACCGAACAAGGTTTGTGCACAACTTAGTGGATGCATAGTCGTTCCTG
GGTATAAATGTATTAAGAAATATCCATATGGCCTTTACAACTCTGGTGAAACTGTCAATG
AATACTGCAAGTTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCCAGGACT
TCGATGCAGGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTCATT
TCTGCACCAAGGGATCAGCTATTGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCATAATCTA
TGTATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATG
TTAGACTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGTC********CTAGAAGGTCATCTA
TCCCTATATTGTTTATCCCTTCTACTTGCTATATATATATAT**GAAAAATTTACACT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2H544JQB 528 0 0
AAGCAAACGTTTGTTGCCCGACCAGGGCAGCCAGCTTAGTGGTTCGTGAATGTGTTTTTA
TTAAACCGAACAAGGTTTGTGCACAACTTAGTGGATGCATAGTCGTTCCTGGGTATAAAT
GTATTAAGAAATATCCATATGGCCTTTACAATTCTGGTGAAACTGTCAATGAATACTGCA
AGTTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTTTCCAGGACTTCGATGCAG
GTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTTTCATTTTTGCACCA
AGGGATCAGCTATTGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCATAATCTATGTATTGTA
TGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGTTAGACTCT
TGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGTC********CTAGAAGGCCATCTATCCCTATAT
TGTTTATCCCTTCTACTTGCTATATATATATAT**GAAAAATTTACAC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2CN88TF 649 0 0
GATCAATACAAGTTGTAATCTCTAAGTACATTTTGTGACCAAACAAGTAATCAGTGTTAA
AATGGAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTTTTTTCATGGTGCATAA
TCAAGTCGAAGCAAACGTTTGTTGCCCGACCAGGGCAGCCAGCTTAGTGGTTCGTGAATG
TGTTCTTATTAAACCGAACAAGGTTTGTGCACAACTTAGTGGATGCATAGTCGTTCCTGG
GTATAAATGTATTAAGAAATATCCATATGGCCTTTACAACTCTGGTGAAACTGTCAATGA
ATACTGCAAGTTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCGAGGACTT
CGATGCAGGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTCATTT
CTGCACCAAGGGATCAGCTATTGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCATAATCTAT
GTATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGT
TAGACTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGTCGTAGAAGCCTAGAAGGTCATCTAT
CCCTATATTGTTTATCCCTTCTACTTGCTATATATATATAT**GAAAAA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2EY78TF 657 0 0
GGATCAATACAAGTTGTAATCTCTAAGTACATTTTGTGACCAAACAAGTAATCAGTGTTA
AAATGGAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTTTTTTCATGGTGCATA
ATCAAGTCGAAGCAAACGTTTGTTGCCCGACCAGGGCAGCCAGCTTAGTGGTTCGTGAAT
GTGTTCTTATTAAACCGAACAAGGTTTGTGCACAACTTAGTGGATGCATAGTCGTTCCTG
GGTATAAATGTATTAAGAAATATCCATATGGCCTTTACAACTCTGGTGAAACTGTCAATG
AATACTGCAAGTTGGGTTGTGCATCCTCTGTGCGCAGTGACTTAGCCACTCTCCAGGACT
TCGATGCAGGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTCATT
TCTGCACCAAGGGATCAGCTATTGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCATAATCTA
TGTATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATG
TTAGACTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGTC********CTAGAAGGTCATCTA
TCCCTATATTGTTTATCCCTTCTACTTGCTATATATATATAT**GAAAAATTTACAC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2H544TF 657 0 0
GGATCAATACAAGTTGTAATCTCTAAGTACATTTTGTGACCAAACAAGTAATCAGTGTTA
AAATGGAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTTTTTTCATGGTGCATA
ATCAAGTCGAAGCAAACGTTTGTTGCCCGACCAGGGCAGCCAGCTTAGTGGTTCGTGAAT
GTGTTCTTATTAAACCGAACAAGGTTTGTGCACAACTTAGTGGATGCATAGTCGTTCCTG
GGTATAAATGTATTAAGAAATATCCATATGGCCTTTACAACTCTGGTGAAACTGTCAATG
AATACTGCAAGTTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCCAGGACT
TCGATGCAGGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTCATT
TCTGCACCAAGGGATCAGCTATTGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCATAATCTA
TGTATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATG
TTAGACTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGTC********CTAGAAGGCCATCTA
TCCCTATATTGTTTATCCCTTCTACTTGCTATATATATATAT**GAAAAATTTACAC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2BY24TF 658 0 0
GGATCAATACAAGTTGTAATCTCTAAGTACATTTTGTGACCAAACAAGTAATCAGTGTTA
AAATGGAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTTTTTTCATGGTGCATA
ATCAAGTCGAAGCAAACGTTTGTTGCCCGACCAGGGCAGCCAGCTTAGTGGTTCGTGAAT
GTGTTCTTATTAAACCGAACAAGGTTTGTGCACAACTTAGTGGATGCATAGTCGTTCCTG
GGTATAAATGTATTAAGAAATATCCATATGGCCTTTACAACTCTGGTGAAACTGTCAATG
AATACTGCAAGTTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCCAGGACT
TCGATGCAGGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTCATT
TCTGCACCAAGGGATCAGCTATTGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCATAATCTA
TGTATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATG
TTAGACTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGTC********CTAGAAGGTCATCTA
TCCCTATATTGTTTATCCCTTCTACTTGCTATATATATATAT**GAAAAATTTACACT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2BW55JQ 655 0 0
GG
AATACAAGTTGTAATCTCTAAGTACATTTTGTGACCAAACAAGTAATCAGTGTTAAAATG
GAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTTTTTTCATGGTGCATAATCAA
GTCGAAGCAAACGTTTGTTGCCCGACCAGGGCAGCCAGCTTAGTGGTTCGTGAATGTGTT
TTTATTAAACCGAACAAGGTTTGTGCACAACTTAGTGGATGCATAGTCGTTCCTGGGTAT
AAATGTATTAAGAAATATCCATATGGCCTTTACAACTCTGGTGAAACTGTCAATGAATAC
TGCAAGTTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCGAGGACTTCGAT
GCAGGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTCATTTCTGC
ACCAAGGGATCAGCTATTGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCATAATCTATGTAT
TGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGTTAGA
CTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGTCGTAGAAGCCTAGAAGGTCATCTATCCCT
ATATTGTTTATCCCTTCTACTTGCTATATATATATATATGAAAAATTTACACT

QA 3 655 3 655
DS 

RD RR2BW55TF 654 0 0
GG
AATACAAGTTGTAATCTCTAAGTACATTTTGTGACCAAACAAGTAATCAGTGTTAAAATG
GAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTTTTTTCATGGTGCATAATCAA
GTCGAAGCAAACGTTTGTTGCCCGACCAGGGCAGCCAGCTTAGTGGTTCGTGAATGTGTT
TTTATTAAACCGAACAAGGTTTGTGCACAACTTAGTGGATGCATAGTCGTTCCTGGGTAT
AAATGTATTAAGAAATATCCATATGGCCTTTACAACTCTGGTGAAACTGTCAATGAATAC
TGCAAGTTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCGAGGACTTCGAT
GCAGGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTCATTTCTGC
ACCAAGGGATCAGCTATTGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCATAATCTATGTAT
TGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGTTAGA
CTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGTCGTAGAAGCCTAGAAGGTCATCTATCCCT
ATATTGTTTATCCCTTCTACTTGCTATATATATATAT
ATGAAAATTTACACT

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR2F153TF 662 0 0
GG
AATACAAGTTGTAATCTCTAAGTACATTTTGTGACCAAACAAGTAATCAGTGTTAAAATG
GAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTTTTTTCATGGTGCATAATCAA
GTCGAAGCAAACGTTTGTTGCCCGACCAGGGCAGCCAGCTTAGTGGTTCGTGAATGTGTT
CTTATTAAACCGAACAAGGTTTGTGCACAACTTAGTGGATGCATAGTCGTTCCTGGGTAT
AAATGTATTAAGAAATATCCATATGGCCTTTACAACTCTGGTGAAACTGTCAATGAATAC
TGCAAGTTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCGAGGACTTCGAT
GCAGGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATTCACCAACGCATGTTCTCATTTCTGC
ACCAAGGGATCAGCTATTGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCATAATCTATGTAT
TGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGTTAGA
CTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGTCGTAGAAGCCTAGAAGGTCATCTATCCCT
ATATTGTTTATCCCTTCTACTTGCTATATATATATAT**GAAAAATTTACACT
TAGAGCC

QA 3 655 3 655
DS 

RD RR2F153JQ 641 0 0
AAGTACATTTTGTGACCAAACAAGTAATCAGTGTTAAAATGGAAGGCAAAACTGTGATTT
TAAGTGTGCTCATAATGAGTTTTTTCATGGTGCATAATCAAGTCGAAGCAAACGTTTGTT
GCCCGACCAGGGCAGCCAGCTTAGTGGTTCGTGAATGTGTTCTTATTAAACCGAACAAGG
TTTGTGCACAACTTAGTGGATGCATAGTCGTTCCTGGGTATAAATGTATTAAGAAATATC
CATATGGCCTTTACAACTCTGGTGAAACTGTCAATGAATACTGCAAGTTGGGTTGTGCAT
CCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCGAGGACTTCGATGCAGGTGAAATTGTGAATG
GAGCGGTTGCACAATTCACCAACGCATGTTCTCATTTCTGCACCAAGGGATCAGCTATTG
CAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCATAATCTATGTATTGTATGTGTTGTTGTTCTC
CTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGTTAGACTCTTGTTTTATTTCCTGG
TTTTCTATGTGTCGTAGAAGCCTAGAAGGTCATCTATCCCTATATTGTTTATCCCTTCTA
CTTGCTATATATATATAT**GAAAAATTTACACTTAGAGCC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 2 11

CO CL434Contig1 822 3 9 U
GGAGAACATAAGCTCCGACCGAGAAAACAATCCCCATCTCTCTCCGACGACAAACCAGAC
CCGCGACCCTTTGGAGACAAGAAGAAATGGGTTTCTTCTCTTTTCTAGGAAGAGTTCTCT
TCGCTTCTCTCTTCATCCTCTCCGCCTGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGCTGACGGTG
GTCCAGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCCAAGCTTGACCTGGCCAAAGCACACCTCTCTTCCA
GATTAGGAGTAGCATTGCCCCACATAGAGGTGAAGCAAGTCGTATCGGCAATTGTTGCTT
TGAAAGGGCTCGGAGGCTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCTTTGGTGCCTATCTTCTGG
CTTTCTACTTGGTGGTTGTTAGTCCCATCTTATATGATTTCTACAACTATGGACCCGAGG
ACCGCCAATTCTCCCTTCTATTGACTGAGTTCTTGCAGAGCGTCGCGCTTCTCGGTGCAT
TGCTATTTTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGACCACGACCTCCTCAAAGAGCAGCAACC
TGAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAGGCTGCTTAGAGCTGTTCT*TTCTCTTCCACACAC
GCTTAGAACAGCTTCTGATGTGTTCACGCTTTGCCTTTATTTTGTCTTCCTTGCAACTTT
TTCTACTGTACGATTCTAGACTTGGCCACAATTCTTTTTTTATTTCTCTTCTAGTTTTTA
TTTATTTTTGAGATCTAAGAAATTTCTTTTGTTTGATCATACAATTTTTTTGATCATAAT
TTATTGTTCCGACAATTTTTGGCAGCATGAACCATTTTCTGC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F777TF U 1
AF RR2GG35TF U 1
AF RR2F777JQ C 76
BS 1 61 RR2F777TF
BS 62 62 RR2GG35TF
BS 63 565 RR2F777TF
BS 566 566 RR2GG35TF
BS 567 667 RR2F777TF
BS 668 700 RR2GG35TF
BS 701 701 RR2F777JQ
BS 702 711 RR2GG35TF
BS 712 822 RR2F777JQ

RD RR2F777TF 667 0 0
GGAGAACATAAGCTCCGACCGAGAAAACAATCCCCATCTCTCTCCGACGACAAACCAGAC
CTGCGACCCTTTGGAGACAAGAAGAAATGGGTTTCTTCTCTTTTCTAGGAAGAGTTCTCT
TCGCTTCTCTCTTCATCCTCTCCGCCTGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGCTGACGGTG
GTCCAGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCCAAGCTTGACCTGGCCAAAGCACACCTCTCTTCCA
GATTAGGAGTAGCATTGCCCCACATAGAGGTGAAGCAAGTCGTATCGGCAATTGTTGCTT
TGAAAGGGCTCGGAGGCTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCTTTGGTGCCTATCTTCTGG
CTTTCTACTTGGTGGTTGTTAGTCCCATCTTATATGATTTCTACAACTATGGACCCGAGG
ACCGCCAATTCTCCCTTCTATTGACTGAGTTCTTGCAGAGCGTCGCGCTTCTCGGTGCAT
TGCTATTTTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGACCACGACCTCCTCAAAGAGCAGCAACC
TGAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAAGCTGCTTAGAGCTGTTCT*TTCTCTTCCACACAC
GCTTAGAACAGCTTCTGATGTGTTCACGCTTTGCCTTTATTTTGTCTTCCTTGCAACTTT
TTCTACT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2GG35TF 711 0 0
GG
AGAACATAAGCTCCGACCGAGAAAACAATCCCCATCTCTCTCCGACGACAAACCAGACCC
GCGACCCTTTGGAGACAAGAAGAAATGGGTTTCTTCTCTTTTCTAGGAAGAGTTCTCTTC
GCTTCTCTCTTCATCCTCTCCGCCTGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGCTGACGGTGGT
CCAGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCCAAGCTTGACCTGGCCAAAGCACACCTCTCTTCCAGA
TTAGGAGTAGCATTGCCCCACATAGAGGTGAAGCAAGTCGTATCGGCAATTGTTGCTTTG
AAAGGGCTCGGAGGCTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCTTTGGTGCCTATCTTCTGGCT
TTCTACTTGGTGGTTGTTAGTCCCATCTTATATGATTTCTACAACTATGGACCCGAGGAC
CGCCAATTCTCCCTTCTATTGACTGAGTTCTTGCAGAGCGTCGCGCTTCTCGGTGCATTG
CTATTTTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGACCACGACCTCCTCAAAGAGCAGCAACCTG
AAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAGGCTGCTTAGAGCTGTTCTATTCTCTTCCACACACGC
TTAGAACAGCTTCTGATGTGTTCACGCTTTGCCTTTATTTTGTCTTCCTTGCAACTTTTT
CTACTGTACGATTCTAGACTTGGCCACAATTCTTTTTT*ATTTCTCTTC

QA 3 711 3 711
DS 

RD RR2F777JQ 747 0 0
GACAAGAAGAAATGGGTTTCTTCTCTTTTCTAGGAAGAGTTCTCTTCGCTTCTCTCTTCA
TCCTCTCCGCCTGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGCTGACGGTGGTCCAGCAGCTAAAG
AGTTGGCTCCCAAGCTTGACCTGGCCAAAGCACACCTCTCTTCCAGATTAGGAGTAGCAT
TGCCCCACATAGAGGTGAAGCAAGTCGTATCGGCAATTGTTGCTTTGAAAGGGCTCGGAG
GCTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCTTTGGTGCCTATCTTCTGGCTTTCTACTTGGTGG
TTGTTAGTCCCATCTTATATGATTTCTACAACTATGGACCCGAGGACCGCCAATTCTCCC
TTCTATTGACTGAGTTCTTGCAGAGCGTCGCGCTTCTCGGTGCATTGCTATTTTTCATTG
GAATGAAGAATTCGAGGACCACGACCTCCTCAAAGAGCAGCAACCTGAAGAAGAGGATAC
CCAAGCCTAAGGCTGCTTAGAGCTGTTCT*TTCTCTTCCACACACGCTTAGAACAGCTTC
TGATGTGTTCACGCTTTGCCTTTATTTTGTCTTCCTTGCAACTTTTTCTACTGTAGGATT
CTAGACTTGGCCACAATTCTTTTTTTATTTCTCTTCTAGTTTTTATTTATTTTTGAGATC
TAAGAAATTTCTTTTGTTTGATCATACAATTTTTTTGATCATAATTTATTGTTCCGACAA
TTTTTGGCAGCATGAACCATTTTCTGC

QA 1 747 1 747
DS 



CO CL434Contig2 838 8 12 U
GGAGAGGAACAGAAGTACAGAACATAAGCTCCGACCGAGAAAACAATCCCCCTCTCTCTC
CGACGACAAACCAGACCTGCGACCCTTTGGAGACAAGAAGAAATGGGTTTCTTCTCTTTT
CTAGGAAGAGTTCTCTTCGCTTCTCTATTCATCCTCTCCGCTTGGCAAATGTTCAATGAC
TTTGGAGCTGACGGTGGTCCAGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCCAAGCTTGATCTGGCCAAA
TCACACCTCTCTTCCAGATTAGGAGTAGCATTGCCCCACATAGAGGTGAAGCAAGTCGTA
TCGGCAATTGTTGCTCTGAAAGGGCTCGGAGGGTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCTTT
GGTGCCTATCTTCTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTTAGTCCCATCTTATATGATTTCTAC
AACTATGGACCCCAGGACCGCCAATTCTCCTTTCTATTGACTGAGTTCTTGCAGAGCGTT
GCGCTTCTCGGGGCATTGCTATTTTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGACTACGACCTCC
TCAAAGAGCAGCAACCTGAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAGGCTGCTTAGAGCTGTTCT
ATTCTCTTCCACACACGCTTATCAGGCTTTAGAACAGCTTCTGATGTGTTCAAGCTTTGC
CTTCATTTTGTCTTCCTGACAACTTTTTCTACTGTAGAATTTTAGACTTGGCCACGATTC
TTTTTTATTTCTCTTCTAGTTTTTATTTACTTTTGAGATCTAAGAATTTTCGTTTGTTTG
ATCATACAATTTTTTTGATCATAATTTATTGTTCCGACAATTTTTGGCAGCATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH17TF U 1
AF RR2DK56TF U 244
AF RR2FW22TF U 15
AF RR2GH17JQB C 82
AF RR2DM73JQ C 124
AF RR2FW22JQ C 161
AF RR2DM73TF U 124
AF RR2DK56JQ C 607
BS 1 212 RR2GH17TF
BS 213 213 RR2FW22TF
BS 214 469 RR2GH17TF
BS 470 549 RR2FW22TF
BS 550 550 RR2DM73TF
BS 551 725 RR2FW22TF
BS 726 726 RR2DM73TF
BS 727 743 RR2FW22TF
BS 744 744 RR2DM73TF
BS 745 763 RR2FW22TF
BS 764 824 RR2DM73TF
BS 825 838 RR2DK56JQ

RD RR2GH17TF 469 0 0
GGAGAGGAACAGAAGTACAGAACATAAGCTCCGACCGAGAAAACAATCCCCCTCTCTCTC
CGACGACAAACCAGACCTGCGACCCTTTGGAGACAAGAAGAAATGGGTTTCTTCTCTTTT
CTAGGAAGAGTTCTCTTCGCTTCTCTATTCATCCTCTCCGCTTGGCAAATGTTCAATGAC
TTTGGAGCTGACGGTGGTCCAGCAGCTAAAGAATTGGCTCCCAAGCTTGATCTGGCCAAA
TCACACCTCTCTTCCAGATTAGGAGTAGCATTGCCCCACATAGAGGTGAAGCAAGTCGTA
TCGGCAATTGTTGCTCTGAAAGGGCTCGGAGGGTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCTTT
GGTGCCTATCTTCTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTTAGTCCCATCTTATATGATTTCTAC
AACTATGGACCCCAGGACCGCCAATTCTCCTTTCTATTGACTGAGTTCT

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR2DK56TF 222 0 0
CACCTCTCTTCCAGATTAGGAGTAGCATTGCCCCACATAGAGGTGAAGCAAGTCGTATCG
GCAATTGTTGCTCTGAAAGGGCTCGGAGGGTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCTTTGGT
GCCTATCTTCTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTTAGTCCCATCTTATATGATTTCTACAAC
TATGGACCCCAGGACCGCCAATTCTCCTTTCTATTGACTGAG

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR2FW22TF 749 0 0
GGAC
AGAACATAAGCTCCGACCGAGAAAACAATCCCCCTCTCTCTCCGACGACAAACCAGACCT
GCGACCCTTTGGAGACAAGAAGAAATGGGTTTCTTCTCTTTTCTAGGAAGAGTTCTCTTC
GCTTCTCTATTCATCCTCTCCGCTTGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGCTGACGGTGGT
CCAGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCCAAGCTTGATCTGGCCAAATCACACCTCTCTTCCAGA
TTAGGAGTAGCATTGCCCCACATAGAGGTGAAGCAAGTCGTATCGGCAATTGTTGCTCTG
AAAGGGCTCGGAGGGTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCTTTGGTGCCTATCTTCTGGCT
TTCTACTTGGTGGTTGTTAGTCCCATCTTATATGATTTCTACAACTATGGACCCCAGGAC
CGCCAATTCTCCTTTCTATTGACTGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCGCTTCTCGGGGCATTG
CTATTTTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGACTACGACCTCCTCAAAGAGCGGCAACCTG
AAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAGGCTGCTTAGAGCTGTTCTATTCTCTTCCACACACGC
TTATCAGGCTTTAGAACAGCTTCTGATGTGTTCAAGCTTTGCCTTCATTTTGTCTTCCTG
ACAACTTTTTCTACTGTAGAATTTTAGACTTGGCCACGATTCTTTTT*ATTTCTCTTCTA
GTTTT*ATTTACTTTTGAGATCTAA

QA 5 749 5 749
DS 

RD RR2GH17JQB 703 0 0
ACCCTTTGGAGACAAGAAGAAATGGGTTTCTTCTCTTTTCTAGGAAGAGTTCTCTTCGCT
TCTCTATTCATCCTCTCCGCTTGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGCTGACGGTGGTCCA
GCAGCTAAAGAATTGGCTCCCAAGCTTGATCTGGCCAAATCACACCTCTCTTCCAGATTA
GGAGTAGCATTGCCCCACATAGAGGTGAAGCAAGTCGTATCGGCAATTGTTGCTCTGAAA
GGGCTCGGAGGGTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCTTTGGTGCCTATCTTCTGGCTTTC
TACTTGGTGGTTGTTAGTCCCATCTTATATGATTTCTACAACTATGGACCCCAGGACCGC
CAATTCTCCTTTCTATTGACTGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCGCTTCTCGGGGCATTGCTA
TTTTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGACTACGACCTCCTCAAAGAGCAGCAACCTGAAG
AAGAGGATACCCAAGCCTAAGGCTGCTTAGAGCTGTTCTATTCTCTTCCACACACGCTTA
TCAGGCTTTAGAACAGCTTTTGATGTGTTCAAGCTTTGCCTTCATTTTGTCTTCCTGACA
ACTTTTTTTACTGTAGAATTTTAGACTTGGCCACGATTCTTTTTTATTTCTCTTCTAGTT
TTTATTTACTTTTGAGATCTAAGAATTTTCGTTTGTTTGATC
G

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2DM73JQ 708 0 0
GGAAGAGTTCTCTTCGCTTCTCTATTCATCCTCTCCGCTTGGCAAATGTTCAATGACTTT
GGAGCTGACGGTGTTCCAGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCCAAGCTTGATCTGGCCAAATCA
CACCTCTCTTCCAGATTAGGAGTAGCATTGCCCCACATAGAGGTGAAGCAAGTCGTATCG
GCAATTGTTGCTCTGAAAGGGCTCGGAGGGTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCTTTGGT
GCCTATCTTCTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTTAGTCCCATCTTATATGATTTCTACAAC
TATGGACCCCAGGACCGCCAATTCTCCTTTCTATTGACTGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCG
CTTCTCGGGGCATTGCTATTTTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGACTACGACCTCCTCA
AAGAGCAGCAACCTGAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAGGCTGCTTAGAGCTGTTCTATT
CTCTTCCACAC**GCTTATCAGGCTTTAGAACAGCTTCTGATGTGTTCAAGCTTTGCCTT
CATTTTGTCTTCCTGACAACTTTTTCTACTGTAGAATTTTAGACTTGGCCACGATTCTTT
TTTATTTCTCTTCTAGTTTTTATTTACTTTTGAGATCTAAGAATTTTCGTTTGTTTGATC
ATACAATTTTTTTGATCATAATTTATTGTTCCGACAATTTT
TGGCAGC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2FW22JQ 658 0 0
CTTGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGCTGACGGTGGTCCAGCAGCTAAAGAGTTGGCTC
CCAAGCTTGATCTGGCCAAATCACACCTCTCTTCCAGATTAGGAGTAGCATTGCCCCACA
TAGAGGTGAAGCAAGTCGTATCGGCAATTGTTGCTCTGAAAGGGCTCGGAGGGTTACTCT
TTGTTGTTGGCAACGTCTTTGGTGCCTATCTTCTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTTAGTC
CCATCTTATATGATTTCTACAACTATGGACCCCAGGACCGCCAATTCTCCTTTCTATTGA
CTGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCGCTTCTCGGGGCATTGCTATTTTTCATTGGAATGAAGA
ATTCGAGGACTACGACCTCCTCAAAGAGCGGCAACCTGAAGAAGAGGATACCCAAGCCTA
AGGCTGCTTAGAGCTGTTCTATTCTCTTCCACACACGCTTATCAGGCTTTAGAACAGCTT
CTGATGTGTTCAAGCTTTGCCTTCATTTTGTCTTCCTGACAACTTTTTCTACTGTAGAAT
TTTAGACTTGGCCACGATTCTTTTTTATTTCTCTTCTAGTTTTTATTTACTTTTGAGATC
TAAGAATTTTCGTTTGTTTGATCATACAATTTTTTTGATCATAATTTATTGTTCCGAC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2DM73TF 713 0 0
GGAAGAGTTCTCTTCGCTTCTCTATTCATCCTCTCCGCTTGGCAAATGTTCAATGACTTT
GGAGCTGACGGTGTTCCAGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCCAAGCTTGATCTGGCCAAATCA
CACCTCTCTTCCAGATTAGGAGTAGCATTGCCCCACATAGAGGTGAAGCAAGTCGTATCG
GCAATTGTTGCTCTGAAAGGGCTCGGAGGGTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCTTTGGT
GCCTATCTTCTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTTAGTCCCATCTTATATGATTTCTACAAC
TATGGACCCCAGGACCGCCAATTCTCCTTTCTATTGACTGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCG
CTTCTCGGGGCATTGCTATTTTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGACTACGACCTCCTCA
AAGAGCAGCAACCTGAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAGGCTGCTTAGAGCTGTTCTATT
CTCTTCCACAC**GCTTATCAGGCTTTAGAACAGCTTCTGATGTGTTCAAGCTTTGCCTT
CATTTTGTCTTCCTGACAACTTTTTCTACTGTAGAATTTTAGACTTGGCCACGATTCTTT
TTTATTTCTCTTCTAGTTTTTATTTACTTTTGAGATCTAAGAATTTTCGTTTGTTTGATC
ATACAATTTTTTTGATCATAATTTATTGTTCCGACAATTTT
GGCAGCAAAAAA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2DK56JQ 232 0 0
TTCCACACACGCTTATCAGGCTTTAGAACAGCTTCTGATGTGTTCAAGCTTTGCCTTCAT
TTTGTCTTCCTGACAACTTTTTCTACTGTAGAATTTTAGACTTGGCCACGATTCTTTTTT
ATTTCTTTTCTAGTTTTTATTTACTTTTGAGATTTAAGAATTTTCGTTTGTTTGATCATA
CAATTTTTTTGATCATAATTTATTGTTCCGACAATTTTTGGCAGCATAAAAA

QA 1 232 1 232
DS 



AS 1 10

CO CL435Contig1 831 10 9 U
GGTGAAAGCGAAATGGACAATTATATATTTGAATAGAAGTCAATACAAGGCCATAAGCCA
TTCTTTAGCTACATTCAGATTCAAAGGCAAAAAGAAAAAAAGACTACATATATGGAGAAA
CGTGGAAGATAAGGACTTTTCCTTTAAGTTGCGAAAATTCGGTTACTTAGACAAAAACAC
TTGGGGGCAATGAGTTTTACTCACCTTCCCAACCTGATTGCCGAGCTCGCTTCTCCC*AC
AAAGCAGTGATCTTCCTCTCCTTGATCAACAAAGCTTCAGCTCTCTCCC*TAGCTGACTC
ACAGATCTCAGTGGCGGCGTTGCATTTCTCAGCTTCCTTTTGGTACTGAGACGCAACTCT
TTTAGCTTCTGCGAGGGTAACGTTCATATGACGGCTATGCTCATCAGCAACTGCTTCTTG
CAGCTTCAGCTCCTCGGTCAGAAGGTCCACAAACTGCTTCTCCATTTCCTGTTTGAGCTC
TGGATCATCACCTCCACAATCTGTAACAGTGAGATTTGCAAGCCCAGGAGCAATCTCGAG
GAGAGAGACAGGTGGCGGGCAATCACAGACGCAAGGAGGACAAACAGAGCTCTTATGAGC
GGATCCAACGAAACCCTTGTTGAATTTCCAATACAGAGCAGGTCCACACACTACTAAGGC
AGATACAACCGCGAAGATCACCAGGCATCTCATGCAGTCTCCAGACCGACGCGCCATATC
*AACAAAAAAAAGAAAGCTCAATCGAGCGAATATCAGAGTGGAAGTGCAGCAACGATGGC
GATTAGTGTGTGGAAAGAAGATTTAGAAACAGAGCTGATGAGTGTGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU25JQB U 1
AF RR2E142JQ U 1
AF RR2AA32TF C 218
AF RR2A937JQ U 4
AF RR2A937TF C 128
AF RR2G708JQ U 4
AF RR2E142TF C 94
AF RR2E050TF C 146
AF RR2G708TF C 216
AF RR2AA32JQ U 705
BS 1 42 RR2E142JQ
BS 43 43 RR2GU25JQB
BS 44 634 RR2E142JQ
BS 635 646 RR2A937JQ
BS 647 647 RR2G708JQ
BS 648 731 RR2A937JQ
BS 732 732 RR2AA32JQ
BS 733 825 RR2A937JQ
BS 826 831 RR2E050TF

RD RR2GU25JQB 511 0 0
GGTGA
AAGCGAAATGGACAATTATATATTTGAATAGAAGTCAATACAAGGCCATAAGCCATTCTT
TAGCTACATTCAGATTCAAAGGCAAAAAGAAAAAAAGACTACATATATGGAGAAACGTGG
AAGATAAGGACTTTTCCTTTAAGTTGCGAAAATTCGGTTACTTAGACAAAAACACTTGGG
GGCAATGAGTTTTACTCACCTTCCCAACCTGATTGCCGAGCTCGCTTCTCCC*ACAAAGC
AGTGATCTTCCTCTCCTTGATCAACAAAGCTTCAGCTCTCTCCC*TAGCTGACTCACAGA
TCTCAGTGGCGGCGTTGCATTTCTCAGCTTCCTTTTGGTACTGAGACGCAACTCTTTTAG
CTTCTGCGAGGGTAACGTTCATATGACGGCTATGCTCATCAGCAACTGCTTCTTGCAGCT
TCAGCTCCTCGGTCAGAAGGTCCACAAACTGCTTCTCCATTTCCTGTTTGAGCTCTGGAT
CATCACCTCCACAATCTGTAACAGTG

QA 6 511 6 511
DS 

RD RR2E142JQ 634 0 0
GGTGAAAGCGAAATGGACAATTATATATTTGAATAGAAGTCAGTACAAGGCCATAAGCCA
TTCTTTAGCTACATTCAGATTCAAAGGCAAAAAGAAAAAAAGACTACATATATGGAGAAA
CGTGGAAGATAAGGACTTTTCCTTTAAGTTGCGAAAATTCGGTTACTTAGACAAAAACAC
TTGGGGGCAATGAGTTTTACTCACCTTCCCAACCTGATTGCCGAGCTCGCTTCTCCC*AC
AAAGCAGTGATCTTCCTCTCCTTGATCAACAAAGCTTCAGCTCTCTCCC*TAGCTGACTC
ACAGATCTCAGTGGCGGCGTTGCATTTCTCAGCTTCCTTTTGGTACTGAGACGCAACTCT
TTTAGCTTCTGCGAGGGTAACGTTCATATGACGGCTATGCTCATCAGCAACTGCTTCTTG
CAGCTTCAGCTCCTCGGTCAGAAGGTCCACAAACTGCTTCTCCATTTCCTGTTTGAGCTC
TGGATCATCACCTCCACAATCTGTAACAGTGAGATTTGCAAGCCCAGGAGCAATCTCGAG
GAGAGAGACAGGTGGCGGGCAATCACAGACGCAAGGAGGACAAACAGAGCTCTTATGAGC
GGATCCAACGAAACCCTTGTTGAATTTCCAATAC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2AA32TF 464 0 0
TTGCCGAGCTCGCTTCTCCCCACAAAGCAGTGATCTTCCTCTCCTTGATCAACAA*GCTT
CAGCTCTCTCCCCTAGCTGACTCACAGATCTCAGTGGCGGCGTTGCATTTCTCAGCTTCC
TTTTGGTACTGAGACGCAACTCTTTTAGCTTCTGCGAGGGTAACGTTCATATGACGGCTA
TGCTCATCAGCAACTGCTTCTTGCAGCTTCAGCTCCTCGGTCAGAAGGTCCACAAACTGC
TTCTCCATTTCCTGTTTGAGCTCTGGATCATCACCTCCAAAATCTGTAACAGTGAGATTT
GCAAGCCCAGGAGCAATCTCGAGGAGAGAGACAGGTGGCGGGCAATCACAGACGCAAGGA
GGACAAACAGAGCTCTTATGAGCGGATCCAACGAAACCCTTGTTGAATTTCCAATACAGA
GCAGGTCCACACACTACTAAGGCAGATACAACCGCGAAGATCAC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2A937JQ 824 0 0
GA
AAGCGAAATGGACAATTATATATTTGAATAGAAGTCAATACAAGGCCATAAGCCATTCTT
TAGCTACATTCAGATTCAAAGGCAAAAAGAAAAAAAGACTACATATATGGAGAAACGTGG
AAGATAAGGACTTTTCCTTTAAGTTGCGAAAATTCGGTTACTTAGACAAAAACACTTGGG
GGCAATGAGTTTTACTCACCTTCCCAACCTGATTGCCGAGCTCGCTTCCCCC*ACAAAGC
AGTGGTCTTCCTCTCCTTGATCAGCAAAGCTTCAGCTCTCTCCC*TAGCTGACTCACAGA
TCTCAGTGGCGGCGTTGCATTTCTCAGCTTCCTTTTGGTACTGAGACGCAACTCTTTTAG
CTTCTGCGAGGGTAACGTTCATATGACGGATATGCTCATCAGCAACTGCTTCTTGCAGCT
TCAGCTCCTCGGTCAGAAGGTCCACAAACTGCTTCTCCATTTCCTGTTTGAGCTCTGGAT
CATCACCTCCACAATCTGTAACAGTGAGATTTGCAAGCCCAGGAGCAATCTCGAGGAGAG
AGACAGGTGGCGGGCAATCACAGACGCAAGGAGGACAAACAGAGCTCTTATGAGCGGATC
CAACGAAACCCTTGTTGAATTTCCAATACAGAGCAGGTCCAAACACTACTAAGGCAGATA
CAACCGCGAAGATCACCAGGCATCTCATGCAGTCTCCAGACCGACGCGCCATATC*AACA
AAAAAA*GAAAGCTCAATCGAGCGAATATCAGAGTGGAAGTGCAGCAACGATGGCGATTA
GTGTGTGGAAAGAAGATTTAGAAACAGAGCTGATGAGTGT
CC

QA 3 822 3 822
DS 

RD RR2A937TF 700 0 0
GATAAGGACTTTTCCTTTAAGTTGCGAAAATTCGGTTACTTAGACAAAAACACTTGGGGG
CAATGAGTTTTACTCACCTTCCCAACCTGATTGCCGAGCTCGCTTCCCCC*ACAAAGCAG
TGGTCTTCCTCTCCTTGATCAGCAAAGCTTCAGCTCTCTCCC*TAGCTGACTCACAGATC
TCAGTGGCGGCGTTGCATTTCTCAGCTTCCTTTTGGTACTGAGACGCAACTCTTTTAGCT
TCTGCGAGGGTAACGTTCATATGACGGATATGCTCATCAGCAACTGCTTCTTGCAGCTTC
AGCTCCTCGGTCAGAAGGTCCACAAACTGCTTCTCCATTTCCTGTTTGAGCTCTGGATCA
TCACCTCCACAATCTGTAACAGTGAGATTTGCAAGCCCAGGAGCAATCTCGAGGAGAGAG
ACAGGTGGCGGGCAATCACAGACGCAAGGAGGACAAACAGAGCTCTTATGAGCGGATCCA
ACGAAACCCTTGTTGAATTTCCAATACAGAGCAGGTCCAAACACTACTAAGGCAGATACA
ACCGCGAAGATCACCAGGCATCTCATGCAGTCTCCAGACCGACGCGCCATATC*AACAAA
AAAA*GAAAGCTCAATCGAGCGAATATCAGAGTGGAAGTGCAGCAACGATGGCGATTAGT
GTGTGGAAAGAAGATTTAGAAACAGAGCTGATGAGTGT
CC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2G708JQ 806 0 0
GG
AAGCGAAATGGACAATTATATATTTGAATAGAAGCCAATACAAGGCCATAAGCCATTCTT
TAGCTACATTCAGATTCAAAGGCAAAAAGAAAAAAAGACTACATATATGGAGAAACGTGG
AAGATAAGGACTTTTCCTTTAAGTTGCGAAAATTCGGTTACTTAGACAAAAACACTTGGG
GGCAATGAGTTTTACTCACCTTCCCAACCTGATTGCCGAGCTCGCTTCTCCC*ACAAAGC
AGTGATCTTCCTCTCCTTGATCAACAAAGCTTCAGCTCTCTCCC*TAGCTGACTCACAGA
TCTCAGTGGCGGCGTTGCATTTCTCAGCTTCCTTTTGGTACTGAGACGCAACTCTTTTAG
CTTCTGCGAGGGTAACGTTCATATGACGGCTATGCTCATCAGCAACTGCTTCTTGCAGCT
TCAGCTCCTCGGTCAGAAGGTCCACAAACTGCTTCTCCATTTCCTGTTTGAGCTCTGGAT
CATCACCTCCACAATCTGTAACAGTGAGATTTGCAAGCCCAGGAGCAATCTCGAGGAGAG
AGACAGGTGGCGGGCAATCACAGACGCAAGGAGGACAAACAGAGCTCTTATGAGCGGATC
CAACGAAACCCTTGTTGAATTTCCAATACAGAGCAGGTCCACACACTACTAAGGCAGATA
CAACCGCGAAGATCACCAGGCATCTCATGCAGTCTCCAGACCGACGCGCCATATC*AACA
AAAAAA*GAAAGCTCAATCGAGCGAATATCAGAGTGGAAGTGCAGCAACGATGGCGATTA
GTGTGTGGAAAGAAGATTTAGAA
G

QA 3 805 3 805
DS 

RD RR2E142TF 698 0 0
AG
AAAAAAGACTACATATATGGAGAAACGTGGAAGATAAGGACTTTTCCTTTAAGTTGCGAA
AATTCGGTTACTTAGACAAAAACACTTGGGGGCAATGAGTTTTACTCACCTTCCCAACCT
GATTGCCGAGCTCGCTTCTCCC*ACAAAGCAGTGATCTTCCTCTCCTTGATCAACAAAGC
TTCAGCTCTCTCCC*TAGCTGACTCACAGATCTCAGTGGCGGCGTTGCATTTCTCAGCTT
CCTTTTGGTACTGAGACGCAACTCTTTTAGCTTCTGCGAGGGTAACGTTCATATGACGGC
TATGCTCATCAGCAACTGCTTCTTGCAGCTTCAGCTCCTCGGTCAGAAGGTCCACAAACT
GCTTCTCCATTTCCTGTTTGAGCTCTGGATCATCACCTCCACAATCTGTAACAGTGAGAT
TTGCAAGCCCAGGAGCAATCTCGAGGAGAGAGACAGGTGGCGGGCAATCACAGACGCAAG
GAGGACAAACAGAGCTCTTATGAGCGGATCCAACGAAACCCTTGTTGAATTTCCAATACA
GAGCAGGTCCACACACTACTAAGGCAGATACAACCGCGAAGATCACCAGGCATCTCATGC
AGTTTCCAGACCGACGCGCCATATC*AACAAAAAAAAGAAAGCTCAATCGAGCGAATATC
AGAGTGGAAGTGCAGCAACGATGGCGATTAGTGT
CC

QA 3 696 3 696
DS 

RD RR2E050TF 686 0 0
AAGTTGCGAAAATTCGGTTACTTAGACAAAAACACTTGGGGGCAATGAGTTTTACTCACC
TTCCCAACCTGATTGCCGAGCTCGCTTCTCCC*ACAAAGCAGTGATCTTCCTCTCCTTGA
TCAACAAAGCTTCAGCTCTCTCCC*TAGCTGACTCACAGATCTCAGTGGCGGCGTTGCAT
TTCTCAGCTTCCTTTTGGTACTGAGACGCAACTCTTTTAGCTTCTGCGAGGGTAACGTTC
ATATGACGGCTATGCTCATCAGCAACTGCTTCTTGCAGCTTCAGCTCCTCGGTCAGAAGG
TCCACAAACTGCTTCTCCATTTCCTGTTTGAGCTCTGGATCATCACCTCCACAATCTGTA
ACAGTGAGATTTGCAAGCCCAGGAGCAATCTCGAGGAGAGAGACAGGTGGCGGGCAATCA
CAGACGCAAGGAGGACAAACAGAGCTCTTATGAGCGGATCCAACGAAACCCTTGTTGAAT
TTCCAATACAGAGCAGGTCCACACACTACTAAGGCAGATACAACCGCGAAGATCACCAGG
CATCTCATGCAGTCTCCAGACCGACGCGCCATATCGAAAAAAAAAAAGAAAGCTCAATCG
AGCGAATATCAGAGTGGAAGTGCAGCAACGATGGCGATTAGTGTGTGGAAAGAAGATTTA
GAAACAGAGCTGATGAGTGTGAATCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2G708TF 612 0 0
GATTGCCGAGCTCGCTTCTCCC*ACAAAGCAGTGATCTTCCTCTCCTTGATCAACAAAGC
TTCAGCTCTCTCCC*TAGCTGACTCACAGATCTCAGTGGCGGCGTTGCATTTCTCAGCTT
CCTTTTGGTACTGAGACGCAACTCTTTTAGCTTCTGCGAGGGTAACGTTCATATGACGGC
TATGCTCATCAGCAACTGCTTCTTGCAGCTTCAGCTCCTCGGTCAGAAGGTCCACAAACT
GCTTCTCCATTTCCTGTTTGAGCTCTGGATCATCACCTCCACAATCTGTAACAGTGAGAT
TTGCAAGCCCAGGAGCAATCTCGAGGAGAGAGACAGGTGGCGGGCAATCACAGACGCAAG
GAGGACAAACAGAGCTCTTATGAGCGGATCCAACGAAACCCTTGTTGAATTTCCAATACA
GAGCAGGTCCACACACTACTAAGGCAGATACAACCGCGAAGATCACCAGGCATCTCATGC
AGTCTCCAGACCGACGCGCCATATC*AACAAAAAAAAGAAAGCTCAATCGAGCGAATATC
AGAGTGGAAGTGCAGCAACGATGGCGATTAGTGTGTGGAAAGAAGATTTAGAAGCAGAGC
TGATGAGTGT
CC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2AA32JQ 121 0 0
ACCGACGCGCCATATC*AACAAAAAAAAGAAAGCTCAATCGAGCGAATATCAGAGTGGAA
GTGCAGCAACGATGGCGATTAGTGTGTGGAAAGAAGATTTAGAAACAGAGCTGATGAGTG
T

QA 1 121 1 121
DS 



AS 2 8

CO CL436Contig1 681 3 4 U
GAGTGTAAAGTTAGGCTCACTTAAAAATATCTTGTCAACAAAAAAAGGTTGCAGCACCAA
ATTTTAGGAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAAAAGGTTGCAAGTGTTCACTAATGCTTGT
TGGCAAAAAGACAAAACAAGATTCAAATGTTTTGTTCTCTCGTCTAAATATGAAAATCAG
GCTTTATTTTACTCTATTCGACTGGAGAACCACTCACGGGATTTTCTACTTATGGTAGAG
GTAGACGAAGCTGAAAACAAAAAAACCCGCCATAGTGGTAAAGCAGGCTCCATAATAGGG
ATACGCAGTTGGGATAAATCTCTCATACTCATTGTGTCTGTAAGGCCTCACAGGAATCTG
CTTTGAAAGAAATAATGTAGTGTAGCCTAGCTTTTCATATTCGACCTTAAACTGGAATAC
ACCATACACATCAGGAACCTTGAATGATGTATGAAATAGACCCTTCTTGTCTGTTGACAA
GGTTTTCAGAACATATGGGCTCATCATGTAAAACTGAACCTGCACATCATCAGCTACATA
CGGTTCCCAGCTCTTCCCTGACCACTCCAGTATCTCCACCGAAAATTCCAAGTCATCCTT
TATCCTGTATATTGCTGGCTCATCTGTTTCTCCAACCCTGTGGTGTACAAGACTACCAGC
CTTCAAATGCCCTCTTTCGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F411JQ U 1
AF RR2F411TF C 1
AF RR2AM07JQ U 405
BS 1 458 RR2F411JQ
BS 459 459 RR2AM07JQ
BS 460 463 RR2F411JQ
BS 464 681 RR2AM07JQ

RD RR2F411JQ 464 0 0
GAGTGTAAAGTTAGGCTCACTTAAAAATATCTTGTCAACAAAAAAAGGTTGCAGCACCAA
ATTTTAGGAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAAAAGGTTGCAAGTGTTCACTAATGCTTGT
TGGCAAAAAGACAAAACAAGATTCAAATGTTTTGTTCTCTCGTCTAAATATGAAAATCAG
GCTTTATTTTACTCTATTCGACTGGAGAACCACTCACGGGATTTTCTACTTATGGTAGAG
GTAGACGAAGCTGAAAACAAAAAAACCCGCCATAGTGGTAAAGCAGGCTCCATAATAGGG
ATACGCAGTTGGGATAAATCTCTCATACTCATTGTGTCTGTAAGGCCTCACAGGAATCTG
CTTTGAAAGAAATAATGTAGTGTAGCCTAGCTTTTCATATTCGACCTTAAACTGGAATAC
ACCATACACATCAGGAACCTTGAATGATGTATGAAATAAACCC
C

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2F411TF 464 0 0
GAGTGTAAAGTTAGGCTCACTTAAAAATATCTTGTCAACAAAAAAAGGTTGCAGCACCAA
ATTTTAGGAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAAAAGGTTGCAAGTGTTCACTAATGCTTGT
TGGCAAAAAGACAAAACAAGATTCAAATGTTTTGTTCTCTCGTCTAAATATGAAAATCAG
GCTTTATTTTACTCTATTCGACTGGAGAACCACTCACGGGATTTTCTACTTATGGTAGAG
GTAGACGAAGCTGAAGACAAAGAAACCCGCCATAGTGGTAAAGCAGGCTCCATAATAGGG
ATACGCAGTTGGGATAAATCTCTCATACTCATTGTGTCTGTAAGGCCTCACAGGAATCTG
CTTTGAAAGAGATAATGTAGTGTAGCCTAGCTTTTCATATTCGACCTTAAACTGGAATAC
ACCATACACATCAGGAACCTTGAATGATGTATGAAATAGACCC
C

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2AM07JQ 277 0 0
CCTTAAACTGGAATACACCATACACATCAGGAACCTTGAATGATGTATGAAATAGACCCT
TCTTGTCTGTTGACAAGGTTTTCAGAACATATGGGCTCATCATGTAAAACTGAACCTGCA
CATCATCAGCTACATACGGTTCCCAGCTCTTCCCTGACCACTCCAGTATCTCCACCGAAA
ATTCCAAGTCATCCTTTATCCTGTATATTGCTGGCTCATCTGTTTCTCCAACCCTGTGGT
GTACAAGACTACCAGCCTTCAAATGCCCTCTTTCGTG

QA 1 277 1 277
DS 



CO CL436Contig2 1495 5 28 U
GGACTCACTCTATACCCGTGAAAACCCACCCATAGGAGGCGCTACCGCTACGATGAACCT
CTCGAGATCCGCCGCGCTGATCTCCTTATTCCTTCTTCCGTTGCTTAGCTTCTCGTTCTC
CGTCGATCATCCGACGGATCGACGGGTTCTGGTTCTTCTCGACGATCTCTCACTCAAATC
CTCTCATTCTATCTTCTTCAACACTCTCAAATCCCGTGGATTCGATCTCGATTTCAAATT
AGCAGATGATTCGAAGCTCGCGCTTCAACGATACGGCCAGTACTTGTACGATGGGCTCAT
CATCTTCGCCCCCTCCACAGAGCAATTTGGAGGTTCATTGGATTCGAAATCGATAGCTGA
TTTCGTAGATTCGGGTCGTGACTTGATCTTATCGGCGGATACTTCTGCATCTGATCTGAT
TCGGGGGATTGCTTTAGAATGTGGTGTTGATTTCGATGAGGATTCTTCGGCTATGGTTAT
TGATCATTCCAGCTTCTCTGTCTCTGACGGCGACCACACCTTGATTGCTGCTGATGATTT
AGTTAAGTCCGATGTCATTTTAGGAAAAGCCAAAATTGAGGCTCCCGTGCTCTTCAGAGG
TGTTGCGCATTCATTGAACCCTACCAACAATCTGGTTTTGAAAGTTCTTTCAGCTTCTCC
ATCAGCTTATTCTGCTAACCCGAGCTCTAAGTTGTCGAGTCCTCCTCAGCTCACTGGGTC
TGCAATTTCGCTAGTGTCGGTCATGCAGGCCAGGAACAATGCTAGGGTTGTGATCTCTGG
CTCTTTGCAGTTGTTTAGCGATAGGTTGTTCAGATCTGGTGTCCAGAAAGCTGGGAGTCC
GAACAAATATGAAAAATCTGGAAACGAACAGTTTGTGACTGAAGTAAGCAAATGGGTCTT
CCACGAAAGAGGCCACCCGAAGGCTGGTAGTCTGGTACACCATAGGGTTGGAGAAACAGA
TGAGCCAGCAATATATAGGATAAAGGATGACCTGGAATTTTCGGTGGAGATACTGGAGTG
GTCAGGGAAGAGCTGGGAACCGTATGTAGCTGATGATGTGCAGGTTCAGTTTTACATGAT
GAGCCCATATGTGTTGAAAACCTTGTCAACAGACAAGAAGGGTATGTTTCATACATCTTT
CAAGGTGCCTGATGTGTATGGTGTATTCCAGTTTAAGGTTGAATATGAAAAGCTAGGCTA
CACTACGTTATCTCTTTCAAAGCAGATTCCTGTGAGGCCTTACAGACATAATGAGTATGA
GAGATTTATTCCAACTGCGTATCCTTATTATGGAGCCTGCTTTACCACTATGGCTGGTTT
CTTTGTCTTCAGCTTCGTCTACCTCTACCACAAGTAGAAAAATCTCCTAAATGGTTATCG
AGTCGCCTAAAGTAAGCTAGACCTTCATATTTAGACGAGAAAAAATACATTTGATCTTGA
TACCATTAGTTTTTTTGGCCAACAAGCTTTAAAACACTTGCAACCTTTTTTTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ08TF U 1
AF RR2AW17TFB U 26
AF RR2FX42JQ C 938
AF RR2FX42TF U 625
AF RR2C763TF U 786
BS 1 323 RR2GJ08TF
BS 324 324 RR2AW17TFB
BS 325 595 RR2GJ08TF
BS 596 748 RR2AW17TFB
BS 749 749 RR2FX42TF
BS 750 796 RR2AW17TFB
BS 797 855 RR2FX42TF
BS 856 856 RR2C763TF
BS 857 917 RR2FX42TF
BS 918 918 RR2C763TF
BS 919 1342 RR2FX42TF
BS 1343 1343 RR2C763TF
BS 1344 1348 RR2FX42TF
BS 1349 1349 RR2C763TF
BS 1350 1350 RR2FX42TF
BS 1351 1351 RR2C763TF
BS 1352 1361 RR2FX42TF
BS 1362 1362 RR2C763TF
BS 1363 1385 RR2FX42TF
BS 1386 1386 RR2C763TF
BS 1387 1390 RR2FX42TF
BS 1391 1391 RR2C763TF
BS 1392 1394 RR2FX42TF
BS 1395 1395 RR2C763TF
BS 1396 1402 RR2FX42TF
BS 1403 1403 RR2C763TF
BS 1404 1424 RR2FX42TF
BS 1425 1495 RR2C763TF

RD RR2GJ08TF 595 0 0
GGACTCACTCTATACCCGTGAAAACCCACCCATAGGAGGCGCTACCGCTACGATGAACCT
CTCGAGATCCGCCGCGCTGATCTCCTTATTCCTTCTTCCGTTGCTTAGCTTCTCGTTCTC
CGTCGATCATCCGACGGATCGACGGGTTCTGGTTCTTCTCGACGATCTCTCACTCAAATC
CTCTCATTCTATCTTCTTCAACACTCTCAAATCCCGTGGATTCGATCTCGATTTCAAATT
AGCAGATGATTCGAAGCTCGCGCTTCAACGATACGGCCAGTACTTGTACGATGGGCTCAT
CATCTTCGCCCCCTCCACAGAGCGATTTGGAGGTTCATTGGATTCGAAATCGATAGCTGA
TTTCGTAGATTCGGGTCGTGACTTGATCTTATCGGCGGATACTTCTGCATCTGATCTGAT
TCGGGGGATTGCTTTAGAATGTGGTGTTGATTTCGATGAGGATTCTTCGGCTATGGTTAT
TGATCATTCCAGCTTCTCTGTCTCTGACGGCGACCACACCTTGATTGCTGCTGATGATTT
AGTTAAGTCCGATGTCATTTTAGGAAAAGCCAAAATTGAGGCTCCCGTGCTCTTC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2AW17TFB 771 0 0
GG
ACCCATAGGAGGGGCTACCGCTACGATGAACCTCTCGAGATCCGCCGCGCTGATCTCCTT
ATTCCTTCTTCCGTTGCTTAGCTTCTCGTTCTCCGTCGATCATCCGACGGATCGACGGGT
TCTGGTTCTTCTCGACGATCTCTCACTCAAATCCTCTCATTCTATCTTCTTCAACACTCT
CAAATCCCGTGGATTCGATCTCGATTTCAAATTAGCAGATGATTCGAAGCTCGCGCTTCA
ACGATACGGCCAGTACTTGTACGATGGGCTCATCATCTTCGCCCCCTCCACAGAGCAATT
TGGAGGTTCATTGGATTCGAAATCGATAGCTGATTTCGTAGATTCGGGTCGTGACTTGAT
CTTATCGGCGGATACTTCTGCATCTGATCTGATTCGGGGGATTGCTTTAGAATGTGGTGT
TGATTTCGATGAGGATTCTTCGGCTATGGTTATTGATCATTCCAGCTTCTCTGTCTCTGA
CGGCGACCACACCTTGATTGCTGCTGATGATTTAGTTAAGTCCGATGTCATTTTAGGAAA
AGCCAAAATTGAGGCTCCCGTGCTCTTCAGAGGTGTTGCGCATTCATTGAACCCTACCAA
CAATCTGGTTTTGAAAGTTCTTTCAGCTTCTCCATCAGCTTATTCTGCTAACCCGAGCTC
TAAGTTGTCGAGTCCTCCTCAGCTCACTGGGTCTGCAATTTCGCTAGTGTCGGTCATGCA
G*CCAGGAACAATGCTAGGGTTGTGATCTCTGGCTCTTTGCAGTTGTTT

QA 3 771 3 771
DS 

RD RR2FX42JQ 343 0 0
CACCATAGGGTTGGAGAAACAGATGAGCCAGCAATATATAGGATAAAGGATGACCTGGAA
TTTTCGGTGGAGATACTGGAGTGGTCAGGGAAGAGCTGGGAACCGTATGTAGCTGATGAT
GTGCAGGTTCAGTTTTACATGATGAGCCCATATGTGTTGAAAACCTTGTCAACAGACAAG
AAGGGTATGTTTCATACATCTTTCAAGGTGCCTGATGTGTATGGTGTATTCCAGTTTAAG
GTTGAATATGAAAAGTTAGGCTACACTACGTTATTTCTTTCAAAGCAGATTCCTGTGAGG
CCTTACAGACATAATGAGTATGAGAGATTTATTCCAACTG
GGT

QA 1 340 1 340
DS 

RD RR2FX42TF 800 0 0
G
AACAATCTGGTTTTGAAAGTTCTTTCAGCTTCTCCATCAGCTTATTCTGCTAACCCGAGC
TCTAAGTTGTCGAGTCCTCCTCAGCTCACTGGGTCTGCAATTTCGCTAGTGTCGGTCATG
CAGGCCAGGAACAATGCTAGGGTTGTGATCTCTGGCTCTTTGCAGTTGTTTAGCGATAGG
TTGTTCAGATCTGGTGTCCAGAAAGCTGGGAGTCCGAACAAATATGAAAAGTCTGGAAAC
GAACAGTTTGTGACTGAAGTAAGCAAATGGGTCTTCCACGAAAGAGGCCACCTGAAGGCT
GGTAGTCTGGTACACCATAGGGTTGGAGAAACAGATGAGCCAGCAATATATAGGATAAAG
GATGACCTGGAATTTTCGGTGGAGATACTGGAGTGGTCAGGGAAGAGCTGGGAACCGTAT
GTAGCTGATGATGTGCAGGTTCAGTTTTACATGATGAGCCCATATGTGTTGAAAACCTTG
TCAACAGACAAGAAGGGTATGTTTCATACATCTTTCAAGGTGCCTGATGTGTATGGTGTA
TTCCAGTTTAAGGTTGAATATGAAAAGCTAGGCTACACTACGTTATCTCTTTCAAAGCAG
ATTCCTGTGAGGCCTTACAGACATAATGAGTATGAGAGATTTATTCCAACTGCGTATCCT
TATTATGGAGCCTGCTTTACCACTATGGCTGGTTTCTTTGTCTTCAGCTTCGTCTAC*TC
TAC*ATAAGTAGAAAA*TCTCCTAAATGGTTATCGAGTCGTCTAA*GTA*GCTAGAC*TT
CATATTTAGACGAGAAAAA

QA 2 800 2 800
DS 

RD RR2C763TF 710 0 0
G
GCAGTTGTTTAGCGATAGGTTGTTCAGATCTGGTGTCCAGAAAGCTGGGAGTCCGAACAA
ATATGAAAAATCTGGAAACGAACAGTTTGTGACTGAAGTAAGCAAATGGGTCTTCCACGA
AAGAGGCCACCCGAAGGCTGGTAGTCTTGTACACCATAGGGTCGGAGAAACAGATGAGCC
AGCAATATATAGGATAAAGGATGACCTGGAATTTTCGGTGGAGATACTAGAGTGGTCAGG
GAAGAGCTGGGAACCATATGTAGCCGATGATGTGCAGGTTCAGTTT*ACATGATGAGCCC
ATATGTGTTGAAAACCTTGTCAACAGACAAGAAGGGTATGTTTCATACATCTTTCAAGGT
GCCTGATGTGTATGGTGTATTCCTGTTTAAGGTTGAATATGAAAAGCTAGGCTACACTAC
ATTATCTCTTTCAAAGCAGATTCCTGTGAGGCCTTACAGACACAATGAGTATGAGAGATT
TATTCCAACTGCGTATCCTTATTATGGAGCCTGCTTTACCACTATGGCTGGTTTCTTTGT
CTTCAGCTTCGTCTACCTCTACCACAAGTAGAAAAATCTCCTAAATGGTTATCGAGTCGC
CTAAAGTAAGCTAGACCTTCATATTTAGACGAGTAAAAATACATTTGATCTTGATACCAT
TAGTTTTTTTGGCCAACAAGCTTTAAAACACTTGCAACCTTTTTTTGGG

QA 2 710 2 710
DS 



AS 2 11

CO CL437Contig1 916 6 8 U
GAATTAAATAGTTATAAGCAGAATCAGAAAGAAAACAAAAATGACTTGTAGAAAGAACCA
AAATA*CATTCAAACTTGATTGTAGTTATGTTCGGGAGAATTTAAAAAGTAGAAGTAATG
AAAGTCCATGGTGGAAAAGACTTTGCTAAACTGCAAAAAGCATTTATTATTCTTTCACAA
ACGATCTGGTTGACTCTTTTTTTACCGAAGAACAAGATGTGGCTTCCATGAGAAAGGGAA
GAAGACTTTGGATTCTTCTTATTCAGAGGTCCTCCGGACCATTGATGTCCTTGTTCTCGA
TCACAGCACCATTGGGGATTTCCACCTTTGTCCCAGATTTTGCGGTTACAGTCACCTTGC
CCTTGAGAACAACGGAAGAGCCAAAATAGACATCACCAGACACCTTAAGGCTGTCGAGCT
CGACAATACTAGGGATGGACTTGAACCGGCTCAAGAAATTAGCCACCTTCTTGAATTCGG
GTCCCAATTCAACTGATGGGTTTGAGGGGTTAGTTCTAGCAGGGTTTCGGGTGACAAAGC
CATCAACTAGGGTGTAGAGATCAGACTGGACGAGCAGCAAGTCTGAAGTTGCCTTCACTG
GCAAGAACCGTGAGCGAGGTACGTTAACACCGATAGCATTGTCAAAGAACCTTATTGCAG
CACCAGCTGCAGTTTCCAGTTGAAGAACTTTCACTCCATCGACTTCCTTTGGGTTAGGAA
TGATCTCCATTTTAAGTGCATCAGCTTCCACGAGCTTTTTGATGGCCTTCAAGTTAACCC
ATAAGTTGTTTGTGTTGAATATCTTGAACTTCTCAATTGATTTGAACTCATTGACATGTT
CATCAGAACCTGAGCAATCTCTAAAAGCTGAACTTTGCCTTCATAAGAGATGAGAGTCCT
CCCTTTACATCAGCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ29JQ U 19
AF RR2C457JQ U 1
AF RR2FC12JQ U 43
AF RR2BX64JQ U 75
AF RR2CB65JQ U 85
AF RR2DE80JQ U 31
BS 1 307 RR2C457JQ
BS 308 308 RR2FC12JQ
BS 309 421 RR2C457JQ
BS 422 422 RR2FC12JQ
BS 423 690 RR2C457JQ
BS 691 732 RR2DE80JQ
BS 733 734 RR2BX64JQ
BS 735 916 RR2DE80JQ

RD RR2BQ29JQ 638 0 0
CAGAATCAGAAAGAAAACAAAAATGACTTGTAGAAAGAACCAAAATA*CATTCAAACTTG
ATTGTAGTTATGTTCGGGAGAATTTAAAAAGTAGAAGTAATGAAAGTCCATGGTGGAAAA
GACTTTGCTAAACTGCAAAAAGCATTTATTATTCTTTCACAAACGATCTGGTTGACTCTT
TTTTTACCGAAGAACAAGATGTGGCTTCCATGAGAAAGGGAAGAAGACTTTGGATTCTTC
TTATTCAGAGGTCCTCCGGACCATTGATGTCCTTGTTCTCGATCACAGCACCATTGGGGA
TTTCCACCTTTGTCCCAGATTTTGCGGTTACAGTCACCTTGCCCTTGAGAACAACGGAAG
AGCCAAAATAGACATCACCAGACACCTTAAGGCTGTCGAGCTCGACAATACTAGGGATGG
ACTTGAACCGGCTCAAGAAATTAGCCACCTTCTTGAATTCGGGTCCCAATTCAACTGATG
GGTTTGAGGGGCTAGTTCTAGCAGGGTTTCGGGTGACAAAGCCATCAACTAGGGTGTAGA
GATCAGACTGGACGAGCAGCAAGTCTGAAGTTGCCTTCACTGGCAAGAACCGTGAGAGAG
GTACGTTAACACCGATAGCATTGTCAAAGAACCTTATT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2C457JQ 690 0 0
GAATTAAATAGTTATAAGCAGAATCAGAAAGAAAACAAAAATGACTTGTAGAAAGAACCA
AAATA*CATTCAAACTTGATTGTAGTTATGTTCGGGAGAATTTAAAAAGTAGAAGTAATG
AAAGTCCATGGTGGAAAAGACTTTGCTAAACTGCAAAAAGCATTTATTATTCTTTCACAA
ACGATCTGGTTGACTCTTTTTTTACCGAAGAACAAGATGTGGCTTCCATGAGAAAGGGAA
GAAGACTTTGGATTCTTCTTATTCAGAGGTCCTCCGGACCATTGATGTCCTTGTTCTCGA
TCACAGCGCCATTGGGGATTTCCACCTTTGTCCCAGATTTTGCGGTTACAGTCACCTTGC
CCTTGAGAACAACGGAAGAGCCAAAATAGACATCACCAGACACCTTAAGGCTGTCGAGCT
CAACAATACTAGGGATGGACTTGAACCGGCTCAAGAAATTAGCCACCTTCTTGAATTCGG
GTCCCAATTCAACTGATGGGTTTGAGGGGTTAGTTCTAGCAGGGTTTCGGGTGACAAAGC
CATCAACTAGGGTGTAGAGATCAGACTGGACGAGCAGCAAGTCTGAAGTTGCCTTCACTG
GCAAGAACCGTGAGCGAGGTACGTTAACACCGATAGCATTGTCAAAGAACCTTATTGCAG
CACCAGCTGCAGTTTCCAGTTGAAGAACTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2FC12JQ 634 0 0
AG
CTTGTAGAAAGAACCAAAATA*CATTCAAACTTGATTGTAGTTATGTTCGGGAGAATTTA
AAAAGTAGAAGTAATGAAAGTCCATGGTGGAAAAGACTTTGTTAAACTGCAAAAAGCATT
TATTATTCTTTCACAAACGATCTGGTTGACTCTTTTTTTACCGAAGAACAAGATGTGGCT
TCCATGAGAAAGGGAAGAAGACTTTGGATTCTTCTTATTCAGAGGTCCTCCGGACCATTG
ATGTCCTTGTTCTCGATCACAGCACCATTGGGGATTTCCACCTTTGTCCCAGATTTTGCG
GTTACAGTCACCTTGCCCTTGAGAACAACGGAAGAGCCAAAATAGACATCACCAGACACC
TTAAGGCTGTCGAGCTCGACAATACTAGGGATGGACTTGAACCGGCTCAAGAAATTAGCC
ACCTTCTTGAATTCGGGTCCCAATTCAACTGATGGGTTTGAGGGGTTAGTTCTAGCAGGG
TTTCGGGTGACAAAGCCATCAACTAGGGTGTAGAGATCAGACTGGACGAGCAGCAAGTCT
GAAGTTGCCTTCACTGGCAAGAACCGTGAGCGAGGTACGTTAACACCGATAGCATTGTCA
AAGAACCTTATTGCAGCACCAGCTGCAGTTTC

QA 3 634 3 634
DS 

RD RR2BX64JQ 696 0 0
CTTGATTGTAGTTATGTTCGGGAGAATTTAAAAAGTAGAAGTAATGAAAGTCCATGGTGG
AAAAGACTTTGCTAAACTGCAAAAAGCATTTATTATTCTTTCACAAACGATCTGGTTGAC
TCTTTTTTTACCGAAAAACAAGATGTGGCTTCCATGAAAAAGGGAAGAAGACTTTGGATT
CTTCTTATTCAGAGGTCCTCCGGACCATTGATGTCCTTGTTCTCGATCACAGCACCATTG
GGGATTTCCACCTTTGTCCCAAATTTTGCGGTTACAGTCACCTTGCCCTTGAGAACAACG
GAAGAGCCAAAATAGACATCACCAGACACCTTAAGGCTGTCGAGCTCGACAATACTAGGG
ATGGACTTGAACCGGCTCAAGAAATTAGCCACCTTCTTGAATTCGGGTCCCAATTCAACT
GATGGGTTTGAGGGGTTAGTTCTAGCAGGGTTTCGGGTGACAAAGCCATCAACTAGGGTG
TAGAGATCAGACTGGACGAGCAGCAAGTCTGAAGTTGCCTTCACTGGCAAGAACCGTGAG
CGAGGTACGTTAACACCGATAGCATTGTCAAAGAACCTTATTGCAGCACCAGCTGCAGTT
TCCAGTTGAAGAACTTTCACTCCATCGACTTCCTTTGGGTTAGGAATGATCTCCATTTTA
AGTGCATCAGCTTCCACGAGCTTTTTGATGGCCTTC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2CB65JQ 782 0 0
GTTATGTTCGGGAGAATTTAAAAAGTAGAAGTAATGAAAGTCCATGGTGGAAAAGACTTT
GCTAAACTGCAAAAAGCATTTATTATTCTTTCACAAACGATCTGGTTGACTCTTTTTTTA
CCGAAGAACAAGATGTGGCTTCCATGAGAAAGGGAAGAAGACTTTGGATTCTTCTTATTC
AGAGGTCCTCCGGACCATTGATGTCCTTGTTCTCGATCACAGCACCATTGGGGATTTCCA
CCTTTGTCCCAGATTTTGCGGTTACAGTCACCTTGCCCTTGAGAACAACGGAAGAGCCAA
AATAGACATCACCAGACACCTTAAGGCTGTCGAGCTCGACAATACTAGGGATGGACTTGA
ACCGGCTCAAGAAATTAGCCACCTTCTTGAATTCGGGTCCCAATTCAACTGATGGGTTTG
AGGGGTTAGTTCTAGCAGGGTTTCGGGTGACAAAGCCATCAACTAGGGTGTAGAGATCAG
ACTGGACGAGCAGCAAGTCTGAAGTTGCCTTCACTGGCAAGAACCGTGAGCGAGGTACGT
TAACACCGATAGCATTGTCAAAGAACCTTATTGCAGCACCAGCTGCAGTTTCCAGTTGAA
GAACTTTCACTCCATCGACTTCCTTTGGGTTAGGAATGATCTCCATTTTAAGTGCATCAG
CTTCCACGAGCTTTT*GATGGCCTTCAAGTTAACCCATAAGTTGTTTGTGTTGA*TATCT
TGAACTTCTCAATTGATTTGA*CTCATTGACATGTTCATCAGAACTTGAGCA
TCTCCAAAGC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2DE80JQ 886 0 0
GAAAACAAAAATGACTTGTAGAAAGAACCAGAATAACACTCATACTTGATTGTAATTATG
TTCGGGAAAATTTAAAAAGCAGAAGTAATGAAAGTCCATGGTGGAAAAGACTTTGCTAAA
CTGCAAAAAGCATTTATTATTCTTTCACAAACGATCTGGTTGACTCTTTAT**ACCGAAG
AACAAGATGTGGCTTCCATGAGAAAGGGAAGAAGACTTTGGATTCTTCTTATTCAGAGGT
CCTCCGGACCATTGATGTCCTTGTTCTCGATCACAGCACCATCGGGGATTTCCACCTTTG
TCCCAGATTTTGCGGTTACAGTCACCTTGCCCTTGAGAACAACGGAAGAGCCAAAATAGA
CATCACCAGACACCTTAAGGCTGTCGAGCTCGACTATACTAGGGATGGACTTGAACCGGA
TCAAGAAATTAGCCACCTCCTTAAATTCGGGTCCCAATTCAACTGACGGGTTTGAGGGGT
TGGTTCTAGCAGGGTTTCGGGTGACAAAGCCATCAACTAGGGTGTAGAGGTCAGACTGGA
CGAGCAGCAAGTCTGACGTTGCCTTCACTGGCAAGAACCGTGAGCGAGGTACATTAACAC
CGATAGCATTGTCAAAGAACCTTATTGCAGCACCAGCTGCAGTTTCCAGTTGAAGAACTT
TCACTCCATCGACTTCCTTTGGGTTAGGAATGATCTCCATTTGTAGTGCATCAGCTTCCA
CGAGCTTTTTGATGGCCTTCAAGTTAACCCATAAGTTGTTTGTGTTGAATATCTTGAACT
TCTCAATTGATTTGAACTCATTGACATGTTCATCAGAACCTGAGCAATCTCTAAAAGCTG
AACTTTGCCTTCATAAGAGATGAGAGTCCTCCCTTTACATCAGCTA

QA 1 886 1 886
DS 



CO CL437Contig2 1191 5 29 U
GGACTTCATCACCACTACTCCTCCCAAACTCCCAATTCGCATATATACACACTCAATCTC
CATCATCATCATCATCATCTACAATCTTCTCAAGCTCTAAATCGATAATCGACGATGGCT
GCCACCACCGAGAATCTCCCCCAGCTCAAATCCGCCGTCGATGGCCTTACTGAAATGAGT
GAGAATGAGAGGAGTGGATTCATCAACCTCGTTTCACGCTACCTCAGCGGTGAGGCGCAG
CACATTGAGTGGAGTAAGATCCAGACACCTACTGATGAAATCGTTGTTCCTTACGAGAAA
ATGGCTCCCGTCTCCGAAGATGTTTCCGAGACCAAGAATCTGTTGGACAAACTTGTTGTC
TTGAAGCTTAATGGAGGTCTTGGGACAACCATGGGATGCACTGGCCCTAAGTCGGTTATC
GAAGTTCGTGATGGTTTGACATTTCTAGATCTGATTGTTATCCAGATTGAGAATCTCAAC
AACAAGTATGGCTGCAAGGTCCCATTGGTTCTCATGAACTCGTTTAATACACATGATGAC
ACACAAAAGATTGTGGAGAAGTACACCAACTCTAATGTTGACATCCACACTTTTAACCAG
AGCAAATATCCCCGTGTTGTCGCTGATGAGTTTGTGCCATGGCCCAGCAAGGGAAAGACC
GACAAGGATGGCTGGTATCCTCCCGGTCATGGTGATGTATTCCCATCCCTCATGAACAGT
GGAAAGCTCGATGCTTTCTTATCCCAGGGTAAAGAATATGTGTTTGTTGCCAATTCAGAC
AACTTGGGTGCCATCGTTGACTTAAAAATATTGAAGCACTTAATCCAGAACAAGAATGAG
TACTGTATGGAGGTTACACCCAAAACATTAGCTGATGTAAAGGGAGGAACTCTCATCTCT
TATGAAGGCAAAGTTCAGCTTTTAGAGATTGCTCAAGTTCCTGATGAACATGTCAATGAG
TTCAAATCAATTGAGAAGTTCAAGATATTCAACACAAACAACTTATGGGTTAACTTGAAG
GCCATCAAAAAGCTCGTGGAAGCTGATGCACTAAAAATGGAGATCATTCCTAACCCAAAG
GAAGTCGATGGAGTGAAAGTTCTTCAACTGGAAACTGCAGCTGGTGCTGCAATAAAGTTC
TTTGACAATGCTATCGGTGTTAACGTACCTCGCTCACGTTCTTGCCAGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C457TF U 1
AF RR2FC12TF U 42
AF RR2DV25TF U 69
AF RR2BQ29TF U 494
AF RR2DE80TF U 564
BS 1 76 RR2C457TF
BS 77 79 RR2FC12TF
BS 80 256 RR2C457TF
BS 257 257 RR2FC12TF
BS 258 303 RR2C457TF
BS 304 304 RR2FC12TF
BS 305 308 RR2C457TF
BS 309 309 RR2FC12TF
BS 310 666 RR2C457TF
BS 667 667 RR2FC12TF
BS 668 685 RR2C457TF
BS 686 686 RR2FC12TF
BS 687 731 RR2C457TF
BS 732 742 RR2FC12TF
BS 743 743 RR2BQ29TF
BS 744 744 RR2DE80TF
BS 745 770 RR2BQ29TF
BS 771 771 RR2DE80TF
BS 772 821 RR2BQ29TF
BS 822 822 RR2DE80TF
BS 823 923 RR2BQ29TF
BS 924 924 RR2DE80TF
BS 925 1052 RR2BQ29TF
BS 1053 1053 RR2DE80TF
BS 1054 1147 RR2BQ29TF
BS 1148 1148 RR2DE80TF
BS 1149 1171 RR2BQ29TF
BS 1172 1172 RR2DE80TF
BS 1173 1191 RR2BQ29TF

RD RR2C457TF 731 0 0
GGACTTCATCACCACTACTCCTCCCAAACTCCCAATTCGCATATATACACACTCAATCTC
CATCATCATCATCATC***TACAATCTTCTCAAGCTCTAAATCGATAATCGACGATGGCT
GCCACCACCGAGAATCTCCCCCAGCTCAAATCCGCCGTCGATGGCCTTACTGAAATGAGT
GAGAATGAGAGGAGTGGATTCATCAACCTCGTTTCACGCTACCTCAGCGGTGAGGCGCAG
CACATTGAGTGGAGTAGGATCCAGACACCTACTGATGAAATCGTTGTTCCTTACGAGAAA
ATGACTCC*GTCTCCGAAGATGTTTCCGAGACCAAGAATCTGTTGGACAAACTTGTTGTC
TTGAAGCTTAATGGAGGTCTTGGGACAACCATGGGATGCACTGGCCCTAAGTCGGTTATC
GAAGTTCGTGATGGTTTGACATTTCTAGATCTGATTGTTATCCAGATTGAGAATCTCAAC
AACAAGTATGGCTGCAAGGTCCCATTGGTTCTCATGAACTCGTTTAATACACATGATGAC
ACACAAAAGATTGTGGAGAAGTACACCAACTCTAATGTTGACATCCACACTTTTAACCAG
AGCAAATATCCCCGTGTTGTCGCTGATGAGTTTGTGCCATGGCCCAGCAAGGGAAAGACC
GACAAG*ATGGCTGGTATCCTCCCG*TCATGGTGATGTATTCCCATCCCTCATGAACAGT
GGAAAGCTCGA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2FC12TF 701 0 0
G
ATATACACACTCAATCTCCATCATCATCATCATCATCTACAATCTTCTCAAGCTCTAAAT
CGATAATCGACGATGGCTGCCACCACCGAGAATCTCCCCCAGCTCAAATCCGCCGTCGAT
GGCCTTACTGAAATGAGTGAGAATGAGAGGAGTGGATTCATCAACCTCGTTTCACGCTAC
CTCAGCGGTGAGGCGCAGCACATTGAGTGGAGTAAGATCCAGACACCTACTGATGAAATC
GTTGTTCCTTACGAGAAAATGGCTCCCGTCTCCGAAGATGTTTCCGAGACCAAGAATCTG
TTGGACAAACTTGTTGTCTTGAAGCTTAATGGAGGTCTTGGGACAACCATGGGATGCACT
GGCCCTAAGTCGGTTATCGAAGTTCGTGATGGTTTGACATTTCTAGATCTGATTGTTATC
CATATTGAGAATCTCAACAACAAGTATGGCTGCAAGGTCCCATTGGTTCTCATGAACTCG
TTTAATACACATGATGACACACAAAAGATTGTGGAGAAGTACACCAACTCTAATGTTGAC
ATCCACACTTTTAACCAGAGCAAATATCCCCGTGTTGTCGCTGATGAGTTTGTGCCATGG
CCCAGCAAGGGAAAGACCGACAAGGATGGCCGGTATCCTCCCGGTCATGGTGATGTATTC
CCATCCCTCATGAACAGTGGAAAGCTCGATGCTTTCTTAT

QA 2 701 2 701
DS 

RD RR2DV25TF 674 0 0
GG
ATCATCATCTACAATCTTCTCAAGCTCTAAATCGATAATCGACGATGGCTGCCACCACCG
AGAATCTCCCCCAGCTCAAATCCGCCGTCGATGGCCTTACTGAAATGAGTGAGAATGAGA
GGAGTGGATTCATCAACCTCGTTTCACGCTACCTCAGCGGTGAGGCGCAGCACATTGAGT
GGAGTAAGATCCAGACACCTACTGATGAAATCGTTGTTCCTTACGAGAAAATGGCTCCCG
TCTCCGAAGATGTTTCCGAGACCAAGAATCTGTTGGACAAACTTGTTGTCTTGAAGCTTA
ATGGAGGTCTTGGGACAACCATGGGATGCACTGGCTCTAAGTCGGTTATCGAAGTTCGTG
ATGGTTTGACATTTCTAGATCTGATTGTTATCCAGATTGAGAATCTCAACAACAAGTATG
GCTGCAAGGTCCCATTGGTTCTCATGAACTCGTTTAATACACATGATGACACACAAAAGA
TTGTGGAGAAGTACACCAACTCTAATGTTGACATCCACACTTTTAACCAGAGCAAATATC
CCCGTGTTGTCGCTGATGAGTTTGTGCCATGGCCCAGCAAGGGAAAGACCGACAAG*ATG
GCTGGTATCCTCCCGGTCATGGTGATGTATTCCCATCCCTCATGAACAGTGGAAAGCTCG
ATGCTTTCTTAT

QA 3 674 3 674
DS 

RD RR2BQ29TF 698 0 0
GCAAGGTCCCATTGGTTCTCATGAACTCGTTTAATACACATGACGACACACAAAAGATTG
TGGAGAAGTACACCAACTCTAATGTTGACATCCACACTTTTAACCAGAGCAAATATCCCC
GTGTTGTCGCTGATGAGTTTGTGCCATGGCCCAGCAAGGGAAAGACCGACAAGGATGGCT
GGTATCCTCCCGGTCATGGTGATGTATTCCCATCCCTCATGAACAGTGGAAAGCTCGATG
CTTTCTTATCGCAGGGTAAAGAATATGTGTTTGTTGCTAATTCAGACAACTTGGGTGCCA
TCGTTGACTTAAAAATATTGAAGCACTTGATCCAGAACAAGAATGAGTACTGTATGGAGG
TTACACCCAAAACATTAGCTGATGTAAAGGGAGGAACTCTCATCTCTTATGAAGGCAAAG
TTCAGCTTTTGGAGATTGCTCAAGTTCCTGATGAACATGTCAATGAGTTCAAATCAATTG
AGAAGTTCAAGATATTCAACACAAACAACTTATGGGTTAACTTGAAGGCCATCAAAAAGC
TCGTGGAAGCTGATGCACTTAAAATGGAGATCATTCCTAACCCAAAGGAAGTCGATGGAG
TGAAAGTTCTTCAACTGGAAACTGCAGCTGGTGCTGCAATAAAGTTCTTTGACA*TGCTA
TCGGTGTTAACGTACCTCTCTCACGTTCTTGCCAGTGA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2DE80TF 611 0 0
G
ACCAACTCTAATGTTGACATCCACACTTTTAACCAGAGCAAATATCCCCGTGTTGTCGCT
GATGAGTTTGTGCCATGGCCCAGCAAGGGAAAGACCGACAAGGATGGCTGGTATCCTCCC
GGTCATGGAGATGTATTCCCATCCCTGATGAACAGTGGAAAGCTCGATGCTTTCTTATCC
CAGGGTAAAGAATATGTGTTTGTTGCCAATTCAGACAACTTGGGTGCCATCGTTGACTTA
AAAATATTGAAGCACTTAATCCAGAACAAGAATGAGTACTGTATGGAGGTTACACCCAAA
ACATTAGCTGATGTAAAGGGAGGAACTCTCATCTCTTATGAAGGCAAAGTTCAGCTTTTA
GAGATTGCTCAGGTTCCTGATGAACATGTCAATGAGTTCAAATCAATTGAGAAGTTCAAG
ATATTCAACACAAACAACTTATGGGTTAACTTGAAGGCCATCAAAAAGCTCGTGGAAGCT
GATGCACTACAAATGGAGATCATTCCTAACCCAAAGGAAGTCGATGGAGTGAAAGTTCTT
CAACTGGAAACTGCAGCTGGTGCTGCAATAAAGTTCTTTGACAATGCTATCGGTGTTAAT
GTACCTCGCT

QA 2 611 2 611
DS 



AS 1 12

CO CL438Contig1 731 12 26 U
GGGAAAAATCAAAGAGGGGCCTCAATTTAACGAGAGCAGTCCAACGAAATTGATAAAGAA
ACCGAAATCTTGAGTATTGTAGAGAAAAAAAAA*GAAATGACTCTCAAGAAGTTGGACGC
AGATCCCTCAACCTTGGAGACGGTGTTGGAAGAATTGAAATCTGACGAATCAAACCGTAA
CAAGATCAATTTCATCCTCTTCCTCGCCAACAATGAACCCACCACCAACCGCAGCTG*GT
GTCCTGATTGCGTTAGGGCTGAGCCTGTGATTTACAAGACTCTAGAGGAATCACCGGAGG
AAGTGAATCTTATTCGGGCTTACGCCGGAGATAGACCGACGTGGAGGAATCCGATGCACC
CGTGGAGAGTCGATCCTCGATTCAAGGTCACCGGAGTGCCAACACTTGTTCGCTGGGATG
GAGACAGTGTTAAGGGTCGTCTTGAGGATCACCAGGCTCATGTTCCTAACTTGATTCGCC
CACTTCTTGCACCATCCACTTAATTCGATAAGGGACTATGGCTGGATCGATGATCAAGTT
TATGAATCGCTAGTTTTCTGTTGATTTCCAATAAACCCTTGAAAATAAAA*TGGAGCACC
GAAAGTTTGTGTGTTCTGGTTTTTTATGATTTGGTATTTGTTTCTTGCTCAATGTATCGT
TGCATACTCTTGCTTCTCGACTTAATAATAATGCACACTATTTGGGTGTT**GCTTACAA
TTAAAAAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 15 55 15 0 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 45 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 15 25 50 20 20 20 40 40 40 40 35 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY19JQ C 43
AF RR2GJ84TF U 1
AF RR2BY52TF U 1
AF RR2BY52JQ C 25
AF RR2CY19TF U 32
AF RR2DY76TF U 70
AF RR2G515TF U 40
AF RR2E996JQ C 87
AF RR2G515JQ C 492
AF RR2GM69TF U 236
AF RR2E996TF U 87
AF RR2GQ58TF U 158
BS 1 100 RR2BY52TF
BS 101 101 RR2CY19TF
BS 102 140 RR2BY52TF
BS 141 141 RR2CY19TF
BS 142 334 RR2BY52TF
BS 335 335 RR2CY19TF
BS 336 376 RR2BY52TF
BS 377 377 RR2GJ84TF
BS 378 412 RR2BY52TF
BS 413 413 RR2CY19TF
BS 414 563 RR2BY52TF
BS 564 564 RR2CY19TF
BS 565 590 RR2BY52TF
BS 591 591 RR2CY19TF
BS 592 615 RR2BY52TF
BS 616 616 RR2CY19TF
BS 617 623 RR2BY52TF
BS 624 624 RR2CY19TF
BS 625 648 RR2BY52TF
BS 649 649 RR2CY19TF
BS 650 687 RR2BY52TF
BS 688 688 RR2CY19TF
BS 689 708 RR2BY52TF
BS 709 713 RR2CY19TF
BS 714 722 RR2G515TF
BS 723 731 RR2GQ58TF

RD RR2CY19JQ 122 0 0
AACGAAATTGGTAAAGAAACCGAAATCTTGAGTATTGTAGAGAAAAACA***GAAATGAC
TCTCAAGAAGTTGGACGCAGATCCCTCAACCTTGGAGACGGTGTTGGAAGAATTGAAATC
TG

QA 1 122 1 122
DS 

RD RR2GJ84TF 506 0 0
GGGAAAAATCAAAGAGGGGCCTCAATTTAACGAGAGCAGTCCAACGAAATTGATAAAGAA
ACCGAAATCTTGAGTATTTTAGAGAAAAAAAAAAGAAATGGCTCTCAAGAAGTTGGACGC
AGATCCCTCAACCTTGGAGAAGGTGTTGGAAGAATTGAAATCTGACGAATCAAACCGTAA
CAAGATCAATTTCATCCTCTTCCTCGCCAACAATGAACCCACCACCAACCGCAGCTG*GT
GTCCTGATTGCGTTAGGGCTGAGCCTGTGATTTACAAGACTCTAGAGGAATCACCGGAGG
AAGTGAATCTTATTCGGGCTTACGCCGGAGATAGGCCGACGTGGAGGAATCCGATGCACC
CGTGGAGAGTCGATCCTCGATTCAAGGTCACCGGAGTGCCAACACTTGTTCGTTGGGATG
GAGACAGTGTTAAGGGTCGTCTTGAGGATCACCAGGCTCATGTTCCTAACTTGATTCGCC
CACTTCTTGCACCATCCACTTAATTC

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2BY52TF 724 0 0
GGGAAAAATCAAAGAGGGGCCTCAATTTAACGAGAGCAGTCCAACGAAATTGATAAAGAA
ACCGAAATCTTGAGTATTGTAGAGAAAAAAAAA*GAAATGGCTCTCAAGAAGTTGGACGC
AGATCCCTCAACCTTGGAGAAGGTGTTGGAAGAATTGAAATCTGACGAATCAAACCGTAA
CAAGATCAATTTCATCCTCTTCCTCGCCAACAATGAACCCACCACCAACCGCAGCTG*GT
GTCCTGATTGCGTTAGGGCTGAGCCTGTGATTTACAAGACTCTAGAGGAATCACCGGAGG
AAGTGAATCTTATTCGGGCTTACGCCGGAGATAGGCCGACGTGGAGGAATCCGATGCACC
CGTGGAGAGTCGATCCCCGATTCAAGGTCACCGGAGTGCCAACACTTGTTCGTTGGGATG
GAGACAGTGTTAAGGGTCGTCTTGAGGATCACCAGGCTCATGTTCCTAACTTGATTCGCC
CACTTCTTGCACCATCCACTTAATTCGATAAGGGACTATGGCTGGATCGATGATCAAGTT
TATGAATCGCTAGTTTTCTGTTGCTTTCCAATAAACCCTTGAAAATAAAAATGGAGCACC
GAAAGTTTGTGTGTTTTGGTTTTGTATGATTTGGTATTTGTTTCTTGCCCAATGTATCGT
TGCATACTCTTGCTTCTCGACTTAATA*TAATGCACACTATTTGGGTG
CGTCGCTTACAATAAA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2BY52JQ 693 0 0
ATTTAACGAGAGCAGTCC
AACGAAATTGATAAAGAAACCGAAATCTTGAGTATTGTAGAGAAAAAAAAA*GAAATGGC
TCTCAAGAAGTTGGACGCAGATCCCTCAACCTTGGAGAAGGTGTTGGAAGAATTGAAATT
TGACGAATCAAACCGTAACAAGATCAATTTCATCCTCTTCCTCGCCAACAATGAACCCAC
CACCAACCGCAGCTG*GTGTCCTGATTGCGTTAGGGCTGAGCCTGTGATTTACAAGACTC
TAGAGGAATCACCGGAGGAAGTGAATTTTATTCGGGCTTACGCCGGAGATAGGCCGACGT
GGAGGAATCCGATGCACCCGTGGAGAGTCGATCCCCGATTCAAGGTCACCGGAGTGCCAA
CACTTGTTCGTTGGGATGGAGACAGTGTTAAGGGTCGTCTTGAGGATCACCAGGCTCATG
TTCCTAACTTGATTCGCCCACTTCTTGCACCATCCACTTAATTCGATAAGGGACTATGGC
TGGATCGATGTTCAAGTTTATGAATCGCTAGTTTTCTGTTGCTTTCCAATAAACCCTTGA
AAATAAAAATGGAGCACCGAAAGTTTGTGTGTTTTGGTTTTGTATGATTTGGTATTTGTT
TCTTGCCCAATGTATCGTTGCATACTCTTGCTTCTCGACTTAATAATAATGCACACTATT
TGGGTGCG**TCGCT

QA 19 693 19 693
DS 

RD RR2CY19TF 682 0 0
GGGAAAAATCA
AACGAAATTGGTAAAGAAACCGAAATCTTGAGTATTGTAGAGAAAAACA***GAAATGAC
TCTCAAGAAGTTGGACGCAGATCCCTCAACCTTGGAGACGGTGTTGGAAGAATTGAAATC
TGACGAATCAAACCGTAACAAGATCAATTTCATCCTCTTCCTCGCCAACAATGAACCCAA
CACCAACCGCAGCTG*GTGTCCTGATTGCGTTAGGGCTGAGCCTGTGATTTACAAGACTC
TAGAGGAATCACCGGAGGAAGTGAATCTTATTCGTGCTTACGCCGGAGATAGACCGACGT
GGAGGAATCCGATGCACCCGTGGAGAGTCGATCCTCGATTCAAGGTC*CCGGAGTGCCAA
CACTTGTTCGCTGGGATGGAGACAGTGTTAAGGGTCGTCTTGAGGATCACCAGGCTCATG
TTCCTAACTTGATTCGCCCACTTCTTGCACCATCCACTTAATTCGATAAGGGACTATGGC
TGGATCGATGATCAAGTTTATGAATCGCTAGTTTTCTGTTGATTTCCAATAAACCCTTGA
AAATAAAA*TGGAGCACCGAAAGTTTGTGTGTTCTGGTTTTTTATGATTTGGTATTTGTT
TCTTGCTCAATGTATCGTTGCATACTCTTGCTTCTCGACTTAATAATAATGCACACTATT
TGGGTGTT**G

QA 12 682 12 682
DS 

RD RR2DY76TF 651 0 0
TTGAGTATTGTAGAGAAAAAAAAAAGAAATGGCTCTCAAGAAGTTGGACGCAGATCCCTC
AACCTTGGAGAAGGTGTTGGAAGAATTGAAATCTGACGAATCAAACCGTAACAAGATCAA
TTTCATCCTCTTCCTCGCCAACAATGAACCCACCACCAACCGCAGCTG*GTGTCCTGATT
GCGTTAGGGCTGAGCCTGTGATTTACAAGACTCTAGAGGAATCACCGGAGGAAGTGAATC
TTATTCGGGCTTACGCCGGAGATAGGCCGACGTGGAGGAATCCGATGCACCCGTGGAGAG
TCGATCCTCGATTCAAGGTCACCGGAGTGCCAACACTTGTTCGTTGGGATGGAGACAGTG
TTAAGGGTCGTCTTGAGGATCACCAGGCTCATGTTCCTAACTTGATTCGCCCACTTCTTG
CACCATCCACTTAATTCGATAAGGGACTATGGCTGGATCGATGATCAAGTTTATGAATCG
CTAGTTTTCTGTTGCTTTCCAATAAACCCTTGAAAATAAAAATGGAGCACCGAAAGTTTG
TGTGTTTTGGTTTTGTATGATTTGGTATTTGTTTCTTGCCCAATGTATCGTTGCATACTC
TTGCTTCTCGACTTAATAATAATGCACACTATTTGGGTGTG**TCGCT
TAC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2G515TF 683 0 0
GGA
AACGAAATTGGTAAAGAAACCGAAATCTTGAGTATTGTAGAGAAAAACA***GAAATGAC
TCTCAAGAAGTTGGACGCAGATCCCTCAACCTTGGAGACGGTGTTGGAAGAATTGAAATC
TGACGAATCAAACCGTAACAAGATCAATTTCATCCTCTTCCTCGCCAACAATGAACCCAA
CACCAACCGCAGCTG*GTGTCCTGATTGCGTTAGGGCTGAGCCTGTGATTTACAAGACTC
TAGAGGAATCACCGGAGGAAGTGAATCTTATTCGTGCTTACGCCGGAGATAGACCGACGT
GGAGGAATCCGATGCACCCGTGGAGAGTCGATCCTCGATTCAAGGTCACCGGAGTGCCAA
CACTTGTTCGCTGGGATGGAGACAGTGTTAAGGGTCGTCTTGAGGATCACCAGGCTCATG
TTCCTAACTTGATTCGCCCACTTCTTGCACCATCCACTTAATTCGATAAGGGACTATGGC
TGGATCGATGATCAAGTTTATGAATCGCTAGTTTTCTGTTGATTTCCAATAAACCCTTGA
AAATAAAA*TGGAGCACCGAAAGTTTGTGTGTTCTGGTTTTTTATGATTTGGTATTTGTT
TCTTGCTCAATGTATCGTTGCATACTCTTGCTTCTCGACTTAATAATAATGCACACTATT
TGGGTGTT**GCTTACAATT

QA 4 683 4 683
DS 

RD RR2E996JQ 636 0 0
GG
AAAACAGAAATGACTCTCAAGAAGTTGGACGCAGATCCCTCAACCTTGGAGACGGTGTTG
GAAGAATTGAAATCTGACGAATCAAACCGTAACAAGATCAATTTCATCCTCTTCCTCGCC
AACAATGAACCCAACACCAACCGCAGCTG*GTGTCCTGATTGCGTTAGGGCTGAGCCTGT
GATTTACAAGACTCTAGAGGAATCACCGGAGGAAGTGAATCTTATTCGTGCTTACGCCGG
AGATAGACCGACGTGGAGGAATCCGATGCACCCGTGGAGAGTCGATCCTCGATTCAAGGT
CACCGGAGTGCCAACACTTGTTCGCTGGGATGGAGACAGTGTTAAGGGTCGTCTTGAGGA
TCACCAGGCTCATGTTCCTAACTTGATTCGCCCACTTCTTGCACCATCCACTTAATTCGA
TAAGGGACTATGGCTGGATCGATGATCAAGTTTATGAATCGCTAGTTTTCTGTTGATTTC
CAATAAACCCTTGAAAATAAAA*TGGAGCACCGAAAGTTTGTGTGTTCTGGTTTTTTATG
ATTTGGTATTTGTTTCTTGCTCAATGTATCGTTGCATACTCTTGCTTCTCGACTTAATAA
TAATGCACACTATTTGGGTGTT**GCTTACAATT

QA 3 636 3 636
DS 

RD RR2G515JQ 231 0 0
CCATCCACTTAATTCGATAAGGGACTATGGCTGGATCGATGATCAAGTTTATGAATCGCT
AGTTTTTTGTTGATTTCCAATAAACCCTTGAAAATAAAA*TGGAGCACCGAAAGTTTGTG
TGTTTTGGTTTTTTATGATTTGGTATTTGTTTCTTGCTCAATGTATCGTTGCATACTCTT
GCTTCTCGACTTAATAATAATGCACACTATTTGGGTGTT**GCTTACAATT

QA 1 231 1 231
DS 

RD RR2GM69TF 486 0 0
G
G*GTGTCCTGATTGCGTTAGGGCTGAGCCTGTGATTTACAAGACTCTAGAGGAATCAGCG
GAGGAAGTGAATCTTATTCGGGCTTACGCCGGAGATAGACCGACGTGGAGGAATCCGATG
CACCCGTGGAGAGTCGATCCTCGATTCAAGGTCACCGGAGTGCCAACACTTGTTCGCTGG
GATGGAGACAGTGTTAAGGGTCGTCTTGAGGATCACCAGGCTCATGTTCCTAACTTGATT
CGCCCACTTCTTGCACCATCCACTTAATTCGATAAGGGACTATGGCTGGATCGATGATCA
AGTTTATGAATCGCTAGTTTTCTGTTGATTTCCAATAAACCCTTGAAAATAAAA*TGGAG
CACCGAAAGTTTGTGTGTTCTGGTTTTTTATGATTTGGTATTTGTTTCTTGCTCAATGTA
TCGTTGCATACTCTTGCTTCTCGACTTAATAATAATGCACACTATTTGGGTGTT**GCTT
ACAAT

QA 2 486 2 486
DS 

RD RR2E996TF 637 0 0
GG
AAAACAGAAATGACTCTCAAGAAGTTGGACGCAGATCCCTCAACCTTGGAGACGGTGTTG
GAAGAATTGAAATCTGACGAATCAAACCGTAACAAGATCAATTTCATCCTCTTCCTCGCC
AACAATGAACCCAACACCAACCGCAGCTG*GTGTCCTGATTGCGTTAGGGCTGAGCCTGT
GATTTACAAGACTCTAGAGGAATCACCGGAGGAAGTGAATCTTATTCGTGCTTACGCCGG
AGATAGACCGACGTGGAGGAATCCGATGCACCCGTGGAGAGTCGATCCTCGATTCAAGGT
CACCGGAGTGCCAACACTTGTTCGCTGGGATGGAGACAGTGTTAAGGGTCGTCTTGAGGA
TCACCAGGCTCATGTTCCTAACTTGATTCGCCCACTTCTTGCACCATCCACTTAATTCGA
TAAGGGACTATGGCTGGATCGATGATCAAGTTTATGAATCGCTAGTTTTCTGTTGATTTC
CAATAAACCCTTGAAAATAAAA*TGGAGCACCGAAAGTTTGTGTGTTCTGGTTTTTTATG
ATTTGGTATTTGTTTCTTGCTCAATGTATCGTTGCATACTCTTGCTTCTCGACTTAATAA
TAATGCACACTATTTGGGTGTT**GCTTACAATT
A

QA 3 636 3 636
DS 

RD RR2GQ58TF 574 0 0
G
AATCTGACGAATCAAACCGTAACAAGATCAATTTCATCCTCTTCCTCGCCAACAATGAAC
CCACCACCAACCGCAGCTGAGTGTCCTGATTGCGTTAGGGCTGAGCCTGTGATTTACAAG
ACTCTAGAGGAATCACCGGAGGAAGTGAATCTTATTCGGGCTTACGCCGGAGATAGGCCG
ACGTGGAGGAATCCGATGCACCCGTGGAGAGTCGATCCTCGATTCAAGGTCACCGGAGTG
CCAACACTTGTTCGTTGGGATGGAGACAGTGTTAAAGGTCGTCTTGAGGATCACCAGGCT
CATGTTCCTAACTTGATTCGCCCACTTCTTGCACCATCCACTTAATTCGATAAGGGACTA
TGGCTGGATCGATGATCAAGTTTATGAATCGCTAGTTTTCTGTTGCTTTCCAATAAACCC
TTGAAAATAAAAATGGAGCACCGAAAGTTTGTGTGTTTTGGTTTTGTATGATTTGGTATT
TGTTTCTTGCCCAATGTGTCGTTGCATACTCTTGCTTCTCGACTTAATAATAATGCACAC
TATTTGGGTGTGTCGCTTACAATTAAAAAAAAA

QA 2 574 2 574
DS 



AS 1 12

CO CL439Contig1 644 12 6 U
GGAGCTTCGTTGCGCAAATCGGTGAAAGAGAGAGAGAGATCGCAAAGAGAGATAGTGAGA
GAAGATGTCTTCGTTTCTAAAATCCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTAT
GCACATGAAAGCCGTCTCCACTCGCCTCCGTAGATACGGTCTGAGGTACGACGATACGTA
CGATCAGTATTACCACATGGACATCAAAGAGGCCCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGT
CGACGCTCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTACCT
TTCCGAGGAACTTCAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGC
TCTCGTTGAGAGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCG
CACTCTTCCTTAAGCATATTTTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCT
CTGCATAAAACTCATCTCCAAATGGATGACATTGATATTTTCGAAATCATATTCTATACC
GAGCTTTTTGCTTTCCTATAATGCAGAAGTCTTGTAATAGTACTCGTCTGTTGTTACATT
TTTATGTTTGCTGGTTTGAATAAAATCGAAACTCTTCTCTGAAA


BQ
30 30 35 35 35 35 5 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 55 70 40 70 70 70 70 70 70 55 40 10 10 10 

AF RR2BC95JQ C 1
AF RR2BC95TF U 1
AF RR2D063JQ C 1
AF RR2DC31JQ C 71
AF RR2F885TF U 54
AF RR2F665JQ C 7
AF RR2GQ59TF U 20
AF RR2GB10JQ C 7
AF RR2GB10TF U 7
AF RR2DC31TF U 1
AF RR2D063TF U 1
AF RR2F665TF U 7
BS 1 54 RR2BC95TF
BS 55 55 RR2GQ59TF
BS 56 639 RR2BC95TF
BS 640 640 RR2GQ59TF
BS 641 641 RR2DC31TF
BS 642 644 RR2F665TF

RD RR2BC95JQ 639 0 0
GGAGCTTCGTTGCGCAAATCGGTGAAAGAGAGAGAGAGATCGCAAAGAGAGATATTGAGA
GAAGATGTCTTCGTTTCTAAAATCCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTAT
GCACATGAAAGCCGTCTCCACTCGCCTCCGTAGATACGGTCTGAGGTACGACGATACGTA
CGATCAGTATTACCACATGGACATCAAAGAGGCCCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGT
CGACGCTCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTACCT
TTCCGAGGAACTTCAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGC
TCTCGTTGAGAGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCG
CACTCTTCCTTAAGCATATTTTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCT
CTGCATAAAACTCATCTCCAAATGGATGACATTGATATTTTCGAAATCATATTCTATACC
GAGCTTTTTGCTTTCCTATAATGCAGAAGTCTTGTAATAGTACTCGTCTGTTGTTACATT
TTTATGTTTGCTGGTTTGAATAAAATCGAAACTCTTCTC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2BC95TF 639 0 0
GGAGCTTCGTTGCGCAAATCGGTGAAAGAGAGAGAGAGATCGCAAAGAGAGATATTGAGA
GAAGATGTCTTCGTTTCTAAAATCCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTAT
GCACATGAAAGCCGTCTCCACTCGCCTCCGTAGATACGGTCTGAGGTACGACGATACGTA
CGATCAGTATTACCACATGGACATCAAAGAGGCCCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGT
CGACGCTCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTACCT
TTCCGAGGAACTTCAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGC
TCTCGTTGAGAGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCG
CACTCTTCCTTAAGCATATTTTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCT
CTGCATAAAACTCATCTCCAAATGGATGACATTGATATTTTCGAAATCATATTCTATACC
GAGCTTTTTGCTTTCCTATAATGCAGAAGTCTTGTAATAGTACTCGTCTGTTGTTACATT
TTTATGTTTGCTGGTTTGAATAAAATCGAAACTCTTCTC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2D063JQ 642 0 0
GGAGCTTCGTTGCGCAAATCGGTGAAAGAGAGAGAGAGATCGCAAAGAGAGATAGTGAGA
GAAGATGTCTTCGTTTCTAAAATCCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTAT
GCACATGAAAGCCGTCTCCACTCGCCTCCGTAGATACGGTCTGAGGTACGACGATACGTG
CGATCAGTATTACCACATGGACATCAAAGAGGCCCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGT
CGACGCTCGTAACCAGCGTTTCAGGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTACCT
TTCCGAGGAACTTCAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGC
TCTCGTTGAGAGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCG
CACTCTTCCTTAAGCATATTTTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCT
CTGCATAAAACTCATCTCCAAATGGATGACATTGATATTTTCGAAATCATATTCTATACC
GAGCTTTTTGCTTTCCTATAATGCAGAAGTCTTGTAATAGTACTCGTCTGTTGTTACATT
TTTATGTTTGCTGGTTTGAATAAAATCGAAACTCTTCTCTG
G

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2DC31JQ 572 0 0
TCGTTTCTAAAATCCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTATGCACATGAAA
GCCGTCTCCACTCGCCTCCGTAGATACGGTCTGAGGTACGACGATACGTACGATCAGTAT
TACCACATGGACATCAAAGAGGCCCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGTCGACGCTCGT
AACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTTCCGAGGAA
CTTCAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAG
AGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCGCACTCTTCCT
TAAGCATATTTTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCTCTGCATAAAA
CTCATCTCCAAATGGATGACATTGATATTTTCGAAATCATATTCTATACCGAGCTTTTTG
CTTTCCTATAATGCAGAAGTCTTGTAATAGTACTCGTCTGTTGTTACATTTTTATGTTTG
CTGGTTTGAATAAAATCGAAACTCTTCTCTG
C

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2F885TF 593 0 0
GGG
GAGAGAAGATGTCTTCGTTTCTAAAATCCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTC
GTATGCACATGAAAGCCGTCTCCACTCGCCTCCGTAGATACGGTCTGAGGTACGACGATA
CGTACGATCAGTATTACCACATGGACATCAAAGAGGCCCTGAACAGATTGCCCAGGGAGG
TCGTCGACGCTCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGT
ACCTTTCCGAGGAACTTCAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGC
TGGCTCTCGTTGAGAGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACC
AGCGCACTCTTCCTTAAGCATATTTTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTC
TTCTCTGTATAAAACTCATCTCCAAATGGATGACATTGATATTTTCGAAATCATATTCTA
TACCGAGCTTTTTGCTTTCCTATAATGCAGAAGTCTTGTAATAGTACTCGTCTGTTGTTA
CATTTTTATGTTTGCTGGTTTGAATAAAATCGAAACTCTTCTC
CGAAAAA

QA 4 586 4 586
DS 

RD RR2F665JQ 635 0 0
GGGTTGCGCAAATCGGTGAAAGAGAGAGAGAGATCGCAAAGAGAGATAGTGAGAGAAGAT
GTCTTCGTTTCTAAAATCCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTATGCACAT
GAAAGCCGTCTCCACTCGCCTCCGTAGATACGGTCTGAGGTACGACGATACGTACGATCA
GTATTACCACATGGACATCAAAGAGGCCCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGTCGACGC
TCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTCCCGA
GGAACTTCAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGCTCTCGT
TGAGAGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCGCACTCT
TCCTTAAGCATATTTTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCTCTGCAT
AAAACTCATCTCCAAATGGATGACATTGATATTTTCGAAATCATATTCTATACCGAGCTT
TTTGCTTTCCTATAATGCAGAAGTCTTGTAATAGTACTCGTCTGTTGTTACATTTTTATG
TTTGCTGGTTTGAATAAAATCGAAACTCTTCTCTG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2GQ59TF 621 0 0
G
GGTGAAAGAGAGAGAGAGATCGCAAAGAGAGATAGTGAGAGAAGATGTCTTCGTTTCTAA
AATCCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTATGCACATGAAAGCCGTCTCCA
CTCGCCTCCGTAGATACGGTCTGAGGTACGACGATACGTACGATCAGTATTACCACATGG
ACATCAAAGAGGCCCTGAACAAATTGCCCAGGGAGGTCGTCGACGCTCGTAACCAGCGTC
TCAAGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTTCCGAGGAACTTCAGGCGT
TGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAGAGGGAAAGAA
AGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCGCACTCTTCCTTAAGCATATT
TTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCTCTGCATAAAACTCATCTCCA
AATGGATGACATTGATATTTTCGAAATCATATTCTATACCGAGCTTTTTGCTTTCCTATA
ATGCAGAAGTCTTGTAATAGTACTCGTCTGTTGTTACATTTTTATGTTTGCTGGTTTGAA
TAAA*TCGAAACTCTTCTCT

QA 2 621 2 621
DS 

RD RR2GB10JQ 635 0 0
GGGTTGCGCAAATCGGTGAAAGAGAGAGAGAGATCGCAAAGAGAGATAGTGAGAGAAGAT
GTCTTCGTTTCTAAAATCCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTATGCACAT
GAAAGCCGTCTCCACTCGCCTCCGTAGATACGGTCTGAGGTACGACGATACGTACGATCA
GTATTACCACATGGACATCAAAGAGGCCCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGTCGACGC
TCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTTCCGA
GGAACTTCAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGCTCTCGT
TGGGAGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCGCACTCT
TCCTTAAGCATATTTTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCTCTGCAT
AAAACTCATCTCCAAATGGATGACATTGATATTTTCGAAATCATATTCTATACCGAGCTT
TTTGCTTTCCTATAATGCAGAAGTCTTGTAATAGTACTCGTCTGTTGTTACATTTTTATG
TTTGCTGGTTTGAATAAAATCGAAACCCTTCTCT
C

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2GB10TF 635 0 0
GGGTTGCGCAAATCGGTGAAAGAGAGAGAGAGATCGCAAAGAGAGATAGTGAGAGAAGAT
GTCTTCGTTTCTAAAATCCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTATGCACAT
GAAAGCCGTCTCCACTCGCCTCCGTAGATACGGTCTGAGGTACGACGATACGTACGATCA
GTATTACCACATGGACATCAAAGAGGCCCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGTCGACGC
TCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTTCCGA
GGAACTTCAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGCTCTCGT
TGGGAGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCGCACTCT
TCCTTAAGCATATTTTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCTCTGCAT
AAAACTCATCTCCAAATGGATGACATTGATATTTTCGAAATCATATTCTATACCGAGCTT
TTTGCTTTCCTATAATGCAGAAGTCTTGTAATAGTACTCGTCTGTTGTTACATTTTTATG
TTTGCTGGTTTGAATAAAATCGAAACCCTTCTCT
C

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2DC31TF 642 0 0
GGAGCTTCGTTGCGCAAATCGGTGAAAGAGAGAGAGAGATCGCAAAGAGAGATAGTGAGA
GAAGATGTCTTCGTTTCTAAAATCCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTAT
GCACATGAAAGCCGTCTCCACTCGCCTCCGTAGATACGGTCTGAGGTACGACGATACGTA
CGATCAGTATTACCACATGGACATCAAAGAGGCCCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGT
CGACGCTCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTACCT
TTCCGAGGAACTTCAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGC
TCTCGTTGAGAGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCG
CACTCTTCCTTAAGCATATTTTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCT
CTGCATAAAACTCATCTCCAAATGGATGACATTGATATTTTCGAAATCATATTCTATACC
GAGCTTTTTGCTTTCCTATAATGCAGAAGTCTTGTAATAGTACTCGTCTGTTGTTACATT
TTTATGTTTGCTGGTTTGAATAAAATCGAA*CTCTTCTCTG
C

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2D063TF 642 0 0
GA
AGCTTCGTTGCGCAAATCGGTGAAAGAGAGAGAGAGATCGCAAAGAGAGATAGTGAGAGA
AGATGTCTTCGTTTCTAAAATCCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTATGC
ACATGAAAGCCGTCTCCACTCGCCTCCGTAGATACGGTCTGAGGTACGACGATACGTGCG
ATCAGTATTACCACATGGACATCAAAGAGGCCCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGTCG
ACGCTCGTAACCAGCGTCTCAGGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTT
CCGAGGAACTTCAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGCTC
TCGTTGAGAGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCGCA
CTCTTCCTTAAGCATATTTTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCTCT
GCATAAAACTCATCTCCAAATGGATGACATTGATATTTTCGAAATCATATTCTATACCGA
GCTTTTTGCTTTCCTATAATGCAGAAGTCTTGTAATAGTACTCGTCTGTTGTTACATTTT
TATGTTTGCTGGTTTGAATAAAATCGAAACTCTTCTCTG
G

QA 3 641 3 641
DS 

RD RR2F665TF 638 0 0
GGGTTGCGCAAATCGGTGAAAGAGAGAGAGAGATCGCAAAGAGAGATAGTGAGAGAAGAT
GTCTTCGTTTCTAAAATCCTTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTATGCACAT
GAAAGCCGTCTCCACTCGCCTCCGTAGATACGGTCTGAGGTACGACGATACGTACGATCA
GTATTACCACATGGACATCAAAGAGGCCCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGTCGACGC
TCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTCCCGA
GGAACTTCAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGCTCTCGT
TGAGAGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCGCACTCT
TCCTTAAGCATATTTTCCCACCCTTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCTCTGCAT
AAAACTCATCTCCAAATGGATGACATTGATATTTTCGAAATCATATTCTATACCGAGCTT
TTTGCTTTCCTATAATGCAGAAGTCTTGTAATAGTACTCGTCTGTTGTTACATTTTTATG
TTTGCTGGTTTGAATAAAATCGAAACTCTTCTCTGAAA

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 10

CO CL440Contig1 764 10 6 U
ATAAAATTAATGGGTTTATCCATTTTTTGTTTGAGGTGAATTCAAAATTGTTCGAATAGT
GTAATCGTCAATTACTGACATTGGTAAACGACCCAAAGCGATTTGATTATAATTCAACTC
GTGACGATCATAAGTTGAAAATTCATATTCTTCAGTCATTGACAAACAATTTGTTGGACA
ATACTCAACACAATTACCACAAAATATACAAATTCCAAAATCAATACTGTAATTAAGCAA
TCGTTTTTTTCGAATATTGGTTTCCAATTTCCAATCAACAACCGGCAGATCTATAGGACA
TACTCGAACACATACTTCACAAGCAATGCATTTATCAAATTCGAAATGGATTCGACCGCG
GAAACGTTCTGATGTTATTAATTTTTCATAGGGGTATTGAATAGTTACAGGTAAACGATT
TGTGTGGGATAAGGTAATCATGAAACCCTGACCAATATACCTTGCAGCTCGTAGGGTTTG
TTGACCATAATTCATGAACCCGGTTATCATAGGAAGCATATTGTAATTATCTATGAATAA
TTTGATCTTTGTTTCTTTCTCTTGTTTAAAACAAGTAATGAATATCTTGGATTGATTTTC
AATTTAGAGTGAAAAGAGTTGGAAAGAAGTTGTTAATAATAGATTACCAAGGGAAATCGG
TAAAAGAAATTTCCATCCAAGATTTAATAGTTGATCCATTCTTAGCCTAGGTAAAGTCCA
TCTGGTTGCGATAGAAATGAACAAGAACAAATAAGTTTTAGCTC


BQ
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU21JQ U 1
AF RR2BU21TF C 1
AF RR2EX06JQ U 53
AF RR2BS05JQ U 1
AF RR2BS05TF C 1
AF RR2DY21JQ U 1
AF RR2EX17JQ U 1
AF RR2F322JQ U 1
AF RR2F322TF C 25
AF RR2EX06TF C 24
BS 1 500 RR2BS05JQ
BS 501 522 RR2DY21JQ
BS 523 523 RR2EX17JQ
BS 524 567 RR2DY21JQ
BS 568 729 RR2F322JQ
BS 730 764 RR2EX06TF

RD RR2BU21JQ 403 0 0
ATAAAATTAATGGGTTTATCCATTTTTTGTTTGAGGTGAATTCAAAATTGTTCGAATAGT
GTAATCGTAAATTACTGACATTGGTAAACGACCCAAAGCGATTTGATTATAATTCAACTC
GTGACGATCATAAGTTGAAAATTCATATTCTTCAGTCATTGACAAACAATTTGTTGGACA
ATACTCAACACAATTACCACAAAATATACAAATTCCAAAATCAATACTGTAATTAAGCAA
TCGTTTTTTTCGAATATTGGTTTCCAATTTCCAATCAACAACCGGCAGATCTATAGGACA
TACTCGAACACATACTTCACAAGCAATGCATTTATCAAATTCGAAATGGATTCGACCGCG
GAAACGTTCTGATGTTATTAATTTTTCATAGGGGTATTGAAT
C

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR2BU21TF 403 0 0
ATAAAATTAATGGGTTTATCCATTTTTTGTTTGAGGTGAATTCAAAATTGTTCGAATAGT
GTAATCGTAAATTACTGACATTGGTAAACGACCCAAAGCGATTTGATTATAATTCAACTC
GTGACGATCATAAGTTGAAAATTCATATTCTTCAGTCATTGACAAACAATTTGTTGGACA
ATACTCAACACAATTACCACAAAATATACAAATTCCAAAATCAATACTGTAATTAAGCAA
TCGTTTTTTTCGAATATTGGTTTCCAATTTCCAATCAACAACCGGCAGATCTATAGGACA
TACTCGAACACATACTTCACAAGCAATGCATTTATCAAATTCGAAATGGATTCGACCGCG
GAAACGTTCTGATGTTATTAATTTTTCATAGGGGTATTGAAT
C

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR2EX06JQ 381 0 0
CGAATAGTGTAATCGTCAATTACTGACATTGGTAAACGACCCAAAGCGATTTGATTATAA
TTCAACTCGTGACGATCATAAGTTGAAAATTCATATTCTTCAGTCATTGACAAACAATTT
GTTGGACAATACTCAACACAATTACCACAAAATATACAAATTCCAAAATCAATACTGTAA
TTAAGCAATCGTTTTTTTCGAATATTGGTTTCCAATTTCCAATCAACAACCGGCAGATCT
ATAGGACATACTCGAACACATACTTCACAAGCAATGCATTTATCAAATTCGAAATGGATT
CGACCGCGGAAACGTTCTGATGTTATTAATTTTTCATAGGGGTATTGAATAGTTACAGGT
AAACGATTTGTGTGGGATAAG

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR2BS05JQ 500 0 0
ATAAAATTAATGGGTTTATCCATTTTTTGTTTGAGGTGAATTCAAAATTGTTCGAATAGT
GTAATCGTCAATTACTGACATTGGTAAACGACCCAAAGCGATTTGATTATAATTCAACTC
GTGACGATCATAAGTTGAAAATTCATATTCTTCAGTCATTGACAAACAATTTGTTGGACA
ATACTCAACACAATTACCACAAAATATACAAATTCCAAAATCAATACTGTAATTAAGCAA
TCGTTTTTTTCGAATATTGGTTTCCAATTTCCAATCAACAACCGGCAGATCTATAGGACA
TACTCGAACACATACTTCACAAGCAATGCATTTATCAAATTCGAAATGGATTCGACCGCG
GAAACGTTCTGATGTTATTAATTTTTCATAGGGGTATTGAATAGTTACAGGTAAACGATT
TGTGTGGGATAAGGTAATCATGAAACCCTGACCAATATACCTTGCAGCTCGTAGGGTTTG
TTGACCATAATTCATGAACC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2BS05TF 500 0 0
ATAAAATTAATGGGTTTATCCATTTTTTGTTTGAGGTGAATTCAAAATTGTTCGAATAGT
GTAATCGTCAATTACTGACATTGGTAAACGACCCAAAGCGATTTGATTATAATTCAACTC
GTGACGATCATAAGTTGAAAATTCATATTCTTCAGTCATTGACAAACAATTTGTTGGACA
ATACTCAACACAATTACCACAAAATATACAAATTCCAAAATCAATACTGTAATTAAGCAA
TCGTTTTTTTCGAATATTGGTTTCCAATTTCCAATCAACAACCGGCAGATCTATAGGACA
TACTCGAACACATACTTCACAAGCAATGCATTTATCAAATTCGAAATGGATTCGACCGCG
GAAACGTTCTGATGTTATTAATTTTTCATAGGGGTATTGAATAGTTACAGGTAAACGATT
TGTGTGGGATAAGGTAATCATGAAACCCTGACCAATATACCTTGCAGCTCGTAGGGTTTG
TTGACCATAATTCATGAACC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2DY21JQ 567 0 0
ATAAAATTAATGGGTTTATCCATTTTTTGTTTGAGGTGAATTCAAAATTGTTCGAATAGT
GTAATCGTCAATTACTGACATTGGTAAACGACCCAAAGCGATTTGATTATAATTCAACTC
GTGACGATCATAAGTTGAAAATTCATATTCTTCAGTCATTGACAAACAATTTGTTGGACA
ATACTCAACACAATTACCACAAAATATACAAATTCCAAAATCAATACTGTAATTAAGCAA
TCGTTTTTTTCGAATATTGGTTTCCAATTTCCAATCAACAACCGGCAGATCTATAGGACA
TACTCGAACACATACTTCACAAGCAATGCATTTATCAAATTCGAAATGGATTCGACCGCG
GAAACGTTCTGATGTTATTAATTTTTCATAGGGGTATTGAATAGTTACAGGTAAACGATT
TGTGTGGGATAAGGTAATCATGAGACCCTGACCAATATACCTTGCAGCTCGTAGGGTTTG
TTGACCATAATTCATGAACCCGGTTATCATAGGAAGCATATTATAATTATCTATGAATAA
TTTGATCTTTGTTTCTTTCTCTTGTTT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2EX17JQ 554 0 0
ATAAAATTAATGGGTTTATCCATTTTTTGTTTGAGGTGAATTCAAAATTGTTCGAATAGT
GTAATCGTCAATTACTGACATTGGTAAACGACCCAAAGCGATTTGATTATAATTCAACTC
GCGACGATCATAAGTTGAAAATTCATATTCTTCAGTCATTGACAAACAATTTGTTGGACA
ATACTCAACACAATTACCACAAAATATACAAATTCCAAAATCAATACTGTAATTAAGCAA
TCGTTTTTT*CGAATATTGGTTTCCAATTTCCAATCAACAACCGGCAGATCTATAGGACA
TACTCGAACACATACTTCACAAGCAATGCACTTATCAAATTCGAAATGGATTCGACCGCG
GAAACGTTCTGATGTTATTAATTTTTCATAGGGGTATTGAATAGTTACAGGTAAACGATT
TGTGTGGGATAAGGTAATCATGAAACCCTGACCAATATACCCTGCAGCTCGTAGGGTTTG
TTGACCATAATTCATGAACCCGGTTATCATAGGAAGCATATTGTAATTATCTATGAATAA
TTTGATCTTTGTTT

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2F322JQ 730 0 0
ATAAAATTAATGGGTTTATCCATTTTTTGTTTGAGGTGAATTCAAGATTGTTCGAATAGT
GTAATCGTCAATTACTGACATTGGTAAACGACCCAAAGCGATTTGATTATAATTCAACTC
GTGACGATCATAAGTTGAAAATTCATATTCTTCAGTCATTGACAAACAATTTGTTGGACA
ATACTCAACACAATTACCACAAAATATACAAATTCCAAAATCAATACTGTAATTAAGCAA
TCGTTTTTTTCGAATATTGGTTTCCAATTTCCAATCAACAACCGGCAGATCTATAGGACA
TACTCGAACACATACTTCACAAGCAATGCATTTATCAAATTCGAAATGGATTCGACCGCG
GAAACGTTCTGATGTTATTAATTTTTCATAGGGGTATTGAATAGTTACAGGTAAACGATT
TGTGTGGGATAAGGTAATCATGAAACCCTGACCAATATACCTTGCAGCTCGTAGGGTTTG
TTGACCATAATTCATGAACCCGGTTATCATAGGAAGCATATTGTAATTATCTATGAATAA
TTTGATCTTTGTTTCTTTCTCTTGTTTAAAACAAGTAATGAATATCTTGGATTGATTTTC
AATTTAGAGTGAAAAGAGTTGGAAAGAAGTTGTTAATAATAGATTACCAAGGGAAATCGG
TAAAAGAAATTTCCATCCAAGATTTAATAGTTGATCCATTCTTAGCCTAGGTAAAGTCCA
TCTGGTTGC
C

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2F322TF 706 0 0
TTTTTG
TTGAGGTGAATTCAAGATTGTTCGAATAGTGTAATCGTCAATTACTGACATTGGTAAACG
ACCCAAAGCGATTTGATTATAATTCAACTCGTGACGATCATAAGTTGAAAATTCATATTC
TTCAGTCATTGACAAACAATTTGTTGGACAATACTCAACACAATTACCACAAAATATACA
AATTCCAAAATCAATACTGTAATTAAGCAATCGTTTTTTTCGAATATTGGTTTCCAATTT
CCAATCAACAACCGGCAGATCTATAGGACATACTCGAACACATACTTCACAAGCAATGCA
TTTATCAAATTCGAAATGGATTCGACCGCGGAAACGTTCTGATGTTATTAATTTTTCATA
GGGGTATTGAATAGTTACAGGTAAACGATTTGTGTGGGATAAGGTAATCATGAAACCCTG
ACCAATATACCTTGCAGCTCGTAGGGTTTGTTGACCATAATTCATGAACCCGGTTATCAT
AGGAAGCATATTGTAATTATCTATGAATAATTTGATCTTTGTTTCTTTCTCTTGTTTAAA
ACAAGTAATGAATATCTTGGATTGATTTTCAATTTAGAGTGAAAAGAGTTGGAAAGAAGT
TGTTAATAATAGATTACCAAGGGAAATCGGTAAAAGAAATTTCCATCCAAGATTTAATAG
TTGATCCATTCTTAGCCTAGGTAAAGTCCATCTGGTTGC
C

QA 7 705 7 705
DS 

RD RR2EX06TF 741 0 0
TTTTTGTTTGAGGTGAATTCAAAATTGTTCGAATAGTGTAATCGTCAATTACTGACATTG
GTAAACGACCCAAAGCGATTTGATTATAATTCAACTCGTGACGATCATAAGTTGAAAATT
CATATTCTTCAGTCATTGACAAACAATTTGTTGGACAATACTCAACACAATTACCACAAA
ATATACAAATTCCAAAATCAATACTGTAATTAAGCAATCGTTTTTTTCGAATATTGGTTT
CCAATTTCCAATCAACAACCGGCAGATCTATAGGACATACTCGAACACATACTTCACAAG
CAATGCATTTATCAAATTCGAAATGGATTCGACCGCGGAAACGTTCTGATGTTATTAATT
TTTCATAGGGGTATTGAATAGTTACAGGTAAACGATTTGTGTGGGATAAGGTAATCATGA
AACCCTGACCAACATACCTTGCAGCTCGTAGGGTTTGTTGACTATAATTCATGAACCCGG
TTATCATAGGAAGCATATTGTAATTATCTATGAATAATTTGATCTTTGTTTCTTTCTCTT
GTTTAAAACAAGTAATGAATATCTTGGATTGATTTTCAATTTAGAGTGAAAAGAGTTGGA
AAGAAGTTGTTAATAATAGATTACCAAGGGAAATCGGTAAAAGAAATTTCCATCCAAGAT
TTAATAGTTGATCCATTCTTAGCCTAGGTAAAGTCCATCTGGTTGCGATAGAAATGAACA
AGAACAAATAAGTTTTAGCTC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 12

CO CL441Contig1 685 12 13 U
GGAAAAAGAGGAATCCGATGCGTCAGTACAAATGCGCGGCGAAAGCAATCTTGGAAATTT
CAGTTATTTTGTTTATATAAATCTCTCAGCCATCACTGTTCCGAAGGCATTAACTCTCGG
AGAATCATAAAAAGCCCTTAAGGATGTCTGCAACACAGGAAGAAGACAAGAAGCCCGGTG
GTGGTGACGGAGGAGCTCACATCAATCTTAAGGTCAAGGGACAGGACGGGAATGAGGTGT
TCTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGAATGCTTACTGTGACAGGC
AATCTGTGGACATGAACGCCATTGCCTTCTTGTTTGATGGGCGTCGTCTGCGTGCTGAGC
AGACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGACGGTGATGAGATCGATGCCATGCTCCATCAGA
CTGGTGGCTGTGGTGGTGGAGGTGGCCTGACATTTATCCGGGTTTAGGGTTTCATGATGT
GTGATAGGAATGGTTAAGGAGTAATCGGCATTAGGAATTGCAGACTTGTTTTTCTTTTTT
TTTCTTAAATCGTGACCATTGGCGTTAAAAAA*CTAATATGGTCATGAAGGCTTAAAAAA
ACCTTTT*GTTAATTGTTGGTCTTGTTCCTTTGGTATTGGATCCTACTATTTTATGATAA
TGTTTGCTCTTAAAAATTGTTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 70 10 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 
70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 5 60 40 40 40 35 35 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS95JQ C 458
AF RR2GB08TF U 1
AF RR2AL25TF U 32
AF RR2G940JQ C 89
AF RR2G940TF U 34
AF RR2F477JQ C 32
AF RR2EM95JQ C 34
AF RR2EM95TF U 34
AF RR2F477TF U 32
AF RR2AR87JQ C 48
AF RR2AR87TF U 48
AF RR2DS95TF U 107
BS 1 45 RR2GB08TF
BS 46 46 RR2AL25TF
BS 47 100 RR2GB08TF
BS 101 101 RR2AL25TF
BS 102 457 RR2GB08TF
BS 458 458 RR2AL25TF
BS 459 542 RR2GB08TF
BS 543 543 RR2AL25TF
BS 544 668 RR2GB08TF
BS 669 672 RR2AL25TF
BS 673 674 RR2F477TF
BS 675 675 RR2AR87TF
BS 676 685 RR2DS95TF

RD RR2DS95JQ 185 0 0
CCGGGTTTAGGGTTTCATGATGTGTGATAGGAATGGTTAAGGAGTAATCGGCATTAGGAA
TTGCAGACTTGTTTTTCTTTTTTTTTCTTAAATCGTGACCATTGGCGTTAAAAAA*CTAA
TATGGTCATGAAGGCTTAAAAAAACCTTTT*GTTAAAGGTTGGTCTTGTTCCTTTGGTAT
TGGAT

QA 1 185 1 185
DS 

RD RR2GB08TF 668 0 0
GGAAAAAGAGGAATCCGATGCGTCAGTACAAATGCGCGGCGAAAGTAATCTTGGAAATTT
CAGTTATTTTGTTTATATAAATCTCTCAGCCATCACTGTTTCGAAGGCATTAACTCTCGG
AGAATCATAAAAAGCCCTTAAGGATGTCTGCAACACAGGAAGAAGACAAGAAGCCCGGTG
GTGGTGACGGAGGAGCTCACATCAATCTTAAGGTCAAGGGACAGGACGGGAATGAGGTGT
TCTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGAATGCTTACTGTGACAGGC
AATCTGTGGACATGAACGCCATTGCCTTCTTGTTTGATGGGCGTCGTCTGCGTGCTGAGC
AGACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGACGGTGATGAGATCGATGCCATGCTCCATCAGA
CTGGTGGCTGTGGTGGTGGAGGTGGCCTGACATTTATTCGGGTTTAGGGTTTCATGATGT
GTGATAGGAATGGTTAAGGAGTAATCGGCATTAGGAATTGCAGACTTGTTTTTCTTTTTT
TT*CTTAAATCGTGACCATTGGCGTTAAAAAA*CTAATATGGTCATGAAGGCTTAAAAAA
ACCTTTT*GTTAATTGTTGGTCTTGTTCCTTTGGTATTGGATCCTACTATTTTATGATAA
TGTTTGCT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2AL25TF 641 0 0
GG
GCGCGGCGAAAGCAATCTTGGAAATTTCAGTTATTTTGTTTATATAAATCTCTCAGCCAT
CACTGTTCCGAAGGCATTAACTCTCGGAGAATCATAAAAAGCCCTTAAGGATGCCTGCAA
CACAGGAAGAAGACAAGAAGCCCGGTGGTGGTGACGGAGGAGCTCACATCAATCTTAAGG
TCAAGGGACAGGACGGGAATGAGGTCTTCTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCTGAAGA
AGCTGATGAATGCTTACTGTGACAGGCAATCTGTGGACATGTACACCATTGCCTTCTTGT
TTGATGGGCGTCGTTTGCGTGCTGAGCAGACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGATGGTG
ATGAGATCGATGCCATGCTCCATCAGACTGGTGGCTGTGGTGGTGGAGATGGCCTGACAT
TTATCCTGATTTAGGGTTTCATGATGTGTGATAGGAATGGTTAAGGAGTAATCGGCATTA
GGAATTGCATACTTGTTTTTCTTTTTTTTTCTTAAATCGTGACCATTGGCGTTAAAAAA*
CTAATATGGTCATGAAGGCTTAAAAAAACCTTTTTGTTAATTGTTGGTCTTGTTCCTTTG
GTATTGGATCCTACTATGTTATGATAATGTTTGCGCTTA

QA 3 641 3 641
DS 

RD RR2G940JQ 583 0 0
GCCATCACTGTTCCGAAGGCATTAACTCTCGGAGAATCATAAAAAGCCCTTAAGGATGTC
TGCAACACAGGAAGAAGACAAGAAGCCCGGTGGTGGTGACGGAGGAGCTCACATCAATCT
TAAGGTCAAGGGACAGGACGGGAATGAGGTCTTCTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCT
GAGGAAGCTGATGAATGCTTACTGTGACAGGCAATCTGTGGACATGAACGCCATTGCCTT
CTTGTTTGATGGGCGTCGTTTGCGTGCTGAGCAGACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGA
TGGTGATGAGATCGATGCCATGCTCCATCAGACTGGTGGCTGTGGTGGTGGAGGTGGCCT
GACATTTATCCTGGTTTAGGGTTTCATGATGTGTGATAGGAATGGTTAAGGAGTAATCGG
CATTAGGAATTGCAGACTTGTTTTTCTTTTTTTTTCTTAAATCGTGACCATTGGCGTTAA
AAAAACTAATATGGTCATGAAGGCTTAAAAAAACCTTTTTGTTAATTGTTGGTCTTGTTC
CTTTGGTATTGGATCCTACTATGTTATGATAATGTTTGCGC
AT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2G940TF 636 0 0
GG
GCGGCGAAAGCAATCTTGGAAATTTCAGTTATTTTGTTTATATAAATCTCTCAGCCATCA
CTGTTCCGAAGGCATTAACTCTCGGAGAATCATAAAAAGCCCTTAAGGATGTCTGCAACA
CAGGAAGAAGACAAGAAGCCCGGTGGTGGTGACGGAGGAGCTCACATCAATCTTAAGGTC
AAGGGACAGGACGGGAATGAGGTCTTCTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCTGAGGAAG
CTGATGAATGCTTACTGTGACAGGCAATCTGTGGACATGAACGCCATTGCCTTCTTGTTT
GATGGGCGTCGTTTGCGTGCTGAGCAGACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGATGGTGAT
GAGATCGATGCCATGCTCCATCAGACTGGTGGCTGTGGTGGTGGAGGTGGCCTGACATTT
ATCCTGGTTTAGGGTTTCATGATGTGTGATAGGAATGGTTAAGGAGTAATCGGCATTAGG
AATTGCAGACTTGTTTTTCTTTTTTTTTCTTAAATCGTGACCATTGGCGTTAAAAAAACT
AATATGGTCATGAAGGCTTAAAAAAACCTTTTTGTTAATTGTTGGTCTTGTTCCTTTGGT
ATTGGATCCTACTATGTTATGATAATGTTTGCGC

QA 3 636 3 636
DS 

RD RR2F477JQ 653 0 0
GG
GCGCGGCGAAAGCAATCTTGGAAATTTCAGTTATTTTGTTTATATAAATCTCTCAGCCAT
CACTGTTTCGAAGGCATTAACTCTCGGAGAATCATAAAAAGCCCTTAAGGATGTCTGCAA
CACAGGAAGAAGACAAGAAGCCCGGTGGCGGTGACGGAGGAGCTCACATCAATCTTAAGG
TCAAGGGACAGGACGGGAATGAGGTGTTCTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCTGAAGA
AGCTGATGAATGCTTACTGTGACAGGCAATCTGTGGACATGAACGCCATTGCCTTCTTGT
TTGATGGGCGTCGTCTGCGTGCTGAGCAGACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGACGGTG
ATGAGATCGATGCCATGCTCCATCAGACTGGTGGCTGTGGTGGTGGAGGTGGCCTGACAT
TTATCCGGGTTTAGGGTTTCATGATGTGTGATAGGAATGGTTAAGGAGTAATCGGCATTA
GGAATTGCAGACTTGTTTTTCTTTTTTTTTCTTAAATCGTGACCATTGGCGTTAAAAAA*
CTAATATGGTCATGAAGGCTTAAAAAAACCTTTT*GTTAATTGTTGGTCTTGTTCCTTTG
GTATTGGATCCTACTATTTTATGATAATGTTTGCTCTTAAAA
ATTGTTATT

QA 3 644 3 644
DS 

RD RR2EM95JQ 637 0 0
GG
GCGGCGAAAGCAATCTTGGAAATTTCAGTTATTTTGTTTATATAAATCTCTCAGCCATCA
CTGTTTCGAAGGCATTAACTCTCGGAGAATCATAAAAAGCCCTTAAGGATGTCTGCAACA
CAGGAAGAAGACAAGAAGCCCGGTGGTGGTGACGGAGGAGCTCACATCAATCTTAAGGTC
AAGGGACAGGACGGGAATGAGGTGTTCTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCTGAAGAAG
CTGATGAATGCTTACTGTGACAGGCAATCTGTGGACATGAACGCCATTGCCTTCTTGTTT
GATGGGCGTCGTCTGCGTGCTGAGCAGACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGACGGTGAT
GAGATCGATGCCATGCTCCATCAGACTGGTGGCTGTGGTGGTGGGGGTGGCCTGACATTT
ATCCGGGTTTAGGGTTTCATGATGTGTGATAGGAATGGTTAAGGAGTAATCGGCATTAGG
AATTGCAGACTTGTTTTTCTTTTTTTTTCTTAAATCGTGACCATTGGCGTTAAAAAA*CT
AATATGGTCATGAAGGCTTAAAAAAACCTTTT*GTTAATTGTTGGTCTTGTTCCTTTGGT
ATTGGATCCTACTATTTTATGATAATGTTTGCTC
C

QA 3 636 3 636
DS 

RD RR2EM95TF 637 0 0
GG
GCGGCGAAAGCAATCTTGGAAATTTCAGTTATTTTGTTTATATAAATCTCTCAGCCATCA
CTGTTTCGAAGGCATTAACTCTCGGAGAATCATAAAAAGCCCTTAAGGATGTCTGCAACA
CAGGAAGAAGACAAGAAGCCCGGTGGTGGTGACGGAGGAGCTCACATCAATCTTAAGGTC
AAGGGACAGGACGGGAATGAGGTGTTCTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCTGAAGAAG
CTGATGAATGCTTACTGTGACAGGCAATCTGTGGACATGAACGCCATTGCCTTCTTGTTT
GATGGGCGTCGTCTGCGTGCTGAGCAGACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGACGGTGAT
GAGATCGATGCCATGCTCCATCAGACTGGTGGCTGTGGTGGTGGGGGTGGCCTGACATTT
ATCCGGGTTTAGGGTTTCATGATGTGTGATAGGAATGGTTAAGGAGTAATCGGCATTAGG
AATTGCAGACTTGTTTTTCTTTTTTTTTCTTAAATCGTGACCATTGGCGTTAAAAAA*CT
AATATGGTCATGAAGGCTTAAAAAAACCTTTT*GTTAATTGTTGGTCTTGTTCCTTTGGT
ATTGGATCCTACTATTTTATGATAATGTTTGCTC
C

QA 3 636 3 636
DS 

RD RR2F477TF 643 0 0
GG
GCGCGGCGAAAGCAATCTTGGAAATTTCAGTTATTTTGTTTATATAAATCTCTCAGCCAT
CACTGTTTCGAAGGCATTAACTCTCGGAGAATCATAAAAAGCCCTTAAGGATGTCTGCAA
CACAGGAAGAAGACAAGAAGCCCGGTGGCGGTGACGGAGGAGCTCACATCAATCTTAAGG
TCAAGGGACAGGACGGGAATGAGGTGTTCTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCTGAAGA
AGCTGATGAATGCTTACTGTGACAGGCAATCTGTGGACATGAACGCCATTGCCTTCTTGT
TTGATGGGCGTCGTCTGCGTGCTGAGCAGACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGACGGTG
ATGAGATCGATGCCATGCTCCATCAGACTGGTGGCTGTGGTGGTGGAGGTGGCCTGACAT
TTATCCGGGTTTAGGGTTTCATGATGTGTGATAGGAATGGTTAAGGAGTAATCGGCATTA
GGAATTGCAGACTTGTTTTTCTTTTTTTTTCTTAAATCGTGACCATTGGCGTTAAAAAA*
CTAATATGGTCATGAAGGCTTAAAAAAACCTTTT*GTTAATTGTTGGTCTTGTTCCTTTG
GTATTGGATCCTACTATTTTATGATAATGTTTGCTCTTAAA

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR2AR87JQ 641 0 0
ATCTTGGAAATTTCAGTTATTTTGTTTATATAAATCTCTCAGCCATCACTGTTCCGAAGG
CATTAACTCTCGGAGAATCATAAAAAGCCCTTAAGGATGTCTGCAACACAGGAAGAAGAC
AAGAAGCCCGGTGGTGGTGACGGAGGAGCTCACATCAATCTTAAGGTCAAGGGACAGGAC
GGGAATGAGGTCTTCTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGAATGCT
TACTGTGACAGGCAATCTGTGGACATGAACGCCATTGCCTTCTTGT**GATGGGCGTCGT
TTGCGTGCTGAGCAGACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGATGGTGATGAGATCGATGCC
ATGCTCCATCAGACTGGTGGCTGTGGTGGTGGAGGTGGCCTGACATTTATCCTGGTTTAG
GGTTTCATGATGTGTGGTAGGAATGGTTAAGGAGTAATCGGCATTAGGAATTGCAGACTT
GTTTTTCTTTTTTTTTCTTAAATCGTGACCATTGGCGTTAAAAAA*CTAATATGGTCATG
AAGGCTTAAAAAAACCTTTTTGTTAATTGTTGGTCTTGTTCCTTTGGTATTGGATCCTAC
TATGTTATGATAATGTTTGCGCTTAAAA
TTGTTATTTAACC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2AR87TF 641 0 0
ATCTTGGAAATTTCAGTTATTTTGTTTATATAAATCTCTCAGCCATCACTGTTCCGAAGG
CATTAACTCTCGGAGAATCATAAAAAGCCCTTAAGGATGTCTGCAACACAGGAAGAAGAC
AAGAAGCCCGGTGGTGGTGACGGAGGAGCTCACATCAATCTTAAGGTCAAGGGACAGGAC
GGGAATGAGGTCTTCTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGAATGCT
TACTGTGACAGGCAATCTGTGGACATGAACGCCATTGCCTTCTTGT**GATGGGCGTCGT
TTGCGTGCTGAGCAGACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGATGGTGATGAGATCGATGCC
ATGCTCCATCAGACTGGTGGCTGTGGTGGTGGAGGTGGCCTGACATTTATCCTGGTTTAG
GGTTTCATGATGTGTGGTAGGAATGGTTAAGGAGTAATCGGCATTAGGAATTGCAGACTT
GTTTTTCTTTTTTTTTCTTAAATCGTGACCATTGGCGTTAAAAAA*CTAATATGGTCATG
AAGGCTTAAAAAAACCTTTTTGTTAATTGTTGGTCTTGTTCCTTTGGTATTGGATCCTAC
TATGTTATGATAATGTTTGCGCTTAAAA
TTGTTATTTAACC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2DS95TF 579 0 0
GG
ATTAACTCTCGGAGAATCATAAAAAGCCCTTAAGGATGTCTGCAACACAGGAAGAAGACA
AGAAGCCCGGTGGTGGTGACGGAGGAGCTCACATCAATCTTAAGGTCAAGGGACAGGACG
GGAATGAGGTGTTCTTTAGGATCAAGAGAAGCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGAATGCTT
ACTGTGACAGGCAATCTGTGGACATGAACGCCATTGCCTTCTTGTTTGATGGGCGTCGTC
TGCGTGCTGAGCAGACTCCCGATGAGCTTGAAATGGAGGACGGTGATGAGATCGATGCCA
TGCTCCATCAGACTGGTGGCTGTGGTGGTGGAGGTGGCCTGACATTTATCCGGGTTTAGG
GTTTCATGATGTGTGATAGGAATGGTTAAGGAGTAATCGGCATTAGGAATTGCAGACTTG
TTTTTTTTTTTTTTTCTTAAATCGTGACCATTGGCGTTAAAAAA*CTAATATGGTCATGA
AGGCTTAAAAAAACCTTTT*GTTAATTGTTGGTCTTGTTCCTTTGGTATTGGATCCTACT
ATTTTATGATAATGTTTGCTCTTAAAAATTGTTATTT

QA 3 579 3 579
DS 



AS 1 11

CO CL442Contig1 804 11 21 U
GGAGAACCAATCGGTTCTTGGAAGGGTGGAGAGTAGAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCAA
TTCCACTTTCTTCCTCGTCCTCTCTCTCCAATGCCTATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCT
TCGATTTCCGCAATCCTCGTTCCATGTTTGAGATTCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGG
TTCGAAGAACATCTTTAAAGTGCAATTGCTGCAGCAAAGGGAATGGAGGTGAAAACGAAA
ACAGAAATGTGTTAGATGCTTTCTTTCTGGGAAAGGCACTAGCTGAGGTTATCAACGAGC
GAATTGAGTCCGCAGTTGGCGAAGTTTTGGGTAATATTGGAAGGTTTCAAGCTGAGCAAC
AGAAGCAAGTTCAAGAAATTCAGGGAGAGGTGCTAGAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGAAA
GAGCAGCTAGAGAAACCGTGGAGGCACAAGGACTCGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTG
CTGGTGTTGTTGCCTCTGTTGTAACCCCTACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAA
ATGATGAAAAGCTGCCGGGTTTCTCCGGATCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGA
GTTCTAGCGACGAAGACAGTGACTAAGGGATTGTTCCTTGGGCCAATTTCAAGGCTTGGT
TATAGTATCAGACTTGTTTGAAACGGTTGAGAACATCTTCGTTGATATATGTACTTATTA
CGATGGAAGTTGAGAATAAATAACCCTTGTTATTATTTGTGTAAAACAAAAAAAGTACTA
GGAATTAAAAAAACGAATTGGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 30 30 30 30 15 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 
60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK88TF U 27
AF RR2BJ16TF U 33
AF RR2BJ16JQ C 121
AF RR2EN68TF U 1
AF RR2BF96TF U 27
AF RR2GK88JQ C 28
AF RR2EN68JQ C 110
AF RR2GP41TF U 433
AF RR2AD82JQ C 84
AF RR2AD82TF U 33
AF RR2GG94JQB C 34
BS 1 27 RR2EN68TF
BS 28 28 RR2GK88TF
BS 29 32 RR2EN68TF
BS 33 33 RR2GK88TF
BS 34 58 RR2EN68TF
BS 59 60 RR2GK88TF
BS 61 142 RR2EN68TF
BS 143 143 RR2GK88TF
BS 144 198 RR2EN68TF
BS 199 199 RR2GK88TF
BS 200 223 RR2EN68TF
BS 224 224 RR2GK88TF
BS 225 235 RR2EN68TF
BS 236 236 RR2GK88TF
BS 237 417 RR2EN68TF
BS 418 419 RR2GK88TF
BS 420 654 RR2EN68TF
BS 655 655 RR2BF96TF
BS 656 738 RR2EN68TF
BS 739 752 RR2GP41TF
BS 753 804 RR2GG94JQB

RD RR2GK88TF 622 0 0
G
GGAGAGTAGAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCAATTCCACTTTCTTCCTCGTCCTCTCTCT
CCAATGCCTATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATTTCCGCAATCCTCGTTCCATGT
TTGAGATTCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGGTTCGAAGAACGTCTTTAAAGTGCAATT
GCTGCAGCAAAGGGAATGGAGGTGAAAACGAAAACAGAAATGTGTTAGATGCTTTCTTTC
TGGGAAAGGCACTAGCTGAGGTTATCAACGAGCGAATTGAGTCCGCAGTTGGCGAAGTTT
TGGGTAATATTGGAAGGTTTCAAGCTGAGCAACAGAAGCAAGTTCAAGAAATTCAGGGAG
AGGTGCTAGAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGAAAGAGCTGCTAGAGAAACCGTGGAGGCAC
AAGGACTCGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTGCTGGTGTTGTTGCCTCTGTTGTAACCC
CTACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATGATGAAAAGCTGCCGGGTTTCTCCG
GATCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTCTAGCGACGAAGACAGTGACTAAG
GGATTGTTCCTTGGGCCAATT

QA 2 622 2 622
DS 

RD RR2BJ16TF 605 0 0
GG
AGAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCAATTCCACTTTCTTCCTCGTCCTCTCTCTCCAATGC
CTATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATTTCCGCAATCCTCGTTCCATGTTTGAGAT
TCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGGTTCGAAGAACATCTTTAAAGTGCAATTGCTGCAG
CAAAGGGAATGGAGGTGAAAACGAAAACAGAAATGTGTTAGATGCTTTCTTTCTGGGAAA
GGCACTAGCTGAGTTTATCAACGAGCGAATTGAGTCCGCAGTTGGCGAAGTTTTGGGTAA
TATTGGAAGGTTTCAAGCTGAGCAACAGAAGCAAGTTCAAGAAATTCAGGGAGAGGTGCT
AGAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGAAAGAGCAGCTAGAGAAACCGTGGAGGCACAAGGACT
CGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTGCTGGTGTTGTTGCCTCTGTTGTAACCCCTACCTC
GATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATGATGAAAAGCTGCCGGGTTTCTCCGGATCTTC
AGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTCTAGCGACGAAGACAGTGACTAAGGGATTGT
TCC

QA 3 605 3 605
DS 

RD RR2BJ16JQ 575 0 0
TCGATTTCCGCAATCCTCGTTCCATGTTTGAGATTCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGG
TTCGAAGAACATCTTTAAAGTGCAATTGCTGCAGCAAAGGGAATGGAGGTGAAAACGAAA
ACAGAAATGTGTTAGATGCTTTCTTTCTGGGAAAGGCACTAGCTGAGTTTATCAACGAGC
GAATTGAGTCCGCAGTTGGGGAAGTTTTGGGTAATATTGGAAGGTTTCAAGCTGAGCAAC
AGAAGCAAGTTCAAGAAATTCAGGGAGAGGTGCTAGAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGAAA
GAGCAGCTAGAGAAACCGTGGAGGCACAAGGACTCGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTG
CTGGTGTTGTTGCCTCTGTTGTAACCCCTACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAA
ATGATGAAAAGCTGCCGGGTTTCTCCGGATCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGA
GTTCTAGCGACGAAGACAGTGACTAAGGGATTGTTCCTTGGGCCAATTTCAAGGCTTGGT
TATAGTATCAGACTTGTTTGAAACGGTTGAGA
GCA

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2EN68TF 738 0 0
GGAGAACCAATCGGTTCTTGGAAGGGTTGAGACTAGAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCGG
TTCCACTTTCTTCCTCGTCCTCTCTCTCCAATGCCTATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCT
TCGATTTCCGCAATCCTCGTTCGATGTTTGAGATTCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGG
TTCGAAGAACATCTTTAA*GTGCAATTGCTGCAGCAAAGGGAACGGAGGTGAAAATGAAA
ACAGAAATGTGTTAGATGCTTTCTTTCTGGGAAAGGCACTAGCTGAGGTTATCAACGAGC
GAATTGAGTCCGCAGTTGGCGAAGTTTTGGGTAATATTGGAAGGTTTCAAGCTGAGCAAC
AGAAGCAAGTTCAAGAAATTCAGGGAGAGGTGCTAGAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGTTA
GAGCAGCTAGAGAAACCGTGGAGGCACAAGGACTCGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTG
CTGGTGTTGTTGCCTCTGTTGTAACCCCTACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAA
ATGATGAAAAGCTGCCGGGTTTCTCCGGATCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGA
GTTCTAGCGACGAAGACAGTGACTAAGGGATTGTTCCTTGGGCCAATTTCAAGGTTTGGT
TATAGTATCAGACTTGTTTGAAACGGTTGAGAACATCTTCGTTGATATATGTACTTATTA
CGATGGAAGTTGAGAATA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2BF96TF 711 0 0
G
GGAGAGTAGAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCAATTCCACTTTCTTCCTCGTCCTCTCTCT
CCAATGCCTATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATTTCCGCAATCCTCGTTCCATGT
TTGAGATTCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGGTTCGAAGAACATCTTTAAAGTGCAATT
GCTGCAGCAAAGGGAATGGAGGTGAAAACGAAAACAGAAATGTGTTAGATGCTTTCTTTC
TGGGAAAGGCGCTAGCTGAGGTTATCAACGAGCGAATTGAGTCCGCAGTTGGCGAAGTTT
TGGGTGATATTGGAAGGTTTCAAGCTGAGCAACAGAAGCAAGTTCAAGAAATTCAGGGAG
AGGTGCTAGAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGAAAGAGCAGCTAGAGAAACCGTGGAGGCAC
AAGGACTCGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTGCTGGTGTTGTTGCCTCTGTTGTAACCC
CTACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATGATGAAAAGCTGCCGGGTTTCTCCG
GATCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTCTAGCGACGAAGACAGTGACTAAG
GGATTGTTCCTTGGGCCAATTTCAAGGCTTGGTTATAGTATCAGACTTGTTTGAAATGGT
TGAGAACATCTTCGTTGATATATGTACTTATTACGATGGAAGTTGAGAAT

QA 2 711 2 711
DS 

RD RR2GK88JQ 726 0 0
GGAGAGTAGAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCAATTCCACTTTCTTCCTCGTCCTCTCTCT
CCAATGCCTATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATTTCCGCAATCCTCGTTCCATGT
TTGAGATTCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGGTTCGAAGAACGTCTTTAAAGTGCAATT
GCTGCAGCAAAGGGAATGGAGGTGAAAACGAAAACAGAAATGTGTTAGATGCTTTCTTTC
TGGGAAAGGCACTAGCTGAGGTTATCAACGAGCGAATTGAGTCCGCAGTTGGCGAAGTTT
TGGGTAATATTGGAAGGTTTCAAGCTGAGCAACAGAAGCAAGTTCAAGAAATTCAGGGAG
AGGTGCTAGAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGAAAGAGCTGCTAGAGAAACCGTGGAGGCAC
AAGGACTCGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTGCTGGTGTTGTTGCCTCTGTTGTAACCC
CTACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATGATGAAAAGCTGCCGGGTTTCTCCG
GATCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTCTAGCGACGAAGACAGTGACTAAG
GGATTGTTCCTTGGGCCAATTTCAAGGCTTGGTTATAGTATCAGACTTGTTTGAAACGGT
TGAGAACATCTTCGTTGATATATGTACTTATTACGATGGAAGTTGAGAATAAATAACCCT
TGTTA
C

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2EN68JQ 629 0 0
TCGTGTTCGCTTCGATTTCCGCAATCCTCGTTCGATGTTTGAGATTCGCGGGATACGACT
AAGTGGGAGGGTTCGAAGAACATCTTTAA*GTGCAATTGCTGCAGCAAAGGGAACGGAGG
TGAAAATGAAAACAGAAATGTGTTAGATGCTTTCTTTCTGGGAAAGGCACTAGCTGAGGT
TATCAACGAGCGAATTGAGTCCGCAGTTGGCGAAGTTTTGGGTAATATTGGAAGGTTTCA
AGCTGAGCAACAGAAGCAAGTTCAAGAAATTCAGGGAGAGGTGCTAGAAAGAGCCAAGAA
AGCTAAAGTTAGAGCAGCTAGAGAAACCGTGGAGGCACAAGGACTCGAATCCACAAACCC
AAAACCAGCTGCTGGTGTTGTTGCCTCTGTTGTAACCCCTACCTCGATCGTTGAAAGCAA
GGCTATAAGAAATGATGAAAAGCTGCCGGGTTTCTCCGGATCTTCAGAGCCCGACATTAT
GGATAGCTCGAGTTCTAGCGACGAAGACAGTGACTAAGGGATTGTTCCTTGGGCCAATTT
CAAGGTTTGGTTATAGTATCAGACTTGTTTGAAACGGTTGAGAACATCTTCGTTGATATA
TGTACTTATTACGATGGAAGTTGAGAATA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2GP41TF 326 0 0
G
AACCGTGGAGGCACAAGGACTCGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTGCTGGTGTTGTTGT
CTCTGTTGTAACCCCTACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATGATGAAAAGCT
GCCGGGTTTCTCCGGATCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTCTAGCGACGA
AGACAGTGACTAAGGGATTGTTCCTTGGGCCAATTTCAAGGCTTGGTTATAGTATCAGAC
TTGTTTGAAACGGTTGAGAACATCTTCGTTGATATATGTACTTATTACGATGGAAGTTGA
GAATAAATAACCCTTGTTA
TAAACC

QA 2 320 2 320
DS 

RD RR2AD82JQ 675 0 0
CTCTCCAATGCCTATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATTTCCGCAATCCTCGTTCC
ATGTTTGAGATTCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGGTTCGAAGAACATCTTTAAAGTGC
AATTGCTGCAGCAAAGGGAATGGAGGTGAAAACGAAAACAGAAATGTGTTAGATGCTTTC
TTTCTGGGAAAGGCACTAGCTGAGGTTATCAACGAGCGAATTGAGTCCGCAGTTGGCGAA
GTTTTGGGTAATATTGGAAGGTTTCAAGCTGAGCAACAGAAGCGAGTTCAAGAAATTCAG
GGAGAGGTGCTAGAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGAAAGAGCAGCTAGAGAAACCGTGGAG
GCACAAGGACTCGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTGCTGGTGTTGTTGCCTCTGTTGTA
ACCCCTACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATTATGAAAAGCTGCCGGGTTTT
TCCGGATCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTCTAGCGACGAAGACAGTGAT
TAAGGGATTGTTCCTTGGGCCAATTTCAAGGCTTGGTTATAGTATCAGACTTGTTTGAAA
CGGTTGAGAACATCTTCGTTGATATATGTACTTATTACGATGGAAGTTGAGAATAAATAA
CCCTTGTTA
TAAACC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2AD82TF 726 0 0
GG
AGAGCGAGAGATTAGCAGCTTCGCAATTCCACTTTCTTCCTCGTCCTCTCTCTCCAATGC
CTATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATTTCCGCAATCCTCGTTCCATGTTTGAGAT
TCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGGTTCGAAGAACATCTTTAAAGTGCAATTGCTGCAG
CAAAGGGAATGGAGGTGAAAACGAAAACAGAAATGTGTTAGATGCTTTCTTTCTGGGAAA
GGCACTAGCTGAGGTTATCAACGAGCGAATTGAGTCCGCAGTTGGCGAAGTTTTGGGTAA
TATTGGAAGGTTTCAAGCTGAGCAACAGAAGCGAGTTCAAGAAATTCAGGGAGAGGTGCT
AGAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGAAAGAGCAGCTAGAGAAACCGTGGAGGCACAAGGACT
CGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTGCTGGTGTTGTTGCCTCTGTTGTAACCCCTACCTC
GATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATTATGAAAAGCTGCCGGGTTTCTCCGGATCTTC
AGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTCTAGCGACGAAGACAGTGACTAAGGGATTGT
TCCTTGGGCCAATTTCAAGGCTTGGTTATAGTATCAGACTTGTTTGAAACGGTTGAGAAC
ATCTTCGTTGATATATGTACTTATTACGATGGAAGTTGAGAATAAATAACCCTTGTTA
TAAACC

QA 3 720 3 720
DS 

RD RR2GG94JQB 771 0 0
TAGAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCGGTTCCACTTTCTTCCTCGTCCTCTCTCTCCAATG
CCTATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATTTCCGCAATCCTCGTTCGATGTTTGAGA
TTCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGGTTCGAAGAACATCTTTAAAGTGCAATTGCTGCA
GCAAAGGGAACGGAGGTGAAAACGAAAACAGAAATGTGTTAGATGCTTTCTTTCTGGGAA
AGGCACTAGCTGAGGTTATCAACGAGCGAATTGAGTCCGCAGTTGGCGAAGTTTTGGGTA
ATATTGGAAGGTTTCAAGCTGAGCAACAGAAGCAAGTTCAAGAAATTCAGGGAGAGGTGC
TAGAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGAAAGAGCAGCTAGAGAAACCGTGGAGGCACAAGGAC
TCGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTGCTGGTGTTGTTGCCTCTGTTGTAACCCCTACCT
CGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATGATGAAAAGCTGCCGGGTTTTTCCGGATCTT
CAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTCTAGCGACGAAGACAGTGACTAAGGGATTG
TTCCTTGGGCCAATTTCAAGGTTTGGTTATAGTATCAGACTTGTTTGAAACGGTTGAGA*
CATCTTCGTTGATATATGTACTTATTACGATGGAAGTTGAGAATAAATAACC*TTGATAT
TATTTGTGTAAAACAAAAAAAGTACTAGGAATTAAAAAAACGAATTGGTAC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 11

CO CL443Contig1 1257 11 37 U
GGGGACACAGCCAGATTTCTTGTTTCGCCAACCTCTCATTATAAATGAAAGCGACTCTCG
CACCCTCCTCTCTCATCAGCCTCCCCAGGCACAAAGTTTCTTCTCTCCGTTCACCGTCGC
TTCTCATTCAGTCCCAACGGCCATCCTCAGCCTTAATGACGACGACG***ACGGCATCAC
GTGGAAGCGTGGCTGTGACGGCTGCTGCTACCTCCTCCGTTGAGGCGCTGCGAGAAGGAA
TAGCTGAATTCTACAACGAGACGTCGGGATTATGGGAAGAGATTTGGGGAGATCATATGC
ACCACGGCTTCTACGATCCTGATTCCTCTGTTCAACTTTCAGATTCCGGTCACCGGGAAG
CTCAGATCCGGATGATTGAAGAGTCTCTACGTTTCGCCGGCGTTACTGAAGAGGAGAAAA
AGATAAAGAAAGTAGTGGATGTTGGGTGTGGGATCGGAGGAAGCTCAAGGTATATTGCCT
CTAAATTTGGTGCCGAATGCGTCGGCATCACACTCAGTCCCGTTCAAGCCAAGAGAGCCA
ATGATCTCGCCGCCGCTCAATCACTCTCTCAAAAGGTTTCCTTCCAGGTTGCAGATGCAC
TGGAGCAACCATTTGAAGATGGTATGTTCGATCTTGTGTGGTCAATGGAAAGCGGTGAGC
ATATGCCTGACAAGGCCAAGTTCGTGAAGGAATTGGTACGTGTGGCGGCTCCAGGAGGAA
GGATAATAATAGTGACATGGTGCCACAGAAATCTATCCCCAGGAGAAGAAGCTTTGCAGC
CATGGGAACAGAACCTCTTGGACAGAATCTGCAAAACATTTTATCTCCCGGCCTGGTGCT
CCACCTCTGATTATGTCGATTTGCTTCAATCCCTCTCGCTCCAGGATATTAAGTGTGCAG
ATTGGTCAGAGAATGTAGCTCCTTTCTGGCCGGCGGTTATACGAACCGCATTAACATGGA
AGGGCCTTGTGTTTCTGCTTCGTAGTGGTATGAAGAGTATAAAAGGAGCATTGACAATGC
CATTGATGATCGAAGGGTACAAGAAAGGTGTCATTAAGTTTGGCATCATCACTTGCCAGA
AGCCTCTCTAAGTTTAAGATAAACAATAAAATTGTCGTATAAGTGATCTTCAGTGAATTG
GTTTCTATCTATGATATAGGAGATTGAATAAGAGACGTGAGAAATTAATGTGGATGCATG
AGATCCCTTAACGTCATTAATGTTCATTTCTTGGCTCCGTTGTTTATTTTAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 0 35 15 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG29TF U 1
AF RR2DW93TF U 14
AF RR2H783TF U 20
AF RR2GJ22TF U 13
AF RR2AU01TF U 14
AF RR2A610TF U 13
AF RR2GJ22JQB C 417
AF RR2H466JQB C 554
AF RR2G201TF U 640
AF RR2GG29JQB C 813
AF RR2H783JQB C 687
BS 1 13 RR2GG29TF
BS 14 14 RR2A610TF
BS 15 25 RR2GG29TF
BS 26 26 RR2A610TF
BS 27 58 RR2GG29TF
BS 59 59 RR2A610TF
BS 60 97 RR2GG29TF
BS 98 98 RR2A610TF
BS 99 127 RR2GG29TF
BS 128 128 RR2A610TF
BS 129 172 RR2GG29TF
BS 173 173 RR2A610TF
BS 174 203 RR2GG29TF
BS 204 204 RR2A610TF
BS 205 277 RR2GG29TF
BS 278 278 RR2A610TF
BS 279 280 RR2GG29TF
BS 281 281 RR2A610TF
BS 282 301 RR2GG29TF
BS 302 302 RR2A610TF
BS 303 357 RR2GG29TF
BS 358 358 RR2A610TF
BS 359 363 RR2GG29TF
BS 364 409 RR2A610TF
BS 410 412 RR2GJ22TF
BS 413 502 RR2A610TF
BS 503 503 RR2GJ22TF
BS 504 571 RR2A610TF
BS 572 572 RR2GJ22TF
BS 573 752 RR2A610TF
BS 753 970 RR2G201TF
BS 971 971 RR2GJ22JQB
BS 972 972 RR2G201TF
BS 973 973 RR2GJ22JQB
BS 974 994 RR2G201TF
BS 995 995 RR2GJ22JQB
BS 996 1257 RR2G201TF

RD RR2GG29TF 363 0 0
GGGGACACAGCCACATTTCTTGTTTTGCCAACCTCTCATTATAAATGAAAGCGACTCTAG
CACCCTCCTCTCTCATCAGCCTCCCCAGGCACAAAGTGTCTTCTCTCCGTTCACCGTCGC
TTCTCATCCAGTCCCAACGGCCATCCTCAGCCTTAATGACGACGACG***ACAGCATCAC
GTGGAAGCGTGGCTGTGACGGCTTCTGCTACCTCCTCCGTTGAGGCGCTGCGAGAAGGAA
TAGCTGAATTCTACAACGAGACGTCGGGATTATGGGAGGATATTTGGGGAGATCATATGC
ATCACGGCTTCTACGATCCTGATTCCTCTGTTCAACTTTCAGATTCCGGTCACCGGGGAG
CTC

QA 1 363 1 363
DS 

RD RR2DW93TF 440 0 0
GATTTCTTGTTTCGCCAACCTCTCATTATAAATGAAAGCGACTCTCGCACCCTCCTCTCT
CATCAGCCTCCCCAGGCACAAAGTTTCTTCTCTCCGTTCACCGTCGCTTCTCATTCAGTC
CCAACGGCCATCCTCAGCCTTAATGACGACGACG***ACGGCATCACGTGGAAGCGTGGC
TGTGACGGCTGCTGCTACCTCCTCCGTTGAGGCGCTGCGAGAAGGAATAGCTGAATTCTA
CAACGAGACGTCGGGATTATGGGAAGAGATTTGGGGAGATCATATGCACCACGGCTTCTA
CGATCCTGATTCCTCTGTTCAACTTTCAGATTCCGGTCACCGGGAAGCTCAGATCCGGAT
GATTGAAGAGTCTCTACGTTTCGCCGGCGTTACTGAAGAGGAGAAAAAGATAAAGAAAGT
AGTGGATGTTGGGTGTGGGA

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR2H783TF 503 0 0
GG
GTTTCGCCAACCTCTCATTATAAATGAAAGCGACTCTCGCACCCTCCTCTCTCATCAGCC
TCCCCAGGCACAAAGTTTCTTCTCTCCGTTCACCGTCGCTTCTCATTCAGTCCCAACGGC
CATCCTCAGCCTTAATGACGACGACG***ACGGCATCACTTGGAAGCGTGGCTGTGACGG
CTGCTGCTACCTCCTCCGTTGAGGCGCTGCGAGAAGGAATAGCTGAATTCTACAACGAGA
CGTCGGGATTATGGGAAGAGATTTGGGGAGATCATATGCACCACGGCTTCTACGATCCTG
ATTCCTCTGTTCAACTTTCAGATTCCGGTCACCGGGAAGCTCAGATCCGGATGATTGAAG
AGTCTCTACGTTTCGCCGGCGTTACTGAAGAGGAGAAAAAGATAAAGAAAGTAGTGGATG
TTGGGTGTGGGATCGGAGGAAGCTCAAGGTATATTGCCTCTAAATTTGGTGCCGAATGCG
TTGGCATCACACTCAGTCCCG

QA 3 503 3 503
DS 

RD RR2GJ22TF 674 0 0
G
GATTTCTTGTTTTGCCAACCTCTCATTATAAATGAAAGCGACTCTCGCACCCTCCTCTCT
CATCAGCCTCCCCAGGCACAAATTTTCTTCTCTCCGTTCACCGTCGCTTCTCATTCAGTC
CCAACGGCCATCCTCAGCCTTAATGACGACGATGAAGACGGCATCACGTGGAAGCGTGGC
TGTGACGGCTGCTGCCACCTCCTCCGTTGAGGCGCTGCGAGAAGGAATAGCTGAATTCTA
CAACGAGACGTCGGGATTATGGGAGGAGATTTGGGGAGATCATATGCACCACGGCTTCTA
CGATCCTGATTCCTCTGTTCAACTTTCAGATTCCGGTCACCGGGAAGCTCAGATCCGGAT
GATTGAAGAGTCTCTACGTTTCGCCGGCGTTACTGAAGAGGAGAAAAAGATAAAGAGAGT
AGTTGATGTTGGGTGTGGGATCGGAGGAAGCTCAAGGTATATTGCCTCTAAATTTGGTGC
CGAATGCGTCGGCATCACACTCAGTCCCGTTCAAGCCAAGAGAGCCAATGATCTCGCCGC
CGCTCAATCACTCTCTCAAAAGGTTTCCTTCCAGGTTGCAGATGCACTGGAGCAACCATT
TGAAGATGGTATGTTCGATCTTGTGTGGTCAATGGAAAGTGGTGAGCATATGCCTGACAA
G*CCAAGTTCGTG

QA 2 674 2 674
DS 

RD RR2AU01TF 703 0 0
GATTTCTTGTTTCGCCAACCTCTCATTATAAATGAAAGCGACTCTCGCACCCTCCTCTCT
CATCAGCCTCCCCAGGCACAAAGTTTCTTCTCTCCGTTCACCGTCGCTTCTCATTCAGTC
CCAACGGCCATCCTCAGCCTTAATGACGACGACG***ACGGCATCACGTGGAAGCGTGGC
TGTGACGGCTGCTGCTACCTCCTCCGTTGAGGCGCTGCGAGAAGGAATAGCTGAATTCTA
CAACGAGACGTCGGGATTATGGGAAGAGATTTGGGGAGATCATATGCACCACGGCTTCTA
CGATCCTGATTCCTCTGTTCAACTTTCAGATTCCGGTCACCGGGAAGCTCAGATCCGGAT
GATTGAAGAGTCTCTACGTTTCGCCGGCGTTACTGAAGAGGAGAAAAAGATAAAGAAAGT
AGTGGATGTTGGGTGTGGGATCGGAGGAAGCTCAAGGTATATTGCCTCTAAATTTGGTGC
CGAATGCGTTGGCATCACACTCAGTCCCGTTCAAGCCAAGAGAGCCAATGATCTCGCCGC
CGCTCAATCACTCTCTCAGAAGGTTTCCTTCCAGGTTGCAGATGCACTGGAGCAACCATT
TGAAGATGGTATGTTCGATCTTGTGTGGTCAATGGAAAGCGGTGAGCATATGCCTGACAA
GGCCAAGTTCGTGAAGGAATTGGTACGTGTGGCGGCTCCAGGA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2A610TF 740 0 0
G
GATTTCTTGTTTCGCCAACCTCTCATTATAAACGAAAGCGACTCTCGCACCCTCCTCTCT
CATCAGCCTCCCCAGGCACAAAGTTTCTTCTCTCCGTTCACCGTCGCTTCTCATTCAGTC
CCAACGGCCATCCTCAGCCTTAATGACGACGACG***ACGGCATCACGTGGAAGCGTGGC
TGTGACGGCTGCTGCTACCTCCTCCGTTGAGGCGCTGCGAGAAGGAATAGCTGAACTCTA
CGACGAGACGTCGGGATTATGGGAAGAGATTTGGGGAGATCATATGCACCACGGCTTCTA
CGATCCTGATTCCTCTGTTCAACTTTCAGATTCCGGTCACCGGGAAGCTCAGATCCGGAT
GATTGAAGAGTCTCTACGTTTCGCCGGCGTTACTGA***GGAGAAAAAGATAAAGAAAGT
AGTGGATGTTGGGTGTGGGATCGGAGGAAGCTCAAGGTATATTGCCTCTAAATTTGGTGC
CGAATGCGTTGGCATCACACTCAGTCCCGTTCAAGCCAAGAGAGCCAATGATCTCGCCGC
CGCTCAATCACTCTCTCAGAAGGTTTCCTTCCAGGTTGCAGATGCACTGGAGCAACCATT
TGAAGATGGTATGTTCGATCTTGTGTGGTCAATGGAAAGCGGTGAGCATATGCCTGACAA
GGCCAAGTTCGTGAAGGAATTGGTACGTGTGGCGGCTCCAGGAGGAAGGATAATAATAGT
GACATGGTGCCACAGAAAT

QA 2 740 2 740
DS 

RD RR2GJ22JQB 750 0 0
AAAAAGATAAAGAGAGTAGTTGATGTTGGGTGTGGGATCGGAGGAAGCTCAAGGTATATT
GCCTCTAAATTTGGTGCCGAATGCGTCGGCATCACACTCAGTCCCGTTCAAGCCAAGAGA
GCCAATGATCTCGCCGCCGCTCAATCACTCTCTCAAAAGGTTTCCTTCCAGGTTGCAGAT
GCACTGGAGCAACCATTTGAAGATGGTATGTTCGATCTTGTGTGGTCAATGGAAAGTGGT
GAGCATATGCCTGACAAGGCCAAGTTCGTGAAGGAATTGGTACGTGTGGCGGCTCCAGGA
GGAAGGATAATAATAGTGACATGGTGCCACAGAAATCTATCCCAAGGGGAAGAAGCTTTG
CAACCATGGGAACAGAACCTCTTGGACAGAATTTGCAAAACATTTTATCTCCCGGCCTGG
TGCTCCACCTCTGATTATGTCGATTTGCTTCAATCCCTCTCGCTCCAGGATATTAAGTGT
GCAGATTGGTCAGAGAATGTAGCTCCTTTCTGGCCGGCGGTTATACGAACCGCATTAACA
TGGAAGGGCCTTGTGTTTTTGCTTCGTAGTGGTATGAAGAGTATAAAAGGAGCATTGACA
ATGCCATTGACGATCGAAGGGTACAAGAAAGGTGTCATTAAGTTCGGCATCATCACTTGC
CAGAAGCCTCTCTAAGTTTAAGATAAACAATAAAATTGTCGTATAAATGCTCTTCAGTGA
ATTGGTTTCTATCTATGATATAGGAGATTG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2H466JQB 684 0 0
CGCTCAATCACTCTCTCATAAGGTTTCCTTCCAGGTTGCAGATGCACTGGAGCAACCATT
TGAAGATGGTATGTTCGATCTTGTGTGGTCAATGGAAAGCGGTGAGCATATGCCTGACAA
GGCCAAGTTCGTGAAGGAATTGGTACGTGTGGCGGCTCCAGGAGGAAGGATAATAATAGT
GACATGGTGCCACAGAAATCTATCCCCAGGGGAAGAAGCTCTGCAGCCATGGGAACAGAA
CCTCTTGGACAGAATCTGCAAAACATTTTATCTCCCGGCCTGGTGCTCCACCTCTGATTA
TGTCAATTTGCTTCAATCCCTCTCCCTCCAGGATATTAAGTGTGCAGATTGGTCAGAGAA
TGTAGCTCCTTTCTGGCCGGCGGTTATACGAACCGCATTAACATGGAAGGGCCTTGTGTT
TCTGCTTCGTAGTGGTATGAAGAGTATAAAAGGAGCATTGACAATGCCATTGATGATCGA
AGGGTACAAGAAAGGTGTCATTAAGTTTGGCATCATCACTTGCCAGAAGCCTCTCTAAGT
TTAAGATAAACAATAAAATCGTCGTGTAAGTGATCTTCAGTGAATTGGTTTCTATCTATG
ATATAGGAGATTGAATAAGAGACGTGAGAAATTAATGTGGATGCATGAGATCCCTTAACG
TCATTAATGTTCATTTCTTGGC
CC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2G201TF 618 0 0
GGTCAATGGAAAGCGGTGAGCATATGCCTGACAAGGCCAAGTTCGTGAAGGAATTGGTAC
GTGTGGCGGCTCCAGGAGGAAGGATAATAATAGTGACATGGTGCCACAGAAATCTATCCC
CAGGAGAAGAAGCTTTGCAGCCATGGGAACAGAACCTCTTGGACAGAATCTGCAAAACAT
TTTATCTCCCGGCCTGGTGCTCCACCTCTGATTATGTCGATTTGCTTCAATCCCTCTCGC
TCCAGGATATTAAGTGTGCAGATTGGTCAGAGAATGTAGCTCCTTTCTGGCCGGCGGTTA
TACGAACCGCATTAACATGGAAGGGCCTTGTTTCTCTGCTTCGTAGTGGTATGAATAGTA
TAAAAGGAGCATTGACAATGCCATTGATGATCGAAGGGTACAAGAAAGGTGTCATTAAGT
TTGGCATCATCACTTGCCAGAAGCCTCTCTAAGTTTAAGATAAACAATAAAATTGTCGTA
TAAGTGATCTTCAGTGAATTGGTTTCTATCTATGATATAGGAGATTGAATAAGAGACGTG
AGAAATTAATGTGGATGCATGAGATCCCTTAACGTCATTAATGTTCATTTCTTGGCTCCG
TTGTTTATTTTAGAAAAA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2GG29JQB 425 0 0
AAAACATTTTATCTCCCGGCCTGGTGCTCCACTTCTGATTATGTCAATTTGCTTCAATCC
CTCTCCCTCCAGGATATTAAGTGTGCAGATTGGTCAGAGAATGTAGCTCCTTTCTGGCCG
GCGGTTATACGAACCGCATTAACATGGAAGGGCCTTGTGTTTTTGCTTCGTAGTGGTATG
AAGAGTATAAAAGGAGCATTGACAATGCCATTGATGATCGAAGGGTACAAGAAAGGTGTC
ATTAAGTTTGGCATCATCACTTGCCAGAAGCCTCTTTAAGTTTAAGATAAACAATAAAAT
CGTCGTGTAAGTGATCTTCAGTGAATTGGTTTCTATCTATGATATAGGAGATTGAATAAG
AGACGTGAGAAATTAATGTGGATGCATGAGATCCCTTAACGTCATTAATGTTCATTTCTT
GGC
CC

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR2H783JQB 532 0 0
AAGGAATTGGTACGTGTGGCGGCTCCAGGAGGAAGGATAATAATAGTGACATGGTGCCAC
AGAAATCTATCCCCAGGAGAAGAAGCTTTGCAGCCATGGGAACAGAACCTTTTGGACAGA
ATTTGCAAAACATTTTATCTCCCGGCCTGGTGCTCCACCTCTGATTATGTCGATTTGCTT
CAATCCCTCTCGCTCCAGGATATTAAGTGTGCAGATTGGTCAGAGAATGTAGCTCCTTTT
TGGCCGGCGGTTATACGAACCGCATTAACATGGAAGGGCCTTGTTTTTTTGCTTCGTAGT
GGTATGAAGAGTATAAAAGGAGCATTGACAATGCCATTGATGATCGAAGGGTACAAGAAA
GGTGTCATTAAGTTTGGCATCATCACTTGCCAGAAGCCTCTTTAAGTTTAAGATAAACAA
TAAAATTGTCGTATAAGTGATCTTCAGTGAATTGGTTTCTATCTATGATATAGGAGATTG
AATAAGAGACGTGAGAAATTAATGTGGATGCATGAGATCCCTTAACGTCATT

QA 1 532 1 532
DS 



AS 2 10

CO CL444Contig1 780 4 4 U
GGGAGCTTCGCAGCAACTCAGCTGAAAAAAAAAACGGAACCCTAGCGAAGCGAATCTTTC
TGAGCTTCCCGTCTCCTCCTCCTCCTTGAAGCTACACTGATAGAGAAAGGATGCCTCCGA
AAGGGAAAGCAAAGGATGCAGGTCCCGTAGAGAGGCCAATCCTTGGCCGTTTCTCTTCTC
ACCTCAAGATCGGAATCGTAGGGTTACCAAACGTGGGAAAGTCAACACTTTTCAACACCC
TAACGAAGCTTTCAATCCCAGCTGAGAACTTCCCCTTTTGTACCATTGAGCCCAACGAGG
CACGTGTCAATATCCCCGATGACAGGTTTGATTGGCTTTGTCAATTGTACAAGCCCAAGA
GTGAGATTCCTGCTTTCTTGGAAATTCATGACATTGCTGGCCTTGTTCGAGGCGCTCATG
AAGGACAGGGTCTTGGAAACAACTTCTTGTCTCATATTCGTGCTGTTGATGGCATCTTCC
ATGTTCTACGTGCCTTTGAAGATCCTGATATTATTCATGTTGATGATATTGTGGATCCTG
TTAGAGATTTGGAGACCATTACTGAAGAATTGCGTCTCAAGGATATTGAATTCATTAAAA
AGAAGATTGAAGATGTCGAGAAGAGCATGAAGAGGAGCAATGACAAGGCGCTTAAAGTCG
AACTTGAGCTCTTGCTTAAAGTAAAAGCTTGGCTGGAAGAAGAAAGTATGTCCGTTTTGG
GGACTGGAAGCAGCTGATATCGAGATTTTGAACACTTTCCATTGCTTTCCGCTAAGCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE47TF U 2
AF RR2A578TF U 8
AF RR2C545TF U 2
AF RR2AE23TF U 1
BS 1 32 RR2AE23TF
BS 33 33 RR2EE47TF
BS 34 34 RR2A578TF
BS 35 780 RR2AE23TF

RD RR2EE47TF 681 0 0
GGAGCTTC
GCAGCAACTCAGCTGAAAAAAAAA*CGGAACCCTAGCGAAGCGAATCTTTCTGAGCTTCC
CGTCTCCTCCTCCTCCTTGAAGCTACACTGATAGAGAAAGGATGCCTCCGAAAGGGAAAG
CAAAGGATGCAGGTCCCGTAGAGAGGCCAATCCTTGGCCGTTTCTCTTCTCACCTCAAGA
TCGGAATCGTAGG*TTACCAAACGTGGGAAAGTCAACACTTTTCAACACCCTAACGAAGC
TTTCAATCCCAGCTGAGAACTTCCCCTTTTGTACCATTGAGCCCAACGAGGCACGTGTCA
ATATCCCCGATGACAGGTTTGATTGGCTTTGTCAATTGTACAAGCCCAAGAGTGAGATTC
CTGCTTTCTTGGAAATTCATGACATTGCTGGCCTTGTTCGAGGCGCTCATGAAGGACAGG
GTCTTGGAAACAACTTCTTGTCTCATATTCGTGCTGTTGATGGCATCTTCCATGTTCTAC
GTGCCTTTGAAGATCCTGATATTATTCATGTTGATGATATTGTGGATCCTGTTAGAGATT
TGGAGACCATTACTGAAGAATTGCGTCTCAAGGATATTGAATTCATTAAAAAGAAGATTG
AAGATGTCGAGAAAGGCATGAAGAGGAGCAATGACAAGACGCTTAAAGTCGAACTTGAGC
TCTTGCTTAA
GTA

QA 9 678 9 678
DS 

RD RR2A578TF 677 0 0
GG
GCAGCAACTCAGCTGAAAAAAAAAACGGAACCCTAGCGAAGCGAATCTTTCTGAGCTTCC
CGTCTCCTCCTCCTCCTTGAAGCTACACTGATAGAGAAAGGATGCCTCCGAAAGGGAAAG
CAAAGGATGCAGGTCCCGTAGAGAGGCCAATCCTTGGCCGTTTCTCTTCTCACCTCAAGA
TCGGAATCGTAGGGTTACCAAACGTGGGAAAGTCAACACTTTTCAACACCCTAACGAAGC
TTTCAATCCCAGCTGAGAACTTCCCCTTTTGTACCATTGAGCCCAACGAGGCACGTGTCA
ATATCCCCGATGACAGGTTTGATTGGCTTTGTCAATTGTACAAGCCCAAGAGTGAGATTC
CTGCTTTCTTGGAAATTCATGACATTGCTGGCCTTGTTCGAGGCGCTCATGAAGGACAGG
GTCTTGGAAACAACTTCTTGTCTCATATTCGTGCTGTTGATGGCATCTTCCATGTTCTAC
GTGCCTTTGAAGATCCTGATATTATTCATGTTGATGATATTGTGGATCCTGTTAGAGATT
TGGAGACCATTACTGAAGAATTGCGTCTCAAGGATATTGAATTCATTAAAAAGAAGATTG
AAGATGTCGAGAAGAGCATGAAGAGGAGCAATGACAAGGCGCTTAAAGTCGAACTTGAGC
TCTTGCTTAA
AGTAA

QA 3 672 3 672
DS 

RD RR2C545TF 675 0 0
GGAGCTTC
GCAGCAACTCAGCTGAAAAAAAAAACGGAACCCTAGCGAAGCGAATCTTTCTGAGCTTCC
CGTCTCCTCCTCCTCCTTGAAGCTACACTGATAGAGAAAGGATGCCTCCGAAAGGGAAAG
CAAAGGATGCAGGTCCCGTAGAGAGGCCAATCCTTGGCCGTTTCTCTTCTCACCTCAAGA
TCGGAATCGTAGGGTTACCTAACGTGGGAAAGTCAACACTTTTCAACACCCTAACGAAGC
TTTCAATCCCAGCTGAGAACTTCCCCTTTTGTACCATTGAGCCCAACGAGGCACGTGTCA
ATATCCCCGATGACAGGTTTGATTGGCTTTGTCAATTGTACAAGCCCAAGAGTGAGATTC
CTGCTTTCTTGGAAATTCATGACATTGCTGGCCTTGTTCGAGGCGCTCATGAAGGACAGG
GTCTTGGAAACAACTTCTTGTCTCATATTCGTGCTGTTGATGGTATCTTCCATGTTCTAC
GTGCCTTTGAAGATCCTGATATTATTCATGTTGATGATATTGTGGATCCTGTTAGAGATT
TGGAGACCATTACTGAAGAATTGCGTCTCAAGGATATTGAATTCATTAAAAAGAAGATTG
AAGATGTCGAGAAGAGCATGAAGAGGAGCAATGACAAGGCGCTTAAAGTCGAACTTGAGC
TCTTGCT

QA 9 675 9 675
DS 

RD RR2AE23TF 780 0 0
GGGAGCTTCGCAGCAACTCAGCTGAAAAAAAA**CGGAACCCTAGCGAAGCGAATCTTTC
TGAGCTTCCCGTCTCCTCCTCCTCCTTGAAGCTACACTGATAGAGAAAGGATGCCTCCGA
AAGGGAAAGCAAAGGATGCAGGTCCCGTAGAGAGGCCAATCCTTGGCCGTTTCTCTTCTC
ACCTCAAGATCGGAATCGTAGGGTTACCAAACGTGGGAAAGTCAACACTTTTCAACACCC
TAACGAAGCTTTCAATCCCAGCTGAGAACTTCCCCTTTTGTACCATTGAGCCCAACGAGG
CACGTGTCAATATCCCCGATGACAGGTTTGATTGGCTTTGTCAATTGTACAAGCCCAAGA
GTGAGATTCCTGCTTTCTTGGAAATTCATGACATTGCTGGCCTTGTTCGAGGCGCTCATG
AAGGACAGGGTCTTGGAAACAACTTCTTGTCTCATATTCGTGCTGTTGATGGCATCTTCC
ATGTTCTACGTGCCTTTGAAGATCCTGATATTATTCATGTTGATGATATTGTGGATCCTG
TTAGAGATTTGGAGACCATTACTGAAGAATTGCGTCTCAAGGATATTGAATTCATTAAAA
AGAAGATTGAAGATGTCGAGAAGAGCATGAAGAGGAGCAATGACAAGGCGCTTAAAGTCG
AACTTGAGCTCTTGCTTAAAGTAAAAGCTTGGCTGGAAGAAGAAAGTATGTCCGTTTTGG
GGACTGGAAGCAGCTGATATCGAGATTTTGAACACTTTCCATTGCTTTCCGCTAAGCCCG

QA 1 780 1 780
DS 



CO CL444Contig2 951 6 6 U
ATACAAGGAAATATATTTTGGTTTTAAGGTATTTGTTTCAGATTATTGAAAGGGAGTTCT
ACAAAAGACAAGTCTTAAGTAACTGCAGAAAGGAACAAGAGTTACAGATACTAGATTGTG
TTTAGTAAAAGCCAATAAAAAACTTCGGAAACAGAAAATACAGTTTTGGTGCATCTCTCG
AAGTTGTATAAAGCTTCAAGATCTGGAGAGGATACCACGAAATAGGTAAAAAGACAAGAT
GGAATCTCTCATTTCTTCCCACCACCGGAAACGTTGAACTTGAAGAAAATGATATCTCCG
TCCTGAACAACATATGTTTTCCCCTCCTGTCTGTATTTTCCTGCCCCCTTGACTGCAGTT
TCATTGCCAAGTTCCTTGAGATCCTCAAACTTCATGACCTCGGCACAAATGAACCCTCTC
TCAAAATCAGTATGAATGGCCCCTGCAGCTTGAGGAGCCTTTGACTGACGTCTTATTTGC
CAGCACTTCACCTCATCAGGCCCTGCTGTAAAGAAATATATGAGGTTAATAGCTGAAAAT
CCAGTTTTGATGATCCTCGGAAGAGCACTTTGCAGTTTGTTCTCCTCACAATACTTTGCT
GCTTCGTCTGGGAGCATATCAGCGAGACTCCTTTCGAAAACACCACTGAAAGGGATCATA
GTATCACCACCGTGTTCTTGAACCCAAGCATGAATCTTCGGCAGGAACTTGTTTTTCTTC
CTCTGGTAGTCTCTCTCATTCATGTTAATCAAGTAAACAACGGGCTTAGCGGAAAGCAAT
TGGAAAGTGTTCAAAATCTCGATATCAGCTGCTTTCCAGTCCCCAAAACGGACATCCTTT
CCTTCTTCCAGTCAAGCTTTTACCTTAAGCAAGAGCTCAAGTTCGACTTTAAGCGCCTTG
TCATTGCTCCTCTTCATGCTCTTCTCGACATCTTCAATCTTCTTTTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 20 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM56JQ U 1
AF RR2C545JQ U 37
AF RR2EE47JQ U 26
AF RR2A578JQ U 20
AF RR2AE23JQ U 20
AF RR2DM56TF C 343
BS 1 87 RR2DM56JQ
BS 88 88 RR2A578JQ
BS 89 623 RR2DM56JQ
BS 624 814 RR2A578JQ
BS 815 835 RR2AE23JQ
BS 836 951 RR2DM56TF

RD RR2DM56JQ 623 0 0
ATACAAGGAAATATATTTTGGTTTTAAGGTATTTGTTTCAGATTATTGAAAGGGAGTTCT
ACAAAAGACAAGTCTTAAGTAACTGCAAAAAGGAACAAGAGTTACAGATACTAGATTGTG
TTTAGTAAAAGCCAATAAAAAACTTCGGAAACAGAAAATACAGTTTTGGTGCATCTCTCG
AAGTTGTATAAAGCTTCAAGATCTGGAGAGGATACCACGAAATAGGTAAAAAGACAAGAT
GGAATCTCTCATTTCTTCCCACCACCGGAAACGTTGAACTTGAAGAAAATGATATCTCCG
TCCTGAACAACATATGTTTTCCCCTCCTGTCTGTATTTTCCTGCCCCCTTGACTGCAGTT
TCATTGCCAAGTTCCTTGAGATCCTCAAACTTCATGACCTCGGCACAAATGAACCCTCTC
TCAAAATCAGTATGAATGGCCCCTGCAGCTTGAGGAGCCTTTGACTGACGTCTTATTTGC
CAGCACTTCACCTCATCAGGCCCTGCTGTAAAGAAATATATGAGGTTAATAGCTGAAAAT
CCAGTTTTGATGATCCTCGGAAGAGCACTTTGCAGTTTGTTCTCCTCACAATACTTTGCT
GCTTCGTCTGGGAGCATATCAGC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2C545JQ 623 0 0
TTCAGATTATTGAAAGGGAGTTCTACAAAAGACAAGTCTTAAGTAACTGCAGAAAGGAAC
AAGAGTTACAGATACTAGATTGTGTTTAGTAAACGCCAATAAAAAACTTCGGAAACAGAA
AATACAGTTTTGGTGCATCTCTCGAAGTTGTATAAAGCTTCAAGATCTGGAGAGGATACC
ACGAAATAGGTAAAAAGACAAGATGGAATCTCTCATTTCTTCCCACCACCGGAAACGTTG
AACTTGAAGAAAATGATATCTCCGTCCTGAACAACATATGTTTTCCCCTCCTGTCTGTAT
TTTCCTGCCCCCTTGACTGCAGTTTCATTGCCAAGTTCCTTGAGATCCTCAAACTTCATG
ACCTCGGCACAAATGAACCCTCTCTCAAAATCAGTATGAATGGCCCCTGCAGCTTGAGGA
GCCTTTGACTGACGTCTTATTTGCCAGCACTTCACCTCATCAGGCCCTGCTGTAAAGAAA
TATATGAGGTTAATAGCTGAAAATCCAGTTTTGATGATCCTCGGAAGAGCACTTTGCAGT
TTGTTCTCCTCACAATACTTTGCTGCTTCGTCTGGGAGCATATCAGCGAGACTCCTTTCG
AAAACACCACTGAAAGGGATCAT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2EE47JQ 672 0 0
AAGGTATTTGTTTCAGATTATTGAAAGGGAGTTCTACAAAAGACAAGTCTTAAGTAACTG
CAGAAAGGAACAAGAGTTACAGATACTAGATTGTGTTTAGTAAAAGCCAATAAAAAACTT
CGGAAACAGAAAATACAGTTTTGGTGCATCTCTCGAAGTTGTATAAAGCTTCAAGATCTG
GAGAGGATACCACGAAATAGGTAAAAAGACAAGATGGAATCTCTCATTTCTTCCCACCAC
CGGAAACGTTGAACTTGAAGAAAATGATATCTCCGTCCTGGACAACATATGTTTTCCCCT
CCTGTATGTATTTTCCTGCCCCCTTAACTGCAGTTTCATTGCCAAGTTCCTTGAGATCCT
CAAACTTCATGACCTCGGCACAAATGAACCCTCTCTCAAAATCAGTATGAATGGCCCCTG
CAGCTTGAGGAGCCTTTGACTGACGTCTTATTTGCCAGCACTTCACCTCATCAGGCCCTG
CTGTAAAGAAATATATGAGGTTAATAGCTGAAGATCCAGTTTTGATGATCCTCGGAAGAG
CACTTTGCAGTTTGTTCTCCTCACAATACTTTGCTGCTTCGTCTGGGA*CATATCAGCGG
GACTCCTTTCGAAAACACCACTGAAAGGGATCATAGTATCACCACCGTGTTCTTGAACCC
AAGCATGAATCT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2A578JQ 795 0 0
GGTTTT
AAGGTATTTGTTTCAGATTATTGAAAGGGAGTTCTACAAAAGACAAGTCTTAAGTAACTG
CAGAAAGGAACAAGAGTTACAGATACTAGATTGTGTTTAGTAAAAGCCAATAAAAAACTT
CGGAAACAGAAAATACAGTTTTGGTGCATCTCTCGAAGTTGTATAAAGCTTCAAGATCTG
GAGAGGATACCACGAAATAGGTAAAAAGACAAGATGGAATCTCTCATTTCTTCCCACCAC
CGGAAACGTTGAACTTGAAGAAAATGACATCTCCGTCCTGAACAACATATGTTTTCCCCT
CCTGTCTGTATTTTCCTGCCCCCTTGACTGCAGTTTCATTGCCAAGTTCCTTGAGATCCT
CAAACTTCATGACCTCGGCACAAATGAACCCTCTCTCAAAATCAGTATGAATGGCCCCTG
CAGCTTGAGGAGCCTTTGACTGACGTCTTATTTGCCAGCACTTCACCTCATCAGGCCCTG
CTGTAAAGAAATATATGAGGTTAATAGCTGAAAATCCAGTTTTGATGATCCTCGGAAGAG
CACCTTGCAGTTTGTTCTCCTCACAATACTTTGCTGCTTCGTCTGGGAGCATATCAGCGA
GACTCCTTTCGAAAACACCACTGAAAGGGATCATAGTATCACCACCGTGTTCTTGAACCC
AAGCATGAATCTTCGGCAGGAACTTGTTTTTCTTCCTCTGGTAGTCTCTCTCATTCATGT
TAATCAAGTAAACAACGGGCTTAGCGGAAAGCAATTGGAAAGTGTTCAAAATCTCGATAT
CAGCTGCTT

QA 7 795 7 795
DS 

RD RR2AE23JQ 818 0 0
GGTTTT
AAGGTATTTGTTTCAGATTATTGAAAGGGAGTTCTACAAAAGACAAGTCTTAAGTAACTG
CAGAAAGGAACAAGAGTTACAGATACTAGATTGTGTTTAGTAAAAGCCAATAAAAAACTT
CGGAAACAGAAAATACAGTTTTGGTGCATCTCTCGAAGTTGTATAAAGCTTCAAGATCTG
GAGAGGATACCACGAAATAGGTAAAAAGACAAGATGGAATCTCTCATTTCTTCCCACCAC
CGGAAACGTTGAACTTGAAGAAAATGATATCTCCGTCCTGAACAACATATGTTTTCCCCT
CCTGTCTGTATTTTCCTGCCCCCTTGACTGCAGTTTCATTGCCAAAT*CCTTGAGATCCT
CAAACTTCATGACCTCGGCACAAATGAACCCTCTCTCAAAATCAGTATGAATGGCCCCTG
CAGCTTGAGGAGCCTTTGACTGACGTCTTATTTGCCAGCACTTCACCTCATCAGGCCCTG
CTGTAAAGAAATATATGAGGTTAATAGCTGAAAATCCAGTTTTGATGATCCTCGGAAGAG
CACTTTGCAGTTTGTTCTCCTCACAATACTTTGCTGCTTCGTCTGGGAGCATATCAGCGA
GACTCCTTTCGAAA*CACCACTGAAAGGGATCATAGTATCACCACCGTGTTCTTGAACCC
AAGCATGAATCTTCGGCAGGAACTTGTTTTTCTTCCTCTGGTAGTCTCTCTCATTCATGT
TAATCAAGTAAACAACGGGCTTAGCGGAAAGCAATTGGAAAGTGTTCAAAATCTCGATAT
CAGCTGCTTTCCAGTCCCCAAAACGGACAT
AC

QA 7 816 7 816
DS 

RD RR2DM56TF 609 0 0
GCCCCATTGACTGCAGTTTCATTGCCAAGTTCCTTGAGATCCTCAAACTTCATGACCTCG
GCACAAATGAACCCTCTCTCAAAATCAGTATGAATGGCCCCTGCAGCTTGAGGAGCCTTT
GACTGACGTCTTATTTGCCAGCACTTCACCTCATCAGGCCCTGCTGTAAAGAAATATATG
AGGTTAATAGCTGAAAATCCAGTTTTGATGATCCTCGGAAGAGCACTTTGCAGTTTGTTC
TCCTCACAATACTTTGCTGCTTCGTCTGGGAGCATATCAGCGAGACTCCTTTCGAAAACA
CCACTGAAAGGGATCATAGTATCACCACCGTGTTCTTGAACCCAAGCATGAATCTTCGGC
AGGAACTTGTTTTTCTTCCTCTGGTAGTCTCTCTCATTCATGTTAATCAAGTAAACAACG
GGCTTAGCGGAAAGCAATTGGAAAGTGTTCAAAATCTCGATATCAGCTGCTTTCCAGTCC
CCAAAACGGACATCCTTTCCTTCTTCCAGTCAAGCTTTTACCTTAAGCAAGAGCTCAAGT
TCGACTTTAAGCGCCTTGTCATTGCTCCTCTTCATGCTCTTCTCGACATCTTCAATCTTC
TTTTTAATC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 2 11

CO CL445Contig1 867 4 5 U
GGAAGGCTTCGTTTACTTTGCAAACATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGC
ACTACATATGTTACCGAGAATCCCTAGTAAGAATCTAGGAGTTTCTTCATTTATACCATC
AGTGAACTCTCGGATATCATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGATCGAACTTTGG
ATTCGCAATCGATTCCAGGAAGAGGAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTAC
TGAAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTTCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTGGAAGACACTCA
GGTCGAGGAAGCAAAAACTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGGAT
ACTGAACCAGAAAGCTATTGAGGTTTCCGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGAC
AGGGGACATTGTGGAGATCAAATTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATCTA
CAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGTATCCACACTACTATTCGTATCCGGAG
AATCATTGCAGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGA
GATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTATTATCTGAGGGACAA
ACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAATGAGGCACCAAACTCAACATCAGTCTTTTGCTGTC
TTCAGTCTCCAAAGGTAGCCTGCTACTCGTCTCTTCCCTCTTCTTGTAAGAATTGTTTGT
TTGTTTGTTTGGTTGATTGTCTTTTGGATTTTGTTACTCTTCATGTAATATTACAGTGAC
AATTGAGAAAAGTAAATCAAAATGTTT


BQ
15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF63TF U -2
AF RR2BJ87TF U 1
AF RR2H194TF U 1
AF RR2BJ87JQ C 106
BS 1 730 RR2BJ87TF
BS 731 734 RR2H194TF
BS 735 735 RR2BJ87JQ
BS 736 748 RR2H194TF
BS 749 867 RR2BJ87JQ

RD RR2DF63TF 299 0 0
GGGAT
AAGGCTTCGTTTACTTTGCAAACACGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCAC
TACATATGTTACCGAGAATCCCTAGTAAGAATCTAGGAGTTTCTTCATTTATACCATCAG
TGAACTCTCGGATATCATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGATCGAACTTTGGAT
TCGCAATCGATTCCAGGAAGAGGAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTG
AAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTTCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTGGAAGACA

QA 6 299 6 299
DS 

RD RR2BJ87TF 730 0 0
GGAAGGCTTCGTTTACTTTGCAAACATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGC
ACTACATATGTTACCGAGAATCCCTAGTAAGAATCTAGGAGTTTCTTCATTTATACCATC
AGTGAACTCTCGGATATCATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGATCGAACTTTGG
ATTCGCAATCGATTCCAGGAAGAGGAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTAC
TGAAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTTCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTGGAAGACACTCA
GGTCGAGGAAGCAAAAACTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGGAT
ACTGAACCAGAAAGCTATTGAGGTTTCCGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGAC
AGGGGACATTGTGGAGATCAAATTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATCTA
CAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGTATCCACACTACTATTCGTATCCGGAG
AATCATTGCAGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGA
GATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTATTATCTGAGGGACAA
ACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAATGAGGCACCAAACTCAACATCAGTCTTTTGCTGTC
TTCAGTCTCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2H194TF 754 0 0
GGAAGGCTTCGTTTACTTTGCAAACATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGC
ACTACATATGTTACCGAGAATCCCTAGTAAGAATCTAGGAGTTTCTTCATTTATACCATC
AGTGAACTCTCGGATATCATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGATCGAACTTTGG
ATTCGCAATCGATTCCAGGAAGAGGAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTAC
TGAAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTTCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTGGAAGACACTCA
GGTCTAGGAAGCAAAAACTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGGAT
ACTGAACCAGAAAGCTATTGAGGTTTCCGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGAC
AGGGGACATTGTGGAGATCAAATTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATCTA
CAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGTATCCACACTACTATTCGTATCCGGAG
AATCATTGCAGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGA
GATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAG*CTTTATTATCTGAGGGACAA
ACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAA*TGAG*CAC*AAACTCA*CATCAGTCTTTTGCTGTC
TTCAGTCTCCAAAG*TAGCCTGCTACTC
GTCTCT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2BJ87JQ 762 0 0
TTCATTTATACCATCAGTGAACTCTCGGATATCATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTC
CAGATCGAACTTTGGATTCGCAATCGATTCCAGGAAGAGGAGGGAGTTTATAGCTAAAGC
CGAAGAGAGCAGTACTGAAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTTCGGAGGATGTTGCTGAAAC
AGTGGAAGACACTCAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGG
AGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCTATTGAGGTTTCCGAGAAAGTAAGACCGGT
TCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTGGAGATCAAATTGGAAGTACCTGAGAACAGGCG
TAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGTATCCACACTAC
TATTCGTATCCGGAGAATCATTGCAGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTC
ACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTA
TTATCTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAATGAGGCACCAAACTCAACAT
CAGTCTTTTGCTGTCTTCAGTCTCCAAAGGTAGCCTGCTACTCGTCTCTTCCCTCTTCTT
GTAAGAATTGTTTGTTTGTTTGTTTGGTTGATTGTCTTTTGGATTTTGTTACTCTTCATG
TAATATTACAGTGACAATTGAGAAAAGTAAATCAAAATGTTT

QA 1 762 1 762
DS 



CO CL445Contig2 877 7 35 U
GGAAGGCTTCGTTACTCTGCAAACATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCA
CTGCATATGATACCGAGAATCCCTAGTAAGAATCATCTAGGAGTTTCTTCATTTATACCA
TCAGTGAACTCTCGGATATCATTTTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCTGCTCGAACGTT
GGATTCGCAATCGATTCCAGGAAGCGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGT
ACTGAAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTGGAAGCTACT
CAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAACTCGGAGATGTCATGGGG
ATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCTGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGG
ACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGACGTAGGCTATCAATC
TACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATTCGTATCCGG
AGAATCATTGCAGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAG
GAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTATTATCTGAGGGAC
AAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAATGAGGCACCAAACCCAACATCAGTCTTTTGCTG
TCTTCAATCTCCAAAGGTAGCTTGCTACTCTTGTCTCTTCCCTCTTCTTGTAAGAATTGT
TTGTTTGTTTGCTTTGTCTTTTGGGATTTTGTTACTCGTCATGTAACATTACAGTGACAA
TTGAGAAAAGTAAATCAAAATGCTTTGTGAGGCTCCC


BQ
15 15 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2CQ95TF U 1
AF RR2EI78TF U 1
AF RR2HB81TF U -2
AF RR2DC90TF U 2
AF RR2DC90JQ C 130
AF RR2EI78JQ C 172
AF RR2HB81JQ C 207
BS 1 143 RR2CQ95TF
BS 144 145 RR2EI78TF
BS 146 168 RR2CQ95TF
BS 169 170 RR2EI78TF
BS 171 177 RR2CQ95TF
BS 178 178 RR2EI78TF
BS 179 199 RR2CQ95TF
BS 200 200 RR2EI78TF
BS 201 204 RR2CQ95TF
BS 205 205 RR2EI78TF
BS 206 267 RR2CQ95TF
BS 268 268 RR2EI78TF
BS 269 290 RR2CQ95TF
BS 291 291 RR2EI78TF
BS 292 295 RR2CQ95TF
BS 296 297 RR2EI78TF
BS 298 323 RR2CQ95TF
BS 324 324 RR2EI78TF
BS 325 341 RR2CQ95TF
BS 342 342 RR2EI78TF
BS 343 389 RR2CQ95TF
BS 390 390 RR2EI78TF
BS 391 431 RR2CQ95TF
BS 432 432 RR2EI78TF
BS 433 464 RR2CQ95TF
BS 465 465 RR2EI78TF
BS 466 524 RR2CQ95TF
BS 525 525 RR2EI78TF
BS 526 551 RR2CQ95TF
BS 552 552 RR2EI78TF
BS 553 636 RR2CQ95TF
BS 637 637 RR2HB81TF
BS 638 687 RR2DC90TF
BS 688 874 RR2DC90JQ
BS 875 877 RR2EI78JQ

RD RR2CQ95TF 636 0 0
GGAAGGCTTCGTTACTCTGCAAACATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCA
CTGCATATGATACCGAGAATCCCTAGTAAGAATCATCTAGGAGTTTCTTCATTTATACCA
TCAGTGAACTCTCGGATATCATTGCCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCATCTCGAACTTT
GGATTCGCAATCGATTCCATGAAGAGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGT
ACTGAAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTTCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTAGAAGACACT
CAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCCTTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGG
ATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGG
ACAGGGGACATCGTAGAGATCAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATC
TACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACCACTATTCGTATCCGG
AGAATCATTGCTGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAG
GAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2EI78TF 624 0 0
GGAAGGCTTCGTTACTCTGCAAACATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCA
CTGCATATGATACCGAGAATCCCTAGTAAGAATCATCTAGGAGTTTCTTCATTTATACCA
TCAGTGAACTCTCGGATATCATTTTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCTGCTCGAACGTT
GGATTCGCAATCGATTCCAGGAAGCGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGT
ACTGAAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTGGAAGCTACT
CAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAACTCGGAGATGTCATGGGG
ATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCTGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGG
ACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGACGTAGGCTATCAATC
TACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATTCGTATCCGG
AGAATCATTGCAGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAG
GAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2HB81TF 640 0 0
GGGAT
AAGGCTTCGTTACTCTGCAAACATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCACT
GCATATGATACCGAGAATCCCTAGTAAGAATCATCTAGGAGTTTCTTCATTTATACCATC
AGTGAACTCTCGGATATCATTTTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCTGCTCGAACGTTGG
ATTCGCAATCGATTCCAGGAAGCGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTAC
TGAAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTGGAAGCTACTCA
GGTCGAGGAAGCAAAAACTCCGTGGAAGCCAAGGGCCAAACTCGGAGATGTCATGGGGAT
ACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCTGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGAC
AGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGACGTAGGCTATCAATCTA
CAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATTCGTATCCGGAG
AATCATTGCAGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGA
GATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAG

QA 6 640 6 640
DS 

RD RR2DC90TF 686 0 0
GG
AGGCTTCGTTACTCTGCAAACATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCACTG
CATATGATACCGAGAATCCCTAGTAAGAATCATCTAGGAGTTTCTTCATTTATACCATCA
GTGAACTCTCGGATATCATTTTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCTGCTCGAACGTTGGA
TTCGCAATCGATTCCAGGAAGCGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACT
GAAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCC**AGGATGTTGCTGAAACAGTGGAAGCTACTCAG
GTCGAGGAAGCAAAAACTCCGCGGAAGCCAAGGACCAAACTCGGAGATGTCATGGGGATA
CTGAACCAGAAAGCAGTTGAGGTTTCTGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACA
GGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGACGTAGGCTATCAATCTAC
AAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATTCGTATCCGGAGA
ATCATTGCAGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGAG
ATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTATTATCTGAGGGACAAA
CTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAA

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR2DC90JQ 746 0 0
TCTCGGATATCATTTTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCTGCTCGAACGTTGGATTCGCA
ATCGATTCCAGGAAGCGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGAAGGT
GAAGACACTGAAGCAGTTCC**AGGATGTTGCTGAAACAGTGGAAGCTACTCAGGTCGAG
GAAGCAAAAACTCCGCGGAAGCCAAGGACCAAACTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAAC
CAGAAAGCAGTTGAGGTTTTTGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGAC
ATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGACGTAGGCTATCAATCTACAAAGGG
ATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATTCGTATCCGGAGAATCATT
GCAGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAA
GTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTATTATCTGAGGGACAAACTTCCT
CGTCTCTCTACTTTTAAATGAGGCACCAAACCCAACATCAGTCTTTTGCTGTCTTCAATC
TCCAAAGGTAGCTTGCTACTCTTGTCTCTTCCCTCTTCTTGTAAGAATTGTTTGTTTGTT
TGCTTTGTCTTTTGGGATTTTGTTACTCGTCATGTAACATTACAGTGACAATTGAGAAAA
GTAAATCAAAATGCTTTGTGAGGCT
C

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2EI78JQ 706 0 0
TCGAACGTTGGATTCGCAATCGATTCCAGGAAGCGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAA
GAGAGCAGTACTGAAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTG
GAAGCTACTCAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAACTCGGAGAT
GTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCTGAGAAAGTAAGACCGGTTCCA
GAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGACGTAGG
CTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATT
CGTATCCGGAGAATCATTGCAGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCC
AACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTATTAT
CTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAATGAGGCACCAAACCCAACATCAGT
CTTTTGCTGTCTTCAATCTCCAAAGGTAGCTTGCTACTCTTGTCTCTTCCCTCTTCTTGT
AAGAATTGTTTGTTTGTTTGCTTTGTCTTTTGGGATTTTGTTACTCGTCATGTAACATTA
CAGTGACAATTGAGAAAAGTAAATCAAAATGCTTTGTGAGGCTCCC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2HB81JQ 671 0 0
AAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGAAGGTGAAGACACTGAAGCAGT
TCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTGGAAGCTACTCAGGTCGAGGAAGCAAAAACTCCGTG
GAAGCCAAGGGCCAAACTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGT
TTCTGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACT
GGAAGTACCTGAGAACAGACGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCA
AAACGCAGGCATCCACACTACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCAGGCATTGGCGTTGA
AATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAA
AGTGAGAAGAGCAAGGCTTTATTATCTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAA
ATGAGGCACCAAACCCAACATCAGTCTTTTGCTGTCTTCAATCTCCAAAGGTAGCTTGCT
ACTCTTGTTTCTTCCCTCTTCTTGTAAGAATTGTTTGTTTGTTTGCTTTGTCTTTTGGGA
TTTTGTTACTCGTCATGTAACATTACAGTGACAATTGAGAAAAGTAAATCAAAATGCTTT
GTGAGGCT
CCC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 2 11

CO CL446Contig1 1175 6 13 U
AGAATATTGATTAACATTGTAATGCAACCAAACAACAATGCACCATTTAGTCAGAAAAGC
CTAAGCACCGATTATTATGTTTCACAACTTAATAAAGATCATTTCCAAGCTTCCAATAAA
TAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCTCCATCCTTATTGCATTCACATTATTTCTTCT
TGTGATCCAAGTTTGAACCTTCTTTAGTGTTTTGGGTGAAAAACTTGAACTCTTTTCCCT
GCCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGTCTCAAAAAAGCTCACTTGATCTTTTTCATTCTTTC
ACGCTGTTATCAACTCTTAACACCACCATCTCACTAGACCGTCATGAACAGCCAGAAGGA
TGACATCACGACCGCAAACGCCAAGCCAAGCTGAGAAGAATTAATAACTGAAGCTGAACT
TGTTGAGTTGGCTTTGCTAGAAGACGCCGTAGGAGCAGTATCAGCAGCCTTAGCAGCAGC
AGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGGTGGGGATGGTGGCTCGTCATACTC
ATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGGTGAAGATGATGTATAAACAAAATC
AGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCTAATATGAAGCACCGAGATGTTAAA
CGGCTCTGACGCAACCGACTCTAAAAGCTGAGCATCAAGGAGAGAACCATAAACCGCAGA
TCCAAACATAACGTCGCCGTTGTTATTAACGGTTACGTTTATGAACCCTTGTTTGCCTTT
GGCTTGACCACTTGATTGGAAGAGAGTGGTGAGTAACGCTGTTTTCTTGCTCAGGCTCTT
GAGTTTCTTGATGTCGTAGTAGTCTAGGACGACGTGGAGGCTGAAGGCTCTCTTGTTTTC
TTCGACCGATTGGCTGGAGAAGAAGGACATTGCGTCGTTGGAGAGGGCGAGGACGGTTAT
GGTCTGACGGGAGTTGATGGTGGAAGCGAGTTGGGTCTGGGAGAGCATCTTGTTGAAATC
GGAGAAGTTTTTGTTTTGGCTTAAGATGGTTGTGATGTTGAATGAGTTTGATGGAGTGTA
GAGGAAGGTAAAAGCGAATAAGAAGAAGAGTGTTAGTGAAGAATAAGAAGAAGAAGACAT
TGTGTTGATTGATAGAGATAGATGAGGTTACTTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A553JQ U 1
AF RR2ER13JQ U 1
AF RR2BP89JQ U 53
AF RR2EU96JQ U 24
AF RR2DJ05TF C 342
AF RR2B531TF C 348
BS 1 178 RR2A553JQ
BS 179 179 RR2ER13JQ
BS 180 525 RR2A553JQ
BS 526 526 RR2ER13JQ
BS 527 772 RR2A553JQ
BS 773 786 RR2DJ05TF
BS 787 787 RR2B531TF
BS 788 815 RR2DJ05TF
BS 816 816 RR2B531TF
BS 817 963 RR2DJ05TF
BS 964 964 RR2B531TF
BS 965 988 RR2DJ05TF
BS 989 1175 RR2B531TF

RD RR2A553JQ 772 0 0
AGAATATTGATTAACATTGTAATGCAACCAAACAACAATGCACCATTTAGTCAGAAAAGC
CTAAGCACCGATTATTATGTTTCACAACTTAATAAAGATCATTTCCAAGCTTCCAATAAA
TAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCTCCATCCTTATTGCATTCACATTATTTCTTAT
TGTGATCCAAGTTTGAACCTTCTTTAGTGTTTTGGGTGAAAAACTTGAACTCTTTTCCCT
GCCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGTCTCAAAAAAGCTCACTTGATCTTTTTCATTCTTTC
ACGCTGTTATCAACTCTTAACACCACCATCTCACTAGACCGTCATGAACAGCCAGAAGGA
TGACATCACGACCGCAAACGCCAAGCCAAGCTGAGAAGAATTAATAACTGAAGCTGAACT
TGTTGAGTTGGCTTTGCTAGAAGACGCCGTAGGAGCAGTATCAGCAGCCTTAGCAGCAGC
AGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGGTGGGGATGGCGGCTCGTCATACTC
ATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGGTGAAGATGATGTATAAACAAAATC
AGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCTAATATGAAGCACCGAGATGTTAAA
CGGCTCTGACGCAACCGACTCTAAAAGCTGAGCATCAAGGAGAGAACCATAAACCGCAGA
TCCAAACATAACGTCGCCGTTGTTATTAACGGTTACGTTTATGAACCCTTGT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2ER13JQ 767 0 0
AGAATATTGATTAACATTGTAATGCAACCAAACAACAATGCACCATTTAGTCAGAAAAGC
CTAAGCACCGATTATTATGTTTCACAACTTAATAAAGATCATTTCCAAGCTTCCAATAAA
TAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCTCCATCCTTATTGCATTCACATTATTTCTTCT
TGTGATCCAAGTTTGAACCTTCTTTAGTGTTTTGGGTGAAAAACTTGAACTCTTTTCCCT
GCCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGTCTCAAAAAAGCTCACTTGATCTTTTTCATTCTTTC
ACGCTGTTATCAACTCTTAACACCACCATCTCACTAGACCGTCATGAACAGCCAGAAGGA
TGACATCACGACCGCAAACGCCAAGCCAAGCTGAGAAGAATTAATAACTGAAGCTGAACT
TGTTGAGTTGGCTTTGCTAGAAGACGCCGTAGGAGCAGTATCAGCAGCCTTAGCAGCAGC
AGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGGTGGGGATGGTGGCTCGTCATACTC
ATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGGTGAAGATGATGTATAAACAAAATC
AGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCTAATATGAAGCACCGAGATGTTAAA
CGGCTCTGACGCAACCGACTCTAAAAGCTGAGCATCAAGGAGAGAACCATAAACCGCAGA
TCCAAACATAACGTCGCCGTTGTTATTAACGGTTACGTTTATGAACC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2BP89JQ 696 0 0
AGAAAAGCCTAAGCACCGATTATTATGTTTCACAACTTAATAAAGATCATTTCCAAGCTT
CCAATAAATAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCTCCATCCTTATTGCATTCACATTA
TTTCTTCTTGTGATCCAAGTTTGAACCTTCTTTAGTGTTTTGGGTGAAAAACTTGAACTC
TTTTCCCTGTCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGTCTCAAAAAAGCTCACTTGATCTTTTTC
ATTCTTTCACGCTGTTATCAACTCTTAACACCACCATCTCACTAGACCGTCATGAACAGC
CAGAAGGATGACATCACGACCGCAAACGCCAAGCCAAGCTGAGAAGAATTAATAACTGAA
GCTGAACTTGTTGAGTTGGCTTTGCTAGAAGACGCCGTAGGAGCAGTATCAGCAGCCTTA
GCAGCAGCAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGGTGGGGATGGTGGCTCG
TCATACTCATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGGTGAAGATGATGTATAA
ACAAAATCAGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCTAATATGAAGCACCGAG
ATGTTAAACGGCTCTGACGCAACCGACTCTAAAAGCTGAGCATCAAGGAGAGAACCATAA
ACCGCAGATCCAAACATAACGTCGCCGTTGTTAT
AA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2EU96JQ 724 0 0
GT
AACCAAACAACAATGCACCATTTAGTCAGAAAAGCCTAAGCACCGATTATTATGTTTCAC
AACTTAATAAAGATCATTTCCAAGCTTCCAATAAATAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACT
TTCTCCATCCTTATTGCATTCACATTATTTCTTCTTGTGATCCAAGTTTGAACCTTCTTT
AGTGTTTTGGGTGAAAAACTTGAACTCTTTTCCCTGCCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGT
CTCAAAAAAGCTCACTTGATCTTTTTCATTCTTTCACGCTGTTATCAACTCTTAACACCA
CCATCTCACTAGACCGTCATGAACAGCCAGAAGGATGACATTACGACCGCAAACGCCAAG
CCAAGCTGAGAAGAATTAATAACTGAAGCTGAACTTGTTGAGTTGGCTTTGCTAGAAGAC
GCCGTAGGAGCAGTATCAGCAGCCTTAGCAGCAGCAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCA
GAGGATGATGGTGGGGATGGTGGCTCGTAATACTCATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGT
GCAGGAAGTGGTGAAGATGATGTATAAACAAAATCAGAATTATTAGGATCCATTATAGGT
ATAGAAGTGCTAATATGAAGCACCGAGATGTTAAACGGCTCTGACGCAACCGACTCTAAA
AGCTGAGCATCAAGGAGAGAACCATAAACCGCAGATCCAAACATAACGTCGCCGTTGTTA
TT

QA 3 724 3 724
DS 

RD RR2DJ05TF 648 0 0
TCATGAACAGCCAGAAGGATGACATCACGACCGCAAACGCCAAGCCAAGCTGAGAAGAAT
TAATAACTGAAGCTGAACTTGTTGAGTTGGCTTTGCTAGAAGACGCCGTAGGAGCAGTAT
CAGCAGCCTTAGCAGCAGCAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGGTGGGG
ATGGTGGCTCGTCATACTCATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGGTGAAG
ATGATGTATAAACAAAATCAGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCTAATAT
GAAGCACCGAGATGTTAAACGGCTCTGACGCAACCGACTCTAAAAGCTGAGCATCAAGGA
GAGAACCATAAACCGCAGATCCAAACATAACGTCGCCGTTGTTATTAACAGTTACGTTTA
TGAACCCTTGTTTGCCTTTGGCTTGGCCACTTGATTGGAAGAGAGTGGTGAGTATCGCTG
TTTTCTTGCTCAGGCTCTTGAGTTTCTTGATGTCGTAGTAGTCTAGGACGACGTGGAGGC
TGAAGGCTCTCTTGTTTTCTTCGACCGATTGGCTGGAGAAGAAGGACATTGCGTCGTTGG
AGAGGGCGAGGACGGTTATGGTTTGACGGGAGTTGATGGTGGAAGCG
C

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2B531TF 828 0 0
ACAA
CCAGAAGGATGACATCACGACCGCAAACGCCAAGTTAAGCTGAGAAGAATTAATAACCGA
AGCTGAACTTGTTGAGTTGTCTTTGCTAGAAGACGCCGTAGGAGCAGTATCAGCAGCCTT
AGCAGCAGCAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGGTGGGGATGGTGGCTC
GTCATACTCATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGGTGAAGATGATGTATA
AACAAAATCAGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCTAATATGAAGCACCGA
GATGTTAAACGGCTCTGACGCAACCGACTCTAAAAGCTGAGCATCAAGGAGAGAACCATA
AACCGCAGATCCAAACATGACGTCGCCGTTATTGTTAACGGTTACGTTTATGAAGCCTTG
TTTGCCTTTGGCTTGACCGCTTGATTGGAAGAGAGTGGTGAGTAACGCTGTTTTCTTGCT
CAGGCTCTTGAGTTTCTTGATGTCGTAGTAGTCTAGGACGACGTGGAGGCTGAAGGCTCT
CTTGTTTTCTTCGACCGATTGGCTGGAGAAGAAGGACATTGTGTCGTTGGAGAGGGCGAG
GACGGTTATGGTCTGACGGGAGTTGATGGTGGAAGCGAGTTGGGTCTGGGAGAGCATCTT
GTTGAAATCGGAGAAGTTTTTGTTTTGGCTTAAGATGGTTGTGATGTTGAATGAGTTTGA
TGGAGTGTAGAGGAAGGTAAAAGCGAATAAGAAGAAGAGTGTTAGTGAAGAATAAGAAGA
AGAAGACATTGTGTTGATTGATAGAGATAGATGAGGTTACTTTC

QA 5 828 5 828
DS 



CO CL446Contig2 752 5 12 U
GGAAAGCAACCTCATCTATCTCTACCAATCAACACAATGTCTTCTTCTTATTCTTCACTT
ACACTCTTCATCTTCTTATTCGCTTCTGCCTTCCTCTACACTCCATCAAACTCATTCAAC
ATCACAACCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAAATGCTCTCCCAG
ACCCAACTCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCAAC
GACGCAATGTCCTTCTTCTCCAGCCAATCGGTCGAAGAAAACAAGAGAGCCTTCAGCCTC
CACGTCGTCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAAAACAGCG
ATACTCACCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAAAC
GTAACCGTTAATAACAACGGCGACGTTATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCCTT
GATGCTCAGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCAGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATATT
AGCACTTCTATACCTATAATGGATCCTAATAATTCTGATTTTGTTTATACATCATCTTCA
CCACTTCCTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACCATCCCCA
CCATCATCCTCTGCTAAG*CTAA*GCTCATGCTCCTGCTGCTGCTAAGCTGCTGATACTG
CTCCTACGCGTCTTCTAGCAAAGCCACTCACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A553TF U 1
AF RR2EU96TF U 1
AF RR2BP89TF U 6
AF RR2ER13TF U 6
AF RR2C250TF U 7
BS 1 134 RR2A553TF
BS 135 135 RR2EU96TF
BS 136 141 RR2A553TF
BS 142 142 RR2EU96TF
BS 143 650 RR2A553TF
BS 651 651 RR2EU96TF
BS 652 678 RR2A553TF
BS 679 679 RR2EU96TF
BS 680 683 RR2A553TF
BS 684 684 RR2EU96TF
BS 685 702 RR2A553TF
BS 703 752 RR2C250TF

RD RR2A553TF 702 0 0
GGAAAGCAACCTCATCTATCTCTACCAATCAACACAATGTCTTCTTCTTATTCTTCACTT
ACACTCTTCATCTTCTTATTCGCTTCTGCCTTCCTCTACACTCCATCAAACTCATTCAAC
ATCACAACCATCTTGAGCCAATACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAAATGCTCTCCCAG
ACCCAACTCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCAAC
GACGCAATGTCCTTCTTCTCCAGCCAATCGGTCGAAGAAAACAAGAGAGCCTTCAGCCTC
CACGTCGTCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAAAACAGCG
ATACTCACCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAAAC
GTAACCGTTAATAACAACGGCGACGTTATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCCTT
GATGCTCAGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCAGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATATT
AGCACTTCTATACCTATAATGGATCCTAATAATTCTGATTTTGTTTATACATCATCTTCA
CCACTTCCTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCGCCATCCCCA
CCATCATCCTCTGCTAAGGCTAACGCTCATGCTCCTGCTGCT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2EU96TF 699 0 0
GGAAAGC
AACCTCATCTATCTCTACCAATCAACACAATGTCTTCTTCTTATTCTTCACTTACACTCT
TCATCTTCTTATTCGCTTCTGCCTTCCTCTACACTCCATCAAACTCATTCAACATCACAA
CCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAAATGCTCTCCCAGACCCAAC
TCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCAACGACGCAA
TGTCCTTCTTCTCCAGCCAATCGGTCGAAGAAAACAAGAGAGCCTTCAGCCTCCACGTCG
TCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAAAACAGCGATACTCA
CCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAAACGTAACCG
TTAATAACAACGGCGACGTTATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCCTTGATGCTC
AGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCAGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATATTAGCACTT
CTATACCTATAATGGATCCTAATAATTCTGATTTTGTTTATACATCATCTTCACCACTTC
CTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATTACGAGCCACCATCCCCACCATCAT
CCTCTGCTAAG*CTAA*GCTCATGCTCCTGCT

QA 8 699 8 699
DS 

RD RR2BP89TF 680 0 0
GG
AACCTCATCTATCTCTACCAATCAACACAATGTCTTCTTCTTATTCTTCACTTACACTCT
TCATCTTCTTATTCGCTTCTGCCTTCCTCTACACTCCATCAAACTCATTCAACATCACAA
CCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAAATGCTCTCCCAGACCCAAC
TCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCAACGACGCAA
TGTCCTTCTTCTCCAGCCAATCGGTCGAAGAAAACAAGAGAGCCTTCAGCCTCCACGTCG
TCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAAAACAGCGATACTCA
CCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAAACGTAACCG
TTAATAACAACGGCGACGTTATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCCTTGATGCTC
AGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCAGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATATTAGCACTT
CTATACCTATAATGGATCCTAATAATTCTGATTTTGTTTATACATCATCTTCACCACTTC
CTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACCATCCCCACCATCAT
CCTCTGCTAAG
CTAAGCT

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR2ER13TF 656 0 0
GG
AACCTCATCTATCTCTACCAATCAACACAATGTCTTCTTCTTATTCTTCACTTACACTCT
TCATCTTCTTATTCGCTTCTGCCTTCCTCTACACTCCATCAAACTCATTCAACATCACAA
CCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAAATGCTCTCCCAGACCCAAC
CCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCAACGACGCAA
TGTCCTTCTTCTCCAGCCAATCGGTCGAAGAAAACAAGAGAGCCTTCAGCCTCCACGTCG
TCCTGGACTACTACGACATCAAGAAACTTAAAAGCCTGAGCAAGAAAACAGCGATACTCA
CCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAAACGTAACCG
TTAATAACAACGGCGACGTTATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCCTTGATGCTC
AGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCAGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATATTAGCACTT
CTATACCTATAATGGATCCTAATAATTCTGATTTTGTTTATACATCATCTTCACCACTTC
CTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACCATCCCCAC

QA 3 656 3 656
DS 

RD RR2C250TF 746 0 0
G
AACCTCATCTATCTCTACCAATCAACACAATGTCTTCTTCTTATTCTTCACTTACACTCT
TCATCTTCTTATTCGCTTCTGCCTTCCTCTACACTCCATCAAACTCATTCAACATCACAA
CCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAAATGCTCTCCCAGACCCAAC
TCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCAACGACGCAA
TGTCCTTCTTCTCCAGCCAATCGGTCGAAGAAAACAAGAGAGCCTTCAGCCTCCACGTCG
TCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAAAACAGCGATACTCA
CCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAAACGTAACCG
TTAATAACAACGGCGACGTTATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCCTTGATGCTC
AGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCAGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATATTAGCACTT
CTATACCTATAATGGATCCTAATAATTCTGATTTTGTTTATACATCATCTTCACCACTTC
CTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACCATCCCCACCATCAT
CCTCTGCTAAG*CTAA*GCTCATGCTCCTGCTGCTGCTAAGCTGCTGATACTGCTCCTAC
GCGTCTTCTAGCAAAGCCACTCACA

QA 2 746 2 746
DS 



AS 2 7

CO CL447Contig1 921 2 4 U
GGCGCTGAATGAGATATACGTAGAAGAAGAAGACTACGACAGGTTGCGCGAGTCTATTGA
TTTGCATGACAGCTTTGATCAGATAGGCCTCGCTCAGAAGATTGAGAAACACGAGCTTGT
GGAAATGAGACGTGTGGCTGCGTATATCTACAAGAAAGCTGGTAGATGGAAGCAATCAAT
TGCGTTGTCCAAGAAAGATAACATGTACAAGGACTGTATGGAAACTGCTTCACAATCCGG
CGACCATGACCTTGCTGAACAACTTCTGGTTTACTTCATTGAACAGGGTAAAAAGGAATG
CTTTGCCACATGTCTCTTTGTCTGTTATGACTTAATCCGACCAGATGTTGCTCTGGAACA
TGCTTGGATCAACAATATGCTTGACTTTGCCTTCCCGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGA
ATACTCTGGGAAAGTGGATGAACTAATCAAGGACAAGCTAGAAGCACAGAAGGAAGTGAA
GGCCAAAGAGCAGGAAGAGAAGGATGTCATGTCCCAACAGAACATGTACGCCCAATTATT
GCCACTGGCTCTACCTGCCCCACCGATGCCAGGAATGGGAGGTGGTCCAGGGATGGGAGG
CGGTTACGGTCCGCCACCACAGATGGGAGGGATGCCCGGTATGCCACCAATGCCACCATA
TGGAATGCCACCGATGGGAGGCTACTAAGACCATCGAAAACAAAAACTCATCTCTACCAC
GGTGGTATTCGTCTACTACAGGACTGTGACTGTTACTCGTACGGAATGTTTCCTTTCTTT
TTTTGATTTTATAGGGTATGTGTGGATAATAATCTCGGTACACTTCCGTTTGTAATAATA
TTCTTTGGGATCTTTAGAAGAGTCATTTTTGGTTTAAGGCCATTTTACCATTGTCAACAT
TTTATAAAACTTTTTGAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G504TF U 1
AF RR2CL04TF U 273
BS 1 528 RR2G504TF
BS 529 529 RR2CL04TF
BS 530 579 RR2G504TF
BS 580 921 RR2CL04TF

RD RR2G504TF 588 0 0
GGCGCTGAATGAGATATACGTAGAAGAAGAAGACTACGACAGGTTGCGCGAGTCTATTGA
TTTGCATGACAGCTTTGATCAGATAGGCCTCGCTCAGAAGATTGAGAAACACGAGCTTGT
GGAAATGAGACGTGTGGCTGCGTATATCTACAAGAAAGCTGGTAGATGGAAGCAATCAAT
TGCGTTGTCCAAGAAAGATAACATGTACAAGGACTGTATGGAAACTGCTTCACAATCCGG
CGACCATGACCTTGCTGAACAACTTCTGGTTTACTTCATTGAACAGGGTAAAAAGGAATG
CTTTGCCACATGTCTCTTTGTCTGTTATGACTTAATCCGACCAGATGTTGCTCTGGAACA
TGCTTGGATCAACAATATGCTTGACTTTGCCTTCCCGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGA
ATACTCTGGGAAAGTGGATGAACTAATCAAGGACAAGCTAGAAGCACAGAAGGAAGTGAA
GGCCAAAGAGCAGGAAGAGAAGGATGTCATGTCCCAACAGAACATGTATGCCCAATTATT
GCCACTGGCTCTACCTGCCCCACCGATGCCAGGAATGGG
GAGGTGGTC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2CL04TF 649 0 0
G
CTTCATTGAACAGGGTAAAAAGGAATGCTTTGCCACATGTCTCTTTGTCTGTTATGACTT
AATCCGACCAGATGTTGCTCTGGAGCATGCTTGGATCAACAATATGCTTGACTTTGCCTT
CCCGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGAATACTCTGGGAAAGTGGATGAACTAATCAAGGA
CAAGCTAGAAGCACAGAAGGAAGTGAAGGCCAAAGAGCAGGAAGAGAAGGATGTCATGTC
CCAACAGAACATGTACGCCCAATTATTGCCACTGGCTCTACCTGCCCCACCGATGCCAGG
AATGGGAGGTGGTCCAGGGATGGGAGGCGGTTACGGTCCGCCACCACAGATGGGAGGGAT
GCCCGGTATGCCACCAATGCCACCATATGGAATGCCACCGATGGGAGGCTACTAAGACCA
TCGAAAACAAAAACTCATCTCTACCACGGTGGTATTCGTCTACTACAGGACTGTGACTGT
TACTCGTACGGAATGTTTCCTTTCTTTTTTTGATTTTATAGGGTATGTGTGGATAATAAT
CTCGGTACACTTCCGTTTGTAATAATATTCTTTGGGATCTTTAGAAGAGTCATTTTTGGT
TTAAGGCCATTTTACCATTGTCAACATTTTATAAAACTTTTTGAGTTT

QA 2 649 2 649
DS 



CO CL447Contig2 1149 5 9 U
AAAATGATGGAAATTTATAAGTGAAACAATAAGCTCAAAGAAAGAACCAACATGAAACAA
GGTCAAAGTAAATGATAAGACTATCAATGAGTCACCTCTCTCCGCTCCAAAGAAATGTAA
TAAAATGTGTCCTTAAACCAAAAATGACTCACCTAAAAGACCCCCCAAAGAATATTACAA
ACAAAAGTACGAGAGATTATTATCCACACATACCTATAAAATCAAACAACGAAAGAAACA
TTCCGACGAATACCACCGTGGTAGAGATTGCGCAACTGCTTACTTGGACGGATAGCTTTT
GTTTCTGATAGTCTTAGTAGCCGCCCATCGGTGGCATTCCATATGGTGGCATCGGAGGCA
TTCCCGGCATTCCTCCCATTGGTGGTGGCGGACCATAACCGCCTCCCATACCTGGACCTC
CTCCCATTCCTGGCATCGGTGGTGCAGGTAGAGCCAGTGGCAATAGTTGTGCGTACATGT
TCTGTTGGGACATGACATCCTTCTCTTCCTGCTCTTTGGCCTTCACTTCTTTCTGTGCCT
CTATCTTATCCTTGATCAGTTCATCCACTTTGCCAGAGTATTCTCGGATAAACTGGAGGA
GATACGGGAAGGCGAAGTCAATCATGTTGTTGATCCAAGCAAGTTCTAGAGCAACATCTG
GTCGGATTAAGTCATAACACACAAATAGACATGTGGCAAAGCATTCCTTTTTCCCCTGTT
CAATGAAGTAAACCAGAAGCTGTTCTGCAAGGTCATGGTCGCCGGATCGTGAAGCAGTTT
CCATACAGTCCTTGTACATGTTATCTTTCTTCGACAAAGCAATTGATTGCTTCCATCTAC
CAGCTTTCTTGTAGATATACGCAGCCACACGTCTCATTTCCACGAGCTCGTGTTTCTCAA
TCTTCTGAGCGAGGCCTATCTGGTCAAAGCTGTCATGCAAATCAGTAGACTCGCGCAACC
TGTCATAGTCTTCTTCTTCTACGTATATCTCATTCAGAGCTTCATTTACAGCAGAAACAT
TGTTGCTCTGAACTGCAACCATGTACGGCTTAATAAGGCGCAACTGACCAGCCTTGCGCA
TAATATCAACGACACGTGTGTGGTCTAACCGCAGAGCAAGCACATTGAGAAGATCGTTGA
TTATATCAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP86JQ U 1
AF RR2EX03JQ U 59
AF RR2BW34JQ U 6
AF RR2BW34TF C 436
AF RR2GP86TF C 387
BS 1 198 RR2GP86JQ
BS 199 199 RR2BW34JQ
BS 200 545 RR2GP86JQ
BS 546 546 RR2BW34JQ
BS 547 644 RR2GP86JQ
BS 645 722 RR2BW34JQ
BS 723 723 RR2GP86TF
BS 724 745 RR2BW34JQ
BS 746 1149 RR2GP86TF

RD RR2GP86JQ 644 0 0
AAAATGATGGAAATTTATAAGTGAAACAATAAGCTCAAAGAAAGAACCAACATGAAACAA
GGTCAAAGTAAATGATAAGACTATCAATGAGTCACCTCTCTCCGCTCCAAAGAAATGTAA
TAAAATGTGTCCTTAAACCAAAAATGACTCACCTAAAAGACCCCCCAAAGAATATTACAA
ACAAAAGTACGAGAGATTGTTATCCACACATACCTATAAAATCAAACAACGAAAGAAACA
TTCCGACGAATACCACCGTGGTAGAGATTGCGCAACTGCTTACTTGGACGGATAGCTTTT
GTTTCTGATAGTCTTAGTAGCCGCCCATCGGTGGCATTCCATATGGTGGCATCGGAGGCA
TTCCCGGCATTCCTCCCATTGGTGGTGGCGGACCATAACCGCCTCCCATACCTGGACCTC
CTCCCATTCCTGGCATCGGTGGTGCAGGTAGAGCCAGTGGCAATAGTTGTGCGTACATGT
TCTGTTGGGACATGACATCCTTCTCTTCCTGCTCTTTGGCCTTCACTTCTTTCTGTGCCT
CTATCCTATCCTTGATCAGTTCATCCACTTTGCCAGAGTATTCTCGGATAAACTGGAGGA
GATACGGGAAGGCGAAGTCAATCATGTTGTTGATCCAAGCAAGT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2EX03JQ 603 0 0
AAGGTCAAAGTAAATGATAAGACTATCAATGAGTCACCTCTCTCCGCTCCAAAGAAATGT
AATAAAATGTGTCCTTAAACCAAAAATGACTCACCTAAAAGACCCCCCAAAGAATATTAC
AAACAAAAGTACGAGAGATTATTATCCACACATACCTATAAAATCAAACAACGAAAGAAA
CATTCCGACGAATACCACCGTGGTAGAGATTGCGCAACTGCTTACTTGGACGGATAGCTT
TTGTTTCTGATAGTCTTAGTAGCCGCCCATCGGTGGCATTCCATATGGTGGCATCGGAGG
CATTCCCGGCATTCCTCCCATTGGTGGTGGCGGACCATAACCGCCTCCCATACCTGGACC
TCCTCCCATTCCTGGCATCGGTGGTGCAGGTAGAGCCAGTGGCAATAGTTGTGCGTACAT
GTTCTGTTGGGACATGACATCCTTCTCTTCCTGCTCTTTGGCCTTCACTTCTTTCTGTGC
CTCTATCTTATCCTTGATCAGTTCATCCACTTTGCCAGAGTATTCTCGGATAAACTGGAG
GAGATACGGGAAGGCGAAGTCAATCATGTTGTTGATCCAAGCAAGTTCTAGAGCAACATC
TGG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2BW34JQ 742 0 0
GATGGAAATTTATAAGTGAAACAATAAGCTCAAAGAAAGAACCAACATGAAACAAGGTCA
AAGTAAATGATAAGACTATCAATGAGTCACCTCTCTCCGCTCCGAAGAAATGTAATAAAA
TGTGTCCTTAAACCAAAAATGACTCACCTAAAAGACCCCCCAAAGAATATTACAAACAAA
AGTACGAGAGATTATTATCCACACATACCTATAAAATCAAACAACGAAAGAAACATTCCG
ACGAATACCACCGTGGTAGAGATTGCGCAACTGCTTACTTGGACGGATAGCTTTTGTTTC
TGATAGTCTTAGTAGCCGCCCATCGGTGGCATTCCATATGGTGGCGTCGGAGGCATTCCC
GGCATTCCTCCCATTGGTGGTGGCGGACCATAACCGCCTCCCATACCTGGACCTCCTCCC
ATTCCTGGCATCGGTGGTGCAGGTAGAGCCAGTGGCAATAGTTGTGCGTACATGTTCTGT
TGGGACATGACATCCTTCTCTTCCTGCTCTTTGGCCTTCACTTCTTTCTGTGCCTCTATC
TTATCCTTGATCAGTTCATCCACTTTGCCAGAATATTCTCGGATAAACTGGAGGAGATAC
GGGAAGGCGAAGTCAATCATGTTGTTGATCCAAGCAAGTTCTAGAGCAACATCTGGTCGG
ATTAAGTCATAACACACAAATAGACATGTGGCAAAGCATTCCTTTTTCCCCTGTTCA*TG
AAGTAAACCAGAAGCTGTTC
TG

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2BW34TF 704 0 0
CATCGT
GTGCAGGTAGAGCCAGTGGCAATAGTTGTGCGTACATGTTCTGTTGGGACATGACATCCT
TCTCTTCCTGCTCTTTGGCCTTCACTTCTTTCTGTGCCTCTATCTTATCCTTGATCAGTT
CATCCACTTTGCCAGAGTATTCTCGGATAAACTGGAGGAGATACGGGAAGGCGAAGTCAA
TCATGTTGTTGATCCAAGCAAGTTCTAGAGCAACATCTGGTCGGATTAAGTCATAACACA
CAAATAGACATGTGGCAAAGCATTCCTTTTTCCCCTGTTCAATGAAGTAAACCAGAAGCT
GTTCTGCAAGGTCATGGTCGCCGGATTGTGAAGCAGTTTCCATACAGTCCTTGTACATGT
TATCTTTCTTCGACAAAGCAATTGATTGCTTCCATCTACCAGCTTTCTTGTAGATATACG
CAGCCACACGTCTCATTTCCACGAGCTCGTGTTTCTCAATCTTCTGAGCGAGGCCTATCT
GGTCAAAGCTGTCATGCAAATCAGTAGACTCGCGCAACCTGTCATAGTCTTCTTCTTCTA
CGTATATCTCATTCAGAGCTTCATTTACAGCAGAAACATTGTTGCTCTGAACTGCAACCA
TGTACGGCTTAATAAGGCGCAACTGACCAGCCTTGCGCATAATATCAACGACACGTGTGT
GGTCTAACCGCAGAGCAAGCACATTGAGAAGATCGTT
C

QA 7 703 7 703
DS 

RD RR2GP86TF 763 0 0
GGCGGACCATAACCGCCTCCCATACCTGA**CTC*TCCCATTCCTGGCATCGGTGGTGCA
GGTAGAGCCAGTGGCAATAGTTGTGCGTACATGTTCTGTTGGGACATGACATCTTTCTCT
TC*TGCTCTTTGGCCTTCACTTCTTTCTGTGCCTCTATCCTATCCTTGATCAGTTCATCC
ACTTTGCCAGAGTATTCTCGGATAAACTGGAGGAGATACGGGAAGGCGAAGTCAATCATG
TTGTTGATCCAAGCAAGTTCTAGAGCAACATCTGGTCGGATTAAGTCATAACACACAAAT
AGACATGTGGCAAAGCATTCCTTTTTCCCCTGTTCAATGAAGTAAACCAGAAGCTGTTCT
GCAAGGTCATGGTCGCCGGATCGTGAAGCAGTTTCCATACAGTCCTTGTACATGTTATCT
TTCTTCGACAAAGCAATTGATTGCTTCCATCTACCAGCTTTCTTGTAGATATACGCAGCC
ACACGTCTCATTTCCACGAGCTCGTGTTTCTCAATCTTCTGAGCGAGGCCTATCTGGTCA
AAGCTGTCATGCAAATCAGTAGACTCGCGCAACCTGTCATAGTCTTCTTCTTCTACGTAT
ATCTCATTCAGAGCTTCATTTACAGCAGAAACATTGTTGCTCTGAACTGCAACCATGTAC
GGCTTAATAAGGCGCAACTGACCAGCCTTGCGCATAATATCAACGACACGTGTGTGGTCT
AACCGCAGAGCAAGCACATTGAGAAGATCGTTGATTATATCAC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 2 11

CO CL448Contig1 606 4 2 U
GACGTAAACAACATTTTATTGATACGATGACTACTACAGAACATCAAGCCTGGCTAACAT
GAAAGAAAACATAGATAAAAACGATAAAGATGATCCATAAAGCACACAAAACAGATAGTA
ATCCTCAATAACAAGACTCTTGCAATACGTTAACTTTTTCTTCAGAGGATTCAGGATTTG
GATTCTTGATCTTAGAGTTCTTCCCTCAATATCTTGGAAGTTGGAAATCCCGGCTTAAGA
AAATCAGCATACCATTTGCCGGAAACTTTCTGATGACGGGTCAAATTGTTTTGGAAATCG
ATGTAGTAAAGCCCGAACCTAGCCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTGTCCATCAAA
GACCAGACGTAGCATCCAGTAACTTTAACCTTGTCGTCGCATATGGCTTCATGCAAACTC
AAAAGATGCCTCTGGAGATAATATTTCCTGTTGTGATTATTTGTTCCAACTGCAACGTCA
TTGTGAAAGTCTCCAAGATCCTCTCCATATCCATTCTCAGTAATCATAATTTCTGGATCT
CCATAGTTGTCCTTGATATACTTCAAGAGCTTCCTCATTCCTCTTGAATACACATCCAGT
TTCCCG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 

AF RR2FN02JQ U 179
AF RR2E138JQ U 1
AF RR2E138TF C 1
AF RR2FA38JQ U 1
BS 1 605 RR2E138JQ
BS 606 606 RR2FA38JQ

RD RR2FN02JQ 159 0 0
TGGATTCTTGATCTTAGAGTTCTTCCCTCAATATCTTGGATGTTGGAAATCCCGGCTTAA
AAAAATCAGCATACCATTTCCCGGAAACTTTCTGATGACGGGGCAAATTGTTTTGGAAAT
CGATGTAGTAAAGCCCGAACCTAGCCTTGTAACCATCTT

QA 1 159 1 159
DS 

RD RR2E138JQ 605 0 0
GACGTAAACAACATTTTATTGATACGATGACTACTACAGAACATCAAGCCTGGCTAACAT
GAAAGAAAACATAGATAAAAACGATAAAGATGATCCATAAAGCACACAAAACAGATAGTA
ATCCTCAATAACAAGACTCTTGCAATACGTTAACTTTTTCTTCAGAGGATTCAGGATTTG
GATTCTTGATCTTAGAGTTCTTCCCTCAATATCTTGGAAGTTGGAAATCCCGGCTTAAGA
AAATCAGCATACCATTTGCCGGAAACTTTCTGATGACGGGTCAAATTGTTTTGGAAATCG
ATGTAGTAAAGCCCGAACCTAGCCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTGTCCATCAAA
GACCAGACGTAGCATCCAGTAACTTTAACCTTGTCGTCGCATATGGCTTCATGCAAACTC
AAAAGATGCCTCTGGAGATAATATTTCCTGTTGTGATTATTTGTTCCAACTGCAACGTCA
TTGTGAAAGTCTCCAAGATCCTCTCCATATCCATTCTCAGTAATCATAATTTCTGGATCT
CCATAGTTGTCCTTGATATACTTCAAGAGCTTCCTCATTCCTCTTGAATACACATCCAGT
TTCCC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2E138TF 605 0 0
GACGTAAACAACATTTTATTGATACGATGACTACTACAGAACATCAAGCCTGGCTAACAT
GAAAGAAAACATAGATAAAAACGATAAAGATGATCCATAAAGCACACAAAACAGATAGTA
ATCCTCAATAACAAGACTCTTGCAATACGTTAACTTTTTCTTCAGAGGATTCAGGATTTG
GATTCTTGATCTTAGAGTTCTTCCCTCAATATCTTGGAAGTTGGAAATCCCGGCTTAAGA
AAATCAGCATACCATTTGCCGGAAACTTTCTGATGACGGGTCAAATTGTTTTGGAAATCG
ATGTAGTAAAGCCCGAACCTAGCCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTGTCCATCAAA
GACCAGACGTAGCATCCAGTAACTTTAACCTTGTCGTCGCATATGGCTTCATGCAAACTC
AAAAGATGCCTCTGGAGATAATATTTCCTGTTGTGATTATTTGTTCCAACTGCAACGTCA
TTGTGAAAGTCTCCAAGATCCTCTCCATATCCATTCTCAGTAATCATAATTTCTGGATCT
CCATAGTTGTCCTTGATATACTTCAAGAGCTTCCTCATTCCTCTTGAATACACATCCAGT
TTCCC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2FA38JQ 606 0 0
GACGTAAACAACATCTTATTAATACGATGACTACTACAGAACCTCAAGCCTGGCTAACAT
GAAAGAAAACATAGATAAAAACGATAAAGATGATCCATAATACACACAAAACAGATAGTA
ATCCTCAAAAACAAGACCCTTGCAATACGTTAACTTATTCTTCAAAGGATTCAGGATTTG
GATTCTTGATCTTAGAGTTCTTCCCTCAATATCTTGGATGTTGGAAATCCCGGCTTAAGA
AAATCAGCATACCATTTCCCGGAAACTTTCTGATGACGGGTCAAATTGTTTTGGAAATCG
ATGTAGTAAAGCCCGAACCTAGCCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTGTCCATCAAA
GACCACACGTAGTATCCAGTAACTTTAACCTTGTCATCGCATATGGCTCCATGCAAACTC
AAAAGATGCCTCTGGAGATAATATTTCCTGTTGTGATCATTTGTTCCAACTGCGACGTCA
TTGTGTAAGTCTCCAAGATCCTCTCCACATCCATTCTCAGTAATCATAATTTCTGGGTCT
CCATAGTTGTCCTTGATGTACTTCAAAAGCTTCCTCATTCCTCTTGAATACACATCCAGT
TTCCCG

QA 1 606 1 606
DS 



CO CL448Contig2 1725 7 32 U
GGACCAATTAACTCAACCAGTGTTTAGAGTGAAAGAGAAGGAGAGAAACACAAAATGGTG
AAGTTCGAGAGGGTTCCTTTACTGTTATTAGGGTTAGTTCTGGTTCTACTTCTGGTCGGA
GCCAAAGCCAGTGAACCTGTCTGTCGTCAAGCTGAGAAGTTTAGCAGAGCTAGCTTTCCT
GAAGGTTTTCTTTGGGGAACCGCAACCGCAGCGTTTCAGGTTGAAGGAGCTGTTGATGAA
GGCTGCAGAGGTCCAAGCATGTGGGACACTTTCACTAAGAAATATCCACATAAATGCCAA
AATCATAACGCTGACGTAGCTGTTGATTTCTACCATCGTTACAAGGAAGATATCAAGTTG
ATGAGAGACCTCAACACTGATGCTTTTAGACTTTCTCTTGCGTGGCCTCGAATTTTTCCT
CATGGAAGAATGTCTAAGGGAATAAGCAAACAAGGAGTCCAATTCTACCACGACCTCATC
GATGAGCTTCTTAAAAACAAGATAACTCCACTAGTCACTGTATTTCACTGGGATACTCCT
CAGGACTTAGAAGATGAATACGGTGGTTTCTTGAGTGGTAACATTGTGAAGGATTTTACG
GAGTATGCAAACTTTACTTTCCATGAATACGGGCACAAAGTGAAGAACTGGATCACATTC
AATGAGCCATGGGTGTTTAGTCGTGCCGGTTACGACGTCGGGAAGAAAGCTCCGGGACGT
TGTTCGCCATACATTGAAGAATGGGGAAAGCATTGTGAAGATGGACGGTCAGGATTTGAA
GCTTATCAAGTCAGTCACAACTTACTCTTAGCTCATGCTCATTCCGTTGAAGCCTTCAGA
GCATGCGAACAGTGCGCTGGGGGTAAAATAGGAATTGCACACAGTCCAGCCTGGTTTGAA
CCAGCCGACCTTGAGAGTATTGGAGCTCCCATTGAACGTGTGCTTGATTTCATCCTGGGA
TGGCATTTGCATCCAACAACTTACGGAGACTATCCACAGTCGATGAAGGATCGCATTGGT
CATAGATTGCCAAAGTTCACTGAAGCTGAAAAGAGAATCCTAAAGAACTCTGCAGATTTT
GTCGGAATGAATTATTATACATCATTGTTCGGAGCTAATATGAAGACAGGTGATTCGAAG
AACCCGAGTTGGACGACCGACTCTCTTGTCCAGTGGGAAAGTAAGACTGTGGATGGATAC
AAGATTGGTAGCAAGCCTGCCGGTGGGAAACTGGATGTGTATTCAAGAGGAATGAGGAAG
CTCTTGAAGTATATCAAGGACAACTATGGAGATCCAGAAATTATGATTACTGAGAATGGA
TATGGAGAGGATCTTGGAGACTTTCACAATGACGTTGCAGTTGGAACAAATGATCACAAC
AGGAAATATTATCTCCAGAGGCATTTTTTGAGTTTGCATGAAGCCATATGGGACGACAAG
GTTAAAGTTACTGGATACTACGTCTGGTCTTTGATGGACAACTTTGAGTGGCAAGATGGT
TACAAGGCTAGGTTCGGGCTTTACTACATCGATTTCCAAAACAATTTGACCCGTCATCAG
AAAGTTTCCGGCAAATGGTATGCTGATTTTCTTAAGCCGGGATTTCCAACTTCCAAGATA
TTGAGGGAAGAACTCTAAGATCAAGAATCCAAATCCTTAATCCTCTGAAGAAAAAGTTAA
CGTATTGCAAGAGTCTTGTTATTGAGGATTACTATCTGTTTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A234TF U 252
AF RR2FA38TF U 1
AF RR2EP40TF U 294
AF RR2CQ56TF U 598
AF RR2A234JQ C 1117
AF RR2A410JQ C 1162
AF RR2A410TF U 1008
BS 1 292 RR2FA38TF
BS 293 293 RR2A234TF
BS 294 424 RR2FA38TF
BS 425 425 RR2A234TF
BS 426 696 RR2FA38TF
BS 697 757 RR2EP40TF
BS 758 758 RR2CQ56TF
BS 759 985 RR2EP40TF
BS 986 986 RR2CQ56TF
BS 987 1008 RR2EP40TF
BS 1009 1009 RR2CQ56TF
BS 1010 1036 RR2EP40TF
BS 1037 1037 RR2CQ56TF
BS 1038 1056 RR2EP40TF
BS 1057 1057 RR2CQ56TF
BS 1058 1066 RR2EP40TF
BS 1067 1067 RR2CQ56TF
BS 1068 1086 RR2EP40TF
BS 1087 1087 RR2CQ56TF
BS 1088 1090 RR2EP40TF
BS 1091 1091 RR2CQ56TF
BS 1092 1093 RR2EP40TF
BS 1094 1095 RR2CQ56TF
BS 1096 1117 RR2EP40TF
BS 1118 1249 RR2CQ56TF
BS 1250 1250 RR2A410TF
BS 1251 1315 RR2CQ56TF
BS 1316 1404 RR2A410TF
BS 1405 1405 RR2A234JQ
BS 1406 1430 RR2A410TF
BS 1431 1431 RR2A234JQ
BS 1432 1725 RR2A410TF

RD RR2A234TF 296 0 0
TCCAAGCATGTGGGACACTTTCACTAAGAAATATCCACATAAATGCCAAAATCATAACGC
TGACGTAGCTGTTGATTTCTACCATCGTTACAAGGAAGATATCAAGTTGATGAGAGACCT
CGACACTGATGCTTTTAGACTTTCTCTTGCGTGGCCTCGAATTTTTCCTCACGGAAGAAT
GTCTAAGGGAATAAGCAAACAAGGAGTCCAATTCTACCACGACCTCATCGATGAGCTTCT
TAAAAACAAGATAACTCCACTAGTCACTGTATTTCACTGGGATACTCCTCAGGACT

QA 1 296 1 296
DS 

RD RR2FA38TF 696 0 0
GGACCAATTAACTCAACCAGTGTTTAGAGTGAAAGAGAAGGAGAGAAACACAAAATGGTG
AAGTTCGAGAGGGTTCCTTTACTGTTATTAGGGTTAGTTCTGGTTCTACTTCTGGTCGGA
GCCAAAGCCAGTGAACCTGTCTGTCGTCAAGCTGAGAAGTTTAGCAGAGCTAGCTTTCCT
GAAGGTTTTCTTTGGGGAACCGCAACCGCAGCGTTTCAGGTTGAAGGAGCTGTTGATGAA
GGCTGCAGAGGTCCAAGCATGTGGGACACTTTCACTAAGAAATATCCACATAGATGCCAA
AATCATAACGCTGACGTAGCTGTTGATTTCTACCATCGTTACAAGGAAGATATCAAGTTG
ATGAGAGACCTCAACACTGATGCTTTTAGACTTTCTCTTGCGTGGCCTCGAATTTTTCCT
CATGTAAGAATGTCTAAGGGAATAAGCAAACAAGGAGTCCAATTCTACCACGACCTCATC
GATGAGCTTCTTAAAAACAAGATAACTCCACTAGTCACTGTATTTCACTGGGATACTCCT
CAGGACTTAGAAGATGAATACGGTGGTTTCTTGAGTGGTAACATTGTGAAGGATTTTACG
GAGTATGCAAACTTTACTTTCCATGAATACGGGCACAAAGTGAAGAACTGGATCACATTC
AATGAGCCATGGGTGTTTAGTCGTGCCGGTTACGAC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2EP40TF 842 0 0
G
TGCCAAAATCATAACGCTGACGTAGCTGTTGATTT*TACCATCGTTACAATGAAGATATC
AAGTTGATGAGAGACCTCAACACTGATGCTTTTAGACTTTCTCTTGCGTGGCCTCGAATT
TTTCCTCATGGAAGAATGTCTAAGGGAATAAGCAAACAAGGAGTCCAATTCTACCACGAC
CTCATCGATGAGCTTCTTAAAAACAAGATAACTCCACTAGTCACTGTATTTCACTGG*AT
ACTCCTCAGGACTTAGAAGATGAATACGGTGGTTTCTTGAGTGGTAACATTGTGAAGGAT
TTTACGGAGTATGCAAACTTTACTTTCCATGAATACGGGCACAAAGTGAAGAACTGGATC
ACATTCAATGAGCCATGGGTGTTTAGTCGTGCCGGTTACGACGTCGGGAAGAAAGCTCCG
GGACGTTGTTCGCCATACATTGAAGAATGGGGAAAGCATTGTGGAGATGGACGGTCAGGA
TTTGAAGCTTATCAAGTCAGTCACAACTTACTCTTAGCTCATGCTCATTCCGTTGAAGCC
TTCAGAGCATGCGAACAGTGCGCTGGGGGTAAAATAGGAATTGCACACAGTCCAGCCTGG
TTTGAACCAGCCGACCTTGAGAGTATTGGAGCTCCCATTGAACGTGTGCTTGATTTCATC
CTGGGATGGCATTTGCATCCAACAACTTACG*AGACTATCCACAGTCGATGAAG*ATCGC
ATTGGTCATAGATTGCCAAAGT*CACTGAAGCTGAAAAGAGA*TCCTAAAGA*CTCTGCA
GATTTTGTCGGA*TGATTT**TATACATCATTGTTCGGAGCTA
TATGAGACAGGTGATCGA

QA 2 824 2 824
DS 

RD RR2CQ56TF 729 0 0
G
CGGAGTATGCAAACTTTACTTTCCATGAATACGGGCACAAAGTGAAGAACTGGATCACAT
TCAATGAGCCATGGGTGTTTAGTCGTGCCGGTTACGACGTCGGGAAGAAAGCTCCGGGAC
GTTGTTCGCCATACATTGAAGAATGGGGAAAGCATTGTGAAGATGGACGGTCAGGATTTG
AAGCTTATCAAGTCAGTCACAACTTACTCTTAGCTCATGCTCATTCCGTTGAAGCCTTCA
GAGCATGCGAACAGTGCGCTGGGGGTAAAATAGGAATTGCACACAGTCCAGCCTGGTTTG
AACCAGCCGACCTTGAGAGTATTGGAGCTCCCATTGAACGTGTGCTTGATTTCATCCTGG
GATGGCATTTGCATCCAACAACTTACGGAGACTATCCACAGTCGATGAAGGATCGCATTG
GTCATAGATTGCCAAAGTTCACTGAAGCTGAAAAGAGAATCCTAAAGAACTCTGCAGATT
TTGTCGGAATGAATTATTATACATCATTGTTCGGAGCTAATATGAAGACAGGTGATTCGA
AGAACCCGAGTTGGACGACCGACTCTCTTGTCCAGTGGGAAAGTAAGACTGTGGATGGAT
ACAAGATTGGTAGCAAGCCTGCCGGTGGGAAACTGGATGTGTATTCAAGAG*AATGAGGA
AGCTCTTGAAGTATATCAAGGACAACTATGGAGATCCAGAAATTATGATTACTGAGA
TGGATATTGGA

QA 2 718 2 718
DS 

RD RR2A234JQ 352 0 0
AATATGAAGACAGGTGATTCGAAGAACCCGAGTTGGACGACCGACTCTCTTGTCCAGTGG
GAAAGTAAGACTGTGGATGGATACAAGATTGGTAGCAAGCCTGCCGGTGGGAAACTGGAT
GTGTATTCAAGAGGAATGAGGAAGCTCTTGAAGTATATCAAGGACAACTATGGAGATCCA
GAAATTATGATTAATGAGAATGGATATGGAGAGGATCTTGGAGACTTTCACAATGACGTT
GCAGTTGGAACAAATGATCACAACAGGAAATATTATCTCCAGAGGCATTTTTTGAGTTTG
CATGAAGCCATATGGGACGACAAGGTTAAAGTTACTGGATACTACGTCTGGT

QA 1 352 1 352
DS 

RD RR2A410JQ 295 0 0
TCTCTTGTCCAGTGGGAAAGTAAGACTGTGGATGGATACAAGATTGGTAGCAAGCCTGCC
GGTGGGAAACTGGATGTGTATTCAAGAGGAATGAGGAAGCTCTTGAAGTATATCAAGGAC
ATCTATGGAGATCCAGAAATTATGATTACTGAGAATGGATATGGAGAGGATCTTGGAGAC
TTTCACAATGACGTTGCAGTTGGAACAAATGATCACAACAGGAAATATTATCTCCAGAGG
CATTTTTTGAGTTTGCATGAAGCCATATGGGACGACAAGGTTAAAGTTACTGGAT

QA 1 295 1 295
DS 

RD RR2A410TF 718 0 0
GGATCGCATTGGTCATAGATTGCCAAAGTTCACTGAAGCTGAAAAGAGAATCCTAAAGAA
CTCTGCAGATTTTGTCGGAATGAATTATTATACATCATTGTTCGGAGCTAATATGAAGAC
AGGTGATTCGAAGAACCCGAGTTGGACGACCGACTCTCTTGTCCAGTGGGAAAGTAAGAC
TGTGGATGGATACAAGATTGGTAGCAAGCCTGCCGGTGGGAAACTGGATGTGTATTCAAG
AGGAATGAGGAAGCTCTTGAAGTATATCAAGGACATCTATGGAGATCCAGAAATTATGAT
TACTGAGAATGGATATGGAGAGGATCTTGGAGACTTTCACAATGACGTTGCAGTTGGAAC
AAATGATCACAACAGGAAATATTATCTCCAGAGGCATCTTTTGAGTTTGCATGAAGCCAT
ATGCGACGACAAGGTTAAAGTTACTGGATACTACGTCTGGTCTTTGATGGACAACTTTGA
GTGGCAAGATGGTTACAAGGCTAGGTTCGGGCTTTACTACATCGATTTCCAAAACAATTT
GACCCGTCATCAGAAAGTTTCCGGCAAATGGTATGCTGATTTTCTTAAGCCGGGATTTCC
AACTTCCAAGATATTGAGGGAAGAACTCTAAGATCAAGAATCCAAATCCTTAATCCTCTG
AAGAAAAAGTTAACGTATTGCAAGAGTCTTGTTATTGAGGATTACTATCTGTTTTGTG

QA 1 718 1 718
DS 



AS 2 9

CO CL449Contig1 1260 5 19 U
ATATCTTTGTACTGATTTCAATCAGTACAGACAAGACCAACACACTTAGACCAAAGAGAC
AAAGCTCAACAGACGCACACTTTCACCTAGACTCTGCCTTTCTTGTAAGGCTTAAACTTG
TTTACTCTTACTCCACACTTGCATCGCCAGAGAATGAGTCACTAGACCTAAGATTACATA
GCAACACATCTCTTCCGCTTAAAGTCATTTTGAAGAAACTGTCAACTTCCTCTAGTAACT
GATCTAACCCTTGAGACAACTTCTCAGCCTGCGTCCCCAACTCCATCACATAGTCCTTAA
AAGTTTCATCTTCCACAGGATCAACACCGTCTTGTATCATCGGGTAAAGCTTCTCCACAC
TAGCATCAACCCTCTCCAGCTCTTTGAGAATCGTACTCCTACCCGAAGACAACAAGTCTC
TGATCTCAGCGTTCACAACACTCTGCATATCAGCGAAAGCCTTAGCCCACAGCGGTTTAT
CAGAGACGGTTAAATCGAAAAGATCGCTGGTGGAGTCAGACCAGGCCGCGGTAAATACAC
TGCAGATATAAACCGTTTGGACCTTCACACCGTAGAAAGCTCGCATCAGAACCTTCCCTT
TAGGAGAGTTCTTGACCTTAGGCAAGCTCAGAGTCTTCACAAGAGAGTCTAGAACCGCAC
GGCAGTTTCCAACTCTAGCGTTGTTGCCATTAACATGCTGCCTCCAGCTATCGAGAGAAG
ACCGAGCCTGGAGATACTTCTCACCAGAACCAGACTGTAAACTATGAAGAACGCACTTAA
GGTAGAGATCCCCTTGGTTGAGACGCGTGAGCTCCGAGCTAAAGGCGTTGCAGAGATCCA
GTAGCTTCACGCTGATGTCGAGGTAGACGTCGACCCATTTCTCTTCCCAGTCGGAGACGG
GGAGCTGGAGGTCGGTGATAAGCGTGTTGATGTTGTTGTGAGTCTCGCAGAGTGACTCCA
TAGCTAGCTTCATCCAGGATAGAGTGAGGATGTCGTCTTTGGACTTAGGCATGAGTTTCT
TGAGTCTCTCTGCTAAAAGTAACTCGAAGTTGTGCAATAGAGAGAGTAGCCACGGGGATA
AAGCTGAGCTCTTTGGGGATAGCATACGAAAGGGGTTCCCAAATGGGAAGAAACCTCTCG
GTGGATCTTGTGCTCTGCTCATTTTGCTAGACGCGATTTAAAGTTGCTGGAGATGAGAAA
TTACAGGTAAAGTGTCGTGGAAATGATCTTCTAATTCTTCATTAAATATTTTTTAGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH83JQ U 153
AF RR2H782JQB U 29
AF RR2DO86JQ U 1
AF RR2DP27TF C 405
AF RR2DO86TF C 615
BS 1 114 RR2DO86JQ
BS 115 115 RR2H782JQB
BS 116 582 RR2DO86JQ
BS 583 583 RR2DP27TF
BS 584 735 RR2DO86JQ
BS 736 763 RR2DP27TF
BS 764 764 RR2DO86TF
BS 765 784 RR2DP27TF
BS 785 785 RR2DO86TF
BS 786 837 RR2DP27TF
BS 838 838 RR2DO86TF
BS 839 919 RR2DP27TF
BS 920 920 RR2DO86TF
BS 921 922 RR2DP27TF
BS 923 923 RR2DO86TF
BS 924 928 RR2DP27TF
BS 929 929 RR2DO86TF
BS 930 1013 RR2DP27TF
BS 1014 1260 RR2DO86TF

RD RR2CH83JQ 289 0 0
AATGAGTCACTAGACCTAAAATTACATAGCAACCCATCTCTTCCGCTTAAAGTCATTTTG
AAAAAACTGTCAACTTCCTCTAGTAACTGATCTAACCCTTGAGACAACTTCTCAGCCTGG
GTCCCCAACTCCATCACATAGTCCTTAAAAGTTTCATCTTCCACAGGATCAACACCGTCT
TGTATCATCGGGCAAAGCTTCTCCACACTAGCATCAACCCTCTCCAGCTCTTTGAGAATC
GTACTCCTACCCGAAAACAACAAGTCTCTGATCTCAGCGTTCACAACAC

QA 1 289 1 289
DS 

RD RR2H782JQB 544 0 0
AGACAAGACCAACACACTTAGACCAAAGAGACAAAGCTCAACAGACGCACACTTTCACCT
AGACTCTGCCTTTCTTGTAAGGCTTAAACTTGTTTACTCTTACTCCACACTTGCATCGCC
AGAGAATGAGTCACTAGACCTAAGATTACATAGCAACACATCTCTTCCGCTTAAAGTCAT
TTTGAAGAAACTGTCAACTTCCTCTAGTAACTGATCTAACCCTTGAGACAACTTCTCAGC
CTGCGTCCCCAGCTCCATCACATAGTCCTTAAAAGTTTCATCTTCAACAGGATCAACACC
ATCTTGTATCATCGGGTAAAGCTTCTCCACACTAACATCAACCCTCTCCAGCTCTTTGAG
AATCGTACTCCTACCTGAAGACAACAAGTCTCTGATCTCAGCGTTCACAACACTCTGCAT
ATCAGCGAAAGCCTTAGCCCACAGCGGTTTATCAGAGACGGTTAAATCGAAAAGATCGGT
GGTGGAGTCAGACCAGGCCGCGGTAAATACACTGCAGATATAAACCGTTTGGACCTTCAC
ACCG

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2DO86JQ 735 0 0
ATATCTTTGTACTGATTTCAATCAGTACAGACAAGACCAACACACTTAGACCAAAGAGAC
AAAGCTCAACAGACGCACACTTTCACCTAGACTCTGCCTTTCTTGTAAGGCTTACACTTG
TTTACTCTTACTCCACACTTGCATCGCCAGAGAATGAGTCACTAGACCTAAGATTACATA
GCAACACATCTCTTCCGCTTAAAGTCATTTTGAAGAAACTGTCAACTTCCTCTAGTAACT
GATCTAACCCTTGAGACAACTTCTCAGCCTGCGTCCCCAACTCCATCACATAGTCCTTAA
AAGTTTCATCTTCCACAGGATCAACACCGTCTTGTATCATCGGGTAAAGCTTCTCCACAC
TAGCATCAACCCTCTCCAGCTCTTTGAGAATCGTACTCCTACCCGAAGACAACAAGTCTC
TGATCTCAGCGTTCACAACACTCTGCATATCAGCGAAAGCCTTAGCCCACAGCGGTTTAT
CAGAGACGGTTAAATCGAAAAGATCGCTGGTGGAGTCAGACCAGGCCGCGGTAAATACAC
TGCAGATATAAACCGTTTGGACCTTCACACCGTAGAAAGCTCTCATCAGAACCTTCCCTT
TAGGAGAGTTCTTGACCTTAGGCAAGCTCAGAGTCTTCACAAGAGAGTCTAGAACCGCAC
GGCAGTTTCCAACTCTAGCGTTGTTGCCATTAACATGCTGCCTCCAGCTATCGAGAGAAG
ACCGAGCCTGGAGAT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2DP27TF 610 0 0
GAAGACAACAAGTCTCTGATCTCAGCGTTCACAACACTCTGCATATCAGCGAAAGC*TTA
GCCCACAGCGGTTTATCAGAGACGGTTAAATCGAAAAGATCGCTGGTGGAATCAGACCAG
GCCGCGGTAAATACACTGCAGATATAAACCGTCTGGACCTTCACACCGTAGAAAGCTCGC
ATCAGAACTTTCCCTTTAGGAGAGTTCTTGACCTTAGGCAAGCTCAGAGTCTTCACAAGA
GAGTCTAGAACAGCACGGCAGTTTCCAACTCTAGCGTTGTTGGCATTAACATGCTGCCTC
CAGCAATCGAGAGAAGACCGAGCCTGGAGATACTTCTCACCAGAACCAGACTGTAAACTG
TGAAGAACGCACTTAAGGTATAGATCCCCTTGGTTGAGACGCGTGAGCTCCGAGCTAAAG
GCGTTGCAGAGATTCAGTAGCTTCACGCTGATGTCGAGGTAGACGTCGACCCATTTCTCT
TCCCAGTCGGAGACGGGGAGCTGGAGGTCGGTGATGAGTGTGTTTATGTTGTTGTGAGTC
TCGCAGAGTGACTCCATAGCTAGCTTCATCCAGGATAGAGTGAGGATGTCGTCTTTGGAC
TTAGGCATG
C

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2DO86TF 646 0 0
ACT
TTAGGCAAGCTCAGAGTCTTCACAAGAGAGTCTAGAACCGCACGGCAGTTTCCAACTCTA
GCGTTGTTGCCATTAACATGCTGCCTCCAGCTATCGAGAGAAGACCGAGCCTGGAGATAC
TTCTCACCAGAACCAGACTGTAAACTATGCAGCACGCACTTAAGGTAGAGATCTCCTTGG
TTGAGACGCGTGAGCTCCGAGCTAAAGGCGTTGCAGAGATCCAGTAGCTTCACGCTGATG
TCGAGGTAGACGTCGACCCATTTCTCTTCCCAGTCGGAGACGGGGAGCTGGAGGTCGGTG
ATAAGCGTGTTGATGTTGTTGTGAGTCTCGCAGAGTGACTCCATAGCTAGCTTCATCCAT
GATAGAGTGAGGATGTCGTCTTTGGACTTGGGCATGAGTTTCTTGAGTCTCTCTGCTAAA
AGTAACTCGAAGTTGTGCAATAGAGAGAGTAGCCACGGGGATAAAGCTGAGCTCTTTGGG
GATAGCATACGAAAGGGGTTCCCAAATGGGAAGAAACCTCTCGGTGGATCTTGTGCTCTG
CTCATTTTGCTAGACGCGATTTAAAGTTGCTGGAGATGAGAAATTACAGGTAAAGTGTCG
TGGAAATGATCTTCTAATTCTTCATTAAATATTTTTTAGGTCC

QA 4 646 4 646
DS 



CO CL449Contig2 1275 4 14 U
GGACGACACTTTGATTTCTTCATCTCCAGCGACTTTAAATCGTGTCTAGCAAAATGAGCC
GAGCACAAGATCCACCGAGAGGTTTCTTCCCATTTGGGAACCCCTTTCGTATGCTATCCC
CCAAGGGCTCAGCTTTATCACCTTGGCTACTCTCTCTATTGCACAACTTCGAGTTACTTT
TAGCAGAAAGGCTAAAGAAACTCATGCCTAAGTCCAAAGACGACATCCTCACTCTATCAT
GGATGAAGCTAGCTATGGAGTCGCTCTGCGAGACTCACAACAACATCAACACCCTCATCA
CCGACCTCCAGCTTCCCGTCTCCGACTGGGAAGAGAAATGGGTCGACGTCTACCTCGACA
TAAGCGTCAAGCTACTAGACCTCTGCAACGCGTTTAGCTCGGAGCTCACGCGTCTCAACC
AAGGAGATCTCTACCTTAAGTGCGTTCTGCATAGTTTACAGTCTGGTTCTGGTGAGAAGT
ATCTCCAGGCTCGGTCTTCTCTCGATAGCTGGAGGCAGCATGTTAATGCCAACAACGCAA
ACAACGCGAGAGTAGTCGAAAACTGCCGTGCGGTTCTAGACTCTCTTGTGAAGACTCTGA
GCTTGCCTAAGGTCAAGAACTCTCCTAAAGGGAAAGTTCTGATGCGAGCTTTCTACGGTG
TGAAGGTCCAGACGGTTTATATCTGCAGTGTATTTACCGCGGCCTGGTCTGATTCCACCA
GCGATCTTTTCGATTTAACCGTCTCTGATAAACCGCTGTGGGCTAAGGCTTTCGCTGATA
TGCAGAGTGTTGTGAACGCTGAGATCAGAGACTTGTTGTCTTCGGGTAGGAGTACGATTC
TCAAAGAGCTGGAGAGGGTTGATGCTAGTGTGGAGAAGCTTTACCCGATTATACAAGACG
GTGTTGATCCTGTTGAAGATGAAACTTTTAAGGACTGTGTGATGGAGCTGGGGACGCAGG
CTGAGAAGTTGTCTCGAGGGTTAGATCAGTTACTAGAGAAAGTTGATAGTTTCTTCAAAA
TGACTTTAAGCGGAAGAGATGTGTTGCTATGTAATCTTAGGTCAAGTGACTCATTCTCTG
GCGATGCAAATGTGGAGTAAGAGTAAACAAGTGTAAGCCTTACAAGAAAGGCAGAGTCTA
GGTGAAAGTGTGCGTCTGTTGAGCTTTTGTCCCTTTGGTCTAAGTGTGTTGGTCTTGTCT
GTACTGATTGAAATCAATACAAAATATATAAAACTTCTGTTTGACTTGTTTTTAATAAAA
AGATATAATCCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG21TF U 1
AF RR2EQ73TF U 4
AF RR2EQ73JQ C 490
AF RR2EG21JQ C 500
BS 1 139 RR2EG21TF
BS 140 140 RR2EQ73TF
BS 141 611 RR2EG21TF
BS 612 612 RR2EQ73TF
BS 613 653 RR2EG21TF
BS 654 670 RR2EQ73TF
BS 671 744 RR2EQ73JQ
BS 745 745 RR2EG21JQ
BS 746 1064 RR2EQ73JQ
BS 1065 1065 RR2EG21JQ
BS 1066 1171 RR2EQ73JQ
BS 1172 1172 RR2EG21JQ
BS 1173 1243 RR2EQ73JQ
BS 1244 1275 RR2EG21JQ

RD RR2EG21TF 653 0 0
GGACGACACTTTGATTTCTTCATCTCCAGCGACTTTAAATCGTGTCTAGCAAAATGAGCC
GAGCACAAGATCCACCGAGAGGTTTCTTCCCATTTGGGAACCCCTTTCGTATGCTATCCC
CCAAGGGCTCAGCTTTATCGCCTTGGCTACTCTCTCTATTGCACAACTTCGAGTTACTTT
TAGCAGAAAGGCTAAAGAAACTCATGCCTAAGTCCAAAGACGACATCCTCACTCTATCAT
GGATGAAGCTAGCTATGGAGTCGCTCTGCGAGACTCACAACAACATCAACACCCTCATCA
CCGACCTCCAGCTTCCCGTCTCCGACTGGGAAGAGAAATGGGTCGACGTCTACCTCGACA
TAAGCGTCAAGCTACTAGACCTCTGCAACGCGTTTAGCTCGGAGCTCACGCGTCTCAACC
AAGGAGATCTCTACCTTAAGTGCGTTCTGCATAGTTTACAGTCTGGTTCTGGTGAGAAGT
ATCTCCAGGCTCGGTCTTCTCTCGATAGCTGGAGGCAGCATGTTAATGCCAACAACGCAA
ACAACGCGAGAGTAGTCGAAAACTGCCGTGCGGTTCTAGACTCTCTTGTGAAGACTCTGA
GCTTGCCTAAG*TCAAGAACTCTCCTAAAGGGAAAGTTCTGATGCGAGCTTTC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2EQ73TF 667 0 0
GGACACTTTGATTTCT
TCATCTCCAGCGACTTTAAATTGTGTCTAGCAAAATGAGCCGAGCACAAGATCCACCGAG
AGGTTTCTTCCCATTTGGGAACCCCTTTCGTATGCTATCCCCCAAGGGCTCAGCTTTATC
ACCTTGGCTACTCTCTCTATTGCACAACTTCGAGTTACTTTTAGCAGAAAGGCTAAAGAA
ACTCATGCCTAAGTCCAAAGACGATATCCTCACTCTATCATGGATGAAGCTAGCTATGGA
GTCGCTCTGCGAGACTCACAACAACATCAACACCCTCATCACCGACCTCCAGCTTCCCGT
CTCCGACTGGGAAGAGAAATGGGTCGACGTCTACCTCGACATAAGCGTCCAGCTACTAGA
CCTCTGCAACGCGTTTAGCTCGGAGCTCACGCGTCTCAACCAAGGAGATCTCTACCTTAA
GTGCGTTCTGCATAGTTTACAGTCTGGTTCTGGTGAGAAGTATCTCCAGGCTCGGTCTTC
TCTCGATAGCTGGAGGCAGCATGTTAATGCCAACAACGCAAACAACGCGAGAGTAGTCGA
AAACTGCCGTGCGGTTCTAGACTCTCTTGTGAAGACTCTGAGCTTGCCTAAGGTCAAGAA
CTCTCCTAAAGGGAAAGTTCTGATGCGAGCTTTCTACGGTGTGAAGGTCCA

QA 17 667 17 667
DS 

RD RR2EQ73JQ 754 0 0
CTCGGTCTTCTCTCGATAGCTGGAGGCAGCATGTTAATGCCAACAACGCAAACAACGCGA
GAGTAGTCGAAAACTGCCGTGCGGTTCTAGACTCTCTTGTGAAGACTCTGAGCTTGCCTA
AGGTCAAGAACTCTCCTAAAGGGAAAGTTCTGATGCGAGCTTTCTACGGTGTGAAGGTCC
AGACGGTTTATATCTGCAGTGTATTTACCGCGGCCTGGTCTGATTCCACCAGCGATCTTT
TCGATTTAACCGTCTTTGATAAACCGCTGTGGGCTAAGGCTTTCGCTGATATGCAGAGTG
TTGTGAACGCTGAGATCAGAGACTTGTTGTCTTCGGGTAGGAGTACGATTCTCAAAGAGC
TGGAGAGGGTTGATGCTAGTGTGGAGAAGCTTTACCCGATTATACAAGACGGTGTTGATC
CTGTTGAAGATGAAACTTTTAAGGACTGTGTGATGGAGCTGGGGACGCAGGCTGAGAAGT
TGTCTCGAGGGTTAGATCAGTTACTAGAGAAAGTTGATAGTTTCTTCAAAATGACTTTAA
GCGGAAGAGATGTGTTGCTATGTAATCTTAGGTCAGGTGACTCATTCTCTGGCGATGCAA
ATGTGGAGTAAGAGTAAACAAGTGTAAGCCTTACAAGAAAGGCAGAGTCTAGGTGAAAGT
GTGCGTCTGTTGAGCTTTTGTCTCTTTGGTCTAAGTGTGTTGGTCTTGTCTGTACTGATT
GAAATCAATACAAAATATATAAAACTTCTGTTTG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2EG21JQ 776 0 0
TCTCGATAGCTGGAGGCAGCATGTTAATGCCAACAACGCAAACAACGCGAGAGTAGTCGA
AAACTGCCGTGCGGTTCTAGACTCTCTTGTGAAGACTCTGAGCTTGCCTAAGGTCAAGAA
CTCTCCTAAAGGGAAAGTTCTGATGCGAGCTTTCTACGGTGTGAAGGTCCAGACGGTTTA
TATCTGCAGTGTATTTACCGCGGCCTGGTCTGATTCCACCAGCGATCTTTTCGATTTAAC
CGTCTCTGATAAACCGCTGTGGGCTAAGGCTTTCGCTGATATGCAGAGTGTTGTGAACGC
TGAGATCAGAGACTTGTTGTCTTCGGGTAGGAGTACGATTCTCAAAGAGCTGGAGAGGGT
TGATGCTAGTGTGGAGAAGCTTTACCCGATTATACAAGACGGTGTTGATCCTGTTGAAGA
TGAAACTTTTAAGGACTGTGTGATGGAGCTGGG*ACGCAGGCTGAGAAGTTGTCTCGAGG
GTTAGATCAGTTACTAGAGGAAGTTGATAGTTTCTTCAAAATGACTTTAAGCGGAAGAGA
TGTGTTGCTATGTAATCTTAGGTCTAGTGACTCATTCTCTGGCGATGCAAATGTGGAGTA
AGAGTAAACAAGTGTAAGCCTTACAAGAAAGGCAGAGTCTAGGTGAAAGTGTGCGTCTGT
TGAGCTTTTGTCCCTTTGGTCTAAGTGTGTTGGTCTTGTCTGTACTGATTGAAATCAATA
CAAAATATATAAAACTTCTGTTTGACTTGTTTTTAATAAAAAGATATAATCCTTAT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 11

CO CL450Contig1 948 11 11 U
GCATGCATCACAGGGCCAAACTCAGATCAATAGCAACATATATACTTCAAAAGTCTATTA
GAAAATGACAGAGAGTAGAGAGACACACACA*ACCC*AAGAGTTTTATTGTACTTATTAG
TTCTCTCCTTATTTTCATTCAACAAACAGTAGCAAATGTGATCACTTAAGTAAGATAGAG
CCTTCTCTCAATCAATCATTTGACGTAAGTCACAAACCAATCAAGCATCTCCTTGTGAGC
TTCTTCTGCAGCTTTAACAGCCTCTGGGTCATTGATGTCGTACCGAGTTGTCCAACCGTG
TGAGACATTCAGGAAAATCTTCACATAACTACTCACCTCGGGCTTGGAAGCAAGAATCTC
CTCAAATTGCTTCACGAGTGCTGGTGGGGTCAAAAAATCATCCTCAGCTCCTAGTATAGC
TATTGGAACCTTCACACCCTTGATATCATCGATAGTGACATAAGTAGGATGTAGCAAAAC
ACCTGCTTGGATAAGCTCTTGTTTTGACAATTCCACAACCACTTTTCCACCCCAGCACAT
CCCAGCAGCTCCAATGGCAGTGATGCCTTTGTTCTTTATGGCTTCAAGTACTGGCTTTGT
GTCTTCAAACCCCTTATTAGGGCCATGGTCTTTGATCCAGACATGGACTGGTCTCTCCTG
CTGAGAGGGGTCATAAGGATCTCCATAGAAGTAGTCAGGAACCACGACATAGAATCCTGA
AGCTGCAACCTTGTCCGCAAGCGCCCTCAAGTTTGGAGCTTCATACCCATAAATATCGGA
GACGAGGAGGACGCACTTCTTGGAATCTGGAGAGCCAGAGACGTAGGCATCGAGGCCACC
TAGCTTCTCCACATGACCCGAACCGGAGAGAGGGTCAAGAACCGGCGGGTTTTCGCAGCA
CTGAGGTCCCAACATTATTGGTTCTTCAAAGTGGTTCAGACAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 45 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 35 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 50 50 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 35 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF43JQ U 1
AF RR2BK54JQ U 15
AF RR2BK54TF C 46
AF RR2GU66JQB U 13
AF RR2H443JQB U 13
AF RR2AF73JQ U 32
AF RR2BJ28JQ U 33
AF RR2BJ28TF C 135
AF RR2AF43TF C 266
AF RR2H443TF C 269
AF RR2GU66TF C 245
BS 1 431 RR2AF43JQ
BS 432 432 RR2BK54JQ
BS 433 540 RR2AF43JQ
BS 541 541 RR2BK54JQ
BS 542 707 RR2AF43JQ
BS 708 725 RR2GU66JQB
BS 726 780 RR2H443JQB
BS 781 788 RR2AF73JQ
BS 789 859 RR2BJ28JQ
BS 860 937 RR2BJ28TF
BS 938 948 RR2GU66TF

RD RR2AF43JQ 707 0 0
GCATGCATCACAGGGCCAAACTCAGATCAATAGCAACATATATACTTCAAAAGTCTATTA
GAAAATGACAGAGAGTAGAGAGACACACACA*ACCC*AAGAGTTTTATTGTACTTATTAG
TTCTCTCCTTATTTTCATTCAACAAACAGTAGCAAATGTGATCACTTAAGTAAGATAGAG
CCTTCTCTCAATCAATCATTTGACGTAAGTCACAAACCAATCAAGCATCTCCTTGTGAGC
TTCTTCTGCAGCTTTAACAGCCTCTGGGTCATTGATGTCGTACCGAGTTGTCCAACCGTG
TGAGACATTCAGGAAAATCTTCACATAACTACTCACCTCGGGCTTGGAAGCAAGAATCTC
CTCAAATTGCTTCACGAGTGCTGGTGGGGTCAAAAAATCATCCTCAGCTCCTAGTATAGC
TATTGGAACCTCCACACCCTTGATATCATCGATAGTGACATAAGTAGGATGTAGCAAAAC
ACCTGCTTGGATAAGCTCTTGTTTTGACAATTCCACAACCACTTTTCCACCCCAGCACAT
ACCAGCAGCTCCAATGGCAGTGATGCCTTTGTTCTTTATGGCTTCAAGTACTGGCTTTGT
GTCTTCAAACCCCTTATTAGGGCCATGGTCTTTGATCCAGACATGGACTGGTCTCTCCTG
CTGAGAGGGGTCATAAGGATCTCCATAGAAGTAGTCAGGAACCACGA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2BK54JQ 683 0 0
GCCAAACTCAGATCAATAGCAACATATATACTTCAAAAGTCTATTAGAAAATGACAGAGA
GTAGAGAGACACACACA*ACCC*AAGAGTTTTATTGTACTTATTAGTTCTCTCCTTATTT
TCATTCAACAAACAGTAGCAAATGTGATCACTTAAGTAAGATAGAGCCTTCTCTCAATCA
ATCATTTGACGTAAGTCACAAACCAATCAAGCATCTCCTTGTGAGCTTCTTCTGCAGCTT
TAACAGCCTCTGGGTCATTGATGTCGTACCGAGTTGTCCAACCGTGTGAGACATTCAGGA
AAATCTTCACATAACTACTCACCTCGGGCTTGGAAGCAAGAATCTCCTCAAATTGCTTCA
CGAGTGCTGGTGGGGTCAAAAAATCATCCTCAGCTCCTAGTATAGCTATTGGAACCTTCA
CACCCTTGATATCATCGATAGTGACATAAGTAGGATGTAGCAAAACACCTGCTTGGATAA
GCTCTTGTTTTGACAATTCCACAACCACTTTTCCACCCCAGCACATCCCAGCAGCTCCAA
TGGCAGTGATGCCTTTGTTCTTTATGGCTTCAAGTACTGGCTTTGTGTCTTCAAACCCCT
TATTAGGGCCATGGTCTTTGATCCAGACATGGACTGGTCTCTCCTGCTGAGAGGGGTCAT
AAGGATCTCCATAGAAGTAGTC
C

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2BK54TF 652 0 0
TTCAAAAGTCTATTAGAAAATGACAGAGAGTAGAGAGACACACACA*ACCCCAAGAGTTT
*ATTGTACTTATTAGTTCTCTCCTTATTTTCATTCAACAAACAGTAGCAAATGTGATCAC
TTAAGTAAGATAGAGCCTTCTCTCAATCAATCATTTGACGTAAGTCACAAACCAATCAAG
CATCTCCTTGTGAGCTTCTTCTGCAGCTTTAACAGCCTCTGGGTCATTGATGTCGTACCG
AGTTGTCCAACCGTGTGAGACATTCAGGAAAATCTTCACATAACTACTCACCTCGGGCTT
GGAAGCAAGAATCTCCTCAAATTGCTTCACGAGTGCTGGTGGGGTCAAAAAATCATCCTC
AGCTCCTAGTATAGCTATTGGAACCTTCACACCCTTGATATCATCGATAGTGACATAAGT
AGGATGTAGCAAAACACCTGCTTGGATAAGCTCTTGTTTTGACAATTCCACAACCACTTT
TCCACCCCAGCACATCCCAGCAGCTCCAATGGCAGTGATGCCTTTGTTCTTTATGGCTTC
AAGTACTGGCTTTGTGTCTTCAAACCCCTTATTAGGGCCATGGTCTTTGATCCAGACATG
GACTGGTCTCTCCTGCTGAGAGGGGTCATAAGGATCTCCATAGAAGTAGTC
C

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2GU66JQB 713 0 0
GT
GCCAAACTCAGATCAATAGCAACATATATACTTCAAAAGTCTATTAGAAAATGACAGAGA
GTAGAGAGACACACACA*ACCC*AAGAGTTTTATTGTACTTATTAGTTCTCTCCTTATTT
TCATTCAACAAACAGTAGCAAATGTGATCACTTAAGTAAGATAGAGCCTTCTCTCAATCA
ATCATTTGACGTAAGTCACAAACCAATCAAGCATCTCCTTGTGAGCTTCTTCTGCAGCTT
TAACAGCCTCTGGGTCATTGATGTCGTACCGAGTTGTCCAACCGTGTGAGACATTCAGGA
AAATCTTCACATAACTACTCACCTCGGGCTTGGAAGCAAGAATATCCTCAAATTGCTTCA
CGAGTGGTGGTGGGGTCAAAAAATCATCCTCAGCTCCTAGTATAGCTATTGGAACCTTCA
CACCCTTGATATCATCGGTAGTGACATAAGTAGGATGTAGCAAAACACCTGCTTGGATAA
GCTCTTGTTTTGACAATTCCACAACCACTTTTCCACCCCAGCACATCCCAGCAGCTCCAA
TGGCAGTGATGCCTTTGTTCTTTATGGCTTCAAGTACTGGCTTTGTGTCTTCAAACCCCT
TATTAGGGCCATGGTCTTTGATCCAGACATGGACTGGTCTCTCCTGCTGAGAGGGGTCAT
AAGGATCTCCATAGAAGTAGTCAGGAACCACGACATAGAATCCTGAAGCTG

QA 3 713 3 713
DS 

RD RR2H443JQB 768 0 0
GG
GCCAAACTCAGATCAATAGCAACATATATACTTCAAAAGTCTATTAGAAAATGACAGAGA
GTAGAGAGACACACACA*ACCC*AAGAGTTTTATTGTACTTATTAGTTCTCTCCTTATTT
TCATTCAACAAACAGTAGCAAATGTGATCACTTAAGTAAGATAGAGCCTTCTCTCAATCA
ATCATTTGACGTAAGTCACAAACCAATCAAGCATCTCCTTGTGAGCTTCTTCTGCAGCTT
TAACGGCCTCTGGGTCATTGATGTCGTACCGAGTTGTCCAACCGTGTGAGACATTCAGGA
AAATCTTCACATAACTACTCACCTCGGGCTTGGAAGCAAGAATCTACTCAAATTGCTTCA
CGAGTGCTGGTGGGGTCAAAAAATCATCCTCAGCTCCTAGTATAGCTATTGGAACCTTCA
CACCCTTGATATCATCGATAGTGACATAAGTAGGATGTAGCAAAACACCTGCTTGGATAA
GCTCTTGTTTTGACAATTCCACAACCACTTTTCCACCCCAGCACATCCCAGCAGCTCCAA
TGGCAGTGATGCCTTTGTTCTTTATGGCTTCAAGTACTGGCTTTGTGTCTTCAAACCCCT
TATTAGGGCCATGGTCTTTGATCCAGACATGGACTGGTCTCTCCTGCTGAGAGGGGTCAT
AAGGATCTCCATAGAAGTAGTCAGGAACCACGACATAGAATCCTGAAGCTGCAACCTTGT
CCGCAAGCGCCCTCAAGTTTGGAGCTTCATACCCATAAATATCGGA

QA 3 768 3 768
DS 

RD RR2AF73JQ 757 0 0
AGCAACATATATACTTCAAAAGTCCATTAGACAATGACATAGAGTAGAGAGACACACACA
CAACCCGAGAGTTTTATTGTACTTATCAGTTCTCTCCTTATTTTCATTCAACAAACAGTA
GCAAATGTGATCGCTTAAGTAAGATAGAGCCTTCTCTCAATCAATCATTTGACGTAAGTT
ACAAACCAATCAAGCATCTCCTTGTGAGCTTCTTCTGCAGCTTGAACAGCCTCTAGGTCA
TTGATGTCGTACCGAGTTGTCCAACCGTGTGAGACATTCGGGAAAATCTTCACATAACTA
CTCACCTCGGGCTTGGAAGCAAGAATCTCCTCAAATTGCTTCACGAGAGCTGGTGGGGTC
AAAAAATCATCCTCAGCTCCTAGTATAGCTATTGGAACCTTCACACCCTTGATATCATCG
ATAGTGACATAAGTAGGATGATTTAAAACAGCTGCTTGGATCAGCTCTTGTTTTGACAAT
TCCACAACCACTTTTCCACCCCGGCACATCCCAGCAGCTCCAATGGCAGTGATGCCTTTG
TTCTTTATGGCTTCAAGTACTGGCTTTGTGTCTTCAAACCCCTTATCAGGGCCATGGTCT
TTGATCCAGACAGGGACTGGTCTCTCCTGATGAGAGGGGTCATAAGGATCTCCATAGAAG
TAATCAGGAACCACGACATAGAATCCTGAAGCTGCAACCTTGTCCGCAAGCGCCCTCAAG
TTTGGTGCTTCGTACCCATAAATATCGGAGACGAGGA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2BJ28JQ 827 0 0
GCAACATATATACTTCAAAAGTCTATTAGAAAATGACAGAGAGTAGAGAGACACACACA*
ACCC*AAGAGTTTTATTGTACTTATTAGTTCTCTCCTTATTTTCATTCAACAAACAGTAG
CAAATGTGATCACTTAAGTAAGATAGAGCCTTCTCTCAATCAATCATTTGACGTAAGTCA
CAAACCAATCAAGCATCTCCTTGTGAGCTTCTTCTGCAGCTTTAACAGCCTCTGGGTCAT
TGATGTCGTACCGAGTTGTCCAACCGTGTGAGACATTCAGGAAAATCTTCACATAACTAC
TCACCTCGGGCTTGGAAGCAAGAATCTCCTCAAATTGCTTCACGAGTGCTGGTGGGGTCG
AAAAATCATCCTCAGCTCCTAGTATAGCTATTGGAACCTTCACACCCTTGATATCATCGA
TAGTGACATAAGTAGGATGTAGCAAAACACCTGCTTGGATAAGCTCTTGTTTTGACAATT
CCACAACCACTTTTCCACCCCAGCACATCCCAGCAGCTCCAATGGCAGTGATGCCTTTGT
TCTTTATGGCTTCAAGTACTGGCTTTGTGTCTTCAAACCCCTTATTAGGGCCATGGTCTT
TGATCCAAACATGGACTGGTCTCTCCTGCTGAGAGGGGTCATAAGGATCTCCATAGAAGT
AGTCAGGAACCACGACATAGAATCCTGAAGCTGCAAACTTGTCCGCAAGCGCCCTCAAGT
TTGGAGCTTCATACCCATAAATATCGGAGACGAGGAGGACGCACTTCTTGGAATCTGGAG
AGCCAGAGACGTAGGCATCGAGGCCACCTAGCTTCTCCACATGACCC

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2BJ28TF 809 0 0
TCATTCAACAAACAGTAGCAAATGTGATCACTTAAGTAAGATAGAGC*TTCTCTCAATCA
ATCATTTGACGTAAGTCACAAACCAATCAAGCATCTCCTTGTGAGCTTCTTCTGCAGCTT
TAACAGCCTCTGGGTCATTGATGTCGTACCGAGTTGTCCAACCGTGTGAGACATTCAGGA
AAATCTTCACATAACTACTCACCTCGGGCTTGGAAGCAAGAATCTCCTCAAATTGCTTCA
CGAGTGCTGGTGGGGTCGAAAAATCATCCTCAGCTCCTAGTATAGCTATTGGAACCTTCA
CACCCTTGATATCATCGATAGTGACATAAGTAGGATGTAGCAAAACACCTGCTTGGATAA
GCTCTTGTTTTGACAATTCCACAACCACTTTTCCACCCCAGCACATCCCAGCAGCTCCAA
TGGCAGTGATGCCTTTGTTCTTTATGGCTTCAAGTACTGGCTTTGTGTCTTCAAACCCCT
TATTAGGGCCATGGTCTTTGATCCAGACATGGACTGGTCTCTCCTGCTGAGAGGGGTCAT
AAGGATCTCCATAGAAGTAGTCAGGAACCACGACATAGAATCCTGAAGCTGCAAACTTGT
CCGCAAGCGCCCTCAAGTTTGGAGCTTCATACCCATAAATATCGGAGACGAGGAGGACGC
ACTTCTTGGAATCTGGAGAGCCAGAGACGTAGGCATCGAGGCCACCTAGCTTCTCCACAT
GACCCGAACCGGAGAGAGGGTCAAGAACCGGCGGGTTTTCGCAGCACTGAGGTCCCAACA
TTATTGGTTCTTCAAAGTGGTTC
AGACCC

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2AF43TF 674 0 0
GGGTCATTGATGTCGTACCGAGTTGTCCAACCGTGTGAGACATTCAGGAAAATCTTCACA
TAACTACTCAC*TCGGGCTTGGAAGCAAGAATCTCCTCAAATTGCTTCACGAGTGCTGGT
GGGGTCAAAAAATCATCCTCAGCTCCTAGTATAGCTATTGGAACCTCCACACCCTTGATA
TCATCGATAGTGACATAAGTAGGATGTAGCAAAACACCTGCTTGGATAAGCTCTTGTTTT
GACAATTCCACAACCACTTTTCCACCCCAGCACATACCAGCAGCTCCAATGGCAGTGATG
CCTTTGTTCTTTATGGCTTCAAGTACTGGCTTTGTGTCTTCAAACCCCTTATTAGGGCCA
TGGTCTTTGATCCAGACATGGACTGGTCTCTCCTGCTGAGAGGGGTCATAAGGATCTCCA
TAGAAGTAGTCAGGAACCACGACATAGAATCCTGAAGCTGCAACCTTGTCCGCAAGCGCC
CTCAAGTTTGGAGCTTCATACCCATAAATATCGGAGACGAGGAGGACGCACTTCTTGGAA
TCTGGAGAGCCAGAGACGTAGGCATCGAGGCCACCTAGCTTCTCTACATGACCCGAACCG
GAGAGAGGGTCAAGAACCGGCGGGTTTTCGCAGCACTGAGGTCCCAACATTATTGGTTCT
TCAAAGTGGTTC
CC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2H443TF 671 0 0
GTCA
TGATGTCGTACCGAGTTGTCCAAC*GTGTGAGACATTCAGGAAAATCTTCACATAACTAC
TCAC*TCGGGCTTGGAAGCAAGAATCTACTCAAATTGCTTCACGAGTGCTGGTGGGGTCA
AAAAATCATCCTCAGCTCCTAGTATAGCTATTGGAACCTTCACACCCTTGATATCATCGA
TAGTGACATAAGTAGGATGTAGCAAAACACCTGCTTGGATAAGCTCTTGTTTTGACAATT
CCACAACCACTTTTCCACCCCAGCACATCCCAGCAGCTCCAATGGCAGTGATGCCTTTGT
TCTTTATGGCTTCAAGTACTGGCTTTGTGTCTTCAAACCCCTTATTAGGGCCATGGTCTT
TGATCCAGACATGGACTGGTCTCTCCTGCTGAGAGGGGTCATAAGGATCTCCATAGAAGT
AGTCAGGAACCACGACATAGAATCCTGAAGCTGCAACCTTGTCCGCAAGCGCCCTCAAGT
TTGGAGCTTCATACCCATAAATATCGGAGACGAGGAGGACGCACTTCTTGGAATCTGGAG
AGCCAGAGACGTAGGCATCGAGGCCACCTAGCTTCTCTACATGACCCGAACCGGAGAGAG
GGTCAAGAACCGGCGGGTTTTCGCAGCACTGAGGTCCCAACATTATTGGTTCTTCAAAGT
GGTTC
CC

QA 5 669 5 669
DS 

RD RR2GU66TF 704 0 0
TCTGCAGCTTTAACAGCCTCTGGGTCATTGATGTCGTACCGAGTTGTCCA*CCGTGTGAG
ACATTCAGGAAAATCTTCACATAACTACTCACCTCGGGCTTGGAAGCAAGAATATCCTCA
AATTGCTTCACGAGTGCTGGTGGGGTCAAAAAATCATCCTCAGCTCCTAGTATAGCTATT
GGAACCTTCACACCCTTGATATCATCGGTAGTGACATAAGTAGGATGTAGCAAAACACCT
GCTTGGATAAGCTCTTGTTTTGACAATTCCACAACCACTTTTCCACCCCAGCACATCCCA
GCAGCTCCAATGGCAGTGATGCCTTTGTTCTTTATGGCTTCAAGTACTGGCTTTGTGTCT
TCAAACCCCTTATTAGGGCCATGGTCTTTGATCCAGACATGGACTGGTCTCTCCTGCTGA
GAGGGGTCATAAGGATCTCCATAGAAGTAGTCAGGAACCACGACATAGAATCCTGAAGCT
GCAACCTTGTCCGCAAGCGCCCTCAAGTTTGGAGCTTCATACCCATAAATATCGGAGACG
AGGAGGACGCACTTCTTGGAATCTGGAGAGCCAGAGACG*AGGCATCGAGGCCACCTAGC
TTCTCTACATGACCCGAACCGGAGAGAGGGTCAAGAACCGGCGGGTTTTCGCAGCACTGA
GGTCCCAACATTATTGGTTCTTCAAAGTGGTTCAGACAAAAAAA

QA 1 704 1 704
DS 



AS 2 11

CO CL451Contig1 884 7 21 U
GTGTGTAAACAAAAATTAATTTATCTTGAGATACATAAAATTGAAA*GGGAAAAAGAAAA
CAAAACAAAACATAAAACAGCCTCTCAAAACCAAAGAACAACAACCCCTTATTGATACCA
ATATTTGATCAACTCCATAAGAAGACCAATATCTCATATTTCCCCAACCATACCAAACCC
GAACCAACTTAAACAATAGCCATTTGGATTATAACCAAATGGTCTAATCATAAAACCATA
CAAAGAACCAAAGCTTGATCCGTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGCTAACAGGCTTGTAG
GGACCTTCAACGGGTATGCTAACGTAGTCAGATTGGTCCTTGGTGAGCTTGGTGAGTCTA
GCACCTAGCTTGCCTAAGTGAAGTGCAGCAACCTTCTCATCCAAGTGTTTAGGCAAAACA
TATACCTTCTTCTCATACTTCCCACTTGACTTTTCGTTCCAGAGCTCAAGCTGTGCAATC
ACCTGGTTGGTGAACGAGCACGACATCACGAAACTCGGGTGTCCAGTGGCACATCCCAAG
TTCATCAGACGACCCTCGGCCAGCACAATGATGCCTGATTTGGTGTCAGGGAACACCCAC
CTATCAGTCTGTGGCTTGATGGTGATGCGTTTCACACCAGGGAAAGTCTCAAGTCCTTGC
ATGTCGATTTCATTGTCAAAGTGACCAATGTTGCACACAATGGCGTTGTTCTTCATCTTC
CTCATGTGGTCGACCATGATGATGTCTTTGTTTCCAGTGGTGGTGCAAAAGATGTCAGCT
TCAGAGACAACGTCCTCAAGGGTTAGAACTTGAAGGCCTTCCATGAGAGCCTGGAGGGCA
CAGATTGGATCGATCTCAGTCACGATCACACGTGCACCGGCGGC


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H762JQB U 2
AF RR2D015JQ U 2
AF RR2FU91JQ U 1
AF RR2D611JQ U 2
AF RR2A403JQ U 2
AF RR2FU91TF C 110
AF RR2A403TF C 112
BS 1 41 RR2FU91JQ
BS 42 42 RR2A403JQ
BS 43 46 RR2FU91JQ
BS 47 47 RR2A403JQ
BS 48 134 RR2FU91JQ
BS 135 135 RR2A403JQ
BS 136 189 RR2FU91JQ
BS 190 190 RR2A403JQ
BS 191 374 RR2FU91JQ
BS 375 375 RR2A403JQ
BS 376 419 RR2FU91JQ
BS 420 420 RR2A403JQ
BS 421 521 RR2FU91JQ
BS 522 522 RR2A403JQ
BS 523 560 RR2FU91JQ
BS 561 561 RR2A403JQ
BS 562 641 RR2FU91JQ
BS 642 677 RR2A403JQ
BS 678 678 RR2D611JQ
BS 679 802 RR2A403JQ
BS 803 884 RR2A403TF

RD RR2H762JQB 458 0 0
G
GTGTAAACAAAAATTAATTTATCTTGAGATACATAAAATTGAAA*GGGAAAAAGAAAACA
AAACAAAACATAAAACAGCCTCTCAAAACCAAAGAACAACAACCCCTTATTAATACCAAT
ATTTGATCAACTCCATAAGAAGACCAATATCTCATATTTCCCCAACCATACCAAACCCGA
ACCAACTTAAACAATAGCCATTTGGATTATAACCAAATGGTCTAATCATAAAACCATACA
AAGAACCAAAGCTTGATCCGTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGCTAACAGGCTTGTAGGG
ACCTTCAACGGGTATGCTAACGTAGTCAGATTGGTCCTTGGTGAGCTTGGTGAGTCTAGC
ACCTAGCTTGCCTAAGTGAAGTGCAGCAACCTTCTCATCCAAGTGTTTAGGCAAAACATA
TACCTTCTTCTCATACTTCCCACTTGACTTTTCGTTC

QA 2 458 2 458
DS 

RD RR2D015JQ 544 0 0
G
GTGTAAACAAAAATTAATTTATCTTGAGATACATAAAATTGAAA*GGGAAAAAGAAAACA
AAACAAAACATAAAACAGCCTCTCAAAACCAAAGAACAACAACCCCTTATTGATACCAAT
ATTTGATCAACTCCATAAGAAGACCAATATCTCATATTTCCCCAACCATACCAAACCCGA
ACCAACTTAAACAATAGCCATTTGGATTATAACCAAATGGTCTAATCATAAAACCATACA
AAGAACCAAAGCTTGATCCGTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGCTAACAGGCTTGTAGGG
ACCTTCAACGGGTATGCTAACGTAGTCAGATTGGTCCTTGGTGAGCTTGGTGAGTCTAGC
ACCTAGCTTGCCTAAGTGAAGTGCAGCAACCTTCTCATCCAAGTGTTTAGGCAAAACATA
TACCTTCTTCTCATACTTCCCACTTGACTTTTCGTTCCAGAACTCAAGCTGTGCAATCAC
CTGGTTGGTGAACGAGCACGACATCACGAAACTCGGGTGTCCAGTGGCACATCCCAAGTT
CAT

QA 2 544 2 544
DS 

RD RR2FU91JQ 641 0 0
GTGTGTAAACAAAAATTAATTTATCTTGAGATACATAAAATGGAAAAGGGAAAAAGAAAA
CAAAACAAAACATAAAACAGCCTCTCAAAACCAAAGAACAACAACCCCTTATTGATACCA
ATATTTGATCAACTTCATAAGAAGACCAATATCTCATATTTCCCCAACCATACCAAACCC
GAACCAACTCAAACAATAGCCATTTGGATTATAACCAAATGGTCTAATCATAAAACCATA
CAAAGAACCAAAGCTTGATCCGTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGCTAACAGGCTTGTAG
GGACCTTCAACGGGTATGCTAACGTAGTCAGATTGGTCCTTGGTGAGCTTGGTGAGTCTA
GCACCTAGCTTGCCCAAGTGAAGTGCAGCAACCTTCTCATCCAAGTGTTTAGGCAAAACG
TATACCTTCTTCTCATACTTCCCACTTGACTTTTCGTTCCAGAGCTCAAGCTGTGCAATC
ACCTGGTTGGTGAACGAGCACGACATCACGAAACTCGGGTGACCAGTGGCACATCCCAAG
TTCATCAGACGACCCTCGGCTAGCACAATGATGCCTGATTTGGTGTCAGGGAACACCCAC
CTATCAGTCTGTGGCTTGATGGTGATGCGTTTCACACCAGG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2D611JQ 751 0 0
C
GTGTAAACAAAAATTAATTTATCTTGAGATACATAAAATTGAAA*GGGAAAAAGAAAACA
AAACAAAACATAAAACAGCCTCTCAAAACCAAAGAACAACAACCCCTTATTGATACCAAT
ATTTGATCAACTCCATAAAAAGACCAATATCTCATATTTCCCCAACCATACCAAACCCGA
ACCAACTTAAACAATAGCCATTTGGATTATAACCAAATGGTCTAATCATAAAACCATACA
AAGAACCAAAGCTTGATCCGTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGCTAACAGGCTTGTAGGG
ACCTTCAACGGGTATGCTAACGTAGTCAAATTGGTCCTTGGTGAGCTTGGTGAGTCTAGC
ACCTAGCTTGCCTAAGTGAAGTGCAGCAACCTTCTCATCCAAGTGTTTAGGCAAAACATA
TACCTTCTTCTCATACTTCCCACTTGACTTTTCGTTCCAAAGCTCAAGCTGTGCAATCAC
CTGGTTGGTGAACGAGCACGACATCACGAAACTCGGGTGTCCAGTGGCACATCCCAAGTT
CATCAAACGACCCTCGGCCAGCACAATGATGCCTGATTTGGTGTCAGGGAACACCCACCT
ATCAGTCTGTGGCTTGATGGTGATGCGTTTCACACCAGGGAAAGTCTCAAGTCCTTGCAT
GTCGATTTCATTGTCAAAGTGACCAATGTTGCACACAATGGCGTTGTTCTTCATCTTCCT
CATGTGGTCGACCATGATGATGTCTTTGTT

QA 2 751 2 751
DS 

RD RR2A403JQ 801 0 0
A
GTGTAAACAAAAATTAATTTATCTTGAGATACATAAAATTGAAA*GGGAAAAAGAAAACA
AAACAAAACATAAAACAGCCTCTCAAAACCAAAGAACAACAACCCCTTATTGATACCAAT
ATTTGATCAACTCCATAAGAAGACCAATATCTCATATTTCCCCAACCATACCAAACCCGA
ACCAACTTAAACAATAGCCATTTGGATTATAACCAAATGGTCTAATCATAAAACCATACA
AAGAACCAAAGCTTGATCCGTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGCTAACAGGCTTGTAGGG
ACCTTCAACGGGTATGCTAACGTAGTCAGATTGGTCCTTGGTGAGCTTGGTGAGTCTAGC
ACCTAGCTTGCCTAAGTGAAGTGCAGCAACCTTCTCATCCAAGTGTTTAGGCAAAACATA
TACCTTCTTCTCATACTTCCCACTTGACTTTTCGTTCCAGAGCTCAAGCTGTGCAATCAC
CTGGTTGGTGAACGAGCACGACATCACGAAACTCGGGTGTCCAGTGGCACATCCCAAGTT
CATCAGACGACCCTCGGCCAGCACAATGATGCCTGATTTGGTGTCAGGGAACACCCACCT
ATCGGTCTGTGGCTTGATGGTGATGCGTTTCACACCAGGGAAAGTCTCAAGTCCTTGCAT
GTCGATTTCATTGTCGAAGTGACCAATGTTGCACACAATGGCGTTGTTCTTCATCTTCCT
CATGTGGTCGACCATGATGATGTCTTTGTTTCCAGTGGTGGTGCAAAAGATGTCAGCTTC
AGAGACAACGTCCTCAAGGG

QA 2 801 2 801
DS 

RD RR2FU91TF 692 0 0
TATTGATACCAATATTTGATCAACTTCATAAGAAGACCAATATCTCATATTTCCCCAACC
ATACCAAACCCGAACCAACTCAAACAATAGCCATTTGGATTATAACCAAATGGTCTAATC
ATAAAACCATACAAAGAACCAAAGCTTGATCCGTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGCTAA
CAGGCTTGTAGGGACCTTCAACGGGTATGCTAACGTAGTCAGATTGGTCCTTGGTGAGCT
TGGTGAGTCTAGCACCTAGCTTGCCCAAGTGAAGTGCAGCAACCTTCTCATCCAAGTGTT
TAGGCAAAACGTATACCTTCTTCTCATACTTCCCACTTGACTTTTCGTTCCAGAGCTCAA
GCTGTGCAATCACCTGGTTGGTGAACGAGCACGACATCACGAAACTCGGGTGACCAGTGG
CACATCCCAAGTTCATCAGACGACCCTCGGCTAGCACAATGATGCCTGATTTGGTGTCAG
GGAACACCCACCTATCAGTCTGTGGCTTGATGGTGATGCGTTTCACACCAGGGAAAGTCT
CAAGTCCTTGCATGTCGATTTCATTGTCAAAGTGACCAATGTTGCATACAATGGCGTTGT
TCTTCATCTTCCTCATGTGGTCGACCATGATGATGTCTTTGTTTCCAGTGGTGGTGCAAA
AGATGTCAGCTTCAGAGACAACGTCCTCAAG
C

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2A403TF 773 0 0
TTGATACCAATATTTGATCAACTCCATAAGAAGACCAATATCTCATATTTCCCCAACCAT
ACCAAACCCGAACCAACTTAAACAATAGCCATTTGGATTATAACCAAATGGTCTAATCAT
AAAACCATACAAAGAACCAAAGCTTGATCCGTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGCTAACA
GGCTTGTAGGGACCTTCAACGGGTATGCTAACGTAGTCAGATTGGTCCTTGGTGAGCTTG
GTGAGTCTAGCACCTAGCTTGCCTAAGTGAAGTGCAGCAACCTTCTCATCCAAGTGTTTA
GGCAAAACATATACCTTCTTCTCATACTTCCCACTTGACTTTTCGTTCCAGAGCTCAAGC
TGTGCAATCACCTGGTTGGTGAACGAGCACGACATCACGAAACTCGGGTGTCCAGTGGCA
CATCCCAAGTTCATCAGACGACCCTCGGCCAGCACAATGATGCCTGATTTGGTGTCAGGG
AACACCCACCTATCGGTCTGTGGCTTGATGGTGATGCGTTTCACACCAGGGAAAGTCTCA
AGTCCTTGCATGTCGATTTCATTGTCGAAGTGACCAATGTTGCACACAATGGCGTTGTTC
TTCATCTTCCTCATGTGGTCGACCATGATGATGTCTTTGTTTCCAGTGGTGGTGCAAAAG
ATGTCAGCTTCAGAGACAACGTCCTCAAGGGTTAGAACTTGAAGGCCTTCCATGAGAGCC
TGGAGGGCACAGATTGGATCGATCTCAGTCACGATCACACGTGCACCGGCGGC

QA 1 773 1 773
DS 



CO CL451Contig2 1476 4 18 U
GGAGTACACTCTGTTCCCATCTTCACACAGAACAGAAACATTCAAACAGAAAAAACAATG
GCGTTGCTTGTAGAGAAGACGTCGAGTGGCCGTGAGTACAAGGTCAAGGACATGTCTCAG
GCCGACTTCGGTCGTCTCGAGATCGAGCTCGCCGAGGTCGAAATGCCTGGTCTCGTCTCC
TGCGTCACCGAGTTCGGACCATCTCAGCCACTCAAAGGAGCAAGAATCACCGGTTCTCTC
CACATGACCATCCAAACCGCCGTCCTCATCGAAACCTTAACCGCTCTCGGCGCAGAGGTC
AGATGGTGCTCCTGCAACATCTTCTCCACCCAGGACCACGCCGCCGCCGCCATTGCTCGT
GACTCCGCCGCCGTGTTCGCCTGGAAAGGGGAGACTCTCCAGGAGTATTGGTGGTGCACG
GAGAGGGCTCTCGACTGGGGTCCTGGAGGTGGTCCCGACCTGATCGTCGACGACGGCGGT
GACGCTACGCTCCTTATCCACGAAGGTGTTAAGGCTGAGGAGATCTTTGCTAAGACCGGT
CAGCTCCCCGACCCGACTTCCACGGACAATCCTGAGTTCCAGATCGTGTTGTCGATTATC
AAAGATGGTCTTCAGGTTGATCCCAAGAAGTACCACAAGATGAAAGAGAGATTGGTTGGT
GTTTCGGAGGAGACGACCACTGGTGTTAAGAGGCTTTACCAAATGCAGGAGACTGGAGCT
CTCTTGTTCCCTGCCATTAACGTCAATGACTCCGTCACCAAGAGCAAGTTTGACAACTTG
TATGGATGTCGCCACTCTCTCCCTGACGGTCTTATGAGAGCCACTGATGTCATGATCGCC
GGAAAGGTCGCTGTCATCTGCGGTTATGGTGATGTCGGAAAGGGTTGTGCTGCAGCCATG
AAAACCGCCGGTGCACGTGTGATCGTGACTGAGATCGATCCAATCTGTGCCCTCCAGGCT
CTCATGGAAGGCCTTCAAGTTCTAACCCTTGAGGACGTTGTCTCTGAAGCTGACATCTTT
TGCACCACCACTGGAAACAAAGACATCATCATGGTCGACCACATGAGGAAGATGAAGAAC
AACGCCATTGTGTGCAACATTGGTCACTTTGACAATGAAATCGACATGCAAGGACTTGAG
ACTTTCCCTGGTGTGAAACGCATCACCATCAAGCCACAGACTGATAGGTGGGTGTTCCCT
GACACCAAATCAGGCATCATTGTGCTGGCCGAGGGTCGTCTGATGAACTTGGGATGTGCC
ACTGGACACCCGAGTTTCGTGATGTCGTGCTCGTTCACCAACCAGGTGATTGCACAGCCT
GAGCTCTGGAACGAAAAGTCAAGTGGGAAGTATGAGAAGAAGTATATGTTTTGCCTAAAC
ACTTGGATGAGAAGTTGCTGCACTTCACTTAGCAAGCTAGTGCTAGACTCACCAAGCTCA
CCAAGTACCATCTGACTACGTAGCATACCCGTTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H762TF U 1
AF RR2D611TF U 579
AF RR2D015TF U 683
AF RR2C741TF U 797
BS 1 669 RR2H762TF
BS 670 670 RR2D611TF
BS 671 692 RR2H762TF
BS 693 693 RR2D611TF
BS 694 708 RR2H762TF
BS 709 709 RR2D611TF
BS 710 739 RR2H762TF
BS 740 740 RR2D611TF
BS 741 745 RR2H762TF
BS 746 746 RR2D611TF
BS 747 766 RR2H762TF
BS 767 1026 RR2D611TF
BS 1027 1027 RR2D015TF
BS 1028 1276 RR2D611TF
BS 1277 1318 RR2D015TF
BS 1319 1319 RR2C741TF
BS 1320 1355 RR2D015TF
BS 1356 1476 RR2C741TF

RD RR2H762TF 771 0 0
GGAGTACACTCTGTTCCCATCTTCACACAGAACAGAAACATTCAAACAGAAAAAACAATG
GCGTTGCTTGTAGAGAAGACGTCGAGTGGCCGTGAGTACAAGGTCAAGGACATGTCTCAG
GCCGACTTCGGTCGTCTCGAGATCGAGCTCGCCGAGGTCGAAATGCCTGGTCTCGTCTCC
TGCGTCACCGAGTTCGGACCATCTCAGCCACTCAAAGGAGCAAGAATCACCGGTTCTCTC
CACATGACCATCCAAACCGCCGTCCTCATCGAAACCTTAACCGCTCTCGGCGCAGAGGTC
AGATGGTGCTCCTGCAACATCTTCTCCACCCAGGACCACGCCGCCGCCGCCATTGCTCGT
GACTCCGCCGCCGTGTTCGCCTGGAAAGGGGAGACTCTCCAGGAGTATTGGTGGTGCACG
GAGAGGGCTCTCGACTGGGGTCCTGGAGGTGGTCCCGACCTGATCGTCGACGACGGCGGT
GACGCTACGCTCCTTATCCACGAAGGTGTTAAGGCTGAGGAGATCTTTGCTAAGACCGGT
CAGCTCCCCGACCCGACTTCCACGGACAATCCTGAGTTCCAGATCGTGTTGTCGATTATC
AAAGATGGTCTTCAGGTTGATCCCAAGAAGTACCACAAGATGAAAGAGAGATTGGTTGGT
GTTTCGGAG*AGACGACCACTGGTGTTAAGAG*CTTTACCAAATGCAG*AGACTGGAGCT
CTCTTGTTCCCTGCCATTA*CGTCA*TGACTCCGTCACCAAGAGCA
GTTTG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2D611TF 698 0 0
G
CAGATCGTGTTGTCGATTATCAAAGATGGTCTTCAGGTTGATCCCAGGAAGTACCACAAG
ATGAAGGAGAGATTGGTTGGTGTTTCGGAGGAGACGACCACTGGTGTTAAGAGGCTTTAC
CAAATGCAGGAGACTGGAGCTCTCTTGTTCCCTGCCATTAACGTCAATGACTCCGTCACC
AAGAGCAAGTTTGACAACTTGTATGGATGTCGCCACTCTCTCCCTGACGGTCTTATGAGA
GCCACTGATGTCATGATCGCCGGAAAGGTCGCTGTCATCTGCGGTTATGGTGATGTCGGA
AAGGGTTGTGCTGCAGCCATGAAAACCGCCGGTGCACGTGTGATCGTGACTGAGATCGAT
CCAATCTGTGCCCTCCAGGCTCTCATGGAAGGCCTTCAAGTTCTAACCCTTGAGGACGTT
GTCTCTGAAGCTGACATCTTTTGCACCGCCACTGGAAACAAAGACATCATCATGGTCGAC
CACATGAGGAAGATGAAGAACAACGCCATTGTGTGCAACATTGGTCACTTTGACAATGAA
ATCGACATGCAAGGACTTGAGACTTTCCCTGGTGTGAAACGCATCACCATCAAGCCACAG
ACTGATAGGTGGGTGTTCCCTGACACCAAATCAGGCATCATTGTGCTGGCCGAGGGTCGT
CTGATGAACTTGGGATGTGCCACTGGACACCCGAGTT

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR2D015TF 673 0 0
GTGTTAAGAGGCTTTAC*AAATGCAGGAGACTGGAGCTCTCTTGTTCCCTGCCATTAACG
TCAATGACTCCGTCACCAAGAGCAAGTTTGACAACTTGTATGGATGTCGCCACTCTCTCC
CTGACGGTCTTATGAGAGCCACTGATGTCATGATCGCCGGAAAGGTCGCTGTCATCTGCG
GTTATGGTGATGTCGGAAAGGGTTGTGCTGCAGCCATGAAAACCGCCGGTGCACGTGTGA
TCGTGACTGAGATCGATCCAATCTGTGCCCTCCAGGCTCTCATGGAAGGCCTTCAAGTTC
TAACCCTTGAGGACGTTGTCTCTGAAGCTGACATCTTTTGCACCACCACTGGAAACAAAG
ACATCATCATGGTCGACCACATGAGGAAGATGAAGAACAACGCCATTGTGTGCAACATTG
GTCACTTTGACAATGAAATCGACATGCAAGGACTTGAGACTTTCCCTGGTGTGAAACGCA
TCACCATCAAGCCACAGACTGATAGGTGGGTGTTCCCTGACACCAAATCACGCATCATTG
TGCTGGCCGAGGGTCGTCTGATGAACTTGGGATGTGCCACTGGACACCCGAGTTTCGTGA
TGTCGTGCTCGTTCACCAACCAGGTGATTGCACAGCTTGAGCTCTGGAACGAAAAGTCAA
GTGGGAAGTATGA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2C741TF 680 0 0
CTCTCCCTGACGGTCTTATGAGAGCCACTGATGTCATGATCGCCGGAAGGGTCGCTGTCA
TCTGCGGTTATGGTGATGTCGGAAAGGGTTGTTCTGCAGCCATGAAAACCGCCGGTGCAC
GTGTGATCGTGACTGAGATCGATCCAATCTGTGCCCTCCAGGCTCTCATGGAAGGCCTTC
AAGTTCTAACCCTTGAGGACGTTGTCTCTGAAGCTGACATCTTTTGCACCACCACTGGAA
ACAAAGACATCATCATGGTCGACCACATGAGGAAGATGAAGAACAACGCCATTGTGTGCA
ACATTGGTCACTTTGACAATGAAATCGACATGCAAGGACTTGAGACTTTCCCTGGTGTGA
AACGCATCACCATCAAGCCACAGACTGATAGGTGGGTGTTCCCTGACACCAAATCAGGCA
TCATTGTGCTGGCCGAGGGTCGTCTGATGAACTTGGGATGTGCCACTGGACACCCGAGTT
TCGTGATGTCGTGCTCGTTCACCAACCAGGTGATTGCACAGCCTGAGCTCTGGAACGAAA
AGTCAAGTGGG**GTATGAGAAGAAGTATATGTTTTGCCTAAACACTTGGATGAGAAGTT
GCTGCACTTCACTTAGCAAGCTAGTGCTAGACTCACCAAGCTCACCAAGTACCATCTGAC
TACGTAGCATACCCGTTGAA

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 11

CO CL452Contig1 716 11 13 U
GGAGATCAGATCTCAGTATCCTACATTCATATAACATAACCAATAATGGCTCGCCGCGAC
GTTCTCCTCCTCTCCGTCCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGAC
GATGATGCAGAATGTGTCTACACATTCTACCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAAGCCGGC
ACTGAATCGATCATAAGCGCTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGA
AACCTAGAGGCATGGGGTGGGTTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGTAAT
CTGGACATTTTCAGTGGGAAAGCACCGTGTCTTCCTAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTG
ACCTCCGATGGCTCCGGCGACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACG
GCAGGAGTCCACGCTAAGTGCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAGTGGCTTGCGACC
GATACTTCGCCTTATAATCTCACTGCTGTTAGGAATAACTGCCCGGTTTCTCTTAGGGAG
AGTGTTGGTCGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGACTCTCTCTTGGATCGTGTGAATTGAT
AAATGAATGAATGTGTGTGTTTTTGGAGACTTGTTCTATGTTGTCTTGTGAACGTGTGAT
TGCAATAAAGAAAAATGATTCGATCAAATAAAATTTCAGTTTTTGTTGTTGTCGGC


BQ
35 35 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 
55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 
55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 25 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 10 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ71TF U 101
AF RR2BV84TF U -3
AF RR2CU11TF U 8
AF RR2AJ71JQ C 1
AF RR2CU11JQ C 1
AF RR2D792JQ C 1
AF RR2GJ71JQB C 152
AF RR2GT90TF U 16
AF RR2D792TF U 1
AF RR2AJ71TF U 1
AF RR2BV84JQ C -3
BS 1 7 RR2D792TF
BS 8 100 RR2CU11TF
BS 101 168 RR2GJ71TF
BS 169 169 RR2CU11TF
BS 170 243 RR2GJ71TF
BS 244 310 RR2CU11TF
BS 311 311 RR2GT90TF
BS 312 514 RR2CU11TF
BS 515 535 RR2GT90TF
BS 536 536 RR2D792TF
BS 537 675 RR2GT90TF
BS 676 707 RR2AJ71TF
BS 708 716 RR2BV84JQ

RD RR2GJ71TF 143 0 0
CCTCAGTCTCATTCGCCGACGATGATGCAGAATGTGTCTACACATTCTACCTCAGGACCG
GATCGATCAGGAAAGCCGGCACTGAATCGATCATAAGCGCTAGAATCTACGACAAATACG
GAGACTACATTGGGATCCGAAAC

QA 1 143 1 143
DS 

RD RR2BV84TF 285 0 0
GGGGAC
AGATCAGATCTCAGTATCCTACATTCATATAACATAACCAATAATGGCTCGCCGCGACGT
TCTCCTCCTCTCCGTCCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGACGA
TGATGCAGAATGTGTCTACACATTCTATCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAGGCCGGCAC
TGAATCGATCATAAGCGTTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGAAA
CCTAGAGGCATGGGGTGGATTAATGGGACCAGGTTACAA

QA 7 285 7 285
DS 

RD RR2CU11TF 514 0 0
AGATCTCAGTATCCTACATTCATATAACATAACCAATAATGGCTCGCCGCGACGTTCTCC
TCCTCTCCGTCCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGACGATGATG
CAGAATGTGTCTACACATTCTACCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAAGCCGGCACTGAAT
CGATCATAAGCGCTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGAAACCTAG
AGGCATGGGGTGGGTTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGTAATCTGGACA
TTT*CAGTGGGAAAGCACCGTGTCTTCCTAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTGACCTCCG
ATGGCTCCGGCGACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACGGCAGGAG
TCCACGCTAAGTGCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAGTGGCTTGCGACCGATACTT
CGCCTTATAATCTCACTGCTGTTAGGA
TAACTGC

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2AJ71JQ 707 0 0
GGAGATCAGATCTCAGTATCCTACATTCATATAACATAACCAATAATGGCTCGCCGCGAC
GTTCTCCTCCTCTCCGTCCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGAC
GATGATGCAGAATGTGTCTACACATTCTATCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAGGCCGGC
ACTGAATCGATCATAAGCGCTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGA
AACCTAGAGGCATGGGGTGGATTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGCAAT
CTCGACATTTTCAGTGGGAAAGCACCGTGTCTTCCTAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTA
ACCTCCGACGGCTCAGGCGACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGTTCACGACG
GCAGGAGTCCACGCTAAGTGCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAATGGCTTGCGACC
GATACTTCGCCTTATAATCTCACTGCTGTTAGGAATAACTGCCCGGTTTCTCTTAGGGAG
AGTGTTGGTCGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGACTCTCTCTTGGATCGTGTGAACTAAT
AAATGAATGAATATGTGTGTTTCTG*AGACTTGTTCTATGTTGTCTTGTGAGCGTGTGAT
TGCAATAAAGAAAAATGATTCGATCAAATAAAATTTCAGTTTTTGTT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2CU11JQ 671 0 0
GGAGATCAGATCTCAGTATCCTACATTCATATAACATAACCAATAATGGCTCGCCGCGAC
GTTCTCCTCCTCTCCGTCCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGAC
GATGATGCAGAATGTGTCTACACATTCTACCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAAGCCGGC
ACTGAATCGATCATAAGCGCTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGA
AACCTAGAGGCATGGGGTGGGTTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGTAAT
CTGGACATTT*CAGTGGGAAAGCACCGTGTCTTCCTAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTG
ACCTCCGATGGCTCCGGCGACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACG
GCAGGAGTCCACGCTAAGTGCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAGTGGCTTGCGACC
GATACTTCGCCTTATAATCTCACTGCTGTTAGGAATAACTGCCCGGTTTCTCTTAGGGAG
AGTGTTGGTCGGATCGGGTCTGAGATCCGGAAGACTCTCTCTTGGATCGTGTGAATTGAT
AAATGAATGAATGTGTGTGTTTTTGGAGACTTGTTCTATGTTGTCTTGTGAACGTGTGAT
TGCAATAAAGA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2D792JQ 685 0 0
GGAGATCAGATCTCAGTATCCTACATTCATATAACATAACCAATAATGGCTCGCCGCGAC
GTTCTCCTCCTCTCCGTCCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGAC
GATGATGCAGAATGTGTCTACACATTCTACCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAAGCCGGC
ACTGAATCGATCATAAGCGCTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGA
AACCTAGAGGCATGGGGTGGGTTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGTAAT
CTGGACATTTTCAGTGGGAAAGCACCGTGTCTTCCTAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTG
ACCTCCGATGTCTCCGGCGACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACG
GCAGGAGTCCACGCTAAGTGCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAGTGGCTTGCGACC
GATACTTCGCCTTATAATCTCACTGCTGTTAGGAATAACTGCCCGGTTTCTCTTAGGGAG
AGTGTTGGTCGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGACTCTCTCTTGGATCGTGTGAATTGAT
AAATGAATGAATGTGTGTGTTTTTGGAGACTTGTTCTATGTTGTCTTGTGAACGTGTGAT
TGCAATAAAGAAAAATGATTCGATC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2GJ71JQB 534 0 0
TCAGGACCGGATCGATCAGGAAAGCCGGCACTGAATCGATCATAAGCGCTAGAATCTACG
ACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGAAACCTAGAGGCATGGGGTGGGTTAATGGGAC
CAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGTAATCTGGACATTTTCAGTGGGAAAGCACCGTGTC
TTCCTAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTGACCTCCGATGGCTCCGGCGACCACCACGGTT
GGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACGGCAGGAGTCCACGCTAAGTGCTCGCAGCAAA
GCTTTGAAGTTGAGCAGTGGCTTGCGACCGATACTTCGCCTTATAATCTCACTGCTGTTA
GGAATAACTGCCCGGTTTCTCTTAGGGAGAGTGTTGGTCGGGTCGGGTCTGAGATCCGGA
AGACTCTCTCTTGGATCGTGTGAATTGATAAATGAATGAATGTGTGTGTTTTTGGAGACT
TGTTCTATGTTGTCTTGTGAACGTGTGATTGCAATAAAGAAAAATGATTCGATC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2GT90TF 660 0 0
GG
ATCCTACATTCATATAACATAACCAATAATGGCTCGCCGCGACGTTCTCCTCCTCTCCGT
CCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGACGATGATGCAGAATGTGT
CTACACATTCTACCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAAGCCGGCACTGAATCGATCATAAG
CGCTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGAAACCTAGAGGCATGGGG
TGGGTTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGTAATCTGGACATTTTCAGTGG
GAAAGCACCGTGTCTTCCTAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTGACCTCCGATGGCTCCGG
CGACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACGGCAGGAGTCCACGCTAA
GTGCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAGTGGCTTGCGACCGATACTTCGCCTTATAA
TCTCACTGCTGTTAGGAATAACTGCCCGGTTTCTCTTAAGGAGAGTGTTGGTCGGGTCGG
GTCTGAGATCCGGAAGACTCTCTCTTGGATCGTGTGAATTGATAAATGAATGAATGTGTG
TGTTTTTGGAGACTTGTTCTATGTTGTCTTGTGAACGTGTGATTGCAATAAAGAAAAA

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR2D792TF 669 0 0
GGAGATCAGATCTCAGTATCCTACATTCATATAACATAACCAATAATGGCTCGCCGCGAC
GTTCTCCTCCTCTCCGTCCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGAC
GATGATGCAGAATGTGTCTACACATTCTACCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAAGCCGGC
ACTGAATCGATCATAAGCGCTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGA
AACCTAGAGGCATGGGGTGGGTTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGTAAT
CTGGACATTTTCAGTGGGAAAGCACCGTGTCTTCCTAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTG
ACCTCCGATGTCTCCGGCGACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACG
GCAGGAGTCCACGCTAAGTGCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAGTGGCTTGCGACC
GATACTTCGCCTTATAATCTCACTGCTGTTAGGAATAACTGCCCGGTTTCTCTTAGGGAG
AGTGTTGGTCGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGACTCTCTCTTGGATCGTGTGAATTGAT
AAATGAATGAATGTGTGTGTTTTTGGAGACTTGTTCTATGTTGTCTTGTGAACGTGTGAT
TGCAATAAA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2AJ71TF 707 0 0
GGAGATCAGATCTCAGTATCCTACATTCATATAACATAACCAATAATGGCTCGCCGCGAC
GTTCTCCTCCTCTCCGTCCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGAC
GATGATGCAGAATGTGTCTACACATTCTATCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAGGCCGGC
ACTGAATCGATCATAAGCGCTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGA
AACCTAGAGGCATGGGGTGGATTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGCAAT
CTCGACATTTTCAGTGGGAAAGCACCGTGTCTTCCTAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTA
ACCTCCGACGGCTCAGGCGACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGTTCACGACG
GCAGGAGTCCACGCTAAGTGCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAATGGCTTGCGACC
GATACTTCGCCTTATAATCTCACTGCTGTTAGGAATAACTGCCCGGTTTCTCTTAGGGAG
AGTGTTGGTCGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGACTCTCTCTTGGATCGTGTGAACTAAT
AAATGAATGAATATGTGTGTTTCTG*AGACTTGTTCTATGTTGTCTTGTGAGCGTGTGAT
TGCAATAAAGAAAAATGATTCGATCAAATAAAATTTCAGTTTTTGTT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2BV84JQ 720 0 0
GGGGAC
AGATCAGATCTCAGTATCCTACATTCATATAACATAACCAATAATGGCTCGCCGCGACGT
TCTCCTCCTCTCCGTCCTCCTCGTCATCGCCACCTTCTCCTCAGTCTCATTCGCCGACGA
TGATGCAGAATGTGTCTACACATTCTATCTCAGGACCGGATCGATCTGGAAGGCCGGCAC
TGAATCGATCATAAGCGTTAGAATCTACGACAAATACGGAGACTACATTGGGATCCGAAA
CCTAGAGGCATGGGGTGGATTAATGGGACCAGGTTACAAGTACTACGAGAGGGGCAATCT
CGACATTTTCAGTGGGAAAGCACCGTGTCTTCCTAGCCCAGTCTGTTCGTTGAATCTAAC
CTCCGACGGCTCAGGCGACCACCACGGTTGGTATGTTAACTACGTGGAGGTCACGACGGC
AGGAGTCCACGCTAAGTGCTCGCAGCAAAGCTTTGAAGTTGAGCAATGGCTTGCGACCGA
TACTTCGCCTTATAATCTCACTGCTGTTAGGAATAACTGCCCGGTTTCTCTTAGGGAGAG
TGTTGGTCGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGACTCTCTCTTGGATCGTGTGAACTAATAA
ATGAATGAATATGTGTGTTTCTG*AGACTTGTTCTATGTTGTCTTGTGAGCGTGTGATTG
CAATAAAGAAAAATGATTCGATCAAATAAAATTTCAGTTTTTGTTGTTGTCGGC

QA 7 720 7 720
DS 



AS 1 6

CO CL453Contig1 963 6 27 U
GGGAAAATCTCTGGAACAAAAGATAAACAGAAACTAAAAAGAAAGAATAATGGCGAGAGG
GAAGATACAGATCAAGAGAATAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGACGTATTCTAAGAG
AAGAAATGGTTTGTTCAAGAAAGCTCACGAGCTTACGGTTTTGTGTGATGCTAGGGTTTC
GATTATCATGTTCTCTAGCTCCAACAAGCTTCATGAGTTTATAAGCCCTAACACCACAAC
AAAGGAGATCATAGATCTATACCAAACGGTTTCTGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTA
TGAGAGAATGCAAGAAACCAAGAGGAAGCTGTTGGAAACTAATAGAAAGCTCCGGACTCA
GATTAAGCAGAGGCTAGGTGAGTGTTTGGATGAACTTGATATTCAGGAGCTGCGTAGTCT
TGAGGAAGAAATGGAAAACACTTTCAAACTCGTTCGTGAGCGCAAGTTCAAATCCCTTGG
GAATCAGATCGAAACCACCAAGAAAAAGAACAAAAGTCAACAAGACATACAAAAGAATCT
CATACATGAGCTGGAGCTAAGAGCGGAAGATCCTCACTATGGCCTAGTAGACAATGGAGG
CGACTACGACTCGGTTCTTGGATATCAAATCGAAGGATCACGTGCTTATGCTCTTCGTTA
CCATCAAAACCATAATCACCATTACCCCAACCATGCCCTCCATGCACCATCTGCCTCTGA
CATCATTACCTTCCACCTTCTTGAATGATTAA*GGGTTAAAAGGTTGCTGCTATTTATCA
TTATCTATCTACTTAATAACTACTTGAAAAGCATAAGGCTGGTTCTACTACAAATTTAAA
CTATCATGTTTCTTAATTATGTATTTCTTACAGTCTTAAGTATGGATTGTGTGATCAGTA
GCTTGCTGCTTTGACATATTGTGGTTGGAATGTTTTCAAGACTATGTATGAATTTGTATT
GAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 5 5 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 0 25 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2GA11TF U 1
AF RR2GW75TF U 21
AF RR2E184TF U 13
AF RR2CO16TF U 69
AF RR2B138TF U 13
AF RR2B138JQ C 143
BS 1 12 RR2GA11TF
BS 13 14 RR2B138TF
BS 15 32 RR2GA11TF
BS 33 33 RR2E184TF
BS 34 70 RR2GA11TF
BS 71 71 RR2B138TF
BS 72 78 RR2GA11TF
BS 79 79 RR2E184TF
BS 80 114 RR2GA11TF
BS 115 115 RR2E184TF
BS 116 130 RR2GA11TF
BS 131 131 RR2E184TF
BS 132 136 RR2GA11TF
BS 137 137 RR2B138TF
BS 138 141 RR2GA11TF
BS 142 142 RR2E184TF
BS 143 269 RR2GA11TF
BS 270 270 RR2B138TF
BS 271 381 RR2GA11TF
BS 382 382 RR2B138TF
BS 383 386 RR2GA11TF
BS 387 387 RR2B138TF
BS 388 566 RR2GA11TF
BS 567 752 RR2B138TF
BS 753 753 RR2E184TF
BS 754 790 RR2B138TF
BS 791 963 RR2B138JQ

RD RR2GA11TF 566 0 0
GGGAAAATCTCTTCAACAAAAGATAAACAGAA*CTAAAAAGAAAGAATAATGGCGAGAGG
GAAGATACAGGTCAAGAGGATAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGACGTATTCCAAGAG
AAGAAATGGTCTGTTCGAGAAGGCTCACGAGCTTACGGTTTTGTGTGATGCTAGGGTTTC
GATTATCATGTTCTCTAGCTCCAACAAGCTTCATGAGTTTATAAGCCCTAACACCACAAC
AAAGGAGATCATAGATCTATACCAAACGGCTTCTGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTA
TGAGAGAATGCAAGAAACCAAGAGGAAGCTGTTGGAAACTAATAGAAAGCTCCGGACTCA
GATTAAGCAGAGGCTAGGTGAATGTT*GGATGAACTTGATATTCAGGAGCTGCGTAGTCT
TGAGGAAGAAATGGAAAACACTTTCAAACTCGTTCGTGAGCGCAAGTTCAAATCCCTTGG
GAATCAGATCGAAACCACCAAGAAAAAGAACAAAAGTCAACAAGACATACAAAAGAATCT
CATACATGAGCTGGAGCTAAGAGCGG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2GW75TF 685 0 0
AGATAAACAGAAACTAAAAAGAAAGAATAATGGCGAGAGGGAAGATCCAGATCAAGAGAA
TAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGACGTATTCTAAGAGAAGAAATGGTTTGTTCAAGA
AAGCTCACGAGCTTACGGTTCTGTGTGATGCTAGGGTTTCCATTATCATGTTCTCTAGCT
CTAACAAGCTTCATGAGTTTATAAGCCCTAACACCGCAACAAAGGAGATCATAGATCTGT
ACCAAACGGTTTCAGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAATGCAAGAAACCA
AGAGGAAGCTGTTGGAAACTAATAGAAAGCTCCGGACTCAGATTAAGCAGAGGCTAGGTG
AGTGTTTGGATGAACTTGATATTCAGGAGCTGCGTAGTCTTGAGGAAGAAATGGAAAACA
CTTTCAAACTCGTTCGTGAGCGCAAGTTCAAATCCCTTGGGAATCATATCGAAACCACCA
AGAAAAAGAACAAAAGTCAACAATACATACAAAAGAATCTCATACATGAGCTGGAGCTAA
GAGCGGAAGATCCTCACTATGGCCTAGTAGACAATGGAG*CGACTACGACTCGGTTCTTG
GATATCAAATCGAAAGATCACGTGCTTATGCTCTTCGTTACCATCAAAACCATAATCACC
ATTACCCCAACCATGCTCTCCATGC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2E184TF 747 0 0
GGAACAAAAGATAAACAGAAACTAAAAAGAAAGAATAATGGCGAGAGGGAAGATCCAGAT
CAAGAGAATAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGACGTATTCTAAGAGAAGAAATGGTTT
GTTCAAGAAAGCTCACGAGCTTACGGTTTTGTGTGATGCTAGGGTTTCCATTATCATGTT
CTCTAGCTCTAACAAGCTTCATGAGTTTATAAGCCCTAACACCACAACAAAGGAGATCAT
AGAT*TGTACCAAACGGTTTCAGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAATGCA
AGAAACCAAGAGGAAGCTGTTGGAAACTAATAGAAAGCTCCGGACTCAGATTAAGCGGAG
GCTAGGTGAGTGTTTGGATGAACTTGATATTCAGGAGCTGCGTAGTCTTGAGGAAGAAAT
GGAAAACACTTTCAAACTCGTTCGTGAGCGCAAGTTCAAATCCCTTGGGAATCATATCGA
AACCACCAAGAAAAAGAACAAAAGTCAACAAGACATACAAAAGAATCTCATACATGAGCT
GGAGCTAAGAGCGGAAGATCCTCACTATGGCCTAGTGGACAATGGAGGCGACTACGACTC
GGTTCTTGGATATCAAATCGAAGGATCACGTGCTTATGCTCTTCGTTACCATCAAAACCA
TAATCACCATTACCCCAACCATGCTCTCCATGCACCATCAGCCTCTGACATCATTACCTT
CCACCTTCTTGAATGAATAA*GGGTTA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2CO16TF 660 0 0
AGATCAAGAGAATAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGGCGTATTCTAAGAGAAGAAATG
GTTTGTTCAAGAAAGCTCACGAGCTTACGGTTTTGTGTGATGCTAGGGTTTCCATTATCA
TGTTCTCTAGCTCTAACAAGCTTCATGAGTTTATAAGCCCTAACACCACAACAAAGGAGA
TCATAGATCTGTACCAAACGTTTTCAGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAA
TGCA*GAAACCAAGAGGAAGCTGTTGGAAACTAATAGAAAGCTCCGGACTCAGATTAAGC
AGAGGCTAGGTGAGTGTTTGGATGAACTTGATATTCAGGAGCTGCGTAGTCTTGAGGAAG
AAATGGAAAACACTTTCAAACTCGTTCGTGAGCGCAAGTTCAAATCCCTTGGGAATCATA
TCGAAACCACCAAGAAAAAGAACAAAAGTCAACAAGACGTACAAAAGAATCTCATACATG
AGCTGGAGCTAAGAGCGGAAGATCCTCACTATGGCCTAGTAGACAATGGAGGCGACTACG
ACTCGGTTCTTGGATATCAAATCGAAGGATCACGTGCTTATGCTCTTCGTTACCATCAAA
ACCATAATCACCATTACCCCAACCATGCTCTCCATGCACCATCAGCCTCTGACATCATTA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2B138TF 778 0 0
GGAACAAAAGATAAACAGAA*CTAAAAAGAAAGAATAATGGCGAGAGGGAAGATACAGAT
CAAGAGGATAGAGAACCAGACCAACCGACAAGTGACGTATTCCAAGAGAAGAAATGGTCT
GTTCAAGAAGGCTCACGAGCTTACGGTTTTGTGTGATGCTAGGGTTTCGATTATCATGTT
CTCTAGCTCCAACAAGCTTCATGAGTTTATAAGCCCTAACACCACAACAAAGGAGATCAT
AGATCTATACCAAACGGTTTCTGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAATGCA
AGAAACCAAGAGGAAGCTGTTGGAAACTAATAGAAAGCTCCGGACTCAGATTAAGCAGAG
GCTAGGTGAGTGTTTGGATGAACTTGATATTCAGGAGCTGCGTAGTCTTGAGGAAGAAAT
GGAAAACACTTTCAAACTCGTTCGTGAGCGCAAGTTCAAATCCCTTGGGAATCAGATCGA
AACCACCAAGAAAGAGAACAAAAGTCAACAAGACATACAAAAGAATCTCATACATGAGCT
GGAGCTAAGAGCGGAAGATCCTCACTATGGCCTAGTAGACAATGGAGGCGACTACGACTC
GGTTCTTGGATATCAAATCGAAGGATCACGTGCTTATGCTCTTCGTTACCATCAAAACCA
TAATCACCATTACCCCAACCATGCCCTCCATGCACCATCTGCCTCTGACATCATTACCTT
CCACCTTCTTGAATGATTAAAGGGTTAAAAGGTTGCTGCTATTTATCATTATCTATCT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2B138JQ 821 0 0
GCTCACGAGCTTACGGTTTTGTGTGATGCTAGGGTTTCGATTATCATGTTCTCTAGCTCC
AACAAGCTTCATGAGTTTATAAGCCCTAACACCACAACAAAGGAGATCATAGATCTATAC
CAAACGGTTTCTGATGTTGATGTTTGGAGCGCTCACTATGAGAGAATGCAAGAAACCAAG
AGGAAGCTGTTGGAAACTAATAGAAAGCTCCGGACTCAGATTAAGCAGAGGCTAGGTGAG
TGTTTGGATGAACTTGATATTCAGGAGCTGCGTAGTCTTGAGGAAGAAATGGAAAACACT
TTCAAACTCGTTCGTGAGCGCAAGTTCAAATCCCTTGGGAATCAGATCGAAACCACCAAG
AAAGAGAACAAAAGTCAACAAGACATACAAAAGAATCTCATACATGAGCTGGAGCTAAGA
GCGGAAGATCCTCACTATGGCCTAGTAGACAATGGAGGCGACTACGACTCGGTTCTTGGA
TATCAAATCGAAGGATCACGTGCTTATGCTCTTCGTTACCATCAAAACCATAATCACCAT
TACCCCAACCATGCCCTCCATGCACCATCTGCCTCTGACATCATTACCTTCCACCTTCTT
GAATGATTAA*GGGTTAAAAGGTTGCTGCTATTTATCATTATCTATCTACTTAATAACTA
CTTGAAAAGCATAAGGCTGGTTCTACTACAAATTTAAACTATCATGTTTCTTAATTATGT
ATTTCTTACAGTCTTAAGTATGGATTGTGTGATCAGTAGCTTGCTGCTTTGACATATTGT
GGTTGGAATGTTTTCAAGACTATGTATGAATTTGTATTGAC

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 9

CO CL454Contig1 893 9 14 U
GGAACTCTCTGTCTCTTGATGTGAAA**AAAAAGAAGACACTCACTCTCTGTTTTTTTT*
CCTTGAAATACAACAAAAAGGTTAGCTCTGTGCCTCTCAAACCACAGCACTAAGAAACCG
CCAAAAATGACGGAGAAAGAATGTGAACATCACCACGACGAGGATGAGAACATGCGCAGA
CGCATAGGAGCGGCGGTGCTTGGCTTGCTTGCAGCTGGCCTTTTTGTGGTTTTCTTGGTG
TGGGCTATTCTTCACCCGCACGGACCGCGTTTTGTTCTTCAAGACGCAACCATTTATGCG
TTTAACATCTCCGAGCCCAATTTTCTGACCTCCAATCTCCAGGTCACTCTCTCTTCTCGA
AATCCTAATGACAAGATCGGAATCTTCTATGACCGCCTTGACATTTACGCCTCCTACCGC
AACCAGCAGGTGACGTTGGCAACTTTACTGCCGGCCACTTACCAAGGTCACCTTGATGTG
ACGTTATGGTCGCCGATTCTCTACGGAACATCCGTGCCGGTGGCACCGTTCTTTTCGCCT
GCTTTAAGCCAAGATCTAATGGCAGGGATGGTGCTTCTGAACATCAAGATCGACGGTTGG
GTTCGATGGAAAGTGGGGACGTGGATCTCCGGAAGGTACCGCCTACATGTCAATTGTCCA
GCTTACATTACTCTTGCCGGTCATTTTTCCGGTGAAGGTCCAGCTGTTAAGTACCAGCTC
GTCCAGCGATGTGGTGTTGACGTTTAAGCAAAGGGATGATCATTATTCTTTACAAAGACT
AGAGTCTAGACTACGATTCCTGTGCTTTTATTTCTTTAGTTAACTGTAATATGCTTATAA
ATGTTTTGTACTGCGTTTTTATGATGGAGATTTATGTTTACCAAATAATAACT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
15 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 25 55 
55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 20 50 45 45 45 40 35 35 35 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM10TF U 1
AF RR2DS27TF U 1
AF RR2F089TF U 1
AF RR2HA07TF U 1
AF RR2H094TF U 1
AF RR2DS27JQ C 558
AF RR2BM10JQ C 66
AF RR2HA07JQ C 127
AF RR2H094JQ C 98
BS 1 32 RR2BM10TF
BS 33 33 RR2DS27TF
BS 34 601 RR2BM10TF
BS 602 602 RR2DS27TF
BS 603 609 RR2BM10TF
BS 610 635 RR2DS27TF
BS 636 636 RR2F089TF
BS 637 668 RR2DS27TF
BS 669 669 RR2F089TF
BS 670 684 RR2DS27TF
BS 685 691 RR2F089TF
BS 692 849 RR2BM10JQ
BS 850 850 RR2HA07JQ
BS 851 893 RR2BM10JQ

RD RR2BM10TF 609 0 0
GGAACTCTCTGTCTCTTGATGTGAAA**AAAA*GAAGACACTCACTCTCTGTTTTTTTT*
CCTTGAAATACAACAAAAAGGTTAGCTCTGTGCCTCTCAAACCACAGCACTAAGAAACCG
CCAAAAATGACGGAGAAAGAATGTGAACATCACCACGACGAGGATGAGAACATGCGCAGA
CGCATAGGAGCGGCGGTGCTTGGCTTGCTTGCAGCTGGCCTTTTTGTGGTTTTCTTGGTG
TGGGCTATTCTTCACCCGCACGGACCGCGTTTTGTTCTTCAAGACGCAACCATTTATGCG
TTTAACATCTCCGAGCCCAATTTTCTGACCTCCAATCTCCAGGTCACTCTCTCTTCTCGA
AATCCTAATGACAAGATCGGAATCTTCTATGACCGCCTTGACATTTACGCCTCCTACCGC
AACCAGCAGGTGACGTTGGCAACTTTACTGCCGGCCACTTACCAAGGTCACCTTGATGTG
ACGTTATGGTCGCCGATTCTCTACGGAACATCCGTGCCGGTGGCACCGTTCTTTTCGCCT
GCTTTAAGCCAAGATCTAATGGCAGGGATGGTGCTTCTGAACATCAAGATCGACGGTTGG
GCTCGATGG

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2DS27TF 684 0 0
GGAACTCTCTGTCTCTTGATGTGAAA**AAAAAGAAGACACTCACTCTCTGTTTTTTTT*
CCTTGAAATACAACAAAAAGGTTAGCTCTGTGCCTCTCAAACCGCAGCACTAAGAAACCG
CCAAAAATGACGGAGAAAGAATGTGAACATCACCACGACGAGGATGAGAACATGCGCAGA
CGCATAGGAGCGGCGGTGCTTGGCTTGCTTGCAGCTGGCCTTTTTGTGGTTTTCTTGGTG
TGGGCTATTCTTCACCCGCACGGACCGCGTTTTGTTCTTCAAGACGCAACCATTTATGCG
TTTAACATCTCCGAGCCCAATTTTCTGACCTCCAATCTCCAGGTCACTCTCTCTTCTCGA
AATCCTAATGACAAGATCGGAATCTTCTATGACCGCCTTGACATTTACGCCTCCTACCGC
AACCAGCAGGTGACGTTGGCAACTTTACTGCCGGCCACTTACCAAGGTCACCTTGATGTG
ACGTTATGGTCGCCGATTCTCTACGGAACATCCGTGCCGGTGGCACCGTTCTTTTCGCCT
GCTTTAAGCCAAGATCTAATGGCAGGGATGGTGCTTCTGAACATCAAGATCGACGGTTGG
GTTCGATGGAAAGTGGGGACGTGGATCTCCGGAAG*TACCGCCTACATGTCAATTGTCCA
GCTTACAT*ACTCTTGCCGGTCAT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2F089TF 694 0 0
GGAACTCTCTGTCTCTTGATGTGAAA**AAAAAGAAGACACTCACTCTCTGTTTTTTTT*
CCTTGAAATACAACAAAAAGGTTAGCTCTGTGCCTCTCAAACCACAGCACTAAGAAACCG
CCAAAAATGACGGAGAAAGAATGTGAACATCACCACGACGAGGATGAGAACATGCGCAGA
CGCATAGGAGCGGCGGTGCTTGGCTTGCTTGCAGCTGGCCTTTTTGTGGTTTTCTTGGTG
TGGGCTATTCTTCACCCGCACGGACCGCGTTTTGTTCTTCAAGACGCAACCATTTATGCG
TTTAACATCTCCGAGCCCAATTTTCTGACCTCCAATCTCCAGGTCACTCTCTCTTCTCGA
AATCCTAATGACAAGATCGGAATCTTTTATGACCGCCTTGACATTTACGCCTCCTACCGC
AACCAGCAGGTGACGTTGGCAACTTTACTGCCGGCCACTTACCAAGGTCACCTTGATGTG
ACGTTATGGTCGCCGATTCTCTACGGAACATCCATGCCGGTGGCACCGTTCTTTTCGCCT
GCTTTAAGCCAAGATCTAATGGCAGGGATGGTGCTTCTGAACATCAAGATCGACGGTTGG
GTTCGATGGAAAGTGGGGACGTGGATCTCCGGAAGGTACCGCCTACATGTCAATTGTCCA
GCTTACATTACTCTTGCCG*TCATTTTTCCG
TGA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2HA07TF 688 0 0
GGAACTCTCTGTCTCTTGATGTGAAAGGAAAAAGAA*ACACTCACTCTCTGTTTTTTTC*
CCTAGAAATACAACAAAGAGGTTAGCTCTCTGCCTCTCAAACCACAGCACTAAGAAACCG
CCAAAAATGACGGAGAAAGAATGTGAACATCACCACGACGAGGATGAGAACATGCGCAGA
CGCATAGGAGCGGCGGTTCTTGGCTTGCTTGCAGCTGGCCTTTTTGTGGTTTTCTTGGTG
TGGGCTATTCTTCACCCGCACGGACCGCGTTTTGTTCTTCAAGACGCAACCATTTACGCG
TTTAACATCTCCGAGCCCAATTTTCTGACCTCCAATCTCCAGGTCACTCTCTCTTCTCGA
AATCCTAATGACAAGATCGGAATCTTCTATGACCGCCTTGACATTTACGCCTCCTACCGC
AACCAGCAGGTGACGTTAGCAACTTTACTGCCGGCCACTTACCAAGGTCACCTTGATGTG
ACGTTATGGTCGCCGATTCTCTACGGAACATCCGTGCCGGTGGCACCGTTCTTTTCGCCT
GCTTTAAGCCAAGATCTAATGGCAGGGATGGTGCTTCTGAACATCAAGATCGACGGCTGG
GTTCGATGGAAAGTGGGAACGTGGATCTCCGGAAG*TACCGCCTACATGTCAATTGTCCA
GCTTACATTACTCTTGCCGGTCGTTTTT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2H094TF 687 0 0
GGAACTCTCTGTCTCTTGATGTGAAA**AAAAAGAAGACACTCACTCTCTGTTTTTTTTT
CCTTGAAATACAACAAAAAGGTTAGCTCTGTGCCTCTCAAACCACAGCACTAAGAAACCG
CCAAAAATGACGGAGAAAGAATGTGAACATCACCACGACGAGGATGAGAACATGCGCAGA
CGCATAGGAGCGGCGGTGCTTGGCTTGCTTGCAGCTGGCCTTTTTGTGGTTTTCTTGGTG
TGGGCTATTCTTCACCCGCACGGACCGCGTTTTGTTCTTCAAGACGCAACCATTTATGCG
TTTAACATCTCCGAGCCCAATTTTCTGACCTCCAATCTCCAGGTCACTCTCTCTTCTCGA
AATCCTAATGACAAGATCGGAATCTTCTATGACCGCCTTGACATTTACGCCTCCTACCGC
AACCAGCAGGTGACGTTGGCAACTTTACTGCCGGCCACTTACCAAGGTCACCTTGATGTG
ACGTTATGGTCGCCGATTCTCTACGGAACATCCGTGCCGGTGGCACCGTTCTTTTCGCCT
GCTTTAAGCCAAGATCTAATGGCAGGGATGGTGCTTCTGAACATCAAGATCGACGGTTGG
GTTCGATGGAAAGTGGGGACGTGGATCTCCGGAAGGTACCGCCTACATGTCAATTGTCCA
GCTTACATTACTCTTGCCGGTCATTTT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2DS27JQ 227 0 0
AATGGCAGGGATGGTGCTTCTGAACATCAAGATCGACGGTTGGGTTCGATGGAAAGTGGG
GACGTGGATTTCCGGAAGGTACCGCCTACATGTCAATTGTCCAGCTTACATTACTCTTGC
CGGTCATTTTTCCGGTGAAGGTCCAGCTGTTAAGTACCAGCTCGTCCAGCGATGTGGTGT
TGACGTTTAAGCAAAGGGATGATCATTATTCTTTACAAAGACTAGAG

QA 1 227 1 227
DS 

RD RR2BM10JQ 828 0 0
AAATACAACAAAAAGGTTAGCTCTGTGCCTCTCAAACCACAGCACTAAGAAACCGCCAAA
A*TGACGGAGAAAGAATGTGAACATCACCACGACGAGGATGAGAACATGCGCAGACGCAT
AGGAGCGGCGGTGCTTGGCTTGCTTGCAGCTGGCCTTTTTGTGGTTTTCTTGGTGTGGGC
TATTCTTCACCCGCACGGACCGCGTTTTGTTCTTCAAGACGCAACCATTTATGCGTTTAA
CATCTCCGAGCCCAATTTTCTGACCTCCAATCTCCAGGTCACTCTCTCTTCTCGAAATCC
TAATGACAAGATCGGAATCTTCTATGACCGCCTTGACATTTACGCCTCCTACCGCAACCA
GCAGGTGACGTTGGCAACTTTACTGCCGGCCACTTACCAAGGTCACCTTGATGTGACGTT
ATGGTCGCCGATTCTTTACGGAACATCCGTGCCGGTGGCACCGTTCTTTTCGCCTGCTTT
AAGCCAAGATCTAATGGCAGGGATGGTGCTTCTGAACATCAAGATCGACGGTTGGGCTCG
ATGGAAAGTGGGGACGTGGATCTCCGGAAGGTACCGCCTACATGTCAATTGTCCAGCTTA
CATTACTCTTGCCGGTCATTTTTCCGGTGAAGGTCCAGCTGTTAAGTACCAGCTCGTCCA
GCGATGTGGTGTTGACGTTTAAGCAAAGGGATGATCATTATTCTTTACAAAGACTAGAGT
CTAGACTACGATTCCTGTGCTTTTATTTCTTTAGTTAACTGTAATATGCTTATAAATGTT
TTGTGCTGCGTTTTTATGATGGAGATTTATGTTTACCAAATAATAACT

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2HA07JQ 757 0 0
ATGACGGAGAAAGAATGTGAACATCACCACGACGAGGATGAGAACATGCGCAGACGCATA
GGAGCGGCGGTTCTTGGCTTGCTTGCAGCTGGCCTTTTTGTGGTTTTCTTGGTGTGGGCT
ATTCTTCACCCGCACGGACCGCGTTTTGTTCTTCAAGACGCAACCATTTACGCGTTTAAC
ATCTCCGAGCCCAATTTTCTGACCTCCAATCTCCAGGTCACTCTCTCTTCTCGAAATCCT
AATGACAAGATCGGAATCTTCTATGACCGCCTTGACATTTACGCCTCCTACCGCAACCAG
CAGGTGACGTTAGCAACTTTACTGCCGGCCACTTACCAAGGTCACCTTGATGTGACGTTA
TGGTCGCCGATTCTCTACGGAACATCCGTGCCGGTGGCACCGTTCTTTTCGCCTGCTTTA
AGCCAAGATCTAATGGCAGGGATGGTGCTTCTGAACATCAAGATCGACGGCTGGGTTCGA
TGGAAAGTGGGAACGTGGATCTCCGGAAGGTACCGCCTACATGTCAATTGTCCAGCTTAC
ATTACTCTTGCCGGTCGTTTTTCCGGTGACGGTCCAGCTGTTAAGTACCAGCTTGTCCAG
CGATGTGGTGTTGACGTTTAAGCAAAGGGATGATCATTATTCTTTACAAAGACTAGAGTC
TAGACTACGATTCCTGTGCTTTTATTGCTTTAGTTAACTGGAATGCTTATATAAATGTTT
TGTACTGCGTTTTTATGATTGAGATTTATGTTTACC
T

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2H094JQ 785 0 0
CAAACCACAGCACTAAGAAACCGCCAAAAATGACGGAGAAAGAATGTGAACATCACCACG
ACGAGGATGAGAACATGCGCAGACGCATAGGAGCGGCGGTGCTTGGCTTGCTTGCAGCTG
GCCTTTTTGTGGTTTTCTTGGTGTGGGCTATTCTTCACCCGCACGGACCGCGTTTTGTTC
TTCAAGACGCAACCATTTATGCGTTTAACATCTCCGAGCCCAATTTTCTGACCTCCAATC
TCCAGGTCACTCTCTCTTCTCGAAATCCTAATGACAAGATCGGAATCTTCTATGACCGCC
TTGACATTTACGCCTCCTACCGCAACCAGCAGGTGACGTTGGCAACTTTACTGCCGGCCA
CTTACCAAGGTCACCTTGATGTGACGTTATGGTCGCCGATTCTCTACGGAACATCCGTGC
CGGTGGCACCGTTCTTTTCGCCTGCTTTAAGCCAAGATCTAATGGCAGGGATGGTGCTTC
TGAACATCAAGATCGACGGTTGGGTTCGATGGAAAGTGGGGACGTGGATCTCCGGAAGGT
ACCGCCTACATGTCAATTGTCCAGCTTACATTACTCTTGCCGGTCATTTTTCCGGTGAAG
GTCCAGCTGTTAAGTACCAGCTCGTCCAGCGATGTGGTGTTGACGTTTAAGCAAAGGGAT
GATCATTATTCTTTACAAAGACTAGAGTCTAGACTACGATTCCTGTGCTTTTATTTCTTT
AGTTAACTGTAATATGCTTATAAATGTTTTGTACTGCGTTTTTATGATGGAGATTTATGT
TTACC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 10

CO CL455Contig1 596 10 7 U
TTTAAGATTCCCTCTATATATATATAGTACAGCAGATTAGAACAAGAGGAAGCAACGAAT
CAAATAATAATCAGAGAGAAAGGAAGCAGGAGATAATGGCGGATCAAGGAACAGTCGTAG
GAGGAGTTCGCGATATAGATCCAAATGCAAATGATCTCCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTT
TCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAAGGAGAACGTGACACTGGAGTACAAGAGGCTCCTTG
GTGCGAAAACACAGGTTGTGGCGGGAACGATGCATCATCTCACCGTGGAGGTGGCTGATG
GTGAGACCAATAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGGGAGAATCTCAAGC
AGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAATTCCCAATATCCGAGCTTGTCTATG
CGGGTTAACACATCTCAGGCTACGTCCCTGTTTAACCAAGTATATTTAAATAAGTGAATG
TGAATCCCGTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTATGTTGTGTATCTCTGACTTTCGTTTGT
TTTTTATTGCGAGTTGTCACTTTATATTTATCTACCATATGATTTTACGAGACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 35 10 10 10 10 10 

AF RR2DY07TF U 66
AF RR2GD36TF U 48
AF RR2B323TF U 1
AF RR2C120TF U 48
AF RR2CO75TF U 461
AF RR2D490TF U 48
AF RR2FX85TF U 49
AF RR2GD36JQ C 48
AF RR2GY55JQ C 48
AF RR2GY55TF U 48
BS 1 47 RR2B323TF
BS 48 49 RR2C120TF
BS 50 409 RR2B323TF
BS 410 410 RR2C120TF
BS 411 569 RR2B323TF
BS 570 591 RR2C120TF
BS 592 596 RR2GD36JQ

RD RR2DY07TF 216 0 0
AATAATCAGAGAGAAAGGAAGCAGGAGATAATGGCGGATCAAGGAACAGTCGTAGGAGGA
GTTCGCGATATAGATCCAAATGCAAATGATCTCCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCT
GTCGATGAGCACAACGAGAAGGAGAACGTGACACTGGAGTACAAGAGGCTCCTTGGTGCG
AAAACACAGGT*GTGGCGGGAACGATGC
TCATCTCA

QA 1 208 1 208
DS 

RD RR2GD36TF 487 0 0
GGAAGCAACGAATCAAATAATAATCAGAGAGAAAGGAAGCAGGAGATAATGGCGGATCAA
GGAACAGTCGTAGGAGGAGTTCGCGATATAGATCCAAATGCAAATGATCTCCAAGTCGAG
AGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAGGGAGAACGTGACACTGGAGTAC
AAGAGGCTCCTTGGTGCGAAAACACAGGTTGTGGCGGGAACGATGCATCATCTCACCGTG
GAGGTGGCTGATGGTGAGACCAATAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGG
GAGAATCTCAAGCAGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAATTCCCAATATCC
GAGCTTGTCTATGCGGGTTAACACATCTCAGGCTACGTCCCTGTTTAACCAAGTATATTT
AAATAAGTGAATGTGCATCCCGTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTATGTTGTGTATCTCT
GACTTTC

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR2B323TF 569 0 0
TTTAAGATTCCCTCTATATATATATAGTACAGCAGATTAGAACAAGACTAAGCAACGAAT
CAAATAATAATCAGAGAGAAAGGAAGCAGGAGATAATGGCGGATCAAGGAACAGTCGTAG
GAGGAGTTCGCGATATAGATCCAAATGCAAATGATCTCCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTT
TCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAAGGAGAACGTGACACTGGAGTACAAGAGGCTCCTTG
GTGCGAAAACACAGGTTGTGGCGGGAACGATGCATCATCTCACCGTGGAGGTGGCTGATG
GTGAGACCAATAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGGGAGAATCTCAAGC
AGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAATTCCCAATATCCGAACTTGTCTATG
CGGGTTAACACATCTCAGGCTACGTCCCTGTTTAACCAAGTATATTTAAATAAGTGAATG
TGAATCCCGTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTATGTTGTGTATCTCTGACTTTCGTTTGT
TTTTTATTGCGAGTTGTCACTTTATATTT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2C120TF 544 0 0
GGAAGCAACGAATCAAATAATAATCAGAGAGAAAGGAAGCAGGAGATAATGGCGGATCAA
GGAACAGTCGTAGGAGGAGTTCGCGATATAGATCCAAATGCAAATGATCTCCAAGTCGAG
AGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAGCAAGAAGGAGAACGTGACACTGGAGTAC
AAGAGGCTCCTTGGTGCGAAAACACAGGTTGTGGCGGGAACGATGCATCATCTCACCGTG
GAGGTGGCTGATGGTGAGACCAATAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGG
GAGAATCTCAAGCAGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAATTCCCAATATCC
GAGCTTGTCTATGCGGGTTAACACATCTCAGGCTACGTCCCTGTTTAACCAAGTATATTT
AAATAAGTGAATGTGAATCCCGTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTATGTTGTGTATCTCT
GACTTTCGTTTGTTTTTTATTGCGAGTTGTCACTTTATATTTATCTACCATATGATTTTA
CGAG

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2CO75TF 127 0 0
TT
TATTTAAATAAGTGAATGTGAATCCCGTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTATGTTGTGTA
TCTCTGACTTTCGTTTGTTTTTTATTGCGAGTTGTCACTTTATATTTATCTACCATATGA
TTTTA

QA 3 127 3 127
DS 

RD RR2D490TF 543 0 0
GGAAGCAACGAATCAAATAATAATCAGAGAGAAAGGAAGCAGGAGATAATGGCGGATCAA
GGAACAGTCGTAGGAGGAGTTCGCGATATAGATCCAAATGCAAATGATCTCCAAGTCGAG
AGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAAGGAGAACGTGACACTGGAGTAC
AAGAGGCTCCTTGGTGCGAAAACACAGGTTGTGGCGGGAACGATGCATCATCTCACCGTG
GAGATGGCTGATGGTGAGACCAATAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGG
GAGAATCTCAAGCAGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGTGATGTTTAATTCCCAATATCC
GAGCTTGTCTATGCGGGTTAACACATCTCAGGCTACGTCCCTGTTTAACCAAGTATATTT
AAATAAGTGAATGTGAATCCCGTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTATGTTGTGTATCTCT
GACTTTCGTTTGTTTTTT*TTGCGAGTTGTCACTTTATATTTATCTACCATATGATTTTA
CGA

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2FX85TF 543 0 0
GAAGCAACGAATCAAATAATAATCAGAGAGAAAGGAAGCAGGAGATAATGGCGGATCAAG
GAACAGTCGTAGGAGGAGTTCGCGATATAGATCCAAATGCAAATGATCTCCAAGTCGAGA
GTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAAGGAGAACGTGACACTGGAGTACA
AGAGGCTCCTTGGTGCGAAAACACAGGTTGTGGCGGGAACGATGCATCATCTCACCGTGG
AGGTGGCTGATGGTGAGACCAATAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGGG
AGAATCTCAAGCAGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAATTCCCAATATCCG
AGCTTGTCTATGCGGGTTAACACATCTCAGGCTACGTCCCTGTTTAACCAAGTATATTTA
AATAAGTGAATGTGAATCCCGTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTATGTTGTGTATCTCTG
ACTTTCGTTTGTTTTTTATTGCGAGTTGTCACTTTATATTTATCTACCATATGATTTTAC
GAG

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2GD36JQ 549 0 0
GGAAGCAACGAATCAAATAATAATCAGAGAGAAAGGAAGCAGGAGATAATGGCGGATCAA
GGAACAGTCGTAGGAGGAGTTCGCGATATAGATCCAAATGCAAATGATCTCCAAGTCGAG
AGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAGGGAGAACGTGACACTGGAGTAC
AAGAGGCTCCTTGGTGCGAAAACACAGGTTGTGGCGGGAACGATGCATCATCTCACCGTG
GAGGTGGCTGATGGTGAGACCAATAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGG
GAGAATCTCAAGCAGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAATTCCCAATATCC
GAGCTTGTCTATGCGGGTTAACACATCTCAGGCTACGTCCCTGTTTAACCAAGTATATTT
AAATAAGTGAATGTGCATCCCGTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTATGTTGTGTATCTCT
GACTTTCGTTTGTTTTTTATTGCGAGTTGTCACTTTATATTTATCTACCATATGATTTTA
CGAGACATT

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2GY55JQ 549 0 0
GGAAGCAACGAATCAAATAATAATCAGAGAGAAAGGAAGCAGGAGATAATGGCGGATCAA
GGAACAGTCGTAGGAGGAGTTCGCGATATAGATCCAAATGCAAATGATCTCCAAGTCGAG
AGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAGGGAGAACGTGACACTGGAGTAC
AAGAGGCTCCTTGGTGCGAAAACACAGGTTGTGGCGGGAACGATGCATCATCTCACCGTG
GAGGTGGCTGATGGTGAGACCAATAAGGTTTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGG
GAGAATCTCAAGCAGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAATTCCCAATATCC
GAGCTTGTCTATGCGGGTTAACACATCTCAGGCTACGTCCCTGTTTAACCAAGTATATTT
AAATAAGTGAATGTGCATCCCGTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTATGTTGTGTATCTCT
GACTTTCGTTTGTTTTTTATTGCGAGTTGTCACTTTATATTTATCTACCATATGATTTTA
CGAG
ACATT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2GY55TF 549 0 0
GGAAGCAACGAATCAAATAATAATCAGAGAGAAAGGAAGCAGGAGATAATGGCGGATCAA
GGAACAGTCGTAGGAGGAGTTCGCGATATAGATCCAAATGCAAATGATCTCCAAGTCGAG
AGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAGGGAGAACGTGACACTGGAGTAC
AAGAGGCTCCTTGGTGCGAAAACACAGGTTGTGGCGGGAACGATGCATCATCTCACCGTG
GAGGTGGCTGATGGTGAGACCAATAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGG
GAGAATCTCAAGCAGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAATTCCCAATATCC
GAGCTTGTCTATGCGGGTTAACACATCTCAGGCTACGTCCCTGTTTAACCAAGTATATTT
AAATAAGTGAATGTGCATCCCGTCCATGTGTTTGATTTGATGGGTATGTTGTGTATCTCT
GACTTTCGTTTGTTTTTTATTGCGAGTTGTCACTTTATATTTATCTACCATATGATTTTA
CGAG
ACATT

QA 1 544 1 544
DS 



AS 2 11

CO CL456Contig1 536 9 13 U
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAAAAGTTAATAATAAACGTGTGTATTG
TAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCATCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTT
GATTGCTTTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAGGAACTTGCAAACAAACCCC
ATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTG
TTACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAAC
CTACATCAAAGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTA
CTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCT
ACTGTATTTGTGTTTAAAAACTTTCATATTCTATTATATGTAATGCGAATAAATTAAACT
TTTTTTTCTCCTTTTGTTTTAACTTGCTATTAATTTCTTAAATATTTCTTCGGGTT


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 10 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB67TF U 1
AF RR2A327JQ C 138
AF RR2CP74TF U 1
AF RR2GP14TF U 1
AF RR2G850TF U 1
AF RR2B190JQ C 1
AF RR2A327TF U 62
AF RR2BW93TF U 1
AF RR2AM39TF U 7
BS 1 111 RR2FB67TF
BS 112 112 RR2A327TF
BS 113 121 RR2FB67TF
BS 122 309 RR2A327TF
BS 310 310 RR2BW93TF
BS 311 436 RR2A327TF
BS 437 437 RR2BW93TF
BS 438 481 RR2A327TF
BS 482 482 RR2BW93TF
BS 483 502 RR2A327TF
BS 503 503 RR2B190JQ
BS 504 524 RR2A327TF
BS 525 536 RR2B190JQ

RD RR2FB67TF 123 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAAAAGTTAATAATAAACGTGTGTATTG
TAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCATCATCACAGTTCGCTATCTTTTG*ATCATCTT
G
TT

QA 1 121 1 121
DS 

RD RR2A327JQ 129 0 0
TTCAGGAATTTGTGGATGGCCAAGGAACTTGCAAACAAACCCCATGCCCCAACGCCAAAG
ATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTGTTACGCGACCAAAGATA
CATGTGCAG

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR2CP74TF 480 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAAA*GTTAATAACAAACGTGTGTATTG
TAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTT
GATTGCTTTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAGGAACTTGCAAACAAACCCC
ATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTG
TTACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAAC
CTACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTA
CTTTTGTTTTATATGAATAAAGCATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCT
ACTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATTATATGTAATGCGAATAAATTAAACT

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2GP14TF 472 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAA**GTTAATAACAAACGTGTGTATTG
TAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTT
GATTGCTTTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAGGAACTTGCAAACAAACCCC
ATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTG
TTACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAAC
CTACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTA
CTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCT
ATTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATTATATGTAATGCGAATAA

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2G850TF 470 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAAA*GTTAATAACAAACGTGTGTATTG
TAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTT
GATTGCTTTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAGGAACTTGCAAACAAACCCC
ATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTG
TTACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAAC
CTACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTA
CTTTTGTTTCATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCT
ACTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATTATATGTAATGCGAAT

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR2B190JQ 536 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAAAAGTTAATAATAAACGTGTGTATTG
TAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCATCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTT
GATTGCTTTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGCCCAAGGAACTTGCAAACAAACCCC
ATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGTTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTG
TTACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAAC
CTACATCAAAGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTA
CTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCT
ACTGTATTTGTGTTTAAAAACTTTCATATTCTATTATATGTAATGCAAATAAATTAAACT
TTTTTTTCTCCTTTTGTTTTAACTTGCTATTAATTTCTTAAATATTTCTTCGGGTT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2A327TF 463 0 0
AAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTTG
ATTGCTTTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAGGAACTTGCAAACAAACCCCA
TGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTGT
TACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAACC
TACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTAC
TTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCTA
CTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATTATATGTAATGCGAATAAATTAAACTT
ATTTTTCTCCTTTTGTTTTAATTTGCTATTAATTTCTTAAATA

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2BW93TF 492 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAAAAGTTAATAATAAACGTGTGTATTG
TAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCATCGTCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTT
GATTGCTTTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGCCCAAGGAACTTGCAAACAAACCCC
ATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGTTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTG
TTACGCGACCAAAGGTACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAAC
CTACATCAAAGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTA
CTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCT
ACTGTATTTGTGTTTAAAAACTTTCATATTCTATTATATGTAATGC*AATAAATTAAACT
TTTTTTTCTCC
T

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2AM39TF 490 0 0
GGA
AAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAAAAGTTAATAATAAACGTGTGTATTGTAAGAATAT
CACAAAGAACAAAATGTCATCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTTGATTGCTTT
ATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGCCCAAGGAACTTGCAAACAAACCCCATGCCCCAA
CGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGTTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTGTTACGCGAC
CAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAACCTACATCAA
AGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTACTTTTGTTT
TATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCTACTGTATTT
GTGTTTAAAAACTTTCATATTCTATTATATGTAATGCAAATAAATTAAACTTTTTTTT
TCTCCTAAG

QA 4 481 4 481
DS 



CO CL456Contig2 668 2 2 U
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAAAAGTTAATAATAAACGTGTGTATTG
TAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCATCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTT
GATTGCTTTATTTCCTCTTCATGAATGTATGCATTTATAATAGTTTTCCTTTGTCCATCA
TCTATCTTTTTCACCATTGTAATTCCATCATAATATCCTCGACAATTGTTTTTCTCTCCA
AATGATACTGTTGTTATTTTTTTGTTTATACAGTTGTCGATGCCCAAGGAACTTGCAAAC
AAACCCCATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGTTTTTGTTGTCCCTCCAATA
ACAGGTGTTACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCT
TGAGAACCTACATCAAAGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTA
ATATCTACTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATG
TATGTCTACTGTATTTGTGTTTAAAAACTTTCATATTCTATTATATGTAATGCAAATAAA
TTAAACTTTTTTTTCTCCCCTTTTTGTTTTTAACTTTGCTATTAATTTCTTAAATATTTC
TTCGGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB84TF U 1
AF RR2B190TF U 553
BS 1 618 RR2EB84TF
BS 619 668 RR2B190TF

RD RR2EB84TF 618 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAAAAGTTAATAATAAACGTGTGTATTG
TAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCATCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTT
GATTGCTTTATTTCCTCTTCATGAATGTATGCATTTATAATAGTTTTCCTTTGTCCATCA
TCTATCTTTTTCACCATTGTAATTCCATCATAATATCCTCGACAATTGTTTTTCTCTCCA
AATGATACTGTTGTTATTTTTTTGTTTATACAGTTGTCGATGCCCAAGGAACTTGCAAAC
AAACCCCATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGTTTTTGTTGTCCCTCCAATA
ACAGGTGTTACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCT
TGAGAACCTACATCAAAGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTA
ATATCTACTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATG
TATGTCTACTGTATTTGTGTTTAAAAACTTTCATATTCTATTATATGTAATGCAAATAAA
TTAAACTTTTTTTTCTCC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2B190TF 116 0 0
ATTTGTGTTTAAAAACTTTCATATTCTATTATATGTAATGCAAATAAATTAAACTTTTTT
TTTTCTCCTTTTTGTTTTTAACTTTGCTATTAATTTCTTAAATATTTCTTCGGGTT

QA 1 116 1 116
DS 



AS 1 11

CO CL457Contig1 1114 11 11 U
TTTTTCATCCTCATCATCATCGCTGAAACACACAAAGGAGAGAGAGAAAAATGGAGATTG
GGTTTCTGGGCTTGGGTATCATGGGAAAGGCCATGTCAATGAATCTACTGAAACATGGTT
TCAAGCTAACCGTCTGGAACCGGACACTCTCCAAGTGCGATGAACTTGTGGAGCATGGAG
CTTCAGTATGTGAGACTCCAGCTGAAGTAATCAAGAAATGCAAATACACTATCGCTATGC
TCTCTGACCCTTCTGCTGCTCTTTCGGTTGTTTTCGATAAAGATGGCGTTTTGGAGCAAA
TCTGTGAAGGGAAAGGTTATATCGATATGTCAACTGTTGATGCTGAGACCTCCTTAAAGA
TCAATGAGGCAATCACTGGGAAAGGTGGTCGGTTTGTAGAAGGTCCGGTTTCAGGTAGCA
AGAAGCCGGCAGAAGATGGCCAGCTCATCATACTTGCTGCTGGTGACAAGTCCCTTTTCG
ATGAATCGGTCCCAGCTTTTGACGTCTTGGGG*AAGAAGTCTTTTTACTTGGGACAAGTT
GGGAACGGAGCTAAGATGAAACTTGTTGTCAACATGGTCATGGGAAGCATGATGAACGCC
TTCTCCGAGGGGCTTGTATTAGCTGACAAGAGTGGACTTAGCTCTGACACTCTTCTTGAT
ATTCTGG*ATCTTGGTGCAATGACTAACCCGATGTTCAAAGGGAAAGGACCTTCGATGAA
TAAGAGTAGTTACCCACCAGCGTTCCCGTTGAAACATCAGCAGAAGGACATGAGGCTAGC
TCTTGCTCTTGGCGATGAAAACGCTGTTTCCATGCCTGTAGCTGCAGCTGCAAATGAGGC
TTTTAAGAAAGCAAGAAGCTTGGGACTTGGAGATCTGGACTTTTCTGCTGTGATTGAGGC
TGTGAAATTCTCCAGGGAGTAGTAGTTAAACTATTGGAAAAGAAAAAAA*CTAAAATGAT
TGTTGTCTTCCCAAAGACAGTTTACTCTACTCATGATTTGGCCAAGAACACATTTTAATC
CTTCACCAAATAAGACGTCTTTTAAAACAGTCCTTATGTTACCTCTTTTGGTTTGTGTAA
CAAATGCAAAAGCTTGGTAACAAGTGAATTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 50 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D165TF U 1
AF RR2BM09TF U 1
AF RR2CK74TF U 1
AF RR2G443TF U 5
AF RR2AB68TF U 40
AF RR2GC53TF U 76
AF RR2D165JQ C 685
AF RR2AB68JQ C 255
AF RR2BM09JQ C 222
AF RR2GC53JQ C 357
AF RR2G443JQ C 356
BS 1 529 RR2BM09TF
BS 530 530 RR2CK74TF
BS 531 614 RR2BM09TF
BS 615 615 RR2CK74TF
BS 616 666 RR2BM09TF
BS 667 679 RR2CK74TF
BS 680 680 RR2G443TF
BS 681 697 RR2CK74TF
BS 698 766 RR2AB68TF
BS 767 1043 RR2BM09JQ
BS 1044 1114 RR2G443JQ

RD RR2D165TF 216 0 0
TTTTTC
ATCCTCATCATCATCGCTGAAACACACAAAGGACAGAGAGAAAAATGGAGATTGGGTTTC
TGGGCTTGGGTATCATGGGAAAGGCCATGTCAATGAATCTACTGAAACATGGTTTCAAAC
TAACCGTCTGGAACAGGACACTCTCCGAGTGCGATGAACTTGTGGAGCATGGAGCTTCAA
TATGTGAGACTCCCGCTGAAGTAATCAAGA

QA 7 216 7 216
DS 

RD RR2BM09TF 666 0 0
TTTTTCATCCTCATCATCATCGCTGAAACACACAAAGGAGAGAGAGAAAAATGGAGATTG
GGTTTCTGGGCTTGGGTATCATGGGAAAGGCCATGTCAATGAATCTACTGAAACATGGTT
TCAAGCTAACCGTCTGGAACCGGACACTCTCCAAGTGCGATGAACTTGTGGAGCATGGAG
CTTCAGTATGTGAGACTCCAGCTGAAGTAATCAAGAAATGCAAATACACTATCGCTATGC
TCTCTGACCCTTCTGCTGCTCTTTCGGTTGTTTTCGATAAAGATGGCGTTTTGGAGCAAA
TCTGTGAAGGGAAAGGTTATATCGATATGTCAACTGTTGATGCTGAGACCTCCTTAAAGA
TCAATGAGGCAATCACTGGGAAAGGTGGTCGGTTTGTAGAAGGTCCGGTTTCAGGTAGCA
AGAAGCCGGCAGAAGATGGCCAGCTCATCATACTTGCTGCTGGTGACAAGTCCCTTTTCG
ATGAATCGGTCCCAGCTTTTGACGTCTTGGGG*AAGAAGTCTTTTTACTCGGGACAAGTT
GGGAACGGAGCTAAGATGAAACTTGTTGTCAACATGGTCATGGGAAGCATGATGAACGCC
TTCTCCGAGGGGCT*GTATTAGCTGACAAGAGTGGACTTAGCTCTGACACTCTTCTTGAT
ATTCTG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2CK74TF 697 0 0
TTTTTC
ATCCTCATCATCATCGCTGAAACACACAAAGGAGAGAGAGAAAAATGGAGATTGGGTTTC
TGGGCTTGGGTATCATGGGAAAGGCCATGTCAATGAATCTACTGAAACATGGTTTCAAGC
TAACCGTCTGGAACCGGACACTCTCCAAGTGCGATGAACTTGTGGAGCATGGAGCTTCAG
TATGTGAGACTCCAGCTGAAGTAATCAAGAAATGCAAATACACTATCGCTATGCTCTCTG
ACCCTTCTGCTGCTCTTTCGGTTGTTTTCGATAAAGATGGCGTTTTGGAGCAAATCTGTG
AAGGGAAAGGTTATATCGATATGTCAACTGTTGATGCTGAGACCTCCTTAAAGATCAATG
AGGCAATCCCTGGGAAAGGTGGTCGGTTTGTAGAAGGTCCGGTTTCAGGTAGCAAGAAGC
CGGCAGAAGATGGCCAGCTCATCATACTTGCTGCTGGTGACAAGTCCCTTTTCGATGAAT
CGGTCCCAGCTTTTGACGTCTTGGGG*AAGAAGTCTTTTTACTTGGGACAAGTTGGGAAC
GGAGCTAAGATGAAACTTGTTGTCAACATGGTCATGGGAAGCATGATGAACGCCTTCTCC
GAGGGGCTTGTATTAGCTGACAAGAGTGGACTTAGCTCTGACACTCTTCTTGATATTCTG
G*ATCTTGGTGCA*TGACTAACCCGATGTTC

QA 7 697 7 697
DS 

RD RR2G443TF 693 0 0
GG
ATCCTCATCATCATCGCTGAAACACACAAAGGAGAGAGAGAAAAATGGAGATTGGGTTTC
TGGGCTTGGGTATCATGGGAAAGGCCATGTCAATGAATCTACTGAAACATGGTTTCAAGC
TAGCCGTCTGGAACCGGACACTCTCCAAGTGCGATGAACTTGTGGAGCATGGAGCTTCAG
TATGTGAGACTCCAGCTGAAGTAATCAAGAAATGCAAATACACTATCGCTATGCTCTCTG
ACCCTTCTGCTGCTCTTTCGGTTGTTTTCGATAAAGATGGCGTTTTGGAGCAAATCTGTG
AAGGGAAAGGTTATATCGATATGTCAACTGTTGATGCTGAGACCTCCTTAAAGATCAATG
AGGCAATCACTGGGAAAGGTGGTCGGTTTGTAGAAGGTCCGGTTTCAGGTAGCAAGAAGC
CGGCAGAAGATGGCCAGCTCATCATACTTGCTGCTGGTGACAAGTCCCTTTTCGATGAAT
CGGTCCCAGCTTTTGACGTCTTGGGG*AAGAAGTCTTTTTACTTGGGACAAGTTGGGAAC
GGAGCTAAGATGGAACTTGTTGTCAACATGGTCATGGGAAGCATGATGAACGCCTTCTCC
GAGGGGCTTGTATTAGCTGACAAGAGTGGACTTAGCTCTGACACTCTTCTTGATATTCTG
G*ATCTTGGTGCAATGACTAACCCGATGTTC

QA 3 693 3 693
DS 

RD RR2AB68TF 730 0 0
GG
GAGAGAAAAATGGAGATTGGGTTTCTGGGCTTGGGTGTCATGGGAAAGGCCATGTCAATG
AATCTACTGAAACATGGTTTCAAGCTAACCGTCTGGAACCGGACACTCTCCAAGTGCGAT
GAACTTGTGGAGCATGGAGCTTCAGTATGTGAGACTCCAGCTGAAGTAATCAAGAAATGC
AAATACACTATCGCTATGCTCTCTGACCCTTCTGCTGCTCTTTCGGTTGTTTTCGATAAA
GATGGCGTTTTGGAGCAAATCTGTGAAGGGAAAGGTTATATCGATATGTCAACTGTTGAT
GCTGAGACCTCCTTAAAGATCAATGAGGCAATCACTGGGAAAGGTGGTCGGTTTGTAGAA
GGTCCGGTTTCAGGTAGCAAGAAGCCGGCAGAAGATGGCCAGCTCATCATACTTGCTGCT
GGTGACAAGTCCCTTTTCGATGAATCGGTCCCAGCTTTTGACGTCTTGGGGGAAGAAGTC
TTTTTACTTGGGACAAGTTGGGAACGGAGCTAAGATGAAACTTGTTGTCAACATGGTCAT
GGGAAGCATGATGAACGCCTTCTCCGAGGGGCTTGTATTAGCTGACAAGAGTGGACTTAG
CTCTGACACTCTTCTTGATATTCTGGGATCTTGGTGCAATGACTAACCCGATGTTCAAAG
GGAAAGGACCTTCGATGAATAAGAGTAGTTACCCACCAGCGTTCCCGTTGAAACATCAGC
AGAAG
ACA

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR2GC53TF 687 0 0
GG
ATCATGGGAAAGGCCATGTCAATGAATCTACTGAAACATGGTTTCAAACTAACCGTCTGG
AACAGGACACTCTCCAAGTGCGATGAACTTGTGGAGCATGGAGCTTCAGTATGTGAGACT
CCAGCTGAAGTAATCAAGAAATGCAAATACACTATCGCTATGCTCTCTGACCCTTCTGCT
GCTCTTTCGGTTGTTTTCGATAAAGATGGTGTTTTGGAGCAAATCTGTGAAGGGAAAGGC
TATATCGATATGTCAACTGTTGATTCTGAGACATCCTTAAAGATCAATGAGGCAATCACC
GGGAAAGGTGGTCGGTTTGTAGAAGGTCCGGTTTCAGGTAGCAAGAAGCCGGCAGAAGAT
GGCCAGCTCATCATACTTGCTGCTGGTGACAAGTCCCTTTTCGATGAATCGGTCCCAGCT
TTTGACGTCTTGGGG*AAGAAGTCTTTTTACTTGGGACAAGTTGGGAACGGAGCTAAGAT
GAAACTTGTTGTCAACATGGTCATGGGAAGCATGATGAACGCCTTCTCCGAGGGGCTTGT
ATTAGCTGACAAGAGTGGACTTAGCTCTGACACTCTTCTTGATATTCTGG*ATCTTGGTG
CAATGACAAACCCGATGTTCAAAGGGAAAGGACCTTCGATGAATAAGAGCAGTTACCCAC
CAGCGTTCCCGTTGAAACATCAGCA

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR2D165JQ 100 0 0
A
AACCCGATGTTCAAAGGGAAAGGACCTTCGATGAATAAGAGCAGTTACCCACCGGCGTTC
CCGTTGAAACATCAGCAGAAGGACATGAGGCTGGCTCTT

QA 2 100 2 100
DS 

RD RR2AB68JQ 745 0 0
GCTGCTCTTTCGGTTGTTTTCGATAAAGATGGCGTTTTGGAGCAAATCTGTGAAGGGAAA
GGTTATATCGATATGTCAACTGTTGATGCTGAGACCTCCTTAAAGATCAATGAGGCAATC
ACTGGGAAAGGTGGTCGGTTTGTAGAAGGTCCGGTTTCAGGTAGCAAGAAGCCGGCAGAA
GATGGCCAGCTCATCATACTTGCTGCTGGTGACAAGTCCCTTTTCGATGAATCGGTCCCA
GCTTTTGACGTCTTGGGG*AAGAAGTCTTTTTACTTGGGACAAGTTGGGAACGGAGCTAA
GATGAAACTTGTTGTCAACATGGTCATGGGAAGCATGATGAACGCCTTCTCCGAGGGGCT
TGTATTAGCTGACAAGAGTGGACTTAGCTCTGACACTCTTCTTGATATTCTGG*ATCTTG
GTGCAATGACTAACCCGATGTTCAAAGGGAAAGGACCTTCGATGAATAAGAGTAGTTACC
CACCAGCGTTCCCGTTGAAACATCAGCAGAAGGACATGAGGCTAGCTCTTGCTCTTGGCG
ATGAAAACGCTGTTTCCATGCCTGTAGCTGCAGCTGCAAATGAGGCTTTTAA**AAGCAA
GAAGCTTGGGACTTGGAGTTCTGGACTTTTCTGCTGTGATTGAGGCTGTGAAATTCTCCA
GGGAGTAGTAGTTAAACTATTGGAAAAGAAAAAAA*CTAAAATGATTGTTGTCTTCCCAA
AGACAGTTTACTCTACTCATGATTT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2BM09JQ 822 0 0
AAATACACTATCGCTATGCTCTCTGACC*TTCTGCTGCTCTTTCGGTTGTTTTCGATAAA
GATGGCGTTTTGGAGCAAATCTGTGAAGGGAAAGGTTATATCGATATGTCAACTGTTGAT
GCTGAGACCTCCTTAAAGATCAATGAGGCAATCACTGGGAAAGGTGGTCGGTTTGTAGAA
GGTCCGGTTTCAGGTAGCAAGAAGCCGGCAGAAGATGGCCAGCTCATCATACTTGCTGCT
GGTGACAAGTCCCTTTTCGATGAATCGGTCCCAGCTTTTGACGTCTTGGGG*AAGAAGTC
TTTTTACTCGGGACAAGTTGGGAACGGAGCTAAGATGAAACTTGTTGTCAACATGGTCAT
GGGAAGCATGATGAACGCCTTCTCCGAGGGGCT*GTATTAGCTGACAAGAGTGGACTTAG
CTCTGACACTCTTCTTGATATTCTGG*ATCTTGGTGCAATGACTAACCCGATGTTCAAAG
GGAAAGGACCTTCGATGAATAAGAGTAGTTACCCACCAGCGTTCCCGTTGAAACATCAGC
AGAAGGACATGAGGCTAGCTCTTGCTCTTGGCGATGAAAACGCTGTTTCCATGCCTGTAG
CTGCAGCTGCAAATGAGGCTTTTAAGAAAGCAAGAAGCTTGGGACTTGGAGATCTGGACT
TTTCTGCTGTGATTGAGGCTGTGAAATTCTCCAGGGAGTAGTAGTTAAACTATTGGAAAA
GAAAAAAA*CTAAAATGATTGTTGTCTTCCCAAAGACAGTTTACTCTACTCATGATTTGG
CCAAGAACACATTTTAATCCTTCACCAAATAAGACGTCTTTT

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR2GC53JQ 671 0 0
AAGATCAATGAGGCAATCACCGGGAAAGGTGGTCGGTTTGTAGAAGGTCCGGTTTCAGGT
AGCAAGAAGCCGGCAGAAGATGGCCAGCTCATCATACTTGCTGCTGGTGACAAGTCCCTT
TTCGATGAATCGGTCCCAGCTTTTGACGTCTTGGGG*AAGAAGTCTTTTTACTTGGGACA
AGTTGGGAACGGAGCTAAGATGAAACTTGTTGTCAACATGGTCATGGGAAGCATGATGAA
CGCCTTCTCCGAGGGGCTTGTATTAGCTGACAAGAGTGGACTTAGTTCTGACACTCTTCT
TGATATTCTGG*ATCTTGGTGCAATGACAAACCCGATGTTCAAAGGGAAAGGACCTTCGA
TGAATAAGAGCAGTTACCCACCAGCGTTCCCGTTGAAACATCAGCAGAAGGACATGAGGC
TAGCTCTTGCTCTTGGCGATGAAAACGCTGTTTCCATGCCTGTAGCTGCAGCTGCAAATG
AGGCTTTTAAGAAGGCCAGAAGCATGGGACTTGGAGATCTGGACTTTTCTGCTGTGATTG
AGGCTGTGAAATTCTCCAGGGAGTAGTAGTTAAACTATTGGAAAAGAAAAAAAACTAAAA
TGATTGTTGTCTTCCCAA***CAGTTTACTC*****ATGATTTGGCTAAGAACACATTTT
AATCCTTCACC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2G443JQ 759 0 0
AAAGATCAATGAGGCAATCACTGGGAAAGGTGGTCGGTTTGTAGAAGGTCCGGTTTCAGG
TAGCAAGAAGCCGGCAGAAGATGGCCAGCTCATCATACTTGCTGCTGGTGACAAGTCCCT
TTTCGATGAATCGGTCCCAGCTTTTGACGTCTTGGGG*AAGAAGTCTTTTTACTTGGGAC
AAGTTGGGAACGGAGCTAAGATGGAACTTGTTGTCAACATGGTCATGGGAAGCATGATGA
ACGCCTTCTCCGAGGGGCTTGTATTAGCTGACAAGAGTGGACTTAGCTCTGACACTCTTC
TTGATATTCTGG*ATCTTGGTGCAATGACTAACCCGATGTTCAAAGGGAAAGGACCTTCG
ATGAATAAGAGTAGTTACCCACCAGCGTTCCCGTTGAAACATCAGCAGAAGGACATGAGG
CTAGCTCTTGCTCTTGGCGATGAAAACGCTGTTTCCATGCCTGTAGCTGCAGCTGCAAAT
GAGGCTTTTAAGAAAGCAAGAAGCTTGGGACTTGGAGATCTGGACTTTTCTGCTGTGATT
GAGGCTGTGAAATTCTCCAGGGAGTAGTAGTTAAACTATTGGAAAAGAAAAAAA*CTAAA
ATGATTGTTGTCTTCCCAAAGACAGTTTACTCTACTCATGATTTGGCCAAGAACACATTT
TAATCCTTCACCAAATAAGACGTCTTTTAAAACAGTCCTTATGTTACCTCTTTTGGTTTG
TGTAACAAATGCAAAAGCTTGGTAACAAGTGAATTATAT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 11

CO CL458Contig1 971 11 19 U
GGAATCAATAATTTATTCTCGTCATCTCTATCTTGCTCCACCTCCTGTCCTTAGCCACCG
TCTTATCTGCCACCGTGTTCCTTCTTCGATCCGCCTCCCAAGCCATCGTTCTACTACCAC
ATCCCTCCGCATCTTCAACTACAGCAGCAGCGAGTCGGGAGAGTGAAATAATGGCACCAG
CAGGTAAAGAAGAAGGACAAGATCCGAGAATCCCTAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCA
TCCCTGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACAACGCTGCTTCTGGACA
CTGAGGCCTTTAAGGATACTATTGATATATTTGTTGAACGTTACAAAGGCAAAGACATCT
CTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGATTCATATTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTA
TTGGTGCCAAGTTTGTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAGTTATATCTG
TGGAGTATTCATTGGAGTATGGAACAGATACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTAGAGC
CTGGTGAGCGTGCTATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACGGGTGGGACTCTCGCTGCTG
CTATCCGACTACTTGAGCGAGTAGGAGTGAAGATAGTGGAGTGTGCATGCGTGATTGAGT
TACCAGAGCTCAAGGGAAGGGAGAAACTAGGAGATGCGCCACTATTCATTCTTGTAACCT
CGGATGCTGCCTAAACAAGAATAATAAAGCCTGCCCCTAAAAAAAGGAAAATGGCGGTGG
TAACCTATTGGGAGTTTATCAAAAATGTGATTTTTCTTTGTGTTCCTTTGGGATATGATG
ATCACTTTCTTCTTGTTTTCAACTTATCATAACTGGCTCGGACTATAAAAGTTGTGGCAC
TCTGCATGCCGGGATTTGATTGCAGTGTTCTGATTGTTTTCCATCTAAAATAAAGTCCGA
ATTAAGTGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 5 5 30 30 5 5 5 5 30 5 30 30 5 30 5 5 5 
0 35 0 0 0 35 0 0 35 0 0 35 0 35 35 0 35 0 0 35 0 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 45 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2GG45TF U 55
AF RR2EI01TF U 13
AF RR2CV52TF U 1
AF RR2EV39TF U 103
AF RR2D562TF U 103
AF RR2CA35TF U 120
AF RR2CA35JQ C 228
AF RR2EI01JQ C 378
AF RR2EV39JQ C 228
AF RR2D562JQ C 257
AF RR2CV52JQ C 232
BS 1 130 RR2CV52TF
BS 131 131 RR2EV39TF
BS 132 140 RR2CV52TF
BS 141 141 RR2EV39TF
BS 142 142 RR2CV52TF
BS 143 143 RR2EV39TF
BS 144 270 RR2CV52TF
BS 271 271 RR2EV39TF
BS 272 485 RR2CV52TF
BS 486 486 RR2EV39TF
BS 487 690 RR2CV52TF
BS 691 691 RR2D562TF
BS 692 734 RR2CV52TF
BS 735 735 RR2D562TF
BS 736 764 RR2CV52TF
BS 765 765 RR2CA35JQ
BS 766 800 RR2CA35TF
BS 801 902 RR2CA35JQ
BS 903 971 RR2EV39JQ

RD RR2GG45TF 566 0 0
GG
ACCGTCTTATCTGCCACCGTGTTCCTTCTTCGATCCGCCTCCCAAGCCATCGTTCTACTA
CCACATCCCTCCGCCTCTTCAACTGC*GCAGCAGCGAGTCGGGAGAGTGAAATAATGGCA
CCAGCAGGTAAAGAAGAAGGACAAGATCCGAGAATCCCTAAGATCGCCTCTTCCATTAGA
GTCATCCCTGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACAACGCTGCTTCTG
GACACTGAGGCCTTTAAGGATACTATTGATATATTTGTTGAACGTTACAAAGGCAAAGAC
ATCTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGATTCATATTTGGCCCTCCTATTGCCTTG
GCTATTGGTGCCAAGTTTGTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAGTTATA
TCTGTGGAGTATTCATTGGAGTATGGAACAGATACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTA
GAGCCTGGTGAGCGTGCTATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACGGGTGGGACTCTCGCT
GCTGCTATCCGACTACTTGAGCGA

QA 3 566 3 566
DS 

RD RR2EI01TF 664 0 0
GG
ATTCTCGTCATCTCTATCTTGCTCCACCTCCTGTCCTTAGCCACCGTCTTATCTGCCACC
GTGTTCCTTCTTCGATCCGCCTCCCAAGCCATCGTTCTACTACCACATCCCTCCGCCTCT
TCAACTGC*GCAGCAGCGAGTCGGGAGAGTGAAATAATGGCACCAGCAGGTAAAGAAGAA
GGACAAGATCCGAGAATCCCTAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCATCCCTGACTTCCCT
AAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACAACGCTGCTTCTGGACACTGAGGCCTTTAAG
GATACTATTGATATATTTGTTGAACGTTACAAAGGCAAAGACATCTCTGTTGTTGCAGGT
GTTGAAGCAAGAGGATTCATATTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGGTGCCAAGTTT
GTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAGTTATATCTGTGGAGTATTCATTG
GAGTATGGAACAGATACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTAGAGCCTGGTGAGCGTGCT
ATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACGGGTGGGACCCTCGCTGCTGCTATCCGACTACTT
GAGCGAGTAGGAGTGAAGATAGTGGAGTGTGCATGCGTGATTGAGTTACCAGAGCTCAAG
GG

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR2CV52TF 764 0 0
GGAATCAATAATTTATTCTCGTCATCTCTATCTTGCTCCACCTCCTGTCCTTAGCCACCG
TCTTATCTGCCACCGTGTTCCTTCTTCGATCCGCCTCCCAAGCCATCGTTCTACTACCAC
ATCCCTCCGCCTCTTCAACTGC*GCAGCAGCGAGTCGGGAGAGTGAAATAATGGCACCAG
CAGGTAAAGAAGAAGGACAAGATCCGAGAATCCCTAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCA
TCCCTGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTCTCAGGACATAACAACGCTGCTTCTGGACA
CTGAGGCCTTTAAGGATACTATTGATATATTTGTTGAACGTTACAAAGGCAAAGACATCT
CTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGATTCATATTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTA
TTGGTGCCAAGTTTGTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAGTTATATCTG
TGGAGCATTCATTGGAGTATGGAACAGATACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTAGAGC
CTGGTGAGCGTGCTATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACGGGTGGGACTCTCGCTGCTG
CTATCCGACTACTTGAGCGAGTAGGAGTGAAGATAGTGGAGTGTGCATGCGTGATTGAGT
TACCAGAGCTCAAGGGAAGGGAGAAACTAG*AGATGCGCCACTATTCATTCTTGTAACCT
CGGATGCTGCCTAA*CAAGAATAATAAAGCCTGCCCCTAAAAAA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2EV39TF 661 0 0
CTGTCCCGATTCT*CTTTGTGTGTGTGTATGTTTATTTACAGCAGCAGCGAGTCGGGAGA
GTGAAATAATGGCACCAGCAGGTAAAGAAGAAGGACAAGATCCGAGAATCCCTAAGATCA
CCTCTTCCATTAGAGTCATCCCTGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAA
CAACGCTGCTTCTGGACACTGAGGCCTTTAAGGATACTATTGATATATTTGTTGAACGTT
ACAAAGGCAAAGACATCTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGATTCATATTTGGCC
CTCCTATTGCCTTGGCTATTGGTGCCAAGTTTGTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTAC
CTGGGGAAGTTATATCTGTGGAGTATTCATTGGAGTATGGAACAGATACGATGGAGATGC
ATGTAGGTGCAGTAGAGCCTGGTGAGCGTGCTATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACGG
GTGGGACTCTCGCTGCTGCTATCCGACTACTTGAGCGAGTAGGAGTGAAGATAGTGGAGT
GTGCATGCGTGATTGAGTTACCAGAGCTCAAGGGAAGGGAGAAACTAG*AGATGCGCCAC
TATTCATTCTTGTAACCTCGGATGCTGCCTAA*CAAGAATAATAAAGCCTGCCCCTAAAA
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2D562TF 656 0 0
CTGTCCCGATTCT*CTTTGTGTGTGTGTATGTTTATTTACAGCAGCAGCGAGTCGGGAGA
ATGAAATAATGGCACCAGCAGGTAAAGAAGAAGGACAAGATCCGAGAATCCCTAAGATCG
CCTCTTCCATTAGAGTCATCCCTGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAA
CAACGCTGCTTCTGGACACTGAGGCCTTTAAGGATACTATTGATATATTTTTTGAACGTT
ACAAAGGCAAAGACATCTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAGGAGGATTCATATTTGGCC
CTCCTATTGCCTTGGCTATTGGTGCCAAGTTTGTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTAC
CTGGGGAAGTTATATCTGTGGAGTATTCATTGGAGTATGGAACAGATACGATGGAGATGC
ATGTAGGTGCAGTAGAGCCTGGTGAGCGTGCTATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACGG
GTGGGACTCTCGCTGCTGCTATCCGACTACTTGAGCGAGTAGGAGTGAAGATAGTGGAGT
GTGCATGCGTGATTGAGTTACCAGAGCTCAAGGGAAGGGAGAAACTAGGAGATGCGCCAC
TATTCATTCTTGTAACCTCGGATGCTGCCTAAACAAGAATAATAAAGCCTGCCCCT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2CA35TF 681 0 0
G
GTGTGTGTGTATGTTTATTTACAGCAGCAGCGAGTCGGGAGAGTGAAATAATGGCACCAG
CAGGTAAAGAAGAAGGACAAGATCCGAGAATCCCTAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCA
TCCCTGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACAACGCTGCTTCTGGACA
CTGAGGCCTTTAAGGATACTATTGATATATTTGTTGAACGTTACAAAGGCAAAGACATCT
CTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGATTCATATTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTA
TTGGTGCCAAGTTTGTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAGTTATATCTG
TGGAGTATTCATTGGAGTATGGAACAGATACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTAGAGC
CTGGTGAGCGTGCTATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACGGGTGGGACTCTCGCTGCTG
CTATCCGACTACTTGAGCGAGTAGGAGTGAAGATAGTGGAGTGTGCATGCGTGATTGAGT
TACCAGAGCTCAAGGGAAGGGAGAAACTAGGAGATGCGCCACTATTCATTCTTGTAACCT
CGGATGCTGCCTAAACAAGAATAATAAAGCCTGCCCCTAAAAAA*GGAAAATGGCGGTGG
TAACCTATTGGGAGTTTATC

QA 2 681 2 681
DS 

RD RR2CA35JQ 675 0 0
TCCATTAGAGTCATCCCTGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACAACG
CTGCTTCTGGACACTGAGGCCTTTAAGGATACTATTGATATATTTGTTGAACGTTACAAA
GGCAAAGACATCTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGATTCATATTTGGCCCTCCT
ATTGCCTTGGCTATTGGTGCCAAGTTTGTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGG
GAAGTTATATCTGTGGAGTATTCATTGGAGTATGGAACAGATACGATGGAGATGCATGTA
GGTGCAGTAGAGCCTGGTGAGCGTGCTATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACGGGTGGG
ACTCTCGCTGCTGCTATCCGACTACTTGAGCGAGTAGGAGTGAAGATAGTGGAGTGTGCA
TGCGTGATTGAGTTACCAGAGCTCAAGGGAAGGGAGAAACTAGGAGATGCGCCACTATTC
ATTCTTGTAACCTCGGATGCTGCCTAAACAAGAATAATAAAGCCTGCCCCTAAAAAAAGG
AAAATGGCGGTGGTAACCTATTGGGAGTTTATCAAAAATGTGATTTTTCTTTGTGTTCCT
TTGGGATATGATGATCACTTTCTTCTTGTTTTCAACTTATCATAACTGGCTCGGACTATA
AAAGTTGTGGCACTC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2EI01JQ 549 0 0
GAAGCAAGAGGATTCATATTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGGTGCCAAGTTTGTA
CCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAGTTATATCTGTGGAGTATTCATTGGAG
TATGGAACAGATACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTAGAGCCTGGTGAGCGTGCTATC
GTCATAGATGACCTCATTGCCACGGGTGGGACCCTCGCTGCTGCTATCCGACTACTTGAG
CGAGTAGGAGTGAAGATAGTGGAGTGTGCATGCGTGATTGAGTTACCAGAGCTCAAGGGA
AGGGAGAAACTAGGAGATGCGCCACTATTCATTCTTGTAACCTCGGATGCTGCCTAAACA
AGAATAATAAAGCCTGCCCCTAAAAAAAGGAAAATGGCGGTGGTAACCTATTGGGAGTTT
ATCAAAAATGTGATTTTTCTTTGTGTTCCTTTGGGATATGATGATCACTTTCTTCTTGTT
TTCAACTTATCATAACTGGCTCGGACTATAAAAGTTGTGGCACTCTGCATGCCGGGATTT
GATTGCAGT

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2EV39JQ 744 0 0
TCCATTAGAGTCATCCCTGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACAACG
CTGCTTCTGGACACTGAGGCCTTTAAGGATACTATTGATATATTTGTTGAACGTTACAAA
GGCAAAGACATCTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGATTCATATTTGGCCCTCCT
ATTGCCTTGGCTATTGGTGCCAAGTTTGTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGG
GAAGTTATATCTGTGGAGTATTCATTGGAGTATGGAACAGATACGATGGAGATGCATGTA
GGTGCAGTAGAGCCTGGTGAGCGTGCTATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACGGGTGGG
ACTCTCGCTGCTGCTATCCGACTACTTGAGCGAGTAGGAGTGAAGATAGTGGAGTGTGCA
TGCGTGATTGAGTTACCAGAGCTCAAGGGAAGGGAGAAACTAGGAGATGCGCCACTATTC
ATTCTTGTAACCTCGGATGCTGCCTAAACAAGAATAATAAAGCCTGCCCCTAAAAAAAGG
AAAATGGCGGTGGTAACCTATTGGGAGTTTATCAAAAATGTGATTTTTCTTTGTGTTCCT
TTGGGATATGATGATCACTTTCTTCTTGTTTTCAACTTATCATAACTGGCTCGGACTATA
AAAGTTGTGGCACTCTGCATGCCGGGATTTGATTGCAGTGTTCTGATTGTTTTCCATCTA
AAATAAAGTCCGAATTAAGTGTAA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2D562JQ 713 0 0
ACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACAACGCTGCTTCTGGACACTGAGGCCTTTAAGGA
TACTATTGATATATTTTTTGAACGTTACAAAGGCAAAGACATCTCTGTTGTTGCAGGTGT
TGAAGCAGGAGGATTCATATTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGGTGCCAAGTTTGT
ACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAGTTATATCTGTGGAGTATTCATTGGA
GTATGGAACAGATACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTAGAGCCTGGTGAGCGTGCTAT
CGTCATAGATGACCTCATTGCCACGGGTGGGACTCTCGCTGCTGCTATCCGACTACTTGA
GCGAGTAGGAGTGAAGATAGTGGAGTGTGCATGCGTGATTGAGTTACCAGAGCTCAAGGG
AAGGGAGAAACTAGGAGATGCGCCACTATTCATTCTTGTAACCTCGGATGCTGCCTAAAC
AAGAATAATAAAGCCTGCCCCTAAAAAAAGGAAAATGGCGGTGGTAACCTATTGGGAGTT
TATCAAAAATGTGATTTTTCTTTGTGTTCCTTTGGGATATGATGATCACTTTCTTCTTGT
TTTCAACTTATCATAACTGGCTCGGACTATAAAAGTTGTGGCACTCTGCATGCCGGGATT
TGATTGCAGTGTTCTGATTGTTTTCCATCTAAAATAAAGTCCGAATTAAGT
AC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2CV52JQ 737 0 0
TTAGAGTCATCCCTGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTCTCAGGACATAACAACGCTGC
TTCTGGACACTGAGGCCTTTAAGGATACTATTGATATATTTGTTGAACGTTACAAAGGCA
AAGACATCTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGATTCATATTTGGCCCTCCTATTG
CCTTGGCTATTGGTGCCAAGTTTGTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAG
TTATATCTGTGGAGCATTCATTGGAGTATGGAACAGATACGATGGAGATGCATGTAGGTG
CAGTAGAGCCTGGTGAGCGTGCTATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACGGGTGGGACTC
TCGCTGCTGCTATCCGACTACTTGAGCGAGTAGGAGTGAAGATAGTGGAGTGTGCATGCG
TGATTGAGTTACCAGAGCTCAAGGGAAGGGAGAAACTAGGAGATGCGCCACTATTCATTC
TTGTAACCTCGGATGCTGCCTAAACAAGAATAATAAAGCCTGCCCCTAAAAAAAGGAAAA
TGGCGGTGGTAACCTATTGGGAGTTTATCAAAAATGTGATTTTTCTTTGTGTTCCTTTGG
GATATGATGATCACTTTCTTCTTGTTTTCAACTTATCATAACTGGCTCGGACTATAAAAG
TTGTGGCACTCTGCATGCCGGGATTTGATTGCAGTGTTCTGATTGTTTTCCATCTAAAAT
AAAGTCCGAATTAAGT
G

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 11

CO CL459Contig1 976 11 24 U
GGAAAACCTAAAAGTCAGCAAACCAAAGGCATATTCCTCTTTTCCTCATAAGCCTTATTT
TCCACATTCAGATTCAAGAATCCATGGCGATCACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAA
TATGCTCCATGATCCAATCCAGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGG
AGAAAGGTGCACTTGAAGTCACCGCTACACCCAGCCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTG
CCGGAGTTGATAAGTTGAGCATTACGTGGAAGGTAAGCTCGACGGCTACCAAGGAGGCTG
AATTTAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAAGTGGACCGACCAT
GGCGCAAGACCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCAT
TTCCCTATGACCCCACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCGACTATACCCTCGAGCGCGACA
TCCCCACAGGGACCTACTACGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAGTTG
CCTTTGGACAGACCACAAACGAGGCCAAGACAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATTA
GTGGCCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCTGTCTGTTTCAGCGTCTTCTCCGTCGTGG
CTCTTCTCGTCTTCTTTGTGAACGAAAAG*AGGAAGGCCAAGATAGAGCAAAGCAAATGA
GTCGTTTGCGTATTGCGACGTTGAACAAAAAGGCGTTGACTTTAAATTTTCATTTCTATC
AATTGCGTATGTTTGTTAAAACAAGCTTACTTCTTACTTCTTCTTTCCTTTGTACCTTTA
CTTACATGTTTGTATGGTTATATAAGTCACTCATATGGGACCAAAAAGAACTAACGAATC
CTACGGTGGTGATGTGTTGTACGCTTTCTAAATTCTTACTACAAATTTGAAATATTCATA
TAAGCTTTGTATTGGT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 35 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 45 60 60 60 60 60 45 60 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 30 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM08TF U 2
AF RR2E290TF U 19
AF RR2BZ28TF U 1
AF RR2E254TF U 68
AF RR2GD35TF U 64
AF RR2AC16TF U 2
AF RR2GD35JQ C 648
AF RR2AC16JQ C 106
AF RR2GM08JQ C 514
AF RR2E290JQ C 155
AF RR2E254JQ C 220
BS 1 185 RR2BZ28TF
BS 186 186 RR2AC16TF
BS 187 289 RR2BZ28TF
BS 290 290 RR2E290TF
BS 291 309 RR2BZ28TF
BS 310 310 RR2AC16TF
BS 311 595 RR2BZ28TF
BS 596 596 RR2AC16TF
BS 597 681 RR2BZ28TF
BS 682 682 RR2AC16TF
BS 683 694 RR2BZ28TF
BS 695 695 RR2AC16TF
BS 696 711 RR2BZ28TF
BS 712 712 RR2AC16TF
BS 713 722 RR2BZ28TF
BS 723 821 RR2AC16TF
BS 822 822 RR2AC16JQ
BS 823 857 RR2AC16TF
BS 858 858 RR2AC16JQ
BS 859 879 RR2AC16TF
BS 880 921 RR2AC16JQ
BS 922 922 RR2E254JQ
BS 923 957 RR2AC16JQ
BS 958 976 RR2E254JQ

RD RR2GM08TF 587 0 0
GG
AAACCTAAAAGTCAGCAAACCAAAGGCATATTCCCCTTTTCCTCATAAGCCTTATTTTCC
ACATTCAGATTCAAGAATCCATGGCGATCACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAATAT
GCTCCATGATCCAATCCAGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAGA
AAGGTGCACTTGAAGTCACCGCTACACCCAGCCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCCG
GATTTGATAAGTTGAGCATTACGTGGAAGGTAAGCTCGACGGCTACAAAGGAGGCTGAAT
TTAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAAGTGGACCGACCATGGC
GCAAGACCCATAATGGGCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCATTTC
CCTATGACCCCACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCGACTATACCCTCGAGCGCGACATCC
CCACAGGGACCTACTACGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAGTTGCCT
TTGGACAGACCACAAACGAGGCCAAGACAACCAATCTCTTCAGCG

QA 3 587 3 587
DS 

RD RR2E290TF 672 0 0
G
AAACCAAAGGCATATTCCTCTTTTCCTCATAAGCCTTATTTTCCACATTCAGATTCAAGA
ATCCATGGCGATCACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAATATGCTCCATGATCCAATC
CAGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAGAAAGGTGCACTTGAAGT
CACCGCTACACCCAGCCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCCGGAGTTGATAAGTTGAG
CATTACGTGGAAGGTAAGCTCGACGGCTACCAAGGAGGCTGAATTTAAGATCATTAAAGT
AAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAAGTGGACCGACCATGGCGCAAGACCCATAATGA
GCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCATTTCCCTATGACCCCACTGT
CAAAACCGCTCAATCATTCGACTATACCCTCGAGCGCGACATCCCCACAGGGACCTACTA
CGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAGTTGCCTTTGGACAGACCACAAA
CGAGGCCAAGACAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATTAGTGGCCGCCACAAATCCTT
AGATATTGCCTCTGTCTGTTTCAGCGTCTTCTCCGTCGTGGCTCTTCTCGTCTTCTTTGT
GAACGAAAAGA

QA 2 672 2 672
DS 

RD RR2BZ28TF 722 0 0
GGAAAACCTAAAAGTCAGCAAACCAAAGGCATATTCCTCTTTTCCTCATAAGCCTTATTT
TCCACATTCAGATTCAAGAATCCATGGCGATCACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAA
TATGCTCCATGATCCAATCCAGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGG
AGAAATGTGCACTTGAAGTCACCGCTACACCCAGCCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTG
CCGGAGTTGATAAGTTGAGCATTACGTGGAAGGTAAGCTCGACGGCTACAAAGGAGGCTG
AATTTAAGACCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAAGTGGACCGACCAT
GGCGCAAGACCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCAT
TTCCCTATGACCCCACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCGACTATACCCTCGAGCGCGACA
TCCCCACAGGGACCTACTACGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAGTTG
CCTTTGGACAGACCACAAACGAGGCCAAGACAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCCATTA
GTGGCCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCTGTCTGTTTCAGCGTCTTCTCCGTCGTGG
CTCTTCTCGTCTTCTTTGTGA*CGAAAAG*AGGA*GGCCAAGATAGAGCAA*GCAAATGA
GT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2E254TF 753 0 0
G
CAGATTCAAGAATCCATGGCGATCACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAATATGCTCC
ATGATCCAATCCAGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAGAAAGGT
GCACTTGAAGTCACCGCTACACCCAGCCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCCGGAGTT
GATAAGTTGAGCATTACGTGGAAGGTAAGCTCGACGGCTACCAAGGAGGCTGAATTTAAG
ATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAAGTGGACCGACCATGGCGCAAG
ACCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCATTTCCCTAT
GACCCCACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCGACTATACCCTCGAGCGCGACATCCCCACA
GGGACCTACTACGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAGTTGCCTTTGGA
CAGACCACAAACGAGGCCAAGACAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATTAGTGGTCGC
CACAAATCCTTAGATATTGCCTCTGTCTGTTTCAGCGTCTTCTCCGTCGTGGCTCTTCTC
GTCTTCTTTGTGAACGAAAAG*AGGAAGGCCAAGATAGAGCAAAGCAAATGAGTCGTTTG
CGTATTGCGACGTTGAC**AAAAGGCGTTGACTTTAA*TTTTCATTTCTATCAATTGCGT
ATGTTTGTTAAA*CAAGCTTACTTCTTACTTC

QA 2 753 2 753
DS 

RD RR2GD35TF 749 0 0
G
CATTCAGATTCAAGAATCCATGGCGATCACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAATATA
CTCCATGATCCAATCCAGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAGAA
AGGTGCACTTGAAGTCACCGCTACACCCAGCCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCCGG
AGTTGATAAGTTGAGCATTACGTGGAAGGTAAGCTCGACGGCTACCAATGAGGCTGAATT
TAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAAGTGGACCGACCATGGCG
CAAGACCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCATTTCC
CTATGACCCCACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCGACTATACCCTCGAGCGCGACATCCC
CACAGGGACCTACTGCGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAGTTGCCTT
TGGACAGACCACAAACGAGGCCAAGACAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATTAGTGG
CCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCTGTCTGTTTCAGCGTCTTCTCCGTCGTGGCTCT
TCTCGTCTTCTTTGTTAACGAAAAG*AGGAAAGCCAAGATAGAGCAAAGCAAATGAGTCG
TTTGCGTATTGCGACGTTGAACAAAAAGGCGTTGACTTTAAATTTTCATTTCTATCAATT
GCGTATGTTTGTTAAAACAAGCTTACTT

QA 2 749 2 749
DS 

RD RR2AC16TF 878 0 0
GG
AAACCTAAAAGTCAGCAAACCAAAGGCATATTCCTCTTTTCCTCATAAGCCTTATTTTCC
ACATTCAGATTCAAGAATCCATGGCGATCACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAATAT
GCTCCATGATCCAATCCAGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAGA
AAGGTGCACTTGAAGTCACCGCTACACCCAGCCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCCG
GAGTTGATAAGTTGAGCATTACGTGGAAGGTAAGCTCGACGGCTACAAAGGAGGCTGAAT
TTAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAAGTGGACCGACCATGGC
GCAAGATCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCCTCATTTC
CCTATGACCCCACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCGACTATACCCTCGAGCGCGACATCC
CCACAGGGACCTACTACGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAGTTGCCT
TTGGACAGACCACAAACGAGGCCAAGACAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATTAGTG
GCCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCTGTCTGTTTCAGCGTCTTCTCCGTCGTGGCTC
TTCTCGTCTTCTTTGTGAACGAAAAGGAGGAAGGCCAAGATAGAGCAAAGCAAATGAGTC
GTTTGCGTATTGCGACGTTGAACAAAAAGGCGTTGACTTTAAATTTTCATTTCTATCAAT
TGCGTATGTTTGTTAAAACAAGCTTACTTCTTACTTCT*CTTTCCTTTGTACCTTTACTT
ACATGTTTGTATGGGTATATAAGTCACTCATATGGG

QA 3 878 3 878
DS 

RD RR2GD35JQ 235 0 0
TTT
TCCGTCGTGGCTCTTTTCGTCTTCTTTGTTAACGAAAAG*AGGAAGGCCAAGATAGAGCA
AAGCAAATGAGTCGTTTGCGTATTGCGACGTTGAACAAAAAGGCGTTGACTTTAAATTTT
CATTTCTATCAATTGCGTATGTTTGTTAAAACAAGCTTACTTCTTACTTCTTCTTTCCTT
TGTACCTTTACTTGCATGTTT*TATGGTTATATAAGTCACTCATATGGGACC

QA 4 235 4 235
DS 

RD RR2AC16JQ 853 0 0
TAGCTTCACTTCTAATATGCTCCATGATCCAATCCAGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGAC
TCTTCACCGACCTGGAGAAAGGTGCACTTGAAGTCACCGCTACACCCAGCCGAACTGGAG
GTGTCGTTTTGGCTGCCGGAGTTGATAAGTTGAGCATTACGTGGAAGGTAAGCTCGACGG
CTACAAAGGAGGCTGAATTTAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCC
AAGTGGACCGACCATGGCGCAAGATCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCAC
ACAAGATCTCCTCATTTCCCTATGACCCCACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCGACTATA
CCCTCGAGCGCGACATCCCCACAGGGACCTACTACGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCC
AGGACCATGAAGTTGCCTTTGGACAGACCACAAACGAGGCCAAGACAACCAATCTTTTCA
GCGTTCAGGCTATTAGTGGCCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCTGTCTGTTTCAGCG
TCTTTTCCGTCGTGGCTCTTCTCGTCTTCTTTGTGAACGAAAGG*AGGAAGGCCAAGATA
GAGCAAAGCAAATGAGTCGTTTGCGTATTGCGACGTTGAACAAAAAGGCGTTGACTTTAA
ATTTTCATTTCTATCAATTGCGTATGTTTGTTAAAACAAGCTTACTTCTTACTTCTTCTT
TCCTTTGTACCTTTACTTACATGTTTGTATGGTTATATAAGTCACTCATATGGGACCAAA
AAGAACTAACGAATCCTACGGTGGTGATGTGTTGTATGCTTTCTAAATTCTTACTACAAA
TTTGAAATATTC
G

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR2GM08JQ 412 0 0
CAGTTGATGCCCAGGACCATGAAGTTGCCTTTGGACAGACCACAAACGAGGCCAAGACAA
CCAATTTTTTCAGCGTTCAGGCTATTAGTGGCCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCTG
TCTGTTTCAGCGTTTTTTCCGTCGTGGCTCTTTTCGTTTTCTTTGTGAACGAAAAG*AGG
AAGGCCAAGATAGAGCAAAGCAAATGAGTCGTTTGCGTATTGCAACGTTGAACAAAAAGG
CGTTGACTTTAAATTTTCATTTCTATCAATTGCGTATGTTTGTTAAAACAAGCTTACTTC
TTACTTTTTCTTTCCTTTGTACCTTTACTTACATGTTTGTATGGTTATATAAGTCACTCA
TATGGGACCAAAAAGAACTAACGAATCCTACGGTGGTGATGTGTTGTA
TGCC

QA 1 408 1 408
DS 

RD RR2E290JQ 752 0 0
CAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAGAAAGGTGCACTTGAAGTCACCGCTACACCCAG
CCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCCGGAGTTGATAAGTTGAGCATTACGTGGAAGGT
AAGCTCGACGGCTACCAAGGAGGCTGAATTTAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGC
TCCGGTCAGCCAAGTGGACCGACCATGGCGCAAGACCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAA
GAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCATTTCCCTATGACCCCACTGTCAAAACCGCTCAATC
ATTCGACTATACCCTCGAGCGCGACATCCCCACAGGGACCTACTACGTTCGTGCCTACGC
AGTTGATGCCCAGGACCATGAAGTTGCCTTTGGACAGACCACAAACGAGGCCAAGACAAC
CAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATTAGTGGCCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCTGT
CTGTTTCAGCGTCTTCTCCGTCGTGGCTCTTCTCGTCTTCTTTGTGAACGAAAAG*AGGA
AGGCCAAGATAGAGCAAAGCAAATGAGTCGTTTGCGTATTGCGACGTTGAACAAAAAGGC
GTTGACTTTAAATTTTCATTTCTATCAATTGCGTATGTTTGTTAAAACAAGCTTACTTCT
TACTTCTTCTTTCCTTTGTACCTTTACTTGCATGTTTGTATGGTTATATAAGTCACTCAT
ATGGGACCAAAAAGAACTAACGAATCCTAC
CG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2E254JQ 757 0 0
CTGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCCGGAGTTGATAAGTTGAGCATTACGTGGAAGGTAAGCT
CGACGGCTACCAAGGAGGCTGAATTTAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGG
TCAGCCAAGTGGACCGACCATGGCGCAAGACCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAAGAGCT
GCCCACACAAGATCTCTTCATTTCCCTATGACCCCACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCG
ACTATACCCTCGAGCGCGACATCCCCACAGGGACCTACTACGTTCGTGCCTACGCAGTTG
ATGCCCAGGACCATGAAGTTGCCTTTGGACAGACCACAAACGAGGCCAAGACAACCAATC
TCTTCAGCGTTCAGGCTATTAGTGGTCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCTGTCTGTT
TCAGCGTCTTCTCCGTCGTGGCTCTTCTCGTCTTCTTTGTGAACGAAAAG*AGGAAGGCC
AAGATAGAGCAAAGCAAATGAGTCGTTTGCGTATTGCGACGTTGAACAAAAAGGCGTTGA
CTTTAAATTTTCATTTCTATCAATTGCGTATGTTTGTTAAAACAAGCTTACTTCTTACTT
CTTCTTTCCTTTGTACCTTTACTTGCATGTTTGTATGGTTATATAAGTCACTCATATGGG
ACCAAAAAGAACTAACGAATCCTACCGTGGTGATGTGTTGTACGCTTTCTAAATTCTTAC
TACAAATTTGAAATATTCATATAAGCTTTGTATTGGT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 11

CO CL460Contig1 722 11 11 U
GGGAGATTATCTGTACTCACTATTAAAACCCACTAGTCCACCTCTAAATCACAAGTCCAC
TAGAGGAGACAGAGAGAGAGAGAG**AAAAGATGGCGAGATTCACGGTGTTGATTGCGGC
AGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTT
AGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCGACTATACCACCTGGGTTCAGGGAAA
GCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTCGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCT
TGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGATCCGAAACTATAC
ACGTGGAGCTGGGAGAGACATTGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATCTACTTGA
CGGAAGGGG*TGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTC
CTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTTCACATGACAAGAGTTTA
AAAACATCAGTTGATTGTTTGCCTCTCTTGTCGTGATATTCATTTCCGTGGATGATCTTG
TTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTTACTTT*CTTTTTGTTTTAGCATAAGA
CATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATGATAATGATATTTCTTGCTGG
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 5 55 5 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 10 

AF RR2AT43TF U 1
AF RR2AT43JQ C 46
AF RR2DE72JQ C 16
AF RR2DE72TF U 16
AF RR2GC34JQ C 37
AF RR2GC34TF U 37
AF RR2FO69TF U 38
AF RR2AI30JQ C 157
AF RR2G244JQ C 394
AF RR2G244TF U 450
AF RR2AI30TF U 157
BS 1 23 RR2AT43TF
BS 24 24 RR2DE72TF
BS 25 431 RR2AT43TF
BS 432 432 RR2DE72TF
BS 433 656 RR2AT43TF
BS 657 682 RR2DE72TF
BS 683 683 RR2GC34TF
BS 684 701 RR2DE72TF
BS 702 720 RR2GC34TF
BS 721 721 RR2G244TF
BS 722 722 RR2AI30JQ

RD RR2AT43TF 656 0 0
GGGAGATTATCTGTACTCACTATGAAAACCCACTAGTCCACCTCTAAATCACAAGTCCAC
TAGAGGAGACAGAGAGAGAGAGAG**AAAAGATGGCGAGATTCACGGTGTTGATTGCGGC
AGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTT
AGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCGACTATACCACCTGGGTTCAGGGAAA
GCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTCGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCT
TGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGATCCGAAACTATAC
ACGTGGAGCTGGGAGAGACATTGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATCTACTTGA
CGGAAGGGG*TTGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTC
CTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTTCACATGACAAGAGTTTA
AAAACATCAGTTGATTGTTTGCCTCTCTTGTCGTGATATTCATTTCCGTGGATGATCTTG
TTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTTACTTT*CTTTTTGTTTTAGCAT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2AT43JQ 611 0 0
AAATCACAAGTCCACTAGAGGAGACAGAGAGAGAGAGAG**AAAAGATGGCGAGATTCAC
GGTGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGAC
GGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCGACTATACCAC
CTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTCGTGTACTACAGAGA
CCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCC
GATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGACATTGTCCCTCTCAATGTCACCAAACA
GTACTATCTACTTGACGGAAGGGG*TTGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAG
TCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTTCA
CATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGTTTGCCTCTCTTGTCGTGATATTCATTT
CCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTTACTTT*CTTTT
TGTTTTAGCAT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2DE72JQ 685 0 0
GGG
ACTATTAAAACCCACTAGTCCACCTCTAAATCACAAGTCCACTAGAGGAGACAGAGAGAG
AGAGAGAGAAAAGATGGCGAGATTCACGGTGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTTCT
AGTGGCAGCGCCAGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAATTT
TTGGAATCCAAACATCAACTACAACACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGA
TTGGCTCTATTTCGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGA
CTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGA
CATTGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGGGG*TGGTTGTT
TTAAGGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCAC
TTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTCCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGT
TTGCCTCTCTTGTCGTGATATTCATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGT
TTTGTTGCTATGGTTTACTTT*CTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCT
AAAAATATGGATCTACCATATG

QA 4 685 4 685
DS 

RD RR2DE72TF 690 0 0
GGG
ACTATTAAAACCCACTAGTCCACCTCTAAATCACAAGTCCACTAGAGGAGACAGAGAGAG
AGAGAGAGAAAAGATGGCGAGATTCACGGTGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTTCT
AGTGGCAGCGCCAGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAATTT
TTGGAATCCAAACATCAACTACAACACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGA
TTGGCTCTATTTCGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGA
CTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGA
CATTGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGGGG*TGGTTGTT
TTAAGGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCAC
TTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTCCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGT
TTGCCTCTCTTGTCGTGATATTCATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGT
TTTGTTGCTATGGTTTACTTT*CTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCT
AAAA*TATGGATCTACCATATGA
AAAA

QA 4 686 4 686
DS 

RD RR2GC34JQ 690 0 0
GG
CACCTCTAAATCACAAGTCCACTAGAGGAGACAGAGAGAGAGAGA****AAAGATGGCGA
GATTCACGGTGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGG
AAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAA*GTTTTGGAATCCAAACATCGACT
ATACCACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTCGTGTACT
ACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCTG
ACCATCCTATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGACATTGTCCCTCTCAATGTCA
CCAAACAGTACTATTTACTTGACGGAAGGGG*TGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACT
GTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATC
AGTTTCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGTTTGCCTCTCTTGTCGTGATA
TTCATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTTACTT
T*CTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATA
TGATAATGATATTTCTTGCTGG
TTTGTT

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR2GC34TF 690 0 0
GG
CACCTCTAAATCACAAGTCCACTAGAGGAGACAGAGAGAGAGAGA****AAAGATGGCGA
GATTCACGGTGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGG
AAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAA*GTTTTGGAATCCAAACATCGACT
ATACCACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTCGTGTACT
ACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCTG
ACCATCCTATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGACATTGTCCCTCTCAATGTCA
CCAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGGGGGTGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACT
GTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATC
AGTTTCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGTTTGCCTCTCTTGTCGTGATA
TTCATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTTACTT
TTCTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATA
TGATAATGATATTTCTTGCTGG
TTTGTT

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR2FO69TF 690 0 0
GG
ACCTCTAAATCACAAGTCCACTAGAGGAGACAGAGAGAGAGA******AAAGATGGCGAG
ATTCACGGTGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGCAGCTCCGGTGCCGGA
AGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCGACTA
TACCACCCGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTCGTGTACTA
CAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCTGA
CCATCCTATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGACATTGTCCCTCTCAATGTCAC
CAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGGGG*TGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTG
TTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCA
GTTTCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGTTTGCCTCTCTTGTCGTGATAT
TCATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGT***GTTTTGTTGCTATGGTTTACTTT
*CTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATAT
GATAATGATATTTCTTGCTGG
TTTGTTT

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2AI30JQ 566 0 0
GGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAATTTTTGGAATCCAAACATCAA
CTACAACACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTCGTGTA
CTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTC
CGACCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGAACTGGGAGAGACATTGTCCCTCTCAATGT
CACCAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGGGG*TGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCA
CTGTTACAGCCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGA
TCAGTTCCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGTTTGCCTCTCTTGTCGTGA
TATTCATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTTAC
TTT*CTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCA
TATGATAATGATTTTTCTTGCTGGCT

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2G244JQ 329 0 0
G
GTCACCAAACAGTACTATTTACTTGACGGAAGGGG*TGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCT
CACTGTTACATTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTA
GATCAGTTTCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGTTTGCCTCTCTTGTCGT
GATATTCATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTT
ACTTT*CTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTAC
CATATGGTAATGATATTTCTTGCTGGC
C

QA 2 328 2 328
DS 

RD RR2G244TF 273 0 0
AAGCTCACTGTTACATTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAG
CACTAGATCAGTTTCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGTTTGCCTCTCTT
GTCGTGATATTCATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTAT
GGTTTACTTT*CTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGA
TCTACCATATGGTAATGATATTTCTTGCTGGC
C

QA 1 272 1 272
DS 

RD RR2AI30TF 566 0 0
GGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAATTTTTGGAATCCAAACATCAA
CTACAACACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTCGTGTA
CTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTC
CGACCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGAACTGGGAGAGACATTGTCCCTCTCAATGT
CACCAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGGGG*TGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCA
CTGTTACAGCCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGA
TCAGTTCCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGTTTGCCTCTCTTGTCGTGA
TATTCATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTTAC
TTT*CTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCA
TATGATAATGATTTTTCTTGCTGGC
T

QA 1 565 1 565
DS 



AS 2 11

CO CL461Contig1 937 3 9 U
GGAGCTGCTAATAAACCCTAACTCACTCAACCTTTCCTTCCTCGATTGTCAGCTATGGAG
TTCTGGGGAGTCGAAGTTCAAGCAGGGAGGCCACTTAAAGTGACGCCCGAAGATGGCACT
CTTGTCCACATCTCTCATGCATCGCTTGGAGATTGTAAAGGAAAGAAAGGAGAAGCTGTG
ACTTTGAATGTGAAGGTTGGGGACAAGAAGTTCGTCATGGGAACTCTTTTGTCTGAGAGC
ATTCCTCAGACTTGCTTTGATATGTTATTCGATCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACAACTGG
GGAAAAGGAAGTGTCCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCAACAACAAAGATGGTGAGGGA
GGAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAAGAGGAAGAGGAAGTTGCTGCCACTGTTGCA
GCTAATGGGAATGCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAAGCCTGAAGCAGATGATTCTGAT
TCTGAAGGAATGGATGAAGACGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGATTCCTAAGGCTGAAACA
AGAAGAAAGAGAGCACATGAAGTCGCACCCGGACCCAAGACACCTGTGTCTGCGAAGAAG
GCCAAAGGAGAAGCGACTCCCAAGAAAACAGAGGAGAAGAAGAAAGGTGGACCTGCAAAG
AAAGGTGGAAACACCCCCGCAACTGCAACGCAGAGCCCAAAGTCTGCAAGTCAAGTCTCA
TGTGGTTCATGCAAGAAGACATTCAACTCATCGAACGCACTTGAGTCTCACACCAAGGCC
AAGCACTCTGCTACCGCCAAGTGAAGTGGTTTCCTAAACTTCCGCTGTTTTGGATCTTTG
AGACTTATCTTTTTGAACTTCTGCTGTAGTCTTTTTGGAACCTTTCGGATTTGTATTTAC
CAGTGACCAATATCTTGCAGTATTCTTTCTTAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D519TF U 1
AF RR2BB15TF U 11
AF RR2BB15JQ C 27
BS 1 35 RR2D519TF
BS 36 36 RR2BB15TF
BS 37 352 RR2D519TF
BS 353 353 RR2BB15TF
BS 354 523 RR2D519TF
BS 524 524 RR2BB15TF
BS 525 593 RR2D519TF
BS 594 852 RR2BB15TF
BS 853 937 RR2BB15JQ

RD RR2D519TF 593 0 0
GGAGCTGCTAATAAACCCTAACTCACTCAACCTTTTCTTCCTCGATTGTCAGCTATGGAG
TTCTGGGGAGTCGAAGTTCAAGCAGGGAGGCCACTTAAAGTGACGCCCGAAGATGGCACT
CTTGTCCACATCTCTCATGCATCGCTTGGAGATTGTAAAGGAAAGAAAGGAGAAGCTGTG
ACTTTGAATGTGAAGGTTGGGGACAAGAAGTTCGTCATGGGAACTCTTTTGTCTGAGAGC
ATTCCTCAGACTTGCTTTGATATGTTATTCGATCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACAACTGG
GGAAAAGGAAGTGTCCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCAACAACAAAGATGATGAGGGA
GGAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAAGAGGAAGAGGAAGTTGCTGCCACTGTTGCA
GCTAATGGGAATGCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAAGCCTGAAGCAGATGATTCTGAT
TCTGAAGGAATGGATGAAGACGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGACTCCTAAGGCTGAAACA
AGAAGAAAGAGAGCACATGAAGTCGCACCCGGACCCAAGACACCTGTGTCTGC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2BB15TF 842 0 0
GG
AAACCCTAACTCACTCAACCTTTCCTTCCTCGATTGTCAGCTATGGAGTTCTGGGGAGTC
GAAGTTCAAGCAGGGAGGCCACTTAAAGTGACGCCCGAAGATGGCACTCTTGTCCACATC
TCTCATGCATCGCTTGGAGATTGTAAAGGAAAGAAAGGAGAAGCTGTGACTTTGAATGTG
AAGGTTGGGGACAAGAAGTTCGTCATGGGAACTCTTTTGTCTGAGAGCATTCCTCAGACT
TGCTTTGATATGTTATTCGATCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACAACTGGGGAAAAGGAAGT
GTCCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCAACAACAAAGATGGTGAGGGAGGAGAAGACTTT
TCTGATTCAGAGGAAGAAGAGGAAGAGGAAGTTGCTGCCACTGTTGCAGCTAATGGGAAT
GCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAAGCCTGAAGCAGATGATTCTGATTCTGAAGGAATG
GATGAAGACGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGATTCCTAAGGCTGAAACAAGAAGAAAGAGA
GCACATGAAGTCGCACCCGGACCCAAGACACCTGTGTCTGCGAAGAAGGCCAAAGGAGAA
GCGACTCCCAAGAAAACAGAGGAGAAGAAGAAAGGTGGACCTGCAAAGAAAGGTGGAAAC
ACCCCCGCAACTGCAACGCAGAGCCCAAAGTCTGCAAGTCAAGTCTCATGTGGTTCATGC
AAGAAGACATTCAACTCATCGAACGCACTTGAGTCTCACACCAAGGCCAAGCACTCTGCT
ACCGCCAAGTGAAGTGGTTTCCTAAACTTCCGCTGTTTTGGATCTTTGAGACTTATCTTT

QA 3 842 3 842
DS 

RD RR2BB15JQ 911 0 0
CACTCAACTTTCTT
CTCGATTGTCAGCTATGGAGTTCTGGGGAGTCGAAGTTCAAGCAGGGAGGCCACTTAAAG
TGACGCCCGAAGATGGCACTCTTGTCCACATCTCTCATGCATCGCTTGGAGATTGTAAAG
GAAAGAAAGGAGAAGCTGTGACTTTGAATGTGAAGGTTGGGGACAAGAAGTTCGTCATGG
GAACTCTTTTGTCTGAGAGCATTCCTCAGACTTGCTTTGATATGTTATTCGATCAGGAGT
TTGAGCTTTCTCACAACTGGGGAAAAGGAAGTGTCCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCA
ACAACAAAGATGGTGAGGGAGGAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAAGAGGAAGAGG
AAGTTGCTGCCACTGTTGCAGCTAATGGGAATGCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAAGC
CTGAAGCAGATGATTCTGATTCTGAAGGAATGGATGAAGACGGTTCTGAGGAAGAAGAGG
AGATTCCTAAGGCTGAAACAAGAAGAAAGAGAGCACATGAAGTCGCACCCGGACCCAAGA
CACCTGTGTCTGCGAAGAAGGCCAAAGGAGAAGCGACTCCCAAGAAAACAGAGGAGAAGA
AGAAAGGTGGACCTGCAAAGAAAGGTGGAAACACCCCCGCAACTGCAACGCAGAGCCCAA
AGTCTGCAAGTCAAGTCTCATGTGGTTCATGCAAGAAGACATTCAACTCATCGAACGCAC
TTGAGTCTCACACCAAGGCCAAGCACTCTGCTACCGCCAAGTGAAGTGGTTTCCTAAACT
TCCGCTGTTTTGGATCTTTGAGACTTATCTTTTTGAACTTCTGCTGTAGTCTTTTTGGAA
CCTTTCGGATTTGTATTTACCAGTGACCAATATCTTGCAGTATTCTTTCTTAGTTCC

QA 15 911 15 911
DS 



CO CL461Contig2 1072 8 13 U
GGTAAAACTAGGATTTCCTTCTTTTTCTATCTTTTCGTAAAGAAAACTCAGATTTCCACA
TTTGCATATTAATTTGTTGAAATTTAGAACGGGCAACTAAGAAAGAATACTGAAAGATAC
TGGTAACTGGTAAATACAAATCCGAGAGGTTTCAAAAAGACTACAGCCAAAGTTCAAAAA
GAAAAGTCTCCAACTAAATCCAAAACAGCGGAAGTTGTTACTCTTAGGAATCCACTTCAC
TTGGCGGTAGCAGAGTGCTTGGCCTTGGTGTGAGACTCAAGTGCGTTCGATGAGTTGAAT
GTCTTCTTGCATGAACCACATGAGACTTGACTTGCAGACTTTGGGCTCTGCGTTGCAGTT
GCGGGAGTGTTTCCACCTTTCTTAGCCGGGTGGGGGGTTGCAGGTCCACCTTTCTTCTTC
TCCTCTGTTTTCTTGGGAGTAGCTTCTGCTTTGGCCTTCTTCGCAGACACAGGTGTCTTG
GGTCCAGGTGCGACTTCATGTGCTCTCTTTCTTCTTGTTTCAGCCTTAGGAGTCTCCTCT
TCTTCCTCAGAATCATCTTCATCCATTCCTTCAGAATCAGAATCATCTGCTTCAGGCTTT
GGTTTTGTTACGCCCTTTGCAGCATTCCCATTAGCTGCAACAGTGGCAGCAACTTCCTCT
TCCTCTTCTTCCTCTTCTTCCTCTGAATCAGAAAAGTCTTCTCCTCCCTCATCATCTTTG
TTGTTGGGACATTGGAATCCAACAAAGTGGACACTTCCTTTTCCCCAGTTGTGAGAAAGC
TCAAACTCCTGATCGAATAACATATCAAAGCAAGTCTGAGGAATGCTCTCAGACAAAAGA
GTTCCCATGACGAACTTCTTGTCCCCAACCTTCACATTCAAAGTCACAGCTTCTCCTTTC
TTTCCTTTACAATCTCCAAGCGATGCATGAGAGATGTGGACAAGAGTGCCATCTTCGGGC
GTCACTTTAAGTGGCTTCCCTGCTTGAACTTCGACTCCCCAGAACTCCATAGCTGACAAT
CGAGGAAGAAAAGGTTGAGTGACTTAGGGTTTATTAGCAGCTGAGGTCCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU29JQB U 1
AF RR2F158JQ U 74
AF RR2CV63JQ U 99
AF RR2B286JQ U 109
AF RR2GU29TF C 460
AF RR2B286TF C 247
AF RR2F158TF C 458
AF RR2CV63TF C 431
BS 1 203 RR2GU29JQB
BS 204 204 RR2F158JQ
BS 205 361 RR2GU29JQB
BS 362 362 RR2F158JQ
BS 363 494 RR2GU29JQB
BS 495 495 RR2F158JQ
BS 496 576 RR2GU29JQB
BS 577 804 RR2F158JQ
BS 805 845 RR2CV63JQ
BS 846 846 RR2B286JQ
BS 847 867 RR2CV63JQ
BS 868 875 RR2B286JQ
BS 876 1072 RR2B286TF

RD RR2GU29JQB 576 0 0
GGTAAAACTAGGATTTCCTTCTTTTTCTATCTTTTCGTAAAGAAAACTCAGATTTCCACA
TTTGCATATTAATTTGTTGAAATTTAGAACGGGCAACTAAGAAAGAATACTGAAAGATAC
TGGTAACTGGTAAATACAAATCCGAGAGGTTTCAAAAAGACTACAGCCAAAGTTCAAAAA
GAAAAGTCTCCAACTAAATCCAAGACAGCGGAAGTTGTTACTCTTAGGAATCCACTTCAC
TTGGCGGTAGCAGAGTGCTTGGCCTTGGTGTGAGACTCAAGTGCGTTCGATGAGTTGAAT
GTCTTCTTGCATGAACCACATGAGACTTGACTTGCAGACTTTGGGCTCTGCGTTGCAGTT
GAGGGAGTGTTTCCACCTTTCTTAGCCGGGTGGGGGGTTGCAGGTCCACCTTTCTTCTTC
TCCTCTGTTTTCTTGGGAGTAGCTTCTGCTTTGGCCTTCTTCGCAGACACAGGTGTCTTG
GGTCCAGGTGCGACATCATGTGCTCTCTTTCTTCTTGTTTCAGCCTTAGGAGTCTCCTCT
TCTTCCTCAGAATCATCTTCATCCATTCCTTCAGAA

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2F158JQ 731 0 0
C
TGTTGAAATTTAGAACGGGCAACTAAGAAAGAATACTGAAAGATACTGGTAACTGGTAAA
TACAAATCCGAGAGGTTTCAAAAAGACTACAGCCAAAGTTCAAAAAGAAAAGTCTCCAAC
TAAATCCAAAACAGCGGAAGTTGTTACTCTTAGGAATCCACTTCACTTGGCGGTAGCAGA
GTGCTTGGCCTTGGTGTGAGACTCAAGTGCGTTCGATGAGTTGAATGTCTTCTTGCATGA
ACCACATGAGACTTGACTTGCAGACTTTGGGCTCTGCGTTGCAGTTGCGGGAGTGTTTCC
ACCTTTCTTAGCCGGGTGGGGGGTTGCAGGTCCACCTTTCTTCTTCTCCTCTGTTTTCTT
GGGAGTAGCTTCTGCTTTGGCCTTCTTCGCAGACACAGGTGTCTTGGGTCCAGGTGCGAC
TTCATGTGCTCTCTTTCTTCTTGTTTCAGCCTTAGGAGTCTCCTCTTCTTCCTCAGAATC
ATCTTCATCCATTCCTTCAGAATCAGAATCATCTGCTTCAGGCTTTGGTTTTGTTACGCC
CTTTGCAGCATTCCCATTAGCTGCAACAGTGGCAGCAACTTCCTCTTCCTCTTCTTCCTC
TTCTTCCTCTGAATCAGAAAAGTCTTCTCCTCCCTCATCATCTTTGTTGTTGGGACATTG
GAATCCAACAAAGTGGACACTTCCTTTTCCCCAGTTGTGAGAAAGCTCAAACTCCTGATC
GAATAACATA

QA 2 731 2 731
DS 

RD RR2CV63JQ 770 0 0
AG
GAAAGAATACTGAAAGATACTGGTAACTGGTAAATACAAATCCGAGAGGTTTCAAAAAGA
CTACAGCCAAAGTTCAAAAAGAAAAGTCTCCAACTAAATCCAAAACAGCGGAAGTTGTTA
CTCTTAGGAATCCACTTCACTTGGCGGTAGCAGAGTGCTTGGCCTTGGTGTGAGACTCAA
GTGCGTTCGATGAGTTGAATGTCTTCTTGCATGAACCACATGAGACTTGACTTGCAGACT
TTGGGCTCTGCGTTGCAGTTGCGGGAGTGTTTCCACCTTTCTTAGCCGGGTGGGGGGTTG
AAGGTCCACCTTTCTTCTTCTCCTCTGTTTTCTTGGGAGTAGCTTCTGCTTTGGCCTTCT
TCGCAGACACAGGTGTCTTGGGTCCAGGTGCGACTTCATGTGCTCTCTTTCTTCTTGTTT
CAGCCTTAGGAGTCTCCTCTTCTTCCTCAGAATCATCTTCATCCATTCCTTCAGAATCAG
AATCATCTGCTTCAGGCTTTGGTTTTGTTACGCCCTTTGCAGCATTCCCATTAGCTGCAA
CAGTGGCAGCAACTTCCTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCTTCCTCTGAATCAGAAAAGTCTT
CTCCTCCCTCATCATCTTTGTTGTTGGGACATTGGAATCCAACAAAGTGGACACTTCCTT
TTCCCCAGTTGTGAGAAAGCTCAAACTCCTGATCGAATAACATATCAAAGCAAGTCTGAG
GAATGCTCTCAGACAAAAGAGTTCC*ATGACGAACTTCTTGTCCCCA
C

QA 3 769 3 769
DS 

RD RR2B286JQ 767 0 0
G
CTGAAAGATACTGGTAACTGGTAAATACAAATCCGAGAGATTTCAAAAAGACTACAGCCA
AAGTTCAATAAGAAAAGTCTCCAACTAAATCCAAAACAGCGGAAGTTGTTACTCTTAGGA
ATCCACTTCACTTGGCGGTAGCAGAGTGCTTGGCCTTGGTGTGAGACTCAAGTGCGTTCG
ATGAGTTGAATGTCTTCTTGCATGAACCACATGA**CTTGACTTGCAGACTTTGGGCTCT
GCGTTGCAGTTGCGGGAGTGTTTCCACCTTTCTTAGCCGGGTGGGGGGTTGCAGGTCCAC
CTTTCTTCTTCTCCTCTGTTTTCTTGGGAGTAGCTTCTGCTTTGGCCTTCTTCGCAGACA
CAGGTGTCTTGGGTCCAGGTGCGACTTCATGTGCTCTCTTTCTTCTTGTTTCAGCCTTAG
GAGTCTCCTCTTCTTCCTCAGAATCATCTTCATCCATTCCTTCAGAATCAGAATCATCTG
CTTCAGGCTTTGGTTTTGTTACGCCCTTTGCAGCATTCCCATTAGCTGCAACAGTGGCAG
CAACTTCCTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCTTCCTCTGAATCAGAAAAGTCTTCTCCTCCCT
CATCATCTTTGTTGTTGGGACATTGGAATCCAACAAAGTGGACACTTCCTTTTCCCCAGT
TGTGAGAAAGCTCAAACTCCTGATCGAATAACATATCAAAGCAAGTCTGAGGAATGCTCT
CAGACAAAAGAGTTCCCATGACGAACTTCTTGTCCCCAACCTTCAC

QA 2 767 2 767
DS 

RD RR2GU29TF 550 0 0
TTCGCAGACACAGGTGTCTTGGGTCCAGGTGCGACATCATGTGCTCTCTTTCTTCTTGTT
TCAGCCTTAGGAGTCTCCTCTTCTTCCTCAGAATCATCTTCATCCATTCCTTCAGAATCA
GAATCATCTGCTTCAGGCTTTGGTTTTGTTACGCCCTTTGCAGCATTCCCATTAGCTGCA
ACAGTGGCAGCAACTTCCTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCTTCCTCTGAATCAGAAAAGTCT
TCTCCTCCCTCATCATCTTTGTTGTTGGGACATTGGAATCCAACAAAGTGGACACTTCCT
TTTCCCCAGTTGTGAGAAAGCTCAAACTCCTGATCGAATAACATATCAAAGCAAGTCTGA
GGAATGCTCTCAGACAAAAGAGTTCCCATGACGAACTTCTTGTCCCCAACCTTCACATTC
AAAGTCACAGCTTCTCCTTTCTTTCCTTTACAATCTCCAAGCGATGCATGAGAGATGTGG
ACAAGAGTGCCATCTTCGGGCGTCACTTTAAGTGGCTTCCCTGCTTGAACTTCGACTCCC
CAGAACTCC
C

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2B286TF 826 0 0
GTAGCAGAGTGCTTGGCCTTGGTGTGAGACTCAAGTGCGTTCGATGAGTTGAATGTCTTC
TTGCATGAACCACATGA**CTTGACTTGCAGACTTTGGGCTCTGCGTTGCAGTTGCGGGA
GTGTTTCCACCTTTCTTAGCCGGGTGGGGGGTTGCAGGTCCACCTTTCTTCTTCTCCTCT
GTTTTCTTGGGAGTAGCTTCTGCTTTGGCCTTCTTCGCAGACACAGGTGTCTTGGGTCCA
GGTGCGACTTCATGTGCTCTCTTTCTTCTTGTTTCAGCCTTAGGAGTCTCCTCTTCTTCC
TCAGAATCATCTTCATCCATTCCTTCAGAATCAGAATCATCTGCTTCAGGCTTTGGTTTT
GTTACGCCCTTTGCAGCATTCCCATTAGCTGCAACAGTGGCAGCAACTTCCTCTTCCTCT
TCTTCCTCTTCTTCCTCTGAATCAGAAAAGTCTTCTCCTCCCTCATCATCTTTGTTGTTG
GGACATTGGAATCCAACAAAGTGGACACTTCCTTTTCCCCAGTTGTGAGAAAGCTCAAAC
TCCTGATCGAATAACATATCAAAGCAAGTCTGAGGAATGCTCTCAGACAAAAGAGTTCCC
ATGACGAACTTCTTGTCCCCAACCTTCACATTCAAAGTCACAGCTTCTCCTTTCTTTCCT
TTACAATCTCCAAGCGATGCATGAGAGATGTGGACAAGAGTGCCATCTTCGGGCGTCACT
TTAAGTGGCTTCCCTGCTTGAACTTCGACTCCCCAGAACTCCATAGCTGACAATCGAGGA
AGAAAAGGTTGAGTGACTTAGGGTTTATTAGCAGCTGAGGTCCCCT

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2F158TF 612 0 0
TCTTCGCAGACACAGGTGTCTTGGGTCCAGGTGCGACTTCATGTGCTCTCTTTCTTCTTG
TTTCAGCCTTAGGAGTCTCCTCTTCTTCCTCAGAATCATCTTCATCCATTCCTTCAGAAT
CAGAATCATCTGCTTCAGGCTTTGGTTTTGTTACGCCCTTTGCAGCATTCCCATTAGCTG
CAACAGTGGCAGCAACTTCCTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCTTCCTCTGAATCAGAAAAGT
CTTCTCCTCCCTCATCATCTTTGTTGTTGGGACATTGGAATCCAACAAAGTGGACACTTC
CTTTTCCCCAGTTGTGAGAAAGCTCAAACTCCTGATCGAATAACATATCAAAGCAAGTCT
GAGGAATGCTCTCAGACAAAAGAGTTCCCATGACGAACTTCTTGTCCCCAACCTTCACAT
TCAAAGTCACAGCTTCTCCTTTCTTTCCTTTACAATCTCCAAGCGATGCATGAGAGATGT
GGACAAGAGTGCCATCTTCGGGCGTCACTTTAAGTGGCTTCCCTGCTTGAACTTCGACTC
CCCAGAACTCCATAGCTGACAATCGAGGAAGAAAAGGTTGAGTGACTTAGGGTTTATTAG
CAGCT
GAGGTCC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2CV63TF 639 0 0
TCTTGGGAGTAGCTTCTGCTTTGGC*TTCTTCGCAGACACAGGTGTCTTGGGTCCAGGTG
CGACTTCATGTGCTCTCTTTCTTCTTGTTTCAGCCTTAGGAGTCTCCTCTTCTTCCTCAG
AATCATCTTCATCCATTCCTTCAGAATCAGAATCATCTGCTTCAGGCTTTGGTTTTGTTA
CGCCCTTTGCAGCATTCCCATTAGCTGCAACAGTGGCAGCAACTTCCTCTTCCTCTTCTT
CCTCTTCTTCCTCTGAATCAGAAAAGTCTTCTCCTCCCTCATCATCTTTGTTGTTGGGAC
ATTGGAATCCAACAAAGTGGACACTTCCTTTTCCCCAGTTGTGAGAAAGCTCAAACTCCT
GATCGAATAACATATCAAAGCAAGTCTGAGGAATGCTCTCAGACAAAAGAGTTCCCATGA
CGAACTTCTTGTCCCCAACCTTCACATTCAAAGTCACAGCTTCTCCTTTCTTTCCTTTAC
AATCTCCAAGCGATGCATGAGAGATGTGGACAAGAGTGCCATCTTCGGGCGTCACTTTAA
GTGGCTTCCCTGCTTGAACTTCGACTCCCCAGAACTCCATAGCTGACAATCGAGGAAGAA
AAGGTTGAGTGACTTAGGGTTTATTAGCAGCT
GAGGTCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 3 10

CO CL462Contig1 619 5 8 U
GGATTCATCAAATCATCTCTCTCTCTCTTCTCTTTCTCTCCAATCTCGCAAAACCAGA**
**TCTTATAAACATGGAGTCAACGGGAAATCATGGAGGCATCCAGCAACTGCTTGCTGCT
GAACAGGAAGCTCAGCAGATTGTCAATGCTGCTAGGACCGCGAAAATGGCGAGACTGAAG
CAAGCCAAGGAAGAAGCTGAAACAGAGATTGCTGAGCACAAAACCAGTACTGAGCATGGT
TTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACCAGTGGAGATTCAGGTGCAAACGTGAAGAGGCTTGAG
CAAGAGACCGATGAGAAGATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAGAGAT
GTTGTGGACATGCTTCTCAAACATGTCACCACTGTCAACAACTGATATACACCATCGTCT
TTAAGATGGTCTGAATTGTTTGTCATTTTGAGTGGATTTATTCATTCGTTTCTTTTACTG
TTTGGTGGATTCCGGGTTTCATTCAACTTGTTGCTATTTGATTTTCAGTTTCAGCCTTGA
GTTGTTGTTGTATTCATCTCTCCAGAAGACTTTGACTTTTGTGTTTGTGTTATTCAGAAT
AAAGGGAACCCCATTGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 10 

AF RR2C402TF U 263
AF RR2BR25TF U 275
AF RR2BR25JQ C 1
AF RR2C402JQ C 1
AF RR2EH04TF U 1
BS 1 17 RR2BR25JQ
BS 18 145 RR2EH04TF
BS 146 146 RR2BR25JQ
BS 147 262 RR2EH04TF
BS 263 567 RR2C402TF
BS 568 592 RR2BR25TF
BS 593 617 RR2EH04TF
BS 618 619 RR2BR25JQ

RD RR2C402TF 305 0 0
CCAGTGGAGATTCAGGTGCAAACGTGAAGAGGCTTGAGCAAGAGACCGATGAGAAGATCG
AGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAGAGATGTTGTGGACATGCTTCTCAAAC
ATGTCACCACTGTCAACAACTGATATACACCATCGTCTTTAAGATGGTCTGAATTGTTTG
TCATTTTGAGTGGATTTATTCATTCGTTTCTTTTACTGTTTGGTGGATTCCGGGTTTCAT
TCAACTTGTTGCTATTTGATTTTCAGTTTCAGCCTTGAGTTGTTGTTGTATTCATCTCTC
CAGAA

QA 1 305 1 305
DS 

RD RR2BR25TF 318 0 0
CAGGTGCAAACGTGAAGAGGCTTGAGCAAGAGACCGATGAGAAGATCGAGCAGTTGAAGA
ACGAAGCTTCCAGGATTTCCAGAGATGTTGTGGACATGCTTCTCAAACATGTCACCACTG
TCAACAACTGATATACACCATCGTCTTTAAGATGGTCTGAATTGTTTGTCATTTTGAGTG
GATTTATTCATTCGTTTCTTTTACTGTTTGGTGGATTCCGGGTTTCATTCAACTTGTTGC
TATTTGATTTTCAGTTTCAGCCTTGAGTTGTTGTTGTATTCATCTCTCCAGAAGACTTTG
ACTTTTGTGTTTGTGTTA

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR2BR25JQ 619 0 0
GGATTCATCAAATCATCTCTCTCTCTCTTCTCTTTCTCTCCAATCTCGCAAAACCAGACA
GATCTTATAAACATGGAGTCAACGGGAAATCATGGAGGCATCCAGCAACTGCTTGCTGCT
TAACAGGAAGCTCAGCAGATTGTCAATGCTGCTAGGACCGCGAAAATGGCGAGACTGAAG
CAAGCCAAGGAAGAAGCTGAAACAGAGATTGCTGAGCACAAAACCAGTACTGAGCATGGT
TTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACCAGTGGAGATTCAGGTGCAAACGTGAAGAGGCTTGAG
CAAGAGACCGATGAGAAGATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAGAGAT
GTTGTGGACATGCTTTTCAAACATGTCACCACTGTCAACAACTGATATACACCATCGTCT
TTAAGATGGTTTGAATTGTTTGTCATTTTGAGTGGATTTATTCATTCGTTTCTTTTACTG
TTTGGTGGATTCCGGGTTTCATTCAACTTGTTGCTATTTGATTTTCAGTTTCAGCCTTGA
GTTGTTGTTGTATTCATCTCTCCAGAAGACTTTGACTTTTGTGTTTGTGTTATTCAGAAT
AAAGGGAACCCCATTGGAT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2C402JQ 618 0 0
GGATTCATCAAATCATC
TCTCTCTCTCTTCTCTTTCTCTCCAATCTCGCAAAACCAGA****TCTTATAAACATGGA
GTCAACGGGAAATCATGGAGGCATCCAGCAACTGCTTGCTGCTGAACAGGAAGCTCAGCA
GATTGTCAATGCTGCTAGGACCGCGAAAATGGCGAGACTGAAGCAAGCCAAGGAAGAAGC
TGAAACAGAGATTGCTGAGCACAAAACCAGTACTGAGCATGGTTTCCAGAGGAAACTCGA
AGAGACCAGTGGAGATTCAGGTGCAAACGTGAAGAGGCTTGAGCAAGAGACCGATGAGAA
GATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAGAGATGTTGTGGACATGCTTCT
CAAACATGTCACCACTGTCAACAACTGATATACACCATCGTCTTTAAGATGGTCTGAATT
GTTTGTCATTTTGAGTGGATTTATTCATTCGTTTCTTTTACTGTTTGGTGGATTCCGGGT
TTCATTCAACTTGTTGCTATTTGATTTTCAGTTTCAGCCTTGAGTTGTTGTTGTATTCAT
CTCTCCAGAAGACTTTGACTTTTGTGTCTGTGTTATTCAGAATAAAGGGAACCCCATTGG
A

QA 18 618 18 618
DS 

RD RR2EH04TF 617 0 0
GGATTCATCAAATCATC
TCTCTCTCTCTTCTCTTTCTCTCCAATCTCGCAAAACCAGA****TCTTATAAACATGGA
GTCAACGGGAAATCATGGAGGCATCCAGCAACTGCTTGCTGCTGAACAGGAAGCTCAGCA
GATTGTCAGTGCTGCTAGGACCGCGAAAATGGCGAGACTGAAGCAAGCCAAGGAAGAAGC
TGAAACAGAGATTGCTGAGCACAAAACCAGTACTGAGCATGGTTTCCAGAGGAAACTCGA
AGAGACCAGTGGAGATTCAGGTGCAAACGTGAAGAGGCTTGAGCAAGAGACCTATGAGAA
GATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAGAGATGTTGTGGACATGCTTCT
CAAACATGTCACCACTGTCAACAACTGATATACACCATCGTCTTTAAGATGGTCTGAATT
GTTTGTCATTTTGAGTGGATTTATTCATTCGTTTCTTTTACTGTTTGGTGGATTCCGGGT
TTCATTCAACTTGTTGCTATTTGATTTTCAGTTTCAGCCTTGAGTTGTTGTTGTATTCAT
CTCTCCAGAAGACTTTGACTTTTGTGTTTGTGTTATTCAGAATAAAGGGAACCCCATTGG

QA 18 617 18 617
DS 



CO CL462Contig2 635 2 3 U
GGGAGTCATTCATCAAATCATCTCTCTCTCTTCTCTTTCTCTTCTCTTTCTCTCCAATCT
CGCAAAACCAGAAGAAAGATCTTAAAACATGGAGTCAACGGGTAATCATGGAGGGATCCA
GCAACTGCTTGCTGCTGAACAGGAAGCTCAGCAAATTGTTAATGCTGCTAGGACCGCGAA
AATGGCGAGACTGAAGCAAGCCAAGGAAGAAGCTGAAACAGAGATTGCTGAGCACAAAAC
CAGTACTGAGCATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACCAGTGGAGATTCAGGTGCAAA
CGTGAAGAGGCTTGAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTC
CAGGATTTCCAGAGATTTTGTGGACATGCTTCTCAAACATGTCACCACTGTCAACAACTG
ATATATACACCATCGTCTTTAAGATGGTGTGAATTGTTTGTTATTTTGAGTGGATTTATT
CATTCGTTTCTTTTACTGTTTGGTGGATTCCGGGTTTCATTCAACTTGTTGCTATTTGAT
TTTCAGTTTCAGCCTTGAGTTGTTGTTGTATTCATCTCTCCAGAAGACTTTGACTTTTGT
GTTTGTAATATTCAGAATAAAGGGAACCCCATTGG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E058JQ C 1
AF RR2E058TF U 1
BS 1 2 RR2E058JQ
BS 3 619 RR2E058TF
BS 620 635 RR2E058JQ

RD RR2E058JQ 635 0 0
GGGAGTCATTCATCAAATCATCTCTCTCTCTTCTCTTTCTCTTCTCTTTCTCTCCAATCT
CGCAAAACCAGAAGAAAGATCTTAAAACATGGAGTCAACGGGTAATCATGGAGGGATCCA
GCAACTGCTTGCTGCTGAACAGGAAGCTCAGCAAATTGTTAATGCTGCTAGGACCGCGAA
AATGGCGAGACTGAAGCAAGCCAAGGAAGAAGCTGAAACAGAGATTGCTGAGCACAAAAC
CAGTACTGAGCATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACCAGTGGAGATTCAGGTGCAAA
CGTGAAGAGGCTTGAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTC
CAGGATTTCCAGAGATTTTGTGGACATGCTTCTCAAACATGTCACCACTGTCAACAACTG
ATATATACACCATCGTCTTTAAGATGGTGTGAATTGTTTGTTATTTTGAGTGGATTTATT
CATTCGTTTCTTTTACTGTTTGGTGGATTCCGGGTTTCATTCAACTTGTTGCTATTTGAT
TTTCAGTTTCAGCCTTGAGTTGTTGTTGTATTCATCTCTCCAGAAGACTTTGACTTTTGT
GTTTGTAATATTCAGAATAAAGGGAACCCCATTGG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2E058TF 619 0 0
GG
GAGTCATTCATCAAATCATCTCTCTCTCTTCTCTTTCTCTTCTCTTTCTCTCCAATCTCG
CAAAACCAGAAGAAAGATCTTAAAACATGGAGTCAACGGGTAATCATGGAGGGATCCAGC
AACTGCTTGCTGCTGAACAGGAAGCTCAGCAAATTGTTAATGCTGCTAGGACCGCGAAAA
TGGCGAGACTGAAGCAAGCCAAGGAAGAAGCTGAAACAGAGATTGCTGAGCACAAAACCA
GTACTGAGCATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACCAGTGGAGATTCAGGTGCAAACG
TGAAGAGGCTTGAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCCA
GGATTTCCAGAGATTTTGTGGACATGCTTCTCAAACATGTCACCACTGTCAACAACTGAT
ATATACACCATCGTCTTTAAGATGGTGTGAATTGTTTGTTATTTTGAGTGGATTTATTCA
TTCGTTTCTTTTACTGTTTGGTGGATTCCGGGTTTCATTCAACTTGTTGCTATTTGATTT
TCAGTTTCAGCCTTGAGTTGTTGTTGTATTCATCTCTCCAGAAGACTTTGACTTTTGTGT
TTGTAATATTCAGAATA

QA 3 619 3 619
DS 



CO CL462Contig3 701 3 3 U
GGGAATTCAACACGATCTAAAACATTTGAGTCATTCATCAAATCATCTCTCTCTCTTCTC
TTTCTCTTCTCTTTCTCTCCAATCTCGCAAAACCAGAAGACAGATCTTAAAACATGGAGT
CAACGGGTAATCATGGAGGGATCCAGCAACTGCTTGCTGCTGAACAGGAAGCTCAGCAAA
TTGTTAATGCTGCTAGGACCGCAAAAATGGCGAGACTGAAGCAAGCCAAGGAAGAAGCTG
AAACGGAGATTGCTGAGCACAAAACCAGTACCGAGCATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAG
AGACCAGTGGAGATTCAGGTGCAAACGTGAAGAGGCTTGAGCAAGAGACTGATGAGAAGA
TCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAGAGATGTTGTGGACATGCTTCTCA
AACATGTCACCACTGTCAACAACTGATGATATATATACACCATCATCGTCTTTAAGATGG
TGTGAATTTTTATTTTGAGTGGATTTATTCATTCGCTTCTTTTACTTGTTTGGTGGATTC
CGGGTTTCATTCAACTGTTGCTATTGATTTTCAGTTCCAGCCTTGAGTTGTTGTATTCAT
CTCTCGAGAAGACTTGACTTTTGTGTTTGTAATATTCAGAATAAAGGGAACCCCATTGGA
TATTTCGTTTTTATCAAGAATGTTGTAAGAATGAATGTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GP67TF U 26
AF RR2E065TF U 1
AF RR2E065JQ C 11
BS 1 671 RR2E065TF
BS 672 672 RR2E065JQ
BS 673 701 RR2E065TF

RD RR2GP67TF 633 0 0
GG
GAGTCATTCATCAAATCATCTCTCTCTCTTCTCTTTCTCTTCTCTTTCTCTCCAATCTCG
CAAAACTAGAAGACAGATCTTAAAACATGGAGTCAACGGGTAATCATGGAGGGATCCAGC
AACTGCTTGCTGCTGAACAGGAAGCTCAGCAAATTGTTAATGCTGCTAGGACCGCAAAAA
TGGCGAGACTGAAGCAAGCCAAGGAAGAAGCTGAAACAGAGATTGCTGAGCACAAAACCA
GTACCGAGCATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACCAGTGGAGATTCAGGTGCAAACG
TGAAGAGGCTTGAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCCA
GGATTTCCAGAGATGTTGTGGACATGCTTCTCAAACATGTCACCACTGTCAACAACTGAT
GATATATATACACCATCATCGTCTTTAAGATGGTGTGAATTTTTATTTTGAGTGGATTTA
TTCATTCGTTTCTTTTACTTGTTTGGTGGATTCCGGGTTTCATTCAACTGTTGCTATTGA
TTTTCAGTTCCAGCCTTGAATTGTTGTATTCATCTCTCGAGAAGACTCGACTTTTGTGTT
TGTAATATTCAGAATAAAGGGAACCCCATTG

QA 3 633 3 633
DS 

RD RR2E065TF 701 0 0
GGGAATTCAACACGATCTAAAACATTTGAGTCATTCATCAAATCATCTCTCTCTCTTCTC
TTTCTCTTCTCTTTCTCTCCAATCTCGCAAAACCAGAAGACAGATCTTAAAACATGGAGT
CAACGGGTAATCATGGAGGGATCCAGCAACTGCTTGCTGCTGAACAGGAAGCTCAGCAAA
TTGTTAATGCTGCTAGGACCGCAAAAATGGCGAGACTGAAGCAAGCCAAGGAAGAAGCTG
AAACGGAGATTGCTGAGCACAAAACCAGTACCGAGCATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAG
AGACCAGTGGAGATTCAGGTGCAAACGTGAAGAGGCTTGAGCAAGAGACTGATGAGAAGA
TCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAGAGATGTTGTGGACATGCTTCTCA
AACATGTCACCACTGTCAACAACTGATGATATATATACACCATCATCGTCTTTAAGATGG
TGTGAATTTTTATTTTGAGTGGATTTATTCATTCGCTTCTTTTACTTGTTTGGTGGATTC
CGGGTTTCATTCAACTGTTGCTATTGATTTTCAGTTCCAGCCTTGAGTTGTTGTATTCAT
CTCTCGAGAAGACTTGACTTTTGTGTTTGTAATATTCAGAATAAAGGGAACCCCATTGGA
TATTTCGTTTT*ATCAAGAATGTTGTAAGAATGAATGTCAG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2E065JQ 691 0 0
CACGATCTAAAACATTTGAGTCATTCATCAAATCATCTCTCTCTCTTCTCTTTCTCTTCT
CTTTCTCTCCAATCTCGCAAAACCAGAAGACAGATCTTAAAACATGGAGTCAACGGGTAA
TCATGGAGGGATCCAGCAACTGCTTGCTGCTGAACAGGAAGCTCAGCAAATTGTTAATGC
TGCTAGGACCGCAAAAATGGCGAGACTGAAGCAAGCCAAGGAAGAAGCTGAAACGGAGAT
TGCTGAGCACAAAACCAGTACCGAGCATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACCAGTGG
AGATTCAGGTGCAAACGTGAAGAGGCTTGAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGTT
GAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAGAGATGTTGTGGACATGCTTCTCAAACATGTCAC
CACTGTCAACAACTGATGATATATATACACCATCATCGTCTTTAAGATGGTGTGAATTTT
TATTTTGAGTGGATTTATTCATTCGCTTCTTTTACTTGTTTGGTGGATTCCGGGTTTCAT
TCAACTGTTGCTATTGATTTTCAGTTCCAGCCTTGAGTTGTTGTATTCATCTCTCGAGAA
GACTTGACTTTTGTGTTTGTAATATTCAGAATAAAGGGAACCCCATTGGATATTTCGTTT
TTATCAAGAATGTTGTAAGAATGAATGTCAG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 11

CO CL463Contig1 802 11 30 U
GGAGAGAGAAAAAACAGAGTCAGTTCTTAAACAAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCT
TCCTCTTTTCTCTCCTTTTTGCTCTATCCAATGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGTAGCCA
ACCTGAAACGTGCTGAAACCCCTGCGGGTTACCCATGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAG
CCAAGGACTTTGTCTTTTCCGGTTTAGGCACTCCTGGGAACACTACAAACATCATCAGCG
CTGCCGTCACGCCCGGTTTCGCCGCTCAGTTCCCCGGTCTGAACGGTCTAGGCCTCTCTA
CAGCTAGACTTGACCTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCT
CTGAGGTTCTTTTTGTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAACG
CTGTCTACGTGCAGACGCTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTC
ATTTCCAGATCAATGCGGGGAAATCAGCTGCTGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGTGCTA
GTCCAGGTCTTCAGATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCG
TCTCTGGTACTACTTTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTAGGAG
GAACTGGCTAAAAGATACTTCTGCTTTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTTGTC
TTCTATGTTTTGTAGTCCTTGTAATACCTGTCTACATT**TACATTGTATGTGAGTTTCT
AAATTAAGATTCTGAGTTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 35 35 35 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 0 55 55 0 55 55 55 55 55 0 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 
65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 
65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 
60 60 45 60 30 60 60 60 60 60 60 60 45 30 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 0 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 30 0 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW19TF U 1
AF RR2GY89TF U 13
AF RR2C604JQ C 15
AF RR2DM33TF U 1
AF RR2FU81TF U 4
AF RR2G752TF U 4
AF RR2F235TF U 2
AF RR2C604TF U -4
AF RR2F235JQ C 79
AF RR2G752JQ C 146
AF RR2GY89JQ C 146
BS 1 89 RR2BW19TF
BS 90 90 RR2FU81TF
BS 91 106 RR2BW19TF
BS 107 107 RR2C604TF
BS 108 115 RR2BW19TF
BS 116 116 RR2C604TF
BS 117 639 RR2BW19TF
BS 640 648 RR2DM33TF
BS 649 649 RR2FU81TF
BS 650 662 RR2DM33TF
BS 663 663 RR2FU81TF
BS 664 672 RR2DM33TF
BS 673 673 RR2FU81TF
BS 674 716 RR2DM33TF
BS 717 717 RR2FU81TF
BS 718 730 RR2DM33TF
BS 731 731 RR2FU81TF
BS 732 739 RR2DM33TF
BS 740 740 RR2FU81TF
BS 741 743 RR2DM33TF
BS 744 744 RR2FU81TF
BS 745 756 RR2DM33TF
BS 757 757 RR2FU81TF
BS 758 758 RR2F235JQ
BS 759 762 RR2FU81TF
BS 763 777 RR2G752TF
BS 778 784 RR2C604TF
BS 785 785 RR2F235JQ
BS 786 795 RR2C604TF
BS 796 802 RR2F235JQ

RD RR2BW19TF 639 0 0
GGAGAGAGAAAAAACAGAGTCAGTTCTTAAACAAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCT
TCCTCTTTTCTCTCCTTTTTGCTCTATCCGATGCCTCTGTTCAAGATTTCTGTGTGGCCA
ACCTGAAACGTGCTGAAACCCCTGCGGGTTACCCATGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAG
CCAAGGACTTTGTCTTTTCCGGTTTAGGCACTCCTGGGAACACTACAAACATCATCAGCG
CTGCCGTCACGCCCGGTTTCGCCGCTCAGTTCCCCGGTCTGAACGGTCTAGGCCTCTCTA
CAGCTAGACTTGACCTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCT
CTGAGGTTCTTTTTGTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAACG
CTGTCTACGTGCAGACGCTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTC
ATTTCCAGATCAATGCGGGGAAATCAGCTGCTGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGTGCTA
GTCCAGGTCTTCAGATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCG
TCTCTGGTACTACTTTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2GY89TF 691 0 0
AACAGAGTCAGTTCTTAAACAAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTTTCTC
TCCTTTTTGCTCTATCCAATGCCTCTGTTCAAGATTTCTGTGTGGCCAACCTGAAACGTG
CTGAAACCCCTGCGGGTTACCCATGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACTTTG
TCTTTTCCGGTTTAGGCACTCCTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCCGTCACGC
CCGGTTTCGCCGCTCAGTTCCCCGGTCTGAACGGTCTAGGCCTCTCTACAGCTAGACTTG
ACCTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTTT
TTGTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAACGCTGTCTACGTGC
AGACGCTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTCATTTCCAGATCA
ATGCGGGGAAATCAGCTGCTGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGTGCTAGTCCAGGTCTTC
AGATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTACTA
CTTTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTAGGAGGAACTGGCTAAA
AGATACTTCTGCTTTCATTGACACTTTTCTC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2C604JQ 703 0 0
CAGAGTCAGTTCTTAAACCAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTATCTCTC
CTTTTTGCTCTATCCAATGCCTCTGTTCAAGACTTTTGTGTAGCCAACCTGAAACGTGCT
GAAACCCCTGCGGGTTACCCATGCGTTCGCCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACTTTGTC
TTTTCCGGTTTAGGCACTCCTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCGGTCACGCCC
GGTTTCGCCGCTCAGTTCCCGGGTCTGAACGGTCTAGGTCTCTCTACAGCTAGACTTGAC
CTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTT
GTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAATGCTGTCTACGTGCAG
ACACTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGTCTGCTTCACTTCCAGATCAAT
GCGGGGAAATCAGCTGCTGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTCTTCAG
ATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTACTACT
TTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTCGGAGGAACTGGCTAAAAG
ATACTTGTGCTTTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2DM33TF 756 0 0
GGAGA
GAGAAAAAACAGAGTCAGTTCTTAAACAAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTC
TTTTCTCTCCTTTTTGCTCTATCCGATGCCTCTGTTCAAGATTTCTGTGTGGCCAACCTG
AAACGTGCTGAAACCCCTGCGGGTTACCCATGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAGCCAAG
GACTTTGTCTTTTCCGGTTTAGGCACTCCTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCC
GTCACGCCCGGTTTCGCCGCTCAGTTCCCCGGTCTGAACGGTCTAGGCCTCTCTACAGCT
AGACTTGACCTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAG
GTTCTTTTTGTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAACGCTGTC
TACGTGCAGACGCTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTCATTTC
CAGATCAATGCGGGGAAATCAGCTGCTGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGTGCTAGTCCA
GGTCTTCAGATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCT
GGTACTACTTTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGG*TGTTCTAGGAGGA*CT
GGCTAAA*GATACTTCTGCTTTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCT*GTCTTCTA
TGTTT*GTAGTCCT*GTA*TACCTGTCTACA

QA 6 756 6 756
DS 

RD RR2FU81TF 760 0 0
GG
GAGAAAAAACAGAGTCAGTTCTTAAACAAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTC
TTTTCTCTCCTTTTTGCTCTATCCAATGCCTCTGTTCAAGATTTCTGTGTGGCCAACCTG
AAACGTGCTGAAACCCCTGCGGGTTACCCATGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAGCCAAG
GACTTTGTCTTTTCCGGTTTAGGCACTCCTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCC
GTCACGCCCGGTTTCGCCGCTCAGTTCCCCGGTCTGAACGGTCTAGGCCTCTCTACAGCT
AGACTTGACCTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAG
GTTCTTTTTGTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAACGCTGTC
TACGTGCAGACGCTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTCATTTC
CAGATCAATGCGGGGAAATCAGCTGCTGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGTGCTAGTCCA
GGTCTTCAGATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCT
GGTACTACTTTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTAGGAGGAACT
GGCTAAAAGATACTTCTGCTTTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTA
TGTTTTGTAGTCCTTGTAATACCTGTCTACAT***TA
T

QA 3 759 3 759
DS 

RD RR2G752TF 788 0 0
GG
GAGAAAAAACAGAGTCAGTTCTTAAACAAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTC
TTTTCTCTCCTTTTTGCTCTATCCAATGCCTCTGTTCAAGATTTCTGTGTGGCCAACCTG
AAACGTGCTGAAACCCCTGCGGGTTACCCATGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAGCCAAG
GACTTTGTCTTTTCCGGTTTAGGCACTCCTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCC
GTCACGCCCGGTTTCGCCGCTCAGTTCCCCGGTCTGAACGGTCTAGGCCTCTCTACAGCT
AGACTTGACCTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACGCTCACCCTGGTGCCTCTGAG
GTTCTTTTTGTTCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAACGCTGTC
TACGTGCAGACGCTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTCATTTC
CAGATCAATGCGGGGAAATCAGCTGCTGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGTGCTAGTCCA
GGTCTTCAGATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCT
GGTACTACTTTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTAGGAGGAACT
GGCTAAAA*ATACTTCTGCTTTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTA
TGTTTTGTAGTCCTTGTA*TAC*TGTCTACATA**TACATTGTATGTGAGTT
CTAATAGATCTGAG

QA 3 774 3 774
DS 

RD RR2F235TF 761 0 0
GGAGAAAG
AAAAACAGAGTCAGTTCTTAAACCAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTAT
CTCTCCTTTTTGCTCTATCCAATGCCTCTGTTCAAGACTTTTGTGTAGCCAACCTGAAAC
GTGCTGAAACCCCTGCGGGTTACCCATGCATTCGCCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACT
TTGTCTTTTCCGGTTTAGGCACTCCTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCGGTCA
CGCCCGGTTTCGCCGCTCAGTTCCCGGGTCTGAACGGTCTAGGTCTCTCTACAGCTAGAC
TTGACCTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTC
TTTTTGTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAATGCTGTCTACG
TGCAGACACTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGTCTGCTTCACTTCCAGA
TCAATGCGGGGAAATCAGCTGCTGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTC
TTCAGATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTA
CTACTTTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTCGGAGGAACCGGCT
AAAAGATACTTGTGCTTTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTATGTT
TTGTAGTCCTTGTAGTACCTGTCTACAT***TA

QA 9 761 9 761
DS 

RD RR2C604TF 800 0 0
GGGAATAGAGAAAG
AAAAACAGAGTCAGTTCTTAAACCAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTAT
CTCTCCTTTTTGCTCTATCCAATGCCTCTGTTCAAGACTTTTGTGTAGCCAACCTGAAAC
GTGCTGAAACCCCTGCGGGTTACCCATGCGTTCGCCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACT
TTGTCTTTTCCGGTTTAGGCACTCCTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCGGTCA
CGCCCGGTTTCGCCGCTCAGTTCCCGGGTCTGAACGGTCTAGGTCTCTCTACAGCTAGAC
TTGACCTAGCTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTC
TTTTTGTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAATGCTGTCTACG
TGCAGACACTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGTCTGCTTCACTTCCAGA
TCAATGCGGGGAAATCAGCTGCTGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTC
TTCAGATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTA
CTACTTTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTCGGAGGAACTGGCT
AAAAGATACTTGTGCTTTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGT*CTTGTCTTCTATGTT
TTGTAGTCCTTGTA*TACCTGTCTACATA**TACATTGTATGTGAGTTTCTAAAT*AAGA
TTCTGA

QA 15 800 15 800
DS 

RD RR2F235JQ 724 0 0
TTGCTCTATCCAATGCCTCTGTTCAAGACTTTTGTGTAGCCAACCTGAAACGTGCTGAAA
CCCCTGCGGGTTACCCATGCATTCGCCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACTTTGTCTTTT
CCGGTTTAGGCACTCCTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCGGTCACGCCCGGTT
TCGCCGCTCAGTTCCCGGGTCTGAACGGTCTAGGTCTCTCTACAGCTAGACTTGACCTAG
CTCCTAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTTTGAGGTTCTTTTTGTCC
TTGACGGCTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAATGCTGTCTACGTGCAGACAC
TAAAACCAGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGTCTGCTTCACTTCCAGATCAATGCGG
GGAAATCAGCTGCTGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTCTTCAGATTC
TAGATTTCGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTACTACTTTCC
TTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTCGGAGGAACCGGCTAAAAGATAC
TTGTGCTTTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTATGTTTTGTAGTCC
TTGTAGTACCTGTCTACATTATTACATTGTATGTGAGTTTCTAAATTAAGATTCTGAGTT
GGTC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2G752JQ 657 0 0
GGGTTACCCATGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACTTTGTCTTTTCCGGTTT
AGGCACTCCTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCCGTCACGCCCGGTTTCGCCGC
TCAGTTCCCCGGTCTGAACGGTCTAGGCCTCTCTACAGCTAGACTTGACCTAGCTCCTAA
AGGTGTGATCCCAATGCACGCTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTTGTTCTTGACGG
CTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAACGCTGTCTACGTGCAGACGCTAAAACC
AGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTCATTTCCAGATCAATGCGGGGAAATC
AGCTGCTGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGTGCTAGTCCAGGTCTTCAGATTCTAGATTT
CGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTACTACTTTCCTTGACCC
TGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTAGGAGGAACTGGCTAAAAAATACTTCTGCT
TTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTATGTTTTGTAGTCCTTGTAAT
ACCTGTCTACATTATTACATTGTATGTGAGTTTCTAAATTAAGATTCTGA
GTTGGTC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2GY89JQ 656 0 0
GGGTTACCCATGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACTTTGTCTTTTCCGGTTT
AGGCACTCCTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCCGTCACGCCCGGTTTCGCCGC
TCAGTTCCCCGGTCTGAACGGTCTAGGCCTCTCTACAGCTAGACTTGACCTAGCTCCTAA
AGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTTGTCCTTGACGG
CTACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAACGCTGTCTACGTGCAGACGCTAAAACC
AGGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTCATTTCCAGATCAATGCGGGGAAATC
AGCTGCTGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGTGCTAGTCCAGGTCTTCAGATTCTAGATTT
CGCGCTTTTTGCAAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTACTACTTTCCTTGACCC
TGCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTAGGAGGAACTGGCTAAAAGATACTTCTGCT
TTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTATGTTTTGTAGTCCTTGTAAT
ACCTGTCTACACTATTACATTGTATGTGAGTTTCTAAATTAAGATTCTGA
GTTGGC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 2 11

CO CL464Contig1 969 3 4 U
GGGTTTCCTTCACTCACATCAGCTAGCTACCGAGCAAGAGGAGTCCGTTTTTGAGCTCCC
TGGCCATGGCGACCTTCTCGATGACTCTATCAAATCCGAGGTCGTTCTCAGTTGCTCCAC
GAAGACTTTCTCCAATCAACACCTCTTCCACCACTTTCCGATTGAGCGCCAAGTCCACCT
TCGACTCCACCAAGTTCCCGTCTTTAACCGCCTCATCGCTCCTCCTCCATACATCTTCTT
CCACCAGAAGCAACCGCCGCTGCTTATCTGTTCAATCCAGTGCTGAGCCTTTAGCAGAGC
CGCAATCGAAGATAACGCACAAGGTGTATTTCGACATAAGTGTTGGGAACCCAGTGGGGA
AATTAGCTGGGAGGATTGTTATTGGTTTGTTTGGTGATGATGTTCCCCAAACTGTTGAGA
ACTTCCGTGCTCTTTGTACTGGTGAGAAGGGTTTTGGATACAAGGGTTCAACTTTCCACC
GTGTCATCAGAGATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATGGAACTGGAG
GTAAAAGTGTATATGGCCGGACATTCAAGGATGAGAATTTCAACTTATCCCATGTCGGAC
CAGGAGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGCCCTAATACAAATGGAAGTCAGTTCTTCATCT
GCACTGTTAAGACGTCATGGTTGGACGGGAGGCATGTGGTGTTCGGGCAAGTTATAGAAA
GAATGGATGTGGTGAGGCTTATAGAGGAACAAGAGACTGACAGAGGAGACCGTCCCAGGA
AGAAAGTGATCATTGCAGACTGTGGTCAACTTCCAATGTCTGAAGCTTAAGTAACAACAA
CACATTTAATACCCAAAACCTTTTGACAATGAGATGGAGTTGTGTTTTGCGTTTGCATTT
TTACACGCTTTTTTTTTTTTGTGAAATGGATTCAAGTCTCTTTGTAATAAGATCAATTTC
AGTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C663TF U 63
AF RR2AP05TF U 1
AF RR2AP05JQ C 312
BS 1 137 RR2AP05TF
BS 138 138 RR2C663TF
BS 139 829 RR2AP05TF
BS 830 969 RR2AP05JQ

RD RR2C663TF 654 0 0
GCCATGGCGACCTTCTCGATGACTCTATCAAATCCGAGGTCGTTCTCAGTTGCTCCACGA
AGACTTTCTCCAATCAACACCTCTTCCACCACTTTCCGATTGAGCGCCAAGTCCACCTTC
GACTCCACCAAGTTCCCGTCTTTAACCGCCTCATCGCTCCTCCTCCATACATCTTCTTCC
ACCAGAAGCAACCGCCGCTGCTTATCTGTTCAATCCAGTGCTGAGCCTTTAGCAGAGCCG
TAATCGAAGATAACGCACAAGGTGTATTTCGACATAAGTGTTGGGAACCCAGTGGGGAAA
TTAGCTGGGAGGATTGTTATTGGTTTGTTTGGTGATGATGTTCCCCAAACTGTTGAGAAC
TTCCGTGCTCTTTGTACTGGTGAGAAGGGTTTTGGATACAAGGGTTCAACTTTCCACCGT
GTCATCAGAGATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATGGAACTGGAGGT
AAAAGTGTATATGGCCGGACATTCAAGGATGAGAATTTCAACTTATCCCATGTCGGGCCA
GGAGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGCCCTAATACAAACGGAAGTCAGTTCTTCATCTGC
ACTGTTAAGACGTCATGGTTGGACGGGAGGCATGTGGTGTTCGGGCAAGTTATA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2AP05TF 829 0 0
GGGTTTCCTTCACTCACATCAGCTAGCTACCGAGCAAGAGGAGTCCGTTTTTGAGCTCCC
TGGCCATGGCGACCTTCTCGATGACTCTATCAAATCCGAGGTCGTTCTCAGTTGCTCCAC
GAAGACTTTCTCCAATCGACACCTCTTCCACCACTTTCCGATTGAGCGCCAAGTCCACCT
TCGACTCCACCAAGTTCCCGTCTTTAACCGCCTCATCGCTCCTCCTCCATACATCTTCTT
CCACCAGAAGCAACCGCCGCTGCTTATCTGTTCAATCCAGTGCTGAGCCTTTAGCAGAGC
CGCAATCGAAGATAACGCACAAGGTGTATTTCGACATAAGTGTTGGGAACCCAGTGGGGA
AATTAGCTGGGAGGATTGTTATTGGTTTGTTTGGTGATGATGTTCCCCAAACTGTTGAGA
ACTTCCGTGCTCTTTGTACTGGTGAGAAGGGTTTTGGATACAAGGGTTCAACTTTCCACC
GTGTCATCAGAGATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATGGAACTGGAG
GTAAAAGTGTATATGGCCGGACATTCAAGGATGAGAATTTCAACTTATCCCATGTCGGAC
CAGGAGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGCCCTAATACAAATGGAAGTCAGTTCTTCATCT
GCACTGTTAAGACGTCATGGTTGGACGGGAGGCATGTGGTGTTCGGGCAAGTTATAGAAA
GAATGGATGTGGTGAGGCTTATAGAGGAACAAGAGACTGACAGAGGAGACCGTCCCAGGA
AGAAAGTGATCATTGCAGACTGTGGTCAACTTCCAATGTCTGAAGCTTA

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2AP05JQ 658 0 0
ATAACGCACAAGGTGTATTTCGACATAAGTGTTGGGAACCCAGTGGGGAAATTAGCTGGG
AGGATTGTTATTGGTTTGTTTGGTGATGATGTTCCCCAAACTGTTGAGAACTTCCGTGCT
CTTTGTACTGGTGAGAAGGGTTTTGGATACAAGGGTTCAACTTTCCACCGTGTCATCAGA
GATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATGGAACTGGAGGTAAAAGTGTA
TATGGCCGGACATTCAAGGATGAGAATTTCAACTTATCCCATGTCGGACCAGGAGTTGTG
AGTATGGCAAATGCTGGCCCTAATACAAATGGAAGTCAGTTTTTCATTTGCACTGTTAAG
ACGTCATGGTTGGACGGGAGGCATGTGGTGTTCGGGCAAGTTATAGAAGGAATGGATGTG
GTGAGGCTTATAGAGGAACAAGAGACTGACAGAGGAGACCGTCCCAGGAAGAAAGTGATC
ATTGCAGACTGTGGTCAACTTCCAATGTTTGAAGCTTAAGTAACAACAACACATTTAATA
CCCAAAACCTTTTGACAATGAGATGGAGTTGTGTTTTGCGTTTGCATTTTTACACGCTTT
TTTTTTTTTGTGAAATGGATTCAAGTCTCTTTGTAATAAGATCAATTTCAGTTTTTTC

QA 1 658 1 658
DS 



CO CL464Contig2 970 8 13 U
ACGCACATCAGCTAAGCTACCGAGCAAGAGGAGTCCGTTTTTGAGCTCCCTGGCCATGGC
GACCTTCTCGATGACTCTATCAAATCCGAGGTCGTTCTCAGTTGCTCCACGAAGACTTTC
TCCAACCAACACCTCTTCTACCACTTTCCGATTGAATTTGAACGCCAAGTCTACCTTCGA
CTCCATCAAGTTTCCGTCTTTAACCGCCTCATCGCTCCTCCTCCATACATCTTCATCCAC
CAGAAGAAACCGCCGCTGCTTATCTGTTCAATCCAGTGCTGAGCCTTTAGCAGAGCCGCA
ATCGAAGATAACGCACAAGGTGTATTTCGACATAAGTGTTGGGAACCCAGTGGGGAAATT
AGCTGGGAGGATTGTGATTGGTTTGTTTGGTGATGATGTTCCCCAAACTGTTGAGAACTT
CCGTGCTCTATGCACTGGTGAGAAGGGTTTTGGATACAAGGGTTCAACTTTCCACCGTGT
CATCAGAGATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATGGAACTGGAGGTAA
AAGTGTATATGGCCGGACATTCAAGGATGAGAATTTCAACTTATCCCATGTCGGACCAGG
AGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGTCCTAATACAAATGGAAGTCAGTTCTTCATTTGCAC
TGTTAAGACGTCATGGCTGGACGGGAGGCATGTGGTGTTCGGGCAAGTTATAGAAGGAAT
GGATGTGGTGAGGCTTATAGAGGAACAAGAGACAGACAGAGGCGACCGTCCCAGAAAGAA
AGTGATCATTGCAGACTGTGGTCAACTTCCAATGTCTGAAGCTTAAGTAAAACAACACAT
CTAAAACCCAAAACCTTTTGACAGTGAGATGGAGTTGTATTATGCGGTTGCATTTTTACA
CGCTTTCTTTCTTTTGTGAAATGGATTCAAGTCTCTTTATAATAAGATCAATCTCAGTCT
GTTCTTTGTG


BQ
10 10 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
5 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 15 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH37TF U 3
AF RR2F275TF U 3
AF RR2F934TF U -1
AF RR2AE59TF U 94
AF RR2GH37JQB C 215
AF RR2DA62TF U 519
AF RR2F275JQ C 288
AF RR2F934JQ C 353
BS 1 2 RR2F934TF
BS 3 3 RR2F275TF
BS 4 4 RR2F934TF
BS 5 125 RR2F275TF
BS 126 126 RR2F934TF
BS 127 488 RR2F275TF
BS 489 489 RR2F934TF
BS 490 712 RR2F275TF
BS 713 781 RR2AE59TF
BS 782 782 RR2DA62TF
BS 783 904 RR2AE59TF
BS 905 963 RR2DA62TF
BS 964 970 RR2GH37JQB

RD RR2GH37TF 639 0 0
GG
ACATCAGCTAAGCTACCGAGCAAGAGGAGTCCGTTTTTGAGCTCCCTGGCCATGGCGACC
TTCTCGATGACTCTATCAAATCCGAGGTCGTTCTCAGTTGCTCCACGAAGACTTTCTCCA
ATCAACACCTCTTCTACCACTTTCCGATTGAATTTGAACGCCAAGTCTACCTTCGACTCC
ATCAAGTTTCCGTCTTTAACCGCCTCATCGCTCCTCCTCCATACATCTTCATCCACCAGA
AGAAACCGCCGCTGCTTATCTGTTCAATCCAGTGCTGAGCCTTTAGCAGAGCCGCAATCG
AAGATAACGCACAAGGTGTATTTCGACATAAGTGTTGGGAACCCAGTGGGGAAATTAGCT
GGGAGGATTGTGATTGGTTTGTTTGGTGATGATGTTCCCCAAACTGTTGAGAACTTCCGT
GCTCTATGCACTGGTGAGAAGGGTTTTGGATACAAGGGTTCAACTTTCCACCGTGTCATC
AGAGATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATGGAACTGGAGGTAAAAGT
GTATATGGCCGGACATTCAAGGATGAGAATTTCAACTTATCCCATGTCGGACCAGGAGTT
GTGAGTATGGCAAATGCTGGTCCTAATACAAATGGAA

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR2F275TF 710 0 0
GGACATCAGCTAAGCTACCGAGCAAGAGGAGTCCGTTTTTGAGCTCCCTGGCCATGGCGA
CCTTCTCGATGACTCTATCAAATCCGAGGTCGTTCTCAGTTGCTCCACGAAGACTTTCTC
CAATCAACACCTCTTCTACCACTTTCCGATTGAATTTGAACGCCAAGTCTACCTTCGACT
CCATCAAGTTTCCGTCTTTAACCGCCTCATCGCTCCTCCTCCATACATCTTCATCCACCA
GAAGAAACCGCCGCTGCTTATCTGTTCAATCCAGTGCTGAGCCTTTAGCAGAGCCGCAAT
CGAAGATAACGCACAAGGTGTATTTCGACATAAGTGTTGGGAACCCAGTGGGGAAATTAG
CTGGGAGGATTGTGATTGGTTTGTTTGGTGATGATGTTCCCCAAACTGTTGAGAACTTCC
GTGCTCTATGCACTGGTGAGAAGGGTTTTGGATACAAGGGTTCAACTTTCCACCGTGTCA
TCAGAGGTTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATGGAACTGGAGGTAAAA
GTGTATATGGCCGGACATTCAAGGATGAGAATTTCAACTTATCCCATGTCGGACCAGGAG
TTGTGAGTATGGCAAATGCTGGTCCTAATACAAATGGAAGTCAGTTCTTCATTTGCACTG
TTAAGACGTCATGGCTGGACGGGAGGCATGTGGTGTTCGGGCAAGTTATA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2F934TF 682 0 0
GG
ACTCACATCAGCTA*GCTACCGAGCAAGAGGAGT****TTTTGAGCTCCCTGACCATGGC
GACCTTCTCGATGACTCTGTCAAATCCGAGGTCGTTCTCAGTTGCTCCACGAAGACTTTC
TCCAACCAACACCTCTTCTACCACTTTCCGATTGAATTTGAACGCCAAGTCTACCTTCGA
CTCCATCAAGTTTCCGTCTTTAACCGCCTCATCGCTCCTCCTCCATACATCTTCATCCAC
CAGAGGAAACCAACGCTGCTTATCTGTTCAATCCAGTGCTGAGCCTTTAGCAGAGCCGCA
ATCGAAGATAACACACAAGGTGTATTTCGACATAAGTGTTGGGAACCCAGTGGGGAAATT
AGCTGGGAGGATTGTGATTGGTTTGTTTGGTGATGATGTTCCCCAAACTGTTGAGAACTT
CCGTGCTCTTTGTACTGGTGAGAAGGGTTTTGGATACAAGGGTTCAACTTTCCACCGTGT
TATCAGAGATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATGGAACTGGAGGTAA
AAGTGTATATGGCCGGACATTCAAGGATGAGAATTTCAACTTATCCCATGTCGGACCAGG
AGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGTCCTAATACAAATGGAAGTCCGTTCTTCATTTGCAC
TGTTAAGACGTCATGGCTGG

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR2AE59TF 811 0 0
GTTCTCAGTTGCTCCACGAAGACTTTCTCCAACCAACACCCCTTCTACCACTTTCCGATT
GAATTTGAACGCCAAGTCTACCTTCGACTCCATCAAGTTTCCGTCTTTAACCGCCTCATC
GCTCCTCCTCCATACATCTTCATCCACCAGAAGAAACCAACGCTGCTTATCTGTTCAATC
CAGTGCTGAGCCTTTAGCAGAGCCGCAATCGAAGATAACGCACAAGGTGTATTTCGACAT
AAGTGTTGGGAACCCAGTGGGGAAATTAGCTGGGAGGATTGTGATTGGTTTGTTTGGTGA
TGATGTTCCCCAAACTGTTGAGAACTTCCGTGCTCTTTGTACTGGTGAGAAGGGTTTTGG
ATACAAGGGTTCAACTTTCCACCGTGTTATCAGAGATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTT
TGACAAGGGCAATGGAACTGGAGGTAAAAGTGTATATGGCCGGACATTCAAGGATGAGAA
TTTCAACTTATCCCATGTCGGACCAGGAGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGTCCTAATAC
AAATGGAAGTCAGTTCTTCATTTGCACTGTTAAGACGTCATGGCTGGACGGGAGGCATGT
GGTGTTCGGGCAAGTTATAGAAGGAATGGATGTGGTGAGGCTTATAGAGGAACAAGAGAC
AGACAGAGGCGACCGTCCCAGAAAGAAATTGATCATTGCAGACTGTGGTCAACTTCCAAT
GTCTGAAGCTTAAGTAAAACAACACATCTAAAACCCAAAACCTTTTGACAGTGAGATGGA
GTTGTATTATGCGGTTGCATTTTTACACGCT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2GH37JQB 756 0 0
CTCCTCCTCCATACATCTTCATCCACCAGAAGAAACCGCCGCTGCTTATCTGTTCAATCC
AGTGCTGAGCCTTTAGCAGAGCCGCAATCGAAGATAACGCACAAGGTGTATTTCGACATA
AGTGTTGGGAACCCAGTGGGGAAATTAGCTGGGAGGATTGTGATTGGTTTGTTTGGTGAT
GATGTTCCCCAAACTGTTGAGAACTTCCGTGCTCTATGCACTGGTGAGAAGGGTTTTGGA
TACAAGGGTTCAACTTTCCACCGTGTCATCAGAGATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTT
GACAAGGGCAATGGAACTGGAGGTAAAAGTGTATATGGCCGGACATTCAAGGATGAGAAT
TTCAACTTATCCCATGTCGGACCAGGAGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGTCCTAATACA
AATGGAAGTCAGTTCTTCATTTGCACTGTTAAGACGTCATGGCTGGACGGGAGGCATGTG
GTGTTCGGGCAAGTTATAGAGGGAATGGATGTGGTGAGGCTTATAGAGGAACAAGAGACA
GACAGAGGAGACCGTCCCAGAAAGAAAGTGATCATTGCTGACTGTGGTCAACTTCCAATG
TCTGAAGCTTAAGTAA**CAACACATCTAAAACCCAAAACCTTTTGACAATGAGATGGAG
TTGTATTATGCGGTTGCATTTTTACACGCTTTCTTTCTTTTGTGAAATGGATTCAAGTCT
CTTTATAATAAGATCAATCTCAGCCTGTTCTTTGTG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2DA62TF 445 0 0
G
GGGCAATGGAACTGGAGGTAAAAGTGTATATGGCCGGACATTCAAGGATGAGAATTTCAA
CTTATCCCATGTCGGACCAGGAGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGTCCTAATACAAATGG
AAGTCAGTTCTTCATTTGCACTGTTAAGACGTCATGGCTGGACGGGAGGCATGTGGTGTT
CGGGCAAGTTATAGAAGGAATGGATGTGGTGAGGCTTATAGAGGAACAAGAGACAGACAG
AGGCGACCGTCCCAGAAAGAAAGTGATCATTGCAGACTGTGGTCAACTTCCAATGTCTGA
AGCTTAAGTAAAACAACACATCTAAAACCCAAAACCTTTTGACAGTGAGATGGAGTTGTA
TTATGCGGTTGCATTTTTACACGCTTTCTTTCTTTTGTGAAATGGATTCAAGTCTCTTTA
TAATAAGATCAATCTCAGTCTGTT

QA 2 445 2 445
DS 

RD RR2F275JQ 677 0 0
TAGCAGAGCCGCAATCGAAGATAACGCACAAGGTGTATTTCGACATAAGTGTTGGGAACC
CAGTGGGGAAATTAGCTGGGAGGATTGTGATTGGTTTGTTTGGTGATGATGTTCCCCAAA
CTGTTGAGAACTTCCGTGCTCTATGCACTGGTGAGAAGGGTTTTGGATACAAGGGTTCAA
CTTTCCACCGTGTCATCAGAGGTTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATG
GAACTGGAGGTAAAAGTGTATATGGCCGGACATTCAAGGATGAGAATTTCAACTTATCCC
ATGTCGGACCAGGAGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGTCCTAATACAAATGGAAGTCAGT
TCTTCATTTGCACTGTTAAGACGTCATGGCTGGACGGGAGGCATGTGGTGTTCGGGCAAG
TTATAGAAGGAATGGATGTGGTGAGGCATATAGAGGAACAAGAGACAGACAGAGGAGACC
GTCCCAGAAAGAAAGTGATCATTGCTGACTGTGGTCAACTTCCAATGTCTGAAGCTTAAG
TAA**CAACACATCTAAAACCCAAAACCTTTTGACAATGAGATGGAGTTGTATTATGCGG
TTGCATTTTTACACGCTTTCTTTCTTTTGTGAAATGGATTCAAGTCTCTTTATAATAAGA
TCAATCTCAGTCTGTT
C

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2F934JQ 611 0 0
GGGAAATTAGCTGGGAGGATTGTGATTGGTTTGTTTGGTGATGATGTTCCCCAAACTGTT
GAGAACTTCCGTGCTCTTTGTACTGGTGAGAAGGGTTTTGGATACAAGGGTTCAACTTTC
CACCGTGTTATCAGAGATTTCATGATTCAGGGTGGAGACTTTGACAAGGGCAATGGAACT
GGAGGTAAAAGTGTATATGGCCGGACATTCAAGGATGAGAATTTCAACTTATCCCATGTC
GGACCAGGAGTTGTGAGTATGGCAAATGCTGGTCCTAATACAAATGGAAGTCCGTTTTTC
ATTTGCACTGTTAAGACGTCATGGCTGGACGGGAGGCATGTGGTGTTCGGGCAAGTTATA
GAAGGAATGGATGTGGTGAGGCTTATAGAGGAACAAGAGACAGACAGAGGCGACCGTCCC
AGAAAGAAAGTGATCATTGCAGACTGTGGTCAACTTCCAATGTTTGAAGCTTAAGTAAAA
CAACACATTTAAAACCCAAAACCTTTTGACAGTGAGATGGAGTTGTATTATGCGGTTGCA
TTTTTACACGCTTTCTTTTTTTTGTGAAATGGATTCAAGTCTCTTTATAATAAGATCAAT
TTCAGTCTGTT

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 9

CO CL465Contig1 810 9 14 U
GGACACAAATCTCAAAACACTCTTTCATTCATGAACAGAGCTTATCTCTTCTAGTCTCTC
TTTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAAAAAAAAAGGGACATAACATAATGGAGTGGGAGGA
ACAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTTC
GGCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTT
GAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAAA
CAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGGAGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGG
TGATGCAGAAGAAGTAAAGGAGACAAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTGAGAATGG
TGAAGCTGGAGATGGTGATGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACAGTGATGATGA
TGATGACAATGGGAACAATGATGATGATGAT***GAGGAAGAGGAGGATGAAGATGGTGG
GGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGATGA
GGAGGAAGAGGCGCTACAGCCACCAAAGAAGAGGAAGAAGTAAACAACCCAACCACGCTT
TGATCTTCTAACATTTTAGATTCAAAAAATCAAAAACTTCTTGTGGGTTTCTACCTGAAG
AGAATCTTAAGGCATCACCAGCTTCTTTAGCTTTTCCACTGTAATCTCTGTTGTTCCATG
AATCAAAAAGACCTTTGTTTACTGTGTACC


BQ
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 5 5 5 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF02TF U 2
AF RR2G813TF U 2
AF RR2G726TF U 1
AF RR2B101JQ C 423
AF RR2B461TF U 1
AF RR2B461JQ C 1
AF RR2G813JQ C 451
AF RR2FF02JQ C 161
AF RR2B101TF U 19
BS 1 1 RR2G726TF
BS 2 92 RR2FF02TF
BS 93 93 RR2G726TF
BS 94 239 RR2FF02TF
BS 240 240 RR2G813TF
BS 241 371 RR2FF02TF
BS 372 546 RR2G813TF
BS 547 588 RR2G726TF
BS 589 594 RR2B461TF
BS 595 695 RR2G726TF
BS 696 696 RR2B101TF
BS 697 709 RR2G726TF
BS 710 784 RR2B101TF
BS 785 810 RR2B461JQ

RD RR2FF02TF 370 0 0
GACACAAATCTCAAAACACTCTTTCATTCATGAACAGAGCTTATCTCTTCTAGTCTCTCT
TTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAAAAAAAA*GGGACATAACATAATGGAGTGGGAGGAA
CAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTTCG
GCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTCG
AAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAAAC
AATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGGAGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGGT
GATGCAGAAG

QA 1 370 1 370
DS 

RD RR2G813TF 545 0 0
GACACAAATCTCAAAACACTCTTTCATTCATGAACAGAGCTTATCTCTTCTAGTCTCTCT
TTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAAAAAAAA*GGGACATAACATAATGGAGTGGGAGGAA
CAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTTCG
GCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTTG
AAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAAAC
AATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGGAGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGGT
GATGCAGAAGAAGTAAAGGAGACAAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTGAGAATGGT
GAAGCTGGAGATGGTGATGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACAGTGATGATGAT
GATGACAATGGGAACAATGATGATGATGAT***GAGGAAGAGGAGGATGAAGATGGTGGG
GAAGA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2G726TF 721 0 0
GGACACAAATCTCAAAACACTCTTTCATTCATGAACAGAGCTTATCTCTTCTAGTCTCTC
TTTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAACAAAAAAGGGACATAACATAATGGAGTGGGAGGA
ACAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTTC
GGCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTT
GAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAAA
CAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGGAGGGGAAGGGGAAGAGGAGGAAGGTGG
TGATGCAGAAGAAGTAAAGGAGACAAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTGAGAATGG
TGAAGCTGGAGATG***ATGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACAGTGATGATGA
TGATGACAATGGGAACAATGATGATGATGATGATGAGGAAGAGGAGGATGAAGATGGTGG
GGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGA******AGATGA
GGAGGAAGAGGCGCTACAGCCACCAAAGAAGAGGAAGAAGTAAACAACCCAACCACGCTT
TGATCTTCTAACATTTTAGATTCAAAAAATCAAAAGCTTCTTGTGGGTT
CTACCTGAGAGA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2B101JQ 261 0 0
AAGCTGGAGATG***ATGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACAGTGATGATGATG
ATGACAATGGGAACAATGATGTTGATGAT***GAGGAAGAGGAGGATGAAGATGGTGGGG
AAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGA******AGATGAGG
AGGAAGAGGCGCTACAGCCCCCAAAGAAGAGGAAGAAGTAAACAACCCAACCACGCTTTG
ATCTTCTAACATTTTAGATTC

QA 1 261 1 261
DS 

RD RR2B461TF 730 0 0
GGACACAAATCTCAAAACACTCTTTCATTCATGAACAGAGCTTATCTCTTCTAGTCTCTC
TTTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAAAAAAAAAGGGACATAACATAATGGAGTGGGAGGA
ACAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTTC
GGCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTT
GAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAAA
CAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGGAGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGG
TGATGCAGAAGAAGTAAAGGAGACAAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTGAGAATGG
TGAAGCTGGAGATGGTGATGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACAGTGATGATGA
TGATGACAATGGGAACAATGATGATGATGAT***GAGGAAGAGGAGGATGAAGATGGTGG
GGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGATGA
GGAGGAAGAGGCGCTACAGCCACCAAAGAAGAGGAAGAAGTAAACAACCCAACCACGCTT
TGATCTTCTAACATTTTAGATTCAAAAAATCAAAAACTTCTTGTGGGTTTCTACCTGAAG
AGAATCTTAA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2B461JQ 810 0 0
GGACACAAATCTCAAAACACTCTTTCATTCATGAACAGAGCTTATCTCTTCTAGTCTCTC
TTTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAAAAAAAAAGGGACATAACATAATGGAGTGGGAGGA
ACAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTTC
GGCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTT
GAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAAA
CAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGGAGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGG
TGATGCAGAAGAAGTAAAGGAGACAAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTGAGAATGG
TGAAGCTGGAGATGGTGATGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACAGTGATGATGA
TGATGACAATGGGAACAATGATGATGATGAT***GAGGAAGAGGAGGATGAAGATGGTGG
GGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGATGA
GGAGGAAGAGGCGCTACAGCCACCAAAGAAGAGGAAGAAGTAAACAACCCAACCACGCTT
TGATCTTCTAACATTTTAGATTCAAAAAATCAAAAACTTCTTGTGGGTTTCTACCTGAAG
AGAATCTTAAGGCATCACCAGCTTCTTTAGCTTTTCCACTGTAATCTCTGTTGTTCCATG
AATCAAAAAGACCTTTGTTTACTGTGTACC

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR2G813JQ 350 0 0
ACCTGAACAGGGTGACGACAGTGATGATGATGATGACAATGGGAACAATGATGATGATGA
T***GAGGAAGAGGAGGATGAAGATGGTGGGGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGA
AGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGATGAGGAGGAAGAGGCGCTACAGCCACCAAAGAA
GAGGAAGAAGTAAACAACCCAACCACGCTTTGATCTTCTAACATTTTAGATTCAAAAAAT
CAAAAACTTCTTGTGGGCTTCTACCTGAAGAGAATCTTAAGGCATCACCAGCTTCTTTAG
CTTTTCCACTGTAATCTCTGTTGTTCCATGAATCAAAAAGACCTTTGTTT

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR2FF02JQ 640 0 0
GTGCTAATGCTCACCGCTTCGGCTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTC
CTCTCTCAGGTGGCTGCCTCGAAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGAT
GCAGAGGAAGGCAATGGAAACAATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGGAGGGGAA
GGGGAAGAGGAAGAAGGTGGTGATGCAGAAGAAGTAAAGGAGACAAAGAAAGGATCTGCA
AGTGGTCCTGGTGAGAATGGTGAAGCTGGAGATGGTGATGATGACGATAAACCTGAACAG
GGTGACGACAGTGATGATGATGATGACAATGGGAACAATGATGATGATGAT***GAGGAA
GAGGAGGATGAAGATGGTGGGGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAA
GAGGAAGAGGAAGAAGATGAGGAGGAAGAGGCGCTACAGCCACCAAAGAAGAGGAAGAAG
TAAACAACCCAACCACGCTTTGATCTTCTAACATTTTAGATTCAAAAAATCAAAAACTTC
TTGTGGGTTTCTACCTGAAGAGAATCTTAAGGCATCACCAGCTTCTTTAGCTTTTCCACT
GTAATCTCTGTTGTTCCATGAATCAAAAAGACCTTTGTTT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2B101TF 766 0 0
ACTCTTTCATTCATGAACAGAGCTTATCTCTTCTAGTCTCTCTTTCCTTTTTCTTCCGAG
CTAGCTAACAAAAAAGGGACATAACATAATGGAGTGGGAGGAACAAGGTTTGAGGATGTC
CTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTTCGGCTCTAACGGCTACTGT
GCTTTCCTCTTTGCTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTTTAAGGGTGATGTTAAAGA
GAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAAACAATGAAGACGGTGATAG
TGGTGATGATGATGGAGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGGTGATGCAGAAGAAGTAAA
GGAGACAAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTGAGAATGGTGAAGCTGGAGATG***A
TGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACAGTGATGATGATGATGACAATGGGAACAA
TGATGATGATGAT***GAGGAAGAGGAGGATGAAGATGGTGGGGAAGAAGATGAAGAAGA
GGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGA******AGATGAGGAGGAAGAGGCGCTACA
GCCACCAAAGAAGAGGAAGAAGTAAACAACCCAACCACGCTTTGATCTTCTAACATTTTA
GATTCAAAAAATCAAAAACTTCTTGTGGGTTTCTACCTGAAGAGAATCTTAAGGCATCAC
CAGCTTCTTTAGCTTTTCCACTGTAATCTCTGTTGTTCCATGAATC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 9

CO CL466Contig1 1007 9 35 U
CGGGGGAAAATCTTCGATATCAATAAAACTCTATCAATTTTCAGGAACGAAAAGATATGT
CCACGGACTCGTACGAAGATGCCCTTAAAAAACTTGGAGAGCTTCTCACCAAGAAATCGG
ATCTAGGTAACGTCGCAGCCGCAAAGATCAAGCAGTTAACTAGTGAGCTAGAGGAACTTG
ATTCCAGCAAGATAGATTCTGTAGAAAGGATCAAGTCTGGATTCAACCATTTCAAGACTC
ATAATTATGAGAAGAATCCTTCGTTGTACAGTGCACTTGCCAAGAGCCAGAGCCCCAAGT
TTCTGGTGTTTGCTTGTGCGGATTCTCGAGTTTGCCCGTCTCACATCTTGAATTTTCAAC
TTGGGGAAGCATTTATCGTTAGAAACATTGCAAACATGGTGCCACCTTATGATAAGACAA
AACACTGTAATATTGGTGCCGCCCTTGAATATCCAATCACAGTCCTCAATGTGGAGAGCA
TTCTGGTGATTGGTCACAGCTGTTGTGGTGGAATAAAAGGACTCATGGCAATTGAAGATG
ATGCGGCTCCCTATAAGAGTGAATTCATAGAAGACTGGATCCAGATCTGTGCATCGGCCA
AGAACAAGACCAGGCAGGATTGTAAAGACCTGAGCTTCGACGACCAGTGCACCAACTGTG
AGAAGGAAGCTGTGAACGTGTCGCTGGGGAACCTGTTATCGTACCCGTTCGTGAGAGAGC
GAGTGGTGAAAAACAAGCTCGCCATAAGAGGCGCTCACTATGATTTTGTGAAAGGGACGT
TTGATCTCTGGGAACTTGACTTCAAGACCACCCCAGCTTTTGCCTTGTCATAAAAGAGTT
CTACTCATGTTTTCTCTCTATGTTGCTTCTAAGTGTGTTCTCAATTTCTCATCAATAATC
ATCTTTCTTTACCTTCAGTTTCTTGTCTCTTTTTGTTTTTCTCCTCAACTTCAGTTTCTT
GTATAATCTCATCTTTTATGTTTTAAATTAAATGAATAAGCTATAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 25 0 25 25 0 25 0 25 25 0 25 25 25 0 25 0 25 25 0 25 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 20 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2E427TF U 1
AF RR2CW78TF U 15
AF RR2DQ76TF U 6
AF RR2A145TF U 15
AF RR2A145JQ C 92
AF RR2D394TF U 29
AF RR2CW78JQ C 266
AF RR2E427JQ C 353
AF RR2D394JQ C 476
BS 1 15 RR2E427TF
BS 16 17 RR2A145TF
BS 18 18 RR2E427TF
BS 19 19 RR2A145TF
BS 20 21 RR2E427TF
BS 22 22 RR2A145TF
BS 23 23 RR2E427TF
BS 24 24 RR2A145TF
BS 25 26 RR2E427TF
BS 27 27 RR2A145TF
BS 28 32 RR2E427TF
BS 33 33 RR2A145TF
BS 34 35 RR2E427TF
BS 36 36 RR2A145TF
BS 37 37 RR2E427TF
BS 38 42 RR2A145TF
BS 43 73 RR2E427TF
BS 74 74 RR2DQ76TF
BS 75 515 RR2E427TF
BS 516 617 RR2DQ76TF
BS 618 618 RR2A145TF
BS 619 665 RR2DQ76TF
BS 666 666 RR2D394TF
BS 667 667 RR2DQ76TF
BS 668 668 RR2A145TF
BS 669 696 RR2DQ76TF
BS 697 732 RR2A145TF
BS 733 733 RR2A145JQ
BS 734 750 RR2A145TF
BS 751 751 RR2A145JQ
BS 752 770 RR2A145TF
BS 771 778 RR2CW78JQ
BS 779 999 RR2E427JQ
BS 1000 1000 RR2D394JQ
BS 1001 1007 RR2E427JQ

RD RR2E427TF 515 0 0
CGGGGGAAAATCTTCTGTTTCCA*AATACTCTTTCCA*****AGGAACGAAAAGATATGT
CCACGGACTCGTA*GAAGATGCCCTTAAAAAACTTGGAGAGCTTCTCACCAAGAAATCGG
ATCTAGGTAACGTCGCAGCCGCAAAGATCAAGCAGTTAACTAGTGAGCTAGAGGAACTTG
ATTCCAGCAAGATAGATTCTGTAGAAAGGATCAAGTCTGGATTCAACCATTTCAAGACTC
ATAATTATGAGAAGAATCCTTCGTTGTACAGTGCACTTGCCAAGAGCCAGAGCCCCAAGT
TTCTGGTGTTTGCTTGTGCGGATTCTCGAGTTTGCCCGTCTCACATCTTGAATTTTCAAC
TTGGGGAAGCATTTATCGTTAGAAACATTGCAAACATGGTGCCACCTTATGATAAGACAA
AACACTGTAATATTGGTGCCGCCCTTGAATATCCAATCACAGTCCTCAATGTGGAGAGCA
TTCTGGTGATTGGTCACAGCTGTTGTGGTGGAATA

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2CW78TF 564 0 0
GGATATCAATAAAACTGTATCAATTTTCAGGAACGAAAAGATATGTCCACGGACTCGTAC
GAAGATGCCCTTAAAAAACTTGGAGAGCTTCTCACCAAGAAATCGGATCTAGGTAACGTC
GCAGCCGCAAGGATCAAGCAGTTAACTAGTGAGCTAGAGGAACTTGATTCCAGCAAGATA
GATTCTGTAGAAAGGATCAAGTCTGGATTCAACCATTTCAAGACTCATAATTATGAGAAG
AATCCTTCGTTGTACAGTGCACTTGCCAAGAGCCAGAGCCCCAAGTTTCTGGTGTTTGCT
TGTGCGGATTCTCGAGTTTGCCCGTCTCACATCTTGAATTTTCAACTTGGGGAAGCATTT
ATCGTTAGAAACATTGCAAACATGGTGCCACCTTATGATAAGACAAAACACTGTAATATT
GGTGCCGCCCTTGAATATCCAATCACAGTCCTCAATGTGGAGAGCATTCTGGTGATTGGT
CACAGCTGTTGTGGTGGAATAAAAGGACTCATGGCAATTGAAGACGATGCGGCTCCCTAT
AAGAGTGAATTCATAGAAGACTGG

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2DQ76TF 695 0 0
GG
AAATCTTCTGTTTCCA*AATACTCTTTCCA*****AGGAACGAAAAGATATGTCCACGGA
CTCGTACGAAGATGCCCTTAAAAAACTTGGAGAGCTTCTCACCAAGAAATCGGATCTAGG
TAACGTCGCAGCCGCAAAGATCAAGCAGTTAACTAGTGAGCTAGAGGAACTTGATTCCAG
CAAGATAGATTCTGTAGAAAGGATCAAGTCTGGATTCAACCATTTCAAGACTCATAATTA
TGAGAAGAATCCTTCGTTGTACAGTGCACTTGCCAAGAGCCAGAGCCCCAAGTTTCTGGT
GTTTGCTTGTGCGGATTCTCGAGTTTGCCCGTCTCACATCTTGAATTTTCAACTTGGGGA
AGCATTTATCGTTAGAAACATTGCAAACATGGTGCCACCTTATGATAAGACAAAACACTG
TAATATTGGTGCCGCCCTTGAATATCCAATCACAGTCCTCAATGTGGAGAGCATTCTGGT
GATTGGTCACAGCTGTTGTGGTGGAATAAAAGGACTCATGGCAATTGAAGATGATGCGGC
TCCCTATAAGAGTGAATTCATAGAAGACTGGATCCAGATCTGTGCATCGGCCAAGAACAA
GACCAGGCAG*ATTGTAAAGACCTGAGCTTCGACGACCAGTGCACCAACTGTGAGAAG*A
*GCTGTGAACGTGTCGCTGGGGAACCTGT
ATCG

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR2A145TF 756 0 0
GGATATCAATAAAACTGTATCAATTTTCAGGAACGAAAAGATATGTCCACGGACTCGTAC
GAAGATGCCCTTAAAAAACTTGGAGAGCTTCTCACCAAGAAATCGGATCTAGGTAACGTC
GCAGCCGCAAAGATCAAGCAGTTAACTAGTGAGCTAGAGGAACTTGATTCCAGCAAGATA
GATTCTGTAGAAAGGATCAAGTCTGGATTCAACCATTTCAAGACTCATAATTATGAGAAG
AATCCTTCGTTGTACAGTGCACTTGCCAAGAGCCAGAGCCCCAAGTTTCTGGTGTTTGCT
TGTGCGGATTCTCGAGTTTGCCCGTCTCACATCTTGAATTTTCAACTTGGGGAAGCATTT
ATCGTTAGAAACGTTGCAAACATGGTGCCACCTTATGATAAGACAAAACACTGTAATATT
GGTGCCGCCCTTGAATATCCAATCACAGTCCTCAATGTGGAGAGCATTCTGGTGATTGGT
CACAGCTGTTGTGGTGGAATAAAAGGACTCATGGCAATTGAAGATGATGCGGCTCCCTAT
AAGAGTGAATTCATAGAAGACTGGATCCAGATCTGTGCATCGGCCAAGAACAAGACCAGG
CAGGATTGTAAAGACCTGAGCTTCGACGACCAGTGCACCAACTGTGAGAAG*AAGCTGTG
A*CGTGTCGCTGGGGAACCTGTTATCGTACCCGTTCGTGAGAGAGCGAGTGGTGAAAA*C
AAGCTCGCCATAAGAG*CGCTCACTATGATTTTGTG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2A145JQ 672 0 0
AAACTGGAGAGC
TCTCACCAAGAAATCGGATCTAGGTAACGTCGCAGCCGCAAAGATCAAGCAGTTAACTAG
TGAGCTAGAGGAACTTGATTCCAGCAAGATAGATTCTGTAGAAAGGATCAAGTCTGGATT
CAACCATTTCAAGACTCATAATTATGAGAAGAATCCTTCGTTGTACAGTGCACTTGCCAA
GAGCCAGAGCCCCAAGTTTCTGGTGTTTGCTTGTGCGGATTCTCGAGTTTGCCCGTCTCA
CATCTTGAATTTTCAACTTGGGGAAGCATTTATCGTTAGAAACGTTGCAAACATGGTGCC
ACCTTATGATAAGACAAAACACTGTAATATTGGTGCCGCCCTTGAATATCCAATCACAGT
CCTCAATGTGGAGAGCATTCTGGTGATTGGTCACAGCTGTTGTGGTGGAATAAAAGGACT
CATGGCAATTGAAGATGATGCGGCTCCCTATAAGAGTGAATTCATAGAAGACTGGATCCA
GATCTGTGCATCGGCCAAGAACAAGACCAGGCAGGATTGTAAAGACCTGAGCTTCGACGA
CCAGTGCACCAACTGTGAGAAGGAAGCTGTGAACGTGTCGCTGGGGAACCTGTTATCGTA
CCCGTTCGTGAGAGAGCGAGTGGTGAAAAACAAGCTCGCCATAAGAGGCGCTCACTATGA

QA 13 672 13 672
DS 

RD RR2D394TF 700 0 0
CGGTATCAATTTTC
AGGAACGAAAAGATATGTCCACGGACTCGTACGAAGATGCCCTTAAAAAACTTGGAGAGC
TTCTCACCAAGAAATCGGATCTAGGTAACGTCGCAGCCGCAAAGATCAAGCAGTTAACTA
GTGAGCTAGAGGAACTTGATTCCAGCAAGATAGATTCTGTAGAAAGGATCAAGTCTGGAT
TCAACCATTTCAAGACTCATAATTATGAGAAGAATCCTTCGTTGTACAGTGCACTTGCCA
AGAGCCAGAGCCCCAAGTTTCTGGTGTTTGCTTGTGCGGATTCTCGAGTTTGCCCGTCTC
ACATCTTGAATTTTCAACTTGGGGAAGCATTTATCGTTAGAAACATTGCAAACATGGTGC
CACCTTATGATAAGACAAAACACTGTAATATTGGTGCCGCCCTTGAATATCCAATCACAG
TCCTCAATGTGGAGAGCATTCTGGTGATTGGTCACAGCTGTTGTGGTGGAATAAAAGGAC
TCATGGCAATTGAAGATGATGCGGCTCCCTATAAGAGTGAATTCATAGAAGACTGGATCC
AGATCTGTGCATCGGCCAAGAACAAGACCAGGCAGGATTGTAAAGACCTGAGCTTCGACG
ACCAGTGCACCAACTGTGAGAAGGAAGCTGTGAACGTGTCGCTGGGGAACCTGTTATCGT
ACCCGTTCGTGAGAGAGCGAGTGGTG

QA 15 700 15 700
DS 

RD RR2CW78JQ 513 0 0
GTACAGTGCACTTGCCAAGAGCCAGAGCCCCAAGTTTCTGGTGTTTGCTTGTGCGGATTC
TCGAGTTTGCCCGTCTCACATCTTGAATTTTCAACTTGGGGAAGCATTTATCGTTAGAAA
CATTGCAAACATGGTGCCACCTTATGATAAGACAAAACACTGTAATATTGGTGCCGCCCT
TGAATATCCAATCACAGTCCTCAATGTGGAGAGCATTCTGGTGATTGGTCACAGCTGTTG
TGGTGGAATAAAAGGACTCATGGCAATTGAAGACGATGCGGCTCCCTATAAGAGTGAATT
CATAGAAGACTGGATCCAGATCTGTGCATCGGCCAAGAACAAGACCAGGCAGGATTGTAA
AGACCTGAGCTTCGACGACCAGTGCACCAACTGTGAGAAGGAAGCTGTGAACGTGTCGCT
GGGGAACCTGTTATCGTACCCGTTCGTGAGAGAGCGAGTGGTGAAAAACAAGCTCGCCAT
AAGAGGCGCTCACTATGATTTTGTGAAAGGGAC

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2E427JQ 655 0 0
TTTTCAACTTGGGGAAGCATTTATCGTTAGAAACATTGCAAACATGGTGCCACCTTATGA
TAAGACAAAACACTGTAATATTGGTGCCGCCCTTGAATATCCAATCACAGTCCTCAATGT
GGAGAGCATTCTGGTGATTGGTCACAGCTGTTGTGGTGGAATAAAAGGACTCATGGCAAT
TGAAGATGATGCGGCTCCCTATAAGAGTGAATTCATAGAAGACTGGATCCAGATCTGTGC
ATCGGCCGAGAACAAGACCAGGCAGGATTGTAAAGACCTGAGCTTCGACGACCAGTGCAT
CAACTGTGAGAAGGAAGCTGTGAACGTGTCGCTGGGGAACCTGTTATCGTACCCGTTCGT
GAGAGAGCGAGTGGTGAAAAACAAGCTCGCCATAAGAGGCGCTCACTATGATTTTGTGAA
AGGGACGTTTGATCTCTGGGAACTTGACTTCAAGACCACCCCAGCTTTTGCCTTGTCATA
AAAGAGTTCTACTCATGTTTTCTCTCTATGTTGCTTCTAAGTGTGTTCTCAATTTCTCAT
CAATAATCATCTTTCTTTACCTTCAGTTTCTTGTCTCTTTTTGTTTTTCTCCTCAACTTC
AGTTTCTTGTATAATCTCATCTTTTATGTTTTAAATTAAATGAATAATCTATAAC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2D394JQ 532 0 0
GAGCATTCTGGTGATTGGTCACAGCTGTTGTGGTGGAATAAAAGGACTCATGGCAATTGA
AGATGATGCGGCTCCCTATAAGAGTGAATTCATAGAAGACTGGATCCAGATCTGTGCATC
GGCCAAGAACAAGACCAGGCAGGATTGTAAAGACCTGAGCTTCGACGACCAGTGCACCAA
CTGTGAGAAGGAAGCTGTGAACGTGTCGCTGGGGAACCTGTTATCGTACCCGTTCGTGAG
AGAGCGAGTGGTGAAAAACAAGCTCGCCATAAGAGGCGCTCACTATGATTTTGTGAAAGG
GACGTTTGATCTCTGGGAACTTGACTTCAAGACCACCCCAGCTTTTGCCTTGTCATAAAA
GAGTTCTACT***GTTTTCTCTCTATGTTGCTTCTAAGTGTGTTCTCAATTTCTCATCAA
TAATCATCTTTCTTTACCTTCAGTTTCTTGTCTCTTTTTGTTTTTCTCCTCAACTTCAGT
TTCTTGTATAATCTCATCTTTTATGTTTTAAATTAAATGAATAAGCTATAAC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 11

CO CL467Contig1 692 11 10 U
AGGGGATCAACAAATCTCATAACCTCTTCCACTGCATTATCATCTCACTCCTCTAAATCG
ATCTTCGTTCGCGATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAAGCATTCGGAGGAAGGAAAGC
CGGCGGACCAAAAACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCGGT
CGGGAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCACAGAGACTCGGCGGCGGAGC
TCCGGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCAGCCGAACTTGCTGGTAACGCGGC
GAGAGACAACAAGAAGTCGAGGATTATTCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTAGGAACGA
TGAGGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTCTTGCCTAA
CATCAACTCTGTTTTGCTTCCTAAGAAGTCTGCTAAGTCGACCGAGGAATCTGCTGCGTC
CAAGTCACCGGCTAAGTCTCCCAAGAAGGCTTAAGCCACACGATGTTGGTTTTTTATTTA
TGTTCTTTGTGTTGAGATTGGTTAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTTTTTTTTTTT*
AAGTTTTAATTATGTAATTTGGGGTTTGGTGGATCTTCAGATCCAACTTTCTAAGTTTGA
TAATTTTATAAAATCTTCGCAGTTTGCTTATC


BQ
10 10 10 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 0 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 40 40 40 35 35 35 10 10 10 

AF RR2GI33TF U 4
AF RR2BA75JQ C 1
AF RR2BA75TF U 1
AF RR2B055JQ C 4
AF RR2CQ96TF U 4
AF RR2F844JQ C 4
AF RR2GZ38TF U 4
AF RR2GL96TF U 0
AF RR2B055TF U 4
AF RR2F844TF U 4
AF RR2GI33JQB C 55
BS 1 3 RR2BA75JQ
BS 4 266 RR2BA75TF
BS 267 267 RR2GI33TF
BS 268 356 RR2BA75TF
BS 357 357 RR2GI33TF
BS 358 671 RR2BA75TF
BS 672 677 RR2CQ96TF
BS 678 686 RR2GZ38TF
BS 687 689 RR2B055TF
BS 690 692 RR2GI33JQB

RD RR2GI33TF 500 0 0
GGATCAACAAATCTCATAACCTCTTCCACTGCATTATCATCTCACTCCTCTAAATCGATC
TTCGTTCGCGATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAAGCATTCGGAGGAAGGAAAGCCGG
CGGACCAAAAACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCGGTCGG
GAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCACAGAGACTCGGCGGCGGAGCTCC
GGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCAGCCGAACTTGCTGGTAACGCGGCGAG
AGACAACAAGAAGTCGAGGATTATTCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTAGGAACGATGA
GGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTCTTGCCTAACAT
CAACTCTGTTTTGCTTCCTAAGAAGTCTGCTAAGTCGACCGAGGAATCTGCTGCGTCCAA
GTCACCGGCTAAGTCTCCCA

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2BA75JQ 672 0 0
AGGGGATCAACAAATCTCATAACCTCTTCCACTGCATTATCATCTCACTCCTCTAAATCG
ATCTTCGTTCGCGATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAAGCATTCGGAGGAAGGAAAGC
CGGCGGACCAAAAACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCGGT
CGGGAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCACAGAGACTCGGCGGCGGAGC
TCCGGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGGGTACCTCGCAGCCGAACTTGCTGGTAACGCGGC
GAGAGACAACAAGAAGTCGAGGATTATTCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTAGGAGCGA
TGAGGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTCTTGCCTAA
CATCAACTCTGTTTTGCTTCCTAAGAAGTCTGCTAAGTCGACCGAGGAATTTGCTGCGTC
CAAGTCACCGGCTAAGTCTCCCAAGAAGGCTTAAGCCCCACGATGTTGGTTTTTTATTTA
TGTTCTTTGTGTTGAGATTGGTTAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTTTTTTTTTTT*
AAGTTTTAATTATGTAATTTGGGGTTTGGTGGATCTTCAGATCCAACTTTCTAAGTTTGA
TAATTTTATAA
G

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2BA75TF 672 0 0
AGG
GGATCAACAAATCTCATAACCTCTTCCACTGCATTATCATCTCACTCCTCTAAATCGATC
TTCGTTCGCGATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAAGCATTCGGAGGAAGGAAAGCCGG
CGGACCAAAAACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCGGTCGG
GAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCACAGAGACTCGGCGGCGGAGCTCC
GGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGGGTACCTCGCAGCCGAACTTGCTGGTAACGCGGCGAG
AGACAACAAGAAGTCGAGGATTATTCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTAGGAGCGATGA
GGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTCTTGCCTAACAT
CAACTCTGTTTTGCTTCCTAAGAAGTCTGCTAAGTCGACCGAGGAATCTGCTGCGTCCAA
GTCACCGGCTAAGTCTCCCAAGAAGGCTTAAGCCACACGATGTTGGTTTTTTATTTATGT
TCTTTGTGTTGAGATTGGTTAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTTTTTTTTTTT*AAG
TTTTAATTATGTAATTTGGGGTTTGGTGGATCTTCAGATCCAACTTTCTAAGTTTGATAA
TTTTATAA
G

QA 4 671 4 671
DS 

RD RR2B055JQ 686 0 0
GGATCAACAAATCTCATAACCTCTTCCACTGCATTATCATCTCACTCCTCTAAATCGATC
TTCGTTCGCGATGGAAACCACCGGAAA*GTGAAGAAAGCATTCGGAGGAAGGAAAGCCGG
CGGACCAAAAACCAAATCGGTTTCGGAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCGGTCGG
GAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCACAGAGACTCGGCGGCGGAGCTCC
GGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCAGCCGAACTTGCTGGTAACGCGGCGAG
AGACAACAAGAAGTCGAGGATTATTCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTAGGAACGATGA
GGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTCTTGCCTAACAT
CAACTCTGTTTTGCTTCCTAAGAAGTCTGCTAAGTCGACCGGGGAATCTGCTGCGTCCAA
GTCACCGGCTAAGTCTCCCAAGAAGGCTTAAGCCACACGATGTTGGTTTTTTATTTATGT
TCTTTGTGTTGAGATTGGTTAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTTTTTTTTT***AAG
TTTTAATTATGTAATTTGGGGTTTGGTGGATCTTCAGATCCAACCTTCTAAGTTTGATAA
TTTTATAAAATCTTCGCAGTTTGCTT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2CQ96TF 674 0 0
GGATCAACAAATCTCATAACCTCTTCCACTGCATTATCATCTCACTCCTCTAAATCGATC
TTCGTTCGCGATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAAGCATTCGGAGGAAGGAAAGCCGG
CGGACCAAAAACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCGGTCGG
GAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCACAGAGACTCGGCGGCGGAGCTCC
GGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCAGCCGAACTTGCTG*TAACGCGGCGAG
AGACAACAAGAAGTCGAGGATTATTCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTAGGAACGATGA
GGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTAGTGTCTTGCCTAACAT
CAACTCTGTTTTGCTTCCTAAGAAGTCTGCTAAGTCGACCGAGGAATCTGCTGCGTCCAA
GTCACCGGCTAAGTCTCCCAAGAAGGCTTAAGCCACACGATGTTGGTTTTTTATTTATGT
TCTTTGTGTTGAGATTGGTTAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTTTTTTTTTTT*AAG
TTTTAATTATGTAATTTGGGGTTTGGTGGATCTTCAGATCCAACTTTCTAAGTTTGATAA
TTTTATAAAATCTT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2F844JQ 686 0 0
GGATCAACAAATCTCATAACCTCTTCCACTGCATTATCATCTCACCCCTCTAAATCGATC
TTCGTTCGCGATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAAGCATTCGGAGGAAGGAAAGCCGG
CGGACCAAAAACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCGGTCGG
GAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCACAGAGACTCGGCGGCGGAGCTCC
GGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCAGCCGAACTTGCTGGTAACGCGGCGAG
AGACAACAAGAAGTCGAGGATTATTCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTAGGAACGATGA
GGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTCTTGCCTAACAT
CAACTCTGTTTTGCTTCCTAAGAAGTCTGCTAAGTCGACCGAGGAATCTGCTGCGTCCAA
GTCACCGGCTAAGTCTCCCAAGAAGGCTTAAGCCACACGATGTTGGTTTTTTATTTATGT
TCTTTGTGTTGAGATTGGTTAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTTTTTTTTTT**AAG
TTTTAATTATGTAATTTGGGGTTTGGTGGATCTTCAGATCCAACTTTCTAAGTTTGATAA
TTTTATAAAATCTTCGCAGTTTGCTT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2GZ38TF 683 0 0
GGATCAACAAATCTCATAACCTCTTCCACTGCATTATCATCTCACTCCTCTAAATCGATC
TTCGTTCGCGATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAAGCATTCGGAGGAAGGAAAGCCGG
CGGACCAAAAACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCGGTCGG
GAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCACAGAGACTCGGCGGCGGAGCTC*
GGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCAGCCGAACTTGCTGGTAACGCGGCGAG
AGACAACAAGAAGTCGAGGATTATTCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTAGGAACGATGA
GGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTCTTGCCTAACAT
CAACTCTGTTTTGCTTCCTAAGAAGTCTGCTAAGTCGACCGAGGAATCTGCTGCGTCCAA
GTCACCGGCTAAGTCTCCCAAGAAGGCTTAAGCCACACGGTGTTGGTTTTTTATTTATGT
TCTTTGTGTTGAGATTGGTTAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTTTTTTTTTTT*AAG
TTTTAATTATGTAATTTGGGGTTTGGTGGATCTTCAGATCCAACTTTCTAAGTTTGATAA
TTTTATAAAATCTTCGCAGTTTG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2GL96TF 684 0 0
AGGGAC
ATCAACAAATCTCATAACCTCTTCCACTGCATTATCATCTCACTCCTCTAAATCGATCTT
CGTTCGCGATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAAGCATTCGGAGGAAGGAAAGCCGGCG
GACCAAAAACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCGGTCGGGA
GAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCACAGAGACTCGGCGGCGGAGCTCCGG
TTTACATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCAGCCGAACTTGCTGGTAACGCGGCGAGAG
ACAACAAGAAGTCGAGGATTATTCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTAGGAACGATGAGG
AGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTCTTGCCTAACATCA
ACTCTGTTTTGCTTCCTAAGAAGTCTGCTAAGTCGACCGAGGAATCTGCTGCGTCCAAGT
CACCGGCTAAGTCTCCCAAGAAGGCTTAAGCCACACGATGTTGGTTTTTTATTTATGTTC
TTTGTGTTGAGATTGGTTAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTTTTTTTTTT**AAGTT
TTAATTATGTAATTTGGGGTTTGGTGGATCTTCAGATCCAACTTTCTAAGTTTGATAATT
TTATAAAATCTTCGCAGT

QA 7 684 7 684
DS 

RD RR2B055TF 686 0 0
GGATCAACAAATCTCATAACCTCTTCCACTGCATTATCATCTCACTCCTCTAAATCGATC
TTCGTTCGCGATGGAAACCACCGGAAA*GTGAAGAAAGCATTCGGAGGAAGGAAAGCCGG
CGGACCAAAAACCAAATCGGTTTCGGAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCGGTCGG
GAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCACAGAGACTCGGCGGCGGAGCTCC
GGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCAGCCGAACTTGCTGGTAACGCGGCGAG
AGACAACAAGAAGTCGAGGATTATTCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTAGGAACGATGA
GGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTCTTGCCTAACAT
CAACTCTGTTTTGCTTCCTAAGAAGTCTGCTAAGTCGACCGGGGAATCTGCTGCGTCCAA
GTCACCGGCTAAGTCTCCCAAGAAGGCTTAAGCCACACGATGTTGGTTTTTTATTTATGT
TCTTTGTGTTGAGATTGGTTAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTTTTTTTTT***AAG
TTTTAATTATGTAATTTGGGGTTTGGTGGATCTTCAGATCCAACCTTCTAAGTTTGATAA
TTTTATAAAATCTTCGCAGTTTGCTT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2F844TF 688 0 0
GGATCAACAAATCTCATAACCTCTTCCACTGCATTATCATCTCACCCCTCTAAATCGATC
TTCGTTCGCGATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAAGCATTCGGAGGAAGGAAAGCCGG
CGGACCAAAAACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCGGTCGG
GAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCACAGAGACTCGGCGGCGGAGCTCC
GGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCAGCCGAACTTGCTGGTAACGCGGCGAG
AGACAACAAGAAGTCGAGGATTATTCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTAGGAACGATGA
GGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTCTTGCCTAACAT
CAACTCTGTTTTGCTTCCTAAGAAGTCTGCTAAGTCGACCGAGGAATCTGCTGCGTCCAA
GTCACCGGCTAAGTCTCCCAAGAAGGCTTAAGCCACACGATGTTGGTTTTTTATTTATGT
TCTTTGTGTTGAGATTGGTTAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTTTTTTTTTT**AAG
TTTTAATTATGTAATTTGGGGTTTGGTGGATCTTCAGATCCAACTTTCTAAGTTTGATAA
TTTTATAAAATCTTCGCAGTTTGCTT
AA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2GI33JQB 638 0 0
AAATCGATCTTCGTTCGCGATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAAGCATTCGGAGGAAG
GAAAGCCGGCGGACCAAAAACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATT
CCCGGTCGGGAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCACAGAGACTCGGCGG
CGGAGCTCCGGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCAGCCGAACTTGCTGGTAA
CGCGGCGAGAGACAACAAGAAGTCGAGGATTATTCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTAG
GAACGATGAGGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTCTT
GCCTAACATCAACTCTGTTTTGCTTCCTAAGAAGTCTGCTAAGTCGACCGAGGAATCTGC
TGCGTCCAAGTCACCGGCTAAGTCTCCCAAGAAGGCTTAAGCCACACGATGTTGGTTTTT
TATTTATGTTCTTTGTGTTGAGATTGGTTAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTTTTTT
TTTTTTAAGTTTTAATTATGTAATTTGGGGTTTGGCGGATCTTCAGATCCAACTTTCTAA
GTTTGATAATTTTATAAAATCTTCGCAGTTTGCTTATC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 2 11

CO CL468Contig1 672 9 32 U
GGGAGGAAGAAAAGATCTCATCGAGACAGACAGTGAAGAAA*CTCTAGCTAGTACTTCAA
GATGGGGCGTATGCATTCAAGAGGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCG
TTCACCTCCGGCTTGGCTCAAGACCACCGCGCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTT
TGCAAAGAAGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTAT
CCCTCAGGTCAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGTATCTTGAAAGCACACGGTCT
TGCACCTGAGATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAA
GCACTTGGAGAGGAACAGGAAGGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAG
CAGGATCCACCGTCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAA
GTACGAGTCTACTACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATT*GGAAG
TTCTTCAAGAACTCTTGTTTCTATTCACTTCGTGTATCAGCTGGATTTAATTTCTCATTT
TCGTGTTAGTGCTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGA
AACTTACATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 30 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 15 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 0 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 40 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 50 45 45 35 

AF RR2AC53JQ C 1
AF RR2BU67JQ C 106
AF RR2FG93JQ C 11
AF RR2C680TF U 157
AF RR2FG93TF U 11
AF RR2AS03JQ C 9
AF RR2DH59TF U 11
AF RR2BU67TF U 6
AF RR2AC53TF U 1
BS 1 8 RR2AC53JQ
BS 9 10 RR2AC53TF
BS 11 12 RR2BU67TF
BS 13 90 RR2FG93TF
BS 91 91 RR2DH59TF
BS 92 92 RR2FG93TF
BS 93 93 RR2DH59TF
BS 94 96 RR2FG93TF
BS 97 97 RR2DH59TF
BS 98 150 RR2FG93TF
BS 151 151 RR2BU67TF
BS 152 157 RR2FG93TF
BS 158 216 RR2C680TF
BS 217 217 RR2DH59TF
BS 218 309 RR2C680TF
BS 310 310 RR2DH59TF
BS 311 324 RR2C680TF
BS 325 325 RR2DH59TF
BS 326 414 RR2C680TF
BS 415 415 RR2DH59TF
BS 416 471 RR2C680TF
BS 472 472 RR2DH59TF
BS 473 534 RR2C680TF
BS 535 535 RR2DH59TF
BS 536 555 RR2C680TF
BS 556 556 RR2DH59TF
BS 557 560 RR2C680TF
BS 561 561 RR2DH59TF
BS 562 579 RR2C680TF
BS 580 580 RR2DH59TF
BS 581 668 RR2C680TF
BS 669 672 RR2FG93TF

RD RR2AC53JQ 672 0 0
GGGAGGAAGAAAAGATCTCATCGAGACAGACAGTGAAGAAA*CTCTAGCTAGCACTTCAA
GATGGGGCGTATGCATTCAAGAGGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCG
TTCACCTCCGGCTTGGCTCAAGACCACCGCGCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTT
TGCAAAGAAGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGTTAT
CCCTCAGGTCAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGTATCTTGAAAGCACACGGTCT
TGCACCTGAGATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAA
GCACTTGGAGAGGAACAGGAAGGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAG
CAGGATCCACCGTCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAA
GTACGTGTCTACTACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATT*GGAAG
TTCTTCAAGAACTCTTGTTTCTATTCACTTCGTGTATCAGCTGGATTTAATTTCTCATTT
TCGTGTTAGTGCTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGTA
AACTTACATTTT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2BU67JQ 566 0 0
TTTGCCGTACAAACGTTCACCTCCGGCTTGGCTCAAGACCACCGCGCTCGATGTTGATGA
GTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGGGTTTGACACCATTTCAGATTGGTGTCATTTTCCG
TGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTCAAGGGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGTATCTT
GAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAGATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGC
CGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAACAGGAAGGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTT
GATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGTTTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCT
TCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTTTACTACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATG
GATTGAATT*GGAAGTTTTTCAAGAACTCTTGTTTCTATTCACTTCGTGTATCAGCTGGA
TTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTGCTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTT
TAATCATTTCAAGTAAACTTACATTT

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2FG93JQ 662 0 0
GG
AGATCTCATCGAGACAGACAGTGAAGAAA*CTCTAGCTAGTACTTCAAGATGGGGCGTAT
GCATTCAAGAGGAAAGGGAACCTCCGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCTCCGGC
TTGGCTCAAGACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGGG
TTTGACACCATCTCAGATTGGTGTTATTCTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTCAA
GAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGTATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAAAT
TCCTGAGGATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAG
GAACAGGA*GGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTTGAGAGCAGGATCCACCG
TCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCTGTCTGGAAGTACGAGTCTAC
TACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGTTCTTCAAGAAC
TCTCGTTTTTATTCACTTCGTGTATCAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTGC
TTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAAACTTACATTTT

QA 3 662 3 662
DS 

RD RR2C680TF 512 0 0
G
GTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTT
ATTCTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTCAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTG
CGTATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAAATTCCTGAGGATCTATACCACTTGATC
AAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAACAGGAAGGACAAAGATTCCAAG
TTTAGGTTGATTCTTGTTGAGAGCAGGATCCACCGTCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACC
AAGAAGCTTCCTCCTGTCTGGAAGTACGAGTCTACTACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAG
AGAGCATGGATTGAATTTGGAAGTTCTTCAAGAACTCTCGTTTTTATTCACTTCGTGTAT
CAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTGCTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAAT
TGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAAACTTACA

QA 2 512 2 512
DS 

RD RR2FG93TF 662 0 0
GG
AGATCTCATCGAGACAGACAGTGAAGAAA*CTCTAGCTAGTACTTCAAGATGGGGCGTAT
GCATTCAAGAGGAAAGGGAACCTCCGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCTCCGGC
TTGGCTCAAGACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGGG
TTTGACACCATCTCAGATTGGTGTTATTCTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTCAA
GAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGTATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAAAT
TCCTGAGGATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAG
GAACAGGA*GGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTTGAGAGCAGGATCCACCG
TCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCTGTCTGGAAGTACGAGTCTAC
TACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGTTCTTCAAGAAC
TCTCGTTTTTATTCACTTCGTGTATCAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTGC
TTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAAACTTACATTTT

QA 3 662 3 662
DS 

RD RR2AS03JQ 664 0 0
GG
AAAGATCTCATCGAGACAGACAGTGAAGAAAACTCTT*CTAGTACTTCAAGATGGGGCGT
ATGCATTCAAGAGGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCTCCG
GCTTGGCTCAAGACCACCTCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAG
GGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTC
AAGAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGAATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAG
ATTCCTGAGGATTTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAAGATCCAC
CGTCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCCAGCACACTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATT*GGAAGTTCTTCAAGA
ACTCTTGTTTCTATTCACTTCGTGTATCAGCTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTCAGT
GCTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAAACTTACATT
TT

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR2DH59TF 659 0 0
GG
AGATCTCATCGAGACAGACAGTGAAGAAAACTCTT*CTAGTACTTCAAGATGGGGCGTAT
GCATTCAAGAGGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCTCCGGC
TTGGCTCAAGACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGGG
TTTGACACCATCTCAGACTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTCAA
GAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGAATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAGAT
TCCTGAGGATTCGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAG
GAACAGGAAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCG
TCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTAC
TACTGCCAGCACACTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATT*GGAAGTTCTTCAAGAAC
TCTTGTTTCTATTCACTTCGTGTATCAGCTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTGC
TTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAAACTTACAT

QA 3 659 3 659
DS 

RD RR2BU67TF 666 0 0
GGGGA
AAAGGTCTCATCGAGACAGACAGTGAAGAAA*CTCTAGCTAGCACTTCAAGATGGGGCGT
ATGCATTCAAGAGGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAACGTTCACCTCCG
GCTTGGCTCAAGACCACCGCGCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAG
GGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTC
AAGGGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGTATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAG
ATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCCGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAGGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCAC
CGTCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATT*GGAAGTTCTTCAAGA
ACTCTTGTTTCTATTCACTTCGTGTATCAGCTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGT
GCTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGTAAACTTACATT
T

QA 6 666 6 666
DS 

RD RR2AC53TF 672 0 0
GGGAGGAA
GAAAAGATCTCATCGAGACAGACAGTGAAGAAA*CTCTAGCTAGCACTTCAAGATGGGGC
GTATGCATTCAAGAGGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCTC
CGGCTTGGCTCAAGACCACCGCGCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGA
AGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGTTATCCCTCAGG
TCAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGTATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTG
AGATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGG
AGAGGAACAGGAAGGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCC
ACCGTCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGTGT
CTACTACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATT*GGAAGTTCTTCAA
GAACTCTTGTTTCTATTCACTTCGTGTATCAGCTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTA
GTGCTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGTAAACTTACA
TTTT

QA 9 672 9 672
DS 



CO CL468Contig2 700 2 7 U
GGAGGAAGGAAAGATCTCATCTAGACAAGACAGTGAAGAAAACTCTTCTAGTACTTCAAG
ATGGGGCGTATGCACTCAAGAGGAAAGGGAATCTCCGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGT
TCACCTCCGGCTTGGCTCAAGACCACCGCTGTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTT
GCAAAGAAGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTTATTCTTCGTGACTCTCACGGTATC
CCTCAGGTCAAAAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGAATCTTGAAAGCACACGGTCTT
GCACCTGAGATTCCTGAGGATCTCTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAG
CACTTGGAGAGGAACAGGAAGGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTTGAGAGC
AGGATCCACCGTCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAG
TACGAGTCTACTACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAAAGAGCATGGATTGAATTTGGAA
GTTCCTCAAGAACTCTCGTTTCTATACACTTCGTGTATCAACTGGATTTAATTTCTCATT
TTCGTGTTAGTGCTTGTTTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTT
CAAGGAACAATCGTGCTTAAATTTTATAGTCATGGTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ29TF U 202
AF RR2FN86JQ C 1
BS 1 201 RR2FN86JQ
BS 202 277 RR2CQ29TF
BS 278 278 RR2FN86JQ
BS 279 544 RR2CQ29TF
BS 545 545 RR2FN86JQ
BS 546 614 RR2CQ29TF
BS 615 700 RR2FN86JQ

RD RR2CQ29TF 413 0 0
TCTCAGATTGGTGTTATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTCAAAAGTGTTACC
GGTAACAAGATCTTGCTAATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAGATTCCTGAGGAT
CTCTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAACAGGAAG
GACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTTGAGAGCAGGATCCACCGTCTTGCTCGC
TATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACTACTGCCAGC
ACCCTTGTTGCTTAGAAAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGTTCTTCAAGAACTCTCGTTT
CTATACACTTCGTGTATCAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTGCT

QA 1 413 1 413
DS 

RD RR2FN86JQ 700 0 0
GGAGGAAGGAAAGATCTCATCTAGACAAGACAGTGAAGAAAACTCTTCTAGTACTTCAAG
ATGGGGCGTATGCACTCAAGAGGAAAGGGAATCTCCGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGT
TCACCTCCGGCTTGGCTCAAGACCACCGCTGTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTT
GCAAAGAAGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTTATTCTTCGTGACTCTCACGGTATC
CCTCAGGTCAAAAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGAATCTTGAAAGCACACGGTCTT
GCACCTGAGATTCCTGAGGATCTCTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAG
CACTTGGAGAGGAACAGGAAGGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTTGAGAGC
AGGATCCACCGTCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAG
TACGAGTCTACTACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAAAGAGCATGGATTGAATTTGGAA
GTTCCTCAAGAACTCTCGTTTCTATTCACTTCGTGTATCAACTGGATTTAATTTCTCATT
TTCGTGTTAGTGCTTGTTTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTT
CAAGGAACAATCGTGCTTAAATTTTATAGTCATGGTTACT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 11

CO CL469Contig1 1027 11 7 U
GGAACCCATTTTCTCATTTTCTATAAATAACGTCATGGCTCGCAGTTGAAGACCACGCGC
TTTACTGTTTTTTCTTCTCACTTTCCGCAAGATTGTTCTGTTCTTGAAACAGTTCCACGA
TGAGTGAAGAGGTCAATAAGCTTCAGAAGCCAACTCCACGTTTAAACGAGAGGATCCTCT
CATCTTTATCTAAGAGATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTG
GAGCTCCAGTGATTTTCAATGTGGTTGTTGAGATCTCAAAGGGTAGCAAGGTCAAATATG
AACTTGACAAAAAGACAGGACTAATCAAGGTTGATAGGATCCTTTATTCATCAGTTGTGT
ATCCTCATAACTACGGTTTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATG
TGCTAGTCATCATGCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTG
GATTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCCGTATGTGTTG
ATGATCCGGAGTATAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTG
AAATCCGGCGATTCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATG
ACTTTCTTCCGAATGGTCCTGCTGTTGAAGCCATTCAGTACTCAATGGACCTTTACGCTG
AGTACATTCTTCACACCTTGAGAAGATAAGGGAAGGGCCATTCTTGCCAAAAGAAAGAGA
GAATTTGTCTGATTGAATTTTGAATAAAGCACGTGTTCATGAAACTGTTCTGATGTTTTG
ACTTTAAAGCTTTTTTGTTGTTGTTTTCTTCTGGGGATCTTTTGTCTGAAGATTAAATCC
CAGTTGAGTTTTTTT**TCCTCTTATTTGTATTGGATCTTTTTTATCCTTTTAAAGTTTC
GATTTCGTTCCAACGAAACCAGATCTTTTTTTATTTATAAAAATGAATGTATCGCAATCA
CTTTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 

AF RR2GM91TF U 1
AF RR2C861TF U 74
AF RR2BX50TF U 68
AF RR2DD77TF U 68
AF RR2GX65TF U 68
AF RR2EW95TF U 100
AF RR2C861JQ C 195
AF RR2BX50JQ C 342
AF RR2EW95JQ C 345
AF RR2GM91JQ C 309
AF RR2GX65JQ C 378
BS 1 333 RR2GM91TF
BS 334 334 RR2BX50TF
BS 335 640 RR2GM91TF
BS 641 743 RR2BX50TF
BS 744 747 RR2EW95TF
BS 748 975 RR2C861JQ
BS 976 1027 RR2GM91JQ

RD RR2GM91TF 640 0 0
GGAACCCATTTTCTCATTTTCTATAAATAACGTCATGGCTCGCAGTTGAAGACCACGCGC
TTTACTGTTTTTTCTTCTCACTTTCCGCAAGATTGTTCTGTTCTTGAAACAGTTCCACGA
TGAGTGAAGAGGTCAATAAGCTTCAGAAGCCAACTCCACGTTTAAACGAGAGGATCCTCT
CATCTTTATCTAAGAGATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTG
GAGCTCCAGTGATTTTCAATGTGGTTGTTGAGATCTCAAAGGGTAGCAAGGTCAAATATG
AACTTGACAAAAAGACAGGACTAATCAAGGTTGGTAGGATCCTTTATTCATCAGTTGTGT
ATCCTCATAACTACGGTTTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATG
TGCTAGTCATCATGCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTG
GATTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCCGTATGTGTTG
ATGATCCGGAGTATAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTG
AAATCCGGCGATTCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2C861TF 565 0 0
CTTCTCACTTTCCGCAAGATTGTTCTGTTCTTGAAACAGTTCCACGATGAGTGAAGAGGT
CAATAAGCTTCAGAAGCCAACTCCACGTTTAAACGAGAGGATCCTCTCATCTTTATCTAA
GAGATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTGGAGCTCCAGTGAT
TTTCAATGTGGTTGTTGAGATCTCAAAGGGTAGCAAGGTCAAATATGAACTTGACAAAAA
GACAGGACTAATCAAGGTTGATAGGATCCTTTATTCATCAGTTGTGTATCCTCATAACTA
CGGTTTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGTCATCAT
GCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAATGCCCAT
GATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCCGGAGTA
TAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCGGCGATT
CTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAG

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2BX50TF 679 0 0
TTTTTTCTTCTCACTTTCCGCAAGATTGTTCTGTTCTTGAAACAGTTCCACGATGAGTGA
AGAGGTCAATAAGCTTCAGAAGCCAACTCCACGTTTAAACGAGAGGATCCTCTCATCTTC
ATCTAAGAGATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTGGAGCTCC
AGTGATTTTCAATGTGGTTGTTGAGATCTCAAAGGGTAGCAAGGTCAAATATGAACTTGA
CAAAAAGACAGGACTAATCAAGGTTGATAGGATCCTTTATTCATCAGTTGTGTATCCTCA
TAACTACGGTTTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGT
CATCATGCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAAT
GCCCATGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCC
GGAGTATAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCG
GCGATTCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGACTTTCT
TCCGAATGGTCCTGCTGTTGAAGCCATTCAGTACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACAT
TCTTCACACCTTGAGA
GAT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2DD77TF 676 0 0
TTTTTTCTTCTCACTTTCCGCAAGATTGTTCTGTTCTTGAAACAGTTCCACGATGAGTGA
AGAGGTCAATAAGCTTCAGAAGCCAACTCCACGTTTAAACGAGAGGATCCTCTCATCTTT
ATCTAAGAGATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCCGGAGCTCC
AGTGATTTTCAATGTGGTTGTTGAGATCTCAAAGGGTAGCAAGGTCAAATATGAACTTGA
CAAAAAGACAGGACTAATCAAGGTTGATAGGATCCTTTATTCATCAGTTGTGTATCCTCA
TAACTACGGTTTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGT
TATCATGCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAAT
GCCCATGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCC
GGAGTATAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTAAAATCCG
GCGATTCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAAGAAGTTGCTGTAAATGACTTTCT
TCCGAATGGTCCTGCTGTTGAAGCCATTCAGTACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACAT
TCTTCACACCTTGAGA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2GX65TF 679 0 0
TTTTTTCTTCTCACTTTCCGCAAGATTGTTCTGTTCTTGAAACAGTTCCACGATGAGTGA
AGAGGTCAATAAGCTTCAGAAGCCAACTCCACGTTTAAACGAGAGGATCCTCTCATCTTT
ATCTAAGAGATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTGGAGCTCC
AGTGATTTTCAATGTGGTTGTTGAGATCTCAAAGGGTAGCAAGGTCAAATATGAACTTGA
CAAAAAGACAGGACTAATCAAGGTTGATAGGATCCTTTATTCATCAGTTGTGTATCCTCA
TAACTACGGTTTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGT
CATCATGCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAAT
GCCCATGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCC
GGAGTATAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCG
GCGATTCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAAGAAGTTGCTGTAAATGACTTTCT
TCCGAATGGTCCTGCTGTTGAAGCCATTCAGTACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACAT
TCTTCACACCTTGAGA
GAT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2EW95TF 648 0 0
GTTCTTGAAACAGTTCCACGATGAGTGAAGAGGTCAATAAGCTTCAGAAGCCAACTCCAC
GTTTAAACGAGAGGATCCT*TCATCTTTATCTAAGAGATCGTTTGCTGCTCATCCATGGC
ATGATCTTGAAATCGGACCTGGAGCTCCAGTGATTTTCAATGTGGTTGTTGAGATCTCAA
AGGGTAGCAAGGTCAAATATGAACTTGACAAAAAGACAGGACTAATCAAGGTTGATAGGA
TCCTTTATTCATCAGTTGTGTATCCTCATAACTACGGTTTTATTCCCCGCACATTATGCG
AAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGTCATCATGCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTT
TTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACA
AGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCCGGAGTATAAGCATTACACTGACATCAAAGAAC
TTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCGGCGATTCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGA
ACAAGGAAGTTGTTGTAAATGACTTTCTTCCGAATGGTCCTGCTGTTGAAGCCATTCAGT
ACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACATTCTTCACACCTTGAGAAGAT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2C861JQ 781 0 0
AGATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTGGAGCTCCAGTGATT
TTCAATGTGGTTGTTGAGATCTCAAAGGGTAGCAAGGTCAAATATGAACTTGACAAAAAG
ACAGGACTAATCAAGGTTGATAGGATCCTTTATTCATCAGTTGTGTATCCTCATAACTAC
GGTTTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGTCATCATG
CAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTTTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAATGCCCATG
ATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCCGGAGTAT
AAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCGGCGATTC
TTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGACTTTCTTCCGAAT
GGTCCTGCTGTTGAAGCCATTCAGTACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACATTCTTCAC
ACCTTGAGAAGATAAGGGAAGGGCCATTCTTGCCAAAAGAAAGAGAGAATTTGTCTGATT
GAATTTTGAATAAAGCACGTGTTCATGAAACTGTTCTGATGTTTTGACTTTAAAGCTTTT
TTGTTGTTGTTTTCTTCTGGGGATCTTTTGTCTGAAGATTAAATCCCAGTTGAGTTTTTT
T**TCCTCTTATTTGTATTGGATCTTTTTTATCCTTTTAAAGTTTCGATTTCGTTCCAAC
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2BX50JQ 643 0 0
CTTTATTCATCAGTTGTGTATCCTCATAACTACGGTTTTATTCCCCGCACATTATGCGAA
GACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGTCATCATGCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTT
TTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAG
ATCATTGCCGTATGTGTTGATGTTCCGGAGTATAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTT
CCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCGGCGATTCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAAC
AAGGAAGTTGCTGTAAATGACTTTCTTCCGAATGGTCCTGCTGTTGAAGCCATTCAGTAC
TCAATGGACCTTTACGCTGAGTACATTCTTCACCCCTTGAGAAGATAAGGGAAGGGCCAT
TCTTGCCAAAAGAAAGAGAGAATTTGTCTGATTGAATTTTGAATAAAGCACGTGTTCATG
AAACTGTTCTGATGTTTTGACTTTAAAGCTTTTTTGTTGTTGTTTTCTTCTGGGGTTCTT
TTGTCTGAAGATTAAATCCCAGTTGAGTTTTTTTTTTCCTCTTATTTGTATTGGTTCTTT
TTTATCCTTTTAAAGTTTCGATTTCGTTCCAACGAAACCAGA
C

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2EW95JQ 627 0 0
TATTCATCAGTTGTGTATCCTCATAACTACGGTTTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGAC
AATGATCCGTTGGATGTGCTAGTCATCATGCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTG
CGCGCCCGAGCTATTGGATTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATC
ATTGCCGTATGTGTTGATGATCCGGAGTATAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCT
CCTCATCGTCTCACTGAAATCCGGCGATTCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAG
GAAGTTGTTGTAAATGACTTTCTTCCGAATGGTCCTGCTGTTGAAGCCATTCAGTACTCA
ATGGACCTTTACGCTGAGTACATTCTTCACACCTTGAGAAGATAAGGGAAGGGCCATTCT
TGCCAAAAGAAAGAGAGAATTTGTCTGATTGAATTTTGAATAAAGCACGTGTTCATGAAA
CTGTTCTGATGTTTTGACTTTAAAGCTTTTTTGTTGTTGTTTTCTTCTGGGGATCTTTTG
TCTGAAGATTAAATCCCAGTTGAGTTTTTTT**TCCTCTTATTTGTATTGGATCTTTTTT
ATCCTTTTAAAGTTTCGATTTCGTTCC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2GM91JQ 719 0 0
AAAAAGACAGGACTAATCAAGGTTGGTAGGATCCTTTATTCATCAGTTGTGTATCCTCAT
AACTACGGTTTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGTC
ATCATGCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAATG
CCCATGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCCG
GAGTATAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCGG
CGATTCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGACTTTCTT
CCGAATGGTCCTGCTGTTGAAGCCATTCAGTACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACATT
CTTCACACCTTGAGAAGATAAGGGAAGGGCCATTCTTGCCAAAAGAAAGAGAGAATTTGT
CTGATTGAATTTTGAATAAAGCACGTGTTCATGAAACTGTTCTGATGTTTTGACTTTAAA
GCTTTTTTGTTGTTGTTTTCTTCTGGGGATCTTTTGTCTGAAGATTAAATCCCAGTTGAG
TTTTTTT**TCCTCTTATTTGTATTGGATCTTTTTTATCCTTTTAAAGTTTCGATTTCGT
TCCAACGAAACCAGATCTTTTTTTATTTATAAAAATGAATGTATCGCAATCACTTTAGT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2GX65JQ 650 0 0
TTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGTCATCATGCAG
GAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAATGCCCATGATT
GATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCCGGAGTATAAG
CATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCGGCGATTCTTT
GAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGACTTTCTTCCGAATGGT
CCTGCTGTTGAAGCCATTCAGTACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACATTCTTCACACC
TTGAGAAGATAAGGGAAGGGCCATTCTTGCCAAAAGAAAGAGAGAATTTGTTTGATTGAA
TTTTGAATAAAGCACGTGTTCATGAAACTGTTTTGATGTTTTGACTTTAAAGCTTTTTTG
TTGTTGTTTTTTTTTGGGGATCTTTTGTCTGAAGATTAAATCCCAGTTGAGTTTTTTTTT
TCCTCTTATTTGTATTGGATCTTTTTTATCCTTTTAAAGTTTCGATTTCGTTCCAACGAA
ACCAGATCTTTTTTTATTTATAAAAATGAATGTATCGCAATCACTTTAGT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 2 11

CO CL470Contig1 1286 9 12 U
GGATCTAAGAGTTGAGATCACTAGAGTAGCTTAGAGCAGAGAAGAGTTATGGGAAAAGGA
GGAATGTCTCAGGGAGAAGGCTCAAAGGTTGAAGAAGAGAACATGGCTGCCTGGTTGGTT
GGTGTCAACACTCTCAAGATCCAACCTTTTCCTCTTCCTTCCCTTGGTCCTCATGATGTG
AGAGTTAGGATGAAGGCTGTTGGAATTTGTGGAAGTGATGTTCATTACCTCAAGACCATG
AGATGTGCGGATTTCATTGTGAAAGAACCGATGGTGATTGGACATGAATGTGCCGGGATC
ATTGAAGAGGTAGGTGAAGGAGTGAAACATCTAGTGGTCGGTGACCGAGTGGCTCTTGAG
CCTGGGATTAGTTGCTGGAGATGCAACCTCTGCAAGGAAGGAAGATACAATCTTTGTCCT
GAGATGAAGTTCTTTGCAACCCCACCGGTTCATGGCTCTCTAGCTAACCAAGTGGTTCAC
CCTGCGGATCTGTGCTTTAAATTGCCTGACAATGTGAGTTTGGAGGAAGGAGCAATGTGT
GAGCCACTAAGTGTTGGTGTGCATGCTTGTCGCCGAGCTGAGGTTGGTCCTGAGACAAAC
GTGTTGGTAATGGGAGCCGGACCTATTGGACTTGTCACCATGTTGGCTGCTCGTGCCTTT
GGTGTGCCAAGGATTGTGATTGTGGATGTTGATGATAACCGTTTATCCGTAGCCAAACAG
CTAGGCGCAGATGGGATTGTTAAAGTGACAACAAGCTTAGAGGATGTTGGTTTTGAGGTT
GAACAAATTAAGAAAGCTATAGGGTCAAACATCGATGTGACATTCGATTGTGCAGGTTTC
AACAAAACCATGTCGACGGCATTAGCAGCCACTCGATGCGGCGGTAAAGTTTGCCTTGTC
GGAATGGGTCATGGTATAATGACTGTCCCTCTCACTCCCGCAGCTGCAAGGGAGGTAGAT
GTGGTGGGTGTGTTCAGGTACAAGAACACATGGCCTTTATGTCTCGAGTTCCTTACAAGT
GGTAAGATTGATGTGAAGCCACTCATAACACACAGATTTGGTTTCTCTCAGAAGGAAGTG
GAAGATGCCTTTGAAACCAGTGCTCGTGGAAGCAATGCTATTAAAGTTATGTTCAATCTC
TGAAACAACCGTAAAAAGAAAAGGAACTATTTGATCTTCTAAGATCATTTCAATGTTTCT
GTAATAAGAATGCGTCTGCAACTGTGTTCATGTATCATCATCACTCTCGTTAATCCTTGT
TGAATAGATAAATCTTTTATTATGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 
45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 

AF RR2DY96TF U 1
AF RR2HA72TF U 32
AF RR2D534TF U 31
AF RR2GH56TF U 1
AF RR2B769TF U 1
AF RR2B769JQ C 489
AF RR2DY96JQ C 859
AF RR2D534JQ C 532
AF RR2HA72JQ C 510
BS 1 107 RR2B769TF
BS 108 108 RR2DY96TF
BS 109 486 RR2B769TF
BS 487 487 RR2DY96TF
BS 488 835 RR2B769TF
BS 836 836 RR2B769JQ
BS 837 858 RR2B769TF
BS 859 859 RR2B769JQ
BS 860 881 RR2B769TF
BS 882 938 RR2B769JQ
BS 939 939 RR2DY96JQ
BS 940 1286 RR2B769JQ

RD RR2DY96TF 630 0 0
GGATCTAAGAGTTGAGATCACTAGAGTAGCTTAGAGCAGAGAAGAGTTATGGGAAAAGGA
GGAATGTCTCAGGGAGAAGGCTCAAAGGTTGAAGAAGAGAACATGGCTGCCTGGTTGGTT
GGTGTCAACACTCTCAAGATCCAACCTTTTCCTCTTCCTTCCCTTGGTCCTCATGATGTG
AGAGTTAGGATGAAGGCTGTTGGAATTTGTGGAAGTGATGTTCATTACCTCAAGACCATG
AGATGTGCGGATTTCATTGTGAAAGAACCGATGGTGATTGGACATGAATGTGCCGGGATC
ATTGAAGAGGTAGGTGAAGGAGTGAAACATCTAGTGGTCGGTGACCGAGTGGCTCTTGAG
CCTGGGATTAGTTGCTGGAGATGCAACCTCTGCAAGGAAGGAAGATACAATCTTTGTCCT
GAGATGAAGTTCTTTGCAACCCCACCGGTTCATGGCTCTCTAGCTAACCAAGTGGTTCAC
CCTGCGGATCTGTGCTTTAAATTGCCTGACAATGTGAGTTTGGAGGAAGGAGCAATGTGT
GAGCCACTAAGTGTTGGTGTGCATGCTTGTCGCCGAGCTGAGGTTGGTCCTGAGACAAAC
GTGTTGGTAATGGGAGCCGGACCTATTGGA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2HA72TF 727 0 0
GGGG
GCAGAGAAGAGTTATGGGAAAAGGAGGAATGTCTCAGGGAGAAGGCTCAAAGGTTGAAGA
AGAGAACATGGCTGCCTGGTTGGTTGGTGTCAACACTCTCAAGATCCAACCTTTTCCTCT
TCCTTCCCTTGGCCCTCATGATGTGAGAGTTAGGATGAAGGCTGTTGGAATTTGTGGAAG
TGATGTTCATTACCTCAAGACCATGAGATGTGCGGATTTCATTGTGAAAGAACCGATGGT
GATTGGACATGAATGTGCCGGGATCATTGAAGAGGTAGGTGAAGGAGTGAAACATCTAGT
GGTCGGTGACCGAGTGGCTCTTGAGCCTGGGATTAGTTGCTGGAGATGCAACCTCTGCAA
GGAAGGAAGATACAATCTTTGTCCTGAGATGAAGTTCTTTGCAACCCCACCGGTTCATGG
CTCTCTAGCTAACCAAGTGGTTCACCCTGCGGATCTGTGCTTTAAATTGCCTGACAATGT
GAGTTTGGAGGAAGGAGCAATGTGTGAGCCACTAAGTGTTGGTGTGCATGCTTGTCGCCG
AGCTGAGGTTGGTCCTGAGACAAACGTGTTGGTAATGGGAGCCGGACCTATTGGACTTGT
CACCATGTTGGCTGCTCGTGCCTTTGGTGTGCCAAGGATTGTGATTGTGGATGTTGATGA
TAACCGTTTATCCGTAGCCAAACAGCTAGGCGCAGATGGGATTGTTAAAGTGACAACAAG
CTT

QA 5 727 5 727
DS 

RD RR2D534TF 750 0 0
GG
AGAGCAGAGAAGAGTTATGGGAAAAGGAGGAATGTCTCAGGGAGAAGGCTCAAAGGTTGA
AGAAGAGAACATGGCTGCCTGGTTGGTTGGTGTCAACACTCTCAAGATCCAACCTTTTCC
TCTTCCTTCCCTTGGTCCTCATGATGTGAGAGTTAGGATGAAGGCTGTTGGAATTTGTGG
AAGTGATGTTCATTACCTCAAGACCGTGAGATGTGCGGATTTCATTGTGAAAGAACCGAT
GGTGATTGGACATGAATGTGCCGGGATCATTGAAGAGGTAGGTGAAGGAGTGAAACATCT
AGTGGTCGGTGACCGAGTGGCTCTTGAGCCTGGGATTAGTTGCTGGAGATGCAACCTCTG
CAAGGAAGGAAGATACAATCTTTGTCCTGAGATGAAGTTCTTTGCAACCCCACCGGTTCA
TGGCTCTCTAGCTAACCAAGTGGTTCACCCTGCGGATCTGTGCTTTAAATTGCCTGACAA
TGTGAGTTTGGAGGAAGGAGCAATGTGTGAGCCACTAAGTGTTGGTGTGCATGCTTGTCG
CCGAGCTGAGGTTGGTCCTGAGACAAACGTGTTGGTAATGGGAGCCGGACCTATTGGACT
TGTCACCATGTTGGCTGCTCGTGCCTTTGGTGTGCCAAGGATTGTGATTGTGGATGTTGA
TGATAACCGTTTATCCGTAGCCAA*CAGCCAGGCGCAGATGGGATTGTTAAAGTGACA*C
AAGCTTAGAGGATGTTGGTTTTGAG
TTG

QA 3 747 3 747
DS 

RD RR2GH56TF 760 0 0
GGATCTAAGAGTTGAGATCACTAGAGTAGCTTAGAGCAGAGAAGAGTTATGGGAAAAGGA
GGAATGTCTCAGGGAGAAGGCTCAAAGGTTGAAGAAGAGAACATGGCTGCCTGGTTGGTT
GGTGTCAACACTCTCAAGATCCAACCTTTTCCTCTTCCTTCCCTTGGTCCTCATGATGTG
AGAGTTAGGATGAAGGCTGTTGGAATTTGTGGAAGTGATGTTCATTACCTCAAGACCATG
AGATGTGCGGATTTCATTGTGAAAGAACCGATGGTGATTGGACATGAATGTGCCGGGATC
ATTGAAGAGGTAGGTGAAGGAGTGAAACATCTAGTGGTCGGTGACCGAGTGGCTCTTGAG
CCTGGGATTAGTTGCTGGAGATGCAACCTCTGCAGGGAAGGAAGATACAATCTTTGTCCT
GAGATGAAGTTCTTTGCAACCCCACCGGTTCATGGCTCCCTAGCTAACCAAGTGGTTCAC
CCTGCGGATCTGTGCTTTAAATTGCCTGACAATGTGAGTTTGGAGGAAGGAGCAATGTGT
GAGCCACTAAGTGTTGGTGTGCATGCTTGTCGCCGAGCTGAGGTTGGTCCTGAGACAAAC
GTGTTGGTAATGGGAGCCGGACCTATTGGACTTGTCACCATGTTGGCTGCTCGTGCCTTT
GGTGTGCCAAGGATTGTGATTGTGGATGTTGATGATAACCGTTTATCCGTAGCCAA*CAG
CTAG*CGCAGATGGGATTGTTAAAGTGACA
CAGCTTAGAG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2B769TF 881 0 0
GGATCTAAGAGTTGAGATCACTAGAGTAGCTTAGAGCAGAGAAGAGTTATGGGAAAAGGA
GGAATGTCTCAGGGAGAAGGCTCAAAGGTTGAAGAAGAGAACATGGCCGCCTGGTTGGTT
GGTGTCAACACTCTCAAGATCCAACCTTTTCCTCTTCCTTCCCTTGGTCCTCATGATGTG
AGAGTTAGGATGAAGGCTGTTGGAATTTGTGGAAGTGATGTTCATTACCTCAAGACCATG
AGATGTGCGGATTTCATTGTGAAAGAACCGATGGTGATTGGACATGAATGTGCCGGGATC
ATTGAAGAGGTAGGTGAAGGAGTGAAACATCTAGTGGTCGGTGACCGAGTGGCTCTTGAG
CCTGGGATTAGTTGCTGGAGATGCAACCTCTGCAAGGAAGGAAGATACAATCTTTGTCCT
GAGATGAAGTTCTTTGCAACCCCACCGGTTCATGGCTCTCTAGCTAACCAAGTGGTTCAC
CCTGCGAATCTGTGCTTTAAATTGCCTGACAATGTGAGTTTGGAGGAAGGAGCAATGTGT
GAGCCACTAAGTGTTGGTGTGCATGCTTGTCGCCGAGCTGAGGTTGGTCCTGAGACAAAC
GTGTTGGTAATGGGAGCCGGACCTATTGGACTTGTCACCATGTTGGCTGCTCGTGCCTTT
GGTGTGCCAAGGATTGTGATTGTGGATGTTGATGATAACCGTTTATCCGTAGCCAAACAG
CTAGGCGCAGATGGGATTGTTAAAGTGACAACAAGCTTAGAGGATGTTGGTTTTGAGGTT
GAACAAATTAAGAAAGCTATAGGGTCAAACATCGATGTGACATTCGATTGTGCAG*TTTC
AACAAAACCATGTCGACG*CATTAGCAGCCACTCGATGCGG

QA 1 881 1 881
DS 

RD RR2B769JQ 798 0 0
TCTGTGCTTTAAATTGCCTGACAATGTGAGTTTGGAGGAAGGAGCAATGTGTGAGCCACT
AAGTGTTGGTGTGCATGCTTGTCGCCGAGCTGAGGTTGGTCCTGAGACAAACGTGTTGGT
AATGGGAGCCGGACCTATTGGACTTGTCACCATGTTGGCTGCTCGTGCCTTTGGTGTGCC
AAGGATTGTGATTGTGGATGTTGATGATAACCGTTTATCCGTAGCCAAACAGCTAGGCGC
AGATGGGATTGTTAAAGTGACAACAAGCTTAGAGGATGTTGGTTTTGAGGTTGAACAAAT
TAAGAAAGCTATAGGGTCAAACATCGATGTGACATTCGATTGTGCAGGTTTCAACAAAAC
CATGTCGACGGCATTAGCAGCCACTCGATGCGGCGGTAAAGTTTGCCTTGTCGGAATGGG
TCATGGTATAATGACTGTCCCTCTCACTCCTGCAGCTGCAAGGGAGGTAGATGTGGTGGG
TGTGTTCAGGTACAAGAACACATGGCCTTTATGTCTCGAGTTCCTTACAAGTGGTAAGAT
TGATGTGAAGCCACTCATAACACACAGATTTGGTTTCTCTCAGAAGGAAGTGGAAGATGC
CTTTGAAACCAGTGCTCGTGGAAGCAATGCTATTAAAGTTATGTTCAATCTCTGAAACAA
CCGTAAAAAGAAAAGGAACTATTTGATCTTCTAAGATCATTTCAATGTTTCTGTAATAAG
AATGCGTCTGCAACTGTGTTCATGTATCATCATCACTCTCGTTAATCCTTGTTGAATAGA
TAAATCTTTTATTATGGC

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2DY96JQ 428 0 0
GCATTAGCAGCCACTCGATGCAGCGGTAAAGTTTGCCTTGTCGGAATGGGTCATGGTATA
ATGACTGTCCCTCTCACTCCCGCAGCTGCAAGGGAGGTAGATGTGGTGGGTGTGTTCAGG
TACAAGAACACATGGCCTTTATGTCTCGAGTTCCTTACAAGTGGTAAGATTGATGTGAAG
CCACTCATAACACACAGATTTGGTTTTTTTCAGAAGGAAGTGGAAGATGCCTTTGAAACC
AGTGCTCGTGGAAGCAATGCTATTAAAGTTATGTTCAATTTTTGAAACAACCGTAAAAAG
AAAAGGAACTATTTGATTTTTTAAGATCATTTCAATGTTTCTGTAATAAGAATGCGTCTG
CAACTGTGTTCATGTATCATCATCACTCTCGTTAATCCTTGTTGAATAGATAAATCTTTT
ATT
ATGAC

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR2D534JQ 750 0 0
GCAATGTGTGAGCCACTAAGTGTTGGTGTGCATGCTTGTCGCCGAGCTGAGGTTGGTCCT
GAGACAAACGTGTTGGTAATGGGAGCCGGACCTATTGGACTTGTCACCATGTTGGCTGCT
CGTGCCTTTGGTGTGCCAAGGATTGTGATTGTGGATGTTGATGATAACCGTTTATCCGTA
GCCAAACAGCCAGGCGCAGATGGGATTGTTAAAGTGACAACAAGCTTAGAGGATGTTGGT
TTTGAGGTTGAACAAATTAAGAAAGCTATAGGGTCAAACATCGATGTGACATTCGATTGT
GCAGGTTTCAACAAAACCATGTCGACGGCATTAGCAGCCACTCGATGCGGCGGTAAAGTT
TGCCTTGTCGGAATGGGTCATGGTATAATGACTGTCCCTCTCACTCCCGCAGCTGCAAGG
GAGGTAGATGTGGTGGGTGTGTTCAGGTACAAGAACACATGGCCTTTATGTCTCGAGTTC
CTTACAAGTGGTAAGATTGATGTGAAGCCACTCATAACACACAGATTTGGTTTCTCTCAG
AAGGAAGTGGAAGATGCCTTTGAAACCAGTGCTCGTGGAAGCAATGCTATTAAAGTTATG
TTCAATCTCTGAAACAACCGTAAAAAGAAAAGGAACTATTTGATCTTCTAAGATCATTTC
AATGTTTCTGTAATAAGAATGCGTCTGCAACTGTGTTCATGTATCATCATCACTCTCGTT
AATCCTTGTTGAATAGATAAATCTTTTATT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2HA72JQ 772 0 0
CAATGTGAGTTTGGAGGAAGGAGCAATGTGTGAGCCACTAAGTGTTGGTGTGCATGCTTG
TCGCCGAGCTGAGGTTGGTCCTGAGACAAACGTGTTGGTAATGGGAGCCGGACCTATTGG
ACTTGTCACCATGTTGGCTGCTCGTGCCTTTGGTGTGCCAAGGATTGTGATTGTGGATGT
TGATGATAACCGTTTATCCGTAGCCAAACAGCTAGGCGCAGATGGGATTGTTAAAGTGAC
AACAAGCTTAGAGGATGTTGGTTTTGAGGTTGAACAAATTAAGAAAGCTATAGGGTCAAA
CATCGATGTGACATTCGATTGTGCAGGTTTCAACAAAACCATGTCGACGGTATTAGCAGC
CACTCGATGCGGCGGTAAAGTTTGCCTTGTCGGAATGGGTCATGGTATAATGACTGTCCC
TCTCACTCCCGCAGCTGCAAGGGAGGTAGATGTGGTGGGTGTGTTCAGGTACAAGAACAC
ATGGCCTTTATGTCTCGAGTTCCTTACAAGTGGTAAGATTGATGTGAAGCCACTCATAAC
ACACAGATTTGGTTTCTCTCAGAAGGAAGTGGAAGATGCCTTTGAAACCAGTGCTCGTGG
AAGCAATGCTATTAAAGTTATGTTCAATCTCTGAAACAACCGTAAAAAGAAAAGGAACTA
TTTGATCTTCTAAGATCATTTCAATGTTTCTGTAATAAGAATGCGTCTGCAACTGTGTTC
ATGTATCATCATCACTCTCGTTAATCCTTGTTGAATAGATAAATCTTTTAT
C

QA 1 771 1 771
DS 



CO CL470Contig2 1289 2 4 U
GTGGATGATTTCGATGCTGACTCCTTTATTTTCTTTAATCATTCTTCAAGAAGAGTTATG
GGAAAAGGAGGAATGTCTCAGGGAGAAGGCTCAAAGGTGGAAGAAGAGAACATGGCTGCT
TGGTTGGTTGGTCTCAACACTCTCAAGATCCAACCTTTTCCCCTCCCTTCCCTTGGTCCT
CATGATGTGAGAGTTAGGATGAAGGCTGTTGGAATTTGTGGAAGTGATGTTCATTACCTA
AAGACCATGAGATGTGCGGATTTCATTGTGAAAGAACCGATGGTGATTGGACATGAATGC
GCTGGGATCATTGAAGAGGTAGGTGAAGGAGTGAAACATCTAGTGGTCGGTGACCGAGTG
GCTCTTGAGCCTGGGATTAGTTGCTGGAGATGCAACCTCTGCAAGGAAGGAAGATACAAT
CTTTGTCCTGAGATGAAGTTCTTTGCAACCCCACCGGTTCATGGCTCTCTAGCTAACCAA
GTGGTTCACCCTGCGGATCTATGTTTTAAATTGCCTGACAATGTGAGTCTGGAGGAAGGA
GCAATGTGTGAGCCACTAAGTGTTGGTGTGCATGCTTGTCGCCGAGCTGAGGTTGGTCCT
GAGACAAACGTGTTGGTAATGGGAGCCGGACCTATTGGACTTGTCACCATGTTGGCTGCT
CGTGCTTTTGGTGTACCAAGGATTGTGATTGTGGATGTTGATGATAACCGTTTATCTGTA
GCCAAACAGCTAGGCGCAGATGGGATTGTCAAAGTGACAACAAGCTTAGAGGATGTTGGT
TTTGAGGTTGAACAAATTAAGAAAGCTATAGGGTCAAACATCGATGTGACATTCGATTGT
GCAGGTTTCAACAAAACCATGTCGACGGCATTAGCAGCCACTCGATGCGGCGGTAAAGTC
TGCCTTGTCGGAATGGGTCATGGTATAATGACTGTCCCTCTCACTCCCGCAGCTGCAAGG
GAGGTAGATGTGGTGGGTGTGTTCAGGTACAAGAACACATGGCCTTTATGTCTTGAGTTC
CTTACAAGTGGTAAGATTGATGTGAAGCCACTCATAACCCACAGATTTGGTTTCTCTCAG
AAGGAAGTGGAAGATGCCTTTGAAACTAGTGCTCGTGGAAGCAATGCTATTAAAGTTATG
TTCAATCTCTGAAACAACCCTAAAAAGAAAAAGAGTATTTGCTCTTCTAAGAACATTTCA
ATGTTTCTGTAATAAGAATGCGTCTGCAGCTTTGTTCATGTATCATCATCACTCTCGTTA
ATCCTTGTTGAATTGATAAATCTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS63TF U 1
AF RR2FS63JQ C 460
BS 1 759 RR2FS63TF
BS 760 760 RR2FS63JQ
BS 761 772 RR2FS63TF
BS 773 1289 RR2FS63JQ

RD RR2FS63TF 772 0 0
GTGGATGATTTCGATGCTGACTCCTTTATTTTCTTTAATCATTCTTCAAGAAGAGTTATG
GGAAAAGGAGGAATGTCTCAGGGAGAAGGCTCAAAGGTGGAAGAAGAGAACATGGCTGCT
TGGTTGGTTGGTCTCAACACTCTCAAGATCCAACCTTTTCCCCTCCCTTCCCTTGGTCCT
CATGATGTGAGAGTTAGGATGAAGGCTGTTGGAATTTGTGGAAGTGATGTTCATTACCTA
AAGACCATGAGATGTGCGGATTTCATTGTGAAAGAACCGATGGTGATTGGACATGAATGC
GCTGGGATCATTGAAGAGGTAGGTGAAGGAGTGAAACATCTAGTGGTCGGTGACCGAGTG
GCTCTTGAGCCTGGGATTAGTTGCTGGAGATGCAACCTCTGCAAGGAAGGAAGATACAAT
CTTTGTCCTGAGATGAAGTTCTTTGCAACCCCACCGGTTCATGGCTCTCTAGCTAACCAA
GTGGTTCACCCTGCGGATCTATGTTTTAAATTGCCTGACAATGTGAGTCTGGAGGAAGGA
GCAATGTGTGAGCCACTAAGTGTTGGTGTGCATGCTTGTCGCCGAGCTGAGGTTGGTCCT
GAGACAAACGTGTTGGTAATGGGAGCCGGACCTATTGGACTTGTCACCATGTTGGCTGCT
CGTGCTTTTGGTGTACCAAGGATTGTGATTGTGGATGTTGATGATAACCGTTTATCTGTA
GCCAAACAGCTAGGCGCAGATGGGATTGTCAAAGTGACA*CAAGCTTAGAGG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2FS63JQ 830 0 0
CATGGCTCTCTAGCTAACCAAGTGGTTCACC*TGCGGATCTATGTTTTAAATTGC*TGAC
AATGTGAGTCTGGAGGAAGGAGCAATGTGTGAGCCACTAAGTGTTGGTGTGCATGCTTGT
CGCCGAGCTGAGGTTGGTCCTGAGACAAACGTGTTGGTAATGGGAGCCGGACCTATTGGA
CTTGTCACCATGTTGGCTGCTCGTGCTTTTGGTGTACCAAGGATTGTGATTGTGGATGTT
GATGATAACCGTTTATCTGTAGCCAAACAGCTAGGCGCAGATGGGATTGTCAAAGTGACA
ACAAGCTTAGAGGATGTTGGTTTTGAGGTTGAACAAATTAAGAAAGCTATAGGGTCAAAC
ATCGATGTGACATTCGATTGTGCAGGTTTCAACAAAACCATGTCGACGGCATTAGCAGCC
ACTCGATGCGGCGGTAAAGTCTGCCTTGTCGGAATGGGTCATGGTATAATGACTGTCCCT
CTCACTCCCGCAGCTGCAAGGGAGGTAGATGTGGTGGGTGTGTTCAGGTACAAGAACACA
TGGCCTTTATGTCTTGAGTTCCTTACAAGTGGTAAGATTGATGTGAAGCCACTCATAACC
CACAGATTTGGTTTCTCTCAGAAGGAAGTGGAAGATGCCTTTGAAACTAGTGCTCGTGGA
AGCAATGCTATTAAAGTTATGTTCAATCTCTGAAACAACCCTAAAAAGAAAAAGAGTATT
TGCTCTTCTAAGAACATTTCAATGTTTCTGTAATAAGAATGCGTCTGCAGCTTTGTTCAT
GTATCATCATCACTCTCGTTAATCCTTGTTGAATTGATAAATCTTTTATT

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 11

CO CL471Contig1 445 11 13 U
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAA**GAAAGAAACAAAACTACCACTAAAAAA*CAAAA
AGAAAAAAAA*CTTTCAGGTCTCAACTAGAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGTGGAGT
TCTTTTCGCTGCTGCTTCCATGACCACCGTCATGGCCACAGAGGTTGGAGCTCCGGCACC
AGGACCCGCCGCAAGTGGAGCCTCCGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGAGC
TTCCCTTGTGTCTCTCTTCACCTACTACTTAAACTAAATAAGCTTATACAAAAAAAA**T
TGATGTTTCTATCAATTTATACTACGTCACGGTTTTGTACGTGTAGGCAAAGTGAATAAG
ACGGAAGAAGAAATAATCTGATTATGATCAGATAATCTTTATGTAATACATGCTGATTAT
AAAAATATACAATGGGTTCTTCTCC


BQ
55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 55 25 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 

AF RR2DE63JQ C 1
AF RR2DE63TF U 1
AF RR2AW85JQ C 1
AF RR2H003TF U 1
AF RR2EM03JQ C 1
AF RR2EQ44TF U 1
AF RR2F221JQ C 1
AF RR2F221TF U 1
AF RR2EM03TF U 1
AF RR2EN25TF U 2
AF RR2AW85TFB U 296
BS 1 25 RR2DE63TF
BS 26 27 RR2F221TF
BS 28 54 RR2DE63TF
BS 55 55 RR2F221TF
BS 56 289 RR2DE63TF
BS 290 296 RR2EQ44TF
BS 297 297 RR2F221TF
BS 298 299 RR2EQ44TF
BS 300 300 RR2F221TF
BS 301 396 RR2EQ44TF
BS 397 397 RR2F221TF
BS 398 444 RR2EQ44TF
BS 445 445 RR2F221TF

RD RR2DE63JQ 289 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAAACGAAAGAAACAAAACTACCACTAAAAAAACAAAA
AGAAAAAAAA*CTTTCAGGTCTCAACTAGAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGTGGAGT
TCTTTTCGCTGCTGCTTCCATGACCACCGTCATGGCCACAGAGGTTGGAGCTCCGGCACC
AGGACCCGCCGCAAGTGGAGCCTCCGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGAGC
TTCCCTTGTGTCTCTCTTCACCTACTACTTAAACTAAATAAGCTTATAC

QA 1 289 1 289
DS 

RD RR2DE63TF 289 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAAACGAAAGAAACAAAACTACCACTAAAAAAACAAAA
AGAAAAAAAA*CTTTCAGGTCTCAACTAGAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGTGGAGT
TCTTTTCGCTGCTGCTTCCATGACCACCGTCATGGCCACAGAGGTTGGAGCTCCGGCACC
AGGACCCGCCGCAAGTGGAGCCTCCGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGAGC
TTCCCTTGTGTCTCTCTTCACCTACTACTTAAACTAAATAAGCTTATAC

QA 1 289 1 289
DS 

RD RR2AW85JQ 407 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAA**GAAAGAAACAAAACTACCATTAAAAAA*CAAAA
AGAAAAAAAA*CTTTCAGGTTTCAACTAGAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGTGGAGT
TTTTTTCGCTGCTGCTTCCATGACCACCGTCATGGCCACAGAGGTTGGAGTTCCGGCACC
AGGACCCGCCGCAAGTGGAGCCTCCGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTGGGAGC
TTCCCTTGTGTCTCTCTTCACCTACTACTTAAACTAAATAAGCTTATACAAAAAAA***T
TGATGTTTCTATCAATTTATATTACGTCACGGTTTTGTACGTGTAGGCAAAGTGAATAAG
ACGGAAGAAGAAATAATCTGATTATGATCAGATAATCTTTATGTAAT

QA 1 407 1 407
DS 

RD RR2H003TF 412 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAA***GAAAGAAACAAAACTACCACTAAAAAA*CAAAA
AGAAAAAAAAACTTTCAGGTCTCAACTAGAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGTGGAGT
TCTTTTCGCTGCTGCTTCCATGACCACCGTCATGGCCACAGAGGTTGGAGCTCCGGCACC
AGGACCCGCCGCAAGTGGAGCCTCCGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGAGC
TTCCCTTGTGTCTCTCTTCACCTACTACTTAAACTAAATAAGCTTATACAAAAAAAAA*T
TGATGTTTCTATCAATTTATACTACGTCACGGTTTTGTACGTGTAGGCAAAGTGAATAAG
ACGGAAGAAGAAATAATCTGATTATGATCAGATAATCTTTATGTAATACATG

QA 1 412 1 412
DS 

RD RR2EM03JQ 445 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAA**GAAAGAAACAAAACTACCACTAAAAAA*CAAAA
AGAAAAAAAA*CTTTCAGGTCTCAACTAGAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGTGGAGT
TCTTTTCGCTGCTGCTTCCATGACCACCGTCATGGCCACAGAGGTTGGAGCTCCGGCACC
AGGACCCGCCGCAAGTGGGGCCTCCGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGAGC
TTCCCTTGTGTCTCTCTTCACCTACTACTTAAACTAAATAAGCTTATACAAAAAAAA**T
TGATGTTTCTATCAATTTATATTACGTCACGGTTTTGTACGTGTAGGCAAAGTGAATAAG
ACGGAAGAAGAAATAATCTGATTATGATCAGATAATCTTTATGTAATACATGCTGATTAT
AAAAATATACAATGGGTTCTTCTCC

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR2EQ44TF 446 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAAAATAAAGAAACAAAACTACCACTAAAAAAACAAAA
AGAAAAAAAA*CTTTCAGGTCTCAACTAGAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGTGGAGT
TCTTTTCGCTGCTGCTTCCATGACCACCGTCATGGCCACAGAGGTTGGAGCTCCGGCACC
AGGACCCGCCGCAAGTGGAGCCTCCGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGAGC
TTCCCTTGTGTCTCTCTTCACCTACTACTTAAACTAAATAAGCTTATACAAAAAAA****
TGATGTTTCTATCAATTTATACTACGTCACGGTTTTGTACGTGTAGGCAAAGTGAATAAG
ACGGAAGAAGAAATAATCTGATTATGATCAGATAATTTTTATGTAATACATGCTGATTAT
AAAAATATACAATGGGTTCTTCTC
AC

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR2F221JQ 445 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAA**GAAAGAAACAAAACTACCACTAAAAAA*CAAAA
AGAAAAAAAA*CTTTCAGGTTTCAACTAGAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGTGGAGT
TCTTTTCGCTGCTGCTTCCATGACCACCGTCATGGCCCCAGAGGTTGGAGCTCCGGCACC
AGGACCCGCCGCAAGTGGAGCCTCCGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGAGC
TTCCCTTGTGTCTCTCTTCACCTACTACTTAAACTAAATAAGCTTATACAAAAAAAAAAT
TGATGTTTCTATCAATTTATACTACGTCACGGTTTTGTACGTGTAGGCAAAGTGAATAAG
ACGGAAGAAGAAATAATCTGATTATGATCAGATAATCTTTATGTAATACATGCTGATTAT
AAAAATATACAATGGGTTCTTCTCC

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR2F221TF 445 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAA**GAAAGAAACAAAACTACCACTAAAAAA*CAAAA
AGAAAAAAAA*CTTTCAGGTCTCAACTAGAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGTGGAGT
TCTTTTCGCTGCTGCTTCCATGACCACCGTCATGGCCACAGAGGTTGGAGCTCCGGCACC
AGGACCCGCCGCAAGTGGAGCCTCCGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGAGC
TTCCCTTGTGTCTCTCTTCACCTACTACTTAAACTAAATAAGCTTATACAAAAAAAAAAT
TGATGTTTCTATCAATTTATACTACGTCACGGTTTTGTACGTGTAGGCAAAGTGAATAAG
ACGGAAGAAGAAATAATCTGATTATGATCAGATAATCTTTATGTAATACATGCTGATTAT
AAAAATATACAATGGGTTCTTCTCC

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR2EM03TF 445 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAA**GAAAGAAACAAAACTACCACTAAAAAA*CAAAA
AGAAAAAAAA*CTTTCAGGTCTCAACTAGAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGTGGAGT
TCTTTTCGCTGCTGCTTCCATGACCACCGTCATGGCCACAGAGGTTGGAGCTCCGGCACC
AGGACCCGCCGCAAGTGGGGCCTCCGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGAGC
TTCCCTTGTGTCTCTCTTCACCTACTACTTAAACTAAATAAGCTTATACAAAAAAAA**T
TGATGTTTCTATCAATTTATACTACGTCACGGTTTTGTACGTGTAGGCAAAGTGAATAAG
ACGGAAGAAGAAATAATCTGATTATGATCAGATAATCTTTATGTAATACATGCTGATTAT
AAAAATATACAATGGGTTCTTCTCC

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR2EN25TF 441 0 0
GAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAA**GAAAGAAACAAAACTACCACTAAAAAA*CAAAAA
GAAAAAAAA*CTTTCAGGTCTCAACTAGAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGTGGAGTT
CTTTTCGCTGCTGCTTCCATGACCACCGTCATGGCCACAGAGGTTGGAGCTCCGGCACCA
GGACCCGCCGCAAGTGGAGCCTCCGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGAGCT
TCCCTTGTGTCTCTCTTCACCTACTACTTAAACTAAATAAGCTTATACAAAAAAAA**TT
GATGTTTCTATCAATTTATACTACGTCACGGTTTTGTACGTGTAGGCAAAGTGAATAAGA
CGGAAGAAGAAATAATCTGATTATGATCAGATAATCTTTATGTAATACATGCTGATTATA
AAAATATACAATGGGTTCTTC

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR2AW85TFB 150 0 0
AAAATTGATGTTTCTATCAATTTATACTACGTCACGGTTTTGTACGTGTAGGCAAAGTGA
ATAAGACGGAAGAAGAAATAATCTGATTATGATCAGATAATCTTTATGTAATACATGCTG
ATTATAAAAATATACAATGGGTTCTTCTCC

QA 1 150 1 150
DS 



AS 1 9

CO CL472Contig1 836 9 39 U
AAAAATAAAGGAAGAATAATGAGACCACTCTTTTGCTAGAGTTTCTTGTCTGAAGCAGTT
ATGATAAAAGCTGAGA**ACAATAGAGGATCACAT*AAATCCCAAAGCAATACAACGAAA
AATAACATGTTTTGATATCCAATAATAAATAAAACCCATTGTGTCCTTTAGGGTGGGTTT
CTCCTTAGCTTGTTAAGCAGCATCAGAGGTCACAAGAATAAATAGTGGCGTCTCTCCTAG
CTTCTCCCTTCCCTTGAGCACTGGTAACTCAATCACGCAAGCACACTCAGCAATCGTCAC
TCCTACTCGCTCAAGAAGACGGATAGCAGCAGCGAGAGTGCCACCAGTGGCAATGAGGTC
ATCAATGATGATAGCACGCTCACCAGGCTCTACAGCACCTACATGCATCTCTATCTTATC
TGTTCCATACTCCAACGAATACTCCTCCGATATTACCTTCCCAGGGAGCTTCTTGGGCTT
CCTCATGGGAACAAATTTGGCACCAATAGCCAAGGCAATAGGAGGGCCAAAAATGAAACC
TCTTGCTTCAACACCAGCAACAACAGAGATGCCTTTGCCTTTGTATCTTTCAACAAAAAT
ATCAATGGTGTCCTTAAAGGCCTCAGTGTCGAGAAGCAGCGTGGTTATGTCCTGAAACAT
GATCCCTGGTTTAGGGAAGTCGGGGATGACTCTAATGGAAGAGGCGATCTTTGGGATTCT
CGGATCTTGCACCTCTTCTTCTTTAGTTCCTGCCATGATCTCCCTCTTCCGACTCGCGGC
TTGCTGCTGCTTTGAACACACAAAGAGAATCGGAGAACAAATGAGAGAGAAGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW37JQ U 96
AF RR2DX28JQ U 1
AF RR2FP24JQ U 30
AF RR2H974JQ U 30
AF RR2GT54JQB U 21
AF RR2FP24TF C 144
AF RR2H974TF C 69
AF RR2BW37TF C 536
AF RR2GT54TF C 162
BS 1 36 RR2DX28JQ
BS 37 38 RR2GT54JQB
BS 39 53 RR2DX28JQ
BS 54 55 RR2GT54JQB
BS 56 57 RR2DX28JQ
BS 58 58 RR2GT54JQB
BS 59 76 RR2DX28JQ
BS 77 78 RR2GT54JQB
BS 79 82 RR2DX28JQ
BS 83 83 RR2GT54JQB
BS 84 84 RR2DX28JQ
BS 85 85 RR2GT54JQB
BS 86 89 RR2DX28JQ
BS 90 90 RR2GT54JQB
BS 91 92 RR2DX28JQ
BS 93 93 RR2GT54JQB
BS 94 95 RR2DX28JQ
BS 96 96 RR2GT54JQB
BS 97 261 RR2DX28JQ
BS 262 262 RR2GT54JQB
BS 263 393 RR2DX28JQ
BS 394 394 RR2GT54JQB
BS 395 453 RR2DX28JQ
BS 454 454 RR2GT54JQB
BS 455 465 RR2DX28JQ
BS 466 466 RR2GT54JQB
BS 467 474 RR2DX28JQ
BS 475 475 RR2GT54JQB
BS 476 534 RR2DX28JQ
BS 535 535 RR2GT54JQB
BS 536 555 RR2DX28JQ
BS 556 556 RR2GT54JQB
BS 557 599 RR2DX28JQ
BS 600 674 RR2GT54JQB
BS 675 711 RR2H974TF
BS 712 712 RR2BW37TF
BS 713 730 RR2H974TF
BS 731 731 RR2BW37TF
BS 732 836 RR2H974TF

RD RR2BW37JQ 147 0 0
TAAATCCCAAAGCAATACAACGAAAAATAACATGTTTTGATATCCAATAATAAATAAAAC
CCATTGTGTCCTTTAGGGTGGGTTTCTCCTTAGCTTGTTAAGCAGCATCAAAGGTCACAA
GAATAAATAGTGGCGTCTCTCCTAGCT

QA 1 147 1 147
DS 

RD RR2DX28JQ 599 0 0
AAAAATAAAGGAAGAATAATGAGACCACTCTTTTGCACGAGTTTCTTGTCTGAGACAATT
ATGATAAAAGCTGAGAGAACAACAAAGGACCATATCAAATCCCAAAGCAATACAACGAAA
AATAACATGTTTTGATATCCAATAATAAATAAAACCCATTGTGTCCTTTAGGGTGGGTTT
CTCCTTAGCTTGTTAAGCAGCATCAGAGGTCACAAGAATAAATAGTGGCGTCTCTCCTAG
CTTCTCCCTTCCCTTGAGCACAGGTAACTCAATCACGCAAGCACACTCAGCAATCGTCAC
TCCTACTCGCTCAAGAAGACGGATAGCAGCAGCGAGAGTGCCACCAGTGGCAATGAGGTC
ATCAATGATGATAGCACGCTCACCAGGCTCTACCGCACCTACATGCATCTCTATCTTATC
TGTTCCATACTCCAACGAATACTCCTCCGATATCACCTTCCCAGGAAGCTTCTTAGGCTT
CCTCATGGGAACAAATTTGGCACCAATAGCCAAGGCAATAGGAGGGCCAAAAATAAAACC
TCTTGCTTCAACACCTGCAACAACAGAGATGCCTTTGCCTTTGTATCTTTCAACAAAAA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2FP24JQ 535 0 0
CTTTTGCTAGAGTTTCTTGTCTGAAGCAGTTATGATAAAAGCTGAAA**ACAATAGAGGA
TCACAT*AAATCCCAAAGCAATACAACGAAAAATAACATGTTTTGATATCCAATAATAAA
TAAAACCCATTGTGTCCTTTAGGGTGGGTTTCTCCTTAGCTTGTTAAGCAGCATCAGAGG
TCACAAGAATAAATAGTGGCGTCTCTCCTAGCTTCTCCCTTCCCTTGAGCACTGGTAACT
CAATCACGCAAGCACACTCAGCAATCGTCACTCCTACTCGCTCAAGAAGACGGATAGCAG
CAGCGAGAGTGCCACCAGTGGCAATGAGGTCATCAATGATGATAGCACGCTCACCAGGCT
CTACAGCACCTACATGCATCTCTATCTTATCTGTTCCATACTCCAACGAATACTCCTCCG
ATATTACCTTCCCAGGGAGCTTCTTGGGCTTCCTCATGGGAACAAATTTGGCACCAATAG
CCAAGGCAATAGGAGGGCCAAAAATGAAACCTCTTGCTTCAACACCAGCAACAAC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2H974JQ 535 0 0
CTTTTGCTAGAGTTTCTTGTCTGAAGCAGTTATGATAAAAGCTGAAA**ACAATAGAGGA
TCACAT*AAATCCCAAAGCAATACAACGAAAAATAACATGTTTTGATATCCAATAATAAA
TAAAACCCATTGTGTCCTTTAGGGGGGGTTTCTCCTTAGCTTGTTAAGCAGCATCAGAGG
TCACAAGAATAAATAGTGGCGTCTCTCCTAGCTTCTCCCTTCCCTTGAGCACTGGTAATT
CAATCACGCAAGCACACTCAGCAATCGTCACTCCTACTCGCTCAAGAAGACGGATAGCAG
CAGCGAGAGTGCCACCAGTGGCAATGAGGTCATCAATGATGATAGCACGCTCACCAGGCT
CTACAGCACCTACATGCATCTCTATCTTATCTGTTCCATACTCCAACGAATACTCCTCCG
ATATTACCTTCCCAGGGAGCTTCTTGGGCTTCCTCATGGGAACAAATTTGGCACCAATAG
CCAAGGCAATAGGAGGGCCAAAAATGAAACCTCTTGCTTCAACACCAGCAACAAC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2GT54JQB 654 0 0
A
AGACCACTCTTTTGCTAGAGTTTCTTGTCTGAAGCAGTTATGATAAAAGCTGAGA**ACA
ATAGAGGATCACAT*AAATCCCAAAGCAATACAACGAAAAATAACATGTTTTGATATCCA
ATAATAAATAAAACCCATTGCGTCCTTTAGGGTGGGTTTCTCCTTAGCTTGTTAAGCAGC
ATCAGAGGTCACAAGAATAAATAGTGGCGTCTCTCCTAGCTTCTCCCTTCCCTTGAGCAC
TGGTAACTCAATCACGCAAGCACACTCAGCAATCGTCACTCCTACTCGCTCAAGAAGACG
GATAGCAGCAGCGAGAGTGCCACCAGTGGCAATGAGGTCATCAATGATGATAGCACGCTC
ACCAGGCTCTACAGCACCTACATGCATCTCTATCTTATCTGTTCCATACTCCAACGAATA
CTCCTCCGATATTACCTTCCCAGGGAGCTTCTTGGGCTTCCTCATGGGAACAAATTTGGC
ACCAATAGCCAAGGCAATAGGAGGGCCAAAAATGAAACCTCTTGCTTCAACACCAGCAAC
AACAGAGATGCCTTTGCCTTTGTATCTTTCAACAAAAATATCAATGGTGTCCTTAAAGGC
CTCAGTGTCGAGAAGCAGCGTGGTTATGTCCTGAAACATGATCCCTGGTTTAG

QA 2 654 2 654
DS 

RD RR2FP24TF 545 0 0
AATAAATAAAACCCATTGTGTCCTTTAGGGTGGGTTTCTCCTTAGCTTGTTAAGCAGCAT
CAGAGGTCACAAGAATAAATAGTGGCGTCTCTCCTAGCTTCTCCCTTCCCTTGAGCACTG
GTAACTCAATCACGCAAGCACACTCAGCAATCGTCACTCCTACTCGCTCAAGAAGACGGA
TAGCAGCAGCGAGAGTGCCACCAGTGGCAATGAGGTCATCAATGATGATAGCACGCTCAC
CAGGCTCTACAGCACCTACATGCATCTCTATCTTATCTGTTCCATACTCCAACGAATACT
CCTCCGATATTACCTTCCCAGGGAGCTTCTTGGGCTTCCTCATGGGAACAAATTTGGCAC
CAATAGCCAAGGCAATAGGAGGGCCAAAAATGAAACCTCTTGCTTCAACACCAGCAACAA
CAGAGATGCCTTTGCCTTTGTATCTTTCAACAAAAATATCAATGGTGTCCTTAAAGGCAT
CAGTGTCGAGAAGCAGCGTGGTTATGTCCTGAAACATGATCCCTGGTTTAGGGAAGTCGG
GGAT
C

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2H974TF 768 0 0
AGCTGAGA**ACAATAGAGGATCACAT*AAATCCCAAAGCAATACAACGAAAAATAACAT
GTTT*GATATCCAATAATAAATAAAACCCATTGTGTC*TTTAGGGTGGGTTTCTCCTTAG
CTTGTTAAGCAGCATCAGAGGTCACAAGAATAAATAGTGGCGTCTCTCCTAGCTTCTCCC
TTCCCTTGAGCACTGGTAATTCAATCACGCAAGCACACTCAGCAATCGTCACTCCTACTC
GCTCAAGAAGACGGATAGCAGCAGCGAGAGTGCCACCAGTGGCAATGAGGTCATCAATGA
TGATAGCACGCTCACCAGGCTCTACAGCACCTACATGCATCTCTATCTTATCTGTTCCAT
ACTCCAACGAATACTCCTCCGATATTACCTTCCCAGGGAGCTTCTTGGGCTTCCTCATGG
GAACAAATTTGGCACCAATAGCCAAGGCAATAGGAGGGCCAAAAATGAAACCTCTTGCTT
CAACACCAGCAACAACAGAGATGCCTTTGCCTTTGTATCTTTCAACAAAAATATCAATGG
TGTCCTTAAAGGCCTCAGTGTCGAGAAGCAGCGTGGTTATGTCCTGAAACATGATCCCTG
GTTTAGGGAAGTCGGGGATGACTCTAATGGAAGAGGCGATCTTCGGGATTCTCGGATCTT
GCGCCTCTTCTTCTTTAGTTCCTGCCATGATCTCCCTCTTCCGACTCGCGGCTTGCTGCT
GCTTTGAACACACAAAGAGAATCGGAGAACAAATGAGAGAGAAGGCCC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2BW37TF 285 0 0
AAACCTCTTGCTTCAACACCAGCAACAACAGAGATGCCTTTGCCTTTGTATCTTTCAACA
AAAATATCAATGGTGTCCTTAAAGGCCTCAGTGTCGAGAAGCAGCGTGGTTATGTCCTGA
AACATGATCCCTGGTTTAGGGAAGTCGGGGATGACTCTAATGGAAGAGGCGATCTTTGGG
ATTCTCGGATCTTGCACCTCTTCTTCTTTAGTTCCTGCCATGATCTCCCTCTTCCGACTC
GCGGCTTGCTGCTGCTTTGAACACACAAAGAGAATCGG
AGAACCC

QA 1 278 1 278
DS 

RD RR2GT54TF 635 0 0
GCGT
CTTTAGGGTGGGTTTCTC*TTAGCTTGTTAAGCAGCATCAGAGGTCACAAGAATAAATAG
TGGCGTCTCTCCTAGCTTCTCCCTTCCCTTGAGCACTGGTAACTCAATCACGCAAGCACA
CTCAGCAATCGTCACTCCTACTCGCTCAAGAAGACGGATAGCAGCAGCGAGAGTGCCACC
AGTGGCAATGAGGTCATCAATGATGATAGCACGCTCACCAGGCTCTACAGCACCTACATG
CATCTCTATCTTATCTGTTCCATACTCCAACGAATACTCCTCCGATATTACCTTCCCAGG
GAGCTTCTTGGGCTTCCTCATGGGAACAAATTTGGCACCAATAGCCAAGGCAATAGGAGG
GCCAAAAATGAAACCTCTTGCTTCAACACCAGCAACAACAGAGATGCCTTTGCCTTTGTA
TCTTTCAACAAAAATATCAATGGTGTCCTTAAAGGCCTCAGTGTCGAGAAGCAGCGTGGT
TATGTCCTGAAACATGATCCCTGGTTTAGGGAAGTCGGGGATGACTCTAATGGAAGAGGC
GATCTTTGGGATTCTCGGATCTTGCACCTCTTCTTCTTTAGTTCCTGCCATGATCTCCCT
CTTCCGACTCGCGGCTTG
CTGCTGCTTTTCC

QA 5 622 5 622
DS 



AS 1 10

CO CL473Contig1 617 10 13 U
GGACTCACCAAAGCATCATATACACTTTTACTTCTCTTCTCATCCTCTTTGTTTTTTCTC
TCTTTAGCTTTCGTCCTTTCGAAATGGCCAACGTTGAGAATGAACAAGTGATTGCTCCAG
CAGAAGAGAACGTTGAGTTGCCAACAAAGACGGTGGAGGAGCCAGAAGTTACGGAACAGC
CGGAAGAAGTCGTCACCGCGACAGAAGAAGAATCTGAAGCACCAGTGGAAGAAACGAGCA
AAGATGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGCAAAAAGAAGAAGAAGCAGAGAAAGAAACGGAAG
AGCCAAAGGTAGAAGAGAAGACAGAAACTCCGGTGGTTGTGGAGGAGCCAAAGGAAGAAG
AGAAGGAGGAGGAGACTGAAACCCCAGCTGTTGTGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGACTG
AGGCAGAGGAAGTTGTGGCTGCTGAGGAAGTCGCCGCCGAGTAAAGAGCAAGAAACTATA
TATGACCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTCTTTTTAAATTATATTTTATCAAAATTTCAT
ATGTATTTTCTGTATCGTTTGTTTGGGTTTATGATGATGTAATCAGATCTTTGGTTATGA
TGATTATTCGGTTAACG


BQ
50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 15 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 50 50 50 45 45 35 25 25 25 25 10 10 

AF RR2CD25JQ C 1
AF RR2B961JQ C 5
AF RR2B961TF U 5
AF RR2DP84TF U 1
AF RR2CD25TF U 1
AF RR2D104JQ C 1
AF RR2D104TF U 1
AF RR2D626JQ C 1
AF RR2D626TF U 1
AF RR2H721TF U 1
BS 1 6 RR2DP84TF
BS 7 47 RR2B961TF
BS 48 48 RR2DP84TF
BS 49 268 RR2B961TF
BS 269 269 RR2DP84TF
BS 270 349 RR2B961TF
BS 350 350 RR2DP84TF
BS 351 605 RR2B961TF
BS 606 608 RR2DP84TF
BS 609 610 RR2CD25TF
BS 611 611 RR2D104TF
BS 612 615 RR2D626TF
BS 616 617 RR2D626JQ

RD RR2CD25JQ 611 0 0
GGACTCACCAAAGCATCATATACACTTTTACTTCTCTTCTCATCCTCTTTGTTTTTTCTC
TCTTTAGCTTTCGTCCTTTCGAAATGGCCAACGTTGAGAATGAACAAGTGATTGCTCCAG
CAGAAGAGAACGTTGAGTTGCCAACAAAGACGGTGGAGGAGCCAGAAGTTACGGAACAGC
CGGAAGAAGTCGTCACCGCGACAGAAGAAGAATCTGAAGCACCAGTGGAAGAAACGAGCA
AAGATGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGCAAAAAGAAGAAGAAGCAGAGAAAGAAACGGAAG
AGCCAAAGGTAGAAGAGAAGACAGAAACTCCGGTGGTTGTGGAGGAGCCAAAGGAAGAAG
AGAAGGAGGAGGAGACTGAAACCCCAGCTGTTGTGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGACTG
AGGCAGAGGAAGTTGTGGCTGCTGAGGAAGTCGCCGCCGAGTAAAGAGCAAGAAACTATA
TATGACCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTCTTTTTAAATTATATTTTATCAAAATTTCAT
ATGTATTTTCTGTATCGTTTGTTTGGGTTTATGATGATGTAATCAGATCTTTGGTTATGA
TGATTATTCG
C

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2B961JQ 601 0 0
GG
ACCAAAGCATCATATACACTTTTACTTCTCTTCTCATCCTCCTTGTTTTTTCTCTCTTTA
GCTTTCGTCCTTTCGAAATGGCCAACGTTGAGAATGAACAAGTGATTGCTCCAGCAGAAG
AGAACGTTGAGTTGCCAACAAAGACGGTGGAGGAGCCAGAAGTTACGGAACAGCCGGAAG
AAGTCGTCACCGCGACAGAAGAAGAATCTGAAGCACCAGTGGAAGAAACGAGCAAAGATG
TGGTTGTGGAAGAGGCAGAGCAGAAAGAAGAAGAAGCAGAGAAAGAAACGGAAGAGCCAA
AGGTAGAAGAGAAGACAGAAACTCCGGTGGTTGTGGAGGAGCCGAAGGAAGAAGAGAAGG
AGGAGGAGACTGAAACCCCAGCTGTTGTGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGACTGAGGCAG
AGGAAGTTGTGGCTGCTGAGGAAGTCGCCGCCGAGTAAAGAGCAAGAAACTATATATGAC
CTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTCTTTTTAAATTATATTTTATCAAAATTTCATATGTAT
TTTCTGTATCGTTTGTTTGGGTTTATGATGATGTAATCAGATCTTTGGTTATGATGATT

QA 3 601 3 601
DS 

RD RR2B961TF 601 0 0
GG
ACCAAAGCATCATATACACTTTTACTTCTCTTCTCATCCTCCTTGTTTTTTCTCTCTTTA
GCTTTCGTCCTTTCGAAATGGCCAACGTTGAGAATGAACAAGTGATTGCTCCAGCAGAAG
AGAACGTTGAGTTGCCAACAAAGACGGTGGAGGAGCCAGAAGTTACGGAACAGCCGGAAG
AAGTCGTCACCGCGACAGAAGAAGAATCTGAAGCACCAGTGGAAGAAACGAGCAAAGATG
TGGTTGTGGAAGAGGCAGAGCAGAAAGAAGAAGAAGCAGAGAAAGAAACGGAAGAGCCAA
AGGTAGAAGAGAAGACAGAAACTCCGGTGGTTGTGGAGGAGCCGAAGGAAGAAGAGAAGG
AGGAGGAGACTGAAACCCCAGCTGTTGTGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGACTGAGGCAG
AGGAAGTTGTGGCTGCTGAGGAAGTCGCCGCCGAGTAAAGAGCAAGAAACTATATATGAC
CTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTCTTTTTAAATTATATTTTATCAAAATTTCATATGTAT
TTTCTGTATCGTTTGTTTGGGTTTATGATGATGTAATCAGATCTTTGGTTATGATGATT

QA 3 601 3 601
DS 

RD RR2DP84TF 608 0 0
GGACTCACCAAAGCATCATATACACTTTTACTTCTCTTCTCATCCTCTTTGTTTTTTCTC
TCTTTAGCTTTCGTCCTTTCGAAATGGCCGACGTTGAGAATGAACAAGTGATTGCTCCAG
CAGAAGAGAACGTTGAGTTGCCAACAAAGACGGTGGAGGAGCCAGAAGTTACGGAACAGC
CGGAAGAAGTCGTCACCGCGACAGAAGAAGAATCTGAAGCACCAGTGGAAGAAACGAGCA
AAGATGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGCAAAAAGAAGAAGAAGCAGAGAAAGAAACGGAAG
AGCCAAAGGTAGAAGATAAGACAGAAACTCCGGTGGTTGTGGAGGAGCCAAAGGAAGAAG
AGAAGGAGGAGGAGACTGAAACCCCAGCTGTTGTGGAGGAGGAGGAGGAGAAGGAGACTG
AGGCAGAGGAAGTTGTGGCTGCTGAGGAAGTCGCCGCCGAGTAAAGAGCAAGAAACTATA
TATGACCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTCTTTTTAAATTATATTTTATCAAAATTTCAT
ATGTATTTTCTGTATCGTTTGTTTGGGTTTATGATGATGTAATCAGATCTTTGGTTATGA
TGATTATT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2CD25TF 611 0 0
GGACTCACCAAAGCATCATATACACTTTTACTTCTCTTCTCATCCTCTTTGTTTTTTCTC
TCTTTAGCTTTCGTCCTTTCGAAATGGCCAACGTTGAGAATGAACAAGTGATTGCTCCAG
CAGAAGAGAACGTTGAGTTGCCAACAAAGACGGTGGAGGAGCCAGAAGTTACGGAACAGC
CGGAAGAAGTCGTCACCGCGACAGAAGAAGAATCTGAAGCACCAGTGGAAGAAACGAGCA
AAGATGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGCAAAAAGAAGAAGAAGCAGAGAAAGAAACGGAAG
AGCCAAAGGTAGAAGAGAAGACAGAAACTCCGGTGGTTGTGGAGGAGCCAAAGGAAGAAG
AGAAGGAGGAGGAGACTGAAACCCCAGCTGTTGTGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGACTG
AGGCAGAGGAAGTTGTGGCTGCTGAGGAAGTCGCCGCCGAGTAAAGAGCAAGAAACTATA
TATGACCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTCTTTTTAAATTATATTTTATCAAAATTTCAT
ATGTATTTTCTGTATCGTTTGTTTGGGTTTATGATGATGTAATCAGATCTTTGGTTATGA
TGATTATTCG
C

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2D104JQ 612 0 0
GGACTCACCAAAGCATCATATACACTTTTACTTCTCTTCTCATCCTCTTTGTTTTTTCTC
TCTTTAGCTTTCGTCCTTTCGAAATGGCCAACGTTGAGAATGAACAAGTGATTGCTCCAG
CAGAAGGGAACGTTGAGTTGCCAACAAAGACGGTGGAGGAGCCAGAAGTTACGGAACAGC
CGGAAGAAGTCGTCACCGCGACAGAAGAAGAATCTGAAGCACCAGTGGAAGAAACGAGCA
AAGATGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGCAAAAAGAAGAAGAAGCAGAGAAAGAAACGGAAG
AGCCAAAGGTAGAAGAGAAGACAGAAACTCCGGTTGTTGTGGAGGAGCCAAAGGAAGAAG
AGAAGGAGGAGGAGACTGAAACCCCAGCTGTTGTGGAGGAGGAGGAGGAGAA**AGACTG
AGGCAGAGGAAGTTGTGGCTGCTGAGGAAGTCGCCGCCGAGTAAAGAGCAAGAAACTATA
TATGACCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTCTTTTTAAATTATATTTTATCAAAATTTCAT
ATGTATTTTCTGTATCGTTTGTTTGGGTTTATGATGATGTAATCAGATCTTTGGTTATGA
TGATTATTCGG
C

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2D104TF 620 0 0
GGACTCACCAAAGCATCATATACACTTTTACTTCTCTTCTCATCCTCTTTGTTTTTTCTC
TCTTTAGCTTTCGTCCTTTCGAAATGGCCAACGTTGAGAATGAACAAGTGATTGCTCCAG
CAGAAGGGAACGTTGAGTTGCCAACAAAGACGGTGGAGGAGCCAGAAGTTACGGAACAGC
CGGAAGAAGTCGTCACCGCGACAGAAGAAGAATCTGAAGCACCAGTGGAAGAAACGAGCA
AAGATGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGCAAAAAGAAGAAGAAGCAGAGAAAGAAACGGAAG
AGCCAAAGGTAGAAGAGAAGACAGAAACTCCGGTTGTTGTGGAGGAGCCAAAGGAAGAAG
AGAAGGAGGAGGAGACTGAAACCCCAGCTGTTGTGGAGGAGGAGGAGGAGAA**AGACTG
AGGCAGAGGAAGTTGTGGCTGCTGAGGAAGTCGCCGCCGAGTAAAGAGCAAGAAACTATA
TATGACCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTCTTTTTAAATTATATTTTATCAAAATTTCAT
ATGTATTTTCTGTATCGTTTGTTTGGGTTTATGATGATGTAATCAGATCTTTGGTTATGA
TGATTATTCGG
CAAAAAAAA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2D626JQ 617 0 0
GGACTCACCAAAGCATCATATACACTTTTACTTCTCTTCTCATCCTCTTTGTTTTTTCTC
TCTTTAGCTTTGGTCCTTTCGAAATGGCCAACGTTGAGAATGAACAAGTGATTGCTCCAG
CAGAAGAGAACGTTGAGTTGCCAACAAAGACGGTGGAGGAGCCAGAAGTTACGGAACAGC
CGGAAGAAGTTGTCACCGCGACAGAAGAAGAATCTGAAGCACCAGTGGAAGAAACGAGCA
AAGATGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGCAAAAAGAAGAAGAAGCAGAGAAAGAAACGGAAG
AGCCAAAGGTAGAAGAGAAGACAGAAACTCCGGTGGTTGTGTAGGAGCCAAAGGAAGAAG
AGAAGGAGGAGGAGACTGAAACCCCAGCTGTTGTGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGACTG
AGGCAGAGGAAGTTGTGGCTGCTGAGGAAGTCGCCGCCGAGTAAAGAGCAAGAAACTATA
TATGACCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTCTTTTTAAATTATATTTTATCAAAATTTCAT
ATGTATTTTCTGTATCGTTTGTTTGGGTTTATGATGATGTAATCAGATCTTTGGTTATGA
TGATTATTCGGTTAACG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2D626TF 617 0 0
GGACTCACCAAAGCATCATATACACTTTTACTTCTCTTCTCATCCTCTTTGTTTTTTCTC
TCTTTAGCTTTCGTCCTTTCGAAATGGCCAACGTTGAGAATGAACAAGTGATTGCTCCAG
CAGAAGAGAACGTTGAGTTGCCAACAAAGACGGTGGAGGAGCCAGAAGTTACGGAACAGC
CGGAAGAAGTCGTCACCGCGACAGAAGAAGAATCTGAAGCACCAGTGGAAGAAACGAGCA
AAGATGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGCAAAAAGAAGAAGAAGCAGAGAAAGAAACGGAAG
AGCCAAAGGTAGAAGAGAAGACAGAAACTCCGGTGGTTGTGTAGGAGCCAAAGGAAGAAG
AGAAGGAGGAGGAGACTGAAACCCCAGCTGTTGTGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGACTG
AGGCAGAGGAAGTTGTGGCTGCTGAGGAAGTCGCCGCCGAGTAAAGAGCAAGAAACTATA
TATGACCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTCTTTTTAAATTATATTTTATCAAAATTTCAT
ATGTATTTTCTGTATCGTTTGTTTGGGTTTATGATGATGTAATCAGATCTTTGGTTATGA
TGATTATTCGGTTAA
CG

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2H721TF 617 0 0
GGACTCACCAAAGCATCATATACACTTTTACTTCTCTTCTCATCCTCTTTGTTTTTTCTC
TCTTTAGCTTTCGTCCTTTCGAAATGGCCAACGTTGAGAATGAACAAGTGATTGCTCCAG
CAGAAGAGAACGTTGAGTTGCCAACAAAGACGGTGGAGGAGCCAGAAGTTACGGAACAGC
CGGAAGAAGTCGTCACCGCGACAGAAGAAGAATCTGAAGCACCAGTGGAAGAAACGAGCA
AAGATGTGGCTGTGGAAGAGGCAGAGCAAAAAGAAGAAGAAGCAGAGAAAGAAACGGAAG
AGCCAAAGGTAGAAGAGAAGACAGAAACTCCGGTGGTTGTGGAGGAGCCAAAGGAAGAAG
AGAAGGAGGAGGAGACTGAAACCCCAGCTGTTGTGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGACTG
AGGCAGAGGAAGTTGTGGCTGCTGAGGAAGTCGCCGCCGAGTAAAGAGCAAGAAACTATA
TATGACCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTCTTTTTAAATTATATTTTATCAAAATTTCAT
ATGTATTTTCTGTATCGTTTGTTTGGGTTTATGATGATGTAATCAGATCTTTGGTTATGA
TGATTATTCGGTTAA
TG

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 10

CO CL474Contig1 629 10 5 U
GCTCTTCGAAACAGAGGGCTTGATTGATCTAAAAGCAGATTTTGCATTTGTTTGGCAATG
CAAACAAACAAAAAAAAAGGTACCGTTTGATCAGTAAGAACAAAAGAGCTTCATAAACAA
ATGTCTCATATGCATCCAGAAGCTTGACAACAACAATAACAAATATATATTAATATAAAG
AAAAGGATTGTTCAATCTATTTACTCAGCTTCCTCAACAGAAGCTTCGATTCGAAGGAGA
ACGAATCCAACCGCAACGCCGACGAGAGTAAGAGCGTTCATGATTGCTGCAATCTTGAAA
ATCTCTCCGACTGCGTTACAAGTTGAGGTTAAGGCTCCTCCACTTCCACTTGTTCGCCCT
TTGAGAGACATGACGACATTAGCAAAGCACTGTTCGGTGCAGAGCGGTAATCCCATGGAG
ACAACCTTGTTGTTCTGTGCCTTGAGACCACCGTAAGAATTTAGTCCTCTTACGTAAGAA
ACTTTCATCTCTGGTTTCCTCTGTGCCTGTCCGGATTTGAACGCAACTCCCGCTCTTGTC
CATGCAACCACCGCCGGTGCCGCTGCTGTAGCCATTTCCTTTTTGCTATGAGTAAGGTTG
AAGGATGCAACAGAAGTGGATGGAGTGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX03JQ U 112
AF RR2DN35JQ U 96
AF RR2E472JQ U 1
AF RR2E472TF C 1
AF RR2D379JQ U 92
AF RR2FD89JQ U 92
AF RR2FD89TF C 92
AF RR2DX03TF C 112
AF RR2D379TF C 92
AF RR2DN35TF C 96
BS 1 154 RR2E472JQ
BS 155 155 RR2D379JQ
BS 156 615 RR2E472JQ
BS 616 621 RR2D379JQ
BS 622 629 RR2DN35TF

RD RR2DX03JQ 462 0 0
CG
TAAACAAATGTCTCATATGCATCCAGAAGCTTGACAACAACAATAACAAATATATATTAA
TATAAAGAAAAGGATTGTTCAATCTATTTACTCAGCTTCCTCAACAGAAGCTTCGATTCG
AAGGAGAACGAATCCAACCGCAACGCCGACGAGAGTAAGAGCGTTCATGATTGCTGCAAT
CTTGAAAATCTCTCCGACTGCGTTACAAGTTGAGGTTAAGGCTCCTCCACTTCCACTTGT
TCGCCCTTTGAGAGACATGACGACATTAGCAAAGCACTGTTCGGTGCAGAGCGGTAATCC
CATGGAGACAACCTTGTTGTTCTGTGCCTTGAGACCACCGTAAGAATTTAGTCCTCTTAC
GTAAGAAACTTTCATCTCTGGTTTCCTCTGTGCCTGTCCGGATTTGAACGCAACTCCCGC
TCTTGTCCATGCAACCACCGCCGGTGCCGCTGCTGTAGCC

QA 3 462 3 462
DS 

RD RR2DN35JQ 494 0 0
AAGAACAAAAGAGCTTCATAAACAAATGTCTCATATGCATCCAGAAGCTTGACAACAACA
ATAACAAATATATATTAATATAAAGAAAAGGATTGTTCAATCTATTTACTCAGCTTCCTC
AACAGAAGCTTCGATTCGAAGGAGAACGAATCCAACCGCAACGCCGACGAGAGTAAGAGC
GTTCATGATTGCTGCAATCTTGAAAATCTCTCCGACTGCGTTACAAGTTGAGGTTAAGGC
CCCTCCACTTCCACTTGTTCGCCCTTTGAGAGAAATGACGACATTAGCAAAGCACTGTTC
GGTGCAGAGCGGTAATCCCATGGAGACAACCTTGTTGTTCTGTGCCTTGAGACCACCGTA
AGAGTTTAGTCCTCTTACGTAAGAAACTTTCATCTCTGGTTTCCTCTGTGCCTGTCCGGA
TTTGAACGCAACTCCCGCTCTTGTCCATGCAACCACCGCCGGTGCCGCTGCTGTGGCCAT
TTCCTTTTTGCTAT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2E472JQ 615 0 0
GCTCTTCGAAACAGAGGGCTTGATTGATCTAAAAGCAGATTTTGCATTTGTTTGGCAATG
CAAACAAACAAAAAAAAAGGTACCGTTTGATCAGTAAGAACAAAAGAGCTTCATAAACAA
ATGTCTCATATGCATCCAGAAGCTTGACAACAACGATAACAAATATATATTAATATAAAG
AAAAGGATTGTTCAATCTATTTACTCAGCTTCCTCAACAGAAGCTTCGATTCGAAGGAGA
ACGAATCCAACCGCAACGCCGACGAGAGTAAGAGCGTTCATGATTGCTGCAATCTTGAAA
ATCTCTCCGACTGCGTTACAAGTTGAGGTTAAGGCTCCTCCACTTCCACTTGTTCGCCCT
TTGAGAGACATGACGACATTAGCAAAGCACTGTTCGGTGCAGAGCGGTAATCCCATGGAG
ACAACCTTGTTGTTCTGTGCCTTGAGACCACCGTAAGAATTTAGTCCTCTTACGTAAGAA
ACTTTCATCTCTGGTTTCCTCTGTGCCTGTCCGGATTTGAACGCAACTCCCGCTCTTGTC
CATGCAACCACCGCCGGTGCCGCTGCTGTAGCCATTTCCTTTTTGCTATGAGTAAGGTTG
AAGGATGCAACAGAA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2E472TF 615 0 0
GCTCTTCGAAACAGAGGGCTTGATTGATCTAAAAGCAGATTTTGCATTTGTTTGGCAATG
CAAACAAACAAAAAAAAAGGTACCGTTTGATCAGTAAGAACAAAAGAGCTTCATAAACAA
ATGTCTCATATGCATCCAGAAGCTTGACAACAACGATAACAAATATATATTAATATAAAG
AAAAGGATTGTTCAATCTATTTACTCAGCTTCCTCAACAGAAGCTTCGATTCGAAGGAGA
ACGAATCCAACCGCAACGCCGACGAGAGTAAGAGCGTTCATGATTGCTGCAATCTTGAAA
ATCTCTCCGACTGCGTTACAAGTTGAGGTTAAGGCTCCTCCACTTCCACTTGTTCGCCCT
TTGAGAGACATGACGACATTAGCAAAGCACTGTTCGGTGCAGAGCGGTAATCCCATGGAG
ACAACCTTGTTGTTCTGTGCCTTGAGACCACCGTAAGAATTTAGTCCTCTTACGTAAGAA
ACTTTCATCTCTGGTTTCCTCTGTGCCTGTCCGGATTTGAACGCAACTCCCGCTCTTGTC
CATGCAACCACCGCCGGTGCCGCTGCTGTAGCCATTTCCTTTTTGCTATGAGTAAGGTTG
AAGGATGCAACAGAA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2D379JQ 532 0 0
CAGTAAGAACAAAAGAGCTTCATAAACAAATGTCTCATATGCATCCAGAAGCTTGACAAC
AACAATAACAAATATATATTAATATAAAGAAAAGGATTGTTCAATCTATTTACTCAGCTT
CCTCAACAGAAGCTTCGATTCGAAGGAGAACGAATCCAACCGCAACGCCGACGAGAGTAA
GAGCGTTCATGATTGCTGCAATCTTGAAAATCTCTCCGACTGCGTTACAAGTTGAGGTTA
AGGCTCCTCCACTTCCACTTGTTCGCCCTTTGAGAGACATGACGACATTAGCAAAGCACT
GTTCGGTGCAGAGCAGTAATCCCATGGAGACAACCTTGTTGTTCTGTGCCTTGAGACCAC
CGTAAGAATTTAGTCCTCTTACGTAAGAAACTTTCATCTCTGGTTTCCTCTGTACCTGTC
CGGATTTGAACGCAACTCCCGCTCTTGTCCATGCAACCACCGCCGGTGCCGCTGCTGTAG
CCATTTCCTTTTTGCTATGAGTAAGGTTGAAGGATGCAACAGAAGTGGAT
CC

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2FD89JQ 542 0 0
CAGTAAGAACAAAAGAGCTTCATAAACAAATGTCTCATATGCATCCAGAAGCTTGACAAC
AACAATAACAAATATATAGTAATATAAAGAAAAGGATTGTTCAATCTGTTTACTCAGCTT
CCTCAACAGAAGCTTCGATTCGGAGGAGAACGAATCCAACCGCAACGCCGACAAGAGTAA
GAGCGTTCATGATTGCTGCAATCTTGAAAATCTCTCCGACTGCGTTACAAGTTGAGGTTA
AGGCTCCTCCACTTCCACTTGTTCGCCCTTTGAGAGAAATGACGACGTTAGCAAAGCACT
GTTCGGTGCAGAGTGGTAATCCCATGGAGACAACCTTGTTGTTCTGTGCCTTGAGACCAC
CGTAAGAATTTAGTCCTCTTACGTAAGAAACTTTCATCTCCGTTTTCCTCTGTGCCTGTC
CGGATTTGAACGCGACTCCCGCTCTTGTCCATGCAACCACCGCCGGTGCCGCTGCTGTAG
CCATTTCTTTTTTGCTATGAGTGAGGTTGAAGGATGCAACAGAAGTG
TATGACTGGAGATCC

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2FD89TF 542 0 0
CAGTAAGAACAAAAGAGCTTCATAAACAAATGTCTCATATGCATCCAGAAGCTTGACAAC
AACAATAACAAATATATAGTAATATAAAGAAAAGGATTGTTCAATCTGTTTACTCAGCTT
CCTCAACAGAAGCTTCGATTCGGAGGAGAACGAATCCAACCGCAACGCCGACAAGAGTAA
GAGCGTTCATGATTGCTGCAATCTTGAAAATCTCTCCGACTGCGTTACAAGTTGAGGTTA
AGGCTCCTCCACTTCCACTTGTTCGCCCTTTGAGAGAAATGACGACGTTAGCAAAGCACT
GTTCGGTGCAGAGTGGTAATCCCATGGAGACAACCTTGTTGTTCTGTGCCTTGAGACCAC
CGTAAGAATTTAGTCCTCTTACGTAAGAAACTTTCATCTCCGTTTTCCTCTGTGCCTGTC
CGGATTTGAACGCGACTCCCGCTCTTGTCCATGCAACCACCGCCGGTGCCGCTGCTGTAG
CCATTTCTTTTTTGCTATGAGTGAGGTTGAAGGATGCAACAGAAGTG
TATGACTGGAGATCC

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2DX03TF 523 0 0
CG
TAAACAAATGTCTCATATGCATCCAGAAGCTTGACAACAACAATAACAAATATATATTAA
TATAAAGAAAAGGATTGTTCAATCTATTTACTCAGCTTCCTCAACAGAAGCTTCGATTCG
AAGGAGAACGAATCCAACCGCAACGCCGACGAGAGTAAGAGCGTTCATGATTGCTGCAAT
CTTGAAAATCTCTCCGACTGCGTTACAAGTTGAGGTTAAGGCTCCTCCACTTCCACTTGT
TCGCCCTTTGAGAGACATGACGACATTAGCAAAGCACTGTTCGGTGCAGAGCGGTAATCC
CATGGAGACAACCTTGTTGTTCTGTGCCTTGAGACCACCGTAAGAATTTAGTCCTCTTAC
GTAAGAAACTTTCATCTCTGGTTTCCTCTGTGCCTGTCCGGATTTGAACGCAACTCCCGC
TCTTGTCCATGCAACCACCGCCGGTGCCGCTGCTGTAGCCATTTCCTTTTTGCTATGAGT
AAGGTTGAAGGATGCAACAGAAGTG
GATGGAGTGGAGATCC

QA 3 507 3 507
DS 

RD RR2D379TF 532 0 0
CAGTAAGAACAAAAGAGCTTCATAAACAAATGTCTCATATGCATCCAGAAGCTTGACAAC
AACAATAACAAATATATATTAATATAAAGAAAAGGATTGTTCAATCTATTTACTCAGCTT
CCTCAACAGAAGCTTCGATTCGAAGGAGAACGAATCCAACCGCAACGCCGACGAGAGTAA
GAGCGTTCATGATTGCTGCAATCTTGAAAATCTCTCCGACTGCGTTACAAGTTGAGGTTA
AGGCTCCTCCACTTCCACTTGTTCGCCCTTTGAGAGACATGACGACATTAGCAAAGCACT
GTTCGGTGCAGAGCAGTAATCCCATGGAGACAACCTTGTTGTTCTGTGCCTTGAGACCAC
CGTAAGAATTTAGTCCTCTTACGTAAGAAACTTTCATCTCTGGTTTCCTCTGTACCTGTC
CGGATTTGAACGCAACTCCCGCTCTTGTCCATGCAACCACCGCCGGTGCCGCTGCTGTAG
CCATTTCCTTTTTGCTATGAGTAAGGTTGAAGGATGCAACAGAAGTGGAT
CC

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2DN35TF 534 0 0
AAGAACAAAAGAGCTTCATAAACAAATGTCTCATATGCATCCAGAAGCTTGACAACAACA
ATAACAAATATATATTAATATAAAGAAAAGGATTGTTCAATCTATTTACTCAGCTTCCTC
AACAGAAGCTTCGATTCGAAGGAGAACGAATCCAACCGCAACGCCGACGAGAGTAAGAGC
GTTCATGATTGCTGCAATCTTGAAAATCTCTCCGACTGCGTTACAAGTTGAGGTTAAGGC
CCCTCCACTTCCACTTGTTCGCCCTTTGAGAGAAATGACGACATTAGCAAAGCACTGTTC
GGTGCAGAGCGGTAATCCCATGGAGACAACCTTGTTGTTCTGTGCCTTGAGACCACCGTA
AGAGTTTAGTCCTCTTACGTAAGAAACTTTCATCTCTGGTTTCCTCTGTGCCTGTCCGGA
TTTGAACGCAACTCCCGCTCTTGTCCATGCAACCACCGCCGGTGCCGCTGCTGTGGCCAT
TTCCTTTTTGCTATGAGTAAGGTTGAAGGATGCAACAGAAGTGGATGGAGTGGC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 11

CO CL475Contig1 749 11 9 U
AGGGCTCCACAAGCCATCAACACAACACACAGAGAAACCAAGAAAAATCCTCAAATTCTC
TAAAAAAAA*CAAAAGAAATGGCTTCCACAGCTCTCTCAAGCGCCGTCGTCGGAACTTCC
TTCCTCCGCCGTCAAACATCTCCCATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACCCAG
ACCCTCTTCGGTCTCAAGTCAGGAACCGCACGTGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCCACA
TACAAGGTCAAGTTCGTCACTCCAGAAGGAGAGCAAGTGGTTGAGTGCGACGACGACGTT
TACGTCCTCGACGCTGCTGAGGAGGCCGGGCTCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCCGGT
TCTTGCTCGAGCTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTTCCGTTGACCAGTCTGACCAGAGT
TTCCTCGATGATGACCAGATTGCTGAAGGGTTTGTCCTGACTTGTGCGGCTTATCCTACT
TCTGATGTTACCATTGAGACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAGCTCCGTA
ACATGCTGCTTTTGATGGTTTCGTAATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGT
TGTTTACTTTAGTATAATCTATTGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTTGAACATCTT
TTGGTGAGATCAATGGATAACTGTTTTAAACTTATGGTAATGCATGTTATGAATAAAGTT
TGATGAGAATCTAAACGTTATCTTTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G904JQ C 192
AF RR2DM59TF U 7
AF RR2G904TF U 8
AF RR2BQ25TF U 1
AF RR2A728JQ C 187
AF RR2A728TF U 56
AF RR2G910JQ C 54
AF RR2G910TF U 7
AF RR2BQ25JQ C 113
AF RR2G008TF U 617
AF RR2G008JQ C 504
BS 1 69 RR2BQ25TF
BS 70 70 RR2DM59TF
BS 71 270 RR2BQ25TF
BS 271 271 RR2DM59TF
BS 272 452 RR2BQ25TF
BS 453 453 RR2DM59TF
BS 454 689 RR2BQ25TF
BS 690 690 RR2A728TF
BS 691 749 RR2BQ25TF

RD RR2G904JQ 502 0 0
TCTCAAGTCAGGAACCGCACGTGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCCACATACAAGGTCAA
GTTCGTCACTCCAGAAGGAGAGCAAGTGGTTGAGTGCGACGACGACGTTTACGTCCTCGA
CGCTGCTGAGGAGGCCGGGCTCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCCGGTTCTTGCTCGAG
CTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTTCCGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGA
TGACCAGATTGCTGAAGGGTTCTTCCTGACTTGTGCGGCTTATCCTACTTTTGATGTTAC
CATTGAGACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAGCTCCGTAACATGCTGCTT
TTGATGGTTTCGTAATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGTTGTTTACTTTA
GTATAATCTATTGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTTGAACATCTTTTGGTGAGATC
AATGGATAACTGTTTTAAACTT

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR2DM59TF 666 0 0
GG
ACAAGCCATCAACACAACACACAGAGAAACCAAGAAAAATCCTCAAATTCTCTAAAAAAA
A*CAAAAGAAATGGCTTCCACAGCTCTCTCAAGCGCCGTCGTCGGAACTTCCTTCCTCCG
CCGTCAAACATCTCCCATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACCCAGACCCTCTT
CGGTCTCAAGTCAGGAACCGCACGTGGTGGACGCGTCACAGTCATGGCCACATACAAGGT
CAAGTTCGTCACTCCAGAAGGAGAGCAAGTGGTTGAGTGCGACGACGACGTTTACGTCCT
CGACGCTGCTGAGGAGGCCGGGCTCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCCGGTTCTTGCTC
GAGCTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTTCCGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGA
TGATGACCAGATTGCTGAAGGGTTTGTCCTGACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGT
TACCATTGAGACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAGCTCCGTAACATGCTG
CTTTTGATGGTTTCGTAATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGTTGTTTACT
TTAGTATAATCTATTGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTTGAACATCTTTTGGTGAG
ATCA

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR2G904TF 684 0 0
G
ACAAGCCATCAACACAACACACAGAGAAACCAAGAAAAATCCTCAAATTCTCTAAAAAAA
A*CAAAAGAAATGGCCTCCACAGCTCTCTCAAGCGCCGTCGTCGGAACTTCCTTCCTCCG
CCGTCAAACATCTCCCATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACCCAGACCCTCTT
CGGTCTCAAGTCAGGAACCGCACGTGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCCACATACAAGGT
CAAGTTCGTCACTCCAGAAGGAGAGCAAGTGGTTGAGTGCGACGACGACGTTTACGTCCT
CGACGCTGCTGAGGAGGCCGGGCTCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCCGGTTCTTGCTC
GAGCTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTTCCGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGA
TGATGACCAGATTGCTGAAGGGTTCTTCCTGACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGT
TACCATTGAGACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAGCTCCGTAACATGCTG
CTTTTGATGGTTTCGTAATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGTTGTTTACT
TTAGTATAATCTATTGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTTGAACATCTTTTGGTGAG
ATCAATGGATAACTGTTTTAAAC

QA 2 684 2 684
DS 

RD RR2BQ25TF 749 0 0
AGGGCTCCACAAGCCATCAACACAACACACAGAGAAACCAAGAAAAATCCTCAAATTCTC
TAAAAAAAAACAAAAGAAATGGCTTCCACAGCTCTCTCAAGCGCCGTCGTCGGAACTTCC
TTCCTCCGCCGTCAAACATCTCCCATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACCCAG
ACCCTCTTCGGTCTCAAGTCAGGAACCGCACGTGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCCACA
TACAAGGTCAAGTTCGTCACTCCAGAAGGAAAGCAAGTGGTTGAGTGCGACGACGACGTT
TACGTCCTCGACGCTGCTGAGGAGGCCGGGCTCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCCGGT
TCTTGCTCGAGCTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTTCCGTTGACCAGTCTGACCAGAGT
TTCCTCGATGATGACCAGATTGCTGAAGGGTTCGTCCTGACTTGTGCGGCTTATCCTACT
TCTGATGTTACCATTGAGACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAGCTCCGTA
ACATGCTGCTTTTGATGGTTTCGTAATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGT
TGTTTACTTTAGTATAATCTATTGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTTGAACATCTT
TTGGTGAGATCAATGGATAACTGTTTTAA*CTTATGGTAATGCATGTTATGAATAAAGTT
TGATGAGAATCTAAACGTTATCTTTGAGC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2A728JQ 545 0 0
TTCGGTCTCAAGTCAGGAACCGCACGTGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCCACATACAAG
GTCAAGTTCGTCACTCCAGAAGGAGAGCAAGTGGTTGAGTGCGACGACGACGTTTACGTC
CTCGACGCTGCTGAGGAGGCCGGGCTCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCCGGTTCTTGC
TCGAGCTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTTCCGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTC
GATGATGACCAGATTGCTGAAGGGTTTGTCCTGACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGAT
GTTACCATTGAGACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAGCTCCGTAACATGC
TGCTTTTGATGGTTTCGTAATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGTTGTTTA
CTTTAGTATAATCTATTGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTTGAACATCTTTTGGTG
AGATCAATGGATAACTGTTTTAAACTTATGGTAATGCATGTTATGAATAAAGTTTGATGA
GAATC

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2A728TF 676 0 0
GG
CTCTAAAAAAAA*CAAAAGAAATGGCTTCCACAGCTCTCTCAAGCGCCGTCGTCGGAACT
TCCTTCCTCCGCCGTCAAACATCTCCCATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACC
CAGACCCTCTTCGGTCTCAAGTCAGGAACCGCACGTGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCC
ACATACAAGGTCAAGTTCGTCACTCCAGAAGGAGAGCAAGTGGTTGAGTGCGACGACGAC
GTTTACGTCCTCGACGCTGCTGAGGAGGCCGGGCTCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCC
GGTTCTTGCTCGAGCTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTTCCGTTGACCAGTCTGACCAG
AGTTTCCTCGATGATGACCAGATTGCTGAAGGGTTTGTCCTGACTTGTGCGGCTTATCCT
ACTTCTGATGTTACCATTGAGACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAGCTCC
GTAACATGCTGCTTTTGATGGTTTCGTAATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTTGAGTT
TGTTGTTTACTTTAGTATAATCTATTGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTTGAACAT
CTTTTGGTGAGATCAATGGATAACTGTTTTAAACTTATGGTAATGCATGTTATGAATAAA
GTTTGATGAGAATC

QA 3 676 3 676
DS 

RD RR2G910JQ 675 0 0
AATTCTCTAAAAAAAA*CAAAAGAAATGGCTTCCACAGCTCTCTCAAGCGCCGTCGTCGG
AACTTCCTTCCTCCGCCGTCAAACATCTCCCATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAA
CACCCAGACCCTCTTCGGTCTCAAGTCAGGAACCGCACGTGGTGGACGCGTCACAGCCAT
GGCCACATACAAGGTCAAGTTCGTCACTCCAGAAGGAGAGCAAGTGGTTGAGTGCGACGA
CGACGTTTACGTCCTCGACGCTGCTGAGGAGGCCGGGCTCGACTTGCCTTACTCTTGCCG
TGCCGGTTCTTGCTCGAGCTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTTCCGTTGACCAGTCTGA
CCAGAGTTTCCTCGATGATGACCAGACTGCTGAAGGGTTTGTCCTGACTTGTGCGGCTTA
TCCTACTTCTGATGTTACCATTGAGACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAG
CTCCGTAACATGCTGCTTTTGATGGTTTCGTAATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTTG
AGTTTGTTGTTTACTTTAGTATAATCTATTGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTTGA
ACATCTTTTGGTGAGATCAATGGATAACTGTTTTAAACTTATGGTAATGCATGTTATGAA
TAAAGTTTGATGAG
G

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2G910TF 721 0 0
GG
ACAAGCCATCAACACAACACACAGAGAAACCAAGAAAAATCCTCAAATTCTCTAAAAAAA
A*CAAAAGAAATGGCTTCCACAGCTCTCTCAAGCGCCGTCGTCGGAACTTCCTTCCTCCG
CCGTCAAACATCTCCCATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACCCAGACCCTCTT
CGGTCTCAAGTCAGGAACCGCACGTGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCCACATACAAGGT
CAAGTTCGTCACTCCAGAAGGAGAGCAAGTGGTTGAGTGCGACGACGACGTTTACGTCCT
CGACGCTGCTGAGGAGGCCGGGCTCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCCGGTTCTTGCTC
GAGCTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTTCCGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGA
TGATGACCAGACTGCTGAAGGGTTTGTCCTGACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGT
TACCATTGAGACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAGCTCCGTAACATGCTG
CTTTTGATGGTTTCGTAATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGTTGTTTACT
TTAGTATAATCTATTGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTTGAACATCTTTTGGTGAG
ATCAATGGATAACTGTTTTAAACTTATGGTAATGCATGTTATGAATAAAGTTTGATGAG

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR2BQ25JQ 637 0 0
GAACTTCCTTCCTCCGCCGTCAAACATCTCCCATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCA
ACACCCAGACCCTTTTCGGTCTCAAGTCAGGAACCGCACGTGGTGGACGCGTCACAGCCA
TGGCCACATACAAGGTCAAGTTCGTCACTCCAGAAGGAAAGCAAGTGGTTGAGTGCGACG
ACGACGTTTACGTCCTCGACGCTGCTGAGGAGGCCGGGCTCGACTTGCCTTACTCTTGCC
GTGCCGGTTCTTGCTCGAGCTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTTCCGTTGACCAGTCTG
ACCAGAGTTTCCTCGATGATGACCAGATTGCTGAAGGGTTCGTCCTGACTTGTGCGGCTT
ATCCTACTTCTGATGTTACCATTGAGACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAA
GCTCCGTAACATGCTGCTTTTGATGGTTTCGTAATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTT
GAGTTTGTTGTTTACTTTAGTATAATCTATTGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTTG
AACATCTTTTGGTGAGATCAATGGATAACTGTTTTAAACTTATGGTAATGCATGTTATGA
ATAAAGTTTGATGAGAATCTAAACGTTATCTTTGAGC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2G008TF 117 0 0
ATCTATTGTTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTTGAACATCTTTTGGTGAGATCAATGG
ATAACTGTTTTAAACTTATGGTAATGCATGTTATGAATAAAGTTTGATGAGAATCT
T

QA 1 116 1 116
DS 

RD RR2G008JQ 230 0 0
G
AAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAGCTCCGTAACATGCTGCTTTTGATGGTTTCGT
AATCATTCATGTCTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGTTGTTTACTTTAGTATAATCTATTG
TTGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTTGAACATCTTTTGGTGAGATCAATGGATAACTGT
TTTAAACTTATGGTAATGCATGTTATGAATAAAGTTTGATGAGAATCT
T

QA 2 229 2 229
DS 



AS 1 11

CO CL476Contig1 1158 11 25 U
GGAGCGCTCTTCATTTTAAAGTCTCTGCACAAGAACCAGAGCAAAGCTACAAAAAAAAAT
TATATATTCAAAACCTTAAAGAAAAAAAACCTGAGAAGAGCTATGAGATCGAGTAACCAT
CTAATAGGTATGGTCAACTTCCTCACCTTCCTCCTATCGATCCCAATACTAGGCGGAGGG
ATATGGCTGAGCAGCAGAGCTAACTCAACCGACTGTTTACGTTTCCTCCAGTGGCCACTC
ATCGTCATCGGAATCTCCATCATGGTCGTATCCCTAGCCGGATTCGCCGGAGCTTGTTAC
CGTAACAAGTTCCTCATGTGGCTGTACCTCGTGGCAATGCTTCTCATCATCGCAGCCTTG
ATAGGATTCATCATCTTTGCTTATGCAGTCACCGATAAAGGATCTGGTCGAAACGTGCTG
AACAGGGGTTATCTTGACTATTATCTTCAAGATTATTCCGGTTGGTTGAAGGATAGGGTT
TCTGATGATGGATACTGGGGAAAAATCAGCTCGTGTATTAGAGATTCTGGAGCTTGTAGG
AAGATCGGAAGGAACTTTAATGGCGTCCCTGAAAGTGCTGATATGTTCTTCCAGAGAAGC
CTTAGCCCTGTTGAGTCTGGCTGTTGCAAGCCGCCATCAGATTGCGGGTATGCATATGGT
AACGAGACGTTTTGGACGCAAGGAGGAGGGCTGGTAGGATCAAACCCGGACTGTATGTTG
TGGAATAACGAACAGAGCATGCTCTGTTACCAGTGCAGTGCTTGTAAAGCGGGTGTTCTA
GGGAGCTTGAAGAAAAGCTGGAGAAAAGTGTCCGTCATCAACATCGTGGTGCTCATTATT
CTCGTTATCTTCTACGTGATCGCTTATGCGGCTTACAGGAATGTCAAGAGGATTGATAAC
GATGAGCCGGGCGGTGAGGCTAGGATGACAAAATCACACCCTAGTCATTTCCACCTTTGA
TCAAAATTGTGGTGAAGTTTATTACATGTTAATGAAAATCTGGTGAGAAACAATGAAACA
AAAGATTGGTGCTTTGATATATGTTTTCACTTGCTTATGATTTAGTACTTTCGTGTTTGT
TTTTGATATGTAACACATTTCTTTGTGTGTGTATACTATTTATGATGGAACTAAATATTA
TTGTTTCTTTAAGTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 20 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 50 50 50 0 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ48TF U 46
AF RR2EE32TF U 1
AF RR2E085TF U 46
AF RR2FU33TF U 47
AF RR2A017TF U 47
AF RR2A017JQ C 292
AF RR2BQ48JQ C 331
AF RR2E085JQ C 586
AF RR2FU33JQ C 317
AF RR2EE32JQ C 391
AF RR2BW70TF U 448
BS 1 62 RR2EE32TF
BS 63 63 RR2BQ48TF
BS 64 88 RR2EE32TF
BS 89 94 RR2BQ48TF
BS 95 113 RR2EE32TF
BS 114 114 RR2BQ48TF
BS 115 167 RR2EE32TF
BS 168 168 RR2BQ48TF
BS 169 266 RR2EE32TF
BS 267 267 RR2BQ48TF
BS 268 703 RR2EE32TF
BS 704 704 RR2A017TF
BS 705 721 RR2EE32TF
BS 722 782 RR2E085TF
BS 783 783 RR2A017TF
BS 784 795 RR2E085TF
BS 796 796 RR2FU33TF
BS 797 812 RR2E085TF
BS 813 820 RR2A017TF
BS 821 821 RR2FU33TF
BS 822 833 RR2A017TF
BS 834 834 RR2FU33TF
BS 835 870 RR2A017TF
BS 871 1151 RR2BW70TF
BS 1152 1158 RR2EE32JQ

RD RR2BQ48TF 616 0 0
GGACA
AAAAAAAAATTATATATTCAAAACCTTAAAGAAAAAAAACCTGAGAAGAGCTATGAGATC
GAGTAACCATCTAATAGGTATGGTCAACTTCCTCACCTTCCTCCTATCGATCCCAATACT
AGGCGGAGGGATATGGCTGAGCAGCAGAGCTAACTCAACCGACTGTTTACGTTTCCTCCA
GTGGCCACTCATCGTCATCGGAATCTCCATCATGGTCGTATCCCTAGCCGGATTCGCCGG
AGCTTGTTACCGTAACAAGTTCCTCATGTGGCTGTACCTCGTGGCAATGCTTCTCATCAT
CGCAGCCTTGATAGGATTCATCATCTTTGCTTATGCAGTCACCGATAAAGGATCTGGTCG
AAACGTGCTGAACAGGGGTTATCTTGACTATTATCTTCAAGATTATTCCGGTTGGTTGAA
GGATAGGGTTTCTGATGATGGATACTGGGGAAAAATCAGCTCGTGTATTAGAGATTCTGG
AGCTTGTAGGAAGATCGGAAGGAACTTTAATGGCGTCCCTGAAAGTGCTGATATGTTCTT
CCAGAGAAGCCTTAGCCCTGTTGAGTCTGGCTGTTGCAAGCCGCCATCAGATTGCGGGTA
TGCATATGGTA

QA 6 616 6 616
DS 

RD RR2EE32TF 721 0 0
GGAGCGCTCTTCATTTTAAAGTCTCTGCACAAGAACCAGAGCAAAGCTACAAAAAAAAAT
TACATATTCAAAACCTTAAAGAAAAAAA******GAAGAGCTATGAGATCGAGCAACCAT
CTAATAGGTATGGTCAACTTCCTCACCTTCCTCCTATCGATCCCAATCCTAGGCGGAGGG
ATATGGCTGAGCAGCAGAGCTAACTCAACCGACTGTTTACGTTTCCTCCAGTGGCCACTC
ATCGTCATCGGAATCTCCATCATGGTAGTATCCCTAGCCGGATTCGCCGGAGCTTGTTAC
CGTAACAAGTTCCTCATGTGGCTGTACCTCGTGGCAATGCTTCTCATCATCGCAGCCTTG
ATAGGATTCATCATCTTTGCTTATGCAGTCACCGATAAAGGATCTGGTCGAAACGTGCTG
AACAGGGGTTATCTTGACTATTATCTTCAAGATTATTCCGGTTGGTTGAAGGATAGGGTT
TCTGATGATGGATACTGGGGAAAAATCAGCTCGTGTATTAGAGATTCTGGAGCTTGTAGG
AAGATCGGAAGGAACTTTAATGGCGTCCCTGAAAGTGCTGATATGTTCTTCCAGAGAAGC
CTTAGCCCTGTTGAGTCTGGCTGTTGCAAGCCGCCATCAGATTGCGGGTATGCATATGGT
AACGAGACGTTTTGGACGCAAGGAGGAGGGCTGGTAGGATCAA*CCCGGACTGTATGTTG
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2E085TF 767 0 0
GGACA
AAAAAAAAATTATATATTCAAAACCTTAAAGAAAAAAAACCTGAGAAGAGCTATGAGATC
GAGTAACCATCTAATAGGTATGGTCAACTTCCTCACCTTCCTCCTATCGATCCCAATACT
AGGCGGAGGGATATGGCTGAGCAGCAGAGCTAACTCAACCGACTGTTTACGTTTCCTCCA
GTGGCCACTCATCGTCATCGGAATCTCCATCATGGTCGTATCCCTAGCCGGATTCGCCGG
AGCTTGTTACCGTAACAAGTTCCTCATGTGGCTGTACCTCGTGGCAATGCTTCTCATCAT
CGCAGCCTTGATAGGATTCATCATCTTTGCTTATGCAGTCACCGATAAAGGATCTGGTCG
AAACGTGCTGAACAGGGGTTATCTTGACTATTATCTTCAAGATTATTCCGGTTGGTTGAA
GGATAGGGTTTCTGATGATGGATACTGGGGAAAAATCAGCTCGTGTATTAGAGATTCTGG
AGCTTGTAGGAAGATCGGAAGGAACTTTAATGGCGTCCCTGAAAGTGCTGATATGTTCTT
CCAGAGAAGCCTTAGCCCTGTTGAGTCTGGCTGTTGCAAGCCGCCATCAGATTGCGGGTA
TGCATATGGTAACGAGACGTTTTGGACGCAAGGAGGAGGGCTGGTAGGAA*AA*CCCGGA
CTGTATGTTGTGGAATAACGAACAGAGCATGCTCTGTTACCAGTGCAGTGCTTGTAAAGC
GGGTGTTCTAGG*AGCTTGAAGAAA*GCTGGAGAAAAGTGTC

QA 6 767 6 767
DS 

RD RR2FU33TF 789 0 0
GGAC
AAAAAAAAATTACATATTCAAAACCTTAAAGAAAAAAA******GAAGAGCTATGAGATC
GAGCAACCATCTAATAGGTATGGTCAACTTCCTCACCTTCCTCCTATCGATCCCAATCCT
AGGCGGAGGGATATGGCTAAGCAGCAGAGCTAACTCAACCGACTGTTTACGTTTCCTCCA
GTGGCCACTCATCGTCATCGGAATCTCCATCATGGTAGTATCCCTAGCCGGATTCGCCGG
AGCTTGTTACCGTAACAAGTTCCTCATGTGGCTGTACCTCGTGGCAATGCTTCTCATCAT
CGCAGCCTTGATAGGATTCATCATCTTTGCTTATGCAGTCACCGATAAAGGATCTGGTCG
AAACGTGCTGAACAGGGGTTATCTTGACTATTATCTTCAAGATTATTCCGGTTGGTTGAA
GGATAGGGTTTCTGATGATGGATACTGGGGAAAAATCAGCTCGTGTATTAGAGATTCTGG
AGCTTGTAGGAAGATCGGAAGGAACTTTAATGGCGTCCCTGAAAGTGCTGATATGTTCTT
CCAGAGAAGCCTTAGCCCTGTTGAGTCTGGCTGTTGCAAGCCGCCATCAGATTGCGTGTA
TGCATATGGTAACGAGACGTTTTGGACGCAAGGAGGAGGGCTGGTAGGATCAAACCCGGA
CTGTATGTTGTGGAATAACGAACAGAGCATGCTCTGTTACCAGTGCAGTGCTTGTAAAGC
GGGTGTTCTAGGGAGCTTGAAGAAAAGCTGGAGAAA*GTGTCCGTGATCAACATCGTGGT
GCTCA

QA 5 789 5 789
DS 

RD RR2A017TF 843 0 0
GGAC
AAAAAAAAATTATATATTCAAAACCTTAAAGAAAAAAAACCTGAGAAGAGCTATGAGATC
GAGTAACCATCTAATAGGTATGGTCAACTTCCTCACCTTCCTCCTATCGATCCCAATACT
AGGCGGAGGGATATGGCTAAGCAGCAGAGCTAACTCAACCGACTGTTTACGTTTCCTCCA
GTGGCCACTCATCGTCATCGGAATCTCCATCATGGTCGTATCCCTAGCCGGATTCGCCGG
AGCTTGTTACCGTAACAAGTTCCTCATGTGGCTGTACCTCGTGGCAATGCTTCTCATCAT
CGCAGCCTTGATAGGATTCATCATCTTTGCTTATGCAGTCACCGATAAAGGATCTGGTCG
AAACGTGCTGAACAGGGGTTATCTTGACTATTATCTTCAAGATTATTCCGGTTGGTTGAA
GGATAGGGTTTCTGATGGTGGATACTGGGGAAAAATCAGCTCGTGTATTAGAGATTCTGG
AGCTTGTAGGAAGATCGGAAGGAACTTTAATGGCGTCCCTGAAAGTGCTGATATGTTCTT
CCAGAGAAGCCTTAGCCCTGTTGAGTCTGGCTGTTGCAAGCCGCCATCAGATTGCGGGTA
TGCATATGGTAACGAGACGTTTTGGACGCAAGGAGGAGGGCTGGTAGGATCAAACCCGGA
CTGTATGTTGTGGAATAACGAACAGAGCATGCTCCGTTACCAGTGCAGTGCTTGTAAAGC
GGGTGTTCTAGGGAGCTTGAAGAAA*GCTGGAGAAAAGTGTCCGTCATCA*CATCGTGGT
GCTTATTATTCTCGTTATCTTCTACGTGATCGCTTATGCG
CTTACAGATGTCAGAGATT

QA 5 824 5 824
DS 

RD RR2A017JQ 725 0 0
GCTTGTTACCGTAACAAGTTCCTCATGTGGCTGTACCTCGTGGCAATGCTTCTCATCATC
GCAGCCTTGATAGGATTCATCATCTTTGCTTATGCAGTCACCGATAAAGGATCTGGTCGA
AACGTGCTGAACAGGGGTTATCTTGACTATTATCTTCAAGATTATTCCGGTTGGTTGAAG
GATAGGGTTTCTGATGGTGGATACTGGGGAAAAATCAGCTCGTGTATTAGAGATTCTGGA
GCTTGTAGGAAGATCGGAAGGAACTTTAATGGCGTCCCTGAAAGTGCTGATATGTTCTTC
CAGAGAAGCCTTAGCCCTGTTGAGTCTGGCTGTTGCAAGCCGCCATCAGATTGCGGGTAT
GCATATGGTAACGAGACGTTTTGGACGCAAGGAGGAGGGCTGGTAGGATCAAACCCGGAC
TGTATGTTGTGGAATAACGAACAGAGCATGCTCCGTTACCAGTGCAGTGCTTGTAAAGCG
GGTGTTCTAGGGAGCTTGAAGAAAAGCTGGAGAAAAGTGTCCGTCATCAACATCGTGGTG
CTTATTATTCTCGTTATCTTCTACGTGATCGCTTATGCGGCTTACAGGAATGTCAAGAGG
ATTGATAACGATGAGCCGGGCGGTGAGGCTAGGATGACAAAATCACCCCCTAGTCATTTC
CCCCTTTGATCAAAATTATGGTGAAGTTTATTAGATGTTAATGAAAATCTGGTGAGAAAC
AATGA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2BQ48JQ 802 0 0
GTGGCAATGCTTCTCATCATCGCAGCCTTGATAGGATTCATCATCTTTGCTTATGCAGTC
ACCGATAAAGGATCTGGTCGAAACGTGCTGAACAGGGGTTATCTTGACTATTATCTTCAA
GATTATTCCGGTTGGTTGAAGGATAGGGTTTCTGATGATGGATACTGGGGAAAAATCAGC
TCGTGTATTAGAGATTCTGGAGCTTGTAGGAAGATCGGAAGGAACTTTAATGGCGTCCCT
GAAAGTGCTGATATGTTCTTCCAGAGAAGCCTTAGCCCTGTTGAGTCTGGCTGTTGCAAG
CCGCCATCAGATTGCGGGTATGCATATGGTAACGAGACGTTTTGGACGCAAGGAGGAGGG
CTGGTAGGA**AAACCCGGACTGTATGTTGTGGAATAACGAACAGAGCATGCTCTGTTAC
CAGTGCAGTGCTTGTAAAGCGGGTGTTCTAGGGAGCTTGAAGAAAAGCTGGAGAAAAGTG
TCCGTCATCAACATCGTGGTGCTTATTATTCTCGTTATCTTCTACGTGATCGCTTATGCG
GCTTACAGGAATGTCAAGAGGATTGATAACGATGAGCCGGGCGGTGAGGCTAGGATGACA
AAATCACACCCTAGTCATTTCCACCTTTGATCAAAATTATGGTGAAGTTTATTAGATGTT
AATGAAAATCTGGTGAGAAACAATGAAACAAAAGATGGGTGCTTTGATATATGTTTTCAC
TTGCTTATGATTTAGTACTTTCGTGTTTGTTTTTGATATGTAACACATTTCTTTGTGTGT
GTATACTATTTATGATTGAAC
C

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2E085JQ 547 0 0
TTCTTCCAGAGAAGCCTTAGCCCTGTTGAGTCTGGCTGTTGCAAGCCGCCATCAGATTGC
GGGTATGCATATGGTAACGAGACGTTTTGGACGCAAGGAGGAGGGCTGGTAGGA**AAAC
CCGGACTGTATGTTGTGGAATAACGAACAGAGCATGCTCTGTTACCAGTGCAGTGCTTGT
AAAGCGGGTGTTCTAGGGAGCTTGAAGAAAAGCTGGAGAAAAGTGTCCGTCATCAACATC
GTGGTGCTTATTATTCTCGTTATCTTCTACGTGATCGCTTATGCGGCTTACAGGAATGTC
AAGAGGATTGATAACGATGAGCCGGGCGGTGAGGCTAGGATGACAAAATCACACCCTAGT
CATTTCCACCTTTGATCAAAATTATGGTGAAGTTTATTAGATGTTAATGAAAATCTGGTG
AGAAACAATGAAACAAAAGATGGGTGCTTTGATATATGTTTCCACTTGCTTATGATTTAG
TACTTTCGTGTTTGTTTTTGATATGTAACACATTTCTTTGTGTGTGTATACTATTTATGA
TTGAAC
C

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2FU33JQ 831 0 0
TGTGGCTGTACCTCGTGGCAATGCTTCTCATCATCGCAGC*TTGATAGGATTCATCATCT
TTGCTTATGCAGTCACCGATAAAGGATCTGGTCGAAACGTGCTGAACAGGGGTTATCTTG
ACTATTATCTTCAAGATTATTCCGGTTGGTTGAAGGATAGGGTTTCTGATGATGGATACT
GGGGAAAAATCAGCTCGTGTATTAGAGATTCTGGAGCTTGTAGGAAGATCGGAAGGAACT
TTAATGGCGTCCCTGAAAGTGCTGATATGTTCTTCCAGAGAAGCCTTAGCCCTGTTGAGT
CTGGCTGTTGCAAGCCGCCATCAGATTGCGTGTATGCATATGGTAACGAGACGTTTTGGA
CGCAAGGAGGAGGGCTGGTAGGATCAAACCCGGACTGTATGTTGTGGAATAACGAACAGA
GCATGCTCTGTTACCAGTGCAGTGCTTGTAAAGCGGGTGTTCTAGGGAGCTTGAAGAAAA
GCTGGAGAAAAGTGTCCGTGATCAACATCGTGGTGCTCATTATTCTCGTTATCTTCTACG
TGATCGCTTATGCGGCTTACAGGAATGTCAAGAGGATTGATAACGATGAGCCGGGCGGTG
AGGCTAGGATGACAAAATCACACCCTAGTCATTTCCACCTTTGATCAAAATTGTGGTGAA
GTTTATTACATGTTAATGAAAATCTGGTGAGAAACAATGAAACAAAAGATTGGTGCTTTG
ATATATGTTTTCACTTGCTTATGATTTAGTACTTTCGTGTTTGTTTTTGATATGTAACAC
ATTTCTTTGTGTGTGTATACTATTTATGATGGAACTAAATATTATTGTT
CC

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2EE32JQ 768 0 0
ACCGATAAAGGATCTGGTCGAAACGTGCTGAACAGGGGTTATCTTGACTATTATCTTCAA
GATTATTCCGGTTGGTTGAAGGATAGGGTTTCTGATGATGGATACTGGGGAAAAATCAGC
TCGTGTATTAGAGATTCTGGAGCTTGTAGGAAGATCGGAAGGAACTTTAATGGCGTCCCT
GAAAGTGCTGATATGTTCTTCCAGAGAAGCCTTAGCCCTGTTGAGTCTGGCTGTTGCAAG
CCGCCATCAGATTGCGGGTATGCATATGGTAACGAGACGTTTTGGACGCAAGGAGGAGGG
CTGGTAGGATCAAACCCGGACTGTATGTTGTGGAATAACGAACAGAGCATGCTCTGTTAC
CAGTGCAGTGCTTGTAAAGCGGGTGTTCTAGGGAGCTTGAAGAAAAGCTGGAGAAAAGTG
TCCGTGATCAACATCGTGGTGCTCATTATTCTCGTTATCTTCTACGTGATCGCTTATGCG
GCTTACAGGAATGTCAAGAGGATTGATAACGATGAGCCGGGCGGTGAGGCTAGGATGACA
AAATCACACCCTAGTCATTTCCACCTTTGATCAAAATTGTGGTGAAGTTTATTACATGTT
AATGAAAATCTGGTGAGAAACAATGAAGCAAAAGATTGGTACTTTGATATATGTTTTCAC
TTGCTTATGATTTAGTACTTTCGTGTTTGTTTTTGATATGTAACACATTTCTTTGTGTGT
GTATACTATTTATGATGGAACTAAATATTATTGTTTCTTTAAGTAAGC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2BW70TF 708 0 0
G
AAGATTATTCCGGTTGGTTGAAGGATAGGGTTTCTGATGATGGATACTGGGGAAAAATCA
GCTCGTGTATTAGAGATTCTGGAGCTTGTAGGAAGATCGGAAGGAACTTTAATGGCGTCC
CTGAAAGTGCTGATATGTTCTTCCAGAGAAGCCTTAGCCCTGTTGAGTCTGGCTGTTGCA
AGCCGCCATCAGATTGCGGGTATGCATATGGTAACGAGACGTTTTGGACGCAAGGAGGAG
GGCTGGTAGGATCAAACCCGGACTGTATGTTGTGGAATAACGAACAGAGCATGCTCTGTT
ACCAGTGCAGTGCTTGTAAAGCGGGTGTTCTAGGGAGCTTGAAGAGAAGCTGGAGAAAAG
TGTCCGTGATCAACATCGTGGTGCTCATTATTCTCGTTATCTTCTACGTGATCGCTTATG
CGGCTTACAGGAATGTCAAGAGGATTGATAACGATGAGCCGGGCGGTGAGGCTAGGATGA
CAAAATCACACCCTAGTCATTTCCACCTTTGATCAAAATTGTGGTGAAGTTTATTACATG
TTAATGAAAATCTGGTGAGAAACAATGAAACAAAAGATTGGTGCTTTGATATATGTTTTC
ACTTGCTTATGATTTAGTACTTTCGTGTTTGTTTTTGATATGTAACACATTTCTTTGTGT
GTGTATACTATTTATGATGGAACTAAATATTATTGTTTCTTTA
GTAG

QA 2 704 2 704
DS 



AS 2 11

CO CL477Contig1 657 9 20 U
GGGAAGCATCTGGAGATTCGACAGAGCTACCCG****AGAGAGAGAAGAGAAGAGAGAAG
ATTAAGCAAAAGCGATGGGTGTAGAGAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGCCAAAC
CCGCTCCAGGTCAAACCGTCACCGTCCACTGCACTGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTTT
CCCAGCAGTTCTGGAGTACAAAGGACGCGGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTA
AAGGTGCTGTCATCAAAGGATGGGATGAAGGCGTTTTGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTG
CTCGCTTGCGGTGCTCACCGGATTACGCATATGGCCCTGGTGGATTTCCCGCGTGGGGAA
TCCAGCCAAACTCGGTTCTCGACTTTGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTC
TCTCTATGACAAAAGCACAACAAAACTTATGTTAAATTATTAAGTGGTGTTAACCCTTTT
TATGTTAATCGCTTCGGGGATCTTTGTTCAAATAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAG
TACTTGTTTAAACTCGGTGGACAACGTTCTATCTTAAATAAAAGACCCCCGTTCCGAATG
TTGCATGTTTTCTTTCAGTTATTGTGATAGTATTATTATGGGAAAATTCCATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 0 50 50 50 50 50 0 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 35 50 35 50 50 50 35 50 25 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ92TF U 1
AF RR2CS69JQ C 421
AF RR2B137JQ C 13
AF RR2B137TF U 13
AF RR2CS69TF U 2
AF RR2GD89JQ C 142
AF RR2C822JQ C 2
AF RR2GD89TF U 18
AF RR2C822TF U 8
BS 1 44 RR2BJ92TF
BS 45 46 RR2B137TF
BS 47 84 RR2BJ92TF
BS 85 85 RR2B137TF
BS 86 145 RR2BJ92TF
BS 146 146 RR2B137TF
BS 147 316 RR2BJ92TF
BS 317 317 RR2B137TF
BS 318 334 RR2BJ92TF
BS 335 335 RR2B137TF
BS 336 349 RR2BJ92TF
BS 350 350 RR2B137TF
BS 351 367 RR2BJ92TF
BS 368 368 RR2B137TF
BS 369 373 RR2BJ92TF
BS 374 374 RR2B137TF
BS 375 598 RR2BJ92TF
BS 599 637 RR2GD89TF
BS 638 652 RR2C822TF
BS 653 657 RR2C822JQ

RD RR2BJ92TF 599 0 0
GGGAAGCATCTGGAGATTCGACAGAGCTACCCG****AGAGAGA**AGAGAAGAGAGAAG
ATTAAGCAAAAGCGATGGGTGTAGGGAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGCCAAAC
CCGCTCCAGGTCAAACCGTCACCGTTCACTGCACTGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTTT
CCCAGCAGTTCTGGAGTACAAAGGACGCGGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTA
AAGGTGCTGTCATCAAAGGATGGGATGAAGGCGTTTTGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTG
CTCGCTTGCGGTGCTCTCCGGATTACGCATATGGTCCTGGTGGATTTCCGGCGTGGGGAA
TCCAGCCTAACTCTGTTCTCGACTTTGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTC
TCTCTATGACAAAAGCACAACAAAACTTATGTTAAATTATTAAGTGGTGTTAACCCTTTT
TATGTTAATCGCTTCGGGGATCTTTGTTCAAATAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAG
TACTTGTTTAAACTCGGTGGACAACGTTCTATCTTAAATAAAAGACCCCCGTTCCGAA
G

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2CS69JQ 147 0 0
TTTT
TATGACAAAAGCACAACAAAACTTATGTTAAATTATTAAGGGGGGTTAACCCTTTTTATG
TTAATCGCTTCGGGGATTTTTGTTCAAATAAAACTTTGGGATGTCACTCTTGTCAGTACT
TGTTTAAACTCGGGGGACAACGT

QA 5 147 5 147
DS 

RD RR2B137JQ 585 0 0
GGGATTC
GACAGAGCTACCAGAAAGAGAGAGAGAAGAGAAGAGAGAAGATTAAGCAAAAGCGATGGG
TGTAGAGAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGCCAAACCCGCTCCAGGTCAAACCGT
CACCGTCCACTGCACTGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTTTCCCAGCAGTTCTGGAGTAC
AAAGGACGCGGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTAAAGGTGCTGTCATCAAAGG
ATGGGATGAAGGCGTTTTGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTGCGGTGCTCACC
GGATTACGCATATGGCCCTGGTGTATTTCCCGCGTGGGGAATCCAGCCAAACTCGGTTCT
CGACTTTGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTCTCTTTATGACAAAAGCACA
ACAAAACTTATGTTAAATTATTAAGTGGTGTTAACCCTTTTTATGTTTATCGCTTCGGGG
ATCTTTGTTCAAATAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGTACTTGTTTAAACTCGGTG
GACAACGTTCTATCTTAAATAAAAGACCCCCGTTCC
AC

QA 8 583 8 583
DS 

RD RR2B137TF 585 0 0
GGGATTC
GACAGAGCTACCAGAAAGAGAGAGAGAAGAGAAGAGAGAAGATTAAGCAAAAGCGATGGG
TGTAGAGAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGCCAAACCCGCTCCAGGTCAAACCGT
CACCGTCCACTGCACTGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTTTCCCAGCAGTTCTGGAGTAC
AAAGGACGCGGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTAAAGGTGCTGTCATCAAAGG
ATGGGATGAAGGCGTTTTGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTGCGGTGCTCACC
GGATTACGCATATGGCCCTGGTGTATTTCCCGCGTGGGGAATCCAGCCAAACTCGGTTCT
CGACTTTGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTCTCTCTATGACAAAAGCACA
ACAAAACTTATGTTAAATTATTAAGTGGTGTTAACCCTTTTTATGTTTATCGCTTCGGGG
ATCTTTGTTCAAATAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGTACTTGTTTAAACTCGGTG
GACAACGTTCTATCTTAAATAAAAGACCCCCGTTCC
AC

QA 8 583 8 583
DS 

RD RR2CS69TF 575 0 0
GGAAGC
ATCTGGAGATTCGACAGAGCTACCCG****AGAGAGAGAAGAGAAGAGAGAAGATTAAGC
AAAAGCGATGGGTGTAGAGAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGCCAAACCCGCTCC
AGGTCAAACCGTCACCGTTCACTGCACTGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTTTCCCAGCA
GTTCTGGAGTACAAAGGACGCGGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTAAAGGTGC
TGTCATCAAAGGATGGGATGAAGGCGTTTTGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTT
GCGGTGCTCTCCGGATTACGCATATGGTCCTGGTGGATTTCCGGCGTGGGGAATCCAGCC
TAACTCTGTTCTCGACTTTGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTCTCTCTAT
GACAAAAGCACAACAAAACTTATGTTAAATTATTAAGTGGTGTTAACCCTTTTTATGTTA
ATCGCTTCGGGGATCTTTGTTCAAATAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGTACTTGT
TTAAACTCGGTGGACAACGTTCTATCTTA

QA 7 575 7 575
DS 

RD RR2GD89JQ 426 0 0
CCGTCCACTGCACTGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTTTCCCAGCAGTTTTGGAGTACAA
AGGACGCGGGGCAAAAACCTTTTTCCTTCCAAATCGGTAAAGGTGCTGTCATCAAAGGAT
GGGATGAAGGCGTTTTGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTGCGGTGCTCACCGG
ATTACGCATATGGCCCTGGTGGATTTCCCGCGTGGGGAATCCAGCCAAACTCGGTTTTCG
ACTTTGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAAT*TTTTCTTTTTATGACAAAAGCACAAC
AAAACTTATGTTAAATTATTAAGTGGTGTTAACCCTTTTTATGTTTATCGCTTCGGGGAT
TTTTGTTCAAATAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGTACTTGTTTAAACTCGGTGGA
CAACGT

QA 1 426 1 426
DS 

RD RR2C822JQ 656 0 0
GGAAGC
ATCTGGAGATTCGACAGAGCTACCCG****AGAGAGAGAAGAGAAGAGAGAAGATTAAGC
AAAAGCGATGGGTGTAGGGAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGCCAAACCCGCTCC
AGGTCAAACCGTCACCGTTCACTGCACTGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTTTCCCAGCA
GTTCTGGAGTACAAAGGACGCGGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTAAAGGTGC
TGTCATCAAAGGATGGGATGAAGGCGTTTTGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTT
GCGGTGCTCTCCGGATTACGCATATGGTCCTGGTGGATTTCCGGCGTGGGGAATCCAGCC
TAACTCTGTTCTCGACTTTGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTCTCTCTAT
GACAAAAGCACAACAAAACTTATGTTAAATTATTAAGTGGTGTTAACCCTTTTTATGTTA
ATCGCTTCGGGGATCTTTGTTCAAATAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGTACTTGT
TTAAACTCGGTGGACAACGTTCTATCTTAAATAAAAGACCCCCGTTCCGAATGTTGCATG
TTTTCTTTCAGTTATTGTGATAGTATTATTATGGGAAAATTCCATAAAAA

QA 7 656 7 656
DS 

RD RR2GD89TF 620 0 0
GGGACAGAGCTACCAGAAA
GAGAGAGAGAAGAGAAGAGAGAAGATTAAGCAAAAGCGATGGGTGTAGAGAAGCAAGTCA
TCAGACCCGGCACTGGTGCCAAACCCGCTCCAGGTCAAACCGTCACCGTCCACTGCACTG
GATTCGGGAAAGGTGGTGATCTTTCCCAGCAGTTCTGGAGTACAAAGGACGCGGGGCAAA
AACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTAAAGGTGCTGTCATCAAAGGATGGGATGAAGGCGTTT
TGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTGCGGTGCTCACCGGATTACGCATATGGCC
CTGGTGGATTTCCCGCGTGGGGAATCCAGCCAAACTCGGTTCTCGACTTTGAAATCGAAG
TACTCAGCGTGCAGTAAT*CTCTCTCTCTATGACAAAAGCACAACAAAACTTATGTTAAA
TTATTAAGTGGTGTTAACCCTTTTTATGTTTATCGCTTCGGGGATCTTTGTTCAAATAAA
ACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGTACTTGTTTAAACTCGGTGGACAACGTTCTATCTTA
AATAAAAGACCCCCGTTCCGAATGTTGCATGTTTTCTTTCAGTTATTGTGATAGTATTAT
T

QA 20 620 20 620
DS 

RD RR2C822TF 645 0 0
ATCTGGAGATTCGACAGAGCTACCCG****AGAGAGAGAAGAGAAGAGAGAAGATTAAGC
AAAAGCGATGGGTGTAGGGAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGCCAAACCCGCTCC
AGGTCAAACCGTCACCGTTCACTGCACTGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTTTCCCAGCA
GTTCTGGAGTACAAAGGACGCGGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTAAAGGTGC
TGTCATCAAAGGATGGGATGAAGGCGTTTTGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTT
GCGGTGCTCTCCGGATTACGCATATGGTCCTGGTGGATTTCCGGCGTGGGGAATCCAGCC
TAACTCTGTTCTCGACTTTGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTCTCTCTAT
GACAAAAGCACAACAAAACTTATGTTAAATTATTAAGTGGTGTTAACCCTTTTTATGTTA
ATCGCTTCGGGGATCTTTGTTCAAATAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGTACTTGT
TTAAACTCGGTGGACAACGTTCTATCTTAAATAAAAGACCCCCGTTCCGAATGTTGCATG
TTTTCTTTCAGTTATTGTGATAGTATTATTATGGGAAAATTCCAT

QA 1 645 1 645
DS 



CO CL477Contig2 621 2 4 U
GGAGAGCTACCAGAGAGAGAAGAGAAGGGAGAAGATTAAGCAAAAGCGATGGGTGTAGAG
AAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGCCAAACCCGCTCCAGGTCAAACCGTCACCGTC
CACTGCACCGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTTTCCCAGCAGTTCTGGAGTACAAAGGAC
GCGGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTAAAGGAGCTGTCATCAAAGGATGGGAT
GAAGGCGTTTTGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTGCGGTGCTCACCGGATTAC
GCATATGGTCCTGGTGGATTTCCGGCGTGGGGAATCCAGCCAAACTCTGTTCTCGACTTT
GAAATTGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTCTCTATTGACAAAAGCGCAACAAAACT
TATGTTAAATTATTAAGTGGTTTGTAGCCCTTTTTATGTTTATCGCTTCGGGGATCTTTG
TTCAAACAAAACTTTGTGCTGTCACTGTTGTCAGTACTTGTCCAAACTCGGTGGACAACG
TTTTATCTTAAATAAAAGCCCCCGTTACTCTTGTTTCAGTCCGAATGTTGCATGTTTTCT
TTCAGTTATTGTGATATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H073JQ C 1
AF RR2H073TF U 1
BS 1 11 RR2H073JQ
BS 12 561 RR2H073TF
BS 562 562 RR2H073JQ
BS 563 621 RR2H073TF

RD RR2H073JQ 621 0 0
GGAGAGCTACCAGAGAGAGAAGAGAAGGGAGAAGATTAAGCAAAAGCGATGGGTGTAGAG
AAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGCCAAACCCGCTCCAGGTCAAACCGTCACCGTC
CACTGCACCGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTTTCCCAGCAGTTCTGGAGTACAAAGGAC
GCGGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTAAAGGAGCTGTCATCAAAGGATGGGAT
GAAGGCGTTTTGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTGCGGTGCTCACCGGATTAC
GCATATGGTCCTGGTGGATTTCCGGCGTGGGGAATCCAGCCAAACTCTGTTCTCGACTTT
GAAATTGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTCTCTATTGACAAAAGCGCAACAAAACT
TATGTTAAATTATTAAGTGGTTTGTAGCCCTTTTTATGTTTATCGCTTCGGGGATCTTTG
TTCAAACAAAACTTTGTGCTGTCACTGTTGTCAGTACTTGTCCAAACTCGGTGGACAACG
TTTTATCTTAAATAAAAGCCCCCGTTACTCTTGTTTCAGTCCGAATGTTGCATGTTTTCT
TTCAGTTATTGTGATATTATT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2H073TF 621 0 0
GGAGAGCTACC
AGAGAGAGAAGAGAAGGGAGAAGATTAAGCAAAAGCGATGGGTGTAGAGAAGCAAGTCAT
CAGACCCGGCACTGGTGCCAAACCCGCTCCAGGTCAAACCGTCACCGTCCACTGCACCGG
ATTCGGGAAAGGTGGTGATCTTTCCCAGCAGTTCTGGAGTACAAAGGACGCGGGGCAAAA
ACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTAAAGGAGCTGTCATCAAAGGATGGGATGAAGGCGTTTT
GGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTGCGGTGCTCACCGGATTACGCATATGGTCC
TGGTGGATTTCCGGCGTGGGGAATCCAGCCAAACTCTGTTCTCGACTTTGAAATTGAAGT
ACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTCTCTATTGACAAAAGCGCAACAAAACTTATGTTAAATT
ATTAAGTGGTTTGTAGCCCTTTTTATGTTTATCGCTTCGGGGATCTTTGTTCAAACAAAA
CTTTGTGCTGTCACTGTTGTCAGTACTTGTCCAAACTCGGTGGACAACGTTTTATCTTAA
ATAAAAGCCCTCGTTACTCTTGTTTCAGTCCGAATGTTGCATGTTTTCTTTCAGTTATTG
TGATATTATT

QA 12 621 12 621
DS 



AS 1 10

CO CL478Contig1 1056 10 22 U
ATGAAGTCATCCAAACTCTCATCTATTTCTCTCTGTTTCATTCTCATTTGCATTATCTTC
TTTCCTCAAAAATCCTTCTCATGTGGCTCCTGCAACCCCAGGAAGGGTGGAAAACACTCC
ACTAAACCCCCGGTGACCGTCCCGAAGTTACCTGTTCCTCCAGTGACCGTACCTAAGCTT
CCAGTTCCTCCGGTGACAGTTCCTAAGCTACCTGTTCCTCCAGTCACCGTCCCAAAGCTA
CCTGTACCTCCCGTGACCGTCCCAGAACTACCACTTCCCCCGGTTGGAGGGCTACCCATT
CCTCCGGTTGGAGGGCTACCCATACCTCCGGTTGGAGGGCTACCCATACCTCCGGTTGGA
GGGCTACCCATACCTCCGGTTGGAGGGTTACCCATACCTCCGGTTGGAGGGCTACCCACA
TTGCCACTGCCACCGTTGCCGATTGTGGGTCCTCTTCTTCCTCCAGGGACAAACCCTCCT
AGTTCAGGAGGAAAAGATTGCCCTCCACCCCC*TGGGTAGCCATAAGTCCCCACCAGGCA
CTGGGAAGGCGACATGTCCAATAGACACGCTGAAGTTGGGGGCGTGTGTTGACTTGTTGG
GAGGTTTAGTAAAGATAGGGTTAGGAGACCCAGCCGTTAACAAATGCTGTCCGATACTTA
AAGGCCTCGTTGAAGTTGAAGCAGCAGCTTGTCTCTGCACTACACTTAAGCTTAAAGCTC
TTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTCTTCAGCTTCTTCTTACCTGTGGCAAAAAGC
CACCTCCGGGCTACACTTGCTCCATCTGAGAAATTTAGTCCAGTTAAAGGATAACTTGGA
GTAAAAAGTGAGAAGACAATGGCAGAGCTCTGGTTTATCCTTTCACGTGTATTAATCATG
TCCAATCCTTTCCCTTTGATTCTTTCACATATCTATCCCTTCTGCTTGTATCGTTGTGGT
TCTAGATTAATGATTCTTCTCTTGTATGAAAGTACGATTTGAAATTATTTATTTTTAACG
AATGAATTGAGGTGTGTGAAAATATTATTGTAAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV94TF U 269
AF RR2HB74TF U 1
AF RR2C306TF U 89
AF RR2HB74JQ C 719
AF RR2C306JQ C 283
AF RR2DP26JQ C 697
AF RR2FM62TF U 463
AF RR2D667TF U 531
AF RR2G763TF U 465
AF RR2AB25TF U 855
BS 1 140 RR2HB74TF
BS 141 141 RR2C306TF
BS 142 513 RR2HB74TF
BS 514 514 RR2C306TF
BS 515 663 RR2HB74TF
BS 664 664 RR2C306TF
BS 665 704 RR2HB74TF
BS 705 777 RR2C306TF
BS 778 778 RR2FM62TF
BS 779 829 RR2C306TF
BS 830 830 RR2FM62TF
BS 831 846 RR2C306TF
BS 847 847 RR2FM62TF
BS 848 853 RR2C306TF
BS 854 854 RR2FM62TF
BS 855 858 RR2C306TF
BS 859 859 RR2FM62TF
BS 860 875 RR2C306TF
BS 876 876 RR2FM62TF
BS 877 891 RR2C306TF
BS 892 1029 RR2FM62TF
BS 1030 1056 RR2AB25TF

RD RR2CV94TF 181 0 0
TACCACTTCCCCCGGTTGGAGGGCTACCCATTCCTCCGGTTGGAGGGCTACCCATACCTC
CGGTTGGAGGGCTACCCATACCTCCGGTTGGAGGGCTACCCATACCTCCGGTTGGAGGGT
TACCCATACCTCCGGTTGGAGGGCTACCCACATTGCCACTGCCACCGTTGCCGATTGTGG
G

QA 1 181 1 181
DS 

RD RR2HB74TF 704 0 0
ATGAAGTCATCCAAACTCTCATCTATTTCTCTCTGTTTCATTCTCATTTGCATTATCTTC
TTTCCTCAAAAATCCTTCTCATGTGGCTCCTGCAACCCCAGGAAGGGTGGAAAACACTCC
ACTAAACCCCCGGTGACCGTTCCGAAGTTACCTGTTCCTCCAGTGACCGTACCTAAGCTT
CCAGTTCCTCCGGTGACAGTTCCTAAGCTACCTGTTCCTCCAGTCACCGTCCCAAAGCTA
CCTGTACCTCCCGTGACCGTCCCAGAACTACCACTTCCCCCGGTTGGAGGGCTACCCATT
CCTCCGGTTGGAGGGCTACCCATACCTCCGGTTGGAGGGCTACCCATACCTCCGGTTGGA
GGGCTACCCATACCTCCGGTTGGAGGGTTACCCATACCTCCGGTTGGAGGGCTACCCACA
TTGCCACTGCCACCGTTGCCGATTGTGGGTCCTCTTCTTCCTCCAGGGACAAACCCTCCT
AGTTCAGGAGGAAAAGATTGCCCTCCACCCCC**GGGTAGCCATAAGTCCCCACCAGGCA
CTGGGAAGGCGACATGTCCAATAGACACGCTGAAGTTGGGGGCGTGTGTTGACTTGTTGG
GAGGTTTAGTAAAGATAGGGTTAGGAGACCCAGCCGTTAACAAATGCTGTCCGATACTTA
AAG*CCTCGTTGAAGTTGAAGCAGCAGCTTGTCTCTGCACTACA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2C306TF 803 0 0
G
CTGCAACCCCAGGAAGGGTGGAAAACACTCCACTAAACCCCCGGTGACCGTCCCGAAGTT
ACCTGTTCCTCCAGTGACCGTACCTAAGCTTCCAGTTCCTCCGGTGACAGTTCCTAAGCT
ACCTGTTCCTCCAGTCACCGTCCCAAAGCTACCTGTACCTCCCGTGACCGTCCCAGAACT
ACCACTTCCCCCGGTTGGAGGGCTACCCATTCCTCCGGTTGGAGGGCTACCCATACCTCC
GGTTGGAGGGCTACCCATACCTCCGGTTGGAGGGCTACCCATACCTCCGGTTGGAGGGTT
ACCCATACCTCCGGTTGGAGGGCTACCCACATTGCCACTGCCACCGTTGCCGATTGTGGG
TCCTCTTCTTCCTCCAGGGACAAACCCTCCTAGTTCAGGAGGAAAAGATTGCCCTCCACC
CCC*TGGGTAGCCATAAGTCCCCACCAGGCACTGGGAAGGCGACATGTCCAATAGACACG
CTGAAGTTGGGGGCGTGTGTTGACTTGTTGGGAGGTTTAGTAAAGATAGGGTTAGGAGAC
CCAGCCGTTAACAAATGCTGTCCGATACTTAAAGGCCTCGTTGAAGTTGAAGCAGCAGCT
TGTCTCTGCACTACACTTAAGCTTAAAGCTCTTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCT
CTTCAGCTTCTTCTTACCTGTGGCAAAA*GCCACCTCCGGGCTACACTTGCTCCATCTGA
GAAATTTAGTCCAGTTAAAG*ATAACTTGGAGTAAAA*GTGAGA*GACA*TGGCAGAGCT
CTGGTT*ATCCTTTCACGTGTA

QA 2 803 2 803
DS 

RD RR2HB74JQ 283 0 0
TCTTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGTTCTTCAGCTTTTTTTTACCTGTGGCAAAAA
GCCACCTCCGGGCTACACTTGCTCCATTTGAGAAATTTAGTCCAGTTAAAGGATAACTTG
GAGTAAAAAGTGAGAAGACAATGGCAGAGCTTTGGTTTATCCTTTCACGTGTATTAATCA
TGTCCAATCCTTTCCCTTTGATTCTTTCACATATCTATCCCTTCTGCTTGTATCGTTGTG
GTTCTAGATTAATGATTCTTCTCTTGTATGAAAGTACGATTTG

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR2C306JQ 757 0 0
GG
TGGAGGGCTACCCATTCCTCCGGTTGGAGGGCTACCCATACCTCCGGTTGGAGGGCTACC
CATACCTCCGGTTGGAGGGCTACCCATACCTCCGGTTGGAGGGTTACCCATACCTCCGGT
TGGAGGGCTACCCACATTGCCACTGCCACCGTTGCCGATTGTGGGTCCTCTTCTTCCTCC
AGGGACAAACCCTCCTAGTTCAGGAGGAAAAGATTGCCCTCCACCCCCCTGGGTAGCCAT
AAGTCCCCACCAGGCACTGGGAAGGCGACATGTCCAATAGACACGCTGAAGTTGGGGGCG
TGTGTTGACTTGTTGGGAGGTTTAGTAAAGATAGGGTTAGGAGACCCAGCCGTTAACAAA
TGCTGTCCGATACTTAAAGGCCTCGTTGAAGTTGAAGCAGCAGCTTGTCTTTGCACTACA
CTTAAGCTTAAAGCTCTTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTCTTCAGCTTCTTTTT
ACCTGTGGCAAAAAGCCACCTCCGGGCTACACTTGCTCCATTTGAGAAATTTAGTCCAGT
TAAAGGATAACTTGGAGTAAAAAGTGAGAAGACAATGGCAGAGCTCTGGTTTATCCTTTC
ACGTGTATTAATCATGTCCAATCCTTTCCCTTTGATTCTTTCACATATCTATCCCTTCTG
CTTGTATCGTTGTGGTTCTAGATTAATGATTCTTCTCTTGTATGAAAGTACGATTTGAAA
TTATTTATTTTTAACGAATGAATTGAGGTGTGT
GG

QA 3 755 3 755
DS 

RD RR2DP26JQ 343 0 0
GCACTACACTTAAGCTTAAAGCTTTTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTTTTCAGC
TTCTTTTTACCTGTGGCAAAAAGCCACCACCGGGCTACACTTGCTCCATTTGAGAAATTT
AGTCCAGTTAAAGGATAACTTGGAGTAAAAAGTGAGAAGACAATGGCAGAGCTCTGGTTT
ATCCTTTCACGTGTATTAATCATGTCCAATCCTTTCCCTTTGATTCTTTCACATATCTAT
CCCTTCTGCTTGTATCGTTGTGGTTCTAGATTAATGATTCTTCTCTTGTATGAAAGTACG
ATTTGAAATTATTTATTTTTAACGAATGAATTGAGGTGTGT
AC

QA 1 341 1 341
DS 

RD RR2FM62TF 567 0 0
CCAGGGACAAACCCTCCTAGTTCAGGAGGAAAAGATTGCCCTCCACCCCC**GGGTAGCC
ATAAGTCCCCACCAGGCACTGGGAAGGCGACATGTCCAATAGACACGCTGAAGTTGGGGG
CGTGTGTTGACTTGTTGGGAGGTTTAGTAAAGATAGGGTTAGGAGGCCCAGCCGTTAACA
AATGCTGTCCGATACTTAAAGGCCTCGTTGAAGTTGAAGCAGCAGCTTGTCTCTGCACTA
CACTTAAGCTTAAAGCTCTTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTCTTCAGCTTCTTC
TTACCTGTGGCAAAAAGCCACCACCGGGCTACACTTGCTCCATCTGAGAAATTTAGTCCA
GTTAAAGGATAACTTGGAGTAAAAAGTGAGAAGACAATGGCAGAGCTCTGGTTTATCCTT
TCACGTGTATTAATCATGTCCAATCCTTTCCCTTTGATTCTTTCACATATCTATCCCTTC
TGCTTGTATCGTTGTGGTTCTAGATTAATGATTCTTCTCTTGTATGAAAGTACGATTTGA
AATTATTTATTTTTAACGAATGAATTG

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2D667TF 495 0 0
G
CACCAGGCACTGGGAAGGCGACATGTCCAATAGACACGCTGAAGTTGGGGGCGTGTGTTG
ACTTGTTGGGAGGTTTAGTAAAGATAGGGTTAGGAGACCCAGCCGTTAACAAATGCTGTC
CGATACTTAAAGGCCTCGTTGAAGTTGAAGCAGCAGCTTGTCTCTGCACTACACTTAAGC
TTAAAGCTCTTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTCTTCAGCTTCTTCTTACCTGTG
GCAAAAAGCCACCACCGGGCTACACTTGCTCCATCTGAGAAATTTAGTCCAGTTAAAGGA
TAACTTGGAGTAAAAAGTGAGAAGACAATGGCAGAGCTCTGGTTTATCCTTTCACGTGTA
TTAATCATGTCCAATCCTTTCCCTTTGATTCTTTCACATATCTATCCCTTCTGCTTGTAT
CGTTGTGGTTCTAGATTAATGATTCTTCTCTTGTATGAAAGTACGATTTGAAATTATTTA
TTTTTAACGAATGA

QA 2 495 2 495
DS 

RD RR2G763TF 563 0 0
AGGGACAAACCCTCCTAGTTCAGGAGGAAAAGATTGCCCTCCACCCCC**GGGTAGCCAT
AAGTCCCCACCAGGCACTGGGAAGGCGACATGTCCAATAGACACGCTGAAGTTGGGGGCG
TGTGTTGACTTGTTGGGAGGTTTAGTAAAGATAGGGTTAGGAGACCCAGCCGTTAACAAA
TGCTGTCCGATACTTAAAGGCCTCGTTGAAGTTGAAGCAGCAGCTTGTCTCTGCACTACA
CTTAAGCTTAAAGCTCTTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTCTTCAGCTTCTTCTT
ACCTGTGGCAAAAAGCCACCTCCGGGCTACACTTGCTCCATCTGAGAAATTTAGTCCAGT
TAAAGGATAACTTGGAGTAAAAAGTGAGAAGACAATGGCAGAGCTCTGGTTAATCCTTTC
ACGTGTATTAATCATGTCCAATCCTTTCCCTTTGATTCTTTCACATATCTATCCCTTCTG
CTTGTATCGTTGTGGTTCTAGATTAATGATTCTTCTCTTGTATGAAAGTACGATTTGAAA
TTATTTATTTTTAACGAATGAAT

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2AB25TF 202 0 0
GACAATGGCAGAGCTCTGGTTTATCCTTTCACGTGTATTAATCATGTCCAATCCTTTCCC
TTTGATTCTTTCACATATCTATCCCTTCTGCTTGTATCGTTGTGGTTCTAGATTAATGAT
TCTTCTCTTGTATGAAAGTACGATTTGAAATTATTTATTTTTAACGAATGAATTGAGGTG
TGTGAAAATATTATTGTAAAAC

QA 1 202 1 202
DS 



AS 2 11

CO CL479Contig1 726 3 12 U
GGTCAAAGTTGTCTGGATTCTGGTTTACTTTTCATTGGTAAATGTCTGAAGTTTTACAAA
CTTTAAAAACACATTCTGGAAAAGCCAAAACCTCTAAATGCCACTACCTGAATTCGACAG
AGATACAAAACTGGATATAAGAACTGAGAGGAGAAGTTAGTCTTCTTCAGATTCAATAGG
AAGGCCTTCCTTGCTCCATGTGTAGATTCCTCCTTCAAGGTGAAATACGTTCTTATAGCC
GTTCAGGACCAGAACATAA*GCAGCTATGAGAGACCTAGATTGTTGGCCTTCAGGG*AGA
TTCTGAGTCGGCTTCATAGTCCCTGCGGATGAACAAGCTACTATTATCTTTGCCTCTTTG
TCAAGTTTAGCCTCTACACTTTGGATAAACTCTGG*ATTCTCTTCTGTGCCAGAGAAGAT
ACCGAAGAA*TGCAAA*TCCAAGACGACGAGCTATGTCCCATGGCGTCCATTCCCTTATC
AGTCTGTACATCTCCACATTGATAGCTCCCGGAGGATGACCCTCCTCGTACTCAGCCTCT
GGTCTAACATCAAGAATCACAAAGTTGTTCTCCTTCTGTAACCGCAGAGCTTCCTTCACG
TCCACACTTCTCACCCTTTTCTCCAGTAGAAGCTCTCTCTTCTGTCTCCAATCGACTTCA
GCTGCTGGTTTGTCAGGTTTCGTTGCAGCGCTTCGAATAGTCAGAAGCGATGATGAAGAA
GAAGAA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2A164TF C 200
AF RR2BW61JQ U 1
AF RR2GI89JQB U 1
BS 1 26 RR2BW61JQ
BS 27 27 RR2GI89JQB
BS 28 89 RR2BW61JQ
BS 90 90 RR2GI89JQB
BS 91 91 RR2BW61JQ
BS 92 92 RR2GI89JQB
BS 93 142 RR2BW61JQ
BS 143 143 RR2GI89JQB
BS 144 551 RR2BW61JQ
BS 552 552 RR2GI89JQB
BS 553 708 RR2BW61JQ
BS 709 726 RR2GI89JQB

RD RR2A164TF 295 0 0
GTGTAGATTC*TCTTTCAAGGTGAAATACGTTCTTATAGCCGTTCAGGACCAGAACATAA
AGCAGCTATGAGAGACCTAGATTGTTGGCCTTCAGGGGAGATTCTGAGTCGGCTTCATAG
TCCCTGCGGATGAACAAGCTACTATTATCTTTGCATCTTTGTCAAGTTTAGCCTCTACAC
TTTGGATAAACTCTGGGATTCTCTTCTGTGCCAGAGAAGATACCGAAGAAATGCAAAATC
CAAGACGACGAGCTATGTCCCATGGCGTCCATTCCCTTATCAGTCTGTACATCTC

QA 1 295 1 295
DS 

RD RR2BW61JQ 708 0 0
GGTCAAAGTTGTCTGGATTCTGGTTTGCTTTTCATTGGTAAATGTCTGAAGTTTTACAAA
CTTTAAAAACACATTCTGGAAAAGCCAAATC*TCTAAATGCCACTACCTGAATTCGACAG
AGATACAAAACTGGATATAAGACCTGAGAGGAGAAGTTAGTCTTCTTCAGATTCAATAGG
AAGGCCTTCCTTGCTCCATGTGTAGATTCCTCCTTCAAGGTGAAATACGTTCTTATAGCC
GTTCAGGACCAGAACATAA*GCAGCTATGAGAGACCTAGATTGTTGGCCTTCAGGG*AGA
TTCTGAGTCGGCTTCATAGTCCCTGCGGATGAACAAGCTACTATTATCTTTGCCTCTTTG
TCAAGTTTAGCCTCTACACTTTGGATAAACTCTGG*ATTCTCTTCTGTGCCAGAGAAGAT
ACCGAAGAA*TGCAAA*TCCAAGACGACGAGCTATGTCCCATGGCGTCCATTCCCTTATC
AGTCTGTACATCTCCACATTGATAGCTCCCGGAGGATGACCCTCCTCGTACTCAGCCTCT
GGTCTAACATCGAGAATCACAAAGTTGTTCTCCTTCTGTAACCGCAGAGCTTCCTTCACG
TCCACACTTCTCACCCTTTTCTCCAGTAGAAGCTCTCTCTTCTGTCTCCAATCGACTTCA
GCTGCTGGTTTGTCAGGTTTCGTTGCAGCGCTTCGAATAGTCAGAAGC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2GI89JQB 726 0 0
GA
TCAAAGTTGTCTGGATTCTGGTTTACTTTTCATTGGTAAATGTCTGAAGTTTTACAAACT
T*AAAAACACATTCTGGAAAAGCCAAAACCTCTAAATGCCACTACCTGAATTCGACAGAG
ATACAAAACTGGATATAAGAACTGAGAGGTGAAGTTAGTCTTCTTCAGATTCAATAGGAA
GGCCTTCCTTGCTCCATGTGTAGATTCCTCCTTCAAGGTGAAATACGTTCTTATAGCCGT
TCAGGACCAGAACATAA*GCAGCTATGAGAGACCTAGATTGTTGGCCTTCAGGG*AGATT
CTGAGTCGGCTTCATAGTCCCTGCGGATGAACAAGCTACTATTATCTTTGCCTCTTTGTC
AAGTTTAGCTTCTACACTTTGGATAAACTCTGG*ATTCTCTTCTGTTCCAGAGAAGATAC
CGAAGAA*TGCAAA*TCCAAGGCGGCGAGCTATGTCCCATGGCGTCCATTCCCTTATCAG
TCTGTACATCTCCACATTGATAGCTCCCGGAGGATGACCCTCCTTGTACTCAGCCTCTGG
TCTAACATCAAGAATCACAAAGTTGTTCTCTTTCTGTAACCGCAGAGCTTCCTTCACGTC
CACACTTCTCACCCTTTTCTCCAGTAGAAGCTCTCTCTTCTGTCTCCAATCGACTTCAGC
TGCTGGTTTGTCAGGTTTCGTTGCAGCGCTTCGAATAGTCAGAAGCGATGATGAAGAAGA
AGAA

QA 3 726 3 726
DS 



CO CL479Contig2 923 8 32 U
GGGTCTCTTTCTGTCTTTCCATCATCCTGCATTTAAATTCTCTCATTTTCCAGCCAAAAA
AATATCTCAGAAGAAGATGGCTTCACTTACTTCTATTGCCACCCCTTATCGCAGCTCAAG
CTATCCATCTTCGTCGCAAGCTTTACGTGTCAAACTCACCGGAAACACTCTGTTCTCAGC
TGGAGTTAGATCCCCTGCTTCTTCTTCTTCTTCATC***GCTTCTGACTATTCGAAGCGC
TGCAACGAAACCTGACAAACCAGCAGCTGAAGTCGATTGGAGACAGAAGAGAGAGCCTCT
ACTGGAGAAAAGGGTGAGAAGTGTGGACGTGAAGGAAGCTCTGCGGTTACAGAAGGAGAA
CAACTTTGTGATTCTCGATGTTAGACCAGAGGCTGAGTACAAGGAGGGTCATCCTCCGGG
AGCTATCAATCTGGAGATGTACAGATTGATAAGGGAATGGACGCCATGGGACATAGCTCG
TCGTCTTGGATTTGCATTCTTCGGTATCTTCTCTGGCACAGAAGAGAATCCAGAGTTTAT
CAAAAGTGTAGAAGCTAAACTTGACAAAGAGGCAAAGATAATAGTAGCTTGTTCATCCGC
AGGGACTATGAAGCCGACTCAGAACCTCCCTGAAGGCCAACAATCTAGGTCTCTCATAGC
TGCTTATGTTCTGGTCCTGAACGGCTATAAGAACGTATTTCACCTTGAAGGAGGAATCTA
CACATGGAGCAAGGAAGGCCTTCCTATTGAATCTGAAGAAGACTAACTTCTCCTCTCAGG
TCTTATATATCCAGTTTTGTATCTCTGTCGAATTAAGGTAGTGGCATTTAGAAGGTTTGG
CTTTTCCAGAATGTGTTTTTAAGTTTGTAAAACTTCAGACATTTACCAATGAAAAGCAAA
CCAGAATCCAGACAACTTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 30 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ77TF U 62
AF RR2GI89TF U 1
AF RR2BW61TF U 67
AF RR2FB11TF U 66
AF RR2FQ31TF U 62
AF RR2FE06TF U 476
AF RR2FQ31JQ C 199
AF RR2DZ77JQ C 481
BS 1 210 RR2GI89TF
BS 211 211 RR2DZ77TF
BS 212 296 RR2GI89TF
BS 297 297 RR2FQ31TF
BS 298 354 RR2GI89TF
BS 355 355 RR2FQ31TF
BS 356 375 RR2GI89TF
BS 376 376 RR2FQ31TF
BS 377 430 RR2GI89TF
BS 431 431 RR2FQ31TF
BS 432 445 RR2GI89TF
BS 446 446 RR2FQ31TF
BS 447 480 RR2GI89TF
BS 481 481 RR2FQ31TF
BS 482 483 RR2GI89TF
BS 484 484 RR2FQ31TF
BS 485 516 RR2GI89TF
BS 517 517 RR2FQ31TF
BS 518 541 RR2GI89TF
BS 542 542 RR2FQ31TF
BS 543 624 RR2GI89TF
BS 625 625 RR2FQ31TF
BS 626 631 RR2GI89TF
BS 632 709 RR2FQ31TF
BS 710 710 RR2FE06TF
BS 711 737 RR2FQ31TF
BS 738 738 RR2FE06TF
BS 739 779 RR2FQ31TF
BS 780 780 RR2FE06TF
BS 781 813 RR2FQ31TF
BS 814 897 RR2FE06TF
BS 898 923 RR2FQ31JQ

RD RR2DZ77TF 209 0 0
GGATCTC
AGAAGAAGATGGCTTCACTTACTTCTATTGCCACCCCTTATCGCAGCTCAAGCTATCCAT
CTTCGTCGCAAGCTTTACGTGTCAAACTCACCGGAAACACTCTGTTCTCAGCTGGAGTTA
GATCCCCTGCTTCTTCTTCTTCTTCATC***GCTTCTGACTATTCGAATCGCTGCAACGA
AACCTGACAAACCAGCAGCTGA

QA 8 209 8 209
DS 

RD RR2GI89TF 631 0 0
GGGTCTCTTTCTGTCTTTCCATCATCCTGCATTTAAATTCTCTCATTTTCCAGCCAAAAA
AATATCTCAGAAGAAGATGGCTTCACTTACTTCTATTGCCACCCCTTATCGCAGCTCAAG
CTATCCATCTTCGTCGCAAGCTTTACGTGTCAAACTCACCGGAAACACTCTGTTCTCAGC
TGGAGTTAGATCCCCTGCTTCTTCTTCTTCATCATC***GCTTCTGACTATTCGAAGCGC
TGCAACGAAACCTGACAAACCAGCAGCTGAAGTCGATTGGAGACAGAAGAGAGAGCTTCT
ACTGGAGAAAAGGGTGAGAAGTGTGGACGTGAAGGAAGCTCTGCGGTTACAGAAAGAGAA
CAACTTTGTGATTCTTGATGTTAGACCAGAGGCTGAGTACAAGGAGGGTCATCCTCCGGG
AGCTATCAATGTGGAGATGTACAGACTGATAAGGGAATGGACGCCATGGGACATAGCTCG
CCGCCTTGGATTTGCATTCTTCGGTATCTTCTCTGGAACAGAAGAGAATCCAGAGTTTAT
CCAAAGTGTAGAAGCTAAACTTGACAAAGAGGCAAAGATAATAGTAGCTTGTTCATCCGC
AGGGACTATGAAGCCGACTCAGAATCTCCCT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2BW61TF 630 0 0
GG
AGAAGAAGATGGCTTCACTTACTTCTATTGCCACCCCTTATCGCAGCTCAAGCTATCCAT
CTTCGTCGCAAGCTTTACGTGTCAAACTCACCGGAAACACTCTGTTCTCAGCTGTAGTTA
GATCCCCTGCTTCTTCTTCATCATCATCATCGCTTCTGACTATTCGAAGCGCTGCAACGA
AACCTGACAAACCAGCAGCTGAAGTCGATTGGAGACAGAAGAGAGAGCTTCTACTGGAGA
AAAGGGTGAGAAGTGTGGACGTGAAGGAAGCTCTGCGGTTACAGAAGGAGAACAACTTTG
TGATTCTCGATGTTAGACCAGAGGCTGAGTACGAGGAGGGTCATCCTCCGGGAGCTATCA
ATGTGGAGATGTACAGACTGATAAGGGAATGGACGCCATGGGACATAGCTCGTCGTCTTG
GATTTGCATTCTTCGGTATCTTCTCTGGCACAGAAGAGAATCCAGAGTTTATCCAAAGTG
TAGAGGCTAAACTTGACAAAGAGGCAAAGATAATAGTAGCTTGTTCATCCGCAGGGACTA
TGAAGCCGACTCAGAATCTCCCTGAAGGCCAACAATCTAGGTCTCTCATAGCTGCTTATG
TTCTGGTCCTGAACGGCTATAAGAACGT

QA 3 630 3 630
DS 

RD RR2FB11TF 642 0 0
GGG
AGAAGAAGATGGCTTCACTTACTTCTATTGCCACCCCTTATCGCAGCTCAAGCTATCCAT
CTTCGTCGCAAGCTTTACGTGTCAAACTCACCGGAAACACTCTGTTCTCAGCTGGAGTTA
GATCCCCTGCTTCTTCTTCTTCTTCATC***GCTTCTGACTATTCGAAGCGCTGCAACGA
AACCTGACAAACCAGCAGCTGAAGTCGATTGGAGACAGAAGAGTGAGCTTCTACTGGAGA
AAAGGGTGAGAAGTGTGGACGTGAAGGAAGCTCTGCGGTTACAGAAGGAGAACAACTTTG
TGATTCTCGATGTTAGACCAGAGGCTGAGTACAAGGAGGGTCACCCTCCGGGAGCTATCA
ATCTGGAGATGTACAGATTGATAAGGGAATGGACGCCATGGGACATAGCTCGTCGTCTTG
GATTTGCATTCTTCGGTATCTTCTCTGGCACAGAAGAGAATCCAGAGTTTATCAAAAGTG
TAGAAGCTAAACTTGACAAAGAGGCAAAGATAATAGTAGCTTGTTCATCCGCAGGGACTA
TGAAGCCGACTCAGAACCTCCCTGAAGGCCAACAATCTAGGTCTCTCATAGCTGCTTATG
TTCTGGTCCTGAACGGCTATAAGAACGTATTTCACCTTG

QA 4 642 4 642
DS 

RD RR2FQ31TF 765 0 0
GGATCTC
AGAAGAAGATGGCTTCACTTACTTCTATTGCCACCCCTTATCGCAGCTCAAGCTATCCAT
CTTCGTCGCAAGCTTTACGTGTCAAACTCACCGGAAACACTCTGTTCTCAGCTGGAGTTA
GATCCCCTGCTTCTTCTTCTTCTTCATC***GCTTCTGACTATTCGAAGCGCTGCAACGA
AACCTGACAAACCAGCAGCTGAAGTCGATTGGAGACAGAAGAGAGAGCCTCTACTGGAGA
AAAGGGTGAGAAGTGTGGACGTGAAGGAAGCTCTGCGGTTACAGAAGGAGAACAACTTTG
TGATTCTCGATGTTAGACCAGAGGCTGAGTACAAGGAGGGTCATCCTCCGGGAGCTATCA
ATCTGGAGATGTACAGATTGATAAGGGAATGGACGCCATGGGACATAGCTCGTCGTCTTG
GATTTGCATTCTTCGGTATCTTCTCTGGCACAGAAGAGAATCCAGAGTTTATCAAAAGTG
TAGAAGCTAAACTTGACAAAGAGGCAAAGATAATAGTAGCTTGTTCATCCGCAGGGACTA
TGAAGCCGACTCAGAACCTCCCTGAAGGCCAACAATCTAGGTCTCTCATAGCTGCTTATG
TTCTGGTCCTGAACGGCTATAAGAACGTATTTCACCTTGAAAGAGGAATCTACACATGGA
GCAAGGAAG*CCTTCCTATTGAATCTGAAGAAGACTAACTTCTCCTCTCAG*TCTTATAT
ATCCAGTTTTGTATCTCTGTCGAAT
AAGTAGTGGCATT

QA 8 752 8 752
DS 

RD RR2FE06TF 422 0 0
GCTCGTCGTCTTGGATTTGCATTCTTCGGTATCTTCTCTGGCACAGAAGAGAATCCAGAG
TTTATCAAAAGTGTAGAAGCTAAACTTGACAAAGAGGCAAAGATAATAGTAGCTTGTTCA
TCCGCAGGGACTATGAAGCCGACTCAGAACCTCCCTGAAGGCCAACAATCTAGGTCTCTC
ATAGCTGCTTATGTTCTGGTCCTGAACGGCTATAAGAACGTATTTCACCTTGAAGGAGGA
ATCTACACATGGAGCAAGGAAGGCCTTCCTATTGAATCTGAAGAAGACTAACTTCTCCTC
TCAGGTCTTATATATCCAGTTTTGTATCTCTGTCGAATTAAGGTAGTGGCATTTAGAAGG
TTTGGCTTTTCCAGAATGTGTTTTTAAGTTTGTAAAACTTCAGACATTTACCAATGAAAA
GC

QA 1 422 1 422
DS 

RD RR2FQ31JQ 725 0 0
TTCTTCTTCTTCTTCATC***GCTTCTGACTATTCGAAGCGCTGCAACGAAACCTGACAA
ACCAGCAGCTGAAGTCGATTGGAGACAGAAGAGAGAGCCTCTACTGGAGAAAAGGGTGAG
AAGTGTGGACGTGAAGGAAGCTCTGCGGTTACAGAAGGAGAACAACTTTGTGATTCTCGA
TGTTAGACCAGAGGCTGAGTACAAGGAGGGTCATCCTCCGGGAGCTATCAATCTGGAGAT
GTACAGATTGATAAGGGAATGGACGCCATGGGACATAGCTCGTCGTCTTGGATTTGCATT
CTTCGGTATCTTTTCTGGCACAGAAGAGAATCCAGAGTTTATCAAAAGTGTAGAAGCTAA
ACTTGACAAAGAGGCAAAGATAATAGTAGCTTGTTCATCCGCAGGGACTATGAAGCCGAC
TCAGAACCTCCCTGAAGGCCAACAATCTAGGTCTTTCATAGCTGCTTATGTTCTGGTCCT
GAACGGCTATAAGAACGTATTTCACCTTGAAGGAGGAATCTACACATGGAGCAAGGAAGG
CCTTCCTATTGAATCTGAAGAAGACTAACTTCTCCTCTCAGGTCTTATATATCCAGTTTT
GTATCTCTGTCGAATTAAGGTAGTGGCATTTAGAAGGTTTGGCTTTTCCAGAATGTGTTT
TTAAGTTTGTAAAACTTCAGACATTTACCAATGAAAAGCAAACCAGAATCCAGACAACTT
TGATC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2DZ77JQ 429 0 0
TCGTCTTGGATTTGCATTCTTCGGTATCTTCTCTGGCACAGAAGAGAATCCAGAGTTTAT
CAAAAGTGTAGAAGCTAAACTTGACAAAGAGGCAAAGATAATAGTAGCTTGTTCATCCGC
AGGGACTATGAAGCCGACTCAGAACCTCCCTGAAGGCCAACAATCTAGGTCTCTCATAGC
TGCTTATGTTCTGGTCCTGAACGGCTATAAGAACGTATTTCACCTTGAAGGAGGAATCTA
CACATGGAGCAAGGAAGGCCTTCCTATTGAATCTGAAGAAGACTAACTTCTCCTCTCAGG
TCTTATATATCCAGTTTTGTATCTCTGTCGGATTAAGGTAGTGGCATTTAGAAGGTTTGG
CTTTTCCAGAATGTGTTTTTAAGTTTGTAAAACTTCAGACATTTACCAATGAAAAGCAAA
CCAGAATCC

QA 1 429 1 429
DS 



AS 2 10

CO CL480Contig1 630 2 2 U
GGACCGTACTCACTATTACAACAACCAAAGAACTAAAGAAAGAAAGAAAATCTCTCTTCT
CTGCTACTCTCTGACGAAGAAACTGAGTTGTATGGCAACCAGATCGAAGAGCTTTCAATT
GATCGCCGGCCTAAGGAAGCTCGCTGTCATCCCACGCGCTTCCTCACGCGCCACCTACAC
TGCTCTCTTCACTTCACGGAGTGGGCATTCCTCAGCTTATGACAAGAACGTGGAGGATGA
ATTGCAGGCAACTGCAGTTCCTGATGACGTCATAAAGCCAGATTCTGATAAATACTGGTC
TCCTCATCCTCAAACCGGAGTCTTTGGTCCTTCCACGACTGATCAGAGTGCAGCAGCGGA
GGCTGCTCGCCAAGACTCGGCGGTGGGAGGAGACTGCTTGGTTTCGTCCCACAAGTCTCG
AGGACTCGGACAAGACTCACCATGTTTAAGTCTGTCTTTCTCCTGCCGTTTTCTTCGGAT
GTTTTAATGTTGTAATAAGTTTCTAAGTAGACAAACTGCATTGTCAAGTAGTAGTATCCT
AAAAAACCTTCCAAGGTCTGTTATGTCTGAAGGGTCCTTTTGTTTTCCCTGTCTAATATG
TCTAAGGGTTTTATTATATAATTCAAAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2BF85TF U 1
AF RR2BF85JQ C 57
BS 1 628 RR2BF85TF
BS 629 630 RR2BF85JQ

RD RR2BF85TF 629 0 0
GGACCGTACTCACTATTACAACAACCAAAGAACTAAAGAAAGAAAGAAAATCTCTCTTCT
CTGCTACTCTCTGACGAAGAAACTGAGTTGTATGGCAACCAGATCGAAGAGCTTTCAATT
GATCGCCGGCCTAAGGAAGCTCGCTGTCATCCCACGCGCTTCCTCACGCGCCACCTACAC
TGCTCTCTTCACTTCACGGAGTGGGCATTCCTCAGCTTATGACAAGAACGTGGAGGATGA
ATTGCAGGCAACTGCAGTTCCTGATGACGTCATAAAGCCAGATTCTGATAAATACTGGTC
TCCTCATCCTCAAACCGGAGTCTTTGGTCCTTCCACGACTGATCAGAGTGCAGCAGCGGA
GGCTGCTCGCCAAGACTCGGCGGTGGGAGGAGACTGCTTGGTTTCGTCCCACAAGTCTCG
AGGACTCGGACAAGACTCACCATGTTTAAGTCTGTCTTTCTCCTGCCGTTTTCTTCGGAT
GTTTTAATGTTGTAATAAGTTTCTAAGTAGACAAACTGCATTGTCAAGTAGTAGTATCCT
AAAAAACCTTCCAAGGTCTGTTATGTCTGAAGGGTCCTTTTGTTTTCCCTGTCTAATATG
TCTAAGGGTTTTATTATATAATTCAAAA
C

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2BF85JQ 574 0 0
TTCTCTGCTACTCTCTGACGAAGAAACTGAGTTGTATGGCAACCAGATCGAAGAGCTTTC
AATTGATCGCCGGCCTAAGGAAGCTCGCTGTCATCCCACGCGCTTCCTCACGCGCCACCT
ACACTGCTCTCTTCACTTCACGGAGTGGGCATTCCTCAGCTTATGACAAGAACGTGGAGG
ATGAATTGCAGGCAACTGCAGTTCCTGATGACGTCATAAAGCCAGATTTTGATAAATACT
GGTCTCCTCATCCTCAAACCGGAGTCTTTGGTCCTTCCACGACTGATCAGAGTGCAGCAG
CGGAGGCTGCTCGCCAAGACTCGGCGGTGGGAGGAGACTGCTTGGTTTCGTCCCACAAGT
CTCGAGGACTCGGACAAGACTCACCATGTTTAAGTCTGTCTTTCTCCTGCCGTTTTCTTC
GGATGTTTTAATGTTGTAATAAGTTTCTAAGTAGACAAACTGCATTGTCAAGTAGTAGTA
TCCTAAAAAACCTTCCAAGGTCTGTTATGTTTGAAGGGTCCTTTTGTTTTCCCTGTCTAA
TATGTCTAAGGGTTTTATTATATAATTCAAAACG

QA 1 574 1 574
DS 



CO CL480Contig2 665 8 4 U
ACTCAATAATCAAATATCATCGACTCGATTTGGTTCGTTTTTGAATTATATAATAAAACC
CTTAAGACATATTAGACGGGGAAAACAAAGGGACCCTTCAGACATAACAGACCTTGGAAG
GTTTTTTAGGATACTACTACTTGACATACAGTTTGTCTTGGAAACTTATTACAACATTAA
ACCATCAGAAGAAAACGGCAGGAGAAAGACAGACTTAAACATGGTGAGTCTTGTCCGAGT
CCTCGAGACTTGTGGGACGAAACCAAGCAGTCTCCTCCAACACCGCCGAGTCTTGGCGAG
CAGCTTCCGCCGCTGCACTCTGATCAGTCGTGGAAGGACCAAAAACTCCGGTTTGAGGAT
GAGGAGACCAGTATTTATCAGAATCTGGCTTTATGACGTCATCAGGAACTGCAGTTGCCT
GCAATTCATCCTCCACGTTCTTGTCATAAGCTGAGGAATGCCCACTCCGTGAAGTGAAGA
GAGCAGTGTAGGTGGCGCGTGAGGAAGCGCGTGGGATGACAGCGAGCTTCCTTAGACCGG
CGATCAATTGAAAGCTCTTCGATCTGGTTGCCATACAACTCAGTTTCTTCGTCAGAGAGT
AGCAGAGAAGAGAGATTTTCTTTCTTTCTTTAGTTCTTTGGTTGTTGTAATAGTGAGTAG
GGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 10 10 10 10 

AF RR2BH74JQ U 12
AF RR2DY52JQ U 1
AF RR2DY52TF C 322
AF RR2CJ25JQ U 8
AF RR2CJ25TF C 8
AF RR2GW02JQ U 43
AF RR2GW02TF C 43
AF RR2BH74TF C 12
BS 1 638 RR2DY52JQ
BS 639 639 RR2GW02JQ
BS 640 660 RR2DY52JQ
BS 661 665 RR2BH74TF

RD RR2BH74JQ 582 0 0
G
AATATCATCGACTCGATTTGGTTCGTTTTTGAATTATATAATAAAACCCTTAAGACATAT
TAGACGGGGAAAACAAAGGGACCCTTCAGACATAACAGACCTTGGAAGGTTTTTTAGGAT
ACTACTACTTGACATACAGTTTGTCTTGGAAACTTATTACAACATTAAACCATCAGAAGA
AAACGGCAGGAGAAAGACAGACTTAAACATGGTGAGTCTTGTCCGAGTCCTCGAGACTTG
TGGGACGAAACCAAGCAGTCTCCTCCAACACCGCCGAGTCTTGGCGAGCAGCTTCCGCCG
TTGCACTCTGATCAGTCGTGGAAGGACCAAAA*CTCCGGTTTGAGGATGAGGAGACCAGT
ATTTATCAGAATCTGGCTTTATGACGTCATCAGGAACTGCAGTTGCCTGCAATTCATCCT
CCACGTTCTTGTCATAAGCTGAGGAATGCCCACTCCGTGAAGTGAAAAGAGCAGTGTAGG
TGGCGCGTGAGGAAGCGCGTGGGATGACAGCGAGCTTCCTTAGACCGGCGATCAATTGAA
AGCTCTTCGATCTGGTTGCCATACAACTCAGTTTCTTCGTC

QA 2 582 2 582
DS 

RD RR2DY52JQ 661 0 0
ACTCAATAATCAAATATCATCGACTCGATTTGGTTCGTTTTTGAATTATATAATAAAACC
CTTAAGACATATTAGACGGGGAAAACAAAGGGACCCTTCAGACATAACAGACCTTGGAAG
GTTTTTTAGGATACTACTACTTGACATACAGTTTGTCTTGGAAACTTATTACAACATTAA
ACCATCAGAAGAAAACGGCAGGAGAAAGACAGACTTAAACATGGTGAGTCTTGTCCGAGT
CCTCGAGACTTGTGGGACGAAACCAAGCAGTCTCCTCCAACACCGCCGAGTCTTGGCGAG
CAGCTTCCGCCGCTGCACTCTGATCAGTCGTGGAAGGACCAAAAACTCCGGTTTGAGGAT
GAGGAGACCAGTATTTATCAGAATCTGGCTTTATGACGTCATCAGGAACTGCAGTTGCCT
GCAATTCATCCTCCACGTTCTTGTCATAAGCTGAGGAATGCCCACTCCGTGAAGTGAAGA
GAGCAGTGTAGGTGGCGCGTGAGGAAGCGCGTGGGATGACAGCGAGCTTCCTTAGACCGG
CGATCAATTGAAAGCTCTTCGATCTGGTTGCCATACAACTCAGTTTCTTCGTCAGAGAGT
AGCAGAGAAGAGAGATTTTCTTTCTTTCTTTAGTTCTTCGGTTGTTGTAATAGTGAGTAG
C

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2DY52TF 340 0 0
GATCAGTCGTGGAAGG*CCAAAAACTCCGGTTTGAGGATGAGGAGACCAGTATTTATCAG
AATCTGGCTTTATGACGTCATCAGGAACTGCAGTTGCCTGCAATTCATCCTCCACGTTCT
TGTCATAAGCTGAGGAATGCCCACTCCGTGAAGTGAAGAGAGCAGTGTAGGTGGCGCGTG
AGGAAGCGCGTGGGATGACAGCGAGCTTCCTTAGACCGGCGATCAATTGAAAGCTCTTCG
ATCTGGTTGCCATACAACTCAGTTTCTTCGTCAGAGAGTAGCAGAGAAGAGAGATTTTCT
TTCTTTCTTTAGTTCTTCGGTTGTTGTAATAGTGAGTAG
C

QA 1 339 1 339
DS 

RD RR2CJ25JQ 596 0 0
AGTCA
AATATCATCGACTCGATTTGGTTCGTTTTTGAATTATATAATAAAACCCTTAAGACATAT
TAGACGGGGAAAACAAAGGGACCCTTCAGACATAACAGACCTTGGAAGGTTTTTTAGGAT
ACTACTACTTGACATACAGTTTGTCTTGGAAACTTATTACAACATTAAACCATCAGAAGA
AAACGGCAGGAGAAAGACAGACTTAAACATGGTGAGTCTTGTCCGAGTCCTCGAGACTTG
TGGGACGAAACCAAGCAGTCTCCTCCAACACCGCCGAGTCTTGGCGAGCAGCTTCCGCCG
CTGCACTCTGATCAGTCGTGGAAGGACCAAAAACTCCGGTTTGAGGATGAGGAGACCAGT
ATTTATCAGAATCTGGCTTTATGACGTCATCAGGAACTGCAGTTGCCTGCAATTCATCCT
CCACGTTCTTGTCATAAGCTGAGGAATGCCCACTCCGTGAAGTGAAGAGAGCAGTGTAGG
TGGCGCGTGAGGAAGCGCGTGGGATGACAGCGAGCTTCCTTAGACCGGCGATCAATTGAA
AGCTCTTCGATCTGGTTGCCATACAACTCAGTTTCTTCGTCAGAGAGTAGC

QA 6 596 6 596
DS 

RD RR2CJ25TF 658 0 0
AGTCA
AATATCATCGACTCGATTTGGTTCGTTTTTGAATTATATAATAAAACCCTTAAGACATAT
TAGACGGGGAAAACAAAGGGACCCTTCAGACATAACAGACCTTGGAAGGTTTTTTAGGAT
ACTACTACTTGACATACAGTTTGTCTTGGAAACTTATTACAACATTAAACCATCAGAAGA
AAACGGCAGGAGAAAGACAGACTTAAACATGGTGAGTCTTGTCCGAGTCCTCGAGACTTG
TGGGACGAAACCAAGCAGTCTCCTCCAACACCGCCGAGTCTTGGCGAGCAGCTTCCGCCG
CTGCACTCTGATCAGTCGTGGAAGGACCAAAAACTCCGGTTTGAGGATGAGGAGACCAGT
ATTTATCAGAATCTGGCTTTATGACGTCATCAGGAACTGCAGTTGCCTGCAATTCATCCT
CCACGTTCTTGTCATAAGCTGAGGAATGCCCACTCCGTGAAGTGAAGAGAGCAGTGTAGG
TGGCGCGTGAGGAAGCGCGTGGGATGACAGCGAGCTTCCTTAGACCGGCGATCAATTGAA
AGCTCTTCGATCTGGTTGCCATACAACTCAGTTTCTTCGTCAGAGAGTAGCAGAGAAGAG
AGATTTTCTTTCTTTCTTTAGTTCTTTGGTTGTTGTAATAGTGAGTAG
GGTCC

QA 6 653 6 653
DS 

RD RR2GW02JQ 610 0 0
GAATTATATAATAAAACCCTTAAGACATATTAGACGGGGAAAACAAAGGGACCCTTCAGA
CATAACAGACCTTGGAAGGTTTTTTAGGATACTACTACTTGACATACAGTTTGTCTTGGA
AACTTATTACAACATTAAACCATCAGAAGAAAACGGCAGGAGAAAGACAGACTTAAACAT
GGTGAGTCTTGTCCGAGTCCTCGAGACTTGTGGGACGAAACCAAGCAGTCTCCTCCAACA
CCGCCGAGTCTTGGCGAGCAGCTTCCGCCGCTGCACTCTGATCAGTCGTGGAAGGACCAA
AAACTCCGGTTTGAGGATGAGGAGACCAGTATTTATCAGAATCTGGCTTTATGACGTCAT
CAGGAACTGCAGTTGCCTGCAATTCATCCTCCACGTTCTTGTCATAAGCTGAGGAATGCC
CACTCCGTGAAGTGAAGAGAGCAGTGTAGGTGGCGCGTGAGGAAGCGCGTGGGATGACAG
CGAGCTTCCTTAGACCGGCGATCAATTGAAAGCTCTTCGATCTGGTTGCCATACAACTCA
GTTTCTTCGTCAGAGAGTAGCAGAGAAGAGAGATTTTCTTTCTTTCTTTAGTTCTTTGGT
TGTTGTAAT
C

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2GW02TF 610 0 0
GAATTATATAATAAAACCCTTAAGACATATTAGACGGGGAAAACAAAGGGACCCTTCAGA
CATAACAGACCTTGGAAGGTTTTTTAGGATACTACTACTTGACATACAGTTTGTCTTGGA
AACTTATTACAACATTAAACCATCAGAAGAAAACGGCAGGAGAAAGACAGACTTAAACAT
GGTGAGTCTTGTCCGAGTCCTCGAGACTTGTGGGACGAAACCAAGCAGTCTCCTCCAACA
CCGCCGAGTCTTGGCGAGCAGCTTCCGCCGCTGCACTCTGATCAGTCGTGGAAGGACCAA
AAACTCCGGTTTGAGGATGAGGAGACCAGTATTTATCAGAATCTGGCTTTATGACGTCAT
CAGGAACTGCAGTTGCCTGCAATTCATCCTCCACGTTCTTGTCATAAGCTGAGGAATGCC
CACTCCGTGAAGTGAAGAGAGCAGTGTAGGTGGCGCGTGAGGAAGCGCGTGGGATGACAG
CGAGCTTCCTTAGACCGGCGATCAATTGAAAGCTCTTCGATCTGGTTGCCATACAACTCA
GTTTCTTCGTCAGAGAGTAGCAGAGAAGAGAGATTTTCTTTCTTTCTTTAGTTCTTTGGT
TGTTGTAAT
C

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2BH74TF 654 0 0
G
AATATCATCGACTCGATTTGGTTCGTTTTTGAATTATATAATAAAACCCTTAAGACATAT
TAGACGGGGAAAACAAAGGGACCCTTCAGACATAACAGACCTTGGAAGGTTTTTTAGGAT
ACTACTACTTGACATACAGTTTGTCTTGGAAACTTATTACAACATTAAACCATCAGAAGA
AAACGGCAGGAGAAAGACAGACTTAAACATGGTGAGTCTTGTCCGAGTCCTCGAGACTTG
TGGGACGAAACCAAGCAGTCTCCTCCAACACCGCCGAGTCTTGGCGAGCAGCTTCCGCCG
TTGCACTCTGATCAGTCGTGGAAGGACCAAAA*CTCCGGTTTGAGGATGAGGAGACCAGT
ATTTATCAGAATCTGGCTTTATGACGTCATCAGGAACTGCAGTTGCCTGCAATTCATCCT
CCACGTTCTTGTCATAAGCTGAGGAATGCCCACTCCGTGAAGTGAAGAGAGCAGTGTAGG
TGGCGCGTGAGGAAGCGCGTGGGATGACAGCGAGCTTCCTTAGACCGGCGATCAATTGAA
AGCTCTTCGATCTGGTTGCCATACAACTCAGTTTCTTCGTCAGAGAGTAGCAGAGAAGAG
AGATTTTCTTTCTTTCTTTAGTTCTTTGGTTGTTGTAATAGTGAGTAGGGTCC

QA 2 654 2 654
DS 



AS 1 7

CO CL481Contig1 976 7 14 U
ACACTGCAACAATTCATTATTCAAGACGAAAAATTCCATTGAACTAAACGCATTCAACTG
CCAAAAAAACTGAACATAGGTTTTAAAAACAACATGAGAAAAAA*CTTGTCTGCTTCGAA
GACATAAAAACAAGAAGTATCTTAAAGAGACGATGATAAGGTTTCACAAAAAAGAGAGGC
ATTCCAACGAGTCATCTTCTAGGCGACAGGGATCATCTCAGGGTAATCTACGGCTGTAAG
GGGAGCTTCTGGTAGAAGTGCAGCCGGAGCAGCAACCTGAGCTGGAGCAGAGCTAACATC
ATCTTCCTTGGGAGAATGGATGATGACAACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCCAATAC
TCCCTTAGGGTCCCAGTCAAGCATGACCTTAACCTTGATTCCAAGCACACCCTGTCTGAG
CAAAACATGTCTGACTGCGGAGTCGATGTACTATTTGGTAGGTTGACCAGAGGAAACCAT
GTAACCGTCCTTGAATTTCATGGACTTGGCACGTGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAAT
AACCTCACATCCCTTGGCGCCACTCTCCATGACAAATCTCAAGACACCATAGCAAGCCCT
GCGAACGGCAAGACCACCGAGGAGTTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTGAGCGATGGCACA
GAGACCTCTGTTGGCAACCTTCTCAGCGTAAAGCTCAACACTGTCTTGAGGGAATCTGAA
CCTCTTCTGAACAAGGGACGTCAACTCTCTGATTCTCCTTCCCTTCTCACCGAGAACATT
TTGAGTACGTGTGGCTCTGATGATAATCTCAGTCCTCACTGGAGTAACCCTAACCTCCAC
ACCTGAGTAACCATCCTCTGCTAGCTCCCTAGTTAGCACCTCGTTCAACTCAGCGTAGAA
CACACCGTCGGCCACAAACTTCCTCTTCTTGCTGATTTGCGTCGCCATGATGATGTTCAA
GTCGCGAAAACCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 20 20 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 10 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 15 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2EX42JQ U 22
AF RR2BQ14JQ U 23
AF RR2GI84JQB U 21
AF RR2BZ88JQ U 1
AF RR2BQ14TF C 666
AF RR2GI84TF C 367
AF RR2BZ88TF C 693
BS 1 207 RR2BZ88JQ
BS 208 208 RR2EX42JQ
BS 209 237 RR2BZ88JQ
BS 238 238 RR2EX42JQ
BS 239 270 RR2BZ88JQ
BS 271 271 RR2EX42JQ
BS 272 285 RR2BZ88JQ
BS 286 286 RR2EX42JQ
BS 287 297 RR2BZ88JQ
BS 298 298 RR2EX42JQ
BS 299 452 RR2BZ88JQ
BS 453 453 RR2GI84JQB
BS 454 729 RR2BZ88JQ
BS 730 976 RR2GI84TF

RD RR2EX42JQ 687 0 0
CAA
GACGAAAAATTCAATTGAACTAAACGCATTCAACTGCCAAAAAAACTGAACATAGGTTTT
AAAAACAACATGAGAAAAAA*CTTGTCTGCTTCGAAGACATAAAAACAAGAAGTATCTTA
AAGAGACGATGATAAGGTTTGAAAAAAAAGAGAGGCATTCCAACGAGTCATCTTCTAGGC
GACAGGGATCATCTCAGGGTAATCTACGGCTGTAAGGGGAGCTTCTGGTAGAAGTGCAGC
CGGAGCAGCAACCTGAGCTGGAGCAGAGCTAACATCATCTTCCTTGGGAGAATGGATGAT
GACAACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCCAATACTCTCTTAGGGTCCCAGTCAAGCAT
GACCTTGACCTTGATTCCAAGCACACCTTGTCTGAGCAAAACATGTCTGACTGCGGAGTC
GATGTACTCT**GGTGGGTTGACCAGAGGAAACCATGTAACCGTCCTTGAATTTCATGGA
CTTGGCACGAGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAATGACCTCACAACCCTTAGCGCCACT
CTCCATGACGAATCTCAAGACACCATAGCAGGCCCTGCGAACGGCAAGACCACCGAGGAG
CTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTGAGCAATGGCACAGAGACCTCTGTTGGCAACCTTCTC
AGCGTAAAGCTCAACACTGTCTTG

QA 4 687 4 687
DS 

RD RR2BQ14JQ 684 0 0
AT
GACGAAAAATTCCATTGAACTAAACGCATTCAACTGCCAAAAAAACTGAACATAGGTTTT
AAAAACAACATGAGAAAAAAACTTGTCTGCTTCGAAGACATAAAAACAAGAAGTATCTTA
AAGAGACGATGATAAGGTTTGACAAAAAAGAGAGGCATTCCAACGAGTCATCTTCTAGGC
GACAGGGATCATCTCAGGGTAATCTACGGCTGTAAGGGGAGCTTCTGGTAGAAGTGCAGC
CGGAGCAGCAACCTGAGCTGGAGCAGAGCTAACATCTTCTTCCTTGGGAGAATGGATGAT
GACAACATCAGGCAATGGCGTCTTTGGTCCCAATACTCCCTTAGGGTCCCAGTCAAGCAT
GACCTTGACCTTGATTCCAAGCACCCCCTGTCTGAGCAGAACATGTCTGACTGCGGAGTC
GATGTACTCTTTGGTGGGTTGACCAGAGGAAACCATGTAACCGTCCTTGAATTTCATGGA
CTTGGCACGAGCTACACGAAGCTTTCCACTAACAATGACCTCACATCCCTTGGCGCCACT
CTCCATGACAAATCTCAAGACACCATAGCAAGCCCTGCGAACGGCAAGACCGCCGAGGAG
CTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTGAGCGACGGCACAGAGACCTCTGTTGGCAACCTTCTC
AGCGTAAAGCTCAACACTGTCT

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR2GI84JQB 663 0 0
ACAA
GACGAAAAATTCCATTGAACTAAGCGCATTCAACTGCCAAAAAAACTGAACATAGGTTTT
AAAAACAACATGAGAAAAAA*CTTGTCTGCTTCGAAGACATAAAAACAAGAAGTATCTTA
AAGAGACGATGATAAGGTTTCACAAAAAGGAGAGGCATTCCAACGAGTCATCTTCTAGGC
GACTGGGATCATCTCAGGGTAATCTACGGCTGTGAGGGGAGCTTCTGGTAGAAGTGCAGC
CGGAGCGGCAACCTGAGCTGGTGCAGAGCTAACATCATCTTCCTTGGGAGAATGGATGAT
GACAACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCCAATACTCCCTTAGGGTCCCAGTCAAGCAT
GACCTTAACCTTGATTCCAAGCACACCCTGTCTGAGCAAAACATGTCTGACTGCGGAGTC
GATGTACTATTTGGTAGGTTGACCAGAGGAAACCATGTAACCGTCCTTGAATTTCATGGA
CTTGGCACGTGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAATAACCTCACATCCCTTGGCGCCACT
CTCCATGACAAATCTCAAGACACCATAGCAAGCCCTGCGAACGGCAAGACCACCGAGGAG
TTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTGAGCGATGGCACAGAGACCTCTGTTGGCAACCTTCT

QA 5 663 5 663
DS 

RD RR2BZ88JQ 729 0 0
ACACTGCAACAATTCATTATTCAAGACGAAAAATTCCATTGAACTAAACGCATTCAACTG
CCAAAAAAACTGAACATAGGTTTTAAAAACAACATGAGAAAAAA*CTTGTCTGCTTCGAA
GACATAAAAACAAGAAGTATCTTAAAGAGACGATGATAAGGTTTCACAAAAAAGAGAGGC
ATTCCAACGAGTCATCTTCTAGGCGACTGGGATCATCTCAGGGTAATCTACGGCTGTGAG
GGGAGCTTCTGGTAGAAGTGCAGCCGGAGCGGCAACCTGAGCTGGTGCAGAGCTAACGTC
ATCTTCCTTGGGAGAATGGATGATGACAACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCCAATAC
TCCCTTAGGGTCCCAGTCAAGCATGACCTTAACCTTGATTCCAAGCACACCCTGTCTGAG
CAAAACATGTCTGACTGCGGAGTCGATGTACTCTTTGGTAGGTTGACCAGAGGAAACCAT
GTAACCGTCCTTGAATTTCATGGACTTGGCACGTGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAAT
AACCTCACATCCCTTGGCGCCACTCTCCATGACAAATCTCAAGACACCATAGCAAGCCCT
GCGAACGGCAAGACCACCGAGGAGTTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTGAGCGATGGCACA
GAGACCTCTGTTGGCAACCTTCTCAGCGTAAAGCTCAACACTGTCTTGAGGGAATCTGAA
CCTCTTCTG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2BQ14TF 285 0 0
CTCTGTTGGCAACCTTCTCAGCGTAAAGCTCAACACTGTCTTGAGGGAATCTGAATCTCT
TCTGAACAAGGGACGTCAACTCTCTGATTCTCCTTCCCTTCTCACCGAGAACATTTTGAG
TACGGGTGGCTCTGATGATAATCTCAGTCCTCATGGGAGTAACCCTAACCTCCACACCTG
AGTAACCATCCTCTGCTAGCTCCCTAGTTAGCACCTCGTTCAACTCAGCGTAGAACACAC
CATCGGCCACAAACTTCCTATTCTTGCTGATTTGCGTCGCCATG
C

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2GI84TF 610 0 0
AGGGTCCCAGTCAAGCATGACCTTAACCTTGATTCCAAGCACACCCTGTCTGAGCAAAAC
ATGTCTGACTGCGGAGTCGATGTACTATTTGGTAGGTTGACCAGAGGAAACCATGTAACC
GTCCTTGAATTTCATGGACTTGGCACGTGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAATAACCTC
ACATCCCTTGGCGCCACTCTCCATGACAAATCTCAAGACACCATAGCAAGCCCTGCGAAC
GGCAAGACCACCGAGGAGTTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTGAGCGATGGCACAGAGACC
TCTGTTGGCAACCTTCTCAGCGTAAAGCTCAACACTGTCTTGAGGGAATCTGAACCTATT
CTGAACAAGGGACGTCAACTCTCTGATTCTCCTTCCCTTCTCACCGAGAACATTTTGAGT
ACGTGTGGCTCTGATGATAATCTCAGTCCTCACTGGAGTAACCCTAACCTCCACACCTGA
GTAACCATCCTCTGCTAGCTCCCTAGTTAGCACCTCGTTCAACTCAGCGTAGAACACACC
GTCGGCCACAAACTTCCTCTTCTTGCTGATTTGCGTCGCCATGATGATGTTCAAGTCGCG
AAAACCCTCC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2BZ88TF 284 0 0
GCTCAACACTGTCTTGAGGGAATCTGAACCTCTTCTGAACAAGGGACGTCAACTCTCTGA
TTCTCCTTCCCTTCTCACCGAGAACATTTTGAGTACGTGTGGCTCTGATGATAATCTCAG
TCCTCACTGGAGTAACCCTAACCTCCACACCTGAGTAACCATCCTCTGCTAGCTCCCTAG
TTAGCACCTCGTTCAACTCAGCGTAGAACACACCGTCGGCCCCAAACTTCCTCTTCTTGC
TGATTTGCGTCGCCATGATGATGTTCAAGTCGCGAAAACCCTCC

QA 1 284 1 284
DS 



AS 2 11

CO CL482Contig1 651 9 8 U
GGGTCTTTGCTCCTTCATTTGTTTACCGCCGCATCATCTTCCTCGCAGGTAAGTAAGCTA
AGTCACAGGTAAACTGAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCT
CGTCAGGTGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACACTCGACTTCCACACCAACAAGAAG
ATCCTCGAAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGATTC
TCCACCCATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCAGTGCGTGGCATCTCACTCAAGCTC
CAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGACC
GATTTGATCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGAC
ACTCCTGGCGTCTCTATTGTCGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCC
AGAAGGTTCTGAGGATAGTGTGTTTGGCTGTTGTTTTTTTTTCTTCACTGTTAGGGACAA
AAGAGTTGCATTTCGAGTGTTTATGTCTTTTGATTCTAGTCTTGTGTCTGAAACTGAAAG
TTAAGACTCTTTTTCTGTTCCATGCCTTTTGAGTTTTGATGATCTTTGAGC


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 
55 55 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C914JQ C 1
AF RR2C914TF U 1
AF RR2AZ94TFB U 126
AF RR2AR27JQ C 1
AF RR2AR27TF U 1
AF RR2G380TF U 1
AF RR2AZ94JQ C 23
AF RR2BP65JQ C 68
AF RR2BP65TF U 68
BS 1 420 RR2C914TF
BS 421 421 RR2AR27TF
BS 422 498 RR2C914TF
BS 499 621 RR2AR27TF
BS 622 625 RR2G380TF
BS 626 626 RR2BP65TF
BS 627 641 RR2G380TF
BS 642 651 RR2AZ94JQ

RD RR2C914JQ 484 0 0
GGGTCTTTGCTCCTTCATTTGTTTACCGCCGCATCATCTTCCTCGCAGGTAAGTAAGCTA
AGTCACAGGTAAACTGAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCT
CGTCAGGTGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACACTCGACTTCCACACCAACAAGAAG
ATCCTCGAAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGATTC
TCCACCCATCTCATGAAGAGGTTCCAGAAGGGACCAGTGCGTGGCATCTCACTCAAGCTC
CAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGACC
GATTTGATCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGAC
*CTCCTGGCGTCTCTATTGTCGAGACACAGGTTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCCCCC
AGAA

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2C914TF 498 0 0
GGGTCTTTGCTCCTTCATTTGTTTACCGCCGCATCATCTTCCTCGCAGGTAAGTAAGCTA
AGTCACAGGTAAACTGAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCT
CGTCAGGTGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACACTCGACTTCCACACCAACAAGAAG
ATCCTCGAAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGATTC
TCCACCCATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCAGTGCGTGGCATCTCACTCAAGCTC
CAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGACC
GATTTGATCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGAC
*CTCCTGGCGTCTCTATTGTCGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCC
AGAAGGTTCTGAGGATAG

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2AZ94TFB 452 0 0
GGTGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACACTCGACTTCCACACCAACAAGAAGATCCT
CGAAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGATTCTCCAC
CCATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCAGTGCGTGGCATCTCACTCAAGCTCCAAGA
GGAAGAGCGTGAGCACCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGACCGATTT
GATCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGACACTCC
TGGCGTCTCTATTGTCGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCCAGAAG
GTTCTGAGGATAGTGTGTTTGGCTGTTGTTTTTTTTTCTTCACTGTTAGGGACAAAAGAG
TTGCATTTCGAGTGTTTATGTCTTTTGATTCT

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2AR27JQ 621 0 0
GGGTCTTTGCTCCTTCATTTGTTTACCGCCGCATCATCTTCCTCGCAGGTAAGTAAGCTA
AGTCACAGGTAAACTGAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCT
CGTCAGGTGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACACTCGACTTCCACACCAACAAGAAG
ATCCTCGAAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGATTC
TCCACCCATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCAGTGCGTGGCATCTCACTCAAGCTC
CAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGGCC
GATTTGATCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGAC
ACTCCTGGCGTCTCTATTGTCGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCC
AGAAGGTTCTGAGGATAGTGTGTTTGGCTGTTGTTTTTTTTTCTTCACTGTTAGGGACAA
AAGAGTTGCATTTCGAGTGTTTATGTCTTTTGATTCTAGTCTTGTGTCTGAAACTGAAAG
TTAAGACTCTTTTTCTGTTCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2AR27TF 621 0 0
GGGTCTTTGCTCCTTCATTTGTTTACCGCCGCATCATCTTCCTCGCAGGTAAGTAAGCTA
AGTCACAGGTAAACTGAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCT
CGTCAGGTGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACACTCGACTTCCACACCAACAAGAAG
ATCCTCGAAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGATTC
TCCACCCATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCAGTGCGTGGCATCTCACTCAAGCTC
CAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGGCC
GATTTGATCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGAC
ACTCCTGGCGTCTCTATTGTCGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCC
AGAAGGTTCTGAGGATAGTGTGTTTGGCTGTTGTTTTTTTTTCTTCACTGTTAGGGACAA
AAGAGTTGCATTTCGAGTGTTTATGTCTTTTGATTCTAGTCTTGTGTCTGAAACTGAAAG
TTAAGACTCTTTTTCTGTTCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2G380TF 645 0 0
GGGTCTTTGCTCCTTCATTTGTTTACCGCCGCATCATCTTCCTCGCAGGTAAGTAAGCTA
AGTCACAGGTAAACTGAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCT
CGTCAGGTGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACACTCGACTTCCACACCAACAAGAAG
ATCCTCGAAGAAGTCGCAATCATCCCTTTGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGATTC
TCCACCCATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCAGTGCGTGGCATCTCACTCAAGCTC
CAAGAGGAAGAGCGTTAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGACC
GATTTGATCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGAC
ACTCCTGGCGTCTCTATTGTCGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCC
AGAAGGTTCTGAGGATAGTGTGTTTGGCTGTTGTTTTTTTTTCTTCACTGTTAGGGACAA
AAGAGTTGCATTTCGAGTGTTTATGTCTTTTGATTCTAGTCTTGTGTCTGAAACTGAAAG
TTAAGACTCTTTTTCTGTTCCATGCTTTTTGAGTTTTGATG
ATCT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2AZ94JQ 629 0 0
GG
ACCGCCGCATCATCTTCCTCGCAGGTAAGTAAGCTAAGTCACAGGTAAACTGAAAAGATG
GGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCTCGTCAGGTGATCGAGAAATACTAC
TCTCGCATGACACTCGACTTCCACACCAACAAGAAGATCCTCGAAGAAGTCGCAATCATC
CCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGATTCTCCACCCATCTCATGAAGAGGATC
CAGAAGGGACCAGTGCGTGGCATCTCACTCAAGCTCCAAGAGGAAGAGCGTGAGCACCGC
ATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGACCGATTTGATCAAGGTCGACAAAGAG
ACTCTCGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGACACTCCTGGCGTCTCTATTGTCGAG
ACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCCAGAAGGTTCTGAGGATAGTGTGTT
TGGCTGTTGTTTTTTTTTCTTCACTGTTAGGGACAAAAGAGTTGCATTTCGAGTGTTTAT
GTCTTTTGATTCTAGTCTTGTGTCTGAAACTGAAAGTTAAGACTCTTTTTCTGTTCCATG
CTTTTTGAGTTTTGATGATCTTTGAGC

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR2BP65JQ 574 0 0
GGTAAACTGAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCTCGTCAGG
TGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACACTCGACTTCCACACCAACAAGAAGATCCTCG
AAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGATTCTCCACCC
ATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCAGTGCGTGGCATCTCACTCAAGCTCCAAGAGG
AAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTTTGCTATCAGGACCGATTTGA
TCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGACACTCCTG
GCGTCTCTATTGTCGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCCAGAAGGT
TTTGAGGATAGTGTGTTTGGCTGTTGTTTTTTTTTCTTCACTGTTAGGGACAAAAGAGTT
GCATTTCGAGTGTTTATGTCTTTTGATTCTAGTCTTGTGTCTGAAACTGAAAGTTAAGAC
TCTTTTTCTGTTCCATGCCTTTTGAGTTTTGATG

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2BP65TF 574 0 0
GGTAAACTGAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCTCGTCAGG
TGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACACTCGACTTCCACACCAACAAGAAGATCCTCG
AAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGATTCTCCACCC
ATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCAGTGCGTGGCATCTCACTCAAGCTCCAAGAGG
AAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGACCGATTTGA
TCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGACACTCCTG
GCGTCTCTATTGTCGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCCAGAAGGT
TCTGAGGATAGTGTGTTTGGCTGTTGTTTTTTTTTCTTCACTGTTAGGGACAAAAGAGTT
GCATTTCGAGTGTTTATGTCTTTTGATTCTAGTCTTGTGTCTGAAACTGAAAGTTAAGAC
TCTTTTTCTGTTCCATGCCTTTTGAGTTTTGATG

QA 1 574 1 574
DS 



CO CL482Contig2 645 2 2 U
GGCTGTCTTTGCTCCTTCATTTGTTTACCGCCGCATCATCTTCCTCGCAGGTAAGTAAGC
AAGTCACAGGTAAACTGAGAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATC
TCGCCAGGTGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACGCTGGACTTCCACACCAACAAGAA
GATCCTCGAAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTTCGCAACAAGATCGCCGGATT
CTCCACCCATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCAGTGCGTGGCATCTCGCTCAAGCT
CCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAAGAC
CGATGTGATCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGA
CACTCCCGGCGTCTCTATAGTCGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACC
CAGAAGGTTCTGAGGAGAGTTTATTTGGCTGTTGTTTTTTTTCTTCACTGTTAGGGACAA
AAGAGTTACATTTCGAGTTTTTATGTCTTTTGATTCTAGACTTATGTCTGAAACTGAAAG
TTAAGACTCTTTTTCTATTCAATGCTTTTTTGAGTTAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW35TF U 1
AF RR2GW35JQ C 29
BS 1 630 RR2GW35TF
BS 631 645 RR2GW35JQ

RD RR2GW35TF 644 0 0
GGCTGTCTTTGCTCCTTCATTTGTTTACCGCCGCATCATCTTCCTCGCAGGTAAGTAAGC
AAGTCACAGGTAAACTGAGAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATC
TCGCCAGGTGATCGAGAAATACTACTCTCGCATGACGCTGGACTTCCACACCAACAAGAA
GATCCTCGAAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTTCGCAACAAGATCGCCGGATT
CTCCACCCATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCAGTGCGTGGCATCTCGCTCAAGCT
CCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAAGAC
CGATGTGATCAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGA
CACTCCCGGCGTCTCTATAGTCGAGACACAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACC
CAGAAGGTTCTGAGGAGAGTTTATTTGGCTGTTGTTTTTTTTCTTCACTGTTAGGGACAA
AAGAGTTACATTTCGAGTTTTTATGTCTTTTGATTCTAGACTTATGTCTGAAACTGAAAG
TTAAGACTCTTTTTCTATTCAATGCTTTTT
TGAGTTAAAAAAAA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2GW35JQ 617 0 0
CGCCGCATCATCTTCCTCGCAGGTAAGTAAGCAAGTCACAGGTAAACTGAGAAGATGGGG
CGTGTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCTCGCCAGGTGATCGAGAAATACTACTCT
CGCATGACGCTGGACTTCCACACCAACAAGAAGATCCTCGAAGAAGTCGCAATCATCCCT
TCGAAGCGTCTTCGCAACAAGATCGCCGGATTCTCCACCCATCTCATGAAGAGGATCCAG
AAGGGACCAGTGCGTGGCATCTCGCTCAAGCTCCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATG
GACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAAGACCGATGTGATCAAGGTCGACAAAGAGACT
CTCGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGGGTGACACTCCCGGCGTCTCTATAGTCGAGACA
CAGGCTCCGGCACCTACTTTTAACAGGCCACCCAGAAGGTTCTGAGGAGAGTTTATTTGG
CTGTTGTTTTTTTTCTTCACTGTTAGGGACAAAAGAGTTACATTTCGAGTTTTTATGTCT
TTTGATTCTAGACTTATGTCTGAAACTGAAAGTTAAGACTCTTTTTCTATTCAATGCTTT
TTTGAGTTAAAAAAAAA

QA 1 617 1 617
DS 



AS 3 11

CO CL483Contig1 699 4 7 U
GGGGTTGCATTAGGAGAAGCCAAAATTTTCTTTGCGTCTCTGAGCTGTGTATTGAACTAC
ATCTCCTTCAATGGCTTCCCTATCAACCAGCTCTCTAAGCTTCAAAGCTACCTCCATACA
ATCTACCAGAATTTCTCAGGTGTTAAGAAAACCCTTGAGTTTCCAGTCCATCTCCTTTGG
ACGTTTTCAGTCTTCAAAGAAGCTTCGTCTTCAGATCACTTGTGCAGCAAAACCAGAGAC
CGTGCAGAAAGTGAGTGACATTGTAAGGGAACAATTGGCTTTGTCGGCCGACACTGCGCT
CACTGCTGAGTCCAAGTTCTCTGCCCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACCGTGGAGATAGT
GATGGCTTTGGAGGAAAAGTTTAACATAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTAC
GACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGATTGAGGATCTTGTTCAGAAGACACCTGCGGCCTA
AGCTTCGTAAACTATCCCGGTTTAACACCAACCGGCTGTCTTTTTTTTTTCCTTCTTTCT
GAGCTTTCTTGGTTTCAGATCATTTTATTTTGGTTTTGTTAGACCAAGTTATTTTTTTTG
TTTTCTTCTTTTGGAAGTTAAGATTGGATGTTGATGATGAGAAAACTTTGGTACGTTGAG
ATTGATTCTTTGTGGTGATTGGTCTTTCATAAATTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH67TF U 1
AF RR2EV48JQ C 71
AF RR2EV48TF U 5
AF RR2EH67JQ C 43
BS 1 90 RR2EH67TF
BS 91 91 RR2EV48TF
BS 92 324 RR2EH67TF
BS 325 325 RR2EV48TF
BS 326 590 RR2EH67TF
BS 591 669 RR2EV48TF
BS 670 699 RR2EH67JQ

RD RR2EH67TF 590 0 0
GGGGTTGCATTAGGAGAAGCCAAAATTTTCTTTGCGTCTCTGAGCTGTGTATTGAACTAC
ATCTCCTTCAATGGCTTCCCTATCAACCAGTTCTCTAAGCTTCAAAGCTACCTCCATACA
ATCTACCAGAATTTCTCAGGTGTTAAGAAAACCCTTGAGTTTCCAGTCCATCTCCTTTGG
ACGTTTTCAGTCTTCAAAGAAGCTTCGTCTTCAGATCACTTGTGCAGCAAAACCAGAGAC
CGTGCAGAAAGTGAGTGACATTGTAAGGGAACAATTGGCTTTGTCGGCCGACACTGCGCT
CACTGCTGAGTCCAAGTTCTCTGCTCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACCGTGGAGATAGT
GATGGCTTTGGAGGAAAAGTTTAACATAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTAC
GACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGATTGAGGATCTTGTTCAGAAGACACCTGCGGCCTA
AGCTTCGTAAACTATCCCGGTTTAACACCAACCGGCTGTCTTTTTTTTTTCCTTCTTTCT
GAGCTTTCTTGGTTTCAGATCATTTTATTTTGGTTTTGTTAGACCAAGTT

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2EV48JQ 525 0 0
ATGGCTTCCCTATCAACCAGCTCTCTAAGCTTCAAAGCTACCTCCATACAATCTACCAGA
ATTTCTCAGGTGTTAAGAAAACCCTTGAGTTTCCAGTCCATCTCCTTTGGACGTTTTCAG
TCTTCAAAG***CTTCGTCTTCAGATCACTTGTGCAGCAAAACCAGAGACCGTGCAGAAA
GTGAGTGACATTGTAAGGGAACAATTGGCTTTGTCGGCCGACACTGCGCTCACTGCTGAG
TCCAAGTTCTCTGCCCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACCGTGGAGATAGTGATGGCTTTG
GAGGAAAAGTTTAACATAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACGTTACGACGATTCAA
GAGGCGGCTGATTTGATTGAGGATCTTGTTCAGAAGACACCTGCGGCCTAAGCTTCGTAA
ACTATCCCGGTTTAACACCAACCGGCTGTCTTTTTTTT**CCTTCTTTCTGAGCTTTCTT
GGTTTCAGATCATTTTATTTTGGTTTTGTTAGACCAAGTT
ATTTT

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2EV48TF 665 0 0
GGGC
ATTAGGAGAAGCCAAAATTTTCTTTGCGTCTCTGAGCTGTGTATTGAACTACATCTCCTT
CAATGGCTTCCCTATCAACCAGCTCTCTAAGCTTCAAAGCTACCTCCATACAATCTACCA
GAATTTCTCAGGTGTTAAGAAAACCCTTGAGTTTCCAGTCCATCTCCTTTGGACGTTTTC
AGTCTTCAAAG***CTTCGTCTTCAGATCACTTGTGCAGCAAAACCAGAGACCGTGCAGA
AAGTGAGTGACATTGTAAGGGAACAATTGGCTTTGTCGGCCGACACTGCGCTCACTGCTG
AGTCCAAGTTCTCTGCCCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACCGTGGAGATAGTGATGGCTT
TGGAGGAAAAGTTTAACATAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACGTTACGACGATTC
AAGAGGCGGCTGATTTGATTGAGGATCTTGTTCAGAAGACACCTGCGGCCTAAGCTTCGT
AAACTATCCCGGTTTAACACCAACCGGCTGTCTTTTTTTT**CCTTCTTTCTGAGCTTTC
TTGGTTTCAGATCATTTTATTTTGGTTTTGTTAGACCAAGTTATTTTTTTTGTTTTCTTC
TTTTGGAAGTTAAGATTGGATGTTGATGATGAGAAAACTTTGGTACGTTGAGATTGATTC
T

QA 5 665 5 665
DS 

RD RR2EH67JQ 657 0 0
AGCTGTGTATTGAACTACATCTCCTTCAATGGCTTCCCTATCAACCAGTTCTCTAAGCTT
CAAAGCTACCTCCATACAATCTACCAGAATTTCTCAGGTGTTAAGAAAACCCTTGAGTTT
CCAGTCCATCTCCTTTGGACGTTTTCAGTCTTCAAAGAAGCTTCGTCTTCAGATCACTTG
TGCAGCAAAACCAGAGACCGTGCAGAAAGTGAGTGACATTGTAAGGGAACAATTGGCTTT
GTCGGCCGACACTGCGCTCACTGCTGAGTCCAAGTTCTCTGCTCTCGGAGCTGATTCTCT
CGACACCGTGGAGATAGTGATGGCTTTGGAGGAAAAGTTTAACATAAGTGTGGAGGAAGC
TGATGCTCAGAACATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGATTGAGGATCTTGTTCA
GAAGACACCTGCGGCCTAAGCTTCGTAAACTATCCCGGTTTAACACCAACCGGCTGTCTT
TTTTTTTTCCTTCTTTTTGAGCTTTCTTGGTTTCAGATCATTTTATTTTGGTTTTGTTAG
ACCAAGTTATTTTTTTTGTTTTCTTCTTTTGGAAGTTAAGATTGGATGTTGATGATGAGA
AAACTTTGGTACGTTGAGATTGATTCTTTGTGGTGATTGGTCTTTCATAAATTAAGC

QA 1 657 1 657
DS 



CO CL483Contig2 715 3 7 U
GGGCATTAGGAAAAGCCAAATTTTCTTTTGCGTCTCTGAGCTGTGTATTGAACTACATCT
CCTTCAATGGCTTCCCTATCAACCAGTTCCCTAAGCTTCAGAGCTCCCTCCATACAATCT
ACCAGAATTTCTCAGGTGTTAAGAAAACCCTTGAGTTTCCAGTCTATCTCCTTTGGACGT
TTTCAGTCTTCAAAGAAGCTTCGTCTTCAGATCAGTTGTGCAGCAAAACCAGAGACGGTG
CAGAAAGTGAGTGACATTGTAAGGGAACAATTGGCTTTGTCGGCCGACACTGCGCTCACT
GCTGAGTCCAAGTTCTCTGCTCTCGGAGCTGATTCTCTCGACATCGTGGAGATAGTGATG
GCTTTGGAGGAAAAGTTTAACATAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACG
ATTCAAGAGGCGGCTGATTTGATTGAGGATCTTGTTCAGAAGACACCTGCGGCCTAAGCT
TCATAAACTATCCCGGTTTAACACAAACCGGCTATCTTTTTTTCCCCTTCTTTCTGAGCT
TTCTTGGTTTCAGATCATTTTATTTTGGTTTATTAGACCATGTTATTATTTTTTGTTTTC
TCCTTTTGGAAGTTAAGATTGGATGTTGATGATGAGAGAACTTTGGTACGTTGAGATTGA
TTCTTTGTGGTGATTGGTCTTAATTTCATGAATTAAGCATATATCCAACTTTCCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2FT52TF U 1
AF RR2EW54TF U 5
AF RR2EW54JQ C 320
BS 1 343 RR2FT52TF
BS 344 344 RR2EW54TF
BS 345 500 RR2FT52TF
BS 501 501 RR2EW54TF
BS 502 645 RR2FT52TF
BS 646 714 RR2EW54TF
BS 715 715 RR2EW54JQ

RD RR2FT52TF 645 0 0
GGGCATTAGGAAAAGCCAAATTTTCTTTTGCGTCTCTGAGCTGTGTATTGAACTACATCT
CCTTCAATGGCTTCCCTATCAACCAGTTCCCTAAGCTTCAGAGCTCCCTCCATACAATCT
ACCAGAATTTCTCAGGTGTTAAGAAAACCCTTGAGTTTCCAGTCTATCTCCTTTGGACGT
TTTCAGTCTTCAAAGAAGCTTCGTCTTCAGATCAGTTGTGCAGCAAAACCAGAGACGGTG
CAGAAAGTGAGTGACATTGTAAGGGAACAATTGGCTTTGTCGGCCGACACTGCGCTCACT
GCTGAGTCCAAGTTCTCTGCTCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACCGTGGAGATAGTGATG
GCTTTGGAGGAAAAGTTTAACATAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACG
ATTCAAGAGGCGGCTGATTTGATTGAGGATCTTGTTCAGAAGACACCTGCGGCCTAAGCT
TCATAAACTATCCCGGTTTAGCACAAACCGGCTATCTTTTTTTCCCCTTCTTTCTGAGCT
TTCTTGGTTTCAGATCATTTTATTTTGGTTTATTAGACCATGTTATTATTTTTTGTTTTC
TCCTTTTGGAAGTTAAGATTGGATGTTGATGATGAGAGAACTTTG

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2EW54TF 711 0 0
ATTAGGAAAAGCCAAATTTTCTTTTGCGTCTCTGAGCTGTGTATTGAACTACATCTCCTT
CAATGGCTTCCCTATCAACCAGTTCCCTAAGCTTCAGAGCTCCCTCCATACAATCTACCA
GAATTTCTCAGGTGTTAAGAAAACCCTTGAGTTTCCAGTCTATCTCCTTTGGACGTTTTC
AGTCTTCAAAGAAGCTTCGTCTTCAGATCAGTTGTGCAGCAAAACCAGAGACGGTGCAGA
AAGTGAGTGACATTGTAAGGGAACAATTGGCTTTGTCGGCCGACACTGCGCTCACTGCTG
AGTCCAAGTTCTCTGCTCTCGGAGCTGATTCTCTCGACATCGTGGAGATAGTGATGGCTT
TGGAGGAAAAGTTTAACATAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACGATTC
AAGAGGCGGCTGATTTGATTGAGGATCTTGTTCAGAAGACACCTGCGGCCTAAGCTTCAT
AAACTATCCCGGTTTAACACAAACCGGCTATCTTTTTTTCCCCTTCTTTCTGAGCTTTCT
TGGTTTCAGATCATTTTATTTTGGTTTATTAGACCATGTTATTATTTTTTGTTTTCTCCT
TTTGGAAGTTAAGATTGGATGTTGATGATGAGAGAACTTTGGTACGTTGAGATTGATTCT
TTGTGGTGATTGGTCTTAATTTCATGAATTAAGCATATATCCAACTTTCC
C

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2EW54JQ 396 0 0
CTT
TCGGAGCTGATTCTCTCGACATCGTGGAGATAGTGATGGCTTTGGAGGAAAAGTTTAACA
TAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGA
TTGAGGATCTTGTTCAGAAGACACCTGCGGCCTAAGCTTCATAAACTATCCCGGTTTAAC
ACAAACCGGCTATCTTTTTTTCCCCTTCTTTCTGAGCTTTCTTGGTTTCAGATCATTTTA
TTTTGGTTTATTAGACCATGTTATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGGAAGTTAAGATTGG
ATGTTGATGATGAGAGAACTTTGGTACGTTGAGATTGATTCTTTGTGGTGATTGGTCTTA
ATTTCATGAATTAAGCATATATCCAACTTTCCC

QA 4 396 4 396
DS 



CO CL483Contig3 719 4 6 U
TGACTGAGGAAAGTTGGACATATGCTTAATTCATGAAAGACCAATCACCACAAAGAATCA
ATCTCAACGTACCAAAGTTTTCTCATCATCAACATCCAATCTTACTTCCAAAAGAAGAAA
ACAAAAACTAATAACATAGTCTAACAAAACCAAAATAAAATGAACTGAAACCAAGAAAGC
TTAAAAAGAAGGGAAAAGAAAAAGATAGCCGGTTTGTGTTAAACCGGGATAGTTTAGGAA
GCTTAAGCCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAAATCAGCCGCCTCTTGAATC
GTCGTAATGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACTTATGTTAAACTTTTCCTCCAAAGCC
ATCACTATCTCCACGGTGTCGAGAGAATCAGCTCCGAGAGCAGAGAACTTGGACTCAGCA
GTGAGCGCAGTGTCGGCCGACAAAGCCAATTGTTCCCTTACAATGTCACTCACTTTCTGC
ACGGTCTCTGGTTTTGCTGCACAACTGATCTGAAGACGAAGCTTCTTTGAAGACTGAAAA
CGTCCAAAGGAGATGGACTGGAAACTCAAGGGTTTTCTTAACACCTGAGAAATTCTGGTA
GATAGTATGGAGGTAGCTTTGAAGCTTAGAGAACTGGTTGATAGGGAAGCCATTGAAGGA
GATGTAGTTCAATACACAGCTCAGAGACGCAAAGAAAATTTTGGCTTCTCCTAATTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2GA85JQ U 2
AF RR2H522JQB U 2
AF RR2H522TF C 1
AF RR2GA85TF C 223
BS 1 7 RR2H522TF
BS 8 404 RR2GA85JQ
BS 405 405 RR2H522TF
BS 406 520 RR2H522JQB
BS 521 715 RR2H522TF
BS 716 719 RR2GA85TF

RD RR2GA85JQ 403 0 0
GACTGA
GGAAAGTTGGACATATGCTTAATTCATGAAAGACCAATCACCACAAAGAATCAATCTCAA
CGTACCAAAGTTTTCTCATCATCAACATCCAATCTTACTTCCAAAAGAAGAAAACAAAAA
CTAATAACATAGTCTAACAAAACCAAAATAAAATGAACTGAAACCAAGAAAGCTTAAAAA
GAAGGGAAAAGAAAAAGATAGCCGGTTTGTGTTAAACCGGGATAGTTTAGGAAGCTTAAG
CCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAAATCAGCCGCCTCTTGAATCGTCGTAA
TGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACTTATGTTAAACTTTTCCTCCAAAGCCATCACTA
TCTCCACGGTGTCGAGAGAATCAGCTCCGAGAGCAGA

QA 7 403 7 403
DS 

RD RR2H522JQB 519 0 0
GACTGA
GGAAAGTTGGACATATGCTTAATTCATGAAAGACCAATCACCACAAAGAATCAATCTCAA
CGTACCAAAGTTTTCTCATCATCAACATCCAATCTTACTTCCAAAAGAAGAAAACAAAAA
CTAATAACATAGTCTAACAAAACCAAAATAAAATGAACTGAAACCAAAAAAGCTTAAAAA
GAAGGGAAAAGAAAAAGATAGCCGGTTTGTGTTAAACCGGGATAGTTTAGGAAGCTTAAG
CCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAAATCAGCCGCCTCTTGAATCGTCGTAA
TGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACTTATGTTAAACTTTTCCTCCAAAGCCATCACTA
TCTCCACGGTGTCGAGAGAATCAGCTCCGAAAGCAGAAAACTTGGACTCAGCAGTGAGCG
CAGTGTCGGCCGACAAAGCCAATTGTTCCCTTACAATGTCACTCACTTTCTGCACGGTCT
CTGGTTTTGCTGCACAACTGATCTGAAGACGAA

QA 7 519 7 519
DS 

RD RR2H522TF 719 0 0
TGACTGAGGAAAGTTGGACATATGCTTAATTCATGAAAGACCAATCACCACAAAGAATCA
ATCTCAACGTACCAAAGTTTTCTCATCATCAACATCCAATCTTACTTCCAAAAGAAGAAA
ACAAAAACTAATAACATAGTCTAACAAAACCAAAATAAAATGAACTGAAACCAAGAAAGC
TTAGAAAGAAGGGAAAAGAAAAAGATAGCCGGTTTGTGTTAAACCGGGATAGTTTAGGAA
GCTTAAGCCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAAATCAGCCGCCTCTTGAATC
GTCGTAATGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACTTATGTTAAACTTTTCCTCCAAAGCC
ATCACTATCTCCACGGTGTCGAGAGAATCAGCTCCGAGAGCAGAGAACTTGGACTCAGCA
GTGAGCGCAGTGTCGGCCGACAAAGCCAATTGTTCCCTTACAATGTCACTCACTTTCTGC
ACGGTCTCTGGTTTTGCTGCACAACTGATCTGAAGACGAAGCTTCTTTGAAGACTGAAAA
CGTCCAAAGGAGATGGACTGGAAACTCAAGGGTTTTCTTAACACCTGAGAAATTCTGGTA
GATAGTATGGAGGTAGCTTTGAAGCTTAGAGAACTGGTTGATAGGGAAGCCATTGAAGGA
GATGTAGTTCAATACACAGCTCAGAGACGCAAAGAAAATTTTGGCTTCTCCTAAT
TCCC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2GA85TF 497 0 0
ACCGGGATAGTTTAGGAAGCTTAAGCCGCAGGTTTCTTCTGAACAAGATCCTCAATCAAA
TCAGCCGCCTCTTGAATCGTCGTAATGTTCTGAGCATCAGCTTCCTCCACACTTATGTTA
AACTTTTCCTCCAAAGCCATCACTATCTCCACGGTGTCGAGAGAATCAGCTCCGAGAGCA
GAGAACTTGGACTCAGCAGTGAGCGCAGTGTCGGCCGACAAAGCCAATTGTTCCCTTACA
ATGTCACTCACTTTCTGCACGGTCTCTGGTTTTGCTGCACAACTGATCTGAAGACGAAGC
TTCTTTGAAGACTGAAAACGTCCAAAGGAGATGGACTGGAAACTCAAGGGTTTTCTTAAC
ACCTGAGAAATTCTGGTAGATAGTATGGAGGTAGCTTTGAAGCTTAGAGAACTGGTTGAT
AGGGAAGCCATTGAAGGAGATGTAGTTCAATACACAGCTCAGAGACGCAAAGAAAATTTT
GGCTTCTCCTAATTCCC

QA 1 497 1 497
DS 



AS 2 11

CO CL484Contig1 643 9 10 U
GGGAAGCAAAATAAAGAATGGGTGTACTTGAAAACCTCTGGGACGACGTCGTGGCTGGTC
CTCAACCTGAAGCCCGTGGCCGTGGGCATCTCAGGCGAATCTCTACCGGTTTGACTAGCC
TGAACAATACCAAAGAAGCAACAATGGTGGGCGGATCAGCGTCTCTACCAGCGAGTCCGA
CTACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTGTGGAGAAGTGTATTTCATC
CAGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATC
CTAATTCTCCCACGGTTTATGACTGGATGTACAGCAGCGAAACGAGGAGCAAGCACCGTT
GAAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAACTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAA
GTGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATTAGTTGACTTGGCCGTTTGATTGGTA
TTTAAATAATCTGTTAAAGATTTTGAGCTTTTTTT*GCTTTATTGCCTCTCACTTTTCAA
CATAAAAATCAAAACACAATATGTCAAGCCAATCAATAACGTTTTTACAATTTACAAGCA
TATTTGACATAAAATATAATACAAAGCATCTTTTTATTGCGAA


BQ
10 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2E825TF U -2
AF RR2FS03JQ C 442
AF RR2FS03TF U -2
AF RR2EC78TF U 2
AF RR2D166TF U 1
AF RR2D166JQ C 102
AF RR2DA01TF U 1
AF RR2DA01JQ C 168
AF RR2EU20TF U 1
BS 1 461 RR2D166TF
BS 462 462 RR2DA01TF
BS 463 478 RR2D166TF
BS 479 479 RR2DA01TF
BS 480 491 RR2D166TF
BS 492 492 RR2DA01TF
BS 493 521 RR2D166TF
BS 522 522 RR2DA01TF
BS 523 614 RR2D166TF
BS 615 643 RR2DA01TF

RD RR2E825TF 521 0 0
GGATC
GAAGCAAAATAAAGAATGGGTGTACTTGAAAACCTCTGGGACGACGTCGTGGCTGGTCCT
CAACCTGAAGCCCGTGGCCGTGGGCATCTCAGGCGAATCTCTACCGGTTTGACTAGCCTG
AACAATACCAAAGAAGCAACAATGGTGGGCGGATCAGCGTCTCTACCAGCGAGTCCGACT
ACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTGTGGAGAAGTGTATTTCATCCA
GCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATCCT
AATTCTCCCACGGTTTATGACTGGATGTACAGCAGCGAAACGAGGATCAAGCACCGTTGA
AGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAACTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAAGT
GGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATTAGTTGACTTGGCCGTTTGATTGGTATT
TAAATAATCTGTTAAAGATTTTGAGCTTTTTTT*GC

QA 6 521 6 521
DS 

RD RR2FS03JQ 129 0 0
GATGATTAATAATTAGTTGACTTGGCCGTTTGATTGGTATTTAAATAATCTGTTAAAGAT
TTTGAGCTTTTTTT*GCTTTATTGCCTCTCACTTTTCAACATAAAAATCAAAACACAATA
TGTCAAGCC

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR2FS03TF 573 0 0
GGGTC
GAAGCAAAATAAAGAATGGGTGTACTTGAAAACCTCTGGGACGACGTCGTGGCTGGTCCT
CAACCTGAAGCCCGTGGCCGTGGGCATCTCAGGCGAATCTCTACCGGTTTGACTAGCCTG
AACAATACCAAAGAAGCAACAATGGTGGGCGGATCAGCGTCTCTACCAGCGAGTCCGACT
ACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTGTGGAGAAGTGTATTTCATCCA
GCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATCCT
AATTCTCCCACGGTTTATGACTGGATGTACAGCAGCGAAACGAGGAGCAAGCACCGTTGA
AGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAACTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAAGT
GGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATTAGTTGACTTGGCCGTTTGATTGGTATT
TAAATAATCTGTTAAAGATTTTGAGCTTTTTTT*GCTTTATTGCCTCTCACTTTTCAACA
TAAAAATCAAAACACAATATGTCAAGCC

QA 6 573 6 573
DS 

RD RR2EC78TF 570 0 0
GGAAGCAAAATAAAGAATGGGTGTACTTGAAAACCTCTGGGACGACGTCGTGGCTGGTCC
TCAACCTGAAGCCCGTGGCCGTGGGCATCTCAGGCGAATCTCTACCGGTTTGACTAGCCT
GAACAATACCAAAGAAGCAACAATGGTGGGCGGATCAGCGTCCCTACCAGCGAGTCCGAC
TACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTGTGGAGAAGTGTATTTCATCC
AGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATCC
TAATTCTCCCACGGTTTATGACTGGATGTACAGCAGCGAAACGAGGAGCAAGCACCGTTG
AAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAACTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAAG
TGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATTAGTTGAGTTGGCCGTTTGATTGGTAT
TTAAATAATCCGTTAAAGATTTTGAGCTTTTTT**GCTTTGTTGCCTCTCACTTTTCAAC
ATAAAAATCAAAACACAATATGTCAAGCC
C

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2D166TF 619 0 0
GGGAAGCAAAATAAAGAATGGGTGTACTTGAAAACCTCTGGGACGACGTCGTGGCTGGTC
CTCAACCTGAAGCCCGTGGCCGTGGGCATCTCAGGCGAATCTCTACCGGTTTGACTAGCC
TGAACAATACCAAAGAAGCAACAATGGTGGGCGGATCAGCGTCTCTACCAGCGAGTCCGA
CTACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTGTGGAGAAGTGTATTTCATC
CAGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATC
CTAATTCTCCCACGGTTTATGACTGGATGTACAGCAGCGAAACGAGGAGCAAGCACCGTT
GAAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAACTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAA
GTGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATTAGTTGAGTTGGCCGTTTGATTGGCA
TTTAAATAATCCGTTAAAGATTTTGAGCTTTTTTT*GCTTTGTTGCCTCTCACTTTTCAA
CATAAAAATCAAAACACAATATGTCAAGCCAATCAATAACGTTTTTACAATTTACAAGCA
TATTTGACATAAAA
AAAAA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2D166JQ 509 0 0
TCTACCGGTTTGACTAGCCTGAACAATACCAAAGAAGCAACAATGGTGGGCGGATCAGCG
TCTCTACCAGCGAGTCCGACTACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTG
TGGAGAAGTGTATTTCATCCAGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCTAATGTC
TTTGATAAACCTTTTCATCCTAATTCTCCCACGGTTTATGACTGGATGTACAGCAGCGAA
ACGAGGAGCAAGCACCGTTGAAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAACTAAAATAAGT
CAAGATCTCATAAAATTAAGTGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATTAGTTGA
GTTGGCCGTTTGATTGGCATTTAAATAATCCGTTAAAGATTTTGAGCTTTTTTT*GCTTT
GTTGCCTCTCACTTTTCAACATAAAAATCAAAACACAATATGTCAAGCCAATCAATAACG
TTTTTACAATTTACAAGCATATTTGACAT

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2DA01TF 643 0 0
G
GGAAGCAAAATAAAGAATGGGTGTACTTGAAAACCTCTGGGACGACGTCGTGGCTGGTCC
TCAACCTGAAGCCCGTGGCCGTGGGCATCTCAGGCGAATCTCTACCGGTTTGACTAGCCT
GAACAATACCAAAGAAGCAACAATGGTGGGCGGATCAGCGTCTCTACCAGCGAGTCCGAC
TACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTGTGGAGAAGTGTATTTCATCC
AGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATCC
TAATTCTCCCACGGTTTATGACTGGATGTACAGCAGCGAAACGAGGAGCAAGCACCGTTG
AAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAACTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAAG
TGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATTAGTTGACTTGGCCGTTTGATTGGTAT
TTAAATAATCTGTTAAAGATTTTGAGCTTTTTTTTGCTTTATTGCCTCTCACTTTTCAAC
ATAAAAATCAAAACACAATATGTCAAGCCAATCAATAACGTTTTTACAATTTACAAGCAT
ATTTGACATAAAATATAATACAAAGCATCTTTTTATTGCGAA

QA 2 643 2 643
DS 

RD RR2DA01JQ 474 0 0
CCAGCGAGTCCGACTACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTGTGGAGA
AGTGTATTTCATCCAGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCTAATGTTTTTGAT
AAACCTTTTCATCCTAATTTTCCCACGGTTTATGACTGGATGTACAGCAGCGAAACGAGG
AGCAAGCCCCGTTGAAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAAATAAAATAAGTCAAGAT
TTCATAAAATTAAGTGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATTAGTTGACTTGGC
CGTTTGATTGGTATTTAAATAATTTGTTAAAGATTTTGAGCTTTTTTTTGCTTTATTGCC
TCTCACTTTTCAACATAAAAATCAAAACACAATATGTCAAGCCAATCAATAACGTTTTTA
CAATTTACAAGCATATTTGACATAAAATATAATACAAAGCATTTTTTTATTG
GG

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2EU20TF 642 0 0
G
GGAAGCAAAATAAAGAATGGGTGTACTTGAAAACCTCTGGGACGACGTCGTGGCTGGTCC
TCAACCTGAAGCCCGTGGCCGTGGGCATCTCAGGCGAATCTCTACCGGTTTGACTAGCCT
GAACAATACCAAAGAAGCAACAATGGTGGGCGGATCAGCGTCTCTACCAGCGAGTCCGAC
TACCCCGGCCACACCAGGATCTGGCCGGAAAGTGGATGTGTGGAGAAGTGTATTTCATCC
AGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGATTGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATCC
TAATTCTCCCACGGTTTATGACTGGATGTACAGCAGCGAAACGAGGAGCAAGCACCGTTG
AAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCAAACTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAAG
TGGCTACACTACTATTTCAAGATGATTAATAATTAGTTGAGTTGGCCGTTTGATTGGTAT
TTAAATAATCCGTTAAAGATTTTGAGCTTTTTTT*GCTTTGTTGCCTCTCACTTTTCAAC
ATAAAAATCAAAACACAATATGTCAAGCCAATCAATAACGTTTTTACAATTTACAAGCAT
ATTTGACATAAAATATAATACAAAGCATCTTTTTATTG
TGT

QA 2 639 2 639
DS 



CO CL484Contig2 510 2 1 U
GGATCGAAGCAAAATAAAGAATGGGTGTACTTGAAAACCTCTGGGACGACGTCGTGGCTG
GTCCTCAACCTGAAGCCCGTGGCCGTGGGCATCTCAGGCGAATCTCTACCGGTTTGACTA
GCCTGAACAATACCAAAGAAGTGTATTTCATCCAGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGAT
TGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATCCTAATTCTCCCACGGTTTATGACTGGAT
GTACAGCAGCGAAACGAGGAGCAAGCACCGTTGAAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCA
AACTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAAGTGGCTACACTACTATCTCAAGATGATT
AATAATTAGTTGACTTGGCCGTTTGATTGGTATTTAAATAATCTGTTAAAGATTTTGAGC
TTTTTTTGCTTTATTGCCTCTCACTTTTCAACATAAAAATCAAAACACAATATGTCAAGC
CAATCAATAACGTTTTTACAATTTACAAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ED84JQ C 1
AF RR2ED84TF U 1
BS 1 510 RR2ED84TF

RD RR2ED84JQ 510 0 0
GGATCGAAGCAAAATAAAGAATGGGTGTACTTGAAAACCTCTGGGACGACGTCGTGGCTG
GTCCTCAACCTGAAGCCCGTGGCCGTGGGCATCTCAGGCGAATCTCTACCGGTTTGACTA
GCCTGAACAATACCAAAGAAGTGTATTTCATCCAGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGAT
TGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATCCTAATTCTCCCACGGTTTATGACTGGAT
GTACAGCAGCGAAACGAGGAGCAAGCACCGTTGAAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCA
AACTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAAGTGGCTACACTACTATCTCAAGATGATT
AATAATTAGTTGACTTGGCCGTTTGATTGGTATTTAAATAATCTGTTAAAGATTTTGAGC
TTTTTTTGCTTTATTGCCTCTCACTTTTCAACATAAAAATCAAAACACAATATGTCAAGC
CAATCAATAACGTTTTTACAATTTACAAGC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2ED84TF 510 0 0
GGATCGAAGCAAAATAAAGAATGGGTGTACTTGAAAACCTCTGGGACGACGTCGTGGCTG
GTCCTCAACCTGAAGCCCGTGGCCGTGGGCATCTCAGGCGAATCTCTACCGGTTTGACTA
GCCTGAACAATACCAAAGAAGTGTATTTCATCCAGCAAGTAATGTGACCACAAGGGAGAT
TGGTGCTAATGTCTTTGATAAACCTTCTCATCCTAATTCTCCCACGGTTTATGACTGGAT
GTACAGCAGCGAAACGAGGAGCAAGCACCGTTGAAGCTTGCTGTTATCAACGGATCGTCA
AACTAAAATAAGTCAAGATCTCATAAAATTAAGTGGCTACACTACTATCTCAAGATGATT
AATAATTAGTTGACTTGGCCGTTTGATTGGTATTTAAATAATCTGTTAAAGATTTTGAGC
TTTTTTTGCTTTATTGCCTCTCACTTTTCAACATAAAAATCAAAACACAATATGTCAAGC
CAATCAATAACGTTTTTACAATTTACAAGC

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 11

CO CL485Contig1 994 11 27 U
GGATACTCTCATTTGCTAGGGTTCGAATCAGATTATCTGCAAAAACAAAAAAATGGCGTT
AGCTGGTCGTATCAGATCCGGAATCTCCTTCTTCAAGACCATCTCCGTCTCACCTGCTAG
ATCTCACCTCCGTGGAGCGCCTCTCATCCCCGCGTTGAGAGATTACGCAACAGCTTCGGC
TCAGAAGACCGCCAATGTTAAGGTGCCTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTTGC
CTCGTGGCTGTACATTGCAGCCGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCT
CTCCGAGCTGGTCGAGGCTATGAAGACGAGCCCTATTTTTTCGCAGTTCACTAAAGATCC
ATCTGTTCCTAGAGAGACCAGACTCGCTGCTATTGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTT
CGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTT
GGATGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGTTGACGACAGCACATAGAGGGGATGTTAAGGT
TTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCACCTGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACT
CCAGGAGATAATCGGAGAA*GGGAAGAAAGTGACCGTGGAACAAAAGATTGATCCGAGTA
TCTACGGAGGGCTAATAGTGGAGTTTCAACAGAAGGTGTTGGACATGTCTATCAGGACAA
GGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAGCCTGTTGACTTCACCAACCTTTGAAGAC
TTTCCCCCTAAAGAAACGTGCTTGCTTGTGATGATGATGCTATGCTACCACCAGTTGACA
AATAAAAATATGACACTCTCCTGAGAAAAACAACCTATAAACACTTGTGTCGGTTTTTTT
GAATTTTGTCATTTCATTCTACAATTGTTGTTTCTGCTTCGAAATAAGCTTTTGAAGACA
TCAAATTTGAATGATATTTGGGTTTACGTTTGAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
20 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2DL84TF U 1
AF RR2E406TF U 13
AF RR2F514TF U 13
AF RR2FQ68TF U 1
AF RR2DB85TF U 17
AF RR2BW26TF U 28
AF RR2BW26JQ C 240
AF RR2FQ68JQ C 766
AF RR2E406JQ C 464
AF RR2F514JQ C 282
AF RR2DL84JQ C 336
BS 1 356 RR2DL84TF
BS 357 357 RR2FQ68TF
BS 358 562 RR2DL84TF
BS 563 582 RR2FQ68TF
BS 583 583 RR2DB85TF
BS 584 591 RR2FQ68TF
BS 592 592 RR2DB85TF
BS 593 619 RR2FQ68TF
BS 620 620 RR2BW26TF
BS 621 622 RR2FQ68TF
BS 623 623 RR2DB85TF
BS 624 666 RR2FQ68TF
BS 667 667 RR2BW26TF
BS 668 683 RR2FQ68TF
BS 684 694 RR2BW26TF
BS 695 695 RR2BW26JQ
BS 696 715 RR2BW26TF
BS 716 716 RR2BW26JQ
BS 717 722 RR2BW26TF
BS 723 723 RR2BW26JQ
BS 724 739 RR2BW26TF
BS 740 740 RR2BW26JQ
BS 741 762 RR2BW26TF
BS 763 829 RR2BW26JQ
BS 830 830 RR2F514JQ
BS 831 848 RR2BW26JQ
BS 849 994 RR2F514JQ

RD RR2DL84TF 562 0 0
GGATACTCTCATTTGCTAGGGTTCGAATCAGATTATCTGCAAAAACAAAAAAATGGCGTT
AGCTGGTCGTATCAGATCCGGAATCTCCTTCTTCAAGACCATCTCCGTCTCACCTGCTAG
ATCTCACCTCCGTGGAGCGCCTCTCATCCCCGCGTTGAGAGATTACGCAACAGCTTCGGC
TCAGAAGACCGCCAATGTTAAGGTGCCTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTTGC
CTCGTGGCTGTACATTGCAGCCGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCT
CTCCGAGCTGGTCGAGGCTATGAAGACGAGCCCTATTTTTTCGCAGTTCACTAAAGGTCC
ATCTGTTCCTAGAGAGACCAGACTCGCTGCTATTGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTT
CGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTT
GGATGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGTTGACGACAGCACATAGAGGGGATGTTAAGGT
TTTGGTTACCACTGTCATGCCG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2E406TF 545 0 0
GG
GCTAGGGTTCGAATCAGATTATCTGCAAAAACAAAAAAATGGCGTTAGCTGGTCGTATCA
GATCCGGAATCTCCTTCTTCAAGACCATCTCCGTCTCACCTGCTAGATCTCACCTCCGTG
GAGCGCCTCTCATCCCCGCGTTGAGAGATTACGCAACAGCTTCGGCTCAGAAGACCGCCA
ATGTTAAGGTGCCTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTTGCCTCGTGGCTGTACA
TTGCAGCCGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCCGAGCTGGTCG
AGGCTATGAAGACGAGCCCTATTTTTTCGCAGTTCACTAAAGATCCATCTGTTCCTAGAG
AGACCAGACTCGCTGCTATTGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAGAACCCACCA
AGAACTTCCTCTCTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTGATTGTAA
AAAAATTCATGCAGTTGACGACAGCACATAGAGGGGATGTTAAGGTTCTGGTTACCACTG
TCA

QA 3 545 3 545
DS 

RD RR2F514TF 605 0 0
GG
GCTAGGGTTCGAATCAGATTATCTGCAAAAACAAAAAAATGGCGTTAGCTGGTCGTATCA
GATCCGGAATCTCCTTCTTCAAGACCATCTCCGTCTCACCTGCTAGATCTCACCTCCGTG
GAGCGCCTCTCATCCCCGCGTTGAGAGATTACGCAACAGCTTCGGCTCAGAAGACCGCCA
ATGTTAAGGTGCCTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTTGCCTCGTGGCTGTACA
TTGCAGCCGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCCGAGCTGGTCG
AGGCTATGAAGACGAGCCCTATTTTTTCGCAGTTCACTAAAGATCCATCTGTTCCTAGAG
AGACCAGACTCGCTGCTATTGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAGAACCCACCA
AGAACTTCCTCTCTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTGATTGTGA
AAAAATTCATGCAGTTGACGACAGCACATAGAGGGGATGTTAAGGTTTTGGTTACCACTG
TCATGCCGCTTCCACCTGCTGAGGAGAAAGAGTTGAAAGAGACACTCTAGGAGATAATCG
GAG

QA 3 605 3 605
DS 

RD RR2FQ68TF 683 0 0
GGATACTCTCATTTGCTAGGGTTCGAATCAGATTATCTGCAAAAACAAAAAAATGGCGTT
AGCTGGTCGTATCAGATCCGGAATCTCCTTCTTCAAGACCATCTCCGTCTCACCTGCTAG
ATCTCACCTCCGTGGAGCGCCTCTCATCCCCGCGTTGAGAGATTACGTAACAGCTTCGGC
TCAGAAGACCGCCAATGTTAAGGTGCCTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTTGC
CTCGTGGCTGTACATTGCAGCCGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCT
CTCCGAGCTGGTCGAGGCTATGAAGACGAGCCCTGTTTTTTCGCAGTTCACTAAAGATCC
ATCTGTTCCTAGAGAGACCAGACTCGCTGCTATTGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTT
CGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTT
GGATGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGTTGACGACAGCACATAGAGGGGATGTTAAGGT
TTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCACCTGCTGAGGAGAAAGAGTTGAAAGAGACACT
CCAGGAGATAATCGGAGAAAGG*AAGAAAGTGACCGTGGAACAAAAGATTGATCCGAGTA
TCTACG*AGGGCTAATAGTGGAG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2DB85TF 646 0 0
G
AGGGTTCGAATCAGATTATCTGCAAAAACAAAAAAATGGCGTTAGCTGGTCGTATCAGAT
CCGGAATCTCCTTCTTCAAGACCATCTCCGTCTCACCTGCTAGATCTCACCTCCGTGGAG
CGCCTCTCATCCCCGCGTTGAGAGATTACGTAACAGCTTCGGCTCAGAAGACCGCCAATG
TTAAGGTGCCTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTTGCCTCGTGGCTGTACATTG
CAGCCGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCCGAGCTGGTCGAGG
CTATGAAGACGAGCCCTATTTTTTCGCAGTTCACTAAAGATCCATCTGTTCCTAGAGAGA
CCAGACTCGCTGCTATTGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAGAACCCACCAAGA
ACTTCCTCTCTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTGATTGTGAAAA
AATTCATGCAGTTGACGACAGCACATAGAGGGGATGTTAAGGTTTTGGTTACCACTGTCA
TGCCGCTTCCACCTGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATCGGAG
AAAGGGAAGAAAGTGACCGTGGAACAAAAGATTGATCCGAGTATC

QA 2 646 2 646
DS 

RD RR2BW26TF 735 0 0
GG
AGATTATCTGCAAAAACAAAAAAATGGCGTTAGCTGGTCGTATCAGATCCGGAATCTCCT
TCTTCAAGACCATCTCCGTCTCACCTGCTAGATCTCACCTCCGTGGAGCGCCTCTCATCC
CCGCGTTGAGAGATTACGCAACAGCTTCGGCTCAGAAGACCGCCAATGTTAAGGTGCCTG
TGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTTGCCTCGTGGCTGTACATTGCAGCCGTGAAAA
TGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCCGAGCTGGTCGAGGCTATGAAGACGA
GCCCTATTTTTTCGCAGTTCACTAAAGATCCATCTGTTCCTAGAGAGACCAGACTCGCTG
CTATTGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTC
TGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGT
TGACGACAGCACATAGAGGGGATGTTAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCAC
CTGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATCGGAGAA*GGGAAGAAA
GTGACCGTGGAACAAAAGATTGATCCGAGTATCTACGGAGGGCTAATAGTGGAGTTTCAA
CAGAAAGTGTTGGACATGTCTATCAG*ACAAGG*CACAGCAGATGGAGAG*CTCCTCCGT
GAGCCTGTTGACT

QA 3 735 3 735
DS 

RD RR2BW26JQ 609 0 0
CCTCGTGGCTGTACATTGCAGCCGTGAAAATGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATC
TCTCCGAGCTGGTCGAGGCTATGAAGACGAGCCCTATTTTTTCGCAGTTCACTAAAGATC
CATCTGTTCCTAGAGAGACCAGACTCGCTGCTATTGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGT
TCGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTTTCTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATT
TGGATGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGTTGACGACAGCACATAGAGGGGATGTTAAGG
TTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCACCTGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACAC
TCCAGGAGATAATCGGAGAA*GGGAAGAAAGTGACCGTGGAACAAAAGATTGATCCGAGT
ATTTACGGAGGGCTAATAGTGGAGTTTCAACAGAAGGTGTTGGACATGTCTATCAGGACA
AGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAGCCTGTTGACTTCACCAACCTTTGAAGA
CTTTCCCCCTAAAGAAACGTGCTTGCTTGTGATGATGATGCTATGCTACCCCCAGTTGAC
AAATAAAAA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2FQ68JQ 180 0 0
CCAACCTTTGAATACTT*CCCCCTAAAGAAACGTGCTTGCTTGTGATGATGATGCTATGC
TACCACCAGTTGACAAATAAAAATATGACACTCTCCTGAGAAAAACAACCTATAAACACT
TGTGTCGGTTTTTTTGAATTTTGTCATTTCATTCTACAATTGTTGTTT
TGTTGAAATAAG

QA 1 168 1 168
DS 

RD RR2E406JQ 459 0 0
GGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTGATTGTAAAAAAATTCATGCAGTTGACGACAGCACAT
AGAGGGGATGTTAAGGTTCTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCACCTGCTGAGGAGAAG
GAGTTGAAGGAGACACTCCAGTAGATAATCGGAGAA*GGGAAGAAAGTGACCGTGGAACA
AAAGATTGATCCGAGTATCTACGGAGGGCTAATAGTGGAGTTTCAACAGAAGGTGTTGGA
CATGTCTATCAGGACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAGCCTGTTGACTT
CACCAACCTTTGAAGACTTTCCCCCTAAAGAAACGTGCTTGCTTGTGATGATGATGCTAT
GCTACCACCAGTTGACAAATAAAAATATGACACTCTCCTGAGAAAAACAACCTATAAACA
CTTGTGTCGGTTTTTTTGAATTTTGTCATTTCATTCTAC

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR2F514JQ 713 0 0
AGAAGATCGAGTCTGATCTCTCCGAGCTGGTCGAGGCTATGAAGACGAGCCCTATTTTTT
CGCAGTTCACTAAAGATCCATCTGTTCCTAGAGAGACCAGACTCGCTGCTATTGTGGATG
TTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTCTGTTAGCTGAGA
ATGGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGTTGACGACAGCAC
ATAGAGGGGATGTTAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCACCTGCTGAGGAGA
AGGAGTTGAAGGAGACACTCTAGGAGATAATCGGAGAA*GGGAAGAAAGTGACCGTGGAA
CAAAAGATTGATCCGAGTATCTACGGAGGGCTAATAGTGGAGTTTCAACAGAAGGTGTTG
TACATGTCTATCAGGACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAGCCTGTTGAC
TTCACCAACCTTTGAAGACTTTCCCCCTAAAGAAACGTGCTTGCTTGTGATGATGATGCT
ATGCTACCACCAGTTGACAAATAAAAATATGACACTCTCCTGAGAAAAACAACCTATAAA
CACTTGTGTCGGTTTTTTTGAATTTTGTCATTTCATTCTACAATTGTTGTTTCTGCTTCG
AAATAAGCTTTTGAAGACATCAAATTTGAATGATATTTGGGTTTACGTTTGAG

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2DL84JQ 657 0 0
TTTTTTCGCAGTTCACTAAAGGTCCATCTGTTCCTAGAGAGACCAGACTCGCTGCTATTG
TGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTCTGTTAG
CTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGTTGACGA
CAGCACATAGAGGGGATGTTAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCACCTGCTG
AGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATCGGAGAA*GGGAAGAAAGTGACC
GTGGAACAAAAGATTGATCCGAGTATTTACGGAGGGCTAATAGTGGAGTTTCAACAGAAG
GTGTTGGACATGTCTATCAGGACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAGCCT
GTTGACTTCACCAACCTTTGAAGACTTTCCCCCTAAAGAAACGTGCTTGCTTGTGATGAT
GATGCTATGCTACCACCAGTTGACAAATAAAAATATGACACTCTCCTGAGAAAAACAACC
TATAAACACTTGTGTCGGTTTTTTTGAATTTTGTCATTTCATTCTACAATTGTTGTTTTT
GCTTCGAAATAAGCTTTTGAAGACATCAAATTTGAATGATATTTGGGTTTACGTT
CG

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 10

CO CL486Contig1 1752 10 20 U
GGGGGTTTGAGGTTTCGATCTTGGAGTTACTGTTTGATCTGATTCGAAGTTGTGTTTTGT
CGATCTGACTGACTTGTGTTTGTTTCAGGGTTTTGTTCGTTTGGTCGAGAACTATGAAGA
AAGTTTGTTTCTTTATGATCCTTGTCTGCTTAAACGCAGCGTCGTTTCTAGTGTCTGCTG
ATCCACAAACGTGTCCTGCTGATTTGGGAGGGAAGTGCAGTGATTCTGATGATTGGCAAG
GAGAGTTCTTCCCTGAGATCCCTCAGATTAAGTATGAGGGACCTTCTAGCAAGAACCCAC
TTGCTTACAGGTGGTATAACGCTGAAGAGGAGATTCTTGGCAAGAAAATGAAGGATTGGT
TTAGATTCAGTGTTGCGTTTTGGCATACGTTCCGTGGGACTGGAGGTGACCCATTTGGTG
CTGCTACAAAGTATTGGCCCTGGGAAGATGGTACTAACTCTGTCTCTATGGCCAAGAGAA
GAATGAGAGCCAACTTTGAGTTTTTGAAGAAACTTGGAGTTGATTGGTGGTGTTTCCATG
ACAGAGACATTGCCCCTGATGGCAACACACTTGAGGAATCTAACAAAAATTTGGATGAAG
TTATCGAACTCGCCAAAGAACTCCAAAAGGGAAGCAAGATCAGACCATTATAGGGAACAG
CTCAGCTTTTCCTGCATCCTCGTTACATGCACGGAGGAGCAACCAGCTCTGAGGTTGGAG
TCTATGCTTACGCCGCCGCTCAGGTGAAGAAGGCCATGGAGGTGACACATTACCTGGGAG
GCGAAAACTATGTTTTCTGGGGCGGTCGTGAAGGTTACCAGACGCTCTTGAACACTGATA
TGGAAAGAGAGCTTGATCATATGGCCAGATTCTTTGAAGCTGCTGTTGCTTACAAGAAGA
AGATTGGATTCAACGGAACGCTTTTAATCGAGCCGAAGCCTCAAGAACCAACCAAGCACC
AGTATGACTGGGATGCTGCAACAGCTGCCAACTTCCTGAGGAAATACGGACTTATCAACG
AGTTTAAACTCAACATTGAGTGTAACCACGCCACGCTTTCTGGTCACACCTGCCATCACG
AGCTTGAAACTGCAAGAATTAACGGTTTGCTTGGTAACATTGATGCAAACACTGGCGATG
CTCAAACTGGATGGGATACAGATCAGTTTCTTACAGATGTTGGTGAAGCAACCATGGTTA
TGATGAGTGTCATCAAAAACGGTGGGATTGCTCCGGGAGGCTTCAACTTCGACGCCAAAC
TGCGAAGAGAGAGTACAGATGTTGAAGACTTGTTCATTGCTCATATTAGTGGGATGGACA
CAGTCGCTCGTGGACTGAGAAATGCAGCCAAGATCTTGGAGGATGGACGTCTAGGTGAAT
TGGTAGGCAAGAGATACTCAAGCTGGAACACTGAACTTGGGAAGCAAATAGAAGAAGGCA
AAGCTGATTTTGAGTATCTTGAGAAGAAGGCTAAAGAGTTTGGAGAACCAAAGGTTCCTT
CTGCTAAACAGGAACTCGCTGAGATGATCTTCCAGTCGGCAATGTAATTGTGGTTGAAGT
AGAAACTCTCTCTCTTGTCTTGGAGAAGTTTGAAAAATAAAGGACTAAAACGATGATTAG
CGATGTTGGTTTTAATTAGTTTCAGCTTATGCAGTATGCTTTCACACCCCTACTACGTCT
TACCTCAAATAGTCAAATTGAATAAGAAAAACTATTTGGGCCTTACTTGAATTCAATGTA
GGTTTCAGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC59TF U 1
AF RR2FB91TF U 469
AF RR2E703TF U 650
AF RR2BO03TF U 959
AF RR2E703JQ C 971
AF RR2BH47JQ C 955
AF RR2GF01JQ C 1178
AF RR2GF01TF U 1119
AF RR2BO03JQ C 1000
AF RR2FB91JQ C 1074
BS 1 589 RR2GC59TF
BS 590 671 RR2FB91TF
BS 672 672 RR2E703TF
BS 673 1215 RR2FB91TF
BS 1216 1341 RR2E703TF
BS 1342 1342 RR2GF01TF
BS 1343 1350 RR2E703TF
BS 1351 1351 RR2GF01TF
BS 1352 1361 RR2E703TF
BS 1362 1362 RR2GF01TF
BS 1363 1374 RR2E703TF
BS 1375 1465 RR2GF01TF
BS 1466 1466 RR2BO03TF
BS 1467 1590 RR2GF01TF
BS 1591 1591 RR2BO03TF
BS 1592 1651 RR2GF01TF
BS 1652 1652 RR2BH47JQ
BS 1653 1661 RR2GF01TF
BS 1662 1724 RR2BO03JQ
BS 1725 1752 RR2FB91JQ

RD RR2GC59TF 589 0 0
GGGGGTTTGAGGTTTCGATCTTGGAGTTACTGTTTGATCTGATTCGAAGTTGTGTTTTGT
CGATCTGACTGACTTGTGTTTGTTTCAGGGTTTTGTTCGTTTGGTCGAGAACTATGAAGA
AAGTTTGTTTCTTTATGATCCTTGTCTGCTTAAACGCAGCGTCGTTTCTAGTGTCTGCTG
ATCCACAAACGTGTCCTGCTGATTTGGGAGGGAAGTGCAGTGATTCTGATGATTGGCAAG
GAGAGTTCTTCCCTGAGATCCCTCAGATTAAGTATGAGGGACCTTCTAGCAAGAACCCAC
TTGCTTACAGGTGGTATAACGCTGAAGAGGAGATTCTTGGCAAGAAAATGAAGGATTGGT
TTAGATTCAGTGTTGCGTTTTGGCATACGTTCCGTGGGACTGGAGGTGACCCATTTGGTG
CTGCTACAAAGTATTGGCCCTGGGAAGATGGTACTAACTCTGTCTCTATGGCCAAGAGAA
GAATGAGAGCCAACTTTGAGTTTTTGAAGAAACTTGGAGTTGATTGGTGGTGTTTCCATG
ACAGAGACATTGCCCCTGATGGCAACACACTTGAGGAATCTAACAAAAA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2FB91TF 747 0 0
G
GGCCAAGAGAAGAATGAGAGCCAACTTTGAGTTTTTGAAGAAACTTGGAGTTGATTGGTG
GTGTTTCCATGACAGAGACATTGCCCCTGATGGCAACACACTTGAGGAATCTAACAAAAA
TTTGGATGAAGTTATCGAACTCGCCAAAGAACTCCAAAAGGGAAGCAAGATCAGACCATT
ATAGGGAACAGCTCAGCTTTTCTTGCATCCTCGTTACATGCACGGAGGAGCAACCAGCTC
TGAGGTTGGAGTCTATGCTTACGCCGCCGCTCAGGTGAAGAAGGCCATGGAGGTGACACA
TTACCTGGGAGGCGAAAACTATGTTTTCTGGGGCGGTCGTGAAGGTTACCAGACGCTCTT
GAACACTGATATGGAAAGAGAGCTTGATCATATGGCCAGATTCTTTGAAGCTGCTGTTGC
TTACAAGAAGAAGATTGGATTCAACGGAACGCTTTTAATCGAGCCGAAGCCTCAAGAACC
AACCAAGCACCAGTATGACTGGGATGCTGCAACAGCTGCCAACTTCCTGAGGAAATACGG
ACTTATCAACGAGTTTAAACTCAACATTGAGTGTAACCACGCCACGCTTTCTGGTCACAC
CTGCCATCACGAGCTTGAAACTGCAAGAATTAACGGTTTGCTTGGTAACATTGATGCAAA
CACTGGCGATGCTCAAACTGGATGGGATACAGATCAGTTTCTTACAGATGTTGGTGAAGC
AACCATGGTTATGATGAGTGTCATCA

QA 2 747 2 747
DS 

RD RR2E703TF 728 0 0
GGC
GGGAACAGCTCAGCTTTTCCTGCATCCTCGTTACATGCACGGAGTAGCAACCAGCTCTGA
GGTTGGAGTCTATGCTTACGCCGCCGCTCAGGTGAAGAAGGCCATGGAGGTGACACATTA
CCTGGGAGGCGAAAACTATGTTTTCTGGGGCGGTCGTGAAGGTTACCAGACGCTCTTGAA
CACTGATATGGAAAGAGAGCTTGATCATGTGGCCAGATTCTTTGAAGCTGCTGTTGCTTA
CAAGAAGAAGATTGGATTCAACGGAACGCTTTTAATCGAGCCGAAGCCTCAAGAACCAAC
CAAGCACCAGTATGACTGGGATGCTGCAACAGCTGCCAACTTCCTGAGGAAATACGGACT
TATCAACGAGTTTAAACTCAACATTGAGTGTAACCACGCCACGCTTTCTGGTCACACCTG
CCATCACGAGCTTGAAACTGCAAGAATTAACGGTTTGCTTGGTAACATTGATGCAAACAC
TGGCGATGCTCAAACTGGATGGGATACAGATCAGTTTCTTACAGATGTTGGTGAAGCAAC
CATGGTTATGATGAGTGTCATCAAAAACGGTGGGATTGCTCCGGGAGGCTTCAACTTCGA
CGCCAAACTGCGAAGAGAGAGTACAGATGTTGAAGACTTGTTCATTGCTCATATTAGTGG
GATGGACACAGTCGCTCGTGGACTGAGAA*TGCAGCCA*GATCTTGGAG*ATGGACGTCT
AG
TGA

QA 4 725 4 725
DS 

RD RR2BO03TF 640 0 0
G
CAGTATTACTGGGATGCTGCAACAGCTGCCAACTTCCTGAGGAAATACGGACTTATCAAC
GAGTTTAAACTCAACATTGAGTGTAACCACGCCACGCTTTCTGGTCACACCTTCCATCAC
GAGCTTGAAACTGCAAGAATTAACGGTTTGCTTGGTAACATTGATGCAAACACTGGCGAT
GCTCAAACTGGATGGGATACAGATCAGTTTCTTACAGATGTTGGTGAAGCAACCATGGTT
ATGATGAGTGTCATCAAAAACGGTGGGATTGCTCCGGGAGGCTTCAACTTCGACGCCAAA
CTGCGAAGAGAGAGTACAGATGTTGAAGGCCTGTTCATTGCTCATATTAGTGGGATGGAC
ACAGTCGCTCGTGGACTGAGAAATGCAGCCAAGATCTTGGAGGATGGACGTCTAGGTGAA
TTGGTAGGCAAGAGATACTCAAGCTGGAACACTGAACTTGGGAAGCAAATAGAAGAAGGC
AAAGCTGATTTTGAGTATCTTGAGAAGAAGGCTAAAGAGTTTGGAGGACCAAAGGTTCCT
TCTGCCAAACAGGAACTCGCTGAGATGATCTTCCAGTCGGCAATGTAATTGTGGTTGAAG
TAGAAACTCTCTCTCTTGTCTTGGAGAAGTTTGAAAA
TA

QA 2 638 2 638
DS 

RD RR2E703JQ 627 0 0
GGATGCTGCAACAGCTGCCAACTTCCTGAGGAAATACGGACTTATCAACGAGTTTAAACT
CAACATTGAGTGTAACCACGCCACGCTTTCTGGTCACACCTGCCATCACGAGCTTGAAAC
TGCAAGAATTAACGGTTTGCTTGGTAACATTGATGCAAACACTGGCGATGCTCAAACTGG
ATGGGATACAGATCAGTTTCTTACAGATGTTGGTGAAGCAACCATGGTTATGATGAGTGT
CATCAAAAACGGTGGGATTGCTCCGGGAGGCTTCAACTTCGACGCCAAACTGCGAAGAGA
GAGTACAGATGTTGAAGACTTGTTCATTGCTCATATTAGTGGGATGGACACAGTCGCTCG
TGGACTGAGAAATGCAGCCAAGATCTTGGAGGATGGACGTCTAGGTGAATTGGTAGGCAA
GAGATACTCAAGCCGGAACACTGAACTTGGGAAGCAAATAGAAGAAGGCAAAGCTGATTT
TGAGTATCTTGAGTAGAAGGCTAAAGAGTTTGGAGAACCAAAGGTTCCTTCTGCTAAACA
GGAACTCGCTGAGATGATCTTCCAGTCGGCAATGTAATTGTGGTTGAAGTAGAAACTCTC
TCTCTTGTCTTGGAGAAGTTTGAAAAA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2BH47JQ 711 0 0
AGCAC
CAGTATGACTGGGATGCTGCAACAGCTGCCAACTTCCTGAGGAAATACGGACTTATCAAC
GAGTTTAAACTCAACATTGAGTGTAACCACGCCACGCTTTCTGGTCACACCTGCCATCAC
GAGCTTGAAACTGCAAGAATTAACGGTTTGCTTGGTAACATTGATGCAAACACTGGCGAT
GCTCAAACTGGATGGGATACAGATCAGTTTTTTACAGATGTTGGTGAAGCAACCATGGTT
ATGATGAGTGTCATCAAAAACGGTGGGATTGTTCCGGGAGGCTTCAACTTCGACGCCAAA
CTGCGAAGAGAGAGTACAGATGTTGAAGACTTGTTCATTGCTCATATTAGTGGGATGGAC
ACAGTCGCTCGTGGACTGAGAAATGCAGCCAAGATCTTGGAGGATGGACGTCTAGGTGAA
TTGGTAGGCAAGAGATACTCAAGCTGGAACACTGAACTTGGGAAGCAAATAGAAGAAGGC
AAAGCTGATTTTGAGTATCTTGAGAAGAAGGCTAAAGAGTTTGGAGAACCAAAGGTTCCT
TCTGCTAAACAGGAACTCGCTGAGATGATCTTCCAGTCGGCAATGTAATTGTGGTTGAAG
TAGAAACTCTCTCTCTTGTCTTGGAGAAGTTTGAAAAATAAAGGACTAAAACGATGATTA
GCGATGTTGGTTTTAATTAGTTTCAGCTTATGCAGTATGCTT
TCAC

QA 6 707 6 707
DS 

RD RR2GF01JQ 486 0 0
TGTTGGTGAAGCAACCATGGTTATGATGAGTGTCATAAAAAACGGTGGGATTGCTCCAGG
AGGCTTCAACTTCGACGCCAAACTGCGAAGAGAGAGTACAGATGTTGAAGACTTGTTCAT
TGCTCATATTAGTGGAATGGACACAGTCGCTCGTGGACTTAGAAATGCAGCCAAGATCTT
GGAGGATGGACGTCTAGGTGAATTGGTAGGCAAGAGATACTCAAGCTGGAACACTGAACT
TGGGAAGCAAATAGAAGAAGGCAAAGCTGATTTTGAGTATCTTGAGAACAAGGCTAAAGA
GTTTGGAGAACCAAAGGTTCCTTCTGCTAAACAGGAACTCGCTGAGATGATCTTCCAGTC
GGCAATGTAATTGTGGTTGAAGTAGAAACTCTCTCTCTTGTCTTGGAGAAGTTCGAAAAA
TAAAGGACTAAAACGATGATTAGCGATGTTGGTTTTAATTAGTTTCAGCTTATGTAGTAT
GCTT
CC

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2GF01TF 545 0 0
GG
TGATGCAAACACTGGCGATGCTCAAACTGGATGGGATACAGATCAGTTTCTTACAGATGT
TGGTGAAGCAACCATGGTTATGATGAGTGTCATAAAAAACGGTGGGATTGCTCCAGGAGG
CTTCAACTTCGACGCCAAACTGCGAAGAGAGAGTACAGATGTTGAAGACTTGTTCATTGC
TCATATTAGTGGAATGGACACAGTCGCTCGTGGACTTAGAAATGCAGCCAAGATCTTGGA
GGATGGACGTCTAGGTGAATTGGTAGGCAAGAGATACTCAAGCTGGAACACTGAACTTGG
GAAGCAAATAGAAGAAGGCAAAGCTGATTTTGAGTATCTTGAGAACAAGGCTAAAGAGTT
TGGAGAACCAAAGGTTCCTTCTGCTAAACAGGAACTCGCTGAGATGATCTTCCAGTCGGC
AATGTAATTGTGGTTGAAGTAGAAACTCTCTCTCTTGTCTTGGAGAAGTTCGAAAAATAA
AGGACTAAAACGATGATTAGCGATGTTGGTTTTAATTAGTTTCAGCTTATGTAGTATGCT
T
CC

QA 3 543 3 543
DS 

RD RR2BO03JQ 725 0 0
GGAAATACGGACTTATCAACGAGTTTAAACTCAACATTGAGTGTAACCACGCCACGCTTT
CTGGTCACACCTTCCATCACGAGCTTGAAACTGCAAGAATTAACGGTTTGCTTGGTAACA
TTGATGCAAACACTGGCGATGCTCAAACTGGATGGGATACAGATCAGTTTCTTACAGATG
TTGGTGAAGCAACCATGGTTATGATGAGTGTCATCAAAAACGGTGGGATTGCTCCGGGAG
GCTTCAACTTCGACGCCAAACTGCGAAGAGAGAGTACAGATGTTGAAGGCCTGTTCATTG
CTCATATTAGTGGGATGGACACAGTCGCTCGTGGACTGAGAAATGCAGCCAAGATCTTGG
AGGATGGACGTCTAGGTGAATTGGTAGGCAAGAGATACTCAAGCTGGAACACTGAACTTG
GGAAGCAAATAGAAGAAGGCAAAGCTGATTTTGAGTATCTTGAGAAGAAGGCTAAAGAGT
TTGGAGGACCAAAGGTTCCTTTTGCCAAACAGGAACTCGCTGAGATGATCTTCCAGTCGG
CAATGTAATTGTGGTTGAAGTAGAAACTCTCTCTCTTGTCTTGGAGAAGTTTGAAAAATA
AAGGACTAAAACGATGATTAGCGATGTTGGTTTTAATTAGTTTCAGCTTATGCAGTATGC
TTTCACACCCCTACTACGTCTTACCTCAAATAGTCAAATTGAATAAGAAAAACTATTTGG
GCCTT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2FB91JQ 679 0 0
CATCACGAGCTTGAAACTGCAAGAATTAACGGTTTGCTTGGTAACATTGATGCAAACACT
GGCGATGCTCAAACTGGATGGGATACAGATCAGTTTCTTACAGATGTTGGTGAAGCAACC
ATGGTTATGATGAGTGTCATCAAAAACGGTGGGATTGCTCCGGGAGGCTTCAACTTGGAC
GCCAAACTGCGAAGAGAGAGTACAGATGTTGAAGACTTGTTCATTGCTCATATTAGTGGG
ATGGACACAGTCGCTCGTGGACTGAGAAATGTAGCCAAGATCTTGGAGGATGGACGTCTA
GGTGAATTGGTAGGCAAGAGATACTCAAGCTGGAACACTGAACTTGGGAAGCAAATAGAA
GAAGGCAAAGCTGATTTTGAGTATCTTGAGAAGAAGGCTAAAGAGTTTGGAGAACCAAAG
GTTCCTTCTGCTAAACAGGAACTCGCTGAGATGATCTTCCAGTCGGCAATGTAATTGTGG
TTGAAGTAGAAACTCTCTCTCTTGTCTTGGAGAAGTTTGAAAAATAAAGGACTAAAACGA
TGATTAGCGATGTTGGTTTTAATTAGTTTCAGCTTATGCAGTATGCTTTCACACCCCTAC
TACGTCTTACCTCAAATAGTCAAATTGAATAAGAAAAACTATTTGGGCCTTACTTGAATT
CAATGTAGGTTTCAGTGCC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 2 10

CO CL487Contig1 742 4 17 U
TTTGGACTTAAAGTTTACAAATTCCATGAGATTTAAATGAAAATGGGAGATCATGCGATT
TCTTACTGATCTCAGTCTTCACAATTTTTTTTAATAAGACAGAAAAGTTTTATAAATATG
ATTACATAGAAATGAGAAGAGTTCTTTTAGGTTATTAAAAAGGGAAGTCCTTGCGGGGGA
GAGTGGTCAGCCCATTCCGTACTTTTGAGTCCAGGTACGGGCAGTAGACTCGTACTTGTT
CTTGTCAGTCTTGTACACGCGAGCAATCTCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATC
CGTCAACAACGAACAGATCGACAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACTG
CTCCTTCAAGATGTCGAGGCAGATGCTCCCATTACTGTTGATGTTTGGATGGAACACCTT
TGTCCTAAAAGCCACCTTGGGAGGTTTAAAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAAC
AAGAAAAACACCGCCAGAGTAAGGGCTGTCGGATGGACCCATTATCGTCGCTTGCCAATG
GAACATGTCTTCCGCCACCGGTCCTGCGCTGCATGAAGTAGGAGGATCCTTCTGCAGGTC
CTTCAATTCCTTCAAAATCCGTTTCGATGCCATCTCCGATAATCACCTTTCACGTTTTTT
TTGGTTCAGCTTAGCTTTAGATTCTTCGTAATTTAGGAAAAAAAAAAAAGAGAGAGAAAG
GAAACTGTAAATGGGTCTTCCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 25 15 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK25JQ U 11
AF RR2B440JQ U 4
AF RR2DK25TF C 12
AF RR2B440TF C 1
BS 1 4 RR2B440TF
BS 5 10 RR2B440JQ
BS 11 11 RR2DK25JQ
BS 12 13 RR2B440JQ
BS 14 15 RR2DK25JQ
BS 16 16 RR2B440JQ
BS 17 257 RR2DK25JQ
BS 258 258 RR2B440JQ
BS 259 259 RR2DK25JQ
BS 260 260 RR2B440JQ
BS 261 304 RR2DK25JQ
BS 305 305 RR2B440JQ
BS 306 393 RR2DK25JQ
BS 394 394 RR2B440JQ
BS 395 577 RR2DK25JQ
BS 578 659 RR2B440JQ
BS 660 742 RR2B440TF

RD RR2DK25JQ 567 0 0
AGTTT*ACAAATTCCATGAGATTTAAATGAAAATGGGAGATCATGCGATTTCTTACTGAT
CTCAGTCTTCACAATTTTTTTTAATAAGACAGAAAAGTTTTATAAATATGATTACATAGA
AATGAGAAGAGTTCTTTTAGGTTATTAAAAAGGGAAGTCCTTGCGGGGGAGAGTGGTCAG
CCCATTCCGTACTTTTGAGTCCAGGTACGGGCAGTAGACTCGTACTTGTTCTTGTCAGTC
TTGTACATGTGAGCAATCTCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATCCGTCGACAAC
GAACAGATCGACAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCCTTCAAG
ATGTCGAGGCAGATGCTCCCATTGCTGTTGATGTTTGGATGGAACACCTTTGTCCTAAAA
GCCACCTTGGGAGGTTTAAAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGAAAAACA
CCGCCAGAGTAAGGGCTGTCGGATGGACCCATTATCGTCGCTTGCCAATGGAACATGTCT
TCCGCCACCGGTCCTGCGCTGCATGAA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2B440JQ 669 0 0
G
GACTTAAAGTTTACAAATTCCATGAGATTTAAATGAAAATGGGAGATCATGCGATTTCTT
ACTGATCTCAGTCTTCACAATTTTTTTTAATAAGACAGAAAAGTTTTATAAATATGATTA
CATAGAAATGAGAAGAGTTCTTTTAGGTTATTAAAAAGGGAAGTCCTTGCGGGGGAGAGT
GGTCAGCCCATTCCGTACTTTTGAGTCCAGGTACGGGCAGTAGACTCGTACTTGTTCTTG
TCAGTCTTGTACACGCGAGCTATCTCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATCCGTC
AACAACGAACAGATCGACAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCC
TTCAAGATGTCGAGGCAGATGCTCCCATTACTGTTGATGTTTGGATGGGACACCTTTGTC
CTAAAAGCCACCTTGGGAGGTTTAAAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGA
AAAACACCGCCAGAATAAGGGCTGTCGGATGGACCCATTATCGTCGCTTGCCAATGGAAC
ATGTCTTCCGCCACCGGTCCTGCGCTGCATGAAGTAGGAGGATCCTTCTGCAGGTCCTTC
AATTCCTTCAAAATCCGTTTCGATGCCATCTCCGATAATCACCTTTCACGTTTTT
TTTGGTTCAGCTT

QA 2 656 2 656
DS 

RD RR2DK25TF 610 0 0
AGTTTACAAATTCCATGAGATTTAAATGAAAATGGGAGATCATGCGATTTCTTACTGATC
TCAGTCTTCACAATTTTTTTTAATAAGACAGAAAAGTTTTATAAATATGATTACATAGAA
ATGAGAAGAGTTCTTTTAGGTTATTAAAAAGGGAAGTCCTTGCGGGGGAGAGTGGTCAGC
CCATTCCGTACTTTTGAGTCCAGGTACGGGCAGTAGACTCGTACTTGTTCTTGTCAGTCT
TGTACATGTGAGCAATCTCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATCCGTCGACAACG
AACAGATCGACAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCCTTCAAGA
TGTCGAGGCAGATGCTCCCATTGCTGTTGATGTTTGGATGGAACACCTTTGTCCTAAAAG
CCACCTTGGGAGGTTTAAAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGAAAAACAC
CGCCAGAGTAAGGGCTGTCGGATGGACCCATTATCGTCGCTTGCCAATGGAACATGTCTT
CCGCCACCGGTCCTGCGCTGCATGAAGTAGGAGGATCCTTCTGCAGGTCCTTCAATTCCT
TCAAAATCC
C

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2B440TF 742 0 0
TTTGGACTTAAAGTT*ACAAATTCCATGAGATTTAAATGAAAATGGGAGATCATGCGATT
TCTTACTGATCTCAGTCTTCACAATTTTTTTTAATAAGACAGAAAAGTTTTATAAATATG
ATTACATAGAAATGAGAAGAGTTCTTTTAGGTTATTAAAAAGGGAAGTCCTTGCGGGGGA
GAGTGGTCAGCCCATTCCGTACTTTTGAGTCCAGGTACGGGCAGTAGACTCGTACTTGTT
CTTGTCAGTCTTGTACACGCGAGCTATCTCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATC
CGTCAACAACGAACAGATCGACAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACTG
CTCCTTCAAGATGTCGAGGCAGATGCTCCCATTACTGTTGATGTTTGGATGGGACACCTT
TGTCCTAAAAGCCACCTTGGGAGGTTTAAAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAAC
AAGAAAAACACCGCCAGAGTAAGGGCTGTCGGATGGACCCATTATCGTCGCTTGCCAATG
GAACATGTCTTCCGCCACCGGTCCTGCGCTGCATGAAGTAGGAGGATCCTTCTGCAGGTC
CTTCAATTCCTTCAAAATCCGTTTCGATGCCATCTCCGATAATCACCTTTCACGTTTTTT
TTGGTTCAGCTTAGCTTTAGATTCTTCGTAATTTAGGAAAAAAAAAAAAGAGAGAGAAAG
GAAACTGTAAATGGGTCTTCCC

QA 1 742 1 742
DS 



CO CL487Contig2 760 6 8 U
GCAAACTGGGAACGGGATGGACTTAAAGTTTACAAATTCCATGAGATTTAAATGAAAATG
GGAGATCATGCGATTTCTTACTGATCTCAGTCTTCACAATTTTTTTTTAATAAGACAGAA
AAGTTTATAAATATGATTACATAGAAATGAGAAGAGTTTTTTAGGTTACTAAAAGGAAGG
GGTAAGTCCTTGCGGGGGGAGAGTGGTCAGCCCATTCCGTACTTTTGAGTCCAGGTACGG
GCAGTAGACTCGTACTTGTTCTCGTCAGTCTTGTACATGTGAGCAATCTCCGGAACCAAA
GGATCATCCGGGTTTGGATCCGTCAACAACGAACAGATCGACAGCAGCACCTTGGAAATG
GTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCCTTCAAGATGTCGAGGCAGATGCTCCCATTGCTGTTG
ATGTTTGGATGGAACACCTTTGTCCTAAAAGCCACCTTGGGAGGTTTAAAAGGATAATCA
GGAGGGAAATGAATGGTAACAAGAAAAACACCGCCAGAGTAAGGGCTGTCGGATGGACCC
ATTATCGTCGCTTGCCAATGGAACATGTCTTCCGCCACCGGTCCTGCGCTGCATGAAGTA
GGAGGATCCTTCTGCAGATCTTTCAATTCCTTCAATATCCGTTTCGATGCCATCCCCGAT
AATCACCTTTCACGTTTTTGGTTCAGCTTTGCTTTAGATTCTTCGTAATTTAGGAAAAGA
AAAGAGAGAGAAAGGAAACTGTAAATGGTTCTTCTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2CZ88JQ U 1
AF RR2CY87JQ U 20
AF RR2CY87TF C 30
AF RR2CZ88TF C 108
AF RR2A295JQ U 47
AF RR2A295TF C 109
BS 1 518 RR2CZ88JQ
BS 519 519 RR2CY87JQ
BS 520 584 RR2CZ88JQ
BS 585 713 RR2CY87JQ
BS 714 714 RR2A295JQ
BS 715 730 RR2CY87JQ
BS 731 756 RR2CY87TF
BS 757 760 RR2A295TF

RD RR2CZ88JQ 584 0 0
GCAAACTGGGAACGGGATGGACTTAAAGTTTACAAATTCCATGAGATTTAAATGAAAATG
GGAGATCATGCGATTTCTTACTGATCTCAGTCTTCACAATTTTTTTTTAATAAGACAGAA
AAGTTTATAAATATGATTACATAGAAATGAGAAGAGTTTTTTAGGTTACTAAAAGGAAGG
GGTAAGTCCTTGCGGGGGGAGAGTGGTCAGCCCATTCCGTACTTTTGAGTCCAGGTACGG
GCAGTAGACTCGTACTTGTTCTCGTCAGTCTTGTACATGTGAGCAATCTCCGGAACCAAA
GGATCATCCGGGTTTGGATCCGTCAACAACGAACAGATCGACAGCAGCACCTTGGAAATG
GTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCCTTCAAGATGTCGAGGCAGATGCTCCCATTGCTGTTG
ATGTTTGGATGGAACACCTTTGTCCTAAAAGCCACCTTGGGAGGTTTAAAAGGATAATCA
GGAGGGAAATGAATGGTAACAAGAAAAACACCGCCAGAATAAGGGCTGTCGGATGGACCC
ATTATCGTCGCTTGCCAATGGAACATGTCTTCCGCCACCGGTCC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2CY87JQ 711 0 0
GACTTAAAGTTTACAAATTCCATGAGATTTAAATGAAAATGGGAGATCATGCGATTTCTT
ACTGATCTCAGTCTTCACAATTTTTTTTTAATAAGACAGAAAAGTTTATAAATATGATTA
CATAGAAATGAGAAGAGTTTTTTAGGTTACTAAAAGGAAGGGGTAAGTCCTTGCGGGGGG
AGAGTGGTCAGCCCATTCCGTACTTTTGAGTCCAGGTACGGGCAGTAGACTCGTACTTGT
TCTCGTCAGTCTTGTACATGTGAGCAATCTCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGAT
CCGTCAACAACGAACAGATCGACAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACT
GCTCCTTCAAGATGTCGAGGCAGATGCTCCCATTGCTGTTGATGTTTGGATGGAACACCT
TTGTCCTAAAAGCCACCTTGGGAGGTTTAAAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAA
CAAGAAAAACACCGCCAGAGTAAGGGCTGTCGGATGGACCCATTATCGTCGCTTGCCAAT
GGAACATGTCTTCCGCCACCGGTCCTGCGCTGCATGAAGTAGGAGGATCCTTCTGCAGAT
CTTTCAATTCCTTCAATATCCGTTTCGATGCCATCCCCGATAATCACCTTTCACGTTTTT
GGTTCAGCTTTGCTTTAGATTCTTCGTAATTTAG*AAAAGAAAAGAGAGAG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2CY87TF 731 0 0
TTACAAATTCCATGAGATTTAAATGAAAATGGGAGATCATGCGATTTCTTACTGATCTCA
GTCTTCACAATTTTTTTT*AATAAGACAGAAAAGTTTATAAATATGATTACATAGAAATG
AGAAGAGTTTTTTAGGTTACTAAAAGGAAGGGGTAAGTCCTTGCGGGGGGAGAGTGGTCA
GCCCATTCCGTACTTTTGAGTCCAGGTACGGGCAGTAGACTCGTACTTGTTCTCGTCAGT
CTTGTACATGTGAGCAATCTCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATCCGTCAACAA
CGAACAGATCGACAGCAGCACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCCTTCAA
GATGTCGAGGCAGATGCTCCCATTGCTGTTGATGTTTGGATGGAACACCTTTGTCCTAAA
AGCCACCTTGGGAGGTTTAAAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGAAAAAC
ACCGCCAGAGTAAGGGCTGTCGGATGGACCCATTATCGTCGCTTGCCAATGGAACATGTC
TTCCGCCACCGGTCCTGCGCTGCATGAAGTAGGAGGATCCTTCTGCAGATCTTTCAATTC
CTTCAATATCCGTTTCGATGCCATCCCCGATAATCACCTTTCACGTTTTTGGTTCAGCTT
TGCTTTAGATTCTTCGTAATTTAGGAAAAGAAAAGAGAGAGAAAGGAAACTGTAAATGGT
TCTTCTC
TTCC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2CZ88TF 653 0 0
TAATAAGACAGAAAAGTTTATAAATATGATTACATAGAAATGAGAAGAGTTTTT*AGGTT
ACTAAAAGGAAGGGGTAAGTCCTTGCGGGGGGAGAGTGGTCAGCCCATTCCGTACTTTTG
AGTCCAGGTACGGGCAGTAGACTCGTACTTGTTCTCGTCAGTCTTGTACATGTGAGCAAT
CTCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATCCGTCAACAACGAACAGATCGACAGCAG
CACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCCTTCAAGATGTCGAGGCAGATGCT
CCCATTGCTGTTGATGTTTGGATGGAACACCTTTGTCCTAAAAGCCACCTTGGGAGGTTT
AAAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGAAAAACACCGCCAGAGTAAGGGCT
GTCGGATGGACCCATTATCGTCGCTTGCCAATGGAACATGTCTTCCGCCACCGGTCCTGC
GCTGCATGAAGTAGGAGGATCCTTCTGCAGATCTTTCAATTCCTTCAATATCCGTTTCGA
TGCCATCCCCGATAATCACCTTTCACGTTTTTGGTTCAGCTTTGCTTTAGATTCTTCGTA
ATTTAGGAAAAGAAAAGAGAGAGAAAGGAAACTGTAAATGGTTCTTCTC
TTCC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2A295JQ 686 0 0
CG
TAAATGAAAATGGGAGATCATGCGATTTCTTACTGATCTCAGTCTTCACAATTTTTTTTT
AATAAGACAGAAAAGTTTATAAATATGATTACATAGAAATGAGAAGAGTTTTTTAGGTTA
CTAAAAGGAAGGGGTAAGTCCTTGCGGGGGGAGAGTGGTCAGCCCATTCCGTACTTTTGA
GTCCAGGTACGGGCAGTAAACTCGTACTTGTTCTTGTCAGTCTTGTACATGTGAGCAATC
TCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATCCGTCAACAACGAACAGATCGACAGCAGC
ACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCCTTCAAGATGTCGAGGCAAATGCTC
CCATTGCTGTTGATGTTTGGATGGAACACCTTTGTCCTAAAAGCCACCTTGGGAGGTTTA
AAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGAAAAACACCGCCAGAGTAAGGGCTG
TCGGATGGACCCATTATCGCCGCTTGCCAATGGAACATGTCTTCCGCCACCGGTCCTGCG
CTGCATGAAGTAGGAGGATCCTTCTGCAGATCTTTCAATTCCTTCAATATCCGTTTCGAT
GCCATCCCCGATAATCACCTTTCACGTTTTTGGTTCAGCTTTGCTTTAGATTCTTCGTAA
TTTAGGAAAAGAAAAGAG
GAGAAA

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR2A295TF 652 0 0
AATAAGACAGAAAAGTTTATAAATATGATTACATAGAAATGAGAAGAGTTTTTTAGGTTA
CTAAAAGGAAGGGGTAAGTCCTTGCGGGGGGAGAGTGGTCAGCCCATTCCGTACTTTTGA
GTCCAGGTACGGGCAGTAGACTCGTACTTGTTCTTGTCAGTCTTGTACATGTGAGCAATC
TCCGGAACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATCCGTCAACAACGAACAGATCGACAGCAGC
ACCTTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCACTGCTCCTTCAAGATGTCGAGGCAGATGCTC
CCATTGCTGTTGATGTTTGGATGGAACACCTTTGTCCTAAAAGCCACCTTGGGAGGTTTA
AAAGGATAATCAGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGAAAAACACCGCCAGAGTAAGGGCTG
TCGGATGGACCCATTATCGCCGCTTGCCAATGGAACATGTCTTCCGCCACCGGTCCTGCG
CTGCATGAAGTAGGAGGATCCTTCTGCAGATCTTTCAATTCCTTCAATATCCGTTTCGAT
GCCATCCCCGATAATCACCTTTCACGTTTTTGGTTCAGCTTTGCTTTAGATTCTTCGTAA
TTTAGGAAAAGAAAAGAG*GAGAAAGGAAACTGTAAATGGTTCTTCTCTTCC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 2 9

CO CL488Contig1 1161 5 25 U
GGTTGTAAAGCTCCTTGCTACCACAGTTATAACACTGACAAGGCATGACACAAATGTGGA
TAGACTGTCAAAGAGAAATGATTATACAAATTACATTAGAATTTAGAAGAAAGCTTCGCA
TTCAGAGTTCTGAACCAAAAAAAACCACCAAAAGTGTACGAATCCCGTCTAAACAAAATG
GAAGAGACAGAGGGAACTTCTCAGTCCCTTAAAATCCACGCCTTGGACGCTCCTCCGCTA
CATTTACTCTGATCGCTCTACCCTCCATGTTCTGTCCGTCAAGAGCAGCGACGGCATCAT
TGAGTTCAGTCTCATTAGACATTGTAACAAAACCAAATCCACGTGAACGACCTGTCTCAC
GGTCATAAACCACTTTAGCTTCCACAACTTTGCCATGCTCGCTGAAAACTTGTTCTAGAC
GACCACTGTCCACATCCCACGGTAGGTTCCCAACATACACTCTGAATGCAGGTTCGTATA
CCCGAGGTTGGCGTTCTGGACGTGATCCTTTGGG*AGCTGCCTTGTTTACTGTCAAAAGC
CT*TCCGTTCAAATCATAACGGTTAAACTTCTCAA*CAGCTGTCTCAGCTTCTTCAACTG
TACTCATTGTCACAAATCC**AAACCCACGACTCTGGTCGGTTTCCCTGTTGTATATAAC
CTCAGCGATTTCAACAGTACCGGCTTGCTCAAAGAGCATAGCCAAGGCCTGGCTATCAAC
GTCGTAAGCCAAGTTTCCGACGAATAGCTTCGCTTCTTCCGGTGGCTCATGGAAGTCGCC
ACCTCCTCCTCCTTCGCTCACGTCTCCTTCCCCTTCAGAAAAGGTCGCTTCTTCTGGGTC
GCTCTCCTCGACGGCGACCGATGATGAGCTCCCATCTTCTTCCCCGGACCAATCCGAAGT
CTCGGCGACTAAGGTAACGAAAGGTGACTTCTTTAGATGGGTTTTGGATTTGAGAGAGAG
GGAGACGCGGGAGAAGGAGAGAGGGAGGTTGGTGCGTCTGGTGAGGAAGGAGCAGCGGGT
TTTGGAGGAATGGATAGTGGAGAATGAAGGGTGGGAGAAAATGGTTGAAGAAGAGGATTC
TGACATGGCTAATGGCCTCAAGCTTGAGGTTACTATTGAAGAAGCCATTGTGAGAGATAG
AAAGAAAGGAAGTGTGTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D819JQ U 1
AF RR2B046TF C 461
AF RR2G828JQ U 84
AF RR2B046JQ U 59
AF RR2G828TF C 414
BS 1 180 RR2D819JQ
BS 181 181 RR2B046JQ
BS 182 192 RR2D819JQ
BS 193 193 RR2B046JQ
BS 194 207 RR2D819JQ
BS 208 208 RR2B046JQ
BS 209 244 RR2D819JQ
BS 245 245 RR2B046JQ
BS 246 325 RR2D819JQ
BS 326 326 RR2B046JQ
BS 327 448 RR2D819JQ
BS 449 449 RR2B046JQ
BS 450 583 RR2D819JQ
BS 584 584 RR2B046JQ
BS 585 595 RR2D819JQ
BS 596 596 RR2B046JQ
BS 597 645 RR2D819JQ
BS 646 646 RR2B046JQ
BS 647 648 RR2D819JQ
BS 649 649 RR2B046JQ
BS 650 672 RR2D819JQ
BS 673 673 RR2B046JQ
BS 674 684 RR2D819JQ
BS 685 820 RR2B046JQ
BS 821 1161 RR2G828TF

RD RR2D819JQ 684 0 0
GGTTGTAAAGCTCCTTGCTACCACAGTTATAACACTGACAAGGCATGACACAAATGTGGA
TAGACTGTCAAAGAGAAATGATTATACAAATTACATTAGAATTTAGAAGAAAGCTTCGCA
TTCAGAGTTCTGAACCAAAAAAAACCACCAAAAGTGTACGAATCCCGTCTAAACAAAATG
CAAGAGACAGAGAGAACTTCTCAGTCC*TTAAAATCCACGCCTTGGACGCTCCTCCGCTA
CATTCACTCTGATCGCTCTACCCTCCATGTTCTGTCCGTCAAGAGCAGCGACGGCATCAT
TGAGTTCAGTCTCATTAGACATTGTCACAAAACCAAATCCACGTGAACGACCTGTCTCAC
GGTCATAAACCACTTTAGCTTCCACAACTTTGCCATGCTCGCTGAAAACTTGTTCTAGAC
GACCACTGTCCACATCCCACGGTAGGTTTCCAACATACACTCTGAATGCAGGTTCGTATA
CCCGAGGTTGGCGTTCTGGACGTGATCCTTTGGG*AGCTGCCTTGTTTACTGTCAAAAGC
CT*TCCGTTCAAATCATAACGGTTAAACTTCTCAA*CAGCTGTTTCAGCTTCTTCCACTG
TACTCATTGTCACAAATCC**AAACCCACGACTCTGGTCGGTTTCTCTATTGTATATAAC
CTCAGCGATTTCGACAGTACCGGC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2B046TF 319 0 0
TCTGAATGCAGGTTCGTATACCCGAGGTTGGCGTTCTGGACGTGATCCTTTGGGGAGCTG
CCTTGTTTACTGTCAAAAGCCCCTCCGTTCAAATCATAACGGTTAAACTTCTCAAACAGC
TGTCTCAGCTTCTTCAACTGTACTCATTGTCACAAATCCCAAAACCCACGACTCTGGTCG
GTTTCCCTGTTGTATATAACCTCAGCGATTTCAACAGTACCGGCTTGCTCAAAGAGCATA
GCCAAGGCCTGGCTATCAACGTCGTAAGCCAAGTTTCCGACGAATAGCTTCGCTTCTTCC
GGTGGCTCATGGAAGTCGC

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR2G828JQ 653 0 0
G
TACAAATTACATTAGAATTTAGAAGAAAGCTTCGCATTCAGAGTTCTGAACCAAAAAAAA
ACACCAAAAGTGTACGAATCCCGTCTAAACAAAATGGAAGAAACAGAGGGAACTTCTCAG
TCCCTTAAAATCCACGCCTTGGACGCTCCTCCGCTACATTTACTCTGATCGCTCTACCCT
CCATGTTCTGTCCGTCAAGAGCAGCGACGGCATCATTGAGTTCAGTCTCATTAGACATTG
TAACAAAACCAAATCCACGTGAACGACCTGTCTCACGGTCATAAACCACTTTAGCTTCCA
CAACTTTGCCATGCTCGCTGAAAACTTGTTCTAGACGACCACTGTCCACATCCCACGGTA
GGTTCCCAACATACACTCTGAATGCAGGTTCGTATACCCGAGGTTGGCGTTCTGGACGTG
ATCCTTTGGG*AGCTGCCTTGTTTACTGTCAAAAGCCT*TCCGTTCAAATCATAACGGTT
AAACTTCTCAA*CAGCTGTCTCAGCTTCTTCAACTGTACTCATTGTCACAAATCC**AAA
CCCACGACTCTGGTCGGTTTCCCTGTTGTATATAACCTCAGCGATTTCAACAGTACCGGC
TTGCTCAAAGAGCATAGCCAAGGCCTGGCTATCAACGTCGTAAGCCAAGTTT

QA 2 653 2 653
DS 

RD RR2B046JQ 762 0 0
GG
TAGACTGTCAAAGAGAAATGATTATACAAATTACATTAGAATTTAGAAGAAAGCTTCGCA
TTCAGAGTTCTGAACCAAAAAAAAC*ACCAAAAGTGTACGAATCCCGTCTAAACAAAATG
GAAGAGACAGAGGGAACTTCTCAGTCCCTTAAAATCCACGCCTTGGACGCTCCTCCGCTA
CATTTACTCTGATCGCTCTACCCTCCATGTTCTGTCCGTCAAGAGCAGCGACGGCATCAT
TGAGTTCAGTCTCATTAGACATTGTAACAAAACCAAATCCACGTGAACGACCTGTCTCAC
GGTCATAAACCACTTTAGCTTCCACAACTTTGCCATGCTCGCTGAAAACTTGTTCTAGAC
GACCACTGTCCACATCCCACGGTAGGTTCCCAACATACACTCTGAATGCAGGTTCGTATA
CCCGAGGTTGGCGTTCTGGACGTGATCCTTTGGG*AGCTGCCTTGTTTACTGTCAAAAGC
CC*TCCGTTCAAATCATAACGGTTAAACTTCTCAA*CAGCTGTCTCAGCTTCTTCAACTG
TACTCATTGTCACAAATCC**AAACCCACGACTCTGGTCGGTTTCCCTGTTGTATATAAC
CTCAGCGATTTCAACAGTACCGGCTTGCTCAAAGAGCATAGCCAAGGCCTGGCTATCAAC
GTCGTAAGCCAAGTTTCCGACGAATAGCTTCGCTTCTTCCGGTGGCTCATGGAAGTCGCC
ACCTCCTCCTCCTTCGCTCACGTCTCCTTCCCCTTCAGAA

QA 3 762 3 762
DS 

RD RR2G828TF 748 0 0
TCTAGACGACCACTGTCCACATCCCACGGTAGGTTCCCAACATACACTCTGAATGCAGGT
TCGTATACCCGAGGTTGGCGTTCTGGACGTGATCCTTTGGG*AGCTGCCTTGTTTACTGT
CAAAAGCCT*TCCGTTCAAATCATAACGGTTAAACTTCTCAA*CAGCTGTCTCAGCTTCT
TCAACTGTACTCATTGTCACAAATCC**AAACCCACGACTCTGGTCGGTTTCCCTGTTGT
ATATAACCTCAGCGATTTCAACAGTACCGGCTTGCTCAAAGAGCATAGCCAAGGCCTGGC
TATCAACGTCGTAAGCCAAGTTTCCGACGAATAGCTTCGCTTCTTCCGGTGGCTCCTGGA
AGTCGCCACCTCCTCCTCCTTCGCTCACGTCTCCTTCCCCTTCAGAAAAGGTCGCTTCTT
CTGGGTCGCTCTCCTCGACGGCGACCGATGATGAGCTCCCATCTTCTTCCCCGGACCAAT
CCGAAGTCTCGGCGACTAAGGTAACGAAAGGTGACTTCTTTAGATGGGTTTTGGATTTGA
GAGAGAGGGAGACGCGGGAGAAGGAGAGAGGGAGGTTGGTGCGTCTGGTGAGGAAGGAGC
AGCGGGTTTTGGAGGAATGGATAGTGGAGAATGAAGGGTGGGAGAAAATGGTTGAAGAAG
AGGATTCTGACATGGCTAATGGCCTCAAGCTTGAGGTTACTATTGAAGAAGCCATTGTGA
GAGATAGAAAGAAAGGAAGTGTGTCCCC

QA 1 748 1 748
DS 



CO CL488Contig2 1148 4 11 U
TTTTTGGTCTTGCTGTCTAGGCCCTCCTTATCCCTATCTCTCTCACGCACCGTTCTAAAA
CCCTCCCCTTCCTCTTCTTTCTCAACACTTCCTTCTTCCATCTCTCACAATGGCTTCTTC
AATAGTAACCTCAAGCTTGAGGCCATTAGCCATGTCAGAATCCTCCTCTTCAACCATTTT
CTCCCACCCCTCATTCTCCACTATCTACTCCTCCAAAACCCGCTGCTCCTTCCTCGCCAA
ACGCACTAACCTTTCCCTCTCTCTCAAATCCAAAACCCATCTAAAGAAGTCACCTTTCGT
TACCTTAGTCGCCGAGACTTCTGATTGGTCCGGCGAAGAAGATGGGAGCTCATCATCGGT
CGCCGTCGAGGAGAGCGACCCAGAAGAAGCCTCGTTTTCTGAAGGGGAAGGAGACGTGAG
CGAAGGAGGAGACTTCCAGGAGCCACCGGAAGAAGCGAAGCTCTTCGTCGGGAACTTGGC
TTACGACGTTGATAGCCAGGCCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCCGGTACTGTTGAAAT
CGCTGAGGTTATATACAATAGAGAAACCGACCAGAGTCGTGGGTTTGGATTTGTGACAAT
GAGTACAGTGGAAGAAGCTGAGACAGCTGTTGAGAAGTTTAACCGTTATGATTTGAACGG
AAGGCTTTTGACAGTAAACAAGGCAACTCCCAAAGGATCACGTCCAGAGCGTCAACCTCG
AGTATACGAACCTGCATTCAGAGTGTACGTTGGAAACCTACCGTGGGATGTGGACAGTGG
TCGTCTAGAACAAGTTTTCAGCGAGCATGGCAAAGTGGTGGAAGCTAAAGTGGTTTATGA
CCGTGAGACAGGTCGTTCACGTGGATTTGGTTTTGTGACAATGTCTAATGAGACTGAACT
CAATGATGCCGTCGCTGCTCTTGACGGACAGAACATGGAGGGTAGAGCGATCAGAGTGAA
TGTAGCGGAGGAGCGTCCAAGGCGTGGATTTTAAGGGACTGAGAAGTTCTCTCCTGTGCC
CTCTCCGTCTCTTGCATTTTGTTTAGACGGGATTCATCACACTTTTGGTGATTTTCTTTC
TTTTTTCTTTTTGGTCAGAACTCTGAATGCGAAGCTTCTTCTAAAATTCTAATGTAATTT
GTATCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN95TF U 1
AF RR2EF14TF U 85
AF RR2CF29TF U 58
AF RR2EF14JQ C 545
BS 1 189 RR2GN95TF
BS 190 190 RR2CF29TF
BS 191 468 RR2GN95TF
BS 469 469 RR2CF29TF
BS 470 659 RR2GN95TF
BS 660 685 RR2CF29TF
BS 686 686 RR2EF14JQ
BS 687 726 RR2CF29TF
BS 727 727 RR2EF14JQ
BS 728 758 RR2CF29TF
BS 759 1148 RR2EF14JQ

RD RR2GN95TF 659 0 0
TTTTTGGTCTTGCTGTCTAGGCCCTCCTTATCCCTATCTCTCTCACGCACCGTTCTAAAA
CCCTCCCCTTCCTCTTCTTTCTCAACACTTCCTTCTTCCATCTCTCACAATGGCTTCTTC
AATAGTAACCTCAAGCTTGAGGCCATTAGCCATGTCAGAATCCTCCTCTTCAACCATTTT
CTCCCACCCTTCATTCTCCACTATCTACTCCTCCAAAACCCGCTGCTCCTTCCTCGCCAA
ACGCACTAACCTTTCCCTCTCTCTCAAATCCAAAACCCATCTAAAGAAGTCACCTTTCGT
TACCTTAGTCGCCGAGACTTCTGATTGGTCCGGCGAAGAAGATGGGAGCTCATCATCGGT
CGCCGTCGAGGAGAGCGACCCAGAAGAAGCCTCGTTTTCTGAAGGGGAAGGAGACGTGAG
CGAAGGAGGAGACTTCCAGGAGCCACCGGAAGAAGCGAAGCTCTTCGTTGGGAACTTGGC
TTACGACGTTGATAGCCAGGCCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCCGGTACTGTTGAAAT
CGCTGAGGTTATATACAATAGAGAAACCGACCAGAGTCGTGGGTTTGGATTTGTGACAAT
GAGTACAGTGGAAGAAGCTGAGACAGCTGTTGAGAAGTTTAACCGTTATGATTTGAACG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2EF14TF 593 0 0
GG
ACTTCCTTCTTCCATCTCTCACAATGGCTTCTTCAATAGTAACCTCAAGCTTGAGGCCAT
TAGCCATGTCAGAATCCTCCTCTTCAACCATTTTCTCCCACCCCTCATTCTCCACTATCT
ACTCCTCCAAAACCCGCTGCTCCTTCCTCGCCAAACGCACTAACCTTTCCCTCTCTCTCA
AATCCAAAACCCATCTAAAGGAGTCACCTTTCGTTACCTTAGTCGCCGAGACTTCTGATT
GGTCCGGCGAAGAAGATGGGAGCTCATCATCGGTCGCCGTCGAGGAGAGCGACCCAGAAG
AAGCCTCGTTTTCTGAAGGGGAAGGAGACGTGAGCGAAGGAGGAGACTTCCAGGAGCCAC
CGGAAGAAGCGAAGCTCTTCGTCGGGAACTTGGCTTACGACGTTGATAGCCAGGCCTTGG
CTATGCTCTTTGAGCAAGCCGGTACTGTTGAAATCGCTGAGGTTATATACAATAGAGAAA
CCGACCAGAGTCGTGGGTTTGGATTTGTGACAATGAGTACAGTGGAAGAAGCTGAGACAG
CTGTTGAGAAGTTTAACCGTTATGATTTGAACGGAAGGCTTTTGACAGTAA

QA 3 593 3 593
DS 

RD RR2CF29TF 701 0 0
GGACCCT
CCCCTTCCTCTTCTTTCTCAACACTTCCTTCTTCCATCTCTCACAATGGCTTCTTCAATA
GTAACCTCAAGCTTGAGGCCATTAGCCATGTCAGAATCCTCCTCTTCAACCATTTTCTCC
CACCCCTCATTCTCCACTATCTACTCCTCCAAAACCCGCTGCTCCTTCCTCGCCAAACGC
ACTAACCTTTCCCTCTCTCTCAAATCCAAAACCCATCTAAAGAAGTCACCTTTCGTTACC
TTAGTCGCCGAGACTTCTGATTGGTCCGGCGAAGAAGATGGGAGCTCATCATCGGTCGCC
GTCGAGGAGAGCGACCCAGAAGAAGCCTCGTTTTCTGAAGGGGAAGGAGACGTGAGCGAA
GGAGGAGACTTCCAGGAGCCACCGGAAGAAGCGAAGCTCTTCGTCGGGAACTTGGCTTAC
GACGTTGATAGCCAAGCCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCCGGTACTGTTGAAATCGCT
GCTGTTATATACAATAGAGAAACCGACCAGAGTCGTGGGTTTGGATTTGTGACAATGAGT
ACAGTGGAAGAAGCTGAGACAGCTGTTGAGAAGTTTAACCGTTATGATTTGAACGGAAGG
CTTTTGACAGTAAACAAGGCAGCTCCCAAAGGATCACGTCCAGAGCGTCAACCTCGAGTA
TATGAACCTGCATTCAGAGTGTACGTTGGAAACC

QA 8 701 8 701
DS 

RD RR2EF14JQ 604 0 0
GAGGTTATATACAATAGAGAAACCGACCAGAGTCGTGGGTTTGGATTTGTGACAATGAGT
ACAGTGGAAGAAGCTGAGACAGCTGTTGAGAAGTTTAACCGTTATGATTTGAACGGAAGG
CTTTTGACAGTAAACAAGGCAACTCCCAAAGGATCACGTCCAGAGCGTCAACCTCGAGTA
TACGAACCTGCATTCAGAGTGTACGTTGGAAACCTACCGTGGGATGTGGACAGTGGTCGT
CTAGAACAAGTTTTCAGCGAGCATGGCAAAGTGGTGGAAGCTAAAGTGGTTTATGACCGT
GAGACAGGTCGTTCACGTGGATTTGGTTTTGTGACAATGTCTAATGAGACTGAACTCAAT
GATGCCGTCGCTGCTCTTGACGGACAGAACATGGAGGGTAGAGCGATCAGAGTGAATGTA
GCGGAGGAGCGTCCAAGGCGTGGATTTTAAGGGACTGAGAAGTTCTCTCCTGTGCCCTCT
CCGTCTCTTGCATTTTGTTTAGACGGGATTCATCACACTTTTGGTGATTTTCTTTCTTTT
TTCTTTTTGGTCAGAACTCTGAATGCGAAGCTTCTTCTAAAATTCTAATGTAATTTGTAT
CATC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 2 10

CO CL489Contig1 713 3 3 U
GTAATAAATTTGTAACTCTTATTTAATAAAAGTGAGTTTATCCAGCAAAAAAGAAAGAAA
CCTTATGATTGAATTAATTTTACATAAATTGGTTTTTTATACTTTTAGTTCTTAAATATT
ACGGACCGACTTGGTAATAAAAGGGTAAAATTCAAGCCTAAAAGTACAGCTCCTACCTAC
AACCCTCGCTCCTCGAAAATTATCCACGCAATGGTGAAAATGAAAGGTTTTATACCACAC
ACACTCCTTACAAGCTTTTTGCGATAAGTCTCTCGCACACTGCACCATTCCGTATACCAT
CTCACCCTTGTACCGCTTCTCCCCCACAGAGTACAATGTAGAATTATCTCCAGTGGTGGC
TAATTCCGTCAGATCGTCAACGAGAATATTCCAAACTTTTATAAATCCGAGGGGGACTCC
ATTGTCTACCACCTTCTTCGCGTTGGAAATACAAAAGTTATTGTCGTAATCGATCTGCCC
AATAGAATATTTGGAATCCATCGAGAGAAGACATTGGCCATACCATATTATTCTCCCCTT
GTACCACGGACATCTCCTACGAAGCGCAGCGAGGGCGGTGACAAAGCAGTCGTGGCACTT
GGGCCCGTAGGAGTCGCCGCGACACTGGAGGACAGCGGTAAAATTAGAATCGCCAAAAAA
GTCGTAACCTCTAATACTGTTTTTATAGAACATTTTCATGATATTTTTTGAAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW06JQ U 54
AF RR2H591TF C 1
AF RR2DB35JQ U 1
BS 1 517 RR2DB35JQ
BS 518 518 RR2H591TF
BS 519 713 RR2DB35JQ

RD RR2DW06JQ 140 0 0
GAAA
AAACCTTATGATTGAATTAATTTTACATAAATTGGTTTTTTATACTTTTAGTTCTTAAAT
ATTACGGACCGACTTGGTAATAAAAGGGTAAAATTCAAGCCTAAAAGTACAGCTCCTACC
TACAACCCTCG
CCCCT

QA 5 135 5 135
DS 

RD RR2H591TF 593 0 0
GT
AATAAATTTGTAACTTTTATTTAATAAAAGTGAGTTTATCCAGCAAAAAAGAAAGAAACC
TTATGATTGAATTAATTTTACATAAATTGGTTTTTTATACTTTTAGTTCTTAAATATTAC
GGACCGACTTGGTAATAAAAGGGTAAAATTCAAGCCTAAAAGTACAGCTCCTACCTACAA
CCCTCGCTCCTCGAAAATTATCCACGCAATGGTGAAAATGAAAGGTTTTATACCACACAC
ACTCCTTACAAGCTTTTTGCGATAAGTCTCTCGCACACTGCACCATTCCGTGTACCATCT
CACCCTTGTACCGCTTCTCCCCCACAGGGTACAATGTAGAATTATCTCCAGTGGTGGCTA
ATTCCGTCAGATCGTCAACGAGAATATTCCAAACTTTTATAAATCCGAGGGGGACTCCAT
TGTCTACCACCTTCTTCGCGTTGGAAATACAAAAGTTATTGTCGTAATCGATCTGCCCAA
TAGAATATTTGGAATCCATCGAGAGAAGACATTGGCCATACCATATTATTCTCCCCTTGT
ACCACGGACATCTCCTACGAAGCGCAGCGAGGGCGGTGACAAAGCAGTCG
C

QA 3 592 3 592
DS 

RD RR2DB35JQ 713 0 0
GTAATAAATTTGTAACTCTTATTTAATAAAAGTGAGTTTATCCAGCAAAAAAGAAAGAAA
CCTTATGATTGAATTAATTTTACATAAATTGGTTTTTTATACTTTTAGTTCTTAAATATT
ACGGACCGACTTGGTAATAAAAGGGTAAAATTCAAGCCTAAAAGTACAGCTCCTACCTAC
AACCCTCGCTCCTCGAAAATTATCCACGCAATGGTGAAAATGAAAGGTTTTATACCACAC
ACACTCCTTACAAGCTTTTTGCGATAAGTCTCTCGCACACTGCACCATTCCGTATACCAT
CTCACCCTTGTACCGCTTCTCCCCCACAGAGTACAATGTAGAATTATCTCCAGTGGTGGC
TAATTCCGTCAGATCGTCAACGAGAATATTCCAAACTTTTATAAATCCGAGGGGGACTCC
ATTGTCTACCACCTTCTTCGCGTTGGAAATACAAAAGTTATTGTCGTAATCGATCTGCCC
AATAGAATATTTGGAATCCATCGAGAGAAGACATTGGTCATACCATATTATTCTCCCCTT
GTACCACGGACATCTCCTACGAAGCGCAGCGAGGGCGGTGACAAAGCAGTCGTGGCACTT
GGGCCCGTAGGAGTCGCCGCGACACTGGAGGACAGCGGTAAAATTAGAATCGCCAAAAAA
GTCGTAACCTCTAATACTGTTTTTATAGAACATTTTCATGATATTTTTTGAAC

QA 1 713 1 713
DS 



CO CL489Contig2 1038 7 10 U
GGGGACCTTTTCAAACAAATTTCGTATTGGATAACCAAAAAAATAACCATATATCAATTC
AGTATCCAAATCCGTCTGAGGCTCGTCCATGAACATCAATCTCAACTAACCATCTATAGA
AAAGAACCTTTGACAAAAATAATTCAAGTAATGTACTCTTCATCGTCTGTATCAAAACAC
CTCATTTTGATCTATATCTTTGCCATACAACTACTCCTTATAAACAGCGAATTGTCCGTA
AACACGACCAATGAGTATCTCCGCCACACATGTTTGGTTAGTCAGGGAAAATACAAGACG
GGAAGTGAGTACGAGAAACGTTTAAAAAATATCATGAAAATGTTCAATAAAAACAGTATT
AAAGGTTACGACTTTTTTGGCGATTCTACTTTTACCGCTGTCCTCCAGTGCCGCGGCGAC
TCTTACGGGCCCAAGTGCCACGACTGCTTTGTCACCGCCCTCGCTGCGCTTCGTAAGAGA
TGTCCGTGGTACAAGGGGAGAATAATATGGTATGACCTATGTCTTCTGTCGATGGATTCC
AAATATTCTATTGGGCAGATCGATTACGACAATAACTTTTGTATTACCAACGCTAAGAAG
GTGGTAGACAACGGAGTCTCCCTCGCATTTATAAAAGTTTGGAATATTCTCGTTGACGAT
CTGACGGAATTAGCCACCAGTGGAGATAATTCTACATTGTACTCTGTGGGGG*AGAAGCG
GTACAAGGGTGATATGGTATATGGAATGGTGCAGTGTGCGAGAGACTTATCGCAAAAAGC
TTGTAAGGAGTGTGTGTGGTATAAAACCTTTCATTTTCACAATTGCGTGGATAATTTTCG
AGGAACGAGAGTTGTAGGTAGGAGCTGTACTTTTAGGCTTGAATTTTACCCTTTTATTAC
CAAGTCGGTCCGTAATATTTAAAAGAACTAAAAGTATTAAAAAATCAATTTATGTAAAAT
TAAGTCAATCATAAGGTTTCTTTTTTTTT***GCTGGATAAATTCACTTTTATTAAATAA
AAATTACAAATTTATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 15 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2F175TF U 1
AF RR2GE32TF U 87
AF RR2DB35TF U 105
AF RR2AI69TF U 87
AF RR2AI69JQ C 241
AF RR2F175JQ C 419
AF RR2GE32JQ C 421
BS 1 453 RR2F175TF
BS 454 454 RR2AI69TF
BS 455 613 RR2F175TF
BS 614 614 RR2AI69TF
BS 615 685 RR2F175TF
BS 686 853 RR2AI69TF
BS 854 989 RR2AI69JQ
BS 990 992 RR2F175JQ
BS 993 1036 RR2AI69JQ
BS 1037 1038 RR2F175JQ

RD RR2F175TF 685 0 0
GGGGACCTTTTCAAACAAATTTCGTATTGGATAACCAAAAAAATAACCATATATCAATTC
AGTATCCAAATCCGTCTGAGGCTCGTCCATGAACATCAATCTCAACTAACCATCTATAGA
AAAGAACCTTTGACAAAAATAATTCAAGTAATGTACTCTTCATCGTCTGTATCAAAACAC
CTCATTTTGATCTATATCTTTGCCATACAACTACTCCTTATAAACAGCGAATTGTCCGTA
AACACGACCAATGAGTATCTCCGCCACACATGTTTGGTTAGTCAGGGAAAATACAAGACG
GGAAGTGAGTACGAGAAACGTTTAAAAAATATCATGAAAATGTTCAATAAAAACAGTATT
AAAGGTTACGACTTTTTTGGCGATTCTACTTTTACCGCTGTCCTCCAGTGCCGCGGCGAC
TCTTACGGGCCCAAGTGCCACGACTGCTTTGTCTCCGCCCTCGCTGCGCTTCGTAAGAGA
TGTCCGTGGTACAAGGGGAGAATAATATGGTATGACCTATGTCTTCTGTCGATGGATTCC
AAATATTCTATTGGGCAGATCGATTACGACAATAACTTTTGTATTACCAACGCTAAGAAG
GTGGTAGACAACGTAGTCTCCCTCGCATTTATAAAAGTTTGGAATATTCTCGTTGACGAT
CTGACGGAATTAGCCACCAGTGGAG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2GE32TF 576 0 0
GGATGA
ACATCAATCTCAACTAACCATCTATAGAAAAGAATCTTTGACAAAAATAATTCAAGTAAT
GTACTCTTCATCGTCTGTATCAAAACACCTCATTTTGATCTATATCTTTGCCATACAACT
ACTCCTTATAAACGGCGAATTGTCCGTAAACACGACCAATGAGTATCTCCGCCACACATG
TTTGGTTAGTCAGGGAAAATACAAGACGGGAAGTGAGTACGAGAAACGTTTAAAAAATAT
CATGAAAATGTTCAATAAAAACAGTATTAAAGGTTACGACTTTTTTGGCGATTCTACTTT
TACCGCTGTCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCTTACGGGCTCAAGTGCCACGACTGCTTTGT
CACCGCCCTCGCTGCGCTTCGTAAGAGATGTCCGTGGTACAAGGGGAGAATAATATGGTA
TGACCTATGTCTTCTGTCGATGGATTCCAAATATTCTATTGGGCAGATCGATTACGACAA
TAACTTTTGTATTACCAACGCTAAGAAGGTGGTAGACAACGGAGTCTCCCTCGCATTTAT
AAAAGTTTGGAATATTCTCGTTGACGATCT

QA 7 576 7 576
DS 

RD RR2DB35TF 739 0 0
AT
TAACCATCTATAGAAAAGAACTTTTGACAAAAATTATTCAAGTAATGTACTCTTCATCGT
CTGTATCAAAACACCTCATTTTGATCTATATCTTTGCCATACAACTACTCCTTATAAACA
GCGAATTGTCCGTAAACACGACCAATGAGTATCTCAGCCACACATGTTTGGTTAGTCAGG
GAAAATACAAGACGGGAAGTGAGTACGAGAAACGTTCAAAAAATATCATGAAAATGTTCT
ATAAAAACAGTATTAGAGGTTACGACTTTTTTGGCGATTCTAATTTTACCGCTGTCCTCC
AGTGTCGCGGCGACTCCTACGGGCCCAAGTGCCACGACTGCTTTGTCACCGCCCTCGCTG
CGCTTCGTAGGAGATGTCCGTGGTACAAGGGGAGAATAATATGGTATGACCAATGTCTTC
TCTCGATGGATTCCAAATATTCTATTGGGCAGATCGATTACGACAATAACTTTTGTATTT
CCAACGCGAAGAAGGTGGTAGACAATGGAGTCCCCCTCGGATTTATAAAAGTTTGGAATA
TTCTCGTTGACGATCTGACGGAATTAGCCACCACTGGAGATAATTCTACATTGTACTCTG
TGGGGGGAGAAGCGGTACAAGGGTGAGATGGTATACGGAATGGTGCAGTGTGCGAGAGAC
TTATCGCAAAA*GCTTGTAAG*AGTGTGTGTGGTATAAA*CCTTTCATTT*CACA*TTGC
GTGGATAATTT
CGAGGA

QA 3 733 3 733
DS 

RD RR2AI69TF 767 0 0
GGATGA
ACATCAATCTCAACTAACCATCTATAGAAAAGAACCTTTGACAAAAATAATTCAAGTAAT
GTACTCTTCATCGTCTGTATCAAAACACCTCATTTTGATCTATATCTTTGCCATACAACT
ACTCCTTATAAACAGCGAATTGTCCGTAAACACGACCAATGAGTATCTCCTCCACACATG
TTTGGTTAGTCAGGGAAAATACAAGACGGGAAGTGAGTACGAGAAACGTTTAAAAAATAT
CATGAAAATGTTCAATAAAAACAGTATTAAAGGTTACGACTTTTTTGGCGATTCTACTTT
TACCGCTGTCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCTTACGGGCCCAAGTGCCACGACTGCTTTGT
CACCGCCCTCGCGGCGCTTCGTAAGAGATGTCCGTGGTACAAGGGGAGAATAATATGGTA
TGACCTATGTCTTCTGTCGATGGATTCCAAATATTCTATTGGGCAGATCGATTACGACAA
TAACTTTTGTATTACCAACGCTAAGAAGGTGGTAGACAACGGAGTCTCCCTCGCATTTAT
AAAAGTTTGGAATATTCTCGTTGACGATCTGACGGAATTAGCCACCAGTGGAGATAATTC
TACATTGTACTCTGTGGGGG*AGAAGCGGTACAAGGGTGATATGGTATATGGAATGGTGC
AGTGTGCGAGAGACTTATCGCAAAAAGCTTGTAAGGAGTGTGTGTGGTATAAAACCTTTC
ATTTTCACAATTGCGTGGATAATTTTCGAGGAACGAGAGTT

QA 7 767 7 767
DS 

RD RR2AI69JQ 796 0 0
AACACGACCAATGAGTATCTCCTCCACACATGTTTGGTTAGTCAGGGAAAATACAAGACG
GGAAGTGAGTACGAGAAACGTTTAAAAAATATCATGAAAATGTTCAATAAAAACAGTATT
AAAGGTTACGACTTTTTTGGCGATTCTACTTTTACCGCTGTCCTCCAGTGCCGCGGCGAC
TCTTACGGGCCCAAGTGCCACGACTGCTTTGTCACCGCCCTCGCGGCGCTTCGTAAGAGA
TGTCCGTGGTACAAGGGGAGAATAATATGGTATGACCTATGTCTTCTGTCGATGGATTCC
AAATATTCTATTGGGCAGATCGATTACGACAATAACTTTTGTATTACCAACGCTAAGAAG
GTGGTAGACAACGGAGTCTCCCTCGCATTTATAAAAGTTTGGAATATTCTCGTTGACGAT
CTGACGGAATTAGCCACCAGTGGAGATAATTCTACATTGTACTCTGTGGGGG*AGAAGCG
GTACAAGGGTGATATGGTATATGGAATGGTGCAGTGTGCGAGAGACTTATCGCAAAAAGC
TTGTAAGGAGTGTGTGTGGTATAAAACCTTTCATTTTCACAATTGCGTGGATAATTTTCG
AGGAACGAGAGTTGTAGGTAGGAGCTGTACTTTTAGGCTTGAATTTTACCCTTTTATTAC
CAAGTCGGTCCGTAATATTTAAAAGAACTAAAAGTATTAAAAAATCAATTTATGTAAAAT
TAAGTCAATCATAAGGTTTCTTTTTTTTTTTTGCTGGATAAATTCACTTTTATTAAATAA
AAATTACAAATTTATT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2F175JQ 620 0 0
AT
TCTTACGGGCCCAAGTGCCACGACTGCTTTGTCTCCGCCCTCGCTGCGCTTCGTAAGAGA
TGTCCGTGGTACAAGGGGAGAATAATATGGTATGACCTATGTCTTCTGTCGATGGATTCC
AAATATTCTATTGGGCAGATCGATTACGACAATAACTTTTGTATTACCAACGCTAAGAAG
GTGGTAGACAACGTAGTCTCCCTCGCATTTATAAAAGTTTGGAATATTCTCGTTGACGAT
CTGACGGAATTAGCCACCAGTGGAGATAATTTTACATTGTACTCTGTGGGGG*AGAAGCG
GTACAAGGGTGATATGGTATATGGAATGGTGCAGTGTGCGAGAGACTTATCGCAAAAAGC
TTGTAAGGAGTGTGTGTGGTATAAAACCTTTCATTTTCACAATTGCGTGGATAATTTTCG
AGGAACGAGAGTTGTAGGTAGGAGCTGTACTTTTAGGCTTGAATTTTACCCTTTTATTAC
CAAGTCGGTCCGTAATATTTAAAAGAACTAAAAGTATTAAAAAATCAATTTATGTAAAAT
TAAGTCAATCATAAGGTTTCTTTTTTTTT***GCTGGATAGATTCACTTTTATTAAATAA
AAATGACAAATTTATTGC

QA 3 620 3 620
DS 

RD RR2GE32JQ 618 0 0
TCTTACGGGCTCAAGTGCCACGACTGCTTTGTCACCGCCCTCGCTGCGCTTCGTAAGAGA
TGTCCGTGGTACAAGGGGAGAATAATATGGTATGACCTATGTCTTCTGTCGATGGATTCC
AAATATTCTATTGGGCAGATCGATTACGACAATAACTTTTGTATTACCAACGCTAAGAAG
GTGGTAGACAACGGAGTCTCCCTCGCATTTATAAAAGTTTGGAATATTCTCGTTGACGAT
CTGACGGAATTAGCCACCAGTGGAGATAATTTTACATTGTACTCTGTGGGGG*AGAAGCG
GTACAAGGGTGATTTGGTATATGGAATGGTGCAGTGTGCGAGAGACTTATCGCAAAAAGC
TTGTAAGGAGTGTGTGTGGTATAAAACCTTTCATTTTCACAATTGCGTGGATAATTTTCG
AGGAACGAGAGTTGTAGGTAGGAGCTGTACTTTTAGGCTTGAATTTTACCCTTTTATTAC
CAAGTCGGTCCGTAATATTTAAAAGAACTAAAAGTATTAAAAAATCAATTTATGTAAAAT
TAAGTCAATCATAAGGTTTCTTTTTTTT****GCTGGATAAATTCACTTTTATTAAATAA
AAATTACAAATTTATT
AC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 10

CO CL490Contig1 904 10 13 U
GGACATGCATAACACACACAAAATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAAGGAATGACTGCTCT
AGTAACTGGTGGAGGCAGAGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAGGAGTTGGCTGGTTTTGG
AGCTAAAATCCATGTATGTGACATATCCGAGACTTTGCTCAATCAAAGTTTAAGCGAATG
GGAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGATGTAACTTCTCGACCCGAGAG
AGAAACTTTGATGCAAACTGTCTCCTCTCTGTTCAATGGCAAGCTCAATATTTTCGTGAA
CAATGTGGGTGGACTTCGTTCAAAGCCAACGACAGAATATGATGCAGACGATTTTGATTT
CCATATCAAAACAAACTTGGAAGCTGCTTTCCATTTTTGCCAGCTTTCACATCCTCTGCT
AAAGGCTTCAGGCTATGGAAGCATCGTCTTCATTTCGTCTGTTGCTGGGATTGTATTCTT
TGAATCTGGATCTATTTATGGTCTAGCCAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAAAAATTT
GGCATGTGAATGGGCAAAAGATGGTATAAGAGCAAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAA
GACTTCAATGGCTCAACCATATCTTGATGACGTCACTTTCAAGGAGGGATTTTTGGGTAG
AACTCCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCAATGGTGGTCTTCTTGTG
TCTACCTGCAGCGTCTTATATAACTGGTCAAACAATTTGCGTTGATGGAGGCCTCACCGT
TAACGGTCTCTCCTATCAACCACATGGTTGAGAATGGCCTTCTCGCGTTTTATTTACTTC
AACTGTCTTTGAACTCTTAAAATCTGCTCTCTAATAAAAAAATGTCACACTGTGAGTTCA
TAAG


BQ
10 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 
50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 

AF RR2DW44TF U 2
AF RR2AT37TF U 1
AF RR2CW73TF U 1
AF RR2EN46TF U 1
AF RR2BP51TF U 3
AF RR2D680TF U 3
AF RR2CW73JQ C 119
AF RR2EI80JQ C 271
AF RR2AT37JQ C 48
AF RR2D680JQ C 122
BS 1 45 RR2AT37TF
BS 46 46 RR2CW73TF
BS 47 131 RR2AT37TF
BS 132 132 RR2CW73TF
BS 133 292 RR2AT37TF
BS 293 293 RR2CW73TF
BS 294 688 RR2AT37TF
BS 689 734 RR2CW73TF
BS 735 742 RR2EN46TF
BS 743 751 RR2D680TF
BS 752 886 RR2AT37JQ
BS 887 887 RR2D680JQ
BS 888 904 RR2AT37JQ

RD RR2DW44TF 287 0 0
GACATGCATAACACACACAAAATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAAGGAATGACTGCTCTA
GTAACTGGTGGAGGCAGAGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAGGAGTTGGCTGGTTTTGGA
GCTAAAATCCATGTATGTGACATATCCGAGACTTTGCTCAATCAAAGTTTAAGCGAATGG
GAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGATGTAACTTCTCGACCCGAGAGA
GAAACTTTGATGCAAACTGTCTCCTCTCTGTTCAATGGCAAGCTCAA

QA 1 287 1 287
DS 

RD RR2AT37TF 688 0 0
GGACATGCATAACACACACAAAATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAGGGAATGACTGCTCT
AGTAACTGGTGGAGGCAGAGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAGGAGTTGGCTGGTTTTGG
AGCTAAAATCCGTGTATGTGACATATCCGAGACTTTGCTCAATCAAAGTTTAAGCGAATG
GGAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGATGTAACTTCTCGACCCGAGAG
AGAAACTTTGATGCAAACTGTCTCCTCTCTGTTCAATGGCAAGCTCAATATTCTCGTGAA
CAATGTGGGTGGACTTCGTTCAAAGCCAACGACAGAATATGATGCAGACGATTTTGATTT
CCATATCAAAACAAACTTGGAAGCTGCTTTCCATTTTTGCCAGCTTTCACATCCTCTGCT
AAAGGCTTCAGGCTATGGAAGCATCGTCTTCATTTCGTCTGTTGCTGGGATTGTATTCTT
TGAATCTGGATCTATTTATGGTCTAGCCAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAAAAATTT
GGCATGTGAATGGGCAAAAGATGGTATAAGAGCAAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAA
GACTTCAATGGCTCAACCATATCTTGATGACGTCACTTTCAAGGAGGGATTTTTGGGTAG
AACTCCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2CW73TF 734 0 0
G
GACATGCATAACACACACAAAATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAAGGAATGACTGCTCTA
GTAACTGGTGGAGGCAGAGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAGGAGTTGGCTGGTTTTGGA
GCTAAAATCCATGTATGTGACATATCCGAGACTTTGCTCAATCAAAGTTTAAACGAATGG
GAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGATGTAACTTCTCGACCCGAGAGA
GAAACTTTGATGCAAACTGTCTCCTCCCTGTTCAATGGCAAGCTCAATATTTTCGTGAAC
AATGTGGGCGGACTTCGTTCAAAGCCAACGACAGAATATGATGCAGACGATTTTGATTTC
CATATCAAAACAAACTTGGAAGCTGCTTTCCATTTTTGCCAGCTTTCACATCCTCTGCTA
AAGGCTTCAGGCTATGGAAGCATCGTCTTCATTTCGTCTGTTGCTGGGATTGTATTCTTT
GAATCTGGATCAATTTATGGTCTAGCCAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAAAAATTTG
GCATGTGAATGGGCAAAAGATGGTATAAGAGCCAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAG
ATTTCAATGGCTCAACCATATCTTGATGACGTCACTTTCAAG*AGGGATTTTTGGGTAGA
ACTCCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCAATGGTGGTCTTCTTGTGT
CTACCTGCAGCGT

QA 2 734 2 734
DS 

RD RR2EN46TF 745 0 0
G
GACATGCATAACACACACAAAATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAAGGAATGACTGCTCTA
GTAACTGGTGGAGGCAGAGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAGGAGTTGGCTGGTTTTGGA
GCTAAAATCCATGTATGTGACATATCCGAGACTTTGCTCAATCAAAGTTTAAGCGAATGG
GAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCGGTCTGTGATGTAACTTCTCGACCCGAGAGA
GAAACTTTGATGCAAACTGTCTCCTCCCTGTTCAATGGCAAGCTCAATATTTTCGTGAAC
AATGTGGGCGGACTTCGTTCAAAGCCAACGACAGAATATGATGCAGACGATTTTGATTTC
CATATCAAAACAAACTTGGAAGCTGCTTTCCATTTTTGCCAGCTTTCACATCCTCTGCTA
AAGGCTTCAGGCTATGGAAGCATCGTCTTCATTTCGTCTGCTGCTGGGATTGTATTCTTT
GAATCTGGATCAATTTATGGTCTAGCCAAAGGAGCT**GAATCAGCTAGCAAAAAATTTG
GCATGTGAATGGGCAAAAGATGGTATAAGAGCCAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAG
ACTTCAATGGCTCAACCATATCTTGATGACGTCACTTTCAAGGAGGGATTTTTGGGTAGA
ACTCCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCAATGGTGGTCTTCT*GTGT
CTACCTGCAGCGTCTTATATA
CTG

QA 2 742 2 742
DS 

RD RR2BP51TF 740 0 0
GG
ATGCATAACACACACAAAATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAAGGAATGACTGCTCTAGTA
ACTGGTGGAGGCAGAGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAGGAGTTGGCTGGTTTTGGAGCT
AAAATCCATGTATGTGACATATCCGAGACTTTGCTCAATCAAAGTTTAAGCGAATGGGAA
AAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGATGTAACTTCTCGACCCGAGAGAGAA
ACTTTGATGCAAACTGTCTCCTCTCTGTTCAATGGCAAGCTCAGTATTTTCGTGAACAAT
GTGGGTGGACTTCGTTCAAAGCCAACGACAGAATATGATGCAGACGATTTTGATTTCCAT
ATCAAAACAAACTTGGAAGCTGCTTTCCATTTTTGCCAGCTTTCACATCCTCTGCTAAAG
GCTTCAGGCTATGGAAGCATCGTCTTCATTTCGTCTGTTGCTGGGATTGTATTCTTTGAA
TCTGGATCTATTTATGGTCTAGCCAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAAAAATTTGGCA
TGTGAATGAGCAAAAGATGGTATAAGAGCAAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAGACT
TCAATGGCTCAACCATATCTTGATGACGTCACTTTCAAG*AGGGATTTTTGGGTAGAACT
CCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGT*GCATCAATGGTGGTCTTCTTGTGTCTA
CCTGCAGCGTCTTATATA

QA 3 740 3 740
DS 

RD RR2D680TF 752 0 0
GG
ATGCATAACACACACAAAATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAAGGAATGACTGCTCTAGTA
ACTGGTGGAGGCAGAGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAGGAGTTGGCTGGTTTTGGAGCT
AAAATCCATGTATGTGACATATCCAAGACTTTGCTCAATCAAAGTTTAAGCGAATGGGAA
AAGAAATGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGACGTAACTTCTCGACCCGAGAGAGAA
ACTTTGATGCAAACTGTCTCCTCTCTGTTCAATGGCAAGCTCAATATTTTCGTGAACAAT
GTGGGTGGACTTCGTTCAAAGCCAACGACAGAATATGATGCAGACGATTTTGATTTCCAC
ATCAAAACAAACTTGGAAGCTGCTTTCCATTTTTGCCAGCTTTCACATCCTCTGCTAAAG
GCTTCAGGCTATGGAAGCATCGTCTTCATTTCGTCTGTTGCTGGGATTGTATTCTTTGAA
TCTGGATCTATTTATGGTCTAGCCAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAAAAATTTGGCA
TGTGAATGGGCAAAAGATGGTATAAGAGCAAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAGACT
TCAATGGCTCAACCATATCTTGATGACGTCACTTTCAAG*AGGGATTTTTGGGTAGA*CT
CCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCAATGGTGGTCTTCTTGTGTCTA
CCTGCAGCGTCTTATATAACTGGTCAA
CAT

QA 3 749 3 749
DS 

RD RR2CW73JQ 764 0 0
GGAGCTAAAATCCATGTATGTGACATATCCGAGACTTTGCTCAATCAAAGTTTAAACGAA
TGGGAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGATGTAACTTCTCGACCCGAG
AGAGAAACTTTGATGCAAACTGTCTCCTCCCTGTTCAATGGCAAGCTCAATATTTTCGTG
AACAATGTGGGCGGACTTCGTTCAAAGCCAACGACAGAATATGATGCAGACGATTTTGAT
TTCCATATCAAAACAAACTTGGAAGCTGCTTTCCATTTTTGCCAGCTTTCACATCCTCTG
CTAAAGGCTTCAGGCTATGGAAGCATCGTCTTCATTTCGTCTGTTGCTGGGATTGTATTC
TTTGAATCTGGATCAATTTATGGTCTAGCCAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAAAAAT
TTGGCATGTGAATGGGCAAAAGATGGTATAAGAGCCAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATC
AAGATTTCAATGGCTCAACCATATCTTGATGACGTCACTTTCAAGGAGGGATTTTTGGGT
AGAACTCCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCAATGGTGGTCTTCTTG
TGTCTACCTGCAGCGTCTTATATAACTGGTCAAACAATTTGCGTTGATGGAGGCCTCACC
GTTAACGGTCTCTCCTATCATCCACATGGTTGAGAATGGCCTTCTCGCGTTTTATTTACT
TCAACTGTCTTTGAACTCTTAAAATCTGCTCTCTAATAAAAAAA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2EI80JQ 590 0 0
GTTCAATGGCAAGCTCAATATTTTCGTGAACAATGTGGGCGGACTTCGTTCAAAGCCAAC
GACAGAATATGATGCAGACGATTTTGATTTCCATATCAAAACAAACTTGGAAGCTGCTTT
CCATTTTTGCCAGCTTTCACATCCTCTGCTAAAGGCTTCAGGCTATGGAAGCATCGTCTT
CATTTCGTCTGTTGCTGGGATTGTATTCTTTGAATCTGGATCAATTTATGGTCTAGCCAA
AGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAAAAATTTGGCATGTGAATGGGCAAAAGATGGTATAAG
AGCCAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAGACTTCAATGGCTCAACCATATCTTGATGA
CGTCACTTTCAAGGAGGGATTTTTGGGTAGAACTCCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAA
TGAAGTTGCATCAATGGTGGTCTTCTTGTGTCTACCTGCAGCGTCTTATATAACTGGTCA
AACAATTTGCGTTGATGGAGGCCTCACCGTTAACGGTCTCTCCTATCATCCACATGGTTG
AGAATGGCCTTCTCGCGTTTTATTTACTTCAACTGTCTTTGAACTCTTAA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2AT37JQ 857 0 0
GAATGACTGCTCTAGTAACTGGTGGAGGCAGAGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAGGAGT
TGGCTGGTTTTGGAGCTAAAATCCGTGTATGTGACATATCCGAGACTTTGCTCAATCAAA
GTTTAAGCGAATGGGAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGATGTAACTT
CTCGACCCGAGAGAGAAACTTTGATGCAAACTGTCTCCTCTCTGTTCAATGGCAAGCTCA
ATATTCTCGTGAACAATGTGGGTGGACTTCGTTCAAAGCCAACGACAGAATATGATGCAG
ACGATTTTGATTTCCATATCAAAACAAACTTGGAAGCTGCTTTCCATTTTTGCCAGCTTT
CACATCCTCTGCTAAAGGCTTCAGGCTATGGAAGCATCGTCTTCATTTCGTCTGTTGCTG
GGATTGTATTCTTTGAATCTGGATCTATTTATGGTCTAGCCAAAGGAGCTCTGAATCAGC
TAGCAAAAAATTTGGCATGTGAATGGGCAAAAGATGGTATAAGAGCAAACGCTGTTGCTC
CTAATGTTATCAAGACTTCAATGGCTCAACCATATCTTGATGACGTCACTTTCAAGGAGG
GATTTTTGGGTAGAACTCCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGGAGTTGCATCAATGG
TGGTCTTCTTGTGTCTACCTGCAGCGTCTTATATAACTGGTCAAACAATTTGCGTTGATG
GAGGCCTCACCGTTAACGGTCTCTCCTATCAACCACATGGTTGAGAATGGCCTTCTCGCG
TTTTATTTACTTCAACTGTCTTTGAACTCTTAAAATCTGCTCTCTAATAAAAAAATGTCG
CACTGTGAGTTCATAAG

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR2D680JQ 782 0 0
GCTAAAATCCATGTATGTGACATATCCAAGACTTTGCTCAATCAAAGTTTAAGCGAATGG
GAAAAGAAATGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTCTGTGACGTAACTTCTCGACCCGAGAGA
GAAACTTTGATGCAAACTGTCTCCTCTCTGTTCAATGGCAAGCTCAATATTTTCGTGAAC
AATGTGGGTGGACTTCGTTCAAAGCCAACGACAGAATATGATGCAGACGATTTTGATTTC
CACATCAAAACAAACTTGGAAGCTGCTTTCCATTTTTGCCAGCTTTCACATCCTCTGCTA
AAGGCTTCAGGCTATGGAAGCATCGTCTTCATTTCGTCTGTTGCTGGGATTGTATTCTTT
GAATCTGGATCTATTTATGGTCTAGCCAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAAAAATTTG
GCATGTGAATGGGCAAAAGATGGTATAAGAGCAAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAG
ACTTCAATGGCTCAACCATATCTTGATGACGTCACTTTCAAGGAGGGATTTTTGGGTAGA
ACTCCACTTGGTCGTGCTGGAGAGCCAAATGAAGTTGCATCAATGGTGGTCTTCTTGTGT
CTACCTGCAGCGTCTTATATAACTGGTCAAACAATTTGCGTTGATGGAGGCCTCACCGTT
AACGGTCTCTCCTATCAACCACATGGTTGAGAATGGCCTTCTCGCGTTTTATTTACTTCA
ACTGTCTTTGAACTCTTAAAATCTGCTCTCTAATAAAAAAATGTCACACTGTGAGTTCAT
A
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 2 9

CO CL491Contig1 1075 5 23 U
CACACTAAAGCTTGCATTGATTTATAACAAAGGAGGAATACATTTTTTGAGAGCCTAAGC
CGACGAGTATGCAATACTCCCGGAGTCTAAAGCCAACAAGAAAACACAGTTCTTCTGGAG
ACAAACAACAAAAACACAGATGATACCCTGAAACCTAAGGCATTACACAAGACATAAACT
TGAGAAACTAAAAACAGAGTCTAAATCAATTCACAAAACACCCAAGCAAATGATACCAAC
GCATGGAGGAGGTTGTGGAGGAGACATGCATCAAAGGCTGAACTTTATTAAGGGAGCCAT
GGAGATCAACCTCAATCTATTGTTCCGGAATCAAACCAGGAACCACGAGATGACACCAAA
GAAGCAATCCCAAAGGGTGAAGAGACGAACCGTAACTCATTCAACCCCACGCCAAGATGC
AAATATATGAGCCGAAGCCCCTTTGCCTTAGGATCAAGCCGGAGAATCCACGCGAACCGA
GAACAGATAGGAGCTATTCCGTCGCTACGAACCCAAGGCAAAGCGTACCTCCAAAACACG
TCGGTACCACTACCAGAAGCAAACTAGGAGGCGCACATACAGGTCGAAGGCTAAGGACCC
TCGGAGAGGAACCTTTGAAGTTGGAGCACCGACAACTCAGAAGCCCACAACTTCAAGAAG
GAGAATGATAGATCGAAACCCATCAACGCCTTCATCTAGCCTTCAGATCTGACAAACAGG
ATTTAGATCTGTTCCCGAGAGTTTATCAAGTTTGTCCAAAAGACATGTAAGCCAGGAACG
CCGACTCCTCCACTCACCACCGAACCAAACCACCGCGTCTTAACTCCAGGGGAGGTCGAA
GTACCGTCAGCAAGATGAGGCTGAGGAAGCTCGCCGGACCAGAGCTCAGAACAAGACGGT
GGCAGAACTAAGACGAGGGAGTAGCAAAGACTAACTAGAAGACAGGGGGGAACCTCCGGC
GCCGACACGCGCTTCCACGCGCTTCCGGACACCGGGGGAGACTCAGATCTCATTTCTCTC
TTTTTTCTCTCTCGAACAGTGTTTCTCTCCTGTTTTTTACGACTTTGGGTCTTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2A757JQ U 1
AF RR2EN50JQ U 1
AF RR2AR34JQ U 1
AF RR2F281TF C 291
AF RR2EN50TF C 435
BS 1 70 RR2A757JQ
BS 71 72 RR2AR34JQ
BS 73 95 RR2A757JQ
BS 96 96 RR2AR34JQ
BS 97 140 RR2A757JQ
BS 141 142 RR2AR34JQ
BS 143 230 RR2A757JQ
BS 231 231 RR2AR34JQ
BS 232 266 RR2A757JQ
BS 267 267 RR2AR34JQ
BS 268 449 RR2A757JQ
BS 450 450 RR2AR34JQ
BS 451 577 RR2A757JQ
BS 578 578 RR2AR34JQ
BS 579 602 RR2A757JQ
BS 603 603 RR2AR34JQ
BS 604 611 RR2A757JQ
BS 612 612 RR2AR34JQ
BS 613 647 RR2A757JQ
BS 648 850 RR2AR34JQ
BS 851 879 RR2F281TF
BS 880 880 RR2EN50TF
BS 881 1075 RR2F281TF

RD RR2A757JQ 647 0 0
CACACTAAAGCTTGCATTGATTTATAACAAAGGAGGAATACATTTTTTGAGAGCCTAAGC
CGACGAGTATAAAATACTCCCGGAGTCTAAAGCCAGCAAGAAAACACAGTTCTTCTGGAG
ACAAACAACAAAAACACAGAAAATACCCTGAAACCTAAGGCATTACACAAGACATAAACT
TGAGAAACTAAAAACAGAGTCTAAATCAATTCACAAAACACCCAAGCAAAAGATACCAAC
GCATGGAGGAGGTTGTGGAGGAGACAGGCATCAAAGGCTGAACTTTATTAAGGGAGCCAT
GGAGATCAACCTCAATCTATTGTTCCGGAATCAAACCAGGAACCACGAGATGACACCAAA
GAAGCAATCCCAAAGGGTGAAGAGACGAACCGTAACTCATTCAACCCCACGCCAAGATGC
AAATATATGAGCCGAAGCCCCTTTGCCTTGGGATCAAGCCGGAGAATCCACGCGAACCGA
GAACAGATAGGAGCTATTCCGTCGCTACGAACCCAAGGCAAAGCGTACCTCCAAAACACG
TCGGTACCACTACCAGAAGCAAACTAGGAGGCGCACACACAGGTCGAAGGCTAAGGACCC
TCAGAGAGGAATCTTTGAAGTTGGAGCACCGACAACTCAGAAGCCCA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2EN50JQ 754 0 0
CA
CACTAAAGCTTGCATTGATTTGTAACAAAGGAGGAATACATTTTTTGAGAGCCTAAGCCG
ACGAGTATGCAATACTCCCGGAGTCTAAAGCCAACAAGAAAACACAGTTCTTCTGGAGAC
AAACAACAAAAACACAGATGATACCCTGAAACCTAAGGCATTACACAAGACATAAACTTG
AGAAACTAAAAACAGAGTCTAAATCAATTCACAAAACACCCAAGCAAATGATACCAACGC
ATGGAGGAGGTTGTGGAGGAGACATGCATCAAAGGCTGAACTTTATTAAGGGAGCCATGG
AGATCAACCTCAATCTATTGTTCCGGAATCAAACCAGGAACCACGAGATGACACCAAAGA
AGCAATCCCAAAGGGTGAAGAGACGAACCGTAACTCATTCAACCCCACGCCAAGATGCAA
ATATATGAGCCGAAGCCCCTTTGCCTTAGGATCAAGCCGGAGAATCCACGCGAACCGAGA
ACAGATAGGAACTATTCCGTCGCTACGAACCCAAGGCAAAGCGTACCTCCAAAACACGTC
GGTACCACTACCAGAAGCAAACTAGGAGGCGCACATACAGGTCGAAGGCTAAGGACCCTC
GGAGAGGAACCTTTGAAGTTGGAGCACCGACAACTCAGAAGCCCACAACTTCAAGAAGGA
GAATGATAGATCGAAACCCATCAACGCCTTCATCTAGCCTTCAGATCTGACAAACAGGAT
TTAGATCTGTTCCCGAGAGTTTATCAAGTTTG

QA 3 754 3 754
DS 

RD RR2AR34JQ 850 0 0
CG
CACTAAAGCTTGCATTGATTTATAACAAAGGAGGAATACATTTTTTGAGAGCCTAAGCCG
ACGAGTATGCAATACTCCAGGAGTCTAAAGCCAACAAGAAAACACAGTTCTTCTGGAGAC
AAACAACAAAAACACAGATGATACCCTGAAACCTAAGGCATTACACAAGACATAAACTTG
AGGAACTAAAAACAGAGTCTAAATCAATTCACAAAACACCCAAGCAAATGATACCAACGC
ATGGAGGAGGTTGTGGAGGAGACATGCATCAAAGGCTGAACTTTATTAAGGGAGTCATGG
AGATCAACCTCAATCTATTGTTCCGGAATCAAACCAGGAACCACGAGATGACACCAAAGA
AGCAATCCCAAAGGGTGAAGAGACGAACCGTAACTCATTCAACCCCACGCCAAGATGCAA
ATATATGAGCCGAAGCCCCTTTGCCTTAGGATCAAGCCGGAGAATCCACGCGAACCGAGA
ACAGATAGGAGCTATTCCGTCGCTACGAACCCAAGGCAAAGCGTACCTCCAAAACACGTC
GGTACCACTACCAGAAGCAAACTAGGAGGCGCACATACAGGTCGAAGGCTAAGGACCCTC
GGAGAGGAACCTTTGAAGTTGGAGCACCGACAACTCAGAAGCCCACAACTTCAAGAAGGA
GAATGATAGATCGAAACCCATCAACGCCTTCATCTAGCCTTCAGATCTGACAAACAGGAT
TTAGATCTGTTCCCGAGAGTTTATCAAGTTTGTCCAAAAGACATGTAAGCCAGGAACGCC
GACTCCTCCACTCACCACCGAACCAAACCACCGCGTCTTAACTCCAGGGGAGGTCGAAGT
ACCGTCAG

QA 3 850 3 850
DS 

RD RR2F281TF 785 0 0
AGGGAGCCATGGAGATCAACCTCAATCTATTGTTC*GGAATCAAACCAGGAACCACGAGA
TGACACCAAAGAAGCAATCCCAAAGGGTGAAGAGACGAACCGTAACTCATTCAACCCCAC
GCCAAGATGCAAATATATGAGCCGAAGCCCCTTTGCCTTAGGATCAAGCCGGAGAATCCA
CGCGAACCGAGAACAGATAGGAGCTATTCCGTCGCTACGAACCCAAGGCAAAGCGTACCT
CCAAAACACGTCGGTACCACTACCAGAAGCAAACTAGGAGGCGCACATACAGGTCGAAGG
CTAAGGACCCTCGGAGAGGAACCTTTGAAGTTGGAGCACCGACAACTCAGAAGCCCACAA
CTTCAAGAAGGAGAATGATAGATCGAAACCCATCAACGCCTTCATCTAGCCTTCAGATCT
GACAAACAGGATTTAGATCTGTTCCCGAGAGTTTATCAAGTTTGTCCAAAAGACATGTAA
GCCAGGAACGCCGACTCCTCCACTCACCACCGAACCAAACCACCGCGTCTTAACTCCAGG
GGAGGTCGAAGTACCGTCAGCAAGATGAGGCTGAGGAAGCTCGCCGGAC*AGAGCTCAGA
ACAAGACGGTGGCAGAACTAAGACGAGGGAGTAGCAAAGACTAACTAGAAGACAGGGGGG
AACCTCCGGCGCCGACACGCGCTTCCACGCGCTTCCGGACACCGGGGGAGACTCAGATCT
CATTTCTCTCTTTTTTCTCTCTCGAACAGTGTTTCTCTCCTGTTTTTTACGACTTTGGGT
CTTCC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2EN50TF 638 0 0
AAGCCCCTTTGCTTTAGGATCAAGCCGGAGAATCCACGCGAACCGAGAACAGATAGGAAC
TATTCCGTCGCTACGAACCCAAGGCAAAGCGTACCTCCAAAACACGTCGGTACCACTACC
AGAAGCAAACTAGGAGGCGCACATACAGGTCGAAGGCTAAGGACCCTCGGAGAGGAACCT
TTGAAGTTGGAGCACCGACAACTCAGAAGCCCACAACTTCAAGAAGGAGAATGATAGATC
GAAACCCATCAACGCCTTCATCTAGCCTTCAGATCTGACAAACAGGATTTAGATCTGTTC
CCGAGAGTTTATCAAGTTTGTCCAAAAGACATGTAAACCAGGAACGCCGACTCCTCCACT
CACCACCGAACCAAACCACCGCGTCTTAACTCCAGGGGAGGTCGAAGTACCGTCAGCAAG
ATGAGGCTGAGGAAGCTCGCCGGACCAGAGCTCAGAACAAGACGGTGGCAGAACTAAGAC
GAGGGAGTAGCAAAGACTAACTAGAAGACAGGGGGGAACCTCCGGCGCCGACACGCGCTT
CCACGCGCTTCCGGACACCGGGGGAGACTCAGATCTCTTTTCTCTCTTTTTTCTCTCTCG
AACAGTGTTTCTCTCCTGTTTTTTACGACTTTGGGTC
C

QA 1 637 1 637
DS 



CO CL491Contig2 1009 4 13 U
GGGAGAAAAGAGATCTGAGTCTTTCCCGGTGTCCGGAAGCGCGTGTCGGCGCCGGAGGTT
CCCCCTGTCTTCTAGTTAGTCTTTGCTTCTTCCTCGTCCTAGTTCTGCCACCGTCTTGTT
CTGAGCTCTGGTCCGGCGAGCTTCCTCAGCCTCATCTTGCTGACGGTGTTTCGACCTCCC
CTGGAGTTAAGACGCGGTGGTGTGGTTCGGTGGCGAGTGGAGGAGTCGGTGTTCCTGGCT
TACATGTCTTTTGGACAGACTTGATAAACTCTCGGGAACAGATCTAAATCCTGTTTGTCG
GATCTGAAGGCTAGATGAAGGTGTTGATGGGTTTCGATCTATCATTCTCCTTCTTGAAGT
TGTGGGGTTCTGAGTTGTCGGTGCTCCAACTTCAAAGGTTCCTCTCCGAGGGTCCTTAGC
CTTCGATCTGTGTGCGCGCCTCCTAGTTTGCTTCTGGTAGTGGTACCGACGTGTTTTGGA
GTTATGCTTTGCCTTGGGTTCGTAGCGACGGAACAGCTCCTATCTGTTCTCGGTTCGTGT
GGATTCTCCGGCTTGATCCCAAGGCAAAGGGGCTTTGGCTCATATATTTGCATCTTGGCG
TGGGGTTGAATGAGTTACTGTTCATCTCTTCACCCTTTGGGATTGCTTCTTAGGTGTCAT
CTCGTGGTTCCTGGTTTGATTCCGGAACAATAGATTGAGGTTGATCTCCATGGCTCCCTT
AATAAAGTTCAGTCTTTGATGCGTGTCTCCTCTACAACCTCCTCCATGCGTTGGTATCAT
TTGCTTGGGTGTTTTATGAATTGATTTAGATTCTGTTTTTAGTTTCCCAAGTTTATGTCT
TCTGTAAAGCTTTAGGCTTCCGGATATCATCTGTGTTTTTGTTGTATGTCTACATAAGAA
CTGTGTTTTCTTGCTGGCTTTAGACTCCGGGAGTATTGCATACTCGTCGGCTTAGGCTCT
CCAAAACTGTATTCCTCCTTTGTTATTAATCAATGCAAGCTTTAGTGCG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2C885TF U 1
AF RR2G105TF U 4
AF RR2C885JQ C 240
AF RR2G105JQ C 254
BS 1 98 RR2C885TF
BS 99 99 RR2G105TF
BS 100 651 RR2C885TF
BS 652 652 RR2G105TF
BS 653 666 RR2C885TF
BS 667 681 RR2G105TF
BS 682 731 RR2C885JQ
BS 732 732 RR2G105JQ
BS 733 891 RR2C885JQ
BS 892 892 RR2G105JQ
BS 893 939 RR2C885JQ
BS 940 940 RR2G105JQ
BS 941 1009 RR2C885JQ

RD RR2C885TF 666 0 0
GGGAGAAAAGAGATCTGAGTCTTTCCCGGTGTCCGGAAGCGCGTGTCGGCGCCGGAGGTT
CCCCCTGTCTTCTAGTTAGTCTTTGCTTCTTCCTCGTCTTAGTTCTGCCACCGTCTTGTT
CTGAGCTCTGGTCCGGCGAGCTTCCTCAGCCTCATCTTGCTGACGGTGTTTCGACCTCCC
CTGGAGTTAAGACGCGGTGGTGTGGTTCGGTGGCGAGTGGAGGAGTCGGTGTTCCTGGCT
TACATGTCTTTTGGACAGACTTGATAAACTCTCGGGAACAGATCTAAATCCTGTTTGTCG
GATCTGAAGGCTAGATGAAGGTGTTGATGGGTTTCGATCTATCATTCTCCTTCTTGAAGT
TGTGGGGTTCTGAGTTGTCGGTGCTCCAACTTCAAAGGTTCCTCTCCGAGGGTCCTTAGC
CTTCGATCTGTGTGCGCGCCTCCTAGTTTGCTTCTGGTAGTGGTACCGACGTGTTTTGGA
GTTATGCTTTGCCTTGGGTTCGTAGCGACGGAACAGCTCCTATCTGTTCTCGGTTCGTGT
GGATTCTCCGGCTTGATCCCAAGGCAAAGGGGCTTTGGCTCATATATTTGCATCTTGGCG
TGGGGTTGAATGAGTTACTGTTCATCTCTTCACCCTTTGGGATTGCTTCTTTGGTGTCAT
CTCGTG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2G105TF 678 0 0
G
GAAAAGAGATCTGAGTCTTTCCCGGTGTCCGGAAGCGCGTGTCGGCGCCGGAGGTTCCCC
CTGTCTTCTAGTTAGTCTTTGCTTCTTCCTCGTCCTAGTTCTGCCACCGTCTTGTTCTGA
GCTCTGGTCCGGCGAGCTTCCTCAGCCTCATCTTGCTGACGGTGTTTCGACCTCCCCTGG
AGTTAAGACGCGGTGGTGTGGTTCGGTGGCGAGTGGAGGAGTCGGTGTTCCTGGCTTACA
TGTCTTTTGGACAGACTTGATAAACTCTCGGGAACAGATCTAAATCCTGTTTGTCGGATC
TGAAGGCTAGATGAAGGTGTTGATGGGTTTCGATCTATCATTCTCCTTCTTGAAGTTGTG
GGGTTCTGAGTTGTCGGTGCTCCAACTTCAAAGGTTCCTCTCCGAGGGTCCTTAGCCTTC
GATCTGTGTGCGCGCCTCCTAGTTTGCTTCTGGTAGTGGTACCGACGTGTTTTGGAGTTA
TGCTTTGCCTTGGGTTCGTAGCGACGGAACAGCTCCTATCTGTTCTCGGTTCGTGTGGAT
TCTCCGGCTTGATCCCAAGGCAAAGGGGCTTTGGCTCATATATTTGCATCTTGGCGTGGG
GTTGAATGAGTTACTGTTCATCTCTTCACCCTTTGGGATTGCTTCTTAG*TGTCATCTCG
TGGTTCCTGGTTTGATT

QA 2 678 2 678
DS 

RD RR2C885JQ 770 0 0
TTACATGTCTTTTGGACAGACTTGATAAACTCTCGGGAACAGATCTAAATCCTGTTTGTC
GGATCTGAAGGCTAGATGAAGGTGTTGATGGGTTTCGATCTATCATTCTCCTTCTTGAAG
TTGTGGGGTTCTGAGTTGTCGGTGCTCCAACTTCAAAGGTTCCTCTCCGAGGGTCCTTAG
CCTTCGATCTGTGTGCGCGCCTCCTAGTTTGCTTCTGGTAGTGGTACCGACGTGTTTTGG
AGTTATGCTTTGCCTTGGGTTCGTAGCGACGGAACAGCTCCTATCTGTTCTCGGTTCGTG
TGGATTCTCCGGCTTGATCCCAAGGCAAAGGGGCTTTGGCTCATATATTTGCATCTTGGC
GTGGGGTTGAATGAGTTACTGTTCATCTCTTCACCCTTTGGGATTGCTTCTTTGGTGTCA
TCTCGTGGTTCCTGGTTTGATTCCGGAACAATAGATTGAGGTTGATCTCCATGGCTCCCT
TAATAAAGTTCATTCTTTGATGCGTGTCTCCTCTACAACCTCCTCCATGCGTTGGTATCA
TTTGCTTGGGTGTTTTATGAATTGATTTAGATTCTGTTTTTAGTTTCCCAAGTTTATGTC
TTCTGTAAAGCTTTAGGCTTCCGGATATCATCTGTGTTTTTGTTGTATGTCTTCATAAGA
ACTGTGTTTTCTTGCTGGCTTTAGACTCCGGGAGTATTGCGTACTCGTCGGCTTAGGCTC
TCCAAAACTGTATTCCTCCTTTGTTATTAATCAATGCAAGCTTTAGTGCG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2G105JQ 756 0 0
GACAGACTTGATAAACTCTCGGGAACAGATCTAAATCCTGTTTGTCGGATCTGAAGGCTA
GATGAAGGTGTTGATGGGTTTCGATCTATCATTCTCCTTCTTGAAGTTGTGGGGTTCTGA
GTTGTCGGTGCTCCAACTTCAAAGGTTCCTCTCCGAGGGTCCTTAGCCTTCGATCTGTGT
GCGCGCCTCCTAGTTTGCTTCTGGTAGTGGTACCGACGTGTTTTGGAGTTATGCTTTGCC
TTGGGTTCGTAGCGACGGAACAGCTCCTATCTGTTCTCGGTTCGTGTGGATTTTCCGGCT
TGATCCCAAGGCAAAGGGGCTTTGGCTCATATATTTGCATCTTGGCGTGGGGTTGAATGA
GTTACTGTTCATCTCTTCACCCTTTGGGATTGCTTCTTAGGTGTCATCTCGTGGTTCCTG
GTTTGATTCCGGAACAATAGATTGAGGTTGATCTCCATGGCTCCCTTAATAAAGTTCAGT
CTTTGATGCGTGTCTCCTCTACAACCTCCTCCATGCGTTGGTATCATTTGCTTGGGTGTT
TTATGAATTGATTTAGATTCTGTTTTTAGTTTCCCAAGTTTATGTCTTCTGTAAAGCTTT
AGGCTTCCGGATATCATCTGTGTTTTTGTTGTTTGTCTACATAAGAACTGTGTTTTCTTG
CTGGCTT*AGACTCCGGGAGTATTGCATACTCGTCGGCTTAGGCTCTCCAAAACTGTATT
CCTCCTTTGTTATTAATCAATGCAAGCTTTAGTG
TG

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 11

CO CL492Contig1 613 11 21 U
GGAAGAGATCCAACTCCAAATAAAATTAAATATATAAATAAAATAAATCGAACTCCTATC
CGGGATTTCTTTTATAAATTTATTTATTTAAATTATTTGGAAGATAAAAAATACTAGTAA
TAATACGAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTGTAGTGTTCTT
GGCTCTTGCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGCTGATCTTAATGGTGG
AGATCACGCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTAGTACCTGCAAGAAGCAAGAAGTCAA
TCATTACCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATACA
GATGATAACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGTTTCCTGATTATTATAATATATTGACAGG
CTTCTAACTTGGAGAACAACTATTGATTAATTTATACGAAGGCAATCATATTAATTTGAG
ATGATCAAATTAATTTCCTTGTTATTTATTTAGTCTTGTTATTTATTTAGTCTGTTATTG
GTTTTGTAATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATAAATATCTTTGTT
CCCTATTCTAACC


BQ
40 40 40 45 50 50 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 35 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 35 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 35 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 35 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK76JQ C 1
AF RR2BK76TF U 8
AF RR2DS79JQ C 1
AF RR2EI57TF U 1
AF RR2ES91JQ C 2
AF RR2ES91TF U 2
AF RR2BB50JQ C 1
AF RR2DS79TF U 1
AF RR2DC81JQ C 5
AF RR2DC81TF U 5
AF RR2BB50TF U 1
BS 1 7 RR2DS79TF
BS 8 91 RR2BK76TF
BS 92 92 RR2DS79TF
BS 93 113 RR2BK76TF
BS 114 114 RR2DS79TF
BS 115 281 RR2BK76TF
BS 282 282 RR2DS79TF
BS 283 444 RR2BK76TF
BS 445 446 RR2DS79TF
BS 447 448 RR2BK76TF
BS 449 449 RR2DS79TF
BS 450 461 RR2BK76TF
BS 462 462 RR2DS79TF
BS 463 492 RR2BK76TF
BS 493 493 RR2DS79TF
BS 494 507 RR2BK76TF
BS 508 508 RR2DS79TF
BS 509 588 RR2BK76TF
BS 589 601 RR2DS79TF
BS 602 605 RR2DC81TF
BS 606 613 RR2BB50JQ

RD RR2BK76JQ 588 0 0
GGAAGAGATCCAACTCCAAATAAAATTAAATATATAAATAAAATAAATCGAACTCCTATC
CGGGATTTCTTTTATAAATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAGATAAAAAATAATAGTAA
TAATACGAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTGTAGTGTTCTT
GGCTCTTGCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGCTGATCTTAATGGTGG
AGATCACGCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTAGTACCTACAAGAAGCAAGAAGTCAA
TCATTACCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATACA
GATGATAACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGTTTCCTGATTATTATAATATATTGACAGG
CTTCTAACTTGGAGAACAACTATTTGTTCATTTATACGAAG*CAATCATATTAATTTGAG
ATGATCAAATTAGTTTCCTTGTTATTTTTTTAGTCTTGTTATTTATTTAGTCTGTTATTG
GTTTTGTAATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2BK76TF 581 0 0
ATCCAACTCCAAATAAAATTAAATATATAAATAAAATAAATCGAACTCCTATCCGGGATT
TCTTTTATAAATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAGATAAAAAATAATAGTAATAATACG
AGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTGTAGTGTTCTTGGCTCTT
GCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGCTGATCTTAATGGTGGAGATCAC
GCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTAGTACCTACAAGAAGCAAGAAGTCAATCATTAC
CGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATACAGATGATA
ACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGTTTCCTGATTATTATAATATATTGACAGGCTTCTAA
CTTGGAGAACAACTATTTGTTCATTTATACGAAG*CAATCATATTAATTTGAGATGATCA
AATTAGTTTCCTTGTTATTTTTTTAGTCTTGTTATTTATTTAGTCTGTTATTGGTTTTGT
AATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATA

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2DS79JQ 588 0 0
GGAAGAGATCCAACTCCAAATAAAATTAAATATATAAATAAAATAAATCGAACTCCTATC
CGGGATTTCTTTTATAAATTTATTTATTTAAATTATTTGGAAGATAAAAAATACTAGTAA
TAATACGAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTT***TCTCTAGTTCTTGTAGTGTTCTT
GGCTCTTGCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGCTGATCTTAATGGTGG
AGATCACGCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTAGTACCTGCAAGAAGCAAGAAGTCAA
TCATTACCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATACA
GATGATAACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGTTTCCTGATTATTATAATATATTGACAGG
CTTCTAACTTGGAGAACAACTATTGATTAATTTATACGAAGGCAATCATATTAATTTGAG
ATGATCAAATTAATTTCCTTGTTATTTATTTT*TCTTGTTATTTATTTAGTCTGTTATTG
GTTTTGTAATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2EI57TF 588 0 0
GGAAGAGATCCAACTCCAAATAAAATTAAATATATAAATAAAATAAATCGAACTCCTATC
CGGGATTTCTTTTATAAATTTATTTATTTAAATTATTTGGAAGATAAAAAATACTAGTAA
TAATACTAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTGTAGTGTTCTT
GGCTCTTGCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGCTGATCTTAATGGTGG
AGATCACGCCTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTAGTACCTGCAAGAAGCAAGAAGTCAA
TCATTACCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATACA
GATGATAACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGTTTCCTGATTATTATAATATATTGACAGG
CTTCTAACTTGGAGAACAACTATTGATTAATTTATACGAAGGCAATCATATTAATTTGAG
ATGATCAAATTAATTTCCTTGTTATTTATTTAGTCTTGTTATTTATTTAGTCTGTTATTG
GTTTTGTAATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2ES91JQ 587 0 0
GG
AGAGATCCAACTCCAAATAAAATTAAATATATAAATAAAATAAATCGAACTCCTATCCGG
GATTTCTTTTATAAATTTATTTATTTAAATTATTTGGAAGATAAAAAATACTAGTAATAA
TACGAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCCTGTAGTGTTCTTGGC
TCTTGCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGCTGATCTTAATGGTGGAGA
TCACGCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTAGTACCTGCAAGAAGCAAGAAGTCAATCA
TTACCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATACAGAT
GATAACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGTTTCCTGATTATTATAATATATTGACAGGCTT
CTAACTTGTAGAACAACTATTGATTAATTTATACGAAGGCAATCATATTAATTTGAGATG
ATCAAATTAATTTCCTTGTTATTTATTTAGTCTTGTTATTTATTTAGTCTGTTATTGGTT
TTGTAATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATA

QA 3 587 3 587
DS 

RD RR2ES91TF 587 0 0
GGG
GAGATCCAACTCCAAATAAAATTAAATATATAAATAAAATAAATCGAACTCCTATCCGGG
ATTTCTTTTATAAATTTATTTATTTAAATTATTTGGAAGATAAAAAATACTAGTAATAAT
ACGAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCCTGTAGTGTTCTTGGCT
CTTGCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGCTGATCTTAATGGTGGAGAT
CACGCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTAGTACCTGCAAGAAGCAAGAAGTCAATCAT
TACCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATACAGATG
ATAACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGTTTCCTGATTATTATAATATATTGACAGGCTTC
TAACTTGTAGAACAACTATTGATTAATTTATACGAAGGCAATCATATTAATTTGAGATGA
TCAAATTAATTTCCTTGTTATTTATTTAGTCTTGTTATTTATTTAGTCTGTTATTGGTTT
TGTAATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATA

QA 4 587 4 587
DS 

RD RR2BB50JQ 613 0 0
GGAAGAGATCCAACTCCAAATAAAATTAAATATATAAATAAAATAAATCGAACTCCTATC
CGGGATTTCTTTTATAAATTTATTTATTTAAATTATTTGGAAGATAAAAAATACTAGTAA
TAATACGAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTGTAGTGTTCTT
GGCTCTTGCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGCTGATCTTAATGGTGG
ATATCACGCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTAGTACCTGCAAGAAGCAAGAAGTCAA
TCATTACCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCT*GTTGATTTATACA
GATGATAACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGTTTCCTGATTATTATAATATATTGACAGG
CTTCTAACTTGGAGAACAACTATTGATTAATTTATACGAAGACAATCATATTAATTTGAG
ATGATCAAATTAATTTCCTTGTTATTTATTTAGTCTTGTTATTTATTTAGTCTGTTATTG
GTTTTGTAATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATAAATATCTTTGTT
CCCTATTCTAACC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2DS79TF 610 0 0
GGAAGAGATCCAACTCCAAATAAAATTAAATATATAAATAAAATAAATCGAACTCCTATC
CGGGATTTCTTTTATAAATTTATTTATTTAAATTATTTGGAAGATAAAAAATACTAGTAA
TAATACGAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTT***TCTCTAGTTCTTGTAGTGTTCTT
GGCTCTTGCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGCTGATCTTAATGGTGG
AGATCACGCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTAGTACCTGCAAGAAGCAAGAAGTCAA
TCATTACCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATACA
GATGATAACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGTTTCCTGATTATTATAATATATTGACAGG
CTTCTAACTTGGAGAACAACTATTGATTAATTTATACGAAGGCAATCATATTAATTTGAG
ATGATCAAATTAATTTCCTTGTTATTTATTTT*TCTTGTTATTTATTTAGTCTGTTATTG
GTTTTGTAATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATAAATATCTTTGTT
C
ACAAAAAAA

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2DC81JQ 602 0 0
GG
GATCCAACTCCAAATAAAATTAAATATATAAATAAAATAAATCGAACTCCTATCCGGGAT
TTCTTTTATAAATTTATTTATTTAAATTATTTGGAAGATAAAAAATACTAGTAATAATAC
GAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTGTAGTGTTCTTGGCTCT
TGCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGCTGATCTTAATGGTGGAGATCA
CGCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTAGTACCTGCAAGAAGCAATAAGTCAATCATTA
CCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATACAGATGAT
AACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGTTTCCTGATTATTATAATATATTGACAGGCTTCTA
ACTTGGAGAACAACTATTGATTAATTTATACGAAGGCAATCATATTAATTTGAGATGATC
AAATTAATTTCCTTGTTATTTATTTAGTCTTGTTATTTATTTAGTCTGTTATTGGTTTTG
TAATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATAAATATCTTTGTTCCCTA
G

QA 3 601 3 601
DS 

RD RR2DC81TF 602 0 0
GG
GATCCAACTCCAAATAAAATTAAATATATAAATAAAATAAATCGAACTCCTATCCGGGAT
TTCTTTTATAAATTTATTTATTTAAATTATTTGGAAGATAAAAAATACTAGTAATAATAC
GAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTGTAGTGTTCTTGGCTCT
TGCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGCTGATCTTAATGGTGGAGATCA
CGCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTAGTACCTGCAAGAAGCAATAAGTCAATCATTA
CCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATACAGATGAT
AACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGTTTCCTGATTATTATAATATATTGACAGGCTTCTA
ACTTGGAGAACAACTATTGATTAATTTATACGAAGGCAATCATATTAATTTGAGATGATC
AAATTAATTTCCTTGTTATTTATTTAGTCTTGTTATTTATTTAGTCTGTTATTGGTTTTG
TAATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATAAATATCTTTGTTCCCTA
G

QA 3 601 3 601
DS 

RD RR2BB50TF 613 0 0
GGAAGAGATCCAACTCCAAATAAAATTAAATATATAAATAAAATAAATCGAACTCCTATC
CGGGATTTCTTTTATAAATTTATTTATTTAAATTATTTGGAAGATAAAAAATACTAGTAA
TAATACGAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTGTAGTGTTCTT
GGCTCTTGCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGCTGATCTTAATGGTGG
ATATCACGCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTAGTACCTGCAAGAAGCAAGAAGTCAA
TCATTACCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCT*GTTGATTTATACA
GATGATAACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGTTTCCTGATTATTATAATATATTGACAGG
CTTCTAACTTGGAGAACAACTATTGATTAATTTATACGAAGACAATCATATTAATTTGAG
ATGATCAAATTAATTTCCTTGTTATTTATTTAGTCTTGTTATTTATTTAGTCTGTTATTG
GTTTTGTAATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATAAATATCTTTGTT
CCCTA
TTCTAACC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 10

CO CL493Contig1 756 10 9 U
GGGTCCTTTCACCAGATTCTCCTTCAGCTCATCTCTCGTCTCTCTCGCCACGACCAGATC
TCATAAACTAAAATCGGATCGAATCCACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGT
TGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTTGCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATAGG
AGATGGAACTGTGAGCTATGGAATGGATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGAC
TGGCACTATCATCGCTCCTCATAACACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCT
CTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAAAAACCTCCCACTGTCCGTTTCCATTCACGTATCAA
CATGGCTTGCGTCAACAATGAAACAGGAGTGGTGGAACCTAAGAAGTTTGGGCTTCTTGC
GAACTGGCAAAGGGACTACACAATGGAGACAATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTC
TACGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAAA
ATCTTTGCCCCTTCTAATACTAAAGTATGTATCTGGGGGTACTCCATTGTCGTTCTCAAG
CTTTTTTTCTAAATTTGTGATAAAAAATTGGTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGAT
G***TTCGATTGATCATCTGAAGTTTATCCTTGTGTGCAAATTATCCAAAAAAACAGTGT
CTTCCCCGATTCATGTATGTTCAATCTTTTGAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 35 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR2B215TF U 155
AF RR2G865TF U 1
AF RR2DL96TF U 19
AF RR2DL96JQ C 112
AF RR2H930TF U 24
AF RR2AD14TF U 23
AF RR2G865JQ C 26
AF RR2AD14JQ C 64
AF RR2AM29JQ C 29
AF RR2AM29TF U 29
BS 1 263 RR2G865TF
BS 264 264 RR2DL96TF
BS 265 639 RR2G865TF
BS 640 661 RR2DL96TF
BS 662 664 RR2AD14TF
BS 665 720 RR2DL96TF
BS 721 721 RR2AD14TF
BS 722 751 RR2AM29TF
BS 752 756 RR2AM29JQ

RD RR2B215TF 357 0 0
CTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAATGTATGATGGA
GATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAACACTGTTCAT
GAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAAAAACCTCCC
ACTGTCCGTTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAACAGGAGTGGTG
GAACCTAAGAAGTTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAATGGAGACAATA
CTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCT

QA 1 357 1 357
DS 

RD RR2G865TF 639 0 0
GGGTCCTTTCACCAGATTCTCCTTCAGCTCATCTCTCGTCTCTCTCGCCACGACCAGATC
TCATAAACTAAAATCGGATCGAATCCACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGT
TGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTTGCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATAGG
AGATGGAACTGTGAGCTATGGAATGGATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGAC
TGGCACTATCATCGCTCCTCATAGCACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCT
CTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAAAAACCTCCCACTGTCCGTTTCCATTCACGTATCAA
CATGGCTTGCGTCAACAATGAAACAGGAGTGGTGGAACCTAAGAAGTTTGGGCTTCTTGC
GAACTGGCAAAGGGACTACACAATGGAGACAATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTC
TACGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAAA
ATCTTTGCCCCTTCTAATACTAAAGTATGTATCTGGGGGTACTCCATTGTCGTTCTCAAG
CTTTTTTTCTAAATTTGTGATAAAAAATTGGTCTATGTG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2DL96TF 702 0 0
GGCCTTC
AGCTCATCTCTCGTCTCTCTCGCCACGACCAGATCTCATAAACTAAAATCGGATCGAATC
CACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTTG
CTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAATG
GATGATGGAGACGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAAC
ACTGTTCATGAAGGGAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAA
AAACCTCCCACTGTCCGTTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAACA
GGAGTGGTGGAACCTAAGAAGTTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAATG
GAGACAATACTGACACAGCTGAAGGAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCTTAAGCTTGTT
CAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAAAATCTTTGCCCCTTCTAATACTAAAG
TATGTATCTGGGGGTACTCCATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGATAAAA
AATTGGTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGATGATGTTCGATTGATCATCTGAAGTT
TATCCTTGTGTGCAAATTATCCAAAAAAACAGTGT

QA 8 702 8 702
DS 

RD RR2DL96JQ 609 0 0
ATCGAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTTGCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAA
AGGTATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAATGGATGATGGAGACGACATTTACATGCG
CTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAACACTGTTCATGAAGGGAGGATCTATCA
GTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAAAAACCTCCCACTGTCCGTTTCCATTC
ACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAACAGGAGTGGTGGAACCTAAGAAGTTTGG
GCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAATGGAGACAATACTGACACAGCTGAAGGA
GGAGATGTCTACGTCGCATAACCTTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTA
GTAGTGAAAATCTTTGCCCCTTCTAATACTAAAGTATGTATCTGGGGGTACTCCATTGTC
GTTCTCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGATAAAAAATTGGTCTATGTGGATGGTGATGAT
GATGATGATGATGTTCGATTGATCATCTGAAGTTTATCCTTGTGTGCAAATTATCCAAAA
AAACAGTGT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2H930TF 690 0 0
GG
AGCTCATCTCTCGTCTCTCTCGCCACGACCAGATCTCATAAACTAAAATCGGATCGAATC
CACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTTG
CTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAGAGGTATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAATG
GATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAAC
ACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAA
AAACCTCCCACTGTCCGTTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAACA
GGAGTGGTGGAACCTAAGAAATTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAATG
GAGACTATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGTT
CAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAAAATCTTTGCCCCTTCTAATACTAAAG
TATGTATCTGGGGGTACTCTATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGATAAAA
AATTGGTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGATG***TTCGATTGATCATCTGAAGTT
TATCCTTGTGTGCAAATTATCCAAAAAA

QA 3 690 3 690
DS 

RD RR2AD14TF 709 0 0
GGG
AGCTCATCTCTCGTCTCTCTCGCCACGACCAGATCTCATAAACTAAAATCGGATCGAATC
CACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTTG
CTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAATG
GATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAAC
ACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAA
AAACCTCCCACTGTCCGTTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAACA
GGAGTGGTGGAACCTAAGAAATTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAATG
GAGACTATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGTT
CAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAAAATCTTTGCCCCTTCTAATACTAAAT
TATGTATCTGGGGGTACTCTATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGATAAAA
AATTGGTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGATG***TTCGATTGATCATCTGAAGTT
TATCCTTGTGTGCAAATTATCCAAAAAAACAGTGTC
CTCTTTCCCG

QA 4 699 4 699
DS 

RD RR2G865JQ 726 0 0
AGCTCATCTCTCGTCTCTCTCGCCACGACCAGATCTCATAAACTAAAATCGGATCGAATC
CACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTTG
CTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAATG
GATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAGC
ACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAA
AAACCTCCCACTGTCCGTTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAACA
GGAGTGGTGGAACCTAAGAAGTTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAATG
GAGACAATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTTTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGTT
CAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAAAATCTTTGCCCCTTCTAATACTAAAG
TATGTATCTGGGGGTACTCCATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGATAAAA
AATTGGTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGATGATGTTCGATTGATCATCTGAAGTT
TATCCTTGTGTGCAAATTATCCAAAAAAACAGTGTCTTCCCCGATTCATGTATGTTCAAT
CTTTTG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2AD14JQ 668 0 0
TAAACTAAAATCGGATCGAATCCACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTTGT
TGTTCCGAGGAATTTCCGGTTGCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATAGGAGA
TGGAACTGTGAGCTATGGAATGGATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGG
CACTATCATCGCTCCTCATAACACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTT
CTGTGACAAAGATTACCCGGAAAAACCTCCCACTGTCCGTTTCCATTCACGTATCAACAT
GGCTTGCGTCAACAATGAAACAGGAGTGGTGGAACCTAAGAAATTTGGGCTTCTTGCGAA
CTGGCAAAGGGACTACACAATGGAGACTATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTTTAC
GTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTTTAGTAGTGAAAATC
TTTGCCCCTTCTAATACTAAATTATGTATCTGGGGGTACTCTATTGTCGTTCTCAAGCTT
TTTTTCTAAATTTGTGATAAAAAATTGGTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGATG**
*TTCGATTGATCATCTGAAGTTTATCCTTGTGTGCAAATTATCCAAAAAAACAGTGTC
CTCTTTCCCG

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2AM29JQ 728 0 0
GG
ATCTCTCGTCTCTCTCGCCACGACCAGATCTCATAAACTAAAATCGGATCGAATCCACAA
CATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTTGCTAGA
GGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAATGGATGA
TGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAACACTGT
TCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAAAAACC
TCCCACTGTCCGTTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAACAGGAGT
GGTGGAACCTAAGAAGTTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAATGGAGAC
AATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACC
TCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAAAATCTTTGCCCCTTCTAATACTAAAGTATGT
ATCTGGGGGTACTCCATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGATAAAAAATTG
GTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGATG***TTCGATTGATCATCTGAAGTTTATCC
TTGTGTGCAAATTATCCAAAAAAACAGTGTCTTCCCCGATTCATGTATGTTCAATCTTTT
GAATTT

QA 3 728 3 728
DS 

RD RR2AM29TF 728 0 0
GG
ATCTCTCGTCTCTCTCGCCACGACCAGATCTCATAAACTAAAATCGGATCGAATCCACAA
CATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTTGCTAGA
GGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAATGGATGA
TGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAACACTGT
TCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAAAAACC
TCCCACTGTCCGTTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAACAGGAGT
GGTGGAACCTAAGAAGTTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAATGGAGAC
AATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACC
TCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAAAATCTTTGCCCCTTCTAATACTAAAGTATGT
ATCTGGGGGTACTCCATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTCTAAATTTGTGATAAAAAATTG
GTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGATG***TTCGATTGATCATCTGAAGTTTATCC
TTGTGTGCAAATTATCCAAAAAAACAGTGTCTTCCCCGATTCATGTATGTTCAATCTTTT
G
AATTT

QA 3 723 3 723
DS 



AS 1 11

CO CL494Contig1 806 11 8 U
TTTTTCAAGAATCATAAAAGGAAAAGAGAGAGACAGAGATTCATAAATAAATAAAAAATG
GCGATCGTGGGTCCTCAATTTTGCGCACCGTACCCAGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAG
GTGATGACAATAACAGACGGTAACTTCGCCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTC
AAAGTCAAAGAACCATTGTTTAGCCTCTCCGACAAGAGGATCTTACTTGATGCTTCAGAC
AATCCGATTTTGACCTTGAGAGAAAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGGTGGCAAGTATTT
AGAGGAAAGAGCACAGACCAAAATGATTTGGTGTTCACGTTGAAACGATCGTCAATGATT
CAACTGATTAAGCCAAAACTAGATGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGC
GACTTCCATGTTAAAGGAAGTTGGATCGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCGGGGAAATCT
GATGCCATTGTTGCTCAGATGCACAAAAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAG
AGTAACTTCTCGGTCACTGTTTATCCGAATGTCGATTATGCGTTTATAGTATCCCTCATT
GTAATTCTCGATGACATTAACCGAGAAGATTCTGATGACTAAACTAATGCTTTTTTTTTG
TTTGGATATGAATACAATTCTCTCTGTCTCGACAGAGGATTATTGAACACAGTTTCAAGT
TTATTCAGTTCTTTGAATAAGCAATCGATTGTACTCTTGATACGTGCAACATTTGACACA
TAGATAATACTCTCCCTCCGTTTCGC


BQ
30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 
65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2GH54TF U 1
AF RR2GH54JQB C 1
AF RR2CB84TF U 1
AF RR2GS35TF U 1
AF RR2CB84JQ C 15
AF RR2AT48TF U 6
AF RR2AO03TF U 192
AF RR2A630JQ C 6
AF RR2A630TF U 6
AF RR2AT48JQ C 23
AF RR2GS35JQB C 254
BS 1 161 RR2CB84TF
BS 162 162 RR2GH54TF
BS 163 624 RR2CB84TF
BS 625 625 RR2GH54TF
BS 626 706 RR2CB84TF
BS 707 711 RR2AT48TF
BS 712 726 RR2A630TF
BS 727 806 RR2AT48JQ

RD RR2GH54TF 644 0 0
TTTTTCAAGAATCATAAAAGGAAAAGAGAGAGACAGAGATTCATAAATAAATAAAAAATG
GCGATCGTGGGTCCTCAATTTTGCGCACCGTACCCAGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAG
GTGATGACAATAACAGACGGTAACTTCGCCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTC
AAAGTCAAAGAACCATTGTTTAGCCTCTCCGACAAGAGGATCTTACTTGATGCTTCAGAC
AATCCGATTTTGACCTTGAGAGAAAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGGTGGCAAGTATTT
AGAGGAAAGAGCACAGACCAAAATGATTTGGTGTTCACGTTGAAACGATCGTCAATGATT
CAACTGATTAAGCCAAAACTAGATGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGC
GACTTCCATGTTAAAGGAAGTTGGATCGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCGGGGAAATCT
GATGCCGTTGTTGCTCAGATGCACAAAAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAG
AGTAACTTCTCGGTCACTGTTTATCCGAATGTCGATTATGCGTTTATAGTATCCCTCATT
GTAATTCTCGATGACATTAACCGAGAAGATTCTGATGACTAAA
A

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2GH54JQB 640 0 0
TTTTTCAAGAATCATAAAAGGAAAAGAGAGAGACAGAGATTCATAAATAAATAAAAAATG
GCGATCGTGGGTCCTCAATTTTGCGCACCGTACCCAGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAG
GTGATGACAATAACAGACGGTAACTTCGCCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTC
AAAGTCAAAGAACCATTGTTTAGCCTCTCCGACAAGAGGATCTTACTTGATGCTTCAGAC
AATCCGATTTTGACCTTGAGAGAAAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGGTGGCAAGTATTT
AGAGGAAAGAGCACAGACCAAAATGATTTGGTGTTCACGTTGAAACGATCGTCAATGATT
CAACTGATTAAGCCAAAACTAGATGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGC
GACTTCCATGTTAAAGGAAGTTGGATCGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCGGGGAAATCT
GATGCCGTTGTTGCTCAGATGCACAAAAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAG
AGTAACTTCTCGGTCACTGTTTATCCGAATGTCGATTATGCGTTTATAGTATCCCTCATT
GTAATTCTCGATGACATTAACCGAGAAGATTCTGATGACT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2CB84TF 709 0 0
TTTTTCAAGAATCATAAAAGGAAAAGAGAGAGACAGAGATTCATAAATAAATAAAAAATG
GCGATCGTGGGTCCTCAATTTTGCGCACCGTACCCAGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAG
GTGATGACAATAACAGACGGTAACTTCGCCGTCACTGACGTGAACGGAAACCTCCTTTTC
AAAGTCAAAGAACCATTGTTTAGCCTCTCCGACAAGAGGATCTTACTTGATGCTTCAGAC
AATCCGATTTTGACCTTGAGAGAAAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGGTGGCAAGTATTT
AGAGGAAAGAGCACAGACCAAAATGATTTGGTGTTCACGTTGAAACGATCGTCAATGATT
CAACTGATTAAGCCAAAACTAGATGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGC
GACTTCCATGTTAAAGGAAGTTGGATCGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCGGGGAAATCT
GATGCCATTGTTGCTCAGATGCACAAAAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAG
AGTAACTTCTCGGTCACTGTTTATCCGAATGTCGATTATGCGTTTATAGTATCCCTCATT
GTAATTCTCGATGACATTAACCGAAAAGATTCTGATGACTAAACTAATGCTTTTTTTTTG
TTTGGATATGAATACAATTCTCTCTGTCTCGACAGAGGATTATTGA
GCA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2GS35TF 674 0 0
TTTTTCAAGAATCATAAAAGGAAAAGAGAGAGACAGAGATTCATAAATAAATAAAAAATG
GCGATCGTGGGTCCTCAATTTTGCGCACCGTACCCAGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAG
GTGATGACAATAACAGACGGTAACTTCGCCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTC
AAAGTCAAAGAACCATTGTTTAGCCTCTCCGACAAGAGGATCTTACTTGATGCTTCAGAC
AATCCGATTTTGACCTTGAGAGAAAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGGTGGCAAGTATTT
AGAGGAAAGAGCACAGACCAAAATGATTTGGTGTTCACGTTGAAACGATCGTCAATGATT
CAACTGATTAAGCCAAAACTAGATGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGC
GACTTCCATGTTAAAGGAAGTTGGATCGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCGGGGAAATCT
GATGCCATTGTTGCTCAGATGCACAAAAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAG
AGTAACTTCTCGGTCACTGTTTATCTGAATGTCGATTATGCGTTTATAGTATCCCTCATT
GTAATTCTCGATGACATTAACCGAGAAGATTCTGATGACTAAACTAATGCTTTTTTTTTG
TTTGGATATGAATA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2CB84JQ 694 0 0
TAAAAGGAAAAGAGAGAGACAGAGATTCATAAATAAATAAAAAATGGCGATCGTGGGTCC
TCAATTTTGCGCACCGTACCCAGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAGGTGATGACAATAAC
AGACGGTAACTTCGCCGTCACTGACGTGAACGGAAACCTCCTTTTCAAAGTCAAAGAACC
ATTGTTTAGCCTCTCCGACAAGAGGATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCCGATTTTGAC
CTTGAGAGAAAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGGTGGCAAGTATTTAGAGGAAAGAGCAC
AGACCAAAATGATTTGGTGTTCACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAACTGATTAAGCC
AAAACTAGATGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGCGACTTCCATGTTAA
AGGAAGTTGGATCGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCGGGGAAATCTGATGCCATTGTTGC
TCAGATGCACAAAAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAACTTCTCGGT
CACTGTTTATCCGAATGTCGATTATGCGTTTATAGTATCCCTCATTGTAATTCTCGATGA
CATTAACCGAAAAGATTCTGATGACTAAACTAATGCTTTTTTTTTGTTTGGATATGAATA
CAATTCTCTCTGTCTCGACAGAGGATTATTGA
GC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2AT48TF 706 0 0
CAAGAATCATAAAAGGAAAAGAGAGAGACAGAGATTCATAAATAAATAAAAAATGGCGAT
CGTGGGTCCTCAATTTTGCGCACCGTACCCAGTAGATTTGGGTATCGTGCGTAAGGTGAT
GACAATAACAGACGGTAACTTCGCCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTCAAAGT
CAAAGAACCATTGTTTAGCCTCTCCGACAAGAGGATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCC
GATTTTGACCTTGAGAGAAAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGGTGGCAAGTATTTAGAGG
AAAGAGCACAGACCAAAATGATTTGGTGTTCACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAACT
GATTAAGCCAAAACTAGATGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAGTGAAGGTATGCGACTT
CCATGTTAAAGGAAGTTGGATCGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCGGGGAAATCTGATGC
CATTGTTGCTCAGATGCACAAAAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAA
CTTCTCGGTCACTGTTTATCCGAATGTCGATTATGCGTTTATAGTATCCCTCATTGTAAT
TCTCGATGACATTAACCGAGAAGATTCTGATGACTAAACTAATGCTTTTTTTT*GTTTGG
ATATGAATACAATTCTCTCTGTCTCGACAGAGGATTATTGAACACA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2AO03TF 519 0 0
ACCATTGTTTAGCCTCTCCGACAAGAGGATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCCGATTTT
GACCTTGAGAGAAAATGGGGTGAGCCTGCACGATAGGTGGCAAGTATTTAGAGGAAAGAG
CACAGACCAAAATGATTTGGTGTTCACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAACTGATTAA
GCCGAAACTAGATGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGCGACTTCCATGT
TAAAGGAAGTTGGATCGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCGGGGAAATCTGATGCCATTGT
TGCTCAGATGCACAAAAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAACTTCTC
GGTCACTGTTTATCCGAATGTCGATTATGCGTTTATAGTATCCCTCATTGTAATTCTCGA
TGACATTAACCGAGAAGATTCTGATGACTAAACTAATGCTTTTTTTT*GTTTGGATATGA
ATACAATTCTCTCTGTCTCGACAGAG*ATTATTGAACAC

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2A630JQ 721 0 0
CAAGAATCATAAAAGGAAAAGAGAGAGACAGAGATTCATAAATAAATAAAAAATGGCGAT
CGTGGGTCCTCAATTTTGCGCACCGTACCCAGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAGGTGAT
GACAATAACAGACGGTAACTTCGCCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTCAAAGT
CAAAGAACCATTGTTTAGCCTCTCCGACAAGAGGATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCC
GATTTTGACCTTGAGAGAAAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGGTGGCAAGTATTTAGAGG
AAAGAGCACAGACCAAAATGATTTGGTGTTCACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAACT
GATTAAGCCAAAACTAGATGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGCGACTT
CCATGTTAAAGGAAGTTGGATCGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCGGGGAAATCTGATGC
CATTGTTGCTCAGATGCACAAAAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAA
CTTCTCGGTCACTGTTTATCCGAATGTCGATTATGCGTTTATAGTATCCCTCATTGTAAT
TCTCGATGACATTAACCGAGAAGATTCTGATGACTAAACTAATGCTTTTTTTTTGTTTGG
ATATGAATACAATTCTCTCTGTCTCGACAGAGGATTATTGAACACAGTTTCAAGTTTATT
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2A630TF 721 0 0
CAAGAATCATAAAAGGAAAAGAGAGAGACAGAGATTCATAAATAAATAAAAAATGGCGAT
CGTGGGTCCTCAATTTTGCGCACCGTACCCAGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAGGTGAT
GACAATAACAGACGGTAACTTCGCCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTCAAAGT
CAAAGAACCATTGTTTAGCCTCTCCGACAAGAGGATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCC
GATTTTGACCTTGAGAGAAAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGGTGGCAAGTATTTAGAGG
AAAGAGCACAGACCAAAATGATTTGGTGTTCACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAACT
GATTAAGCCAAAACTAGATGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGCGACTT
CCATGTTAAAGGAAGTTGGATCGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCGGGGAAATCTGATGC
CATTGTTGCTCAGATGCACAAAAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAA
CTTCTCGGTCACTGTTTATCCGAATGTCGATTATGCGTTTATAGTATCCCTCATTGTAAT
TCTCGATGACATTAACCGAGAAGATTCTGATGACTAAACTAATGCTTTTTTTTTGTTTGG
ATATGAATACAATTCTCTCTGTCTCGACAGAGGATTATTGAACACAGTTTCAAGTTTATT
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2AT48JQ 784 0 0
AAAGAGAGAGACAGAGATTCATAAATAAATAAAAAATGGCGATCGTGGGTCCTCAATTTT
GCGCACCGTACCCAGTAGATTTGGGTATCGTGCGTAAGGTGATGACAATAACAGACGGTA
ACTTCGCCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTCAAAGTCAAAGAACCATTGTTTA
GCCTCTCCGACAAGAGGATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCCGATTTTGACCTTGAGAG
AAAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGGTGGCAAGTATTTAGAGGAAAGAGCACAGACCAAA
ATGATTTGGTGTTCACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAACTGATTAAGCCAAAACTAG
ATGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAGTGAAGGTATGCGACTTCCATGTTAAAGGAAGTT
GGATCGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCGGGGAAATCTGATGCCATTGTTGCTCAGATGC
ACAAAAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAACTTCTCGGTCACTGTTT
ATCCGAATGTCGATTATGCGTTTATAGTATCCCTCATTGTAATTCTCGATGACATTAACC
GAGAAGATTCTGATGACTAAACTAATGCTTTTTTTT*GTTTGGATATGAATACAATTCTC
TCTGTCTCGACAGAGGATTATTGAACACAGTTTCAAGTTTATTCAGTTCTTTGAATAAGC
AATCGATTGTACTCTTGATACGTGCAACATTTGACACATAGATAATACTCTCCCTCCGTT
TCGC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2GS35JQB 553 0 0
CCTTGAGAGAAAATAGGGTGAGCCTGCACGATAGGTGGCAAGTATTTAGAGGAAAGAGCA
CAGACCAAAATGATTTGGTGTTCACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAACTGATTAAGC
CAAAACTAGATGTGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGCGACTTCCATGTTA
AAGGAAGTTGGATCGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCGGGGAAATTTGATGCCATTGTTG
CTCAGATGCACAAAAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAACTTTTCGG
TCACTGTTTATTTGAATGTCGATTATGCGTTTATAGTATCCCTCATTGTAATTCTCGATG
ACATTAACCGAGAAGATTTTGATGACTAAACTAATGCTTTTTTTTTGTTTGGATATGAAT
ACAATTCTTTCTGTCTCGACAGAGGATTATTGAACACAGTTTCAAGTTTATTCAGTTCTT
TGAATAAGCAATCGATTGTACTCTTGATACGTGCAACATTTGACACATAGATAATACTCT
CCCTCCGTTTC
AT

QA 1 551 1 551
DS 



AS 2 11

CO CL495Contig1 747 5 5 U
GCACAGCAAATGAAATTATATTTGATCATCATATTGCTTGAAAACATTTACATATACAAA
AGCAGAGTCATAATAAGAGCACCCACAGAGAGTTTGCTACATTGATACAGCCATATTACA
AGTAAAGACATGGGGGATTGGCTCATCCCGAAGAACTAGCAGACCTTGCTGTTTCAATGG
CTGCAACTAGATCATCATATTTGGCACCCGTAACTTCCTTCACCACTTGGTTATCCTTCA
ATATTTTAAAAGTTGGAACCACTCTTATTCCTAGTTCCTTTGCTAATGGCCTGTTTTCAG
GGTTGCAGTCAAGCTTAAGAAACACAACGTCCTCATATTTCTCTGATAAAGCTTTGTATT
TAGGAGCAATCACTTTACATGGACCACACCATTGAGTGTACATGTCAAGTACCACAATCT
TTTCCCCGGCGGCTTTAACGATGGGCCAGAAGGTATCCTTATCCACTTCCGTCACTTGAC
CAACACTTACATTCACAGTCTCTAAGCTACACCTCACCACAGAGGAGTCTCCCCTTCTCA
CAGAATCCAGTGACCAGAAACCAATCCTCGTCGTCGTCGTCGTCGCCACGCCGGAGTAAG
GGATACGACACTGCTTTTTCGCAGCTCCAAATCCACCGGTTGTCGGAGATAAAGCCGTAG
GAGATGGAGCTAGACGGAGAGACAGAGGCATTGTTGAGTTCGGCGAAAGAGTGTCGGAAC
GATGAGATTGATCAGCTTGTGTGTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2AR12JQ U 338
AF RR2D730JQ U 1
AF RR2D777JQ U 12
AF RR2D777TF C 13
AF RR2D730TF C 71
BS 1 437 RR2D730JQ
BS 438 438 RR2D777JQ
BS 439 653 RR2D730JQ
BS 654 744 RR2D777JQ
BS 745 747 RR2D730TF

RD RR2AR12JQ 183 0 0
TTTCTCTGATAAAGCTTTGTATTTAGGAGCAATCACTTTACATGGACCACACCATTGAGT
GTACATGTCAAGTACCACAATCTTTTCCCCGGCGGCTTTAACGATGGGCCAGAAGGTATC
CTTATCCACTTCCGTCACTTGACCAACACTTACATTCACAGTCTCTAAGCTACACCTCAC
CAC

QA 1 183 1 183
DS 

RD RR2D730JQ 653 0 0
GCACAGCAAATGAAATTATATTTGATCATCATATTGCTTGAAAACATTTACATATACAAA
AGCAGAGTCATAATAAGAGCACCCACAGAGAGTTTGCTACATTGATACAGCCATATTACA
AGTAAAGACATGGGGGATTGGCTCATCCCGAAGAACTAGCAGACCTTGCTGTTTCAATGG
CTGCAACTAGATCATCATATTTGGCACCCGTAACTTCCTTCACCACTTGGTTATCCTTCA
ATATTTTAAAAGTTGGAACCACTCTTATTCCTAGTTCCTTTGCTAATGGCCTGTTTTCAG
GGTTGCAGTCAAGCTTAAGAAACACAACGTCCTCATATTTCTCTGATAAAGCTTTGTATT
TAGGAGCAATCACTTTACATGGACCACACCATTGAGTGTACATGTCAAGTACCACAATCT
TTTCCCCGGCGGCTTTAGCGATGGGCCAGAAGGTATCCTTATCCACTTCCGTCACTTGAC
CAACACTTACATTCACAGTCTCTAAGCTACACCTCACCACAGAGGAGTCTCCCCTTCTCA
CAGAATCCAGTGACCAGAAACCAATCCTCGTCGTCGTCGTCGTCGCCACGCCGGAGTAAG
GGATACGACACTGCTTTTTCGCAGCTCCAAATCCACCGGTTGTCGGAGATAAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2D777JQ 742 0 0
GAAATTATATTTGATCATCATATTGCTTGAAAACATTTACATATACAAAAGCAGAGTCAT
AATAAGAGCACCCACAGAGAGTTTGCTACATTGATACAGCCATATTACAAGTAAAGACAT
GGGGGATTGGCTCATCCCGAAGAACTAGCAGACCTTGCTGTTTCAATGGCTGCAACTAGA
TCATCATATTTGGCACCCGTAACTTCCTTCACCACTTGGTTATCCTTCAATATTTTAAAA
GTTGGAACCACTCTTATTCCTAGTTCCTTTGCTAATGGCCTGTTTTCAGGGTTGCAGTCA
AGCTTAAGAAACACAACGTCCTCATATTTCTCTGATAAAGCTTTGTATTTAGGAGCAATC
ACTTTACATGGACCACACCATTGAGTGTACATGTCAAGTACCACAATCTTTTCCCCGGCG
GCTTTAACGATGGGCCAGAAGGTATCCTTATCCACTTCCGTCACTTGACCAACACTTACA
TTCACAGTCTCTAAGCTACACCTCACCACAGAGGAGTCTCCCCTTCTCACAGAATCCAGT
GACCAGAAACCAATCCTCGTCGTCGTCGTCGTCGCCACGCCGGAGTAAGGGATACGACAC
TGCTTTTTCGCAGCTCCAAATCCACCGGTTGTCGGAGATAAAGCCGTAGGAGATGGAGCT
AGACGGAGAGACAGAGGCATTGTTGAGTTCGGCGAAAGAGTGTCGGAACGATGAGATTGA
TCAGCTTGTGTGT
GTGTGTGCC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2D777TF 741 0 0
GAAA
TATATTTGATCATCATATTGCTTGAAAACATTTACATATACAAAAGCAGAGTCATAATAA
GAGCACCCACAGAGAGTTTGCTACATTGATACAGCCATATTACAAGTAAAGACATGGGGG
ATTGGCTCATCCCGAAGAACTAGCAGACCTTGCTGTTTCAATGGCTGCAACTAGATCATC
ATATTTGGCACCCGTAACTTCCTTCACCACTTGGTTATCCTTCAATATTTTAAAAGTTGG
AACCACTCTTATTCCTAGTTCCTTTGCTAATGGCCTGTTTTCAGGGTTGCAGTCAAGCTT
AAGAAACACAACGTCCTCATATTTCTCTGATAAAGCTTTGTATTTAGGAGCAATCACTTT
ACATGGACCACACCATTGAGTGTACATGTCAAGTACCACAATCTTTTCCCCGGCGGCTTT
AACGATGGGCCAGAAGGTATCCTTATCCACTTCCGTCACTTGACCAACACTTACATTCAC
AGTCTCTAAGCTACACCTCACCACAGAGGAGTCTCCCCTTCTCACAGAATCCAGTGACCA
GAAACCAATCCTCGTCGTCGTCGTCGTCGCCACGCCGGAGTAAGGGATACGACACTGCTT
TTTCGCAGCTCCAAATCCACCGGTTGTCGGAGATAAAGCCGTAGGAGATGGAGCTAGACG
GAGAGACAGAGGCATTGTTGAGTTCGGCGAAAGAGTGTCGGAACGATGAGATTGATCAGC
TTGTGTGT
GTGTGTGCC

QA 5 732 5 732
DS 

RD RR2D730TF 677 0 0
TAATAAGAGCACCCACAGAGAGTTTGCTACATTGATACAGCCATATTACAAGTAAAGACA
TGGGGGATTGGCTCATCCCGAAGAACTAGCAGACCTTGCTGTTTCAATGGCTGCAACTAG
ATCATCATATTTGGCACCCGTAACTTCCTTCACCACTTGGTTATCCTTCAATATTTTAAA
AGTTGGAACCACTCTTATTCCTAGTTCCTTTGCTAATGGCCTGTTTTCAGGGTTGCAGTC
AAGCTTAAGAAACACAACGTCCTCATATTTCTCTGATAAAGCTTTGTATTTAGGAGCAAT
CACTTTACATGGACCACACCATTGAGTGTACATGTCAAGTACCACAATCTTTTCCCCGGC
GGCTTTAGCGATGGGCCAGAAGGTATCCTTATCCACTTCCGTCACTTGACCAACACTTAC
ATTCACAGTCTCTAAGCTACACCTCACCACAGAGGAGTCTCCCCTTCTCACAGAATCCAG
TGACCAGAAACCAATCCTCGTCGTCGTCGTCGTCGCCACGCCGGAGTAAGGGATACGACA
CTGCTTTTTCGCAGCTCCAAATCCACCGGTTGTCGGAGATAAAGCCGTAGGAGATGGAGC
TAGACGGAGAGACAGAGGCATTGTTGAGTTCGGCGAAAGAGTGTCGGAACGATGAAATTG
ATCAGCTTGTGTGTCAC

QA 1 677 1 677
DS 



CO CL495Contig2 738 6 10 U
GAAATTATATTTGATCATCATATTGCTTGAAAACATTTACACATACAAAAGCAGAGTCAC
AATAAGAGCACCAACAGAAAGCTTGTTACATTGATACAGCCATATTACAAGTAAAGACAT
GGAGGTTGATTGGCTCATCCCGAAGAACTAGCAGACCTTGCTGTTTCAATGGCTGCAACT
AGATCATCATATTTGGCACCCGTAACTTCCTTCACCACTTGGTTATCCTTCAATATTTTA
AAAGTTGGAACCACTCTTATTCCTAGTTCCTTTGCTAATGGCCTGTTTTCAGGGTTGCAG
TCAAGCTTAAGAAACACAACGTCCTCATATTTCTCTGATAAAGCTTTGTATTTAGGAGCA
ATCACTTTACATGGACCACACCATTGAGTGTACATGTCAAGTACCACAATCTTTTCCCCG
GCGGCTTTAACGATGGGCCAGAAGGTATCCTTATCCACTTCCGTCACTTGACCAACACTT
ACATTCACAGTCTCTAAGCTACACCTCACCACAGAGGAGTCTCCCCTTCTCACAGAATCC
AGTGAGCAGAACCCAATCCTCGTCGTCGTCGTCGTCGCCACGCCGGAGTAAGGGATACGA
CACTGCTTTTTCGCAGCTCCAAATCCACCGGTTGTCGGAGATAAAGCCGTAGGAGATGGA
GCTAGACGGAGAGACAGAGGCATTGTTGAGTTCGGCGAAAGAGTGTCGGAACGATGAAAT
TGATCAGCTTGTGTGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2FX54JQ U 1
AF RR2FD09JQ U 14
AF RR2GC30JQ U 1
AF RR2GC30TF C 34
AF RR2FD09TF C 14
AF RR2FX54TF C 14
BS 1 144 RR2FX54JQ
BS 145 145 RR2GC30JQ
BS 146 153 RR2FX54JQ
BS 154 154 RR2GC30JQ
BS 155 311 RR2FX54JQ
BS 312 312 RR2GC30JQ
BS 313 338 RR2FX54JQ
BS 339 474 RR2GC30JQ
BS 475 475 RR2FD09JQ
BS 476 738 RR2GC30JQ

RD RR2FX54JQ 342 0 0
GAAATTATATTTGATCATCATATTGCTTGAAAACATTTACACATACAAAAGCAGAGTCAC
AATAAGAGCACCAACAGAAAGCTTGTTACATTGATACAGCCATATTACAAGTAAAGACAT
GGAGGTTGATTGGCTCATCCCGAAAAACTAGCAAACCTTGCTGTTTCAATGGCTGCAACT
AGATCATCATATTTGGCACCCGTAACTTCCTTCACCACTTGGTTATCCTTCAATATTTTA
AAAGTTGGAACCACTCTTATTCCTAGTTCCTTTGCTAATGGCCTGTTTTCAGGGTTGCAG
TCAAGCTTAAGGAACACAACGTCCTCATATTTCTCTGA
AAAA

QA 1 338 1 338
DS 

RD RR2FD09JQ 571 0 0
ATCATCATATTGCTTGAAAACATTTACACATACAAAAGCAGAGTCACAATAAGAGCACCA
ACAGAAAGCTTGTTACATTGATACAGCCATATTACAAGTAAAGACATGGAGGTTGATTGG
CTCATCCCGAAGAACTAGCAGACCTTGCTGTTTCAATGGCTGCAACTAGATCATCATATT
TGGCACCCGTAACTTCCTTCACCACTTGGTTATCCTTCAATATTTTAAAAGTTGGAACCA
CTCTTATTCCTAGTTCCTTTGCTAATGGCCTGTTTTCAGGGTTGCAGTCAAGCTTAAGAA
ACACAACGTCCTCATATTTCTCTGATAAAGCTTTGTATTTAGGAGCAATCACTTTACATG
GACCACACCATTGAGTGTACATGTCAAGTACCACAATCTTTTCCCCGGCGGCTTTAACGA
TGGGCCAGAAGGTATCCTTATCCACTTCCGTCACTTGACCAACACTTACATTCACAGTCT
CTAAGCTACACCTCACCACAGAGGAGTCTCCCCTTCTCACAGAATCCAGTGAGCAGAACC
CAATCCTCGTCGTCGTCGTCGTCGCCACGCC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2GC30JQ 738 0 0
GAAATTATATTTGATCATCATATTGCTTGAAAACATTTACACATACAAAAGCAGAGTCAC
AATAAGAGCACCAACAGAAAGCTTGTTACATTGATACAGCCATATTACAAGTAAAGACAT
GGAGGTTGATTGGCTCATCCCGAAGAACTAGCAGACCTTGCTGTTTCAATGGCTGCAACT
AGATCATCATATTTGGCACCCGTAACTTCCTTCACCACTTGGTTATCCTTCAATATTTTA
AAAGTTGGAACCACTCTTATTCCTAGTTCCTTTGCTAATGGCCTGTTTTCAGGGTTGCAG
TCAAGCTTAAGAAACACAACGTCCTCATATTTCTCTGATAAAGCTTTGTATTTAGGAGCA
ATCACTTTACATGGACCACACCATTGAGTGTACATGTCAAGTACCACAATCTTTTCCCCG
GCGGCTTTAACGATGGGCCAGAAGGTATCCTTATCCACTTCCGTCACTTGACCAGCACTT
ACATTCACAGTCTCTAAGCTACACCTCACCACAGAGGAGTCTCCCCTTCTCACAGAATCC
AGTGAGCAGAACCCAATCCTCGTCGTCGTCGTCGTCGCCACGCCGGAGTAAGGGATACGA
CACTGCTTTTTCGCAGCTCCAAATCCACCGGTTGTCGGAGATAAAGCCGTAGGAGATGGA
GCTAGACGGAGAGACAGAGGCATTGTTGAGTTCGGCGAAAGAGTGTCGGAACGATGAAAT
TGATCAGCTTGTGTGTCC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2GC30TF 705 0 0
CATTTACACATACAAAAGCAGAGTCACAATAAGAGCACCAACAGAAAGCTTGTTACATTG
ATACAGCCATATTACAAGTAAAGACATGGAGGTTGATTGGCTCATCCCGAAGAACTAGCA
GACCTTGCTGTTTCAATGGCTGCAACTAGATCATCATATTTGGCACCCGTAACTTCCTTC
ACCACTTGGTTATCCTTCAATATTTTAAAAGTTGGAACCACTCTTATTCCTAGTTCCTTT
GCTAATGGCCTGTTTTCAGGGTTGCAGTCAAGCTTAAGAAACACAACGTCCTCATATTTC
TCTGATAAAGCTTTGTATTTAGGAGCAATCACTTTACATGGACCACACCATTGAGTGTAC
ATGTCAAGTACCACAATCTTTTCCCCGGCGGCTTTAACGATGGGCCAGAAGGTATCCTTA
TCCACTTCCGTCACTTGACCAGCACTTACATTCACAGTCTCTAAGCTACACCTCACCACA
GAGGAGTCTCCCCTTCTCACAGAATCCAGTGAGCAGAACCCAATCCTCGTCGTCGTCGTC
GTCGCCACGCCGGAGTAAGGGATACGACACTGCTTTTTCGCAGCTCCAAATCCACCGGTT
GTCGGAGATAAAGCCGTAGGAGATGGAGCTAGACGGAGAGACAGAGGCATTGTTGAGTTC
GGCGAAAGAGTGTCGGAACGATGAAATTGATCAGCTTGTGTGTCC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2FD09TF 725 0 0
ATCATCATATTGCTTGAAAACATTTACACATACAAAAGCAGAGTCACAATAAGAGCACCA
ACAGAAAGCTTGTTACATTGATACAGCCATATTACAAGTAAAGACATGGAGGTTGATTGG
CTCATCCCGAAGAACTAGCAGACCTTGCTGTTTCAATGGCTGCAACTAGATCATCATATT
TGGCACCCGTAACTTCCTTCACCACTTGGTTATCCTTCAATATTTTAAAAGTTGGAACCA
CTCTTATTCCTAGTTCCTTTGCTAATGGCCTGTTTTCAGGGTTGCAGTCAAGCTTAAGAA
ACACAACGTCCTCATATTTCTCTGATAAAGCTTTGTATTTAGGAGCAATCACTTTACATG
GACCACACCATTGAGTGTACATGTCAAGTACCACAATCTTTTCCCCGGCGGCTTTAACGA
TGGGCCAGAAGGTATCCTTATCCACTTCCGTCACTTGACCAACACTTACATTCACAGTCT
CTAAGCTACACCTCACCACAGAGGAGTCTCCCCTTCTCACAGAATCCAGTGAGCAGAACC
CAATCCTCGTCGTCGTCGTCGTCGCCACGCCGGAGTAAGGGATACGACACTGCTTTTTCG
CAGCTCCAAATCCACCGGTTGTCGGAGATAAAGCCGTAGGAGATGGAGCTAGACGGAGAG
ACAGAGGCATTGTTGAGTTCGGCGAAAGAGTGTCGGAACGATGAAATTGATCAGCTTGTG
TGTCC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2FX54TF 725 0 0
TGATCATCATATGC
TGAAAACATTTACACATACAAAAGCAGAGTCACAATAAGAGCACCAACAGAAAGCTTGTT
ACATTGATACAGCCATATTACAAGTAAAGACATGGAGGTTGATTGGCTCATCCCGAAGAA
CTAGCAGACCTTGCTGTTTCAATGGCTGCAACTAGATCATCATATTTGGCACCCGTAACT
TCCTTCACCACTTGGTTATCCTTCAATATTTTAAAAGTTGGAACCACTCTTATTCCTAGT
TCCTTTGCTAATGGCCTGTTTTCAGGGTTGCAGTCAAGCTTAAGGAACACAACGTCCTCA
TATTTCTCTGATAAAGCTTTGTATTTAGGAGCAATCACTTTACATGGACCACACCATTGA
GTGTACATGTCAAGTACCACAATCTTTTCCCCGGTGGCTTTAACGATGGGCCAGAAGGTA
TCCTTATCCACTTCCGTCACTTGACCAACACTTACATTCACAGTCTCTAAGCTACACCTC
ACCACAGAGGAGTCTCCCCTTCTCACAGAATCCAGTGAGCAGAACCCAATCCTCGTCGTC
GTCGTCGTCGCCACGCCGGAGTAAGGGATACGACACTGCTTTTTCGCAGCTCCAAATCCA
CCGGTTGTCGGAGATAAAGCCGTAGGAGATGGAGCTAGACGGAGAGACAGAGGCATTGTT
GAGTTCGGCGAAAGAGTGTCGGAACGATGAAATTGATCAGCTTGTGTGTCC

QA 15 725 15 725
DS 



AS 2 11

CO CL496Contig1 698 5 8 U
GGGACACAAAGATATCAAATAAAAAAAAAGTAAATCTAAGCCTCTAATCTTCATCATGGC
CTCAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCGTTCACCGGTCTCAAATCCACAATCTC
CAAACCCTCCGTTGTCGTCAGAATCCCCACAACATCACGGAAGCTCACCGTGAAGTCATC
TCTAAAGGACTTCGGAGTCGCGGCCGTAGCTGCTGCAGCTTCAATCGCTTTGGCTGGAAA
CGCCATGGCGATAGATGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCGTTAGCTTTCGTTCCCAA
CGAGTTCACAATAGCGAAAGGAGAGAAGATTGTGTTCAAGAACAACGCTGGATTCCCACA
CAATGTTGTGTTCGATGAGGACGAGATCCCGAGTGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTCCAT
GGACGAGCAAGATCTACTCAACGCTGCGGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGACCGAGCC
TGGGACTTACAGCTTCTATTGTGCGCCCCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGTAAAGTCAC
CGTTAACTAAATAAAGTGTGAATGTAAGTGAAAGAGTGCCTCTGAACCAAAGCAGAGGCT
TTCCTATCCGTCTTACATAATGTGTTTTTGTAATTCTAAAGAGTGTTGAGTCGAATGGAC
CGTGATTTGTTATAGTATGAATTGGTCCCATAACTGCT


BQ
20 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E453TF U 2
AF RR2BS62JQ C 1
AF RR2E453JQ C 2
AF RR2GR96TF U 4
AF RR2BS62TF U 1
BS 1 1 RR2BS62TF
BS 2 89 RR2E453TF
BS 90 90 RR2GR96TF
BS 91 354 RR2E453TF
BS 355 355 RR2GR96TF
BS 356 511 RR2E453TF
BS 512 673 RR2GR96TF
BS 674 698 RR2BS62TF

RD RR2E453TF 510 0 0
GGACACAAAGATATCAAATAAAAAAAAAGTAAATCTAAGCCTCTAATCTTCATCATGGCC
TCAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCC*ATCGTTCACCGGTCTCAAATCCACAATCTCC
AAACCCTCCGTTGTCGTCAGAATCCCCACAACATCACGGAAGCTCACCGTGAAGTCATCT
CTAAAGGACTTCGGAGTCGCGGCCGTAGCTGCTGCAGCTTCAATCGCTTTGGCTGGAAAC
GCCATGGCGATAGATGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCGTTAGCTTTCGTTCCCAAC
GAGTTCACAATAGCGAAAGGAGAGAAGATTGTGTTCAAGAACAACGCTGGATTTCCACAC
AATGTTGTGTTCGATGAGGACGAGATCCCGAGTGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTCCATG
GACGAGCAAGATCTACTCAACGCTGCGGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGACCGAGCCT
GGGACTTACAGCTTCTATTGTGCGCCCCAT

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2BS62JQ 698 0 0
GGGACACAAAGATATCAAATAAAAAAAAAGTAAATCTAAGCCTCTAATCTTCATCATGGC
CTCAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCGTTCACCGGTCTCAAATCCACAATCTC
CAAACCCTCCGTTGTCGTCAGAATCCCCACAACATCACGGAAGCTCACCGTGAAGTCATC
TCTAAAGGACTTCGGAGTCGCGGCCGTAGCTGCTGCAGCTTCAATCGCTTTGGCTGGAAA
CGCCATGGCGATAGATGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCGTTAGCTTTCGTTCCCAA
CGAGTTCACAATAGCGAAAGGAGAGAAGATTGTGTTCAAGAACAACGCTGGATTCCCACA
CAATGTTGTGTTCGATGAGGACGAGATCCCGAGTGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTCCAT
GGACGAGCAAGATCTACTCAACGCTGCGGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGACCGAGCC
TGGGACTTACAGCTTCTATTGTGCGCCCCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGTAAAGTCAC
CGTTAACTAAATAAAGTGTGAATGTAAGTGAAAGAGTGCCTCTGAACCAAAGCAGAGGCT
TTCCTATCCGTCTTACATAATGTGTTTTTGTAATTCTAAAGAGTGTTGAGTCGAATGGAC
CGTGATTTGTTATAGTATGAATTGGTCCCATAACTGCT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2E453JQ 672 0 0
GGACACAAAGATATCAAATAAAAAAAAAGTAAATCTAAGCCTCTAATCTTCATCATGGCC
TCAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCC*ATCGTTCACCGGTCTCAAATCCACAATCTCC
AAACCCTCCGTTGTCGTCAGAATCCCCACAACATCACGGAAGCTCACCGTGAAGTCATCT
CTAAAGGACTTCGGAGTCGCGGCCGTAGCTGCTGCAGCTTCAATCGCTTTGGCTGGAAAC
GCCATGGCGATAGATGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCGTTAGCTTTCGTTCCCAAC
GAGTTCACAATAGCGAAAGGAGAGAAGATTGTGTTCAAGAACAACGCTGGATTTCCACAC
AATGTTGTGTTCGATGAGGACGAGATCCCGAGTGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTCCATG
GACGAGCAAGATCTACTCAACGCTGCGGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGACCGAGCCT
GGGACTTACAGCTTCTATTGTGCGCCCCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGTAAAGTCACC
GTTAACTAAATAAAGTGTGAATGTAAGTGAAAGAGTGCCTCTGAACCAAAGCAGAGGCTT
TCCTATCCGTCTTACATAATGTGTTTTTGTAATTCTAAAGAGTGTTGAGTCGAATGGACC
GTGATTTGTTA
C

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2GR96TF 670 0 0
GG
ACAAAGATATCAAATAAAAAAAAAGTAAATCTAAGCCTCTAATCTTCATCATGGCCTCAG
TAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCGTTCACCGGTCTCAAATCCACAATCTCCAAAC
CCTCCGTTGTCGTCAGAATCCCCACAACATCACGGAAGCTCACCGTGAAGTCATCTCTAA
AGGACTTCGGAGTCGCGGCCGTAGCTGCTGCAGCTTCAATCGCTTTGGCTGGAAACGCCA
TGGCGATAGATGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCGTTAGCTTTCGTTCCCAACGAGT
TCACAATAGCGAAAGGAGAGAAGATTGTGTTCAAGAACAACGCTGGATTCCCACACAATG
TTGTGTTCGATGAGGACGAGATCCCGAGTGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTCCATGGACG
AGCAAGATCTACTCAACGCTGCGGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGACCGAGCCTGGGA
CTTACAGCTTCTATTGTGCGCCCCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGTAAAGTCACCGTTA
ACTAAATAAAGTGTGAATGTAAGTGAAAGAGTGCCTCTGAACCAAAGCAGAGGCTTTCCT
ATCCGTCTTACATAATGTGTTTTTGTAATTCTAAAGAGTGTTGAGTCGAATGGACCGTGA
TTTGTTAT

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR2BS62TF 698 0 0
GGGACACAAAGATATCAAATAAAAAAAAAGTAAATCTAAGCCTCTAATCTTCATCATGGC
CTCAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCGTTCACCGGTCTCAAATCCACAATCTC
CAAACCCTCCGTTGTCGTCAGAATCCCCACAACATCACGGAAGCTCACCGTGAAGTCATC
TCTAAAGGACTTCGGAGTCGCGGCCGTAGCTGCTGCAGCTTCAATCGCTTTGGCTGGAAA
CGCCATGGCGATAGATGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCGTTAGCTTTCGTTCCCAA
CGAGTTCACAATAGCGAAAGGAGAGAAGATTGTGTTCAAGAACAACGCTGGATTCCCACA
CAATGTTGTGTTCGATGAGGACGAGATCCCGAGTGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTCCAT
GGACGAGCAAGATCTACTCAACGCTGCGGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGACCGAGCC
TGGGACTTACAGCTTCTATTGTGCGCCCCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGTAAAGTCAC
CGTTAACTAAATAAAGTGTGAATGTAAGTGAAAGAGTGCCTCTGAACCAAAGCAGAGGCT
TTCCTATCCGTCTTACATAATGTGTTTTTGTA*TTCTAAAGAGTGTTGAGTCGAATGGAC
CGTGATTTGT*ATAGTATGAATTGGTCCCATAACTGCT

QA 1 698 1 698
DS 



CO CL496Contig2 739 6 5 U
AGTAGAGACATAAATCTACATACAATTGATAAACCAGGAAAAAGCAGTTATGGAACCAAT
TCATACTATAACAAATCACGGTCCATTCGACTCAACACTCTTTAGAATTACAAAAAACAC
ATTATGTAAGACGGACAGGAAAGCCTCTACTTTGGTTCAGAGGCACTCTTT*CACTTACA
TTCACACTTTATTTAGTTAACGGTGACTTTACCGACCATACCAGCACCCTGATGGGGCGC
ACAATAGAAGCTGTAAGTCCCAGGCTCGGTCAAAGCAACCTCGTACGTCTCTCCCGCAGC
GTTGAGTAGATCTTGCTCGTCCATGGAGATCTTGCTCGCGTCAACACCACTTGGGATCTC
GTCCTCATCGAACACAACATTGTGTGGGAATCCAGCGTTGTTCTTGAACACAATCTTCTC
TCCTTTCGCTATTGTGAAGTCGTTGGGAACGAAAGCTAACGCTCCATCTCCTGATCCCAA
GAGAACATCTATCGCCATGGCGTTTCCAGCCAAAGCGATTGAAGCTGCAGCCGCTACGGC
CGCGACTCCGAAGTCCTTTAGAGATGACTTCACGGTGAGCTTCCGTGATGTTGTGGGGAT
TCTGACGATGGAGGAGGATTTGGATATTGTGGATTTGAGACCGGTGAACGATGGGATTGC
GACGGTGGCTGAGGTTACTGAGGCCATGATGAAGATTAGAGGCTTAGATTTACTTTTTTT
TTTGATATCTTTGTGTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 

AF RR2H069JQ U 1
AF RR2H069TF C 1
AF RR2BQ56JQ U 32
AF RR2BQ56TF C 61
AF RR2BJ90JQ U 50
AF RR2BJ90TF C 50
BS 1 675 RR2H069JQ
BS 676 722 RR2BQ56JQ
BS 723 723 RR2BJ90JQ
BS 724 737 RR2BQ56JQ
BS 738 739 RR2BJ90JQ

RD RR2H069JQ 676 0 0
AGTAGAGACATAAATCTACATACAATTGATAAACCAGGAAAAAGCAGTTATGGAACCAAT
TCATACTATAACAAATCACGGTCCATTCGACTCAACACTCTTTAGAATTACAAAAAACAC
ATTATGTAAGACGGACAGGAAAGCCTCTACTTTGGTTCAGAGGCACTCTTT*CACTTACA
TTCACACTTTATTTAGTTAACGGTGACTTTACCGACCATACCAGCACCCTGATGGGGCGC
ACAATAGAAGCTGTAAGTCCCAGGCTCGGTCAAAGCAACCTCGTACGTCTCTCCCGCAGC
GTTGAGTAGATCTTGCTCGTCCATGGAGATCTTGCTCGCGTCAACACCACTTGGGATCTC
GTCCTCATCGAACACAACATTGTGTGGGAATCCAGCGTTGTTCTTGAACACAATCTTCTC
TCCTTTCGCTATTGTGAAGTCGTTGGGAACGAAAGCTAACGCTCCATCTCCTGATCCCAA
GAGAACATCTATCGCCATGGCGTTTCCAGCCAAAGCGATTGAAGCTGCAGCCGCTACGGC
CGCGACTCCGAAGTCCTTTAGAGATGACTTCACGGTGAGCTTCCGTGATGTTGTGGGGAT
TCTGACGATGGAGGAGGATTTGGATATTGTGGATTTGAGACCGGTGAACGATGGGATTGC
GACGGTGGCTGAGGT
C

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2H069TF 676 0 0
AGTAGAGACATAAATCTACATACAATTGATAAACCAGGAAAAAGCAGTTATGGAACCAAT
TCATACTATAACAAATCACGGTCCATTCGACTCAACACTCTTTAGAATTACAAAAAACAC
ATTATGTAAGACGGACAGGAAAGCCTCTACTTTGGTTCAGAGGCACTCTTT*CACTTACA
TTCACACTTTATTTAGTTAACGGTGACTTTACCGACCATACCAGCACCCTGATGGGGCGC
ACAATAGAAGCTGTAAGTCCCAGGCTCGGTCAAAGCAACCTCGTACGTCTCTCCCGCAGC
GTTGAGTAGATCTTGCTCGTCCATGGAGATCTTGCTCGCGTCAACACCACTTGGGATCTC
GTCCTCATCGAACACAACATTGTGTGGGAATCCAGCGTTGTTCTTGAACACAATCTTCTC
TCCTTTCGCTATTGTGAAGTCGTTGGGAACGAAAGCTAACGCTCCATCTCCTGATCCCAA
GAGAACATCTATCGCCATGGCGTTTCCAGCCAAAGCGATTGAAGCTGCAGCCGCTACGGC
CGCGACTCCGAAGTCCTTTAGAGATGACTTCACGGTGAGCTTCCGTGATGTTGTGGGGAT
TCTGACGATGGAGGAGGATTTGGATATTGTGGATTTGAGACCGGTGAACGATGGGATTGC
GACGGTGGCTGAGGT
C

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2BQ56JQ 708 0 0
AACCAGGAAAAAGCAGTTATGGAACCAATTCATACTATAACAAATCACGGTCCATTCGAC
TCAACACTCTTTAGAATTACAAAAAACACATTATGTAAGACGGACAGGAAAGCCTCTACT
TTGGTTCAAAGGCACTCTTT*CACTTACATTCACACTTTATTTAGTTAACGGTGACTTTA
CCGACCATACCAGCACCCTGATGGGGCGCACAATAGAAGCTGTAAGTCCCAGGCTCGGTC
AAAGCAACCTCGTACGTCTCTCCCGCAGCGTTGAGTAGATCTTGC**GTCCATGGAGATC
TTGCTCGCGTCAACACCACTTGGGATCTCGTCCTCATCGAACACAACATTGTGTGGGAAT
CCAGCGTTGTTCTTGAACACAATCTTCTCTCCTTTCGCTATTGTGAAGTCGTCGGGAACG
AAAGCTAACGCTCCATCTCCTGATCCCAAGAGAACATCTATCGCCATGGCGTTTCCAGCC
AAAGCGATTGAAGCTGCAGCCGCTACGGCCGCGACTCCGAAGTCCTTTAGAGATGACTTC
ACGGTGAGCTTCCGTGATGTTGTGGGGATTCTGACGATGGAGGAGGATTTGGATATTGTG
GATTTGAGACCGGTGAACGATGGGATTGCGACGGTGGCTGAGGTTACTGAGGCCATGATG
AAGATTAGAGGCTTAGATTTACTTTTTTTTT*GATATCTTTGTGTC
GA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2BQ56TF 679 0 0
TCATACTATAACAAATCACGGTCCATTCGACTCAACACTCTTTAGAAT*ACAAAAAACAC
ATTATGTAAGACGGACAGGAAAGCCTCTACTTTGGTTCAGAGGCACTCTTT*CACTTACA
TTCACACTTTATTTAGTTAACGGTGACTTTACCGACCATACCAGCACCCTGATGGGGCGC
ACAATAGAAGCTGTAAGTCCCAGGCTCGGTCAAAGCAACCTCGTACGTCTCTCCCGCAGC
GTTGAGTAGATCTTGC**GTCCATGGAGATCTTGCTCGCGTCAACACCACTTGGGATCTC
GTCCTCATCGAACACAACATTGTGTGGGAATCCAGCGTTGTTCTTGAACACAATCTTCTC
TCCTTTCGCTATTGTGAAGTCGTCGGGAACGAAAGCTAACGCTCCATCTCCTGATCCCAA
GAGAACATCTATCGCCATGGCGTTTCCAGCCAAAGCGATTGAAGCTGCAGCCGCTACGGC
CGCGACTCCGAAGTCCTTTAGAGATGACTTCACGGTGAGCTTCCGTGATGTTGTGGGGAT
TCTGACGATGGAGGAGGATTTGGATATTGTGGATTTGAGACCGGTGAACGATGGGATTGC
GACGGTGGCTGAGGTTACTGAGGCCATGATGAAGATTAGAGGCTTAGATTTACTTTTTTT
TTTGATATCTTTGTGTC
GA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2BJ90JQ 690 0 0
C
TGGAACCAATTCATACTATAACAAATCACGGTCCATTCGACTCAACACTCTTTAGAATTA
CAAAAA*CACATTATGTAAGACGGACAGGAAAGCCTCTACTTTGGTTCAGAGACACTCTT
TTCACTTACATTCACACTTAATTTAGTTAACGGTGACTTTACCGACCATACCAGCACCCT
GATGGGGCGCACAATAGAAGCTGTAAGTCCCAGGCTCGGTCAAAGCAACCTCGTACGTCT
CTCCCGCAGCGTTGAGTAGATCTTGCTCGTCCATGGAGATCTTGCTCACGTCAACACCAC
TTGGGATCTCGTCCTCATCGAACACAACATTGTGTGGGAATCCAGCGTTGTTCTTGAACA
CAATCTTCTCTCCTTTCGATATTGTGAAGTCGTTGGGAACGAAAGCTAACGCTCCATCTC
CTGATCCCAAGAGAACATCTATCGCCATGGCGTTTCCAGCCAAAGCGATTGAAGCTGCAG
CCGCTACGGCCGCGACTCCGAAGTCCTTTAGAGATGACTTCACGGTGAGCTTCCGTGATG
TTGTGGGGATTCTGACGATGGAGGAGGATTTGGATATTGTGGATTTGAGACCGGTGAACG
ATGGGATTGCGACGGTGGCTGAGGTTACTGAGGCCATGATGAAGATTAGAGGCTTAGATT
TACTTTTTTTTTTGATATCTTTGTGTCCC

QA 2 690 2 690
DS 

RD RR2BJ90TF 690 0 0
C
TGGAACCAATTCATACTATAACAAATCACGGTCCATTCGACTCAACACTCTTTAGAATTA
CAAAAA*CACATTATGTAAGACGGACAGGAAAGCCTCTACTTTGGTTCAGAGACACTCTT
TTCACTTACATTCACACTTAATTTAGTTAACGGTGACTTTACCGACCATACCAGCACCCT
GATGGGGCGCACAATAGAAGCTGTAAGTCCCAGGCTCGGTCAAAGCAACCTCGTACGTCT
CTCCCGCAGCGTTGAGTAGATCTTGCTCGTCCATGGAGATCTTGCTCACGTCAACACCAC
TTGGGATCTCGTCCTCATCGAACACAACATTGTGTGGGAATCCAGCGTTGTTCTTGAACA
CAATCTTCTCTCCTTTCGATATTGTGAAGTCGTTGGGAACGAAAGCTAACGCTCCATCTC
CTGATCCCAAGAGAACATCTATCGCCATGGCGTTTCCAGCCAAAGCGATTGAAGCTGCAG
CCGCTACGGCCGCGACTCCGAAGTCCTTTAGAGATGACTTCACGGTGAGCTTCCGTGATG
TTGTGGGGATTCTGACGATGGAGGAGGATTTGGATATTGTGGATTTGAGACCGGTGAACG
ATGGGATTGCGACGGTGGCTGAGGTTACTGAGGCCATGATGAAGATTAGAGGCTTAGATT
TACTTTTTTTTTTGATATCTTTGTGTCCC

QA 2 690 2 690
DS 



AS 2 11

CO CL497Contig1 479 2 3 U
CATAACCATAATATCTATCTTACTTATCATAAAGTTTCCAACACAAACATTCAAATTATT
AAAAAAAAACATTTAACCATAAACGATCACTCCTTTACATAATAACAGAAATAATTAAAA
GCATTACGGGACTTCGGGCTCGACTTCGTACTCGACTTCGTACTCGACTTCGTTTGCGAC
TGCGACTGCGGCTGCGGCGGGGGCTGCAGCATCATCATCGATTTCCACTTCAACTTCAAA
TTCATCACCACCACCACCTCCACCTCCACCACCATCACCGGAAACCACATTGTTGAAGCA
CTGAGCGTATCCCCCAGCAGGAACGGAAATAAAGCCATCATTTTCATCTTCAAATTCCAT
AGGCTCATGTGCAAACAAATAACCATTACAAATGCGCACTATCCCACCGTAAGGGAAGCT
GAAACGCTGCTCATCAGTGGTAAAATGTTGGTTACCGGGAAGATCGGGAACCGTGTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD15JQ U 212
AF RR2AV79JQ U 1
BS 1 312 RR2AV79JQ
BS 313 313 RR2BD15JQ
BS 314 479 RR2AV79JQ

RD RR2BD15JQ 152 0 0
TCATCATCGATTTCCACTTCAACTTCAAATTCATCACCACCACCACCTCCACCTCCACCA
CCATCACCGGAAACCACATTGTTGAAGCACTGAGCGTATCCCCCAGCAGGAACGGAAATA
AAGCCATCATTTTCATCTTCAAATTCCATAGG

QA 1 152 1 152
DS 

RD RR2AV79JQ 479 0 0
CATAACCATAATATCTATCTTACTTATCATAAAGTTTCCAACACAAACATTCAAATTATT
AAAAAAAAACATTTAACCATAAACGATCACTCCTTTACATAATAACAGAAATAATTAAAA
GCATTACGGGACTTCGGGCTCGACTTCGTACTCGACTTCGTACTCGACTTCGTTTGCGAC
TGCGACTGCGGCTGCGGCGGGGGCTGCAGCATCATCATCGATTTCCACTTCAACTTCAAA
TTCATCACCACCACCACCTCCACCTCCACCACCATCACCGGAAACCACATTGTTGAAGCA
CTGAGCGTATCCGCCAGCAGGAACGGAAATAAAGCCATCATTTTCATCTTCAAATTCCAT
AGGCTCATGTGCAAACAAATAACCATTACAAATGCGCACTATCCCACCGTAAGGGAAGCT
GAAACGCTGCTCATCAGTGGTAAAATGTTGGTTACCGGGAAGATCGGGAACCGTGTAAG

QA 1 479 1 479
DS 



CO CL497Contig2 1083 9 6 U
GGGATTCATAGCAACTAACAATGGCAGATGAAAATCCTCCTCACGTTCCCGGTGTCCCTG
CTCTGGCTCCCGGTGTCCCTCCTCAGTTTGGTCCCTTTCTCACCGCCGACCTTCCTAACT
TCGACCGGCAAGGTGATCAGATCCGTCTGACTTATGAGGACGTCGTCAGCAAATCGTACG
TCTTTCCCATAAAGTTCGCAGTAACCAGTGGAGGAGTGTCTTACTCGCATACCGAGTCTC
CCGCTGTATCTCGCGTTCTCACCGCTGCTCAGTCGTATGTCGAATTCCCTCACGGTGGGT
TGCTGCTCATTAATCCTGGTCGTCTGTTTGCCCATAAGGTTTTGAAAGTTAATCGTGTAG
CCATTATGGAGATTCCTAGTGGCGGATATGTTAAGTTCTTCGGCAATGAGACGGATGAAG
ACCAAATCGAAAACGAAAACGAAAACGAAAACGAAGACGAAGTCGAAGACGCAGTCGCAC
CTCAGTTTGGTCCTTTTCCCACCAACGACCTTGCTGCGTTTGACTTCAATGGTGATCAGA
TCCGTTGTGTGTCTGGCGACGAGTCGTACGTGTTTCCCATAAAGTTCGCAGTAACCAGTG
GAGCATTTTCTTACACGGTTCCCGATCTTCCCGGTAACCAACATTTTACCACTGATGAGC
AGCGTCTCAGCTTCCCTTACGGTGGGATAGTGCGCATTCGTAATGGTTATTTGTTTGCAC
ATGAGCCTATGGAATTTGAAGATGAAAATGATGGCTTTATTTCCGTTCCTGCTGGCGGAT
ACGCTCAGTGCTTCAACAATGTGGTTTCCGGTGATGGTGGTGGTGGAGGTGGTGGTGGTG
ATGAAGTTGAAGTTGAAGTGGAAATCGATGATGATGCTGCAGCCCCAGCCGCAGCCGCAG
CCGCAGTCGCAGTCGCAAACGAAATCGAGTACGAAGTCGAGCACGAAGTCCAGTAAAGCT
TTTAATTATCTCTGTTATTATGTAAAGGAGTTATCGTTTATGGTTAAATGTTTTTCTTTA
ATAATTTGAATGTTGTGTTGGAAACTTTATGATAAGTAAGATAGATATTATGGTTATGAA
TTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 

AF RR2F110TF U 5
AF RR2CZ19TF U 2
AF RR2FV35TF U 1
AF RR2AV79TF U 2
AF RR2D820TF U 69
AF RR2BD15TF U 6
AF RR2D820JQ C 316
AF RR2FV35JQ C 402
AF RR2F110JQ C 496
BS 1 331 RR2FV35TF
BS 332 332 RR2CZ19TF
BS 333 738 RR2FV35TF
BS 739 791 RR2BD15TF
BS 792 1078 RR2D820JQ
BS 1079 1083 RR2F110JQ

RD RR2F110TF 570 0 0
GGG
ATAGCAACTAACAATGGCAGATGAAAATCCTCCTCACGTTCCCGGTGTCCCTGCTCTGGC
TCCCGGTGTCCCTCCTCAGTTTGGTCCCTTTCTCACCGCCGACCTTCCTAACTTCGACCG
GCAAGGTGATCAGATCCGTCTGACTTATGAGGACGTCGTCAGCAAATCGTACGTCTTTCC
CATAAAGTTCGCAGTAACCAGTGGAGGAGTGTCTTACTCGCATACCGAGTCTCCCGCTGT
ATCTCGCGTTCTCACCGCTGCTCAGTCGTATGTCGAATTCCCTCACGGTGGGTTGCTGCT
CATTAATCCTGGTCGTCTGTTTGCCCATAAGGTTTTGAAAGTTAATCGTGTAGCCATTAT
GGAGATTCCTAGTGGCGGATATGTTAAGTTCTTCGGCAATGAGACGGATGAAGACCAAAT
CGAAAACGAAAACGAAAACGAAAACGAAGACGAAGTCGAAGACGCAGTCGCACCTCAGTT
TGGTCCTTTTCCCACCAACGACCTTGCTGCGTTTGACTTCAATGGTGATCAGATCCGTTG
TGTGTCTGGCGACGAGTCGTACGTGTT

QA 4 570 4 570
DS 

RD RR2CZ19TF 728 0 0
GGATTC
ATAGCAACTAACAATGGCAGATGAAAATCCTCCTCACGTTCCCGGTGTCCCTGCTCTGGC
TCCCGGTGTCCCTCCTCAGTTTGGTCCCTTTCTCACCGCCGACCTTCCTAACTTCGACCG
GCAAGGTGATCAGATCCGTCTGACTTATGAGGACGTCGTCAGCAAATCGTACGTCTTTCC
CATAAAGTTCGCAGTAACCAGTGGAGGAGTGTCTTACTCGCATACCGAGTCTCCCGCTGT
ATCTCGCGTTCTCACCGCTGCTCAGTCGTATGTCGAATTCCCTCACGGTGGGTTGCTGCT
CATTAATCCTGGTCGTCTGTTTGCCCATAAGGTTTTGAAAGTTAATCGTGTAGCCATTAT
GGAGATTCCTAGTGGCGGATATGTTAAGTTCTTCGGCAATGAGACGGATGAAGACCAAAT
CGAAAACGAAAACGAAAACGAAAACGAAGACGAAGTCGAAGACGCAGTCGCACCTCAGTT
TGGTCCTTTTCCCACCAACGACCTTGCTGCGTTTGACTTCAATGGTGATCAGATCCGTTG
TGTGTCTGGCGACGAGTCGTACGTGTTTCCCATAAAGTTCGCAGTAACCAGTGGAGCATT
TTCTTACACGGTTCCCGATCTTCCCGGTAACCAACATTTTACCACTGATGAGCAGCGTCT
CAGCTTCCCTTACGGGGGGATAGTGCGCATTCGTAATGGTTATT
GTTGCATATGAGCCTATG

QA 7 710 7 710
DS 

RD RR2FV35TF 738 0 0
GGGATTCATAGCAACTAACAATGGCAGATGAAAATCCTCCTCACGTTCCCGGTGTCCCTG
CTCTGGCTCCCGGTGTCCCTCCTCAGTTTGGTCCCTTTCTCACCGCCGACCTTCCTAACT
TCGACCGGCAAGGTGATCAGATCCGTCTGACTTATGAGGACGTCGTCAGCAAATCGTACG
TCTTTCCCATAAAGTTCGCAGTAACCAGTGGAGGAGTGTCTTACTCGCATACCGAGTCTC
CCGCTGTATCTCGCGTTCTCACCGCTGCTCAGTCGTATGTCGAATTCCCTCACGGTGGGT
TGCTGCTCATTAATCCTGGTCGTCTGTTTGCTCATAAGGTTTTGAAAGTTAATCGTGTAG
CCATTATGGAGATTCCTAGTGGCGGATATGTTAAGTTCTTCGGCAATGAGACGGATGAAG
ACCAAATCGAAAACGAAAACGAAAACGAAAACGAAGACGAAGTCGAAGACGCAGTCGCAC
CTCAGTTTGGTCCTTTTCCCACCAACGACCTTGCTGCGTTTGACTTCAATGGTGATCAGA
TCCGTTGTGTGTCTGGCGACGAGTCGTACGTGTTTCCCATAAAGTTCGCAGTAACCAGTG
GAGCATTTTCTTACACGGTTCCCGATCTTCCCGGTAACCAACATTTTACCACTGATGAGC
AGCGTCTCAGCTTCCCTTACGGTGGGATAGTGCGCATTCGTAATGGTTATTTGTTTGCAC
ATGAGCCTATGGAATTTG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2AV79TF 732 0 0
GGATTC
ATAGCAACTAACGATGGCAGATGAAAATCCTCCTCACGTTCCCGGTGTCCCTGCTCTGGC
TCCCGGTGTCCCTCCTCAGTTTGGTCCCTTTCTCACCGCCGACCTTCCTAACTTCGACCG
GCAAGGTGATCAGATCCGTCTGACTTATGAGGACGTCGTCAGCAAATCGTACGTCTTTCC
CATAAAGTTCGCAGTAACCAGTGGAGGAGTGTCTTACTCGCATACCGAGTCTCCCGCTGT
ATCTCGCGTTCTCACCGCTGCTCAGTCGTATGTCGAATTCCCTCACGGTGGGTTGCTGCT
CATTAATCCTGGTCGTCTGTTTGCCCATAAGGTTTTGAAAGTTAATCGTGTAGCCATTAT
GGAGATTCCTAGTGGCGGATATGTTAAGTTCTTCGGCAATGAGACGGATGAAGACCAAAT
CGAAGACGAAAACGAAAACGAAAACGAAGACGAAGTCGAAGACGCAGTCGCACCTCAGTT
TGGTCCTTTTCCCACCAACGACCTTGCTGCGTTTGACTTCAATGGTGATCAGATCCGTTG
TGTGTCTGGCGACGAGTCGTACGTGTTTCCCATAAATTTCGCAGTAACCAGTGGAGCATT
TTCTTACACGGTTCCCGATCTTCCCGGTAACCAACATTTTACCACTGATGAGCAGCGTCT
CAGCTTCCCTTACG*TGGGATAGTGCGCATTCGTAATGGTTATTTGTTTGCACATGAGCC
TATGGA

QA 7 732 7 732
DS 

RD RR2D820TF 681 0 0
CCCGGTGTCCCTCCTCAGTTTGGTCCCTTTCTCACCGCCGACCTTCCTAACTTCGACCGG
CAAGGTGATCAGATCCGTCTGACTTATGAGGACGTCGTCAGCAAATCGCACGTCTTTCCC
ATAAAGTTCGCAGTAACCAGTGGAGGAGTGTCTTACTCGCATACCGAGTCTCCCGCTGTA
TCTCGCGTTCTCACCGCTGCTCAGTCGTATGTCGAATTCCCTCACGGTGGGTTGCTGCTC
ATTAATCCTGGTCGTCTGTTTGCCCATAAGGTTTTGAAAGTTAATCGTGTAGCCATTATG
GAGATTCCTAGTGGCGGATATGTTAAGTTCTTCGGCAATGAGACGGATGAAGACCAAATC
GAAAACGAAAACGAAAACGAAAACGAAGACGAAGTCGAAGACGCAGTCGCACCTCAGTTT
GGTCCTTTTCCCACCAACGACCTTGCTGCGTTTGACTTCAATGGTGATCAGATCCGTTGT
GTGTCTGGCGACGAGTCGTACGTGTTTCCCATAAAGTTCGCAGTAACCAGTGGAGCATTT
TCTTACACGGTTCCCGATCTTCCCGGTAACCAACATTTTACCACTGATGAGCAGCGTCTC
AGCTTCCCTTACGGTGGGATAGTGCGCATTCGTAATGGTTATTTGTTTGCACATGAGCCT
ATGGAATTTGA
GATGAAATGA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2BD15TF 786 0 0
GG
ATAGCAACTAACGATGGCAGATGAAAATCCTCCTCACGTTCCCGGTGTCCCTGCTCTGGC
TCCCGGTGTCCCTCCTCAGTTTGGCCCCTTTCTCACCGCCGACCTTCCTAACTTCGACCG
GCAAGGTGATCAGATCCGTCTGACTTATGAGGACGTCGTCAGCAAATCGTACGTCTTTCC
CATAAAGTTCGCAGTAACCAGTGGAGGAGTGTCTTACTCGCATACCGAGTCTCCCGCTGT
ATCTCGCGTTCTCACCGCTGCTCAGTCGTATGTCGAATTCCCTCACGGTGGGTTGCTGCT
CATTAATCCTGGTCGTCTGTTTGCCCATAAGGTTTTGAAAGTTAATCGTGTAGCCATTAT
GGAGATTCCTAGTGGCGGATATGTTAAGTTCTTCGGCAATGAGACGGATGAAGACCAAAT
CGAAGACGAAAACGAAAACGAAAACGAAGACGAAGTCGAAGACGCAGTCGCACCTCAGTT
TGGTCCTTTTCCCACCAACGACCTTGCTGCGTTTGACTTCAATGGTGATCAGATCCGTTG
TGTGTCTGGCGACGAGTCGTACGTGTTTCCCATAAATTTCGCAGTAACCAGTGGAGCATT
TTCTTACACGGTTCCCGATCTTCCCGGTAACCAACATTTTACCACTGATGAGCAGCGTCT
CAGCTTCCCTTACG*TGGGATAGTGCGCATTCGTAATGGTTATTTGTTTGCACATGAGCC
TATGGAATTTGAAGATGAAAATGATGGCTTTATTTCCGTTCCTGCTGGCGGATACGCTCA
GTGC

QA 3 786 3 786
DS 

RD RR2D820JQ 763 0 0
CTGGTCGTCTGTTTGCCCATAAGGTTTTGAAAGTTAATCGTGTAGCCATTATGGAGATTC
CTAGTGGCGGATATGTTAAGTTCTTCGGCAATGAGACGGATGAAGACCAAATCGAAAACG
AAAACGAAAACGAAAACGAAGACGAAGTCGAAGACGCAGTCGCACCTCAGTTTGGTCCTT
TTCCCACCAACGACCTTGCTGCGTTTGACTTCAATGGTGATCAGATCCGTTGTGTGTCTG
GCGACGAGTCGTACGTGTTTCCCATAAAGTTCGCAGTAACCAGTGGAGCATTTTCTTACA
CGGTTCCCGATCTTCCCGGTAACCAACATTTTACCACTGATGAGCAGCGTTTCAGCTTCC
CTTACGGTGGGATAGTGCGCATTCGTAATGGTTATTTGTTTGCACATGAGCCTATGGAAT
TTGAAGATGAAAATGATGGCTTTATTTCCGTTCCTGCTGGCGGATACGCTCAGTGCTTCA
ACAATGTGGTTTCCGGTGATGGTGGTGGTGGAGGTGGTGGTGGTGATGAAGTTGAAGTTG
AAGTGGAAATCGATGATGATGCTGCAGCCCCAGCCGCAGCCGCAGCCGCAGTCGCAGTCG
CAAACGAAATCGAGTACGAAGTCGAGCACGAAGTCCAGTAAAGCTTTTAATTATCTCTGT
TATTATGTAAAGGAGTTATCGTTTATGGTTAAATGTTTTTCTTTAATAATTTGAATGTTG
TGTTGGAAACTTTATGATAAGTAAGATAGATATTATGGTTATG

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2FV35JQ 678 0 0
GGCAATGAGACGGATGAAGACCAAATCGAAAACGAAAACGAAAACGAAAACGAAGACGAA
GTCGAAGACGCAGTCGCACCTCAGTTTGGTCCTTTTCCCACCAACGACCTTGCTGCGTTT
GACTTCAATGGTGATCAGATCCGTTGTGTGTCTGGCGACGAGTCGTACGTGTTTCCCATA
AAGTTCGCAGTAACCAGTGGAGCATTTTCTTACACGGTTCCCGATCTTCCCGGTAACCAA
CATTTTACCACTGATGAGCAGCGTCTCAGCTTCCCTTACGGTGGGATAGTGCGCATTCGT
AATGGTTATTTGTTTGCACATGAGCCTATGGAATTTGAAGATGAAAATGATGGCTTTATT
CCCGTTCCTGCTGGCGGATACGCTCAGTGCTTCAACAATGTGGTTTCCGGTGATGGTGGT
GGTGGAGGTGGTGGTGGTGATGAAGTTGAAGTTGAAGTGGAAATCGATGATGATGCTGCA
GCCCCAGCCGCAGCCGCAGCCGCAGTCGCAGTCGCAAACGAAATCGAGTACGAAGTCGAG
CACGAAGTCCAGTAAAGCTTTTAATTATCTCTGTTATTATGTAAAGGAGTTATCGTCTAT
GGTTAAATGTTTTTCTTTAATAATTCGAATGTTGTGTTGGAAACTTTATGATAAGTAAGA
TAGATATTATGGTTATG
G

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2F110JQ 588 0 0
TTCCCACCAACGACCTTGCTGCGTTTGACTTCAATGGTGATCAGATCCGTTGTGTGTCTG
GCGACGAGTCGTACGTGTTTCCCATAAAGTTCGCAGTAACCAGTGGAGCATTTTCTTACA
CGGTTCCCGATCTTCCCGGTAACCAACATTTTACCACTGATGAGCAGCGTCTCAGCTTCC
CTTACGGTGGGATAGTGCGCATTCGTAATGGCTATTTGTTTGCACATGAGCCTATGGAAT
TTGAAGATGAAAATGATGGCTTTATTTCCGTTCCTGCTGGCGGATACGCTCAGTGCTTCA
ACAATGTGGTTTCCGGTGATGGTGGTGGTGGAGGTGGTGGTGGTGATGAAGTTGAAGTTG
AAGTGGAAATCGATGATGATGCTGCAGCCCCAGCCGCAGCCGCAGCCGCAGTCGCAGTCG
CAAACGAAATCGAGTACGAAGTCGAGCACGAAGTCCATTAAAGCTTTTAATTATCTCTGT
TATTATGTAAAGGAGTTATCGTTTATGGTTAAATGTTTTTCTTTAATAATTTGAATGTTG
TGTTGGAAACTTTATGATAAGTAAGATAGATATTATGGTTATGAATTC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 11

CO CL498Contig1 1239 11 26 U
GGATCCAAAAACACATCCTTCAGACCAATCTTACCACTTCAAAAGTCTTCACTCGTCACT
TCACTTCACAAACAATCTCTGAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAAATCAAATGACGACA
CTCTTAGGGTTCTCTCATACCAAGTTACCCCACTGCAACGTCTCTATCACTTCTCCAACA
TGCTCATCTTCCTCCACGGTGGTCTCAATGGTGGGGAGACGCTCCGATTCAAAGACTCTC
CGGTCAGGCTTCCTAGGCCGTATCACTCACCATGATCGCCTACCCTCGACTGGTCGGAGA
AGCTCATCAGCAGTGAAAATGTCGTGGGACGGTTCTCTCGCTTCCGTCAAGCTGATCATC
CAAGGCAAAAACCTCGAGTTATCAGAGGCAATCAAGCAGCATGTTGAGGACAAAGTAGGA
AAAGCTGTTCAGAAGCACAGTCATCTCGTCAGAGAAGTTGATGTGAGACTCTCTGTTCGA
GGTGGAGAGTTTGGTAAAGGACCTAAGATCCGTAGATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAG
AAGCATGGCGTTGTGCGCGGTGAGGAAGATGCTGAGACGGTATACGCTTGTATCGACTTG
GTATCAACGATAATACAGAGGAAGCTGAGGAAGATCAAGGAGAAGGACTCTGACCATGGA
AGGCACATGAAAGGTTTCAACAGGTCGAAGGTGAGAGAGCCAGTGATTGAGCCCGTTGTG
GAGGATCCTGAGGACGTTGCTGGAGAAGAAGAAGAGGATGATTTGATCAAGGAGATTGTG
CGTACCAAGTACTTTGAGATGCCACCATTGACTGTCTCTGAGGCAGTGGAGCAGCTGGAG
TTAGTATCTCACGATTTTTACGGCTTCCAGAATGAAGAAACCGGTGAGATAAACATAGTG
TACAAGAGAAAAGAAGGAGGGTACGGTTTGATAATCCCTAAGAAAGATGGCAAGGCTGAG
AAAGTTGATCCGCTTCCAACTGAGCAATTGAATGAACACTCTTTTGCTGAGTAGACTTGT
GTGTCTGTCTCAGAACCAAAACTGATGTTACTTCTCTCCTTACAGATGGTTTGCATGTAT
GGATATGGGCTAAGGGTTCTTGAGAGAAAACAGTGAAAGAAATTGAATTTGTTATGGTTC
AGGAAACAGTGTAAATAATAATAAAAGGCTAGAGAACTTTTTTTTTAAATGATTCTGTTC
TACTCTATTTGAGGTAGAAAGAAAATTGAATCTGAAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 30 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 50 35 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 0 35 10 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F516TF U 31
AF RR2F839TF U 1
AF RR2H685TF U 33
AF RR2B267TF U 71
AF RR2A138TF U 198
AF RR2B020TF U 156
AF RR2F516JQ C 617
AF RR2A138JQ C 384
AF RR2B020JQ C 361
AF RR2H685JQB C 612
AF RR2B267JQ C 822
BS 1 110 RR2F839TF
BS 111 111 RR2H685TF
BS 112 271 RR2F839TF
BS 272 272 RR2H685TF
BS 273 440 RR2F839TF
BS 441 441 RR2H685TF
BS 442 471 RR2F839TF
BS 472 472 RR2F516TF
BS 473 545 RR2F839TF
BS 546 546 RR2H685TF
BS 547 645 RR2F839TF
BS 646 646 RR2H685TF
BS 647 662 RR2F839TF
BS 663 663 RR2B267TF
BS 664 673 RR2F839TF
BS 674 679 RR2H685TF
BS 680 746 RR2B267TF
BS 747 857 RR2B020TF
BS 858 858 RR2B020JQ
BS 859 910 RR2B020TF
BS 911 927 RR2B020JQ
BS 928 928 RR2A138JQ
BS 929 1185 RR2B020JQ
BS 1186 1186 RR2B267JQ
BS 1187 1217 RR2H685JQB
BS 1218 1239 RR2B267JQ

RD RR2F516TF 604 0 0
GGACC
ACTTCAAAAGTCTTCACTCGTCACTTCACTTCACAAACAATCTCTGAATCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCAAAATCAGATGACGACACTCTTAGGGTTCTCTCATACCAAGTTACCCCACTG
CAACGTCTCTATCACTTCTCCAACATGCTCATCTTCCTCCACGGTGGTCTCAATGGTGGG
GAGACGCTCCGATTCAAAGACTCTCCGGTCAGGCTTCCTAGGCCGTATCACTCACCGTGA
TCGCCTACCCTCGACTGGTCGGAGAAGCTCATCAGCAGTGAAAATGTCGTGGGACGGTTC
TCTCGCTTCCGTCAAGCTGATCATCCAAGGCAAAAACCTCGAGTTATCAGAGGCAATCAA
GCAGCATGTTGAGGACAAAGTAGGAAAAGCTGTTCAGAAGCACAGCCATCTCGCCAGAGA
AGTTGATGTGAGACTCTCTGTTCGAGGTGGAGAGTTTGGTAAAGGACCTAAGATCCGTAG
ATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAGAAGCACGGCGTTGTGCGCGGTGAGGAAGATGCTGA
GACGGTATACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGATAATACAGAGGAAGCTGAGGAAGA

QA 6 604 6 604
DS 

RD RR2F839TF 678 0 0
GGATCCAAAAACACATCCTTCAGACCAATCTTACCACTTCAAAAGTCTTCACTCGTCACT
TCACTTCACAAACAATCTCTGAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAAATCAGATGACGACA
CTCTTAGGGTTCTCTCATACCAAGTTACCCCACTGCAACGTCTCTATCACTTCTCCAACA
TGCTCATCTTCCTCCACGGTGGTCTCAATGGTGGGGAGACGCTCCGATTCAAAGACTCTC
CGGTCAGGCTTCCTAGGCCGTATCACTCACCGTGATCGCCTACCCTCGACTGGTCGGAGA
AGCTCATCAGCAGTGAAAATGTCGTGGGACGGTTCTCTCGCTTCCGTCAAGCTGATCATC
CAAGGCAAAAACCTCGAGTTATCAGAGGCAATCAAGCAGCATGTTGAGGACAAAGTAGGA
AAAGCTGTTCAGAAGCACAGCCATCTCGTCAGAGAAGTTGATGTGAGACTCCCTGTTCGA
GGTGGAGAGTTTGGTAAAGGACCTAAGATCCGTAGATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAG
AAGCACGGCGTTGTGCGCGGTGAGGAAGATGCTGAGACGGTATACGCTTGTATCGACTTG
GTATCAACGATAATACAGAGGAAGCTGAGGAAGATCAAGGAGAAG*ACTCTGACCATGGA
AG*CACATGAAAG
TTTCA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2H685TF 647 0 0
GGG
ACTTCAAAAGTCTTCACTCGTCACTTCACTTCACAAACAATCTCTGAATCTCTCTCTCAA
A*****TCAAA*TCAAATGACGACACTCTTAGGGTTCTCTCATACCAAGTTACCCCACTG
CAACGTCTCTATCACTTCTCCAACATGCTCATCTTCCTCCACGGTGGTCTCAATGGTGGG
GAGACGCTCCGATTCAAAGACTCTCCGGTCAGGCTTCCTAGGCCGTATCACTCACCATGA
TCGCCTACCCTCGACTGGTCGGAGAAGCTCATCAGCAGTGAAAATGTCGTGGGACGGTTC
TCTCGCTTCCGTCAAGCTGATCATCCAAGGCAAAAACCTCGAGTTATCAGAGGCGATCAA
GCAGCATGTGGAGGATAAAGTAGGAAAAGCTGTTCAGAAGCACAGTCATCTTGTCAGAGA
AGTTGACGTGAGACTCTCTGTTCGAGGTGGAGAGTTTGGTAAAGGACCCAAGATCCGTAG
ATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAGAAGCATGGCGTTGTTCGCGGTGAGGAAGATGCTGA
GACGGTATACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGATAATACAGAGGAAGCTGAGGAAGAT
CAAGGAGAAGGACTCTGACCATGGAGG*CACATGAAAGGTTTCA

QA 4 647 4 647
DS 

RD RR2B267TF 676 0 0
GGGACAAACAATCTCTGAA
TCTCTCTCTCTCTCAAAATCAAATGACGACACTCTTAGGGTTCTCTCACACCAAGTTACC
CAACTGCAACGTCTCTATCACTTCTCCAACATGCTCATCTTCCTCCACGGTGGTCTCAAT
GGTGGGGAGACGCTCCGATTCAAAGACTCTCCGGTCAGGCTTCCTAGGCCGTATCACTCA
CCATGATCGCCTACCCTCGACTGGTCGGAGAAGCTCATCAGCAGTGAAAATGTCGTGGGA
CGGTTCTCTCGCTTCCGTCAAGCTGATCATCCAAGGCAAAAACCTCGAGTTATCAGAGGC
AATCAAGCAGCATGTTGAGGACAAAGTAGGAAAAGCTGTTCAGAAGCACAGTCATCTCGT
CAGAGAAGTTGATGTGAGACTCTCTGTTCGAGGTGGAGAGTTTGGTAAAGGACCTAAGAT
CCGTAGATGCGAGGTAACACTGTTTACGAAGAAGCATGGCGTTGTGCGCGGTGAGGAAGA
TGCTGAGACGGTCTACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGATAATACAGAGGAAGCTGAG
GAAGATCAAGGAGAAGGACTCCGACCATGGAAGGCACATGCAAGGTTTCAACAGGTCGAA
GGTGAGAGAGCCAGTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGAGGACGTTGCTGGAGA

QA 20 676 20 676
DS 

RD RR2A138TF 569 0 0
GGTGGTCTCAATGGTGGGGAGACGCTCCGATTCAAAGACTCTCCGGTCAGGCTTCCTAGG
CCGTATCACTCACCATGATCGCCTGCCCTCGACTGGTCGGAGAAGCTCATCAGCAGTGAA
AATGTCGTGGGACGGTTCTCTCGCTTCCGTCAAGCTGATCATCCAAGGCAAAAACCTCGA
GTTATCAGAGGCAATCAAGCAGCATGTTGAGGACAAAGTAGGAAAAGCTGTTCAGAAGCA
CAGTCATCTCGTCAGAGAAGTTGATGTGAGACTCTCTGTTCGAGGTGGAGAGTTTGGTAA
AGGACCTAAGATCCGTAGATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAGAAGCATGGCGTTGTGCG
CGGTGAGGAAGATGCTGAGACGGTATACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGATAATACA
GAGGAAGCTGAGGAAGATCAAGGAGAAGGACTCTGACCATGGAAGGCACATGAAAGGTTT
CAACAGGTCGAAGGTGAGAGAGCCTGTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGAGGACGT
TGCTGGAGAAGAAGAAGAGGATGATTTGA

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2B020TF 755 0 0
G
AACGTCTCTATCACTTCTCCAACATGCTCATCTTCCTCCACGGTGGTCTCAATGGTGGGG
AGACGCTCCGATTCAAAGACTCTCCGGTCAGGCTTCCTAGGCCGTATCACTCACCATGAT
CGCCTACCCTCGACTGGTCGGAGAAGCTCATCAGCAGTGAAAATGTCGTGGGACGGTTCT
CTCGCTTCCGTCAAGCTGATCATCCAAGGCAAAAACCTCGAGTTATCAGAGGCAATCAAG
CAGCATGTTGAGGACAAAGTAGGAAAAGCTGTTCAGAAGCACAGTCATCTCGTCAGAGAA
GTTGATGTGAGACTCTCTGTTCGAGGTGGAGAGTTTGGTAAAGGACCTAAGATCCGTAGA
TGCGAGGTAACACTGTTTACAAAGAAGCATGGCGTTGTGCGCGGTGAGGAAGATGCTGAG
ACGGTCTACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGATAATACAGAGGAAGCTGAGGAAGATC
AAGTAGAAGGACTCCGACCATGGAAGGCACATGAAAGGTTTCAACAGGTCGAAGGTGAGA
GAGCCAGTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGAGGACGTTGCTGGAGAAGAAGAAGAG
GATGATTTGATCAAGGAGATTGTGCGTACCAAGTACTTTGAGATGCCACCATTGACTGTC
TCTGAGGCAGTGGAGCAGCTGGAGTTAGTATCTCACGATTTCTACGGCTTCCAGAATGAA
GAAACCGGTGAGATAAACATAGTGTACAAGAGAA

QA 2 755 2 755
DS 

RD RR2F516JQ 405 0 0
AGAGGAAGCTGAGGAAGATCAAGGAGAAGGACTCTGACCATGGAAGGCACATGAAAGGCT
TCAACAGGTCGAAGGTGAGAGAGCCAGTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGAGGACG
TTGCTGGAGAAGAAGAAGAGGATGATTTGATCAAGGAGATTGTGCGTACCAAGTACTTTG
AGATGCCACCATTGACTGTTTTTGAGGCAGTGGAGCAGCTGGAGTTAGTATCTCACGATT
TTTACGGCTTCCAGAATGAAGAAACCGGTGAGATAAACATAGTGTACAAGAGAAAAGAAG
GAGGGTACGGTTTGATAATCCCTAAGAAAGATGGCAAGGCTGAGAAAGTTGATCCGCTTC
CAACTGAGCAATTGAATGAACACTTTTTTGCTGAGTAGACTTGTG

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR2A138JQ 725 0 0
AGAGGCAATCAAGCAGCATGTTGAGGACAAAGTAGGAAAAGCTGTTCAGAAGCACAGTCA
TCTCGTCAGAGAAGTTGATGTGAGACTCTCTGTTCGAGGTGGAGAGTTTGGTAAAGGACC
TAAGATCCGTAGATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAGAAGCATGGCGTTGTGCGCGGTGA
GGAAGATGCTGAGACGGTATACGCTTGTATCGACTTGGTATCAACGATAATACAGAGGAA
GCTGAGGAAGATCAAGGAGAAGGACTCTGACCATGGAAGGCACATGAAAGGTTTCAACAG
GTCGAAGGTGAGAGAGCCTGTGATTGAGCCCGTTGTGGAGGATCCTGAGGACGTTGCTGG
AGAAGAAGAAGAGGATGATTTGATCAAGGAGATTGTGCGTACCAAGTACTTTGAGATGCC
ACCATTGACTGTTTTTGAGGCAGTGGAGCAGCTGGAGTTAGTATCTCACGATTTTTACGG
CTTCCAGAATGAAGAAACCGGTGAGATAAACATAGTGTACAAGAGAAAAGAAGGAGGGTA
CGGTTTGATAATCCCTAAGAAAGATGGCAAGGCTGAGAAAGTTGATCCGCTTCCAACTGA
GCAATTGAATGAACACTCTTTTGCTGAGTAGGCTTGTGTGTCTGTTTCAGAACCAAAACT
GATGTTACTTCTCTCCTTACAGATGGTTTGCATGTATGGATATGGGCTAAGGGTTCTTGA
GAGAA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2B020JQ 834 0 0
CAAGGCAAAAACCTCGAGTTATCAGAGGCAATCAAGCAGCATGTTGAGGACAAAGTAGGA
AAAGCTGTTCAGAAGCACAGTCATCTCGTCAGAGAAGTTGATGTGAGACTCTCTGTTCGA
GGTGGAGAGTTTGGTAAAGGACCTAAGATCCGTAGATGCGAGGTAACACTGTTTACAAAG
AAGCATGGCGTTGTGCGCGGTGAGGAAGATGCTGAGACGGTCTACGCTTGTATCGACTTG
GTATCAACGATAATACAGAGGAAGCTGAGGAAGATCAAGTAGAAGGACTCCGACCATGGA
AGGCACATGAAAGGTTTCAACAGGTCGAAGGTGAGAGAGCCAGTGATTGAGCCCGTTGTG
GAGGATCCTGAGGACGTTGCTGGAGAAGAAGAAGAGGATGATTTGATCAAGGAGATTGTG
CGTACCAAGTACTTTGAGATGCCACCATTGACTGTTTCTGAGGCAGTGGAGCAGCTGGAG
TTAGTATCTCACGATTTTTACGGCTTCCAGAATGAAGAAACCGGTGAGATAAACATAGTG
TACAAGAGAAAAGAAGGAGGGTACGGTCTGATAATCCCTAAGAAAGATGGCAAGGCTGAG
AAAGTTGATCCGCTTCCAACTGAGCAATTGAATGAACACTCTTTTGCTGAGTAGACTTGT
GTGTCTGTCTCAGAACCAAAACTGATGTTACTTCTCTCCTTACAGATGGTTTGCATGTAT
GGATATGGGCTAAGGGTTCTTGAGAGAAAACAGTGAAAGAAATTGAATTTGTTATGGTTC
AGGAAACAGTGTAAATAATAATAAAAGGCTAGAGAACTTTTTTTT
AAATGATCC

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR2H685JQB 606 0 0
AATACAGAGGAAGCTGAGGAAGATCAAGGAGAAGGACTCTGACCATGGAAGGCACATGAA
AGGTTTCAACAGGTCGAAGGTGAGAGAGCCTGTGATTGAGCCCGTTGTGGGGGATCCTGA
GGACGTTGCTGGAGAAGAAGCAGAGGATGATTTGATCAAGGAGATTGTGCGTACCAAGTA
CTTTGAGATGCCACCATTGACCGTCTCTGAGGCAGTGGAGCAGCTGGAGTTAGTATCTCA
CGATTTCTACGGCTTCCAGAATGAAGAAACCGGTGAGATAAACATAGTGTACAACA*AAA
AGAAGGAGGGTACGGTCTGATAATCCCTAAGAAAGATGGCAAGGCTGAGAAAGTTGATCC
GCTTCCAACTGAGCAATTGAATGAACACTCTTTTGCTGAGTAGACTTGTGTGTCTGTCTC
AGAACCAAAACTGATCTTACTTCTCTCCTTACAGATGGTTTGCATGTATGGATATGGGCT
AAGGGTTCTTGAGAGAAAACAGTGAAAGAAATTGAATCTGTTATGGTTCAGGAAACAGTG
TACATAATAATAAAAGGCTAGAGAACTTTTTTCT*AAATGATTCTGTTCTACTCTATTTG
AGGTAG

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2B267JQ 418 0 0
GGCAGTGGAGCAGCTGGAGTTAGTATCTCACGATTTTTACGGCTTCCAGAATGAAGAAAC
CGGTGAGATAAACATAGTGTACAAGAGAAAAGAAGGAGGGTACGGTTTGATAATCCCTAA
GAAAGATGGCAAGGCTGAGAAAGTTGATCCGCTTCCAACTGAGCAATTGAATGAACACTC
TTTTGCTGAGTAGACTTGTGTGTCTGTTTCAGAACCAAAACTGATGTTACTTCTCTCCTT
ACAGATGGTTTGCATGTATGGATATGGGCTAAGGGTTCTTGAGAGAAAACAGTGAAAGAA
ATTGAATTTGTTATGGTTCAGGAAACAGTGTAAATAATAATAAAAGGCTAGAGAACTTTT
TTTTTAAATGATTCTGTTTTACTCTATTTGAGGTAGAAAGAAAATTGAATCTGAAGCT

QA 1 418 1 418
DS 



AS 2 7

CO CL499Contig1 607 2 12 U
GCATATATGAGAGAATGCAACTACATTCAACTAATGTACTTGCAATCAATCGCCACCTAA
TCTCAACAAAAAAAAAAAAAAAATCAGTCACGTAACCCCCAAACGTGTGCGCGACTAAAA
CAACCAGAGACATGGTTTGGTATGGTTATCACAGTGACCTTCACACACATTATATCCAAG
TGTATGTCTTGACCAAAAACATGGTTTGTTTTGGTAAAGTTCATGTATTATTGTTTTCTA
TCATACTAAAAGAAAACCACAAGGAAAAAAAAAGAGAGAGGAGTTTTTGTTGGTGTGGGT
TGACTAGTCTCTCAGCTAATGATCATCTTGTTGAAAAACTCAGCTTGGTCAGGGAAAAAC
TCCAAAAGCTCATCTTTGGTTACCCACACAAAGTCTTCGCAGTTACTTATGTTATACTTC
GATGCTGCTACTACACTGCATTTGAAGAAAAATCTCTTGAAAGATGGCAAATCAGGTGTT
TCTTCAGTAGGTTGTACAGCCATGTGAGCCATTGGAGCATTTCCAACAAAGTACGTGTGA
GTGAGGTCTCCCAAGACTGACTTCAAAGCAAACTCAGCACACTTGCGAAAAGTAGGCTCA
GAATCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR48JQ U 1
AF RR2E723JQ U 117
BS 1 481 RR2AR48JQ
BS 482 482 RR2E723JQ
BS 483 496 RR2AR48JQ
BS 497 497 RR2E723JQ
BS 498 527 RR2AR48JQ
BS 528 528 RR2E723JQ
BS 529 554 RR2AR48JQ
BS 555 555 RR2E723JQ
BS 556 578 RR2AR48JQ
BS 579 579 RR2E723JQ
BS 580 597 RR2AR48JQ
BS 598 607 RR2E723JQ

RD RR2AR48JQ 597 0 0
GCATATATGAGAGAATGCAACTACATTCAACTAATGTACTTGCAATCAATCGCCACCTAA
TCTCAACAAAAAAAAAAAAAAAATCAGTCACGTAACCCCCAAACGTGTGCGCGACTAAAA
CAACCAGAGACATGGTTTGGTATGGTTATCACAGTGACCTTCACACACATTATATCCAAG
TGTATGTCTTGACCAAAAACATGGTTTGTTTTGGTAAAGTTCATGTATTATTGTTTTCTA
TCATACTAAAAGAAAACCACAAGGAAAAAAAAAGAGAGAGGAGTTTTTGTTGGTGTGGGT
TGACTAGTCTCTCAGCTAATGATCATCTTGTTGAAAAACTCAGCTTGGTCAGGGAAAAAC
TCCAAAAGCTCATCTTTGGTTACCCACACAAAGTCTTCGCAGTTACTTATGTTATACTTC
GATGCTGCTACTACACTGCATTTGAAGAAAAATCTCTTGAAAGATGGCAAATCAGGTGTT
TGTTCAGTAGGTTGTATAGCCATGTGAGCCATTGGAGCATTTCCAACGAAGTACGTGTGA
GTGAGGTCTCCCAATACTGACTTCAAAGCAAACTCAGCGCACTTGCGAAAAGTAGGC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2E723JQ 491 0 0
G
AAACAACCAGAGACATGGTTTGGTATGGTTATCACAGTGACCTTTACACACATTATATCC
ATGTGTATGTCTTGACCAGAAACATGGTTTGTTTTGGTAAAGTTCATGTATTATTGTTTT
CTATCATACTAAAAGAGAACCACAAGGAAAAAAAAAGAGAGAGGAGTTTTTGTTGGTGTG
GGTTGACTAGTCTCTCAGCTAATGATCATCTTGTTGAAGAACTCAGCTTGGTCAGGGAAG
AACTCCAAAAGCTCATCTTTGGTTACCCACACAAAGTCTTCGCAGTTACTTATGTTGTAC
TTCGATGCTGCTACTACACTGCATTTGAAGAAGAATCTCTTGAAAGATGGCAAATCAGGT
GTTTCTTCAGTAGGTTGTACAGCCATGTGAGCCATTGGAGCATTTCCAACAAAGTAGGTG
TGAGTGAGGTCTCCCAAGACTGACTTCAAAGCAGATTCAGCACACTTGCGAAGAGTAGGC
TCAGAATCGT

QA 2 491 2 491
DS 



CO CL499Contig2 1149 5 28 U
TTTTTCAAAGTCTGCTCCTTTTTTTTTTGGTTGTCATTTTGGGGAGAGAGAGAGAGAAAT
GCAGAGACTGAGATCTCAGCTACTGGCTAGGCCTCTCTTGGAGGAGAGCAGCAGGCTGCG
AGGGTATTGCACGAGCTCTTCCTCAACCGAAAAGATCGTAGCTTCGGTGCTTTTCGAGAG
ACTGCGAGTTGTGATACCAAAACCGGATCCTAACGTTTACGCTTTTCAGGAGTTCAAATT
CAATTGGCAGCAGCAGTTTCGCCGTAGATACCCTGATGAGTTCTTGGACATTGCTAAAAA
CAGAGCCAAGGGTGAATATCAAATGGATTATGTCCCTGCTCCCAGAGTTACAGAGGCTGA
CAAGAATAACGATAGGAAGTCATTATATAGAGCTCTGGACAAGAAGTTGTATCTTCTTGT
CTTCGGCAAGCCATTTGGAGCTACTAGTGACAAACCTGTCTGGCATTTCCCTGAAAAACT
CTACGATTCTGAGCCTACTCTTCGCAAGTGCGCTGAATCTGCTTTGAAGTCAGTATTGGG
AGACCTCACTCACACCTACTTCGTTGGAAATGCTCCAATGGCTCACATGGCTATACAACC
TACTGAACAAACACCTGATTTGCCATCTTTCAAGAGATTCTTCTTCAAATGCAGTGTAGT
AGCAGCATCGAAGTACAACATAAGTAACTGCGAAGACTTTGTGTGGGTAACCAAAGATGA
GCTTTTGGAGTTCTTCCCTGACCAAGCTGAGTTCTTCAACAAGATGATCATTAGCTGAGA
GACTAGTCAACCCACACCAACAAAAACTCCTCTCTCTTTTTTTTCCTTGTGGTTCTCTTT
TAGTATGATAGAAAACAATAATACATGAACTTTACCAAAACAAACCATGTTTTTGGTCAA
GACATACACATGGATATAATGTGTGTCATGGTCACTGTGATAACCATACCAAACCATGTT
TTTGGTTGTTTTAGTCGCGCACACGTGTGGGGGTTACGTGACTGATTTTTTTTGTTGAGA
TTAGGTGGCGATTGATTGCAAGTACATTAGTTGAATGTAGTTGCATTCTCTCATATATGC
ACACAAAACATGTGTATGGTGAAGTAGGAAGTTTTTAGATTGTCCAGGGAAACGAGCATT
GTGGTAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E723TF U 1
AF RR2FU61TF U 29
AF RR2AR48TF U 35
AF RR2B330TF U 428
AF RR2FU61JQ C 645
BS 1 54 RR2E723TF
BS 55 55 RR2FU61TF
BS 56 100 RR2E723TF
BS 101 101 RR2FU61TF
BS 102 237 RR2E723TF
BS 238 238 RR2FU61TF
BS 239 297 RR2E723TF
BS 298 298 RR2FU61TF
BS 299 327 RR2E723TF
BS 328 328 RR2FU61TF
BS 329 435 RR2E723TF
BS 436 436 RR2FU61TF
BS 437 478 RR2E723TF
BS 479 479 RR2AR48TF
BS 480 510 RR2E723TF
BS 511 511 RR2AR48TF
BS 512 534 RR2E723TF
BS 535 535 RR2AR48TF
BS 536 561 RR2E723TF
BS 562 562 RR2AR48TF
BS 563 592 RR2E723TF
BS 593 593 RR2AR48TF
BS 594 607 RR2E723TF
BS 608 608 RR2AR48TF
BS 609 627 RR2E723TF
BS 628 694 RR2FU61TF
BS 695 785 RR2B330TF
BS 786 1149 RR2FU61JQ

RD RR2E723TF 627 0 0
TTTTTCAAAGTCTGCTCCTTTTTTTTTTGGTTGTCATTTTGGGGAGAGAGAGAGGGAAAT
GCAGAGACTGAGATCTCAGCTACTGGCTAGGCCTCTCTTGAAGGAGAGCAGCAGGCTGCG
AGGGTATTGCACGAGCTCTTCCTCAACCGAAAAGATCGTAGCTTCGGTGCTTTTCGAGAG
ACTGCGAGTTGTGATACCAAAACCGGATCCTAACGTTTACGCTTTTCAGGAGTTCAAGTT
CAATTGGCAGCAGCAGTTTCGCCGTAGATACCCTGATGAGTTCTTGGACATTGCTAAGAA
CAGAGCCAAGGGTGAATATCAAATGGACTATGTCCCTGCTCCCAGAGTTACAGAGGCTGA
CAAGAATAACGATAGGAAGTCATTATATAGAGCTCTGGACAAGAAGTTGTATCTTCTTGT
CTTCGGCAAGCCATTCGGAGCTACTAGTGACAAACCTGTCTGGCATTTCCCTGAAAAAGT
CTACGATTCTGAGCCTACTCTTCGCAAGTGTGCTGAATCTGCTTTGAAGTCAGTCTTGGG
AGACCTCACTCACACCTACTTTGTTGGAAATGCTCCAATGGCTCACATGGCTGTACAACC
TACTGAAGAAACACCTGATTTGCCATC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2FU61TF 666 0 0
GGTTGTCATTTTGGGGA
GAGAGAGAGAGAAATGCAGAGACTGAGATCTCAGCTACTGGCTAGGCCTCTCTTGGAGGA
GAGCAGCAGGCTGCGAGGGTATTGCACGAGCTCTTCCTCAACCGAAAAGATCGTAGCTTC
GGTGCTTTTCGAGAGACTGCGAGTTGTGATACCAAAACCAGATCCTAACGTTTACGCTTT
TCAGGAGTTCAAATTCAATTGGCAGCAGCAGTTTCGCCGTAGATACCCTGATGAGTTCTT
GGACATTGCTAAAAGCAGAGCCAAGGGTGAATATCAAATGGATTATGTCCCTGCCCCCAG
AGTTACAGAAGCTGACAAGAATAACGATAGGAAGTCGTTATATAGAGCTCTCGACAAGAA
ACTCTATCTTCTGGTCTTCGGCAAGCCATTTGGAGCTACTAGTGACAAACCTGTCTGGCA
TTTCCCTGAAAAAGTCTACGATTCTGAGCCTACTCTTCGCAAGTGTGCTGAATCTGCTTT
GAAGTCAGTCTTGGGAGACCTCACTCACACCTACTTTGTTGGAAATGCTCCAATGGCTCA
CATGGCTGTACAACCTACTGAAGAAACACCTGATTTGCCATCTTTCAAGAGATTCTTCTT
CAAATGCAGTGTAGTAGCAGCATCGAAGTACAACATAAGTAACTGCGAA

QA 18 666 18 666
DS 

RD RR2AR48TF 633 0 0
GTCATTTTGGG
GAGATAGAGAGAAATGCAGAGACTGAGATCTCAGCTACTGGCTAGGCCTCTCTTGGAG**
****AGCAGGCTGCGAGGGTATTGCACGAGCTCCTCCTCATCCGAAAAGATCGTAGCTTC
GGTGCTTTTCGAGAGATTGCGAGTTGTGATACCAAAACCGGATCCTAACGTTTACGCTTT
TCAGGAGTTCAAATTCAATTGGCAGCAGCAGTTTCGCCGTAGATACCCTGATGAGTTCTT
GGACATTGCTAAAAACAGAGCCAAGGGTGAATATCAAATGGATTATGTCCCTGCTCCCAG
AGTTACAGAGGCTGACAAGAATAACGATAGGAAGTCATTATATAGAGCTCTGGACAAGAA
GTTGTATCTTCTTGTCTTCGGCAAGCCATTTGGAGCTACTAGTGACAAACCTGTCTGGCA
TTTCCCTGAAAAACTCTACGATTCTGAGCCTACTCTTCGCAAGTGCGCTGAGTCTGCTTT
GAAGTCAGTATTGGGAGACCTCACTCACACGTACTTCGTTGGAAATGCTCCAATGGCTCA
CATGGCTATACAACCTACTGAACAAACACCTGATTTGCCATCTTTCAAGAGATTCTTCTT
CAAATGCAGTGTAGTAGCAGCA

QA 12 633 12 633
DS 

RD RR2B330TF 358 0 0
AAGCCATTTGGAGCTACTAGTGACAAACCTGTCTGGCATTTCCCTGAAAAACTCTACGAT
TCTGAGCCTACTCTTCGCAAGTGCGCTGAGTCTGCTTTGAAGTCAGTATTGGGAGACCTC
ACTCACACGTACTTCGTTGGGAATGCTCCAATGGCTCACATGGCTATACAACCTACTGAA
CAAACACCTGATTTGCCATCTTTCAAGAGATTCTTCTTCAAATGCAGTGTAGTAGCAGCA
TCGAAGTATAACATAAGTAACTGCGAAGACTTTGTGTGGGTAACCAAAGATGAGCTTTTG
GAGTTCTTCCCTGACCAAGCTGAGTTCTTCAACAAGATGATCATTAGCTGAGAGACTA

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR2FU61JQ 505 0 0
TCAAATGCAGTGTAGTAGCAGCATCGAAGTACAACATAAGTAACTGCGAAGACTTTGTGT
GGGTAACCAAAGATGAGCTTTTGGAGTTCTTCCCTGACCAAGCTGAGTTTTTCAACAAGA
TGATCATTAGCTGAGAGACTAGTCAACCCACACCAACAAAAACTCCTCTCTCTTTTTTTT
CCTTGTGGTTCTCTTTTAGTATGATAGAAAACAATAATACATGAACTTTACCAAAACAAA
CCATGTTTTTGGTCAAGACATACACATGGATATAATGTGTGTCATGGTCACTGTGATAAC
CATACCAAACCATGTTTTTGGTTGTTTTAGTCGCGCACACGTGTGGGGGTTACGTGACTG
ATTTTTTTTGTTGAGATTAGGTGGCGATTGATTGCAAGTACATTAGTTGAATGTAGTTGC
ATTCTCTCATATATGCACACAAAACATGTGTATGGTGAAGTAGGAAGTTTTTAGATTGTC
CAGGGAAACGAGCATTGTGGTAACG

QA 1 505 1 505
DS 



AS 2 11

CO CL500Contig1 644 2 3 U
GCGAGAGGAGAGAGAGCATTCAAAAGCTACTGTTAATGCAATGGGAGCTCATTTGAGAGC
TCTTGGCGTGGGAACACCGAGACGCGTGTTGTCTACAGTCGCAGAGGGTATCAAGATGAC
AGAGGAAGATCAGACTTCTCCAAAACCCCAAAGCTTCCGCCCTCTTTCTCCTCACCTCAC
TGTTTACCAGCCTCAGAAGAACTCCATGTTGTCCATTTTCAACAGAATCTCGGGGATTTA
CTTGACCGGAGTCTTTTATGGCGGATACCTTCTCTACCTGAAGATGGGTATGATCTGCCT
CACTTACCCAAGCTTCTACCAGGTTCATTACCTTGTACAGCAGCAACTCCCTGTCATCAC
CTCGGTTACTGCATTAGCCGCGCTTTATCATACTATCAAGAGTATTCACTCACTCTTGAC
CCATTGAAAACAACCTCCTTCCAAAGCTCTTTCGTTTTTTGGTTAAAGCCGCCGCCAAAG
TCTCCAGTAAGAGTTTCCTTGAGATGCACAAGATTTAATAAAAGAGAGTAGAAACGTTTT
GTCAAACTCTCTTCGTCTTTTGACAAAGCAAGTGTCTAGCTTTTGTTTTGGGATTTCAGG
CTTTGAAAGCTCTATGTTTGTTTGCTTTTTCTTTGTTATAAGAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET70TF U 1
AF RR2ET70JQ C 1
BS 1 2 RR2ET70JQ
BS 3 595 RR2ET70TF
BS 596 644 RR2ET70JQ

RD RR2ET70TF 595 0 0
GC
GAGAGGAGAGAGAGCATTCAAAAGCTACTGTTAATGCAATGGGAGCTCATTTGAGAGCTC
TTGGCGTGGGAACACCGAGACGCGTGTTGTCTACAGTCGCAGAGGGTATCAAGATGACAG
AGGAAGATCAGACTTCTCCAAAACCCCAAAGCTTCCGCCCTCTTTCTCCTCACCTCACTG
TTTACCAGCCTCAGAAGAACTCCATGTTGTCCATTTTCAACAGAATCTCGGGGATTTACT
TGACCGGAGTCTTTTATGGCGGATACCTTCTCTACCTGAAGATGGGTATGATCTGCCTCA
CTTACCCAAGCTTCTACCAGGTTCATTACCTTGTACAGCAGCAACTCCCTGTCATCACCT
CGGTTACTGCATTAGCCGCGCTTTATCATACTATCAAGAGTATTCACTCACTCTTGACCC
ATTGAAAACAACCTCCTTCCAAAGCTCTTTCGTTTTTTGGTTAAAGCCGCCGCCAAAGTC
TCCAGTAAGAGTTTCCTTGAGATGCACAAGATTTAATAAAAGAGAGTAGAAACGTTTTGT
CAAACTCTCTTCGTCTTTTGACAAAGCAAGTGTCTAGCTTTTGTTTTGGGATT

QA 3 595 3 595
DS 

RD RR2ET70JQ 644 0 0
GCGAGAGGAGAGAGAGCATTCAAAAGCTACTGTTAATGCAATGGGAGCTCATTTGAGAGC
TCTTGGCGTGGGAACACCGAGACGCGTGTTGTCTACAGTCGCAGAGGGTATCAAGATGAC
AGAGGAAGATCAGACTTCTCCAAAACCCCAAAGCTTCCGCCCTCTTTCTCCTCACCTCAC
TGTTTACCAGCCTCAGAAGAACTCCATGTTGTCCATTTTCAACAGAATCTCGGGGATTTA
CTTGACCGGAGTCTTTTATGGCGGATACCTTCTCTACCTGAAGATGGGTATGATCTGCCT
CACTTACCCAAGCTTCTACCAGGTTCATTACCTTGTACAGCAGCAACTCCCTGTCATCAC
CTCGGTTACTGCATTAGCCGCGCTTTATCATACTATCAAGAGTATTCACTCACTCTTGAC
CCATTGAAAACAACCTCCTTCCAAAGCTCTTTCGTTTTTTGGTTAAAGCCGCCGCCAAAG
TCTCCAGTAAGAGTTTCCTTGAGATGCACAAGATTTAATAAAAGAGAGTAGAAACGTTTT
GTCAAACTCTCTTCGTCTTTTGACAAAGCAAGTGTCTAGCTTTTGTTTTGGGATTTCAGG
CTTTGAAAGCTCTATGTTTGTTTGCTTTTTCTTTGTTATAAGAC

QA 1 644 1 644
DS 



CO CL500Contig2 1069 9 9 U
GATCAGTCAAGAATCCAATTTTCAATTTCTTCTCCACTCACTCTCAAAGTATCATTCCCA
TGCCCAACCTGCATCTCCCTCAAGCGTAGTCTAAGAACTGGTAAACATTTTATTACATTC
CAACCCCTTCAATTAGGTCTTATAACAAAGAAAAAGCAAACAAACATAAAGCTTTCAAAG
CCTGAAATCTCAAAACAAAAGCTAGACACTTGCTTTGCCAAAAAGACGATGAGAGTTTGA
CAAAACGTTTCTACTCTCTTTTATTAAATCTTGTGCATCTCAAGGAAACTCTTACTGGAG
ACTTTGGCCGCGGCTTTAACCAAACAACGAAAGAGCTTTGGGAGGAGGTTGTTTTCAATG
GGTCAAGAGCGAGTGAATACTCTTGATAGTATGGTAAAGCGCGGCTAATGCAGTAACCGA
GGTGATGACAGGGAGTTGCTGCTGTACAAGGTAATGAACCTGGTAGAAGCTTGGGTAGGT
GAGGCAGATCATACCCATCTTCAGGTAGAGAAGGTATCCGCCATAAAAGACTCCGGTCAA
GTAAATCCCCGAGATTCTGTTGAAAATGGATAACATGGAGTTTTTCTGAGGCTGGTAAAC
AGTGAGGTGAGGAGATAAAGGGCGAAAGCTTTGGGGTTTTGGAGAAGTCTGATCTTCCTC
TGTCATCTTGATACCCTCTGCGACTGTAGACAACACGCGTCTCGGTGTTCCCACACCAAG
AGCTCTCAAATGATGAGCTCCCATAGCATTCACAGTAGCTCTTGAGTGCTCTCTCTCCTC
TCTAAAGGCATTGCTTATGTTAGTAGTTCCAAAACCAGTCCCAAAATTGTCGTTCAAAAC
AGATTTCGATCCGAAAACTCTACACAAACTTGCATAGTTTTGACCACTACCCAATGAAGG
TTGAGCGTTACCAGCAAGAGATTTGTAGACGGAAAGAGGCGCAGAGACGACGTCGCGTCG
GCGAAGCGATCGGAGAAGAGCCGTGGCAGCCATCGTCTGAATCGAAAGCAGTATCTGGAC
TACTAACCTTCCTGCGAGCGAGAGACAAGTCCGAACAAAAGGAAAATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 40 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 35 10 50 50 50 50 
50 15 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H533JQB U 1
AF RR2GB07JQ U 1
AF RR2D317JQ U 331
AF RR2FY57JQ U 100
AF RR2AP94JQ U 100
AF RR2H533TF C 323
AF RR2FY57TF C 334
AF RR2AP94TF C 330
AF RR2GB07TF C 327
BS 1 355 RR2GB07JQ
BS 356 356 RR2AP94JQ
BS 357 423 RR2GB07JQ
BS 424 424 RR2AP94JQ
BS 425 448 RR2GB07JQ
BS 449 527 RR2AP94JQ
BS 528 528 RR2FY57JQ
BS 529 895 RR2AP94JQ
BS 896 1069 RR2H533TF

RD RR2H533JQB 224 0 0
GATCAGTCAAGAATCCAATTTTCAATTTCTTCTCCACTCACTCTCAAAGTATCATTCCCA
TGCCCAACCTGCATCTCCCTCAAGCGTAGTCTAAGAACTGGTAAACATTTTATTACATTC
CAACCCCTTCAATTAGGTCTTATAACAAAAAAAAAGCAAACAAACATAAAGCTTTCAAAG
CCTGAAATCTCAAAACAAAAGCTAGACACTTGCTTTGCCAAAAA

QA 1 224 1 224
DS 

RD RR2GB07JQ 448 0 0
GATCAGTCAAGAATCCAATTTTCAATTTCTTCTCCACTCACTCTCAAAGTATCATTCCCA
TGCCCAACCTGCATCTCCCTCAAGCGTAGTCTAAGAACTGGTAAACATTTTATTACATTC
CAACCCCTTCAATTAGGTCTTATAACAAAGAAAAAGCAAACAAACATAAAGCTTTCAAAG
CCTGAAATCTCAAAACAAAAGCTAGACACTTGCTTTGCCAAAAAGACGATGAGAGTTTGA
CAAAACGTTTCTACTCTCTTTTATTAAATCTTGTGCATCTCAAGGAAACTCTTACTGGAG
ACTTTGGCCGCGGCTTTAACCAAACAACGAAAGAGCTTTGGGAGGAGGTTGTTTTTAATG
GGTCAAGAGCGAGTGAATACTCTTGATAGTATGGTAAAGCGCGGCTAATGCAGTAACCGA
GGTAATGACAGGGAGTTGCTGCTGTACA

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR2D317JQ 311 0 0
AAGAGCTTTGGGAGGAGGTTGTTTTCAATGGGTCAAGAGCGAGTGAATACTCTTGATAGT
ATGGTAAAGCGCGGCTAATGCAGTAACCGAGGTGATGACAGGGAGTTGCTGCTGTACAAG
GTAATGAACCTGGTAGAAGCTTGGGTAGGTGAGGCAGATCATACCCATCTTCAGGTAGAG
AAGGTATCCGCCATAAAAGACTCCGGTCAAGTAAATCCCCGAGATTCTGTTGAAAATGGA
TAACATGGAGTTTTTCTGAGGCTGGTAAACAGTGAGGTGAGGAGATAAAGGGCGAAAGCT
GTGGGGTTTTG

QA 1 311 1 311
DS 

RD RR2FY57JQ 710 0 0
GGTAAACATTTTATTACATTCCAACCCCTTCAATTAGGTCTTATAACAAAGAAAAAGCAA
ACAAACATAAAGCTTTCAAAGCCTGAAATCTCAAAACAAAAGCTAGACACTTGCTTTGCC
AAAAAGACGATGAGAGTTTGACAAAACGTTTCTACTCTCTTTTATTAAATCTTGTGCATC
TCAAGGAAACTCTTACTGGAGACTTTGGCCGCGGCTTTAACCAAACAACGAAAGAGCTTT
GGGAGGAGGTTGTTTTCAATGGGTCAAGAGCGAGTGAATACTCTTGATAGTATGGTAAAG
CGCGGCTAATGCAGTAACCGAGGTGATGACAGGGAGTTGCTGCTGTACAAGGTAATGAAC
CTGGTAGAAGCTTGGGTAGGTGAGGCAGATCATACCCATCTTCAGGTAGAGAAGGTATCC
GCCATAAAAGACTCCGGTCAAGTAAATCCCCGAGATTCTGTTGAAAATGGATAACATGGA
GTTTTTCTGAGGCTGGTAAACAGTGAGGTGAGGAGATAAAGGGCGAAAGCTTTGGGGTTT
TGGAGAAGTCTGATCTTCCTCTGTCATCTTGATACCCTCTGCGACTGTAGACAACACGCG
TCTCGGTGTTCCCACACCAAGAGCTCTCAAATGATGAGCTCCCATAGCATTCACAGTAGC
TCTTGAGTGCTCTCTCTCCTCTCTAAAGGCATTGCTTATGTTAGTAGTTC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2AP94JQ 796 0 0
GGTAAACATTTTATTACATTCCAACCCCTTCAATTAGGTCTTATAGCAAAGAAAAAGCAA
ACAAACATAAAGCTTTCAAAGCCTGAAATCTCAAAACAAAAGCCAGACACTTGCTTTGCC
AAAAAGACGATGAGAGTTTGACAAAACGTTTCTACTCTCTTTTATTAAATCTTGTGCATC
TCAAGGAAACTCTTACTGGAGACTTTGGCCGCGGCTTTAACCAAACAACGAAAGAGCTTT
GGGAGGAGGTTGTTTTCAATGGGTCAAGAGCGAGTGAATACTCTTGATAGTATGGTAAAG
CGCGGCTAATGCAGTAACCGAGGTGATGACAGGGAGTTGCTGCTGTACAAGGTAATGAAC
CTGGTAGAAGCTTGGGTAGGTGAGGCAGATCATACCCATCTTCAGGTAGAGAAGGTATCC
GCCATAAAGGACTCCGGTCAAGTAAATCCCCGAGATTCTGTTGAAAATGGATAACATGGA
GTTTTTCTGAGGCTGGTAAACAGTGAGGTGAGGAGATAAAGGGCGAAAGCTTTGGGGTTT
TGGAGAAGTCTGATCTTCCTCTGTCATCTTGATACCCTCTGCGACTGTAGACAACACGCG
TCTCGGTGTTCCCACACCAAGAGCTCTCAAATGATGAGCTCCCATAGCATTCACAGTAGC
TCTTGAGTGCTCTCTCTCCTCTCTAAAGGCATTGCTTATGTTAGTAGTTCCAAAACCAGT
CCCAAAATTGTCGTTCAAAACAGATTTCGATCCGAAAACTCTACACAAACTTGCATAGTT
TTGACCACTACCCAAT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2H533TF 747 0 0
AACAACGAAAGAGCTTTGG*AGGAGGTTGTTTT*AATGG*TCAAGAGCGAGTGAATACTC
TTGATAGTATGGTAAAGCGCGGCTAATGCAGTAACCGAGGTAATGACAGGGAGTTGCTGC
TGTACAAGGTAATGAACCTGGTAGAAGCTTGGGTAGGTGAGGCAGATCATACCCATCTTC
AGGTAGAGAAGGTATCCGCCATAAAAGACTCCGGTCAAGTAAATCCCCGAGATTCTGTTG
AAAATGGATAACATGGAGTTTTTCTGAGGCTGGTAAACAGTGAGGTGAGGAGATAAAGGG
CGAAAGCTTTGGGGTTTTGGAGAAGTCTGATCTTCCTCTGTCATCTTGATACCCTCTGCG
ACTGTAGACAACACGCGTCTCGGTGTTCCCACACCAAGAGCTCTCAAATGATGAGCTCCC
ATAGCATTCACAGTAGCTCTTGAGTGCTCTCTCTCCTCTCTAAAGGCATTGCTTATGTTA
GTAGTTCCAAAACCAGTCCCAAAATTGTCGTTCAAACCAGATTTCGATCCGAAAACTCTA
CACAAACTTGCATAGTTTTGACCACTACCCAATGAAGGTTGAGCGTTACCAGCAAGAGAT
TTGTAGACGGAAAGAGGCGCAGAGACGACGTCGCGTCGGCGAAGCGATCGGAGAAGAGCC
GTGGCAGCCATCGTCTGAATCGAAAGCAGTATCTGGACTACTAACCTTCCTGCGAGCGAG
AGACAAGTCCGAACAAAAGGAAAATCC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2FY57TF 725 0 0
GAGC
TTGGGAGGAGGTTGTTT*CAATGG*TCAAGAGCGAGTGAATACTCTTGATAGTATG*TAA
AGCGCGGCTAATGCAGTAACCGAGGTGATGACAGGGAGTTGCTGCTGTACAAGGTAATGA
ACCTGGTAGAAGCTTGGGTAGGTGAGGCAGATCATACCCATCTTCAGGTAGAGAAGGTAT
CCGCCATAAAAGACTCCGGTCAAGTAAATCCCCGAGATTCTGTTGAAAATGGATAACATG
GAGTTTTTCTGAGGCTGGTAAACAGTGAGGTGAGGAGATAAAGGGCGAAAGCTTTGGGGT
TTTGGAGAAGTCTGATCTTCCTCTGTCATCTTGATACCCTCTGCGACTGTAGACAACACG
CGTCTCGGTGTTCCCACACCAAGAGCTCTCAAATGATGAGCTCCCATAGCATTCACAGTA
GCTCTTGAGTGCTCTCTCTCCTCTCTAAAGGCATTGCTTATGTTAGTAGTTCCAAAACCA
GTCCCAAAATTGTCGTTCAAACCAGATTTCGATCCGAAAACTCTACACAAACTTGCATAG
TTTTGACCACTACCCAATGAAGGTTGAGCGTTACCAGCAAGAGATTTGTAGACGGAAAGA
GGCGCAGAGACGACGTCGCGTCGGCGAAGCGATCGGAGAAGAGCCGTGGCAGCCATCGTC
TGAATCGAAAGCAGTATCTGGACTACTAACCTTCCTGCGAGCGAGAGACAAGTCCGAAC
CC

QA 5 723 5 723
DS 

RD RR2AP94TF 740 0 0
AAAGAGCTTTGGGAGGAGGTTGTTTTCAATGGGTCAAGAGCGAGTGAATACTCTTGATAG
TATGGTAAAGCGCGGCTAATGCAGTAACCGAGGTGATGACAGGGAGTTGCTGCTGTACAA
GGTAATGAACCTGGTAGAAGCTTGGGTAGGTGAGGCAGATCATACCCATCTTCAGGTAGA
GAAGGTATCCGCCATAAAGGACTCCGGTCAAGTAAATCCCCGAGATTCTGTTGAAAATGG
ATAACATGGAGTTTTTCTGAGGCTGGTAAACAGTGAGGTGAGGAGATAAAGGGCGAAAGC
TTTGGGGTTTTGGAGAAGTCTGATCTTCCTCTGTCATCTTGATACCCTCTGCGACTGTAG
ACAACACGCGTCTCGGTGTTCCCACACCAAGAGCTCTCAAATGATGAGCTCCCATAGCAT
TCACAGTAGCTCTTGAGTGCTCTCTCTCCTCTCTAAAGGCATTGCTTATGTTAGTAGTTC
CAAAACCAGTCCCAAAATTGTCGTTCAAAACAGATTTCGATCCGAAAACTCTACACAAAC
TTGCATAGTTTTGACCACTACCCAATGAAGGTTGAGCGTTACCAGCAAGAGATTTGTAGA
CGGAAAGAGGCGCAGAGACGACGTCGCATCGGCGAAGCGATCGGAGAAGAGCCGTGGCAG
CCATCGTCTGAATCGAAAGCAGTATCTGGACTACTAACCTTCCTGCGAGCGAGAGACAAG
TCCGAACAAAAGGAAAATCC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2GB07TF 743 0 0
ACGAAAGAGCTTTGG*AGGAG**TGTTTT*AATGG*TCA*GAGCGAGTGAATACTCT*GA
TAGTATG*TAAAGCGCGGCTAATGCAGTA*CCGAGGTAATGACAGGGAGTTGCTGCTGTA
CAAGGTAATGAACCTGGTAGAAGCTTGGGTAGGTGAGGCAGATCATACCCATCTTCAGGT
AGAGAAGGTATCCGCCATAAAAGACTCCGGTCAAGTAAATCCCCGAGATTCTGTTGAAAA
TGGATAACATGGAGTTTTTCTGAGGCTGGTAAACAGTGAGGTGAGGAGATAAAGGGCGAA
AGCTTTGGGGTTTTGGAGAAGTCTGATCTTCCTCTGTCATCTTGATACCCTCTGCGACTG
TAGACAACACGCGTCTCGGTGTTCCCACACCAAGAGCTCTCAAATGATGAGCTCCCATAG
CATTCACAGTAGCTCTTGAGTGCTCTCTCTCCTCTCTAAAGGCATTGCTTATGTTAGTAG
TTCCAAAACCAGTCCCAAAATTGTCGTTCAAACCAGATTTCGATCCGAAAACTCTACACA
AACTTGCATAGTTTTGACCACTACCCAATGAAGGTTGAGCGTTACCAGCAAGAGATTTGT
AGACGGAAAGAGGCGCAGAGACGACGTCGCGTCGGCGAAGCGATCGGAGAAGAGCCGTGG
CAGCCATCGTCTGAATCGAAAGCAGTATCTGGACTACTAACCTTCCTGCGAGCGAGAGAC
AAGTCCGAACAAAAGGAAAATCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 11

CO CL501Contig1 715 11 5 U
AACGAAAATGCATGAGCATAATAAATTTAACAAAGTATCTAAAAGTAGTTTCATCATAAA
GCAAAAACAAATGCAAAAAAATAAAAAGGATCCGAATACATAAGAGACAACTCAAAGCAA
AGACCATATAACGATGAAGGAACACATTCCCCAAGCAGCAATATAAGCTCTTCTTCACTT
GAGAGGAATAAACCTGGAGGAGTGGGTAGCACCAACACCAGGCCTACCGTGCTTAACCGG
CTTGTATGAGATGGAGAACTCAGCCAAGTAGTGACCAATCATCTCAGGCTTGATCTCGAC
TTGGTTAAAGGTCTTTCCATTGTACACTCCAATGATGCTTCCGATCATCTCTGGGACAAT
GATCATGTTCCTCAAGTGGGTTCTCACTGGCTCTGGCTTCTCACCTTGTGGTGCCTCCCT
TTTCGCCTTACGGAGCTTCTTAATGAGAGCCATTGGCTTCCTGGTCAAACCTCTTGAAAA
CCTTCTGCGAATACGAGAAGGGAAGAGCTTGACGAGATCATCAGTAGACATGTCAAGAAG
AGCATCGAGATCGACTCCTTTGAAGGCAAACTTCTTGAACGTCCTCTTCTTTGGGACTCC
AGCAGCAGCAACCTCTGGTTCAACATCCGCCATGGTTTAGATCTCAGAGAAAGGATAAAA
CCCTAAAACGGCTAAAAAGCTTGAGGAAGTTTTATTAGGTCTTTGCGAAGAGTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 15 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 50 65 65 65 65 55 55 55 55 5 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 0 50 50 
0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 40 40 40 40 40 40 40 40 
15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 

AF RR2GX89JQ U 3
AF RR2C736JQ U 17
AF RR2DC68JQ U 220
AF RR2D862JQ U 30
AF RR2CO66JQ U 20
AF RR2GB93JQ U 1
AF RR2CO66TF C 12
AF RR2GX89TF C 12
AF RR2GB93TF C 101
AF RR2D862TF C 30
AF RR2C736TF C 102
BS 1 540 RR2GB93JQ
BS 541 541 RR2D862JQ
BS 542 678 RR2GB93JQ
BS 679 714 RR2CO66TF
BS 715 715 RR2C736TF

RD RR2GX89JQ 516 0 0
G
GAAAATGCATGAGCATAATAAATTTAACAAAGTATCTAAAAGTAGTTTCATCATAAAGCA
AAAACAAATGCAAAAAAATAAAAAGGATCCGAATACATAAGAAACAACTCAAAGCAAAGA
CCATATAACGATGAAGGAACACATTCCCCAAGCAGCAATATAAGCTCTTCTTCACTTGAG
AGGAATAAACCTGGAGGAGTGGGTAGCACCAACACCAGGCCTACCGTGCTTAACCGGCTT
GTATGAAATGGAGAACTCAGCCAAGTAGTGACCAATCATCTCAGGCTTGATCTCGACTTG
GTTAAAGGTCTTTCCATTGTACACTCCAATGATGCTTCCGATCATCTCTGGGACAATGAT
CATGTTCCTCAAGTGGGTTCTCACTGGCTCTGGCTTCTCACCTTGTGGTGCCTCCCTTTT
CGCCTTACGGAGCTTCTTAATGAGAGCCATTGGCTTCCTGGTCAAACCTCTTGAAAACCT
TCTGCGAATACGAAAAGGGAAGAGCTTGACGAGAT

QA 2 516 2 516
DS 

RD RR2C736JQ 502 0 0
CATAATAAATTTAACAAAGTATCTAAAAGTAGTTTCATCATAAAGCAAAAACAAATGCAA
AAAA*TAAAAAGGATCCGAATACATAAGAGACAACTCAAAGCAAAGACCATATAACGATG
AAGGAACACATTCCCCAAGCAGCAATATAAGCTCTTCTTCACTTGAGAGGAATAAACCTG
GAGGAGTGGGTAGCACCAACACCAGGCCTACCGTGCTTAACCGGCTTGTATGAGATGGAG
AACTCAGCCAAGTAGTGACCAATCATCTCAGGCTTGATCTCGACTTGGTTAAAGGTCTTT
CCATTGTACACTCCAATGATGCTTCCGATCATCTCTGGGACAATGATCATGTTCCTCAAG
TGGGTTCTCACTGGCTCTGGCTTCCCACCTTGTGGTGCCTCCCTTTTCGCCTTACGGAGC
TTCTTAATGAGAGCCATTGGCTTCCTGGTCAAACCTCTTGAAAACCTTCTGCGAATACGA
GAAGGGAAGAGCTTGACGAGAT

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR2DC68JQ 306 0 0
TT
GCCTACCGTGCTTAACCGGCTTGTATGAGATGGAGAACTCACCCAAGTAGTGACCAATCA
TCTCAGGCTTGATCTCGACTTGGTTAAAGGTCTTTCCATTGTACACTCCAATGATGCTTC
CGATCATCTCTGGGACAATGATCATGTTCCTCAAGTGGGTTCTCACTGGCTCTGGCTTCT
CACCTTGTGGTGCCTCCCTTTTCGCCTTACGGAGCTTCTTAATGAGAGCCATTGGCTTCC
TGGTCAAACCTCTTGAGAACCTTCTGCGAATACGAGAAGGGAAGAGCTTGACAAGATCAT
CAGT

QA 3 306 3 306
DS 

RD RR2D862JQ 522 0 0
G
CAAAGTATCTAAAAGTAGTTTCATCATAAAGCAAAAACAAATGCAAAAAAATAAAAAGGA
TCCGAATACATAAGAGACAACTCAAAGCAAAGACCATATAACGATGAAGGAGCACATTCC
CCAAGCAGCAATATAAGCTCTTCTTCACTTGAGAGGAATGAACCTGGAGGAGTGGGTAGC
ACCAACACCAGGCCTACCGTGCTTAACCGGCTTGTACGAAATGGAGAACTCAGCCAAGTA
GTGACCAATCATCTCAGGCTTGATCTCGACTTGGTTAAAGGTCTTTCCATTGTACACTCC
AATGATGCTTCCGATCATCTCTGGGACAATGATCATGTTCCTCAAGTGGGTTCTCACTGG
CTCTGGCTTCTCACCTTGTGGTGCCTCCCTTTTCGCCTTACGGAGCTTCTTAATGAGAGC
CATTGGCTTCCTGGTCAAACCTCTTGAGAACCTTCTGCGAATACGAGAAGGGAAGAGCTT
GACGAGATCATCGGTAGACATGTCGAGTAGAGCATCGAGAT

QA 2 522 2 522
DS 

RD RR2CO66JQ 572 0 0
AATAAATTTAACAAAGTATCTAAAAGTAGTTTCATCATAAAGCAAAAACAAATGCAAAAA
AATAAAAAGGATCCGAATACATAAGAGACAACTCAAAGCAAAGACCATATAACGATGAAG
GAACACATTCCCCAAGCAGCAATATAAGCTCTTCTTCACTTGAGAGGAATGAACCTGGAG
GAGTGGGTAGCACCAACACCAGGCCTACCGTGCTTAACCGGCTTGTACGAGATGGAGAAC
TCAGCCAAGTAGTGACCAATCATCTCAGGGTTGATCTCGACTTGGTTAAAGGTCTTTCCA
TTGTACACTCCAATGATGCTTCCGATCATCTCTGGGACAATGATCATGTTCCTCAAGTGG
GTTCTCACTGGCTCTGGCTTCTCACCTTGTGGTGCCTCCCTTTTCGCCTTACGGAGCTTC
TTAATGAGAGCCATTGGCTTCCTGGTCAAACCTCTTGAGAACCTTCTGCGAATACGAGAA
GGGAAGAGCTCGACGAGATCATCGGTAGACATGTCGAGTAGAGCATCGAGATCGACTCCT
TTGAAGGCAAACTTCTTGAACGTCCTCTTCTT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2GB93JQ 678 0 0
AACGAAAATGCATGAGCATAATAAATTTAACAAAGTATCTAAAAGTAGTTTCATCATAAA
GCAAAAACAAATGCAAAAAAATAAAAAGGATCCGAATACATAAGAGACAACTCAAAGCAA
AGACCATATAACGATGAAGGAACACATTCCCCAAGCAGCAATATAAGCTCTTCTTCACTT
GAGAGGAATAAACCTGGAGGAGTGGGTAGCACCAACACCAGGCCTACCGTGCTTAACCGG
CTTGTATGAGATGGAGAACTCAGCCAAGTAGTGACCAATCATCTCAGGCTTGATCTCGAC
TTGGTTAAAGGTCTTTCCATTGTACACTCCAATGATGCTTCCGATCATCTCTGGGACAAT
GATCATGTTCCTCAAGTGGGTTCTCACTGGCTCTGGCTTCTCACCTTGTGGTGCCTCCCT
TTTCGCCTTACGGAGCTTCTTAATGAGAGCCATTGGCTTCCTGGTCAAACCTCTTGAAAA
CCTTCTGCGAATACGAGAAGGGAAGAGCTTGACGAGATCATCAGTAGACATGTCAAGAAG
GGCATCGAGATCGACTCCTTTGAAGGCAAACTTCTTGAACGTCCTCTTCTTTGGGACTCC
AGCAGCAGCAACCTCTGGTTCAACATCCGCCATGGTTTAGATCTCAGAGAAAGGATAAAA
CCCTAAAACGGCTAAAAA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2CO66TF 704 0 0
ATGAGCATAATAAATT*AACAAAGTATCTAAAAGTAGTTTCATCATAAAGCAAAAACAAA
TGCAAAAAA*TAAAAAGGATCCGAATACATAAGAGACAACTCAAAGCAAAGACCATATAA
CGATGAAGGAACACATTCCCCAAGCAGCAATATAAGCTCTTCTTCACTTGAGAGGAATGA
ACCTGGAGGAGTGGGTAGCACCAACACCAGGCCTACCGTGCTTAACCGGCTTGTACGAGA
TGGAGAACTCAGCCAAGTAGTGACCAATCATCTCAGGGTTGATCTCGACTTGGTTAAAGG
TCTTTCCATTGTACACTCCAATGATGCTTCCGATCATCTCTGGGACAATGATCATGTTCC
TCAAGTGGGTTCTCACTGGCTCTGGCTTCTCACCTTGTGGTGCCTCCCTTTTCGCCTTAC
GGAGCTTCTTAATGAGAGCCATTGGCTTCCTGGTCAAACCTCTTGAGAACCTTCTGCGAA
TACGAGAAGGGAAGAGCTCGACGAGATCATCGGTAGACATGTCGAGTAGAGCATCGAGAT
CGACTCCTTTGAAGGCAAACTTCTTGAACGTCCTCTTCTTAGGGACTCCGGCAGCAGCAA
CCTCTGGTTCAACATCCGCCATGGTTTAGATCTCAGAGAAAGGATAAAACCCTAAAACGG
CTAAAAAGCTTGAGGAAGTTTTATTAGGTCTTTGCGAAGAGTC
C

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2GX89TF 704 0 0
ATGAGCATAATAAATTTAACAAAGTATCTAAAAGTAGTTTCATCATAAAGCAAAAACAAA
TGCAAAAAAATAAAAAGGATCCGAATACATAAGAGACAACTCAAAGCAAAGACCATATAA
CGATGAAGGAACACATTCCCCAAGCAGCAATATAAGCTCTTCTTCACTTGAGAGGAATAA
ACCTGGAGGAGTGGGTAGCACCAACACCAGGCCTACCGTGCTTAACCGGCTTGTATGAGA
TGGAGAACTCAGCCAAGTAGTGACCAATCATCTCAGGCTTGATCTCGACTTGGTTAAAGG
TCTTTCCATTGTACACTCCAATGATGCTTCCGATCATCTCTGGGACAATGATCATGTTCC
TCAAGTGGGTTCTCACTGGCTCTGGCTTCTCACCTTGTGGTGCCTCCCTTTTCGCCTTAC
GGAGCTTCTTAATGAGAGCCATTGGCTTCCTGGTCAAACCTCTTGAAAACCTTCTGCGAA
TACGAGAAGGGAAGAGCTTGACGAGATCATCAGTAGACATGTCAAGAAGGGCATCGAGAT
CGACTCCTTTGAAGGCAAACTTCTTGAACGTCCTCTTCTTTGGGACTCCAGCAGCAGCAA
CCTCTGGTTCAACATCCGCCATGGTTTAGATCTCAGAGAAAGGATAAAACCCTAAAACGG
CTAAAAAGCTTGAGGAAGTTTTATTAGGTCTTTGCGAAGAGTC
C

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2GB93TF 614 0 0
TAAGAGACAACTCAAAGCAAAGACCATATAACGATGAAGGAACACATTCCCCAAGCAGCA
ATATAAGCTCTTCTTCACTTGAGAGGAATAAACCTGGAGGAGTGGGTAGCACCAACACCA
GGCCTACCGTGCTTAACCGGCTTGTATGAGATGGAGAACTCAGCCAAGTAGTGACCAATC
ATCTCAGGCTTGATCTCGACTTGGTTAAAGGTCTTTCCATTGTACACTCCAATGATGCTT
CCGATCATCTCTGGGACAATGATCATGTTCCTCAAGTGGGTTCTCACTGGCTCTGGCTTC
TCACCTTGTGGTGCCTCCCTTTTCGCCTTACGGAGCTTCTTAATGAGAGCCATTGGCTTC
CTGGTCAAACCTCTTGAAAACCTTCTGCGAATACGAGAAGGGAAGAGCTTGACGAGATCA
TCAGTAGACATGTCAAGAAGGGCATCGAGATCGACTCCTTTGAAGGCAAACTTCTTGAAC
GTCCTCTTCTTTGGGACTCCAGCAGCAGCAACCTCTGGTTCAACATCCGCCATGGTTTAG
ATCTCAGAGAAAGGATAAAACCCTAAAACGGCTAAAAAGCTTGAGGAAGTTTTATTAGGT
CTTTGCGAAGAGTC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2D862TF 682 0 0
G
CAAAGTATCTAAAAGTAGTTTCATCATAAAGCAAAAACAAATGCAAAAAAATAAAAAGGA
TCCGAATACATAAGAGACAACTCAAAGCAAAGACCATATAACGATGAAGGAGCACATTCC
CCAAGCAGCAATATAAGCTCTTCTTCACTTGAGAGGAATGAACCTGGAGGAGTGGGTAGC
ACCAACACCAGGCCTACCGTGCTTAACCGGCTTGTACGAGATGGAGAACTCAGCCAAGTA
GTGACCAATCATCTCAGGCTTGATCTCGACTTGGTTAAAGGTCTTTCCATTGTACACTCC
AATGATGCTTCCGATCATCTCTGGGACAATGATCATGTTCCTCAAGTGGGTTCTCACTGG
CTCTGGCTTCTCACCTTGTGGTGCCTCCCTTTTCGCCTTACGGAGCTTCTTAATGAGAGC
CATTGGCTTCCTGGTCAAACCTCTTGAGAACCTTCTGCGAATACGAGAAGGGAAGAGCTT
GACGAGATCATCGGTAGACATGTCGAGTAGAGCATCGAGATCGACTCCTTTGAAGGCAAA
CTTCTTGAACGTCCTCTTCTTAGGGACTCCGGCAGCAGCAACCTCTGGTTCAACGTCCGC
CATGGTTTAGATCTCAGAGAAAGGATAAAACCCTAAAACGGCTAAAAAGCTTGAGGAAGT
TTTATTAGGTCTTTGCGAA
CC

QA 2 680 2 680
DS 

RD RR2C736TF 614 0 0
AAGAGACAACTCAAAGCAAAGACCATATAACGATGAAGGAACACATTCCCCAAGCAGCAA
TATAAGCTCTTCTTCACTTGAGAGGAATAAACCTGGAGGAGTGGGTAGCACCAACACCAG
GCCTACCGTGCTTAACCGGCTTGTATGAGATGGAGAACTCAGCCAAGTAGTGACCAATCA
TCTCAGGCTTGATCTCGACTTGGTTAAAGGTCTTTCCATTGTACACTCCAATGATGCTTC
CGATCATCTCTGGGACAATGATCATGTTCCTCAAGTGGGTTCTCACTGGCTCTGGCTTCC
CACCTTGTGGTGCCTCCCTTTTCGCCTTACGGAGCTTCTTAATGAGAGCCATTGGCTTCC
TGGTCAAACCTCTTGAAAACCTTCTGCGAATACGAGAAGGGAAGAGCTTGACGAGATCAT
CAGTAGACATGTCAAGAAGGGCATCGAGATCGACTCCTTTGAAGGCAAACTTCTTGAACG
TCCTCTTCTTTGGGACTCCAGCAGCAGCAACCTCTGGTTCAACATCCGACATGGTTTAGA
TCTCAGAGAAAGGATAAAACCCTAAAACGGCTAAAAAGCTTGGGGAAGTTTTATTAGGTC
TTTGCGAAGAGTCC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 11

CO CL502Contig1 932 11 33 U
GGAAAGAATCTAAAGCTCTCATCTCTCCGCTTCTCTGTACTCCTCCACACTTCCTTCCCC
CTCAACGAGTTTCAAAACCCGAGTAGCCATGTCGTTCACGATCCCGACGAACCTCGTCCT
CAACCCGAGATCCAACAAATCTCTCACTCAATCCTTGCCCAAATCCACCGCGAGATTCGT
CTGCTCCGATGACAAATCCGCGACGCAGCAACAGCAGTCCATGAAGGCTTTCTCCGCTGC
AGTGGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCAGCTCCGATGCCAGCCGTCGCTGATATCTCGGG
GTTGACCCCTTGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAAGAA
GCTTCAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTTAACGC
TCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTATGGACTTCTGTGTGG
CGCAGACGGTCTACCACACCTGATAGTGAACGGAGACCAGCGGCATTGGGGAGAGTTCAT
AACCCCAGGCCTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGGGTTGGAAGAAGCTA
CTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAGGAGATCATTATTGATGTTCC
ATTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAGCGTT
AATCAACGGCGATCTCATTGCCAAGGATGTCTAGAAAAACAAAAAACAAATCTATATTTG
TTGTTTTGTTTGCTTCTCTTTCTCTCATGTTTTCCATTGTATGTATTGATATCTCTAATT
AACTCTTCCTTCAAAGAATATCTTTGCATTATGGAAAAACTTGTATTTTGGATTAAATGT
TAATGGCGGAAAACAGTCATTTCATACCCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 5 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 
10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 30 60 60 30 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 30 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 
60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF76TF U 56
AF RR2GZ18TF U 1
AF RR2CT66TF U 49
AF RR2D318TF U 329
AF RR2DF76JQ C 376
AF RR2A778TF U 54
AF RR2GW92JQ C 255
AF RR2GW92TF U 255
AF RR2CT66JQ C 158
AF RR2GZ18JQ C 161
AF RR2D318JQ C 393
BS 1 75 RR2GZ18TF
BS 76 76 RR2CT66TF
BS 77 94 RR2GZ18TF
BS 95 95 RR2CT66TF
BS 96 130 RR2GZ18TF
BS 131 131 RR2CT66TF
BS 132 139 RR2GZ18TF
BS 140 140 RR2CT66TF
BS 141 159 RR2GZ18TF
BS 160 160 RR2CT66TF
BS 161 471 RR2GZ18TF
BS 472 472 RR2CT66TF
BS 473 480 RR2GZ18TF
BS 481 481 RR2CT66TF
BS 482 495 RR2GZ18TF
BS 496 496 RR2CT66TF
BS 497 501 RR2GZ18TF
BS 502 502 RR2CT66TF
BS 503 508 RR2GZ18TF
BS 509 509 RR2CT66TF
BS 510 543 RR2GZ18TF
BS 544 544 RR2CT66TF
BS 545 639 RR2GZ18TF
BS 640 640 RR2CT66TF
BS 641 739 RR2GZ18TF
BS 740 745 RR2CT66TF
BS 746 746 RR2A778TF
BS 747 758 RR2CT66TF
BS 759 856 RR2A778TF
BS 857 857 RR2CT66JQ
BS 858 864 RR2A778TF
BS 865 923 RR2CT66JQ
BS 924 932 RR2GZ18JQ

RD RR2DF76TF 108 0 0
GG
CCCCTCAACGAGTTTCAAAACCCGAGTATCCATGTCGTTCACGATCCCGACGAACCTCGT
CCTCAACCCGAGATCCAACAAATCTCTCACTCAATCCTTGCC
CAAA

QA 3 104 3 104
DS 

RD RR2GZ18TF 739 0 0
GGAAAGAATCTAAAGCTCTCATCTCTCCGCTTCTCTGTACTCCTCCACACTTCCTTCCCC
CTCAACGAGTTTCAACACCCGAGTAGCCATGTCGCTCACGATCCCGACGAACCTCGTCCT
CAACCCGAGAGCCAACAAACCTCTCACTCAATCCTTGCCTAAATCCACCGCGAGATTCGT
CTGCTCCGATGACAAATCCGCGACGCAGCAACAGCAGTCCATGAAGGCTTTCTCCGCTGC
AGTGGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCAGCTCCGATGCCAGCCGTCGCTGATATCTCGGG
GTTGACCCCTTGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAAGAA
GCTTCAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTTAACGC
TCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTATGGACTACTGTGTGG
TGCAGACGGTCTACCCCACCTAATAGTGGACGGAGACCAGCGGCATTGGGGAGAGTTCAT
AACTCCAGGCCTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGGGTTGGAAGAAGCTA
CTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAAGAGATCATTATTGATGTTCC
ATTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAGCGTT
AATCAACGGCGATCTCATT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2CT66TF 713 0 0
GGACACTTC
CCCCTCAACGAGTTTCAAAACCCGAGTAGCCATGTCGTTCACGATCCCGACGAACCTCGT
CCTCAACCCGAGATCCAACAAATCTCTCACTCAATCCTTGCCCAAATCCACCGCGAGATT
CGTCTGCTCCGATGACAAATCCGCGACGCAGCAACAGCAGTCCATGAAGGCTTCCTCCGC
TGCAGTGGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCAGCTCCTATGCCAGCCGTCGCTGATATCTC
GGGGCTGACTCCTTGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAA
GAAGCTTCAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTTAA
CGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTATGGACTTCTGTG
TGGCGCAGACGGTCTACCACACCTGATAGTGAACGGAGACCAGCGGCATTGGGGAGAGTT
CATAACCCCAGGCCTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGGGTTGGAAGAAG
CTACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAGGAGATCATTATTGATGT
TCCATTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAGC
GTTAATCAACGGCGATCTCATTGCCAAG*ATGTCTAGAAAA
CAA

QA 10 710 10 710
DS 

RD RR2D318TF 410 0 0
G
TCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAAGAAGCTTCAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTC
CTGAAAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTTAACGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCG
ACAACTACGGCAAGTATGGACTTCTGTGTGGCGCAGACGGTCTACCACACCTGATAGTGA
ACGGAGACCAGCGGCATTGGGGAGAGTTCATAACCCCAGGCCTTCTCTTCCTCTACATTG
CTGGATGGATCGGGTGGGTTGGAAGAAGCTACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAAC
CAGCGATGAAGGAGATCATTATTGATGTTCCATTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTT
*CATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAACGTTAATCAACGGCGATCTC
TT

QA 2 408 2 408
DS 

RD RR2DF76JQ 450 0 0
TAAGCTTTACGCTCCCGAAAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTTAACGCTCAGATCGAGAAGAC
CAAAAGCAGGTTCGACAAATACGGCAAGTATGGAATTCTGTGTGGCGCAGACGGTTTACC
ACACCTGATAGTGAACTGAGACCAGCGGCATTGGGGAGAGTTCATAACCCCAGGCCTTCT
CTTCCTCTACATTGCTGGAGGGATCGGGTGGGTTGGAAGAAGCTACTTGATAGCGATCAG
TGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAGGAGATCATTATTGATGTTCCATTGGCTAGTCGTCT
CATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAGCGTTAATCAACGGCGATCT
CATTGCCAAGGATGTCTAGAAAAACAAAAAACAAATCTATATTTGTTGTTTTGTTTGCTT
CTCTTTCTCTCATGTTTTCCATTGTA
AGTA

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR2A778TF 811 0 0
GGTC
CCCCTCAACGAGTTTCAAAACCCGAGTAGCCATGTCGTTCACGATCCCGACGAACCTCGT
CCTCAACCCGAGATCCAACAAATCTCTCACTCAATCCTTGCCCAAATCCACCGCGAGATT
CGTCTGCTCCGATGACAAATCCGCGACGCAGCAACAGCAGTCCATGAAGGCTTTCTCCGC
TGCAGTGGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCAGCTCCTATGCCAGCCGTCGCTGATATCTC
GGGGCTGACTCCTTGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAA
GAAGCTTCAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTTAA
CGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTATGGACTTCTGTG
TGGCGCAGACGGTCTACCACACCTGATAGTGAACGGAGACCAGCGGCATTGGGGAGAGTT
CATAACCCCAGGCCTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGGGTTGGAAGAAG
CTACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAGGAAACCAGCGATGAAGGAGATCATTATTGATGT
TCCATTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAGC
GTTAATCAACGGCGATCTCATTGCCAAGGATGTCTAGAAAAACAAAAAACAAATCTATAT
TTGTTGTTTTGTTTGCTTCTCTTTCTCTCATGTTTTCCATTGTATGTATTGATATCTCTA
ATTAACTCTTCCTTCAAAGTATATCTT

QA 5 811 5 811
DS 

RD RR2GW92JQ 598 0 0
G
CATCCTCCTCTCAGCACCGATGCCAGCCGTCGCTGATATCTCGGGGTTGACCCCTTGCAA
GGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAAGAAGCTTCAATCATCTCT
TAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTTAACGCTCAGATCGAGAAGAC
CAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTATGGACTTCTGTGTGGTGCAGACGGTCTGCC
ACACCTGATAGTGAACGGAGACCAGCGGCATTGGGGAGAATTCATAACTCCAGGCCTTCT
CTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGGGTTGGGAGAAGCTACTTGATAGCGATCAG
TGATGAGAGGAAACCGGCGATGAAGGAGATCATTATCGATGTTCCATTGGCTAGTCGTCT
CATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAGCGTTAATCAACGGCGATCT
CATTGCCAAGGATGTCTAGAAAAACAAAAAACAAATCTATATTTGTTGTTTTGTTTGCTT
CTCTTTCTCTCATGTTTTCCATTGTATGTATTGATATCTCTAATTAACTCTT
TCTCC

QA 2 593 2 593
DS 

RD RR2GW92TF 598 0 0
G
CATCCTCCTCTCAGCACCGATGCCAGCCGTCGCTGATATCTCGGGGTTGACCCCTTGCAA
GGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAAGAAGCTTCAATCATCTCT
TAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTTAACGCTCAGATCGAGAAGAC
CAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTATGGACTTCTGTGTGGTGCAGACGGTCTGCC
ACACCTGATAGTGAACGGAGACCAGCGGCATTGGGGAGAATTCATAACTCCAGGCCTTCT
CTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGGGTTGGGAGAAGCTACTTGATAGCGATCAG
TGATGAGAGGAAACCGGCGATGAAGGAGATCATTATCGATGTTCCATTGGCTAGTCGTCT
CATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAGCGTTAATCAACGGCGATCT
CATTGCCAAGGATGTCTAGAAAAACAAAAAACAAATCTATATTTGTTGTTTTGTTTGCTT
CTCTTTCTCTCATGTTTTCCATTGTATGTATTGATATCTCTAATTAACTCTT
TCTCC

QA 2 593 2 593
DS 

RD RR2CT66JQ 767 0 0
CCC
AAATCCACCGCGAGATTCGTCTGCTCCGATGACAAATCCGCGACGCAGCAACAGCAGTCC
ATGAAGGCTTCCTCCGCTGCAGTGGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCAGCTCCTATGCCA
GCCGTCGCTGATATCTCGGGGCTGACTCCTTGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGG
GAGAAGCAACAGATCAAGAAGCTTCAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCT
CCTGCTCTTGCTCTTAACGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGC
AAGTATGGACTTCTGTGTGGCGCAGACGGTCTACCACACCTGATAGTGAACGGAGACCAG
CGGCATTGGGGAGAGTTCATAACCCCAGGCCTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATC
GGGTGGGTTGGAAGAAGCTACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAG
GAGATCATTATTGATGTTCCATTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCT
GTTGCTGCTTACAGAGCGTTAATCAACGGCGATCTCATTGCCAAGGATGTCTAGAAAAAC
AAAAAACAAATCTATATTTGTTGTTTTGTTTGCTTCTCTTTCTCTCATGTTTTCCATTGT
ATGTATTGATATCTCTAATTAACTCTTCCTTCAAAGAATATCTTTGCATTATGGAAAAAC
TTGTATTTTGGATTAAATGTTAATGGCGGAAAACAGTCATTTC
C

QA 4 766 4 766
DS 

RD RR2GZ18JQ 772 0 0
AAATCCACCGCGAGATTCGTCTGCTCCGATGACAAATCCGCGACGCAGCAACAGCAGTCC
ATGAAGGCTTTCTCCGCTGCAGTGGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCAGCTCCGATGCCA
GCCGTCGCTGATATCTCGGGGTTGACCCCTTGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGG
GAGAAGCAACAGATCAAGAAGCTTCAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCT
CCTGCTCTTGCTCTTAACGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGC
AAGTATGGACTACTGTGTGGTGCAGACGGTCTACCCCACCTAATAGTGGACGGAGACCAG
CGGCATTGGGGAGAGTTCATAACTCCAGGCCTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATC
GGGTGGGTTGGAAGAAGCTACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAG
GAGATCATTATTGATGTTCCATTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCT
GTTGCTGCTTACAGAGCGTTAATCAACGGCGATCTCATTGCCAAGGATGTCTAGAAAAAC
AAAAAACAAATCTATATTTGTTGTTTTGTTTGCTTCTCTTTCTCTCATGTTTTCCATTGT
ATGTATTGATATCTCTAATTAACTCTTCCTTCAAAGAATATCTTTGCATTATGGAAAAAC
TTGTATTTTGGATTAAATGTTAATGGCGGAAAACAGTCATTTCATACCCACC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2D318JQ 536 0 0
AAAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTTAACGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCGACA
ACTACGGCAAGTATGGACTTCTGTGTGGCGCAGACGGTCTACCACACCTGATAGTGAACG
GAGACCAGCGGCATTGGGGAGAGTTCATAACCCCAGGCCTTTTCTTCCTCTACATTGCTG
GATGGATCGGGTGGGTTGGAAGAAGCTACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAACCAG
CGATGAAGGAGATCATTATTGATGTTCCATTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCA
TTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAACGTTAATCAACGGCGATCTCATTGCCAAGGATGTCT
AGAAAAACAAAAAACAAATCTATATTTGTTGTTTTGTTTGCTTCCCTTTCTCTCATGTTT
TCCATTGTATGTATTGATATCTCTAATTAACTCTTCCTTCAAAGAATATCTTTGCATTAT
GGAAAAACTTGTATTTTGGATTAAATGTTAATGGCGGAAAACAGTCATTTC
ATACC

QA 1 531 1 531
DS 



AS 2 10

CO CL503Contig1 799 7 15 U
GCAAATCAAGATATTTGCAAGGCAAACCAACATCACTCTTTTAAGACATTAAAAGCAAAC
ATCCAGCATTGGTCCTTCAAGACGAACATAGGTCATGAATTACAAAAGGAAAA*TAGCAA
A*GTCATCATCATCCACACTGATCATCCACAGAAAAAAA*AAAG**AACAAAATAAAAAG
CAAGAAACTGGTTGGTTTGCTTCAACGACCTCTCTCTCACACACATCATTCAAAAGCCCA
TTGGTTCTCCCTGCGCACCTCCTCTTCTTCCTCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAA
GGTCGTGCGAATCTCTTCCGGAGTCTTGCCCTTGATCATATCAGCCACAGTCTGGCATGT
AAGGTCAAGCAGGTTCTTGATGTTCAAATAATTAGCAGCCAGGATGAGTTCGAAGAGGGT
GGCTTGATCGATCTTCATGAACTCAGCATCCCAGGCCTTGAGGTCATCGTCGGAGGAACC
GCCACCGTCGACGGCCTCGCTCTTGGAAGCGGCAGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTC
GATCACCTTGGCGAGGATCTTGCTCGTGACGTTGGGAAGAGGGACACCGTTGTCGACGCA
GTCGTCTTCGACCATGTGGGCTATGGTCTGAGACTCGAGGGCAACCGCCTCGTCCACCTC
GAAAGACTCGCCATCGGAGCTCTTCAACACGATCTTCTTCGTCGACATGATTGTG*GGGG
AGAACGCAA*GAGAAGATTTGAGAGAAGCGATGAGATGATGAGATCCCTTAGTTTTTTTT
TTTGTTTATAAGTGGGTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC53JQ U 22
AF RR2DV06JQ U 17
AF RR2B011JQ U 1
AF RR2B011TF C 4
AF RR2AL34JQ U 17
AF RR2AL34TF C 17
AF RR2FC53TF C 22
BS 1 139 RR2B011JQ
BS 140 140 RR2AL34JQ
BS 141 154 RR2B011JQ
BS 155 155 RR2AL34JQ
BS 156 164 RR2B011JQ
BS 165 166 RR2AL34JQ
BS 167 171 RR2B011JQ
BS 172 172 RR2AL34JQ
BS 173 606 RR2B011JQ
BS 607 607 RR2DV06JQ
BS 608 715 RR2B011JQ
BS 716 716 RR2AL34JQ
BS 717 721 RR2B011JQ
BS 722 753 RR2AL34JQ
BS 754 799 RR2FC53TF

RD RR2FC53JQ 578 0 0
GCAAACCAACATCACTCTTTTAAGACATTAAAAGCAAACATCCAGCATTGGTCCTTCAAG
ACGAACATAGGTCATGAATTACAAAAGGAAAA*TAGCAAA*GTCATCATCATCCACACTG
ATCATCCACAGAAAAAAA*AAAG**AACAAAATAAAAAGCAAGAAACTGGTTGGTTTGCT
TCAACGACCTCTCTCTCACACACATCATTCAAAAGCCCATTGGTTCTCCCTGCGCACCTC
CTCTTCTTCCTCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAAGGTCGTGCGAATCTCTTCCGG
AGTCTTGCCCTTGATCATATCAGCCACAGTCTGGCATGTAAGGTCAAGCAGGTTCTTGAT
GTTCAAATAATTAGCAGCCAGGATGAGTTCGAAGAGGGTGGCTTGATCGATCTTCATGAA
CTCAGCATCCCAGGCCTTGAGGTCATCGTCGGAGGAACCGCCACCGTCGACGGCCTCGCT
CTTGGAAGCGGCAGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTCGATCACCTTGGCGAGGATCTT
GCTCGTGACGTTGGGAAGAGGGACACCGTTGTCGACGC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2DV06JQ 683 0 0
GC
AAGGCAAACCAACATCACTCTTTTAAGACATTAAAAGCAAACATCCAGCATTGGTCCTTC
AAGACGAACATAGGTCATGAATTACAAAAGGAAAA*TAGCAAA*GTCATCATCATCCACA
CCGATCATCCACAGAAGAAAAGAAAGCCAACAACATAAAAAGCAAGAAACTGGTTGGTTT
GCTTCAACGACCTCTCTCTCACACACATCATTCAAAAGCCCATTGGTTCTCCCTGCGCAC
CTCCTCTTCTTCCTCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAAGGTCGTGCGAATCTCTTC
CGGAGTCTTGTCCTTGATCATATCAGCCACAGTCTGGCATGTAAGGTCAAGCAGGTTCTT
GATGTTCAAATAATTAGCAGCCAGGATGAGTTCGAAGAGGGTGGCTTGATCGATCTTCAT
GAACTCAGCATCCCAGGCCTTGAGGTCATCGTCGGAGGAACCGCCACCGTCGACGGCCTC
GCTCTTGGAAGCGGCAGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTCGATCACCTTGGCGAGGAT
CTTGCTCGTGACGTTGGGAAGAGGGACACCGTTGTCGACGCAGTCGTCTTCGACCATGTG
GGCTATGGTCTGAGACTCGAGGGCAACCGCCTCGTCCACCTCGAAAGACTCGCCATCGGA
GCTCTTCAACACGATCTTCTT

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2B011JQ 722 0 0
GCAAATCAAGATATTTGCAAGGCAAACCAACATCACTCTTTTAAGACATTAAAAGCAAAC
ATCCAGCATTGGTCCTTCAAGACGAACATAGGTCATGAATTACAAAAGGAAAA*TAGCAA
A*GTCATCATCATCCACACCGATCATCCACAGAAGAAAA*AAAGCCAACAACATAAAAAG
CAAGAAACTGGTTGGTTTGCTTCAACGACCTCTCTCTCACACACATCATTCAAAAGCCCA
TTGGTTCTCCCTGCGCACCTCCTCTTCTTCCTCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAA
GGTCGTGCGAATCTCTTCCGGAGTCTTGCCCTTGATCATATCAGCCACAGTCTGGCATGT
AAGGTCAAGCAGGTTCTTGATGTTCAAATAATTAGCAGCCAGGATGAGTTCGAAGAGGGT
GGCTTGATCGATCTTCATGAACTCAGCATCCCAGGCCTTGAGGTCATCGTCGGAGGAACC
GCCACCGTCGACGGCCTCGCTCTTGGAAGCGGCAGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTC
GATCACCTTGGCGAGGATCTTGCTCGTGACGTTGGGAAGAGGGACACCGTTGTCGACGCA
GTCGTCCTCGACCATGTGGGCTATGGTCTGAGACTCGAGGGCAACCGCCTCGTCCACCTC
GAAAGACTCGCCATCGGAGCTCTTCAACACGATCTTCTTCGTCGACATGATTGTGTGGGG
AA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2B011TF 739 0 0
AATCAAGATATTTGCAAGGCAAACCAACATCACTCTTTTAAGACATTAAAAGCAAACATC
CAGCATTGGTCCTTCAAGACGAACATAGGTCATGAATTACAAAAGGAAAA*TAGCAAA*G
TCATCATCATCCACACCGATCATCCACAGAAGAAAA*AAAGCCAACAACATAAAAAGCAA
GAAACTGGTTGGTTTGCTTCAACGACCTCTCTCTCACACACATCATTCAAAAGCCCATTG
GTTCTCCCTGCGCACCTCCTCTTCTTCCTCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAAGGT
CGTGCGAATCTCTTCCGGAGTCTTGCCCTTGATCATATCAGCCACAGTCTGGCATGTAAG
GTCAAGCAGGTTCTTGATGTTCAAATAATTAGCAGCCAGGATGAGTTCGAAGAGGGTGGC
TTGATCGATCTTCATGAACTCAGCATCCCAGGCCTTGAGGTCATCGTCGGAGGAACCGCC
ACCGTCGACGGCCTCGCTCTTGGAAGCGGCAGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTCGAT
CACCTTGGCGAGGATCTTGCTCGTGACGTTGGGAAGAGGGACACCGTTGTCGACGCAGTC
GTCCTCGACCATGTGGGCTATGGTCTGAGACTCGAGGGCAACCGCCTCGTCCACCTCGAA
AGACTCGCCATCGGAGCTCTTCAACACGATCTTCTTCGTCGACATGATTGTGTGGGGAAA
ACGCAAAGAAAAGATTT
CC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2AL34JQ 738 0 0
GT
AAGGCAAACCAACATCACTCTTTTAAGACATTAAAAGCAAACATCCAGCATTGGTCCTTC
AAGACGAACATAGGTCATGAATTACAAAAGGAAAA*TAGCAAA*GTCATCATCATCCACA
CTGATCATCCACAGAAAAAAA**AAG**AACAAAATAAAAAGCAAGAAACTGGTTGGTTT
GCTTCAACGACCTCTCTCTCACACACATCATTCAAAAGCCCATTGGTTCTCCCTGCGCAC
CTCCTCTTCTTCCTCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAAGGTCGTGCGAATCTCTTC
CGGAGTCTTGCCCTTGATCATATCAGCCACAGTCTGGCATGTAAGGTCAAGCAGGTTCTT
GATGTTCAAATAATTAGCAGCCAGGATGAGTTCGAAGAGGGTGGCTTGATCGATCTTCAT
GAACTCAGCATCCCAGGCCTTGAGGTCATCGTCGGAGGAACCGCCACCGTCGACGGCCTC
GCTCTTGGAAGCCGCAGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTCGATCACCTTGGCGAGGAT
CTTGCTCGTGACGTTGGGAAGAGGGACACCGTTGTCGACGCAGTCGTCTTCGACCATGTG
GGGTATGGTCTGGGACTCGAGGGCAACCGCCTCGTCGACCTCGAAAGACTCGCCATCGGA
GCTCTTCAACACGATCTTCTTCGTCGACATGATTGTG*GGGGAGAACGCAA*GAGAAGAT
TTGAGAGAAGCGATG
C

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR2AL34TF 738 0 0
GT
AAGGCAAACCAACATCACTCTTTTAAGACATTAAAAGCAAACATCCAGCATTGGTCTTTC
AAGACGAACATAGGTCATGAATTACAAAAGGAAAAATAGCAAAAGTCATCATCATCCACA
CTGATCATCCACAGAAAAAAA**AAG**AACAAAATAAAAAGCAAGAAACTGGTTGGTTT
GCTTCAACGACCTCTCTCTCACACACATCATTCAAAAGCCCATTGGTTCTCCCTGCGCAC
CTCCTCTTCTTCCTCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAAGGTCGTGCGAATCTCTTC
CGGAGTCTTGCCCTTGATCATATCAGCCACAGTCTGGCATGTAAGGTCAAGCAGGTTCTT
GATGTTCAAATAATTAGCAGCCAGGATGAGTTCGAAGAGGGTGGCTTGATCGATCTTCAT
GAACTCAGCATCCCAGGCCTTGAGGTCATCGTCGGAGGAACCGCCACCGTCGACGGCCTC
GCTCTTGGAAGCGGCAGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTCGATCACCTTGGCGAGGAT
CTTGCTCGTGACGTTGGGAAGAGGGACACCGTTGTCGACGCAGTCGTCTTCGACCATGTG
GGGTATGGTCTGGGACTCGAGGGCAACCGCCTCGTCGACCTCGAAAGACTCGCCATCGGA
GCTCTTCAACACGATCTTCTTCGTCGACATGATTGTG*GGGGAGAACGCAA*GAGAAGAT
TTGAGAGAAGCGATG
C

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR2FC53TF 778 0 0
GCAAACCAACATCACTCTTT*AAGACATTAAA*GCAAACATCCAGCAT*GGTC*TTCAAG
ACGAACATAGGTCATGAATTACAAAAGGAAAA*TAGCAAA*GTCATCATCATCCACACTG
ATCATCCACAGAAAAAAA**AAG**AACAAAATAAAAAGCAAGAAACTGGTTGGTTTGCT
TCAACGACCTCTCTCTCACACACATCATTCAAAAGCCCATTGGTTCTCCCTGCGCACCTC
CTCTTCTTCCTCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAAGGTCGTGCGAATCTCTTCCGG
AGTCTTGCCCTTGATCATATCAGCCACAGTCTGGCATGTAAGGTCAAGCAGGTTCTTGAT
GTTCAAATAATTAGCAGCCAGGATGAGTTCGAAGAGGGTGGCTTGATCGATCTTCATGAA
CTCAGCATCCCAGGCCTTGAGGTCATCGTCGGAGGAACCGCCACCGTCGACGGCCTCGCT
CTTGGAAGCGGCAGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTCGATCACCTTGGCGAGGATCTT
GCTCGTGACGTTGGGAAGAGGGACACCGTTGTCGACGCAGTCGTCTTCGACCATGTGGGC
TATGGTCTGGGACTCGAGGGCAACCGCCTCGTCGACCTCGAAAGACTCGCCATCGGAGCT
CTTCAACACGATCTTCTTCGTCGACATGATTGTG*GGGGAGAACGCAA*GAGAAGATTTG
AGAGAAGCGATGAGATGATGAGATCCCTTAGTTTTTTTTTTTGTTTATAAGTGGGTCC

QA 1 778 1 778
DS 



CO CL503Contig2 662 3 17 U
GGAACCCACTTATATAAAAAAAAAACTAGAAAAAAAAAAACTCAGCATCTCATCATCTCA
TCGCTTCTCTCAAATCTTTTCTTTGCGTTTTCCCCACACAATCATGTCGACGAAGAAGAT
CGTGTTGAAGAGCTCCGATGGCGAGTCTTTCGAGGTGGACGAGGCGGTTGCCCTCGAGTC
TCAGACCATAGCCCACATGGTCGAAGACGACTGCGTCGACAACGGTGTCCCTCTTCCCAA
CGTCACGAGCAAGATCCTCGCCAAGGTGATCGAGTACTGCAAGAAGCACGTCGACGCTGC
CGCTTCCAAGAGCGAGGCCGTCGACGGTGGCGGTTCCTCCGACGATGACCTCAAGGCCTG
GGATGCTGAGTTCATGAAGATCGATCAAGCCACCCTCTTCGAACTCATCCTGGCTGCTAA
TTATTTGAACATCAAGAACCTGCTTGACCTTACATGCCAGACTGTGGCTGATATGATCAA
GGACAAGACTCCGGAAGAGATTCGCACGACCTTCAACATCAAGAACGACTTTACACCCGA
GGAAGAAGAGGAGGTGCGCAGGGAGAACCAATGGGCTTTTTATGTTGTTGGCTTTTTTTT
TCTTCTGTGGATGATCGGTGTGGATGATGATGACTTTGCTATTTTCCTTTTGTAATTCAC
GA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 0 15 0 0 0 0 15 0 0 0 0 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2FQ06TF U 1
AF RR2DV06TF U 21
AF RR2FD68TF U 57
BS 1 29 RR2FQ06TF
BS 30 30 RR2DV06TF
BS 31 31 RR2FQ06TF
BS 32 35 RR2DV06TF
BS 36 36 RR2FQ06TF
BS 37 40 RR2DV06TF
BS 41 44 RR2FQ06TF
BS 45 45 RR2DV06TF
BS 46 168 RR2FQ06TF
BS 169 169 RR2DV06TF
BS 170 188 RR2FQ06TF
BS 189 189 RR2DV06TF
BS 190 191 RR2FQ06TF
BS 192 192 RR2DV06TF
BS 193 475 RR2FQ06TF
BS 476 546 RR2DV06TF
BS 547 662 RR2FD68TF

RD RR2FQ06TF 475 0 0
GGAACCCACTTATATAAAAAAAAAACTAGGATCTCATCCTCTCATCATCTCATCATCTCA
TCGCTTCTCTCAAATCTTTTCTTTGCGTTTTCCCCACACAATCATGTCGACGAAGAAGAT
CGTGTTGAAGAGCTCCGATGGCGAGTCTTTCGAGGTGGACGAGGCGGTGGCCCTCGAGTC
TCAGACCACAGTCCACATGGTCGAAGACGACTGCGTCGACAACGGTGTCCCTCTTCCCAA
CGTCACGAGCAAGATCCTCGCCAAGGTGATCGAGTACTGCAAGAAGCACGTCGACGCTGC
CGCTTCCAAGAGCGAGGCCGTCGACGGTGGCGGTTCCTCCGACGATGACCTCAAGGCCTG
GGATGCTGAGTTCATGAAGATCGATCAAGCCACCCTCTTCGAACTCATCCTGGCTGCTAA
TTATTTGAACATCAAGAACCTGCTTGACCTTACATGCCAGACTGTGGCTGATATG

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2DV06TF 526 0 0
GACTTATAT
AAAAAAAAAAACT*AGGATCTCATCATCTCATCGCTTCTCTCAAATCTTTTCTTTGCGTT
TTCCCCACACAATCATGTCGACGAAGAAGATCGTGTTGAAGAGCTCCGATGGCGAGTCTT
TCGAGGTGGACGAGGCGGTTGCCCTCGAGTCTCAGACCATAGCCCACATGGTCGAAGACG
ACTGCGTCGACAACGGTGTCCCTCTTCCCAACGTCACGAGCAAGATCCTCGCCAAGGTGA
TCGAGTACTGCAAGAAGCACGTCGACGCTGCCGCTTCCAAGAGCGAGGCCGTCGACGGTG
GCGGTTCCTCCGACGATGACCTCAAGGCCTGGGATGCTGAGTTCATGAAGATCGATCAAG
CCACCCTCTTCGAACTCATCCTGGCTGCTAATTATTTGAACATCAAGAACCTGCTTGACC
TTACATGCCAGACTGTGGCTGATATGATCAAGGACAAGACTCCGGAAGAGATTCGCACGA
CCTTCAACATCAAGAACGACTTTACACCCGAGGAAGA

QA 10 526 10 526
DS 

RD RR2FD68TF 606 0 0
GGG
ATCGCTTCTCTCAAATCTTTTCTTTGCGTTTTCCCCACACAATCATGTCGACGAAGAAGA
TCGTGTTGAAGAGCTCCGATGGCGAGTCTTTCGAGGTGGACGAGGCGGTTGCCCTCGAGT
CTCAGACCATAGCCCACATGGTCGAAGACGACTGCGTCGACAACGGTGTCCCTCTTCCCA
ACGTCACGAGCAAGATCCTCGCCAAGGTGATCGAGTACTGCAAGAAGCACGTCGACGCCG
CCGCTTCCAAGAGCGAGGCCGTCGACGGTGGCGGTTCCTCCGACGATGACCTCAAGGCCT
GGGATGCTGAGTTCATGAAGATCGATCAAGCCACCCTCTTCGAACTCATCCTGGCTGCTA
ATTATTTGAACATCAAGAACCTGCTTGACCTTACATGCCAGACTGTGGCTGATATGATCA
AGGGCAAGACTCCGGAAGAGATTCGCACGACCTTCAACATCAAGAACGACTTTACACCCG
AGGAAGAAGAGGAGGTGCGCAGGGAGAACCAATGGGCTTTTTATGTTGTTGGCTTTTTTT
TTCTTCTGTGGATGATCGGTGTGGATGATGATGACTTTGCTATTTTCCTTTTGTAATTCA
CGA

QA 4 606 4 606
DS 



AS 3 10

CO CL504Contig1 691 3 12 U
GGGCAGCAGGAGGAGGAGGAGGAGCAACCAGTAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCA
TTTCTAAAGCAACCAAAGGTGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAGAGGCCT
GGAAAGGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTTCCCGCGAG
GCCATTGACGGACATTACATTGACAAGAAATGTCCACTCACTGGAACTGTCTCTGTGAGA
GGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGAACCATCATTGTTCGC
AGAAACTATCTCCACTTCGTCAAGAAGTATCAAAGATATGAGAAGAGACATTCCAACATC
CCTGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATCGGCCAA
TGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCA
TCTGCCTTTGCAAAGAAGGCGTTCACTGGAATGTAATAGTTTTGAAGTTACGGAGAGTCT
TCTTCGTTTGGTTTTTATATTTCTTTCGGAATTTTCTGTTTGTTGATCTCTTTTGTATAA
GACTTGGTCTATCCACAGACTGAATAGAAACCTACGTACTACTTTCGTCATCTGAAATTA
CTACATTCGACTGTGCTGTGACTTCTGTCTT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2E729TF U 1
AF RR2E729JQ C 1
AF RR2A319TF U 304
BS 1 2 RR2E729JQ
BS 3 212 RR2E729TF
BS 213 213 RR2E729JQ
BS 214 245 RR2E729TF
BS 246 246 RR2E729JQ
BS 247 257 RR2E729TF
BS 258 258 RR2E729JQ
BS 259 294 RR2E729TF
BS 295 303 RR2E729JQ
BS 304 596 RR2A319TF
BS 597 597 RR2E729JQ
BS 598 691 RR2A319TF

RD RR2E729TF 294 0 0
GG
GCAGCAGGAGGAGGAGGAGGAGCAACCAGTAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCATT
TCTAAAGCAACCAAAGGTGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAGAGGCCTGG
AAAGGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTTCCCGCGAGGC
CATTGACGGACATTACATTGACAAGAAATG*CCACTCACTGGAACTGTCTCTGTGAGAGG
ACG*ATCTTAGCTGG*ACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGAACCATCATT

QA 3 294 3 294
DS 

RD RR2E729JQ 690 0 0
GGGCAGCAGGAGGAGGAGGAGGAGCAACCAGTAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCA
TTTCTAAAGCAACCAAAGGTGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAGAGGCCT
GGAAAGGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTTCCCGCGAG
GCCATTGACGGACATTACATTGACAAGAAATGTCCACTCACTGGAACTGTCTCTGTGAGA
GGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGAACCATCATTGTTCGC
AGAAACTATCTCCACTTCGTCAAGAAGTATCAAAGATATGAGGAGAGACATTCCAACATC
CCTGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATCGGCCAA
TGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCA
TCTGCCTTTGCAAAGAAGGCGTTCACTGGAATGTAATAGTTTTGAAGTTACGGAGAGTCT
TCTTCGTTTGGTTTTTATATTTCTTTCGGAATTTTCTGTTTGTTGATCTCTTTTGTATAA
GACTTGGTCTATCCACAGACTGAATAGAAACCTACGTACTACTTTCGTCATCTGAAATTA
CTACATTCGACTGTGCTGTGACTTCTGTC
G

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2A319TF 388 0 0
AACTATCTCCACTTCGTCAAGAAGTATCAAAGATATGAGAAGAGACATTCCAACATCCCT
GCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATCGGCCAATGC
AGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCATCT
GCCTTTGCAAAGAAGGCGTTCACTGGAATGTAATAGTTTTGAAGTTACGGAGAGTCTTCT
TCGTTTGGTTTTTATATTTCTTTCGGAATTTTCTGTTTGTTGATCTCTTTTGTGTAAGAC
TTGGTCTATCCACAGACTGAATAGAAACCTACGTACTACTTTCGTCATCTGAAATTACTA
CATTCGACTGTGCTGTGACTTCTGTCTT

QA 1 388 1 388
DS 



CO CL504Contig2 675 3 1 U
GGGGAGAGCAACAGCAGCAGGAGGAGGAGGAGCAACCAGTAGCCATGGCGGATCAGACTG
AGAAGGCATTTCTAAAGCAGCCAAAGGTGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGGAAAAGGAA
AGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTC
CCCGCGATGCCAT*GACGGACATTACATTGACAAGAAATGTCCATTCACTGGAACTGTTT
CTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGAACCATCA
TTGTTCGCAGAAACTATCTCCACTTCGTCAAGAAGTATCAAAGATATGAGAAGAGGCATT
CCAACATCCCTGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCA
TTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAG
CCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTTAC
GGAGAGTTTCTTTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATGTTTTGTTTGTTGATCCCTCTTGT
GTGAGACTTGGTTTATCCGCAGACTGAATAGAAACCTACGTACTACTTTCGTCATCTAAA
AATTACTACAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX59JQ C 105
AF RR2FI37TF U 130
AF RR2EX59TF U 1
BS 1 675 RR2EX59TF

RD RR2EX59JQ 565 0 0
AAATCAGGAAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGT
TTGGGTTTCAAGACTCCCCGCGATGCCAT*GACGGACATTACATTGACAAGAAATGTCCA
TTCACTGGAACTGTTTCTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAG
ATGCAGAGAACCATCATTGTTCGCAGAAACTATCTCCACTTCGTCAAGAAGTATCAAAGA
TATGAGAAGAGGCATTCCAACATCCCTGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTCAAAGAA
GGTGATCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTG
TTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAA
TAGTTTTTGAAGTTACGGAGAGTTTCTTTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATGTTTTGTT
TGTTGATCCCTCTTGTGTGAGACTTGGTTTATCCGCAGACTGAATAGAAACCTACGTACT
ACTTTCGTCATCT
AAAAATTACTAC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2FI37TF 533 0 0
GCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGCGATG
CCATTGACGGACATTACATTGACAAGAAATGTCCATTCACTGGAACTGTTTCTGTGAGAG
GACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGAACCATCATTGTTCGCA
GAAACTATCTCCACTTCGTCAAGAAGTATCAAAGATATGAGAAGAGGCATTCCAACATCC
CTGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCCAAT
GCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAACGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCAT
CTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTTACGGAGAGTTT
CTTTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATGTTTTGTTTGTTGATCCCTCTTGTGTGAGACTT
GGTTTATCCGCAGACTGAATAGAAACCTACGTACTACTTTCGTCATCT
AAAAA

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2EX59TF 675 0 0
GGGGAGAGCAACAGCAGCAGGAGGAGGAGGAGCAACCAGTAGCCATGGCGGATCAGACTG
AGAAGGCATTTCTAAAGCAGCCAAAGGTGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGGAAAAGGAA
AGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTC
CCCGCGATGCCAT*GACGGACATTACATTGACAAGAAATGTCCATTCACTGGAACTGTTT
CTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGAACCATCA
TTGTTCGCAGAAACTATCTCCACTTCGTCAAGAAGTATCAAAGATATGAGAAGAGGCATT
CCAACATCCCTGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCA
TTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAG
CCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTTAC
GGAGAGTTTCTTTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATGTTTTGTTTGTTGATCCCTCTTGT
GTGAGACTTGGTTTATCCGCAGACTGAATAGAAACCTACGTACTACTTTCGTCATCTAAA
AATTACTACAAAAAA

QA 1 675 1 675
DS 



CO CL504Contig3 685 4 5 U
GGACATCTCATTTCGCCTCAATCCATCAGTGGAGAGCAGCAGCAGCAGGAGGAGGAGGAG
CAACCAGTAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCATTTCTAAAACAACCAAAGGTGTTC
CTAAGCTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGG
AAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACATTGAC
AAGAAATGTCCGTTCACTGGAACTGTTTCTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGC
CACAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATCATTGTTCGCAGAAACTATCTCCACTTTGTCAAG
AAGTATCAAAGATACGAGAAGAGACATTCCAACATCCCTGCCCATGTCTCACCCTGCTTC
CGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTG
AGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTC
ACTGGAATGTAACAGTTTTTTTGAAGTTATGGAGAATTTCTTTGTTTCGTTTTTATGTTT
CAGAATGTTTTGTTTGTTGATCCCTCTCGTGTGAGACTTGGTTTTTCCACAGACTGAATA
GAAACCTACGTACTACTTTCTGTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2FB40TF U 1
AF RR2FB40JQ C 1
AF RR2AT65JQ C 18
AF RR2AT65TF U 18
BS 1 136 RR2FB40TF
BS 137 137 RR2AT65TF
BS 138 636 RR2FB40TF
BS 637 680 RR2AT65TF
BS 681 685 RR2AT65JQ

RD RR2FB40TF 636 0 0
GGACATCTCATTTCGCCTCAATCCATCAGTGGAGAGCAGCAGCAGCAGGAGGAGGAGGAG
CAACCAGTAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCATTTCTAAAACAACCAAAGGTGTTC
CTAAGCTCGAAGAAATTAGGGAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGG
AAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACATTGAC
AAGAAATGTCCGTTCACTGGAACTGTTTCTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGC
CACAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATCATTGTTCGCAGAAACTATCTCCACTTTGTCAAG
AAGTATCAAAGATACGAGAAGAGACATTCCAACATCCCTGCCCATGTCTCACCCTGCTTC
CGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTG
AGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTC
ACTGGAATGTAACAGTTTTTTTGAAGTTATGGAGAATTTCTTTGTTTCGTTTTTATGTTT
CAGAATGTTTTGTTTGTTGATCCCTCTCGTGTGAGA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2FB40JQ 678 0 0
GGACATCTCATTTCGCCTCAATCCATCAGTGGAGAGCAGCAGCAGCAGGAGGAGGAGGAG
CAACCAGTAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCATTTCTAAAACAACCAAAGGTGTTC
CTAAGCTCGAAGAAATTAGGGAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGG
AAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACATTGAC
AAGAAATGTCCGTTCACTGGAACTGTTTCTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGC
CACAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATCATTGTTCGCAGAAACTATCTCCACTTTGTCAAG
AAGTATCAAAGATACGAGAAGAGACATTCCAACATCCCTGCCCATGTCTCACCCTGCTTC
CGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTG
AGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTC
ACTGGAATGTAACAGTTTTTTTGAAGTTATGGAGAATTTCTTTGTTTCGTTTTTATGTTT
CAGAATGTTTTGTTTGTTGATCCCTCTCGTGTGAGACTTGGTTTTTCCACAGACTGAATA
GAAACCTACGTACTACTT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2AT65JQ 668 0 0
GG
AATCCATCAGTGGAGAGCAGCAGCAGCAGGAGGAGGAGGAGCAACCAGTAGCCATGGCGG
AACAGACTGAGAAGGCATTTCTAAAGCAACCAAAGGTGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAG
GGAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTT
TCAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACATTGACAAGAAATGTCCGTTCACTG
GAACTGTTTCTGTGAGAGGACGTATTTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGA
GGACCATCATTGTTCGCAGAAACTATCTCCACTTTGTCAAGAAGTATCAAAGATACGAGA
AGAGACATTCCAACATCCCTGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATC
ATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGG
TGATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAACAGTTTT
TTTGAAGTTATGGAGAATTTCTTTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATGTTTTGTTTGTTG
ATCCCTCTCGTGTGAGACTTGGTTTTTCCACAGACTGAATAGAAACCTACGTACTACTTT
CTGTCG

QA 3 668 3 668
DS 

RD RR2AT65TF 668 0 0
GG
AATCCATCAGTGGAGAGCAGCAGCAGCAGGAGGAGGAGGAGCAACCAGTAGCCATGGCGG
AACAGACTGAGAAGGCATTTCTAAAGCAACCAAAGGTGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAG
GGAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTT
TCAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACATTGACAAGAAATGTCCGTTCACTG
GAACTGTTTCTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGA
GGACCATCATTGTTCGCAGAAACTATCTCCACTTTGTCAAGAAGTATCAAAGATACGAGA
AGAGACATTCCAACATCCCTGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATC
ATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGG
TGATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAACAGTTTT
TTTGAAGTTATGGAGAATTTCTTTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATGTTTTGTTTGTTG
ATCCCTCTCGTGTGAGACTTGGTTTTTCCACAGACTGAATAGAAACCTACGTACTACTTT
C
TGTCG

QA 3 663 3 663
DS 



AS 2 11

CO CL505Contig1 648 5 6 U
GGGGCTAGATCATTTTAAAAGACAAATAAGAAGAACCAAAAAAAAAAAACTGAAAAACAG
ATCGCACAATAAAATTTAAGTTTGTTTAACGTAACAGTCGAAGGAAATGGCGAGCACTGT
GATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGTGCCAGCAGGATCTCCGCAGCTCCTGT
TCAACGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGGAAATGGTGCACTCGGTGCAAA
GTGTGGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACATCTACGACCCTGAT
GCTGTTCGCGGGGAGATTCGGACTTGCACCATCAGCAAATAGGAAAGCAACAGCTGGGCT
TAAGCTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGATCCAGCCGGGTTCACGCTCGC
TGACACGTTGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGAGTAGGAGTTGTCCTTGGCCT
CAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTATTTTTTATTGGTATCTGTAACCATTGTAGATT
TCTGAAACAAAATTCTCAAGATACCTGA**GGGGGAGATCTAAATAAATCTTTAAGTGTT
TATATTTATAATGTCTGCATCGCATGCATATGTTCAAATAGAAATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E081TF U 1
AF RR2DY38JQ C 51
AF RR2DY38TF U 51
AF RR2GW94JQ C 44
AF RR2GW94TF U 44
BS 1 110 RR2E081TF
BS 111 111 RR2DY38TF
BS 112 567 RR2E081TF
BS 568 569 RR2DY38TF
BS 570 570 RR2GW94TF
BS 571 648 RR2E081TF

RD RR2E081TF 648 0 0
GGGGCTAGATCATTTTAAAAGACAAATAAGAAGAACCAAAAAAAAAAAACTGAAAAACAG
ATCGCACAATAAAATTTAAGTTTGTTTAACGTAACAGTCGAAGGAAATGGTGAGCACTGT
GATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGTGCCAGCAGGATCTCCGCAGCTCCTGT
TCAACGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGGAAATGGTGCACTCGGTGCAAA
GTGTGGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACATCTACGACCCTGAT
GCTGTTCGCGGGGAGATTCGGACTTGCACCATCAGCAAATAGGAAAGCAACAGCTGGGCT
TAAGCTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGATCCAGCCGGGTTCACGCTCGC
TGACACGTTGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGAGTAGGAGTTGTCCTTGGCCT
CAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTATTTTTTATTGGTATCTGTAACCATTGTAGATT
TCTGAAACAAAATTCTCAAGATACCTGGAGGGGGGAGATCTAAATAAATCTTTAAGTGTT
TATATTTATAATGTCTGCATCGCATGCATATGTTCAAATAGAAATACC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2DY38JQ 557 0 0
G
GAAAAACAGATCGCACAATAAAATTTAAGTTTGTTTAACGTAACAGTCGAAGGAAATGGC
GAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGTGCCAGCAGGATCTCCGC
AGCTCCTGTTCAACGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGGAAATGGTGCACT
CGGTGCAAAGTGTGGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACATCTAC
GACCCTGATGCTGTTCGCGGGGAGATTCGGACTTGCA***TCAGCAAATAGGAAAGCAAC
AGCTGGGCTTAAGCTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGATCCAGCCGGGTT
CACGCTCGCTGACACGTTGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGAGTAGGAGTTGT
CCTTGGCCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTATTTTT*ATTGGTATCTGTAACCA
TTGTAGATTTCTGAAACAAAATTCTCTAGATACCTGA**GGGGGAGATCTAAATAAATCT
TTAAGTGTTTATATTT

QA 2 557 2 557
DS 

RD RR2DY38TF 557 0 0
G
GAAAAACAGATCGCACAATAAAATTTAAGTTTGTTTAACGTAACAGTCGAAGGAAATGGC
GAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGTGCCAGCAGGATCTCCGC
AGCTCCTGTTCAACGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGGAAATGGTGCACT
CGGTGCAAAGTGTGGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACATCTAC
GACCCTGATGCTGTTCGCGGGGAGATTCGGACTTGCA***TCAGCAAATAGGAAAGCAAC
AGCTGGGCTTAAGCTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGATCCAGCCGGGTT
CACGCTCGCTGACACGTTGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGAGTAGGAGTTGT
CCTTGGCCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTATTTTT*ATTGGTATCTGTAACCA
TTGTAGATTTCTGAAACAAAATTCTCTAGATACCTGA*GGGGGGAGATCTAAATAAATCT
TTAAGTGTTTATATTT

QA 2 557 2 557
DS 

RD RR2GW94JQ 564 0 0
GG
AAAACTGAAAAACAGATCGCACAATAAAATTTAAGTTTGTTTAACGTAACAGTCGAAGGA
AATGGCGAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGTGCCAGCAGGAT
CTCCGCAGCTCCTGTTCAACGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGGAAATGG
TGCACTCGGTGCAAAGTGTGGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAAC
ATTTACGACCCTGATGCTGTTCGCGGGGAGATTCGGACTTGCACCATCAGCAAATAGGAA
AGCAACAGCTGGGCTTAAGCTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGATCCAGC
CGGGTTCACGCTCGCTGACACGTTGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGAGTAGG
AGTTGTCCTTGGCCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTATTTTTTATTGGTATCTG
TAACCATTGTAGATTTCTGAAACAAAATTCTCAAGATACCTGA**GGGGGAGATCTAAAT
AAATCTTTAAGTGTTTATATTT

QA 3 564 3 564
DS 

RD RR2GW94TF 564 0 0
GG
AAAACTGAAAAACAGATCGCACAATAAAATTTAAGTTTGTTTAACGTAACAGTCGAAGGA
AATGGCGAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGTGCCAGCAGGAT
CTCCGCAGCTCCTGTTCAACGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGGAAATGG
TGCACTCGGTGCAAAGTGTGGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAAC
ATCTACGACCCTGATGCTGTTCGCGGGGAGATTCGGACTTGCACCATCAGCAAATAGGAA
AGCAACAGCTGGGCTTAAGCTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGATCCAGC
CGGGTTCACGCTCGCTGACACGTTGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGAGTAGG
AGTTGTCCTTGGCCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTATTTTTTATTGGTATCTG
TAACCATTGTAGATTTCTGAAACAAAATTCTCAAGATACCTGA**GGGGGAGATCTAAAT
AAATCTTTAAGTGTTTATATTT

QA 3 564 3 564
DS 



CO CL505Contig2 659 6 15 U
TTTTTTCATCTTGTTAGAAGCTCACGTAAAAACTTCTAAGCCTGGTGGTATTTTCTATTT
GAACATATGCATGCGATGCAGACATTATAAACATAAAGACACTTAAAGATTTATGTAGAT
CTCCCCCTCAGGTTCTTGAGAATTTTGTTTCAGAAATCTACAATGGTTACAAATACACAA
TAAAAGAAGTTTTAAATAGCACCAATGTTTTTGAGGCCAAGGACAACTCCTACTCCGATG
ATATGACCAACGGTACCACAAGCCAACGTGTCAGCGAGCGTGAACCCGGCTGGGTCACCT
GTTTGTAGACCCGAGTCACGTGCCTCCAGCTTAAGTCCGGCAGTTGCTTTTCTATTCGCT
GATGGTGCAAGTCCGAATCTCCCCGCGAACAGCATCAGGGTCGTAGATGTTACCATTATC
AGATTTGTTGATGAACCAATGAAGTCACCACACTTTGCACCGAGTGCACCATTTCCCTTG
CGTCTCATGGGCTGAACAGTTGCCAGGCGTTGAACAGGAGCTGCGGAGATCTTGCTGGCA
CGAAGACCATTGAACTGAGGCAGTGTAGTCATTACAGTGCTCGCCATTTCCTTCGACTGT
TACGTTAAACAAACTTAAATTTTACTGTGCGATCTGTTTTTCAGTTTTTTTGGTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR2EZ34TF C 1
AF RR2BH37JQ U 110
AF RR2BH37TF C 110
AF RR2F243JQ U 89
AF RR2F243TF C 89
AF RR2EZ34JQ U 7
BS 1 6 RR2EZ34TF
BS 7 90 RR2EZ34JQ
BS 91 110 RR2F243JQ
BS 111 216 RR2BH37JQ
BS 217 217 RR2F243JQ
BS 218 405 RR2BH37JQ
BS 406 406 RR2F243JQ
BS 407 486 RR2BH37JQ
BS 487 487 RR2F243JQ
BS 488 556 RR2BH37JQ
BS 557 557 RR2F243JQ
BS 558 585 RR2BH37JQ
BS 586 586 RR2F243JQ
BS 587 656 RR2BH37JQ
BS 657 659 RR2EZ34JQ

RD RR2EZ34TF 659 0 0
TTTTTTCATCTTGTTAGAAGCTCACGTAAAAACTTCTAAGCCTGGTGGTATTTTCTATTT
GAACATATGCATGCGATGCAGACATTATAAACATAAAGACACTTAAAGATTTATGTAGAT
CTCCCCCTCAGGTTCTTGAGAATTTTGTCTCAGAAATCTACAATGGTTACAAATACACAA
TAAAAGAAGTTTTAAATAGCACCAATGTTTTTGAGGCCAAGGACAACTCCTACTCCGATG
ATATGACCAACGGTACCACGAGCCAACGTGTCAGCGAGCGTGAACCCGGCTGGGTCACCT
GTTTGTAGACCCGAGTCACGTGCCTCCAGCTTAAGTCCGGCAGTTGCTTTTCTATTCGCT
GATGGTGCAAGTCCGAATCTCCCCGCGAACAGCATCAGGGTCGTAGATGTTACCATTATC
AGATTTGTTGATGAACCAATGAAGTCACCACACTTTGCACCGAGTGCACCATTTCCCTTG
CGTCTCATGGGCTGAACAGTTGCCAGGCGTTGAACAGGAGCTGCGGAGATCTTGCTGGCA
CGAAGACCATTGAACTGAGGCAGTGTAGTCATTACAGTGCTCGCCATTTCCTTCGACTGT
TACGTTAAACAAACTTAAATTTTACTGTGCGATCTGTTTTTCAGTTTTTTTGGTTC
TCC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2BH37JQ 548 0 0
C
TTATGTAGATCTCCCCCTCAGGTTCTTGAGAATTTTGTTTCAGAAATCTACAATGGTTAC
AAATACACAATAAAAGAAGTTTTAAATAGCACCAATGTTTTTGAGGACAAGGACAACTCC
TACTCCGATGATATGACCAACGGTACCACAAGCCAACGTGTCAGCGAGCGTGAACCCGGC
TGGGTCACCTGTTTGTAGACCCGAGTCACGTGCCTCCAGCTTAAGTCCGGCAGTTGCTTT
TCTATTCGCTGATGGTGCAAGTCCGAATCTCCCCGCGAACAGCATCAGGGTCGTAAATGT
TACCATTATCAGATTTGTTGATGAACCAATGAAGTCACCACACTTTGCACCGAGTGCACC
ATTTCCCTTGCGTCTCCTGGGCTGAACAGTTGCCAGGCGTTGAACAGGAGCTGCGGAGAT
CTTGCTGGCACGAAGACCATTGAACTAAGGCAGTGTAGTCATTACAGTGCTCGCCGTTTC
CTTCGACTGTTACGTTAAACAAACTTAAATTTTACTGTGCGATCTGTTTTTCAGTTTTTT
TGGTTC
C

QA 2 547 2 547
DS 

RD RR2BH37TF 548 0 0
C
TTATGTAGATCTCCCCCTCAGGTTCTTGAGAATTTTGTTTCAGAAATCTACAATGGTTAC
AAATACACAATAAAAGAAGTTTTAAATAGCACCAATGTTTTTGAGGACAAGGACAACTCC
TACTCCGATGATATGACCAACGGTACCACAAGCCAACGTGTCAGCGAGCGTGAACCCGGC
TGGGTCACCTGTTTGTAGACCCGAGTCACGTGCCTCCAGCTTAAGTCCGGCAGTTGCTTT
TCTATTCGCTGATGGTGCAAGTCCGAATCTCCCCGCGAACAGCATCAGGGTCGTAGATGT
TACCATTATCAGATTTGTTGATGAACCAATGAAGTCACCACACTTTGCACCGAGTGCACC
ATTTCCCTTGCGTCTCCTGGGCTGAACAGTTGCCAGGCGTTGAACAGGAGCTGCGGAGAT
CTTGCTGGCACGAAGACCATTGAACTAAGGCAGTGTAGTCATTACAGTGCTCGCCGTTTC
CTTCGACTGTTACGTTAAACAAACTTAAATTTTACTGTGCGATCTGTTTTTCAGTTTTTT
TGGTTC
C

QA 2 547 2 547
DS 

RD RR2F243JQ 577 0 0
AG
ACATAAAGACACTTAAAGATTTATTTAGATCTCCCCCTCAGGTTCTTGAGAATTTTGTTT
AAGGAATCTACAATGGTTACAAATACACAATAAAAGAAGTTTTAAATAGCACCAATGTTT
TTGAGGCCAAGGACAACTCCTACTCCGATGATATGACCAACGGTACCACAAGCCAACGTG
TCAGCGAGCGTGAACCCGGCTGGGTCACCTGTTTGTAGACCCGAGTCACGTGCCTCCAGC
TTAAGTCCGGCTGTTGCTTTTCTATTCGCTGATGGTGCAAGTCCGAATCTCCCCGCGAAC
AGCATCAGGGTCGTAGATGTTACCATTATCAGATTTGTTGATGAACCAATGAAGTCACCA
CACTTTGCACCGAGTGCACCATTTCCCTTGCGTCTCATGGGCTGAACAGTTGACAGGCGT
TGAACAGGAGCTGCGGAGATCCTGCTGGCACGAAGACCATTGAACTGAGGCAGTGTAGTC
ATCACAGTGCTCGCCATTTCCTTCGACTGTTACGTTAAACAAACTTAAATTTTATTGTGC
GATCTGTTTTTCAGTTTTTTT
TTTGGTTCTAGCCC

QA 3 563 3 563
DS 

RD RR2F243TF 577 0 0
AG
ACATAAAGACACTTAAAGATTTATTTAGATCTCCCCCTCAGGTTCTTGAGAATTTTGTTT
AAGGAATCTACAATGGTTACAAATACACAATAAAAGAAGTTTTAAATAGCACCAATGTTT
TTGAGGCCAAGGACAACTCCTACTCCGATGATATGACCAACGGTACCACAAGCCAACGTG
TCAGCGAGCGTGAACCCGGCTGGGTCACCTGTTTGTAGACCCGAGTCACGTGCCTCCAGC
TTAAGTCCGGCTGTTGCTTTTCTATTCGCTGATGGTGCAAGTCCGAATCTCCCCGCGAAC
AGCATCAGGGTCGTAGATGTTACCATTATCAGATTTGTTGATGAACCAATGAAGTCACCA
CACTTTGCACCGAGTGCACCATTTCCCTTGCGTCTCATGGGCTGAACAGTTGACAGGCGT
TGAACAGGAGCTGCGGAGATCCTGCTGGCACGAAGACCATTGAACTGAGGCAGTGTAGTC
ATCACAGTGCTCGCCATTTCCTTCGACTGTTACGTTAAACAAACTTAAATTTTATTGTGC
GATCTGTTTTTCAGTTTTTTT
TTTGGTTCTAGCCC

QA 3 563 3 563
DS 

RD RR2EZ34JQ 653 0 0
CATCTTGTTAGAAGCTCACGTAAAAACTTCTAAGCCTGGTGGTATTTTCTATTTGAACAT
ATGCATGCGATGCAGACATTATAAACATAAAGACACTTAAAGATTTATGTAGATCTCCCC
CTCAGGTTCTTGAGAATTTTGTCTCAAAAATCTACAATGGTTACAAATACACAATAAAAG
AAGTTTTAAATAGCACCAATGTTTTTGAGGCCAAGGACAACTCCTACTCCGATGATATGA
CCAACGGTACCACGAGCCAACGTGTCAGCGAGCGTGAACCCGGCTGGGTCACCTGTTTGT
AGACCCGAGTCACGTGCCTCCAGCTTAAGTCCGGCAGTTGCTTTTCTATTCGCTGATGGT
GCAAGTCCGAATCTCCCCGCGAACAGCATCAGGGTCGTAGATGTTACCATTATCAGATTT
GTTGATGAACCAATGAAGTCACCACACTTTGCACCGAGTGCACCATTTCCCTTGCGTCTC
ATGGGCTGAACAGTTGCCAGGCGTTGAACAGGAGCTGCGGAGATCTTGCTGGCACGAAGA
CCATTGAACTGAGGCAGTGTAGTCATTACAGTGCTCGCCATTTCCTTCGACTGTTACGTT
AAACAAACTTAAATTTTACTGTGCGATCTGTTTTTCAGTTTTTTTGGTTCTCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 2 9

CO CL506Contig1 810 6 9 U
GGGTTGTAAGAACAAGCCGCAAAGCCTCTTAAGACAGACGCTTCTTCACCCTTGCAGATT
TCGCTAACCGATTCTGTGAAGATGTTCTCCGCTCAGAACAAGATCAAGAAGGACAAGAAT
GCCGAGCCGACAGAATGCGATGTGCAAGTTGCTCAGGCTTTGTTTGATTTAGAAAACACC
AACCAGGAGTTGAAAAGCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACATGGAC
ATCTCTGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCGTTCAGATTGAGGAAAGCTTTC
CGCAAGATCCACCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTT
ATCTTTGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCACCAAAGAAGGGTGCTGCTGTTCAGAGG
CCACGCAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGATGTCGCTTACCCT
GCTGAGATCGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTCGATGGATCCAAAGTCATGAAGGTG
TATTTGGAGGCCAAGGAAAGGAACAACACGGAGTACAAGCTCGAGACTATGGTGGGAGTC
TACCGCAAACTCACAGGAAAGGATGTCACCTTTGAGTACCCGGTGGAAGCTTGATGATGG
ATGATACTCCGAAGAATCATCATCATCATGATAGAGAAGAGAGGTTTTGAATTTATATGT
TGTCGTATTCACAATCTTTAATGTTACATTTCACAAAGACTTGTGTCTGTACTTTTCAAT
TTTGAAACCTATTTTATAGTTCCAGTTTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 25 25 25 25 25 
25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL27TF U 1
AF RR2AG26TF U 1
AF RR2AS80TF U 34
AF RR2AK36JQ C 63
AF RR2AK36TF U 56
AF RR2GL27JQ C 200
BS 1 195 RR2AG26TF
BS 196 196 RR2GL27TF
BS 197 774 RR2AG26TF
BS 775 778 RR2AS80TF
BS 779 779 RR2AK36JQ
BS 780 788 RR2AS80TF
BS 789 789 RR2AK36JQ
BS 790 803 RR2AS80TF
BS 804 810 RR2GL27JQ

RD RR2GL27TF 550 0 0
GGC
TTGTAAGAACAAGCCGCAAAGCCTCTTAAGACAGACGCTTCTTCACCCTTACAGATTTCG
CTAACCGATTCTGTGAAGATGTTCTCCGCTCAGAACAAGATCAAGAAGGACAAGAATGCC
GAGCCGACAGAATGCGATGTGCAAGTTGCTCAGGCTTTGTTTGATTTAGAAAACACCAAC
CAGGAGTTGAAAAGCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACATGGACATC
TCTGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCGTTCAGATTGAGGAAAGCTTTCCGC
AAGATCCACCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTTATC
TTTGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCACCAAAGAAGGGTGCTGCTGTTCAGAGGCCA
CGCAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGATGTCGCTTACCCTGCT
GAGATCGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTCGATGGATCCAAAGTCATGAAAGTGTAT
TTGGAGG

QA 4 550 4 550
DS 

RD RR2AG26TF 774 0 0
GGGTTGTAAGAACAAGCCGCAAAGCCTCTTAAGACAGACGCTTCTTCACCCTTGCAGATT
TCGCTAACCGATTCTGTGAAGATGTTCTCCGCTCAGAACAAGATCAAGAAGGACAAGAAT
GCCGAGCCGACAGAATGCGATGTGCAAGTTGCTCAGGCTTTGTTTGATTTAGAAAACACC
AACCAGGAGTTGAAA*GCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACATGGAC
ATCTCTGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCGTTCAGATTGAGGAAAGCTTTC
CGCAAGATCCACCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTT
ATCTTTGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCACCAAAGAAGGGTGCTGCTGTTCAGAGG
CCACGCAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGATGTCGCTTACCCT
GCTGAGATCGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTCGATGGATCCAAAGTCATGAAGGTG
TATTTGGAGGCCAAGGAAAGGAACAACACGGAGTACAAGCTCGAGACTATGGTGGGAGTC
TACCGCAAACTCACAGGAAAGGATGTCACCTTTGAGTACCCGGTGGAAGCTTGATGATGG
ATGATACTCCGAAGAATCATCATCATCATGATAGAGAAGAGAGGTTTTGAATTTATATGT
TGTCGTATTCACAATCTTTAATGTTACATTTCACAAAGACTTGTGTCTGTACTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2AS80TF 774 0 0
GG
AGACGCTTCTTCACCCTTGCAGATTTCGCTAACCGATTCTGTGAAGATGTTCTCCGCTCA
GAACAAGATCAAGAAGGACAAGAATGCCGAGCCGACAGAATGCGATGTGCAAGTTGCTCA
GGCTTTGTTTGATTTAGAAAACACCAACCAGGAGTTGAAAAGCGAGTTGAAAGATCTTTA
CATCAACCAAGCTGTTAACATGGACATCTCTGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGT
CCCGTTCAGATTGAGGAAAGCTTTCCGCAAGATCCACCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTTGA
GAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTTATCTTTGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCACC
AAAGAAGGGTGCTGCTGTTCAGAGGCCACGCAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGC
TATGCTCGAGGATGTCGCTTACCCTGCTGAGATCGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCT
CGATGGATCCAAAGTCATGAAGGTGTATTTGGAGGCCAAGGAAAGGAACAACACGGAGTA
CAAGCTCGAGACTATGGTGGGAGTCTACCGCAAACTCACAGGAAAGGATGTCACCTTTGA
GTACCCGGTGGAAGCTTGATGATGGATGATACTCCGAAGAATCATCATCATCATGATAGA
GAAGAGAGGTTTTGAATTTATATGTTGTCGTATTCACAATCTTTAATGTTACATTTCACA
AAGACTTGTGTCTGTACTTTTCA*TTTTGAAAC*TATTTTATAGTTCC
AGTT

QA 3 770 3 770
DS 

RD RR2AK36JQ 741 0 0
GCTAACCGATTCTGTGAAGATGTTCTCCGCTCAGAACAAGATCAAGAAGGACAAGAATGC
CGAGCCGACAGAATGCGATGTGCAAGTTGCTCAGGCTTTGTTTGATTTAGAAAACACCAA
CCAGGAGTTGAAAAGCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACATGGACAT
CTCTGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCGTTCAGATTGAGGAAAGCTTTCCG
CAAGATCCACCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTTAT
CTTTGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCACCAAAGAAGGGTGCTGCTGTTCAGAGGCC
ACGCAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGATGTCGCTTACCCTGC
TGAGATCGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTCGATGGATCCAAAGTCATGAAGGTGTA
TTTGGAGGCCAAGGAAAGGAACAACACGGAGTACAAGCTCGAGACTATGGTGGGAGTCTA
CCGCAAACTCACAGGAAAGGATGTCACCTTTGAGTACCCGGTGGAAGCTTGATGATGGAT
GATACTCCGAAGAATCATCATCATCATGATAGAGAAGAGAGGTTTTGAATTTATATGTTG
TCGTATTCACAATCTTTAATGTTACATTTCACAAAGACTTGTGTCTGTACTTTTCAATTT
TGAAACCTATTTTATAGTTCC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2AK36TF 735 0 0
AGATTTCGCTAACCGATTCTGTGAAGATGTTCTCCGCTCAGAACAAGATCAAGAAGGACA
AGAATGCCGAGCCGACAGAATGCGATGTGCAAGTTGCTCAGGCTTTGTTTGATTTAGAAA
ACACCAACCAGGAGTTGAAAAGCGAGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACA
TGGACATCTCTGGAAACCGCAAGGCTATTGTGATTTACGTCCCGTTCAGATTGAGGAAAG
CTTTCCGCAAGATCCACCCCCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGG
ATGTTATCTTTGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCACCAAAGAAGGGTGCTGCTGTTC
AGAGGCCACGCAACAGGACTCTAACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGATGTCGCTT
ACCCTGCTGAGATCGTTGGAAAACGTACTCGTTACCGTCTCGATGGATCCAAAGTCATGA
AGGTGTATTTGGAGGCCAAGGAAAGGAACAACACGGAGTACAAGCTCGAGACTATGGTGG
GAGTCTACCGCAAACTCACAGGAAAGGATGTCACCTTTGAGTACCCGGTGGAAGCTTGAT
GATGGATGATACTCCGAAGAATCATCATCATCATGATAGAGAAGAGAGGTTTTGAATTTA
TATGTTGTCGTATTCACAATCTTTAATGTTACATTTCACAAAGACTTGTGTCTGTACTTT
TCA*TTTTGAAAC
TA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2GL27JQ 611 0 0
AGTTGAAAGATCTTTACATCAACCAAGCTGTTAACATGGACATCTCTGGAAACCGCAAGG
CTATTGTGATTTACGTCCCGTTCAGATTGAGGAAAGCTTTCCGCAAGATCCACCCCCGTC
TCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGAAAGGATGTTATTTTTGTTGCCACAAGAA
GGATCATGCGTCCACCAAAGAAGGGTGCTGCTGTTCAGAGGCCACGCAACAGGACTCTAA
CCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGATGTCGCTTACCCTGCTGAGATCGTTGGAAAAC
GTACTCGTTACCGTCTCGATGGATCCAAAGTCATGAAGGTGTATTTGGAGGCCAAGGAAA
GGAACAACACGGAGTACAAGCTCGAGACTATGGTGGGAGTCTACCGCAAACTCACAGGAA
AGGATGTCACCTTTGAGTACCCGGTGGAAGCTTGATGATGGATGATACTCCGAAGAATCA
TCATCATCATGATAGAGAAGAGAGGTTTTGAATTTATATGTTGTCGTATTCACAATCTTT
AATGTTACATTTCACAAAGACTTGTGTCTGTACTTTTCAATTTTGAAACCTATTTTATAG
TTCCAGTTTCC

QA 1 611 1 611
DS 



CO CL506Contig2 816 3 7 U
AAACCTCAAAATAGGTTTAAAAATTGATAAAGCACAGAAACTTTTTAGTCTTTTTGTAAT
ATGAAGATTGTGAATAAGGAGAACTGAATCAAAACAGAGTTTACATCATCCTAAAGCACC
ACAAAACAGAATCAAAAGCACTCTCTTCTCTATCCTGATGTGATTCTTCAGCATCACCAA
CATCTTCAAGCTTCAACAGGGTACTCGAAAGTGACATCCTTTCCAGTAAGTTTCCGGTAC
ACACCCATCATAGTCTCCAGCTTGTACTCTGTGTTGTTCCTCTCCTTGGCCTCCAAATAG
ACCTTCATGATCTTGGAACCATCAAGACGGTAACGAGTACGTTTTCCAACAATCTCAGCA
GGGTAAGCGACATCCTCGAGCATTGCTTCATGAACAGAGGTTAGAGTCCTGTTGCGTGGC
CTCTGCACAGCAGCACCCTTCTTAGGTGGACGCATGATCCTTCTTGTCGCAACAAAGATA
ACATCCTTTCCACTGAACTTCTTCTCAAGCTCTCTAACGAGACGGGGATGAATCTTGCGG
AAAGCTTTCCTCAGTCTGAATGGGACGTAAATCACAATAGCCTTGCGGTTTCCAGAGATG
TCCATGTTAACAGCTTGGTTGATGTAAAGATCTTTCAACTCGCTCTTCAACTCCTGGTTG
GTGTTCTCCAAATCAAACAGAGCCTGAGCAACTTGCTCATCGCATTTGTTGGAGTGGCAT
TCTTGTCCTTCTTGATCTTGTTCTGAGCCGAGGACATCTTCACAGATTCGTATAGCGAAA
AAGTCTCAGGAACGAAGAAGAATAGCTCAAGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP72JQ U 1
AF RR2D812JQ U 7
AF RR2D812TF C 83
BS 1 239 RR2GP72JQ
BS 240 240 RR2D812JQ
BS 241 467 RR2GP72JQ
BS 468 468 RR2D812JQ
BS 469 652 RR2GP72JQ
BS 653 706 RR2D812JQ
BS 707 816 RR2D812TF

RD RR2GP72JQ 652 0 0
AAACCTCAAAATAGGTTTAAAAATTGATAAAGCACAGAAACTTTTTAGTCTTTTTGTAAT
ATGAAGATTGTGAATAAGGAGAACTGAATCAAAACAGAGTTTACATCATCCTAAAGCACC
ACAAAACAGAATCAAAAGCACTCTCTTCTCTATCCTGATGTGATTCTTCAGCATCACCAA
CATCTTCAAGCTTCAACAGGGTACTCGAAAGTGACATCCTTTCCAGTAAGTTTCCGGTAA
ACACCCATCATAGTCTCCAGCTTGTACTCTGTGTTGTTCCTCTCCTTGGCCTCCAAATAG
ACCTTCATGATCTTGGAACCATCAAGACGGTAACGAGTACGTTTTCCAACAATCTCAGCA
GGGTAAGCGACATCCTCGAGCATTGCTTCATGAACAGAGGTTAGAGTCCTGTTGCGTGGC
CTCTGCACAGCAGCACCCTTCTTAGGTGGACGCATGATCCTTCTTGTAGCAACAAAGATA
ACATCCTTTCCACTGAACTTCTTCTCAAGCTCTCTAACGAGACGGGGATGAATCTTGCGG
AAAGCTTTCCTCAGTCTGAATGGGACGTAAATCACAATAGCCTTGCGGTTTCCAGAGATG
TCCATGTTAACAGCTTGGTTGATGTAAAGATCTTTCAACTCGCTCTTCAACT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2D812JQ 719 0 0
CAAAATAGGTTTAAAAATTGATAAAGCACAGAAACTTTTTAGTCTTTTTGTAATATGAAG
ATTGTGAATAAGGAGAACTGAATCAAAACAGAGTTTACATCATCCTAAAGCACCACAAAA
CAGAATCAAAAGCACTCTCTTCTCTATCCTGATGTGATTCTTCAGCATCACCAACATCTT
CAAGCTTCAACAGGGTACTCGAAAGTGACATCCTTTCCAGTAAGTTTCCGGTACACACCC
ATCATAGTCTCCAGCTTGTACTCTGTGTTGTTCCTCTCCTTGGCCTCCAAATAGACCTTC
ATGATCTTGGAACCATCAAGACGGTAACGAGTACGTTTTCCAACAATCTCAGCAGGGTAA
GCGACATCCTCGAGCATTGCTTCATGAACAGAGGTTAGAGTCCTGTTGCGTGGCCTCTGC
ACAGCAGCACCCTTCTTAGGTGGACGCATGATCCTTCTTGTCGCAACAAAGATAACATCC
TTTCCACTGAACTTCTTCTCAAGCTCTCTAACGAGACGGGGATGAATCTTGCGGAAAGCT
TTCCTCAGTCTGAATGGGACGTAAATCACAATAGCCTTGCGGTTTCCAGAGATGTCCATG
TTAACAGCTTGGTTGATGTAAAGATCTTTCAACTCGCTCTTCAACTCCTGGTTGGTGTTC
TCCAAATCAAACAGAGCCTGAGCAACTTGCTCATCGCATT
TGTTGGAGTGGCATTCTTG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2D812TF 734 0 0
ACTGAATCAAAACAGAGTT*ACATCATC*TAAAGCACCACAAAACAGAATCAAAAGCACT
CTCTTCTCTATC*TGATGTGATTCTTCAGCATCACCAACATCTTCAAGCTTCAACAGGGT
ACTCGAAAGTGACATCCTTTCCAGTAAGTTTCCGGTACACACCCATCATAGTCTCCAGCT
TGTACTCTGTGTTGTTCCTCTCCTTGGCCTCCAAATAGACCTTCATGATCTTGGAACCAT
CAAGACGGTAACGAGTACGTTTTCCAACAATCTCAGCAGGGTAAGCGACATCCTCGAGCA
TTGCTTCATGAACAGAGGTTAGAGTCCTGTTGCGTGGCCTCTGCACAGCAGCACCCTTCT
TAGGTGGACGCATGATCCTTCTTGTCGCAACAAAGATAACATCCTTTCCACTGAACTTCT
TCTCAAGCTCTCTAACGAGACGGGGATGAATCTTGCGGAAAGCTTTCCTCAGTCTGAATG
GGACGTAAATCACAATAGCCTTGCGGTTTCCAGAGATGTCCATGTTAACAGCTTGGTTGA
TGTAAAGATCTTTCAACTCGCTCTTCAACTCCTGGTTGGTGTTCTCCAAATCAAACAGAG
CCTGAGCAACTTGCTCATCGCATTTGTTGGAGTGGCATTCTTGTCCTTCTTGATCTTGTT
CTGAGCCGAGGACATCTTCACAGATTCGTATAGCGAAAAAGTCTCAGGAACGAAGAAGAA
TAGCTCAAGATTCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 2 9

CO CL507Contig1 1443 5 6 U
GGATCCCCAACCAAACTCGATCTTCTTTCACTGCGCACACAAAGCGAGAGACGAAGAAGA
AGAGAGAGAGAAAAACAAAAGTGGAGGAAAGCGTAGAAATTTAGGGTTTCCTGGATCGGA
CGAAGAGGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAACGAGAATGGGCGCGAATTCG
ATACCGACGGAGGCAACGATTGATCTCGATGAGCAGATCTCGCAGCTCATGCAGTGCAAG
CCCCTCTCCGAGCAACAGGTTAGATCATTATGCGAGAAAGCCAAGGAGATCTTAATAGAT
GAAAGCAACGTTCAGCCTGTGAAAAGCCCTGTGACAATCTGCGGTGATATTCATGGACAG
TTCCATGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATTGGGGGAATGTGCCCTGATACCAACTACCTG
TTTATGGGAGATTATGTTGATCGTGGTTATTATTCTGTTGAAACTGTTACGCTGTTAGTC
GCCTTGAAGATGCGATATCCTCAGCGAATCACCATTCTTAGAGGAAACCATGAAAGTCGT
CAGATCACTCAGGTCTATGGATTTTATGATGAATGTTTGCGAAAGTATGGCAACGCAAAT
GTTTGGAAGATCTTTACAGACCTCTTCGATTACTTCCCATTGACAGCCTTGGTTGAGTCA
GAAATATTCTGCCTCCATGGAGGATTGTCTCCATCTATCGAGACACTTGACAACATAAGG
AACTTTGATCGAGTTCAAGAAGTGCCCCATGAAGGGCCCATGTGTGACTTATTATGGTCT
GATCCTGATGACCGTTGTGGTTGGGGGATCTCTCCACGTGGTGCTGGATATACATTTGGT
CAGGACATATCCGAACAGTTCAACCACTCAAACAGCTTAAAGCTGATCGCAAGAGCCCAT
CAGCTTGTTATGGATGGATACAACTGGGCTCATGAGCAAAAGGTGGTAACTATCTTCAGT
GCACCAAACTATTGTTACCGTTGTGGGAACATGGCTTCAATTCTTGAGGTTGATGACTGC
ATGAATCACAGCTTCATTCAGTTTGAACCAGCACCGAGGAGAGGAGAACCAGACGTTACT
CGAAGAACACCAGACTACTTTCTCTGATCACTAGACACAGAGTGATCTCAGCAGCTGCAG
CCAACAACTGAAAAGTCACAGTTGGTAACTCAAGTATCTGGTTTCTGTGCAGCTTGTTAA
GGTTGCTGGCGAAGAAGGCCCTCTCTGATCTTCCTCTATACCCAAGAAAAAAGAGGTCAA
TGGGTGACTCTACATTACCCATCATGCATGCACATTGTTTGGTTGATGTTATTACCTTCT
TTTTTCTTCTTTCTGCATCAGATTGTGTTTTCTCAGATCTTTTTAATTTTATTTATTGTA
ATTCTTCACCCAAATGTCATGCACTATTTTTTAGTTTACAAATCTAATGACTGATTGCAG
TCG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2BQ69TF U 1
AF RR2CU92TF U 49
AF RR2FI94TF U 2
AF RR2FI94JQ C 670
AF RR2BQ69JQ C 681
BS 1 711 RR2BQ69TF
BS 712 747 RR2FI94TF
BS 748 1164 RR2FI94JQ
BS 1165 1165 RR2BQ69JQ
BS 1166 1433 RR2FI94JQ
BS 1434 1443 RR2BQ69JQ

RD RR2BQ69TF 711 0 0
GGATCCCCAACCAAACTCGATCTTCTTTCACTGCGCACACAAAGCGAGAGACGAAGAAGA
AGAGAGAGAGAAAAACAAAAGTGGAGGAAAGCGTAGAAATTTAGGGTTTCCTGGATCGGA
CGAAGAGGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAACGAGAATGGGCGCGAATTCG
ATACCGACGGAGGCAACGATTGATCTCGATGAGCAGATCTCGCAGCTCATGCAGTGCAAG
CCCCTCTCCGAGCAACAGGTTAGATCATTATGCGAGAAAGCCAAGGAGATCTTAATAGAT
GAAAGCAACGTTCAGCCTGTGAAAAGCCCTGTGACAATCTGCGGTGATATTCATGGACAG
TTCCATGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATTGGGGGAATGTGCCCTGATACCAACTACCTG
TTTATGGGAGATTATGTTGATCGTGGTTATTATTCTGTTGAAACTGTTACGCTGTTAGTC
GCCTTGAAGATGCGATATCCTCAGCGAATCACCATTCTTAGAGGAAACCATGAAAGTCGT
CAGATCACTCAGGTCTATGGATTTTATGATGAATGTTTGCGAAAGTATGGCAACGCAAAT
GTTTGGAAGATCTTTACAGACCTCTTCGATTACTTCCCATTGACAGCCTTGGTTGAGTCA
GAAATATTCTGCCTCCATGGAGGATTGTCTCCATCTATCGAGACACTTGAC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2CU92TF 667 0 0
GGCG
GAAGAAGAAGAGAGAGAGAAAAACAAAAGTGGAGGAAAGCGTAGAAATTTAGGGTTTCCT
GGATCGGACGAAGAGGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAACGAGAATGGGCG
CGAATTCGATACCGACGGAGGCAACGATTGATCTCGATGAGCAGATCTCACAGCTCATGC
AGTGCAAGCCCCTCTCCGAGCAACAGGTTAGATCATTATGCGAGAAAGCCAAGGAGATCT
TAATAGATGAAAGCAACGTTCAGCCTGTGAAAAGCCCTGTGACAATCTGCGGTGATATTC
ATGGACAGTTCCATGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATTGGGGGAATGTGCCCTGATACCA
ACTACCTGTTTATGGGAGATTATGTTGATCGTGGTTATTATTCTGTTGAAACTGTTACGC
TGTTAGTCGCCTTGAAGATGCGATATCCTCAGCGAATCACCATTCTTAGAGGAAACCATG
AAAGTCGTCAGATCACTCAGGTCTATGGATTTTATGATGAATGTTTGCGAAAGTATGGCA
ACGCAAATGTTTGGAAGATCTTTACAGACCTCTTCGATTACTTCTCATTGACAGCCTTGG
TTGAGTCAGAAATATTCTGCCTCCATGGAGGATTGTCTCCATCTATCGAGACACTTGACA
ACA

QA 5 667 5 667
DS 

RD RR2FI94TF 751 0 0
GATCCCCAACCAAACTCGATCTTCTTTCACTGCGCACACAAAGCGAGAGACGAAGAAGAA
GAGAGAGAGAAAAACAAAAGTGGAGGAAAGCGTAGAAATTTAGGGTTTCCTGGATCGGAC
GAAGAGGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAACGAGAATGGGCGCGAATTCGA
TACCGACGGAGGCAACGATTGATCTCGATGAGCAGATCTCGCAGCTCATGCAGTGCAAGC
CCCTCTCCGAGCAACAGGTTAGATCATTATGCGAGAAAGCCAAGGAGATCTTAATAGATG
AAAGCAACGTTCAGCCTGTGAAAAGCCCTGTGACAATCTGCGGTGATATTCATGGACAGT
TCCATGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATTGGGGGAATGTGCCCCGATACCAACTACCTGT
TTATGGGAGATTATGTTGATCGTGGTTATTATTCTGTTGAAACTGTTACGCTGTTAGTCG
CCTTGAAGATGCGATATCCTCAGCGAATCACCATTCTTAGAGGAAACCATGAAAGTCGTC
AGATCACTCAGGTCTATGGATTTTATGATGAATGTTTGCGAAAGTATGGCAACGCAAATG
TTTGGAAGATCTTTACAGACCTCTTCGATTACTTCCCATTGACAGCCTTGGTTGAGTCAG
AAATATTCTGCCTCCATGGAGGATTGTCTCCATCTATCGAGACACTTGACAACATAAGGA
ACTTTGATCGAGTTCAAGAAGTGCCC
ATGAA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2FI94JQ 764 0 0
TGCCTCCATGGAGGATTGTCTCCATCTATCGAGACACTTGACAACATAAGGAACTTTGAT
CGAGTTCAAGAAGTGCCCCATGAAGGGCCCATGTGTGACTTATTATGGTCTGATCCTGAT
GACCGTTGTGGTTGGGGGATCTCTCCACGTGGTGCTGGATATACATTTGGTCAGGACATA
TCCGAACAGTTCAACCACTCAAACAGCTTAAAGCTGATCGCAAGAGCCCATCAGCTTGTT
ATGGATGGATACAACTGGGCTCATGAGCAAAAGGTGGTAACTATCTTCAGTGCACCAAAC
TATTGTTACCGTTGTGGGAACATGGCTTCAATTCTTGAGGTTGATGACTGCATGAATCAC
AGCTTCATTCAGTTTGAACCAGCACCGAGGAGAGGAGAACCAGACGTTACTCGAAGAACA
CCAGACTACTTTCTCTGATCACTAGACACAGAGTGATCTCAGCAGCTGCAGCCAACAACT
GAAAAGTCACAGTTG*TAACTCAAGTATCTGGTTTCTGTGCAGCTTGTTAAGGTTGCTGG
CGAAGAAGGCCCTCTCTGATCTTCCTCTATACCCAAGAAAAAAGAGGTCAATGGGTGACT
CTACATTACCCATCATGCATGCACATTGTTTGGTTGATGTTATTACCTTCTTTTTTCTTC
TTTCTGCATCAGATTGTGTTTTCTCAGATCTTTTTAATTTTATTTATTGTAATTCTTCAC
CCAAATGTCATGCACTATTTTTTAGTTTACAAATCTAATGACTG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2BQ69JQ 763 0 0
A
GGATTGTCTCCATCTATCGAGACACTTGACAACATAAGGAACTTTGATCGAGTTCAAGAA
GTGCCCCATGAAGGGCCCATGTGTGACTTATTATGGTCTGATCCTGATGACCGTTGTGGT
TGGGGGATCTCTCCACGTGGTGCTGGATATACATTTGGTCAGGACATATCCGAACAGTTC
AACCACTCAAACAGCTTAAAGCTGATCGCAAGAGCCCATCAGCTTGTTATGGATGGATAC
AACTGGGCTCATGAGCAAAAGGTGGTAACTATCTTCAGTGCACCAAACTATTGTTACCGT
TGTGGGAACATGGCTTCAATTCTTGAGGTTGATGACTGCATGAATCACAGCTTCATTCAG
TTTGAACCAGCACCGAGGAGAGGAGAACCAGACGTTACTCGAAGAACACCAGACTACTTT
CTCTGATCACTAGACACAGAGTGATCTCAGCAGCTTCAGCCAACAACTGAAAAGTCACAG
TTGGTAACTCAAGTATCTGGTTTCTGTGCAGCTTGTTAAGGTTGCTGGCGAAGAAGGCCC
TCTCTGATCTTCCTCTATACCCAAGAAAAAAGAGGTCAATGGGTGACTCTACATTACCCA
TCATGCATGCACATTGTTTGGTTGATGTTATTACCTTCTTTTTTCTTCTTTCTGCATCAG
ATTGTGTTTTCTCAGATCTTTTTAATTTTATTTATTGTAATTCTTCACCCAAATGTCATG
CACTATTTTTTAGTTTACAAATTTAATGACTGATTGCAGTCG

QA 2 763 2 763
DS 



CO CL507Contig2 1446 4 6 U
GGATTCCCTTTTCGATCTTCTTCTATCACTCAGAGAAGAGAGAGAGAGAGAGGGGCGAAG
AATACGCAGATTCAATCCAATTTAGGGTTAGTGATTCCCCTAATTTGGAAAACCTAGTCC
TGAGTTTCCCCGGATCGGACGAAGAAGACGGAAGTAACGAGAATGGGCGCGAATTCTATA
CCGACGGACGCGACCATTGGTCTCGATGAGCAGATCTCGCAGCTCATGCAGTGCAAGCCT
CTCTCCGAGCAACAGGTTAGAGCATTATGCGAAAAAGCCAAGGAGATCTTAATGGATGAA
AGCAACGTTCAGCCTGTGAAAAGCCCCGTGACAATCTGCGGAGATATTCATGGACAGTTT
CATGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATTGGGGGAATGTGCCCTGATACCAATTACCTGTTT
ATGGGAGATTACGTTGACCGTGGTTATTACTCTGTTGAAACTGTTACGCTGTTAGTCGCC
TTAAAGTTGCGATATCCTCAGCGAATCACCATTCTTAGAGGAAACCATGAAAGTCGTCAG
ATCACTCAGGTTTATGGATTTTATGATGAATGTCTGCGAAAGTATGGCAATGCAAATGTT
TGGAAAATCTTTACAGACCTCTTTGACTATTTCCCACTGACAGCCTTGGTTGAGTCAGAA
ATATTTTGCCTTCATGGTGGATTGTCTCCATCAATCGAGACCCTTGACAACATAAGGAAC
TTTGATCGGGTTCAAGAAGTGCCCCATGAAGGGCCCATGTGTGACTTATTATGGTCTGAT
CCTGATGACCGTTGTGGTTGGGGCATCTCTCCTCGTGGTGCTGGATATACATTTGGTCAG
GATATATCCGAACAGTTCAACCACTCAAACAGCTTAAAGCTGATCGCCAGAGCCCATCAG
CTGTTATGGATGGATACAACTGGGCTCATGAGCAAAAGGTGGTAACCATCTTCAGTGCAC
CAAATTATTGTTACCGTTGTGGGAACATGGCTTCAATTCTCGAAGTTGATGACTGCAGGA
ACCACACCTTTATTCAGTTTGAACCAGCACCGAGGGAGAGGAGAACCAGACGTTACTCGG
AGAACACCAGACTACTTCCTGTGATCACTGGATACAGAGTCACCTCTCAGCAGCTGCAAC
CAACAACTGAAAAGTCCCAGTTAAGATTGCTGTGTGTTTTTTAAGTTCCAACTTAGTCCC
ACCACCGAAAGTATAGTGTGTGTTATAGGCGAAGAAGACCCTCTCTTTATACCTTCCTCG
ATAACCAAGAAGAAGAGGAAAGAGGTCAATGGACTCTCTACAATACCCATTATGCACATT
GTTTGTTTATTTAACTTCTTCTTTTTCTGCATCAGAATTGTCTTTTCTTGTGAGAGATCT
GTTTAATTTGATTTCTTGTAATTCTTCTCTTAAGTTTCTTCTATTTTTTTTGTTTGTTTG
TTTAGA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2F502TF U 1
AF RR2B463TF U 2
AF RR2A832TF U 404
AF RR2A832JQ C 651
BS 1 60 RR2F502TF
BS 61 61 RR2B463TF
BS 62 697 RR2F502TF
BS 698 714 RR2B463TF
BS 715 1120 RR2A832TF
BS 1121 1446 RR2A832JQ

RD RR2F502TF 697 0 0
GGATTCCCTTTTCGATCTTCTTCTATCACTCAGAGAAGAGAGAGAGAGAGAGGGGCGAAG
GATACGCAGATTCAATCCAATTTAGGGTTAGTGATTCCCCTAATTTGGAAAACCTAGTCC
TGAGTTTCCCCGGATCGGACGAAGAAGACGGAAGTAACGAGAATGGGCGCGAATTCTATA
CCGACGGACGCGACCATTGGTCTCGATGAGCAGATCTCGCAGCTCATGCAGTGCAAGCCT
CTCTCCGAGCAACAGGTTAGAGCATTATGCGAAAAAGCCAAGGAGATCTTAATGGATGAA
AGCAACGTTCAGCCTGTGAAAAGCCCCGTGACAATCTGCGGAGATATTCATGGACAGTTT
CATGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATTGGGGGAATGTGCCCTGATACCAATTACCTGTTT
ATGGGAGATTACGTTGACCGTGGTTATTACTCTGTTGAAACTGTTACGCTGTTAGTCGCC
TTAAAGTTGCGATATCCTCAGCGAATCACCATTCTTAGAGGAAACCATGAAAGTCGTCAG
ATCACTCAGGTTTATGGATTTTATGATGAATGTCTGCGAAAGTATGGCAATGCAAATGTT
TGGAAAATCTTTACAGACCTCTTTGACTATTTCCCACTGACAGCCTTGGTTGAGTCAGAA
ATATTTTGCCTTCATGGTGGATTGTCTCCATCAATCG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2B463TF 713 0 0
GATTCCCTTTTCGATCTTCTTCTATCACTCAGAGAAGAGAGAGAGAGAGAGGGGCGAAGA
ATACGCAGATTCAATCCAATTTAGGGTTAGTGATTCCCCTAATTTGGAAAACCTAGTCCT
GAGTTTCCCCGGATCGGACGAAGAAGACGGAAGTAACGAGAATGGGCGCGAATTCTATAC
CGACGGACGCGACCATTGGTCTCGATGAGCAGATCTCGCAGCTCATGCAGTGCAAGCCTC
TCTCCGAGCAACAGGTTAGAGCATTATGCGAAAAAGCCAAGGAGATCTTAATGGATGAAA
GCAACGTTCAGCCTGTGAAAAGCCCTGTGACAATCTGCGGAGATATTCATGGACAGTTTC
ATGATCTTGCTGAGCTTTTCCGTATTGGGGGAATGTGCCCTGATACCAATTACCTGTTTA
TGGGAGATTACGTTGACCGTGGTTATTACTCTGTTGAAACTGTTACGCTGTTAGTCGCCT
TAAAGTTGCGATATCCTCAGCGAATCACCATTCTTAGAGGAAACCATGAAAGTCGTCAGA
TCACTCAGGTTTATGGATTTTATGATGAATGTCTGCGAAAGTATGGCAATGCAAATGTTT
GGAAAATCTTTACAGACCTCTTTGACTATTTCCCACTGACAGCCTTGGTTGAGTCAGAAA
TATTTTGCCTTCATGGTGGATTGTCTCCATCAATCGAGACCCTTGACAACATA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2A832TF 722 0 0
G
TACCAATTACCTGTTTATGGGAGATTACGTTGACCGTGGTTATTACTCTGTTGAAACTGT
TACGCTGTTAGTCGCCTTAAAGTTGCGATATCCTCAGCGAATCACCATTCTTAGAGGAAA
CCATGAAAGTCGTCAGATCACTCAGGTTTATGGATTTTATGATGAATGTCTGCGAAAGTA
TGGCAATGCAAATGTTTGGAAAATCTTTACAGACCTCTTTGACTATTTCCCACTGACAGC
CTTGGTTGAGTCAGAAATATTTTGCCTTCATGGTGGATTGTCTCCATCAATCGAGACCCT
TGACAACATAAGGAACTTTGATCGGGTTCAAGAAGTGCCCCATGAAGGGCCCATGTGTGA
CTTATTATGGTCTGATCCTGATGACCGTTGTGGTTGGGGCATCTCTCCTCGTGGTGCTGG
ATATACATTTGGTCAGGATATATCCGAACAGTTCAACCACTCAAACAGCTTAAAGCTGAT
CGCCAGAGCCCATCAGCTGTTATGGATGGATACAACTGGGCTCATGAGCAAAAGGTGGTA
ACCATCTTCAGTGCACCAAATTATTGTTACCGTTGTGGGAACATGGCTTCAATTCTCGAA
GTTGATGACTGCAGGAACCACACCTTTATTCAGTTTGAACCAGCACCGAGGGAGAGGAGA
ACCAGACGTTACTCGGAGAACACCAGACTACTTCCTGTGATCACTGGATACAGAGT
CACCT

QA 2 717 2 717
DS 

RD RR2A832JQ 796 0 0
TGAGTCAGAAATATTTTGCCTTCATGGTGGATTGTCTCCATCAATCGAGACCCTTGACAA
CATAAGGAACTTTGATCGGGTTCAAGAAGTGCCCCATGAAGGGCCCATGTGTGACTTATT
ATGGTCTGATCCTGATGACCGTTGTGGTTGGGGCATCTCTCCTCGTGGTGCTGGATATAC
ATTTGGTCAGGATATATCCGAACAGTTCAACCACTCAAACAGCTTAAAGCTGATCGCCAG
AGCCCATCAGCTGTTATGGATGGATACAACTGGGCTCATGAGCAAAAGGTGGTAACCATC
TTCAGTGCACCAAATTATTGTTACCGTTGTGGGAACATGGCTTCAATTCTCGAAGTTGAT
GACTGCAGGAACCACACCTTTATTCAGTTTGAACCAGCACCGAGG*AGAGGAGAACCAGA
CGTTACTCGGAGAACACCAGACTACTTCCTGTGATCACTGGATACAGAGTCACCTCTCAG
CAGCTGCAACCAACAACTGAAAAGTCCCAGTTAAGATTGCTGTGTGTTTTTTAAGTTCCA
ACTTAGTCCCACCACCGAAAGTATAGTGTGTGTTATAGGCGAAGAAGACCCTCTCTTTAT
ACCTTCCTCGATAACCAAGAAGAAGAGGAAAGAGGTCAATGGACTCTCTACAATACCCAT
TATGCACATTGTTTGTTTATTTAACTTCTTCTTTTTCTGCATCAGAATTGTCTTTTCTTG
TGAGAGATCTGTTTAATTTGATTTCTTGTAATTCTTCTCTTAAGTTTCTTCTATTTTTTT
TGTTTGTTTGTTTAGA

QA 1 796 1 796
DS 



AS 2 11

CO CL508Contig1 501 3 3 U
GGGGGGGGGGGTTGCTAACTCAACGGTAGAGTACTCGGCTTTTAAGTGCGACTAGCATCT
TTTACACATTTGTATGAAGAAAAGGATTCGTCCAGATCTGCGGTAGAGTTTGTAAGACCA
CGACTGATCCTGAAAGGAATGAACGGAAAAAATAGCATGTCGTATCAAGGGAGAATTCAG
ATACCATTTTTTTTTTGCTTTTCTGATCGGTACAACCTTGTCGAAAAAAAAAAAAAGAAG
AATTCCAATTTGGGTCGAGTGAATAAATATAAATGGATGGATAAAAAACCAGTTTTCCTT
ATTCTAAGAAAAAAAAGAAACGAGCTTCCATTCGTAATTTGAAAAATTACCCGATCTAAT
TAAATGTTAAAATAAATTAATACCCAATACGGGCATAGGAAGGAATTTTTTTCTTGCGTG
TTATTATCAATTTTTTCGTGAGTCCTAATTATTTTTTCCCTAATTCGTTTGGGTTAGGTT
GGAAATGGATGTGTAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW57JQ C 7
AF RR2FW57TF U 7
AF RR2C910JQ U 1
BS 1 10 RR2C910JQ
BS 11 11 RR2FW57TF
BS 12 501 RR2C910JQ

RD RR2FW57JQ 217 0 0
GGGGGTTGCTAACTCAACGGTAGAGTACTCGGCTTTTAAGTGCGACTAGCATCTTTTACA
CATTTGTATGAAGAAAAGGATTCGTCCAGATTTGCGGTAGAGTTTGTAAGACCACGACTG
ATCCTGAAAGGAATGAACGGAAAAAATAGCATGTCGTATCAAGGGAGAATTCAGATACCA
TTTTTTTTTTGCTTTTCTGATCGGTACAACCTTGTCG

QA 1 217 1 217
DS 

RD RR2FW57TF 217 0 0
GGGGGTTGCTAACTCAACGGTAGAGTACTCGGCTTTTAAGTGCGACTAGCATCTTTTACA
CATTTGTATGAAGAAAAGGATTCGTCCAGATCTGCGGTAGAGTTTGTAAGACCACGACTG
ATCCTGAAAGGAATGAACGGAAAAAATAGCATGTCGTATCAAGGGAGAATTCAGATACCA
TTTTTTTTTTGCTTTTCTGATCGGTACAACCTTGTCG

QA 1 217 1 217
DS 

RD RR2C910JQ 501 0 0
GGGGGGGGGGATTGCTAACTCAACGGTAGAGTACTCGGCTTTTAAGTGCGACTAGCATCT
TTTACACATTTGTATGAAGAAAAGGATTCGTCCAGATCTGCGGTAGAGTTTGTAAGACCA
CGACTGATCCTGAAAGGAATGAACGGAAAAAATAGCATGTCGTATCAAGGGAGAATTCAG
ATACCATTTTTTTTTTGCTTTTCTGATCGGTACAACCTTGTCGAAAAAAAAAAAAAGAAG
AATTCCAATTTGGGTCGAGTGAATAAATATAAATGGATGGATAAAAAACCAGTTTTCCTT
ATTCTAAGAAAAAAAAGAAACGAGCTTCCATTCGTAATTTGAAAAATTACCCGATCTAAT
TAAATGTTAAAATAAATTAATACCCAATACGGGCATAGGAAGGAATTTTTTTCTTGCGTG
TTATTATCAATTTTTTCGTGAGTCCTAATTATTTTTTCCCTAATTCGTTTGGGTTAGGTT
GGAAATGGATGTGTAAAAAAA

QA 1 501 1 501
DS 



CO CL508Contig2 1317 8 17 U
GGAGAATTTGTCTTCTAAAAAGGGAAATATTGAATGAATTGATTGTAAATTGTAAGATTT
TTTTACATTTTTTCCTTCGATAGAGGATCCCAACCTTAGGGAAAATGGAATTTCTACAAT
CACTGCAAATAAAACAGATATCATTTGATAATAGAAATTATTGGTATGCCCCAGATTTTT
GTTCAAATCCTTAGTGGGAATAATCAAACGATTCTGTTCGTACATTCGTAAAATTAAGCG
TTTCACAATTAGTGAACTATATTTTTTGTCATAATCCGCATTTTCCAAGAAAATAAGGCG
ATTTCTATTTAATCTATTTAAACCGTGATCATAAGCAAATACATAAATATACTCCCGAAA
AAAA*GTGGATATAGAAAACTCTGTTGCCGAGCCCCATCGAACTCTAAATATCCTTGAAA
TTTCTCCATTTGGATTGAAATTCGATTTGAACTAAAAGTAAAGTCTTTATTTTCTTGAGT
TCTGAAATGACACATAGTGCGATACAGTCAAAATAAGGTATTAGATTACGAAAGCAATAA
ATACCTCATAAACAGGTAGACTGCTAACCGGATTCTCTATCTTTAATAGGTTTCTGTTCG
TTATATTATAGAATAGCAAAACAAGATGATTAGAAATCCTTTATTTTTTGAACCTAATCG
CTCTTTTGATTTTGGAAATATATATATATATTTTTTTT*ATCAATATACTGCTTCTTTTA
CACATCCATCTCCAACCTAACCCAAACGAACTAGGGAAAAAATAATTAGGACTCACGAAA
AAATTGATAATAACACGCAAGAAAAAAATTCCTTCCTATACCCGTATTAGGTACTAATCT
ATTTTTAACATTTAATTAGATCGGGTAATTTTTCAAATTACGAATGGAAGCTCGTTTCTT
TTTTTTCTTAGAATAAGGAAAACTGGTTTTTTATCCATCCATTTATATTTATTCACTCGA
CCCAAATTGGAATTCTTCTTTTTTTTTTTTTCGACAAGGTTGTACCGATCAGAAAAGCAA
AAAAAAA*********TGGTATCTGAATTCTCCCTTGATACGACATGCTATTTTTTCCGT
TCATTCCTTTCAGGATCAGTCGTGGTCTTACAAACTCTACCGCAGATCTGGACGAATCCT
TTTCTTCATACAAATGTGTAAAAGATGCTAGTCGCACTTAAAAGCCGAGTACTCTACCGT
TGAGTTAGCAACCCCCCCCCAAAAAAAAAAGAAAGTACAGCAAATATGTAGATACAACCA
GAATAAAGAAAAATCCAGTCATGTGTGCGTCAGGGATAAATAGATCTATTTCTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 10 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FJ20TF U 1
AF RR2EO57JQ U 74
AF RR2EZ77TF U 282
AF RR2C910TF U 650
AF RR2EO57TF C 464
AF RR2EZ77JQ C 754
AF RR2CV13JQ U 993
AF RR2CV13TF C 993
BS 1 322 RR2FJ20TF
BS 323 323 RR2EO57JQ
BS 324 364 RR2FJ20TF
BS 365 365 RR2EO57JQ
BS 366 520 RR2FJ20TF
BS 521 783 RR2EO57JQ
BS 784 905 RR2EZ77TF
BS 906 906 RR2C910TF
BS 907 931 RR2EZ77TF
BS 932 932 RR2C910TF
BS 933 962 RR2EZ77TF
BS 963 963 RR2C910TF
BS 964 988 RR2EZ77TF
BS 989 1027 RR2C910TF
BS 1028 1028 RR2CV13JQ
BS 1029 1090 RR2C910TF
BS 1091 1317 RR2CV13JQ

RD RR2FJ20TF 520 0 0
GGAGAATTTGTCTTCTAAAAAGGGAAATATTGAATGAATTGATTGTAAATTGTAAGATTT
TTTTACATTTTTTCCTTCGATAGAGGATCCCAACCTTAGGGAAAATGGAATTTCTACAAT
CACTGCAAATAAAACAGATATCATTTGATAATAGAAATTATTGGTATGCCCCAGATTTTT
GTTCAAATCCTTAGTGGGAATAATCAAACGATTCTGTTCGTACATTCGTAAAATTAAGCG
TTTCACAATTAGTGAACTATATTTTTTGTCATAATCCGCATTTTCCAAGAAAATAAGGCG
ATTTCTATTTAATCTATTTAAATCGTGATCATAAGCAAATACATAAATATACTCCCGAAA
AAAAAGTGGATATAGAAAACTCTGTTGCCGAGCCCCATCGAACTCTAAATATCCTTGAAA
TTTCTCCATTTGGATTGAAATTCGATTTGAACTAAAAGTAAAGTCTTTATTTTCTTGAGT
TCTGAAATGACACATAGTGCGATACAGTCAAAATAAGGTA

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2EO57JQ 710 0 0
G
CTTCGATAGAGGATCCCAACCTTAGGGAAAATGGAATTTCTACAATCACTGCAAATAAAA
CAGATATCATTTGATAATAGAAATTATTGGTATGCCCCAGATTTTTGTTCAAATCCTTAG
TGGGAATAATCAAACGATTCTGTTCGTACATTCGTAAAATTAAGCGTTTCACAATTAGTG
AACTATATTTTTTGTCATAATCCGCATTTTCCAAGAAAATAAGGCGATTTCTATTTAATC
TATTTAAACCGTGATCATAAGCAAATACATAAATATACTCCCGAAAAAAA*GTGGATATA
GAAAACTCTGTTGCCGAGCCCCATCGAACTCTAAATATCCTTGAAATTTCTCCATTTGGA
TTGAAATTCGATTTGAACTAAAAGTAAAGTCTTTATTTTCTTGAGTTCTGAAATGACACA
TAGTGCGATACAGTCAAAATAAGGTATTAGATTACGAAAGCAATAAATACCTCATAAACA
GGTAGACTGCTAACCGGATTCTCTATCTTTAATAGGTTTCTGTTCGTTATATTATAGAAT
AGCAAAACAAGATGATTAGAAATCCTTTATTTTTTGAACCTAATCGCTCTTTTGATTTTG
GAAATATATATATATATTTTTTTT*ATCAATATACTGCTTCTTTTACACATCCATCTCCA
ACCTAACCCAAACGAACTAGGGAAAAAATAATTAGGACTCACGAAAAAA

QA 2 710 2 710
DS 

RD RR2EZ77TF 710 0 0
G
TTCCAAGAAAATAAGGCGATTTCTATTTAATCTATTTAAACCGTGATCATAAGCAAATAT
ATAAATATACTCCCGAAAAAAA*GTGGATATAGAAAACTCTGTTGCCGAGCCCCATCGAA
CTCTAAATATCCTTGAAATTTCTCCATTTGGATTGAAATTCGATTTGAACTAAAAGTAAA
GTCTTTATTTTCTTGAGTTCTGAAATGACACATAGTGCGATACAGTCAAAATAAGGTATT
AGATTACGAAAGCAATAAATACCTCATAAACAGGTAGACTGCTAACCGGATTCTCTATCT
TTAATAGGTTTCTGTTCGTTATATTATAGAATAACAAAACAAGATGATTAGAAATCCTTT
ATTTTTTGAACCTAATCGCTCTTTTGATTTTGGAAATATATATATATATTTTTTTT*ATC
AATATACTGCTTCTTTTACACATCCATCTCCAACCTAACCCAAACGAACTAGGGAAAAAA
TAATTAGGACTCACGAAAAAATTGATAATAACACGCAAGAAAAAAATTCCTTCCTATACC
CGTATTAGGTACTAATCTATTTTTAACATTTAATTAGATCGGGTAATTTTTCAAATTACG
AATGGAAGCTCGTTTCTTTTTTT*CTTAGAATAAGGAAAACTGGTTTTT*ATCCATCCAT
TTATATTTATTCACTCGACC*AAATTGGAATTCTTCTTTTTTTTTT
CGA

QA 2 707 2 707
DS 

RD RR2C910TF 441 0 0
GAACCTAATCGCTCTTTTGATTTTGGAAATATATATATATATTTTTTTTTATCAATATAC
TGCTTCTTTTACACATCCATCTCCAACCTAACCCAAACGAACTAGGGAAAAAATAATTAG
GACTCACGAAAAAATTGATAATAACACGCAAGAAAAAAATTCCTTCCTATGCCCGTATTG
GGTACTAATCTATTTT*AACATTTAATTAGATCGGGTAATTTTTCAAATTACGAATGGAA
GCTCGTTTCTTTTTTTTCTTAAAATAAGGAAAACTGGTTTTTTATCCATCCATTTATATT
TATTCACTCGACCCAAATTGGAATTCTTCTTTTTTTTTTTTTCGACAAGGTTGTACCGAT
CAGAAAAGCAAAAAAAAAA********TGGTATCTGAATTCTCCCTTGATACGACATGCT
ATTTTTTCCGTTCATTCCTTT

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR2EO57TF 752 0 0
TCTTTATTTTCTTGAGTTCTGAAATGACACATAGTGCGATACAGTCAAAATAAGGTATTA
GATTACGAAAGCAATAAATACCTCATAAACAGGTAGACTGCTAACCGGATTCTCTATCTT
TAATAGGTTTCTGTTCGTTATATTATAGAATAGCAAAACAAGATGATTAGAAATCCTTTA
TTTTTTGAACCTAATCGCTCTTTTGATTTTGGAAATATATATATATATTTTTTTT*ATCA
ATATACTGCTTCTTTTACACATCCATCTCCAACCTAACCCAAACGAACTAGGGAAAAAAT
AATTAGGACTCACGAAAAAATTGATAATAACACGCAAGAAAAAAATTCCTTCCTATACCC
GTATTAGGTACTAATCTATTTTTAACATTTAATTAGATCGGGTAATTTTTCAAATTACGA
ATGGAAGCTCGTTTCTTTTTTTTCTTAGAATAAGGAAAACTGGTTTTTTATCCATCCATT
TATATTTACTCACTCGACCCAAATTGGAATTCTTCTTTTTTTTTTTTTCGACAAGGTTGT
ACCGATCAGAAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAATGGTATCTGAATTCTCCCTTGATACGA
CATGCTATTTTTTCCGTTCATTCCTTTCAGGATCAGTCGTGGTCTTACAAACTCTACCGC
AGATCTGGACGAATCCTTTTCTTCATACAAATGTGTAAAAGATGCTAGTCGCACTTAAAA
GCCGAGTACTCTACCGTTGAGTTAGCAACCCC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2EZ77JQ 468 0 0
GGGAAAAAATAATTAGGACTCACGAAAAAATTGATAATAACACGCAAGAAAAAAATTCCT
TCCTATACCCGTATTAGGTACTAATCTATTTTTAACATTTAATTAGATCGGGTAATTTTT
CAAATTACGAATGGAAGCTCGTTTCTTTTTTTTCTTAGAATAAGGAAAACTGGTTTTTTA
TCCATCCATTTATATTTATTCACTCGACCCAAATTGGAATTCTTCTTTTTTTTTTT**CG
ACAAGGTTGTACCGATCAGAAAAGCAAAAAAAAA*********TGGTATCTGAATTCTCC
CTTGATACGACATGCTATTTTTTCCGTTCATTCCTTTCAGGATCAGTCGTGGTCTTACAA
ACTCTACCGCAGATCTGGACGAATCCTTTTCTTCATACAAATGTGTAAAAGATGCTAGTC
GCACTTAAAAGCCGAGTACTCTACCGTTGAGTTAGCAACCCCCCCCC
C

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2CV13JQ 325 0 0
GACAAGGTTGTACCGATCAGAAAAGCAAAAAAAAA*********TGGTATCTGAATTCTC
CCTTGATACGACATGCTATTTTTTCCGTTCATTCCTTTCAGGATCAGTCGTGGTCTTACA
AACTCTACCGCAGATCTGGACGAATCCTTTTCTTCATACAAATGTGTAAAAGATGCTAGT
CGCACTTAAAAGCCGAGTACTCTACCGTTGAGTTAGCAACCCCCCCCCAAAAAAAAAAGA
AAGTACAGCAAATATGTAGATACAACCAGAATAAAGAAAAATCCAGTCATGTGTGCGTCA
GGGATAAATAGATCTATTTCTCTCT

QA 1 325 1 325
DS 

RD RR2CV13TF 325 0 0
GACAAGGTTGTACCGATCAGAAAAGCAAAAAAAAA*********TGGTATCTGAATTCTC
CCTTGATACGACATGCTATTTTTTCCGTTCATTCCTTTCAGGATCAGTCGTGGTCTTACA
AACTCTACCGCAGATCTGGACGAATCCTTTTCTTCATACAAATGTGTAAAAGATGCTAGT
CGCACTTAAAAGCCGAGTACTCTACCGTTGAGTTAGCAACCCCCCCCCAAAAAAAAAAGA
AAGTACAGCAAATATGTAGATACAACCAGAATAAAGAAAAATCCAGTCATGTGTGCGTCA
GGGATAAATAGATCTATTTCTCTCT

QA 1 325 1 325
DS 



AS 1 8

CO CL509Contig1 1128 8 17 U
GTGGATCTGAGATTTTATTCACAGTCTCTCATCGTCTCTTCTTCAGCTCCTCTTCTTCTC
TGGTTTTTGGGGGTTTTAAGCATTTGCAATGATGGACCTTACGAAGCTGAAGCCTCCACA
GATCACTTTCTACTGCTCTGCTTTCTCCGTCTTCATCACAGTCCTGTTGACGTTACAGCT
TGTATCTCAGCATCTCTCTCACTGGAAGAACCCCAAGGAGCAAAAGGCGATCCTCATCAT
TGTTCTCATGGCTCCTATCTACGCCGTTGTTTCCTTTGTTGGGTTGTTAGATGTCAAAGG
AAGTGAAATCTTCTTCCTCTTCCTTGAATCCATCAAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCAT
TGCTAAGTTCTTGGCGTTGATGTATAGTTACTTGAAAATATCTATCAGCAAAAACATTGT
CCCTGATGGAATCAAAGGAAGAGAGATTCACCATTCTTTCCCTATGACTTTCTTCCAGCC
TCATGTAGTTCGTCTGGACCATCGAACTCTTAGACTCTTGAAATACTGGACGTGGCAATT
CGTGGTCATCAGACCCGTGTGCTCCATCTTGATGATTGCTTTACAAATCATCGGGTTTTA
TCCTTCTTGGTTGAGCTGGACGTTCACTATCGTTCTCAACCTCTCGGTTTCTCTGGCGCT
TTATTCACTTGTGGTATTCTACCACGTGTTTGCTAAGGAGCTTGCTCCTCACAATCCACT
CGCAAAGTTCCTCTGCATCAAAGGGATTGTCTTCTTCTGCTTCTGGCAGGGGGTAGCACT
AGACATTCTGGTGGCAATGGGAGTGATCAAGTCTCACCATTTCTGGTTGGAGGTGGAACA
GATCCAGGAGGCTATTCAGAATGTGTTGGTGTGTTTAGAGATGGTTATCTTCGCTGCGGT
TCAGAAGCATGCTTATCATGTTGGTCCTTATAGCGGAGAGACCAAGAAGAAGCTCGACAA
AAAGACAGAGTGATATCTTGTCCCCGTGTTAGAACGGGAAATCGACTGTTTTTTTTT*GT
TCAGGTGTTTTGGAGACTTGAAACTTTTGCTTGTCACCACGATTGGGATAAGAGACGATA
AAATAATGTTTTTGAGATATCATCATCAGACAATAATGTTAAAACCCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 0 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2CP93TF U 2
AF RR2GE95TF U 1
AF RR2BW33TF U 2
AF RR2FG09TF U 2
AF RR2AK02TF U 119
AF RR2AK02JQ C 329
AF RR2BW33JQ C 434
AF RR2GE95JQ C 475
BS 1 716 RR2GE95TF
BS 717 717 RR2FG09TF
BS 718 725 RR2BW33TF
BS 726 744 RR2FG09TF
BS 745 745 RR2AK02TF
BS 746 763 RR2FG09TF
BS 764 764 RR2AK02TF
BS 765 771 RR2FG09TF
BS 772 773 RR2AK02TF
BS 774 796 RR2FG09TF
BS 797 797 RR2AK02TF
BS 798 809 RR2FG09TF
BS 810 857 RR2AK02TF
BS 858 1017 RR2AK02JQ
BS 1018 1018 RR2BW33JQ
BS 1019 1126 RR2AK02JQ
BS 1127 1128 RR2BW33JQ

RD RR2CP93TF 643 0 0
G
GGATCTGAGATTTTATTCACAGTCTCTCATCGTCTCTTCTTCAGCTCCTCTTCTTCTCTG
GTTTTTGGGGGTTTTAAGCATTTGCAATGATGGACCTTACGAAGCTGAAGCCTCCACAGA
TCACTTTCTACTGCTCTGCTTTCTCCGTCTTCATCACAGTCCTGTTGACGTTACAGCTTG
TATCTCAGCATCTCTCTCACTGGAAGAACCCCAAGGAGCAAAAGGCGATCCTCATCATTG
TTCTTATGGCTCCTATCTACGCCGTTGTTTCCTTTGTTGGGTTGCTAGATGTCAAAGGAA
GTGAAATCTTCTTCCTCTTCCTTGAATCCATCAAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCATTG
CAAAGTTCTTGGCGTTGATGTATAGTTACTTGAACATATCTATCAGCAAAAACATTGTCC
CTGATGGAATCAAAGGAAGAGAGATTCACCATTCTTTCCCTATGACTTTCTTCCAGCCTC
ATGTAGTGCGTCTGGATCATCGAACTCTTAGACTCTTGAAATACTGGACGTGGCAATTCG
TGGTCATCAGACCCGTGTGCTCCATCTTGATGATTGCTTTACAAATCATCGGGTTTTATC
CTTCTTGGT*GAGCTGGACGTTCACTATCGTTCTCAACCTCT

QA 2 643 2 643
DS 

RD RR2GE95TF 716 0 0
GTGGATCTGAGATTTTATTCACAGTCTCTCATCGTCTCTTCTTCAGCTCCTCTTCTTCTC
TGGTTTTTGGGGGTTTTAAGCATTTGCAATGATGGACCTTACGAAGCTGAAGCCTCCACA
GATCACTTTCTACTGCTCTGCTTTCTCCGTCTTCATCACAGTCCTGTTGACGTTACAGCT
TGTATCTCAGCATCTCTCTCACTGGAAGAACCCCAAGGAGCAAAAGGCGATCCTCATCAT
TGTTCTCATGGCTCCTATCTACGCCGTTGTTTCCTTTGTTGGGTTGTTAGATGTCAAAGG
AAGTGAAATCTTCTTCCTCTTCCTTGAATCCATCAAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCAT
TGCTAAGTTCTTGGCGTTGATGTATAGTTACTTGAAAATATCTATCAGCAAAAACATTGT
CCCTGATGGAATCAAAGGAAGAGAGATTCACCATTCTTTCCCTATGACTTTCTTCCAGCC
TCATGTAGTTCGTCTGGACCATCGAACTCTTAGACTCTTGAAATACTGGACGTGGCAATT
CGTGGTCATCAGACCCGTGTGCTCCATCTTGATGATTGCTTTACAAATCATCGGGTTTTA
TCCTTCTTGGTTGAGCTGGACGTTCACTATCGTTCTCAACCTCTCGGTTTCTCTGGCGCT
TTATTCACTTGTGGTATTCTACCACGTGTTTGCTAAGGAGCTTGCTCCTCACAATC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2BW33TF 736 0 0
G
GGATCTGAGATTTTATTCACAGTCTCTCATCGTCTCTTCTTCAGCTCCTCTTCTTCTCTG
GTTTTTGGGGGTTTTAAGCATTTGCAATGATGGACCTTACGAAGCTGAAGCCTCCACAGA
TCACTTTCTACTGCTCTGCTTTCTCCGTCTTCATCACAGTCCTGTTGACGTTACAGCTTG
TATCTCAGCATCTCTCTCACGGGAAGAACCCCAAGGAGCAAAAGGCGATCCTCATCATTG
TTCTCATGGCTCCTATCTACGCCGTTGTTTCCTTTGTTGGGTTGTTAGATGTCAAAGGAA
GTGAAATCTTCTTCCTCTTCCTTGAATCCATCAAAGAATGTTACGAAGCACTCGTCATTG
CTAAGTTCTTGGCGTTGATGTATAGTTACTTGAAAATATCTATCAGCAAAAACATTGTCC
CTGATGGAATCAAAGGAAGAGAGATTCACCATTCTTTCCCTATGACTTTCTTCCAGCCTC
ATGTAGTTCGTCTGGACCATCGAACTCTTAGACTCTTGAAATACTGGACGTGGCAATTCG
TGGTCATCAGACCCGTGTGCTCCATCTTGATGATTGCTTTACAAATCATCGGGTTTTATC
CTCCTTGGTTGAGCTGGACGTTCACTATCGTTCTCAACCTCTCGGTTTCTCTGGCGCTTT
ATTCACTTGTGGTATTCTACCACGTGTTTGCTAAG*AGCTTGCTCCTCACATCC*ACTCG
CAA
GTCCTCTGCATC

QA 2 724 2 724
DS 

RD RR2FG09TF 808 0 0
G
GGATCTGAGATTTTATTCACAGTCTCTCATCGTCTCTTCTTCAGCTCCTCTTCTTCTCTG
GTTTTTGGGGGTTTTAAGCATTTGCAATGATGGACCTTACGAAGCTGAAGCCTCCACAGA
TCACTTTCTACTGCTCTGCTTTCTCCGTCTTCATCACAGTCCTGTTGACGTTACAGCTTG
TATCTCAGCATCTCTCTCACTGGAAGAACCCCAAGGAGCAAAAGGCGATCCTCATCATTG
TTCTTATGGCTCCTATCTACGCCGTTGTTTCCTTTGTTGGGTTGCTAGATGTCAAAGGAA
GTGAAATCTTCTTCCTCTTCCTTGAATCCATCAAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCATTG
CAAAGTTCTTGGCGTTGATGTATAGTTACTTGAACATATCTATCAGCAAAAACATTGTCC
CTGATGGAATCAAAGGAAGAGAGATTCACCATTCTTTCCCTATGACTTTCTTCCAGCCTC
ATGTAGTGCGTCTGGATCATCGAACTCTTAGACTCTTGAAATACTGGACGTGGCAATTCG
TGGTCATCAGACCCGTGTGCTCCATCTTGATGATTGCTTTACAAATCATCGGGTTTTATC
CTTCTTGGTTGAGCTGGACGTTCACTATCGTTCTCAACCTCTCGGTTTCTCTGGCGCTTT
ATTCACTTGTGGTATTCTACCACGTGTTTGCTAAG*AGCTTGCTCCTCACAATCCACTCG
CAAAGTTCCTCTGCATCAAAGG*ATTGTCTTCTTCTGCTTCCGGCAGGGA*TAGCACTAG
ACATTCTGGTGGCA*TGGGAGTGATCA

QA 2 808 2 808
DS 

RD RR2AK02TF 739 0 0
G
AGATCGCTTTCTACTGCTCTGCTTTCTCCGTCTTCATCACAGTCCTGTTGACGTTACAGC
TTGTATCTCAGCATCTCTCTCACTGGAAGAACCCCAAGGAGCAAAAGGCGATCCTCATCA
TTGTTCTCATGGCTCCTATCTACGCCGTTGTTTCCTTTGTTGGGTTGTTAGATGTCAAAG
GAAGTGAAATCTTCTTCCTCTTCCTTGAATCCATCAAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCA
TTGCTAAGTTCTTGGCGTTGATGTATAGTTACTTGAAAATATCTACCAGCAAAAACATTG
TCCCTGATGGAATCAAAGGAAGAGAGATTCACCATTCTTTCCCTATGACTTTCTTCCAGC
CTCATGTAGTTCGTCTGGACCATCGAACTCTTAGACTCTTGAAATACTGGACGTGGCAAT
TCGTGGTCATCAGACCCGTGTGCTCCATCTTGATGATTGCTTTACGAATCATCGGGTTTT
ATCCTTCTTGGTTGAGCTGGACGTTCACTATCGTTCTCAACCTCTCGGTTTCTCTGGCGC
TTTATTCACTTGTGGTATTCTACCACGTGTTTGCTAAGGAGCTTGCTCCTCACAATCCAC
TCGCAAAGTTCCTCTGCATCAAAGGGATTGTCTTCTTCTGCTTCTGGCAGGGGGTAGCAC
TAGACATTCTGGTGGCAATGGGAGTGATCAAGTCTCACCATTTCTGGTTGGAGGTGGAAC
AGATCCAGGAGGCTATTC

QA 2 739 2 739
DS 

RD RR2AK02JQ 798 0 0
TCCATCAAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCATTGCTAAGTTCTTGGCGTTGATGTATAGT
TACTTGAAAATATCTACCAGCAAAAACATTGTCCCTGATGGAATCAAAGGAAGAGAGATT
CACCATTCTTTCCCTATGACTTTCTTCCAGCCTCATGTAGTTCGTCTGGACCATCGAACT
CTTAGACTCTTGAAATACTGGACGTGGCAATTCGTGGTCATCAGACCCGTGTGCTCCATC
TTGATGATTGCTTTACGAATCATCGGGTTTTATCCTTCTTGGTTGAGCTGGACGTTCACT
ATCGTTCTCAACCTCTCGGTTTTTCTGGCGCTTTATTCACTTGTGGTATTCTACCACGTG
TTTGCTAAGGAGCTTGCTCCTCACAATCCACTCGCAAAGTTCCTCTGCATCAAAGGGATT
GTCTTCTTCTGCTTCTGGCAGGGGGTAGCACTAGACATTCTGGTGGCAATGGGAGTGATC
AAGTCTCACCATTTCTGGTTGGAGGTGGAACAGATCCAGGAGGCTATTCAGAATGTGTTG
GTGTGTTTAGAGATGGTTATCTTCGCTGCGGTTCAGAAGCATGCTTATCATGTTGGTCCT
TATAGCGGAGAGACCAAGAAGAAGCTCGACAAAAAGACAGAGTGATATCTTGTCCCCGTG
TTAGAACGGGAAATCGACTGTTTTTTTTTTGTTCAGGTGTTTTGGAGACTTGAAACTTTT
GCTTGTCACCACGATTGGGATAAGAGACGATAAAATAATGTTTTTGAGATATCATCATCA
GACAATAATGTTAAAACC

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2BW33JQ 695 0 0
AAAGGAAGAGAGATTCACCATTCTTTCCCTATGACTTTCTTCCAGCCTCATGTAGTTCGT
CTGGACCATCGAACTCTTAGACTCTTGAAATACTGGACGTGGCAATTCGTGGTCATCAGA
CCCGTGTGCTCCATCTTGATGATTGCTTTACAAATCATCGGGTTTTATCCTCCTTGGTTG
AGCTGGACGTTCACTATCGTTCTCAACCTCTCGGTTTTTCTGGCGCTTTATCCACTTGTG
GTATTCTACCACGTGTTTGCTAAGGAGCTTGCTCCTCACAATCCACTCGCAAAGTTCCTC
TGCATCAAAGGGATTGTCTTCTTCTGCTTCTGGCAGGGGATAGCACTAGACATTCTGGTG
GCAATGGGAGTGATCAAGTCTCACCATTTCTGGTTGGAGGTGGAACAGATCCAGGAGGCT
ATTCAGAATGTGTTGGTGTGTTTAGAGATGGTTATCTTCGCTGCGGTTCAGAAGCATGCT
TATCATGTTGGTCCTTATAGCGGAGAGACCAAGAAGAAGCTCGACAAAAAGACAGAGTGA
TATCTTGTCCCCGTGTTAGAACGGGAAATCGACTGTTTTTTTTT*GTTCAGGTGTTTTGG
AGACTTGAAACTTTTGCTTGTCACCACGATTGGGATAAGAGACGATAAAATAATGTTTTT
GAGATATCATCATCAGACAATAATGTTAAAACCCC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2GE95JQ 646 0 0
CCAGCCTCATGTAGTTCGTCTGGACCATCGAACTCTTAGACTCTTGAAATACTGGACGTG
GCAATTCGTGGTCATCAGACCCGTGTGCTCCATCTTGATGATTGCTTTACAAATCATCGG
GTTTTATCCTTCTTGGTTGAGCTGGACGTTCACTATCGTTCTCAACCTCTCGGTTTTTCT
GGCGCTTTATTCACTTGTGGTATTCTACCACGTGTTTGCTAAGGAGCTTGCTCCTCACAA
TCCACTCGCAAAGTTCCTCTGCATCAAAGGGATTGTCTTCTTCTGCTTCTGGCAGGGGAT
AGCACTAGACATTCTGGTGGCAATGGGAGTGATCAAGTCTCACCATTTCTGGTTGGAGGT
GGAACAGATCCAGGAGGCTATTCAGAATGTGTTGGTGTGTTTAGAGATGGTTATTTTCGC
TGCGGTTCAGAAGCATGCTTATCATGTTGGTCCTTATAGCGGAGAGACCAAGAAGAAGCT
CGACAAAAAGACAGAGTGATATCTTGTCCCCGTGTTAGAACGGGAAATCGACTGTTTTTT
TT**GTTCAGGTGTTTTGGAGACTTGAAACTTTTGCTTGTCACCACGATTGGGATAAGAG
ACGATAAAATAATGTTTTTGAGATATCATCATCAGACAATAATGTT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 2 9

CO CL510Contig1 740 2 2 U
TTACAAATATTAGCCTTAGTGAAAACACTGCACAAAAGCTGCAGCAAAATGTTTGCTCTC
AAGTACAAGACATTCCAAGAGAACAAAAACCTCATGAGATTTATTCAAAAAGAAAACAAA
AGAAGGCATAAAGAGAGATTCAGAACACAATTCTCATGTAGACACAACCTTCTTCACCAC
TTTGGTAACCTCTTCAGGAGCCTTCTCTGCTGGTATGTTCACCAGGTTCCCCTTCTTCGC
GTAGTAGTCAATGACCGGTTGCGTCTGCTTGTGGAATGCATCCAGCCTTGACCTAAGAAC
ATCCGCATTGTCATCTTTACGTTGAATCAGTGGCTCTCCAGTCACATCATCGACTCCAGG
AACTTTAGGAAGTGCAAATTTGGTATGGTAGCTCCTTCCACTTGAAGGGTGAATCCACCT
TCCAGTAATTCTTTCTTCAAGAACCGAATCATCAATTGCAAAATTAAGCACTTTGTCAAT
CTGAGCTCCTCTTCTATTAAGCATCTCATCAAGCTTCTCAGCTTGTGTGACGGTCCTAGG
AAAACCATCAAGAATGAAACCTTTCTGACATTTAGGTCTGTTCATTGCTTCATCCATGAT
ACCAACAACCAAGTCATCAGTAACAAGCTCTCCCTTGTCCATAGCTTCCTTTGCCTTGAC
GCCAAGAGGGGACTTAGCAGCAACAGCAGCTCTAAGCATGTCACCGGTGGACAAATGACA
CAAGCAGAACTCATCCTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD32JQ U 1
AF RR2CF81JQ U 18
BS 1 206 RR2BD32JQ
BS 207 740 RR2CF81JQ

RD RR2BD32JQ 206 0 0
TTACAAATATTAGCCTTAGTGAAAACACTGCACAAAAGCTGCAGCAAAATGTTTGCTCTC
AAGTACAAGACATTCCAAGAGAACAAAAACCTCATGAGATTTATTCAAAAAGAAAACAAA
AGAAGGCATAAAGAGAGATTCAGAACACAATTCTCATGTAGACACAACCTTCTTCACCAC
TTTGGTAACCTCTTCAGGAGCCTTCT

QA 1 206 1 206
DS 

RD RR2CF81JQ 723 0 0
G
GTGAAAACACTGCACAAAAGCTGCAGCAAAATGTTTGCTCTCAAGTACAAGACATTCCAA
GAGAACAAAAACCTCATGAGATTTATTCAAAAAGAAAACAAAAGAAGGCATAAAGAGAGA
TTCAGAACACAATTCTCATGTAGACACAACCTTCTTCACCACTTTGGTAACCTCTTCAGG
AGCCTTCTCTGCTGGTATGTTCACCAGGTTCCCCTTCTTCGCGTAGTAGTCAATGACCGG
TTGCGTCTGCTTGTGGAATGCATCCAGCCTTGACCTAAGAACATCCGCATTGTCATCTTT
ACGTTGAATCAGTGGCTCTCCAGTCACATCATCGACTCCAGGAACTTTAGGAAGTGCAAA
TTTGGTATGGTAGCTCCTTCCACTTGAAGGGTGAATCCACCTTCCAGTAATTCTTTCTTC
AAGAACCGAATCATCAATTGCAAAATTAAGCACTTTGTCAATCTGAGCTCCTCTTCTATT
AAGCATCTCATCAAGCTTCTCAGCTTGTGTGACGGTCCTAGGAAAACCATCAAGAATGAA
ACCTTTCTGACATTTAGGTCTGTTCATTGCTTCATCCATGATACCAACAACCAAGTCATC
AGTAACAAGCTCTCCCTTGTCCATAGCTTCCTTTGCCTTGACGCCAAGAGGGGACTTAGC
AGCAACAGCAGCTCTAAGCATGTCACCGGTGGACAAATGACACAAGCAGAACTCATCCTT
TA

QA 2 723 2 723
DS 



CO CL510Contig2 1017 7 41 U
GGACATGCACTTCAGAGAAAACT**AAAATCTTGTTCCTCAAAAAGACAACGAACATGGC
GAAAAACGGTGTAGATATGGAAGACATTCAGACAGTCGATCTCATGTCTGAACTCCTCCG
TCGCATGAAGTGTGCCTCTAAACCTGACAAACGTCTCGTTTTCATCGGTCCACCTGGCTC
AGGAAAAGGTACGCAGTCTCCGGTCATAAAGGATGAGTTCTGCTTGTGTCATTTGTCCAC
TGGAGACATGCTTAGAGCTGCTGTTGCTGCTAAGTCCCCTCTTGGTGTCAAGGCAAAGGA
AGCTATGGACAAGGGAGAGCTTGTTTCTGATGACTTGGTTGTTGGTATCATGGATGAAGC
AATGAACAGACCCAAATGTCAGAAAGGTTTCATTCTTGATGGCTTCCCTAGGACCGTCAC
ACAAGCTGAGAAGCTTGATGAGATGCTTAATAGAAGAGGAGCTCAGATTGACAAAGTGCT
TAATTTTGCAATCGATGATTCGGTTCTTGAAGAAAGAATTACTGGAAGGTGGATTCACCC
TTCAAGTGGAAGGAGCTATCATACCAAATTCGCACCTCCTAAAGTTCCTGGAGTCGATGA
TGTGACTGGAGAGCCATTGATTCAACGTAAAGATGACAATGCGGATGTTCTTAGGTCAAG
GCTGG*ATGCATTCCACAAGCAGACGCAACCGGTCATTGACTACTACGCGAAGAA*GGGG
AATCTGGTGAACATACCAGCAGAGAAGGCTCCTGAAGAGGTTACCAAAGTGGTGAAGAAG
GTTGTGTCTACATGAGAACTGTAATAAATTTGGCATGAGAATTGAGTTCTAAAATCTCTC
TTTATACCTTCTTTTGTTTTCTTTTTGAATAAATCTCCTGAGGTTTTTGTTCTCCTGGAA
TGTCTTGTACTTGAGAGCAAACATGTTGCTGCAGCTGTTGTCCAGTGTTTTCACTAAGGT
CATTTGTTTGTTACCGTCTTAACGAGTAAAAAAAAAGCAAAATGAAATGAGTTTTGC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 0 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 20 45 
45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO84TF U 12
AF RR2CF81TF U 1
AF RR2BD32TF U 1
AF RR2B937TF U 32
AF RR2DQ03JQ C 149
AF RR2B937JQ C 178
AF RR2G582JQ C 238
BS 1 65 RR2BD32TF
BS 66 67 RR2BO84TF
BS 68 111 RR2BD32TF
BS 112 112 RR2BO84TF
BS 113 165 RR2BD32TF
BS 166 166 RR2BO84TF
BS 167 240 RR2BD32TF
BS 241 241 RR2BO84TF
BS 242 243 RR2BD32TF
BS 244 244 RR2BO84TF
BS 245 285 RR2BD32TF
BS 286 286 RR2BO84TF
BS 287 325 RR2BD32TF
BS 326 326 RR2BO84TF
BS 327 372 RR2BD32TF
BS 373 373 RR2BO84TF
BS 374 402 RR2BD32TF
BS 403 403 RR2BO84TF
BS 404 405 RR2BD32TF
BS 406 406 RR2BO84TF
BS 407 492 RR2BD32TF
BS 493 493 RR2BO84TF
BS 494 508 RR2BD32TF
BS 509 509 RR2BO84TF
BS 510 558 RR2BD32TF
BS 559 559 RR2BO84TF
BS 560 570 RR2BD32TF
BS 571 571 RR2BO84TF
BS 572 616 RR2BD32TF
BS 617 617 RR2BO84TF
BS 618 654 RR2BD32TF
BS 655 655 RR2B937TF
BS 656 722 RR2BD32TF
BS 723 723 RR2B937TF
BS 724 742 RR2BD32TF
BS 743 746 RR2B937TF
BS 747 747 RR2DQ03JQ
BS 748 756 RR2B937TF
BS 757 955 RR2DQ03JQ
BS 956 959 RR2B937JQ
BS 960 1017 RR2G582JQ

RD RR2BO84TF 645 0 0
GG
AGAGAAGACTTAAAAATCTAATTCCTCAAGAAGACAACGAACATGGCGAAAAACGGTGTA
GATATGGAAGACATTCAGACAGTCGATCTCATGTCTGAACTCCTCCGTCGCATGAAGTGT
GCCTCTAAACCTGACAAACGTCTCGTTTTCATCGGTCCACCTGGCTCAGGAAAAGGTACG
CAGTCTCCGGTCATAAAGGATGAGTTCTGCTTGTGTCATTTGTCCACTGGAGACATGCTT
AGAGCTGCTGTTGCTGCTAAGTCCCCTCTTGGTGTCAAGGCAAAGGAAGCTATGGACAAG
GGAGAGCTTGTTTCTGATGACTTGGTTGTTGGTATCATGGATGAAGCAATGAACAGACCC
AAATGTCAGAAAGGTTTCATTCTTGATGGCTTCCCTAGGACCGTCACACAAGCTGAGAAG
CTTGATGAGATGCTTAATAGAAGAGGAGCTCAGATTGACAAAGTGCTTAATTTTGCAATC
GATGATTCGGTTCTTGAAGAAAGAATTACTGGAAGGTGGATTCACCCTTCAAGTGGAAGG
AGCTATCATACCAAATTCGCACCTCCTAAAGTTCCTGGAGTCGATGATGTGACTGGAGAG
CCATTGATTCAACGTAAAGATGACAATGCGGATGTTCTTA
TGT

QA 3 642 3 642
DS 

RD RR2CF81TF 635 0 0
GG
ACATGCACTTCAGAGAAAACT**AAAATCTTGTTCCTCAAAAAGACAACGAACATGGCGA
AAAGTAGTGTAGATATGGAAGACATTCAGACAGTCGATCTCATGTCTGAGCTCCTCCGTC
GCATGAAGTGTGCCTCTAAACCTGACAAACGTCTCGTTTTCATAGGTCCACCTGGCTCAG
GAAAAGGTACGCAGTCTCCGGTCATAAAGGATGAGTTCTGCTTGTGTCATTTGTCCACCG
GTGACATGCTTAGAGCTGCTGTTGCTGCTAAGTCCCCTCTTGGCGTCAAGGCAAAGGAAG
CTATGGACAAGGGAGAGCTTGTTACTGATGACTTGGTTGTTGGTATCATGGATGAAGCAA
TGAACAGACCTAAATGTCAGAAAGGTTTCATTCTTGATGGTTTTCCTAGGACCGTCACAC
AAGCTGAGAAGCTTGATGAGATGCTTAATAGAAGAGGAGCTCAGATTGACAAAGTGCTTA
ATTTTGCAATTGATGATTCGGTTCTTGAAGAAAGAATTACTGGAAGGTGGATTCACCCTT
CAAGTGGAAGGAGCTACCATACCAAATTTGCACTTCCTAAAGTTCCTGGAGTCGATGATG
TGACTGGAGAGCCACTGATTCAACGTAAAGATG

QA 3 635 3 635
DS 

RD RR2BD32TF 742 0 0
GGACATGCACTTCAGAGAAAACT**AAAATCTTGTTCCTCAAAAAGACAACGAACATGGC
GAAAAGTGGTGTAGATATGGAAGACATTCAGACAGTCGATCTCATGTCTGAGCTCCTCCG
TCGCATGAAGTGTGCCTCTAAACCTGACAAACGTCTCGTTTTCATAGGTCCACCTGGCTC
AGGAAAAGGTACGCAGTCTCCGGTCATAAAGGATGAGTTCTGCTTGTGTCATTTGTCCAC
CGGTGACATGCTTAGAGCTGCTGTTGCTGCTAAGTCCCCTCTTGGCGTCAAGGCAAAGGA
AGCTATGGACAAGGGAGAGCTTGTTACTGATGACTTGGTTGTTGGTATCATGGATGAAGC
AATGAACAGACCTAAATGTCAGAAAGGTTTCATTCTTGATGGTTTTCCTAGGACCGTCAC
ACAAGCTGAGAAGCTTGATGAGATGCTTAATAGAAGAGGAGCTCAGATTGACAAAGTGCT
TAATTTTGCAATTGATGATTCGGTTCTTTAAGAAAGAATTACTGGAAGGTGGATTCACCC
TTCAAGTGGAAGGAGCTACCATACCAAATTTGCACCTCCTAAAGTTCCTGGAGTCGATGA
TGTGACTGGAGAGCCACTGATTCAACGTAAAGATGACAATGCGGATGTTCTTAG*TCAAG
GCTGG*ATGCATTCCACAAGCAGACGCAACCGGTCATTGACTACTACGCGAAGAA*GGGG
AACCTGGTGAACATACCAGCAG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2B937TF 726 0 0
TAA
TTCCTCAAGAAGACAACGAACATGGCGAAAAACGGTGTAGATATGGAAGACATTCAGACA
GTCGATCTCACGTCTGAACTCCTCCGTCGCATGAAGCGTGCCTCTAAACCTGACAAACGT
CTCGTTTTCATCGGTCCACCTGGCTCAGGAAAAGGTACGCAGTCTCCGGTCATAAAGGAT
GAGTTCTGCTTGTGTCATTTGTCCACTGGAGACATGCTTAGAGCTGCTGTTGCTGCTAAG
TCCCCTCTTGGTGTCAAGGCAAGGGAAGCTATGGACAAGGGAGAGCTTGTTTCTGATGAC
TTGGTTGTTGGTATCATGGATGAAGCAATGAACAGACCCAAATGTCAGAAAGGTTTCATT
CTTGATGGCTTCCCTAGGACCGTCACACAAGCTGAGAAGCTTGATGAGATGCTTAATAGA
AGAGGAGCTCAGATTGACAAAGTGCTTAATTTTTCAATCGATGATTCGGTTCTTGAAGAA
AGAATTACTGGAAGGTGGATTCACCCTTCAAGTGGAAGGAGCTATCATACCAAATTCGCA
CCTCCTAAAGTTCCTGGAGTCGATGATGTGACTGGAGAGCCATTGATTCAACGTAAAGAT
GACAATGCGGATGTTCTTAGGTCAAGGCTGGGATGCATTCCACAAGCAGACGCAACCGGT
CATTGACTACTACGCGAAGAAAGGGGAATCTGGTGAACATACCAGCAGAGAAAGCTCCTG
AA
T

QA 4 725 4 725
DS 

RD RR2DQ03JQ 807 0 0
AAACGTCTCGTTTTCATCGGTCCAC*TGGCTCAGGAAAAGGTACTCAGTCTCCGGTCATA
AAGGATGAGTTCTGCTTGTGTCATTTGTCCACTGGAGACATGCTTAGAGCTGCTGTTGCT
GCTAAGTCCCCTCTTGGTGTCAAGGCAAAGGAAGCTATGGACAAGGGAGAGCTTGTTTCT
GATGACTTGGTTGTTGGTATCATGGATGAAGCAATGAACAGACCCAAATGTCAGAAAGGT
TTCATTCTTGATGGCTTCCCTAGGACCGTCACACAAGCTGAGAAGCTTGATGAGATGCTT
AATAGAAGAGGAGCTCAGATTGACAAAGTGTTTAATTTTGCAATCGATGATTCGGTTCTT
GAAGAAAGAATTACTGGAAGGTGGATTCACCCTTCAAGTGGAAGGAGCTATCATACCAAA
TTCGCACCTCCTAAAGTTCCTGGAGTCGATGATGTGACTGGAGAGCCATTGATTCAACGT
AAAGATGACAATGCGGATGTTCTTAGGTCAAGGCTGG*ATGCATTCCACAAGCAGACGCA
ACCGGTCATTGACTACTACGCGAAGAA*GGGGAATCTGGTGAACATACCAGCAGAGAAGG
CTCCTGAAGAGGTTACCAAAGTGGTGAAGAAGGTTGTGTCTACATGAGAACTGTAATAAA
TTTGGCATGAGAATTGAGTTCTAAAATCTCTCTTTATACCTTCTTTTGTTTTCTTTTTGA
ATAAATCTCCTGAGGTTTTTGTTCTCCTGGAATGTCTTGTACTTGAGAGCAAACATGTTG
CTGCAGCTGTTGTCCAGTGTTTTCACT

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2B937JQ 798 0 0
CTCAGGAAAAGGTACGCAGTCTCCGGTCATAAAGGATGAGTTCTGCTTGTGTCATTTGTC
CACTGGAGACATGCTTAGAGCTGCTGTTGCTGCTAAGTCCCCTCTTGGTGTCAAGGCAAG
GGAAGCTATGGACAAGGGAGAGCTTGTTTCTGATGACTTGGTTGTTGGTATCATGGATGA
AGCAATGAACAGACCCAAATGTCAGAAAGGTTTCATTCTTGATGGCTTCCCTAGGACCGT
CACACAAGCTGAGAAGCTTGATGAGATGCTTAATAGAAGAGGAGCTCAGATTGACAAAGT
GCTTAATTTTTCAATCGATGATTCGGTTCTTGAAGAAAGAATTACTGGAAGGTGGATTCA
CCCTTCAAGTGGAAGGAGCTATCATACCAAATTCGCACCTCCTAAAGTTCCTGGAGTCGA
TGATGTGACTGGAGAGCCATTGATTCAACGTAAAGATGACAATGCGGATGTTCTTAGGTC
AAGGCTGG*ATGCATTCCACAAGCAGACGCAACCGGTCATTGACTACTACGCGAAGAA*G
GGGAATCTGGTGAACATACCAGCAGAGAAGGCTCCTGAATAGGTTACCAAAGTGGTGAAG
AAGGTTGTGTCTACATGAGAACTGTAATAAATTTGGCATGAGAATTGAGTTCTAAAATCT
CTCTTTATACCTTCTTTTGTTTTCTTTTTGAATAAATCTCCTGAGGTTTTTGTTCTCCTG
GAATGTCTTGTACTTGAGAGCAAACATGTTGCTGCAGCTGTTGTCCAGTGTTTTCACTAA
GG
TCATTTGTTTGTTACC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2G582JQ 780 0 0
CACTGGAGACATGCTTAGAGCTGCTGTTGCTGCTAAGTCCCCTCTTGGTGTCAAGGCAAA
GGAAGCTATGGACAAGGGAGAGCTTGTTTCTGATGACTTGGTTGTTGGTATCATGGATGA
AGCAATGAACAGACCCAAATGTCAGAAAGGTTTCATTCTTGATGGCTTCCCTAGGACCGT
CACACAAGCTGAGAAGCTTGATGAGATGCTTAATAGAAGAGGAGCTCAGATTGACAAAGT
TCTTAATTTTGCAATCGATGATCCGGTTCTTGAAGAAAGAATTACTGGAAGGTGGATTCA
CCCTTCAAGTGGAAGGAGCTATCATACCAAATTCGCACCTCCTAAAGTTCCTGGAGTCGA
TGATGTGACTGGAGAGCCATTGATTCAACGTAAAGATGACAATGCGGATGTTCTTAGGTC
AAGGCTGG*ATGCATTCCACAAGCAGACGCAACCGGTCATTGACTACTACGCGAAGAA*G
GGGAATCTGGTGAACATACCAGCAGAGAAGGCTCCTGAAGAGGTTACCAAAGTGGTGAAG
AAGGTTGTGTCTACATGAGAACTGTAATAAATTTGGCATGAGAATTGAGTTCTAAAATCT
CTCTTTATACCTTCTTTTGTTTTCTTTTTGAATAAATCTCCTGAGGTTTTTGTTCTCCTG
GAATGTCTTGTACTTGAGAGCAAACATGTTGCTGCAGCTGTTGTCCAGTGTTTTCACTAA
GGTCATTTGTTTGTTACCGTCTTAACGAGTAAAAAAAAAGCAAAATGAAATGAGTTTTGC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 3 10

CO CL511Contig1 794 4 10 U
GGATATGCATAGCTCTTAAAGACACGTTCATCTCTATTCAAAATGGCCGTTGCTGTCAAC
GCCGGCTTCAGTTCTCCGCTTCATAACAGATCCCACCCCGTTGTAAGATTCTCAACTCAA
GTCACAACGTTAAAGCCTTCACCTTTAGCGTTCAACACATCTCCCAGTCCGTTACTTTCA
AGCAAACGTAGATTGGTTTCATCTTGTCTGAAGTCAAACGAAGATTCCATCGCAACAACA
TCGGTCAACGACCCTCCTCCCTCTTCGGATTCCTCAAGCAAACCCGTTGAACCAAGCAAC
AACAACAACAACAACGGTTCCGCGAAAAGAGCGCCGTTGACAGCAAGAGAGAGGCTAAGA
GCAGCTCGTGTCCTTAGTCGATACACGGAAGCGACGCCGAAACCATCGAAACCCAAAATG
GGGAGCCAGATCCTGGAGGTGCTCAAGGAGAGTGACAAGAAATCTAATAGGAAACCGGGT
CTACCCGAAGCACCGACCAACATGCTTGATGATAGCAAGAGAGGTATGCCGAAGAAAGGG
CTTACCTTTGATCTACCTGGAAGTGCAGATATACTGGTGATTGCCTTTTCGTTTGTGTTC
ATAAGCACTGTGATGTTTGCTACCACTTATGTTGTCTGGAAACTTGGTGGCATTCACTTC
AATGAGAACTAAAGATAAGATATTTGGACAAGTTTCTAGAGTTTGGAAACCTATTGAATA
GAGAGTGGGAGAGTTGCAGTTGAAATGTATACTTGGTGGAAGGTTTATCACTTGGCAAAG
ATTGTTTTGATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU15TF U 38
AF RR2GU15JQB C 213
AF RR2DR26TF U 1
AF RR2DR26JQ C 147
BS 1 272 RR2DR26TF
BS 273 273 RR2GU15TF
BS 274 389 RR2DR26TF
BS 390 391 RR2GU15TF
BS 392 415 RR2DR26TF
BS 416 416 RR2GU15TF
BS 417 717 RR2DR26TF
BS 718 718 RR2DR26JQ
BS 719 740 RR2DR26TF
BS 741 794 RR2DR26JQ

RD RR2GU15TF 551 0 0
GCAC
AATGGCCGTTGCTGTCAACGCCGGCTTCAGTTCTCCGCTTCATAACAGATCCCACCCCGT
TGTAAGATTCTCAACTCAAGTCACAACGTTAAAGCCTTCACCTTTAGCGTTCAACACATC
TCCCAGTCCGTTACTTTCAAGCAAAAGTAGATTGGTTTCATCTTGTCTGAAGTCAAACGA
AGATTCCATCGCAACAACATCGGTCAACGACCCTCCTCCCTCTTCGGATTCCTCAAGCAA
ACCCGTTGAACCAAGCAACAACAACAACAACAACGGTTCCGCGAAAAGAGCGCCGTTGAC
AGCAAGAGAGAGGCTAAGAGCAGCTCGTGTCCTTAGTCGATACACGGAAGCGACGCCGAA
ACCATCGAAACCCAAAATGGGGAGCCAGATCCTGGAGGTGCTCAAGGAGAGTGACAAGAA
ATCTAATAGGAAACCGGGTCTACCCTAAGCACCGACCAACATGCTTGATGATAGCAAGAG
AGGTATGCCGAAGAAAGGGCTTACCTTTGATCTACCTGGAAGTGCAGATATACTGGTGAT
TGCCTTT

QA 5 551 5 551
DS 

RD RR2GU15JQB 500 0 0
GTCAAACGAAGATTCCATCGCAACAACATCGGTCAACGACCCTCCTCCCTCTTCGGATTC
CTCAAGCAAACCCGTTGAACCAAGCAACAACAACAACAACAACGGTTCCGCGAAAAGAGC
GCCGTTGACAGCAAGAGAGAGGCTAAGAGCAGCTCGTGTCCTTAGTCGATACACGGAAGG
GACGCCGAAACCATCGAAACCCAAAATGGGGAGCCAGATCCTGGAGGTGCTCAAGGAGAG
TGACAAGAAATTTAATAGGAAACCGGGTCTACCCTAAGCACCGACCAACATGCTTGATGA
TAGCAAGAGAGGTATGCCGAAGAAAGGGCTTACCTTTGATTTACCTGGAAGTGCAGATAT
ACTGGTGATTGCCTTTTCGTTTGTGTTCATAAGCACTGTGATGTTTGCTACCACTTATGT
TGTCTGGAAACTTGGTGGCATTCACTTCAATGAGAACTAAAGATAAGATATTTGGACAAG
TTTCTAGAGTTTGGAAACCT

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2DR26TF 740 0 0
GGATATGCATAGCTCTTAAAGACACGTTCATCTCTATTCAAAATGGCCGTTGCTGTCAAC
GCCGGCTTCAGTTCTCCGCTTCATAACAGATCCCACCCCGTTGTAAGATTCTCAACTCAA
GTCACAACGTTAAAGCCTTCACCTTTAGCGTTCAACACATCTCCCAGTCCGTTACTTTCA
AGCAAACGTAGATTGGTTTCATCTTGTCTGAAGTCAAACGAAGATTCCATCGCAACAACA
TCGGTCAACGACCCTCCTCCCTCTTCGGATTCTTCAAGCAAACCCGTTGAACCAAGCAAC
AACAACAACAACAACGGTTCCGCGAAAAGAGCGCCGTTGACAGCAAGAGAGAGGCTAAGA
GCAGCTCGTGTCCTTAGTCGATACACGGAT*CGACGCCGAAACCATCGAAACCCAGAATG
GGGAGCCAGATCCTGGAGGTGCTCAAGGAGAGTGACAAGAAATCTAATAGGAAACCGGGT
CTACCCGAAGCACCGACCAACATGCTTGATGATAGCAAGAGAGGTATGCCGAAGAAAGGG
CTTACCTTTGATCTACCTGGAAGTGCAGATATACTGGTGATTGCCTTTTCGTTTGTGTTC
ATAAGCACTGTGATGTTTGCTACCACTTATGTTGTCTGGAAACTTGGTGGCATTCACTTC
AATGAGAACTAAAGATAAGATATTTGGACAAGTTTCTAGAGTTTGGAAACCTATTGA*TA
GAGAGTGGGAGAGTTGCAGT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2DR26JQ 648 0 0
AGCGTTCA
ACACATCTCCCAGTCCGTTACTTTCAAGCAAACGTAGATTGGTTTCATCTTGTCTGAAGT
CAAACGAAGATTCCATCGCAACAACATCGGTCAACGACCCTCCTCCCTCTTCGGATTCTT
CAAGCAAACCCGTTGAACCAAGCAACAACAACAACAACAACGGTTCCGCGAAAAGAGCGC
CGTTGACAGCAAGAGAGAGGCTAAGAGCAGCTCGTGTCCTTAGTCGATACACGGAT*CGA
CGCCGAAACCATCGAAACCCAGAATGGGGAGCCAGATCCTGGAGGTGCTCAAGGAGAGTG
ACAAGAAATCTAATAGGAAACCGGGTCTACCCGAAGCACCGACCAACATGCTTGATGATA
GCAAGAGAGGTATGCCGAAGAAAGGGCTTACCTTTGATCTACCTGGAAGTGCAGATATAC
TGGTGATTGCCTTTTCGTTTGTGTTCATAAGCACTGTGATGTTTGCTACCACTTATGTTG
TCTGGAAACTTGGTGGCATTCACTTCAATGAGAACTAAAGATAAGATATTTGGACAAGTT
TCTAGAGTTTGGAAACCTATTGAATAGAGAGTGGGAGAGTTGCAGTTGAAATGTATACTT
GGTGGAAGGTTTATCACTTGGCAAAGATTGTTTTGATTGC

QA 9 648 9 648
DS 



CO CL511Contig2 870 4 9 U
GACAAAAACACAAAGCGGTTTCCCTCTTCGTCTTCTTCCATATGCATAGCTCTTAAGACA
CGTTCATCTCAATTCAAAATGGCGGTTGCTGTCAACGCCGGCTTCAGTTCTCCGCTTCAT
AACAGATCCCACCCCGTTGTAAGATTCTCAACTCAAGTCACAACGTTAAAGCCTTCACCT
TTAACGCTCCACACATCTCCAAGTCCGTTACTTTCAAGCAAAAGTAGATTGGTTTCATCT
TGTCTGAAGTCAAACGAAGATTCCATCACAGCAACATCGGTCAACGACCCTCCTCCCCCT
TCGGATTCTTCAAGCAAACCCGTAGAACCAAGCAGCAACAACAGCAACAACGGTTCCGCG
AAAA*GAGCGCCGTTGACAGCAAGAGAGAGGCTAAGAGCAGCTCGCGTGCTTAGCCGATA
CACGGAAGCGACGCCGAAACCGTCGAAACCCAAAATGGGGAGCCAAATCCTGGAGGTGCT
CAAGGAGAGTGACAAGAAATCGAATAGGAAACCGGGTCTACCCGAAGCACCGACCAACAT
GCTCGATGATAGCAAGAGAGGTATGCCCAAGAAAGGGCTTACCTTTGATCTACCGGGAAG
CGCAGATATACTGGTGATTGCTTTTTCGTTTGTGTTTATAAGCACCGTGATGTTCGCTAC
CACTTATGTTGTCTGGAAACTTGGTGGCATTCACTTCAATGAGAACTAAAGATATGATCT
TTGGACAAGTTTCTAGAGTTTGGAAACCTATTGAACAGAGAGTGAAAGATTTGTAGTTGA
AATGTATACTTGGGGGAAGTTTATCACTTGGCAAAGATGGTTTGATTGTATACTGTGTAG
TTAGTAGTATACATAATTTTGTTTTCACAT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A353JQ C 297
AF RR2G479TF U 1
AF RR2A353TF U 2
AF RR2G479JQ C 481
BS 1 253 RR2G479TF
BS 254 254 RR2A353TF
BS 255 477 RR2G479TF
BS 478 478 RR2A353TF
BS 479 727 RR2G479TF
BS 728 728 RR2A353TF
BS 729 754 RR2G479TF
BS 755 788 RR2A353TF
BS 789 870 RR2G479JQ

RD RR2A353JQ 147 0 0
CC
CTTCGGATTCTTCAAGCAAACCCGTAGAACCAAGCAGCAACAACAGCAACAACGGTTCCG
CGAAAAAGAGCGCCGTTGACAGCAAGAGAGAGGCTAAGAGCAGCTCGCGTGCTTAGCCGA
TACACGGAAGCGACGCCGAAACC
GT

QA 3 145 3 145
DS 

RD RR2G479TF 761 0 0
GACAAAAACACAAAGCGGTTTCCCTCTTCGTCTTCTTCCATATGCATAGCTCTTAAGACA
CGTTCATCTCAATTCAAAATGGCGGTTGCTGTCAACGCCGGCTTCAGTTCTCCGCTTCAT
AACAGATCCCACCCCGTTGTAAGATTCTCAACTCAAGTCACAACGTTAAAGCCTTCACCT
TTAACGCTCCACACATCTCCAAGTCCGTTACTTTCAAGCAAAAGTAGATTGGTTTCATCT
TGTCTGAAGTCAACCGAAGATTCCATCACAGCAACATCGGTCAACGACCCTCCTCCCCCT
TCGGATTCTTCAAGCAAACCCGTAGAACCAAGCAGCAACAACAGCAACAACGGTTCCGCG
AAAA*GAGCGCCGTTGACAGCAAGAGAGAGGCTAAGAGCAGCTCGCGTGCTTAGCCGATA
CACGGAAGCGACGCCGAAACCGTCGAAACCCAAAATGGGGAGCCAAATCCTGGAGGTTCT
CAAGGAGAGTGACAAGAAATCGAATAGGAAACCGGGTCTACCCGAAGCACCGACCAACAT
GCTCGATGATAGCAAGAGAGGTATGCCCAAGAAAGGGCTTACCTTTGATCTACCGGGAAG
CGCAGATATACTGGTGATTGCTTTTTCGTTTGTGTTTATAAGCACCGTGATGTTCGCTAC
CACTTATGTTGTCTGGAAACTTGGTGGCATTCACTTCAATGAGAACTAAAGATATGATCT
TTGGACA*GTTTCTAGAGTTTGGAAACCTATTGA
CAGAGAG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2A353TF 787 0 0
GG
AAAAACACAAAGCGGTTTCCCTCTTCGTCTTCTTCCATATGCATAGCTCTTAAGACACGT
TCATCTCAATTCAAAATGGCGGTTGCTGTCAACGCCGGCTTCAGTTCTCCGCTTCATAAC
AGATCCCACCCCGTTGTAAGATTCTCAACTCAAGTCACAACGTTAAAGCCTTCACCTTTA
ACGCTCCACACATCTCCAAGTCCGTTACTTTCAAGCAAAAGTAGATTGGTTTCATCTTGT
CTGAAGTCAAACGAAGATTCCATCACAGCAACATCGGTCAACGACCCTCCTCCCCCTTCG
GATTCTTCAAGCAAACCCGTAGAACCAAGCAGCAACAACAGCAACAACGGTTCCGCGAAA
A*GAGCGCCGTTGACAGCAAGAGAGAGGCTAAGAGCAGCTCGCGTGCTTAGCCGATACAC
GGAAGCGACGCCGAAACCGTCGAAACCCAAAATGGGGAGCCAAATCCTGGAGGTGCTCAA
GGAGAGTGACAAGAAATCGAATAGGAAACCGGGTCTACCCGAAGCACCGACCAACATGCT
CGATGATAGCAAGAGAGGTATGCCCAAGAAAGGGCTTACCTTTGATCTACCGGGAAGCGC
AGATATACTGGTGATTGCTTTTTCGTTTGTGTTTATAAGCACCGTGATGTTCGCTACCAC
TTATGTTGTCTGGAAACTTGGTGGCATTCACTTCAATGAGAACTAAAGATATGATCTTTG
GACAAGTTTCTAGAGTTTGGAAACCTATTGAACAGAGAGTGAAAGATTTGTAGTTGAAAT
GTATA

QA 3 787 3 787
DS 

RD RR2G479JQ 390 0 0
CAAGGAGAGTGACAAGAAATCGAATAGGAAACCGGGTCTACCCGAAGCCCCGACCAACAT
GCTCGATGATAGCAAGAGAGGTATGCCCAAGAAAGGGCTTACCTTTGATTTACCGGGAAG
GGCAGATATACTGGTGATTGCTTTTTCGTTTGTGTTTATAAGCACCGTGATGTTCGCTAC
CACTTATGTTGTTTGGAAACTTGGTGGCATTCACTTCAATGAGAACTAAAGATATGATCT
TTGGACAAGTTTTTAGAGTTTGGAAACCTATTGAACAGAGAGTGAAAGATTTGTAGTTGA
AATGTATACTTGGGGGAAGTTTATCACTTGGCAAAGATGGTTTGATTGTATACTGTGTAG
TTAGTAGTATACATAATTTTGTTTTCACAT

QA 1 390 1 390
DS 



CO CL511Contig3 729 2 4 U
AACTCAATTCACAACGTTAAAGCCTTTACCTTTAACGCTCCACACATCTCCAAGTCCGTT
ACTTTCAAGCAAAAGTAGATTGGTTTCATCTTGTCTGAAGTCAAATGACGATTCCGTTAC
AGCAACATCGGTCAACGACCCTCCTCCCTCTTCGGATTCTTCAAGCAAACCCGTTGAACC
AAGCAACAACAACGGTTCCGCGAAAAGAGCACCGTTGACAGCAAGAGAAAGGCTAAGAGC
AGCTCGTGTCCTTAGCCGATACACGGAAGCGACACCGAAACCATCGAAACCCAAAATGGG
GAGCCAGATCCTGGAGGTGCTCAAGGAGAGTGACAAGAAATCGAACAGGAAACCGGGTCT
ACCCGAAGCACCGACCAACATGCTTGATGATAGCAAGAGAGGTATGCCGAAGAAAGGGCT
TACCTTTGATCTACCGGGAAGCGCAGATATATTGGTGATTGCTTTTTCGTTTGTGTTCAT
AAGCACTGTGATGTTTGCTACCACTTATGTTGTCTGGAAACTTGGTGGCATTCACTTCAA
TGAAAACTAAGGATAAGATATTTGGACAAGTTTCTAGAGTTTGGAAACTATTGAACTGAG
GCTGAGAGAGAGTTGTAGTTGAAATGTATACTTGGGGGAATGTTTATCACTTGGCAAAGA
TGGTTTGATTGTATACTGTGTAGTTAGTAGTACACATAATTTTGTTTTTCACATAATCTC
TTCTTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA05JQ C 1
AF RR2DL69TF U 272
BS 1 274 RR2HA05JQ
BS 275 326 RR2DL69TF
BS 327 327 RR2HA05JQ
BS 328 729 RR2DL69TF

RD RR2HA05JQ 674 0 0
AACTCAATTCACAACGTTAAAGCCTTTACCTTTAACGCTCCACACATCTCCAAGTCCGTT
ACTTTCAAGCAAAAGTAGATTGGTTTCATCTTGTCTGAAGTCAAATGACGATTCCGTTAC
AGCAACATCGGTCAACGACCCTCCTCCCTCTTCGGATTCTTCAAGCAAACCCGTTGAACC
AAGCAACAACAACGGTTCCGCGAAAAGAGCACCGTTGACAGCAAGAGAAAGGCTAAGAGC
AGCTCGTGTCCTTAGCCGATACACGGAAGCGACACCGAAACCATCGAAACCCAAAATGGG
GAGCCAGATCCTGGAGGTGCTCAAGGAGAGTGACAAGAAATCGAACAGGAAACCGGGTCT
ACCCTAAGCACCGACCAACATGCTTGATGATAGCAAGAGAGGTATGCCGAAGAAAGGGCT
TACCTTTGATCTACCGGGAAGCGCAGATATATTGGTGATTGCTTTTTCGTTTGTGTTCAT
AAGCACTGTGATGTTTGCTACCACTTATGTTGTCTGGAAACTTGGTGGCATTCACTTCAA
TGAAAACTAAGGATAAGATATTTGGACAAGTTTCTAGAGTTTGGAAACTATTGAACTGAG
GCTGAGAGAGAGTTGTAGTTGAAATGTATACTTGGGGGAATGTTTATCACTTGGCAAAGA
TGGTTT
GATTGTAC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2DL69TF 458 0 0
GCA
CCGAAACCATCGAAACCCAAAATGGGGAGCCAGATCCTGGAGGTGCTCAAGG*GAGTGAC
AAGAAATCGAACAGGAAACCGGGTCTACCCGAAGCACCGACCAACATGCTTGATGATAGC
AAGAGAGGTATGCCGAAGAAAGGGCTTACCTTTGATCTACCGGGAAGCGCAGATATATTG
GTGATTGCTTTTTCGTTTGTGTTCATAAGCACTGTGATGTTTGCTACCACTTATGTTGTC
TGGAAACTTGGTGGCATTCACTTCAATGAAAACTAAGGATAAGATATTTGGACAAGTTTC
TAGAGTTTGGAAACTATTGAACTGAGGCTGAGAGAGAGTTGTAGTTGAAATGTATACTTG
GGGGAATGTTTATCACTTGGCAAAGATGGTTTGATTGTATACTGTGTAGTTAGTAGTACA
CATAATTTTGTTTTTCACATAATCTCTTCTTGCTC

QA 4 458 4 458
DS 



AS 1 7

CO CL512Contig1 875 7 9 U
TTTTTCTCCCAAAGCTTTCTCACTTTTCGATTCCAAGCAAGCAAGATGAGTGGAGAAACG
AAAGAGAATCAGAAGCAGCTGCAGCGACCTGCTCCTCGTCTTAACGAGAGGATTCTCTCT
TCCTTGTCTAGACGATCCGCTGCTGCTCACCCCTGGCACGATCTTGAGATTGGTCCTGGA
GCTCCACAGATTTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGAAGCAAGGTCAAATATGAA
CTTGACAAAAAGACTGGACTCATCAAGGTTGATCGTATTCTCTACTCTTCTGTTGTGTAC
CCTCACAACTATGGTTTCGTTCCTCGCACCCTATGTGAAGACAATGACCCTATTGATGTT
TTAGTCATCATGCAGGAACCTGTGCTTCCAGGTTGTTTTCTGCGTGCTCGTGCTATTGGA
TTAATGCCTATGATTGACCAGGGTGAGAAAGATGACAAGATTATTGCAGTTTGTGTTGAT
GATCCTGAGTACAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTCCCTCCTCACCGTCTCTCTGAG
ATCCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCAGTTAATGAT
TTTCTCCCATCTGAGAAAGCTATTGAAGCTATCCAGTACTCAATGGACCTTTATGCTGAG
TACATTCTCCATACCCTGAGACGTTGAAGCTTTCTCCTCTCAACATTTCTGCAACGTCTT
GTTTCTGTTTCTTTCTATGATGATTACTTTCTCTGAATTTTCTTGTTAAACTTTGAATTT
GTCCTTGTGAACTCAATAATATTTTCTTCTAAATCATCTTTGTTATGTCTTAGAAATTGG
AATACCTTCAATAAAACATTTTATTCTTGTACACT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU20TF U 1
AF RR2BS49TF U 1
AF RR2HB30TF U 1
AF RR2GP93TF U 90
AF RR2GP93JQ C 310
AF RR2GU20JQB C 163
AF RR2HB30JQ C 127
BS 1 139 RR2BS49TF
BS 140 140 RR2HB30TF
BS 141 702 RR2BS49TF
BS 703 703 RR2GP93TF
BS 704 715 RR2BS49TF
BS 716 790 RR2GP93TF
BS 791 791 RR2HB30JQ
BS 792 809 RR2GP93TF
BS 810 875 RR2HB30JQ

RD RR2GU20TF 639 0 0
TTTT
TCTCCCAAAGCTTTCTCACTTTTCGATTCCAAGCAAGCAAGATGAGTGGAGAAACGAAAG
AGAATCAGAAGCAGCTGCAGCGACCTGCTCCTCGTCTTAACGAGAGGATTCTCTCTTCCT
TGTCTAGACGATCCGTTGCTGCTCACCCCTGGCACGATCTTGAGATTGGTCCTGGAGCTC
CACAGATTTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGGAGCAAGGTCAAATATGAACTTG
ACAAAAAGACTGGACTCATCAAGGTTGATCGTATTCTCTACTCTTCTGTTGTGTACCCTC
ACAACTATGGTTTCGTTCCTCGCACCCTATGTGAAGACAATGACCCTATTGATGTTTTAG
TCATCATGCAGGAACCTGTGCTTCCAGGTTGTTTTCTGCGTGCTCGTGCTATTGGATTAA
TGCCTATGATTGACCAGGGTGAGAAAGATGACAAGATTATTGCAGTTTGTGTTGATGATC
CTGAGTACAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTCCCTCCTCACCGTCTCTCTGAGATCC
GTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCAGTTAATGATTTTC
TCCCATCTGAGAAAGCTATTGAAGCTATCCAGTAC

QA 5 639 5 639
DS 

RD RR2BS49TF 715 0 0
TTTTTCTCCCAAAGCTTTCTCACTTTTCGATTCCAAGCAAGCAAGATGAGTGGAGAAACG
AAAGAGAATCAGAAGCAGCTGCAGCGACCTGCTCCTCGTCTTAACGAGAGGATTCTCTCT
TCCTTGTCTAGACGATCCGTTGCTGCTCACCCCTGGCACGATCTTGAGATTGGTCCTGGA
GCTCCACAGATTTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGAAGCAAGGTCAAATATGAA
CTTGACAAAAAGACTGGACTCATCAAGGTTGATCGTATTCTCTACTCTTCTGTTGTGTAC
CCTCACAACTATGGTTTCGTTCCTCGCACCCTATGTGAAGACAATGACCCTATTGATGTT
TTAGTCATCATGCAGGAACCTGTGCTTCCAGGTTGTTTTCTGCGTGCTCGTGCTATTGGA
TTAATGCCTATGATTGACCAGGGTGAGAAAGATGACAAGATTATTGCAGTTTGTGTTGAT
GATCCTGAGTACAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTCCCTCCTCACCGTCTCTCTGAG
ATCCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCAGTTAATGAT
TTTCTCCCATCTGAGAAAGCTATTGAAGCTATCCAGTACTCAATGGACCTTTATGCTGAG
TACATTCTCCATACCCTGAGACGTTGAAGCTTTCTCCTCTCA*CATTTCTGCAAC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2HB30TF 699 0 0
TTTT
TCTCCCAAAGCTTTCTCACTTTTCGATTCCAAGCAAGCAAGATGAGTGGAGAAACGAAAG
AGAATCAGAAGCAGCTGCAGCGACCTGCTCCTCGTCTTAACGAGAGGATTCTCTCTTCCT
TGTCTAGACGATCCGCTGCTGCTCACCCCTGGCACGATCTTGAGATTGGTCCTGGAGCTC
CACAGATTTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGAAGCAAGGTCAAATATGAACTTG
ACAAAAAGACTGGACTCATCAAGGTTGATCGTATTCTCTACTCTTCTGTTGTGTACCCTC
ACAACTATGGTTTCGTTCCTCGCACCCTATGTGAAGACAATGACCCTATTGATGTTTTAG
TCATCATGCAGGAACCTGTGCTTCCAGGTTGTTTTCTGCGTGCTCGTGCTATTGGATTAA
TGCCTATGATTGACCAGGGTGAGAAAGATGACAAGATTATTGCAGTTTGTGTTGATGATC
CTGAGTACAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTCCCTCCTCACCGTCTCTCCGAGATCC
GTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCAGTTAATGATTTTC
TCCCATCTGAGAAAGCTATTGAAGCTATCCAGTACTCAATGGACCTTTATGCTGAGTACA
TTCTCCATACCCTGAGACGTTGAAGCTTTCTCCTC

QA 5 699 5 699
DS 

RD RR2GP93TF 727 0 0
G
GCTCCTCGTCTTAACGAGAGGATTCTCTCTTCCTTGTCTAGACGATCCGTTGCTGCTCAC
CCCTGGCACGATCTTGAGATTGGTCCTGGAGCTCCACAGATTTTCAATGTGGTGGTTGAG
ATCACAAAGGGAAGCAAGGTCAAATATGAACTTGACAAAAAGACTGGACTCATCAAGGTT
GATCGTATTCTCTACTCTTCTGTTGTGTACCCTCACAACTATGGTTTCGTTCCTCGCACC
CTATGTGAAGACAATGACCCTATTGATGTTTTAGTCATCATGCAGGAACCTGTGCTTCCA
GGTTGTTTTCTGCGTGCTCGTGCTATTGGATTAATGCCTATGATTGACCAGGGTGAGAAA
GATGACAAGATTATTGCAGTTTGTGTTGATGATCCTGAGTACAAGCATTACACTGACATC
AAAGAACTCCCTCCTCACCGTCTCTCTGAGATCCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGGAG
AATGAGAACAAGGAAGTTGCAGTTAATGATTTTCTCCCATCTGAGAGAGCTATTGAAGCT
ATCCAGTACTCAATGGACCTTTATGCTGAGTACATTCTCCATACCCTGGGACGTTGAAGC
TTTCTCCTCTCAACATTTCTGCAACGTCTTGTTTCTGTTTCTTTCTATGATGATTACTTT
CTCTGAATTTTCTTGTTAAACTTTGAATTTGTCCTTGTGA*CTCAATAATATTTTCTTC
TAAACCG

QA 2 720 2 720
DS 

RD RR2GP93JQ 507 0 0
TATGGTTTCGTTCCTCGCACCCTATGTGAAGACAATGACCCTATTGATGTTTTAGTCATC
ATGCAGGAACCTGTGCTTCCAGGTTGTTTTCTGCGTGCTCGTGCTATTGGATTAATGCCT
ATGATTGACCAGGGTGAGAAAGATGACAAGATTATTGCAGTTTGTGTTGATGATCCTGAG
TACAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTCCCTCCTCACCGTCTCTCTGAGATCCGTCGT
TTCTTTGAAGACTACAAGGAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCAGTTAATGATTTTCTCCCA
TCTGAGAGAGCTATTGAAGCTATCCAGTACTCAATGGACCTTTATGCTGAGTACATTCTC
CATACCCTGGGACGTTGAAGCTTTCTCCTCTCAACATTTTTGCAACGTCTTGTTTCTGTT
TCTTTCTATGATGATTACTTTCTCTGAATTTTCTTGTTAAACTTTGAATTTGTCCTTGTG
AACTCAATAATATTTTCTTC
TAAACCG

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2GU20JQB 648 0 0
CTTGAGATTGGTCCTGGAGCTCCACAGATTTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGG
AGCAAGGTCAAATATGAACTTGACAAAAAGACTGGACTCATCAAGGTTGATCGTATTCTC
TACTCTTCTGTTGTGTACCCTCACAACTATGGTTTCGTTCCTCGCACCCTATGTGAAGAC
AATGACCCTATTGATGTTTTAGTCATCATGCAGGAACCTGTGCTTCCAGGTTGTTTTCTG
CGTGCTCGTGCTATTGGATTAATGCCTATGATTGACCAGGGTGAGAAAGATGACAAGATT
ATTGCAGTTTGTGTTGATGATCCTGAGTACAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTCCCT
CCTCACCGTCTTTCTGAGATCCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAATGAGAACAAG
GAAGTTGCAGTTAATGATTTTCTCCCATCTGAGAAAGCTATTGAAGCTATCCAGTACTCA
ATGGACCTTTATGCTGAGTACATTCTCCATACCCTGAGACGTTGAAGCTTTCTCCTCTCA
ACATTTCTGCAACGTCTTGTTTCTGTTTCTTTCTATGATGATTACTTTCTCTGAATTTTC
TTGTTAAACTTTGAATTTGTCCTTGTGAACTCAATAATATTTTCTTC
C

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2HB30JQ 749 0 0
TCTAGACGATCCGCTGCTGCTCACCCCTGGCACGATCTTGAGATTGGTCCTGGAGCTCCA
CAGATTTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGAAGCAAGGTCAAATATGAACTTGAC
AAAAAGACTGGACTCATCAAGGTTGATCGTATTCTCTACTCTTCTGTTGTGTACCCTCAC
AACTATGGTTTCGTTCCTCGCACCCTATGTGAAGACAATGACCCTATTGATGTTTTAGTC
ATCATGCAGGAACCTGTGCTTCCAGGTTGTTTTCTGCGTGCTCGTGCTATTGGATTAATG
CCTATGATTGACCAGGGTGAGAAAGATGACAAGATTATTGCAGTTTGTGTTGATGATCCT
GAGTACAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTCCCTCCTCACCGTCTCTCCGAGATCCGT
CGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCAGTTAATGATTTTCTC
CCATCTGAGAAAGCTATTGAAGCTATCCAGTACTCAATGGACCTTTATGCTGAGTACATT
CTCCATACCCTGAGACGTTGAAGCTTTCTCCTCTCAACATTTCTGCAACGTCTTGTTTCT
GTTTCTTTCTATGATGATTACTTTCTCTGAATTTTCTTGTTAAACTTTGAATTTGTCCTT
GTGAACTCAATAATATTTTCTTCTAAATCATCTTTGTTATGTCTTAGAAATTGGAATACC
TTCAATAAAACATTTTATTCTTGTACACT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 2 11

CO CL513Contig1 684 9 7 U
GGACCGCAAAACCTAAATCTCAAATCAAATTCCCGAGAAAAACCAATCAACCGAGAGAAA
TGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCCGCCGCGGCGGAGAAGCCAG
CGGAGGACGTCGTAGCCGAGAAATCCCCAGCGGAGAAGAAACCAAAAGCCGGGAAGAAGC
TACCGAAGGAAGCAATCGGCGCCTCCTCCGCGACGGACAAGAAGAAGAAGCGGAGCAAGA
AGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAAGTCCACCCTGACA
TCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGA
AGCTCGCTGGTGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCCACGATTACTTCCC
GCGAGATCCAGACTGCTGTGAGGCTTGTGCTTCCCGGTGAGCTCGCTAAGCACGCTGTTT
CCGAAGGGACCAAGGCGGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATTAGGGTTTCTAGATCTG
CTGCCCCCTTTCTGGTTTTATGATTTGGTTTGTAATTGGTTGAAGAACATATCAATCTGA
TGTTTTAAATCGGCTCTTTT*GGGAAGTTGAAATCTCAAATATTATGTGTTCGTGGTTTA
ATAGCACACATCCTTTTCGTTAGC


BQ
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ35TF U 1
AF RR2BT60JQ C 1
AF RR2BT60TF U 1
AF RR2CV79TF U 1
AF RR2G674JQ C 1
AF RR2G674TF U 1
AF RR2AQ90JQ C 1
AF RR2AQ90TF U 1
AF RR2G017JQ C 1
BS 1 341 RR2AQ35TF
BS 342 342 RR2BT60TF
BS 343 639 RR2AQ35TF
BS 640 640 RR2AQ90TF
BS 641 658 RR2AQ35TF
BS 659 667 RR2AQ90TF
BS 668 684 RR2G017JQ

RD RR2AQ35TF 658 0 0
GGACCGCAAAACCTAAATCTCAAATCAAATTCCCGAGAAAAACCAATCAACCGAGAGAAA
TGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCCGCCGCGGCGGAGAAGCCAG
CGGAGGACGTCGTAGCCGAGAAATCCCCAGCGGAGAAGAAACCAAAAGCCGGGAAGAAGC
TACCGAAGGAAGCAATCGGCGCCTCCTCCGCGACGGACAAGAAGAAGAAGCGGAGCAAGA
AGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAAGTCCACCCTGACA
TCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCGTCAACGACATCTTCGAGA
AGCTCGCTGGTGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCCACGATTACTTCCC
GCGAGATCCAGACTGCTGTGAGGCTTGTGCTTCCCGGTGAGCTCGCTAAGCACGCTGTTT
CCGAAGGGACCAAGGCGGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATTAGGGTTTCTAGATCTG
CTGCCCCCTTTCTGGTTTTATGATTTGGTTTGTAATTGGTTGAAGAACATATCAATCTGA
TGTTTTAAATCGGCTCTTTT*GGGAAGTTGAAATCTCAA*TATTATGTGTTCGTGGTT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2BT60JQ 606 0 0
GGACCGCAAAACCTAAATCTCAAATCAAATTCCCGAGAAAAACCAATCAACCGAGAGAAA
TGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCCGCCGCGGCGGAGAAGCCAG
CGGAGGACGTCGTAGCCGAGAAATCCCCAGCGGAGAAGAAACCAAAAGCCGGGAAGAAGC
TACCGAAGGAAGCAATCGGCGCCTCCTCCGCGACGGACAAGAAGAAGAAGCGGAGCAAGA
AGAGCGTGGAGACGTACAAGGTCTACATCTTCAGGGTGCTGAAGCAAGTCCACCCTGACA
TCGGGATCTCTCTCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGA
AGCTCGCTGGTGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCCACGATTACTTCCC
GCGAGATCCAGACTGCTGTGAGGCTTGTGCTTCCCGGTGAGCTCGCTAAGCACGCTGTTT
CCGAAGGGACCAAGGCGGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATTAGGGTTTCTAGATCTG
CTGCCCCCTTTCTGGTTTTATGATTTGGTTTGTAATTGGTTGAAGAACATATCAATCTGA
TGTTTT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2BT60TF 606 0 0
GGACCGCAAAACCTAAATCTCAAATCAAATTCCCGAGAAAAACCAATCAACCGAGAGAAA
TGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCCGCCGCGGCGGAGAAGCCAG
CGGAGGACGTCGTAGCCGAGAAATCCCCAGCGGAGAAGAAACCAAAAGCCGGGAAGAAGC
TACCGAAGGAAGCAATCGGCGCCTCCTCCGCGACGGACAAGAAGAAGAAGCGGAGCAAGA
AGAGCGTGGAGACGTACAAGGTCTACATCTTCAGGGTGCTGAAGCAAGTCCACCCTGACA
TCGGGATCTCTCTCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGA
AGCTCGCTGGTGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCCACGATTACTTCCC
GCGAGATCCAGACTGCTGTGAGGCTTGTGCTTCCCGGTGAGCTCGCTAAGCACGCTGTTT
CCGAAGGGACCAAGGCGGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATTAGGGTTTCTAGATCTG
CTGCCCCCTTTCTGGTTTTATGATTTGGTTTGTAATTGGTTGAAGAACATATCAATCTGA
TGTTTT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2CV79TF 630 0 0
GGACCGCAAAACCTAAATCTCAAATCAAATTCCCGAGAAAAACCAATCAACCGAGAGAAA
TGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCCGCCGCGGCGGAGAAGCCAG
CGGAGGACGTCGTAGCCGAGAAATCCCCAGCGGAGAAGAAACCAAAAGCCGGGAAGAAGC
TACCGAAGGAAGCAATCGGCGCCTCCTCCGCGACGGACAAGAAGAAGAAGCGGAGCAAGA
AGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAAGTCCACTCTGACA
TCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCACTAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGA
AGCTCGCTGGTGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCCACGATTACTTCCC
GCGAGATCCAGACTGCTGTGAGGCTTGTGCTTCCCGGTGAGCTCGCTAAGCACGCTGTTT
CCGAAGGGACCAAGGCGGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATTAGGGTTTCTAGATCTG
CTGCCCCCTTTCTGGTTTTATGATTTGGTTTGTAATCGGTTGAAGAACATATCAATCTGA
TGTTTTAA*TCGGCTCTTTT*GGGAAGTTG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2G674JQ 637 0 0
GGACCGCAAAAC*TAAATCTCAAATCAACTTCCCGAGAAAAACCAATCAACCGAGAGAAA
TGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCCGCCGCGGCGGAGAAGCCAG
CGGAGGACGTCGTAGCCGAGAAATCCCCAGCGGAGAAGAAACCAAAAGCCGGGAAGAAGC
TACCGAAGGAAGCAATCGGCGCCTCCTCCGCGACGGACAAGAAGAAGAAGCGGAGCAAGA
AGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAAGTCCACCCTGACA
TCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGA
AGCTCGCTGGTGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCCACGATTACTTCCC
GCGAGATCCAGACTGCTGTGAGGCTTGTGCTTCCCGGTGAGCTCGCTAAGCACGCTGTTT
CCGAAGGGACCAAGGCGGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATTAGGGTTTCTAGATCTG
CTGCCCCCTTTCTGGTTTTATGATTTGGTTTGTAATTGGTTGAAGAACATATCAATCTGA
TGTTTTAAATCGGCTCTTTT*GGGAAGTTGAAATC
CC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2G674TF 637 0 0
GGACCGCAAAACCTAAATCTCAAATCAACTTCCCGAGAAAAACCAATCAACCGAGAGAAA
TGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCCGCCGCGGCGGAGAAGCCAG
CGGAGGACGTCGTAGCCGAGAAATCCCCAGCGGAGAAGAAACCAAAAGCCGGGAAGAAGC
TACCGAAGGAAGCAATCGGCGCCTCCTCCGCGACGGACAAGAAGAAGAAGCGGAGCAAGA
AGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAAGTCCACCCTGACA
TCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGA
AGCTCGCTGGTGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCCACGATTACTTCCC
GCGAGATCCAGACTGCTGTGAGGCTTGTGCTTCCCGGTGAGCTCGCTAAGCACGCTGTTT
CCGAAGGGACCAAGGCGGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATTAGGGTTTCTAGATCTG
CTGCCCCCTTTCTGGTTTTATGATTTGGTTTGTAATTGGTTGAAGAACATATCAATCTGA
TGTTTTAAATCGGCTCTTTT*GGGAAGTTGAAATC
CC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2AQ90JQ 667 0 0
GGACCGCAAAACCTAAATCTCAAATCAAATTCCCGAGAAAAACCAATCAACCGAGAGAAA
TGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCCGCCGCGGCGGAGAAGCCAG
CGGAGGACGTCGTAGCCGAGAAATCCCCAGCGGAGAAGAAACCAAAAGCCGGGAAGAAGC
TACCGAAGGAAGCAATCGGCGCCTCCTCCGCGACGGACAAGAAGAAGAAGCGGAGCAAGA
AGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAAGTCCACCCTGACA
TCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGA
AGCTCGCTGGTGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCCACGATTACTTCCC
GCGAGATCCAGACTGCTGTGAGGCTTGTGCTTCCCGGTGAGCTCGCTAAGCACGCTGTTT
CCGAAGGGACCAAGGCGGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATTAGGGTTTCTAGATCTG
CTGCCCCCTTTCTGGTTTTATGATTTGGTTTGTAATTGGTTGAAGAACATATCAATCTGA
TGTTTTAAATCGGCTCTTTT*GGGAAGTTGAAATCTCAAATATTATGTGTTCGTGGTTTA
ATAGCAC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2AQ90TF 667 0 0
GGACCGCAAAACCTAAATCTCAAATCAAATTCCCGAGAAAAACCAATCAACCGAGAGAAA
TGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCCGCCGCGGCGGAGAAGCCAG
CGGAGGACGTCGTAGCCGAGAAATCCCCAGCGGAGAAGAAACCAAAAGCCGGGAAGAAGC
TACCGAAGGAAGCAATCGGCGCCTCCTCCGCGACGGACAAGAAGAAGAAGCGGAGCAAGA
AGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAAGTCCACCCTGACA
TCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGA
AGCTCGCTGGTGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCCACGATTACTTCCC
GCGAGATCCAGACTGCTGTGAGGCTTGTGCTTCCCGGTGAGCTCGCTAAGCACGCTGTTT
CCGAAGGGACCAAGGCGGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATTAGGGTTTCTAGATCTG
CTGCCCCCTTTCTGGTTTTATGATTTGGTTTGTAATTGGTTGAAGAACATATCAATCTGA
TGTTTTAAATCGGCTCTTTTTGGGAAGTTGAAATCTCAAATATTATGTGTTCGTGGTTTA
ATAGCAC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2G017JQ 684 0 0
GGACCGCAAAACCTAAATCTCAAATCAAATTCCCGAGAAAAACCAATCAACCGAGAGAAA
TGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCCGCCGCGGCGGAGAAGCCAG
CGGAGGACGTCGTAGCCGAGAAATCCCCAGCGGAGAAGAAACCAAAAGCCGGGAAGAAGC
TACCGAAGGAAGCAATCGGCGCCTCCTCCGCGACGGACAAGAAGAAGGAGCGGAGCAAGA
AGAGCGTGGAGACGTGCAAGATCTACGTCTTCAAGGTGCTGAAGCAAGTCCACCCCGACA
TCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTCCATCAACGACATTTTCGAGA
AGCTCGCTGGTGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAGGAAGCCCACGATTACTTCCC
GCGAGATCCAGACTGCTGTGAGGCTTGTGCTTCCCGGTGAGCTCGCTAAGCACGCTGTTT
CCGAAGGGACCAAGGCGGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATTAGGGTTTCTAGATCTG
CTGCCCCCTTTCTGGTTTTATGATTTGGTTTGTAATTGGTTGAAGAACATATCAATCTGA
TGTTTTAAATCGGCTCTTTT*GGGAAGTTGAAATCTCAAATATTATGTGTTCGTGGTTTA
ATAGCACACATCCTTTTCGTTAGC

QA 1 684 1 684
DS 



CO CL513Contig2 598 2 1 U
GGACCGCAAAACCTAAATCTCAAATCAAATTCCCGAGAAAAAAATCAATCAGCGAGAAAA
TGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCCGCAGAGAAGAAACCCGCCGCGGCGGAGAAGCCAG
CGGAGGACGTCGTAGTCGAGAAATCACCGGCGGAGAAGAAACCAAAAGCCGGGAAGAAGC
TACCGAAAGAAGCCTCCATCGGCGCCTCCTCCGCGACGGACAAGAAGAAGAAGCGGAGCA
AGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAAGTCCACCCGG
ACATCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCG
AGAAGCTCGCTGGTGAGGCGTCGAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACTT
CCCGCGAGATCCAGACCGCTGTGAGGCTTGTGCTTCCCGGTGAGCTCGCTAAGCACGCTG
TTTCTGAAGGGACCAAGGCGGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATTAGGGTTTCTAGAT
CTACTGCCCCTTTCTGGTTTTAATGATTTGGTTTGTAATTGGTTGAAGAACATATCAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EJ92JQ C 1
AF RR2EJ92TF U 1
BS 1 598 RR2EJ92TF

RD RR2EJ92JQ 598 0 0
GGACCGCAAAACCTAAATCTCAAATCAAATTCCCGAGAAAAAAATCAATCAGCGAGAAAA
TGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCCGCAGAGAAGAAACCCGCCGCGGCGGAGAAGCCAG
CGGAGGACGTCGTAGTCGAGAAATCACCGGCGGAGAAGAAACCAAAAGCCGGGAAGAAGC
TACCGAAAGAAGCCTCCATCGGCGCCTCCTCCGCGACGGACAAGAAGAAGAAGCGGAGCA
AGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAAGTCCACCCGG
ACATCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCG
AGAAGCTCGCTGGTGAGGCGTCGAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACTT
CCCGCGAGATCCAGACCGCTGTGAGGCTTGTGCTTCCCGGTGAGCTCGCTAAGCACGCTG
TTTCTGAAGGGACCAAGGCGGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATTAGGGTTTCTAGAT
CTACTGCCCCTTTCTGGTTTTAATGATTTGGTTTGTAATTGGTTGAAGAACATATCAA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2EJ92TF 598 0 0
GGACCGCAAAACCTAAATCTCAAATCAAATTCCCGAGAAAAAAATCAATCAGCGAGAAAA
TGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCCGCAGAGAAGAAACCCGCCGCGGCGGAGAAGCCAG
CGGAGGACGTCGTAGTCGAGAAATCACCGGCGGAGAAGAAACCAAAAGCCGGGAAGAAGC
TACCGAAAGAAGCCTCCATCGGCGCCTCCTCCGCGACGGACAAGAAGAAGAAGCGGAGCA
AGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAAGTCCACCCGG
ACATCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCG
AGAAGCTCGCTGGTGAGGCGTCGAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACTT
CCCGCGAGATCCAGACCGCTGTGAGGCTTGTGCTTCCCGGTGAGCTCGCTAAGCACGCTG
TTTCTGAAGGGACCAAGGCGGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATTAGGGTTTCTAGAT
CTACTGCCCCTTTCTGGTTTTAATGATTTGGTTTGTAATTGGTTGAAGAACATATCAA

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 11

CO CL514Contig1 701 11 1 U
GGATTCTAAAAACAAACATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGGATCACCGATCTC
AAAGCTTTCGGTTCGTTTTATCTAAAGTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAG
TTGGTATGTCATGCCAAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAG
GCGTTGAGTCATTTGACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTG
AGCCTGAGGCAGTTTTTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCG
TGGAGGCTGAGGTTGAGCCTAAGGACGAGACTGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGA
CTGAGGGTAAGGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTA
AGGCTGATGTTGAACCGAAGCACGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATG
ATGAGATACTTGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGA
AACTCGTTGAAGCCGAGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACCAAAGAAATATTGTAATG
ATGATTTTAATCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTTTAAG
AACTAAAAAATGTATCCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 10 

AF RR2GP23TF U 1
AF RR2AS11TF U 1
AF RR2AS11JQ C 44
AF RR2DH75JQ C 57
AF RR2FX82JQ C 6
AF RR2GW29JQ C 81
AF RR2FX82TF U 6
AF RR2GW29TF U 6
AF RR2BL93JQ C 11
AF RR2BL93TF U 1
AF RR2DH75TF U 1
BS 1 701 RR2AS11TF

RD RR2GP23TF 657 0 0
GGATTCTAAAAACAAACATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGGATCACCGATCTC
AAAGCTTTCGGTTCGTTTTATCTAAAGTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAG
TTGGTATGTCATGCCAAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAG
GCGTTGAGTCATTTGACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTG
AGCCTGAGGCAGTTTTTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCG
TGGAGGCTGAGGTTGAGCCTAAGGACGAGACTGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGA
CTGAGGGTAAGGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTA
AGGCTGATGTTGAACCGAAGCACGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATG
ATGAGATACTTGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGA
AACTCGTTGAAGCCGAGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACCAAAGAAATATTGTAATG
ATGATTTTAATCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTTT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2AS11TF 701 0 0
GGATTCTAAAAACAAACATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGGATCACCGATCTC
AAAGCTTTCGGTTCGTTTTATCTAAAGTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAG
TTGGTATGTCATGCCAAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAG
GCGTTGAGTCATTTGACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTG
AGCCTGAGGCAGTTTTTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCG
TGGAGGCTGAGGTTGAGCCTAAGGACGAGACTGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGA
CTGAGGGTAAGGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTA
AGGCTGATGTTGAACCGAAGCACGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATG
ATGAGATACTTGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGA
AACTCGTTGAAGCCGAGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACCAAAGAAATATTGTAATG
ATGATTTTAATCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTTTAAG
AACTAAAAAATGTATCCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2AS11JQ 658 0 0
TTCGGATCACCGATCTCAAAGCTTTCGGTTCGTTTTATCTAAAGTTGTAGCCATGTCTCA
GACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTCATGCCAAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGT
CCTAGGCAAAATGGAAGGCGTTGAGTCATTTGACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGAC
AGTGAAAGGAAAAGTTGAGCCTGAGGCAGTTTTTCAAACAGTTTTTAAGACTGGAAAGAA
GACTTTTTACTGGCCCGTGGAGGCTGAGGTTGAGCCTAAGGACGAGACTGAGACAAAACC
TGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGGTAAGGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGA
TGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAGCACGCAGAAACGGAGACTAAGAC
CGAGGGTAAGGTTGATGATGAGATACTTGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAA
GGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGAAGCCGAGACTAAGCCCCCCCAAGTTTAAGTACC
AAAGAAATATTGTAATGATGATTTTAATCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGT
TTATCTGTTGTTTTAAGAACTAAAAAATGTATCCGATTTACTAAAAAATGTTTT
TTTT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2DH75JQ 645 0 0
TCTCAAAGCTTTCGGTTCGTTTTATCTAAAGTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTC
AAAGTTGGTATGTCATGCCAAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATG
GAAGGCGTTGAGTCATTTGACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAA
GTTGAGCCTGAGGCAGTTTTTCAAACAGTGTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGG
CCCGTGGAGGCTGAGGTTGAGCCTAAGGACGAGACTGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACT
AAGACTGAGGGTAAGGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAG
CCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAGCACGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTT
GATGATGAGATACTTGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAA
CCGAAACTCGTTGAAGCCGAGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACCAAAGAAATATTGT
AATGATGACTTTAATCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTT
TAAGAACTAAAAAATGTATCCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2FX82JQ 696 0 0
GG
AAAAACAAACATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGGATCACCGATCTCAAAGCTT
TCGGTTCGTTTTATCTAAAGTTGTAGTCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTAT
GTCATGCCAAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAGGCGTTGA
GTCATTTGACATTGATATCAAGGAATAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTGAGCCTGA
GGCAGTTTTTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCGTGGAGGC
TGAGGTTGAGCCTAAGGACGAGACTGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGG
TAAGGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGA
TGTTGAACCGAAGCACGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATGATGAGAT
ACTTGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGT
TGAAGCCGAGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACCAAAGAAATATTGTAATGATGATTT
TAATCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTTTAAGAACTAAA
AAATGTATCCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCC

QA 3 696 3 696
DS 

RD RR2GW29JQ 621 0 0
TCTAAAGTTGTAGTCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTCATGCCAAGGT
TGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAGGCGTTGAGTCATTTGACATT
GATATCAAGGAATAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTGAGCCTGAGGCAGTTTTTCAA
ACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCGTGGAGGCTGAGGTTGAGCCT
AAGGACGAGACTGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGGTAAGGTTGATGCT
GAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAG
CACGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATGATGAGATACTTGATGCCAAG
GTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGAAGCCGAGACT
AAGCCACCACAAGTTTAAGTACCAAAGAAATATTGTAATGATGATTTTAATCCATATTTG
CAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTTTAAGAACTAAAAAATGTATCCGAT
TTACTAAAAAATGTTTTCTCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2FX82TF 703 0 0
GG
AAAAACAAACATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGGATCACCGATCTCAAAGCTT
TCGGTTCGTTTTATCTAAAGTTGTAGTCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTAT
GTCATGCCAAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAGGCGTTGA
GTCATTTGACATTGATATCAAGGAATAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTGAGCCTGA
GGCAGTTTTTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCGTGGAGGC
TGAGGTTGAGCCTAAGGACGAGACTGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGG
TAAGGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGA
TGTTGAACCGAAGCACGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATGATGAGAT
ACTTGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGT
TGAAGCCGAGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACCAAAGAAATATTGTAATGATGATTT
TAATCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTTTAAGAACTAAA
AAATGTATCCGATTTACTAAAAA
TGTTTTCTCCAAAAAAAA

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR2GW29TF 696 0 0
GG
AAAAACAAACATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGGATCACCGATCTCAAAGCTT
TCGGTTCGTTTTATCTAAAGTTGTAGTCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTAT
GTCATGCCAAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAGGCGTTGA
GTCATTTGACATTGATATCAAGGAATAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTGAGCCTGA
GGCAGTTTTTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCGTGGAGGC
TGAGGTTGAGCCTAAGGACGAGACTGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGG
TAAGGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGA
TGTTGAACCGAAGCACGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATGATGAGAT
ACTTGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGT
TGAAGCCGAGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACCAAAGAAATATTGTAATGATGATTT
TAATCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTTTAAGAACTAAA
AA*TGTATCCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCC

QA 3 696 3 696
DS 

RD RR2BL93JQ 691 0 0
AACAAACATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGGATCACCGATCTCAAAGCTTTCG
GTTCGTTTTATCTAAAGTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTC
ATGCCAAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAGGCGTTGAGTC
ATTTGACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTGAGCCTGAGGC
AGTTTTTCAAACAGTTTTTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCGTGGAGGCTGA
GGTTGAGCCTAAGGACGAGACTGAGACAAAACCTGAAGATGAGACTAAGACTGAGGGTAA
GGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGT
TGAACCGAAGCACGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATGATGAGATACT
TGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGA
AGCCGAGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACCAAAGAAATATTGTAATGATGATTTTAA
TCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTTTAAGAACTAAAAAA
TGTATCCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2BL93TF 701 0 0
GGATTCTAAAAACAAACATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGGATCACCGATCTC
AAAGCTTTCGGTTCGTTTTATCTAAAGTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAG
TTGGTATGTCATGCCAAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAG
GCGTTGAGTCATTTGACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTG
AGCCTGAGGCAGTTTTTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCG
TGGAGGCTGAGGTTGAGCCTAAGGACGAGACTGAGACAAAACCTGAAGATGAGACTAAGA
CTGAGGGTAAGGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTA
AGGCTGATGTTGAACCGAAGCACGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATG
ATGAGATACTTGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGA
AACTCGTTGAAGCCGAGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACCAAAGAAATATTGTAATG
ATGATTTTAATCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTTTAAG
AACTAAAAA*TGTATCCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2DH75TF 701 0 0
GGATTCTAAAAACAAACATCTTCTCATTTCCCATTTTATCTAATTCGGATCACCGATCTC
AAAGCTTTCGGTTCGTTTTATCTAAAGTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAG
TTGGTATGTCATGCCAAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAG
GCGTTGAGTCATTTGACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTG
AGCCTGAGGCAGTTTTTCAAACAGTGTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCG
TGGAGGCTGAGGTTGAGCCTAAGGACGAGACTGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGA
CTGAGGGTAAGGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTA
AGGCTGATGTTGAACCGAAGCACGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATG
ATGAGATACTTGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGA
AACTCGTTGAAGCCGAGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACCAAAGAAATATTGTAATG
ATGACTTTAATCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTTTAAG
AACTAAAAAATGTATCCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 3 8

CO CL515Contig1 600 2 2 U
GGCTGCTTCGCTTGAAACAAAACAACGTTCGTCGTCTCCGCGATCTGGAGAAAATCGAAG
GTGGAAAGATGGGTTATATCGGAGAAACCATAGATTCAATCAAATCTATACAGATCCGTC
AGCTTCTCACTCAGGCCATAAGCCTTGGGATGATTGTGACGTCAGCTTTGATCATATGGA
AAGCTTTGATGTGTGTGACTGGAAGTGAATCTCCCGTGGTTGTTGTTCTCTCCGGAAGCA
TGGAACCTGGTTTCAAGAGGGGAGATATATTGTTCTTGCACATGAGTAAGGACCCGATTC
GAGCTGGCGAGATTGTGGTTTTCAATGTTGATGGTCGTGATATTCCAATTGTTCATCGTG
TCATTAAGGTACACGAAAGAGACAATACAGGAGAAGTCGATGTTTTGACAAAAGGTGACA
ATAACTATGGAGATGACAGACTTCTCTATGCTGAAGGTCAGCAATGGCTTCATCGACATC
ATATAATGGGTCGTGCTGTCGGGTTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACTATCATTATGA
CAGAAAAGCCTATCATCAAGTATATTCTCATAGGTGCGTTGGGTTTACTTGTTATAACGT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ19TF U 1
AF RR2D949TF U 3
BS 1 320 RR2DZ19TF
BS 321 600 RR2D949TF

RD RR2DZ19TF 320 0 0
GGCTGCTTCGCTTGAAACAAAACAACGTTCGTCGTCTCCGCGATCTGGAGAAAATCGAAG
GTGGAAAGATGGGTTATATCGGAGAAACCATAGATTCAATCAAATCTATACAGATCCGTC
AGCTTCTCACTCAGGCCATAAGCCTTGGGATGATTGTGACGTCAGCTTTGATCATATGGA
AAGCTTTGATGTGTGTGACTGGAAGTGAATCTCCCGTGGTTGTTGTTCTCTCCGGAAGCA
TGGAACCTGGTTTCAAGAGGGGAGATATATTGTTCTTGCACATGAGTAAGGACCCGATTC
GAGCTGGCGAGATTGTGGTT

QA 1 320 1 320
DS 

RD RR2D949TF 598 0 0
GG
GCTTCGCTTGAAACAAAACAACGTTCGTCGTCTCCGCGATCTGGAGAAAATCGAAGGTGG
AAAGATGGGTTATATCGGAGAAACCATAGATTCAATCAAATCTATACAGATCCGTCAGCT
TCTCACTCAGGCCATAAGCCTTGGGATGATTGTGACGTCAGCTTTGATCATATGGAAAGC
TTTGATGTGTGTGACTGGAAGTGAATCTCCCGTGGTTGTTGTTCTCTCCGGAAGCATGGA
ACCTGGTTTCAAGAGGGGAGATATATTGTTCTTGCACATGAGTAAGGACCCGATTCGAGC
TGGCGAGATTGTGGTTTTCAATGTTGATGGTCGTGATATTCCAATTGTTCATCGTGTCAT
TAAGGTACACGAAAGAGACAATACAGGAGAAGTCGATGTTTTGACAAAAGGTGACAATAA
CTATGGAGATGACAGACTTCTCTATGCTGAAGGTCAGCAATGGCTTCATCGACATCATAT
AATGGGTCGTGCTGTCGGGTTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACTATCATTATGACAGA
AAAGCCTATCATCAAGTATATTCTCATAGGTGCGTTGGGTTTACTTGTTATAACGT

QA 3 598 3 598
DS 



CO CL515Contig2 850 4 18 U
GAGCTGTACTACTGACTCTATTCTTACTTCTACTCAACCCCTTTGTTCATGCACTATTAC
ATTTTGAGGTGGTCAATAACAATAAAAATTAGCTTGTGATTCTACTGTTTAAAGTGGTCT
AAACCACAAAATGACCAAGTCTTTTAAATTGTATTTTCTTCTTAAAACAACATGACCATA
AGGGTG**ACAAAACGAGAGTCCCATGCCTCTCCAAAGAAGTCAATCAATCTTTGGACGT
TATAACGAGTAAAGCCAATGCTCCTATGAGAATGTACTTGATGATAGGCTTTTCTGTCAT
AATGATAGTCACCCATCCAACGTAAGGCAAGAACCCAACCGCACGACCCATTATATGATG
TCGATGAAGCCACTGCTGCCCTTCAGCATAGAGAAGTCTATCATCTCCATAGTTATTGTC
ACCTTTAGTCAAAACATCGACTTCTCCTGTATTCTCCCTTTCGTGAACCTTAATGACACG
ATGTACAATGGGAATATCACGACCATCAACATTGAAAACAACAATCTCTCCTGCTCGAAT
AGGGTCCTTACTCATGTGCAAGAACAGTATATCTCCCCTCTTGAAGCCAGGTTCCATACT
TCCAGAGAGAACAACAACAACAGGAGATTCGCTGCCAGTGACACACATCAAAGCTTTCCA
TATGATCAAAGCAGATGTAACAATCATCCCAAGACTGATGGCCTGAGTGAGATGCTGACG
GATCTGAATTGATTTGATTGAATCTATGGTTTCTCCGATCAAACCCATCTTTTTGCTTTC
TGATTCTCGACGGGATAGTTCAGATAGCAGAGACGAACGTTGTTTCAAGCGAAGCAGAGG
AGAAGAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G785JQ U 200
AF RR2G728JQ U 78
AF RR2EL95JQ U 1
AF RR2G785TF C 127
BS 1 210 RR2EL95JQ
BS 211 211 RR2G785JQ
BS 212 223 RR2EL95JQ
BS 224 224 RR2G785JQ
BS 225 253 RR2EL95JQ
BS 254 254 RR2G785JQ
BS 255 261 RR2EL95JQ
BS 262 262 RR2G785JQ
BS 263 426 RR2EL95JQ
BS 427 427 RR2G785JQ
BS 428 463 RR2EL95JQ
BS 464 464 RR2G728JQ
BS 465 492 RR2EL95JQ
BS 493 493 RR2G785JQ
BS 494 642 RR2EL95JQ
BS 643 643 RR2G785TF
BS 644 710 RR2EL95JQ
BS 711 850 RR2G785TF

RD RR2G785JQ 302 0 0
GTCCCATGCCTCTCCAAAGAAGTCAATCAATCTTTGGACGTTATAACGAGTAAAGCCAAT
GCTCCTATGAGAATGTACTTGATGATAGGCTTTTCTGTCATAATGATAGTCACCCATCCA
ACGTAAGGCAAGAACCCAACCGCACGACCCATTATATGATGTCCATGAAGCCACTGCTGC
CCTTCAGCATAAAGAAGTCTATCATCTCCATAGTTATTGTCACCTTTAGTCAAAACATCG
ACTTCTCCTGTATTCTCCCTTTCGTGAACCTTAATGACACGATGTACAATGGGAATATCA
CG

QA 1 302 1 302
DS 

RD RR2G728JQ 526 0 0
AACAATAAAAATTAGCTTGTGATTCTACTGTTTAAAGTGGTCTAAACCACAAAATGACCA
AGTCTTTTAAATTGTATTTTCTTCTTAAAACAACATGACCATAAGGGTG**ACAAAACGA
GAGTCCCATGCCTTTCCAAAGAAGTCGATCAATCTTTGGACGTTATAACGAGTAAACCCA
ATGCCCCTATGAAAATGTACTTGATGATAGGCTTTTCTGTCATAATGATAGTCACCCATC
CAACGTAAGGCAAGAACCCAACCGCACGACCCATTATATGATGTCGATGAAGCCACTGCT
GCCCTTCAGCATAGAGAAGTCTATCATCTCCATAGTTATTGTCACCTTTTG*CAAAACAT
CGACTTCTC*TGTATTCTCCCTTTCGTGAACCTTAATGACACGATGTACAATGGGGATAT
CACGACCATCAACATTGAAAACAACAACCTCTCCTGCTCGAATAGGGTCCTTACTCATGT
GCAAGAACAGTATATCTCCCCTCTTGAAGCCAGGTTCCACACTTCC

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2EL95JQ 710 0 0
GAGCTGTACTACTGACTCTATTCTTACTTCTACTCAACCCCTTTGTTCATGCACTATTAC
ATTTTGAGGTGGTCAATAACAATAAAAATTAGCTTGTGATTCTACTGTTTAAAGTGGTCT
AAACCACAAAATGACCAAGTCTTTTAAATTGTATTTTCTTCTTAAAACAACATGACCATA
AGGGTG**ACAAAACGAGAGTCCCATGCCTTTCCAAAGAAGTCGATCAATCTTTGGACGT
TATAACGAGTAAACCCAATGCCCCTATGAGAATGTACTTGATGATAGGCTTTTCTGTCAT
AATGATAGTCACCCATCCAACGTAAGGCAAGAACCCAACCGCACGACCCATTATATGATG
TCGATGAAGCCACTGCTGCCCTTCAGCATAGAGAAGTCTATCATCTCCATAGTTATTGTC
ACCTTTTGTCAAAACATCGACTTCTCCTGTATTCTCCCTTTCGCGAACCTTAATGACACG
ATGTACAATGGGGATATCACGACCATCAACATTGAAAACAACAATCTCTCCTGCTCGAAT
AGGGTCCTTACTCATGTGCAAGAACAGTATATCTCCCCTCTTGAAGCCAGGTTCCATACT
TCCAGAGAGAACAACAACAACAGGAGATTCGCTGCCAGTGACGCACATCAAAGCTTTCCA
TATGATCAAAGCAGATGTAACAATCATCCCAAGACTGATGGCCTGAGTGA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2G785TF 724 0 0
CAAAATGACCA*GTCTTTTAAATTGTATTTTCTTCTTAAAACAACATGACCATAAGGGTG
TGACAAAACGAGAGTCCCATGCCTCTCCAAAGAAGTCAATCAATCTTTGGACGTTATAAC
GAGTAAAGCCAATGCTCCTATGAGAATGTACTTGATGATAGGCTTTTCTGTCATAATGAT
AGTCACCCATCCAACGTAAGGCAAGAACCCAACCGCACGACCCATTATATGATGTCGATG
AAGCCACTGCTGCCCTTCAGCATAGAGAAGTCTATCATCTCCATAGTTATTGTCACCTTT
AGTCAAAACATCGACTTCTCCTGTATTCTCCCTTTCGTGAACCTTAATGACACGATGTAC
AATGGGAATATCACGACCATCAACATTGAAAACAACAATCTCTCCTGCTCGAATAGGGTC
CTTACTCATGTGCAAGAACAGTATATCTCCCCTCTTGAAGCCAGGTTCCATACTTCCAGA
GAGAACAACAACCACAGGAGATTCGCTGCCAGTGACACACATCAAAGCTTTCCATATGAT
TAAAGCAGATGTAACAATCATCCCAAGACTGATGGCCTGAGTGAGATGCTGACGGATCTG
AATTGATTTGATTGAATCTATGGTTTCTCCGATCAAACCCATCTTTTTGCTTTCTGATTC
TCGACGGGATAGTTCAGATAGCAGAGACGAACGTTGTTTCAAGCGAAGCAGAGGAGAAGA
AGCC

QA 1 724 1 724
DS 



CO CL515Contig3 701 2 4 U
GGAAGACCTTCCTTGACACCGAGAGAGAGAGTCCCTTCTTCTCCGCCTCTGCTTCGCCTG
CGATCCGAACTATCCCGTCGAGAATCAGAAAGTCAAAAGATGGGTTTGATCGGAGAAACC
ATAGATTCAATCAAATCTATTCAGTTCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCATCAGTCTTGGG
ATGATTGTTACATCTGCTTTGATCATATGGAAAGCTTTGATGTGCGTCACTGGCAGCGAA
TCTCCTGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGTATGGAACCTGGCTTCAAGAGGGGAGATATA
CTGTTCTTGCACATGAGTAAGGACCCTATTCGAGCAGGAGAGATTGTTGTTTTCAATGTT
GATGGTCGTGATATCCCCATTGTACATCGTGTCATTAAGGTTCACGAAAGGGAGAATACA
GGAGAAGTCGATGTTTTGACAAAAGGTGACAATAACTATGGAGATGATAGACTTCTCTAT
GCTGAAGGGCAGCAGTGGCTTCATCGACATCATATAATGGGTCGTGCGGTTGGGTTCTTG
CCTTACGTTGGATGGGTGACTATCATTATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTACATTCTC
ATAGGGGCATTGGGTTTACTCGTTATAACGTCCAAAGATTGATCGACTTCTTTGGAAAGC
ATGGGACTCTCGTTTTGTCACCCTTATGGTCATGTTGTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL95TF U 1
AF RR2G728TF U 1
BS 1 403 RR2EL95TF
BS 404 404 RR2G728TF
BS 405 626 RR2EL95TF
BS 627 701 RR2G728TF

RD RR2EL95TF 626 0 0
GGAAGACCTTCCTTGACACCGAGAGAGAGAGTCCCTTCTTCTCCGCCTCTGCTTCGCCTG
CGATCCGAACTATCCCGTCGAGAATCAGAAAGTCAAAAGATGGGTTTGATCGGAGAAACC
ATAGATTCAATCAAATCTATTCAGTTCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCATCAGTCTTGGG
ATGATTGTTACATCTGCTTTGATCATATGGAAAGCTTTGATGTGCGTCACTGGCAGCGAA
TCTCCTGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGTATGGAACCTGGCTTCAAGAGGGGAGATATA
CTGTTCTTGCACATGAGTAAGGACCCTATTCGAGCAGGAGAGATTGTTGTTTTCAATGTT
GATGGTCGTGATATCCCCATTGTACATCGTGTCATTAAGGTTCGCGAAAGGGAGAATACA
GGAGAAGTCGATGTTTTGACAAAAGGTGACAATAACTATGGAGATGATAGACTTCTCTAT
GCTGAAGGGCAGCAGTGGCTTCATCGACATCATATAATGGGTCGTGCGGTTGGGTTCTTG
CCTTACGTTGGATGGGTGACTATCATTATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTACATTCTC
ATAGGGGCATTGGGTTTACTCGTTAT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2G728TF 701 0 0
GGAAGACCTTCCTTGACACCGAGAGAGAGAGTCCCTTCTTCTCCTCCTCTGCTTCGCCTG
CGATCCGAACTATCCCGTCGAGAATCAGAAAGTCAAAAGATGGGTTTGATCGGAGAAACC
ATAGATTCAATCAAATCTATTCAGTTCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCATCAGTCTTGGG
ATGATTGTTACATCTGCTTTGATCATATGGAAAGCTTTGATGTGCGTCACTGGCAGCGAA
TCTCCTGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGTGTGGAACCTGGCTTCAAGAGGGGAGATATA
CTGTTCTTGCACATGAGTAAGGACCCTATTCGAGCAGGAGAGGTTGTTGTTTTCAATGTT
GATGGTCGTGATATCCCCATTGTACATCGTGTCATTAAGGTTCACGAAAGGGAGAATACA
G*AGAAGTCGATGTTTTG*CAAAAGGTGACAATAACTATGGAGATGATAGACTTCTCTAT
GCTGAAGGGCAGCAGTGGCTTCATCGACATCATATAATGGGTCGTGCGGTTGGGTTCTTG
CCTTACGTTGGATGGGTGACTATCATTATGACAGAAA*GCCTATCATCAAGTACATTCTC
ATAGGGGCATTGGGTTTACTCGTTATAACGTCCAAAGATTGATCGACTTCTTTGGAAAGC
ATGGGACTCTCGTTTTGTCACCCTTATGGTCATGTTGTTTT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 2 7

CO CL516Contig1 861 5 7 U
GGTCGAAGTGAAATACATATAACAACTATGCAGAGGAATGTGGTTAAGATAATACATGGA
AACACATAGAAACATTGTAAGGAACAAACAAATCACAGAGTCTGAAACACACACAGACAC
AAAGAGAGGAACAAAGAAAAAGGAGAGGGAGACAGTGTTGGTGGAATCAAACACAAGAGA
AGAGGTTCAATTGTTTTTTTT*GAAGACAAATGCTACAAAGAAAAGACTATTTACTTAGT
CAGCAGTCCAGCTTTGTTCCACAACCTCGCGGACTCTTCTGTTGTACTCTCGTTTGCTTT
CGCTGAACATTCGCGCAGCTTCCGAGTTCGCAGGAGAATTCGGATTAGGATCACAGAGCA
ATGACTGGATGGAGGTAAGAATAGCAGCGACATCATATATAGGACTCCACTGGTTTTGGA
GAATGTCCAAGCATATGCTCCCATCAGCATATATGTTAGGATGGAACATCCGTGAAACAA
ACCGAACAGTAGGTGGTTTGTTTGGATAATCTTCTGAAAACTGCAATGAGAGTTTGAAAG
TACCTCCATCCCAGGGGGTATCATCAGGCCCGAAAATAACAGCATTCCAGAGCATGATGT
TGTTGTCTTGAGGAGCACCGCTGATTCCAGCAGGTGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAGT
CCCTCATCAATCTCTTCCTCGCTGGTGTCGACATCCTTTCTCTTTCACTCTATATTGTTG
AGCGAAAAAAAGGGTAAAGATCGGTGGAGGTTCGTCGTCAAGCGAGCATCTTTCCTTGCG
GCGAGGTAAAGGACTGACCTTTAAGCGACGATGATAACCACCTGATAGATGAGAGGAGAG
TCTCCGATCGGTGATCTTTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 0 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
15 30 30 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL74JQ U 1
AF RR2CD23JQ U 1
AF RR2A753JQ U 40
AF RR2CD23TF C 61
AF RR2BL74TF C 81
BS 1 591 RR2BL74JQ
BS 592 592 RR2CD23JQ
BS 593 724 RR2BL74JQ
BS 725 730 RR2CD23TF
BS 731 731 RR2BL74TF
BS 732 844 RR2CD23TF
BS 845 861 RR2BL74TF

RD RR2BL74JQ 724 0 0
GGTCGAAGTGAAATACATATAACAACTATGCAGAGGAATGTGGTTAAGATAATACATGGA
AACACATAGAAACATTGTAAGGAACAAACAAATCACAGAGTCTGAAACACACACAGACAC
AAAGAGAGGAACAAAGAAAAAGGAGAGGGAGACAGTGTTGGTGGAATCAAACACAAGAGA
AGAGGTTCAATTGTTTTTTTT*GAAGACAAATGCTACAAAGAAAAGACTATTTACTTAGT
CAGCAGTCCAGCTTTGTTCCACAACCTCGCGGACTCTTCTGTTGTACTCTCGTTTGCTTT
CGCTGAACATTCGCGCAGCTTCCGAGTTCGCAGGAGAATTCGGATTAGGATCACAGAGCA
ATGACTGGATGGAGGTAAGAATAGCAGCGACATCATATATAGGACTCCACTGGTTTTGGA
GAATGTCCAAGCATATGCTCCCATCAGCATATATGTTAGGATGGAACATCCGTGAAACAA
ACCGAACAGTAGGTGGTTTGTTTGGATAATCTTCTGAAAACTGCAATGAGAGTTTGAAAG
TACCTCCATCCCAGGGGGTATCATCAGGCCCGAAAATAACAGCATTCCAGAACATGATGT
TGTTGTCTTGAGGAGCACCGCTGATTCCAGCAGGTGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAGT
CCCTCATCAATCTCTTCCTCGCTGGTGTCGACATCCTTTCTCTTTCACTCTATATTGTTG
AGCG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2CD23JQ 721 0 0
GA
TCGAAGTGAAATACATATAACAACTATGCAGAGGAATGTGGTTAAGATAATACATGGAAA
CACATAGAAACATTGTAAGGAACAAACAAATCACAGAGTCTGAAACACACACAGACACAA
AGAGAGGAACAAAAAAAAAGGAGAGGGAGACAGTGTTGGTGGAATCAAACACAAGAGAAG
AGGTTCAATTGTTTTTTTT*GAAGACAAATGCTACAAAGAAAAGACTATTTACTTAGTCA
GCAGTCCAGCTTTGTTCCACAACCTCGCGGACTCTTCTGTTGTACTCTCGTTTGCTTTCG
CTGAACATTCGCGCAGCTTCCGAGTTCGCAGGAGAATTCGGATTAGGATCACAGAGCAAT
GACTGGATGGAGGTAAGAATAGCAGCGACATCATATATAGGACTCCACTGGTTTTGGAGA
ATGTCCAAGCATATGCTCCCATCAGCATATATGTTAGGATGGAACATCCGTGAAACAAAC
AGAACAGTAGGTGGTTTGTTTGGATAATCTTCTGAAAACTGCAATGAGAGTTTGAAAGTA
CCTCCATCCCAGGGGGTATCATCAGGCCCGAAAATAACAGCACTCCAGAGCATGATGTTG
TTGTCTTGAGGAGCACCGCTGATTCCAGCAGGTGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAGTCC
CTCATCAATCTCTTCCTCGCTGGTGTCGACATCCTTTCTCTTTCACTCTATATTGTTGA

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR2A753JQ 685 0 0
GTGGTTAAGATAATACATGGAAACACATAGAAACATTGTAAGGAACAAACAAATCACAGA
GTCTGAAACACACACAGACACAAAGAGAGGAACAAAAAAAAAGGAGAGGGAGACAGTGTT
GGTGGAATCAAACACAAGAGAAGAGGTTCAATTGTTTTTTTTTGAAGACAAATGCTACAA
AGAAAAGACTATTTACTTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGTTCCACAACCTCCCGGACTCTTC
TGTTGTACTCTCGTTTGCTTTCGCTGAACATTCGTGCAGCTTCCGAGTTGGCAGGAGAGT
TCGGATTAGGATCACAGAGCAATGACTGGATGGAGGTAAGTATAGCAGCGACATCATATA
TAGGACTCCACTGGTTTTGGAGAATGTCTAAGCATATACTCCCATCAGCATATATGTTAG
GATGGAACATCCGTGAAACAAACCGAACAGTAGGTGGTTTGTTTGGATAATCTTCTGAAA
ACTGCAGTGAGAGTTTGAAAGTACCTCCATCCCATGGGGTATCATCAGGCCCAAAAATAA
CAGCATTCCAGAACATGATGTTGTTGTCTTGAGGAGCACCGCTGATTCCAGCAGGTGGGT
CTTGCTGCAACCTCTTGAAGTCCCTCATCAATCTCTTCCTCGCTGGTGTCGACATCCTTT
CTCTTTCACTCTATATTGTTGAGCG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2CD23TF 791 0 0
AACACATAGAAACATTGTAGGGA*CAAACAAATCACAGAGTCTGAAACACACACAGACAC
AAAGAGAGGA*CAAA*AAAAAGGAGAGGGAGACAGTGTTGGTGGAATCAAACACAAGAGA
AGAGGTTCAATTGTTTTTTT**GAAGACAAATGCTACAAAGAAAAGACTATTTACTTAGT
CAGCAGTCCAGCTTTGTTCCACAACCTCGCGGACTCTTCTGTTGTACTCTCGTTTGCTTT
CGCTGAACATTCGCGCAGCTTCCGAGTTCGCAGGAGAATTCGGATTAGGATCACAGAGCA
ATGACTGGATGGAGGTAAGAATAGCAGCGACATCATATATAGGACTCCACTGGTTTTGGA
GAATGTCCAAGCATATGCTCCCATCAGCATATATGTTAGGATGGAACATCCGTGAAACAA
ACAGAACAGTAGGTGGTTTGTTTGGATAATCTTCTGAAAACTGCAATGAGAGTTTGAAAG
TACCTCCATCCCAGGGGGTATCATCAGGCCCGAAAATAACAGCACTCCAGAGCATGATGT
TGTTGTCTTGAGGAGCACCGCTGATTCCAGCAGGTGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAGT
CCCTCATCAATCTCTTCCTCGCTGGTGTCGACATCCTTTCTCTTTCACTCTATATTGTTG
AACGAAAAAA*GGGTAAAGATCGGTGGAGGTTCGTCGTCAAGCGAGCATCTTTCCTTGCG
GCGAGGTAAAGGACTGACCTTTAAGCGACGATGATAACCACCTGATAGATGAGAGGAGAG
TCTC
CGATCCC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2BL74TF 781 0 0
GGAACAAACAAATCACAGAGTCTGAAACACACACAGACACAAAGAGAGGA*CAAAGAAAA
*GGAGAGGGAGACAGTGTTGGTGGAATCAAACACAAGAGAAGAGGTTCAATTGTTTTTTT
**GAAGACAAATGCTACAAAGAAAAGACTATTTACTTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGTTCC
ACAACCTCGCGGACTCTTCTGTTGTACTCTCGTTTGCTTTCGCTGAACATTCGCGCAGCT
TCCGAGTTCGCAGGAGAATTCGGATTAGGATCACAGAGCAATGACTGGATGGAGGTAAGA
ATAGCAGCGACATCATATATAGGACTCCACTGGTTTTGGAGAATGTCCAAGCATATGCTC
CCATCAGCATATATGTTAGGATGGAACATCCGTGAAACAAACCGAACAGTAGGTGGTTTG
TTTGGATAATCTTCTGAAAACTGCAATGAGAGTTTGAAAGTACCTCCATCCCAGGGGGTA
TCATCAGGCCCGAAAATAACAGCATTCCAGAGCATGATGTTGTTGTCTTGAGGAGCACCG
CTGATTCCAGCAGGTGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAGTCCCTCATCAATCTCTTCCTC
GCTGGTGTCGACATCCTTTCTCTTTCACTCTATATTGTTGAGCGAAAAAAAGGGTAAAGA
TCGGTGGAGGTTCGTCGTCAAGCGAGCATCTTTCCTTGCGGCGAGGTAAAGGACTGACCT
TTAAGCGACGATGATAACCACCTGATAGATGAGAGGAGAGTCTCCGATCGGTGATCTTTC
C

QA 1 781 1 781
DS 



CO CL516Contig2 828 2 2 U
GGACACTGCGTGGCACGGTGAATTCGAGGATCGAGGAGCTTGAAATCGTTCGGACACATT
TCTGTCGTCATCATCGTCGCTTAAAGTTCCGACCTTTCGTCGCCAGAAGGAAAGATGCTC
GCTTGACGTCGATCTCCACCGTTCTGCCTCTATCTTTTACCCTTTTTTTGAGCTCAACAC
GTCAGTCAGATAATATTTTTTGGTGCTTGGTGGGTTTTGATAAAGAGTAAGAAGGAAGGA
GATGTCGACACCAGCGAGGAAGAGATTGATGAGGGATTTCAAGAGGTTGCAGCAAGACCC
ACCTGCTGGAATCAGCGGTGCTCCTCAAGACAATAACATCATGCTCTGGAATGCTGTTAT
ATTCGGGCCTGATGATACCCCTTGGGATGGAGGTACTTTCAAACTCTCACTGCAGTTTTC
AGAAGATTATCCAAACAAACCACCAACGGTTCGGTTTGTTTCAAGGATGTTCCATCCTAA
TATATATGCTGATGGGAGTATATGCTTGGACATTCTCCAAAACCAGTGGAGTCCAATTTA
TGATGTCGCTGCTATCCTTACCTCCATCCAGTCATTACTCTGTGATCCTAATCCGAATTC
CCCTGCCGACTCGGAAGCTGCACGAATGTTCAGCGAAAGCAAACGTGAGTACAACAGAAG
AGTCCGCGAGGTTGTGGAACAAAGCTGGACTGCAGACTAGTAATAATAATAGTATTTGTC
TTTTATTGTCATTTAACCTTCCTCTCTTGTTTTTTCATTCCGCAACACTTCGTTTCCTTT
CTCGTCTTTGTATGTTTTTTTCCTTTCAAACTATGTGATTTGTTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS02TF U 1
AF RR2FS02JQ C 129
BS 1 741 RR2FS02TF
BS 742 828 RR2FS02JQ

RD RR2FS02TF 750 0 0
GGACACTGCGTGGCACGGTGAATTCGAGGATCGAGGAGCTTGAAATCGTTCGGACACATT
TCTGTCGTCATCATCGTCGCTTAAAGTTCCGACCTTTCGTCGCCAGAAGGAAAGATGCTC
GCTTGACGTCGATCTCCACCGTTCTGCCTCTATCTTTTACCCTTTTTTTGAGCTCAACAC
GTCAGTCAGATAATATTTTTTGGTGCTTGGTGGGTTTTGATAAAGAGTAAGAAGGAAGGA
GATGTCGACACCAGCGAGGAAGAGATTGATGAGGGATTTCAAGAGGTTGCAGCAAGACCC
ACCTGCTGGAATCAGCGGTGCTCCTCAAGACAATAACATCATGCTCTGGAATGCTGTTAT
ATTCGGGCCTGATGATACCCCTTGGGATGGAGGTACTTTCAAACTCTCACTGCAGTTTTC
AGAAGATTATCCAAACAAACCACCAACGGTTCGGTTTGTTTCAAGGATGTTCCATCCTAA
TATATATGCTGATGGGAGTATATGCTTGGACATTCTCCAAAACCAGTGGAGTCCAATTTA
TGATGTCGCTGCTATCCTTACCTCCATCCAGTCATTACTCTGTGATCCTAATCCGAATTC
CCCTGCCGACTCGGAAGCTGCACGAATGTTCAGCGAAAGCAAACGTGAGTACAACAGAAG
AGTCCGCGAGGTTGTGGAACAAAGCTGGACTGCAGACTAGTAATAATAATAGTATTTGTC
TTTTATTGTCATTTAACCTTC
CTCTCTTGT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2FS02JQ 700 0 0
TCGATCTCCACCGTTCTGCCTCTATCTTTTACCCTTTTTTTGAGCTCAACACGTCAGTCA
GATAATATTTTTTGGTGCTTGGTGGGTTTTGATAAAGAGTAAGAAGGAAGGAGATGTCGA
CACCAGCGAGGAAGAGATTGATGAGGGATTTCAAGAGGTTGCAGCAAGACCCACCTGCTG
GAATCAGCGGTGCTCCTCAAGACAATAACATCATGCTCTGGAATGCTGTTATATTCGGGC
CTGATGATACCCCTTGGGATGGAGGTACTTTCAAACTCTCACTGCAGTTTTCAGAAGATT
ATCCAAACAAACCACCAACGGTTCGGTTTGTTTCAAGGATGTTCCATCCTAATATATATG
CTGATGGGAGTATATGCTTGGACATTCTCCAAAACCAGTGGAGTCCAATTTATGATGTCG
CTGCTATCCTTACCTCCATCCAGTCATTACTCTGTGATCCTAATCCGAATTCCCCTGCCG
ACTCGGAAGCTGCACGAATGTTCAGCGAAAGCAAACGTGAGTACAACAGAAGAGTCCGCG
AGGTTGTGGAACAAAGCTGGACTGCAGACTAGTAATAATAATAGTATTTGTCTTTTATTG
TCATTTAACCTTCCTCTCTTGTTTTTTCATTCCGCAACACTTCGTTTCCTTTCTCGTCTT
TGTATGTTTTTTTCCTTTCAAACTATGTGATTTGTTGCTC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 2 11

CO CL517Contig1 1071 7 24 U
GGGACTAATCTCGAAATCAAAATAGAGAGAGCATCCATTGTTTGTTTCAGATAGAGAAAC
AGAGAGAGGAGAAAGAAGGCATGGAGACTGAGAGGGAAAAGCAGGTTTACTCGGCGAAGC
TCTCCGAGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCAATGAAGAAAGTAGCTGAGA
TGGATGTGGAGCTCACGGTAGAGGAGAGGAACCTGGTATCTGTGGGTTACAAGAACGTCA
TTGGCGCAAGGAGAGCTTCGTGGAGGATACTATCCTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGTCCA
AGGGGAACGAGGAGAACGTCAAGAGGATTCAGACTTACCGAAAGAGGGTTGAAGATGAGC
TTGCCAAAGTTTGTAATGACATCTTGTCTGTCATTGACAAGCACCTCATCCCTTCCTCTA
CCGCTGTTGAGTCCACTGTCTTTTTCTACAAAATGAAAGGAGATTACTATCGCTATCTGG
CAGAGTTCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAGTCTCTTGAAGCATACA
AGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCTACACATCCAGTTAGACTTGGCT
TGGCTTTGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTTAAACTCTCCTGAAAGCGCATGCC
AATTGGCTAAGCAAGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAGCCTCAACGAGGAGT
CATACAAGGACAGCACTCTTATCATGCAGCTTCTTAGAGACAATCTCACCCTGTGGACTT
CTGACCTCCCGGAGGAAGGAGAAGAGAAATCCAAAGGTGATGAGCCGAAAGAAGAGAACT
GAATCCTGTGTGTGAAGAGAAACGACCTTTGATGCATGCGAAGACAGCAAGTGTCGTTGC
TCGAAAAAATGTGTATTTTTTTTTATTTTATCGTCTTTCTTTATCATGTTTTTCAGATAT
TTGACGTTCTACAACATAGTAGTACTACTACATAACTTCGAATGCTTGATGTCATACACT
TAGTTTGCTTTGTTGTTGTTGAATTGAGACCATGCATTTTGGGTTTTGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 0 25 0 
35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D133TF U 1
AF RR2D393TF U 2
AF RR2AH20TF U 2
AF RR2FE18TF U 5
AF RR2AH20JQ C 57
AF RR2D133JQ C 296
AF RR2FE18JQ C 458
BS 1 51 RR2D133TF
BS 52 53 RR2AH20TF
BS 54 57 RR2D133TF
BS 58 58 RR2AH20TF
BS 59 65 RR2D133TF
BS 66 66 RR2AH20TF
BS 67 208 RR2D133TF
BS 209 209 RR2AH20TF
BS 210 214 RR2D133TF
BS 215 215 RR2AH20TF
BS 216 250 RR2D133TF
BS 251 251 RR2AH20TF
BS 252 466 RR2D133TF
BS 467 467 RR2AH20TF
BS 468 577 RR2D133TF
BS 578 578 RR2AH20TF
BS 579 695 RR2D133TF
BS 696 728 RR2AH20TF
BS 729 729 RR2AH20JQ
BS 730 792 RR2AH20TF
BS 793 793 RR2FE18TF
BS 794 1028 RR2AH20JQ
BS 1029 1038 RR2D133JQ
BS 1039 1071 RR2FE18JQ

RD RR2D133TF 695 0 0
GGGACTAATCTCGAAATCAAAATAGAGAGAGCATCCATTGTTTGTTTCAGA**GAGAGAC
AGAGAAAGGAGAAAGAAGGCATGGAGACTGAGAGGGAAAAGCAGGTTTACTCGGCGAAGC
TCTCCGAGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCAATGAAGAAAGTAGCTGAGA
TGGATGTGGAGCTCACGGTAGAGGAGAGAAACCTCGTATCTGTGGGTTACAAGAACGTCA
TTGGCGCAAGAAGAGCTTCGTGGAGGATACTATCCTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGTCCA
AGGGGAACGAGGAGAACGTCAAGAGGATTCAGACTTACCGAAAGAGGGTTGAAGATGAGC
TTGCCAAAGTTTGTAATGACATCTTGTCTGTCATTGACAAGCACCTCATCCCTTCCTCTA
CCGCTGTTGAGTCCACTGTCTTTTTCTACAAAATGAAAGGAGATTATTATCGCTATCTGG
CAGAGTTCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAGTCTCTTGAAGCATACA
AGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCCACACATCCAGTTAGACTTGGCT
TGGCTTTGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTTAAACTCTCCTGAAAGCGCATGCC
AATTGGCTAAGCAAGCATTTGACGATGCAATCGCT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2D393TF 717 0 0
GGACT
AATCTCGAAATCAAAATAGAGAGAGCATCCATTGTTTGTTTCAGA**GAGAGACAGAGAA
AGGAGAAAGAAGGCATGGAGACTGAGAGGGAAAAGCAGGTTTACTCGGCGAAGCTCTCCG
AGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCAGTGAAGAAAGTAGCTGAGATGGATG
TGGAGCTCACGGTAGAGGAGAGAAACCTCGTATCCGTGGGTTACGAGAACGTCATTGGCG
CAAGAAGAGCTTCGTGGAGGATACTATCCTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGTCCAAGGGGA
ACGAGGAGAACGTCAAGAGGATTCAGACTTACCGAAAGAGGGTTGAAGATGAGCTTGCCA
AGGTTTGTAATGACATCTTGTCTGTCATTGACAAGCACCTCATCCCTTCCTCTACCGCTG
TTGAGTCCACTGTCTTTTTCTACAAAATGAAAGGAGATTATTATCGCTATCTGGCAGAGT
TCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAGTCTCTTGAAGCATACAAGGCTG
CTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCCACACATCCAGTTAGACTTGGCTTGGCTT
TGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTTAAACTCTCCTGAAAGCGCATGCCAATTGG
CTAAGCAAGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAGCCTCAACGAGGA

QA 6 717 6 717
DS 

RD RR2AH20TF 791 0 0
GGACT
AATCTCGAAATCAAAATAGAGAGAGCATCCATTGGTTGGTTCAGATAGAGAAAGAGAGAG
AGGAGAAAGAAGGCATGGAGACTGAGAGGGAAAAGCAGGTTTACTCGGCGAAGCTCTCCG
AGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCAATGAAGAAAGTAGCTGAGATGGATG
TGGAGCTCACGGTAGAGGAGAGGAACCTGGTATCTGTGGGTTACAAGAACGTCATTGGCG
CAAGGAGAGCTTCGTGGAGGATACTATCCTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGTCCAAGGGGA
ACGAGGAGAATGTCAAGAGGATTCAGACTTACCGAAAGAGGGTTGAAGATGAGCTTGCCA
AAGTTTGTAATGACATCTTGTCTGTCATTGACAAGCACCTCATCCCTTCCTCTACCGCTG
TTGAGTCCACTGTCTTTTTCTACAAAATGAAAGGAGATTACTATCGCTATCTGGCAGAGT
TCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAGTCTCTTGAAGCATACAAGGCTG
CTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCTACACATCCAGTTAGACTTGGCTTGGCTT
TGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTTAAACTCTCCTGAAAGCGCATGCCAATTGG
CTAAGCAAGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAGCCTCAACGAGGAGTCATACA
AG*ACAGCACTCTTATCATGCAGCTTCTTAGAGACAATCTCACCCTGTGGACTTCTGACC
TCCCGG

QA 6 791 6 791
DS 

RD RR2FE18TF 789 0 0
GG
AATCTCGAAATCAAAATAGAGAGAGCATCCATTGTTTGTTTCAGATAGAGAAAGAGAGAG
AGGAGAAAGAAGGCATGGAGACTGAGAGGGAAAAGCAGGTTTACTCGGCGAAGCTCTCCG
AGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCAATGAAGAAAGTAGCTGAGATGGATG
TGGAGCTCACGGTAGAGGAGAGGAACCTGGTATCTGTGGGTTACAAGAACGTCATTGGCG
CAAGGAGAGCTTCGTGGAGGATACTATCCTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGTCCAAGGGGA
ACGAGGAGAATGTCAAGAGGATTCAGACTTACCGAAAGAGGGTTGAAGATGAGCTTGCCA
AAGTTTGTAATGACATCTTGTCTGTCATTGACAAGCACCTCATCCCTTCCTCTACCGCTG
TTGAGTCCACTGTCTTTTTCTACAAAATGAAAGGAGATTACTATCGCTATCTGGCAGAGT
TCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAGTCTCTTGAAGCATACAAGGCTG
CTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCTACACATCCAGTTAGACTTGGCTTGGCTT
TGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTTAAACTCTCCTGAAAGCGCATGCCAATTGG
CTAAGCAAGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAGCCTCAACGAGGAGTCATACA
AG*ACAGCACTCTTATCATGCAGCTTCTTAGAGACA*TCTCACCCTGTGGACTTCTGACC
TCCCGGA

QA 3 789 3 789
DS 

RD RR2AH20JQ 973 0 0
AAAG
AGAGAGAGGAGAAAGAAGGCATGGAGACTGAGAGGGAAAAGCAGGTTTACTCGGCGAAGC
TCTCCGAGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCAATGAAGAAAGTAGCTGAGA
TGGATGTGGAGCTCACGGTAGAGGAGAGGAACCTGGTATCTGTGGGTTACAAGAACGTCA
TTGGCGCAAGGAGAGCTTCGTGGAGGATACTATCCTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGTCCA
AGGGGAACGAGGAGAATGTCAAGAGGATTCAGACTTACCGAAAGAGGGTTGAAGATGAGC
TTGCCAAAGTTTGTAATGACATCTTGTCTGTCATTGACAAGCACCTCATCCCTTCCTCTA
CCGCTGTTGAGTCCACTGTCTTTTTCTACAAAATGAAAGGAGATTACTATCGCTATCTGG
CAGAGTTCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAGTCTCTTGAAGCATACA
AGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCTACACATCCAGTTAGACTTGGCT
TGGCTTTGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTTAAACTCTCCTGAAAGCGCATGCC
AATTGGCTAAGCAAGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAGCCTCAACGAGGAGT
CATACAAGGACAGCACTCTTATCATGCAGCTTCTTAGAGACAATCTCACCCTGTGGACTT
CTGACCTCCCGGAGGAAGGAGAAGAGAAATCCAAAGGTGATGAGCCGAAAGAAGAGAACT
GAATCCTGTGTGTGAAGAGAAACGACCTTTGATGCATGCGAAGACAGCAAGTGTCGTTGC
TCGAAAAAATGTGTATTTTTTTTTATTTTATCGTCTTTCTTTATCATGTTTTTCAGATAT
TTGACGTTCTACAACATAGTAGTACTACTACATAACTTCGAATGCTTGATGTCATACACT
TAGTTTGC
C

QA 5 972 5 972
DS 

RD RR2D133JQ 743 0 0
GTCCAAGGGGAACGAGGAGAACGTCAAGAGGATTCAGACTTACCGAAAGAGGGTTGAAGA
TGAGCTTGCCAAAGTTTGTAATGACATCTTGTCTGTCATTGACAAGCACCTCATCCCTTC
CTCTACCGCTGTTGAGTCCACTGTCTTTTTCTACAAAATGAAAGGAGATTATTATCGCTA
TCTGGCAGAGTTCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAGTCTCTTGAAGC
ATACAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCCACACATCCAGTTAGACT
TGGCTTGGCTTTGAACTTTTCTGTTTTTTACTACGAGATCTTAAACTCTCCTGAAAGCGC
ATGCCAATTGGCTAAGCAAGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAGCCTCAACGA
GGAGTCATACAAGGACAGCACTCTTATCATGCAGCTACTTAGAGACAATCTCACCCTGTG
GACTTCTGACCTCCCGGAGGAAGGAGAAGAGAAATCCAAAGGTGATGAGCCGAAAGAAGA
GAACTGAATCCTCTGTGTTAAGAGAAACGACCTTTGATGCATCCGAAGACAGCAAGTGTC
GTTGCTCGGAAAA*TGTGTATTTTTTTTTATTTTATCGTCTTTCTTTATCATGTTTTTCA
GATATTTGACGTTCTACAACATACTA***CTACTGCATAACTTCGAATGCTTGATGTCAT
ACACTTAGTTTGCTTTGTTGTTG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2FE18JQ 614 0 0
AGGAGATTACTATCGCTATCTGGCAGAGTTCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGC
AGATCAGTCTCTTGAAGCATACAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACC
TACACATCCAGTTAGACTTGGCTTGGCTTTGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTT
AAACTCTCCTGAAAGCGCATGCCAATTGGCTAAGCAAGCATTTGACGATGCAATCGCTGA
ACTTGACAGCCTCAACGAGGAGTCATACAAGGACAGCACTCTTATCATGCAGCTTTTTAG
AGACAATCTCACCCTGTGGACTTCTGACCTCCCGGAGGAAGGAGAAGAGAAATCCAAAGG
TGATGAGCCGAAAGAAGAGAACTGAATCCTGTGTGTGAAGAGAAACGACCTTTGATGCAT
GCGAAGACAGCAAGTGTCGTTGCTCGAAAAAATGTGTATTTTTTTTTATTTTATCGTCTT
TCTTTATCATGTTTTTCAGATATTTGACGTTCTACAACATAGTAGTACTACTACATAACT
TCGAATGCTTGATGTCATACACTTAGTTTGCTTTGTTGTTGTTGAATTGAGACCATGCAT
TTTGGGTTTTGCAC

QA 1 614 1 614
DS 



CO CL517Contig2 740 4 3 U
GGACTAATCTCGAAATCAAAATAGAGAGAGTATCCATTGTTTGTTTCAGAGAGAGACAGA
GAAAGGAGAAAGAAGGCATGGAGACTGAGAGGGAAAAGCAGGTTTACTCGGCGAAGCTCT
CCGAGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCAATGAAAGGAGATTATTATCGCT
ATCTGGCAGAGTTCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAGTCTCTTGAAG
CATACAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCCACACATCCAGTTAGAC
TTTGCTTGGCTTTGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTTAAACTCTCCTGAAAGCG
CATGCCAATTGGCTAAGCAGGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAGCCTCAACG
AGGAGTCATACAAGGACAGCACTCTTATCATGCAGCTACTTAGAGACAATCTCACCCTGT
GGACTTCTGACCTCCCGGAGGAAGGAGAAGAGAAATCCAAAGGTGATGAGCCGAAAGAAG
AGAACTGAATCCTCTGTGTTAAGAGAAACGACCTTTGATGCATCCGAAGACAGCAAGTGT
CGTTGCTCGGAAAATGTGTATTTTTTTTTATTTTATCGTCTTTCTTTATCATGTTTTTCA
GATATTTGACGTTCTACAACATACTACTACTGCATAACTTCGAATGCTTGATGTCATACA
CTTAGTTTGCTTTGTTGTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GV51TF U 1
AF RR2H825TF U 1
AF RR2H825JQ C 118
AF RR2GV51JQB C 351
BS 1 628 RR2GV51TF
BS 629 655 RR2H825TF
BS 656 740 RR2H825JQ

RD RR2GV51TF 628 0 0
GGACTAATCTCGAAATCAAAATAGAGAGAGTATCCATTGTTTGTTTCAGAGAGAGACAGA
GAAAGGAGAAAGAAGGCATGGAGACTGAGAGGGAAAAGCAGGTTTACTCGGCGAAGCTCT
CCGAGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCAATGAAAGGAGATTATTATCGCT
ATCTGGCAGAGTTCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAGTCTCTTGAAG
CATACAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCCACACATCCAGTTAGAC
TTTGCTTGGCTTTGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTTAAACTCTCCTGAAAGCG
CATGCCAATTGGCTAAGCAGGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAGCCTCAACG
AGGAGTCATACAAGGACAGCACTCTTATCATGCAGCTACTTAGAGACAATCTCACCCTGT
GGACTTCTGACCTCCCGGAGGAAGGAGAAGAGAAATCCAAAGGTGATGAGCCGAAAGAAG
AGAACTGAATCCTCTGTGTTAAGAGAAACGACCTTTGATGCATCCGAAGACAGCAAGTGT
CGTTGCTCGGAAAATGTGTATTTTTTTT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2H825TF 655 0 0
GGACTAATCTCGAAATCAAAATAGAGAGAGTATCCATTGTTTGTTTCAGAGAGAGACAGA
GAAAGGAGAAAGAAGGCATGGAGACTGAGAGGGAAAAGCAGGTTTACTCGGCGAAGCTCT
CCGAGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCAATGAAAGGAGATTATTATCGCT
ATCTGGCAGAGTTCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAGTCTCTTGAAG
CATACAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCCACACATCCAGTTAGAC
TTTGCTTGGCTTTGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTTAAACTCTCCTGAAAGCG
CATGCCAATTGGCTAAGCAGGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAGCCTCAACG
AGGAGTCATACAAGGACAGCACTCTTATCATGCAGCTACTTAGAGACAATCTCACCCTGT
GGACTTCTGACCTCCCGGAGGAAGGAGAAGAGAAATCCAAAGGTGATGAGCCGAAAGAAG
AGAACTGAATCCTCTGTGTTAAGAGAAACGACCTTTGATGCATCCGAAGACAGCAAGTGT
CGTTGCTCGGAAAATGTGTATTTTTTTTTATTTTATCGTCTTTCTTTATCATGTT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2H825JQ 623 0 0
TCTCCGAGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCAATGAAAGGAGATTATTATC
GCTATCTGGCAGAGTTCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAGTCTCTTG
AAGCATACAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCCACACATCCAGTTA
GACTTTGCTTGGCTTTGAACTTTTCTGTTTTTTACTACGAGATCTTAAACTCTCCTGAAA
GCGCATGCCAATTGGCTAAGCAGGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAGCCTCA
ACGAGGAGTCATACAAGGACAGCACTCTTATCATGCAGCTACTTAGAGACAATCTCACCC
TGTGGACTTCTGACCTCCCGGAGGAAGGAGAAGAGAAATCCAAAGGTGATGAGCCGAAAG
AAGAGAACTGAATCCTCTGTGTTAAGAGAAACGACCTTTGATGCATCCGAAGACAGCAAG
TGTCGTTGCTCGGAAAATGTGTATTTTTTTTTATTTTATCGTCTTTCTTTATCATGTTTT
TCAGATATTTGACGTTCTACAACATACTACTACTGCATAACTTCGAATGCTTGATGTCAT
ACACTTAGTTTGCTTTGTTGTTG

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2GV51JQB 390 0 0
CCTGAAAGCGCATGCCAATTGGCTAAGCAGGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGAC
AGCCTCAACGAGGAGTCATACAAGGACAGCACTCTTATCATGCAGCTACTTAGAGACAAT
CTCACCCTGTGGACTTCTGACCTCCCGGAGGAAGGAGAAGAGAAATCCAAAGGTGATGAG
CCGAAAGAAGAGAACTGAATCCTCTGTGTTAAGAGAAACGACCTTTGATGCATCCGAAGA
CAGCAAGTGTCGTTGCTCGGAAAATGTGTATTTTTTTTTATTTTATCGTCTTTCTTTATC
ATGTTTTTCAGATATTTGACGTTTTACAACATACTACTACTGCATAACTTCGAATGCTTG
ATGTCATACACTTAGTTTGCTTTGTTGTTG

QA 1 390 1 390
DS 



AS 1 9

CO CL518Contig1 1945 9 18 U
GGAGAAAACAAAAACAAAAAGAGGATAAACATAAAAAGAAGCTACAAAAAAAGATAATAA
GTATCAATAAGGTAAACTACAATAAAAATGGTGGGCATGCGTAGACCAAAGGCGTTGTTT
GTTGTACTACTAGTAGTTTTGGCCATCTCAATAGCAAAGGCTGCCAAGGATCTCAAAGAA
AAAGATGCTGGAGTCCCAAGAAACTTAAGTGAAGACGATAATCCTAAAAAAGATGGAAAA
GATGCAAAAGATGCAAAAGATGCAAAAGATGGAAAGGATGGAAAAGATGCAAAAGATGCA
AAAGATGGAAAAGATTCAAAAGATGCAAAAGATGGAAAAGATGCAAAAGATGGAAAAGAT
TCAAAAGATGCAAAAGATGAAAAAGATGCATCTATCGGTTCCAAAATAAAAGACAAAGTC
AAAGGAGCTGCTGCGTCGGTTGCATCAGCTGCATCTAACGCATCTTCTGCCTCAGCTGCA
TCTGTCGCTTCTGCTGCCTCGGCTGCATCAGGTAAAATCAAAGGAGCTGTTGCACCTATT
GGTGATAAGTTGGGAATCAAAGGAGGCGCGCCAAGCGGTCCATCAATGGATGTTAAAGCA
AGTGGAGCTAAAGGAGATGGCAAAACTGATGACAGTGCGGCATTTATGGATGTATGGAAA
AAAGCAATTGCAGCAACAACACCAACAACGATTTTAGTGCCAAAGGGTGACTACTTGGTG
GAAACCTTAGAACTCGAAGGTCCAAGCAAAAGTGCCATCACTTTCGAAATGCAAGGCAAT
CTTAAGGCTCCATCTGCTGTCACTACCCGAAAACCGCATAGTGGATGGGTTAATTTCAGA
AAACTCGAGGGCTTCATTTTGAATGGAAACGGAGCCATTTTTGACGGTCAAGGCTCAGTG
GCTTGGAAGGTCAATGACTGCAAACAAACCGGCAAACGCAACAATCTCCCCATCAACATC
CGACTTACGCAACTCAATAACTCGCAAAATTCCGGCATAACATCAACAAACAGCAAACTA
TTCCACATGAACATCCATCAATGCAACAACGTAACTCTTACAGATGTTCATATTGAGGCA
CCACCTGAGAGTCTCAACACCGATGGTATCCACGTCGGAAAGTCCGTACGCGTCACCATA
AGAGGGTCAAAGATTAGAACCGGAGATGACTGCATTTCCATTGGAGGCGGTACTGAAAAT
TTACTTGTCGAGGGCGTAGAATGTGGACCAGGACACGGTCTTTCCATCGGAAGTCTTGGA
AAGCATCCTAATGAGCAACCAGTGAAAGGAATCACCATTCGTAAATGCATCATCAAGCAT
ACCGATAATGGTGTTCGTATCAAAACATGGCCTGGATCTCCCCCTGGTCTCGTCTCCAAC
GTTATTTTTGAAGATATCACCATGGACAATGTTAGCTTGCCCGTTCTCATCGACCAAGTG
TACTGCCCTCATGGCAAATGCAAGAGTGGGGCATCAAAAGTACAGTTGGAGAACCTGAAC
TTCAAGAACATTCATGGCACATCATCAACAAAGATTGCTGTGCAACTAAACTGCAGTCCA
GGCGCTCCTTGCCAAAAAGTTACTTTGTCTGACATAAACTTGGTCAGCAGCGGTAAAGAG
GGTGCAGCTGTCTCGGCATGTTCTAACGTCAAGCCTATTGTCACCGGGAAAATGATTCCA
CCGGCTTGCACCGAAGAATGTAAACCGGATAAAAAATAATTCGCTTGCCCACCAAGCTTT
CTTCCGATCTGGTGGAGATGATTCCATTAGATGGAGTATTAAATTATGTTAAGTTTTTTT
TTTGTCGAATAAATAGGCAATAGTCCCTTTACGCTTGGAGTTTACCAGCTAAAGAGTGAC
TAATGACTGAGTAGTAATTAATGTACGATTCGAATCATGCGAGAATGTTTAAACTTTTAT
TTAATAAAGGAGGACATCATTGAAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2E608TF U 1
AF RR2DT70TF U 1
AF RR2EG48TF U 155
AF RR2DB52TF U 540
AF RR2FV06TF U 599
AF RR2EG48JQ C 1594
AF RR2BG70TF U 1131
AF RR2BG70JQ C 1133
AF RR2E608JQ C 1210
BS 1 530 RR2DT70TF
BS 531 531 RR2EG48TF
BS 532 541 RR2DT70TF
BS 542 663 RR2EG48TF
BS 664 1034 RR2DB52TF
BS 1035 1035 RR2FV06TF
BS 1036 1251 RR2DB52TF
BS 1252 1252 RR2FV06TF
BS 1253 1290 RR2DB52TF
BS 1291 1291 RR2BG70TF
BS 1292 1315 RR2DB52TF
BS 1316 1316 RR2FV06TF
BS 1317 1326 RR2DB52TF
BS 1327 1391 RR2FV06TF
BS 1392 1825 RR2BG70TF
BS 1826 1826 RR2BG70JQ
BS 1827 1916 RR2BG70TF
BS 1917 1945 RR2BG70JQ

RD RR2E608TF 507 0 0
GGAGAAAACAAAAACAAAAAGAGGATAAACATAAAAAGAAGCTACAAAAAAAGATAATAA
GTATCAATAAGGTAAACTACAATAAAAATGGTGGGCATGCGTAGACCAAAGGCGTTGTTT
GTTGTACTACTAGTAGTTTTGGCCATCTCAGTAGCAAAGGCTGCCAAGGATCTCAAAGAA
AAAGATGCTGGAGTCCCAAGAAACTTAAGTGAAGACGATAATCCTAAAAAAGATGGAAAA
GATGCAAAAGATGCAAAAGATGCAAAAGATGGAAAGGATGGAAAAGATGCAAAAGATGCA
AAAGATGGAAAAGATTCAAAAGATGCAAAAGATGGAAAAGATGCAAAAGATGGAAAAGAT
TCAAAAGATGCAAAAGATGAAAAAGGTGCATCTATCGGTTCCAAAATAAAAGACAAAGTC
AAAGGAGCTGCTGCGTCGGTTGCATCAGCTGCATCTAACGCATCTTCTGCCTCAGCTGCA
TCTGTCGCTTCTGCTGCCTCGGCTGCA

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2DT70TF 552 0 0
GGAGAAAACAAAAACAAAAAGAGGATAAACATAAAAAGAAGCTACAAAAAAAGATAATAA
GTATCAATAAGGTAAACTACAATAAAAATGGTGGGCATGCGTAGACCAAAGGCGTTGTTT
GTTGTACTACTAGTAGTTTTGGCCATCTCAATAGCAAAGGCTGCCAAGGATCTCAAAGAA
AAAGATGCTGGAGTCCCAAGAAACTTAAGTGAAGACGATAATCCTAAAAAAGATGGAAAA
GATGCAAAAGATGCAAAAGATGCAAAAGATGGAAAGGATGGAAAAGATGCAAAAGATGCA
AAAGATGGAAAAGATTCAAAAGATGCAAAAGATGGAAAAGATGCAAAAGATGGAAAAGAT
TCAAAAGATGCAAAAGATGAAAAAGATGCATCTATCGGTTCCAAAATAAAAGACAAAGTC
AAAGGAGCTGCTGCGTCGGTTGCATCAGCTGCATCTAACGCATCTTCTGCCTCAGCTGCA
TCTGTCGCTTCTGCTGCCTCGGCTGCATCAGGTAAAATCAAAGGAGCTGT*GCACCTATT
G
TGATAATTGGG

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR2EG48TF 509 0 0
CAAAGGCTGCCAAGGATCTCAAAGAAAAAGATGCTGGAGTCCCAAGAAACTTAAGTGAAG
ACGATAATCCTAAAAAAGATGGAAAAGATGCAAAAGATGCAAAAGATGCAAAAGATGGAA
AGGATGGAAAAGATGCAAAAGATGCAAAAGATGGAAAAGATTCAAAAGATGCAAAAGATG
GAAAAGATGCAAAAGATGGAAAAGATTCAAAAGATGCAAAAGATGAAAAAGATGCATCTA
TCGGTTCCAAAATAAAAGACAAAGTCAAAGGAGCTGCTGCGTCGGTTGCATCAGCTGCAT
CTAACGCATCTTCTGCCTCAGCTGCATCTGTCGCTTCTGCTGCCTCGGCTGCATCAGGTA
AAATCAAAGGAGCTGTTGCACCTATTGGTGATAAGTTGGGAATCAAAGGAGGCGCGCCAA
GCGGTCCATCAATGGATGTTAAAGCAAGTGGAGCTAAAGGAGATGGCAAAACTGATGACA
GTGCGGCATTTATGGATGTATGGAAAAAA

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2DB52TF 787 0 0
G
GGTGATAAGTTGGGAATCAAAGGAGGCGCGCCAAGCGGTCCATCAATGGATGTTAAAGCA
AGTGGAGCTAAAGGAGATGGCAAAACTGATGACAGTGCGGCATTTATGGATGTATGGAAA
AAAGCAATTGCAGCAACAACACCAACAACGATTTTAGTGCCAAAGGGTGACTACTTGGTG
GAAACCTTAGAACTCGAAGGTCCAAGCAAAAGTGCCATCACTTTCGAAATGCAAGGCAAT
CTTAAGGCTCCATCTGCTGTCACTACCCGAAAACCGCATAGTGGATGGGTTAATTTCAGA
AAACTCGAGGGCTTCATTTTGAATGGAAACGGAGCCATTTTTGACGGTCAAGGCTCAGTG
GCTTGGAAGGTCAATGACTGCAAACAAACCGGCAAACGCAACAATCTCCCCATCAACATC
CGACTTACGCAACTCAATAACTCGCAAAATTCCGGCATAACATCAACAAACAGCAAACTA
TTCCACATGAACATGCATCAATGCAACAACGTAACTCTTACAGATGTTCATATTGAGGCA
CCACCTGAGAGTCTCAACACCGATGGTATCCACGTCGGAAAGTCCGTACGCGTCACCATA
AGAGGGTCAAAGATTAGAACCGGAGATGACTGCATTTCCATTGGAGGCGGTACTGAAAAT
TTACTTGTCGAGGGCGTAGAATGTGGACCAGGACACGGTCTTTCCATCGGA*GTCTTGGA
AAGCATCCTAATGAGCAACCAGTGAAAGGA*TCACCATTCGTAAATGCATCATCA*GCAT
ACCGAT

QA 2 787 2 787
DS 

RD RR2FV06TF 795 0 0
G
AAGTGGAGCTAAAGGAGATGGCAAAACTGATGACAGTGCGGCATTTATGGATGTATGGAA
AAAAGCAATTGCAGCAACAACACCAACAACGATTTTAGTGCCAAAGGGTGACTACTTGGT
GGAAACCTTAGAACTCGAAGGTCCAAGCAAAAGTGCCATCACTTTCGAAATGCAAGGCAA
TCTTAAGGCTCCATCTGCTGTCACTACCCGAAAACCGCATAGTGGATGGGTTAATTTCAG
AAAACTCGAGGGCTTCATTTTGAATGGAAACGGAGCCATTTTTGACGGTCAAGGCTCAGT
GGCTTGGAAGGTCAATGACTGCAAACAAACCGGCAAATGCAACAATCTCCCCATCAACAT
CCGACTTACGCAACTCAATAGCTCGCAAATTTCCGGCATAACATCAACAAACAGCAAACT
ATTCCACATGAACATCCATCAATGCAACAACGTAACTCTTACAGATGTTCATATTGAGGC
ACCACCTGAGAGTCTCAACACCGATGGTATCCACGTCGGAAAGTCCGTAGGCGTCACCAT
AAGAGGGTCAAAGATTAGAACCGGAGATGACTGCATTTCCATTGGAGGCGGTACTGAAAA
TTTACTTGTCGAGGGCGTAGAATGTGGACCAGGACACGGTCTTTCCATCGGAAGTCTTGG
AAAGCATCCTAATGAGCAACCAGTGAAAGGA*TCACCATTCGTAAATGCATCATCAAGCA
TACCGATAATGGTGTTCGTATCAAAACATGGCCTGGATCTCCCCCTGGTCTCGTCTCCAA
CGTTATTTTTGA
GA

QA 2 793 2 793
DS 

RD RR2EG48JQ 263 0 0
ATAAACTTGGTCAGCAGCGGTAAAGAGGGTGCAGCTGTCTCGGCATGTTCTAACGTCAAG
CCTATTGTCACCGGGAAAATGATTCCACCGGCTTGCACCGAAGAATGTAAACCGGATAAA
AAATAATTCGCTTGCCCACCAAGCTTTCTTCCGATCTGGTGGAGATGATTCCATTAGATG
GAGTATTAAATTATGTTAAGTTTTTTTTT*GTAGAATAAATAGGCAATAGTCCCTTTACG
CTTGGAGTTTACCAGCTAAAGAG

QA 1 263 1 263
DS 

RD RR2BG70TF 786 0 0
GG
TCACCATAAGAGGGTCAAAGATTAGAACCGGAGATGACTGCATTTCCATTGGAGGCGGTA
CTGAAAATTTACTTGTCGAGGGCGTAGAATGTGGACCAGGACACGGTCTTTCCATCGGAA
GTCTTGGAAAGCATCCTAATGAGCAACCAGTGAAAGGAATCACCATTCGTAAATGCATCA
TCAAGCATACCGATAATGGTGTTCGTATCAAAACATGGCCTGGATCTCCCCCTGGTCTCG
TCTCCAACGTTATTTTTGAAGATATCACCATGGACAATGTTAGCTTGCCCGTTCTCATCG
ACCAAGTGTACTGCCCTCATGGCAAATGCAAGAGTGGGGCATCAAAAGTACAGTTGGAGA
ACCTGAACTTCAAGAACATTCATGGCACATCATCAACAAAGATTGCTGTGCAACTAAACT
GCAGTCCAGGCGCTCCTTGCCAAAAAGTTACTTTGTCTGACATAAACTTGGTCAGCAGCG
GTAAAGAGGGTGCAGCTGTCTCGGCATGTTCTAACGTCAAGCCTATTGTCACCGGGAAAA
TGATTCCACCGGCTTGCACCGAAGAATGTAAACCGGATAAAAAATAATTCGCTTGCCCAC
CAAGCTTTCTTCCGATCTGGTGGAGATGATTCCATTAGATGGAGTATTAAATTATGTTAA
GTTTTTTTTTTGTCGAATAAATAGGCAATAGTCTCTTTACGCTTGGAGTTTACCAGCTAA
AGAGTGACTAATGACTGAGTAGTAATTAATGTACGATTCGAATCATGCGAGAATGTTTAA
ACTT

QA 3 786 3 786
DS 

RD RR2BG70JQ 813 0 0
TCACCATAAGAGGGTCAAAGATTAGAACCGGAGATGACTGCATTTCCATTGGAGGCGGTA
CTGAAAATTTACTTGTCGAGGGCGTAGAATGTGGACCAGGACACGGTCTTTCCATCGGAA
GTCTTGGAAAGCATCCTAATGAGCAACCAGTGAAAGGAATCACCATTCGTAAATGCATCA
TCAAGCATACCGATAATGGTGTTCGTATCAAAACATGGCCTGGATCTCCCCCTGGTCTCG
TCTCCAACGTTATTTTTGAAGATATCACCATGGACAATGTTAGCTTGCCCGTTCTCATCG
ACCAAGTGTACTGCCCTCATGGCAAATGCAAGAGTGGGGCATCAAAAGTACAGTTGGAGA
ACCTGAACTTCAAGAACATTCATGGCACATCATCAACAAAGATTGCTGTGCAACTAAACT
GCAGTCCAGGCGCTCCTTGCCAAAAAGTTACTTTGTCTGACATAAACTTGGTCAGCAGCG
GTAAAGAGGGTGCAGCTGTCTCGGCATGTTCTAACGTCAAGCCTATTGTCACCGGGAAAA
TGATTCCACCGGCTTGCACCGAAGAATGTAAACCGGATAAAAAATAATTCGCTTGCCCAC
CAAGCTTTCTTCCGATCTGGTGGAGATGATTCCATTAGATGGAGTATTAAATTATGTTAA
GTTTTTTTTTTGTCGAATAAATAGGCAATAGTCCCTTTACGCTTGGAGTTTACCAGCTAA
AGAGTGACTAATGACTGAGTAGTAATTAATGTACGATTCGAATCATGCGAGAATGTTTAA
ACTTTTATTTAATAAAGGAGGACATCATTGAAT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2E608JQ 733 0 0
GAGGGCGTAGAATGTGGACCAGGACACGGTCTTTCCATCGGAAGTCTTGGAAAGCATCCT
AATGAGCAACCAGTGAAAGGAATCACCATTCGTAAATGCATCATCAAGCATACCGATAAT
GGTGTTCGTATCAAAACATGGCCTGGATCTCCCCCTGGTCTCGTCTCCAACGTTATTTTT
GAAGATATCACCATGGACAATGTTAGCTTGCCCATTCTCATCGACCAAGTGTACTGCCCT
CATGGCAAATGCAAGAGTGGGGCATCAAAAGTACAGTTGGAGAACCTGAACTTCAAGAAC
ATTCATGGCACATCATCAACAAAGATTGCTGTGCAACTAAACTGCAGTCCAGGCGCTCCT
TGCCAAAAAGTTACTTTGTCTGACATAAACTTGGTCAGCAGCGGTGAAGAGGGTGCAGCT
GTCTCGGCATGTTCTAACGTCAAGCCTATTGTCACCGGGAAAATGATTCCACCGGCTTGC
ACCGAAGAATGTAAACCGGATAAAAAATAATTCGCTTGCCCACCAAGCTTTCTTCCGATC
TGGTGGAGATGATTCCATTAGATGGAGTATTAAATTATGTTAAGTTTTTTTTT*GTCGAA
TAAATAGGCAATAGTCCCTTTACGCTTGGAGTTTACCAGCTAAAGAGTGACTAATGACTG
AGTAGTAATTAATGTACGATTCGAATCATGCGAGAATGTTTAAACTTTTATTTAATAAAG
GAGGACATCATTG

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 11

CO CL519Contig1 925 11 14 U
GGAGCCACTGAAACAAAAAGGGTACCATTTTCGCTGCGCTGTTCTAGAAAGGGTTTCGTT
TCGTTC*****GAAGAAGAAGATGCCAGGCCCCGTCGTCGACGAAGTGAAGGTTGAGGAG
CTGTTGAAGGACGCCGTCAAAGAGCAAACGAAGCTCGAGAAGGAAGATGATGTTGTCGTT
GAAGATGTCAAAGACGGAGATGAAGACGACGATGTTGATGACGACGACGACGATGACAAC
GTCGATGGAGCTGGTGAGAATGAGAGCTCTAAGCAAAGTAGAAGCGAGAAGAAAAGCCGC
AAAGCAATGCTCAAACTTGGAATGAAACCTGTTACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAG
AGATCCAAGAATGTTTTGTTTGTCATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGCCCAAACTCG
GACACCTATGTGATATTCGGTGAGGCGAAGATTGACGATATGAGCTCTCAGCTACAAGCT
CAGGCTGCTCAGAGGTTCAAGATGCCAGACGTTGCATCTATGATCCCTAACGCTGATGCC
TCTGAAGCAGCCGCGGCTGCACAAGAGGAGGAGGAAGATGAAGATGTTGATGAGACTGGT
GTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCTCGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCAAAGGCCAAAGCT
ACTAAGGCTCTTAAAGCCAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAGCTCACTACA
TAGGTTGAGTTGCAGAAGCTCGCAATTGTTCTCGTTTCTTAGTTCACTTCTCGTTTCTTA
ATTCACTTCTCGTTTCTCGAACATTGTTTGTGTTTCTCCACTATTTTAAGGCTATTTTGC
TTTATAATATGAGGCATTCATGTTTAATGTTGTAAGACAGTTTAGTAAGGTGGACATTTC
GGTTATTATTTTTAGAAGAAACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 45 60 60 60 
60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 25 
55 20 55 55 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 50 50 25 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 35 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E823TF U 22
AF RR2EX95TF U 23
AF RR2E332TF U 22
AF RR2D787TF U 1
AF RR2H303TF U 20
AF RR2CU78TF U 149
AF RR2E823JQ C 139
AF RR2EX95JQ C 292
AF RR2CU78JQ C 183
AF RR2D787JQ C 391
AF RR2H303JQ C 671
BS 1 382 RR2D787TF
BS 383 383 RR2H303TF
BS 384 419 RR2D787TF
BS 420 420 RR2H303TF
BS 421 651 RR2D787TF
BS 652 652 RR2H303TF
BS 653 666 RR2D787TF
BS 667 667 RR2H303TF
BS 668 723 RR2D787TF
BS 724 724 RR2CU78TF
BS 725 826 RR2D787TF
BS 827 863 RR2E823JQ
BS 864 864 RR2D787JQ
BS 865 925 RR2CU78JQ

RD RR2E823TF 534 0 0
GG
ACCATTTTCGCTGCGCTGTTCTAGAAAGGGTTTCGTTTCGTTC*****GAAGAAGAAGAT
GCCAGGCCCCGCCGTCGACGAAGTGAAGGTTGAGGAGCTGTTGAAGGACGCCGTCAAAGA
GCAAACGAAGCTCGAGAAGGAAGATGATGTTGTCGTTGAAGATGTCAAAGACGGAGATGA
AGACGACGATGCCGATGACGACGACGACGATGACAACGTCGATGGAGCTGGTGAGAATGA
GAGCTCTAAGCAAAGTAGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCAATGCTCAAACTTGGAAT
GAAACCTGTTACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGAGATCCAAGAATGTTTTGTTTGT
CATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGCCCAAACTCGGACACCTATGTGATATTCGGTGA
GGCGAAGATTGACGATATGAGCTCTCAGCTACAAGCTCAGGCTGCTCAGAGGT*CAAGAT
GCCAGACGT*GCATCTATGATCCCTAACGCTGATGC*TCTGAAGCAGCCGCG

QA 3 534 3 534
DS 

RD RR2EX95TF 697 0 0
G
ACCATTTTCGCTGCGCTGTTCTAGAAAGGGTTTCGTTTCGTTTCGTCTGAAGAAGAAGAT
GCCAGGCCCCGTCGTCGACGAAGTGAAGGTTGAGGAGCTGTTGAAGGACGCCATCAAAGA
GCAAACGAAGCTCGAGAAGGAAGATGATGTTGTCGTTGAAGATGTCAAAGACGGAGATGA
AGACGACGATGTTGATGACGACGACGACGATGACAACGTCGATGGAGCTGGTGAGAATGA
GAGCTCTAAGCAAAGTAGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCAATGCTCAAACTCGGAAT
GAAACCTGTTACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGATATCCAAGAATGTTTTGTTTGT
CATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGCCCAAACTCGGACACCTATGTGATATTCGGTGA
GGCCAAGATTGACGATATGAGCTCTCAGCTACAAGCTCAGGCTGCTCAGAGGTTCAAGAT
GCCAGACGTTGCATCTATGATCCCTAACGCTGATGCTTCTGAAGCAGCCGCGGCTGCACA
AGAGGAGGAGGAAGATGAAGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCT
CGTGATGACTCACGCTGGTGTCTCAAAGGCCAAAGCCACTAAG*CTCTTAAAGCCAATGA
TGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAGCTCACTAC

QA 2 697 2 697
DS 

RD RR2E332TF 700 0 0
GG
ACCATTTTCGCTGCGCTGTTCTAGAAAGGGTTTCGTTTCGTTC*****GAAGAAGAAGAT
GCCAGGCCCCGTCGTCGACGAAGTGAAGGTTGAGGAGCTGTTGAAGGACGCCGTCAAAGA
GCAAACGAAGCTCGAGAAGGAAGATGATGTTGTCGTTGAAGATGTCAAAGACGGAGATGA
AGACGACGATGTTGATGACGACGACGACGATGACAACGTCGATGGAGCTGGTGAGAATGA
GAGCTCTAAGCAAAGTAGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCAATGCTCAAACTTGGAAT
GAAACCTGTTACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGAGATCCAAGAATGTTTTGTTTGT
CATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGCCCAAACTCGGACACCTATGTGATATTCGGTGA
GGCGAAGATTGACGATATGAGCTCTCAGCTACAAGCTCAGGTTGCTCAGAGGTTCAAGAT
GCCAGACGTTGCATCTATGATCCCTAACGCTGATGCCTCTGAAGCAGCCGCGGCTGCACA
AGAGGAGGAGGAAGATGAAGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCT
CGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCAAAGGCCAAAGCTACTAAG*CTCTTAAAGCCAATGA
TGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAGCTCACTACAT

QA 3 700 3 700
DS 

RD RR2D787TF 826 0 0
GGAGCCACTGAAACAAAAAGGGTACCATTTTCGCTGCGCTGTTCTAGAAAGGGTTTCGTT
TCGTTC*****GAAGAAGAAGATGCCAGGCCCCGTCGTCGACGAAGTGAAGGTTGAGGAG
CTGTTGAAGGACGCCGTCAAAGAGCAAACGAAGCTCGAGAAGGAAGATGATGTTGTCGTT
GAAGATGTCAAAGACGGAGATGAAGACGACGATGTTGATGACGACGACGACGATGACAAC
GTCGATGGAGCTGGTGAGAATGAGAGCTCTAAGCAAAGTAGAAGCGAGAAGAAAAGCCGC
AAAGCAATGCTCAAACTTGGAATGAAACCTGTTACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAG
AGATCCAAGAATGTTTTGTTTGCCATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGCCCAAACTCA
GACACCTATGTGATATTCGGTGAGGCGAAGATTGACGATATGAGCTCTCAGCTACAAGCT
CAGGCTGCTCAGAGGTTCAAGATGCCAGACGTTGCATCTATGATCCCTAACGCTGATGCC
TCTGAAGCAGCCGCGGCTGCACAAGAGGAGGAGGAAGATGAAGATGTTGATGAGACTGGT
GTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCTCGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCAAAG*CCAAAGCT
ACTAAG*CTCTTAAAGCCAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAGCTCACTACA
TAG*TTGAGTTGCAGAAGCTCGCAATTGTTCTCGTTTCTTAGTTCACTTCTCGTTTCTTA
ATTCACTTCTCGTTTCTCGAACATTGTTTGTGTTTCTCCACTATTT

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2H303TF 785 0 0
GGGT
ACCATTTTCGCTGCGCTGTTCTAGAAAGGGTTTCGTTTCGTTC*****GAAGAAGAAGAT
GCCAGACCCCGTCGTCGACGAAGCGAAGGTTGAGGAGCTGTTGAAGGACGCCGTCAAAGA
GCAAACGAAGCTCGAGAAGGAAGATGATGTTGTCGTTGAAGATGTCAAAGACGGAGATGA
AGACGACGATGTTGATGACGACGACGACGATGACAACGTCGATGGAGCTGGTGAGAATGA
GAGCTCTAAGCAAAGTAGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCAATGCTCAAACTTGGAAT
GAAACCTGTTACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGAGATCCAAGAATGTTTTGTTTGT
CATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGCCCAAACTCGGACACCTATGTGATATTCGGTGA
GGCGAAGATTGACGATATGAGCTCTCAGCTACAAGCTCAGGCTGCTCAGAGGTTCAAGAT
GCCAGACGTTGCATCTATGATCCCTAACGCTGATGCCTCTGAAGCAGCCGCGGCTGCACA
AGAGGAGGAGGAAGATGAAGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCT
CGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCAAAGGCCAAAGCTACTAAGGCTCTTAAAGCCAATGA
TGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAGCTCACTACATAG*TTGAGTTGCAGAAGCTCGC
AATTGTTCTCGTT*CTTAGTTCACTTCTCGTTTCTTA*TTCACTTCTCGTTTCTCGAACA
T

QA 5 785 5 785
DS 

RD RR2CU78TF 676 0 0
G
GAAGCTCGAGAAGGAAGATGATGTTGTCGTTGAAGATGTCAAAGACGGAGATGAAGACGA
CGATGTTGATGACGACGACGACGATGACAACGTCGATGGAGCTGGTGAGAATGAGAGCTC
TAAGCAAAGTAGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCAATGCTCAAACTTGGAATGAAACC
TGTTACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGAGATCCAAGAATGTTTTGTTTGTCATCTC
GAAGCCGGATGTGTTCAAGAGCCCAAACTCGGACACCTATGTGATATTCGGTGAGGCGAA
GATTGACGATATGAGCTCTCAGCTACAAGCTCAGGCTGCTCAGAGGTTCAAGATGCCAGA
CGTTGCATCTATGATCCCTAACGCTGATGCCTCTGAATCAGCCGCGGCTGCACAAGAGGA
GGAGGAAGATGAAGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCTCGTGAT
GACTCAAGCTGGTGTCTCAAAGGCCAAAGCTACTAGGGCTCTTAAAGCCAATGATGGAGA
TATCGTTTCTGCCATTATGGAGCTCACTACATAGGTTGAGTTGCAGAAGCTCGCAATTGT
TCTCGTTTCTTAGTTCACTTCTCGTTTCTTAATTCACTTCTCGTTTCTCGAACATTGTTT
GTGTTTCTCCACTAT

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR2E823JQ 727 0 0
AAAGAGCAAACGAAGCTCGAGAAGGAAGATGATGTTGTCGTTGAAGATGTCAAAGACGGA
GATGAAGACGACGATGCCGATGACGACGACGACGATGACAACGTCGATGGAGCTGGTGAG
AATGAGAGCTCTAAGCAAAGTAGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCAATGCTCAAACTT
GGAATGAAACCTGTTACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGAGATCCAAGAATGTTTTG
TTTGTCATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGCCCAAACTCGGACACCTATGTGATATTC
GGTGAGGCGAAGATTGACGATATGAGCTTTCAGCTACAAGCTCAGGCTGCTCAGAGGTTC
AAGATGCCAGACGTTGCATCTATGATCCCTAACGCTGATGCCTCTGAAGCAGCCGCGGCT
GCACAAGAGGAGGAGGAAGATGAAGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAAGCCAAGGATGTT
GAGCTCGTGATGACTCAAGCTGGTGTCCCAAAGGCCAAAGCTACTAAGGCTCTTAAAGCC
AATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAGCTCACTACATAGGTTGAGTTTCAGAAG
CCCGCAATTGTTCTCGTTTCTTAGTTCACTTCTCGTTTCTTAATTCACTTCTCGTTTCTC
GAACATTGTTTGTGTTTCTCCACTATTTTAAGGCTATTTTGCTTTATAATATGAGGCATT
CATGT
CC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2EX95JQ 571 0 0
AAAAGCCGCAAAGCAATGCTCAAACTCGGAATGAAACCTGTTACTGATGTTAGCAGAGTC
ACAATCAAGATATCCAAGAATGTTTTGTTTGTCATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGC
CCAAACTCGGACACCTATGTGATATTCGGTGAGGCCAAGATTGACGATATGAGCTCTCAG
CTACAAGCTCAGGCTGCTCAGAGGTTCAAGATGCCAGACGTTGCATCTATGATCCCTAAC
GCTGATGCTTCTGAAGCAGCCGCGGCTGCACAAGAGGAGGAGGAAGATGAAGATGTTGAT
GAGACTGGTGTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCTCGTGATGACTCAGGCTGGTGTCTCAAAG
GCCAAAGCCACTAAGGCTCTTAAAGCCAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAG
CTCACTACATAGGTTGAGTTGCAGAGACTCGCAATTGTTCTCGTTTCTTAGTTCACTTCT
CGTTTCTTAATTCACTTCTCGTTTCTCGAACATTGTTTGTGTTTCTCCACTATTTTAAGG
CTATTTTGCTTTATAATATGAGGCATTCATG

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2CU78JQ 743 0 0
AGATGTCAAAGACGGAGATGAAGACGACGATGTTGATGACGACGACGACGATGACAACGT
CGATGGAGCTGGTGAGAATGAGAGCTCTAAGCAAAGTAGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAA
AGCAATGCTCAAACTTGGAATGAAACCTGTTACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGAG
ATCCAAGAATGTTTTGTTTGTCATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGCCCAAACTCGGA
CACCTATGTGATATTCGGTGAGGCGAAGATTGACGATATGAGCTTTCAGCTACAAGCTCA
GGCTGCTCAGAGGTTCAAGATGCCAGACGTTGCATCTATGATCCCTAACGCTGATGCCTC
TGAATCAGCCGCGGCTGCACAAGAGGAGGAGGAAGATGAAGATGTTGATGAGACTGGTGT
TGAAGCCAAGGATGTTGAGCTCGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCAAAGGCCAAAGCTAC
TAGGGCTCTTAAAGCCAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAGCTCACTACATA
GGTTGAGTTGCAGAAGCTCGCAATTGTTCTCGTTTCTTAGTTCACTTCTCGTTTCTTAAT
TCACTTCTCGTTTCTCGAACATTGTTTGTGTTTCTCCACTATTTTAAGGCTATTTTGCTT
TATAATATGAGGCATTCATGTCTAATGTTGTAAGACAGTTTAGTAAGGTGGACATTTCGG
TTATTATTTTTAGAAGAAACTCC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2D787JQ 523 0 0
AAGCCGGATGTGTTCAAGAGCCCAAACTCAGACACCTATGTGATATTCGGTGAGGGGAAG
ATTGACGATATGAGCTTTCAGCTACAAGCTCAGGCTGCTCAGAGGTTCAAGATGCCAGAC
GTTGCATTTATGATCCCTAACGCTGATGCCTTTGAAGCAGCCGCGGCTGCACAAGAGGAG
GAGGAAGATGAAGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCTCGTGATG
ACTCAAGCTGGTGTCTCAAAGGCCAAAGCTACTAAGGCTTTTAAAGCCAATGATGGAGAT
ATCGTTTTTGCCATTATGGAGCTCACTACATAGGTTGAGTTGCAGAAGCTCGCAATTGTT
TTCGTTTTTTAGTTCACTTCTCGTTTTTTAATTCACTTCTCGTTTTTCGAACATTGTTTG
TGTTTTTCCACTATTTTAAGGCTATTTTGCTTTATAATATGAGGCATTCATGTTTAATGT
TGTAAGACAGTTTAGTAAGGTGGACATTTCGGTT
ATTTTTTTT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2H303JQ 240 0 0
TTAAAGCCAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAGCTCACTACATAGGTTGAGT
TGCAGAAGCTCGCAATTGTTTTCGTTTTTTAGTTCACTTCTCGTTTTTTAATTCACTTCT
CGTTTCTCGAACATTGTTTGTGTTTTTCCACTATTTTAAGGTTATTTTGCTTTATAATAT
GAGGCATTCATGTTTAATGTTGTAAGACAGTTTAGTAAGGTGGACATTTCGGTT
TTTATT

QA 1 234 1 234
DS 



AS 1 10

CO CL520Contig1 1548 10 25 U
GGACCGTTCAAACCCTTACAGAGCTCAAGAACTGACTGGACTTGAAAATGGCGAGGATGT
ACAAGAAGTTGGCAATTTGCGGCGGTGAAGGAGGACGTGAATGGGATGACGATGTATTCG
AAGGCGTGAGAAAAGTGTACGTTGGGCAAGATCTCTCACGTATCAGTTACATCAAATTCG
AGTACGTGAAGGTAGACGGTGCAGTAATAACACGTGAATATGGGACAATACATCAACAAC
CTAAAGAGTTTGAACTTTACCCTGATGAACACATCAAAGCGGTGGAGGGAAGCTACAAGT
CAGTGGCTCTGTGTGCCACCGAGGTAATCACGTCCCTAGTCTTCAAGACGTCGAAGGGTA
GAACGTCTCCAACCTTTGGTGCGAACTTGTTCGGTACAAAGTTCATTTTTGAGGAAACTC
AAGGTAAGAAGATCGTAGGGTTTCATGGACGGTCAGGTAATGCTCTGGACGCTATTGGAG
TTTACTTTGCACTGGACTCTCTGACTACACCGACCCCTGTTTACAAGCTGGAAGCTCAAG
GTGGTACAGAGGGGCGTGTTTGGG*ATGATGGTTTTTACGATGGTGTTAAAACCATGCGG
ATTGGTCAAGATAATAGCCGTATCACTTATTTAGAGTGTGAGTACGTGAAAGGTGGGAAA
TTGGAGACGCGTTGCCATGGGAAGAAAGGAGAAAAACAATTTGAGATTGTGCTTGTCCCG
GGTGAATACATCAAATCGGTGGAAGCAACTTATGATAAGACAAGCTTCTTTCGCAACACG
GTCCTTACGTCGCTTAAGCTCGAAACATCAGCGGGGAGAACAAGTTTCTTTGGGTATAAG
ACGGGTAAAATGTTTGTCCTGAAACAAAAGGATCGAAGACTTGTGGGATTCCATGGAAGA
GAAGGCGACGCTATTGATGCAGTTGGAGCCTATTTTGCACCTATTCCTACTCCTGTTCCT
GTGATTCCAGCCACAAAACTACCAGCGGTAGGTGGAAAGGGAGGAGTTGCATGGGATGAT
GGTGTCTACGATGGTGTTAGGAAGATATACGTAGGACAAGGTAATGATGGTGTGTCCTTT
GTTAAGTTTGAGTACGTTAAAGGGACAAACTTGGTATCTGGAGATGACCATGGGAAGAAG
ACAATACTCGGAGCTGAAGAGTTTGTGTTAGAAGATGGTGAATACCTCACGGTTTTGGAA
GGCTACTACGATAAGATCTTTGGAGTGCAGGAACCGGTGATTATCTCTCTTAAGTTCAAG
ACAAACAAAAGGGATTCAATTCCGTTTGGAATGAATTCCGGTGAGAAGTTCTCACTCGGG
GAGAAAGGCCACAAGATCGTCGGGTTCCATGGGCAAGCTAGTGATGTTCTTCACAGTGTT
GGAGTTACTGTTGTTCCCATCACCCCTACCAAGTGAAACATGCATCTATTGTATGAATAA
TACTGAATGAACTTTTAATCAGATTGTCCTGTGTTCCCTTGACGCTGCTACTTTCATTGT
ACTTTTAATGGTATTTACTTTGAATAATAAAGTCTATCGGTTCTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2GM65TF U 4
AF RR2B477TF U 1
AF RR2B245TF U 2
AF RR2AK20TF U 8
AF RR2GY85TF U 357
AF RR2FG62TF U 461
AF RR2B245JQ C 634
AF RR2AK20JQ C 666
AF RR2B477JQ C 706
AF RR2EJ32JQ C 787
BS 1 11 RR2B477TF
BS 12 12 RR2GM65TF
BS 13 17 RR2B477TF
BS 18 18 RR2GM65TF
BS 19 87 RR2B477TF
BS 88 88 RR2GM65TF
BS 89 106 RR2B477TF
BS 107 107 RR2GM65TF
BS 108 651 RR2B477TF
BS 652 652 RR2B245TF
BS 653 818 RR2B477TF
BS 819 900 RR2GY85TF
BS 901 901 RR2FG62TF
BS 902 937 RR2GY85TF
BS 938 938 RR2FG62TF
BS 939 1019 RR2GY85TF
BS 1020 1108 RR2FG62TF
BS 1109 1109 RR2B245JQ
BS 1110 1201 RR2FG62TF
BS 1202 1202 RR2B245JQ
BS 1203 1222 RR2FG62TF
BS 1223 1488 RR2B245JQ
BS 1489 1525 RR2AK20JQ
BS 1526 1545 RR2B477JQ
BS 1546 1548 RR2EJ32JQ

RD RR2GM65TF 694 0 0
GG
GTTCAAACCCTTACAGAGCTCAAGAACTTACTGGACTTGAAAATGGCGAGGATGTACAAG
AAGTTGGCAATTTGCGGCGGTGAAGGAGGACGTGAATGGGATGACGATGTATTCGAAGGC
GTGAGAAAAGTGTACGTTGGGCAAGATCTCTCACGTATCAGTTACATCAAATTCGAGTAC
GTGAAGGTAGACGGTGCAGTAATAACACGTGAATATGGGACAATACATCAACAACCTAAA
GAGTTTGAACTTTACCCTGATGAACACATCAAAGCGGTGGAGGGGAGCTACAAGTCAGTG
GCTCTGTGTGCCACCGAGGTAATCACGTCCCTAGTCTTCAAGACGTCGAAGGGTAGAACG
TCTCCAACCTTTGGTGCGAACTTGTTCGGTACAAAGTTCATTTTTGAGGAAACTCAAGGT
AAGAAGATCGTAGGGTTTCATGGACGGTCAGGTAATGCTCTGGACGCTATTGGAGTTTAC
TTTGCACTGGACTCTCTGACTACACCGACCCCTGTTTACAAGCTGGAAGCTCAAGGTGGT
ACAGAGGGGCGTGTTTGGG*ATGATGGTTTTTACGATGGTGTTAAAACCATGCGGATTGG
TCAAGATAATAGCCGTATCACTTATTTAGAGTGTGAGTACGTGAAA*GTGGGAAATTGGA
GACGCGTTGCCATGGGAAGAAAG
AGAAAAAAA

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR2B477TF 818 0 0
GGACCGTTCAACCCCTTGCAGAGCTCAAGAACTGACTGGACTTGAAAATGGCGAGGATGT
ACAAGAAGTTGGCAATTTGCGGCGGTGGAGGAGGACGTGAATGGGACGACGATGTATTCG
AAGGCGTGAGAAAAGTGTACGTTGGGCAAGATCTCTCACGTATCAGTTACATCAAATTCG
AGTACGTGAAGGTAGACGGTGCAGTAATAACACGTGAATATGGGACAATACATCAACAAC
CTAAAGAGTTTGAACTTTACCCTGATGAACACATCAAAGCGGTGGAGGGAAGCTACAAGT
CAGTGGCTCTGTGTGCCACCGAGGTAATCACGTCCCTAGTCTTCAAGACGTCGAAGGGTA
GAACGTCTCCAACCTTTGGTGCGAACTTGTTCGGTACAAAGTTCATTTTTGAGGAAACTC
AAGGTAAGAAGATCGTAGGGTTTCATGGACGGTCAGGTAATGCTCTGGACGCTATTGGAG
TTTACTTTGCACTGGACTCTCTGACTACACCGACCCCTGTTTACAAGCTGGAAGCTCAAG
GTGGTACAGAGGGGCGTGTTTGGG*ATGATGGTTTTTACGATGGTGTTAAAACCATGCGG
ATTGGTCAAGATAATAGCCGTATCACTTATTTAGAGTGTGAGTACGTGAAATGTGGGAAA
TTGGAGACGCGTTGCCATGGGAAGAAAGGAGAAAAACAATTTGAGATTGTGCTTGTCCCG
GGTGAATACATCAAATCGGTGGAAGCAACTTATGATAAGACAAGCTTCTTTCGCAACACG
GTCCTTACGTCGCTTAAGCTCGAAACATCAGCGGGGAG

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2B245TF 799 0 0
GACC
GTTCAAACCCTTACAGAGCTCAAGAACTGACTGGACTCGAAAATGGCGAGGATGTACAAG
AAGTTGGCAATTTGCGGCGGTGAAGGAGGACGTGAATGGGATGACGATGTATTCGAAGGC
*TGAGAAAAGTGTACGTTGGGCAAGATCTCTCACGTATCAGTTACATCAAATTCGAGTAC
GTGAAGGTAGACGGTGCAGTAATAACACGTGAATATGGGACAATACATCAACAACCTAAA
GAGTTTGAACTTTACCCTGATGAACACATCAAAGCGGTGGAGGGAAGCTACAAGTCAGTG
GCTCTGTGTGCCACCGAGGTAATCACGTCCCTAGTCTTCAAGACGTCGAAGGGTAGAACG
TCTCCAACCTTTGGTGCGAACTTGTTCGGTACAAAGTTCATTTTTGAGGAAACTCAAGGT
AA**AGATCGTAGGGTT*CATGGACGGTCAGGTAATGCTCTGGACGCTATTGGAGTTTAC
TTTGCACTGGACTCTCTGACTACACCGACCCCTGTTTACAAGCTGGAAGCTCAAGGTGGT
ACAGAGGGGCGTGTTTGGGGATGATGGTTTTTACGATGGTGTTAAAACCATGCGGATTGG
TCAAGATAATAGCCGTATCACTTATTTAGAGTGTGAGTACGTGAAAGGTGGGAAATTGGA
GACGCGTTGCCATGGGAAGAAGGGAGAAAAACAATTTGAGATTGTGCTTGTCCCGGGTGA
ATACATCAAATCGGTGGAAGCAACTTATGATAAGACAAGCTTCTTTCGCAACACGGTCCT
TACGTCGCTTAAGCT

QA 5 799 5 799
DS 

RD RR2AK20TF 809 0 0
TCAAACCCTTACAGAGCTCAAGAACTGACTGGACTTGAAAATGGCGAGGATGTACAAGAA
GTTGGCAATTTGCGGCGGTGAAGGAGGACGTGAATGGGATGACGATGTATTCGAGGGCGT
GAGAAAAGTGTACGTTGGGCAAGATCTCTCACGTATCAGTTACATCAAATTCGAGTACGT
GAAGGTAGACGGTGCAGTAATAACACGTGAATATGGGACAATACATCAACAACCTAAAGA
GTTTGAACTTTACCCTGATGAACACATCAAAGCGGTGGAGGGAAGCTACAAGTCAGTGGC
TCTGTGTGCCACCGAGGTAATCACGTCCCTAGTCTTCAAGACGTCGAAGGGTAGAACGTC
TCCAACCTTTGGTGCGAACTTGTTCGGTACAAAGTTCATTTTTGAGGAAACTCAAGGTAA
GAAGATCGTAGGGTTTCATGGACGGTCAGGTAATGCTCTGGACGCTATTGGAGTTTACTT
TGCACTGGACTCTCTGACTACACCGACCCCTGTTTACAAGCTGGAAGCTCAAGGTGGTAC
AGAGGGGCGTGTTTGGG*ATGATGGTTTTTACGATGGTGTTAAAACCATGCGGATTGGTC
AAGATAATAGCCGTATCACTTATTTAGAGTGTGAGTACGTGAAAGGTGGGAAATTGGAGA
CGCGTTGCCATGGGAAGAAAGGAGAAAAACAATTTGAGATTGTGCTTGTCCCGGGTGAAT
ACATCAAATCGGTGGAAGCAACTTATGATAAGACAAGCTTCTTTCGCAACACGGTCCTTA
CGTCGCTTAAGCTCGAAACATCAGCGGG
A

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2GY85TF 663 0 0
GGTAGAACGTCTCCAACCTTTGGTGCGAACTTGTTCGGTACAAAGTTCATTTTTGAGGAA
ACTCAAGGTAAGAAGATCGTAGGGTTTCATGGACGGTCAGGTAATGCTCTGGACGCTATT
GGAGTTTACTTTGCACTGGACTCTCTGACTACACCGACCCCTGTTTACAAGCTGGAAGCT
CAAGGTGGTACAGAGGGGCGTGTTTGGG*ATGATGGTTTTTACGATGGTGTTAAAACCAT
GCGGATTGGTCAAGATAATAGCCGTATCACTTATTTAGAGTGTGAGTACGTGAAAGGTGG
GAAATTGGAGACGCGTTGCCATGGGAAGAAAGGAGAAAAACAATTTGAGATTGTGCTTGT
CCCGGGTGAATACATCAAATCGGTGGAAGCAACTTATGATAAGACAAGCTTCTTTCGCAA
CACGGTCCTTACGTCGCTTAAGCTCGAAACATCAGCGGGGAGAACAAGTTTCTTTGGGTA
TAAGACGGGTAAAATGTTTGTCCTGAAACAAAAGGATCGAAGACTTGTGGGATTCCATGG
AAGAAAAGGCGACGCTATTGATGCAGTTGGAGCCTATTTTGTACCTATTCCTACTCCTGT
TCCTGTGATTCCAGCCACAAAACTACCAGCGGTAGGTGGAAAGGGAGGAGTTGCATGGGA
TGA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2FG62TF 762 0 0
G
GCTCTGGACGCTATTGGAGTTTACTTTGCACTGGACTCTCTGACTACACCGACCCCTGTT
TACAAGCTGGAAGCTCAAGGTGGTACAGAGGGGCGTGTTTGGG*ATGATGGTCTTTACGA
TGGTGTTAAAACCATGCGGATTGGTCAAGATAATAGCCGT*TCACTTATTTAGAGTGTGA
GTACGTGAAAGGTGGGAAATTGGAGACGCGTTGCCATGGGAAGAAAGGAGAAAAACAATT
TGAGATTGTGCTTGTCCCGGGTGAATACATCAAATCGGTGGAGGCAACTTATGATAAGAC
AAGCTTCTTTCGCAACACGGTCCTTACGTCGCTTAAGCTCGAAACATCAGCGGGGAGAAC
AAGTTTCTTTGGGTATAAGACGGGTAAAATGTTTGTCCTGAAACAAAAGGATCGAAGACT
TGTGGGATTCCATGGAAGAGAAGGCGACGCTATTGATGCAGTTGGAGCCTATTTTGCACC
TATTCCTACTCCTGTTCCTGTGATTCCAGCCACAAAACTACCAGCGGTAGGTGGAAAGGG
AGGAGTTGCATGGGATGATGGTGTCTACGATGGTGTTAGGAAGATATACGTAGGACAAGG
TAATGATGGTGTGTCCTTTGTTAAGTTTGAGTACGTTAAAGGGACAAGCTTGGTATCTGG
AGATGACCATGGGAAGAAGACAATACTCGGAGCTGAAGAGTTTGTGTTAGAAGATGGTGA
ATACCTCACGGTTTTGGAAG*CTACTACGATAAGATCTTTG

QA 2 762 2 762
DS 

RD RR2B245JQ 856 0 0
GAGTGTGAGTACGTGAAAGGTGGGAAATTGGAGACGCGTTGCCATGGGAAGAAGGGAGAA
AAACAATTTGAGATTGTGCTTGTCCCGGGTGAATACATCAAATCGGTGGAAGCAACTTAT
GATAAGACAAGCTTCTTTCGCAACACGGTCCTTACGTCGCTTAAGCTCGAAACATCAGCG
GGGAGAACAAGTTTCTTTGGGTATAAGACGGGTAAAATGTTCGTCCTGAAACAAAAGGAT
CGAAGACTTGTGGGATTCCATGGAAGAGAAGGCGACGCTATTGATGCAGTTGGAGCCTAT
TTTGCACCTATTCCTACTCCTGTTCCTGTGATTCCAGCCACAAAACTACCAGCGGTAGGT
GGAAAGGGAGGAGTTGCATGG*ATGATGGTGTCTACGATGGTGTTAGGAAGACATACGTA
GGACAAGGTAATGATGGTGTGTCCTTTGTTAAGTTTGAGTACGTTAAAGGGACAAACTTG
GTATCTGGAGATGACCATGGGAAGAAGACAATACTCGGAGCTGAAGAGTTTGTGTTAGAA
GATGGTGAATACCTCACGGTTTTGGAAGGCTACTACGATAAGATCTTTGGAGTGCAGGAA
CCGGTGATTATCTCTCTTAAGTTCAAGACAAACAAAAGGGATTCAATTCCGTTTGGAATG
AATTCCGGTGAGAAGTTCTCACTCGGGGAGAAAGGCCACAAGATCGTCGGGTTCCATGGG
CAAGCTAGTGATGTTCTTCACAGTGTTGGAGTTACTGTTGTTCCCATCACCCCTACCAAG
TGAAACATGCATCTATTGTATGAATAATACTGAATGAACTTTTAATCAGATTGTCCTGTG
TTCCCTTGACGCTGC
C

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR2AK20JQ 860 0 0
GACGCGTTGCCATGGGAAGAAAGGAGAAAAACAATTTGAGATTGTGCTTGTCCCGGGTGA
ATACATCAAATCGGTGGAAGCAACTTATGATAAGACAAGCTTCTTTCGCAACACGGTCCT
TACGTCGCTTAAGCTCGAAACATCAGCGGGGAGAACAAGTTTCTTTGGGTATAAGACGGG
TAAAATGTTTGTCCTGAAACAAAAGGATCGAAGACTTGTGGGATTCCATGGAAGAGAAGG
CGACGCTATTGATGCAGTTGGAGCCTATTTTGCACCTATTCCTACTCCTGTTCCTGTGAT
TCCAGCCACAAAACTACCAGCGGTAGGTGGAAAGGGAGGAGTTGCATGGGATGATGGTGT
CTACGATGGTGTTAGGAAGATATACGTAGGACAAGGTAATGATGGTGTGTCCTTTGTTAA
GTTTGAGTACGTTAAAGGGACAAACTTGGTATCTGGAGATGACCATGGGAAGAAGACAAT
ACTCGGAGCTGAAGAGTTTGTGTTAGAAGATGGTGAATACCTCACGGTTTTGGAAGGCTA
CTACGATAAGATCTTTGGAGTGCAGGAACCGGTGATTATCTCTCTTAAGTTCAAGACAAA
CAAAAGGGATTCAATTCCGTTTGGAATGAATTCCGGTGAGAAGTTCTCACTCGGGGAGAA
AGGCCACAAGATCGTCGGGTTCCATGGGCAAGCTAGTGATGTTCTTCACAGTGTTGGAGT
TACTGTTGTTCCCATCACCCCTACCAAGTGAAACATGCATCTATTGTATGAATAATACTG
AATGAACTTTTAATCAGATTGTCCTGTGTTCCCTTGACGCTGCTACTTTCATTGTACTTT
TAATGGTATTTACTTTGAAT

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR2B477JQ 840 0 0
ATTGTGCTTGTCCCGGGTGAATACATCAAATCGGTGGAAGCAACTTATGATAAGACAAGC
TTCTTTCGCAACACGGTCCTTACGTCGCTTAAGCTCGAAACATCAGCGGGGAGAACAAGT
TTCTTTGGGTATAAGACGGGTAAAATGTTTGTCCTGAAACAAAAGGATCGAAGACTTGTG
GGATTCCATGGAAGAGAAGGCGACGCTATTGATGCAGTTGGAGCCTATTTTGCACCTATT
CCTACTCCTGTTCCTGTGATTCCAGCCACAAAACTACCAGCGATAGGTGGAAAGGGAGGA
GTTGCATGGGATGATGGTGTCTACGATGGTGTTAGGAAGATATACGTAGGACAAGGTAAT
GATGGTGTGTCCTTTGTTAAGTTTGAGTACGTTAAAGGGACAAACTTGGTATCTGGAGAT
GACCATGGGAAGAAGACAATACTCGGAGCTGAAGAGTTTGTGTTAGAAGATGGTGAATAC
CTCACGGTTTTGGAAGGCTACTACGATAAGATCTTTGGAGTGCAGGAACCGGTGATTATC
TCTCTTAAGTTCAAGACAAACAAAAGGGATTCAATTCCGTTTGGAATGAATTCCGGTGAG
AAGTTCTCACTCGGGGAGAAAGGCCACAAGATCGTCGGGTTCCATGGGCAAGCTAGTGAT
GTTCTTCACAGTGTTGGAGTTACTGTTGTTCCCATCACCCCTACCAAGTGAAACATGCAT
CTATTGTATGAATAATACTGAATGAACTTTTAATCAGATTGTCCTGTGTTCCCTTGACGC
TGCTACTTTCATTGTACTTTTAATGGTATTTACTTTGAATAATAAAGTCTATCGGTTCTT

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2EJ32JQ 762 0 0
ACGTCGCTTAAGCTCGAAACATCAGCGGGGAGAACAAGTTTCTTTGGGTATAAGACGGGT
AAAATGTTTGTCCTGAAACAAAAGGATCGAAGACTTGTGGGATTCCATGGAAGAGAAGGC
GACGCTATTGATGCAGTTGGAGCCTATTTTGCACCTATTCCTACTCCTGTTCCTGTGATT
CCAGCCACAAAACTACCAGCGGTAGGTGGAAAGGGAGGAGTTGCATGGGATGATGGTGTC
TACGATGGTGTTAGGAAGATATACGTAGGACAAGGTAATGATGGTGTGTCCTTTGTTAAG
TTTGAGTACGTTAAAGGGACAAACTTGGTATCTGGAGATGACCATGGGAAGAAGACAATA
CTCGGAGCTGAAGAGTTTGTGTTAGAAGATGGTGAATACCTCACGGTTTTGGAAGGCTAC
TACGATAAGATCTTTGGAGTGCAGGAACCGGTGATTATCTCTCTTAAGTTCAAGACAAAC
AAAAGGGATTCAATTCCGTTTGGAATGAATTCCGGTGAGAAGTTCTCACTCGGGGAGAAA
GGCCACAAGATCGTCGGGTTCCATGGACAAGCTAGTGATGTTCTTCACAGTGTTGGAGTT
ACTGTTGTTCCCATCACCCCTACCAAGTGGAACATGCATCTATTGTATGAATAATACTGA
ATGAACTTTTAATCAGATTGTCCTGTGTTCCCTTGACGCTGCTACTTTCATTGTACTTTT
AATGGTATTTACTTTGAATAATAAAGTCTATCGGTTCTTTTC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 2 11

CO CL521Contig1 884 6 6 U
AAAAAATTGTCATTCATAAAATCATCAGATTTTCACAAGGCAGTGGAATAATATACATTT
TCTTATTATTAGCAAGAGATGACTCTTTTCTCTACAAGCAATCTTAAAAGAAAAGGGACA
TCAAACATACCCAAGCAAACACACAACCATCAAACCAACCAACAAGCAAACATCAAACAA
CCACAAACCCAGTTAATTTAAACTCGGATCTCGCGGGTTTCAACAGATTCGTAAGGAGAA
CCGATGAACACGTCTCCGTAGATAAGTCCAGCAAGTGCACCACCAACGAGTGGACCCACC
CAGTATATCCAGATTTGTGACAAGTCTCCACTTACAATAGCTGGTCCGAACGACCTTGCC
GGGTTCATGGAGCCACCGCTAAATGGACCGGCAGCGAGGATGTTGGCACCAACGATGAAA
CCAATAGCGATTGGTGCGATGGTTCCGAGCGAACCTTTCTTTGGATCAGCAGCTGTGGCG
TAAACGGTGTAGACCAAAGCAAAGGTCACAATGATCTCCATCACGATAGCTTCGACCGCT
CCTAAACCGGCGCCAACTCCGTGGGTTGGTACGCTCTCGCCGTTGGTAACAAAGACAAGG
AGAAGGCATGCAACGATGGAGCCAAGACACTGAGCAACCCAGTACAAGAAACCTGTGATC
AGTGTGATGTTTCCTCCGACAGCAAGACCGAGAGTCACGGCTGGGTTTAAGTGGCCACCA
GAGATGTTAGCTGCAACCGAAACTCCGACAAACAACGCGAAGGCGTGAGCTACCGCAATA
GCCACAAGACCAGCTGGGTCCAAGCTGCATCAGAGGTTATCTTACCAAAGCATAGCAGAG
CCACACCAGCGAATACAAGATAAGAGTGCGATGACTCAGACAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C767JQ U 45
AF RR2C133JQ U 43
AF RR2GC79JQ U 50
AF RR2CD03TF C 14
AF RR2AK88JQ U 1
AF RR2FP15JQ U 50
BS 1 247 RR2AK88JQ
BS 248 248 RR2C133JQ
BS 249 595 RR2AK88JQ
BS 596 596 RR2C133JQ
BS 597 800 RR2AK88JQ
BS 801 884 RR2FP15JQ

RD RR2C767JQ 414 0 0
GGAATAATATACATTTTCTTATTATTAGCAAGAGATGACTCTTTTCTCTACAAGCAATCT
TAAAAGAAAAGGGACATCAAACATACCCAAGCAAACACACAACCATCAAACCAACCAACA
AGCAAACATCAAACAACCACAAACCCAGTTAATTTAAACTCGGAACTCGCGGGTTTCAAC
AGATTCGTAAGGAGAACCGATGAACACGTCTCCGTAGATAAGTCCAGCAAGTGCACCACC
AACGAGTGGACCCACCCAGTATATCCAGATTTGTGACAAGTCTCCACTTACAATAGCTGG
TCCGAACGACCTTGCCGGGTTCATGGAGCCACCGCTAAATGGACCGGCAGCGAGGATGTT
GGCACCAACGATGAAACCAATAGCGATTGGTGCGATGGTTCCGAGCGAACCTTT

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR2C133JQ 578 0 0
TT
GGAATAATATACATTTTCTTATTATTAGCAAGAGATGACTCTTTTCTCTACAGGAAATCT
TAAAAGAAAAGGGACATCAAACATACCCAAGCAAACACACAACCATCAAACCGACCAACA
AGCAAACATCAAACAACCACAAACCCGGTTAATT*AAACTCGGATCTCGCGGGTTTCAAC
AGATTCGTAAGGAGAACCGATGAACACGTCTCCGTAGATGAGTCCAGCAAGTGCACCACC
AACGAGTGGACCCACCCAGTATATCCAGATTTGTGACAAGTCTCCACTTACAATAGCTGG
TCCGAACGACCTTGCTGGGTTCATGGAGCCACCACTAAATGGACCGGCAGCGAGGATGTT
GGCACCAACGATGAAACCAATAGCGATTGGTGCGATGGTTCCGAGCGAACCTTTCTTTGG
ATCAGTAGCTGTGGCGTAAACGGTGTAGACCAAAGCAAAGGTCACAATGATCTCCATCAC
GATAGCTTCGACCGCTCCTAAACCGGCTCCAACTCCGTGGGTCGGTACGCTCTCGCCGTT
GGTAACGAAGACAAGGAGAAGGCATGCAACGATGGA

QA 3 578 3 578
DS 

RD RR2GC79JQ 709 0 0
AG
TATACATTTTCTTATTATTAGCAAGAGATGACTCTTTTCTCTACAGGAAATCTTAAAAGA
AAAGGGACATCAAACATACCCAAGCAAACACACAACCATCAAACCGACCAACAAGCAAAC
ATCAAACAACCACAAACCCGGTTAATT*AAACTCGGATCTCGCGGGTTTCAACAGATTCG
TAAGGAGAACCGATGAACACGTCTCCGTAGATGAGTCCAGCAAGTGCACCACCAACGAGT
GGACCCACCCAGTATATCCAGATTTGTGACAAGTCTCCACTTACAATAGCTGGTCCGAAC
GACCTTGCTGGGTTCATGGAGCCACCGCTAAATGGACCGGCAGCGAGGATGTTGGCACCA
ACGATGAAACCAATAGCGATTGGTGCGATGGTTCCGAGCGAACCTTTCTTTGGATCAGCA
GCTGTGGCGTAAACGGTGTAGACCAAAGCAAAGGTCACAATGATCTCCATCACGATAGCT
TCGACCGCTCCTAAACCGGCTCCAACTCCGTGGGTCGGTACGCTCTCGCCGTTGGTAACG
AAGACAAGGAGAAGGCATGCAACGATGGAGCCAAGACACTGAGCAACCCAGTACAAGAAA
CCTGTGATCAGTGTGATGTTTCCTCCAACAGCAAGACCGAGAGTCACGGCTGGGTTTAAG
TGGCCACCAGAGATGTTAGCTGCGACCGAAACTCCGACAAACAACGC

QA 3 709 3 709
DS 

RD RR2CD03TF 714 0 0
TCG
TAAAATCATCAGATTT*CACAAGGCAGTGGAATAATATACATTTTCTTATTATTAGCAAG
AGATGACTCTTTTCTCTACAAGCAATCTTAAAAGAAAAGGGACATCAAACATACCCAAGC
AAACACACAACCATCAAACCAACCAACAAGCAAACATCAAACAACCACAAACCCAGTTAA
TTTAAACTCGGATCTCGCGGGTTTCAACAGATTCGTAAGGAGAACCGATGAACACGTCTC
CGTAGATAAGTCCAGCAAGTGCACCACCAACGAGTGGACCCACCCAGTATATCCAGATTT
GTGACAAGTCTCCACTTACAATAGCTGGTCCGAACGACCTTGCCGGGTTCATGGAGCCAC
CGCTAAATGGACCGGCAGCGAGGATGTTGGCACCAACGATGAAACCAATAGCGATTGGTG
CGATGGTTCCGAGCGAACCTTTCTTTGGATCAGCAGCTGTGGCGTAAACGGTGTAGACCA
AAGCAAAGGTCACAATGATCTCCATCACGATAGCTTCGACCGCTCCTAAACCGGCGCCAA
CTCCGTGGGTTGGTACGCTCTCGCCGTTGGTAACAAAGACAAGGAGAAGGCATGCAACGA
TGGAGCCAAGACACTGAGCAACCCAGTACAAGAAACCTGTGATCAGTGTGATGTTTCCTC
CGACAGCAAGACCGAGAGTCACGGCTGGGTTTAAGTGGCCACCAGAGATG
C

QA 4 713 4 713
DS 

RD RR2AK88JQ 800 0 0
AAAAAATTGTCATTCATAAAATCATCAGATTTTCACAAGGCAGTGGAATAATATACATTT
TCTTATTATTAGCAAGAGATGACTCTTTTCTCTACAAGCAATCTTAAAAGAAAAGGGACA
TCAAACATACCCAAGCAAACACACAACCATCAAACCAACCAACAAGCAAACATCAAACAA
CCACAAACCCAGTTAATTTAAACTCGGATCTCGCGGGTTTCAACAGATTCGTAAGGAGAA
CCGATGAGCACGTCTCCGTAGATAAGTCCAGCAAGTGCACCACCAACGAGTGGACCCACC
CAGTATATCCAGATTTGTGACAAGTCTCCACTTACAATAGCTGGTCCGAACGACCTTGCC
GGGTTCATGGAGCCACCGCTAAATGGACCGGCAGCGAGGATGTTGGCACCAACGATGAAA
CCAATAGCGATTGGTGCGATGGTTCCGAGCGAACCTTTCTTTGGATCAGCAGCTGTGGCG
TAAACGGTGTAGACCAAAGCAAAGGTCACAATGATCTCCATCACGATAGCTTCGACCGCT
CCTAAACCGGCGCCAACTCCGTGGGTTGGTACGCTCTCGCCGTTGGTAACAAAGATAAGG
AGAAGGCATGCAACGATGGAGCCAAGACACTGAGCAACCCAGTACAAGAAACCTGTGATC
AGTGTGATGTTTCCTCCGACAGCAAGACCGAGAGTCACGGCTGGGTTTAAGTGGCCACCA
GAGATGTTAGCTGCAACCGAAACTCCGACAAACAACGCGAAGGCGTGAGCTACCGCAATA
GCCACAAGACCAGCTGGGTC

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2FP15JQ 835 0 0
AATATACATTTTCTTATTATTAGCAAGAGATGACTCTTTTCTCTACAAGCAATCTTAAAA
GAAAAGGGACATCAAACATACCCAAGCAAACACACAACCATCAAACCAACCAACAAGCAA
ACATCAAACAACCACAAACCCAGTTAATTTAAACTCGGATCTCGCGGGTTTCAACAGATT
CGTAAGGAGAACCGATGAACACGTCCCCGTAGATAAGTCCAGCAAGTGCACCACCAACGA
GTGGACCCACCCAGTATATCCAGATTTGTGACAAGTCTCCACTTACAATAGCTGGTCCGA
ACGACCTTGCCGGGTTCATGGAGCCACCGCTAAATGGACCGGCAGCGAGGATGTTGGCAC
CAACGATGAAACCAATAGCGATTGGTGCGATGGTTCCGAGCGAACCTTTCTTTGGATCAG
CAGCTGTGGCGTAAACGGTGTAGACCAAAGCAAAGGTCACAATGATCTCCATCACGATAA
CTTCGACCGTTCCTAAACCGGCGCCAACTCCGTGGGTTGGTACGCTCTCGCCGTTGGTAA
CAAAGACAAGGAGAAGGCATGCAACGATGGAGCCAAGACACTGAGCAACCCAGTACAAGA
AACCTGTGATCAGTGTGATGTTTCCTCCGACAGCAAGACCGAGAGTCACGGCTGGGTTTA
AGTGGCCACCAGAGATGTTAGCTGCAACCGAAACTCCGACAAACAACGCGAAGGCGTGAG
CTACCGCAATAGCCACAAGACCAGCTGGGTCCAAGCTGCATCAGAGGTTATCTTACCAAA
GCATAGCAGAGCCACACCAGCGAATACAAGATAAGAGTGCGATGACTCAGACAGT

QA 1 835 1 835
DS 



CO CL521Contig2 832 5 50 U
GGGCAGAGAAAAAAAACTAACACACCAAAAAAA*CCAACCAGAAGCAAAAGTCTTCGAGT
TTTTTAAAAA*TGGTTAAGATCGCAGTTGGAAGTTTGGGTGACTCATTCAGTGTTGCATC
TCTGAAGGCTTACTTGTCTGAGTTCATCGCAACTCTTATCTTTGTATTCGCTGGTGTTGG
CTCTGCTATTGCTTTTGGTAAGATAACCTCTGATGCAGCCTTGGACCCAGCTGGTCTTGT
GGCTATTGCGGTAGCTCACGCCTTCGCGTTGTTTGTCGGAGTTTCGGTTGCAGCTAACAT
CTCTGGTGGCCACTTAAACCCAGCCGTGACTCTCGGTCTTGCTGTCGGAGGAAACATCAC
ACTGATCACAGGTTTCTTGTACTGGGTTGCTCAGTGTCTTGGCTCCATCGTTGCATGCCT
TCTCCTTGTCTTTGTTACCAACGGCGAGAGCGTACCAACCCACGGAGTTGGCGCCGGTTT
AGGAGCGGTCGAAGCTATCGTGATGGAGATCATTGTGACCTTTGCTTTGGTCTACACCGT
TTACGCCACAGCTGCTGATCCAAAGAAAGGTTCGCTCGGAACCATCGCACCAATCGCTAT
TGGTTTCATCGTTGGTGCCAACATCCTCGCTGCCGGTCCATTTAGCGGTGGCTCCATGAA
CCCGGCAAGGTCGTTCGGACCAGCTATTGTAAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATATA
CTGGGTGGGTCCACTCGTTGGTGGTGCACTTGCTGGACTCATCTACGAGACGTGTTCATC
GGTTCTCCTTACGATCTGTTGAACCCGCGAGATCCGAGTTAATTAACTGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C133TF U 1
AF RR2C767TF U 3
AF RR2GC79TF U 1
AF RR2FP15TF U 3
AF RR2AK88TF U 4
BS 1 31 RR2C133TF
BS 32 33 RR2C767TF
BS 34 41 RR2C133TF
BS 42 42 RR2C767TF
BS 43 70 RR2C133TF
BS 71 71 RR2C767TF
BS 72 75 RR2C133TF
BS 76 76 RR2C767TF
BS 77 102 RR2C133TF
BS 103 103 RR2C767TF
BS 104 115 RR2C133TF
BS 116 116 RR2C767TF
BS 117 118 RR2C133TF
BS 119 119 RR2GC79TF
BS 120 180 RR2C133TF
BS 181 181 RR2C767TF
BS 182 198 RR2C133TF
BS 199 199 RR2C767TF
BS 200 213 RR2C133TF
BS 214 214 RR2C767TF
BS 215 217 RR2C133TF
BS 218 218 RR2C767TF
BS 219 225 RR2C133TF
BS 226 226 RR2C767TF
BS 227 252 RR2C133TF
BS 253 253 RR2C767TF
BS 254 288 RR2C133TF
BS 289 289 RR2C767TF
BS 290 345 RR2C133TF
BS 346 346 RR2C767TF
BS 347 361 RR2C133TF
BS 362 362 RR2GC79TF
BS 363 432 RR2C133TF
BS 433 433 RR2C767TF
BS 434 456 RR2C133TF
BS 457 457 RR2C767TF
BS 458 471 RR2C133TF
BS 472 472 RR2C767TF
BS 473 553 RR2C133TF
BS 554 554 RR2GC79TF
BS 555 645 RR2C133TF
BS 646 646 RR2GC79TF
BS 647 663 RR2C133TF
BS 664 664 RR2C767TF
BS 665 665 RR2C133TF
BS 666 714 RR2GC79TF
BS 715 715 RR2FP15TF
BS 716 779 RR2GC79TF
BS 780 783 RR2FP15TF
BS 784 832 RR2AK88TF

RD RR2C133TF 665 0 0
GGGCAGAGAAAAAAAACTAACACACCAAAAA***CCAACCAAAAGCAAAAGTCTTCGAGT
TTTTTAAAAAATGGTGAAGATCGCAGTTGGAAGTTTGGGTGATTCATTCAGTGTTTCACC
TCTGAAGGCTTACTTGTCTGAGTTCATCGCAACTCTTATCTTTGTATTCGCTGGTGTTGG
GTCTGCTATTGCTTTTGGCAAGATAACCTCTGACGCACCCTTGGATCCAGCTGGTCTTGT
GGCTATTGCGGTGGCTCACGCCTTCGCGTTGTTTGTCGGAGTTTCGGTCGCAGCTAACAT
CTCTGGTGGCCACTTAAACCCAGCCGTGACTCTCGGTCTTGCTGTTGGAGGAAACATCAC
ATTGATCACAGGTTTCTTGTACTGGGTTGCTCAGTGTCTTGGCTCCATCGTTGCATGCCT
TCTCCTTGTCTTCGTTACCAACGGCGAGAGCGTACCGACCCACGGAGTTGGAGCCGGTTT
AGGAGCGGTCGAAGCTATCGTGATGGAGATCATTGTGACCTTTGCTTTGGTCTACACCGT
TTACGCCACAGCTACTGATCCAAAGAAAGGTTCGCTCGGAACCATCGCACCAATCGCTAT
TGGTTTCATCGTTGGTGCCAACATCCTCGCTGCCGGTCCATTTAGTGGTGGCTCCATGAA
CCCAG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2C767TF 664 0 0
GGGC
AGAAAAAAAACTAACACACCAAAAAAAACCAACCAGAAGCAAAAGTCTTCGAGTTTTTTA
AAAA*TGGTTAAGATCGCAGTTGGAAGTTTGGGTGACTCATTCAGTGTTGCATCTCTGAA
GGCTTACTTGTCTGAGTTCATCGCAACTCTTATCTTTGTATTCGCTGGTGTTGGCTCTGC
TATTGCTTTTGGTAAGATAACCTCTGATGCAGCCTTGGACCCAGCTGGTCTTGTGGCTAT
TGCGGTAGCTCACGCCTTCGCGTTGTTTGTCGGAGTTTCGGTTGCAGCTAACATCTCTGG
TGGCCACTTAAACCCAGCCGTGACTCTCGGTCTTGCTGTCGGA**AAACATCACACTGAT
CACAGGTTTCTTGTACTGGGTTGCTCAGTGTCTTGGCTCCATCGTTGCATGCCTTCTCCT
TGTCTTTGTTACCAACGGCGAGAGCGTACCAACCCACGGAGTTGGCGCCGGTTTAGGAGC
GGTCGAAGCTATCGTGATGGAGATCATTGTGACCTTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGC
CACAGCTGCTGATCCAAAGAAAGGTTCGCTCGGAACCATCGCACCAATCGCTATTGGTTT
CATCGTTGGTGCCAACATCCTCGCTGCCGGTCCATTTAGCGGTGGCTCCATGAACCCGGC

QA 5 664 5 664
DS 

RD RR2GC79TF 779 0 0
GGACAG
AGAAAAAAAACTAACACACCAAAAA***CCAACCAAAAGCAAAAGTCTTCGAGTTTTTTA
AAAAATGGTGAAGATCGCAGTTGGAAGTTTGGGTGATTCATTCAGTGTTTCATCTCTGAA
GGCTTACTTGTCTGAGTTCATCGCAACTCTTATCTTTGTATTCGCTGGTGTTGGGTCTGC
TATTGCTTTTGGCAAGATAACCTCTGACGCACCCTTGGATCCAGCTGGTCTTGTGGCTAT
TGCGGTGGCTCACGCCTTCGCGTTGTTTGTCGGAGTTTCGGTCGCAGCTAACATCTCTGG
TGGCCACTTAAACCCAGCCGTGACTCTCGGTCTTGCTGTTGGAGGAAACATCACACTGAT
CACAGGTTTCTTGTACTGGGTTGCTCAGTGTCTTGGCTCCATCGTTGCATGCCTTCTCCT
TGTCTTCGTTACCAACGGCGAGAGCGTACCGACCCACGGAGTTGGAGCCGGTTTAGGAGC
GGTCGAAGCTATCGTGATGGAGATCATTGTGACCTTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGC
CACAGCTGCTGATCCAAAGAAAGGTTCGCTCGGAACCATCGCACCAATCGCTATTGGTTT
CATCGTTGGTGCCAACATCCTCGCTGCCGGTCCATTTAGCGGTGGCTCCATGAACCCAGC
AAGGTCGTTCGGACCAGCTATTGTAAGTGGAGACTTGTCACAAATCTG*ATATACTGGGT
GGGTCCACTCGTTGGTGGTGCACTTGCTGGACTCATCTACGAGACGTGTTCAT

QA 7 779 7 779
DS 

RD RR2FP15TF 788 0 0
AGGC
AGAAAAAAAACTAACACACCAAAAAAA*CCAACCAGAAGCAAAAGTCTTCGAGTTTTTTA
AAAA*TGGTTAAGATCGCAGTTGGAAGTTTGGGTGACTCATTCAGTGTTGCATCTCTGAA
GGCTTACTTGTCTGAGTTCATCGCAACTCTTATCTTTGTATTCGCTGGTGTTGGCTCTGC
TATTGCTTTTGGTAAGATAACCTCTGATGCAGCCTTGGACCCAGCTGGTCTTGTGGCTAT
TGCGGTAGCTCACGCCTTCGCGTTGTTTGTCGGAGTTTCGGTTGCAGCTAACATCTCTGG
TGGCCACTTAAACCCAGCCGTGACTCTCGGTCTTGCTGTCGGAGGAAACATCACACTGAT
CACAGGTTTCTTGTACTGGGTTGCTCAGTGTCTTGGCTCCATCGTTGCATGCCTTCTCCT
TGTCTTTGTTACCAACGGCGAGAGCGTACCAACCCACGGAGTTGGCGCCGGTTTAGGAAC
GGTCGAAGTTATCGTGATGGAGATCATTGTGACCTTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGC
CACAGCTGCTGATCCAAAGAAAGGTTCGCTCGGAACCATCGCACCAATCGCTATTGGTTT
CATCGTTGGTGCCAACATCCTCGCTGCCGGTCCATTTAGCGGTGGCTCCATGAACCCGGC
AAGGTCGTTCGGACCAGCTATTGTAAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATATACTGGGT
GGGTC*ACTCGTTGGTGGTGCACTTGCTGGACT*ATCTACGGGACGTGTTCATCGGT
CTCCTTA

QA 5 781 5 781
DS 

RD RR2AK88TF 829 0 0
GGC
AGAAAAAAAACTAACACACCAAAAAAA*CCAACCAGAAGCAAAAGTCTTCGAGTTTTTTA
AAAA*TGGTTAAGATCGCAGTTGGAAGTTTGGGTGACTCATTCAGTGTTGCATCTCTGAA
GGCTTACTTGTCTGAGTTCATCGCAACTCTTATCTTTGTATTCGCTGGTGTTGGCTCTGC
TATTGCTTTTGGTAAGATAACCTCTGATGCGGCCTTGGACCCAGCTGGTCTTGTGGCTAT
TGCGGTAGCTCACGCCTTCGCGTTGTTTGTCGGAGTTTCGGTTGCAGCTAACATCTCTGG
TGGCCACTTAAACCCAGCCGTGACTCTCGGTCTTGCTGTCGGAGGAAACATCACACTGAT
CACAGGTTTCTTGTACTGGGTTGCTCAGTGTCTTGGCTCCATCGTTGCATGCCTTCTCCT
TATCTTTGTTACCAACGGCGAGAGCGTACCAACCCACGGAGTTGGCGCCGGTTTAGGAGC
GGTCGAAGCTATCGTGATGGAGATCATTGTGACCTTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGC
CACAGCTGCTGATCCAAAGAAAGGTTCGCTCGGAACCATCGCACCAATCGCTATTGGTTT
CATCGTTGGTGCCAACATCCTCGCTGCCGGTCCATTTAGCGGTGGCTCCATGAACCCGGC
AAGGTCGTTCGGACCAGCTATTGTAAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATATACTGGGT
GGGTCCACTCGTTGGTGGTGCACTTGCTGGACTTATCTACGAGACGTGCTCATCGGTTCT
CCTTACGATCTGTTGAACCCGCGAGATCCGAGTTAATTAACTGGGT

QA 4 829 4 829
DS 



AS 1 11

CO CL522Contig1 984 11 4 U
GTGAAACATTCATACAAGAGCTGGCGACAAAATGAAATAGTCCCAGAAACAAAAACCCAT
AAGAAGCGGTAACTGAAACCCACATCGGGCGACTTAAACCCACACCGGGGTGCCTTAAAG
ATAGAATAAATCTACACCATAACATCTATGCAGGAACATATAACAGAAAGACTAGCAATC
TTTAAAACTAAGCAAAGACCAATGATGGGGAGTTACCGCTACTGCCCATAGCCCGTCACC
CGGTAACCACCACTTCTGTACTCAAACCACGACCTATCGCTGCTGCCTTGCCCGCCAAAC
GATAAGACCAAGAACCCGAGGCTTCAAAACTTAACAAGGGGAACCACTGCCCGGTCCACG
CGCCTTGTAAACTGATATAACGTAAAAACGTCCAGTTCCGTACAAAGAAGCTCTCCCAAC
ACACCAAGAAGATGAAGCCTTGCCAATCTAACCTCCCGGTACCATATCCGGAGGAAGAAA
CCAACGGCAAGCAACCATTAGAAACAATACCCAAGAAAAAAGACTGCTAATCCAAGTGCC
AAACTCCAGACAAAAAGACATCTTAAAACTTAGTAGATCGAAAGAGAGAAACCTGATAAA
GAACACTCGCTGAAAAGAGAGGAGATTAAAGCTCCAAAAGAGACATAAAAAAGACCAATG
AAATCAGGCTATGAACAGCCATACATCGCAAATCAACAGAGTTGACCAAACCAATAAAAA
CGCTCACCAATCAAGTATATCTACCCTTTTAAGATTTCAAACCCAACAAATCAAACGAGG
ACAACAGGGATCTCAGATCTAGACCGAAAGAACTACAAAATATAAATACCAACATAAAAC
ACGATAAGGAACCGACGCCGGTGCTATCTAAGCCACCGCACGCCGGTCCCCCCCAAGAGA
CCTCGAAACGGAAGGGATGAAGTTCTACGGCGCCGAGAGAGAAAAATACTGTTTCAGATC
TGTTTTTCGTTTATGATCATCTCC


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2DB24JQ U 1
AF RR2EC84JQ U 1
AF RR2H860JQ U 1
AF RR2DR89JQ U 1
AF RR2H105JQ U 1
AF RR2BA50JQ U 1
AF RR2BA50TF C 148
AF RR2H105TF C 299
AF RR2H860TF C 432
AF RR2DB24TF C 369
AF RR2DR89TF C 443
BS 1 781 RR2BA50JQ
BS 782 941 RR2BA50TF
BS 942 981 RR2H105TF
BS 982 984 RR2DR89TF

RD RR2DB24JQ 556 0 0
GTGAAACATTCATACAAGAGCTGGCGACAAAATGAAATAGTCCCAGAAACAAAAACCCAT
AAGAAGCGGTAACTGAAACCCACATCGGGCGACTTAAACCCACACCGGGGGGCCTTAAAG
ATAGAATAAATCTACACCATAACATCTATGCAGGAACATATAACAGAAAGACTAGCAATC
TTTAAAACTAAGCAAAGACCAATGATGGGGAGTTACCGCTACTGCCCATAGCCCGTCACC
CGGTAACCACCACTTCTGTACTCAAACCACGACCTATCGCTGCTGCCTTGCCCGCCAAAC
GATAAGACCAAGAACCCGAGGCTTCAAAACTTAACAAGGGGAACCACTGCCCGGTCCACG
CGCCTTGTAAACTGATATAACGTAAAAACGTCCAGTTCCGTACAAAGAAGCTCTCCCAAC
ACACCAAGAAGATGAAGCCTTGCCAATCTAACCTCCCGGTACCATATCCGGAGGAAGAAA
CCAACGGCAAGCAACCATTAGAAACAATACCCAAGAAAAAAGACTGCTAATCCAAGTGCC
AAACTCCAGACAAAAA

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2EC84JQ 646 0 0
GTGAAACATTCATACAAGAGCTGGCGACAAAATGAAATAGTCCCAGAAACAAAAACCCAT
AAGAAGCGGTAACTGAAACCCACATCGGGCGACTTAAACCCACACCGGGGTGCCTTAAAG
ATAGAATAAATCTACACCATAACATCTATGCAGGAACATATAACAGAAAGACTAGCAATC
TTTAAAACTAAGCAAAGACCAATGATGGGGAGTTACCGCTACTGCCCATAGCCCGTCAAC
CGGTAACCACCACTTCTGTACTCAAACCACGACCTATCGCTGCTGCCTTGCCCGCCAAAC
GATAAGACCAAGAACCCGAGGCTTCAAAACTTAACAAGGGGAACCACTGCCCGGTCCACG
CGCCTTGTAAACTGATATAACGTAAAAACGTCCAGTTCCGTACAAAGAAGCTCTCCCAAC
ACACCAAGAAGATGAAGCCTTGCCAATCTAACCTCCCGGTACCATATCCGGAGGAAGAAA
CCAACGGCAAGCAACCATTAGAAACAATACCCAAGAAAAAAGACTGCTAATCCAAGTGCC
AAACTCCAGACAAAAAGACATCTTAAAACTTAGTAGATCGAAAGAGAGAAACCTGATAAA
GAACACTCGCTGAAAAGAGAGGAGATTAAAGCTCCAAAAGAGACAT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2H860JQ 714 0 0
GTGAAACATTCATACAAGAGCTGGCGACAAAATGAAATAGTCCCAGAAACAAAAACCCAT
AAGAAGCGGTAACTGAAACCCACATCGGGCGACTTAAACCCACACCGGGGTGCCTTAAAG
ATAGAATAAATCTACACCATAACATCTATGCAGGAACATATAACAGAAAGACTAGCAATC
TTTAAAACTAAGCAAAGACCAATGATGGGGAGTTACCGCTACTGCCCATAGCCCGTCACC
CGGTAACCACCACTTCTGTACTCAAACCACGACCTATCGCTGCTGCCTTGCCCGCCAAAC
GATAAGACCAAGAACCCGAGGCTTCAAAACTTAACAAGGGGAACCACTGCCCGGTCCACG
CGCCTTGTAAACTGATATAACGTAAAAACGTCCAGTTCCGTACAAAGAAGCTCTCCCAAC
ACACCAAGAAGATGAAGCCTTGCAAATCTAACCTCCCGGTACCATATCCGGAGGAAGAAA
CCAACGGCAAGCAACCATTAGAAACAATACCCAAGAAAAAAGACTGCTAATCCAAGTGCC
AAACTCCAGACAAAAAGACATCTTAAAACTTAGTAGATCGAAAGAGAGAAACCTGATAAA
GAACACTCGCTGAAAAGAGAGGAGATTAAAGCTCCAAAAGAGACATAAAAAAGACCAATG
AAATCAGGCTATGAACAGCCATACATCGCAAATCAACAGAGTTGACCAAACCAA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2DR89JQ 749 0 0
GTGAAACATTCATACAAGAGCTGGCGACAAAATGAAATAGTCCCAGAAACAAAAACCCAT
AAGAAGCGGTAACTGAAACCCACATCGGGCGACTTAAACCCACACCGGGGTGCCTTAAAG
ATAGAATAAATCTACACCATAACATCTATGCAGGAACATATAACAGAAAGACTAGCAATC
TTTAAAACTAAGCAAAGACCAATGATGGGGAGTTACCGCTACTGCCCATAGCCCGTCACC
CGGTAACCACCACTTCTGTACTCAAACCACGACCTATCGCTGCTGCCTTGCACGCCAAAC
GATAAGACCAAGAACCCGAGGCTTCAAAACTTAACAAGGGGAACCACTGCCCGGTCCACG
CGCCTTGTAAACTGATATAACGTAAAAACGTCCAGTTCCGTACAAAGAAGCTCTCCCAAC
ACACCAAGAAGATGAAGCCTTGCCAATCTAACCTCCCGGTACCATATCCGGAGGAAGAAA
CCAACGGCAAGCAACCATTAGAAACAATACCCAAGAAAAAAGACCGCTAATCCAAGTGCC
AAACTCCAGACAAAAAGACATCTTAAAACTTAGTAGATCGAAAGAGAGAAACCTGATAAA
GAACACTCGCTGAAAAGAGAGGAGATTAAAGCTCCAAAAGAGACATAAAAAAGACCAATG
AAATCAGGCTATGAACAGCCATACATCGCAAATCAACAGAGTTGACCAAACCAATAAAA*
CGCTCACCAATCAAGTGTATCTACCCTTT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2H105JQ 780 0 0
GTGAAACATTCATACAAGAGCTGGCGACAAAATGAAATAGTCCCAGAAACAAAAACCCAT
AAGAAGCGGTAACTGAAACCCACATCGGGCGACTTAAACCCACACCGGGGTGCCTTAAAG
ATAGAATAAATCTACACCATAACATCTATGCAGGAACATATAACAGAAAGACTAGCAATC
TTTAAAACTAAGCAAAGACCAATGATGGGGAGTTACCGCTACTGCCCATAGCCCGCCACC
CGGTAACCACCACTTCTGTACTCAAACCACGACCTATCGCTGCTGCCTTGCCCGCCAAAC
GATAAGACCAAGAACCCGAGGCTTCAAAACTTAACAAGGGGAACCACTGCCCGGTCCACG
CGCCTTGTAAACTGATATAACGTAAAAACGTCCAGTTCCGTACAAAGAAGCTCTCCCAAC
ACACCAAGAAGATGAAGCCTTGCCAATCTAACCTCCCGGTACCATATCCGGAGGAAGAAA
CCAACGGCAAGCAACCATTAGAAACAATACCCAAGAAAAAAGACTGCTAATCCAAGTGCC
AAACTCCAGACAAAAAGACATCTTAAAACTTAGTAGATCGAAAGAGAGAAACCTGATAAA
GAACACTCGCTGAAAAGAGAGGAGATTAAAGCTCCAAAAGAGACATAAAAAAGACCAATG
AAATCAGGCTATGAACAGCCATACATCGCAAATCAACAGAGTTGACCAAACCAATAAAAA
CGCTCACCAATCAAGTATATCTACCCTTTTAAGATTTCAAACCCAACAAATCAAACGAGG

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2BA50JQ 781 0 0
GTGAAACATTCATACAAGAGCTGGCGACAAAATGAAATAGTCCCAGAAACAAAAACCCAT
AAGAAGCGGTAACTGAAACCCACATCGGGCGACTTAAACCCACACCGGGGTGCCTTAAAG
ATAGAATAAATCTACACCATAACATCTATGCAGGAACATATAACAGAAAGACTAGCAATC
TTTAAAACTAAGCAAAGACCAATGATGGGGAGTTACCGCTACTGCCCATAGCCCGTCACC
CGGTAACCACCACTTCTGTACTCAAACCACGACCTATCGCTGCTGCCTTGCCCGCCAAAC
GATAAGACCAAGAACCCGAGGCTTCAAAACTTAACAAGGGGAACCACTGCCCGGTCCACG
CGCCTTGTAAACTGATATAACGTAAAAACGTCCAGTTCCGTACAAAGAAGCTCTCCCAAC
ACACCAAGAAGATGAAGCCTTGCCAATCTAACCTCCCGGTACCATATCCGGAGGAAGAAA
CCAACGGCAAGCAACCATTAGAAACAATACCCAAGAAAAAAGACTGCTAATCCAAGTGCC
AAACTCCAGACAAAAAGACATCTTAAAACTTAGTAGATCGAAAGAGAGAAACCTGATAAA
GAACACTCGCTGAAAAGAGAGGAGATTAAAGCTCCAAAAGAGACATAAAAAAGACCAATG
AAATCAGGCTATGAACAGCCATACATCGCAAATCAACAGAGTTGACCAAACCAATAAAAA
CGCTCACCAATCAAGTATATCTACCCTTTTAAGATTTCAAACCCAACAAATCAAACGAGG
A

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2BA50TF 794 0 0
ATGCAGGAACATATAACAGAAAGACTAGCAATCTTTAAAACTAAGCAAAGACCAATGATG
GGGAGTTACCGCTACTGCCCATAGCCCGTCACCCGGTAACCACCACTTCTGTACTCAAAC
CACGACCTATCGCTGCTGCCTTGCCCGCCAAACGATAAGACCAAGAACCCGAGGCTTCAA
AACTTAACAAGGGGAACCACTGCCCGGTCCACGCGCCTTGTAAACTGATATAACGTAAAA
ACGTCCAGTTCCGTACAAAGAAGCTCTCCCAACACACCAAGAAGATGAAGCCTTGCCAAT
CTAACCTCCCGGTACCATATCCGGAGGAAGAAACCAACGGCAAGCAACCATTAGAAACAA
TACCCAAGAAAAAAGACTGCTAATCCAAGTGCCAAACTCCAGACAAAAAGACATCTTAAA
ACTTAGTAGATCGAAAGAGAGAAACCTGATAAAGAACACTCGCTGAAAAGAGAGGAGATT
AAAGCTCCAAAAGAGACATAAAAAAGACCAATGAAATCAGGCTATGAACAGCCATACATC
GCAAATCAACAGAGTTGACCAAACCAATAAAAACGCTCACCAATCAAGTATATCTACCCT
TTTAAGATTTCAAACCCAACAAATCAAACGAGGACAACAGGGATCTCAGATCTAGACCGA
AAGAACTACAAAATATAAATACCAACATAAAACACGATAAGGAACCGACGCCGGTGCTAT
CTAAGCCACCGCACGCCGGTCCCCCCCAAGAGACCTCGAAACGGAAGGGATGAAGTTCTA
CGGCGCCGAGAGAG

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2H105TF 686 0 0
AACGAT
AGACCAAGAACCCGAGGCTTCAAAACTTAACAAGGGGAACCACTGCCCGGTCCACGCGCT
TTGTAAACTGATATAACGTAAAAACGTCCAGTTCCGTACAAAGAAGCTCTCCCAACACAC
CAAGAAGATGAAGCCTTGCCAATCTAACCTCCCGGTACCATATCCGGAGGAAGAAACCAA
CGGCAAGCAACCATTAGAAACAATACCCAAGAAAAAAGACTGCTAATCCAAGTGCCAAAC
TCCAGACAAAAAGACATCTTAAAACTTAGTAGATCGAAAGAGAGAAACCTGATAAAGAAC
ACTCGCTGAAAAGAGAGGAGATTAAAGCTCCAAAAGAGACATAAAAAAGACCAATGAAAT
CAGGCTATGAACAGCCATACATCGCAAATCAACAGAGTTGACCAAACCAATAAAAACGCT
CACCAATCAAGTATATCTACCCTTTTAAGATTTCAAACCCAACAAATCAAACGAGGACAA
CAGGGATCTCAGATCTAGACCGAAAGAACTACAAAATATAAATACCAACATAAAACACGA
TAAGGAACCGACGCCGGTGCTATCTAAGCCACCGCACGCCGGTCCCCCCCAAGAGACCTC
GAAACGGAAGGGATGAAGTTCTACGGCGCCGAGAGAGAAAAATACTGTTTCAGATCTGTT
TTTCGTTTATGATCATC
TCC

QA 7 683 7 683
DS 

RD RR2H860TF 553 0 0
ATGAAGCCTTGCAAATCTAACCTCCCGGTACCATATCCGGAGGAAGAAACCAACGGCAAG
CAACCATTAGAAACAATACCCAAGAAAAAAGACTGCTAATCCAAGTGCCAAACTCCAGAC
AAAAAGACATCTTAAAACTTAGTAGATCGAAAGAGAGAAACCTGATAAAGAACACTCGCT
GAAAAGAGAGGAGATTAAAGCTCCAAAAGAGACATAAAAAAGACCAATGAAATCAGGCTA
TGAACAGCCATACATCGCAAATCAACAGAGTTGACCAAACCAATAAAAACGCTCACCAAT
CAAGTATATCTACCCTTTTAAGATTTCAAACCCAACAAATCAAACGAGGACAACAGGGAT
CTCAGATCTAGACCGAAAGAACTACAAAATATAAATACCAACATAAAACACGATAAGGAA
CCGACGCCGGTGCTATCTAAGCCACCGCACGCCGGTCCCCCCCAAGAGACCTCGAAACGG
AAGGGATGAAGTTCTACGGCGCCGAGAGAGAAAAATACTGTTTCAGATCTGTTTTTCGTT
TATGATCATC
TCC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2DB24TF 615 0 0
AAACTGATATAACGTAAAAACGTCCAGTTCCGTACAAAGAAGCTCTCCCAACACACCAAG
AAGATGAAGCCTTGCCAATCTAACCTCCCGGTACCATATCCGGAGGAAGAAACCAACGGC
AAGCAACCATTAGAAACAATACCCAAGAAAAAAGACTGCTAATCCAAGTGCCAAACTCCA
GACAAAAAGACATCTTAAAACTTAGTAGATCGAAAGAGAGAAACCTGATAAAGAACACTC
GCTGAAAAGAGAGGAGATTAAAGCTCCAAAAGAGACATAAAAAAGACCAATGAAATCAGG
CTATGAACAGCCATACATCGCAAATCAACAGAGTTGACCAAACCAATAAAAACGCTCACC
AATCAAGTATATCTACCCTTTTAAGATTTCAAACCCAACAAATCAAACGAGGACAACAGG
GATCTCAGATCTAGACCGAAAGAACTACAAAATATAAATACCAACATAAAACACGATAAG
GAACCGACGCCGGTGCTGTCTAAGCCACCGCACGCCGGTCCCCCCCAAGAGACCTCGAAA
CGGAAGGGATGAAGTTCTACGGCGCCGAGAGAGAAAAAAACTGTTTCAGATCTGTTTTTC
GTTTATGATCATC
CC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2DR89TF 542 0 0
CCAATCTAACCTCCCGGTACCATATCCGGAGGAAGAAACCAACGGCAAGCAACCATTAGA
AACAATACCCAAGAAAAAAGACCGCTAATCCAAGTGCCAAACTCCAGACAAAAAGACATC
TTAAAACTTAGTAGATCGAAAGAGAGAAACCTGATAAAGAACACTCGCTGAAAAGAGAGG
AGATTAAAGCTCCAAAAGAGACATAAAAAAGACCAATGAAATCAGGCTATGAACAGCCAT
ACATCGCAAATCAACAGAGTTGACCAAACCAATAAAAACGCTCACCAATCAAGTGTATCT
ACCCTTTTAAGATTTCAAACCCAACAAATCAAACGAGGACAACAGGGATCTCAGATCTAG
ACCGAAAGAACTACAAAATATAAATACCAACATAAAACACGATAAGGAACCGACGCCGGT
GCTATCTAAGCCACCGCACGCCGGTCCCCCCCAAGAGACCTCGAAACGGAAGGGATGAAG
TTCTACGGCGCCGAGAGAGAAAAATACTGTTTCAGATCTGTTTTTCGTTTATGATCATCT
CC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 10

CO CL523Contig1 921 10 4 U
GGGAGTTTCACCACACTTAACGCTAGTCCAAATCAGAAGAGGATAAACTCTTCTCCTGTA
ACCAAAAAAATGGCTACTTCGTCTTCTCACTCACCATTCTCTGCAATCTTCAACGTCTCC
AAACCCAATCCATCTGTAAACCCTGCGGCTTTTCTCGTCCCTTCCTTGAAATTCTCCACC
GCCATATCGAATTTCGCGAATCTGAGCAATGGGTTTTCTCTAAAATCTCCGATTAATCCT
GGGTTTCTCTTCAAGTCCCGAACTTTCAACGTTCAAGCCAGAGCTGCTGCTGAGAAGACC
GTTCACGATTTCACTGTAAAGGACATTGATGGGAGTGATGTTTCTTTGAACAAGTATAAG
GGGAAAGTTATGTTGATCGTCAATGTCGCTTCAAGATGTGGTTTGACATCATCAAATTAC
TCCGAGCTTTCACATCTGTACGAGAAATACAAGAGCCAAGGACTTGAGATTTTAGCTTTC
CCTTGCAATCAGTTTGGTGGCCAAGAGCCCGGTTCAAACACTGAGATCAAACAGTTTGCT
TGCACCCGGTTTAAAGCAGAGTTCCCTATATTTGATAAGGTCGATGTGAATGGACCGAGC
ACAGCACCAATCTACCAGTTCTTGAAATCAAACGCAGGAGGATTCTTGGGTGATCTCATT
AAATGGAACTTTGAGAAGTTCTTGATTGATAAAAAGGGAAAGGTTGTTGAGAGGTACCCT
CCCACCACATCCCCTTTCCAAATCGAGAAGGACATCAAGAAGTTGCTTGCTGATTAGTAA
CCTCTGCTCATGAGAGACCACACAGACTGGTTGTAAAATATTCAGTACTTGAAAGTTGAA
ACTCGGTTTTGCCAGTTATGGTTTGTATACAATGTAATGATATATATTTTATTATAATAC
TAAGTACGATAATAAGTTTCC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 

AF RR2BU41TF U 394
AF RR2FP95TF U 2
AF RR2A717TF U 1
AF RR2FN23TF U 2
AF RR2BA04TF U 2
AF RR2BA04JQ C 81
AF RR2FN23JQ C 293
AF RR2FP35JQ C 287
AF RR2FP35TF U 287
AF RR2FP95JQ C 289
BS 1 690 RR2A717TF
BS 691 749 RR2BA04TF
BS 750 750 RR2FP35TF
BS 751 921 RR2BA04TF

RD RR2BU41TF 181 0 0
AA
ATGTGGTTTGACATCATCAAATTACTCCGAGCTTTCACATCTGTACGAGAAATACAAGAG
CCAAGGACTTGAGATTTTAGCTTTCCCTTGCAATCAGTTTGGTGGCCAAGAGCCCGGTTC
AAACACTGAGATCAAACAGTTTGCTTGCACCCGGTTTAAAGCAGAGTTCCCTATATTTG

QA 3 181 3 181
DS 

RD RR2FP95TF 637 0 0
GGAGTTTCACCACACTTAACGCTAGTCCAAATCAGAAGAGGATAAACTCTTCTCCTGTAA
CCAAAAAAATGGCTACTTCGTCTTCTCACTCACCATTCTCTGCAATCTTCAACGTCTCCA
AACCCAATCCATCTGTAAACCCTGCGGCTTTTCTCGTCCCTTCCTTGAAATTCTCCACCG
CCATATCGAATTTCGCGAATCTGAGCAATGGGTTTTCTCTAAAATCTCCGATTAATCCTG
GGTTTCTCCTCAAGTCCCGAACTTTCAACGTTCAAGCCAGAGCTGCTGCTGAGAAGACCG
TTCACGATTTCACTGTAAAGGACATTGATGGGAGTGATGTTTCTTTGAACAAGTATAAGG
GGAAAGTTATGTTGATCGTCAATGTCGCTTCAAGATGTGGTTTGACATCATCAAATTACT
CCGAGCTTTCACATCTGTACGAGAAATACAAGAGCCAAGGACTTGAGATTTTAGCTTTCC
CTTGCAATCAGTTTGGTGGCCAAGAGCCCGGTTCAAACACTGAGATCAAACAGTTTGCTT
GCACCCGGTTTAAAGCAGAGTTCCCTATATTTGATAAGGTCGATGTGAATGGACCGAGCA
CAGCACCAATCTACCAGTTCTTGAAATCAAACGCA
CG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2A717TF 690 0 0
GGGAGTTTCACCACACTTAACGCTAGTCCAAATCAGAAGAGGATAAACTCTTCTCCTGTA
ACCAAAAAAATGGCTACTTCGTCTTCTCACTCACCATTCTCTGCAATCTTCAACGTCTCC
AAACCCAATCCATCTGTAAACCCTGCGGCTTTTCTCGTCCCTTCCTTGAAATTCTCCACC
GCCATATCGAATTTCGCGAATCTGAGCAATGGGTTTTCTCTAAAATCTCCGATTAATCCT
GGGTTTCTCTTCAAGTCCCGAACTTTCAACGTTCAAGCCAGAGCTGCTGCTGAGAAGACC
GTTCACGATTTCACTGTAAAGGACATTGATGGGAGTGATGTTTCTTTGAACAAGTATAAG
GGGAAAGTTATGTTGATCGTCAATGTCGCTTCAAGATGTGGTTTGACATCATCAAATTAC
TCCGAGCTTTCACATCTGTACGAGAAATACAAGAGCCAAGGACTTGAGATTTTAGCTTTC
CCTTGCAATCAGTTTGGTGGCCAAGAGCCCGGTTCAAACACTGAGATCAAACAGTTTGCT
TGCACCCGGTTTAAAGCAGAGTTCCCTATATTTGATAAGGTCGATGTGAATGGACCGAGC
ACAGCACCAATCTACCAGTTCTTGAAATCAAACGCAGGAGGATTCTTGGGTGATCTCATT
AAATGGAACTTTGAGAAGTTCTTGATTGAT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2FN23TF 698 0 0
GGAGTTTCACCACACTTAACGCTAGTCCAAATCAGAAGAGGATAAACTCTTCTCCTGTAA
CCAAAAAAATGGCTACTTCGTCTTCTCACTCACCATTCTCTGCAATCTTCAACGTCTCCA
AACCCAATCCATCTGTAAACCCTGCGGCTTTTCTCGTCCCTTCCTTGAAATTCTCCACCG
CCATATCGAATTTCGCGAATCTGAGCAATGGGTTTTCTCTAAAATCTCCGATTAATCCTG
GGTTTCTCTTCAAGTCCCGAACTTTCAACGTTCAAGCCAGAGCTGCTGCTGAGAAGACCG
TTCACGATTTCACTGTAAAGGACATTGATGGGAGTGATGTTTCTTTGAACAAGTATAAGG
GGAAAGTTATGTTGATCGTCAATGTCGCTTCAAGATGTGGTTTGACATCATCAAATTACT
CCGAGCTTTCACATCTGTACGAGAAATACAAGAGCCAAGGACTTGAGATTTTAGCTTTCC
CTTGCAATCAGTTTGGTGGCCAAGAGCCCGGTTCAAACACTGAGATCAAACAGTTTGCTT
GCACCCGGTTTAAAGCAGAGTTCCCTATATTTGATAAGGTCGATGTGAATGGACCGAGCA
CAGCACCAATCTACCAGTTCTTGAAATCAAACGCAGA**GATTCTTGGGTGATCTCATTA
AATGGAACTTTGAGAAGTTCTTGATTGATAAAA
GGGAA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2BA04TF 920 0 0
GGAGTTTCACCACACTTAACGCTAGTCCAAATCAGAAGAGGATAAACTCTTCTCCTGTAA
CCAAAAAAATGGCTACTTCGTCTTCTCACTCACCATTCTCTGCAATCTTCAACGTCTCCA
AACCCAATCCATCTGTAAACCCTGCGGCTTTTCTCGTCCCTTCCTTGAAATTCTCCACCG
CCATATCGAATTTCGCGAATCTGAGCAATGGGTTTTCTCTAAAATCTCCGATTAATCCTG
GGTTTCTCTTCAAGTCCCGAACTTTCAACGTTCAAGCCAGAGCTGCTGCTGAGAAGACCG
TTCACGATTTCACTGTAAAGGACATTGATGGGAGTGATGTTTCTTTGAACAAGTATAAGG
GGAAAGTTATGTTGGTCGTCAATGTCGCTTCAAGATGTGGTTTGACATCATCAAATTACT
CCGAGCTTTCACATCTGTACGAGAAATACAAGAGCCAAGGACTTGAGATTTTAGCTTTCC
CTTGCAGTCAGTTTGGTGGCCAAGAGCCCGGTTCAAACACTGAGATCAAACAATTTGCTT
GCACCCGGTTTAAAGCAGAGTTCCCTATATTTGATAAGGTCGATGTGAATGGACCGAGCA
CAGCACCAATCTACCAGTTCTTGAAATCAAACGCAGGAGGATTCTTGGGTGATCTCATTA
AATGGAACTTTGAGAAGTTCTTGATTGATAAAAAGGGAAAGGTTGTTGAGAGGTACCCTC
CCACCACATCCCCTTTCCAAATCGAGAAAGACATCAAGAAGTTGCTTGCTGATTAGTAAC
CTCTGCTCATGAGAGACCACACAGACTGGTTGTAAAATATTCAGTACTTGAAAGTTGAAA
CTCGGTTTTGCCAGTTATGGTTTGTATACAATGTAATGATATATATTTTATTATAATACT
AAGTACGATAATAAGTTTCC

QA 1 920 1 920
DS 

RD RR2BA04JQ 841 0 0
GTCTTCTCACTCACCATTCTCTGCAATCTTCAACGTCTCCAAACCCAATCCATCTGTAAA
CCCTGCGGCTTTTCTCGTCCCTTCCTTGAAATTCTCCACCGCCATATCGAATTTCGCGAA
TCTGAGCAATGGGTTTTCTCTAAAATCTCCGATTAATCCTGGGTTTCTCTTCAAGTCCCG
AACTTTCAACGTTCAAGCCAGAGCTGCTGCTGAGAAGACCGTTCACGATTTCACTGTAAA
GGACATTGATGGGAGTGATGTTTCTTTGAACAAGTATAAGGGGAAAGTTATGTTGGTCGT
CAATGTCGCTTCAAGATGTGGTTTGACATCATCAAATTACTCCGAGCTTTCACATCTGTA
CGAGAAATACAAGAGCCAAGGACTTGAGATTTTAGCTTTCCCTTGCAGTCAGTTTGGTGG
CCAAGAGCCCGGTTCAAACACTGAGATCAAACAATTTGCTTGCACCCGGTTTAAAGCAGA
GTTCCCTATATTTGATAAGGTCGATGTGAATGGACCGAGCACAGCACCAATCTACCAGTT
CTTGAAATCAAACGCAGGAGGATTCTTGGGTGATCTCATTAAATGGAACTTTGAGAAGTT
CTTGATTGATAAAAAGGGAAAGGTTGTTGAGAGGTACCCTCCCACCACATCCCCTTTCCA
AATCGAGAAGGACATCAAGAAGTTGCTTGCTGATTAGTAACCTCTGCTCATGAGAGACCA
CACAGACTGGTTGTAAAATATTCAGTACTTGAAAGTTGAAACTCGGTTTTGCCAGTTATG
GTTTGTATACAATGTAATGATATATATTTTATTATAATACTAAGTACGATAATAAGTTTC
C

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR2FN23JQ 629 0 0
AGAAGACCGTTCACGATTTCACTGTAAAGGACATTGATGGGAGTGATGTTTCTTTGAACA
AGTATAAGGGGAAAGTTATGTTGATCGTCAATGTCGCTTCAAGATGTGGTTTGACATCAT
CAAATTACTCCGAGCTTTCACATCTGTACGAGAAATACAAGAGCCAAGGACTTGAGATTT
TAGCTTTCCCTTGCAATCAGTTTGGTGGCCAAGAGCCCGGTTCAAACACTGAGATCAAAC
AGTTTGCTTGCACCCGGTTTAAAGCAGAGTTCCCTATATTTGATAAGGTCGATGTGAATG
GACCGAGCACAGCACCAATCTACCAGTTCTTGAAATCAAACGCAGGAGGATTCTTGGGTG
ATCTCATTAAATGGAACTTTGAGAAGTTCTTGATTGATAAAAAGGGAAAGGTTGTTGAGA
GGTACCCTCCCACCACATCCCCTTTCCAAATCGAGAAGGACATCAAGAAGTTGCTTGCTG
ATTAGTAACCTCTGCTCATGAGAGACCACACAGACTGGTTGTAAAATATTCAGTACTTGA
AAGTTGAAACTCGGTTTTGCCAGTTATGGTTTGTATACAATGTAATGATATATATTTTAT
TATAATACTAAGTACGATAATAAGTTTCC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2FP35JQ 635 0 0
G
TGCTGAGAAGACCGTTCACGATTTCACTGTAAAGGACATTGATGGGAGTGATGTTTCTTT
GAACAAGTATAAGGGGAAAGTTATGTTGATCGTCAATGTCGCTTCAAGATGTGGTTTGAC
ATCATCAAATTACTCCGAGCTTTCACATCTGTACGAGAAATACAAGAGCCAAGGACTTGA
GATTTTAGCTTTCCCTTGCAATCAGTTTGGTGGCCAAGAGCCCGGTTCAAACACTGAGAT
CAAACAGTTTGCTTGCACCCGGTTTAAAGCAGAGTTCCCTATATTTGATAAGGTCGATGT
GAATGGACCGAGCACAGCACCAATTTACCAGTTCTTGAAATCAAACGCAGGAGGATTCTT
GGGTGATCTCATTAAATGGAACTTTGAGAAGTTCTTGATTGATAAAAAGGGAAAGGTTGT
TGAGAGGTACCCTCCCACCACATCCCCTTTCCAAATCGAGAAGGACATCAAGAAGTTGCT
TGCTGATTAGTAACCTCTGCTCATGAGAGACCACACAGACTGGTTGTAAAATATTCAGTA
CTTGAAAGTTGAAACTCGGTTTTGCCAGTTATGGTTTGTATACAATGTAATGATATATAT
TTTATTATAATACTAAGTACGATAATAAGTTTC
G

QA 2 634 2 634
DS 

RD RR2FP35TF 635 0 0
G
TGCTGAGAAGACCGTTCACGATTTCACTGTAAAGGACATTGATGGGAGTGATGTTTCTTT
GAACAAGTATAAGGGGAAAGTTATGTTGATCGTCAATGTCGCTTCAAGATGTGGTTTGAC
ATCATCAAATTACTCCGAGCTTTCACATCTGTACGAGAAATACAAGAGCCAAGGACTTGA
GATTTTAGCTTTCCCTTGCAATCAGTTTGGTGGCCAAGAGCCCGGTTCAAACACTGAGAT
CAAACAGTTTGCTTGCACCCGGTTTAAAGCAGAGTTCCCTATATTTGATAAGGTCGATGT
GAATGGACCGAGCACAGCACCAATCTACCAGTTCTTGAAATCAAACGCAGGAGGATTCTT
GGGTGATCTCATTAAATGGAACTTTGAGAAGTTCTTGATTGATAAAAAGGGAAAGGTTGT
TGAGAGGTACCCTCCCACCACATCCCCTTTCCAAATCGAGAAGGACATCAAGAAGTTGCT
TGCTGATTAGTAACCTCTGCTCATGAGAGACCACACAGACTGGTTGTAAAATATTCAGTA
CTTGAAAGTTGAAACTCGGTTTTGCCAGTTATGGTTTGTATACAATGTAATGATATATAT
TTTATTATAATACTAAGTACGATAATAAGTTTC
G

QA 2 634 2 634
DS 

RD RR2FP95JQ 622 0 0
GCTGAGAAGACCGTTCACGATTTCACTGTAAAGGACATTGATGGGAGTGATGTTTCTTTG
AACAAGTATAAGGGGAAAGTTATGTTGATCGTCAATGTCGCTTCAAGATGTGGTTTGACA
TCATCAAATTACTCCGAGCTTTCACATCTGTACGAGAAATACAAGAGCCAAGGACTTGAG
ATTTTAGCTTTCCCTTGCAATCAGTTTGGTGGCCAAGAGCCCGGTTCAAACACTGAGATC
AAACAGTTTGCTTGCACCCGGTTTAAAGCAGAGTTCCCTATATTTGATAAGGTCGATGTG
AATGGACCGAGCACAGCACCAATCTACCAGTTCTTGAAATCAAACGCAGGAGGATTCTTG
GGTGATCTCATTAAATGGAACTTTGAGAAGTTCTTGATTGATAAAAAGGGAAAGGTTGTT
GAGAGGTACCCTCCCACCACATCCCCTTTCCAAATCGAGAAGGACATCAAGAAGTTGCTT
GCTGATTAGTAACCTCTGCTCATGAGAGACCACACAGACTGGTTGTAAAATATTCAGTAC
TTGAAAGTTGAAACTCGGTTTTGCCAGTTATGGTTTGTATACAATGTAATGATATATATT
TTATTATAATACTAAGTACGAT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 10

CO CL524Contig1 979 10 7 U
CTTATACAAACTGGTGCATTGATTTATTTATTTAGAAATTGCAAATGTGAGAATATTATT
AATAACAAAGGCAAACAAGACTAATGGGAAGAAACCACACGAACGAGTTCTTGTTTTATT
ATTAGTAAAAGTTGCGATGAGAGTTTTTGACTATATGGTGTAACTGAAGCCGTTGACTGT
GAATCCTCCATCAACAGAAATGACCTGACCGGTGATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAGAG
AAAAGCAACCATCGACGAGACTTCCTCTGGTTCTCCAACGCGCCCAAGTGGGGTACGCGA
AACCACCGCCTCCTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAAGTCTTGAT
GTACCACGGCGCCACGCAATTGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTT
CCTTGTAAGCTGATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGATG
AACCAGTCCAGCCACAGAGGAGATGAACACAATGCTACCAACCCCAGATGCTTTTAAAAG
AGGATGTGCAATTTGGGAAAAATGGAAAGCGGATTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGC
ATAATCCTCACTCGTGTACTCCACTGTTGGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTTAT
AAGGATGTTGAGCGTGCCGCTAAAGGCAGACGAAACTTCCTCAATCAACTTCTCCCTCTG
ATCTCTATCCGAAGCATCGCAAACCGAACCGGTTACCACTAAACCATTGGACTTCCAATC
ATCCAAGCATGATTTGAGCTCGTCCTGGTTCCTTGAACATGTGTGAACTGTTGCACCGAA
TCTCGCTAGCTCCTCCACTACCGCTCGCCCAATTCCGCGAGTACCACCGGTTACCAGAGC
GGTTTTTCCGGCGAGGGACCACCTTTTGTTATTCTCCATCGTCAATCTCCTCCACACAAT
CACACTGTGAGTGAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 15 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 25 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW41JQ U 6
AF RR2E279JQ U 2
AF RR2B231JQ U 1
AF RR2C338TF C 318
AF RR2C338JQ U 4
AF RR2B231TF C 13
AF RR2AY78JQ U 13
AF RR2E279TF C 177
AF RR2DW41TF C 783
AF RR2AY78TFB C 193
BS 1 254 RR2B231JQ
BS 255 255 RR2DW41JQ
BS 256 679 RR2B231JQ
BS 680 770 RR2C338JQ
BS 771 892 RR2AY78JQ
BS 893 914 RR2E279TF
BS 915 979 RR2AY78TFB

RD RR2DW41JQ 454 0 0
ACAAACTGGTGCATTGATTTATTTATTTAGAAATTGCAAATGTGAGAATATTATTAATAA
CAAAGGCAAACAAGACTAATGGGAAGAAACCACACGAACGAGTTCTTGTTTTATTATTAG
TAAAAGTTGCGATGAGAGTTTTTGACTATATGGTGTAACTGAAGCCGTTGACTGTGAATC
CTCCATCAAAAGAAATGACCTGACCGGTGATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAGAGAAAAG
CAACCATCGACGAGACTTCCTCTGGTTCTCCAACGCGCCCAAGTGGGGTACGCGAAACCA
CCGCCTCCTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAAGTCTTGATGTACC
ACGGCGCCACGCAATTGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCATTG
TAAGCTGATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATA

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR2E279JQ 492 0 0
GTAT
ACAAACTGGTGCATTGATTTATTTATTTAGAAATTGCAAATGTGAGAATATTATTAATAA
CAAAGGCAAACAAGACTAATGGGAAGAAACCACACGAACGAGTTCTTGTTTTATTATTAG
TAAAAGTTGTGATGAGAGTTTTTGACTATATGGTGTAACTGAAGCCGTTGACTGTGAATC
CTCCATCAACAGAAATGACCTGACCGGTGATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAGAAAAAAG
CAACCATCGACGAAACTTCCTCTGGTTCTCCAACGCGCCCAAGTGGGGTACGCGAAACCA
CCGCCTCCTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAAGTCTTGATGTACC
ACGGCGCCACGCAATTGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTG
TAAGCTGATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGATGAACCA
GTCCAGCC

QA 5 492 5 492
DS 

RD RR2B231JQ 679 0 0
CTTATACAAACTGGTGCATTGATTTATTTATTTAGAAATTGCAAATGTGAGAATATTATT
AATAACAAAGGCAAACAAGACTAATGGGAAGAAACCACACGAACGAGTTCTTGTTTTATT
ATTAGTAAAAGTTGCGATGAGAGTTTTTGACTATATGGTGTAACTGAAGCCGTTGACTGT
GAATCCTCCATCAACAGAAATGACCTGACCGGTGATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAGAG
AAAAGCAACCATCGGCGAGACTTCCTCTGGTTCTCCAACGCGCCCAAGTGGGGTACGCGA
AACCACCGCCTCCTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAAGTCTTGAT
GTACCACGGCGCCACGCAATTGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTT
CCTTGTAAGCTGATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGATG
AACCAGTCCAGCCACAGAGGAGATGAACACAATGCTACCAACCCCAGATGCTTTTAAAAG
AGGATGTGCAATTTGGGAAAAATGGAAAGCGGATTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGC
ATAATCCTCACTCGTGTACTCCACTGTTGGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTTAT
AAGGATGTTGAGCGTGCCG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2C338TF 401 0 0
AAA
CTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAAGTCTTGATGTACCACGGCGCCACGCAAT
TGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTGTAAGCTGATTAAGTG
CTCCTTTAGTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGATGAACCAGTCCAGCCACAGAGG
AGATGAACACAATGCTACCAACCCCAGATGCTTTTAAAAGAGGATGTGCAATTTGGGAAA
AATGGAAAGCGGATTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGCATAATCCTCACTCGTGTACT
CCACTGTTGGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTTATAAGGATGTTGAGCGTGCCGC
TAAAGGCAGACGAAACTTCCTCAATCAACTTCTCCCTC

QA 4 401 4 401
DS 

RD RR2C338JQ 767 0 0
AT
ACAAACTGGTGCATTGATTTATTTATTTAAAAATTGCAAATGTGAGAATATTATTAATAA
CAAAGGCAAACAAGACTAATGGGAAGAAACCACACGAACGAGTTCTTGTTTTATTATTAG
TAAAAGTTGCGATGAGAGTTTTTGACTATATGGTGTAACTGAAGCCGCTGACTGTGAATC
CTCCATCAACAAAAATGACCTGACCGGTGATGTAAAAAGCTGCGGGAAGGCAAAAAAAAG
CAACCATCGACGAAACTTCCTCTGGTTCTCCAACGCGCCCAAGTGGGGTACGCGAAACCA
CCGCCTCCTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAAGTCTTGATGTACC
ACGGCGCCCCGCAATTGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTG
TAAGCTGATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATAAACAGATCCACTACTAAAATGAACCA
GTCCAGCCACAGAGGAAATGAACACAATGCTACCAACCCCAAATGCTTTTAAAAAAGGAT
GTGCAATTTGGGAAAAATGGAAAGCGGATTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGCATAAT
CCTCACTCGTGTACTCCACTGTTGGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTTATAAGGA
TGTTGAGCGTGCCGCTAAAGGCAGACGAAACTTCCTCAATCAACTTCTCCCTCTGATCTC
TATCCGAAGCATCGCAAACCGAACCGGTTACCACTAAACCATTGG

QA 3 767 3 767
DS 

RD RR2B231TF 814 0 0
GGTGCATTGATTTATTTATTTAGAAATTGCAAATGTGAGAATATTATTAATAACAAAGGC
AAACAAGACTAATGGGAAGAAACCACACGAACGAGTTCTTGTTTTATTATTAGTAAAAGT
TGCGATGAGAGTTTTTGACTATATGGTGTAACTGAAGCCGTTGACTGTGAATCCTCCATC
AACAGAAATGACCTGACCGGTGATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAGAGAAAAGCAACCAT
CGGCGAGACTTCCTCTGGTTCTCCAACGCGCCCAAGTGGGGTACGCGAAACCACCGCCTC
CTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAAGTCTTGATGTACCACGGCGC
CACGCAATTGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTGTAAGCTG
ATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGATGAACCAGTCCAGC
CACAGAGGAGATGAACACAATGCTACCAACCCCAGATGCTTTTAAAAGAGGATGTGCAAT
TTGGGAAAAATGGAAAGCGGATTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGCATAATCCTCACT
CGTGTACTCCACTGTTGGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTTATAAGGATGTTGAG
CGTGCCGCTAAAGGCAGACGAAACTTCCTCAATCAACTTCTCCCTCTGATCTCTATCCGA
AGCATCGCAAACCGAACCGGTTACCACTAAACCATTGGACTTCCAATCATCCAAGCATGA
TTTGAGCTCGTCCTGGTTCCTTGAACATGTGTG
C

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2AY78JQ 880 0 0
GGTGCATTGATTTATTTATTTAGAAATTGCAAATGTGAGAATATTATTAATAACAAAGGC
AAACAAGACTAATGGGAAGAAACCACACGAACGAGTTCTTGTTTTATTATTAGTAAAAGT
TGCGATGAGAGTTTTTGACTATATGGTGTAACTGAAGCCGTTGACTGTGAATCCTCCATC
AACAGAAATGACCTGACCGGTGATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAGAAAAAAGCAACCAT
CGACGAGACTTCCTCTGGTTCTCCAACGCGCCCAAGTGGGGTACGCGAAACCACCGCCTC
CTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAAGTCTTGATGTACCACGGCGC
CACGCAATTGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTGTAAGCTG
ATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGATGAACCAGTCCAGC
CACAGAGGAGATGAACACAATGCTACCAACCCCAGATGCTTTTAAAAGAGGATGTGCAAT
TTGGGAAAAATGGAAAGCGGATTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGCATAATCCTCACT
CGTGTACTCCACTGTTGGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTTATAAGGATGTTGAG
CGTGCCGCTAAAGGCAGACGAAACTTCCTCAATCAACTTCTCCCTCTGATCCCTATCCGA
AGCATCGCAAACCGAACCGGTTACCACTAAACCATTGGACTTCCAATCATCCAAGCATGA
TTTGAGCTCGTCCTGGTTCCTTGAACATGTGTGAACTGTTGCACCGAATCTCGCTAGCTC
CTCCACTACCGCTCGCCCAATTCCGCGAGTACCACCGGTT

QA 1 880 1 880
DS 

RD RR2E279TF 738 0 0
ACTGTG
ATCCTCCATCAACAGAAATGAC*TGACCGGTGATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAGAGAA
AAGCAACCATCGACGAGACT*CCTCTGGTTCTCCAACGCGCCCAAGTGGGGTACGCGAAA
CCACCGCCTCCTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAAGTCTTGATGT
ACCACGGCGCCACGCAATTGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCC
TTGTAAGCTGATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGATGAA
CCAGTCCAGCCACAGAGGAGATGAACACAATGCTACCAACCCCAGATGCTTTTAAAAGAG
GATGTGCAATTTGGGAAAAATGGAAAGCGGATTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGCAT
AATCCTCACTCGTGTACTCCACTGTTGGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTTATAA
GGATGTTGAGCGTGCCGCTAAAGGCAGACGAAACTTCCTCAATCAACTTCTCCCTCTGAT
CTCTATCCGAAGCATCGCAAACCGAACCGGTTACCACTAAACCATTGGACTTCCAATCAT
CCAAGCATGATTTGAGCTCGTCCTGGTTCCTTGAACATGTGTGAACTGTTGCACCGAATC
TCGCTAGCTCCTCCACTACCGCTCGCCCAATTCCGCGAGTACCACCGGTTACCAGAGCGG
TTTTTCCGGCGA

QA 7 738 7 738
DS 

RD RR2DW41TF 177 0 0
CCAAGCATGATTTGAGCTCGTCCTGGTTCCTTGAACATGTGTGAACTGTTGCACCGAATC
TCGCTAGCTCCTCCACTACCGCTCGCCCAATTCCGCGAGTACCACCGGTTACCAGAGCGG
TTTTTCCGGCGAGGGACCACCTTTTGTTATTCTCCATCGTCAATCTCCTCCACAC
CC

QA 1 175 1 175
DS 

RD RR2AY78TFB 787 0 0
AACAGAAATGAC*TGACCGGTGATGTAAGAAGCTGCGGGAAGGCAGAGAAAAGCAACCAT
CGACGAGACTTCCTCTGGTTCTCCAACGCGCCCAAGTGGGGTACGCGAAACCACCGCCTC
CTCAAAACCTTTCTTCTCAAGTAGCGGTTTCACAAGTGAAGTCTTGATGTACCACGGCGC
CACGCAATTGGTTCTGATGTTGTCCCCTGCCCATTCGCAAGCTAGGTTCCTTGTAAGCTG
ATTAAGTGCTCCTTTAGTTGCACCATAGACAGATCCACTACTAAGATGAACCAGTCCAGC
CACAGAGGAGATGAACACAATGCTACCAACCCCACATGCTTTTAAAAGAGGATGTGCAAT
TTGGGAAAAATGGAAAGCGGATTCCAAGTTGATCGACATGATTTTAGCATAATCCTCACT
CGTGTACTCCACTGTTGGTTTCCTTATATTAGTTCCAACATTGTTTATAAGGATGTTGAG
CGTGCCGCTAAAGGCAGACGAAACTTCCTCAATCAACTTCTCCCTCTGATCCCTATCCGA
AGCATCGCAAACCGAACCGGTTACCACTAAACCATTGGACTTCCAATCATCCAAGCATGA
TTTGAGCTCGTCCTGGTTCCTTGAACATGTGTGAACTGTTGCACCGAATCTCGCTAGCTC
CTCCACTACCGCTCGCCCAATTCCGCGAGTACCACCGGTTACCAGAGCGGTTTTTCCGGC
GAGGGACCACCTTTTGTTATTCTCCATCGTCAATCTCCTCCACACAATCACACTGTGAGT
GAAGTCC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 2 10

CO CL525Contig1 1309 8 6 U
GGGACGATTTTATTCCATACGCTCATTCTCTTTCTCACTCACGAGTGAAGCTTGCTTGAA
TCATGGCCTCTCGTATTGCTAAAGATGTTACCGAATTGATTGGGAACACCCCTTTGGTTT
ATCTGAACAATGTGGCTGAAGGATGTGTTGGTCGTGTCGCTGCTAAGCTCGAGATGATGG
AACCTTGCTCCAGTGTCAAAGACAGGATTGGTTTTAGCATGATTTCTGATGCAGAGAAAA
AGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGCTGATTGAGCCAACGAGTGGAAACACTGGAG
TTGGGTTAGCCTTCACGGCTGCTGCCAAGGGCTACAAGCTTATCATTACTATGCCAGCTT
CAATGAGTGTAGAGAGGAGGATCATTCTCTTAGCTTTTGGTGTTGAGTTGATCTTAACTG
ATCCTGCTAAGGGCATGAAAGGCGCTATCGCCAAAGCTGAAGAGATTTTGGCCAAAACAC
CCAACGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTGCCAACCCAAAGATACACTATGAGA
CTACTGGACCTGAGATATGGAAAGGCACTGGTGGTAAAATCGATGGATTTGTTTCTGGGA
TTGGTACTGGTGGTACCATCACAGATGCAGGGAAGTATCTCAAGGAACAGAACCCTAACG
TTAAGCTGTATGGTGTGGAGCCAATTGAAAGTGCTATTCTCTCCGGTGGGAAGCCAGGCC
CTCACAAGATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGTGTGTTGGAAGTTGATCTTA
TAGATGAAGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATGGCTAGGCTTCTTGCTC
TTAAAGAAGGTCTTCTTGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCAGCAGCCGCAGCAATCAAAC
TTGCAAAGAGGCCAGAAAATGCCGGGAAGCTTTTCGTGGCGGTGTTCCCGAGTTTCGGGG
AGAGGTACCTGTCCACTGTACTATTCGATGCCACAAGGAAAGAAGCAGAATCAATGACCT
TCGAGGCTTGAATTTGTCTCACCTGAAAATTTCTCTTTTTCTTTTCATTAGAGACGCCAA
AAATAAAATAAAAAGAGAGATGTTAAGTTTTCTCATGAAGAGAATCTTCATCTTCAGCTT
CAGTGTGCTTTGTGTTTGTGTTTCTGTATCTTTCTTTTGTGTGAGAATAAAAATCAATCT
AGATTTTTTCTCTGTTTTTCTCTTTTGAAGAACACATCGCTGTCAGTAAGTTTGAGTCTA
CTTTGATTTGATTTCCATATTTTCATAATGAACAGATCATCATCAGAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GN09TF U 40
AF RR2AT94TF U 1
AF RR2F520TF U 41
AF RR2B670TF U 1
AF RR2B562TF U 40
AF RR2B670JQ C 371
AF RR2AT94JQ C 377
AF RR2B562JQ C 472
BS 1 203 RR2AT94TF
BS 204 204 RR2GN09TF
BS 205 701 RR2AT94TF
BS 702 835 RR2B670TF
BS 836 842 RR2B562TF
BS 843 1309 RR2B670JQ

RD RR2GN09TF 581 0 0
CACGAGTGAAGCTTGCTTGAATCATGGCCTCTCGTATTGCTAAAGATGTTACCGAATTGA
TTGGGAACACCCCTTTGGTTTATCTGAACAATGTGGCTGAAGGATGTGTTGGTCGTGTCG
CTGCTAAGCTCGAGATGATGGAACCTTGCTCCAGTGCCAAAGACAGGATTGGTTTTAGCA
TGATTTCTGATGCAGAGAAAAAGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGCTGATTGAGC
CAACGAGTGGAAACACTGGAGTTGGGTTAGCCTTCACGGCTGCTGCCAAGGGCTACAAGC
TTATCATTACTATGCCAGCTTCAATGAGTGTAGAGAGGAGGATCATTCTCTTAGCTTTTG
GTGTTGAGTTGATCTTAACTGATCCTGCTAAGGGCATGAAAGGCGCTATCGCCAAAGCTG
AAGAGATTTTGGCCAAAACACCCAACGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTGCCA
ACCCAAAGATACACTATGAGACTACTGGACCTGAGATATGGAAAGGCACTGGTGGTAAAA
TCGATGGATTTGTTTCTGGGATTGGTACTGGTGGTACCATC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2AT94TF 701 0 0
GGGACGATTTTATTCCATACGCTCATTCTCTTTCTCACTCACGAGTGAAGCTTGCTTGAA
TCATGGCCTCTCGTATTGCTAAAGATGTTACCGAATTGATTGGGAACACCCCTTTGGTTT
ATCTGAACAATGTGGCTGAAGGATGTGTTGGTCGTGTCGCTGCTAAGCTCGAGATGATGG
AACCTTGCTCCAGTGTCAAAGACGGGATTGGTTTTAGCATGATTTCTGATGCAGAGAAAA
AGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGCTGATTGAGCCAACGAGTGGAAACACTGGAG
TTGGGTTAGCCTTCACGGCTGCTGCCAAGGGCTACAAGCTTATCATTACTATGCCAGCTT
CAATGAGTGTAGAGAGGAGGATCATTCTCTTAGCTTTTGGTGTTGAGTTGATCTTAACTG
ATCCTGCTAAGGGCATGAAAGGCGCTATCGCCAAAGCTGAAGAGATTTTGGCCAAAACAC
CCAACGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTGCCAACCCAAAGATACACTATGAGA
CTACTGGACCTGAGATATGGAAAGGCACTGGTGGTAAAATCGATGGATTTGTTTCTGGGA
TTGGTACTGGTGGTACCATCACAGATGCAGGGAAGTATCTCAAGGAACAGAACCCTAACG
TTAAGCTGTATGGTGTGGAGCCAATTGAAAGTGCTATTCTC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2F520TF 692 0 0
CACGAGCTT
GCTTGCTTGAATCATGGCCTCTCGTATTGCTAAAGATGTTACCGAATTGATTGGGAACAC
CCCTTTGGTTTATCTGAACAATGTGGCTGAAGGATGTGTTGGTCGTGTCGCCGCTAAGCT
CGAGATGATGGAACCTTGCTCCAGTGTCAAAGACAGGATTGGTTTTAGCATGATTTCTGA
TGCAGAGAAAAAGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGCTGATTGAGCCAACGAGTGG
AAACACCGGAGTTGGGTTAGCCTTCACGGCTGCTGCCAAGGGCTACAAGCTTATCATTAC
CATGCCAGCTTCAATGAGTGTGGAGAGGAGGATCATTCTCTTAGCTTTTGGTGTTGAGTT
GATCTTAACTGACCCTGCTAAGGGCATGAAAGGCGCTATCGCCAAAGCTGAAGAGATTTT
AGCCAAAACACCTAACGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTGCCAACCCAAAGAT
ACACTATGAGACTACTGGACCTGAGATATGGAAAGGCACTGGTGGTAAAATCGATGGATT
TGTTTCTGGGATTGGTACTGGTGGTACCATCACAGGTGCAGGGAAGTATCTCAAGGAACA
GAACCCTAACGTTAAGCTGTATGGTGTGGAGCCAATTGAAAGCGCTATTCTATCCGGTGG
GAAGCCAGGCCCTCACAAGAT
CA

QA 10 690 10 690
DS 

RD RR2B670TF 843 0 0
GGGACGATTTTATTCCATACGCTCATTCTCTTTCTCACTCACGAGTGAAGCTTGCTTGAA
TCATGGCCTCTCGTATTGCTAAAGATGTTACCGAATTGATTGGGAACACCCCTTTGGTTT
ATCTGAACAATGTGGCTGAAGGATGTGTTGGTCGTGTCGCTGCTAAGCTCGAGATGATGG
AACCTTGCTCCAGTGTCAAAGACGGGATTGGTTTTAGCATGATTTCTGATGCAGAGAAAA
AGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGCTGATTGAGCCAACGAGTGGAAACACTGGAG
TTGGGTTAGCCTTCACGGCTGCTGCCAAGGGCTACAAGCTTATCATTACTATGCCAGCTT
CAATGAGTGTAGAGAGGAGGATCATTCTCTTAGCTTTTGGTGTTGAGTTGATCTTAACTG
ATCCTGCTAAGGGCATGAAAGGCGCTATCGCCAAAGCTGAAGAGATTTTGGCCAAAACAC
CCAACGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTGCCAACCCAAAGATACACTATGAGA
CTACTGGACCTGAGATATGGAAAGGCACTGGTGGTAAAATCGATGGATTTGTTTCTGGGA
TTGGTACTGGTGGTACCATCACAGATGCAGGGAAGTATCTCAAGGAACAGAACCCTAACG
TTAAGCTGTATGGTGTGGAGCCAATTGAAAGTGCTATTCTCTCCGGTGGGAAGCCAGGCC
CTCACAAGATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGTGTGTTGGAAGTTGATCTTA
TAGATGAAGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATGGCTAGGCTTCT
GCTCTTAA

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR2B562TF 803 0 0
CACGAGTGAAGCTTGCTTGAATCATGGCCTCTCGTATTGCTAAAGATGTTACCGAATTGA
TTGGGAACACCCCTTTGGTTTATCTGAACAATGTGGCTGAAGGATGTGTTGGTCGTGTCG
CTGCTAAGCTCGAGATGATGGAACCTTGCTCCAGTGTCAAAGACAGGATTGGTTTTAGCA
TGATTTCTGATGCAGAGAAAAAGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGCTGATTGAGC
CAACGAGTGGAAACACTGGAGTTGGGTTAGCCTTCACGGCTGCTGCCAAGGGCTACAAGC
TTATCATTACTATGCCAGCTTCAATGAGTGTAGAGAGGAGGATCATTCTCTTAGCTTTTG
GTGTTGAGTTGATCTTAACTGATCCTGCTAAGGGCATGAAAGGCGCTATCGCCAAAGCTG
AAGAGATTTTGGCCAAAACACCCAACGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTGCCA
ACCCAAAGATACACTATGAGACCACTGGACCTGAGATATGGAAAGGCACTGGTGGTAAAA
TCGATGGATTTGTTTCTGGGATTGGTACTGGTGGTACCATCACAGGTGCAGGGAAGTATC
TCAAGGAACAGAACCCTAACGTTAAGCTGTATGGTGTGGAGCCAATTGAAAGTGCTATTC
TCTCCGGTGGGAAGCCAGGCCCTCACAAGATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAA
GTGTGTTGGAAGTTGATCTTATAGATGAAGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCG
ACATGGCTAGGCTTCCTGCTCTT

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2B670JQ 939 0 0
AGAGAGGAGGATCATTCTCTTAGCTTTTGGTGTTGAGTTGATCTTAACTGATCCTGCTAA
GGGCATGAAAGGCGCTATCGCCAAAGCTGAAGAGATTTTGGCCAAAACACCCAACGGTTA
CATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTGCCAACCCAAAGATACACTATGAGACTACTGGACC
TGAGATATGGAAAGGCACTGGTGGTAAAATCGATGGATTTGTTTCTGGGATTGGTACTGG
TGGTACCATCACAGATGCAGGGAAGTATCTCAAGGAACAGAACCCTAACGTTAAGCTGTA
TGGTGTGGAGCCAATTGAAAGTGCTATTCTCTCCGGTGGGAAGCCAGGCCCTCACAAGAT
TCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGTGTGTTGGAAGTTGATCTTATAGATGAAGT
TGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATGGCTAGGCTTCTTGCTCTTAAAGAAGG
TCTTCTTGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCAGCAGCCGCAGCAATCAAACTTGCAAAGAG
GCCAGAAAATGCCGGGAAGCTTTTCGTGGCGGTGTTCCCGAGTTTCGGGGAGAGGTACCT
GTCCACTGTACTATTCGATGCCACAAGGAAAGAAGCAGAATCAATGACCTTCGAGGCTTG
AATTTGTCTCACCTGAAAATTTCTCTTTTTCTTTTCATTAGAGACGCCAAAAATAAAATA
AAAAGAGAGATGTTAAGTTTTCTCATGAAGAGAATCTTCATCTTCAGCTTCAGTGTGCTT
TGTGTTTGTGTTTCTGTATCTTTCTTTTGTGTGAGAATAAAAATCAATCTAGATTTTTTC
TCTGTTTTTCTCTTTTGAAGAACACATCGCTGTCAGTAAGTTTGAGTCTACTTTGATTTG
ATTTCCATATTTTCATAATGAACAGATCATCATCAGAAC

QA 1 939 1 939
DS 

RD RR2AT94JQ 933 0 0
GAGGATCATTCTCTTAGCTTT*GGTGTTGAGTTGATCT*AACTGATC*TGCTAAGGGCAT
GAAAGGCGCTATCGCCAAAGCTGAAGAGATTTTGGCCAAAACACCCAACGGTTACATGCT
CCAACAGTTTGAGAACCCTGCCAACCCAAAGATACACTATGAGACTACTGGACCTGAGAT
ATGGAAAGGCACTGGTGGTAAAATCGATGGATTTGTTTCTGGGATTGGTACTGGTGGTAC
CATCACAGATGCAGGGAAGTATCTCAAGGAACAGAACCCTAACGTTAAGCTGTATGGTGT
GGAGCCAATTGAAAGTGCTATTCTCTCCGGTGGGAAGCCAGGCCCTCACAAGATTCAAGG
GATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGTGTGTTGGAAGTTGATCTTATAGATGAAGTTGTTCA
AGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATGGCTAGGCTTCTTGCTCTTAAAGAAGGTCTTCT
TGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCAGCAGCCGCAGCAATCAAACTTGCAAAGAGGCCAGA
AAATGCCGGGAAGCTTTTCGTGGCGGTGTTCCCGAGTTTCGGGGAGAGGTACCTGTCCAC
TGTACTATTCGATGCCACAAGGAAAGAAGCAGAATCAATGACCTTCGAGGCTTGAATTTG
TCTCACCTGAAAATTTCTCTTTTTCTTTTCATTAGAGACGCCAAAAATAAAATAAAAAGA
GAGATGTTAAGTTTTCTCATGAAGAGAATCTTCATCTTCAGCTTCAGTGTGCTTTGTGTT
TGTGTTTCTGTATCTTTCTTTTGTGTGAGAATAAAAATCAATCTAGATTTTTTCTCTGTT
TTTCTCTTTTGAAGAACACATCGCTGTCAGTAAGTTTGAGTCTACTTTGATTTGATTTCC
ATATTTTCATAATGAACAGATCATCATCAGAAC

QA 1 933 1 933
DS 

RD RR2B562JQ 805 0 0
CCAAAACACCCAACGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTGCCAACCCAAAGATAC
ACTATGAGACCACTGGACCTGAGATATGGAAAGGCACTGGTGGTAAAATCGATGGATTTG
TTTCTGGGATTGGTACTGGTGGTACCATCACAGGTGCAGGGAAGTATCTCAAGGAACAGA
ACCCTAACGTTAAGCTGTATGGTGTGGAGCCAATTGAAAGTGCTATTCTCTCCGGTGGGA
AGCCAGGCCCTCACAAGATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGTGTGTTGGAAG
TTGATCTTATAGATGAAGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATGGCTAGGC
TTCCTGCTCTTAAAGAAGGTCTTCTTGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCAGCAGCCGCAG
CAATCAAACTTGCAAAGAGGCCAGAAAATGCCGGGAAGCTTTTCGTGGCGGTGTTCCCGA
GTTTCGGGGAGAGGTACCTGTCCACTGTACTATTCGATGCCACAAGGAAAGAAGCAGAAT
CAATGACCTTCGAGGCTTGAATTTGTCTCACCTGAAAATTTCTCTTTTTCTTTTCATTAG
AGACGCCAAAAATAAAATAAAAAGAGAGATGTTAAGTTTTCTCATGAAGAGAATCTTCAT
CTTCAGCTTCAGTGTGCTTTGTGTTTGTGTTTCTGTATCTTTCTTTTGTGTGAGAATAAA
AATCAATCTAGATTTTTTCTCTGTTTTTCTCTTTTGAAGAACACATCGCTGTCAGTAAGT
TTGAGTCTACTTTGATTTGATTTC
T

QA 1 804 1 804
DS 



CO CL525Contig2 531 2 15 U
CGAAAGAGAAAAACAGAGAAAATCTAGATTGATTTTTATTATTCTCACACAAAAGAAAGA
TACAGAAACACAAACACAAAGACGCACTGAAGATGAAGATGAAGAGATTCTCTTCATGAG
AAAACTGAACATCTCTCTTTTTTTATTTTTTGGCGTCTCAAATGAAAAGAAACAGAGAAA
TTTTCAGGTGAGACAAATTCAAGCCTCGAAGGTCATTGATTCTGCTTCTTTCCTTGTGGC
ATCGAATAGTACAGTGGACAGGTACCTCCCCCCGAAACTCGGGAACACCGCGACAAAAAG
CTTCCCGGCATTTTCTGGCCTCTTTGCAAGTTTGATTGCTGCGGCTGCTGCTGCACCAAA
TGATATTCCCACAAGAAAACCTTCTTTAAAAACAAGAAGCCTTGCCATGTCAATGGATTC
ATCACTTGAAACTTGAACAACTTCATCTATAAAATCAACCTCCAACACACTTGGTATAAA
ACCAGCACCTATCCCTTGAATCTTGTGAGGGCCTGGCTTCCCACCGGATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2DV63JQ U 1
AF RR2F520JQ U 256
BS 1 268 RR2DV63JQ
BS 269 269 RR2F520JQ
BS 270 294 RR2DV63JQ
BS 295 295 RR2F520JQ
BS 296 358 RR2DV63JQ
BS 359 359 RR2F520JQ
BS 360 377 RR2DV63JQ
BS 378 378 RR2F520JQ
BS 379 389 RR2DV63JQ
BS 390 390 RR2F520JQ
BS 391 391 RR2DV63JQ
BS 392 392 RR2F520JQ
BS 393 452 RR2DV63JQ
BS 453 453 RR2F520JQ
BS 454 531 RR2DV63JQ

RD RR2DV63JQ 531 0 0
CGAAAGAGAAAAACAGAGAAAATCTAGATTGATTTTTATTATTCTCACACAAAAGAAAGA
TACAGAAACACAAACACAAAGACGCACTGAAGATGAAGATGAAGAGATTCTCTTCATGAG
AAAACTGAACATCTCTCTTTTTTTATTTTTTGGCGTCTCAAATGAAAAGAAACAGAGAAA
TTTTCAGGTGAGACAAATTCAAGCCTCGAAGGTCATTGATTCTGCTTCTTTCCTTGTGGC
ATCGAATAGTACAGTGGACAGGTACCTCTCCCCGAAACTCGGGAACACCGCGACGAAAAG
CTTCCCGGCATTTTCTGGCCTCTTTGCAAGTTTGATTGCTGCGGCTGCTGCTGCACCAGA
TGATATTCCCACAAGAAGACCTTCTTTAAGAGCAAGAAGCCTTGCCATGTCAATGGATTC
ATCACTTGAAACTTGAACAACTTCATCTATAAGATCAACCTCCAACACACTTGGTATAAA
ACCAGCACCTATCCCTTGAATCTTGTGAGGGCCTGGCTTCCCACCGGATAG

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2F520JQ 271 0 0
GGACAGGTACCTCCCCCCGAAACTCGGGAACACCGCGACAAAAAGCTTCCCGGCATTTTC
TGGCCTCTTTGCAAGTTTGATTGCTGCGGCTGCTGCTGCACCAAATGATATTCCCACAGG
AAAACCTTCTTTAAAAACAAGAAGCCTTGCCATGTCAATGGATTCATCACTTGAAACTTG
AACAACTTCATCTATAAAATCAACCTCCAACACACTTGGTATAAAACCAGCACCTATCCC
TTGAATCTTGTGAGGGCCTGGCTTCCCACCG

QA 1 271 1 271
DS 



AS 1 11

CO CL526Contig1 993 11 13 U
TGATAAACAAGAGTTATAATCCATCAAAAAACGAGTACAAAAAACAGTCGCAAAGAGGTA
GAAGTTCTCTTAACAAAACTCCACAACATTAGTTTTTCTTGCCAAACATGAAAAAAACAA
ATCTATAAATCTTCTAAGCTCCGATGATTTCAGTTGGTTCCTCAACTGTCTCTTCAGCTG
GCCTGTCTACCTTCACACCAACATCCTCTGCTGTGTAGTCACCATGAACCTCCATGAGCT
TTCCAAGGTCAAACTTAGGAGCCTTGAGGATCTTGACTTTACGGATGAACACATTCTGCA
ATGGGTAGATGTTCTGTGTCGCCTTCTCAATCGCCTTCCCAATGGACTCTGGGATGAACT
TGGCCACAAGCTCCTTAAGGTCACATGATGAAGCCTCCTTCACCATAATCTCACTCATCT
TTCTGCGGATCTGGCGGACTTGGCTGGACTGAGCATAGCAAGTACGCTTCACCTGGTTAG
CACGCCTCTTGGTGAAACCAATGCAGAACATCCTCAAGGTGTAGCTGTCAGTGGTCTTCA
CATCGACATGGGCTTCAATCAAAGTCTGCCACTTCTTCACCAACGACCTCACCTTGTCGG
TTGTGAAATCCATACCCCAGAACTGGGTCAACACATTCCTTCCCTGAACATCTTCAGCTC
TGAGACGGATCTT*CCTGTAAGAATGATCCTCATCGCTTTGAAGATCAGCGAGAGACACC
TCAAAAACCCTGTGTTTCAACCCCTCAGAGGCAATCTTGGTACCCTGAGTTCTGGAAACA
A*GGGTCTTTCCGACATTTCTGTGAGTGAAGTTAGAGGGAGCCTTGATGTCATACCAATC
CTTCTTGGAGAAAGGATCAACAATCTTCTTCTTGCCTCCTTTACGACCCTTAGAGATCCT
CTTGTTCTTCCCGACAGCCATGGTTAGAGAGCTTCAGGGGCAACAGTGAAGAAGAAGAAG
CGGCTTCAACAACTGGAGAGAGGAAGACCTCCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 25 55 55 25 55 5 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 10 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 10 60 60 10 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 45 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G231JQ U 5
AF RR2AB36JQ U 149
AF RR2BI05JQ U 2
AF RR2BR41JQ U 34
AF RR2DQ66JQ U 55
AF RR2AL91JQ U 1
AF RR2BI05TF C 193
AF RR2AL91TF C 211
AF RR2BR41TF C 267
AF RR2AB36TF C 258
AF RR2DQ66TF C 669
BS 1 260 RR2AL91JQ
BS 261 261 RR2BI05JQ
BS 262 270 RR2AL91JQ
BS 271 271 RR2BI05JQ
BS 272 673 RR2AL91JQ
BS 674 674 RR2BI05JQ
BS 675 781 RR2AL91JQ
BS 782 782 RR2BI05TF
BS 783 833 RR2AL91JQ
BS 834 957 RR2BI05TF
BS 958 960 RR2AB36TF
BS 961 983 RR2AL91TF
BS 984 993 RR2DQ66TF

RD RR2G231JQ 614 0 0
AAACAAGAGTTATAATCCATCAAAAAACGAGAACGAAAAACAGTCGCAAAGAGGTAGAAG
TTCTCTTAACAAAACTCCACAACATTAGTTTTTCTTGCCAAACATGAAAAAAACAAATCT
ATAAATCTTCTATGCTCCGATGATTTCAGTTGGTTCCTCAGCTGTCTCTTCAGCTGGCCT
GTCTACCTTCACACCAACATCCTCTGCTGTGTAGTCACCATGAACCTCCATGAGCTTTCC
AAGGTCAAACTTAGGAGCCTTAAGGATCTTGACTTTACGGATGAACACATTCTGCAATGG
GTAGATGTTCTGTGTAGCCTTCTCAATCGCCTTCCCAATGGACTCTGGGATGAACTTGGC
CACAAGCTCCTTAAGGTCACATGATGAAGCCTCCTTCACCATAATCTCACTCATCTTTCT
CCGAATCTGACGGACTTGGCTGGACTGAGCATAGCAAGTACGCTTCACCTGGTTAGCACG
CCTCTTGGTGAAACCAATGCAGAACATCCTCAAGGTGTAGCTGTCAGTGGTCTTCACATC
GACATGGGCTTCAATCAAAGTCTGCCACTTCTTCACCAACGACCTCACCTTGTCGGTTGT
GAAATCCATACCCC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2AB36JQ 532 0 0
TTCAGTTGGTTCCTCAGCTGTCTCTTCAGCTGGCCTGTCTACCTTCACACCAACATCCTC
TGCTGTGTAGTCACCATGAACCTCCATGAGCTTTCCAAGGTCAAACTTAGGAGCCCTAAG
GATCTTGACTTTACGGATGAACACATTCTGCAATGGGTAGATGTTCTGTGTAGCCTTCTC
AATCGCCTTCCCAATGGACTCTGGGATGAACTTGGCCACAAGCTCCTTAAGGTCACATGA
TGAAGCCTCCTTCACCATAATCTCACTCATCTTTCTCCGAATCTGGCGGACTTGGCTGGA
CTGAGCATAGCAAGTACGCTTCACCTGGTTAGCACGCCTCTTGGTGAAACCAATGCAGAA
CATCCTCAAGGTGTAGCTGTCAGTGGTCTTCACATCGACATGGGCTTCAATCAAAGTCTG
CCACTTCTTCACCAACGACCTCACCTTGTCGGTTGTGAAATCCATACCCCAGAACTGGGT
CAACACATTCCTTCCCTGAACATCTTCAGCTCTGAGACGGATCTT*CCTGTA

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2BI05JQ 777 0 0
GAT
AAACAAGAGTTATAATCCATCAAAAAACGAGTACAAAAAACAGTCGCAAAGAGGTAGAAG
TTCTCTTAACAAAACTCCACAACATTAGTTTTTCTTGCCAAACATGAAAAAAACAAATCT
ATAAATCTTCTAAGCTCCGATGATTTCAGTTGGTTCCTCAACTGTCTCTTCAGCTGGCCT
GTCTACCTTCACACCAACATCCTCTGCTGTGTAGTCACCATGAACCTCCATGAGCTTTCC
AAGGTCAAACTTAGGAGCCTTGAGGATCTTGACTTTACGGATGAACACATTCTGCAATGG
GTAGATGTTCTGTGTCGCCTTCTCAATCGCCTTCCCAATGGACTCTGGGATGAACTTGGC
CACAAGCTCCTTAAGGTCACATGATGAAGCCTCCTTCACCATAATCTCACTCATCTTTCT
GCGGATCTGGCGGACTTGGCTGGACTGAGCATAGCAAGTACGCTTCACCTGGTTAGCACG
CCTCTTGGTGAAACCAATGCAGAACATCCTCAAGGTGTAGCTGTCAGTGGTCTTCACATC
GACATGGGCTTCAATCAAAGTCTGCCACTTCTTCACCAACGACCTCACCTTGTCGGTTGT
GAAATCCATACCCCAGAACTGGGTCAACACATTCCTTCCCTGAACATCTTCAGCTCTGAG
GCGGATCTT*CCTGTAAGAATGATCCTCATCGCTTTGAAGATCAGCGAGAGACACCTCAA
AAACCCTGTGTTTCAACCCCTCAGAGGCAATCTTGGTACCCTGAGTTCTGGAAA

QA 4 777 4 777
DS 

RD RR2BR41JQ 694 0 0
AGTACA
AAAAACAGTCGCAAAGAGGTAGAAGTTCTCTTAACAAAACTCCACAACATTAGTTTTTCT
TGCCAAACATGAAAAAAACAAATCTATAAATCTTCTAAGCTCCGATGATTTCAGTTGGTT
CCTCAACTGTCTCTTCAGCTGGCCTGTCTACCTTCACACCAACATCCTCTGCTGTGTAGT
CACCATGAACCTCCATGAGCTTTCCAAGGTCAAACTTAGGAGCCTTGAGGATCTTGACTT
TACGGATGAACACATTCTGCAATGGGTAGATGTTCTGTGTCGCCTTCTCAATCGCCTTCC
CAATGGACTCTGGGATGAACTTGGCCACAAGCTCCTTAAGGTCACATGATGAAGCCTCCT
TCACCATAATCTCACTCATCTTTCTGCGGATCTGGCGGACTTGGCTGGACTGAGCATAGC
AAGTACGCTTCACCTGGTTAGCACGCCTCTTGGTGAAACCAATGCAGAACATCCTCAAGG
TGTAGCTGTCAGTGGTCTTCACATCGACATGGGCTTCAATCAAAGTCTGCCGCTTCTTCA
CCAACGACCTCACCTTGTCGGTTGTGAAATCCATACCCCAGAACTGGGTCAACACATTCC
TTCCCTGAACATCTTCAGCTCTGAGACGGATCTT*CCTGTAAGAATGATCCTCATCGCTT
TGAAGATCAGCGAGAGACACCTCAAAAA

QA 7 694 7 694
DS 

RD RR2DQ66JQ 723 0 0
GG
GGTAGAAGTTCTCTTAACAAAACTCCACAACATTAGTTTTTCTTGCCAAACATGAAAAAA
ACAAATCTATAAATCTTCTATGCTCCGATGATTTCAGTTGGTTCCTCAGCTGTCTCCTCA
GCTGGCCTGTCTACCTTCACACCAACATCCTCTGCTGTGTAGTCACCATGAACCTCCATG
AGCTTTCCAAGGTAAAACTTAGGAGCCTTAAGGATCTTGACTTTACGGATGAACACATTC
TGCAATGGGTAGATGTTCTGCGTAGCCTTCTCAATCGCCTTCCCAATGGACTCTGGGATG
AACTTGGCCACAAGCTCCTTAAGGTCACATGATGAAGCCTCCTTCACCATAATCTCACTC
ATCTTTCTCCGAATCTGGCGGACTTGGCTGGACTGAGCATAGCAAGTACGCTTCACCTGG
TTAGCACGCCTCTTGGTGAAACCAATGCAGAACATCCTCAAGGTGTAGCTGTCAGTGGTC
TTCACATCGACATGGGCTTCAATCAAAGTCTGCCACTTCTTCACCAACGACCTCACCTTG
TCGGTTGTGAAATCCATACCCCAGAACTGGGTCAACACATTCCTTCCCTGAACATCTTCA
GCTCTGAGACGGATCTT*CCTGTAAGAATGATCCTCATCGCTTTGAAGATCAGCGAGAGA
CACCTCAAAAACCCTGTGTTTCAACCCCTCAGAGGCAATCTTGGTACCCTGAGTTCTGGA
A

QA 3 723 3 723
DS 

RD RR2AL91JQ 833 0 0
TGATAAACAAGAGTTATAATCCATCAAAAAACGAGTACAAAAAACAGTCGCAAAGAGGTA
GAAGTTCTCTTAACAAAACTCCACAACATTAGTTTTTCTTGCCAAACATGAAAAAAACAA
ATCTATAAATCTTCTAAGCTCCGATGATTTCAGTTGGTTCCTCAACTGTCTCTTCAGCTG
GCCTGTCTACCTTCACACCAACATCCTCTGCTGTGTAGTCACCATGAACCTCCATGAGCT
TTCCAAGGTCAAACTTAGGAACCTTGAGGAACTTGACTTTACGGATGAACACATTCTGCA
ATGGGTAGATGTTCTGTGTCGCCTTCTCAATCGCCTTCCCAATGGACTCTGGGATGAACT
TGGCCACAAGCTCCTTAAGGTCACATGATGAAGCCTCCTTCACCATAATCTCACTCATCT
TTCTGCGGATCTGGCGGACTTGGCTGGACTGAGCATAGCAAGTACGCTTCACCTGGTTAG
CACGCCTCTTGGTGAAACCAATGCAGAACATCCTCAAGGTGTAGCTGTCAGTGGTCTTCA
CATCGACATGGGCTTCAATCAAAGTCTGCCACTTCTTCACCAACGACCTCACCTTGTCGG
TTGTGAAATCCATACCCCAGAACTGGGTCAACACATTCCTTCCCTGAACATCTTCAGCTC
TGAGACGGATCTTTCCTGTAAGAATGATCCTCATCGCTTTGAAGATCAGCGAGAGACACC
TCAAAAACCCTGTGTTTCAACCCCTCAGAGGCAATCTTGGTACCCTGAGTTCTGGAAACA
AAGGGTCTTTCCGACATTTCTGTGAGTGAAGTTAGAGGGAGCCTTGATGTCAT

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2BI05TF 777 0 0
TCACACCAACATCCTCTGCTGTGTAGTCACCATGAACCTCCATGAGCTTTCCAAGGTCAA
ACTTAGGAGCCTTGAGGATCTTGACTTTACGGATGAACACATTCTGCAATGGGTAGATGT
TCTGTGTCGCCTTCTCAATCGCCTTCCCAATGGACTCTGGGATGAACTTGGCCACAAGCT
CCTTAAGGTCACATGATGAAGCCTCCTTCACCATAATCTCACTCATCTTTCTGCGGATCT
GGCGGACTTGGCTGGACTGAGCATAGCAAGTACGCTTCACCTGGTTAGCACGCCTCTTGG
TGAAACCAATGCAGAACATCCTCAAGGTGTAGCTGTCAGTGGTCTTCACATCGACATGGG
CTTCAATCAAAGTCTGCCACTTCTTCACCAACGACCTCACCTTGTCGGTTGTGAAATCCA
TACCCCAGAACTGGGTCAACACATTCCTTCCCTGAACATCTTCAGCTCTGAGGCGGATCT
T*CCTGTAAGAATGATCCTCATCGCTTTGAAGATCAGCGAGAGACACCTCAAAAACCCTG
TGTTTCAACCCCTCAGAGGCAATCTTGGTACCCTGAGTTCTGGAAACAA*GGGTCTTTCC
GACATTTCTGTGAGTGAAGTTAGAGGGAGCCTTGATGTCATACCAATCCTTCTTGGAGAA
AGGATCAACAATCTTCTTCTTGCCTCCTTTACGACCCTTAGAGATCCTCTTGTTCTTCCC
GACAGCCATGGTTAGAGAGCTTCAGGGGCAACAGTGAAGAAGAAG
CGGCTTCAACCC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2AL91TF 776 0 0
CTGTGTAGTCACCATGAACCTCCATGAGCTTTCCAAGGTCAAACTTAGGAACCTTGAGGA
TCTTGACTTTACGGATGAACACATTCTGCAATGGGTAGATGTTCTGTGTCGCTTTCTCAA
TCGCCTTCCCAATGGACTCTGGGATGAACTTGGCCACAAGCTCCTTAAGGTCACATGATG
AAGCCTCCTTCACCATAATCTCACTCATCTTTCTGCGGATCTGGCGGACTTGGCTGGACT
GAGCATAGCAAGTACGCTTCACCTGGTTAGCACGCCTCTTGGTGAAACCAATGCAGAACA
TCCTCAAGGTGTAGCTGTCAGTGGTCTTCACATCGACATGGGCTTCAATCAAAGTCTGCC
ACTTCTTCACCAACGACCTCACCTTGTCGGTTGTGAAATCCATACCCCAGAACTGGGTCA
ACACATTCCTTCCCTGAACATCTTCAGCTCTGAGACGGATCTT*CCTGTAAGAATGATCC
TCATCGCTTTGAAGATCAGCGAGAGACACCTCAAAAACCCTGTGTTTCAACCCCTCAGAG
GCAATCTTGGTACCCTGAGTTCTGGAAACAA*GGGTCTTTCCGACATTTCTGTGAGTGAA
GTTAGAGGGAGCCTTGATGTCATACCAATCCTTCTTGGAGAAAGGATCAACAATCTTCTT
CTTGCCTCCTTTACGACCCTTAGAGATCCTCTTGTTCTTCCCGACAGCCATGGTTAGAGA
GCTTCAGGGGCAACAGTGAAGAAGAAG***CGGCTTCAACAACTGGAGAGAGG
CCC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2BR41TF 719 0 0
AGGATCTTGACTTTACGGATGAACACAT*CTGCAATGG*TAGATGTTCTGTGTCGC*TTC
TCAATCGC*TTCCCAATGGACTCTGGGATGAACTTGGCCACAAGCTCCTTAAGGTCACAT
GATGAAGCCTCCTTCACCATAATCTCACTCATCTTTCTGCGGATCTGGCGGACTTGGCTG
GACTGAGCATAGCAAGTACGCTTCACCTGGTTAGCACGCCTCTTGGTGAAACCAATGCAG
AACATCCTCAAGGTGTAGCTGTCAGTGGTCTTCACATCGACATGGGCTTCAATCAAAGTC
TGCCGCTTCTTCACCAACGACCTCACCTTGTCGGTTGTGAAATCCATACCCCAGAACTGG
GTCAACACATTCCTTCCCTGAACATCTTCAGCTCTGAGACGGATCTT*CCTGTAAGAATG
ATCCTCATCGCTTTGAAGATCAGCGAGAGACACCTCAAAAACCCTGTGTTTCAAACCCTC
AGAGGCAATCTTGGTACCCTGAGTTCTGGGAACAG*GGGTCTTTCCGACATTTCTGTGAG
TGAAGTTAGAGGGAGCCTTGATGTCATACCAATCCTTCTTGGAGAAAGGATCAACAATCT
TCTTCTTGCCTCCTTTACGACCCTTAGAGATCCTCTTGTTCTTCCCGACAGCCATGGTTA
GAGAGCTTCAGGGGCAACAGTGAAGAAGAAG***CGGCTTCAACAACTGGAGAGAGG
CC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2AB36TF 729 0 0
GGAGCCCTAAGGATCTTGACTTTACGGATGAACACATTCTGCAATGGGTAGATGTTCTGT
GTAGC*TTCTCAATCGCCTTCCCAATGGACTCTGGGATGAACTTGGCCACAAGCTCCTTA
AGGTCACATGATGAAGCCTCCTTCACCATAATCTCACTCATCTTTCTCCGAATCTGGCGG
ACTTGGCTGGACTGAGCATAGCAAGTACGCTTCACCTGGTTAGCACGCCTCTTGGTGAAA
CCAATGCAGAACATCCTCAAGGTGTAGCTGTCAGTGGTCTTCACATCGACATGGGCTTCA
ATCAAAGTCTGCCACTTCTTCACCAACGACCTCACCTTGTCGGTTGTGAAATCCATACCC
CAGAACTGGGTCAACACATTCCTTCCCTGAACATCTTCAGCTCTGAGACGGATCTT*CCT
GTAAGAATGATCCTCATCGCTTTGAAGATCAGCGAGAGACACCTCAAAAACCCTGTGTTT
CAACCCCTCAGAGGCAATCTTGGTACCCTGAGTTCTGGAAACAA*GGGTCTTTCCGACAT
TTCTGTGAGTGAAGTTAGAGGGAGCCTTGATATCATACCAATCCTTCTTGGAGAAAGGAT
CAACAATCTTCTTCTTGCCTCCTTTACGACCCTTAGAGATCCTCTTGTTCTTCCCGACAG
CCATGGTTAGGGAGCTTCAAGGGCAACAGTGAAGAAGAAGAAGCGGCTTCAACAACTGGA
GAGAGG
ACC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2DQ66TF 325 0 0
ATCTT*CCTGTAAGAATGATCCTCATCGCTTTGAAGATCAGCGAGAG*CACCTCAAAAAC
CCTGTGTTTCA*CCCCTCAGAGGCAATCTTGGTACCCTGAGTTCTGGAAACAA*GGGTCT
TTCCGACATTTCTGTGAGTGAAGTTAGAGGGAGCCTTGATATCATACCAATCCTTCTTGG
AGAAAGGATCAACAATCTTCTTCTTGCCTCCTTTACGACCCTTAGAGATCCTCTTGTTCT
TCCCGACAGCCATGGTTAGGGAGCTTCAAGGGCAACAGTGAAGAAGAAGAAGCGGCTTCA
ACAACTGGAGAGAGGAAGACCTCCC

QA 1 325 1 325
DS 



AS 2 10

CO CL527Contig1 478 3 2 U
GGATTACCATTCCTTTTAGATTTTAAAACCATTATCAATTCACTTCTATCATATATGATG
AAAAAAACCCCTCAACTATCTTTTACAGTCTTGACTGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGA
ATGATTGCAAATGCACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAA
GATGGGGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTAAA
GGGAAGAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGGAGAAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGT
TAACATTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATATCGATCTCTGA
AGTATTTTTTTTT*AAATTTCTCTCTTGTTTTTTCTTTAATATTTTTATTGGGAGCCTTA
TAATAAAGTATTGAAGTTGACAT**ATAATTGA*AGTATTGAAATTTTTGTTTTTTGG


BQ
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 5 5 20 20 5 20 20 20 20 5 5 20 20 5 5 5 15 15 0 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2B420TF U 1
AF RR2FD39TF U 4
AF RR2EM63TF U 1
BS 1 473 RR2B420TF
BS 474 478 RR2EM63TF

RD RR2B420TF 473 0 0
GGATTACCATTCCTTTTAGATTTTAAAACCATTATCAATTCACTTCTATCATATATGATG
AAAAAAACCCCTCAACTATCTTTTACAGTCTTGACTGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGA
ATGATTGCAAATGCACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAA
GATGGGGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTAAA
GGGAAGAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGGAGAAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGT
TAACATTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATATCGATCTCTGA
AGTATTTTTTTTT*AAATTTCTCTCTTGTTTTTTCTTTAATATTTTTATTGGGAGCCTTA
TAATAAAGTATTGAAGTTGACAT**ATAATTGA*AGTATTGAAATTTTTGTTT

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2FD39TF 464 0 0
GG
ACCATTCCTTTTAGATTTTAAAACCATTATCAATTCACTTCTATCATATATGATGAAAAA
AACTCCTCAACTATCTTTTACAGTCTTGACTGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGAATGAT
TGCAAATGCACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAAGATGG
GGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTAAAGGGAA
GAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGGAGAAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGTTAACA
TTCTGGTTCAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATATCGATCTCTGAAGTAT
TTTTTTTT*AAATTTCTCTCTTGTTTTTTCTTTAATATTTTTATTGGGAGCCTTATAATA
AAGTATTGAAGATGATAATAATAATAAATAATATTATAACCG

QA 3 464 3 464
DS 

RD RR2EM63TF 478 0 0
GGATTACCATTCCTTTTAGATTTTAAAACCATTATCAATTCACTTCTATCATATATGATG
AAAAAAACCCCTCAACTATCTTTTACAGTCTTGACTGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGA
ATGATTGCAAATGCACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAA
GATGGGGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTAAA
GGGAAGAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGGAGAAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGT
TAACATTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATATCGACCTCTGA
AGTATTTTTTTTTTAAATTTCTCTCTTGTTTTTTCTTTAATATTTTTATTGGGAGCCTTA
TAATAAAGTATTGAAGTTGACAT**ATAATTGA*AGTATTGAAATTTTTTTTTTTTGG

QA 1 478 1 478
DS 



CO CL527Contig2 517 7 7 U
GGATTACCATTCCTTTTAGATTTTAAAACCATTATCAATTCACTTCTATCATATATGATG
AAAAAAATCCCTCAACTATCTTTTACAGTCTTCACTGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGA
ATGATTGCAAATGCACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAA
GATGGGGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTAAA
GGGAAGAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGGAGAAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGT
TAACATTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATATCGATCTCTGA
AGTATTTTTTCAAAAAAA*TTCTCTCTTGTTTTTTCTTTAATATTTTTATTGGGAGCCTT
ATAATAAAGTATTGAAGTTGACATATAATTGAAGTATTGAAATTTTTGTTTTGGATTTGT
TGCATTTTTATAATAATGAATAACATAAATATGAATC


BQ
20 20 25 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DG49TF U -1
AF RR2BU26JQ C 1
AF RR2BU26TF U 1
AF RR2GH88JQB C 0
AF RR2GH88TF U 194
AF RR2CL49JQ C 4
AF RR2CL49TF U 4
BS 1 2 RR2BU26TF
BS 3 222 RR2DG49TF
BS 223 269 RR2BU26TF
BS 270 270 RR2GH88TF
BS 271 444 RR2BU26TF
BS 445 472 RR2GH88TF
BS 473 517 RR2CL49TF

RD RR2DG49TF 224 0 0
GGAC
ATTACCATTCCTTTTAGATTTTAAAACCATTATCAATTCACTTCTATCATATATGATGAA
AAAAATCCCTCAACTATCTTTTACAGTCTTCACTGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGAAT
GATTGCAAATGCACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAAGA
TGGGGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTT

QA 5 224 5 224
DS 

RD RR2BU26JQ 444 0 0
GGATTACCATTCCTTTTAGATTTTAAAACCATTATCAATTCACTTCTATCATATATGATG
AAAAAAATCCCTCAACTATCTTTTATAGTCTTCACTGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGA
ATGATTGCAAATGTACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAA
GATGGGGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTAAA
GGGAAGAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGGA*AAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGT
TAACATTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATATCGATCTCTGA
AGTATTTTTTCAAAAAAA*TTCTCTCTTGTTTTTTCTTTAATATTTTTATTGGGAGCCTT
ATAATAAAGTATTGAAGTTGACAT

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR2BU26TF 444 0 0
GGATTACCATTCCTTTTAGATTTTAAAACCATTATCAATTCACTTCTATCATATATGATG
AAAAAAATCCCTCAACTATCTTTTATAGTCTTCACTGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGA
ATGATTGCAAATGTACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAA
GATGGGGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTAAA
GGGAAGAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGGA*AAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGT
TAACATTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATATCGATCTCTGA
AGTATTTTTTCAAAAAAA*TTCTCTCTTGTTTTTTCTTTAATATTTTTATTGGGAGCCTT
ATAATAAAGTATTGAAGTTGACAT

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR2GH88JQB 475 0 0
GGAT
TTACCATTCCTTTTAGATTTTAAAACCATTATCAATTCACTTCTATCATATATGATGAAA
AAAATCCCTCAACTATCTTTTATAGTCTTCACTGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGAATG
ATTGCAAATGCACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAAGAT
GGGGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTAAAGGG
AAGAGTTTGTGTTTTGGGTCAAAGGAGAAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGTTAA
CATTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATATCGATCTTTGAAGT
ATTTTTTCAAAAAAAATTCTCTCTTGTTTTTTCTTTAATATTTTTATTGGGAACCTTATA
ATAAAGTATTGAAGTTGACATATAATTGAAGTATTGAAATTTTTGTTTT
AG

QA 5 473 5 473
DS 

RD RR2GH88TF 281 0 0
TTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTAAAGGGAAGAGTTTGT
GTTCTGGGTCAAAGGAGAAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGTTAACATTCTGGTT
TAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATATCGATCTCTGAAGTATTTTTTCAA
AAAAAATTCTCTCTTGTTTTTTCTTTAATATTTTTATTGGGAACCTTATAATAAAGTATT
GAAGTTGACATATAATTGAAGTATTGAAATTTTTGTTTT
AG

QA 1 279 1 279
DS 

RD RR2CL49JQ 514 0 0
GG
ACCATTCCTTTTAGATTTTAAAACCATTATCAATTTACTTCTATCATATATGATGAAAAA
AACCCCTCAACTATCTTTTACAGTCTTGACTGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGAATGAT
TGCAAATGCACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAAGATGG
GGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTAAAGGGAA
GAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGGAGGAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGTTAACA
TTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATATCGATCTCTGAAGTAT
TTTTTTAAAAAAA*TTCTTTCTTGTTTTTTCTTTAATATTTTTATTGGGAGCCTTATAAT
AAAGTATTGAAGTTGACATATAATTGAAGTATTGAAATTTTTGTTTTGGATTTGTTGCAT
TTTTATAATAATGAATAACATAAATATGAATC

QA 3 514 3 514
DS 

RD RR2CL49TF 514 0 0
GG
ACCATTCCTTTTAGATTTTAAAACCATTATCAATTTACTTCTATCATATATGATGAAAAA
AACCCCTCAACTATCTTTTACAGTCTTGACTGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAGGAATGAT
TGCAAATGCACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAAAAGATGG
GGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTAAAGGGAA
GAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGGAGGAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTTGTTAACA
TTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATATCGATCTCTGAAGTAT
TTTTTTAAAAAAA*TTCTTTCTTGTTTTTTCTTTAATATTTTTATTGGGAGCCTTATAAT
AAAGTATTGAAGTTGACATATAATTGAAGTATTGAAATTTTTGTTTTGGATTTGTTGCAT
TTTTATAATAATGAATAACATAAATATGAATC

QA 3 514 3 514
DS 



AS 2 10

CO CL528Contig1 751 2 11 U
GGAAAGAAAAAAAAAAACAACAGTACTCAAGATCTCAGTTTCCGACAACATGTCGTCAGG
ATCCGACAAAGACAGAGAGACATTCGTCTACTTGGCTAAGCTCTCCGAACAAGCCGAGCG
ATACGACGAGATGGTGGAGACGATGAAGAAAGTTGCCAAGGTGGACAGCGAGCTGACGGT
TGAGGAGAGGAATCTGTTGTCGGTTGGTTACAAGAACGTGATCGGAGCAAGACGTGCCTC
GTGGAGGATAATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCCAAAGGCAACGAATCTAACGT
GAAACACATCAAGGGTTATCGCCAGAAGGTAGAAGACGAGCTTGCCGACATCTGTCGGGA
CATTCTCACCATCATCGATGAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCAGGAGAAGCCACCGT
TTTCTATTACAAGATGAAAGGTGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACCGAGCA
AGAGAGGAAAGAAGCTTCTGAACAGTCACTCAAAGGCTATGAGGCTGCAACACAAGCTGC
AAGCACTGACCTTCCTTCGACACACCCGATTCGTCTTGGCCTTGCTCTTAACTTCTCTGT
TTTCTACTATGAGACCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGCCTT
TGACGAGGCCATTGCTGAGTTGGATACTCTGAGTGAGGAGTCATACAGACAGCACTTTGA
TCATGCAGCTCTGAGAGACACCTACTCTGGA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF09TF U 1
AF RR2CP77TF U 3
BS 1 175 RR2DF09TF
BS 176 176 RR2CP77TF
BS 177 388 RR2DF09TF
BS 389 389 RR2CP77TF
BS 390 550 RR2DF09TF
BS 551 551 RR2CP77TF
BS 552 654 RR2DF09TF
BS 655 655 RR2CP77TF
BS 656 697 RR2DF09TF
BS 698 698 RR2CP77TF
BS 699 751 RR2DF09TF

RD RR2DF09TF 751 0 0
GGAAAGAAAAAAAAAAACAACAGTACTCAAGATCTCAGTTTCCGACAACATGTCGTCAGG
ATCCGACAAAGACAGAGAGACATTCGTCTACTTGGCTAAGCTCTCCGAACAAGCCGAGCG
ATACGACGAGATGGTGGAGACGATGAAGAAAGTTGCCAAGGTGGACAGCGAGCTGGCGGT
TGAGGAGAGGAATCTGTTGTCGGTTGGTTACAAGAACGTGATCGGAGCAAGACGTGCCTC
GTGGAGGATAATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCCAAAGGCAACGAATCTAACGT
GAAACACATCAAGGGTTATCGCCAGAAGGTAGAAGACGAGCTTGCCGACATCTGTCGGGA
CATTCTCACCATCATCGATGAGCATCTCGTCCCTCACGCTACCTCAGGAGAAGCCACCGT
TTTCTATTACAAGATGAAAGGTGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACCGAGCA
AGAGAGGAAAGAAGCTTCTGAACAGTCACTCAAAGGCTATGAGGCTGCAACACAAGCTGC
AAGCACTGACTTTCCTTCGACACACCCGATTCGTCTTGGCCTTGCTCTTAACTTCTCTGT
TTTCTACTATGAGACCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCA*GCCTT
TGACGAGGCCATTGCTGAGTTGGATACTCTGAGTGAG*AGTCATACAGACAGCACTTTGA
TCATGCAGCTCTGAGAGACACCTACTCTGGA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2CP77TF 727 0 0
GG
AGAAAAAAAAAAACGACAGTACTCAAGATCTCAGTTTCCGACAACATGTCGTCAGGATCC
GACAAAGACAGAGAGACATTCGTCTACTTGGCTAAGCTCTCCGAACAAGCCGAGCGATAC
GACGAGATGGTGGAGACGATGAAGAAAGTTGCCAAGGTGGACAGCGAGCTGACGGTTGAG
GAGAGGAATCTGTTGTCGGTTGGTTACAAGAACGTGATCGGAGCAAGACGTGCCTCGTGG
AGGATAATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCCAAAGGCAACGAATCTAACGTGAAA
CACATCAAGGGTTATCGCCAGAAGGTAGAAGACGAGCTTGCCGACATCTGTCGGGACATT
CTCACCATCATCGATGAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCAGGAGAAGCCACCGTTTTC
TATTACAAGATGAAAGGTGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACCGAGCAAGAG
AGGAAAGAAGCTTCTGAACAGTCACTCAAAGGCTATGAGGCTGCAACACAAGCTGCAAGC
ACTGACCTTCCTTCGACACACCCGATTCGTCTTGGCCTTGCTCTTAACTTCTCTGTTTTC
TACTATGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGCCTTTGAC
GAGGCCATTGCTGAGTTGGATACTCTGAGTGAGGAGTCATACAGACAGCACTTTGATCAT
GCAGC

QA 3 727 3 727
DS 



CO CL528Contig2 1112 8 22 U
GGGAAGACAAAACAAAAAAAAACACAGAAATCAAGAACTCTGTTTCCGACACATAATCGT
GAACAAAAAATGTCGTCAGAGAGGGAGACATTCGTCTACTTGGCTAAGCTCTCCGAACAA
GCCGAGCGTTACGACGAGATGGTTGAGACGATGAAGAAAGTGGCGAAGGTGGACAGCGAG
CTGACTGTGGAAGAGAGGAATCTGTTGTCCGTTGGTTACAAGAACGTGATCGGAGCGAGA
CGGGCCTCGTGGAGGATCATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAA
TCAAACGTGAAAACAATCAAGGGGTATCGCCAAAAGGTAGAGGACGAGCTCGCAGACATC
TGTCAAGACATTCTCAGCATCATTGATCAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGAGAA
GCCACTGTTTTCTATTACAAGATGAAAGGGGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAG
ACCGAGCAAGATAGGAAGGAAGCCTCTGAACAGTCTCTCAAAGGCTATGAGGCTGCAACA
CAAGCTGCAAGCACTGAGCTTCCTTCAACACACCCGATTCGTCTTGGCCTTGCTCTTAAC
TTCTCTGTTTTCTACTATGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAG
CAAGCCTTTGATGAGGCGATTGCGGAGTTAGATACTCTTAGTGAGGAGTCGTACAAGGAC
AGCACTTTGATCATGCAGCTCCTTAGAGACAACCTCACCCTCTGGACTTCCGATCTTCCT
GAAGATGGAGGAGAAGAGAGCATCAAGACCGATGAACCCAAGAAAGAAGAGGCCAAGTCT
GCAGAAGCCACTGAGAACTGATCAAAGAACTCTGGAAGTTGAATGAGGCCTTTCTATTAA
GTGAAGATGAGATCAGAGACTGTTGAATCCAATCATATATTGTTTTTTTTCTTTTTCTAA
TTACACATTTTGTCTTTCTTTTGTTGTCAATCTCATGATATCAAATACTCTATTTATGTT
ATTTGATTTGATCAGATATGTTTTACATTTCCAATATACAGACAATCAACTGTATTATTA
AAAATTTCCAACCAAACAGAACAAACAAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY16TF U 2
AF RR2G173TF U 1
AF RR2AY06TFB U 81
AF RR2BI33TF U 7
AF RR2CY16JQ C 529
AF RR2BI33JQ C 129
AF RR2G173JQ C 246
AF RR2AY06JQ C 508
BS 1 139 RR2G173TF
BS 140 140 RR2CY16TF
BS 141 339 RR2G173TF
BS 340 340 RR2CY16TF
BS 341 427 RR2G173TF
BS 428 428 RR2CY16TF
BS 429 715 RR2G173TF
BS 716 716 RR2BI33TF
BS 717 717 RR2AY06TFB
BS 718 749 RR2G173TF
BS 750 815 RR2BI33TF
BS 816 816 RR2BI33JQ
BS 817 827 RR2BI33TF
BS 828 828 RR2BI33JQ
BS 829 835 RR2BI33TF
BS 836 836 RR2BI33JQ
BS 837 854 RR2BI33TF
BS 855 855 RR2G173JQ
BS 856 876 RR2BI33TF
BS 877 1031 RR2BI33JQ
BS 1032 1052 RR2G173JQ
BS 1053 1112 RR2AY06JQ

RD RR2CY16TF 671 0 0
GGAAGAC
AAAACAAAAAAAAACACAGAAATCAAGAACTCTGTTTCCGACACATAATCGTGAACAAAA
AATGTCGTCAGAGAGGGAGACATTCGTCTACTTGGCTAAGCTCTCCGAACAAGCCGAGCG
TTACGACGAGATGGTTGAGACGATGAAGAAAGTGGCGAAGGTGGACAGCGAGCTGACTGT
GGAAGAGAGGAATCTGTTGTCCGTTGGTTACAAGAACGTGATCGGAGCGAGACGGGCCTC
GTGGAGGATCATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAATCAAACGT
GAAAACAATCAAGGGGTATCGCCAAAAGGTAGAGGACGAGCTCGCAGACATCTGTCAAGA
CATTCTCAGCATCATTGATCAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGAGAAGCCACTGT
TTTCTATTACAAGATGAAAGGGGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACCGAGCA
AGATAGGAAGGAAGCCTCTGAACAGTCTCTCAAAGGCTATGAGGCTGCAACACAAGCTGC
AAGCACTGAACTTCCTTCAACACACCCGATTCGTCTTGGCCTTGCTCTTAACTTCTCTGT
TTTCTACTATGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGCCTT
TGAT

QA 8 671 8 671
DS 

RD RR2G173TF 749 0 0
GGGAAGACAAAACAAAAAAAAACACAGAAATCAAGAACTCTGTTTCCGACACATAATCGT
GAACAAAAAATGTCGTCAGAGAGGGAGACATTCGTCTACTTGGCTAAGCTCTCCGAACAA
GCCGAGCGTTACGACGAGACGGTTGAGACGATGAAGAAAGTGGCGAAGGTGGACAGCGAG
CTGACTGTGGAAGAGAGGAATCTGTTGTCCGTTGGTTACAAGAACGTGATCGGAGCGAGA
CGGGCCTCGTGGAGGATCATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAA
TCAAACGTGAAAACAATCAAGGGGTATCGCCAAAAGGTATAGGACGAGCTCGCAGACATC
TGTCAAGACATTCTCAGCATCATTGATCAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGAGAA
GCCACTGGTTTCTATTACAAGATGAAAGGGGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAG
ACCGAGCAAGATAGGAAGGAAGCCTCTGAACAGTCTCTCAAAGGCTATGAGGCTGCAACA
CAAGCTGCAAGCACTGAGCTTCCTTCAACACACCCGATTCGTCTTGGCCTTGCTCTTAAC
TTCTCTGTTTTCTACTATGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAG
CAAGCCTTTGATGAGGCGATTGCGGAGTTAGATACTCTTAGTGAGGAGTCGTACAG*GAC
AGCACTTTGATCATGCAGCTCCTTAGAGA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2AY06TFB 674 0 0
GAGGGAGACATTCGTCTACTTGGCTAAGCTCTCCGAACAAGCCGAGCGTTACGACGAGAT
GGTTGAGACGATGAAGAAAGTGGCGAAGGTGGACAGCGAGCTGACTGTGGAAGAGAGGAA
TCTGTTGTCCGTTGGTTACAAGAACGTGATCGGAGCGAGACGGGCCTCGTGGAGGATCAT
GTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAATCAAACGTGAAAACAATCAA
GGGGTATCGCCAAAAGGTAGAGGACGAGCTCGCAGACATCTGTCAAGACATTCTCAGCAT
CATTGATCAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGAGAAGCCACTGTTTTCTATTACAA
GATGAAAGGGGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACCGAGCAAGATAGGAAGGA
AGCCTCTGAACAGTCTCTCAAAGGCTATGAGGCTGCAACACAAGCTGCAAGCACTGAGCT
TCCTTCAACACACCCGATTCGTCTTGGCCTTGCTCTTAACTTCTCTGTTTTCTACTATGA
GATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGCCTTTGATGAGGCGAT
TGCGGAGTTAGATACTCTTAGTGAGGAGTCGTACAAGGACAACACTTTGATCATGCAGCT
CCTTAGAGACAACC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2BI33TF 870 0 0
GG
AAAACAAAAAAAAACACAGAAATCAAGAACTCTGTTTCCGACACATAATCGTGAACAAAA
AATGTCGTCAGAGAGGGAGACATTCGTCTACTTGGCTAAGCTCTCCGAACAAGCCGAGCG
TTACGACGAGATGGTTGAGACGATGAAGAAAGTGGCGAAGGTGGACAGCGAGCTGACTGT
GGAAGAGAGGAATCTGTTGTCCGTTGGTTACAAGAACGTGATCGGAGCGAGACGGGCCTC
GTGGAGGATCATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAATCAAACGT
GAAAACAATCAAGGGGTATCGCCAAAAGGTAGAGGACGAGCTCGCAGACATCTGTCAAGA
CATTCTCAGCATCATTGATCAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGAGAAGCCACTGT
TTTCTATTACAAGATGAAAGGGGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACCGAGCA
AGATAGGAAGGAAGCCTCTGAACAGTCTCTCAAAGGCTATGAGGCTGCAACACAAGCTGC
AAGCACTGAGCTTCCTTCAACACACCCGATTCGTCTTGGCCTTGCTCTTAACTTCTCTGT
TTTCTACTATGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGCCTT
TGATGAGGCGATTGCGGAGTTAGATACTCTTAGTGAGGAGTCGTACAAAGACAGCACTTT
GATCATGCAGCTCCTTAGAGACAACCTCACCCTCTGGACTTCCGATCTTCCTGAAGATGG
AGGAGAAGAGAGCATCAAGACCGATGA*CCCAAGAAAGA*GAGGCCA*GTCTGCAGAAGC
CACTGATAACTGATCAAAGAACTCTGGA

QA 3 870 3 870
DS 

RD RR2CY16JQ 457 0 0
GAGGCTGCAACACAAGCTGCAAGCACTGAACTTCCTTCAACACACCCGATTCGTCTTGGC
CTTGCTTTTAACTTTTCTGTTTTTTACTATGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGC
CATTTGGCGAAGCAAGCCTTTGATGAGGCGATTGCGGAGTTAGATACTCTTAGTGAGGAG
TCGTACAAGGACAGCACTTTGATCATGCAGCTCCTTAGAGACAACCTCACCCTCTGGACT
TCTGATCTTCCTGAAGATGGAGGAGAAGAGAGCATCAAGACCGATGAACCCAAGAAAGAA
GAGGCCAAGTCTGCAGAAGCCACTGAGAACTGATCAAAGAACTCTGGAAGTTGAATGAGG
CCTTTCTATTAAGTGAAGATGAGATCAGAGACTGTTGAATCCAATCATATATTGTTTTTT
TTCTTTTTCTAATTACACATTTTGTCTTTCTTTTGTT

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR2BI33JQ 905 0 0
TTACGACGAGATGGTTGAGACGATGAAGAAAGTGGCGAAGGTGGACAGCGAGCTGACTGT
GGAAGAGAGGAATCTGTTGTCCGTTGGTTACAAGAACGTGATCGGAGCGAGACGGGCCTC
GTGGAGGATCATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAATCAAACGT
GAAAACAATCAAGGGGTATCGCCAAAAGGTAGAGGACGAGCTCGCAGACATCTGTCAAGA
CATTCTCAGCATCATTGATCAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGAGAAGCCACTGT
TTTCTATTACAAGATGAAAGGGGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACCGAGCA
AGATAGGAAGGAAGCCTCTGAACAGTCTCTCAAAGGCTATGAGGCTGCAACACAAGCTGC
AAGCACTGAGCTTCCTTCAACACACCCGATTCGTCTTGGCCTTGCTCTTAACTTCTCTGT
TTTCTACTATGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGCCTT
TGATGAGGCGATTGCGGAGTTAGATACTCTTAGTGAGGAGTCGTACAAGGACAGCACTTT
GATCATGCAGCTCCTTAGAGACAACCTCACCCTCTGGACTTCCGATCTTCCTGAAGATGG
AGGAGAAGAGAGCATCAAGACCGATGAACCCAAGAAAGAAGAGGCCAAGTCTGCAGAAGC
CACTGATAACTGATCAAAGAACTCTGGAAGTTGAATGAGGCCTTTCTATTAAGTGAAGAT
GAGATCAGAGACTGTTGAATCCAATCATATATTGTTTTTTTTCTTTTTCTAATTACACAT
TTTGTCTTTCTTTTGTTGTCAATCTCATGATATCAAATACTCTATTTATGTTATTTGATT
TGA
CC

QA 1 903 1 903
DS 

RD RR2G173JQ 807 0 0
CTCGTGGAGGATCATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAATCAAA
CGTGAAAACAATCAAGGGGTATCGCCAAAAGGTATAGGACGAGCTCGCAGACATCTGTCA
AGACATTCTCAGCATCATTGATCAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGAGAAGCCAC
TGGTTTCTATTACAAGATGAAAGGGGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACCGA
GCAAGATAGGAAGGAAGCCTCTGAACAGTCTCTCAAAGGCTATGAGGCTGCAACACAAGC
TGCAAGCACTGAGCTTCCTTCAACACACCCGATTCGTCTTGGCCTTGCTCTTAACTTCTC
TGTTTTTTACTATGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGC
CTTTGATGAGGCGATTGCGGAGTTAGATACTCTTAGTGAGGAGTCGTACAAGGACAGCAC
TTTGATCATGCAGCTCCTTAGAGACAACCTCACCCTCTGGACTTCTGATCTTCCTGAAGA
TGGAGGAGAAGAGAGCATCAAGACCGATGAACCCAAGAAAGAAGAGGCCAAGTCTGCAGA
AGCCACTGAGAACTGATCAAAGAACTCTGGAAGTTGAATGAGGCCTTTCTATTAAGTGAA
GATGAGATCAGAGACTGTTGAATCCAATCATATATTGTTTTTTTTCTTTTTCTAATTACA
CATTTTGTCTTTCTTTTGTTGTCAATCTCATGATATCAAATACTCTATTTATGTTATTTG
ATTTGATCAGATATGTTTTACATTTCC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2AY06JQ 605 0 0
GAACAGTCTCTCAAAGGCTATGAGGCTGCAACACAAGCTGCAAGCACTGAGCTTCCTTCA
ACACACCCGATTCGTCTTGGCCTTGCTCTTAACTTTTCTGTTTTCTACTATGAGATCATG
AACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGGGAAGCAAGCCTTTGATGAGGCGATTGCGGAG
TTAGATACTCTTAGTGAGGAGTCGTACAAGGACAACACTTTGATCATGCAGCTCCTTAGA
GACAACCTCACCCTCTGGACTTCTGATCTTCCTGAAGATGGAGGAGAAGAGAGCATCAAG
ACCGATGAACCCAAGAAAGAAGAGGCCAAGTCTGCAGAAGCCACTGAGAACTGATCAAAG
AACTCTGGAAGTTGAATGAGGCCTTTCTATTAAGTGAAGATGAGATCAGAGACTGTTGAA
TCCAATCATATATTGTTTTTTTTCTTTTTCTAATTACACATTTTGTCTTTCTTTTGTTGT
CAATCCCATGATATCAAATACTCTATTTATGTTATTTGATTTGATCAGATATGTTTTACA
TTTCCAATATACAGACAATCAACTGTATTATTAAAAATTTCCAACCAAACAGAACAAACA
AACAC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 2 10

CO CL529Contig1 1106 4 8 U
AAAGCGTATAATTTTGTAATTCAAAGAAATGAAAGACTTCTGACTCATGTCCACGAAAAC
AACCATCGCTATCCTCAAAATAAAGACCATCCAAAAAGAACCAATAACAGACGCTGAAAA
CAATGAATTCAATGTACTCTTACTGATTAACCGAACCTTGATCTCTCATATCACTCGCCC
ACACTTTCGACTCAAAACTATAAAACCCAAAACGACTCAGCAAAACCCAACCCCAAACCA
CTTGATATGATCCGACAACACATGTAGATGATAGTTAGTGCCAAGACACTAGTAAACTCG
AGATGGATGCATCAAAACAAGGCTAATAATACCTCGCCAAAGGAGCTTAAACATTGATGC
ATCTTAAGTTGAGGGAGCAGCCTCTTCGGTTTTCTTTTCTTCACCAGCCTTCTCTGACTC
GGTTTTTGTCTTTTCCTCTGCTTCCACTTCGGTCTTCACCTTCTCCACAGGTTTCTCCTC
AGTTTTTGTCTCTTCAACGGACAACTTCTCAAGAAGACCAGCGGTGTCAGATGCATCTTT
GCTCTCTTCTTTCTCTACTTCAGATTCAGCAACTTCATTGAACTTCTGCATAAATGCTTT
GCAGTTCTCAATTGAAGCAAATCGGATGCAGAAAAGCTCATCCTTGAGCTCTCCATCAGC
AAAGTCACGAGCGTGCCACACACACGACTTCTCGTTTCCAACGTGTTCCTGAACAGGCAT
GCCCTGTTTAACGAAATGATTGGCACAGATCTTGAGAGTTTTAGATTGCCTCATAACGAG
ACGAATCTTGCCGGTGCTCTTATGCTTCAAGAGCTTCACAGTACCAGCACCTCTCTCCTT
CCACTGATTCGCTTCCTTGTCGAACCGATATAGCTTCGATTTCAGATCGAGGATTGCGTC
TTCGTCTTCCTCGCCGGTGGTGACGGCAACTTCCTCAAGCCTAACGATCGGAGCGACCTG
AGCTCCGGTGTCCTCATCCTCGTTAGCTCCAGATTCTTCTGCGTCTCTGTTCTCGTGCTC
GGGTTCGTTGGTCGCCATAGAATCTAGGGACTGAGGTTTCTTCGTGGATTCAACAGTTGG
TGCGGCGTACGAGAAAGTGAGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2E212JQ U 52
AF RR2D720JQ U 1
AF RR2A912TF C 377
AF RR2D720TF C 391
BS 1 136 RR2D720JQ
BS 137 137 RR2E212JQ
BS 138 267 RR2D720JQ
BS 268 270 RR2E212JQ
BS 271 294 RR2D720JQ
BS 295 295 RR2E212JQ
BS 296 787 RR2D720JQ
BS 788 1106 RR2A912TF

RD RR2E212JQ 513 0 0
CATGA
AAACAACCATCTCTATCCTCAAAATAAAGACCATCCAAAAAGAACCAATAACAGACGCTG
AAAACAATGAATTCACTGTACT*TTACTGATTAACCGAACCTTGATCTCTCATATCACTC
GCCCACACTTTCGACTCAAAACTATAAAACCCAAAACGACTCAGCAAAACCCAACCCCAA
ACCACTTGATATGATCCGACAACACATGTAGATGATAGTTAGTGCCGGGACACTAGTAAA
CTCGAGATGGATGCATCAAAACAAGGCTAATAATACCTCGCCAAAGGAGCTTAAACATTG
ATGCATCTTAAGTTGAGGGAGCAGCCTCTTCGGTTTTCTTTTCTTCACCAGCTTTCTCTG
GCTCGGTTTTTGTCTTTTCATCTGCTTCAACTTCGGTCTTCACCTTCTCCACAGGTTTCT
CCTCTGTTTTTGTCTCTTCAACGGACAACTTCTCAAGAAGACCAGCGGTGTCAGATGCAT
CTTTGCTCTCTTCTTTCTCTACTTCAGA

QA 6 513 6 513
DS 

RD RR2D720JQ 787 0 0
AAAGCGTATAATTTTGTAATTCAAAGAAATGAAAGACTTCTGACTCATGTCCACGAAAAC
AACCATCGCTATCCTCAAAATAAAGACCATCCAAAAAGAACCAATAACAGACGCTGAAAA
CAATGAATTCAATGTATTCTTACTGATTAACCGAACCTTGATCTCTCATATCACTCGCCC
ACACTTTCGACTCAAAACTATAAAACCCAAAACGACTCAGCAAAACCCAACCCCAAACCA
CTTGATATGATCCGACAACACATGTAG***ATAGTTAGTGCCAAGACACTAGTAGACTCG
AGATGGATGCATCAAAACAAGGCTAATAATACCTCGCCAAAGGAGCTTAAACATTGATGC
ATCTTAAGTTGAGGGAGCAGCCTCTTCGGTTTTCTTTTCTTCACCAGCCTTCTCTGACTC
GGTTTTTGTCTTTTCCTCTGCTTCCACTTCGGTCTTCACCTTCTCCACAGGTTTCTCCTC
AGTTTTTGTCTCTTCAACGGACAACTTCTCAAGAAGACCAGCGGTGTCAGATGCATCTTT
GCTCTCTTCTTTCTCTACTTCAGATTCAGCAACTTCATTGAACTTCTGCATAAATGCTTT
GCAGTTCTCAATTGAAGCAAATCGGATGCAGAAAAGCTCATCCTTGAGCTCTCCATCAGC
AAAGTCACGAGCGTGCCACACACACGACTTCTCGTTTCCAACGTGTTCCTGAACAGGCAT
GCCCTGTTTAACGAAATGATTGGCACAGATCTTGAGAGTTTTAGATTGCCTCATAACGAG
ACGAATC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2A912TF 730 0 0
GCAGCCTCTTCGGTTTTCTTTTCTTCACCAGCCTTCTCTGACTCGGTTTTTGTCTTTTCC
TCTGCTTCCACTTCGGTCTTCACCTTCTCCACAGGTTTCTCCTCAGTTTTTGTCTCTTCA
ACGGACAACTTCTCAAGAAGACCAGCGGTGTCAGATGCATCTTTGCTCTCTTCTTTCTCT
ACTTCAGATTCAGCAACTTCATTGAACTTCTGCATAAATGCTTTGCAGTTCTCAATTGAA
GCAAATCGGATGCAGAAAAGCTCATCCTTGAGCTCTCCATCAGCAAAGTCACGAGCGTGC
CACACACACGACTTCTCGTTTCCAACGTGTTCCTGAACAGACATGCCCTGTTTAACGAAA
TGATTGGCACAGATCTTGAGAGTTTTAGATTGCCTCATAACGAGACGAATCTTGCCGGTG
CTCTTATGCTTCAAGAGCTTCACAGTACCAGCACCTCTCTCCTTCCACTGATTCGCTTCC
TTGTCGAACCGATATAGCTTCGATTTCAGATCGAGGATTGCGTCTTCGTCTTCCTCGCCG
GTGGTGACGGCAACTTCCTCAAGCCTAACGATCGGAGCGACCTGAGCTCCGGTGTCCTCA
TCCTCGTTAGCTCCAGATTCTTCTGCGTCTCTGTTCTCGTGCTCGGGTTCGTTGGTCGCC
ATAGAATCTAGGGACTGAGGTTTCTTCGTGGATTCAACAGTTGGTGCGGCGTACGAGAAA
GTGAGATTCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2D720TF 716 0 0
CGGTTTCTTTCTCACCAG
CTTCTCTGACTCGGTTTT*GTCTTT*CCTCTGCTTCCACTTCGGTCTTCAC*TTCTCCAC
AGGTTTCTCCTCAGTTTTTGTCTCTTCAACGGACAACTTCTCAAGAAGACCAGCGGTGTC
AGATGCATCTTTGCTCTCTTCTTTCTCTACTTCAGATTCAGCAACTTCATTGAACTTCTG
CATAAATGCTTTGCAGTTCTCAATTGAAGCAAATCGGATGCAGAAAAGCTCATCCTTGAG
CTCTCCATCAGCAAAGTCACGAGCGTGCCACACACACGACTTCTCGTTTCCAACGTGTTC
CTGAACAGGCATGCCCTGTTTAACGAAATGATTGGCACAGATCTTGAGAGTTTTAGATTG
CCTCATAACGAGACGAATCTTGCCGGTGCTCTTATGCTTCAAGAGCTTCACAGTACCAGC
ACCTCTCTCCTTCCACTGATTCGCTTCCTTGTCGAACCGATATAGCTTCGATTTCAGATC
GAGGATTGCGTCTTCGTCTTCCTCGCCGGTGGTGACGGCAACTTCCTCAAGCCTAACGAT
CGGAGCGACCTGAGCTCCGGTGTCCTCATCCTCGTTAGCTCCAGATTCTTCTGCGTCTCT
GTTCTCGTGCTCGGGTTCGTTGGTCGCCATAGAATCTAGGGACTGAGGTTTCTTCGTGGA
TTCAACAGTTGGTGCGGCGTACGAGAAAGTGAGATTCC

QA 19 716 19 716
DS 



CO CL529Contig2 978 6 6 U
GGAGCTCAGGTCGCTCCGATCGTTAGGCTTGAGGAAGTTGCCGTCACTACCGGCGAGGAA
GACGAAGACGCCATCCTCGATCTGAAATCGAAGCTGTATCGGTTCGACAAGGAAGCGAAT
CAGTGGAAGGAGAGAGGTGCTGGTACTGTGAAGCTCTTGAAGCATAAGAGCACTGGCAAG
ATTCGTCTCGTTATGAGACAATCGAAAACTCTGAAGATCTGTGCCAATCATTTCGTTAAA
CAGGGCATGTCTGTTCAGGAACACGTTGGAAACGAGAAGTCTTGTGTGTGGCACGCTCGG
GACTTTGCTGATGGTGAGCTGAAGGATGAACTTTTCTGCATCCGATTTGCCTCAATTGAG
AACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAA
GAGAGCAAAGATGCATCTGACACCGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTGTCCGTTGAAGAGACA
AAAACAGAGGAGAAATCTGTGGAGAAGCTGAAGACCGAAGTTGAAGCAGAGGAAAAGACA
AAAACCGAGCCAGAGAAGGCTGATGAAGAAAAGAAAACCGAAGAGGCTGCTCCCTCAACT
TAAGATGCATCAATGTTTAATCTCCTTTGGCGAGGTATTATTAGCCTTGTTTTGATGCAT
CCATCTCGAGTCTACTAGTGTCTTGGCACTAACTATCATCTACATGTGTTGTCGGATCAT
ATCAAGTGGTTTGGGGTTGGGTTTTGCTGAGTCGTTTTGGGTTTTTATAGTTTTGAGTCG
AAAGTGTGGGTGAGTGATATGAGAGATTAAGGTTTGGTTATCAGTAAGAATACATTGAAT
TCATTGTTTTCAGCGTTTGTTATGGGTTGTTTTTGGATGGTCTTTATTTTGAGGATAGAG
ATGGTTGTTTGTTCATGGACATGAGTCAGAAGTCTTCATTTCTTTTGGATTACAAAATTA
TACGCATTGTTGATTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR2DB09TF U 1
AF RR2AC02TF U 229
AF RR2AC02JQ C 229
AF RR2EX87JQ C 407
AF RR2DB09JQ C 313
AF RR2EX87TF U 229
BS 1 590 RR2DB09TF
BS 591 927 RR2AC02TF
BS 928 956 RR2EX87TF
BS 957 957 RR2AC02JQ
BS 958 977 RR2EX87TF
BS 978 978 RR2AC02JQ

RD RR2DB09TF 590 0 0
GGAGCTCAGGTCGCTCCGATCGTTAGGCTTGAGGAAGTTGCCGTCACTACCGGCGAGGAA
GACGAAGACGCCATCCTCGATCTGAAATCGAAGCTGTATCGGTTCGACAAGGAAGCGAAT
CAGTGGAAGGAGAGAGGTGCTGGTACTGTGAAGCTCTTGAAGCATAAGAGCACTGGCAAG
ATTCGTCTCGTTATGAGACAATCGAAAACTCTGAAGATCTGTGCCAATCATTTCGTTAAA
CAGGGCATGTCTGTTCAGGAACACGTTGGAAACGAGAAGTCTTGTGTGTGGCACGCTCGG
GACTTTGCTGATGGTGAGCTGAAGGATGAACTTTTCTGCATCCGATTTGCCTCAATTGAG
AACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAA
GAGAGCAAAGATGCATCTGACACCGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTGTCCGTTGAAGAGACA
AAAACAGAGGAGAAATCTGTGGAGAAGCTGAAGACCGAAGTTGAAGCAGAGGAAAAGACA
AAAACCGAGCCAGAGAAGGCTGATGAAGAAAAGAAAACCGAAGAGGCTGC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2AC02TF 699 0 0
G
ATTTCGTTAAACAGGGCATGTCTGTTCAGGAACACGTTGGAAACGAGAAGTCTTGTGTGT
GGCACGCTCGGGACTTTGCTGATGGTGAGCTGAAGGATGAACTTTTCTGCATCCGATTTG
CCTCAATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAG
TAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATGCATCTGACACCGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTGTCCG
TTGAAGAGACAAAAACAGAGGAGAAATCTGTGGAGAAGCTGAAGACCGAAGTTGAAGCAG
AGGAAAAGACAAAAACCGAGCCAGAGAAGGCTGATGAAGAAAAGAAAACCGAAGAGGCTG
CTCCCTCAACTTAAGATGCATCAATGTTTAATCTCCTTTGGCGAGGTATTATTAGCCTTG
TTTTGATGCATCCATCTCGAGTCTACTAGTGTCTTGGCACTAACTATCATCTACATGTGT
TGTCGGATCATATCAAGTGGTTTGGGGTTGGGTTTTGCTGAGTCGTTTTGGGTTTTTATA
GTTTTGAGTCGAAAGTGTGGGTGAGTGATATGAGAGATTAAGGTTTGGTTATCAGTAAGA
ATACATTGAATTCATTGTTTTCAGCGTTTGTTATGGGTTGTTTTTGGATGGTCTTTATTT
TGAGGATAGAGATGGTTGTTTGTTCATGGACATGAGTC

QA 2 699 2 699
DS 

RD RR2AC02JQ 750 0 0
G
ATTTCGTTAAACAGGGCATGTCTGTTCAGGAACACGTTGGAAACGAGAAGTCTTGTGTGT
GGCACGCTCGGGACTTTGCTGATGGTGAGCTGAAGGATGAACTTTTCTGCATCCGATTTG
CCTCAATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAG
TAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATGCATCTGACACCGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTGTCCG
TTGAAGAGACAAAAACAGAGGAGAAATCTGTGGAGAAGCTGAAGACCGAAGTTGAAGCAG
AGGAAAAGACAAAAACCGAGCCAGAGAAGGCTGATGAAGAAAAGAAAACCGAAGAGGCTG
CTCCCTCAACTTAAGATGCATCAATGTTTAATCTCCTTTGGCGAGGTATTATTAGCCTTG
TTTTGATGCATCCATCTCGAGTCTACTAGTGTCTTGGCACTAACTATCATCTACATGTGT
TGTCGGATCATATCAAGTGGTTTGGGGTTGGGTTTTGCTGAGTCGTTTTGGGTTTTTATA
GTTTTGAGTCGAAAGTGTGGGTGAGTGATATGAGAGATTAAGGTTTGGTTATCAGTAAGA
ATACATTGAATTCATTGTTTTCAGCGTTTGTTATGGGTTGTTTTTGGATGGTCTTTATTT
TGAGGATAGAGATGGTTGTTTGTTCATGGACATGAGTCAGAAGTCTTCATTTCTTTTGGA
TTACAAAATTATACGCATTGTTGATTTTA

QA 2 750 2 750
DS 

RD RR2EX87JQ 572 0 0
AAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATGCATCTGACACCGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTGT
CCGTTGAAGAGACAAAAACAGAGGAGAAATCTGTGGAGAAGCTGAAGACCGAAGTTGAAG
CAGAGGAAAAGACAAAAACCGAGCCAGAGAAGGCTGATGAAGAAAAGAAAACCGAAGAGG
CTGCTCCCTCAACTTAAGATGCATCAATGTTTAATCTCCTTTGGCGAGGTATTATTAGCC
TTGTTTTGATGCATCCATCTCGAGTCTACTAGTGTCTTGGCACTAACTATCATCTACATG
TGTTGTCGGATCATATCAAGTGGTTTGGGGTTGGGTTTTGCTGAGTCGTTTTGGGTTTTT
ATAGTTTTGAGTCGAAAGTGTGGGTGAGTGATATGAGAGATTAAGGTTTGGTTATCAGTA
AGAATACATTGAATTCATTGTTTTCAGCGTTTGTTATGGGTTGTTTTTGGATGGTCTTTA
TTTTGAGGATAGAGATGGTTGTTTGTTCATGGACATGAGTCAGAAGTCTTCATTTCTTTT
GGATTACAAAATTATACGCATTGTTGATTTT
A

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2DB09JQ 665 0 0
GGTGAGCTGAAGGATGAACTTTTCTGCATCCGATTTGCCTCAATTGAGAACTGCAAAGCA
TTTATGCAGAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGAT
GCATCTGACACCGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTGTCCGTTGAAGAGACAAAAACAGAGGAG
AAATCTGTGGAGAAGCTGAAGACCGAAGTTGAAGCAGAGGAAAAGACAAAAACCGAGCCA
GAGAAGGCTGATGAAGAAAAGAAAACCGAAGAGGCTGCTCCCTCAACTTAAGATGCATCA
ATGTTTAATCTCCTTTGGCGAGGTATTATTAGCCTTGTTTTGATGCATCCATCTCGAGTC
TACTAGTGTCTTGGCACTAACTATCATCTACATGTGTTGTCGGATCATATCAAGTGGTTG
GGGGTTGGGTTTTGCTGAGTCGTTTTGGGTTTT*ATAGTTTTGAGTCGAAAGTGTGGGTG
AGTGATATGAGAGATTAAGGTTTGGTTATCAGTAAGAATACATTGAATTCATTGTTTTCA
GCGTTTGTTATGGGTTGTTTTTGGATGGTCTTTATTTTGAGGATAGAGATGGTTGTTTGT
TCATGGACATGAGTCAGAAGTCTTCATTTCTTTTGGATTACAAAATTATACGCATTGTTG
ATTTT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2EX87TF 750 0 0
G
ATTTCGTTAAACAGGGCATGTCTGTTCAGGAACACGTTGGAAACGAGAAGTCTTGTGTGT
GGCACGCTCGGGACTTTGCTGATGGTGAGCTGAAGGATGAACTTTTCTGCATCCGATTTG
CCTCAATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAG
TAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATGCATCTGACACCGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTGTCCG
TTGAAGAGACAAAAACAGAGGAGAAATCTGTGGAGAAGCTGAAGACCGAAGTTGAAGCAG
AGGAAAAGACAAAAACCGAGCCAGAGAAGGCTGATGAAGAAAAGAAAACCGAAGAGGCTG
CTCCCTCAACTTAAGATGCATCAATGTTTAATCTCCTTTGGCGAGGTATTATTAGCCTTG
TTTTGATGCATCCATCTCGAGTCTACTAGTGTCTTGGCACTAACTATCATCTACATGTGT
TGTCGGATCATATCAAGTGGTTTGGGGTTGGGTTTTGCTGAGTCGTTTTGGGTTTTTATA
GTTTTGAGTCGAAAGTGTGGGTGAGTGATATGAGAGATTAAGGTTTGGTTATCAGTAAGA
ATACATTGAATTCATTGTTTTCAGCGTTTGTTATGGGTTGTTTTTGGATGGTCTTTATTT
TGAGGATAGAGATGGTTGTTTGTTCATGGACATGAGTCAGAAGTCTTCATTTCTTTTGGA
TTACAAA*TTATACGCATTGTTGATTTT
A

QA 2 749 2 749
DS 



AS 2 10

CO CL530Contig1 1068 6 11 U
GGATGATGATCATTAAGATAATCCAAGAGGAGATAAGATTGATGAATAAGAATATAAGCT
TTTATCAAGTTCTTCATGTATAACTGAAGTATAACTGAAGTATAATTGAAGCCCATGAAA
GATTGTAGAAAAGGGAGTCTTTTTAGCTATTAAAGCTCTTAATTAACACTACCACTCTTG
TGTTCTCATCAGTTCTAACAAAACAACCTTGATGGGGTTTTGGTTTTGGTGATGGTTCAA
ACCCTGTTGTATGCAACAGACTTGCTGAAGAGCTTGCGGATATATAGAACCTGAAGACCA
CTAGCTGCTGCAAGGAATATGTACTCTCCTACTGTGTAGAATATCACTCGCTTTCTCGTG
CTCTCATTAGTATGACGGTGACGAGTATCACGTGCTTTCAAATACTTTTGCTCAGCAACA
ACAGACTCCAACGATTCTCTCAGCTCAGCTATCTTAACATTCACCGGGTCCAAGTGTTCA
TCTTTGGCTAAGTCATGCTCGTTGGGGATATGACCAACGTGAATGTAGAAAGAGACAGTT
TCAGGAGTAGAGTAAGGATTATGGAAACAAAACTTGTACATTCCACTTCTCGGTGCCTTA
AACTCAAACTTATCCCCTGATGTCCCCTTCAACGTTTGTACAATGTTCCCAGCAGGAGAC
GTCACCGTGAAATCCAAACCGGGATGGTCTGATCCCCAGAAGATTTCATGGTCGACGACG
ACGAAGTTACCGGAGACGGTGTCTCCTTCGTAAAGGACATACTCTTGGACGCATTCTTCG
TCGCTAACCGTCACCGAGAGCGACGAGATTCGCTCGATCGAACTCAGTAGTATCAGGGTA
AGCAATAAGAAGACATGGGTGGTCTTATTGCTCGATTGTCTGCTCTCCATCTTCCTTTCC
TTAGATCTCTAACCCTCTCCGATCAAATTTTCCGTTTGTTTTCTCCAAATCGTAGAAGAA
GAGAGGATTTAATTGCGATTTAGCTTGAGTAAACCGGGAAATCAAAACCGGTTTGTTACG
ATGCGGTGATATTTTGGAGCTCGTCAACGGGTTTGCTTCTGGTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB47JQ U 15
AF RR2BQ18JQ U 1
AF RR2BL19JQ U 41
AF RR2BL19TF C 92
AF RR2BQ18TF C 187
AF RR2AB47TF C 295
BS 1 125 RR2BQ18JQ
BS 126 126 RR2AB47JQ
BS 127 403 RR2BQ18JQ
BS 404 404 RR2AB47JQ
BS 405 696 RR2BQ18JQ
BS 697 697 RR2BL19JQ
BS 698 719 RR2BQ18JQ
BS 720 821 RR2BL19JQ
BS 822 826 RR2BL19TF
BS 827 924 RR2BQ18TF
BS 925 1068 RR2AB47TF

RD RR2AB47JQ 639 0 0
AAGATAATCCAAGAGGAGATAAGATTGATGAATAAGAATATAAGCTTTTATCAAGTTCTT
CATGTATAACTGAAGTATAACTGAAGTATAATTGAAGCCCATGAAAGATTGTAGGAAAGG
GAGTCTTTTTAGCTATTAAAGCTCTTAATTAACACTACCACTCTTGTGTTCTCATCAGTT
CTAACAAAACAACCTTGATGGGGTTTTGGTTTTGGTGATGGTTCAAACCCTGTTGTATGC
AACAGACTTGCTGAAGAGCTTGCGGATATATAGAACCTGAAGACCACTAGCTGCTGCAAG
GAATATGTACTCTCCTACTGTGTAGAATATCACTCGCTTTCTCGTGCTCTCATTAGTACG
ACGGTGACGAGTATCACGTGCTTTCAAATACTTTTGCTCAGCAACAACAGACTCCAACGA
TTCTCTCAGCTCAGCTATCTTAACATTCACCGGGTCCAAGTGTTCATCTTTGGCTAAGTC
ATGCTCGTTGGGGATATGACCAACGTGAATGTAGAAAGAGACAGTTTCAGGAGTAGAGTA
AGGATTATGGAAACAAAACTTGTACATTCCACTTCCCGGTGCCTTAAACTCAAACTTATC
CCCTGACGTCCCCTTCAACGTTTGTACAATGTTCCCAGC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2BQ18JQ 719 0 0
GGATGATGATCATTAAGATAATCCAAGAGGAGATAAGATTGATGAATAAGAATATAAGCT
TTTATCAAGTTCTTCATGTATAACTGAAGTATAACTGAAGTATAATTGAAGCCCATGAAA
GATTGCAGAAAAGGGAGTCTTTTTAGCTATTAAAGCTCTTAATTAACACTACCACTCTTG
TGTTCTCATCAGTTCTAACAAAACAACCTTGATGGGGTTTTGGTTTTGGTGATGGTTCAA
ACCCTGTTGTATGCAACAGACTTGCTGAAGAGCTTGCGGATATATAGAACCTGAAGACCA
CTAGCTGCTGCAAGGAATATGTACTCTCCTACTGTGTAGAATATCACTCGCTTTCTCGTG
CTCTCATTAGTATGACGGTGACGAGTATCACGTGCTTTCAAATGCTTTTGCTCAGCAACA
ACAGACTCCAACGATTCTCTCAGCTCAGCTATCTTAACATTCACCGGGTCCAAGTGTTCA
TCTTTGGCTAAGTCATGCTCGTTGGGGATATGACCAACGTGAATGTAGAAAGAGACAGTT
TCAGGAGTAGAGTAAGGATTATGGAAACAAAACTTGTACATTCCACTTCTCGGTGCCTTA
AACTCAAACTTATCCCCTGATGTCCCCTTCAACGTTTGTACAATGTTCCCAGCAGGAGAC
GTCACCGTGAAATCCAAACCGGGATGGTCTGATCCCAAGAAGATTTCATGGTCGACGAC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2BL19JQ 789 0 0
AG
TGAATAAGAATATAAGCTTTTATCAAGTTCTTCATGTATAACTGAAGTATAACTGAAGTA
TAATTGAAGCCCATGAAAGATTGTAGAAAAGGGAGTCTTTTTAGCTATTAAAGCTCTTAA
TTAACACTACCACTCTTGTGTTCTCATCAGTTCTAACAAAACAACCTTGATGGGGTTTTG
GTTTTGGTGATGGTTCAAACCCTGTTGTATGCAACAGACTTGCTGAAGAGCTTGCGGATA
TATAGAACCTGAAGACCACTAGCTGCTGCAAGGAATATGTACTCTCCTACTGTGTAGAAT
ATCACTCGCTTTCTCGTGCTCTCATTAGTATGACGGTGACGAGTATCACGTGCTTTCAAA
TACTTTTGCTCAGCAACAACAGACTCCAACGATTCTCTCAGCTCAGCTATCTTAACATTC
ACCGGGTCCAAGTGTTCATCTTTGGCTAAGTCATGCTCGTTGGGGATATGACCAACGTGA
ATGTAGAAAGAGACAGTTTCAGGAGTAGAGTAAGGATTATGGAAACAAAACTTGTACATT
CCACTTCTCGGTGCCTTAAACTCAAACTTATCCCCTGATGTCCCCTTCAACGTTTGTGCA
ATGTTCCCAGCAGGAGACGTCACCGTGAAATCCAAACCGGGATGGTCTGATCCCCAGAAG
ATTTCATGGTCGACGACGACGAAGTTACCGGAGACGGTGTCTCCTTCGTAAAGGACATAC
TCTTGGACGCATTCTTCGTCGCTAACCGTCACCGAGAGCGACGAGATTCGCTCGATCGA
CTCAGTAC

QA 3 781 3 781
DS 

RD RR2BL19TF 739 0 0
TAACTGAAGTATAAT*GAAGCCCATGAAAGATTGTAGAAAAGGGAGTCTTTT*AGCTAT*
AAAGCTCTTAATTAACACTACCACTCTTGTGTTCTCATCAGTTCTAACAAAACAACCTTG
ATGGGGTTTTGGTTTTGGTGATGGTTCAAACCCTGTTGTATGCAACAGACTTGCTGAAGA
GCTTGCGGATATATAGAACCTGAAGACCACTAGCTGCTGCAAGGAATATGTACTCTCCTA
CTGTGTAGAATATCACTCGCTTTCTCGTGCTCTCATTAGTATGACGGTGACGAGTATCAC
GTGCTTTCAAATACTTTTGCTCAGCAACAACAGACTCCAACGATTCTCTCAGCTCAGCTA
TCTTAACATTCACCGGGTCCAAGTGTTCATCTTTGGCTAAGTCATGCTCGTTGGGGATAT
GACCAACGTGAATGTAGAAAGAGACAGTTTCAGGAGTAGAGTAAGGATTATGGAAACAAA
ACTTGTACATTCCACTTCTCGGTGCCTTAAACTCAAACTTATCCCCTGATGTCCCCTTCA
ACGTTTGTGCAATGTTCCCAGCAGGAGACGTCACCGTGAAATCCAAACCGGGATGGTCTG
ATCCCCAGAAGATTTCATGGTCGACGACGACGAAGTTACCGGAGACGGTGTCTCCTTCGT
AAAGGACATACTCTTGGACGCATTCTTCGTCGCTAACCGTCACCGAGAGCGACGAGATTC
GCTCGATCGAACTCA
GTAC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2BQ18TF 740 0 0
TCATCAG
TCTAACAAAACAACCTTGATGGGGTTTTG*TTTTGGTGATGGTTCAAACCCTGTTGTATG
CAACAGACTTGCTGAAGAGCTTGCGGATATATAGAACCTGAAGACCACTAGCTGCTGCAA
GGAATATGTACTCTCCTACTGTGTAGAATATCACTCGCTTTCTCGTGCTCTCATTAGTAT
GACGGTGACGAGTATCACGTGCTTTCAAATGCTTTTGCTCAGCAACAACAGACTCCAACG
ATTCTCTCAGCTCAGCTATCTTAACATTCACCGGGTCCAAGTGTTCATCTTTGGCTAAGT
CATGCTCGTTGGGGATATGACCAACGTGAATGTAGAAAGAGACAGTTTCAGGAGTAGAGT
AAGGATTATGGAAACAAAACTTGTACATTCCACTTCTCGGTGCCTTAAACTCAAACTTAT
CCCCTGATGTCCCCTTCAACGTTTGTACAATGTTCCCAGCAGGAGACGTCACCGTGAAAT
CCAAACCGGGATGGTCTGATCCCAAGAAGATTTCATGGTCGACGACGACGAAGTTACCGG
AGACGGTGTTTCCTTCGTAAAGGACATACTCTTGGACGCATTCTTCGTCGCTAACCGTCA
CCGAGAGCGACGAGATTCGCTCGATCGAACTCAGTAGTATCAGGGTAAGCAATAAGAAGA
CATGGGTGGTCTTATTGCTCGATTGTCTGCTCTCCATCTTCCTTTCCTTAGATCTCTAAC
CCTCTCCGATC
CC

QA 8 738 8 738
DS 

RD RR2AB47TF 774 0 0
AGACCACTAGCTGCTGCAAGGAATATGTACTCTCCTACTGTGTAGAATATCACTCGCTTT
CTCGTGCTCTCATTAGTACGACGGTGACGAGTATCACGTGCTTTCAAATACTTTTGCTCA
GCAACAACAGACTCCAACGATTCTCTCAGCTCAGCTATCTTAACATTCACCGGGTCCAAG
TGTTCATCTTTGGCTAAGTCATGCTCGTTGGGGATATGACCAACGTGAATGTAGAAAGAG
ACAGTTTCAGGAGTAGAGTAAGGATTATGGAAACAAAACTTGTACATTCCACTTCCCGGT
GCCTTAAACTCAAACTTATCCCCTGACGTCCCCTTCAACGTTTGTACAATGTTCCCAGCA
GGAGACGTCACCGTGAAATCCAAACCGGGATGGTCTGATCCCCAGAAGATTTCATGGTCG
ACGACGACGAAGTTACCGGAGACGGTGTCTCCTTCGTAAAGGACATACTCTTGGACGCAT
TCTTCGTCGCTAACCGTCACCGAGAGCGACGAGATTCGCTCGATCGAACTCAGTAGTATC
AGGGTAAGCAATAAGAAGACATGGGTGGTCTTATTGCTCGATTGTCTGCTCTCCATCTTC
CTTTCCTTAGATCTCTAACCCTCTCCGATCAAATTTTCCGTTTGTTTTCTCCAAATCGTA
GAAGAAGAGAGGATTTAATTGCGATTTAGCTTGAGTAAACCGGGAAATCAAAACCGGTTT
GTTACGATGCGGTGATATTTTGGAGCTCGTCAACGGGTTTGCTTCTGGTCTTCC

QA 1 774 1 774
DS 



CO CL530Contig2 798 4 18 U
TATCGATCGAGAGTTGAGAGTAAAGATGAAGATGGAGAGAAGACAAGCGAGGAGCTCGAA
GATCCATGTCTTTGTACTGGTCGGTCTGATACTATTGAGCTCGATCGAGCGAATCTCAGC
ACTATCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCGTCCAAGAGTATGTCCTTTACGAAGGAGA
TAACGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATATCTTCTGGGGATCTGATCATCC
CGGTTTGGACTTCACGGTGACGTCGCCTGCTGGGAACATAGTACACACTTTGAAGGGAAC
ATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTTTCCA
CAACCCTTACTCTACTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACATTCATGTTGGCCATATCCCCAA
CGAGCATGACTTGGCTAAAGACGAACATTTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCT
GAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTATTTGAAAGCACGTGATACCCG
TCACCGTCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTA
CATATTCCTAGCAGCAGCCAGTGGTCTTCAGGTTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAA
GTCGGTTGCATACAACAGGGTTTGAATATATTTCAAGGTTCTGTGTCCTTTTTCTATTAT
GTTTGAATTGATGAACACAATTATAAACAAGTGTTAGTTAATTAAGACTTTAATATAATA
GCTAAGATCCCTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2GN20TF U 7
AF RR2G845TF U 1
AF RR2G845JQ C 271
AF RR2GN20JQ C 449
BS 1 81 RR2G845TF
BS 82 82 RR2GN20TF
BS 83 120 RR2G845TF
BS 121 121 RR2GN20TF
BS 122 249 RR2G845TF
BS 250 250 RR2GN20TF
BS 251 593 RR2G845TF
BS 594 594 RR2G845JQ
BS 595 631 RR2G845TF
BS 632 632 RR2G845JQ
BS 633 674 RR2G845TF
BS 675 730 RR2G845JQ
BS 731 731 RR2GN20JQ
BS 732 771 RR2G845JQ
BS 772 772 RR2GN20JQ
BS 773 790 RR2G845JQ
BS 791 791 RR2GN20JQ
BS 792 798 RR2G845JQ

RD RR2GN20TF 583 0 0
TCGAAAGC
TGAGAGTAAAGATGAAGATGGAGAGAAGACAAGCGAGGAGCTCGAAGATCCATGTCTTTG
TACTGGTCGGTCTGATACTATTGAGCTCGATCGAGCGAATCTCAGCACTATCGGTTACGG
TTAGCGACGATGAATGCGTCCAAGAGTATGTCCTTTACGAAGGAGATAACGTCTCTGGAA
ACTTCGTCGTCGTTGACCATGATATCTTCTGGGGATCTGATCATCCCGGTTTGGACTTCA
CGGTGACGTCGCCTGCTGGGAACATAGTACACACTTTGAAGGGAACATCAGGAGATAAGT
TTGAGTTCAAGGCTCCAAGAAGTGGAATGTACAAGTTTTGTTTCCACAACCCTTACTCTA
CTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACATTCATGTTGGTCATATCCCCAACGAGCATGACTTAG
CTAAAGACGAACATTTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGG
AGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTATTTGAAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATACCA
ATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTCTACACA

QA 9 583 9 583
DS 

RD RR2G845TF 674 0 0
TATCGATCGAGAGTTGAGAGTAAAGATGAAGATGGAGAGAAGACAAGCGAGGAGCTCGAA
GATCCATGTCTTTGTACTGGTTGGTCTGATACTATTGAGCTCGATCGAGCGAATCTCAGC
GCTATCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCGTCCAAGAGTATGTCCTTTACGAAGGAGA
TAACGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATATCTTCTGGGGATCTGATCATCC
CGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCGCCTGCTGGGAACATAGTACACACTTTGAAGGGAAC
ATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTTTCCA
CAACCCTTACTCTACTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACATTCATGTTGGCCATATCCCCAA
CGAGCATGACTTGGCTAAAGACGAACATTTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCT
GAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTATTTGAAAGCACGTGATACCCG
TCACCGTCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTCTACACAGTAG*AGAGTA
CATATTCCTAGCAGCAGCCAGTGGTCTTCAG*TTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAA
GTCGGTTGCATACA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2G845JQ 528 0 0
TGGGAACATAGTACACACTTTGAAGGGAACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCC
AAAAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTTTCCACAACCCTTACTCTACTCCTGAAACCGTCTC
CTTCTACATTCATGTTGGCCATATCCCCAACGAGCATGACTTGGCTAAAGACGAACATTT
GGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGA
GCAAAAGTATTTGAAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATACCAATGAGAGCACGAGAAA
GCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTACATATTCCTAGCAGCAGCCAGTGGTCTTCA
GGTTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCGGTTGCATACAACAGGGTTTGAATATA
TTTCAAGGTTCTGTGTCCTTTTTCTATTATGTTTGAATTGGTGAACACAATTATAAACAA
GTGTTAGTTAATTAAGACTTTGATATAATAGCTAAGATCCTTTTTTCC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2GN20JQ 349 0 0
TTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCT
GAGCAAAAGTATTTGAAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATACCAATGAGAGCACGAGA
AAGCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTACATATTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCTT
CAGGTTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCGGTTGCATACAACAGGGTTTGAATA
TATTTCAAGGTTCTGTGTCCTTTTTCTATTATGTTTGAATTGATGAACACAATTATAAAC
AAGTGTTAGTTATTTAAGACTTTAATATAATAGCTAAGATCCCTTTTT
T

QA 1 348 1 348
DS 



AS 2 9

CO CL531Contig1 816 4 28 U
GTGGCGACAGTGGCCTGCACCCACGGACAAGAACCGGTGAAAGACACTGCCGGGAATTCT
CTTGAGACAGGTCAGCAATACTTCATCCGGCCGATCAAGGCTGCGAGCCTCAATGGTGGT
GGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCCACTTGGCATCAACCAAGCACTC
TTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTTCTGACTCCGTCACAGAATCC
ATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGCTAGCAAGCCGCTACCACTC
TGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATC***GGCTTCCGAGCCAGCA
ATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTAAGATAGAGAAAGCCGGA
GAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCCTAGACGGGACCGTTGGAAGCGTC
CCCGGTTTTTTTGGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATGATGACGCTAAGACCATATTC
GTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTTCTCGTGTTGAGAACTCAGGT
CTAAGGATGTTCCCATTCTAATAGTCAAGATAATGTAACGTTAAGCCTAAGACTCCTCCA
TGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGAAAATACCCGCACGCATGTTTCTTTACTTTCCTCATGA
ATATATAAAATGAAATTATGTTTTATAATGCTTTATGAGACACACACAGCATTGGTTTAA
ACCAGTTTTTAATTATAAAATGAAATCATGTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BD19TF U 1
AF RR2H868JQ C 579
AF RR2AA96JQ C 114
AF RR2AA96TF U 114
BS 1 155 RR2BD19TF
BS 156 156 RR2AA96TF
BS 157 219 RR2BD19TF
BS 220 220 RR2AA96TF
BS 221 237 RR2BD19TF
BS 238 238 RR2AA96TF
BS 239 341 RR2BD19TF
BS 342 344 RR2AA96TF
BS 345 456 RR2BD19TF
BS 457 457 RR2AA96TF
BS 458 465 RR2BD19TF
BS 466 466 RR2AA96TF
BS 467 482 RR2BD19TF
BS 483 483 RR2AA96TF
BS 484 524 RR2BD19TF
BS 525 525 RR2AA96TF
BS 526 568 RR2BD19TF
BS 569 569 RR2AA96TF
BS 570 593 RR2BD19TF
BS 594 594 RR2AA96TF
BS 595 611 RR2BD19TF
BS 612 612 RR2AA96TF
BS 613 638 RR2BD19TF
BS 639 639 RR2AA96TF
BS 640 748 RR2BD19TF
BS 749 749 RR2AA96TF
BS 750 768 RR2BD19TF
BS 769 816 RR2AA96TF

RD RR2BD19TF 776 0 0
GTGGCGACAGTGGCCTGCACCCACGGACAAGAACCGGTGAAAGACACTGCCGGGAATTCT
CTTGAGACAGGTCAGCAATACTTCATCCGGCCGATCAAGGCTGCGAGCCTCAATGGTGGT
GGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGTCCACTTGGCATCAACCAAGCACTC
TTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTGCTGACTCCGTCACAGAACCC
ATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGCTAGCAAGCCGCTACCACTC
TGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATCATCGGCTTCCGAGCCAGCA
ATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTAAGATAGAGAAAGCCGGA
GAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTAGACGGGGCCGTTGGAAGCGTC
CCGGGTTTTTTTGGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATGATGATGCTAAGACCATATTC
GTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTATTACATCTGCTTCTCGTGTTGAGAAGTCAGGT
CTAAGGATGTTTCCATTCTAATAGTCAAGATAATGTAATGTTAAGCCTAAGACTCCTCCA
TGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGAAAATACCCGCACGCATGTTTCTTTACTTTCCTCATGA
ATATATAAAATGAAATTATGTTTTATAACGCTTTATGAGACACACACA
ACTTTGAT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2H868JQ 165 0 0
TTCTCGTGTTGAGAAGTCAGGTTTAAGGATGTTTCCATTTTAATAGTCAAGATAATGTAA
TGTTAAGCCTAAGACTCCTCCATGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGAAAATACCCGCACGCA
TGTTTCTTTACTTTCCTCATGAATATATAAAATGAAATTATGTTT

QA 1 165 1 165
DS 

RD RR2AA96JQ 703 0 0
G
GGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCCACTTGGCATCAACCAA
GCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTTCTGACTCCGTCACA
GAATCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGCTAGCAAGCCGCTA
CCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATC***GGCTTCCGAG
CCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTAAGATAGAGAAA
GCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCCTAGACGGGACCGTTGGA
AGCGTCCCCGGTTTTTTTGGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATGATGACGCTAAGACC
ATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTTCTCGTGTTGAGAAC
TCAGGTCTAAGGGTGTTCCCATTCTAATAGTCAAGATAATGTAACGTTAAGCCTAAGACT
CGTCCATGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGATAATACCCGCATGCATGTTTCTTTACTTTCC
TCATGAATATATAAAATGAAATTATGTTTTATAATGCTTTATGAGACCCACACAGCATTG
GTTTAAACCAGTTTTTAATTATAAAATGAAATCATGTTTTAC

QA 2 703 2 703
DS 

RD RR2AA96TF 703 0 0
G
GGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCCACTTGGCATCAACCAA
GCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTTCTGACTCCGTCACA
GAATCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGCTAGCAAGCCGCTA
CCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATC***GGCTTCCGAG
CCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTAAGATAGAGAAA
GCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCCTAGACGGGACCGTTGGA
AGCGTCCCCGGTTTTTTTGGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATGATGACGCTAAGACC
ATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTTCTCGTGTTGAGAAC
TCAGGTCTAAGGGTGTTCCCATTCTAATAGTCAAGATAATGTAACGTTAAGCCTAAGACT
CGTCCATGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGATAATACCCGCATGCATGTTTCTTTACTTTCC
TCATGAATATATAAAATGAAATTATGTTTTATAATGCTTTATGAGACACACACAGCATTG
GTTTAAACCAGTTTTTAATTATAAAATGAAATCATGTTTTAC

QA 2 703 2 703
DS 



CO CL531Contig2 825 5 6 U
GGACTCAAACACCCCAAACACCAAACCTAAAAACACAAGAACATCATCACAATGAAGATC
TCTTTTCTCATCACTCTCCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACCCACGGACAAGAACCGGTG
AAAGACACTGCCGGGAATTCTCTTGAGACAGGTCAGCAATACTTCATCCGGCCGATCAAG
ACTGCGAGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGTCCA
CTTGGCATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGTTTCCAGTTT
GCTGACTCCGTCACAGAACCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAAC
GCTAGCAAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCA
***TCGGCTTCCGAGCCAGCGATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGG
TTTAAGATAGAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTA
GACGGGACCGTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTTGGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAAT
GATGACGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGTT
TCTCGTGTTGAGAACTCAGGTCTAAGGATGTTCCCATTCTAATAGTCAAGATAATGTAAC
GTTAAGCCTAAGACTCGTCCATGGCCAAAAATAAGGGATTGAGATAATACCCGCATGCAT
GTTTCTTTACTTTCCTCATGAATATATAAAATGATTATGTTTTAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV58TF U 71
AF RR2H868TF U 1
AF RR2CU53TF U 1
AF RR2H283JQ C 107
AF RR2CU53JQ C 164
BS 1 679 RR2CU53TF
BS 680 680 RR2H283JQ
BS 681 685 RR2CU53TF
BS 686 686 RR2H283JQ
BS 687 751 RR2CU53TF
BS 752 825 RR2H283JQ

RD RR2AV58TF 605 0 0
G
CACTCTCCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACCCACGGACAAGAACCGGTGAAAGACACTGC
CGGGAATTCTCTTGAGACAGGTCAGCAATACTTCATCCGGCCGATCAGGACTGCGAGCCT
CAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGTCCACTTGGCATCAA
CCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTGCTGACTCCGT
CACAGAACCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGCTAGCAAGCC
GCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATCATCGGCTTC
CGAGCCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTAAGATAGA
GAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTAGACGGGACTGT
TGGGAGCGTCCCGGGTTTTTTTGGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATGATGATGCTAA
GACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTATTACATCTGCTTCTCGTGTTGA
GAA
G

QA 2 604 2 604
DS 

RD RR2H868TF 675 0 0
GGACTCAAACACCCCAAACACCAAACCTAAAAACACAAGAACATCATCACAATGAAGATC
TCTTTTCTCATCACTCTCCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACCCACGGACAAGAACCGGTG
AAAGACACTGCCGGGAATTCTCTTGAGACAGGTCAGCAATACTTCATCCGGCCGATCAAG
ACTGCGAGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGTCCA
CTTGGCATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCGACCGCTTAGCTTCCAGTTT
GCTGACTCCGTCACAGAACCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAAC
GCTAGCAAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCA
TCATCGGCTTCCGAGCCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGG
TTTAAGATAGAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTA
GACGGGACAGTTGGAAGCGTCCCGGGTTTTTTTGGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAAT
GATGATGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTATTACATCTGCT
TCTCGTGTTGAGAA
G

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2CU53TF 751 0 0
GGACTCAAACACCCCAAACACCAAACCTAAAAACACAAGAACATCATCACAATGAAGATC
TCTTTTCTCATCACTCTCCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACCCACGGACAAGAACCGGTG
AAAGACACTGCCGGGAATTCTCTTGAGACAGGTCAGCAATACTTCATCCGGCCGATCAAG
ACTGCGAGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGTCCA
CTTGGCATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGTTTCCAGTTT
GCTGACTCCGTCACAGAACCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAAC
GCTAGCAAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCA
***TCGGCTTCCGAGCCAGCGATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGG
TTTAAGATAGAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTA
GACGGGACCGTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTTGGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAAT
GATGACGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGTT
TCTCGTGTTGAGAACTCAG*TCTAAAGATGTTCCCATTCTAATAGTCAAGATAATGTAAC
GTTAAGCCTAAGACTCGTCCATGGCCAAAAA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2H283JQ 719 0 0
GACAAGAACCGGTGAAAGACACTGCCGGGAATTCTCTTGAGACAGGTCAGCAATACTTCA
TCCGGCCGATCAAGACTGCGAGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAAT
TTCCCCCTTGTCCACTTGGCATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGC
TTAGTTTCCAGTTTGCTGACTCCGTCACAGAACCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAA
CCATCGAGTTCAACGCTAGCAAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGG
AAGTTGAGTCCTCA***TCGGCTTCCGAGCCAGCGATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGA
GCCAAAATAGCCGGTTTAAGATAGAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATA
AGCTGGCCAGCTTAGACGGGACCGTTGGAAGCGTCCCCGATTTTTTTGGGGCACCAAAAC
TAGTTCTCACCAATGATGACGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAG
CTACTACATCTGTTTCTCGTGTTGAGAACTCAGGTCTAAGGATGTTCCCATTCTAATAGT
CAAGATAATGTAACGTTAAGCCTAAGACTCGTCCATGGCCAAAAATAAGGGATTGAGATA
ATACCCGCATGCATGTTTCTTTACTTTCCTCATGAATATATAAAATGATTATGTTTTAT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2CU53JQ 659 0 0
TCATCCGGCCGATCAAGACTGCGAGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTA
AATTTCCCCCTTGTCCACTTGGCATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAAC
CGCTTAGTTTCCAGTTTGCTGACTCCGTCACAGAACCCATCGTTAAGACATCTACTGATG
TAACCATCGAGTTCAACGCTAGCAAGCCGCTACCATTTTGCAACGAATTTTCCTTTATAT
GGGAAGTTGAGTCCTCA***TCGGCTTCCGAGCCAGCGATTTTCCTCGGTGGTATAGCGG
GGAGCCAAAATAGCCGGTTTAAGATAGAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTT
ATAAGCTGACCAGCTTAGACGGGACCGTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTTGGGGCACCAA
AACTAGTTCTCACCAATGATGACGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATG
AAGCTACTACATCTGTTTCTCGTGTTGAGAACTCAGGTCTAAGGATGTTCCCATTTTAAT
AGTCAAGATAATGTAACGTTAAGCCTAAGATTCGTCCATGGCCAAAAATAAGGGGTTGAG
ATAATACCCGCATGCATGTTTCTTTACTTTCCTCATGAATATATAAAATGA
TTATGTTT

QA 1 651 1 651
DS 



AS 2 8

CO CL532Contig1 1132 5 12 U
AAAAACAAAATAGTTTGATATATTATTACAAGAGTTTTATTGGCAACAGAACCAAGCAAA
TACATTGTTGGCAAAGACGAACAAACGAATAGGAGAGACTCTCTACTTATTGTGTAGATT
AAATACACGCACTCACTCACACAC**GTAGAGCGACGACATAAACAGTCAATGCAACAAA
ACCGCAGATTATACAGCAGAAAACAAGAAGTCTGGAGCAATATAAAGATAAACCAACAAC
CAACTACACTGGTTCGTTCTTCCACATCTTTTACCAGACCACCTCAGAACATGTAAACAA
CACTGTCGTGGATCCTTGACTTCTGGTTCTGTGCAACACACTCCGATATCCACATAAGGT
TCCTGATCTCCCGCTCCCTCAACCTCATATACGCAAAGAACACCCCGTAATGGAACTGCT
GCTCAAAGGCTAAGCAAAGCCTTCTGACTTCTTCTTCATAAAACGCCTTGTCGAGCATTT
GGCTCTCTCCATAAGACATCTTGGAGAATATTGCTTGGTAAGGAGGGTACTTCTCCATAA
CACCACGAACCTGATCTATGTCTTCGCAGATAGCAAGCTCCTCGTGACCATATGGATAGA
GGAGACCAAAGTTAGAGTACAGTTTCTTCCTGTCTTCTCTTGTAAGCTCAGTGCCAATGC
TGTTGATGGTGATGTTCACAGCTCTTCTGTCAGCTTCGAAGGCAAGAAGGTCAGACATTA
TCTCTGCTGTTGCCCCACCAAGTTTCTGACAGAACTTGTAAAAATCCTCGAGGTATGCTT
TGTAGAGCGTGTTCCTCATAATCTCAATGTTCATGTCATCCAAATCCTCTGAGGTTAAGC
ATTCAGAGAAATATGGAGCTAGAGGAGTATCCACAAGTACCAACCTATAGAGCTCCCTCA
TGTTCTGAGCAACTGCCAGCGTGGCAATGCTATCAAACATGCCTAAAGGATGACATTTCT
CGATCAGCCCTTGAACATCTCTCTCGTGGAGGGTTCCAGTAACAATCAGCACGACGTTGT
CAATCATGTGGCCGTATCTGATGTACTCCAAGAAGGTAGACATAGGCTCAGTTGCTTGAC
AAAGCATATGCTTATAATCATCAACAAGCTTGAGAGTGCACTTCTCCACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT81JQ U 35
AF RR2D168JQ U 1
AF RR2EJ14JQ U 41
AF RR2EJ14TF C 205
AF RR2D168TF C 446
BS 1 160 RR2D168JQ
BS 161 161 RR2DT81JQ
BS 162 261 RR2D168JQ
BS 262 262 RR2EJ14JQ
BS 263 371 RR2D168JQ
BS 372 372 RR2EJ14JQ
BS 373 597 RR2D168JQ
BS 598 598 RR2DT81JQ
BS 599 697 RR2D168JQ
BS 698 764 RR2EJ14JQ
BS 765 859 RR2EJ14TF
BS 860 1132 RR2D168TF

RD RR2DT81JQ 606 0 0
TTTTAT
TGGCAACAGAACCAAGCAAATACATTGTTGGCAAAAACGAACAAACGAATAGGAGAGACT
CTCTACTTATTGTGTAGATTAAATACACTCACTCACTCACACACACGTAGAGCGACGACA
TAAACAGTCAATGCAACAAAACCGCAGATTATACAACAGGAAACAAGAAGTCTGGAGCAA
TATAAAGAAAAACCAACAACCAACTACACTGGTTCGTTCTTTCACATCTTTTACCAGACC
ACCTCAGAACATGTAGACAACACTGTCGTGGATCCTTGACTTCTGGTTCTGTGCAACACA
CTCCGATATCCACATCAGGTTCCTGATCTCCTGCTCCCTCAACCTCATATACGCAAAGAA
CACCCCGTAATGGAATTGCTGCTCAAAGGCTAAGCAAAGCCTTCTGACTTCTTCTTCGTA
AAACGCCTTGTCGAGCATTTGGCTCTCTCCGTAAGACATCTTGGAGAATATCGCTTGGTA
AGGAGGGTACTTCTCCATAACACCACGAACCTGATCTATGTCTTCGCAGATAGCAAGTTC
CTCGTGACCATATGGATAGAGGAGACCAAAGTTAGAGTACAGTTTCTTCCTGTCTTCTCT

QA 7 606 7 606
DS 

RD RR2D168JQ 697 0 0
AAAAACAAAATAGTTTGATATATTATTACAAGAGTTTTATTGGCAACAGAACCAAGCAAA
TACATTGTTGGCAAAGACGAACAAACGAATAGGAGAGACTCTCTACTTATTGTGTAGATT
AAATACACGCACTCACTCACACAC**GTAGAGCGACGACACAAACAGTCAATGCAACAAA
ACCGCAGATTATACAGCAGAAAACAAGAAGTCTGGAGCAATATAAAGATAAACCAACAAC
CAACTACACTGGTTCGTTCTTTCACATCTTTTACCAGACCACCTCAGAACATGTAAACAA
CACTGTCGTGGATCCTTGACTTCTGGTTCTGTGCAACACACTCCGATATCCACATAAGGT
TCCTGATCTCCTGCTCCCTCAACCTCATATACGCAAAGAACACCCCGTAATGGAACTGCT
GCTCAAAGGCTAAGCAAAGCCTTCTGACTTCTTCTTCATAAAACGCCTTGTCGAGCATTT
GGCTCTCTCCATAAGACATCTTGGAGAATATTGCTTGGTAAGGAGGGTACTTCTCCATAA
CACCACGAACCTGATCTATGTCTTCGCAGATAGCAAGCTCCTCGTGACCATATGGATGGA
GGAGACCAAAGTTAGAGTACAGTTTCTTCCTGTCTTCTCTTGTAAGCTCAGTGCCAATGC
TGTTGATGGTGATGTTCACAGCTCTTCTGTCAGCTTC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2EJ14JQ 724 0 0
TGGCAACAGAACCAAGCAAATACATTGTTGGCAAAGACGAACAAACGAATAGGAGAGACT
CTCTACTTATTGTGTAGATTAAATACACGCACTCACTCACACAC**GTAGAGCGACGACA
TAAATAGTCAATGCAACAAAACCGCAGATTATACAGCAGAAAACAAGAAGTCTGGAACAA
TATAAAGATAAACCAACAACCAACTACACTGGTTCGTTCTTCCACATCTTTTACCAGACC
ACCTCAGAACATGTAAACAACACTGTCGTGGATCCTTGACTTCTGGTTCTGTGCAACACA
CTCCGATATCCACATAAGGTTCCTGATCTCCCGCTCCCTCAACCTCATATACGCAAAGAA
CACCCCGTAATGGAACTGCTGCTCAAAGGCTAAGCAAAGCCTTCTGACTTCTTCTTCATA
AAACGCCTTGTCGAGCATTTGGCTCTCTCCATAAGACATCTTGGAGAATATTGCTTGGTA
AGGAGGGTACTTCTCCATAACACCACGAACCTGATCTATGTCTTCGCAGATAGCAAGCTC
CTCGTGACCATATGGATAGAGGAGACCAAAGTTAGAGTACAGTTTCTTCCTGTCTTCTCT
TGTAAGCTCAGTGCCAATGCTGTTGATGGTGATGTTCACAGCTCTTCTGTCAGCTTCGAA
GGCAAGAAGGTCAGACATTATCTCTGCTGTTGCCCCACCAAGTTTCTGACAGAACTTGTA
AAAA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2EJ14TF 657 0 0
AACAGAGTCTGAA
CAATATAAAGATAAACCAACAACCAACTACACTGGTTCGTTCTTCCACATCTTTTACCAG
ACCACCTCAGAACATGTAAACAACACTGTCGTGGATCCTTGACTTCTGGTTCTGTGCAAC
ACACTCCGATATCCACATAAGGTTCCTGATCTCCCGCTCCCTCAACCTCATATACGCAAA
GAACACCCCGTAATGGAACTGCTGCTCAAAGGCTAAGCAAAGCCTTCTGACTTCTTCTTC
ATAAAACGCCTTGTCGAGCATTTGGCTCTCTCCATAAGACATCTTGGAGAATATTGCTTG
GTAAGGAGGGTACTTCTCCATAACACCACGAACCTGATCTATGTCTTCGCAGATAGCAAG
CTCCTCGTGACCATATGGATAGAGGAGACCAAAGTTAGAGTACAGTTTCTTCCTGTCTTC
TCTTGTAAGCTCAGTGCCAATGCTGTTGATGGTGATGTTCACAGCTCTTCTGTCAGCTTC
GAAGGCAAGAAGGTCAGACATTATCTCTGCTGTTGCCCCACCAAGTTTCTGACAGAACTT
GTAAAAATCCTCGAGGTATGCTTTGTAGAGCGTGTTCCTCATAATCTCAATGTTCATGTC
ATCCAAATCCTCTGAGGTTAAGCATTCAGAGAAATATGGAGC
TC

QA 14 655 14 655
DS 

RD RR2D168TF 687 0 0
GACTTCTTCTTCATAAAACGCCTTGTCGAGCATTTGGCTCTCTCCATAAGACATCTTGGA
GAATATTGCTTGGTAAGGAGGGTACTTCTCCATAACACCACGAACCTGATCTATGTCTTC
GCAGATAGCAAGCTCCTCGTGACCATATGGATGGAGGAGACCAAAGTTAGAGTACAGTTT
CTTCCTGTCTTCTCTTGTAAGCTCAGTGCCAATGCTGTTGATGGTGATGTTCACAGCTCT
TCTGTCAGCTTCGAAGGCAAGAAGGTCAGACATTATCTCTGCTGTTGCCCCACCAAGTTT
CTGACAGAACTTGTAAAAATCCTCGAGGTATGCTTTGTAGAGCGTGTTCCTCATAATCTC
AATGTTCATGTCATCCAAATCCTCTGAGGTTAAGCATTCAGAGAAATATGGAGCTAGAGG
AGTATCCACAAGTACCAACCTATAGAGCTCCCTCATGTTCTGAGCAACTGCCAGCGTGGC
AATGCTATCAAACATGCCTAAAGGATGACATTTCTCGATCAGCCCTTGAACATCTCTCTC
GTGGAGGGTTCCAGTAACAATCAGCACGACGTTGTCAATCATGTGGCCGTATCTGATGTA
CTCCAAGAAGGTAGACATAGGCTCAGTTGCTTGACAAAGCATATGCTTATAATCATCAAC
AAGCTTGAGAGTGCACTTCTCCACACC

QA 1 687 1 687
DS 



CO CL532Contig2 1020 3 19 U
GGATCTTCTTCGCGTCGATCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTGGATATTTTTCTCTCTCCAGA
TCTCTCTCTCCCCGTGTCAAATCTTCGAGATCTGAATATCTCCTCCTCCTGATGAAGGAG
AAAGGATGTACGGATTCGAGGCGCTCACCTTCAACATCCATGGCGGATACCTGGAGGCGA
TCGTGAGGGGCCACCGTGCTGGTCTCCTCACCACCGCCGATTACAACAATCTGTGCCAAT
GTGAAAACCTAGACGACATCAAAATGCACCTCTCCGCCACCAAATACGGCTCTTACCTCC
AGAACGAACCGTCACCTCTGCATACGACGACAATCGTGGAGAAGTGTACGCTCAAGCTTG
TGGATGATTACAAGCATATGCTTTGCCAAGCTACTGAGCCTATGTCCACCTTCTTAGAGT
ACATCAGATACGGCCACATGATTGACAATGTGGTGCTGATTGTTACTGGAACTTTGCACG
AGAGAGATGTTCAAGAGTTGATTGAGAAATGTCACCCTTTAGGCATGTTTGACAGCATTG
CCACACTGGCTGTTGCTCAGAACATGAGGGAGCTCTATAGGTTGGTGCTTGTTGATACTC
CTCTGGCTCCATATTTTTCTGAGTGCTTGACATCTGAGGATTTGGATGACATGAACATAG
AGATTATGAGGAACACCCTCTACAAAGCATACCTTGAGGATTTTTACAAGTTCTGTCAGA
AACTTGGAGGGGCAACAGCAGAAATAATGTCTGACCTTCTGGCCTTCGAAGCTGACAGAA
GAGCTGTGAACATCACCATCAATAGCATTGGCACTGAGCTAACAAGAGAAGACAGGAAGA
AACTGTACTCCAACTTTGGTCTCCTCTATCCATATGGTCAGGAGGAGCTTGCAATCTGCG
AAGACATAGATCAGGTTCGTGGTGTTATGGAGAAGTACCCTCCTTACCAAGCAATATTCT
CAAAGATGTCTTATGGAGAGAGCCAGATGCTTGACAAAGCATTTTATGAAGAAGAAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 0 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D441TF U 1
AF RR2AH51TF U 54
AF RR2A938TF U 321
BS 1 85 RR2D441TF
BS 86 86 RR2AH51TF
BS 87 112 RR2D441TF
BS 113 114 RR2AH51TF
BS 115 122 RR2D441TF
BS 123 123 RR2AH51TF
BS 124 145 RR2D441TF
BS 146 146 RR2AH51TF
BS 147 217 RR2D441TF
BS 218 218 RR2AH51TF
BS 219 313 RR2D441TF
BS 314 314 RR2AH51TF
BS 315 646 RR2D441TF
BS 647 647 RR2AH51TF
BS 648 695 RR2D441TF
BS 696 862 RR2AH51TF
BS 863 863 RR2A938TF
BS 864 877 RR2AH51TF
BS 878 1020 RR2A938TF

RD RR2D441TF 695 0 0
GGATCTTCTTCGCGTCGATCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTGGATATTTTTCTCTCTCCAGA
TCTCTCTCTCCCCGTGTCAAATCTTTGAGATCTGAATATCTCCTCCTCCTGA**AAGGAG
AA*GGATGTACGGATTCGAGGCGCTTACCTTCAACATCCATGGCGGATACCTGGAGGCGA
TCGTGAGGGGCCACCGTGCTGGTCTCCTCACCACCGCGGATTACAACAATCTGTGCCAAT
GTGAAAACCTAGACGACATCAAAATGCACCTCTCCGCCACCAAATACGGCTCTTACCTCC
AGAACGAACCGTCGCCTCTGCATACGACGACAATCGTGGAGAAGTGTACGCTCAAGCTTG
TGGATGATTACAAGCATATGCTTTGCCAAGCTACTGAGCCTATGTCCACCTTCTTAGAGT
ACATCAGATACGGCCACATGATTGACAATGTGGTGCTGATTGTTACTGGAACTTTGCACG
AGAGAGATGTTCAAGAGTTGATTGAGAAATGTCACCCTTTAGGCATGTTTGACAGCATTG
CCACACTGGCTGTTGCTCAGAACATGAGGGAGCTCTATAGGTTGGTGCTTGTTGATACTC
CTCTGGCTCCATATTTTTCTGAGTGCTTGACATCTGAGGATTTGGA*GACATGAACATAG
AGATTATGAGGAACACCCTCTACAAAGCATACCTT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2AH51TF 824 0 0
CTCTCCAGATCC
CTCTCCCCGTGTCAA*TCTTCGAGATCTGAATATCTCCTCCTCCTGATGAAGGGGAAAGG
ATGTACGGATTCGAGGCGCTCACCTTCAACATTCATGGCGGATACCTGGAGGCGATCGTG
AGGGGCCACCGTGCTGGTCTTCTCACCACCGCCGATTACAACAATCTGTGCCAATGTGAA
AACCTAGACGACATCAAAATGCACCTCTCCGCCACCAAATACGGCTCTTACCTCCAGAAC
GAACCGTCACCTCTGCATACGACGACAATCGTGGAGAAGTGTACGCTCAAGCTTGTGGAT
GATTACAAGCATATGCTTTGCCAAGCTACTGAGCCTATGTCCACCTTCTTAGAGTACATC
AGATACGGCCACATGATTGACAATGTGGTGCTGATTGTTACTGGAACTTTGCACGAGAGA
GATGTTCAAGAGTTGATTGAGAAATGTCACCCTTTAGGCATGTTTGACAGCATTGCCACA
CTGGCTGTTGCTCAGAACATGAGGGAGCTCTATAGGTTGGTGCTTGTTGATACTCCTCTG
GCTCCATATTTTTCTGAGTGCTTGACATCTGAGGATTTGGATGACATGAACATAGAGATT
ATGAGGAACACCCTCTACAAAGCATACCTTGAGGATTTTTACAAGTTCTGTCAGAAACTT
GGAGGGGCAACAGCAGAAATAATGTCTGACCTTCTGGCCTTCGAAGCTGACAGAAGAGCT
GTGAACATCACCATCAATAGCATTGGCACTGAGCTAACAAGAGAAGACAGGAAGAAACTG
TACTCCAACTTTGGTCTTCTCTATCCATATGG

QA 13 824 13 824
DS 

RD RR2A938TF 700 0 0
G
ATACGACGACAATCGTGGAGAAGTGTACGCTCAAGCTTGTGGATGATTACAAGCATATGC
TTTGCCAAGCTACTGAGCCTATGTCCACCTTCTTAGAGTACATCAGATACGGCCACATGA
TTGACAATGTGGTGCTGATTGTTACTGGAACTTTGCACGAGAGAGATGTTCAAGAGTTGA
TTGAGAAATGTCACCCTTTAGGCATGTTTGACAGCATTGCCACACTGGCTGTTGCTCAGA
ACATGAGGGAGCTCTATAGGTTGGTGCTTGTTGATACTCCTCTGGCTCCATATTTTTCTG
AGTGCTTGACATCTGAGGATTTGGATGACATGAACATAGAGATTATGAGGAACACCCTCT
ACAAAGCATACCTTGAGGATTTTTACAAGTTCTGTCAGAAACTTGGAGGGGCAACATCAG
AGATAATGTCTGACCTTCTGGCCTTCGAAGCTGACAGAAGAGCTGTGAACATCACCATCA
ATAGCATTGGCACTGAGCTAACAAGAGAAGACAGGAAGAAACTGTACTCCAACTTTGGTC
TCCTCTATCCATATGGTCAGGAGGAGCTTGCAATCTGCGAAGACATAGATCAGGTTCGTG
GTGTTATGGAGAAGTACCCTCCTTACCAAGCAATATTCTCAAAGATGTCTTATGGAGAGA
GCCAGATGCTTGACAAAGCATTTTATGAAGAAGAAAGTC

QA 2 700 2 700
DS 



AS 2 8

CO CL533Contig1 805 2 11 U
CAAGACTATTTTACATAAAATCAAAGGCTCAAGATAAGTTTCAAGCATACAATAGAATCC
AGAATCAATTATTGTCTCAAGTAGATACCAGACACAGGACTCTCTCATCAAACTCCAAGT
TCTCACACACACACACCTCTTCTTTTATTAGACGACATTTAATACATTCAAACACAAACA
GAAGACAGTTCAAATTAACACACACCATTCATCTTCTTCCTCTCCTTCACAAACTTCCTC
CATCCAACAATGACTTCCATCAAAATGTCCCTTTCCACCTTCTTCCCTTTCACATTTCCG
AAATCCTCTGCTCCCATCTTCTTGGATATCTTGGATGGCAAGGTGTCGAGCTCGCGAAGC
ACCTTCACAATATCAGCCACAAGTCTCTCCGCAAGTGTTCTTGAAAAATCTTCCCTTATG
ACAACACGGAAAACCGTGATGTGTTGCGCATCCGCAGGCATGGTGTAAGCCGGTACAATC
CAGCCGAAACGGCGTAGCATCTCCGAGATCTCGAACTCGTTGTGGAAACTGTGGTCCTTG
AGAGAGAAGGCTACGAGTGGCACTCCTACCTCCTTTGAGACTATGTTGAAACGCTCTGTT
TTCTCTATCCCTTCTCTTAGAACCACCATGTTCTCTCTGCAGTTCTCCATCACGTTCTTG
TAGCCCTCGAAGCCAAGACGAATGAGCTGATAGTATTGAGCAATAATTTGGCTCGATCCC
TTGGAGAAATTGAGAGTGAAAGTGGGTTGATCAGCACCAAGATAGTTGATATGAAGATGA
GCTCATCAGCAAATCCTGTTGTGTC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H913JQ U 1
AF RR2EG75JQ U 1
BS 1 117 RR2EG75JQ
BS 118 118 RR2H913JQ
BS 119 192 RR2EG75JQ
BS 193 193 RR2H913JQ
BS 194 262 RR2EG75JQ
BS 263 263 RR2H913JQ
BS 264 404 RR2EG75JQ
BS 405 405 RR2H913JQ
BS 406 430 RR2EG75JQ
BS 431 431 RR2H913JQ
BS 432 805 RR2EG75JQ

RD RR2H913JQ 676 0 0
CG
AGACTATTTTACATAAAATCAAAGGCTCAAGATAAGTTTCAAGCATACAATAGAATCCAG
AATCAATTATTGTCTCAAGTAGATACCAGACACAGGACTCTCTCATCAAACTCCAAGTTC
TCACACACACACACCTCTTCTTTTATTAGACGACATTTAATACATTCAAACACAAACAGA
AGACAGTTCAAATTAACACACACCATTCATCTTCTTCCTCTCCTTCACAAACTTCCTCCA
TCCAACAATGACTTCCATCAAAATGTCCCTTTCCACCTTCTTCCCTTTCACATTTCCGAA
ATCCTCTGCTCCCATCTTCTTGGATATCTTGGATGGCAAGGTGTCGAGCTCGTGAAGCAC
CTTCACAATATCAGCCACAAGTCTCTCCGCAAGTGTTCTTGAAAAATCTTCCCTTATGAC
AACACGGAAAACCGTGATGTGTTGCGCATCCGCAGGCATGGTGTAAGCCGGTACAATCCG
GCCGAAACGGCGTAGCATCTCCGAGATCTCGAACTCGTTGTGGAAACTGTGGTCCTTGAG
AGAGAAGGCTACGAGTGGCACTCCTACCTCCTTTGAGACTATGTTGAAACGCTCTGTTTT
CTCTATCCCTTCTCTTAGAACCACCATGTTCTCTCTGCAGTTCTCCATCACGTTCTTGTA
GCCCTCGAAGCCAA

QA 3 676 3 676
DS 

RD RR2EG75JQ 805 0 0
CAAGACTATTTTACATAAAATCAAAGGCTCAAGATAAGTTTCAAGCATACAATAGAATCC
AGAATCAATTATTGTCTCAAGTAGATACCAGACACAGGACTCTCTCATCAAACTCCATGT
TCTCACACACACACACCTCTTCTTTTATTAGACGACATTTAATACATTCAAACACAAACA
GAAGACAGTTCAGATTAACACACACCATTCATCTTCTTCCTCTCCTTCACAAACTTCCTC
CATCCAACAATGACTTCCATCAGAATGTCCCTTTCCACCTTCTTCCCTTTCACATTTCCG
AAATCCTCTGCTCCCATCTTCTTGGATATCTTGGATGGCAAGGTGTCGAGCTCGCGAAGC
ACCTTCACAATATCAGCCACAAGTCTCTCCGCAAGTGTTCTTGAGAAATCTTCCCTTATG
ACAACACGGAGAACCGTGATGTGTTGCGCATCCGCAGGCATGGTGTAAGCCGGTACAATC
CAGCCGAAACGGCGTAGCATCTCCGAGATCTCGAACTCGTTGTGGAAACTGTGGTCCTTG
AGAGAGAAGGCTACGAGTGGCACTCCTACCTCCTTTGAGACTATGTTGAAACGCTCTGTT
TTCTCTATCCCTTCTCTTAGAACCACCATGTTCTCTCTGCAGTTCTCCATCACGTTCTTG
TAGCCCTCGAAGCCAAGACGAATGAGCTGATAGTATTGAGCAATAATTTGGCTCGATCCC
TTGGAGAAATTGAGAGTGAAAGTGGGTTGATCAGCACCAAGATAGTTGATATGAAGATGA
GCTCATCAGCAAATCCTGTTGTGTC

QA 1 805 1 805
DS 



CO CL533Contig2 1644 6 32 U
GGATATTCTTCTTACTCCTCTCACTACCAATAAAGAAAAAACAAGATGGTTCTAAGTCGA
GCGGCCACCGAAAGTGACGAAAATGTTTGCTCGACGTTCGGATCTCGCTATGTCCGCACT
TCACTGCCCAAGTATGAGATTGGTGAGGGCTCGATACCGAAGGAGGCTGCGTATCAGATC
ATAAAAGATGAGCTGATGCTTGATGGTAACCCGAGGCTTAACCTGGCTTCCTTTGTGACG
ACATGGATGGAGCCTGAGTGTGACAAACTCATTATGGAATCTATCAACAAGAACTACGTC
GACATGGACGAGTACCCTGTCACCACCGAGCTCCAGAACCGATGTGTAAACATGATAGCT
CGACTGTTCAATGCGCCGCTTGGGGAAACTGAGACCGCCATGGGAGTAGGCACTGTTGGG
TCTTCGGAAGCCATCATGTTAGCCGGATTAGCCTTCAAAAGGAATTGGCAGAACAAACGC
AAAGCTGAGGGTAAACCCTATGACAAACCCAACATTGTCACAGGAGCCAATGTTCAAGTG
TGCTGGGAGAAATTCGCTAGGTACTTCGAGGTGGAGCTAAAAGAAGTGAAGCTTAGTGAA
GGTTACTACGTGATGGATCCAGATAAAGCAGCTGAAATGGTAGACGAGAACACAATCTGT
GTTGCTGCCATACTTGGTTC*ACACTCAACGGTGAGTTCGAAGACGTCAAGCGCCTTAAT
GACTTGCTGGTCAAGAAAAACGAAGAGACTGGCTGGAACACTCCGATCCACGTTGACGCA
GCAAGTGGAGGCTTCATAGCTCCATTTATTTACCCTGACTTGGAATGGGACTTTAGGCTT
CCTTTGGTGAAGAGTATCAATGTGAGTGGTCATAAGTATGGGCTGGTCTATGCGGGTATT
GGCTGGGTCGTGTGGAGGACACAACAGGATTTGCCTGATGAGCTCATCTTTCATATCAAC
TATCTTGGTGCTGATCAACCCACTTTCACTCTCAATTTCTCCAAGGGATCGAGCCAAATT
ATTGCTCAATACTATCAGCTCATTCGTCTTGGCTTCGAGGGCTACAAGAACGTGATGGAG
AACTGCAGAGAGAACATGGTGGTTCTAAGAGAAGGGATAGAGAAAACAGAGCGTTTCAAC
ATAGTCTCAAAGGAGATAGGAGTGCCACTCGTAGCCTTCTCTCTCAAGGATCACAGTTTC
CACAACGAGTTCGAGATCTCAGAGATGCTACGCCGTTTCGGATGGATTGTCCCGGCTTAC
ACCATGCCTGCGGATGCGCAACACATCACGGTTCTCCGTGTTGTCATAAGGGAAGATTTC
TCAAGAACACCTGCGGAGAGACTTGTGGCTGATATTGTGAAGGTGCTTCACGAGCTTGAC
ACCTTGCCTTCCAAGATATCCAAGAAGATGGGAGCAGAGGATTTCGGAAATGTGAAAGGG
AAAAAGGTGGAAAGGGACATTCTGATGGAAGTCATTGTTGGATGGAGGAAGTTTGTGAAG
GAGCGCAAGAAGATGAATGGTGTGGGTTAATCTGAAGTGTCTTCGGTTTGTGTTCGAATG
TATTAAATGTCGTCTAATAAAAGAAGAGGTATGTGAGTGTGTGAGAACTTGGAGTTTGAT
GAAAGAGTTGTGTGTCTGGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H267TF U 1
AF RR2EG75TF U 25
AF RR2FY67TF U 485
AF RR2F877TF U 795
AF RR2F877JQ C 1378
AF RR2H267JQ C 863
BS 1 70 RR2H267TF
BS 71 71 RR2EG75TF
BS 72 253 RR2H267TF
BS 254 254 RR2EG75TF
BS 255 314 RR2H267TF
BS 315 315 RR2EG75TF
BS 316 362 RR2H267TF
BS 363 363 RR2EG75TF
BS 364 521 RR2H267TF
BS 522 522 RR2EG75TF
BS 523 601 RR2H267TF
BS 602 602 RR2EG75TF
BS 603 649 RR2H267TF
BS 650 650 RR2EG75TF
BS 651 691 RR2H267TF
BS 692 692 RR2EG75TF
BS 693 709 RR2H267TF
BS 710 710 RR2EG75TF
BS 711 733 RR2H267TF
BS 734 893 RR2FY67TF
BS 894 894 RR2F877TF
BS 895 1057 RR2FY67TF
BS 1058 1058 RR2F877TF
BS 1059 1151 RR2FY67TF
BS 1152 1229 RR2F877TF
BS 1230 1230 RR2H267JQ
BS 1231 1330 RR2F877TF
BS 1331 1331 RR2H267JQ
BS 1332 1442 RR2F877TF
BS 1443 1524 RR2H267JQ
BS 1525 1525 RR2F877JQ
BS 1526 1644 RR2H267JQ

RD RR2H267TF 737 0 0
GGATATTCTTCTTACTCCTCTCACTACCAATAAAGAAAAAACAAGATGGTTCTAAGTCGA
GCGGCCACCGGAAGTGACGAAAATGTTTGCTCGACGTTCGGATCTCGCTATGTCCGCACT
TCACTGCCCAAGTATGAGATTGGTGAGGGCTCGATACCGAAGGAGGCTGCGTATCAGATC
ATAAAAGATGAGCTGATGCTTGATGGTAACCCGAGGCTTAACCTGGCTTCCTTTGTGACG
ACATGGATGGAGC*TGAGTGTGACAAACTCATTATGGAATCTATCAACAAGAACTACGTC
GACATGGACGAGTATCCTGTCACCACCGAGCTCCAGAACCGATGTGTAAACATGATAGCT
CGGCTGTTCAATGCGCCGCTTGGGGAAACTGAGACCGCCATGGGAGTAGGCACTGTTGGG
TCTTCGGAAGCCATCATGTTAGCCGGATTAGCCTTCAAAAGGAATTGGCAGAACAAACGC
AAAGCTGAGGGTAAACCCTATGACAAACCCAACATTGTCACCGGAGCCAATGTTCAAGTG
TGCTGGGAGAAATTCGCTAGGTACTTCGAGGTGGAGCTAAAAGAAGTGAAGCTTAGTGAA
G*TTACTACGTGATGGATCCAGATAAAGCAGCTGAAATGGTAGACGAGA*CACAATCTGT
GTTGCTGCCATACTTGGTTC*ACACTCAACG*TGAGTTCGAAGACGTCA*GCGCCTTAAT
GACTTGCTGGTCA
GAAA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2EG75TF 715 0 0
GGCAGAAAAGA
AAAAAACAAGATGGTTCTAAGTCGAGCGGCCCGCGAAAGTGACGAAAATGTTTGCTCGAC
GTTCGGATCTCGCTATGTCCGCACTTCTTTGCCCAAGTATGAGATTGGTGAGGGCTCGAT
ACCGAAGGAGGCTGCGTATCAGATCATAAAAGATGAGCTGATGCTTGATGGTAACCCGAG
GCTTAACCTGGCTTCCTTTGTGACGACATGGATGGAGCCTGAGTGTGACAAACTCATTAT
GGAATCTATCAACAAGAACTACGTCGACATGGACGAGTACCCTGTCACTACCGAGCTCCA
GAACCGATGTGTAAACATGATAGCTCGACTGTTCAATGCGCCGCTTGGGGAAACTGAGAC
CGCCATGGGAGTAGGCACTGTTGGGTCTTCGGAAGCCATCATGTTAGCCGGATTAGCCTT
CAAAAGGAATTGGCAGAACAAACGCAAAGCTGAGGGTAAACCCTATGACAAACCCAACAT
TGTCACAGGAGCCAATGTTCAAGTGTGCTGGGAGAA*TTCGCTAGGTACTTCGAGGTGGA
GCTAAAAGAAGTGAAGCTTAGTGAAGGTTACTACGTGATGGATCCAGATAAAGCAGCTGA
AATGGTAGACGAGAACATAATCTGTGTTGCTGCCATACTTGGTTC*ACACTCAACGGTGA
GTTCGAAGACGTCAAGCGCCTTAATGACTTGCTGGTCA
AAAAAA

QA 12 709 12 709
DS 

RD RR2FY67TF 667 0 0
AG
GAGGGTAAACCCTATGACAAACCCAACATTGTCACAGGAGCCAATGTTCAAGTGTGCTGG
GAGAAATTCGCTAGGTACTTCGAGGTGGAGCTAAAAGAAGTGAAGCTTAGTGAAGGTTAC
TACGTGATGGATCCAGATAAAGCAGCTGAAATGGTAGACGAGAACACAATCTGTGTTGCT
GCCATACTTGGTTCCACACTCAACGGTGAGTTCGAAGACGTCAAGCGCCTTAATGACTTG
CTGGTCAAGAAAAACGAAGAGACTGGCTGGAACACTCCGATCCACGTTGACGCAGCAAGT
GGAGGCTTCATAGCTCCATTTATTTACCCTGACTTGGAATGGGACTTTAGGCTTCCTTTG
GTGAAGAGTATCAATGTGAGTGGTCATAAGTATGGGCTGGTCTATGCTGGTATTGGCTGG
GTCGTGTGGAGGACACAACAGGATTTGCCTGATGAGCTCATCTTTCATATCAACTATCTT
GGTGCTGATCAACCCACTTTCACTCTCAATTTCTCCAAGGGATCGAGCCAAATTATTGCT
CAATACTATCAGCTCATTCGTCTTGGCTTCGGGGGCTACAAGAACGTGATGGAGAACTGC
AGAGAGAACATGGTGGTTCTAAGAGAAGGGATAGAGAAAACAGAGCGTTTCAACATAGTC
TCAAA

QA 3 667 3 667
DS 

RD RR2F877TF 648 0 0
G
ATAGCTCCGTTTATTTACCCTGACTTGGAATGT*ACTTTAGGCTTCCTTTGGTGAAGAGT
ATCAATGTGAGTGGTCATAAGTATGGGCTGGTCTATGCGGGTATTGGCTGGGTCGTGTGG
AGGACACAACAGGATTTGCCTGATGAGCTCATCTTTCATATCAACTATCTTGGTGCTGAT
CAACCCACTTTCACTCTCAATTTCTCCAAGGGATCGAGCCAAATTATTGCTCAATACTAT
CAGCTCATTCGTCTTGGCTTCGAGGGCTACAAGAACGTGATGGAGAACTGCAGAGAGAAC
ATGGTGGTTCTAAGAGAAGGGATAGAGAAAACAGAGCGTTTCAACATAGTCTCAAAGGAG
ATAGGAGTGCCACTCGTAGCCTTCTCTCTCAAGGATCACAGTTTCCACAACGAGTTCGAG
ATCTCAGAGATGCT*CGCCGTTTCGGATGGATTGTCCCGGCTTACACCATGCCTGCGGAT
GCGCAACACATCACGGTTCTCCGTGTTGTCATAAGGGAAGATTTCTCAAGAACACTTGCG
GAGAGACTTGTGGCTGATATTGTGAAGGTGCTTCACGAGCTTGACACCTTGCCTTCCAAG
ATATCCAAGAAGATGGGAGCAGAGGATTTCGGAAATGTGAAAGGGAA

QA 2 648 2 648
DS 

RD RR2F877JQ 214 0 0
GACACCTTGCCTTCCAAGATATCCAAGAAGATGGGAGCAGAGGATTTCGGAAATGTGAAA
GGGAAAAAGGTGGAAAGGGACATTCTGATGGAAGTCATTGTTGGATGGAGGAAGTTTGTG
AAGGAGCGCAAGAAGATGAATGGTGTGGGTTAATCTGAAGTGTCTTCGGTTTGTGTTCGA
ATGTATTAAATGTCGTCTAATAAAAGAAGAG
ATA

QA 1 211 1 211
DS 

RD RR2H267JQ 782 0 0
TGAGTGGTCATAAGTATGGGCTGGTCTATGCGGGTATTGGCTGGGTCGTGTGGAGGACAC
AACAGGATTTGCCTGATGAGCTCATCTTTCATATCAACTATCTTGGTGCTGATCAACCCA
CTTTCACTCTCAATTTCTCCAAGGGATCGAGCCAAATTATTGCTCAATACTATCAGCTCA
TTCGTCTTGGCTTCGAGGGCTACAAGAACGTGATGGAGAACTGCAGAGAGAACATGGTGG
TTCTAAGAGAAGGGATAGAGAAAACAGAGCGTTTCAACATAGTCTCAAAGGAGATAGGAG
TGCCACTCGTAGCCTTCTCTCTCAAGGATCACAGTTTCCACAACGAGTTCGAGATCTCAG
AGATGCTACGCCGTTTCGGATGGATTGTCCCGGCTTACACCATGCCTGCGGATGCGCAAC
ACATCACGGTTCTCCGTGTTGTCATAAGGGAAGATTTCTCAAGAACACCTGCGGAGAGAC
TTGTGGCTGATATTGTGAAGGTGCTTCACGAGCTTGACACCTTGCCTTCCAAGATATCCA
AGAAGATGGGAGCAGAGGATTTCGGAAATGTGAAAGGGAAAAAGGTGGAAAGGGACATTC
TGATGGAAGTCATTGTTGGATGGAGGAAGTTTGTGAAGGAGCGCAAGAAGATGAATGGTG
TGTGTTAATCTGAAGTGTCTTCGGTTTGTGTTCGAATGTATTAAATGTCGTCTAATAAAA
GAAGAGGTATGTGAGTGTGTGAGAACTTGGAGTTTGATGAAAGAGTTGTGTGTCTGGTAT
CC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 3 10

CO CL534Contig1 266 2 2 U
GTGGGGGAGTAAGGGACTCTAGCTGTAACCAACTACTCTGCCAGTTCAAAATAAAGTAAT
GATTATGTATACTGAATAATAATATTATAACTAAGACGTGTGTGATGAACATGTTTCAGT
ATCGTACTAAGACCAAACATGGGAGTTTTAACAAAAAAAAAAAAAAAACAGAAAGAAAGT
GTTCTTGTTTGATGAACTTATGATTACTAAAGAGTGTTGTTGTTGCTGCTTATGTTGAAT
AAAAATGATGCAAGTATTATCAATTG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2AN14TF U 1
AF RR2AN14JQ C 1
BS 1 261 RR2AN14TF
BS 262 266 RR2AN14JQ

RD RR2AN14TF 266 0 0
GTGGGGGAGTAAGGGACTCTAGCTGTAACCAACTACTCTGCCAGTTCAAAATAAAGTAAT
GATTATGTATACTGAATAATAATATTATAACTAAGACGTGTGTGATGAACATGTTTCAGT
ATCGTACTAAGACCAAACATGGGAGTTTTAACAAAAAAAAAAAAAAAACAGAAAGAAAGT
GTTCTTGTTTGATGAACTTATGATTACTAAAGAGTGTTGTTGTTGCTGCTTATGTTGAAT
AAAAATGATGCAAGTATTATC
AATTG

QA 1 261 1 261
DS 

RD RR2AN14JQ 266 0 0
GG
GGGGGAGTAAGGGACTCTAGCTGTAACCAACTACTTTGCCAGTTCAAAATAAAGTAATGA
TTATGTATACTGAATAATAATATTATAACTAAGACGTGTGTGATGAACATGTTTCAGTAT
CGTACTAAGACCAAACATGGGAGTTTTAACAAAAAAAAAAAAAAAACAGAAAGAAAGTGT
TCTTGTTTGATGAACTTATGATTACTAAAGAGTGTTGTTGTTGCTGCTTATGTTGAATAA
AAATGATGCAAGTATTATCAATTG

QA 3 266 3 266
DS 



CO CL534Contig2 992 3 2 U
GGACGTACTTGTATCTAAGAAAACTAAGCCAAGTATATTTATAAATAAATAAATGCTTGA
CAATCTTATCGCAGAGTACGGGCACGGATACGGCAATGGCTACGGCCACAAGGATCACAG
AAGCAGAGGCTACGGCTTTGAGGAGCACAAGGAGTACAAGTCTCATATGGAGTCAGAAGG
AGGCTACTTTGACCGTCAAGCCCGCTACGACCACCGCGTGAGGCTTCCGGCCAACCACGG
CCGTCCACCCATGGCTCACATGCCTCTCTTTGATGAAGACGACTCAGATGTAGAGGAATT
CTATAAGAGCAGCCGAAGCCACCACACTACTGTGTTACCGCACCACGGCAAAAACCACCA
CCAGCAGCCACCTCATATGAACTTCATGCCCCCACCTCCGATGTCTCAACCTCACCATAG
TGGAAAGATGGGTAATGGATGGCAGGGGAAGCATGAAGATGCATACCATGGCGGGCACGG
GATGCAGCACCACGGTGAGTATGGGATGCAGCAGCACGGGATGCAGCACCACGGTGAGTA
CGGGATGAAGCAGCACGGGATGAAGCACCACGGTGAGTACGGGATGAAGCACCAGGACAG
GCTTATGGCTCCTCAGATGTCACCACATCATGTCTACATGAACCCAAACCATGGCACTGG
CAGTGGCCATGCTGTAGTGGTCAATGCTTCGGAAAACTGGCCAGTCAGCAACAGCGGTGG
CGGCCATTACAAGGCGGGGTGGGGGAGTAAGGGACTCTAGCTGCAACCAACTACTCTGCC
AGTTCAAAATAAAAGTAATGATTATGTATACTGAATAATAATATTATAACTAAGACGTGT
GTGATGAACATGTTTCAGTATCGTACTAAGACCAAACATGGGACTTTTAACAAAAAAAAC
AGAAAGTATGCGTTCTCGTTTGATGAACTTATGATTACTAAAGAGTGTTGTTGCTGCTGC
TTATGTTGAATAAAAATGATGCAAGTATTATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E684TF U 1
AF RR2B594TF U 1
AF RR2B594JQ C 295
BS 1 739 RR2B594TF
BS 740 992 RR2B594JQ

RD RR2E684TF 281 0 0
GGACGTACTTGTATCTAAGAAAACTAAGCCAAGTATATTTATAAATAAATAAATGCTTGA
CAATCTTATCGCAGAGTACGGGCACGGATACGGCAATGGCTACGGCCACAAGGATCACAG
AAGCAGAGGCTACGGCTTTGGGGAGCACAAGGAGTACAAGTCTCATATGGAGTCAGAAGG
AGGCTACTTTGACCGTCAAGCCCGCTACGACCACCGCGTGAGGCTTCCGGCCAACCACGG
CCGTCCACCCATGGCTCACATGCCTCTCTTTGATGAAGACG

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR2B594TF 741 0 0
GGACGTACTTGTATCTAAGAAAACTAAGCCAAGTATATTTATAAATAAATAAATGCTTGA
CAATCTTATCGCAGAGTACGGGCACGGATACGGCAATGGCTACGGCCACAAGGATCACAG
AAGCAGAGGCTACGGCTTTGAGGAGCACAAGGAGTACAAGTCTCATATGGAGTCAGAAGG
AGGCTACTTTGACCGTCAAGCCCGCTACGACCACCGCGTGAGGCTTCCGGCCAACCACGG
CCGTCCACCCATGGCTCACATGCCTCTCTTTGATGAAGACGACTCAGATGTAGAGGAATT
CTATAAGAGCAGCCGAAGCCACCACACTACTGTGTTACCGCACCACGGCAAAAACCACCA
CCAGCAGCCACCTCATATGAACTTCATGCCCCCACCTCCGATGTCTCAACCTCACCATAG
TGGAAAGATGGGTAATGGATGGCAGGGGAAGCATGAAGATGCATACCATGGCGGGCACGG
GATGCAGCACCACGGTGAGTATGGGATGCAGCAGCACGGGATGCAGCACCACGGTGAGTA
CGGGATGAAGCAGCACGGGATGAAGCACCACGGTGAGTACGGGATGAAGCACCAGGACAG
GCTTATGGCTCCTCAGATGTCACCACATCATGTCTACATGAACCCAAACCATGGCACTGG
CAGTGGCCATGCTGTAGTGGTCAATGCTTCGGAAAACTGGCCAGTCAGCAACAGCGGTGG
CGGCCATTACAAGGCGGGG
TG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2B594JQ 698 0 0
GGAATTCTATAAGAGCAGCCGAAGCCACCACACTACTGTGTTACCGCACCACGGCAAAAA
CCACCACCAGCAGCCACCTCATATGAACTTCATGCCCCCACCTCCGATGTCTCAACCTCA
CCATAGTGGAAAGATGGGTAATGGATGGCAGGGGAAGCATGAAGATGCATACCATGGCGG
GCACGGGATGCAGCACCACGGTGAGTATGGGATGCAGCAGCACGGGATGCAGCACCACGG
TGAGTACGGGATGAAGCAGCACGGGATGAAGCACCACGGTGAGTACGGGATGAAGCACCA
GGACAGGCTTATGGCTCCTCAGATGTCACCACATCATGTTTACATGAACCCAAACCATGG
CACTGGCAGTGGCCATGCTGTAGTGGTCAATGCTTCGGAAAACTGGCCAGTCAGCAACAG
CGGTGGCGGCCATTACAAGGCGGGGTGGGGGAGTAAGGGACTCTAGCTGCAACCAACTAC
TCTGCCAGTTCAAAATAAAAGTAATGATTATGTATACTGAATAATAATATTATAACTAAG
ACGTGTGTGATGAACATGTTTCAGTATCGTACTAAGACCAAACATGGGACTTTTAACAAA
AAAAACAGAAAGTATGCGTTCTCGTTTGATGAACTTATGATTACTAAAGAGTGTTGTTGC
TGCTGCTTATGTTGAATAAAAATGATGCAAGTATTATC

QA 1 698 1 698
DS 



CO CL534Contig3 981 5 11 U
GATAATACTTGCATCATTTTTATTCAACATAAGCAGCAACAACAACACTCTTTAGTAATC
ATAAGTTCATCAAACAAGAACACTTTCTTTCTGTTTTTTTTTTGTTAAAACTCCCATGTT
TGGTCTTAGTACGATACTGAAACATGTTCATCACACACGTCTTAGTTATAATATTATTAT
TCAGTATACATAATCATTACTTTATTTTGAACTGGCAGAGTAGTTGGTTGCAGCTAGAGT
CCCTTACTCCCCCACCCCCCCTTGTAATGGCCGCCACCGCTGTTGCTGACTGGCCAGTTT
TCCGAAGCATTGACCACTACAGCATGGCCACTGCCAGTGCCATGGTTTGGGTTCATGTAG
ACATGATGTGGTGACATCTGAGGAGCCATAAGCCTGTCCTGGTGCTTCATCCCGTACTCA
CCTTGGTGCTGCATCCCGTGCTGCTTCATCCCGTACTCACCGTGGTGCTGCATCCCGTAC
TGATCACCGTGGTGCTGCATCTCGTGCCCACCATGGTATGCATCTTCATGCTTCCCCTGC
CATCCATTACCCATCTTTCCACTATGGTGAGGTTGAGACATCGGAGGTGGGGGCATGAAG
TTCATATGAGGTGGCTGCTGGTGGTGGTTTTTGCCGTGGTGCGGTAACACAGTAGTGTGG
TGGCTTCGGCTGCTCTTATAGAATTCCTCTACATCTGAGTCGTCTTCATCAAAGAGAGGC
ATGTGAGCCATGGGTGGACGGCCGTGGTTGGCCGGAAGCCTCACGCGGTGGTCGTAGCGG
GCTTGACGGTCAAAGTAGCCTCCTTCTGACTCCATATGAGACTTGTACTCCTCGTGCTCC
TCAAAGCCGTAGCCTCTGCTTCTGTGATCCTTGTGGCCGTAGCCATTGCCGTATCCGTGC
CCGTACTCTGCGATAAGATTGTCAAGCATTTATTTATTTATAAATATACTTGGCTTAGTT
TTCTTAGATACAAGTACGTCC


BQ
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP57JQ U 1
AF RR2GP57TF C 1
AF RR2E684JQ U 236
AF RR2CG20JQ U 4
AF RR2CG20TF C 258
BS 1 77 RR2GP57JQ
BS 78 78 RR2CG20JQ
BS 79 217 RR2GP57JQ
BS 218 218 RR2CG20JQ
BS 219 219 RR2GP57JQ
BS 220 220 RR2CG20JQ
BS 221 255 RR2GP57JQ
BS 256 258 RR2CG20JQ
BS 259 259 RR2E684JQ
BS 260 838 RR2CG20JQ
BS 839 981 RR2CG20TF

RD RR2GP57JQ 255 0 0
GATAATACTTGCATCATTTTTATTCAACATAAGCAGCAACAACAACACTCTTTAGTAATC
ATAAGTTCATCAAACAAAAACACTTTCTTTCTGTTTTTTTTTTGTTAAAACTCCCATGTT
TGGTCTTAGTACGATACTGAAACATGTTCATCACACACGTCTTAGTTATAATATTATTAT
TCAGTATACATAATCATTACTTTATTTTGAACTGGCAAAATAGTTGGTTGCAGCTAGAGT
CCCTTACTCCCCCAC

QA 1 255 1 255
DS 

RD RR2GP57TF 255 0 0
GATAATACTTGCATCATTTTTATTCAACATAAGCAGCAACAACAACACTCTTTAGTAATC
ATAAGTTCATCAAACAAGAACACTTTCTTTCTGTTTTTTTTTTGTTAAAACTCCCATGTT
TGGTCTTAGTACGATACTGAAACATGTTCATCACACACGTCTTAGTTATAATATTATTAT
TCAGTATACATAATCATTACTTTATTTTGAACTGGCAGAGTAGTTGGTTGCAGCTAGAGT
CCCTTACTCCCCCAC

QA 1 255 1 255
DS 

RD RR2E684JQ 341 0 0
AGAGTCCCTTACTCCCCCCCCCCCCCTTGTAATGGCCGCCACCGCTGTTGCTGACTGGCC
AGTTTTCCGAAGCATTGACCACTACAGCATGGCCACTGCCAGTGCCATGGTTTGGGTTCA
TGTAAACATGATGTGGTGACATCTGAGGAGCCATAAACCTGTCCTGGTGCTTCATCCCGT
ACTCACCTTGGTGCTGCATCCCGTGCTGCTTCATCCCGTACTCACCGTGGTGCTGCATCC
CGTACTGATCACCGTGGTGCTGCATCCCGTGCCCACCATGGTATGCATCTTCATGCTTCC
CCTGCCATCCATTACCCATCTTTCCACTATGGTGAGGTTGA

QA 1 341 1 341
DS 

RD RR2CG20JQ 835 0 0
AATACTTGCATCATTTTTATTCAACATAAGCAGCAACAACAACACTCTTTAGTAATCATA
AGTTCATCAAACAAGAACACTTTCTTTCTGTTTTTTTT**GTTAAAACTCCCATGTTTGG
TCTTAGTACGATACTGAAACATGTTCATCACACACGTCTTAGTTATAATATTATTATTCA
GTATACATAATCATTACTTTATTTTGAACTGGCAGAGTAGTTGGTTGCAGCTAGAGTCCC
TTACTCCCCCACCCCGCCTTGTAATGGCCGCCACCGCTGTTGCTGACTGGCCAGTTTTCC
GAAGCATTGACCACTACAGCATGGCCACTGCCAGTGCCATGGTTTGGGTTCATGTAGACA
TGATGTGGTGACATCTGAGGAGCCATAAGCCTGTCCTGGTGCTTCATCCCGTACTCACCT
TGGTGCTGCATCCCGTGCTGCTTCATCCCGTACTCACCGTGGTGCTGCATCCCGTACTGA
TCACCGTGGTGCTGCATCTCGTGCCCACCATGGTATGCATCTTCATGCTTCCCCTGCCAT
CCATTACCCATCTTTCCACTATGGTGAGGTTGAGACATCGGAGGTGGGGGCATGAAGTTC
ATATGAGGTGGCTGCTGGTGGTGGTTTTTGCCGTGGTGCGGTAACACAGTAGTGTGGTGG
CTTCGGCTGCTCTTATAGAATTCCTCTACATCTGAGTCGTCTTCATCAAAGAGAGGCATG
TGAGCCATGGGTGGACGGCCGTGGTTGGCCGGAAGCCTCACGCGGTGGTCGTAGCGGGCT
TGACGGTCAAAGTAGCCTCCTTCTGACTCCATATGAGACTTGTACTCCTCGTGCT

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR2CG20TF 724 0 0
CCCCGCTTGTAT
GCCGCCACCGCTGTTGCTGACTGGCCAGTTT*CCGAAGCATTGACCACTACAGCATGGCC
ACTGCCAGTGCCATGGTTTGGGTTCATGTAGACATGATGTGGTGACATCTGAGGAGCCAT
AAGCCTGTCCTGGTGCTTCATCCCGTACTCACCTTGGTGCTGCATCCCGTGCTGCTTCAT
CCCGTACTCACCGTGGTGCTGCATCCCGTACTGATCACCGTGGTGCTGCATCTCGTGCCC
ACCATGGTATGCATCTTCATGCTTCCCCTGCCATCCATTACCCATCTTTCCACTATGGTG
AGGTTGAGACATCGGAGGTGGGGGCATGAAGTTCATATGAGGTGGCTGCTGGTGGTGGTT
TTTGCCGTGGTGCGGTAACACAGTAGTGTGGTGGCTTCGGCTGCTCTTATAGAATTCCTC
TACATCTGAGTCGTCTTCATCAAAGAGAGGCATGTGAGCCATGGGTGGACGGCCGTGGTT
GGCCGGAAGCCTCACGCGGTGGTCGTAGCGGGCTTGACGGTCAAAGTAGCCTCCTTCTGA
CTCCATATGAGACTTGTACTCCTCGTGCTCCTCAAAGCCGTAGCCTCTGCTTCTGTGATC
CTTGTGGCCGTAGCCATTGCCGTATCCGTGCCCGTACTCTGCGATAAGATTGTCAAGCAT
TTATTTATTTATAAATATACTTGGCTTAGTTTTCTTAGATACAAGTACGTCC

QA 13 724 13 724
DS 



AS 1 10

CO CL535Contig1 826 10 9 U
GGAACTCGAAGATAATAAGAATTGGGGAGAAAATTAGGGCTCTTTTTCTCTCGCATAGTC
TCAGTCTCGATTGTCCCCGATCCAGCGATGGAAAGATCCGATCCTCCTTCACCGAAGCGT
CAGAAGAAGACGGAGGAAGAAACAACCCGCTATAATGGCCGTCCCGAGGGTTTCGAATCC
GACGAGTGCTCCGACGAGGAGATGGAGTTGTTCGACCAAGAGTTGGATAGGAGCGGCGGT
TATGAAATCGACTTCAAGAAATTTCGTTACTGTTTTGGTTGGAAATCACTGGATCTGGAC
GATAGTACAATGGTTGATGAGCCTGAAACTAACAGAGATTTCGTAGCTACTTTGGTGAAC
CTCGCTCTCACCAAAACAAACACAGAAAGAGGAACAAGTTTGGAACTGGGCAAGATTTTG
ATTGCAAACTATCATCCATCCTGCGCAGTCACTTTCTACCTCTCATTCGAAGTCAATGAT
CCTTCAGATGGTAATCAGACAAAACCCTATCGTGCAGTGGTTCGCTACTTCCCGGGAGAC
ATTGAAGTTGTCTCTTGCAATCCCAAAGAGTGACTTCTCTCAGAGATCCACCACCAGTCT
CATGGATTTGAAGACTGAAGAATGGTTT*GTTTGTCTATGTATCCTACTCTATGAAATTT
GCTATGCTAGCTTAAAAGGGAAAAAAAAAAAGAAGAGTTTCCAGCTTCTTCTTTTTTCCT
CTGTTTATGTATCAACTTGTTTGATATTTCTTCTTTCGGCTATTGTTGTTTTAAGTGTAT
TGCATAACCTTAAGTTATATGAATAATTTACTAGTTACTTTTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 40 40 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 50 45 45 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2CK49TF U 53
AF RR2EA36TF U 1
AF RR2CN16TF U 6
AF RR2CG32JQ C 12
AF RR2GH33TF U 51
AF RR2CG32TF U 12
AF RR2A890TF U 48
AF RR2CK49JQ C 81
AF RR2EA36JQ C 151
AF RR2GH33JQB C 194
BS 1 122 RR2EA36TF
BS 123 123 RR2CN16TF
BS 124 367 RR2EA36TF
BS 368 368 RR2CN16TF
BS 369 675 RR2EA36TF
BS 676 689 RR2CG32TF
BS 690 764 RR2A890TF
BS 765 823 RR2CK49JQ
BS 824 826 RR2EA36JQ

RD RR2CK49TF 285 0 0
GG
ATAGTCTCAGTCTCGATTGTCCCCGATCCAGCGATGGAGAGATCCGATCCTCCTTCACCG
AAGCGTCAGAAGAAGACGGAGGAAGAAACAACCCGCTATAATGGCCGTCCCGAGGGTTTC
GAATCCGACGAGTGCTCCGACCAGGAGATGGAGTTGTTCGACCAAGAGTTGGATGGGAGC
GGCGGTTATGAAATCGACTTCAAGAAATTTCGTTACTGTTTTGGTTGGAAATCACTGGAT
CTGGACGATAGTACAATGGTTGATGAGCCTGAAACTAACAGAG

QA 3 285 3 285
DS 

RD RR2EA36TF 675 0 0
GGAACTCGAAGATAATAAGAATTGGGGAGAAAATTAGGGCTCTTTTTCTCTCGCATAGTC
TCAGTCTCGATTGTCCCCGATCCAGCGATGGAAAGATCCGATCCTCCTTCACCGAAGCGT
CATAAGAAGACGGAGGAAGAAACAACCCGCTATAATGGCCGTCCCGAGGGTTTCGAATCC
GACGAGTGCTCCGACGAGGAGATGGAGTTGTTCGACCAAGAGTTGGATAGGAGCGGCGGT
TATGAAATCGACTTCAAGAAATTTCGTTACTGTTTTGGTTGGAAATCACTGGATCTGGAC
GATAGTACAATGGTTGATGAGCCTGAAACTAACAGAGATTTCGTAGCTACTTTGGTGAAC
CTCGCTCCCACCAAAACAAACACAGAAAGAGGAACAAGTTTGGAACTGGGCAAGATTTTG
ATTGCAAACTATCATCCATCCTGCGCAGTCACTTTCTACCTCTCATTCGAAGTCAATGAT
CCTTCAGATGGTAATCAGACAAAACCCTATCGTGCAGTGGTTCGCTACTTCCCGGGAGAC
ATTGAAGTTGTCTCTTGCAATCCCAAAGAGTGACTTCTCTCAGAGATCCACCACCAGTCT
CATGGATTTGAAGACTGAAGAATGGTTT*GTTTGTCTATGTATCCTACTCTATGAAATTT
GCTATGCTAGCTTAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2CN16TF 668 0 0
GGGAAGAT
AATAAGAATTGGGGAGAAAATTAGGGCTCTTTTTCTCTCGCATAGTCTCAGTCTCGATTG
TCCCCGATCCAGCGATGGAAAGATCCGATCCTCCTTCACCGAAGCGTCAGAAGAAGACGG
AGGAAGAAACAACCCGCTATAATGGCCGTCCCGAGGGTTTCGAATCCGACGAGTGCTCCG
ACGAGGAGATGGAGTTGTTCGACCAAGAGTTGGATAGGAGCGGCGGTTATGAAATCGACT
TCAAGAAATTTCGTTACTGTTTTGGTTGGAAATCACTGGATCGGGACGATAGTACAATGG
TTGATGAGCCTGAAACTAACAGAGATTTCGTAGCTACTTTGGTGAACCTCGCTCTCACCA
AAACAAACACAGAAAGAGGAACAAGTTTGGAACTGGGCAAGATTTTGATTGCAAACTATC
ATCCATCCTGCGCAGTCACTTTCTACCTCTCATTCGAAGTCAATGATCCTTCAGATGGTA
ATCAGACAAAACCCTATCGTGCAGTGGTTCGCTACTTCCCGGGAGACATTGAAGTTGTCT
CTTGCAATCCCAAAGAGTGACTTCTCTCAGAGATCCACCACCAGTCTCATGGATTTGAAG
ACTGAAGAATGGTTT*ATTTGTCTATGTATCCTACTCTATGAAATTTGCTATGCTAGCTT

QA 9 668 9 668
DS 

RD RR2CG32JQ 669 0 0
GG
AATAAGAATTGGGGAGAAAATTAGGGCTCTTTTTCTCTCGCATAGTCTCAGTCTCGATTG
TCCCCGATCCAGCGATGGAAAGATCCGATCCTCCTTCACCGAAGCGTCAGAAGAAGACGG
AGGAAGAAACAACCCGCTATAATGGCCGTCCCGAGGGTTTCGAATCCGACGAGTGCTCCG
ACGAGGAGATGGAGTTGTTCGACCAAGAGTTGGATAGGAGCGGCGGTTATGAAATCGACT
TCAAGAAATTTCGTTACTGTTTTGGTTGGAAATCACTGGATCTGGACGATAGTACGATGG
TTGATGAGCCTGAAACTAACAGAGATTTCGTAGCTACTTTGGTGAACCTCGCTCTCACCA
AAACAAACACAGAAAGAGGAACAAGTTTGGAACTGGGTAAGATTTTGATTGCAAACTATC
ATCCATCCTGCGCAGTCACTTTCTACCTCTCATTCGAAGTCAATGATCCTTCAGATGGTA
ATCAGACAAAACCCTATCGTGCAGTGGTTCGCTACTTCCCGGGAGACATTGAAGTTGTCT
CTTGCAATCCCAAAGAGTGACTTCTCTCAGAGATCCACCACCAGTCTCATGGATTTGAAG
ACTGAAGAATGGTTT*GTTTGTCTATGTATCCTACTCTATGAAATTTGCTATGCTAGCTT
AAAAGGG

QA 3 669 3 669
DS 

RD RR2GH33TF 622 0 0
GG
GCATAGTCTCAGTCTCGATTGTCCCCGATCCAGCGATGGAAAGATCCGATCCTTCTTCAC
CGAAGCGTCAGAAGAAGACGGAGGAAGAAACAACCCGCTATAATGGCCGTCCCGAGGGTT
TCGAATCCGACGAGTGCTCCGACGAGGAGATGGAGTTGTTCGACCAAGAGTTGGATAGGA
GCGGCGGTTATGAAATCGACTTCAAGAAATTTCGTTACTGTTTTGGTTGGAAATCACTGG
ATCTGGACGATAGTACAATGGTTGATGAGCCTGAAACTAACAGAGATTTCGTAGCTACTT
TGGTGAACCTCGCTCTCACCAAAACAAACACAGAAAGAGGAACAAGTTTGGAACTGGGCA
AGATTTTGATTGCAAACTATCATCCATCCTGCGCAGTCACTTTCTACCTCTCATTCGAAG
TCAATGATCCTTCAGATGGTAATCAGACAAAACCCTATCGTGCAGTGGTTCGCTACTTCC
CGGGAGACATTGAAGTTGTCTCTTGCAATCCCAAAGAGTGACTTCTCTCAGAGATCCACC
ACCAGTCTCATGGATTTGAAGACTGAAGAATGGTTT*GTTTGTCTATGTATCCTACTCTA
TGAAATTTGCTATGCTAGCT

QA 3 622 3 622
DS 

RD RR2CG32TF 678 0 0
GG
AATAAGAATTGGGGAGAAAATTAGGGCTCTTTTTCTCTCGCATAGTCTCAGTCTCGATTG
TCCCCGATCCAGCGATGGAAAGATCCGATCCTCCTTCACCGAAGCGTCAGAAGAAGACGG
AGGAAGAAACAACCCGCTATAATGGCCGTCCCGAGGGTTTCGAATCCGACGAGTGCTCCG
ACGAGGAGATGGAGTTGTTCGACCAAGAGTTGGATAGGAGCGGCGGTTATGAAATCGACT
TCAAGAAATTTCGTTACTGTTTTGGTTGGAAATCACTGGATCTGGACGATAGTACGATGG
TTGATGAGCCTGAAACTAACAGAGATTTCGTAGCTACTTTGGTGAACCTCGCTCTCACCA
AAACAAACACAGAAAGAGGAACAAGTTTGGAACTGGGTAAGATTTTGATTGCAAACTATC
ATCCATCCTGCGCAGTCACTTTCTACCTCTCATTCGAAGTCAATGATCCTTCAGATGGTA
ATCAGACAAAACCCTATCGTGCAGTGGTTCGCTACTTCCCGGGAGACATTGAAGTTGTCT
CTTGCAATCCCAAAGAGTGACTTCTCTCAGAGATCCACCACCAGTCTCATGGATTTGAAG
ACTGAAGAATGGTTT*GTTTGTCTATGTATCCTACTCTATGAAATTTGCTATGCTAGCTT
AAAAGGGAAAAAAAAA

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR2A890TF 720 0 0
CTCTCGCATAGTCTCAGTCTCGATTGTCCCCGATCCAGCGATGGAAAGATCCGATCCTCC
TTCACCGAAGCGTCAGAAGAAGACGGAGGAAGAAACAACCCGCTATAATGGCCGTCCCGA
GGGTTTCGAATCCGACGAGTGCTCCGACGAGGAGGTGGAGTTGTTCGACCAAGAGTTGGA
TAGGAGCGGCGGTTATGAAATCGACTTCAAGAAATTTCGTTACTGTTTTGGTTGGAAATC
ACTGGATCTGGACGATAGTACAATGGTTGATGAGCCTGAAACTAACAGAGATTTCGTAGC
TACTTTGGTGAACCTCGCTCTCACCAAAACAAACACAGAAAGAGGAACAAGTTTGGAACT
GGGCAAGATTTTGATTGCAAACTATCATCCATCCTGCGCAGTCACTTTCTACCTCTCATT
CGAAGTCAATGATCCTTCAGATGGTAATCAGACAAAACCCTATCGTGCAGTGGTTCGCTA
CTTCCCGGGAGACATTGAAGTTGTCTCTTGCAATCCCAAAGAGTGACTTCTCTCAGAGAT
CCACCACCAGTCTCATGGATTTGAAGACTGAAGAATGGTTTTGTTTGTCTATGTATCCTA
CTCTATGAAATTTGCTATGCTAGCTTAAAAGGGAAAAAAAAAAAGAAGAGTTTCCAGCTT
CTTCTTTTTTCCTCTGTTTATGTATCAACTTGTTTGATATTTCTTCTTTCGGCTATT
GTT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2CK49JQ 743 0 0
TCCAGCGATGGAAAGATCCGATCCTCCTTCACCGAAGCGTCAGAAGAAGACGGAGGAAGA
AACAACCCGCTATAATGGCCGTCCCGAGGGTTTCGAATCCGACGAGTGCTCCGACGAGGA
GATGGAGTTGTTCGACCAAGAGTTGGATGGGAGCGGCGGTTATGAAATCGACTTCAAGAA
ATTTCGTTACTGTTTTGGTTGGAAATCACTGGATCTGGACGATAGTACAATGGTTGATGA
GCCTGAAACTAACAGAGATTTCGTAGCTACTTTGGTGAACCTCGCTCTCACCAAAACAAA
CACAGAAAGAGGAACAAGTTTGGAACTGGGCAAGATTTTGATTGCAAACTATCATCCATC
CTGCGCAGTCACTTTTTACCTCTCATTCGAAGTCAATGATCCTTCAGATGGTAATCAGAC
AAAACCCTATCGTGCAGTGTTTCGCTACTTCCCGGGAGACATTGAAGTTGTCTCTTGCAA
TCCCAAAGAGTGACTTCTCTCAGAGATCCACCACCAGTCTCATGGATTTGAAGACTGAAG
AATGGTTT*GTTTGTCTATGTATCCTACTCTATGAAATTTGCTATGCTAGTTTAAAAGGG
AAAAAAAAA**GAAGAGTTTCCAGCTTCTTCTTTTTTCCTCTGTTTATGTATCAACTTGT
TTGATATTTCTTCTTTCGGCTATTGTTGTTTTAAGTGTATTGCATAACCTTAAGTTATAT
GAATAATTTACTAGTTACTTTTT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2EA36JQ 676 0 0
TATAATGGCCGTCCCGAGGGTTTCGAATCCGACGAGTGCTCCGACGAGGAGATGGAGTTG
TTCGACCAAGAGTTGGATAGGAGCGGCGGTTATGAAATCGACTTCAAGAAATTTCGTTAC
TGTTTTGGTTGGAAATCACTGGATCTGGACGATAGTACAATGGTTGATGAGCCTGAAACT
AACAGAGATTTCGTAGCTACTTTGGTGAACCTCGCTCCCACCAAAACAAACACAGAAAGA
GGAACAAGTTTGGAACTGGGCAAGATTTTGATTGCAAACTATCATCCATCCTGCGCAGTC
ACTTTCTACCTCTCATTCGAAGTCAATGATCCTTCAGATGGTAATCAGACAAAACCCTAT
CGTGCAGTGGTTCGCTACTTCCCGGGAGACATTGAAGTTGTCTCTTGCAATCCCAAAGAG
TGACTTCTCTCAGAGATCCACCCCCAGTCTCATGGATTTGAAGACTGAAGAATGGTTT*G
TTTGTCTATGTATCCTACTCTATGAAATTTGCTATGCTAGCTTAAAAGGGAAAAAAAAAA
AGAAGAGTTTCCAGCTTCTTCTTTTTTCCTCTGTTTATGTATCAACTTGTTTGATATTTC
TTCTTTCGGCTATTGTTGTTTTAAGTGTATTGCATAACCTTAAGTTATATGAATAATTTA
CTAGTTACTTTTTACT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2GH33JQB 632 0 0
ACGAGGAGATGGAGTTGTTCGACCAAGAGTTGGATAGGAGCGGCGGTTATGAAATCGACT
TCAAGAAATTTCGTTACTGTTTTGGTTGGAAATCACTGGATCTGGACGATAGTACAATGG
TTGATGAGCCTGAAACTAACAGAGATTTCGTAGCTACTTTGGTGAACCTCGCTCTCACCA
AAACAAACACAGAAAGAGGAACAAGTTTGGAACTGGGCAAGATTTTGATTGCAAACTATC
ATCCATCCTGCGCAGTCACTTTCTACCTCTCATTCGAAGTCAATGATCCTTCAGATGGTA
ATCAGACAAAACCCTATCGTGCAGTGGTTCGCTACTTCCCGGGAGACATTGAAGTTGTCT
CTTGCAATCCCAAAGAGTGACTTCTCTCAGAGATCCACCACCAGTCTCATGGATTTGAAG
ACTGAAGAATGGTTT*GTTTGTCTATGTATCCTACTCTATGAAATTTGCTATGCTAGCTT
AAAAGGGAAAAAAAAA**GAAGAGTTTCCAGCTTCTTCTTTTTTCCTCTGTTTATGTATC
AACTTGTTTGATATTTCTTCTTTCGGCTATTTTTGTTTTAAGTGTATTGCATAACCTTAA
GTTATATGAATAATTTACTAGTTACTTTTT
AC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 2 10

CO CL536Contig1 650 2 8 U
GGAATCGGTGTGCTTCGATGGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCCGTAGCAGTCATGA
TGCCACGTGTCTCCGCCCGCTTCTCAGCGGTTCCTTACCTTCCTCCTCGCTCTTTTGGCC
GATCCTCTTTCACTGTTCCGGTGAAGCTACTTTCAGGGAATGGTTTACACAAGGTTGAAT
CGATGAAGACGAGAGCTTCTTCATCAGAAGATACATCAGCATCCATTGACACCAACGAGA
TCTTCACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAGTCAACTGTAATAATAT
ATGGAGGAGGAGCTGTTGTTGCTGTTTGGTTATCTTCCATTGTTGTTGGTGCCATCAACT
CTGTCCCTCTGCTTCCAAAGGTGATGGAACTTGTTGGTCTTGGGTACACAGGATGGTTCG
TCTACAGATACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCT
TGAAGAAGAAGATTGCAGGGACCGAATAGATTGTTTCAAAAAATATAAAACCAGCTTTCT
CTATGGGATTTTCCTGTAATTTATACAATATATATATATATTTCAACAATGTATCTTCTG
CGGTCTGAAACTATTCTCTTAGATCCACCGTCAGTGAATGCAATTTAGTA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT18TF U 1
AF RR2E123TF U 2
BS 1 52 RR2FT18TF
BS 53 53 RR2E123TF
BS 54 356 RR2FT18TF
BS 357 357 RR2E123TF
BS 358 364 RR2FT18TF
BS 365 365 RR2E123TF
BS 366 624 RR2FT18TF
BS 625 650 RR2E123TF

RD RR2FT18TF 624 0 0
GGAATCGGTGTGCTTCGATGGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCCGTAGCGGTCATGA
TGCCACGTGTCTCCGCCCGCTTCTCAGCGGTTCCTTACCTTCCTCCTCGCTCTTTTGGCC
GATCCTCTTTCACTGTTCCGGTGAAGCTACTTTCAGGGAATGGTTTACACAAGGTTGAAT
CGATGAAGACGAGAGCTTCTTCATCAGAAGATACATCAGCATCCATTGACACCAACGAGA
TCTTCACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAGTCAACTGTAATAATAT
ATGGAGGAGGAGCTGTTGTTGCTGTTTGGTTATCTTCCATTGTTGTTGGTGCCATCGACT
CTGTTCCTCTGCTTCCAAAGGTGATGGAACTTGTTGGTCTTGGGTACACAGGATGGTTCG
TCTACAGATACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCT
TGAAGAAGAAGATTGCAGGGACCGAATAGATTGTTTCAAAAAATATAAAACCAGCTTTCT
CTATGGGATTTTCCTGTAATTTATACAATATATATATATATTTCAACAATGTATCTTCTG
CGGTCTGAAACTATTCTCTTAGAT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2E123TF 649 0 0
GG
ATCGGTGTGCTTCGATGGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCCGTAGCAGTCATGATGC
CACGTGTCTCCGCCCGCTTCTCAGCGGTTCCTTACCTTCCTCCTCGCTCTTTTGGCCGAT
CCTCTTTCACTGTTCCGGTGAAGCTACTTTCAGGGAATGGTTTACACAAGGTTGAATCGA
TGAAGACGAGAGCTTCTTCATCAGAAGATACATCAGCATCCATTGACACCAACGAGATCT
TCACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAGTCAACTGTAATAATATATG
GAGGAGGAGCTGTTGTTGCTGTTTGGTTATCTTCCATTGTTGTTGGTGCCATCAACTCTG
TCCCTCTGCTTCCAAAGGTGATGGAACTTGTTGGTCTTGGGTACACAGGATGGTTCGTCT
ACAGATACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGA
AGAAGAAGATTGCAGGGACCGAATAGATTGTTTCAAAAAATATAAAACCAGCTTTCTCTA
TGGGATTTTCCTGTAATTTATACAATATATATATATATTTCAACAATGTATCTTCTGCGG
TCTGAAACTATTCTCTTAGATCCACCGTCAGTGAATGCAATTTAGTA

QA 3 649 3 649
DS 



CO CL536Contig2 687 8 4 U
TTTTTTTTTGGATCTAAGAGAATAGTTTCAGACCGCAGAAGATACATTGTTGAAATATAT
ATATATATATTGTATAACATATCATATTACAGGAAAATCCCATAGAGAAAGCTGGTTTAT
ATTTTTTGAAAGAATCTATTCGGTCCCAGCGATCTTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTC
AGCCAACTCCTTTCTGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTGTAGACGAACCATCCTGTGTA
CCCAAGACCAACAAGTTCCATCACCTTTGGAAGCAGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAAC
AACAATGGAAGATAACCAAACAGCAACAACAGCTCCTCCTCCATAGATTATTACAGTTGA
CTTGTTTTCAAGACCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTGAAGATTTCGTTGGTGTCAAT
GGATGCTGATGTATCTTCTGACGAAGAAGCTCTCGTCTTCATCGATTCAACCTTGTGTAA
ACCATTCCCTGAAAGTAGCTTCACCGGAACAGTGAAAGAGGATCGGCCAAAAGAGCGAGG
AGGAAGGTAAGGAACGGCTGAGAAGCGGGCAGATACGGAATGGACACGTGGCATCATGAC
TGCCACAGAGGACGAAGCTGCTACTGTCATCGCCATAGAAGCACACCGATAATTTTTTCT
TCAGCTTCTTCTTTAATTTCTCCGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2GQ64JQ U 10
AF RR2GF27JQ U 43
AF RR2GP03TF C 1
AF RR2GQ64TF C 10
AF RR2GP03JQ U 10
AF RR2AP45JQ U 11
AF RR2GF27TF C 44
AF RR2AP45TF C 11
BS 1 9 RR2GP03TF
BS 10 564 RR2GQ64JQ
BS 565 658 RR2GP03JQ
BS 659 687 RR2AP45JQ

RD RR2GQ64JQ 555 0 0
GGATCTAAGAGAATAGTTTCAGACCGCAGAAGATACATTGTTGAAATATATATATATATA
TTGTATAACATATCATATTACAGGAAAATCCCATAGAGAAAGCTGGTTTATATTTTTTGA
AAGAATCTATTCGGTCCCAGCGATCTTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTC
CTTTCTGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTGTAGACGAACCATCCTGTGTACCCAAGACC
AACAAGTTCCATCACCTTTGGAAGCAGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAACAACAATGGA
AGATAACCAAACAGCAACAACAGCTCCTCCTCCATAGATTATTACAGTTGACTTGTTTTC
AAGACCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTGAAGATTTCGTTGGTGTCAATGGATGCTGA
TGTATCTTCTGACGAAGAAGCTCTCGTCTTCATCGATTCAACCTTGTGTAAACCATTCCC
TGAAAGTAGCTTCACCGGAACAGTGAAAGAGGATCGGCCAAAAGAGCGAGGAGGAAGGTA
AGGAACGGCTGAGAA

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2GF27JQ 517 0 0
TACATTGTTGAAATATATATATATATATTGTATAACATATCATATTACAGGAAAATCCCA
TAGAGAAAGCTGGTTTATATTTTTTGAAAGAATCTATTCGGTCCCAGCGATCTTCTTCTT
CAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTCCTTTCTGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTGTA
GACGAACCATCCTGTGTACCCAAGACCAACAAGTTCCATCACCTTTGGAAGCAGAGGAAC
AGAGTTGATGGCACCAACAACAATGGAAGATAACCAAACAGCAACAACAGCTCCTCCTCC
ATAGATTATTACAGTTGACTTGTTTTCAAGACCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTGAA
GATTTCGTTGGTGTCAATGGATGCTGATGTATCTTCTGACGAAAAAGCTCTCGTCTTCAT
CGATTCAACCTTGTGTAAACCATTCCCTGAAAGTAGCTTCACCGGAACAGTGAAAGAGGA
TCGGCCAAAAGAGCGAGGAGGAAGGTAAGGAACGGCT

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2GP03TF 651 0 0
TTTTTTTTTGGATCTAAGAGAATAGTTTCAGACCGCAGAAGATACATTGTTGAAATATAT
ATATATATATTGTATAACATATCATATTACAGGAAAATCCCATAGAGAAAGCTGGTTTAT
ATTTTTTGAAAGAATCTATTCGGTCCCAGCGATCTTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTC
AGCCAACTCCTTTCTGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTGTAGACGAACCATCCTGTGTA
CCCAAGACCAACAAGTTCCATCACCTTTGGAAGCAGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAAC
AACAATGGAAGATAACCAAACAGCAACAACAGCTCCTCCTCCATAGATTATTACAGTTGA
CTTGTTTTCAAGACCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTGAAGATTTCGTTGGTGTCAAT
GGATGCTGATGTATCTTCTGACGAAGAAGCTCTCGTCTTCATCGATTCAACCTTGTGTAA
ACCATTCCCTGAAAGTAGCTTCACCGGAACAGTGAAAGAGGATCGGCCAAAAGAGCGAGG
AGGAAGGTAAGGAACGGCTGAGAAGCGGGCAGATACGGAATGGACACGTGGCATCATGAC
TGCCACAGAGGACGAAGCTGCTACTGTCATCGCCATAGAAGCACACCGATA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2GQ64TF 642 0 0
GGATCTAAGAGAATAGTTTCAGACCGCAGAAGATACATTGTTGAAATATATATATATATA
TTGTATAACATATCATATTACAGGAAAATCCCATAGAGAAAGCTGGTTTATATTTTTTGA
AAGAATCTATTCGGTCCCAGCGATCTTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTC
CTTTCTGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTGTAGACGAACCATCCTGTGTACCCAAGACC
AACAAGTTCCATCACCTTTGGAAGCAGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAACAACAATGGA
AGATAACCAAACAGCAACAACAGCTCCTCCTCCATAGATTATTACAGTTGACTTGTTTTC
AAGACCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTGAAGATTTCGTTGGTGTCAATGGATGCTGA
TGTATCTTCTGACGAAGAAGCTCTCGTCTTCATCGATTCAACCTTGTGTAAACCATTCCC
TGAAAGTAGCTTCACCGGAACAGTGAAAGAGGATCGGCCAAAAGAGCGAGGAGGAAGGTA
AGGAACGGCTGAGAAGCGGGCAGATACGGAATGGACACGTGGCATCATGACTGCCACAGA
GGACGAAGCTGCTACTGTCATCGCCATAGAAGCACACCGATA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2GP03JQ 660 0 0
GGATCTAAGAGAATAGTTTCAGACCGCAGAAGATACATTGTTGAAATATATATATATATA
TTGTATAACATATCATATTACAGGAAAATCCCATAGAGAAAGCTGGTTTATATTTTTTGA
AAGAATCTATTCGGTCCCAGCGATCTTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTC
CTTTCTGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTGTAGACGAACCATCCTGTGTACCCAAGACC
AACAAGTTCCATCACCTTTGGAAGCAGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAACAACAATGGA
AGATAACCAAACAGCAACAACAGCTCCTCCTCCATAGATTATTACAGTTGACTTGTTTTC
AAGACCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTGAAGATTTCGTTGGTGTCAATGGATGCTGA
TGTATCTTCTGACGAAGAAGCTCTCGTCTTCATCGATTCAACCTTGTGTAAACCATTCCC
TGAAAGTAGCTTCACCGGAACAGTGAAAGAGGATCGGCCAAAAGAGCGAGGAGGAAGGTA
AGGAACGGCTGAAAAGCGGGCAGATACGGAATGGACACGTGGCATCATGACTGCCACAGA
GGACGAAGCTGCTACTGTCATCGCCATAGAAGCACACCGATAATTTTTT
TCTTCAGCTCC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2AP45JQ 677 0 0
GG
TCTAAGAGAATAGTTTCAGACCGCAGAAGATACATTGTTGAAATATATATATATATATTG
TATAACATATCATATTACAGGAAAATCCCATAGAGAAAGCTGGTTTATATTTTTTGAAAG
AATCTATTCGGTCCCAGCGATCTTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTCCTT
TCTGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTGTAGACGAACCATCCTGTGTACCCAAGACCAAC
AAGTTCCATCACCTTTGGAAGCAGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAACAACAATGGAAGA
TAACCAAACAGCAACAACAGCTCCTCCTCCATAGATTATTACAGTTGACTTGTTTTCAAG
ACCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTGAAGATTTCGTTGGTGTCAATGGATGCTGATGT
ATCTTCTGACGAAGAAGCTCTCGTCTTCATCGATTCAACCTTGTGTAAACCATTCCCTGA
AAGTAGCTTCACCGGAACAGTGAAAGAGGATCGGCCAAAAGAGCGAGGAGGAAGGTAAGG
AACGGCTGAGAAGCGGGCGGATACGGAGTGGACACGTGGCATCATGACTGCCACAGAGGA
CGAAGCTGCTACTGTCATCGCCATAGAAGCACACCGATAATTTTTTCTTCAGCTTCTTCT
TTAATTTCTCCGCCC

QA 3 677 3 677
DS 

RD RR2GF27TF 644 0 0
ACATTGTTGAAATATATATATATATATTGTATAACATATCATATTACAGGAAAATCCCAT
AGAGAAAGCTGGTTTATATTTTTTGAAAGAATCTATTCGGTCCCAGCGATCTTCTTCTTC
AAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTCCTTTCTGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTGTAG
ACGAACCATCCTGTGTACCCAAGACCAACAAGTTCCATCACCTTTGGAAGCAGAGGAACA
GAGTTGATGGCACCAACAACAATGGAAGATAACCAAACAGCAACAACAGCTCCTCCTCCA
TAGATTATTACAGTTGACTTGTTTTCAAGACCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTGAAG
ATTTCGTTGGTGTCAATGGATGCTGATGTATCTTCTGACGAAGAAGCTCTCGTCTTCATC
GATTCAACCTTGTGTAAACCATTCCCTGAAAGTAGCTTCACCGGAACAGTGAAAGAGGAT
CGGCCAAAAGAGCGAGGAGGAAGGTAAGGAACGGCTGAGAAGCGGGCGGATACGGAGTGG
ACACGTGGCATCATGACTGCCACAGAGGACGAAGCTGCTACTGTCATCGCCATAGAAGCA
CACCGATAATTTTTTCTTCAGCTTCTTCTTTAATTTCTCCGCCC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2AP45TF 677 0 0
GG
TCTAAGAGAATAGTTTCAGACCGCAGAAGATACATTGTTGAAATATATATATATATATTG
TATAACATATCATATTACAGGAAAATCCCATAGAGAAAGCTGGTTTATATTTTTTGAAAG
AATCTATTCGGTCCCAGCGATCTTCTTCTTCAAGGAATCAATATCCTCAGCCAACTCCTT
TCTGCTTGACTTGAAGAGAAGGTATCTGTAGACGAACCATCCTGTGTACCCAAGACCAAC
AAGTTCCATCACCTTTGGAAGCAGAGGAACAGAGTTGATGGCACCAACAACAATGGAAGA
TAACCAAACAGCAACAACAGCTCCTCCTCCATAGATTATTACAGTTGACTTGTTTTCAAG
ACCATCCCACTTTTCCTTCAAGTCTGTGAAGATTTCGTTGGTGTCAATGGATGCTGATGT
ATCTTCTGACGAAGAAGCTCTCGTCTTCATCGATTCAACCTTGTGTAAACCATTCCCTGA
AAGTAGCTTCACCGGAACAGTGAAAGAGGATCGGCCAAAAGAGCGAGGAGGAAGGTAAGG
AACGGCTGAGAAGCGGGCGGATACGGAGTGGACACGTGGCATCATGACTGCCACAGAGGA
CGAAGCTGCTACTGTCATCGCCATAGAAGCACACCGATAATTTTTTCTTCAGCTTCTTCT
TTAATTTCTCCGCCC

QA 3 677 3 677
DS 



AS 2 8

CO CL537Contig1 1232 4 12 U
GCTCTAAAATTGGTGAGGAAAATAGTTTCCTCTTTTACCATTTTTTGTTTAAAGAGTACA
GCGGCGATCAAAACACAAAAACACAAATCAAGAAGGAACTCATAACCAAAAGCTAATTTA
AGTTTCAAGAAAAAGAAGAACAACAAGCAACAACCTTCAAAGCCAATAACCCTTTATTCA
GAAAGGTATTAGGTCAACTTCATCAGCGGACCAATATCTTCCACTCTTCCCACCATAAAC
GACGCAAACCACAAGCAGAACCAAAAAGCTCTCCTCTCAGTACCTGTAGTGAGCAGGCTT
GTATGGTCCTTCAATGGGAATGCTGACGTAGTCAGATTGGTCCTTTGTGAGCTTAGTGAG
CTTAGCTCCAAGCTTGCCCAAGTGAAGAGCCGCAACCTTCTCATCCAAATGCTTGGGTAG
AACGTACACCTTCTTCTCGTACTTACCGCTCGACTTCTCATTCCAAAGCTCAAGCTGGGC
GATCACCTGGTTGGTGAAAGAGCAAGACATGACGAAACTCGGGTGACCAGTGGCACAACC
CAGGTTCATGAGACGACCCTCAGCGAGAACAATGATTCCGGACTTGGTGTCTGGGAAGAC
CCACCTGTCGGTCTGGGGCTTGATGGTGATACGCTTGACACCAGGGAAGGTCTCGAGACC
AAGCATGTCAATCTCGTTGTCAAAGTGACCAATGTTGCAGACGATGGCGTTGTTCTTCAT
CTTCCTCATGTGGTCAACCATAATGATGTCTTTGTTACCGGTGGTGGTGACAAAGATGTC
GGCTTCGGAGACGACATCCTCAAGGGTCAGAACCTGAAGTCCTTCCATCATAGCTTGTAA
AGCACAGATGGGATCGATCTCGGTGACAATGACTCTGGCACCAGCGGTCTTCATGGCAGC
GGCACAACCCTTTCCGACATCACCATATCCGCAAACAACGACAACCTTTCCGGCGATCAT
GACATCAGTGGCCCTCATGAGACCATCAGGTAGAGAGTGACGGCATCCGTACAAGTTGTC
GAACTTGCTCTTGGTGACGGAGTCGTTGACGTTAATGGCAGGGAACAAAAGAGCGCCAGT
CTCCTGCATCTGGTAAAGCCTCTTGACACCAGTGGTGGTCTCCTCAGAGACACCAACGAG
TCTCTCCTTCATCTTGTGGTACTTCTTAGGATCAACCTGAAGACCTTCCTTGATGATCGA
AAGCACGATCTGGAACTCAGGGTTATCGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP27JQ U 1
AF RR2C078JQ U 6
AF RR2C078TF C 305
AF RR2E433TF C 615
BS 1 317 RR2EP27JQ
BS 318 318 RR2C078JQ
BS 319 713 RR2EP27JQ
BS 714 714 RR2C078JQ
BS 715 736 RR2EP27JQ
BS 737 737 RR2C078JQ
BS 738 781 RR2EP27JQ
BS 782 787 RR2C078JQ
BS 788 788 RR2C078TF
BS 789 801 RR2C078JQ
BS 802 855 RR2C078TF
BS 856 1232 RR2E433TF

RD RR2EP27JQ 782 0 0
GCTCTAAAATTGGTGAGGAAAATAGTTTCCTCTTTTACCATTTTTTGTTTAAAGAGTACA
GCGGCGATCAAAACACAAAAACACAAATCAAGAAGGAACTCATAACCAAAAGCTAATTTA
AGTTTCAAGAAAAAGAAGAACAACAAGCAACAACCTTCAAAGCCAATAACCCTTTATTCA
GAAAGGTATTAGGTCAACTTCATCAGCGGACCAATATCTTCCACTCTTCCCACCATAAAC
GACGCAAACCACAAGCAGAACCAAAAAGCTCTCCTCTCAGTACCTGTAGTGAGCAGGCTT
GTATGGTCCTTCAATGG*AATGCTGACGTAGTCAGATTGGTCCTTTGTGAGCTTAGTGAG
CTTAGCTCCAAGCTTGCCCAAGTGAAGAGCCGCAACCTTCTCATCCAAATGCTTGGGTAG
AACGTACACCTTCTTCTCGTACTTACCGCTCGACTTCTCATTCCAAAGCTCAAGCTGGGC
GATCACCTGGTTGGTGAAAGAGCAAGACATGACGAAACTCGGGTGACCAGTGGCACAACC
CAGGTTCATGAGACGACCCTCAGCGAGAACAATGATTCCGGACTTGGTGTCTGGGAAGAC
CCACCTGTCGGTCTGGGGCTTGATGGTGATACGCTTGACACCAGGGAAGGTCTCGAGACC
AAGCATGTCAATCTCGTTGTCAAAGTGACCAATGTTGCAGACGATGGCGTTGT*CTTCAT
CTTCCTCATGTGGTCA*CCATAATGATGTCTTTGTTACCGGTGGTGGTGACAAAGATGTC
G
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2C078JQ 796 0 0
AAAATTGGTGAGGAAAATAGTTTCCTCTTTTACCATTTTTTGTTTAAAGAGTACAGCGGC
GATCAAAACACAAAAACACAAATCAAGAAGGAACTCATAACCAAAAGCTAATTTAAGTTT
CAAGAAAAAGAAGAACAACAAGCAACAACCTTCAAAGCCAATAACCCTTTATTCAGAAAG
GTATTAGGTCAACTTCATCAGCGGACCAATATCTTCCACTCTTCCCACCATAAACGACGC
AAACCACAAGCAGAACCAAAAAGCTCTCCTCTCAGTACCTGTAGTGAGCAGGCTTGTATG
GTCCTTCAATGGGAATGCTGACGTAGTCAGATTGGTCCTTTGTGAGCTTAGTGAGCTTAG
CTCCAAGCTTGCCCAAGTGAAGAGCCGCAACCTTCTCATCCAAATGCTTGGGTAGAACGT
ACACCTTCTTCTCGTACTTACCGCTCGACTTCTCATTCCAAAGCTCAAGCTGGGCGATCA
CCTGGTTGGTGAAAGAGCAAGACATGACGAAACTCGGGTGACCAGTGGCACAACCCAGGT
TCATGAGACGACCCTCAGCGAGAACAATGATTCCGGACTTGGTGTCTGGGAAGACCCACC
TGTCGGTCTGGGGCTTGATGGTGATACGCTTGACACCAGGGAAGGTCTCGAGACCAAGCA
TGTCAATCTCGTTGTCAAAGTGACCAATGTTGCAGACGATGGCGTTGTTCTTCATCTTCC
TCATGTGGTCAACCATAATGATGTCTTTGTTACCGGTGGTGGTGACAAAGATGTCGGCTT
CG*AGACGACATCCTC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2C078TF 551 0 0
GGTCCTTCAATGGGAATGCTGACGTAGTCAGATTGGTCCTTTGTGAGCTTAGTGAGCTTA
GCTCCAAGCTTGCCCAAGTGAAGAGCCGCAACCTTCTCATCCAAATGCTTGGGTAGAACG
TACACCTTCTTCTCGTACTTACCGCTCGACTTCTCATTCCAAAGCTCAAGCTGGGCGATC
ACCTGGTTGGTGAAAGAGCAAGACATGACGAAACTCGGGTGACCAGTGGCACAACCCAGG
TTCATGAGACGACCCTCAGCGAGAACAATGATTCCGGACTTGGTGTCTGGAAAGACCCAC
CTGTCGGTCTGGGGCTTGATGGTGATACGCTTGACACCAGGGAAGGTCTCGAGACCAAGC
ATGTCAATCTCGTTGTCAAAGTGACCAATGTTGCAGACGATGGCGTTGTTCTTCATCTTC
CTCATGTGGTCAACCATAATGATGTCTTTGTTACCGGTGGTGGTGACAAAGATGTCGGCT
TCGGAGACGACATCCTCAAGGGTCAGAACCTGAAGTCCTTCCATCATAGCTTGTAAAGCA
CAGATGGGATC

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2E433TF 618 0 0
GGGGCTTGATGGTGATACGCTTGACACCAGGGAAGGTCTCGAGACCAAGCATGTCAATCT
CGTTGTCAAAGTGACCAATGTTGCAGACGATGGCGTTGTTCTTCATCTTCCTCATGTGGT
CAACCATGATGATGTCTTTGTTACCGGTGGTGGTGACAAAGATGTCAGCTTCGGAGACGA
CATCCTCAAGGGTGAGAACTTGAAGTCCTTCCATCATAGCTTGTAAAGCACAGATGGGAT
CGATCTCGGTGACAATGACTCTGGCACCAGCGGTCTTCATGGCAGCGGCACAACCCTTTC
CGACATCACCATATCCGCAAACAACGACAACCTTTCCGGCGATCATGACATCAGTGGCCC
TCATGAGACCATCAGGTAGAGAGTGACGGCATCCGTACAAGTTGTCGAACTTGCTCTTGG
TGACGGAGTCGTTGACGTTAATGGCAGGGAACAAAAGAGCGCCAGTCTCCTGCATCTGGT
AAAGCCTCTTGACACCAGTGGTGGTCTCCTCAGAGACACCAACGAGTCTCTCCTTCATCT
TGTGGTACTTCTTAGGATCAACCTGAAGACCTTCCTTGATGATCGAAAGCACGATCTGGA
ACTCAGGGTTATCGGTCC

QA 1 618 1 618
DS 



CO CL537Contig2 710 4 19 U
GCCATCGTCTGCAACATTGGTCACTTTGACAACGAGATTGACATGCTTGGTCTCGAGACC
TTCCCTGGTGTCAAGCGTATCACCATCAAGCCCCAGACCGACAGGTGGGTCTTCCCAGAC
ACCAAGTCCGGAATCATTGTTCTGGCTGAGGGTCGTCTCATGAACTTGGGTTGTGCCACT
GGTCACCCGAGTTTCGTCATGTCTTGCTCTTTCACCAACCAGGTGATCGCCCAGCTTGAG
CTTTGGAATGAGAAGTCGAGCGGTAAGTACGAGAAGAAGGTGTACGTTCTACCCAAGCAT
TTGGATGAGAAGGTTGCGGCTCTTCACTTGGGCAAGCTTGGAGCTAAGCTCACTAAGCTC
ACAAAGGACCAATCTGACTACGTCAGCATTCCCGTCGAAGGACCATACAAGCCTGCTCAC
TACAGGTACTGAGAGGAGAGCTCTTTGGTTCTGCTTGTGGTTTGTGTCGTTTATGGTGGG
AAGAGTGGAAGATATTGGTCCGCTGATGAAGTTGACCTAATTTCATTCTGAATAAAGGGT
TATTATTGGCTTTGATGGTTGTTGCTTGTTGTTCTTCTTTTTCTTCAAACTTAATTTAGC
TTTT*GGTTATCAGTTCCTTCTTGATTTGTTATTGTGTTTTGATCGCCGCTGTACTCTTT
AAACGAAAAATGGTAAAAGAGGAAACTATTGTCCTCACCAATTTTAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H639TF U 1
AF RR2EI23TF U 51
AF RR2EE24JQ C 88
AF RR2E433JQ C 388
BS 1 585 RR2H639TF
BS 586 586 RR2EI23TF
BS 587 604 RR2H639TF
BS 605 605 RR2EE24JQ
BS 606 611 RR2H639TF
BS 612 612 RR2EE24JQ
BS 613 622 RR2H639TF
BS 623 623 RR2EE24JQ
BS 624 631 RR2H639TF
BS 632 632 RR2E433JQ
BS 633 641 RR2H639TF
BS 642 642 RR2EE24JQ
BS 643 645 RR2H639TF
BS 646 646 RR2EE24JQ
BS 647 649 RR2H639TF
BS 650 650 RR2EE24JQ
BS 651 658 RR2H639TF
BS 659 699 RR2EE24JQ
BS 700 710 RR2E433JQ

RD RR2H639TF 658 0 0
GCCATCGTCTGCAACATTGGTCACTTTGACAACGAGATTGACATGCTTGGTCTCGAGACC
TTCCCTGGTGTCAAGCGTATCACCATCAAGCCCCAGACCGACAGGTGGGTCTTCCCAGAC
ACCAAGTCCGGAATCATTGTTCTGGCTGAGGGTCGTCTCATGAACTTGGGTTGTGCCACT
GGTCACCCGAGTTTCGTCATGTCTTGCTCTTTCACCAACCAGGTGATCGCCCAGCTTGAG
CTTTGGAATGAGAAGTCGAGCGGTAAGTACGAGAAGAAGGTGTACGTTCTACCCAAGCAT
TTGGATGAGAAGGTTGCGGCTCTTCACTTGGGCAAGCTTGGAGCTAAGCTCACTAAGCTC
ACAAAGGACCAATCTGACTACGTCAGCATTCCCGTCGAAGGACCATACAAGCCTGCTCAC
TACAGGTACTGAGAGGAGAGCTCTTTGGTTCTGCTTGTGGTTTGTGTCGTTTATGGTGGG
AAGAGTGGAAGATATTGGTCCGCTGATGAAGTTGACCTAATTTCATTCTGAATAAAGGGT
TATTATTGGCTTTGATGGTTGTTGCTTGTTGTTCTTCTTTTTCTTGAAACTTAATTTAGC
TTTTTGGTTATGAGTTCCTTCTCGATTTGTTTTTGTGTTTTAATCACCGTTGTACTCT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2EI23TF 552 0 0
G
CTCGAGACCTTCCCTGGTGTCAAGCGTATCACCATCAAGCCCCAGACCGACAGGTGGGTC
TTCCCAGACACCAAGTCCGGAATCATTGTTCTGGCTGAGGGTCGTCTCATAAACTTGGGT
TGTGCCACTGGTCACCCGAGTTTCGTCATGTCTTGCTCTTTCACCAACCAGGTGATCGCC
CAGCTTGAGCTTTGGAATGAGAAGTCGAGCGGTAGGTACGAGAAGAAGGTGTACGTTCTA
CCCAAGCATTTGGATGAGAAGGTTGCGGCTCTTCACTTGGGCAAGCTTGGAGCTAAGCTC
ACTAAGCTCACAAAGGACCAATCTGACTACGTCAGCATTCCCGTCGAAGGACCATACAAG
CCTGCTCACTACAGGTACTGAGAGGAGAGCTCTTTGGTTCTGCTTGTGGTTTGCGTCGTT
TATGGTGGGAAGAGTGGAAGATATTGGTCCGCTGATGAAGTTGACCTAATTTCATTCTGA
ATAAAGGGTTATTATTGGCTTTGATGGTTGTTGCTTGTTGTTCTTCTTTTTCTTCAAACT
TAATTTAGCTT

QA 2 552 2 552
DS 

RD RR2EE24JQ 612 0 0
G
AGCCCCAGACCGACAGGTGGGTCTTCCCAGACACCAAGTCCGGAATCATTGTTCTCGCTG
AGGGTCGTCTCATGAACTTGGGTTGTGCCACTGGTCACACGAGTTTCGTCATGTCTTGCT
CTTTCACCAACCAGGTGATCGCCCAGCTTGAGCTTTGGAATGAGAAGTCGAGCGGTAAGT
ACGAGAAGAAGGTGTACGTTCTACCCAAGCATTTGGATGAGAAGGTTGCGGCTCTTCACT
TGGGCAAGCTTGGAGCTAAGCTCACTAAGCTTACAAAGGACCAATCTGACTACGTCAGCA
TTCCCGTCGAAGGACCATACAAGCCTGCTCACTACAGGTACTGAGAGGAGAGCTGTTTGG
TTCTGCTTGTGGTTTGTGTCGTTTATGGTGGGAAGAGTGGAAGATATTGGTCCGCTGATG
AAGTTGACCTAATTTCATTCTGAATAAAGGGTTATTATTGGCTTTGATGGTTGTTGCTTG
TTGTTCTTCTTTTTCTTCAAACTTAATTTAGCTTTT*GGTTATCAGTTCCTTCTTGATTT
GTTGTTGTGTTTTGATCGCCGCTGTACTCTTTAAACGAAAAATGGTAAAAGAGGAAACTA
TTGTCCTCACC

QA 2 612 2 612
DS 

RD RR2E433JQ 323 0 0
ATTCCCGTGGAAGGACCATACAAGCCTGCTCATTACAGGTATTGAGAGGAGAGCTGTTTG
GTTCTGCTTGTGGTTTGTGTCGTTTATGGTGGGAAGAGTGGAAGATATTGGTCCGCTGAT
GAAGTTGACCTAATTTCATTCTGAATAAAGGGTTATTATTGGCTTTGATGGTTGTTGCTT
GTTGTTCTTCTTTTTCTTCAAACTTAATTTAGCTTTT*GGTTATCAGTTCCTTCTTGATT
TGTTATTGTGTTTTGATCGCCGCTGTACTCTTTAAACGAAAAATGGTAAAAGAGGAAACT
ATTGTCCTCACCAATTTTAGAGC

QA 1 323 1 323
DS 



AS 1 10

CO CL538Contig1 690 10 6 U
GGATTCATCACTTCTCCATACAACAAAATATTCCAAACAATTCGAAAATGGCTTCCAAGG
CATTAGTTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCGACAT
CCGAAGAGCGGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTGACCATGACCAAT
ATGGTGGTGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGTTACAACGGAGGGGGAGGTTACAACGGAG
GAGGAGGATACAATGGAGGCGGAGGATACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGAT
ACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGATACAACGGAGGAGGCCGAGGAGGAGGTT
ACTGCCGCCATGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAGGTGTTGCTCATATG
CCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGGTAATGTATTAACCACCAC
CATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATCGTGGTGTGTTTGTAATGAA
TAATGATGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTAAGAGGCCAAATTATGAGAA
TAAAGTTTGATTATGTAATGTCATTGCGTTTGAGTTGTTATCTTTCGTGGCTGTCATAAT
AAAATCGTTTGTAGTTTATGATATTCACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 45 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 25 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX40TF U 1
AF RR2C551JQ C 124
AF RR2GL10TF U 57
AF RR2DX40JQ C 294
AF RR2F326TF U 5
AF RR2GL10JQ C 162
AF RR2GL29TF U 5
AF RR2GL29JQ C 286
AF RR2GT96TF U 5
AF RR2C551TF U 11
BS 1 109 RR2DX40TF
BS 110 110 RR2F326TF
BS 111 419 RR2DX40TF
BS 420 420 RR2F326TF
BS 421 560 RR2DX40TF
BS 561 690 RR2F326TF

RD RR2DX40TF 560 0 0
GGATTCATCACTTCTCCATACAACAAAATATTCCAAACAATTCGAAAATGGCTTCCAAGG
CATTAGTTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTCGCCGCGACAT
CCGAAGAGCGGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTGACCATGACCAAT
ATGGTGGTGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGTTACAACGGAGGGGGAGGTTACAACGGAG
GAGGAGGATACAATGGAGGCGGAGGATACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGAT
ACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGATACAACGGAGGAGGCCGAGGAGGAGGTT
ACTGCCGCCATGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAGGTGTTGCTCATATA
CCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGGTAATGTATTAACCACCAC
CATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATCGTGGTGTGTTTGTAATGAA
TAATGATGTAAGTGACTTTT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2C551JQ 462 0 0
AAGAGCGGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTGACCATGACCAATATG
GTGGTGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGTTACAACGGAGGGGGAGGTTACAACGGAGGAG
GAGGATACAATGGAGGCGGAGGATACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGATACA
ACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGATACAACGGAGGAGGCCGAGGAGGAGGTTACT
GCCGCCATGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAGGTGTTGCTCATATGCCG
GAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGGTAATGTATTAACCCCCCCCAT
ATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATCGTGGTGTGTTTGTAATGAATAA
TGATGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTAAGAG

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2GL10TF 529 0 0
G
AGGCATTAGTTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCGA
CATCCGAAGAGCGGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTGACCATGACC
AATATGGTGGTGGTGGCCGCGGTGGCGATGGAGGTTACAACGGAGGGGGAGGTTACAACG
GAGGAGGAGGATACAATGGAGGCGGAGGATACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGAG
GATACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGATACAACGGAGGAGGCCGAGGAGGAG
GTTACTGCCGCCATGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAGGTGTTGCTCAT
ATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGGTAATGTATTAACCAC
CACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATCGTGGTGTGTTTGTAAT
GAATAATGATGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTAAGAG

QA 2 529 2 529
DS 

RD RR2DX40JQ 364 0 0
GGAGGATACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGATACAACGGAGGAGGCCGAGGA
GGAGGTTACTGCCGCCATGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAGGTGTTGC
TCATATACCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGGTAATGTATTAA
CCCCCCCCATATATGCAGTTATGTGTTTTTATGAGTACGAAAACCATCGTGGTGTGTTTG
TAATGAATAATGATGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTAAGAGGCCAAATT
ATGAGAATAAAGTTTGATTATGTAATGTCATTGCGTTTGAGTTGTTATTTTTCGTGGCTG
TCAT

QA 1 364 1 364
DS 

RD RR2F326TF 686 0 0
GG
ATCACTTCTCCATACAACAAAATATTCCAAACAATTCGAAAATGGCTTCCAAGGCATTAG
TTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCGACATCCGAAG
AGCGGTCATTGAGGTCAGAGAGTAAGGACACCTTACAACCTGACCATGACCAATATGGTG
GTGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGTTACAACGGAGGGGGAGGTTACAGCGGAGGAGGAG
GATACAATGGAGGCGGAGGATACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGATACAACG
GAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGATACAACGGAGGAGGCCGAGGAGGAGGTTACTGCC
GCCATGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAGGTGTTGCTCATATGCCGGAG
AAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGGTAATGTATTAACCACCACCATATA
TGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATCGTGGTGTGTTTGTAATGAATAATGA
TGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTAAGAGGCCAAATTATGAGAATAAAGT
TTGATTATGTAATGTCATTGCGTTTGAGTTGTTATCTTTCGTGGCTGTCATAATAAAATC
GTTTGTAGTTTATGATATTCACTT

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR2GL10JQ 521 0 0
CAACCTGACCATGACCAATATGGTGGTGGTGGCCGCGGTGGCGATGGAGGTTACAACGGA
GGGGGAGGTTACAACGGAGGAGGAGGATACAATGGAGGCGGAGGATACAACGGAGGAGGA
CACAATGGAGGAGGAGGATACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGATACAACGGA
GGAGGCCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCATGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGC
TCAAGGTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCG
GTAATGTATTAACCACCACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATC
GTGGTGTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTA
AGAGGCCAAATTATGAGAATAAAGTTTGATTATGTAATGTCATTGCGTTTGAGTTGTTAT
CTTTCGTGGCTGTCATAATAAAATCGTTTGTAGTTTATGA
T

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2GL29TF 685 0 0
GG
ATCACTTCTCCATACAACAAAATATTCCAAACAATTCGAAAATGGCTTCCAAGGCATTAG
TTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCGACATCCGAAG
AGCGGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTGACCATGACCAATATGGTG
GTGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGTTACAACGGAGGGGGAGGTTACAACGGAGGAGGAG
GATACAATGGAGGCAGAGGATACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGATACAACG
GAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGATACAACGGAGGAGGCCGAGGAGGAGGTTACTGCC
GCCATGGCTGCTGCTACGGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAGGTGTTGCTCATATGCCGGAG
AAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGGTAATGTATTAACCACCACCATATA
TGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATCGTGGTGTGTTTGTAATGAATAATGA
TGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTAAGAGGCCAAATTATGAGAATAAAGT
TTGATTATGTAATGTCATTGCGTTTGAGTTGTTATCTTTCGTGGCTGTCATAATAAAATC
GTTTGTAGTTTATGA
AAAAAAAA

QA 3 677 3 677
DS 

RD RR2GL29JQ 395 0 0
ATGGAGGAGGGGGATACAACGGAGGAGGACCCAATGGAGGAGGAGGATACAACGGAGGAG
GCCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCATGGCTGCTGCTACGGAGGTTACCGTGGCTGCTCAA
GGTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGGTAA
TGTATTAACCACCCCCATATATGCAGTTATGTGTTTTTATGAGTACGAAAACCATCGTGG
TGTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTAAGAG
GCCAAATTATGAGAATAAAGTTTGATTATGTAATGTCATTGCGTTTGAGTTGTTATCTTT
CGTGGCTGTCATAATAAAATCGTTTGTAGTTTATG

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR2GT96TF 662 0 0
GG
ATCACTTCTCCATACAACAAAATATTCCAAACAATTCGAAAATGGCTTCCAAGGCATTAG
TTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCGACATCCGAAG
AGCGGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTGACCATGACCAATATGGTG
GTGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGTTACAACGGAGGGGGAGGTTACAACGGAGGAGGAG
GATACAATGGAGGCGGAGGATACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGATACAACG
GAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGATACAACGGAGGAGGCCGAGGAGGAGGTTACTGCC
GCCATGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAGGTGTTGCTCATATGCCGGAG
AAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGGTAATGTATTAACCACCACCATATA
TGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATCGTGGTGTGTTTGTAATGAATAATGA
TGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTAAGAGGCCAAATTATGAGAATAAAGT
TTGATTATGTAATGTCATTGCGTTTGAGTTGTTATCTTTCGTGGCTGTCATAATAAAATC

QA 3 662 3 662
DS 

RD RR2C551TF 675 0 0
CTTCTCCATACAACAAAATATTCCAAACAATTCGAAAATGGCTTCCAAGGCATTAGTTTT
GTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCGACATCCGAAGAGCG
GTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTGACCATGACCAATATGGTGGTGG
TGGCCGCGGTGGCAATGGAGGTTACAACGGAGGGGGAGGTTACAACGGAGGAGGAGGATA
CAATGGAGGCGGAGGATACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGAGGATACAACGGAGG
AGGACACAATGGAGGAGGAGGATACAACGGAGGAGGCCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCA
TGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAGGTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGC
TGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGGTAATGTATTAACCACCACCATATATGCA
GTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATCGTGGTGTGTTTGTAATGAATAATGATGTA
AGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTAAGAGGCCAAATTATGAGAATAAAGTTTGA
TTATGTAATGTCATTGCTTTTGAGTTGTTATCTTTCGTGGCTGTCGTAATAAAATCGTTT
GTAGTTTATGA
CAAA

QA 1 671 1 671
DS 



AS 2 8

CO CL539Contig1 937 4 7 U
GGTAAAAGAATAACCCACTTGCCCCCAAAATTCAGAGGAACTATTATTAAGGTTACAACA
ACACACGACTCATAACCAGAACAAAAGCGTCTAAATATTTGTCAACAAGGTAAAAGAAAA
AGAAAGAAAAGATTTTGGTAATCTTTGAGGTACAGTTTTGGAGATTGGAATGTAACCAAG
TGCGACAAAGTAACAAGTTCTCATATATGATCATTGTGTTCATCCATGGAAGGAGCATCT
ATTTCAGGTGGTGCTCAAACAACGACGCCATCTCGAGCGCCGTCAAAGCAGTTTCAGCTC
CCTTGTTTCCGGCTTTGCCACCAGATCGATTCAGTGCCTGATCCATGTCCTCGCATGTCA
GTACACCAAATATGCATGAAACACCTGAATTGATGCCAGCAGAAAGTACTCCAGATGCAG
CAGAGTTGGCAACAGCATCATAATGTGTGGTATCTCCTCTTATCACAGCACCGATACATA
AAACAGCATCAAAGTTTCCTGATTTCCCAAGGTTTTGTGCAACAACCCCAATCTCAAAGC
TGCCAGGAACCCATATAACTTGGATGTCTTCTTCTCTGACTGAATACTTCTTGAAAGTTT
CAATGGCTCCTTCCAAAAGCAACTTCGTCACAACCTCGTTGAAACGAGCAACAACGATGG
CGAATCGAAGACCTTCCCCTCTCATAAGCGACCCGGTGACATGTCGAACAGCTTCCGTAA
CGAACGAAGAGCGTAGCTCCTTCTCTACAGCGAGTGGTGACGCGAAACCTGATGCGGCTG
AAGAGAATGATAGGCTACTGGATTTGATTACAGAAGAGAAACAAGACGATTGACGCGGGC
GGAGATGAGGGCGTGACGTCGGAGTTAGACGGAGGCACGGCGGCGATGCTAACGACTTCA
TCTGAGATGCGGTTAGTAGTAAGTGTCTAAGTGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2DP16JQ U 1
AF RR2DO50JQ U 74
AF RR2DO50TF C 389
AF RR2DP16TF C 389
BS 1 169 RR2DP16JQ
BS 170 170 RR2DO50JQ
BS 171 378 RR2DP16JQ
BS 379 379 RR2DO50JQ
BS 380 674 RR2DP16JQ
BS 675 856 RR2DO50JQ
BS 857 937 RR2DO50TF

RD RR2DP16JQ 674 0 0
GGTAAAAGAATAACCCACTTGCCCCCAAAATTCAGAGGAACTATTATTAAGGTTACAACA
ACACACGACTCATAACCAGAACAAAAGCGTCTAAATATTTGTCAACAAGGTAAAAGAAAA
AGAAAGAAAAGATTTTGGTAATCTTTGAGGTACAGTTTTGGAGATTGGAGTGTAACCAAG
TGCGACAAAGTAACAAGTTCTCATATATGATCATTGTGTTCATCCATGGAAGGAGCATCT
ATTTCAGGTGGTGCTCAAACAACGACGCCATCTCGAGCGCCGTCAAAGCAGTTTCAGCTC
CCTTGTTTCCGGCTTTGCCACCAGATCGATTCAGTGCCTGATCCATGTCCTCGCATGTCA
GTACACCAAATATGCATGGAACACCTGAATTGATGCCAGCAGAAAGTACTCCAGATGCAG
CAGAGTTGGCAACAGCATCATAATGTGTGGTATCTCCTCTTATCACAGCACCGATACATA
AAACAGCATCAAAGTTTCCTGATTTCCCAAGGTTTTGTGCAACAACCCCAATCTCAAAGC
TGCCAGGAACCCATATAACTTGGATGTCTTCTTCTCTGACTGAATACTTCTTGAAAGTTT
CAATGGCTCCTTCCAAAAGCAACTTCGTCACAACCTCGTTGAAACGAGCAACAACGATGG
CGAATCGAAGACCT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2DO50JQ 784 0 0
AACCAGAACAAAAGCGTCTAAATATTTGTCAACAAGGTAAAAGAAAAAGAAAGAAAAGAT
TTTGGTAATCTTTGAGGTACAGTTTTGGAGATTGGAATGTAACCAAGTGCGACAAAGTAA
CAAGTTCTCATATATGATCATTGTGTTCATCCATGGAAGGAGCATCTATTTCAGGTGGTG
CTCAAACAACGACGCCATCTCGAGCGCCGTCAAAGCAGTTTCAGCTCCCTTGTTTCCGGC
TTTGCCACCAGATCGATTCAGTGCCTGATCCATGTCCTCGCATGTCAGTACACCAAATAT
GCATGAAACACCTGAATTGATGCCAGCAGAAAGTACTCCAGATGCAGCAGAGTTGGCAAC
AGCATCATAATGTGTGGTATCTCCTCTTATCACAGCACCGATACATAAAACAGCATCAAA
GTTT**TGATTTCCCAAGGTTTTGTGCAACAACCCCAATCTCAAAGCTGCCAGGAACCCA
TATAACTTGGATGTCTTCTTCTCTGACTGAATACTTCTTGAAAGTTTCAATGGCTCCTTC
CAAAAGCAACTTCGTCACAACCTCGTTGAAACGAGCAACAACGATGGCGAATCGAAGACC
TTCCCCTCTCATAAGCGACCCGGTGACATGTCGAACAGCTTCCGTAACGAACGAAGAGCG
TAGCTCCTTCTCTACAGCGAGTGGTGACGCGAAACCTGATGCGGCTGAAGAGAATGATAG
GCTACTGGATTTGATTACAGAAGAGAAACAAGACGATTGACGCGGGCGGAGATGAGGGCG
TGA
C

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2DO50TF 549 0 0
ATTGATGCCAGCAGAAAGTACTCCAGATGCAGCAGAGTTGGCAACAGCATCATAATGTGT
GGTATCTCCTCTTATCACAGCACCGATACATAAAACAGCATCAAAGTTT**TGATTTCCC
AAGGTTTTGTGCAACAACCCCAATCTCAAAGCTGCCAGGAACCCATATAACTTGGATGTC
TTCTTCTCTGACTGAATACTTCTTGAAAGTTTCAATGGCTCCTTCCAAAAGCAACTTCGT
CACAACCTCGTTGAAACGAGCAACAACGATGGCGAATCGAAGACCTTCCCCTCTCATAAG
CGACCCGGTGACATGTCGAACAGCTTCCGTAACGAACGAAGAGCGTAGCTCCTTCTCTAC
AGCGAGTGGTGACGCGAAACCTGATGCGGCTGAAGAGAATGATAGGCTACTGGATTTGAT
TACAGAAGAGAAACAAGACGATTGACGCGGGCGGAGATGAGGGCGTGACGTCGGAGTTAG
ACGGAGGCACGGCGGCGATGCTAACGACTTCATCTGAGATGCGGTTAGTAGTAAGTGTCT
AAGTGACCC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2DP16TF 546 0 0
ATTGATGCCAGCAGAAAGTACTCCAGATGCAGCAGAGTTGGCAACAGCATCATAATGTGT
GGTATCTCCTCTTATCACAGCACCGATACATAAAACAGCATCAAAGTTTCCTGATTTCCC
AAGGTTTTGTGCAACAACCCCAATCTCAAAGCTGCCAGGAACCCATATAACTTGGATGTC
TTCTTCTCTGACTGAATACTTCTTGAAAGTTTCAATGGCTCCTTCCAAAAGCAACTTCGT
CACAACCTCGTTGAAACGAGCAACAACGATGGCGAATCGAAGACCTTCCCCTCTCATAAG
CGACCCGGTGACATGTCGAACAGCCTCCGTAACGAACGAAGAGCGTAGCTCCTTCTCTAC
AGCGAGTGGTGACGCGAAACCTGATGCGGCTGAAGAGAATGATAGGCTACTGGATTTGAT
TACAGAAGAGAAACAAGACGATTGACGCGGGCGGAGATGAGGGCGTGACGTCGGAGTTAG
GCGGAGGCACGGCGGCGATGCTAACGACTTCATCTGAGATGCGGTTAGTAGTAAGTGTCT
AAGT
CC

QA 1 544 1 544
DS 



CO CL539Contig2 934 4 4 U
AATGAGAACCATATTTTTGTTTGGTAAAGAATGACCCACTTGTCCCCAAAATTCAAAGGG
ACTTATTATTAGGTTACAACACACGATTCATAACCAGACCAAAAGCGTCTAAATATTTGT
CAACAAGGTGAAAAAAAAGAAAGGAAAGATTTTGGTAATCTTTGAGGTACAGTTTTGGAG
ATTGGATTGTAACCAAGTGCGACAGAGTAGCAAGTTGTCATATATGATCATTGCGTTCAT
CCATGGAAAGGAACAGCTATTTCAGGTGGTGCTCAAACAACGACGCCATCTCGAGAGCCG
TCAAAGCAGTTTCAGCTCCCTTGTTTCCAGCTTTGCCACCAGATCGATTAAGAGCCTGAT
CCATGTCCTCGCATGTCAGTACACCAAATATGCATGGAACACCTGAATTGATGCCAGCAG
AAAGTACTCCAGATGCAGCAGAGTTGGCAACAGCATCATAATGTGTGGTATCTCCTCTTA
TCACAGCACCAATACACAAAACGGCATCAAAGTTTCCTGATTTCCCAAGGTTTTGTGCAA
CAACACCAATTTCAAAGCTGCCAGGAACCCATATAACTTGGATGTCTTCTTCTCTGACTG
AATACTTCTTGAAAGTCTCAATGGCTCCTTCCAAAAGCAACTTCGTCACAACCTCGTTGA
AACGAGCAACAACGATGGCGAATCGAAGACCTTCCCCTCTCATAAGCGACCCAGTGACAT
GTCGAACAGCTTCCGTAACGAACGATGAGCGTAGCTCCTTCTCTACAGCGAGTGGTGACG
CGAAACCAGATGCGGATGAAGAGAATGATAAGCTATTGGATTTGATTACAGAAGGGAAAC
AAGACGATTGACGCGAGTGGAGATGAGGGCGTGATGTCGGAGTTAGGCGGAGGCACGGCG
GCGATGCTAACGACTTCATTTGAGATGCGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2EY67JQ U 1
AF RR2EX88JQ U 23
AF RR2EY67TF C 125
AF RR2EX88TF C 329
BS 1 248 RR2EY67JQ
BS 249 817 RR2EX88JQ
BS 818 932 RR2EY67TF
BS 933 934 RR2EX88TF

RD RR2EY67JQ 252 0 0
AATGAGAACCATATTTTTGTTTGGTAAAGAATGACCCACTTGTCCCCAAAATTCAAAGGG
ACTTATTATTAGGTTACAACACACGATTCATAACCAGACCAAAAGCGTCTAAATATTTGT
CAACAAGGTGAAAAAAAAGAAAGGAAAGATTTTGGTAATCTTTGAGGTACAGTTTTGGAG
ATTGGATTGTAACCAAGTGCGACAGAGTAGCAAGTTGTCATATATGATCATTGCGTTCAT
CCATGGAA
AGGA

QA 1 248 1 248
DS 

RD RR2EX88JQ 795 0 0
GGT
AAAGAATGACCCACTTGTCCCCAAAATTCAGAGGGACTTATTATTAGGTTACAACACACG
ATTCATAACCAGACCAAAAGCGTCTAAATATTTGTCAACAAGGTGAAAAAAAAGAAAGAA
AAGATTTTGGTAATCTTTGAGGTACAGTTTTGGAGATTGGATTGTAACCAAGTGCGACAG
AGTAACAAGTTGTCATATATGATCATTGTGTTCATCCATGGAAAGGAACAGCTATTTCAG
GTGGTGCTCAAACAACGACGCCATCTCGAGAGCCGTCAAAGCAGTTTCAGCTCCCTTGTT
TCCAGCTTTGCCACCAGATCGATTAAGAGCCTGATCCATGTCCTCGCATGTCAGTACACC
AAATATGCATGGAACACCTGAATTGATGCCAGCAGAAAGTACTCCAGATGCAGCAGAGTT
GGCAACAGCATCATAATGTGTGGTATCTCCTCTTATCACAGCACCAATACACAAAACGGC
ATCAAAGTTTCCTGATTTCCCAAGGTTTTGTGCAACAACACCAATTTCAAAGCTGCCAGG
AACCCATATAACTTGGATGTCTTCTTCTCTGACTGAATACTTCTTGAAAGTCTCAATGGC
TCCTTCCAAAAGCAACTTCGTCACAACCTCGTTGAAACGAGCAACAACGATGGCGAATCG
AAGACCTTCCCCTCTCATAAGCGACCCAGTGACATGTCGAACAGCTTCCGTAACGAACGA
TGAGCGTAGCTCCTTCTCTACAGCGAGTGGTGACGCGAAACCAGATGCGGATGAAGAGAA
TGATAAGCTATT

QA 4 795 4 795
DS 

RD RR2EY67TF 810 0 0
ACAAGGTGAAAAAAAG
AAGGAAAGATTTTGGTA*TCTTTGAGGTACAGTTT*GGAGATTGGAT*GTAACCAAGTGC
GACAGAGTAGCAAGTTGTCATATATGATCATTGCGTTCATCCATGGAAAGGAACAGCTAT
TTCAGGTGGTGCTCAAACAACGACGCCATCTCGAGAGCCGTCAAAGCAGTTTCAGCTCCC
TTGTTTCCAGCTTTGCCACCAGATCGATTAAGAGCCTGATCCATGTCCTCGCATGTCAGT
ACACCAAATATGCATGGAACACCTGAATTGATGCCAGCAGAAAGTACTCCAGATGCAGCA
GAGTTGGCAACAGCATCATAATGTGTGGTATCTCCTCTTATCACAGCACCAATACACAAA
ACGGCATCAAAGTTTCCTGATTTCCCAAGGTTTTGTGCAACAACACCAATTTCAAAGCTG
CCAGGAACCCATATAACTTGGATGTCTTCTTCTCTGACTGAATACTTCTTGAAAGTCTCA
ATGGCTCCTTCCAAAAGCAACTTCGTCACAACCTCGTTGAAACGAGCAACAACGATGGCG
AATCGAAGACCTTCCCCTCTCATAAGCGACCCAGTGACATGTCGAACAGCTTCCGTAACG
AACGATGAGCGTAGCTCCTTCTCTACAGCGAGAGGTGACGCGAAACCAGATGCGGATGAA
GAGAATGATAAGCTATTGGATTTGATTACAGAAGGGAAACAAGACGATTGACGCGAGTGG
AGATGAGGGCGTGATGTCGGAGTTAGGCGGAGGCACGGCGGCGATGCTAACGACTTCATT
TGAGATGCGGTT
CC

QA 17 808 17 808
DS 

RD RR2EX88TF 606 0 0
A
GCTTTGCCACCAGATCGATTAAGAGC*TGATCCATGTCCTCGCATGTCAGTACACCAAAT
ATGCATGGAACACCTGAATTGATGCCAGCAGAAAGTACTCCAGATGCAGCAGAGTTGGCA
ACAGCATCATAATGTGTGGTATCTCCTCTTATCACAGCACCAATACACAAAACGGCATCA
AAGTTTCCTGATTTCCCAAGGTTTTGTGCAACAACACCAATTTCAAAGCTGCCAGGAACC
CATATAACTTGGATGTCTTCTTCTCTGACTGAATACTTCTTGAAAGTCTCAATGGCTCCT
TCCAAAAGCAACTTCGTCACAACCTCGTTGAAACGAGCAACAACGATGGCGAATCGAAGA
CCTTCCCCTCTCATAAGCGACCCAGTGACATGTCGAACAGCTTCCGTAACGAACGATGAG
CGTAGCTCCTTCTCTACAGCGAGTGGTGACGCGAAACCAGATGCGGATGAAGAGAATGAT
AAGCTATTGGATTTGATTACAGAAGGGAAACAAGACGATTGACGCGAGTGGAGATGAGGG
CGTGATGTCGGAGTTAGGCGGAGGCACGGCGGCGATGCTAACGACTTCATTTGAGATGCG
GTTCC

QA 2 606 2 606
DS 



AS 1 10

CO CL540Contig1 713 10 10 U
GGATCTTCTTCTTCCTCACAATCAATCAGAGGGAGTGCAGAAATAAAAAAGAAAGATTGC
CGAGAGCACAAACCCTAAATGGCATCACTCTCCATGGCATCCGTTATCCTTAAGTTCTCT
TCTTTACGCTCTTCTCCAAAGGTTTCCTCCACTCACGTGTCTGTTCAATTCGCTCGATTC
AGCTCGTCGAGCCTTGCCTCAGCTCACTGCATTTCTGGGCTTCGTGCGGTTATTCCTCAG
AAGATATCCACAGTCGTTTCTCAGAATCCGCAAAGGCTTCAGTCTCTTACAGTTTTCGCT
CATAAGGGATATAAGATGAAGACCCACAAGGCGTCAGCGAAACGGTTTAGAGTAACGGGA
AGGGGGAAGATAGTGAGGAGGAGATCGGGAAAGCAGCATTTGTTAGCTAAGAAGAACAAC
AAGAGGAAGCTCCGTCTTTCCAAAATGCACGAAGTTAGCAGGAGCGACTATGACAATGTG
ATCGGAGCTCTTCCATACCTGAAAGTCAATCGAAAGGCGACTTAAAAACAAAGCCTAGGA
ATGATCCTTTTATTTCCTGTATTTCTCATTTTGTAATCTAACTTGTGATAGAAAGAAATA
CTTTTTGTTTTGTGATTATTTGTTCAATGAGTTTCGCATTTGTGTCTTCTCATTCTTCGT
TTTCTTGTCTGGCATGACGAAAGATTTTGTGAATACGACGCAAGTTGTTCGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FZ86TF U 30
AF RR2BF16JQ C 1
AF RR2BI66JQ C 70
AF RR2BI66TF U 35
AF RR2BF16TF U 1
AF RR2E402TF U 32
AF RR2CA11JQ C 30
AF RR2CA11TF U 30
AF RR2BP08JQ C 16
AF RR2BP08TF U 16
BS 1 31 RR2BF16TF
BS 32 333 RR2FZ86TF
BS 334 334 RR2BI66TF
BS 335 581 RR2FZ86TF
BS 582 637 RR2BI66TF
BS 638 644 RR2BF16TF
BS 645 646 RR2E402TF
BS 647 692 RR2BP08TF
BS 693 693 RR2BP08JQ
BS 694 713 RR2BP08TF

RD RR2FZ86TF 552 0 0
GG
GGAGTGCAGAAATAAAAAAGAAAGATTGCCGAGAGCACAAACCCTAAATGGCATCACTCT
CCATGGCATCCGTTATCCTTAAGTTCTCTTCTTTACGCTCTTCTCCAAAGGTTTCCTCCA
CTCACGTGTCTGTTCAATTCGCTCGATTCAGCTCGTCGAGCCTTGCCTCAGCTCACTGCA
TTTCTGGGCTTCGTGCGGTTATTCCTCAGAAGATATCCACAGTCGTTTCTCAGAATCCGC
AAAGGCTTCAGTCTCTTACAGTTTTCGCTCATAAGGGATATAAGATGAAGACCCACAAGG
CGCCAGCGAAACGGTTTAGAGTAACGGGAAGGGGGAAGATAGTGAGGAGGAGATCGGGAA
AGCAGCATTTGTTAGCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAGCTCCGTCTTTCCAAAATGCACG
AAGTTAGCAGGAGCGACTATGACAATGTGATCGGAGCTCTTCCATACCTGAAAGTCAATC
GAAAGGCGACTTAAAAACAAAGCCTAGGAATGATCCTTTTATTTCCTGTATTTCTCATTT
TGTAATCTAA

QA 3 552 3 552
DS 

RD RR2BF16JQ 645 0 0
GGATCTTCTTCTTCCTCACAATCAATCAGAGTGAGTGCAGAAATAAAAAAGAAAGATTGC
CGAGAGCACAAACCCTAAATGGCATCACTCTCCATGGCATCCGTTATCCTTAAGTTCTCT
TCTTTACGCTCTTCTCCAAAGGTTTCCTCCACTCACGTGTCTGTTCAATTCGCTCGATTC
AGCTCGTCGAGCCTTGCCTCAGCTCACTGCATTTCTGGGCTTCGTGCGGTTATTCCTCAG
AAGATATCCACAGTCGTTTCTCAGAATCCGCAAAGGCTTCAGTCTCTTACAGTTTTCGCT
CATAAGGGATATAAGATGAAGACCCACAAGGCGTCAGCGAAACGGTTTAGAGTAACGGGA
AGGGGGAAGATAGTGAGGAGGAGATCGGGAAAGCAGCATTTGTTAGCTAAGAAGAACAAC
AAGAGGAAGCTCCGTCTTTCCAAAATGCACGAAGTTAGCAGGAGCGACTATGACAATGTG
ATCGGAGCTCTTCCATACCTGAAAGTCAATCGAAAGGCGACTTAAAAACAAAGCCTAGGA
ATGATCCTTTTATTTCCTGTATTTCTCATTTTGTAATCTAACTTGTGATAGAAAGAAATA
CTTTTTGTTTTGTGATTATTTGTTCAATGAGTTTCGCATTTGTG
C

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2BI66JQ 568 0 0
AAACCCTAAATGGCATCACTCTCCATGGCATCCGTTATCCTTAAGTTCTCTTCTTTACGC
TCTTCTCCAAAGGTTTCCTCCACTCACGTGTCTGTTCAATTCGCTCGATTCAGCTCGTCG
AGCCTTGCTTCAGCTCACTGCATTTCTGGGCTTCGTGCGGTTATTCCTCAGAAGATATCC
ACAGTCGTTTCTCAGAATCCGCAAAGGCTTCAGTCTCTTACAGTTTTCGCTCATAAGGGA
TATAAGATGAAGACCCACAAGGCGTCAGCGAAACGGTTTAGAGTAACGGGAAGGGGGAAG
ATAGTGAGGAGGAGATCGGGAAAGCAGCATTTGTTAGCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAG
CTCCGTCTTTCCAAAATGCACGAAGTTAGCAGGAGCGACTATGACAATGTGATCGGAGCT
TTTCCATACCTGAAAGTCAATCGAAAGGCGACTTAAAAACAAAGCCTAGGAATGATCCTT
TTATTTCCTGTATTTCTCATTTTGTAATCTAACTTGTGATAGAAAGAAATACTTTTTGTT
TTGTGATTATTTGTTCAATGAGTTTCGC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2BI66TF 603 0 0
GG
GCAGAAATAAAAAAGAAAGATTGCCGAGAGCACAAACCCTAAATGGCATCACTCTCCATG
GCATCCGTTATCCTTAAGTTCTCTTCTTTACGCTCTTCTCCAAAGGTTTCCTCCACTCAC
GTGTCTGTTCAATTCGCTCGATTCAGCTCGTCGAGCCTTGCCTCAGCTCACTGCATTTCT
GGGCTTCGTGCGGTTATTCCTCAGAAGATATCCACAGTCGTTTCTCAGAATCCGCAAAGG
CTTCAGTCTCTTACAGTTTTCGCTCATAAGGGATATAAGATGAAGACCCACAAGGCGTCA
GCGAAACGGTTTAGAGTAACGGGAAGGGGGAAGATAGTGAGGAGGAGATCGGGAAAGCAG
CATTTGTTAGCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAGCTCCGTCTTTCCAAAATGCACGAAGTT
AGCAGGAGCGACTATGACAATGTGATCGGAGCTCTTCCATACCTGAAAGTCAATCGAAAG
GCGACTTAAAAACAAAGCCTAGGAATGATCCTTTTATTTCCTGTATTTCTCATTTTGTAA
TCTAACTTGTGATAGAAAGAAATACTTTTTGTTTTGTGATTATTTGTTCAATGAGTTTCG
C

QA 3 603 3 603
DS 

RD RR2BF16TF 645 0 0
GGATCTTCTTCTTCCTCACAATCAATCAGAGTGAGTGCAGAAATAAAAAAGAAAGATTGC
CGAGAGCACAAACCCTAAATGGCATCACTCTCCATGGCATCCGTTATCCTTAAGTTCTCT
TCTTTACGCTCTTCTCCAAAGGTTTCCTCCACTCACGTGTCTGTTCAATTCGCTCGATTC
AGCTCGTCGAGCCTTGCCTCAGCTCACTGCATTTCTGGGCTTCGTGCGGTTATTCCTCAG
AAGATATCCACAGTCGTTTCTCAGAATCCGCAAAGGCTTCAGTCTCTTACAGTTTTCGCT
CATAAGGGATATAAGATGAAGACCCACAAGGCGTCAGCGAAACGGTTTAGAGTAACGGGA
AGGGGGAAGATAGTGAGGAGGAGATCGGGAAAGCAGCATTTGTTAGCTAAGAAGAACAAC
AAGAGGAAGCTCCGTCTTTCCAAAATGCACGAAGTTAGCAGGAGCGACTATGACAATGTG
ATCGGAGCTCTTCCATACCTGAAAGTCAATCGAAAGGCGACTTAAAAACAAAGCCTAGGA
ATGATCCTTTTATTTCCTGTATTTCTCATTTTGTAATCTAACTTGTGATAGAAAGAAATA
CTTTTTGTTTTGTGATTATTTGTTCAATGAGTTTCGCATTTGTG
C

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2E402TF 618 0 0
GGAGTGCAGAAATAAAAAAGAAAGATTGCCGAGAGCACAAACCCTAAATGTCATCACTCT
CCATGGCATCCGTTATCCTTAAGTTCTCTTCTTTACGCTCTTCTCCAAAGGTTTCCTCCA
CTCACGTGTCTGTTCAATTCGCTCGATTCAGCTCGTCGAGCCTTGCCTCAGCTCACTGCA
TTTCTGGGCTTCGTGCGGTTATTCCTCAGAAGATATCCACAGTCGTTTCTCAGAATCCGC
AAAGGCTTCAGTCTCTTACAGTTTTCGCTCATAAGGGATATAAGATGAAGACCCACAAGG
CGTCAGCGAAACGGTTTAGAGTAACGGGAAGGGGGAAGATAGTGAGGAGGAGATCGGGAA
AGCAGCATTTGTTAGCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAGCTCCGTCTTTCCAAAATGCACG
AAGTTAGCAGGAGCGACTATGACAATGTGATCGGAGCTCTTCCATACCTGAAAGTCAATC
GAAAGGCGACTTAGAAACAAAGCCTAGGAATGATCCTTTTATTTCCTGTATTTCTCATTT
TGTAATCTAACTTGTGATAGAAAGAAATACTTTTTGTTTTGTGATTATTTGTTCAATGAG
TTTCGCATTTGTGTC
TTC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2CA11JQ 619 0 0
GT
GGAGTGCAGAAATAAAAAAGAAAGATTGCCGAGAGCACAAACCCTAAATGGCATCACTCT
CCATGGCATCCGTTATCCTTAAGTTCTCTTCTTTACGCTCTTCTCCAAAGGTTTCCTCCA
CTCACGTGTCTGTTCAATTCGCTCGATTCAGCTCGTCGAGCCTTGCCTCAGCTCACTGCA
TTTCTGGACTTCGTGCGGTTATTCCTCAGAAGATATCCACAGTCGTTTCTCAGAATCCGC
AAAGGCTTCAGTCTCTTACAGTTTTCGCTCATAAGGGATATAAGATGAAGACCCACAAGG
CGTCAGCGAAACGGTTTAGAGTAACGGGAAGGGGGAAGATAGTGAGGAGGAGATCGGGAA
AGCAGCATTTGTTAGCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAGCTCCGTCTTTCCAAAATGCACG
AAGTTAGCAGGAGCGACTATGACAATGTGATCGGAGCTCTTCCATACCTGAAAGTCAATC
GAAAGGCGACTTAAAAACAAAGCCTAGGAATGATCCTTTTATTTCCTGTATTTCTCATTT
TGTAATCTAACTTGTGATAGAAAGAACTACTTTTTGTTTTGTGATTATTTGTTCAATGAG
TTTCGCATTTGTGTC
GT

QA 3 617 3 617
DS 

RD RR2CA11TF 619 0 0
GT
GGAGTGCAGAAATAAAAAAGAAAGATTGCCGAGAGCACAAACCCTAAATGGCATCACTCT
CCATGGCATCCGTTATCCTTAAGTTCTCTTCTTTACGCTCTTCTCCAAAGGTTTCCTCCA
CTCACGTGTCTGTTCAATTCGCTCGATTCAGCTCGTCGAGCCTTGCCTCAGCTCACTGCA
TTTCTGGACTTCGTGCGGTTATTCCTCAGAAGATATCCACAGTCGTTTCTCAGAATCCGC
AAAGGCTTCAGTCTCTTACAGTTTTCGCTCATAAGGGATATAAGATGAAGACCCACAAGG
CGTCAGCGAAACGGTTTAGAGTAACGGGAAGGGGGAAGATAGTGAGGAGGAGATCGGGAA
AGCAGCATTTGTTAGCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAGCTCCGTCTTTCCAAAATGCACG
AAGTTAGCAGGAGCGACTATGACAATGTGATCGGAGCTCTTCCATACCTGAAAGTCAATC
GAAAGGCGACTTAAAAACAAAGCCTAGGAATGATCCTTTTATTTCCTGTATTTCTCATTT
TGTAATCTAACTTGTGATAGAAAGAACTACTTTTTGTTTTGTGATTATTTGTTCAATGAG
TTTCGCATTTGTGTC
GT

QA 3 617 3 617
DS 

RD RR2BP08JQ 698 0 0
GG
ACAATCAATCAGAGTGAGTGCAGAAATAAAAAAGAAAGATTGCCGAGAGCACAAACCCTA
AATGGCATCACTCTCCATGGCATCCGTTATCCTTAAGTTCT**TCTTTACGCTCTTCTCC
AAAGGTTTCCTCCACTCACGTGTCTGTTCAATTCGCTCGATTCAGCTCGTCGAGCCTTGC
CTCAGCTCACTGCATTTCTGGGCTTCGTGCGGTTATTCCTCAGAAGATATCCACAGTCGT
TTCTCAGAATCCGCAAAGGCTTCAGTCTCTTACAGTTTTCGCTCATAAGGGATATAAGAT
GAAGACCCACAAGGCGTCAGCGAAACGGTTTAGAGTAACGGGAAGGGGGAAGATAGTGAG
GAGGAGATCGGGAAAGCAGCATTTGTTATCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAGCTCCGTCT
TTCCAAAATGCACGAAGTTAGCAGGAGCGACTATGACAATGTGATCGGAGCTCTTCCATA
CCTGAAAGTCAATCGAAAGGCGACTTAAAAACAAAGCCTAGGAATGATCCTTTTATTTCC
TGTATTTCTCATTTTGTAATCTAACTTGTGATAGAAAGAAATACTTTTTGTTTTGTGATT
ATTTGTTCAATGAGTTTCGCATTTGTGTCTTCTCATTCTTCGTTTTCTTGTCTGGCATGA
CGAAAGATTTTGTGAATACGACGCAAGTTGTTCGTT

QA 3 698 3 698
DS 

RD RR2BP08TF 698 0 0
GG
ACAATCAATCAGAGTGAGTGCAGAAATAAAAAAGAAAGATTGCCGAGAGCACAAACCCTA
AATGGCATCACTCTCCATGGCATCCGTTATCCTTAAGTTCT**TCTTTACGCTCTTCTCC
AAAGGTTTCCTCCACTCACGTGTCTGTTCAATTCGCTCGATTCAGCTCGTCGAGCCTTGC
CTCAGCTCACTGCATTTCTGGGCTTCGTGCGGTTATTCCTCAGAAGATATCCACAGTCGT
TTCTCAGAATCCGCAAAGGCTTCAGTCTCTTACAGTTTTCGCTCATAAGGGATATAAGAT
GAAGACCCACAAGGCGTCAGCGAAACGGTTTAGAGTAACGGGAAGGGGGAAGATAGTGAG
GAGGAGATCGGGAAAGCAGCATTTGTTATCTAAGAAGAACAACAAGAGGAAGCTCCGTCT
TTCCAAAATGCACGAAGTTAGCAGGAGCGACTATGACAATGTGATCGGAGCTCTTCCATA
CCTGAAAGTCAATCGAAAGGCGACTTAAAAACAAAGCCTAGGAATGATCCTTTTATTTCC
TGTATTTCTCATTTTGTAATCTAACTTGTGATAGAAAGAAATACTTTTTGTTTTGTGATT
ATTTGTTCAATGAGTTTCGCATTTGTGTCTTCTCATTCTTCGTTTTCTTGTCTGGCATGA
CGAAAGATTTTGTGA*TACGACGCAAGTTGTTCGTT

QA 3 698 3 698
DS 



AS 2 7

CO CL541Contig1 1062 5 17 U
GGAAAGAGAAAGCATCTCAAATCAACGAGACAGCGAATCCTCCTCGACAAAATTCGATCA
AGCAGCTGCAGTTGTTCTCTTACACTCCATAACTAGATGGCAGAAAAGGCTTGTATAAAA
CGTCTTCAAAAGGAATATAGAGCACTTTGCAAGGAACCAGTCTCCCATGTTGTTGCTCGT
CCATCCCCAAATGACATTCTTGAGTGGCATTATGTGCTGGAAGGAAGTGATGGAACACCT
TTTGCTGGTGGATTTTACTATGGAAAGATCAAGTTCCCTCCGGAGTATCCTTACAAGCCA
CCTGGAATTACAATGACTACACCAAATGGTCGATTCATTACACAAAAGAAGATTTGTTTG
TCTATGAGTGATTTTCATCCAGAAAGCTGGAATCCAATGTGGTCTGTGTCAAGCATTCTT
ACAGGGCTTCTCTCATTTATGATGGATACTAGTCCGACAACTGGAAGTGTGAACACAACT
GTAGCTGAGAAACAGCGGCTGGCTAAGTCATCGCTCGCTTTCAATTGTAAAACCCCAGCA
TTCCGAAAGCTGTTTCCAGAGTACGTAGAGAAGTACAACCAGCAGCAACTAGCCGAGCAA
ACGCATCAGACCGCACCAGAGTCTCCTCAAGAGAGCAATGCCAAAGCTGAATCGGAGAAA
ACAGTCGACACAACAAAGGAGGACTCAGATGGTGGATTGAA*GGAGAGGAGGAAGAACAA
GAAGCACGGATTGCCAGCGTGGATTATAGTGTTGCTAGTGTCGGTTTTCGGGGTTGTAAT
GGCGCTGCCTCTGCTTCAACTGTGATTTTCTATGTAACAAAACATAGAAATGGATGTTGA
CTCTTCGGATAAAATCTCTCTCCTCTTTCTCTCTCTCTGCCCTTCAGTATCAAGAGTAGT
CTTCTTTTGTCTAGTGCTCTTCTTATGTCCGAATTTACTCAATTTAGCCCGTTCTCGTGG
TTTGTGTTTTTAAAGGCCATATATTACATAAGTTTGGAACTAATTTGTATAGTATATGGT
TTGTTTGCATTTGATAAATAGAACCTTATGGTTTTCATGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO77TF U 60
AF RR2AA51TF U 7
AF RR2BA62TF U 1
AF RR2BA62JQ C 293
AF RR2DD52JQ C 508
BS 1 62 RR2BA62TF
BS 63 65 RR2AA51TF
BS 66 287 RR2BA62TF
BS 288 288 RR2AA51TF
BS 289 557 RR2BA62TF
BS 558 558 RR2AA51TF
BS 559 772 RR2BA62TF
BS 773 773 RR2AA51TF
BS 774 821 RR2BA62TF
BS 822 822 RR2BA62JQ
BS 823 853 RR2BA62TF
BS 854 854 RR2BA62JQ
BS 855 862 RR2BA62TF
BS 863 863 RR2BA62JQ
BS 864 883 RR2BA62TF
BS 884 1055 RR2BA62JQ
BS 1056 1062 RR2DD52JQ

RD RR2BO77TF 291 0 0
AGCTGCAGTTGTTCT
TTCTCTTACACTCCATAACTAGATGGCAGAAAAGGCTTGTATAAAGCGTCTTCAAAAGGA
ATATAGAGCACTTTGCAAGGAACCAGTCTCCCATGTTGTTGCTCGTCCTTCCCCAAATGA
CATTCTCGAGTGGCATTATGTGCTGGAAGGAAGTGATGGAACACCTTTTGCTGGTGGATT
TTACTATGGAAAGATCAAGTTCCCTCCTGAGTATCCTTACAAACCACCTGGAATTACAAT
GACTACACCAAATGGTCGATTCATTACACAAAAGAA

QA 16 291 16 291
DS 

RD RR2AA51TF 775 0 0
GGAAAGCATCTC
AAATCAACGAGACAGCGAATCCTCCTCGACAAAATTCGATCAAGCAGCTGCAGTTGTTCT
CTTACACTCCATAACTAGATGGCAGAAAAGGCTTGTATAAAACGTCTTCAAAAGGAATAT
AGAGCACTTTGCAAGGAACCAGTCTCCCATGTTGTTGCTCGTCCATCCCCAAATGACATT
CTTGAGTGGCATTATGTGCTGGAAGGAAGTGATGGAACACCTTTTGCTGGTGGATTTTAC
TATGGAAAGATCAAGTTCCCTCCGGAGTATCCTTACAAGCCACCTGGAATTACAATGACT
ACACCAAATGGTCGATTCATTACACAAAAGAAGATTTGTTTGTCTATGAGTGATTTTCAT
CCAGAAAGCTGGAATCCAATGTGGTCTGTGTCAAGCATTCTTACAGGGCTTCTCTCATTT
ATGATGGATACTAGTCCGACAACTGGAAGTGTGAACACAACTGTAGCTGAGAAACAGCGG
CTGGCTAAGTCATCGCTCGCTTTCAATTGTAAAACCCCAGCATTCCGAAAGCTGTTGCCA
GAGTACGTAGAGAAGTACAACCAGCAGCAACTAGCCGAGCAAACGCATCAGACCGCACCA
GAGTCTCCTCAAGAGAGCAATGCCAAAGCTGAATCGGAGAAAACAGTCGACACAACAAAG
GAGGACTCAGATGGTGGATTGAAAGGAGAGGAGGAAGAACAAGAAGCACGGATTGCCAGC
GTGGATTATAGTGTTGCTAGTGTCGGTTTTCGGGGTTGTAATG

QA 13 775 13 775
DS 

RD RR2BA62TF 898 0 0
GGAAAGAGAAAGCATCTCAAATCAACGAGACAGCGAATCCTCCTCGACAAAATTCGATCA
AG***CTGCAGTTGTTCTCTTACACTCCATAACTAGATGGCAGAAAAGGCTTGTATAAAA
CGTCTTCAAAAGGAATATAGAGCACTTTGCAAGGAACCAGTCTCCCATGTTGTTGCTCGT
CCATCCCCAAATGACATTCTTGAGTGGCATTATGTGCTGGAAGGAAGTGATGGAACACCT
TTTGCTGGTGGATTTTACTATGGAAAGATCAAGTTCCCTCCGGAGTACCCTTACAAGCCA
CCTGGAATTACAATGACTACACCAAATGGTCGATTCATTACACAAAAGAAGATTTGTTTG
TCTATGAGTGATTTTCATCCAGAAAGCTGGAATCCAATGTGGTCTGTGTCAAGCATTCTT
ACAGGGCTTCTCTCATTTATGATGGATACTAGTCCGACAACTGGAAGTGTGAACACAACT
GTAGCTGAGAAACAGCGGCTGGCTAAGTCATCGCTCGCTTTCAATTGTAAAACCCCAGCA
TTCCGAAAGCTGTTTCCGGAGTACGTAGAGAAGTACAACCAGCAGCAACTAGCCGAGCAA
ACGCATCAGACCGCACCAGAGTCTCCTCAAGAGAGCAATGCCAAAGCTGAATCGGAGAAA
ACAGTCGACACAACAAAGGAGGACTCAGATGGTGGATTGAA*GGAGAGGAGGAAGAACAA
GAAGCACGGATTGCCAGCGTGGATTATAGTGTTGCTAGTGTCGGTTTTCGGG*TTGTAAT
GGCGCTGCCTCTGCTTCAACTGTGATTTTCTATGTAACAAA*CATAGAAATGGATGTTGA
CTCTTCGGATAAA*TCTCTCTC*TCTTTCTCTCTCTCTGCCCT
CAGTATCAGAGTAGT

QA 1 883 1 883
DS 

RD RR2BA62JQ 764 0 0
ACAAGCCACCTGGAATTACAATGACTACACCAAATGGTCGATTCATTACACAAAAGAAGA
TTTGTTTGTCTATGAGTGATTTTCATCCAGAAAGCTGGAATCCAATGTGGTCTGTGTCAA
GCATTCTTACAGGGCTTCTCTCATTTATGATGGATACTAGTCCGACAACTGGAAGTGTGA
ACACAACTGTAGCTGAGAAACAGCGGCTGGCTAAGTCATCGCTCGCTTTCAATTGTAAAA
CCCCAGCATTCCGAAAGCTGTTTCCGGAGTACGTAGAGAAGTACAACCAGCAGCAACTAG
CCGAGCAAACGCATCAGACCGCACCAGAGTCTCCTCAAGAGAGCAATGCCAAAGCTGAAT
CGGAGAAAACAGTCGACACAACAAAGGAGGACTCAGATGGTGGATTGAA*GGAGAGGAGG
AAGAACAAGAAGCAGGGATTGCCAGCGTGGATTATAGTGTTGCTAGTGTCGGTTTTCGGG
GTTGTAATGGCGCTGCCTCTGCTTCAACTGTGATTTTCTATGTAACAAAACATAGAAATG
GATGTTGACTCTTCGGATAAAATCTCTCTCCTCTTTCTCTCTCTCTGCCCTTCAGTATCA
AGAGTAGTCTTCTTTTGTCTAGTGCTCTTCTTATGTCCGAATTTACTCAATTTAGCCCGT
TCTCGTGGTTTGTGTTTTTAAAGGCCATATATTACATAAGTTTGGAACTAATTTGTATAG
TATATGGTTTGTTTGCATTTGATAAATAGAACCTTATGGTTTT
C

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2DD52JQ 555 0 0
TCATCGCTCGCTTTCAATTGTAAAACCCCAGCATTCCGAAAGCTGTTTCCAGAGTACGTA
GAGAAGTACAACCAGCAGCAACTAGCCGAGCAAACGCATCAGACCGCACCAGAGTCTCCT
CAAGAGAGCAATGCCAAAGCTGAATCGGAGAAAACAGTCGACACAACAAAGGAGGACTCA
GATGGTGGATTGAA*GGAGAGGAGGAAGAACAAGAAGCAGGGATTGCCAGCGTGGATTAT
AGTGTTGCTAGTGTCGGTTTTCGGGGTTGTAATGGCGCTGCTTCTGCTTCAACTGTGATT
TTCTATGTAACAAAACATAGAAATGGATGTTGACTCTTCGGATAAAGTCTCTCTCCTCTT
TCTCTCTCTCTGCCCTTCAGTATCAAGAGTAGTCTTCTTTTGTCTAGTGCTCTTCTTATG
TCCGAATTTACTCAATTTAGCCCGTTCTCGTGGTTTGTGTTTTTAAAGGCCATATATTAC
ATAAGTTTGGAACTAATTTGTATAGTATATGGTTTGTTTGCATTTGATAAATAGAACCTT
ATGGTTTTCATGTGT

QA 1 555 1 555
DS 



CO CL541Contig2 1057 2 2 U
GGAAAGTAAAATCAACGAGACAGCGAATCCTCCTCGACAAAATTCGATCAAAGCTGCAGT
TGTTCTCTTACTCACATAATAATTAGATGGCGGAAAAGGCTTGTATCAAACGTCTTCAAA
AGGAATATAGAGCACTTTGCAAGGAACCAGTCTCCCATGTTGTTGCTCGTCCTTCCCCAA
ATGACATTCTCGAGTGGCATTATGCGCTGGAAGGAAGTGATGGAACACCTTTTGCTGGTG
GATTTTACTATGGAAAGATCAAGTTCCCTCCTGAGTATCCTTACAAACCACCTGGAATTA
CAATGACTACACCAAATGGTCGATTCATTACACAAAAGAAGATCTGTTTGTCTATGAGTG
ATTTTCATCCAGAAAGCTGGAATCCAATGTGGTCTGTGTCAAGCATACTTACAGGGCTTC
TCTCATTTATGATGGATACTAGTCCTACAACCGGAAGTGTGAACACTACTGTATCTGAGA
AACAACGCCTGGCTAAGTCATCGCTCGCTTTCAATTGTGAAACCCCAGCATTCAGAAAGC
TGTTCCCAGAGTACGTAGAGAAGTACAACCAGCAGCAACTAGCCGAGCAAACGCAGCAGG
CGGCACCAGAGTCTCCTCAAGAGAGCAATGCCAAAGCAGAGTCGGAGAAAACAGCCGACA
CAACAAAGGAGGACTCAGATGGTGGATTGAAGGAGAGGACGAAGAACAAGAAGCAGGGAT
TGCCAGCGTGGATTATACTGTTGCTAGTGTCGGTTTTCGGGGTTGTAATGGCGCTGCCTC
TGCTTCAACTGTGATTTTCTATGTAACAAAAACATAGAAATGGATGTTGACTCTTCGGAT
AAAATCTCTCTCCTCTCTCTTTCTCTCTGCCCTTCAGTATCAAGAGTAGTCTTCTTCTGT
CTAGTGCTCTTCTTATGTCCGAATTTACTCAATTTATAGCCCCCTTCTCGTGGTTTGTAT
TTTTTTAAGGCCATATATTACATAAGTTTGGAACTAATTTGTATAGTATATGGTTTGTTT
GCATTTGATAAATAGAACCTTATGGTTTTTATGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA88TF U 1
AF RR2FA88JQ C 383
BS 1 507 RR2FA88TF
BS 508 1057 RR2FA88JQ

RD RR2FA88TF 507 0 0
GGAAAGTAAAATCAACGAGACAGCGAATCCTCCTCGACAAAATTCGATCAAAGCTGCAGT
TGTTCTCTTACTCACATAATAATTAGATGGCGGAAAAGGCTTGTATCAAACGTCTTCAAA
AGGAATATAGAGCACTTTGCAAGGAACCAGTCTCCCATGTTGTTGCTCGTCCTTCCCCAA
ATGACATTCTCGAGTGGCATTATGCGCTGGAAGGAAGTGATGGAACACCTTTTGCTGGTG
GATTTTACTATGGAAAGATCAAGTTCCCTCCTGAGTATCCTTACAAACCACCTGGAATTA
CAATGACTACACCAAATGGTCGATTCATTACACAAAAGAAGATCTGTTTGTCTATGAGTG
ATTTTCATCCAGAAAGCTGGAATCCAATGTGGTCTGTGTCAAGCATACTTACAGGGCTTC
TCTCATTTATGATGGATACTAGTCCTACAACCGGAAGTGTGAACACTACTGTATCTGAGA
AACAACGCCTGGCTAAGTCATCGCTCG

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2FA88JQ 675 0 0
TCCAATGTGGTCTGTGTCAAGCATACTTACAGGGCTTCTCTCATTTATGATGGATACTAG
TCCTACAACCGGAAGTGTGAACACTACTGTATCTGAGAAACAACGCCTGGCTAAGTCATC
GCTCGCTTTCAATTGTGAAACCCCAGCATTCAGAAAGCTGTTCCCAGAGTACGTAGAGAA
GTACAACCAGCAGCAACTAGCCGAGCAAACGCAGCAGGCGGCACCAGAGTCTCCTCAAGA
GAGCAATGCCAAAGCAGAGTCGGAGAAAACAGCCGACACAACAAAGGAGGACTCAGATGG
TGGATTGAAGGAGAGGACGAAGAACAAGAAGCAGGGATTGCCAGCGTGGATTATACTGTT
GCTAGTGTCGGTTTTCGGGGTTGTAATGGCGCTGCCTCTGCTTCAACTGTGATTTTCTAT
GTAACAAAAACATAGAAATGGATGTTGACTCTTCGGATAAAATCTCTCTCCTCTCTCTTT
CTCTCTGCCCTTCAGTATCAAGAGTAGTCTTCTTCTGTCTAGTGCTCTTCTTATGTCCGA
ATTTACTCAATTTATAGCCCCCTTCTCGTGGTTTGTATTTTTTTAAGGCCATATATTACA
TAAGTTTGGAACTAATTTGTATAGTATATGGTTTGTTTGCATTTGATAAATAGAACCTTA
TGGTTTTTATGTGTG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 2 10

CO CL542Contig1 747 8 7 U
GGAAAGCTGAGGAAAAGGAAGAGAAGAGAAAAGAAAAGACCCACACACCGTAGACTCCAT
CGTCTCTGAAACTAATCTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTGGAATGGCAGTCCAC
GATGACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACATACCGTTTCATCGTT
TACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGATTGTTGAGAAACTCGGCGAACCTGGGCAA
TCCCACGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCCGATGAATGCCGATACGCCATCTTCGAC
TTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAAAAGAGCAAGATTTTCTTCGTCGCATGGTCT
CCGGACACAGCGAGAGTGAGAAGCAAAATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGATTCAAG
AGAGAGCTAGATGGGATTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTC
GACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTGTATCAAAACTTTGTTTCTTGT
ATTACCAAATTGATATGCTTTATCCCTAAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGC
TTCATTTTATCGGTCTTTGTCTTGAGTGTTTTTTTT*CTTTTTGGTTCTTACAGTGTCTT
GCTTAGAACTTAAGATAATTGGCTTTGTGCTCTTTTACAGTTGTGTAAGAAACCCGAACC
GTTTATCAAAACAGATTACCCTATTGG


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RR2DX19TF U 7
AF RR2FR29TF U 1
AF RR2EZ55TF U 1
AF RR2EZ55JQ C 149
AF RR2BI77JQ C 3
AF RR2BI77TF U 3
AF RR2FR29JQ C 53
AF RR2DX19JQ C 179
BS 1 100 RR2EZ55TF
BS 101 101 RR2FR29TF
BS 102 363 RR2EZ55TF
BS 364 364 RR2FR29TF
BS 365 694 RR2EZ55TF
BS 695 742 RR2BI77TF
BS 743 747 RR2DX19JQ

RD RR2DX19TF 499 0 0
GG
GAGGAAAAGGAAGAGAAGAGAAAAGAAAAGACCCACACACCGTAGACTCCGTCGTCTCTG
AAACTAATCTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTGGAATGGCAGTCCACGATGACTG
CAAGCTCAAGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACATACCGTTTCATCGTTTACAAGAT
CGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGATTGTTGAGAAACTCGGCGAACCTGGGCAATCCCACGA
TGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCCGATGAATGCCGATACGCCATCTTCGACTTTGATTT
CGTCACTGCTGAGAACTGCCAAAAGAGCAAGATTTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACAC
AGCGAGAGTGAGAAGCAGAATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGATTCAAGAGAGAGCT
AGATGGGATTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTCGACATTTT
CAAAAGCCGAGCCAATT

QA 3 499 3 499
DS 

RD RR2FR29TF 629 0 0
GGAA
AGCTGAGGAAAAGGAAGAGAAGAGAAAAGAAAAGACCCACACACCGTAGACTCCATCGTC
TCTGAAACTAATCTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTGGAATGGCAGTCCACGATT
ACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACATACCGTTTCATCGTTTACA
AGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGATTGTTGAGAAACTCGGCGAACCTGGGCAATCCC
ACGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCCGATGAATGCCGATACGCCATCTTCGACTTTG
ATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAAAAGAGCAAGATTTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGG
ACACAGCGAGAGTGAGAAGCAAAATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGATTCAAGAGAG
AGCTAGATGGGACTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTCGACA
TTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTGTATCAAAACTTTGTTTCTTGTATTA
CCAAATTGATATGCTTTATCCCTAAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCA
TTTTATCGGTCTTTGTCTTGAGTGT

QA 5 629 5 629
DS 

RD RR2EZ55TF 694 0 0
GGAAAGCTGAGGAAAAGGAAGAGAAGAGAAAAGAAAAGACCCACACACCGTAGACTCCAT
CGTCTCTGAAACTAATCTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGTGTCTGGAATGGCAGTCCAC
GATGACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACATACCGTTTCATCGTT
TACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGATTGTTGAGAAACTCGGCGAACCTGGGCAA
TCCCACGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCCGATGAATGCCGATACGCCATCTTCGAC
TTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAAAAGAGCAAGATTTTCTTCGTCGCATGGTCT
CCGAACACAGCGAGAGTGAGAAGCAAAATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGATTCAAG
AGAGAGCTAGATGGGATTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTC
GACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTGTATCAAAACTTTGTTTCTTGT
ATTACCAAATTGATATGCTTTATCCCTAAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGC
TTCATTTTATCGGTCTTTGTCTTGAGTGTTTTTTTT*CTTTTTGGTTCTTACAGTGTCTT
GCTTAGAACTTAAGATAATTGGCTTTGTGCTCTT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2EZ55JQ 546 0 0
TCAAGGCCAAGAGGACATACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAG
TGATTGTTGAGAAACTCGGCGAACCTGGGCAATCCCACGATGACTTTGCAGCAAGTTTTC
CAGCCGATGAATGCCGATACGCCATTTTCGACTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCC
AAAAGAGCAAGATTTTTTTCGTCGCATGGTTTCCGAACACAGCGAGAGTGAGAAGCAAAA
TGATTTATGCGAGCTTTAAGGACAGATTCAAGAGAGAGCTAGATGGGATTCAAGTAGAGC
TTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAG
GAACGGTTGTGTATCAAAACTTTGTTTCTTGTATTACCAAATTGATATGCTTTATCCCTA
AAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCGGTCTTTGTCTTGAGTG
TTTTTTTT*CTTTTTGGTTCTTACAGTGTCTTGCTTAGAACTTAAGATAATTGGCTTTGT
GCTCTT

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2BI77JQ 740 0 0
GG
AGCTGAGGAAAAGGAAGAGAGGAGAAAAGAAAAGACCCACACACCGTAGACTCCATCGTC
TCTGAAACTAATCTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTGGAATGGCAGTCCACGATG
ACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACATACCGTTTCATCGTTTACA
AGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGATTGTTGAGAAACTCGGCGAACCTGGGCAATCCC
ACGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCCGATGAATGCCGATACGCCATCTTCGACTTTG
ATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAAAAGAGCAAGATATTCTTCGTCGCATGGTCTCCGG
ACACAGCGAGAGTGAGAAGCAAAATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGATTCAAGAGAG
AGCTAGATGGGATTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTCGACA
TTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTGTATCAAAACTTTGTTTCTTGTATTA
CCAAATTGATATGCTTTATCCCTAAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCA
TTTTATCGGTCTTTGTCTTGAGTGTTTTTTTT*CTTTTTGGTTCTTACAGTGTCTTGCTT
AGAACTTAAGATAATTGGCTTTGTGCTCTTTTACAGTTGTGTAAGAAACCCGAACCGTTT
ATCAAAACAGATTACCCT

QA 3 740 3 740
DS 

RD RR2BI77TF 740 0 0
GG
AGCTGAGGAAAAGGAAGAGAGGAGAAAAGAAAAGACCCACACACCGTAGACTCCATCGTC
TCTGAAACTAATCTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTGGAATGGCAGTCCACGATG
ACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACATACCGTTTCATCGTTTACA
AGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGATTGTTGAGAAACTCGGCGAACCTGGGCAATCCC
ACGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCCGATGAATGCCGATACGCCATCTTCGACTTTG
ATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAAAAGAGCAAGATATTCTTCGTCGCATGGTCTCCGG
ACACAGCGAGAGTGAGAAGCAAAATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGATTCAAGAGAG
AGCTAGATGGGATTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTCGACA
TTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTGTATCAAAACTTTGTTTCTTGTATTA
CCAAATTGATATGCTTTATCCCTAAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCA
TTTTATCGGTCTTTGTCTTGAGTGTTTTTTTT*CTTTTTGGTTCTTACAGTGTCTTGCTT
AGAACTTAAGATAATTGGCTTTGTGCTCTTTTACAGTTGTGTAAGAAACCCGAACCGTTT
ATCAAAACAGATTACCCT

QA 3 740 3 740
DS 

RD RR2FR29JQ 695 0 0
GACTCCATCGTCTCTGAAACTAATCTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTGGAATGG
CAGTCCACGATTACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACATACCGTT
TCATCGTTTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGATTGTTGAGAAACTCGGCGAAC
CTGGGCAATCCCACGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCCGATGAATGCCGATACGCCA
TCTTCGACTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAAAAGAGCAAGATTTTCTTCGTCG
CATGGTCTCCGGACACAGCGAGAGTGAGAAGCAAAATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACA
GATTCAAGAGAGAGCTAGATGGGACTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGA
TGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTGTATCAAAACTTTG
TTTCTTGTATTACCAAATTGATATGCTTTATCCCTAAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACC
AAAACAGCTTCATTTTATCGGTCTTTGTCTTGAGTGTTTTTTTTTCTTTTTGGTTCTTAC
AGTGTCTTGCTTAGAACTTAAGATAATTGGCTTTGTGCTCTTTTACAGTTGTGTAAGAAA
CCCGAACCGTTTATCAAAACAGATTACCCT
ATTGG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2DX19JQ 569 0 0
TTTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGATTGTTGAGAAACTCGGCGAACCTGGGC
AATCCCACGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCCGATGAATGCCGATACGCCATCTTCG
ACTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAAAAGAGCAAGATTTTTTTCGTCGCATGGT
CTCCGGACACAGCGAGAGTGAGAAGCAGAATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGATTCA
AGAGAGAGCTAGATGGGATTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATC
TCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTGTATCAAAACTTTGTTTCTT
GTATTACCAAATTGATATGCTTTATCCCTAAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACA
GCTTCATTTTATCGGTCTTTGTCTTGAGTGTTTTTTTT*CTTTTTGGTTCTTACAGTGTC
TTGCTTAGAACTTAAGATAATTGGCTTTGTGCTCTTTTACAGTTGTGTAAGAAACCCGAA
CCGTTTATCAAAACAGATTACCCTATTGG

QA 1 569 1 569
DS 



CO CL542Contig2 727 2 2 U
GGAAAGCTGAGGAATAGGAAGAGAAAAGAAAAGACGCACACACCCGTAGACTCCATCGTC
TCTGAAACTCATCTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTGGAATGGCAGTCCACGATG
ACTGCAAGCTCAAGTTTCTTGAACTCAAGGCCAAGAGGACTTACCGTTTCATCGTTTACA
AGATCGAGGAGCAGCAGAAGCAAGTGGTTGTAGAGAAACTCGGCGAACCTGGTCAATCAC
ATGATGACTTTGCAGCATGTCTTCCAGCTGATGAATGCAGATACGCCATCTTCGACTTTG
ATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCGTCGCATGGTCTCCTG
ACACTGCGAGAGTGAGAAGCAAAATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGGTTCAAGAGAG
AGCTAGACGGGATTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTCGACA
TTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTATATCAAAACTTTTGTTTCTTATGCT
TTATCCCTAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCGGTCTTTGT
CTTGAGTGTCTTTTTTTCTTTTGGTTCTTACAGTGTCTTGTTTAGAACTTAAGAGAATTG
GCTTGTGCTCTTTTACAGTTGTGTAAGAAACCCAAACCGTTTTATCAACAGATTACCCTA
TTGGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F543TF U 1
AF RR2F543JQ C 3
BS 1 702 RR2F543TF
BS 703 727 RR2F543JQ

RD RR2F543TF 712 0 0
GGAAAGCTGAGGAATAGGAAGAGAAAAGAAAAGACGCACACACCCGTAGACTCCATCGTC
TCTGAAACTCATCTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTGGAATGGCAGTCCACGATG
ACTGCAAGCTCAAGTTTCTTGAACTCAAGGCCAAGAGGACTTACCGTTTCATCGTTTACA
AGATCGAGGAGCAGCAGAAGCAAGTGGTTGTAGAGAAACTCGGCGAACCTGGTCAATCAC
ATGATGACTTTGCAGCATGTCTTCCAGCTGATGAATGCAGATACGCCATCTTCGACTTTG
ATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCGTCGCATGGTCTCCTG
ACACTGCGAGAGTGAGAAGCAAAATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGGTTCAAGAGAG
AGCTAGACGGGATTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTCGACA
TTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTATATCAAAACTTTTGTTTCTTATGCT
TTATCCCTAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCGGTCTTTGT
CTTGAGTGTCTTTTTTTCTTTTGGTTCTTACAGTGTCTTGTTTAGAACTTAAGAGAATTG
GCTTGTGCTCTTTTACAGTTGTGTAAGAAACCCAAACCGTTT
TATCAACAGA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2F543JQ 725 0 0
AAAGCTGAGGAATAG
GAAGAGAAAAGAAAAGACGCACACACCCGTAGACTCCATCGTCTCTGAAACTCATCTGAT
TCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTGGAATGGCAGTCCACGATGACTGCAAGCTCAAGTTT
CTTGAACTCAAGGCCAAGAGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAGGAGCAGCAG
AAGCAAGTGGTTGTAGAGAAACTCGGCGAACCTGGTCAATCACATGATGACTTTGCAGCA
TGTCTTCCAGCTGATGAATGCAGATACGCCATCTTCGACTTTGATTTCGTCACTGCTGAG
AACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTTTTCGTCGCATGGTCTCCTGACACTGCGAGAGTGAGA
AGCAAAATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGGTTCAAGAGAGAGCTAGACGGGATTCAA
GTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCC
AATTGAGGAACGGTTGTATATCAAAACTTTTGTTTCTTATGCTTTATCCCTAAGTTTGCT
GTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCGGTCTTTGTCTTGAGTGTCTTTTTTT
CTTTTGGTTCTTACAGTGTCTTGTTTAGAACTTAAGAGAATTGGCTTGTGCTCTTTTACA
GTTGTGTAAGAAACCCAAACCGTTTTATCAACAGATTACCCTATTGGAGC

QA 16 725 16 725
DS 



AS 2 10

CO CL543Contig1 1380 6 26 U
GGTAATCCCATAACATAGCCAGATTGTACTATTGTAAACCTTTTCAAATTAACAATAAAT
TTTATGCATCAATGAAACCCAATTAAGAGACTAAATGCAACTTATGGTTTTTTTAATATA
TACACAATACCCAGAAGCTGCATTTTTATGTATCTTATGTCATAAACAACAACATACAAT
CATTTGACAAATCTCTACAGAGATCACTTTGCTCATATGAGTCAGAATCCTCTCTGAAGA
AACAAATGTGCAGTGTCACCATCTTCTTACGCAATGTTCTTCCTGCTCTGCGACCAGAAT
GGTGTTGCGGGCTTGCGCTTTATGGCCTTGATACTAAACGGACTGTTCTTGCTCATTAAA
CAAGTTCCCTGATCAAGGTCACAAACGGGGTACTCGTGAGGGCAGCAACTATAGTTGTCA
TCACAACATGTGGCTGCTTCTAGTGGGCAACATCCCCAAGCAAGGCAATACTTGCCATAA
TCAAAAAGACAACAACAAGTGTTGCTCTCAGGACATGTGTAGTAACTGTCACATTGGGTC
GGAGGCGTGACGGGAGATGGAGGTGAAGGTCCAGGGTTTGGTGGGTTTTGGCCGTTCTTG
ATCGGATATGAAGGCTCAACAGCGATTCCACATTTTCCTGCTGAAGACGCAATGTTACGC
TCCATCCTTATGTATCCGCTCTCTCCCCAGCTTGTTCCCCATGAGTTTTTCACAATCCAA
TAGTCTTTGCCGCTCTCTGTTCCGTATCCGACCGCCAAAACTCCGTGGTCTAGATCTGTT
CCACAAATTCCATCGAATATCCCAGAATCATAGAGCTGGAACGCACGACCACCACCCTCA
ATGGCCACGCTGATTGGTTGGTGAGAAAGTGCTTTCTTCAAGGACTCTTCGCTGTTAGCC
GGCACATCCTCATATGAATCGATTGTAACAACTTTAGCGTTTTTTCTGGTCTGATCACAA
CGTCCGTCAACACCCTTGTAAGGGTAATCTTCCTCTGTATCGATTCCACCGTTGTTGATA
ATGAACTCAAAAGCATAGTCCATGAGACCTCCGTTACAACCTTCATTGTATGAAGTGTCA
CAGTCGACCAATTCTTGTTCAGACAATGATATTAAGTCTCCGGTCACGACCTTGTTTATG
CCCTCCACTGCTCCGATGAAAAAAAACGCCCAACAACTCCCGCAGCTTCCCTGATCTTTA
ACCTCAGCGACGGCACCTTCCTTCCTCCAGTCAACGCTCTCCGGGATAGCGTCACCTACA
CGCGCCTCGTAGCGAACGCTGGTCTTCGTGGCTTTCCTCTTGAGCCTAGACCCGAGGTAC
ATGGATCTATACTCATCGTTAGTGAGATCCGCAAACTTCGTAAGGCCCAATCTGTAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 0 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK60JQ U 140
AF RR2AX68JQ U 1
AF RR2B815JQ U 26
AF RR2GN63JQ U 51
AF RR2AX68TFB C 331
AF RR2B815TF C 671
BS 1 82 RR2AX68JQ
BS 83 83 RR2B815JQ
BS 84 312 RR2AX68JQ
BS 313 313 RR2B815JQ
BS 314 320 RR2AX68JQ
BS 321 321 RR2B815JQ
BS 322 485 RR2AX68JQ
BS 486 486 RR2B815JQ
BS 487 497 RR2AX68JQ
BS 498 498 RR2B815JQ
BS 499 543 RR2AX68JQ
BS 544 544 RR2B815JQ
BS 545 732 RR2AX68JQ
BS 733 733 RR2B815JQ
BS 734 793 RR2AX68JQ
BS 794 842 RR2B815JQ
BS 843 843 RR2GN63JQ
BS 844 882 RR2B815JQ
BS 883 883 RR2AX68TFB
BS 884 895 RR2B815JQ
BS 896 903 RR2AX68TFB
BS 904 904 RR2B815TF
BS 905 911 RR2AX68TFB
BS 912 912 RR2B815TF
BS 913 966 RR2AX68TFB
BS 967 1380 RR2B815TF

RD RR2EK60JQ 488 0 0
GCATTTTTATGTATCTTATGTCATAAACAACAACATACAATCATTTGACAAATCTCTACA
GAGATCACTTTGCTCATATGAGTCAGAATCCTCTCTGAAGAAACAAATGTGCAGTGTCAC
CATCTTCTTACGCAATGTTCTTCCTGCTCTGCGACCAGAATGGTGTTGCGGGCTTGCGCT
TTATGGCCTTGATACTAAACGGACTGTTCTTGCTCATTAAACAAGTTCCCTGATCAAGGT
CACAAACGGGGTACTCGTGAGGGCAGCAACTATAGTTGTCATCACAACATGTGGCTGCTT
CTAGTGGGCAGCATCCCCAAGCAAGGCAATACTTGCCATAATCAAAAAGGCAACAACAAG
TGTTGCTCTCAGGACATGTGTAGTAACTGTCACATTGGGTCGGAAGCGTGACGGGAGATG
GAGGTGAAGGTCCAGGGTTTGGTGGGTTTTGGCCGTTCTTGATCGGATATGAAGGCTCAA
CA
ACAATT

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR2AX68JQ 793 0 0
GGTAATCCCATAACATAGCCAGATTGTACTATTGTAAACCTTTTCAAATTAACAATAAAT
TTTATGCATCAATGAAACCCAACTAAGAGACTAAATGCAACTTATGGTTTTTTTAATATA
TACACAATACCCAGAAGCTGCATTTTTATGTATCTTATGTCATAAACAACAACATACAAT
CATTTGACAAATCTCTACAGAGATCACTTTGCTCATATGAGTCAGAATCCTCTCTGAAGA
AACAAATGTGCAGTGTCACCATCTTCTTACGCAATGTTCTTCCTGCTCTGCGACCAGAAT
GGTGTTGCGGGCCTGCGCTTCATGGCCTTGATACTAAACGGACTGTTCTTGCTCATTAAA
CAAGTTCCCTGATCAAGGTCACAAACGGGGTACTCGTGAGGGCAGCAACTATAGTTGTCA
TCACAACATGTGGCTGCTTCTAGTGGGCAACATCCCCAAGCAAGGCAATACTTGCCATAA
TCAAAGAGACAACAACAGGTGTTGCTCTCAGGACATGTGTAGTAACTGTCACATTGGGTC
GGAAGCGTGACGGGAGATGGAGGTGAAGGTCCAGGGTTTGGTGGGTTTTGGCCGTTCTTG
ATCGGATATGAAGGCTCAACAGCGATTCCACATTTTCCTGCTGAAGACGCAATGTTACGC
TCCATCCTTATGTATCCGCTCTCTCCCCAGCTTGTTCCCCATGAGTTTTTCACAATCCAA
TAGTCTTTGCCGTTCTCTGTTCCGTATCCGACCGCCAAAACTCCGTGGTCTAGATCTGTT
CCACAAATTCCAT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2B815JQ 870 0 0
GTACTATTGTAAACCTTTTCAAATTAACAATAAATTTTATGCATCAATGAAACCCAATTA
AGAGACTAAATGCAACTTATGGTTTTTT*AATATATACACAATACCCAGAAGCCGCATTT
TTATGTATCTTATGTCATAAACAACAACATACAATCATTTGACAAATCTCTACAGAGATC
ACTTTGCTCATATGAGTCAGAATCCTCTCTGAAGAAACAAATGTGCAGTGTCACCATCTT
CTTACGCAATGTTCTTCCTGCTCTGCGACCAGAATGGTGTTGCGGGCTTGCGCTTTATGG
CCTTGATACTAAACGGACTGTTCTTGCTCATTAAACAAGTTCCCTGATCAAGGTCACAAA
CGGGGTACTCGTGAGGGCAGCAACTATAGTTGTCATCACAACATGTGGCTGCTTCTAGTG
GGCAACATCCCCAAGCAAGGCAATACTTGCCATAATCAAAAAGACAACAACAAGTGTTGC
TCTCAGGACATGTGTAGTAACTGTCAAATTGGGTCGGAGGCGTGACGGGAGATGGAGGTG
AAGGTCCAGGGTTTGGTGGGTTTTGGCCGTTCTTGATCGGATATGAAGGCTCAACAGCGA
TTCCACATTTTCCTGCTGAAGACGCAATGTTACGCTCCATCCTTATGTATCCGCTCTCTC
CCCAGCTTGTTCCCCATGAGTTTTTCACAATCCAATAGTCTTTGCCGCTCTCTGTTCCGT
ACCCGACCGCCAAAACTCCGTGGTCTAGATCTGTTCCACAAATTCCATCGAATATCCCAG
AATCATAGAGCTGGAACGCACGACCACCACCCTCAATTGCCACGCTGATTGGTTGGTGAG
AAAGTGCTTTCTTCAAG*ACTCTTCGCTGT

QA 1 870 1 870
DS 

RD RR2GN63JQ 809 0 0
AACAATAAATTTTATGCATCAATGAAACCCAATTAAGAGACTAAATGCAACTTATGGTTT
TTTTAATATATACACAATACCCAGAAGCTGCATTTTTATGTATCTTATGTCATAAACAAC
AACATACAATCATTTGACAAATCTCTACAGAGATCACTTTGCTCATATGAGTCAAAATCC
TCTCTGAAAAAACAAATGTGCAGTGTCACCATCTTCTTACGCAATGTTCTTCCTGCTCTG
CGACCAGAATGGTGTTGCGGGCTTGCGCTTTATGGCCTTGATACTAAACGGACTGTTCTT
GCTCATTAAACAAGTTCCCTGATCAAGGTCACAAACGGGGTACTCGTGAGGGCAGCAACT
ATAGTTGTCATCACAACATGTGGCTGCTTCTAGTGGGCAACATCCCCAAGCAAGGCAATA
CTTGCCATAATCAAAAAAACAACAACAAGTGTTGCTCTCAGGACATGTGTAGTAACTGTC
ACATTGGGTCGGAGGCGTGACGGGAGATGGAGGTGAAGGTCCAGGGTTTGGTGGGTTTTG
GCCGTTCTTGATCGGATATGAAGGCTCAACAGCAATTCCACATTTTCCTGCTGAAGACGC
AATGTTACGCTCCATTCTTATGTATCCGCTCTCTCCCCAGCTTGTTCCCCATGAGTTTTT
CACAATCCAATAGTCTTTGCCGCTCTCTGTTCCGTATCCGACCGCCAAAACTCCGTGGTC
TAGATCTGTTCCACAAATTCCATCGAATATACCAGAATCATAGAGCTGGAACGCACGACC
ACCACCCTCAATGGCCACGCTGATTGGTT

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2AX68TFB 636 0 0
ATACTAAACGGACTGTTCTTGCTCATTAAACAAGTTCCCTGATCAAGGTCACAAACGGGG
TACTCGTGAGGGCAGCAACTATAGTTGTCATCACAACATGTGGCTGCTTCTAGTGGGCAA
CATCCCCAAGCAAGGCAATACTTGCCATAATCAAAGAGACAACAACAGGTGTTGCTCTCA
GGACATGTGTAGTAACTGTCACATTGGGTCGGAGGCGTGACGGGAGATGGAGGTGAAGGT
CCAGGGTTTGGTGGGTTTTGGCCGTTCTTGATCGGATATGAAGGCTCAACAGCGATTCCA
CATTTTCCTGCTGAAGACGCAATGTTACGCTCCATCCTTATGTATCCGCTCTCTCCCCAG
CTTGTTCCCCATGAGTTTTTCACAATCCAATAGTCTTTGCCGTTCTCTGTTCCGTATCCG
ACCGCCAAAACTCCGTGGTCTAGATCTGTTCCACAAATTCCATCGAATATCCCAGAATCA
TAGAGCTGGAACGCACGACCACCACCCTCAATGGCCACGCTGATTGGTTGGTGAGAAAGT
GCTTTCTTCAAGGACTCTTCGCTGTTAGCCGGCGCATCCTCGTATGAATCGATTGTAACA
ACTTTAGCGTTTTTTCTGGTCTGATCACAACGTCCG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2B815TF 710 0 0
TGTATCCGCTCTCTCCCCAGCTTGTTCCCCATGAGTTTTTCACAATCCAATAGTCTTTGC
CGCTCTCTGTTCCGTACCCGACCGCCAAAACTCCGTGGTCTAGATCTGTTCCACAAATTC
CATCGAATATCCCAGAATCATAGAGCTGGAACGCACGACCACCACCCTCAATTGCCACGC
TGATTGGTTGGTGAGAAAGTGCTTTCTTCAAGGACTCTTCGCTGTTAGCCGGCACATCCT
CATATGAATCGATTGTAACAACTTTAGCGTTTTTTCTGGTCTGATCACAACGTCCGTCAA
CACCCTTGTAAGGGTAATCTTCCTCTGTATCGATTCCACCGTTGTTGATAATGAACTCAA
AAGCATAGTCCATGAGACCTCCGTTACAACCTTCATTGTATGAAGTGTCACAGTCGACCA
ATTCTTGTTCAGACAATGATATTAAGTCTCCGGTCACGACCTTGTTTATGCCCTCCACTG
CTCCGATGAAAAAAAACGCCCAACAACTCCCGCAGCTTCCCTGATCTTTAACCTCAGCGA
CGGCACCTTCCTTCCTCCAGTCAACGCTCTCCGGGATAGCGTCACCTACACGCGCCTCGT
AGCGAACGCTGGTCTTCGTGGCTTTCCTCTTGAGCCTAGACCCGAGGTACATGGATCTAT
ACTCATCGTTAGTGAGATCCGCAAACTTCGTAAGGCCCAATCTGTAACTC

QA 1 710 1 710
DS 



CO CL543Contig2 812 4 16 U
GGATCACATCTTTCATCATCTTTCCTTCTCCTCCAAAGAAAAACAGTGAAAAGAAAATGA
AGCTCCTTAACTCAGCTACCGTGATCCTCTTCTTAACGATGATCGTGGTATCATCAGCGA
TGGATATGTCAATCATTTCCTACGACAAAAACCACCGCACCGTCTCTTCCAGAAGCGATG
CCGAAGTTTCAAGACTGTACGAGGAGTGGCTAGTCAAACACGGGAAGGCTCAGAATTCTC
TTACAGAGAAAGATCGACGGTTCGAGATCTTTAAAGACAATCTCCGTTTCATAGACGAAC
ACAACGGGAAGAATCTTAGTTACAGACTGGGTCTTACGAAGTTCGCGGATCTCACTAACA
ATGAGTATAGATCCATGTACGTCGGGTCTAGGCTCAAGAGGAAAGCCACGAAGACCAGCC
TTCGCTACGAGGCGCGTGTAGGTGACGCTATCCCGGAGAGCGTTGACTGGAGGAAGGAAG
GTGCCGTCGCTGAGGTTAAAGATCAGGGAAGCTGCGGGAGTTGTTGGGCGTTTTCAACAA
TCGGAGCAGTGGAGGGCATAAACAAGGTCGTGACCGGAGACTTAATATCATTGTCTGAAC
AAGAATTGGTCGACTGTGACACTTCATACAATGAAAGTTGTAACGGAG*TCTCATGGACT
ATGCTTTTGAGTTCATTATCAACAACGGTGGAATCGATACAGAGGAAGATACCCTTACAA
GGTGTTGACGGACGTTGTGATCAGACAGAAAAACGCTAAAGTTGTTACATCGATCATACG
AGGATGTGCCGGCTAACATCGAAGAGTCTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN63TF U 1
AF RR2FX22TF U 1
AF RR2EK60TF U 4
AF RR2FI70TF U 20
BS 1 50 RR2FX22TF
BS 51 51 RR2GN63TF
BS 52 65 RR2FX22TF
BS 66 66 RR2GN63TF
BS 67 112 RR2FX22TF
BS 113 113 RR2GN63TF
BS 114 219 RR2FX22TF
BS 220 220 RR2GN63TF
BS 221 655 RR2FX22TF
BS 656 656 RR2EK60TF
BS 657 680 RR2FX22TF
BS 681 681 RR2EK60TF
BS 682 687 RR2FX22TF
BS 688 688 RR2EK60TF
BS 689 704 RR2FX22TF
BS 705 812 RR2FI70TF

RD RR2GN63TF 314 0 0
GGATCGT
ATCTTTCATCATCTTTCCTTCTCCTCCAAAGAAAAACAGTGAAAAGAAAATGAAGCTCCT
TAACTCAGCTACCGTGATCCTCTTCTTAACGATGATCGTGGTATCATCAGCGATGGATAT
GTCAATCATTTCCTACGACAAAAACCACCGCACCGTCTCTTCCAGAAGCGATGCCGAAGT
TTCAAGACTGTACGAGGAGTGGCTAGTGAAACACGGGAAGGCTCAGAATTCTCTTACAGA
GAAAGATCGACGGTTCGAGATCTTTAAAGACAATCTCCGTTTCATAGACGAACACAACGG
GAAGAAT

QA 8 314 8 314
DS 

RD RR2FX22TF 714 0 0
GGATCACATCTTTCATCATCTTTCCTTCTCCTCCAAAGAAAAACAGTGAAGAGAAAATGA
AGCTCTTTAACTCAGCTACCGTGATCCTCTTCTTAACGATGATCGTGGTATCGTCAGCGA
TGGATATGTCAATCATTTCCTACGACAAAAACCACCGCACCGTCTCTTCCAGAAGCGATG
CCGAAGTTTCAAGACTGTACGAGGAGTGGCTAGTCAAACGCGGGAAGGCTCAGAATTCTC
TTACAGAGAAAGATCGACGGTTCGAGATCTTTAAAGACAATCTCCGTTTCATAGACGAAC
ACAACGGGAAGAATCTTAGTTACAGACTGGGTCTTACGAAGTTCGCGGATCTCACTAACA
ATGAGTATAGATCCATGTACGTCGGGTCTAGGCTCAAGAGGAAAGCCACGAAGACCAGCC
TTCGCTACGAGGCGCGTGTAGGTGACGCTATCCCGGAGAGCGTTGACTGGAGGAAGGAAG
GTGCCGTCGCTGAGGTTAAAGATCAGGGAAGCTGCGGGAGTTGTTGGGCGTTTTCAACAA
TCGGAGCAGTGGAGGGCATAAACAAGGTCGTGACCGGAGACTTAATATCATTGTCTGAAC
AAGAATTGGTCGACTGTGACACTTCATACAATGAAAGTTGTAACGGAG*TCTCATTGACT
ATGCTTTTGAGTTCATTATCGACAACG*TGGAATCGATACAGAG
AAGATACCCT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2EK60TF 706 0 0
GGGT
ATCTTTCATCATCTTTCCTTCTCCTCCAAAGAAAAACAGTGAAAAGAAAATGAAGCTCCT
TAACTCAGCTACCGTGATCCTCTTCTTAACGATGATCGTGGTATCATCAGCGATGGATAT
GTCAATCATTTCCTACGACAAAAACCACCGCACCGTCTCTTCCAGAAGCGATGCCGAAGT
TTCAAGACTGTACG**GAGTGGCTAGTGAAACACGGGAAGGCTCAGAATTCTCTTACAGA
GAAAGATCGACGGTTCGAGATCTTTAAAGACAATCTCCGTTTCATAGACGAACACAACGG
GAAGAATCTTAGTTACAGATTGGGTCTTACGAAGTTCGCGGATCTCACTAACGATGAGTA
TAGATCCATGTACCTCGGGTCTAGGCTCAAGAGGAAAGCCACGAAGACCAGCCTTCGCTA
CGAGGCGCGTGTAGGTGACGCTATCCCGGAGAGCGTTGATTGGAGGAAGGAAGGTGCCGT
CGCTGAGGTTAAAGATCATGGAAGCTGCGGGAGTTGTTGGGCGTTTTCAACAATCGGAGC
AGTGGAGGGCATAAACAAGGTCGTGACCGGAGACTTAATATCATTGTCTGAACAAGAATT
GGTCGACTGTGACACTTCATACAATGAAAGTTGTAACGGAG*TCTCATGGACTATGCTTT
TGAGTTCATTATCAACAACGGTGGAATCGATACAGAG
GAAGA

QA 5 701 5 701
DS 

RD RR2FI70TF 793 0 0
CTTTCCTTCTCCTCCAAAGAAAAACAGTGAAGAGAAAATGAAGCTCTTTAACTCAGCTAC
CGTGATCCTCTTCTTAACGATGATCGTGGTATCATCAGCGATGGATATGTCAATCATTTC
CTACGACAAAAACCACCGCACCGTCTCTTCCAGAAGCGATGCCGAAGTTTCAAGACTGTA
CGAGGAGTGGCTAGTCAAACGCGGGAAGGCTCAGAATTCTCTTACAGAGAAAGATCGACG
GTTCGAGATCTTTAAAGACAATCTCCGTTTCATAGACGAACACAACGGGAAGAATCTTAG
TTACAGACTGGGTCTTACGAAGTTCGCGGATCTCACTAACAATGAGTATAGATCCATGTA
CGTCGGGTCTAGGCTCAAGAGGAAAGCCACGAAGACCAGCCTTCGCTACGAGGCGCGTGT
AGGTGACGCTATCCCGGAGTGCGTTGACTGGAGGAAGGAAGGTGCCGTCGCTGAGGTTAA
AGATCAGGGAAGCTGCGGGAGTTGTTGGGCGTTTTCAACAATCGGAGCAGTGGAGGGCAT
AAACAAGGTCGTGACCGGAGACTTAATATCATTGTCTGAACAAGAATTGGTCGACTGTGA
CACTTCATACAATGAAAGTTGTAACGGAGGTCTCATGGACTATGCTTTTGAGTTCATTAT
CAACAACGGTGGAATCGATACAGAGGAAGATACCCTTACAAGGTGTTGACGGACGTTGTG
ATCAGACAGAAAAACGCTAAAGTTGTTACATCGATCATACGAGGATGTGCCGGCTAACAT
CGAAGAGTCTTGA

QA 1 793 1 793
DS 



AS 2 9

CO CL544Contig1 742 7 8 U
GTACTTAAAAGTTAAACTTGCCATTTAGAACATTTGTTTTTCCCTTACACAAAGCAAACC
ACAAACAGAGTAGCTCATACCATTGGTTTTTGGCTCTGTTACTTAGTCTCACTTTCTCTC
TACATAAATCTTTTGTTTCAAATCTCTCACAAACACACAGACAAACTCACTCATACATTA
GACACAACAAGAACAAGGGTAGTCGCTTATT**CGGCAGAGCTTCTTCACCCTTTTGCTC
GACTCTTAGCTAACTCCCAAAAGCTTACGCTCTTATGGTAATATGCATATATATATATAG
AGATAGATAGATTTCACATCACTTCCCTTAGCAACGTGGTATTGCAAGGTTGCTCGGCTT
ATGCAGAACCAGCTTGTTCGCAGAGATCTAGAAGATCCAACGTCTCAGGAACAGAGAGCT
CAAGACGGAATTTTGGTCCATCGTAGTGGTGAAGAACAGGCCTGAAGGAATCCTCTTCCA
AGGCTTTGCAGATCTTCCTCACTCTGATCCTTACCTGAGCCGGAAATCTTGACTCTCCTT
TGCACTTTTTGTCTTCCCAAGCAGTTGCATCAATATTGGTACCTCCAAAAGTTGTTGCCT
CAAAGATACCATGCAGCTGGTGAGTAGTGTAGTTGTACAGAAACAGAGGCAATCCAGGTG
TTATCGCCCGAACAGAGTCCCTGTATCTTGGAGGTAAACCAAAGAGGTGACGTTTCAAGT
CCTCCTGCATGGTATCATTGTT


BQ
10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 15 15 15 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 30 30 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 15 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY58JQ U 1
AF RR2GU50JQB U 3
AF RR2H696TF C 6
AF RR2H976TF C 6
AF RR2FV68JQ U 21
AF RR2FV68TF C 21
AF RR2FI26JQ U 3
BS 1 343 RR2EY58JQ
BS 344 344 RR2GU50JQB
BS 345 625 RR2EY58JQ
BS 626 626 RR2FV68JQ
BS 627 645 RR2EY58JQ
BS 646 673 RR2FI26JQ
BS 674 674 RR2FV68JQ
BS 675 742 RR2FI26JQ

RD RR2EY58JQ 645 0 0
GTACTTAAAAGTTAAACTTGCCATTTAGAACATTTGTTTTTCCCTTACACAAAGCAAACC
ACAAACAGAGTAGCTCATACCATTGGTTTTTGGCTCTGTTACTTAGTCTCACTTTCTCTC
TACATAAATCTTTTGTTTCAAATCTCTCACAAACACACAGACAAACTCACTCATACATTA
GACACAACAAGAACAAGGGTAGTCGCTTATT**CGGCAGAGCTTCTTCACCCTTTTGCTC
GACTCTTAGCTAACTCCCAAAAGCTTACGCTCTTATGGTAATATGCATATATATATATAG
AGATAGATAGATTTCACATCACTTCCCTTAGCAACGTGGTATTACAAGGTTGCTCGGCTT
ATGCAGAACCAGCTTGTTCGCAGAGATCTAGAAGATCCAACGTCTCAGGAACAGAGAGCT
CAAGACGGAATTTTGGTCCATCGTAGTGGTGAAGAACAGGCCTGAAGGAATCCTCTTCCA
AGGCTTTGCAGATCTTCCTCACTCTGATCCTTACCTGAGCCGGAAATCTTGACTCTCCTT
TGCACTTTTTGTCTTCCCAAGCAGTTGCATCAATATTGGTACCTCCAAAAGTTGTTGCCT
CAAAGATACCATGCAGCTGGTGAGTGGTGTAGTTGTACAGAAACA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2GU50JQB 627 0 0
GCT
TAAAAGTTAAACTTGCCATTTAGAACATCTGTTTTTCCCTTACACAAAGCAAACCACAAA
CAGAGTAGCTCATACCATTGGTTTTTGGCTCTGTTACTTAGTCTCACTTTCTCTCTACAT
AAATCTTTTGTTTCAAATCTCTCACAAACACACAGACAAACTCACTCATACATTAGACAC
AACAAGAACAAGGGTAGTCGCTTATT**CGGCAGAACTTCTTCACCCTTTTGCTCGACTC
TTAGCTAACTCCCAAAAGCTTACGCTCTTATGGTAATATGCATATATATATATAGAGATA
GATAGATTTCACATCACTTCCCTTAGCAACGTGGTATTGCAAGGTTGCTCGGCTTATGCA
GAACCAGCTTGTTCGCAGAGATCTAGAAGATCCAACGTCTCAGGAACAGAGAGCTCAAGA
CGGAATTTTGGTCCATCGTAGTGGTGAAGAACAGGCCTGAAGGAATCCTCTTCCAAGGCT
TTGCAGATCTTCCTCACTCTGATCCTTACCTGAGCCGGAAATCTTGACTCTCCTTTGCAC
TTTTTGTCCTCCCAAGCAGTTGCATCAATATTGGTACCTCCAAAAGTTGTTGCCTCAAAG
ATACCATGCAGCTGGTGAGT
GGTG

QA 4 623 4 623
DS 

RD RR2H696TF 619 0 0
TAAAAGTTAAACTTGCCATTTAGAACATTTGTTTTTCCCTTACACAAAGCAAACCACAAA
CAGAGTAGCTCATACCATTGGTTTTTGGCTCTGTTACTTAGTCTCACTTTCTCTCTACAT
AAATCTTTTGTTTCAAATCTCTCACAAACACACAGACAAACTCACTCATACATTAGACAC
AACAAGAACAAGGGTAGTCGCTTATT**CGGCAGAGCTTCTTCACCCTTTTGCTCGACTC
TTAGCTAACTCCCAAAAGCTTACGCTCTTATGGTAATATGCATATATATATATAGAGATA
GATAGATTTCACATCACTTCCCTTAGCAACGTGGTATTGCAAGGTTGCTCGGCTTATGCA
GAACCAGCTTGTTCGCAGAGATCTAGAAGATCCAACGTCTCAGGAACAGAGAGCTCAAGA
CGGAATTTTGGTCCATCGTAGTGGTGAAGAACAGGCCTGAAGGAATCCTCTTCCAAGGCT
TTGCAGATCTTCCTCACTCTGATCCTTACCTGAGCCGGAAATCTTGACTCTCCTTTGCAC
TTTTTGTCTTCCCAAGCAGTTGCATCAATATTGGTACCTCCAAAAGTTGTTGCCTCAAAG
ATACCATGCAGCTGGTGA
C

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2H976TF 619 0 0
TAAAAGTTAAACTTGCCATTTAGAACATTTGTTTTTCCCTTACACAAAGCAAACCACAAA
CAGAGTAGCTCATACCATTGGTTTTTGGCTCTGTTACTTAGTCTCACTTTCTCTCTACAT
AAATCTTTTGTTTCAAATCTCTCACAAACACACAGACAAACTCACTCATACATTAGACAC
AACAAGAACAAGGGTAGTCGCTTATT**CGGCAGAGCTTCTTCACCCTTTTGCTCGACTC
TTAGCTAACTCCCAAAAGCTTACGCTCTTATGGTAATATGCATATATATATATAGAGATA
GATAGATTTCACATCACTTCCCTTAGCAACGTGGTATTGCAAGGTTGCTCGGCTTATGCA
GAACCAGCTTGTTCGCAGAGATCTAGAAGATCCAACGTCTCAGGAACAGAGAGCTCAAGA
CGGAATTTTGGTCCATCGTAGTGGTGAAGAACAGGCCTGAAGGAATCCTCTTCCAAGGCT
TTGCAGATCTTCCTCACTCTGATCCTTACCTGAGCCGGAAATCTTGACTCTCCTTTGCAC
TTTTTGTCTTCCCAAGCAGTTGCATCAATATTGGTACCTCCAAAAGTTGTTGCCTCAAAG
ATACCATGCAGCTGGTGA
C

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2FV68JQ 671 0 0
CCATTTAGAACATTTGTTTTTCCCTTGCACAAAGCAAACCACAAACAGAGTAGCTCATAC
CATTGGTTTTTGGCTCTGTTACTTAGTCTCACTTTCTCTCTACATAAATCTTTTGTTTCA
AATCTCTCACAAACACACAGACAAACTCACTCATACATTAGACAAAACAAGAACAAGGGT
AGTCGCTTATTTTCGGCAGAGCTTCTTCACCCTTTTGCTCGACTCTTAGCTAACTCCCAA
AAGCTTACGCTCTTATGGTGGTA***ATATGCATATATATAGATAGATAGATTTCACATC
ACTTCCCTTAGCAACGTGGTATTGCAAGGTGGATCGGCTTATGCAGAACCAGCTTGTTCG
CAAAGATCTAGAAGATCCAACGTCTCAGGAACAGAGAGCTCAAGACGGAATTTTGGTCCA
TCATAGTGGTGAAGAACAGGCATGAAGGAATCCTCTTCCAAGGCTTTGCAGATCTTCCTC
ACTCTGATCCTTACCTGAGCCGGAAATCTTGACTCTCCTTTGCACTTTTTGTCTTCCCAA
GCAGTTGCATCAATATTGGTACCTCCAAAAGTTGTTGCCTCAAAGATACCATGCAGCTGG
TGAGTAGTGTAGTTGTACAGAAACAGAGGCAATCCAGGTGTTATCGCCCGAACAGAGTCC
CTGTATCTTG
C

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2FV68TF 671 0 0
CCATTTAGAACATTTGTTTTTCCCTTGCACAAAGCAAACCACAAACAGAGTAGCTCATAC
CATTGGTTTTTGGCTCTGTTACTTAGTCTCACTTTCTCTCTACATAAATCTTTTGTTTCA
AATCTCTCACAAACACACAGACAAACTCACTCATACATTAGACAAAACAAGAACAAGGGT
AGTCGCTTATTTTCGGCAGAGCTTCTTCACCCTTTTGCTCGACTCTTAGCTAACTCCCAA
AAGCTTACGCTCTTATGGTGGTA***ATATGCATATATATAGATAGATAGATTTCACATC
ACTTCCCTTAGCAACGTGGTATTGCAAGGTGGATCGGCTTATGCAGAACCAGCTTGTTCG
CAGAGATCTAGAAGATCCAACGTCTCAGGAACAGAGAGCTCAAGACGGAATTTTGGTCCA
TCATAGTGGTGAAGAACAGGCATGAAGGAATCCTCTTCCAAGGCTTTGCAGATCTTCCTC
ACTCTGATCCTTACCTGAGCCGGAAATCTTGACTCTCCTTTGCACTTTTTGTCTTCCCAA
GCAGTTGCATCAATATTGGTACCTCCAAAAGTTGTTGCCTCAAAGATACCATGCAGCTGG
TGAGTAGTGTAGTTGTACAGAAACAGAGGCAATCCAGGTGTTATCGCCCGAACAGAGTCC
CTGTATCTTG
C

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2FI26JQ 740 0 0
GCT
TAAAAGTTAAACTTGCCATTTAGAACATTTGTTTTTCCCTTACACAAAGCAAACCACAAA
CAGAGTAGCTCATACCATTGGTTTTTGGCTCTGTTACTTAGTCTCACTTTCTCTCTACAT
AAATCTTTTGTTTCAAATCTCTCACAAACACACAGACAAACTCACTCATACATTAGACAC
AACAAGAACAAGGGTAGTCGCTTATT**CGGCAGAGCTTCTTCACCCTTTTGCTCGACTC
TTAGCTAACTCCCAAAAGCTTACGCTCTTATGGTAATATGCATATATATATA**GAGATA
GATAGATTTCACATCACTTCCCTTAGCAACGTGGTATTGCAAGGTTGCTCGGCTTATGCA
GAACCAGCTTGTTCGCAGAGATCTAGAAGATCCAACGTCTCAGGAACAGAGAGCTCAAGA
CGGAATTTTGGTCCATCGTAGTGGTGAAGAACAGGCCTGAAGGAATCCTCTTCCAAGGCT
TTGCAGATCTTCCTCACTCTGATCCTTACCTGAGCCGGAAATCTTGACTCTCCTTTGCAC
TTTTTGTCTTCCCAAGCAGTTGCATCAATATTGGTACCTCCAAAAGTTGTTGCCTCAAAG
ATACCATGCAGCTGGTGAGTGGTGTAGTTGTACAGAAACAGAGGCAATCCAGGTGTTATC
GCCCGAACCGAGTCCCTGTATCTTGGAGGTAAACCAAAGAGGTGACGTTTCAAGTCCTCC
TGCATGGTATCATTGTT

QA 4 740 4 740
DS 



CO CL544Contig2 782 2 5 U
GGGACCATCTCTCTCTTTCTCTTCTGACGTGTTTCCCTTCATCTCCGGCGACTTTCGAGG
AAGCGAAGCTCAAGGTTTAGGAACTATGGACAGCTTCTGGCAATTAGGTGATGAGCTCCG
AGGTCAGTCACGAGCCTCCGAGGATCACAAATGGTCCACTGTTGCTACCAAGCTCGCTGA
GCAGACTAGGATGAAAGGAGAAAGGATGAACAACCTTGATCTCTCCAAACCCTACTCTGA
GTTCAGGCCGCCTACAACCGACAAGTTTAGTTTCCAGGACAACAACAACCTTAACTTCAA
CATGTTGAACTTTGACGGCAAATTTGTGCAAGGCATGGGCAAGGCTCCGATGCAGAGCAG
CAATGTTTACAACAACAACGTGAACAATGTTTTCCAGAAGAACGACTTCAAGAGCGGAGG
AGGCAACTTGAAGGTTAACAAGTACAGTGGCAATGTTGTTGCTAACAAGGAGCTGAGCAA
CAACAACAAGCACAACAATAATGATAATCTGGGTGTTGACAAGAGGTTTAAGACCCTGCC
TGCTTCGGAGACGCTTCCAAGGAATGAAGTTCTTGGCGGCTACATCTTTGTTTGCAACAA
TGATACCATGCAGGAGGACTTGAAACGTCACCTCTTTGGTTTACCTCCAAGATACAGGGA
CTCGGTTCGGGCGATAACACCTGGATTGCCTCTGTTTCTGTACAACTACACCACTCACCA
GCTGCATGGTATCTTTGAGCACACTTTTGGAGGTACCAATATTGATGCACTGCTTGGGAA
GA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2EY58TF U 2
AF RR2FI26TF U 1
BS 1 148 RR2FI26TF
BS 149 149 RR2EY58TF
BS 150 704 RR2FI26TF
BS 705 705 RR2EY58TF
BS 706 782 RR2FI26TF

RD RR2EY58TF 736 0 0
GGACCATCTCTCTCTTTCTCTTCTGACGTGTTTCCCTTCATCTCCGGTGACTTTCGAGGA
AGCGAAGCTCAAGGTTTAGGAACTATGGACAGCTTCTGGCAATTAGGTGATGAGCTCCGA
GGTCAGTCACGAGCCTCCGAGGATCACAAATGGTCCACTGTTGCTACCAAGCTCGCTGAG
CAGACTAGGATGGAAGGAGAAAGGATGAACAACCTTGATCTCTCCAAACCCTACTCTGAG
TTCAGGCCGCCTACAACCGACAAGTTTAGTTTCCAGGACAACAACAACCTTAACTTCAAC
ATGTTGAACTTTGACGGCAAATTTGTGCAAGGCATGGGCAAGGCTCCGATGCAGAGCAGC
AATGTTTACAACAACAACGTGAACAATGTTTTCCAGAAGAACGACTTCAAGAGCGGAGGA
GGCAACTTGAAGGTTAACAAGTACAGTGGCAATGTTGTTGCTAACAAGGAGCTGAGCAAC
AACAACAAGCGCAACAATAATGATAATCTGGGTGTTGACAAGAGGTTTAAGACCCTGCCT
GCTTCGGAGACGCTTCCAAGGAATGAAGTTCTTGGCGGCTACATCTTTGTTTGCAACAAT
GATACCATGCAGGAGGACTTGAAACGTCACCTCTTTGGTTTACCTCCAAGATACAGGGAC
TCGGTTCGGGCGATAACACCTGGATTGCCTCTGTTTCTGTACAACTACACCACTCACCAG
CTGCATGGTATCTTTG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2FI26TF 782 0 0
GGGACCATCTCTCTCTTTCTCTTCTGACGTGTTTCCCTTCATCTCCGGCGACTTTCGAGG
AAGCGAAGCTCAAGGTTTAGGAACTATGGACAGCTTCTGGCAATTAGGTGATGAGCTCCG
AGGTCAGTCACGAGCCTCCGAGGATCACGAATGGTCCACTGTTGCTACCAAGCTCGCTGA
GCAGACTAGGATGAAAGGAGAAAGGATGAACAACCTTGATCTCTCCAAACCCTACTCTGA
GTTCAGGCCGCCTACAACCGACAAGTTTAGTTTCCAGGACAACAACAACCTTAACTTCAA
CATGTTGAACTTTGACGGCAAATTTGTGCAAGGCATGGGCAAGGCTCCGATGCAGAGCAG
CAATGTTTACAACAACAACGTGAACAATGTTTTCCAGAAGAACGACTTCAAGAGCGGAGG
AGGCAACTTGAAGGTTAACAAGTACAGTGGCAATGTTGTTGCTAACAAGGAGCTGAGCAA
CAACAACAAGCACAACAATAATGATAATCTGGGTGTTGACAAGAGGTTTAAGACCCTGCC
TGCTTCGGAGACGCTTCCAAGGAATGAAGTTCTTGGCGGCTACATCTTTGTTTGCAACAA
TGATACCATGCAGGAGGACTTGAAACGTCACCTCTTTGGTTTACCTCCAAGATACAGGGA
CTCGGTTCGGGCGATAACACCTGGATTGCCTCTGTTTCTGTACA*CTACACCACTCACCA
GCTGCATGGTATCTTTGAGCACACTTTTGGAGGTACCAATATTGATGCACTGCTTGGGAA
GA

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 10

CO CL545Contig1 666 10 8 U
GGACTCACCAAAGCATCAAATACATTTTACTTCTCTTCTATTTCTCTTTATATCCATCAT
CTTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAG
CAGAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGC
CGGAAGAAGTCGTGGCTGCCACGACAGAATCTGCCGCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAAC
AAGAATCTGAAGCACCAGTGGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTGGGAGAGGCAGAGA
AAAAAGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCTGTGGCTG
AGGAGGAGGCAAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTATTGTGGAGG
AGGAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTTGCCGCCGAGAAGGCCG
AGGAGTAAAGACGAAGAAACAATATGTATTTTCTATCGTTGTTTGGTCTCATTTCGTTGT
TTTAAAAAGATCACTTCGCAAAATTTCATAAGTATTTTCTATCGTGTGTTATGATGAAAT
GATATTTGGTTATGATGAAATGATATATTTGGG*AGTTTTGCTGGTTGTTACAAAAAAGA
AAAAAA


BQ
35 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 
55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 30 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2A702TF U 1
AF RR2AP89JQ C 1
AF RR2AP89TF U 1
AF RR2B335TF U 1
AF RR2FF21JQ C 63
AF RR2EZ76TF U -1
AF RR2FF21TF U 1
AF RR2FE39JQ C 2
AF RR2B335JQ C 42
AF RR2FE39TF U 2
BS 1 17 RR2A702TF
BS 18 18 RR2AP89TF
BS 19 617 RR2A702TF
BS 618 633 RR2AP89TF
BS 634 634 RR2B335TF
BS 635 648 RR2AP89TF
BS 649 650 RR2B335TF
BS 651 666 RR2FE39TF

RD RR2A702TF 617 0 0
GGACTCACCAAAGCATCGAATACATTTTACTTCTCTTCTATTTCTCTTTATATCCATCAT
CTTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAG
CAGAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGC
CGGAAGAAGTCGTGGCTGCCACGACAGAATCTGCCGCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAAC
AAGAATCTGAAGCACCAGTGGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTGGGAGAGGCAGAGA
AAAAAGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCTGTGGCTG
AGGAGGAGGCAAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTATTGTGGAGG
AGGAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTTGCCGCCGAGAAGGCCG
AGGAGTAAAGACGAAGAAACAATATGTATTTTCTATCGTTGTTTGGTCTCATTTCGTTGT
TTTAAAAAGATCACTTCGCAAAATTTCATAAGTATTTTCTATCGTGTGTTATGATGAAAT
GATATTTGGTTATGATG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2AP89JQ 650 0 0
GGACTCACCAAAGCATCAAATACATTTTACTTCTCTTCTATTTCTCTTTATATCCATCGT
CTTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAG
CAGAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGC
CGGAAGAAGTCGTGGCTGCCACGACAGAATCTGCCGCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAAC
AAGAATCTGAAGCACCAGTGGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTGGGAGAGGCAGAGA
AAAAAGATTAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGGAGCTCCTGTGGCTG
AGGAGGAGGCAAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTATTGTGGAGG
AGGAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTTGCCGCCGAGAAGGCCG
AGGAGTAAAGACGAAGAAACAATATGTATTTTCTATCGTTGTTTGGTCTCATTTCGTTGT
TTTAAAAAGATCACTTCGCAAAATTTCATAAGTATTTTCTATCGTGTGTTATGATGAAAT
GATATTTGGTTATGATGAAATGATATATTTGGG*AGTTTTGCTGGTTG
CC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2AP89TF 650 0 0
GGACTCACCAAAGCATCAAATACATTTTACTTCTCTTCTATTTCTCTTTATATCCATCGT
CTTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAG
CAGAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGC
CGGAAGAAGTCGTGGCTGCCACGACAGAATCTGCCGCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAAC
AAGAATCTGAAGCACCAGTGGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTGGGAGAGGCAGAGA
AAAAAGATTAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGGAGCTCCTGTGGCTG
AGGAGGAGGCAAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTATTGTGGAGG
AGGAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTTGCCGCCGAGAAGGCCG
AGGAGTAAAGACGAAGAAACAATATGTATTTTCTATCGTTGTTTGGTCTCATTTCGTTGT
TTTAAAAAGATCACTTCGCAAAATTTCATAAGTATTTTCTATCGTGTGTTATGATGAAAT
GATATTTGGTTATGATGAAATGATATATTTGGGGAGTTTTGCTGGTTG
CC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2B335TF 650 0 0
GGACTCACCAAAGCATCAAATACATTTTACTTCTCTTCTATTTCTCTTTATATCCATCAT
CTTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAG
CAGAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGC
CGGAAGAAGTCGTGGCTGCCACGACAGAATCTGCCGCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAAC
AAGAATCTGAAGCACCAGTGGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTGGGAGAGGCAGAGA
AAAAAGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCTGTGGCTG
AGGAGGAGGCAAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTATTGTGGAGG
AGGAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTTGCCGCCGAGAAGGCCG
AGGAGTAAAGACGAAGAAACAATATGTATTTTCTATCGTTGTTTGGTCTCATTTCGTTGT
TTTAAAAAGATCACTTCGCAAAATTTCATAAGTATTTTCTATCGTGTGTTATGATGAAAT
GATATTTGGTTATGATGAAATGATATATTTGGG*AGTTTTGCTGGTTGTT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2FF21JQ 588 0 0
TTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAGCA
GAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGCCG
GAAGAAGTCGTGGCTGCCACGACAGAATCTGCCGCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAACAA
GAATTTGAAGCACCAGTGGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTGGGAGAGGCAGAGAAA
AAAGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCTGTGGCTGAG
GAGGAGGCAAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTATTGTGGAGGAG
GAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTTGCCGCCGAGAAGGCCGAG
GAGTAAAGACGAAGAAACAATATGTATTTTCTATCGTTGTTTGGTCTCATTTCGTTGTTT
TAAAAGGATCACTTCGCAAAATTTCATAGGTATTTTCTATCGTGTGTTATGATGAAATGA
TATTTGGTTATGATGAAATGATATATTTGGG*AGTTTTGCTGGTTGTT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2EZ76TF 638 0 0
GGTC
ACTCACCAAAGCATCAAATACATTTTACTTCTCTTCTATTTCTCTTTATATCCATCATCT
TTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAGCA
GAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGCCG
GAAGAAGTCGTGGCTGCCACGACAGAATCTGCCGCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAACAA
GAATCTGAAGCACCAGTGGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTGGGAGAGGCAGAGAAA
AAAGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCTGTGGCTGAG
GAGGAGGCAAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTATTGTGGAGGAG
GAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTTGCCGCCGAGAAGGCCGAG
GAGTAAAGACGAAGAAACAATATGTATTTTCTATCGTTGTTTGGTCTCATTTCGTTGTTT
TAAAAAGATCACTTCGCAAAATTTCATAAGTATTTTCTATCGTGTGTTATGATGAAATGA
TATTTGGTTATGATGAAATGATATATTTGGG*AG

QA 5 638 5 638
DS 

RD RR2FF21TF 650 0 0
GGACTCACCAAAGCATCAAATACATTTTACTTCTCTTCTATTTCTCTTTATATCCATCAT
CTTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAG
CAGAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGC
CGGAAGAAGTCGTGGCTGCCACGACAGAATCTGCCGCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAAC
AAGAATCTGAAGCACCAGTGGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTGGGAGAGGCAGAGA
AAAAAGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCTGTGGCTG
AGGAGGAGGCAAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTATTGTGGAGG
AGGAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTTGCCGCCGAGAAGGCCG
AGGAGTAAAGACGAAGAAACAATATGTATTTTCTATCGTTGTTTGGTCTCATTTCGTTGT
TTTAAAAGGATCACTTCGCAAAATTTCATAGGTATTTTCTATCGTGTGTTATGATGAAAT
GATATTTGGTTATGATGAAATGATATATTTGGG*AGTTTTGCTGGTTGTT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2FE39JQ 651 0 0
GACTCACCAAAGCATCAAATACATTTTACTTCTCTTCTATTTCTCTTTATATCCATCATC
TTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAGC
AGAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGCC
GGAAGAAGTCGTGGCTGCCACGACAGAATCTGCCGCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAACA
AGAATCTGAAGCACCAGTGGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTGGGAGAGGCAGAGAA
AAAAGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCTGTGGCTGA
GGAGGAGGCAAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTATTGTGGAGGA
GGAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTTGCCGCCGAGAAGGCCGA
GGAGTAAAGACGAAGAAACAATATGTATCTTCTATCGTTGTTTGGTCTCATTTCGTTGTT
TTAAAAAGATCACTTCGCAAAATTTCATAAGTATTTTCTATCGTGTGTTATGATGAAATG
ATATTTGGTTATGATGAAATGATATATTTGGG*AGTTTTGCTGGTTGTT
AC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2B335JQ 609 0 0
TTCTCTTTATATCCATCATCTTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAA
CAAGTGATTGCTCCAGCAGCAGAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCA
GATGTGGAGACCAAACAGCCGGAAGAAGTCGTGGCTGCCACGACAGAATTTGCCGCTGCT
CCAGCCGCCGTAACTGAACAAGAATTTGAAGCACCAGTGGTAGAAACGAGCAAAGAAGTG
GTTGTGGGAGAGGCAGAGAAAAAAGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAG
ACGGAAGCTCCTGTGGCTGAGGAGGAGGCAAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAA
ACTCCGGCTATTGTGGAGGAGGAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAA
GTTGCCGCCGAGAAGGCCGAGGAGTAAAGACGAAGAAACAATATGTATTTTCTATCGTTG
TTTGGTCTCATTTCGTTGTTTTAAAAAAATCACTTCGCAAAATTTCATAAGTATTTTTTA
TCGTGTGTTATGATGAAATGATATTTGGTTATGATGAAATGATATATTTGGG*AGTTTTG
CTGGTTGTT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2FE39TF 665 0 0
GACTCACCAAAGCATCAAATACATTTTACTTCTCTTCTATTTCTCTTTATATCCATCATC
TTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAGC
AGAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGCC
GGAAGAAGTCGTGGCTGCCACGACAGAATCTGCCGCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAACA
AGAATCTGAAGCACCAGTGGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTGGGAGAGGCAGAGAA
AAAAGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCTGTGGCTGA
GGAGGAGGCAAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTATTGTGGAGGA
GGAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTTGCCGCCGAGAAGGCCGA
GGAGTAAAGACGAAGAAACAATATGTATCTTCTATCGTTGTTTGGTCTCATTTCGTTGTT
TTAAAAAGATCACTTCGCAAAATTTCATAAGTATTTTCTATCGTGTGTTATGATGAAATG
ATATTTGGTTATGATGAAATGATATATTTGGG*AGTTTTGCTGGTTGTTACAAAAAAGAA
AAAAA

QA 1 665 1 665
DS 



AS 3 9

CO CL546Contig1 986 4 23 U
GGAGGGAAGCCCAAAATAATAAATAAATAACCAAAAAACATTCACCATTTAGGTCTCTCT
CTCGTCTCGTCTTTCGTCCGACGAAGAAGATCGCTGAGAGATTACTACCGCCGGATTTCC
GTTTTACCGCGAGATACTCTTTGGATACGTCGGAGATCGATCTAGAAACATGAATCCTGA
ATATGACTATCTGTTCAAGCTTTTGCTTATTGGTGACTCTGGTGTTGGCAAATCTTGCTT
GCTTCTAAGGTTTGCTGATGATTCTTACCTGGATAGCTACATCAGTACCATTGGTGTTGA
CTTTAAAATCCGCACCGTTGAACAAGACGGAAAGACAATCAAACTCCAGATCTGGGACAC
AGCAGGCCAAGAACGTTTCAGGACTATCACCAGTAGCTACTACAGAGGAGCTCATGGGAT
CATTGTCACCTATGACGTCACGGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTCAAACAATGGCTGAA
TGAAATCGACCGTTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAACAAAAACGA
TCTCACTTCACAGAAGGTTGTATCCACTGAGACAGCTCAGGCTTTTGCAGATGAACTTGG
GATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAATGCAACCAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGC
CATGACTGCTGCTATTAAGACCAGAATGGCTAGCCAACCAGCTGGAGGTGCCAAGCCACC
GACGGTCAATATTCGCGGACAGCCAGTGAACCAGCAATCAGGCTGTTGCTCATCTTGATT
CTATTAGTCTCAAGAAAGTCTATTTGGATCATAACACACCATTATAATCATTTGTTTGCA
TTGCATGTAAGACTTCTCCAATTGACAACTTCTTTTCCTTCCGTTTTATAGCTTTTCTCT
TCTTTTTCTGATGTATTTCGAAGTTTGAAACCCATAAATTCTATAGTGAAAGACCATTTA
TGCAAATAAAGCGACAAACCCTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 

AF RR2FQ50TF U 1
AF RR2B814TF U 16
AF RR2FQ50JQ C 207
AF RR2DO60JQ C 315
BS 1 135 RR2FQ50TF
BS 136 136 RR2B814TF
BS 137 150 RR2FQ50TF
BS 151 151 RR2B814TF
BS 152 555 RR2FQ50TF
BS 556 556 RR2B814TF
BS 557 580 RR2FQ50TF
BS 581 581 RR2B814TF
BS 582 629 RR2FQ50TF
BS 630 630 RR2B814TF
BS 631 696 RR2FQ50TF
BS 697 717 RR2B814TF
BS 718 718 RR2FQ50JQ
BS 719 760 RR2B814TF
BS 761 761 RR2FQ50JQ
BS 762 837 RR2B814TF
BS 838 838 RR2FQ50JQ
BS 839 898 RR2B814TF
BS 899 899 RR2FQ50JQ
BS 900 907 RR2B814TF
BS 908 980 RR2FQ50JQ
BS 981 981 RR2DO60JQ
BS 982 986 RR2FQ50JQ

RD RR2FQ50TF 699 0 0
GGAGGGAAGCCCAAAATAATAAATAAATAACCAAAAAACATTCACCATTTAGGTCTCTCT
CTCGTCTCGTCTTTCGTCCGACGAAGAAGATCGCTGAGAGATTACTACCGCCGGATTTCC
GTTTTACCGCGAGATTCTCTTTGGATACGTTGGAGATCGATCTAGAAACATGAATCCTGA
ATATGACTATCTGTTCAAGCTTTTGCTTATTGGTGACTCTGGTGTTGGCAAATCTTGCTT
GCTTCTAAGGTTTGCTGATGATTCTTACCTGGATAGCTACATCAGTACCATTGGTGTTGA
CTTTAAAATCCGCACCGTTGAACAAGACGGAAAGACAATCAAACTCCAGATCTGGGACAC
AGCAGGCCAAGAACGTTTCAGGACTATCACCAGTAGCTACTACAGAGGAGCTCATGGGAT
CATTGTCACCTATGACGTCACGGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTCAAACAATGGCTGAA
TGAAATCGACCGTTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAACAAAAACGA
TCTCACTTCACAGAAAGTTGTATCCACTGAGACAGCTCAG*CTTTTGCAGATGAACTTGG
GATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAA*TGCAACCAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGC
CATGACTGCTGCTATTAAGACCAGAATGGCTAGCCA
CCA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2B814TF 892 0 0
GG
AATAAATAAATAACCAAAAA*CATTCACCATTTAGGTCTCTCTCTC*TCTCGTCTTTCGT
CCGACGAAGAAGATCGCTGAGAGATTACTACCGCCGGATTTCCGTTTTACCGCGAGATAC
TCTTTGGATACGTCGGAGATCGATCTAGAACCATGAATCCTGAATATGACTATCTGTTCA
AGCTTTTGCTTATTGGTGACTCTGGTGTTGGCAAATCTTGCTTGCCTCTAAGGTTTGCTG
ATGATTCTTACCTGGATAGCTACATCAGTACCATTGGTGTCGACTTTAAAATCCTCACCG
TTGAACAAGACGGAAAGACAATCAAACTCCAGATCTGGGACACAGCAGGCCAAGAACGTT
TCAGGACTATCACCAGTAGCTACTACAGAGGAGCTCATGGGATCATTGTCACCTATGACG
TCACCGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTCAAACAATGGCTGAATGAAATCGACCGTTATG
CCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAGG
TTGTATCCACTGAGACAGCTCAGGCTTTTGCAGATGAACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAA
CAAGTGCTAAAAATGCAACCAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGCTATGACTGCTGCAATTA
AGACCAGAATGGCTAGCCAACCAGCTGGAGGTGCCAAGCCGCCGACGGTCAATATTCGCG
GACAGCCAGTGAACCAGCAATCACGCTGTTGCTCATCTTGATTCTATTAGTCTCAAGAAA
GTCTATTTGGATCATAACACACCATTATAATCATTTGTTTCCATTGCATGTAAGACTTCT
CCAATTGACAACTTCTTTTCCTTCCGTTTTATAGCTTTTCTTTTCTTTTT

QA 3 892 3 892
DS 

RD RR2FQ50JQ 780 0 0
TTATTGGTGACTCTGGTGTTGGCAAATCTTGCTTGCTTCTAAGGTTTGCTGATGATTCTT
ACCTGGATAGCTACATCAGTACCATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGCACCGTTGAACAAG
ACGGAAAGACAATCAAACTCCAGATCTGGGACACAGCAGGCCAAGAACGTTTCAGGACTA
TCACCAGTAGCTACTACAGAGGAGCTCATGGGATCATTGTCACCTATGACGTCACGGACC
AAGAGAGCTTCAACAACGTCAAACAATGGCTGAATGAAATCGACCGTTACGCCAGTGAGA
ATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAGGTTGTATCCA
CTGAGACAGCTCAGGCTTTTGCAGATGAACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTA
AAAATGCAACCAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGCCATGACTGCTGCTATTAAGACCAGAA
TGGCTAGCCAACCAGCTGGAGGCGCCAAGCCACCGACGGTCAATATTCGCGGACAGCCGG
TGAACCAGCAATCAGGCTGTTGCTCATCTTGATTCTATTAGTCTCAAGAAAGTCTATTTG
GATCATAACACACCATTATAATCATTTGTTTGCATTGCATGTAAGACTTCTCCAATTGAC
AACTTCTTTTCCTTCCGTTTTATAGCTTTTCTCTTCTTTTTCTGATGTATTTCGAAGTTT
GAAACCCATAAATTCTATAGTGAAAGACCATTTATGCAAATAAAGCGACAAACCTTTTCT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2DO60JQ 672 0 0
CAGTCGAACAGGACGGGAAGACAATCAAACTCCAGATCTGGGACACAGCAGGTCAAGAAC
GTTTCAGGACTATCACCAGCAGCTACTACAGAGGAGCTCATGGCATCATTGTCACCTATG
ATGTCACTGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTCAAGCAATGGCTCAATGAAATCGACCGTT
ACGCTAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTCGTTGGGAACAAAAACGATCTCACTTCACAGA
AGGTTGTATCCACTGAGACAGCTCAGGCTTTTGCAGATGAACTTGGGATCCCTTTCTTGG
AAACAAGTGCTAAAAATGCAACCAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGCCATGACTGCTGCTA
TTAAGACCAGGATGGCTAGCCAACCATCTGGAGGTGCCAAACCACCGACGGTCAATATTC
GCGGACAGCCAGTGAACCAGCAATCAGGCTGTTGCTCATCTTGATTCTATTAGTCTCAAG
AAAGTCTATTTGGATCATAACGCACCATTATAATCATTTGTTTGCATTGCATGTAAGACT
TCTCCAATTGACAACTTCTTTTCCTTCCGTTTTATAGCTTTTCTCTTCTTTTTCTGATGT
ATTTCGAAGTTTGAAACCCATAAATTCTATAGTGAAAGACCATTTATGCAAATAAAGCGA
CAAACCCTTTCT

QA 1 672 1 672
DS 



CO CL546Contig2 734 3 3 U
CGGAGAAATTAGGATTACTATAGAATTTATGAGTTTTAAACTTCGAAATACATCGGACAA
AGAATAGCAAAGCTATAAAATGAAGGAAGAAAAAAAGGATTCAACTGAGTTGTCACAACT
GGAAAAGTCACATGCAATGGAAACAAAGGATTATAATGGTGTAATGATCCAAATTGAGAC
TAATGGAATCAAGATGAGCAACAGCCTGATTGCTGGTTCACCGGCTGTCCGCGAATCTGG
ACCGTCGGTGGTTTGGCACCTCCAGATGGTTGGCTAGCCATCCTGGTCTTAATAGCAGCA
GTCATGGCCATGAAAGCTTCTTCAACATTGGTTGCATTTTTAGCACTTGTTTCCAAGAAA
GGGATCCCAAGTTCATCTGCAAAAGCCTGAGCTGTCTCAGTGGATACAACCTTCTGTGAA
GTGAGATCGTTTTTGTTCCCAACGAGTAGCTTGTTCACATTCTCACTAGCGTAACGGTCG
ATTTCATTGAGCCATTGCTTGACGTTGTTGAAGCTCTCTTGGTCGGTGACATCATAGGTG
ACAATGATGCCATGAGCTCCTCTGTAGTAGCTGCTGGTGATAGTCCTGAAACGTTCTTGA
CCTGCTGTGTCCCAGATCTGGAGTTTGATTGTCTTCCCGTCCTGTTCGACTGTACGGATT
TTAAAGTCAACACCAATGGTACTGATGTAGCTATCCAGGTAAGAATCATCAGCAAATCTT
AGAAGCAAGCATGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI42TF C 107
AF RR2GS84JQB U 1
AF RR2GI42JQB U 1
BS 1 468 RR2GI42JQB
BS 469 469 RR2GS84JQB
BS 470 734 RR2GI42JQB

RD RR2GI42TF 445 0 0
TGAG
TGTCACAACTGGAAAAGTCACATGCAATGGAAACAAAGGATTATAATGGTGTAATGATCC
AAATTGAGACTAATGGAATCAAGATGAGCAACAGCCTGATTGCTGGTTCACCGGCTGTCC
GCGAATCTGGACCGTCGGTGGTTTGGCACCTCCAGATGGTTGGCTAGCCATCCTGGTCTT
AATAGCAGCAGTCATGGCCATGAAAGCTTCTTCAACATTGGTTGCATTTTTAGCACTTGT
TTCCAAGAAAGGGATCCCAAGTTCATCTGCAAAAGCCTGAGCTGTCTCAGTGGATACAAC
CTTCTGTGAAGTGAGATCGTTTTTGTTCCCAACGAGTAGCTTGTTCACATTCTCACTAGC
GTAACGGTCGATTTCATTGAGCCATTGCTTGACGTTGTTGAAGCTCTCTTGGTCGGTGAC
ATCATAGGTGACAATGATGCC

QA 5 445 5 445
DS 

RD RR2GS84JQB 588 0 0
CGGAGAAATTAGGATTACTATAGAATTTATGAGTTTTAAACTTCGAAATACATCGGACAA
AGAATAGCAAAGCTATAAAATGAAGGAAGAAAAAAAGGATTCAACTGAGTTGTCACAACT
GGAAAAGTCACATGCAATGGAAACAAAGGATTATAATGGTGTAATGATCCAAATTGAGAC
TAATGGAATCAAGATGAGCAACAGCCTGATTGCTGGTTCACCGGCTGTCCGCGAATCTGG
ACCGTCGGTGGTTTGGCACCTCCAGATGGTTGGCTAGCCATCCTGGTCTTAATAGCAGCG
GTCATGGCCATGAAAGCTTCTTCAACATTGGTTGCATTTTTAGCACTTGTTTCCAAGAAA
GGGATCCCAAGTTCATCTGCAAAAGCCTGAGCTGTCTCAGTGGATACAACCTTCTGTGAA
GTGAGATCGTTTTTGTTCCCAACGAGTAGCTTGTTCACATTCTCACTAGCGTAACGGTCG
ATTTCATTGAGCCATTGCTTGACGTTGTTGAAGCTCTCTTGGTCAGTGACATCATAGGTG
ACAATGATGCCATGAGCTCCTCTGTAGTAGCTGCTGGTGATAGTCCTG

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2GI42JQB 734 0 0
CGGAGAAATTAGGATTACTATAGAATTTATGAGTTTTAAACTTCGAAATACATCGGACAA
AGAATAGCAAAGCTATAAAATGAAGGAAGAAAAAAAGGATTCAACTGAGTTGTCACAACT
GGAAAAGTCACATGCAATGGAAACAAAGGATTATAATGGTGTAATGATCCAAATTGAGAC
TAATGGAATCAAGATGAGCAACAGCCTGATTGCTGGTTCACCGGCTGTCCGCGAATCTGG
ACCGTCGGTGGTTTGGCACCTCCAGATGGTTGGCTAGCCATCCTGGTCTTAATAGCAGCA
GTCATGGCCATGAAAGCTTCTTCAACATTGGTTGCATTTTTAGCACTTGTTTCCAAGAAA
GGGATCCCAAGTTCATCTGCAAAAGCCTGAGCTGTCTCAGTGGATACAACCTTCTGTGAA
GTGAGATCGTTTTTGTTCCCAACGAGTAGCTTGTTCACATTCTCACTACCGTAACGGTCG
ATTTCATTGAGCCATTGCTTGACGTTGTTGAAGCTCTCTTGGTCGGTGACATCATAGGTG
ACAATGATGCCATGAGCTCCTCTGTAGTAGCTGCTGGTGATAGTCCTGAAACGTTCTTGA
CCTGCTGTGTCCCAGATCTGGAGTTTGATTGTCTTCCCGTCCTGTTCGACTGTACGGATT
TTAAAGTCAACACCAATGGTACTGATGTAGCTATCCAGGTAAGAATCATCAGCAAATCTT
AGAAGCAAGCATGA

QA 1 734 1 734
DS 



CO CL546Contig3 790 2 12 U
GGAATTTCCTTCGGCCTAAGGAAAAATAAATAAATAAAATTAACAAAAACATTCAGTCTA
TCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTTTCGATACGTTGTGAGATCGATCTAGATAACGATAGTTC
GTCATGAATCCTGAGTATGACTATCTGTTCAAGCTTTTGCTTATCGGTGACTCTGGTGTT
GGAAAATCATGCTTGCTTCTAAGATTTGCTGATGATTCTTACCTGGATAGCTACATCAGT
ACCATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGTACAGTCGAACAGGACGGGAAGACAATCAAACTC
CAGATCTGGGACACAGCAGGTCAAGAACGTTTCAGGACTATCACCAGCAGCTACTACAGA
GGAGCTCATGGCATCATTGTCACCTATGATGTCACTGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTC
AAGCAATGGCTCAATGAAATCGACCGTTACGCTAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTCGTT
GGGAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAGGTTGTATCCACTGAGACAGCTCAGGCTTTT
GCAGATGAACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAATGCAACCAATGTTGAA
GAAGCTTTCATGGCCATGACCGCTGCTATTAAGACCAGGATGGCTAGCCAACCATCTGGA
GTGCCAAACCACCGACGTCAAGATTCGCGGACAGCCAGGTGAACCAGCAATCAGCTGTTG
CTCATCTTGATTCCATTAGTCTCAAGAAAGTCTATTTGGATCATAACACACATTATAATC
ATTTGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS84TF U 1
AF RR2DO60TF U 17
BS 1 679 RR2GS84TF
BS 680 680 RR2DO60TF
BS 681 696 RR2GS84TF
BS 697 697 RR2DO60TF
BS 698 744 RR2GS84TF
BS 745 753 RR2DO60TF
BS 754 764 RR2GS84TF
BS 765 765 RR2DO60TF
BS 766 769 RR2GS84TF
BS 770 770 RR2DO60TF
BS 771 777 RR2GS84TF
BS 778 790 RR2DO60TF

RD RR2GS84TF 777 0 0
GGAATTTCCTTCGGCCTAAGGAAAAATAAATAAATAAAATTAACAAAAACATTCAGTCTA
TCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTTTCGATACGTTGTGAGATCGATCTAGATAACGATAGTTC
GTCATGAATCCTGAGTATGACTATCTGTTCAAGCTTTTGCTTATCGGTGACTCTGGTGTT
GGAAAATCATGCTTGCTTCTAAGATTTGCTGATGATTCTTACCTGGATAGCTACATCAGT
ACCATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGTACAGTCGAACAGGACGGGAAGACAATCAAACTC
CAGATCTGGGACACAGCAGGTCAAGAACGTTTCAGGACTATCACCAGCAGCTACTACAGA
GGAGCTCATGGCATCATTGTCACCTATGATGTCACTGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTC
AAGCAATGGCTCAATGAAATCGACCGTTACGCTAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTCGTT
GGGAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAGGTTGTATCCACTGAGACAGCTCAGGCTTTT
GCAGATGAACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAATGCAACCAATGTTGAA
GAAGCTTTCATGGCCATGACCGCTGCTATTAAGACCAGGATGGCTAGCCAACCATCTGGA
GTGCCAAACCACCGACGTCCAGATTCGCGGACAGCCCGGTGAACCAGCAATCAGCTGTTG
CTCATCTTGATTCCATTAGTCTCA*********ATTTGGATCATTACAC*CATTATA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2DO60TF 774 0 0
G
AAGGAAAAATAAATAAATAAAATTAACAAAAACATTCAGTCTATCTCTCTCTCTCTTTCT
CTCTTTTGATACGTTGTGAGATCGATCTAGATAACGATAGTTCGTCATGAATCCTGAGTA
TGACTATCTGTTCAAGCTTTTGCTTATCGGTGACTCTGGTGTTGGAAAATCATGCTTGCT
TCTAAGATTTGCTGATGATTCTTACCTGGATAGCTACATCAGTACCATTGGTGTTGACTT
TAAAATCCGTACAGTCGAACAGGACGGGAAGACAATCAAACTCCAGATCTGGGACACAGC
AGGTCAAGAACGTTTCAGGACTATCACCAGCAGCTACTACAGAGGAGCTCATGGCATCAT
TGTCACCTATGATGTCACTGACCAAGAGAGCTTCAACAACGTCAAGCAATGGCTCAATGA
AATCGACCGTTACGCTAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTCGTTGGGAACAAAAACGATCT
CACTTCACAGAAGGTTGTATCCACTGAGACAGCTCAGGCTTTTGCAGATGAACTTGGGAT
CCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAATGCAACCAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGCCAT
GACTGCTGCTATTAAGACCAGGATGGCTAGCCAACCATCTGGAGTGCCAAACCACCGACG
TCAATATTCGCGGACAGCCAG*TGAACCAGCAATCAGCTGTTGCTCATCTTGATTCTATT
AGTCTCAAGAAAGTCTATTTGGATCATAACGCACATTATAATCATTTGTTTGC

QA 2 774 2 774
DS 



AS 1 10

CO CL547Contig1 1203 10 9 U
GGGCTCGTTGACTCTCTTAAAGCTTCTCTAATGGCGATGGCCTCGCTAACGACTTCTTCT
GCTCTTCTCAACAAGTCCTTTTTACCTAACCGCTCTTCCCTCTCCTCCTCTACCTCTCAT
TCTCGTCTTTACCGATTCTCTTCCTCTGTTCGCTCTCGTTTCCCATCTGCCACCATACGC
GCCGTTGCTCTTGAACCAGAACTAAACGAAACTCCAAGTTCCGACAAGAAAGACGCTGAA
ACTCAAAGTGTTAAAGTCGAGGAGACGCAAGTGTTCGCGTGTCCTGTTTGCTACGAACCG
CTTATGAGGAAAGGGCCTTCAGGTATTAACCTACAAGCGATCTACAGGTCTGGTTTCAAG
TGTGGACAGTGTAACAAGACATACTCTAGCAAAGATGAATACTTGGATCTAACTGTTACT
GCTGGTTTTGATTCTTTCAATGAAGTCAAACCCATTACAACTGAACTCTTTCGGAGTCCA
TTAGTATCATTCTTGTATGAAAGAGGTTGGAGACAGAACTTTGCTCGAAGCGGTTTTCCT
GGTCCAGATGAAGAGTTTAGAATGGCTGAGGAGTACTTCAAAGAAGCAGAAGGTGGAGTT
CTCGTGGACGTTAGCTGTGGAAGCGGTTTGTTCTCGAGAAAATTTGCAAAGTCTGGCAAA
TACTCTGGCGTCATTGCTCTAGACTACTCTGAAAACATGCTTCGTCAGTGTAATGACTTC
ATCAAGAAGGACACCACGTTCGATAGCTCGACTAACATAGCTGTTGTCAGAGCAGACGTC
TCTCGCCTCCCTTTCCCTTCGGCTTCTGTTGATGCAGTTCATGCTGGTGCGGCATTACAC
TGTTGGCCGTCTCCTACAAATGCTATTGCTGAGGTATGTCGTGTTCTGAGAAGTGGAGGT
GTTTTTGTTGGGACAACGTTTTTAAGATACAGTCCTTCCACTCCATGGATCATCAGACCT
TTTCAATCGAGGATTCTGCAGAACTACAATTACTTGATGCAGGATGAGATCAAGGATGTG
TGTACAACATGTGGTCTCACAGATTATGAAGATATTGTTCAGGATTCTTTTATAATGTTT
ACTGCTAGGAAGCCATAGAGATATATGCTCTTTGCTACCTATTCATGTAACTTGTTGTAT
AGACACAGAAACAAAAGTTGTTATAGTAATAAAGAGGAAGATGATATATAAAACTTGAAG
ATG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 30 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2D008TF U 1
AF RR2A495TF U 1
AF RR2CS58TF U 1
AF RR2BD94TF U 1
AF RR2A754TF U 1
AF RR2AK93TF U 8
AF RR2A495JQ C 640
AF RR2AK93JQ C 335
AF RR2CS58JQ C 390
AF RR2D008JQ C 1009
BS 1 96 RR2A495TF
BS 97 97 RR2A754TF
BS 98 620 RR2A495TF
BS 621 728 RR2A754TF
BS 729 729 RR2AK93TF
BS 730 799 RR2A754TF
BS 800 805 RR2AK93TF
BS 806 1197 RR2AK93JQ
BS 1198 1203 RR2D008JQ

RD RR2D008TF 428 0 0
GGGCTCGTTGACTCTCTTAAAGCTTCTCTAATGGCGATGGCCTCGCTAACGACTTCTTCT
GCTCTTCTCAACAAGTCCTTTTTACCTAACCGCTCTTCCCTCTCCTCCTCTACCTCTCAT
TCTCGTCTTTACCGATTCTCTTCCTCTGTTCGCTCTCGTTTCCCATCTGCCACCATACGC
GCCGTTGCTCTTGAACCAGAACTAAACGAAACTCCAAGTTCCGACAAGAAAGACGCTGAA
ACTCAAAGTGTTAAAGTCGAGGAGACGCAAGTGTTCGCGTGTCCTGTTTGCTACGAACCG
CTTATGAGGAAAGGGCCTTCAGGTATTAACCTACAAGCGATCTACAGGTCTGGTTTCAAG
TGTGGACAGTGTAACAAGACATACTCTAGCAAAGATGAATACTTGGATCTAACTGT*ACT
GCTGGTTT

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR2A495TF 620 0 0
GGGCTCGTTGACTCTCTTAAAGCTTCTCTAATGGCGATGGCCTCGCTAACGACTTCTTCT
GCTCTTCTCAACAAGTCCTTTTTACCTAACCGCTCTCCCCTCTCCTCCTCTACCTCTCAT
TCTCGTCTTTACCGATTCTCTTCCTCTGTTCGCTCTCGTTTCCCATCTGCCACCATACGC
GCCGTTGCTCTTGAACCAGAACTAAACGAAACTCCAAGTTCCGACAAGAAAGACGCTGAA
ACTCAAAGTGTTAAAGTCGAGGAGACGCAAGTGTTCGCGTGTCCTGTTTGCTACGAACCG
CTTATGAGGAAAGGGCCTTCAGGTATTAACCTACAAGCGATCTACAGGTCTGGTTTCAAG
TGTGGACAGTGTAACAAGACATACTCTAGCAAAGATGAATACTTGGATCTAACTGTTACT
GCTGGTTTTGATTCTTTCAATGAAGTCAAACCCATTACAACTGAACTCTTTCGGAGTCCA
TTAGTATCATTCTTGTATGAAAGAGGTTGGAGACAGAACTTTGCTCGAAGCGGTTTTCCT
GGTCCAGATGAAGAGTTTAGAATGGCTGAGGAGTACTTCAAAGAAGCAGAAGGTGGAGTT
CTCGTGGACGTTAGCTGTGG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2CS58TF 723 0 0
GGGCTCGTTGACTCTCTTAAAGCTTCTCTAATGGCGACGGCCTCGTTAACGACTTCTTCT
GCTCTTCTCAACAAGTCCTTTTTACCTAACCGCTCTTCCCTCTCCTCCTCTACCTCTCAT
TCTCGTCTTTACCGATTCTCTTCCTCTGTTCGCTCTCGTTTCCCATCTGCCACCATACGC
GCCGTTGCTCTTGAACCAGAACTAAACGAAACTCCAAGTTCCGACAAGAAAGACGCTGAA
ACTCAAAGTGTTAAAGTCGAGGAGACGCAAGTGTTCGTGTGTCCTGTTTGCTACGAACCG
CTTATGAGGAAAGGGCCTTCAGGTATTAACCTACAAGCGATCTACAGGTCTGGT**CAAG
TGTGGACAGTGTAACAAGACATACTCTAGCAAAGATGAATACTTGGATCTAACTGTTACT
GCTGGTTTTGATTCTTTCAATGAAGTCAAACCCATTACAACTGAACTCTTTCGGAGTCCA
TTAGTATCATTCTTGTATGAAAGAGGTTGGAGACAGAACTTTGCTCGAAGCGGTTTTCCT
GGTCCAGATGAAGAGTTTAGAATGGCTGAGGAGTACTTCAAAGAAGCAGAAGGTGGAGTT
CTCGTGGACGTTAGCTGTGGAAGCGGTTTGTTCTCGAGAAAATTTGCAAAGTCTGGCAAA
TACTCTGGCGACATTGCTCTAGACTACTCTGAAAACATGCTTCGTCAGTGTAATGACTTC
ATC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2BD94TF 757 0 0
GGGCTCGTTGACTCTCTTAAAGCTTCTCTAATGGCGATGGCCTCGCTAACGACTTCTTCT
GCTCTTCTCAACAAGTCCTTTTTACCTAACCGCTCTTCCCTCTCCTCCTCTACCTCTCAT
TCTCGTCTTTACCGATTCTCTTCCTCTGTTCGCTCTCGTTTCCCATCTGCCACCATACGC
GCCGTTGCTCTTGAACCAGGACTAAACGAAACTCCAAGTTCCGACAAGAAAGACGCTGAA
ACTCAAAGTGTTAAAGTCGAGGAGACGCAAGTGTTCGCGTGTCCTGTTTGCTACGAACCG
CTTATGAGGAAAGGGCCTTCAGGTATTGACCTACAAGCGATCTACAGGTCTGGTTTCAAG
TGTGGACAGTGTAACAAGACATACTCTAGCAAAGATGAATACTTGGATCTAACTGTTACT
GCTGGTTTTGATTCTTTCAATGAAGTCAAACCCATTACAACTGAACTCTTTCGGAGTCCA
TTAGTATCATTCTTGTATGAAAGAGGTTGGAGACAGAACTTTGCTCGAAGCGGTTTTCCT
GGTCCAGATGAAGAGTTTAGAATGGCTGAGGAGTACTTCAAAGAAGCAGAAGGTGGAGTT
CTCGTGGACGTTAGCTGTGGAAGCGGTTTGTTCTCGAGAAAATTTGCAAAGTCTGGCAAA
TACTCTGGCGTCATTGTTCTAGACTACTCTGAAAACATGCTTCGTCAGTGTAATGACTTC
ATCAAGAAAGACACCACGTTCGATAGCTCGACTAA
GC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2A754TF 799 0 0
GGGCTCGTTGACTCTCTTAAAGCTTCTCTAATGGCGATGGCCTCGCTAACGACTTCTTCT
GCTCTTCTCAACAAGTCCTTTTTACCTAACCGCTCTTCCCTCTCCTCCTCTACCTCTCAT
TCTCGTCTTTACCGATTCTCTTCCTCTGTTCGCTCTCGTTTCCCATCTGCCACCATACGC
GCCGTTGCTCTTGAACCAGAACTAAACGAAACTCCAAGTTCCGACAAGAAAGACGCTGAA
ACTCAAAGTGTTAAAGTCGAGGAGACGCAAGTGTTCGCGTGTCCTGTTTGCTACGAACCG
CTTATGAGGAAAGGGCCTTCAGGTATTAACCTACAAGCGATCTACAGGTCTGGTTTCAAG
TGTGGACAGTGTAACAAGACATACTCTAGCAAAGATGAATACTTGGATCTAACTGTTACT
GCTGGTTTTGATTCTTTCAATGAAGTCAAACCCATTACAACTGAACTCTTTCGGAGTCCA
TTAGTATCATTCTTGTATGAAAGAGGTTGGAGACAGAACTTTGCTCGAAGCGGTTTTCCT
GGTCCAGATGAAGAGTTTAGAATGGCTGAGGAGTACTTCAAAGAAGCAGAAGGTGGAGTT
CTCGTGGACGTTAGCTGTGGAAGCGGTTTGTTCTCGAGAAAATTTGCAAAGTCTGGCAAA
TACTCTGGCGTCATTGCTCTAGACTACTCTGAAAACATGCTTCGTCAGTGTAATGACTTC
ATCAAGAAAGACACCACGTTCGATAGCTCGACTAACATAGCTGTTGTCAGAGCAGACGTC
TCTCGCCTCCCTTTCCCTT

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2AK93TF 798 0 0
GG
GACTCTCTTAAAGCTTCTCTAATGGCGATGGCTTCGCTAACGACTTCTTCTGCTCTTCTC
AACAAGTCCTTTTTACCTAACCGCTCTTCCCTCTCCTCCTCTACCTCTCATTCTCGTCTT
TACCGATTCTCTTCCTCTGTTCGCTCTCGTTTCCCATCTGCCACCATACGCGCCGTTGCT
CTTGAACCAGAACTAAACGAAACTCCAAGTTCCGACAAGAAAGACGCTGAAACTCAAAGT
GTTAAAGTCGAGGAGACGCAAGTGTTCGCGTGTCCTGTTTGCTACGAACCGCTTATGAGG
AAAGGGCCTTCAGGTATTAACCTACAAGCGATCTACAGGTCTGGCTTCAAGTGTGTACAG
TGTAACAAGACATACTCTAGCAAAGATGAATACTTGGATCTAACTGTTACTGCTGGTTTT
GATTCTTTCAATGAAGTCAAACCCATTACAACTGAACTCTTTCGGAGTCCATTAGTATCA
TTCTTGTATGAAAGAGGTTGGAGACAGAACTTTGCTCGAAGCGGTTTTCCTGGTCCAGAT
GAAGAGTTTAGAATGGCTGAGGAGTACTTCAAAGAAGCAGAAGGTGGAGTTCTCGTGGAC
GTTAGCTGTGGAAGCGGTTTGTTCTCGAGAAAATTTACAAAGTCTGGCAAATACTCTGGC
GTCATTGCTCTAGACTACTCTGAAAACATGCTTCGTCAGTGTAATGACTTCATCAAGAAG
GACACCACGTTCGATAGCTCGACTAACATAGCTGTTGTCAGAGCAGACGTCTCTCGCCTC
CCTTTCCCTTCGGCTT

QA 3 798 3 798
DS 

RD RR2A495JQ 395 0 0
AAATTTGCAAAGTCTGGCAAATACTCTGGCGTCATTGCTCTAGACTACTCTGAAAACATG
CTTCGTCAGTGTAATGACTTCATCAAGAAGGACACCACGTTCGATAGCTCGACTAACATA
GCTGTTGTCAGAGCAGACGTCTCTCGCCTCCCTTTCCCTTCGGCTTCTGTTGATGCAGTT
CATGCTGGTGCGGCATTACACTGTTGGCCGTCTCCTACAAATGCTATTGCTGAGGTATGT
CGTGTTCTGAGAAGTGGAGGTGTTTTTGTTGGGACAACGTTTCTAAGATCCAGTCCTTCC
ACTCCATGGATCATCAGACCTTTTCAATCGAGGATTCTGCAGAACTACAATTACTTGATG
CAGGATGAGATCAAGGATGTGTGTACAACATGTGG

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR2AK93JQ 863 0 0
AAGCGATCTACAGGTCTGGCTTCAAGTGTGTACAGTGTAACAAGACATACTCTAGCAAAG
ATGAATACTTGGATCTAACTGTTACTGCTGGTTTTGATTCTTTCAATGAAGTCAAACCCA
TTACAACTGAACTCTTTCGGAGTCCATTAGTATCATTCTTGTATGAAAGAGGTTGGAGAC
AGAACTTTGCTCGAAGCGGTTTTCCTGGTCCAGATGAAGAGTTTAGAATGGCTGAGGAGT
ACTTCAAAGAAGCAGAAGGTGGAGTTCTCGTGGACGTTAGCTGTGGAAGCGGTTTGTTCT
CGAGAAAATTTACAAAGTCTGGCAAATACTCTGGCGTCATTGCTCTAGACTACTCTGAAA
ACATGCTTCGTCAGTGTAATGACTTCATCAAGAAGGACACCACGTTCGATAGCTCGACTA
ACATAGCTGTTGTCAGAGCAGACGTCTCTCGCCTCCCTTTCCCTTCGGCTTCTGTTGATG
CAGTTCATGCTGGTGCGGCATTACACTGTTGGCCGTCTCCTACAAATGCTATTGCTGAGG
TATGTCGTGTTCTGAGAAGTGGAGGTGTTTTTGTTGGGACAACGTTTTTAAGATACAGTC
CTTCCACTCCATGGATCATCAGACCTTTTCAATCGAGGATTCTGCAGAACTACAATTACT
TGATGCAGGATGAGATCAAGGATGTGTGTACAACATGTGGTCTCACAGATTATGAAGATA
TTGTTCAGGATTCTTTTATAATGTTTACTGCTAGGAAGCCATAGAGATATATGCTCTTTG
CTACCTATTCATGTAACTTGTTGTATAGACACAGAAACAAAAGTTGTTATAGTAATAAAG
AGGAAGATGATATATAAAACTTG

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR2CS58JQ 798 0 0
CAAAGATGAATACTTGGATCTAACTGTTACTGCTGGTTTTGATTCTTTCAATGAAGTCAA
ACCCATTACAACTGAACTCTTTCGGAGTCCATTAGTATCATTCTTGTATGAAAGAGGTTG
GAGACAGAACTTTGCTCGAAGCGGTTTTCCTGGTCCAGATGAAGAGTTTAGAATGGCTGA
GGAGTACTTCAAAGAAGCAGAAGGTGGAGTTCTCGTGGACGTTAGCTGTGGAAGCGGTTT
GTTCTCGAGAAAATTTGCAAAGTCTGGCAAATACTCTGGCGACATTGCTCTAGACTACTC
TGAAAACATGCTTCGTCAGTGTAATGACTTCATCAAGAAGGACACCACGTTCGATAGCTC
GACTAACATAGCTGTTGTCAGAGCAGACGTCTCTCGCCTCCCTTTCCCTTCGGCTTCTGT
TGATGCAGTTCATGCTGGTGCGGCATTACACTGTTGGCCGTCTCCTACAAATGCTATTGC
TGAGGTATGTCGTGTTCTGAGAAGTGGAGGTGTTTTTGTTGGGACAACGTTTTTAAGACA
CAGTCCTTCCACTCCATGGATCATCAGACCTTTTCAATCGAGGACTCTGCAGAACTACAA
TTACTTGATGCAGGATGAGATCAAGGATGTGTGTACAACATGTGGTCTCACAGATTATGA
AGATATTGTTCAGGATTCTTTTATAATGTTTACTGCTAGGAAGCCATAGAGATATATGCT
CTTTGCTACCTATTCATGTAACTTGTTGTATAGACACAGAAACAAAAGTTGTTATAGTAA
TAAAGAGGAAGATGATAT

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2D008JQ 195 0 0
ATCG
AGGATGTGTGTACAACAT*TGGTTTCACAGATTATGAAGATATTGTTCAGGATTTTTTTA
TAATGTTTACTGCTAGGAAGCCATAGAGATATATGCTCTTTGCTACCTATTCATGTAACT
TGTTGTATAGACACAGAAACAAAAGTTGTTATAGTAATAAAGAGGAAGATGATATATAAA
ACTTGAAGATG

QA 5 195 5 195
DS 



AS 1 9

CO CL548Contig1 926 9 11 U
GAAACTAGAGACTAACATGAATTTTAGATAGAGAGGAGTTTTTAGTTTGATCGTGTCACC
GTAGAGACATAACACAAAGTGCCAGAAACTAACAATAAAAAGTATCCACAAACATAGTAG
CCACATCACGAGACTCTTATTTAAACAAAACTATATCCATACGAAGAACCTGCCACCTCC
AAAGTCACCATCATATCTTCTGTGCCAGGGAGATTGGTTCCTTGTTGACCGTAGGCCTTG
GACGTTTTGCCTTCTCCATCTCCTCGGCATGTTTTATCCTCATCATTGCTTCGACTTTCA
TTAGGGCACCCGATATCTCAAAGCTAAACACAGTCAGTTCCAAGTAACCCATACCATCAA
GCTCTTTACCAATCATTCTCTCGTTTAAAAGACGTAGTCTCTCCTTCTCGATCACCAGAG
AGTCGATGTCTGTCTTCAGTCTTTCAGGGTCATTGCTACGCCAAGGTTGGGTTTGGGTTT
CTGGAGGGCTGAGGCGGAATGCTCTAGCCTTGTTCCTCAAAGCTCTCCTTCTCCCTGCTA
GAAGGGATTGGTAGGCCAAATCTTCTTTCTCTAGTCTTCGAATCCAGTCCATTCCCCCCA
TGAGATCATACTCAACAATCTGCTTGACTGTTAAATCCTCGTGTGCCTTATCTGTTTGTT
TGTCCACGATGCTGAAGCCCTCACTTAAGATACGTTCAAGTGAAGCCAGCTCGGTGTAGC
TCATATCATCGAGACCGACACCATTCAGTTTCTCGTTTGAAATCTGTAACAACTTGACCT
CCTCTTGCAAATCTTTGATGTCTTGTAGACACTGGAGCCTTCGTTTTTCCGAGCTGCGTG
TAGTTCTGATAGACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCGCTCT
CGCTCGCTTCCGCTTCCGGCCCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 25 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 10 10 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 10 10 10 10 10 

AF RR2GU61JQB U 1
AF RR2H272JQ U 44
AF RR2HB08JQ U 44
AF RR2A922JQ U 177
AF RR2DG27JQ U 26
AF RR2A922TF C 240
AF RR2GU61TF C 283
AF RR2H272TF C 243
AF RR2HB08TF C 263
BS 1 397 RR2GU61JQB
BS 398 733 RR2DG27JQ
BS 734 874 RR2A922TF
BS 875 875 RR2GU61TF
BS 876 876 RR2H272TF
BS 877 878 RR2GU61TF
BS 879 879 RR2A922TF
BS 880 881 RR2H272TF
BS 882 920 RR2A922TF
BS 921 921 RR2H272TF
BS 922 926 RR2A922TF

RD RR2GU61JQB 397 0 0
GAAACTAGAGACTAACATGAATTTTAGATAGAGAGGAGTTTTTAGTTTGATCGTGTCACC
GTAGAGACATAACACAAAGTGCCAGAAACTAACAATAAAAAGTATCCACAAACATAGTAG
CCACATCACGAGACTCTTATTTAAACAAAACTATATCCATACGAAGAACCTGCCACCTCC
AAAGTCACCATCATATCTTCTGTGCCAGGGAGATTGGTTCCTTGTTGACCGTAGGCCTTG
GACGTTTTGCCTTCTCCATCTCCTCGGCATGTTTTATCCTCATCATTGCTTCGACTTTCA
TTAGGGCACCCGATATCTCAAAGCTAAACACAGTCAGTTCCAAGTAACCCATACCATCAA
GCTCTTTACCAATCATTCTCTCGTTTAAAAGACGTAG

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR2H272JQ 372 0 0
G
GTTTGATCGTGTCACCGTAGAGACATGACACAAAGTGCCAGAAACTAACAATAAAAAGTA
TCCACAAACATAGTAGCCACATCACGAGACTCTTATTTAAACAAAACTATATCCATACGA
AGAACCTGCCACCTCCAAAGTCACCATCATATCTTCTGTGCCAGGGAGATTGGTTCCTTG
TTGACCGTAGGCCTTGGACGTTTTGCCTTCTCCATCTCCTCGGCATGTTTTATCCTCATC
ATTGCTTCGACTTTCATTAGGGCACCCGATATCTCAAAGCTAAACACAGTCAGTTCCAAG
TAACCCATACCATCAAGCTCTTTACCAATCATTCTCTCGTTTAAAAGACGTAGTCTCTCC
TTCTCGATCAC

QA 2 372 2 372
DS 

RD RR2HB08JQ 352 0 0
G
GTTTGATCGTGTCACCGTAAAGACATGACACAAAGTGCCAGAAACTAACAATAAAAAGTA
TCCACAAACATAGTAGCCACATCACGAGACTCTTATTTAAACAAAACTATATCCATACGA
AAAACCTGCCACCTCCAAAGTCACCATCATATCTTCTGTGCCAGGGAGATTGGTTCCTTG
TTGACCGTAGGCCTTGGACGTTTTGCCTTCTCCATCTCCTCGGCATGTTTTATCCTCATC
ATTGCTTCCACTTTCATTAGGGCACCCGATATCTCAAAGCTAAACACAGTCAGTTCCAAG
TAACCCATACCATCAAGCTCTTTACCAATCATTCTCTCGTTTAAAAGACGT

QA 2 352 2 352
DS 

RD RR2A922JQ 430 0 0
CTCCAAAGTCACCATCATATCTTCTGGGCCAGGGAGATTGGTTCCTTGTTGACCGTAGGC
CTTGGACGTTTTGACTTCTCCATCTCCTCGGCATGTTTTATCCTCATCATTGCTTCGACT
TTCATTAGGGCACCCGATATCTCAAAGCTAAACACAGTCAGTTCCAAGTAACCCATACCA
TCAAGCTCTTTACCAATCATTCTCTCGTTTAAAAAACGTAGTCTCTCCTTCTCGATCACC
AAAAAGTCGATGTCTGTCTTCAGTCTTTCAGGGTCATTGCTACCCCAAGGTTGGGTTTGG
GTTTCTGGAGGGCTGAGGCGGAATGCTCTAGCCTTGTTCCTCAAAGCTCTCCTTCTCCCT
GCTAAAAGGGATTGGTAGGCCAAATCTTCTTTCTCTAGTCTTCGAATCCAGTCCATTCCC
CCCATGAGAT

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2DG27JQ 708 0 0
AGATAGAGAGGAGTTTTTAGTTTGATCGTGTCACCGTAGAGACATAACACAAAGTGCCAG
AAACTAACAATAAAAAGTATCCACAAACATAGTAGCCACATCACGAGACTCTTATTTAAA
CAAAACTATATCCATACGAAGAACCTGCCACCTCCAAAGTCACCATCATATCTTCTGTGC
CAGGGAGATTGGTTCCTTGTTGACCGTAGGCCTTGGACGTTTTGCCTTCTCCATCTCCTC
GGCATGTTTTATCCTCATCATTGCTTCGACTTTCATTAGGGCACCCGATATCTCAAAGCT
AAACACAGTCAGTTCCAAGTAACCCATACCATCAAGCTCTTTACCAATCATTCTCTCGTT
TAAAAGACGTAGTCTCTCCTTCTCGATCACCAGAGAGTCGATGTCTGTCTTCAGTCTTTC
AGGGTCATTGCTACGCCAAGGTTGGGTTTGGGTTTCTGGAGGGCTGAGGCGGAATGCTCT
AGCCTTGTTCCTCAAAGCTCTCCTTCTCCCTGCTAGAAGGGATTGGTAGGCCAAATCTTC
TTTCTCTAGTCTTCGAATCCAGTCCATTCCCCCCATGAGATCATACTCAACAATCTGCTT
GACTGTTAAATCCTCGTGTGCCTTATCTGTTTGTTTGTCCACGATGCTGAAGCCCTCACT
TAAGATACGTTCAAGTGAAGCCAGCTCGGTGTAGCTCATATCATCGAG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2A922TF 687 0 0
GGACGTTTTGACTTCTCCATCTCCTCGGCATGTTTTATCCTCATCATTGCTTCGACTTTC
ATTAGGGCACCCGATATCTCAAAGCTAAACACAGTCAGTTCCAAGTAACCCATACCATCA
AGCTCTTTACCAATCATTCTCTCGTTTAAAAGACGTAGTCTCTCCTTCTCGATCACCAGA
GAGTCGATGTCTGTCTTCAGTCTTTCAGGGTCATTGCTACGCCAAGGTTGGGTTTGGGTT
TCTGGAGGGCTGAGGCGGAATGCTCTAGCCTTGTTCCTCAAAGCTCTCCTTCTCCCTGCT
AGAAGGGATTGGTAGGCCAAATCTTCTTTCTCTAGTCTTCGAATCCAGTCCATTCCCCCC
ATGAGATCATACTCAACAATCTGCTTGACTGTTAAATCCTCGTGTGCCTTATCTGTTTGT
TTGTCCACGATGCTGAAGCCCTCACTTAAGATACGTTCAAGTGAAGCCAGCTCGGTGTAG
CTCATATCATCGAGACCGACACCATTCAGTTTCTCGTTTGAAATCTGTAACAACTTGACC
TCCTCTTGCAAATCTTTGATGTCTTGTAGACACTGGAGCCTTCGTTTTTCCGAGCTGCGT
GTAGTTCTGATAGACATCTCTCTCTCTCTCTCTCT****C**TCTCTCTCTCTCTCGCTC
TCGCTCGCTTCCGCTTCCGGCGCATCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2GU61TF 644 0 0
TCATTGCTTCGACTTTCATTAGGGCACCCGATATCTCAAAGCTAAACACAGTCAGTTCCA
AGTAACCCATACCATCAAGCTCTTTACCAATCATTCTCTCGTTTAAAAGACGTAGTCTCT
CCTTCTCGATCACCAGAGAGTCGATGTCTGTCTTCAGTCTTTCAGGGTCATTGCTACGCC
AAGGTTGGGTTTGGGTTTCTGGAGGGCTGAGGCGGAATGCTCTAGCCTTGTTCCTCAAAG
CTCTCCTTCTCCCTGCTAGAAGGGATTGGTAGGCCAAATCTTCTTTCTCTAGTCTTCGAA
TCCAGTCCATTCCCCCCATGAGATCATACTCAACAATCTGCTTGACTGTTAAATCCTCGT
GTGCCTTATCTGTTTGTTTGTCCACGATGCTGAAGCCCTCACTTAAGATACGTTCAAGTG
AAGCCAGCTCGGTGTAGCTCATATCATCGAGACCGACACCATTCAGTTTCTCGTTTGAAA
TCTGTAACAACTTGACCTCCTCTTGCAAATCTTTGATGTCTTGTAGACACTGGAGCCTTC
GTTTTTCCGAGCTGCGTGTAGTTCTGATAGACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTC**T
CTCTCTCTCTCTCGCTCTCGCTCGCTTCCGCTTCCGGC
GCATCC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2H272TF 679 0 0
ACGTTTTG
CTTCTCCATCTCCTCGGCATGTTTTATCCTCATCATTGCTTCGACTTTCATTAGGGCACC
CGATATCTCAAAGCTAAACACAGTCAGTTCCAAGTAACCCATACCATCAAGCTCTTTACC
AATCATTCTCTCGTTTAAAAGACGTAGTCTCTCCTTCTCGATCACCAGAGAGTCGATGTC
TGTCTTCAGTCTTTCAGGGTCATTGCTACGTCAAGGTTGGGTTTGGGTTTCTGGAGGGCT
GAGGCGGAATGCTCTAGCCTTGTTCCTCAAAGCTCTCCTTCTCCCTGCTAGAAGGGATTG
GTAGGCCAAATCTTCTTT*****GTCTTCGAATCCAGTCCATTCCCCCCATGAGATCATA
CTCAACAATCCGCTTGACTGTTAAATCCTCGTGTGCCTTATCTGTTTGTTTGTCCACGAT
GCTGAAGCCCTCACTTAAGATACGTTCAAGTGAAGCCAGCTCGGTGTAGCTCATATCATC
GAGACCGACACCATTCAGTTTCTCGTTTGAAATCTGTAACAACTTGGCCTCCTCTTGCAA
ATCTTTGATGTCTTGTAGACACTGGAGCCTTCGTTTTTCCGAGCTGCGTGTAGTTCTGAT
AGACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCGCTCTCGCTCGCTTC
CGCTTCCGGCC

QA 9 679 9 679
DS 

RD RR2HB08TF 659 0 0
CTCGGCATGTTTTATCCTCATCATTGCTTCGACTTTCATTAGGGCACCCGATATCTCAAA
GCTAAACACAGTCAGTTCCAAGTAACCCATACCATCAAGCTCTTTACCAATCATTCTCTC
GTTTAAAAGACGTAGTCTCTCCTTCTCGATCACCAGAGAGTCGATGTCTGTCTTCAGTCT
TTCAGGGTCATTGCTACGTCAAGGTTGGGTTTGGGTTTCTGGAGGGCTGAGGCGGAATGC
TCTAGCCTTGTTCCTCAAAGCTCTCCTTCTCCCTGCTAGAAGGGATTGGTAGGCCAAATC
TTCTTT*****GTCTTCGAATCCAGTCCATTCCCCCCATGAGATCATACTCAACAATCCG
CTTGACTGTTAAATCCTCGTGTGCCTTATCTGTTTGTTTGTCCACGATGCTGAAGCCCTC
ACTTAAGATACGTTCAAGTGAAGCCAGCTCGGTGTAGCTCATATCATCGAGACCGACACC
ATTCAGTTTCTCGTTTGAAATCTGTAACAACTTGGCCTCCTCTTGCAAATCTTTGATGTC
TTGTAGACACTGGAGCCTTCGTTTTTCCGAGCTGCGTGTAGTTCTGATAGACATCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCGCTCTCGCTCGCTTCCGCTTCCGGC
C

QA 1 658 1 658
DS 



AS 3 9

CO CL549Contig1 835 2 2 U
GGACGTCTCTCATCTTCTTCTCGGGAAGATCAGAAAACAACTTCTTTTTGTTTAAATTTC
ATCCTCAAGCTTCGAGGATCGCAGGAAAATTCTCATTTCGATCTTACCGTTTCTGGCAGG
ATTTTAAAAGACAACAACAATGAGCTCTGAGCAAAACAACAGCACAAGCTTCCCACCAAC
AGAGCCAAAGCTCTGCGATAACGGATGCGGATTCTTCGGGTCACCCTCCAACATGAACCT
TTGTTCCAAATGTTACCGAAGCCTACGTGCCGAGGAAGATCAAACGGCGGTGGCAAAAGC
TGCGGTGGAGAAATCACTAAAGCTTCCATCTTGCAGTCTCATCACCGCACCAGAGCCAAA
ACAACCTCTGGAGACCGAACCAGTCTCGGTGGAAACCGTTGTGATCGCTGAGCCGACTTC
CGTTCCTCCTGTAGCTACGGGACAGGAGGAGGGAGAGCCGTCGAAGCCTGCACGGCCTAA
CAGGTGTTTCAGCTGTAACAAGAAGGTTGGAGTTATGGGGTTTAAGTGCAAATGCGGGAG
CACTTTTTGCGGGAGCCATAGGTACCCGGAGAAGCATGAGTGTAGCTTCGATTTCAAAGA
GGTTGGACGCGGTGCAATCGCAAAGGCGAATCCTGTGGTCAAGGCGGATAAAGTCCAGAG
GATTTGATGTGATGTGATGTGTCTATCTTTCAGTTTATTCCGAGAATGTTGCTGTGATGT
GGTCATGTTCGATGTTGGGTTTCTATGAATCAAAATGAAAATTGCTGCTATTGGTTTTCT
CATGAATCCTTTTTTAGTGCTTTTAAGTCTATTGAAATGGAGTCTCCCTTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY22TFB U 1
AF RR2AY22JQ C 50
BS 1 638 RR2AY22TFB
BS 639 835 RR2AY22JQ

RD RR2AY22TFB 638 0 0
GGACGTCTCTCATCTTCTTCTCGGGAAGATCAGAAAACAACTTCTTTTTGTTTAAATTTC
ATCCTCAAGCTTCGAGGATCGCAGGAAAATTCTCATTTCGATCTTACCGTTTCTGGCAGG
ATTTTAAAAGACAACAACAATGAGCTCTGAGCAAAACAACAGCACAAGCTTCCCACCAAC
AGAGCCAAAGCTCTGCGATAACGGATGCGGATTCTTCGGGTCACCCTCCAACATGAACCT
TTGTTCCAAATGTTACCGAAGCCTACGTGCCGAGGAAGATCAAACGGCGGTGGCAAAAGC
TGCGGTGGAGAAATCACTAAAGCTTCCATCTTGCAGTCTCATCACCGCACCAGAGCCAAA
ACAACCTCTGGAGACCGAACCAGTCTCGGTGGAAACCGTTGTGATCGCTGAGCCGACTTC
CGTTCCTCCTGTAGCTACGGGACAGGAGGAGGGAGAGCCGTCGAAGCCTGCACGGCCTAA
CAGGTGTTTCAGCTGTAACAAGAAGGTTGGAGTTATGGGGTTTAAGTGCAAATGCGGGAG
CACTTTTTGCGGGAGCCATAGGTACCCGGAGAAGCATGAGTGTAGCTTCGATTTCAAAGA
GGTTGGACGCGGTGCAATCGCAAAGGCGAATCCTGTGG

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2AY22JQ 786 0 0
GTTTAAATTTCATCCTCAAGCTTCGAGGATCGCAGGAAAATTCTCATTTCGATCTTACCG
TTTCTGGCAGGATTTTAAAAGACAACAACAATGAGCTCTGAGCAAAACAACAGCACAAGC
TTCCCACCAACAGAGCCAAAGCTCTGCGATAACGGATGCGGATTCTTCGGGTCACCCTCC
AACATGAACCTTTGTTCCAAATGTTACCGAAGCCTACGTGCCGAGGAAGATCAAACGGCG
GTGGCAAAAGCTGCGGTGGAGAAATCACTAAAGCTTCCATCTTGCAGTCTCATCACCGCA
CCAGAGCCAAAACAACCTCTGGAGACCGAACCAGTCTCGGTGGAAACCGTTGTGATCGCT
GAGCCGACTTCCGTTCCTCCTGTAGCTACGGGACAGGAGGAGGGAGAGCCGTCGAAGCCT
GCACGGCCTAACAGGTGTTTCAGCTGTAACAAGAAGGTTGGAGTTATGGGGTTTAAGTGC
AAATGCGGGAGCACTTTTTGCGGGAGCCATAGGTACCCGGAGAAGCATGAGTGTAGCTTC
GATTTCAAAGAGGTTGGACGCGGTGCAATCGCAAAGGCGAATCCTGTGGTCAAGGCGGAT
AAAGTCCAGAGGATTTGATGTGATGTGATGTGTCTATCTTTCAGTTTATTCCGAGAATGT
TGCTGTGATGTGGTCATGTTCGATGTTGGGTTTCTATGAATCAAAATGAAAATTGCTGCT
ATTGGTTTTCTCATGAATCCTTTTTTAGTGCTTTTAAGTCTATTGAAATGGAGTCTCCCT
TTGCCC

QA 1 786 1 786
DS 



CO CL549Contig2 872 2 2 U
GGAGTTGCGTGTTTGGTTATCTTTTCTTTCGTGTAACCTAAATTAAGGGATTTGTTCTAA
CAAATCTCTCTAGACTCCAAAAAGGAAGAATCACGTCTCTCATCTTCCTCTCGGGAAGAT
CAGAAAACAACTTCTTTTTGTTTAAATTTCATCCTCAAGCTTCGAAGATCGCAGGAAAAA
TTCTCGTTTCGATCTGACCATTTCTGGCAGGATTTACAACAACAACAACAATGAGCTCTG
GGCAAAACAACAGCACAAGCTTCCCACCAACAGAGCCAAAGCTCTGCGATAACGGATGCG
GGTTCTTCGGGTCACCCTCCAACATGAACCTTTGTTCCAAATGTTACCGAAGCCTACGTG
CCGAGGAAGATCAAACGGCGGTGGCAAAAGCTGCGGTGGAGAAATCACTGAAGCTTCCAT
CTTGCAGTCTCATCACCGCACCAGAGCCAAAACAGCCTCTGGAGACCGAACCGGTCTCGG
TGGAAACCGTTGTGATCGCTGAACCGACTTCTGTTCCTCCTGTAGCTACGGGACAGGAGG
AGGGAGAGCCGTCGAAGCCTGCACGGCCTAACAGGTGTTTCAGCTGTAACAAGAAGGTTG
GAGTTATGGGGTTTAAGTGCAAATGCGGGAGCACGTTTTGCTGGAGCCATAGGTACCCGG
AGAAGCATGAGTGTAGCTTCGATTTCAAAGAGGTTGGACGCGGTGCAATCGCAAAGGCAA
ATCCTGTGGTCAAGGCTGATAAAGTCCAGAGGATTTGATTGTGATGTGTCTTATCTTTCA
GTTTATTCCGAGAATGCTGCCGTGATGTGGTCATGTTCGATGTTGGGTTTCTATGAATCA
AAATGAAAAAAATGCTGCTATTGGTTTTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D828TF U 1
AF RR2D828JQ C 172
BS 1 565 RR2D828TF
BS 566 872 RR2D828JQ

RD RR2D828TF 570 0 0
GGAGTTGCGTGTTTGGTTATCTTTTCTTTCGTGTAACCTAAATTAAGGGATTTGTTCTAA
CAAATCTCTCTAGACTCCAAAAAGGAAGAATCACGTCTCTCATCTTCCTCTCGGGAAGAT
CAGAAAACAACTTCTTTTTGTTTAAATTTCATCCTCAAGCTTCGAAGATCGCAGGAAAAA
TTCTCGTTTCGATCTGACCATTTCTGGCAGGATTTACAACAACAACAACAATGAGCTCTG
GGCAAAACAACAGCACAAGCTTCCCACCAACAGAGCCAAAGCTCTGCGATAACGGATGCG
GGTTCTTCGGGTCACCCTCCAACATGAACCTTTGTTCCAAATGTTACCGAAGCCTACGTG
CCGAGGAAGATCAAACGGCGGTGGCAAAAGCTGCGGTGGAGAAATCACTGAAGCTTCCAT
CTTGCAGTCTCATCACCGCACCAGAGCCAAAACAGCCTCTGGAGACCGAACCGGTCTCGG
TGGAAACCGTTGTGATCGCTGAACCGACTTCTGTTCCTCCTGTAGCTACGGGACAGGAGG
AGGGAGAGCCGTCGAAGCCTGCACG
CCTAA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2D828JQ 701 0 0
CAGGA
AAAATTCTCGTTTCGATCTGACCATTTCTGGCAGGATTTACAACAACAACAACAATGAGC
TCTGGGCAAAACAACAGCACAAGCTTCCCACCAACAGAGCCAAAGCTCTGCGATAACGGA
TGCGGGTTCTTCGGGTCACCCTCCAACATGAACCTTTGTTCCAAATGTTACCGAAGCCTA
CGTGCCGAGGAAGATCAAACGGCGGTGGCAAAAGCTGCGGTGGAGAAATCACTGAAGCTT
CCATCTTGCAGTCTCATCACCGCACCAGAGCCAAAACAGCCTCTGGAGACCGAACCGGTC
TCGGTGGAAACCGTTGTGATCGCTGAACCGACTTCTGTTCCTCCTGTAGCTACGGGACAG
GAGGAGGGAGAGCCGTCGAAGCCTGCACGGCCTAACAGGTGTTTCAGCTGTAACAAGAAG
GTTGGAGTTATGGGGTTTAAGTGCAAATGCGGGAGCACGTTTTGCTGGAGCCATAGGTAC
CCGGAGAAGCATGAGTGTAGCTTCGATTTCAAAGAGGTTGGACGCGGTGCAATCGCAAAG
GCAAATCCTGTGGTCAAGGCTGATAAAGTCCAGAGGATTTGATTGTGATGTGTCTTATCT
TTCAGTTTATTCCGAGAATGCTGCCGTGATGTGGTCATGTTCGATGTTGGGTTTCTATGA
ATCAAAATGAAAAAAATGCTGCTATTGGTTTTAAGG

QA 6 701 6 701
DS 



CO CL549Contig3 958 5 7 U
AGCAGGCAAAGGGAGACTCCATTTCAATAGACTTAAAAGCACTAAAAAAGGATTCATGAG
AAAACCAATAGCAGCATTTTTTCATTTTGATTCATAGAAACCCAACATCGAACATGACCA
CATCACAGCAACATTCTCGGAATAAACTGAAAGATA*GACACATCACATCACAATCATAT
CCTCTGGACTTTATCCGCCTTGACCACAGGATTCGCCTTTGCGATTGCACCGCGTCCAAC
CTCTTTGAAATCGAAGCTACACTCATGCTTCTCCGGGTACCTATGGCTCCCGCAAAACGT
GCTCCC*GCATTTGCACTTAAACCCC*ATGACTCCAACTTTCTTGTTACAGCTGAAACAC
CTGTTAGGCCGTGCAGGCTTCGACGGCTCTCCCTCCTCCTGTCCCGTAGCTACAGGAGGA
ACAGAAGTCGGTTCAGCGATCACAACGGTTTCCACCGAGACTGGTTCCGTCTCCAGAGGC
TGTTTCGGCTCTGGCGCGGTGATGAGACTGCAAGAGGGAAGCTTTAGTGATTTCTCCACC
GCAGCTTTGGCCACTGCCGTTTGATCTTCCTCGGCACGTAGGCTTCGGTAACATTTGGAA
CAAAGGTTCATGTTGGAGGGTGACCCGAAGAATCCGCATCCGTTATCGCAGAGCTTTGGC
TCTGTTGGTGGGAAGCTTGTGCTGTTGTTTTGCTCAGAGCTCATTGTTGTTGTTGTTGTC
GTCTTTTAAAATCCTGCCTTCTCACCAGAAATGGTCAGATCGAAACGAAAATTTTTCCTG
CGATCTTCGAAGCTTGAAGATGAAATTTAAACAAAAAGAAGTTGTTTTCTGATCTTCCCG
AGAAGAAGATGAGAGACGTGAGATTCTTCCTTTTTGGAGTCTAGAGAGATTTGTTAGAAC
AAATCCCTTAATTTAGGTTACACGAAAGAAAAGATAACCAAACACGCAACTGGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX95JQ U 77
AF RR2F031JQ U 30
AF RR2GI74JQB U 1
AF RR2GI74TF C 221
AF RR2GX95TF C 284
BS 1 816 RR2GI74JQB
BS 817 817 RR2GI74TF
BS 818 874 RR2GI74JQB
BS 875 875 RR2GI74TF
BS 876 892 RR2GI74JQB
BS 893 921 RR2GI74TF
BS 922 958 RR2GX95TF

RD RR2GX95JQ 304 0 0
TTTTTTCATTTTGATTCATAGAAACCCAACATCGAACATGACCACATCACAGCAACATTC
TCGGAATAAACTGAAAGATA*GACACATCACATCACAATCGTATCCTCTGGACTTTATCC
GCCTTGACCACAGGATTCGCCTTTGCGATTGCACCGCGTCCAACCTCTTTGAAATCGAAG
CTACACTCATGCTTCTCCGGGTACCTATGGCTCCCGCAAAACGTGCTCCC*GCATTTGCA
CTTAAACCCC*ATGACTCCAACTTTCTTGTTACAGCTGAAACACCTGTTAGGCCGTGCAG
GCTT

QA 1 304 1 304
DS 

RD RR2F031JQ 620 0 0
GACTTAAAAGCACTAAAAA*GGATTCATGAGAAAACCAATAGCAGCATTTTTTCATTTTG
ATTCATAGAAACCCAACATCGAACATGACCAAATCACAGCAACATTCTCGGAATTAACTG
AAAGATAAGACACATCACATCA*AATCAAATCCTCTGGACTTTATCCGCCTTGACCACAG
GATTCGCCTTTGCGATTGCACCGCGTCCAACCTCTTTGAAATCGAAGCTACACTCATGCT
TCTCCGGGTACCTATGGCTCCCGCAAAACGTGCTCCC*GCATTTGCACTTAAACCCC*AT
AACTCCAACCTTCTTGTTACAGCTGAAACACCTGTTAGGCCGTGCAGGCTTCGACGGCTC
TCCCTCCTCCTGTCCCGTAGCTACAGGAGGAACAGAAGTCGGTTCAGCGATCACAACGGT
TTCCACCGAGACTGGTTCGGTCTCCAGAGGCTGTTTTGGCTCTGGTGCGGTGATGAGACT
GCAAGATGGAAGCTTTAGTGATTTCTCCACCGCAGCTTTCGCCACTGCCGTTTGATCTTC
CTCGGCACGTAGGCTTCGGTAACATTTGGAACAAAGGTTCATGTTGGAGGGTGACCCGAA
GAATCCGCATCCGTTATCGC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2GI74JQB 892 0 0
AGCAGGCAAAGGGAGACTCCATTTCAATAGACTTAAAAGCACTAAAAAAGGATTCATGAG
AAAACCAATAGCAGCATTTTTTCATTTTGATTCATAGAAACCCAACATCGAACATGACCA
CATCACAGCAACATTCTCGGAATAAACTGAAAGATA*GACACATCACATCACAATCATAT
CCTCTGGACTTTATCCGCCTTGACCACAGGATTCGCCTTTGCGATTGCACCGCGTCCAAC
CTCTTTGAAATCGAAGCTACACTCATGCTTCTCCGGGTACCTATGGCTCCCGCAAAACGT
GCTCCC*GCATTTGCACTTAAACCCC*ATGACTCCAACTTTCTTGTTACAGCTGAAACAC
CTGTTAGGCCGTGCAGGCTTCGACGGCTCTCCCTCCTCCTGTCCCGTAGCTACAGGAGGA
ACAGAAGTCGGTTCAGCGATCACAACGGTTTCCACCGAGACTGGTTCCGTCTCCAGAGGC
TGTTTCGGCTCTGGCGCGGTGATGAGACTGCAAGAGGGAAGCTTTAGTGATTTCTCCACC
GCAGCTTTGGCCACTGCCGTTTGATCTTCCTCGGCACGTAGGCTTCGGTAACATTTGGAA
CAAAGGTTCATGTTGGAGGGTGACCCGAAGAATCCGCATCCGTTATCGCAGAGCTTTGGC
TCTGTTGGTGGGAAGCTTGTGCTGTTGTTTTGCTCAGAGCTCATTGTTGTTGTTGTTGTC
GTCTTTTAAAATCCTGCCTTCTCACCAGAAATGGTCAGATCGAAACGAAAATTTTTCCTG
CGATCTTCGAAGCTTGAAGATGAAATTTAAACAAAA*GAAGTTGTTTTCTGATCTTCCCG
AGAAGAAGATGAGAGACGTGAGATTCTTCCTTTT*GGAGTCTAGAGAGATTT

QA 1 892 1 892
DS 

RD RR2GI74TF 704 0 0
GCGATTGCACCGCGTCCAAC*TCTTTGAAATCGAAGCTACACTCATGCTTCTCCGGGTAC
*TATGGCTCCCGCAAAACGTGCTCCC*GCATTTGCACTTAAACCCC*ATGACTCCAACTT
TCTTGTTACAGCTGAAACACCTGTTAGGCCGTGCAGGCTTCGACGGCTCTCCCTCCTCCT
GTCCCGTAGCTACAGGAGGAACAGAAGTCGGTTCAGCGATCACAACGGTTTCCACCGAGA
CTGGTTCCGTCTCCAGAGGCTGTTTCGGCTCTGGCGCGGTGATGAGACTGCAAGAGGGAA
GCTTTAGTGATTTCTCCACCGCAGCTTTGGCCACTGCCGTTTGATCTTCCTCGGCACGTA
GGCTTCGGTAACATTTGGAACAAAGGTTCATGTTGGAGGGTGACCCGAAGAATCCGCATC
CGTTATCGCAGAGCTTTGGCTCTGTTGGTGGGAAGCTTGTGCTGTTGTTTTGCTCAGAGC
TCATTGTTGTTGTTGTTGTCGTCTTTTAAAATCCTGCCTTCTCACCAGAAATGGTCAGAT
CGAAACGAAAATTTTTCCTGCGATCTTCGAAGCTTGAAGATGAAATTTAAACAAAAAGAA
GTTGTTTTCTGATCTTCCCGAGAAGAAGATGAGAGACGTGAGATTCTTCCTTTTTGGAGT
CTAGAGAGATTTGTTAGAACAAATCCCTTAATTTAGGTTAC
CAC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2GX95TF 675 0 0
TGGCTCCCGCAAAACGTGCTCCCCGCATTTGCACTTAAACCCCCATGACTCCAACTTTCT
TGTTACAGCTGAAACACCTGTTAGGCCGTGCAGGCTTCGACGGCTCTCCCTCCTCCTGTC
CCGTAGCTACAGGAGGAACAGAAGTCGGTTCAGCGATCACAACGGTTTCCACCGAGACTG
GTTCCGTCTCCAGAGGCTGTTTCGGCTCTGGCGCGGTGATGAGACTGCAAGAGGGAAGCT
TTAGTGATTTCTCCACCGCAGCTTTGGCCACTGCCGTTTGATCTTCCTCGGCACGTAGGC
TTCGGTAACATTTGGAACAAAGGTTCATGTTGGAGGGTGACCCGAAGAATCCGCATCCGT
TATCGCAGAGCTTTGGCTCTGTTGGTGGGAAGCTTGTGTTGTTGTTTTGCTCAGAGCTCA
TTGTTGTTGTTGTTGTCGTCTTTTAAAATCCTGCCTTCTCACCAGAAATGGTCAGATCGA
AACGAAAATTTTTCCTGCGATCTTCGAAGCTTGAAGATGAAATTTAAACAAAAAGAAGTT
GTTTTCTGATCTTCCCGAGAAGAAGATGAGAGACGTGAGATTCTTCCTTTTTGGAGTCTA
GAGAGATTTGTTAGAACAAATCCCTTAATTTAGGTTACACGAAAGAAAAGATAACCAAAC
ACGCAACTGGTTTCC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 8

CO CL550Contig1 1054 8 17 U
GGGGTTCAAATCAAATCGGAAAGTTAAAAGATCTACGCGAAATCGAATCGGCGAAAAAGA
TGACGGAGGACCACAAACACGAAGAAGAACCCTTGACCGCGTCGGAGCCAGCGGTGGAGA
TTTCGGAGAGGGGATTGATGGACAAGATATCGGAGAAGATCCACCACGGCGGCGATTCGT
CGTCTTCTTCTTCATCCTCAGACGACGATGACGATAAGAAGAAGAAGAAACCGTCTTCCC
CGTCTTCGATGCAATCGAAAGTTTACCGCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCCGTTCACAAAG
TCCTCGGCGGTGGAAAACCTGCTGATATATTCATGTGGAAGAACAAGAAGATGTCTGGTG
GTGTTCTCGGTGGTGCGACAGCTGCGTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTATCACCTCC
TCACTTTGCTTTGCCATGTGATGATTGTTGTTCTTGCGTTTCTGTTTCTCTGGTCTAATG
CCACCATGTTCATTCACAAGTCACCACCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGC
CTGTTCTTCAGCTTGCGTCTGGGCTCAGGATAGAGATCAACCGTGGGTTCTCTTCTCTTC
GTGAGATTGCATCTGGAAGGGATCTCAAGAAGTTCATCTCTGCTGTTGCTGGCTTGTGGG
TTCTTTCAATCTTGGG*TGGATGGTTCAATTTCTTGACATTGGCATACATAGCTCTTGTG
CTGCTCTTCACGGTGCCTCTTGTCTACGACAAGTACGAAGACAAAGTTGATCCATTAGGT
GAGAAAGCAATGATAGAGATCAAGAAGCAGTACGCGGTGTTGGACGAGAAGGTGTTGAGC
AAGATCCCGTTGGGCCCGTTGAAGAACAAGAAGAGAGATTAGTAGGGTTCTCTACGAAAT
GGTAATACGTTGTTAGTTAAAAAAAA*GGGTGTTGTTGAAATTGTGTCAGAATCTGTGTG
TTACTACATCTCTTTAGTATGTTATTTGGTTCAGGTGGATTGTTGTAAGAAGTTTTAGAC
TTAATACAGTATCTTACTACCTCTTTATTCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D335TF U 103
AF RR2FS36TF U 2
AF RR2FH62TF U 1
AF RR2B374TF U 6
AF RR2FS36JQ C 378
AF RR2B374JQ C 245
AF RR2FH62JQ C 276
AF RR2F460JQ C 356
BS 1 264 RR2FH62TF
BS 265 265 RR2FS36TF
BS 266 567 RR2FH62TF
BS 568 568 RR2FS36TF
BS 569 688 RR2FH62TF
BS 689 689 RR2B374TF
BS 690 751 RR2FH62TF
BS 752 752 RR2B374TF
BS 753 758 RR2FH62TF
BS 759 759 RR2B374TF
BS 760 778 RR2FH62TF
BS 779 779 RR2B374JQ
BS 780 808 RR2B374TF
BS 809 809 RR2FH62JQ
BS 810 824 RR2B374TF
BS 825 1041 RR2B374JQ
BS 1042 1054 RR2F460JQ

RD RR2D335TF 462 0 0
G
GGAGCCAGCGGTGGAGATTTCGGAGAGGGGATTGATGGACAAGATATCGGAGAAGATCCA
CCACGGCGGCGATTCGTCGTCTTCTTCTTCATCCTCAGACGACGATGACGATAAGAAGAA
GAAGAAACCGTCTTCCCCGTCTTCGATGCAATCGAAAGTTTACCGCTTGTTCGGAAGGGA
GAAGCCCGTTCACAAAGTCCTCGGCGGTGGAAAACCTGCTGATATATTCATGTGGAAGAA
CAAGAAGATGTCTGGTGGTGTTCTCGGTGGTGCGACAGCTGCGTGGGTTCTGTTTGAGTT
GATGGAGTATCACCTCCTCACTTTGCTTTGCCATGTGATGATTGTTGTTCTTGCGTTTCT
GTTTCTCTGGTCTAATGCCACCATGTTCATTCACAAGTCACCACCGAAGATTCCTGAAGT
TCATATCCCTGAGGAGCCTGTTCTTCAGCTTGCGTCTGGGC

QA 2 462 2 462
DS 

RD RR2FS36TF 671 0 0
GGGTTC
AAATCAAATCGGAAAGTTAAAAGATCTACGCGAAATCGAATCGGCGAAAAAGATGACGGA
GGACCACAAACACGAAGAAGAACCCTTGACCGCGTCGGAGCCAGCGGTGGAGATTTCGGA
GAGGGGATTGATGGACAAGATATCGGAGAAGATCCACCACGGCGGCGATTCGTCGTCTTC
TTCTTCATCCTCAGACGACGATGACGATAAGAAGAAGAAGAAACCGTCTTCCCCGTCTTC
GATGCAATCGAAAGTTTACCGCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCCGTTCACAAAGTCCTCGG
CGGTGGAAAACCTGCTGATATATTCATGTGGAAGAACAAGAAGATGTCTGGTGGTGTTCT
CGGTGGTGCGACAGCTGCGTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTATCACCTCCTCACTTT
GCTTTGCCATGTGATGATTGTTGTTCTTGCGTTTCTGTTTCTCTGGTCTAATGCCACCAT
GTTCATTCACAAGTCACCACCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTGTTCT
TCAGCTTGCGTCTGGGCTCAGGATAGAGATCAACCGTGGGTTCTCTTCTCTTCGTGAGAT
TGCATCTGGAAGGGATCCCAAGAAGTTCATCTCTGCTGTTGCTGGCTTGTGGGTTCTTTC
AATCT

QA 7 671 7 671
DS 

RD RR2FH62TF 795 0 0
GGGGTTCAAATCAAATCGGAAAGTTAAAAGATCTACGCGAAATCGAATCGGCGAAAAAGA
TGACGGAGGACCACAAACACGAAGAAGAACCCTTGACCGCGTCGGAGCCAGCGGTGGAGA
TTTCGGAGAGGGGATTGATGGACAAGATATCGGAGAAGATCCACCACGGCGGCGATTCGT
CGTCTTCTTCTTCATCCTCAGACGACGATGACGATAAGAAGAAGAAGAAACCGTCTTCCC
CGTCTTCGATGCAATCGAAAGTTTGCCGCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCCGTTCACAAAG
TCCTCGGCGGTGGAAAACCTGCTGATATATTCATGTGGAAGAACAAGAAGATGTCTGGTG
GTGTTCTCGGTGGTGCGACAGCTGCGTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTATCACCTCC
TCACTTTGCTTTGCCATGTGATGATTGTTGTTCTTGCGTTTCTGTTTCTCTGGTCTAATG
CCACCATGTTCATTCACAAGTCACCACCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGC
CTGTTCTTCAGCTTGCGTCTGGGCTCACGATAGAGATCAACCGTGGGTTCTCTTCTCTTC
GTGAGATTGCATCTGGAAGGGATCTCAAGAAGTTCATCTCTGCTGTTGCTGGCTTGTGGG
TTCTTTCAATCTTGGG*TGGATGGTTCA*TTTCTTGACATTGGCATACATAGCTCTTGTG
CTGCTCTTCACGGTGCCTCTTGTCTACGACA*GTACGA*GACAAAGTTGATCCATTAG
TGAGAAGCATGATAGAG

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2B374TF 819 0 0
GG
AAATCAAATCGGAAAGTTAAAAGATCTACGCGAAATCGAATCGGCGAAAAAGATGACGGA
GGACCACAAACACGAAGAAGAACCCTTGACCGCGTCGGAGCCAGCGGTGGAGATTTCGGA
GAGGGGATTGATGGACAAGATATCGGAGAAGATCCACCACGGCGGCGATTCGTCGTCTTC
TTCTTCATCCTCAGACGACGATGACGATAAGAAGAAGAAGAAACCGTCTTCCCCGTCTTC
GATGCAATCGAAAGTTTACCGCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCCGTTCACAAAGTCCTCGG
CGGTGGAAAACCTGCTAATATATTCATGTGGAAGAACAAGAAGATGTCTGGTGGTGTTCT
CGGTGGTGCGACAGCTGCGTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTATCACCTCCTCACTTT
GCTTTGCCATGTGATGATTGTTGTTCTTGCGTTTCTGTTTCTCTGGTCTAATGCCACCAT
GTTCATTCACAAGTCACCACCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTGTTCT
TCAGCTTGCGTCTGGGCTCAGGATAGAGATCAACCGTGGGTTCTCTTCTCTTCGTGAGAT
TGCATCTGGAAGGGATCTCAAGAAGTTCATCTCTGCCGTTGCTGGCTTGTGGGTTCCTTC
AATCTTGGGGTGGATGGTTCAATTTCTTGACATTGGCATACATAGCTCTTGTGCTGCTCT
TCACGGTGCCTCTTGTCTACGACAAGTACGAAGACAAAGTTGATCCATTAG*TGAGAAAG
CAATGATAGAGATCAAGAAGCGGTACGCGGTGTTGGA

QA 3 819 3 819
DS 

RD RR2FS36JQ 621 0 0
ACAGCTGCGTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTATCACCTCCTCACTTTGCTTTGCCAT
GTGATGATTGTTGTTCTTGCGTTTCTGTTTCTCTGGTCTAATGCCACCATGTTCATTCAC
AAGTCACCACCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTGTTCTTCAGCTTGCG
TCTGGGCTCAGGATAGAGATCAACCGTGGGTTCTCTTCTCTTCGTGAGATTGCATCTGGA
AGGGATCCCAAGAAGTTCATCTCTGCTGTTGCTGGCTTGTGGGTTCTTTCAATCTTGGG*
TGGATGGTTCAATTTCTTGACATTGGCATACATAGCTCTTGTGCTGCTCTTCACGGTGCC
TCTTGTTTACGACAAGTACGAAGACAAAGTTGATCCATTAGGTGAGAAAGCAATGATAGA
GATCAAGAAGCAGTACGCGGTGTTGGACGAGAAGGTGTTGAGCAAGATCCCGTTGGGCCC
GTTGAAGAACAAGAAGAGAGATTAGTAGGGTTCTCTACGAAATGGTAATACGTTGTTAGT
TAAAAAAAA*GTGTGTTGTTGAAATTGTGTCAGAATCTGTGTGTTACTACATCTCTTTAG
TATGTTATTTGGTTCAGGT
AG

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2B374JQ 797 0 0
TTCGATGCAATCGAAAGTTTACCGCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCCGTTCACAAAGTCCT
CGGCGGTGGAAAACCTGCTAATATATTCATGTGGAAGAACAAGAAGATGTCTGGTGGTGT
TCTCGGTGGTGCGACAGCTGCGTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTATCACCTCCTCAC
TTTGCTTTGCCATGTGATGATTGTTGTTCTTGCGTTTCTGTTTCTCTGGTCTAATGCCAC
CATGTTCATTCACAAGTCACCACCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTGT
TCTTCAGCTTGCGTCTGGGCTCAGGATAGAGATCAACCGTGGGTTCTCTTCTCTTCGTGA
GATTGCATCTGGAAGGGATCTCAAGAAGTTCATCTCTGCCGTTGCTGGCTTGTGGGTTCC
TTCAATCTTGGG*TGGATGGTTCAATTTCTTGACATTGGCATACATAGCTCTTGTGCTGC
TCTTCACGGTGCCTCTTGTCTACGACAAGTACGAAGACAAAGTTGATCCATTAGGTGAGA
AAGCAATGATAGAGATCAAGAAGCGGTACGCGGTGTTGGACGAGAAGGTGTTGAGCAAGA
TCCCGTTGGGCCCGTTGAAGAACAAGAAGAGAGATTAGTAGGGTTCTCTACGAAATGGTA
ATACGTTGTTAGTTAAAAAAAA*GGGTGTTGTTGAAATTGTGTCAGAATCTGTGTGTTAC
TACATCTCTTTAGTATGTTATTTGGTTCAGGTGGATTGTTGTAAGAAGTTTTAGACTTAA
TACAGTATCTTACTACC

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2FH62JQ 767 0 0
GGAAGGGAGAAGCCCGTTCACAAAGTCCTCGGCGGTGGAAAACCTGCTGATATATTCATG
TGGAAGAACAAGAAGATGTCTGGTGGTGTTCTCGGTGGTGCGACAGCTGCGTGGGTTCTG
TTTGAGTTGATGGAGTATCACCTCCTCACTTTGCTTTGCCATGTGATGATTGTTGTTCTT
GCGTTTCTGTTTCTCTGGTCTAATGCCACCATGTTCATTCACAAGTCACCACCGAAGATT
CCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTGTTCTTCAGCTTGCGTCTGGGCTCAGGATAGAG
ATCAACCGTGGGTTCTCTTCTCTTCGTGAGATTGCATCTGGAAGGGATCTCAAGAAGTTC
ATCTCTGCTGTTGCTGGCTTGTGGGTTCTTTCAATCTTGGG*TGGATGGTTCAATTTCTT
GACATTGGCATACATAGCTCTTGTGCTGCTCTTCACGGTGCCTCTTGTCTACGACAAGTA
CGAAGACAAAGTTGATCCATTAGGTGAGAAAGCAATGATAGAGATCAAGAAGCAGTACGC
GGTGTTGGACGAGAAGGTGTTGAGCAAGATCCCGTTGGGCCCGTTGAAGAACAAGAAGAG
AGATTAGTAGGGTTCTCTACGAAATGGTAATACGTTGTTAGTTAAAAAAA**GGGTGTTG
TTGAAATTGTGTCAGAATCTGTGTGTTACTACATCTCTTTAGTATGTTATTTGGTTCAGG
TGGATTGTTGTAAGAAGTTTTAGACTTAATACAGTATCTTACTACC
C

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2F460JQ 699 0 0
TGGTGGTGTTCTCGGTGGTGCGACAGCTGCGTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTATCA
TCTTCTCACTTTGATGTGTCATGTGATGATTGTTGTTCTTGCGGTTCTGTTTCTCTGGTC
TAATGCCACCATGTTCATCCACAAGTCACCACCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGA
GGAGCCTGTTCTTCAGCTTGCGTCTGGGCTCAGGATAGAGATCAACCGTGGGTTCTCTTC
TCTTCGTGAGATTGCATCTGGAAGGGATCTCAAGAAGTTCATCTCTGCTGTTGCTGGCTT
GTGGGTTCTTTCAATCTTGGG*TGGATGGTTCAATCTCTTGACATTGGCATACATAGCTC
TTGTGCTGCTCTTCACGGTGCCTCTTGTTTACGACAAGTACGAAGACAAAGTTGATCCAT
TAGGTGAGAAAGCAATGATAGAGATCAAGAAGCAGTACGCGGTGTTGGACGAGAAGGTGT
TGAGCAAGATCCCGTTGGGCCCGTTGAAGAACAAGAAGAGAGATTAGTAGGGTTCTCTAC
GAAATGGTAATACGTTGCTAGTTAAAAAAAAAGGGTGTTGTTGAAATTGTGTCAGAATCT
GTGTGTTACTACATCTCTTTAGTATGTTATTTGGTTCAGGTGGATTGTTGTAAGAAGTTT
TAGACTTAATACAGTATCTTACTACCTCTTTATTCTGTC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 2 10

CO CL551Contig1 635 4 7 U
GGAAAAACACAAAAGACAGAGATCTCAAAAAACAAAGAAAAAAAAAACAGGGAGATGGGT
TTGGTTACAGATGAAGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACACAGGAGATGAGCTATGCCGC
GAGAAGACCAAGGAGTTCCTCAAGGAAGTTGATATGCCTAATGGGTTATTGCCTTTGAAG
GACATAGAAGAGGTTGGATACGACAGAGAAACCGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGAAG
AGCATCACTCACAAGTTTGAATCTATTGGGAAACTTGTCTCTTACGGCACTGAGGTCACT
GCCGTGGTGGAAGTCGGAAAGATCAAGAAGCTTACCGGTGTTAAGGCCAAGGAGCTTCTT
ATCTGGGTCACTCTCAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAACAAGTTCTGGGAAGATCAAT
TTCAGGACACCGACCGGATTGTCCAGGACTTTCCCTATTTCAGCTTTTGTGGTTCCTGAG
GTTGAGAAGCCTGCAATGGCTAAAGAAGCTATTGCAAATTAGAGATGCTTACTCAAAGTA
TCTCTATTTTTAATTATCTTTAATCATGTATTACTTTCAACATGTTATGCTTAATTTTCT
ATTTTAATAAGATATTTTTCAGTCTGAAAAAAAAA


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC82JQ C 1
AF RR2CC82TF U 1
AF RR2BU33JQ C 9
AF RR2BU33TF U 9
BS 1 2 RR2CC82JQ
BS 3 456 RR2CC82TF
BS 457 457 RR2BU33TF
BS 458 478 RR2CC82TF
BS 479 479 RR2BU33TF
BS 480 624 RR2CC82TF
BS 625 635 RR2BU33TF

RD RR2CC82JQ 611 0 0
GGAAAAACACAAAAGACAGAGATCTCAAAAAACAAAGAAAAAAAAAACAGGGAGATGGGT
TTGGTTACAGATGAAGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACACAGGAGATGAGCTATGCCGC
GAGAAGACCAAGGAGTTCCTCAAGGAAGTTGATATGCCTAATGGGTTATTGCCTTTGAAG
GACATAGAAGAGGTTGGATACGACAGAGAAACCGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGAAG
AGCATCACTCACAAGTTTGAATCTATTGGGAAACTTGTCTCTTACGGCACTGAGGTCACT
GCCGTGGTGGAAGTCGGAAAGATCAAGAAGCTTACCGGTGTTAAGGCCAAGGAGCTTCTT
ATCTGGGTCACTCTCAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAACAAGTTCTGGGAAGATCAAT
TTCAGGACACCGACCGGATTGTCCAGGACTTTCCCTGTTTCAGCTTTTGTGGTTCCTGGG
GTTGAGAAGCCTGCAATGGCTAAAGAAGCTATTGCAAATTAGAGATGCTTACTCAAAGTA
TCTCTATTTTTAATTATCTTTAATCATGTATTACTTTCAACATGTTATGCTTAATTTTCT
ATTTTAATAAG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2CC82TF 629 0 0
GG
AAAAACACAAAAGACAGAGATCTCAAAAAACAAAGAAAAAAAAAACAGGGAGATGGGTTT
GGTTACAGATGAAGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACACAGGAGATGAGCTATGCCGCGA
GAAGACCAAGGAGTTCCTCAAGGAAGTTGATATGCCTAATGGGTTATTGCCTTTGAAGGA
CATAGAAGAGGTTGGATACGACAGAGAAACCGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGAAGAG
CATCACTCACAAGTTTGAATCTATTGGGAAACTTGTCTCTTACGGCACTGAGGTCACTGC
CGTGGTGGAAGTCGGAAAGATCAAGAAGCTTACCGGTGTTAAGGCCAAGGAGCTTCTTAT
CTGGGTCACTCTCAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAACAAGTTCTGGGAAGATCAATTT
CAGGACACCGACCGGATTGTCCAGGACTTTCCCTGTTTCAGCTTTTGTGGTTCCTGGGGT
TGAGAAGCCTGCAATGGCTAAAGAAGCTATTGCAAATTAGAGATGCTTACTCAAAGTATC
TCTATTTTTAATTATCTTTAATCATGTATTACTTTCAACATGTTATGCTTAATTTTCTAT
TTTAATAAGATATTTTTCAGTC
CAAAA

QA 3 624 3 624
DS 

RD RR2BU33JQ 603 0 0
GG
AAAAGACAGAGATCTCAAAAAACAAAGAAAAAAAAAACAGGGAGATGGGTTTGGTTACAG
ATGAAGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACACAGGAGATGAGCTATGCCGCGAGAAGACCA
AGGAGTTCCTCAAGGAAGTTGATATGCCTAATGGGTTATTGCCTTTGAAGGACATAGAAG
AGGTTGGATACGACAGAGAAACCGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGAAGAGCATCACTC
ACAAGTTTGAATCTATTGGGAAACTTGTCTCTTACGGCACTGAGGTCACTGCCGTGGTGG
AAGTCGGAAAGATCAAGAAGCTTACCGGTGTTAAGGCCAAGGAGCTTCTTATCTGGGTCA
CTCTCAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAACAAGTTCTGGGAAGATCAATTTCAGGACAC
CGACCGGATTGTCCAGGACTTTCCCTATTTCAGCTTTTGTGGTTCCTGAGGTTGAGAAGC
CTGCAATGGCTAAAGAAGCTATTGCAAATTAGAGATGCTTACTCAAAGTATCTCTATTTT
TAATTATCTTTAATCATGTATTACTTTCAACATGTTATGCTTAATTTTCTATTTTAATAA
G

QA 3 603 3 603
DS 

RD RR2BU33TF 627 0 0
GG
AAAAGACAGAGATCTCAAAAAACAAAGAAAAAAAAAACAGGGAGATGGGTTTGGTTACAG
ATGAAGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACACAGGAGATGAGCTATGCCGCGAGAAGACCA
AGGAGTTCCTCAAGGAAGTTGATATGCCTAATGGGTTATTGCCTTTGAAGGACATAGAAG
AGGTTGGATACGACAGAGAAACCGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGAAGAGCATCACTC
ACAAGTTTGAATCTATTGGGAAACTTGTCTCTTACGGCACTGAGGTCACTGCCGTGGTGG
AAGTCGGAAAGATCAAGAAGCTTACCGGTGTTAAGGCCAAGGAGCTTCTTATCTGGGTCA
CTCTCAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAACAAGTTCTGGGAAGATCAATTTCAGGACAC
CGACCGGATTGTCCAGGACTTTCCCTATTTCAGCTTTTGTGGTTCCTGAGGTTGAGAAGC
CTGCAATGGCTAAAGAAGCTATTGCAAATTAGAGATGCTTACTCAAAGTATCTCTATTTT
TAATTATCTTTAATCATGTATTACTTTCAACATGTTATGCTTAATTTTCTATTTTAATAA
GATATTTTTCAGTCTGAAAAAAAAA

QA 3 627 3 627
DS 



CO CL551Contig2 674 6 9 U
TTTTTGGGTTTGTGAAAGATATTCCGGTTTATGTTGGTTTAGACTGAAAAGTATCTTATT
AAAATATGAAATGAAGCATAACATTTAGGAAGTAATACATGATTTAAGATAATTAAAAAG
AGAGAGACTTGGGTAAGTAAGCATCTCTAATTTGCAATAGCTTCTTTAGCCACTGCAGGC
TTCTCAACCTCAGGAACCACAAAAGCTGAAACAGGGAAAGTCCTGGACAATCCGGTCGGT
GTCCTGAAATTGATCTTCCCAGAACTTGTTGGCTGCTCCAAGACAAGCTCATTGAGAGTG
ACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTAACACCGGTAAGCTTCTTGATCTTTCCGACTTCC
ACCACGGCAGTGACCTCAGTGCCGTAAGAGACAAGTTTCCCAATAGATTCAAACTTGTGA
GTGATGCTCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACACCGGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCT
TCTATGTCCTTCAATGGCAATAACCCATTAGGCATATCAACTTCCTTGAGGAACTCCTTG
GTCTTCTCGCGGCATAACGCATCTCCTGTGTATTTCTCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCT
GTAACCAAACCCATCTCCCTGTTTTTTTTTTCTTCTTTGTTTTTGAGATCTCTGTCTTTC
GTGTTTTTACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR2EU85JQ U 36
AF RR2EU85TF C 36
AF RR2GZ52TF C 1
AF RR2GZ52JQ U 6
AF RR2AO79JQ U 41
AF RR2AO79TF C 41
BS 1 5 RR2GZ52TF
BS 6 35 RR2GZ52JQ
BS 36 544 RR2EU85JQ
BS 545 631 RR2GZ52JQ
BS 632 632 RR2AO79JQ
BS 633 659 RR2GZ52JQ
BS 660 660 RR2AO79JQ
BS 661 671 RR2GZ52JQ
BS 672 674 RR2AO79JQ

RD RR2EU85JQ 510 0 0
GGTTTAGACTGAAAAGTATCTTATTAAAATATGAAATGAAGCATAACATTTAGGAAGTAA
TACATGATTTAAGATAATTAAAAAGAGAGAGACTTGGGTAAGTAAGCATCTCTAATTTGC
AATAGCTTCTTTAGCCACTGCAGGCTTCTCAACCTCAGGAACCACAAAAGCTGAAACAGG
GAAAGTCCTGGACAATCCGGTCGGTGTCCTGAAATTGATCTTCCCAGAACTTGTTGGCTG
CTCCAAGACAAGCTCATTGAGAGTGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTAACACCGGT
AAGCTTCTTGATCTTTCCGACTTCCACCACGGCAGTGACCTCAGTGCCGTAAGAGACAAG
TTTCCCAATAGATTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACACC
GGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCTATGTCCTTCAATGGCAATAACCCATTAGGCAT
ATCAACTTCCTTGAGGAACTCCTTGGTCT
C

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2EU85TF 510 0 0
GGTTTAGACTGAAAAGTATCTTATTAAAATATGAAATGAAGCATAACATTTAGGAAGTAA
TACATGATTTAAGATAATTAAAAAGAGAGAGACTTGGGTAAGTAAGCATCTCTAATTTGC
AATAGCTTCTTTAGCCACTGCAGGCTTCTCAACCTCAGGAACCACAAAAGCTGAAACAGG
GAAAGTCCTGGACAATCCGGTCGGTGTCCTGAAATTGATCTTCCCAGAACTTGTTGGCTG
CTCCAAGACAAGCTCATTGAGAGTGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTAACACCGGT
AAGCTTCTTGATCTTTCCGACTTCCACCACGGCAGTGACCTCAGTGCCGTAAGAGACAAG
TTTCCCAATAGATTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACACC
GGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCTATGTCCTTCAATGGCAATAACCCATTAGGCAT
ATCAACTTCCTTGAGGAACTCCTTGGTCT
C

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2GZ52TF 671 0 0
TTTTTGGGTTTGTGAAAGATATTCCGGTTTATGTTGGTTTAGACTGAAAAGTATCTTATT
AAAATATGAAATGAAGCATAACATTTAGGAAGTAATACATGATTTAAGATAATTAAAAAG
AGAGAGACTTGGGTAAGTAAGCATCTCTAATTTGCAATAGCTTCTTTAGCCACTGCAGGC
TTCTCAACCTCAGGAACCACAAAAGCTGAAACAGGGAAAGTCCTGGACAATCCGGTCGGT
GTCCTGAAATTGATCTTCCCAGAACTTGTTGGCTGCTCCGAGACAAGCTCATTGAGAGTG
ACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTAACACCGGTAAGCTTCTTGATCTTTCCGACTTCC
ACCACGGCAGTGACCTCAGTGCCGTAAGAGACAAGTTTCCCAATAGATTCAAACTTGTGA
GTGATGCTCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACACCGGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCT
TCTATGTCCTTCAATGGCAATAACCCATTAGGCATATCAACTTCCTTGAGGAACTCCTTG
GTCTTCTCGCGGCATAACGCATCTCCTGTGTATTTCTCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCT
GTAACCAAACCCATCTCCCTGTTTTTTTTTTTTTCTTTGTTTTTGAGATCTCTGTCTTTT
GTGTTTTTACC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2GZ52JQ 666 0 0
GGGTTTGTGAAAGATATTCCGGTTTATGTTGGTTTAGACTGAAAAGTATCTTATTAAAAT
ATGAAATGAAGCATAACATTTAGGAAGTAATACATGATTTAAGATAATTAAAAAGAGAGA
GACTTGGGTAAGTAAGCATCTCTAATTTGCAATAGCTTCTTTAGCCACTGCAGGCTTCTC
AACCTCAGGAACCACAAAAGCTGAAACAGGGAAAGTCCTGGACAATCCGGTCGGTGTCCT
GAAATTGATCTTCCCAGAACTTGTTGGCTGCTCCGAGACAAGCTCATTGAGAGTGACCCA
GATAAGAAGCTCCTTGGCCTTAACACCGGTAAGCTTCTTGATCTTTCCGACTTCCACCAC
GGCAGTGACCTCAGTGCCGTAAGAAACAAGTTTCCCAATAGATTCAAACTTGTGAGTGAT
GCTCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACACCGGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCTAT
GTCCTTCAATGGCAATAACCCATTAGGCATATCAACTTCCTTGAGGAACTCCTTGGTCTT
CTCGCGGCATAACGCATCTCCTGTGTATTTCTCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCTGTAAC
CAAACCCATCTCCCTGTTTTTTTTTTTTTCTTTGTTTTTGAGATCTCTGTCTTTTGTGTT
TTTACC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2AO79JQ 634 0 0
G
GACTGAAAAGTATCTTATTAAAATATGAAATGAAGCATAACATTTAGGAAGTAATACATG
ATTTAAGATAATTAAAAAGAGAGAGACTTGGGTAAGTAAGCATCTCTAATTTGCAATAGC
TTCTTTAGCCACTGCAGGCTTCTCAACCTCAGGAACCACAAAAGCTGAAACAGGGAAAGT
CCTGGACAATCCGGTCGGTGTCCTGAAATTGATCTTCCCAGAACTTGTTGGCTGCTCCAA
GACAAGCTCATTGAGAGTGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTAACACCGGTAAGCTT
CTTGATCTTTCCGACTTTCACCACGGCAGTGACCTCAGTGCCGTAAGAAACAAGTTTCCC
AATAGATTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACACCGGTTTC
TCTGTCGTATCCAACCTCTTCTATGTCCTTCAATGGCAATAACCCATTAGGCATATCAAC
TTCCTTGAGGAACTCCTTGGTCTTCTCGCGGCATAACGCATCTCCTGTGTATTTCTCTGC
CCTAGCTCTCACTTCATCTGTAACCAAACCCATCTCCCTGTTTTTTTTTTCTTCTTTGTT
TTTGAGATCTCTGTCTTTCGTGTTTTTACCTCC

QA 2 634 2 634
DS 

RD RR2AO79TF 634 0 0
G
GACTGAAAAGTATCTTATTAAAATATGAAATGAAGCATAACATTTAGGAAGTAATACATG
ATTTAAGATAATTAAAAAGAGAGAGACTTGGGTAAGTAAGCATCTCTAATTTGCAATAGC
TTCTTTAGCCACTGCAGGCTTCTCAACCTCAGGAACCACAAAAGCTGAAACAGGGAAAGT
CCTGGACAATCCGGTCGGTGTCCTGAAATTGATCTTCCCAGAACTTGTTGGCTGCTCCAA
GACAAGCTCATTGAGAGTGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTAACACCGGTAAGCTT
CTTGATCTTTCCGACTTTCACCACGGCAGTGACCTCAGTGCCGTAAGAGACAAGTTTCCC
AATAGATTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACACCGGTTTC
TCTGTCGTATCCAACCTCTTCTATGTCCTTCAATGGCAATAACCCATTAGGCATATCAAC
TTCCTTGAGGAACTCCTTGGTCTTCTCGCGGCATAACGCATCTCCTGTGTATTTCTCTGC
CCTAGCTCTCACTTCATCTGTAACCAAACCCATCTCCCTGTTTTTTTTTTCTTCTTTGTT
TTTGAGATCTCTGTCTTTCGTGTTTTTACC
TCC

QA 2 631 2 631
DS 



AS 2 10

CO CL552Contig1 606 2 2 U
GGATATCAAACTGTGATTACACAAGAATCATCTCTCCTTAATCGCTATAGTGTAATCAGT
TAAATAGACCAATGAAGATATATCGTGCCATAATCCTGGTGACACTCTTGGCCTTGATCA
AGACAGCGGTTTCCCAACTTCAGTCGATTGAGCAGTGCAGAGAGGTGTTCGAAAGTTTCA
TGCCGTGCATGGGCTTCGTCGAAGGAATCTTCCAGCAACCTTCTCCGGAATGCTGCAGAG
GCGTGAGCCACTTGAATAACGTCGTCAAGTTCAAGGCTCCAGGATCGAGGAAGAATGAGC
AGGGGAGTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATTGAGATAATGGGAAAAGCAGATC
ATCTTCCTTTTCTGGCATCCGCCATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTTCTCTTAGTCTCA
GCTTCCCTATATCTGTTGGAATGGACTGTTCTCAGCTCAGAAACATGAAGGAACTCGACG
CTGAAAAGTTAAATTAGTTACAAGTATATATGAATAGTGGAAATGGAAGACTTGTGATAT
GCATGATATATAATCGAACTTATTGTATTAGTGACCAGTGTTACAAAAAAATAATGCGAA
TTAGTC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2F591JQ C 1
AF RR2F591TF U 1
BS 1 1 RR2F591JQ
BS 2 606 RR2F591TF

RD RR2F591JQ 606 0 0
GGATATCAAACTGTGATTACACAAGAATCATCTCTCCTTAATCGCTATAGTGTAATCAGT
TAAATAGACCAATGAAGATATATCGTGCCATAATCCTGGTGACACTCTTGGCCTTGATCA
AGACAGCGGTTTCCCAACTTCAGTCGATTGAGCAGTGCAGAGAGGTGTTCGAAAGTTTCA
TGCCGTGCATGGGCTTCGTCGAAGGAATCTTCCAGCAACCTTTTCCGGAATGCTGCAGAG
GCGTGAGCCACTTGAATAACGTCGTCAAGTTCAAGGCTCCAGGATCGAGGAAGAATGAGC
AGGGGAGTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATTGAGATAATGGGAAAAGCAGATC
ATCTTCCTTTTCTGGCATCCGCCATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTTCTCTTAGTCTCA
GCTTCCCTATATCTGTTGGAATGGACTGTTCTCAGCTCAGAAACATGAAGGAACTCGACG
CTGAAAAGTTAAATTAGTTACAAGTATATATGAATAGTGGAAATGGAAGACTTGTGATAT
GCATGATATATAATCGAACTTATTGTATTAGTGACCAGTGTTACAAAAAAATAATGCGAA
TTAGTC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2F591TF 606 0 0
G
GATATCAAACTGTGATTACACAAGAATCATCTCTCCTTAATCGCTATAGTGTAATCAGTT
AAATAGACCAATGAAGATATATCGTGCCATAATCCTGGTGACACTCTTGGCCTTGATCAA
GACAGCGGTTTCCCAACTTCAGTCGATTGAGCAGTGCAGAGAGGTGTTCGAAAGTTTCAT
GCCGTGCATGGGCTTCGTCGAAGGAATCTTCCAGCAACCTTCTCCGGAATGCTGCAGAGG
CGTGAGCCACTTGAATAACGTCGTCAAGTTCAAGGCTCCAGGATCGAGGAAGAATGAGCA
GGGGAGTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATTGAGATAATGGGAAAAGCAGATCA
TCTTCCTTTTCTGGCATCCGCCATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTTCTCTTAGTCTCAG
CTTCCCTATATCTGTTGGAATGGACTGTTCTCAGCTCAGAAACATGAAGGAACTCGACGC
TGAAAAGTTAAATTAGTTACAAGTATATATGAATAGTGGAAATGGAAGACTTGTGATATG
CATGATATATAATCGAACTTATTGTATTAGTGACCAGTGTTACAAAAAAATAATGCGAAT
TAGTC

QA 2 606 2 606
DS 



CO CL552Contig2 775 8 7 U
GGATAGAGATATCGAACTGTGATTACACAAGAACAATCTCTCCTTAGTCCCTATAGTGTA
ATCAGTTAAATAGACCAATGAAGATACATCGTGCCATAATCCTGGTGACACTCTTGGCCT
TGATCAAGACCGCGGTTTCCCAACTTCAATCGATTGAGCAGTGCAGAGAGGTGTTCGAAA
GTTTCATGCCGTGCATGGGCTTCGTCGAGGGAATCTTCCAGCAACCTTCTCCGCAATGCT
GCAGAGGCGTGACCCACTTGAACAACGTCGTAAAGTTCAAGACTCCAGGATCGAGGAAGA
ATGAGCAGGGGACTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATAGAGATAATGGGAAAAG
CAGATCATCTTCCTTTTCTGGCATCCGCCATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTTCTCTTA
GTCTCAGCTTCCCTATATCTGTTGGAATGGACTGTTCTCAGTTCAGAAACATGAAGGAAC
TCGATGCTGAAAA*GTTAAATTAGTTACAAGTGTGTATGAATAATGGAAATGGAACACTT
GTAATGGCTATGCATGATACATAATGGAACTTATTGTATTAGTGACCAGTGTAACAAAAA
ATAATACGAATTAGTCAAGAAAGAGCGGATAAAACTTGATCGATAACTCTTCCATTGATA
TTTGACAGCATAAAAGAATATGAATTAGTCAAGAAAGAGCACTTGATCGATAGCTCTTTC
ACTAATATTTGTGTGTGTGTGGTTGTATATCAACGACGAAAACTTTTGATTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT71TF U 7
AF RR2GF74TF U 33
AF RR2GD49TF U 9
AF RR2GK25TF U 1
AF RR2D266TF U 9
AF RR2GK25JQ C 217
AF RR2D790TF U 26
AF RR2D790JQ C 55
BS 1 194 RR2GK25TF
BS 195 195 RR2GT71TF
BS 196 202 RR2GK25TF
BS 203 203 RR2GT71TF
BS 204 653 RR2GK25TF
BS 654 716 RR2D790TF
BS 717 775 RR2D790JQ

RD RR2GT71TF 560 0 0
G
GATATCGAACTGTGATTACACAAGAACAATCTCTCCTTAGTCCCTATAGTGTAATCAGTT
AAATAGACCAATGAAGATACATCGTGCCATAATCCTGGTGACACTCTTGGCCTTGATCAA
GACCGCGGTTTCCCAACTTCAATCGATTGAGCAGTGCAGAGAGGTGTTCGAAAGTTTCAT
GCCGTGCATGGGCTTCGTCGAGGGAATCTTCCAGCAACCTTCTCCGCAATGCTGCAGAGG
CGTGACCCACTTGAACAACGTCGTAAAGTTCAAGACTCCAGGATCGAGGAAGAATGAGCA
GGGGACTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATAGAGATAATGGGAAAAGCAGATCA
TCTTCCTTTTCTGGCATCCGCCATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTTCTCTTAGTCTCAG
CTTCCCTATATCTGTTGGAATGGACTGTTCTCAGTTCAGAAACATGAAGGAACTCGATGC
TGAAAA*GTTAAATTAGTTACAAGTGTGTATGAATAATGGAAATGTAACACTTGTAATGG
CTATGCATGATACATAATG

QA 2 560 2 560
DS 

RD RR2GF74TF 547 0 0
GG
AATCTCTCCTTAGTCCCTATAGTGTAATCAGTTAAATAGACCAATGAAGATACATCGTGC
CATAATCCTGGTGACACTCTTGGCCTTGATCAAGACCGCGGTTTCCCAACTTCAATCGAT
TGAGCAGTGCAGAGAGGTGTTCGAAAGTTTCATGCCGTGCATGGGCTTCGTCGAGGGAAT
CTTCCAGCAACCTTCTCCGCAATGCTGCAGAGGCGTGACCCACTTGAACAACGTCGTAAA
GTTCAAGACTCCAGGATCGAGGAAGAATGAGCAGGGGACTGGAGAGCTAGAGAGAGTATG
TGAATGCATAGAGATAATGGGAAAAGCAGATCATCTTCCTTTTCTGGCATCCGCCATCAA
CAATCTTCCACCCCTTTGTTCTCTTAGTCTCAGCTTCCCTATATCTGTTGGAATGGACTG
TTCTCAGTTCAGAAACATGAAGGAACTCGATACTGAAAA*GTTAAATTAGTTACAAGTGT
GTATGAATAATGGAAATGGAACACTTGTAATGGCTATGCATGATACATAATGGAACTTAT
TGTAT

QA 3 547 3 547
DS 

RD RR2GD49TF 567 0 0
GG
ATCGAACTGTGATTACACAAGAACAATCTCTCCTTAGTCCCTATAGTGTAATCAGTTAAA
TAGACCAATGAAGATACATCGTGCCATAATCCTGGTGACACTCTTGGCCTTGATCAAGAC
CGCGGTTTCCCAACTTCAATCGATTGAGCAGTGCAGAGAGGTGTTCGAAAGTTTCATGCC
GTGCATGGGCTTCGTCGAGGGAATCTTCCAGCAACCTTCTCCGCAATGCTGCATAGGCAT
GACCCACTTGAACAACGTCGTAAAGTTCAAGACTCCAGGATCGAGGAAGAATGAGCAGGG
GACTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATAGAGATAATGGGAAAAGCAGATCATCT
TCCTTTTCTGGCATCCGCCATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTTCTCTTAGTCTCAGCTT
CCCTATATCTGTTGGAATGGACTGTTCTCAGTTCAGAAACATGAAGGAACTCGATGCTGA
AAAAGTTAAATTAGTTACAAGTGTGTATGAATAATGGAAATGGAACACTTGTAATGGCTA
TGCATGATACATAATGGAACTTATT

QA 3 567 3 567
DS 

RD RR2GK25TF 653 0 0
GGATAGAGATATCGAACTGTGATTACACAAGAACAATCTCTCCTTAGTCCCTATAGTGTA
ATCAGTTAAATAGACCAATGAAGATACATCGTGCCATAATCCTGGTGACACTCTTGGCCT
TGATCAAGACCGCGGTTTCCCAACTTCAATCGATTGAGCAGTGCAGAGAGGTGTTCGAAA
GTTTCATGCCGTGCGTGGGCTTTGTCGAGGGAATCTTCCAGCAACCTTCTCCGCAATGCT
GCAGAGGCGTGACCCACTTGAACAACGTCGTAAAGTTCAAGACTCCAGGATCGAGGAAGA
ATGAGCAGGGGACTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATAGAGATAATGGGAAAAG
CAGATCATCTTCCTTTTCTGGCATCCGCCATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTTCTCTTA
GTCTCAGCTTCCCTATATCTGTTGGAATGGACTGTTCTCAGTTCAGAAACATGAAGGAAC
TCGATGCTGAAAA*GTTAAATTAGTTACAAGTGTGTATGAATAATGGAAATGGAACACTT
GTAATGGCTATGCATGATACATAATGGAACTTATTGTATTAGTGACCAGTGTAACAAAAA
ATAATACGAATTAGTCAAGAAAGAGCGGATAAAACTTGATCGATAACTCTTCC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2D266TF 628 0 0
GG
ATCGAACTGTGATTACACAAGAACAATCTCTCCTTAGTCCCTATAGTGTAATCAGTTAAA
TAGACCAATGAAGATACATCGTGCCATAATCCTGGTGACACTCTTGGCCTTGATCAAGAC
CGCGGTTTCCCAACTTCAATCGATTGAGCAGTGCAGAGAGGTGTTCGAAAGTTTCATGCC
GTGCATGGGCTTCGTCGAGGGAATCTTCCAGCAACCTTCTCCGCAATGCTGCAGAGGCGT
GACCCACTTGAACAACGTCGTAAAGTTCAAGACTCCAGGATCGAGGAAGAATGAGCAGGG
GACCGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATAGAGATAATGGGAAAAGCAGATCATCT
TCCTTTTCTGGCATCCGCCATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTTCTCTTAGTCTCAGCTT
CCCTATATCTGTTGGAATGGACTGTTCTCAGTTCAGAAACATGAAGGAACTCGATGCTGA
AAA*GTTAAATTAGTTACAAGTGTGTATGAATAATGGAAATGGAACACTTGTAATGGCTA
TGCATGATACATAATGGAACTTATTGTATTAGTGACCAGTGTAACAAAAAATAATACGAA
TTAGTCAAGGAAGAGCGGATAAAACT

QA 3 628 3 628
DS 

RD RR2GK25JQ 437 0 0
TCCAGCAACCTTTTCCGCAATGCTGCAGAGGCGTGACCCACTTGAACAACGTCGTAAAGT
TCAAGACTCCAGGATCGAGGAAGAATGAGCAGGGGACTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTG
AATGCATAGAGATAATGGGAAAAGCAGATCATCTTCCTTTTCTGGCATCCGCCATCAACA
ATTTTCCACCCCTTTGTTTTCTTAGTTTCAGCTTCCCTATATCTGTTGGAATGGACTGTT
CTCAGTTCAGAAACATGAAGGAACTCGATGCTGAAAA*GTTAAATTAGTTACAAGTGTGT
ATGAATAATGGAAATGGAACACTTGTAATGGCTATGCATGATACATAATGGAACTTATTG
TATTAGTGACCAGTGTAACAAAAAATAATACGAATTAGTCAAGAAAGAGCGGATAAAACT
TGATCGATAACTCTTCC

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR2D790TF 691 0 0
GGG
AAGAACAATCTCTCCTTAGTCCCTATAGTGTAATCAGTTAAATAGACCAATGAAGATACA
TCGTGCCATAATCCTGGTGACACTCTTGGCCTTGATCAAGACCGCGGTTTCCCAACTTCA
ATCGATTGAGCAGTGCAGAGAGGTGTTCGAAAGTTTCATGCCGTGCATGGGCTTCGTCGA
GGGAATCTTCCAGCAACCTTCTCCGCAATGCTGCAGAGGCGTGACCCACTTGAACAACGT
CGTAAAGTTCAAGACTCCAGGATCGAGGAAGAATGAGCAGGGGACTGGAGAGCTAGAGAG
AGTATGTGAATGCATAGAGATAATGGGAAAAGCAGATCATCTTCCTTTTCTGGCATCCGC
CATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTTCTCTTAGTCTCAGCTTCCCTATATCTGTTGGAAT
GGACTGTTCTCAGTTCAGAAACATGAAGGAACTCGATGCTGAAAA*TTTAAATTAGTTAC
AAGTGTGTATGAATAATGGAAATGGAACACTTGTAATGGCTATGCATGATACATAATGGA
ACTTATTGTATTAGTGACCAGTGTAACAAAAAATAATACGAATTAGTCAAGAAAGAGCGG
ATAAAACTTGATCGATAATTCTTCCATTGATATTTGACAGCATAAAAGAATATGAATTAG
TCAAGAAAGAGCACTTGATCGATAGCTC

QA 4 691 4 691
DS 

RD RR2D790JQ 721 0 0
AGTGTAATCAGTTAAATAGACCAATGAAGATACATCGTGCCATAATCCTGGTGACACTCT
TGGCCTTGATCAAGACCGCGGTTTCCCAACTTCAATCGATTGAGCAGTGCAGAGAGGTGT
TCGAAAGTTTCATGCCGTGCATGGGCTTCGTCGAGGGAATCTTCCAGCAACCTTCTCCGC
AATGCTGCAGAGGCGTGACCCACTTGAACAACGTCGTAAAGTTCAAGACTCCAGGATCGA
GGAAGAATGAGCAGGGGACTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATAGAGATAATGG
GAAAAGCAGATCATCTTCCTTTTCTGGCATCCGCCATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTT
CTCTTAGTCTCAGCTTCCCTATATCTGTTGGAATGGACTGTTCTCAGTTCAGAAACATGA
AGGAACTCGATGCTGAAAA*TTTAAATTAGTTACAAGTGTGTATGAATAATGGAAATGGA
ACACTTGTAATGGCTATGCATGATACATAATGGAACTTATTGTATTAGTGACCAGTGTAA
CAAAAAATAATACGAATTAGTCAAGAAAGAGCGGATAAAACTTGATCGATAATTCTTCCA
TTGATATTTGACAGCATAAAAGAATATGAATTAGTCAAGAAAGAGCACTTGATCGATAGC
TCTTTCACTAATATTTGTGTGTGTGTGGTTGTATATCAACGACGAAAACTTTTGATTGGA
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 2 8

CO CL553Contig1 852 5 39 U
GGAGTCGTCAAAAGAAGCCTAGACATTTTATCTCGTCTCGCCGCAGGAGGAAGGAAGCTC
TCTTCAGTAACATTCTGAGGTGGAAAAATGAAGCACAACAATGTTATCCCGAATGGTCAT
TTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATGTCAAGACATGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAGACC
AGAAGAAGAGCTGCGAGACAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACCGCTGGA
CCTCTTCGCCCTGTTGTGCACGGTCAGACCCTTAAGTACAACATGAAGGTCAGGACTGGT
AAAGGATTCACCCTTGAAGAGCTTAAGGCTGCTGGAATCCCAAAAAAGCTGGCACCAACC
ATTGGTATCTCTGTTGACCATCGCCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTCTTCAGTCCAAT
GTCCAGAGGCTTAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAG
GTCAAGGCTGGTGATTCAACTGCAGAAGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAGGGAGAC
TACATGCCTATTGTACGTGAGAAGCAAGCAACGGAGCTAGTGAAGCTGACCGCTGAGATG
AAATCGCTCAATGCTTATGACAAGATCCGTCCAGAGCGTACAAACAAGAGACATGCAGGT
GCTAGAGCCAAGAGAGCTGCTGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAGTGAGGATACCTTCTT
CTTTTTAGTTTTAAGAAACTCCTTTTTATCTTGTCATCGTTTGGATCTCTAGTTTTTTTG
TGTATCAGACTTTTCTTGTTTCCTAAGTTTTTATCAGTACTTTACTTTTCTGGATTATGG
AAAGATCATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL30TF U 17
AF RR2C566TF U 1
AF RR2A018JQ C 373
AF RR2FS21TF U 15
AF RR2A018TF U 47
BS 1 91 RR2C566TF
BS 92 92 RR2GL30TF
BS 93 257 RR2C566TF
BS 258 258 RR2FS21TF
BS 259 311 RR2C566TF
BS 312 312 RR2FS21TF
BS 313 348 RR2C566TF
BS 349 349 RR2FS21TF
BS 350 383 RR2C566TF
BS 384 384 RR2FS21TF
BS 385 422 RR2C566TF
BS 423 423 RR2FS21TF
BS 424 497 RR2C566TF
BS 498 498 RR2FS21TF
BS 499 515 RR2C566TF
BS 516 516 RR2FS21TF
BS 517 551 RR2C566TF
BS 552 552 RR2FS21TF
BS 553 572 RR2C566TF
BS 573 573 RR2FS21TF
BS 574 585 RR2C566TF
BS 586 586 RR2FS21TF
BS 587 606 RR2C566TF
BS 607 607 RR2A018TF
BS 608 631 RR2C566TF
BS 632 632 RR2A018TF
BS 633 637 RR2C566TF
BS 638 638 RR2GL30TF
BS 639 658 RR2C566TF
BS 659 659 RR2FS21TF
BS 660 674 RR2C566TF
BS 675 675 RR2FS21TF
BS 676 693 RR2C566TF
BS 694 725 RR2FS21TF
BS 726 726 RR2A018TF
BS 727 778 RR2FS21TF
BS 779 779 RR2A018TF
BS 780 802 RR2FS21TF
BS 803 852 RR2A018TF

RD RR2GL30TF 638 0 0
GG
CTAGACATTTTATCTCGTCTCGCCGCAGGAGGAAGGAAGCTCTCTTCAGTAACATTCTGA
GGTGGAAAAATGAAGCACAACAATGTTATCCCGAATGGTCATTTCAAGAAGCACTGGCAG
AACTATGTCAAGACATGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAGACCAGAAGAAGAGCTGCGAGA
CAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACCGCTGGACCTCTTCGCCCTGTTGTT
CACGGTCAGACCCTTAAGTACAATATGAAGGTCAGGACTGGTAAAGGATTCACTCTTGAA
GAGCTTAAGGCTGCTGGAATCCCAAAAAAGTTGGCACCAACCATTGGTATCTCTGTTGAC
TATCGTCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTCTTCAGTCCA*TGTACAGAGGCTTAAAACC
TACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCT
ACTGCAGAAGGGTTGGCTAATGCCACTCAAGTCCAGGGAGACTACATGCCTATCGTACGT
GAGAAGCAAGCAACTGAGCTAGTGAAGTTGACCGCTGAGATGAAATCGTTCAATGCTTAT
GACAAGATCCGTCTAGAGCGTACAAACAAGAGACAT

QA 3 638 3 638
DS 

RD RR2C566TF 695 0 0
GGAGTCGTCAAAAGAAGCCTAGACATTTTATCTCGTCTCGCCGCAGGAGGAAGGAAGCTC
TCTTCAGTAACATTCTGAGGTGGAAAAATGAGGCACAACAATGTTATCCCGAATGGTCAT
TTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATGTCAAGACATGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAGACC
AGAAGAAGAGCTGCGAGACAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACCGCTGGA
CCTCTTCGCCCTGTTGTTCACGGTCAGACCCTTAAGTACAACATGAAGGTCAGGACTGGT
AAAGGATTCACTCTTGAAGAGCTTAAGGCTGCTGGAATCCCAAAAAAGTTGGCACCAACC
ATTGGTATCTCTGTTGACCATCGTCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTCTTCAGTCCAAT
GTACAGAGGCTTAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAG
GTCAAGGCTGGTGATTCTACTGCAGAAGAGTTGGCTAATGCCACTCAAGTCCAGGGAGAC
TACATGCCTATCGTACGTGAGAAGCAAGCAACTGAGCTAGTGAAGTTGACCGCTGAGATG
AAATCGTTCAATGCTTATGACAAGATCCGTCTAGAGCTTACAAACAAGAGACATGCAG*T
GCTAGAGCCAAGAG*GCTGCTGATGCTGAGAAA
AA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2A018JQ 411 0 0
GTTGACCATCGCCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTTTTCAGTCCAATGTCCAGAGGCTT
AAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGT
GATTCAACTGCAGAAGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAGGGAGACTACATGCCTATT
GTACGTGAGAAGCAAGCAACGGAGCTAGTGAAGCTGACCGCTGAGATGAAATCGCTCAAT
GCTTATGACAAGATCCGTCCAGAGCGTACAAACAAGAGACATGCAGGTGCTAGAGCCCAG
AGAGCTGCTGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAGTGAGGATACCTTTTTCTTTTTAGTTTT
AAGAAACTCCTTTTTATCTTGTCATCGTTTGGTTCTCTAGTTTTTT
TGTGT

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR2FS21TF 788 0 0
GGGC
CTAGACATTTTATCTCGTCTCGCCGCAGGAGGAAGGAAGCTCTCTTCAGTAACATTCTGA
GGTGGAAAAATGAAGCACAACAATGTTATCCCGAATGGTCATTTCAAGAAGCACTGGCAG
AACTATGTCAAGACATGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAGACCAGAAGAAGAGCTGCGAGA
CAAAAGAAGGCTGTGAAGATCCTCCCCCGTCCCACCGCTGGACCTCTTCGCCCTGTTGTG
CACGGTCAGACCCTTAAGTACAACATGAAGGTCAGGACTGGTAAAGGTTTCACCCTTGAA
GAGCTTAAGGCTGCTGGAATCCCAAAGAAGCTGGCACCAACCATTGGTATCTCTGTTGAC
CATCGCCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTCCTCAGTCCAATGTCCAGAGGCTTAAAACC
TACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCA
ACTGCAGAAGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAGGGAGACTACATGCCTATTGTACGT
GAGAAGCAAGCAACGGAGCTAGTGAAGCTGACCGCTGAGATGAAATCGTTCAATGCTTAT
GACAAGATCCGTCTAGAGCGTACAAACAAGAGACATGCAGGTGCTAGAGCCAAGAGAGCT
GCTGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAGTGAGGATACCTTCTTCTTTT*AGTTTTAAGAAA
CTCCTTTTTATCTTGTCATCGTTTGGATCTCTAGTTTTTT*GTGTATCAGACTTTTCTTG
TTTC

QA 5 788 5 788
DS 

RD RR2A018TF 806 0 0
GAGGAAGGAAGCTCTCTTCAGTAACATTCTGAGGTGGAAAAATGAAGCACAACAATGTTA
TCCCGAATGGTCATTTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATGTCAAGACATGGTTCAACCAGC
CTGCCAGGAAGACCAGAAGAAGAGCTGCGAGACAATAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCC
GTCCCACCGCTGGACCTCTTCGCCCTGTTGTGCACGGTCAGACCCTTAAGTACAACATGA
AGGTCAGGACTGGTAAAGGTTTCACCCTTGAAGAGCTTAAGGCTGCTGGAATCCCAAAGA
AGCTGGCACCAACCATTGGTATCTCTGTTGACCATCGCCGCAAGAACAGATCTTTGGAGG
GTCTTCAGTCCAATGTCCAGAGGCTTAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGC
GTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCAACTGCAGAAGAGTTGGCCAATGCCACTC
AAGTCCAGGGAGACTACATGCCTATTGTACGTGAGAAGCAAGCAACGGAGCTAGTGAAGC
TGACCGCTGAGATGAAATCGCTCAATGCTTATGACAAGATCCGTCCAGAGCGTACAAACA
AGAGACATGCAGGTGCTAGAGCCAAGAGAGCTGCTGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAGT
GAGGATACCTTCTTCTTTTTAGTTTTAAGAAACTCCTTTTTATCTTGTCATCGTTTGGAT
CTCTAGTTTTTTTGTGTATCAGACTTTTCTTGTTTCCTAAGTTTTTATCAGTACTTTACT
TTTCTGGATTATGGAAAGATCATTTC

QA 1 806 1 806
DS 



CO CL553Contig2 834 3 9 U
GGCTAGACATTTTATCTCGTCTCGCCGCAGGAGGAAGGAAGCTCTCTTCAGTAACACTCT
GAGGTGAAGAAATGAAGCACAACAATGTTATCCCGAATGGTCATTTCAAGAAGCACTGGC
AGAACTATGTCAAGACATGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAGCTGCGA
GACAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACCACTGGTCCTCTCCGCCCTGTTG
TCCACGGTCAGACTCTTAAGTACAACATGAAGGTCAGGACTGGTAAAGGATTCACTCTTG
AAGAGCTCAAGGCCGCTGGAATTCCCAAGAAGTTGGCACCAACCATTGGTATCTCTGTTG
ACCATCGTCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAGAGGCTTAAAA
CCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATT
CAACTGCAGAAGAGTTGGCTAATGCCACTCAAGTCCAGGGAGACTACATGCCTATCGTAC
GTGAGAAGCAAGCAACTGAGCTAGTGAAGTTGACCGCTGAGATGAAATCGTTCAATGCTT
ATGACAAGATCCGTCTAGAGCGTACAAACAAGAGACATGCAGGTGCTAGAGCCAAGAGGG
CTGCTGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAGCGAGGGGATGCCTTCTTGTTTAGGTTTTATC
TTGTCGTCGTTTAAATCTCTGGATTTTTGTGTATCGGACCCTTTTTTTTGTTGCTTCGTC
AGTTTTTATCAGTACTTTCTTTTTTGGATTATGGAAAAAGATTATTTCGCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G832TF U 1
AF RR2AH92TF U 51
AF RR2AH92JQ C 230
BS 1 142 RR2G832TF
BS 143 143 RR2AH92TF
BS 144 313 RR2G832TF
BS 314 314 RR2AH92TF
BS 315 520 RR2G832TF
BS 521 521 RR2AH92TF
BS 522 638 RR2G832TF
BS 639 694 RR2AH92TF
BS 695 834 RR2AH92JQ

RD RR2G832TF 638 0 0
GGCTAGACATTTTATCTCGTCTCGCCGCAGGAGGAAGGAAGCTCTCTTCAGTAACACTCT
GAGGTGAAGAAATGAAGCACAACAATGTTATCCCGAATGGTCATTTCAAGAAGCACTGGC
AGAACTATGTCAAGACATGGTTTAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAGCTGCGA
GACAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACCACTGGTCCTCTCCGCCCTGTTG
TCCACGGTCAGACTCTTAAGTACAACATGAAGGTCAGGACTGGTAAAGGATTCACTCTTG
AAGAGCTCAAGGCTGCTGGAATTCCCAAGAAGTTGGCACCAACCATTGGTATCTCTGTTG
ACCATCGTCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAGAGGCTTAAAA
CCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATT
CAACTGCAGAAGAGTTGGCTAATGCCACTCAAGTCCAGGGGGACTACATGCCTATCGTAC
GTGAGAAGCAAGCAACTGAGCTAGTGAAGTTGACCGCTGAGATGAAATCGTTCAATGCTT
ATGACAAGATCCGTCTAGAGCGTACAAACAAGAGACAT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2AH92TF 658 0 0
GTAACACTCTGAGGTGAAGAAATGAAGCACAACAATGTTATCCCGAATGGTCATTTCAAG
AAGCACTGGCAGAACTATGTCAAGACATGGTTCAACCAGCCTGCCATGAAAACCAGAAGA
AGAGCTGCGAGACAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACCACTGGTCCTCTC
CGCCCTGTTGTCCACGGTCAGACTCTTAAGTACAACATGAAGGTCAGGACTGGTAAAGGA
TTCACTCTTGAAGAGCTCAAGGCCGCTGGAATTCCCAAGAAGTTGGCACCAACCATTGGT
ATCTCTGTTGACCATCGTCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAG
AGGCTTAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAG
GCTGGTGATTCAACTGCAGAAGAGTTGGCTAATGCCACTCAAGTCCAGGGAGACTACATG
CCTATCGTACGTGAGAAGCAAGCAACTGAGCTAGTGAAGTTGACCGCTGAGATGAAATCG
TTCAATGCTTATGACAAGATCCGTCTAGAGCGTACAAACAAGAGACATGCAGGTGCTAGA
GCCAAGAGGGCTGCTGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAGCGAGG
GGATGCCTTCTTGT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2AH92JQ 605 0 0
C
CGCCCTGTTGTCCACGGTCAGACTTTTAAGTACAACATGAAGGTCAGGACTGGTAAAGGA
TTCACTCTTGAAGAGCTCAAGGCCGCTGGAATTCCCAAGAAGTTGGCACCAACCATTGGT
ATTTTTGTTGACCATCGTCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTTTTCAGTCCAATGTCCAG
AGGCTTAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCGCGTCGTGCCAGGAAGGTCAAG
GCTGGTGATTCAACTGCAGAAGAGTTGGCTAATGCCACTCAAGTCCAGGGAGACTACATG
CCTATCGTACGTGAGAAGCAAGCAACTGAGCTAGTGAAGTTGACCGCTGAGATGAAATCG
TTCAATGCTTATGACAAGATCCGTTTAGAGCGTACAAACAAGAGACATGCAGGTGCTAGA
GCCAAGAGGGCTGCTGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAGCGAGGGGATGCCTTCTTGTTT
AGGTTTTATCTTGTCGTCGTTTAAATCTCTGGATTTTTGTGTATCGGACCCTTTTTTTTG
TTGCTTCGTCAGTTTTTATCAGTACTTTCTTTTTTGGATTATGGAAAAAGATTATTTCGC
TTTT

QA 2 605 2 605
DS 



AS 1 10

CO CL554Contig1 980 10 21 U
GGATTCCTTCGTCTTTAATAGATCGCAGAACAACAAAGGAGCAAAGGGTTT*ACTAGTGA
ATCTAA*GGCCGAGAGAAAAG*ATGAGCAGAGGAAGCGGCGCAGGATACGATCGTCACAT
CACGATCTTCTCACCGGAAGGTCGTCTCTTCCAAGTCGAATATGCATTCAAAGCCGTCAA
AGCAGCAGGAATCACCTCCATCGGCGTTCGTGGAAAAGATTCAGTATGCGTCGTTACCCA
GAAGAAAGTTCCCGACAAGCTTCTAGATCAGTCAAGCGTATCTCACCTTTTCCCTGTCAC
TAAGTACCTTGGCTTGTTAGCCACTGGCATGACAGCTGATTCAAGGTCCTTGGTCACACA
AGCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTTTAGGTTCCAATACGGATACGAGATGCCTGCCGACAT
CCTTGCTAAATGGATTGCAGACAAGTCACAGGTCTACACTCAACATGCTTACATGAGACC
TCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCTGGGTATGGACGAAGAGAGAGGACCCCTGCTTTACAA
GTGTGACCCTGCTGGACACTTTTACGGTCACAAGGCAACTAGTGCAGGTATGAAAGAGCA
AGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAAGAAAATGAAAGAGAACCCTGCCTTCACTTATGATGA
AACAGTGCAGACTGCCATATCTGCCCTGCAATCTGTTCTTCAAGAAGACTTCAAGGCAAC
TGAGATTGAGGTTGGAGTTGTGAGAGCTGATAACCCGATCTTCCGTTCCCTTGAAACGGA
GGAGATCGAGGAGCATTTGACTGCCATTAGCGAACGTGACTGATCACTTCGAAATCAGAC
TTTGCAATCTCTTCCTTTTGCTTTCATTATCTTTCTAAGAACATTCACATCTCATAGAAA
CTTGTTTCCGTCTGTGTTATGAATCTTGTGGTCTCCATTTGAACCTTCTGCTTTCTCAGA
TCCTCTTTTATATTGTTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 30 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 20 50 50 50 50 20 50 50 50 50 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 25 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT15TF U 332
AF RR2DO06TF U 1
AF RR2GL57TF U 1
AF RR2AK57TF U 1
AF RR2H322TF U 448
AF RR2CT23JQ C 268
AF RR2CT23TF U 385
AF RR2DO06JQ C 265
AF RR2GL57JQ C 340
AF RR2AT15JQ C 291
BS 1 7 RR2AK57TF
BS 8 8 RR2DO06TF
BS 9 51 RR2AK57TF
BS 52 52 RR2DO06TF
BS 53 53 RR2AK57TF
BS 54 54 RR2DO06TF
BS 55 79 RR2AK57TF
BS 80 80 RR2DO06TF
BS 81 204 RR2AK57TF
BS 205 205 RR2DO06TF
BS 206 210 RR2AK57TF
BS 211 211 RR2DO06TF
BS 212 234 RR2AK57TF
BS 235 235 RR2DO06TF
BS 236 333 RR2AK57TF
BS 334 334 RR2DO06TF
BS 335 715 RR2AK57TF
BS 716 716 RR2H322TF
BS 717 862 RR2AK57TF
BS 863 954 RR2H322TF
BS 955 980 RR2DO06JQ

RD RR2AT15TF 103 0 0
ACAGCTGATTCAAGGTCCTTGGTCACACAAGCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTTTAGGTTC
CAATACGGATACGAGATGCCTGCCGACATCCTTGCTAAATGGA

QA 1 103 1 103
DS 

RD RR2DO06TF 701 0 0
GGATTCCTTCGTCTTTAACAGATCGCAGAACAACAAAGGAGCAAAGGGTTT*ACTAGTGA
ATCTAAAGGTCGAGAGAAAAG*ATGAGCAGAGGAAGCGGCGCAGGATACGATCGTCACAT
CACGATCTTCCCACCTGAAGGTCGTCTCTTCCAAGTCGAATATGCATTCAAAGCCGTCAA
AGCAGCTGGAATCACCTCCATCGGCGTTCGTGGAAAAGATTCAGTATGCGTCGTTACCCA
GAAGAAAGTTCCCGACAAGCTTCTAGATCAGTCAAGCGTACCTCACCTTTTCCCTGTTAC
TAAGTACCTTGGCTTGTTAGCCACTGGCATGACAGCTGATTCAAGGTCCTTGGTAACACA
AGCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTTTAGGTTCCAATACGGATACGAGATGCCTGCCGACAT
CCTTGCTAAATGGATTGCAGACAGGTCACAGGTCTACACTCAACATGCTTACATGAGACC
TCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCTGGGTATGGACGAAGAGAGAGGACCCCTGCTTTACAA
GTGTGACCCAGCTGGACACTTTTACAGTCACAAGGCAACTAGTGCAGGTATGAAAGAGCA
AGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAAGAAAATGAAAGAGAACCCTGCCTTCACTTATGATGA
AACAGTGCAGACTGCCATATCTGCCCTACAATCTGTTCTTC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2GL57TF 692 0 0
GGATTCCTTCGTCTTTAATAGATCGCAGAACAACAAAGGAGCAAAGGGTTT*ACTAGTGA
ATCTAA*GGCCGAGAGAAAAATATGAGCAGAGGAAGCGGCGCAGGATACGATCGTCACAT
CACGATCTTCTCACCGGAAGGTCGTCTCTTCCAAGTCGAATATGCATTCAAAGCCGTCAA
AGCAGCAGGAATCACCTCCATCGGCGTTCGTGGAAAAGATTCAGTATGCGTCGTTACCCA
GAAGAAAGTTCCCGACAAGCTTCTAGATCAGTCGAGCGTATCTCACCTTTTCCCTGTCAC
TAAGTACCTTGGTTTGTTAGCCACTGGCATGACAGCTGATTCAAGGTCATTGGTCACACA
AGCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTTTAGGTTCCAATACGGATACGAGATGCCTGCCGACAT
CCTTGCTAAATGGATTGCGGACAAGTCACAGGTCTACACTCAACATGCTTACATGAGACC
TCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCTGGGTATGGACGAAGAGAGAGGACCCCTGCTTTACAA
GTGTGACCCTGCTGGACACTTTTATGGTCACAAG*CAACTAGTGCAGGTATGAAAGAGCA
AGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAAGAAAATGAAAGAAAACCCTGCCTTCACTTATGATGA
AACTGTGCAGACTGCCATATCTGCCCTGCAAT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2AK57TF 862 0 0
GGATTCCGTCGTCTTTAATAGATCGCAGAACAACAAAGGAGCAAAGGGTTTTATTAGTGA
ATCTAA*GGCCGAGAGAAA*G*ATGAGCAGAGGAAGCGGCGCAGGATACGATCGTCACAT
CACGATCTTCTCACCGGAAGGTCGTCTCTTCCAAGTCGAATATGCATTCAAAGCCGTCAA
AGCAGCAGGAATCACCTCCATCGGTGTTCGCGGAAAAGATTCAGTATGCGTCGTCACCCA
GAAGAAAGTTCCCGACAAGCTTCTAGATCAGTCAAGCGTATCTCACCTTTTCCCTGTCAC
TAAGTACCTTGGCTTGTTAGCCACTGGCATGACGGCTGATTCAAGGTCCTTGGTCACACA
AGCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTTTAGGTTCCAATACGGATACGAGATGCCTGCCGACAT
CCTTGCTAAATGGATTGCAGACAAGTCACAGGTCTACACTCAACATGCTTACATGAGACC
TCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCTGGGTATGGACGAAGAGAGAGGACCCCTGCTTTACAA
GTGTGACCCTGCTGGACACTTTTACGGTCACAAGGCAACTAGTGCAGGTATGAAAGAGCA
AGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAAGAAAATGAAAGAGAACCCTGCCTTCACTTATGATGA
AACAGTGCAGACTGCCATATCTGCCCTGCAATCTGTTCTTCAAGAAGACTTCAAG*CAAC
TGAGATTGAGGTTGGAGTTGTGAGAGCTGATAACCCGATCTTCCGTTCCCTTGAAACGGA
GGAGATCGAGGAGCATTTGACTGCCATTAGCGAACGTGACTGATCACTTCGAAATCAGAC
TTTGCAATCTCTTCCTTTTGCT

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR2H322TF 510 0 0
G
CAGGTCTACACTCAACATGCTTACATGAGACCTCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCTGGGT
ATGGACGAAGAGAGAGGACCCCTGCTTTACAAGTGTGACCCTGCTGGACACTTTTACGGT
CACAAGGCAACTAGTGCAGGTATGAAAGAGCAAGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAAGAAA
ATGAAAGAGAACCCTGCCTTCACTTATGATGAAACAGTGCAGACTGCCATATCTGCCCTG
CAATCTGTTCTTCAAGAAGACTTCAAGGCAACTGAGATTGAGGTTGGAGTTGTGAGAGCT
GATAACCCGATCTTCCGTTCCCTTGAAACGGAGGAGATCGAGGAGCATTTGACTGCCATT
AGCGAACGTGACTGATCACTTCGAAATCAGACTTTGCAATCTCTTCCTTTTGCTTTCATT
ATCTTTCTAAGAACATTCACATCTCATAGAAACTTGTTTCCGTCTGTGTTATGAATCTTG
TGGTCTCCATTTGAACCTTCTGCTTT
CTC

QA 2 507 2 507
DS 

RD RR2CT23JQ 687 0 0
TCAGTCAAGCGTATCTCACCTTTTCCCTGTCACTAAGTACCTTGGCTTGTTAGCCACTGG
CATGACAGCTGATTCAAGGTCCTTGGTCACACAAGCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTTTAG
GTTCCAATACGGATACGAGATGCCTGCCGACATCCTTGCTAAATGGATTGCAGACAAGTC
ACAGGTCTACACTCAACATGCTTACATGAGACCTCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCTGGG
TATGGACGAAGAGAGAGGACCCCTGCTTTACAAGTGTGACCCTGCTGGACACTTTTACGG
TCACAAGGCAACTAGTGCAGGTATGAAAGAGCAAGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAAGAA
AATGAAAGAGAACCCTGCCTTCACTTATGATGAAACAGTGCAGACTGCCATATCTGCCCT
GCAATCTGTTCTTCAAGAAGACTTCAAGGCAACTGAGATTGAGGTTGGAGTTGTGAGAGC
TGATAACCCGATCTTCCGTTCCCTTGAAACGGAGGAGATCGAGGAGCATTTGACTGCCAT
TAGCGAACGTGACTGATCACTTCGAAATCAGACTTTGCAATCTCTTCCTTTTGCTTTCAT
TATCTTTCTAAGAACATTCACATCTCATAGAAACTTGTTTCCGTCTGTGTTATGAATCTT
GTGGTCTCCATTTGAACCTTCTGCTTT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2CT23TF 570 0 0
TAGGTTCCAATACGGATACGAGATGCCTGCCGACATCCTTGCTAAATGGATTGCAGACAA
GTCACAGGTCTACACTCAACATGCTTACATGAGACCTCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCT
GGGTATGGACGAAGAGAGAGGACCCCTGCTTTACAAGTGTGACCCTGCTGGACACTTTTA
CGGTCACAAGGCAACTAGTGCAGGTATGAAAGAGCAAGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAA
GAAAATGAAAGAGAACCCTGCCTTCACTTATGATGAAACAGTGCAGACTGCCATATCTGC
CCTGCAATCTGTTCTTCAAGAAGACTTCAAGGCAACTGAGATTGAGGTTGGAGTTGTGAG
AGCTGATAACCCGATCTTCCGTTCCCTTGAAACGGAGGAGATCGAGGAGCATTTGACTGC
CATTAGCGAACGTGACTGATCACTTCGAAATCAGACTTTGCAATCTCTTCCTTTTGCTTT
CATTATCTTTCTAAGAACATTCACATCTCATAGAAACTTGTTTCCGTCTGTGTTATGAAT
CTTGTGGTCTCCATTTGAACCTTCTGCTTT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2DO06JQ 716 0 0
AGATCAGTCAAGCGTACCTCACCTTTTCCCTGTTACTAAGTACCTTGGCTTGTTAGCCAC
TGGCATGACAGCTGATTCAAGGTCCTTGGTAACACAAGCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTT
TAGGTTCCAATACGGATACGAGATGCCTGCCGACATCCTTGCTAAATGGATTGCAGACAG
GTCACAGGTCTACACTCAACATGCTTACATGAGACCTCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCT
GGGTATGGACGAAGAGAGAGGACCCCTGCTTTACAAGTGTGACCCAGCTGGACACTTTTA
CAGTCACAAGGCAACTAGTGCAGGTATGAAAGAGCAAGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAA
GAAAATGAAAGAGAACCCTGCCTTCACTTATGATGAAACAGTGCAGACTGCCATATCTGC
CCTACAATCTGTTCTTCAAGAAGACTTCAAGGCAACTGAGATTGAGGTTTGAGTTGTGGG
AGCTGATAACCCGATCTTCCGTTCCCTTGAAACGGAGGAGATCGAGGAGCATTTGACTTC
CATTAGCGAACGTGACTGATCACTTCGAAATCAGACTTTGCAATCTCTTCCTTTTGCTTT
CATTATCTTTCTAAGAACATTCACATCTCATAGAAACTTGTTTCCGTCTGTGTTATGAAT
CTTGTGGTCTCCATTTGAACCTTCTGCTTTCTCAGATCCTCTTTTATATTGTTTGC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2GL57JQ 633 0 0
TTCAAGGTCATTGGTCACACAAGCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTTTAGGTTCCAATACGG
ATACGAGATGCCTGCCGACATCCTTGCTAAATGGATTGCGGACAAGTCACAGGTCTACAC
TCAACATGCTTACATGAGACCTCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCTGGGTATGGACGAAGA
GAGAGGACCCCTGCTTTACAAGTGTGACCCTGCTGGACACTTTTATGGTCACAAGGCAAC
TAGTGCAGGTATGAAAGAGCAAGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAAGAAAATGAAAGAAAA
CCCTGCCTTCACTTATGATGAAACTGTGCAGACTGCCATATCTGCCCTGCAATCTGTTCT
TCAAGAAGACTTCAAGGCAACTGAGATTGAGGTTGGAGTTGTGAGAGCTGATAACCCGAT
CTTCCGTTCCCTTGAAACAGAGGAGATCGAGGAGCATTTGACTGCTATTAGCGAACGTGA
CTGATCACTTTGAAATCAGACTTTGCATTCTCTTCCTTTTGCTTTCAT*ATCTTTCTAAG
AACATTCACATCTCATAGAAACTTGTTTCCATCTGTGTTATGAATCTTGTTGTCTCCATT
TGAACTATCT*CTTTCTCAGATCCTC
CTTTTAC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2AT15JQ 681 0 0
TCCCTGTCACTAAGTACCTTGGCTTGTTAGCCACTGGCATGACAGCTGATTCAAGGTCCT
TGGTCACACAAGCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTTTAGGTTCCAATACGGATACGAGATGC
CTGCCGACATCCTTGCTAAATGGATTGCAGACAAGTCACCGGTCTACACTCAACATGCTT
ACATGAGACCTCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCTGAGTATGGACGAAGAGAGAGGACCCC
TGCTTTACAAGTGTGACCCTGCTGGACACTTTTGCGGTCACAAGGCAACTAGTGCAGGTA
TGAAAGAGCAAGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAAGAAAATGAAAGAGAACCCTGCCTTCA
CTTATGATGAAACAGTGCAGACTGCCATATCTGCCCTGCAATCTGTTCTTCAAGAAGACT
TCAAGGCAACTGAGATTGAGGTTTGAGTTGTGAGAGCTGATAACCCGATCTTCCGTTCCC
TTGAAACGGAGGAGATCGAGGAGCATTTGACTGCCATTAGCGAACGTGACTGATCACTTC
GAAATCAGACTTTGCAATCTCTTCCTTTTGCTTTCATTATCTTTCTAAGAACATTCACAT
CTCATAGAAACTTGTTTCCGTCTGTGTTATGAATCTTGTGGTCTCCATTTGAACCTTCTG
CTTTCTCAGATCCTC
TTTTAT

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 10

CO CL555Contig1 1212 10 9 U
AGCATAATAACGACCACTACGGTTGGAATTTGGAACTACAAACAAAGTCAGCTTTGAATT
TAATGGGTTCCCACCCACATACTTAAGCAAAAAAAAATTGGGTTTTAAACTTTATTATTG
TCCCATTCAAAACACACATAAGATAAAACAAGTATGAAAATAATAATTAAAACATTGATT
ATTATTAGTCTCTATCATTGTGACCTCCAATACTTGGCCATTTCGAAGCCATTTTTACCA
TAATGATAATCTTCAATGGTCATATCAATCTCAGCTTGAGTATTCATCACGAACGGACCA
TACTGAACCACCGGCTCACCTATTGGTTCTCCAGCAATTAACACAAACCGCAATTTCTTG
GAAGCTGACTTGTTCCACACGCTAACACCGTCATTTCCTTGTCCAAACACTACAACATTG
TGTGCGGAAACAGGGGACGCGTTTGGTGAGCCGAAAACAGCTCCGCCTTCACCGCTTTCA
AGAACGTAAGCAAACGCGTTCCAAGATTCAGGAACGTTCTGGTGGAACTGAGCTCCTGGA
TCGAGAGTGAAATCGAGGAACATTGTTGGTGTTCTTGTGTAAACAGGGGATTGAACTCCC
ATTGATTCTCCTGCTATTACTTTGACTTGAACACCGTTTTCTTCTGCTTTTGGTATGTCT
GAACTTGACAGTTCTTGGTAGTTTGGCTCTATCATTTTCTCGTTGGATGACAGATTGATC
CAAAGCTGTAAACCTTTGTTAACTTCTTCTTCAGGCATTTCAGAGTGAATGATTCCCCTT
CCTGCAGTCATCCACTGAACATCACCAGCATAGATTGTACCCTTATGGCCTTTGAAATCT
TGATGAGTGATTCCTCCCTCTAGAACGTATGTAACAGTTTCAAAACCTCTGTGAGGATGA
TCTGGGAATCCAGCTGGAGGAGAAACGGAGAATTCATCAAGCATCAAGAACGGATCTAAT
AACTTCTGCTCACTCCTGGAAATGCCACGTCTAACGACCGCTCCATCGCCTTCTTTCTGA
AGCTTAGCGAAGACTTTCTTGATTACAGATCTTGATACAAAGTTTTGAGAAGAAGACGAC
GACATCGATTTAACGTTTCTGAATGAAAACAACCCTCCAAGAAGATTTGCTCTGTTTAAA
GCAGCTCTCGTATACTACAAACTAAACGTGTTTCTCTTTTTATTCTTCTTAACTTGTGTT
CTCGCTAAGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 15 40 40 40 
40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2DV39JQ U 1
AF RR2GT07JQB U 100
AF RR2CZ82JQ U 176
AF RR2EW05JQ U 128
AF RR2DO45JQ U 100
AF RR2EW05TF C 323
AF RR2CZ82TF C 558
AF RR2DO45TF C 710
AF RR2DV39TF C 651
AF RR2GT07TF C 593
BS 1 202 RR2DV39JQ
BS 203 203 RR2DO45JQ
BS 204 450 RR2DV39JQ
BS 451 759 RR2DO45JQ
BS 760 971 RR2EW05TF
BS 972 972 RR2CZ82TF
BS 973 998 RR2EW05TF
BS 999 999 RR2DO45TF
BS 1000 1212 RR2CZ82TF

RD RR2DV39JQ 450 0 0
AGCATAATAACGACCACTACGGTTGGAATTTGGAACTACAAACAAAGTCAGCTTTGAATT
TAATGGGTTCCCACCCACATACTTAAGCAAAAAAAAATTGGGTTTTAAACTTTATTATTG
TCCCATTCAAAACACACATAAGATAAAACAAGTATGAAAATAATAATTAAAACATTGATT
ATTATTAGTCTCTATCATTGTGGCCTCCAATACTTGGCCATTTCGAAGCCATTTTTACCA
TAATGATAATCTTCAATGGTCATATCAATCTCAGCTTGAGTATTCATCACGAACGGACCA
TACTGAACCACCGGCTCACCTATTGGTTCTCCAGCAATTAACACAAACCGCAATTTCTTG
GAAGCTGACTTGTTCCACACGCTAACACCGTCATTTCCTTGTCCAAACACTACAACATTG
TGTGCGGAAACAGGGGACGCGTTTGGTGAG

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR2GT07JQB 360 0 0
GGGTTTTAAACTTTATTATTGTCCCATTCAAATCACACATAAGATAAAACAAGTATGAAA
ATAATAATTAAAACATTTATTATTATTATCCTCTATCATTGTGACCTCCAATACTTGGCC
ATTTCGAAGCCATTTTTACCATAGTGATAATCTTCAATGGTCATATCAATCTCAGCTTGA
GTATTCATCACGAACGGACCGTACTGAACCACCGGCTCACCTATTGGTTCTCCAGCAATT
AACACAAACCGCAATTTCTTGGAAGCTGACTTGTTCCACACGCTAACACCGTCATTTCCT
TGTCCGAACACTAAAACGTTGTGTGCTGAAACAGGGGAAGCGTTTGGTGAGCCGAAAACA

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR2CZ82JQ 282 0 0
TT
ATTATTATTATCCTCTATCATTGTGACCTCCAATACTTGGCCATTTCGAAGCCATTTTTA
CCATAGTGATAATCTTCAATAGTCATATCAATCTCAGCTTGAGTATTCATCACGAACGGA
CCGTACTGAACCACCGGCTCACCTATTGGTTCTCCAGCAATTAACACAAACCGCAATTTC
TTGGAAGCTGACTTGTTCCACACGCTAACACCGTCATTTCCTTGTCCGAACACTAAAACG
TTGTGTGCTGAAACAGGGGAAGCGTTTGGTGAGCCAAAAA

QA 3 282 3 282
DS 

RD RR2EW05JQ 585 0 0
CAAAACACACATAAGATAAAACAAGTATGAAAATAATAATTAAAACATTGATTATTATTA
GTCTCTATCATTGTGACCCCCAATACTTGGCCATTTCGAAGCCATTTTTACCATAATGAT
AATCTTCAATGGTCATATCAATCTCAGCTTGAGTATTCATCACGAACGGACCATACTGAA
CCACCGGCTCACCTATTGGTTCTCCAGCAATTAACACAAACCGCAATTTCTTGGAAGCTG
ACTTGTTCCACACGCTAACACCGTCATTTCCTTGTCCAAACACTACAACATTGTGTGCGG
AAACAGGGGACGCGTTTGGTGAGCCGAAAACAGCTCCGCCTTCACCGCTTTCAAGAACGT
AAGCAAACGCGTTCCAAGATTCAGGAACGTTCTGGTGGAACTGAGCTCCTGGATCGAGAG
TGAAATCGAGGAACATTGTTGGTGTTCTTGTGTAAACAGGGGATTGAACTCCCATTGATT
CTCCTGCTATTACTTTGACTTGAACACCGTTTTCTTCTGCTTTTGGTATGTCTGAACTTG
ACAGTTCTTGGTAGTTTGGCTCTATCATTTTCTCGTTGGATGACA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2DO45JQ 660 0 0
GGGTTTTAAACTTTATTATTGTCCCATTCAAAACACACATAAGATAAAACAAGTATGAAA
ATAATAATTAAAACATTGATTATTATTAGTCTCTATCATTGTGACCTCCAATACTTGGCC
AGTTCGAAGCCATTTTTACCATAATGATAATCTTCAATGGTCATATCAATCTCAGCTTGA
GTATTCATCACGAACGGACCATTCTGAACCACCGGCTCACCTATTGGTTCTCCAGCAATT
AACACAAACCGCAATTTCTTGGAAGCTGACTTGTTCCACACGCTAACACCGTCATTTCCT
TGTCCAAACACTACAACATTGTGTGCGGAAACAGGGGACGCGTTTGGTGAGCCGAAAACA
GCTCCGCCTTCACCGCTTTCAAGAACGTAAGCAAACGCGTTCCAAGATTCAGGAACGTTC
TGGTGGAACTGAGCTCCTGGATCGAGAGTGAAATCGAGGAACATTGTTGGTGTTCTTGTG
TAAACAGGGGATTGAACTCCCATTGATTCTCCTGCTATTACTTTGACTTGAACACCGTTT
TCTTCTGCTTTTGGTATGTCTGAACTTGACAGTTCTTGGTAGTTTGGCTCTATCATTTTC
TCGTTGGATGACAGATTGATCCAAAGCTGTAAACCTTTGTTAACTTCTTCTTCAGGCATT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2EW05TF 679 0 0
TTGGTTCTCCAGCAATTAACACAAACCGCAATTTCTTGGAAGCTGACTTGTTCCACACGC
TAACACCGTCATTTCTTTGTCCAAACACTACAACATTGTGTGCGGAAACAGGGGACGCGT
TTGGTGAGCCGAAAACAGCTCCGCCTTCACCGCTTTCAAGAACGTAAGCAAACGCGTTCC
AAGATTCAGGAACGTTCTGGTGGAACTGAGCTCCTGGATCGAGAGTGAAATCGAGGAACA
TTGTTGGTGTTCTTGTGTAAACAGGGGATTGAACTCCCATTGATTCTCCTGCTATTACTT
TGACTTGAACACCGTTTTCTTCTGCTTTTGGTATGTCTGAACTTGACAGTTCTTGGTAGT
TTGGCTCTATCATTTTCTCGTTGGATGACAGATTGATCCAAAGCTGTAAACCTTTGTTAA
CTTCTTCTTCAGGCATTTCAGAGTGAATGATTCCCCTTCCTGCAGTCATCCACTGAACAT
CACCAGCATAGATTGTACCCTTATGGCCTTTGAAATCTTGATGAGTGATTCCTCCCTCTA
GAACGTATGTAACAGTTTCAAAACCTCTGTGAGGATGATCTGGGAATCCAGCTGGAGGAG
AAACGGAGAATTCATCAAGCATCAAGAACGGATCTAATAACTTCTGCTCGCTCCTGGAAA
TGCCACGTCTAACGAC
CCC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2CZ82TF 655 0 0
GAACATTGTTGGTGTTCTTGTGTAAACAGGGGATTGAACTCCCATCGATTCTC*TGCTAT
TACTTTGACTTGAACACCGTTTTCTTCTGCTTTTGGTATGTCTGAACTTGACAGCTCTTG
GTAGTTTGGCTCTATCATTTTCTCGTTGGATGACAGATTGATCCAAAGCTGTAAACCTTT
GTTAACTTCTTCTTCAGGCATTTCAGAGTGAATGATTCCTCTTCCTGCAGTCATCCACTG
AACATCACCAGCATAGATTGTACCCTTATGGCCTTTGAAATCTTGATGAGTGATTCCTCC
CTCTAGGACGTATGTAACAGTTTCAAAACCTCTGTGAGGATGATCTGGGAATCCAGCTGG
AGGAGAAACGGAGAATTCATCAAGCATCAAGAACGGATCTAATAACTTCTGCTCACTCCT
GGAAATGCCACGTCTAACGACGGCTCCATCGCCTTCTTTCTGAAGCTTAGCGAAGACTTT
CTTGATTACAGATCTTGATACAAAGTTTTGAGAAGAAGACGACGACATCGATTTAACGTT
TCTGAATGAAAACAACCCTCCAAGAAGATTTGCTCTGTTTAAAGCAGCTCTCGTATACTA
CAAACTAAACGTGTTTCTCTTTTTATTCTTCTTAACTTGTGTTCTCGCTAAGATG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2DO45TF 503 0 0
ACAGATTGATCCAAAGCTGTAAACCTTTGTTAACTTCTTCTTCAGGCATTTCAGAGTGAA
TGATTCCCCTTCCTGCAGTCATCCACTGAACATCACCAGCATAGATTGTACCCTTATGGC
CTTTGAAATCTTGATGAGTGATTCCTCCCTCTAGAACGTATGTAACAGTTTCAAAACCTC
TGTGAGGATGATCTGGGAATCCAGCTGGAGGAGAAACGGAGAATTCATCAAGCATCAAGA
ACGGATCTAATAACTTCTGCTCACTCCTGGAAATGCCACGTCTAACGACCGCTCCATCGC
CTTCTTTCTGAAGCTTAGCGAAGACTTTCTTGATTACAGATCTTGATACAAAGTTTTGAG
AAGAAGACGACGACATCGATTTATCGTTTCTGAATGAAAACAACCCTCCAAGAAGATTTG
CTCTGTTTAAAACAGCTCTCGTATACTACAAACTAAACGTGTTTCTCTTTTTATTCTTCT
TAACTTGTGTTCTCGTTAAGATG

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2DV39TF 562 0 0
TGGTATGTCTGAACTTGACAGTTCTTGGTAGTTTGGCTCTATCATTTTCTCGTCGGATGA
CAGATTGATCCAAAGCTGTAAACCTTTGTTAACTTCTTCTTCAGGCATTTCAGAGTGAAT
GATTCCCCTTCCTGCAGTCATCCACTGAACATCACCAGCATAGATTGTACCCTTATGGCC
TTTGAAATCTTGATGAGTGATTCCTCCCTCTAGAACGTATGTAACAGTTTCAAAACCTCT
GTGAGGATGATCTGGGAATCCAGCTGGAGGAGAAACGGAGAATTCATCAAGCATCAAGAA
CGGATCTAATAACTTCTGCTCACTCCTGGAAATGCCACGTCTAACGACCGCTCCATCGCC
TTCTTTCTGAAGCTTAGCGAAGACTTTCTTGATTACAGATCTTGATACAAAGTTTTGAGA
AGAAGACGACGACATCGATTTATCGTTTCTGAATGAAAACAACCCTCTAAGAAGATTTGC
TCTGTTTAAAGCAGCTCTCGTATACTACAAACTAAACGTGTTTCTCTTTTTATTCTTCTT
AACTTGTGTTCTCGTTAAGATG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2GT07TF 620 0 0
GAACTCCCATCGATTCTC*TGCTATTACTTTGACTTGAACAC*GTTTTCTTCTGCTTTTG
GTATGTCTGAACTTGACAGCTCTTGGTAGTTTGGCTCTATCATTTTCTCGTTGGATGACA
GATTGATCCAAAGCTGTAAACCTTTGTTAACTTCTTCTTCAGGCATTTCAGAGTGAATGA
TTCCTCTTCCTGCAGTCATCCACTGAACATCACCAGCATAGATTGTACCCTTATGGCCTT
TGAAATCTTGATGAGTGATTCCTCCCTCTAGGACGTATGTAACAGTTTCAAAACCTCTGT
GAGGATGATCTGGGAATCCAGCTGGAGGAGAAACGGAGAATTCATCAAGCATCAAGAACG
GATCTAATAACTTCTGCTCACTCCTGGAAATGCCACGTCTAACGACGGCTCCATCGCCTT
CTTTCTGAAGCTTAGCGAAGACTTTCTTGATTACAGATCTTGATACAAAGTTTTGAGAAG
AAGACGACGACATCGATTTAACGTTTCTGAATGAAAACAACCCTCCAAGAAGATTTGCTC
TGTTTAAAGCAGCTCTCGTATACTACAAACTAAACGTGTTTCTCTTTTTATTCTTCTTAA
CTTGTGTTCTCGCTAAGATG

QA 1 620 1 620
DS 



AS 2 8

CO CL556Contig1 936 5 14 U
GGGAAACTCCGTTTGATTCGAACTCAACAGTGGTTAGAAATGACAGAATCAAAGGTTGTA
GTTCCGGAGTCTCACCTGAAGAAGAGAAAGAGAGAGGAGGAGTGGGCTTTGGCGAAGAAG
CAGAGCGCTGAAGCAGCCAAGAAGACAAACGCCGCCAACAGGAAGCTTATCTACAAAAGG
GCCGAGCAGTACGCCAAGGAGTACGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTGATCTCTTTGAAACGT
GAGGCTAAGCTTAAAGGAGGTTTCTATGTTGATTCTGAAGCTAAACTCTTGTTCATCGTC
CGCATCCGTGGTATTAATGCCATTGACCCAAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCTCTTGCGT
TTGAGACAGATATTCAACGGTGTCTTTCTCAAAGTCAACAAGGCTACAATGAACATGCTT
CGTCGTGTTGAGCCCTATGTGACCTACGGGTTCCCCAACTTGAAGAGTGTCAAGGAATTG
ATCTACAAGAGAGGATACGGAAAACTCAACTCCCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAACTCT
ATCGTAGAGCAGGGTTTGGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAG
ATTCTAACAGTTGGGCCTCATTTCAAGGAAGCAAACAACTTCCTGTGGCCGTTCCAGCTC
AAGGCACCACTCGGTGGCCTGAAGAAGAAGAGGAATCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCT
GGTAACCGTGAGAACTTCATCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATTAGATGATGTCTTCT
TCTTTTCCAATCTCAAGTCTTATGATCTGTTTGTTTTCACTACTCCTGGATTTTGATATT
TTTGTTGAGTCTAGACATTTTGAGCTTTCTCTTTTATTGTCTTTGGATCGTATTCGTTCG
CTTTCCGTTTTAAGAAATAGTTCTACTTTAAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV31TF U 1
AF RR2CU12TF U 17
AF RR2AC51TF U 7
AF RR2AC51JQ C 64
AF RR2DV31JQ C 347
BS 1 273 RR2DV31TF
BS 274 274 RR2AC51TF
BS 275 302 RR2DV31TF
BS 303 303 RR2AC51TF
BS 304 376 RR2DV31TF
BS 377 377 RR2AC51TF
BS 378 633 RR2DV31TF
BS 634 634 RR2AC51TF
BS 635 651 RR2DV31TF
BS 652 708 RR2AC51TF
BS 709 709 RR2AC51JQ
BS 710 752 RR2AC51TF
BS 753 929 RR2AC51JQ
BS 930 936 RR2DV31JQ

RD RR2DV31TF 651 0 0
GGGAAACTCCGTTTGATTCGAACTCAACAGTGGTTAGAAATGACAGAATCAAAGGTTGTA
GTTCCGGAGTCTCACCTGAAGAAGAGAAAGAGAGAGGAGGAGTGGGCTTTGGCGAAGAAG
CAGAGCGCTGAAGCAGCCAAGAAGACAAACGCCGCCAACAGGAAGCTTATCTACAAAAGG
GCCGAGCAGTACGCCAAGGAGTACGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTGATCTCTTTGAAACGT
GAGGCTAAGCTTAAAGGAGGTTTCTATGTTGATCCTGAAGCTAAACTCTTGTTCATCGTC
CGTATCCGTGGTATTAATGCCATTGACCCAAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCTCTTGCGT
TTGAGACAGATATTCAGCGGTGTCTTTCTCAAAGTCAACAAGGCTACAATGAACATGCTT
CGTCGTGTTGAGCCCTATGTGACCTACGGGTTCCCCAACTTGAAGAGTGTCAAGGAATTG
ATCTACAAGAGAGGATACGGAAAACTCAACTCCCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAACTCT
ATCGTAGAGCAGGGTTTGGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAG
ATTCTAACAGTTGGGCCTCATTTCAAGGAAGCAGACAACTTCCTGTGGCCG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2CU12TF 671 0 0
GGG
GAACTCAGCAGAGGTTAGAAATGACAGAATCAAAGATTGTAGTTCCGGAGTCTCACCTGA
AGAAGACGAAGAGAGAGGAGGGGTGGGCTTTGGCGAAGAAGCAGAGCGCTGAAGCTGCCA
AGAAGACAAACGCAGCCAACAGGAAGCTTATCTACGAAAGGGCCGAGCAGTACGCTAAGG
AGTACGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTGATCTCTTTGAAACGTGAGGCTAAGCTTAAAGGAG
GTTTCTATGTTGATCCTGAAGCTAAACTCTTGTTCATCATCCGTATCCGTGGTATTAACG
CCATTGACCCAAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCTCTTGCGTTTGAGACAGATATTTAACG
GTGTCTTTCTCAAAGTCAACAAGGCTACAATGAACATGCTTCGTCGTGTTGAGCCCTATG
TGACCTACGGGTTCCCTAACTTGAAGAGTGTCAAGGAATTGATCTACAAGAGAGGATACG
GAAAGCTTAACTCCCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAACTCTATCGTAGAACAGGGTTTGG
GTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAGATTCTAACAGTTGGACCTC
ATTTCAAGGAGGCAAACAACTTCCTGTGGCCTTTCCAGCTCAAGGCACCACTCGGTGGCC
TGAAGAAG

QA 4 671 4 671
DS 

RD RR2AC51TF 746 0 0
GG
CCGTTTGATTCGAACTCAACAGTGGTTAGAAATGACAGAATCAAAGGTTGTAGTTCCGGA
GTCTCACCTGAAGAAGAGAAAGAGAGAGGAGGAGTGGGCTTTGGCGAAGAAGCAGAGCGC
TGAAGCAGCCAAGAAGACAAACGCCGCCAACAGGAAGCTTATCTACAAAAGGGCCGAGCA
GTACGCCAAGGAGTACGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTGATCTCTTTGAAACGTGAGGCTAA
GCTTAAAGGAGGTTTCTATGTTGATTCTGAAGCTAAACTCTTGTTCATCGTCCGCATCCG
TGGTATTAATGCCATTGACCCAAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCTCTTGCGTTTGAGACA
GATATTCAACGGTGTCTTTCTCAAAGTCAACAAGGCTACAATGAACATGCTTCGTCGTGT
TGAGCCCTATGTGACCTACGGGTTCCCCAACTTGAAGAGTGTCAAGGAATTGATCTACAA
GAGAGGATACGGAAAACTCAACTCCCAGAGGGTGGCTTTGACCGACAACTCTATCGTAG*
GCAGGGTTTGGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAGATTCTAAC
AGTTGGGCCTCATTTCAAGGAAGCAAACAACTTCCTGTGGCCGTTCCAGCTCAAGGCACC
ACTCGGTGGCCTGAAGAAGAAGAGGAATCACTACGTTGAAAGTGGTGATGCTGGTAACCG
TGAGAACTTCATCAATGAGCTTAT

QA 3 746 3 746
DS 

RD RR2AC51JQ 869 0 0
CCGGAGTCTCAC*TGAAGAAGAGAAAGAGAGAGGAGGAGTGGGCTTTGGCGAAGAAGCAG
AGCGCTGAAGCAGCCAAGAAGACAAACGCCGCCAACAGGAAGCTTATCTACAAAAGGGCC
GAGCAGTACGCCAAGGAGTACGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTGATCTCTTTGAAACGTGAG
GCTAAGCTTAAAGGAGGTTTCTATGTTGATTCTGAAGCTAAACTCTTGTTCATCGTCCGC
ATCCGTGGTATTAATGCCATTGACCCAAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCTCTTGCGTTTG
AGACAGATATTCAACGGTGTCTTTCTCAAAGTCAACAAGGCTACAATGAACATGCTTCGT
CGTGTTGAGCCCTATGTGACCTACGGGTTCCCCAACTTGAAGAGTGTCAAGGAATTGATC
TACAAGAGAGGATACGGAAAACTCAACTCCCAGAGGGTGGCTTTGACCGACAACTCTATC
GTAG*GCAGGGTTTGGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAGATT
CTAACAGTTGGGCCTCATTTCAAGGAAGCAAACAACTTCCTGTGGCCGTTCCAGCTCAAG
GCACCACTCGGTGGCCTGAAGAAGAAGAGGAATCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGT
AACCGTGAGAACTTCATCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATTAGATGATGTCTTCTTCT
TTTCCAATCTCAAGTCTTATGATCTGTTTGTTTTCACTACTCCTGGATTTTGATATTTTT
GTTGAGTCTAGACATTTTGAGCTTTCTCTTTTATTGTCTTTGGATCGTATTCGTTCGCTT
TCCGTTTTAAGAAATAGTTCTACTTT
AAG

QA 1 866 1 866
DS 

RD RR2DV31JQ 590 0 0
TTCAGCTCTTGCGTTTGAGACAGATATTCAGCGGTGTCTTTCTCAAAGTCAACAAGGCTA
CAATGAACATGCTTCGTCGTGTTGAGCCCTATGTGACCTACGGGTTCCCCAACTTGAAGA
GTGTCAAGGAATTGATCTACAAGAGAGGATACGGAAAACTCAACTCCCAGAGGGTGGCTT
TGACTGACAACTCTATCGTAGAGCAGGGTTTGGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGG
ATTTGATCCACGAGATTCTAACAGTTGGGCCTCATTTCAAGGAAGCAGACAACTTCCTGT
GGCCGTTCCAGCTCAAGGCACCACTCGGTGGCCTGAAGAAGAAGAGGAATCACTACGTTG
AAGGTGGTGATGCTGGTAACCGTGAGAACTTCATCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATT
AGATGATGTCTTCTTCTTTTCCAATCTCAAGTCTTATGATCTGTTTGTTTTCACTACTCC
TGGATTTTGATATTTTTGTTGAGTCTAGACATTTTGAGCTTTCTCTTTTATTGTCTTTGG
ATCGTATTCGTTCTCTTTCCGTTTTAAGAAATAGTTCTACTTTAAAATCC

QA 1 590 1 590
DS 



CO CL556Contig2 877 3 10 U
GGGTAGCCGCACTGAACTTCATCTCTCTCTTTGTTTAATCTGCAAGAATCGGGAAAATGG
CAGAGTCGAAGGTTGTAGTTCCAGAGTCAGTGCTGAAGAAGAGGAAGAGAGAGGAGGAGT
GGGCTCTCGCTAAGAAACAGACCGCCGAAGCTGCCAAGAAGACAAACGCCGCCAACAGGA
AGCTTATCTACAAAAGAGCCGAACAGTACGCCAAGGAGTACGCCGAGAAGGAGAATGAGT
TGATCTCGTTGAAACGTGAGGCTAAGCTCAAAGGTGGTTTCTATGTCGACCCTGAAGCTA
AGCTCTTGTTCATCATCCGTATTCGTGGTATTAATGCTATTGACCCAAAGACAAAAAAGA
TTCTTCAGCTTTTGCGTCTCAGACAGATCTTCAACGGTGTGTTTCTGAAAGTCAACAAGG
CTACAATGAACATGCTTCGTCGTGTTGAGCCCTATGTGACCTATGGATTCCCTAACTTGA
AGAGTGTTAAGTAATTGATCTACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACTCCCAGAGGGTGG
CTTTGACTGACAACTCCATCGTTGAGCAGGCTTTGGGTAAACATGGGATCATCTGCACTG
AGGATCTGATTCACGAGATTCTAACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCAAACAACTTCC
TGTGGCCATTCCAGCTCAAGGCACCCCTCGGCGGTCTTAAGAAAAAGAGGAATCACTACG
TTGAAGGTGGTGATGCCGGCAACCGTGAAAGCTTCATTAATGAGCTTATCAGGAGGATGA
ATTAGAGATGTCTGTCGTATTATCTATGAACTTGACTTCACCAAGTGTTTGCTTCTGGAT
TTTGATATTTTCTCTTATGTTAAAAGACATTCGGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS46TF U 24
AF RR2EV57TF U 1
AF RR2GS46JQB C 404
BS 1 145 RR2EV57TF
BS 146 146 RR2GS46TF
BS 147 268 RR2EV57TF
BS 269 269 RR2GS46TF
BS 270 491 RR2EV57TF
BS 492 492 RR2GS46TF
BS 493 513 RR2EV57TF
BS 514 514 RR2GS46TF
BS 515 640 RR2EV57TF
BS 641 877 RR2GS46JQB

RD RR2GS46TF 542 0 0
GGCCCT
TTTGTTTGATCTGCAAGAATCGGGAAAATGGCAGAGTCGAAGGTTGTAGTTCCAGAGTCA
GTGCTGAAGAAGAGGAAGAGAGAGGAGGAGTGGTCTCTCGCTAAGAAGCAGAGCGCCGAA
GCTGCCAAGAAGACAAACGCCGCCAACAGGAAGCTTATCTACAAAAGAGCCGAACAGTAC
GCCAAGGAGTACGCCGAGAAGGAGAATGAGTTGATCTCGTTGAAACGTGAGGCTAAGCTC
AAAGGTGGTTTCT*TGTTGACCCTGAAGCTAAGCTCTTGTTCATCATCCGTATTCGTGGT
ATTAATGCTATTGACCCAAAGACAAAGAAGATTCTTCAGCTTTTGCGTCTCAGACAGATC
TTCAACGGTGTGTTTCTGAAAGTCAACAAGGCTACAATGAACATGCTTCGTCGTGTTGAG
CCCTATGTGACCTATGGATTCCCTAACTTGAAGAGTGTTAAGTAATTGATCTACAAGAGA
GGATACGGAAAGCTTAACTCCCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAACTCCATCGT
TGA

QA 7 539 7 539
DS 

RD RR2EV57TF 640 0 0
GGGTAGCCGCACTGAACTTCATCTCTCTCTTTGTTTAATCTGCAAGAATCGGGAAAATGG
CAGAGTCGAAGGTTGTAGTTCCAGAGTCAGTGCTGAAGAAGAGGAAGAGAGAGGAGGAGT
GGGCTCTCGCTAAGAAACAGACCGCTGAAGCTGCCAAGAAGACAAACGCCGCCAACAGGA
AGCTTATCTACAAAAGAGCCGAACAGTACGCCAAGGAGTACGCCGAGAAGGAGAATGAGT
TGATCTCGTTGAAACGTGAGGCTAAGCTTAAAGGTGGTTTCTATGTCGACCCTGAAGCTA
AGCTCTTGTTCATCATCCGTATTCGTGGTATTAATGCTATTGACCCAAAGACAAAAAAGA
TTCTTCAGCTTTTGCGTCTCAGACAGATCTTCAACGGTGTGTTTCTGAAAGTCAACAAGG
CTACAATGAACATGCTTCGTCGTGTTGAGCCCTATGTGACCTATGGATTCCCTAACTTGA
AGAGTGTTAAGGAATTGATCTACAAGAGAGGATGCGGAAAGCTTAACTCCCAGAGGGTGG
CTTTGACTGACAACTCCATCGTTGAGCAGGCTTTGGGTAAACATGGGATCATCTGCACTG
AGGATCTGATTCACGAGATTCTAACAGTTGGACCTCATTT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2GS46JQB 474 0 0
TCTG
AAAGTCAACAAGGCTACAATGAACATGCTTCGTCGTGTTGAGCCCTATGTGACCTATGGA
TTCCCTAACTTGAAGAGTGTTAAGTAATTGATCTACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAAC
TCCCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAACTCCATCGTTGAGCAGGCTTTGGGTAAACATGGG
ATCATCTGCACTGAGGATCTGATTCACGAGATTCTAACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAG
GCAAACAACTTCCTGTGGCCATTCCAGCTCAAGGCACCCCTCGGCGGTCTTAAGAAAAAG
AGGAATCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCCGGCAACCGTGAAAGCTTCATTAATGAGCTT
ATCAGGAGGATGAATTAGAGATGTCTGTCGTATTATCTATGAACTTGACTTCACCAAGTG
TTTGCTTCTGGATTTTGATATTTTCTCTTATGTTAAAAGACATTCGGAGC

QA 5 474 5 474
DS 



AS 2 10

CO CL557Contig1 705 2 1 U
ATAGAATTGATATCATAATGGAAACAGAAAGTTTGCCAAATATTTAACTTGACAAAACAA
AGAGTAATGATTTTAACTTGTCTCATTGTAATCAGTGGACCAGAAAAAGTTACAGAATAT
CCACAACAATTACAAAACTTATTACAAGCATTTTTTGCTTTTGTTTAGTAATTTACAATT
TTGTATGTTCGTTATTTTTTATTATTATTATTGCATTATTAGGTATTGTCTGAAACCTAT
ATTCATTTCTTGGCTGGGAATTTTCCCTTAACCTTCTGAATCACCTGTGGTTCAACACCG
AACGCCTTGGCAAGCAAGTCATCAGGAATAGGAGGGTTAGCACCAAACAGAGACGGTCCA
ACACTTTGAGTCCCAGGGTTTTGACTATCGAAAGCAGCAATCACGGAGGCAGGAGCGTTG
TTAGGGTTCTGCTGGAAATGGAGGAGAGCTCTTGGGAATACAAAGACGTCACCCTTGTTG
ATGTGTTTGGAGATGAGTTTTCCAGTGGTGGTCAAGAAGCCGACGAAGAGACGTCCTTCG
AGGACGAATATGGATTCAGAAGCTCGGGGGTGAAGATGTGGCGGGTTGAGTCCACCAGGT
GCGTAGTCGATACGAGACATGGAGGTACCCATCATGTTGAGGCCAGGGATTTTCTCAACG
TTGCCTGCTGTAACGGCTGACCCCATTGCGGTGTTGGATGTGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E662JQ U 112
AF RR2DO49JQ U 1
BS 1 705 RR2DO49JQ

RD RR2E662JQ 415 0 0
ACAGAATATCCACAACAATTACAAAACTTATTACAAGCATTTTTTGCTTTTGTTTAGTAA
TTTACAATTTTGTATGTTCGTTATTTTTTATTATTATTATTGCATTATTAGGTATTGTCT
GAAACCTATATTCATTTCTTGGCTGGGAATTTTCCCTTAACTTTCTGAATCACCTGTGGT
TCAACACCGAACGCCTTGGCAAGCAAGTCATCAGGAATAGGAGGGTTAGCACCAAACAGA
GACGGTCCAACACTTTGAGTCCCAGGGTTTTGACTATCGAAAGCAGCAATCACGGAGGCA
GGAGCGTTGTTAGGGTTCTGCTGGAAATGGAGGAGAGCTCTTGGGAATACAAAGACGTCA
CCCTTGTTGATGTGTTTGGAGATGAGTTTTCCAGTGGTGGTCAAGAAGCCGACGA

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR2DO49JQ 705 0 0
ATAGAATTGATATCATAATGGAAACAGAAAGTTTGCCAAATATTTAACTTGACAAAACAA
AGAGTAATGATTTTAACTTGTCTCATTGTAATCAGTGGACCAGAAAAAGTTACAGAATAT
CCACAACAATTACAAAACTTATTACAAGCATTTTTTGCTTTTGTTTAGTAATTTACAATT
TTGTATGTTCGTTATTTTTTATTATTATTATTGCATTATTAGGTATTGTCTGAAACCTAT
ATTCATTTCTTGGCTGGGAATTTTCCCTTAACCTTCTGAATCACCTGTGGTTCAACACCG
AACGCCTTGGCAAGCAAGTCATCAGGAATAGGAGGGTTAGCACCAAACAGAGACGGTCCA
ACACTTTGAGTCCCAGGGTTTTGACTATCGAAAGCAGCAATCACGGAGGCAGGAGCGTTG
TTAGGGTTCTGCTGGAAATGGAGGAGAGCTCTTGGGAATACAAAGACGTCACCCTTGTTG
ATGTGTTTGGAGATGAGTTTTCCAGTGGTGGTCAAGAAGCCGACGAAGAGACGTCCTTCG
AGGACGAATATGGATTCAGAAGCTCGGGGGTGAAGATGTGGCGGGTTGAGTCCACCAGGT
GCGTAGTCGATACGAGACATGGAGGTACCCATCATGTTGAGGCCAGGGATTTTCTCAACG
TTGCCTGCTGTAACGGCTGACCCCATTGCGGTGTTGGATGTGTCT

QA 1 705 1 705
DS 



CO CL557Contig2 871 8 18 U
GGTCTGAAATTCATCAATAACACATTTCTCAACAAGAACCAACAATGGCAACTTCCATGA
CCCAACTTTTTGTTACCCTCTTGCTTGTGGCTGCCCACACGGCCTTCGCCGAAACAAACA
TGCTTCAAGATCTTTGTGTTGCTGATCTCAAAGGTACCAAAGTAAACGGATACGCATGCA
AAGACCCATCACAAGTAACACCAGATGATTTCTACTACATAGGCTTAGCCGCCCCTGCAG
ACACATCCAACACCGCAATGGGGTCAGCCGTTACAGCAGGCAACGTTGAGAAAATCCCTG
GCCTCAACATGATGGGTACCTCCATGTCTCGTATCGACTACGCACCTGGTGGACTCAACC
CGCCACATCTTCACCCCCGAGCTTCTGAAGCCATATTCGTCCTCGAAGGACGTCTCTTCG
TCGGCTTCTTGACCACCACTGGAAAACTCATCTCCAAACACATCAACAAAGGAGACGTCT
TTGTATTCCCTAGAGCTCTCCTCCATTTCCAGCAGAACCCTAACAACGCTCCTGCCTCCG
TGATTGCTGCTTTCGATAGTCAAAACCCTGGGACTCAAAGTGTTGGACCGTCTCTGTTTG
GTGCTAACCCTCCTATTCCTGATGACTTGCTTGCCAAGGCGTTCGGTGTTGAACCACAGG
TGATTCAGAAGGTTAAGGGAAAATTCCCAGCCAAGAAATGAATATAGGTTTCAGACCATA
TCTAATAATGTAATAATAATATACAAATAATGAACATAAAAGTTTGTAAACTACTAAACA
AAAGCAAAGAGTGCTTGTGAGTTTTGTAATCGTTGTAGATATTCTGTAACTTTTTCGGTC
CACTGATTACAATGAGACAGGTTAAAAATCG


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 25 25 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO49TF U 5
AF RR2BT72TF U 22
AF RR2E662TF U 4
AF RR2FZ57TF U 4
AF RR2FF20TF U 1
AF RR2FZ57JQ C 113
AF RR2FF20JQ C 417
AF RR2BT72JQ C 113
BS 1 247 RR2FF20TF
BS 248 248 RR2E662TF
BS 249 671 RR2FF20TF
BS 672 672 RR2FZ57JQ
BS 673 707 RR2FF20TF
BS 708 708 RR2FZ57JQ
BS 709 732 RR2FF20TF
BS 733 735 RR2FZ57JQ
BS 736 738 RR2FF20TF
BS 739 739 RR2FZ57JQ
BS 740 749 RR2FF20TF
BS 750 750 RR2FF20JQ
BS 751 760 RR2FF20TF
BS 761 761 RR2FZ57JQ
BS 762 782 RR2FF20TF
BS 783 783 RR2FZ57JQ
BS 784 802 RR2FF20TF
BS 803 871 RR2FZ57JQ

RD RR2DO49TF 459 0 0
G
GAAATTCATCAATAACACATTTCTCGACAACAACCAACAATGGCAACTTCCATGACCCAA
CTTTTTGTTACCCTCTTGCTTGTGGCTGCCCACACGGCCTTCGCCGAAACAAACATGCTT
CAAGATCTCTGTGTTGCTGATCTCAAAGGTACCAAAGTAAACGGATACGCATGCAAAGAC
CCATCACAAGTAACACCAGATGATTTCTACTACATAGGCTTAGCCGCCCCTGCAGACACA
TCCAACACCGCAATGGGGTCAGCCGTTACAGCAGGCAACGTTGAGAAAATCCCTGGCCTC
AACATGATGGGTACCTCCATGTCTCGTATCGACTACGCACCTGGTGGACTCAACCCGCCA
CATCTTCACCCCCGAGCTTCTGAATCCATATTCGTCCTCGAAGGACGTCTCTTCGTCGGC
TTCTTGACCACCACTGGAAAACTCATCTCCAAACACAT

QA 2 459 2 459
DS 

RD RR2BT72TF 546 0 0
ACATTTCTCAACAAGAACCAACAATGGCAACTTCCATGACCCAACTTTTTGTTACCCTCT
TGCTTGTGGTTGCCCACACGGCCTTCGCCGAAACAAAC*TGCTTCAAGATCTTTGTGTTG
CTGATCTCAAAGGTACCAAAGTAAACGGATACGCATGCAAAGACCCATCACAAGTAACAC
CAGATGATTTCTACTACATAGGCTTAGCCGCCCCTGCAGACACATCCAACACCGCAATGG
GGTCAGCCGTTACAGCAGGCAACGTTGAGAAAATCCCTGGCCTCAACATGATGGGTACCT
CCATGTCTCGTATCGACTACGCACCTGGTGGACTCAACCCGCCACATCTTCACCCCCGAG
CTTCTGAAGCCATATTCGTCCTCGAAGGACGTCTCTTCGTCGGCTTCTTGACCACCACTG
GAAAACTCATCTCCAAACACATCAACAAAGGAGACGTCTTTGTATTCCCTAGAGCTCTCC
TCCATTTCCAGCAGAACCCTAACAACGCTCCTGCCTCCGTGATTGCTGCTTTCGATAGTC
AAAACC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2E662TF 631 0 0
GG
GAAATTCATCAATAACACATTTCTCGACAACAACCAACAATGGCAACTTCCATGACCCAA
CTTTTTGTTACCCTCTTGCTTGTGGCTGCCCACACGGCCTTCGCCGAAACAAAGATGCTT
CAAGATCTCTGTGTTGCTGATCTCAAAGGTACCAAAGTAAACGGATACGCATGCAAAGAC
CCATCACAAGTAACACCAGATGATTTCTACTACATAGGCTTAGCCGCCCCTGCAGACACA
TCCAACACCGCAATGGGGTCAGCCGTTACAGCAGGCAACGTTGAGAAAATCCCTGGCCTC
AACATGATGGGTACCTCCATGTCTCGTATCGACTACGCACCTGGTGGACTCAACCCGCCA
CATCTTCACCCCCGAGCT*CTGAAGCCATATTCGTCCTCGAAGGACGTCTCTTCGTCGGC
TTCTTGACCACCACTGGAAAACTCATCTCCAAACACATCAACAAGGGTGACGTCTTTGTA
TTCCCAAGAGCTCTCCTCCATTTCCAGCAGAACCCTAACAACGCTCCTGCCTCCGTGATT
GCTGCTTTCGATAGTCAAAACCCTGGGACTCAAAGTGTTGGACCGTCTCTGTTTGGTGCT
AACCCTCCTATTCCTGATGACTTGCTTGC

QA 3 631 3 631
DS 

RD RR2FZ57TF 638 0 0
GG
GAAATTCATCAATAACACATTTCTCAACAAGAACCAACAATGGCAACTTCCATGACCCAA
CTTTTTGTTACCCTCTTGCTTGTGGCTGCCCACACGGCCTTCGCCGAAACAAACATGCTT
CAAGATCTTTGTGTTGCTGATCTCAAAGGTACCAAAGTAAACGGATACGCATGCAAAGAC
CCATCACAAGTAACACCAGATGATTTCTACTACATAGGCTTAGCCGCCCCTGCAGACACA
TCCAACACCGCAATGGGGTCAGCCGTTACAGCAGGCAACGTTGAGAAAATCCCTGGCCTC
AACATGATGGGTACCTCCATGTCTCGTATCGACTACGCACCTGGTGGACTCAACCCGCCA
CATCTTCACCCCCGAGCTTCTGAAGCCATATTCGTCCTCGAAGGACGTCTCTTCGTCGGC
TTCTTGACCACCACTGGAAAACTCATCTCCAAACACATCAACAAAGGAGACGTCTTTGTA
TTCCCTAGAGCTCTCCTCCATTTCCAGCAGAACCCTAACAACGCTCCTGCCTCCGTGATT
GCTGCTTTCGATAGTCAAAACCCTGGGACTCAAAGTGTTGGACCGTCTCTGTTTGGTGCT
AACCCTCCTATTCCTGATGACTTGCTTGCCAAG
CGT

QA 3 635 3 635
DS 

RD RR2FF20TF 802 0 0
GGTCTGAAATTCATCAATAACACATTTCTCAACAAGAACCAACAATGGCAACTTCCATGA
CCCAACTTTTTGTTACCCTCTTGCTTGTGGCTGCCCACACGGCCTTCGCCGAAACAAACA
TGCTTCAAGATCTTTGTGTTGCTGATCTCAAAGGTACCAAAGTAAACGGATACGCATGCA
AAGACCCATCACAAGTAACACCAGATGATTTCTACTACATAGGCTTAGCCGCCCCTGCAG
ACACATCTAACACCGCAATGGGGTCAGCCGTTACAGCAGGCAACGTTGAGAAAATCCCTG
GCCTCAACATGATGGGTACCTCCATGTCTCGTATCGACTACGCACCTGGTGGACTCAACC
CGCCACATCTTCACCCCCGAGCTTCTGAAGCCATATTCGTCCTCGAAGGACGTCTCTTCG
TCGGCTTCTTGACCACCACTGGAAAACTCATCTCCAAACACATCAACAAAGGAGACGTCT
TTGTATTCCCTAGAGCTCTCCTCCATTTCCAGCAGAACCCTAACAACGCTCCTGCCTCCG
TGATTGCTGCTTTCGATAGTCAAAACCCTGGGACTCAAAGTGTTGGACCGTCTCTGTTTG
GTGCTAACCCTCCTATTCCTGATGACTTGCTTGCCAAGGCGTTCGGTGTTGAACCACAGG
TGATTCAGAAG*TTAAGGGAAAATTCCCAGCCAAGAAATGAATATAG*TTTCAGACCATA
TCTAATAATGTA**TATA*TATACAAATA*TGAACATAAA*GTTTGTAAACTACTAAACA
AA*GCAAAGAGTGCTTGTGAGT

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2FZ57JQ 759 0 0
AACAAACATGCTTCAAGATCTTTGTGTTGCTGATCTCAAAGGTACCAAAGTAAACGGATA
CGCATGCAAAGACCCATCACAAGTAACACCAGATGATTTCTACTACATAGGCTTAGCCGC
CCCTGCAGACACATCCAACACCGCAATGGGGTCAGCCGTTACAGCAGGCAACGTTGAGAA
AATCCCTGGCCTCAACATGATGGGTACCTCCATGTCTCGTATCGACTACGCACCTGGTGG
ACTCAACCCGCCACATCTTCACCCCCGAGCTTCTGAAGCCATATTCGTCCTCGAAGGACG
TCTCTTCGTCGGCTTCTTGACCACCACTGGAAAACTCATCTCCAAACACATCAACAAAGG
AGACGTCTTTGTATTCCCTAGAGCTTTCCTCCATTTCCAGCAGAACCCTAACAACGCTCC
TGCCTCCGTGATTGCTGCTTTCGATAGTCAAAACCCTGGGACTCAAAGTGTTGGACCGTC
TCTGTTTGGTGCTAACCCTCCTATTCCTGATGACTTGCTTGCCAAGGCGTTCGGTGTTGA
ACCACAGGTGATTCAGAAGGTTAAGGGAAAATTCCCAGCCAAGAAATGAATATAGGTTTC
AGACCATATCTAATAATGTAATAATAATATACAAATACTGAACATAAAAGTTTGTAAACT
ACTAAACAAAAGCAAAGAATGCTTGTGAGTTTTGTAATCGTTGTAGATATTCTGTAACTT
TTTCGGTCCACTGATTACAATGAGACAGGTTAAAAATCG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2FF20JQ 439 0 0
TTCGTCGGCTTCTTGACCACCACTGGAAAACTCATCTCCAAACACATCAACAAAGGAGAC
GTCTTTGTATTCCCTAGAGCTTTCCTCCATTTCCAGCAGAACCCTAACAACGCTCCTGCC
TCCGTGATTGCTGCTTTCGATAGTCAAAACCCTGGGACTCAAAGTGTTGGACCGTCTCTG
TTTGGTGCTAACCCTCCTATTCCTGATGACTTGCTTGCCAAGGCGTTCGGTGTTGAACCA
CAGGTGATTCAGAAGGTTAAGGGAAAATTCCCAGCCAAGAAATGAATATAGGTTTCAGAC
CATATCTAATAATGTAATAATAATATACAAATAATGAACATAAAAGTTTGTAAACTACTA
AACAAAAGCAAAGAGTGCTTGTGAGTTTTGTAATCGTTGTAGATATTCTGTAACTTTTTC
GGTCCACTGATTACAATGA

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2BT72JQ 743 0 0
AAACAAAC
TGCTTCAAGATCTTTGTGTTGCTGATCTCAAAGGTACCAAAGTAAACGGATACGCATGCA
AAGACCCATCACAAGTAACACCAGATGATTTCTACTACATAGGCTTAGCCGCCCCTGCAG
ACACATCCAACACCGCAATGGGGTCAGCCGTTACAGCAGGCAACGTTGAGAAAATCCCTG
GCCTCAACATGATGGGTACCTCCATGTCTCGTATCGACTACGCACCTGGTGGACTCAACC
CGCCACATCTTCACCCCCGAGCTTCTGAAGCCATATTCGTCCTCGAAGGACGTCTCTTCG
TCGGCTTCTTGACCACCACTGGAAAACTCATCTCCAAACACATCAACAAAGGAGACGTCT
TTGTATTCCCTAGAGCTCTCCTCCATTTCCAGCAGAACCCTAACAACGCTCCTGCCTCCG
TGATTGCTGCTTTCGATAGTCAAAACCCTGGGACTCAAAGTGTTGGACCGTCTCTGTTTG
GTGCTAACCCTCCTATTCCTGATGACTTGCTTGCCAAGGCGTTCGGTGTTGAACCACAGG
TGATTCAGAAGGCTAAGGGAAAATTCCCAGCCAAGAAATGAATATAGGTTTCAGACCATA
TCTAATAATGTAATAATAATATACAAATAATGAACATAAAAGTTTGTAAACTACTAAACA
AAAGCAAAGAATGCTTGTGAGTTTTGTAATCGTTGTAGATATTCTGTAACTTTTTCGGTC
CACTGATTACAATGA

QA 9 743 9 743
DS 



AS 1 8

CO CL558Contig1 1049 8 21 U
GGATTCAGATATTCCCATAGGATAATTTAGATTTCCATTTTATCCTTTTTTTCTCCAAGC
TAATGGACATGGATTGGTCCTGATGAAGGTGAGGGAGTGAGTTATGTCTTAAAGATTCTT
CGAAGCTAACACAGACAAAAAAAAACTGTAATAATAAAAATTTCGAAGCTTCCCAATGGC
CATGGCCTCTCAGATTATAGCATCTTCTTCACCAACGATTACAAATAGGTCTCACCTTCT
CGCTTCTTACAAAACTTCGAAACCTTATCTCTCTTCATGTTTGGGTTGTTCTCCTCGTTT
CTCTCCTTACATTGGTCTAAAGCATATGGGCATCTCTATCTCGCCAAAATCTTCAAACCC
AGAGAAGAAGAGAAGATGTCGTAAAGGTATGGTGATTCGTGCGTCTCTATTTGGCGTTGG
AGCACCTGAGGCTTTGGTAATTGGTGTTGTTGCTTTGCTTGTCTTTGGTCCTAAAGGCCT
TGCAGAGGTAGCTCGAACTCTTGGGAAAACACTGCGTACATTTCAGCCCACTATTAGAGA
GCTACAGGATGTTTCAAGAGATTTCAAAAGCACCCTTGAGCGTGAGATTGGACTCGATGA
AATCTCAACTCCAAATGTATACAACCAGAACAGAATGAACACTCCACCACCACCACCTCC
AACATCAGTTCCTAGCGCCGAAGATCCTGTGACTGCTTCAAGTGACCCGAAAGCAGATGA
TGTTCAATCACCAAAAGCTTACACAACCGAGGATTACCTCAAGATTACGGAAGAGCAGCT
CAAAGCTTTGTCTCCAGGTGAAGCAGGCGATCAAACTCAGACTCAACAAACATCTTCTAC
CGAAGAAAGCCAACCCAAAGGTACATCAACGGCCACATCCCCTCCAAGACAAGATTGAAA
ACACCAAAAACTGACTTCGGGATGGATACTTTTTGATCTGCCAAAAGAAATGAAGCTGTT
AGCTCTCTCAGGACGTTTTTCTCAAATCATTATATGCAATCTTTAATATGGATTCAGAAA
TTGACTCATTTGTGTATTTATTTTCCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 15 15 15 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 25 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 10 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT90TF U 1
AF RR2FN24TF U 87
AF RR2BK81TF U 109
AF RR2EE31TF U 89
AF RR2BA27TF U 69
AF RR2CT90JQ C 310
AF RR2BA27JQ C 378
AF RR2EE31JQ C 496
BS 1 235 RR2CT90TF
BS 236 236 RR2BA27TF
BS 237 660 RR2CT90TF
BS 661 661 RR2BA27TF
BS 662 683 RR2CT90TF
BS 684 805 RR2BA27TF
BS 806 806 RR2CT90JQ
BS 807 891 RR2BA27TF
BS 892 892 RR2CT90JQ
BS 893 933 RR2BA27TF
BS 934 934 RR2CT90JQ
BS 935 945 RR2BA27TF
BS 946 946 RR2CT90JQ
BS 947 959 RR2BA27TF
BS 960 960 RR2CT90JQ
BS 961 971 RR2BA27TF
BS 972 975 RR2CT90JQ
BS 976 990 RR2BA27TF
BS 991 991 RR2CT90JQ
BS 992 1001 RR2BA27TF
BS 1002 1049 RR2CT90JQ

RD RR2CT90TF 683 0 0
GGATTCAGATATTCCCATAGGATAATTTAGATTTCCATTTTATCCTTTTTTTCTCCAAGC
TAATGGACATGGATTGGTCCTGATGAAGGTGAGGGAGTGAGTTATGTCTTAAAGATTCTT
CGAAGCTAACACAGACAAAAAAAAACTGTAATAATAAAAATTTCGAAGCTTCCCAATGGC
CATGGCCTCTCAGATTATAGCATCTTCTTCACCAACGATTACAAATAGGTCTCACTTTCT
CGCTTCTTACAAAACTTCGAAACCTTATCTCTCTTCATGTTTGGGTTGTTCTCCTCGTTT
CTCTCCTTACATTGGTCTAAAGCATATGGGCATCTCTATCTCGCCAAAATCTTCAAACCC
AGAGAAGAAGAGAAGATGTCGTAAAGGTATGGTGATTCGTGCGTCTCTATTTGGCGTTGG
AGCACCTGAGGCTTTGGTAATTGGTGTTGTTGCTTTGCTTGTCTTTGGTCCTAAAGGCCT
TGCAGAGGTAGCTCGAACTCTTGGGAAAACACTGCGTACATTTCAGCCCACTATTAGAGA
GCTACAGGATGTTTCAAGAGATTTCAAAAGCACCCTTGAGCGTGAGATTGGACTCGATGA
AATCTCAACTCCAAATGTATACAACCAGAACAGAATGAACACTCCACCACCACCACCTCC
CACATCAGTTCCTAGCGCCGAAG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2FN24TF 681 0 0
G
GGTGAGGGAGTGAGTTATGTCTTAAAGATTCTTCGAAGCTAACACAGACAAAAAAAAACT
GTAATAATAAAAATTTCGAAGCTTCCCAATGGCCATGGCCTCTCAGATTATAGCATCTTC
TTCACCAACGATTACAAATAGGTCTCACCTTCTCGCTTCTTACAAAACTTCGAAACCTTA
TCTCTCTTCATGTTTGGGTTGTTCTCCTCGTTTCTCTCCTTACATTGGTCTAAAGCATAT
GGGCATCTCTATCTCGCCAAAATCTTCAAACCCAGAGAAGAAGAGAAGATGTCGTAAAGG
TATGGTGATTCGTGCGTCTCTATTTGGCGTTGGAGCACCTGAGGCTTTGGTAATTGGTGT
TGTTGCTTTGCTTGTCTTTGGTCCTGAAGGCCTTGCAGAGGTATCTCGAACTCTTGGGAA
AACACTGCGTACATTTCAGCCCACTATTAGAGAGCTACAGGATGTTTCAAGAGATTTCAA
AAGCACCCTTGAGCGTGAGATTGGACTCGATGAAATCTCAACTCCAAATGTATACAACCA
GAACAGAATGAACACTCCACCACCACCACCTCCAACATCAGTTCCTAGCGCCGAAGATCC
TGTGACTGCTTCAAGTGACCCGAA******TGATGTTCAATCACCAAAAGCTTACACAAC
CGAG*ATTACCTCAAGATTA

QA 2 681 2 681
DS 

RD RR2BK81TF 685 0 0
GG
AAAGATTCTTCGAAGCTAACACAGACAAAAAAAAACTGTAATAATAAAAATTTCGAAGCT
TCCCAATGGCCATGGCCTCTCAGATTATAGCATCTTCTTCACCAACGATTACAAATAGGT
CTCACCTTCTCGCTTCTTACAAAACTTCGAAACCTTATCTCTCTTCATGTTTGGGTTGTT
CTCCTCGTTTCTCTCCTTACATTGGTCTAAAGCATATGGGCATCTCTATCTCGCCAAAAT
CTTCAAACCCAGAGAAGAAGAGAAGATGTCGTAAAGGTATGGTGATTCGTGCGTCTCTAT
TTGGCGCTGGAGCACCTGAGGCTTTGGTAATTGGTGTTGTTGCTTTGCTTGTCTTTGGTC
CTAAAGGCCTTGCAGAGGTAGCTCGAACTCTTGGGAAAACACTGCGTACATTTCAGCCCA
CTATTAGAGAGCTACAGGATGTTTCAAGAGATTTCAAAAGCACCCTTGAGCGTGAGATTG
GACTCGATGAAATCTCAACTCCAAATGTATACAACCAGAACAGAATGAACACTCCACCAC
CACCACCTCCAACATCAGTTCCTAGCGCCGAAGATCCTGTGACTGCTTCAAGTGACCCGA
AAGCAGATGATGTTCAATCACCAAAAGCTTACACAACCGAGGATTACCTCAAGATTACG*
*AGAGCAGCTCAA*GCTTTGTCT

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR2EE31TF 706 0 0
GG
GAGGGAGTGAGTTATGTCTTAAAGATTCTTCGAAGCTAACACAGACAAAAAAA**CTGTA
ATAATAAAAATTTCGAAGCTTCCCAATGGCCATGGCCTCTCAGATTATAGCATCTTCTTC
ACCAACGATTACAAATAGGTCTCACCTTCTCGCTTCTTACAAAACTTCGAAACCTTATCT
CTCTTCATGTTTGGGTTGTTCTCCTCGTTTCTCTCCTTACATTGGTCTAAAGCATATGGG
CATCTCTATCTCGCCAAAATCTTCAAACCCAGAGAAGAAGAGAAGATGTCGTAAAGGTAT
GGTGATTCGTGCGTCTCTATTTGGCGTTGGAGCACCTGAGGCTTTGGTAATTGGTGTTGT
TGCTTTGCTTGTCTTTGGTCCTAAAGGCCTTGCAGAGGTAGCTCGAACTCTTGGGAAAAC
ACTGCGTACATTTCAGCCCACTATTAGAGAGCTACAGGATGTTTCAAGAGATTTCAAAAG
CACCCTTGAGCGTGAGATTGGACTCGATGAAATCTCAACTCCAAATGTATACAACCAGAA
CAGAATGAACACTCCACCACCACCACCTCCAACATCAGTTCCTAGCGCCGAAGATCCTGT
GACTGCTTCAAGTGACCCGAAAGCAGATGATGTTCAATCACCAAAAGCTTACACAACCGA
G*ATTACCTCAAGATTACGG*AGAGCAGCTCAAAGCTTTGTCTC

QA 3 706 3 706
DS 

RD RR2BA27TF 933 0 0
GG
GGATTGGTCCTGATGAAGGTGAGGGAGTGAGTTATGTCTTAAAGATTCTTCGAAGCTAAC
ACAGACAAAAAAAAACTGTAATAATAAAAATTTCGAAGCTTCCCAATGGCCATGGCCTCT
CAGATTATAGCATCTTCTTCACCAACGATTACAAATAGGTCTCACCTTCTCGCTTCTTAC
AAAACTTCGAAACCTTATCTCTCTTCATGTTTGGGTTGTTCTCCTCGTTTCTCTCCTTAC
ATTGGTCTAAAGCATATGGGCATCTCTATCTCGCCAAAATCTTCAAACCCAGAGAAGAAG
AGAAGATGTCGTAAAGGTATGGTGATTCGTGCGTCTCTATTTGGCGTTGGAGCACCTGAG
GCTTTGGTAATTGGTGTTGTTGCTTTGCTTGTCTTTGGTCCTAAAGGCCCTGCAGAGGTA
GCTCGAACTCTTGGGAAAACACTGCGTACATTTCAGCCCACTATTAGAGAGCTACAGGAT
GTTTCAAGAGATTTCAAAAGCACCCTTGAGCGTGAGATTGGACTCGATGAAATCTCAACT
CCAAATGTATACAACCAGAACAGAATGAACACTCCACCACCACCACCTCCAACATCAGTT
CCTAGCGCCGAAGATCCTGTGACTGCTTCAAGTGACCCGAAAGCAGATGATGTTCAATCA
CCAAAAGCTTACACAACCGAGGATTACCTCAAGATTACGGAAGAGCAGCTCAAAGCTTTG
TCTCCAGGTGAAGCACGCGATCAAACTCAGACTCAACAAACATCTTCTACCGAAGAAAGC
CAACCCAAAGGTACATCAACGGCCACATCCCCTCCAAGACA*GATTGAAAACACCAAAAA
CTGACTTCGGGATGGATACTTTT*GATCTGCCAAA*GAAATGAAGCTGT*AGCTCTCTCA
GACGTTTTTTCTCAAATCAT*ATATGCAATC

QA 3 933 3 933
DS 

RD RR2CT90JQ 740 0 0
CATTGGTCTAAAGCATATGGGCATCTCTATCTCGCCAAAATCTTCAAACCCAGAGAAGAA
GAGAAGATGTCGTAAAGGTATGGTGATTCGTGCGTCTCTATTTGGCGTTGGAGCACCTGA
GGCTTTGGTAATTGGTGTTGTTGCTTTGCTTGTCTTTGGTCCTAAAGGCCTTGCAGAGGT
AGCTCGAACTCTTGGGAAAACACTGCGTACATTTCAGCCCACTATTAGAGAGCTACAGGA
TGTTTCAAGAGATTTCAAAAGCACCCTTGAGCGTGAGATTGGACTCGATGAAATCTCAAC
TCCAAATGTATACAACCAGAACAGAATGAACACTCCACCACCACCACCTCCAACATCAGT
TCCTAGCGCCGAAGATCCTGTGACTGCTTCAAGTGACCCGAA******TGATGTTCAATC
ACCAAAAGCTTACACAACCGAGGATTACCTCAAGATTACGGAAGAGCAGCTCAAAGCTTT
GTCTCCAGGTGAAGCAGGCGATCAAACTCAGACTCAACAAACATCGTCTACCGAAGAAAG
CCAACCCAAAGGTACATCAACGGCCACATCCCCTCCAAGACAAGATTGAAAACACCAAAA
ACTGACTTCGGGATGGATACTTTTTGATCTGCCAAAAGAAATGAAGCTGTTAACTCTCTC
AGGACGTTTTTCTCAAACCATTATGTACAATCTTTAATATGGATTCAGAAATTGACTCAT
TTGTGTATTTATTTTCCCAT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2BA27JQ 655 0 0
GTCGTAAAGGTATGGTGATTCGTGCGTCTCTATTTGGCGTTGGAGCACCTGAGGCTTTGG
TAATTGGTGTTGTTGCTTTGCTTGTCTTTGGTCCTAAAGGCCCTGCAGAGGTAGCTCGAA
CTCTTGGGAAAACACTGCGTACATTTCAGCCCACTATTAGAGAGCTACAGGATGTTTCAA
GAGATTTCAAAAGCACCCTTGAGCGTGAGATTGGACTCGATGAAATCTCAACTCCAAATG
TATACAACCAGAACAGAATGAACACTCCACCACCACCACCTCCAACATCAGTTCCTAGCG
CCGAAGATCCTGTGACTGCTTCAAGTGACCCGAAAGCAGATGATGTTCAATCACCAAAAG
CTTACACAACCGAGGATTACCTCAAGATTACGGAAGAGCAGCTCAAAGCTTTGTCTCCAG
GTGAAGCAGGCGATCAAACTCAGACTCAACAAACATCTTCTACCGAAGAAAGCCAACCCA
AAGGTACATCAACGGCCACATCCCCTCCAAGACAAGATTGAAAACACCAAAAACTGACTT
CGGGATGGATACTTTTTGATCTGCCAAAAGAAATGAAGCTGTTAGCTCTCTCAGGACGTT
TTTCTCAAATCATTATATGCAATCTTTAATATGGATTCAGAAATTGACTCATTTG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2EE31JQ 537 0 0
AACTCTTGGGAAAACACTGCGTACATTTCAGCCCACTATTAGAGAGCTACAGGATGTTTC
AAGAGATTTCAAAAGCACCCTTGAGCGTGAGATTGGACTCGATGAAATCTCAACTCCAAA
TGTATACAACCAGAACAGAATGAACACTCCACCACCACCACCTCCAACATCAGTTCCTAG
CGCCGAAGATCCTGTGACTGCTTCAAGTGACCCGAAAGCAGATGATGTTCAATCACCAAA
AGCTTACACAACCGAGGATTACCTCAAGATTACGGAAGAGCAGCTCAAAGCTTTGTCTCC
AGGTGAAGCAGGCGATCAAACTCAGACTCAACAAACATCTTCTACCGAAGAAAGCCAACC
CAAAGGTACATCAACGGCCACATCCCCTCCAAGACAAGATTGAAAACACCAAAAACTGAC
TTCGGGATGGATACTTTTTGATCTGCCAAAAGAAATGAAGCTGTTAGCTCTCTCAGGACG
TTTTTCTCAAACCATTATGTGCAATCTTTAATATGGATTCAGAAATTGACTCATTTG

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 8

CO CL559Contig1 1049 8 33 U
AAAAAACAAGAAATCAAGAAGAAAATATAACGTAGAAGCATGCATAATTCACATTCATCT
AAAAAAAGCCTTCAAGGACAATTACAACTCCAACAACAAACCCAAATACAACATAAATCA
ACGGACAAGGGTTCATCTAAAAAGAAGATCCAACGGGCACACAGAAATTCAATTACGAAG
AGAAATAAAAACAAATCATATCACAACATTTAATTTTCAGCGTCTTCAGTAATCAGTGGT
GGGCAATTGCTCGTGGCCGTTTTCGATGATGTAAACAAAGTCGTAGATGATTCCGGCGAG
ACCACCACCAACAAGAGGACCAACCCAGTAAATCCAGTGGTTGCTCCATGACCAGCTCAC
GACGGCTGGTCCAAAAGCGACGGCTGGGTTCATGGAGGCTCCGCTGAAAGCTCCACCCGC
GAGGATGTTAGCTCCAACGATGAAACCTATGGCTATTGGTGCGATTGTTCCGAGGCTACC
GTTTTTGGGGTCGATGGCTGTGGCGTAGACGGTGTAGACGAGCCCGAAGGTCATCACGAT
CTCGAAGACGAGACCGCTCAAGGTTCCAACTCCAGCGGAGAGACCGAACGCTGGAACTGC
CAAACCACCGGTGGCGAATTGAAGGAGGAAACAAGCGGCGACTGAGCCAAGAAGCTGAGC
GATCCAGTAAAGAAGGCCACGGAGGAGAGTGATGTTTCCACCGAGGAAGGCACCGAAGGT
AACGGCAGGGTTAACGTGTCCACCGGAGATGTTGGCACCGACAGAAACAGCAACGAAGAG
ACCGAAAGCATGAGCTAAGGCAGCGGCGACGAGGCCTGAAGGAGTGGTGGCTCCATTGTC
AGTGAGCTTGTTGAAAGCAATCCCGGAGCCTGAGCCGGCGAAGACAAAGATCAAAGTCGA
GATAAACTCAGCGAGGGCCGCCCTAAGTGCGCTGGGGTGAGTCACTTCTTCTTGGACTCC
ACCGATGGCAATGTTTCTGGCCGGCATGATCGCAGAGATTTAGGTTAAAACGTTTTCTGA
TGGGTTTATTTATGTGGTGATTAGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ41TF C 28
AF RR2GE73JQ U 1
AF RR2C040JQ U 29
AF RR2D270JQ U 29
AF RR2CM46JQ U 29
AF RR2D270TF C 190
AF RR2GE73TF C 296
AF RR2CM46TF C 338
BS 1 151 RR2GE73JQ
BS 152 152 RR2C040JQ
BS 153 178 RR2GE73JQ
BS 179 179 RR2C040JQ
BS 180 255 RR2GE73JQ
BS 256 256 RR2C040JQ
BS 257 309 RR2GE73JQ
BS 310 310 RR2C040JQ
BS 311 363 RR2GE73JQ
BS 364 364 RR2C040JQ
BS 365 372 RR2GE73JQ
BS 373 373 RR2C040JQ
BS 374 435 RR2GE73JQ
BS 436 436 RR2C040JQ
BS 437 450 RR2GE73JQ
BS 451 451 RR2C040JQ
BS 452 453 RR2GE73JQ
BS 454 454 RR2C040JQ
BS 455 548 RR2GE73JQ
BS 549 579 RR2CM46JQ
BS 580 580 RR2D270TF
BS 581 704 RR2CM46JQ
BS 705 858 RR2D270TF
BS 859 861 RR2GE73TF
BS 862 862 RR2CM46TF
BS 863 864 RR2GE73TF
BS 865 865 RR2CM46TF
BS 866 960 RR2GE73TF
BS 961 961 RR2CM46TF
BS 962 988 RR2GE73TF
BS 989 989 RR2CM46TF
BS 990 1030 RR2GE73TF
BS 1031 1049 RR2CM46TF

RD RR2FZ41TF 295 0 0
GC
ACGTAGAAGCATGCATAATTCACATTCATCTAAAAAAAGCCTTCAAGGACAATTACAACT
CCAACAACAAACCCAAATACAACATAAATCAACGGACAAGGGTTCATCTAAAAAGAAGAT
CCAACGGGCACACAGAAATTCAATTACGATGAGAAATAAAAACAAATCATATCACAACAT
TTAATTTTCAGCGTCTTCAGTAATCAGTGGTGGGCAATTGCTCGTGACCGTTTTCGATGA
TGTAAACAAAGTCGTAGATGATTCCGGCGAGACCACCACCGACAAGAGGACC
C

QA 3 294 3 294
DS 

RD RR2GE73JQ 548 0 0
AAAAAACAAGAAATCAAGAAGAAAATATAACGTAGAAGCATGCATAATTCACATTCATCT
AAAAAAAGCCTTCAAGGACAATTACAACTCCAACAACAAACCCAAATACAACATAAATCA
ACGGACAAGGGTTCATCTAAAAAGAAGATCCGACGGGCACACAGAAATTCAATTACGATG
AGAAATAAAAACAAATCATATCACAACATTTAATTTTCAGCGTCTTCAGTAATCAGTGGT
GGGCAATTGCTCGTGACCGTTTTCGATGATGTAAACAAAGTCGTAGATGATTCCGGCGAG
ACCACCACCGACAAGAGGACCAACCCAGTAAATCCAGTGGTTGCTCCATGACCAGCTCAC
GACAGCTGGTCCGAAAGCGACGGCTGGGTTCATGGAGGCTCCGCTGAAAGCTCCACCCGC
GAGGATGTTAGCTCCGACGATGAAACCTATTGCGATTGGTGCGATTGTTCCGAGGCTACC
GTTTTTGGGGTCGATGGCTGTGGCGTAGACGGTGTAGACGAGCCCGAAGGTCATCACGAT
CTCGAAGA

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2C040JQ 518 0 0
A
ACGTAGAAGCATGCATAAATCACATTCATCTAAAAAA*GCCTTCAAGGACAATTACAACT
CCAACAACAAACCCAAATACAACATAAATCAACGGACAAGGGTTCATCTAAAAAGAAGAT
CCAACGGGCACACAGAAATTCAATTACGAAGAGAAATAAAAACAAATCATATCACAACAT
TTAATTTTCAGCGTCTTCAGTAATCAGTGGTGGGCAATTGCTCGTGGCCGTTTTCGATGA
TGTAAACAAAGTCGTAGATGATTCCGGCGAGACCACCACCAACAAGAGGACCAACCCAGT
AAATCCAGTGGTTGCTCCATGACCAGCTCACGACGGCTGGTCCAAAAGCGACGGCTGGGT
TCATGGAGGCTCCGCTGAAAGCTCCACCCGCGAGGATGTTAGCTCCAACGATGAAACCTA
TGGCTATTGGTGCGATTGTTCCGAGGCTACCGTTTTTGGGGTCGATGGCTGTGGCGTAAA
CGGTGTAAACGAGCCCGAAGGTCATCACGATCTCGAA

QA 2 518 2 518
DS 

RD RR2D270JQ 518 0 0
AG
CGTAGAAGCATGCATAAGTCACATTCATCTAAAAAA*GCCTTCAAGGACAATTACAACTC
CAACAACAAACCCAAATACAACATAAATCAACGGACAAGGGTTCATCTAAAAAGAAGATC
CAACGGGCACACAGAAATTCAATTACGAAGAGAAATAAAAACAAATCATATCACAACATT
TAATTTTCAGCGTCTTCAGTAATCAGTGGTGGGCAATTGCTCGTGGCCGTTTTCGATGAT
GTAAACAAAGTCGTAGATGATTCCGGCGAGACCACCACCAACAAGAGGACCAACCCAGTA
AATCCAGTGGTTGCTCCATGACCAGCTCACGACGGCTGGTCCAAAAGCGACGGCTGGGTT
CATGGAGGCTCCGCTGAAAGCTCCACCCGCGAGGATGTTAGCTCCAACGATGAAACCTAT
GGCTATTGGTGCGATTGTTCCGAGGCTACCGTTTTTGGGGTCGATGGCTGTGGCGTAAAC
GGTGTAAACGAGCCCGAAGGTCATCACGATCTCGAA

QA 3 518 3 518
DS 

RD RR2CM46JQ 676 0 0
A
ACGTAGAAGCATGCATAAGTCACATTCATCTAAAAAA*GCCTTCAAGGACAATTACAACT
CCAACAACAAACCCAAATACAACATAAATCAACGGACAAGGGTTCATCTAAAAAGAAGAT
CCAACGGGCACACAGAAATTCAATTACGAAGAGAAATAAAAACAAATCATATCACAACAT
TTAATTTTCAGCGTCTTCAGTAATCAGTGGTGGGCAATTGCTCGTGGCCGTTTTCGATGA
TGTAAACAAAGTCGTAGATGATTCCGGCGAGACCACCACCAACAAGAGGACCAACCCAGT
AAATCCAGTGGTTGCTCCATGACCAGCTCACGACGGCTGGTCCAAAAGCGACGGCTGGGT
TCATGGAGGCTCCGCTGAAAGCTCCACCCGCGAGGATGTTAGCTCCAACGATGAAACCTA
TGGCTATTGGTGCGATTGTTCCGAGGCTACCGTTTTTGGGGTCGATGGCTGTGGCGTAAA
CGGTGTAAACGAGCCCGAAGGTCATCACAATCTCGAAGACGAGACCGCTCAAGGTTCCAA
CTCCAGCGGAAAGACCGAACGCTGGAACTGCCAAACCACCGGTGGCGAATTGAAGGAGGA
AACAAGCGGCGACTGAGCCAAGAAGCTGAGCGATCCAGTAAAGAAGGCCACGGAGGAGAG
TGATGTTTCCACCGA

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR2D270TF 670 0 0
AACAAATCATATCACAACATTTAATTTTCAGCGTCTTCAGTAATCAGTGGTGGGCAATTG
CTCGTGGCCGTTTTCGATGATGTAAACAAAGTCGTAGATGATTCCGGCGAGACCACCACC
AACAAGAGGACCAACCCAGTAAATCCAGTGGTTGCTCCATGACCAGCTCACGACGGCTGG
TCCAAAAGCGACGGCTGGGTTCATGGAGGCTCCGCTGAAAGCTCCACCCGCGAGGATGTT
AGCTCCAACGATGAAACCTATGGCTATTGGTGCGATTGTTCCGAGGCTACCGTTTTTGGG
GTCGATGGCTGTGGCGTAGACGGTGTAGACGAGCCCGAAGGTCATCACGATCTCGAAGAC
GAGACCGTTCAAGGTTCCAACTCCAGCGGAGAGACCGAACGCTGGAACTGCCAAGCCACC
GGTGGCGAATTGAAGGAGGAAACAAGCGGCGACTGAGCCAAGAAGCTGAGCAATCCAGTA
AAGAAGGCCACGGAGGAGAGTGATGTTTCCACCGAGGAAGGCACCGAAGGTAACGGCAGG
GTTAACGTGTCCACCGGAGATGTTGGCACCGACAGAAACAGCAACGAAGAGACCGAAAGC
ATGAGCTAAGGCAGCGGCGACGAGGCCTGAAGGAGTGGTGGCTCCATTGTCAGTGAGCTT
GTTGAAAGC
C

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2GE73TF 737 0 0
GCGAGACCACCAC*GACAAGAGGACCAACCCAGTAAATCCAGTGGT*GCTCCATGACCAG
CTCACGACAGCTGGTC*GAAAGCGACGGCTGGGTTCATGGAGGCTCCGCTGAAAGCTCCA
CCCGCGAGGATGTTAGCTCCGACGATGAAACCTATTGCGATTGGTGCGATTGTTCCGAGG
CTACCGTTTTTGGGGTCGATGGCTGTGGCGTAGACGGTGTAGACGAGCCCGAAGGTCATC
ACGATCTCGAAGACGAGACCGTTTAAGGTTCCAACTCCTGCGGAGAGACCGAACGCTGGA
ACTGCCAAGCCACCGGTGGCGAATTGAAGGAGGAAACAAGCGGCGACTGAGCCAAGAAGC
TGAGCAATCCAATAGAGAATACCACGGAGGAGTGTGATGTTTCCACCGAGGAAAGCACCG
AAGGTAACGGCAGGGTTAACGTGTCCACCGGAGATGTTAGCACCGACGGAAACAGCAACG
AAGAGACCGAAAGCATGAGCTAAGGCAGCGGCGACGAGGCCTGAAGGAGTGGTGGCTCCA
TTGTCAGTGAGCTTGTTGAAAGCAATTCCTGAGCCTGAGCCGGCGAAGACAAAGATCAAA
GTCGAGATAAACTCAGCGAGGGCCGCCCTAAGTGCGCTGGGGTGAGTCACTTCTTCTTGG
ACTCCGCCGATGGCAATGTTTCTGGCCGGCATGGTCGCAGAGATTTAGGTTAAAACGTTT
TCTGATGGGTTTATT
GA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2CM46TF 712 0 0
AGTGGTGCT
CATGACCAGCTCACGACGGCTGGTCCAAAAGCGACGGCTGG*TTCATGGAGGCTCCGCTG
AAAGCTCCACCCGCGAGGATGT*AGCTCCAACGATGAAACCTATGGCTATTGGTGCGATT
GTTCCGAGGCTACCGTTTTTGGGGTCGATGGCTGTGGCGTAGACGGTGTAGACGAGCCCG
AAGGTCATCACAATCTCGAAGACGAGACCGCTCAAGGTTCCAACTCCAGCGGAGAGACCG
AACGCTGGAACTGCCAAACCACCGGTGGCGAATTGAAGGAGGAAACAAGCGGCGACTGAG
CCAAGAAGCTGAGCGATCCAGTAAAGAAGGCCACGGAGGAGAGTGATGTTTCCACCGAGG
AAGGCACCGAAGGTAACGGCAGGGTTAACGTGTC*ACCGGAGATGTTGGCACCGACAGAA
ACAGCAACGAAGGGACCGAAAGCATGAGCTAAGGCAGCGGCGACGAGGCCTGAAGGAGTG
GTGGCTCCATTGTCAGTGAGCTTGTTGAAAGCAATCCCGGAGCCTGAGCCGGCGAAGACA
AAGATCAAAGTCGAGATAAACTCAGCGAGGGCCGCCCTAAGTGCGCTGGGGTGAGTCACT
TCTTCTTGGACTCCACCGATGGCAATGTTTCTGGCCGGCATGATCGCAGAGATTTAGGTT
AAAACGTTTTCTGATGGGTTTATTTATGTGGTGATTAGTCTCC

QA 10 712 10 712
DS 



AS 3 10

CO CL560Contig1 922 4 6 U
AAAGAAGAGTAAAAATTGCTCCCAATGTCTTAAACCATTCATAAAAGAAATATCCAAAAG
GGTATTTCGACAATAATAATAACA******AAACAGTCTTTGGTTTTTGAGCGACTCTAT
AGAAAGGAGAAAGTAAAAAAAGACCAAAGTTGTTCAAAGATACCGGGCAGGCAGGCTCTG
CGACTCCGAAACAAACTTAAAATTTTAAAAAGAAAAGACTTTAAAACATTTTGATATATA
TATATAAACACGTAACGACGCCTCAAGTACCTTCTTCTTCTTTTAGACTTCTGCTTTCTC
TCTTTCTCT***ACAATAGATTTGATCTTTTCAGTTGCACTCATGGGCGGTGAAGGTGCG
GCCTCACTGGTGTCTTTGATGGGCTTACCCTTATTGGGAGTGCGCCCAAGACCATACCAC
TGCAGTGAAGTGCAGTGATTGCACTATCCGCCATCGCAAACTCAACAAAAGCAATGCGGG
TATGGTTGTGATAGTCTCCAAGCCTCAGACGAAAAACCTCTCCGCAAATCATTTCAAAGA
AGCCTTTCAACTCAACTTGACTAATCCGCTTGTCAATGTTGGTACAGTAAACAGTCCTCA
GGCACATCTCACGCTCACCCTCAGACCGGGGAAGGAAAGTAGGGTTAACAGGTGCAATAG
CGGTCTTGGAAGGGAGCACCTTAAGAGGGTAAAAACCAAGCACCGTTCCTGACATGCTCA
AGGCAGCCCTAGCTCCCTCTTCATTTGTGAACTCAACGAAAGCGAAACGGAGGATGGAGT
TTGTATCACCGCATACACGACAATCAACAACCTGTCCACAGTTAACAAAGACACCAGCTA
GGTTCTCCTCAGTAACCTGACGATCGATATCAGAGACATAAACAGTTCTCTTGATACATC
TTCCTTCTGAGCAAGCTGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 
10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G793JQ U 18
AF RR2D144JQ U 27
AF RR2AD30JQ U 1
AF RR2CF14JQ U 18
BS 1 237 RR2AD30JQ
BS 238 238 RR2G793JQ
BS 239 754 RR2AD30JQ
BS 755 755 RR2CF14JQ
BS 756 893 RR2AD30JQ
BS 894 922 RR2CF14JQ

RD RR2G793JQ 390 0 0
GCTCCCAATGTCTTAAACCATTCATAAAAGAAATATCCAAAAGGGTATTTCGACAATAAT
AATAACA******AAACAGTCTTTGGTTTTTGAGCGACTCTATAGAAAGGAGAAAGTAAA
AAAAGACCAAAGTTGTTCAAAGATACCGGGCAGGCAGGCTCTGCGACTCCGAAACAAACT
TAAAATTTTAAAAAGAAAAGACTTTAAAACATTTTGATATATATATATAAACACGTAACG
ACGCCTCAAGTACCTTCTTCTTCTTTTAGACTTCTGCTTTCTCTCTTTCTCT***ACAAT
AGATTTGATCTTTTCAGTTGCACTCATGGGCGGTGAAGGTGCGGCCTCACTGGTGTCTTT
GATGGGCTTACCCTTATTGGGAGTGCGCCC

QA 1 390 1 390
DS 

RD RR2D144JQ 595 0 0
GTCTTAAACCATTCATAAAAGAAATATCCAAAAGGGTATTTCGACAATAATAATAACAAA
GGAAAAACAGTCTTTGGTTTTTGAGCGACTCTATAGAAAGGAGAAAGTTAAAAAAGACCA
AAGTTGTTCAAAGATACCGGGCAGGCAGGCTCTGCGACTCCGAAACAAACTTAAAATTTT
AAAAAGAAAAGACTTTAAAACATTTTGATATATATATAAACACACATAACGACGCCTCAA
GTACCTTCTTCTTCTTTTAGACTTCTGCTTTCTCTCTTTCTCTTCTACAATAGATTTGAT
CTTTTCAGTTGCACTCATGGGCGGTGAAGGTGCGGCCTCACTGGTGTCTTTGATGGGCTT
ACCCTTATTGGGAGTGCGCCCAAGACCATACCACTGCAGTGAAGTGCAGTGATTGCACTA
TCCGCCATCGCAAACTCAACAAAAGCAATGCGGGTATGGTTGTGATAGTCTCCAAGCCTC
AGACGGAAAACCTCTCCGCAAATCATTTCAAAGAAGCCTTTCAACTCAACTTGACTAATC
CGCTTGTCAATGTTGGTACAGTAAACAGTCCTCAGGCACATCTCACGCTCACCCT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2AD30JQ 893 0 0
AAAGAAGAGTAAAAATTGCTCCCAATGTCTTAAACCATTCATAAAAGAAATATCCAAAAG
GGTATTTCGACAATAATAATAACA******AAACAGTCTTTGGTTTTTGAGCGACTCTAT
AGAAAGGAGAAAGTAAAAAAAGACCAAAGTTGTTCAAAGATACCGGGCAGGCAGGCTCTG
CGACTCCGAAACAAACTTAAAATTTTAAAAAGAAAAGACTTTAAAACATTTTGATATGTA
TATATAAACACGTAACGACGCCTCAAGTACCTTCTTCTTCTTTTAGACTTCTGCTTTCTC
TCTTTCTCT***ACAATAGATTTGATCTTTTCAGTTGCACTCATGGGCGGTGAAGGTGCG
GCCTCACTGGTGTCTTTGATGGGCTTACCCTTATTGGGAGTGCGCCCAAGACCATACCAC
TGCAGTGAAGTGCAGTGATTGCACTATCCGCCATCGCAAACTCAACAAAAGCAATGCGGG
TATGGTTGTGATAGTCTCCAAGCCTCAGACGAAAAACCTCTCCGCAAATCATTTCAAAGA
AGCCTTTCAACTCAACTTGACTAATCCGCTTGTCAATGTTGGTACAGTAAACAGTCCTCA
GGCACATCTCACGCTCACCCTCAGACCGGGGAAGGAAAGTAGGGTTAACAGGTGCAATAG
CGGTCTTGGAAGGGAGCACCTTAAGAGGGTAAAAACCAAGCACCGTTCCTGACATGCTCA
AGGCAGCCCTAGCTCCCTCTTCATTTGTGAACTCGACGAAAGCGAAACGGAGGATGGAGT
TTGTATCACCGCATACACGACAATCAACAACCTGTCCACAGTTAACAAAGACACCAGCTA
GGTTCTCCTCAGTAACCTGACGATCGATATCAGAGACATAAACAGTTCTCTTG

QA 1 893 1 893
DS 

RD RR2CF14JQ 905 0 0
GCTCCCAATGTCTTAAACCATTCATAAAAGAAATATCCAAAAGGGTATTTCGACAATAAT
AATAACA******AAACAGTCTTTGGTTTTTGAGCGACTCTATAGAAAGGAGAAAGTAAA
AAAAGACCAAAGTTGTTCAAAGATACCGGGCAGGCAGGCTCTGCGACTCCGAAACAAACT
TAAAATTTTAAAAAGAAGAGACTTTAAAACATTTTGATATATATATATAAACACGTAACA
ACGCCTCAAGTACCTTCTTCTTCTTTTAGACTTCTGCTTTCTCTCTTTCTCT***ACAAT
AGATTTGATCTTTTCAGTTGCACTCATGGGCGGTGAAGGTGCGGCCTCACTGGTGTCTTT
GATGGGCTTACCCTTATTGGGAGTGCGCCCAAGACCATACCACTGCAGTGAAGTGCAGTG
ATTGCACTATCCGCCATCGCAAACTCAACAAAAGCAATGCGGGTATGGTTGTGATAGTCT
CCAAGCCTCAGACGAAAAACCTCTCCGCAAATCATTTCAAAGAAGCCTTTCAACTCAACT
TGAATAATCCGCTTGTCAATGTTAGTACAGTAAACAGTCCTCAGGCACATCTCACGCTCA
CCCTCAGACCGGGGAAGGAAAGTAGGGTTAACAGGTGCAATAGCGGTCTTGGAAGGGAGC
ACCTTAAGAGGGTAAAAACCAAGCACCGTTCCTGACATGCTCAAG*CAGCCCTAGCTCCC
TCTTCATTTGTGAACTCAACGAAAGCGAAACGGAGGATGGAGTTTGTATCACCGCATACA
CGACAATCAACAACCTGTCCACAGTTAC**AAGACACCAGCTAGGT*CTCCTCAGTA*CC
TGATGATCGATATCAGAGACATAA*CAGT*CTCTTGATACATCTTCCTTCTGAGCAAGCT
GGTTC

QA 1 905 1 905
DS 



CO CL560Contig2 767 4 7 U
GGACATTTTGATCGAGACATCTGCAACCTCCTAACTCGTTTTCAACTCTCTTTTGGTCCG
ATCATGGCCGTCGCTGAGAATGCTGGTCTCAAAGTGGACTCTTCTGGTCAGAATTTAGAC
AACAACAACACTTCTTCTTCAGCTTCCGACACGACGACGAATCCCTCTGATGATCAGAGC
CCTAAATCCGATTCCTTTCTCGACTCATCGGATCCTCCGACTCCAGATTCCGACGATCGG
ACCAATGAGACTGCCGGAAAGAGTCAGACCGTGAATGGGTTTAACGGAGGAGACGGTGTG
AAGGGCGAGATCAAGAACCTCTCCGATGCGTTCTCCAAGCTCAATCCGATGGCTAAGGAG
TTTGTTCCTCCTTCGCTTGCTCGAAGTCAATCTGGAGGGGTTTCGAGAAATGGGTTAGGG
TTTACTAACGGTTTCACGGCAGCGCAGCCTGTTGTTGTTGCAGATGGAAATGGTCAATTC
GCCAGAAGGAGAAGGAGCTTTGGACAAGGGAGGAGAAGAGTGAACAAAAGAACCAGCTTG
GCTCAGAAGGAAGATGTTATCAAGAGAACTGTTTATGTCTCTGATATCGATCATCAGGTT
ACTGAGGAGAACCTAGCTGGTGTCTTTGTTAACTGTGGACAGGTTGTTGATTGTCGTGTA
TGCGGTGATACAAACTCCATCCTCCGTTTCGCTTTCGTCGAGTTCACAAATGAAGAGGGA
GCTAGGGCTGCCTTGAGCATGTCAGAACGGTGCTTGGTTTTTACCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D144TF U 8
AF RR2G793TF U 3
AF RR2AD30TF U 1
AF RR2CF14TF U 3
BS 1 342 RR2AD30TF
BS 343 343 RR2CF14TF
BS 344 475 RR2AD30TF
BS 476 476 RR2CF14TF
BS 477 592 RR2AD30TF
BS 593 593 RR2CF14TF
BS 594 767 RR2AD30TF

RD RR2D144TF 389 0 0
GG
GATCGAGACATCTGCAACCTCCTAACTCGTTTTCAACTCTCTTTTGGTCCGATCATGGCC
GTCGCTGAGAATGCTGGTCTCAAAGTGGACTCTTCTGGTCAGAATTTAGACAACA*****
*CTTCTTCTTCAGCTTCCGACACG*CGACGAATCCCTCTGATGATCAGAGCCCTAAATCC
GATTTCTTTCTCGACTCATCGGATCCTCCGACTCCAGATTCCGACGATCGGACCAATGGG
ACTGCCGGAAAGGGTCAGACCGCGAATGGGTTTAACGGAGGAGACGGTGTGAAGGGCGAG
ATCAAGAACCTCTCCGATGCGTTCTCCAAGCTCAATCCGATGGCTAAGGAGTT*GTTCCT
CCTTCGCTTGCTCGAA*TCAATCTGGA

QA 3 389 3 389
DS 

RD RR2G793TF 636 0 0
GGATTTT
GATCGAGACATCTGCAACCTCCTAACTCGTTTTCAACTCTCTTTTGGTCCGATCATGGCC
GTCGCTGAGAATGCTGGTCTCAAAGTGGACTCTTCTGGTCAGAATTTAGACAACAACAAC
ACTTCTTCTTCAGCTTCCGACACGACGACGAATCCCTCTGATGATCAGAGCCCTAAATCC
GATTCCTTTCTCGACTCATCGGATCCTCCGACTCCAGATTCCGACGATCGGACCAATGAG
ACTGCCGGAAAGAGTCAGACCGTGAATGGGTTTAACGGAGGAGACGGTGTGAAGGGCGAG
ATCAAGAACCTCTCCGATGCGTTCTCCAAGCTCAATCCGATGGCTAAGGAGTTTGTTCCT
CCTTCGCTTGCTCGAAGTCAATCTGGAGGGGTTTCGAGAAATGGGTTAGGGTTTACTAAC
GGTTTCACGGCAGCGCCGCCTGTTGTTGTTGCAGATGGAAATGGTCAATTCGCCAGAAGG
AGAAGGAGCTTTGGACAAGGGAGGAGAAGAGTGAACAAAAGAACCAGCTTGGCTCAGAAG
GAAGATGTTATCAAGAGAACTGTTTATGTCTCTGATATCGATCATCAGGTTACTGAGGAG
AACCTAGCTGGTGTCTTTGTTAACTGTGG

QA 8 636 8 636
DS 

RD RR2AD30TF 767 0 0
GGACATTTTGATCGAGACATCTGCAACCTCCTAACTCGTTTTCAACTCTCTTTTGGTCCG
ATCATGGCCGTCGCTGAGAATGCTGGTCTCAAAGTGGACTCTTCTGGTCAGAATTTAGAC
AACAACAACACTTCTTCTTCAGCTTCCGACACGACGACGAATCCCTCTGATGATCAGAGC
CCTAAATCCGATTCCTTTCTCGACTCATCGGATCCTCCGACTCCAGATTCCGACGATCGG
ACCAATGAGACTGCCGGAAAGAGTCAGACCGTGAATGGGTTTAACGGAGGAGACGGTGTG
AAGGGCGAGATCAAGAACCTCTCCGATGCGTTCTCCAAGCTCGATCCGATGGCTAAGGAG
TTTGTTCCTCCTTCGCTTGCTCGAAGTCAATCTGGAGGGGTTTCGAGAAATGGGTTAGGG
TTTACTAACGGTTTCACGGCAGCGCAGCCTGTTGTTGTTGCAGATGGAAATGGTCGATTC
GCCAGAAGGAGAAGGAGCTTTGGACAAGGGAGGAGAAGAGTGAACAAAAGAACCAGCTTG
GCTCAGAAGGAAGATGTTATCAAGAGAACTGTTTATGTCTCTGATATCGATCGTCAGGTT
ACTGAGGAGAACCTAGCTGGTGTCTTTGTTAACTGTGGACAGGTTGTTGATTGTCGTGTA
TGCGGTGATACAAACTCCATCCTCCGTTTCGCTTTCGTCGAGTTCACAAATGAAGAGGGA
GCTAGGGCTGCCTTGAGCATGTCAGAACGGTGCTTGGTTTTTACCCT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2CF14TF 739 0 0
GGATTTT
GATCGAGACATCTGCAACCTCCTAACTCGTTTTCAACTCTCTTTTGGTCCGATCATGGCC
GTCGCTGAGAATGCTGGTCTCAAAGTGGACTCTTCTGGTCAGAATTTAGACAACAACAAC
ACTTCTTCTTCAGCTTCCGACACGACGACGAATCCCTCTGATGATCAGAGCCCTAAATCC
GATTCCTTTCTCGACTCATCGGATCCTCCGACTCCAGATTCCGACGATCGGACCAATGAG
ACTGCCGGAAAGAGTCAGACCGTGAATGGGTTTAACGGAGGAGACGGTGTGAAGGGCGAG
ATCAAGAACCTCTCCGATGCGTTCTCCAAGCTCAATCCGATGGCTAAGGAGTTTGTTCCT
CCTTCGCTTGCTCGAAGTCAATCTGGAGGGGTTTCGAGAAATGGGTTAGGGTTTACTAAC
GGTTTCACGGCAGCGCAGCCTGTTGTTGTTGCAGATGGAAATGGTCAATTCGCCAGAAGG
AGAAGGAGCTTTGGACAAGGGAGGAGAAGAGTGAACAAAAGAACCAGCTTGGCTCAGAAG
GAAGATGTTATCAAGAGAACTGTTTATGTCTCTGATATCGATCATCAGGTTACTGAGGAG
AACCTAGCTGGTGTCTTTGTTAACTGTGGACAGGTTGTTGATTGTCGTGTATGCGGTGAT
ACAAACTCCATCCTCCGTTTCGCTTTCGTTGAGTTCACAAATGAAGAGG*AGCTAGGGCT
GCCTTGAGCATG

QA 8 739 8 739
DS 



CO CL560Contig3 438 2 3 U
GGCACTGCACTTCACTGCAGTGGTATGGTCTTGGGCGCACTCCCAATAAGGGTAAGCCCA
TCAAAGACACCAGTGAGGCCGCACCTTCACCGCCCATGAGTGCAACTGAAAAGATCAAAT
CTATTGTAGAGAAAGAGAGAAAGCAGAAGTCTAAAAGAAGAAGAAGGTACTTGAGGCGTC
GTTATGTGTTTATATATATATCAAATGTTTTAAAGTCTTTTCTTTTTAAAATTTTAAGTT
TGTTTCGGAGTCGCAGAGCCTGCCTGCCCGGTATCTTTGAACAACTTTGGTCTTTTTTAA
CTTTCTCCTTTCTATAGAGTCGCTCAAAAACCAAAGACTGTTTTTCCTTTGTTATTATTA
TTGTCGAAATACCCTTTTGGATATTTCTTTTATGAATGGTTTAAGACATTTGGAGCAGTC
TATACTCTTCTTTATTTC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2F149JQ C 1
AF RR2F149TF U 1
BS 1 2 RR2F149JQ
BS 3 433 RR2F149TF
BS 434 438 RR2F149JQ

RD RR2F149JQ 438 0 0
GGCACTGCACTTCACTGCAGTGGTATGGTCTTGGGCGCACTCCCAATAAGGGTAAGCCCA
TCAAAGACACCAGTGAGGCCGCACCTTCACCGCCCATGAGTGCAACTGAAAAGATCAAAT
CTATTGTAGAGAAAGAGAGAAAGCAGAAGTCTAAAAGAAGAAGAAGGTACTTGAGGCGTC
GTTATGTGTTTATATATATATCAAATGTTTTAAAGTCTTTTCTTTTTAAAATTTTAAGTT
TGTTTCGGAGTCGCAGAGCCTGCCTGCCCGGTATCTTTGAACAACTTTGGTCTTTTTTAA
CTTTCTCCTTTCTATAGAGTCGCTCAAAAACCAAAGACTGTTTTTCCTTTGTTATTATTA
TTGTCGAAATACCCTTTTGGATATTTCTTTTATGAATGGTTTAAGACATTTGGAGCAGTC
TATACTCTTCTTTATTTC

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR2F149TF 438 0 0
GG
CACTGCACTTCACTGCAGTGGTATGGTCTTGGGCGCACTCCCAATAAGGGTAAGCCCATC
AAAGACACCAGTGAGGCCGCACCTTCACCGCCCATGAGTGCAACTGAAAAGATCAAATCT
ATTGTAGAGAAAGAGAGAAAGCAGAAGTCTAAAAGAAGAAGAAGGTACTTGAGGCGTCGT
TATGTGTTTATATATATATCAAATGTTTTAAAGTCTTTTCTTTTTAAAATTTTAAGTTTG
TTTCGGAGTCGCAGAGCCTGCCTGCCCGGTATCTTTGAACAACTTTGGTCTTTTTTAACT
TTCTCCTTTCTATAGAGTCGCTCAAAAACCAAAGACTGTTTTTCCTTTGTTATTATTATT
GTCGAAATACCCTTTTGGATATTTCTTTTATGAATGGTTTAAGACATTTGGAGCAGTCTA
TACTCTTCTTT
ATTTC

QA 3 433 3 433
DS 



AS 1 8

CO CL561Contig1 1081 8 14 U
GAGTATAATGCTGCATCTCATTCAAAGGACAAAGCAGTAACGCAGCACATTACCGAAAAA
AACAACGTGTCACAAACGATTCAAAAATTACAAAACGATAAAATATAAAAATATATGTAA
ACAAGTCAAATATTGATAACATTCACGACGACGATGATTCTTAAAGTTCCGCTCCAGTTT
GATTTTGACTCTGGTGATCCTTTT*ATATAATATACATCGCATGTTCTTGTTTATCATCA
ATGCATACACAGATCTGCTCAAACCAAGTCAATAACCTTAGAGGGCCATCTCAGCCTGTA
ATGCAGCGAGTTCTTCTTCCTCGGCTGTCCGTTTAGGAGCAACAGGACGGACTGGTTGAC
GCCCTGGAACAGAAGGCATTGGTGTTGGCTGAAGAAGTTGTTCTTCAAGCTCTGCACCTT
CTAATTCTTCAAGCTCAGCTTCGAGCTCATCCTCATCGAAGTCAGCAGCCGCACCGATTG
GAGTAGACAAAGCTTCTTGGATCTGTTTCATGTTCTCTGTCTGCTCATTGATCTCGTCCA
TGGTCTTGTCTACATCATCTATGTTCGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGAAGCTC
CACTCCTCAACGCATCAACAGTTTCGGTTGTTGCTTTTGCGCCTTCTAACATAATCATTT
GATCATGAATACGGAGCTGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCATACAACCTCT
TCCTCTTCAAGCACTGAATAGCCGCGCGTTTGTTTTTAGAACGAGTGTATTCTTTGGCTT
TCTCGACCTCTTGTCCAGCTTTCTTTAACAGCACTTTCTCCTTCTTCTCTAGCATCTCAA
GCGTCTCGTTGAGCTTGTCTAATGTCTGGAGAGCATTACCCTCATGCTTTGGTTTCCCAA
ATAGCCGATTCATCATCTTTTTCCTTCTTCCTTTATTTCACCCTCTTCTACCCAAATCGA
TTGCTAGATCCCTGGGGAAAAAATCTAGATTTCGATTAAAAATTGGAATCTTCGAAAGAG
AGGACTTTCTCTGGTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCGCGAAATATTATTAAGCAGC
C


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 5 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV23JQ U 1
AF RR2BP42JQ U 1
AF RR2CI35JQ U 24
AF RR2F060JQ U 23
AF RR2CZ38JQ U 135
AF RR2DV23TF C 324
AF RR2BP42TF C 369
AF RR2CI35TF C 375
BS 1 147 RR2BP42JQ
BS 148 148 RR2DV23JQ
BS 149 710 RR2BP42JQ
BS 711 711 RR2F060JQ
BS 712 724 RR2BP42JQ
BS 725 725 RR2F060JQ
BS 726 734 RR2BP42JQ
BS 735 852 RR2F060JQ
BS 853 858 RR2CZ38JQ
BS 859 943 RR2DV23TF
BS 944 949 RR2BP42TF
BS 950 950 RR2CI35TF
BS 951 1048 RR2BP42TF
BS 1049 1081 RR2CI35TF

RD RR2DV23JQ 343 0 0
GG
GTATAATGCTGCATCTCATTCAAAGGACAAAGCAGTAACGCAGCACATTACCGAAAAAAA
CAACGTGTCACAAACGATTCAAAAATTACAAAACGATAAAATATAAAAATATATGTAAAC
AAGTCAAATATTGATAACATTCACGACGACCATGATTCTTAAAGTTCCGCTCCAGTTTGA
TTTTGACTCTGGTGATCCTTTT*ATATAATATACATCGCATGTTCTTGTTTATCATCAAT
GCATACACAGATCTGCTCAAACCAAGTCAATAACCTTAGAGGGCCATCTCAGCCTGTAAT
GCAGCGAGTTCTTCTTCCTCGGCTGTCCGTTTAGGAGCAAC

QA 3 343 3 343
DS 

RD RR2BP42JQ 734 0 0
GAGTATAATGCTGCATCTCATTCAAAGGACAAAGCAGTAACGCAGCACATTACCGAAAAA
AACAACGTGTCACAAACGATTCAAAAATTACAAAACGATAAAATATAAAAATATATGTAA
ACAAGTCAAATATTGATAACATTCACGGCGACGATGATTCTTAAAGTTCCGCTCCAGTTT
GATTTTGACTCTGGTGATCCTTTT*ATATAATATACATCGCATGTTCTTGTTTATCATCA
ATGCATACACAGATCTGCTCAAACCAAGTCAATAACCTTAGAGGGCCATCTCAGCCTGTA
ATGCAGCGAGTTCTTCTTCCTCGGCTGTCCGTTTAGGAGCAACAGGACGGACTGGTTGAC
GCCCTGGAACAGAAGGCATTGGTGTTGGCTGAAGAAGTTGTTCTTCAAGCTCTGCACCTT
CTAATTCTTCAAGCTCAGCTTCGAGCTCATCCTCATCGAAGTCAGCAGCCGCACCGATTG
GAGTAGACAAAGCTTCTTGGATCTGTTTCATGTTCTCTGTCTGCTCATTGATCTCGTCCA
TGGTCTTGTCTACATCATCTATGTTCGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGAAGCTC
CACTCCTCAACGCATCAACAGTTTCGGTTGTTGCTTTTGCGCCTTCTAACATAATCATTT
GATCATGAATACGGAGCTGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCAAACAACCTCT
TCCTTTTCAAGCAC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2CI35JQ 786 0 0
AAAGGACAAAGCAGTAACGCAGCACATTACCGAAAAAA*CAACGTGTCACAAACGATTCA
AAAATTACAAAACGATAAAATATAAAAATATATGTAAACAAGTCAAATGTTGATAACATT
CACGACGACGATGATTCTTAAAGTTCCGCTCCAGTTTGATTTTGACTCTGGTGATCCTTT
T*ATATAATATACATCGCATGTTCTTGTTTATCATCAATGCATACACAGATCTGCTCAAA
CCAAGTCAATAACCTTAGAGGGCCATCTCAGCCTGTAATGCAGCGAGTTCTTCTTCCTCG
GCTGTACGTTTAGGAGCAACAGGACGGACTGGTTGACGCCCTGGAACAGAAGGCATTGGT
GTTGGCTGAAGAAGTTGTTCTTCAAGCTCTGCACCTTCTAATTCTTCAAGCTCAGCTTCG
AGCTCATCCTCATCGAAGTCAGCAGCCGCACCGATTGGAGTAAACAAAGCTTCTTGGATC
TGTTTCATGTTCTCTGTCTGCTCATTGATCTCGTCCATGGTCTTGTCTACATCATCTATG
TTCGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGAAGCTCCACTCCTCAACGCATCAACAGTT
TCGGTTGTCGCTTTTGCGCCTTCTAACATAATCATTTGATCATGAATACGGAGCTGGAAG
TTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCATACAACCTCTTCCTCTTCAAGCATTGAATAGCC
GCGCGTTTGTTTTTAGAACGAGTGTATTCTTTGGCTTTCTCGACCTCTTGTCCAGCTTTC
TTTAAC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2F060JQ 830 0 0
C
AAAGGACAAAGCAGTAACGCAGCACATTACCGAAAAAAA*AACGTGTCACAAACGATTCA
AAAATTACAAAACGATAAAATATAAAAATATATGTAAACAAGTCAAATGTTGATAACATT
CACGACGACGATGATTCTTAAAGTTCCGCTCCAGTTTGATTTTGACTCTGGTGATCCTTT
TTATATAATATACATCGCATGTTCTTGTTTATCATCAATGCATACACAGATCTGCTCAAA
CCAAGTCAATAACCTTAGAGGGCCATCTCAGCCTGTAATGCAGCGAGTTCTTCTTCCTCG
GCTGTCCGTTTAGGAGCAACAGGACGGACTGGTTGACGCCCTGGAACAGAAGGCATTGGT
GTTGGCTGAAGAAGTTGTTCTTCAAGCTCTGCACCTTCTAATTCTTCAAGCTCAGCTTCG
AGCTCATCCTCATCGAAGTCAGCAGCCGCACCGATTGGAGTAGACAAAGCTTCTTGGATC
TGTTTCATGTTCTCTGTCTGCTCATTGATCTCGTCCATGGTCTTGTCTACATCATCTATG
TTCGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGAAGATCCACTCCTCAACGCATCAACAGTC
TCGGTTGTTGCTTTTGCGCCTTCTAACATAATCATTTGATCATGAATACGGAGCTGGAAG
TTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCATACAACCTCTTCCTCTTCAAGCACTGAATAGCC
GCGCGTTTGTTTTTAGAACGAGTGTATTCTTTGGCTTTCTCGACCTCTTGTCCAGCTTTC
TTTAACAGCACTTTCTCCTTCTTCTCTAGCATCTCAAGCGTCTCGTTGA

QA 2 830 2 830
DS 

RD RR2CZ38JQ 724 0 0
GATAACATTCACGACGACGAAGATTCTTAAAGTTCCGCTCCAGTTTGATTTTGACTCTGG
TGATCCTTTTTATATAATATACATCGCATGTTCTTGTTTATCATCAATGCATACACAGAT
CTGCTCAAACCAAGTCAATAACCTTAGAGGGCCATCTCAGCCTGTAATGCAGCGAGTTCT
TCTTCCTCGGCTGTCCGTTTAGGAGCAACAGGACGGACTGGTTGACGCCCTGGAACAGAA
GGCATTGGTGTTGGCTGAAGAAGTTGTTCTTCAAGCTCTGAACCTTCTAATTCTTCAAGC
TCAGCTTCGAGCTCATCCTCATCGAAGCCAGCAGCCGCACCGATTGGAGTAGACAAAGCT
TCTTGGATCTGTTTCATGTTCTCTGTCTGCTCATTGATCTCGTCCATGGTCTTGTCTACA
TCATCTATGTTCGTAGCTTTCTGCATAGTTTTCATAGCAGAAGCTCCACTCCTCAACGCA
TCAACAGTCTCGGTTGTTGCTTTTGCGCCTTCTAACATAATCATTTGATCATGAATACGG
AGCTGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCATACAACCTCTTCCTCTTCAAGCAC
TGAATAGCCGCGCGTTTGTTTTTAGAACGAGTGTATTCTTTGGCTTTCCCGACCTCTTGT
CCAGCTTTCTTTAACAGCACTTTCTCCTTCTTCTCTAGCATCTCAAGCGTCTCGTTGAGC
TTGT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2DV23TF 621 0 0
GCTGTCCGTTTAGGAGCAACAGGACGGACTGGTTGACGCCCTGGAACAGAAGGCATTGGT
GTTGGCTGAAGAAGTTGTTCTTCAAGCTCTGCACTTTCTAATTCTTCAAGCTCAGCTTCG
AGCTCATCCTCATCGAAGTCAGCAGCCGCACCGATTGGAGTAGACAAAGCTTCTTGGATC
TGTTTCATGTTCTCTGTCTGCTCATTGATCTCGTCCATGGTCTTATCTACATCATCTATG
TTCGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGAAGCTCCACTCCTCAACGCATCAACAGTT
TCGGTTGTTGCTTTTGCGCCTTCTAACATAATCATTTGATCATGAATACGGAGCTGGAAG
TTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCATACAACCTCTTCCTTTTCAAGCACTGAATAGCC
GCGCGTTTGTTTTTGGAACGAGTGTATTCTTTGGCTTTCTCGACCTCTTGTCCAGCTTTC
TTTAAGAGCACTTTCTCCTTCTTCTCTAGCATCTCAAGTGTCTCGTTGAGCTTGTCTAAT
GTCTGGAGAGCATTACCCTCATGCTTTGGTTTCCCAAATAGCCGATTCATCATCTTTTTC
CTTCTTCCTTTATTTCACCC
C

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2BP42TF 680 0 0
ACAGAAGGCATTGGTGTTGGCTGAAGAAGTTGTTCTTCAAGCTCTGCACTTTCTAATTCT
TCAAGCTCAGCTTCGAGCTCATCCTCATCGAAGTCAGCAGCCGCACCGATTGGAGTAGAC
AAAGCTTCTTGGATCTGTTTCATGTTCTCTGTCTGCTCATTGATCTCGTCCATGGTCTTG
TCTACATCATCTATGTTCGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGAAGCTCCACTCCTC
AACGCATCAACAGTTTCGGTTGTTGCTTTTGCGCCTTCTAACATAATCATTTGATCATGA
ATACGGAGCTGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCAAACAACCTCTTCCTTTTC
AAGCACTGAATAGCCGCGCGTTTGTTTTTGGAACGAGTGTATTCTTTGGCTTTCTCGACC
TCTTGTCCAACTTTCTTTAAGAGCACTTTCTCCTTCTTCTCTAGCATCTCAAGTGTCTCG
TTGAGCTTGTCTAATGTCTGGAGAGCATTACCCTCATGCTTTGGTTTCCCAAATAGCCGA
TTCATCATCTTTTTCCTTCTTCCTTTATTTCACCCTCTTCTCCCCAAATCGATTGCTAGA
TCCCTGGGGAAAAAATCTAGATTTCGATTAAAAATTGGAATCTTCGAAAGAGAGGACTTT
CTCTGGTCTTCCTTCCTTCC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2CI35TF 707 0 0
GGCATTGGTGT*GGCTGAAGAAGTTGTTCTTCAAGCTCTGCACTTTCTAATTCT*CAAGC
TCAGCTTCGAGCTCATCCTCATCGAAGTCAGCAGCCGCACCGATTGGAGTAGACAAAGCT
TCTTGGATCTGTTTCATGTTCTCTGTCTGCTCATTGATCTCGTCCATGGTCTTGTCTACA
TCATCTATGTTCGTAGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGAAGCTCCACTCCTCAACGCA
TCAACAGTTTCGGTTGTCGCTTTTGCGCCTTCTAACATAATCATTTGATCATGAATACGG
AGCTGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCATACAACCTCTTCCTCTTCAAGCAT
TGAATAGCCGCGCGTTTGTTTTTAGAACGAGTGTATTCTTTGGCTTTCTCGACCTCTTGT
CCAGCTTTCTTTAACAGCACTTTCTCCTTCTTCTCTAGCATCTCAAGCGTCTCGTTGAGC
TTGTCTAATGTCTGGAGAGCATTACCCTCATGCTTTGGTTTCCCAAATAGCCGATTCATC
ATCTTTTTCCTTCTTCCTTTATTTCACCCTCTTCTACCCAAATCGATTGCTAGATCCCTG
GGGAAAAA*TCTGGATTTCGATTAAAAATTGGAATCTTCGAAAGAGAGGACTTTGTCTGG
TCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCGCGAAATATTATTAAGCAGCC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 8

CO CL562Contig1 1239 8 18 U
GGGCCTTGGACACCACAAACATACATACACACCTCTAAATCTCTCAAATCAGAGCAGAAG
AAGCGACAAGAAAACCCCTTCTTTCTCTTCCGCCATTGAAATGGCTCTTATTAAAGCTTC
ACCAGTCGCCGGATTATTCCCTCCTCTCCGCCCCACTGCTTCCACTTCTAATCGCCCTTG
TAGTACCCTCAGGCTCAGGCCACTTCCCCTCCGAACATCCTTCTTCGGAAACTCCGGTAG
AGCTTTGAGAGTGAACGAGCTGAGAGTAGCTTGTGCAAATAGGTTGAAGTGCAATGCTCA
TGGTCCTACCATGAATCTTTTTGAAAGATTTTCTAGGGTTGTCAAGTCATATGCCAATGC
ACTTATAAGCTCCTTCGAAGACCCTGAGAAGATCCTCGAGCAAACTGTTATTGAAATGAA
TTCTGATTTGACCAAGATGCGTCAAGCCACTGCACAGGTTTTAGCTTCACAAAAGCAGCT
GGAGAACAAATATAAAGCTTCAAAGCAATCTTCTGATGATTGGTACAAAAGAGCACAACT
TGCTCTTGCAAAAGGAGACGAGGATCTTGCACGTGAAGCCCTTAAACGAAGAAAGTCTTT
TGCTGACAACGCTGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGCAAAAAGGTGTTGTCGACAA
TCTTGTTTCAAATACGAGGTTATTGGAGAGCAAGATACAAGAGGCAAAAGCAAAGAAAGA
TACGCTCCTTGCACGTGCTCGCACTGCTAAGACTGCAACCAAAGTTCAAGAGATGATAGG
GACAGTGAATACAAGCGGTGCTCTATCAGCCTTTGAGAAAATGGAGGAGAAAGTGATGGC
TATGGAGTCTGAAGCAGATGCACTTACTCAGATTGGAACAGATGAACTCGAGGGAAAGTT
TCAAATGCTTGAAACTTCATCTGTGGATGATGATCTTGCAAAGTTGAAGAATGAGTTGTC
CGGAAGCTCAAAGAAAGGAGAGCTTCCTCCAGGGAGAAGCACGGTCGCAGCAAACACAGG
ATACCCATTCAAGGACTCTGAGATCGAGAACGAGTTAAACGAATTACGAAGGAAAGCTAA
CGAGTTTTAGGCAACTGCTGTTTCTGAGTTGTGTTACTGGTTAACTTCTTTTATGTAAAC
TATTTTTGTTTCTTGAAGAAAAATAACACCAAAAGCATGTGTTTAAATAAGTAAATATCC
AGCTACCTAATCTTCATTTATGACTTGGTTAAATTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G710TF U 25
AF RR2DH42TF U 1
AF RR2FO38TF U 58
AF RR2G376TF U 35
AF RR2G710JQ C 396
AF RR2CE06JQ C 399
AF RR2F329JQ C 544
AF RR2FO38JQ C 523
BS 1 554 RR2DH42TF
BS 555 555 RR2G710TF
BS 556 608 RR2DH42TF
BS 609 609 RR2G376TF
BS 610 646 RR2DH42TF
BS 647 678 RR2G376TF
BS 679 679 RR2FO38TF
BS 680 703 RR2G376TF
BS 704 704 RR2G710JQ
BS 705 759 RR2G376TF
BS 760 804 RR2G710JQ
BS 805 805 RR2CE06JQ
BS 806 851 RR2G710JQ
BS 852 852 RR2CE06JQ
BS 853 1119 RR2G710JQ
BS 1120 1120 RR2CE06JQ
BS 1121 1191 RR2G710JQ
BS 1192 1239 RR2CE06JQ

RD RR2G710TF 575 0 0
GG
ACACACCTCTAAATCTCTCAAATCAGAGCAGAAGAAGCGACAAGAAAACCCCTTCTTTCT
CTTCCGCCATTGAAATGGCTCTTATTAAAGCTTCACCAGTCGCCGGATTATTCCCTCCTC
TCCGCCCCACTGCTTCCACTTCTAATCGCCCTTGTAGTACCCTCAGGCTCAGGCCTCTTC
CCCTCCGAACATCCTTCTTCGGAAACTCCGGTAGAGCTTTGAGAGTGAACGAGCTGAGAG
TAGCTTGTGCAAATAGGTTGAAGTGCAATGCTCATGGTCCTACCATGAATCTTTTTGAAA
GATTTTCTAGGGTTGTCAAGTCATATGCCAATGCACTTATAAGCTCCTTCGAAGACCCTG
AGAAGATCCTCGAGCAAACTGTTATTGAAATGAATTCTGATTTGACCAAGATGCGTCAAG
CCACTGCACAGGTTTTAGCTTCACAAAAGCAGCTGGAGAACAAATATAAAGCTTCAAAGC
AATCTTCTGATGATTGGTACAAAAGAGCACAACTTGCTCTTGCAAAAGGAGACGAGGATC
TTGCACGTGAAGCCCTTAAACGAAGAAAGTCTT

QA 3 575 3 575
DS 

RD RR2DH42TF 646 0 0
GGGCCTTGGACACCACAAACATACATACACACCTCTAAATCTCTCAAATCAGAGCAGAAG
AAGCGACAAGAAAACCCCTTCTTTCTCTTCCGCCATTGAAATGGCTCTTATTAAAGCTTC
ACCAGTCGCCGGATTATTCCCTCCTCTCCGCCCCACTGCTTCCACTTCTAATCGCCCTTG
TAGTACCCTCAGGCTCAGGCCACTTCCCCTCCGAACATCCTTCTTCGGAAACTCCGGTAG
AGCTTTGAGAGTGAACGAGCTGAGAGTAGCTTGTGCAAATAGGTTGAAGTGCAATGCTCA
TGGTCCTACCATGAATCTTTTTGAAAGATTTTCTAGGGTTGTCAAGTCATATGCCAATGC
ACTTATAAGCTCCTTCGAAGACCCTGAGAAGATCCTCGAGCAAACTGTTATTGAAATGAA
TTCTGATTTGACCAAGATGCGTCAAGCCACTGCACAGGTTTTAGCTTCACAAAAGCAGCT
GGAGAACAAATATAAAGCTTCAAAGCAATCTTCTGATGATTGGTACAAAAGAGCACAACT
TGCTCTTGCAAAAG*AGACGAGGATCTTGCACGTGAAGCCCTTAAACGAAGAAAGTCTTT
TGCTGACA*CGCTGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGCAAAAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2FO38TF 639 0 0
AAGAAGCGACAAGAAAACCCCTTCTTTCTCTTCCGCCATTGAAATGGCTCTTATTAAAGC
TTCACCAGTCGCCGGATTATTCCCTCCTCTCCGCCCCACTGCTTCCACTTCTAATCGCCC
TTGTAGTACCCTCAGGCTCAGGCCACTTCCCCTCCGAACATCCTTCTTCGGAAACTCCGG
TAGAGCTTTGAGAGTGAACGAGCTGAGAGTAGCTTGTGCAAATAGGTTGAAGTGCAATGC
TCATGGTCCTACCATGAATCTTTTTGAAAGATTTTCTAGGGTTGTCAAGTCATATGCCAA
TGCACTTATAAGCTCCTTCGAAGGCCCTGAGAAGATCCTCGAGCAAGCTGTTATTGAAAT
GAATTCTGATTTGACCAAGATGCGTCAAGCCACTGCACAGGTTTTAGCTTCACAAAAGCA
GCTGGAGAACAAATATAAAGCTTCAAAGCAATCTTCTGATGATTGGTACAAAAGAGCACA
ACTTGCTCTTGCAAAAAGAGACGAGGATCTTGCACGTGAAGCCCTTAAACGAAGAAAGTC
TTTTGCTGACAACGCTGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGCAAAAAGGTGTTGTCGA
CAATCTTGTTTCAAATACGAGGTTATTGGAGAGCAAGAT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2G376TF 739 0 0
GG
AAATCTCTCAAATCAGAGCAGAAGAAGCGACAAGAAAACCCCTTCTTTCTCTTCCGCCAT
TGAAATGGCTCTTATTAAAGCTTCACCAGTCGCCGGATTATTCCCTCCTTTCCGCCCCAC
TGCTTCCACTTCTAATCGCCCTTGTAGTACCCTCAGGCTCAGTCCACTTCCCCTCCGAAC
ATCCTTCTTCGGAAACTCCGGTAGAGCTTTGAGAGTGAACGAGCTGAGAGTAGCTTGTGC
AAATAGGTTGAAGTGCAATGCTCATGGTCCTACCATGAATCTTTTTGAAAGATTTTCTAG
GGTTGTCAAGTCATATGCCAATGCACTTATAAGCTCCTTCGAAGACCCTGAGAAGATCCT
CGAGCAAACTGTTATTGAAATGAATTCTGATTTGACCAAGATGCGTCAAGCCACTGCACA
GGTTTTAGCTTCACAAAAGCAGCTGGAGAACAAATATAAAGCTTCAAAGCAATCTTCTGA
TGATTGGCACAAAAGAGCACAACTTGCTCTTGCAAAAGGAGACGAGGATCTTGCACGTGA
AGCCCTTAAACGAAGAAAGTCTTTTGCTGACAACGCTGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGA
TCAGCAAAAAGGTGTTGTCGACAATCTTGTTTCAAATACGAG*TTATTGGAGAGCAAGAT
ACAAGAG*CAAAAGCAAAGAAAGATACGCTCCTTGCACGTGCTCGCACTGCTAAGACTGC
AAC
AAAGTCAAGAGATG

QA 3 725 3 725
DS 

RD RR2G710JQ 797 0 0
TCGAGCAAACTGTTATTGAAATGAATTCTGATTTGACCAAGATGCGTCAAGCCACTGCAC
AGGTTTTAGCTTCACAAAAGCAGCTGGAGAACAAATATAAAGCTTCAAAGCAATCTTCTG
ATGATTGGTACAAAAGAGCACAACTTGCTCTTGCAAAAGGAGACGAGGATCTTGCACGTG
AAGCCCTTAAACGAAGAAAGTCTTTTGCTGACAACGCTGCTGCCCTGAAAACTCAACTAG
ATCAGCAAAAAGGTGTTGTCGACAATCTTGTTTCAAATACGAGGTTATTGGAGAGCAAGA
TACAAGAGGCAAAAGCAAAGAAAGATACGCTCCTTGCACGTGCTCGCACTGCTAAGACTG
CAACCAAAGTTCAAGAGATGATAGGGACAGTGAATACAAGCGGTGCTCTCTCAGCCTTTG
AGAAAATGGAGGAGAAAGTGATGGCTATGGAGTCTGGAGCAGATGCACTTACTCAGATTG
GAACAGATGAACTCGAGGGAAAGTTTCAAATGCTTGAAACTTCATCTGTGGATGATGATC
TTGCAAAGTTGAAGAATGAGTTGTCCGGAAGCTCAAAGAAAGGAGAGCTTCCTCCAGGGA
GAAGCACGGTCGCAGCAAACACAGGATACCCATTCAAGGACTCTGAGATCGAGAACGAGT
TAAACGAATTACGAAGGAAAGCTAACGAGTTTTAGGCAACTGCTGTTTCTGAGTTGTGTT
ACTGATTAACTTCTTTTATGTAAACTATTTTTGTTTCTTGAAGAAAAATAACACCAAAAG
CATGTGTTTAAATAAG
C

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2CE06JQ 841 0 0
CGAGCAAACTGTA
TGAAATGAATTCTGATTTGACCAAGATGCGTCAAGCCACCGCACAGGTTT*AGCATCACA
GAAGCAGCTGGAGAACAAATATAAAGCTTCAAAGCAATCTTCTGATGATTGGTACAAAAG
AGCACAACTTGCTCTTGCAAAAGGAGACGAGGATCTTGCACGTGAAGCTCTTAAACGAAG
AAAGTCTTTTGCTGACAACGCTGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGCAAAAAGGTGT
TGTCGACAATCTTGTCTCAAATACGAGGTTATTGGAGAGCGAGATACAAGAGGCAAAAGC
AAAGAAAGATACGCTCCTTGCACGTGCTCGCACTGCTAAGACTGCAACCAAAGTTCAAGA
GATGATAGGGACAGTGAATACAAGCGGTGCTCTATCAGCCTTTGAGAAAATGGAGGAGAA
AGTGATGGCTATGGAGTCTGAAGCAGATGCGCTTACTCAGATTGGAACGGATGAACTCGA
GGGAAAGTTTCAAATGCTTGAAACTTCATCTGTGGATGATGATCTTGCAAAGTTGAAGAA
TGAGTTGTCTGGAAGCTCAAAGAAAGGAGAGCTTCCTCCAGGGAGAAGCACGGTCGCAGC
AAGCACAGGATACCCATTCAAGGACTCGGAGATCGAGAACGAGTTAAACCAATTACGAAG
GAAAGCTAACGAGTTTTAGGCAACTGCTGTTTCTGAGTTGTGTTACTGGTTAACTTCTTT
TATGTAAACTATTTTTGTTTCTTGAAGAAAAATAACACCAAAAGCATGTGTTTAAATAAG
TAAATATCCAGCTACCTAATCTTCATTTATGACTTGGTTAAATTTGGC

QA 14 841 14 841
DS 

RD RR2F329JQ 672 0 0
TCTTGCAAAAGGAGACGAGGATCTTGCACGTGAAGCACTTAAACGAAGAAAGTCTTTTGC
TGACAACGCTGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGCAAAAAGGTGTTGTCGACGATCT
TGTTTCAAATACGAGGTTATTGGAGAGCAAGATTCAAGAGGCAAAAGCAAAGAAAGATAC
GCTCCTTGCACGTGCTCGCACTGCTAAGGCTGCAACCAAAGTTCAAGAGATGATAGGGAC
AGTGATTACAAGCGGTGCTCTATCAGCCTTTGAGAAAATGGAGGAGAAAGTGATGGCTAT
GGAGTCTGAAGCAGATGCACTTACTCAGATTGGAACAGATGAACTCGAGGGAAAGTTTCA
AATGCTTGAAACTTCATCTGTGGATGATGATCTTGCAAAGTTGAAGAATGAGTTGTCCGG
AAGCTCAAAGAAAGGAGAGCTTCCTCCAGGGAGAAGCACGGTCGCAGCAAACACAGGATA
CCCATTCAAGGACTCTGAGATCGAGAACGAGTTAAACGAATTACGAAGGAAAGCTAACGA
GTTTTAGGCAACTGCTGTTTTTGAGTTGTGTTACTGGTTAACTTCTTTTATGTAAACTAT
TTTTGTTTCTTGAAGAAAAATAACACCAAAAGCATGTGTTTAAATAAGTAAATATCCAGC
TACCTAATCT
CC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2FO38JQ 692 0 0
GTACAAAAGAGCACAACTTGCTCTTGCAAAAAGAGACGAGGATCTTGCACGTGAAGCCCT
TAAACGAAGAAAGTCTTTTGCTGACAACGCTGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGCA
AAAAGGTGTTGTCGACAATCTTGTTTCAAATACGAGGTTATTGGAGAGCAAGATACAAGA
GGCAAAAGCAAAGAAAGATACGCTCCTTGCACGTGCTCGCACTGCTAAGACTGCAACCAA
AGTTCAAGAGATGATAGGGACAGTGAATACAAGCGGTGCTCTCTCAGCCTTTGAGAAAAT
GGAGGAGAAAGTGATGGCTATGGAGTTTGAAGCAGATGCACTTACTCAGATTGGAACAGA
TGAACTCGAGGGAAAGTTTCAAATGCTTGAAACTTCATCTGTGGATGATGATCTTGCAAA
GTTGAAGAATGAGTTGTCCGGAAGCTCAAAGAAAGGAGAGCTTCCTCCAGGGAGAAGCAC
GGTCGCAGCAAACACAGGATACCCATTCAAGGACTCTGAGATCGAGAACGAGTTAAACGA
ATTACGAAGGAAAGCTAACGAGTTTTAGGCAACTGCTGTTTCTGAGTTGTGTTACTGGTT
AACTTCTTTTATGTAAACTATTTTTGTTTCTTGAAGAAAAATAACACCAAAAGCATGTGT
TTAAATAAGTAAATATCCAGCTACCTAATCT
T

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 10

CO CL563Contig1 586 10 10 U
TTTTTGGGAGGAGGCAGAGCAATGTACGCGAGGAGGAAGTCATGTGCAAAATTTGGGGGG
AGACGACCACATCCCGGTACTTTTCGGCGTAAAAAGCATACGGGGCTGTCTGATCTTTTG
CCCGCCGGCCGAGAACTCCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCT
GCTACAAATTCGACCATACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTGGTGATGAAGAAAATGTCA
TCACTTACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCT
CACGATGTTACTGCCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGC
TCCGATCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATA
GCCTAATCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTC
AAAAAAGGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATG
TGATATTGATAAATCTTTTGTAATGATTAAGTCGTTTTCTTGTATT


BQ
40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR2C605JQ C 138
AF RR2C605TF U 1
AF RR2C937JQ C 1
AF RR2EX79JQ C 1
AF RR2EX79TF U 1
AF RR2H012JQ C 1
AF RR2H012TF U 1
AF RR2AS45JQ C 6
AF RR2C937TF U 78
AF RR2AS45TF U 6
BS 1 254 RR2C605TF
BS 255 255 RR2EX79TF
BS 256 486 RR2C605TF
BS 487 487 RR2EX79TF
BS 488 500 RR2C605TF
BS 501 501 RR2EX79TF
BS 502 536 RR2C605TF
BS 537 547 RR2EX79TF
BS 548 583 RR2H012TF
BS 584 586 RR2AS45JQ

RD RR2C605JQ 176 0 0
CCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCTGCTACAAATTCGACCAT
ACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTGGTGATGAAGAAAATGTCATCACTTACTACTACCTC
CACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCTCACGATGTTACTG

QA 1 176 1 176
DS 

RD RR2C605TF 536 0 0
TTTTTGGGAGGAGGCAGAGCAATGTACGCGAGGAGGAAGTCATGTGCAAAATTTGGGGGG
AGACGACCACATCCCGGTACTTTTCGGCGTAAAAAGCATACGGGGCTGTCTGATCTTTTG
CCCGCCGGCCGAGAACTCCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCT
GCTACAAATTCGACCATACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTGGTGATGAAGAAAATGTCA
TCACTTACTACTACCTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCT
CACGATGTTACTGCCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGC
TCCGATCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATA
GCCTAATCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTC
AAAAAAAGACCTGTGTT*GCCTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2C937JQ 522 0 0
TTTTTGGGAGGAGGCAGAGCAATGTACGCGAGGAGGAAGTCATGTGCAAAATTTGGGGGG
AGACGACCACATCCCGGTACTTTTCGGCGTAAAAAGCATACGGGGCTGTCTGATCTTTTG
CCCGCCGGCCGAGAACTCCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCT
GCTACAAATTCGACCATACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTGGTGATGAAGAAAATGTCA
TCACTTACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCT
CACGATGTTACTGCCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGC
TCCGATCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATA
GCCTAATCCACCCCCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTC
AAAAAAGGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAA

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2EX79JQ 548 0 0
TTTTTGGGAGGAGGCATAGCAATGTACGCGAGGAGGAAGTCATGTGCAAAATTTGGGGGG
AGACGACCACATCCCGGTACTTTTCGGCGTAAAAAGCATACGGGGCTGTCTGATCTTATG
CCCGCCGGCCGAGAACTCCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCT
GCTACAAATTCGACCATACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTGGTGATGAAGAAAATGTCA
TCACTTACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCT
CACGATGTTACTGCCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGC
TCCGATCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATA
GCCTAATCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTC
AAAAAAGGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATG
TGATATT
C

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2EX79TF 548 0 0
TTTTTGGGAGGAGGCATAGCAATGTACGCGAGGAGGAAGTCATGTGCAAAATTTGGGGGG
AGACGACCACATCCCGGTACTTTTCGGCGTAAAAAGCATACGGGGCTGTCTGATCTTATG
CCCGCCGGCCGAGAACTCCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCT
GCTACAAATTCGACCATACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTGGTGATGAAGAAAATGTCA
TCACTTACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCT
CACGATGTTACTGCCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGC
TCCGATCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATA
GCCTAATCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTC
AAAAAAGGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATG
TGATATT
C

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2H012JQ 583 0 0
TTTTTGGGAGGAGGCAGAGCAATGTACGCGAGGAGGAAGTCATGTGCAAAATTTGGGGGG
AGACGACCACATCCCGGTACTTTTCGGCGTAAAAAGCATACGGGGCTGTCTGATCTTTTG
CCCGCCGGCCGAGAACTCCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCT
GCTACAAATTCGACCATACCCTGTCCGCATGGTCCTCCTTTGGTGATGAAGAAAATGTCA
TCACTTACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCT
CACGATGTTACTGCCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGC
TCCGATCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATA
GCCTAATCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTC
AAAAAAGGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATG
TGATATTGATAAATCTTTTGTAATGATTAAGTCGTTTTCTTGT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2H012TF 583 0 0
TTTTTGGGAGGAGGCAGAGCAATGTACGCGAGGAGGAAGTCATGTGCAAAATTTGGGGGG
AGACGACCACATCCCGGTACTTTTCGGCGTAAAAAGCATACGGGGCTGTCTGATCTTTTG
CCCGCCGGCCGAGAACTCCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCT
GCTACAAATTCGACCATACCCTGTCCGCATGGTCCTCCTTTGGTGATGAAGAAAATGTCA
TCACTTACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCT
CACGATGTTACTGCCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGC
TCCGATCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATA
GCCTAATCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTC
AAAAAAGGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATG
TGATATTGATAAATCTTTTGTAATGATTAAGTCGTTTTCTTGT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2AS45JQ 581 0 0
GGGAGGAGGCAGAGCAATGTACGCGAGGAGGAAGTCATGTGCAAAATTTGGGGGGAGACG
ACCACATCCCGGTACTTTTCGGCGTAAAAAGCATACGGGGCTGTCTGATCTTTTGCCCGC
CGGCCGAGAACTCCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCTGCTAC
AAATTCGACCATACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTGGTGATGAAGAAAATGTCATCACT
TACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCTCACGA
TGTTACTGCCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGCTCCGA
TCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATAGCCTA
ATCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTCAAAAA
AGGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATGTGATA
TTGATAAATCTTTTGTAATGATTAAGTCGTTTTCTTGTATT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2C937TF 467 0 0
TACTTTTCGGCGTAAAAAGCATACGGGGCTGTCTGATCTTTTGCCCGCCGGCCGAGAACT
CCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCTGCTACAAATTCGACCAT
ACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTGGTGATGAAGAAAATGTCATCACTTACTACTACTTC
CACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCTCACGATGTTACTGCCAC
CACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGCTCCGATCAAGTTTAGAG
ATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATAGCCTAATCCACCACCTA
AGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTCAAAAAAGGACCTGTGTT
TGCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATGTGA
G

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR2AS45TF 581 0 0
GGGAGGAGGCAGAGCAATGTACGCGAGGAGGAAGTCATGTGCAAAATTTGGGGGGAGACG
ACCACATCCCGGTACTTTTCGGCGTAAAAAGCATACGGGGCTGTCTGATCTTTTGCCCGC
CGGCCGAGAACTCCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCTGCTAC
AAATTCGACCATACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTGGTGATGAAGAAAATGTCATCACT
TACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCTCACGA
TGTTACTGCCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGCTCCGA
TCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATAGCCTA
ATCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTCAAAAA
AGGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATGTGATA
TTGATAAATCTTTTGTAATGATTAAGTCGTTTTCTTGT
ATT

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 10

CO CL564Contig1 861 10 12 U
AGGAAAGTCTCAGAGATTTTATCCAAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAGAAAA
CCATTTGATCAGCTCTTGTTCTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCAAAAG
ACGGCTAAAGTTGACGTAGAATCTCCGACGGTTGTAACTCCGGCGAAGGAACCTACTCCT
GCTCCGGTGGAAGTTTCTAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTACACTTCCCGAC
GAGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGT
TCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACT
TCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAG
AAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTC
AGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAAC
AAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAG
GGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTT
CCCAAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAAAGTCTTTTTATTTAATATGTTTCTCATGTCATT
GTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTTGTGTGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTT
TGTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATATATTTGGTGATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGTTA
AAGATTTTATGTATTTTCTGT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 
50 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 40 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 0 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY69TF U 1
AF RR2GM79TF U 54
AF RR2BO27TF U 69
AF RR2A607TF U 23
AF RR2FD26TF U 69
AF RR2BA15TF U 2
AF RR2BA15JQ C 2
AF RR2BO27JQ C 94
AF RR2E040TF U 279
AF RR2DY69JQ C 483
BS 1 219 RR2DY69TF
BS 220 220 RR2FD26TF
BS 221 478 RR2DY69TF
BS 479 687 RR2FD26TF
BS 688 688 RR2BA15TF
BS 689 817 RR2FD26TF
BS 818 818 RR2E040TF
BS 819 826 RR2FD26TF
BS 827 827 RR2BA15JQ
BS 828 836 RR2FD26TF
BS 837 852 RR2E040TF
BS 853 861 RR2BO27JQ

RD RR2DY69TF 478 0 0
AGGAAAGTCTCAGAGATTTTATCCAAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAGAAAA
CCATTTGATCAGCTCTTGTTCTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCAAAAG
ACGGCTAAAGTTGACGTAGAATCTCCGACGGTTGTAACTCCGGCGAAGGAACCTACTCCT
GCTCCGGTGGAAGTTTCTAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAATTCATACTACACTTCCCGAC
GAGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGT
TCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACT
TCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAG
AAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAAC

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2GM79TF 609 0 0
GG
GAAAACCATTTGATCAGCTCTTGTTCTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGC
AAAAGACGGCTAAAGTTGACGTAGAATCTCCGACGGTTGTAACTCCGGCGAAGGAACCTA
CTCCTGCTCCGGTGGAAGTTTCCAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTACACTTC
CCGACGAGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCAAAGA
AAAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGA
AAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCAC
AAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTC
AACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGA
AGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCATAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTA
AAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTG
TCGTTCC

QA 3 609 3 609
DS 

RD RR2BO27TF 630 0 0
GG
AGCTCTTGTTCTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCAAAAGACGGCTAAAG
TTGACGTAGAATCTCCGACGGTTGTAACTCCGGCGAAGGAACCTACTCCTGCTCCGGTGG
AAGTTTCTAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTACACTTCCCGACGAGTCCAAAG
CTCTTGCCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTTCAGCTGGTT
CGGTTGATAGAGATGTGAAGCTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCATTCATCA
AAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATCTG
ATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCAGGAAGATTG
AAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCGG
CTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGC
TTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAC
CCTGTGGATGTTTCTAAAGTCTTTT
ATT

QA 3 627 3 627
DS 

RD RR2A607TF 657 0 0
GG
AAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAGAAAACCATTTGATCAGCTCTTGTTCTTC
TTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCAAAAGACGGCTAAAGTTGACGTAGAATCT
CCGACGGTTGTAACTCCGGCGAAGGAACCTACTCCTGCTCCGGTGGAAGTTTCTAAAGAC
GTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTACACTTCCCGACGAGTCCAAAGCTCTTGCCATTGTG
GAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGAT
GTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAG
AGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGG
GAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAG
AAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAA
GCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAA
GAAATGGCTGCTAAGTACAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACCTGTGGAT

QA 3 657 3 657
DS 

RD RR2FD26TF 769 0 0
GG
AGCTCTTGTTCTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCAAAAGACGGCTAAAG
TTGACGTAGAATCTCCGACGGTTGTAACCCCGGCGAAGGAACCTACTCCTGCTCCGGTGG
AAGTTTCTAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTACACTTCCCGACGAGTCCAAAG
CTCTTGCCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTTCAGCTGGTT
CGGTTGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCATTCATCA
AAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATCTG
ATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCAGGAAGATTG
AAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCGG
CTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGC
TTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAA
CCTGTGGATGTTTCTAA*GTCTTTTTATTTAATATGTTTCTCATGTCATTGTTTGTAATA
CTTCCTCTCTCCTTTTTTGTGTGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTG
CTGTCTTGTTTATATATTTGGTGATTT*GTATAAAA*GACATCAAG
T

QA 3 768 3 768
DS 

RD RR2BA15TF 789 0 0
GGAAAGTCTCAGAGATTTTATCCAAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAGAAAAC
CATTTGATCAGCTCTTGTTCTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCAAAAGA
CGGCTAAAGTTGACGTAGAATCTCCGACGGTTGTAACTCCGGCGAAGGAACCTACTCCTG
CTCCGGTGGAAGTTTCTAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTACACTTCCCGACG
AGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTT
CAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTT
CATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGA
AGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCA
GGAAGATTGAGGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACA
AAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGG
GAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTC
CCAAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAAAGTCTTTTTATTTAATCTGTTTCTCATGTCATTG
TTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTT*GTGTGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTTT
GTTTGTTTG

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2BA15JQ 842 0 0
GGAAAGTCTCAGAGATTTTATCCAAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAGAAAAC
CATTTGATCAGCTCTTGTTCTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCAAAAGA
CGGCTAAAGTTGACGTAGAATCTCCGACGGTTGTAACTCCGGCGAAGGAACCTACTCCTG
CTCCGGTGGAAGTTTCTAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTACACTTCCCGACG
AGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTT
CAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTT
CATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGA
AGATATTTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCA
GGAAGATTGAGGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACA
AAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGG
GAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTC
CCAAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAAAGTCTTTTTATTTAATCTGTTTCTCATGTCATTG
TTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTT*GTGTGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTTT
GTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATATATTTGGTGATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGTTAA
AG

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR2BO27JQ 768 0 0
TGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCAAAAGACGGCTAAAGTTGACGTAGAATCTCCGACGGTT
GTAACTCCGGCGAAGGAACCTACTCCTGCTCCGGTGGAAGTTTCTAAAGACGTGGCGGAG
GAGAAAGTTCATACTACACTTCCCGACGAGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGTTGAAAAACCC
ATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAGCTT
GCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAG
TCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATTTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGC
AAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAG
GCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAAGAG
AAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCT
GCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAAAGTCTT
TTTATTTAATCTGTTTCTCATGTCATTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTTGTGTG
ATTCAGTTATCTTTTATAGTTTGTTTTTGTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATATATTTGGTG
ATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGTTAAAGATTTTATGTATTTTCTGT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2E040TF 580 0 0
GGAGCCCACACCAAAGAAAAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAAATGTGAAACTTGCAGA
CTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAA
GGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAA
AGCAGCCACTGAAGCTCAACTCATGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGA
GTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAG
AGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAA
GTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAA*GTCTTTTTAT
TTAATATGTTTCTCATGTCATTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTTGTGTGATTCA
GTTATCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATATATTTGGTGATTTT
GTATAAAA*GACATCAAGGTTAAAGATTTTATGT
ATTTTC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2DY69JQ 370 0 0
GAAGATTGAAGAGGAACTGGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAA
AGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGG
AGAAGAGCTTTTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTACAGAGCCACTGGTGTCGTTCC
CAAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAA*GTCTTTTTATTTAACATGTTCCTCATGTCATTGT
TTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTTGTGCGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTTTG
TTTGTTTGCTGTCTTGTTTATATATTTGGTGATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGTTAAA
GATTTTATGT

QA 1 370 1 370
DS 



AS 2 9

CO CL565Contig1 571 2 3 U
GGAACATTCAAGCTACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGA
GTCGCTCTTGTGAACTATGGAAAGGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGGCGTCGTG
GACCAGAACAGGGCTTTAGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGTATCCAGATGAACTTCAAG
AGGTTGTCTCTTACTGACATCGTGATCGAGATCAACCGAGTGCCTAAGAAGAAGGCATTG
ATTGAGGCCATGGAGAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGG
AAGCTCATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTTGACAGATTCAAGATCATG
TTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAACTTGCTAAACTCAAGAAGGAG
ATCACCGCCTGATCATATTGAGGATTATCCGCAACTCTGTTTTTCTATTTCGAATTGGTA
GTTAGTGTTTTTGAAAGTGGCAAACATCATTATCTACTTTGTTGTCGGATGTTAATTTCA
ATTTTGAATGAAACCTTGTTTGGAAGACTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2A465JQ C 1
AF RR2A465TF U 1
BS 1 2 RR2A465JQ
BS 3 569 RR2A465TF
BS 570 571 RR2A465JQ

RD RR2A465JQ 571 0 0
GGAACATTCAAGCTACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGA
GTCGCTCTTGTGAACTATGGAAAGGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGGCGTCGTG
GACCAGAACAGGGCTTTAGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGTATCCAGATGAACTTCAAG
AGGTTGTCTCTTACTGACATCGTGATCGAGATCAACCGAGTGCCTAAGAAGAAGGCATTG
ATTGAGGCCATGGAGAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGG
AAGCTCATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTTGACAGATTCAAGATCATG
TTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAACTTGCTAAACTCAAGAAGGAG
ATCACCGCCTGATCATATTGAGGATTATCCGCAACTCTGTTTTTCTATTTCGAATTGGTA
GTTAGTGTTTTTGAAAGTGGCAAACATCATTATCTACTTTGTTGTCGGATGTTAATTTCA
ATTTTGAATGAAACCTTGTTTGGAAGACTCC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2A465TF 571 0 0
GG
AACATTCAAGCTACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGAGT
CGCTCTTGTGAACTATGGAAAGGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGGCGTCGTGGA
CCAGAACAGGGCTTTAGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGTATCCAGATGAACTTCAAGAG
GTTGTCTCTTACTGACATCGTGATCGAGATCAACCGAGTGCCTAAGAAGAAGGCATTGAT
TGAGGCCATGGAGAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAA
GCTCATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAATGATTTTGACAGATTCAAGATCATGTT
GGCCAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAACTTGCTAAACTCAAGAAGGAGAT
CACCGCCTGATCATATTGAGGATTATCCGCAACTCTGTTTTTCTATTTCGAATTGGTAGT
TAGTGTTTTTGAAAGTGGCAAACATCATTATCTACTTTGTTGTCGGATGTTAATTTCAAT
TTTGAATGAAACCTTGTTTGGAAGACT
CC

QA 3 569 3 569
DS 



CO CL565Contig2 640 7 5 U
GGGAAACATTCAAGCTACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGA
GAGTCGCGCTTGTTAACTATGGAAAGGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGACGTCG
TGGACCAGAACAGGGCTTTGGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGGATCCAAATGAACTTCA
AGAGATTGTCTCTCACTGACATCGTGATCGAGATCAACCGAGTGCCTAAGAAGAAGGCTT
TGATTGAGGCCATGGAGAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTA
GGAAGCTCATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAACGATTTCGACAGATTCAAGATCA
TGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGG
AGATCACTGCCTGATCAACTTGAGGATTATCTACTTCTCTGTTTTTTCGATTTTGAATTG
GTAGTTAGTGTTTTTGAAAGTGTCAAACATCATTTATCTACTCTACTGTCGGATGTTAAG
TTCAAGTTTGAATGAAACCTTGTTTGGAAGACTTCATTTTGTTGTTTGATCGCATTCTCA
TCACTAAAAGCATGTTTATTTTCTAATTAGTCTTTATTCG


BQ
10 10 10 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AP26JQ C 117
AF RR2H086TF U 1
AF RR2GG92JQB C 1
AF RR2AP26TF U 6
AF RR2GG92TF U 1
AF RR2EO39JQ C 15
AF RR2EO39TF U 15
BS 1 4 RR2GG92JQB
BS 5 573 RR2H086TF
BS 574 624 RR2AP26TF
BS 625 628 RR2GG92TF
BS 629 640 RR2EO39TF

RD RR2AP26JQ 104 0 0
GTCGTGGACCAGAACAGGGCTTTGGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGGATCCAAATGAAC
TTCAAGAGATTGTCTCTCACTGACATCGTGATCGAGATCAACCG

QA 1 104 1 104
DS 

RD RR2H086TF 573 0 0
GGGA
AACATTCAAGCTACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGAGT
CGCGCTTGTTAACTATGGAAAGGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGACGTCGTGGA
CCAGAACAGGGCTTTGGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGGATCCAAATGAACTTCAAGAG
ATTGTCTCTCACTGACATCGTGATCGAGATCAACCGAGTGCCTAAGAAGAAGGCTTTGAT
TGAGGCCATGGAGAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAA
GCTCATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAACGATTTCGACAGATTCAAGATCATGTT
GGCCAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGAGAT
CACTGCCTGATCAACTTGAGGATTATCTACTTCTCTGTTTTTTCGATTTTGAATTGGTAG
TTAGTGTTTTTGAAAGTGTCAAACATCATTTATCTACTCTACTGTCGGATGTTAAGTTCA
AGTTTGAATGAAACCTTGTTTGGAAGACT

QA 5 573 5 573
DS 

RD RR2GG92JQB 628 0 0
GGGAAACATTCAAGCTACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGA
GAGTCGCGCTTGTTAACTATGGAAAGGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGACGTCG
TGGACCAGAACAGGGCTTTGGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGGATCCAAATGAACTTCA
AGAGATTGTCTCTCACTGACATCGCGATCGAGATCAACCTAGTGCCTAAGAAGAAGGCTT
TGATTGAGGCCATGGAGAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTA
GGAAGCTCATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAACGATTTCGACAGATTCAAGATCA
TGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGG
AGATCACTGCCTGATCAACTTGAGGATTATCTACTTCTCTGTTTTTTCGATTTTGAATTG
GTAGTTAGTGTTTTTGAAAGTGTCAAACATCATTTATCTACTCTACTGTCGGATGTTAAG
TTCAAGTTTGAATGAAACCTTGTTTGGAAGACTTCATTTTGTTGTTTGATCGCATTCTCA
TCACTAAAAGCATGTTTATTTTCTAATT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2AP26TF 619 0 0
GG
ATTCAAGCTACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGAGTCGC
GCTTGTTAACTATGGAAAGGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGACGTCGTGGACCA
GAACAGGGCTTTGGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGGATCCAAATGAACTTCAAGAGATT
GTCTCTCACTGACATCGTGATCGAGATCAACCGAGTGCCTAAGAAGAAGGCTTTGATTGA
GGCCATGGAGAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCT
CATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAACGATTTCGACAGATTCAAGATCATGTTGGC
CAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGAGATCAC
TGCCTGATCAACTTGAGGATTATCTACTTCTCTGTTTTTTCGATTTTGAATTGGTAGTTA
GTGTTTTTGAAAGTGTCAAACATCATTTATCTACTCTACTGTCGGATGTTAAGTTCAAGT
TTGAATGAAACCTTGTTTGGAAGACTTCATTTTGTTGTTTGATCGCATTCTCATCACTAA
AAGCATGTTTATTTTCT

QA 3 619 3 619
DS 

RD RR2GG92TF 628 0 0
GGGA
AACATTCAAGCTACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGAGT
CGCGCTTGTTAACTATGGAAAGGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGACGTCGTGGA
CCAGAACAGGGCTTTGGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGGATCCAAATGAACTTCAAGAG
ATTGTCTCTCACTGACATCGCGATCGAGATCAACCTAGTGCCTAAGAAGAAGGCTTTGAT
TGAGGCCATGGAGAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAA
GCTCATCGTTCAGAAGCGTAGGGCTAGCCTCAACGATTTCGACAGATTCAAGATCATGTT
GGCCAAAATCAAGAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAACTCAAGAAGGAGAT
CACTGCCTGATCAACTTGAGGATTATCTACTTCTCTGTTTTTTCGATTTTGAATTGGTAG
TTAGTGTTTTTGAAAGTGTCAAACATCATTTATCTACTCTACTGTCGGATGTTAAGTTCA
AGTTTGAATGAAACCTTGTTTGGAAGACTTCATTTTGTTGTTTGATCGCATTCTCATCAC
TAAAAGCATGTTTATTTTCTAATT

QA 5 628 5 628
DS 

RD RR2EO39JQ 626 0 0
GG
ACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGAGTCGCGCTTGTTAA
CTATGGAAAGGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGACGTTGTGGACCAGAACAGGGC
TTTGGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGGATCCAAATGAACTTCAAGAGATTGTCTCTCAC
TGACATCGTGATCGAGATCAACCGAGTGCCCAAGAAGAAGGCTTTGATTGAGGCCATGGA
GAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTCATCGTTCA
GAAGCGTAGGGCTAGCCTCAACGATTTCGACAGATTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAA
GAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAGCTCAAGAAGGAGATCACTGCCTGATC
AACTTGAGGATTATCTACTTCTCTGTTTTTTCGATTTTGAATTGGTAGTTAGTGTTTTTG
AAAGTGTCAAACATCATTTATCTACTCTACTGTCGGATGTTAAGTTCAAGTTTGAATGAA
ACCTTGTTTGGAAGACTTCATTTTGTTGTTTGATCGCATTCTCATCACTAAAAGCATGTT
TATTTTCTAATTAGTCTTTATTCG

QA 3 626 3 626
DS 

RD RR2EO39TF 626 0 0
GG
ACCGCCGGCGAAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGAGTCGCGCTTGTTAA
CTATGGAAAGGACCATGGAAAGCTCGTCGTCATCGTCGACGTTGTGGACCAGAACAGGGC
TTTGGTAGATGCCCCTGACATGGAGAGGATCCAAATGAACTTCAAGAGATTGTCTCTCAC
TGACATCGTGATCGAGATCAACCGAGTGCCCAAGAAGAAGGCTTTGATTGAGGCCATGGA
GAAAGCTGACGTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTCATCGTTCA
GAAGCGTAGGGCTAGCCTCAACGATTTCGACAGATTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAA
GAAAGCTGGTGTTGTCAGGCAAGAGCTTGCAAAGCTCAAGAAGGAGATCACTGCCTGATC
AACTTGAGGATTATCTACTTCTCTGTTTTTTCGATTTTGAATTGGTAGTTAGTGTTTTTG
AAAGTGTCAAACATCATTTATCTACTCTACTGTCGGATGTTAAGTTCAAGTTTGAATGAA
ACCTTGTTTGGAAGACTTCATTTTGTTGTTTGATCGCATTCTCATCACTAAAAGCATGTT
TATTTTCTAATTAGTCTTTATTCG

QA 3 626 3 626
DS 



AS 1 10

CO CL566Contig1 1243 10 22 U
GCCGACGCTCAATGTGTTTCAGGGGTCTCTAAGTTCCTCACCGCTCCGAATCCGGACCTA
GCGAGTGTGATCGAGCAAGAATGTAGTAAAACATCATGGGAGGGAATAGTGAAGAGACTA
TGGCCAAAAGCAAAATGCATAGAAGCAGTTGTTACCGGCTCTATGGTACAATATATTCCA
TTGTTAGAATTCTATGGAGGAGGTCTTCCTTTGATTTCATCTTGGTACGGCAGCTCTGAA
TGTTTCATTGGGATTAACGTCGATCCTCTAAGCAAACCTTGTGATGTGTCCTACACCATT
GTTCCAAGTATGGCCTACTTCGAGTTCTTAGAGGTCGAGAAAGACCATCAAGAAACTGTT
CACAATCCCACAAAGAACCCTGTAGTCGTTGATCTTGCCGATGTTAAAATTGGACATGAT
TATGAACTTATTATCACAACATTCTCTGGTTTGTATAGGTACCGCTTGGGGGATGTTCTG
AGAGTAACTGGTTTCTACAACAATGCCCCACAATTTTATTTTGTAGGAAGACAAAAAGTT
GTTCTGAGCATGGACATTGATAAGACCTACGAAGAAGATTTGCACAAGGCCGTGACAAGC
GCCACACACTTGCTCGAGCCACATGACCTCATGCTCATCGATTTCACTAGCCGTGTGGAC
TCCTCAACGTTTCCAGGTCACTACGTGATCTATTGGGAACTCGGGAGAAAACTGAAGGAC
GCAAAAGTGGAGCCCCACCGCCATGTCTTAGAGGAATGCTGCTTCACCATTGAGAAGTCT
CTCAACTCTGTGTACAGAAAGTTACGTAAGAATGATGGTACCATTGGTCCCCTTGAGATT
AAGGTTGTTAGGCGTGGCGCTTTTGATGAGCTCATGAATTTGTTCCTGTCTCGAGGCTCT
TCTGTGAGTCAGTACAAGACCCCGAGGTCGGTGAGTAGTGAAGAAGCTTTTAAGATATTG
GAAGAGGCAGTTGTTTCCGAGTTTCTTAGCACGAAAACTCCGTCGTGGGAGCCACGTGAG
ATGCACTCTGGCCGATAAATCCAGTCTCGTAATGTGGACAGTATAAGCCTTCGCTTATAA
TTACATATGAATAACGTCGCTATATATA****CTTTATATCACATAAAAGACACGATTAC
ATAATCGAATATATAAGTCTATTACAATCGTCAAGTGATGTTCTATAAAGTCTTTCACGT
GTCTATAAAATGAAGACCTGCTCTTATGAAGATGTGTTGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 20 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2EW21TF U 1
AF RR2A882JQ C 728
AF RR2BC12TF U 273
AF RR2A882TF U 728
AF RR2CG55TF U 646
AF RR2BC12JQ C 526
AF RR2FY28TF U 570
AF RR2FY28JQ C 635
AF RR2GE11TF U 680
AF RR2EW21JQ C 916
BS 1 717 RR2EW21TF
BS 718 718 RR2BC12TF
BS 719 755 RR2EW21TF
BS 756 756 RR2BC12TF
BS 757 784 RR2EW21TF
BS 785 785 RR2BC12TF
BS 786 802 RR2EW21TF
BS 803 803 RR2BC12TF
BS 804 811 RR2EW21TF
BS 812 812 RR2BC12TF
BS 813 831 RR2EW21TF
BS 832 940 RR2BC12TF
BS 941 941 RR2A882TF
BS 942 1096 RR2BC12TF
BS 1097 1103 RR2A882TF
BS 1104 1104 RR2FY28TF
BS 1105 1108 RR2A882TF
BS 1109 1112 RR2FY28TF
BS 1113 1170 RR2A882TF
BS 1171 1221 RR2FY28TF
BS 1222 1240 RR2GE11TF
BS 1241 1243 RR2EW21JQ

RD RR2EW21TF 840 0 0
GCCGACGCTCAATGTGTTTCAGGGGTCTCTAAGTTCCTCACCGCTCCGAATCCGGACCTA
GCGAGTGTGATCGAGCAAGAATGTAGTAAAACATCATGGGAGGGAATAGTGAAGAGACTA
TGGCCAAAAGCAAAATGCATAGAAGCAGTTGTTACCGGCTCTATGGTACAATATATTCCA
TTGTTAGAATTCTATGGAGGAGGTCTTCCTTTGATTTCATCTTGGTACGGCAGCTCTGAA
TGTTTCATTGGGATTAACGTCGATCCTCTAAGCAAACCTTGTGATGTGTCCTACACCATT
GTTCCAAGTATGGCCTACTTCGAGTTCTTAGAGGTCGAGAAAGACCATCAAGAAACTGTT
CACAATCCCACAAAGAACCCTGTAGTCGTTGATCTTGCCGATGTTAAAATTGGACATGAT
TATGAACTTATTATCACAACATTCTCTGGTTTGTATAGGTACCGCTTGGGGGATGTTCTG
AGAGTAACTGGTTTCTACAACAATGCCCCACAATTTTATTTTGTAGGAAGACAAAAAGTT
GTTCTGAGCATGGACATTGATAAGACCTACGAAGAAGATTTGCACAAGGCCGTGACAAGC
GCCACACACTTGCTCGAGCCACATGACCTCATGCTCATCGATTTCACTAGCCGTGTGGAC
TCCTCAACGTTTCCAGGTCACTACGTGATCTATTGGGAACTCGGGAGAAAACTGAAG*AC
GCAAAAGTGGAGCCCCACCGCCATGTCTTAGAGGA*TGCTGCTTCACCATTGAGAAGTCT
CTCA*CTCTGTGTACAGAAAGT*ACGTAAGA*TGATGGTACCATTGGTCCC
TTGAGATAA

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR2A882JQ 269 0 0
G
GGAGCCCCACCGCCATGTCTTAGAGGAATGCTGCTTCACCATTGAGAAGTCTCTCAACTC
TGTGTACAGAAAGTTACGTAAGAATGATGGTACCATTGGTCCCCTTGAGATTAAGGTTGT
TAGGCGTGGCGCTTTCGACGAGCTCATGAATTTGTTCCTGTCTCGAGGCTCTTCTGTGAG
TCAGTACAAGACCCCGAGGTCGGTGAGTAGTGAAGAAGCTTTTAAGATATTGGAAGAGGC
AGTTGTTTCCGAGTTTCTTACCACGAAA

QA 2 269 2 269
DS 

RD RR2BC12TF 824 0 0
G
AAACCTTGTGATGTGTCCTACACCATTGTTCCAAGTATGGCCTACTTCGAGTTCTTAGAG
GTCGAGAAAGACCATCAAGAAACTGTTCACAATCCCACAAAGAACCCTGTAGTCGTTGAT
CTTGCCGATGTTAAAATTGGACATGATTATGAACTTATTATCACAACATTCTCTGGTTTG
TATAGTTACCGCTTGGGGGATGTTCTGAGAGTAACTGGTTTCTACAACAATGCCCCACAA
TTTTATTTTGTAGGAAGACAAAAAGTTGTTCTGAGCATGGACATTGATAAGACCTACGAA
GAAGATTTGCACAAGGCCGTGACAAGCGCCACACACTTGCTCGAGCCACATGACCTCATG
CTCATCGATTTCACTAGCCGTGTGGACTCCTCAACGTTTCCAGGTCACTACGTGATCTAT
TGGGAACTCGGGAGAAAACTGAAGGACGCAAAAGTGGAGCCCCACCGCCATGTCTTAGAG
GAATGCTGCTTCACCATTGAGAAGTCTCTCAACTCTGTGTACAGAAAGTTACGTAAGAAT
GATGGTACCATTGGTCCCCTTGAGATTAAGGTTGTTAGGCGTGGCGCTTTTGATGAGCTC
ATGAATTTGTTCCTGTCTCGAGGCTCTTCTGTGAGTCAGTACAAGACCCCGAGGTCGGTG
AGTAGTGTAGAAGCTTTTAAGATATTGGAAGAGGCAGTTGTTTCCGAGTTTCTTAGCACG
AAAACTCCGTCGTGGGAGCCACGTGAGATGCACTCTGGCCGATAAATCCAGTCTCGTAAT
GTGGACAGTATAAGCCTTCGCTTATAATTACATATGAATAACG

QA 2 824 2 824
DS 

RD RR2A882TF 445 0 0
G
GGAGCCCCACCGCCATGTCTTAGAGGAATGCTGCTTCACCATTGAGAAGTCTCTCAACTC
TGTGTACAGAAAGTTACGTAAGAATGATGGTACCATTGGTCCCCTTGAGATTAAGGTTGT
TAGGCGTGGCGCTTTCGACGAGCTCATGAATTTGTTCCTGTCTCGAGGCTCTTCTGTGAG
TCAGTACAAGACCCCGAGGTCGGTGAGTAGTGAAGAAGCTTTTAAGATATTGGAAGAGGC
AGTTGTTTCCGAGTTTCTTAGCACGAAAACTCCGTCGTGGGAGCCACGTGAGATGCACTC
TGGCCGATAAGTCCAGTCTCGTAATGTGGACAGTATGAGCCTTCGCTTATAATTACATAT
GAATAACGTCGCTATCTATATGTACTTTATATCACATAAAAGACACGATTACATAATCGA
ATATATAAGTCTATTACAATCG
CC

QA 2 443 2 443
DS 

RD RR2CG55TF 504 0 0
G
CTAGCCGTGTGGACTCCTCCACGTTTCCAGGTCACTACGTGATCTATTGGGAACTCGGGA
GAAAACTCAAGGACGCGAAAGTGGAGCCCCACCGCCATGTCTTAGAGGAATGCTGCTTCA
CCATTGAGAAGTCTCTCAACTCTGTGTACAGAAAGTTACGTAAGAATGATGGTACCATTG
GTCCCCTTGAGATTAAGGTTGTTAGGCGTGGCGCTTTCGACGAGCTCATGAATTTGTTCC
TGTCTCGAGGCTCTTCTGTGAGTCAGTACAAGACCCCGAGGTCGGTGAGTAGTGAAGAAG
CTTTTAAGATATTGGAAGAGGCAGTTGTTTCCGAGTTTCTTAGCACGAAAACTCCGTCGT
GGGAGCCACGTGAGATGCACTCTGGCCGATAAGTCCAGTCTCGTAATGTGGACAGTATGA
GCCTTCGCTTATAATTACATATGAATAACGTCGCTATCCATATGTACTTTATATCACATA
AAAGACACGATTACATAATCGAA

QA 2 504 2 504
DS 

RD RR2BC12JQ 703 0 0
GGAAGACAAAAAGTTGTTCTGAGCATGGACATTGATAAGACCTACGAAGAAGATTTGCAC
AAGGCCGTGACAAGCGCCACACACTTGCTCGAGCCACATGACCTCATGCTCATCGATTTC
ACTAGCCGTGTGGACTCCTCAACGTTTCCAGGTCACTACGTGATCTATTGGGAACTCGGG
AGAAAACTGAAGGACGCAAAAGTGGAGCCCCACCGCCATGTCTTAGAGGAATGCTGCTTC
ACCATTGAGAAGTCTCTCAACTCTGTGTACAGAAAGTTACGTAAGAATGATGGTACCATT
GGTCCCCTTGAGATTAAGGTTGTTAGGCGTGGCGCTTTTGATGAGCTCATGAATTTGTTC
CTGTCTCGAGGCTTTTCTGTGAGTCAGTACAAGACCCCGAGGTCGGTGAGTAGTGTAGAA
GCTTTTAAGATATTGGAAGAGGCAGTTGTTTCCGAGTTTCTTAGCACGAAAACTCCGTCG
TGGGAGCCACGTGAGATGCACTCTGGCCGATAAATCCAGTCTCGTAATGTGGACAGTATA
AGCCTTCGCTTATAATTACATATGAATAACGTCGCTATATATA****CTTTATATCACAT
AAAAGACACGATTACATAATCGAATATATAAGTCTATTACAATCGTCAAGTGATGTTCTA
TAAAGTCTTTCACGTGTCTATAAAATGAAGACCTGC
TCTTATG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2FY28TF 662 0 0
G
GAAGAAGATTTGCACAAGGCCGTGACAAGCGCCACACACTTGCTCGAGCCACATGACCTC
ATGCTCATCGATTTCACTAGCCGTGTGGACTCCTCAACGTTTCCAGGTCACTACGTGATC
TATTGGGAACTCGGGAGAAAACTGAAGGACGCAAAAGTGGAGCCCCACCGCCATGTCTTA
GAGGAATGTTGCTTCACCATTGAGAAGTCTCTCAACTCTGTGTACAGAAAGTTACGTAAG
AATGATGGTACCATTAGTCCCCTTGAGATTAAGGTTGTTAGGCGTGGCGCTTTTGATGAG
CTCATGAATTTGTTCCTGTCTCGAGGCTCTTCTGTGAGTCAGTACAAGACCCCGAGGTCG
GTGAGTAGTGAAGAAGCTTTTAAGATATTGGAAGAGGCAGTTGTTTCCGAGTTTCTTAGC
ACGAAAACTCCGTCGTGGGAGCCACGTGAGATGCACTCTGGCCGATAAATCCAGTCCCGT
AATGTGGACAGTATAAGCCTTCGCTTATAATTACATATGAATAACGTCGCTATATATA**
**CTTTATATCACATAAAAGACACGATTACATAATCGAATATATAAGTCTATTACAATCG
TCAAGTGATGTTCTATAAAGTCTTTCACGTGTCTATAAAATGAAGACCTGC
CCCAAAAAAA

QA 2 652 2 652
DS 

RD RR2FY28JQ 591 0 0
TCATCGATTTCACTAGCCGTGTGGACTCCTCAACGTTTCCAGGTCACTACGTGATCTATT
GGGAACTCGGGAGAAAACTGAAGGACGCAAAAGTGGAGCCCCACCGCCATGTCTTAGAGG
AATGTTGCTTCACCATTGAGAAGTCTCTCAACTCTGTGTACAGAAAGTTACGTAAGAATG
ATGGTACCATTAGTCCCCTTGAGATTAAGGTTGTTAGGCGTGGCGCTTTTGATGAGCTCA
TGAATTTGTTCCTGTCTCGAGGCTCTTCTGTGAGTCAGTACAAGACCCCGAGGTCGGTGA
GTAGTGAAGAAGCTTTTAAGATATTGGAAGAGGCAGTTGTTTCCGAGTTTCTTAGCACGA
AAACTCCGTCGTGGGAGCCACGTGAGATGCACTCTGGCCGATAAATCCAGTCCCGTAATG
TGGACAGTATAAGCCTTCGCTTATAATTACATATGAATAACGTCGCTATATATA****CT
TTATATCACATAAAAGACACGATTACATAATCGAATATATAAGTCTATTACAATCGTCAA
GTGATGTTCTATAAAGTCTTTCACGTGTCTATAAAATGAAGACCTGC
CCCC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2GE11TF 561 0 0
G
CTACGTGATCTATTGGGAACTCGGGAGAAAACTGAAGGACGCAAAAGTGGAGCCCCACCG
CCATGTCTTAGAGGAATGCTGCTTCACCATTGAGAAGTCTCTCAACTCTGTGTACAGAAA
GTTACGTAAGAATGATGGTACCATTGGTCCCCTTGAGATTAAGGTTGTTAGGCGTGGCGC
TTTTGATGAGCTCATGAATTTGTTCCTGTCTCGAGGCTCTTCTGTGAGTCAGTACAAGAC
CCCGAGGTCGGTGAGTAGTGAAGAAGCTTTTAAGATATTGGAAGAGGCAGTCGTTTCCGA
GTTTCTTAGCACGAAAACTCCGTCGTGGGAGCCACGTGAGATGCACTCTGGCCGATAAAT
CCAGTCTCGTAATGTGGACAGTATAAGCCTTCGCTTATAATTACATATGAATAACGTCGC
TATATATA****CTTTATATCACATAAAAGACACGATTACATAATCGAATATATAAGTCT
ATTACAATCGTCAAGTGATGTTCTATAAAGTCTTTCACGTGTCTATAAAATGAAGACCTG
CTCTTATGAAGATGTGTTGA

QA 2 561 2 561
DS 

RD RR2EW21JQ 328 0 0
AAGACCCCGAGGTCGGTGAGTAGTGAAGAAGCTTTTAAGATATTGGAAGAGGCAGTTGTT
TCCGAGTTTCTTAGCACGAAAACTCCGTCGTGGGAGCCACGTGAGATGCACTCTGGCCGA
TAAATCCAGTCTCGTAATGTGGACAGTATAAGCCTTCGCTTATAATTACATGTGAATAAC
GTCGCTATATATA****CTTTATATCACATAAAAGACACGATTACATAATCGAATATATA
AGTCTATTACAATCGTCAAGTGATGTTCTATAAAGTCTTTCACGTGTCTATAAAATGAAG
ACCTGCTCTTATGAAGATGTGTTGAACC

QA 1 328 1 328
DS 



AS 1 9

CO CL567Contig1 998 9 12 U
CATTTCAAGTTCTCTTTTGAAATAAAATAATAGTCGTCGAATTAACATAATACTCAAGAA
ACATTGATTTATTGTGAAGGAGATTACAAAGACAGTGATAGTAAAACATCGGTTTATAAG
ATTACAAGCATCATTATTATACAAACACGAAACAACCATACATGGAATAGTATCTTTTGA
AGGATTTAACGACCAAGCAATGATGGATCGATGAGAATATCATGACTGTACCTTTGAGAG
ACAAGCATAACTGTAGATTGGTGGTCTCTAGATGCTTGGCCTTACATTGAGACGGCTTGC
CAGTTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCTTGAGACCAATAAGAGATCCAGATGCTACGGAT
TTCATGAGTGAGACGCGGCTCTGACAGGATCTCAACCCATCTCTTAACAAACCTGTCTTG
CCTGTCTGGTGCCCAGGATCTGTACCTATCTCCAGCC*GCTTGAAGTTGTTCTCTTTCTT
GATGACACACTTTGTTCTGATTCCAGTGTAGGATTTGTTAGGGATTGGAACTTTCTCGGC
GCAACGGACAGGATCAAACTTTGATGGATAATAATTGATCTCCTCATCTCTATGCATGAA
GTTCATAAAACCTTCATGGTGATTGTTGTGGTGAGCACATTTTGGAGCATTCACCGGTAG
CTGCAGATAGTTAGGTCCAAGACGATGTCTCTGAGTGTCACCATACGCAAAGATCCTACA
CTGAAGCAGCTTATCATCCGAGTAGTAGATCCCAGGAACCACAAGACCAGGGTTGAAAGC
AAGCTGCTCAGTTTCATTAAAGAAGTTGTCAATAGTCTTGTTGAGAACCAAGCGACCAAC
GGGTTGCAGAGGCAAGATATCCTCAGGCCAGATCTTGGTCACATCAAGCGGGTCGAAATC
AAACTTATCCTCATCAGCAGGATCCATGGTCTGGATGAAAAGCTTCACTCAGGATAGTTA
CCAGATGAGATAGCATCATGGAGATCCTTGGTAGCATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 40 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AI37TF C 1
AF RR2AI37JQ U 1
AF RR2GH21JQB U 169
AF RR2F672TF C 52
AF RR2F672JQ U 55
AF RR2E252JQ U 45
AF RR2E381JQ U 45
AF RR2E252TF C 188
AF RR2E381TF C 238
BS 1 119 RR2AI37JQ
BS 120 120 RR2E252JQ
BS 121 214 RR2AI37JQ
BS 215 215 RR2E252JQ
BS 216 237 RR2AI37JQ
BS 238 238 RR2E252JQ
BS 239 255 RR2AI37JQ
BS 256 256 RR2E252JQ
BS 257 335 RR2AI37JQ
BS 336 670 RR2E252JQ
BS 671 690 RR2E381JQ
BS 691 998 RR2E252TF

RD RR2AI37TF 275 0 0
CATTTCAAGTTCTCTTTTGAAATAAAATAATAGTCGTCGAATTAACATAATACTCAAGAA
ACATTGATTTATTGTGAAGGAGATTACAAAGACAGTGATAGTAAAACATCGGTTTATAAG
ATTACAAGCATCATTATTATACAAACACGAAACAACCATACATGGAATAGTATCTTTTGA
AGGATTTAACGACCAAGCAATGATGGATCGATGAGAATATCATGACTGTACCTTTGAGAG
ACAAGCATAACTGTAGATTGGTGGTCTCTAGATGC

QA 1 275 1 275
DS 

RD RR2AI37JQ 336 0 0
CATTTCAAGTTCTCTTTTGAAATAAAATAATAGTCGTCGAATTAACATAATACTCAAGAA
ACATTGATTTATTGTGAAGGAGATTACAAAGACAGTGATAGTAAAACATCGGTTTATAAA
ATTACAAGCATCATTATTATACAAACACGAAACAACCATACATGGAATAGTATCTTTTGA
AGGATTTAACGACCAAGCAATGATGGATCGATGAAAATATCATGACTGTACCTTTGAAAG
ACAAGCATAACTGTAAATTGGTGGTCTCTAGATGCTTGGCCTTACATTGAGACGGCTTGC
CAGTTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCTTGAGACC
C

QA 1 335 1 335
DS 

RD RR2GH21JQB 178 0 0
AGTATCTTTTGAAGGATTTAACGACCAAGCAATGATGGGTCGATGAGAATATCATGACTG
TACCTTTGAGAGACAAGCATAACTGTAGATTGGTGGTCTCTAGATGCTTGGCCTTACATT
GAGACGGCTTGCCAGTTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCTTGAGACCAATAAGAGATC

QA 1 178 1 178
DS 

RD RR2F672TF 565 0 0
TT
TCAAGAAACATTGATTTATTGTGAAGGAGATTACAAAGACAGTGATAGTAAAACATCGGT
TTATAAGATTACAAGCATCATTATTATACAAACACGAAACAACCATACATGGAATAGTAT
CTTTTGAAGGATTTAACGACCAAGCAATGATGGATCGATGAGAATATCATGACTGTACCT
TTGAGAGACAAGCATAACTGTAGATTGGTGGTCTCTAGATGCTTGGCCTTACATTGAGAC
GGCTTGCCAGTTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCTTGAGACCAATAAGAGATCCAGATGC
TACGGATTTCATGAGTGAGACGCGGCTCTGATAGGATCTCAACCCATCTCTTAACAAACC
TGTCTTGCCTGTCTGGTGCCCAGGATCTGTACCTATCTCCAGCCTGCTTGAAGTTGTTCT
CCTTCTTGATGACACACTTTGTTCTTATTCCAGTGTAGGATTTGTTAGGGATTGGAACTT
TCTCGGCGCAACGGACAGGATCAAACTTTGATGGGTAATAATTGATCTCCTCATCTCTAT
GCATGAAGTTCATGAAACCTTC
C

QA 3 564 3 564
DS 

RD RR2F672JQ 562 0 0
CAAGAAACATTGATTTATTGTGAAGGAGATTACAAAGACAGTGATAGTAAAACATCGGTT
TATAAGATTACAAGCATCATTATTATACAAACACGAAACAACCATACATGGAATAGTATC
TTTTGAAGGATTTAACGACCAAGCAATGATGGATCGATGAGAATATCATGACTGTACCTT
TGAGAGACAAGCATAACTGTAGATTGGTGGTCTCTAGATGCTTGGCCTTACATTGAGACG
GCTTGCCAGTTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCTTGAGACCAATAAGAGATCCAGATGCT
ACGGATTTCATGAGTGAGACGCGGCTCTGATAGGATCTCAACCCATCTCTTAACAAACCT
GTCTTGCCTGTCTGGTGCCCAGGATCTGTACCTATCTCCAGCCTGCTTGAAGTTGTTCTC
CTTCTTGATGACACACTTTGTTCTTATTCCAGTGTAGGATTTGTTAGGGATTGGAACTTT
CTCGGCGCAACGGACAGGATCAAACTTTGATGGGTAATAATTGATCTCCTCATCTCTATG
CATGAAGTTCATGAAACCTTC
C

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2E252JQ 626 0 0
GCT
TAATACTCAAGAAACATTGATTTATTGTGA*GGAGATTACAAAGACAGCGATAGTAAAAC
ATCGGTTTATAAGATTACAAGCATCATTATTATACAAACACGAAACAACCATACATGGAA
TAGTATCTTTTGAAGGATTTAACGACCAAGCGATGATGGATCGATGAGAATATCATGACT
GTACCTTTGAGAGACAAGCATAACTGTAGATTGGTGGTCTCTAGATGCTTGGCCTTACAT
TGAGACGGCTTGCCAGTTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCTTGAGACCAATAAGAGATCC
AGATGCTACGGATTTCATGAGTGAGACGCGGCTCTGACAGGATCTCAACCCATCTCTTAA
CAAACCTGTCTTGCCTGTCTGGTGCCCAGGATCTGTACCTATCTCCAGCC*GCTTGAAGT
TGTTCTCTTTCTTGATGACACACTTTGTTCTGATTCCAGTGTAGGATTTGTTAGGGATTG
GAACTTTCTCGGCGCAACGGACAGGATCAAACTTTGATGGATAATAATTGATCTCCTCAT
CTCTATGCATGAAGTTCATAAAACCTTCATGGTGATTGTTGTGGTGAGCACATTTTGGAG
CATTCACCGGTAGCTGCAGATAG

QA 4 626 4 626
DS 

RD RR2E381JQ 646 0 0
GCT
TAATACTCAAGAAACATTGATTTATTGTGA*GGAGATTACAAAGACAGCGATAGTAAAAC
ATCGGTTTATAAGATTACAAGCATCATTATTATACAAACACGAAACAACCATACATGGAA
TAGTATCTTTTGAAGGATTTAACGACCAAGCGATGATGGATCGATGAGAATATCATGACT
GTACCTTTGAGAGACAAGCATAACTGTAGATTGGTGGTCTCTAGATGCTTGGCCTTACAT
TGAGACGGCTTGCCAGTTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCTTGAGACCAATAAGAGATCC
AGATGCTACGGATTTCATGAGTGAGACGCGGCTCTGACAGGATCTCAACCCATCTCTTAA
CAAACCTGTCTTGCCTGTCTGGTGCCCAGGATCTGTACCTATCTCCAGCC*GCTTGAAGT
TGTTCTCTTTCTTGATGACACACTTTGTTCTGATTCCAGTGTAGGATTTGTTAGGGATTG
GAACTTTCTCGGCGCAACGGACAGGATCAAACTTTGATGGATAATAATTGATCTCCTCAT
CTCTATGCATGAAGTTCATAAAACCTTCATGGTGATTGTTGTGGTGAGCACATTTTGGAG
CATTCACCGGTAGCTGCAGATAGTTAGGTCCAAGACGATGTCT

QA 4 646 4 646
DS 

RD RR2E252TF 811 0 0
TTACGACC
AGCGATGATGGATCGATGAGA*TATCATGACTGTAC*TTTGAGAGACAAGCATAACTGTA
GATTGGTGGTCTCTAGATGCTTGGC*TTACATTGAGACGGCTTGCCAGTTTCTGTCCCAA
AGATCGATCAGCTTGAGACCAATAAGAGATCCAGATGCTACGGATTTCATGAGTGAGACG
CGGCTCTGACAGGATCTCAACCCATCTCTTAACAAACCTGTCTTGCCTGTCTGGTGCCCA
GGATCTGTACCTATCTCCAGCC*GCTTGAAGTTGTTCTCTTTCTTGATGACACACTTTGT
TCTGATTCCAGTGTAGGATTTGTTAGGGATTGGAACTTTCTCGGCGCAACGGACAGGATC
AAACTTTGATGGATAATAATTGATCTCCTCATCTCTATGCATGAAGTTCATAAAACCTTC
ATGGTGATTGTTGTGGTGAGCACATTTTGGAGCATTCACCGGTAGCTGCAGATAGTTAGG
TCCAAGACGATGTCTCTGAGTGTCACCATACGCAAAGATCCTACACTGAAGCAGCTTATC
ATCCGAGTAGTAGATCCCAGGAACCACAAGACCAGGGTTGAAAGCAAGCTGCTCAGTTTC
ATTAAAGAAGTTGTCAATAGTCTTGTTGAGAACCAAGCGACCAACGGGTTGCAGAGGCAA
GATATCCTCAGGCCAGATCTTGGTCACATCAAGCGGGTCGAAATCAAACTTATCCTCATC
AGCAGGATCCATGGTCTGGATGAAAAGCTTCACTCAGGATAGTTACCAGATGAGATAGCA
TCATGGAGATCCTTGGTAGCATC

QA 9 811 9 811
DS 

RD RR2E381TF 761 0 0
GAGACAAGCATAACTGTAGATTGGTGGTCTCTAGATGCTTGGC*TTACATTGAGACGGCT
TGCCAGTTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCTTGAGACCAATAAGAGATCCAGATGCTACG
GATTTCATGAGTGAGACGCGGCTCTGACAGGATCTCAACCCATCTCTTAACAAACCTGTC
TTGCCTGTCTGGTGCCCAGGATCTGTACCTATCTCCAGCC*GCTTGAAGTTGTTCTCTTT
CTTGATGACACACTTTGTTCTGATTCCAGTGTAGGATTTGTTAGGGATTGGAACTTTCTC
GGCGCAACGGACAGGATCAAACTTTGATGGATAATAATTGATCTCCTCATCTCTATGCAT
GAAGTTCATAAAACCTTCATGGTGATTGTTGTGGTGAGCACATTTTGGAGCATTCACCGG
TAGCTGCAGATAGTTAGGTCCAAGACGATGTCTCTGAGTGTCACCATACGCAAAGATCCT
ACACTGAAGCAGCTTATCATCCGAGTAGTAGATCCCAGGAACCACAAGACCAGGGTTGAA
AGCAAGCTGCTCAGTTTCATTAAAGAAGTTGTCAATAGTCTTGTTGAGAACCAAGCGACC
AACGGGTTGCAGAGGCAAGATATCCTCAGGCCAGATCTTGGTCACATCAAGCGGGTCGAA
ATCAAACTTATCCTCATCAGCAGGATCCATGGTCTGGATGAAAAGCTTCACTCAGGATAG
TTACCAGATGAGATAGCATCATGGAGATCCTTGGTAGCATC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 10

CO CL568Contig1 794 10 17 U
GGGAGAGAGAGCCACATATACGCAGCTACGGTTTCTAAGCATCCCTTTCTTCAAAACGGC
GCTGCTAGAGAAAACTCTTTAAAACCGGAGAGCTCAGTTTGATCTCGGAGGAATCGCAGC
CATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAGGACAAGGAAGTTCATGACCAACAGGCTTCTCTC
CAGGAAACAGTTCGTTATTGACGTTCTTCACCCAGGAAGAGCCAATGTCTCAAAGGCTGA
GCTAAAGGAGAAGTTGGCGAGGATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCAATCTTTGTATT
CAAATTCAGAACCCATTTTGGAGGTGGTAAATCATCTGGATTTGGTTTGATCTATGACAA
CGTCGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCCTAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGACTT*GACA
CCAAGATAGAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGAGCCAAGAAAATCC
GTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGCTTGCTGAAGAGAGC
TTGCAGGA***GCAAGGGTTGTTGTACTCTGCAGTATATCCCTTGTTTATGTCCCATGTT
TACTATTAGTCA*TCATCTAATTCGATTTTGTGGTTTGCCACTCGTTTTGTCTCGGTTTG
GATTATATGCTTTAAGCTTTAGAGAACCAATGTGGTAAGATTTTGCTGAATACATTTTCA
AACTTTTTCTCCTTGAACATCCATTGGTAAAGCATATGGGCGTTTAATTTGCTCCATTGG
AGCTTTAGCTTACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 15 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 15 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 45 60 60 60 30 60 60 60 60 60 
60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2H465TF U 123
AF RR2AN52TF U 1
AF RR2H465JQB C 345
AF RR2BN57TF U 19
AF RR2BN57JQ C 19
AF RR2BR07TF U 50
AF RR2BR07JQ C 50
AF RR2AN52JQ C 1
AF RR2AQ81JQ C 26
AF RR2AQ81TF U 26
BS 1 372 RR2AN52TF
BS 373 373 RR2BN57TF
BS 374 415 RR2AN52TF
BS 416 416 RR2BN57TF
BS 417 561 RR2AN52TF
BS 562 591 RR2BN57TF
BS 592 592 RR2BR07TF
BS 593 612 RR2BN57TF
BS 613 613 RR2BR07TF
BS 614 694 RR2BN57TF
BS 695 709 RR2BR07TF
BS 710 710 RR2AQ81TF
BS 711 736 RR2BR07TF
BS 737 737 RR2AQ81TF
BS 738 774 RR2BR07TF
BS 775 790 RR2AQ81TF
BS 791 794 RR2AN52JQ

RD RR2H465TF 294 0 0
TGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAGGACAAGGAACTTCATGACCAACAGGCTTCTCTCCA
GGAAGCAGTTTGTTATTGATTTTCTTCACCCAGGAAGAGCTAATGTTTCTAAGGCTGAGC
TGAAGGAGAAGTTGGCAAGGATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCAATCTTTGTATTCA
AATTCAGAACCCATTTTGGAGGTGGTAAATCATCTGGATTTGGTTTGATCTATGACAACG
TGGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCCTAGGTACAGGCTCATCAGGAATGGGCTTG

QA 1 294 1 294
DS 

RD RR2AN52TF 561 0 0
GGGAGAGAGAGCCACATATACGCAGCTACGGTTTCTAAGCATCCCTTTCTTCAAAACGGC
GCTGCTAGAGAAAACTCTTTAAAACCGGAGAGCTCAGTTTGATCTCGGAGGAATCGCAGC
CATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAGGACAAGGAAGTTCATGACCAACAGGCTTCTCTC
CAGGAAACAGTTCGTTATTGACGTTCTTCACCCAGGAAGAGCCAATGTCTCAAAGGCTGA
GCTAAAGGAGAAGTTGGCGAGGATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCAATCTTTGTATT
CAAATTCAGAACCCATTTTGGAGGTGGTAAATCATCTGGATTTGGTTTGATCTATGACAA
CGTCGAGAGTGCAAAGAAGTTCGAGCCTAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGACTTTGACA
CCAAGATAGAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGAGCCAAGAAAATCC
GTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGCTTGCTGAAGAGAGC
TTGCAGGA***GCAAGGGTTG

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2H465JQB 227 0 0
GTTGA
ATCTATGACAACGTGGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCCTAGGTACAGGTTCATCAGGAAT
GGGCTT*GACACCAAGATAGAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGGAAGAACAGAGC
CAAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGCTTG
CTGAAGAGAGCTTGCAGGAGGAGCAAGGGTTGTTGTACTCTG

QA 6 227 6 227
DS 

RD RR2BN57TF 681 0 0
G
ACGCAGCTACGGTTTCTAAGCATCCCTTTCTTCAAAACGGCGCTGCTAGAGAAAACTCTT
TAAAACCGGAGAGCTCAGTTTGATCTCGGAGGAATCGCAGCCATGGCGGAGAGAGCAGTC
ACCATCAGGACAAGGAACTTCATGACCAACAGGCTTCTCTCCAGGAAGCAGTTTGTTATT
GATGTTCTTCACCCAGGAAGAGCTAATGTTTCAAAGGCTGAGCTGAAGGAGAAGTTGGCA
AGGATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCAATCTTTGTATTCAAATTCAGAACCCATTTT
GGAGGTGGTAAATCATCTGGATTTGGTTTGATCTATGACAACGTGGAGAGTGCCAAGAAG
TTCGAGCCTAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGGCTT*GACACCAAGATAGAGAAATCAAG
GAGACAGATTAAGGAGAGGAAGAACAGAGCCAAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAA
GGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGCTTGCTGAAGAGAGCTTGCAGGAGGAGCAAGGGT
TGTTGTACTCTGCAGTATATCCCTTGTTTATGGCCCATGTTTACTATTAGTCAATCATCT
AATTCGATTTTGTGGTTTGCCACTCGTTTTGTCTCGGTTTGGATTATATGCTTTAAGCTT
TAGAGAACCAATGTG
CTAAA

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR2BN57JQ 678 0 0
G
ACGCAGCTACGGTTTCTAAGCATCCCTTTCTTCAAAACGGCGCTGCTAGAGAAAACTCTT
TAAAACCGGAGAGCTCAGTTTGATCTCGGAGGAATCGCAGCCATGGCGGAGAGAGCAGTC
ACCATCAGGACAAGGAACTTCATGACCAACAGGCTTCTCTCCAGGAAGCAGTTTGTTATT
GATGTTCTTCACCCAGGAAGAGCTAATGTTTCAAAGGCTGAGCTGAAGGAGAAGTTGGCA
AGGATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCAATCTTTGTATTCAAATTCAGAACCCATTTT
GGAGGTGGTAAATCATCTGGATTTGGTTTGATCTATGACAACGTGGAGAGTGCCAAGAAG
TTCGAGCCTAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGGCTT*GACACCAAGATAGAGAAATCAAG
GAGACAGATTAAGGAGAGGAAGAACAGAGCCAAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAA
GGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGCTTGCTGAAGAGAGCTTGCAGGAGGAGCAAGGGT
TGTTGTACTCTGCAGTATATCCCTTGTTTATGGCCCATGTTTACTATTAGTCAATCATCT
AATTCGATTTTGTGGTTTGCCACTCGTTTTGTCTCGGTTTGGATTATATGCTTTAAGCTT
TAGAGAACCAATGTG
CT

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR2BR07TF 728 0 0
GGA
AAAACGGCGCTGCTAGAGAAAACTCTTTAAAACCGGAGAGCTCAGTTTGATCTCGGAGGA
ATCGCAGCCATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAGGACAAGGAAGTTCATGACCAACAGG
CTTCTCTCCAGGAAACAGTTCGTTATTGACGTTCTTCACCCAGGAAGAGCCAATGTCTCA
AAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCGAGGATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCAATC
TTTGTATTCAAATTCAGAACCCATTTTGGAGGTGGTAAATCATCTGGATTTGGTTTGACC
TATGACAACGTCGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCCTAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGA
CTT*GACACCAAGATAGAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGAGCCAA
GAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGCTTGCTG
AAGAGAGCTTGCAGGA***GCAAGGGTTGTTGTACTCTGCAGTATATCCCTTGTTTATGT
CCCATGTTTACTATTAGTCA*TCATCTAATTCGATTTTGTGGTTTGCCACTCGTTTTGTC
TCGGTTTGGATTATATGCTTTAAGCTTTAGAGAACCAATGTGGTAAGATTTTGCTGA*TA
CATTTTCAAACTTTTTCTCCTTGA*CATCCATTGGTAAAGCATATGGGCGTTTAATTTGC
TC
AAA

QA 4 725 4 725
DS 

RD RR2BR07JQ 725 0 0
GGA
AAAACGGCGCTGCTAGAGAAAACTCTTTAAAACCGGAGAGCTCAGTTTGATCTCGGAGGA
ATCGCAGCCATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAGGACAAGGAAGTTCATGACCAACAGG
CTTCTCTCCAGGAAACAGTTCGTTATTGACGTTCTTCACCCAGGAAGAGCCAATGTCTCA
AAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCGAGGATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCAATC
TTTGTATTCAAATTCAGAACCCATTTTGGAGGTGGTAAATCATCTGGATTTGGTTTGATC
TATGACAACGTCGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCCTAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGA
CTT*GACACCAAGATAGAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGAGCCAA
GAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGCTTGCTG
AAGAGAGCTTGCAGGA***GCAAGGGTTGTTGTACTCTGCAGTATATCCCTTGTTTATGT
CCCATGTTTACTATTAGTCA*TCATCTAATTCGATTTTGTGGTTTGCCACTCGTTTTGTC
TCGGTTTGGATTATATGCTTTAAGCTTTAGAGAACCAATGTGGTAAGATTTTGCTGAATA
CATTTTCAAACTTTTTCTCCTTGAACATCCATTGGTAAAGCATATGGGCGTTTAATTTGC
TC

QA 4 725 4 725
DS 

RD RR2AN52JQ 794 0 0
GGGAGAGAGAGCCACATATACGCAGCTACGGTTTCTAAGCATCCCTTTCTTCAAAACGGC
GCTGCTAGAGAAAACTCTTTAAAACCGGAGAGCTCAGTTTGATCTCGGAGGAATCGCAGC
CATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAGGACAAGGAAGTTCATGACCAACAGGCTTCTCTC
CAGGAAACAGTTCGTTATTGACGTTCTTCACCCAGGAAGAGCCAATGTCTCAAAGGCTGA
GCTAAAGGAGAAGTTGGCGAGGATGTACGAGGTCAAGGACCCAAATGCAATCTTTGTATT
CAAATTCAGAACCCATTTTGGAGGTGGTAAATCATCTGGATTTGGTTTGATCTATGACAA
CGTCGAGAGTGCAAAGAAGTTCGAGCCTAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGACTT*GACA
CCAAGATAGAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGAGCCAAGAAAATCC
GTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGCTTGCTGAAGAGAGC
TTGCAGGA***GCAAGGGTTGTTGTACTCTGCAGTATATCCCTTGTTTATGTCCCATGTT
TACTATTAGTCG*TCATCTAATTCGATTTTGTGGTTTGCCACTCGTTTTGTCTCGGTTTG
GATTATATGCTTTAAGCTTTAGAGAACCAATGTGGTAAGATTTTGCTGAATACATTTTCA
AACTTTTTCTCCTTGAACATCCATTGGTAAAGCATATGGGCGTTTAATTTGCTCCATTGG
AGCTTTAGCTTACT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2AQ81JQ 765 0 0
GG
ACGGTTTCTAAGCATCCCTTTCTTCAAAACGGCGCTGCTAGAGAAAACTCTTTAAAACCG
GAGAGCTCAGTTTGATCTCGGAGGAATCGCAGCCATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAG
GACAAGGAAGTTCATGACCAACAGGCTTCTCTCCAGGAAACAGTTCGTTATTGACGTTCT
TCACCCAGGAAGAGCCAATGTCTCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCGAGGATGTA
CGAGGTCAAGGACCCAAATTCAATCTTTGTATTCAAATTCAGAACCCATTTTGGAGGTGG
TAAATCATCTGGATTTGGTTTGATCTACGACAACGTCGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCC
TAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGACTT*GACACCAAGATAGAGAAATCAAGGAAACAGA
TTAAGGAGAGAAAGAACAGAGCCAAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTG
ACCCCAAGAAGAAGTAAGCTTGCTGAAGAGAGCTTGCAGGA***GCAAGGGTTGTTGTAC
TCTGCAGTATATCCCTTGTTTATGTTCCATGTTTACTATTAGTCA*TCATCTAATTCGAT
TTTGTGGTTTGCCACTCGTTTTGTCTCGGTTTGGATTATATGCTTTAAGCTTTAGAGAAC
CAATGTGGTAAGATTTTGCTGAATACATTTTCAAACTTTTTCTCCTTGAACATCCATTGG
TAAAGCATATGGGCGTTTAATTTGCTCCATTGGAGCTTTAGCT

QA 3 765 3 765
DS 

RD RR2AQ81TF 765 0 0
GG
ACGGTTTCTAAGCATCCCTTTCTTCAAAACGGCGCTGCTAGAGAAAACTCTTTAAAACCG
GAGAGCTCAGTTTGATCTCGGAGGAATCGCAGCCATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAG
GACAAGGAAGTTCATGACCAACAGGCTTCTCTCCAGGAAACAGTTCGTTATTGACGTTCT
TCACCCAGGAAGAGCCAATGTCTCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCGAGGATGTA
CGAGGTCAAGGACCCAAATTCAATCTTTGTATTCAAATTCAGAACCCATTTTGGAGGTGG
TAAATCATCTGGATTTGGTTTGATCTACGACAACGTCGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCC
TAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGACTT*GACACCAAGATAGAGAAATCAAGGAAACAGA
TTAAGGAGAGAAAGAACAGAGCCAAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTG
ACCCCAAGAAGAAGTAAGCTTGCTGAAGAGAGCTTGCAGGA***GCAAGGGTTGTTGTAC
TCTGCAGTATATCCCTTGTTTATGTTCCATGTTTACTATTAGTCA*TCATCTAATTCGAT
TTTGTGGTTTGCCACTCGTTTTGTCTCGGTTTGGATTATATGCTTTAAGCTTTAGAGAAC
CAATGTGGTAAGATTTTGCTGAATACATTTTCAAACTTTTTCTCCTTGAACATCCATTGG
TAAAGCATATGGGCGTTTAATTTGCTCCATTGGAGCTTTAGCT

QA 3 765 3 765
DS 



AS 1 10

CO CL569Contig1 646 10 7 U
GGATGACGTTTGTATCCGGAAGAAGAAGTAAAGAAAAAAGATCGAAAGATCTGAGAGAGA
GGAAGGCAAAGGAAGATGGGAATAAGGTTCATATTAATGGTGAACAAGCAAGGCCAGACT
CGCCTTGCTCAGTACTACGAATGGCTCACCCTCGAGGAACGTCGTGCTCTCGAAGGCGAG
ATCGTTCGTAAATGCCTCGCTCGCAACGACCAGCAGTGTTCGTTTGTGGAGCATCGCAAC
TACAAGATCGTCTACAGGCGTTATGCGTCTCTCTTTTTCATGGTTGGCGTTGATGACGAT
GAAAACGAGCTGGCGATTCTAGAGTTCATACATCTTTTGGTCGAGACTATGGACAAGCAT
TTTGGAAATGTGTGTGAGCTGGACATAATGTTCCATCTGGAGAAAGCTCATTTCATGCTC
GAGGAAATGGTGATGAATGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAAAGCCAACATACTTTCGCCT
ATACAGCTCATGGACAAAGCCCATTAATTTTCAAAAGACTTGTTCTTTTCCTTTTCAGCA
CACTGTTGAGACAACTTCTGTAATATTATTACTTCTTCACTCGTTTGTCCCATTCGAATC
TAAAGAACAATTTGTTTTCTTCCATGCTTTGAATGTTAGTGGTTAG


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DD66TF U 1
AF RR2GH76JQB C 2
AF RR2GH76TF U 2
AF RR2AF85JQ C 18
AF RR2AF85TF U 18
AF RR2CG85JQ C 18
AF RR2FM57TF U 62
AF RR2CG85TF U 18
AF RR2CH21JQ C 42
AF RR2CH21TF U 42
BS 1 17 RR2DD66TF
BS 18 19 RR2AF85TF
BS 20 615 RR2DD66TF
BS 616 619 RR2GH76TF
BS 620 621 RR2FM57TF
BS 622 622 RR2CG85TF
BS 623 646 RR2CH21TF

RD RR2DD66TF 615 0 0
GGATGACGTTTGTATCCTCAAGAAGAAGTAAAGAAAAAAGATCGAAAGATCTGAGAGAGA
GGAAGGCAAAGGAAGATGGGAATAAGGTTCATATTAATGGTGAACAAGCAAGGCCAGACT
CGCCTTGCTCAGTACTACGAATGGCTCACCCTCGAGGAACGTCGTGCTCTCGAAGGCGAG
ATCGTTCGTAAATGCCTCGCTCGCAACGACCAGCAGTGTTCGTTTGTGGAGCATCGCAAC
TACAAGATCGTCTACAGGCGTTATGCGTCTCTCTTTTTCATGGTTGGCGTTGATGACGAT
GAAAACGAGCTGGCGATTCTAGAGTTCATACATCTTTTGGTCGAGACTATGGACAAGCAT
TTTGGAAATGTGTGTGAGCTGGACATAATGTTCCATCTGGAGAAAGCTCATTTCATGCTC
GAGGAAATGGTGATGAATGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAAAGCCAACATACTTTCGCCT
ATACAGCTCATGGACAAAGCCCATTAATTTTCAAAAGACTTGTTCTTTTCCTTTTCAGCA
CACTGTTGAGACAACTTCTGTAATATTATTACTTCTTCACTCGTTTGTCCCATTCGAATC
TAAAGAACAATTTGT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2GH76JQB 618 0 0
GGG
GACGTTTGTATCCTCAAGAAGAAGTAAAGAAAAAAGATCGAAAGATCTGAGAGAGAGGAA
GGCAAAGGAAGATGGGAATAAGGTTCATATTAATGGTGAACAAGCAAGGCCAGACTCGCC
TTGCTCAGTACTACGAATGGCTCACCCTCGAGGAACGTCGTGCTCTCGAAGGCGAGATCG
TTCGTAAATGCCTCGCTCGCAACGACCAGCAGTGTTCGTTTGTGGAGCATCGCAACTACA
AGATCGTCTACAGGCGTTATACGTCTCTCTTTTTCATGGTTGGCGTTGATGACGATGAAA
ACGAGCTGGCGATTCTAGAGTTCATACATCTTTTGGTCGAGACTATGGACAAGCATTTTG
GAAATGTGTGTGAGCTGGACATAATGTTCCATCTGGAGAAAGCTCATTTCATGCTCGAGG
AAATGGTGATGAATGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAAAGCCAACATACTTTCGCCTATAC
AGCTCATGGACAAAGCCCATTAATTTTCAAAAGACTTGTTCTTTTCCTTTTCAGCACACT
GTTGAGACAACTTCTGTAATATTATTACTTCTTCACTCGTTTGTCCCATTCGAATCTAAA
GAACAATTTGTTTTC

QA 4 618 4 618
DS 

RD RR2GH76TF 618 0 0
GGG
GACGTTTGTATCCTCAAGAAGAAGTAAAGAAAAAAGATCGAAAGATCTGAGAGAGAGGAA
GGCAAAGGAAGATGGGAATAAGGTTCATATTAATGGTGAACAAGCAAGGCCAGACTCGCC
TTGCTCAGTACTACGAATGGCTCACCCTCGAGGAACGTCGTGCTCTCGAAGGCGAGATCG
TTCGTAAATGCCTCGCTCGCAACGACCAGCAGTGTTCGTTTGTGGAGCATCGCAACTACA
AGATCGTCTACAGGCGTTATACGTCTCTCTTTTTCATGGTTGGCGTTGATGACGATGAAA
ACGAGCTGGCGATTCTAGAGTTCATACATCTTTTGGTCGAGACTATGGACAAGCATTTTG
GAAATGTGTGTGAGCTGGACATAATGTTCCATCTGGAGAAAGCTCATTTCATGCTCGAGG
AAATGGTGATGAATGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAAAGCCAACATACTTTCGCCTATAC
AGCTCATGGACAAAGCCCATTAATTTTCAAAAGACTTGTTCTTTTCCTTTTCAGCACACT
GTTGAGACAACTTCTGTAATATTATTACTTCTTCACTCGTTTGTCCCATTCGAATCTAAA
GAACAATTTGTTTTC

QA 4 618 4 618
DS 

RD RR2AF85JQ 603 0 0
GGAAGAAGAAGTAAAGAAAAAAGATCGAAAGATCTGAGAGAGAGGAAGGTAAAGGAAGAT
GGGAATAAGGTTCATATTAATGGTGAACAAGCAAGGCCAGACTCGCCTTGCTCAGTACTA
CGAATGGCTCACCCTCGAGGAACGTCGTGCTCTCGAAGGCGAGATCGTTCGTAAATGCCT
CGCTCGCAACGACCAGCAGTGTTCGTTTGTGGAGCATCGCAACTACAAGATCGTCTACAG
GCGTTATGCGTCTCTCTTTTTCATGGTTGGCGTTGATGACGATGAAAACGAGCTGGCGAT
TCTAGAGTTCATACATCTTTTGGTCGAGACTATGGACAAGCATTTTGGAAATGTGTGTGA
GCTGGACATAATGTTCCATCTGGAGAAAGCTCATTTCATGCTCGAGGAAATGGTGATGAA
TGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAAAGCCAACATACTTTCGCCTATACAGCTCATGGACAA
AGCCCATTAATTTTCAAAAGACTTGTTCTTTTCCTTTTCAGCACACTGTTGAGACAACTT
CTGTAATATTATTACTTCTTCACTCGTTTGTCCCATTCGAATCTAAAGAACAATTTGTTT
TC
C

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2AF85TF 603 0 0
GGAAGAAGAAGTAAAGAAAAAAGATCGAAAGATCTGAGAGAGAGGAAGGTAAAGGAAGAT
GGGAATAAGGTTCATATTAATGGTGAACAAGCAAGGCCAGACTCGCCTTGCTCAGTACTA
CGAATGGCTCACCCTCGAGGAACGTCGTGCTCTCGAAGGCGAGATCGTTCGTAAATGCCT
CGCTCGCAACGACCAGCAGTGTTCGTTTGTGGAGCATCGCAACTACAAGATCGTCTACAG
GCGTTATGCGTCTCTCTTTTTCATGGTTGGCGTTGATGACGATGAAAACGAGCTGGCGAT
TCTAGAGTTCATACATCTTTTGGTCGAGACTATGGACAAGCATTTTGGAAATGTGTGTGA
GCTGGACATAATGTTCCATCTGGAGAAAGCTCATTTCATGCTCGAGGAAATGGTGATGAA
TGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAAAGCCAACATACTTTCGCCTATACAGCTCATGGACAA
AGCCCATTAATTTTCAAAAGACTTGTTCTTTTCCTTTTCAGCACACTGTTGAGACAACTT
CTGTAATATTATTACTTCTTCACTCGTTTGTCCCATTCGAATCTAAAGAACAATTTGTTT
TC
C

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2CG85JQ 605 0 0
GGAAGAAGAAGTAAAGAAAAAAGATCGAAAGATCTGAGAGAGAGGAAGGCAAAGGAAGAT
GGGAATAAGGTTCATATTAATGGTGAACAAGCAAGGCCAGACTCGCCTTGCTCAGTACTA
CGAATGGCTCACCCTCGAGGAACGTCGTGCTCTCGAAGGCGAGATCGTTCGTAAATGCCT
CGCTCGCAACGACCAGCAGTGTTCGTTTGTGGAGCATCGCAACTACAAGATCGTCTACAG
GCGTTATGCGTCTCTCTTTTTCATGGTTGGCGTTGATGACGATGAAAACGAGCTGGCGAT
TCTAGAGTTCATACATCTTTTGGTCGAGACTATGGACAAGCATTTTGGAAATGTGTGTGA
GCTGGACATAATGTTCCATCTGGAGAAAGCTCATTTCATGCTCGAGGAAATGGTGATGAA
TGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAAAGCCAACATACTTTCGCCTATACAGCTCATGGACAA
AGCCCATTAATTTTCAAAAGACTTGTTCTTTTCCTTTTCAGCACACTGTTGAGACAACTT
CTGTAATATTATTACTTCTTCACTCGTTTGTCCCATTCGAATCTAAAGAACAATTTGTTT
TCTTC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2FM57TF 560 0 0
GG
AGGCAAAGGAAGATGGGAATAAGGTTCATATTAATGGTGAACAAGCAAGGCCAGACTCGC
CTTGCTCAGTACTACGAATGGCTCACCCTCGAGGAACGTCGTGCTCTTGAAGGCGAGATC
GTTCGTAAATGCCTCGCTCGCAACGACCAGCAGTGTTCGTTTGTGGAGCATCGCAACTAC
AAGATCGTCTACAGGCGTTATGCGTCTCTCTTTTTCATGGTTGGCGTTGATGACGATGAA
AACGAGCTGGCGATTCTAGAGTTCATACATCTTTTGGTCGAGACTATGGACAAGCATTTT
GGAAATGTGTGTGAGCTGGACATAATGTTCCATCTGGAGAAAGCTCATTTCATGCTCGAG
GAAATGGTGATGAATGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAAAGCCAACATACTTTCGCCTATA
CAGCTCATGGACAAAGCCCATTAATTTTCAAAAGACTTGTTCTTTTCCTTTTCAGCACAC
TGTTGAGACAACTTCTGTAATATTATTACTTCTTCACTCGTTTGTCCCATTCGAATCTAA
AGAACAATTTGTTTTCTT

QA 3 560 3 560
DS 

RD RR2CG85TF 605 0 0
GGAAGAAGAAGTAAAGAAAAAAGATCGAAAGATCTGAGAGAGAGGAAGGCAAAGGAAGAT
GGGAATAAGGTTCATATTAATGGTGAACAAGCAAGGCCAGACTCGCCTTGCTCAGTACTA
CGAATGGCTCACCCTCGAGGAACGTCGTGCTCTCGAAGGCGAGATCGTTCGTAAATGCCT
CGCTCGCAACGACCAGCAGTGTTCGTTTGTGGAGCATCGCAACTACAAGATCGTCTACAG
GCGTTATGCGTCTCTCTTTTTCATGGTTGGCGTTGATGACGATGAAAACGAGCTGGCGAT
TCTAGAGTTCATACATCTTTTGGTCGAGACTATGGACAAGCATTTTGGAAATGTGTGTGA
GCTGGACATAATGTTCCATCTGGAGAAAGCTCATTTCATGCTCGAGGAAATGGTGATGAA
TGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAAAGCCAACATACTTTCGCCTATACAGCTCATGGACAA
AGCCCATTAATTTTCAAAAGACTTGTTCTTTTCCTTTTCAGCACACTGTTGAGACAACTT
CTGTAATATTATTACTTCTTCACTCGTTTGTCCCATTCGAATCTAAAGAACAATTTGTTT
TCTTC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2CH21JQ 605 0 0
TCGAAAGATCTGAGAGAGAGGAAGGCAAAGGAAGATGGGAATAAGGTTCATATTAATGGT
GAACAAGCAAGGCCAGACTCGCCTTGCTCAGTACTACGAATGGCTCACCCTCGAGGAACG
TCGTGCTCTCGAAGGCGAGATCGTTCGTAAATGCCTCGCTCGCAACGACCAGCAGTGTTC
GTTTGTGGAGCATCGCAACTACAAGATCGTCTACAGGCGTTATGCGTCTCTCTTTTTCAT
GGTTGGCGTTGATGACGATGAAAACGAGCTGGCGATTCTAGAGTTCATACATCTTTTGGT
CGAGACTATGGACAAGCATTTTGGAAATGTGTGTGAGCTGGACATAATGTTCCATCTGGA
GAAAGCTCATTTCATGCTCGAGGAAATGGTGATGAATGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAA
AGCCAACATACTTTCGCCTGTACAGCTCATGGACAAAGCCCATTAATTTTCAAAAGACTT
GTTCTTTTCCTTTTCAGCACACTGTTGAGACAACTTCTGTAATATTATTACTTCTTCACT
CGTTTGTCCCATTCGAATCTAAAGAACAATTTGTTTTCTTCCATGCTTTGAATGTTAGTG
GTTAG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2CH21TF 605 0 0
TCGAAAGATCTGAGAGAGAGGAAGGCAAAGGAAGATGGGAATAAGGTTCATATTAATGGT
GAACAAGCAAGGCCAGACTCGCCTTGCTCAGTACTACGAATGGCTCACCCTCGAGGAACG
TCGTGCTCTCGAAGGCGAGATCGTTCGTAAATGCCTCGCTCGCAACGACCAGCAGTGTTC
GTTTGTGGAGCATCGCAACTACAAGATCGTCTACAGGCGTTATGCGTCTCTCTTTTTCAT
GGTTGGCGTTGATGACGATGAAAACGAGCTGGCGATTCTAGAGTTCATACATCTTTTGGT
CGAGACTATGGACAAGCATTTTGGAAATGTGTGTGAGCTGGACATAATGTTCCATCTGGA
GAAAGCTCATTTCATGCTCGAGGAAATGGTGATGAATGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAA
AGCCAACATACTTTCGCCTGTACAGCTCATGGACAAAGCCCATTAATTTTCAAAAGACTT
GTTCTTTTCCTTTTCAGCACACTGTTGAGACAACTTCTGTAATATTATTACTTCTTCACT
CGTTTGTCCCATTCGAATCTAAAGAACAATTTGTTTTCTTCCATGCTTTGAATGTTAGTG
GTTAG

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 10

CO CL570Contig1 606 10 7 U
CGGTTACGTCTAAAAAATACTGAAACGTCTTAACAAAGTCTGTCTAATACCAAACTCATG
TTTGTAGATTGCAAACACAGACGGTAAACAAAATCGTCTTACAAAATGGGAAATGCAAAC
AAACCAGAAACAAACTTAATAGTTTAGTTACTTCACTCGTCCTCTTGGCTACGGAGCCTA
GCAAGCCTGTTGGTCACAACAATATCCAACTGAGAAGCTCTCTCCACAATAGCCTTCCTC
TTCTTGGTCGATACGTTGTGTGCAATCTCCGCGCAGTACGTCCTGTTGTGCATCATCAGC
AGCTCGAGGTCACTCGTGTTGTGCACAACAAACTTCTTGAACCCGTTGGGTAGGTAGTGA
CGTGTCTTCTTGTCTGATCCGTAACCAACATTGGGCATCAACGTCACACCCTTGAACTTT
CTTCTAACCCTTGAATCAATACCCTTTGGCCTCCTCCAGCTTTCCTTGACGGTGATTCTA
CGGTCGCTCTGGGGTCTGATGAACTTGGCAGACCTCTTCTTCACCACCTTCTTCGTTAGC
AACGGTACCGCCATTTCTGCTGCTTCCTAAGATCAGAACCTCGATGCGACTCTCTGTAAA
CGGCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 30 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 35 35 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 

AF RR2DV82JQ U 46
AF RR2AQ49JQ U 46
AF RR2A470JQ U 46
AF RR2DV82TF C 46
AF RR2A470TF C 46
AF RR2BT77JQ U 26
AF RR2BT77TF C 26
AF RR2D047JQ U 1
AF RR2D047TF C 1
AF RR2AQ49TF C 46
BS 1 213 RR2D047JQ
BS 214 214 RR2A470JQ
BS 215 419 RR2D047JQ
BS 420 420 RR2DV82JQ
BS 421 497 RR2D047JQ
BS 498 498 RR2DV82JQ
BS 499 606 RR2D047JQ

RD RR2DV82JQ 508 0 0
AATACCAAACTCATGTTTGTAGATTGCAAACACAGACGGTAAACAAAATCGTCTTACAAA
ATGGGAAATGCAAACAAACCAGAAACAAACTTAATAGTTTAGTTACTTCACTCGTCCTCT
TTGCTACGGAGCCTAGCAAGCCTGTTGGTCACAACAATATCCAACTGAAAAGCTCTCTCC
ACAATAGCCTTCCTCTTCTTGGTCGATACGTTGTGTGCAATCTCCGCGCAGTACGTCCTG
TTGTGCATCATCAGCAGCTCGAGATCACTCGTGTTGTGCACAACAAACTTCTTGAACCCG
TTGGGTAGGTAGTGACGTGTCTTCTTGTCTGATCCGTAACCAACATTGGGCATCAACGCC
ACACCCTTGAACTTTCTTCTAACCCTTGAATCAATACCCTTTGGCCTCCTCCAGCTTTCC
TTGACGGTGATTCTACGGTCGCTCTGGGGTCTGATGAACTTGGCAGACCTCTTCTTCACC
ACCTTCTTCGTTAGCAACGGTACCGCCA

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2AQ49JQ 527 0 0
AATACCAAACTCATGTTTGTAGATTGCAAACACAGACGGTAAACAAAATCGTCTTACAAA
ATGGGAAATGCAAACAAACCAAAAACAAACTTAATAGTTTAGTTACTTCACTCGTCCTCT
TGGCTACGGAGCCTAGCAAGCCTGTTGGTCACAACAATATCCAACTGAAAAGCTCTCTCC
ACAATAGCCTTCCTCTTCTTGGTCGATACGTTGTGTGCAATCTCCGCGCAGTACGTCCTG
TTGTGCATCATCAGCAGCTCGAGGTCACTCGTGTTGTGCACAACAAACTTCTTGAACCCG
TTGGGTAGGTAGTGACGTGTCTTCTTGTCTGATCCGTAACCAACATTGGGCATCAACGTC
A*ACCCTTGAACTTTCTTCTAACCCTTGAATCAATACCCTTTGGCCTCCTCCAGCTTTCC
TTGACGGTGATTCTACGGTCGCTCTGGGGTCTGATGAACTTGGCAGACCTCTTCTTCACC
ACCTTCTTCGTTAGCAACGGTACCGCCATTTCTGCTGCTTCCTAAGA

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2A470JQ 550 0 0
AATACCAAACTCATGTTTGTAGATTGCAAACACAGACGGTAAACAAAATCGTCTTACAAA
ATGGGAAATGCAAACAAACCAGAAACAAACTTAATAGTTTAGTTACTTCACTCGTCCTCT
TGGCTACGGAGCCTAGCAAGCCTGTTGGTCACAACAATATCCAACTGAGAAGCTCTCTCC
ACAATAGCCTTCCTCTTCTTGGTCGATACGTTGTGTGCAATCTCCGCGCAGTACGTCCTG
TTGTGCATCATCAGCAGCTCGAGGTCACTCGTGTTGTGCACAACAAACTTCTTGAACCCG
TTGGGTAGGTAGTGACGTGTCTTCTTGTCTGATCCGTAACCAACATTGGGCATCAACGTC
ACACCCTTGAACTTTCTTCTAACCCTTGAATCAATACCCTTTGGCCTCCTCCAGCTTTCC
TTGACGGTGATTCTACGGTCGCTCTGGGGTCTGATGAACTTGGCAGACCTCTTCTTCACC
ACCTTCTTCGTTAGCAACGGTACCGCCATTTCTGCTGCTTCCTAAGATCAGAACCTCGAT
GCGACTCTC
C

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2DV82TF 547 0 0
AATACCAAACTCATGTTTGTAGATTGCAAACACAGACGGTAAACAAAATCGTCTTACAAA
ATGGGAAATGCAAACAAACCAGAAACAAACTTAATAGTTTAGTTACTTCACTCGTCCTCT
TTGCTACGGAGCCTAGCAAGCCTGTTGGTCACAACAATATCCAACTGAGAAGCTCTCTCC
ACAATAGCCTTCCTCTTCTTGGTCGATACGTTGTGTGCAATCTCCGCGCAGTACGTCCTG
TTGTGCATCATCAGCAGCTCGAGATCACTCGTGTTGTGCACAACAAACTTCTTGAACCCG
TTGGGTAGGTAGTGACGTGTCTTCTTGTCTGATCCGTAACCAACATTGGGCATCAACGCC
ACACCCTTGAACTTTCTTCTAACCCTTGAATCAATACCCTTTGGCCTCCTCCAGCTTTCC
TTGACGGTGATTCTACGGTCGCTCTGGGGTCTGATGAACTTGGCAGACCTCTTCTTCACC
ACCTTCTTCGTTAGCAACGGTACCGCCATTTCTGCTGCTTCCTAAGATCAGAACCTCGAT
GCGAC
CC

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2A470TF 550 0 0
AATACCAAACTCATGTTTGTAGATTGCAAACACAGACGGTAAACAAAATCGTCTTACAAA
ATGGGAAATGCAAACAAACCAGAAACAAACTTAATAGTTTAGTTACTTCACTCGTCCTCT
TGGCTACGGAGCCTAGCAAGCCTGTTGGTCACAACAATATCCAACTGAGAAGCTCTCTCC
ACAATAGCCTTCCTCTTCTTGGTCGATACGTTGTGTGCAATCTCCGCGCAGTACGTCCTG
TTGTGCATCATCAGCAGCTCGAGGTCACTCGTGTTGTGCACAACAAACTTCTTGAACCCG
TTGGGTAGGTAGTGACGTGTCTTCTTGTCTGATCCGTAACCAACATTGGGCATCAACGTC
ACACCCTTGAACTTTCTTCTAACCCTTGAATCAATACCCTTTGGCCTCCTCCAGCTTTCC
TTGACGGTGATTCTACGGTCGCTCTGGGGTCTGATGAACTTGGCAGACCTCTTCTTCACC
ACCTTCTTCGTTAGCAACGGTACCGCCATTTCTGCTGCTTCCTAAGATCAGAACCTCGAT
GCGACTCTC
C

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2BT77JQ 568 0 0
CGTCTTAACAAAGTCTGTCTAATACCAAACTCATGTTTGTAGATTGCAAACACAGACGGT
AAACAAAATCGTCTTACAAAATGGGAAATGCAAACAAAACAGAAACAAACTTAATAGTTT
AGTTACTTCACTCGTCCTCTTGGCTACGGAGCCTAGCAAGCCTGTTGGTCACAACAATAT
CCAACTGAGAAGCTCTCTCCACAATAGCCTTCCTCTTCTTGGTCGATACGTTGTGTGCAA
TCTCCGCGCAGTACGTCCTGTTGTGCATCATCAGCAGCTCGAGGTCACTCGTGTTGTGCA
CAACAAACTTCTTGAACCCGTTGGGTAGGTAGTGACGTGTCTTCTTGTCTGATCCGTAAC
CAACATTGGGCATCAACGTCACACCCTTGAACTTTCTTCTAACCCTTGAATCAATACCCT
TTGGCCTCCTCCAGCTTTCCTTGACGGTGATTCTACGGTCGCTCTGGGGTCTGATGAACT
TGGCAGACCTCTTCTTCACCACCTTCTTCGTTAGCAACGGTACCGCCATTTCTGCTGCTT
CCTAAGATCAGAACCTCGATGCGACTC
C

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2BT77TF 568 0 0
CGTCTTAACAAAGTCTGTCTAATACCAAACTCATGTTTGTAGATTGCAAACACAGACGGT
AAACAAAATCGTCTTACAAAATGGGAAATGCAAACAAAACAGAAACAAACTTAATAGTTT
AGTTACTTCACTCGTCCTCTTGGCTACGGAGCCTAGCAAGCCTGTTGGTCACAACAATAT
CCAACTGAGAAGCTCTCTCCACAATAGCCTTCCTCTTCTTGGTCGATACGTTGTGTGCAA
TCTCCGCGCAGTACGTCCTGTTGTGCATCATCAGCAGCTCGAGGTCACTCGTGTTGTGCA
CAACAAACTTCTTGAACCCGTTGGGTAGGTAGTGACGTGTCTTCTTGTCTGATCCGTAAC
CAACATTGGGCATCAACGTCACACCCTTGAACTTTCTTCTAACCCTTGAATCAATACCCT
TTGGCCTCCTCCAGCTTTCCTTGACGGTGATTCTACGGTCGCTCTGGGGTCTGATGAACT
TGGCAGACCTCTTCTTCACCACCTTCTTCGTTAGCAACGGTACCGCCATTTCTGCTGCTT
CCTAAGATCAGAACCTCGATGCGACTC
C

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2D047JQ 606 0 0
CGGTTACGTCTAAAAAATACTGAAACGTCTTAACAAAGTCTGTCTAATACCAAACTCATG
TTTGTAGATTGCAAACACAGACGGTAAACAAAATCGTCTTACAAAATGGGAAATGCAAAC
AAACCAGAAACAAACTTAATAGTTTAGTTACTTCACTCGTCCTCTTGGCTACGGAGCCTA
GCAAGCCTGTTGGTCACAACAATATCCAACTGAAAAGCTCTCTCCACAATAGCCTTCCTC
TTCTTGGTCGATACGTTGTGTGCAATCTCCGCGCAGTACGTCCTGTTGTGCATCATCAGC
AGCTCGAGGTCACTCGTGTTGTGCACAACAAACTTCTTGAACCCGTTGGGTAGGTAGTGA
CGTGTCTTCTTGTCTGATCCGTAACCAACATTGGGCATCAACGTCACACCCTTGAACTTC
CTTCTAACCCTTGAATCAATACCCTTTGGCCTCCTCCAGCTTTCCTTGACGGTGATTCTA
CGGTCGCTCTGGGGTCTAATGAACTTGGCAGACCTCTTCTTCACCACCTTCTTCGTTAGC
AACGGTACCGCCATTTCTGCTGCTTCCTAAGATCAGAACCTCGATGCGACTCTCTGTAAA
CGGCCC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2D047TF 606 0 0
CGGTTACGTCTAAGAAATACTGAAACGTCTTAACAAAGTCTGTCTAATACCAAACTCATG
TTTGTAGATTGCAAACACAGACGGTAAACAAAATCGTCTTACAAAATGGGAAATGCAAAC
AAACCAGAAACAAACTTAATAGTTTAGTTACTTCACTCGTCCTCTTGGCTACGGAGCCTA
GCAAGCCTGTTGGTCACAACAATATCCAACTGAGAAGCTCTCTCCACAATAGCCTTCCTC
TTCTTGGTCGATACGTTGTGTGCAATCTCCGCGCAGTACGTCCTGTTGTGCATCATCAGC
AGCTCGAGGTCACTCGTGTTGTGCACAACAAACTTCTTGAACCCGTTGGGTAGGTAGTGA
CGTGTCTTCTTGTCTGATCCGTAACCAACATTGGGCATCAACGTCACACCCTTGAACTTC
CTTCTAACCCTTGAATCAATACCCTTTGGCCTCCTCCAGCTTTCCTTGACGGTGATTCTA
CGGTCGCTCTGGGGTCTAATGAACTTGGCAGACCTCTTCTTCACCACCTTCTTCGTTAGC
AACGGTACCGCCATTTCTGCTGCTTCCTAAGATCAGAACCTCGATGCGACTCTCTGTAAA
CGGCCC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2AQ49TF 561 0 0
AATACCAAACTCATGTTTGTAGATTGCAAACACAGACGGTAAACAAAATCGTCTTACAAA
ATGGGAAATGCAAACAAACCAGAAACAAACTTAATAGTTTAGTTACTTCACTCGTCCTCT
TGGCTACGGAGCCTAGCAAGCCTGTTGGTCACAACAATATCCAACTGAGAAGCTCTCTCC
ACAATAGCCTTCCTCTTCTTGGTCGATACGTTGTGTGCAATCTCCGCGCAGTACGTCCTG
TTGTGCATCATCAGCAGCTCGAGGTCACTCGTGTTGTGCACAACAAACTTCTTGAACCCG
TTGGGTAGGTAGTGACGTGTCTTCTTGTCTGATCCGTAACCAACATTGGGCATCAACGTC
A*ACCCTTGAACTTTCTTCTAACCCTTGAATCAATACCCTTTGGCCTCCTCCAGCTTTCC
TTGACGGTGATTCTACGGTCGCTCTGGGGTCTGATGAACTTGGCAGACCTCTTCTTCACC
ACCTTCTTCGTTAGCAACGGTACCGCCATTTCTGCTGCTTCCTAAGATCAGAACCTCGAT
GCGACTCTCTGTAAACGGCCC

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 10

CO CL571Contig1 997 10 35 U
GGAACAAACAAGTTCGTCTTCCTTTTCGCAAAACCGTTTGAAAGAGGTTTATCTTTTGTT
TATCGTATCTTTCATCATGAAGTTCCTGGAGTACACCAACCTTGACAGATTGAATGTGTT
TATGGGTCATCTTAATCTCGGGGAAATAACTATCAAAGGTTGCCTTGAAGCTTACTCTTG
TAAACATGCTGGAACTGATAAAAGATTGTCTCTCAGTTTGGAGAATGAGATGCTCGACTA
TCTCGGGAAATCTTCTGACACTGACTCATCTTCACCCGTTGATCTTTTGTTAAGCAGATC
AAGTCGAAAGGCTTTGATCTACTTGGTTCTTACACTCTATCAGATGTATCCGGACTACGA
TTTCAGCGCTGTGAAAGCACATCAGTTTTTCTCCGAGGAGAGCTGGGACACGTTTACTCA
GATTTTTAACAACTATATGTTTGAAGCTTCTAAGGAATGGACTGAGAGGAATGAGGATGG
TTCCTTACTTGAGGCAATCTACCAGGCTCTTGATGAGGTTGTGAAACTAGCTGAATGTGA
GATATATGTGTACAACCCCAATCCTAATGCTGATCCTTTCCTCGAAGACGGAGCAATATG
G*TCTTTCTGTTTCTTATTCTACAACCGAAAACTGAAGCGTGTTGCAGGGTTTCGTTTCT
GCTGCATAAGTAACCTGGCAAGTGATGCCTTTCTCGCCGACACACCTCCATATGGAGAGG
ATGAAGAGATCTTTGACGACATGGATATGTGATCTCTCTATCTTCAAGTTGAGCTGCAAA
GTCTGTAGAAATTCTGTATATCATCCATGTTTAGATGTTATGCTCTCTAGTTTCTAGGCT
TGTGAATCCAAGTCCAAGGTTAAGCTCTTCGCTTTCCTTTATCTGTGTAGTTAACGTATA
CTCTGTACCTTGTCATGTCCAATAAGCT**TATCAGAGACTTTGTTGTAATCTAATGTCC
CTATATAATGAGACAAAAAAAATGTTGTGATTTATTT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 
55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 30 55 55 55 15 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 40 25 40 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 40 40 15 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C082TF U 87
AF RR2BP23TF U 1
AF RR2G965TF U 3
AF RR2GX06TF U 12
AF RR2CZ86TF U 31
AF RR2EU15TF U 4
AF RR2FS64TF U 4
AF RR2C082JQ C 168
AF RR2GX06JQ C 181
AF RR2BP23JQ C 386
BS 1 48 RR2BP23TF
BS 49 49 RR2G965TF
BS 50 99 RR2BP23TF
BS 100 100 RR2G965TF
BS 101 227 RR2BP23TF
BS 228 228 RR2C082TF
BS 229 237 RR2BP23TF
BS 238 238 RR2G965TF
BS 239 348 RR2BP23TF
BS 349 349 RR2G965TF
BS 350 484 RR2BP23TF
BS 485 485 RR2G965TF
BS 486 526 RR2BP23TF
BS 527 527 RR2G965TF
BS 528 558 RR2BP23TF
BS 559 559 RR2G965TF
BS 560 588 RR2BP23TF
BS 589 589 RR2G965TF
BS 590 590 RR2BP23TF
BS 591 591 RR2EU15TF
BS 592 594 RR2BP23TF
BS 595 595 RR2G965TF
BS 596 631 RR2BP23TF
BS 632 632 RR2EU15TF
BS 633 649 RR2BP23TF
BS 650 650 RR2EU15TF
BS 651 680 RR2BP23TF
BS 681 681 RR2G965TF
BS 682 694 RR2BP23TF
BS 695 697 RR2G965TF
BS 698 792 RR2EU15TF
BS 793 793 RR2C082JQ
BS 794 810 RR2EU15TF
BS 811 980 RR2C082JQ
BS 981 997 RR2BP23JQ

RD RR2C082TF 303 0 0
TGGAGTACACCAATCTTGACAGATTGAATGTGTTTATGGGTCATCTTAATCTCGGGGAAA
TAACTATCAAAGGTTGCCTTGAAGCTTACTCTTGTAAACATGCTGGAACTGATAAAAGAT
TGTCTCTCAGTTTGGAGAATGAGATGCTCGATTAT*TCGGGAAATCTTCTGACACTGACT
CATCTTCACCCGTTGATCTTTTGTTAAGCAGACCAAGTCGAAAGGCTTTGAACTACTTGG
TTCCTACACTCTATCAGATGTACCCGGACTACGATTTCAGCGCTGTGAAAGCACATCAGT
TTT

QA 1 303 1 303
DS 

RD RR2BP23TF 694 0 0
GGAACAAACAAGTTCGTCTTCCTTTTCGCAAAACCGTTTGAAAGAGGTGTATCTTTTGTT
TATCGTATCTTTCATCATGAAGTTCCTGGAGTACACCAATCTTGACAGATTGAATGTGTT
TATGGGTCATCTTAATCTCGGGGAAATAACTATCAAAGGTTGCCTTGAAGCTTACTCTTG
TAAACATGCTGGAACTGATAAAAGATTGTCTCTCAGTTTGGAGAATGGGATGCTCGATTA
TCTCGGGAAATCTTCTGACACTGACTCATCTTCACCCGTTGATCTTTTGTTAAGCAGATC
AAGTCGAAAGGCTTTGATCTACTTGGTTCTTACACTCTATCAGATGTACCCGGACTACGA
TTTCAGCGCTGTGAAAGCACATCAGTTTTTCTCCGAGGAGAGCTGGGACACGTTTACTCA
GATTTTTAACAACTATATGTTTGAAGCTTCTAAGGAATGGACTGAGAGGAATGAGGATGG
TTCCCTACTTGAGGCAATCTACCAGGCTCTTGATGAGGTTGTGAAATTAGCTGAATGTGA
GATATATGTGTACAACCCGAATCCTAATGCTGATCCTTTCCTCGAAGAAG*AGCGATATG
G*TCTTTCTGTTTCTTATTCTACAACCGAAA*CTGAAGCGTGTTGCAGG*TTTCGTTTCT
GCTGCATAAGTAACCTGGCA*GTGATGCCTTTCT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2G965TF 703 0 0
GGA
AAACAAGTTCGTCTTCCTTTTCGCAAAACCGTTTGAAAGAGGTTTATCTTTTGTTTATCG
TATCTTTCATCATGAAGTTCCTGGAGTACACCAACCTTGACAGATTGAATGTGTTTATGG
GTCATCTTAATCTCGGGGAAATAACTATCAAAGGTTGCCTTGAAGCTTACTCTTGTAAAC
ATGCTGGAACTGATAAAAGATTGTCTCTCAGTTTGGAGAATGAGATGCTCGACTATCTCG
GGAAATCTTCTGACACTGACTCATCTTCACCCGTTGATCTTTTGTTAAGCAGATCAAGTC
GAAAGGCTTTGATCTACTTGGTTCTTACACTCTATCAGATGTATCCGGACTACTATTTCA
GCGCTGTGAAAGCACATCAGTTTTTCTCCGAGGAGAGCTGGGACACGTTTACTCAGATTT
TTAACAACTATATGTTTGAAGCTTCTAAGGAATGGACTGAGAGGAATGAGGATGGTTCCT
TACTTGAGGCAATCTACCAGGCTCTTGATGAGGTTGTGAAACTAGCTGAATGTGAGATAT
ATGTGTACAACCCCAATCCTAATGCTGATCCTTTCCTCGAAGACG*AGCAATATGG*TCT
TTCTGTTTCTTATTCTATAACCAAAA*CTGAAGCGTGTTGCAGG*TTTCGTTTCTGCTGC
ATAAGTAACCTGGCAAGTGATGCCTTTCTCGC
GACCACTC

QA 4 695 4 695
DS 

RD RR2GX06TF 675 0 0
GTTCGTCTTCCTTTTCGCAAAACCGTTTGAAAGAGGTTTATCTTTTGTTTATCGTATCTT
TCATCATGAAGTTCCTGGAGTACACCAACCTTGACAGATTGAATGTGTTTATGGGTCATC
TTAATCTCGGGGAAATAACTATCAAAGGTTGCCTTGAAGCTTACTCTTGTAAACATGCTG
GAACTGATAAAAGATTGTCTCTCAGTTTGGAGAATGAGATGCTCGACTATCTCGGGAAAT
CTTCTGACACTGACTCATCTTCACCCGTTGATCTTTTGTTAAGCAGATCAAGTCGAAAGG
CTTTGAACTACTTGGTTCTTACACTCTATCAGATGTATCCGGACTACGATTTCAGCGCTG
TGAAAGCACATCAGTTTTTCTCCGAGGAGAGCTGGGACACGTTTACTCAGATTTTTAACA
ACTATATGTTTGAAGCTTCTAAGGAATTGACTGAGAGGAATGAGGATGGTTCCTTACTTG
AGGCAATCTACCAGGCTCTTGATGAGGTTGTGAAACTAGCTGAATGTGAGATATATGTGT
ACAACCCCAATCCTAATGCTGATCCTTTCCTCGAAGACGGAGCAATATGGGTCTTTCTGT
TTCTTATTCTACAACCGAAAACTGAAGCGTGTTGCAAGGTTTCGTTTCTGCTGCATAAGT
AACCTGGCAAGTGAT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2CZ86TF 724 0 0
AAACCGTTTGAAAGAGGTTTATCTTTTGTTTATCGTATCTTTCATCATGAAGTTCCTGGA
GTACACCAACCTTGACAGATTGAATGTGTTTATGGGTCATCTTAATCTCGGGGAAATAAC
TATCAAAGGTTGCCTTGAAGCTTACTCTTGTAAACATGCTGGAACTGATAAAATATTGTC
TCTCAGTTTGGAGAATGAGATGCTCGACTATCTCGGGAAATCTTCTGACACTGACTCATC
TTCACCCGTTGATCTTTTGTTAAGCAGATCAAGTCGAAAGGCTTTGATCTACTTGGTTCT
TACACTCTATCAGATGTATCCGGACTACGATTTCAGCGCTGTGAAAGCACATCAGTTTTT
CTCCGAGGAGAGCTGGGACACGTTTACTCAGATTTTTAACAACTATATGTTTGAAGCTTC
TAAGGAATGGACTGAGAGGAATGAGGATGGTTCCTTACTTGAGGCAATCTACCAGGCTCT
TGATGAGGTTGTGAAACTAGCTGAATGTGAGATATATGTGTACAACCCCAATCCTAATGC
TGATCCTTTCCTCGAAGACGGAGCAATATGG*TCTTTCTGTTTCTTATTCTACAACCGAA
AACTGAAGCGTGTTGCAGGGTTTCGTTTCTGCTGCATAAGTAACCTGGCAAGTGATGCCT
TTCTCGCCGACACAC*TCCATATGGAGAGGATGAAGAGATCTTTGACGACATGGATATGT
GATC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2EU15TF 807 0 0
GG
AAACAAGTTCGTCTTCCTTTTCGCAAAACCGTTTGAAAGAGGTTTATCTTTTGTTTATCG
TATCTTTCATCATGAAGTTCCTGGAGTACACCAACCTTGACAGATTGAATGTGTTTATGG
GTCATCTTAATCTCGGGGAAATAACTATCAAAGGTTGCCTTGAAGCTTACTCTTGTAAAC
ATGCTGGAACTGATAAAAGATTGTCTCTCAGTTTGGAGAATGAGATGCTCGACTATCTCG
GGAAATCTTCTGACACTGACTCATCTTCACCCGTTGATCTTTTGTTAAGCAGATCAAGTC
GAAAGGCTTTGATCTACTTGGTTCTTACACTCTATCAGATGTATCCGGACTACGATTTCA
GCGCTGTGAAAGCACATCAGTTTTTCTCCGAGGAGAGCTGGGACACGTTTACTCAGATTT
TTAACAACTATATGTTTGAAGCTTCTAAGGAATGGACTGAGAGGAATGAGGATGGTTCCT
TACTTGAGGCAATCTACCAGGCTCTTGATGAGGTTGTGAAACTAGCTGAATGTGAGATAT
ATGTGTACAACCCCAATCCTAATGCTGATCCTTTCCTCGAAGACGGAGCAATATGG*TCT
TTCTGTTTCTTATTCTACAACCGAAAACTGAAGCGTGTTGCAGGGTTTCGTTTCTGCTGC
ATAAGTAACCTGGCAAGTGATGCCTTTCTCGCCGACACACCTCCATATGGAGAGGATGAA
GAGATCTTTGACGACATGGATATGTGATCTCTCTATCTTCAAGTTGAGCTGCAAAGTCTG
TAGAAAT*CTGTATATCATCCATGT

QA 3 807 3 807
DS 

RD RR2FS64TF 796 0 0
GG
AAACAAGTTCGTCTTCCTTTTCGCAAAACCGTTTGAAAGAGGTTTATCTTTTGTTTATCG
TATCTTTCATCATGAAGTTCCTGGAGTACACCAACCTTGACAGATTGAATGTGTTTATGG
GTCATCTTAATCTCGGGGAAATAACTATCAAAGGTTGCCTTGAAGCTTACTCTTGTAAAC
ATGCTGGAACTGATAAAAGATTGTCTCTCAGTTTGGAGAATGAGATGCTCGACTATCTCG
GGAAATCTTCTGACACTGACTCATCTTCACCCGTTGATCTTTTGTTAAGCAGATCAAGTC
GAAAGGCTTTGATCTACTTGGTTCTTACACTCTATCAGATGTATCCGGACTACGATTTCA
GCGCTGTGAAAGCACATCAGTTTTTCTCCGAGGAGAGCTGGGACACGTTTACTCAGATTT
TTAACAACTATATGTTTGAAGCTTCTAAGGAATGGACTGAGAGGAATGAGGATGGTTCCT
TACTTGAGGCAATCTACCAGGCTCTTGATGAGGTTGTGAAACTAGCTGAATGTGAGATAT
ATGTGTACAACCCCAATCCTAATGCTGATCCTTTCCTCGAAGACGGAGCAATATGG*TCT
TTCTGTTTCTTATTCTACAACCGAAAACTGAAGCGTGTTGCAGGGTTTCGTTTCTGCTGC
ATAAGTAACCTGGCAAGTGATGCCTTTCTCGCCGACACACCTCCATATGGAGAGGATGAA
GAGATCTTTGACGACATGGATATGTGATCTCTCTATCTTCAAGTTGAGCTGCAAAGTCTG
TAGAAAT
CTGTATA

QA 3 789 3 789
DS 

RD RR2C082JQ 827 0 0
AAGCTTACTCTTGTAAACATGCTGGAACTGATAAAAGAT*GTCTCTCAGTTTGGAGAATG
AGATGCTCGATTAT*TCGGGAAATCTTCTGACACTGACTCATCTTCACCCGTTGATCTTT
TGTTAAGCAGATCAAGTCGAAAGGCTTTGATCTACTTGGTTCCTACACTCTATCAGATGT
ACCCGGACTACGATTTCAGCGCTGTGAAAGCACATCAGTTTTTCTCCGAGGAGAGCTGGG
ACACGTTTACTCAGATTTTTAACAACTATATGTTTGAAGCTTCTAAGGAATGGACTGAGA
GGAATGAGGATGGTTCCCTACTTGAGGCAATCTACCAGGCTCTTGATGAGGTTGTGAAAT
TAGCTGAATGTGAGATATATGTGTACAACCCGAATCCTAATGCTGATCCTTTCCTCGAAG
AAGGAGCGATATGG*TCTTTCTGTTTCTTATTCTACAA****AAACTGAAGCGTGTTGCA
GGGTTTCGTTTCTGCTGCATAAGTAACCTGGCAAGTGATGCCTTTCTCGCCGGCACACCT
CCATATGAAGAGGATGAAGAGATCTTTGACGACATGGATATGTGATCTCTCTATCTTCAA
GTTGAGCTGCGCAGTCTGTAGAAATTCTGTATATCATCCATGTTTAGATGTTATGCTCTC
TAGTTTCTAGGCTTGTGAATCCAAGTCCAAGGTTAAGCTCTTCGCTTTCCTTTATCTGTG
TAGTTAACGTATACTCTGTACCTTGTCATGTCCAATAAGCT**TATCAGAGACTTTGTTG
TAATCTAATGTCCCTATATAATGAGACAAAAAA
AAATGTTGTGATTT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2GX06JQ 815 0 0
TAAACATGCTGGAACTGATAAAAGATTGTCTCTCAGTTTGGAGAATGAGATGCTCGACTA
TCTCGGGAAATCTTCTGACACTGACTCATCTTCACCCGTTGATCTTTTGTTAAGCAGATC
AAGTCGAAAGGCTTTGATCTACTTGGTTCTTACACTCTATCAGATGTATCCGGACTACGA
TTTCAGCGCTGTGAAAGCACATCAGTTTTTCTCCGAGGAGAGCTGGGACACGTTTACTCA
GATTTTTAACAACTATATGTTTGAAGCTTCTAAGGAATTGACTGAGAGGAATGAGGATGG
TTCCTTACTTGAGGCAATCTACCAGGCTCTTGATGAGGTTGTGAAACTAGCTGAATGTGA
GATATATGTGTACAACCCCAATCCTAATGCTGATCCTTTCCTCGAAGACGGAGCAATATG
G*TCTTTCTGTTTCTTATTCTACAACCGAAAACTGAAGCGTGTTGCAGGGTTTCGTTTCT
GCTGCATAAGTAACCTGGCAAGTGATGCCTTTCTCGCCGACACACCTCCATATGGAGAGG
ATGAAGAGATCTTTGACGACATGGATATGTGATCTCTCTATCTTCAAGTTGAGCTGCAAA
GTCTGTAGAAATTCTGTATATCATCCATGTTTAGATGTTATGCTCTCTAGTTTCTAGGCT
TGTGAATCCAAGTCCAAGGTTAAGCTCTTCGCTTTCCTTTATCTGTGTAGTTAACGTATA
CTCTGTACCTTGTCATGTCCAATAAGCTTTTATCAGAGACTTTGTTGTAATCTAATGTCC
CTAGATAATGAGACAAAAAA
TGTTGTGATTTGTTT

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2BP23JQ 612 0 0
TTTTTCTCCGAGGAGAGCTGGGACACGTTTACTCAGATTTTTAACAACTATATGTTTGAA
GCTTCTAAGGAATGGACTGAGAGGAATGAGGATGGTTCCCTACTTGAGGCAATCTACCAG
GCTCTTGATGAGGTTGTGAAATTAGCTGAATGTGAGATATATGTGTACAACCCGAATCCT
AATGCTGATCCTTTCCTCGAAGAAGGAGCGATATGG*TCTTTCTGTTTCTTATTCTACAA
CCGAAAACTGAAGCGTGTTGCAGGGTTTCGTTTTTGCTGCATAAGTAACCTGGCAAGTGA
TGCCTTTCTCGCCGGCACACCTCCATATGAAGAGGATGAAGAGATCTTTGACGACATGGA
TATGTGATCTCTCTATCTTCAAGTCGAGCTGCGCAGTCTGTAGAAATTCTGTATATCATC
CATGTTTAGATGTTATGCTCTCTAGTTTTTAGGCTTGTGAATCCAAGTCCAAGGTTAAGC
TCTTCGCTTTCCTTTATCTGTGTAGTTAACGTATACCCTGTACCTTGTCATGTCCAATAA
GCT**TATCAGAGACTTTGTTGTAATCTAATGTCCCTATATAATGAGACAAAAAAAATGT
TGTGATTTATTT

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 7

CO CL572Contig1 1217 7 22 U
GGATGTGCTCTCATCAAGGAGCCGAAGCGTTTCCTTATCTCCTTTACAAAGAAGATATTT
T*CGAACTTGAGTCTCTCACAGACAGCGATGGCGGCTTCACTCTCTTCCACTGCTCAGAC
CACACCGATTCTTCGATTCAGAGCCAATGATTCCAAGTCCCTCGTCTCTCCCCCAGGTTC
GTGTTTGAGGGTCATCGCTTCGAACAATTCTTTATCTGCACGCGCAATTGCGTGTTCTTT
AAGGAGCGACAATCCTTGGCTCGGTGCGGGAGTTAAGCTCTCTGGTGGTGGCCCCGTTGT
CAAGCGGTCACTACAGAAGAGAGTGGTGATAAGATCTGCAACTATTGAAGAAATTGAAGC
CGAGAAATCTGCTATTGAGAAAGACGTTAAATCAAAAATGGAGAAGACTATTGAAACGCT
TAGGACTAGTTTCAACTCCATAAGGACCGGGAGAGCCAATGTTGCTATGCTTGACAAGAT
TGAGGTTGAATACTATGGAAGTCCTGTAAGTCTGAAAAGCATTGCCCAAATCAGTACCCC
CGATGGTACTTCTCTTTTGCTTCAGCCTTATGACAAATCTAGCTTGAAGGCTATAGAGAA
GGCCATTGTCAGTTCTGATCTTGGTGTCACTCCTAATAACGACGGTGATGTCATTCGCTT
GTCCTTGCCTCCCCTCACTTCTGAGCGAAGAAAGGAACTAACAAAGGTTGTAGCCAAACA
GTCTGAAGATGGGAAGGTTGCACTGAGAAACATAAGGAGGGATGCCTTGAAATCTTATGA
TAAACTCGAGAAGGAGAAGAAGCTGTCAGAAGACAACGTGAAGGATTTGTCAAGCGATTT
GCAGAAACTAATTGACACATACATGAAGAAGGTAGAGGAGCTCTGCAAACAGAAAGAGAA
GGAATTGTTGAAGGTGTAACTTGGCATGGGTGTTAGACGAAGATCTAGTAAAATCCCCAT
ATTTCCCATCTCCCCTTGCCGCTTTTACTACATCTTTCATCGGGAAAAAAATATGTTGTG
TTTCTTGGGGTACAAGAATGCCTTTGGGAATCGAGAGTAACTTTGTTTAAGTCTATTTTC
ACTTCTTCTAAGTGTTTCCCTCTTTGTACAGCAAACTCTTGTTAACTTTATTTCCTGCTG
CTGCCATAACACATTTATTTTCTACATTCCTCCTCTGTGTTGAATTCGGGTTTTCGAATG
CGCTTTGTTTATGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL17TF U 1
AF RR2AQ76TF U 11
AF RR2GV88TF U 22
AF RR2GK64TF U 77
AF RR2BT35TF U 180
AF RR2GK64JQ C 683
AF RR2GV88JQB C 834
BS 1 191 RR2EL17TF
BS 192 703 RR2AQ76TF
BS 704 736 RR2GK64TF
BS 737 737 RR2BT35TF
BS 738 755 RR2GK64TF
BS 756 756 RR2BT35TF
BS 757 783 RR2GK64TF
BS 784 784 RR2BT35TF
BS 785 793 RR2GK64TF
BS 794 901 RR2BT35TF
BS 902 938 RR2GK64JQ
BS 939 939 RR2GV88JQB
BS 940 946 RR2GK64JQ
BS 947 947 RR2GV88JQB
BS 948 973 RR2GK64JQ
BS 974 974 RR2GV88JQB
BS 975 1003 RR2GK64JQ
BS 1004 1004 RR2GV88JQB
BS 1005 1074 RR2GK64JQ
BS 1075 1075 RR2GV88JQB
BS 1076 1088 RR2GK64JQ
BS 1089 1217 RR2GV88JQB

RD RR2EL17TF 193 0 0
GGATGTGCTCTCATCAAGGAGCCGAAGCGTTTCCTTATCTCCTTTACAAAGAAGATATTT
T*CGAACTTGAGTCTCTCACAGACAGCGATGGCGGCTTCACTCTCTTCCACTGCTCAGAC
CACACCGATTCTTCGATTCAGAGCCAATGATTCCAAGTCCCTCGTCTCTCCCCCAGGTTC
GTGTTTGAGGG
TC

QA 1 191 1 191
DS 

RD RR2AQ76TF 693 0 0
GG
ATCAAGGAGCCGAAGCGTTTCCTTATCTCCTTTACAAAGAAGATATTTT*CGAACTTGAG
TCTCTCACAGACAGCGATGGCGGCTTCACTCTCTTCCACTGCTCAGACCACACCGATTCT
TCGATTCAGAGCCAATGATTCCAAGTCCCCCGTCTCTCCCCCAGGTTCGTGTTTGAGGAT
CATCGCTTCGAACAATTCTTTATCTGCACGCGCAATTGCGTGTTCTTTAAGGAGCGACAA
TCCTTGGCTCGGTGCGGGAGTTAAGCTCTCTGGTGGTGGCCCCGTTGTCAAGCGGTCACT
ACAGAAGAGAGTGGTGATAAGATCTGCAACTATTGAAGAAATTGAAGCCGAGAAATCTGC
TATTGAGAAAGACGTTAAATCAAAAATGGAGAAGACTATTGAAACGCTTAGGACTAGTTT
CAACTCCATAAGGACCGGGAGAGCCAATGTTGCTATGCTTGACAAGATTGAGGTTGAATA
CTATGGAAGTCCTGTAAGTCTGAAAAGCATTGCCCAAATCAGTACCCCCGATGGTACTTC
TCTTTTGCTTCAGCCTTATGACAAATCTAGCTTGAAGGCTATAGAGAAGGCCATTGTCAG
TTCTGATCTTGGTGTCACTCCTAATAACGACGGTGATGTCATTCGCTTGTCCTTGCCTCC
CCTCACTTCTGAGCGAAGAAAGGAACTAACA

QA 3 693 3 693
DS 

RD RR2GV88TF 669 0 0
GGGAA
GCGTTTCCTTATCTCCTTTACAAAGAAGATTTTTTTCGAACTTGAGTCTCTCACAGACAG
CGATGGCGGCTTCACTCTCTTCCACTGCTCAGACCACACCGATTCTTCGATTCAGAGCCA
GTGATTCCAAGTCCCTCGTCTCTCCCCCAGGTTCGTGTTTGAGGGTCATGGCTTCGAACA
ATGCTTCATCTGCACGCGCAATTGCGTGTTCTTTAAGGAGCGACAATCCTTGGCTGGGTG
CGGGAGTTAAGCTCTCTGGTGGTGGCCCCGTTGTCAAGCGGTCACTACAGAAGAGAGTGG
TGATAAGATCTGCAACTATTGAAGAAATTGAAGCCGAGAAATCTGCTATTGAGAAAGACG
TTAAATCAAAAATGGAGAAGACGATTGAAACGCTTAGGACTAGTTTCAACTCCATAAGGA
CCGGGAGAGCCAATGTTGCTATGCTTGACAAGATTGAGGTGGAATACTATGGAAGTCCTG
TAAGTCTGAAAAGCATTGCCCAAATCAGTACCCCCGATGGCACTTCTCTTTTGCTTCAGC
CTTATGACAAATCTAGCTTGAAGGCTATAGAGAAAGCCATTGTCAGTTCTGATCTTGGTG
TCACTCCTAATAACGACG*TGATGTCATTCGCTTGTCCTTGCCTCCCCTCACTTCTGAGC
GAAG

QA 6 669 6 669
DS 

RD RR2GK64TF 721 0 0
GG
ACAGACAGCGATGGCGGCTTCACTCTCTTCCACTGCTCAGACCACACCGATTCTTCGATT
CAGAGCCAATGATTCCAAGTCCCTCGTCTCTCCCCCAGGTTCGTGTTTGAGGGTCATCGC
TTCGAACAATTCTTTATCTGCACGCGCAATTGCGTGTTCTTTAAGGAGCGACAATCCTTG
GCTCGGTGCGGGAGTTAAGCTCTCTGGTGGTGGCCCCGTTGTCAAGCGGTCACTACAGAA
GAGAGTGGTGATAAGATCTGCAACTATTGAAGAAATTGAAGCCGAGAAATCTGCTATTGA
GAAAGACGTTAAATCAAAAATGGAGAAGACTATTGAAACGCTTAGGACTAGTTTCAACTC
CATAAGGACCGGGAGAGCCAATGTTGCTATGCTTGACAAGATTGAGGTTGAATACTATGG
AAGTCCTGTAAGTCTGAAAAGCATTGCCCAAATCAGTACCCCCGATGGTACTTCTCTTTT
GCTTCAGCCTTATGACAAATCTAGCTTGAAGGCTATAGAGAAGGCCATTGTCAGTTCTGA
TCTTGGTGTCACTCCTAATAACGACGGTGATGTCATTCGCTTGTCCTTGCCTCCCCTCAC
TTCTGAGCGAAGAAAGGAACTAACAAAGGTTGTAGCCAAACAGTCTGAAGATGGGAAG*T
TGCACTGAGAAACATAAAGAGGGATGCCTTGAAATCTTATGATAA*CTCGAGAAG
AGAG

QA 3 717 3 717
DS 

RD RR2BT35TF 729 0 0
G
GTGTTTGAGGGTCATCGCTTCGAACAATTCTTTATCTGCACGCGCAATTGCGTGTTCTTT
AAGGAGCGACAATCCTTGGCTCGGTGCGGGAGTTAAGCTCTCTGGTGGTGGCCCCGTTGT
CAAGCGGTCACTACAGAAGAGAGTGGTGATAAGATCTGCAACTATTGAAGAAATTGAAGC
CGAGAAATCTGCTATTGAGAAAGACGTTAAATCAAAAATGGAGAAGACTATTGAAACGCT
TAGGACTAGTTTCAACTCCATAAGGACCGGGAGAGCCAATGTTGCTATGCTTGACAAGAT
TGAGGTTGAATACTATGGAAGTCCTGTAAGTCTGAAAAGCATTGCCCAAATCAGTACCCC
CGATGGTACTTCTCTTTTGCTTCAGCCTTATGACAAATCTAGCTTGAAGGCTATAGAGAA
GGCCATTGTCAGTTCTGATCTTGGTGTCACTCCTAATAACGACGGTGATGTCATTCGCTT
GTCCTTGCCTCCCCTCACTTCTGAGCGAAGAAAGGAACTAACAAAGGTTGTAGCCAAACA
GTCTGAAGATGGGAAGGTTGCACTGAGAAACATAAGGAGGGATGCCTTGAAATCTTATGA
TAAACTCGAGAAGGAGAAGAAGCTGTCAGAAGACAACGTGAAGGATTTGTCAAGCGATTT
GCAGAAACTAATTGACACATACATGAAGAAGGTAGAGGAGCTCTGCAAACAGAAAGAGAA
G
AATTGTT

QA 2 722 2 722
DS 

RD RR2GK64JQ 413 0 0
GAGG
GAAGAAAGGAACTAACAAAGGTTGTAGCCAAACAGTCTGAAGATGGGAAGGTTGCACTGA
GAAACATAAGGAGGGATGCCTTGAAATCTTATGATAAACTCGAGAAGGAGAAGAAGCTGT
CAGAAGACAACGTGAAGGATTTGTCAAGCGATTTGCAGAAACTAATTGACACATACATGA
AGAAGGTAGAGGAGCTCTGCAAACAGAAAGAGAAGGAATTGTTGAAGGTGTAACTTGGCA
TGGGTGTTAGACTAAGATCTGGTAAAATCCCCATATTTCCCATCTCCTCTTGCCGCTTTT
ACTACATCTTTCATCGG*AAAAAAATATGTTGTGTTTCTTGGGGTACAAGAATGCCTTTG
GGAATCGAGAGTAACTTTGTTTAAGTCTGTTTTCACTTCTTC
AAGTGTT

QA 5 406 5 406
DS 

RD RR2GV88JQB 384 0 0
GCGATTTGCAGAAACTAATTGACACATACATGAAGAAGGTAGAGGAGCTCTGCAAACAGA
AAGAGAAGGAATTGTTGAAGGTGTAACTTG*CATGGGTGTTAGACGAAGATCTAGTAAAA
TCCCCATATTTCCCATCTCCCCTTGCCGCTTTTACTACATCTTTCATCGGGAAAAAAATA
TGTTGTGTTTCTTGGGGTACAAGAATGCCTTTGGGAATCGAGAGTAACTTTGTTTAAGTC
TATTTTCACTTCTTCTAAGTGTTTCCCTCTTTGTACAGCAAACTCTTGTTAACTTTATTT
CCTGCTGCTGCCATAACACATTTATTTTCTACATTCCTCCTCTGTGTTGAATTCGGGTTT
TCGAATGCGCTTTGTTTATGTACC

QA 1 384 1 384
DS 



AS 1 10

CO CL573Contig1 1238 10 33 U
GGATAAAAGGATTCTTTGTGATATGGAGTTTCCTCATCTTTCTCTAGTAAAACCAATCAG
AGAATTTTCTTCGGAGAAAAAAATGCATTCCTCTTCTTTGTCTTCGTTGTCAACTTGGAC
ATTAACCCTTATAACAGTGGGATGCCTTATGCTTCATTCATCTCTCTCTAGTGCTCAAGC
ACTAACTCCTACTTTCTACGACAATACATGCCCTAACGTGACTACCATCATCCGGGGAAT
CATCGTCAACGAGCTAAGATCGGATCCTCGTATTGCTGCGAGCCTCCTTCGTCTTCACTT
CCACGACTGCTTCGTGAATGGTTGCGATGCATCGATCTTGCTAGACAACACAACATCATT
TCGAACAGAAAAAGATGCTGCGCCAAATGCAAACTCGGCTCGAGGATTTCCAGTGGTTGA
CAGAATGAAAACAGCAGTGGAGGCACAATGTCCGGGGACTGTTTCATGTGCAGATATTCT
AACTATCGCAGCTCAACAATCAGTCAATCTGGCAGGAGGTCCTTCATGGAGGGTTCCTTT
GGGAAGACGAGATAGCCTACAAGCTTTCTTTAATCTTTCTAATAACAATCTTCCTGCTCC
ATTCTTCACGCTTCCCCAACTTAAAGCCAGTTTCAGCAATGTCGGGCTTAACCTTCCTTC
TGATCTCGTTGCCCTTTCCGGGGGTCACACTTTTGGTAAAAACCAATGCCAGTTTATTAT
GGACAGGCTATACAACTTCACCAACACTGGTTTACCTGACCCTACCCTCAACACTACTTA
TCTCCAGACGCTTCGTGGACTATGCCCTCGTAATGGTAACCAGAGCGTTCTAGTGGATTT
TGATCTACGTACACCGACAGTTTTTGACAACAAATATTATGTGAATCTGAAAGAGCTCAA
AGGACTTATCCAAACCGATCAAGAGCTGTTCTCAAGCCCCAATGCCACTGATACTATCCC
CTTGGTGAGAGAATACGCTGATGGGACACAAAAGTTCTTCAATGCGTTTATAACGGCGAT
GGATAGAATGGGAAACATTACCCCTCTCACGGGATCTCAAGGACAGATCAGACAAAACTG
TAGAGTGGTGAACTCCAACTCTTTTCTCCATGATGTTGTTGAAATCGTCGACTTTGTCAG
CTCTATGTAATAATAGTTGGCTCAATATATGTGGCAACTAATATGTAAGTTTGATAAAAA
TAATAAAACGCTCTCCTTATCTTATTTAAGGATCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 15 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF84TF U 42
AF RR2CT47TF U 1
AF RR2BP70TF U 47
AF RR2BL02TF U 47
AF RR2D269TF U 237
AF RR2BL02JQ C 485
AF RR2BP70JQ C 560
AF RR2D269JQ C 623
AF RR2CT47JQ C 781
AF RR2DI68JQ C 636
BS 1 194 RR2CT47TF
BS 195 195 RR2BL02TF
BS 196 222 RR2CT47TF
BS 223 226 RR2BL02TF
BS 227 229 RR2CT47TF
BS 230 230 RR2BL02TF
BS 231 674 RR2CT47TF
BS 675 683 RR2BL02TF
BS 684 684 RR2D269TF
BS 685 701 RR2BL02TF
BS 702 702 RR2D269TF
BS 703 734 RR2BL02TF
BS 735 735 RR2D269TF
BS 736 761 RR2BL02TF
BS 762 762 RR2D269TF
BS 763 770 RR2BL02TF
BS 771 771 RR2D269TF
BS 772 784 RR2BL02TF
BS 785 785 RR2D269TF
BS 786 812 RR2BL02TF
BS 813 815 RR2D269TF
BS 816 820 RR2BL02TF
BS 821 821 RR2D269TF
BS 822 835 RR2BL02TF
BS 836 838 RR2D269TF
BS 839 864 RR2BL02TF
BS 865 902 RR2D269TF
BS 903 903 RR2BL02JQ
BS 904 937 RR2D269TF
BS 938 956 RR2BL02JQ
BS 957 957 RR2BP70JQ
BS 958 1223 RR2BL02JQ
BS 1224 1238 RR2BP70JQ

RD RR2BF84TF 111 0 0
GGCTA
GTAAAACCAATCAGAGAATTTTCTTCGGAGAAAAAAATGCATTCCTCTTCTTTGTCTTCG
TTGTCAACTTGGACATTAACCCTTATAACAGTGGGATGCCTTATGC

QA 6 111 6 111
DS 

RD RR2CT47TF 674 0 0
GGATAAAAGGATTCTTTGTGATATGGAGTTTCCTCATCTTTCTCTAGTAAAACCAATCAG
AGAATTTTCTTCGGAGAAAAAAATGCATTCCTCTTCTTTGTCTTCGTTGTCAACTTGGAC
ATTAACCCTTATAACAGTGGGATGCCTTATGCTTCATTCATCTCTCTCTAGTGCTCAAGC
ACTAACTCCTACTTCCTACGACAATACATGCCCTAACGTGAC****ATCGTCCGGGGAAT
CATCGTCAACGAGCTAAGATCGGATCCTCGTATTGCTGCGAGCCTCCTTCGTCTTCACTT
CCACGACTGCTTCGTGAATGGTTGCGATGCATCGATCTTGCTAGACAACACAACATCATT
TCGAACAGAAAAAGATGCTGCGCCAAATGCAAACTCGGCTCGAGGATTTCCAGTGGTTGA
CAGAATGAAAACAGCAGTGGAGGCACAATGTCCGGGGACTGTTTCATGTGCAGATATTCT
AACTATCGCAGCTCAACAATCAGTCAATCTGGCAGGAGGTCCTTCATGGAGGGTTCCTTT
GGGAAGACGAGATAGCCTACAAGCTTTCTTTAATCTTTCTAATAACAATCTTCCTGCTCC
ATTCTTCACGCTTCCCCAACTTAAAGCCAGTTTCAGCAATGTCGGGCTTAACCTTCCTTC
TGATCTCGTTGCCC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2BP70TF 628 0 0
GTAAAACCAATCAGAGAATTTTCTTCGGAGAAAAAAATGCATTCCTCTTCTTTGTCTTCG
TTGTCAACTTGGACATTAACCCTTATAACAGTGGGATGCCTTATGCTTCATTCATCTCTC
TCTAGTGCTCAAGCACTAACTCCTACTTTCTACGACAATAC*TGCCCTAACGTGACTACC
ATCATCCGGGGAATCATCGTCAACGAGCTAAGATCGGATCCTCGTATTGCTGCGAGCCTC
CTTCGTCTTCACTTCCACGACTGCTTCGTGAATGGTTGCGATGCATCGATCTTGCTAGAC
AACACAACATCATTTCGAACAGAAAAAGATGCTGCGCCAAATGCAAACTCGGCTCGAGGA
TTTCCAGTGGTTGACAGAATGAAAACAGCAGTGGAGGCACAATGTCCGGGGACTGTTTCA
TGTGCAGATATTCTAACTATCGCAGCTCAACAATCAGTCAATCTGGCAGGAGGTCCTTCA
TGGAGGGTTCCTTTGGGAAGACGAGATAGCCTACAAGCTTTCTTTAATCTTTCTAATAAC
AATCTTCCTGCTCCATTCTTCACGCTTCCCCAACTTAAAGCCAGTTTCAGCAATGTCGGG
CTTAACCTTCCTTCTGATCTCGTTGCCC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2BL02TF 819 0 0
GTAAAACCAATCAGAGAATTTTCTTCGGAGAAAAAAATGCATTCCTCTTCTTTGTCTTCG
TTGTCAACTTGGACATTAACCCTTATAACAGTGGGATGCCTTATGCTTCATTCATCTCTC
TCTAGTGCTCAAGCACTAACTCCTACTTTCTACGACAATACATGCCCTAACGTGACTACC
ATCATCCGGGGAATTATCGTCAACGAGCTAAGATCGGATCCTCGTATTGCTGCG*GCCTC
CTTCGTCTTCACTTCCACGACTGCTTCGTGAATGGTTGCGATGCATCGATCTTGCTAGAC
AACACAACATCATTTCGAACAGAAAAAGATGCTGCGCCAAATGCAAACTCGGCTCGAGGA
TTTCCAGTGGTTGACAGAATGAAAACAGCAGTGGAGGCACAATGTCCGGGGACTGTTTCA
TGTGCAGATATTCTAACTATCGCAGCTCAACAATCAGTCAATCTGGCAGGAGGTCCTTCA
TGGAGGGTTCCTTTGGGAAGACGAGATAGCCTACAAGCTTTCTTTAATCTTTCTAATAAC
AATCTTCCTGCTCCATTCTTCACGCTTCCCCAACTTAAAGCCAGTTTCAGCAATGTCGGG
CTTAACCTTCCTTCTGATCTCGTTGCCCTTTCCGGGG*TCACACTTTTGGTAAAA*CCAA
TGCCAGTTTATTATGGACAGGCTATACA*CTTCACCAACACTGGTTTACCTGACC*TACC
CTCA*CACTACTTATCTC*AGACGCTTCGTGGACTATGCCCTCGTAT**GTAAC*AGAGC
GTTCTAGTG**ATTTGATCTACGTACACCGACAGTTTT
G

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2D269TF 701 0 0
GAATCATCGTCAACGAGCTAAGATCGGATCCTCGTATTGCTGCGAGCCTCCTTCGTCTTC
ACTTCCACGACTGCTTCGTGAATGGTTGCGATGCATCGATCTTGCTAGACAACACAACAT
CATTTCGAACAGAAAAAGATGCTGCGCCAAATGCAAACTCGGCTCGAGGATTTCCAGTGG
TTGACAGAATGAAAACAGCAGTGGAGGCACAATGTCCGGGGACTGTCTCATGTGCAGATA
TTCTAACTATCGCAGCTCAACAATCAGTCAATCTGGCAGGAGGTCCTTCATGGAGGGTTC
CTTTGGGAAGACGAGATAGCCTACAAGCTTTCTTTAATCTTTCTAATAACAATCTTCCTG
CTCCATTCTTCACGCTTCCCCAACTTAAAGCCAGTTTCAGCAATGTCGGGCTTAACCTTC
CTTCTGATCTCGTTGCCCTTTCCGGGGGTCACACTTTTGGTAAAAACCAATGCCAGTTTA
TTATGGACAGGCTATACAACTTCACCAACACTGGTTTACCTGACCCTACCCTCAACACTA
CTTATCTCCAGACGCTTCGTGGACTATGCCCTCGTAATGGTAACCAGAGCGTTCTAGTGG
ATTTTGATCTACGTACACCGACAGTTTTTGACAACAAATATTATGTGAATCTGAAAGAGC
TCAAAG*ACTTATCCAAACCGATCAAGAGCTGTTCTCAAGC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2BL02JQ 739 0 0
ATCGCAGCTCAACAATCAGTCAATCTGGCAGGAGGTCTTTCATGGAGGGTTCCTTTGGGA
AGACGAGATAGCCTACAAGCTTTCTTTAATCTTTCTAATAACAATCTTCCTGCTCCATTC
TTCACGCTTCCCCAACTTAAAGCCAGTTTCAGCAATGTCGGGCTTAACCTTCCTTCTGAT
CTCGTTGCCCTTTCCGGGGGTCACACTTTTGGTAAAAACCAATGCCAGTTTATTATGGAC
AGGCTATACAACTTCACCAACACTGGTTTACCTGACCCTACCCTCAACACTACTTATCTC
CAGACGCTTCGTGGACTATGCCCTCGTAATGGTAACCAGAGCGTTCTAGTGGATTTTGAT
CTACGTACACCGACAGTTTTTGACAACAAATATTATGTGAATCTGAAAGAGCTCAAAGGA
CTTATCCAAACCGATCAAGAGCTGTTCTCAAGCCCCAATGCCACTGATACTAGCCCCTTG
GTGAGAGAATACGCTGATGGGACACAAAAGTTCTTCAATGCGTTTATAACGGCGATGGAT
AGAATGGGAAACATTACCCCTCTCACGGGATCTCAAGGACAGATCAGACAAAACTGTAGA
GTGGTGAACTCCAACTCTTTTCTCCATGATGTTGTTGAAATCGTCGACTTTGTCAGCTCT
ATGTAATAATAGTTGGCTCAATATATGTGGCAACTAATATGTAAGTTTGATAAAAATAAT
AAAACGCTCTCCTTATCTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2BP70JQ 679 0 0
CAAGCTTTCTTTAATCTTTCTAATAACAATCTTCCTGCTCCATTCTTCACGCTTCCCCAA
CTTAAAGCCAGTTTCAGCAATGTCGGGCTTAACCTTCCTTCTGATCTCGTTGCCCTTTCC
GGGGGTCACACTTTTGGTAAAAACCAATGCCAGTTTATTATGGACAGGCTATACAACTTC
ACCAACACTGGTTTACCTGACCCTACCCTCAACACTGCTTATCTCCAGACGCTTCGTGGA
CTATGCCCTCGTAATGGTAACCAGAGCGTTCTAGTGGATTTTGATCTACGTACACCGACA
GTTTTTGACAACAAATATTATGTGAATCTGAAAGAGCTCAAAGGACTTATCCAAACCGAT
CAAGAGCTGTTCTCAAGCCCCAATGCCACTGATACTATCCCCTTGGTGAGAGAATACGCT
GATGGGACACAAAAGTTCTTCAATGCGTTTATAACGGCGATGGATAGAATGGGAAACATT
ACCCCTCTCACGGGATCTCAAGGACAGATCAGACAAAACTGTAGAGTGGTGAACTCCAAC
TCTTTTCTCCATGATGTTGTTGAAATCGTCGACTTTGTCAGCTCTATGTAATAATAGTTG
GCTCAATATATGTGGCAACTAATATGTAAGTTTGATAAAAATAATAAAACGCTCTCCTTA
TCTTATTTAAGGATCTTCC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2D269JQ 609 0 0
AAAGCCAGTTTCAGCAATGTCGGGCTTAACCTTCCTTCTGATCTCGTTGCCCTTTCCGGG
GGTCACACTTTTGGTAAAAACCAATGCCAGTTTATTATGGACAGGCTATACAACTTCACC
AACACTGGTTTACCTGACCCTACCCTCAACACTACTTATCTCCAGACGCTTCGTGGACTA
TGCCCTCGTAATGGTAACCAGAGCGTTCTAGTGGATTTTGATCTACGTACACCGACAGTT
TTTGACAACAAATATTATGTGAATCTGAAAGAGCTCAAAGGACTTATCCAAACCGATCAA
GAGCTGTTCTCAAGCCCCAATGCCACTGATACTATCCCCTTGGTGAGAGAATACGCTGAT
GGCACACAAAAGTTCTTCAATGCGTTTATAACGGCGATGGATAGAATGGGAAACATTACC
CCTCTCACAGGATCTCAGGGACAGATCAGACAAAACTGTAGGGTGGTGAACTCCAACTCT
CTGCTCCATGATGTTGTTGAAATCGTCGACTTTGTCGGCTCTATGTAATAATAGTTGGCT
CAATATATGTGGCAACTAATATGTAAGTTTGATAAAAATAATAAAACGCTTTCCTAATCT
T
GTTTAACT

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2CT47JQ 429 0 0
TT
TCCAGACGCTTCGTGGACTATGCCCTCGTAATGGTAACCAGAGCGTTCTAGTGGATTTTG
ATCTACGTACACCGACAGTTTTTGACAACAAATATTATGTGAATCTGAAAGAGCTCAAAG
GACTTATCCAAACCGATCAAGAGCTGTTCTCAAGCCCCAATGCCACTGATACTATCCCCT
TGGTGAGAGAATACGCTGACGGCACACAAAAGTTCTTCAATGCGTTTATAACGGCGATGG
ATAGAATGGGAAACATTACCCCTCTCACAGGATTTCAGGGACAGATCAGACAAAACTGTA
GGGTGGTGAACTCCAACTTTTTGCTCCATGATGTTGTTGAAATCGTCGACTTTGTCAGCT
CTATGTAATAATAGTTGGCTCAATATATGTGGCAACTAATATGTAAGTTTGATAAAAATA
ATAAAAC

QA 3 429 3 429
DS 

RD RR2DI68JQ 591 0 0
GCAATGTCGGGCTTAACCTTCCTTCTGATCTCGTTGCCCTTTCCGGGGGTCACACTTTTG
GTAAAAACCAATGCCAGTTTATTATGGACAGGCTATACAACTTCACCAACACTGGTTTAC
CTGACCCTACCCTCAACACTACTTATCTCCAGACGCTTCGTGGACTATGCCCTCGTAATG
GTAACCAGAGCGTTCTAGTGGATTTTGATCTACGTACACCGACAGTTTTTGACAACAAAT
ATTATGTGAATCTGAAAGAGCTCAAAGGACTTATCCAAACCGATCAAGAGCTGTTCTCAA
GCCCCAATGCCACTGATACTATCCCCTTGGTGAGAGAATACGCTGATGGGACACAAAAGT
TCTTCAATGCGTTTATAACGGCGATGGATAGAATGGGAAACATTACCCCTCTCACGGGAT
CTCAAGGACAGATCAGACAAAACTGTAGAGTGGTGAACTCCAACTCTTTTCTCCATGATG
TTGTTGAAATCGTCGACTTTGTCAGCTCTATGTAATAATAGTTGGCTCAATATATGTGGC
AACTAATATGTAAGTTTGATAAAAATAATAAAACGCTCTCCTTATCTT
ATT

QA 1 588 1 588
DS 



AS 2 9

CO CL574Contig1 802 7 2 U
GGACAAGCAAATAAAGCAGAAAAAAAAAAAACTGAAGAGAAAATAAAAATGAGTGGCTCG
GGTGCGCAACTTCACAATGTTTTCGTCTATGGTAGCTTTCAGGAGCCTGAGGTCGCCAAG
GTCATGCTTGATCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTT
AGGCTTAAAGGACGTTTGTATCCATGTGTTATACCGTTTGAAGATGGAGAAGTTCATGGA
AAGTTACTAATGGGATTAACGGATGAAGAACTTGGGCATTTAGATACTGTTGAGGGTAAT
GAATATGAGAGAGTGACAGTTGGTGTCGTACGAGAGGACAACTCTGAGAAGATGACTGTC
AAAACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATTGGAGGAGAATGGGATTTTGAG
GAATGGAAACGACTACACATGAAGGAATTCATAAAGACGTTCAAAGAAATCATGGAATGG
AAGAGGAATCCTCAAGGAAAGGGAAGGGACGAGTTCAGCAAGGCCCTACGCGATGCTCCT
TCGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAAGAGTATGTTTTATGTATCATTTTTCTCCAGATTCC
GAGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTATCGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGC
CATATGTTATCTT*GTGGATTTTGTATTATTGTGCTTTTATGGGATTTTGGTATCTATAT
TTTGTATGGTTTGCTTGATGCTAATGCTTATGCCTTTGTTTATGTATTACTTCGAAAGTA
ATTTATCACTGAATTATTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY22TF U 1
AF RR2DA88JQ C 84
AF RR2DA88TF U 84
AF RR2CU23TF U 213
AF RR2CU23JQ C 28
AF RR2BY22JQ C 31
AF RR2GH07TF U 7
BS 1 647 RR2BY22TF
BS 648 802 RR2GH07TF

RD RR2BY22TF 647 0 0
GGACAAGCAAATAAAGCAGAAAAAAAAAAAACTGAAGAGAAAATAAAAATGAGTGGCTCG
GGTGCGCAACTTCACAATGTTTTCGTCTATGGTAGCTTTCAGGAGCCTGAGGTCGCCAAG
GTCATGCTTGATCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTT
AGGCTTAAAGGACGTTTGTATCCATGTGTTATACCGTTTGAAGATGGAGAAGTTCATGGA
AAGTTACTAATGGGATTAACGGATGAAGAACTTGGGCATTTAGATACTGTTGAGGGTAAT
GAATATGAGAGAGTGACAGTTGGTGTCGTACGAGAGGACAACTCTGAGAAGATGACTGTC
AAAACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATTGGAGGAGAATGGGATTTTGAG
GAATGGAAACGACTACACATGAAGGAATTCATAAAGACGTTCAAAGAAATCATGGAATGG
AAGAGGAATCCTCAAGGAAAGGGAAGGGACGAGTTCAGCAAGGCCCTACGCGATGCTCCT
TCGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAAGAGTATGTTTTATGTATCATTTTTCTCCAGATTCC
GAGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTATCGTGGAGATCAGTGAA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2DA88JQ 605 0 0
G
GTCTATGGTAGCTTTCAGGAGTCTGAGGTCGCCAAGGTCATGCTTGATCGTACTCCTGAA
ATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGGCTTAAAGGACGTTTGTATCCA
TGTGTTATACCGTTTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAAGTTACTAATGGGATTAACGGAT
GAAGAACTTGGGCATTTAGATACTGTTGAGGGTAATGAATATGAGAGAGTGACAGTTGGT
GTCGTACGAGAGGACAACTCTGAGAAGATGACTGTCAAAACATATATATGGATCAATAAA
GATGATCCTGATATTGGAGGAGAATGGGATTTTGAGGAATGGAAACGACTACACATGAAG
GAATTCATAAAGACGTTCAAAGAAATCATGGAATGGAAGAGGAATCCTCAAGGAAAGGGA
AGGGACGAGTTCAGCAAGGCCCTACGCGATGCTCCTTCGGTTTGAATGAAATCTGTGTTA
AGAGTATGTTTTATGTATCATTTTTCTCCAGATTCCGAGTATAATAAAACCTAGAGACTG
ATAGTATCGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCCATATGTTATCTT*GTGGATTTTG
TATT

QA 2 605 2 605
DS 

RD RR2DA88TF 605 0 0
G
GTCTATGGTAGCTTTCAGGAGTCTGAGGTCGCCAAGGTCATGCTTGATCGTACTCCTGAA
ATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGGCTTAAAGGACGTTTGTATCCA
TGTGTTATACCGTTTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAAGTTACTAATGGGATTAACGGAT
GAAGAACTTGGGCATTTAGATACTGTTGAGGGTAATGAATATGAGAGAGTGACAGTTGGT
GTCGTACGAGAGGACAACTCTGAGAAGATGACTGTCAAAACATATATATGGATCAATAAA
GATGATCCTGATATTGGAGGAGAATGGGATTTTGAGGAATGGAAACGACTACACATGAAG
GAATTCATAAAGACGTTCAAAGAAATCATGGAATGGAAGAGGAATCCTCAAGGAAAGGGA
AGGGACGAGTTCAGCAAGGCCCTACGCGATGCTCCTTCGGTTTGAATGAAATCTGTGTTA
AGAGTATGTTTTATGTATCATTTTTCTCCAGATTCCGAGTATAATAAAACCTAGAGACTG
ATAGTATCGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCCATATGTTATCTT*GTGGATTTTG
TATT

QA 2 605 2 605
DS 

RD RR2CU23TF 482 0 0
ACCGTCTGAAGATGGAGAAGCTCATGGAAAGTTACTAATGGGATTAACGGATGAAGAACT
TGGGCATTTAGATACTGTTGAGGGTAATGAATATGAGAGAGTGACAGTTGGTGTCGTACG
AGAGGACAACTCTGAGAAGATGACTGTCAAAACATATATATGGACCAATAAAGATGACCC
TGATATCGGGGGAGAATGGGATTTTGAGGAATGGAAACGACTACACATGAAGGAATTCAT
AAAGACGTTCAAAGAAATCATGGAATGGAAGAGGAATCCTCAAGGAAAGGGAAGGGACGA
GTTCAGCAAGGCCCTACGCGATGCTCCTTCGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAAGAGTATG
TTTTATGTATCATTTTTCTCCAGATTCCGAGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTATC
GTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCCATATGTTATCTTTGTGGATTTTGTATTATTG
TG

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR2CU23JQ 734 0 0
AAA
ACTGAAGAGAAAATAAAAATGAGTGGATCTGGTGCGCAGCTTCACAATGTTTTCGTCTAT
GGTAGCTTTCAGGAGCCTGAGGTCGCCAAGGTCATGCTTGATCGTACTCCTGAAATCATC
TCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGGCTTAAAGGACGTTTGTATCCATGTGTT
ATACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAAGTTACTAATGGGATTAACGGATGAAGAA
CTTGGGCATTTAGATACTGTTGAGGGTAATGAATATGAGAGAGTGACAGTTGGTGTCGTA
CGAGAGGACAACTCTGAGAAGATGACTGTCAAAACATATATATGGATCAATAAAGATGAT
CCTGATATCGGGGGAGAATGGGATTTTGAGGAATGGAAACGACTACACATGAAGGAATTC
ATAAAGACGTTCAAAGAAATCATGGAATGGAAGAGGAATCCTCAAGGAAAGGGAAGGGAC
GAGTTCAGCAAGGCCCTACGCGATGCTCCTTCGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAAGAGTA
TGTTTTATGTATCATTTTTCTCCAGATTCCGAGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTA
TCGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCCATATGTTATCTT*GTGGATTTTGTATTAT
TGTGCTTTTATGGGATTTTGGTATCTATATTTTGTATGGTTTGCTTGATGCTAATGCTTA
TGC
CTTTGTTT

QA 4 726 4 726
DS 

RD RR2BY22JQ 735 0 0
ACTGAAGAGAAAATAAAAATGAGTGGCTCGGGTGCGCAACTTCACAATGTTTTCGTCTAT
GGTAGCTTTCAGGAGCCTGAGGTCGCCAAGGTCATGCTTGATCGTACTCCTGAAATCATC
TCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGGCTTAAAGGACGTTTGTATCCATGTGTT
ATACCGTTTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAAGTTACTAATGGGATTAACGGATGAAGAA
CTTGGGCATTTAGATACTGTTGAGGGTAATGAATATGAGAGAGTGACAGTTGGTGTCGTA
CGAGAGGACAACTCTGAGAAGATGACTGTCAAAACATATATATGGATCAATAAAGATGAT
CCTGATATTGGAGGAGAATGGGATTTTGAGGAATGGAAACGACTACACATGAAGGAATTC
ATAAAGACGTTCAAAGAAATCATGGAATGGAAGAGGAATCCTCAAGGAAAGGGAAGGGAC
GAGTTCAGCAAGGCCCTACGCGATGCTCCTTCGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAAGAGTA
TGTTTTATGTATCATTTTTCTCCAGATTCCGAGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTA
TCGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCCATATGTTATCTT*GTGGATTTTGTATTAT
TGTGCTTTTATGGGATTTTGGTATCTATATTTTGTATGGTTTGCTTGATGCTAATGCTTA
TGC
CTTTGTTTATGT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2GH07TF 796 0 0
GG
AAATAAAGCAGAAAAAAAAAAA*CTGAAGAGAAAATAAAAATGAGTGGCTCGGGTGCGCA
GCTTCACAATGTTTTCGTCTATGGTAGCTTTCAGGAGCCTGAGGTCGCCAAGGTCATGCT
TGATCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGGCTTAA
AGGACGTTTGTATCCATGTGTTATACCGTTTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAAGTTACT
AATGGGATTAACGGATGAAGAACTTGGGCATTTAGATACTGTTGAGGGTAATGAATATGA
GAGAGTGACAGTTGGTGTCGTACGAGAGGACAACTCTGAGAAGATGACTGTCAAAACATA
TATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATTGGAGGAGAATGGGATTTTGAGGAATGGAA
ACGACTACACATGAAGGAATTCATAAAGATGTTCAAAGAAATCATGGAATGGAAGAGGAA
TCCTCAAGGAAAGGGAAGGGACGAGTTCAGCAAGGCCCTACGCGATGCTCCTTCGGTTTG
AATGAAATCTGTGTTAAGAGTATGTTTTATGTATCATTTTTCTCCAGATTCCGAGTATAA
TAAAACCTAGAGACTGATAGTATCGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCCATATGTT
ATCTT*GTGGATTTTGTATTATTGTGCTTTTATGGGATTTTGGTATCTATATTTTGTATG
GTTTGCTTGATGCTAATGCTTATGCCTTTGTTTATGTATTACTTCGAAAGTAATTTATCA
CTGAATTATTTGCT

QA 3 796 3 796
DS 



CO CL574Contig2 692 2 2 U
GGACAATGTTTTCGTCTATGGTAGCTTTCAGGAGCCTGAGGTCGTCAAGGTCATGCTTGA
TCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGGCTTAAAGG
ACGTCAGTATCCATGTGTTATCCCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAAGTTACTAAT
GGGATTAACAGATGAAGAACTTGAGAATTTAGATACTGTTGAGGGTAATGAATATGAGAG
AGTGACAGTTGGTGTCGTACGAGAGGACAATTCTGAGAAGATGACTGTGAAAACATATAT
ATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGGAGGAGAATGGGATTTTGAGGAATGGAAACG
CCTACACATGAAGGAATTCATAAAGACGTTCAAAGAAATAATGGAATGGAAGAGGAATCC
TTAAGGAAAGGGAAGGGACGAGTTCAACAATGCCCTACGCGATGCTCCTTCGGTTTGAAT
GAAATCTGTGCTAAGAGTATGTTCTATGTATCATTTTTCTCCAGATTGCGAGTATAATAA
AACCTAGAGTCTGATAGTATTGTGGTGACCAGTGAAAATGATATAGTGCCATATGTTATC
TTGTGGATTGTATTATTGTTCTTATATGGGATTTTGGTATATATATTTTGTATGGTTTGC
TTGATGTTAATGCTAATGCTCCTAATTGCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ24TF U 1
AF RR2CZ24JQ C 31
BS 1 634 RR2CZ24TF
BS 635 692 RR2CZ24JQ

RD RR2CZ24TF 634 0 0
GGACAATGTTTTCGTCTATGGTAGCTTTCAGGAGCCTGAGGTCGTCAAGGTCATGCTTGA
TCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGGCTTAAAGG
ACGTCAGTATCCATGTGTTATCCCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAAGTTACTAAT
GGGATTAACAGATGAAGAACTTGAGAATTTAGATACTGTTGAGGGTAATGAATATGAGAG
AGTGACAGTTGGTGTCGTACGAGAGGACAATTCTGAGAAGATGACTGTGAAAACATATAT
ATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGGAGGAGAATGGGATTTTGAGGAATGGAAACG
CCTACACATGAAGGAATTCATAAAGACGTTCAAAGAAATAATGGAATGGAAGAGGAATCC
TTAAGGAAAGGGAAGGGACGAGTTCAACAATGCCCTACGCGATGCTCCTTCGGTTTGAAT
GAAATCTGTGCTAAGAGTATGTTCTATGTATCATTTTTCTCCAGATTGCGAGTATAATAA
AACCTAGAGTCTGATAGTATTGTGGTGACCAGTGAAAATGATATAGTGCCATATGTTATC
TTGTGGATTGTATTATTGTTCTTATATGGGATTT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2CZ24JQ 662 0 0
GGAGCCTGAGGTCGTCAAGGTCATGCTTGATCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACT
CCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGGCTTAAAGGACGTCAGTATCCATGTGTTATCCCGTCTGA
AGATGGAGAAGTTCATGGAAAGTTACTAATGGGATTAACAGATGAAGAACTTGAGAATTT
AGATACTGTTGAGGGTAATGAATATGAGAGAGTGACAGTTGGTGTCGTACGAGAGGACAA
TTCTGAGAAGATGACTGTGAAAACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGG
AGGAGAATGGGATTTTGAGGAATGGAAACGCCTACACATGAAGGAATTCATAAAGACGTT
CAAAGAAATAATGGAATGGAAGAGGAATCCTTAAGGAAAGGGAAGGGACGAGTTCAACAA
TGCCCTACGCGATGCTCCTTCGGTTTGAATGAAATCTGTGCTAAGAGTATGTTCTATGTA
TCATTTTTCTCCAGATTGCGAGTATAATAAAACCTAGAGTCTGATAGTATTGTGGTGACC
AGTGAAAATGATATAGTGCCATATGTTATCTTGTGGATTGTATTATTGTTCTTATATGGG
ATTTTGGTATATATATTTTGTATGGTTTGCTTGATGTTAATGCTAATGCTCCTAATTGCT
TT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 10

CO CL575Contig1 770 10 17 U
GGACTTCACACGCCTCAATCATTCTGTTTTATTGACACACACAACAAAGCTGCCCCACTC
CACCGTTCTCACTCATTACTCTCTTGCTTTCTTTCTTTCAAATCTCAGATCTTCCGTAAC
AAAAAAGCGGATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTG
GTTGCTCTCTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCTAACAGGAACCCGTTT
GTAGTCAGAGGCCGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCT
ACTTTCATCCCTGGAGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTA
ACCTACAGGCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAA
GACCATGAGGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCC
AATGTCTCACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCT
TCAGACGAACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGT
GCAGAGATCATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTT
TATCCATGTTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCA
TTGTATGGTTTGTTTACTTCTGAAATATTAAAAAATATATATATGATGAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GF06TF U 129
AF RR2AP49JQ C 105
AF RR2AP49TF U 105
AF RR2BB51JQ C 1
AF RR2DS82JQ C 129
AF RR2DS82TF U 129
AF RR2G476TF U 129
AF RR2G476JQ C 129
AF RR2GF06JQ C 193
AF RR2BB51TF U 1
BS 1 106 RR2BB51TF
BS 107 128 RR2AP49TF
BS 129 130 RR2DS82TF
BS 131 224 RR2AP49TF
BS 225 225 RR2G476TF
BS 226 251 RR2AP49TF
BS 252 252 RR2G476TF
BS 253 314 RR2AP49TF
BS 315 315 RR2G476TF
BS 316 590 RR2AP49TF
BS 591 591 RR2G476TF
BS 592 602 RR2AP49TF
BS 603 603 RR2G476TF
BS 604 714 RR2AP49TF
BS 715 749 RR2DS82TF
BS 750 753 RR2G476TF
BS 754 770 RR2BB51TF

RD RR2GF06TF 323 0 0
GGATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCT
CTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCGTGTCGGCTCGTCCTAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAG
AGGCCGTGTCTATTGCGATACTTGCCTCGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCAT
CCCTGGAGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAG
GCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGA
GGATCAGTTCTGTGATACCATGT

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR2AP49JQ 610 0 0
GG
AGATCTTCCGTAACAAAAAAGCTCATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGA
AAGCTATTATTCTGGTTGCTCTCTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGA
ACAGGAACCCGTTTGTAGTCAGAGGACGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCG
AAACTTCTGCCTCTACTTTCATCCCTGGTGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGA
GAACAATGGAGTTAACCTACAGGCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGA
TCTTGGTTAGCGAAGACCATGAGGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTC
AGTTACGCTGCTCCAATGTCTCACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTT
TCAACGGCATTGCTTCAGACGAACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAG
CTTCGCCAGGCTGTGCTGAGATCATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCT
CAATCAGTATGTTTTATCCATGTTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGC
TTGTGTTT

QA 3 610 3 610
DS 

RD RR2AP49TF 610 0 0
GG
AGATCTTCCGTAACAAAAAAGCTCATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGA
AAGCTATTATTCTGGTTGCTCTCTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGA
ACAGGAACCCGTTTGTAGTCAGAGGACGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCG
AAACTTCTGCCTCTACTTTCATCCCTGGTGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGA
GAACAATGGAGTTAACCTACAGGCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGA
TCTTGGTTAGCGAAGACCATGAGGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTC
AGTTACGCTGCTCCAATGTCTCACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTT
TCAACGGCATTGCTTCAGACGAACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAG
CTTCGCCAGGCTGTGCTGAGATCATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCT
CAATCAGTATGTTTTATCCATGTTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGC
TTGTGTTT

QA 3 610 3 610
DS 

RD RR2BB51JQ 770 0 0
GGACTTCACACGCCTCAATCATTCTGTTTTATTGACACACACAACAAAGCTGCCCCACTC
CACCGTTCTCACTCATTACTCTCTTGCTTTCTTTCTTTCAAATCTCAGATCTTCCGTAAC
AAAAAAGCTCATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTG
GTTGCTCTCTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCTAACAGGAACCCGTTT
GTAGTCAGAGGCCGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCT
ACTTTCATCCCTGGAGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTA
ACCTACAGGCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAA
GACCATGAGGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCC
AATGTCTCACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCT
TCAGACGAACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGT
GCAGAGATCATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTT
TATCCATGTTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCA
TTGTATGGTTTGTTTACTTCTGAAATATTAAAAAATATATATATGATGAG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2DS82JQ 621 0 0
GGATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCT
CTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAG
AGGACGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCAT
CCCTGGTGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAG
GCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGA
GGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCCAATGTCTC
ACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGA
ACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCGCCAGGCTGTGCTGAGAT
CATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATG
TTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGG
TTTGTTTACTTCTGAAATATT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2DS82TF 621 0 0
GGATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCT
CTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAG
AGGACGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCAT
CCCTGGTGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAG
GCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGA
GGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCCAATGTCTC
ACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGA
ACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCGCCAGGCTGTGCTGAGAT
CATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATG
TTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGG
TTTGTTTACTTCTGAAATATT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2G476TF 629 0 0
GGATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCT
CTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCGTGTCGGCTCGTCCTAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAG
AGGCCGTGTCTATTGCGATACTTGCCTCGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCAT
CCCTGGAGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAG
GCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGA
GGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCCAATGTCTC
ACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGA
ACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGAT
CATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATG
TTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGG
TTTGTTTACTTCTGAAATATTAAAA
TATA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2G476JQ 621 0 0
GGATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCT
CTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCGTGTCGGCTCGTCCTAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAG
AGGCCGTGTCTATTGCGATACTTGCCTCGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCAT
CCCTGGAGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAG
GCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGA
GGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTTTCAGTTACGCTGCTCCAATGTCTC
ACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGA
ACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGAT
CATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATG
TTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGG
TTTGTTTACTTCTGAAATATT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2GF06JQ 557 0 0
TTTTTACCGGCTCTAGTCGTGTCGGCTCGTCCTAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAGAGGC
CGTGTCTATTGCGATACTTGCCTCGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCATCCCT
GGAGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAGGCAC
GAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGAGGAT
CAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTTTCAGTTACGCTGCTCCAATGTCTCACCT
GGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGAACGT
TTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGATCATG
AAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATGTTCC
TGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGGTTTG
TTTACTTCTGAAATATT

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2BB51TF 770 0 0
GGACTTCACACGCCTCAATCATTCTGTTTTATTGACACACACAACAAAGCTGCCCCACTC
CACCGTTCTCACTCATTACTCTCTTGCTTTCTTTCTTTCAAATCTCAGATCTTCCGTAAC
AAAAAAGCTCATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTG
GTTGCTCTCTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCTAACAGGAACCCGTTT
GTAGTCAGAGGCCGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCT
ACTTTCATCCCTGGAGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTA
ACCTACAGGCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAA
GACCATGAGGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCC
AATGTCTCACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCT
TCAGACGAACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGT
GCAGAGATCATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTT
TATCCATGTTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCA
TTGTATGGTTTGTTTACTTCTGAAATATTAAAAAATATATATATGATGAG

QA 1 770 1 770
DS 



AS 2 8

CO CL576Contig1 1120 6 35 U
CTTCTTTTCTCCTCTTCGTTTGTCACTTACAGCTTCTTCATCTTCTTCTTCTTCTCGCTT
CAATTTGATAACTTTTCTTCAGCAAGGGTTTTAACAATGAAGCTTGATACGAGTGGGTTC
GAGACCTCCATGCCTACGATTGGCTTCGGCTCTAGCAACGACATGCTTGATGGGTTTTCT
ACTGTGCCTTCGTTTGATCTTCCCCGGACCACAGATTTTGATGGGTTTCAGAAAGAAGCA
GTACAGATGGTGAAGCCAGCGAAAGGAACAACCACACTTGCTTTTATCTTCAAAGAAGGT
GTCATGGTCGCTGCGGATTCTCGTGCTAGCATGGGTGGATATATCTCCTCACAATCCGTG
AAGAAGATTATTGAAATCAATCCTTATATGCTTGGTACAATGGCTGGAGGAGCTGCTGAC
TGCCAGTTCTGGCACAGGAATCTTGGAATTAAGTGCCGTCTGCATGAGCTGGCAAACAAG
AGGAGAATTTCTGTTTCAGGAGCTTCAAAACTTCTCGCAAACATGCTCTACTCATACCGT
GGAATGGGACTTTCCGTCGGTACCATGATTGCTGGATGGGACGAAACTGGTCCTGGACTA
TACTATGTGGACAACGAAGGAGGAAGGCTCAAAGGAGACAGGTTCTCAGTCGGTTCCGGT
TCACCATACGCTTACGGTGTACTAGACAGCGGGTACAAGTTCGATATGTCAGTTGAAGAA
GCTTCCGAGTTAGCAAGGAGATCAATCTACCATGCTACATTCCGTGATGGAGCCAGTGGT
GGTGTTGCTAGCGTGTACCACGTGGGTCCTAATGGATGGAAGAAATTGTCGGGAGATGAT
GTCGGGGAGCTACACTATCACTACTACCCCGTGCCACCAGCCATTGCGGAACAAGTCATG
GAGGAAGCAGCTGCCGAGTAAAACTAAGATTATCTTTTGCTTCCAAATCATTCACTCCGT
TTCTCTAGCTTAAGCTGTGGTATTCACTCTATTAAGATTCTCCTTTTTTTTCTTCTTTAA
ACACTGCTCTCTTCGATCAGCTTGTTAAACTCTTCACCCTTT*GTTTCAACCCATGAAAT
TAAGAACACAAGTTGAATATTATTTAAAAGAATGTTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2DT72TF U 27
AF RR2B301TF U 1
AF RR2F014TF U 28
AF RR2F014JQ C 384
AF RR2DJ63TF U 430
AF RR2DT72JQ C 522
BS 1 468 RR2B301TF
BS 469 469 RR2DT72TF
BS 470 485 RR2B301TF
BS 486 486 RR2DT72TF
BS 487 493 RR2B301TF
BS 494 494 RR2DT72TF
BS 495 772 RR2B301TF
BS 773 811 RR2F014TF
BS 812 820 RR2DJ63TF
BS 821 821 RR2F014JQ
BS 822 825 RR2DJ63TF
BS 826 826 RR2F014JQ
BS 827 830 RR2DJ63TF
BS 831 831 RR2F014JQ
BS 832 842 RR2DJ63TF
BS 843 843 RR2F014JQ
BS 844 890 RR2DJ63TF
BS 891 891 RR2F014JQ
BS 892 931 RR2DJ63TF
BS 932 932 RR2F014JQ
BS 933 963 RR2DJ63TF
BS 964 964 RR2F014JQ
BS 965 990 RR2DJ63TF
BS 991 991 RR2F014JQ
BS 992 1001 RR2DJ63TF
BS 1002 1003 RR2F014JQ
BS 1004 1023 RR2DJ63TF
BS 1024 1024 RR2F014JQ
BS 1025 1028 RR2DJ63TF
BS 1029 1029 RR2F014JQ
BS 1030 1060 RR2DJ63TF
BS 1061 1061 RR2F014JQ
BS 1062 1081 RR2DJ63TF
BS 1082 1118 RR2F014JQ
BS 1119 1120 RR2DT72JQ

RD RR2DT72TF 673 0 0
GG
ACAGCTTCTTCATCTTCTTCTTCTTCTCGCTTCAATTTGATAACTTTTCTTCAGCAAGGG
TTTTAACAATGAAGCTTGATACGAGTGGGTTCGAGACCTCCATGCCTACGATTGGCTTCG
GCTCTAGCAACGACATGCTTGATGGGTTTTCTACTGTGCCTTCGTTTGATCTTCCCCGGA
CCACAGATTTTGATGGGTTTCAGAAAGAAGCAGTACAGATGGTGAAGCCAGCGAAAGGAA
CAACCACACTTGCTTTTATCTTCAAAGAAGGTGTCATGGTCGCTGCGGATTCTCGTGCTA
GCATGGGTGGATATATCTCCTCACAATCCGTGAAGAAGATTATTGAAATCAATCCTTATA
TGCTTGGTACAATGGCTGGAGGAGCTGCTGACTGCCAGTTCTGGCACAGGAATCTTGGAA
TTAAGTGCCGTCTGCATGAGCTGGCAAACAAGAGGAGAATTTCTGTTTCAGGAGCTTCAA
AACTTCTCGCAAACATGCTCTACTCATACCGTGGAATGGGACTTTCCGTCGGTACCACGA
TTGCTGGATGGGACGAAACTGGTCCTGGACTATACTATGTGGACAACGAAGTAGGAAGGC
TCAAAGGAGACAGGTTCTCAGTCGGTTCCGGTTCACCATACGCTTACG*TGTACTAGACA
GCGGGTACA
GT

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR2B301TF 772 0 0
CTTCTTTTCTCCTCTTCGTTTGTCACTTACAGCTTCTTCATCTTCTTCTTCTTCTCGCTT
CAATTTGATAACTTTTCTTCAGCAAGGGTTTTAACAATGAAGCTTGATACGAGTGGGTTC
GAGACCTCCATGCCTACGATTGGCTTCGGCTCTAGCAACGACATGCTTGATGGGTTTTCT
ACTGTGCCTTCGTTTGATCTTCCCCGGACCACAGATTTTGATGGGTTTCAGAAAGAAGCA
GTACAGATGGTGAAGCCAGCGAAAGGAACAACCACACTTGCTTTTATCTTCAAAGAAGGT
GTCATGGTCGCTGCGGATTCTCGTGCTAGCATGGGTGGATATATCTCCTCACAATCCGTG
AAGAAGATTATTGAAATCAATCCTTATATGCTTGGTACAATGGCTGGAGGAGCTGCTGAC
TGCCAGTTCTGGCACAGGAATCTTGGAATTAAGTGCCGTCTGCATGAGTTGGCAAACAAG
AGGAGTATTTCTGCTTCAGGAGCTTCAAAACTTCTCGCAAACATGCTCTACTCATACCGT
GGAATGGGACTTTCCGTCGGTACCATGATTGCTGGATGGGACGAAACTGGTCCTGGACTA
TACTATGTGGACAACGAAGGAGGAAGGCTCAAAGGAGACAGGTTCTCAGTCGGTTCCGGT
TCACCATACGCTTACGGTGTACTAGACAGCGGGTACAAGTTCGATATGTCAGTTGAAGAA
GCTTCCGAGTTAGCAAGGAGATCAATCTACCATGCTACATTCCGTGATGGAG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2F014TF 784 0 0
G
ACAGTTTCTTCATCTTCTTCTTCTTCTCGCTTCAATTTGATAACTTTTCTTCAGCAAGGG
TTTTAACAATGAAGCTTGATACGAGTGGGTTCGAGACCTCCATGCCTACGATTGGCTTCG
GCTCTAGCAACGACATGCTTGATGGGTTTTCTACTGTGCCTTCGTTTGATCTTCCCCGGA
CCACAGATTTTGATGGGTTTCAGAAAGAAGCAGTACAGATGGTGAAGCCAGCGAAAGGAA
CAACCACACTTGCTTTTATCTTCAAAGAAGGTGTCATGGTCACTGCGGATTCTCGTGCTA
GCATGGGTGGATATATCTCCTCACAATCCGTGAAGAAGATTATTGAAATCAATCCTTATA
TGCTTGGTACAATGGCTGGAGGAGCTGCTGACTGCCAGTTCTGGCACAGGAATCTTGGAA
TTAAGTGCCGTCTGCATGAGCTGGCAAACAAGAGGAGAATTTCTGTTTCAGGAGCTTCAA
AACTTCTCGCAAACATGCTCTACTCATACCGTGGAATGGGACTTTCCGTCGGTACCATGA
TTGCTGGATGGGACGAAACTGGTCCTGGACTATACTATGTGGACAACGAAGGAGGAAGGC
TCAAAGGAGACAGGTTCTCAGTCGGTTCCGGTTCACCATACGCTTACGGTGTACTAGACA
GCGGGTACAAGTTCGATATGTCAGTTGAAGAAGCTTCCGAGTTAGCAAGGAGATCAATCT
ACCATGCTACATTCCGTGATGGAGCCAGTGGTGGTGTTGCTAGCGTGTACCACGTGGGTC
CTA

QA 2 784 2 784
DS 

RD RR2F014JQ 737 0 0
TTATATGCTTGGTACAATGGCTGGAGGAGCTGCTGACTGCCAGTTCTGGCACAGGAATCT
TGGAATTAAGTGCCGTCTGCATGAGCTGGCAAACAAGAGGAGAATTTCTGTTTCAGGAGC
TTCAAAACTTCTCGCAAACATGCTCTACTCATACCGTGGAATGGGACTTTCCGTCGGTAC
CATGATTGCTGGATGGGACGAAACTGGTCCTGGACTATACTATGTGGACAACGAAGGAGG
AAGGCTCAAAGGAGACAGGTTCTCAGTCGGTTCCGGTTCACCATACGCTTACGGTGTACT
AGACAGCGGGTACAAGTTCGATATGTCAGTTGAAGAAGCTTCCGAGTTAGCAAGGAGATC
AATCTACCATGCTACATTCCGTGATGGAGCCAGTGGTGGTGTTGCTAGCGTGTACCACGT
GGGTCCTAATGGATGGAAGAAATTGTCGGGAGATGATGTCGGGGAGCTACACTATCACTA
CTACCCCGTGCCACCAGCCATTGCGGAACAAGTCATGGAGGAAGCAGCTGCCGAGTAAAA
CTAAGATTATCTTTTGCTTCCAAATCATTCACTCCGTTTCTCTAGCTTAAGCTGTGGTAT
TCACTCTATTAAGATTCTCCTTTTTTTTCTTCTTTAAACACTGCTCTCTTCGATCAGCTT
GTTAAACTCTTCACCCTTTTGTTTCAACCCATGAAATTAAGAACACAAGTTGAATATTAT
TTAAAAGAATGTTTG
AC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2DJ63TF 652 0 0
G
GGCACAGGAATCTTGGAATTAAGTGCCGTCTGCATGAGCTGGCAAACAAGAGGAGAATCT
CTGTTTCCGGAGCTTCAAAACTTCTCGCAAACATGCTCTACTCATACCGTGGAATGGGAC
TTTCCGTCGGCACCATGATCGCTGGATGGGACGAAACTGGTCCTGGACTATACTATGTGG
ACAACGAAGGAGGAAGGCTCAAGGGAGACAGGTTCTCAGTCGGTTCCGGTTCACCATACG
CTTACGGTGTACTTGACAGCGGGTACAAGTTCGATATGTCAGTTGAAGAAGCTTCAGAGT
TAGCAAGGAGATCAATCTACCATGCTACATTCCGTGATGGAGCCAGTGGTGGTGTTGCTA
GCGTGTACCACGTGGGTCCTAATGGATGGACGAAACTGTCAGGAGATGATGTTGGGGAGC
TACACTATCACTACTACCCCGTGCCACCAGCCATTGCGGAGCAAGTCATGGAGGAAGCAG
CTGCCGAGTAAAACTAAGATTCTCTTTTGCTTCCAAATCATTCACTCCGTTTCGCTAGCT
TAAGCTGTGGTATTCACTCTTTTAAGATTCTT*TTTTTTTTCTTCTTTAAACATTGCTTT
CTTCGATCAGCTTGTTAAACTCTTCACCCTGT*GTTTCAACCCATGAAATT

QA 2 652 2 652
DS 

RD RR2DT72JQ 599 0 0
CATGCTCTACTCATACCGTGGAATGGGACTTTCCGTCGGTACCACGATTGCTGGATGGGA
CGAAACTGGTCCTGGACTATACTATGTGGACAACGAAGTAGGAAGGCTCAAAGGAGACAG
GTTCTCAGTCGGTTCCGGTTCACCATACGCTTACGGTGTACTAGACAGCGGGTACAAGTT
CGATATGTCAGTTGAAGAAGCTTCCGAGTTAGCAAGGAGATCAATCTACCATGCTACATT
CCGTGATGGAGCCAGTGGTGGTGTTGCTAGCGTGTACCACGTGGGTCCTAATGGATGGAA
GAAATTGTCGGGAGATGATGTCGGGGAGCTACACTATCACTACTACCCCGTGCCACCAGC
CATTGCGGAACAAGTCATGGAGGAAGCAGCTGCCGAGTAAAACTAAGATTATCTTTTGCT
TCCAAATCATTCACTCCGTTTCTCTAGCTTAAGCTGTGGTATTCACTCTATTAAGATTCT
CCTTTTTTTTCTTCTTTAAACACTGCTCTCTTCGATCAGCTTGTTAAACTCTTCACCCTT
T*GTTTCAACCCATGAAATTAAGAACACAAGTTGAATATTATTTAAAAGAATGTTTGCG

QA 1 599 1 599
DS 



CO CL576Contig2 669 2 2 U
GCAAGAGGAGAATCTCTGTTTCCGGAGCTTCAAAACTTCTGGCAAACATGCTCTACTCGT
ACCGTGGAATGGGTCTTTCTGTCGGCACGATGATCGCTGGATGGGACGAAACTGGTCCTG
GACTATACTATGTCGACAACGAAGGAGGAAGGCTTAAGGGAGACAGGTTTTCAGTCGGTT
CTGGTTCACCATACGCTTACGGTGTCCTAGACAGCGGGTACAAATTCGATATGTCAGTTG
AAGAAGCTTCCGAGTTAGCAAGGAGATCAATCTACCATGCGACATTCCGTGATGGAGCCA
GTGGTGGAGTTGCTAGCGTGTACCACGTGGGTCCTAATGGATGGAAGAAACTGTCAGGAG
ATGACGTTGGGGAGTTACACTATCACTACTACCCCGTGCCACCAGAAACTGCTGAACAAG
TCATGGAGGAAGCAGCCGCTGAGTAAGGAGATCTGTTTTACTTCCAAATGATTCACCCTC
TTTTATCTGTGTTTTGGTTTTTAGTAAGTATACTGAGTTTTTATCTAGCTCTTAAGCTTT
TGGTATTCACTATTACAAGGTTCTCCTTTTTTAACTGCAAATACATGATGTCTTTACTTT
GTTCAAGCAGCTCTTTTTAACTCTCACCCTGTGTTTAAAAGTATGAAATAATCTGTGATT
ATTTTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D947TF U 1
AF RR2D947JQ C 109
BS 1 661 RR2D947TF
BS 662 669 RR2D947JQ

RD RR2D947TF 661 0 0
GCAAGAGGAGAATCTCTGTTTCCGGAGCTTCAAAACTTCTGGCAAACATGCTCTACTCGT
ACCGTGGAATGGGTCTTTCTGTCGGCACGATGATCGCTGGATGGGACGAAACTGGTCCTG
GACTATACTATGTCGACAACGAAGGAGGAAGGCTTAAGGGAGACAGGTTTTCAGTCGGTT
CTGGTTCACCATACGCTTACGGTGTCCTAGACAGCGGGTACAAATTCGATATGTCAGTTG
AAGAAGCTTCCGAGTTAGCAAGGAGATCAATCTACCATGCGACATTCCGTGATGGAGCCA
GTGGTGGAGTTGCTAGCGTGTACCACGTGGGTCCTAATGGATGGAAGAAACTGTCAGGAG
ATGACGTTGGGGAGTTACACTATCACTACTACCCCGTGCCACCAGAAACTGCTGAACAAG
TCATGGAGGAAGCAGCCGCTGAGTAAGGAGATCTGTTTTACTTCCAAATGATTCACCCTC
TTTTATCTGTGTTTTGGTTTTTAGTAAGTATACTGAGTTTTTATCTAGCTCTTAAGCTTT
TGGTATTCACTATTACAAGGTTCTCCTTTTTTAACTGCAAATACATGATGTCTTTACTTT
GTTCAAGCAGCTCTTTTTAACTCTCACCCTGTGTTTAAAAGTATGAAATAATCTGTGATT
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2D947JQ 561 0 0
AAACTGGTCCTGGACTATACTATGTCGACAACGAAGGAGGAAGGCTTAAGGGAGACAGGT
TTTCAGTCGGTTCTGGTTCACCATACGCTTACGGTGTCCTAGACAGCGGGTACAAATTCG
ATATGTCAGTTGAAGAAGCTTCCGAGTTAGCAAGGAGATCAATCTACCATGCGACATTCC
GTGATGGAGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGTGTACCACGTGGGTCCTAATGGATGGAAGA
AACTGTCAGGAGATGACGTTGGGGAGTTACACTATCACTACTACCCCGTGCCACCAGAAA
CTGCTGAACAAGTCATGGAGGAAGCAGCCGCTGAGTAAGGAGATCTGTTTTACTTCCAAA
TGATTCACCCTCTTTTATCTGTGTTTTGGTTTTTAGTAAGTATACTGAGTTTTTATCTAG
CTCTTAAGCTTTTGGTATTCACTATTACAAGGTTCTCCTTTTTTAACTGCAAATACATGA
TGTCTTTACTTTGTTCAAGCAGCTCTTTTTAACTCTCACCCTGTGTTTAAAAGTATGAAA
TAATCTGTGATTATTTTGAGC

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 9

CO CL577Contig1 901 9 11 U
GAAAAACAATGGCAGCAAGTGCATCTCCAATGGCGAGCCAGCTAAGGAGCAGCTTATCCT
CCGCTGCAATTGCTAGGCGTCTAGCCGTCCCTAAGGGAATCTCCGGCCCTTCTTTCGGCG
TATATCCGACCAAGAGAATCTCTTCCTTCACTGTCCGAGCTGCTCAGACCGACAAGCCAA
CATTTCAAGTGATCCAACCAATCAACGGCGATCCATTCATCGGAAGTTTGGAGACTCCTG
TAACGTCAAGCCCTTTGATTGCGTGGTATCTTTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACCGCCG
TCAACCCTCTCCTTCGTGGTGTTGAAGTGGGCTTGGCACATGGTTTCCTCTTAGTGGGCC
CATTCGTCAAAGCTGGCCCATTAAGGAACACTGCTTACGCTGGTTCCGCCGGCTCCTTAG
CCGCCGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCATGTGCCTCACTATCTACGGAATCTCTTCGT
TCAAGGAAGGAGAGCCCTCGATTGCTCCGAGTTTGACGTTGACTGGGCGGAAGAAGCAGC
CTGACCAGCTTCAGACAGCTGAGGGATGGGCAAAATTTACGGGAGGGTTCTTCTTCGGAG
GGATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTACTTTCTCCTCTACGTTCTTGACCTTCCCTATTTCG
TCAAGTGAATGTAGTACAAAATATGAGCTTTCACCAGTATTCTACCTATAAATACTCTCC
AGTACAATTGTTTCTTTTTCCTTTTTAATTTACTTTTGTCTGATCAAGAATCCTAAATCT
CAGGATCGTTTATGCATAATACTGTGCATCTTCTCTTAACTATTTCTTGGTCTTTATTTC
ACATAATGTGTTGTTGACATCTGAAAATTTCTTTGAACACAAAAAAATAAAATACATTTT
G


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2GB42TF U 1
AF RR2CU10TF U 3
AF RR2G625TF U 3
AF RR2EQ11TF U 3
AF RR2EQ11JQ C 95
AF RR2GB42JQ C 150
AF RR2G625JQ C 256
AF RR2CU10JQ C 147
AF RR2DM48TF U 338
BS 1 179 RR2GB42TF
BS 180 180 RR2CU10TF
BS 181 195 RR2GB42TF
BS 196 196 RR2CU10TF
BS 197 494 RR2GB42TF
BS 495 495 RR2CU10TF
BS 496 552 RR2GB42TF
BS 553 739 RR2CU10TF
BS 740 822 RR2DM48TF
BS 823 823 RR2CU10JQ
BS 824 901 RR2DM48TF

RD RR2GB42TF 552 0 0
GAAAAACAATGGCAGCAAGTGCATCTCCAATGGCGAGCCAGCTAAGGAGCAGCTTATCCT
CCGCTGCAATTGCTAGGCGTCTAGCCGTCCCTAAGGGAATCTCCGGCCCTTCTTTCGGCG
TATATCCGACCAAGAGAATCTCTTCCTTCACTGTCCGAGCTGCTCAGACCGACAAGCCAT
CATTTCAAGTGATCCGACCAATCAACGGCGATCCATTCATCGGAAGTTTGGAGACTCCTG
TAACGTCAAGCCCTTTGATTGCGTGGTATCTTTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACCGCCG
TCAACCCTCTCCTTCGTGGTGTTGAAGTGGGCTTGGCACATGGTTTCCTCTTAGTGGGCC
CATTCGTCAAAGCTGGCCCATTAAGGAACACTGCTTACGCTGGTTCCGCCGGCTCCTTAG
CCGCCGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCATGTGCCTCACTATCTACGGAATCTCTTCGT
TCAAGGAAGGAGAGTCCTCGATTGCTCCGAGTTTGACGTTGACTGGGCGGAAGAAGCAGC
CTGACCAGCTTC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2CU10TF 737 0 0
AAAACAATGGCAGCAAGTGCATCTCCAGTGGCGAGCCAGCTAAGGAGCAGCTTATCCTCC
GCTGCAATTGCTAGGCGTCTAGCCGTCCCTAAGGGAATCTCCGGCCCTTCTTTCGGCGTA
TATCCGACCAAGAGAATCTCTTCCTTCACTGTCCGAGCTGCTCAGACCGACAAGCCAACA
TTTCAAGTGATCCAACCAATCAACGGCGATCCATTCATCGGAAGTTTGGAGACTCCTGTA
ACGTCAAGCCCTTTGATTGCGTGGTATCTTTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACCGCCGTC
AACCCTCTCCTTCGTGGTGTTGAAGTGGACTTGGCACATGGTTTCCTCTTAGTGGGCCCA
TTCGTCAAAGCTGGCCCATTAAGGAACACTGCTTACGCTGGTTCCGCCGGCTCCTTAGCC
GCCGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCATGTGCCTCACTATCTACGGAATCTCTTCGTTC
AAGGAAGGAGAGCCCTCGATTGCTCCGAGTTTGACGTTGACTGGGCGGAAGAAGCAGCCT
GACCAGCTTCAGACAGCTGAGGGATGGGCAAAATTTACGGGAGGGTTCTTCTTCGGAGGG
ATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTACTTTCTCCTCTACGTTCTTGACCTTCCCTATTTCGTC
AAGTGAATGTAGTACAAAATATGAGCTTTCACCAGTATTCTACCTATAAATACTCTCCAG
TACAATTGTTTCTTTTT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2G625TF 731 0 0
AAAACAATGGCAGCAAGTGCATCTCCAATGGCGAGCCAGCTAAGGAGCAGCTTATCCTCC
GCTGCAATTGCTAGGCGTCTAGCCGTCCCTAAGGGAATCTCCGGCCCTTCTTTCGGCGTA
TATCCGACCAAGAGAATCTCTTCCTTCACTGTCCGAGCTGCTCAGACCGACAAGCCAACA
TTTCAAGTGATCCAACCAATCAACGGCGATCCATTCATCGGAAGTTTGGAGACTCCTGTA
ACGTCAAGCCCTTTGATTGCGTGGTATCTTTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACCGCCGTC
AACCCTCTCCTTCGTGGTGTTGAAGTGGGCTTGGCACATGGTTTCCTCTTAGTGGGCCCA
TTCGTCAAAGCTGGCCCATTAAGGAACACTGCTTACGCTGGTTCCGCCGGCTCCTTAGCC
GCCGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCATGTGCCTCACTATCTACGGAATCTCTTCGTTC
AAGGAAGGAGAGCCCTCGATTGCTCCGAGTTTGACGTTGACTGGGCGGAAGAAGCAGCCT
GACCAGCTTCAGACAGCTGAGGGATGGTCAAAATTTACGGGAGGGTTCTTCTTCGGAGGT
ATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTACTTTCTCCTCTACGTTCTTGACCTTCCCTATTTCGTC
AAGTGAATGTAGTACAAA*TATGAGCTTTCAC*AGTATTCTACCTATAAATACTCTC*AG
TACAATTGTT
C

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2EQ11TF 727 0 0
AAAACAATGGCAGCAAGTGCATCTCCAATGGCGAGCCAGCTAAGGAGCAGCTTATCCTCC
GCTGCAATTGCTAGGCGTCTAGCCGTCCCTAAGGGAATCTCCGGCCCTTCTTTCGGCGTA
TATCCGACCGAGAGAATCTCTTCCTTCACTGTCCGAGCTGCTCAGACCGACAAGCCAACA
TTTCAAGTGATCCAACCAATCAACGGCGATCCATTCATCGGAAGTTTGGAGACTCCTGTA
ACGTCAAGCCCTTTGATTGCGTGGTATCTTTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACCGCCGTC
AACCCTCTCCTTCGTGGTGTTGAAGTGGGCTTGGCACATGGTTTCCTCTTAGTGGGCCCA
TTCGTCAAAGCTGGCCCATTAAGGAACACTGCTTACGCTGGTTCCGCCGGCTCCTTAGCC
GCCGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCATGTGCCTCACTATCTACGGAATCTCTTCGTTC
AAGGAAGGAGAGCCCTCGATTGCTCCGAGTTTGACGTTGACTGGGCGGAAGAAGCAGCCT
GACCAGCTTCAGACAGCTGAGGGATGGGCAAAATTTACGGGAGGGTTCTTCTTCGGAGGG
ATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTACTTTCTCCTCTACGTTCTTGACCTTCCCTATTTCGTC
AAGTGAATGTAGTACAAAATATGAGCTTTCACCAGTATTCTACCTATAAATACTCTCCAG
TACAAT
G

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2EQ11JQ 678 0 0
GGGAATCTCCGGCCCTTCTTTCGGCGTATATCCGACCGAGAGAATCTCTTCCTTCACTGT
CCGAGCTGCTCAGACCGACAAGCCAACATTTCAAGTGATCCAACCAATCAACGGCGATCC
ATTCATCGGAAGTTTGGAGACTCCTGTAACGTCAAGCCCTTTGATTGCGTGGTATCTTTC
CAACCTCCCGGCTTACCGCACCGCCGTCAACCCTCTCCTTCGTGGTGTTGAAGTGGGCTT
GGCACATGGTTTCCTCTTAGTGGGCCCATTCGTCAAAGCTGGCCCATTAAGGAACACTGC
TTACGCTGGTTCCGCCGGCTCCTTAGCCGCCGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCATGTG
CCTCACTATCTACGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAGGAGAGCCCTCGATTGCTCCGAGTTT
GACGTTGACTGGGCGGAAGAAGCAGCCTGACCAGCTTCAGACAGCTGAGGGATGGGCAAA
ATTTACGGGAGGGTTCTTCTTCGGAGGGATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTACTTTCTCCT
CTACGTTCTTGACCTTCCCTATTTCGTCAAGTGAATGTAGTACAAAATATGAGCTTTCAC
CAGTATTCTACCTATAAATACTCTCCAGTACAATTGTTTCTTTTTCCTTTTTAATTTACT
TTTGTCTGATCAAGAA
CC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2GB42JQ 607 0 0
ACTGTCCGAGCTGCTCAGACCGACAAGCCATCATTTCAAGTGATCCGACCAATCAACGGC
GATCCATTCATCGGAAGTTTGGAGACTCCTGTAACGTCAAGCCCTTTGATTGCGTGGTAT
CTTTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACCGCCGTCAACCCTCTCCTTCGTGGTGTTGAAGTG
GGCTTGGCACATGGTTTCCTCTTAGTGGGCCCATTCGTCAAAGCTGGCCCATTAAGGAAC
ACTGCTTACGCTGGTTCCGCCGGCTCCTTAGCCGCCGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAGC
ATGTGCCTCACTATTTACGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAGGAGAGTCCTCGATTGCTCCG
AGTTTGACGTTGACTGGGCGGAAGAAGCAGCCTGACCAGCTTCAGACAGCTGAGGGATGG
GCAAAATTTACGGGAGGGTTCTTCTTCGGAGGGATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTACTTT
CTCCTCTACGTTCTTGACCTTCCCTATTTCGTCAAGTGAATGTAGTACAAAATATGAGCT
TTCACCAGTATTCTACCTATAAATACTCTCCAGTACAATTGTTTCTTTTTCCTTTTTAAT
TTACTTT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2G625JQ 585 0 0
TGATTGCGTGGTATCTTTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACCGCCGTCAACCCTCTCCTTC
GTGGTGTTGAAGTGGGCTTGGCACATGGTTTCCTCTTAGTGGGCCCATTCGTCAAAGCTG
GCCCATTAAGGAACACTGCTTACGCTGGTTCCGCCGGCTCCTTAGCCGCCGCTGGGCTTG
TAGTCATCCTCAGCATGTGCCTCACTATCTACGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAGGAGAGC
CCTCGATTGCTCCGAGTTTGACGTTGACTGGGCGGAAGAAGCAGCCTGACCAGCTTCAGA
CAGCTGAGGGATGGTCAAAATTTACGGGAGGGTTCTTCTTCGGAGGTATCTCTGGTGTGA
CTTGGGCTTACTTTCTCCTCTACGTTCTTGACCTTCCCTATTTCGTCAAGTGAATGTAGT
ACAAAATATGAGCTTTCACCAGTATTCTACCTATAAATACTCTCCAGTACAATTGTTTCT
TTTTCCTTTTTAATTTACTTTTGTCTGATCAAGAATCCTAAATCTCAGGATCGTTTATGC
ATAATACTGTGCATCTTCTCTTAACTATTTCTTGGTCTTTATTTC

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2CU10JQ 755 0 0
TTCACTGTCCGAGCTGCTCAGACCGACAAGCCAACATTTCAAGTGATCCAACCAATCAAC
GGCGATCCATTCATCGGAAGTTTGGAGACTCCTGTAACGTCAAGCCCTTTGATTGCGTGG
TATCTTTCCAACCTCCCGGCTTACCGCACCGCCGTCAACCCTCTCCTTCGTGGTGTTGAA
GTGGACTTGGCACATGGTTTCCTCTTAGTGGGCCCATTCGTCAAAGCTGGCCCATTAAGG
AACACTGCTTACGCTGGTTCCGCCGGCTCCTTAGCCGCCGCTGGGCTTGTAGTCATCCTC
AGCATGTGCCTCACTATTTACGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAGGAGAGCCCTCGATTGCT
CCGAGTTTGACGTTGACTGGGCGGAAGAAGCAGCCTGACCAGCTTCAGACAGCTGAGGGA
TGGGCAAAATTTACGGGAGGGTTCTTCTTCGGAGGGATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTAC
TTTCTCCTCTACGTTCTTGACCTTCCCTATTTCGTCAAGTGAATGTAGTACAAAATATGA
GCTTTCACCAGTATTCTACCTATAAATACTCTCCAGTACAATTGTTTCTTTTTCCTTTTT
AATTTACTTTTGTCTGATCAAGAATCCTAAATCTCAGGATCGTTTATGCATAATACTGTG
CATCTTCTCTTAACTATTTCTTGGTCTTTATTTCACATAATGTGTTGTTGACATCTGAAA
ATTTCTTTGAACACAAAAAAATAAAATACATTTTG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2DM48TF 564 0 0
G
CATGGTTTCCTCCTAGTGGGCCCATTCGTCAAAGCTGGCCCATTAAGGAACACTGCTTAC
GCTGGTTCCGCCGGCTCCTTAGCCGCCGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCATGTGCCTC
ACTATCTACGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAGGAGAGCCCTCGATTGCTCCGAGTTTGACG
TTGACTGGGCGGAAGAAGCAGCCTGACCAGCTTCAGACAGCTGAGGGATGGGCAAAATTT
ACGGGAGGGTTCTTCTTCGGAGGGATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTACTTTCTCCTCTAC
GTTCTTGACCTTCCCTATTTCGCCAAGTGAATGTAGTACAAAATATGAGCTTTCACCAGT
ATTCTACCTATAAATACTCTCCAGTACAATTGTTTCTTTTTCCTTTTTAATTTACTTTTG
TCTGATCAAGAATCCTAAATCTCAGGATCGTTTATGCATAATACTGTGCATCTTCTCTTA
ACTACTTCTTGGTCTTTATTTCACATAATGTGTTGTTGACATCTGAAAATTTCTTTGAAC
ACAAAAAAATAAAATACATTTTG

QA 2 564 2 564
DS 



AS 1 10

CO CL578Contig1 644 10 11 U
GGGACAAATATACATTTTGAACTAGAGAGTTATTAACATATCCAAAAAGAAGATGTCGTC
GAACCAAGAACTAAGCTACAAGGCCGGAGAAGCCACCGGTCAAGTTCAGCTGAAGAAGGA
AGAGTACTTGAACAAAGTATCACACGCAATGAATGAGAGTGCTGATCATCACTCACACTC
ACACGCGGAACATGATCAGAATAATCCTTCCCTAATTTCTCAGGCCTCCAATGTCATTCA
ACAGACAGGAGGGCAAGTGAAGAATATGGCACAAGGAGCAGCGGACGCTGTGAAGAACAC
TCTTGGGATGAGTCCAGCCACTAACAATCCTAGCAGCCCGGCCGGCACGAACCGCCCGAG
CAACCCTAGCTCCAAAAATCTTTAAAAGAAGTTGTTTTAAGAAATTGTTGGCCTGATCTT
CTCAACATAAATAAAAACTTTTTCATTGTGTTTGGTTTGCTCTATTTCTTCTCTGTTTTT
TTTTTT**GTATTTTTGTTATTGTAAGTTGTCTCTGTTTTTTTTTT**GTATTTTTGTTA
TTGTAAGTTGAGACATTATTACGTGTCTCACTCATCATAACCTTAGTAAGGGCTTTATTT
ATCTTATGAATGATCGTCAAATAATATCATCTATTTCTTTTTAC


BQ
10 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 45 
45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GO30TF U 163
AF RR2E807JQ C 1
AF RR2CB48TF U 2
AF RR2CB48JQ C 2
AF RR2E807TF U 1
AF RR2DT18TF U 2
AF RR2F657JQ C 2
AF RR2F657TF U 2
AF RR2EQ26JQ C 16
AF RR2EQ26TF U 16
BS 1 1 RR2E807JQ
BS 2 483 RR2CB48TF
BS 484 486 RR2E807TF
BS 487 513 RR2CB48TF
BS 514 514 RR2E807TF
BS 515 526 RR2CB48TF
BS 527 527 RR2DT18TF
BS 528 605 RR2CB48TF
BS 606 623 RR2E807TF
BS 624 634 RR2DT18TF
BS 635 644 RR2EQ26TF

RD RR2GO30TF 253 0 0
TGATCATCACTCACACTCACACGCGGAACATGATCAGAATAATCCTTCCCTAATTTCTCA
GGCCTCCAATGTCATTCAACAGACAGGAGGGCAAGTGAAGAATATGGCACAAGGAGCAGC
GGACGCTGTGAAGAACACTCTTGGGATGAGTCCAGCCACTAACAATCCTAGCAGCCCGGC
CGGCACGAACCGCCCGAGCAACCCTAGCTCCAAAAATCTTTAAAAGAAGTTGTTTTAAGA
AATT
TGTTGGCCT

QA 1 244 1 244
DS 

RD RR2E807JQ 625 0 0
GGGACAAATGTACATTTTGAACTAGAGAGTTATTAACATATCCAAAGAGAAGATGTCGTC
GAACCAAGAACTAAGCTACAAGGCCGGAGAAGCCACCGGTCAAGTTCAGCTGAAGAAGGA
AGAGTACTTGAACAAAGTATCACACGCAATGAATGAGAGTGCTGATCATCACTCACACTC
ACACGCGGAACATGATCAGAATAATCCTTCCCTAATTTTTCAGGCCTCCAAT*TCATTCA
ACAGACAGGAGGGCAAGTGAAGAATATGGCACAAGGAGCAGCGGACGCTGTGAAGAACAC
TCTTGGGATGAGTCCAGCCACTAACAATCCTAGCAGCCCGGCCGGCACGAACCGCCCGAG
CAACCCTAGCTCCAAAAATCTTTAAAAGAAGTTGTTTTAAGAAATTGTTGGCCTGATTTT
TTCAACATAAATAAAAACTTTTTCATTGTGTTTGGTTTGCTCTATTTCTTCTCTGTTTTT
TTTTTT**GTATTTTTGTTATTGTAAGTTGTCTCTGTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGTTA
TTGTAAGTTGAGACATTATTACGTGTCTCACTCATCATAACCTTAGTAAGGGCTTTATTT
ATCTTATGAATGATCGTCAAATA
GT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2CB48TF 604 0 0
GGACAAATATACATTTTGAACTAGAGAGTTATTAACATATCCAAAAAGAAGATGTCGTCG
AACCAAGAACTAAGCTACAAGGCCGGAGAAGCCACCGGTCAAGTTCAGCTGAAGAAGGAA
GAGTACTTGAACAAAGTATCACACGCAATGAATGAGAGTGCTGATCATCACTCACACTCA
CACGCGGAACATGATCAGAATAATCCTTCCCTAATTTCTCAGGCCTCCAATGTCATTCAA
CAGACAGGAGGGCAAGTGAAGAATATGGCACAAGGAGCAGCGGACGCTGTGAAGAACACT
CTTGGGATGAGTCCAGCCACTAACAATCCTAGCAGCCCGGCCGGCACGAACCGCCCGAGC
AACCCTAGCTCCAAAAATCTTTAAAAGAAGTTGTTTTAAGAAATTGTTGGCCTGATCTTC
TCAACATAAATAAAAACTTTTTCATTGTGTTTGGTTTGCTCTATTTCTTCTCTGTTTTTT
TT*****GTATTTTTGTTATTGTAAGTTGTCTTTGTTTTTTTTTTT*GTATTTTTGTTAT
TGTAAGTTGAGACATTATTACGTGTCTCACTCATCATAACCTTAGTAAGGGCTTTATTTA
TCTT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2CB48JQ 602 0 0
GGACAAATATACATTTTGAACTAGAGAGTTATTAACATATCCAAAAAGAAGATGTCGTCG
AACCAAGAACTAAGCTACAAGGCCGGAGAAGCCACCGGTCAAGTTCAGCTGAAGAAGGAA
GAGTACTTGAACAAAGTATCACACGCAATGAATGAGAGTGCTGATCATCACTCACACTCA
CACGCGGAACATGATCAGAATAATCCTTCCCTAATTTCTCAGGCCTCCAATGTCATTCAA
CAGACAGGAGGGCAAGTGAAGAATATGGCACAAGGAGCAGCGGACGCTGTGAAGAACACT
CTTGGGATGAGTCCAGCCACTAACAATCCTAGCAGCCCGGCCGGCACGAACCGCCCGAGC
AACCCTAGCTCCAAAAATCTTTAAAAGAAGTTGTTTTAAGAAATTGTTGGCCTGATCTTC
TCAACATAAATAAAAACTTTTTCATTGTGTTTGGTTTGCTCTATTTCTTCTCTGTTTTTT
TT*****GTATTTTTGTTATTGTAAGTTGTCTTTGTTTTTTTTTTT*GTATTTTTGTTAT
TGTAAGTTGAGACATTATTACGTGTCTCACTCATCATAACCTTAGTAAGGGCTTTATTTA
TC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2E807TF 625 0 0
G
GGACAAATGTACATTTTGAACTAGAGAGTTATTAACATATCCAAAGAGAAGATGTCGTCG
AACCAAGAACTAAGCTACAAGGCCGGAGAAGCCACCGGTCAAGTTCAGCTGAAGAAGGAA
GAGTACTTGAACAAAGTATCACACGCAATGAATGAGAGTGCTGATCATCACTCACACTCA
CACGCGGAACATGATCAGAATAATCCTTCCCTAATTTCTCAGGCCTCCAAT*TCATTCAA
CAGACAGGAGGGCAAGTGAAGAATATGGCACAAGGAGCAGCGGACGCTGTGAAGAACACT
CTTGGGATGAGTCCAGCCACTAACAATCCTAGCAGCCCGGCCGGCACGAACCGCCCGAGC
AACCCTAGCTCCAAAAATCTTTAAAAGAAGTTGTTTTAAGAAATTGTTGGCCTGATCTTC
TCAACATAAATAAAAACTTTTTCATTGTGTTTGGTTTGCTCTATTTCTTCTCTGTTTTTT
TTTTT**GTATTTTTGTTATTGTAAGTTGTCTCTGTTTTTTTTTTTTGTATTTTTGTTAT
TGTAAGTTGAGACATTATTACGTGTCTCACTCATCATAACCTTAGTAAGGGCTTTATTTA
TCTTATGAATGATCGTCAAATA
GT

QA 2 623 2 623
DS 

RD RR2DT18TF 635 0 0
GGACAAATATACATTTTGAACTAGAGAGTTATTAACATATCCAAAAAGAAGATGTCGTCG
AACCAAGAACTAAGCTACAAGGCCGGAGAAGCCACCGGTCAAGTTCAGCTGAAGAAGGAA
GAGTACTTGAACAAAGTATCACACGCAATGAATGAGAGTGCTGATCATCACTCACACTCA
CACGCGGAACATGATCAGAATAATCCTTCCCTAATTTCTCAGGCCTCCAATGTCATTCAA
CAGACAGGAGGGCAAGTGAAGAATATGGCACAAGGAGCAGCGGACGCTGTGAAGAACACT
CTTGGGATGAGTCCAGCCACTAACAATCCTAGCAGCCCGGCCGGCACGAACCGCCCGAGC
AACCCTAGCTCCAAAAATCTTTAAAAGAAGTTGTTTTAAGAAATTGTTGGCCTGATCTTC
TCAACATAAATAAAAACTTTTTCATTGTGTTTGGTTTGCTCTATTTCTTCTCTGTTTTTT
TTTTTTTGTATTTTTGTTATTGTAAGTTGTCTCTGTTTTTTTTTT**GTATTTTTGTTAT
TGTAAGTTGAGACATTATTACGTGTCTCACTCATCATAACCTTAGTAAGGGCTTTATTTA
TCTTATGAATGATCGTCAAATAATATCATCTAT
TT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2F657JQ 633 0 0
GGACAAATATACATTTTGAACTAGAGAGTTATTAACATATCCAAAAAGAAGATGTCGTCG
AACCAAGAACTAAGCTACAAGGCCGGAGAAGCCACCGGTCAAGTTCAGCTGAAGAAGGAA
GAGTACTTGAACAAAGTATCACACGCAATGAATGAGAGTGCTGATCATCACTCACACTCA
CACGCGGAACATGATCAGAATAATCCTTCCCTAATTTCTCAGGCCTCCAATGTCATTCAA
CAGACAGGAGGGCAAGTGAAGAATATGGCACAAGGAGCAGCGGACGCTGTGAAGAACACT
CTTGGGATGAGTCCAGCCACTAACAATCCTAGCAGCCCGGCCGGCACGAACCGCCCGAGC
AACCCTAGCTCCAAAAATCTTTAAAAGAAGTTGTTTTAAGAAATTGTTGGCCTGATCTTC
TCAACATAAATAAAAACTTTTTCATTGTGTTTGGTTTGCTCTATTTCTTCTCTGTTTTTT
TTTTT**GTATTTTTGTTATTGTAAGTTGTCTTTGTTTTTTTTT***GTATTTTTGTTAT
CGTAAGTTGAGACATTATTACGTGTCTCACTCATCATAACCTTAGTAAGGGCTTTATTTA
TCTTATGAATGATCGTCAAATAATATCATCTAT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2F657TF 600 0 0
GGACAAATATACATTTTGAACTAGAGAGTTATTAACATATCCAAAAAGAAGATGTCGTCG
AACCAAGAACTAAGCTACAAGGCCGGAGAAGCCACCGGTCAAGTTCAGCTGAAGAAGGAA
GAGTACTTGAACAAAGTATCACACGCAATGAATGAGAGTGCTGATCATCACTCACACTCA
CACGCGGAACATGATCAGAATAATCCTTCCCTAATTTCTCAGGCCTCCAATGTCATTCAA
CAGACAGGAGGGCAAGTGAAGAATATGGCACAAGGAGCAGCGGACGCTGTGAAGAACACT
CTTGGGATGAGTCCAGCCACTAACAATCCTAGCAGCCCGGCCGGCACGAACCGCCCGAGC
AACCCTAGCTCCAAAAATCTTTAAAAGAAGTTGTTTTAAGAAATTGTTGGCCTGATCTTC
TCAACATAAATAAAAACTTTTTCATTGTGTTTGGTTTGCTCTATTTCTTCTCTGTTTTTT
TTTTT**GTATTTTTGTTATTGGAAGTTGTCTTTGTTTTTTTTT***GTATTTTTGTTAT
CGTAAGTTGAGACATTATTACGTGTCTCACTCATCATAACCTTAGTAAGGGCTTTATTTA

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2EQ26JQ 629 0 0
TTTGAACTAGAGAGTTATTAACATATCCAAAAAGAAGATGTCGTCGAACCAAGAACTAAG
CTACAAGGCCGGAGAAGCCACCGGTCAAGTTCAGCTGAAGAAGGAAGAGTACTTGAACAA
AGTATCACACGCAATGAATGAGAGTGCTGATCATCACTCACACTCACACGCGGAACATGA
TCAGAATAATCCTTCCCTAATTTCTCAGGCCTCCAATGTCATTCAACAGACAGGAGGGCA
AGTGAAGAATATGGCACAAGGAGCAGCGGACGCTGTGAAGAACACTCTTGGGATGAGTCC
AGCCACTAACAATCCTAGCAGCCCGGCCGGCACGAACCGCCCGAGCAACCCTAGCTCCAA
AA*TCTTTAAAAGAAGTTGTTTTAAGAAATTGTTGGCCTGATCTTCTCAACATAAATAAA
AACTTTTTCATTGTGTTTGGTTTGCTCTATTTCTTCTCTGTTTTTTTTTTTT*GTATTTT
TGTTATTGTAAGTTGTCTCTGTTTTTTTT****GTATTTTTGTTATTGTAAGTTGAGACA
TTATTACGTGTCTCACTCATCATAACCTTAGTAAGGGCTTTATTTATCTTATGAATGATC
GTCAAATAATATCATCTATTTCTTTTTAC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2EQ26TF 629 0 0
TTTGAACTAGAGAGTTATTAACATATCCAAAAAGAAGATGTCGTCGAACCAAGAACTAAG
CTACAAGGCCGGAGAAGCCACCGGTCAAGTTCAGCTGAAGAAGGAAGAGTACTTGAACAA
AGTATCACACGCAATGAATGAGAGTGCTGATCATCACTCACACTCACACGCGGAACATGA
TCAGAATAATCCTTCCCTAATTTCTCAGGCCTCCAATGTCATTCAACAGACAGGAGGGCA
AGTGAAGAATATGGCACAAGGAGCAGCGGACGCTGTGAAGAACACTCTTGGGATGAGTCC
AGCCACTAACAATCCTAGCAGCCCGGCCGGCACGAACCGCCCGAGCAACCCTAGCTCCAA
AA*TCTTTAAAAGAAGTTGTTTTAAGAAATTGTTGGCCTGATCTTCTCAACATAAATAAA
AACTTTTTCATTGTGTTTGGTTTGCTCTATTTCTTCTCTGTTTTTTTTTTTT*GTATTTT
TGTTATTGTAAGTTGTCTCTGTTTTTTTT****GTATTTTTGTTATTGTAAGTTGAGACA
TTATTACGTGTCTCACTCATCATAACCTTAGTAAGGGCTTTATTTATCTTATGAATGATC
GTCAAATAATATCATCTATTTCTTTTTAC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 2 10

CO CL579Contig1 908 6 11 U
TTTTTATAATGGCGACTTCTTCGATCACTATACCAACCATTCGGGGCACCAAGTTTCTCG
GCCAGACACATCTATTTTCAACTCCAAACCGATCGGTTCTCCCGCCTTCAAAACAGCAAT
CAAACGTTCATCGAGTAAAGGCCATGGCTAAGTTCAACCTATGGGAAGTGATGGGAGGAA
GAGGATTATGCAACGGAGAGAAAGGTATCGAGAAGGAGCTCCAGAGGAACATAGAGGAAG
AGACATCACAGACCGAGAACGAGACAAAGAAACAGAGCGATGACGGCGACAATAGCTTAT
CGTTTCAAGTTCCTGAAGACGGTTTCGAGAAAGAGATGATGGGTCTCACCGGAGGCTTCC
CCGGCGGCGAAAAGGGACTGAAAACGTTCATCGAACAAAACCCACCACCACCACCACCAC
AACCGAAGAGAGGAAGCGATGATGTTGTATCCTTAGTTGGTACAGAGAAGAAGCCGAGAG
CTCCAGAGCTACCGCTTCTCATGCCGGGGATGATCGCTATAGTCAAGAACGCGAACAGTC
CTTACCACATGTACTGTGGGATAGTTCAGAGGATCACTGACGGGAAAGCTGGTGTGTTGT
TCGAAGGAGGGAACTGGGACCGTCTGATAACGTTCAGGCTTGAAGAGCTTGAAAGGAGAG
AGAAAGGACCGCC*GGGTAAGAATCCAAAGTCTTGTGTTCTTGAGCCTCTTATCGAACAG
ATGCAAAAGGAGGCAGCATCGTAAGTTGGATCTCTTTCTCTAATCTCTCTAGTCTCTACT
CTTTGCTTACACTGTGATATGTGTATGCGTATGTGTATGTAACGTACCTTCAAGGTTTCT
GACTGGTTCTGGAAAAAGCTTCAGCATGTAATATAAATATCCATAAATTCCAAACCATTA
ATGCACTC


BQ
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ89TF U 1
AF RR2F988TF U 1
AF RR2B833TF U 6
AF RR2EQ89JQ C 163
AF RR2A933JQ C 182
AF RR2A933TF U 182
BS 1 118 RR2EQ89TF
BS 119 119 RR2F988TF
BS 120 363 RR2EQ89TF
BS 364 364 RR2F988TF
BS 365 597 RR2EQ89TF
BS 598 598 RR2F988TF
BS 599 673 RR2EQ89TF
BS 674 674 RR2B833TF
BS 675 716 RR2EQ89TF
BS 717 829 RR2B833TF
BS 830 908 RR2A933TF

RD RR2EQ89TF 722 0 0
TTTTTATAATGGCGACTTCTTCGATCACTATACCAACCATTCGGGGCACCAAGTTTCTCG
GCCAGACACATCTATTTTCAACTCCAAACCGATCGGTTCTCCCGCCTTCAAAACAGCAGT
CAAACGTTCATCGAGTAAAGGCCATGGCTAAGTTCAACCTATGGGAAGTGATGGGAGGAA
GAGGATTATGCAACGGAGAGAAAGGTATCGAGAAGGAGCTCCAGAGGAACATAGAGGAAG
AGACATCACAGACCGAGAACGAGACAAAGAAACAGAGCGATGACGGCGACAATAGCTTAT
CGTTTCAAGTTCCTGAAGACGGTTTCGAGAAAGAGATGATGGGTCTCACCGGAGGCTTCC
CCGACGGCGAAAAGGGACTGAAAACGTTCATCGAACAAAACCCACCACCACCACCACCAC
AACCGAAGAGAGGAAGCGATGATGTTGTATCCTTAGTTGGTACAGAGAAGAAGCCGAGAG
CTCCAGAGCTACCGCTTCTCATGCCGGGGATGATCGCTATAGTCAAGAACGCGAACAGTC
CTTACCACATGTACTGTGGGATAGTTCAGAGGATCACTGACGGGAAAGCTGGTGTGTCGT
TCGAAGGAGGGAACTGGGACCGTCTGATAACGTTCAGGCTTGAAGAGCTTGAAAGGAGAG
AGAAAGGACCGCCCGGGTAAGAATCCAAAGTCTTGTGTTCTTGAGCCTCTTATCGA
CAGATG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2F988TF 670 0 0
TTTTTATAATGGCGACTTCTTCGATCACTATACCAACCATTCGGGGCACCAAGTTTCTCG
GCCAGACACATCTATTTTCAACTCCAAACCGATCGGTTCTCCCGCCTTCAAAACAGCAAT
CAAACGTTCATCGAGTAAAGGCCATGGCTAAGTTCAACCTATGGGAAGTGATGGGAGGAA
GAGGATTATGCAACGGAGAGAAAGGTATCGAGAAGGAGCCCCAGAGGAACATAGAGGAAG
AGACATCACAGACCGAGAACGAGACAAAGAAACAGAGCGATGACGGCGACAATAGCTTAT
CGTTTCAAGTTCCTGAAGACGGTTTCGAGAAAGAGATGATGGGTCTCACCGGAGGCTTCC
CCGGCGGCGAAAAGGGACTGAAAACGTTCATCGAACAAAACCCACCACCACCACCACCAC
AACCGAAGAGAGGAGGCGATGATGTTGTATCCTTAGTTGGTACAGAGAAGAAGCCGAGAG
CTCCAGAGCTACCGCTTCTCATGCCGGGGATGATCGCTATAGTCAAGAACGCGAACAGTC
CTTACCACATGTACTGTGGGATAGTTCAGAGGATCACTGACGGGAAAGCTGGTGTGTTGT
TCGAAGGAGGGAACTGGGACCGTCTGATAACGTTCAG*CTTGAAGAGCTTGAAAGGAGAG
AGAAAGGACC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2B833TF 824 0 0
ATAATGGCGACTTCTTCGATCACTATACCAACCATTCGGGGCACCAAGTTTCTCGGCCAG
ACACATCTATTTTCAACTCCAAACCGATCGGTTCTCCCGCCTTCAAAACAGCAATCAAAC
GTTCATCGAGTAAAGGCCATGGCTAAGTTCAACCTATGGGAAGTGATGGGAGGAAGAGGA
TTATGCAACGGAGAGAAAGGTATCGAGAAGGAGCTCCAGAGGAACATAGAGGAAGAGACA
TCACAGACCGAGAACGAGACAAAGAAACAGAGCGATGACGGCGACAATAGCTTATCGTTT
CAAGTTCCTGAAGACGGTTTCGAGAAAGAGATGATGGGTCTCACCGGAGGCTTCCCCGGC
GGCGAAAAGGGACTGAAAACGTTCATCGAACAAAACCCACCACCACCACCACCACAACCG
AAGAGAGGAGGCGATGATGTTGTATCCTTAGTTGGTACAGAGAAGAAGCCGAGAGCTCCA
GAGCTACCGCTTCTCATGCCGGGGATGATCGCTATAGTCAAGAACGCGAACAGTCCTTAC
CACATGTACTGTGGGATAGTTCAGAGGATCACTGACGGGAAAGCTGGTGTGTTGTTCGAA
GGAGGGAACTGGGACCGTCTGATAACGTTCAGGCTTGAAGAGCTTGAAAGGAGAGAGAAA
GGACCGCC*GGGTAAGAATCCAAAGTCTTGTGTTCTTGAGCCTCTTATCGAACAGATGCA
AAAGGAGGCAGCATCGTAAGTTGGATCTCTTTCTCTAATCTCTCTAGTCTCTACTCTTTG
CTTACACTGTGATATGTGTATGCGTATGTGTATGTAACGTACCT

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2EQ89JQ 679 0 0
GGGAAGTGATGGGAGGAAGAGGATTATGCAACGGAGAGAAAGGTATCGAGAAGGAGCTCC
AGAGGAACATAGAGGAAGAGACATCACAGACCGAGAACGAGACAAAGAAACAGAGCGATG
ACGGCGACAATAGCTTATCGTTTCAAGTTCCTGAAGACGGTTTCGAGAAAGAGATGATGG
GTCTCACCGGAGGCTTCCCCGACGGCGAAAAGGGACTGAAAACGTTCATCGAACAAAACC
CACCACCACCACCACCACAACCGAAGAGAGGAAGCGATGATGTTGTATCCTTAGTTGGTA
CAGAGAAGAAGCCGAGAGCTCCAGAGCTACCGCTTCTCATGCCGGGGATGATCGCTATAG
TCAAGAACGCGAACAGTCCTTACCACATGTACTGTGGGATAGTTCAGAGGATCACTGACG
GGAAAGCTGGTGTGTCGTTCGAAGGAGGGAACTGGGACCGTCTGATAACGTTCAGGCTTG
AAGAGCTTGAAAGGAGAGAGAAAGGACCGCC*GGGTAAGAATCCAAAGTCTTGTGTTCTT
GAGCCTCTTATCGAACAGATGCAAAAGGAGGCAGCATCGTAAGTTGGATCTCTTTCTCTA
ATCTCTCTAGTCTCTACTCTTTGCTTACACTGTGATATGTGTATGCGTATGTGTATGTAA
CGTACCTTCAAGGTTTCTG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2A933JQ 707 0 0
G
GGATTATGCAACGGAGAGAAAGGTATCGAGAAGGAGCTCCAGAGGAACATAGAGGAAGAG
ACATCACAGACCGAGAACGAGACAAAGAAACAGAGCGATGACGGCGACAATAGCTTATCG
TTTCAAGTTCCTGAAGACGGTTTCGAGAAAGAGATGATGGGTCTCACCGGAGGCTTCCCC
GGCGGCGAAAAGGGACTGAAAACGTTCATCGAACAAAACCCACCACCACCACCACCACAA
CCGAAGAGAGGAAGCGATGATGTTGTATCCTTAGTTGGTACAGAGAAGAAGCCGAGAGCT
CCAGAGCTACCGCTTCTCATGCCGGGGATGATCGCTATAGTCAAGAACGCGAACAGTCCT
TACCACATGTACTGTGGGATAGTTCAGAGGATCACTGACGGGAAAGCTGGTGTGTTGTTC
GAAGGAGGGAACTGGGATCGTCTGATAACGTTCAGGCTTGAAGAGCTTGAAAGGAGAGAG
AAAGGACCGCC*GGGTAAGAATCCAAAGTCTTGTGTTCTTGAGCCTCTTATCGAACAGAT
GCAAAAGGAGGCAGCATCGTAAGTTGGATCTCTTTCTCTAATCTCTCTAGTCTCTACTCT
TTGCTTACACTGTGATATGTGTATGCGTATGTGTATGTAACGTACCTTCAAGGTTTCTGA
CTGGTTCTGGAAAAAGCTTCAGCATGTAATATAAATATCCATAAAT

QA 2 707 2 707
DS 

RD RR2A933TF 727 0 0
G
GGATTATGCAACGGAGAGAAAGGTATCGAGAAGGAGCTCCAGAGGAACATAGAGGAAGAG
ACATCACAGACCGAGAACGAGACAAAGAAACAGAGCGATGACGGCGACAATAGCTTATCG
TTTCAAGTTCCTGAAGACGGTTTCGAGAAAGAGATGATGGGTCTCACCGGAGGCTTCCCC
GGCGGCGAAAAGGGACTGAAAACGTTCATCGAACAAAACCCACCACCACCACCACCACAA
CCGAAGAGAGGAAGCGATGATGTTGTATCCTTAGTTGGTACAGAGAAGAAGCCGAGAGCT
CCAGAGCTACCGCTTCTCATGCCGGGGATGATCGCTATAGTCAAGAACGCGAACAGTCCT
TACCACATGTACTGTGGGATAGTTCAGAGGATCACTGACGGGAAAGCTGGTGTGTTGTTC
GAAGGAGGGAACTGGGATCGTCTGATAACGTTCAGGCTTGAAGAGCTTGAAAGGAGAGAG
AAAGGACCGCC*GGGTAAGAATCCAAAGTCTTGTGTTCTTGAGCCTCTTATCGAACAGAT
GCAAAAGGAGGCAGCATCGTAAGTTGGATCTCTTTCTCTAATCTCTCTAGTCTCTACTCT
TTGCTTACACTGTGATATGTGTATGCGTATGTGTATGTAACGTACCTTCAAGGTTTCTGA
CTGGTTCTGGAAAAAGCTTCAGCATGTAATATAAATATCCATAAATTCCAAACCATTAAT
GCACTC

QA 2 727 2 727
DS 



CO CL579Contig2 1006 4 6 U
GGTCTTAAAACTTTTACTTATATACACTGATTGAGTGCATTAATGGTTTGGAATTTATGG
ATATTTATATTACATGCTGAAGCTTTTTCCAGAACCAGTCAGAAACCTTGAAGGTACGTT
ACATACACATACGCATACACATTCACAGTGTAAGCAAAGAGTAGAGACTAGAGAGATTAG
AGAAAGAGATCCAACTTACGATGCCGCCTCGTTTTGCATCTGTTCGATAAGAGGCTCAAG
AACGCAAGACTTTGGATTCTTACCCGGTGGCCCTTTATCTCTCCTTTCCAGCTCTTCAAG
CCTGAACGTTATCAGACGGTCCCAGTTCCCTCCTTCGAACAGGACACCCGCTTTCCCGTC
CGTGATCCTCTGAACTATCCCACAGTACATGTGGTAAGGACTGTTCGTGTTCTTGACTAT
AGCGATCATCCCCGGCATGAGAAGCGGTAGCTCTGGAGCTCTCGGCTTCTTCTCTGTACC
AACTAAGAATACTACATCATCGCTTTCTCGTTTCGCAGGAGGTGGTGGTGGCGGTGGTGG
GTTTTGTTCGATGAACTTTTTAAGTCCCTTCTCTCCTCCCGGGAAGCCTCCGGTGAGACC
CATCATCTCTTTCTCGAAACCGTCTTCAGGAACTTGAAACGATAAGCTATTCTCGTCGTC
ATCGCTCTCTTTCTTTGTCTCGTTCTCAGTATTTGATGTCTCTTCCTCTATGTTCCTCTG
GAGCTCCTTCTCGATACCTTTCTCACCGTTGCATAGTCCTCTTCCTCCCATCACTTCCCA
TAGGTTGAACTTAGCCATGGCTTTTACTCGATGAACGTTTGGTAGGTGTTTCGGAGGCGG
GAAAACCGATCGGTTTGGAGTTGAAAATAGATGTGTCTGGCCGAGAAACTTGGTTCCCCG
AATGGTTGGTATAGTGATAGAAGAAGTCGCCATTATAAAAATTCTCGGAAGTATCCGCTT
AGAGACAAGGAAAGACAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAGAAGCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU74JQB U 1
AF RR2FO23JQ U 67
AF RR2GU74TF C 306
AF RR2FO23TF C 374
BS 1 204 RR2GU74JQB
BS 205 205 RR2FO23JQ
BS 206 516 RR2GU74JQB
BS 517 592 RR2FO23JQ
BS 593 941 RR2GU74TF
BS 942 1006 RR2FO23TF

RD RR2GU74JQB 516 0 0
GGTCTTAAAACTTTTACTTATATACACTGATTGAGTGCATTAATGGTTTGGAATTTATGG
ATATTTATATTACATGCTGAAGCTTTTTCCAGAACCAGTCAGAAACCTTGAAGGTACGTT
ACATACACATACGCATACACATTCACAGTGTAAGCAAAGAGTAGAGACTAGAGAGATTAG
AGAAAGAGATCCAACTTACGATGCTGCCTCGTTTTGCATCTGTTCGATAAGAGGCTCAAG
AACGCAAGACTTTGGATTCTTACCCGGTGGCCCTTTATCTCTCCTTTCCAGCTCTTCAAG
CCTGAACGTTATCAGACGGTCCCAGTTCCCTCCTTCGAACAGGACACCCGCTTTCCCGTC
CGTGATCCTCTGAACTATCCCACAGTACATGTGGTAAGGACTGTTCGTGTTCTTGACTAT
AGCGATCATCCCCGGCATGAGAAGCGGTAGCTCTGGAGCTCTCGGCTTCTTCTCTGTACC
AACTAAGAATACTACATCATCGCTTTCTCGTTTCGC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2FO23JQ 526 0 0
ATATTACATGCTGAAGCTTTTTCCAGAACCAGTCAGAAACCTTGAAGGTACGTTACGTAC
ACATACGCATACACATTCACAGTGTAAGCAAAGAGTAGAGACTAGAGAGATTAGAGAAAG
AGATCCAACTTACGATGCCGCCTCGTTTTGCATCTGTTCGATAAGAGGCTCAAGAACGCA
AGACTTTGGATTCTTACCCGGTGGTCCTTTATCTCTCCTTTCCAGCTCTTCAAGCCTGAA
CGTTATCAGACGGTCCCAGTTCCCTCCTTCGAACAGGACACCCGCTTTCCCGTCCGTGAT
CCTCTGAACTATCCCACAGTGCATGTGGTAAGGACTGTTCGTGTTCTTGACTATAGCGAT
CATCCCCGGCATGAGAAGCGGTAGCTCTGGAGCTCTCGGCTTCTTCTCTGTACCAACTAA
GAATACTACATCATCGCTTTCTCGTTTCGCAGGAGGTGGTGGTGGCGGTGGTGGGTTTTG
TTCGATGAACTTTTTAAGTCCCTTCTCTCCTCCCGGGAAGCCTCCG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2GU74TF 636 0 0
ACGTTATCAGACGGTCCCAGTTCCCTC*TTCGAACAGGACACCCGCTTTCCCGTCCGTGA
TCCTCTGAACTATCCCACAGTACATGTGGTAAGGACTGTTCGTGTTCTTGACTATAGCGA
TCATCCCCGGCATGAGAAGCGGTAGCTCTGGAGCTCTCGGCTTCTTCTCTGTACCAACTA
AGAATACTACATCATCGCTTTCTCGTTTCGCAGGAGGTGGTGGTGGCGGTGGTGGGTTTT
GTTCGATGAACTTTTTAAGTCCCTTCTCTCCACCCGGGAAGCCTCCGGTGAGACCCATCA
TCTCTTTCTCGAAACCGTCTTCAGGAACTTGAAACGATAAGCTATTCTCGTCGTCATCGC
TCTCTTTCTTTGTCTCGTTCTCAGTATTTGATGTCTCTTCCTCTATGTTCCTCTGGAGCT
CCTTCTCGATACCTTTCTCACCGTTGCATAGTCCTCTTCCTCCCATCACTTCCCATAGGT
TGAACTTAGCCATGGCTTTTACTCGATGAACGTTTGGTAGGTGTTTCGGAGGCGGGAAAA
CCGATCGGTTTGGAGTTGAAAATAGATGTGTCTGGCCGAGAAACTTGGTTCCCCGAATGG
TTGGTATAGTGATAGAAGAAGTCGCCATTATAAAAA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2FO23TF 633 0 0
ACTATCCCACAGTGCATGTGGTAAGGACTGTTCGTGTTCTTGACTATAGCGATCATCCCC
GGCATGAGAAGCGGTAGCTCTGGAGCTCTCGGCTTCTTCTCTGTACCAACTAAGAATACT
ACATCATCGCTTTCTCGTTTCGCAGGAGGTGGTGGTGGCGGTGGTGGGTTTTGTTCGATG
AACTTTTTAAGTCCCTTCTCTCCTCCCGGGAAGCCTCCGGTGAGACCCATCATCTCTTTC
TCGAAACCGTCTTCAGGAACTTGAAACGATAAGCTATTCTCGTCGTCATCGCTCTCTTTC
TTTGTCTCGTTCTCAGTCTTTGATGTCTCTTCCTCTATGTTCCTCTGGAGCTCCTTCTCG
ATACCTTTCTCACCGTTGCATAGTCCTCTTCCTCCCATCACTTCCCATAGGTTGAACTTA
GCCATGGCTTTTACTCGATGAACGTTTGGTAGGTGTTTCGGAGGCGGGAAAACCGATCGG
TTTGGAGTTGAGAATAGATGTGTCTGGCCGAGAAACTTGGTTCCCCGAATGGTTGGTATA
GTGATAGAAGAAGTCGCCATTATAAAAATTCTCGGAAGTATCCGCTTAGAGACAAGGAAA
GACAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAGAAGCGTCC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 3 10

CO CL580Contig1 781 6 11 U
GGGAGTCACTTCTCCTCCGTCATCGAATCACCTGTTTAGTCCCCATGGTGAAGTACTCCC
AGGAACCCGACAATTCCACCAAATCTTGCAAGGCGAGGGGAGCTGATCTCAGGGTCCACT
TCAAGAACACAAGGGAGACAGCGCACGCCATAAGAAGGCTACCATTGAACAAGGCCAAGA
GGTACTTGGAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATCCCTTTCACGCGTTTCTGTCGTG
GTGTTGGTCGTACTGCTCAGGCTAAGAACAGGCATTCAAACGGTCAAGGTCGATGGCCTG
CTAAATCTGCTCAGTTCGTTCTCGATCTCCTCAAGAATGCTGAGAGCAATGCCGAGGTCA
AAGGTTTGGATGTGGATGCGCTTTTCATATCTCACATCCAAGTGAACCAAGCAGCTAAAC
AGAGGCGGAGGACATACCGTGCTCACGGAAGAATCAATCCGTACATGTCGAACCCTTGCC
ACATTGAGTTGATATTGTCAGAGAAGGAAGAGCCTGTGAAGAAAGAGCCGGAGACTCAGT
TGGCAGCTAAGTCAAAGAAAGGAGCCTCGTCTTGAGCTTATTATATAGACAAAGTAGCTT
TTCGTTGATCATCTCTGTTATAAGAACGTATAATACGTTTTGTTATAGACTTATCATTCT
GTAAGACAAGGAGCCAACATTTTCAAAGACATTATAATTATGTTGTTGATTTGTTTTTTG
GAATACCGGATCTTTGTTAAATGCGAAAAACGAATCAGTTCAATAATGGTTACAAAGTCC
C


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2CK90TF U 1
AF RR2G432TF U 1
AF RR2AT28JQ C 6
AF RR2AT28TF U 6
AF RR2G432JQ C 36
AF RR2CK90JQ C 80
BS 1 424 RR2CK90TF
BS 425 425 RR2G432TF
BS 426 625 RR2CK90TF
BS 626 626 RR2G432TF
BS 627 670 RR2CK90TF
BS 671 671 RR2AT28TF
BS 672 676 RR2CK90TF
BS 677 692 RR2G432TF
BS 693 708 RR2AT28TF
BS 709 720 RR2G432JQ
BS 721 781 RR2CK90JQ

RD RR2CK90TF 693 0 0
GGGAGTCACTTCTCCTCCGTCATCGAATCACCTGTTTAGTCCCCATGGTGAAGTACTCCC
AGGAACCCGACAATTCCACCAAATCTTGCAAGGCGAGGGGAGCTGATCTCAGGGTCCACT
TCAAGAACACAAGGGAGACAGCGCACGCCATAAGAAGGCTACCATTGAACAAGGCCAAGA
GGTACTTGGAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATCCCTTTCACGCGTTTCTGTCGTG
GTGTTGGTCGTACTGCTCAGGCTAAGAACAGGCATTCAAACGGTCAAGGTCGATGGCCTG
CTAAATCTGCTCAGTTCGTTCTCGATCTCCTCAAGAATGCTGAGAGCAATGCCGAGGTCA
AAGGTTTGGATGTGGATGCGCTTTTCATATCTCACATCCAAGTGAACCAAGCAGCTAAAC
AGAGTCGGAGGACATACCGTGCTCACGGAAGAATCAATCCGTACATGTCGAACCCTTGCC
ACATTGAGTTGATATTGTCAGAGAAGGAAGAGCCTGTGAAGAAAGAGCCGGAGACTCAGT
TGGCAGCTAAGTCAAAGAAAGGAGCCTCGTCTTGAGCTTATTATATAGACAAAGTAGCTT
TTCGTTGATCATCTCTGTTATAAGA*CGTATAATACGTTTTGTTATAGACTTATCATTCT
GTAAGACAAG*AGCCA
CATTTTCAAGACATATA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2G432TF 693 0 0
GGC
AGTCACTTCTCCTCCGTCATCGAATCACCTGTTTAGTCCCCATGGTGAAGTACTCCCAGG
AACCCGACAATTCCACCAAATCTTGCAAGGCGAGGGGAGCTGATCTCAGGGTCCACTTCA
AGAACACAAGGGAGACAGCGCACGCCATAAGAAGGCTACCATTGAACAAGGCCAAGAGGT
ACTTGGAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATCCCTTTCACGCGTTTCTGTCGTGGTG
TTGGTCGTACTGCTCAGGCTAAGAACAGGCATTCAAACGGTCAAGGTCGATGGCCTGCTA
AATCTGCTCAGTTCGTTCTCGATCTCCTCAAGAATGCTGAGAGCAATGCCGAGGTCAAAG
GTTTGGATGTGGATGCGCTTTTCATATCTCACATCCAAGTGAACCAAGCAGCTAAACAGA
GGCGGAGGACATACCGTGCTCACGGAAGAATCAATCCGTACATGTCGAACCCTTGCCACA
TTGAGTTGATATTGTCAGAGAAGGAAGAGCCTGTGAAGAAAGAGCCGGAGACTCAGTTGG
CAGCTAAGTCAAAGAAAGGAGCCTCGTCTTGAGCTTATTATATAGACAA*GTAGCTTTTC
GTTGATCATCTCTGTTATAAGAACGTATAATACGTTTTGTGTTAGACTTATCATTCTGTA
AGACAAG*AGCCAACATTTTCAAAGACATA

QA 4 693 4 693
DS 

RD RR2AT28JQ 703 0 0
GGG
CTTCTCCTCCGTCATCGAATCACCTGTTTAGTCCCCATGGTGAAGTACTCCCAGGAACCC
GACAATTCCACCAAATCTTGCAAGGCGAGGGGAGCTGATCTCAGGGTCCACTTCAAGAAC
ACAAGGGAGACAGCGCACGCCATAAGAAGGCTACCATTGAACAAGGCCAAGAGGTACTTG
GAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATCCCTTTCACGCGTTTCTGTCGTGGTGTTGGT
CGTACTGCTCAGGCTAAGAACAGGCATTCAAACGGTCAAGGTCGATGGCCTGCTAAATCT
GCTCAGTTCGTTCTCGATCTCCTCAAGAATGCTGAGAGCAATGCCGAGGTCAAAGGTTTG
GATGTGGATGCGCTTTTCATATCTCACATCCAAGTGAACCAAGCAGCTAAACAGAGGCGG
AGGACATACCGTGCTCACGGAAGAATCAATCCGTACATGTCGAACCCTTGCCACATTGAG
TTGATATTGTCAGAGAAGGAAGAGCCTGTGAAGAAAGAGCCGGAGACTCAGTTGGCAGCT
AAGTCAAAGAAAGGAGCCTCGTCTTGAGCTTATTATATAGACAAAGTAGCTTTTCGTTGA
TCATCTCTGTTATAAGAACGTATAATACGTTTTGTTATAGACTTATCATTCTGTAAGACA
AGGAGCCAACATTTTCAAAGACATTATAATTATGTTGTTG

QA 4 703 4 703
DS 

RD RR2AT28TF 703 0 0
GGG
CTTCTCCTCCGTCATCGAATCACCTGTTTAGTCCCCATGGTGAAGTACTCCCAGGAACCC
GACAATTCCACCAAATCTTGCAAGGCGAGGGGAGCTGATCTCAGGGTCCACTTCAAGAAC
ACAAGGGAGACAGCGCACGCCATAAGAAGGCTACCATTGAACAAGGCCAAGAGGTACTTG
GAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATCCCTTTCACGCGTTTCTGTCGTGGTGTTGGT
CGTACTGCTCAGGCTAAGAACAGGCATTCAAACGGTCAAGGTCGATGGCCTGCTAAATCT
GCTCAGTTCGTTCTCGATCTCCTCAAGAATGCTGAGAGCAATGCCGAGGTCAAAGGTTTG
GATGTGGATGCGCTTTTCATATCTCACATCCAAGTGAACCAAGCAGCTAAACAGAGGCGG
AGGACATACCGTGCTCACGGAAGAATCAATCCGTACATGTCGAACCCTTGCCACATTGAG
TTGATATTGTCAGAGAAGGAAGAGCCTGTGAAGAAAGAGCCGGAGACTCAGTTGGCAGCT
AAGTCAAAGAAAGGAGCCTCGTCTTGAGCTTATTATATAGACAAAGTAGCTTTTCGTTGA
TCATCTCTGTTATAAGAACGTATAATACGTTTTGTTATAGACTTATCATTCTGTAAGACA
AGGAGCCAACATTTTCAAAGACATTATAATTATGTTGTTG

QA 4 703 4 703
DS 

RD RR2G432JQ 686 0 0
TTAGTCCCCATGGTGAAGTACTCCCAGGAACCCGACAATTCCACCAAATCTTGCAAGGCG
AGGGGAGCTGATCTCAGGGTCCACTTCAAGAACACAAGGGAGACAGCGCACGCCATAAGA
AGGCTACCATTGAACAAGGCCAAGAGGTACTTGGAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCT
ATCCCTTTCACGCGTTTCTGTCGTGGTGTTGGTCGTACTGCTCAGGCTAAGAACAGGCAT
TCAAACGGTCAAGGTCGATGGCCTGCTAAATCTGCTCAGTTCGTTCTCGATCTCCTCAAG
AATGCTGAGAGCAATGCCGAGGTCAAAGGTTTGGATGTGGATGCGCTTTTCATATCTCAC
ATCCAAGTGAACCAAGCAGCTAAACAGAGGCGGAGGACATACCGTGCTCACGGAAGAATC
AATCCGTACATGTCGAACCCTTGCCACATTGAGTTGATATTGTCAGAGAAGGAAGAGCCT
GTGAAGAAAGAGCCGGAGACTCAGTTGGCAGCTAAGTCAAAGAAAGGAGCCTCGTCTTGA
GCTTATTATATAGACAA*GTAGCTTTTCGTTGATCATCTCTGTTATAAGAACGTATAATA
CGTTTTGTGTTAGACTTATCATTCTGTAAGACAAGGAGCCAACATTTTCAAAGACATTAT
AATTATGTTGTTGATTTGTTTTTTG
C

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2CK90JQ 702 0 0
CAAATCTTGCAAGGCGAGGGGAGCTGATCTCAGGGTCCACTTCAAGAACACAAGGGAGAC
AGCGCACGCCATAAGAAGGCTACCATTGAACAAGGCCAAGAGGTACTTGGAAGATGTGAT
AGCTCACAAGCAAGCTATCCCTTTCACGCGTTTCTGTCGTGGTGTTGGTCGTACTGCTCA
GGCTAAGAACAGGCATTCAAACGGTCAAGGTCGATGGCCTGCTAAATCTGCTCAGTTCGT
TCTCGATCTCCTCAAGAATGCTGAGAGCAATGCCGAGGTCAAAGGTTTGGATGTGGATGC
GCTTTTCATATCTCACATCCAAGTGAACCAAGCAGCTAAACAGAGTCGGAGGACATACCG
TGCTCACGGAAGAATCAATCCGTACATGTCGAACCCTTGCCACATTGAGTTGATATTGTC
AGAGAAGGAAGAGCCTGTGAAGAAAGAGCCGGAGACTCAGTTGGCAGCTAAGTCAAAGAA
AGGAGCCTCGTCTTGAGCTTATTATATAGACAAAGTAGCTTTTCGTTGATCATCTCTGTT
ATAAGAACGTATAATACGTTTTGTTATAGACTTATCATTCTGTAAGACAAGGAGCCAACA
TTTTCAAAGACATTATAATTATGTTGTTGATTTGTTTTTTGGAATACCGGATCTTTGTTA
AATGCGAAAAACGAATCAGTTCAATAATGGTTACAAAGTCCC

QA 1 702 1 702
DS 



CO CL580Contig2 734 2 5 U
TTTTAACAAAGCTCCGGTATCCCAAAAACAAATCAACGTACAATTATGTCTATGAAAATG
TTGGCTCCTTGTCTTACAGAAGGATAAGTCTATAACAAAATGTATCATGCGTTCTTATAA
CAGAGATGATCACGAAAAGCTACTTTGTCTATATAAGCTCAAGACGAGGCTCCCTTCTTT
GACTTAGCTGCCAACTGAGTCTCCGGCTCTTTCTTAACAGGCTCTTCCTTCTCTGACAAT
ATCAACTCAATGTGGCAAGGGTTCGACATGTAAGGGTTGATTCTTCCATGAGCACGGTAT
GTTCTCCGCCTCTGTTTAGCAGCTTGGTTCACTTGGATGTGAGATATGAAAAGTGCATCC
ACATCCAAACCTTTGACCTCGGCATTGCTCTCAGCATTCTTGAGGAGATCAAGAACGAAC
TGAGCAGATTTAGCAGGCCATCGACCTTGACCGTTTGAATGCCTGTTCTTAGCCTGAGCA
GTACGACCAACACCACGACAGAAACGTGTGAAGGGGATCGCTTGCTTGTGCGCTATCACA
TCTTCCAAGTACCTCTTGGCCTTGTTCAATGGTAGCCTTCTTATGGCGTGCACTGTCTCC
CTCGTGTTCTTGAAGTGGACCCTGAGATCAGCACCCCTCGCCTTGCAAGATTTGGTGGAA
TTGTCGGGTTCCTGGGAGTACTTCACCATGGCGGCCAAACAGGTGATTCGATGACGGAGG
AGAAGTGACTGACC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D545JQ U 5
AF RR2D545TF C 1
BS 1 4 RR2D545TF
BS 5 20 RR2D545JQ
BS 21 21 RR2D545TF
BS 22 706 RR2D545JQ
BS 707 734 RR2D545TF

RD RR2D545JQ 702 0 0
AACAAAGCTCCGGTATTCCAAAAACAAATCAACGTACAATTATGTCTATGAAAATGTTGG
CTCCTTGTCTTACAGAAGGATAAGTCTATAACAAAATGTATCATGCGTTCTTATAACAGA
GATGATCACGAAAAGCTACTTTGTCTATATAAGCTCAAGACGAGGCTCCCTTCTTTGACT
TAGCTGCCAACTGAGTCTCCGGCTCTTTCTTAACAGGCTCTTCCTTCTCTGACAATATCA
ACTCAATGTGGCAAGGGTTCGACATGTAAGGGTTGATTCTTCCATGAGCACGGTATGTTC
TCCGCCTCTGTTTAGCAGCTTGGTTCACTTGGATGTGAGATATGAAAAGTGCATCCACAT
CCAAACCTTTGACCTCGGCATTGCTCTCAGCATTCTTGAGGAGATCAAGAACGAACTGAG
CAGATTTAGCAGGCCATCGACCTTGACCGTTTGAATGCCTGTTCTTAGCCTGAGCAGTAC
GACCAACACCACGACAGAAACGTGTGAAGGGGATCGCTTGCTTGTGCGCTATCACATCTT
CCAAGTACCTCTTGGCCTTGTTCAATGGTAGCCTTCTTATGGCGTGCACTGTCTCCCTCG
TGTTCTTGAAGTGGACCCTGAGATCAGCACCCCTCGCCTTGCAAGATTTGGTGGAATTGT
CGGGTTCCTGGGAGTACTTCACCATGGCGGCCAAACAGGTGA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2D545TF 734 0 0
TTTTAACAAAGCTCCGGTATCC**AAAACAAATCAACGTACAATTATGTCTATGAAAATG
TTGGCTC*TTGTCTTACAGAAGGATAAGTCTATAACAAAATGTATCATGCGTTCTTATAA
CAGAGATGATCACGAAAAGCTACTTTGTCTATATAAGCTCAAGACGAGGCTCCCTTCTTT
GACTTAGCTGCCAACTGAGTCTCCGGCTCTTTCTTAACAGGCTCTTCCTTCTCTGACAAT
ATCAACTCAATGTGGCAAGGGTTCGACATGTAAGGGTTGATTCTTCCATGAGCACGGTAT
GTTCTCCGCCTCTGTTTAGCAGCTTGGTTCACTTGGATGTGAGATATGAAAAGTGCATCC
ACATCCAAACCTTTGACCTCGGCATTGCTCTCAGCATTCTTGAGGAGATCAAGAACGAAC
TGAGCAGATTTAGCAGGCCATCGACCTTGACCGTTTGAATGCCTGTTCTTAGCCTGAGCA
GTACGACCAACACCACGACAGAAACGTGTGAAGGGGATCGCTTGCTTGTGCGCTATCACA
TCTTCCAAGTACCTCTTGGCCTTGTTCAATGGTAGCCTTCTTATGGCGTGCACTGTCTCC
CTCGTGTTCTTGAAGTGGACCCTGAGATCAGCACCCCTCGCCTTGCAAGATTTGGTGGAA
TTGTCGGGTTCCTGGGAGTACTTCACCATGGCGGCCAAACAGGTGATTCGATGACGGAGG
AGAAGTGACTGACC

QA 1 734 1 734
DS 



CO CL580Contig3 710 2 4 U
GGAGTCACGTCTCCTCCGTCATCGAATCACCTGTTTGGCCGCCATGGTGAAGTACTCCCA
GGAACCCGACAATTCCACCAAATCTTGCAAGGCGAGGGGTGCTGATCTCAGGGTCCACTT
CAAGAACACGAGGGAGACAGCGCACGCCATAAGAAGGCTACCATTGAACAAGGCCAAGAG
GTACCTGGAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATCCCCTTCACACTTTTCTGTCGTGG
TGTTGGTCGTACTGCTCAGGCTAAGAACAGGCATTCAAACGGTCAAGGTCGATGGCCTGC
TAAATCTGCTCAATTCGTTCTTGATCTCCTCAAGAATGCCGAGAGCAATGCCGAGGTCAA
AGGTTTGGATGTGGATGCACTTTTCATATCTCACATTCAAGTGAACCAAGCTGCTAAACG
AGGCGGAGGACATACCGTGCTCATGGAAGAATCAATCCTTACATGTCAAACCCTTGCCAC
ATTGAGTTGATATTGTCAGAAAAGGAAGAGCCTGTGAAAAAAGAGCCGGAGACTCAGTTG
GCAGCTAAGTCAAAGAAAGGAGCCTCGTCTTGAGCTAATATATGGACAAAGCAGCTTTTC
GTGATCATCTCTGTTATAAGAACGTATGATACGTTTTGTTATAGACGTATCATTTTGTAA
GACAAGGAGCCAACATTTTCAAAGACATAATTATGTTGATTTGTTTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F926TF U 1
AF RR2F926JQ C 44
BS 1 682 RR2F926TF
BS 683 683 RR2F926JQ
BS 684 692 RR2F926TF
BS 693 710 RR2F926JQ

RD RR2F926TF 709 0 0
GGAGTCACGTCTCCTCCGTCATCGAATCACCTGTTTGGCCGCCATGGTGAAGTACTCCCA
GGAACCCGACAATTCCACCAAATCTTGCAAGGCGAGGGGTGCTGATCTCAGGGTCCACTT
CAAGAACACGAGGGAGACAGCGCACGCCATAAGAAGGCTACCATTGAACAAGGCCAAGAG
GTACCTGGAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATCCCCTTCACACTTTTCTGTCGTGG
TGTTGGTCGTACTGCTCAGGCTAAGAACAGGCATTCAAACGGTCAAGGTCGATGGCCTGC
TAAATCTGCTCAATTCGTTCTTGATCTCCTCAAGAATGCCGAGAGCAATGCCGAGGTCAA
AGGTTTGGATGTGGATGCACTTTTCATATCTCACATTCAAGTGAACCAAGCTGCTAAACG
AGGCGGAGGACATACCGTGCTCATGGAAGAATCAATCCTTACATGTCAAACCCTTGCCAC
ATTGAGTTGATATTGTCAGAAAAGGAAGAGCCTGTGAAAAAAGAGCCGGAGACTCAGTTG
GCAGCTAAGTCAAAGAAAGGAGCCTCGTCTTGAGCTAATATATGGACAAAGCAGCTTTTC
GTGATCATCTCTGTTATAAGAACGTATGATACGTTTTGTTATAGACGTATCATTTTGTAA
GACAAGGAGCCAACATTTTCAA*GACATAATT
ATGTTGATTTGTTTTTG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2F926JQ 667 0 0
ATGGTGAAGTACTCCCAGGAACCCGACAATTCCACCAAATCTTGCAAGGCGAGGGGTGCT
GATCTCAGGGTCCACTTCAAGAACACGAGGGAGACAGCGCACGCCATAAGAAGGCTACCA
TTGAACAAGGCCAAGAGGTACCTGGAAGATGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATCCCCTTC
ACACTTTTCTGTCGTGGTGTTGGTCGTACTGCTCAGGCTAAGAACAGGCATTCAAACGGT
CAAGGTCGATGGCCTGCTAAATCTGCTCAATTCGTTCTTGATCTCCTCAAGAATGCCGAG
AGCAATGCCGAGGTCAAAGGTTTGGATGTGGATGCACTTTTCATATCTCACATTCAAGTG
AACCAAGCTGCTAAACGAGGCGGAGGACATACCGTGCTCATGGAAGAATCAATCCTTACA
TGTCAAACCCTTGCCACATTGAGTTGATATTGTCAGAAAAGGAAGAGCCTGTGAAAAAAG
AGCCGGAGACTCAGTTGGCAGCTAAGTCAAAGAAAGGAGCCTCGTCTTGAGCTAATATAT
GGACAAAGCAGCTTTTCGTGATCATCTCTGTTATAAGAACGTATGATACGTTTTGTTATA
GACGTATCATTTTGTAAGACAAGGAGCCAACATTTTCAAAGACATAATTATGTTGATTTG
TTTTTTG

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 9

CO CL581Contig1 910 9 9 U
GGGCCGCGACCCGAAAGAACAAAAAGAAAACAAAAAA*TGGCCAGTCGAAAAAGTCTGAT
TAACGTCCACCGGATCATCCGCTCCACCGCGATGTTTAGCCGGAGATCCGCCACTCCTGC
CGCCGCAACACGAGCCCATCCCATTTTCCGAAATCGAGTTGATTTGGGGGCGAGGTTCTT
CTCCGGGAACACGCCGAGTCCACAAAACTTTGAGATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAA
GAGGATAACGATCAACAGATTGTTGTATAGGAGCAAGCAACGAGGTTTTCTGGAACTTGA
TCTGGTTTTGGGTAACTGGGTTGAGGAGAATGTTGATTCCATGGACGAAACCACTGTCAA
ATCCCTAATTCATGTCCTCGATTTGGAGAACCCTGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCA
GGAACAGCCTCCGGAGATAGTGAGCTCAAATCCAGTATTTTTGGCGTTGCACAAGAAAGT
CATGACGAATCTGAACAAGCATGCAGCACCAGAGACGCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTG
GGTCAAAGGTTGGGATGATTTCAAGAGAGGCCGTGACGCTCCCATCTCAGGGAACCAGTG
AAAGAAAAAACACAGTCTCTTCCTTACAAAAGTAACAGACTGCAAAAACACGTTTATATA
AAAGTATTTTATAAAAATATAATAATGTGTGGCAG*CCGTGAAGAAG*CCGGCGCTATAA
ATGTGTCTCGGTAGTGACACGATGAGATAGATAAATACAGTC**GTTTGTGGAAGTTCTT
GATATGTTAGATATGTGTTTGTTGAAATTGATGTGTTTTTATTTCAGGCAATAAGTCCTT
TTGCCTCTGGCTCAACTTTCTTGGCATATGCAGAACTAGTTACTTCGTTAAGAGTCAATG
TTTCCTTGCC


BQ
10 25 25 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 15 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 20 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2AZ61TFB U 1
AF RR2CQ26TF U 1
AF RR2AZ33TFB U 6
AF RR2BH15TF U 2
AF RR2FB06TF U 1
AF RR2BK22TF U 1
AF RR2H726TF U 2
AF RR2BK22JQ C 125
AF RR2AZ33JQ C 153
BS 1 161 RR2BK22TF
BS 162 162 RR2CQ26TF
BS 163 263 RR2BK22TF
BS 264 264 RR2CQ26TF
BS 265 776 RR2BK22TF
BS 777 777 RR2BK22JQ
BS 778 787 RR2BK22TF
BS 788 894 RR2BK22JQ
BS 895 910 RR2AZ33JQ

RD RR2AZ61TFB 276 0 0
GGA
CCGCGACCCGAAAGAACAAAAA*AAAACAAAAAAATGGGTAGCCGAAAAAGTCTGATTAA
CGTCCACCGGATCATCCGCTCCACCGCGATGGTTAGCCGGAGATCCGTCACTCCTGCCGC
CGCAACACGAGCCCATCCCATTTTCCGAAATCGAGTTGATTTGGGGGGGAGGTTCTTCTC
CGGGAACACGCCGAGTCCACAAAACTTTGATATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAGAG
GATAACGATCAACAGATTGTTGTATAGGAGCAA

QA 4 276 4 276
DS 

RD RR2CQ26TF 701 0 0
G
GGCCGCGACCCGAAAGAACAAAAAGAAAACAAAAAA*TGGCCAGTCGAAAAAGTCTGATT
AACGTCCACCGGATCATCCGCTCCACCGCGATGTTTAGCCGGAGATCCGCCACTCCTGCC
GCCGCAACACGAGCCCATCCCATTTTCCGAAATCGAGTTGATTTGGGGGCGAGGTTCTTC
TCCGGGAACACGCCGAGTCCACAAAACTTTGAGATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAG
AGGATAACGATCAACAGATTGTTGTATAGGAGCAAGCAACGAGGTTTTCTGGAACTTGAT
CTGGTTTTGGGTAACTGGGTTGAGGAGAATGTTGATTCCATGGACGAAACCACTGTCAAA
TCCCTAATTCATGTCCTCGATTTGGAGAACCCTGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCAG
GAACAGCCTCCGGAGATAGTGAGCTCAAATCCAGTATTTTTGGCGTTGCACAAGAAAGTC
ATGACGAATCTGAACAAGCATGCAGCACCAGAGACGCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTGG
GTCAAAGGTTGGGATGATTTCAAGAGAGGCCGTGACGCTCCCATCTCAGGGAACCAGTGA
AAGAAAAA*CACAGTCTCTTCCTTACAAA*GTAACAGACTGCAAAA*CACGTTTATATAA
A*GTATTTTATAAAA*TATAATATTGTGTGGCAG*CCGTG

QA 2 701 2 701
DS 

RD RR2AZ33TFB 667 0 0
GG
GACCCGAAAGAACAAAAAGAAAACAAAAAA*TGGCCAGTCGAAAAAGTCTGATTAACGTC
CACCGGATCATCCGCTCCACCGCGATGTTTAGCCGGAGATCCGCCACTCCTGCCGCCGCA
ACACGAGCCCATCCCATTTTCCGAAATCGAGTTGATTTGGGGGCGAGGTTCTTCTCCGGG
AACACGCCGAGTCCACAAAACTTTGAGATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAGAGGATA
ACGATCAACAGATTGTTGTATAGGAGCAAGCAACGAGGTTT*CTGGAACTTGATCTGGTT
TTGGGTAACTGGGTTGAGGAGAATGTTGATTCCATGGACGAAACCACTGTCAAATCCCTA
ATTCATGTCCTCGATTTGGAGAACCCTGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCAGGAACAG
CCTCCGGAGATAGTGAGCTCAAATCCAGTATTTTTGGCGTTGCACAAGAAAGTCATGACG
AATCTGAACAAGCATGCAGCACCAGAGACGCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTGGGTCAAA
GGTTGGGATGATTTCAAGAGAGGCCGTGACGCTCCCATCTCAGGGAACCAGTGAAAGAAA
AAACACAGTCTCTTCCTTACAAAAGTAACAGACTGCAAAAACACGTTTATATAAAAGTAT
TTTAT

QA 3 667 3 667
DS 

RD RR2BH15TF 671 0 0
GGCCGCGACCCGAAAGAACAAAAAGAAAACAAAAAA*TGGCCAGTCGAAAAAGTCTGATT
AACGTCCACCGGATCATCCGCTCCACCGCGATGTTTAGCCGGAGATCCGCCACTCCTGCC
GCCGCAACACGAGCCCATCCCATTTTCCGAAATCGAGTTGATTTGGGGGCGAGGTTCTTC
TCCGGGAACACGCCGAGTCCACAAAACTTTGAGATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAG
AGGATAACGATCAACAGATTGTTGTATAGGAGCAAGCAACGAGGTTTTCTGAAACTTGAT
CTGGTTTTGGGTAACTGGGTTGAGGAGAATGTTGATTCCATGGACGAAACCACTGTCAAA
TCCCTAATTCATGTCCTCGATTTGGAGAACCCTGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCAG
GAACAGCCTCCGGAGATAGTGAGCTCAAATCCAGTATTTTTGGCGTTGCACAAGAAAGTC
ATGACGAATCTGAACAAGCATGCAGCACCAGAGACGCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTGG
GTCAAAGGTTGGGATGATTTCAAGAGAGGCCGTGACGCTCCCATCTCAGGGAACCAGTGA
AAGAAAAAACACAGTCTCTTCCTTACAAAAGTAACAGACTGCAAAAACACGTTTATATAA
AAGTATTTTAT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2FB06TF 772 0 0
G
GGCCGCGACCCGAAAGAACAAAAAGAAAACAAAAAA*TGGCCAGTCGAAAAAGTCTGATT
AACGTCCACCGGATCATCCGCTCCATCGCGATGTTTAGCCGGAGATCCGCCACTCCTGCC
GCCGCAACACGAGCCCATCCCATTTTCCGAAATCGAGTTGATTTGGGGGCGAGGTTCTTC
TCCGGGAACACGCCGAGTCCACAAAACTTTGAGATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAG
AGGATAACGATCAACAGATTGTTGTATAGGAGCAAGCAACGAGGTTTTCTGGAACTTGAT
CTGGTTTTGGGTAACTGGGTTGAGGAGAATGTTGATTCCATGGACGAAACCACTGTCAAA
TCCCTAATTCATGTCCTCGATTTGGAGAACCCTGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCAG
GAACAGCCTCCGGAGATAGTGAGCTCAAATCCAGTATTTTTGGCGTTGCACAAGAAAGTC
ATGACGAATCTGAACAAGCATGCAGCACCAGAGACGCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTGG
GTCAAAGGTTGGGATGATTTCAAGAGAGGCCGTGACGCTCCCATCTCAGGGAACCAGTGA
AAGAAAAAACACAGTCTCTTCCTTACAAAAGTAACAGACTGCAAAAACACGTTTATATAA
AAGTATTTTATAAAAATATAATAATGTGTGGCAG*CCGTGAAGAAG*CCGGCGCTATAA*
TGTGTCTCGGTAGTGACACGATGAGATAGATAA*TACAGTC**GTTTGTGG

QA 2 772 2 772
DS 

RD RR2BK22TF 797 0 0
GGGCCGCGACCCGAAAGAACAAAAAGAAAACAAAAAA*TGGCCAGTCGAAAAAGTCTGAT
TAACGTCCACCGGATCATCCGCTCCACCGCGATGTTTAGCCGGAGATCCGCCACTCCTGC
CGCCGCAACACGAGCCCATCCCATTTTCCGAAATCGAGTTGGTTTGGGGGCGAGGTTCTT
CTCCGGGAACACGCCGAGTCCACAAAACTTTGAGATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAA
GAGGATAACGATCAACAGATTGTCGTATAGGAGCAAGCAACGAGGTTTTCTGGAACTTGA
TCTGGTTTTGGGTAACTGGGTTGAGGAGAATGTTGATTCCATGGACGAAACCACTGTCAA
ATCCCTAATTCATGTCCTCGATTTGGAGAACCCTGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCA
GGAACAGCCTCCGGAGATAGTGAGCTCAAATCCAGTATTTTTGGCGTTGCACAAGAAAGT
CATGACGAATCTGAACAAGCATGCAGCACCAGAGACGCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTG
GGTCAAAGGTTGGGATGATTTCAAGAGAGGCCGTGACGCTCCCATCTCAGGGAACCAGTG
AAAGAAAAAACACAGTCTCTTCCTTACAAAAGTAACAGACTGCAAAAACACGTTTATATA
AAAGTATTTTATAAAAATATAATAATGTGTGGCAG*CCGTGAAGAAG*CCGGCGCTATAA
ATGTGTCTCGGTAGTGACACGATGAGATAGATAAATACAGTC**GTTTGTGGAAGT*CTT
GATATGT
AGATATGTGT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2H726TF 794 0 0
GA
CCGCGACCCGAAAGAACAAAAAAAAAACAAAAAAATGGCTAGCCGAAAAAGTCTGATTAA
CGTCCACCGGATCATCCGCTCCACCGCGATGGTTAGCCGGAGATCCGTCACTCCTGCCGC
CGCAACACGAGCCCATCCCATTTTCCGAAATCGAGTTGATTTGGGGGCGAGGTTCTTCTC
CGGGAACACGCCGAGTCCACAAAACTTTGATATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAGAG
GATAACGATCAACAGATTGTTGTATAGGAGCAAGCAACGTGGTTTTCTGGAACTTGATCT
GGTTTTGGGTAACTGGGTTGAGGAGAATGTTAATTCCATGGACGAAACCACTGTCAAATC
CTTAATTCATGTCCTCGATTTGGAGAACCCTGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCAGGA
ACAGCCTCCGGAGATAGTGAGCTCAAATCCGGTATTCTTGGCGTTGCACAAGAAAGTCAT
GACGAATCTGAACAAGCATGCGGCACCAGAGACGCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTGGGT
CAAAGGTTGGGATGATTTCAAGAGAGGCCGTGACGCTCCCATCTCAGGGAACCAGTGAAA
GAAAAAACTCATTCTCTTCCTTACAAAAGTAACAGACTGCAAAAACACGTTTATATAAAA
GTATTTTATAAAA*TATAATAATGTGTGGCAG*CCGTGAAGAAG*CCGGAGCTATAAATG
TGTCTCGTTAGTGACACGATGAGATAGATAA*TACAGTCTTGTTTGTGGACGT*CTTGAT
ATGT
TAGTTTTG

QA 3 786 3 786
DS 

RD RR2BK22JQ 772 0 0
GCAACACGAGCCCATCCCATTTTCCGAAATCGAGTTGGTTTGGGGGCGAGGTTCTTCTCC
GGGAACACGCCGAGTCCACAAAACTTTGAGATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAGAGG
ATAACGATCAACAGATTGTCGTATAGGAGCAAGCAACGAGGTTTTCTGGAACTTGATCTG
GTTTTGGGTAACTGGGTTGAGGAGAATGTTGATTCCATGGACGAAACCACTGTCAAATCC
CTAATTCATGTCCTCGATTTGGAGAACCCTGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCAGGAA
CAGCCTCCGGAGATAGTGAGCTCAAATCCAGTATTTTTGGCGTTGCACAAGAAAGTCATG
ACGAATCTGAACAAGCATGCAGCACCAGAGACGCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTGGGTC
AAAGGTTGGGATGATTTCAAGAGAGGCCGTGACGCTCCCATTTCAGGGAACCAGTGAAAG
AAAAAACACAGTCTCTTCCTTACAAAAGTAACAGACTGCAAAAACACGTTTATATAAAAG
TATTTTATAAAAATATAATAATGTGTGGCAGGCCGTGAAGAAGGCCGGCGCTATAAATGT
GTCTCGGTAGTGACACGATGAGATAGATAAATACAGTC**GTTTGTGGAAGTTCTTGATA
TGTTAGATATGTGTTTGTTGAAATTGATGTGTTTTTATTTCAGGCAATAAGTCCTTTTGC
CTCTGGCTCAACTTTCTTGGCATATGCAGAACTAGTTACTTCGTTAAGAG
CC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2AZ33JQ 758 0 0
ATCGAGTTGATTTGGGGGCGAGGTTCTTCTCCGGGAACACGCCGAGTCCACAAAACTTTG
AGATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAGAGGATAACGATCAACAGATTGTTGTATAGGA
GCAAGCAACGAGGTTT*CTGGAACTTGATCTGGTTTTGGGTAACTGGGTTGAGGAGAATG
TTGATTCCATGGACGAAACCACTGTCAAATCCCTAATTCATGTCCTCGATTTGGAGAACC
CTGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCAGGAACAGCCTCCGGAGATAGTGAGCTCAAATC
CAGTATTTTTGGCGTTGCACAAGAAAGTCATGACGAATCTGAACAAGCATGCAGCACCAG
AGACGCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTGGGTCAAAGGTTGGGATGATTTCAAGAGAGGCC
GTGACGCTCCCATCTCAGGGAACCAGTGAAAGAAAAAACACAGTCTCTTCCTTACAAAAG
TAACAGACTGCAAAAACACGTTTATATAAAAGTATTTTATAAAAATATAATAATGTGTGG
CAGGCCGTGAAGAAGGCCGGCGCTATAAATGTGTCTCGGTAGTGACACGATGAGATAGAT
AAATACAGTC**GTTTGTGGAAGTTCTTGATATGTTAGATATGTGTTTGTTGAAATTGAT
GTGTTTTTATTTCAGGCAATAAGTCCTTTTGCCTCTGGCTCAACTTTCTTGGCATATGCA
GAACTAGTTACTTCGTTAAGAGTCAATGTTTCCTTGCC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 10

CO CL582Contig1 842 10 5 U
GGGTCGTTAATAGCTAATAAGTATCCGACAAAGACGGTCTCTCTCTCGCTCCCTCGTTGA
AGCCTTTCTAATTTCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTCGATTCTCGATTGGAGATTAAAAT
CAGAAA*GGTATCTACGAAAAA***AGCAAAAAAGAAAACAATCTCAAGAATGGCGGATC
AGCTCACCGACGATCAGATCTCTGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATG
GTGACGGTTGCATTACCACAAAGGAGCTTGGAACCGTGATGCGTTCTCTCGGACAGAACC
CAACAGAAGCAGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTTGATGCTGATGGTAACGGCACCA
TTGATTTCCCTGAGTTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGG
AAGAGCTCAAAGAAGCCTTCCGGGTCTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTG
CTGAGCTCCGTCATGTGATGACAAACCTGGGAGAGAAGCTCACAGACGAAGAGGTCGATG
AGATGATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGACAGATTAACTACGAGGAGTTTGTCA
AGGTCATGATGGCTAAGTGATTTAAGGTTTTTTGTTACTAAATACTCTCTTTTATGTGAT
TCTTATATTTACTATTATGTTCTAAAGGTTTTTATTCATGGGACATGGTTCTGTTTTATG
GCTGTTTAAGATGCAAATGTTGTCTCTTTATGCTCTGTTTTGTGTCTGAACATTTCAAAG
TCTTGGTCTTTGTAAGTTGTAACTTGGTCTAGTTTCGTGGTGTTTGTTATTAATGGTCTC
TA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 25 50 50 50 50 50 50 25 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 30 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 25 40 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 
55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 40 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H773JQB C 483
AF RR2G026JQ C 201
AF RR2C813TF U 1
AF RR2HA20JQ C 37
AF RR2HA20TF U 37
AF RR2H773TF U 54
AF RR2G026TF U 54
AF RR2D878TF U 65
AF RR2D878JQ C 68
AF RR2B657TF U 54
BS 1 686 RR2C813TF
BS 687 687 RR2HA20TF
BS 688 737 RR2C813TF
BS 738 744 RR2HA20TF
BS 745 842 RR2B657TF

RD RR2H773JQB 227 0 0
GAGT
TCCGTCATGGGATGACAAACCTGGGAGAGAAGCTCACAGACGAAGAGGTCGATGAGATGA
TCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGACAGATTAACTATGAGGAGTTTGTCAAGGTCA
TGATGGGTAAGTGATTTAAGGTTTTT*GTTACTAAATACTCTCTTTTATGTGATTCTTAT
ATTTACTATTATGTTCTAAAGTTTTTTATTCATGGGACATGGT

QA 5 227 5 227
DS 

RD RR2G026JQ 503 0 0
TCTGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGACGGTTGCATTACCACC
AAGGAGCTTGGAACCGTGATGCGTTTTTTCGGACAGAACCCAACAGAGGCAGAGCTCCAA
GACATGATCAGGGAAGTTGACGCTGACGGTAACGGCACCATTGATTTCCCGGAGTTCTTG
AACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACCCCGACTCCGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTC
CGAGTTTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATTTCAGCTGCTGAGCTCCGTCATGTAATG
ACAAACCTGGGAGAGAAGCTCACAGACGAAGAGGTCGATGAGATGATCAAGGAAGCTGAT
GTTGATGGTGATGGACAGATTAACTACGAGGAGTTTGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGA
TTTAAGGTTTTTTGTTACTAAATACTCTCTTTTATGTGATTCTTATATTTACTATTATGT
TCTAAAGGTTTTTATTCATGGGA

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2C813TF 737 0 0
GGGTCGTTAATAGCTAATAAGTATCCGACAAAGACGGTCTCTCTCTCGCTCCCTCGTTGA
AGCCTTTCTAATTTCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTCGATTCTCGATTGGAGATTAAAAT
CAGAAA*GGTATCTACGAAAAA***AGCAAAAAAGAAAACAATCTCAAGAATGGCGGATC
AGCTCACCGACGATCAGATCTCTGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATG
GTGACGGTTGCATTACCACAAAGGAGCTTGGAACCGTGATGCGTTCTCTCGGACAGAACC
CAACAGAAGCAGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTTGATGCTGATGGTAACGGCACCA
TTGATTTCCCTGAGTTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGG
AAGAGCTCAAAGAAGCCTTCCGGGTCTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTG
CTGAGCTCCGTCATGTGATGACAAACCTGGGAGAGAAGCTCACAGACGAAGAGGTCGATG
AGATGATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGACAGATTAACTACGAGGAGTTTGTCA
AGGTCATGATGGCTAAGTGATTTAAGGTTTTTTGTTACTAAATACTCTCTTTTATGTGAT
TCTTATATTTACTATTATGTTCTAAATGTTTTTATTCATGGGACATGGTTCTGTTTTATG
GCTGTTTAAGATGCAAA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2HA20JQ 710 0 0
GG
CTCTCTCTCGCTCCCTCGTTGAAGCCTTTCTAATTTCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTCG
ATTCTCGATTGGAGATTAAAATCAGAAA*GGTATCTACGAAAAA***AGCAAAAAAGAAA
ACAATCTCAAGAATGGCGGATCAGCTCACCGACGATCAGATCTCTGAGTTCAAGGAAGCC
TTCAGCTTATTCGACAAGGTTGGTGACGGTTGCATTACCACAAAGGAGCTTGGAACCGTG
ATGCGTTCTTTCGGACAGAACCCAACAGAAGCAGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTT
GATGCTGATGGTAACGGCACCATTGGTTTCCCTGAGTTCTTGAACCTCATGGCACGTAAG
ATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGCTCAAAGAAGCCTTCCGGGTTTTCGACAAGGAC
CAGAACGGTTTCATTTCAGCTGTTGAGCTCCGTCATGTGATGACAAACCTGGGAGAGAAG
CTCACAGACGAAGAGGTCGATGAGATGATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGACAG
ATTAACTACGAGGAGTTTGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGATTTAAGGTTTTTTGTTAC
TAAATACTCTCTTTTATGTGATTCTTATATTTACTATTATGTTCTAAAGGTTTTTATTCA
TGGGACATGGTTCTGTTTTATGGCTGTTTAAGATGCAAATGTTGTC
CC

QA 3 708 3 708
DS 

RD RR2HA20TF 710 0 0
GG
CTCTCTCTCGCTCCCTCGTTGAAGCCTTTCTAATTTCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTCG
ATTCTCGATTGGAGATTAAAATCAGAAA*GGTATCTACGAAAAA***AGCAAAAAAGAAA
ACAATCTCAAGAATGGCGGATCAGCTCACCGACGATCAGATCTCTGAGTTCAAGGAAGCC
TTCAGCTTATTCGACAAGGTTGGTGACGGTTGCATTACCACAAAGGAGCTTGGAACCGTG
ATGCGTTCTCTCGGACAGAACCCAACAGAAGCAGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTT
GATGCTGATGGTAACGGCACCATTGGTTTCCCTGAGTTCTTGAACCTCATGGCACGTAAG
ATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGCTCAAAGAAGCCTTCCGGGTCTTCGACAAGGAC
CAGAACGGTTTCATCTCAGCTGTTGAGCTCCGTCATGTGATGACAAACCTGGGAGAGAAG
CTCACAGACGAAGAGGTCGATGAGATGATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGACAG
ATTAACTACGAGGAGTTTGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGATTTAAGGTTTTTTGTTAC
TAAATACTCTCTTTTATGTGATTCTTATATTTACTATTATGTTCTAAAGGTTTTTATTCA
TGGGACATGGTTCTGTTTTATGGCTGTTTAAGATGCAAATGTTGTC
CC

QA 3 708 3 708
DS 

RD RR2H773TF 696 0 0
GG
GTTGAAGCCTTTCTAATTTCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTCGATTCTCGATTGGAGATT
AAAATCAGAAAAGGTATCTACGAAAAAGCAAAAAAAAAAAGAAACAATCTCAAGAATGGC
GGATCAGCTCACCGACGATCAGATCTCTGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAA
GGATGGTGACGGTTGCATTACCACCAAGGAGCTTGGAACCGTGATGCGTTCTCTCGGGCA
GAACCCAACAGAGGCAGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTTGACGCTGACGGTAACGG
CACCATTGATTTCCCGGAGTTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTC
CGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCCGAGTCTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTC
AGCTGCTGAGCTCCGTCATGTGATGACAAACCTGGGAGAGAAGCTCACAGACGAAGAGGT
CGATGAGATGATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGACAGATTAACTATGAGGAGTT
TGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGATTTAAGGTTTTT*GTTACTAAATACTCTCTTTTAT
GTGATTCTTATATTTACTATTATGTTCTAAAGTTTTTTATTCATGGGACATGGTTCTGTT
TTATGGCTGTTTAAGATGCAAATGTTGTCTCTTT

QA 3 696 3 696
DS 

RD RR2G026TF 674 0 0
GG
GTTGAAGCCTTTCTAATTTCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTCGATTCTCGATTGGAGATT
AAAATCAGAAAAGGTATCTACGAAAAAGC*AAAAAAAAAAGAAACAATCTCAAGAATGGC
GGATCAGCTCACGGACGATCAGATCTCTGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAA
GGATGGTGACGGTTGCATTACCACCAAGGAGCTTGGAACCGTGATGCGTTCTCTCGGACA
GAACCCAACAGAGGCAGAGCTCCAAGACATGATCAGCGAAGTTGACGCTGACGGTAACGG
CACCATTGATTTCCCGGAGTTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTC
CGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCCGAGTCTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTC
AGCTGCTGAGCTCCGTCATGTAATGACAAACCTGGGAGAGAAGCTCACAGACGAAGAGGT
CGATGAGATGATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGACAGATTAACTACGAGGAGTT
TGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGATTTAAGGTTTTTTGTTACTAAATACTCTCTTTTAT
GTGATTCTTATATTTACTATTATGTTCTAAAGGTTTTTATTCATGGGACATGGTTCTGTT
TTATGGCTGTTT

QA 3 674 3 674
DS 

RD RR2D878TF 745 0 0
TTTCTAATTTCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTCGATTCTCGATTGGAGATTAAAATCAGA
AA*GGTATCTACGAAAAA***AGCAAAAAAGAAAACAATCTCAAGAATGGCGGATCAGCT
CACCGACGATCAGATCTCTGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGA
CGGTTGCATTACCACAAAGGAGCTTGGAACCGTGATGCGTTCTCTCGGACAGAACCCAAC
AGAAGCAGAGCTCCAAGACATGGTCAACGAAGTTGATGCTGATGGTAACGGCACCATTGA
TTTCCCTGAGTTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGA
GCTCAAAGAAGCCTTCCGGGTCTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAACTGCTGA
GCTCCGTCATGTGATGACAAACCTGGGAGAGAAGCTCACAGACGAAGAGGTCGATGAGAT
GATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGACAGATTAACTACGAGGAGTTCTTCAAGGT
CATGATGGCTAAGTGATTTAAGGTTTTTTGTTACTAAATACTCTCTTTTATGTGATTCTT
ATATTTACTATTATGTTCTAAAGGTTTTTATTCATGGGACATGGTTCTGTTTTATGGCTG
TTTAAGATGCAAATGTTGTCTCTTTATGCTCTGTTTTGTGTCTGA*CATTTCAAAGTCTT
GGTCTTTGTAAGTTGTAACTTGGTC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2D878JQ 743 0 0
CTAATTTCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTCGATTCTCGATTGGAGATTAAAATCAGAAA*
GGTATCTACGAAAAA***AGCAAAAAAGAAAACAATCTCAAGAATGGCGGATCAGCTCAC
CGACGATCAGATCTCTGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGACGG
TTGCATTACCACAAAGGAGCTTGGAACCGTGATGCGTTCTCTCGGACAGAACCCAACAGA
AGCAGAGCTCCAAGACATGGTCAACGAAGTTGATGCTGATGGTAACGGCACCATTGATTT
CCCTGAGTTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGCT
CAAAGAAGCCTTCCGGGTTTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTGCTGAGCT
CCGTCATGTGATGACAAACCTGGGAGAGAAGCTCACAGACGAAGAGGTCGATGAGATGAT
CAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGACAGATTAACTACGAGGAGTTCTTCAAGGTCAT
GATGGCTAAGTGATTTAAGGTTTTTTGTTACTAAATACTCTCTTTTATGTGATTCTTATA
TTTACTATTATGTTCTAAAGGTTTTTATTCATGGGACATGGTTCTGTTTTATGGCTGTTT
AAGATGCAAATGTTGTCTCTTTATGCTCTGTTTTGTGTCTGAACATTTCAAAGTCTTGGT
CTTTGTAAGTTGTAACTTGGTC
C

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2B657TF 789 0 0
GG
GTTGAAGCCTTTCTAATTTCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTCGATTCTCGATTGGAGATT
AAAATCAGAAA*GGTATCTACGAAAAA***AGCAAAAAAGAAAACAATCTCAAGAATGGC
GGATCAGCTCACCGACGATCAGATCTCTGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAA
GGATGGTGATGGTTGCATTACCACAAAGGAGCTTGGAACCGTGATGCGTTCTCTCGGACA
GAACCCAACAGAAGCAGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAGTTGATGCTGATGGTAACGG
CACCATTGATTTCCCTGAGTTCTTGAACCTCATGGCACGTAAGATGAAGGACACCGACTC
CGAGGAAGAGCTCAAAGAAGCCTTCCGGGTCTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTC
AGCTGCTGAGCTCCGTCATGTGATGACAAACCTGGGAGAGAAGCTCACAGACGAAGAGGT
CGATGAGATGATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGACAGATTAACTACGAGGAGTT
TGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGATTTAAGGTTTTTTGTTACTAAATACTCTCTTTTAT
GTGATTCTTATATTTACTATTATGTTCTAAAGGTTTTTATTCATGGGACATGGTTCTGTT
TTATGGCTGTTTAAGATGCAAATGTTGTCTCTTTATGCTCTGTTTTGTGTCTGAACATTT
CAAAGTCTTGGTCTTTGTAAGTTGTAACTTGGTCTAGTTTCGTGGTGTTTGTTATTAATG
GTCTCTA

QA 3 789 3 789
DS 



AS 2 10

CO CL583Contig1 751 4 10 U
GTGGAATTGAAGCATCGTATATAAAATTCATCTCTTTTACATTCATATCTTATTATATGC
ATTTATCTCTGTTGAAAACTTGAAATAACTATAGAGCACCGGAGGATTGTTTCTTGAGTC
TCAAGGTACAACCAAACCCCTACTTTTAGCTCAAACATCAAGGTTCCTTGCAACGATGCC
TTCAAATGTAACACCAGGTCCAAAAGCCAGAATCAGACCCCACTCATTTTCACTTCCATT
CATGTTCCTCGCTTTCCTGCTCTCCTCCAACATATACTCCAACACATAAACAATCGAGTT
GCTACTTGCGTTGCCATAGTCCATGAGAGCTCTTCTGCTTGGACTCAGCTTCTCCGGCGA
CAGGTTAAGCCGCTTCTCCATTCGGTTCAATATGGCTGGTCCACCTGGATGAACCGCCCA
AAACATCTGGTTATAGTCTTTATGAACCAGTCCTGCTTTTCCTATCAACTTCTTGCAGAA
ACTCTCCACATTGTCTTCTATTATCTGTGGAAGCTCTCTTGACAGAGTGAAGTTTATCCC
TGTTTCTGTTAGCCTCCCATCTATCGTCTTCTCCGTGTCTGGCAAGAAATTTTGAATTGC
GGTGTGAAGCTCAAAGAGTGGCTTCTCACTAACCGGGTCTGGATCAGACCCGATGATAGC
TCCGGCTCCATCACCAAATAAAGCGACCCCAACAAGATCATACGGTCTATCTTTACTGGG
AGGTTTGAAACCAATAATGGTCGTCTCTGAC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G696JQ U 23
AF RR2E020JQ U 1
AF RR2GK73JQ U 1
AF RR2CR22JQ U 1
BS 1 69 RR2CR22JQ
BS 70 70 RR2G696JQ
BS 71 247 RR2CR22JQ
BS 248 248 RR2E020JQ
BS 249 515 RR2CR22JQ
BS 516 516 RR2G696JQ
BS 517 629 RR2CR22JQ
BS 630 630 RR2G696JQ
BS 631 631 RR2E020JQ
BS 632 751 RR2CR22JQ

RD RR2G696JQ 618 0 0
AAAATTCATCTCTTTTACATTCATATCTTATTATATGCATTTATCTCTGTTGAAAACTTG
AAATAACTATAGAGCACCGGAGGATTGTTTCTTGAGTCTCAAGGTACAACCAAACCCCTA
CTTTTAGCTCAAACATCAAGGTTCCTTGCAACGATGCCTTCAAATGTAACACCAGGTCCA
AAAGCCAGAATCAGACCCCACTCATTTTCACTTCCATTCATGTTCTTCGCTTTCCTGCTC
TCCTCCAACATATACTCCAACACATAAACAATCGAGTTGCTACTTGCGTTGCCATAGTCC
ATGAGAGCTCTTCTGCTTGGACTCAGCTTCTCCGGCGACAGGTTAAGCCGCTTCTCCATT
CGGTTCAATATGGCTGGTCCACCTGGATGAACCGCCCAAAACATCTGGTTATAGTCTTTA
TGAACCAGTCCTGCTTTTCCTATCAACTTCTTGCAGAAACTCTCCACATTGTCTTCTATT
ATCTGTGGAAGCTCTCTTGACAGAGTGAAGTTTATCCCTGTTTCTGTTAGCCTCCCATCT
ATCGTCTTCTCCGTGTCTGGCAAGAAATTTTGAATTGCGGTGTGAAGCTCAAAGAGTGGC
TTCTCACTGACCGGGTCT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2E020JQ 642 0 0
G
TGGAATTGGAGCATCGTATATAAAATTCATCTCTTTTACATTCATATCTTATTATATGCA
TTTATCTCTGTTGAAAACTTGAAATAACTATAGAGCACCGGAGGATTGTTTCTTGAGTCT
CAAGGTACAACCAAACCCCTACTTTTAGCTCAAACATCAAGGTTCCTTGCAACGATGCCT
TCAAATGTAACACCAGGTCCAAAAGCCAGAATCAGACCCCACTCATTTTCACTTCCATTC
ATGTTCCTCGCTTTCCTGCTCTCCTCCAACATATACTCCAACACGTAAACAATCGAGTTG
CTACTTGCGTTGCCATAGTCCATGAGAGCTCTTCTGCTTGGACTCAGCTTCTCCGGCGAC
AGGTTAAGCCGCTTCTCCATCCGGTTCAATATGGCTGGTCCACCTGGATGAACCGCCCAA
AACATCTGGTTATAGTCTTTATGAACCAGTCCTGCTTTTCCTATCAACTTCTTGCAGAAA
CTCTCCACATTGTCTTCTATTATCTGTGGAAGCTCTCTTGACAGAGTGAAGTTTATCCCT
GTTTCTGTTAGCCTCCCATCTATCGTCTTCTCCGTGTCTGGCAAGAAATTTTGAATTGCG
GTGTGAAGCTCAAAGAGTGGCTTCTCACTAACCGGGTCTGG

QA 2 642 2 642
DS 

RD RR2GK73JQ 642 0 0
A
TGGAATTGAAGCATCGTATATAAAATTCATCTCTTTTACATTCATATCTTATTATATGCA
TTTATCTCTGTTGAAAACTTGAAATAACTATAGAGCACCGGAGGATTGTTTCTTGAGTCT
CAAGGTACAACCAAACCCCTACTTTTAGCTCAAACATCAAGGTTCCTTGCAACGATGCCT
TCAAATGTAACACCAGGTCCAAAAGCCAGAATCAGACCCCACTCATTTTCACTTCCATTC
ATGTTCCTCGCTTTCCTGCTCTCCTCCAACATATACTCCAACACGTAAACAATCGAGTTG
CTACTTGCGTTGCCATAGTCCATGAGAGCTCTTCTGCTTGGACTCAGCTTCTCCGGCGAC
AGGTTAAGCCGCTTCTCCATTCGGTTCAATATGGCTGGTCCACCTGGATGAACCGCCCAA
AACATCTGATTATAGTCTTTATGAACCAGTCCTGCTTTTCCTATCAACTTCTTGCAGAAA
CTCTCCACATTGTCTTCTATTATCTGTGGAAGCTCTCTTGACAGAGTGAAGTTTATCCCT
GTTTCTGTTAGCCTCCCATCTATCGTCTTCTCCGTGTCTGGCAAGAAATTTTGAATTGCG
GTGTGAAGCTCAAAGAGTGGCTTCTCACTAACCGGGTCTGG

QA 2 642 2 642
DS 

RD RR2CR22JQ 751 0 0
GTGGAATTGAAGCATCGTATATAAAATTCATCTCTTTTACATTCATATCTTATTATATGC
ATTTATCTCCGTTGAAAACTTGAAATAACTATAGAGCACCGGAGGATTGTTTCTTGAGTC
TCAAGGTACAACCAAACCCCTACTTTTAGCTCAAACATCAAGGTTCCTTGCAACGATGCC
TTCAAATGTAACACCAGGTCCAAAAGCCAGAATCAGACCCCACTCATTTTCACTTCCATT
CATGTTCTTCGCTTTCCTGCTCTCCTCCAACATATACTCCAACACATAAACAATCGAGTT
GCTACTTGCGTTGCCATAGTCCATGAGAGCTCTTCTGCTTGGACTCAGCTTCTCCGGCGA
CAGGTTAAGCCGCTTCTCCATTCGGTTCAATATGGCTGGTCCACCTGGATGAACCGCCCA
AAACATCTGGTTATAGTCTTTATGAACCAGTCCTGCTTTTCCTATCAACTTCTTGCAGAA
ACTCTCCACATTGTCTTCTATTATCTGTGGAAGCTTTCTTGACAGAGTGAAGTTTATCCC
TGTTTCTGTTAGCCTCCCATCTATCGTCTTCTCCGTGTCTGGCAAGAAATTTTGAATTGC
GGTGTGAAGCTCAAAGAGTGGCTTCTCACCGACCGGGTCTGGATCAGACCCGATGATAGC
TCCGGCTCCATCACCAAATAAAGCGACCCCAACAAGATCATACGGTCTATCTTTACTGGG
AGGTTTGAAACCAATAATGGTCGTCTCTGAC

QA 1 751 1 751
DS 



CO CL583Contig2 1320 6 39 U
GGATACACAACAAGAGAAACAAGATTGTAATGGGGAGCATCGATGCCACCGAGTTGTGTT
CAGAGAAGAAACCAAACCCAGGGAAAGCAACCATTCTTTCTATCGGTAAAGCCTTTCCCC
ACCAGCTAGTGATGCAAGAGTACTTGGTCGATGGCTACTTCAAAACCACCAACTGTGACG
ACCCTGAACTCAAACAGAAGCTTACTCGCCTCTGCAAGACAACGACGGTGAAAACAAGGT
ACGTTGTAATGTCAGAGGAGATACTAACAAAGTATCCAGAACTCGCCATCGAAGGAGGAT
CCACCGTGACGCAGCGTCTGGACATATGCAACGACGCTGTAACTGAAATGGCAGTGGAAG
CTTCAAGATCGTGCATCAAGAACTGGGGCCACTCTGTTTCCGACATAACTCACCTTGTCT
ATGTCTCTTCAAGCGAAGCTCGTCTCCCTGGTGGTGACCTGTTCTTAGCCAAAGGGCTTG
GTCTCAGCCCCGAGACGCACCGTGTTCTGCTCTACTTCGTCGGCTGCTCTGGAGGGGTTG
CTGGTCTCCGTGTAGCGAAAGACATAGCCGAGAACAATCCGGGTAGTAGAGTCTTGCTTG
CCACGTCAGAGACGACCATTATTGGTTTCAAACCTCCCAGTAAAGATAGACCGTATGATC
TTGTTGGGGTCGCTTTATTTAGTGATGGAGCCGGAGCTATGATCATCTGGTCTGATCCAG
ACCCGGTTAGTGAGAAGCCACTCTTTGAGCTTCACACCGCAATTCAAAATTTCTTGCCAG
ACACGGAGAAGACGATAGATGGGAGGCTAACAGAAACAGGGATAAACTTCACTCTGTCAA
GAGAGCTTCCACAGATAATAGAAGACAATGTGGAGAGTTTCTGCAAGAAGTTGATAGGAA
AAGCAGGACTGGTTCATAAAGACTATAACCAGATGTTTTGGGCGGTTCATCCAGGTGGAC
CAGCCATATTGAACCGAATGGAGAAGCGGCTTAACCTGTCGCCGGAGAAGCTGAGTCCAA
GCAGAAGAGCTCTCATGGACTATGGCAACGCAAGTAGCAACTCGATTGTTTACGTGTTGG
AGTATATGTTGGAGGAGAGCAGGAAAGCGAGGAACATGAATGGAAGTGAAAATGAGTGGG
GTCTGATTCTGGCTTTTGGACCTGGTGTTACATTTGAAGGCATCGTTGCAAGGAACCTTG
ATGTTTGAGCTAAAAGTAGGGGTTTGGTTGTACCTTGAGACTCAAGAAACAATCCTCCGG
TGCTCTATAGTTATTTCAAGTTTTCAACAGAGATAAATGCATATAATAAGATATGAATGC


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 40 40 
40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G696TF U 1
AF RR2CR22TF U 1
AF RR2GK73TF U 1
AF RR2CD67TF U 2
AF RR2E020TF U 1
AF RR2CD67JQ C 539
BS 1 15 RR2CR22TF
BS 16 16 RR2E020TF
BS 17 77 RR2CR22TF
BS 78 78 RR2G696TF
BS 79 142 RR2CR22TF
BS 143 143 RR2E020TF
BS 144 268 RR2CR22TF
BS 269 269 RR2E020TF
BS 270 421 RR2CR22TF
BS 422 422 RR2E020TF
BS 423 430 RR2CR22TF
BS 431 431 RR2G696TF
BS 432 451 RR2CR22TF
BS 452 452 RR2E020TF
BS 453 454 RR2CR22TF
BS 455 455 RR2E020TF
BS 456 460 RR2CR22TF
BS 461 461 RR2E020TF
BS 462 462 RR2CR22TF
BS 463 463 RR2E020TF
BS 464 535 RR2CR22TF
BS 536 536 RR2E020TF
BS 537 541 RR2CR22TF
BS 542 542 RR2E020TF
BS 543 556 RR2CR22TF
BS 557 557 RR2E020TF
BS 558 680 RR2CR22TF
BS 681 681 RR2CD67TF
BS 682 692 RR2CR22TF
BS 693 693 RR2E020TF
BS 694 694 RR2CD67TF
BS 695 707 RR2E020TF
BS 708 708 RR2CD67TF
BS 709 768 RR2E020TF
BS 769 769 RR2CD67JQ
BS 770 777 RR2E020TF
BS 778 778 RR2CD67JQ
BS 779 803 RR2E020TF
BS 804 1320 RR2CD67JQ

RD RR2G696TF 560 0 0
GGAT
ACACAACAAGATAAACAAGATTGTAATGGGGAGCATCGATGCCACCGAGTTGTGTTCAGA
GAAGAAACCAAACCCAGGGAAAGCAACCATTCTTTCTATCGGTAAAGCCTTTCCCCACCA
GCTAGTGATGCAAGAGTATTTGGTCGATGGCTACTTCAAAACCACCAACTGTGACGACCC
TGAACTCAAACAGAAGCTTACTCGCCTCTGCAAGACAACGACGGTGAAAACAAGGTACGT
TGTAATGTCAGAGGAGATACTAACGAAGTATCCAGAACTCGCCATCGAAGGAGGATCCAC
CGTGACGCAGCGTCTGGACATATGCAACGACGCTGTAACTGAAATGGCAGTGGAAGCTTC
AAGATCGTGCATCAAGAACTGGGGCCACTCTGTTTCCGACATAACTCACCTTGTCTACGT
CTCTTCAAGCGAAGCTCGTCTCCCTGGAGGCGACCTTTACTTAGCCAAAGGGCTTGGTCT
CAGCCCCGAGACGCACCGTGTTCTGCTCTACTTCTTCGGCTGCTCTGGAGGCGCTGCGGG
TCTCCGTGTAGC
CAAA

QA 5 556 5 556
DS 

RD RR2CR22TF 692 0 0
GGATACACAACAAGATAAACAAGATTGTAATGGGGAGCATCGATGCCACCGAGTTGTGTT
CAGAGAAGAAACCAAACTCAGGGAAAGCAACCATTCTTTCTATCGGTAAAGCCTTTCCCC
ACCAGCTAGTGATGCAAGAGTATTTGGTCGATGGCTACTTCAAAACCACCAACTGTGACG
ACCCTGAACTCAAACAGAAGCTTACTCGCCTCTGCAAGACAACGACGGTGAAAACAAGGT
ACGTTGTAATGTCAGAGGAGATACTAACGAAGTATCCAGAACTCGCCATCGAAGGAGGAT
CCACCGTGACGCAGCGTCTGGACATATGCAACGACGCTGTAACTGAAATGGCAGTGGAAG
CTTCAAGATCGTGCATCAAGAACTGGGGCCACTCTGTTTCCGACATAACTCACCTTGTCT
ACGTCTCTTCCAGCGAAGCTCGTCTCCCTGGAGGCGACCTTTACTTAGCCAAAGGGCTTG
GTCTCAGCCCCGAGACGCACCGTGTTCTGCTCTACTTCGTCGGCTGCTCTGGAGGCGTTG
CGGGTCTCCGTGTAGCCAAAGACATAGCCGAGAACAATCCGGGTAGTAGAGTCTTGCTTG
CCACGTCAGAGACGACCATTATTGGTTTCAAACCTCCCAGTAAAGATAGACCGTATGATC
TTGTTGGGGTCGCTTTATTTGGTGATGGAGCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2GK73TF 762 0 0
GGAG
ACACAACAAGAGAAACAAGATTGTAATGGGGAGCATCGATGCCACCGAGTTGTGTTCAGA
GAAGAAACCAAACCCAGGGAAAGCAACCATTCTTTCTATCGGTAAAGCCTTTCCCCACCA
GCTAGCGATGCAAGAGTACTTGGTCGATGGCTACTTCAAAACCACCAACTGTGACGACCC
TGAACTCAAACAGAAGCTTACTCGCCTCTGCAAGACAACGACGGTGAAAACAAGGTACGT
TGTAATGTCAGAGGAGATACTAACAAAGTATCGAGAACTCGCCATCGAAGGAGGATCCAC
CGTGACGCAGCGTCTGGACATATGCAACGACGCTGTAACTGAAATGGCAGTGGAAGCTTC
AAGATCGTGCATCAAGAACTGGGGCCACTCTGTTTCCGACATAACTCACCTTGTCTATGT
CTCTTCAAGCGAAGCTCGTCTCCCTGGTGGTGACCTGTTCTTAGCCAAAGGGCTTGGTCT
CAGCCCCGAGACGCACCGTGTTCTGCTCTACTTCGTCGGCTGCTCTGGAGGGGTTGCTGG
TCTCCGTGTAGCGAAAGACATAGCCGAGAACAATCCGGGTAGTAGAGTCTTGCTTGCCAC
GTCAGAGACGACCATTATTGGTTTCAAACCTCCCAGTAAAGATAGACCGTATGATCTTGT
TGGGGTCGCTTTATTTGGTGATGGAGCCG*AGCTATGATCATCGGGTCTGATCCAGACCC
GGTTAGTGAGAAGCCACTCTTTGAGCT
CACACCGCAAT

QA 5 751 5 751
DS 

RD RR2CD67TF 735 0 0
GAG
ACACAACAAGAGAAACAAGATTGTAATGGGGAGCATCGATGCCACCGAGTTGTGTTCAGA
GAAGAAACCAAACCCAGGGAAAGCAACCATTCTTTCTATCGGTAAAGCCTTTCCCCACCA
GCTAGTGATGCAAGAGTACTTGGTCGATGGCTACTTCAAAACCACCAACTGTGACGACCC
TGAACTCAAACAGAAGCTTACTCGCCTCTGCAAGACAACGACGGTGAAAACAAGGTACGT
TGTAATGTCAGAGGAGATACTAACAAAGTATCCAGAACTCGCCATCGAAGGAGGATCCAC
CGTGACGCAGCGTCTGGACATATGCAACGACGCTGTAACTGAAATGGCAGTGGAAGCTTC
AAGATCGTGCATCAAGAACTGGGGCCACTCTGTTTCCGACATAACTCACCTTGTCTATGT
CTCTTCAAGCGAAGCTCGTCTCCCTGGTGGTGACCTGTTCTTAGCCAAAGGGCTTGGTCT
CAGCCCCGAGACGCACCGTGTTCTGCTCTACTTCGTCGGCTGCTCTGGAGGGGTTGCTGG
TCTCCGTGTAGCGAAAGACATAGCCGAGAACAATCCGGGTAGTAGAGTCTTGCTTGCCAC
GTCAGAGACGACCATTATTGGTTTCAAACCTCCCAGTAAAGATAGACCGTATGATCTTGT
TGGGGTCGCTTTATTTAGTGATGGAGCCGGAGCTATGATCATCTGGTCTGATCCAGACCC
GGTTAGTGAGAA

QA 4 735 4 735
DS 

RD RR2E020TF 803 0 0
GGAG
ACACAACAAGAGAAACAAGATTGTAATGGGGAGCATCGATGCCACCGAGTTGTGTTCAGA
GAAGAAACCAAACCCAGGGAAAGCAACCATTCTTTCTATCGGTAAAGCCTTTCCCCACCA
GCTAGTGATGCAAGAGTACTTGGTCGATGGCTACTT*AAAACCACCAACTGTGACGACCC
TGAACTCAAACAGAAGCTTACTCGCCTCTGCAAGACAACGACGGTGAAAACAAGGTACGT
TGTAATGTCAGAGGAGATACTAACAAAGTATCCAGAACTCGCCATCGAAGGAGGATCCAC
CGTGACGCAGCGTCTGGACATATGCAACGACGCTGTAACTGAAATGGCAGTGGAAGCTTC
AAGATCGTGCATCAAGAACTGGGGCCACTCTGTTTCCGACATAACTCACCTTGTCTATGT
CTCTTCAAGCGAAGCTCGTCTCCCTGGTGGTGACCTGTTCTTAGCCAAAGGGCTTGGTCT
CAGCCCCGAGACGCACCGTGTTCTGCTCTACTTCGTCGGCTGCTCTGGAGGGGTTGCTGG
TCTCCGTGTAGCGAAAGACATAGCCGAGAACAATCCGGGTAGTAGAGTCTTGCTTGCCAC
GTCAGAGACGACCATTATTGGTTTCAAACCTCCCAGTAAAGATAGACCGTATGATCTTGT
TGGGGTCGCTTTATTTGGTGATGGAGCCG*AGCTATGATCATCGGGTCTGATCCAGACCC
GGTTAGTGAGAAGCCACTCTTTGAGCTTCACACCGCAATTCAAA*TTTCTTGC*AGACAC
GGAGAAGACGATAGATGGG

QA 5 803 5 803
DS 

RD RR2CD67JQ 782 0 0
TGCTGGTCTCCGTGTAGCGAAAGACATAGCCGAGAACAATCCGGGTAGTAGAGTCTTGCT
TGCCACGTCAGAGACGACCATTATTGGTTTCAAACCTCCCAGTAAAGATAGACCGTATGA
TCTTGTTGGGGTCGCTTTATTTAGTGATGGAGCCGGAGCTATGATCATCTGGTCTGATCC
AGACCCGGTTAGTGAGAAGCCACTCTTTGAGCTTCACACCGTAATTCAAAATTTCTTGCC
AGACACGGAGAAGACGATAGATGGGAGGCTAACAGAAACAGGGATAAACTTCACTCTGTC
AAGAGAGCTTCCACAGATAATAGAAGACAATGTGGAGAGTTTCTGCAAGAAGTTGATAGG
AAAAGCAGGACTGGTTCATAAAGACTATAACCAGATGTTTTGGGCGGTTCATCCAGGTGG
ACCAGCCATATTGAACCGAATGGAGAAGCGGCTTAACCTGTCGCCGGAGAAGCTGAGTCC
AAGCAGAAGAGCTCTCATGGACTATGGCAACGCAAGTAGCAACTCGATTGTTTACGTGTT
GGAGTATATGTTGGAGGAGAGCAGGAAAGCGAGGAACATGAATGGAAGTGAAAATGAGTG
GGGTCTGATTCTGGCTTTTGGACCTGGTGTTACATTTGAAGGCATCGTTGCAAGGAACCT
TGATGTTTGAGCTAAAAGTAGGGGTTTGGTTGTACCTTGAGACTCAAGAAACAATCCTCC
GGTGCTCTATAGTTATTTCAAGTTTTCAACAGAGATAAATGCATATAATAAGATATGAAT
GC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 10

CO CL584Contig1 849 10 10 U
GGAGCTTTCTTTATATAATTTCTCTCTATTACCATCTTCCTTGCTCCTAACTTCATATTT
TTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGATGA
TCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCA
GAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAA
ACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCC
TTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGAGTGTTCATAG
CGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATCTACGAG
AAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAATAGA
GATGATGAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATGAAG
ACAGAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGCGGA
AGCAGTAAAGTTTTAATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAACTA
TGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAAGTCTCGCCTTTTTATGTTGTTGTAATT
TTCGTTTTGTTTGGAGATTGATAAGTTTTCAGCATTGTGTAATGCAGAGTAGACTAGTGT
CTGCTTATCTCAAGGATTGCGTTTGCCATCTAAGAAGTATTTAATAAACAAAACACATAT
GATACGTTT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 55 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 10 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 30 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET96JQ C 58
AF RR2ET96TF U 58
AF RR2CH29TF U 1
AF RR2GD79JQ C 1
AF RR2H026JQ C 58
AF RR2GD79TF U 1
AF RR2H026TF U 1
AF RR2CS12JQ C 58
AF RR2CS12TF U 58
AF RR2CH29JQ C 52
BS 1 470 RR2CH29TF
BS 471 471 RR2ET96TF
BS 472 489 RR2CH29TF
BS 490 490 RR2ET96TF
BS 491 649 RR2CH29TF
BS 650 650 RR2GD79TF
BS 651 666 RR2CH29TF
BS 667 694 RR2GD79TF
BS 695 701 RR2CS12TF
BS 702 849 RR2CH29JQ

RD RR2ET96JQ 585 0 0
TTTTTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGA
TGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGA
TCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAG
GAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAA
CCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGAGTGTTCA
TAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATCTAC
GAGAAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAAT
AGAGATGATGAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATG
AAGACAGAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGC
GGAAGCAGTAAAGTTTTAATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTT
G

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2ET96TF 585 0 0
TTTTTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGA
TGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGA
TCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAG
GAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAA
CCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGAGTGTTCA
TAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATCTAC
GAGAAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAAT
AGAGATGATGAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATG
AAGACAGAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGC
GGAAGCAGTAAAGTTTTAATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTT
G

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2CH29TF 669 0 0
GGAGCTTTCTTTATATAATTTCTCTCTATTACCATCTTCCTTGCTCCTAACTTCATATTT
TTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGATGA
TCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCA
GAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAA
ACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCC
TTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGAGTGTTCATAG
CGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATCTACGAG
AAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTCTATAATAGA
GATGATGAGTAATCTCCATGAGGTGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATGAAG
ACAGAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGCGGA
AGCAGTAAAGTTTTAATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTA*TGTCTAACTA
TGTTTT
GGT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2GD79JQ 701 0 0
GGAGCTTTCTTTATATAATTTCTCTCTATTACCATCTTCCTTGCTCCTAACTTCATATTT
TTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGATGA
TCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCA
GAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAA
ACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCC
TTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGAGTGTTCATAG
CGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATCTACGAG
AAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCGACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAATAGA
GATGATGAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATGAAG
ACAGAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGCGGA
AGCAGTAAAGTTTTAATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAACTA
TGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAAGTCTCGCC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2H026JQ 644 0 0
TTTTTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGA
TGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGA
TCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAG
GAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAA
CCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGAGTGTTCA
TAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATCTAC
GAGAAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCGACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAAT
AGAGATGATGAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATG
AAGACAGAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGC
GGAAGCAGTAAAGTTTTAATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAA
CTATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAAGTCTCGCC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2GD79TF 694 0 0
GGAGCTTTCTTTATATAATTTCTCTCTATTACCATCTTCCTTGCTCCTAACTTCATATTT
TTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGATGA
TCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCA
GAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAA
ACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCC
TTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGAGTGTTCATAG
CGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATCTACGAG
AAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCGACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAATAGA
GATGATGAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATGAAG
ACAGAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGCGGA
AGCAGTAAAGTTTTAATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAACTA
TGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAAG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2H026TF 694 0 0
GGAGCTTTCTTTATATAATTTCTCTCTATTACCATCTTCCTTGCTCCTAACTTCATATTT
TTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGATGA
TCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCA
GAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAA
ACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCC
TTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGAGTGTTCATAG
CGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATCTACGAG
AAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCGACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAATAGA
GATGATGAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATGAAG
ACAGAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGCGGA
AGCAGTAAAGTTTTAATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAACTA
TGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAAG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2CS12JQ 644 0 0
TTTTTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGA
TGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGA
TCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAG
GAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAATAAGACCTCATTAA
CCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGGGTGTTCA
TAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATCTAC
GAGAAGAGGAATCTTCAGTTGCTTCAACCGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAAT
AGAGATGA*GAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATG
AAGACAGAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGC
GGAAGCAGTAAAGTTTTAATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAA
CTATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAAGTCTCGCC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2CS12TF 644 0 0
TTTTTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGA
TGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGA
TCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAG
GAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAATAAGACCTCATTAA
CCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGGGTGTTCA
TAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATCTAC
GAGAAGAGGAATCTTCAGTTGCTTCAACCGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTTTATAAT
AGAGATGA*GAGGAATCTCCATGAGGTGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATG
AAGACAGAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGC
GGAAGCAGTAAAGTTTTAATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAA
CTATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAAGTCTCGCC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2CH29JQ 798 0 0
CTTCATA
TTTTCAAGAAAACAAGATACAGTAGCGCTCTCTTCTCACTACAGCTTTGATCATATGGAT
GATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGAT
CAGAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGG
AAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAAC
CCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGAGTGTTCAT
AGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATTTACG
AGAAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAATATCTTCTATAATA
GAGATGATGAGTAATCTCCATGAGGTGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATGA
AGACAGAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGCG
GAAGCAGTAAAGTTTTAATCAAGTTCGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAAC
TATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAAGTCTCGCCTTTTTATGTTGTTGTAA
TTTTCGTTTTGTTTGGAGATTGATAAGTTTTCAGCATTGTGTAATGCAGAGTAGACTAGT
GTCTGCTTATCTCAAGGATTGCGTTTGCCATCTAAGAAGTATTTAATAAACAAAACACAT
ATGATACGTTT

QA 8 798 8 798
DS 



AS 2 8

CO CL585Contig1 1284 4 8 U
GGGAGGTTGCTTATACAACGAGATCTTTTAATCTTCTGGGATTCCAAAACCATGGCTGCT
GATTATACAACCAAACTCTGTTTGGTCTCTGTTGTCTTCCTCTTGGGCCTTGTCTCCTCG
TCTCTCAACTTGCAGGGAGTTGCTGCAGAGAATCTTACCAAACAGAAACTGAACTCGAAG
ATACTTCAGGAAGAGATAGTGAAGAAGGTCAACGAACATCCAAACGCTGGATGGAAAGCT
GCTATTAATGATCGTTTCTCTAACGCAACTGTAGCAGAGTTTAAGCGTCTCCTTGGAGCT
AAACCAACACCTAAGAAGTTACTCTTAGGTGTTCCTGTTGTAAGCCATGATCAATCTCTG
AAGTTACCTAAATCATTCGATGCTAGAACACATTGGCCTCAATGCACCAGTATTGGAAAA
ATCTTAGATCAGGGACATTGTGGTTCTTGCTGGGCATTTGGTGCTGTTGAATCACTATCT
GATAGATTCTGTATCCAATTTGGAATGAACATTACTTTATCAGTAAATGATCTCTTAGCA
TGCTGTGGATTCCGTTGTGGTGACGGTTGTGACGGTGGCTACCCAATTTCTGCTTGGCGA
TACTTTTCCTACAGTGGTGTTGTCACTGAAGAGTGTGATCCATACTTTGATCAAACCGGA
TGCTCACACCCTGGCTGTGAACCTGCATACAATACACCGCAATGCCTGAGGAAATGCGTT
GGCAGAAACCAATTATGGAGCGAGTCAAAACATTACATTGTTAATACATACGTTGTCGAG
TCTAATCCTCAAGATATCATGGCTGAGATTTACAAGAATGGACCTGTCGAAGTCTCTTTC
GCAGTTTATGAGGACTTTGCTCATTACAAATCTGGAGTGTACAAGCACATAACAGGTTCT
AACATTGGAGGTCATGCTGTGAAACTTATTGGTTGGGGAACTACTGATGATGGAGAAGAT
TATTGGTTGTTGGCAAATCAATGGAACAGAAGCTGGGGTGATGATGGTTATTTCATGATT
AGGAGAGGAACAAATGAATGTGGAATTGAAGATGAACCAGCGGGTGGTTTGCCTTCAACC
AAGAATGTGTTCAAGGTTACAACCGGTTCAGATGAGATTTCTGTTGCATCGGTTTAAGAT
AAGAGATGGAGAAGTTTGTGTCTGTAAGATATTCTACGTTACTGTGTTGTGGTTGTTGTT
GTTGTTTCCGGGGACCGGAACTTGTTCGCCGTGAAAATGTTATAGACATTAAATAATTCA
ACCGAAGAAGAATTACAATATGGC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH61TF U 1
AF RR2BG05TF U 1
AF RR2BG05JQ C 342
AF RR2CH61JQ C 481
BS 1 298 RR2BG05TF
BS 299 299 RR2CH61TF
BS 300 657 RR2BG05TF
BS 658 658 RR2CH61TF
BS 659 848 RR2BG05TF
BS 849 1060 RR2BG05JQ
BS 1061 1061 RR2CH61JQ
BS 1062 1284 RR2BG05JQ

RD RR2CH61TF 703 0 0
GGGA
GGTTGCTTATACAACGAGATCTTTTAATCTTCTGGGATTCCAAAACCATGGCTGCTGATT
ATACAACCAAACTCTGTTTGGTCTCTGTTGTCTTCCTCTTGGGCCTTGTCTCCTCGTCTC
TCAACTTGCAGGGAGTTGCTGCAGAGAATCTTACCAAACAGAAACTGAACTCGAAGATAC
TTCAGGAAGAGATAGTGAAGAAGGTCAACGAACATCCAAACGCTGGATGGAAAGCTGCTA
TTAATGATCGTTT*TCTAACGCAACTGTAGCAGAGTTTAAGCGTCTCCTTGGAGCTAAAC
CAACACCTAAGAAGTTACTCTTAGGTGTTCCTGTTGTAAGCCATGATCAATCTCTGAAGT
TACCTAAATCATTCGACGCTAGAACACATTGGCCTCAATGCACCAGTATTGGAAAAATCT
TAGATCAGGGACATTGTGGTTCTTGCTGGGCATTTGGTGCTGTTGAATCACTATCTGATA
GATTCTGTATCCAATTTGGAATGAACATTACTTTATCAGTAAATGATCTCTTAGCATGCT
GTGGATTCCGTTGTGGTGACGGTTGTGACGGTGGCTACCCAATTTCTGCTTGGCGATACT
TTTCCTACAGTGGTGTTGTCACTGAAGAGTGTGATCCATACTTTGATCAAACCGGATGCT
CACACCCTGGCTGTGAACCTGCATACAATACACCGCAAT

QA 5 703 5 703
DS 

RD RR2BG05TF 848 0 0
GGGAGGTTGCTTATACAACGAGATCTTTTAATCTTCTGGGATTCCAAAACCATGGCTGCT
GATTATACAACCAAACTCTGTTTGGTCTCTGTTGTCTTCCTCTTGGGCCTTGTCTCCTCG
TCTCTCAACTTGCAGGGAGTTGCTGCAGAGAATCTTACCAAACAGAAACTGAACTCGAAG
ATACTTCAGGAAGAGATAGTGAAGAAGGTCAACGAACATCCAAACGCTGGATGGAAAGCT
GCTATTAATGATCGTTTCTCTAACGCAACTGTAGCAGAGTTTAAGCGTCTCCTTGGAGTT
AAACCAACACCTAAGAAGTTACTCTTAGGTGTTCCTGTTGTAAGCCATGATCAATCTCTG
AAGTTACCTAAATCATTCGATGCTAGAACACATTGGCCTCAATGCACCAGTATTGGAAAA
ATCTTAGATCAGGGACATTGTGGTTCTTGCTGGGCATTTGGTGCTGTTGAATCACTATCT
GATAGATTCTGTATCCAATTTGGAATGAACATTACTTTATCAGTAAATGATCTCTTAGCA
TGCTGTGGATTCCGTTGTGGTGACGGTTGTGACGGTGGCTACCCAATTTCTGCTTGGCGA
TACTTTTCCTACAGTGGTGTTGTCACTGAAGAGTGTGATCCATACTTTGATCAAACCTGA
TGCTCACACCCTGGCTGTGAACCTGCATACAATACACCGCAATGCCTGAGGAAATGCGTT
GGCAGAAACCAATTATGGAGCGAGTCAAAACATTACATTGTTAATACATACGTTGTCGAG
TCTAATCCTCAAGATATCATGGCTGAGATTTACAAGAATGGACCTGTCGAAGTCTCTTTC
GCAGTTTA

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR2BG05JQ 943 0 0
AAGCCATGATCAATCTCTGAAGTTAC*TAAATCATTCGATGCTAGAACACATTGGCCTCA
ATGCACCAGTATTGGAAAAATCTTAGATCAGGGACATTGTGGTTCTTGCTGGGCATTTGG
TGCTGTTGAATCACTATCTGATAGATTCTGTATCCAATTTGGAATGAACATTACTTTATC
AGTAAATGATCTCTTAGCATGCTGTGGATTCCGTTGTGGTGACGGTTGTGACGGTGGCTA
CCCAATTTCTGCTTGGCGATACTTTTCCTACAGTGGTGTTGTCACTGAAGAGTGTGATCC
ATACTTTGATCAAACCTGATGCTCACACCCTGGCTGTGAACCTGCATACAATACACCGCA
ATGCCTGAGGAAATGCGTTGGCAGAAACCAATTATGGAGCGAGTCAAAACATTACATTGT
TAATACATACGTTGTCGAGTCTAATCCTCAAGATATCATGGCTGAGATTTACAAGAATGG
ACCTGTCGAAGTCTCTTTCGCAGTTTATGAGGACTTTGCTCATTACAAATCTGGAGTGTA
CAAGCACATAACAGGTTCTAACATTGGAGGTCATGCTGTGAAACTTATTGGTTGGGGAAC
TACTGATGATGGAGAAGATTATTGGTTGTTGGCAAATCAATGGAACAGAAGCTGGGGTGA
TGATGGTTATTTCATGATTAGGAGAGGAACAAATGAATGTGGAATTGAAGATGAACCAGT
GGGTGGTTTGCCTTCAACCAAGAATGTGTTCAAGGTTACAACCGGTTCAGATGAGATTTC
TGTTGCATCGGTTTAAGATAAGAGATGGAGAAGTTTGTGTCTGTAAGATATTCTACGTTA
CTGTGTTGTGGTTGTTGTTGTTGTTTCCGGGGACCGGAACTTGTTCGCCGTGAAAATGTT
ATAGACATTAAATAATTCAACCGAAGAAGAATTACAATATGGC

QA 1 943 1 943
DS 

RD RR2CH61JQ 796 0 0
GATAGATTCTGTATCCAATTTGGAATGAACATTACTTTATCAGTAAATGATCTCTTAGCA
TGCTGTGGATTCCGTTGTGGTGACGGTTGTGACGGTGGCTACCCAATTTCTGCTTGGCGA
TACTTTTCCTACAGTGGTGTTGTCACTGAAGAGTGTGATCCATACTTTGATCAAACCGGA
TGCTCACACCCTGGCTGTGAACCTGCATACAATACACCGCAATGCCTGAGGAAATGCGTT
GGCAGAAACCAATTATGGAGCGAGTCAAAACATTACAGTGTTAATACATACGTTGTCGAG
TCTAATCCTCAAGATATCATGGCTGAGATTTACAAGAATGGACCTGTCGAAGTCTCTTTC
ACAGTTTATGAGGACTTTGCTCATTACAAATCTGGAGTGTACAGGCACATAACAGGTTCT
AACATTGGAGGTCATGCTGTGAAACTTATTGGTTGGGGAACTACTGATGATGGAGAAGAT
TATTGGTTGTTGGCAAATCAATGGAACAGAAGCTGGGGTGATGATGGTTATTTCATGATT
AGGAGAGGAACAAATGAATGTGGAATTGAAGATGAACCAGCGGGTGGTTTGCCTTCAACC
AAGAATGTGTTCAAGGTTACAACCGGTTCAGATGAGATTTCTGTTGCATCGGTTTAAGAT
AAGAGATGGAGAAGTTTGTGTCTGTAAGATATTCTATGTTACTGTGTTGTGGTTGTTGTT
GTTGTTTCCGGGGACCGGAACTTGTTCGCCGTGAAAATGTTATAGACATTAAATAGTTCA
ACCGAAGAAGAATTA
C

QA 1 795 1 795
DS 



CO CL585Contig2 1301 4 27 U
GGAGGGTTGCTTCTACAACGAGATCTTTTAATCTTCTAGGATTCCAAAAACCATGGCTGC
TGCTGATTCTACAACCAAACTCAGTTTGGTCTCTGTTGTCTTGCTCTTAGGCCTTGTCTC
CTCCTCTCTCGACTTGCAGGGAGTTGCAGCAGAGAATCTTACCAAACAGAAACTGAGCTC
GAAGATACTTCAGGAAGAGATAGTGAAGAAGGTCAACGAACACCCAAACGCTGGATGGAA
AGCTGCTATTAATGATCGTTTCTCTAACGCAACTGTAGCAGAGTTTAAGCGTCTCCTTGG
TGTTAAACCAACACCTAAGAAGTTACTCTTAGGTGTTCCTGTTGTAAGCCATGATCACTC
TCTGAAGTTACCGAAATCATTCGATGCTAGAACACATTGGCCTCAGTGCACCAGTATTGG
AAACATCTTAGATCAGGGACATTGTGGTTCTTGCTGGGCCTTTGGTGCTGTTGAATCACT
TTCTGATAGATTCTGTATCCAATTTGGAATGAACATTACTTTATCAGTAAATGACCTCTT
AGCATGCTGTGGTTTCCGTTGTGGTGACGGTTGTGACGGTGGCTACCCAATTTCTGCTTG
GCAATACTTTTCCTACAGTGGTGTTGTCACTGAAGAGTGTGATCCATACTTTGATCAAAC
CGGATGCTCACACCCTGGTTGTGAACCTGCATACAATACACCGCAATGCCTGAGGAA*TG
CGTTGGCAGAAACCAATTATGGAGCGAGTCAAA*CATTACAGTATTAATACATACGTTGT
CGAGTCTAATCCTCAAGACATCATGGCTGAGATTTACAAGAATGGACCTGTTGAAGTTTC
TTTCACAGTTTATGAGGACTTTGCTCATTACAAATTTGGAGTGTACAAGCACATAACAGG
TTCTAACATTGGAGGTCATGCTGTGAAACTTATTGGTTGGGGAACTACTGATGATGGAGA
AGATTATTGGTTGTTGGCAAATCAATGGAACAGAAGCTGGGGTGATGATGGTTATTTCAT
GATTAGGAGAGGAACTAATGAATGTGGAATTGAAGATGAACCAGTGGGTGGTTTGCCTTC
AACCAAGAATGTGTTCAAGGTTACAACCGGTTCAGATGAGATTTCTGTTGCATCGGTTTA
AGATAAGGGATGGAGAAGTTTGTGTCTGTAAGATATTCTATGTTACTGTGTTGTGGTTCT
TGTTGTTGTTTCCGGTGACCAGAACTTGTTCGCCGTGAAAATGTTATAGACATTAAATAA
TTCAACCCAAGAAGAATTATAATATGGTGAATTTGCTTTTT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2FL51TF U 1
AF RR2GK80TF U 1
AF RR2GK80JQ C 523
AF RR2FL51JQ C 878
BS 1 37 RR2FL51TF
BS 38 38 RR2GK80TF
BS 39 123 RR2FL51TF
BS 124 124 RR2GK80TF
BS 125 209 RR2FL51TF
BS 210 210 RR2GK80TF
BS 211 211 RR2FL51TF
BS 212 212 RR2GK80TF
BS 213 477 RR2FL51TF
BS 478 478 RR2GK80TF
BS 479 678 RR2FL51TF
BS 679 679 RR2GK80TF
BS 680 695 RR2FL51TF
BS 696 696 RR2GK80TF
BS 697 714 RR2FL51TF
BS 715 715 RR2GK80TF
BS 716 767 RR2FL51TF
BS 768 768 RR2GK80TF
BS 769 788 RR2FL51TF
BS 789 789 RR2GK80JQ
BS 790 795 RR2GK80TF
BS 796 796 RR2GK80JQ
BS 797 814 RR2GK80TF
BS 815 1217 RR2GK80JQ
BS 1218 1218 RR2FL51JQ
BS 1219 1298 RR2GK80JQ
BS 1299 1301 RR2FL51JQ

RD RR2FL51TF 789 0 0
GGAGGGTTGCTTCTACAACGAGATCTTTTAATCTTCTGGGATTCCAAAAACCATGGCTGC
TGCTGATTCTACAACCAAACTCAGTTTGGTCTCTGTTGTCTTGCTCTTAGGCCTTGTCTC
CTCGTCTCTCGACTTGCAGGGAGTTGCAGCAGAGAATCTTACCAAACAGAAACTGAGCTC
GAAGATACTTCAGGAAGAGATAGTGAAGATG*TCAACGAACACCCAAACGCTGGATGGAA
AGCTGCTATTAATGATCGTTTCTCTAACGCAACTGTAGCAGAGTTTAAGCGTCTCCTTGG
TGTTAAACCAACACCTAAGAAGTTACTCTTAGGTGTTCCTGTTGTAAGCCATGATCACTC
TCTGAAGTTACCGAAATCATTCGATGCTAGAACACATTGGCCTCAGTGCACCAGTATTGG
AAACATCTTAGATCAGGGACATTGTGGTTCTTGCTGGGCCTTTGGTGCTGTTGAATCGCT
TTCTGATAGATTCTGTATCCAATTTGGAATGAACATTACTTTATCAGTAAATGACCTCTT
AGCATGCTGTGGTTTCCGTTGTGGTGACGGTTGTGACGGTGGCTACCCAATTTCTGCTTG
GCAATACTTTTCCTACAGTGGTGTTGTCACTGAAGAGTGTGATCCATACTTTGATCAAAC
CGGATGCTCACACCCTGGCTGTGAACCTGCATACA*TACACCGCAATGCCTGAGAAA*TG
CGTTGGCAGAAACCAATTATGGAGCGAGTCAAA*CATTACAGTATTA*TACATACGTTGT
CGAGTCTA
T

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2GK80TF 817 0 0
GGAG
GGTTGCTTCTACAACGAGATCTTTTAATCTTCTAGGATTCCAAAAACCATGGCTGCTGCT
GATTCTACAACCAAACTCAGTTTGGTCTCTGTTGTCTTGCTCTTAGGCCTTGTCTCCTCC
TCTCTCGACTTGCAGGGAGTTGCAGCAGAGAATCTTACCAAACAGAAACTGAGCTCGAAG
ATACTTCAGGAAGAGATAGTGAAGAAGGTCAACGAACACCCAAACGCTGGATGGAAAGCT
GCTATTAATGATCGTTTCTCTAACGCAACTGTAGCAGAGTTTAAGCGTCTCCTTGGTGTT
AAACCAACACCTAAGAAGTTACTCTTAGGTGTTCCTGTTGTAAGCCATGATCACTCTCTG
AAGTTACCGAAATCATTCGATGCTAGAACACATTGGCCTCAGTGCACCAGTATTGGAAAC
ATCTTAGATCAGGGACATTGTGGTTCTTGCTGGGCCTTTGGTGCTGTTGAATCACTTTCT
GATAGATTCTGTATCCAATTTGGAATGAACATTACTTTATCAGTAAATGACCTCTTAGCA
TGCTGTGGTTTCCGTTGTGGTGACGGTTGTGACGGTGGCTACCCAATTTCTGCTTGGCAA
TACTTTTCCTACAGTGGTGTTGTCACTGAAGAGTGTGATCCATACTTTGATCAAACCGGA
TGCTCACACCCTGGTTGTGAACCTGCATACAATACACCGCAATGCCTGAGGAA*TGCGTT
GGCAGAAACCAATTATGGAGCGAGTCAAA*CATTACAGTATTAATACATACGTTGTCGAG
TCTA*TCCTCA*GACATCATGGCTGAGATT
ACA

QA 5 814 5 814
DS 

RD RR2GK80JQ 778 0 0
ATCAGTAAATGACCTCTTAGCATGCTGTGGTTTCCGTTGTGGTGACGGTTGTGACGGTGG
CTACCCAATTTCTGCTTGGCAATACTTTTCCTACAGTGGTGTTGTCACTGAAGAGTGTGA
TCCATACTTTGATCAAACCGGATGCTCACACCCTGGTTGTGAACCTGCATACAATACACC
GCAATGCCTGAGGAAATGCGTTGGCAGAAACCAATTATGGAGCGAGTCAAAACATTACAG
TATTAATACATACGTTGTCGAGTTTAATCCTCAAGACATCATGGCTGAGATTTACAAGAA
TGGACCTGTTGAAGTTTCTTTCACAGTTTATGAGGACTTTGCTCATTACAAATTTGGAGT
GTACAAGCACATAACAGGTTCTAACATTGGAGGTCATGCTGTGAAACTTATTGGTTGGGG
AACTACTGATGATGGAGAAGATTATTGGTTGTTGGCAAATCAATGGAACAGAAGCTGGGG
TGATGATGGTTATTTCATGATTAGGAGAGGAACTAATGAATGTGGAATTGAAGATGAACC
AGTGGGTGGTTTGCCTTCAACCAAGAATGTGTTCAAGGTTACAACCGGTTCAGATGAGAT
TTCTGTTGCATCGGTTTAAGATAAGGGATGGAGAAGTTTGTGTCTGTAAGATATTCTATG
TTACTGTGTTGTGGTTCTTGTTGTTGTTTCCGGTGGCCAGAACTTGTTCGCCGTGAAAAT
GTTATAGACATTAAATAATTCAACCCAAGAAGAATTATAATATGGTGAATTTGCTT
CG

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2FL51JQ 424 0 0
GGAGTGTACAAGCACATAACAGGTTTTAACATTGGAGGTCATGCTGTGAAACTTATTGGT
TGGGGAACTACTGATGATGGAGAAGATTATTGGTTGTTGGCAAATCAATGGAACAGAAGC
TGGGGTGATGATGGTTATTTCATGATTAGGAGAGGAACTAATGAATGTGGAATTGAAGAT
GAACCAGTGGGTGGTTTGCCTTCAACCAAGAATGTGTTCAAGGTTACAACCGGTTCAGAT
GAGATTTTTGTTGCATCGGTTTAAGATAAGGGATGGAGAAGTTTGTGTCTGTAAGATATT
TTATGTTACTGTGTTGTGGTTCTTGTTGTTGTTTCCGGTGACCAGAACTTGTTCGCCGTG
AAAATGTTATAGACATTAAATAATTCAACCCAAGAAGAATTATAATATGGTGAATTTGCT
TTTT

QA 1 424 1 424
DS 



AS 3 9

CO CL586Contig1 1453 5 11 U
CTTATGAGAAAGGGAATCCACATATAACTCCATCTGATATACAGAGTCTGATAGAGTTAA
TCAACACGGAGATGCAAAGCGACAACAACGGTAACAACACAAGAAGAACCCACTCAGATC
CTTTCTTTACGAGTACATTGCGTTACATAAGGTTCCAAAAACAGAAAGGTGGCTTGATTG
GTGACAAATATGACCTCATCAAGCTGTGACTTGTATCCTCCTCCACACAATCCTGAAATC
AAATATGGTGTCAACATTGAAAAGTATGTGTATACACACATGTTTGCTTTCTTCTCGGGT
CCATGACAAGCCTCTATATTTTATTCTCTTTGTTGCTAATACTCTCTGCGTGTATAGAAT
CCTCGTTTTCAATCTGTCTATGTCTCAATTTAAACGTCGTTTCTATGGTCCAAAGCTCAT
GACCATAAGTAGCAAAAACAAAAAAAAACATGGATTAAGAAGATTAGTCTACATAGTTAT
AGTACATCAACAACAACACACCAAAGAACTCATCCCTCTCTTTCTTACTGATTAGATTCT
CAACCGAACAAAGCCTGATAACAACCGAACTAGACAGTTTGCTGCTCTGAATCTTTTTTT
TT*CTCTTCTCTTTAGCTTCGTTTGTCACCTACCAAACTTTTTCTTGTTTTTTTTAAAAG
AGGAGATCTCACAAGAAAGCGCAACGATTCTTGTTCTTTTTCTTCTTCTTTGATTTGGGG
GGCTGAAGTACCACTTTTATAGCTGCGTCAAAGACTGCTTTCACGTTCTGCTGCGTCTTT
GAACTACATTCAATGTAAACAGGAGATCCTATCAGCTTCTTTAGTTCCTCTCCCTGGTTT
GTAGTAATCGGTACTGCACCGGGATGGTCTATGAAGAACTGCTTGTCATCTCGAAGATCG
AGTTTAGTTCCAACGAGGATGATAGGAACTCCAGGGGCGTAATGCCTAAGCTCAGGAATC
CACTTCTTGGCAATGTTCTCGTAGCTAGCTTTGCTGATAAGAGAGAAAGCAAGAATGAAG
ACATCTGCACCACGGTAACTCAATGGTCTTAACCTGTTATAGTCTTCTTGACCAGCTGTA
TCCCACAATCCAAGATTCACAGTGTTGCCATCTACAACCACGTTAGCACTGAAGTTGTCG
AACACTGTTGGAACATAGTCCGTAGGGAAAGTGTTGCTGGTGTAAGAGATCAGCATACAA
GTTTTTCCGACGGCGCCGTCGCCGACGGTGACACACTTAATGAACCTCGAAGCACTCATT
CTCCGCCGCTTATTCGAAAAAACAAAAAAAAACTTCTTCTTGACTTTTCTCTCCTCAAAC
CATTACCCAACAATCAAGTTTCTACTAACTCTAGAAGAAAAAAAGAAACCCTAAAATTCG
AATTGCAGAATGAACAATGAAGAAGGGATGTTAATGTTCAATGAGAGAGAATCAAAATGA
GAGAGATGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ36JQ U 1
AF RR2BH27JQ U 437
AF RR2BA55JQ U 439
AF RR2BH27TF C 652
AF RR2AQ36TF C 714
BS 1 542 RR2AQ36JQ
BS 543 543 RR2BH27JQ
BS 544 747 RR2AQ36JQ
BS 748 1118 RR2BH27JQ
BS 1119 1119 RR2BA55JQ
BS 1120 1191 RR2BH27JQ
BS 1192 1192 RR2BA55JQ
BS 1193 1223 RR2BH27JQ
BS 1224 1276 RR2BA55JQ
BS 1277 1447 RR2BH27TF
BS 1448 1453 RR2AQ36TF

RD RR2AQ36JQ 747 0 0
CTTATGAGAAAGGGAATCCACATATAACTCCATCTGATATACAGAGTCTGATAGAGTTAA
TCAACACGGAGATGCAAAGCGACAACAACGGTAACAACACAAGAAGAACCCACTCAGATC
CTTTCTTTACGAGTACATTGCGTTACATAAGGTTCCAAAAACAGAAAGGTGGCTTGATTG
GTGACAAATATGACCTCATCAAGCTGTGACTTGTATCCTCCTCCACACAATCCTGAAATC
AAATATGGTGTCAACATTGAAAAGTATGTGTATACACACATGTTTGCTTTCTTCTCGGGT
CCATGACAAGCCTCTATATTTTATTCTCTTTGTTGCTAATACTCTCTGCGTGTATAGAAT
CCTCGTTTTCAATCTGTCTATGTCTCAATTTAAACGTCGTTTCTATGGTCCAAAGCTCAT
GACCATAAGTAGCAAAAACAAAAAAAAACATGGATTAAGAAGATTAGTCTACATAGTTAT
AGTACATCAACAACAACACACCAAAGAACTCATCCCTCTCTTTCTTACTGATTAGATTCT
CAGCCGAACAAAGCCTGATAACAACCGAACTAGACAGTTTGCTGCTCTGAATCTTTTTTT
TT*CTCTTCTCTTTAGCTTCGTTTGTCACCTACCAAACTTTTTCTTGTTTTTTTTAAAAG
AGGAGATCTCACAAGAAAGCGCAACGATTCTTGTTCTTTTTCTTCTTCTTTGATTTGGGG
GGCTGAAGTACCACTTTTATAGCTGCG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2BH27JQ 787 0 0
GCC
AAAAAAAAACATGGATTAAGAAGATTAGTCTACATAGTTATAGTATATCAACAACAACAC
ACCAAAGAACTCATCCCTCTCTTTCTTACTGATTAGATTCTCAACCGAACAAAGCCTGAT
AACAACCGAACTAGACAGTTTGCTGCTCTGAATCTTTTTTTTTTCTCTTCTCTTTAGCTT
CGTTTGTCACCTACCAAACTTTTTCTTGTTTTTTTTAAAAGAGGAGATCTCACAAGAAAG
CGCAACGATTCTTGTTCTTTTTCTTCTTCTTTGATTTGGGGGGCTGAAGTACCATTTTTA
TAGCTGCGTCAAAGACTGCTTTCACGTTCTGCTGCGTCTTTGAACTACATTCAATGTAAA
CAGGAGATCCTATCAGCTTCTTTAGTTCCTCTCCCTGGTTTGTAGTAATCGGTACTGCAC
CGGGATGGTCTATGAAGAACTGCTTGTCATCTCGAAGATCGAGTTTAGTTCCAACGAGGA
TGATAGGAACTCCAGGGGCGTAATGCCTAAGCTCAGGAATCCACTTCTTGGCAATGTTCT
CGTAGCTAGCTTTGCTGATAAGAGAGAAAGCAAGAATGAAGACATCTGCACCACGGTAAC
TCAATGGTCTTAACCTGTTATAGTCTTCTTGACCAGCTGTATCCCACAATCCAAGATTCA
CAGTGTTGCCATCTACAACTACGTTAGCACTGAAGTTGTCGAACACTGTTGGAACATAGT
CCGTAGGGAAAGTGTTGCTGGTGTAAGAGATCGGCATACAAGTTTTTCCGACGGCGCCGT
CGCC

QA 4 787 4 787
DS 

RD RR2BA55JQ 838 0 0
A
AAAAAAAAACATGGATTAAGAAGATTAGTCTACATAGTTATAGTACATCAACAACAACAC
ACCAAAGAACTCATCCCTCTCTTTCTTACTGATTAGATTCTCAACCGAACAAAGCCTGAT
AACAACCGAACTAGACAGTTTGCTGCTCTGAATCTTTTTTTTT*CTCTTCTCTTTAGCTT
CGTTTGTCACCTACCAAACTTTTTCTTGTTTTTTTTAAAAGAGGAGATCTCACAAGAAAG
CGCAACGATTCTTGTTCTTTTTCTTCTTCTTTGATTTGGGGGGCTGAAGTACCACTTTTA
TAGCTGCGTCAAAGACTGCTTTCACGTTCTGCTGCGTCTTTGAACTACATTCAATGTAAA
CAGGAGATCCTATCAGCTTCTTTAGTTCCTCTCCCAGGTTTGTAGTAATCGGTACTGCAC
CGGGATGGTCTATGAAGAACTGCTTGTCATCTCGAAGATCGAGTTTAGTTCCAACGAGGA
TGATAGGAACTCCAGGGGCGTAATGCCTAAGCTCAGGAATCCACTTCTTGGCAATGTTCT
CGTAGCTAGCTTTGCTGATAAGAGAGAAAGCAAGAATGAAGACATCCGCACCACGGTAAC
TCAATGGTCTTAACCTGTTATAGTCTTCTTGACCAGCTGTATCCCACAATCCAAGATTCA
CAGTGTTGCCATCTACAACCACGTTAGCACTGAAGTTGTCGAAGACAGTTGGAACATAGT
CCGTAGGGAAAGTGTTGCTGGTGTAAGAGATCAGCATACAAGTTTTTCCGACGGCGCCGT
CGCCGACGGTGACACACTTAATGAACCTCGAAGCACTCATTCTCCGCCGCTTATTCG

QA 2 838 2 838
DS 

RD RR2BH27TF 798 0 0
TTTTAAAAGAGGAGATCTCACAAGAAAGCGCAACGATTCTTGTTCTTTTTCTTCTTCTTT
GATTTGGGGGGCTGAAGTACCATTTTTATAGCTGCGTCAAAGACTGCTTTCACGTTCTGC
TGCGTCTTTGAACTACATTCAATGTAAACAGGAGATCCTATCAGCTTCTTTAGTTCCTCT
CCCTGGTTTGTAGTAATCGGTACTGCACCGGGATGGTCTATGAAGAACTGCTTGTCATCT
CGAAGATCGAGTTTAGTTCCAACGAGGATGATAGGAACTCCAGGGGCGTAATGCCTAAGC
TCAGGAATCCACTTCTTGGCAATGTTCTCGTAGCTAGCTTTGCTGATAAGAGAGAAAGCA
AGAATGAAGACATCTGCACCACGGTAACTCAATGGTCTTAACCTGTTATAGTCTTCTTGA
CCAGCTGTATCCCACAATCCAAGATTCACAGTGTTGCCATCTACAACTACGTTAGCACTG
AAGTTGTCGAACACTGTTGGAACATAGTCCGTAGGGAAAGTGTTGCTGGTGTAAGAGATC
GGCATACAAGTTTTTCCGACGGCGCCGTCGCCGACGGTGACACACTTAATGAACCTCGAA
GCACTCATTCTCCGCCGCTTATTCGAAAAAACAAAAAAAAACTTCTTCTTGACTTTTCTC
TCCTCAAACCATTACCCAACAATCAAGTTTCTACTAACTCTAGAAGAAAAAAAGAAACCC
TAAAATTCGAATTGCAGAATGAACAATGAAGAAGGGATGTTAATGTTCAATGAGAGAGAA
TCAAAATGAGAGAGAT
CC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2AQ36TF 740 0 0
TTTGGGGGGCTGAAGTACCACTTTTATAGCTGCGTCAAAGACTGCTTTCACGTTCTGCTG
CGTCTTTGAACTACATTCAATGTAAACAGGAGATCCTATCAGCTTCTTTAGTTCCTCTCC
CTGGTTTGTAGTAATCGGTACTGCACCGGGATGGTCTATGAAGAACTGCTTGTCATCTCG
AAGATCGAGTTTAGTTCCAACGAGGATGATAGGAACTCCAGGGGCGTAATGCCTAAGCTC
AGGAATCCACTTCTTGGCAATGTTCTCGTAGCTAGCTTTGCTGATAAGAGAGAAAGCAAG
AATGAAGACATCTGCACCACGGTAACTCAATGGTCTTAACCTGTTATAGTCTTCTTGACC
AGCTGTATCCC*CAATCCAAGATTCACAGTGTTGCCATCTACAACCACGTTAGCACTGAA
GTTGTCGAACACTGTTGGAACATAGTCCGTAGGGAAAGTGTTGCTGGTGTAAGAGATCAG
CATACAAGTTTTTCCGACGGCGCCGTCGCCGACGGTGACACACTTAATGAACCTCGAAGC
ACTCATTCTCCGCCGCTTATTCGAAAAAACAAAAAAAAACTTCTTCTTGACTTTTCTCTC
CTCAAACCATTACCCAACAATCAAGTTTCTACTAACTCTAGAAGAAAAAAAGAAACCCTA
AAATTCGAATTGCAGAATGAACAATGAAGAAGGGATGTTAATGTTCAATGAGAGAGAATC
AAAATGAGAGAGATGAATCC

QA 1 740 1 740
DS 



CO CL586Contig2 722 2 7 U
GGAAACATTTTCTCATTCTTCTTTCATCAATCTCTCATTTGAGTTTCAAGGTTTTGCTAC
AGTTAGGGGAAAGGTTGTATCTTGATTTTTGGTAATGGCTGAGATTTGAGGAAGAAGAAG
AAGAAGAAGACTTTCATTTGTCCCTTTTTTATTTTGAAATTTGCGGCGGAGATGAGCGCT
TCGAGGTTCATAAAGTGTGTCACAGTCGGCGATGGTGCTGTCGGAAAAACATGTATGCTG
ATTTCTTACACCAGCAACACTTTCCCTACAGACTATGTTCCAACTGTTTTCGACAACTTC
AGTGCTAATGTCGTTGTAGATGGGAACACTGTGAATCTTGGATTGTGGGATACAGCCGGT
CAAGAAGACTATAACAGGTTAAGACCATTGAGTTACCGTGGTGCAGATGTCTTCATTCTT
GCTTTCTCTCTTATTAGCAAAGCTAGCTACGAGAACATAGCCAAGAAGTGGATTCCTGAG
CTCAGGCATTATGCCCCGGGAATTCCTATTATCCTCGTTGGAACAAAACTCGATCTTCGA
GATGACAAGCAGTTCTTCATAGACCATCCTGGTGCAGTGCCGATTACTACAAACCAGGGA
GAAGAACTAAAGAAACTGATAGGATCTCCGGTTTACATTGAGTGTAGTTCAAAGACTCAG
CAGAACGTTAAAGCAGTCTTTGACGCAGCTATAAAATGGTGCTTCAGCCACCGAATCAAA
GA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2FM31TF U 7
AF RR2BP45TF U 1
BS 1 169 RR2BP45TF
BS 170 170 RR2FM31TF
BS 171 269 RR2BP45TF
BS 270 270 RR2FM31TF
BS 271 311 RR2BP45TF
BS 312 312 RR2FM31TF
BS 313 722 RR2BP45TF

RD RR2FM31TF 449 0 0
T
TTTTCTCATTCTTCTTTCATCAATCTCTCATTTGAGTTTCAAGGTTTTGCTACAGTTAGG
GGAAAGGTTGTATCTTGATTTTTGGTAATGGCTGAGATTTGAGGAAGAAGAAGAAGAAGA
***CTTTCATTTGTCCCTTTTTTATTTTGAAATTTGCGGCGGAGATGAGCGCTTCGAGGT
TCATAAAGTGTGTCACAGTCGGCGATGGTGCTGTCGGAAAAACATGTATGCTGATTTCTT
ACACCAGCAACACTTTCCCTACAGACTATGTTCCAACTGTTTTCGACAACTTCAGTGCTA
ATGTCGTTGTAGATGGGAACACTGTGAATCTTGGATTGTGGGATACAGCCGGTCAAGAAG
ACTATAACAGGTTAAGACCATTGAGTTACCGTGGTGCAGATGTCTTCATTCTTGCTTTCT
CTCTTATTAGCAAAGCTAGCTACGAGAA

QA 2 449 2 449
DS 

RD RR2BP45TF 722 0 0
GGAAACATTTTCTCATTCTTCTTTCATCAATCTCTCATTTGAGTTTCAAGGTTTTGCTAC
AGTTAGGGGAAAGGTTGTATCTTGATTTTTGGTAATGGCTGAGATTTGAGGAAGAAGAAG
AAGAAGAAGACTTTCATTTGTCCCTTTTTTATTTTGAAATTTGCGGCGGGGATGAGCGCT
TCGAGGTTCATAAAGTGTGTCACAGTCGGCGATGGTGCTGTCGGAAAAACATGTATGCTG
ATTTCTTACACCAGCAACACTTTCCCTACGGACTATGTTCCAACTGTTTTCGACAACTTC
AGTGCTAATGTGGTTGTAGATGGGAACACTGTGAATCTTGGATTGTGGGATACAGCCGGT
CAAGAAGACTATAACAGGTTAAGACCATTGAGTTACCGTGGTGCAGATGTCTTCATTCTT
GCTTTCTCTCTTATTAGCAAAGCTAGCTACGAGAACATAGCCAAGAAGTGGATTCCTGAG
CTCAGGCATTATGCCCCGGGAATTCCTATTATCCTCGTTGGAACAAAACTCGATCTTCGA
GATGACAAGCAGTTCTTCATAGACCATCCTGGTGCAGTGCCGATTACTACAAACCAGGGA
GAAGAACTAAAGAAACTGATAGGATCTCCGGTTTACATTGAGTGTAGTTCAAAGACTCAG
CAGAACGTTAAAGCAGTCTTTGACGCAGCTATAAAATGGTGCTTCAGCCACCGAATCAAA
GA

QA 1 722 1 722
DS 



CO CL586Contig3 477 2 3 U
ACGATGATAAAATTAATTAAACCTCGTCTGTTAAAAGTACAAAAAGGTTTCCAGCAGCCT
TGTAAAAAAAGCATTAAGAGACTAGTCTACATAGAGGAAGTACAACAACAACACACCAAG
AACTCATCCCTTTCTCTTACTTAAACCTTGGCCTCACTTCAAATGACCACCAAGGCTGCA
TTTGATGCTACACTCTCTTCTTTTTCTTTGTCTCTACCAATATATCTTCATCATTTTTTT
AAAAGATGAGGTCACAATAAAACACAAAGACTCTTATTCAATTTCTTCTTCTTTTGATTC
GGTGGCTGAAGCACCATTTTTATAGCTGCGTCAAAAACTGCTTTAACGTTCTGCTGAGTC
TTTGAACTACACTCAATGTAAACCGGAAATCCTATCAGTTTCTTTAGTTCTTCTCCCTGG
TTTGTAGTAATCGGCACTGCACCTGGATGGTCTATGAAGAACTGCTTGTCATCTCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM31JQ U 1
AF RR2BP45JQ U 249
BS 1 375 RR2FM31JQ
BS 376 376 RR2BP45JQ
BS 377 477 RR2FM31JQ

RD RR2FM31JQ 477 0 0
ACGATGATAAAATTAATTAAACCTCGTCTGTTAAAAGTACAAAAAGGTTTCCAGCAGCCT
TGTAAAAAAAGCATTAAGAGACTAGTCTACATAGAGGAAGTACAACAACAACACACCAAG
AACTCATCCCTTTCTCTTACTTAAACCTTGGCCTCACTTCAAATGACCACCAAGGCTGCA
TTTGATGCTACACTCTCTTCTTTTTCTTTGTCTCTACCAATATATCTTCATCATTTTTTT
AAAAGATGAGGTCACAATAAAACACAAAGACTCTTATTCAATTTCTTCTTCTTTTGATTC
GGTGGCTGAAGCACCATTTTTATAGCTGCGTCAAAAACTGCTTTAACGTTCTGCTGAGTC
TTTGAACTACACTCAGTGTAAACCGGAAATCCTATCAGTTTCTTTAGTTCTTCTCCCTGG
TTTGTAGTAATCGGCACTGCACCTGGATGGTCTATGAAGAACTGCTTGTCATCTCGA

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2BP45JQ 195 0 0
AGGTCACAATAAAACACAAAGACTCTTATTCAATTTCTTCTTCTTTTGATTCGGTGGCTG
AAGCCCCATTTTTATAGCTGCGTCAAAAACTGCTTTAACGTTCTGCTGAGTCTTTGAACT
ACACTCAATGTAAACCGGAGATCCTATCAGTTTCTTTAGTTCTTCTCCCTGGTTTGTAGT
AATCGGCACTGCACC

QA 1 195 1 195
DS 



AS 2 10

CO CL587Contig1 839 2 3 U
GGATAAAAGATTGTACCATCGCATTAATTATTAAATCGTTTCAAGAAAAAGAAGAAGAAT
ATTTGGATGATATTGAATACTCTGAAAGCTCTCAACTTCTGGACACTCCCTCCAGGTTAT
TTAGTATTACTCAAAGGAATTGCTCTCAAACCAAGAAAGAGCAAGGATTCAATAGAATTT
GAAAGAAGTGACCATTCAGATGAACACTGCAACAGAAGTCAAAAGAATCACCAAGGTATC
TCCTGGCCATCCCATGCGAAGAACTTGCCGTTGTCTTGTTTCTTTGCATTGTTGATGATG
TGCAATAGTTTCTGAACAGAGTACTCTTTTGTGAAAAGCTTTCCTTCGGAAACATTCCTT
TGGAACGGTCGAGAGAGATCAGTGTCTACCGTGCCTGGATGCAGTAGAATGCATACCACA
GGATCCTTCTTCCTACCCAACTCAACCGATACATTCTTGGTCAATTGGTTGAGTGCAGTT
TTTGAAGCCCTATAAGAGTGCCAACCACCAATTTTGTTATCTCCAATGGATCCAACTCGG
GCGCTTAAATTGGCTACAACAGCAACCTCCCTCTCGGTTCCATTCCCTCCACCAGCCTTG
AGCAGTGGCCACATATGCTTCATCACTAGAATTGGACCAACCGCATTAACCTCATATGCG
AGCATCAATGATGATTTTTCAACCTTGTTCAATGTTGTTTCTGGCTGCAATACACCAGGA
ATTGAGAGTATGCCAGTGGCATTTATAAGCAAGTTGAGAGAACCATATCTTTCTCTTACA
GATTCCGCTGATTCCTCAATGGTAGTTTCATCTGTAACATCAAGTTTTTGTATGAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH45JQ U 69
AF RR2BV13JQ U 1
BS 1 504 RR2BV13JQ
BS 505 505 RR2DH45JQ
BS 506 839 RR2BV13JQ

RD RR2DH45JQ 552 0 0
GATATTGAATACTCTGAAAGCTCTCAACTTCTGGACACTCCCTCCAGGTTATTTAGTATT
ACTCAAAGGAATTGCTCTCAAACCAAGAAAGAGCAAGGATTCAATAGAATTTGAAAGAAG
TGACCATTCAGATGAACATTGCAACAGAAGTCAAAAGAATCACCAAGGTATCTCCTGGCC
ATCCCATGCGAAGAACTTGCCGTTGTCTTGTTTCTTTGCATTGTTGATGATGTGCAATAG
TTTCTGAACAGAGTACTCTTTTGTGAAAAGCTTTCCTTCGGGAACATTCCTTTGGAACGG
TCGAGAGAGATCAGTGTCTACCGTGCCTGGATGCAGTAGAATGCATACCACAGGATCCTT
CTTCCTACCCAACTCAACCGATACATTCTTGGTCAATTGGTTGAGTGCAGTTTTTGAAGC
CCTATAAGAGTGCCAACCACCAATTTTGTTATCTCCAATGGATCCAACTCGGGCGCTTAA
ATTGGCTACAACAGCAACCTCCCTCTCGGTTCCATTCCCTCCACCAGCCTTGAGCAGTGG
CCACATATGCTT

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2BV13JQ 839 0 0
GGATAAAAGATTGTACCATCGCATTAATTATTAAATCGTTTCAAGAAAAAGAAGAAGAAT
ATTTGGATGATATTGAATACTCTGAAAGCTCTCAACTTCTGGACACTCCCTCCAGGTTAT
TTAGTATTACTCAAAGGAATTGCTCTCAAACCAAGAAAGAGCAAGGATTCAATAGAATTT
GAAAGAAGTGACCATTCAGATGAACACTGCAACAGAAGTCAAAAGAATCACCAAGGTATC
TCCTGGCCATCCCATGCGAAGAACTTGCCGTTGTCTTGTTTCTTTGCATTGTTGATGATG
TGCAATAGTTTCTGAACAGAGTACTCTTTTGTGAAAAGCTTTCCTTCGGAAACATTCCTT
TGGAACGGTCGAGAGAGATCAGTGTCTACCGTGCCTGGATGCAGTAGAATGCATACCACA
GGATCCTTCTTCCTACCCAACTCAACCGATACATTCTTGGTCAATTGGTTGAGTGCAGTT
TTTGAAGCCCTATAAGAGTGCCAATCACCAATTTTGTTATCTCCAATGGATCCAACTCGG
GCGCTTAAATTGGCTACAACAGCAACCTCCCTCTCGGTTCCATTCCCTCCACCAGCCTTG
AGCAGTGGCCACATATGCTTCATCACTAGAATTGGACCAACCGCATTAACCTCATATGCG
AGCATCAATGATGATTTTTCAACCTTGTTCAATGTTGTTTCTGGCTGCAATACACCAGGA
ATTGAGAGTATGCCAGTGGCATTTATAAGCAAGTTGAGAGAACCATATCTTTCTCTTACA
GATTCCGCTGATTCCTCAATGGTAGTTTCATCTGTAACATCAAGTTTTTGTATGAAAAG

QA 1 839 1 839
DS 



CO CL587Contig2 1178 8 36 U
GGAAGTTTCCGTGTCAATGGCGATGAAAAGTGGTTGCCTTTATGATCCATCCTTTTTATC
ATAAATCTCACACATCCGAAAGATAGCATCCAACGCGCTACTCTTTCACAATGAACACTC
TGATGAAGACAGGTGGCGCGTGGCTTGTTTCGCCGTCGTTGGCAGCTGTGAGGAGGATGA
GTGTAGCTGGTTTCGCCACGTCATCATCATCTTCTTCCTTACCCAATTGGGAAGGTGGAG
TTTCCATGGTCCAAGGAGCTTCCAGAGGCATCGGCCTCGAGTTTGTAAGGCAGTTGCTAG
AGAATAGTAAGAAAGGACATGTTGTTGCCACTTGTCGGAATCCAAAAGAAGCAACAGACC
TCGTTAATCTCAAGAACAGCTTTTCTGAGAGGCTTTTCATACAAAAACTTGATGTTACAG
ATGAAACTACCATTGAGGAATCAGCGGAATCTGTAAGAGAAAGATATGGTTCTCTCAACT
TGCTTATAAATGCCACTGGCATACTCTCAATTCCTGGTGTACTGCAGCCAGAAACAACAT
TGAACAAGGTTGAGAAATCATCATTGATGCTTGCATATGAGGTTAATGCGGTTGGTCCAA
TTCTAGTAATGAAGCATATGTGGCCACTGCTTAAGGCTGGTGGAGGAAATGGAACCGAGA
GGGAAGTTGCTGTTGTAGCCAATTTAAGCGCACGAGTTGGATCCATTGGAGATAACAAAC
TTGGTGGTTGGCACTCTTACAGGGCTTCAAAAACCGCACTCAACCAATTGACGAAGAATG
TATCGGTTGAGTTGGGTAGG*AGGAAGGATCCTGTGGTATGCATTTTACTGCATCCAGGC
ACGGTAGACACTGATCTCTCTCGACCGTTCCAAAGGAATGTTCCTGAAGGTAAGCTTTTC
ACAAAAGAGTACTCTGTTCAGAAACTATTGCACATCATCACCAATGCAAAGAAACAAGAC
AACGGCAAGTTCTTCGCATGGGATGGCCAGGAGATACCTTGGTGATTCTTTTGACTTCTT
GTTATGTCCATCTATATGGTCACTTCTTTCAAATTCTATTGAATCCTTGGTCTTTCTTGG
TTTGAGAGCAATTCCTTTGAGTAATACTAAATAACCTGGAGTGAGTGTCCAGAAGTTGAG
AGCTTTCAGAGTATTCAATATCATCCAAATTTCTCGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH45TF U 1
AF RR2F727TF U 53
AF RR2AD73TF U 70
AF RR2GO96TF U 83
AF RR2BV13TF U 86
AF RR2GO96JQ C 671
AF RR2F727JQ C 369
AF RR2AD73JQ C 413
BS 1 143 RR2DH45TF
BS 144 144 RR2F727TF
BS 145 145 RR2DH45TF
BS 146 146 RR2F727TF
BS 147 178 RR2DH45TF
BS 179 179 RR2F727TF
BS 180 186 RR2DH45TF
BS 187 187 RR2F727TF
BS 188 217 RR2DH45TF
BS 218 219 RR2F727TF
BS 220 364 RR2DH45TF
BS 365 365 RR2F727TF
BS 366 521 RR2DH45TF
BS 522 522 RR2F727TF
BS 523 553 RR2DH45TF
BS 554 554 RR2F727TF
BS 555 571 RR2DH45TF
BS 572 572 RR2F727TF
BS 573 607 RR2DH45TF
BS 608 608 RR2F727TF
BS 609 631 RR2DH45TF
BS 632 632 RR2F727TF
BS 633 634 RR2DH45TF
BS 635 635 RR2AD73TF
BS 636 646 RR2DH45TF
BS 647 647 RR2F727TF
BS 648 657 RR2DH45TF
BS 658 714 RR2F727TF
BS 715 796 RR2AD73TF
BS 797 800 RR2GO96TF
BS 801 801 RR2F727JQ
BS 802 816 RR2GO96TF
BS 817 825 RR2F727JQ
BS 826 826 RR2AD73JQ
BS 827 1130 RR2F727JQ
BS 1131 1178 RR2AD73JQ

RD RR2DH45TF 657 0 0
GGAAGTTTCCGTGTCAATGGCGATGAAAAGTGGTTGCCTTTATGATCCATCCTTTTTATC
ATAAATCTCACACATCCGAAAGATAGCATCCAACGCGCTACTCTTTCACAATGAACACTC
TGATGAAGACAGGTGGCGCGTGGATAGTTTCGCCGTCGTTGGCAGCTGTGAGGAGGATAA
GTGTAGGTGGTTTCGCCACGTCATCATCATCTTCTTCTGTACCCAATTGGGAAGGTGGAG
TTTCCATGGTCCAAGGAGCTTCCAGAGGCATCGGCCTCGAGTTTGTAAGGCAGTTGCTAG
AGAATAGTAAGAAAGGACATGTTGTTGCCACTTGTCGGAATCCAAAAGAAGCAACAGACC
TCGTAAATCTCAAGAACAGCTTTTCTGAGAGGCTTTTCATACAAAAACTTGATGTTACAG
ATGAAACTACCATTGAGGAATCAGCGGAATCTGTAAGAGAAAGATATGGTTCTCTCAACT
TGCTTATAAATGCCACTGGCATACTCTCAATTCCTGGTGTATTGCAGCCAGAAACAACAT
TGAACAAGGTTGAAAAATCATCATTGATGCTCGCATATGAGGTTAATGCGGTTGGTCCAA
TTCTAGTGATGAAGCATATGTGGCCACTGCTCAA*GCTGGTGGAGGGAATGGAACCG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2F727TF 663 0 0
TTTTTATCTTAAATCTCACACATCCGAAAGATAGCATCCAACGCGCTACTCTTTCACAAT
GAACACTCTGATGAAGACAGGTGGCGCGTGGCTTGTTTCGCCGTCGTTGGCAGCTGTGAG
GAGGATGAGTGTAGCTGGTTTCGCCACGTCATCATCATCTTCTTCCTTACCCAATTGGGA
AGGTGGAGTTTCCATGGTCCAAGGAGCTTCCAGAGGCATCGGCCTCGAGTTTGTAAGGCA
GTTGCTAGAGAATAGTAAGAAAGGACATGTTGTTGCCACTTGTCGGAATCCAAAAGAAGC
AACAGACCTCGTTAATCTCAAGAACAGCTTTTCTGAGAGGCTTTTCATACAAAAACTTGA
TGTTACAGATGAAACTACCATTGAGGAATCAGCGGAATCTGTAAGAGAAAGATATGGTTC
TCTCAACTTGCTTATAAATGCCACTGGCATACTCTCAATTCCTGGTGTACTGCAGCCAGA
AACAACATTGAACAAGGTTGAGAAATCATCATTGATGCTTGCATATGAGGTTAATGCGGT
TGGTCCAATTCTAGTAATGAAGCATATGTGGCCACTGCTTAAAGCTGGTGGAGGAAATGG
AACCGAGAGGGAAGTTGCTGTTGTAGCCAATTTAAGCGCACGAGTTGGATCCATTGGAGA
TA
C

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2AD73TF 727 0 0
GG
ACATCCGAAAGATAGCATCCAACGCGCTACTCTTTCACAATGAACACTCTGATGAAGACA
GGTGGCGCGTGGCTTGTTTCGCCGTCGTTGGCAGCTGTGAGGAGGATGAGTGTAGCTGGT
TTCGCCACGTCATCATCATCTTCTTCCTTACCCAATTGGGAAGGTGGAGTTTCCATGGTC
CAAGGAGCTTCCAGAGGCATCGGCCTCGAGTTTGTAAGGCAGTTGCTAGAGAATAGTAAG
AAAGGACATGTTGTTGCCACTTGTCGGAATCCAAAAGAAGCAACAGACCTCGTTAATCTC
AAGAACAGCTTTTCTGAGAGGCTTTTCATACTAAAACTTGATGTTACAGATGAAACTACC
ATTGAGGAATCAGCGGAATCTGTAAGAGAAAGATATGGTTCTCTCAACTTGCTTATAAAT
GCCACTGGCATACTCTCAATTCCTGGTGTACTGCAGCCAGAAACAACGTTGAACAAGGTT
GAGAAATCATCATTGATGCTTGCATATGAGGTTAATGCGGTTGGTCCAATTCTAGTAATG
AAGCATATGTGGCCACTGCTTAAGGCTGGTGGAGGAAATGGAACCGAGAGGGAAGTTGCT
GTTGTAGCCAATTTAAGCGCACGAGTTGGATCCATTGGAGATAACAAACTTGGTGGTTGG
CACTCTTACAGGGCTTCAAAAACCGCACTCAACCAATTGACGAAGAATGTATCGGTTGAG
TTGGG

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR2GO96TF 734 0 0
GG
AGCATCCAACGCGCTACTCTTTCACAATGAACACTCTGATGAAGACAGGTGGCGCGTGGC
TTGTTTCGCCGTCGTTGGCAGCTGTGAGGAGGATGAGTGTAGCTGGTTTCGCCACGTCAT
CATCATCTTCTTCCTTACCCAATTGGGAAGGTGGAGTTTCCATGGTCCAAGGAGCTTCCA
GAGGCATCGGCCTCGAGTTTGTAAGGCAGTTGCTAGAGAATAGTAAGAAAGGACATGTTG
TTGCCACTTGTCGGAATCCAAAAGAAGCAACAGACCTCGTTAATCTCAAGAACAGCTTTT
CTGAGAGGCTTTTCATACAAAAACTTGATGTTACAGATGAAACTACCATTGAGGAATCAG
CGGAATCTGTAAGAGAAAGATATGGTTCTCTCAACTTGCTTATAAATGCCACTGGCATAC
TCTCAATTCCTGGTGTACTGCAGCCAGAAACAACATTGAACAAGGTTGAGAAATCATCAT
TGATGCTTGCATATGAGGTTAATGCGGTTGGTCCAATTCTAGTAATGAAGCATATGTGGC
CACTGCTTAAGGCTGGTGGAGGAAATGGAACCGAGAGGGAAGTTGCTGTTGTAGCCAATT
TAAGCGCACGAGTTGGATCCATTGGAGATAACAAACTTGGTGGTTGGCACTCTTACAGGG
CTTCAAAAACCGCACTCAACCAATTGACGAAGAATGTATCGGTTGAGTTGGGTAGGGAGG
AAGGATCCTGTG

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR2BV13TF 725 0 0
GG
ATCCAACGCGCTACTCTTTCACAATGAACACTCTGATGAAGACAGGTGGCGCGTGGATTG
TTTCGCCGTCGTTGGCAGCTGTGAGGAGGATGAGTGTAGGTGGTTTCGCCACGTCATCAT
CATCTTCTTCTGTACCCAATTGGGAAGGTGGAGTTTCCATGGTCCCAGGAGCTTCCAGAG
GCATCGGCCTCGAGTTTGTAAGGCAGTTGCTAGAGAATAGTAAGAAAGGACATGTTGTTG
CCACTTGTCGGAATCCAAAAGAAGCAACAGACCTCGTAAATCTCAAGAACAGCTTTTCTG
AGAGGCTTTTCATACAAAAACTTGATGTTACAGATGAAACTACCATTGAGGAATCAGCGG
AATCTGTAAGAGAAAGATATGGTTCTCTCAACTTGCTTATAAATGCCACTGGCATACTCT
CAATTCCTGGTGTATTGCAGCCAGAAACAACATTGAACAAGGTTGAAAAATCATCATTGA
TGCTCGCATATGAGGTTAATGCGGTTGGTCCAATTCTAGTGATGAAGCATATGTGGCCAC
TGCTCAAGGCTGGTGGAGGGAATGGAACCGAGAGGGAGGTTGCTGTTGTAGCCAATTTAA
GCGCCCGAGTTGGATCCATTGGAGATAACAAAATTGGTGATTGGCACTCTTATAGGGCTT
CAAAA*CTGCACTCAACCAATTGACCAAGAATGTATCGGTTGAGTTGGGTAGGAAGAAG
ATCC

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR2GO96JQ 253 0 0
TGTTGTAGCCAATTTAAGCGCACGAGTTGGATCCATTGGAGATAACAAACTTGGTGGTTG
GCACTTTTACAGGGCTTCAAAAACCGCACTCAACCAATTGACGAAGAATGTTTCGGTTGA
GTTGGGTAGG*AGGAAGGATCCTGTGGTATGCATTTTACTGCATCCAGGCACGGTAGACA
CTGATCTTTTTCGACCGTTCCAAAGGAATGTTCCTGAAGGTAAGCTTTTCACAAAAGAGT
ACTTTGTTCAGAA

QA 1 253 1 253
DS 

RD RR2F727JQ 762 0 0
CTCAAGAACAGCTTTTCTGAGAGGCTTTTCATACAAAAACTTGATGTTACAGATGAAACT
ACCATTGAGGAATCAGCGGAATCTGTAAGAGAAAGATATGGTTCTCTCAACTTGCTTATA
AATGCCACTGGCATACTCTCAATTCCTGGTGTACTGCAGCCAGAAACAACATTGAACAAG
GTTGAGAAATCATCATTGATGCTTGCATATGAGGTTAATGCGGTTGGTCCAATTCTAGTA
ATGAAGCATATGTGGCCACTGCTTAAGGCTGGTGGAGGAAATGGAACCGAGAGGGAAGTT
GCTGTTGTAGCCAATTTAAGCGCACGAGTTGGATCCATTGGAGATAACAAACTTGGTGGT
TGGCACTCTTACAGGGCTTCAAAAACCGCACTCAACCAATTGACGAAGAATGTATCGGTT
GAGTTGGGTAGG*AGGAAGGATCCTGTGGTATGCATTCTACTGCATCCAGGCACGGTAGA
CACTGATCTCTCTCGACCGTTCCAAAGGAATGTTCCTGAAGGTAAGCTTTTCACAAAAGA
GTACTCTGTTCAGAAACTATTGCACATCATCACCAATGCAAAGAAACAAGACAACGGCAA
GTTCTTCGCATGGGATGGCCAGGAGATACCTTGGTGATTCTTTTGACTTCTTGTTATGTC
CATCTATATGGTCACTTCTTTCAAATTCTATTGAATCCTTGGTCTTTCTTGGTTTGAGAG
CAATTCCTTTGAGTAATACTAAATAACCTGGAGTGAGTGTCC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2AD73JQ 766 0 0
TGTTACAGATGAAACTACCATTGAGGAATCAGCGGAATCTGTAAGAGAAAGATATGGTTC
TCTCAACTTGCTTATAAATGCCACTGGCATACTCTCAATTCCTGGTGTACTGCAGCCAGA
AACAACGTTGAACAAGGTTGAGAAATCATCATTGATGCTTGCATATGAGGTTAATGCGGT
TGGTCCAATTCTAGTAATGAAGCATATGTGGCCACTGCTTAAGGCTGGTGGAGGAAATGG
AACCGAGAGGGAAGTTGCTGTTGTAGCCAATTTAAGCGCACGAGTTGGATCCATTGGAGA
TAACAAACTTGGTGGTTGGCACTCTTACAGGGCTTCAAAAACCGCACTCAACCAATTGAC
GAAGAATGTATCGGTTGAGTTGGGTAGG*AGGAAGGATCCTGTGGTATGCATTTTACTGC
ATCCAGGCACGGTAGACACTGATCTCTCTCGACCGTTCCAAAGGAATGTTCCTGAAGGTA
AGCTTTTCACAAAAGAGTACTCTGTTCAGAAACTATTGCACATCATCACCAATGCAAAGA
AACAAGACAACGGCAAGTTCTTCGCATGGGATGGCCAGGAGATACCTTGGTGATTCTTTT
GACTTCTTGTTATGTCCATCTATATGGTCACTTCTTTCAAGTTCTATTGAATCCTTGGTC
TTTCTTGGTTTGAGAGCAATTCCTTTGAGTAATACTAAATAACCTGGAGTGAGTGTCCAG
AAGTTGAGAGCTTTCAGAGTATTCAATATCATCCAAATTTCTCGAG

QA 1 766 1 766
DS 



AS 2 10

CO CL588Contig1 713 4 7 U
GGATCCAACACAAGAAATCATATTCAGCAAACCAAGAAAAAAGAAACTAAAGATGAACTT
CCTCTCCGATCAGGTAAAGAAATTCTCCGACTCCAAACCAGAGGAGCCAGACCACAACAA
GCCCGCCGAAGGAACCGAAACAACCAACAGACCAGCTTCATCCTCCGAGCTCATGGCCAG
TGCCAAGGTCGTAGCCGAAGCTGCTCAAGCCGCTGCTCGTAACGAGTCAGACAAACTCGA
CAAGGCTAAAGTCGCCGGAGCCAGCGCTGATATCTTAGATGCCGCCCAAAAATACGGAAA
GCTCGATGAGAAGAGCGGCACTGGTCAGTACATAGAGAAGGCCGAGAAGCATCTAAACGA
CTTCGAGTCCTCACATTCCTCCGGCGCCGCCGGTACTCCTCCCCCGGCTGCCGGTGCTCC
TCCTCCGGCAAGTCAGGCTGAACCGGAAGCTAAGAAGCCCGAAGAGGAGTCTGGTGGTGG
CTTGGGAGGTTATGCTAAGATGGCTCAAGGTTTCATGAAGTGATTATTGATCTTTGCTAA
TTGTTATTATATCGTGTATTAATAAATTTAAATAAGTACGTACGTTTAGTATAAAACTAA
ATAACTAAGTACTGTACCTAAGAAATCATGATGTATCGTTTTAGTATGGGGAGCGGATGT
AATCTATCTTTGTCATTGTTATGTCCTTAATCTATCTATATTTGCTGTGATGG


BQ
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR2BR83JQ C 1
AF RR2GT95JQB C 165
AF RR2GT95TF U -1
AF RR2BR83TF U 1
BS 1 2 RR2BR83TF
BS 3 327 RR2GT95TF
BS 328 328 RR2BR83TF
BS 329 704 RR2GT95TF
BS 705 705 RR2BR83TF
BS 706 712 RR2GT95TF
BS 713 713 RR2BR83JQ

RD RR2BR83JQ 713 0 0
GGATCCAACACAAGAAATCATATTCAGCAAACCAAGAAAAAAGAAACTAAAGATGAACTT
CCTCTCCGATCAGGTAAAGAAATTCTCCGACTCCAAACCAGAGGAGCCAGACCACAACAA
GCCCGCCGAAGGAACCGAAACAACCAACAGACCAGCTTCATCCTCCGAGCTCATGGCCAG
TGCCAAGGTCGTAGCCGAAGCTGCTCAAGCCGCTGCTCGTAACGAGTCAGACAAACTCGA
CAAGGCTAAAGTCGCCGGAGCCAGCGCTGATATCTTAGATGCCGCCCAAAAATACGGAAA
GCTCGATGAGAAGAGCGGCACTGGTCAGTACATAGAGAAGGCCGAGAAGTATCTAAACGA
CTTCGAGTCCTCACATTCCTCCGGCGCCGCCGGTACTCCTCCCCCGGCTGCCGGTGCTCC
TCCTCCGGCAAGTCAGGCTGAACCGGAAGCTAAGAAGCCCGAAGAGGAGTCTGGTGGTGG
CTTGGGAGGTTATGCTAAGATGGCTCAAGGTTTCATGAAGTGATTATTGATCTTTGCTAA
TTGTTATTATATCGTGTATTAATAAATTTAAATAAGTACGTACGTTTAGTATAAAACTAA
ATAACTAAGTACTGTACCTAAGAAATCATGATGTATCGTTTTAGTATGGGGAGCGGATGT
AATCTATCTTTGTCATTGTTATGTCCTTAATCTATCTATATTTGCTGTGATGG

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2GT95JQB 549 0 0
CCGAGCTCATGGCCAGTGCCAAGGTCGTAGCCGAAGCTGCTCAAGCCGCTGCTCGTAACG
AGTCAGACAAACTCGACAAGGCTAAAGTCGCCGGAGCCAGCGCTGATATCTTAGATGCCG
CCCAAAAATACGGAAAGCTCGATGAGAAGAGCGGCACTGGTCATTACATAGAGAAGGCCG
AGAAGCATCTAAACGACTTCGAGTCCTCACATTCCTCCGGCGCCGCCGGTACTCCTCCCC
CGGCTGCCGGTGCTCCTCCTCCGGCAAGTCAGGCTGAACCGGAAGCTAAGAAGCCCGAAG
AGGAGTCTGGTGGTGGCTTGGGAGGTTATGCTAAGATGGCTCAAGGTTTCATGAAGTGAT
TATTGATCTTTGCTAATTGTTATTATATCGTGTATTAATAAATTTAAATAAGTACGTACG
TTTAGTATAAAACTAAATAACTAAGTACTGTACCTAAGAAATCATGATGTATCGTTTTAG
TATGGGGAGCGGATGTAATCTATCTTTGTCATTGTTATGTCCTTAATCTATCTATATTTG
TTGTGATG
C

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2GT95TF 715 0 0
GGAC
ATCCAACACAAGAAATCATATTCAGCAAACCAAGAAAAAAGAAACTAAAGATGAACTTCC
TCTCCGATCAGGTAAAGAAATTCTCCGACTCCAAACCAGAGGAGCCAGACCACAACAAGC
CCGCCGAAGGAACCGAAACAACCAACAGACCAGCTTCATCCTCCGAGCTCATGGCCAGTG
CCAAGGTCGTAGCCGAAGCTGCTCAAGCCGCTGCTCGTAACGAGTCAGACAAACTCGACA
AGGCTAAAGTCGCCGGAGCCAGCGCTGATATCTTAGATGCCGCCCAAAAATACGGAAAGC
TCGATGAGAAGAGCGGCACTGGTCATTACATAGAGAAGGCCGAGAAGCATCTAAACGACT
TCGAGTCCTCACATTCCTCCGGCGCCGCCGGTACTCCTCCCCCGGCTGCCGGTGCTCCTC
CTCCGGCAAGTCAGGCTGAACCGGAAGCTAAGAAGCCCGAAGAGGAGTCTGGTGGTGGCT
TGGGAGGTTATGCTAAGATGGCTCAAGGTTTCATGAAGTGATTATTGATCTTTGCTAATT
GTTATTATATCGTGTATTAATAAATTTAAATAAGTACGTACGTTTAGTATAAAACTAAAT
AACTAAGTACTGTACCTAAGAAATCATGATGTATCGTTTTAGTATGGGGAGCGGATGTAA
TCTATCTTTGTCATTGTTATGTCCTTAATCTATCTATATTTGTTGTGATG
C

QA 5 714 5 714
DS 

RD RR2BR83TF 713 0 0
GGATCCAACACAAGAAATCATATTCAGCAAACCAAGAAAAAAGAAACTAAAGATGAACTT
CCTCTCCGATCAGGTAAAGAAATTCTCCGACTCCAAACCAGAGGAGCCAGACCACAACAA
GCCCGCCGAAGGAACCGAAACAACCAACAGACCAGCTTCATCCTCCGAGCTCATGGCCAG
TGCCAAGGTCGTAGCCGAAGCTGCTCAAGCCGCTGCTCGTAACGAGTCAGACAAACTCGA
CAAGGCTAAAGTCGCCGGAGCCAGCGCTGATATCTTAGATGCCGCCCAAAAATACGGAAA
GCTCGATGAGAAGAGCGGCACTGGTCAGTACATAGAGAAGGCCGAGAAGTATCTAAACGA
CTTCGAGTCCTCACATTCCTCCGGCGCCGCCGGTACTCCTCCCCCGGCTGCCGGTGCTCC
TCCTCCGGCAAGTCAGGCTGAACCGGAAGCTAAGAAGCCCGAAGAGGAGTCTGGTGGTGG
CTTGGGAGGTTATGCTAAGATGGCTCAAGGTTTCATGAAGTGATTATTGATCTTTGCTAA
TTGTTATTATATCGTGTATTAATAAATTTAAATAAGTACGTACGTTTAGTATAAAACTAA
ATAACTAAGTACTGTACCTAAGAAATCATGATGTATCGTTTTAGTATGGGGAGCGGATGT
AATCTATCTTTGTCATTGTTATGTCCTTAATCTATCTATATTTGCTGTGATG
G

QA 1 712 1 712
DS 



CO CL588Contig2 755 6 9 U
CGGTTTATAAACACCAAAACGTTTAGCATATACTACATCACAACAAATATAGATAGATTA
AAAAGACATAACAATGACAAAGATAGATTACATCCGCTCCCCATACTAAAACGATACATC
ATGATTTCTTACGTACTTAGTTATTTAGTTTTATATTCCATACTAAACGTACGTACTTAT
TTAAATTTATTAATCCACGATATAATAACAATTAACAAAGATCAATAATCACTTCATGAA
ACCTTGAGCCATCTTAGCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGGCTTCTT
AGCTTCCGGTTCAGCCTCACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCAGCCGGGGGAGGAGTACC
GGCTGCGCCGGAGGAATGTGAGGACTCGAAGTCGTTTAGATACTTCTCGGCCTTCTCTAT
GTACTGACCAGCGCCGCTCTTCTCATCGAGCTTTCCGTATTTCTGGGCGGCATCTAAGAT
GTCAGCGCTGGCTCCGGCGACTTTAGCCTTGTCGAGTTTGTCTGACTCGTTACGAGCAGC
GGCTTGAGCAGCTTCGGCTACGACCTTGGCACTGGTCATGAGCTCGGAGGATGAAGCTGG
TCTGTGGGTTGTTTCGGTTCCTTCGGCGGGCTTGTTGTGGTCTGGCTCCTCTGGTTTGGA
GTCGGAGAATTTCTTTACCTGATCGGAGAGGAAGTTCATCTTTCGTTTTTCTTTTTTTTC
TTTGTTTGCTGAATTTGATCTCTTGTGTTGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 

AF RR2GT39JQB U 1
AF RR2FW35JQ U 25
AF RR2H382JQ U 36
AF RR2H382TF C 37
AF RR2GT39TF C 47
AF RR2FW35TF C 63
BS 1 121 RR2GT39JQB
BS 122 122 RR2FW35JQ
BS 123 624 RR2GT39JQB
BS 625 625 RR2FW35JQ
BS 626 645 RR2GT39JQB
BS 646 646 RR2FW35JQ
BS 647 660 RR2GT39JQB
BS 661 663 RR2FW35JQ
BS 664 755 RR2H382JQ

RD RR2GT39JQB 660 0 0
CGGTTTATAAACACCAAAACGTTTAGCATATACTACATCACAACAAATATAGATAGATTA
AAAAGACATAACAATGACAAAGATAGATTACATCCGCTCCCCATACTAAAACGATACATC
ACGATTTCTTACGTACTTAGTTATTTAGTTTTATATTCCATACTAAACGTACGTACTTAT
TTAAATTTATTAATCCACGATATAATAACAATTAACAAAGATCAATAATCACTTCATGAA
ACCTTGAGCCATCTTAGCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGGCTTCTT
AGCTTCCGGTTCAGCCTCACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCAGCCGGGGGAGGAGTACC
GGCTGCGCCGGAGGAATGTGAGGACTCGAAGTCGTTTAGATACTTCTCGGCCTTCTCTAT
GTACTGACCAGCGCCGCTCTTCTCATCGAGCTTTCCGTATTTCTGGGCGGCATCTAAGAT
GTCAGCGCTGGCTCCGGCGACTTTAGCCTTGTCGAGTTTGTCTGACTCGTTACGAGCAGC
GGCTTGAGCAGCTTCGGCTACGACCTTGGCACTGGTCATGAGCTCGGAGGATGAAGCTGG
TCTGTGGGTTGTTTCGGTTCCTTCAGCGGGCTTGTTGTGGTCTGGTTCCTCTGGTTTGGA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2FW35JQ 639 0 0
AGCATATACTACATCACAACAAATATAGATAGATTAAAAAGACATAACAATGACAAAGAT
AGATTACATCCGCTCCCCATACTAAAACGATACATCATGATTTCTTACGTACTTAGTTAT
TTAGTTTTATATTCCATACTAAACGTACGTACTTATTTAAATTTATTAATCCACGATATA
ATAACAATTAACAAAGATCAATAATCACTTCATGAAACCTTGAGCCATCTTAGCATAACC
TCCCAAGCCACCACCAAACTCCTCTTCGGGCTTCTTAGCTTCCGGTTCAGCCTCACTTGC
CGGAGGAGGAGCACCGGCAGCCGGGGGAGGAGTACCGGCTGCCCCGGAGGAATGTGAGGA
CTCGAAGTCGTTTAAATACTTCTCGGCCTTCTCTATGTACTGACCAGCGCCGCTCTTCTC
ATCGAGCTTTCCGTATTTCTGGGCGGCATCTAAAATGTCAGCGCTGGCTCCGGCGACTTT
AGCCTTGTCGAGTTTGTCTGACTCGTTACGAGCAGCGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACGAC
CTTGGCACTGGTCATGAGCTCGGAGGATGAAGCTGGTCTGTGGGTTGTTTCGGTTCCTTC
GGCGGGCTTGTTGTGGTCTGGCTCCTCTGGTTTGGAGTC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2H382JQ 720 0 0
CATCACAACAAATATAGATAGATTAAAAAGACATAACAATGACAAAGATAGATTACATCC
GCTCCCCATACTAAAACGATACATCATGATTTCTTACGTACTTAGTTATTTAGTTTTATA
TTCCATACTAAACGTACGTACTTATTTAAATTTATTAATCCACGATATAATAACAATTAA
CAAAGATCAATAATCACTTCATGAAACCTTGAGCCATCTTAGCATAATCTCCCAAGCCAC
CACCAGACTCCTCTTCGGGCTTCTTAGCTTCCGGTTCAGCCTCACTTGCCGGAGGAGGAG
CACCGGCAGCCGGGGGAGGAGTACCGGCTGCGCCGGAGGAATGTGAGGACTCGAAGTCGT
TTAAATACTTCTCGGCCTTCTCTATGTACTGACCAGCGCCGCTCTTCTCATCGAGCTTTC
CGTATTTCTGGGCGGCATCTAAAATGTCAGCGCTGGCTCCGGCGACTTTAGCCTTGTCGA
GTTTGTCTGACTCGTTACGAGCAGCGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACGACCTTGGCACTGG
TCATGAGCTCGGAGGATGAAGCTGGTCTGTGGGTTGTTTCGGTTCCTTCGGCGGGCTTGT
TGTGGTCTGGCTCCTCTGGTTTGGAGTCGGAGAATTTCTTTACCTGATCGGAGAGGAAGT
TCATCTTTCGTTTTTCTTTTTTTTCTTTGTTTGCTGAATTTGATCTCTTGTGTTGGATCC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2H382TF 719 0 0
CATCAC
ACAAATATAGATAGATTAAAA*GACATAACAATGACAAAGATAGATTACATCCGCTCCCC
ATACTAAAACGATACATCATGATTTCTTACGTACTTAGTTATTTAGTTTTATATTCCATA
CTAAACGTACGTACTTATTTAAATTTATTAATCCACGATATAATAACAATTAACAAAGAT
CAATAATCACTTCATGAAACCTTGAGCCATCTTAGCATAATCTCCCAAGCCACCACCAGA
CTCCTCTTCGGGCTTCTTAGCTTCCGGTTCAGCCTCACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGC
AGCCGGGGGAGGAGTACCGGCTGCGCCGGAGGAATGTGAGGACTCGAAGTCGTTTAGATA
CTTCTCGGCCTTCTCTATGTACTGACCAGCGCCGCTCTTCTCATCGAGCTTTCCGTATTT
CTGGGCGGCATCTAAGATGTCAGCGCTGGCTCCGGCGACTTTAGCCTTGTCGAGTTTGTC
TGACTCGTTACGAGCAGCGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACGACCTTGGCACTGGTCATGAG
CTCGGAGGATGAAGCTGGTCTGTGGGTTGTTTCGGTTCCTTCGGCGGGCTTGTTGTGGTC
TGGCTCCTCTGGTTTGGAGTCGGAGAATTTCTTTACCTGATCGGAGAGGAAGTTCATCTT
TCGTTTTTCTTTTTTTTCTTTGTTTGCTGAATTTGATCTCTTGTGTTGGATCC

QA 7 719 7 719
DS 

RD RR2GT39TF 711 0 0
ATATAGATAGATTAAAA*GACATAACAATGACAAAGATAGATTACATCCGCTCCCCATAC
TAAAACGATACATCACGATTTCTTACGTACTTAGTTATTTAGTTTTATATTCCATACTAA
ACGTACGTACTTATTTAAATTTATTAATCCACGATATAATAACAATTAACAAAGATCAAT
AATCACTTCATGAAACCTTGAGCCATCTTAGCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCC
TCTTCGGGCTTCTTAGCTTCCGGTTCAGCCTCACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCAGCC
GGGGGAGGAGTACCGGCTGCGCCGGAGGAATGTGAGGACTCGAAGTCGTTTAGATACTTC
TCGGCCTTCTCTATGTACTGACCAGCGCCGCTCTTCTCATCGAGCTTTCCGTATTTCTGG
GCGGCATCTAAGATGTCAGCGCTGGCTCCGGCGACTTTAGCCTTGTCGAGTTTGTCTGAC
TCGTTACGAGCAGCGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACGACCTTGGCACTGGTCATGAGCTCG
GAGGATGAAGCTGGTCTGTGGGTTGTTTCGGTTCCTTCAGCGGGCTTGTTGTGGTCTGGT
TCCTCTGGTTTGGAGTCGGAGAATTTCTTTACCTGATCGGAGAGGAAGTTCATCTTTCGT
TTTTCTTTTTTTTCTTTGTTTGCTGAATTTGATCTCTTGTGTTGGAT
GTCC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2FW35TF 693 0 0
AAGACATAACAATGACAAAGATAGATTACATCCGCTCCCCATACTAAAACGATACATCAT
GATTTCTTACGTACTTAGTTATTTAGTTTTATATTCCATACTAAACGTACGTACTTATTT
AAATTTATTAATCCACGATATAATAACAATTAACAAAGATCAATAATCACTTCATGAAAC
CTTGAGCCATCTTAGCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGGCTTCTTAG
CTTCCGGTTCAGCCTCACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCAGCCGGGGGAGGAGTACCGG
CTGCGCCGGAGGAATGTGAGGACTCGAAGTCGTTTAGATACTTCTCGGCCTTCTCTATGT
ACTGACCAGCGCCGCTCTTCTCATCGAGCTTTCCGTATTTCTGGGCGGCATCTAAGATGT
CAGCGCTGGCTCCGGCGACTTTAGCCTTGTCGAGTTTGTCTGACTCGTTACGAGCAGCGG
CTTGAGCAGCTTCGGCTACGACCTTGGCACTGGTCATGAGCTCGGAGGATGAAGCTGGTC
TGTGGGTTGTTTCGGTTCCTTCGGCGGGCTTGTTGTGGTCTGGCTCCTCTGGTTTGGAGT
CGGAGAATTTCTTTACCTGATCGGAGAGGAAGTTCATCTTTCGTTTTTCTTTTTTT*CTT
TGTTTGCTGAATTTGATCTCTTGTGTTGGATCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 2 8

CO CL589Contig1 850 4 18 U
AATTTGACTTTACGAGTAAAAATCATATGAAACAGAAGAGACCTCAAAACAGTTTAAAGA
CGTAGTCTGATAAACAAACAAACAATCCATTCAAAAAAAAAAAAAAGCTTCAAGCATCTG
ACTTTTGCTTTACGAACTGCAAGGATAATCAAAGTTTTATGTTTTATTAGAAGAGATAAA
AGAAAACAGATTGTTCTTCGGTCGCTCACTCACTCTTCTTCCTCAGCCTCTTCCAGCCAG
TTCACAAACGGCTCCAATCCCTTCACAAACGTTTGCCTGCCCTTAGGGTTGCTCCCTTTG
CGATACCAATGGAGAATAGTGTCTTCAGCAAGCACATCAAGCTCATACAAAGACCTCACT
ACCTCTGGAAACACCTTCATCAGCTTTGCATCCTCATAGCATTGCATCTGTACTTTGTAC
ATCAGCTCCATCTCCATTTTCCCGTTGCTGCAGAACGTGTTCAGAAGCGGTGCCCATGTC
TTCACTTGGCGTAACACAGAGTTCGAGTTTTGCTGCTGGTTTTTACCAGACCACTGAACA
GCATCCATTATCCCGTCCCAGATGACACGCACAACCTCAATCTCTGGCAGTTTAGCATCT
TTCACCTGTTGCTTCACCGTTTCAATCACCTCATCTATGTTAATCTCCTCCGTTACTTGG
CTCGTAAGCACCTCTTTTATTTCCTTCAGCTTCACCTCAAATATTTTCTTTTCATTGTAC
TCTACCAGAGCTGTCAATCCTGCCTTGGTGAAATGCTCAGAGAAACATTCAGTAGTCCGC
TTAGTGGGTGGCAAGAAGTCCAAGAGCTTGTCTTCCATCTTGCCACGCCTCAGAATAGCA
ATCAAGTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 0 0 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A085JQ U 1
AF RR2G956JQ U 40
AF RR2EO80JQ U 12
AF RR2AX57JQ U 29
BS 1 39 RR2A085JQ
BS 40 40 RR2EO80JQ
BS 41 102 RR2A085JQ
BS 103 103 RR2EO80JQ
BS 104 106 RR2G956JQ
BS 107 152 RR2A085JQ
BS 153 153 RR2EO80JQ
BS 154 169 RR2A085JQ
BS 170 170 RR2EO80JQ
BS 171 174 RR2A085JQ
BS 175 175 RR2EO80JQ
BS 176 403 RR2A085JQ
BS 404 404 RR2EO80JQ
BS 405 494 RR2A085JQ
BS 495 495 RR2EO80JQ
BS 496 565 RR2A085JQ
BS 566 791 RR2EO80JQ
BS 792 850 RR2AX57JQ

RD RR2A085JQ 565 0 0
AATTTGACTTTACGAGTAAAAATCATATGAAACAGAAGAAACCTCAAAACAGTTTAAAGA
CGTAGTCTGATAAACAAACAAACAATCCATTCAAAAAAAAAA****GCTTCAAGCATCTG
ACTTTTGCTTTACGAACTGCAAGGATAATCAAGGTTTTATGTTTTATTAAAAGAAATAAA
AGAAAACAGATTGTTCTTCGGTCGCTCACTCACTCTTCTTCCTCAGCCTCTTCCAGCCAG
TTCACAAACGGCTCCAATCCCTTCACAAACGTTTGCCTGCCCTTAGGGTTGCTCCCTTTG
CGATACCAATGGAGAATAGTGTCTTCAGCAAGCACATCAAGCTCATACAAAGACCTCACT
ACCTCTGGAAACACCTTCATCAGCTTTGCATCCTCATAGCATTACATCTGTACTTTGTAC
ATCAGCTCCATCTCCATTTTCCCGTTGCTGCAGAACGTGTTCAGAAGCGGTGCCCATGTC
TTCACTTGGCGTAATACAGAGTTCGAGTTTTGCTGCTGGTTTTTACCAGACCACTGAACA
GCATCCATTATCCCGTCCCAGATGA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2G956JQ 707 0 0
ACCTCA
AAAACAGTTTAAAGACGTAGTCTAATAAACAAACAAACAATCCATTCAAAAAAAAAAAAA
AGCTTCAAGCATCTGACTTTTGCTTTACGAACTGCAAGGATAATCAAAGTTTTATGTTTT
ATTAGAAGAGATAAAAGAAAACAGATTGTTCTTCGGTCGCTCACTCACTCTTCTTCCTCA
GCCTCTTCCAGCCAGTTCACAAACGGCTCCAATCCCTTCACAAACGTTTGCCTGCCCTTG
GGGTTGCTCCCTTTGCGATACCAATGGAGAATAGTGTCTTCAGCAAGCACATCAAGCTCA
TACAAAGACCTCACTACCTCTGGAAACACCTTCATCAGCTTTGCATCCTCATAGCATTGC
ATCTGTACTTTGTACATCAGCTCCATCTCCATTTTCCCGTTGCTGCAGAACGTGTTCAGA
AGCGGTGCCCACGTCTTCACTTGGCGTAACACAGAGTTTGAGTTTTGCTGCTGGTTTTTA
CCAGACCACTGAACAGCATCCATTATCCCGTCCCAGATGACACGCACAACCTCAATCTCT
GGCAGTTTAGCATCTTTCACCTGTTGCTTCACCGTTTCAATCACCTCATCTATGTTAATC
TCCTCCGTCACTTGGCTCGTAAGCACCTCTTTTATTTCCTTCAGCTTCACCTCAAATATT
TTCTTTTCATTGTACTCTACAAC*GCTGTCA
TCCCGCTTGG

QA 7 697 7 697
DS 

RD RR2EO80JQ 780 0 0
G
CGAGTAAAAATCATATGAAACAGAAGAGACCTCAAAACAGTTTAAAGACGTAGTCTGATA
AACAAACAAACAATCCATTCAAAAAAAAAAA***GGTTCAAGCATCTGACTTTTGCTTTA
CGAACTGCAAGGATAATCAAAGTTTTATGTTTTATTAGAAGAGATAAAAGAAAACAGATT
GTTCTTCGGTCGCTCACTCACTCTTCTTCCTCAGCCTCTTCCAGCCAGTTCACAAACGGC
TCCAATCCCTTCACAAACGTTTGCCTGCCCTTGGGGTTGCTCCCTTTGCGATACCAATGG
AGAATAGTGTCTTCAGCAAGCACATCAAGCTCATACAAAGACCTCACTACCTCTGGAAAC
ACCTTCATCAGCTTTGCATCCTCATAGCATTGCATCTGTACTTTGTACATCAGCTCCATC
TCCATTTTCCCGTTGCTGCAGAACGTGTTCAGAAGCGGTGCCCATGTCTTCACTTGGCGT
AACACAGAGTTTGAGTTTTGCTGCTGGTTTTTACCAGACCACTGAACAGCATCCATTATC
CCGTCCCAGATGACACGCACAACCTCAATCTCTGGCAGTTTAGCATCTTTCACCTGTTGC
TTCACCGTTTCAATCACCTCATCTATGTTAATCTCCTCCGTTACTTGGCTCGTAAGCACC
TCTTTTATTTCCTTCAGCTTCACCTCAAATATTTTCTTTTCATTGTACTCTACCAGAGCT
GTCAATCCTGCCTTGGTGAAATGCTCAGAGAAACATTCAGTAGTCCGCTTAGTGGGTGG

QA 2 780 2 780
DS 

RD RR2AX57JQ 822 0 0
AG
AACAGAAGAGACCTCAAAACAGTTTAAAGACGTAGTCTGATAAACAAACAAACAATCCAT
TCAAAAAAAAAAAAAAGCTTCAAGCATCTGACTTTTGCTCTACGAACTGCAAGGATAATC
AAAGTTTTATGTTTTATTAGAAGAGATAAAAGAAAACAGATTGTTCTTCGGTCGCTCACT
CACTCTTCTTCCTCAGCCTCTTCCAGCCAGTTCACAAACGGCTCCAATCCCTTCACAAAC
GTTTGCCTGCCCTTAGGGTTGCTCCCTTTGCGATACCAATGGAGAATAGTGTCTTCAGCA
AGCACATCAAGCTCATACAAAGACCTCACTACCTCTGGAAACACCTTCATCAGCTTTGCA
TCCTCATAGCATTGCATCTGTACTTTGGACATCAGCTCCATCTCCATTTTCCCGTTGCTG
CAGAACGTGTTCAGAAGCGGTGCCCATGTCTTCACTTGGCGTAATACAGAGTTCGAGTTT
TGCTGCTGGTTTTTACCAGACCACTGAACAGCATCCATTATCCCGTCCCAGATGACACGC
ACAACCTCAATCTCTGGCAGTTTAGCATCCTTCACCTGTTGCTTCACCGTTTCAATCACC
TCATCTATGTTAATCTCCTCCGTTACTTGGCTCGTAAGCACCTCTTTTATTTCCTTCAGC
TTCACCTCAAATATTTTCTTTTCATTGTACTCTACCAGAGCTGTCAATCCTGCCTTGGTG
AAATGCTCAGAGAAACATTCAGTAGTCCGCTTAGTGGGTGGCAAGAAGTCCAAGAGCTTG
TCTTCCATCTTGCCACGCCTCAGAATAGCAATCAAGTCAT

QA 3 822 3 822
DS 



CO CL589Contig2 827 4 2 U
GGGATAGCGTCGAGACGAAGCTCGATTTTGTTTAGAAACGCGAAGTTGAACAACATCCAT
ATCTCTCTCCCTACCTTTGATCTTTCTACGTATTGGTTTATGAGCTCAAAGGAGAAGCCC
ACTCTCGGAGGAACGCGGATTAAGACCCGCAAAAGGAATATAGCTGCTCCTTTGGACCCT
GCTGCTTTCTCTGATGCTGTTGTCCTGATTTATCTCGATAATGCTGGTGATCTCGAACTT
GTTGCCAAGGCTATTGAGTCATCTGATCTTAATTTCTCTCGTTACGGCGATATCTTCTTT
GAGGTTGTTTTCATTGGAGGACGTACGCAAACCGGTTCTGTGAAATCTGATGAAGGGGAA
CGCCATCCTTACTCTATCATCGACTGCCAACCAAACCGTGAAGCCATCTTACCATCAGTT
GTATACATTCAGAAAATCCTCCGCAGGAAACCATTCCTCATAAAGAACCTCGAGAATGTT
ACCCGGAGGTTCTTGCAGTCGCTCGAGCTTTTCGAGGAGAGCGAGAGGAAGAAGCTCGCC
ATATTCACGGCCCTCGCCTTCTCCCAGAAGCTCTCGGGGTTGCCTGCAGAGACCGTCTTC
CAGCCGCTGCTTAAGGATAACCTTGTTGCCAAAGGGATAGTGCTCACTTTTGTGACGGAC
TTCTTCAATGAGTATTTGGTTGAGAACAGCCTCGATGACTTGATTGCTATTCTGAGGCGT
GGCAAGATGGAAGACAAGCTCTTGGACTTCTTGCCACCCACTAAGCGGACTACTGAATGT
TTCTCTGAGCATTTCACCAAAGCAGATTGACAGCTCTGGTAGAGTAC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX73TF U 2
AF RR2EO80TF U 32
AF RR2AX57TFB U 1
AF RR2A085TF U 229
BS 1 760 RR2AX57TFB
BS 761 827 RR2A085TF

RD RR2BX73TF 544 0 0
GGATAGCGTCGAGACGAAGCTCGATTTTGTTTAGAAACGCGAAGTTGAACAACATCCATA
TCTCTCTCCCTACCTTTGATCTTTCTACGTATTGGTTTATGAGCTCAAAGGAGAAGCCCA
CTCTCGGAGGAACGCGGATTAAGACCCGCAAAAGGAATATAGCTGCTCCTTTGGACCCTG
CTGCTTTCTCTGATGCTGTTGTCCTGATTTATCTCGATAATGCTGGTGATCTCGAACTTG
TTGCCAAGGCTATTGAGTCATCTGATCTTAATTTCTCTCGTTACGGCGATATCTTCTTTG
AGGTTGTTTTCATTGGAGGACGTACGCAAACCGGTTCTGTTAAATCTGATGAAGGGGAAC
GCCATCCTTACTCTATCATCGACTGCCAACCAAACCGTGAAGCCATCTTACCATCAGTTG
TATACATTCAGAAAATCCTCCGCAGGAAACCATTCCTCATAAAGAACCTCGAGAATGTTA
CCCGGAGGTTCTTGCAGTCGCTCGAGCTTTTCGAGGAGAGCGAGAGGAAGAAGCTCGCCA
TATT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2EO80TF 689 0 0
GG
AGAAACGCGAAGTTGAGCAACATCCATATCTCTCTCCCTACCTTTGATCTTTCTACGTAT
TGGTTTATGAGCTCAAAGGAGAAGTCCACTCTCGGAGGAACGCGGATTAAGACCCGCAAA
AGGAATATAGCTGCTCCTTTGGACCCTGCTGCTTTCTCTGATGCTGTTGTCCTGATTTAT
CTCGATAATGCTGGTGATCTCGAACTTGTTGCCAAGGCTATTGAGTCATCTGATCTTAAT
TTCTCTCGTTACGGCGATATCTTCTTTGAGGTTGTTTTCATTGGAGGACGTACGCAAACC
GGTTCTGTGAAATCTTATGAAGGGGAACGCCATCCTTACTCTATCATCGACTGCCAACCA
AACCGTGAAGCCATCTTACCATCAGTTGTATACATTCAGAAAATCCTCCGCAGGAAACCA
TTCCTCATAAAGAACCTCGAGAATGTTACCCGGAGGTTCTTGCAGTCGCTCGAGCTTTTC
GAGGAGAGCGAGAGGAAGAAGCTCGCCATATTCACGGCCCTCGCCTTCTCCCAGAAGCTC
TCGGGGTTGCCTGCAGAGACCGTCTTCCAGCCGCTGCTTAAGGATAACCTTGTTGCCAAA
GGGATAGTGCTCACTTTTGTGACGGACTTCTTCAATGAGTATTTGGTTGAGA*CAGCCTC
GATGACTTGATTGCTATTCTGAG
CGTG

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR2AX57TFB 760 0 0
GGGATAGCGTCGAGACGAAGCTCGATTTTGTTTAGAAACGCGAAGTTGAACAACATCCAT
ATCTCTCTCCCTACCTTTGATCTTTCTACGTATTGGTTTATGAGCTCAAAGGAGAAGCCC
ACTCTCGGAGGAACGCGGATTAAGACCCGCAAAAGGAATATAGCTGCTCCTTTGGACCCT
GCTGCTTTCTCTGATGCTGTTGTCCTGATTTATCTCGATAATGCTGGTGATCTCGAACTT
GTTGCCAAGGCTATTGAGTCATCTGATCTTAATTTCTCTCGTTACGGCGATATCTTCTTT
GAGGTTGTTTTCATTGGAGGACGTACGCAAACCGGTTCTGTGAAATCTGATGAAGGGGAA
CGCCATCCTTACTCTATCATCGACTGCCAACCAAACCGTGAAGCCATCTTACCATCAGTT
GTATACATTCAGAAAATCCTCCGCAGGAAACCATTCCTCATAAAGAACCTCGAGAATGTT
ACCCGGAGGTTCTTGCAGTCGCTCGAGCTTTTCGAGGAGAGCGAGAGGAAGAAGCTCGCC
ATATTCACGGCCCTCGCCTTCTCCCAGAAGCTCTCGGGGTTGCCTGCAGAGACCGTCTTC
CAGCCGCTGCTTAAGGATAACCTTGTTGCCAAAGGGATAGTGCTCACTTTTGTGACGGAC
TTCTTCAATGAGTATTTGGTTGAGAACAGCCTCGATGACTTGATTGCTATTCTGAGGCGT
GGCAAGATGGAAGACAAGCTCTTGGACTTCTTGCCACCCA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2A085TF 599 0 0
GAC
CTCGAACTTGTTGCCAAGGCTATTGAGTCATCTGATCTTAATTTCTCTCGTTACGGCGAT
ATCTTCTTTGAGGTTGTTTTCATTGGAGGACGTACGCAAACCGGTTCTGTGAAATCTGAT
GAAGGGGAACGCCATCCTTACTCTATCATCGACTGCCAACCAAACCGTGAAGCCATCTTA
CCATCAGTTGTATACATTCAGAAAATCCTCCGCAGGAAACCATTCCTCATAAAGAACCTC
GAGAATGTTACCCGGAGGTTCTTGCAGTCGCTCGAGCCTTTCGAGGAGAGCGAGAGGAAG
AAGCTCGCCATATTCACGGCCCTCGCCTTCTCCCAGAAGCTCTCGGGGTTGCCTGCAGAG
ACCGTCTTCCAGCCGCTGCTTAAGGATAACCTTGTTGCCAAAGGGATAGTGCTCACTTTT
GTGACGGACTTCTTCAATGAGTATTTGGTTGAGAACAGCCTCGATGACTTGATTGCTATT
CTGAGGCGTGGCAAGATGGAAGACAAGCTCTTGGACTTCTTGCCACCCACTAAGCGGACT
ACTGAATGTTTCTCTGAGCATTTCACCAAAGCAGATTGACAGCTCTGGTAGAGTAC

QA 4 599 4 599
DS 



AS 3 8

CO CL590Contig1 293 2 3 U
GGAAGTTTGAAGAGGCATGCAAGAAAGTGAATGCGCCGCTCTTACTGCGTCTGCACCCAG
GATACGACCACTCCTACTACTTTATTGCCACCTTCATCGAAGACCACATCACTCACCATT
CTCAAGCCCTTAAGCTGTGGCTCGCTCCAGTTACTCGGTGCATCATGGCCTTTGTCCAAA
TATTAGTATCAATAAAAGGAAGTGGACTTGTAATGTTTTGTGTTCAATAACTGTTTTGGT
GTGGTGTGTGTTGGCTACGATAATAAAAGATTCCATCTACTTCAGTTGGACCG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI88JQ C 1
AF RR2BI88TF U 1
BS 1 2 RR2BI88JQ
BS 3 278 RR2BI88TF
BS 279 293 RR2BI88JQ

RD RR2BI88JQ 293 0 0
GGAAGTTTGAAGAGGCATGCAAGAAAGTGAATGCGCCGCTCTTACTGCGTCTGCACCCAG
GATACGACCACTCCTACTACTTTATTGCCACCTTCATCGAAGACCACATCACTCACCATT
CTCAAGCCCTTAAGCTGTGGCTCGCTCCAGTTACTCGGTGCATCATGGCCTTTGTCCAAA
TATTAGTATCAATAAAAGGAAGTGGACTTGTAATGTTTTGTGTTCAATAACTGTTTTGGT
GTGGTGTGTGTTGGCTACGATAATAAAAGATTCCATCTACTTCAGTTGGACCG

QA 1 293 1 293
DS 

RD RR2BI88TF 293 0 0
GG
AAGTTTGAAGAGGCATGCAAGAAAGTGAATGCGCCGCTCTTACTGCGTCTGCACCCAGGA
TACGACCACTCCTACTACTTTATTGCCACCTTCATCGAAGACCACATCACTCACCATTCT
CAAGCCCTTAAGCTGTGGCTCGCTCCAGTTACTCGGTGCATCATGGCCTTTGTCCAAATA
TTAGTATCAATAAAAGGAAGTGGACTTGTAATGTTTTGTGTTCAATAACTGTTTTGGTGT
GGTGTGTGTTGGCTACGATAATAAAAGATTCCATCT
ACTTCAGTTGGACCG

QA 3 278 3 278
DS 



CO CL590Contig2 798 2 10 U
GAAGATGGAATCTTTTATTATCGTAGCCAACACACACCACACCAAAACAGTTATTGAACA
CAAAACATTACAAGTCCACTTCCTTTTATTGATACTAATATTTGGACAAAGTCAATGCAC
CGAGTAACTGTAGCGAGCTACAGCTTAAGGGCTTGAGAATGGTGAGTGATGTGGTCTTCG
ATGAAGGTGGCAATAAAGTAGTAGGAGTGGTCGTATCCTGGGTGGAGACGCAGTAAGAGC
GGCGCATTCACTTTCTTGCATGCCTCTTCAAACTTGTTTGGCAATAACTGATCAGGGAAG
AACTGGCCGCTTTCTCCCTGATCAATAAGAATTGTGGCAGACAGATTGTTGAACTTTGAA
ATAAGACAAGTGGCATCATATTCCTCCCAAGCAGCCTTGTTGTCACCTAGATAATTGGTG
AATGCTTTCTGTCCCCACTGGCAGTTTATGGGATTGGCAATTGGTGCAAACGCAGACACA
GACTTATACTTGTCTAGGTTCTTCAGGTAAATAGTAAGAGCTCCATGTCCACCCATTGAA
TGTCCAGAGATAGATGCCATTGTTGTGTCAAGCTGTGAAAAGTTGTCAGTCAGGAGTTTG
GGCAACTCTGAGACAATATAGTCATACATACGCCAGTTCTTCCACTTCTCCTGAGTAGCA
TTCAGGTAAAACCCAGCTCCTACTCCAAAGTCATAACTGTCTGCTTCCCCTCCAATATTC
AATCCTCTTGGAGAAGTGTCTGGAACAACAAGAGCAATGCCGCGAGTAGAAGCAGCACGC
TGAGCTCCGGACTTGATG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA67JQ U 1
AF RR2AG41JQ U -8
BS 1 16 RR2EA67JQ
BS 17 17 RR2AG41JQ
BS 18 239 RR2EA67JQ
BS 240 240 RR2AG41JQ
BS 241 306 RR2EA67JQ
BS 307 307 RR2AG41JQ
BS 308 711 RR2EA67JQ
BS 712 712 RR2AG41JQ
BS 713 784 RR2EA67JQ
BS 785 798 RR2AG41JQ

RD RR2EA67JQ 784 0 0
GAAGATGGAATCTTTTGTTATCGTAGCCAACACACACCACACCAAAACAGTTATTGAACA
CAAAACATTACAAGTCCACTTCCTTTTATTGATACTAATATTTGGACAAAGTCAATGCAC
CGAGTAACTGTAGCGAGCTACAGCTTAAGGGCTTGAGAATGGTGAGTGATGTGGTCTTCG
ATGAAGGTGGCAATAAAGTAGTAGGAGTGGTCGTATCCTGGGTGGAGACGCAGTAAGAGT
GGCGCATTCACTTTCTTGCATGCCTCTTCAAACTTGTTTGGCAATAACTGATCAGGGAAG
AACTGGTCGCTTTCTCCCTGATCAATAAGAATTGTGGCAGACAGATTGTTGAACTTTGAA
ATAAGACAAGTGGCATCATATTCCTCCCAAGCAGCCTTGTTGTCACCTAGATAATTGGTG
AATGCTTTCTGTCCCCACTGGCAGTTTATGGGATTGGCAATTGGTGCAAACGCAGACACA
GACTTATACTTGTCTAGGTTCTTCAGGTAAATAGTAAGAGCTCCATGTCCACCCATTGAA
TGTCCAGAGATAGATGCCATTGTTGTGTCAAGCTGTGAAAAGTTGTCAGTCAGGAGTTTG
GGCAACTCTGAGACAATATAGTCATACATACGCCAGTTCTTCCACTTCTCCTGAGTAGCA
TTCAGGTAAAACCCAGCTCCTACTCCAAAGTCATAACTGTCTGCTTCCCCTTCAATATTC
AATCCTCTTGGAGAAGTGTCTGGAACAACAAGAGCAATGCCGCGAGTAGAAGCAGCACGC
TGAG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2AG41JQ 807 0 0
GGTCCAACTGA
AGATGGAATCTTTTATTATCGTAGCCAACACACACCACACCAAAACAGTTATTGAACACA
AAACATTACAAGTCCACTTCCTTTTATTGATACTAATATTTGGACAAAGTCAATGCACCG
AGTAACTGTAGCGAGCTACAGCTTAAGGGCTTGAGAATGGTGAGTGATGT***CTTCGAT
GAAGGTGGCAATAAAGTAGTAGGAGTGGTCGTATCCTGGGTGGAGACGCAGTAAGAGCGG
CGCATTCACTTTCTTGCATGCCTCTTCAAACTTGTTTGGCAATAACTGATCAGGGAAGAA
CTGGCCGCTTTCTCCCTGATCAATAAGAATTGTGGCAGACAGATTGTTGAACTTTGAAAT
AAGACAAGTGGCATCATATTCCTCCCAAGCAGCCTTGTTGTCACCTAGATAATTGGTGAA
TGCTTTCTGTCCCCACTGGCAGTTTATGGGATTGGCAATTGGTGCAAACGCAGACACAGA
CTTGTACTTGTCTAGGTTCTTCAGGTAAATAGTAAGAGCTCCATGTCCACCCATTGAATG
TCCAGAGATAGATGCCATTGTTGTGTCAAGCTGTGAAAAGTTGTCAGTCAGGAGTTTGGG
CAACTCTGAGACAATATAGTCATACATACGCCAGTTCTTCCACTTCTCCTGAGTAGCATT
CAGGTAAAACCCAGCTCCTACTCCAAAGTCATAACTGTCTGCTTCCCCTCCAATATTCAA
TCCTCTTGGAGAAGTGTCTGGAACAACAAGAGCAATGCCGCGAGTAGAAGCAGCACGCTG
AGCTCCGGACTTGATG

QA 12 807 12 807
DS 



CO CL590Contig3 1062 4 25 U
GGGCTTCTTCTTCTTCTTCATCGCTGCATCTGCGAGAGTGAGTTGGTGAGAGAGAGA**A
AGAGAAAATGGAGTCTGGGCTAAGTGAGATCGGAAGCACGAAGATGTTCGATGGATTCAA
CAAAAGATACAAACACTACAGTGAGACACTTGGCTGTTCCATGACTTTCTCCATCTACTT
CCCTCCTTCTTCTTCATCTTCCCGTAGATTCCCTGTGCTTTACTGGCTCTCTGGCCTCAC
CTGCACAGACGAGAACTTCATCATCAAGTCCGGAGCTCAGCGTGCTGCTTCTACTCGCGG
CATTGCTCTTGTTGTCCCAGATACTTCTCCAAGAGGATTAAATATTGAAGGGGAAGCAGA
CAGTTACGACTTTGGAGTAGGAGCTGGGTTTTACCTGGATGCTACTCAGGAGAAGTGGAA
GAACTGGCGTATGTATGACTATATTGTCTCAGAGTTGCCGAAACTCCTGAGTGACAACTT
TTCTCAGCTTGACACAACAATGGCATCTATCTCTGGACATTCAATGGGTGGACATGGAGC
TCTTACTATTTACCTGAAGAACCTAGACAAGTATAAGTCTGTGTCCGCATTTGCACCAAT
TGCCAATCCCATAAACTGCCAGTGGGGACAGAAAGCATTCACCAATTATCTAGGTGACAA
CAAGTCTGCTTGGGAGGAATATGATGCCACTTGTCTTGTTTCAAAGTTCAACAATCTGTC
TGCCACAATTCTTATTGATCAGGGAGAAAACGACCAGTTCTTCCCTGATCAGTTATTGCC
AAACAATTTTGAAGAGGCATGCAAGAAAGTGAATGCGCCGCTCTTACTGCGTTTGCAACC
AGGATACGACCACTCCTACTACTTTATTGCCACCTTCATCGAAGACCACATCACTCACCA
TTCTCAAGCCCTTAAGCTGTAGCTCGCTACAGTTGCTCGGTGCATTGCCTTGGTCCAAAT
ATTAGTATCAATAATAAAAGGAAGTGGACTTGTAATGTTTTGTGTTCAATAACTGTTCTG
GTGTGGTGTGTTTGGCTACGATAATAAAAGATTCCATCTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA67TF U 1
AF RR2AG41TF U 21
AF RR2C972TF U 3
AF RR2C972JQ C 297
BS 1 19 RR2EA67TF
BS 20 20 RR2C972TF
BS 21 315 RR2EA67TF
BS 316 316 RR2C972TF
BS 317 321 RR2EA67TF
BS 322 322 RR2C972TF
BS 323 339 RR2EA67TF
BS 340 340 RR2C972TF
BS 341 366 RR2EA67TF
BS 367 367 RR2C972TF
BS 368 397 RR2EA67TF
BS 398 398 RR2C972TF
BS 399 459 RR2EA67TF
BS 460 460 RR2C972TF
BS 461 470 RR2EA67TF
BS 471 471 RR2C972TF
BS 472 483 RR2EA67TF
BS 484 484 RR2C972TF
BS 485 585 RR2EA67TF
BS 586 586 RR2C972TF
BS 587 588 RR2EA67TF
BS 589 589 RR2C972TF
BS 590 653 RR2EA67TF
BS 654 738 RR2C972TF
BS 739 1062 RR2C972JQ

RD RR2EA67TF 656 0 0
GGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGCTGCATCTGCGAGAGTGAGTTGGTGAGAGAGAGA**A
AGAGAAAATGGAGTCTGGGCTAAGTGAGATCGGAAGCACGAAGATGTTCGATGGATTCAA
CAAAAGATACAAACACTACAGTGAGACACTTGGCTGTTCCATGACTTTCTCCATCTACTT
CCCTCCTTCTTCTTCATCTTCCCGTAGATTCCCTGTGCTTTACTGGCTCTCTGGCCTCAC
CTGCACAGACGAGAACTTCATCATCAAGTCCGGAGCTCAGCGTGCTGCTTCTACTCGCGG
CATTGCTCTTGTTGTTCCAGACACTTCTCCAAGAGGATTGAATATTGAAGGGGAAGCAGA
CAGTTATGACTTTGGAGTAGGAGCTGGGTTTTACCTGAATGCTACTCAGGAGAAGTGGAA
GAACTGGCGTATGTATGACTATATTGTCTCAGAGTTGCCCAAACTCCTGACTGACAACTT
TTCACAGCTTGACACAACAATGGCATCTATCTCTGGACATTCAATGGGTGGACATGGAGC
TCTTACTATTTACCTGAAGAACCTAGACAAGTATAAGTCTGTGTCTGCGTTTGCACCAAT
TGCCAATCCCATAAACTGCCAGTGGGGACAGAAAGCATTCACCAATTATCTAG
TGA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2AG41TF 631 0 0
GGGG
TGCATCTGCGAGAGTGAGTTGGTGAGAGAGAGA**AAAAGAAAATGGAGTCTGGGCTAAG
TGAGATCGGAAGCACGAAGATGTTCGATGGATTCAACAAAAGATACAAACACTACAGTGA
GACACTTGGCTGTTCCATGACTTTCTCCATCTACTTCCCTCCTTCTTCTTCATCTTCCCG
TAGATTCCCTGTGCTTTACTGGCTCTCTGGCCTCACCTGCACAGACGAGAACTTCATCAT
CAAGTCCGGAGCTCAGCGTGCTGCTTCTACTCGCGGCATTGCTCTTGTTGTTCCAGACAC
TTCTCCAAGAGGATTGAATATTGGAGGGGAAGCAGACAGTTATGACTTTGGAGTAGGAGC
TGGGTTTTACCTGAATGCTACTCAGGAGAAGTGGAAGAACTGGCGTATGTATGACTATAT
TGTCTCAGAGTTGCCCAAACTCCTGACTGACAACTTTTCACAGCTTGACACAACAATGGC
ATCTATCTCTGGACATTCAATGGGTGGACATGGAGCTCTTACTATTTACCTGAAGAACCT
AGACAAGTACAAGTCTGTGTCTGCGTTTGCACCAATTGCCAATCCCATAAACTGCCAGTG
GGGACAGAAAGCATTCACCAATTATCT

QA 5 631 5 631
DS 

RD RR2C972TF 736 0 0
GGTG
CTTCTTCTTCTTCATCGTTGCATCTGTGAGAGTGAGTTGGTGAGAGAGAGAGAAAGAGGA
AATGGAGTCAGGGCTAAGCGAGATCGGAAGCACGAAGATGTTCGATGGATTCAACAAAAG
ATACAAACACTACAGTGAGACACTTGGCTGTTCCATGACTTTCTCCGTCTACTTCCCTCC
TTCTTCTTCATCTTCCCGTAGATTCCCTGTGCTTTACTGGCTCTCTGGACTCACCTGCAC
AGACGAGAACTTCATCATCAAGTCCGGAGCCCAACGTGCTGCTTCTAATCGCGGCATTGC
TCTTGTTGTCCCAGATACTTCTCCAAGAGGATTAAATATTGAAGGGGAAGCAGACAGTTA
CGACTTTGGAGTAGGAGCTGGGTTTTACCTGGATGCTACTCAGGAGAAGTGGAAGAACTG
GCGTATGTATGACTATATTGTCTCAGAGTTGCCGAAACTCCTGAGTGACAACTTTTCTCA
GCTTGACACAACAATGGCATCTATCTCTGGACATTCAATGGGTGGACATGGAGCTCTTAC
TATTTACCTGAAGAACCTAGACAAGTATAAGTCTGTGTCCGCATTTGCACCAATTGCCAA
TCCCATAAACTGCCAGTGGGGACAGAAAGCATTCACCAATTATCTAGGTGACAACAAGTC
TGCTTGGGAGGAATATGATGCCACTTGTCTTGTTTCAAAGTTCAACAATCTGTCTGCCAC
AATTCTTATTGA

QA 5 736 5 736
DS 

RD RR2C972JQ 766 0 0
GCGGCATTGCTCTTGTTGTCCCAGATACTTCTCCAAGAGGATTAAATATTGAAGGGGAAG
CAGACAGTTACGACTTTGGAGTAGGAGCTGGGTTTTACCTGGATGCTACTCAGGAGAAGT
GGAAGAACTGGCGTATGTATGACTATATTGTCTCAGAGTTGCCGAAACTCCTGAGTGACA
ACTTTTCTCAGCTTGACACAACAATGGCATCTATCTCTGGACATTCAATGGGTGGACATG
GAGCTCTTACTATTTACCTGAAGAACCTAGACAAGTATAAGTCTGTGTCCGCATTTGCAC
CAATTGCCAATCCCATAAACTGCCAGTGGGGACAGAAAGCATTCACCAATTATCTAGGTG
ACAACAAGTCTGCTTGGGAGGAATATGATGCCACTTGTCTTGTTTCAAAGTTCAACAATC
TGTCTGCCACAATTCTTATTGATCAGGGAGAAAACGACCAGTTCTTCCCTGATCAGTTAT
TGCCAAACAATTTTGAAGAGGCATGCAAGAAAGTGAATGCGCCGCTCTTACTGCGTTTGC
AACCAGGATACGACCACTCCTACTACTTTATTGCCACCTTCATCGAAGACCACATCACTC
ACCATTCTCAAGCCCTTAAGCTGTAGCTCGCTACAGTTGCTCGGTGCATTGCCTTGGTCC
AAATATTAGTATCAATAATAAAAGGAAGTGGACTTGTAATGTTTTGTGTTCAATAACTGT
TCTGGTGTGGTGTGTTTGGCTACGATAATAAAAGATTCCATCTTCA

QA 1 766 1 766
DS 



AS 2 10

CO CL591Contig1 826 8 6 U
AAAAGAATGTGTCTTTATTCATCTTTCATACGAGAGACAAACAAAAAAATAATTAATTTG
TTATTACAACTTCATTCCCATACATTTTATCCTATCGAAAACAAATGTTGTACTTTTCAC
CTTTTACATAAACAAGTACTGGTCTTTTTGTTTTTCTTTATACGCTTTATAATCGAAGCG
TGACAGGAACGTTAGTTTGTTGAATCCAGTTAACGGGACTTAACCAGTTAGCCACAGTGA
ACTGACTTACTTCACCTGCAGTCCTAGCGACCTTAGCCCAGTTAACTCTCCTATTAGTGT
TAGCTCCTGGTCCACGGTTGTTGTATTCAACGTACCTACATGTCTTGTGGTTACTTTCAC
CATCCCACATTCTCCAACCTTCTGGTCTGATCAAATCACCGAGTTCAGTGTTGATGACCA
CCGTGGTTGAGTATTTCTTCCATGGCCTTCCCAAGTATGACTCTACGGTCAACCTCTCTG
CTGCTAGTTTCCTGTCCGGAACGATGCGGCAGTGTTGGAGGACGATACCGAGTTTCATGG
CAAATCCCATTTCGTTTCCGTCGGCTGTGACGGTGTTGTATTGTCCCTTGTTTCCTCTAC
GGACGACGATGAGTGAGTTTTGGATAACGGTTGCTGATTTTCCGAAGATGAAATCGACTG
TTCCTGAGATGACACAGTTTCTGTAGAATTGACGACCGTTGTTGACGTATAGAGTGTCTT
GGTAACCGTCGAATCTACAGTTGAAGATCACTGCACGGTCTCCATTGACTCGGATGGCCA
CGGCTTGATGTCCATTTGGACCAGCTGTGTTCCTGAATCCGATATA


BQ
30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY15TF C 1
AF RR2G996JQ U 1
AF RR2FX38JQ U 43
AF RR2FX38TF C 43
AF RR2B377JQ U 1
AF RR2CX03JQ U 1
AF RR2CX03TF C -2
AF RR2BF21JQ U 1
BS 1 437 RR2B377JQ
BS 438 438 RR2G996JQ
BS 439 465 RR2B377JQ
BS 466 466 RR2G996JQ
BS 467 743 RR2B377JQ
BS 744 826 RR2BF21JQ

RD RR2CY15TF 142 0 0
AAAAGAATGTGTCTTTATTCATCTTTCATACGAGAGACAAACAAAAAAATAATTAATTTG
TTATTACAACTTCATTCCCATACATTTTATCCTATCGAAAACAAATGTTGTACTTTTCAC
CTTTTACATAAACAAGTACTG
C

QA 1 141 1 141
DS 

RD RR2G996JQ 522 0 0
AAAAGAATGTGTCTTTATTCATCTTTCATACGAGAGACAAACAAAAAAATAATTAATTTG
TTATTACAACTTCATTCCCATACATTTTATCCTATCGAAAACAAATGTTGTACTTTTCAC
CTTTTACATAAACAAGTACTGGTCTTTTTGTTTTTCTTTATACGCTTTATAATCGAAGCG
TGACAGGAACGTTAGTTTGTTGAATCCAGTTAACGGGACTTAACCAGTTAGCCACAGTGA
ACTGACTTACTTCACCTGCAGTCCTAGCGACCTTAGCCCAGTTAACTCTCCTATTAGTGT
TAGCTCCTGGTCCACGGTTGTTGTATTCAACGTACCTACATGTCTTGTGGTTACTTTCAC
CATCCCACATTCTCCAACCTTCTGGTCTGATCAAATCACCGAGTTCAGTGTTGATGACCA
CCGTGGTTGAGTATTTCTTCCATGGCCTTCCCAAGTATGACTCTACGGTCAACCTCTCTG
CTGCTAGTTTCCTGTCCGGAACGATGCGGCAGTGTTGGAGGA

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2FX38JQ 478 0 0
AACAAAAAAAA
TAATTTGTTATTACAACTTCATTCCCATACATTTTATCCTATCGAAAACAAATGTTGTAC
TTTTCACCTTTTACATAAACAAGTACTGGTCTTTTTGTTTTTCTTTATACGCTTTATAAT
CGAAGCGTGACAGGAACGTTAGTTTGTTGAATCCAGTTAACGGGACTTAACCAGTTAGCC
ACAGTGAACTGACTTACTTCACCTGCAGTCCTAGCGATCTTAGCCCAGTTAACTCTCCTA
TTAGTGTTAGCTCCTGGTCCACGGTTGTTGTATTCAACGTACCTACATGTCTTGGGGTTA
CTTTCACCATCCCACATTCTCCAACCTTCTGGTCTGATCAAATCACCGAGTTCAGTGTTG
ATGACCACCGTGGTTGAATATTTCTTCCATGGCCTTCCCAAGTATGACTCTACGGTCAAC
CTCTCTGCTGCTAGTTTCCTGTCCGGAACGATGCGGCAGTGTTGGAG

QA 12 478 12 478
DS 

RD RR2FX38TF 512 0 0
AACAAAAAAAA
TAATTTGTTATTACAACTTCATTCCCATACATTTTATCCTATCGAAAACAAATGTTGTAC
TTTTCACCTTTTACATAAACAAGTACTGGTCTTTTTGTTTTTCTTTATACGCTTTATAAT
CGAAGCGTGACAGGAACGTTAGTTTGTTGAATCCAGTTAACGGGACTTAACCAGTTAGCC
ACAGTGAACTGACTTACTTCACCTGCAGTCCTAGCGATCTTAGCCCAGTTAACTCTCCTA
TTAGTGTTAGCTCCTGGTCCACGGTTGTTGTATTCAACGTACCTACATGTCTTGTGGTTA
CTTTCACCATCCCACATTCTCCAACCTTCTGGTCTGATCAAATCACCGAGTTCAGTGTTG
ATGACCACCGTGGTTGAGTATTTCTTCCATGGCCTTCCCAAGTATGACTCTACGGTCAAC
CTCTCTGCTGCTAGTTTCCTGTCCGGAACGATGCGGCAGTGTTGGAGGACGATACCGAGT
TTCATGGCAAATCCCATTTC
C

QA 12 511 12 511
DS 

RD RR2B377JQ 743 0 0
AAAAGAATGTGTCTTTATTCATCTTTCATACGAGAGACAAACAAAAAAATAATTAATTTG
TTATTACAACTTCATTCCCATACATTTTATCCTATCGAAAACAAATGTTGTACTTTTCAC
CTTTTACATAAACAAGTACTGGTCTTTTTGTTTTTCTTTATACGCTTTATAATCGAAGCG
TGACAGGAACGTTAGTTTGTTGAATCCAGTTAACGGGACTTAACCAGTTAGCCACAGTGA
ACTGACTTACTTCACCTGCAGTCCTAGCGACCTTAGCCCAGTTAACTCTCCTATTAGTGT
TAGCTCCTGGTCCACGGTTGTTGTATTCAACGTACCTACATGTCTTGTGGTTACTTTCAC
CATCCCACATTCTCCAACCTTCTGGTCTGATCAAATCACCGAGTTCAGTGTTGATGACCA
CCGTGGTTGAGTATTTCATCCATGGCCTTCCCAAGTATGACTCTATGGTCAACCTCTCTG
CTGCTAGTTTCCTGTCCGGAACGATGCGGCAGTGTTGGAGGACGATACCGAGTTTCATGG
CAAATCCCATTTCGTTTCCGTCGGCTGTGACGGTGTTGTATTGTCCCTTGTTTCCTCTAC
GGACGACGATGAGTGAGTTTTGGATAACGGTTGCTGATTTTCCGAAGATGAAATCGACTG
TTCCTGAGATGACACAGTTTCTGTAGAATTGACGACCGTTGTTGACGTATAGAGTGTCTT
GGTAACCGTCGAATCTACAGTTG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2CX03JQ 723 0 0
G
AAAGAATGTGTCTTTATTCATCTTTCATACGAGAGACAAACAAAAAAATAATTAATTTGT
TATTACAACTTCATTCCCATACATTTTATCCTATCGAAAACAAATGTTGTACTTTTCACC
TTTTACATAAACAAGTACTGGTCTTTTTGTTTTTCTTTATACGCTTTATAATCGAAGCGT
GACAGGAACGTTAGTTTGTTGAATCCAGTTAACGGGACTTAACCAGTTAGCCACAGTGAA
CTGACTTACTTCACCTGCAGTCCTAGCGACCTTAGCCCAGTTAACTCTCCTATTAGTGTT
AGCTCCTGGTCCACGGTTGTTGTATTCAACGTACCTACATGTCTTGTGGTTACTTTCACC
ATCCCACATTCTCCAACCTTCTGGTCTGATCAAATCACCGAGTTCAGTGTTGATGACCAC
CGTGGTTGAGTATTTCTTCCATGGCCTTCCCAAGTATGACTCTACGATCAACCTCTCTGC
TGCTAGTTTCCTGTCCGGAACGATGCGGCAGTGTTGGAGGACGATACCGAGTTTCATGGC
AAATCCCATTTCGTTTCCGTCGGCTGTGACGGTGTTGTATTGTCCCTTGTTTCCTCTACG
GACGACGATGAGTGAGTTTTGGATAACGGTTGCTGATTTTCCGAAGATGAAATCGACTGT
TCCTGAGATGACACAGTTTCTGTAGAATTGACGACCGTTGTTGACGTATAGAGTGTCTTG
G
C

QA 2 722 2 722
DS 

RD RR2CX03TF 726 0 0
TTTG
AAAGAATGTGTCTTTATTCATCTT*CATACGAGAGACAAACAAAAAAATAATTAATTTGT
TATTACAACTTCATTCCCATACATTTTATCCTATCGAAAACAAATGTTGTACTTTTCACC
TTTTACATAAACAAGTACTGGTCTTTTTGTTTTTCTTTATACGCTTTATAATCGAAGCGT
GACAGGAACGTTAGTTTGTTGAATCCAGTTAACGGGACTTAACCAGTTAGCCACAGTGAA
CTGACTTACTTCACCTGCAGTCCTAGCGACCTTAGCCCAGTTAACTCTCCTATTAGTGTT
AGCTCCTGGTCCACGGTTGTTGTATTCAACGTACCTACATGTCTTGTGGTTACTTTCACC
ATCCCACATTCTCCAACCTTCTGGTCTGATCAAATCACCGAGTTCAGTGTTGATGACCAC
CGTGGTTGAGTATTTCTTCCATGGCCTTCCCAAGTATGACTCTACGATCAACCTCTCTGC
TGCTAGTTTCCTGTCCGGAACGATGCGGCAGTGTTGGAGGACGATACCGAGTTTCATGGC
AAATCCCATTTCGTTTCCGTCGGCTGTGACGGTGTTGTATTGTCCCTTGTTTCCTCTACG
GACGACGATGAGTGAGTTTTGGATAACGGTTGCTGATTTTCCGAAGATGAAATCGACTGT
TCCTGAGATGACACAGTTTCTGTAGAATTGACGACCGTTGTTGACGTATAGAGTGTCTTG
G
C

QA 5 725 5 725
DS 

RD RR2BF21JQ 826 0 0
AAAAGAATGTGTCTTTATTCATCTTTCATACGAGAGACAAACAAAAAAAA***TAATTTG
TTATTACAACTTCATTCCCATACATTTTATCCTATCGAAAACAAATGTTGTACTTTTCAC
CTTTTACATAAACAAGTACTGGTCTTTTTGTTTTTCTTTATACGCTTTATAATCGAAGCG
TGACAGGAACGTTAGTTTGTTGAATCCAGTTAACGGGACTTAACCAGTTAGCCACAGTGA
ACTGACTTACCTCACCTGCAGTCCTAGCGATCTTAGCCCAGTTAACTCTCCTATTAGTGT
TAGCTCCTGGTCCACGGTTGTTGTATTCGACGTACCTACATGTCTTGTGGTTACTTTCAC
CATCCCACATTCTCCAACCTTCTGGTCTGATCAAATCACCGAGTTCAGTGTTGATGACCA
CCGTGGTTGAGTATTTCTTCCATGGCCTTCCCAAGTATGACTCTACGGTCAACCTCTCTG
CTGCTAGTTTCCTGTCCGGAACGATGCGGCAGTGTTGGAGGACGATACCGAGTTTCATGG
CAAATCCCATTTCGTTTCCGTCGGCTGTGACGGTGTTGTATTGTCCTTTGTTTCCTCTAC
GGACGACGATGAGTGAGTTTTGGATAACGGTTGCTGATTTTCCGAAGATGAAATCGACTG
TTCCTGAGATGACACAGTTTCTGTAGAATTGACGACCGTTGTTGACGTATAGAGTGTCTT
GGTAACCGTCGAATCTACAGTTGAAGATCACTGCACGGTCTCCATTGACTCGGATGGCCA
CGGCTTGATGTCCATTTGGACCAGCTGTGTTCCTGAATCCGATATA

QA 1 826 1 826
DS 



CO CL591Contig2 1120 2 8 U
GGTCGACAAAGAAACTCCCCCAGTCGTTGATACTCCTGTGGCTGACCCAGATGGTCCTTC
TCGTCGTCTCCTTGAAGATATTGACGAAACCGGAGTCCCAACATGGGTTTCAGGTGCAGA
CAGGAAGCTCTTGGCTAATGCTGGACGTGGCCGAAGACGCGGTGGTGGTGCTAGAATCAG
AGCCAACTTTGTTGTTGCCAAGGATGGAAGCGGCCAGTTTAACTCGATCCAACAAGCTGT
TAACGCTTGTCCCGATAAAAACCCTGGCCGATGCATCATCTACATTAAGGCCGGTATCTA
CAGAGAGCAAGTTATCATCCCTAAGAAGAAGAACAACATCTTCATGTTCGGAGATGGTGC
AAGAAAGACCGTTATCACTTACAACAAAAGTGTTGGTCTCAGTTCTGGAACCACCACTTC
TACTAGTGGCACAGTCCAGGTCGAATCTGAAGGGTACATAGCGAAATATATCGGATTCAG
GAACACAGCCGGTCCAAATGGACATCAAGCCGTGGCCATCCGAGTCAATGGAGACCGTGC
AGTGATCTTCAACTGTAGATTCGACGGTTACCAAGACACTCTATACGTCAACAACGGTCG
TCAATTCTACAGAAACTGTGTCATCTCAGGAACAGTCGATTTCATCTTCGGAAAATCAGC
AACCGTTATCCAAAACTCACTCATCGTCGTCCGTAGAGGAAACAAGGGACAATACAACAC
CGTCACAGCCGACGGAAACGAAATGGGATTTGCCATGAAACTCGGTATCGTCCTCCAACA
CTGCCGCATCGTTCCGGACAGGAAACTAGCAGCAGAGAGGTTGACCATAGAGTCATACTT
GGGAAGGCCATGGATGAAATACTCAACCACGGTGGTCATCAACACTGAACTCGGTGATTT
GATCAGACCAGAAGTTGGAGAATGGGGGATGGGTGAAAGTAACCACAAGACATGTAGGTA
CGTTGAATACAACAACCGTGGACCAGGAGCTAACACTAATAGAGAGTTAACTGGGCTAAA
GTCGCTAGGACTGCAGTGAAGTAAGTCAGTTCACTGTGGCTAAACTGGTTAAGTCCCGTT
AACTGGATTCACAACTAACGTTCCTGTCACGCTTCGATTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF21TF U 1
AF RR2B377TF U 272
BS 1 386 RR2BF21TF
BS 387 387 RR2B377TF
BS 388 455 RR2BF21TF
BS 456 456 RR2B377TF
BS 457 489 RR2BF21TF
BS 490 490 RR2B377TF
BS 491 627 RR2BF21TF
BS 628 1120 RR2B377TF

RD RR2BF21TF 627 0 0
GGTCGACAAAGAAACTCCCCCAGTCGTTGATACTCCTGTGGCTGACCCAGATGGTCCTTC
TCGTCGTCTCCTTGAAGATATTGACGAAACCGGAGTCCCAACATGGGTTTCAGGTGCAGA
CAGGAAGCTCTTGGCTAATGCTGGACGTGGCCGAAGACGCGGTGGTGGTGCTAGAATCAG
AGCCAACTTTGTTGTTGCCAAGGATGGAAGCGGCCAGTTTAACTCGATCCAACAAGCTGT
TAACGCTTGTCCCGATAAAAACCCTGGCCGATGCATCATCTACATTAAGGCCGGTATCTA
CAGAGAGCAAGTTATCATCCCTAAGAAGAAGAACAACATCTTCATGTTCGGAGATGGTGC
AAGAAAGACCGTTATCACTTACAACAGAAGTGTTGGTCTCAGTTCTGGAACCACCACTTC
TACTAGTGGCACAGTCCAGGTCGAATCTGAAGGGTTCATAGCGAAATATATCGGATTCAG
GAACACAGCTGGTCCAAATGGACATCAAGCCGTGGCCATCCGAGTCAATGGAGACCGTGC
AGTGATCTTCAACTGTAGATTCGACGGTTACCAAGACACTCTATACGTCAACAACGGTCG
TCAATTCTACAGAAACTGTGTCATCTC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2B377TF 849 0 0
G
GCATCATCTACATTAAGGCCGGTATCTACAGAGAGCAAGTTATCATCCCTAAGAAGAAGA
ACAACATCTTCATGTTCGGAGATGGTGCAAGAAAGACCGTTATCACTTACAACAAAAGTG
TTGGTCTCAGTTCTGGAACCACCACTTCTACTAGTGGCACAGTCCAGGTCGAATCTGAAG
GGTACATAGCGAAATATATCGGATTCAGGAACACAGCCGGTCCAAATGGACATCAAGCCG
TGGCCATCCGAGTCAATGGAGACCGTGCAGTGATCTTCAACTGTAGATTCGACGGTTACC
AAGACACTCTATACGTCAACAACGGTCGTCAATTCTACAGAAACTGTGTCATCTCAGGAA
CAGTCGATTTCATCTTCGGAAAATCAGCAACCGTTATCCAAAACTCACTCATCGTCGTCC
GTAGAGGAAACAAGGGACAATACAACACCGTCACAGCCGACGGAAACGAAATGGGATTTG
CCATGAAACTCGGTATCGTCCTCCAACACTGCCGCATCGTTCCGGACAGGAAACTAGCAG
CAGAGAGGTTGACCATAGAGTCATACTTGGGAAGGCCATGGATGAAATACTCAACCACGG
TGGTCATCAACACTGAACTCGGTGATTTGATCAGACCAGAAGTTGGAGAATGGGGGATGG
GTGAAAGTAACCACAAGACATGTAGGTACGTTGAATACAACAACCGTGGACCAGGAGCTA
ACACTAATAGAGAGTTAACTGGGCTAAAGTCGCTAGGACTGCAGTGAAGTAAGTCAGTTC
ACTGTGGCTAAACTGGTTAAGTCCCGTTAACTGGATTCACAACTAACGTTCCTGTCACGC
TTCGATTA

QA 2 849 2 849
DS 



AS 2 8

CO CL592Contig1 759 5 12 U
GGGGATAACCACCGTGCGTCTCGAGCTTTACCTTCCTTCTCTCTCTCTCAAAAACCCTAA
AAAAAATCATCTCTGGAGATCGATCGATCGAATCCGTTAGTAATGGCGAATAGCAATCTT
CCGCGAAGAATCATCAAGGAAACTCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCTCCGGGGATAAGT
GCGTCTCCATCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCCTACCCAG
TCTCCTTATGAAGGAGGAGTGTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCTATG
GCAGCTCCCAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTCGGA
AGGATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAACTGTC
CTCTTGAGTATTCAAGCTCTCCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTCTGAGAAC
ATAGCTAAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAGGAGTGGACT
CGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAACGATCGTTGTCATTT
AAATAACATTATATATGGTGAAACTCTTTAAGGTTTTATCTGAATCTTTTTTCTTTAAAA
AA*GAACTGGGGAAAAAGATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATAACTAGAAGAATTG
AAAGACTCGTTTATCCATGCAAACTAACGTTCTTCAAAT


BQ
10 10 10 10 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 5 5 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2DK45TF U 2
AF RR2BG08TF U 1
AF RR2G083TF U 5
AF RR2DK45JQ C 64
AF RR2G083JQ C 44
BS 1 61 RR2BG08TF
BS 62 64 RR2G083TF
BS 65 65 RR2BG08TF
BS 66 66 RR2G083TF
BS 67 143 RR2BG08TF
BS 144 144 RR2DK45TF
BS 145 205 RR2BG08TF
BS 206 206 RR2DK45TF
BS 207 714 RR2BG08TF
BS 715 731 RR2G083TF
BS 732 732 RR2DK45JQ
BS 733 759 RR2G083TF

RD RR2DK45TF 654 0 0
GGG
ATAACCACCGTGCGTCTCGAGCTTTACCTTCCTTCTCTCTCTCTCAAAAACCCTAAA***
ATTCATCTCTGGAGATCGATCGATCGAATCCGTTAGTAATGGCGAATAGCAATCTTCCGC
GAAGAATCATCAAGGAAACTCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCTCCGGGGATAAGTGCGT
CTCCATCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATTATCCTTGGTC*TACCCAGTCTC
CTTATGAAGGAGGAGTGTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCTATGGCAG
CTCCCAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTCGGAAGGA
TCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAACTGTCCTCT
TGAGTATTCAAGCTCTCCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTCTGAGAACATAG
CTAAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAG*AGTGGACTCGTC
TATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAG*AGAACGATCGTTGTCATTTAAAT
AACATTATATATGGTGAAACTCTTTAAG*TTTTATCTGAATCTTTTT
CTTT

QA 4 650 4 650
DS 

RD RR2BG08TF 714 0 0
GGGGATAACCACCGTGCGTCTCGAGCTTTACCTTCCTTCTCTCTCTCTCAAAAACCCTAA
A***ATTCATCTCTGGAGATCGATCGATCGAATCCGTTAGTAATGGCGAATAGCAATCTT
CCGCGAAGAATCATCAAGGAAACCCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCTCCGGGGATAAGT
GCGTCTCCATCAGAGGAAAATATGCATTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCCTACCCAG
TCTCCTTATGAAGGAGGAGTGTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCTATG
GCAGCTCCCAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTCGGA
AGGATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAACTGTC
CTCTTGAGTATTCAAGCTCTCCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTCTGAGAAC
ATAGCTAAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAGGAGTGGACT
CGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAACGATCGTTGTCATTT
AAATAACATTATATATGGTGAAACTCTTTAAGGTTTTATCTGAATCTTTTTTCTTTAAAA
AA*GAACTGGGGAAAAAGATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATAACTAGAA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2G083TF 755 0 0
GG
AACCACCGTGCGTCTCGAGCTTTACCTTCCTTCTCTCTC****AAAAACCCTAAAAAAAA
TCATCTCTGGAGATCGATCGATCGAATCCGTTAGTAATGGCGAATAGCAATCTTCCGCGA
AGAATCATCAAGGAAACTCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCTCCGGGGATAAGCGCGTCT
CCGTCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCCTACCCAGTCTCCT
TATGAAGGAGGAGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCTATGGCAGCT
CCCAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTCGGGAGGATC
TGCCTGGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAACTGTGCTCTTG
AGTATTCAAGCTCTCCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTCTGAGAACATAGCT
AAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGTTAAGGAGTGGACTCGTCTA
TATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTACAAAAGGAGAACGATCGTTGTCATTTAAATAA
CATTATATATGGTGAAACTCTTTAAAGTTTTATCTGAATCTATTTTCTTTAAAAAA*GAA
CTGGGGAAAA*GATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATAACTAGAAGAATTGAAAGAC
TCGTT*ATCCATGCAAACTAACGTTCTTCAAAT

QA 3 755 3 755
DS 

RD RR2DK45JQ 674 0 0
AAT
TCATCTCTGGAGATCGATCGATCGAATCCGTTAGTAATGGCGAATAGCAATCTTCCGCGA
AGAATCATCAAGGAAACTCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCTCCGGGGATAAGTGCGTCT
CCATCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATTATCCTTGGTC*TACCCAGTCTCCT
TATGAAGGAGGAGTGTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCTATGGCAGCT
CCCAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTCGGAAGGATC
TGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAACTGTCCTCTTG
AGTATTCAAGCTCTCCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTCTGAGAACATAGCT
AAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAGGAGTGGACTCGTCTA
TATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTGCAAAAGGAGAACGATCGTTGTCATTTAAATAA
CATTATATATGGTGAAACTCTTTAAGGTTTTATCTGAATCTTTTTTCTTTAAAAAA*GAA
CTGGGGAAAAAGATTTGTACTCTCCGAATCTTCTTTGTATAACTAGAAGAATTGAAAGAC
TCGTTTATC
CG

QA 4 672 4 672
DS 

RD RR2G083JQ 712 0 0
TCTCTCAAAAACCCTAAA
AAAAATCATCTCTGGAGATCGATCGATCGAATCCGTTAGTAATGGCGAATAGCAATCTTC
CGCGAAGAATCATCAAGGAAACTCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCTCCGGGGATAAGCG
CGTCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCCTACCCAGT
CTCCTTATGAAGGAGGAGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCTATGG
CAGCTCCCAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTCGGGA
GGATCTGCCTGGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAACTGTGC
TCTTGAGTATTCAAGCTCTCCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCACTGTCTGAGAACA
TAGCTAAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGTTAAGGAGTGGACTC
GTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTACAAAAGGAGAACGATCGTTGTCATTTA
AATAACATTATATATGGTGAAACTCTTTAAGGTTTTATCTGAATCTATTTTCTTTAAAAA
AAGAACTGGGGAAAAAGATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATAACTAGAAGAATTGA
AAGACTCGTTTATCCATGCAAACTAACGTTCTTC

QA 19 712 19 712
DS 



CO CL592Contig2 711 3 8 U
GAAGAACGTTAGATTGCATGGATAAACGAGTCTTCAATTCTTCTAGTTATACAAAGAAGA
TTCAGAGAGTACAAATCTTTTTCCCCAGTTTTTTTTATAAGAAAAAGGATTCAGATAAAA
CCTTAAGAGTTTCAGCATATATAATGTTATTTAAATGACAACGATCGTTCTCCTTTTGCA
CTCCATCATCAAGCGCCACTTGCATATAGACGAGTCCACTCCTTAGCTGTCTCCACGGCT
TCTGCTTCATTACTCTTCCAATGCTTAGCTATGTTCTCAGACAGTGGATCATCTGGGTTT
GGTGCACTTAGAGGAGCTTGAATACTCAAGAGGACAGTTCTTATTTGAAGCGCAGGACTC
CACTTGTCTTTCAGTATGTCAAGGCAGATCCTTCCGAGCTTGTCAATGTTAGGATGGTAT
ATCTTGGTGAGAAACCTAACTTTGGGAGCAGCCATAGGGTATTCTTCAGGCAAAAAGAGC
TCCAACTTGAAAACTCCTCCTTCATAAGGAGACTGGGTAGGACCAAGGATCATGACATTG
AAATAACGCATATTTTCCTCTGACGGAGACGCACTTATCCCCGGAGCAGGTTCACTAAGT
AGACGCTGAGTTTCCTTGATGATTCTTCGCGGAAGATTGCTATTCGCCATTATTAACGGA
TTCGATCGATCTTCAAAGAAGAATTTAGGGTTTTTGAGAGAGAGAGAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR41JQ U 217
AF RR2BY85JQ U 1
AF RR2CR41TF C 8
BS 1 312 RR2BY85JQ
BS 313 313 RR2CR41JQ
BS 314 483 RR2BY85JQ
BS 484 484 RR2CR41JQ
BS 485 545 RR2BY85JQ
BS 546 546 RR2CR41JQ
BS 547 671 RR2BY85JQ
BS 672 711 RR2CR41TF

RD RR2CR41JQ 441 0 0
CC
CTCCTTAGCTGTCTCCCCGGCTTCTGCTTCATTACTCTTCCAATGCTTAGCTATGTTCTC
AGACAGTGGATCATCTGGGTTTGGTGCACTTAGAGGAGCTTGAATACTCAAGAGGACAGT
TCTTATTTGAAGCGCAGGACTCCACTTGTCTTTCAGTATGTCAAGGCAGATCCTTCCGAG
CTTGTCAATGTTAGGATGGTATATCTTGGTGAGAAACCTAACTTTGGGAGCAGCCATAGG
GTATTCTTCAGGCAAAAAGAGCTCCAACTTGAAAACTCCTCCTTCATAAGGAGACTGGGT
AGGACCAAGGATCATGACATTGAAATAACGCATATTTTCCTCTGACGGAGACGCACTTAT
CCCCGGAGCAGGTTCACTAAGTAGACGCTGAGTTTCCTTGATGATTCTTCGCGGAAGATT
GCTATTCGCCATTATTAAC

QA 3 441 3 441
DS 

RD RR2BY85JQ 684 0 0
GAAGAACGTTAGATTGCATGGATAAACGAGTCTTCAATTCTTCTAGTTATACAAAGAAGA
TTCAGAGAGTACAAATCTTTTTCCCCAGTTTTTTTTATAAGAAAAAGGATTCAGATAAAA
CCTTAAGAGTTTCAGCATATATAATGTTATTTAAATGACAACGATCGTTCTCCTTTTGCA
CTCCATCATCAAGCGCCACTTGCATATAGACGAGTCCACTCCTTAGCTGTCTCCACGGCT
TCTGCTTCATTACTCTTCCAATGCTTAGCTATGTTCTCAGACAGTGGATCATCTGGGTTT
GGTGCACTTAGAAGAGCTTGAATACTCAAGAGGACAGTTCTTATTTGAAGCGCAGGACTC
CACTTGTCTTTCAGTATGTCAAGGCAGATCCTTCCGAGCTTGTCAATGTTAGGATGGTAT
ATCTTGGTGAGAAACCTAACTTTGGGAGCAGCCATAGGGTATTCTTCAGGCAAAAAGAGC
TCCGACTTGAAAACTCCTCCTTCATAAGGAGACTGGGTAGGACCAAGGATCATGACATTG
AAATAGCGCATATTTTCCTCTGACGGAGACGCACTTATCCCCGGAGCAGGTTCACTAAGT
AGACGCTGAGTTTCCTTGATGATTCTTCGCGGAAGATTGCTATTCGCCATTATTAACGGA
TTCGATCGATC
TTCAAAGAAGAAT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2CR41TF 704 0 0
TTTTTTTTTGCAT
GATAAACGAGTCTTCAATT*TTCTAGTTATACAAAGAAGATTCAGAGAGTACAAATCTTT
T*CCCCAGTTTTTTT*ATAAGAAAAAGGATTCAGATAAAACCTTAAGAGTTTCAGCATAT
ATAATGTTATTTAAATGACAACGATCGTTCTCCTTTTGCACTCCATCATCAAGCGCCACT
TGCATATAGACGAGTCCACTCCTTAGCTGTCTCCACGGCTTCTGCTTCATTACTCTTCCA
ATGCTTAGCTATGTTCTCAGACAGTGGATCATCTGGGTTTGGTGCACTTAGAGGAGCTTG
AATACTCAAGAGGACAGTTCTTATTTGAAGCGCAGGACTCCACTTGTCTTTCAGTATGTC
AAGGCAGATCCTTCCGAGCTTGTCAATGTTAGGATGGTATATCTTGGTGAGAAACCTAAC
TTTGGGAGCAGCCATAGGGTATTCTTCAGGCAAAAAGAGCTCCAACTTGAAAACTCCTCC
TTCATAAGGAGACTGGGTAGGACCAAGGATCATGACATTGAAATAACGCATATTTTCCTC
TGACGGAGACGCACTTATCCCCGGAGCAGGTTCACTAAGTAGACGCTGAGTTTCCTTGAT
GATTCTTCGCGGAAGATTGCTATTCGCCATTATTAACGGATTCGATCGATCTTCAAAGAA
GAATTTAGGGTTTTTGAGAGAGAGAGAAGCC

QA 14 704 14 704
DS 



AS 1 9

CO CL593Contig1 1182 9 18 U
GGTTCGCAAGAGGGATAGAAAGAGAGAAACCAAATAAACAATGGCGACTCTGAAACTCTC
TCTGTCTTCACCTTCTCCCTCTTCGATTCAGTCAAAGTTATCTACGGCGTCTTTCATCCC
CAATGCAGCGCGTGCGTTTAATGCGACAGCAAAGGCTTCGAAGTCGCGGTTCATTGGCAA
ATGCTTGAGATCAAGCCCGATGACAATACACAGAGGATCTCGCTCCGTAGAAATCACTTG
TTCTGCTTCATCTTCTCCTGCTACTGCTACTCTTCCCTCAGCTCTTCTCTTCGATTGTGA
TGGTGTGCTTGTTGATACGGAGAAGGACGGTCACAGGATCTCCTTCAACGACACTTTCAA
AGAGAGAGATTTGGGTGTTACCTGGGATGTCGATTTGTACGGAGAACTACTGAAAATAGG
TGGCGGGAAAGAAAGAATGACAGCGTATTTTAATAAGGTGGGTTGGCCTGAGAAAGCTCC
CAAGGATGAGGCAGAGAGGAAAGCGTTCATAGCTGGGCTTCACAAGCAGAAGACTGAGCT
TTTCATGGTTCTCATCGAGAAAAAGCTGCTTCCTCTTCGTCCCGGTGTTGCCAAATTGGT
TGATCAAGCTTTAACGAATGGAGTAAAGGTTGCTGTGTGCAGCACTTCAAATGAGAAGGC
GGTTTCTGCTATAGTTTCATGCTTGCTTGGACCAGAACGAGCAGAGAATATCAAGATATT
CGCTGG*AGATGTAGTTCCCAAAAAGAAACCTGACCCGGCCATCTACAACTTAGCTGCTG
AAACCCTTGGAGTTGATCCCTCAAAATGTGTTGTGGTTGAAGATAGCGCTATTGGACTAG
CAGCTGCAAAAGCTGCGGGTATGACTTGTATAGTAACAAAGAGTGGATACACAGCAGATG
AAGATTTTGTGAACGCAGACGCGGTTTTCGACTGCATTGGAGACCCTCCAGAGGAGAGAT
TTGATCTATCATTCTGTGGAAGCCTTCTCCAGAAACAGTTCGTTAGCTAAACTACAAAAC
TCTCAATCATTGGTTGTGTGTATAGTGAAAAAGACTCATTCACTTTAAACTCGTTTTACA
CATTAATATTTCTGACATTTCCATCAGCGTATGTATTGCTGGACTGAGATTTTGTCTCAT
GCAATGTCACAGTTTCAACTTCTCAAGATGCTATGCACATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI17TF U 30
AF RR2F820TF U 1
AF RR2A866TF U 30
AF RR2C664TF U 6
AF RR2GQ06TF U 29
AF RR2GX01TF U 359
AF RR2F820JQ C 756
AF RR2GX01JQ C 472
AF RR2GQ06JQ C 798
BS 1 545 RR2F820TF
BS 546 546 RR2C664TF
BS 547 692 RR2F820TF
BS 693 693 RR2GQ06TF
BS 694 696 RR2F820TF
BS 697 697 RR2C664TF
BS 698 707 RR2F820TF
BS 708 708 RR2GX01TF
BS 709 713 RR2F820TF
BS 714 714 RR2GQ06TF
BS 715 719 RR2C664TF
BS 720 720 RR2GX01TF
BS 721 726 RR2C664TF
BS 727 727 RR2GX01TF
BS 728 739 RR2C664TF
BS 740 1048 RR2GX01TF
BS 1049 1156 RR2GX01JQ
BS 1157 1182 RR2GQ06JQ

RD RR2EI17TF 127 0 0
GG
AAATAAACAATGGCGACTCTGAAACTCTCTCTGTCTTCACCTTCTCTCTCTTCGATTCAG
TCAAAGTTATCTACGGCGTCTTTCATCCCCAATGCAGCGCGTGCGTTTAATGCGACAGCA
AAGGC

QA 3 127 3 127
DS 

RD RR2F820TF 720 0 0
GGTTCGCAAGAGGGATAGAAAGAGAGAAACCAAATAAACAATGGCGACTCTGAAACTCTC
TCTGTCTTCACCTTCTCCCTCTTCGATTCAGTCAAAGTTATCTACGGCGTCTTTCATCCC
CAATGCAGCGCGTGCGTTTAATGCGACAGCAAAGGCTTCGAAGTCGCGGTTCATTGGCAA
ATGCTTGAGATCAAGCCCGATGACAATACACAGAGGATCTCGCTCCGTAGAAATCACTTG
TTCTGCTTCATCTTCTCCTGCTACTGCTACTCTTCCCTCAGCTCTTCTCTTCGATTGTGA
TGGTGTGCTTGTTGATACGGAGAAGGACGGTCACAGGATCTCCTTCAACGACACTTTCAA
AGAGAGAGATTTGGGTGTTACCTGGGATGTCGATTTGTACGGAGAACTACTGAAAATAGG
TGGCGGGAAAGAAAGAATGACAGCGTATTTTAATAAGGTGGGTTGGCCTGAGAAAGCTCC
CAAGGATGAGGCAGAGAGGAAAGCGTTCATAGCTGGGCTTCACAAGCAGAAGACTGAGCT
TTTCACGGTTCTCATCGAGAAAAAGCTGCTTCCTCTTCGTCCCGGTGTTGCCAAATTGGT
TGATCAAGCTTTAACGAATGGAGTAAAGGTTGCTGTGTGCAGCACTTCAAATGAGAAGGC
GGTTTCTGCTATAGTTTCATGCTTGCTTGGAC*AGA*CGAGCAGAGA*TATCA
AGATATC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2A866TF 643 0 0
GG
AAATAAACAATGGCGACTCTGAAACTCTCTCTGTCTTCACCTTCTCCCTCTTCGATTCAG
TCAAAGTTATCTACGGCGTCTTTCATCCCCAATGCAGCGCGTGCGTTTAATGCGACAGCA
AAGGCTTCGAAGTCGCGGTTCATTGGCAAATGCTTGAGATCAAGCCCGATGACAATACAC
AGAGGATCTCGCTCCGTAGAAATCACTTGTTCTGCTTCATCTTCTCCTGCTACTGCTACT
CTTCCCTCAGCTCTTCTCTTCGATTGTGATGGTGCGCTTGTTGATACGGAGAAGGACGGT
CACAGGATCTCCTTCAACGACACTTTCAAAGAGAGAGATTTGGGTGTTACCTGGGATGTC
GATTTGTACGGAGAACTACTGAAAATAGGTGGCGGGAAAGAGAGAATGACAGCGTATTTT
AATAAGGTGGGTTGGCCTGAGAAAGCTCCCAAGGATGAGGCAGAGAGGAAAGCGTTCATA
GCTGGGCTTCACAAGCAGAAGACTGAGCTTTTCATGGTTCTCATCGAGAAAAAGCTGCTT
CCTCTTCGTCCCGGTGTTGCCAAATTGGTTGATCAAGCTTTAACGAATGGAGTAAAGGTT
GCTGTGTGCAGCACTTCAAATGAGAAGGCGGT
ATGATCCAC

QA 3 634 3 634
DS 

RD RR2C664TF 735 0 0
GG
AAGAGGGATAGAAAGAGAGAAACCAAATAAACAATGGCGACTCTGAAACTCTCTCTGTCT
TCACCTTCTCCCTCTTCGATTCAGTCAAAGTTATCTACGGCGTCTTTCATCCCCAATGCA
GCGCGTGCGTTTAATGCGACAGCAAAGGCTTCGAAGTCGCGGTTCATTGGCAAATGCTTG
AGATCAAGCCCGATGACAATACACAGAGGATCTCGCTCCGTAGAAATCACTTGTTCTGCT
TCATCTTCTCCTGCTACTGCTACTCTTCCCTCAGCTCTTCTCTTCGATTGTGATGGTGTG
CTTGTTGATACGGAGAAGGACGGTCACAGGATCTCCTTCAACGACACTTTCAAAGAGAGA
GATTTGGGTGTTACCTGGGATGTCGATTTGTACGGAGAACTACTGAAAATAGGTGGCGGG
AAAGAAAGAATGACAGCGTATTTTAATAAGGTGGGTTGGCCTGAGAAAGCTCCCAAGGAT
GAGGCAGAGAGGAAAGCGTTCATAGCTGGGCTTCACAAGCAGAAGACTGAGCTTTTCATG
GTTCTCATCGAGAAAAAGCTGCTTCCTCTTCGTCCCGGTGTTGCCAAATTGGTTGATCAA
GCTTTAACGAATGGAGTAAAGGTTGCTGTGTGCAGCACTTCAAATGAGAAGGCGGTTTCT
GCTATAGTTTCATGCTTGCTTGGAC*AGAACGAGCAGAGA*TATCA*GATAT*CGCTGGG
AGATGTAGTTCC
A

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR2GQ06TF 717 0 0
GGA
AAATAAACAATGGCGACTCTGAAACTCTCTCTGTCTTCACCTTCTCCCTCTTCGATTCAG
TCAAAGTTATCTACGGCGTCTTTCATCCCCAATGCAGCGCGTGCGTTTAATGCGACAGCA
AAGGCTTCGAAGTCGCGGTTCATTGGCAAATGCTTGAGATCAAGCCCGATGACAATACAC
AGAGGATCTCGCTCCGTAGAAATCACTTGTTCTGCTTCATCTTCTCCTGCTACTGCTACT
CTTCCCTCAGCTCTTCTCTTCGATTGTGATGGTGTGCTTGTTGATACGGAGAAGGACGGT
CACAGGATCTCCTTCAACGACACTTTCAAAGAGAGAGATTTGGGTGTTACCTGGGATGTC
GATTTGTACGGAGAACTACTGAAAATAGGTGGCGGGAAAGAAAGAATGACAGCGTATTTT
AATAAGGTGGGTTGGCCTGAGAAAGCTCCCAAGGATGAGGCAGAGAGGAAAGCGTTCATA
GCTGGGCTTCACAAGCAGAAGACTGAGCTTTTCATGGTTCTCATCGAGAAAAAGCTGCTT
CCTCTTCGTCCCGGTGTTGCCAAATTGGTTGATCAAGCTTTAACGAATGGAGTAAAGGTT
GCTGTGTGCAGCACTTCAAATGAGAAGGCGGTTTCTGCTATAGTTTCATGCTTGCTTGGA
CCAGAACGAGCAGAGA*TATCAAGATAT*CGCTGGGAGATGTAGTTCC
CAAAAG

QA 4 711 4 711
DS 

RD RR2GX01TF 690 0 0
GG
AGAGAGAGATTTGGGTGTTACCTGGGATGTCGATTTGTACGGAGAACTACTGAAAATAGG
TGGCGGGAAAGAAAGAATGACAGCGTATTTTAATAAGGTGGGTTGGCCTGAGAAAGCTCC
CAAGGATGAGGCAGAGAGGAAAGCGTTCATAGCTGGGCTTCACAAGCAGAAGACTGAGCT
TTTCATGGTTCTCATCGAGAAAAAGCTGCTTCCTCTTCGTCCCGGTGTTGCCAAATTGGT
TGATCAAGCTTTAACGAATGGAGTAAAGGTTGCTGTGTGCAGCACTTCAAATGAGAAGGC
GGTTTCTGCTATAGTTTCATGCTTGCTTGGACCAGAACGAGCAGAGAATATCAAGATATT
CGCTGG*AGATGTAGTTCCCAAAAAGAAACCTGACCCGGCCATCTACAACTTAGCTGCTG
AAACCCTTGGAGTTGATCCCTCAAAATGTGTTGTGGTTGAAGATAGCGCTATTGGACTAG
CAGCTGCAAAAGCTGCGGGTATGACTTGTATAGTAACAAAGAGTGGATACACAGCAGATG
AAGATTTTGTGAACGCAGACGCGGTTTTCGACTGCATTGGAGACCCTCCAGAGGAGAGAT
TTGATCTATCATTCTGTGGAAGCCTTCTCCAGAAACAGTTCGTTAGCTAAACTACAAAAC
TCTCAATCATTGGTTGTGTGTATAGTGA

QA 3 690 3 690
DS 

RD RR2F820JQ 367 0 0
CCGGCCATCTACAACTTAGCTGCTGAAACCCTTGGAGTTGATCCCTCAAAATGTGTTGTG
GTTGAAGATAGCGCTATTGGACTAGCAGCTGCAAAAGCTGCGGGTATGACTTGTATAGTA
ACAAAGAGTGGATACACAGCAGATGAAGATTTTGTGAACGCAGACGCGGTTTTCGACTGC
ATTGGAGACCCTCCAGAGGAGAGATTTGATCTATCATTCTGTGGAAGCCTTCTCCAGAAA
CAGTTCGTTAGCTAAACTACAAAACTCTCAATCATTGGTTGTGTGTATAGTGAAAAAGAC
TCATTCACTTTAAACTCGTTTTACACATTAATATCTCTGACATTTCCATCAGCGTATGTA
TTGCTGG

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR2GX01JQ 685 0 0
GAAAGCTCCCAAGGATGAGGCAGAGAGGAAAGCGTTCATAGCTGGGCTTCACAAGCAGAA
GACTGAGCTTTTCATGGTTCTCATCGAGAAAAAGCTGCTTCCTCTTCGTCCCGGTGTTGC
CAAATTGGTTGATCAAGCTTTAACGAATGGAGTAAAGGTTGCTGTGTGCAGCACTTCAAA
TGAGAAGGCGGTTTCTGCTATAGTTTCATGCTTGCTTGGACCAGAACGAGCAGAGAATAT
CAAGATATTCGCTGG*AGATGTAGTTCCCAAAAAGAAACCTGACCCGGCCATCTACAACT
TAGCTGCTGAAACCCTTGGAGTTGATCCCTCAAAATGTGTTGTGGTTGAAGATAGCGCTA
TTGGACTAGCAGCTGCAAAAGCTGCGGGTATGACTTGTATAGTAACAAAGAGTGGATACA
CAGCAGATGAAGATTTTGTGAACGCAGACGCGGTTTTCGACTGCATTGGAGACCCTCCAG
AGGAGAGATTTGATCTATCATTCTGTGGAAGCCTTCTCCAGAAACAGTTCGTTAGCTAAA
CTACAAAACTCTCAATCATTGGTTGTGTGTATAGTGAAAAAGACTCATTCACTTTAAACT
CGTTTTACACATTAATATTTCTGACATTTCCATCAGCGTATGTATTGCTGGACTGAGATT
TTGTCTCATGCAATGTCACAGTTTC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2GQ06JQ 385 0 0
CCCTCAAAATGTGTTGTGGTTGAAGATAGCGTTATTGGACTAGCAGCTGCAAAAGCTGCG
GGTATGACTTGTATAGTAACAAAGAGTGGATACACAGCAGATGAAGATTTTGTGAACGCA
GACGCGGTTTTCGACTGCATTGGAGACCCTCCAGAGGAGAGATTTGATCTATCATTCTGT
GGAAGCCTTCTCCAGAAACAGTTCGTTAGCTAAACTACAAAACTCTCAATCATTGGTTGT
GTGTATAGTGAAAAAGACCCATTCACTTTAAACTCGTTTTACACATTAATATTTCTGACA
TTTCCATCAGCGTATGTATTGCTGGACTGAGATTTTGTCTCATGCAATGTCACAGTTTCA
ACTTCTCAAGATGCTATGCACATAT

QA 1 385 1 385
DS 



AS 1 10

CO CL594Contig1 1409 10 32 U
GGCCAACTTAAAATTCTTTCTCCCCATTCGTTATCCAAACCCCATCTCTTCCCACAACTA
TGGAAACTAATTATTCTCCATTAGGGTTTCTAATTTCACTCTTCATCGTTGTTACTTTTC
TTGCACCACAAGTCAAATCTAGGGCTTTCTACGTATTTGGTGACTCTCTCGTCGACAATG
GAAACAACGATTACTTAGTCACCACTGCTCGTGCCGACAACTACCCATATGGTATCGATT
ACCCGACCCGTCGACCCACCGGACGTTTCTCAAATGGCCTCAACATCCCCGACATTATCA
GTGAGGCTATAGGCATGCCGTCGACTCTGCCGTACCTTAGCCCGCAGCTCACAGGACAAA
ATCTTCTCGTAGGTGCTAACTTCGCCTCCGCCGGAATTGGAATCCTCAACGACACTGGAA
TTCAATTTGTAAACATAATTAGAATATCTAAGCAGTTCGAATACTTCCAACAGTACCAGC
AACGAGTGAGCGCATTGATCGGACCAGAAGCTACACAACAGCTAGTTAACCAAGCTCTTG
TCTTAATCACACTCGGTGGAAATGATTTCGTTAACAACTATTATCTCATTCCTTTCTCTG
CCCGCTCTCGCCAGTTCACGTTACCGAACTACGTTGTTTATCTCATTTCCGAATACGGAA
AGATCCTTAGGAAACTCTATGAGTTGGGTGCAAGACGGGTTCTAGTAACCGGAACTGGTG
CGATGGGATGTGCACCTGCGGAACTGGCTCAGCATAGTCGAAATGGCGAATGCTATGGTG
CTCTACAAACAGCAGCCGCTTTGTTCAATCCGCAATTAGTTAATTTGATCGCATCAGTCA
ATGCTGAGATCGGTCAGGACGTTTTTGTAGCAGCCAATGCCTATCAAATGAACATGGATT
ATCTAACTAATCCAGAGCAATTCGGGTTTGTGACATCAAAGGTGGCATGTTGTGGACAAG
GACCGTACAATGGCATAGGACTATGCACACCAATCTCGAACTTATGTCCAAACAGAGATT
TATATGCGTTTTGGGATGCGTTTCATCCGACAGAGAAAGCTAATAGGATCATTGTTAATC
AGATCCTCACTGGTTCCTCCAAGTATATGCACCCTATGAACCTCAGTACCGTCATGCTCT
TGGATTCCTCTAGAATCTAATCTTTT*ATTTCAGTTAAATGTCAAGGCATTGCCCTCCTT
TTGTAGTGTGCATTGTTGATTAATAACTTTGATCAGCATAATTAAAAAACTTTTCGTGTT
GGTGATGTGGTTTGATGTTTCTGCTTGTTGTACCTTGATGATTAGCTTAGTTTAGTCATT
TTTTTCATGTATGTGTGCCAACTATCATGTAATATTTGGAGTCATTGTTATATGG*TTTT
CTGTTTTACTCGAGATTATTGATTCAACC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV73TF U 3
AF RR2AH13TF U 1
AF RR2DI85TF U 104
AF RR2FE54TF U 704
AF RR2F318TF U 587
AF RR2AH13JQ C 548
AF RR2AD44TF U 620
AF RR2AD44JQ C 738
AF RR2F318JQ C 761
AF RR2FE54JQ C 785
BS 1 206 RR2AH13TF
BS 207 207 RR2DV73TF
BS 208 210 RR2AH13TF
BS 211 211 RR2DV73TF
BS 212 214 RR2AH13TF
BS 215 215 RR2DV73TF
BS 216 232 RR2AH13TF
BS 233 233 RR2DV73TF
BS 234 459 RR2AH13TF
BS 460 460 RR2DV73TF
BS 461 666 RR2AH13TF
BS 667 669 RR2DI85TF
BS 670 670 RR2F318TF
BS 671 761 RR2DI85TF
BS 762 762 RR2FE54TF
BS 763 829 RR2DI85TF
BS 830 1088 RR2FE54TF
BS 1089 1089 RR2F318TF
BS 1090 1147 RR2FE54TF
BS 1148 1148 RR2F318TF
BS 1149 1284 RR2FE54TF
BS 1285 1285 RR2F318TF
BS 1286 1299 RR2FE54TF
BS 1300 1324 RR2F318TF
BS 1325 1325 RR2AD44TF
BS 1326 1329 RR2F318TF
BS 1330 1330 RR2AD44TF
BS 1331 1352 RR2F318TF
BS 1353 1375 RR2AD44TF
BS 1376 1376 RR2AH13JQ
BS 1377 1391 RR2AD44TF
BS 1392 1409 RR2F318JQ

RD RR2DV73TF 646 0 0
GG
AACTTAAAATTCTTTCTCCCCATTCGTTATCCAAACCCCATCTCTTCCCACAACTATGGA
AACTAATTATTCTCCATTAGGGTTTCTAATTTCACTCTTCATCGTTGTTACTTTTCTTGC
ACCACAAGTCAAATCTAGGGCTTTCTACGTATTTGGTGACTCTCTCGTCGACAATGGAAA
CAACGATTACTTAGTCACCACTGCTCGTGCCGACAACTACCCATATGGTATCGATTACCC
GACCCGTCGACCCACCGGACGTTTCTCAAATGGCCTCAACATCCCCGACATTATCAGTGA
GGCTATAGGCATGCCGTCGACTCTGCCGTACCTTAGCCCGCAGCTCACAGGACAAAATCT
TCTCGTAGGTGCTAACTTCGCCTCCGCCGGAATTGGAATCCTCAACGACACTGGAATTCA
ATTTGTAAACATAATTAGAATATCTAAGCAGTTCGAATACTTCCAACAGTACCAGCAACG
AGTGAGCGCATTGATCGGACCAGAAGCTACACAACAGCTAGTTAACCAAGCTCTTGTCTT
AATCACACTCGGTGGAAATGATTTCGTTAACAACTATTATCTCATTCCTTTCTCTGCCCG
CTCTCGCCAGTTCACGTTACCGAACTACGTTGTTTATCTCATTT

QA 3 646 3 646
DS 

RD RR2AH13TF 666 0 0
GGCCAACTTAAAATTCTTTCTCCCCATTCGTTATCCAAACCCCATCTCTTCCCACAACTA
TGGAAACTAATTATTCTCCATTAGGGTTTCTAATTTCACTCTTCATCGTTGTTACTTTTC
TTGCACCACAAGTCAAATCTAGGGCTTTCTACGTATTTGGTGACTCTCTCGTCGACAATG
GAAACAACGATTACTTAGTCACCACTACTCATGCTGACAACTACCCATATGGCATCGATT
ACCCGACCCGTCGACCCACCGGACGTTTCTCAAATGGCCTCAACATCCCCGACATTATCA
GTGAGGCTATAGGCATGCCGTCGACTCTGCCGTACCTTAGCCCGCAGCTCACAGGACAAA
ATCTTCTCGTAGGTGCTAACTTCGCCTCCGCCGGAATTGGAATCCTCAACGACACTGGAA
TTCAATTTGTAAACATAATTAGAATATCTAAGCAGTTCGGATACTTCCAACAGTACCAGC
AACGAGTGAGCGCATTGATCGGACCAGAAGCTACACAACAGCTAGTTAACCAAGCTCTTG
TCTTAATCACACTCGGTGGAAATGATTTCGTTAACAACTATTATCTCATTCCTTTCTCTG
CCCGCTCTCGCCAGTTCACGTTACCGAACTACGTTGTTTATCTCATTTCCGAATACGGAA
AGATCC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2DI85TF 726 0 0
G
ATCGTTGTTACTTTTCTTGCACCACAAGTCAAATCTAGGGCTTTCTACGTATTTGGTGAC
TCTCTCGTCGACAATGGAAACAACGATTACTTAGTCACCACTGCTCGTGCCGACAACTAC
CCATATGGTATCGATTACCCGACCCGTCGACCCACCGGACGTTTCTCAAATGGCCTCAAC
ATCCCCGACATTATCAGTGAGGCTATAGGCATGCCGTCGACTCTGCCGTACCTTAGCCCG
CAGCTCACAGGACAAAATCTTCTCGTAGGTGCTAACTTCGCCTCCGCCGGAATTGGAATC
CTCAACGACACTGGAATTCAATTTGTAAACATAATTAGAATATCTAAGCAGTTCGAATAC
TTCCAACAGTACCAGCAACGAGTGAGCGCATTGATCGGACCAGAAGCTACACAACAGCTA
GTTAACCAAGCTCTTGTCTTAATCACACTCGGTGGAAATGATTTCGTTAACAACTATTAT
CTCATTCCTTTCTCTGCCCGCTCTCGCCAGTTCACGTTACCGAACTACGTTGTTTATCTC
ATTTCCGAATACGGAAAGATCCTTATGAAACTCTATGAGTTGGGTGCAAGACGGGTTCTA
GTAACCGGAACTGGTGCGATGGGATGTGCACCTGCGGAACTGGCTCAGCATAGTCGAGAT
GGCGAATGCTATGGTGCTCTACAAACAGCAGCCGCTTTGTTCAATCCGCAATTAGTTAAT
TTGAT

QA 2 726 2 726
DS 

RD RR2FE54TF 596 0 0
G
GTAACCGGAACTGGTGCGATGGGATGTGCACCTGCGGAACTGGCTCAGCATAGTCGAAAT
GGCGAATGCTATGGTGCTCTACAAACAGCAGCCGCTTTGTTCAATCCGCAATTAGTTAAT
TTGATCGCATCAGTCAATGCTGAGATCGGTCAGGACGTTTTTGTAGCAGCCAATGCCTAT
CAAATGAACATGGATTATCTAACTAATCCAGAGCAATTCGGGTTTGTGACATCAAAGGTG
GCATGTTGTGGACAAGGACCGTACAATGGCATAGGACTATGCACACCAATCTCGAACTTA
TGTCCAAACAGAGATTTATATGCGTTTTGGGATGCGTTTCATCCGACAGAGAAAGCTAAT
AGGATCATTGTTAATCAGATCCTCGCTGGTTCCTCCAAGTATATGCACCCTATGAACCTC
AGTACCGTCATGCTCTTGGATTCTTCTAGAATCTAATCTTTT*ATTTCAGTTAAATGTCA
AGGCATTGCCCTCCTTTTGTAGTGTGCATTGTTGATTAATAACTTTGATCAGCATAATTA
AAAAACTTTTCGTGTTGGTGATGTGGTTTGATGTTTCTGCATGTTGTACCTTGAT

QA 2 596 2 596
DS 

RD RR2F318TF 766 0 0
G
ATTCCTTTCTCTGCCCGCTCTCGCCAGTTCACGTTACCGAACTACGTTGTTTATCTCATT
TCCGAATACGGAAAGATCCTTAGGAAACTCTATGAGTTGGGTGCAAGACGGGTTCTAGTA
ACCGGAACTGGTGCGATGGGATGTGCACCTGCGGAACTGGCTCAGCATAGTCGAAATGGC
GAATGCTATGGTGCTCTACAAACAGCAGCCGCTTTGTTCAATCCGCAATTAGTTAATTTG
ATCGCATCAGTCAATGCTGAGATCGGTCAGGACGTTTTTGTAGCAGCCAATGCCTATCAA
ATGAACATGGATTATCTAACTAATCCAGAGCAATTCGGGTTTGTGACATCAAAGGTGGCA
TGTTGTGGACAAGGACCGTACAATGGCATAGGACTATGCACACCAATCTCGAACTTATGT
CCAAACAGAGATTTATATGCGTTTTGGGATGCGTTTCATCCGACAGAGAAAGCTAATAGG
ATCATTGTTAATCAGATCCTCACTGGTTCCTCCAAGTATATGCACCCTATGAACCTCAGT
ACCGTCATGCTCTTGGATTCCTCTAGAATCTAATCTTTT*ATTTCAGTTAAATGTCAAGG
CATTGCCCTCCTTTTGTAGTGTGCATTGTTGATTAATAACTTTGATCAGCATAATTAAAA
A*CTTTTCGTGTTGGTGATGTGGTTTGATGTTTCTGCTTGTTGTACCTTGATGATTAGCT
TAGTTTAGTCATTTTTT*CATGCATGTGTGCCAACTATCATGTAA

QA 2 766 2 766
DS 

RD RR2AH13JQ 837 0 0
CACACTCGGTGGAAATGATTTCGTTAACAACTATTATCTCATTCCTTTCTCTGCCCGCTC
TCGCCAGTTCACGTTACCGAACTACGTTGTTTATCTCATTTCCGAATACGGAAAGATCCT
TAGGAAACTCTATGAGTTGGGTGCAAGACGGGTTCTAGTAACCGGAACTGGTGCGATGGG
ATGTGCACCTGCGGAACTGGCTCAGCATAGTCGAAATGGCGAATGCTATGGTGCTCTACA
AACAGCAGCCGCTTTGTTCAATCCGCAATTAGTTAATTTGATCGCATCAGTCAATGCTGA
GATCGGTCAGGACGTTTTTGTAGCAGCCAATGCCTATCAAATGAACATGGATTATCTAAC
TAATCCAGAGCAATTCGGGTTTGTGACATCAAAGGTGGCATGTTGTGGACAAGGACCGTA
CAATGGCATAGGACTATGCACACCAATCTCGAACTTATGTCCAAACAGAGATTTATATGC
GTTTTGGGATGCGTTTCATCCGACAGAGAAAGCTAATAGGATCATTGTTGATCAGATCCT
CACTGGTTCCTCCAAGTATATGCACCCTATGAACCTCAGTACCGTCATGCTCTTGGATTC
CTCTAGAATCTAATCTTTT*ATTTCAGTTAAATGTCAAGGCATTGCCCTCCTTTTGTAGT
GTGCATTGTTGATTAATAACTTTGATCAGCATAATTAAAAAACTTTTCGTGTTGGTGATG
TGGTTTGATGTTTCTGCTTGTTGTACCTTGATGATTAGCTTAGTTTAGTCATTTTTTTCA
TGTATGTGTGCCAACTATCATGTAATATTTGGAGTCATT**TATATGG*TTTTCTGT

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR2AD44TF 773 0 0
GTTACCGAACTACGTTGTTTATCTCATTTCCGAATACGGAAAGATCCTTAGGAAACTCTA
TGAGTTGGGTGCAAGACGGGTTCTAGTAACCGGAACTGGTGCGATGGGATGTGCACCTGC
GGAACTGGCTCAGCATAGTCGAAATGGCGAATGCTATGGTGCTCTACAAACAGCAGCCGC
TTTGTTCAATCCGCAATTAGTTAATTTGATCGCATCAGTCAATGCTGAGATCGGTCAGGA
CGTTTTTGTAGCAGCCAATGCCTATCAAATGAACATGGATTATCTAACTAATCCAGAGCA
ATTCGGGTTTGTGACATCAAAGGTGGCATGTTGTGGACAAGGACCGTACAATGGCATAGG
ACTATGCACACCAATCTCGAACTTATGTCCAAACAGAGATTTATATGCGTTTTGGGATGC
GTTTCATCCGACAGAGAAAGCTAATAGGATCATTGTTAATCAGATCCTCACTGGTTCCTC
CAAGTATATGCACCCTATGAACCTCAGTACCGTCATGCTCTTGGATTCCTCTAGAATCTA
ATCTTTTTATTTCAGTTAAATGTCAAGGCATTGCCCTCCTTTTGTAGTGTGCATTGTTGA
TTAATAACTTTGATCAGCATAATTAAAAAACTTTTCGTGTTGGTGATGTGGTTTGATGTT
TCTGCTTGTTGTACCTTGATGATTAGCTTAGTTTAGTCATTTTTTTCATGTATGTGTGCC
AACTATCATGTAATATTTGGAGTCATTGTTATATGGGTTTTCTGTTTTACTC
C

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2AD44JQ 655 0 0
GCGGAACTGGCTCAGCATAGTCGAAATGGCGAATGCTATGGTGCTCTACAAACAGCAGCC
GCTTTGTTCAATCCGCAATTAGTTAATTTGATCGCATCAGTCAATGCTGAGATCGGTCAG
GACGTTTTTGTAGCAGCCAATGCCTATCAAATGAACATGGATTATCTAACTAATCCAGAG
CAATTCGGGTTTGTGACATCAAAGGTGGCATGTTGTGGACAAGGACCGTACAATGGCATA
GGACTATGCACACCAATCTCGAACTTATGTCCAAACAGAGATTTATATGCGTTTTGGGAT
GCGTTTCATCCGACAGAGAAAGCTAATAGGATCATTGTTAATCAGATCCTCACTGGTTCC
TCCAAGTATATGCACCCTATGAACCTCAGTACCGTCATGCTCTTGGATTCCTCTAGAATC
TAATCTTTT*ATTTCAGTTAAATGTCAAGGCATTGCCCTCCTTTTGTAGTGTGCATTGTT
GATTAATAACTTTGATCAGCATAATTAAAAAACTTTTCGTGTTGGTGATGTGGTTTGATG
TTTCTGCTTGTTGTACCTTGATGATTAGCTTAGTTTAGTCATTTTTTTCATGTATGTGTG
CCAACTATCATGTAATATTTGGAGTCATTGTTATATGG*TTTTCTGTTTTACTC
C

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2F318JQ 649 0 0
AAATGGCGAATGCTATGGTGCTCTACAAACAGCAGCCGCTTTGTTCAATCCGCAATTAGT
TAATTTGATCGCATCAGTCAATGCTGAGATCGGTCAGGACGTTTTTGTAGCAGCCAATGC
CTATCAAATGAACATGGATTATCTAACTAATCCAGAGCAATTCGGGTTTGTGACATCAAA
GGTGGCATGTTGTGGACAAGGACCGTACAATGGCATAGGACTATGCACACCAATCTCGAA
CTTATGTCCAAACAGAGATTTATATGCGTTTTGGGATGCGTTTCATCCGACAGAGAAAGC
TAATAGGATCATTGTTAATCAGATCCTCACTGGTTCCTCCAAGTATATGCACCCTATGAA
CCTCAGTACCGTCATGCTCTTGGATTCCTCTAGAATCTAATCTTTT*ATTTCAGTTAAAT
GTCAAGGCATTGCCCTCCTTTTGTAGTGTGCATTGTTGATTAATAACTTTGATCAGCATA
ATTAAAAAACTTTTCGTGTTGGTGATGTGGTTTGATGTTTCTGCTTGTTGTACCTTGATG
ATTAGCTTAGTTTAGTCATTTTTTTCATGCATGTGTGCCAACTATCATGTAATATTTGGA
GTCATTGTTATATGG*TTTTCTGTTTTACTCGAGATTATTGATTCAACC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2FE54JQ 613 0 0
ACAAACAGCAGCCGCTTTGTTCAATCCGCAATTAGTTAATTTGATCGCATCAGTCAATGC
TGAGATCGGTCAGGACGTTTTTGTAGCAGCCAATGCCTATCAAATGAACATGGATTATCT
AACTAATCCAGAGCAATTCGGGTTTGTGACATCAAAGGTGGCATGTTGTGGACAAGGACC
GTACAATGGCATAGGACTATGCACACCAATCTCGAACTTATGTCCAAACAGAGATTTATA
TGCGTTTTGGGATGCGTTTCATCCGACAGAGAAAGCTAATAGGATCATTGTTAATCAGAT
CCTCGCTGGTTCCTCCAAGTATATGCACCCTATGAACCTCAGTACCGTCATGTTCTTGGA
TTCTTCTAGAATTTAATCTTTT*ATTTCAGTTAAATGTCAAGGCATTGCCCTCCTTTTGT
AGTGTGCATTGTTGATTAATAACTTTGATCAGCATAATTAAAAAACTTTTCGTGTTGGTG
ATGTGGTTTGATGTTTCTGCATGTTGTACCTTGATGATTAGCTTAGTTTAGTCATTTTTT
TCATGTATGTGTGCCAACTATCATGTGATATTTGGAGTCATTGTTATATGG*TTTTCTGT
TTTACTC
GAGACC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 10

CO CL595Contig1 837 10 5 U
GGACAAAATAACCCTTCTTTATCCTCAACAAAACCAACCTTTCAGTTTGTTCTTCTGCAC
AATCTCTCATACTTCTATTTCTCCCTCTCCTTTCACAAGGAAGGGCGTAGAAGATACCAA
AAAACTCAAGCACAAGAGTAATAATATAACTCATCTATACAAAGAAAAAAATACAAAATG
GGTGGTGTCAAATTGTTATTCATCTTTGGCCTCTTGGTTTTAGCTATGGTAGCTAAATCT
GTAAATGCAACCTATCCATTAACTAAATCTTGCATCAACGGGCAAGGTTGCATCGGAGAC
GACGATGAACTCGAGTCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGCCAGCTTGCTAGAGGA
CGTCGTTACATTGGATACGATGCTCTCAAAAAGAACAACGTGCCTTGCAATAGACGTGGC
CGATCTTACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCAGT
GCGATCACGCATTGCTATAGGTACGCGAAATAAGAAACAGAATGATAGAGAGGAGGATTT
GATTCAACACGGTTCGATCTTCATTCATTCCTCATTCTTGATCGCTAATAATTTTCTTTC
TTAACGTACCATATGTTATACGTTTGATTCATTTTATATTTACTTTTGTTCTTTTTTGTT
TCTTTATTTCATCATGATGCATATAAGCTTTTGATTCATTTATATATCGCCTTTTTTTCC
TTTGTTGTTGTTGTCCTTGTGTTTCGTTTCGTTCATATATTTAAGTTCCGTTTGTCTATT
ATATACATCATATGATGTTCTTAGTACAATTAAGCATTTGTTTTTAAATGAGGGCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 25 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD12TF U 47
AF RR2HB47JQ C 1
AF RR2HB47TF U 1
AF RR2GH44TF U 57
AF RR2CZ08TF U 58
AF RR2CZ08JQ C 77
AF RR2GH44JQB C 77
AF RR2DD12JQ C 68
AF RR2EZ46TF U 57
AF RR2EZ46JQ C 317
BS 1 622 RR2HB47TF
BS 623 623 RR2DD12TF
BS 624 701 RR2HB47TF
BS 702 824 RR2EZ46TF
BS 825 837 RR2EZ46JQ

RD RR2DD12TF 604 0 0
GG
GTTCTTCTGCACAATCTCTCATACTTCTATTTCTCCCTCTCCTTTCACAAGGAAGGGCGT
AGAAGATACCAAAAAACTCAAGCACAAGAGTAATAATATAACTCATCTATACAAAGAAAA
AAATACAAAATGGGTGGTGTCAAATTGTTATTCATCTTTGGCCTCTTGGTTTTAGCTATG
GTAGCTAAATCTGTAAATGCAACCTATCCATTAACTAAATCTTGCATCAACGGGCAAGGT
TGCATCGGAGACGACGATGAACTCGAGTCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGCCAG
CTTGCTAGAGGACGTCGTTACATTGGATACGATGCTCTCAAAAAGAACAACGTGCCTTGC
AATAGACGTGGCCGATCTTACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGG
CGTGGATGCAGTGCGATCACGCATTGCTATAGGTACGCGAAATAAGAAACAGAATGATAG
AGAGGAGGATTTGATTCAACACGGTTCGATCTTCATTCATTCCTCATTCTTGATCGCTAA
TAATTTTCTTTCTTAACGTACCATATGTTATACGTTTGATTCATTTTATATTTACTTTTG
TT

QA 3 604 3 604
DS 

RD RR2HB47JQ 701 0 0
GGACAAAATAACCCTTCTTTATCCTCAACAAAACCAACCTTTCAGTTTGTTCTTCTGCAC
AATCTCTCATACTTCTATTTCTCCCTCTCCTTTCACAAGGAAGGGCGTAGAAGATACCAA
AAAACTCAAGCACAAGAGTAATAATATAACTCATCTATACAAAGAAAAAAATACAAAATG
GGTGGTGTCAAATTGTTATTCATCTTTGGCCTCTTGGTTTTAGCTATGGTAGCTAAATCT
GTAAATGCAACCTATCCATTAACTAAATCTTGCATCAACGGGCAAGGTTGCATCGGAGAC
GACGATGAACTCGAGTCTTTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGCCAGCTTGCTAGAGGA
CGTCGTTACATTGGATACGATGCTCTCAAAAAGAACAACGTGCCTTGCAATAGACGTGGC
CGATCTTACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCAGT
GCGATCACGCATTGCTATAGGTACGCGAAATAAGAAACAGAATGATAGAGAGGAGGATTT
GATTCAACACGGTTCGATCTTCATTCATTCCTCATTCTTGATCGCTAATAATTTTCTTTC
TTAACGTACCATATGTTATACGGTTGATTCATTTTATATTTACTTTTGTTCTTTTTTGTT
TCTTTATTTCATCATGATGCATATAAGCTTTTGATTCATTT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2HB47TF 701 0 0
GGACAAAATAACCCTTCTTTATCCTCAACAAAACCAACCTTTCAGTTTGTTCTTCTGCAC
AATCTCTCATACTTCTATTTCTCCCTCTCCTTTCACAAGGAAGGGCGTAGAAGATACCAA
AAAACTCAAGCACAAGAGTAATAATATAACTCATCTATACAAAGAAAAAAATACAAAATG
GGTGGTGTCAAATTGTTATTCATCTTTGGCCTCTTGGTTTTAGCTATGGTAGCTAAATCT
GTAAATGCAACCTATCCATTAACTAAATCTTGCATCAACGGGCAAGGTTGCATCGGAGAC
GACGATGAACTCGAGTCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGCCAGCTTGCTAGAGGA
CGTCGTTACATTGGATACGATGCTCTCAAAAAGAACAACGTGCCTTGCAATAGACGTGGC
CGATCTTACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCAGT
GCGATCACGCATTGCTATAGGTACGCGAAATAAGAAACAGAATGATAGAGAGGAGGATTT
GATTCAACACGGTTCGATCTTCATTCATTCCTCATTCTTGATCGCTAATAATTTTCTTTC
TTAACGTACCATATGTTATACGGTTGATTCATTTTATATTTACTTTTGTTCTTTTTTGTT
TCTTTATTTCATCATGATGCATATAAGCTTTTGATTCATTT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2GH44TF 643 0 0
GG
ACAATCTCTCATACTTCTATTTCTCCCTCTCCTTTCACAAGGAAGGGCGTAGAAGATACC
AAAAAACTCAAGCACAAGAGTAATAATATAACTCATCTATACAAAGAAAAAAATACAAAA
TGGGTGGTGTCAAATTGTTATTCATCTTTGGCCTCTTGGTTTTAGCTATGGTAGCTAAAT
CTGTAAATGCAACCTATCCATTAACTAAATCTTGCATCAACGGGCAAGGTTGCATCGGAG
ACGACGATGAACTCGAGTCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGCCAGCTTGCTAGAG
GACGTCGTTACATTGGATACGATGCTCTCAAAAAGAACAACGTGCCTTGCAATAGACGTG
GCCGATCTTACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCA
GTGCGATCACGCATTGCTATAGGTACGCGAAATAAGAAACAGAATGATAGAGAGGAGGAT
TTGATTCAACACGGTTCGATCTTCATTCATTCCTCATTCTTGATCGCTAATAATTTTCTT
TCTTAACGTACCATATGTTATACGTTTGATTCATTTTATATTTACTTTTGTTCTTTTTT*
TTTCTTTATTTCATCATGATGCATATAAGCTTTTGAT
CCAA

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR2CZ08TF 644 0 0
G
ACAATCTCTCATACTTCTATTTCTCCCTCTCCTTTCACAAGGAAGGGCGTAGAAGATACC
AAAAAACTCAAGCACAAGAGTAATAATATAACTCATCTATACAAAGAAAAAAATACAAAA
TGGGTGGTGTCAAATTGTTATTCATCTTTGGCCTCTTGGTTTTAGCTATGGTAGCTAAAT
CTGTAAATGCAACCTATCCATTAACTAAATCTTGCATCAACGGGCAAGGTTGCATCGGAG
ACGACGATGAACTCGAGTCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGCCAGCTTGCTAGAG
GACGTCGTTACATTGGATACGATGCTCTCAAAAAGAACAACGTGCCTTGCAATAGACGTG
GCCGATCTTACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCA
GTGCGATCACGCATTGCTATAGGTACGCGAAATAAGAAACAGAATGATAGAGAGGAGGAT
TTGATTCAACACGGTTCGATCTTCATTCATTCCTCATTCTTGATCGCTAATAATTTTCTT
TCTTAACGTACCATATGTTATACGTTTGATTCATTTTATATTTACTTTTGTTCTTTTTTG
TTTCTTTATTTCATCATGATGCATATAAGCTTTTGATTTATTT

QA 2 644 2 644
DS 

RD RR2CZ08JQ 624 0 0
ATTTCTCCCTCTCCTTTCACAAGGAAGGGCGTAGAAGATACCAAAAAACTCAAGCACAAG
AGTAATAATATAACTCATCTATACAAAGAAAAAAATACAAAATGGGTGGTGTCAAATTGT
TATTCATCTTTGGCCTCTTGGTTTTAGCTATGGTAGCTAAATCTGTAAATGCAACCTATC
CATTAACTAAATCTTGCATCAACGGGCAAGGTTGCATCGGAGACGACGATGAACTCGAGT
CTTTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGCCAGCTTGCTAGAGGACGTCGTTACATTGGAT
ACGATGCTCTCAAAAAGAACAACGTGCCTTGCAATAGACGTGGCCGATCTTACTACGATT
GCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCAGTGCGATCACGCATTGCT
ATAGGTACGCGAAATAAGAAACAGAATGATAGAGAGGAGGATTTGATTCAACACGGTTCG
ATCTTCATTCATTCCTCATTCTTGATCGCTAATAATTTTCTTTCTTAACGTACCATATGT
TATACGTTTGATTCATTTTATATTTACTTTTGTTCTTTTTTGTTTCTTTATTTCATCATG
ATGCATATAAGCTTTTGATT
TATT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2GH44JQB 621 0 0
ATTTCTCCCTCTCCTTTCACAAGGAAGGGCGTAGAAGATACCAAAAAACTCAAGCACAAG
AGTAATAATATAACTCATCTATACAAAGAAAAAAATACAAAATGGGTGGTGTCAAATTGT
TATTCATCTTTGGCCTCTTGGTTTTAGCTATGGTAGCTAAATCTGTAAATGCAACCTATC
CATTAACTAAATCTTGCATCAACGGGCAAGGTTGCATCGGAGACGACGATGAACTCGAGT
CTTTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGCCAGCTTGCTAGAGGACGTCGTTACATTGGAT
ACGATGCTCTCAAAAAGAACAACGTGCCTTGCAATAGACGTGGCCGATCTTACTACGATT
GCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCAGTGCGATCACGCATTGCT
ATAGGTACGCGAAATAAGAAACAGAATGATAGAGAGGAGGATTTGATTCAACACGGTTCG
ATCTTCATTCATTCCTCATTCTTGATCGCTAATAATTTTCTTTCTTAACGTACCATATGT
TATACGTTTGATTCATTTTATATTTACTTTTGTTCTTTTTTTTTTCTTTATTTCATCATG
ATGCATATAAGCTTTTGAT
CC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2DD12JQ 654 0 0
CATACTTCTATTTCTCCCTCTCCTTTCACAAGGAAGGGCGTAGAAGATACCAAAAAACTC
AAGCACAAGAGTAATAATATAACTCATCTATACAAAGAAAAAAATACAAAATGGGTGGTG
TCAAATTGTTATTCATCTTTGGCCTCTTGGTTTTAGCTATGGTAGCTAAATCTGTAAATG
CAACCTATCCATTAACTAAATCTTGCATCAACGGGCAAGGTTGCATCGGAGACGACGATG
AACTCGAGTCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGCCAGCTTGCTAGAGGACGTCGTT
ACATTGGATACGATGCTCTCAAAAAGAACAACGTGCCTTGCAATAGACGTGGCCGATCTT
ACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCAGTGCGATCA
CGCATTGCTATAGGTACGCGAAATAAGAAACAGAATGATAGAGAGGAGGATTTGATTCAA
CACGGTTCGATCTTCATTCATTCCTCATTCTTGATCGCTAATAATTTTCTTTCTTAACGT
ACCATATGTTATACGTTTGATTCATTTTATATTTACTTTTGTTCTTTTTTGTTTCTTTGT
TTCATCATGATGCATATAAGCTTTTGATTCATTTATATATCGCCTTTTTTTCCT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2EZ46TF 773 0 0
GG
ACAATCTCTCATACTTCTATTTCTCCCTCTCCTTTCACAAGGAAGGGCGTAGAAGATACC
AAAAAACTCAAGCGCAAGAGTAATAATATAACTCATCTATACAAAGAAAAAAATACAAAA
TGGGTGGTGTCAAATTGTTATTCATCTTTGGCCTCTTGGTTTTAGCTATGATAGCTAAAT
CTGTAAATGCAACCTATCCATTAACTAAATCTTGCATCAACGGGCAAGGTTGCATCGGAG
ACGACGATGAACTCGAGTCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGCCAGCTTGCTAGAG
GACGTCGTTACATTGGATACGATGCTCTCAAAAAGAACAACGTGCCTTGCAATAGACGTG
GCCGATCTTACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCA
GTGCGATCACGCATTGCTATAGGTACGCGAAATAAGAAACAGACTGATAGAGAGGAGGAT
TTGATTCAACACGGTTCGATCTTCATTCATTCCTCATTCTTGATCGCTAATAATTTTCTT
TCTTAACGTACCATATGTTATACGTTTGATTCATTTTATATTTACTTTTGTTCTTTTTTG
TTTCTTTATTTCATCATGATGCATATAAGCTTTTGATTCATTTATATATCGCCTTTTTTT
CCTTTGTTGTTGTTGTCCTTGTGTTTCGTTTCGTTCATATATTTAAGTTCCGTTTGTCTA
TTATATACATCATATGATGTTCTTAGTACAATTAAGCATTTGTTTT
AAATG

QA 3 768 3 768
DS 

RD RR2EZ46JQ 521 0 0
CTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGCCAGCTTGCTAGAGGACGTCGTTACATTGGAT
ACGATGCTCTCAAAAAGAACAACGTGCCTTGCAATAGACGTGGCCGATCTTACTACGATT
GCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCAGTGCGATCACGCATTGCT
ATAGGTACGCGAAATAAGAAACAGACTGATAGAGAGGAGGATTTGATTCAACACGGTTCG
ATCTTCATTCATTCCTCATTCTTGATCGCTAATAATTTTCTTTCTTAACGTACCATATGT
TATACGTTTGATTCATTTTATATTTACTTTTGTTCTTTTTTGTTTCTTTATTTCATCATG
ATGCATATAAGCTTTTGATTCATTTATATATCGCCTTTTTTTCCTTTGTTGTTGTTGTCC
TTGTGTTTCGTTTCGTTCATATATTTAAGTTCCGTTTGTCTATTATATACATCATATGAT
GTTCTTAGTACAATTAAGCATTTGTTTTTAAATGAGGGCCC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 10

CO CL596Contig1 839 10 3 U
GCGAGGAAACAGTGAAGAAACAAAAAGAACACAAGTCATATCGTTTTTTGCCGGCTGGAG
AAAAAAACATCTTTCTTCCGCTTCTTGATTTTCAACTAAGAGTTATCGTTTGAAATCGGT
TTGATTCAGCAAGACATGGCAAACGCGGCATCAGGAATGGCTGTGCATGATGATTGCAAG
CTCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTACCATAGTCTACAAGATTGAG
GACAAGCAAGTGATCGTGGACAAACTAGGCGAGCCTGAACAATCATACGATGACTTTGCA
GCAAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCATTTATGACTTCGACTTTGTCACCGAA
GAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCGTGGTCTCCTGACACTGCCAAAGTG
AGAGACAAGATGATATACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTCAAGAGAGAACTGGATGGGATT
CAAGTGGAGCTTCAAGCGACCGATCCAACCGAGATGGGGCTTGATGTTTTCAAGAGCCGC
ACCAACTAAAAAGCTAAAATCCCCCCCCCCCCCCC**ACCCTTGAATAAATTTGTTTCTG
GAGTGAATTTATGTGTGTCTGTTAACTGTTGTTCCCTCTGACGAGTATGAAACTATTAAC
ATCTTCCTTTTATTTGGGTATTGTTATCGTCTTTCGTGTTCTCTTGATGATCATGTGTTT
CATCATCTATGAACTTGTGAGATTGTGCTGCCTTGCCTTCTGGCGGTTTGCAATCTTTTG
TGTCAGTTTATTTATGTACAATACTTTGAAAAATCAGATTGGAGTTTATTGATTGATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP10TF U 52
AF RR2GW33TF U 51
AF RR2BJ55JQ C 551
AF RR2BJ55TF U 51
AF RR2C589TF U 44
AF RR2FE37TF U 51
AF RR2B581TF U 1
AF RR2B581JQ C 100
AF RR2FE37JQ C 556
AF RR2FP10JQ C 561
BS 1 806 RR2B581TF
BS 807 827 RR2B581JQ
BS 828 839 RR2FE37JQ

RD RR2FP10TF 208 0 0
G
GGCTGGAGAAAAAAACATCTTTCTTCCGCTTCTTGATTTTCAACTAAGAGTTATCGTTTG
AAATCGGTTTGATTCAGCAAGACATGGCAAACGCGGCATCAGGAATGGCTGTGCATGATG
ATTGCAGGCTCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTACCATAGTCTACA
AGATTGAGGACAAGCAAGTGATCGTGG

QA 2 208 2 208
DS 

RD RR2GW33TF 505 0 0
CC
GGCTGGAGAAAAAAACATCTTTCTTCCGCTTCTTGATTTTCAACTAAGAGTTATCGTTTG
AAATCGGTTTGATTCAGCAAGACATGGCAAACGCGGCATCAGGAATGGCTGTGCATGATG
ATTGCAAGCTCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTACCATAGTCTACA
AGATTGAGGACAAGCAAGTGATCGTGGACAAACTAGGCGAGCCTGAACAATCATACGATG
ACTTTGCAGCAAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCATTTATGACTTCGACTTTG
TCACCGAAGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCGTGGTCTCCTGACACTG
CCAAAGTGAGAGACAAGATGATATACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTCGAGAGAGAACTGG
ATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAAGCGACCGATCCAACCGAGATGGGGCTTGATGTTTTCA
AGAGCCGCACCAACTAAAA
GCTA

QA 3 501 3 501
DS 

RD RR2BJ55JQ 121 0 0
AAAAGCTAAAAT
CCCCCCCCCCCCC**ACCCTTGAATAAATTTGTTTCTGGAGTGAATTTATGCGTGTCTGT
TAACTGTTGTTCCCTCTGACGAGTATGAAACTATTAACATCTTCCTTTT

QA 13 121 13 121
DS 

RD RR2BJ55TF 621 0 0
GG
GGCTGGAGAAAAAAACATCTTTCTTCCGCTTCTTGATTTTCAACTAAGAGTTATCGTTTG
AAATCGGTTTGATTCAGCAAGACATGGCAAACGCGGCATCAGGAATGGCTGTGCATGATG
ATTGCAAGCTCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTACCATAGTCTACA
AGATTGAGGACAAGCAAGTGATCGTGGACAAACTAGGCGAGCCTGAACAATCATACGATG
ACTTTGCAGCAAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCATTTATGACTTCGACTTTG
TCACCGAAGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCGTGGTCTCCTGACACTG
CCAAAGTGAGAGACAAGATGATATACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTCAAGAGAGAACTGG
ATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAAGCGACCGATCCAACCGAGATGGGGCTTGATGTTTTCA
AGAGCCGCACCAACTAAAAAGCTAAAATCCCCCCCCCCCCC****ACCCTTGAATAAATT
TGTTTCTGGAGTGAATTTATGCGTGTCTGTTAACTGTTGTTCCCTCTGACGAGTATGAAA
CTATTAACATCTTCCTTTT

QA 3 621 3 621
DS 

RD RR2C589TF 682 0 0
TTTTTTGCCGGT
TGGAGAAAAAAACATCTTTCTTCCGCTTCTTGATTTTCAACTAAGAGTTATCGTTTGAAG
TCGGTTTGATTCAGCAAGACATGGCAAACGCGGCATCAGGAATGGCTGTGCATGATGATT
GCAAGCTCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTACCATAGTCTACAAGA
TTGAGGACAAGCAAGTGATCGTGGACAAACTAGGCGAGCCTGAACAATCATACGATGACT
TTGCAGCAAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCATTTATGACTTCGACTTTGTCA
CCGAAGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCGTGGTCTCCTGACACTGCCA
AAGTGAGAGACAAGATGATATACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTCAAGAGAGAACTGGATG
GGATTCAAGTGGAGCTTCAAGCGACCGATCCAACCGAGATGGGGCTTGATGTTTTCAAGA
GCCGCACCAACTAAAAAGCTAAAATCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCTTGAATAAATTTGT
TTCTGGAGTGAATTTATGTGTGTCTGTTAACTGTTGTTCCCTCTGACGAGTATGAAACTA
TTAACATCTTCCTTTTATTTGGGTATTGTTATCGTCTTTCGTGTTCTCTTGATGATCATG
TGTTTCATCA

QA 13 682 13 682
DS 

RD RR2FE37TF 702 0 0
GG
GGCTGGAGAAAAAAACATCTTTCTTCCGCTTCTTGATTTTCAACTAAGAGTTATCGTTTG
AAATCGGTTTGATTCAGCAAGACATGGCAAACGCGGCATCAGGAATGGCTGTGCATGATG
ATTGCAAGCTCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTACCATAGTCTACA
AGATTGAGGACAAGCAAGTGATCGTGGACAAACTAGGCGAGCCTGAACAATCATACGATG
ACTTTGCAGCAAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCATTTATGACTTCGACTTTG
TCACCGAAGAGAACTGCCAGAAGGGCAAGATTTTCTTCATCGCGTGGTCTCCTGACACTG
CCAAAGTGAGAGACAAGATGATATACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTCAAGAGAGAACTGG
ATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAAGCGACCGATCCAACCGAGATGGGGCTTGATGTTTTCA
AGAGCCGCACCAACTAAAAAGCTAAAATCCCCCCCCCCCCCCC**ACCCTTGAATAAATT
TGTTTCTGGAGTGAATTTATGTGTGTCTGTTAACTGTTGTTCCCTCTGACGAGTATGAAA
CTATTAACATCTTCCTTTTATTTGGGTATTGTTATCGTCTTTCGTGTTCTCTTGATGATC
ATGTGTTTCATCATCTATGAACTTGTGAGATTGTGCTGCC

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR2B581TF 806 0 0
GCGAGGAAACAGTGAAGAAACAAAAAGAACACAAGTCATATCGTTTTTTGCCGGCTGGAG
AAAAAAACATCTTTCTTCCGCTTCTTGATTTTCAACTAAGAGTTATCGTTTGAAATCGGT
TTGATTCAGCAAGACATGGCAAACGCGGCATCAGGAATGGCTGTGCATGATGATTGCAAG
CTCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTACCATAGTCTACAAGATTGAG
GACAAGCAAGTGATCGTGGACAAACTAGGCGAGCCTGAACAATCATACGATGACTTTGCA
GCAAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCATTTATGACTTCGACTTTGTCACCGAA
GAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCGTGGTCTCCTGACACTGCCAAAGTG
AGAGACAAGATGATATACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTCAAGAGAGAACTGGATGGGATT
CAAGTGGAGCTTCAAGCGACCGATCCAACCGAGATGGGGCTTGATGTTTTCAAGAGCCGC
ACCAACTAAAAAGCTAAAATCCCCCCCCCCCCCCC**ACCCTTGAATAAATTTGTTTCTG
GAGTGAATTTATGTGTGTCTGTTAACTGTTGTTCCCTCTGACGAGTATGAAACTATTAAC
ATCTTCCTTTTATTTGGGTATTGTTATCGTCTTTCGTGTTCTCTTGATGATCATGTGTTT
CATCATCTATGAACTTGTGAGATTGTGCTGCCTTGCCTTCTGGCGGTTTGCAATCTTTTG
TGTCAGTTTATTTATGTACAATACTT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2B581JQ 728 0 0
GAGTTATCGTTTGAAATCGGTTTGATTCAGCAAGACATGGCAAACGCGGCATCAGGAATG
GCTGTGCATGATGATTGCAAGCTCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGT
ACCATAGTCTACAAGATTGAGGACAAGCAAGTGATCGTGGACAAACTAGGCGAGCCTGAA
CAATCATACGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCATTTAT
GACTTCGACTTTGTCACCGAAGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTTTTCATCGCGTGG
TCTCCTGACACTGCCAAAGTGAGAGACAAGATGATATACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTC
AAGAGAGAACTGGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAAGCGACCGATCCAACCGAGATGGGG
CTTGATGTTTTCAAGAGCCGCACCAACTAAAAAGCTAAAATCCCCCCCCCCCCCCC**AC
CCTTGAATAAATTTGTTTCTGGAGTGAATTTATGTGTGTCTGTTAACTGTTGTTCCCTCT
GACGAGTATGAAACTATTAACATCTTCCTTTTATTTGGGTATTGTTATCGTCTTTCGTGT
TCTCTTGATGATCATGTGTTTCATCATCTATGAACTTGTGAGATTGTGCTGCCTTGCCTT
CTGGCGGTTTGCAATCTTTTGTGTCAGTTTATTTATGTACAATACTTTGAAAAATCAGAT
TGGAGTTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2FE37JQ 284 0 0
TTTGGA
CCCCCCCCCCCCCC**ACCCTTGAATAAATTTGTTTCTGGAGTGAATTTATGTGTGTCTG
TTAACTGTTGTTCCCTCTGACGAGTATGAAACTATTAACATCTTCCTTTTATTTGGGTAT
TGTTATCGTCTTTCGTGTTCTCTTGATGATCATGTGTTTCATCATCTATGAACTTGTGAG
ATTGTGCTGCCTTGCCTTCTGGCGGTTTGCAATCTTTTGTGTCAGTTTATTTATGTACAA
TACTTTGAAAAATCAGATTGGAGTTTATTGATTGATAC

QA 7 284 7 284
DS 

RD RR2FP10JQ 271 0 0
AAT
CCCCCCCCCCCC**ACCCTTGAATAAATTTGTTTCTGGAGTGAATTTATGTGTGTCTGTT
AACTGTTGTTCCCTCTGACGAGTATGAAACTATTAACATCTTCCTTTTATTTGGGTATTG
TTATCGTCTTTCGTGTTCTCTTGATGATCATGTGTTTCATCATCTATGAACTTGTGAGAT
TGTGCTGCCTTGCCTTCTGGCGGTTTGCAATCTTTTGTGTCAGTTTATTTATGTACAATA
CTTTGAAAAATCAGATTGGAGTTT
ATTG

QA 4 267 4 267
DS 



AS 1 10

CO CL597Contig1 1227 10 32 U
GGGACATACCAAAGCAAAAACATGGATCATCACCGCACGAAGTCGTGTTTACTTCTCCTC
TTGGTCTCTTTTCAAATTTCATTTGCTCAAGATGCTCCAACGACTCTTTTTCCTGCAATC
ATGACATTTGGTGACTCTGTGGTCGATGTCGGAAACAACAACTACCTTCCTACCCTTTTC
AGAGCCGACTACCCTCCTTATGGCCGTGATTTTGCTGGCCACAAACCCACAGGCCGTTTC
TGCAACGGCAAATTAGCCACTGATATCACCGCTGAGACACTAGGATTCACTAAATACCCA
CCAGCTTATCTAAGCCCCGAAGCTTCAGGCAAGAACCTTCTCATTGGTGCTAATTTCGCT
TCCGCAGCTTCAGGTTACGATGACAAAGCCGCTCTTCTCAATCATGCGATTCCATTGTAT
CAGCAAGTTGAGTACTTCAAGGAGTACAAGAGCAAGCTCATAAAAGTTGCAGGAAGCAAA
CAATCTGATACGATCATTAAGGGAGCACTCTATCTCTTAAGTGCAGGAAGCAGTGACTTT
GTTCAAAATTATTATGTGAATCCTCTTCTTAACAAAGTCTACACTCCTGATCAGTACGGA
TCTATGCTTCTTGATAACTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTGTATGCGGTTGGGGCAAGG
AAGATCGGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGG*ATGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTGTT
CGG*ATTCCATGAAAAA*GGTTGTGTTTCAAGACTCAA*TACAGATGCTCAGCAA*TTCA
ACAAGAAGCTTAACGCAGCTGCTTCAAAGCTTCAGAAGCAATACTCTGGTCTAAAGATTG
TTGTCTTTGACATCTTCACCCCACTCTATGATCTTGTTCAGTCCCCTGCTAAATCTGGAT
TCACGGAAGCAACAAAAGGATGTTGTGGAACAGGAACGGTCGAGACAACTTCGCTCTTGT
GCAATCCGAAATCGTACGGGACATGCTCCAATGCTACTCAGTATGTGTTCTGGG*ATAGT
GTTCATCCTTCCGAAGCTGCCAATGAGATTCTCGCCACTTCTTTGATTGGACAGGGCTTC
ACTCTCATCGGTTGATCTCCAA**GTCTTATTAATTCTCTTCTGTAATCGCTGTCAAACC
TTGAGAGTCTCTTAC**TGTTATTTCCCTTTTGAATTTATGTATCAAAAACCACCACTAT
TTACTATAAACGAATTGATGATTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 
60 60 60 60 40 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 5 5 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 15 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB94TF U 4
AF RR2A867TF U 3
AF RR2B352TF U 1
AF RR2ER90TF U 4
AF RR2A867JQ C 341
AF RR2AS30TF U 418
AF RR2AS30JQ C 678
AF RR2B352JQ C 439
AF RR2AB94JQ C 567
AF RR2ER90JQ C 455
BS 1 135 RR2B352TF
BS 136 136 RR2AB94TF
BS 137 158 RR2B352TF
BS 159 159 RR2AB94TF
BS 160 164 RR2B352TF
BS 165 165 RR2AB94TF
BS 166 230 RR2B352TF
BS 231 231 RR2AB94TF
BS 232 266 RR2B352TF
BS 267 267 RR2AB94TF
BS 268 284 RR2B352TF
BS 285 285 RR2AB94TF
BS 286 599 RR2B352TF
BS 600 600 RR2AB94TF
BS 601 717 RR2B352TF
BS 718 718 RR2AB94TF
BS 719 737 RR2B352TF
BS 738 738 RR2ER90TF
BS 739 756 RR2B352TF
BS 757 757 RR2ER90TF
BS 758 795 RR2B352TF
BS 796 803 RR2ER90TF
BS 804 1014 RR2AS30TF
BS 1015 1015 RR2A867JQ
BS 1016 1150 RR2AS30TF
BS 1151 1153 RR2A867JQ
BS 1154 1170 RR2AS30TF
BS 1171 1171 RR2A867JQ
BS 1172 1189 RR2AS30TF
BS 1190 1197 RR2B352JQ
BS 1198 1198 RR2AB94JQ
BS 1199 1227 RR2B352JQ

RD RR2AB94TF 730 0 0
GG
ATACCAAAGCGAAAACATGGATCATCACCGCACGAAGTTGTGTTTACTTCTCCTCTTGGT
CTCTTTTCAGATTTCATTTGCTCAAGATGCTCCAACGACTCTTTTTCCTGCAATCATGAC
ATTTGGTGACTCTGTGGTCGATGTCGGAAACAACAACTACCTTCCTACCCTTTTCAGAGC
CGACTACCCTCCTTATGGCCGTGATTTTGCTGGCCACAAACCCGCAGGCCGTTTCTGCAA
CGGCAAATTAGCCACTGATATCACCGCTGAGACACTAGGATTCACTAAATACCCACCAGC
TTATCTAAGCCCCGAAGCTTCAGGCAAGAACCTTCTCATTGGTGCTAATTTCGCTTCTGC
AGCTTCAGGTTACGATGACAAAGCCGCTCTTCTCAATCATGCGATTCCATTGTATCAGCA
AGTTGAGTACTTCAAGGAGTACAAAAGCAAGCTCATAAAAGTTGCAGGAAGCAAACAATC
TGATACGATCATTAAGGGAGCTCTCTATCTCTTAAGTGCAGGAAGCAGTGACTTTGTTCA
AAATTATTATGTGAATCCTCTTCTTAACAAAGTCTACACTCCTGATCAGTACGGATCTAT
GCTTCTTGATAACTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTGTATGCGGTTGGGGCAAGGAAGAT
CGGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGG*ATGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTGTTCGG*A
TTCCATGA

QA 3 730 3 730
DS 

RD RR2A867TF 729 0 0
GAC
ATACCAAAGCAAAAACATGGATCATCACCGCACGAAGTCGTGTTTACTTCTCCTCTTGGT
CTCTTTTCAAATTTCATTTGCTCAAGATGCTCCAACGACTCTTTTTCCTGCAATCATGAC
ATTTGGTGACTCTGTGGTCGATGTCGGAAACAATAACTATCTTCCTACCCTTTTCAGAGC
CGACTACCCTCCTTATGGCCGTGATTTTGCTGGCCACAAACCCACCGGCCGTTTCTGCAA
CGGTAAATTAGCCACTGATATTACCGCTGAGACACTAGGGTTCACTAAATACCCACCAGC
TTATCTAAGCCCCGAAGCTTCAGGCAAGAACCTTCTCATTGGTGCTAATTTCGCTTCCGC
AGCTTCAGGTTACGATGACAAAGCCGCTCTTCTCAATCATGCGATTCCATTGTATCAGCA
AGTTGAGTACTTCAAGGAGTACAAGAGCAAGCTCATAAAAGTTGCAGGAAGCAAACAATC
TGATACGATCATTAAGGGAGCACTCTATCTCTTAAGTGCAGGAAGCAGTGACTTTGTTCA
AAATTATTATGTGAATCCTCTTCTTAACAAAGTCTACACTCCTGATCAGTACGGCTCTAT
GCTTCTTGATAACTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTGTATGCGGTTGGGGCAAGGAAGAT
CGGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGG*ATGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTATTCGG*A
T
CCATG

QA 4 724 4 724
DS 

RD RR2B352TF 795 0 0
GGGACATACCAAAGCAAAAACATGGATCATCACCGCACGAAGTCGTGTTTACTTCTCCTC
TTGGTCTCTTTTCAAATTTCATTTGCTCAAGATGCTCCAACGACTCTTTTTCCTGCAATC
ATGACATTTGGTGACCCTGTGGTCGATGTCGGAAACAATAACTATCTTCCTACCCTTTTC
AGAGCCGACTACCCTCCTTATGGCCGTGATTTTGCTGGCCACAAACCCACCGGCCGTTTC
TGCAACGGCAAATTAGCCACTGATATTACCGCTGAGACACTAGGGTTCACTAAATACCCA
CCAGCTTATCTAAGCCCCGAAGCTTCAGGCAAGAACCTTCTCATTGGTGCTAATTTCGCT
TCCGCAGCTTCAGGTTACGATGACAAAGCCGCTCTTCTCAATCATGCGATTCCATTGTAT
CAGCAAGTTGAGTACTTCAAGGAGTACAAGAGCAAGCTCATAAAAGTTGCAGGAAGCAAA
CAATCTGATACGATCATTAAGGGAGCACTCTATCTCTTAAGTGCAGGAAGCAGTGACTTT
GTTCAAAATTATTATGTGAATCCTCTTCTTAACAAAGTCTACACTCCTGATCAGTACGGC
TCTATGCTTCTTGATAACTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTGTATGCGGTTGGGGCAAGG
AAGATCGGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGG*ATGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTATT
CGG*ATTCCATGAAAAAAGGTTGTGTTTCAAGACTCTA*TACAGATGCTCAGCAA*TTCA
ACAAGAAGCTTAACG

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2ER90TF 800 0 0
GG
ATACCAAAGCGAAAACATGGATCATCACCGCACGAAGTCGTGTTTACTACTCCTCTTGGT
CTCTTTTCAGATTTCATTTGCTCAAGATGTTCCAACGACTCTTTTTCCTGCAATCATGAC
ATTTGGTGACTCTGTGGTCGATGTCGGAAACAACAACTACCTTCCTACCCTTTTCAGAAC
CGACTACCCTCCTTATGGCCGTGATTTTGCTGGCCACAAACCCACAGGCCGTTTCTGCAA
CGGCAAATTAGCCACTGATATCACCGCTGAGACACTAGGATTCACTAAATACCCACCAGC
TTATCTAAGCCCCGAAGCTTCAGGCAAGAACCTTCTCATTGGTGCTAATTTCGCTTCTGC
AGCTTCAGGTTACGATGACAAAGCCGCTCTTCTCAATCATGCGATTCCATTGTATCAGCA
AGTTGAGTACTTCAAGGAGTACAAAAGCAAGCTCATAAAAGTTGCAGGAAGCAAACAATC
TGATACGATCATTAAGGGAGCTCTCTATCTCTTAAGTGCAGGAAGCAGTGACTTTGTTCA
AAATTATTATGTGAATCCTCTTCTTAACAAAGTCTACACTCCTGATCAGTACGGATCTAT
GCTTCTTGATAACTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTGTATGCGGTTGGGGCAAGGAAGAT
CGGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGG*ATGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTGTTCGG*A
T*CCATGAAAAA**GTTGTGTTTCAAGACTCAA*TACAGATGCTCAGCAA*TTCAACAAG
AAGCTTAACGCAGCTGCT

QA 3 800 3 800
DS 

RD RR2A867JQ 845 0 0
TCATTGGTGCTAATTTCGCTTCCGCAGCTTCAGGTTACGATGACAA*GCCGCTCTTCTCA
ATCATGCGATTCCATTGTATCAGCAAGTTGAGTACTTCAAGGAGTACAAGAGCAAGCTCA
TAAAAGTTGCAGGAAGCAAACAATCTGATACGATCATTAAGGGAGCACTCTATCTCTTAA
GTGCAGGAAGCAGTGACTTTGTTCAAAATTATTATGTGAATCCTCTTCTTAACAAAGTCT
ACACTCCTGATCAGTACGGCTCTATGCTTCTTGATAACTTCTCTACATTTATCAAGCAAG
TGTATGCGGTTGGGGCAAGGAAGATCGGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGG*ATGTCTT
CCAGCTGCAAGAACCCTATTCGG*ATTCCATGAAAAA*GGTTGTGTTTCAAGACTCAA*T
ACAGATGCTCAGCAA*TTCAACAAGAAGCTTAACGCAGCTGCTTCAAAGCTTCAGAAGCA
ATACTCTGGTCTAAAGATTGTTGTTTTTGACATCTTCACCCCACTCTATGATCTTGTTCA
GTCCCCTGCTAAATCTGGATTCACGGAAGCAACAAAAGGATGTTGTGGAACAGGAACGGT
CGAGACAACTTCGCTCTTGTGCAATCCGAAATCGTACGGGACATGCTCCAATGCTACTCA
GTATGTGTTCTGGG*ACAGTGTTCATCCCTCCGAAGCTGCCAATGAGATTCTCGCCACTT
CTTTGATTGGACAGGGCTTCACTCTCATCGGTTGATCTCCAAAAGTCTTATTAATTCTCT
TCTGTAATCGCTGTCAAACCTTGAGAGTCTCTTAC**TGTTATTTCCCATTTGATTTTAT
GTATC

QA 1 845 1 845
DS 

RD RR2AS30TF 782 0 0
G
ATCAGCAAGTTGAGTACTTCAAGGAGTACAAGAGCAAGCTCATAAAAGTTGCAGGAAGCA
AACAATCTGATACGATTATTAAGGGAGCACTCTATCTCTTAAGTGCAGGAAGCAGTGACT
TTGTTCAAAATTATTATGTGAATCCTCTTCTTAACAAAGTCTACACTCCTGATCAGTACG
GATCTATGCTTCTTGATAACTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTGTATGCGGTTGGGGCAA
GGAAGATCGGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGG*ATGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTG
TTCGG*ATTCCATGAAAAA*GGTTGTGTTTCAAGACTCAA*TACAGATGCTCAACAA*TT
CAACAAGAAGCTTAACGCAGCTGCTTCAAAGCTTCAGAAGCAATACTCTGGTCTAAAGAT
TGTTGTCTTTGACATCTTCACCCCACTCTATGATCTTGTTCAGTCCCCTGCTAAATCTGG
ATTCACGGAAGCAACAAAAGGATGTTGTGGAACAGGAACGGTCGAGACAACTTCGCTCTT
GTGCAATCCGAAATCGTACGGGACATGCTCCAATGCTACTCAGTATGTGTTCTGGGGATA
GTGTTCATCCTTCCGAAGCTGCCAATGAGATTCTCGCCACTTCTTTGATTGGACAGGGCT
TCACTCTCATCGGTTGATCTCCAA**GTCTTATTAATTCTCTTCTGTAATCGCTGTCAAA
CCTTGAGAGTCTTACAC**TGTTATTTCCCTTATGAATTTATGTATCAAAA
CCACCACTAT

QA 2 772 2 772
DS 

RD RR2AS30JQ 493 0 0
TCTGCCTCCAACGGGGATGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTGTTCGGGATTCCATGAAAAA
AGGTTGTGTTTCAAGACTCAAATACAGATGCTCAACAAATTCAACAAGAAGCTTAACGCA
GCTGCTTCAAAGCTTCAGAAGCAATACTCTGGTCTAAAGATTGTTGTCTTTGACATCTTC
ACCCCACTCTATGATCTTGTTCAGTCCCCTGCTAAATCTGGATTCACGGAAGCAACAAAA
GGATGTTGTGGAACAGGAACGGTCGAGACAACTTCGCTCTTGTGCAATCCGAAATCGTAC
GGGACATGCTCCAATGCTACTCAGTATGTGTTCTGGG*ATAGTGTTCATCCTTCCGAAGC
TGCCAATGAGATTCTCGCCACTTCTTTGATTGGACAGGGCTTCACTCTCATCGGTTGATC
TCCAA**GTCTTATTAATTCTCTTCTGTAATCGCTGTCAAACCTTGAGAGTCTTACAC**
TGTTATTTCCCTT

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR2B352JQ 789 0 0
AAGGAGTACAAGAGCAAGCTCATAAAAGTTGCAGGAAGCAAACAATCTGATACGATCATT
AAGGGAGCACTCTATCTCTTAAGTGCAGGAAGCAGTGACTTTGTTCAAAATTATTATGTG
AATCCTCTTCTTAACAAAGTCTACACTCCTGATCAGTACGGCTCTATGCTTCTTGATAAC
TTCTCTACATTTATCAAGCAAGTGTATGCGGTTGGGGCAAGGAAGATCGGTGTGACTTCT
CTGCCTCCAACGGG*ATGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTATTCGG*ATTCCATGAAAAA*
GGTTGTGTTTCAAGACTCTA*TACAGATGCTCAGCAA*TTCAACAAGAAGCTTAACGCAT
CTGCTTCAAAGCTTCAGAAGCAATACTCTGGTCTAAAGATTGTTGTTTTTGACATCTTCA
CCCCACTCTATGATCTTGTTCAGTCCCCTGCTAAATCTGGATTCACGGAAGCAACAAAAG
GATGTTGTGGAACAGGAACGGTCGAGACAACTTCGCTCTTGTGCAATCCGAAATCGTACG
GGACATGCTCCAATGCTACTCAGTATGTGTTCTGGG*ACAGTGTTCATCCCTCCGAAGCT
GCCAATGAGATTCTCGCCACTTCTTTGATTGGACAGGGCTTCACTCTCATCGGTTGATCT
CCAAAAGTCTTATTAATTCTCTTCTGTAATCGCTGTCAAACCTTGAGAGTCTCTTAC**T
GTTATTTCCCATTTGATTTTATGTATCAAAAACCACCACCATTTACTATAAACGAATTGA
TGATTTTTT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2AB94JQ 656 0 0
TCTTAACAAAGTCTACACTCCTGATCAGTACGGATCTATGCTTCTTGATAACTTCTCTAC
ATTTATCAAGCAAGTGTATGCGGTTGGGGCAAGGAAGATCGGTGTGACTTCTCTGCCTCC
AACGGG*ATGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTGTTCGG*ATTCCATGAAAAA*GGTTGTGT
TTCAAGACTCAA*TACAGATGCTCAGCAA*TTCAACAAGAAGCTTAACGCAGCTGCTTCA
AAGCTTCAGAAGCAATACTCTGGTCTAAAGATTGTTGTCTTTGACATCTTCACCCCACTT
TATGATCTTGTTCAGTCCCCTGCTAAATCTGGATTCACGGAAGCAACAAAAGGATGTTGT
GGAACAGGAACGGTCGAGACAACTTCGCTCTTGTGCAATCCGAAATCGTACGGGACATGC
TCCAATGCTACTCAGTATGTGTTCTGGG*ATAGTGTTCATCCTTCCGAAGCTGCCAATGA
GATTCTCGCCACTTCTTTGATTGGACAGGGCTTCACTCTCATCGGTTGATCTCCAA**GT
CTTATTAATTCTCTTCTGTAATCGCTGTCAAACCTTGAGAGTCTCTTACACTGTTATTTC
CCTTTTGAATTTATGTATCAAAAACCACCACTATTTACTATAAACGAATTGA
TGAT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2ER90JQ 766 0 0
AGCTCATAAAAGTTGCAGGAAGCAAACAATCTGATACGATCATTAAGGGAGCTCTCTATC
TCTTAAGTGCAGGAAGCAGTGACTTTGTTCAAAATTATTATGTGAATCCTCTTCTTAACA
AAGTCTACACTCCTGATCAGTACGGATCTATGCTTCTTGATAACTTCTCTACATTTATCA
AGCAAGTGTATGCGGTTGGGGCAAGGAAGATCGGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGG*A
TGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTGTTCGG*ATTCCATGAAAAA*GGTTGTGTTTCAAGAC
TCAA*TACAGATGCTCAGCAA*TTCAACAAGAAGCTTAACGCAGCTGCTTCAAAGCTTCA
GAAGCAATACTCTGGTCTAAAGATTGTTGTCTTTGACATCTTCACCCCACTCTATGATCT
TGTTCAGTCCCCTGCTAAATCTGGATTCACGGAAGCAACAAAAGGATGTTGTGGAACAGG
AACGGTCGAGACAACTTCGCTCTTGTGCAATCCGAAATCGTACGGGACATGCTCCAATGC
TACTCAGTATGTGTTCTGGG*ATAGTGTTCATCCTTCCGAAGCTGCCAATGAGATTCTCG
CCACTTCTTTGATTGGACAGGGCTTCACTCTCATCGGTTGGTCTCCAA**GTCTTATTAA
TTCTCTTCTGTAATCGCTGTCAAACCTTGAGAGTCTCTTACACTGTTATTTCCCTTTTGA
ATTTATGTATCAAAAACCACCACTATTTACTATAAACGAATTGA
CG

QA 1 764 1 764
DS 



AS 2 8

CO CL598Contig1 1104 6 10 U
GGATTACCCACTCACATAGAAAAGAAAAAAAATACTCTAGAGAGAGAGAGAAATGGAAGG
CAAGGAAGAAGATGTTAGAGTCGGAGCTAACAAGTTTCCGGAGAGACAGCCCATCGGAAC
ATCGGCTCAGAGCGACAAGGACTACAAGGAGCCACCTCCTGCTCCCTTGTTCGAGCCAGG
CGAGCTTGCTTCCTGGTCCTTCTGGAGAGCCGGTATCGCGGAGTTCATCGCCACGTTTCT
TTTCCTTTACATCACTGTGTTGACCGTCATGGGCGTGAAGAGGGCACCGAACATGTGTGC
TTCTGTCGGAATCCAAGGTATCGCTTGGGCTTTCGGTGGTATGATCTTCGCTCTTGTCTA
CTGCACCGCTGGTATCTCCGGTGGGCACATCAACCCAGCTGTCACGTTTGGTCTGTTCTT
GGCCAGGAAGCTTTCGCTTACGCGAGCTGTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTAGGAGC
CATCTGTGGAGCTGGTGTGGTGAAGGGTTTCCAGCCTAAGCAATACCAAGCTCTAGGAGG
TGGAGCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACCAAAGGGAGTGGTCTTGGTGCTGAGATTAT
TGGAACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTCTCCGCCACTGACGCCAAGAGAAACGCTCG
TGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCACCTCTCCCAATCGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCA
CTTAGCAACCATCCCCATCACTGGAACTGGAATCAACCCAGCGAGAAGTCTTGGAGCTGC
CATCATCTTCAACAAGGATAACGCTTGGGACGACCATTGGGTCTTTTGGGTTGGACCATT
CATCGGTGCTGCTCTTGCTGCTCTGTACCACGTGATAGTCATCAGAGCCATCCCATTCAA
GTCCAGAAGCTGATCCAGTCACTCTTAAAAATCTAGCTTTGTGCTATTATTAGTTTGCTT
TGTTTTTGTGAATTGTGTGAAGCATCGTGTGTGTACTTGCTTGTTCCTCTTCTTTGCCTA
ATGCAAGACTATTTGTAAAACAAAGACATTCCCCCTTGCAAAATTTGTAATCTCTCTTCT
ATAACTGGAACATTCTGAGCAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2AN96TF U 1
AF RR2EP94TF U 1
AF RR2CQ74TF U 1
AF RR2CQ74JQ C 335
AF RR2AN96JQ C 379
AF RR2CK79JQ C 425
BS 1 419 RR2AN96TF
BS 420 420 RR2EP94TF
BS 421 779 RR2AN96TF
BS 780 780 RR2CQ74TF
BS 781 1075 RR2CQ74JQ
BS 1076 1076 RR2AN96JQ
BS 1077 1094 RR2CQ74JQ
BS 1095 1095 RR2AN96JQ
BS 1096 1099 RR2CQ74JQ
BS 1100 1104 RR2AN96JQ

RD RR2AN96TF 779 0 0
GGATTACCCACTCACATAGAAAAGAAAAAAAATACTCTAGAGAGAGAGAGAAATGGAAGG
CAAGGAAGAAGATGTTAGAGTCGGAGCTAACAAGTTTCCGGAGAGACAGCCCATCGGAAC
ATCGGCTCAGAGCGACAAGGACTACAAGGAGCCACCTCCTGCTCCCTTGTTCGAGCCAGG
CGAGCTTGCTTCCTGGTCCTTCTGGAGAGCCGGTATCGCGGAGTTCATCGCCACGTTTCT
TTTCCTTTACATCACTGTGTTGACCGTCATGGGCGTGAAGAGGGCACCGAACATGTGTGC
TTCTGTCGGAATCCAAGGTATCGCTTGGGCTTTCGGTGGTATGATCTTCGCTCTTGTCTA
CTGCACCGCTGGTATCTCCGGTGGGCACATCAACCCAGCTGTCACGTTTGGTCTGTTCTC
GGCCAGGAAGCTTTCGCTTACGCGAGCTGTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTAGGAGC
CATCTGTGGAGCTGGTGTGGTGAAGGGTTTCCAGCCTAAGCAATACCAAGCTCTAGGAGG
TGGAGCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACCAAAGGGAGTGGTCTTGGTGCTGAGATTAT
TGGAACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTCTCCGCCACTGACGCCAAGAGAAACGCTCG
TGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCACCTCTCCCAATCGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCA
CTTAGCAACCATCCCCATCACTGGAACTGGAATCAACCCAGCGAGAAGTCTTGGAGCTG

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2EP94TF 759 0 0
GGATTACCCACTCACATAGAAAAGAAAAAAAATACTCTAGAGAGAGAGAGAAATGGAAGG
CAAGGAAGAAGATGTTAGAGTCGGAGCTAACAAGTTTCCGGAGAGACAGCCCATCGGAAC
ATCGGCTCAGAGCGACAAGGACTACAAGGAGCCACCTCCTGCTCCCTTGTTCGAGCCAGG
CGAGCTTGCTTCCTGGTCCTTCTGGAGAGCCGGTATCGCGGAGTTCATCGCCACGTTTCT
TTTCCTTTACATCACTGTGTTGACCGTCATGGGCGTGAAGAGGGCACCGAACATGTGTGC
TTCTGTCGGAATCCAAGGTATCGCTTGGGCTTTCGGTGGTATGATCTTCGCTCTTGTCTA
CTGCACCGCTGGTATCTCCGGTGGGCACATCAACCCAGCTGTCACGTTTGGTCTGTTCTT
GGCCAGGAAGCTTTCGCTTACGCGAGCTGTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTAGGAGC
CATCTGTGGAGCTGGTGTGGTGAAGGGTTTCCAGCCTATGCAATACCAAGCTCTAGGAGG
TGGAGCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACCAAAGGGAGTGGTCTTGGTGCTGAGATTAT
TGGAACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTCTCCGCCACTGACGCCAAGAGAAACGCTCG
TGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCACCTCTCCTAATCGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCA
CTTAGCAACCATCCCCATCACTGGAACTGGAATCAACC
T

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2CQ74TF 784 0 0
GGATTACCCACTCACAAAGAAAAGAAAAAAAATACTCTAGAGAGAGAGAGAAATGGAAGG
CAAGGAAGAAGATGTTAGAGTCGGAGCTAACAAGTTTCCGGAGAGACAGCCCATCGGAAC
ATCGGCTCAGAGCGACAAGGACTACAAGGAGCCACCTCCTGCTCCCTTGTTCGAGCCGGG
CGAGCTTGCTTCCTGGTCCTTCTGGAGAGCCGGTATCGCGGAGTTCATCGCCACGTTTCT
TTTCCTTTACATCACTGTGTTGACCGTCATGGGCGTGAAGAGGGCACCGAACATGTGTGC
TTCTGTCGGAATCCAAGGTATCGCTTGGGCTTTCGGTGGTATGATCTTCGCTCTTGTCTA
CTGCACCGCTGGTATCTCCGGTGGGCACATCAACCCAGCTGTCACGTTTGGTCTGTTCTT
GGCCAGGAAGCTTTCGCTTACGCTAGCTGTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTAGGAGC
CATCTGTGGAGTTGGTGTGGTGAAGGGTTTCCAGCCTAAGCATTACCAAGCTCTAGGAGG
TGGAGCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACCAAAGGGAGTGGTCTTGGTGCTGAGATTAT
TGGAACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTCTCCGCCACTGACGCCAAGAGAAACGCTCG
TGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCACCTCTCCCA*TCGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCA
CTTAGCA*CCATCCCCATCACTGGAACTGGA*TCA*CCCAGCGAGAAGTCTTGGAGCTGC
ATCA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2CQ74JQ 768 0 0
GGTGGTATGATCTTCGCTCTTGTCTACTGCACCGCTGGTATCTCCGGTGGGCACATCAAC
CCAGCTGTCACGTTTGGTCTGTTCTTGGCCAGGAAGCTTTCGCTTACGCTAGCTGTGTAC
TACATAGTGATGCAGTGCTTAGGAGCCATCTGTGGAGTTGGTGTGGTGAAGGGTTTCCAG
CCTAAGCATTACCAAGCTCTAGGAGGTGGAGCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACCAAA
GGGAGTGGTCTTGGTGCTGAGATTATTGGAACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTTTCC
GCCACTGACGCCAAGAGAAACGCTCGTGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCACCTCTCCCA
ATCGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCACTTAGCAACCATCCCCATCACTGGAACTGGAATC
AACCCAGCGAGAAGTCTTGGAGCTGCCATCATCTTCAACAAGGATAACGCTTGGGACGAC
CATTGGGTCTTTTGGGTTGGACCATTCATCGGTGCTGCTCTTGCTGCTCTGTACCACGTG
ATAGTCATCAGAGCCATCCCATTCAAGTCCAGAAGCTGATCCAGTCACTCTTAAAAATCT
AGCTTTGTGCTATTATTAGTTTGCTTTGTTTTTGTGAATTGTGTGAAGCATCGTGTGTGT
ACTTGCTTGTTCCTCTTCTTTGCCTAATGCAAGACTATTTGTAAAACAAAGACATTCCCC
CTTGCAAAATTTGTAATCTCTTTTCTATAACTGGAACATTTTGAG
CAG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2AN96JQ 726 0 0
CGGTGGGCACATCAACCCAGCTGTCACGTTTGGTCTGTTCTCGGCCAGGAAGCTTTCGCT
TACGCGAGCTGTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTAGGAGCCATCTGTGGAGCTGGTGT
GGTGAAGGGTTTCCAGCCTAAGCAATACCAAGCTCTAGGAGGTGGAGCCAACACTGTAGC
TCCTGGTTACACCAAAGGGAGTGGTCTTGGTGCTGAGATTATTGGAACCTTTGTCCTCGT
TTACACCGTTTTCTCCGCCACTGACGCCAAGAGAAACGCTCGTGACTCTCATGTTCCCAT
TCTTGCACCTCTCCCAATCGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCACTTAGCAACCATCCCCAT
CACTGGAACTGGAATCAACCCAGCGAGAAGTCTTGGAGCTGCCATCATCTTCAACAAGGA
TAACGCTTGGGACGACCATTGGGTCTTTTGGGTTGGACCATTCATCGGTGCTGCTCTTGC
TGCTCTGTACCACGTGATAGTCATCAGAGCCATCCCATTCAAGTCCAGAAGCTGATCCAG
TCACTCTTAAAAATCTAGCTTTGTGCTATTATTAGTTTGCTTTGTTTTTGTGAATTGTGT
GAAGCATCGTGTGTGTACTTGCTTGTTCCTCTTCTTTGCCTAATGCAAGACTATTTGTAA
AACAAAGACATTCCCCCTTGCAAAATTTGTAATCTCTCTTCTATAACTGGAACATTCTGA
GCAGAC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2CK79JQ 677 0 0
AGGAAGCTTTCGCTTACGCGTGCTGTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTGGGAGCCATC
TGTGGAGCTGGTGTGGTCAAGGGTTTCCAGCCTAAGCAATACCAAGCTCTAGGTGGTGGA
GCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACCAAAGGGAGTGGTCTTGGAGCTGAGATTATTGGA
ACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTCTCCGCCACTGACGCCAAGAGAAACGCTCGTGAC
TCTCATGTTCCCATTCTTGCACCTCTCCCTATCGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCACTTA
GCAACCATCCCCATCACTGGAACTGGAATCAACCCAGCGAGAAGTCTTGGAGCTGCCATC
ATCTTCAACAAGGATAACGCTTGGGACGACCATTGGGTCTTTTGGGTTGGACCATTCATC
GGTGCTGCTCTTGCTGCTCTGTACCACGTGATAGTCATCAGAGCCATCCCATTTAAGTCC
AGAAGCTGATCCAGTCACTCTTAAAAATCTAGCTTTGTGCTACTATTAGTTTGCTTTCTT
TTTGTGAATTGTGTGAAGCATCGTGTGTGTATTTGCTTGTTCCTCTTCTTTGCCTAATGC
AAGACTATTTGTAAAACAAAGACATTCCCCCTTGCCAAATTTGTAATCTCTCTTCTATAA
CTGGAACATTCTGAG
TT

QA 1 675 1 675
DS 



CO CL598Contig2 567 2 2 U
GGTGTGGTCAAGGGGTTCCAACCAAAGCAATACCAAGCTCTAGGAGGTGGAGCCAACACC
GTAGCTCCTGGCTACACCAAAGGAAGTGGTCTTGGTGCTGAGATTATTGGAACCTTTGTC
CTTGTGTACACCGTCTTCTCCGCTACTGACGCCAAGAGAAACGCTCGTGACTCTCATGTT
CCTATTCTTGCACCTCTCCCAATCGGATTCGCTGTGTTCTTGGTTCACTTAGCAACCATC
CCAATCACTGGAACTGGAATCAACCCAGCAAGAAGTCTTGGAGCTGCCATCATCTTCAAC
AAGGACAACGCTTGGGACGACCATTGGGTGTTTTGGGTTGGACCATTCATCGGTGCTGCA
CTTGCTGCTCTTTACCACGTGATAGTCATCAGAGCCATCCCATTCAAGTCCAGAAACTGA
TTGAGTTACTCTTAAAGAACATGTTCTCTTTTAGTTTGCTTTCTTCTGTGAATGTACTAC
CCCTACTAGTGTGAACCATTGTGTGTATGTGTTGTTCCTCTACTTTGCATGATGCAAGAC
TCTTTATCTAAAACAAAGACATTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H230JQ C 1
AF RR2H230TF U 89
BS 1 88 RR2H230JQ
BS 89 567 RR2H230TF

RD RR2H230JQ 567 0 0
GGTGTGGTCAAGGGGTTCCAACCAAAGCAATACCAAGCTCTAGGAGGTGGAGCCAACACC
GTAGCTCCTGGCTACACCAAAGGAAGTGGTCTTGGTGCTGAGATTATTGGAACCTTTGTC
CTTGTGTACACCGTCTTTTCCGCTACTGACGCCAAGAGAAACGCTCGTGACTCTCATGTT
CCTATTCTTGCACCTCTCCCAATCGGATTCGCTGTGTTCTTGGTTCACTTAGCAACCATC
CCAATCACTGGAACTGGAATCAACCCAGCAAGAAGTCTTGGAGCTGCCATCATCTTCAAC
AAGGACAACGCTTGGGACGACCATTGGGTGTTTTGGGTTGGACCATTCATCGGTGCTGCA
CTTGCTGCTCTTTACCACGTGATAGTCATCAGAGCCATCCCATTCAAGTCCAGAAACTGA
TTGAGTTACTCTTAAAGAACATGTTCTCTTTTAGTTTGCTTTCTTCTGTGAATGTACTAC
CCCTACTAGTGTGAACCATTGTGTGTATGTGTTGTTCCTCTACTTTGCATGATGCAAGAC
TCTTTATCTAAAACAAAGACATTCCCT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2H230TF 479 0 0
GTCTTGGTGCTGAGATTATTGGAACCTTTGTCCTTGTGTACACCGTCTTCTCCGCTACTG
ACGCCAAGAGAAACGCTCGTGACTCTCATGTTCCTATTCTTGCACCTCTCCCAATCGGAT
TCGCTGTGTTCTTGGTTCACTTAGCAACCATCCCAATCACTGGAACTGGAATCAACCCAG
CAAGAAGTCTTGGAGCTGCCATCATCTTCAACAAGGACAACGCTTGGGACGACCATTGGG
TGTTTTGGGTTGGACCATTCATCGGTGCTGCACTTGCTGCTCTTTACCACGTGATAGTCA
TCAGAGCCATCCCATTCAAGTCCAGAAACTGATTGAGTTACTCTTAAAGAACATGTTCTC
TTTTAGTTTGCTTTCTTCTGTGAATGTACTACCCCTACTAGTGTGAACCATTGTGTGTAT
GTGTTGTTCCTCTACTTTGCATGATGCAAGACTCTTTATCTAAAACAAAGACATTCCCT

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 10

CO CL599Contig1 713 10 17 U
TTTATGTCAAATAAAATGTAACAAAAGATTATAAGACTAAATGCATAAAACAGAGTATCG
ATGACCATAACATGTAAGAAACAGAGTATTTATTTAACGAAAGAGAACAAACAAACAAAC
TCTCTTCAGTATCCATAATCATAAGCGAACTCGTTGACACCAACCATAGCTGAGACGACT
TGGGAGACGATGTAGAAGCTTCCACCTAAGATGATCACAATGAGAACGGCGGAGATTGGG
TTCTTGAGGAGCTCGAAGATGGGCTCGAACACGGCGGAAAGAGCTCCCGTGCTGACGGTG
AGTGCGTAAAGACCGTACCTTCTCACGTTGTCCCAGAACTCTTCCATCAAAGGACCTTCC
GGTCCCAAAGCCATCGCCTTTTCTCCATCTATTCCTAATGCCAAAGCCATCATCAACCCT
ACGGAGACACCAGTCACCAGAGCTTGTTTCAGTTGCTTCTTCTCCAGAGACAAAGGTTGT
GTCTTTTCAAGCCTGGTTCTGGTGGATCTTTCCACCGTTGATCTTCTTCTTCTTCTGGAT
GCTTGGCACTGAACACGGCGGCACGGTGTTCTGGTGCTTATGGTTGAGCTCGGAGACGCC
TTAGCTGGTGCTGCTAGTAATCTGCTACTGCTGAAATGGAGATGAGGTTGGAGAGAAGAT
AGTTTCATTTTGGGG*AGAGACATCATCATAGTCATCATCCTCTCTCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 45 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 
50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 

AF RR2BR17JQ U 255
AF RR2FD44JQ U 1
AF RR2CE54JQ U 4
AF RR2H274JQ U 1
AF RR2H274TF C 2
AF RR2FD44TF C 14
AF RR2CE54TF C 26
AF RR2BR17TF C 28
AF RR2AL35JQ U 39
AF RR2AL35TF C 39
BS 1 173 RR2FD44JQ
BS 174 174 RR2H274TF
BS 175 233 RR2FD44JQ
BS 234 234 RR2H274JQ
BS 235 296 RR2FD44JQ
BS 297 297 RR2H274JQ
BS 298 349 RR2FD44JQ
BS 350 350 RR2H274JQ
BS 351 563 RR2FD44JQ
BS 564 564 RR2H274JQ
BS 565 599 RR2FD44JQ
BS 600 611 RR2H274JQ
BS 612 612 RR2AL35JQ
BS 613 675 RR2H274JQ
BS 676 676 RR2AL35JQ
BS 677 709 RR2H274JQ
BS 710 713 RR2AL35JQ

RD RR2BR17JQ 177 0 0
GAAA
ATGGGCTCGAACACGGGGGAAAGAGCTCCCGTGCTGACGGGGAGTGCGTAAAGACCGTAC
CTTCTCACGTTGTCCCAAAACTCTTCCATAAAAGGACCTTCCGGTCCCAAAGCCATCCCC
TTTTCTCCATCTATTCCTAATGCCAAAGCCATCATCAACCCTACGGAAACACC

QA 5 177 5 177
DS 

RD RR2FD44JQ 599 0 0
TTTATGTCAAATAAAATGTAACAAAAGATTATAAGACTAAATGCATAAAACAGAGTATCG
ATGACCATAACATGTAAGAAACAGAGTATTTATTTAACGAAAGAGAACAAACAAACAAAC
TCTCTTCAGTATCCATAATCATAAGCGAACTCGTTGACACCAACCATAGCTGAAACGACT
TGGGAGACGATGTAGAAGCTTCCACCTAAGATGATCACAATGAGAACGGCGGAAATTGGG
TTCTTGAGGAGCTCGAAGATGGGCTCGAACACGGCGGAAAGAGCTCCCGTGCTGACAGTG
AGTGCGTAAAGACCGTACCTTCTCACGTTGTCCCAGAACTCTTCCATCAGAGGACCTTCC
GGTCCCAAAGCCATCGCCTTTTCTCCATCTATTCCTAATGCCAAAGCCATCATCAACCCT
ACGGAGACACCAGTCACCAGAGCTTGTTTCAGTTGCTTCTTCTCCAGAGACAAAGGTTGT
GTCTTTTCAAGCCTGGTTCTGGTGGATCTTTCCACCGTTGATCTTCTTCTTCTTCTGGAT
GCTTGGCACTGAACACGGCGGCAAGGTGTTCTGGTGCTTATGGTTGAGCTCGGAGACGC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2CE54JQ 599 0 0
G
TGTCAAATAAAATGTAACAAAAGATTATAAGACTAAATGCATAAAACAGAGTATCGATGA
CCATAACATGTAAGAAACAGAGTATTTATTTAACGAAAGAGAACAAACAAACAAACTCTC
TTCAGTATCCATAATCATAAGCGAACTCGTTGACACCAACCATAGCTGAAACGACTTGGG
AGACGATGTAGAAGCTTCCACCTAAGATGATCACAATGAGAACGGCGGAAATTGGGTTCT
TGAGGAGCTCGAAGATGGGCTCGAACACGGCGGAAAGAGCTCCCGTGCTGACGGTGAGTG
CGTAAAGACCGTACCTTCTCACGTTGTCCCAGAACTCTTCCATCAAAGGACCTTCCGGTC
CCAAAGCCATCGCCTTTTCTCCATATATTCCTAATGCCAAAGCCATCATCAACCCTACGG
AGACACCAGTCACCAGAGCTTGTTTCAGTTGCTTCTTCTCCAGAAACAAAGGTTGTGTCT
TTTCAAGCCTGGTTCTGGTGGATCTTTCCACCGTTGATCTTCTTCTTCTTCTGGATGCTT
GGCACTGAACACGGCGGCACGGTGTTCTGGTGCTTATGGTTGAGCTCGGAGACGCCTT

QA 2 599 2 599
DS 

RD RR2H274JQ 711 0 0
TTTA
TGTCAAATAAAATGTAACAAAAGATTATAAGACTAAATGCATAAAACAGAGTATCGATGA
CCATAACATGTAAGAAACAGAGTATTTATTTAACGAAAGAGAACAAACAAACAAACTCTC
TTCAGTATCCATAATCATAAGCGAACTCGTTGACACCAACCATAGCTGAAACGACTTGGG
AGACGATGTAGAAGCTTCCACCTAAGATGATCACAATGAGAACGGCGGAGATTGGGTTCT
TGAGGAGCTCGAAGATGGGCTCGAACACGGCGGAAAGAGCTCCCGTGCTGACGGTGAGTG
CGTAAAGACCGTACCTTCTCACGTTGTCCCAGAACTCTTCCATCAAAGGACCTTCCGGTC
CCAAAGCCATCGCCTTTTCTCCATCTATTCCTAATGCCAAAGCCATCATCAACCCTACGG
AGACACCAGTCACCAGAGCTTGTTTCAGTTGCTTCTTCTCCAGAGACAAAGGTTGTGTCT
TTTCAAGCCTGGTTCTGGTGGATCTTTCCACCGTTGATCTTCTTCTTCTTCTGGATGCTT
GGCACTGAACACGGCGGCACGGTGTTCTGGTGCTTATGGTTGAGCTCGGAGACGCCTTAG
CTGGTGCAGCTAGTAATCTGCTACTGCTGAAATGGAGATGAGGTTGGAGAGAAGATAGTT
TCATTTTGGGGGAGAGACATCATCATAGTCATCATCCTCTCTCTC
CC

QA 5 709 5 709
DS 

RD RR2H274TF 710 0 0
TTA
TGTCAAATAAAATGTAACAAAAGATTATAAGACTAAATGCATAAAACAGAGTATCGATGA
CCATAACATGTAAGAAACAGAGTATTTATTTAACGAAAGAGAACAAACAAACAAACTCTC
TTCAGTATCCATAATCATAAGCGAACTCGTTGACACCAACCATAGCTGAGACGACTTGGG
AGACGATGTAGAAGCTTCCACCTAAGATGATCACAATGAGAACGGCGGAGATTGGGTTCT
TGAGGAGCTCGAAGATGGGCTCGAACACGGCGGAGAGAGCTCCCGTGCTGACGGTGAGTG
CGTAAAGACCGTACCTTCTCACGTTGTCCCAGAACTCTTCCATCAAAGGACCTTCCGGTC
CCAAAGCCATCGCCTTTTCTCCATCTATTCCTAATGCCAAAGCCATCATCAACCCTACGG
AGACACCAGTCACCAGAGCTTGTTTCAGTTGCTTCTTCTCCAGAGACAAAGGTTGTGTCT
TTTCAAGCCTGGTTCTGGTGGATCTTTCCACCGTTGATCTTCTTCTTCTTCTGGATGCTT
GGCACTGAACACGGCGGCACGGTGTTCTGGTGCTTATGGTTGAGCTCGGAGACGCCTTAG
CTGGTGCAGCTAGTAATCTGCTACTGCTGAAATGGAGATGAGGTTGGAGAGAAGATAGTT
TCATTTTGGGG*AGAGACATCATCATAGTCATCATCCTCTCTCTC
CC

QA 4 708 4 708
DS 

RD RR2FD44TF 700 0 0
AAATGTAACAAAAGATTATAAGACTAAATGCATAAAACAGAGTATCGATGACCATAACAT
GTAAGAAACAGAGTATTTATTTAACGAAAGAGAACAAACAAACAAACTCTCTTCAGTATC
CATAATCATAAGCGAACTCGTTGACACCAACCATAGCTGAGACGACTTGGGAGACGATGT
AGAAGCTTCCACCTAAGATGATCACAATGAGAACGGCGGAGATTGGGTTCTTGAGGAGCT
CGAAGATGGGCTCGAACACGGCGGAGAGAGCTCCCGTGCTGACAGTGAGTGCGTAAAGAC
CGTACCTTCTCACGTTGTCCCAGAACTCTTCCATCAGAGGACCTTCCGGTCCCAAAGCCA
TCGCCTTTTCTCCATCTATTCCTAATGCCAAAGCCATCATCAACCCTACGGAGACACCAG
TCACCAGAGCTTGTTTCAGTTGCTTCTTCTCCAGAGACAAAGGTTGTGTCTTTTCAAGCC
TGGTTCTGGTGGATCTTTCCACCGTTGATCTTCTTCTTCTTCTGGATGCTTGGCACTGAA
CACGGCGGCAAGGTGTTCTGGTGCTTATGGTTGAGCTCGGAGACGCCTTAGCTGGTGCTG
CTAGTAATCTGCTACTGCTGAAATGGAGATGAGGTTGGAGAGAAGATAGTTTCATTTTGG
GG*AGAGACATCATCATAGTCATCATCCTCTCTCTCTCCC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2CE54TF 688 0 0
AGATTATAAGACTAAATGCATAAAACAGAGTATCGATGACCATAACATGTAAGAAACAGA
GTATTTATTTAACGAAAGAGAACAAACAAACAAACTCTCTTCAGTATCCATAATCATAAG
CGAACTCGTTGACACCAACCATAGCTGAGACGACTTGGGAGACGATGTAGAAGCTTCCAC
CTAAGATGATCACAATGAGAACGGCGGAGATTGGGTTCTTGAGGAGCTCGAAGATGGGCT
CGAACACGGCGGAGAGAGCTCCCGTGCTGACGGTGAGTGCGTAAAGACCGTACCTTCTCA
CGTTGTCCCAGAACTCTTCCATCAAAGGACCTTCCGGTCCCAAAGCCATCGCCTTTTCTC
CATATATTCCTAATGCCAAAGCCATCATCAACCCTACGGAGACACCAGTCACCAGAGCTT
GTTTCAGTTGCTTCTTCTCCAGAGACAAAGGTTGTGTCTTTTCAAGCCTGGTTCTGGTGG
ATCTTTCCACCGTTGATCTTCTTCTTCTTCTGGATGCTTGGCACTGAACACGGCGGCACG
GTGTTCTGGTGCTTATGGTTGAGCTCGGAGACGCCTTAGCTGGTGCTGCTAGTAATCTGC
TACTGCTGAAATGGAGATGAGGTTGGAGAGAAGATAGTTTCATTTTGGGG*AGAGACATC
ATCATAGTCATCATCCTCTCTCTCTCCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2BR17TF 686 0 0
TA
TATAAGACTAAATGCATAAAACAGAGTATAGATGACCATAACATGTAAGAAACAGAGTAT
TTATTTAACGAAAGAGAACAAACAAACAAACTCTCTTCAGTATCCATAATCATAAGCGAA
CTCGTTGACACCAACCATAGCTGAGACGACTTGGGAGACGATGTAGAAGCTTCCACCTAA
GATGATCACAATGAGAACGGCGGAGATTGGGTTCTTGAGGAGCTCGAAGATGGGCTCGAA
CACGGCGGAGAGAGCTCCCGTGCTGACGGTGAGTGCGTAAAGACCGTACCTTCTCACGTT
GTCCCAGAACTCTTCCATAAAAGGACCTTCCGGTCCCAAAGCCATCGCCTTTTCTCCATC
TATTCCTAATGCCAAAGCCATCATCAACCCTACGGAGACACCAGTCACCAGAGCTTGTTT
CAGTTGCTTCTTCTCCAGAGACAAAGGTTGTGTCTTTTCAAGCCTGGTTCTGGTGGATCT
TTCCACCGTTGATCTTCTTCTTCTTCTGGATGCTTGGCACTGAACACGGCGGCACGGTGT
TCTGGTGCTTATGGTTGAGCTCGGAGACGCCTTAGCTGGTGCTGCTAGTAATCTGCTACT
GCTGAAATGGAGATGAGGTTGGAGAGAAGATAGTTTCATTTTGGGG*AGAGACATCATCA
TAGTCATCATCCTCTCTCTCTCCC

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR2AL35JQ 675 0 0
G
AATGCATAAAACAGAGTATCGATGACCATAACATGTAAGAAACAGAGTATTTATTTAACG
AAAGAGAACAAACAAACAAACTCTCTTCAGTATCCATAATCATAAGCGAACTCGTTGACA
CCAACCATAGCTGAAACGACTTGGGAGACGATGTAGAAGCTTCCACCTAAGATGATCACA
ATGAGAACGGCGGAGATTGGGTTCTTGAGGAGCTCGAAGATGGGCTCGAACACGGCGGAA
AGAGCTCCCGTGCTGACGGTGAGTGCGTAAAGAACGTACCTTCTCACGTTGTCCCAGAAC
TCTTCCATCAAAGGACCTTCCGGTCCCAAAGCCATCGCCTTTTCTCCATCTATTCCTAAT
GCCAAAGCCATCATCAACCCTACGGAGACACCAGTCACCAGAGCTTGTTTCAGTTGCTTC
TTCTCCAGAGACAGAGGTTGTGTCTTTTCAAGCCTGGTTCTGGTGGATCTTTCCACCGTT
GATCTTCTTCTTCTTCTGGATGCTTGGCACTGAACACGGCGGCACGGTGTTCTGGTGCTT
ATGGTTGAGCTCGGAGACGCCTTAGCTGGTGCTGCTAGTAATCTGCTACTGCTGAAATGG
AGATGAGGTTGGAGAGAAGATAGTTTCATTTTGGGG*AGAGACATCATCATAGTCATCAT
CCTCTCTCTCTCCC

QA 2 675 2 675
DS 

RD RR2AL35TF 675 0 0
G
AATGCATAAAACAGAGTATCGATGACCATAACATGTAAGAAACAGAGTATTTATTTAACG
AAAGAGAACAAACAAACAAACTCTCTTCAGTATCCATAATCATAAGCGAACTCGTTGACA
CCAACCATAGCTGAGACGACTTGGGAGACGATGTAGAAGCTTCCACCTAAGATGATCACA
ATGAGAACGGCGGAGATTGGGTTCTTGAGGAGCTCGAAGATGGGCTCGAACACGGCGGAG
AGAGCTCCCGTGCTGACGGTGAGTGCGTAAAGAACGTACCTTCTCACGTTGTCCCAGAAC
TCTTCCATCAAAGGACCTTCCGGTCCCAAAGCCATCGCCTTTTCTCCATCTATTCCTAAT
GCCAAAGCCATCATCAACCCTACGGAGACACCAGTCACCAGAGCTTGTTTCAGTTGCTTC
TTCTCCAGAGACAGAGGTTGTGTCTTTTCAAGCCTGGTTCTGGTGGATCTTTCCACCGTT
GATCTTCTTCTTCTTCTGGATGCTTGGCACTGAACACGGCGGCACGGTGTTCTGGTGCTT
ATGGTTGAGCTCGGAGACGCCTTAGCTGGTGCTGCTAGTAATCTGCTACTGCTGAAATGG
AGATGAGGTTGGAGAGAAGATAGTTTCATTTTGGGG*AGAGACATCATCATAGTCATCAT
CCTCTCTCTCTCCC

QA 2 675 2 675
DS 



AS 1 9

CO CL600Contig1 940 9 13 U
AGGGGATCCAATCCTTTCCAATCCACACGTCCATAACAAAAAACCCAAAAAAA*TGAACA
CTCCAATAAAACTCGCCTTTCTAATTCTATGCATCGCCCTAACCACAACTGGATTCATAA
TCCCAGCCAAACGTGACGCCGTCACACCGCAACACCTGAAAACCGTCGCAGGGATCTGCG
GCGTTGTCCAAGACAAACGTCTCTGTAGCATAACCCTGAACACTGTCCCGAGCAATGACC
CTGACGTTTTGGTCCGTCACTTAGCGACGGCTGCAGAAACCTCGGTTAAAAAGGGCTTGA
AGTTCCTCTCTGGAATCAAACCCAAGTACAAGGGAGACAAATTTGCCACAACTTGCATCA
CCAGTTGCGAGAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACTTTTCAGATTTCTGGAAAGCCG
CTGGAAAAGACATCAAGAGCATGGCCGATAATTACTTCACATGCAAGAAGAAGATGACAT
CGATCTTCAACTACCAATCGACTTGTCTCGATGACATCTATGACAAAACGTTGTTGAAAG
AGGTTCAAGGAGGGATTGGGCTCGGGAAAAGAATGAGTGGCGAGTCTGTGGATGTGTTCG
CTGGAATGGGCAAAGTCTTTAACACTCTTAACATTAAGACCAAACTTAACCAGAAAGATA
CCGATTCGTTGCTCCCACCACCTTTGTCATTTTACTACTACTGATCTATTTATTGAAGAA
AAAGCATGGCATCGTCTATGGTGATGAATAATCTGCATCTTTTGGGTTTTTTTTTCAGTT
ATGTTAGGAATCTTGTAAAGAAAGGTTCCTTCTAATGTATGTTTGTGATTAATACGTTAT
GGGTGGTAATCATGTATGGACCTCGTGGTTGGAAAGGATATGGACAAATGTGATTATATA
ATATTAATAACATATTTGGTATAATGCCTTTTATGTATCC


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG31TF U 4
AF RR2DQ45TF U 4
AF RR2DK12TF U 4
AF RR2EY88TF U 4
AF RR2G422TF U 1
AF RR2DQ45JQ C 220
AF RR2DK12JQ C 313
AF RR2EL96TF U 431
AF RR2GG31JQB C 220
BS 1 53 RR2G422TF
BS 54 54 RR2DQ45TF
BS 55 192 RR2G422TF
BS 193 193 RR2DQ45TF
BS 194 217 RR2G422TF
BS 218 218 RR2DQ45TF
BS 219 437 RR2G422TF
BS 438 438 RR2DQ45TF
BS 439 723 RR2G422TF
BS 724 734 RR2EL96TF
BS 735 735 RR2DQ45JQ
BS 736 922 RR2EL96TF
BS 923 940 RR2DQ45JQ

RD RR2GG31TF 398 0 0
GGATCCAATCCTTTCCAATCCACACGTCCATAACAAAAAACCCAAAAAAA*TGAACACTC
CAATAAAACTCGCCTTTCTAATTCTATGCATCGCCCTAACCACAACTGGATTCATAATCC
CAGCCAAACGTGACGCCGTCACACCGCAACACCTGAAAACCGTCGCAGGGATCTGCGGCG
TTGTCCAAGACAAACGTCTCTGTAGCGTAACCCTGAACACTGTCCCGAGCAATGACCCTG
ACGTTTTGGTCCGTCACTTAGCGACGGCTGCAGAAACCTCGGTTAAAAAGGGCTTGAAGT
TCCTCTCTGGAATCAAACCCAAGTACAAGGGAGACAAATTTGCCACAACTTGCATCACCA
GTTGCGAGAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACTTT

QA 1 398 1 398
DS 

RD RR2DQ45TF 612 0 0
GGATCCAATCCTTTCCAATCCACACGTCCATAACAAAAAACCCAAAAAAA*TGAACACTC
CAATAAAACTCGCCTTTCTAATTCTATGCATCGCCCTAACCACAACTGGATTCATAATCC
CAGCCAAACGTGACGCCGTCACACCGCAACACCTGAAAACCGTCGCAGGGATCTGCGGCG
TTGTCCAAGACAAACGTCTCTGTAGCATAACCCTGAACACTGTCCCGAGCAATGACCCTG
ACGTTTTGGTCCGTCACTTAGCGACGGCTGCAGAAACCTCGGTTAAAAAGGGCTTGAAGT
TCCTCTCTGGAATCAAACCCAAGTACAAGGGAGACAAATTTGCCACAACTTGCATCACCA
GTTGCGAGAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACTTTTCAGATTTCTGGAAAGCCGCTG
GAAAAGACATCAAGAGCATGGCCGATAATTACTTCACATGCAAGAAGAAGATGACATCGA
TCTTCAACTACCAATCGACTTGTCTCGATGACATCTATGACAAAACGTTGTTGAAAGAGG
TTCAAGGAGGGATTGGGCTCGGGAAAAGAATGAGTGGCGAGTCTGTGGATGTGTTCGCTG
GAATGGGCAAAG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2DK12TF 716 0 0
GGATCCAATCCTTTCCAATCCACACGTCCATAACAAAAAACCCAAAAAAA*TGAACACTC
CAATAAAACTCGCCTTTCTAATTCTATGCACCGCCCTAACCACAACTGGATTCATAATCC
CAGCCAAACGTGACGCCGTCACACCGCAACACCTGAAAACCGTCGCAGGGATCTGCGGCG
TTGTCCAAGACAAACGTCTCTGTAGCATAACCCTGAACACTGTCCCGAGCAATGACCCTG
ACGTTTTGGTCCGTCACTTAGCGACGGCTGCAGAAACCTCGGTTAAAAAGGGCTTGAAGT
TCCTCTCTGGAATCAAACCCAAGTACAAGGGAGACAAATTTGCCACAACTTGCATCACCA
GTTGCGAGAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACTTTTCAGATTTCTGGAAAGCCGCTG
GAAAAGACATCAAGAGCATGGCCGATAATTACTTCACATGCAAGAAGAAGATGACATCGA
TCTTCAACTACCAATCGACTTGTCTCGATGACATCTATGACAAAACGTTGTTGAAAGAGG
TTCAAGGAGGGATTGGGCTCGGGAAAAGAATGAGTGGCGAGTCTGTGGATGTGTTCGCTG
GAATGGGCAAAGTCTTTAACACTCTTAACATTAAGACCAAACTTAACCAGAAAGATACCG
ATTCGTTGCTCCCACCACCTTTGTCATTTTACTACTACTGATCTATTTATTGAAGA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2EY88TF 662 0 0
GGATCCAATCCTTTCCAATCCACACGTCCATAACAAAAAACCCAAAAAAA*TGAACACTC
CAATAAAACTCGCCTTTCTAATTCTATGCATCGCCCTAACCACAACTGGATTCATAATCC
CAGCCAAACGTGACGCCGTCACACCGCAACACCTGAAAACCGTCGCAGGGATCTGCGGCG
TTGTCCAAGACAAACGTCTCTGTAGCATAACCCTGAACACTGTCCCGAGCAATGACCCTG
ACGTTTTGGTCCGTCACTTAGCGACGGCTGCAGAAACCTCGGTTAAAAAGGGCTTGAAGT
TCCTCTCTGGAATCAAACCCAAGTACAAGGGAGACAAATTTGCCACAACTTGCATCACCA
GTTGCGAGAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACTTTTCAGATTTCTGGAAAGCCGCTG
GAAAAGACATCAAGAGCATGGCCGATAATTACTTCACATGCAAGAAGAAGATGACATCGA
TCTTCAACTACCAATCGACTTGTCTCGATGACATCTATGACAAAACGTTGTTGAAAGAGG
TTCAAGGAGGGATTGGGCTCGGGAAAAGAATGAGTGGCGAGTCTGTGGATGTGTTCGCTG
GAATGGGCAAAGTCTTTAACACTCTTAACATTAAGACCAAACTTAACCAGAAAGATACCG
AT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2G422TF 734 0 0
AGGGGATCCAATCCTTTCCAATCCACACGTCCATAACAAAAAACCCAAAAAAAATGAACA
CTCCAATAAAACTCGCCTTTCTAATTCTATGCATCGCCCTAACCACAACTGGATTCATAA
TCCCAGCCAAACGTGACGCCGTCACACCGCAACACCTGAAAACCGTCGCAGGGATCTGCG
GCGTTGTCCAAGGCAAACGTCTCTGTAGCATAACCCTTAACACTGTCCCGAGCAATGACC
CTGACGTTTTGGTCCGTCACTTAGCGACGGCTGCAGAAACCTCGGTTAAAAAGGGCTTGA
AGTTCCTCTCTGGAATCAAACCCAAGTACAAGGGAGACAAATTTGCCACAACTTGCATCA
CCAGTTGCGAGAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACTTTTCAGATTTCTGGAAAGCCG
CTGGAAAAGACATCAAGGGCATGGCCGATAATTACTTCACATGCAAGAAGAAGATGACAT
CGATCTTCAACTACCAATCGACTTGTCTCGATGACATCTATGACAAAACGTTGTTGAAAG
AGGTTCAAGGAGGGATTGGGCTCGGGAAAAGAATGAGTGGCGAGTCTGTGGATGTGTTCG
CTGGAATGGGCAAAGTCTTTAACACTCTTAACATTAAGACCAAACTTAACCAGAAAGATA
CCGATTCGTTGCTCCCACCACCTTTGTCATTTTACTACTACTGATCTATTTATTGAAGAA
AAA
TCAAATAAAAA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2DQ45JQ 721 0 0
ACACTGTCCCGAGCAATGACCCTGACGTTTTGGTCCGTCACTTAGCGACGGCTGCAGAAA
CCTCGGTTAAAAAGGGCTTGAAGTTCCTCTCTGGAATCAAACCCAAGTACAAGGGAGACA
AATTTGCCACAACTTGCATCACCAGTTGCGAGAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACT
TTTCAGATTTCTGGAAAGCCGCTGGAAAAGACATCAAGAGCATGGCCGATAATTACTTCA
CATGCAAGAAGAAGATGACATCGATCTTCAACTACCAATCGACTTGTCTCGATGACATCT
ATGACAAAACGTTGTTGAAAGAGGTTCAAGGAGGGATTGGGCTCGGGAAAAGAATGAGTG
GCGAGTCTGTGGATGTGTTCGCTGGAATGGGCAAAGTCTTTAACACTCTTAACATTAAGA
CCAAACTTAACCAGAAAGATACCGATTCGTTGCTCCCACCACCTTTGTCATTTTACTACT
ACTGATCTATTTATTGAAGAAAAAGCATGGCATCGTCTATGGTGATGAATAATCTGCATC
TTTTGGGTTTTTTTTTCAGTTATGTTAGGAGTCTTGTAAAGAAAGGTTCCTTCTAATGTA
TGTTTGTGATTAATACGTTATGGGTGGTAATCATGTATGGACCTCGTGGTTGGAAAGGAT
ATGGACAAATGTGATTATATAATATTAATAACATATTTGGTATAATGCCTTTTATGTATC
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2DK12JQ 617 0 0
GAATCAAACCCAAGTACAAGGGAGACAAATTTGCCACAACTTGCATCACCAGTTGCGAGA
AACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACTTTTCAGATTTCTGGAAAGCCGCTGGAAAAGACA
TCAAGAGCATGGCCGATAATTACTTCACATGCAAGAAGAAGATGACATCGATCTTCAACT
ACCAATCGACTTGTCTCGATGACATCTATGACAAAACGTTGTTGAAAGAGGTTCAAGGAG
GGATTGGGCTCGGGAAAAGAATGAGTGGCGAGTCTGTGGATGTGTTCGCTGGAATGGGCA
AAGTCTTTAACACTCTTAACATTAAGACCAAACTTAACCAGAAAGATACCGATTCGTTGC
TCCCACCACCTTTGTCATTTTACTACTACTGATCTATTTATTGAAGAAAAAGCATGGCAT
CGTCTATGGTGATGAATAATCTGCATCTTTTGGGTTTTTTTTTCAGTTATGTTAGGAATC
TTGTAAAGAAAGGTTCCTTCTAATGTATGTTTGTGATTAATACGTTATGGGTGGTAATCA
TGTATGGACCTCGTGGTTGGAAAGGATATGGACAAATGTGATTATATAATATTAATAACA
CATTTGGTAT
AATGCCG

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2EL96TF 497 0 0
G
ATCAAGAGCATGGCCGATAATTACTTCACATGCAGGAAGAAGATGACATCGATCTTCAAC
TACCAATCGACTTGTCTCGATGACATCTATGACAAAACGTTGTTGAAAGAGGTTCAAGGA
GGGATTGGGCTCGGGAAAAGAATGAGTGGCGAGTCTGTGGATGTGTTCGCTGGAATGGGC
AAAGTCTTTAACACTCTTAACATTAAGACCAAACTTAACCAGAAAGATACCGATTCGTTG
CTCCCACCACCTTTGTCATTTTACTACTACTGATCTATTTATTGAAGAAAAAGCATGGCA
TCGCCTATGGTGATGAATAATCTGCATCTTTTGGGTTTTTTTTTCAGTTATGTTAGGAAT
CTTGTAAAGAAAGGTTCCTTCTAATGTATGTTTGTGATTAATACGTTATGGGTGGTAATC
ATGTATGGACCTCGTGGTTGGAAAGGATATGGACAAATGTGATTATATAATATTAATAAC
ATATTTGGTAT
AATGC

QA 2 492 2 492
DS 

RD RR2GG31JQB 703 0 0
ACACTGTCCCGAGCAATGACCCTGACGTTTTGGTCCGTCACTTAGCGACGGCTGCAGAAA
CCTCGGTTAAAAAGGGCTTGAAGTTCCTCTCTGGAATCAAACCCAAGTACAAGGGAGACA
AATTTGCCACAACTTGCATCACCAGTTGCGAGAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACT
TTTCAGATTTCTGGAAAGCCGCTGGAAAAGACATCAAGAGCATGGCCGATAATTACTTCA
CATGCAAGAAGAAGATGACATCGATCTTCAACTACCAATCGACTTGTCTCGATGACATCT
ATGACAAAACGTTGTTGAAAGAGGTTCAAGGAGGGATTGGGCTCGGGAAAAGAATGAGTG
GCGAGTCTGTGGATGTGTTCGCTGGAATGGGCAAAGTCTTTAACACTCTTAACATTAAGA
CCAAACTTAACCAGAAAGATACCGATTCGTTGCTCCCACCACCTTTGTCATTTTACTACT
ACTGATCTATTTATTGAAGAAAAAGCATGGCATCGTCTATGGTGATGAATAATCTGCATC
TTTTGGGTTTTTTTTTCAGTTATGTTAGGAATCTTGTAAAGAAAGGTTCCTTCTAATGTA
TGTTTGTGATTAATACGTTATGGGTGGTAATCATGTATGGATCTCGTGGTTGGAAAGGAT
ATGGACAAATGTGATTATATAATATTAATAACATATTTGGTAT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 2 7

CO CL601Contig1 1507 5 24 U
TATGTATTAAAACCCTTGAGAATGGTGAATCTAATGACAATGCAGGGTATCTTATATATA
TATGGCTTCATGTATTGAAAACAAAGTTGGGGTTTCCATCTGATTGTATTCAGAGATACT
GGTAACACAATGAATTGACATTAATAAGCAAAAAAATCAGCTGGTCAGAAATAGATAAAC
CTGACAGCTTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCACCTTGCCTGCTTCATTTCATTCTGCTGTTA
CCTTGATCTGTCCATAGAGATTAGGGTCTGCTTCATAGTATACAACATCTCCTTCATCGC
TAACAAAATGATCTTCTTTAATACTTTTTGCTAAGATTCCCAGTAAATGTAATGGCAAAG
GTCCAGACTTATCAGGCTCCCTGTAATACTTCCCTAATACTGGTTTAGCTGCTTCCGTTG
CTTCTACTAGATGGTAATGTGGGATCTGCGGGAAAAGATGATGTATCACATGAGTTCCAA
TGTCGTGATGGATGTTGTTGATCAATCCGTAGTCACGGTCCAATGTCGTAAGCCCTCCTC
TCAAGTAACTCCATTCCTTCCCACGGTACCAAGGGAGCTTATCTTCATGACCATGGTGAT
GCAGGTAAGTCACAAAGTCCAACCACATTACATTTATCCAGTAAGGAACTACATAAAGTT
TAAGCATTTGCATAGGACCCATCACAAAGTTGAGGCAGACAAGCAGAGCAGCCATTGCAG
TCCAACAAGCGGTAGAAGTGAGAACATCATTTCTCTCTTTAGGGAGGAACAAATCGCTGT
CCGGATGGTAATGAGAACCCTTCTTCCCCGGACTTCGAGCCCACAAGTAGAAAGGGTAAG
CGAGCATCACAAGAGGCAATGTAAATCTAAAGAACCGAGTCGGTTTGTCCAAACTCTTGT
AGATTTTCTCAGACATAGGATGCCAAGATTCATCATTCTCAACACGTCCATGGTTCTGGT
GGTGAGTTCTGTGGCTAATTCTCCAGCCATGGTAAGGGACCAGAATAGAGGAATGAAGAA
GGTGACCCACCACACCGTTCAACCTCGGATCATTTGAGAAGCTTCCATGTCCACAGTCAT
GGCCAAGAACAAAGAGAGCCCAGAACATGGTTCCTTGAGTAAACCAATAGAGAGGCCAAA
CAAGCCAATTGTTAAGGTAAGCAGCACCAGCAGCCAACGCGAACACGATGGCTACGTCTC
TGACGACATAGCTCATCGATATCCATGGGTCGAATCTCTGCGTTTTGGGTGGTTCTTCCT
CGATTGGTGGAGAGGGGTCTACTGTTAGAGGCGTGCTCACATTCAACGCCCAGTTTCGAG
AATTCAGACGAAACCGGAGAGAGGAGGAAGATGGGGGTTGTCTGAATTTGAAGGAGGTGG
GTTTGTTGTTGTAAGAGAGGGGAGTGGATCTGGGTGTGGTGTAGATTCTCGGGAGTGGTC
TTATTCCACATTCTGATAAGACCCAGTTCGCCATTACCAGAAGCTCTGTTTCTCTCTCAG
AGGAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW51JQ U 52
AF RR2F701JQ U 1
AF RR2F125JQ U 33
AF RR2FT15TF C 321
AF RR2F125TF C 819
BS 1 185 RR2F701JQ
BS 186 186 RR2DW51JQ
BS 187 616 RR2F701JQ
BS 617 617 RR2F125JQ
BS 618 640 RR2F701JQ
BS 641 661 RR2F125JQ
BS 662 662 RR2FT15TF
BS 663 736 RR2F125JQ
BS 737 737 RR2FT15TF
BS 738 772 RR2F125JQ
BS 773 773 RR2FT15TF
BS 774 816 RR2F125JQ
BS 817 818 RR2FT15TF
BS 819 825 RR2F125JQ
BS 826 826 RR2FT15TF
BS 827 847 RR2F125JQ
BS 848 874 RR2FT15TF
BS 875 875 RR2F125TF
BS 876 876 RR2FT15TF
BS 877 877 RR2F125TF
BS 878 944 RR2FT15TF
BS 945 945 RR2F125TF
BS 946 1072 RR2FT15TF
BS 1073 1507 RR2F125TF

RD RR2DW51JQ 203 0 0
TTATATATATATGGCTTCATGTATTGAAAACAAAGTTGGGGTTTCCATCTGATTGTATTC
AAAGATACTGGTAACACAATGAATTGACATTAATAAACAAAAAAATCAGCTGGTCAAAAA
TAAATAAACCTGACAGCTTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCACCTTGCCTGCTTCATTTCATT
CTGCTGTTACCTTGATCTGTCCA

QA 1 203 1 203
DS 

RD RR2F701JQ 642 0 0
TATGTATTAAAACCCTTGAGAATGGTGAATCTAATGACAATGCAGGGTATCTTATATATA
TATGGCTTCATGTATTGAAAACAAAGTTGGGGTTTCCATCTGATTGTATTCAGAGATACT
GGTAACACAATGAATTGACATTAATAAGCAAAAAAATCAGCTGGTCAGAAATAGATAAAC
CTGACGGCTTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCACCTTGCCTGCTTCATTTCATTCTGCTGTTA
CCTTGATCTGTCCATAGAGATTAGGGTCTGCTTCATAGTATACAACATCTCCTTCATCGC
TAACAAAATGATCTTCTTTAATACTTTTTGCTAAGATTCCCAGTAAATGTAATGGCAAAG
GTCCAGACTTATCAGGCTCCCTGTAATACTTCCCTAATACTGGTTTAGCTGCTTCCGTTG
CTTCTACTAGATGGTAATGTGGGATCTGCGGGAAAAGATGATGTATCACATGAGTTCCAA
TGTCGTGATGGATGTTGTTGATCAATCCGTAGTCACGGTCCAATGTCGTAAGCCCTCCTC
TCAAGTAACTCCATTCCTTCCCACGGTACCAAGGGAGCTTATCTTCATGACCATGGTGAT
GCAGGTAAGTCACAAAATCCAACCACATTACATTTATCCA
AT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2F125JQ 815 0 0
A
ATGACAATGCAGGGTATCTTATATATATATGGCTTCAGGTATTGAAAACAAAGTTGGGGT
TTCCATCTGATTGTATTCAGAGATAATGGTAACACAATGAATTGACATTAATAAGCAAAA
AAATCAGCTGGTCAGAAATAGATAAACCTGCCAGCTTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCACCC
TGCCTGCTTCATTTCATTCTGCTGTTACCTTGATCTGTCCATAGAGATTAGGGTCTGCTT
CATAGTATACAACATCTCCTTCATCGCTCACAAAATGATCTTCTTTAATACTTTTTGCTA
AGATTCCCAGTAAATGTAATGGCAAAGGTCCAGACTTATCAGGCTCCCTGTAATACTTCC
CTAATACTGGTTTAGCTGCTTCCGTTGCTTCTGCTAGATGGTAATGTGGGATCTGCGGGA
AAAGATGATGTATCACATGAGTTCCAATGTCGTGATGGATGTTGTTGATCAATCCGTAGT
CACGGTCCAATGTCGTAAGCCCTCCTCTCAAGTAACTCCATTCCTTCCCACGGTACCAAG
GGAGCTTATCTTCATGACCATGGTGATGCAGGTAAGTCACAAAGTCCAACCACATTACAT
TTATCCAGTAAGGAACTACATAAAGTTTGAGCATTTGCATAGGACCCATCACAAAGTTGA
GGCAGACAAGCAGAGCAGCCATTGCAGTCCAACAAGCGGTAGATGTGAGAACATCATTTC
TCTCTTTAGGGAGGAACAAGTCGCTGTCCGGATGGTAATGAGAACCCTTCTTCCCCGGAC
TTCTTGCCCACA*GTAGAAAGGGTAAGCGAGCAT

QA 2 815 2 815
DS 

RD RR2FT15TF 753 0 0
AATAC
TTTTGCTAAGAT*CCCAGTAAATGTAATGGCAAAGGTCCAGACTTATCAGGCTCCCTGTA
ATACTTCCCTAATACTGGTTTAGCTGCTTCTGTTGCTTCTACTAGATGGTAATGTGGGAT
CTGAGGGAAAAGATGATGTATCACATGAGTTCCAATGTCGTGATGGATGTTGTTGATCAA
TCCGTAGTCACGGTCCAATGTCGTAAGCCCTCCTCTCAAGTAACTCCATTCCTTCCCACG
GTACCAAGGGAGCTTATCTTCATGACCATGGTGATGCAGGTAAGTCACAAAGTCCAACCA
CATAACATTTATCCAGTAAGGAACTACATAAAGTTTAAGCATTTGCATAGGACCCATCAC
AAAGTTGAGGCAGACAAGCAGAGCAGCCATTGCAGTCCAACAAGCGGTGGAAGTGAGAAC
ATCATTTCTCTCTTTAGGGAGGAACAAATCGCTGTCCGGATGGTAATGAGAACCCTTCTT
CCCCGGACTTCGAGCCCACAAGTAGAAAGGATAAGCGAGCATCACAAGAGGCAATGTAAA
TCTAAAGAATCTAGTCGGTTTGTCCAAACTCTTGTAGATTTTCTCAGACATAGGATGCCA
AGATTCATCATTCTCAACATGTCCATGGTTCTGGTGGTGAGTTCTGTGGCTAATTCTCCA
GCCATGGTAAGGGACCAGAATAGAGGAATGAAGAAGGTGACCCACCACACCGTTCAACCT
CGGATCATTTGAGAAGCTTCCATGTCC
C

QA 6 752 6 752
DS 

RD RR2F125TF 689 0 0
GCCCACAAGTAGAAAGGGTAAGCGAGCATCACAAGAGGCAATGTAAATCTAAAGAACCGA
GTCGGTTTGTCCAAACTCTTGTAGATTTTCTCAGACATAGGATGCCAAGATTCGTCGTTC
TCAACACGTCCATGGTTCTGGTGGTGAGTTCTGTGGCTAATTCTCCAGCCATGGTAAGGG
ACTAGAATAGAGGAATGAAGAAGGTGACCCACCACACTGTTCAACCTCGGATCATTTGAG
AAGCTTCCATGTCCACAGTCATGGCCAAGAACAAAGAGAGCCCAGAACATGGTTCCTTGA
GTAAACCAATAGAGAGGCCAAACAAGCCAATTGTTAAGGTAAGCAGCACCAGCAGCCAAC
GCGAACACGATGGCTACGTCTCTGACGACATAGCTCATCGATATCCATGGGTCGAATCTC
TGCGTTTTGGGTGGTTCTTCCTCGATTGGTGGAGAGGGGTCTACTGTTAGAGGCGTGCTC
ACATTCAACGCCCAGTTTCGAGAATTCAGACGAAACCGGAGAGAGGAGGAAGATGGGGGT
TGTCTGAATTTGAAGGAGGTGGGTTTGTTGTTGTAAGAGAGGGGAGTGGATCTGGGTGTG
GTGTAGATTCTCGGGAGTGGTCTTATTCCACATTCTGATAAGACCCAGTTCGCCATTACC
AGAAGCTCTGTTTCTCTCTCAGAGGAAAG

QA 1 689 1 689
DS 



CO CL601Contig2 745 2 10 U
AATGACAATACAGGGTATCTTATATATATATGGCTTCAAGTATTGAAAACAAAGTTGGGG
TTTCCATCTCATTGTATTCAGAGATAATGGTAACACAATGAATTGACATCAATAAGCAAA
AAAAAATCAGCTGGTCAAAAACAAATGAATCTGACAACTTCTCTCCCTCTCTTTCTCTTT
GCTTGCTTCATTTCATTCTGCTGTTACCTTGATCTGTCCATAGAGATTAGGGTCTGCTTC
ATAGTATACAACATCTCCTTCATCACTCACAAAATGATCTTCTTTAATACTTTTTGCTAA
AATTCCCAGTAAATGTAATGGCAAAGGTCCAGACTTATCAGGCTCCCTGTAATACTTCCC
TAATACTGGTTTAGCTGCTTCTGTTGCTTCTACTAAATGGTAATGTGGGATCTGAGGGAA
AAGATGATGTATCACATGAGTTCCAATGTCGTGATGGATGTTGTTGATCAATCCGTAGTC
ACGGTCCAATGTCGTAAGCCCTCCTCTCAAGTAACTCCATTCCTTCCCACGGTACCAAGG
GAGCTTATCTTCATGACCATGGTGATGCAGGTAAGTCACAAAGTCCAACCACATAACATT
TATCCAGTAAGGAACTACATAAAGTTTAAGCATTTGCATAGGACCCATCACAAAGTTGAG
ACAGACAAGCAGAGCAGCCATTGCAGTCCAACAAGCAGTAGAAGTAAGAACATCATTTCT
CTCTTTAGGGAGGAACAAGTCGCTG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT15JQ U 1
AF RR2CM91JQ U 2
BS 1 660 RR2FT15JQ
BS 661 661 RR2CM91JQ
BS 662 696 RR2FT15JQ
BS 697 697 RR2CM91JQ
BS 698 699 RR2FT15JQ
BS 700 700 RR2CM91JQ
BS 701 705 RR2FT15JQ
BS 706 706 RR2CM91JQ
BS 707 724 RR2FT15JQ
BS 725 745 RR2CM91JQ

RD RR2FT15JQ 724 0 0
AATGACAATACAGGGTATCTTATATATATATGGCTTCAAGTATTGAAAACAAAGTTGGGG
TTTCCATCTCATTGTATTCAGAGATAATGGTAACACAATGAATTGACATCAATAAGCAAA
AAAAAATCAGCTGGTCAAAAACAAATGAATCTGACAACTTCTCTCCCTCTCTTTCTCTTT
GCTTGCTTCATTTCATTCTGCTGTTACCTTGATCTGTCCATAGAGATTAGGGTCTGCTTC
ATAGTATACAACATCTCCTTCATCACTCACAAAATGATCTTCTTTAATACTTTTTGCTAA
AATTCCCAGTAAATGTAATGGCAAAGGTCCAGACTTATCAGGCTCCCTGTAATACTTCCC
TAATACTGGTTTAGCTGCTTCTGTTGCTTCTACTAAATGGTAATGTGGGATCTGAGGGAA
AAGATGATGTATCACATGAGTTCCAATGTCGTGATGGATGTTGTTGATCAATCCGTAGTC
ACGGTCCAATGTCGTAAGCCCTCCTCTCAAGTAACTCCATTCCTTCCCACGGTACCAAGG
GAGCTTATCTTCATGACCATGGTGATGCAGGTAAGTCACAAAGTCCAACCACATAACATT
TATCCAGTAAGGAACTACATAAAGTTTAAGCATTTGCATAGGACCCATCACAAAGTTGAG
GCAGACAAGCAGAGCAGCCATTGCAGTCCAACAAGCGGTGGAAGTGAGAACATCATTTCT
CTCT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2CM91JQ 744 0 0
ATGACAATACAGGGTATCTTATATATATATGGCTTCAAGTATTGAAAACAAAGTTGGGGT
TTCCATCTCATTGTATTCAGAGATAATGGTAACACAATGAATTGACATCAATAAGCAAAA
AAAAATCAGCTGGTCAGAAACAAATGAATCTGACAACTTCTCTCCCTCTCTTTCTCTTTG
CTTGCTTCATTTCATTCTGCTGTTACCTTGATCTGTCCATAGAGATTAGGGTCTGCTTCA
TAGTATACAACATCTCCTTCATCACTCACAAAATGATCTTCTTTAATACTTTTTGCTAAG
ATTCCCAGTAAATGTAATGGCAAAGGTCCAGACTTATCAGGCTCCCTGTAATACTTCCCT
AATACTGGTTTAGCTGCTTCTGTTGCTTCTACTAGATGGTAATGTGGGATCTGAGGGAAA
AGATGATGTATCACATGAGTTCCAATGTCGTGATGGATGTTGTTGATCAATCCGTAGTCA
CGGTCCAATGTCGTAAGCCCTCCTCTCAAGTAACTCCATTCCTTCCCACGGTACCAAGGG
AGCTTATCTTCATGACCATGGTGATGCAGGTAAGTCACAAAGTCCAACCACATAACATTT
ATCCAGTAAGGAACTACATAAAGTTTAAGCATTTGCATAGGACCCATCACAAAGTTGAGA
CAGACAAGCAGAGCAGCCATTGCAGTCCAACAAGCAGTAGAAGTAAGAACATCATTTCTC
TCTTTAGGGAGGAACAAGTCGCTG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 2 10

CO CL602Contig1 898 2 2 U
GTATTACGGTGTCGTATCACCGGAACTTGGCTCACCGGAGTTTCAAAGTCCCTAAATGGC
TGGAGTATCTCTTAGCCTATTGTGCCCTTCTCGCCATTCAGGGAGATCCGATTGATTGGG
TGAGTACTCATCGATATCATCACCAATTCACGGATTCAGAACGAGACCCACATAGCCCGA
AGGAAGGCTTTTGGTTTAGTCATCTCCTATGGATTTATGATTCCGCGTATCTCTTTACAA
AGTGTGGAAGAAGAACAGACGTGGACGATTTGAAGAGGCAATGGTTCTATAGGTTTCTTC
AAAAGACAGTGCTGTTTCACATTCTAGGACTTGGTATCATTCTCTTCTACCTCGGTGGGA
TGTCCTTCGTTACTTGGGGAATGGGGGTAGGAGCAGCACTGGAGGTGCACGTGACTTGTC
TAATAAACTCACTGTGTCATGTCTGGGGCACTCGAACTTGGAAGACAAATGACACTTCTC
GTAATGTTTGGTGGCTATCTGTATTTTCATTTGGAGAAAGCTGGCACAACAACCACCATG
CGTTCGAGTCGTCAGCTAGACAAGGTCTCGAATGGTGGCAAATCGACATTTCTTGGTACA
TTGTCCGGTTTCTTGAGATTATCGGTTTAGCATATGACGTGAAACTGCCAACGGAATCTC
AGCGACGTCGTATGGCTATTGTTCGTTGAACTGCGGGAAAACAAAAAGAGGAGAGATTAA
TTCTATGTAATTAGAATAATTTCCAGTCCTAAAAAGAGTTTATTGTTTTTATAGTCCTAA
AAAGAGTTTATTGTTTTTATTTTATTTATTTTACTTTGAAGTTTTGGGTAAACTCAATGA
ACGTTTCCGATGTGTTTGTGTTGGAACAAGTTGATTAATATATTTGTCGTAATTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C134TF U 1
AF RR2C134JQ C 82
BS 1 646 RR2C134TF
BS 647 898 RR2C134JQ

RD RR2C134TF 651 0 0
GTATTACGGTGTCGTATCACCGGAACTTGGCTCACCGGAGTTTCAAAGTCCCTAAATGGC
TGGAGTATCTCTTAGCCTATTGTGCCCTTCTCGCCATTCAGGGAGATCCGATTGATTGGG
TGAGTACTCATCGATATCATCACCAATTCACGGATTCAGAACGAGACCCACATAGCCCGA
AGGAAGGCTTTTGGTTTAGTCATCTCCTATGGATTTATGATTCCGCGTATCTCTTTACAA
AGTGTGGAAGAAGAACAGACGTGGACGATTTGAAGAGGCAATGGTTCTATAGGTTTCTTC
AAAAGACAGTGCTGTTTCACATTCTAGGACTTGGTATCATTCTCTTCTACCTCGGTGGGA
TGTCCTTCGTTACTTGGGGAATGGGGGTAGGAGCAGCACTGGAGGTGCACGTGACTTGTC
TAATAAACTCACTGTGTCATGTCTGGGGCACTCGAACTTGGAAGACAAATGACACTTCTC
GTAATGTTTGGTGGCTATCTGTATTTTCATTTGGAGAAAGCTGGCACAACAACCACCATG
CGTTCGAGTCGTCAGCTAGACAAGGTCTCGAATGGTGGCAAATCGACATTTCTTGGTACA
TTGTCCGGTTTCTTGAGATTATCGGTTTAGCATATGACGTGAAACT
GCCAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2C134JQ 817 0 0
TGTG
CCTTCTCGCCATTCAGGGAGATCCGATTGATTGGGTGAGTACTCATCGATATCATCACCA
ATTCACGGATTCAGAACGAGATCCACATAGCCCGAAGGAAGGCTTTTGGTTTAGTCATCT
CCTATGGATTTATGATTCCGCGTATCTCTTTACAAAGTGTGGAAGAAGAACAGACGTGGA
CGATTTGAAGAGGCAATGGTTCTATAGGTTTCTTCAAAAGACAGTGCTGTTTCACATTCT
AGGACTTGGTATCATTCTCTTCTACCTCGGTGGGATGTCCTTCGTTACTTGGGGAATGGG
GGTAGGAGCAGCACTGGAGGTGCACGTGACTTGTCTAATAAACTCACTGTGTCATGTCTG
GGGCACTCGAACTTGGAAGACAAATGACACTTCTCGTAATGTTTGGTGGCTATCTGTATT
TTCATTTGGAGAAAGCTGGCACAACAACCACCATGCGTTCGAGTCGTCAGCTAGACAAGG
TCTCGAATGGTGGCAAATCGACATTTCTTGGTACATTGTCCGGTTTCTTGAGATTATCGG
TTTAGCATATGACGTGAAACTGCCAACGGAATCTCAGCGACGTCGTATGGCTATTGTTCG
TTGAACTGCGGGAAAACAAAAAGAGGAGAGATTAATTCTATGTAATTAGAATAATTTCCA
GTCCTAAAAAGAGTTTATTGTTTTTATAGTCCTAAAAAGAGTTTATTGTTTTTATTTTAT
TTATTTTACTTTGAAGTTTTGGGTAAACTCAATGAACGTTTCCGATGTGTTTGTGTTGGA
ACAAGTTGATTAATATATTTGTCGTAATTTGGT

QA 5 817 5 817
DS 



CO CL602Contig2 1158 8 19 U
GTGATTTATAAGCACCAATTACCACAAATATCTTAAACCAACTTAGTCCAACATCAATAC
ATCGAAAACGTTCACATTGCATTTACCCAAAACATCAAAAGTAAAACAATAAACTCTTTT
CTAGGACTAGATATTCTAATTTTACATAGAATAAATCCTTCTTTTGTTCAACGAACAATA
GCCATCCTACGTCGCTGAGATTCCGTCGGGAGTTTCACATCATATGCTAACCCAACAATC
TCAAGAGACCGAACAATGTACCAAGAAATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTC
GCCGACGACTCGAACGCATGGTGATTGTTGTGCCAACTTTCCCCAAATGAAAACACAGAT
AGCCACCAAACATTACGAGAAGTGTCATTGGTTTTCCATGTCCGAGTGCCCCAAATGTGG
CAGATGGAGTTGATGAAGCAAGTCACGTGCACCTCCAATGCTGCTCCTACACCCATTCCC
CAAGTAACGAAGGACATGCCACCAAGATAGTAGAGAATGAGACCAAGTCCTAGAATATGA
AACATCACCGTTTTTTGAAGGAACCTATAGAACCATTGCTTCTTCAAATCCTCCACGTTT
GTTCTTCTTCCACACTTTGAAACAAGATATGCAGAATCATAAATCCATAGAAGATGACTA
AACCAAAAGCCTTCTTTAGGACTATGTGGATCTCTTTCTGAATCTGTAAACTGGTGATGA
TATCGATGAGTACTCACCCAATCGATCGGATCTCCCTGAATGGCGAGAAGGGCACAATAG
GCTAAGAGATACTCAAGCCATTTAGGGACTTTGAAACTCCGGTGAGCCAAGTTCCGGTGA
TACGACACCGTAATACCAAGACCACCAATCGTATAGAACAAAAACGTTACCCAAAGAGCC
GACCAGCTGAAATAAAACGGCGCCAAGAGAGCCATTGAATGCACAAACAGTGAAGCTGTT
AGTTTGACGTAATCTAATCTCCTCCACTTTCTCCCCCAAAACACCCATCTCTGTCTCCTC
TTCTCCGCCTCTTTCTCCGACGAATAAGGCTTTTTACGATGGTTCTCCTCCACCGTGGAT
GTCACCGACATTTCTCTCTACGTTTCTCTCTTCCTTGGAAATCTTTTCTGATTTAGAGAA
TAATAGAGAGGAGAATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 0 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2G976JQ U 1
AF RR2G976TF C 1
AF RR2D387JQ U 21
AF RR2BL08JQ U 22
AF RR2GG14JQB U 31
AF RR2GG14TF C 353
AF RR2BL08TF C 563
AF RR2D387TF C 716
BS 1 198 RR2G976JQ
BS 199 199 RR2D387JQ
BS 200 401 RR2G976JQ
BS 402 402 RR2D387JQ
BS 403 634 RR2G976JQ
BS 635 666 RR2D387JQ
BS 667 667 RR2BL08JQ
BS 668 727 RR2D387JQ
BS 728 752 RR2BL08JQ
BS 753 920 RR2GG14TF
BS 921 921 RR2BL08TF
BS 922 976 RR2GG14TF
BS 977 977 RR2BL08TF
BS 978 1044 RR2GG14TF
BS 1045 1045 RR2BL08TF
BS 1046 1058 RR2GG14TF
BS 1059 1059 RR2BL08TF
BS 1060 1144 RR2GG14TF
BS 1145 1158 RR2BL08TF

RD RR2G976JQ 636 0 0
GTGATTTATAAGCACCAATTACCACAAATATCTTAAACCAACTTAGTCCAACATCAATAC
ATCGAAAACGTTCACATTGCATTTACCCAAAACATCAAAAGTAAAACAATAAACTCTTTT
CTAGGACTAGATATTCTAATTTTACATAGAATAAATCCTTCTTTTGTTCAACGAACAATA
GCCATCCTACGTCGCTGAAATTCCGTCGGGAGTTTCACATCATATGCTAACCCAACAATC
TCAAGAGACCGAACAATGTACCAAGAAATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTC
GCCGACGACTCGAACGCATGGTGATTGTTGTGCCAACTTTCCCCAAATGAAAACACAGAT
AGCCACCAAACATTACGAGAAGTGTCATTGGTTTTCCATGTACGAGTGCCCCAAATGTGG
CAGATGGAGTTGATGAAGCAAGTCACGTGCACCTCCAATGCTGCTCCTACACCCATTCCC
CAAGTAACGAAGGACATGCCACCAAGATAGTAGAGAATGAGACCAAGTCCTAGAATATGA
AACATCACCGTTTTTTGAAGGAACCTATAGAACCATTGCTTCTTCAAATCCTCCACGTTT
GTTCTTCTTCCACACTTTGAAACAAGATATGCAG
CC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2G976TF 636 0 0
GTGATTTATAAGCACCAATTACCACAAATATCTTAAACCAACTTAGTCCAACATCAATAC
ATCGAAAACGTTCACATTGCATTTACCCAAAACATCAAAAGTAAAACAATAAACTCTTTT
CTAGGACTAGATATTCTAATTTTACATAGAATAAATCCTTCTTTTGTTCAACGAACAATA
GCCATCCTACGTCGCTGAGATTCCGTCGGGAGTTTCACATCATATGCTAACCCAACAATC
TCAAGAGACCGAACAATGTACCAAGAAATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTC
GCCGACGACTCGAACGCATGGTGATTGTTGTGCCAACTTTCCCCAAATGAAAACACAGAT
AGCCACCAAACATTACGAGAAGTGTCATTGGTTTTCCATGTACGAGTGCCCCAAATGTGG
CAGATGGAGTTGATGAAGCAAGTCACGTGCACCTCCAATGCTGCTCCTACACCCATTCCC
CAAGTAACGAAGGACATGCCACCAAGATAGTAGAGAATGAGACCAAGTCCTAGAATATGA
AACATCACCGTTTTTTGAAGGAACCTATAGAACCATTGCTTCTTCAAATCCTCCACGTTT
GTTCTTCTTCCACACTTTGAAACAAGATATGCAG
CC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2D387JQ 707 0 0
A
CCACAAATATCTTAAATAAATTTAGTCCAACATCAATACATCGAAAACGTTCACATTGCA
TTTACCCAAAACTTCAAAAGTAAAACAATAAACTCTTTTCTAGGACTAGATATTCTAATT
TTACATAGAATAAATCCTTCTTTTCTTCAACGGACAATAGCCATCCTACGTCTTTGAGAT
TCCGTCGGGAGTTTCACATCATATGCTAACCCAACAATCTCAAGTGACCGAACAATGTAC
CAAGAGATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTCGCCGACGACTCGAACGCATGG
TGATTGTTGTGCCAACTTTCTCCAAATGAAAACACAGATAGCCACCAAACATTACGAGAA
GTGTCATTGGTTTTCCATGTCCGAGTGCCCCAAATGTGGCAGATGGAGTTGATGAAGCAA
GTCACGTGCACCTCCAATGCTGCTCCTACACCCATTCCCCAAGTAACGAAGGACATGCCA
CCAAGATAGTAGAGAATGAGACCAAGTCCTAGAATATGAAACATCACCGTTTTTTGAAGG
AACCTATAGAACCATTGCTTCTTCAAATCCTCCACGTTTGTTCTTCTTCCACACTTTGAA
ACAAGATATGCAGAATCATAAATCCATAGAAGATGACTAAACCAAGAGCCTTCTTTAGGA
CTATGTGGATCTCTTTCTGAATCTGTAAACTGGTGATGATATCGAT

QA 2 707 2 707
DS 

RD RR2BL08JQ 731 0 0
CCACAAATATCTTAAATAAATTTAGTCCAACATCAATACATCGAAAACGTTCACATTGCA
TTTACCCAAAACTTCAAAAGTAAAACAATAAACTCTTTTCTAGGACTAGATATTCTAATT
TTACATAGAATAAATCCTTCTTTTCTTCAACGGACAATAGCCATCCTACGTCTTTGAGAT
TCCGTCGGGAGTTTCACATCATATGCTAACCCAACAATCTCAAGTGACCGAACAATGTAC
CAAGAGATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTCGCCGACGACTCGAACGCATGG
TGATTGTTGTGCCAACTTTCTCCAAATGAAAACACAGATAGCCACCAAACATTACGAGAA
GTGTCATTGGTTTTCCATGTCCGAGTGCCCCAAATGTGGCAGATGGAGTTGATGAAGCAA
GTCACGTGCACCTCCAATGCTGCTCCTACACCCATTCCCCAAGTAACGAAGGACATGCCA
CCAAGATAGTAGAGAATGAGACCAAGTCCTAAAATATGAAACATCACCGTTTTTTGAAGG
GACCTATAGAACCATTGCTTCTTCAAATCCTCCACGTTTGTTCTTCTTCCACACTTTGAA
ACAAGATATGCAGAATCATAAATCCATAGAAGATGACTAAACCAAAAGCCTTCTTTAGGA
CTATGTGGATCTCTTTCTGAATCTGTAAACTGGTGATGATATCGATGAGTACTCACCCAA
TCGATCGGATC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2GG14JQB 722 0 0
ACCACAAATATC
TTAGTCCAACATCAATACATCGAAAACGTTCACATTGCATTTACCCAAAACTTCAAAAGT
AAAACAATAAACTCTTTTCTAGGACTAGATATTCTAATTTTACATAGAATAAATCCTTCT
TTTGTTCAACGGACAATAGCCATCCTACGTCGTTGAGATTCCGTCGGAAGTTTCACATCA
TATGCTAACCCAACAATCTCAAGTGACCGAACAATGTACCAAGAGATGTCTATTTGCCAC
CATTCAAGTCCTTGCCTCGCCGACGACTCGAACGCATGGTGATTGTTGTGCCAACTTTCT
CCAAATGAAAACACAGACAGCCACCAAACATTACGAGAAGTGTCATTGGTTTTCCATGTC
CGAA**CCCCAAATGTGGCAGATGGAGTTGATGAAGCAAGTCACGTGCACCTCCAATGCT
GCTCCTACACCCATTCCCCAAGTAACGAAGGACATGCCACCAAGATAGTAGAGAATGAGA
CCAAGTCCTAGAATATGAAACATCACCGTTTTTTGAAGGAACCTATAGAACCAATGCTTC
TTAAAATCCTCCACGTTTGTTCTTCTTCCACACTTTGAAACAAGATATGCAGAATCATAA
ATCCATAGAAGATGACTAAACCAAAAGCCTTCTTTAGGACTATGTGGATCTCTTTCTGAA
TCTGTAAACTGGTGATGATATCGATGAGTACTCACCCAATCGATCGGATC

QA 13 722 13 722
DS 

RD RR2GG14TF 794 0 0
ACACAGACAGCCACCAAACAT*ACGAGAAGTGTCATTGGTTT*CCATGTCCGAA**CCCC
AAATGTGGCAGATGGAGTTGATGAAGCAAGTCACGTGCAC*TCCAATGCTGCTCCTACAC
CCATTCCCCAAGTAACGAAGGACATGCCACCAAGATAGTAGAGAATGAGACCAAGTC*TA
GAATATGAAACATCACCGTTTTTTGAAGGAACCTATAGAACCAATGCTTCTTAAAATCCT
CCACGTTTGTTCTTCTTCCACACTTTGAAACAAGATATGCAGAATCATAAATCCATAGAA
GATGACTAAACCAAAAGCCTTCTTTAGGACTATGTGGATCTCTTTCTGAATCTGTAAACT
GGTGATGATATCGATGAGTACTCACCCAATCGATCGGATCTCCCTGAATGGCGAGAAGGG
CACAATAGGCTAAGAGATACTCAAGCCATTTAGGGACTTTGAAACTCCGGTGAGCCAAGT
TCCGGTGATACGACACCGTAATACCAAGACCACCAATCGTATAGAACAAAAACGTTACCC
AAAGAGCCGACCAGCTGAAATAAAACGGTGCCAAGAGAGCCATTGAATGCACAAACAGTG
AAGCTGTTAGTTTGACGTAATCTAGTCTCCTCCACTTTCTCCCCCAAAACACCCATCTCT
GTCTCCTCTTCTCCGCCTCTTTCTCCGACGAAGAAGGCTTTTTACGGTGGTTCTCCTCCA
CCGTGGATGTCACCGACATTTCTCTCTACGTTTCTCTCTTCCTTGGAAATCTTTTCTGAT
TTAGAGAATAAT
CC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2BL08TF 596 0 0
ACCTATAGAACCATTGCTTCTTCAAATCCTCCACGTTTGTTCTTCTTCCACACTTTGAAA
CAAGATATGCAGAATCATAAATCCATAGAAGATGACTAAACCAAAAGCCTTCTTTAGGAC
TATGTGGATCTCTTTCTGAATCTGTAAACTGGTGATGATATCGATGAGTACTCACCCAAT
CGATCGGATCTCCCTGAATGGCGAGAAGGGCACAATAGGCTAAGAGATACTCAAGCCATT
TAGGGACTTTGAAACTCCGGTGAGCCAAGTTCCGGTGATACGACACCGTAATACCAAGAC
CACCAATCGTATAGAACAAAAACGTTACCCAAAGAGCCGACCAGCTGAAATAAAACGGCG
CCAAGAGAGCCATTGAATGCACAAACAGTGAAGCTGTTAGTTTGACGTAATCTAATCTCC
TCCACTTTCTCCCCCAAAACACCCATCTCTGTCTCCTCTTCTCCGCCTCTTTCTCCGACG
AATAAGGCTTTTTACGATGGTTCTCCTCCACCGTGGATGTCACCGACATTTCTCTCTACG
TTTCTCTCTTCCTTGGAAATCTTTTCTGATTTAGAGAATAATAGAGAGGAGAATCC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2D387TF 443 0 0
GATGATATCGATGAGTACTCACCCAATCGATCGGATCTCCCTGAATGGCGAGAAGGGCAC
AATAGGCTAAGAGATACTCAAGCCATTTAGGGACTTTGAAACTCCGGTGAGCCAAGTTCC
GGTGATACGACACCGTAATACCAAGACCACCAATCGTATAGAACAAAAACGTTACCCAAA
GAGCCGACCAGCTGAAATAAAACGGCGCCAAGAGAGCCATTGAATGCACAAACAGTGAAG
CTGTTAGTTTGACGTAATCTAATCTCCTCCACTTTCTCCCCCAAAACACCCATCTCTGTC
TCCTCTTCTCCGCCTCTTTCTCCGACGAATAAGGCTTTTTACGATGGTTCTCCTCCACCG
TGGATGTCACCGACATTTCTCTCTACGTTTCTCTCTTCCTTGGAAATCTTTTCTGATTTA
GAGAATAATAGAGAGGAGAATCC

QA 1 443 1 443
DS 



AS 2 9

CO CL603Contig1 821 2 4 U
AAAAAAAAAATGGCTTCGATGGGTGTTGGCTTACGTGTCACATCTCCCGCCGTTCTCGAA
GGAAACGTGAAGATCAACGGCTCGAGCCGTCTCAACATAACCGGAAGAGTAACGGTGCCT
CAAAGGTCTGGACTTGTCGTAAGAGCTCAGCAGAGCGAGGCGGCTCCGGAGACTTCTCGA
AGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGGTGGCTCGTTTGTTCAGGCCGTA
CTCGCCGATGCTGTCCCGATCAAAATTGGCCCTCCTCCACCTCCCTCCGGTGGCCTTCCT
GGGACAGATAACTCAGACCAAGCAAGGGATCTGAAACTGGCGTTGAAGGAAAGGTTTTAT
TTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCCAAAGAATCTGCGAAGGAGATC
GTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCCATATGTTCAGAACGATCTCCGT
CTCAGGGCTTCTTACCTCCGTTATGACCTTAACACAATCATCTCTTCCAAATCCAAGGAT
GAGAAGAAGTCTCTCAAGGCGCTCACTGGAAAGCTCTTTGATACCATCAACAATCTGGAT
TATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCTGAGAAGTACTATGCAGAGACCGTCTCT
AGTTTGAATGATGTTCTTGCCAAGCTTGGTTAAACCATGTGCTCTGCATTTTTCTTTGTA
AATCTTATTGTCTCTTGATTTTTTTTTGTTTCCTGAGTACTTAAACTCAAATCCCTGAAT
CCGAATTTGTGTTTCAAGTTTTTTTTTTTACCCCAGAAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A159TF U 1
AF RR2A159JQ C 282
BS 1 770 RR2A159TF
BS 771 771 RR2A159JQ
BS 772 796 RR2A159TF
BS 797 821 RR2A159JQ

RD RR2A159TF 802 0 0
AAAAAAAAAATGGCTTCGATGGGTGTTGGCTTACGTGTCACATCTCCCGCCGTTCTCGAA
GGAAACGTGAAGATCAACGGCTCGAGCCGTCTCAACATAACCGGAAGAGTAACGGTGCCT
CAAAGGTCTGGACTTGTCGTAAGAGCTCAGCAGAGCGAGGCGGCTCCGGAGACTTCTCGA
AGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGGTGGCTCGTTTGTTCAGGCCGTA
CTCGCCGATGCTGTCCCGATCAAAATTGGCCCTCCTCCACCTCCCTCCGGTGGCCTTCCT
GGGACAGATAACTCAGACCAAGCAAGGGATCTGAAACTGGCGTTGAAGGAAAGGTTTTAT
TTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCCAAAGAATCTGCGAAGGAGATC
GTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCCATATGTTCAGAACGATCTCCGT
CTCAGGGCTTCTTACCTCCGTTATGACCTTAACACAATCATCTCTTCCAAATCCAAGGAT
GAGAAGAAGTCTCTCAAGGCGCTCACTGGAAAGCTCTTTGATACCATCAACAATCTGGAT
TATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCTGAGAAGTACTATGCAGAGACCGTCTCT
AGTTTGAATGATGTTCTTGCCAAGCTTGGTTAAACCATGTGCTCTGCATTTTTCTTTGTA
AATCTTATTGTCTCTTGATTTTTTTTTGTTTCCTGAGTACTTAAACTCAA*TCCCTGAAT
CCGAATTTGTGTTTCA
GTTTTT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2A159JQ 540 0 0
TCCCTCCGGTGGCCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCAAGGGATCTGAAACTGGC
GTTGAAGGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCCAA
AGAATCTGCGAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCCATA
TGTTCAGAACGATCTCCGTCTCAGGGCTTCTTACCTCCGTTATGACCTTAACACAATCAT
TTCTTCCAAATCCAAGGATGAGAAGAAGTCTCTCAAGGCGCTCACTGGAAAGCTCTTTGA
TACCATCAACAATCTGGATTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCTGAGAAGTA
CTATGCAGAGACCGTCTCTAGTTTGAATGATGTTCTTGCCAAGCTTGGTTAAACCATGTG
CTCTGCATTTTTCTTTGTAAATCTTATTGTCTCTTGATTTTTTTTTGTTTCCTGAGTACT
TAAACTCAAATCCCTGAATCCGAATTTGTGTTTCAAGTTTTTTTTTTTACCCCAGAAAAT

QA 1 540 1 540
DS 



CO CL603Contig2 938 7 34 U
GGAACTTTCGTCTCTAAGAAACAAAAATAAAATAAAAATGGCTTCGATGGGTGTTGGCTT
ACGTGTCACATCTCCCGCCGTTCTCGAAGGAAGCGTGAAGATCAACGGCTCTAGCCGTCT
GAACGTAACCGGAAAAGTAACGGTGGCTCAAAGGTCTGGACTTGTCGTCAGAGCTCAGCA
GAGCGAGGCGGCACCAGAGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTT
AGCCGGTGGCTCGTTTGTTCAGGCCGTACTCGCCGATGCTGTTCCTATCAAAATTGGCCC
TCCTCCACCTCCCTCCGGTGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCGAGAGATCT
GAAACTGGCGTTGAAGGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGC
TAGAGCCAAAGAATCTGCGAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGC
TTGGCCATATGTTCAGAACGATCTCCGTCTCAGGGCTTCTTACCTCCGTTATGACCTAAA
CACAATCATCTCCTCCAAATCAAAGGATG*AGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAA
AGCTCTTTGACACCATCAACAATCTGGATTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATG
CTGAGAAGTACTATGCAGAGACCGTCTCTAGTTTGAACGATGTTCTTGCCAAGCTTGGTT
AAACCATTTCAATGCTCTGCATTTTTCTTTGTAAATCTTATTGTCTCTTGATTTTTGTTT
TGTTTCCTGAGTACTTAAACTCAAATCCCTGAATCCGAATTTGTGTTTCAAGTTTTTTTT
TTTTAACCCCAGAAAATGGCAATTTCTTGTGTATGCATTAGCTTTGCCTCCACCAAATTA
AATATTAAATTTAAATTGTTCCATCAGGGTTCAGCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 45 45 45 5 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 35 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H348TF U 17
AF RR2D306TF U 14
AF RR2B056TF U 1
AF RR2CV33TF U 113
AF RR2CV33JQ C 134
AF RR2D306JQ C 134
AF RR2H348JQ C 279
BS 1 264 RR2B056TF
BS 265 265 RR2D306TF
BS 266 278 RR2B056TF
BS 279 279 RR2D306TF
BS 280 282 RR2B056TF
BS 283 283 RR2D306TF
BS 284 285 RR2B056TF
BS 286 286 RR2D306TF
BS 287 312 RR2B056TF
BS 313 313 RR2D306TF
BS 314 314 RR2B056TF
BS 315 316 RR2D306TF
BS 317 351 RR2B056TF
BS 352 352 RR2D306TF
BS 353 438 RR2B056TF
BS 439 439 RR2D306TF
BS 440 463 RR2B056TF
BS 464 464 RR2D306TF
BS 465 537 RR2B056TF
BS 538 538 RR2D306TF
BS 539 569 RR2B056TF
BS 570 570 RR2D306TF
BS 571 588 RR2B056TF
BS 589 589 RR2D306TF
BS 590 610 RR2B056TF
BS 611 611 RR2D306TF
BS 612 776 RR2B056TF
BS 777 804 RR2CV33TF
BS 805 805 RR2CV33JQ
BS 806 836 RR2CV33TF
BS 837 842 RR2CV33JQ
BS 843 843 RR2D306JQ
BS 844 844 RR2H348JQ
BS 845 938 RR2D306JQ

RD RR2H348TF 456 0 0
G
GAAACAAAAATAAAATAAAAATGGCTTCGATGGGTGTTGGCTTACGTGTCACATCTCCCG
CCGTTCTCGAAGGAAGCGTGAAGATCAACGGCTCTAGCCGTCTGAACGTAACCGGAAAAG
TAACGGTGGCTCAAAGGTCTGGACTTGTCGTCAGAGCTCAGCAGAGCGAGGCGGCACCAG
AGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGGTGGCTCGTTTG
TTCAGGCCGTTCTCGCCGATGCTGTTCCTATCAAAATTGGCCCTCCTCCACCTCCCTCCG
GTGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCGAGAGATCTGAAACTGGCGTTGAAGG
AAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCCAAAGAATCTG
CGAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGAC

QA 2 456 2 456
DS 

RD RR2D306TF 639 0 0
GGAA
GAAACAAAAATAAAATAAAAATGGCTTCGATGGGTGTTGGCTTACGTGTCACATCTCCCG
CCGTTCTCGAAGGAAGCGTGAAGATCAACGGCTCTAGCCGTCTGAACGTAACCGGAAAAG
TAACGGTGGCTCAAAG*TCTGGACTTGTCGTCAGAGCTCAGCAGAGCGAGGCGGCACCAG
AGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGGTGGCTCGTTTG
TTCAGGCCGTTCTCGCCGATGCTGTTCCTATCAAAATTGGCCCTCCTCCACCTCCCTCCG
GTGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCGAGAGATCTGAAACTGGCGTTGAAGG
AAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCCAAAGAATCTG
CGAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCCATATGTTCAGA
ACGATCTCCGTCTCAGGGCTTCTTACCTCCGTTATGACCTAAACACAATCATCTCCTCCA
AATCAAAGGATG*AGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAAAGCTCTTTGACACCATC
AACAATCTGGATTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTAC

QA 5 639 5 639
DS 

RD RR2B056TF 777 0 0
GGAACTTTCGTCTCTAAGAAACAAAAATAAAATAAAAATGGCTTCGATGGGTGTTGGCTT
ACGTGTCACATCTCCCGCCGTTCTCGAAGGAAGCGTGAAGATCAACGGCTCTAGCCGTCT
GAACGTAACCGGAAAAGTAACGGTGGCTCAAAGGTCTGGACTTGTCGTCAGAGCTCAGCA
GAGCGAGGCGGCACCAGAGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTT
AGCCGGTGGCTCGTTTGTTCAGGCTGTACTCGCCGATGTTGTCCCGATCAAAATTGGCCC
TCCTCCACCTCCTT**GGTGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGATCT
GAAACTGGCGTTGAAGGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGC
TAGAGCCAAAGAATCTGCCAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCACTGATCGACAAGAAAGC
TTGGCCATATGTTCAGAACGATCTCCGTCTCAGGGCTTCTTACCTCCGTTATGACCTTAA
CACAATCATCTCCTCCAAATCAAAGGATGGAGAAGAAGTCTCTCAAGGCGCTCACTGGAA
AGCTCTTTGATACCATCAACAATCTGGATTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATG
CTGAGAAGTACTATGCAGAGACCGTCTCTAGTTTGAACGATGTTCTTGCCAAGCTTGGTT
AAACCATTTCAATGCTCTGCATTTTTCTTTGTAAATCTTATTGTCTCTTGATTTTT
G

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2CV33TF 724 0 0
G
GCCGTCTGAACGTAACCGGAAAAGTAACGGTGGCTCAAAGGTCTGGACTTGTCGTCAGAG
CTCAGCAGAGCGAGGCGGCACCAGAGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTG
CTGGTTTAGCCGGTGGCTCGTTTGTTCAGGCTGTACTCGCCGATGCTGTCCCGATCAAAA
TTGGCCCTCCTCCACCTCCCTCCGGTGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCAA
GAGATCTGAAACTGGCGTTGAAGGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAG
CTGTGGCTAGAGCCAAAGAATCTGCCAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCACTGATCGACA
AGAAAGCTTGGCCATATGTTCAGAACGATCTCCGTCTCAGGGCTTCTTACCTCCGTTATG
ACCTTAACACAATCATCTCCTCCAAATCAAAGGATG*AGAAAAAGTCTCTCAAGGCGCTC
ACTGGAAAGCTCTTTGATACCATCAACAATCTGGATTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACT
CCGGATGCTGAGAAGTACTATGCAGAGACCGTCTCTAGTTTGAACGATGTTCTTGCCAAG
CTTGGTTAAACCATTTCAATGCTCTGCATTTTTCTTTGTAAATCTTATTGTCTCTTGATT
TTTGTTTTGTTTCCTGAGTACTTAAACTCAA*TCCCTGAATCCGAATTTGTGTTTCAAGT
TTT

QA 2 724 2 724
DS 

RD RR2CV33JQ 714 0 0
AAAGTAACGGTGGCTCAAAGGTCTGGACTTGTCGTCAGAGCTCAGCAGAGCGAGGCGGCA
CCAGAGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGGTGGCTCG
TTTGTTCAGGCTGTACTCGCCGATGCTGTCCCGATCAAAATTGGCCCTCCTCCACCTCCC
TCCGGTGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGATCTGAAACTGGCGTTG
AAGGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCCAAAGAA
TCTGCCAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCACTGATCGACAAGAAAGCTTGGCCATATGTT
CAGAACGATCTCCGTCTCAGGGCTTCTTACCTCCGTTATGACCTTAACACAATCATCTCC
TCCAAATCAAAGGATG*AGAAAAAGTCTCTCAAGGCGCTCACTGGAAAGCTCTTTGATAC
CATCAACAATCTGGATTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCTGAGAAGTACTA
TGCAGAGACCGTCTCTAGTTTGAACGATGTTCTTGCCAAGCTTGGTTAAACCATTTCAAT
GCTCTGCATTTTTCTTTGTAAATCTTATTGTCTCTTGATTTTTGTTTTGTTTCCTGAGTA
CTTAAACTCAAATCCCTGAATCCGAATTTGTGTTTCAAGTTTTTTTTTT
CCCCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2D306JQ 805 0 0
AAAGTAACGGTGGCTCAAAG*TCTGGACTTGTCGTCAGAGCTCAGCAGAGCGAGGCGGCA
CCAGAGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGGTGGCTCG
TTTGTTCAGGCCGTTCTCGCCGATGCTGTTCCTATCAAAATTGGCCCTCCTCCACCTCCC
TCCGGTGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCGAGAGATCTGAAACTGGCGTTG
AAGGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCCAAAGAA
TCTGCGAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCCATATGTT
CAGAACGATCTCCGTCTCAGGGCTTCTTACCTCCGTTATGACCTAAACACAATCATCTCC
TCCAAATCAAAGGATG*AGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAAAGCTCTTTGACAC
CATCAACAATCTGGATTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCTGAGAAGTACTA
TGCAGAGACTGTCTCTAGTTTGAACGATGTTCTTGCCAAGCTTGGTTAAACCATTTCAAT
GCTCTGCATTTTTCTTTGTAAATCTTATTGTCTCTTGAACTTTTTTTTGTTTCCTGAGTA
CTTAAACTCAAATCCCTGAATCCGAATTTGTGTTTCAAGTTTTTTTTTTT*AACCCCAGA
AAATGGCAATTTCTTGTGTATGCATTAGCTTTGCCTCCACCAAATTAAATATTAAATTTA
AATTGTTCCATCAGGGTTCAGCTAT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2H348JQ 628 0 0
CTGTTCCTATCAAAATTGGCCCTCCTCCACCTCCCTCCGGTGGTCTTCCTGGGACAGATA
ACTCAGACCAAGCGAGAGATCTGAAACTGGCGTTGAAGGAAAGGTTTTATTTACAGCCAT
TGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCCAAAGAATCTGCGAAGGAGATCGTGAATGTGA
AGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCCATATGTTCAGAACGATCTCCGTCTCAGGGCTT
CTTACCTCCGTTATGACCTAAACACAATCATCTCCTCCAAATCAAAGGATG*AGAAGAAG
TCTCTCAAGGAGCTCACTGGAAAGCTCTTTGACACCATCAACAATCTGGATTATGCGGCG
AAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCTGAGAAGTACTATGCAGAGACTGTCTCTAGTTTGAAC
GATGTTCTTGCCAAGCTTGGTTAAACCATTTCAATGCTCTGCATTTTTCTTTGTAAATCT
TATTGTCTCTTGAACTTTTTTTTGTTTCCTGAGTACTTAAACTCAAATCCCTGAATCCGA
ATTTGTGTTTCAAGTTTTTTTTTTTTAACCCCAGAAAATGGCAATTTCTTGTGTATGCAT
TAGCTTTGCCTCCACCAAATTAAATATT

QA 1 628 1 628
DS 



AS 3 9

CO CL604Contig1 742 4 3 U
GATTTGTATATATCCAATCCTATAGATAAGGATGGACATCATGTATATATATGACTGCTA
TGAATACATAACTTTCCACGGAGACTTACATTATAACATAATGTAATCGATCTCAGATTA
TTAAAACAC*ACATGC*AACATAAA*GGAGGTT*GTTTGTTCTCAAACAAACTGGTTGAG
AAACTCATCGAGACTAGTGTACTTGACATCAGGGTAAAGCTCGGAAGCTTCCACTCCAAC
AGAAGGGTCTATAGTTAAGGAGGTAAGCTCACCTTGCACTAGTATTGCATGGATCAAACC
CATCACAACATCCATTGGATCCTGAGCCTCTTGGATGCTTTTGAGAAGTTCTTCCTCTGA
AACATAGATCTTCTCCAGAGTCTTACCGATCTTTCTCTCCCACAAACTTACCATATCGTT
CTGCGAGACAAAGTTCTTGGGTGGATGGATGTAGAGAATCTTGTTAAGTGTTCTCGGGTC
ATCAACAGCTTTCATTGTAGTCGCAACAATGTCCTCTTCTGTGTTGATAATAGCTTTGGC
ATCGCCACTGTCGAAGATGGAAACTTTGTCTGTAGGAGGAGTTCTGAGTCCCAAGTGGCA
TTGACCCAAACTAGGTACGAAATAGCCAGCAAAGCCACCTGAGACAACATACGTATAAGG
TATCTCTGCGGCCTCTATGGCGCGACGTATCTGAGCTTTCATGATGAATCCTGATAACGT
CGGCTCGATGGCCACCGTACGG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK64JQ U 1
AF RR2H623JQB U 6
AF RR2AX24TFB C 362
AF RR2AX24JQ U 1
BS 1 324 RR2AX24JQ
BS 325 325 RR2DK64JQ
BS 326 742 RR2AX24JQ

RD RR2DK64JQ 496 0 0
GATTT
GTATATATCCAATCCTATAGATAAGGATGGACATCATGTATATATATGACTGCTATGAAT
ACATAACTTTCCACGGAGACTTACATTATAACATAATGTAATCGATCTCAGATTATTAAA
ACAGTACATGCTAACATAAAAGGAGGTTTGTTTGTTCTCAAACAAACTGGTTGAAAAACT
CATCGAGACTAGTGTACTTGACATCAGGGTAAAGCTCGGAAGCTTCCACTCCAACAGAAG
GGTCTATAGTGAAGGAGGTAAGCTCACCTTGCACTAGTATTGCATGGATCAAACCCATCA
CAACATCCGTTGGATCCTGAGCCTCTTTGATGCTTTTGAGAAGTTCTTCCTCTGAAACAT
AAATCTTCTCCAGAATCTTACCGATCTTTCTCTCCCACAAACTGACCATATCGTTCTGCG
AGACAATGTTCTTGGGTGGATGGATGTAGAGAATCTTGTTAAGTGTTTTCGGGTCATCAA
CAGCTTTCATT

QA 6 496 6 496
DS 

RD RR2H623JQB 500 0 0
GTATATATCCAATCCTATAGATAAGGATGGACATCATGTATATATATGACTGCTATGAAT
ACATAACTTTCCACGGAGACTTACATTATAACATAATGTAATCGATCTCAGATTATTAAA
ACAC*ACATGC*AACATAAA*GGAGGTT*GTTTGTTCTCAAACAAACTGGTTGAGAAACT
CATCGAGACTAGTGTACTTGACATCAGGGTAAAGCTCGGAAGCTTCCACTCCAACAGAAG
GGTCTATAGTTAAGGAGGTAAGCTCACCTTGCACTAGTATTGCATGGATCAAACCCATCA
CAACATCCATTGGATCCTGAGCCTCTTGGATGCTTTTGAGAAGTTCTTCCTCTGAAACAT
AGATCTTCTCCAGAGTCTTACCGATCTTCCTCTCCCACAAACTTACCATATCGTTCTGCG
AGACAAAGTTCTTGGGTGGATGGATGTAGAGAATCTTGTTAAGTGTTCTCGGGTCACCAA
CAGCTTTCATTGTA
GTGGCA

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2AX24TFB 186 0 0
ACATAGATCTTCTCCAGAGTCTTACCGATCTTTCTCTCCCACAAACTTACCATATCGTTC
TGCGAGACAAAGTTCTTGGGTGGATGGATGTAGAGAATCTTGTTAAGTGTTCTCGGGTCA
TCAACAGCTTTCATTGTAGTCGCAACAATGTCCTCTTCTGTGTTGATAATAGCTTTGGCA
TCGCC
C

QA 1 185 1 185
DS 

RD RR2AX24JQ 742 0 0
GATTTGTATATATCCAATCCTATAGATAAGGATGGACATCATGTATATATATGACTGCTA
TGAATACATAACTTTCCACGGAGACTTACATTATAACATAATGTAATCGATCTCAGATTA
TTAAAACAC*ACATGC*AACATAAA*GGAGGTT*GTTTGTTCTCAAACAAACTGGTTGAG
AAACTCATCGAGACTAGTGTACTTGACATCAGGGTAAAGCTCGGAAGCTTCCACTCCAAC
AGAAGGGTCTATAGTTAAGGAGGTAAGCTCACCTTGCACTAGTATTGCATGGATCAAACC
CATCACAACATCCATTGGATCCTGGGCCTCTTGGATGCTTTTGAGAAGTTCTTCCTCTGA
AACATAGATCTTCTCCAGAGTCTTACCGATCTTTCTCTCCCACAAACTTACCATATCGTT
CTGCGAGACAAAGTTCTTGGGTGGATGGATGTAGAGAATCTTGTTAAGTGTTCTCGGGTC
ATCAACAGCTTTCATTGTAGTCGCAACAATGTCCTCTTCTGTGTTGATAATAGCTTTGGC
ATCGCCACTGTCGAAGATGGAAACTTTGTCTGTAGGAGGAGTTCTGAGTCCCAAGTGGCA
TTGACCCAAACTAGGTACGAAATAGCCAGCAAAGCCACCTGAGACAACATACGTATAAGG
TATCTCTGCGGCCTCTATGGCGCGACGTATCTGAGCTTTCATGATGAATCCTGATAACGT
CGGCTCGATGGCCACCGTACGG

QA 1 742 1 742
DS 



CO CL604Contig2 1054 3 4 U
GGAACTCAAGAAGTCTCCGAAACTCAAAATTCAACGGAGAAGAAGAAGTAGGAAGAGAGA
GGAGATGACGAGCAGGATTCTGGTGATTGGGGCGACGGGTTACATAGGAAAAGTGTTCGT
CGAGGGAAGCGTCAAGTCCGGCCACACCACTTTCGCTCTGGTCAGAGAATCCTCTCTCTC
CGATCCCGTTAAGGCCAAACTCGTCCAGAGTTTCAAAGACCTTGGCGTCACCATTCTCTA
CGGAAGCTTAAATGAGAAAGATAGCTTGGTCAAAGCGATTAAACAAGTAGATGTCGTGAT
TTCTGCTCTTGGTCGGACCCAGATTCTAGATCAGGTGAACATCATCGACGCCATCAAAGA
AGCTGGAAATGTCAAGAGATTCTTACCTTCGGAATTTGGAAATGACGTAGACCGTACGGT
GGCCATCGAGCCGGCGTTATCGGAATTCATCATGAAAGCTCAGATACGTCGTGCCATAGA
GGCCGCGGGGATACCTTATACGTATGTCGTCACAGGTTGCTTTGCTGGTTTTTTCGTACC
TAGTTTGGGCCAATGCCACTTGCGGCTCAGAACTCCTCCTGCTGACAAAGTTTCCATCTA
CGACAGTGGCGATGCCAAAGCTATTATCAACACTGAAGAGGACATTGTTGCGTATACAAT
GAAAGCTGTTGACGACCCAAGAACACTCAACAAGATTCTCTACGTCCATCCACCAAAGAA
CATTGTCTCGCAGAACGATATGGTCAGTTTGTGGGAGAGAAAGATCGGTAAGACTCTGGA
GAAGATTTATGTTTCAGAGGAAGAACTTCTCAAAAGCATCCAAGAGGCTCAGCCTCCAAT
GGATTTTGTGATGGGTTTGATCCATACAGTACTAGTGCAGGGTGATCTTACCTCCTTCAC
TATAGACCCTTCCGCTGGAGTGGAGGCTTCCGAGCTTTACCCTGATGTCAAGTACACCAG
TGTCGATGAGTTTCTCAACCAGTTTGTTTGAGAAACAAACAAACCTCCTTTTATGTTGCA
TGTACTCTTAGACGCTAATCTTTTAATTCAAACG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C761TF U 1
AF RR2B702TF U 1
AF RR2B702JQ C 243
BS 1 191 RR2B702TF
BS 192 192 RR2C761TF
BS 193 765 RR2B702TF
BS 766 1054 RR2B702JQ

RD RR2C761TF 717 0 0
GGAACTCAAGAAGTCTCCGAAACTCAAAATTCAACGGAGAAGAAGAAGTAGGAAGAGAGG
GGAGATGACGAGCAGGATTCTGGTGATTGGGGCGACGGGTTACATAGGAAAAGTGTTCGT
CGAGGGAAGCGTCAAGTCCGGCCACACCACTTTCGCTCTGGTCAGAGAATCCTCTCTCTC
CGATCCCGTTAAGGCCAAACTCGTCCAGAGTTTCAAAGACCTTGGCGTCACCGTTCTCTA
CGGAAGCTTAAATGAGAAAGATAGCTTGGTCAAAGCGATTAAACAAGTAGATGTCGTGAT
TTCTGCTCTTGGTCGGACCCAGATTCTAGATCAGGTGAACATCATCGACGCCATCAAAGA
AGCTGGAAATGTCAAGAGATTCTTACCTTCGGAATTTGGAAATGACGTAGACCGTACGGT
GGCCATCGAGCCGGCGTTATCGGAATTCATCATGAAAGCTCAGATACGTCGTGCCATAGA
GGCCGCGGGGATACCTTATACGTATGTTGTCACAGGTTGCTTTGCTGGTTTTTTCGTACC
TAGTTTGGGCCAATGCCACTTGCGGCTCAGAACTCCTCCTGCTGACAAAGTTTCCATCTA
CGACAGTGGCGATGCCAAAGCTATTATCAACACTGAAGAGGACATTGTTGCGTATACAAT
GAAAGCTGTTGATGACCCAAGAACACTCAACAAGATTCTCTACGTCCATCCACCAA
G

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2B702TF 765 0 0
GGAACTCAAGAAGTCTCCGAAACTCAAAATTCAACGGAGAAGAAGAAGTAGGAAGAGAGA
GGAGATGACGAGCAGGATTCTGGTGATTGGGGCGACGGGTTACATAGGAAAAGTGTTCGT
CGAGGGAAGCGTCAAGTCCGGCCACACCACTTTCGCTCTGGTCAGAGAATCCTCTCTCTC
CGATCCCGTTAGGGCCAAACTCGTCCAGAGTTTCAAAGACCTTGGCGTCACCATTCTCTA
CGGAAGCTTAAATGAGAAAGATAGCTTGGTCAAAGCGATTAAACAAGTAGATGTCGTGAT
TTCTGCTCTTGGTCGGACCCAGATTCTAGATCAGGTGAACATCATCGACGCCATCAAAGA
AGCTGGAAATGTCAAGAGATTCTTACCTTCGGAATTTGGAAATGACGTAGACCGTACGGT
GGCCATCGAGCCGGCGTTATCGGAATTCATCATGAAAGCTCAGATACGTCGTGCCATAGA
GGCCGCGGGGATACCTTATACGTATGTCGTCACAGGTTGCTTTGCTGGTTTTTTCGTACC
TAGTTTGGGCCAATGCCACTTGCGGCTCAGAACTCCTCCTGCTGACAAAGTTTCCATCTA
CGACAGTGGCGATGCCAAAGCTATTATCAACACTGAAGAGGACATTGTTGCGTATACAAT
GAAAGCTGTTGACGACCCAAGAACACTCAACAAGATTCTCTACGTCCATCCACCAAAGAA
CATTGTCTCGCAGAACGATATGGTCAGTTTGTGGGAGAGAAAGAT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2B702JQ 812 0 0
GAAGCTTAAATGAGAAAGATAGCTTGGTCAAAGCGATTAAACAAGTAGATGTCGTGATTT
CTGCTCTTGGTCGGACCCAGATTCTAGATCAGGTGAACATCATCGACGCCATCAAAGAAG
CTGGAAATGTCAAGAGATTCTTACCTTCGGAATTTGGAAATGACGTAGACCGTACGGTGG
CCATCGAGCCGGCGTTATCGGAATTCATCATGAAAGCTCAGATACGTCGTGCCATAGAGG
CCGCGGGGATACCTTATACGTATGTCGTCACAGGTTGCTTTGCTGGTTTTTTCGTACCTA
GTTTGGGCCAATGCCACTTGCGGCTCAGAACTCCTCCTGCTGACAAAGTTTCCATTTACG
ACAGTGGCGATGCCAAAGCTATTATCAACACTGAAGAGGACATTGTTGCGTATACAATGA
AAGCTGTTGACGACCCAAGAACACTCAACAAGATTCTCTACGTCCATCCACCAAAGAACA
TTGTCTCGCAGAACGATATGGTCAGTTTGTGGGAGAGAAAGATCGGTAAGACTCTGGAGA
AGATTTATGTTTCAGAGGAAGAACTTCTCAAAAGCATCCAAGAGGCTCAGCCTCCAATGG
ATTTTGTGATGGGTTTGATCCATACAGTACTAGTGCAGGGTGATCTTACCTCCTTCACTA
TAGACCCTTCCGCTGGAGTGGAGGCTTCCGAGCTTTACCCTGATGTCAAGTACACCAGTG
TCGATGAGTTTCTCAACCAGTTTGTTTGAGAAACAAACAAACCTCCTTTTATGTTGCATG
TACTCTTAGACGCTAATCTTTTAATTCAAACG

QA 1 812 1 812
DS 



CO CL604Contig3 464 2 3 U
GGAAAATTCAACGGAAGAGAAGTAGAAAGAGAGGAGAGATGACGAGCAAGATTCTGGTGA
TCAGGGCGACGGGTTACATAGGAAGAGTGTTCGTCAAGGGAAGCGTCGAGTCCGGCCACG
CCACTTCCGCTCTGGTCAGAGAATCCTCTCTCTCTGATCCCGTTAAGGCCAAACTCGTCC
AGAGTTCCAAAGACCTTGGTGTCACCATACTCTACGGAAGCGTAAATGAGAAAGAGAGCT
TGGTGAAAGCGATCAAACAAGTAGATGTCGTGATTTCTGCTCTTGGTCGAACTCAGATTC
TAGATCAGGTCAACATCATCGACGCCATCAAAGAAGCTGGAAATGTCAAGAGATTCTTAC
CTTCGGAATTTGGAAACGACGTTGATCGTACGGTGGCCATCGAGCCGACGTTATCAGGAT
TCATCATGAAAGCTCAGATACGTCGTGCCATAGAGGCCGCGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H623TF U 11
AF RR2DK64TF U 1
BS 1 186 RR2DK64TF
BS 187 187 RR2H623TF
BS 188 464 RR2DK64TF

RD RR2H623TF 302 0 0
GTGGAAG
AGAAGTAGAAAGAGAGGAGAGATGACGAGCAAGATTCTGGTGATCGGGGCGACGGGTTAC
ATAGGAAGAGTGTTTGTCAAGGGAAGCGTCGAGTCCGGCCACGCCACTTCCGCTCTGGTC
AGAGAATCCTCTCTCTCTGATCCCGTTAAGGCCAAACTCGTCCAGAGTTCCAAAGACCTT
GGTGTCACCGTACTCTACGGAAGCGTAAATGAGAAAGAGAGCTTGGTGAAAGCGATCAAA
CAAGTAGATGTCGTGATTTCTGCTCTTGGTCGAACTCAGATTCTAGATCAGGT
CA

QA 8 300 8 300
DS 

RD RR2DK64TF 464 0 0
GGAAAATTCAACGGAAGAGAAGTAGAAAGAGAGGAGAGATGACGAGCAAGATTCTGGTGA
TCAGGGCGACGGGTTACATAGGAAGAGTGTTCGTCAAGGGAAGCGTCGAGTCCGGCCACG
CCACTTCCGCTCTGGTCAGAGAATCCTCTCTCTCTGATCCCGTTAAGGCCAAACTCGTCC
AGAGTTTCAAAGACCTTGGTGTCACCATACTCTACGGAAGCGTAAATGAGAAAGAGAGCT
TGGTGAAAGCGATCAAACAAGTAGATGTCGTGATTTCTGCTCTTGGTCGAACTCAGATTC
TAGATCAGGTCAACATCATCGACGCCATCAAAGAAGCTGGAAATGTCAAGAGATTCTTAC
CTTCGGAATTTGGAAACGACGTTGATCGTACGGTGGCCATCGAGCCGACGTTATCAGGAT
TCATCATGAAAGCTCAGATACGTCGTGCCATAGAGGCCGCGGAG

QA 1 464 1 464
DS 



AS 2 9

CO CL605Contig1 1233 3 11 U
GTAACCAACTCAATTTTTATTTTTTGACTAAACAAGATTCAAATTATTAACAAAGGAAAA
ACAACAAAGGCAAACCAATCCGAGAAAACAAATGTCCAAGTTTGGAAAAGTACAAAAGAC
AAACCCAAGTGAGAAACTGATGGATTGTCTATTTATTTTGAAGAAACAAAGACAAACACT
CTTATAAAGAGGAAATGGATTCTCCCCGTTCCGTGTGTGGATAGTACATATGAAGAGGAG
ATGCCATGCCACTCGCGTTACAACACCTCCAATCCTAATCGCGGTAAGGTGTTAAATCAA
TTTGGAACCCCTGCTTCCCTTTTGTGACCCTAGCAATCGCGACGAGCTCCTCCAAGAGTT
CTTCAAAATGACGCAAAGGCCACTGAGTTGGACCATCGACTGGAGCACTTAGAGGATCAT
CATGAACCTCCATGAAAATTCCATCGACGCCAACTGCTACAGCAGTTCTCGCAATGCAAG
GTATTAACTCCCGAAGGCCTCCACTAGCAACACCACCACCGTCCAACTTTCTGCCACAAG
GTTGTTGTAGTGAATGGGTTATATCAGCAAGAACAGGACAATTAGCTTCCCTCATCCATT
CCAAGTTTCTTGGATCAACTATCAAATCATTGTATCCAAACATGGTTCCTCTTTCACAAA
CCATCACATTTGGATTCCCAGCAAGTCTGATCTTCTCGGCCGAATTTTCCATGACAGAAG
GAGCACAAAACTGTCCTTTCTTAATATTGATAATTCTCCCGGTTTGGGCTGCCGCTACCA
GAAGATCTGTCTGGCGACATAAGAATGCTGGTATTTGAATTATATCTGCAACCTTGCCAA
CTTCTTCACACTGGAACGGTTCATGCACATCAGTTATTATTGGCAGGTCATATGCTACTT
TCACCGTCTCAAGAATCTTGAGACCCTGAGCCATGCCAGGACCTCGGAACGACTTTGACG
AAGTTCTGTTAGCTTTATCAAAACTTGACTTGAAAACCAGGGGCAACCCAACTTTTGTGG
CAATATCTTTGATGTGCTTAGCCATACGTAGAATATGTTCCTCAGATTCGATAACGTTTG
GACCAGCCAACAAGAAGAACGGCTCAGCAGCCTTAAGCTGGTCGTATAGTGGTGATGTTG
TAGCCATTCTTTTTTCGTCAAAGCTATATAACCTCAAAAGGTGAAACTTTAAGCTTACTC
GATGATCTCGAAGTTGCAGAGGGAGTAAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN60JQ U 1
AF RR2AL84JQ U 2
AF RR2DN60TF C 517
BS 1 114 RR2DN60JQ
BS 115 115 RR2AL84JQ
BS 116 353 RR2DN60JQ
BS 354 354 RR2AL84JQ
BS 355 364 RR2DN60JQ
BS 365 365 RR2AL84JQ
BS 366 478 RR2DN60JQ
BS 479 479 RR2AL84JQ
BS 480 613 RR2DN60JQ
BS 614 715 RR2AL84JQ
BS 716 1233 RR2DN60TF

RD RR2DN60JQ 613 0 0
GTAACCAACTCAATTTTTATTTTTTGACTAAACAAGATTCAAATTATTAACAAAGGAAAA
ACAACAAAGGCAAACCAATCCGAGAAAACAAATGTCCAAGTTTGGAAAAGTACAGAAGAC
AAACCCAAGTGAGAAACTGATGGATTGTCTATTTATTTTGAAGAAACAAAGACAAACACT
CTTATAAAGAGGAAATGGATTCTCCCCGTTCCGTGTGTGGATAGTACATATGAAGAGGAG
ATGCCATGCCACTCGCGTTACAACACCTCCAATCCTAATCGCGGTAAGGTGTTAAATCAA
TTTGGAACCCCTGCTTCCCTTTTGTGACCCTAGCAATCGCGACGAGCTCCTCCCAGAGTT
CTTCTAAATGACGCAAAGGCCACTGAGTTGGACCATCGACTGGAGCACTTAGAGGATCAT
CATGAACCTCCATGAAAATTCCATCGACGCCAACTGCTACAGCAGTTCTCGCAATGCACG
GTATTAACTCCCGAAGGCCTCCACTAGCAACACCACCACCGTCCAACTTTCTGCCACAAG
GTTGTTGTAGTGAATGGGTTATATCAGCAAGAACAGGACAATTAGCTTCCCTCATCCATT
CCAAGTTTCTTGG

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2AL84JQ 714 0 0
ACCAAG
ACTCAATTTTTATTTTTTGACTAAACAAGATTCAAATTATTAACAAAGGAAAAACAACAA
AGGCAAACCAATCCGAGAAAACAAATGTCCAAGTTTGGAAAAGTACAAAAGACAAACCCA
AGTGAGAAACTGATGGATTGTCTATTTATTTTGAAGAAACAAAGACAAGCACTCTTATAA
AGAGGAGATGGATTCTCCCCGTTCCGTGTGTGGATAGTACATATGAAGAGGAGATGCCAT
GCCACTCGCGTTACAACACCTCCAATCCTAATCGCGGTAAGGTGTTAAATCAATTTGGAA
CCCCTGCTTCCCTTTTGTGACCCTAGCAATCGCGACGAGCTCCTCCAAGAGTTCTTCAAA
ATGACGCAAAGGCCACTGAGTTGGACCATCGACTGGAGCACTTAGAGGATCATCATGAAC
CTCCATGAAAATTCCATCGACGCCAACTGCTACAGCAGTTCTCGCAATGCAAGGTATTAA
CTCCCGAAGGCCTCCACTAGCAACACCACCACCGTCCAACTTTCTGCCACAAGGTTGTTG
TAGTGAATGGGTTATATCAGCAAGAACAGGACAATTAGCTTCCCTCATCCATTCCAAGTT
TCTTGGATCAACTATCAAATCATTGTATCCAAACATGGTTCCTCTTTCACAAACCATCAC
ATTTGGATTCCCAGCAAGTCTGATCTTCTCGGCCGAATTTTCCATGAC

QA 7 714 7 714
DS 

RD RR2DN60TF 717 0 0
CCA
CGTCCAACTTTCTGCCACAAGGTTGTTGTAGTGAATGGGTTATATCAGCAAGAACAGGAC
AATTAGCTTCCCTCATCCATTCCAAGTTTCTTGGATCAACTATCAAATCATTGTATCCAA
ACATGGTTCCTCTTTCACAAACCATCACATTTGGATTCCCAGCAAGTCTGATCTTCTCGG
CCGAATTTTCCATGACAGAAGGAGCACAAAACTGTCCTTTCTTAATATTGATAATTCTCC
CGGTTTGGGCTGCCGCTACCAGAAGATCTGTCTGGCGACATAAGAATGCTGGTATTTGAA
TTATATCTGCAACCTTGCCAACTTCTTCACACTGGAACGGTTCATGCACATCAGTTATTA
TTGGCAGGTCATATGCTACTTTCACCGTCTCAAGAATCTTGAGACCCTGAGCCATGCCAG
GACCTCGGAACGACTTTGACGAAGTTCTGTTAGCTTTATCAAAACTTGACTTGAAAACCA
GGGGCAACCCAACTTTTGTGGCAATATCTTTGATGTGCTTAGCCATACGTAGAATATGTT
CCTCAGATTCGATAACGTTTGGACCAGCCAACAAGAAGAACGGCTCAGCAGCCTTAAGCT
GGTCGTATAGTGGTGATGTTGTAGCCATTCTTTTTTCGTCAAAGCTATATAACCTCAAAA
GGTGAAACTTTAAGCTTACTCGATGATCTCGAAGTTGCAGAGGGAGTAAAGTCC

QA 4 717 4 717
DS 



CO CL605Contig2 1162 6 8 U
GGACTCGCACTCACTCTGCAACTTCGAGATCAAAAGCTAAAACCTTAAAGCTTTTTTTTG
CTTTCCCGAGAAGAATGGCGGCAACATCACCACTCTACAATCAGCTTAAGGATGCTGAAC
CATTCTTCTTGTTGGCTGGGCCTAATGTGATCGAATCCGAGGAGCATATTCTTCGAATGG
CCAAGCACATCAAACACATTGCCACAAAAGTTGGGTTGCCACTGGTTTTCAAGTCGAGTT
TTGATAAAGCTAACAGAACTTCTTCTAAGTCCCTCCGAGGTCCTGGCATGGCTGAGGGTC
TCAAGATTCTTGAGAAGGTGAAAGTAGCATATGACTTACCAATTGTAACTGATGTTCATG
AGGCGTATCAGTGTGAAGAAGTTGGCAAGGTTGCTGATATAATTCAGATACCAGCATTCT
TATGTCGCCAGACAGATCTTCTGGTTGCGGCAGCGCAAACTGGAAAAATTATCAATATTA
AGAAAGGACAGTTTTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCAGCTGAGAAGATCAGGCTGG
CTGGGAATCCGAATGTGATGGTTTGTGAAAGAGGAACCATGTTTGGATACAATGATTTGA
TAGTAGATCCACGAAACTTTGAATGGATGAGGGAAGCTAATTGTCCTGTTGTTGCTGATA
TCACCCATGCACTCCAACAACCTGCCGGCAAAAAGTTGGAAGGTGGTGGTGTTGCTAGTG
GAGGCCTTCGGGAGTTAATACCCTGCATTGCCAGAACAGCTGTAGCAGTTGGTGTCGATG
GAATTTTCATGGAGGTTCATGATGATCCTCTAAGTGCTCCAGTTGATGGTCCAACTCAAT
GGCCTTTGCGTCATCTAGAAGAACTCTTAGAGGAGCTCATCACGATTGCTAGGGTCACAA
AAGGAAAGCAGCGGTTCCAGATCGATCTCACACCTTACCGCGACTAGGATTGGTCTCCTC
CTCGGACATATGGGTCCACGGCAAATCCTGGAAAGGTTGCAACCTCTCCGTAAAGGATAC
CTATCATCTACTTTGAGCAAAGAATGTTATTTATTTTTGATTTCTCCAAACTTTGAACAT
ATATATAAGTTTTTATTCAAAATTTCCTCAATTTAAGAGTGTTCAAACATATAATAACTA
TAATGAAGTCTGTTTACATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2A660TF U 353
AF RR2H537TF U 1
AF RR2H185TF U 5
AF RR2H185JQ C 365
AF RR2A660JQ C 410
AF RR2H537JQB C 652
BS 1 60 RR2H537TF
BS 61 61 RR2H185TF
BS 62 573 RR2H537TF
BS 574 574 RR2H185TF
BS 575 611 RR2H537TF
BS 612 683 RR2H185TF
BS 684 1124 RR2H185JQ
BS 1125 1162 RR2A660JQ

RD RR2A660TF 173 0 0
GGTTCATGAGGCGTAT
CAGTGTGAAGAAGTTGGCAAGGTTGCTGATATAATTCACATACCAGCATTCTTATGTCGC
CAGACAGATCTTCTGGTTGCGGCAGCGCAAACTGGAAAAATTATCAATATTAAGAAAGGA
CAGTTTTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCAGCTG

QA 17 173 17 173
DS 

RD RR2H537TF 611 0 0
GGACTCGCACTCACTCTGCAACTTCGAGATCAAAAGCTAAAACCTTAAAGCTTTTTTTTG
TTTTCCCGAGAAGAATGGCGGCAACATCACCACTCTACAATCAGCTTAAGGATGCTGAAC
CATTCTTCTTGTTGGCTGGGCCTAATGTGATCGAATCCGAGGAGCATATTCTTCGAATGG
CCAAGCACATCAAACACATTGCCACAAAAGTTGGGTTGCCACTGGTTTTCAAGTCGAGTT
TTGATAAAGCTAACAGAACTTCTTCTAAGTCCCTCCGAGGTCCTGGCATGGCTGAGGGTC
TCAAGATTCTTGAGAAGGTGAAAGTAGCATATGACTTACCAATTGTAACTGATGTTCATG
AGGCGTATCAGTGTGAAGAAGTTGGCAAGGTTGCTGATATAATTCAGATACCAGCATTCT
TATGTCGCCAGACAGATCTTCTGGTTGCGGCAGCGCAAACTGGAAAAATTATCAATATTA
AGAAAGGACAGTTTTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCAGCTGAGAAGATCAGGCTGG
CTGGGAATCCGAATGTGATGGTTTGTGAAAGAG*AACCATGTTTGGATACAATGATTTGA
TAGTAGATCCA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2H185TF 680 0 0
GG
GCACTCACTCTGCAACTTCGAGATCAAAAGCTAAAACCTTAAAGCTTTTTTT*GCTTTCC
CGAGAAGAATGGCGGCAACATCACCACTCTACAATCAGCTTAAGGATGCTGAATCATTCT
TCTTGTTGGCTGGGCCTAATGTGATCGAATCCGAGGAGCATATTCTTCGAATGGCCAAGC
ACATCAAACACATTGCCACAAAAGTTGGGTTGCCACTGGTTTTCAAGTCGAGTTTTGATA
AAGCTAACAGAACTTCTTCTAAGTCCTTCCGAGGTCCTGGCATGGCTGAGGGTCTCAAGA
TTCTTGAGAAGGTGAAAGTAGCATATGACTTACCAATTGTAACTGATGTTCATGAGGCGT
ATCAGTGTGAAGAAGTTGGCAAGGTTGCTGATATAATTCAGATACCAGCATTCTTATGTC
GCCAGACAGATCTTCTGGTTGCGGCAGCGCAAACTGGAAAAATTATCAATATTAAGAAAG
GACAGTTTTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCAGCTGAGAAGATCAGGCTGGCTGGGA
ATCCGAATGTGATGGTTTGTGAAAGAGGAACCATGTTTGGATACAATGATTTGATAGTAG
ATCCACGAAACTTTGAATGGATGAGGGAAGCTAATTGTCCTGTTGTTGCTGATATCACCC
ATGCACTCCAACAACCT
G

QA 3 679 3 679
DS 

RD RR2H185JQ 760 0 0
GTATCAGTGTGAAGAAGTTGGCAAGGTTGCTGATATAATTCAGATACCAGCATTCTTATG
TCGCCAGACAGATCTTCTGGTTGCGGCAGCGCAAACTGGAAAAATTATCAATATTAAGAA
AGGACAGTTTTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCAGCTGAGAAGATCAGGCTGGCTGG
GAATCCGAATGTGATGGTTTGTGAAAGAGGAACCATGTTTGGATACAATGATTTGATAGT
AGATCCACGAAACTTTGAATGGATGAGGGAAGCTAATTGTCCTGTTGTTGCTGATATCAC
CCATGCACTCCAACAACCTGCCGGCAAAAAGTTGGAAGGTGGTGGTGTTGCTAGTGGAGG
CCTTCGGGAGTTAATACCCTGCATTGCCAGAACAGCTGTAGCAGTTGGTGTCGATGGAAT
TTTCATGGAGGTTCATGATGATCCTCTAAGTGCTCCAGTTGATGGTCCAACTCAATGGCC
TTTGCGTCATCTAGAAGAACTCTTAGAGGAGCTCATCACGATTGCTAGGGTCACAAAAGG
AAAGCAGCGGTTCCAGATCGATCTCACACCTTACCGCGACTAGGATTGGTCTCCTCCTCG
GACATATGGGTCCACGGCAAATCCTGGAAAGGTTGCAACCTCTCCGTAAAGGATACCTAT
CATCTACTTTGAGCAAAGAATGTTATTTATTTTTGATTTCTCCAAACTTTGAACATATAT
ATAAGTTTTTATTCAAAATTTCCTCAATTTAAGAGTGTTC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2A660JQ 753 0 0
ACCAGCATTCTTATGTCGCCAGACAGATCTTCTGGTTGCGGCAGCGCAAACTGGAAAAAT
TATCAATATTAAGAAAGGACAGTTTTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCAGCTGAGAA
GATCAGGCTGGCTGGGAATCCGAATGTGATGGTTTGTGAAAGAGGAACCATGTTTGGATA
CAATGATTTGATAGTAGATCCACGAAACTTTGAATGGATGAGGGAAGCTAATTGTCCTGT
TGTTGCTGATATAACCCATGCACTCCAACAACCTGCCGGCAAAAAGTTGGAAGGTGGTGG
TGTTGCTAGTGGAGGCCTTCGGGAGTTAATACCCTGCATTGCCAGAACAGCTGTAGCAGT
TGGTGTCGATGGAATTTTCATGGAGGTTCATGATGATCCTCTAAGTGCTCCAGTTGATGG
TCCAACTCAATGGTCTTTGCGTCATCTAGAAGAACTCTTAGAGGAGCTCATCACGATTGC
TGGGGTCACAAAGGGAAAGCAGCGGTTCCAGATCGATCTCACACCTTACCGCGACTAGGA
TTGGTCTCCTCCTCGGACATATGGGTCCGCGGCAAATCCTGGAAAGGTTGCAACCTCTCC
GTAAAGGATACCTATCATCTACTTTGAGCAAAGAATGTTATTTATTTTTGATTTCTCCAA
ACTTTGAACATATATATAAGTTTTTATTCAAAATTTCCTCAATTTAAGAGTGTTCAAACA
TATAATAACTATAATGAAGTCTGTTTACATTCG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2H537JQB 511 0 0
TTGCTGATATAACCCATGCACTCCAACAACCTGCCGGCAAAAAGTTGGAAGGTGGTGGTG
TTGGTAGTGGAGGCCTTCGGGAGTTAATACCCTGCATTGCCAGAACGGCTGTAGCAGTTG
GTGTCGATGGAATTTTCATGGAGGTTCATGATGATCCTCTAAGTGCTCCAGTTGATGGTC
CAACTCAATGGCCTTTGGGTCATCTAGAAGAACTTTTAGGGGAGCTCATCACGATTGCTA
GGGTCACAAAAGGAAAGCAGCGGTTCCAGATCGATTTCACACCTTACCGGGACTAGGATT
GGTTTCCTCCTTGGACATATGGGTCCACGGCAAATCCTGGAGAGGTTGCAACCTCTCCGT
AAAGGATACCTATCATTTACTTTGAGCAAAGAATGTTATTTATTTTTGATTTTTCCAAAC
TTTGAACATATATATAAGTTTTTATTCAAAATTTCCTCAATTTAAGAGTGTTCAAACATA
TAATAACTATAATGAAGTCTGTTTACATTCG

QA 1 511 1 511
DS 



AS 3 9

CO CL606Contig1 1110 4 4 U
GTTGTTGCAAATTTGTTCACATTTTGTTCTGACAAAACAGTAATATAATGTTACAGAATC
GCTATCCAAACAACATTAGACGCATTGGCCATTGCATATGATTTGATTATATAACTGAAT
ATAGTAAACAAGCAATGTTCATGTTCAATTGAAATGGAAAGGGTTTGAACATGCAATGAA
GCTGCATCTATGCATTGTCTTGCATGCTGTTTCAGTATTCTGTTTCCAGTAGACCATCGA
TAAGGCCGAACTCGAGCGCCTCAGAAGCGGATAAGAAACGATCTCTTTCGGTATACTGTT
GCACTGTCTCAAGAGGCTGTCCAGTGAAAGCTGCATACATCCTGTCAATTTTTTGTCGTG
CTTCAATGGCTTCGTTCACCTGTCTCCTCACATCCTCCACATGTCCTCCGCATCCAGTTT
GAGGTTGATGTATCATGACACGAGTGTTTGGCATTGCATAGCGCATCCCTTTCTCACCTC
CAGCAAGAAGAAGTGCTCCTTGACTCGCTGCTACTCCAAACGCTACTGTTCCAACTCTAG
GCTTTATCCAAGACATACAGTCATAGATTGCTAAGACGGAGTAGGTGCTGCCTCCCGGAC
AATTCAAGTATATCAAGATGTCGGATTTATCATCAATAGAAGCGAGGGTAACAAGCTGAG
ATATGACACGCTGAGCAACCTGTGCGTTGATTGGTTGTCCGATGAAGATTATGCGGTTGC
GGAATAACACAGAAGATAGGTCCAAAGGTCCTCCAGGTGTCATCACTGCTGGCATTACAG
GCGGATTTCCTTTCTTCGCCTCTATCACTCCAAATCTTGGATCAATGCTACGAGGATCCT
TGTTGCCGGAGACATTACTGGAAAGTCCAGCTTTCAATGAATCACCATAAGGACTCGGAA
GCGCAGAAACTATACCCCTTGTAAGATTTCTTTGATTGTGAGATAGATACGAAGTGGGTT
TAGCGTTTCTTGTTCGAGAAGAGAAGGTGAGACTGAGAGGAGGTGAAATTGACAAACCCG
CCATTACTACCGCCGGAGCTCTAAGCTTTCTCCTGTGTTGAAGATTATCACAAGGATAGA
TTGACAGAGAAGGACAAGACTCGAGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL37JQ U 1
AF RR2GW08JQ U 23
AF RR2AY96JQ U 1
AF RR2AL37TF C 374
BS 1 264 RR2AL37JQ
BS 265 265 RR2GW08JQ
BS 266 752 RR2AL37JQ
BS 753 1110 RR2AL37TF

RD RR2AL37JQ 752 0 0
GTTGTTGCAAATTTGTTCACATTTTGTTCTGACAAAACAGTAATATAATGTTACAGAATC
GCTATCCAAACAACATTAGACGCATTGGCCATTGCATATGATTTGATTATATAACTGAAT
ATAGTAAACAAGCAATGTTCATGTTCAATTGAAATGGAAAGGGTTTGAACATGCAATGAA
GCTGCATCTATGCATTGTCTTGCATGCTGTTTCAGTATTCTGTTTCCAGTAGACCATCGA
TAAGGCCGAACTCGAGCGCCTCAGGAGCGGATAAGAAACGATCTCTTTCGGTATACTGTT
GCACTGTCTCAAGAGGCTGTCCAGTGAAAGCTGCATACATCCTGTCAATTTTTTGTCGTG
CTTCAATGGCTTCGTTCACCTGTCTCCTCACATCCTCCACATGTCCTCCGCATCCAGTTT
GAGGTTGATGTATCATGACACGAGTGTTTGGCATTGCATAGCGCATCCCTTTCTCACCTC
CAGCAAGAAGAAGTGCTCCTTGACTCGCTGCTACTCCAAACGCTACTGTTCCAACTCTAG
GCTTTATCCAAGACATACAGTCATAGATTGCTAAGACGGAGTAGGTGCTGCCTCCCGGAC
AATTCAAGTATATCAAGATGTCGGATTTATCATCAATAGAAGCGAGGGTAACAAGCTGAG
ATATGACACGCTGAGCAACCTGTGCGTTGATTGGTTGTCCGATGAAGATTATGCGGTTGC
GGAATAACACAGAAGATAGGTCCAAAGGTCCT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2GW08JQ 721 0 0
TTTGTTCTGACAAAACAGTAATATAATGTTACAGAATCGCTATCCAAACAACATTAGACG
AATTGGCCATTGCATATGATTTGATTATATAACTGAATATAGTAAACAAGCAATGTTCAT
GTTCAATTGAAATGGAAAGGGTTTGAACATGCAATGAAGCTACATCTATGCATTGTCTTG
CATGCTGTTTCAGTATTCTGTTTCCAGTAGACCATCGATAAGGCCGAACTCGAGCGCCTC
AGAAGCGGATAAGAAACGATCTCTTTCGGTATACTGTTGCACTGTCTCAAGAGGCTGTCC
AGTGAAAGCTGCATACATCCTGTCAATTTTTTGTCGTGCTTCAATGGCTTCGTTCACCTG
TCTCCTCACATCCTCCACATGTCCTCCGCATCCAGTTTGAGGTTGATGTATCATGACACG
AGTGTTTGGCATTGCATAGCGCATCCCTTTCTCACCTCCAGCAAGAAGAAGTGCTCCTTG
ACTCGCTGCTACTCCAAACGCTACTGTTCCAACTCTAGGC******CAAGACATACAGTC
ATAGATTGCTAAGACGGAGTAGGTGCTGCCTCCCGGACAATTCAAGTATATCAAGATGTC
GGATTTATCATCAATAGAAGCGAGGGTAACAAGCTGAGATATGACACGCTGAGCAACCTG
TGCGTTGATTGGTTGTCCGATGAAGATTATGCGGTTGCGGAATAACACAGAAGATAGGTC
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2AY96JQ 741 0 0
GTTGTT
GCAAATTTGTTCACATTTTGTTCTGACAAAACAGTAATATAATGTTACAGAATCGCTATC
CAAACAACATTAGACGCATTGGCCATTGCATATGATTTGATTATATAACTGAATATAGTA
AACAAGCAATGTTCATGTTCAATTGAAATGGAAAGGGTTTGAACATGCAATGAAGCTGCA
TCTATGCATTGTCTTGCATGCTGTTTCAGTATTCTGTTTCCAGCAGACCATCGATAAGGC
CGAACTCGAGCGCCTCAGAAGCGGATAAGAAACGATCTCTTTCGGTATACTGTTGCACTG
TCTCAAGAGGCTGTCCAGTGAAAGCTGCATACATCCTGTCAATTTTTTGTCGTGCTTCAA
TGGCTTCGTTCACCTGTCTCCTCACATCCTCCACATGTCCTCCGCATCCAGTTTGAGGTT
GATGTATCATGACACGAGTGTTCGGCATTGCATAGCGCATCCCTTTCTCACCTCCAGCAA
GAAGAAGTGCTCCTTGACTCGCTGCTACTCCAAACGCTACTGTTCCAACTCTAGGCTTTA
TCCAAGACATACAGTCATAGATTGCTAAGACGGAGTAGGTGCTGCCTCCCGGACAATTCA
AGTATATCAAGATGTCGGATTTATCATCAATAGAAGCGAGGGTAACAAGCTGAGATATGA
CACGCTGAGCAACCTGTGCGTTGATTGGTTGTCCGATGAAGATTATGCGGTTGCGGAATA
ACACAGAAGATAGGT

QA 7 741 7 741
DS 

RD RR2AL37TF 737 0 0
GTTCACCTGTCTCCTCACATCCTCCACATGTCCTCCGCATCCAGTTTGAGGTTGATGTAT
CATGACACGAGTGTTTGGCATTGCATAGCGCATCCCTTTCTCACCTCCAGCAAGAAGAAG
TGCTCCTTGACTCGCTGCTACTCCAAACGCTACTGTTCCAACTCTAGGCTTTATCCAAGA
CATACAGTCATAGATTGCTAAGACGGAGTAGGTGCTGCCTCCCGGACAATTCAAGTATAT
CAAGATGTCGGATTTATCATCAATAGAAGCGAGGGTAACAAGCTGAGATATGACACGCTG
AGCAACCTGTGCGTTGATTGGTTGTCCGATGAAGATTATGCGGTTGCGGAATAACACAGA
AGATAGGTCCAAAGGTCCTCCAGGTGTCATCACTGCTGGCATTACAGGCGGATTTCCTTT
CTTCGCCTCTATCACTCCAAATCTTGGATCAATGCTACGAGGATCCTTGTTGCCGGAGAC
ATTACTGGAAAGTCCAGCTTTCAATGAATCACCATAAGGACTCGGAAGCGCAGAAACTAT
ACCCCTTGTAAGATTTCTTTGATTGTGAGATAGATACGAAGTGGGTTTAGCGTTTCTTGT
TCGAGAAGAGAAGGTGAGACTGAGAGGAGGTGAAATTGACAAACCCGCCATTACTACCGC
CGGAGCTCTAAGCTTTCTCCTGTGTTGAAGATTATCACAAGGATAGATTGACAGAGAAGG
ACAAGACTCGAGGTTCC

QA 1 737 1 737
DS 



CO CL606Contig2 1080 3 9 U
GCAAATTTGTTCACATTTTGTTCTGACAAAAACAGTAATAATGTTAAAAAGAATTGCTAT
CCAAACAACATAGACGCATTGGCCATTGCATTTGCATATGATTTGATTACATAACTGAAT
ATAGTAAACAAGTAATGTTCATATTCAAATGAAAATGGAAAGGGTTTGAACATGCAATGA
AGCTGCATCTATGCATTGTCTTGCACGTTGCCTCAGTATTCTGTTTCCAGTAAACCATAA
ATAAGGCCGAACTCAAGCGCCTCAAAAGCGGATAAAAAACGATCTCTTTCGGTATACTGT
TGCACTGTCTCAAGAGGCTGTCCAGTGAAAGCTGCATACATCCTGTCAATTTTTTGTCGT
GCTTCAATGGCTTCGTTCACCTGTCTCCTCACATCCTCCACATGTCCTCCGCATCCAGTT
TGAGGTTGATGTATCATGACACGAGTGTTTGGCATTGCATAGCGCATTCCTTTCTCACCT
CCAGCGAGAAGAAGTGCTCCTTGACTCGCTGCTACTCCAAACGCTACTGTTCCTACTTTA
GGCTTTATCCAAGACATACAGTCATAGATTGCTAACACGGAGTAGGTGCTGCCTCCCGGA
CAATTCAAGTATATCAAGATATCGGATTTATCATCAATCGAAGCGAGGGTAACAAGCTGA
GATATGACACGCTGAGCAACCTGTGCGTTGATTGGTTGTCCGATGAAGATTATGCGGTTG
CGGAATAACACGGAAGAAAGGTCTAAAGGTCCTCCCGGGGTCATCACTGCTGGCATTACA
GGCGGGTTTCCTTTCTTCGCCTCTATCACTCCGAATCTTGGATCAATGGTACGAGGATCC
TTGTTGTTGTTAATCTTTATTGGGGATCCAGCGACATTACTGGAAAGTCCAGCTTTCAAT
GAATCGCCATAAGGACTCGGAAGAGCAGAAACTATACCCCTTGTAAGATTTCTTTGATTG
TGAGATAGATACGAAGTGGGTTTAGCGTTTCTTGTTCGAGAAGAGAAGGTGAGACTAAGA
GGAGGTGAAATTGCCAATCCCGCCATTACTACCGCCGGAGCTCTAAGCTTTTCTCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX71JQ U 1
AF RR2CI09JQ U 56
AF RR2EX71TF C 373
BS 1 264 RR2EX71JQ
BS 265 265 RR2CI09JQ
BS 266 275 RR2EX71JQ
BS 276 276 RR2CI09JQ
BS 277 321 RR2EX71JQ
BS 322 323 RR2CI09JQ
BS 324 638 RR2EX71JQ
BS 639 822 RR2CI09JQ
BS 823 1080 RR2EX71TF

RD RR2EX71JQ 638 0 0
GCAAATTTGTTCACATTTTGTTCTGACAAAAACAGTAATAATGTTAAAAAGAATTGCTAT
CCAAACAACATAGACGCATTGGCCATTGCATTTGCATATGATTTGATTACATAACTGAAT
ATAGTAAACAAGTAATGTTCATATTCAAATGAAAATGGAAAGGGTTTGAACATGCAATGA
AGCTGCATCTATGCATTGTCTTGCACGTTGCCTCAGTATTCTGTTTCCAGTAAACCATAA
ATAAGGCCGAACTCAAGCGCCTCAGAAGCGGATAAGAAACGATCTCTTTCGGTATACTGT
TGCACTGTCTCAAGAGGCTGT**AGTGAAAGCTGCATACATCCTGTCAATTTTTTGTCGT
GCTTCAATGGCTTCGTTCACCTGTCTCCTCACATCCTCCACATGTCCTCCGCATCCAGTT
TGAGGTTGATGTATCATGACACGAGTGTTTGGCATTGCATAGCGCATTCCTTTCTCACCT
CCAGCGAGAAGAAGTGCTCCTTGACTCGCTGCTACTCCAAACGCTACTGTTCCTACTTTA
GGCTTTATCCAAGACATACAGTCATAGATTGCTAACACGGAGTAGGTGCTGCCTCCCGGA
CAATTCAAGTATATCAAGATATCGGATTTATCATCAAT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2CI09JQ 767 0 0
GCTATCCAAACAACATAGACGCATTGGCCATTGCATTTGCATATGATTTGATTACATAAC
TGAATATAGTAAACAAGTAATGTTCATATTCAAATGAAAATGGAAAGGGTTTGAACATGC
AATGAAGCTGCATCTATGCATTGTCTTGCACGTTGCTTCAGTATTCTGTTTCCAGTAAAC
CATCAATAAGGCCGAACTCAAGCGCCTCAAAAGCGGATAAAAAACGATCTCTTTCGGTAT
ACTGTTGCACTGTCTCAAGAGGCTGTCCAGTGAAAGCTGCATACATCCTGTCAATTTTTT
GTCGTGCTTCAATGGCTTCGTTCACCTGTCTCCTCACATCCTCCACATGTCCTCCGCATC
CAGTTTGAGGTTGATGTATCATGACACGAGTGTTTGGCATTGCATAGCGCATTCCTTTCT
CACCTCCAGCGAGAAGAAGTGCTCCTTGACTCGCTGCTACTCCAAACGCTACTGTTCCTA
CTTTAGGCTTTATCCAAGACATACAGTCATAGATTGCTAACACGGAGTAGGTGCTGCCTC
CCGGACAATTCAAGTATATCAAGATGTCGGATTTATCATCAATCGAAGCGAGGGTAACAA
GCTGAGATATGACACGCTGAGCAACCTGTGCGTTGATTGGTTGTCCGATGAAGATTATGC
GGTTGCGGAATAACACGGAAGAAAGGTCTAAAGGTCCTCCCGGGGTCATCACTGCTGGCA
TTACAGGCGGGTTTCCTTTCTTCGCCTCTATCACTCCGAATCTTGGA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2EX71TF 708 0 0
TCGTTCACCTGTCTCCTCACATCCTCCACATGTCCTCCGCATCCAGTTTGAGGTTGATGT
ATCATGACACGAGTGTTTGGCATTGCATAGCGCATTCCTTTCTCACCTCCAGCGAGAAGA
AGTGCTCCTTGACTCGCTGCTACTCCAAACGCTACTGTTCCTACTTTAGGCTTTATCCAA
GACATACAGTCATAGATTGCTAACACGGAGTAGGTGCTGCCTCCCGGACAATTCAAGTAT
ATCAAGATATCGGATTTATCATCAATCGAAGCGAGGGTAACAAGCTGAGATATGACACGC
TGAGCAACCTGTGCGTTGATTGGTTGTCCGATGAAGATTATGCGGTTGCGGAATAACACG
GAAGAAAGGTCTAAAGGTCCTCCCGGGGTCATCACTGCTGGCATTACAGGCGGGTTTCCT
TTCTTCGCCTCTATCACTCCGAATCTTGGATCAATGGTACGAGGATCCTTGTTGTTGTTA
ATCTTTATTGGGGATCCAGCGACATTACTGGAAAGTCCAGCTTTCAATGAATCGCCATAA
GGACTCGGAAGAGCAGAAACTATACCCCTTGTAAGATTTCTTTGATTGTGAGATAGATAC
GAAGTGGGTTTAGCGTTTCTTGTTCGAGAAGAGAAGGTGAGACTAAGAGGAGGTGAAATT
GCCAATCCCGCCATTACTACCGCCGGAGCTCTAAGCTTTTCTCTGTCC

QA 1 708 1 708
DS 



CO CL606Contig3 695 2 1 U
CGGGGGAAAACATTAACCTCGAGTCTTGTCCTTCTCTGTCAATCTATCCTTGCGATAATC
TTCAACACAGGAGAAAGCTTAGAGCTCCGGCGGTAGTAATGGCGGGTTTGTCAATTTCAC
CTCCTCTCAGTCTCACCTTCTCTTCTCGAACAAGAAACGCTAAACCCACTTCGTATCTAT
CTCACAATCAAAGAAATCTTACAAGGGGTATAGTTTCTGCGCTTCCGAGTCCTTATGGCG
ATTCATTGAAAGCTGGACTTTCCAGTAATGTCTCCGGCAACAAGGATCCTCGTAGCATTG
ATCCAAGATTTGGAGTGATAGAGGCGAAGAAAGGAAATCCGCCTGTAATGCCAGCAGTGA
TGACACCTGGAGGACCTTTGGACCTATCTTCTGTGTTATTCCGCAACCGCATAATCTTCA
TCGGACAACCAATCAACGCACAGGTTGCTCAGCGTGTCATATCTCAGCTTGTTACCCTCG
CTTCTATTGATGATAAATCCGACATCTTGATATACTTGAATTGTCCGGGAGGCAGCACCT
ACTCCGTCTTAGCAATCTATGACTGTATGTCTTGGCCTAGAGTTGGAACAGTAGCGTTTG
GAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGCACTTCTTCTTGCTGGAGGTGAGAAAAGGATGCGCTATG
CAATGCCAAACACTCGTGTCATGATACATCAACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY96TFB U 6
AF RR2GW08TF U 1
BS 1 695 RR2GW08TF

RD RR2AY96TFB 275 0 0
GGAAACATT
AACCTCGAGTCTTGTCCTTCTCTGTCAATCTATCCTTGCGATAATCTTCAACACAGGAGA
AAGCTTAGAGCTCCGGCGGTAGTAATGGCGGGTTTGTCAATTTCACCTCCTCTCAGTCTC
ACCTTCTCTTCTCGAACAAGAAACGCTAAACCCACTTCGTATCTATCTCACAATCAAAGA
AATCTTACAAGGGGTATAGTTTCTGCGCTTCCGAGTCCTTATGGCGATTCATTGAAAGCT
GGACTTTCCAGTAATGTCT
GCGGCAA

QA 10 268 10 268
DS 

RD RR2GW08TF 695 0 0
CGGGGGAAAACATTAACCTCGAGTCTTGTCCTTCTCTGTCAATCTATCCTTGCGATAATC
TTCAACACAGGAGAAAGCTTAGAGCTCCGGCGGTAGTAATGGCGGGTTTGTCAATTTCAC
CTCCTCTCAGTCTCACCTTCTCTTCTCGAACAAGAAACGCTAAACCCACTTCGTATCTAT
CTCACAATCAAAGAAATCTTACAAGGGGTATAGTTTCTGCGCTTCCGAGTCCTTATGGCG
ATTCATTGAAAGCTGGACTTTCCAGTAATGTCTCCGGCAACAAGGATCCTCGTAGCATTG
ATCCAAGATTTGGAGTGATAGAGGCGAAGAAAGGAAATCCGCCTGTAATGCCAGCAGTGA
TGACACCTGGAGGACCTTTGGACCTATCTTCTGTGTTATTCCGCAACCGCATAATCTTCA
TCGGACAACCAATCAACGCACAGGTTGCTCAGCGTGTCATATCTCAGCTTGTTACCCTCG
CTTCTATTGATGATAAATCCGACATCTTGATATACTTGAATTGTCCGGGAGGCAGCACCT
ACTCCGTCTTAGCAATCTATGACTGTATGTCTTGGCCTAGAGTTGGAACAGTAGCGTTTG
GAGTAGCAGCGAGTCAAGGAGCACTTCTTCTTGCTGGAGGTGAGAAAAGGATGCGCTATG
CAATGCCAAACACTCGTGTCATGATACATCAACCT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 2 9

CO CL607Contig1 748 4 9 U
GGACATTCTCTCTGACTCTATAAAGAAAAAGCTAAGTAGGAGAGGAGCGAGGATCTCATT
CGTTTTTTTATCTCTTTTGCACCGCATCATCGTCTTCTCGCTTTCTGATCGCTTCTTTTT
CTCGGTTGAGCCATGGCTTCCAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGAT
CCTCCTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGACAAGCAACT
ATCATGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCTGGAGGAGTCTTTTTGGTTTCCATTCACGTT
CCTCCCGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTTAAGACAAGGGTGTACCACCCA
AACATCAACAGCAATGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCT
CTCACCATATCCAAGGTTTTGCTGTCGATTTGCTCGTTGTTGACTGACCCGAACCCAGAC
GATCCTCTTGTGCCAGAGATTGCTCATATGTACAAGACGGATAAATCCAAGTACGAGTCA
ACCGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCTATGGGATGATAAGAAGAGACTCGAGTGGTC
GAGAGAAGCCAAAGTGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTTAAAACTTTTAAGAAGA
AATGCATGTGTTGGGGTTTGGAAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGCAACTTATA
TGCTCTGCTTAAGCATTATTGTTATCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI70TF U 1
AF RR2CZ75TF U 63
AF RR2G229TF U 63
AF RR2CZ75JQ C 116
BS 1 110 RR2CI70TF
BS 111 111 RR2CZ75TF
BS 112 138 RR2CI70TF
BS 139 341 RR2CZ75TF
BS 342 342 RR2G229TF
BS 343 526 RR2CZ75TF
BS 527 527 RR2G229TF
BS 528 724 RR2CZ75TF
BS 725 748 RR2G229TF

RD RR2CI70TF 138 0 0
GGACATTCTCTCTGACTCTATAAAGAAAAAGCTAAGTAGGAGAGGAGCGAGGATCTCATT
CGTTTTTTTATCTCTTTTGCACCGCATCATCGTCTTCTCGCTTTCTGATCTCTTCTTTTT
CTCGGTTGAGCCATGGCT

QA 1 138 1 138
DS 

RD RR2CZ75TF 662 0 0
TTTTTTTATCTCTTTTGCACTGCATCATCGTCTTCTCGCTTTCTGATCGCTTCTTTTTCT
CGGTTGAGCCATGGCTTCCAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCC
TCCTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGACAAGCAACTAT
CATGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCTGGAGGAGTCTTTTTGGTTTCCATTCACGTTCC
TCCCGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTTAAAACAAGGGTGTACCACCCAAA
CATCAACAGCAATGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCT
CACCATATCCAAGGTTTTGCTGTCGATTTGCTCGTTGTTGACTGACCCGAACCCAGACGA
TCCTCTTGTGCCAGAGATTGCTCATATGTACAAGACGGATAAATTCAAGTACGAGTCAAC
CGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCTATGGGATGATAAGAAGAGACTCGAGTGGTCGA
GAGAAGCCAAAGTGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTTAAAACTTTTAAGAAGAAA
TGCATGTGTTGGGGTTTGGAAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGCAACTTATATG
CT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2G229TF 686 0 0
TTTTTTTATCTCTTTTGCACCGCATCATCGTCTTCTCGCTTTCTGATCGCTTCTTTT*CT
CGGTTGAGCCATGGCTTCCAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCC
TCCTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTAT
CATGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCTGGAGGAGTCTTTTTGGTTTCCATTCACTTTCC
TCCCGATTATCCCTTCAAGCCACCAA**GTGTCTTTTAAGACAAGGGTGTACCACCCAAA
CATCAACAGCAATGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCT
CACCATATCCAAGGTTTTGCTGTCGATTTGCTCGTTGTTGACTGACCCGAACCCAGACGA
TCCTCTTGTGGCGGAGATTGCTCATATGTACAAGACGGATAAATCCAAGTACGAGTCAAC
CACACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCTATGGGATGATAAGAAGAGACTCGAGTGATCGA
GAGAAGCCAAAGTGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTTAAAACTTTTAAGAAGAAA
TGCATGTGTTGGGGTTTGGAAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGCAACTTATATG
CTCTGCTTAAGCATTATTGTTATCCA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2CZ75JQ 631 0 0
T
TTTTCTCGGTTGAGCCATGGCTTCCAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAA
GGATCCTCCTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGACAAGC
AACTATCATGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCTGGAGGAGTCTTTTTGGTTTCCATTCA
CGTTCCTCCCGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTTAAGACAAGGGTGTACCA
CCCAAACATCAACAGCAATGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCC
TGCTCTCACCATATCCAAGGTTTTGCTGTCGATTTGCTCGTTGTTGACTGACCCGAACCC
AGACGATCCTCTTGTGCCAGAGATTGCTCATATGTACAAGACGGATAAATCCAAGTACGA
GTCAACCGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCTATGGGATGATAAGAAGAGACTCGAGT
GGTCGAGAGAAGCCAAAGTGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTTAAAACTTTTAAG
AAGAAATGCATGTGTTGGGGTTTGGAAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGCAACT
TATATGCTCTGCTTAAGCATTA
TTGTTATC

QA 2 623 2 623
DS 



CO CL607Contig2 713 5 6 U
GGGAAGTAGGAGAGGAGCGAGGATCTCATTCGTTTTCTCTCTTTTGCACCGCATCGTCTT
CTCGCTTTCTGATCGCTTCTTTTCTCGGTTGAGCAATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAG
AGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCTCCTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGG
ACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCATGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCCGGAGGAG
TCTTTTTGGTTTCCATTCACTTCCCTCCCGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTT
TTAAGACAAGGGTTTACCACCCAAACATCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTTGATATCC
TGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTCACCATATCCAAGGTTTTGCTGTCGATTTGCTCGT
TGTTGACTGACCCGAACCCAGACGATCCTCTTGTGCCGGAGATTGCTCATATGTACAAGA
CGGATAAATCCAAGTACGAGTCAACCGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGAT
GATGATAAGAAGAGACTCGAGTGGTCGAGAGAAGCCAAAGGGTTAATGTTATTCTGCATC
CAAATATTTAAAAACTTTTAAGAAATGCATGTGCTGGATTTGGTAAACGCTACTTTATGT
GATCATAATCGAGCAACTTAGATGCTCTGCTTAAGCATTACTCTCTCCGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H367TF U 1
AF RR2DX73JQ C 21
AF RR2DX73TF U 21
AF RR2A347JQ C 26
AF RR2A347TF U 26
BS 1 496 RR2H367TF
BS 497 497 RR2DX73TF
BS 498 576 RR2H367TF
BS 577 697 RR2DX73TF
BS 698 700 RR2A347TF
BS 701 713 RR2A347JQ

RD RR2H367TF 576 0 0
GGGAAGTAGGAGAGGAGCGAGGATCTCATTCGTTTTCTCTCTTTTGCACCGCATCGTCTT
CTCGCTTTCTGATCGCTTCTTTTCTCGGTTGAGCAATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAG
AGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCTCCTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGG
ACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCATGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCCGGAGGAG
TCTTTTTGGTTTCCATTCACTTCCCTCCCGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTT
TTAAGACAAGGGTTTACCACCCAAACATCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTTGATATCC
TGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTCACCATATCCAAGGTTTTGCTGTCGATTTGCTCGT
TGTTGACTGACCCGAACCCAGACGATCCTCTTGTGCCGGAGATTGCTCATATGTACAAGA
CGGATAAATCCAAGTATGAGTCAACCGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGAT
GATGATAAGAAGAGACTCGAGTGGTCGAGAGAAGCC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2DX73JQ 676 0 0
GGATCTC
ATTCGTTTTCTCTCTTTTGCACCGCATCGTCTTCTCGCTTTCTGATCGCTTCTTTTCTCG
GTTGAGCAATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCTC
CTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCA
TGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGGTTTCCATTCACTTCCCTC
CCGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTTAAGACAAGGGTTTACCACCCAAACA
TCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTCA
CCATATCCAAGGTTTTGCTGTCGATTTGCTCGTTGTTGACTGACCCGAACCCAGACGATC
CTCTTGTGCCGGAGATTGCTCATATGTACAAGACGGATAAATCCAAGTACGAGTCAACCG
CACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGATGATGATAAGAAGAGACTCGAGTGGTCG
AGAGAAGCCAAAGGGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTAAAAACTTTTAAGAAATG
CATGTGCTGGATTTGGTAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGCAACTTAGATGCTC
TGCTTAAGC

QA 8 676 8 676
DS 

RD RR2DX73TF 685 0 0
GGATCTC
ATTCGTTTTCTCTCTTTTGCACCGCATCGTCTTCTCGCTTTCTGATCGCTTCTTTTCTCG
GTTGAGCAATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCTC
CTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCA
TGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGGTTTCCATTCACTTCCCTC
CCGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTTAAGACAAGGGTTTACCACCCAAACA
TCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTCA
CCATATCCAAGGTTTTGCTGTCGATTTGCTCGTTGTTGACTGACCCGAACCCAGACGATC
CTCTTGTGCCGGAGATTGCTCATATGTACAAGACGGATAAATCCAAGTACGAGTCAACCG
CACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGATGATGATAAGAAGAGACTCGAGTGGTCG
AGAGAAGCCAAAGGGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTAAAAACTTTTAAGAAATG
CATGTGCTGGATTTGGTAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGCAACTTAGATGCTC
TGCTTAAGCA
AAAAAAAA

QA 8 677 8 677
DS 

RD RR2A347JQ 688 0 0
GG
ATTCGTTTTCTCTCTTTTGCACCGCATCGTCTTCTCGCTTTCTGATCGCTTCTTTTCTCG
GTTGAGCAATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCTC
CTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCA
TGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCCGGAG***TCTTTTTGGTTTCCATTCACTTCCCTC
CCGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTTAAGACAAGGGTTTACCACCCAAACA
TCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTCA
CCATATCCAAGGTTTTGCTGTCGATTTGCTCGTTGTTGACTGACCCGAACCCAGACGATC
CTCTTGTGCCGGAGATTGCTCATATGTACAAGACGGATAAATCCAAGTACGAGTCGACCG
CACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGATGATGATAAGAAGAGACTCGAGTGGTCG
AGAGAAGCCAAAGGGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTAAAAACTTTTAAGAAATG
CATGTGCTGGATTTGGTAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGCAACTTAGATGCTC
TGCTTAAGCATTACTCTCTCCGTTTC

QA 3 688 3 688
DS 

RD RR2A347TF 688 0 0
GG
ATTCGTTTTCTCTCTTTTGCACCGCATCGTCTTCTCGCTTTCTGATCGCTTCTTTTCTCG
GTTGAGCAATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCTC
CTTCTAACTGCAGCGCAGGACCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCA
TGGGACCTCCTGACAGTCCCTATGCCGGAG***TCTTTTTGGTTTCCATTCACTTCCCTC
CCGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTGTCTTTTAAGACAAGGGTTTACCACCCAAACA
TCAACAGCAATGGAAGTATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTCA
CCATATCCAAGGTTTTGCTGTCGATTTGCTCGTTGTTGACTGACCCGAACCCAGACGATC
CTCTTGTGCCGGAGATTGCTCATATGTACAAGACGGATAAATCCAAGTACGAGTCGACCG
CACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGATGATGATAAGAAGAGACTCGAGTGGTCG
AGAGAAGCCAAAGGGTTAATGTTATTCTGCATCCAAATATTTAAAAACTTTTAAGAAATG
CATGTGCTGGATTTGGTAAACGCTACTTTATGTGATCATAATCGAGCAACTTAGATGCTC
TGCTTAAGCATTA
CTCTCTCCGTTTC

QA 3 675 3 675
DS 



AS 2 10

CO CL608Contig1 1519 7 17 U
AGCAATGGCGAAACTAATCCTTAGCCTCCTCTCGTTGATTCTTATCGGTCTCATCGCGAT
CGCTTCCGCCGCAGTTATCTTCGAGGAGCGCTTTGATGATGGATGGGAGAGCCGGTGGGT
TAAATCTGAGTGGAAGAAAGATGACAAGTCTGCTGGGGAGTGGAGCCACACTGCAGGAAA
TTGGTCTGGTGATGCTAACGATAAAGGTATCCAGACCAGTGAAGACTACAGATTCTACGC
CATTTCAGCTGAGTTCCCTGAATTTAGCAACAAGGACAAAACCTTAGTCTTCCAATTCTC
GGTCAAGCACGAGCAGAAGCTTGACTGTGGTGGTGGTTACATGAAGCTGCTCAGTGGTGA
TGTTGACCAAAAGAAATTTGGTGGTGACACCCCATACAGCATTATGTTTGGTCCCGATAT
CTGTGGCTACAGCACGAAGAAAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGACGCCAACCACCT
GATCAAGAAGGATGTTCCATGTGAAACTGACCAGCTCACCCACGTGTACACATTCATCCT
CCGCCCAGATGCTACTTACAGTATTCTCATTGACAATGTTGAGAAGCAAACCGGTAGCCT
GTACTCTGACTGGGATCTTCTCCCACCCAAGAAGATCAAGGACCCCAACGCCAAGAAGCC
TGAGGACTGGGACGAGCAAGAGTACATTCCCGACCCTGAAGACAAGAAACCTGACGGATA
CGATGATATCCCAAAGGAGATCCCAGATACTGATGCAACGAAGCCTGAGGACTGGGATGA
GGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCTCCTACCATTCCCAACCCTGAGTACATGGGCGAATG
GAAGCCCAAGCAAATCAAGAACCCCAACTACAAGGGCAAGTGGGAAGCTCCATTGATTGA
CAACCCTGACTTCAAGGATGACGCAGAGCTCTATGTCTTCCCCAAGCTGAAGTATGTTGG
AATCGAATTGTGGCAGGTGAAATCAGGATCATTGTTCGACAATGTCTTGATTTGCGATGA
CCCAGACTACGCCAAGAAGTTGGCAGATGAAACATGGGGAAAGCTCAAGGATGCGGAGAA
AGCAGCTTTCGATGAGATTGAGAAGAAGAAAGAGGAAGAGGAATCCAAGGACGCTCCAGC
AGAAACTGATGCTGAAGATGAAGCAGAGGAAGATGAAGGAGATGAATCAGATACCGAATC
AAAGACCGAGGCCAAATCCGAAGCTAGCGAGGAAACCTCAGAGGAGAAAGACGCCACCGC
TCATGATGAGCTGTAAGGGAAAGAACGTTGAAGAATGAAGACCAAAAGTTTTCGAGCCTC
TTTTATTTTTGTTTTGATCCTTTCTTTTGAAGTACTCTAGCAATCTAGCTTGTCGGAGGG
TAGAACAAGTTTTAGCAGTTTAAAAAGTGGGGCAAATGTGTGGGGCGAGTAGCGGTACAC
AATGATGTGATGATCAAGATGCTCTTTTTGTACTGAAAACCATAAGAT*GATATTTTGCA
CTTACATCTCTTCTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS33TF U 1
AF RR2EV85TF U 207
AF RR2DK74TF U 310
AF RR2AS33JQ C 692
AF RR2EV85JQ C 792
AF RR2DK74JQ C 843
AF RR2AA13TF U 1027
BS 1 336 RR2AS33TF
BS 337 337 RR2EV85TF
BS 338 498 RR2AS33TF
BS 499 499 RR2EV85TF
BS 500 507 RR2AS33TF
BS 508 508 RR2EV85TF
BS 509 532 RR2AS33TF
BS 533 533 RR2EV85TF
BS 534 587 RR2AS33TF
BS 588 859 RR2EV85TF
BS 860 860 RR2DK74TF
BS 861 953 RR2EV85TF
BS 954 976 RR2DK74TF
BS 977 1027 RR2AS33JQ
BS 1028 1502 RR2AA13TF
BS 1503 1503 RR2AS33JQ
BS 1504 1519 RR2EV85JQ

RD RR2AS33TF 587 0 0
AGCAATGGCGAAACTAATCCTTAGCCTCCTCTCGTTGATTCTTATCGGTCTCATCGCGAT
CGCTTCCGCCGCAGTTATCTTCGAGGAGCGCTTTGATGATGGATGGGAGAGCCGGTGGGT
TAAATCTGAGTGGAAGAAAGATGACAAGTCTGCTGGGGAGTGGAGCCACACTGCAGGAAA
TTGGTCTGGTGATGCTAACGATAAAGGTATCCAGACCAGTGAAGACTACAGATTCTACGC
CATTTCAGCTGAGTTCCCTGAATTTAGCAACAAGGACAAAACCTTAGTCTTCCAATTCTC
GGTCAAGCACGAGCAGAAGCTTGACTGTGGTGGTGGCTACATGAAGCTGCTCAGTGGTGA
TGTTGACCAAAAGAAATTTGGTGGTGACACCCCATACAGCATTATGTTTGGTCCCGATAT
CTGTGGCTACAGCACGAAGAAAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGACGCCAACCACCT
GATCAAGAAGGATGTTCCGTGTGAAACCGACCAGCTCACCCACGTGTACACAGTCATCCT
CCGCCCAGATGCTACTTACAGTATTCTCATTGACAATGTTGAGAAGC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2EV85TF 747 0 0
GTATCCAGACCAGTGAGGACTATAGATTCTACGCCATTTCAGCTGAGTTCCCTGAATTTA
GCAACAAGGACAAAACCTTAGTCTTTCAGTTCTCGGTCAAGTACGAGCAGAAGCTTGACT
GTGGTGGTGGTTACATGAAGCTGCTCAGTGGTGATGTTGACCAAAAGAAATTTGGTGGTG
ACACCCCATACAGCATTATGTTTGGTCCCGATATCTGCGGCTACAGCACGAAGAAAGTGC
ATGCTATCCTTACCTACAATGACGCCAACCACCTGATCAAGAAGGATGTTCCATGTGAAA
CTGACCAGCTCACCCACGTGTACACATTCATCCTCCGCCCAGATGCTACTTACAGTATTC
TCATTGACAATGTTGAGAAGCAAACCGGTAGCCTGTACTCTGACTGGGATCTTCTCCCAC
CCAAGAAGATCAAGGACCCCAACGCCAAGAAGCCTGAGGACTGGGACGAGCAAGAGTACA
TTCCCGACCCTGAAGACAAGAAACCTGACGGATACGATGATATCCCAAAGGAGATCCCAG
ATACTGATGCAACGAAGCCTGAGGACTGGGATGAGGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCTC
CTACCATTCCCAACCCTGAGTACATGGGCGAATGGAAGCCCAAGCAAATCAAGGACCCCA
ACTACAAGGGCAAGTGGGAAGCTCCATTGATTGACAACCCTGACTTCAAGGATGACGCAG
AGCTCTATGTCTTCCCCAAGCTGAAGT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2DK74TF 672 0 0
G
GAGCAGAAGCTTGACTGTGGTGGTGGTTACATGAAGCTGCTCAGTGGTGATGTTGACCAA
AAGAAATTTGGTGGTGACACCCCATACAGCATTATGTTTGGTCCCGATATCTGTGGCTAC
AGCACGAAGAAAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGACGCCAACCACCTGATCAAGAAG
GATGTTCCATGTGAAACTGACCAGCTCACCCACGTGTACACATTCATCCTCCGCCCAGAT
GCTACTTACAGTATTCTCATTGACAATGTTGAGAAGCAAACCGGTAGCCTGTACTCTGAC
TGGGATCTTCTCCCACCCAAGAAGATCAAGGACCCCAACGCCAAGAAGCCTGAGGACTGG
GACGAGCAAGAGTACATTCCCGACCCTGAAGACAAGAAACCTGACGGATACGATGATATC
CCAAAGGAGATCCCAGATACTGATGCAACGAAGCCTGAGGACTGGGATGAGGAAGATGAT
GGTGAGTGGACTGCTCCTACCATTCCCAACCCTGAGTACATGGGCGAATGGAAGCCCAAG
CAAATCAAGAACCCCAACTACAAGGGCAAGTGGGAAGCTCCATTGATTGACAACCCTGAC
TTCAAG*ATGACGCAGAGCTCTATGTCTTCCCCAAGCTGAAGTATGTTGGAATCGAATTG
TGGCAG
TGAAA

QA 2 667 2 667
DS 

RD RR2AS33JQ 812 0 0
GACCCTGAAGACAAGAAACCTGACGGATACGATGATATCCCAAAGGAGATCCCAGGTACC
GATGCAACGAAGCCTGAGGACTGGGATGAGGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCTCCTACC
ATTCCCAACCCTGAGTACATGGGTGAATGGAAGCCCAAGCAAATTAAGAACCCCAACTAC
AAGGGCAAATGGGAAGCTCCACTGATTGACAACCCTGACTTCAAGGATGACGCAGAGCTC
TATGTCTTCCCCAAGCTGAAGTATGTTGGAATCGAATTGTGGCAGGTGAAATCAGGATCA
TTGTTCGACAATGTCTTGATTTGCGATGACCCAGACTACGCCAAGAAGTTGGCAGATGAA
ACATGGGGAAAGCTCAAGGATGCGGAGAAAGCAGCTTTCGATGAGATTGAGAAGAAGAAA
GAGGAAGAGGAATCCAAGGACGCTCCAGCAGAAACTGATGCTGAAGATGAAGCAGAGGAA
GATGAAGGAGATGAATCAGATACTGAATCAAAAACCGAGGCCAAATCCGAAGCTAGCGAG
GAAACCTCAGAGGAGAAAGACGCCACCGCTCATGATGAGCTGTAAGGGAAAGAACGTTGA
AGAATGAAGACCAAAAGTTTTCGAGCCTCTTTTATTTTTGTTTTGATCCTTTCTTTTGAA
GTACTCTAGCAATCTAGCTTGTCGGAGGGTAGAACAAGTTTTAGCAGTTTAAAAAGTGGG
GCAAATGTGTGGGGCGAGTAGCGGTACACAATGATGTGATGATCAAGATGCTCTTTTTGT
ACTGAAAACCATAAGATTGACATTTTGCACTT

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR2EV85JQ 728 0 0
GTGAGTGGACTGCTCCTACCATTCCCAACCCTGAGTACATGGGCGAATGGAAGCCCAAGC
AAATCAAGGACCCCAACTACAAGGGCAAGTGGGAAGCTCCATTGATTGACAACCCTGACT
TCAAGGATGACGCAGAGCTCTATGTCTTCCCCAAGCTGAAGTATGTTGGAATCGAATTGT
GGCAGGTGAAATCAGGATCATTGTTCGACAATGTCTTGATTTGCGATGACCCAGACTACG
CCAAGAAGTTGGCAGATGAAACATGGGGAAAGCTCAAGGATGCGGAGAAAGCAGCTTTCG
ATGAGATTGAGAAGAAGAAAGAGGAAGAGGAATCCAAGGACGCTCCAGCAGAAACTGATG
CTGAAGATGAAGCAGAGGAAGATGAAGGAGATGAATCAGATACCGAATCAAAGACCGAGG
CCAAATCCGAAGCTAGCGAGGAAACCTCAGAGGAGAAAGACGCCACCGCTCATGATGAGC
TGTAAGGGAAAGAACGTTGAAGAATGAAGACCAAAAGTTTTCGAGCCTCTTTTATTTTTG
TTTTGATCCTTTCTTTTGAAGTACTCTAGCAATCTAGCTTGTCGGAGGGTAGAACAAGTT
TTAGCAGTTTAAAAAGTGGGGCAAATGTGTGGGGCGAGTAGCGGTACACAATGATGTGAT
GATCAAGATGCTCTTTTTGTACTGAAAACCATAAGAT*GATATTTTGCACTTACATCTCT
TCTTGTTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2DK74JQ 666 0 0
AGCCCAAGCAAATCAAGAACCCCAACTACAAGGGCAAGTGGGAAGCTCCATTGATTGACA
ACCCTGACTTCAAGGATGACGCAGAGCTCTATGTCTTCCCCAAGCTGAAGTATGTTGGAA
TCGAATTGTGGCAGGTGAAATCAGGATCATTGTTCGACAATGTCTTGATCTGCGATGACC
CAGACTACGCCAAGAAGTTGGCAGATGAAACATGGGGAAAGCTCAAGGATGCGGAGAAAG
CAGCTTTCGATGAGATTGAGAAGAAGAAAGAGGAAGAGGAATCCAAGGACGCTCCAGCAG
AAACTGATGCTGAAGATGAAGCAGAGGAAGATGAAGGAGATGAATCAGATACCGAATCAA
AGACCGAGGCCAAATCCGAAGCTAGCGAGGAAACCTCAGAGGAGAAAGACGCCACCGCTC
ATGATGAGCTGTAAGGGAAAGAACGTTGAAGAATGAAGACCAAAAGTTTTCGAGCCTCTT
TTATTTTTGTTTTGATCCTTTCTTTTGAAGTACTCTAGCAATCTAGCTTGTCGGAGGGTA
GAACAAGTTTTAGCAGTTTAAAAAGTGGGGCAAATGTGTGGGGCGAGTAGCGGTACACAA
TGATGTGATGATCAAGATGCTCTTTTTGTACTGAAAACCATAAGAT*GATATTTTGCACT
TACATC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2AA13TF 477 0 0
G
TACGCCAAGAAGTTGGCAGATGAAACATGGGGAAAGCTCAAGGATGCGGAGAAAGCAGCT
TTCGATGAGATTGAGAAGAAGAAAGAGGAAGAGGAATCCAAGGACGCTCCAGCAGAAACT
GATGCTGAAGATGAAGCAGAGGAAGATGAAGGAGATGAATCAGATACCGAATCAAAGACC
GAGGCCAAATCCGAAGCTAGCGAGGAAACCTCAGAGGAGAAAGACGCCACCGCTCATGAT
GAGCTGTAAGGGAAAGAACGTTGAAGAATGAAGACCAAAAGTTTTCGAGCCTCTTTTATT
TTTGTTTTGATCCTTTCTTTTGAAGTACTCTAGCAATCTAGCTTGTCGGAGGGTAGAACA
AGTTTTAGCAGTTTAAAAAGTGGGGCAAATGTGTGGGGCGAGTAGCGGTACACAATGATG
TGATGATCAAGATGCTCTTTTTGTACTGAAAACCATAAGAT*GATATTTTGCACT
C

QA 2 476 2 476
DS 



CO CL608Contig2 735 3 1 U
GGAACCCCAACTACAAGGGCAAATGGGAAGCTCCACTGATTGACAACCCTGACTTCAAGG
ATGACGCAGAGCTCTATGTCTTCCCCAAGCTGAAGTATGTTGGAATCGAATTGTGGCAGG
TGAAATCAGGATCATTGTTCGACAATGTCTTGATCTGCGATGACCCAGACTACGCCAAGA
CGTTGGCAGATGAAACATGGGGAAAGCTCAAGGATGCGGAGAAAGCAGCTTTCGATGAGA
TTGAGAAGAAGAAAGAGGAAGAGGAATCCAAGGACGCTCCAGCAGAAACTGATGCTGAAG
ATGAAGCAGAGGAAGATGAAGGAGATGAATCAGATACTGAATCAAAGACCGAGGCCAAAT
CCGAAGCTAGCGAGGAAACCTCAGAGGAGAAAGACGCCACCGCTCATGATGAGCTGTAAG
GGAAAGGACGTTGAAGATTGAAGAACAAAGTTTTCGAGTCTCTTTTATTTTTGTTTTTAT
CCTTTCTTTTGAAGTACTTTAGCAATCGAGGTAGAACAAGTTTTAGCAGTTTAAAAAGTG
GGGCAAATGTGTGGGGGCGAGTAGCCTTACACAATGATGTGATGATCAGAGGCTCTTTTT
GTACTGAAAACCATAAGATGACCTTTTGCACTTGCATCTCTTTCTCTACCCTTCTTGTTT
TTTTTTTGTAACTGGGCATATTTCATTAATAATAAACTTGGGCTACACTGGGTTTAAAGC
CCAGAGAACTTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G844TF U 291
AF RR2F510JQ C 175
AF RR2F510TF U 1
BS 1 735 RR2F510TF

RD RR2G844TF 342 0 0
GG
TGCTGAAGATGAAGCAGAGGAAGATGAAGGAGATGAATCAGATACTGAATCAAAGACCGA
GGCCAAATCCGAAGCTAGCGAGGAAACCTCAGAGGAGAAAGACGCCACCGCTCATGATGA
GCTGTAAGGGAAAGGACGTTGAAGATTGAAGAACAAAGTCTTCGAGTCTCTTTTATTTTT
GTTTTTATCCTTTCTTTTGAAGTACTTTAGCAATCGAGGTAGAACAAGTTTTAGCAGTTT
AAAAAGTGGGGCAAATGTGTGGGGGCGAGTAGCCTTACACAATGATGTGATGATCAGAGG
CTCTTTTTGTACTGAAAACCATAAGATGACCTTTTGCACT

QA 3 342 3 342
DS 

RD RR2F510JQ 523 0 0
CCAAGACGTTGGCAGATGAAACATGGGGAAAGCTCAAGGATGCGGAGAAAGCAGCTTTCG
ATGAGATTGAGAAGAAGAAAGAGGAAGAGGAATCCAAGGACGCTCCAGCAGAAACTGATG
CTGAAGATGAAGCAGAGGAAGATGAAGGAGATGAATCAGATACTGAATCAAAGACCGAGG
CCAAATCCGAAGCTAGCGAGGAAACCTCAGAGGAGAAAGACGCCACCGCTCATGATGAGC
TGTAAGGGAAAGGACGTTGAAGATTGAAGAACAAAGTTTTCGAGTCTCTTTTATTTTTGT
TTTTATCCTTTCTTTTGAAGTACTTTAGCAATCGAGGTAGAACAAGTTTTAGCAGTTTAA
AAAGTGGGGCAAATGTGTGGGGGCGAGTAGCCTTACACAATGATGTGATGATCAGAGGCT
CTTTTTGTACTGAAAACCATAAGATGACCTTTTGCACTTGCATCTCTTTCTCTACCCTTC
TTGTTTTTTTTTTGTAACTGGGCATATTTCATTAATAATAAAC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2F510TF 735 0 0
GGAACCCCAACTACAAGGGCAAATGGGAAGCTCCACTGATTGACAACCCTGACTTCAAGG
ATGACGCAGAGCTCTATGTCTTCCCCAAGCTGAAGTATGTTGGAATCGAATTGTGGCAGG
TGAAATCAGGATCATTGTTCGACAATGTCTTGATCTGCGATGACCCAGACTACGCCAAGA
CGTTGGCAGATGAAACATGGGGAAAGCTCAAGGATGCGGAGAAAGCAGCTTTCGATGAGA
TTGAGAAGAAGAAAGAGGAAGAGGAATCCAAGGACGCTCCAGCAGAAACTGATGCTGAAG
ATGAAGCAGAGGAAGATGAAGGAGATGAATCAGATACTGAATCAAAGACCGAGGCCAAAT
CCGAAGCTAGCGAGGAAACCTCAGAGGAGAAAGACGCCACCGCTCATGATGAGCTGTAAG
GGAAAGGACGTTGAAGATTGAAGAACAAAGTTTTCGAGTCTCTTTTATTTTTGTTTTTAT
CCTTTCTTTTGAAGTACTTTAGCAATCGAGGTAGAACAAGTTTTAGCAGTTTAAAAAGTG
GGGCAAATGTGTGGGGGCGAGTAGCCTTACACAATGATGTGATGATCAGAGGCTCTTTTT
GTACTGAAAACCATAAGATGACCTTTTGCACTTGCATCTCTTTCTCTACCCTTCTTGTTT
TTTTTTTGTAACTGGGCATATTTCATTAATAATAAACTTGGGCTACACTGGGTTTAAAGC
CCAGAGAACTTGCTT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 10

CO CL609Contig1 802 10 11 U
GGATTCATCAACCAAAGAACCAAACTGAAAAAA*CACACACACTTTACTCACAACACAAA
GAAGATAAGAGAGAGATGGCGACGTCGGGAACATATGTGACTGAGGTTCCGTTGAAAGGA
TCGGCGGAGAAACACTACAAGCGATGGAGAAATGAGAACAACGTCTTTCCCGACGCCATT
GGCCACCACATCCAAAGTGTCACCGTCCACGACGGTGAATGGGACTCTCATGGAGCCATC
AAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTACAAGGAGAGGAGAGAAATC
GACGACGAGAACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATGGAGACTCTT
AAGGTGTATGATGCCATCTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCTGATGATATCATCTGCAAG
ATCACTATGATCTGGGAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCATCAACTACATGAAG
TTTGTCAAGAGCATGGTTGCTGATATGGACAACCATGTCGTCAAAGCTTAAAAAAATCCC
ATCCTCCCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTCTATTGGTGTTTGTGTGTG
TCGGTTTATCTGTTGAAATCAATATAATAAATAAGGAGGCTCATGTATGGTATTATTAGT
TACTACTTACTATTACTGCTTGCGGTTTGTAATATGCTTTCATGTTGTTTAAAAAGGGGT
TTATATGCTTTCATGTTTAATTATGCGTAACCATTGATGGCAAGATGTTGCATGTATATC
CACTTATATATGTATCTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G949TF U 1
AF RR2G883TF U 1
AF RR2AX11TFB U 288
AF RR2C657TF U 5
AF RR2AQ47TF U 7
AF RR2BK92TF U 18
AF RR2C657JQ C 545
AF RR2AX11JQ C 5
AF RR2BK92JQ C 323
AF RR2AQ47JQ C 43
BS 1 502 RR2G883TF
BS 503 536 RR2AX11TFB
BS 537 537 RR2C657TF
BS 538 635 RR2AX11TFB
BS 636 691 RR2C657TF
BS 692 692 RR2AQ47TF
BS 693 715 RR2C657TF
BS 716 738 RR2AX11JQ
BS 739 746 RR2AQ47JQ
BS 747 747 RR2BK92JQ
BS 748 802 RR2AQ47JQ

RD RR2G949TF 390 0 0
GGATTC
ATCAACCAAAGAACCAAACTGAAAAAA*CACACACACTTTACTCACAACACAAAGAAGAT
AAGAGAGAGATGGCGACGTCGGGAACATATGTGACTGAGGTTCCGTTGAAAGGATCGGCG
GAGAAACACTACAAGCGATGGAGAAATGAGAACAACGTCTTTCCCGACGCCATTGGCCAC
CACATCCAAAGTGTCACCGTCCACGACGGTGAATGGGACTCTCATGGAGCCATCAAGATT
TGGAACTACACATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTACAAGGAGAGGAGAGAAATCGACGAC
GAGAACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATGGAGACTCTTAAGGTG
TATGATGCCATCTTACAGTTCATT

QA 7 390 7 390
DS 

RD RR2G883TF 502 0 0
GGATTCATCAACCAAAGAACCAAACTGAAAAAA*CACACACACTTTACTCACAACACAAA
GAAGATAAGAGAGAGATGGCGACGTCGGGAACATATGTGACTGAGGTTCCGTTGAAAGGA
TCGGCGGAGAAACACTACAAGCGATGGAGAAATGAGAACAACGTCTTTCCCGACGCCATT
GGCCACCACATCCAAAGTGTCACCGTCCACGACGGTGAATGGGACTCTCATGGAGCCATC
AAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTACAAGGAGAGGAGAGAAATC
GACGACGAGAACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATGGAGACTCTT
AAGGTGTATGATGCCATCTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCTGATGATATCATCTGCAAG
ATCACTATGATCTGGGAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCATCAACTACATGAAG
TTTGTCAAGAGCATGGTTGCTG

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR2AX11TFB 348 0 0
GAGGAGAGAAATCGACTACGAGAACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCC
GATGGAGACTCTTAAGGTGTATGATGCCATCTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCTGATGA
TATCATCTGCAAGATCACTATGATCTGGTAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCAT
CAACTACATGAAGTTTGTCAAGAGCATGGTTGCTGATATGGACAACCATGTCGTCAAAGC
TTAAAAAAACCCCATCCTCCCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTCTATTG
GTGTTTGTGTGTGTCGGTTTATCTGTTGAAATCAATATAATAAATAAG

QA 1 348 1 348
DS 

RD RR2C657TF 711 0 0
GG
ATCAACCAAAGAACCAAACTGAAAAAA***CACACACTTTACTCACAACACAAAGAAGAT
AAGAGAGAGATGGCGACGTCGGGAACATATGTGACTGAGGTTCCGTTGAAGGGATCGGCG
GAGAAACACTACAAGCGATGGAGAAATGAGAACAACGTCTTTCCCGACGCCATTGGCCAC
CACATCCAAAGTGTCACCGTCCACGACGGTGAATGGGACTCTCATGGAGCCATCAAGATT
TGGAACTACACATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTACAAGGAGAGGAGAGAAATCGACGAC
GAGAACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATGGAGACTCTTAAGGTG
TATGATGCCATCTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCTGATGATATCATCTGCAAGATCACT
ATGATCTGGGAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCATCAACTACATGAAGTTTGTC
AAGAGCATGGTTGCTGATATGGACAACCATGTCGTCAAAGCTTAAAAAAATCCCATCCTC
CCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTCTATTGGTGTTTGTGTGTGTCGGTT
TATCTGTTGAAATCAATATAATAAATAAGGAGGCTCATGTATGGTATTATTAGTTACTAC
TTACTATTACTGCTTGCGGTTTGTA*TATGCTTTCATGTTGTTTAAAAA

QA 3 711 3 711
DS 

RD RR2AQ47TF 706 0 0
ATCAACCAAAGAACCAAACTGAAAAAA*CACACACACTTTACTCACAACACAAAGAAGAT
AAGAGAGAGATGGCGACGTCGGGAACATATGTGACTGAGGTTCCGTTGAAAGGATCGGCG
GAGAAACACTACAAGCGATGGAGAAATGAGAACAACGTCTTTCCCGACGCCATTGGCCAC
CACATCCAAGGTGTCACCGTCCACGACGGTGAATGGGACTCTCATGGAGCCATCAAGATT
TGGAACTACACATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTACAAGGAGGGGAGAGAAATCGACGAC
GAGAACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATGGAGACTCTTAAGGTG
TATGATGCCATCTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCTGATGATATCATCTGCAAGATCACT
ATGATCTGGGAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCATCAACTACATGAAGTTTGTC
AAGAGCATGGTTGCTGATATGGACAACCATGTCGTCAAAGCTTAAAAAAATCCCATCCTC
CCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTCTATTGGTGTTTGTGTGTGTCGGTT
TATCTGTTGAAATCAATATAATAAATAAGGAGGCTCATGTATGGTATTATTAGTTACTAC
TTACTATTACTGCTTGCGGTTTGTAATATGCTTTCATGTTGTTTAA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2BK92TF 678 0 0
G
ACCAAACTGAAAAAA*CACACACACTTTACTCACAACACAAAGAAGATAAGAGAGAGATG
GCGACGTCGGGAACATATGTGACTGAGGTTCCGTTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACTAC
AAGCGATGGAGAAATTAGAACAACGTCTTTCCCGACGCCATTGGCCACCACATCCAAAGT
GTCACCGTCCACGACGGTGAATGGGACTCTCATGGAGCCATCAAGATTTGGAACTACACA
TGCGGTGGGAAACCGGAGGTGTACAAGGAGAGGAGAGAAATCGACGACGAGAACAATGCT
GTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATGGAGACTCTTAAGGTGTATGATGCCATC
TTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCCGATGATATCATCTGCAAGATCACTATGATCTGGGAG
AAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCATCAACTACATGAAGTTTGTCAAGAGCATGGTT
GCTGATATGGACAACCATGTCGTCAAAGCTTAAAAAAATCCCATCCTCCCCTATCTTTCG
AACCATCATCGTCATATATGGCTCTATTGGTGTTTGTGTGTGTCGGTTTATCTGTTGAAA
TCAATATAATAAATAAGGAGGCTCATGTATGGTATTATTAGTTACTACTTACTATTACTG
CTTGCGGTTTGTA
TATG

QA 2 674 2 674
DS 

RD RR2C657JQ 171 0 0
TCCCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTCTATTGGTGTTTGTGTGTGTCGG
TTTATCTGTTGAAATCAATATAATAAATAAGGAGGCTCATGTATGGTATTATTAGTTACT
ACTTACTATTACTGCTTGCGGTTTGTAATATGCTTTCATGTTGTTTAAAAA

QA 1 171 1 171
DS 

RD RR2AX11JQ 734 0 0
GG
ATCAACCAAAGAACCAAACTGAAAAAAACACACACACTTTACTCACAACACAAAGAAGAT
AAGAGAGAGATGGCGACGTCGGGAACATATGTGACTGAGGTTCCGTTGAAAGGATCGGCG
GAGAAACACTACAAGCGATGGAGAAATGAGAACAACGTCTTTCCCGACGCCATTGGCCGC
CACATCCAAAGTGTCACCGTCCACGACGGTGAATGGGACTCTCATGGAGCCATCAAGATT
TGGAACTACACATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTACAAGGAGAGGAGAGAAATCGACTAC
GAGAACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATGGAGACTCTTAAGGTG
TATGATGCCATCTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCTGATGATATCATCTGCAAGATCACT
ATGATCTGGTAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCATCAACTACATGAAGTTTGTC
AAGAGCATGGTTGCTGATATGGACAACCATGTCGTCAAAGCTTAAAAAAACCCCATCCTC
CCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTCTATTGGTGTTTGTGTGTGTCGGTT
TATCTGTTGAAATCAATATAATAAATAAGGAGGCTCATGTATGGTATTATTAGTTACTAC
TTACTATTACTGCTTGCGGTTTGTAATATGCTTTCATGTTGTTTAAAAAGGGGTTTATAT
GCTTTCATGTTT

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR2BK92JQ 438 0 0
TTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATGGAGACTCTTAAGGTGTATGATGCCATCTTAC
AGTTCATTCAAAAGTCGCCCGATGATATCATCTGCAAGATCACTATGATCTGGGAGAAGC
GAACCGATGACTCGCCTGAGCCCATCAACTACATGAAGTTTGTCAAGAGCATGGTTGCTG
ATATGGACAACCATGTCGTCAAAGCTTAAAAAAATCCCATCCTCCCCTATCTTTCGAACC
ATCATCGTCATATATGGCTCTATTGGTGTTTGTGTGTGTCGGTTTATCTGTTGAAATCAA
TATAATAAATAAGGAGGCTCATGTATGGTATTATTAGTTACTACTTACTATTACTGCTTG
CGGTTTGTAATATGCTTTCATGTTGTTTAAAA*GGGGTTTATATGCTTTCATGTTTAATT
ATGCGTAACCATTGATGG

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR2AQ47JQ 760 0 0
CTTTACTCACAACACAAAGAAGATAAGAGAGAGATGGCGACGTCGGGAACATATGTGACT
GAGGTTCCGTTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACTACAAGCGATGGAGAAATGAGAACAAC
GTCTTTCCCGACGCCATTGGCCACCACATCCAAGGTGTCACCGTCCACGACGGTGAATGG
GACTCTCATGGAGCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTAC
AAGGAGGGGAGAGAAATCGACGACGAGAACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGA
CACCCGATGGAGACTCTTAAGGTGTATGATGCCATCTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCT
GATGATATCATCTGCAAGATCACTATGATCTGGGAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAG
CCCATCAACTACATGAAGTTTGTCAAGAGCATGGTTGCTGATATGGACAACCATGTCGTC
AAAGCTTAAAAAAATCCCATCCTCCCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTC
TATTGGTGTTTGTGTGTGTCGGTTTATCTGTTGAAATCAATATAATAAATAAGGAGGCTC
ATGTATGGTATTATTAGTTACTACTTACTATTACTGCTTGCGGTTTGTAATATGCTTTCA
TGTTGTTTAAAAAGGGGTTTATATGCTTTCATGTTTAATTATGCTTAACCATTGATGGCA
AGATGTTGCATGTATATCCACTTATATATGTATCTTTCCC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 10

CO CL610Contig1 892 10 12 U
GTAGTTATAGTAGTAGTATGTTTAATGAGATTAGGAAAGGGTTAATCAGTCACGTAATAC
ACTCACTTGTAAAAAGTAGAACTTTACATATCAAATAAATAAATAAAACTTTTGTGGAAG
TGAGTTTGATTAAATAGTGTAGGGTGTAGGCAATGGCAAGCCCTTGACGATACCACAGAG
GTTGGTGTTGAGTGGGATGTTGTATTCGTCTCTTAGTGATTTCTCAGGGGAAAGAACACT
GACGTACATTTGCTGTCCCAAGTATCTCTTCTCCCAGTTCTCTGATCTGATGTTCCACAT
ACCGGCGTTGTCGAATGTCAAGAGGATGGCTGACCACGACTTGGGGAACACTTGCACGGT
GTGTCTGCTGACAGCATCGAGCAAGTTGTAGTTGCTTCTCTTCTCTGGTGTCCATCTTCC
TGGCTCAGAAGCGACTGAGAAGAAGGAGTAACCATCCAAATGGAAGGATTGCATGCTCTT
CTCGTGGTTCTCGAAGACGATTTCGACAAAGGTACGGAAAGTGATGTTAAGGACATTAGG
CTCGATGGTTAGTGTAGTGATCTTGGCTGCTGGCTCATCCTTGATGACATTGTACTTGAA
GACCTTCTCGGACATCTCGAAGTACTCAGCAAGCTTCAAAGGAGTCTCGGTGTCAACGTG
TGATACACCGTTGAACCCAAACCTGACCTTACCGTCCACCAAGTTCTTGGTGTTGGCGAG
CTTGATGGTACGTGTGATGTTGATCTTTCCGTAATGGTAAGACCCTTGTGGGTTAGGTCT
AGCGGCACTGGCGGTTAAGTTCCATCTGAATGATCTGAACTGGTTAAGAGACCAAGCCCA
GCCAACTGGAGCCTTGGGAAGCTCATTTGAAGGCTGAACACTGCTTCCTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 45 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR88JQ U 1
AF RR2FR88TF C 1
AF RR2GY39JQ U 39
AF RR2AP24JQ U 9
AF RR2GY39TF C 39
AF RR2AP24TF C 9
AF RR2AA16JQ U 31
AF RR2EK22JQ U 39
AF RR2AA16TF C 58
AF RR2EK22TF C 160
BS 1 367 RR2FR88JQ
BS 368 368 RR2AP24JQ
BS 369 404 RR2FR88JQ
BS 405 549 RR2AP24JQ
BS 550 550 RR2AA16JQ
BS 551 625 RR2AP24JQ
BS 626 749 RR2AA16JQ
BS 750 833 RR2EK22JQ
BS 834 864 RR2AA16TF
BS 865 865 RR2EK22TF
BS 866 873 RR2AA16TF
BS 874 892 RR2EK22TF

RD RR2FR88JQ 408 0 0
GTAGTTATAGTAGTAGTATGTTTAATGAGATTAGGAAAGGGTTAATCAGTCACGTAATAC
ACTCACTTGTAAAAAGTAGAACTTTACATATCAAATAAATAAATAAAACTTTTGTGGAAG
TGAGTTTGATTAAATAGTGTAGGGTGTAGGCAATGGCAAGCCCTTGACGATACCACAGAG
GTTGGTGTTGAGTGGGATGTTGTATTCGTCTCTTAGTGATTTCTCAGGGGAAAGAACACT
GACGTACATTTGCTGTCCCAAGTATCTCTTCTCCCAGTTCTCTGATCTGATGTTCCACAT
ACCGGCGTTGTCGAATGTCAAGAGGATGGCTGACCACGACTTGGGGAACACTTGCACGGT
GTGTCTGATGACAGCATCGAGCAAGTTGTAGTTGCTTCTCTTCT
ATGC

QA 1 404 1 404
DS 

RD RR2FR88TF 408 0 0
GTAGTTATAGTAGTAGTATGTTTAATGAGATTAGGAAAGGGTTAATCAGTCACGTAATAC
ACTCACTTGTAAAAAGTAGAACTTTACATATCAAATAAATAAATAAAACTTTTGTGGAAG
TGAGTTTGATTAAATAGTGTAGGGTGTAGGCAATGGCAAGCCCTTGACGATACCACAGAG
GTTGGTGTTGAGTGGGATGTTGTATTCGTCTCTTAGTGATTTCTCAGGGGAAAGAACACT
GACGTACATTTGCTGTCCCAAGTATCTCTTCTCCCAGTTCTCTGATCTGATGTTCCACAT
ACCGGCGTTGTCGAATGTCAAGAGGATGGCTGACCACGACTTGGGGAACACTTGCACGGT
GTGTCTGATGACAGCATCGAGCAAGTTGTAGTTGCTTCTCTTCT
ATGC

QA 1 404 1 404
DS 

RD RR2GY39JQ 433 0 0
GGGTTAATCAGTCACGTAATACACTCACTTGTAAAAAGTAAAACTTTACATATCAAATAA
ATAAATAAAACTTTTGTGGAAGTGAGTTTGATTAAATAGTGTAGGGTGTAGGTAATGGCA
AGCCCTTGACGATACCACAGAGGTTGGTGTTGAGTGGGATGTTGTATTCCTCCCTTAGTG
ATTTCTCGGGGGAAAGAACACTGACGTACATTTGCTGTCCCAAGTATCTTTTCTCCCAGT
TCTCTGATCTGATGTTCCACATACCGGCGTTGTCCAATGTCAAGAGGATGGCTGACCACG
ACTTGGGGAACACTTGCACGGTGTGTCTGCTGACCGCATCGAGCAAGTTGTAGTTGCTTC
TCTTCTCTGGTGTCCATCTTCCTGGCTCAAAAGCGACTGAAAAGAAGGAGTAACCATCCA
AATGGAAGGATTG

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR2AP24JQ 617 0 0
G
GTAGTAGTATGTTTAATGAGATTAGGAAAGGGTTAATCAGTCACGTAATACACTCACTTG
TAAAAAGTAGAACTTTACATATCAAATAAATAAATAAAACTTTTGTGGAAGTGAGTTTGA
TTAAATAGTGTAGGGTGTAGGCAATGGCAAGCCCTTGACGATACCACAGAGGTTGGTGTT
GAGTGGGATGTTGTATTCGTCTCTTAGTGATTTCTCAGGGGAAAGAACACTGACGTACAT
TTGCTGTCCCAAGTATCTCTTCTCCCAGTTCTCTGATCTGATGTTCCACATACCGGCGTT
GTCGAATGTCAAGAGGATGGCTGACCACGACTTGGGGAACACTTGCACGGTGTGTCTGCT
GACAGCATCGAGCAAGTTGTAGTTGCTTCTCTTCTCTGGTGTCCATCTTCCTGGCTCAGA
AGCGACTGAGAAGAAGGAGTAACCATCCAAATGGAAGGATTGCATGCTCTTCTCGTGGTT
CTCGAAGACGATTTCGACAAAGGTACGGAAAGTGATGTTAAGGACATTAGGCTCGATGGT
CAGTGTAGTGATCTTGGCTGCTGGCTCATCCTTGATGACATTGTACTTGAAGACCTTCTC
GGACATCTCGAAGTAC

QA 2 617 2 617
DS 

RD RR2GY39TF 615 0 0
GGGTTAATCAGTCACGTAATACACTCACTTGTAAAAAGTAGAACTTTACATATCAAATAA
ATAAATAAAACTTTTGTGGAAGTGAGTTTGATTAAATAGTGTAGGGTGTAGGTAATGGCA
AGCCCTTGACGATACCACAGAGGTTGGTGTTGAGTGGGATGTTGTATTCGTCCCTTAGTG
ATTTCTCGGGGGAAAGAACACTGACGTACATTTGCTGTCCCAAGTATCTTTTCTCCCAGT
TCTCTGATCTGATGTTCCACATACCGGCGTTGTCGAATGTCAAGAGGATGGCTGACCACG
ACTTGGGGAACACTTGCACGGTGTGTCTGCTGACCGCATCGAGCAAGTTGTAGTTGCTTC
TCTTCTCTGGTGTCCATCTTCCTGGCTCAGAAGCGACTGAGAAGAAGGAGTAACCATCCA
AATGGAAGGATTGCATGCTCTTCTCGTGGTTCTCGAAGACGATTTCGACAAAGGTACGGA
AAGTGATGTTAAGGACACTAGGCTCGATGGTTAGTGTAGTGATCTTGGCTGCTGGTTCAT
CCTTGATGACATTGTATTTGAAGACCTTCTCGGACATCTCGAAGTACTCAGCAAGCTTCA
AAGGAGTCTCGGTG
C

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2AP24TF 671 0 0
G
GTAGTAGTATGTTTAATGAGATTAGGAAAGGGTTAATCAGTCACGTAATACACTCACTTG
TAAAAAGTAGAACTTTACATATCAAATAAATAAATAAAACTTTTGTGGAAGTGAGTTTGA
TTAAATAGTGTAGGGTGTAGGCAATGGCAAGCCCTTGACGATACCACAGAGGTTGGTGTT
GAGTGGGATGTTGTATTCGTCTCTTAGTGATTTCTCAGGGGAAAGAACACTGACGTACAT
TTGCTGTCCCAAGTATCTCTTCTCCCAGTTCTCTGATCTGATGTTCCACATACCGGCGTT
GTCGAATGTCAAGAGGATGGCTGACCACGACTTGGGGAACACTTGCACGGTGTGTCTGCT
GACAGCATCGAGCAAGTTGTAGTTGCTTCTCTTCTCTGGTGTCCATCTTCCTGGCTCAGA
AGCGACTGAGAAGAAGGAGTAACCATCCAAATGGAAGGATTGCATGCTCTTCTCGTGGTT
CTCGAAGACGATTTCGACAAAGGTACGGAAAGTGATGTTAAGGACATTAGGCTCGATGGT
CAGTGTAGTGATCTTGGCTGCTGGCTCATCCTTGATGACATTGTACTTGAAGACCTTCTC
GGACATCTCGAAGTACTCAGCAAGCTTCAAGGGAGTCTCGGTGTCAACGTGTGATACACC
GTTGAAC
TCC

QA 2 668 2 668
DS 

RD RR2AA16JQ 719 0 0
TTAGGAAAGGGTCAATCAGTCACGTAATACACTCACTTGTAAAAAGTAGAACTTTACATA
TCAAATAAATAAATAAAACTTTTGTGGAAGTGAGTTTGATTAAATAGTGTAGGGTGTAGG
TAATGGCAAGCCCTTGACGATACCACAGAGGTTGGTGTTGAGTGGGATGTTGTATTCGTC
TCTTAGTGATTTCTCAGGGGAAAGAACACTGACGTACATTTGCTGTCCCAAGTATCTTTT
CTCCCAGTTCTCTGATCTGATGTTCCACATACCGGCGTTGTCAAATGTCAAGAGGATGGC
TGACCACGACTTGGGGAACACTTGCACGGTGTGTCTGCTGACCGCATCGAGCAAGTTGTA
GTTGCTTCTCTTCTCTGGTGTCCATCTTCCTGGCTCAGAAGCGACTGAGAAGAAGGAGTA
ACCATCCAAATGGAAGGATTGCATGCTCTTCTCGTGGTTCTCGAAGACGATTTCGACAAA
GGTACGGAAAGTGATGTTAAGGACATTAGGCTCGATGGTTAGTGTAGTGATCTTGGCTGC
TGGTTCATCCTTGATGACATTGTATTTGAAGACCTTCTCGGACATCTCGAAGTACTCAGC
AAGCTTCAAAGGAGTCTCGGTGTCAACGTGTGATACACCGTTGAACCCAAACCTGACCTT
ACCGTCCACCAAGTTCTTGGTGTTGGCGAGCTTGATGGTACGTGTGATGTTGATCTTTC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2EK22JQ 795 0 0
GGGTTAATCAGTCACGTAATACACTCACTTGTAAAAAGTAGAACTTTACATATCAAATAA
ATAAATAAAACTTTTGTGGAAGTGAGTTTGATTAAATAGTGTAGGGTGTAGGCAATGGCA
AGCCCTTGACGATACCACAGAGGTTGGTGTTGAGTGGGATGTTGTATTCGTCTCTTAGTG
ATTTCTCAGGGGAAAGAACACTGACGTACATTTGCTGTCCCAAGTATCTCTTCTCCCAGT
TCTCTGATCTGATGTTCCACATACCGGCGTTGTCGAATGTCAAGAGGATGGCTGACCACG
ACTTGGGGAACACTTGCACGGTGTGTCTGCTGACAGCATCGAACAAGTTGTAGTTGCTTC
TCTTCTCTGGTGTCCATCTTCCTGGCTCAGAAGCGACTGAGAAGAAGGAGTAACCATCCA
AATGGAAGGATTGCATGCTCTTCTCGTGGTTCTCGAAGACGATTTCGACAAAGGTACGGA
AAGTGATGTTAAGGACATTAGGCTCGATGGTTAGTGTAGTGATCTTGGCTGCTGGCTCAT
CCTTGATGACATTGTACTTGAAGACCTTCTCGGACATCTCGAAGTACTCAGCAAGCTTCA
AGGGAGTCTCGGTGTCAACGTGCGATACACCGTTGAACCCAAACCTGACCTTACCGTCCA
CCAAGTTCTTGGTGTTGGCTAGCTTGATGGTACGTGTGATGTTGATCTTTCCGTAATGGT
AAGACCCTTGTGGGTTAGGTCTAGCGGCACTGGCGGTTAAGTTCCATCTGAATGATCTGA
ACTGGTTAAGAGACC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2AA16TF 826 0 0
TACACTCACTTGTAAAAAGTAGAACTTTACATATCAAATAAATAAATAAAACTTTTGTGG
AAGTGAGTTTGATTAAATAGTGTAGGGTGTAGGTAATGGCAAGCCCTTGACGATACCACA
GAGGTTGGTGTTGAGTGGGATGTTGTATTCGTCTCTTAGTGATTTCTCAGGGGAAAGAAC
ACTGACGTACATTTGCTGTCCCAAGTATCTTTTCTCCCAGTTCTCTGATCTGATGTTCCA
CATACCGGCGTTGTCGAATGTCAAGAGGATGGCTGACCACGACTTGGGGAACACTTGCAC
GGTGTGTCTGCTGACCGCATCGAGCAAGTTGTAGTTGCTTCTCTTCTCTGGTGTCCATCT
TCCTGGCTCAGAAGCGACTGAGAAGAAGGAGTAACCATCCAAATGGAAGGATTGCATGCT
CTTCTCGTGGTTCTCGAAGACGATTTCGACAAAGGTACGGAAAGTGATGTTAAGGACATT
AGGCTCGATGGTTAGTGTAGTGATCTTGGCTGCTGGTTCATCCTTGATGACATTGTATTT
GAAGACCTTCTCGGACATCTCGAAGTACTCAGCAAGCTTCAAAGGAGTCTCGGTGTCAAC
GTGTGATACACCGTTGAACCCAAACCTGACCTTACCGTCCACCAAGTTCTTGGTGTTGGC
GAGCTTGATGGTACGTGTGATGTTGATCTTTCCGTAATGGTAAGACCCTTGTGGGTTAGG
CCTAGCGGCACTGGCGGTTAAGTTCCATCTGAATGATCTGAACTGGTTAAGAGACCAAGC
CCAGCCAACTGGAGCCTTGGGAAGCTCGTTTGAAGG
GAACGTTGCC

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR2EK22TF 733 0 0
GCCCTTGACGATACCACAGAGGTTGGTGTTGAGTGGGATGT*GTATTCGTCTCTTAGTGA
TTTCTCAGGGGAAAGAACACTGACGTACATTTGCTGTCCCAAGTATCTCTTCTCCCAGTT
CTCTGATCTGATGTTCCACATACCGGCGTTGTCGAATGTCAAGAGGATGGCTGACCACGA
CTTGGGGAACACTTGCACGGTGTGTCTGCTGACAGCATCGAACAAGTTGTAGTTGCTTCT
CTTCTCTGGTGTCCATCTTCCTGGCTCAGAAGCGACTGAGAAGAAGGAGTAACCATCCAA
ATGGAAGGATTGCATGCTCTTCTCGTGGTTCTCGAAGACGATTTCGACAAAGGTACGGAA
AGTGATGTTAAGGACATTAGGCTCGATGGTTAGTGTAGTGATCTTGGCTGCTGGCTCATC
CTTGATGACATTGTACTTGAAGACCTTCTCGGACATCTCGAAGTACTCAGCAAGCTTCAA
GGGAGTCTCGGTGTCAACGTGCGATACACCGTTGAACCCAAACCTGACCTTACCGTCCAC
CAAGTTCTTGGTGTTGGCTAGCTTGATGGTACGTGTGATGTTGATCTTTCCGTAATGGTA
AGACCCTTGTGGGTTAGGTCTAGCGGCACTGGCGGTTAAGTTCCATCTGAATGATCTGAA
CTGGTTAAGAGACCAGGCCCAGCCAACTGGAGCCTTGGGAAGCTCATTTGAAGGCTGAAC
ACTGCTTCCTTCC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 2 10

CO CL611Contig1 1365 4 12 U
GGGGGCTTAGTTACCACAGTGACGACAACAAAGAAAGAGGAGCCAAAAGTCGCTACCTTT
AACGCTTTCGCATTGTCCAAGTGCTTCTCTGTTCTTTCTCTCTCTTCCCCCGCACCACAC
GCTTTACTCTCCTCCAACAGTAGATCTCATCTCCCATTTCAAACCCTAGAAAAATCAATC
AAATTCAATTAACCACAGCTTGCTCCACCAATGGCGAGCTTCATTCTCCCCAAGTCACTC
CTCTTTCTGCTCCTCTTGCCTTTACTCTCACTCTTCTCCGCAATATCTGAAGCTAAACCA
TCCTTTACCTTCGGTAAAAATGGAAGCTTTGAGTCCGACGACATCGCTCTGTACGGCGAA
TCAAACCTCCTCGACGGCGGATCTTCGATTTCAATCCAGCTGAATGACTCAGTGAGTCGT
AACAGTGGGCGAGTCGTCCACAAGAAGCCCATCGAGTTCGTCGAGACCAAGTCCGAGTAT
CCCGCCGGATTCTCTACTCTCATGGCTTTCTCCGTCAATGGTGGCGGGAGACTCGGGTTC
GTCGTGTTCCCTGTTAACGGAACGTTTGAGCAGTCTCTGTTCGAAGTAAAGTTCGGTGCT
TTCGAAAGGAATGTAACTGTGAGTGTAGATGGCACTACGGTTCCCGAGGAGATTCGCAGT
TTCACGGTTGCTAACTTGGAGGGAGAGGATAATAAGGAGAAGAAGGTGGTGTTGTTGTAC
GCTTGGGTTAATTACATTGCAAGTGGGAAGTTCTTGGAAGTCCGTTTAAGCAAATCAGAG
AGCTTCGAACATGTTGATCCTTTGATGTTCACTAGGATCGACTTGTCGGGAATGTTGAAA
GGTGACAATGAGTTCATGGTTGGTGTGAAGGCGTATGGTGGGAACGTGAATCTCCACTCT
TGGAGCTTAGAAGCGAGGAGTGTCTCTAAGGGTGTGCACTCTTATGGGGCGATTATGGTG
GAGAAGCTTATAGAGGAAGAGGAGGCGGAGAAGAGGAGGAGGAGGAGAAGAGCGAGGGCG
TGGGAGATTGTGACTTGCTTTGTGATGACCTTTGGGTCTACAGGGCTTGTGTTTTTCGCC
ATGATGCATATATGGGCAGCTTTCAAAAGGAACAATCTCGTGATGACGAAGGAGTTTGAG
TATGAGAAGATGGAGAAAATGGAAGCTGTGATGGGTAAAGCTGATAGTGCAAAATGAAAA
CAAGTGAAGTAATCAAGTGTTGTGATATATCTCTGTGTGTTTGTTTAGGATATGATCTTT
TTATGTAATCAAGTAGATTCTTCACTGGCTAAATATAGCCCCCTTGTTTTTCATTTCATG
TGTGGCAAACATTGTTTCTCTATGGCATGTTCAGTTTGTTTCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2A502TF U 1
AF RR2ET24TF U 200
AF RR2ET24JQ C 569
AF RR2A502JQ C 636
BS 1 619 RR2A502TF
BS 620 620 RR2ET24TF
BS 621 650 RR2A502TF
BS 651 651 RR2ET24TF
BS 652 704 RR2A502TF
BS 705 705 RR2ET24TF
BS 706 738 RR2A502TF
BS 739 739 RR2ET24TF
BS 740 800 RR2A502TF
BS 801 814 RR2ET24TF
BS 815 1363 RR2ET24JQ
BS 1364 1365 RR2A502JQ

RD RR2A502TF 800 0 0
GGGGGCTTAGTTACCACAGTGACGACAACAAAGAAAGAGGAGCCAAAAGTCGCTACCTTT
AACGCTTTCGCATTGTCCAAGTGCTTCTCTGTTCTTTCTCTCTCTTCCCCCGCACCACAC
GCTTTACTCTCCTCCAACAGTAGATCTCATCTCCCATTTCAAACCCTAGAAAAATCAATC
AAATTCAATTAACCACAGCTTGCTCCACCAATGGCGAGCTTCATTCTCCCCAAGTCACTC
CTCTTTCTGCTCCTCTTGCCTTTACTCTCACTCTTCTCCGCAATATCTGAAGCTAAACCA
TCCTTTACCTTCGGTAAAAATGGAAGCTTTGAGTCCGACGACATCGCTCTGTACGGCGAA
TCAAACCTCCTCGACGGCGGATCTTCGATTTCAATCCAGCTGAATGACTCAGTGAGTCGT
AACAGTGGGCGAGTCGTCCACAAGAAGCCCATCGAGTTCGTCGAGACCAAGTCCGAGTAT
CCCGCCGGATTCTCTACTCTCATGGCTTTCTCCGTCAATGGTGGCGGGAGACTCGGGTTC
GTCGTGTTCCCTGTTAACGGAACGTTTGAGCAGTCTCTGTTCGAAGTAAAGTTCGGTGCT
TTCGAAAGGAATGTAACTGCGAGTGTAGATGGCACTACGGTTCCCGAGGATATTCGCAGT
TTCACGGTTGCTAACTTGGAGGGAGAGGATAATAAGGAGAAGAAAGTGGTGTTGTTGTAC
GCTTGGGTTAATTACATTTCAAGTGGGAAGTTCTTGGAAGTCCGTTTAAGCAAATCAGAG
AGCTTCGAACATGTTGATCC

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2ET24TF 615 0 0
GG
GCTCCACCAATGGCGAGCTTCATTCTCCCCAAGTCACTCCTCTTTCTGCTCCTCTTGCCT
TTACTCTCACTCTTCTCCGCAATATCTGAAGCTAAACCATCCTTTACCTTCGGTAAAAAT
GGAAGCTTTGAGTCCGACGACATCGCTCTGTACGGCGAATCAAACCTCCTCGACGGCGGA
TCTTCGATTTCAATCCAGCTGAATGACTCAGTGAGTCGTAACAGTGGGCGAGTCGTCTAC
AAGAAGCCCATCGAGTTCGTCGAGACCAAGTCCGAGTATCCCGCCGGATTCTCTACTCTC
ATGGCTTTCTCCGTCAATGGTGGCGGGAGACTCGGGTTCGTCGTGTTCCCTGTTAACGGA
ACGTTTGAGCAGTCTCTGTTCGAAGTAAAGTTCGGTGCTTTCGAAAGGAATGTAACTGTG
AGTGTAGATGGCACTACGGTTCCCGAGGAGATTCGCAGTTTCACGGTTGCTAACTTGGAG
GGAGAGGATAATAAGGAGAAGAAGGTGGTGTTGTTGTACGCTTGGGTTAATTACATTGCA
AGTGGGAAGTTCTTGGAAGTCCGTTTAAGCAAATCAGAGAGCTTCGAACATGTTGATCCT
TTGATGTTCACTA

QA 3 615 3 615
DS 

RD RR2ET24JQ 797 0 0
AG
CAGTCTCTGTTCGAAGTAAAGTTCGGTGCTTTCGAAAGGAATGTAACTGTGAGTGTAGAT
GGCACTACGGTTCCCGAGGAGATTCGCAGTTTCACGGTTGCTAACTTGGAGGGAGAGGAT
AATAAGGAGAAGAAGGTGGTGTTGTTGTACGCTTGGGTTAATTACATTGCAAGTGGGAAG
TTCTTGGAAGTCCGTTTAAGCAAATCAGAGAGCTTCGAACATGTTGATCCTTTGATGTTC
ACTAGGATCGACTTGTCGGGAATGTTGAAAGGTGACAATGAGTTCATGGTTGGTGTGAAG
GCGTATGGTGGGAACGTGAATCTCCACTCTTGGAGCTTAGAAGCGAGGAGTGTCTCTAAG
GGTGTGCACTCTTATGGGGCGATTATGGTGGAGAAGCTTATAGAGGAAGAGGAGGCGGAG
AAGAGGAGGAGGAGGAGAAGAGCGAGGGCGTGGGAGATTGTGACTTGCTTTGTGATGACC
TTTGGGTCTACAGGGCTTGTGTTTTTCGCCATGATGCATATATGGGCAGCTTTCAAAAGG
AACAATCTCGTGATGACGAAGGAGTTTGAGTATGAGAAGATGGAGAAAATGGAAGCTGTG
ATGGGTAAAGCTGATAGTGCAAAATGAAAACAAGTGAAGTAATCAAGTGTTGTGATATAT
CTCTGTGTGTTTGTTTAGGATATGATCTTTTTATGTAATCAAGTAGATTCTTCACTGGCT
AAATATAGCCCCCTTGTTTTTCATTTCATGTGTGGCAAACATTGTTTCTCTATGGCATGT
TCAGTTTGTTTCA
TT

QA 3 795 3 795
DS 

RD RR2A502JQ 730 0 0
TACGGTTCCCGAGGATATTCGCAGTTTCACGGTTGCTAACTTGGAGGGAGAGGATAATAA
GGAGAAGAAGGTGGTGTTGTTGTACGCTTGGGTTAATTACATTTCAAGTGGGAAGTTCTT
GGAAGTCCGTTTAAGCAAATCAGAGAGCTTCGAACATGTTGATCCTTTGATGTTCACTAG
GATCGACTTGTCGGGAATGTTGAAAGGTGACAATGAGTTCATGGTTGGTGTGAAGGCGTA
TGGTGGGAACGTGAATCTCCACTCTTGGAGCTTAGAAGCGAGGAGTGTCTCTAAGGGTGT
GCACTCTTATGGGGCGATTATGGTGGAGAAGCTTATAGAGGAAGAGGAGGCGGAGAAGAG
GAGGAGGAGGAGAAGAGCGAGGGCGTGGGAGATTGTGACTTGCTTTGTGATGACCTTTGG
GTCTACAGGGCTTGTGTTTTTCGCCATGATGCATATATGGGCAGCTTTCAAAAGGAACAA
TCTCGTGATGACGAAGGAGTTTGAGTATGAGAAGATGGAGAAAATGGAAGCTGTGATGGG
TAAAGCTGATAGTGCAAAATGAAAACAAGTGAAGTAATCAAGTGTTGTGATATATCTCTG
TGTGTTTGTTTAGGATATGATCTTTTTATGTAATCAAGTAGATTCTTCACTGGCTAAATA
TAGCCCCCTTGTTTTTCATTTCATGTGTGGCAAACATTGTTTCTCTATGGCATGTTCAGT
TTGTTTCAGT

QA 1 730 1 730
DS 



CO CL611Contig2 1334 6 11 U
GGAACGCTTTCGCATTGTCCAAGTGCTTCTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCCCCG
CACCACACACTTTACTCTCCTCCAACACTAGATCTCATCTCCCATTTCAAACCCTAGAAA
AATCAATCAAATTCAATTTAGCCACAGCTTGCTCCACCAATGGCGAGCTTCATTCACCCC
AGCTCACTCCTCCTTCTACTCCTCCCGCCTTTACTCTCACTCTTCTCCACAATCACGATA
TCTGAAGCTAAACCATCCTTTACCTTCGGTAAAAATGGAAGCTTTGAGTCCGAAGACATC
GCTCTGTACGGCGAAGCAAACCTTCTCGACGGCGGATCTTCGATTTCGATTCAGCTGAAT
GACTCAGTGAGTCATAACAGTGGGCGAGTCGTTTACAAGAAGCCCATCGAGTTCGTTGAG
ACTAAGTCCGAGTATCCCGCCGGATTCTCTACTCTCATCTCTTTCTCCGTCGACGGTGGC
GGGAGACTCGGGTTCGTCGTGTTTCCTGTTAACGGAACGTTTGATCAGTCTCTGTTCGAA
GTAAAGTTCGGTGCTTTTGAAAGGAATGTAACCGTGAGTGTAGATGGCACTACGGTTCCT
GAGGAGATTCGCAGTTTCACGATAGCTAACTTGGTGGAGGAAGAGGATAAGGAGAAGAAG
AAGGTGGTGTTGTTGTACGCTTGGGTTAATTACATTGCAGGTGGGAAGTTCTTGGAAGTC
CGGTTAAGCAAATCAGAGAGCTTCGAACATGTTGATCCTTTGATGTTCACTAGGATTGAC
TTGTCAGCAATGTTGAAAGGTAAAGGTGACAATGAGTTCATGGTTGGTGTGAAGGCGTAC
GGTGGGAACGTTGGTCTCCACTCTTGGAGCTTAGAAGCGAGAAGCGTCCCTAAGGGTGTG
CACTCTTATGGGGCGGTTATGGTGGAGAAGCTTATAGAGGAAGAGGAGGCGGAGAAGAGG
AGGAGGATGAGAAGAGCGAGGGCGTGGGAGATTGTGACTTGCTTTGTGATGACCTTTGGG
TCTACAGGGCTTGTGTTCTTCGCCATGATGCATATATGGGCAGCTTTCAAAAGGAACAAT
CTCGTGATGACAAAGGAGTTTGAGTATGAGAAGATGGAGAAAATGGAAGCTGTGATGGGT
AAAGCTGATGGCACAAAATGAAAACAAGTGAAGTAATCAAGTGTTGTGATATCTCTATGT
GTGTTTGTTTAGGATGTTATGATCTTTTATGTAATCAAGTAGATTCTTCACTGGCTAATA
TAGCCCCCTTGTTTTCATTTCATGTGTGAACTTTGCAACATTGTTTCTCTATGGCATGTT
CAGTTTGTTTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2ER49TF U 1
AF RR2E089TF U 12
AF RR2DA21TF U 453
AF RR2DA21JQ C 605
AF RR2ER49JQ C 621
AF RR2E089JQ C 670
BS 1 51 RR2ER49TF
BS 52 53 RR2E089TF
BS 54 181 RR2ER49TF
BS 182 182 RR2E089TF
BS 183 338 RR2ER49TF
BS 339 650 RR2E089TF
BS 651 651 RR2DA21TF
BS 652 660 RR2E089TF
BS 661 1066 RR2DA21TF
BS 1067 1313 RR2DA21JQ
BS 1314 1334 RR2ER49JQ

RD RR2ER49TF 338 0 0
GGAACGCTTTCGCATTGTCCAAGTGCTTCTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCT**GCCCCCG
CACCACACACTTTACTCTCCTCCAACACTAGATCTCATCTCCCATTTCAAACCCTAGAAA
AATCAATCAAATTCAATTTAGCCACAGCTTGCTCCACCAATGGCGAGCTTCATTCACCCC
ATCTCACTCCTCCTTCTACTCCTCCCGCCTTTACTCTCACTCTTCTCCACAATCACGATA
TCTGAAGCTAAACCATCCTTTACCTTCGGTAAAAATGGAAGCTTTGAGTCCGAAGACATC
GCTCTGTACGGCGAAGCAAACCTTCTCGACGGCGGATC

QA 1 338 1 338
DS 

RD RR2E089TF 649 0 0
GG
ATTGTCCAAGTGCTTCTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCCCCGCACCACACACTTT
ACTCTCCTCCAACACTAGATCTCATCTCCCATTTCAAACCCTAGAAAAATCAATCAAATT
CAATTTAGCCACAGCTTGCTCCACCAATGGCGAGCTTCATTCTCCCCAGCTCACTCCTCC
TTCTACTCCTCCCGCCTTTACTCTCACTCTTCTCCACAATCACGATATCTGAAGCTAAAC
CATCCTTTACCTTCGGTAAAAATGGAAGCTTTGAGTCCGAAGACATCGCTCTGTACGGCG
AAGCAAACCTTCTCGACGGCGGATCTTCGATTTCGATTCAGCTGAATGACTCAGTGAGTC
ATAACAGTGGGCGAGTCGTTTACAAGAAGCCCATCGAGTTCGTTGAGACTAAGTCCGAGT
ATCCCGCCGGATTCTCTACTCTCATCTCTTTCTCCGTCGACGGTGGCGGGAGACTCGGGT
TCGTCGTGTTTCCTGTTAACGGAACGTTTGATCAGTCTCTGTTCGAAGTAAAGTTCGGTG
CTTTTGAAAGGAATGTAACCGTGAGTGTAGATGGCACTACGGTTCCTGAGGAGATTCGCA
GTTTCACGATAGCTAACTTGGTGGAGGAAGAGGATAAAGAGAAGAAG

QA 3 649 3 649
DS 

RD RR2DA21TF 614 0 0
TCTCATCT
CTTTCTCCGTCGACGGTGGCGGGAGACTCGGGTTCGTCGTGTTTCCTGTTAACGGAACGT
TTGATCAGTCTCTGTTCGAAGTAAAGTTCGGTGCTTTTGAAAGGAATGTAACCGTGAGTG
TAGATGGCACTACGGTTCCTGAGGAGATTCGCAGTTTCACGATAGCTAACTTGGTGGAGG
AAGAGGATAAGGAGAAGAAGAAGGTGGTGTTGTTGTACGCTTGGGTTAATTACATTGCAG
GTGGGAAGTTCTTGGAAGTCCGGTTAAGCAAATCAGAGAGCTTCGAACATGTTGATCCTT
TGATGTTCACTAGGATTGACTTGTCAGCAATGTTGAAAGGTAAAGGTGACAATGAGTTCA
TGGTTGGTGTGAAGGCGTACGGTGGGAACGTTGGTCTCCACTCTTGGAGCTTAGAAGCGA
GAAGCGTCCCTAAGGGTGTGCACTCTTATGGGGCGGTTATGGTGGAGAAGCTTATAGAGG
AAGAGGAGGCGGAGAAGAGGAGGAGGATGAGAAGAGCGAGGGCGTGGGAGATTGTGACTT
GCTTTGTGATGACCTTTGGGTCTACAGGGCTTGTGTTCTTCGCCATGATGCATATATGGG
CAGCTT

QA 9 614 9 614
DS 

RD RR2DA21JQ 711 0 0
AGATTCGCAGTTTCACGATAGCTAACTTGGTGGAGGAAGAGGATAAGGAGAAGAAGAAGG
TGGTGTTGTTGTACGCTTGGGTTAATTACATTGCAGGTGGGAAGTTCTTGGAAGTCCGGT
TAAGCAAATCAGAGAGCTTCGAACATGTTGATCCTTTGATGTTCACTAGGATTGACTTGT
CAGCAATGTTGAAAGGTAAAGGTGACAATGAGTTCATGGTTGGTGTGAAGGCGTACGGTG
GGAACGTTGGTCTCCACTCTTGGAGCTTAGAAGCGAGAAGCGTCCCTAAGGGTGTGCACT
CTTATGGGGCGGTTATGGTGGAGAAGCTTATAGAGGAAGAGGAGGCGGAGAAGAGGAGGA
GGATGAGAAGAGCGAGGGCGTGGGAGATTGTGACTTGCTTTGTGATGCCCTTTGGGTCTA
CAGGGCTTGTGTTTTTCGCCATGATGCATATATGGGCAGCTTTCAAAAGGAACAATCTCG
TGATGACAAAGGAGTTTGAGTATGAGAAGATGGAGAAAATGGAAGCTGTGATGGGTAAAG
CTGATGGCACAAAATGAAAACAAGTGAAGTAATCAAGTGTTGTGATATCTCTATGTGTGT
TTGTTTAGGATGTTATGATCTTTTATGTAATCAAGTAGATTCTTCACTGGCTAATATAGC
CCCCTTGTTTTCATTTCATGTGTGAACTTTGCAACATTGTTTCTCTATG
AC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2ER49JQ 714 0 0
GATAGCTAACTTGG
TGGAGGAAGAGGATAAGGAGAAGAAGAAGGTGGTGTTGTTGTACGCTTGGGTTAATTACA
TTGCAGGTGGGAAGTTCTTGGAAGTCCGGTTAAGCAAATCAGAGAGCTTCGAACATGTTG
ATCCTTTGATGTTCACTAGGATTGACTTGTCAGCAATGTTGAAAGGTAAAGGTGACAATG
AGTTCATGGTTGGTGTGAAGGCGTACGGTGGGAACGTTGGTCTCCACTCTTGGAGCTTAG
AAGCGAGAAGCGTCCCTAAGGGTGTGCACTCTTATGGGGCGGTTATGGTGGAGAAGCTTA
TAGAGGAAGAGGAGGCGGAGAAGAGGAGGAGGATGAGAAGAGCGAGGGCGTGGGAGATTG
TGACTTGCTTTGTGATGACCTTTGGGTCTACAGGGCTTGTGTTTTTCGCCATGATGCATA
TATGGGCAGCTTTCAAAAGGAACAATCTCGTGATGGCAAAGGAGTTTGAGTATGAGAAGA
TGGAGAAAATGGAAGCTGTGATGGGTAAAGCTGATGGCACAAAATGAAAACAAGTGAAGT
AATCAAGTGTTGTGATATCTCTATGTGTGTTTGTTTAGGATGTTATGATCTTTTATGTAA
TCAAGTAGATTCTTCACTGGCTAATATAGCCCCCTTGTTTTCATTTCATGTGTGAACTTT
GTAACATTGTTTCTATATGGCATGTTCAGTTTGTTTCAGC

QA 15 714 15 714
DS 

RD RR2E089JQ 664 0 0
TTGTTGTACGCTTGGGTTAATTACATTGCAGGTGGGAAGTTCTTGGAAGTCCGGTTAAGC
AAATCAGAGAGCTTCGAACATGTTGATCCTTTGATGTTCACTAGGATTGACTTGTCAGCA
ATGTTGAAAGGTAAAGGTGACAATGAGTTCATGGTTGGTGTGAAGGCGTACGGTGGGAAC
GTTGGTCTCCACTCCTGGAGCTTAGAAGCGAGAAGCGTCCCTAAGGGTGTGCACTCTTAT
GGGGCGGTTATGGTGGAGAAGCTTATAGAGGAAGAGGAGGCGGAGAAGAGGAGGAGGATG
AGAAGAGCGAGGGCGTGGGAGATTGTGACTTGCTTTGTGATGACCTTTGGGTCTACAGGG
CTTGTGTTCTTCGCCATGATGCATATATGGGCAGCTTTCAAAAGGAACAATCTCGTGATG
ACAAAGGAGTTTGAGTATGAGAAGATGGAGAAAATGGAAGCTGTGATGGGTAAAGCTGAT
GGCACAAAATGAAAACAAGTGAAGTAATCAAGTGTTGTGATATCTCTATGTGTGTTTGTT
TAGGATGTTATGATCTTTTATGTAATCAAGTAGATTCTTCACTGGCTAATATAGCCCCCT
TGTTTTCATTTCATGTGTGAACTTTGCAACATTGTTTCTCTATGGCATGTTCAGTTTGTT
TCA
T

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 10

CO CL612Contig1 863 10 9 U
GGGAAGAGAAGAGAAGACTGGTAGAGTCGCAAGGTTATTCTGAAAGGAAGAGAGAGAAAG
CTCCAATCCCTTACTAGAAAAAGTATCGAAATACAGAGACCGTTCGGTGGCCGGTGGCCT
ACGCCGCCGGTTACCATCACTGATCTTATTTGATTTCTGTTTTTGTTGGGTTTGTTATCC
CGGTTGATTTCCACTCCGGCATCGTTGGTTCCTCGGAACTGCATGTCCGGTTTCTAGTTC
CAGTATCGCACCTACCGATGGTGGAAGACTGGCTTTTGACTCTGGGGCCGTGCCGTTCTT
CTTTGGCGGTGGTCGCCGGCTATCATGGTTTCCTCGTGAGTGCTCGAGCGGTGTGACAGT
TTCGTTTCGTGTTTGGTGGCTTGTTGTTTGGATGAGATCGTGATTTATTCGATGGACGCT
CTCCAAAATACAGGCGTATGAGTTGAAACTGCTGAATCCTTAATCCTCTAATACAGTTGT
TAGAGGTGGACTCGGTGGTCATGGTCAAGTTCCCGGTAGGTTCTGGTGGTCAGGTGCTTT
GGTGATGAAGGTAGAGGCTCGTGTTTCCGATGATTCCCTGTTTCCGGTGGACCCGGCGGA
GTGACGCGTACAGGTCCCGGCGGTGATTTCAAATCGGTAGTGACGATGACGTGTCCCATC
CTTTGCCACACGTCTTTTGCGTCTCTTGCGTATCAGGTGGAGGTGGAGGCGTAACAGGTG
GAGAGTGATGGGATTAGGTCATATCTTTTTGGGCTTTGCTGGTGGGCCTCTGTTTGTTTA
TGTTATATGGGCTATGTTCCATCGGTTTGTATGTTTCAAGTTTTCTCTTTTGGGTTTTTA
GGCCCTTAATAAAATAAGATGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 

AF RR2E625TF U 1
AF RR2EL28TF U 6
AF RR2AV76TF U 41
AF RR2GX69TF U 7
AF RR2EG93TF U 3
AF RR2AV76JQ C 123
AF RR2GX69JQ C 166
AF RR2E625JQ C 160
AF RR2EG93JQ C 160
AF RR2EL28JQ C 124
BS 1 277 RR2E625TF
BS 278 278 RR2EG93TF
BS 279 545 RR2E625TF
BS 546 695 RR2EG93TF
BS 696 696 RR2GX69TF
BS 697 717 RR2EG93TF
BS 718 718 RR2AV76JQ
BS 719 733 RR2EG93TF
BS 734 863 RR2AV76JQ

RD RR2E625TF 545 0 0
GGGAAGAGAAGAGAAGACTGGTAGAGTCGCAAGGTTATTCTGAAAGGAAGAGAGAGAAAG
CTCCAATCCCTTACTAGAAAAAGTATCGAAATACAGAGACCGTTCGGTGGCCGGTGGCCT
ACGCCGCCGGTTACCATCACTGATCTTATTTGATTTCTGTTTTTGTTGGGTTTGTTATCC
CGGTTGATTTCCACTCCGGCATCGTTGGTTCCTCGGAACTGCATGTCCGGTTTCTAGTTC
CAGTATCGCACCTACCGATGGTGGAAGACTGGCTTTTTACTCTGGGGCCGTGCCGTTCTT
CTTTGGCGGTGGTCGCCGGCTATCATGGTTTCCTCGTGAGTGCTCGAGCGGTGTGACAGT
TTCGTTTCGTGTTTGGTGGCTTGTTGTTTGGATGAGATCGTGATTTATTCGATGGACGCT
CTCCAAAATACAGGCGTATGAGTTGAAACTGCTGAATCCTTAATCCTCTAATACAGTTGT
TAGAGGTGGACTCGGTGGTCATGGTCAAGTTCCCGGTAGGTTCTGGTGGTCAGGTGCTTT
GGTGA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2EL28TF 700 0 0
GG
GAAGAGAAGACTGGTAGAGTCGCAAGGTTATTCTGAAAGGAAGAGAGAGAAAGCTCCAAT
CCCTTACTAGAAAAAGTATCGAAATACAGAGACCGTTCGGTGGCCGGTGGCCTACGCCGC
CGGTTACCATCACTGATCTTATTTGATTTCTGTTTTTGTTGGGTTTGTTATCCCGGTTGA
TTTCCACTCCGGCATCGTTGGTTCCTCGGAACTGCATGTCCGGTTTCTAGTTCCAGTATC
GCACCTACCGATGGTGGAAGACTGGCTTTTGACTCTGGGGCCGTGCCGTTCTTCTTTGGC
GGTGGTCGCCGGCTATCATGGTTTCCTCGTGAGTGCTCGAGCGGTGTGACAGTTTCGTTT
CGTGTTTGGTGGCTTGTTGTTTGGATGAGATCGTGATTTATTCGATGGACGCTCTCCAAA
ATACAGGCGTATGAGTTGAAACTGCTGAATCCTTAATCCTCTAATACAGTTGTTAGAGGT
GGACTCGGTGGTCATGGTCAAGTTCCCGGTAGGTTCTGGTGGTCAGGTGCTTTGGTGATG
AAGGTAGAGGCTCGTGTTTCCGATGATTCCCTGTTTCCGGTGGACCCGGCGGAGTGACGC
GTACAGGTCCCGGCGGTGATTTCAAATCGGTAGTGACGATGACGTGTCCCATCCTTTGCC
ACACGTCTTTTGCGTCTCTTGCGTATCATGTGGAGGTG

QA 3 700 3 700
DS 

RD RR2AV76TF 654 0 0
G
GAAAGGAAGAGAGAGAAAGCTCCAATCCCTTACTAGAAAAAGTATCGAAATACAGAGACC
GTTCGGTGGCCGGTGGCCTACGCCGCCGGTTACCATCACTGATCTTATTTGATTTCTGTT
TTTGTTGGGTTTGTTATCCCGGTTGATTTCCACTCCGGCATCGTTGGTTCCTCGGAACTG
CATGTCCGGTTTCTAGTTCCAGTATCGCACCTACCGATGGTGGAAGACTGGCTTTTGACT
CTGGGGCCGTGCCGTTCTTCTTTGGCGGTGGTCGCCGGCTATCATGGTTTCCTCGTGAGT
GCTCGAGCGGTGTGACAGTTTCGTTTCGTGTTTGGTGGCTTGTTGTTTGGATGAGATCGT
GATTTATTCGATGGACGCTCTCCAAAATACAGGCGTATGAGTTGAAACTGCTGAATCCTT
AATCCTCTAATACAGTTGTTAGAGGTGGACTCGGTGGTCATGGTCAAGTTCCCGGTAGGT
TCTGGTGGTCAGGTGCTTTGGTGATGAAGGTAGAGGCTCGTGTTTCCGATGATTCCCTGT
TTCCGGTGGACCCGGCGGAGTGACGCGTACAGGTCCCGGCGGTGATTTCAAATCGGTAGT
GACGATGACGTGTCCCATCCTTTGCCACACGTCTTTTGCGTCTCTTGCGTATC

QA 2 654 2 654
DS 

RD RR2GX69TF 706 0 0
G
GAAGAGAAGACTGGTAGAGTCGCAAGGTTATTCTGAAAGGAAGAGAGAGAAAGCTCCAAT
CCCTTACTAGAAAAAGTATCGAAATACAGAGACCGTTCGGTGGCCGGTGGCCTACGCCGC
CGGTTACCATCACTGATCTTATTTGATTTCTGTTTTTGTTGGGTTTGTTATCCCGGTTGA
TTTCCACTCCGGCATCGTTGGTTCCTCGGAACTGCATGTCCGGTTTCTAGTTCCAGTATC
GCACCTACCGATGGTGGAAGACTGGCTTTTGACTCTGGGGCCGTGCCGTTCTTCTTTGGC
GGTGGTCGCCGGCTATCATGGTTTCCTCGTGAGTGCTCGAGCGGTGTGACAGTTTCGTTT
CGTGTTTGGTGGCTTGTTGTTTGGATGAGATCGTGATTTATTCGATGGACGCTCTCCAAA
ATACAGGCGTATGAGTTGAAACTGCTGAATCCTTAATCCTCTAATACAGTTGTTAGAGGT
GGACTCGGTGGTCATGGTCAAGTTCCCGGTAGGTTCTGGTGGTCAGGTGCTTTGGTGATG
AAGGTAGAGGCTCGTGTTTCCGATGATTCCCTGTTTCCGGTGGACCCGGCGGAGTGACGC
GTACAGGTCCCGGCGGTGATTTCAAATCGGTAGTGACGATGACGTGTCCCATCCTTTGCC
ACACGTCTTTTGCGTCTCTTGCGTATCAG
TGGAGTGGAGGCGTAA

QA 2 690 2 690
DS 

RD RR2EG93TF 731 0 0
GGAGA
GAAGAGAAGACTGGTAGAGTCGCAAGGTTATTCTGAAAGGAAGAGAGAGAAAGCTCCAAT
CCCTTACTAGAAAAAGTATCGAAATACAGAGACCGTTCGGTGGCCGGTGGCCTACGCCGC
CGGTTACCATCACTGATCTTATTTGATTTCTGTTTTTGTTGGGTTTGTTATCCCGGTTGA
TTTCCACTCCGGCATCGTTGGTTCCTCGGAACTGCATGTCCGGCTTCTAGTTCCAGTATC
GCACCTACCGATGGTGGAAGACTGGCTTTTGACTCTGGGGCCGTGCCGTTCTTCTTTGGC
GGTGGTCGCCGGCTATCATGGTTTCCTCGTGAGTGCTCGAGCGGTGTGACAGTTTCGTTT
CGTGTTTGGTGGCTTGTTGTTTGGATGAGATCGTGATTTATTCGATGGACGCTCTCCAAA
ATACAGGCGTATGAGTTGAAACTGCTGAATCCTTAATCCTCTAATACAGTTGTTAGAGGT
GGACTCGGTGGTCATGGTCAAGTTCCCGGTAGGTTCTGGTGGTCAGGTGCTTTGGTGATG
AAGGTAGAGGCTCGTGTTTCCGATGATTCCCTGTTTCCGGTGGACCCGGCGGAGTGACGC
GTACAGGTCCCGGCGGTGATTTCAAATCGGTAGTGACGATGACGTGTCCCATCCTTTGCC
ACACGTCTTTTGCGTCTCTTGCGTATCA*GTGGAGGTGGAGGCGTAACAG*TGGAGAGTG
ATGGGA

QA 6 731 6 731
DS 

RD RR2AV76JQ 741 0 0
GCCGCCGGTTACCATCACTGATCTTATTTGATTTCTGTTTTTGTTGGGTTTGTTATCCCG
GTTGATTTCCACTCCGGCATCGTTGGTTCCTCGGAACTGCATGTCCGGTTTCTAGTTCCA
GTATCGCACCTACCGATGGTGGAAGACTGGCTTTTGACTCTGGGGCCGTGCCGTTCTTCT
TTGGCGGTGGTCGCCGGCTATCATGGTTTCCTCGTGAGTGCTCGAGCGGTGTGACAGTTT
CGTTTCGTGTTTGGTGGCTTGTTGTTTGGATGAGATCGTGATTTATTCGATGGACGCTCT
CCAAAATACAGGCGTATGAGTTGAAACTGCTGAATCCTTAATCCTCTAATACAGTTGTTA
GAGGTGGACTCGGTGGTCATGGTCAAGTTCCCGGTAGGTTCTGGTGGTCAGGTGCTTTGG
TGATGAAGGTAGAGGCTCGTGTTTCCGATGATTCCCTGTTTCCGGTGGACCCGGCGGAGT
GACGCGTACAGGTCCCGGCGGTGATTTCAAATCGGTAGTGACGATGACGTGTCCCATCCT
TTGCCACACGTCTTTTGCGTCTCTTGCGTATCAGGTGGAGGTGGAGGCGTAACAGGTGGA
GAGTGATGGGATTAGGTCATATCTTTTTGGGCTTTGCTGGTGGGCCTCTGTTTGTTTATG
TTATATGGGCTATGTTCCATCGGTTTGTATGTTTCAAGTTTTCTCTTTTGGGTTTTTAGG
CCCTTAATAAAATAAGATGGC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2GX69JQ 698 0 0
TTGGGTTTGTTATCCCGGTTGATTTCCACTCCGGCATCGTTGGTTCCTCGGAACTGCATG
TCCGGTTTCTAGTTCCAGTATCGCACCTACCGATGGTGGAAGACTGGCTTTTGACTCTGG
GGCCGTGCCGTTCTTCTTTGGCGGTGGTCGCCGGCTATCATGGTTTCCTCGTGAGTGCTC
GAGCGGTGTGACAGTTTCGTTTCGTGTTTGGTGGCTTGTTGTTTGGATGAGATCGTGATT
TATTCGATGGACGCTCTCCAAAATACAGGCGTATGAGTTGAAACTGCTGAATCCTTAATC
CTCTAATACAGTTGTTAGAGGTGGACTCGGTGGTCATGGTCAAGTTCCCGGTAGGTTCTG
GTGGTCAGGTGCTTTGGTGATGAAGGTAGAGGCTCGTGTTTCCGATGATTCCCTGTTTCC
GGTGGACCCGGCGGAGTGACGCGTACAGGTCCCGGCGGTGATTTCAAATCGGTAGTGACG
ATGACGTGTCCCATCCTTTGCCACACGTCTTTTGCGTTTCTTGCGTATCAGGTGGAGGTG
GAGGCGTAACAGGTGGAGAGTGATAGGATTAGGTCATATCTTTTTGGGCTTTGCTGGTGG
GCCTCTGTTTGTTTATGTTATATGGGCTATGTTCCATCGGTTTGTATGTTTCAAGTTTTC
TCTTTTGGGTTTTTAGGCCCTTAATAAAATAAGATGGC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2E625JQ 699 0 0
TTTTTGTTGGGTTTGTTATCCCGGTTGATTTCCACTCCGGCATCGTTGGTTCCTCGGAAC
TGCATGTCCGGTTTCTAGTTCCAGTATCGCACCTACCGATGGTGGAAGACTGGCTTTTTA
CTCTGGGGCCGTGCCGTTCTTCTTTGGCGGTGGTCGCCGGCTATCATGGTTTCCTCGTGA
GTGCTCGAGCGGTGTGACAGTTTCGTTTCGTGTTTGGTGGCTTGTTGTTTGGATGAGATC
GTGATTTATTCGATGGACGCTCTCCAAAATACAGGCGTATGAGTTGAAACTGCTGAATCC
TTAATCCTCTAATACAGTTGTTAGAGGTGGACTCGGTGGTCATGGTCAAGTTCCCGGTAG
GTTCTGGTGGTCAGGTGCTTTGGTGATGAAGGTAGAGGCTCGTGTTTCCGATGATTCCCT
GTTTCCGGTGGACCCGGCGGAGTGACGCGTACAGGTCCCGGCGGTGATTTCAAATCGGTA
GTGACGATGACGTGTCCCATCCTTTGCCACACGTCTTTTGCGTCTCTTGCGTATCAGGTG
GAGGTGGAGGCGTAACAGGTGGAGAGTGATGGGATTAGGTCATATCTTTTTGGGCTTTGC
TGGTGGGCCTCTGTTTGTTTATGTTATATGGGCTATGTTCCATCGGTTTGTATGTTTCAA
GTTTTCTCTTTTGGGTTTTTAGGCCCTTAATAAAATAAG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2EG93JQ 704 0 0
TTTTTGTTGGGTTTGTTATCCCGGTTGATTTCCACTCCGGCATCGTTGGTTCCTCGGAAC
TGCATGTCCGGCTTCTAGTTCCAGTATCGCACCTACCGATGGTGGAAGACTGGCTTTTGA
CTCTGGGGCCGTGCCGTTCTTCTTTGGCGGTGGTCGCCGGCTATCATGGTTTCCTCGTGA
GTGCTCGAGCGGTGTGACAGTTTCGTTTCGTGTTTGGTGGCTTGTTGTTTGGATGAGATC
GTGATTTATTCGATGGACGCTCTCCAAAATACAGGCGTATGAGTTGAAACTGCTGAATCC
TTAATCCTCTAATACAGTTGTTAGAGGTGGACTCGGTGGTCATGGTCAAGTTCCCGGTAG
GTTCTGGTGGTCAGGTGCTTTGGTGATGAAGGTAGAGGCTCGTGTTTCCGATGATTCCCT
GTTTCCGGTGGACCCGGCGGAGTGACGCGTACAGGTCCCGGCGGTGATTTCAAATCGGTA
GTGACGATGACGTGTCCCATCCTTTGCCACACGTCTTTTGCGTCTCTTGCGTATCAGGTG
GAGGTGGAGGCGTAACAGGTGGAGAGTGATGGGATTAGGTCATATCTTTTTGGGCTTTGC
TGGTGGACCTCTGTTTGTTTATGTTATATGGGCTATGTTCCATCGGTTTGTATGTTTCAA
GTTTTCTCTTTTGGGTTTTTAGGCCCTTAATAAAATAAGATGGC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2EL28JQ 740 0 0
CCC
CCGGTTACCATCACTGATCTTATTTGATTTCTGTTTTTGTTGGGTTTGTTATCCCGGTTG
ATTTCCACTCCGGCATCGTTGGTTCCTCGGAACTGCATGTCCGGTTTCTAGTTCCAGTAT
CGCACCTACCGATGGTGGAAGACTGGCTTTTGACTCTGGGGCCGTGCCGTTCTTCTTTGG
CGGTGGTCGCCGGCTATCATGGTTTCCTCGTGAGTGCTCGAGCGGTGTGACAGTTTCGTT
TCGTGTTTGGTGGCTTGTTGTTTGGATGAGATCGTGATTTATTCGATGGACGCTCTCCAA
AATACAGGCGTATGAGTTGAAACTGCTGAATCCTTAATCCTCTAATACAGTTGTTAGAGG
TGGACTCGGTGGTCATGGTCAAGTTCCCGGTAGGTTCTGGTGGTCAGGTGCTTTGGTGAT
GAAGGTAGAGGCTCGTGTTTCCGATGATTCCCTGTTTCCGGTGGACCCGGCGGAGTGACG
CGTACAGGTCCCGGCGGTGATTTCAAATCGGTAGTGACGATGACGTGTCCCATCCTTTGC
CACACGTCTTTTGCGTCTCTTGCGTATCAGGTGGAGGTGGAGGCGTAACAGGTGGAGAGT
GATGGGATTAGGTCATATCTTTTTGGGCTTTGCTGGTGGGCCTCTGTTTGTTTATGTTAT
ATGGGCTATGTTCCATCGGTTTGTATGTTTCAAGTTTTCTCTTTTGGGTTTTTAGGCCCT
TAATAAAATAAGATGGC

QA 4 740 4 740
DS 



AS 1 9

CO CL613Contig1 1091 9 10 U
GTCGCAATGAATTTTCAAATTCGCAAATGATACCTAGAAATTTATTATTCCATCACAAGA
TTATTCGAGTTAACCACAAATCGGACTCAGTGAAACAGGAACAGGTCATGAGTACTGACT
GAGTTTTAACATCGGGACACACATAAGACAAGACAGGTGGGATAATGTTAAAGGTGACCG
ACGATATATAACATAAAGAGAGACAAAAGTAGGATTGCAGTGCACACCAGTTGAGAATAG
GCTTTCTACTTCCAAGCCTTCTTACGGTTGGCCTTCTTCTTCTTCATCTTGTAACGGCTC
GTCTTCTTGGGGTTGGCAACCCGAGCTGGGATCATGAAGCCACGTGGGAAAGCATCATCG
ACAGGAATGGGGCTGTTTCCCACGGGTTTTAAAGCAGGCACAACAACTAGTTTGAATCCT
CCTCCCATGTCACTCCCATTAAGTTCCAGGGCCTTCTCTTCTGCACCTTCTCCCAGAATA
GAAATGATGGCTTGGTGATCTTGACTGGGATGATGTTCTACGGGGAATAACTGAAAATCA
ACAATCTCTCCGCATGAAGAGAAACGGTTGGTCAAGAAGGTCTTGATATCAGCAGCAGGA
AGCGAAGTGTCATATCCTCTAACGATAATCATTTTGCCATCACAAACTCGTTCTGCCTCG
GCCAACCTAGCAGTCATTTCAGGAGTGAGTTTAAGGAACACCTCGTGAGTTGAAGTAGCA
ACTATTTTGCGTCCTTCCATCTCACTTCCACTAAGTTGCAGTGCCTTCTCTTCTGCGCCG
TCTCCCAAAATATATATATAGCCAGATCTGTTGGGAGCACCGTCTATAGCGAAATAGGGG
ATAGAAACACACACAACCTCTCCACATGAAGAGAAGTGTTTAGTTAACTGGCTCTTGACA
ACATCCACATGAAGGGAAGTGTCATATCCCTTAACTAAAATCCTAACGCTCCGGCTTCTT
CGATCTCTCATAGCTTCCAAATCACTACCCAATTCCATCCCTTTGATTGCGGATTCGTCC
TTGGACACCTTGATGGTTCGATGGCTTAGGTTTTCGAGATTTTTTTCAGGTTTTAGGGAT
TCGGTGCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 50 50 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2CR27JQ U 29
AF RR2BP10JQ U 1
AF RR2DF08JQ U 23
AF RR2EW57JQ U 22
AF RR2FY46JQ U 29
AF RR2BP10TF C 459
AF RR2CR27TF C 345
AF RR2DF08TF C 457
AF RR2FY46TF C 470
BS 1 161 RR2BP10JQ
BS 162 162 RR2EW57JQ
BS 163 245 RR2BP10JQ
BS 246 246 RR2EW57JQ
BS 247 678 RR2BP10JQ
BS 679 788 RR2EW57JQ
BS 789 969 RR2CR27TF
BS 970 970 RR2DF08TF
BS 971 1087 RR2CR27TF
BS 1088 1091 RR2DF08TF

RD RR2CR27JQ 529 0 0
GG
TACCTAGAAATTTATTATTCCATCACAAGATTATTCGAGTTAACCACAAATCGGACTCAG
TGAAACGGGAACAGGTCATGAGTACTGACTGAGTTTTAACATCGGGACACACATAAAACA
AGACAGGTGGGATAATGTTAAAGGTGACCGACGATATATAACATAAAGAGAGACAAAAGT
AGGATTGCAGTGCACACCAGTTGAGAATAGGCTTTCTACTTCCAAGCCTTCTTACGGTTG
GCCTTCTTCTTCTTCATCTTGTAACGGCTCGTCTTCTTGGGGTTGGCAACCCGAGCTGGG
CTCATGAAGCCACGTGGGAAAGCATCATCGACAGGAATGGGGCTGTTTCCCACGGGTTTT
AAAGCAGGCACAACAACTAGTTTGAATCCTCCTCCCATGTCACTCCCATTAAGTTCCAGG
GCCTTCTCTTCTGCACCTTCTCCCAAAATAAAAATGATGGCTTGGTGATCTTGACTGGGA
TGATGTTCTACGGGGAATAACTGAAAATCAACAATCTCTCCCCATGA

QA 3 529 3 529
DS 

RD RR2BP10JQ 678 0 0
GTCGCAATGAATTTTCAAATTCGCAAATGATACCTAGAAATTTATTATTCCATCACAAGA
TTATTCGAGTTAACCACAAATCGGACTCAGTGAAACAGGAACAGGTCATGAGTACTGACT
GAGTTTTAACATCGGGACACACATAAGACAAGACAGGTGGGGTAATGTTAAAGGTGACCG
ACGATATATAACATAAAGAGAGACAAAAGTAGGATTGCAGTGCACACCAGTTGAGAATAG
GCTTT*TACTTCCAAGCCTTCTTACGGTTGGCCTTCTTCTTCTTCATCTTGTAACGGCTC
GTCTTCTTGGGGTTGGCAACCCGAGCTGGGATCATGAAGCCACGTGGGAAAGCATCATCG
ACAGGAATGGGGCTGTTTCCCACGGGTTTTAAAGCAGGCACAACAACTAGTTTGAATCCT
CCTCCCATGTCACTCCCATTAAGTTCCAGGGCCTTCTCTTCTGCACCTTCTCCCAGAATA
GAAATGATGGCTTGGTGATCTTGACTGGGATGATGTTCTACGGGGAATAACTGAAAATCA
ACAATCTCTCCGCATGAAGAGAAACGGTTGGTCAAGAAGGTCTTGATATCAGCAGCAGGA
AGCGAAGTGTCATATCCTCTAACGATAATCATTTTGCCATCACAAACTCGTTCTGCCTCG
GCCAACCTAGCAGTCATT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2DF08JQ 656 0 0
GCAAATGA
TACCTAGAAATTTATTATTCCATCACAAGATTATTCGAGTTAACCACAAATCGGACTCAG
TGAAACAGGAACAGGTCATGAGTACTGACTGAGTTTTAACATCGGGACACACATAAGACA
AGACAGGTGGGATAATGTTAAAGGTGACCGACGATATATAACATAAAGAGAGACAAAAGT
AGGATTGCAGTGCACACCAGTTGAGAATAGGCTTTCTACTTCCAAGCCTTCTTACGGTTG
GCCTTCTTCTTCTTCATCTTGTAACGGCTCGTCTTCTTGGGGTTGGCAACCCGAGCTGGG
ATCATGAAGCCACGTGGGAAAGCATCATCGACAGGAATGGGGCTGTTTCCCACGGGTTTT
AAAGCAGGCACAACAACTAGTTTGAATCCTCCTCCCATGTCACTCCCATTAAGTTCCAGG
GCCTTCTCTTCTGCACCTTCTCCCAGAATAGAAATGATGGCTTGGTGATCTTGACTGGGA
TGATGTTCTACGGGGAATAACTGAGAATCAACAATCTCTCCGCATGAAGAGAAACGGTTG
GTCAAGAAGGTCTTGATATCAGCAGCAGGAAGCGAAGTGTCATATCCTCTAACGATAATC
ATTTTGCCATCACAAACTCGTTCTGCCTCGGCCGACCTAGCAGTCATT

QA 9 656 9 656
DS 

RD RR2EW57JQ 767 0 0
CGCAAATGA
TACCTAGAAATTTATTATTCCATCACAAGATTATTCGAGTTAACCACAAATCGGACTCAG
TGAAACAGGAACAGGTCATGAGTACTGACTGAGTTTTAACATCGGGACACACATAAGACA
AGACAGGTGGGATAATGTTAAAGGTGACCGACGATATATAACATAAAGAGAGACAAAAGT
AGGATTGCAGTGCACACCAGTTGAGAATAGGCTTTCTACTTCCAAGCCTTCTTACGGTTG
GCCTTCTTCTTCTCCATCTTGTAACGGCTCGTCTTCTTGGGGTTGGCAACCCGAGCTGGG
ATCATGAAGCCACGTGGGAAAGCATCATCGACAGGAATGGGGCTGTTTCCCACGGGTTTT
AAAGCAGGCACAACAACTAGTTTGAATCCTCCTCCCATGTCACTCCCATTAAGTTCCAGG
GCCTTCTCTTCTGCACCTTCTCCCAGAATAGAAATGATGGCTTGGTGATCTTGACTGGGA
TGATGTTCTACGGGGAATAACTGAAAATCAACAATCTCTCCGCATGAAGAGAAACGGTTG
GTCAAGAAGGTCTTGATATCAGCAGCAGGAAGCGAAGTGTCATATCCTCTAACGATAATC
ATTTTGCCATCACAAACTCGTTCTGCCTCGGCCAACCTAGCAGTCATTTCAGGAGTGAGT
TTAAGGAACACCTCGTGAGTTGAAGTAGCAACTATTTTGCGTCCTTCCATCTCACTTCCA
CTAAGTTGCAGTGCCTTCTCTTCTGCGCCGTCTCCCAA

QA 10 767 10 767
DS 

RD RR2FY46JQ 757 0 0
GG
TACCTAGAAATTTATTATTCCATCACAAGATTATTCGAGTTAACCACAAATCGGACTCAG
TGAAACAGGAACAGGTCATGAGTACTGACTGAGTTTTAACATCGGGACACACATAAGACA
AGACAGGTGGGATAATGTTAAAGGTGACCGACGATATATAACATAAAGAGAGACAAAAGT
AGGATTGCAGTGCACACCAGTTGAGAATAGGCTTTCTACTTCCAAGCCTTCTTACGGTTG
GCCTTCTTCTTCTTCATCTTGTAACGGCTCGTCTTCTTGGGGTTGGCAACCCGAGCTGGG
ATCATGAAGCCACGTGGGAAAGCATCATCGACAGGAATGGGGCTGTTTCCCACGGGTTTT
AAAGCAGGCACAACAACTAGTTTGAATCCTCCTCCCATGTCACTCCCATTAAGTTCCAGG
GCCTTCTCTTCTGCACCTTCTCCCAGAATAAAAATGATGGCTTGGTGATCTTGACTGGGA
TGATGTTCTACGGGGAATAACTGAAAATCAACAATCTCTCCGCATGAAGAGAAACGGTTG
GTCAAGAAGGTCTTGATATCAGCAGCAGGAAGCGAAGTGTCATATCCTCTAACGATAATC
ATTCTGCCATCACAAACTCGTTCTGCCTCGGCCAACCTAGCAGTCATTTCAGGAGTGAGT
TTAAGGAACACCTCGTGAGTTGAAGTAGCAACTATTTTGCGTCCTTCCATCTCACTTCCA
CTAAGTTGCAGTGCCTTCTCTTCTGCGCCGTCTCC

QA 3 757 3 757
DS 

RD RR2BP10TF 333 0 0
CTTCTGCA
CTTCTCCCAGAATAGAAATGATGGCTTGGTGATCTTGACTGGGATGATGTTCTACGGGGA
ATAACTGAAAATCAACAATCTCTCCGCATGAAGAGAAACGGTTGGTCAAGAAGGTCTTGA
TATCAGCAGCAGGAAGCGAAGTGTCATATCCTCTAACGATAATCATTTTGCCATCACAAA
CTCGTTCTGCCTCGGCCAACCTAGCAGTCATTTCAGGAGTGAGTCTAAGGAACACCTCGT
GAGTTGAAGTAGCAACTATTTTGCGTCCTTCCATCTCACTTCCACTAAGTTGCAGTGCCT
TCTCTTCTGCGCCGTCTCCCAAAAT

QA 9 333 9 333
DS 

RD RR2CR27TF 745 0 0
TGA
GAAAGCATCATCGACAG*AATGGG*CTGTT*CCCACGGGTTT*AAAGCAG*CACAACAAC
TAGTTTGAATCCTCCTCCCATGTCACTCCCATTAAGTTCCAGGGC*TTCTCTTCTGCACC
TTCTCCCAGAATAGAAATGATGGCTTGGTGATCTTGACTGGGATGATGTTCTACGGGGAA
TAACTGAAAATCAACAATCTCTCCGCATGAAGAGAAACGGTTGGTCAAGAAGGTCTTGAT
ATCAGCAGCAGGAAGCGAAGTGTCATATCCTCTAACGATAATCATTTTGCCATCACAAAC
TCGTTCTGCCTCGGCCAACCTAGCAGTCATTTCAGGAGTGAGTTTAAGGAACACCTCGTG
AGTTGAAGTAGCAACTATTTTGCGTCCTTCCATCTCACTTCCACTAAGTTGCAGTGCCTT
CTCTTCTGCGCCGTCTCCCAAAATATATATATAGCCAGATCTGTTGGGAGCACCGTCTAT
AGCGAAATAGGGGATAGAAACACACACAACCTCTCCACATGAAGAGAAGTGTTTAGTTAA
CTGGCTCTTGACAACATCCACATGAAGGGAAGTGTCATATCCCTTAACTAAAATCCTAAC
GCTCCGGCTTCTTCGATCTCTCGTAGCTTCCAAATCACTACCCAATTCCATCCCTTTGAT
TGCGGATTCGTCCTTGGACACCTTGATGGTTCGATGGCTTAGGTTTTCGAGATTTTTTTC
AGGTTTTAGGGATTCGGTGC
CC

QA 4 743 4 743
DS 

RD RR2DF08TF 635 0 0
TCTTCTGCACTTTCTCCCAGAATAGAAATGATGGCTTGGTGATCTTGACTGGGATGATGT
TCTACGGGGAATAACTGAGAATCAACAATCTCTCCGCATGAAGAGAAACGGTTGGTCAAG
AAGGTCTTGATATCAGCAGCAGGAAGCGAAGTGTCATATCCTCTAACGATAATCATTTTG
CCATCACAAACTCGTTCTGCCTCGGCCGACCTAGCAGTCATTTCAGGAGTGAGTTTAAGG
AACACCTCGTGAGTTGAA**AGCAACTATTTTGCGTCCTTCCATCTCACTTCCACTAAGT
TGCAGTGCCTTCTCTTCTGCGCCGTCTCCCAAAATATATATATAGCCAGATCTGTTGGGA
GCACCGTCTATAGCGAAATAGGGGATAGAAACACACACAACCTCTCCACATGAAGAGAAG
TGTTTAGTTAACTGGCTCTTGACAACATCCACATGAAGGGAAGTGTCATATCCCTTAACT
AAAATCCTAACGCTCCGGCTTCTTCGATCCCTCATAGCTTCCAAATCACTACCCAATTCC
ATCCCTTTGATTGCGGATTCGTCCTTGGACACCTTGATGGTTCGATGGCTTAGGTTTTCG
AGATTTTTTTCAGGTTTTAGGGATTCGGTGCGTCC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2FY46TF 622 0 0
CTCCCAGAATAGAAATGATGGCTTGGTGATCTTGACTGGGATGATGTTCTACGGGGAATA
ACTGAAAATCAACAATCTCTCCGCATGAAGAGAAACGGTTGGTCAAGAAGGTCTTGATAT
CAGCAGCAGGAAGCGAAGTGTCATATCCTCTAACGATAATCATTCTGCCATCACAAACTC
GTTCTGCCTCGGCCAACCTAGCAGTCATTTCAGGAGTGAGTTTAAGGAACACCTCGTGAG
TTGAAGTAGCAACTATTTTGCGTCCTTCCATCTCACTTCCACTAAGTTGCAGTGCCTTCT
CTTCTGCGCCGTCTCCCAAAATATATATATAGCCAGATCTGTTGGGAGCACCGTCTATAG
CGAAATAGGGGATAGAAACACACACAACCTCTCCACATGAAGAGAAGTGTTTAGTTAACT
GGCTCTTGACAACATCCACATGAAGGGAAGTGTCATATCCCTTAACTAAAATCCTAACGC
TCCGGCTTCTTCGATCTCTCATAGCTTCCAAATCACTACCCAATTCCATCCCTTTGATTG
CGGATTCGTCCTTGGACACCTTGATGGTTCGATGGCTTAGGTTTTCGAGATTTTTTTCAG
GTTTTAGGGATTCGGTGC
GTCC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 9

CO CL614Contig1 1321 9 6 U
GGATTCCAAAAGAAACGGAAACCGAAGAAGAAAAGATGATGCTGAACAGAACACTTGTTT
CTTCTTCCTCACTTTCTCTCTTACCAAACTCAAAACCTTTCGTCTCCTCCGGATTTCGTT
CTTCCTCCTTCTCCGGCGGCTTCATTCGCAGAATCGACCATAAGCCTATCCGTGTGATGA
CTCCCAATTTGACACCGAGAGCTATGGCGGCACAGCAGCTCGAGAACGCCGATCAGCTCA
TCGATTCCGTTGAAACTTTTATCTTCGATTGTGACGGAGTCATTTGGAAGGGAGATAAAT
TGATTGAGGGAGTTCCTGAAACTCTTGATATGCTCCGTGCCAAGGGAAAGAGGTTGGTTT
TTGTGACGAACAACTCAACAAAATCTAGGAAACAATATGGTAAAAAGTTTGAGACTCTTG
GCCTGAATGTTAACGAGGAGGAAATATTTGCTTCTTCTTTTGCTGCAGCTGCATACTTGC
AGTCTATTAATTTCCCCAAAGATAAGAAGGTCTACGTGATTGGTGAGGAGGGTATTTTGA
AAGAGCTCGACCTTGCTGGTTTTCAATACCTTGGAGGTCCGGATGATGGTAAAAAACAAA
TTGAACTGAAGCCAGGATTTCTAATGGAGCATGATAATGATGTGGGAGCTGTGGTGG*TT
GGATTTGACCGCTATTTCAACTACTACAAAATTCAGTATGGAACTCTCTGTATCCGCGAA
AACCCGGGCTGTCTTTTCATTGCTACAAACCGGGATGCTGTCACTCACCTTACCGATGCT
CAAGAATGGGCAGGTGGTGGCTCCATGGTTGGTGCTCTTGTTGGATCCTGTCAACGTGAA
CCTCTTGTAGTTGGAAAACCCTCAACTTTTATGATGGACTATTTGTCAGACAAATTTGGA
ATCGAAAAGTCACAGATATGCATGGTGGGAGATAGATTGGACACTGATATTTTGTTTGGG
CAGAATGGTGGTTGTAAAACTCTTCTTGTCCTCTCTGGTGTTACTTCAATCTCCATGTTG
GAAAGCCCTGAGAACAAGATACAACCAGATTTCTACACCAGCAAGATTTTTGATTTTCTT
TCCCTCAAAGCAGCTAATGTGTGATGAACTCAGCAAATACAGAGTCAATCCATACGTTTA
TCTATGTATAAACTTTTTCTTAGCTTGTTTTGGCAAGCTGCATTTATTTGAAGCGTCTTC
CTCGTGCATGGCGCATTAGCAAGCACCCATCTCATCCTCTTTAAGTGACACTTTAATGTT
TATCTCACATAACTTTAAATTTGGAATACTATTATATTTATATTTAAATAAGTTTTTAAG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO12TF U 69
AF RR2BN80TF U 6
AF RR2CX04TF U 34
AF RR2A307TF U 15
AF RR2DU01TF U 1
AF RR2AB03TF U 1
AF RR2CX04JQ C 427
AF RR2AB03JQ C 435
AF RR2A307JQ C 551
BS 1 461 RR2AB03TF
BS 462 462 RR2FO12TF
BS 463 782 RR2AB03TF
BS 783 1123 RR2CX04JQ
BS 1124 1224 RR2AB03JQ
BS 1225 1321 RR2A307JQ

RD RR2FO12TF 570 0 0
GG
ACTTTCTCTCTTACCAAACTCAAAACCTTTCGTCTCCTCCGGATTTCGTTCTTCCTCCTT
CTCCGGCGGCTTCATTCGCAGAATCGACCATAAGCCTATCCGTGTGATGACTCCCAATTT
GACACCGAGAGCTATGGCGGCACAGCAGCTCGAGAACGCCGATCAGCTCATCGATTCCGT
TGAAACTTTTATCTTCGATTGTGACGGAGTCATTTGGAAGGGAGATAAATTGATTGAGGG
AGTTCCTGAAACTCTTGATATGCTCCGTGCCAAGGGAAAGAGGTTGGTTTTTGTGACGAA
CAACTCAACAAAATCTAGGAAACAATATGGTAAAAAGTTTGAGACTCTTGGCCTGAATGT
TAACGAGGAGGAAATATTTGCTTCTTCTTTTGCTGCAGCTGCATACTTGCAGTCTATTAA
TTTCCCCAAAGATAAGAAGGTCTACGTGATTGGTGAGGAGGGTATTTTGAAAGAGCTCGA
CCTTGCTGGTTTTCAATACCTTGGAGGTCCGGATGATGGTAAAAAACAAATTGAACTGAA
GCCAGGATTTCTAATGGAGCATGATAAT

QA 3 570 3 570
DS 

RD RR2BN80TF 652 0 0
GG
AAAAGAAACGGAAACCGAAGAAGAAAAGATGATGCTGAACAGAACACTTGTTTCTTCTTC
CTCACTTTCTCTCTTACCAAACTCAAAACCTTTCGTCTCCTCCGGATTTCGTTCTTCCTC
CTTCTCCGGCGGCTTCATTCGCAGAATCGACCATAAGCCTATCCGTGTGATGACTCCCAA
TTTGACACCGAGAGCTATGGCGGCACAGCAACTCGAGAACGCCGATCAGCTCATCGATTC
CGTTGAAACTTTTATCTTCGATTGTGACGGAGTCATTTGGAAGGGAGATAAATTGATTGA
GGGAGTTCCTGAAACTCTTGATATGCTCCGTGCCAAGGGAAAGAGGTTGGTTTTTGTGAC
GAACAACTCAACAAAATCTAGGAAACAATATGGTAAAAAATTTGAGACTCTTGGCCTGAA
TGTTAACGAGGAGGAAATATTTGCTTCTTCTTTTGCTGCAGCTGCATACTTGCAGTCTAT
TAATTTCCCCAAAGATAAGAAGGTCTACGTGATTGGTGAGGAGGGTATTTTGAAAGAGCT
CGACCTTGCCGGTTTTCAATACCTTGGAGGTCCGGATGATGGTAAAAA*CAAATTGAACT
GAAGTCAG*ATTTCTAATGGAGCATGATAATGATGTGGGAGCTG
GGGGTG

QA 3 646 3 646
DS 

RD RR2CX04TF 652 0 0
AGATGATGCTGAACAGAACACTTGTTTCTTCTTCCTCACTTTCTCTCTTACCAAACTCAA
AACCTTTCGTCTCCTCCGGATTTCGTTCTTCCTCCTTCTCCGGCGGCTTCATTCGCAGAA
TCGACCATAAGCCTATCCGTGTGATGACTCCCAATTTGACACCAAGAGCTATGGTGGCAC
AGCAGCTCGAGAACGCCGATCAGCTCATCGATTCCGTTGAAACTTTTATCTTCGATTGTG
ACGGAGTCATTTGGAAGGGAGATAAATTGATTGAGGGAGTTCCTGAAACTCTTGATATGC
TCCGTGCCAAGGGAAAGAGGTTGGTTTTTGTGGCGAACAACTCAACAAAATCTAGGAAAC
AATATGGTAAAAAATTTGAGACTCTTGGCCTGAATGTTAACGAGGAGGAAATATTTGCTT
CTTCTTTTGCTGCAGCTGCATACTTGCAGTCTATTAATTTCCCCAAAGATAAGAAGGTCT
ACGTGATTGGTGAGGAGGGTATTTTGAAAGAGCTCGACCTTGCTGGTTTTCAATACCTTG
GAGGTCCGGATGATGGTAAAAAACAAATTGAACTGAAGCCAGGATTTCTAATGGAGCATG
ATAATGATGTGGGAGCTATGGTGGGTTGGATTTGACCGCTATTTCAACTACT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2A307TF 660 0 0
ACGGAAACCGAAGAAGAAAAGATGATGCTGAACAGAACACTTGTTTCTTCTTCCTCAGTT
TCTCTCTTACCAAACTCAAAACCTTTCGTCTCCTCCGGATTTCGTCCTTCCTCTTTCTCC
GGCGGCTTCATTCGCAGAATCGACCATAAGCCTATCCGTGTGATGACTCCCAATTTGACA
CCGAGAGCTATGGCGGCACAGCAGCTCGAGAACGCCGATCAGCTCATCGATTCCGTTGAA
ACTTTTATCTTCGATTGTGACGGAGTCATTTGGAAGGGAGATAAATTGATTGAGGGAGTT
CCTGAAACTCTTGATATGCTCCGTGCCAAGGGAAAGAGGTTGGTTTT*GTGACGAACAAC
TCAACAAAATCTAGGAAACAATATGGTAAAAAGTTTGAGACTCTCGGCCTGAATGTTAAC
GAGGAGGAAATATTTGCTTCTTCTTTTGCTGCAGCTGCATACTTGCAGTCTATTAATTTC
CCCAAAGATAAGAAGGTCTACGTGATTGGTGAGGAGGGTATTTTGAAAGAGCTCGACCTT
GCTGGTTTTCAATACCTTGGAGGTCCGGATGATGGTAAAAAACAAATTGAACTGAAGCCA
GGATTTCTAATGGAGCATGATAATGATGTGGGAGCTGTGGTGG*TTGGATTTGACCGCTA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2DU01TF 685 0 0
GGATTCC
AAAAGAAACGGAAACCGAAGAAGAAAAGATGATGCTGAACAGAACACTTGTTTCTTCTTC
CTCACTTTCTCTCTTACCAAACTCAAAACCTTTCGTCTCCTCCGGATTTCGTTCTTCCTC
CTTCTCCGGCGGCTTCATTCGCAGAATCGACCATAAGCCTATCCGTGTGATGACTCCCAA
TTTGACACCGAGAGCTATGGCGGCACAGCAGCTCAAGAACGCCGATCAGCTCATCGATTC
CGTTGAAACTTTTATCTTCGATTGTGACGGAGTCATTTGGAAGGGAGATAAATTGATTGA
GGGAGTTCCTGAAACTCTTGATATGCTCCGTGCCAAGGGAAAGACGTTGGTTTTTGTGAC
GAACAACTCAACAAAATCTAGGAAACAATATGGTAAAAAGTTTGAGACTCTTGGCCTGAA
TGTTAACGAGGAGGAAATATTTGCTTCTTCTTTTGCTGCAGCTGCATACTTGCAGTCTAT
TAATTTCCCCAAAGATAAGAAGGTCTACGTGATTGGTGAGGAGGGTATTTTGAAAGAGCT
CGACCTTGCTGGTTTTCAATACCTTGGAGGTCCGGATGATGGTAAAAAACACATTGAACT
GAAGCCAGGATTTCTAATGGAGCATGATAATGATGTGGGAGCTGTGGTGG*TTGGATTTG
ACCGCTATTTCAACTACT

QA 8 685 8 685
DS 

RD RR2AB03TF 788 0 0
GGATTCCAAAAGAAACGGAAACCGAAGAAGAAAAGATGATGCTGAACAGAACACTTGTTT
CTTCTTCCTCACTTTCTCTCTTACCAAACTCAAAACCTTTCGTCTCCTCCGGATTTCGTT
CTTCCTCCTTCTCCGGCGGCTTCATTCGCAGAATCGACCATAAGCCTATCCGTGTGATGA
CTCCCAATTTGACACCGAGAGCTATGGCGGCACAGCAGCTCGAGAACGCCGATCAGCTCA
TCGATTCCGTTGAAACTTTTATCTTCGATTGTGACGGAGTCATTTGGAAGGGAGATAAAT
TGATTGAGGGAGTTCCTGAAACTCTTGATATGCTCCGTGCCAAGGGAAAGAGGTTGGTTT
TTGTGACGAACAACTCAACAAAATCTAGGAAACAATATGGTAAAAAGTTTGAGACTCTTG
GCCTGAATGTTAACGAGGAGGAAATATTTGCTTCTTCTTTTACTGCAGCTGCATACTTGC
AGTCTATTAATTTCCCCAAAGATAAGAAGGTCTACGTGATTGGTGAGGAGGGTATTTTGA
AAGAGCTCGACCTTGCTGGTTTTCAATACCTTGGAGGTCCGGATGATGGTAAAAAACAAA
TTGAACTGAAGCCAGGATTTCTAATGGAGCATGATAATGATGTGGGAGCTGTGGTGG*TT
GGATTTGACCGCTATTTCAACTACTACAAAATTCAGTATGGAACTCTCTGTATCCGCGAA
AACCCGGGCTGTCTTTTCATTGCTACAAACCGGGATGCTGTCACTCACCTTACCGATGCT
CA
GAATGG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2CX04JQ 697 0 0
ATGTTAACGAGGAGGAAATATTTGCTTCTTCTTTTGCTGCAGCTGCATACTTGCAGTCTA
TTAATTTCCCCAAAGATAAGAAGGTCTACGTGATTGGTGAGGAGGGTATTTTGAAAGAGC
TCGACCTTGCTGGTTTTCAATACCTTGGAGGTCCGGATGATGGTAAAAAACAAATTGAAC
TGAAGCCAGGATTTCTAATGGAGCATGATAATGATGTGGGAGCTATGGTGG*TTGGATTT
GACCGCTATTTCAACTACTACAAAATTCAGTATGGAACTCTCTGTATCCGCGAAAACCCG
GGCTGTCTTTTCATTGCTACAAACCGGGATGCTGTCACTCACCTTACCGATGCTCAAGAA
TGGGCAGGTGGTGGCTCCATGGTTGGTGCTCTTGTTGGATCCTGTCAACGTGAACCTCTT
GTAGTTGGAAAACCCTCAACTTTTATGATGGACTATTTGTCAGACAAATTTGGAATCGAA
AAGTCACAGATATGCATGGTGGGAGATAGATTGGACACTGATATTTTGTTTGGGCAGAAT
GGTGGTTGTAAAACTCTTCTTGTCCTCTCTGGTGTTACTTCAATCTCCATGTTGGAAAGC
CCTGAGAACAAGATACAACCAGATTTCTACACCAGCAAGATTTTTGATTTTCTTTCCCTC
AAAGCAGCTAATGTGTGATGAACTCAGCAAATACAGA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2AB03JQ 790 0 0
GAGGAGGAAATATTTGCTTCTTCTTTTACTGCAGCTGCATACTTGCAGTCTATTAATTTC
CCCAAAGATAAGAAGGTCTACGTGATTGGTGAGGAGGGTATTTTGAAAGAGCTCGACCTT
GCTGGTTTTCAATACCTTGGAGGTCCGGATGATGGTAAAAAACAAATTGAACTGAAGCCA
GGATTTCTAATGGAGCATGATAATGATGTGGGAGCTGTGGTGG*TTGGATTTGACCGCTA
TTTCAACTACTACAAAATTCAGTATGGAACTCTCTGTATCCGCGAAAACCCGGGCTGTCT
TTTCATTGCTACAAACCGGGATGCTGTCACTCACCTTACCGATGCTCAAGAATGGGCAGG
TGGTGGCTCCATGGTTGGTGCTCTTGTTGGATCCTGTCAACGTGAACCTCTTGTAGTTGG
AAAACCCTCAACTTTTATGATGGACTATTTGTCAGACAAATTTGGAATCGAAAAGTCACA
GATATGCATGGTGGGAGATAGATTGGACACTGATATTTTGTTTGGGCAGAATGGTGGTTG
TAAAACTCTTCTTGTCCTCTCTGGTGTTACTTCAATCTCCATGTTGGAAAGCCCTGAGAA
CAAGATACAACCAGATTTCTACACCAGCAAGATTTTTGATTCTCTTTCCCTCAAAGCAGC
TAATGTGTGATGAACTCAGCAAATACAGAGTCAATCCATACGTTTATCTATGTATAAACT
TTTTCTTAGCTTGTTTTGGCAAGCTGCATTTATTTGAAGCGTCTTCCTCGTGCATGGCGC
ATTAGCAAGC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2A307JQ 771 0 0
CCTTGCTGGTTTTCAATACCTTGGAGGTCCGGATGATGGTAAAAAACAAATTGAACTGAA
GCCAGGATTTCTAATGGAGCATGATAATGATGTGGGAGCTGTGGTGG*TTGGATTTGACC
GCTATTTCAACTACTACAAAATTCAGTATGGAACTCTCTGTATCCGCGAAAACCCGGGCT
GTCTTTTCATTGCTACAAACCGGGATGCTGTCACTCACCTTACCGATGCTCAAGAATGGG
CAGGTGGTGGCTCCATGGTTGGTGCTCTTGTTGGATCCTGTCAACGTGAACCTCTTGTAG
TTGGAAAACCCTCAACTTTTATGATGGACTATTTGTCAGACAAATTTGGAATCGAAAAGT
CACAGATATACATGGTGGGTGATAGATTGGACACTGATATTTTGTTTGGGCAGAATGGTG
GTTGTAAAACTCTTCCTGTCCTCTCTGGTGTTACTTCAATCTCCATGTTGGAAAGCCCTG
AGAACAAGATACAACCAGATTTTTACACCAGCAAGATTTCTGATTTTCTTTCCCTCAAAG
CAGCTAATGTGTGATGAACTCAGCAAATACAGAGTCAATCCATACGTTTATCTATGTATA
AACTTTTTCTTAGCTTGTTTTGGCAAGCTGCATTTATTTGAAGCGTCTTCCTCGTGCATG
GCGCATTAGCAAGCACCCATCTCATCCTCTTTAAGTGACACTTTAATGTTTATCTCACAT
AACTTTAAATTTGGAATACTATTATATTTATATTTAAATAAGTTTTTAAGC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 8

CO CL615Contig1 1010 8 5 U
CCCTTATTTTAAATCTTATAATTTTGGCCCAGCTCTTTTCAAATTTAGAAGAACAACCCT
TATTTTTATTGATTCTACTCATAGTGTACCCGGATATTTTATTTTAACTGGTTTGGTACA
TTACATCCCAAATGATTTAAAGAAGATAAAAGATTTTAAAAACGAGCGGTGACTTGAGAG
AAGAGAGCCTTAAAGTCTTTAGTAGGAGAACTCGTTCCCTCTGGCTTTGAGCCCAGATCA
AAAGCTTTATTCTTTGCTTCCTCGAACAGCAATGCCTGAATGCAGACTTCAGCAACATCA
GCCCTGGGGACGGTTTTAGTGTCTGTTTGAAGAAGCTCATCGTCTTTACCAACTAGGAGC
TCTCGTGCACCTCCTTCTTTGTCTAGAAGTCCTCCAGCTCTGATTATTGTGTAAGGAGTT
CCAGAATCAGCAAGGTACTGTTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAGAATGTTCCCATTTCCA
AGTTTGTTCAGAGGATGATCCGGATTTGTTCCACCCATGGACCCAACCAAGACAATATGC
TTAACACCAGCAACCTTGGCAGCATCTATTTGGTTCTTCTGGCCAATCCAATCAACCTGT
TCAGGGTATTGACCATCATCGAACATGAACTCAGGTCTTCCACCTTTGGTGGGATCAAAA
CCAGGTTTCATTTTGGGGACAGCGCTAGTGAGAATCACGAGCGCATCGATCCCTTGAACA
GCAGGGGTAATGCTATCAGCATCCCTTATATCACCAATGAAAACATCAGCTTCTCCTCCG
ATCTTGTCTTTCCCTTCGGGAGTTCTCACTAAACCCTTCGCCACAAACTTGTCTGACCTC
TCCTTCAGCTTCTTGTACACAATCTGGCCTGTTCTGCCACTAGCGCCGGTAACGAGAACG
GTGGGAAGGTTCGCCATTGAAGAAGAAACTCTCTATAATTTTCTCAAGACTCTCACTCAA
CCAAATTGACTTACTCCGAAGCCCATTAAAGAGCGTTTGGTGAGACGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 0 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 35 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D890JQ U 1
AF RR2FH37JQ U 62
AF RR2CD11JQ U 42
AF RR2C791JQ U 73
AF RR2CD11TF C 279
AF RR2DG02TF C 280
AF RR2D890TF C 369
AF RR2C791TF C 290
BS 1 715 RR2D890JQ
BS 716 720 RR2CD11JQ
BS 721 809 RR2C791JQ
BS 810 936 RR2CD11TF
BS 937 1010 RR2C791TF

RD RR2D890JQ 715 0 0
CCCTTATTTTAAATCTTATAATTTTGGCCCAGCTCTTTTCAAATTTAGAAGAACAACCCT
TATTTTTATTGATTCTACTCATAGTGTACCCGGATATTTTATTTTAACTGGTTTGGTACA
TTACATCCCAAATGATTTAAAGAAGATAAAAGATTTTAAAAACGAGCGGTGACTTGAGAG
AAGAGAGCCTTAAAGTCTTTAGTAGGAGAACTCGTTCCCTCTGGCTTTGAGCCCAGATCA
AAAGCTTTATTCTTTGCTTCCTCGAACAGCAATGCCTGAATGCAGACTTCAGCAACATCA
GCCCTGGGGACGGTTTTAGTGTCTGTTTGAAGAAGCTCATCGTCTTTACCAACTAGGAGC
TCTCGTGCACCTCCTTCTTTGTCTAGAAGTCCTCCAGCTCTGATTATTGTGTAAGGAGTT
CCAGAATCAGCAAGGTACTGTTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAGAATGTTCCCATTTCCA
AGTTTGTTCAGAGGATGATCCGGATTTGTTCCACCCATGGACCCAACCAAGACAATATGC
TTAACACCAGCAACCTTGGCAGCATCTATTTGGTTCTTCTGGCCAATCCAATCAACCTGT
TCAGGGTATTGACCATCATCGAACATGAACTCAGGTCTTCCACCTTTGGTGGGATCAAAA
CCAGGTTTCATTTTGGGGACAGCGCTAGTGAGAATCACGAGCGCATCGATCCCTT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2FH37JQ 618 0 0
AT
TTTTATTGATTCTACTCATAGTGTACCCGGATATTTTATTTTAACTGGTTTGGTACATTA
CATCCCAAATGATTTAAAGAAAATAAAAGATTTTAAAAACGAGCGGTGACTTGAGAGAAG
AGAGCCTTAAAGTCTTTAGTAGGAGAACTCGTTCCCTCTGGCTTTGAGCCCAGATCAAAA
GCTTTATTCTTTGCTTCCTCGAACAGCAATGCCTGAATGCAGACTTCAGCAACATCAGCC
CTGGGGACGGTTTTAGTGTCTGTTTGAAGAAGCTCATCGTCTTTACCAACTAGGAGCTCT
CGTGCACCTCCTTCTTTGTCTAGAAGTCCTCCAGCTCTGATTATTGTGTAAGGAGTTCCA
GAATCAGCAAGGTACTGTTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAAAATGTTCCCATTTCCAAGT
TTGTTCAGAGGATGATCCGGATTTGTTCCACCCATGGACCCAACCAAGACAATATGCTTA
ACACCAGCAACCTTGGCAGCATCTATTTGGTTCTTCTGGCCAATCCAATCAACCTGTTCA
GGGTATTGACCATCATCGAACATGAACTCAGGTCTTCCACCTTTGGTGGGATCAAAACCA
GGTTTCATTTTGGGGA

QA 3 618 3 618
DS 

RD RR2CD11JQ 679 0 0
AATTTA
GAAGAACAACCCTTATTTTTATTGATTCCACTCATAGTGTACCCGGATATTTTATTTTAA
CTGGTTTGGTACATTACATCCCAAATGATTTAGAGAAGATAAAAGATTTTAAAAACGAGC
GGTGACTTGAGAGAAGAGAGCCTTAAAGTCTTTAGTAGGAGAACTCGTTCCCTCTGGCTT
TGAGCCCAGATCAAAAGCTTTATTCTTTGCTTCCTCGAACAGCAATGCCTGAATGCAGAC
TTCAGCAACATCAGCCCTGGGGACGGTTTTAGTGTCTGTTTGAAGAAGCTCATCGTCTTT
ACCAACTAGGAGCTCTCGTGCACCTCCTTCTTTGTCTAGAAGTCCTCCAGCTCTGATTAT
TGTGTAAGGAGTTCCAGAATCAGCAAGGTACTGTTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAGAAT
GTTCCCATTTCCAAGTTTGTTCGGAGGATGATCCGGATTTGTTCCACCCATGGACCCAAC
CAAGACAATATGCTTAACACCAGCAACCTTGGCAGCATCTATTTGGTTCTTCTGGCCAAT
CCAATCAACCTGTTCAGGGTATTGACCATCATCGAACATGAACTCAGGTCTTCCACCTTT
GGTGGGATCAAAACCAGGTTTCATTTTGGGGACAGAGCTAGTGAGAATCACGAGCGCATC
GATCCCTTGAACA

QA 7 679 7 679
DS 

RD RR2C791JQ 737 0 0
TTCTACTCATAGTGTACCCGGATATTTTATTTTAACTGGTTTGGTACATTACATCCCAAA
TGGTTTAGAGAAGATAAAAGATTTTAAAAACGAGCGGTGACTTGAGAGAAGAGAGCCTTA
AAGTCTTTAGTAGGAGAACTCGTTCCCTCTGGCTTTGAGCCCAGATCAAAAGCTTTATTC
TTTGCTTCCTCGAACAGCAATGCCTGAATGCAGACTTCAGCAACATCAGCCCTGGGGACG
GTTTTAGTGTCTGTTTGAAGAAGCTCATCGTCTTTACCAACTAGGAGCTCTCGTGCACCT
CCTTCTTTGTCTAGAAGTCCTCCAGCTCTGATTATTGTGTAAGGAGTTCCAGAATCAGCA
AGGTACTGTTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAGAATGTTCCCATTTCCAAGTTTGTTCAGA
GGATGATCCGGATTTGTTCCACCCATGGACCCAACCAAGACAATATGCTTAACACCAGCA
ACCTTGGCAGCATCTATTTGGTTCTTCTGGCCAATCCAATCAACCTGTTCAGGGTATTGA
CCATCATCGAACATGAACTCAGGTCTTCCACCTTTGGTGGGATCAAAACCAGGTTTCATT
TTGGGGACAGCGCTAGTGAGAATCACGAGCGCATCGATCCCTTGAACAGCAGGGGTAATG
CTATCAGCATCCCTTATATCACCAATGAAAACATCAGCTTCTCCTCCGATCTTGTCTTTC
CCTTCGGGAGTTCTCAC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2CD11TF 659 0 0
AATGCAGACTTCAGCAACATCAGCCCTGGGGACGGTTTTAGTGTCTGTTTGAAGAAGCTC
ATCGTCTTTACCAACTAGGAGCTCTCGTGCACCTCCTTCTTTGTCTAGAAGTCCTCCAGC
TCTGATTATTGTGTAAGGAGTTCCAGAATCAGCAAGGTACTGTTCAGCTTTCCTCTTCCA
AACCAGAATGTTCCCATTTCCAAGTTTGTTCGGAGGATGATCCGGATTTGTTCCACCCAT
GGACCCAACCAAGACAATATGCTTAACACCAGCAACCTTGGCAGCATCTATTTGGTTCTT
CTGGCCAATCCAATCAACCTGTTCAGGGTATTGACCATCATCGAACATGAACTCAGGTCT
TCCACCTTTGGTGGGATCAAAACCAGGTTTCATTTTGGGGACAGAGCTAGTGAGAATCAC
GAGCGCATCGATCCCTTGAACAGCAGGGGTAATGCTATCAGCATCCCCTATATCACCAAT
GAAAACATCAGCTTCTCCTCCGATCTTGTCTTTCCCTTCGGGAGTTCTCACTAAACCCTT
CGCCACAAACTTGTCTGACCTCTCCTTCAGCTTCTTGTACACAATCTGGCCTGTTCTGCC
ACTAGCGCCGGTAACGAGAACGGTGGGAAGGTTCGCCATTGAAGAAGAAACTCTCTAT
C

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2DG02TF 659 0 0
ATGCAGACTTCAGCAACATCAGCCCTGGGGACGGTTTTAGTGTCTGTTTGAAGAAGCTCG
TCATCTTTACCAACTAGGAGCTCTCGTGCACCTCCTTCTTTGTCTAGAAGTCCCCCAGCT
CTGATTATTGTGTAAGGAGTTCCAGAATCAGCAAGGTACTGTTCAGCTTTCCTCTTCCAA
ACCAGTATGTTCCCATTTCCCAGTTTGTTCAAAGGATGATCCGGATTTGTTCCACCCATG
GACCCAACCAAGACAATATGCTTCACACCAGCAACCTTGGCAGCATCTATTTGGTTCTTC
TGGCCAATCCAATCAACCTGTTCAGGGTACTGTCCATCATCGAAAATGAACTCAGGTCTT
CCACCTTTAGTGGGGTCAAAACCAGGTCTCATCTTGGGGACAGCGCTAGTGAGAATCACA
AGCGCATCGATCCCTTGAACAGCAGGGATAATGCTATCAGCATCCCTTATATCACCAATG
AAAACATCAGCTTCTCCTCCGATCTTCTCTTTCCCTTCAGGAGTTCTCGCTAAACCCTTC
GCCACAAACTTGTCTGACCTCTCCTTCAGCTTCTTGTACACAATCTGGCCTGTTCTGCCA
CTAGCGCCGGTAACGAGAACGGTGGGAAGGTTCGCCATTGAAGAAGAAACTCTCTAT
CC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2D890TF 590 0 0
ACCTCTTTCTTTGTCTAGAAGTCCTCCAGCTCTGATTATTGTGTAAGGAGTTCCAGAATC
AGCAAGGTACTGTTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAGAATGTTCCCATTTCCAAGTTTGTT
CAGAGGATGATCCGGATTTGTTCCACCCATGGACCCAACCAAGACAATATGCTTAACACC
AGCAACCTTGGCAGCATCTATTTGGTTCTTCTGGCCAATCCAATCAACCTGTTCAGGGTA
TTGACCATCATCGAACATGAACTCAGGTCTTCCACCTTTGGTGGGATCAAAACCAGGTTT
CATTTTGGGGACAGCGCTAGTGAGAATCACGAGCGCATCGATCCCTTGAACAGCAGGGGT
AATGCTATCAGCATCCCTTATATCACCAATGAAAACATCAGCTTCTCCTCCGATCTTGTC
TTTCCCTTAGGGAGTTCTCACTAAACCCTTCGCCACAAACTTGTCTGACCTCTCCTTCAG
CTTCTTGTACACAATCTGGCCTGTTCTGCCACTAGCGCCGGTAACGAGAACGGTGGGAAG
GTTCGCCATTGAAGAAGAAACTCTCTATAATTTTCTCAAGACTCTCAC
CC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2C791TF 721 0 0
CAGCAACATCAGCCCTGGG*ACGGTTTTAGTGTCTGTTTGAAGAAGCTCATCGTCTTTAC
CAACTAGGAGCTCTCGTGCAC*TCTTTCTTTGTCTAGAAGTCCTCCAGCTCTGATTATTG
TGTAAGGAGTTCCAGAATCAGCAAGGTACTGTTCAGCTTTCCTCTTCCAAACCAGAATGT
TCCCATTTCCAAGTTTGTTCAGAGGATGATCCGGATTTGTTCCACCCATGGACCCAACCA
AGACAATATGCTTAACACCAGCAACCTTGGCAGCATCTATTTGGTTCTTCTGGCCAATCC
AATCAACCTGTTCAGGGTATTGACCATCATCGAACATGAACTCAGGTCTTCCACCTTTGG
TGGGATCAAAACCAGGTTTCATTTTGGGGACAGCGCTAGTGAGAATCACGAGCGCATCGA
TCCCTTGAACAGCAGGGGTAATGCTATCAGCATCCCTTATATCACCAATGAAAACATCAG
CTTCTCCTCCGATCTTGTCTTTCCCTTCGGGAGTTCTCACTAAACCCTTCGCCACAAACT
TGTCTGACCTCTCCTTCAGCTTCTTGTACACAATCTGGCCTGTTCTGCCACTAGCGCCGG
TAACGAGAACGGTGGGAAGGTTCGCCATTGAAGAAGAAACTCTCTATAATTTTCTCAAGA
CTCTCACTCAACCAAATTGACTTACTCCGAAGCCCATTAAAGAGCGTTTGGTGAGACGGC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 2 10

CO CL616Contig1 1042 7 10 U
TTTTTTTTTCTTCCTGTTACCTTCTTCTCATTCTTTGTACAAAAAAAAAATAACAAACCC
TTTAATTAAACTCTCTTTATTCTTTTGTTTTGTGGGGAAGACTAAATGGTTGTCTCATCT
CCAGGAAATCTCGTATTGAATCAAATCCAATAGTGGGGATTTTCTAGTAACCAAATTAAA
TCAGAACAACATAAATCAAGAAAACAAAGATGGTTTTGAAAGAGGAGGAGAAGAAAGCTG
AAGAAACTTCAGAAGACCAAAAGGGACAAGGGGCGTTAAGCAGAAAGAACAGCCACAGCT
CTTTTTGTCCGACAGATGATGACGACGAAGACGAAGAGAAGAAGCTTGAACTTGGTCCCA
TGATCGCTCTCAAAGAACAGCTCGAGAAAGACAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGGA
AAGAACAACTTCTAGGCAGTGTGGATATGGAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATCCGGTGG
TAAAGATAATGTACTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACATGGTATTGACGGTGC
CTGAAAACGGAAACCCGACATCGAAAGAACCATGGTTTACTCTCAAAGAAGGCTCTAAGT
ACACTCTTGTATTTACTTTCCGTGTGACCAACAACATTGTGTCTGGCCTCCGGTACAGTA
ATTCGGTTTGGAAGACCGGACTCAAGGTGTATAGTAGAAAGGAGATGCTAGGAACGTTTA
GTCCACAGGCGGAACCGTATAACCATGTCATGTTTGAAGAATCGACACCGTCTGGTATGC
TTGTTAGAGGCTCCTATTCCGTTAAATCTAAGTTTGTAGACGACGACAATAAGTGCTACC
TGGAGAACAACTACACCTTCGACATTCGCAAGAATTGGCTGTGATCCTTCCACATAAGTT
AATGGAATAAAAAAAACATACTTCATCTGTTTCAAGAAAAATGTCACTTTAGATTTTTTA
TTTTGTTTTCAAAATAAGTGTCATTCTACAATTTCAATATAATTTTGTACATTAAATCTA
ATTTCTACTCTTTTAAATGACT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FV51TF U 28
AF RR2BW17TF U 1
AF RR2BX80TF U 1
AF RR2FD59TF U 1
AF RR2FV51JQ C 70
AF RR2BW17JQ C 237
AF RR2BX80JQ C 359
BS 1 96 RR2BW17TF
BS 97 97 RR2BX80TF
BS 98 258 RR2BW17TF
BS 259 259 RR2BX80TF
BS 260 587 RR2BW17TF
BS 588 643 RR2BX80TF
BS 644 915 RR2FV51JQ
BS 916 919 RR2BW17JQ
BS 920 920 RR2BX80JQ
BS 921 1042 RR2BW17JQ

RD RR2FV51TF 284 0 0
GATTCTTTGTACAA
AAAAAAAAATAACAAACCCTTTAATTAAACTCTCTTTATTCTTTTGTTTTGTGGGGAAGA
CTAAATGGTTGTCTCATCTCCAGGAAATCTCGTATTGAATCAAATCCAATAGTGGGGATT
TTCTAGTAACCAAATTAAATCAGAACAACATAAATCAAGAAAACAAAGATGGTTTTGAAA
GAGGAGGAGAAGAAAGCTGAAGAAACTTCAGAAGACCAAAAGGGACAAGGGGCGTTAAGC
AGAAAGAACAGCCACAGCTCTTTTTGTCCG

QA 15 284 15 284
DS 

RD RR2BW17TF 587 0 0
TTTTTTTTTCTTCCTGTTACCTTCTTCTCATTCTTTGTACAAAAAAAAAATAACAAACCC
TTTAATTAAACTCTCTTTATTCTTTTGTTTTGTGGG*AAGACTAAATGGTTGTCTCATCT
CCAGGAAATCTCGTATTGAATCAAATCCAATAGTGGGGATTTTCTAGTAACCAAATTAAA
TCAGAACAACATAAATCAAGAAAACAAAGATGGTTTTGAAAGAGGAGGAGAAGAAAGCTG
AAGAAACTTCAGAAGACCGAAAGGGACAAGGGGCGTTAAGCAGAAAGAACAGCCACAGCT
CTTTTTGTCCGACAGATGATGACGACGAAGACGAAGAGAAGAAGCTTGAACTTGGTCCCA
TGATCGCTCTCAAAGAACAGCTCGAGAAAGACAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGGA
AAGAACAACTTCTAGGCAGTGTGGATATGGAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATCCGGTGG
TAAAGATAATGTACTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACATGGTATTGACGGTGC
CTGAAAACGGAAACCCGACATCGAAAGAACCATGGTTTACTCTCAAA

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2BX80TF 643 0 0
TTTT
TTTTTCTTCCTGTTACCTTCTTCTCATTCTTTGTACAAAAAAAAAATAACAAACCCTTTA
ATTAAACTCTCTTTATTCTTTTGTTTTGTGGGGAAGACTAAATGGTTGTCTCATCTCCAG
GAAATCTCGTATTGAATCAAATCCAATAGTGGGGATTTTCTAGTAACCAAATTAAATCAG
AACAACATAAATCAAGAAAACAAAGATGGTTTTGAAAGAGGAGGAGAAGAAAGCTGAAGA
AACTTCAGAAGACCAAAAGGGACAAGGGGCGTTAAGCAGAAAGAACAGCCACAGCTCTTT
TTGTCCGACAGATGATGACGACGAAGACGAAGAGAAGAAGCTTGAACTTGGTCCCATGAT
CGCTCTCAAAGAACAGCTCGAGAAAGACAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGGAAAGA
ACAACTTCTAGGCAGTGTGGATATGGAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATCCGGTGGTAAA
GATAATGTACTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACATGGTATTGACGGTGCCTGA
AAACGGAAACCCGACATCGAAAGAACCATGGTTTACTCTCAAAGAAGGCTCTAAGTACAC
TCTTGTATTTACTTTCCGTGTGACCAACAACATTGTGTC

QA 5 643 5 643
DS 

RD RR2FD59TF 640 0 0
TTTT
TTTTTCTTCCTGTTACCTTCTTCTCATTCTTTGTACAAAAAAAAA*TAACAAACCCTTTA
ATTAAACTCTCTTTATTCTTTTGTTTTGTGGGGAAGACTAAATGGTTGTCTCATCTCCAG
GAAATCTCGTATTGAATCAAATCCAATAGTGGGGATTTTCTAGTAACCAAATTAAATCAG
AACAACATAAATCAAGAAAACAAAGATGGTTTTGAAAGAGGAGGAGAAGAAAGCTGAAGA
AACTTCAGAAGACCAAAAGGGACAAGGGGCGTTAAGCAGAAAGAACAGCCACAGCTCTTT
TTGTCCGACAGATGATGACGACGAAGACGAAGAGAAGAAGCTTGAACTTGGTCCCATGAT
CGCTCTCAAAGAACAGCTCGAGAAAGGCAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGGAAAGA
ACAACTTCTAGGCAGTGTGGATATGGAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATCCGGTGGTAAA
GATAATGTACTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACATGGTATTGACGGTGCCTGA
AAACGGAAACCCGACATCGAAAGAACCATGGTTTACTCTCAAAGAAGGCTCTAAGTACAC
TCTTGTATTTACTTTCCGTGTGACCAACAACAT
CGT

QA 5 637 5 637
DS 

RD RR2FV51JQ 864 0 0
ACTCTCTTTATTCTTTG**TTTGTGGGGAAGACTAAATGGTTGTCTCATCTCCAGGAAAT
CTCGTATTGAATCAAATCCAATAGTGGGGATTTTCTAGTAACCAAATTAAATCAGAACAA
CATAAATCAAGAAAACAAAGATGGTTTTGAAAGAGGAGGAGAAGAAAGCTGAAGAAACTT
CAGAAGACCAAAAGGGACAAGGGGCGTTAAGCAGAAAGAACAGCCACAGCTCTTTTTGTC
CGACAGATGATGACGACGAAGACGAAGAGAAGAAGCTTGAACTTGGTCCCATGATCGCTC
TCAAAGAACAGCTCGAGAAAGACAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGGAAAGAACAAC
TTCTAGGCAGTGTGGATATGGAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATCCGGTGGTAAAGATAA
TGTACTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACATGGTATTGACGGTGCCTGAAAACG
GAAACCCGACATCGAAAGAACCATGGTTTACTCTCAAAGAAGGCTCTAAGTACACTCTTG
TATTTACTTTCCGTGTGACCAACAACATTGTGTCTGGCCTCCGGTACAGTAATTCGGTTT
GGAAGACCGGACTCAAGGTGTATAGTAGAAAGGAGATGCTAGGAACGTTTAGTCCACAGG
CGGAACCGTATAACCATGTCATGTTTGAAGAATCGACACCGTCTGGTATGCTTGTTAGAG
GCTCCTATTCCGTTAAATCTAAGTTTGTAGACGACGACAATAAGTGCTACCTGGAGAACA
ACTACACCTTCGACATTCGCAAGAATTGGCTGTGATCCTTCCACATAAGTTAATGGAATA
AAAAAA
ACATACTTCATCTGTTTC

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR2BW17JQ 806 0 0
GCTGAAGAAACT*CAGAAGACCGAAAGG*ACAAGGGGCGT*AAGCAGAAAGAACAGCCAC
AGCTCTTTT*GTCCGACAGATGATGACGACGAAGACGAAGAGAAGAAGCTTGAACTTGGT
CCCATGATCGCTCTCAAAGAACAGCTCGAGAAAGACAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGA
TGGAAAGAACAACTTCTAGGCAGTGTGGATATGGAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATCCG
GTGGTAAAGATAATGTACTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACATGGTATTGACG
GTGCCTGAAAACGGAAACCCGACATCGAAAGAACCATGGTTTACTCTCAAAGAAGGCTCT
AAGTACACTCTTGTATTTACTTTCCGCGTGACCAACAACATTGTGTCTGGCCTCCGGTAC
AGTAATTCGGTTTGGAAGACCGGACTCAAGGTGTATAGTAGAAAGGAGATGCTAGGAACG
TTTAGTCCACAGGCGGAACCGTATAACCATGTCATGTTTGAAGAATCGACACCGTCTGGT
ATGCTTGTTAGAGGCTCCTATTCCGTTAAATCTAAGTTTGTAGACGACGACAATAAGTGC
TACCTGGAGAACAACTACACCTTCGACATTCGCAAGAATTGGCTGTGATCCTTCCACATA
AGTTAATGGAATAAAAAAAACATGCTTCATCTGTTTCAAGAAAAATGTCACTTTAGATTT
TTTATTTTGTTTTCAAAATAAGTGTCATTCTACAATTTCAATATAATTTTGTACATTAAA
TCTAATTTCTACTCTTTTAAATGACT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2BX80JQ 684 0 0
CATGATCGCTCTCAAAGAACAGCTCGAGAAAGACAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATG
GAAAGAACAACTTCTAGGCAGTGTGGATATGGAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATCCGGT
GGTAAAGATAATGTACTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACATGGTATTGACGGT
GCCTGAAAACGGAAACCCGACATCGAAAGAACCATGGTTTACTTTCAAAGAAGGCTCTAA
GTACACTCTTGTATTTACTTTCCGTGTGACCAACAACATTGTGTCTGGCCTCCGGTACAG
TAATTCGGTTTGGAAGACCGGACTCAAGGTGTATAGTAGAAAGGAGATGCTAGGAACGTT
TAGTCCACAGGCGGAACCGTATAACCATGTCATGTTTGAAGAATCGACACCGTCTGGTAT
GCTTGTTAGAGGCTCCTATTCCGTTAAATCTAAGTTTGTAGACGACGACAATAAGTGCTA
CCTGGAGAACAACTACACCTTCGACATTCGCAAGAATTGGCTGTGATCCTTCCACATAAG
TTAATGGAATAAAAAAAACATACTTCATCTGTTTCAAGAAAAATGTCACTTTAGATTTTT
TATTTTGTTTTCAAAATAAGTGTCATTTTACAATTTCAATATAATTTTGTACATTAAATC
TAATTTTTACTCTTTTAAATGACT

QA 1 684 1 684
DS 



CO CL616Contig2 1020 3 10 U
TTTTTCTTCCTGTTACCTTCCTCTCATTCTTTGTCCAAAAAAAATAACAAACCCTTTAAT
TAAACTCTCTTTATTCTTTTGTTTTGTGTGGACGACTAAATGGTGGTCTCCTCATGGAAA
TCATATTGAATCAAATCCAATAGTGGGGATTTTCTAGTAACCAAATTAAATCAGAACAAT
ATATATCAAGAAAACAAAGATGGTTTTGAAAGAGGAGGAGAAGAAAGCTGAAGAAACTTC
AGAAGACCAAAAGGGACAAGGGGCGTTAAGCAGAAAGAACAGCCACAGCTCTTTTTGTCC
GACAGATGATGACGATGAAGATGAAGAGAAGAAGCTTGAACTTGGTCCCATGATCGCTCT
CAAAGAACAGCTCGAGAAAGACAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGGAAAGAACAACT
TCTAGGCAGTGTGGATATGGAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATCCGGTGGTAAAGATAAT
GTACTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACATGGTATTGACGGTGCCTGAAAACGG
AAACCCGATATCGAAAGAACCATGGTTTACTCTCAAAGAAGGCTCTAAGTACACTCTTGT
ATTTACTTTCCGTGTGACCAACAACATTGTGTCTGGCCTCCGGTACAGTAATTCGGTTTG
GAAGACCGGACTCAAGGTGTATAGTAGAAAGGAGATGCTAGGAACGTTTAGTCCACAGGC
GGAACCGTATAACCATGTCATGTTTGAAGAATCGACACCGTCTGGTATGCTCGTTAGAGG
CTCCTATTCCGTTAAATCTAAGTTCGTAGACGACGACAATAAGTGCTACCTGGAGAACAA
CTACACCTTCGACATTCGCAAGAATTGGCTGTGATCCTTCCACATAAGTTAATGGAATAA
AAAAACAAATTTCATCTTTTCACGATAAATGTCACTTTAGATTTTTTATTTTGTTTTCAA
AATAAAATAAGTGTCATTCTACAATTTCAATGTAATTTGTACATTAAATCTAATTTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR35TF U 24
AF RR2EZ14TF U 1
AF RR2EZ14JQ C 363
BS 1 676 RR2EZ14TF
BS 677 677 RR2FR35TF
BS 678 703 RR2EZ14TF
BS 704 704 RR2FR35TF
BS 705 747 RR2EZ14TF
BS 748 750 RR2EZ14JQ
BS 751 816 RR2EZ14TF
BS 817 817 RR2EZ14JQ
BS 818 829 RR2EZ14TF
BS 830 1020 RR2EZ14JQ

RD RR2FR35TF 691 0 0
GGATTCTTTGTCC
AAAAAAAATAACAAACCCTTTAATTAAACTCTCTTTATTCTTTTGTTTTGTGTGGATGAC
TAAATGGTTGTCTCCTCATGGAAATCATATTGAATCAAATCCAATAGTGGGGATTTTCTA
GTAACCAAATTAAATCAGAACAATATATATCAAGAAAACAAAGATGGTTTTGGAAGAGGA
GGAGAAGAAAGCTGAAGAAACTTCAGAAGACCAAAAGGGACAAGGGGCGTTAAGCAGAAA
GAACAGCCACAGCTCTTTTTGTCCGACAGATGATGACGATGAAGATGAAGAGAAGAAGCT
TGAACTTGGTCCCATGATCGCTCTCAAAGAACTGCTCGAGAAAGACAAGGATGATGAAAG
CTTGAGGAGATGGAAAGAACAACTTCTAGGCAGTGTGGATATGGAGGAGGTTGGATAAAC
TACGGATCCGGTGGTAAAGATAATGTACTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACAT
GGTATTGACGGTGCCTGAAAACGGAAACCCGACATCGAAAGAACCATGGTTTACTCTCAA
AGAAGGCTCTAAGTACACTCTTGTATTTACTTTCCGTGTGACCAACAACATTGTGTCTGG
CCTCCGGTACAGTAATTCGGTTTGGAAGACCGGACTCAAGGTGTATAGTAGAAAGGAGAT
GCTAGGAACGTTTAGTCC

QA 14 691 14 691
DS 

RD RR2EZ14TF 836 0 0
TTTTTCTTCCTGTTACCTTCCTCTCATTCTTTGTCCAAAAAAAATAACAAACCCTTTAAT
TAAACTCTCTTTATTCTTTTGTTTTGTGTGGACGACTAAATGGTGGTCTCCTCATGGAAA
TCATATTGAATCAAATCCAATAGTGGGGATTTTCTAGTAACCAAATTAAATCAGAACAAT
ATATATCAAGAAAACAAAGATGGTTTTGAAAGAGGAGGAGAAGAAAGCTGAAGAAACTTC
AGAAGACCAAAAGGGACAAGGGGCGTTAAGCAGAAAGAACAGCCACAGCTCTTTTTGTCC
GACAGATGATGACGATGAAGATGAAGAGAAGAAGCTTGAACTTGGTCCCATGATCGCTCT
CAAAGAACAGCTCGAGAAAGACAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGGAAAGAACAACT
TCTAGGCAGTGTGGATATGGAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATCCGGTGGTAAAGATAAT
GTACTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACATGGTATTGACGGTGCCTGAAAACGG
AAACCCGATATCGAAAGAACCATGGTTTACTCTCAAAGAAGGCTCTAAGTACACTCTTGT
ATTTACTTTCCGTGTGACCAACAACATTGTGTCTGGCCTCCGGTACAGTAATTCGGTTTG
GAAGACCGGACTCAAG*TGTATAGTAGAAAGGAGATGCTAGGA*CGTTTAGTCCACAGGC
GGAACCGTATAACCATGTCATGTTTGA**GATCGACACCGTCTGGTATGCTCGTTAGAGG
CTCCTATTCCGTTAAATCTAAGTTCGTAGACGACGA*AATAAGTGCTAC
TGGAGAC

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2EZ14JQ 658 0 0
AAGAACAGCTCGAGAAAGACAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGGAAAGAACAACTTC
TAGGCAGTGTGGATATGGAGGAGGTTGGAGAGACTACGGATCCGGTGGTAAAGATAATGT
ACTTAACAATTAGGTCACCGGATAGAGAAGACATGGTATTGACGGTGCCTGAAAACGGAA
ACCCGATATCGAAAGAACCATGGTTTACTCTCAAAGAAGGCTCTAAGTACACTCTTGTAT
TTACTTTCCGTGTGACCAACAACATTGTGTCTGGCCTCCGGTACAGTAATTCGGTTTGGA
AGACCGGACTCAAGGTGTATAGTAGAAAGGAGATGCTAGGAACGTTTAGTCCACAGGCGG
AACCGTATAACCATGTCATGTTTGAAGAATCGACACCGTCTGGTATGCTCGTTAGAGGCT
CCTATTCCGTTAAATCTAAGTTCGTAGACGACGACAATAAGTGCTACCTGGAGAACAACT
ACACCTTCGACATTCGCAAGAATTGGCTGTGATCCTTCCACATAAGTTAATGGAATAAAA
AAACAAATTTCATCTTTTCACGATAAATGTCACTTTAGATTTTTTATTTTGTTTTCAAAA
TAAAATAAGTGTCATTCTACAATTTCAATGTAATTTGTACATTAAATCTAATTTCTAC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 2 8

CO CL617Contig1 664 3 8 U
GGGGGTAATGATTGTCTCTTTAGATTGTTGATGGAAAATCATCACATGCAGAAAAAAGAT
GAAAAATTGACAATGGCATCAGCTCCTTTATCTACATAATAATATTAATAAACCCTCTCA
CAATCTTGCTTAATAAACTTCCACATTCCACTGCTCACTCTTCTTCAATTGCTTCTTGTA
CTCCAACCAATCGATCCCATCTTTAGCAGCAAGTGAGACCATGATCTCATCGATACCCTT
CTCCATACCCTTGAGACCACACATGTAAACAAAGGTGTTGTCTTTCTTAAGCAACTCCCA
CAGCTCTTCTGCATACTCTGCCATTCTTGTCTGTATGTACATTTTCTCTCCCTTCTCGTT
TGTCTGCTCTCTGCTCACCGCAAAGTCCAACCTGAAGTTTTCCGGGTTTTTCTCCTTCAT
CTTCTCAAACTCCTCCTTGTAAAGCAGTGAGCTGCTTGTGGGTACACCCAAGAAGAGCCA
TGCCAAACCGTTGAACTTGTAGTCCTCATGCTCCTCAAAGAACATTTTCCACAAAAATGA
TCTGAATGGTGCTATTCCAGTTCCTGTTCCAAGCATGATGATGGTGGCATTAGGATCTTT
AGGCATAAGCATTTCCTTTCCAACTGGTCCAGTGATCTTTGCCTCATCACCAGGCTTCAA
GTCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2E071JQ U 1
AF RR2DE13JQ U 98
AF RR2E736JQ U 1
BS 1 151 RR2E071JQ
BS 152 152 RR2E736JQ
BS 153 410 RR2E071JQ
BS 411 411 RR2E736JQ
BS 412 438 RR2E071JQ
BS 439 441 RR2E736JQ
BS 442 442 RR2DE13JQ
BS 443 664 RR2E736JQ

RD RR2E071JQ 438 0 0
GGGGGTAATGATTGTCTCTTTAGATTGTTGATGGAAAATCATCACATGCAGAAAAAAGAT
GAAAAATTGACAATGGCATCAGCTCCTTTATCTACATAATAATATTAATAAACCCTCTCA
CAATCTTGCTTAATAAACTTCCACATTCCACCGCTCACTCTTCTTCAATTGCTTCTTGTA
CTCCAACCAATCGATCCCATCTTTAGCAGCAAGTGAGACCATGATCTCATCGATACCCTT
CTCCATACCCTTGAGACCACACATGTAAACAAAGGTGTTGTCTTTCTTAAGCAACTCCCA
CAGCTCTTCTGCATACTCTGCCATTCTTGTCTGTATGTACATTTTCTCTCCCTTCTCGTT
TGTCTGCTCTCTGCTCACCGCAAAGTCCAACCTGAAGTTTTCCGGGTTTTCCTCCTTCAT
CTTCTCAAACTCCTCCTT

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR2DE13JQ 353 0 0
AAAATAT
TTAATAAACCCTCTCACAATCTTGCTTAATAAACTTCCACATTCCACTGCTCACTCTTCT
TCAATTGCTTCTTGTACTCCAACCAATCGATCCCATCTTTAGCAGCAAGTGAAACCATGA
TCTCATCGATACCCTTCTCCATACCCTTGAAACCACACATGTAAACAAAGGTGTTGTCTT
TCTTCAGCAACTCCCACAGCTCTTCTGCATACTCTGCCATTCTTGTCTGTATGTACATTT
TCTCTCCCTTCTCGTTCGTCTGCTCTCTGCTCACCGCAAAGTCCAACCTGAAATTTTCCG
GGTTCTTCTCCTTCATCTTCTCAAACTCCTCCTTGTAAAGCA
AAAA

QA 8 349 8 349
DS 

RD RR2E736JQ 664 0 0
GGGGGTAATGATTGTCTCTT*AGATTGTTGATGGAAAATCATCACATGCAGAAGAAAGAT
GAAGAATTGACAATGGCATCAGCTCCTTTATCTACATAATAATATTAATAAACCCTCTCA
CAATCTTGCTTAGTAGACTTCCACATTCCACTGCTCACTCTTCTTCAATTGCTTCTTGTA
CTCCAACCAATCGATCCCATCTTTAGCAGCAAGTGAGACCATGATCTCATCGATACCCTT
CTCCATACCCTTGAGACCACACATGTAAACAAAGGTGTTGTCTTTCTTAAGCAACTCCCA
CAGCTCTTCTGCATACTCTGCCATTCTTGTCTGTATGTACATTTTCTCTCCCTTCTCGTT
TGTCTGCTCTCTGCTCACCGCAAAGTCCAACCTGAAGTTTTCCGGGTTTTTCTCCTTCAT
CTTCTCAAACTCCTCCTTGTAGAGCAGTGAGCTGCTTGTGGGTACACCCAAGAAGAGCCA
TGCCAAACCGTTGAACTTGTAGTCCTCATGCTCCTCAAAGAACATTTTCCACAAAAATGA
TCTGAATGGTGCTATTCCAGTTCCTGTTCCAAGCATGATGATGGTGGCATTAGGATCTTT
AGGCATAAGCATTTCCTTTCCAACTGGTCCAGTGATCTTTGCCTCATCACCAGGCTTCAA
GTCA

QA 1 664 1 664
DS 



CO CL617Contig2 982 5 6 U
TTTTTTTGTTTTGCAAGAAGAAAAACAGAGAGGCCCATCTTCGTTGCATAGTTGATAAAA
CATGGCTGCTGCAATAGGTGCTGCAGTCTCTTATCCTTCATCCAAGTCCTCTTCTCTTCC
CTCCAAAACTTCCTTCGTCTCCCCTCAAAGGATTTTCCTCAACAACAAGAGCAGAGTGTG
CTACAGAGAGGCGTGTATTTATAGGGGAAGAGTGAAGGCTCAGGTGTCAACAGAGGCGCC
AGTGAAAGTAGTCAAGGAGTCAAAGAAACAAGAAGAAGGGATTGTTGTGAACAAATTCAA
ACCAAAGGAGCCTTACACTGGTCGATGCCTCTTGAACACCAGGATCACTGGCGATGACGC
TCCCGGTGAAACCTGGCACATCGTCTTCAGCACCGAAGGGGAGGTTCCATACAGAGAAGG
GCAGTCGATAGGAGTGATTCCAGAAGGAATTGACAAGAACGGGAAGCCCCACAAGCTGAG
GTTATACTCTATCGCCAGCAGTGCCATTGGTGACTTTGGTGATTCCAAAACCGTTTCTCT
CTGTGTCAAGAGATTAGTTTACACTAACGAAAGCGGAGAGCTTGTTAAGGGAGTCTGCTC
CAACTTCCTGTGTGACTTGAAGCCTGGTGATGAGGCAAAGATCACTGG*ACCAGTTGGAA
AGGAAATGCTTATGCCTAAAGATCCTAATGCCACCATCATCATGCTTGGAACAGGAACTG
GAATAGCACCATTCAGATCATTTTTGTGGAAAATGTTCTTTGAGGAGCATGAGGACTACA
AGTTCAACGGTTTGGCATGGCTCTTCTTGGGTGTACCCACAAGCAGCTCACTGCTCTACA
AGGAGGAGTTTGAGAAGATGAAGAGAAAACCCGGAAAACTTCAGTTGGACTTTGCGGTGA
GCAGAGAGCAGACAACGAGAAGGAGAGAAATGTACATACAGACAGAATGGCAGAGTATGC
AGAGAGCTGTGGGAGTGCTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F736TF U 1
AF RR2E736TF U 28
AF RR2G483TF U 554
AF RR2AK68TF U 66
AF RR2E071TF U 177
BS 1 598 RR2F736TF
BS 599 714 RR2E736TF
BS 715 773 RR2AK68TF
BS 774 774 RR2E071TF
BS 775 837 RR2AK68TF
BS 838 982 RR2E071TF

RD RR2F736TF 598 0 0
TTTTTTTGTTTTGCAAGAAGAAAAACAGAGAGGCCCATCTTCGTTGCATAGTTGATAAAA
CATGGCTGCTGCAATAGGTGCTGCAGTCTCTTATCCTTCATCCAAGTCCTCTTCTCTTCC
CTCCAAAACTTCCTTCGTCTCCCCTCAAAGGATTTTCCTCAACAACAAGAGCAGAGTGTG
CTACAGAGAGGCGTGTATTTATAGGGGAAGAGTGAAGGCTCAGGTGTCAACAGAGGCGCC
AGTGAAAGTAGTCAAGGAGTCAAAGAAACAAGAAGAAGGGATTGTTGTGAACAAATTCAA
ACCAAAGGAGCCTTACACTGGTCGATGCCTCTTGAACACCAGGATCACTGGCGATGACGC
TCCCGGTGAAACCTGGCACATCGTCTTCAGCACCGAAGGGGAGGTTCCATACAGAGAAGG
GCAGTCGATAGGAGTGATTCCAGAAGGAATTGACAAGAACGGGAAGCCCCACAAGCTGAG
GTTATACTCTATCGCCAGCAGTGCCATTGGTGACTTTGGTGATTCCAAAACCGTTTCTCT
CTGTGTCAAGAGATTAGTTTACACTAACGAAAGCGGAGAGCTTGTTAAGGGAGTCTGC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2E736TF 691 0 0
GAGAGGCCCATCTTCGTTGCATAGTTGATAAAACATGGCTGCTGCAATAGGTGCTGCAGT
CTCTTATCCTTCATCCAAGTCCTCTTCTCTTCCCTCCAAAACTTCCTTCGTCTCCCCTCA
AAGGATTTTCCTCAACAACAAGAGCAGAGTGTGCTACAGAGAGGCGTGTATTTATAGGGG
AAGAGTGAAGGCTCAGGTGTCAACAGAGGCGCCAGTGAAAGTAGTCAAGGAGTCAAAGAA
ACAAGAAGAAGGGATTGTTGTGAACAAATTCAAACCAAAGGAGCCTTACACTGGTCGATG
CCTCTTGAACACCAGGATCACTGGCGATGACGCTCCCGGTGAAACCTGGCACATCGTCTT
CAGCACCGAAGGGGAGGTTCCATACAGAGAAGGGCAGTCGATAGGAGTGATTCCAGAAGG
AATTGACAAGAACGGGAAGCCCCACAAGCTGAGGTTATACTCTATCGCCAGCAGTGCCAT
TGGTGACTTTGGTGATTCCAAAACCGTTTCTCTCTGTGTCAAGAGATTAGTTTACACTAA
CGAAAGCGGAGAGCTTGTTAAGGGAGTCTGCTCCAACTTCCTGTGTGACTTGAAGCCTGG
TGATGAGGCAAAGATCACTGG*ACCAGTTGGAAAGGAAATGCTTATGCCTAAAGATCCTA
ATGCCACCATCATCATGCTTGGAACAG
AACT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2G483TF 142 0 0
TTAGTTTACACTAACGAAAGCGGAGAGCTTGTTAAGGGAGTCT*CTCCAACTTCTTGTGT
GACTTGAAGCCTGGTGATGAGGCAAAGATCACTGG*ACCAGTTGGAAAGGAAATGCTTAT
GCCTAAAGATCCTAATGCCACC

QA 1 142 1 142
DS 

RD RR2AK68TF 772 0 0
CTGCTGCAATAGGTGCTGCAGTCTCTTATCCTTCATCCAAGTCCTCTTCTCTTCCCCCCA
AAACTTCCTTCGTCTCCCCTCAAAGGATTTTCCTCAACAACAAGAGCAGAGTGTGCTACA
GAGAGGCGTGTATTTATAGGGGAAGAGTGAAGGCTCAGGTGTCAACAGAGGCGCCAGTGA
AAGTAGTCAAGGAGTCAAAGAAACAAGAAGAAGGGATTGTTGTGAACAAATTCAAACCAA
AGGAGCCTTACACTGGTCGATGCCTCTTGAACACCAGGATCACTGGCGATGACGCTCCCG
GTGAAACCTGGCACATCGTCTTCAGCACCGAAGGGGAGGTTCCATACAGAGAAGGGCAGT
CGATAGGAGTGATTCCAGAAGGAATTGACAAGAACGGGAAGCCCCACAAGCTGAGGTTAT
ACTCTATCGCCAGCAGTGCCATTGGTGACTTTGGTGATTCCAAAACCGTTTCTCTCTGTG
TCAAGAGATTAGTTTACACTAACGAAAGCGGAGAGCTTGTTAAGGGAGTCTGCTCCAACT
TCCTGTGTGACTTGAAGCCTGGTGATGAGGCAAAGATCACTGGGACCAGTTGGAAAGGAA
ATGCTTATGCCTAAAGATCCTAATGCCACCATCATCATGCTTGGAACAGGAACTGGAATA
GCACCATTCAGATCATTTTTGTGGAAAATGTTCTTTGAGGAGCATGAG*ACTACAAGTTC
AACGGTTTGGCATGGCTCTTCTTGGGTGTACCCACAAGCAGCTCACTGCTCT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2E071TF 806 0 0
G
GTGCTACAGAGAGGCGTGTATTTATAGGGGAAGAGTGAAGGCTCAGGTGTCAACAGAGGC
GCCAGTGAAAGTAGTCAAGGAGTCAAAGAAACAAGAAGAAGGGATTGTTGTGAACAAATT
CAAACCAAAGGAGCCTTACACTGGTCGATGCCTCTTGAACACCAGGATCACTGGCGATGA
CGCTCCCGGTGAAACCTGGCACATCGTCTTCAGCACCGAAGGGGAGGCTCCATACAGAGA
AGGGCAGTCGATAGGAGTGATTCCATAAGGAATTGACAAGAACGGGAAGCCCCACAAGCT
GAGGTTATACTCTATCGCCAGCAGTGCCATTGGTGACTTTGGTGATTCCAAAACCGTTTC
TCTCTGTGTCAAGAGATTAGTTTACACTAACGAAAGCGGAGAGCTTGTTAAGGGAGTCTG
CTCCAACTTCCTGTGTGACTTGAAGCCTGGTGATGAGGCAAAGATCACTGG*ACCAGTTG
GAAAGGAAATGCTTATGCCTAAAGATCCTAATGCCACCATCATCATGCTTGGAACAGGAA
CTGGAATAGCACCATTCAGATCATTTTTGTGGAAAATGTTCTTTGAGGAGCATGAGGACT
ACAAGTTCAACGGTTTGGCATGGCTCTTCTTGGGTGTACCCACAAGCAGCTCACTGCTCT
ACAAGGAGGAGTTTGAGAAGATGAAGAGAAAACCCGGAAAACTTCAGTTGGACTTTGCGG
TGAGCAGAGAGCAGACAACGAGAAGGAGAGAAATGTACATACAGACAGAATGGCAGAGTA
TGCAGAGAGCTGTGGGAGTGCTTAA

QA 2 806 2 806
DS 



AS 3 10

CO CL618Contig1 688 2 2 U
GGCTTCTGCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAG
ACAACCAGACCAAGTCATGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACA
CTCGGGAAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCACTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTG
AGGATGTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAA
GGACTGCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAACGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTG
CTCAGTTCGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTCTGG
ATGTTGATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAACAGAGGAGAA
GGACTTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGT
TGATTTTGTCAGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCCA
AGTCGAAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCTTTGTTTTTTTGTTTCTTCTTTTTTTTTGCG
TTTTTGAACGAGATTTTGTTCCCTTTTCTCCATATTCTCAAGACAATGGATAGAGTTAAA
TGTTTTATGAATCATTAATCATTGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AD04JQ C 1
AF RR2AD04TF U 1
BS 1 7 RR2AD04JQ
BS 8 688 RR2AD04TF

RD RR2AD04JQ 688 0 0
GGCTTCTGCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAG
ACAACCAGACCAAGTCATGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACA
CTCGGGAAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCACTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTG
AGGATGTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAA
GGACTGCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAACGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTG
CTCAGTTCGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTCTGG
ATGTTGATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAACAGAGGAGAA
GGACTTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGT
TGATTTTGTCAGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCCA
AGTCGAAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCTTTGTTTTTTTGTTTCTTCTTTTTTTTTGCG
TTTTTGAACGAGATTTTGTTCCCTTTTCTCCATATTCTCAAGACAATGGATAGAGTTAAA
TGTTTTATGAATCATTAATCATTGTTAC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2AD04TF 688 0 0
GGCTTCT
GCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAGACAACCA
GACCAAGTCATGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTCGGGA
AACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCACTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGATGT
GATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
TCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAACGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTCTGGATGTTGA
TGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAACAGAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCAGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCCAAGTCGAA
GAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCTTTGTTTTTTTGTTTCTTCTTTTTTTTTGCGTTTTTGA
ACGAGATTTTGTTCCCTTTTCTCCATATTCTCAAGACAATGGATAGAGTTAAATGTTTTA
TGAATCATTAATCATTGTTAC

QA 8 688 8 688
DS 



CO CL618Contig2 743 4 19 U
GGGCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAGACAAC
CAGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTCGG
GAAACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGAT
GTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACT
GCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAACGGTCAAGGACGCTGGCCTGCTAAATCCGCTCAG
TTCGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGACT
TACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCTAAGTCG
AAGAAGTCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTCTTTTTGCGTTTCTGAAC
GAGATTTTGTTCCCTTTTCTCCATATTCTCAAGACAATGGATAGAGTTCAATGTTGGTCT
TATGAATCATTAATCATTGTTACTAGAATCTTTCTTCTGCCTTCATTGGTTATGTCAGAT
ACTATCTTCAGTTTAACTCTGCT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E478JQ C 1
AF RR2E478TF U 1
AF RR2AD68JQ C 1
AF RR2AD68TF U 1
BS 1 161 RR2AD68TF
BS 162 162 RR2E478TF
BS 163 189 RR2AD68TF
BS 190 190 RR2E478TF
BS 191 258 RR2AD68TF
BS 259 261 RR2E478TF
BS 262 266 RR2AD68TF
BS 267 267 RR2E478TF
BS 268 278 RR2AD68TF
BS 279 279 RR2E478TF
BS 280 308 RR2AD68TF
BS 309 309 RR2E478TF
BS 310 323 RR2AD68TF
BS 324 324 RR2E478TF
BS 325 589 RR2AD68TF
BS 590 590 RR2E478TF
BS 591 644 RR2AD68TF
BS 645 645 RR2E478TF
BS 646 743 RR2AD68TF

RD RR2E478JQ 701 0 0
GGGCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAGACAAC
CAGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTCGG
GAAACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGAT
GTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACT
GCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAACGGTCAAGGACGCTGGCCTGCTAAATCTGCTCAG
TTCGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGACT
TACCGTTCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCTAAGTCG
AAGAAGTCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTTTTTTTGCGTTTCTGAAC
GAGATTTTGTTCCCTTTTCTCCATATTCTCAAGACAATGGATAGAGTTCAATGTTGGTCT
TATGAATCATTAATCATTGTTACTAG
AATCTTTCTTCTGCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2E478TF 675 0 0
GGGCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAGACAAC
CAGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTCGG
GAAACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGAT
GTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACT
GCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAACGGTCAAGGACGCTGGCCTGCTAAATCTGCTCAG
TTCGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGACT
TACCGTTCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCTAAGTCG
AAGAAGTCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTTTTTTTGCGTTTCTGAAC
GAGATTTTGTTCCCTTTTCTCCATATTCTCAAGACAATGGATAGAGTTCAATGTTGGTCT
TATGAATCATTAATC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2AD68JQ 743 0 0
GGGCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAGACAAC
CAGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTCGG
GAAACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGGTACCTTGAGGAT
GTGATAGCTTACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACT
GCTCAAGCTAAGAACAGGT**TCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCCGCTCAG
TTCGTTCTTGATTTGCTCAAGAATGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGACT
TACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTTTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCTAAGTCG
AAGAAGTCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTCTTTTTGTGTTTTTGAAC
GAGATTTTGTTCCCTTTTCTCCATATTCTCAAGACAATGGATAGTGTTCAATGTTGGTCT
TATGAATCATTAATCATTGTTACTAGAATCTTTCTTCTGCCTTCATTGGTTATGTCAGAT
ACTATCTTCAGTTTAACTCTGCT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2AD68TF 743 0 0
GGGCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAGACAAC
CAGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTCGG
GAAACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGGTACCTTGAGGAT
GTGATAGCTTACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACT
GCTCAAGCTAAGAACAGGT**TCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCCGCTCAG
TTCGTTCTTGATTTGCTCAAGAATGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGACT
TACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCAAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCTAAGTCG
AAGAAGTCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTCTTTTTGTGTTTCTGAAC
GAGATTTTGTTCCCTTTTCTCCATATTCTCAAGACAATGGATAGTGTTCAATGTTGGTCT
TATGAATCATTAATCATTGTTACTAGAATCTTTCTTCTGCCTTCATTGGTTATGTCAGAT
ACTATCTTCAGTTTAACTCTGCT

QA 1 743 1 743
DS 



CO CL618Contig3 707 4 7 U
TTTTTTTTTGATACTAGTAACAATGATTAATGATTCATAAGACCAACATTGAACTCTATC
CATTGTCTTGACTGAGAATATGGAGAAAAGGGAACAAAATCTCGTTCAGAAACGCAAAAA
GAAAAAACTGGAAATAAACGAAAGCTTAATTAAGCACTTGATTTCTTCGACTTGGCTGCC
AACTGGGTCTCCGGCTCTTTCTTGACAGACTCTTCCTTCTCAGACAAAATCAACTCAATG
TGGCATGGGTTGGACATGTAAGGGTTGATTCTTCCATGAGCACGGTAAGTCCTTCTCCTC
TGTTTCGCAGCCTGGTTAACTTGAATGTGCGAAATGAATAGCGCATCAACATCCAAACCT
TTCACCTCAGCATTGCTCTCAGCGTTCTTGAGCAAATCAAGAACGAACTGAGCGGATTTA
GCAGGCCAACGTCCTTGACCATTGGAGTGCCTGTTCTTAGCTTGAGCAGTCCTTCCAACA
CCTCTGCAGAAACGGGTGAAAGGAATAGCCTGCTTGTGAGCTATCACATCCTCAAGGTAC
CTCTTCGCCTTGAGCAATGGTAGCTTCCTGATGGCGTGCGCTGTTTCCCGAGTGTTCTTG
AAGTGAACCCTAAGATCGGAACCTCTAGCCTTGCATGACTTGGTCTGGTTGCCTGGTTCT
CGGGAGTACTTTACCATGGCTGCGGCTATCAAAAGAATCGGCTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 

AF RR2GA03TF C 1
AF RR2GA03JQ U 11
AF RR2A889JQ U 60
AF RR2A889TF C 60
BS 1 13 RR2GA03TF
BS 14 395 RR2GA03JQ
BS 396 396 RR2A889JQ
BS 397 660 RR2GA03JQ
BS 661 661 RR2A889JQ
BS 662 680 RR2GA03JQ
BS 681 707 RR2A889JQ

RD RR2GA03TF 712 0 0
TTTTTTTTTGATACTAGTAACAATGATTAATGATTCATAAGACCAACATTGAACTCTATC
CATTGTCTTGACTGAGAATATGGAGAAAAGGGAACAAAATCTCGTTCAGAAACGCAAAAA
GAAAAAACTGGAAATAAACGAAAGCTTAATTAAGCACTTGATTTCTTCGACTTGGCTGCC
AACTGGGTCTCCGGCTCTTTCTTGACAGACTCTTCCTTCTCAGACAAAATCAACTCAATG
TGGCATGGGTTGGACATGTAAGGGTTGATTCTTCCATGAGCACGGTAAGTCCTTCTCCTC
TGTTTCGCAGCCTGGTTAACTTGAATGTGCGAAATGAATAGCGCATCAACATCCAAACCT
TTCACCTCAGCATTGCTCTCAGCGTTCTTGAGCAAGTCAAGAACGAACTGAGCGGATTTA
GCAGGCCAACGTCCTTGACCATTGGAGTGCCTGTTCTTAGCTTGAGCAGTCCTTCCAACA
CCTCTGCAGAAACGGGTGAAAGGAATAGCCTGCTTGTGAGCTATCACATCCTCAAGGTAC
CTCTTCGCCTTGAGCAATGGTAGCTTCCTGATGGCGTGCGCTGTTTCCCGAGTGTTCTTG
AAGTGAACCCTAAGATCGGAACCTCTAGCCTTGCATGACTTGGTCTGGTTGCCTGGTTCT
TGGGAGTACTTTACCATGGCTGCGGCTATCAAAAGAATCGGCTGC
AGAAGCC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2GA03JQ 670 0 0
ATA
CTAGTAACAATGATTAATGATTCATAAGACCAACATTGAACTCTATCCATTGTCTTGACT
GAGAATATGGAGAAAAGGGAACAAAATCTCGTTCAGAAACGCAAAAAGAAAAAACTGGAA
ATAAACGAAAGCTTAATTAAGCACTTGATTTCTTCGACTTGGCTGCCAACTGGGTCTCCG
GCTCTTTCTTGACAGACTCTTCCTTCTCAGACAAAATCAACTCAATGTGGCATGGGTTGG
ACATGTAAGGGTTGATTCTTCCATGAGCACGGTAAGTCCTTCTCCTCTGTTTCGCAGCCT
GGTTAACTTGAATGTGCGAAATGAATAGCGCATCAACATCCAAACCTTTCACCTCAGCAT
TGCTCTCAGCGTTCTTGAGCAAGTCAAGAACGAACTGAGCGGATTTAGCAGGCCAACGTC
CTTGACCATTGGAGTGCCTGTTCTTAGCTTGAGCAGTCCTTCCAACACCTCTGCAGAAAC
GGGTGAAAGGAATAGCCTGCTTGTGAGCTATCACATCCTCAAGGTACCTCTTCGCCTTGA
GCAATGGTAGCTTCCTGATGGCGTGCGCTGTTTCCCGAGTGTTCTTGAAGTGAACCCTAA
GATCGGAACCTCTAGCCTTGCATGACTTGGTCTGGTTGCCTGGTTCTTGGGAGTACTTTA
CCATGGC

QA 4 670 4 670
DS 

RD RR2A889JQ 648 0 0
CCATTGTCTTGACTGAAAATATGGAGAAAAGGGAACAAAATCTCGTTCAGAAACGCAAAA
AGAAAAAACTGGAAATAAACGAAAGCTTAATTAAGCACTTGATTTCTTCGACTTGGCTGC
CAACTGGGTCTCCGGCTCTTTCTTGACAGACTCTTCCTTCTCAGACAAAATCAACTCAAT
GTGGCATGGGTTGGACATGTAAGGGTTGATTCTTCCATGAGCACGGTAAGTCCTTCTCCT
CTGTTTCGCAGCCTGGTTAACTTGAATGTGCGAAATGAATAGCGCATCAACATCCAAACC
TTTCACCTCAGCATTGCTCTCAGCGTTCTTGAGCAAATCAAGAACGAACTGAGCGGATTT
AGCAGGCCAACGTCCTTGACCATTGGAGTGCCTGTTCTTAGCTTGAGCAGTCCTTCCAAC
ACCTCTGCAGAAACGGGTGAAAGGAATAGCCTGCTTGTGAGCTATCACATCCTCAAGGTA
CCTCTTCGCCTTGAGCAATGGTAGCTTCCTGATGGCGTGCGCTGTTTCCCGAGTGTTCTT
GAAGTGAACCCTAAGATCGGAACCTCTAGCCTTGCATGACTTGGTCTGGTTGTCTGGTTC
TCGGGAGTACTTTACCATGGCTGCGGCTATCAAAAGAATCGGCTGCCC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2A889TF 648 0 0
CCATTGTCTTGACTGAGAATATGGAGAAAAGGGAACAAAATCTCGTTCAGAAACGCAAAA
AGAAAAAACTGGAAATAAACGAAAGCTTAATTAAGCACTTGATTTCTTCGACTTGGCTGC
CAACTGGGTCTCCGGCTCTTTCTTGACAGACTCTTCCTTCTCAGACAAAATCAACTCAAT
GTGGCATGGGTTGGACATGTAAGGGTTGATTCTTCCATGAGCACGGTAAGTCCTTCTCCT
CTGTTTCGCAGCCTGGTTAACTTGAATGTGCGAAATGAATAGCGCATCAACATCCAAACC
TTTCACCTCAGCATTGCTCTCAGCGTTCTTGAGCAAATCAAGAACGAACTGAGCGGATTT
AGCAGGCCAACGTCCTTGACCATTGGAGTGCCTGTTCTTAGCTTGAGCAGTCCTTCCAAC
ACCTCTGCAGAAACGGGTGAAAGGAATAGCCTGCTTGTGAGCTATCACATCCTCAAGGTA
CCTCTTCGCCTTGAGCAATGGTAGCTTCCTGATGGCGTGCGCTGTTTCCCGAGTGTTCTT
GAAGTGAACCCTAAGATCGGAACCTCTAGCCTTGCATGACTTGGTCTGGTTGTCTGGTTC
TCGGGAGTACTTTACCATGGCTGCGGCTATCAAAAGAATCGGCTGCCC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 2 10

CO CL619Contig1 831 6 32 U
ACTGTACGCCCTCGATGAGGACCAATCCTCGCCGATGCAAAGCTCATTTTTAATCATAAA
TCTCAAGTTACAAAAACATCATTTATTCCACGTTTAAGATGCATACAAACAAGAACATAC
AATTCTCTCCACATCCATCATCCATAGCTCTGGCATTATTTAAGAAGACATGATCATCAA
ACTAAAGTAAAATAGAACACAACTGAACATAGATAGGAACCAAAGCGACAAACAAACGGA
TCTACTCAACCCCAAACTTCTTCCTGAGCATACCCATAAACTCAGTAACCTTCTCAAAAT
CAGGCAAGGACTTGGCCACACTCTCCCTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGTAATAAGTT
TCGGACACTCTGCTTCGAAGTTGAGGTTACCAAACTTCTCATACCCAGGGAACCAGGAGT
AGAATCCAATCAGTCCAATGTCTACGTAGCCAAAGTCATCCCCACCAAAGTAAGGCTTGT
CTCCAAGCTCGGATTCAAGAGTCTTGAGTATCTCAATGAACTCCTTCTTGCCTGCCTCTT
GTTCCTCACCCTTGGAAGCATACACCTTCCTCTGTGCATCGTACATCTTCTTGTCGATGA
AATCAACCCAGAACCTAGCCTGAGCTCTCTGGTAAGGATCAGAAGGGAGGATAGGGTTCT
TGTGAGACCAGACCTCGTCGATGTACTGAACCTGGATGGCTGATTCACAGACCGGTTTAC
CGTTGTGGATGAGAACCGGAATCTTCTTGTGGACCGGGTTCATCTGGAGAAGCAGAGGGC
TCTTGTCCCTCAGATTCTCGTCCCTGTACTCGAACTCGACACCATTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2A378TF C 1
AF RR2FD31JQ U 70
AF RR2H656JQB U 70
AF RR2BD42JQ U 245
AF RR2H820JQ U 70
AF RR2AQ21JQ U 86
BS 1 70 RR2A378TF
BS 71 79 RR2FD31JQ
BS 80 80 RR2H656JQB
BS 81 92 RR2FD31JQ
BS 93 93 RR2H820JQ
BS 94 182 RR2FD31JQ
BS 183 183 RR2H656JQB
BS 184 192 RR2FD31JQ
BS 193 193 RR2H820JQ
BS 194 224 RR2FD31JQ
BS 225 225 RR2H820JQ
BS 226 256 RR2FD31JQ
BS 257 257 RR2H820JQ
BS 258 277 RR2FD31JQ
BS 278 278 RR2H820JQ
BS 279 351 RR2FD31JQ
BS 352 352 RR2H820JQ
BS 353 432 RR2FD31JQ
BS 433 433 RR2H656JQB
BS 434 534 RR2FD31JQ
BS 535 535 RR2H656JQB
BS 536 649 RR2FD31JQ
BS 650 650 RR2H656JQB
BS 651 651 RR2FD31JQ
BS 652 652 RR2H656JQB
BS 653 706 RR2FD31JQ
BS 707 707 RR2H656JQB
BS 708 768 RR2FD31JQ
BS 769 823 RR2H820JQ
BS 824 824 RR2AQ21JQ
BS 825 828 RR2H820JQ
BS 829 831 RR2AQ21JQ

RD RR2A378TF 437 0 0
ACTGTACGCCCTCGATGAGGACCAATCCTCGCCGATGCAAAGCTCATTTTTAATCATAAA
TCTCAAGTTACAAAAACATCATTTATTCCACGTTTAAGAGGCATACAAACAAGAACATAC
AATTCTCTCCACATCCATCATCCATAGCTCTGGCATTATTTAAGAAGACATGATCATCAA
ACTAAAGTAAAATAGAACACAACTGAGCATAGATAGGAACCAAAGCGACAAACAAACGGA
TCTACTCAACCCCAAACTTCTTCCTGAGCATACCCATAAACTCAGTAACCTTCTCAAAAT
CAGGCAAGGACTTGGCCACACTCTCCCTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGTAATAAGTT
TCGGACACTTTGCTTCGAAGTTGAGGTTACCAAACTTCTCATACCCAGGGAACCAGGAGT
AGAATCCAATCAGTCC
C

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR2FD31JQ 699 0 0
A
CAAAAACATAATTTATTCCACGCTTAAGATGCATACAAACAAGAACATACAATTCTCTCC
ACATCCATCATCCATAGCTCTGGCATTATTTAAGAAGACATGATCATCAAACCAAAGTAA
AACAGAACACAACTGAACATAGATAGGAACCAAA*CGACAAACAAACGGATCTACTCAAC
CCCAAATTTCTTCCTGAGCATACCCATGAACTCAGTAACCTTCTCAAAATCAGGCAAGGA
CTTGGCCACACTCTCCCTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATAAGTTTCGGACACTC
TGCTTCGAAGTTGAGGTTACCAAACTTCTCATACCCAGGGAACCAGGAGTAGAATCCAAT
CAATCCAATGTCTACGTAGCCAAAGTCATCCCCACCAAAGTAAGGCTTGTCTCCAAGCTC
GGATTCAAGAGTCTTGAGTATCTCAATGAACTCCTTCTTGCCTGTCTCTTGTTCCTCACC
CTTGGAAGCATACACCTTCCTCTGTGCATCGTACATCTTCTTGTCGATGAAATCAACCCA
GAACCTAGCCTGAGCTCTCTGGTAAGGATCAGAAGGGAGAAGAGGGTTCTTGTGAGACCA
GACCTCGTCGATGTACTGAACCTGGATGGCTGATTCGCAGACCGGTTTACCGTTGTGGAT
GAGAACCGGAATCTTCTTGTGGACCGGGTTCATCTGGA

QA 2 699 2 699
DS 

RD RR2H656JQB 703 0 0
G
CAAAAACATCATTTATTCCACGCTTAAGATGCATACAAACAAGAACATACAATTCTCTCC
ACATCCATCATCCATATCTCTGGCATTATTTAAGAAGACATGATCATCAAACTAAAGTAA
AACAGAACACAACTGAACATAGATAGGAACCAAA*CGACAAACAAACGGATCTACTCAAC
CCCAAATTTCTTCCTGAGCATACCCATGAACTCAGTAACCTTCCCAAAATCAGGCAGGGA
CTTGGCCACACTCTCCCTCTGCATACACCTCTTGGCCCAAGCAATAAGTTTCGGACACTC
TGCTTCGAAGTTGAGGTTACCAAACTTCTCATACCCAGGGAACCAGGAGTAGAATCCAAT
CAGTCCAATGTCTACGTAGCCAAAGTCATCCCCACCAAAGTAAGGCTTGTCTCCAAGCTC
GGATTCAAGAGTCTTGAGTATCTCAATGAACTCCTTCTTGCCTGCCTCTTGTTCCACACC
CTTGGAAGCATACACCTTCCTCTGTGCATCGTACATCTTCTTGTCGATGAAATCAACCCA
GAACCTAGCCTGAGCTCTCTGGTAAGGATCAGAAGGGAGGATAGGGTTCTTGTGAGACCA
GACCTCGTCGATGTACTGAACCTGGATGGCTGATTCACAGACCGGTTTACCGTTGCGGAT
GAGAACCGGAATCTTCTTGTGGACCGGGTTCATCTGG
GAGGA

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR2BD42JQ 522 0 0
CTCAACCCCAAATTTCTTCCTGAGCATACCCATGAACTCAGTAACCTTCTCAAAATCAGG
CAGGGACTTGGCCACACTCTCCCTCTGCATACACCTCTTGGCCCAAGCAATAAGTTTCGG
ACACTCTGCTTCGAAGTTGAGGTTACCAAACTTCTCATACCCAGGGAACCAGGAGTAGAA
TCCAATCAGTCCAATGTCTACGTAGCCAAAGTCATCCCCACCAAAGTAAGGCTTGTCTCC
AAGCTCGGATTCAAGAGTCTTGAGTATCTCAATGAACTCCTTCTTGCCTGCCTCTTGTTC
CTCACCCTTGGAAGCATACACCTTCCTCTGTGCATCGTACATCTTCTTGTCGATGAAATC
AACCCAGAACCTAGCCTGAGCTCTCTGGTAAGGATCAGAAGGGAGGATAGGGTTCTTGTG
AGACCAGACCTCGTCGATGTACTGAACCTGGATGGCTGATTCACAGACCGGTTTACCGTT
GTGGATGAGAACCGGAATCTTCTTGTGGACCGGGTTCATCTG

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2H820JQ 759 0 0
A
CAAAAACATCATTTATTCCACGTTTAGGATGCATACAAACAAGAACATACAATTCTCTCC
ACATCCATCATCCATAGCTCTGGCATTATTTAAGAAGACATGATCATCAAACTAAAGTAA
AATAGAACACAACTGAACATAGATAGGAACCAAAGCGACAAACAAACGGATCTACTCAAC
CCCAAACTTCTTCCTGAGCATACCCATAAACTCAGTAACCTTCTCAAAATCAGGCAAGGA
CTTGGCCACACTCTCCCTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGTAATAAGTTTCGGACACTC
TGCTTCGAAGTTGAGGTTACCAAACTTCTCATACCCAGGGAACCAGGAGTAGAATCCAAT
CAGTCCAATGTCTACGTAGCCAAAGTCATCCCCACCAAAGTAAGGCTTGTCTCCAAGCTC
GGATTCAAGAGTCTTGAGTATCTCAATGAACTCCTTCTTGCCTGCCTCTTGTTCCTCACC
CTTGGAAGCATACACCTTCCTCTGTGCATCGTACATCTTCTTGTCGATGAAATCAACCCA
GAACCTAGCCTGAGCTCTCTGGTAAGGATCAGAAGGGAGGATAGGGTTCTTGTGAGACCA
GACCTCGTCGATGTACTGAACCTGGATGGCTGATTCACAGACCGGTTTACCGTTGTGGAT
GAGAACCGGAATCTTCTTGTGGACCGGGTTCATCTGGAGAAGCAGAGGGCTCTTGTCCCT
CAGATTCTCGTCCCTGTACTCGAACTCGACACCTTTCT

QA 2 759 2 759
DS 

RD RR2AQ21JQ 746 0 0
TTCCACGTTTAAGATGCATACAAACAAGAACATACAATTCTCTCCACATCCATCATCCAT
AGCTCTGGCATTATTTAAGAAGACATGATCATCAAACTAAAGTAAAATAGAACACAACTG
AACATAGATAGGAACCAAAGCGACAAACAAACGGATCTACTCAACCCCAAACTTCTTCCT
GAGCATACCCATAAACTCAGTAACCTTCTCAAAATCAGGCAAGGACTTGGCCACACTCTC
CCTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGTAATAAGTTTCGGACACTCTGCTTCGAAGTTGAG
GTTACCAAACTTCTCATACCCAGGGAACCAGGAGTAGAATCCAATCAGTCCAATGTCTAC
GTAGCCAAAGTCATCCCCACCAAAGTAAGGCTTGTCTCCAAGCTCGGATTCAAGAGTCTT
GAGTATCTCAATGAACTCCTTCTTGCCTGCCTCTTGTTCCTCACCCTTGGAAGCATACAC
CTTCCTCTGTGCATCGTACATCTTCTTGTCGATGAAATCAACCCAGAACCTAGCCTGAGC
TCTCTGGTAAGGATCAGAAGGGAGGATAGGGTTCTTGTGAGACCAGACCTCGTCGATGTA
CTGAACCTGGATGGCTGATTCACAGACCGGTTTACCGTTGTGGATGAGAACCGGAATCTT
CTTGTGGACCGGGTTCATCTGGAGAAGCAGAGGGCTCTTGTCCCTCAGATTCTCGTCCCT
GTACTCGAACTCGACACCATTCTCCC

QA 1 746 1 746
DS 



CO CL619Contig2 823 4 12 U
GGACAACAGTAAAACAAATATCTCACTTCTGTAAGCTTTCAGGCGTCGCAAAATACAATG
GCGAACGAGGTGATCCTTCTTGATTACTGGCCTAGCATGTTCGGCATGAGGACAAGGATC
GCTTTGAGGGAGAAAGGTGTCGAGTTCGAGTACAGGGACGAGAATCTGAGGGACAAGAGC
CCTCTGCTTCTCCAGATGAACCCGGTCCACAAGAAGATTCCGGTTCTCATCCACAACGGT
AAACCGGTCTGTGAATCAGCCATCCAGGTTCAGTACATCGACGAGGTCTGGTCTCACAAG
AACCCTATCCTCCCTTCTGATCCTTACCAGAGAGCTCAGGCTAGGTTCTGGGTTGATTTC
ATCGACAAGAAGATGTACGATGCACAGAGGAAGGTGTATGCTTCCAAGGGTGAGGAACAA
GAGGCAGGCAAGAAGGAGTTCATTGAGATACTCAAGACTCTTGAATCCGAGCTTGGAGAC
AAGCCTTACTTTGGTGGGGATGACTTTGGCTACGTAGACATTGGACTGATTGGATTCTAC
TCCTGGTTCCCTGGGTATGAGAAGTTTGGTAACCTCAACTTCGAAGCAGAGTGTCCGAAA
CTTATTACTTGGGCTAAGAGGTGTATGCAGAGGGAGAGTGTGGCCAAGTCCTTGCCTGAT
TTTGAGAA*GTTACTGAGTTCATGGGTATGCTCAGAAGAAATTTGGGGTTGAGTAGATCC
GTTTGTTTGTCGTTTGGTTCCTATCTATGTTCAGTTGTGTTCTGTTTACTTTGGTTTGAT
GATCATGTCTTCTTAATATGCAGAGCTATGGATGATGGATGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ21TF U 1
AF RR2H820TF U 1
AF RR2BD42TF U 76
AF RR2FD31TF U 1
BS 1 134 RR2AQ21TF
BS 135 135 RR2H820TF
BS 136 668 RR2AQ21TF
BS 669 669 RR2H820TF
BS 670 680 RR2AQ21TF
BS 681 681 RR2FD31TF
BS 682 695 RR2AQ21TF
BS 696 740 RR2FD31TF
BS 741 741 RR2BD42TF
BS 742 760 RR2FD31TF
BS 761 761 RR2BD42TF
BS 762 823 RR2FD31TF

RD RR2AQ21TF 698 0 0
GGACAACAGTAAAACAAATATCTCACTTCTGTAAGCTTTCAGGCGTCGCAAAATACAATG
GCGAACGAGGTGATCCTTCTTGATTACTGGCCTAGCATGTTCGGCATGAGGACAAGGATC
GCTTTGAGGGAGAATGGTGTCGAGTTCGAGTACAGGGACGAGAATCTGAGGGACAAGAGC
CCTCTGCTTCTCCAGATGAACCCGGTCCACAAGAAGATTCCGGTTCTCATCCACAACGGT
AAACCGGTCTGTGAATCAGCCATCCAGGTTCAGTACATCGACGAGGTCTGGTCTCACAAG
AACCCTATCCTCCCTTCTGATCCTTACCAGAGAGCTCAGGCTAGGTTCTGGGTTGATTTC
ATCGACAAGAAGATGTACGATGCACAGAGGAAGGTGTATGCTTCCAAGGGTGAGGAACAA
GAGGCAGGCAAGAAGGAGTTCATTGAGATACTCAAGACTCTTGAATCCGAGCTTGGAGAC
AAGCCTTACTTTGGTGGGGATGACTTTGGCTACGTAGACATTGGACTGATTGGATTCTAC
TCCTGGTTCCCTGGGTATGAGAAGTTTGGTAACCTCAACTTCGAAGCAGAGTGTCCGAAA
CTTATTACTTGGGCTAAGAGGTGTATGCAGAGGGAGAGTGTGGCCAAGTCCTTGCCTGAT
TTTGAGAAAGTTACTGAGTTTATGGGTATGCTCAG
AAG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2H820TF 691 0 0
GGACAACAGTAAAACAAATATCTCACTTCTGTAAGCTTTCAGGCGTCGCAAAATACAATG
GCGAACGAGGTGGTCCTTCTTGATTACTGGCCTAGCATGTTCGGCATGAGGACAAGGATC
GCTTTGAGGGAGAAAGGTGTCGAGTTCGAGTACAGGGACGAGAATCTGAGGGACAAGAGC
CCTCTGCTTCTCCAGATGAACCCGGTCCACAAGAAGATTCCGGTTCTCATCCACAACGGT
AAACCGGTCTGTGAATCAGCCATCCAGGTTCAGTACATCGACGAGGTCTGGTCTCACAAG
AACCCTATCCTCCCTTCTGATCCTTACCAGAGAGCTCAGGCTAGGTTCTGGGTTGATTTC
ATCGACAAGAAGATGTACGATGCACAGAGGAAGGTGTATGCTTCCAAGGGTGAGGAACAA
GAGGCAGGCAAGAAGGAGTTCATTGAGATACTCAAGACTCTTGAATCCGAGCTTGGAGAC
AAGCCTTACTTTGGTGGGGATGACTTTGGCTACGTAGACATTGGACTGATTGGATTCTAC
TCCTGGTTCCCTGGGTATGAGAAGTTTGGTAACCTCAACTTCGAAGCAGAGTGTCCGAAA
CTTATTACTTGGGCTAAGAGGTGTATGCAGAGGGAGAGTGTGGCCAAGTCCTTGCCTGAT
TTTGAGAA*GTTACTGAGTTTATGGGTATGC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2BD42TF 691 0 0
CTTCTTGATTACTGGCCTAGCATGTTCGGCATGAGGACAAGGACCGCCTTGAGGGAGAAA
GGTGTCGAGTTCGAGTACAGGGACGAGAATCTGAGGGACAAGAGCCCTCTGCTTCTCCAG
ATGAACCCGGTCCACAAGAAGATTCCGGTTCTCATCCACAACGGTAAACCGGTCTGTGAA
TCAGCCATCCAGGTTCAGTACATCGACGAGGTCTGGTCTCACAAGAACCCTATCCTCCCT
TCTGATCCTTACCAGAGAGCTCAGGCTAGGTTCTGGGTTGATTTCATCGACAAGAAGATG
TACGATGCACAGAGGAAGGTGTATGCTTCCAAGGGTGAGGAACAAGAGGCAGGCAAGAAG
GAGTTCATTGAGATACTCAAGACTCTTGAATCCGAGCTTGGAGACAAGCCTTACTTTGGT
GGGGATGACTTTGGCTACGTAGACATTGGACTGATTGGATTCTACTCCTGGTTCCCTGGG
TATGAGAAGTTTGGTAACCTCAACTTCGAAGCAGAGTGTCCGAAACTTATTGCTTGGGCC
AAGAGGTGTATGCAGAGGGAGAGTGTGGCCAAGTCCCTGCCTGATTTTGAGAA*GTTACT
GAGTTCATGGGTATGCTCAGAAGAAATTTGGGGTTGAGTAGATCCGTTTGTTTGTCGTTT
GGTTCCTATCTATGTTCAGTTGTGTTCT
GTT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2FD31TF 823 0 0
GGACAACAGTAAAACAAATCTCTCTCTTCTGTAAGCTTTCAGGCGTCGCAAAATACAATG
GCGAACGAGGTGATCCTTCTTGATTACTGGCCTAGCATGTTCGGCATGAGGACAAGGATC
GCTTTGAGGGAGAAAGGTGTCGAGTTCGAGTACAGAGACGAGAATCTGAGGGACAAGAGC
CCTCTGCTTCTCCAGATGAACCCGGTCCACAAGAAGATTCCGGTTCTCATCCACAACGGT
AAACCGGTCTGCGAATCAGCCATCCAGGTTCAGTACATCGACGAGGTCTGGTCTCACAAG
AACCCTCTTCTCCCTTCTGATCCTTACCAGAGAGCTCAGGCTAGGTTCTGGGTTGATTTC
ATCGACAAGAAGATGTACGATGCACAGAGGAAGGTGTATGCTTCCAAGGGTGAGGAACAA
GAGACAGGCAAGAAGGAGTTCATTGAGATACTCAAGACTCTTGAATCCGAGCTTGGAGAC
AAGCCTTACTTTGGTGGGGATGACTTTGGCTACGTAGACATTGGATTGATTGGATTCTAC
TCCTGGTTCCCTGGGTATGAGAAGTTTGGTAACCTCAACTTCGAAGCAGAGTGTCCGAAA
CTTATTGCTTGGGCTAAGAGGTGTATGCAGAGGGAGAGTGTGGCCAAGTCCTTGCCTGAT
TTTGAGAA*GTTACTGAGTTCATGGGTATGCTCAGAAGAAATTTGGGGTTGAGTAGATCC
GTTTGTTTGTCGTTTGGTTC*TATCTATGTTCAGTTGTGT*CTGTTTACTTTGGTTTGAT
GATCATGTCTTCTTAATATGCAGAGCTATGGATGATGGATGTG

QA 1 823 1 823
DS 



AS 2 9

CO CL620Contig1 740 3 10 U
GGACGCAAAACCGTAAACCGCTACAAAACCGGAAAAAAAAAAGGAAAAACAAATTTGTGT
TTGTTTGTTAGTTTGTTAAGAATCCGATGGACTCATCGTCGTCACCAGCAGCAGGAGCAG
CAGCAGCGAAGCCGGCGAGAGGCGCGGGAGGAAGAAAAGAAGGCAATCGGAAGAAGAGCG
TTTCAAAGTCGGCCAAGGCTGGTCTCCAGTTTCCCGTGGGGCGTATCTCTCGTTACTTGA
AGAAAGGTCGTTACGCGATCAGGTACGGCGCCGGTGCTCCCGTTTACCTCGCCGCCGTTC
TCGAGTACCTCGCCGCCGAGGTTCTGGAGCTGGCAGGAAACGCAGCGAGGGACAACAAGA
AGAACAGGATAAACCCGAGGCATCTTTGCTTGGCGATAAGGAACGACGAGGAGTTGGGGA
AGTTGCTCCACGGAGTCACCATCGCGAGCGGTGGAGTTCTTCCGAACATCAACCCGGTGC
TTCTTCCCAAGAGATCTGCATCTCAAACTGAGAAGCCTGAGAAAGCTGCTAAGGCTGCTA
AATCTCCCAAGAAGGCTTAACTGTTGCTGTGATGCGTTTGTTATATCGATCTAGAAGAAG
AACGACTTGTTTTTTTTTTAGGGATTGTGTAGGTTGGTTGCTTTCTATGTTTACTCTCTG
TTTGTAGTTTTCAAGGCATTGGCTTTGTATATATTTCTGCTGAAGACTTTAAAAATAAAA
GTTCTGCCTTCGGAGAGCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM62TF U 1
AF RR2D022TF U 1
AF RR2D022JQ C 167
BS 1 159 RR2D022TF
BS 160 160 RR2DM62TF
BS 161 632 RR2D022TF
BS 633 633 RR2D022JQ
BS 634 703 RR2D022TF
BS 704 704 RR2D022JQ
BS 705 714 RR2D022TF
BS 715 715 RR2D022JQ
BS 716 732 RR2D022TF
BS 733 740 RR2D022JQ

RD RR2DM62TF 467 0 0
GGACGCAAAACCGTAAACCGCTACAAAACCGGAAAAAAAAAAGGAAAAACAAATTTGTGT
TTGTTTGTTAGTTTGTTAAGAATCCGATGGACTCATCGTCGTCACCAGCAGCAGGAGCAG
CAGCAGCGAAGCCGGCGAGAGGCGCGGGAGGAAGAAAAGAAGGCGATCGGAAGAAGAGCG
TTTCAAAGTCGGCCAAGGCTGGTCTCCAGTTTCCCGTGGGGCGTATCTCTCGTTACTTGA
AGAAAGGTCGTTACGCGATCAGGTACGGCGCCGGTGCTCCTGTTTACCTCGCCGCCGTTC
TCGAGTACCTCGCCGCCGAGGTTCTGGAGCTGGCGGGGAACGCAGCGAGGGACAACAAGA
AGAACAGGATAAACCCGAGGCATCTTTGCTTGGCGATAAGGAACGACGAGGAGTTGGGGA
AGTTGCTCCACGGAGTCTCCATCGCGAGCGGTGGAGTTCTTCCGAAC

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2D022TF 739 0 0
GGACGCAAAACCGTAAACCGCTACAAAACCGGAAAAAAAAAAGGAAAAACAAATTTGTGT
TTGTTTGTTAGTTTGTTAAGAATCCGATGGACTCATCGTCGTCACCAGCAGCAGGAGCAG
CAGCAGCGAAGCCGGCGAGAGGCGCGGGAGGAAGAAAAGGAGGCAATCGGAAGAAGAGCG
TTTCAAAGTCGGCCAAGGCTGGTCTCCAGTTTCCCGTGGGGCGTATCTCTCGTTACTTGA
AGAAAGGTCGTTACGCGATCAGGTACGGCGCCGGTGCTCCCGTTTACCTCGCCGCCGTTC
TCGAGTACCTCGCCGCCGAGGTTCTGGAGCTGGCAGGAAACGCAGCGAGGGACAACAAGA
AGAACAGGATAAACCCGAGGCATCTTTGCTTGGCGATAAGGAACGACGAGGAGTTGGGGA
AGTTGCTCCACGGAGTCACCATCGCGAGCGGTGGAGTTCTTCCGAACATCAACCCGGTGC
TTCTTCCCAAGAGATCTGCATCTCAAACTGAGAAGCCTGAGAAAGCTGCTAAGGCTGCTA
AATCTCCCAAGAAGGCTTAACTGTTGCTGTGATGCGTTTGTTATATCGATCTAGAAGAAG
AACGACTTGTTTTTTTTTTAGGGATTGTGTAG*TTGGTTGCTTTCTATGTTTACTCTCTG
TTTGTAGTTTTCAAGGCATTGGCTTTGTATATATTTCTGCTGA*GACTTTAAAA*TAAAA
GTTCTGCCTTCG
AGAGCCC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2D022JQ 574 0 0
TCGGAAGAAGAGCGTTTCAAAGTCGGCCAAGGCTGGTCTCCAGTTTCCCGTGGGGCGTAT
CTCTCGTTACTTGAAGAAAGGTCGTTACGCGATCAGGTACGGCGCCGGTGCTCCCGTTTA
CCTCGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCCGCCGAGGTTCTGGAGCTGGCAGGAAACGCAGC
GAGGGACAACAAGAAGAACAGGATAAACCCGAGGCATCTTTGCTTGGCGATAAGGAACGA
CGAGGAGTTGGGGAAGTTGCTCCACGGAGTCACCATCGCGAGCGGTGGAGTTCTTCCGAA
CATCAACCCGGTGCTTCTTCCCAAGAGATCTGCATCTCAAACTGAGAAGCCTGAGAAAGC
TGCTAAGGCTGCTAAATCTCCCAAGAAGGCTTAACTGTTGCTGTGATGCGTTTGTTATAT
CGATCTAGAAGAAGAACGACTTGTTTTTTTTTTAGGGATTGTGTAGGTTGGTTGCTTTCT
ATGTTTACTCTCTGTTTGTAGTTTTCAAGGCATTGGCTTTGTATATATTTCTGCTGAAGA
CTTTAAAAATAAAAGTTCTGCCTTCGGAGAGCCC

QA 1 574 1 574
DS 



CO CL620Contig2 793 6 11 U
ACCAGAAAGAAACTTTTATTTATTTGATATACGACTGAGAAACTGAGTAGAAGATACCCA
GAAATTAGTTCATTCATTACAAAATGGCTGTAACACATAATCTTGCCATCCGAGGATCCA
TAAACAAACCACAAACAGAGAGTAAACATAGAAAGCAACCAACCTACACAATCCCTAAAA
AAAA*CAAGTCGTTCTTCTTCTAGATCGATATAACAAACGCATCACAGCAACAGTTAAGC
CTTCTTGGGAGATTTAGCAGCCTTAGCAGCTTTCTCAGGCTTCTCAGTTTGAGATGCAGA
TCTCTTGGGAAGAAGCACCGGGTTGATGTTCGGAAGAACTCCACCGCTCGCGATGGTGAC
TCCGTGGAGCAACTTCCCCAACTCCTCGTCGTTCCTTATCGCCAAGCAAAGATGCCTCGG
GTTTATCCTGTTCTTCTTGTTGTCCCTCGCTGCGTTTCCTGCCAGCTCCAGAACCTCGGC
GGCGAGGTACTCGAGAACGGCGGCGAGGTAAACGGGAGCACCGGCGCCGTACCTGATCGC
GTAACGACCTTTCTTCAAGTAACGAGAGATACGCCCCACGGGAAACTGGAGACCAGCCTT
GGCCGACTTTGAAACGCTCTTCTTCCGATCGCCTCCTTTTCTTCCTCCCGCGCCTCTCGC
CGGCTTCGCTGCTGCTGCTCCTGCTGCTGGTGACGACGATGAGTCCATCGGATTCTTAAC
AAACTAACAAACAAACACAAATTTGTTTTTCCTTTTTTTTTCCGGTTTTGTAGCGGTTTA
CGGTTTTGCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DR82JQ U 57
AF RR2H747JQB U 1
AF RR2F274JQ U 56
AF RR2H747TF C 9
AF RR2F274TF C 53
AF RR2DR82TF C 199
BS 1 167 RR2H747JQB
BS 168 168 RR2DR82JQ
BS 169 280 RR2H747JQB
BS 281 281 RR2F274JQ
BS 282 385 RR2H747JQB
BS 386 386 RR2F274JQ
BS 387 639 RR2H747JQB
BS 640 693 RR2F274JQ
BS 694 760 RR2H747TF
BS 761 761 RR2F274TF
BS 762 793 RR2H747TF

RD RR2DR82JQ 198 0 0
CCCAGAAATTAGTTCATTCATTACAAAATGGCTGTAACACATAATCTTGCCATCCGAGGA
TCCATAAACAAACCACAAACAGAGAGTAAACATAGAAAGCAACCAACCTACACAATCCCT
AAAAAAAAACAAGTCGTTCTTCTTCTAGATCGATATAACAAACGCATCACAGCAACAGTT
AAGCCTTCTTGGGAGATT

QA 1 198 1 198
DS 

RD RR2H747JQB 639 0 0
ACCAGAAAGAAACTTTTATTTATTTGATATACGACTGAGAAACTGAGTAGAAGATACCCA
GAAATTAGTTCATTCATTACAAAATGGCTGTAACACATAATCTTGCCATCCGAGGATCCA
TAAACAAACCACAAACAGAGAGTAAACATAGAAAGCAACCAACCTACGCAATCCCTAAAA
AAAA*CAAGTCGTTCTTCTTCTAGATCGATATAACAAACGCATCACAGCAACAGTTAAGC
CTTCTTGGGAGATTTAGCAGCCTTAGCAGCTTTCTCAGGCCTCTCAGTTTGAGATGCAGA
TCTCTTGGGAAGAAGCACCGGGTTGATGTTCGGAAGAACTCCACCGCTCGCGATGGTGAC
TCCGTGGAGCAACTTCCCCAACTCCCCGTCGTTCCTTATCGCCAAGCAAAGATGCCTCGG
GTTTATCCTGTTCTTCTTGTTGTCCCTCGCTGCGTTTCCTGCCAGCTCCAGAACCTCGGC
GGCGAGGTACTCGAGAACGGCGGCGAGGTAAACGGGAGCACCGGCGCCGTACCTGATCGC
GTAACGACCTTTCTTCAAGTAACGAGAGATACGCCCCACGGGAAACTGGAGACCAGCCTT
GGCCGACTTTGAAACGCTCTTCTTCCGATCGCCTCCTTT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2F274JQ 638 0 0
ACCCAGAAATTAGTTCATTCATTACAAAATGGCTGTAACACATAATCTTGCCATCCGAGG
ATCCATAAACAAACCACAAACAGAGAGTAAACATAGAAAGCAACCAACCTACACAATCCC
TAAAAAAAA*CAAGTCGTTCTTCTTCTAAATCGATATAACAAACGCATCACAGCAACAGT
TAAGCCTTCTTGGGAGATTTAGCAGCCTTAGCAGCTTTCTCAGGCTTCTCAGTTTGAGAT
GCAAATCTCTTGGGAAGAAGCACCGGGTTGATGTTCGGAAAAACTCCACCGCTCGCGATG
GTGACTCCGTGGAGCAACTTCCCCAACTCCTCGTCGTTCCTTATCGCCAAGCAAAGATGC
CTCGGGTTTATCCTGTTCTTCTTGTTGTCCCTCGCTGCGTTTCCTGCCAGCTCCAGAACC
TCGGCGGCGAGGTACTCGAGAACGGCGGCGAGGTAAACGGGAGCACCGGCGCCGTACCTG
ATCGCGTAACGACCTTTCTTCAAGTAGCGAGAGATACGCCCCACGGGAAACTGGAGACCA
GCCTTGGCCGACTTTGAAACGCTCTTCTTCCGATCGCCTCCTTTTCTTCCTCCCGCGCCT
CTCGCCGGCTTCGCTGCTGCTGCTCCTGCTGCTGGTGA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2H747TF 785 0 0
GAAACTTTTATTTATTTGATATACGACTGAGAAACTGAGTAGAAGATACCCAGAAATTAG
TTCATTCATTACAAAATGGCTGTAACACATA*TCTTGCCATCCGAGGATCCATAAACAAA
CCACAAACAGAGAGTAAACATAGAAAGCAACCAAC*TACGCAATCCCTAAAAAAAA*CAA
GTCGTTCTTCTTCTAGATCGATATAACAAACGCATCACAGCAACAGTTAAGCCTTCTTGG
GAGATTTAGCAGCCTTAGCAGCTTTCTCAGGCCTCTCAGTTTGAGATGCAGATCTCTTGG
GAAGAAGCACCGGGTTGATGTTCGGAAGAACTCCACCGCTCGCGATGGTGACTCCGTGGA
GCAACTTCCCCAACTCCCCGTCGTTCCTTATCGCCAAGCAAAGATGCCTCGGGTTTATCC
TGTTCTTCTTGTTGTCCCTCGCTGCGTTTCCTGCCAGCTCCAGAACCTCGGCGGCGAGGT
ACTCGAGAACGGCGGCGAGGTAAACGGGAGCACCGGCGCCGTACCTGATCGCGTAACGAC
CTTTCTTCAAGTAACGAGAGATACGCCCCACGGGAAACTGGAGACCAGCCTTGGCCGACT
TTGAAACGCTCTTCTTCCGATCGCCTCCTTTTCTTCCTCCCGCGCCTCTCGCCGGCTTCG
CTGCTGCTGCTCCTGCTGCTGGTGACGACGATGAGTCCATCGGATTCTTAACAAACTAAC
AAACAAACACAAATTTGTTTTTCCTTTTTTTT*CCGGTTTTGTAGCGGTTTACGGTTTTG
CGTCC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2F274TF 741 0 0
TT
TACCCAGAAATTAGTTCATTCATTACAAAATGGCTGTAACACATAATCTTGCCATCCGAG
GATCCATAAACAAACCACAAACAGAGAGTAAACATAGAAAGCAACCAACCTACACAATCC
CTAAAAAAAA*CAAGTCGTTCTTCTTCTAGATCGATATAACAAACGCATCACAGCAACAG
TTAAGCCTTCTTGGGAGATTTAGCAGCCTTAGCAGCTTTCTCAGGCTTCTCAGTTTGAGA
TGCAGATCTCTTGGGAAGAAGCACCGGGTTGATGTTCGGAAGAACTCCACCGCTCGCGAT
GGTGACTCCGTGGAGCAACTTCCCCAACTCCTCGTCGTTCCTTATCGCCAAGCAAAGATG
CCTCGGGTTTATCCTGTTCTTCTTGTTGTCCCTCGCTGCGTTTCCTGCCAGCTCCAGAAC
CTCGGCGGCGAGGTACTCGAGAACGGCGGCGAGGTAAACGGGAGCACCGGCGCCGTACCT
GATCGCGTAACGACCTTTCTTCAAGTAGCGAGAGATACGCCCCACGGGAAACTGGAGACC
AGCCTTGGCCGACTTTGAAACGCTCTTCTTCCGATCGCCTCCTTTTCTTCCTCCCGCGCC
TCTCGCCGGCTTCGCTGCTGCTGCTCCTGCTGCTGGTGACGACGATGAGTCCATCGGATT
CTTAACAAACTAACAAACAAACACAAATTTGTTTTTCCTTTTTTTTTCCGGTTTTGTAGC
GGTTTACGGTTTTGCGTCC

QA 3 741 3 741
DS 

RD RR2DR82TF 595 0 0
TTCTAGATCGATATAACAAACGCATCACAGCAACAGTTAAGCCTTCTTGGGAGATTTAGC
AGCCTTAGCAGCTTTCTCAGGCTTCTCAGTTTGAGATGCAGATCTCTTGGGAAGAAGCAC
CGGGTTGATGTTCGGAAGAACTCCACCGCTCGCGATGGTGACTCCGTGGAGCAACTTCCC
CAACTCCTCGTCGTTCCTTATCGCCAAGCAAAGATGCCTCGGGTTTATCCTGTTCTTCTT
GTTGTCCCTCGCTGCGTTTCCTGCCAGCTCCAGAACCTCGGCGGCGAGGTACTCGAGAAC
GGCGGCGAGGTAAACGGGAGCACCGGCGCCGTACCTGATCGCGTAACGACCTTTCTTCAA
GTAACGAGAGATACGCCCCACGGGAAACTGGAGACCAGCCTTGGCCGACTTTGAAACGCT
CTTCTTCCGATCGCCTCCTTTTCTTCCTCCCGCGCCTCTCGCCGGCTTCGCTGCTGCTGC
TCCTGCTGCTGGTGACGACGATGAGTCCATCGGATTCTTAACAAACTAACAAACAAACAC
AAATTTGTTTTTCCTTTTTTTTTCCGGTTTTGTAGCGGTTTACGGTTTTGCGTCC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 10

CO CL621Contig1 1458 10 29 U
GCGGTAAATTAAAACTTCCTGGTGCTTAAAAGACGAGAGATGTTTGATAGATGCATGATG
AGAATACAGACTCATTTATTGTAACACAAACACGTACTTATTAATACAAACTCACTTATT
GAAACACATAGACGGACTTATTAGTACTTAGGTGGTTGATAGCAGTTAACAAAGCAAACA
CATGGAGTTGCATGTCCGTACGTGGTTAGAGTAACTCTAACTTGGAAAGTACATGGTTTT
AGAAACGGTTTCAATTTCGACTTGGACAGTCAACTTATCATCAACAAGGAAGCCCTTTGA
TAAATCTCTGAGATTAGAGAGAGGGACAAATTCACTAGAACCCCAACCATATGCACGTCC
AGTTTCCCAGCGACTGAACCAGTTATCAATTTGCCTTTCAACGTTTCTGAATTTGAATTT
GTTAAGAACTCGAAGCTTGGCTCGAACATAAATTCTCTCATAGGGTCTGAGTTCCTCGGT
CTTATTAACGATAAGATACATGGACAAAGCTTTTCCCTTTCCCTTGTCACGACCACTTGG
ATTCACTTGTATATTCCAACGTCTTCCTCCGATGGAGAACACATCAGAGAAGTAAGTATC
TTCGAGCAATGTGGAGAACTTCAGAAGTGTCCAGGTGAATGTAGGGTTTTTGAAGTTACC
AGTGACTGAAAAAAGTTCTGATGTTTGAAAGACAGAGGGTATGGTCACATCAACACCAAA
CTCACAGTGATCTCCATCGTAGAGGTATCCGTTATACGGACTTTTAAATGTATAACCAGG
GAGAACCTGAGAGAACCCCCACATCGTTTTGAAGATATTAAATCTCCATACATCAGTATC
TTGGATGGTAAAATACTTCTTCTGTTTCTTGTTGAAGACGTAAAACCTGAGATCAACGTA
AACCTCTTCATGTGGAGCGAGAGTGGAGTTGTCTATGGCTGCGTAAAGCGAGAGGTACCC
TGCACCTTTGTCATTCTTGTTCCCGTTCGGGTACACAACAAGTGTCCAGTTATAGCCAGC
GGCTGAGAAAGGACGAGATACATATCTCTCCGAGTATTTTGACTTGAGTAGCGTGTTGAA
CGACTCCATCTTTAGAGAGTAAGAAGATGGTGGACGACTTCTTAGACCCTTCACTGTGTT
TGAAGCTGAGACTTTATAGTCACGTGATGAGATCTCTTGATCATGGTTATGTAAGTAATG
TGCTTCTCCTTGGATTGGGCCTGGTCCATCTCCATCTTGAACATGTTTACGCAAGTAGTG
CGCTTCTCCTTGGATTGGGTCTGGTCCATCTCCATTACCATGTTGCAAGCTTGTGATGAA
GTCATCAGTGACTTGCCGTATAAAGGAACTTGAAGAGGCAGACGTGATGAAGAGACAAAA
CAAGAGAACTACAGAAGAAACGGTCTTTGTGTAGTGACTCTTCATCTTTTATTGTTATAC
TAGATGTGAGTCGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX15JQ U 1
AF RR2DU06JQ U 60
AF RR2BS02JQ U 32
AF RR2CO95JQ U 57
AF RR2C808JQ U 82
AF RR2CO95TF C 681
AF RR2C808TF C 344
AF RR2GX15TF C 414
AF RR2BS02TF C 694
AF RR2DU06TF C 801
BS 1 161 RR2GX15JQ
BS 162 162 RR2BS02JQ
BS 163 211 RR2GX15JQ
BS 212 212 RR2BS02JQ
BS 213 356 RR2GX15JQ
BS 357 357 RR2BS02JQ
BS 358 470 RR2GX15JQ
BS 471 471 RR2BS02JQ
BS 472 479 RR2GX15JQ
BS 480 480 RR2BS02JQ
BS 481 585 RR2GX15JQ
BS 586 751 RR2BS02JQ
BS 752 752 RR2CO95JQ
BS 753 791 RR2BS02JQ
BS 792 849 RR2CO95JQ
BS 850 892 RR2C808JQ
BS 893 941 RR2C808TF
BS 942 942 RR2GX15TF
BS 943 955 RR2C808TF
BS 956 956 RR2GX15TF
BS 957 1012 RR2C808TF
BS 1013 1132 RR2GX15TF
BS 1133 1150 RR2BS02TF
BS 1151 1151 RR2DU06TF
BS 1152 1219 RR2BS02TF
BS 1220 1220 RR2DU06TF
BS 1221 1309 RR2BS02TF
BS 1310 1310 RR2DU06TF
BS 1311 1458 RR2BS02TF

RD RR2GX15JQ 585 0 0
GCGGTAAATTAAAACTTCCTGGTGCTTAAAAGACGAGAGATGTTTGATAGATGCATGATG
AGAATACAGACTCATTTATTGTAACACAAACACGTACTTATTAATACAAACTCACTTATT
GAAACACATAGACGGACTTATTAGTACTTAGGTGGTTGATAACAGTTAACAAAGCAAACA
CATGGAGTTGCATGTCCGTACGTGGTTAGAGAAACTCTAACTTGGAAAGTACATGGTTTT
AGAAACGGTTTCAATTTCGACTTGGACAGTCAACTTATCATCAACAAGGAAGCCCTTTGA
TAAATCTCTGAGATTAGAGAGAGGGACAAATTCACTAGAACCCCAACCATATGCAC*TCC
AGTTTCCCAGCGACTGAACCAGTTATCAATTTGCCTTTCAACGTTTCTGAATTTGAATTT
GTTAAGAACTCGAAGCTTGGCTCGAACATAAATTCTCTCATAGGGTCTGAATTCCTCGGC
CTTATTAACGATAAGATACATGGACAAAGCTTTTCCCTTTCCCTTGTCACGACCACTTGG
ATTCACTTGTATATTCCAACGTCTTCCTCCGATGGAGAACACATC

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2DU06JQ 527 0 0
GAGAATACAGACTCATTTATTGTAACACAAACACGTACTTATTAATACAAACTCACTTAT
TGAAACACATAGACGGACTTATTAGTACTTAGGTGGTTGATAGCAGTTAACAAAGCAAAC
ACATGGAGTTGCATGTCCGTACGTGGTTAGAGTAACTCTAACTTGGAAAGTACATGGTTT
TAGAAACGGTTTCAATTTCGACTTGGACAGTCAACTTATCATCAACAAGGAAGCCCTTTG
ATAAATCTCTGAAATTAGAGAGAGGGACAAATTCACTAGAACCCCAACCATATGCACGTC
CAGTTTCCCAGCGACTGAACCAGTTATCAATTTGCCTTTCAACGTTTCTGAATTTGAATT
TGTTAAGAACTCGAAGCTTGGCTCGAACATAAATTCTCTCATAGGGTCTGAGTTCCTCGG
TCTTATTAACGATAAGATACATGGACAAAGCTTTTCCCTTTCCCTTGTCACGACCACTTG
GATTCACTTGTATATTCCAACGTCTTCCTCCGATGGAGAACACATCA

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2BS02JQ 760 0 0
GACGAGAGATGTTTGATAGATGCATGATGAGAATACAGACTCATTTATTGTAACACAAAC
ACGTACTTATTAATACAAACTCACTTATTGAAACACATAGACGGACTTATTAGTACTTAG
GTGGTTGATAGCAGTTAACAAAGCAAACACATGGAGTTGCATGTCCGTACGTGGTTAGAG
TAACTCTAACTTGGAAAGTACATGGTTTTAGAAACGGTTTCAATTTCGACTTGGACAGTC
AACTTATCATCAACAAGGAAGCCCTTTGATAAATCTCTGAGATTAGAGAGAGGGACAAAT
TCACTAGAACCCCAACCATATGCACGTCCAGTTTCCCAGCGACTGAACCAGTTATCAATT
TGCCTTTCAACGTTTCTGAATTTGAATTTGTTAAGAACTCGAAGCTTGGCTCGAACATAA
ATTCTCTCATAGGGTCTGAGTTCCTCGGTCTTATTAACGATAAGATACATGGACAAAGCT
TTTCCCTTTCCCTTGTCACGACCACTTGGATTCACTTGTATATTCCAACGTCTTCCTCCG
ATGGAGAACACATCAGAGAAGTAAGTATCTTCGAGCAATGTGGAGAACTTCAGAAGTGTC
CAGGTGAATGTAGGGTTTTTGAAGTTACCAGTGACTGAAAAAAGTTCTGATGTTTGAAAG
ACAGAGGGTATGGTCACATCAACACCAAACTCACAGTGATCTCCATCGTAGAGGTATCCG
CTATACGGACTTTTAAATGTATAACCAGGGAGAACCTGAG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2CO95JQ 793 0 0
GAT
GAGAATACAGACTCATTTATTGTAACACAAACACGTACTTATTAATACAAACTCACTTAT
TGAAACACATAGACGGACTTATTAGTACTTAGGTGGTTGATAGCAGTTAACAAAGCAAAC
ACATGGAGTTGCATGTCCGTACGTGGTTAGAGTAACTCTAACTTGGAAAGTACATGGTTT
TAGAAACGGTTTCAATTTCGACTTGGACAGTCAACTTATCATCAACAAGGAAGCCCTTTG
ATAAATCTCTGAGATTAGAGAGAGGGACAAATTCACTAGAACCCCAACCATATGCACGTC
CAGTTTCCCAGCGACTGAACCAGTTATCAATTTGCCTTTCAACGTTTCTGAATTTGAATT
TGTTAAGAACTCGAAGCTTGGCTCGAACATAAATTCTCTCATAGGGTCTGAGTTCCTCGG
TCTTATTAACGATAAGATACATGGACAAAGCTTTTCCCTTTCCCTTGTCACGACCACTTG
GATTCACTTGTATATTCCAACGTCTTCCTCCGATGGAGAACACATCAGAGAAGTAAGTAT
CTTCGAGCAATGTGGAGAACTTCAGAAGTGTCCAGGTGAATGTAGGGTTTTTGAAGTTAC
CAGTGACTGAAAAAAGTTCTGATGTTTGAAAGACAGAGGGTATGGTCACATCAACACCAA
ACTCACAGTGATCTCCATCGTAGAGGTATCCGTTATACGGACTTCTAAATGTATAACCAG
GGAGAACCTGAGAGAACCCCCACATCGTTTTGAAGATATTAAATCTCCATACATCAGTAT
CTTGGATGGT

QA 4 793 4 793
DS 

RD RR2C808JQ 811 0 0
TAACACAAACACGTACTTATTAATACAAACTCACTTATTGAAACACATAGACGGACTTAT
TAGTACTTAGGGGGTTGATAGCAGTTAACAAAGCAAACACATGGAGTTGCATGTCCGTAC
GTGGTTAGAGTAACTCTAACTTGGAAAGTACATGGTTTTAGAAACGGTTTCAATTTCGAC
TTGGACAGTCAACTTATCATCAACAAGGAAGCCCTTTGATAAATCTCTGAGATTAGAGAG
AGGGACAAATTCACTAGAACCCCAACCATATGCACGTCCAGTTTCCCAGCGACTGAACCA
GTTATCAATTTGCCTTTCAACGTTTCTGAATTTGAATTTGTTAAGAACTCGAAGCTTGGC
TCGAACATAAATTCTCTCATAGGGTCTGAGTTCCTCGGTCTTATTAACGATAAGATACAT
GGACAAAGCTTTTCCCTTTCCCTTGTCACGACCACTTGGATTCACTTGTATATTCCAACG
TCTTCCTCCGATGGAGAACACATCAAAGAAGTAAGTATCTTCGAGCAATGTGGAGAACTT
CAAAAGTGTCCAGGTGAATGTAGGGTTTTTGAAGTTACCAGTGACTGAAAAAAGTTCTGA
TGTTTGAAAGACAGAGGGTATGGTCACATCAACACCAAACTCACAGTGATCTCCATCGTA
GAGGTATCCGTTATACGGACTTTTAAATGTATAACCAGGGAGAACCTGAGAGAACCCCCA
CATCGTTTTGAAGATATTAAATCTCCATACATCAGTATCTTGGATGGTAAAATACTTCTT
CTGTTTCTTGTTGAAGACGTAAAACCTGAGA

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2CO95TF 281 0 0
ATGTTTGAAAGACAGAGGGTATGGTCACATCAACACCAAACTCACAGTGATCTCCATCGT
AGAGGTATCCGTTATACGGACTTCTAAATGTATAACCAGGGAGAACCTGAGAGAACCCCC
ACATCGTTTTGAAGATATTAAATCTCCATACATCAGTATCTTGGATGGTAAAATACTTCT
TCTGTTTCTTGTTGAAGACGTAAAACCTGAGATCAACGTAAACCTCTTCATGTGGAGCGA
GAGTGGAGTTGTCTATGGCTGCGTAAAGCGAGAGGTACCC
C

QA 1 280 1 280
DS 

RD RR2C808TF 670 0 0
CAACCATATGCACGTCCAGTTTCCCAGCGACTGAACCAGTTATCAATTTGCCTTTCAACG
TTTCTGAATTTGAATTTGTTAAGAACTCGAAGCTTGGCTCGAACATAAATTCTCTCATAG
GGTCTGAGTTCCTCGGTCTTATTAACGATAAGATACATGGACAAAGCTTTTCCCTTTCCC
TTGTCACGACCACTTGGATTCACTTGTATATTCCAACGTCTTCCTCCGATGGAGAACACA
TCAGAGAAGTAAGTATCTTCGAGCAATGTGGAGAACTTCAGAAGTGTCCAGGTGAATGTA
GGGTTTTTGAAGTTACCAGTGACTGAAAAAAGTTCTGATGTTTGAAAGACAGAGGGTATG
GTCACATCAACACCAAACTCACAGTGATCTCCATCGTAGAGGTATCCGTTATACGGACTT
TTAAATGTATAACCAGGGAGAACCTGAGAGAACCCCCACATCGTTTTGAAGATATTAAAT
CTCCATACATCAGTATCTTGGATGGTAAAATACTTCTTCTGTTTCTTGTTGAAGACGTAA
AACCTGAGATCAACGTAAACCTCTTCATGTGGAGCGAGAGTGGAGTTGTCTATGGCTGAG
TAAAGCGAGAGGGACCCTGCACCTTTGTCATTCTTGTTCCCGTTCGGGTACACAACAAGT
GTCCAGTTA
C

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2GX15TF 719 0 0
TTGAA
TTGTTAAGAACTCGAAGCTTGGCTCGAACATAAATTCTCTCATAGGGTCTGAGTTCCTCG
GCCTTATTAACGATAAGATACATGGACAAAGCTTTTCCCTTTCCCTTGTCACGACCACTT
GGATTCACTTGTATATTCCAACGTCTTCCTCCGATGGAGAACACATCAGAGAAGTAAGTA
TCTTCGAGCAATGTGGAGAACTTCAGAAGTGTCCAGGTGAATGTAGGGTTTTTGAAGTTA
CCAGTGACTGAAAAAAGTTCTGATGTTTGAAAGACAGAGGGTATGGTCACATCAACACCA
AACTCACAGTGATCTCCATCGTAGAGGTATCCGTTATACGGACTTTTAAATGTATAACCA
GGGAGAACCTGAGAGAACCCCCACATCGTTTTGAAGATATTAAATCTCCATACATCGGTA
TCTTGGATGGTAAAATACTTCTTCTGTTTCTTGTTGAAGACGTAAAACCTGAGATCAACG
TAAACCTCTTCATGTGGAGCGAGAGTGGAGTTGTCTATGGCTGCGTAAAGCGAGAGGTAC
CCTGCACCTTTGTCATTCTTGTTCCCGTTCGGGTACACAACAAGTGTCCAGTTATAGCCA
GCGGCTGAGAAAGGACGAGATACATATCTCTCCGAGTATTTTGACTTGAGTAGCGTGTTG
AACGACTCCATCTTTAGAGAGTAAGAAGATGGTGGACGACTTCTTAGACCCTTC

QA 6 719 6 719
DS 

RD RR2BS02TF 765 0 0
AGAGGGTATG*TCACATCAACACCAAACTCACAGTGATCTCCATCGTAGAG*TATCCGCT
ATACGGACTTTTAAATGTATAACCAGGGAGAAC*TGAGAGAACCCCCACATCGTTTTGAA
GATATTAAATCTCCATACATCAGTATCTTGGATGGTAAAATACTTCTTCTGTTTCTTGTT
GAAGACGTAAAACCTGAGATCAACGTAAACCTCTTCATGTGGAGCGAGAGTGGAGTTGTC
TATGGCTGCGTAAAGCGAGAGGTACCCTGCACCTTTGTCATTCTTGTTCCCGTTCGGGTA
CACAACAAGTGTCCAGTTATAGCCAGCGGCTGAGAAAGGACGAGATACATATCTCTCCGA
GTATTTTGACTTGAGTAGCGTGTTGAACGACTCCATCTTTAGAGAGTAAGAAGATGGTGG
ACGACTTCTTAGACCCTTCACTGTGTTTGAAGCTGAGGCTTTATAGTCACGTGATGAGAT
CTCTTGATCATGGTTATGTAAGTAATGTGCTTCTCCTTGGATTGGGTCTGGTCCATCTCC
ATCTTGAACATGTTTACGCAAGTAGTGCGCTTCTCCTTGGATTGGGTCTGGTCCATCTCC
ATTACCATGTTGCAAGTTTGTGATGAAGTCATCAGTGACTTGCCGTATAAAGGAACTTGA
AGAGGCAGACGTGATGAAGAGACAAAACAAGAGAACTACAGAAGAAACGGTCTTTGTGTA
GTGACTCTTCATCTTTTATTGTTATACTAGATGTGAGTCGAGTCC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2DU06TF 654 0 0
CACATCG
TTTGAAGATATTAAATCTCCATACATCAGTATCTTGGATGGTAAAATACTTCTTCTGTTT
CTTGTTGAAGACGTAAAACCTGAGATCAACGTAAACCTCTTCATGTGGAGCGAGAGTGGA
GTTGTCTATGGCTGCGTAAAGCGAGAGGTACCCTGCACCTTTGTCATTCTTGTTCCCGTT
CGGGTACACAACAAGTGTCCAGTTATAGCCAGCGGCTGAGAAAGGACGAGATACATATCT
CTCCGAGTATTTTGACTTGAGTAGCGTGTTGAACGACTCCGTCTTTAGAGAGTAAGAAGA
TGGTGGACGACTTCTTAGACCCTTCACTGTGTTTGAAGCTGAGACTTTATAGTCACGTGA
TGAGATCTCTTGATCATGGTTATGTAAGTAATGTGCTTCTCCTTGGATTGGGCCTGGTCC
ATCTCCATCTTGAACATGTTTACGCAAGTAGTGCGCTTCTCCTTGGATTGGGTCTGGTCC
ATCTCCATTACCATGTTGCAAGCTTGTGATGAAGTCATCAGTGACTTGCCGTATGAAGGA
ACTTGAAGAGGCAGACGTGATGAAGAGACAAAACAAGAGAACTACAGAAGAAACGGTCTT
TGTGTAGTGACTCTTCATCTTTTATTGTTATACTAGATGTGAGTC
CC

QA 8 652 8 652
DS 



AS 2 9

CO CL622Contig1 840 3 7 U
GAAACCCAATCTTCTTCGTCTGCCCGCGTTGAAGAGAAGAAGAACATCTCTCTCTGATCC
CACCTCTGTGATTCTCAGAAAAAATGTCAATCCTGCAGCTCTCTAGCTCTTCTCTCTCTT
ATCCTAATGTTCTCTCCATCTCTCCGAGAAAATCTCTGTCGTCGTCTCCGAAGTCGTCTT
CCCGAACAATTCGCTGTTCCCTCGAGGGAACCACTGTAACTGAGCGGAAAGTGTCTGCAA
CCAGCGAGCCTCTTCTTCTGAGAGCTGTCAAAGGTGAAGTTGTTGACAGACCTCCCGTTT
GGCTTATGAGGCAAGCTGGGAGGTACATGAAGAGTTATCAAACTCTCTGTGAGAAGTATC
CTTTATTCCGGGACAGATCAGAGAACGCAGATCTTGTGGTGGAGATCTCTCTTCAACCCT
GGAAGGTGTTCAAGCCGGATGGTGTGATTCTGTTCTCAGACATTCTCACTCCTTTGTCCG
GAATGAACATACCTTTCGACATTGTCAAAGGAAAAGGTCCCATCATCTTCAACCCGCCGC
AGTCAGCTGCTGACGTGAATCAAGTTAGAGAGTTTGTACCGGAGGAATCTGTTCCTTATG
TTGGAGAAGCACTCAAGAGACTAAGAAACGAGGTGGGCAACGAAGCTGCTGTTCTTGGCT
TTGTTGGAGCTCCTTTTACTCTCTCCTCATATGTTATTGAAAGTGGATCATCTAAGAACT
TCACACAGATCAAAAACTAGCTTTCTCTCAACCAAAGTTCTACATGCCTTGCTCCAGAAG
TCACACCTCATGATACTTACATACGTTATCAGCGGACAGCGGAGCTCAGCTGTGCAATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ43TF U 1
AF RR2GG67TF U 18
AF RR2ES58TF U 29
BS 1 701 RR2CJ43TF
BS 702 702 RR2ES58TF
BS 703 717 RR2GG67TF
BS 718 718 RR2ES58TF
BS 719 753 RR2GG67TF
BS 754 754 RR2ES58TF
BS 755 840 RR2GG67TF

RD RR2CJ43TF 705 0 0
GAAACCCAATCTTCTTCGTCTGCCCGCGTTGAAGAGAAGAAGAACATCTCTCTCTGATCC
CACCTCTGTGATTCTCAGAAAAAATGTCAATCCTGCAGCTCTCTAGCTCTTCTCTCTCTT
ATCCTAATGTTCTCTCCATCTCTCCGAGAAAATCTCTGTCGTCGTCTCCGAAGTCGTCTT
CCCGAACAATTCGCTGTTCCCTCGAGGGAACCACTGTAACTGAGCGGAAAGTGTCTGCAA
CCAGCGAGCCTCTTCTTCTGAGAGCTGTCAAAGGTGAAGTTGTTGACAGACCTCCCGTTT
GGCTTATGAGGCAAGCTGGGAGGTACATGAAGAGTTATCAAACTCTCTGTGAGAAGTATC
CTTTATTCCGGGACAGATCAGAGAACGCAGATCTTGTGGTGGAGATCTCTCTTCAACCCT
GGAAGGTGTTCAAGCCGGATGGTGTGATTCTGTTCTCAGACATTCTCACTCCTTTGTCCG
GAATGAACATACCTTTCGACATTGTCAAAGGAAAAGGTCCCATCATCTTCAACCCGCCGC
AGTCAGCTGCTGACGTGAATCAAGTTAGAGAGTTTGTACCGGAGGAATCTGTTCCTTATG
TTGGAGAAGCACTCAAGAGACTAAGAAACGAGGTGGGCAACGAAGCTGCTGTTCTTGGCT
TTGTTGGAGCTCCTTTTACTCTCTCCTCATATGTTATTGAA
GTGG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2GG67TF 823 0 0
GG
CTGCCCGCGTTGAAGAGAAGAAGAACATCTCTCTCTGATCCCACCTCTGTGATTCTCAGA
AAAAATGTCAATCCTGCAGCTCTCTAGCTCTTCTCTCTCTTATCCTAATGTTCTCTCCAT
CTCTCCGAGAAAATCTCTGTCGTCGTCTCCGAAGTCGTCTTCCCGAACAATTCGCTGTTC
CCTCGAGGGAACCACTGTAACTGAGCGGAAAGTGTCTGCAACCAGCGAGCCTCTCCTTCT
GAGAGCTGTCAAAGGTGAAGTTGTTGACAGACCTCCCGTTTGGCTTATGAGGCAAGCTGG
GAGGTACATGAAGAGTTATCAAACTCTCTGTGAGAAGTATCCTTTATTCCGGGACAGATC
AGAGAACGCAGATCTTGTGGTGGAGATCTCTCTTCAACCCTGGAAGGTGTTCAAGCCGGA
TGGTGTGATTCTGTTCTCAGACATTCTCACTCCTTTGTCCGGAATGAACATACCTTTCGA
CATTGTCAAAGGAAAAGGTCCCATCATCTTCAACCCGCCGCAGTCAGCTGCTGACGTGAA
TCAAGTTAGAGAGTTTGTACCGGAGGAATCTGTTCCTTATGTTGGAGAAGCACTCAAGAG
ACTAAGAAACGAGGTGGGCAACGAAGCTGCTGTTCTTGGCTTTGTTGGAGCTCCTTTTAC
TCTCTCCTCATATGTTATTGAA*GTGGATCATCTAAGA*CTTCACACAGATCAAAAACTA
GCTTTCTCTCAACCCAAGTTCTACATGCCTTGCTCCAGAAGTCACACCTCATGATACTTA
CATACGTTATCAGCGGACAGCGGAGCTCAGCTGTGCAATCT

QA 3 823 3 823
DS 

RD RR2ES58TF 761 0 0
GG
GAAGAGAAGAAGAACATCTCTCTCTGATCCCACCTCTGTGATTCTCAGAAAAAATGTCAA
TCCTGCAGCTCTCTAGCTCTTCTCTCTCTTATCCTAATGTTCTCTCCATCTCTCCGAGAA
AATCTCTGTCGTCGTCTCCGAAGTCGTCTTCCCGAACAATTCGCTGTTCCCTCGAGGGAA
CCACTGTAACTGAGCGGAAAGTGTCTGCAACCAGCGAGCCTCTTCTTCTGAGAGCTGTCA
AAGGTGAAGTTGTTGACAGACCTCCCGTTTGGCTTATGAGGCAAGCTGGGAGGTACATGA
AGAGTTATCAAACTCTCTGTGAGAAGTATCCTTTATTCCGGGACAGATCAGAGAACGCAG
ATCTTGTGGTGGAGATCTCTCTTCAACCCTGGAAGGTGTTCAAGCCGGATGGTGTGATTC
TGTTCTCAGACATTCTCACTCCTTTGTCCGGAATGAACATACCTTTCGACATTGTCAAAG
GAAAAGGTCCCATCATCTTCAACCCGCCGCAGTCAGCTGCTGACGTGAATCAAGTTAGAG
AGTTTGTACCGGAGGAATCTGTTCCTTATGTTGGAGAAGCACTCAAGAGACTAAGAAACG
AGGTGGGCAACGAAGCTGCTGTTCTTGGCTTTGTTGGAGCTCCTTTTACTCTCTCCTCAT
ATGTTATTGAAAGTGGATCATCTAAGAACTTCACACAGATCAAAAACTAGCTTTCTCTCA
CCCAAGGTTCTACATGCCTTGCTCCAGAAGT
CACAACCT

QA 3 753 3 753
DS 



CO CL622Contig2 739 6 7 U
AACGTTGATATCCATAAAAATAAATACTCAAATCTGTTAAAATATCAAAATACAAACATA
AAATTACACATGTAA*TTGAGAAACAAAATTTGAACAAGCAAACAAGTTAAGAACAAAGC
ACAATGTAAGAGAATGTGTAGTTACAATCTTCTCTTAATATCTAATCCCTTGAGCAACCT
CAAAGAAGTGTGCAACGTTCTCTTCAGGAGTTCCAACTTTAATACCATGCCCCAGGTTCA
GAATGTGCTTATCTCTCCCAGCTTTCTTCACAGTATCATGAATCCTGCTTGTGATAAACT
CTTTGGATCCGAACAAAACTCCCGGGTCCACGTTTCCTTGAACCGCTATGTTTCTTCCCA
GCCTGTCCCTGCCTTCAGCCATGTCCACAGTCCAGTCCAAGCTCACAACATCAACCCCAG
TCCGAGCCAGCCTCTCTAGCAGACCCCCTGATCCACTTGCGTACAGTATTAGAGGTAGGT
TTGGGTGAGTCTGCTTCACAGCTTCCACAATCTGTTTCAGGTAAGGTAAGCTAAACTCCT
CGAAATCCACAGGGCTAAGCTCAGTAGCCCAAGAATCAAAGATTTGCACAGCCTGAGCTC
CACTATCTGCTTGATAGCGTATGTAAGTGATCATTGAGGTTGTGAACTTTTGGAGCAAAG
CATGTAGAACCTTGGGTTGAGAGAAAACTAGTTTTTTGATCTGTGTGAAGTTCTTTGATG
AGCCACCTTCAATAACATA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 20 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GK22JQ U 1
AF RR2CJ43JQ U 212
AF RR2EP30JQ U 26
AF RR2GG67JQB U 1
AF RR2EP48JQ U 1
AF RR2FB74JQ U 12
BS 1 457 RR2EP48JQ
BS 458 458 RR2EP30JQ
BS 459 658 RR2EP48JQ
BS 659 659 RR2FB74JQ
BS 660 686 RR2EP48JQ
BS 687 687 RR2FB74JQ
BS 688 739 RR2EP48JQ

RD RR2GK22JQ 423 0 0
AACGTTGATATCCATAAAAATAAATACTCAAATCTGTTAAAATATCAAAATACAAACATA
AAATTACACATGTAA*TTGAGAAAAAAAATTTGAACAAGCAAACAAGTTAAGAACAAAGC
ACAATGTAAGAGAATGTGTAGTTACAATCTTCTCTTAATATCTAATCCCTTGAGCAACCT
CAAAGAAGTGTGCAACGTTCTCTTCAGGAGTTCCAACTTTAATACCATGCCCCAGGTTCA
GAATGTGCTTATCTCTCCCAGCTTTCTTCACAGTATCATGAATCCTGCTTGTGATAAACT
CTTTGGATCCGAACAAAACTCCCGGGTCCACGTTTCCTTGAACCGCTATGTTTCTTCCCA
GCCTGTCCTTGCCTTCAGCCATGTCCACAGTCCAGTCCAAGCTCACAACATCAACTCCAG
TCC

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR2CJ43JQ 229 0 0
TCCAACTTTAATACCATGCCCCAGGTTCAAAATGGGCTTATCTCTCCCAGCTTTCTTCAC
GGGATCCTGAATCCTGCTTGGGATAAACTCTTTGGATCCGAACAAAACTCCCGGGTCCAC
GTTTCCTTGAACCGCTATGTTTCTTCCCAGCCTGTCCCTGCCTTCAGCCATGTCCACAGT
CCAGTCCAAGCTCACAACATCAACCCCAGTCCGAGCCAGCCTCTCTAGC

QA 1 229 1 229
DS 

RD RR2EP30JQ 480 0 0
ACTCAAATCTGTTAAAATATCAAAATACAAACATAAAATTACACATGTAA*TTGAGAAAC
AAAATTTGAACAAGCAAACAAGTTAAGAACAAAGCACAATGTAAGAGAATGTGTAGTTAC
AATCTTCTCTTAATATCTAATCCCTTGAGCAACCTCAAAGAAGTGTGCAACGTTCTCTTC
AGGAGTTCCAACTTTAATACCATGCCCCAGGTTCAGAATGTGCTTATCTCTCCCAGCTTT
CTTCACAGTATCATGAATCCTGCTTGTGATAAACTCTTTGGATCCGAACAAAACTCCCGG
GTCCACGTTTCCTTGAACCGCTATGTTTCTTCCCAGCCTGTCCCTGCCTTCAGCCATGTC
AACAATCCAGTCCAAGCTCACAACATCAACCCCATTCCGAGCCAGCCTCTCTAGCAGACC
CCCTGATCCACTTGTGTACAGTATTAGAGGTAGGTTTGGGTGAGTCTGCTTCACAGCTTC

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2GG67JQB 524 0 0
AACGTTGATATCCATAAAAATAAATACTCAAATCTGTTAAAATATCAAAATACAAACATA
AAATTACACATGTAAATTGAGAAACAAAATTTGGACAAGCAAACAAGTTAAGAACAAAGC
ACAATGTAAGAAAATGTGTAGTTACAATCTCCTCTTAATATCTAATCCCTTGAGCAACCT
CAAAGAAGTGTGCAACGTTCTCTTCAGGAGTTCCAACTTTAATACCATGCCCCAGGTTCA
GAATGTGCTTATCTCTCCCAGCTTTCTTCACGGTATCCTGAATCCTGCTTGTGATAAACT
CTTTGGATCCGAACAAAACTCCCGGGTCCACGTTTCCTTGAACCGCTATGTTTCTTCCCA
GCCTGTCCCTGCCTTCAGCCATGTCCACAGTCCAGTCCAAGCTCACAACATCAACCCCAG
TCCGAGCCAGCCTCTCTAGCAGACCCCCTGATCCACTTGCGTACAGTATTAGAGGTAGGT
TTGGGTGAGTCTGCTTCACAGCTTCCACAATCTGTTTCAGGTAA

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2EP48JQ 739 0 0
AACGTTGATATCCATAAAAATAAATACTCAAATCTGTTAAAATATCAAAATACAAACATA
AAATTACACATGTAA*TTGAGAAACAAAATTTGAACAAGCAAACAAGTTAAGAACAAAGC
ACAATGTAAGAGAATGTGTAGTTACAATCTTCTCTTAATATCTAATCCCTTGAGCAACCT
CAAAGAAGTGTGCAACGTTCTCTTCAGGAGTTCCAACTTTAATACCATGCCCCAGGTTCA
GAATGTGCTTATCTCTCCCAGCTTTCTTCACAGTATCATGAATCCTGCTTGTGATAAACT
CTTTGGATCCGAACAAAACTCCCGGGTCCACGTTTCCTTGAACCGCTATGTTTCTTCCCA
GCCTGTCCCTGCCTTCAGCCATGTCCACAGTCCAGTCCAAGCTCACAACATCAACCCCAG
TCCGAGCCAGCCTCTCTAGCAGACCCCCTGATCCACTCGCGTACAGTATTAGAGGTAGGT
TTGGGTGAGTCTGCTTCACAGCTTCCACAATCTGTTTCAGGTAAGGTAAGCTAAACTCCT
CGAAATCCACAGGGCTAAGCTCAGTAGCCCAAGAATCAAAGATTTGCACAGCCTGAGCTC
CACTATCTGCTTGATAGCGTATGTAAGTGATCATTGAGGTTGTGAACTTTTGGAGCAAGG
CATGTAGAACCTTGGGTTGAGAGAAAGCTAGTTTTTTGATCTGTGTGAAGTTCTTTGATG
AGCCACCTTCAATAACATA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2FB74JQ 728 0 0
CCATAAAAATAAATACTCAAATCTGTTAAAATATCAAAATACAAACATAAAATTACACAT
GTAA*TTGAGAAACAAAATTTGAACAAGCAAACAAGTTAAGAACAAAGCACAATGTAAGA
GAATGTGTAGTTACAATCTTCTCTTAATATCTAATCCCTTGAGCAATCTCAAAGAAGTGT
GCAACGTTCTCTTCAGGAGTTCCAACTTTAATACCATGCCCCAGGTTCAGAATGTGCTTA
TCTCTCCCAGCTTTCTTCACAGTATCATGAATCCTGCTTGTGATAAACTCTTTGGATCCG
AACAAAACTCCCGGGTCCACGTTTCCTTGAACCGCTATGTTTCTTCCCAGCCTGTCCCTG
CCTTCAGCCATGCCCACAGTCCAGTCCAAGCTCACAACATCAACCCCAGTCCGAGCCAGC
CTCTCTAGCAGACCCCCTGATCCACTTGCGTACAGTATTAGAGGTAGGTTTGGGTGAGTC
TGCTTCACAGCTTCCACAATCTGTTTCAGGTAAGGTAAGCTAAACTCCTCGAAATCCACA
GGGCTAAGCTCAGTAGCCCAAGAATCAAAGATTTGCACAGCCTGAGCTCCACTATCTGCT
TGATAGCGTATGTAAGTGATCATTGAGGTTGTGAACTTTTGGAGCAAAGCATGTAGAACC
TTGGGTTGAGAGAAAACTAGTTTTTTGATCTGTGTGAAGTTCTTTGATGAGCCACCTTCA
ATAACATA

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 10

CO CL623Contig1 719 10 15 U
GGACGGACTCATTCCTCTCATGATATTTTCCTTTTAACAACTTATAATTTGATCTATTTC
AAATTAAGTTGAGGGAAAATTAATCATTAAACATGGCAAAAATCTCTTTTGTACTTCTCG
TCGTCGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCAACG
AATTAGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGA
AAACGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGA
TAATGTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAA
AAAATCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTT
CCATAATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGA
TTTAGGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGG*AGTTT
GGTTTTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATTTATTAACTAATTGCATCA
ATTGTCTACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGC
TAACATTTGGT*AATTAGTTATCAACACATTATAATAGCTACAGAATGAGTACATTTTT


BQ
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FI15JQ C 384
AF RR2BN16TF U 1
AF RR2DA37TF U 1
AF RR2E222TF U 1
AF RR2F341TF U 1
AF RR2DA37JQ C 181
AF RR2FI52JQ C 1
AF RR2FI52TF U 1
AF RR2AI63TF U 3
AF RR2F341JQ C 118
BS 1 489 RR2BN16TF
BS 490 490 RR2DA37TF
BS 491 534 RR2BN16TF
BS 535 535 RR2DA37TF
BS 536 595 RR2BN16TF
BS 596 596 RR2DA37TF
BS 597 673 RR2BN16TF
BS 674 674 RR2DA37TF
BS 675 684 RR2BN16TF
BS 685 685 RR2DA37TF
BS 686 689 RR2BN16TF
BS 690 700 RR2DA37TF
BS 701 712 RR2F341TF
BS 713 713 RR2FI52TF
BS 714 719 RR2AI63TF

RD RR2FI15JQ 202 0 0
AAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTTCCATAATTAAATGCATTTTGCAG
GATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGATTTAGGGTGTGATGGATGTTGAT
GCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGG*AGTTTGGTTTTACAACTGAGAGGAGCAA
ATAATTTGCCCACCGTATTTAT

QA 1 202 1 202
DS 

RD RR2BN16TF 689 0 0
GGACGGACTCATTCCTCTCATGATATTTTCCTTTTAACAACTTATAATTTGATCTATTTC
AAATTAAGTTGAGGGAAAATTAATCATTAAACATGGCAAAAATCTCTTTTGTACTTCTCG
TCGTCGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCAACG
AATTAGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGA
AAACGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGA
TAATGTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAA
AAAATCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTT
CCATAATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGA
TTTAGGGTGCGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGGGAGTTT
GGTTTTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATTTATTAACTAATTGTATCA
ATTGTCTACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGC
TAACATTTGGT*A*TTAGTTATCAGCACA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2DA37TF 700 0 0
GGACGGACTCATTCCTCTCATGATATTTTCCTTTTAACAACTTATAATTTGATCTATTTC
AAATTAAGTTGAGGGAAAATTAATCATTAAACATGGCAAAAATCTCTTTTGTACTTCTCG
TCGTCGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCAACG
AATTAGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGA
AAACGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGA
TAATGTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAA
AAAATCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTT
CCATAATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGA
TTTAGGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGG*AGTTT
GGTTTTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATTTATTAACTAATTGCATCA
ATTGTCTACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGC
TAACATTTGGT*AATTAGTTATCAACACATTATAATAGCT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2E222TF 692 0 0
GGACGGACTCATTCCTCTCATGATATTTTCCTTTTAACAACTTATAATTTGATCTATTTC
AAATTAAGTTGAGGGAAAATTAATCATTAAACATGGCAAAAATCTCTTTTGTACTTCTCG
TCGTCGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCAACG
AATTAGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGA
AAACGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGA
TAATGTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAA
AAAATCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTT
CCATAATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGA
TTTAGGGTGCGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGG*AGTTT
GGTTTTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATTTATTAACTAATTGTATCA
ATTGTCTACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGC
TAACATTTGGT*AATTAGTTATCAGCACATTA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2F341TF 712 0 0
GGACGGACTCATTCCTCTCATGATATTTTCCTTTTAACAACTTATAATTTGATCTATTTC
AAATTAAGTCGAGGGAAAATTAATCATTAAACATGGCAAAAATCTCTTTTGTACTTCTCG
TCGTCGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCAACG
AATTAGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGA
AAACGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGA
TAATGTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAA
AAAATCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTT
CCATAATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGA
TTTAGGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGG*AGTTT
GGTTTTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATTTATTAACTAATTGCATCA
ATTGTCTACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGC
TAACATTTGGT*AATTAGTTATCAACACATTATAATAGCTACAGAATGAGTA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2DA37JQ 520 0 0
AATTAGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGA
AAACGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGA
TAATGTTGAAGAAACTGGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAA
AAAATCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTT
CCATAATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGA
TTTAGGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGG*AGTTT
GGTTTTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATTTATTAACTAATTGCATCA
ATTGTTTACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGC
TAACATTTGGT*AATTAGTTATCAACACATTATAATAGCT

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2FI52JQ 713 0 0
GGACGGACTCATTCCTCTCATGATATTTTCCTTTTAACAACTTATAATTTGATCTATTTC
AAATTAAGTTGAGGGAAAATTAATCATTAAACATGGCAAAAATCTCTTTTGTACTTCTCG
TCGTCGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCAACG
AATTAGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGA
AAACGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGA
TAATGTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAA
AAAATCTCGAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTT
CCATAATTAAATGCATTTTGCAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGA
TTTAGGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGG*AGTTT
GGTTTTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATTTATTAACTAATTGCATCA
ATTGTCTACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGC
TAACATTTGGT*AATTAGTTATCAACACATTATAATAGCTACAGAATGAGTAC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2FI52TF 713 0 0
GGACGGACTCATTCCTCTCATGATATTTTCCTTTTAACAACTTATAATTTGATCTATTTC
AAATTAAGTTGAGGGAAAATTAATCATTAAACATGGCAAAAATCTCTTTTGTACTTCTCG
TCGTCGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCAACG
AATTAGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGA
AAACGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGA
TAATGTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAA
AAAATCTCGAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTT
CCATAATTAAATGCATTTTGCAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGA
TTTAGGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGG*AGTTT
GGTTTTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATTTATTAACTAATTGCATCA
ATTGTCTACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGC
TAACATTTGGT*AATTAGTTATCAACACATTATAATAGCTACAGAATGAGTAC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2AI63TF 717 0 0
GG
GGACTCATTCCTCTCATGATATTTTCCTTTTAACAACTTATAATTTGATCTATTTCAAAT
TAAGTTGAGGGAAAATTAATCATTAAACATGGCAAAAATCTCTTTTGTACTTCTCGTCGT
CGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTAAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCAACGAATT
AGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGAAAAC
GGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGATAAT
GTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAAAAAA
TCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGCGGGATACATTTCCAT
AATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGATTTA
GGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGG*AGTTTGGTT
TTACAACTGAGAGGAGCAAATAACTTGCCCACCGTATATATTAACTAATTGCATCAATTG
TATACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGCTAAC
ATTTGGTTAATTAGTTATCAACACATTATAATAGCTACAGAATGAGTACATTTTT

QA 3 717 3 717
DS 

RD RR2F341JQ 596 0 0
TCGTCGTCGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCA
ACGAATTAGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGA
AGAAAACGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTG
AGATAATGTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCA
GAAAAAATCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACA
TTTCCATAATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACA
AGATTTAGGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGG*AG
TTTGGTTTTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATTTATTAACTAATTGCA
TCAATTGTCTACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTG
TGCTAACATTTGGT*AATTAGTTATCAACACATTATAATAGCTACAGAATGAGTAC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 10

CO CL624Contig1 748 10 11 U
GGACAACACACATCAGGTTTCACTAAGACCCCACAAAAGAACAAAGAAATAGAGATGGGT
TTGGTTACAGAGGAGATCAGAGCTAAGGCAGAGAAGTACACAGGAGAAATATGCCAAGAG
AAGGCCAAGGTTTTCTACAAGGAAATATCTATGCCCAGTGGCTTACTACCGTTGAAGGAC
ATAGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGAGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAAGAGAGC
ATCATCCACAAGTTCGAAGAGATCGATAAGCTCGTCTCCTATGGAACCGAGATCACTGCC
GTGGTTGAGACCGGCAGGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATA
TGGATCACAGTCAATGAGATCTATACACAGGACGGAGGGAAGATCACATTCAAGACACCA
ACCACTCTGTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTACAGTCCCAGAAGAAGTGGAACCT
GCCAAGGAAAAGGGCAGTGAAGCCACCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCTATCAAGGAGGCT
GTTCCAGTTAAGGAGGCCTAATAAAAGCCTCAATTCTTCGACAGTTAAAAGACGCTAAAA
TCCTTATGTCCACTTCACTCATATGTTACCTACCACTTGTTGCTACTTGTTTTACCTGTA
ATAAGATGTCAACATCATCCTCATCCACAAATATTACCGACTATATCTGTAATCTAAATT
AAAGTTGGTTATGTATGTTACTTCAAAG


BQ
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2E643JQ C 1
AF RR2E643TF U 1
AF RR2GR04TF U 1
AF RR2D503TF U -4
AF RR2D503JQ C 24
AF RR2GR04JQ C 523
AF RR2FY22TF U 1
AF RR2AA35JQ C 227
AF RR2FY22JQ C 280
AF RR2AA35TF U 392
BS 1 67 RR2E643TF
BS 68 68 RR2FY22TF
BS 69 138 RR2E643TF
BS 139 139 RR2FY22TF
BS 140 513 RR2E643TF
BS 514 514 RR2FY22TF
BS 515 551 RR2E643TF
BS 552 552 RR2FY22TF
BS 553 681 RR2E643TF
BS 682 728 RR2FY22TF
BS 729 748 RR2AA35TF

RD RR2E643JQ 681 0 0
GGACAACACACATCAGGTTTCACTAAGACCCCACAAAAGAACAAAGAAATAGAGATGGGT
TTGGTTATAGAGGAGATCAGAGCTAAGGCAGAGAAGTACACAGGAGAAATATGCCAAGAG
AAGGCCAAGGTTTTCTACGAGGAAATATCTATGCCCAGTGGCTTACTACCGTTGAAGGAC
ATAGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGAGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAAGAGAGC
ATCATCCACAAGTTCGAAGAGATCGATAAGCTCGTCTCCTATGGAACCGAGATCACTGCC
GTGGTTGAGACCGGCAGGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATA
TGGATCACAGTCAATGAGATCTATACACAGGACGGAGGGAAGATCACATTCAAGACACCA
ACCACTCTGTCCAGGACTTTCCCTGTTTCAGCTTTTACAGTCCCAGAAGAAGTGGAACCT
GCCAAGGAAAAGGGCAGTGAAGCCACCGAGGTCCAGGAGGCTGTTGCTATCAAGGAGGCT
GTTCCAGTTAAGGAGGCCTAATAAAAGCCTCAATTTTTCGACAGTTAAAAGACGCTAAAA
TCCTTATGTCCACTTCACTCATATGTTACCTACCACTTGTTGCTACTTGTTTTACCTGTA
ATAAGATGTCAACATCATCCT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2E643TF 690 0 0
GGACAACACACATCAGGTTTCACTAAGACCCCACAAAAGAACAAAGAAATAGAGATGGGT
TTGGTTATAGAGGAGATCAGAGCTAAGGCAGAGAAGTACACAGGAGAAATATGCCAAGAG
AAGGCCAAGGTTTTCTACGAGGAAATATCTATGCCCAGTGGCTTACTACCGTTGAAGGAC
ATAGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGAGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAAGAGAGC
ATCATCCACAAGTTCGAAGAGATCGATAAGCTCGTCTCCTATGGAACCGAGATCACTGCC
GTGGTTGAGACCGGCAGGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATA
TGGATCACAGTCAATGAGATCTATACACAGGACGGAGGGAAGATCACATTCAAGACACCA
ACCACTCTGTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTACAGTCCCAGAAGAAGTGGAACCT
GCCAAGGAAAAGGGCAGTGAAGCCACCGAGGTCCAGGAGGCTGTTGCTATCAAGGAGGCT
GTTCCAGTTAAAGAGGCCTAATAAAAGCCTCAATTCTTCGACAGTTAAAAGACGCTAAAA
TCCTTATGTCCACTTCACTCATATGTTACCTACCACTTGTTGCTACTTGTTTTACCTGTA
ATAAGATGTCAACATCATCCT
AAAAAAAAA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2GR04TF 682 0 0
GGACAACACACATCAGGTTTCACTAAGACCCCACAAA*GAACAAAGAAATAGAGATGGGT
TTGGTTACAGAGGAGATCAGAGCTAAGGCAGAGAAGTACACAGGAGAAATATGCCAAGAG
AAGGCCAAGGTTTTCTACGAGGAAATATCTATGCCCAGTGGCTTACTACCGTTGAAGGAC
ATAGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGAGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAAGAGAGC
ATCATCCACAAGTTCGAAGAGATCGATAAGCTCGTCTCCTATGGAACCGAGATCACTGCC
GTGGTTGAGACCGGCAGGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATA
TGGATCACAGTCAATGAGATCTATACACAGGACGGAGGGAAGATCACATTCAAGACACCA
ACCACTCTGTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTACAGTCCCAGAAGAAGTGGAACCT
GCCAAGGAAAAGGGCAGTGAAGCCACCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCTATCAAGGAGGCT
GTTCCAGTTAAGGAGGCCTAATAAAAGCCTCAATTCTTCGACAGTTAAAAGACGCTAAAA
TCCTTATGTCCACTTCACTCATATGTTACCTACCACTTGTTGCTACTTGTTTTACCTGTA
ATAAGATGTCAACATCATCCTC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2D503TF 721 0 0
GGGCTCC
ACAACACACAACAGGTTTCACTAAGACCCCACAAAAGAACAAAGAAATAGAGATGGGTTT
GGTTACAGAGGAGATCAGAGCTAAGGCAGAGAAGTACACAGGAGAAATATGCCAAGAGAA
GGCCAAGGTTTTCTACAAGGAAATATCTATGCCCAGTGGCTTACTACCGTTGAAGGACAT
AGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGAGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAAGAGAGCAT
CATCCACAAGTTCGAAGAGATCGATAAGCTCGTCTCTTATGGAACCGAGATCACTGCCGT
GGTTGAGACCGGCAGGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATATG
GATCACAGTCAATGAGATCTATACACAGGACGGAGGGAAGATCACATTCAAGACACCAAC
CACTCTGTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTACAGTCCCAGAAGAAGTGGAACCTGC
CAAGGAAAAGGGCAGTGAAGCCACCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCTATCAAGGAGGCTGT
TCCAGTTAAGGAGGCCTAATAAAAGCCTCAATTCTTCGACAGTTAAAAGACGCTAAAATC
CTTATGTCCACTTCACTCATATGTTACCTACCACTTGTTGCTACTTGTTTTACCTGTAAT
AAGATGTCAACATCATCCTCATCCACAAATATTACCGACTATATCCGTAATCTA

QA 8 721 8 721
DS 

RD RR2D503JQ 692 0 0
TAAGACCCCACAAAAGAACAAAGAAATAGAGATGGGTTTGGTTACAGAGGAGATCAGAGC
TAAGGCAGAGAAGTACACAGGAGAAATATGCCAAGAGAAGGCCAAGGTTTTCTACAAGGA
AATATCTATGCCCAGTGGCTTACTACCGTTGAAGGACATAGAAGAGGTTGGGTATGACAG
AGAGTCAGGAGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAAGAGAGCATCATCCACAAGTTCGAAGAGAT
CGATAAGCTCGTCTCTTATGGAACCGAGATCACTGCCGTGGTTGAGACCGGCAGGATCAA
GAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATATGGATCACAGTCAATGAGATCTA
TACACAGGACGGAGGGAAGATCACATTCAAGACACCAACCACTCTGTCCAGGACTTTCCC
TGTTTCAGCTTTTACAGTCCCAGAAGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAAAGGGCAGTGAAGC
CACCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCTATCAAGGAGGCTGTTCCAGTTAAGGAGGCCTAATA
AAAGCCTCAATTCTTCGACAGTTAAAAGACGCTAAAATCCTTATGTCCACTTCACTCATA
TGTTACCTACCACTTGTTGCTACTTGTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTCA
TCCACAAATATTACCGACTATATCCGTAATCT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2GR04JQ 160 0 0
GTTGCTATCAAGGAGGCTGTTCCAGTTAAGGAGGCCTAATAAAAGCCTCAATTTTTCGAC
AGTTAAAAGACGCTAAAATCCTTATGTCCACTTCACTCATATGTTACCTACCACTTGTTG
CTACTTGTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTC

QA 1 160 1 160
DS 

RD RR2FY22TF 730 0 0
GGACAACACACAACAGGTTTCACTAAGACCCCACAAAAGAACAAAGAAATAGAGATGGGT
TTGGTTACAGAGGAGATCAGAGCTAAGGCAGAGAAGTACACAGGAGAAATATGCCAAGAG
AAGGCCAAGGTTTTCTACAAGGAAATATCTATGCCCAGTGGCTTACTACCGTTGAAGGAC
ATAGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGAGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAAGAGAGC
ATCATCCACAAGTTCGAAGAGATCGATAAGCTCGTCTCTTATGGAACCGAGATCACTGCC
GTGGTTGAGACCGGCAGGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTCTTATA
TGGATCACAGTCAATGAGATCTATACACAGGACGGAGGGAAGATCACATTCAAGACACCA
ACCACTCTGTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTACAGTCCCAGAAGAAGTGGAACCT
GCCAAGGAAAAGGGCAGTGAAGCCACCGAGGTCAAGGAGGCTGTTGCTATCAAGGAGGCT
GTTCCAGTTAAGGAGGCCTAATAAAAGCCTCAATTCTTCGACAGTTAAAAGACGCTAAAA
TCCTTATGTCCACTTCACTCATATGTTACCTACCACTTGTTGCTACTTGTTTTACCTGTA
ATAAGATGTCAACATCATCCTCATCCACAAATATTACCGACTATATCTGTAATCTAAATT
AAAGTTGG
GT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2AA35JQ 518 0 0
AGCAGAAAGAGAGCATCATCCACAAGTTCGAAGAGATCGATAAGCTCGTCTCCTATGGAA
CCGAGATCACTGCCGTGGTTGAGACCGGCAGGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCA
AGGAGCTTCTTATATGGATCACAGTCAATGAGATCTATACACAGGACGGAGGGAAGATCA
CATTCAAGACACCAACCACTCTGTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTACAGTCCCAG
AAGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAAAGGGCAGTGAAGCCACCGAGGTCAAGGAGGCTGTTG
CTATCAAGGAGGCTGTTCCAGTTAAGGAGGCCTAATAAAAGCCTCAATTTTTCGACAGTT
AAAAGACGCTAAAATCCTTATGTCCACTTCACTCATATGTTACCTACCACTTGTTGCTAC
TTGTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTCATCCACAAATATTACCGACTATAT
CTGTAATTTAAATTAAAGTTGGTTATGTATGTTACTTC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2FY22JQ 451 0 0
TATGGAACCGAGATCACTGCCGTGGTTGAGACCGGCAGGATCAAGAAGCTCACTGGAGTC
AAGGCCAAGGAGCTTCTTATATGGATCACAGTCAATGAGATCTATACACAGGACGGAGGG
AAGATCACATTCAAGACACCAACCACTCTGTCCAGGACTTTCCCTGTTTCAGCTTTTACA
GTCCCAGAAGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAAAGGGCAGTGAAGCCACCGAGGTCAAGGAG
GCTGTTGCTATCAAGGAGGCTGTTCCAGTTAAGGAGGCCTAATAAAAGCCTCAATTCTTC
GACAGTTAAAAGACGCTAAAATCCTTATGTCCACTTCACTCATATGTTACCTACCACTTG
TTGCTACTTGTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTCATCCACAAATATTACCG
ACTATATCTGTAATCTAAATTAAAGTTGG
GT

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2AA35TF 357 0 0
ACGGAGGGAAGATCACATTCAAGACACCAACCACTCTGTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAG
CTTTTACAGTCCCAGAAGAAGTGGAACCTGCCAAGGAAAAGGGCAGTGAAGCCACCGAGG
TCAAGGAGGCTGTTGCTATCAAGGAGGCTGTTCCAGTTAAGGAGGCCTAATAAAAGCCTC
AATTCTTCGACAGTTAAAAGACGCTAAAATCCTTATGTCCACTTCACTCATATGTTACCT
ACCACTTGTTGCTACTTGTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTCATCCACAAA
TATTACCGACTATATCTGTAATCTAAATTAAAGTTGGTTATGTATGTTACTTCAAAG

QA 1 357 1 357
DS 



AS 2 8

CO CL625Contig1 1418 5 11 U
CTAAAGTAATTTCCATTTTTAAGAATTACAATAGAACATTTTACTTTGTTTCATAATTCG
CATGAAAATCTCAAAAACAAGAAACATAAAAAGGTAAATATTATTTGAAGAAAAATCAAC
AACCAAAACCTAATTGCAG**TTAATGAGTTCATCCATTAGATGTTTTACATCAAAGTAA
AA***CATATCTCTCTCTCTCTCTTTCTGTCTTTTTGTTTTTGTCGGAGGAAACAGATGC
AAACCAAAGAATTGCCTCAAAAGAAAAAGCCTAAGCTTTGAAATTATCCTTTGCTTCTCG
GATAATAGCCAAAGCTTCTGCTTCATCTGCAGTCTCTGAAATACCTAAAGCCCGACGAAT
ATCTGTATTCGAACTGCGAAGGAATGGGTTACAAGCTTTCTCCATCTTCAGTGTTGTTGG
AATCGTTGGTAATTTCTTTTTACGGAGCTCTGCAACATGAGCTGCATAAGACTGGAGTAC
TTCGTTGTTTGGCTCTATAGACAATGCAAACTTGGAGTTACTCAGTGTGTATTCATGACC
ACAGTATATGCTTGTGTCGTCTGGTAAAGCAATGATCTTTTTGAGAGAAGCAAGCATCTG
CTTAGGGGTACCTTCAAAGAGTTTACCACAAGATAAGCTAAACAAGGTGTCCCCAGAGAA
GATAGCTCTTGATCCGGGAAAGTATAAGCTGATATGGCCTTTTGTGTGGCCAGGAGTATC
CATAACATGGACTTCATGACCAGCAAACATCCACTTCTCACCATCCTTCAAGGCTATATC
GATTCCAGGTATCCGATCTCTATCTAAAGCTGAGCCAATCACCTTTGCACCGTACCTGTC
TTTCAGTTCAAGATTCCCACCAGTGTGATCATAATGATGATGCGTATTCAATATATACGT
CAGGTTACGACCACTCCTCTGCAAAGAATCTATCACAGGTTCAGCTTCAGAAGGGTCAAC
CACCCCAACAGTGCCGGTGTCCTCGTCATGCAGAATGTAGGCATAGTTGTCTTTAAGACA
AGGCACCATCTCAATTTGCAATGAGGAGGGATTGGAGGAGACACTGCAGAAACTGGAGAC
TCGAATAGATTTGCCAGCACCGCGGAGAGTCCTAAGAGGTGAAGAGACAAGCTTCATGAC
TCTGCAGACGAGACCCTTTCGGATGTGAAGCTGCCTCACACATGGCTCACTTGTTAGCTT
CCTGGAACATCGAAAGAAGGAGATAGCAGAAGAAGCTTTGGAGATGGTTTGCATCTCTGT
GTCTCTGTGTATGAAGAGAATTATTCTCTGTTTTGGAGATCAAAAGGATTTGTCTCTTTC
CTCTGTGTATATATCTCACAGAGATTCTCTTCTCGTTTTGATCGACCAAAGAAGGAATCT
TCGACGGAGAAAGCGCGGCAGAGACAAATGTCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 
5 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A725JQ U 1
AF RR2EM71JQ U 89
AF RR2EM71TF C 371
AF RR2E425JQ U 106
AF RR2A725TF C 619
BS 1 102 RR2A725JQ
BS 103 103 RR2EM71JQ
BS 104 201 RR2A725JQ
BS 202 203 RR2EM71JQ
BS 204 250 RR2A725JQ
BS 251 251 RR2EM71JQ
BS 252 825 RR2A725JQ
BS 826 826 RR2EM71JQ
BS 827 831 RR2A725JQ
BS 832 880 RR2EM71JQ
BS 881 1418 RR2A725TF

RD RR2A725JQ 831 0 0
CTAAAGTAATTTCCATTTTTAAGAATTACAATAGAACATTTTACTTTGTTTCATAATTCG
CATGAAAATCTCAAAAACAAGAAACATAAAAAGGTAAATATTTTTTGAAGAAAAATCAAC
AACCAAAACCTAATTGCAG**TTAATGAGTTCATCCATTAGATGTTTTACATCAAAGTAA
AA***CATATCTCTCTCTCTC**TTTCTGTCTTTTTGTTTTTGTCGGAGGAAACAGATGC
AAACCAAAGAGTTGCCTCAAAAGAAAAAGCCTAAGCTTTGAAATTATCCTTTGCTTCTCG
GATAATAGCCAAAGCTTCTGCTTCATCTGCAGTCTCTGAAATACCTAAAGCCCGACGAAT
ATCTGTATTCGAACTGCGAAGGAATGGGTTACAAGCTTTCTCCATCTTCAGTGTTGTTGG
AATCGTTGGTAATTTCTTTTTACGGAGCTCTGCAACATGAGCTGCATAAGACTGGAGTAC
TTCGTTGTTTGGCTCTATAGACAATGCAAACTTGGAGTTACTCAGTGTGTATTCATGACC
ACAGTATATGCTTGTGTCGTCTGGTAAAGCAATGATCTTTTTGAGAGAAGCAAGCATCTG
CTTAGGGGTACCTTCAAAGAGTTTACCACAAGATAAGCTAAACAAGGTGTCCCCAGAGAA
GATAGCTCTTGATCCGGGAAAGTATAAGCTGATATGGCCTTTTGTGTGGCCAGGAGTATC
CATAACATGGACTTCATGACCAGCAAACATCCACTTCTCACCATCCTTCAAGGCTATATC
GATTCCAGGTATCCGATCTCTATCTAAAGCTGAGCCAATCACCTTCGCACC

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR2EM71JQ 793 0 0
AAAAGGTAAATATTATTTGAAGAAAAATCAACAACCAAAACCTAATTGCAG**TTAATGA
GTTCATCCATTAGATGTTTTACATCAAAGTAAAA***CATATCTCTCTCTCTCTCTTTCT
GTCTTTTTGTTTTTGTCGGAGGAAACAGATGCAAACCAAAGAATTGCCTCAGAAGAAAAA
GCCTAAGCTTTGAAATTATCCTTTGCTTCTCGGATAATAGCCAAAGCTTCTGCTTCATCT
GCAGTCTCTGAAATACCTAAAGCCCGACGAATATCTGTATTCGAACTGCGAAGGAATGGG
TTACAAGCTTTCTCCATCTTCAGTGTTGTTGGAATCGTTGGTAATTTCTTTTTACGGAGC
TCTGCAACATGAGCTGCATAAGACTGGAGTACTTCGTTGTTTGGCTCTATAGACAATGCA
AACTTGGAGTTACTCAGTGTGTATTCATGACCACAGTATATGCTTGTGTCGTCTGGTAAA
GCAATGATCTTTTTGAGAGAAGCAAGCATCTGCTTAGGGGTACCTTCAAAGAGTTTACCA
CAAGATAAGCTAAACAAGGTGTCCCCAGAGAAGATAGCTCTTGATCCGGGAAAGTATAAG
CTGATATGGCCTTTTGTGTGGCCAGGAGTATCCATAACATGGACCTCATGACCAGCAAAC
ATCCACTTCTCACCATCCTTCAAGGCTATATCGATTCCAGGTATCCGATCTCTATCTAAA
GCTGAGCCAATCACCTTTGCACCGTACCTGTCTTTCAGTTCAAGATTCCCACCAGTGTGA
TCATAATGATGA
C

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2EM71TF 511 0 0
GAACTGCGAAGGAATGGGTTACAAGCTTTCTCCATCTTCAGTGTTGTTGGAATCGTTGGT
AATTTCTTTTTACGGAGCTCTGCAACATGAGCTGCATAAGACTGGAGTACTTCGTTGTTT
GGCTCTATAGACAATGCAAACTTGGAGTTACTCAGTGTGTATTCATGACCACAGTATATG
CTTGTGTCGTCTGGTAAAGCAATGATCTTTTTGAGAGAAGCAAGCATCTGCTTAGGGGTA
CCTTCAAAGAGTTTACCACAAGATAAGCTAAACAAGGTGTCCCCAGAGAAGATAGCTCTT
GATCCGGGAAAGTATAAGCTGATATGGCCTTTTGTGTGGCCAGGAGTATCCATAACATGG
ACCTCATGACCAGCAAACATCCACTTCTCACCATCCTTCAAGGCTATATCGATTCCAGGT
ATCCGATCTCTATCTAAAGCTGAGCCAATCACCTTTGCACCGTACCTGTCTTTCAGTTCA
AGATTCCCACCAGTGTGATCATAATGATGA
C

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2E425JQ 755 0 0
C
GAAGAAAAATCACCAACCAAAACCTAATTGCAGTGTTAATGAGTACCAACATTAGATGTT
TTACATCAAACTCAAAGTAAACATATCTCTCTCTCTCTTTCTGTCTTTTTGTTTTTGTCG
GAGGAAACAGATGCAAACCAAAGAATTGCCTCAAAAGAAAAAGCCTAAGCTTTGAAATTA
TCCTTTGCTTCTCGGATAATAGCCAAAGCTTCTGCTTCATCTGCAGTCTCTGAAATACCT
AAAGCCCGACGAATATCTGTATTCGAACTGCGGAGGAATGGGTTACAAGCTTTCTCCATC
TTCAGTGTTGTTGGAATCGTAGGTAATTTCTTTTTACGGAGCTCTGCAACATGAGCTGCA
TAAGACTGAAGTACTTCGTTGTTTGGCTCTATAGACAATGCAAACTTGGAGTTACTCAGT
GTGTATTCATGACCACAGTATATGCTTGTGTCGTCTGGTAAAGAAACGATCTTTTTGAGA
GAAGCAAGCATCTGCTTAGGGGTACCTTCAAAGAGTTTACCACAAGACAAGCTAAACAAG
GTATCTCCGGAGAAGATAGCTCGTGATCCTGGAAAGTATAAGCTGATATGGCCTTTTGTG
TGGCCGGGAGTATCCATAACATGGACTTCATGACCAGCAAACATCCACTTTTCACCATCC
TTCAAGGCTATATCGATTCCAGGTATCCGATCTCTATCTAAAGCTGAGCCAATCACCTTT
GCACCATGCCTGTCTTTCAATTCAAGATTCCCAC

QA 2 755 2 755
DS 

RD RR2A725TF 800 0 0
GAGTTTACCACAAGATAAGCTAAACAAGGTGTCCCCAGAGAAGATAGCTCTTGATCCGGG
AAAGTATAAGCTGATATGGC*TTTTGTGTGGCCAGGAGTATCCATAACATGGACTTCATG
ACCAGCAAACATCCACTTCTCACCATCCTTCAAGGCTATATCGATTCCAGGTATCCGATC
TCTATCTAAAGCTGAGCCAATCACCTTCGCACCGTACCTGTCTTTCAGTTCAAGATTCCC
ACCAGTGTGATCATAATGATGATGCGTATTCAATATATACGTCAGGTTACGACCACTCCT
CTGCAAAGAATCTATCACAGGTTCAGCTTCAGAAGGGTCAACCACCCCAACAGTGCCGGT
GTCCTCGTCATGCAGAATGTAGGCATAGTTGTCTTTAAGACAAGGCACCATCTCAATTTG
CAATGAGGAGGGATTGGAGGAGACACTGCAGAAACTGGAGACTCGAATAGATTTGCCAGC
ACCGCGGAGAGTCCTAAGAGGTGAAGAGACAAGCTTCATGACTCTGCAGACGAGACCCTT
TCGGATGTGAAGCTGCCTCACACATGGCTCACTTGTTAGCTTCCTGGAACATCGAAAGAA
GGAGATAGCAGAAGAAGCTTTGGAGATGGTTTGCATCTCTGTGTCTCTGTGTATGAAGAG
AATTATTCTCTGTTTTGGAGATCAAAAGGATTTGTCTCTTTCCTCTGTGTATATATCTCA
CAGAGATTCTCTTCTCGTTTTGATCGACCAAAGAAGGAATCTTCGACGGAGAAAGCGCGG
CAGAGACAAATGTCTCTCCC

QA 1 800 1 800
DS 



CO CL625Contig2 1283 3 12 U
GGGAGGAGACATTTGTCTCTGACGCGCTTTCTCCGTAAGATTCCTTCTTTGATCGATCAA
AGAGAGAATCTTTGTGAGATATACACAAAGGATAGAGACAAATCCTTTTGATCTCCAAAA
CAGAGAATAGTTCTCTTCATACCCAGAGACACAGAGACGCAAACCATCTCCAAAGCTTCT
TCTGCTATCTCCTTCTTTCGATGTTCCAGGAAGCTAACAAGTGAGCCATGTGTGAGGCAG
CTTCACATCCGAAAGGGTCTCGTCTGCAGAGTCATGAAGCTTGTCTCTTCACCTCTTAGG
ACTCTCCGCGGTGCTGGCAGATCTATTCGAGTCTCCAGTTTCTGCAGTGTCTCCTCCAAT
CCCTCCTCATTGCAAATTGAGATGGTGCCTTGTCTTAAAGACAACTATGCCTACATTTTG
CATGACGAGGATACTGGCACTGTTGGTGTGGTTGACCCTTCTGAAGCTGAACCTGTGATT
GATTCTTTGCAGAGGAGTGGTCGTAACCTAACGTATATATTGAATACGCATCATCATTAT
GATCATACTGGTGGGAATCTTGAATTGAAAGACAGGTACGGTGCAAAGGTGATTGGCTCA
GCTTTAGGTAGAGATCGGATACCTGGAATTGATATAGCCTTGAAGGATGGTGAAAAGTGG
ATGTTTGCTGGTCATGAAGTCCATGTTATGGATACTCCTGGCCACACTAAAGGCCATATC
AGCTTATACTTTCCAGGATCAAGAGCTATCTTCTCTGGGGACACCTTGTTTAGCTTATCA
TGTGGTAAACCCTTTGAAGGTACCCCTAAGCAGATGCTTGCTTCTCTCAAAAAGATCATT
GCTTTACCAGACGACACGAGCATATACTGTGGTCATGAATACACACTGAGTAACTCCAAG
TTTGCATTGTCTATAGAGCCAAACAACGAAGTACTTCAGTCATATGCGGCTCATGTTGCA
GAGCTCCGTAAAAAGAAATTACCTACGATTCCAACAACACTGAAGATGGAGAAAGCTTGT
AACCCATTCCTCCGCAGTTCGAATACAGATATTCGTCGGGCTTTAGGTATTTCAGAGACT
GCAGATGAAGCAGAAGCTTTGGCTATTATCCGAGAAGCAAAGGATAATTTCAAAGCTTAG
GCTTTTTCTTTTGAGGCAATTCTTTGGTTTGCATCTGTTTCCTCCGACAAAAACAAAAAG
ACAGAAAGAGAGAGATATGTTTACTTTTATGTAAAACATCTAATTGGTACTCATTAACAC
TGCAAATTGGGTTTTGGTTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BB66TF U 116
AF RR2DW82TF U 1
AF RR2BB66JQ C 477
BS 1 146 RR2DW82TF
BS 147 147 RR2BB66TF
BS 148 157 RR2DW82TF
BS 158 158 RR2BB66TF
BS 159 607 RR2DW82TF
BS 608 608 RR2BB66TF
BS 609 644 RR2DW82TF
BS 645 645 RR2BB66TF
BS 646 712 RR2DW82TF
BS 713 713 RR2BB66JQ
BS 714 769 RR2DW82TF
BS 770 1283 RR2BB66JQ

RD RR2BB66TF 593 0 0
CAAAACAGAGAATAGTTCTCTTCATACCCAGAGACACAGAGACGCAAACCATCTCCAAAG
CTTCTTCTGCTATCTCCTTCTTTCGATGTTCCAGGAAGCTAACAAGTGAGCCATGTGTGA
GGCAGCTTCACATCCGAAAGGGTCTCGTCTGCAGAGTCATGAAGCTTGTCTCTTCACCTC
TTAGGACTCTCCGCGGTGCTGGCAGATCTATTCGAGTCTCCAGTTTCTGCAGTGTCTCCT
CCAATCCCTCCTCATTGCAAATTGAGATGGTGCCTTGTCTTAAAGACAACTATGCCTACA
TTTTGCATGACGAGGATACTGGCACTGTTGGTGTGGTTGACCCTTCTGAAGCTGAACCTG
TGATTGATTCTTTGCAGAGGAGTGGTCGTAACCTAACGTATATATTGAATACGCATCATC
ATTATGATCATACTGGTGGGAATCTTGAATTGAAAGACAGGTACGGTGCAAAGGTGATTG
GCTCAGCTTTAGGTAGAGATCGGATACCTGGAATTGATATAGCCTTGAAGGATGGTGAAA
AGTGGATGTTTGCTGGTCATGAAGTCCATGTTATGGATACTCCTGGCCACACT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2DW82TF 769 0 0
GGGAGGAGACATTTGTCTCTGACGCGCTTTCTCCGTAAGATTCCTTCTTTGATCGATCAA
AGAGAGAATCTTTGTGAGATATACACAAAGGATAGAGACAAATCCTTTTGATCTCCAAAA
CAGAGAATAGTTCTCTTCATACCCAGGGACACAGAGATGCAAACCATCTCCAAAGCTTCT
TCTGCTATCTCCTTCTTTCGATGTTCCAGGAAGCTAACAAGTGAGCCATGTGTGAGGCAG
CTTCACATCCGAAAGGGTCTCGTCTGCAGAGTCATGAAGCTTGTCTCTTCACCTCTTAGG
ACTCTCCGCGGTGCTGGCAGATCTATTCGAGTCTCCAGTTTCTGCAGTGTCTCCTCCAAT
CCCTCCTCATTGCAAATTGAGATGGTGCCTTGTCTTAAAGACAACTATGCCTACATTTTG
CATGACGAGGATACTGGCACTGTTGGTGTGGTTGACCCTTCTGAAGCTGAACCTGTGATT
GATTCTTTGCAGAGGAGTGGTCGTAACCTAACGTATATATTGAATACGCATCATCATTAT
GATCATACTGGTGGGAATCTTGAATTGAAAGACAGGTACGGTGCAAAGGTGATTGGCTCA
GCTTTAGATAGAGATCGGATACCTGGAATTGATATAGCCTTGAAAGATGGTGAAAAGTGG
ATGTTTGCTGGTCATGAAGTCCATGTTATGGATACTCCTGGCCACACTAAAG*CCATATC
AGCTTATACTTTCCAGGATCAAGAGCTATCTTCTCTGGGGACACCTTGT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2BB66JQ 807 0 0
GATT
GATTCTTTGCAGAGGAGTGGTCGTAACCTAACGTATATATTGAATACGCATCATCATTAT
GATCATACTGGTGGGAATCTTGAATTGAAAGACAGGTACGGTGCAAAGGTGATTGGCTCA
GCTTTAGGTAGAGATCGGATACCTGGAATTGATATAGCCTTGAAGGATGGTGAAAAGTGG
ATGTTTGCTGGTCATGAAGTCCATGTTATGGATACTCCTGGCCACACTAAAGGCCATATC
AGCTTATACTTTCCAGGATCAAGAGCTATCTTCTCTGGGGACACCTTGTTTAGCTTATCA
TGTGGTAAACCCTTTGAAGGTACCCCTAAGCAGATGCTTGCTTCTCTCAAAAAGATCATT
GCTTTACCAGACGACACGAGCATATACTGTGGTCATGAATACACACTGAGTAACTCCAAG
TTTGCATTGTCTATAGAGCCAAACAACGAAGTACTTCAGTCATATGCGGCTCATGTTGCA
GAGCTCCGTAAAAAGAAATTACCTACGATTCCAACAACACTGAAGATGGAGAAAGCTTGT
AACCCATTCCTCCGCAGTTCGAATACAGATATTCGTCGGGCTTTAGGTATTTCAGAGACT
GCAGATGAAGCAGAAGCTTTGGCTATTATCCGAGAAGCAAAGGATAATTTCAAAGCTTAG
GCTTTTTCTTTTGAGGCAATTCTTTGGTTTGCATCTGTTTCCTCCGACAAAAACAAAAAG
ACAGAAAGAGAGAGATATGTTTACTTTTATGTAAAACATCTAATTGGTACTCATTAACAC
TGCAAATTGGGTTTTGGTTGATG

QA 5 807 5 807
DS 



AS 2 10

CO CL626Contig1 804 5 4 U
AGGGACGAACAGAACATCTTACATAAAAAAAAAAA**CTGAGTATCTCTTCCCTAGCCAA
AAATTGTATAAACCCTTACTTAACCAGAGAAATGGGAATCTCAAGATCTAAAGGAAACAC
ACACAACATCTTCCTACTCTGCAACTACATCCTCTTAGGCTCCGCCTCAAGTTGCATCTT
CCTCACAATCTCCCTCCGTCTCTTCCCTTCTCTCTCCGGCCTCTCTCTCATCTTCCTCCA
CACTCTCACCATCGCCACTGCTGTCACCGGCTGCTCCGTTTTCGCCTCTTCAACCGCTGC
AACCACAAGCGACAGATTGTACGGTGCACACATGGTGGCCACAGTCCTCGCTGCCATTTT
CCAAGGGGCAGTCTCTGTTCTGACATTCACGAGAACAGGGGATTTCCTTAGGGTTCTTAA
ATCGTATGTTCTTGTAGAAGACGGAGCGGTGATTCTTAAACTGGCAGGTGGTTTGTGTGT
AGTAATGTTCTGCTTAGAGTGGGTTGTTCTTGTGTTAGCGTTCTTGTTGAAGTATAGTGA
CTATTTGGATGAGAGCGTTGTAGATGACGGAGGTAAGTTCCAGAGGCAAGAAGAAGATCT
CAAGGATTGGCCTTCTTACCCATTCCAACTCAAGCTTTGATTTCAGTTCCACGTTTCTTT
TTTTTGGTACTTTGGATACATTCTTTGGTTGATTTATATAAATTAGATGGCAAAAGCTAT
GCGTGTATGGTTTTGATGCTTGTTACTTGAGAGTTGTGTGATTTTGTCACGCTTAAATAA
GATTAGTGTATATTTTAAATTAAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2EX83TF U 9
AF RR2DC21TF U 3
AF RR2GW30TF U 3
AF RR2BD50TF U 1
AF RR2BD50JQ C 231
BS 1 35 RR2BD50TF
BS 36 37 RR2DC21TF
BS 38 802 RR2BD50TF
BS 803 804 RR2BD50JQ

RD RR2EX83TF 651 0 0
GG
AGAACATCTTACATAAAAAAAAAA***CTGAGTATCTCTTCCCTAGCCAAAAATTGTATA
AACCCTTACTTAACCAGAGAAATGGGAATCTCAAGATCTAAAGGAAACACACACAACATC
TTCCTACTCTGCAACTACATCCTCTTAGGCTCCGCCTCAAGTTGCATCTTCCTCACAATC
TCCCTCCGTCTCTTCCCTTCCCTCTCCGGCCTCTCTCTCATCTTCCTCCACACTCTCACC
ATCGCCACTGCTGTCACCGGCTGCTCCGTTTTCGCCTCTTCAACCGCTGCAACCACAAGC
GACAGATTGTACGGTGCACACATGGTGGCCACAGTCCTCGCTGCCATATTCCAAGGGGCA
GTCTCTGTTCTGATATTCACGAGAACAGGGGATTTCCTTAGGGTTCTTAAATCGTATGTT
CTTGTAGAAGACGGAGCGGTGATTCTTAAACTGGCAGGTGGTTTGTGTGTAGTAATGTTC
TGCTTAGAGTGGGTTGTTCTTGTGTTAGCGTTCTTGTTGAAGTATAGTGACTATTTGGAT
GAGAGCGTTGTAGATGACGGAGGTAAGTTCCAGAGGCAAGAAGAAGATCTCAAGGATTGG
CCTTCTTACCCATTCCAACTCAAGCTTTGATTTCAGTTCCACGTTTCTT

QA 3 651 3 651
DS 

RD RR2DC21TF 707 0 0
GGACGAACAGAACATCTTACATAAAAAAAAAAA**CTGAGTATCTCTTCCCTAGCCAAAA
ATTGTATAAACCCTTACTTAACCAGAGAAATGGGAATCTCAAGATCTAAAGGAAACACAC
ACAACATCTTCCTACTCTGCAACTACACCCTCTTAGGCTCCGCCTCAAGTTGCATCTTCC
TCACAATCTCCCTCCGTCTCTTCCCTTCTCTCTCCGGCCTCTCTCTCATCTTCCTCCACA
CTCTCACCATCGCCACGGCTGTCACCGGCTGCTCCGTTTTCGCCTCTTCAACCGCTGCAA
CCACAAGCGACAGATTGTACGGTGCACACATGGTGGCCACAGTCCTCGCTGCCATATTCC
AAGGGGCAGTCTCTGTTCTGATATTCACGAGAACAGGGGATTTCCTTAGGGTTCTTAAAT
CGTATGTTCTTGTAGAAGACGGAGCGGTGATTCTTAAACTGGCAGGTGGTTTGTGTGTAG
TAATGTTCTGCTTAGAGTGGGTTGTTCTTGTGTTAGCGTTCTTGTTGAAGTATAGTGACT
ATTTGGATGAGAGCGTTGTAGATGACGGAGGTAAGTTCCAGAGGCAAGAAGAAGATCTCA
AGGATTGGCCTTCTTACCCATTCCAACTCAAGCTTTGATTTCAGTTCCACGTTTCTTTTT
T**GGTACTTTGGATACATTCTTTGCTTGATTTATATAAATTAGATG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2GW30TF 706 0 0
GGACGAACAGAACATCTTACATAAAAAAAAAA***CTGAGTATCTCTTCCCTAGCCAAAA
ATTGTATAAACCCTTACTTAACCAGAGAAATGGGAATCTCAAGATCTAAAGGAAACACAC
ACAACATCTTCCTACTCTGCAACTACATCCTCTTAGGCTCCGCCTCAAGTTGCATCTTCC
TCACAATCTCCCTCCGTCTCTTCCCTTCTCTCTCCGGCCTCTCTCTCATCTTCCTCCACA
CTCTCACCATCGCCACTGCTGTCACCGGCTGCTCCGTTTTCGCCTCTTCAACCGCTGCAA
CCACAAGCGACAGATTGTACGGTGCACACATGGTGGCCACAGTCCTCGCTGCCATTTTCC
AAGGGGCAGTCTCTGTTCTGATATTCACGAGAACAGGGGATTTCCTTAGGGTTCTTAAAT
CGTATGTTCTTGTAGAAGACGGAGCGGTGATTCTTAAACTGGCAGGTGGTTTGTGTGTAG
TAATGTTCTGCTTAGAGTGGGTTGTTCTTGTGTTAGCGTTCTTGTTGAAGTATAGTGACT
ATTTGGATGAGAGCGTTGTAGATGACGGAGGTAAGTTCCAGAGGCAAGAAGAAGATCTCA
AGGATTGGCCTTCTTACCCATTCCAACTCAAGCTTTGATTTCAGTTCCACGTTTCTTTTT
TTTGGTACTTTGGATACATTCTTTGGTTGATTTATATAAATTAGAT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2BD50TF 802 0 0
AGGGACGAACAGAACATCTTACATAAAAAAAAAAAAACTGAGTATCTCTTCCCTAGCCAA
AAATTGTATAAACCCTTACTTAACCAGAGAAATGGGAATCTCAAGATCTAAAGGAAACAC
ACACAACATCTTCCTACTCTGCAACTACATCCTCTTAGGCTCCGCCTCAAGTTGCATCTT
CCTCACAATCTCCCTCCGTCTCTTCCCTTCTCTCTCCGGCCTCTCTCTCATCTTCCTCCA
CACTCTCACCATCGCCACTGCTGTCACCGGCTGCTCCGTTTTCGCCTCTTCAACCGCTGC
AACCACAAGCGACAGATTGTACGGTGCACACATGGTGGCCACAGTCCTCGCTGCCATTTT
CCAAGGGGCAGTCTCTGTTCTGACATTCACGAGAACAGGGGATTTCCTTAGGGTTCTTAA
ATCGTATGTTCTTGTAGAAGACGGAGCGGTGATTCTTAAACTGGCAGGTGGTTTGTGTGT
AGTAATGTTCTGCTTAGAGTGGGTTGTTCTTGTGTTAGCGTTCTTGTTGAAGTATAGTGA
CTATTTGGATGAGAGCGTTGTAGATGACGGAGGTAAGTTCCAGAGGCAAGAAGAAGATCT
CAAGGATTGGCCTTCTTACCCATTCCAACTCAAGCTTTGATTTCAGTTCCACGTTTCTTT
TTTTTGGTACTTTGGATACATTCTTTGGTTGATTTATATAAATTAGATGGCAAAAGCTAT
GCGTGTATGGTTTTGATGCTTGTTACTTGAGAGTTGTGTGATTTTGTCACGCTTAAATAA
GATTAGTGTATATTTTAAATTA

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2BD50JQ 574 0 0
TCTTCCTCCACACTCTCACCATCGCCACTGCTGTCACCGGCTGCTCCGTTTTCGCCTCTT
CAACCGCTGCAACCACAAGCGACAGATTGTACGGTGCACACATGGTGGCCACAGTCCTCG
CTGCCATTTTCCAAGGGGCAGTCTCTGTTCTGACATTCACGAGAACAGGGGATTTCCTTA
GGGTTCTTAAATCGTATGTTCTTGTAGAAGACGGAGCGGTGATTCTTAAACTGGCAGGTG
GTTTGTGTGTAGTAATGTTCTGCTTAGAGTGGGTTGTTCTTGTGTTAGCGTTCTTGTTGA
AGTATAGTGACTATTTGGATGAGAGCGTTGTAGATGACGGAGGTAAGTTCCAGAGGCAAG
AAGAAGATCTCAAGGATTGGCCTTCTTACCCATTCCAACTCAAGCTTTGATTTCAGTTCC
ACGTTTCTTTTTTTTGGTACTTTGGATACATTCTTTGGTTGATTTATATAAATTAGATGG
CAAAAGCTATGCGTGTATGGTTTTGATGCTTGTTACTTGAGAGTTGTGTGATTTTGTCAC
GCTTAAATAAGATTAGTGTATATTTTAAATTAAC

QA 1 574 1 574
DS 



CO CL626Contig2 817 5 17 U
TTCTAATTTTTCAAAATACATTAATTTAAAATATACACTAATCTTATTTAAGCGTGACAA
AATCACACAACTCTCAAGTAACAAGCATCAAAACCATACACAATATATAGCTTTTGCCAT
CTAATTTATATAAATCAACCAAAGAATGTATCCAAAGTACCAAAAAA*AGAAACGTGGAA
CTGAAATCAAAGCTTGAGTTGGAATGGGTAAGAAGGCCAATCCTTGAGATCTTCTTCTTG
CCTCTGGAACTTACCTCCGTCATCTACAACGCTCTCATCCAAATAGTCACTATACTTCAA
CAAGAACGCTAACACAAGAACAACCCACTCTAAGCAGAACATTACTACACACAAACCACC
TGCCAGTTTAAGAATCACCGCTCCGTCTTCTACAAGAACATACGATTTAAGAACCCTAAG
GAAATCCCCTGTTCTCGTGAATATCAAAACAGAGACTGCCCCTTGGAATATGGCAGCGAG
GACTGTGGCCACCATGTGTGCACCGTACAATCTGTCGCTTGTGGTTACAGCGGTTGAAGA
GGCGAAAACGGAGCAGCCGGTGACAGCAGTGGCGATGGTGAGAGTGTGGAGGAAGATGAG
AGAGAGGCCGGAGAGAGAAGGGAAGAGACGGAGGGAGATTGTGAGGAAGATGCAACTTGA
GGCGGAGCCTAAGAGGATGTAGTTGCAGAGTAGGAAGATGTTGTGTGTGTTTCCTTTAGA
TCTTGAGATTCCCATTTCTCTGGTTAAGGGTTTATACAAATTTTGGCTAGGGAAGAGATA
CTCAGTTTTTTTTTTATGTAAGACGTTCTGTTCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW30JQ U 11
AF RR2DC21JQ U 1
AF RR2EX83JQ U 46
AF RR2CJ06JQ U 12
AF RR2CJ06TF C 427
BS 1 103 RR2DC21JQ
BS 104 104 RR2GW30JQ
BS 105 138 RR2DC21JQ
BS 139 139 RR2GW30JQ
BS 140 166 RR2DC21JQ
BS 167 167 RR2GW30JQ
BS 168 446 RR2DC21JQ
BS 447 447 RR2GW30JQ
BS 448 526 RR2DC21JQ
BS 527 527 RR2CJ06JQ
BS 528 567 RR2DC21JQ
BS 568 568 RR2GW30JQ
BS 569 619 RR2DC21JQ
BS 620 620 RR2CJ06JQ
BS 621 626 RR2DC21JQ
BS 627 802 RR2CJ06JQ
BS 803 817 RR2CJ06TF

RD RR2GW30JQ 586 0 0
C
CAAAATACATTAAATTAAAATATACACTAATCTTATTTAAGCGTGACAAAATCACACAAC
TCTCAAGTAACAAGCATCAAAACCATACACAATATATAGCTTTTGCCATCTAATTTATAT
AAATCAACCAAAGAATGTATCCAAAGTACCAAAAAAAAGAAACGTGGAACTGAAATCAAA
GCTTGAGTTGGAATGGGTAAGAAGGCCAATCCTTGAGATCTTCTTCTTGCCTCTGGAACT
TACCTCCGTCATCTACAACGCTCTCATCCAAATAGTCACTATACTTCAACAAGAACGCTA
ACACAAGAACAACCCACTCTAAGCAGAACATTACTACACACAAACCACCTGCCAGTTTAA
GAATCACCGCTCCGTCTTCTACAAGAACATACGATTTAAGAACCCTAAGGAAATCCCCTG
TTCTCGTGAATATCAAAACAGAAACTGCCCCTTGGAAAATGGCAGCGAGGACTGTGGCCA
CCATGTGTGCACCGTACAATCTGTCGCTTGTGGTTGCAGCGGTTGAAGAGGCGAAAACGG
AGCAGCCGGTGACAGCAGTGGCGATGGTGAGAGTGTGGAGGAAGA

QA 2 586 2 586
DS 

RD RR2DC21JQ 626 0 0
TTCTAATTTTTCAAAATACATTAATTTAAAATATACACTAATCTTATTTAAGCGTGACAA
AATCACACAACTCTCAAGTAACAAGCATCAAAACCATACACAAAATATAGCTTTTGCCAT
CTAATTTATATAAATCAAGCAAAGAATGTATCCAAAGTACCAAAAA**AGAAACGTGGAA
CTGAAATCAAAGCTTGAGTTGGAATGGGTAAGAAGGCCAATCCTTGAGATCTTCTTCTTG
CCTCTGGAACTTACCTCCGTCATCTACAACGCTCTCATCCAAATAGTCACTATACTTCAA
CAAGAACGCTAACACAAGAACAACCCACTCTAAGCAGAACATTACTACACACAAACCACC
TGCCAGTTTAAGAATCACCGCTCCGTCTTCTACAAGAACATACGATTTAAGAACCCTAAG
GAAATCCCCTGTTCTCGTGAATATCAGAACAGAGACTGCCCCTTGGAATATGGCAGCGAG
GACTGTGGCCACCATGTGTGCACCGTACAATCTGTCGCTTGTGGTTGCAGCGGTTGAAGA
GGCGAAAACGGAGCAGCCGGTGACAGCCGTGGCGATGGTGAGAGTGTGGAGGAAGATGAG
AGAGAGGCCGGAGAGAGAAAGGAAGA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2EX83JQ 703 0 0
AC
TTAAGCGTGACAAAATCACACAACTCTCAAGTAACAAGCATCAAAACCATACACAATATA
TAGCTTTTGCCATCTAATTTATATAAATCAAGCAAAGAATGTATCCAAAGTACCAAAAAA
*AGAAACGTGGAACTGAAATCAAAGCTTGAGTTGGAATGGGTAAGAAGGCCAATCCTTGA
GATCTTCTTCTTGCCTCTGGAACTTACCTCCGTCATCTACAACGCTCTCATCCAAATAGT
CACTATACTTCAACAAGAACGCTAACACAAGAACAACCCACTCTAAGCAGAACATTACTA
CACACAAACCACCTGCCAGTTTAAGAATCACCGCTCCGTCTTCTACAAGAACATACGATT
TAAGAACCCTAAGGAAATCCCCTGTTCTCGTGAATATCAAAACAGAGACTGCCCCTTGGA
ATATGGCAGCGAGGACTGTGGCCACCATGTGTGCACCGTACAATCTGTCGCTTGTGGTTG
CAGCGGTTGAAGAGGCGAAAACGGAGCAGCCGGTGACAGCAGTGGCGATGGTGAGAGTGT
GGAGGAAGATGAGAGAGAGGCCGGAGAGGGAAGGGAAGAGACGGAGGGAGATTGTGAGGA
AGATGCAACTTGAGGCGGAGCCTAAGAGGATGTAGTTGCAGAGTAGGAAGATGTTGTGTG
TGTTTCCTTTAGATCTTGAGATTCCCATTTCTCTGGTTAAG

QA 3 703 3 703
DS 

RD RR2CJ06JQ 791 0 0
CAAAATACATTAATTTAAAATATACACTAATCTTATTTAAGCGTGACAAAATCACACAAC
TCTCAAGTAACAAGCATCAAAACCATACACAATATATAGCTTTTGCCATCTAATTTATAT
AAATCAACCAAAGAATGTATCCAAAGTACCAAAAA**AGAAACGTGGAACTGAAATCAAA
GCTTGAGTTGGAATGGGTAAGAAGGCCGATCCTTGAGATCTTCTTCTTGCCTCTGGAACT
TACCTCCGTCATCTACAACGCTCTCATCCAAATAGTCACTATACTTCAACAAGAACGCTA
ACACAAGAACAACCCACTCTAAGCAGAACATTACTACACACAAACCACCTGCCAGTTTAA
GAATCACCGCTCCGTCTTCTACAAGAACATACGATTTAAGAACCCTAAGGAAATCCCCTG
TTCTCGTGAATATCAAAACAGAGACTGCCCCTTGGAATATGGCAGCGAGGACTGTGGCCA
CCATGTGTGCACCGTACAATCTGTCGCTTGTGGTTACAGCGGTTGAAGAGGCGAAAACGG
AGCAGCCGGTGACAGCAGTGGCGATGGTGAGAGTGTGGAGGAAGATGAGAGAGAGGCCGG
AGAGAGAAGGGAAGAGACGGAGGGAGATTGTGAGGAAGATGCAACTTGAGGCGGAGCCTA
AGAGGATGTAGTTGCAGAGTAGGAAGATGTTGTGTGTGTTTCCTTTAGATCTTGAGATTC
CCATTTCTCTGGTTAAGGGTTTATACAAATTTTGGCTAGGGAAGAGATACTCAGTTTTTT
TTTTATGTAAG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2CJ06TF 391 0 0
CCCTGTTCTCGTGAATATCAGAACAGAGACTGCCCCTTGGAATATGGCAGCGAGGACTGT
GGCCACCATGTGTGCACCGTACAATCTGTCGCTTGTGGTTACAGCGGTTGAAGAGGCGAA
AACGGAGCAGCCGGTGACAGCAGTGGCGATGGTGAGAGTGTGGAGGAAGATGAGAGAGAG
GCCGGAGAGAGAAGGGAAGAGACGGAGGGAGATTGTGAGGAAGATGCAACTTGAGGCGGA
GCCTAAGAGGATGTAGTTGCAGAGTAGGAAGATGTTGTGTGTGTTTCCTTTAGATCTTGA
GATTCCCATTTCTCTGGTTAAGGGTTTATACAAATTTTGGCTAGGGAAGAGATACTCAGT
TTTTTTTTTATGTAAGACGTTCTGTTCGTCC

QA 1 391 1 391
DS 



AS 1 8

CO CL627Contig1 1054 8 32 U
AGCAAATGTTCATCTCAGCTTCAGCTTTGAAAATGTTTGTAGAACCCACTAGGGAGAAAT
AACAAGAAAAGTGATTTTAATTCGGTAACAATCACACAAAGGAACAATCAACTTTAAGCT
TTGTTAAACTATGACAACATTACAAAATGTGAAAAAACAGATTAACCGAGACCAGAGGTC
TCATCTTGGCGAGGAGCGTCGGCTTTGATGCGCGGTGGTCTAACAATCTTATCGATAAGT
CCGTACTCAATAGCCTCTTCTGCGTTGAACCTCTTCATTCTGCTCAAGTCTTTGAAGATC
GTTTCCGCAGGCTGTCCTGTATTCTTGGCTAGTTCGTTGAAGAGGTAATCTCTTATCCTT
GAAAGCTCCTTCGCTTCATTTTGGATATCATCAGCCTGACCACGGGCTGCACCAGCTGGT
GACTGGAGGGCGATTCTAGACAATGGCATCGCAAACCGTTGACCCTTTTCACCGGCAGCA
AGAAGAAAACCAGCAAGGTTATAGGCAAGCCCAA*CACAATGCGTCCCAACAGGACTTTT
CAAGCTCTTCATCGTATCATAGATAGCTAGACTTGGAGTTAGATCACCGCCAGGGCCATT
AAGGTACATATAAATCCTCCTGGAGTCATCAAGAGTATCGAGATACAACATAGTTGCTAA
TATCTGGTTGCTAAACTCTTCGTCAATGTTTTGTCCAATGAAGATCACACGCTCTCGATA
AAGGGCGTTCCAAATATCAACCCATTGCCAAGTGCCTTCCTCTCTGTTTCGGTAGGGAAC
TCTAGGTGTACCAATAGGCATCATCTTCACCCTTGACCTACTCGCTTTCCCCGTCCCGGA
TTGCAAACTCTTGTGAATCCTGCCATAGAACTCCTTGTTCAAATTCTGATACCCATTTCT
CAAAAAGCTTGAAGATTGAGGCTTCAACCCAGAGTAAAGCTTGATGCTACAGCACGGACT
CAAAGAAGACTGGTGAAGGGTTGTGTTAAACGAGACCGCCATGGTCGTCGAGAGCTGTGT
GTTAGAGAGACCAGAACTGGCTTTTGTGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 15 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 
25 0 25 25 25 0 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO60JQ U 61
AF RR2D176JQ U 1
AF RR2AA60JQ U 23
AF RR2A854JQ U 39
AF RR2FO60TF C 275
AF RR2A854TF C 274
AF RR2CT68TF C 281
AF RR2AA60TF C 279
BS 1 99 RR2D176JQ
BS 100 100 RR2AA60JQ
BS 101 105 RR2D176JQ
BS 106 106 RR2AA60JQ
BS 107 121 RR2D176JQ
BS 122 122 RR2AA60JQ
BS 123 179 RR2D176JQ
BS 180 180 RR2AA60JQ
BS 181 254 RR2D176JQ
BS 255 255 RR2AA60JQ
BS 256 368 RR2D176JQ
BS 369 369 RR2AA60JQ
BS 370 409 RR2D176JQ
BS 410 410 RR2FO60JQ
BS 411 531 RR2D176JQ
BS 532 532 RR2AA60JQ
BS 533 684 RR2D176JQ
BS 685 685 RR2AA60JQ
BS 686 719 RR2D176JQ
BS 720 793 RR2AA60JQ
BS 794 821 RR2A854JQ
BS 822 954 RR2FO60TF
BS 955 955 RR2A854TF
BS 956 962 RR2FO60TF
BS 963 963 RR2A854TF
BS 964 969 RR2FO60TF
BS 970 970 RR2A854TF
BS 971 978 RR2FO60TF
BS 979 979 RR2A854TF
BS 980 1023 RR2FO60TF
BS 1024 1038 RR2A854TF
BS 1039 1054 RR2AA60TF

RD RR2FO60JQ 535 0 0
AACAAGAAAAGTGATTTTAATTCGGTAACAATCACACAA*GGAACGATCAACTTTAAGCT
T*GTTAAACTATGACAACATTACAAAATGTGAAAAAACAGATTAACCGAGACCAGAGGTT
TCATCTTGGCGAGGAGCGTCGGCTTTGATGCGCGGTGGTCTAACAATCTTATCGATAAGT
CCGTACTCAATAGCTTCTTCTGCGTTGAACCTCTTCATTCTGCTCAAGTCTTTGAAGATC
GTTTCCGCAGGCTGTCCTGTATTCTTGGCTAGTTCGTTGAAAAGGTAATCTCTTATCCTT
GAAAGCTCTTTCGCTTCATTTTGGATATCATCAGCCTGACCACGGGCTGCACCAGCTGGT
GACTGGAGGGCGATTCTAGACAATGGCATCGCAAACCGTTGACCCTTTTCACCGGCAGCA
AGAAAAAAACCAGCAAGGTTATAGGCAAGCCCAA*CACAATGCGTCCCAACCGGACTTTT
CAAGCTCTTCATCGTATCATAGATAGCTAGACTTGGAGTTAGATCACCGCCAGGG

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2D176JQ 719 0 0
AGCAAATGTTCATCTCAGCTTCAGCTTTGAAAATGTTTGTAGAACCCACTAGGGAGAAAT
AACAAGAAAAGTGATTTTAATTCGGTAACAATCACACAA*GGAACGATCAACTTTAAGCT
T*GTTAAACTATGACAACATTACAAAATGTGAAAAAACAGATTAACCGAGACCAGAGGTT
TCATCTTGGCGAGGAGCGTCGGCTTTGATGCGCGGTGGTCTAACAATCTTATCGATAAGT
CCGTACTCAATAGCTTCTTCTGCGTTGAACCTCTTCATTCTGCTCAAGTCTTTGAAGATC
GTTTCCGCAGGCTGTCCTGTATTCTTGGCTAGTTCGTTGAAGAGGTAATCTCTTATCCTT
GAAAGCTCTTTCGCTTCATTTTGGATATCATCAGCCTGACCACGGGCTGTACCAGCTGGT
GACTGGAGGGCGATTCTAGACAATGGCATCGCAAACCGTTGACCCTTTTCACCGGCAGCA
AGAAGAAAACCAGCAAGGTTATAGGCAAGCCCAA*CACAATGCGTCCCAACCGGACTTTT
CAAGCTCTTCATCGTATCATAGATAGCTAGACTTGGAGTTAGATCACCGCCAGGGCCATT
AAGGTACATATAAATCCTCCTGGAGTCATCAAGAGTATCGAGATACAACATAGTTGCTAA
TATCTGGTTGCTAAACTCTTCGTCTATGTTTTGTCCAATGAAGATCACACGCTCTCGAT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2AA60JQ 771 0 0
AGCTTTA
AAAATGTTTGTAGAACCCAGTAGGGAGAAATAACAAGCAAAGTGATTTTAATTCGGTAAC
AATCACACAAAGGAACAATCAACTTTAAGCTTTGTTAAACTATGACAACATTACAAAATG
TGAAAAAACAGATTAACCGAGACCAGAGGTCTCGTCTTGGCGAGGAGCGTCGGCTTTGAT
GCGCGGTGGTCTAACAATCTTATCGATAAGTCCGTACTCAATAGCCTCTTCTGCGTTGAA
CCTCTTCATTCTGCTCAAGTCTTTGAAGATCGTTTCCGCAGGCTGTCCTGTATTCTTGGC
TAGTTCGTTGAAGAGGTAATCTCTTATCCTTGAAAGCTCCTTTGCTTCATTTTGGATATC
ATCAGCCTGACCACGGGCTGCACCAGCTGGTGACTGGAGGGCGATTCTTGACAATGGCAT
CGCAAACCGTTGACCCTTTTCACCGGCAGCAAGAAGAAAACCAGCAAGGTTATAGGCAAG
CCCAA*CACAATGTGTCCCAACAGGACTTTTCAAGCTCTTCATCGTATCATAAATAGCTA
GACTTGGAGTTAGATCACCGCCAGGTCCATTAAGGTACATATAAATCCTCCTGGAGTCAT
CAAGAGTATCGAGATACAACATAGTTGCTAATATCTGGTTGCTAAACTCTTCGTCAATGT
TTTGTCCAATGAAGATCACACGCTCTCGATAAAGGGCGTTCCAAATATCAACCCATTGCC
AAGTGCCTTCCTCTCTGTTTCGGTAGGGAACTCTAGGTGTACCA

QA 8 771 8 771
DS 

RD RR2A854JQ 783 0 0
GTAGAACCCAG
TAGGGAGAAATAACAAGCAAAGTGATTTTAATTCGGTAACAATCACACAAAGGAACAATC
AACTTTAAGCTTTGTTAAACTATGACAACATTACAAAATGTGAAAAAACAGATTAACCGA
GACCAGAGGTCTCGTCTTGGCGAGGAGCGTCGGCTTTGATGCGCGGTGGTCTAACAATCT
TATCGATAAGTCCGTACTCAATAGCCTCTTCTGCGTTGAACCTCTTCATTCTGCTCAAGT
CTTTGAAGATCGTTTCCGCAGGCTGTCCTGTATTCTTGGCTAGTTCGTTGAAGAGGTAAT
CTCTTATCCTTGAAAGCTCCTTTGCTTCATTTTGGATATCATCAGCCTGACCACGGGCTG
CACCAGCTGGTGACTAGAGGGCGATTCTTGACAATGGCATCGCAAACCGTTGACCCTTTT
CACCGGCAGCAAGAAGAAAACCAGCAAGGTTATAGGCAAGCCCAA*CACAATGTGTCCCA
ACAGGACTTTTCAAGCTCTTCATCGTATCATAGATAGCTAGACTTGGAGTTAGATCACCG
CCAGGTCCATTAAGGTACATATAAATCCTCCTGGAGTCATCAAGAGTATCGAGATACAAC
ATAGTTGCTAATATCTGGTTGCTAAACTCTTCGTCAATGTTTTGTCCAATGAAGATCACA
CGCTCTCGATAAAGGGCGTTCCAAATATCAACCCATTGCCAAGTGCCTTCCTCTCTGTTT
CGGTAGGGAACTCTAGGTGTACCAATAGGCATCATCTTCACCCTTGACCTAC

QA 12 783 12 783
DS 

RD RR2FO60TF 751 0 0
TCATTCTGCTCAAGTCTTTGAAGATCGTTTCCGCAGGCTGTCCTGTATTCTTGGCTAGTT
CGTTGAAGAGGTAATCTCTTATCCTTGAAAGCTCTTTCGCTTCATTTTGGATATCATCAG
CCTGACCACGGGCTGCACCAGCTGGTGACTGGAGGGCGATTCTAGACAATGGCATCGCAA
ACCGTTGACCCTTTTCACCGGCAGCAAGAAGAAAACCAGCAAGGTTATAGGCAAGCCCAA
*CACAATGCGTCCCAACCGGACTTTTCAAGCTCTTCATCGTATCATAGATAGCTAGACTT
GGAGTTAGATCACCGCCAGGGCCATTAAGGTACATATAAATCCTCCTGGAGTCATCAAGA
GTATCGAGATACAACATAGTTGCTAATATCTGGTTGCTAAACTCTTCGTCTATGTTTTGT
CCAATGAAGATCACACGCTCTCGATAAAGGGCGTTCCATATGTCAACCCATTGCCAAGTG
CCTTCCTCTCTGTTGCGGTAGGGAACTCTAGGTGTACCAATAGGCATCATCTTCACCCTT
GACCTACTCGCTTTCCCCGTCCCGGATTGCAAACTCTTGTGAATCCTGCCATAGAACTCC
TTGTTCAAATTCTGATACCCATTTCTCAAAAAGCTTGAAGATTGAGGCTTCAACCCAGAG
TAAAGCTTGATGCTACAGCAGGGACTCAGAGAAGATTGGTGAAGTGTTGTGTTAAACGAG
ACCGCCATGGTCGTCGAGAGCTGTGTGTT
CA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2A854TF 767 0 0
TCAT
TTCTGCTCAAGTCTTTGAAGATCGTTTCCGCAGGCTGTCCTGTATTCTTGGCTAGTTCGT
TGAAGAGGTAATCTCTTATCCTTGAAAGCTCCTTTGCTTCATTTTGGATATCATCAGCCT
GACCACGGGCTGCACCAGCTGGTGACTAGAGGGCGATTCTTGACAATGGCATCGCAAACC
GTTGACCCTTTTCACCGGCAGCAAGAAGAAAACCAGCAAGGTTATAGGCAAGCCCAAACA
CAATGTGTCCCAACAGGACTTTTCAAGCTCTTCATCGTATCATAGATAGCTAGACTTGGA
GTTAGATCACCGCCAGGTCCATTAAGGTACATATAAATCCTCCTGGAGTCATCAAGAGTA
TCGAGATACAACATAGTTGCTAATATCTGGTTGCTAAACTCTTCGTCAATGTTTTGTCCA
ATGAAGATCACACGCTCTCGATAAAGGGCGTTCCAAATATCAACCCATTGCCAAGTGCCT
TCCTCTCTGTTTCGGTAGGGAACTCTAGGTGTACCAATAGGCATCATCTTCACCCTTGAC
CTACTCGCTTTCCCCGTCCCGGATTGCAAACTCTTGTGAATCCTGCCATAGAACTCCTTG
TTCAAATTCTGATACCCATTTCTCAAAAAGCTTGCAGATTGAGGCTTCAACCCAGAGTAA
AGTTTGATGCTACAGCACGGACTCAAAGAGGACTGGTGAAGGGTTGTGTTAAACGAGACC
GCCATGGTCGTCGAGAGCTGTGTGTTAGAGAGACCAGAACT
CC

QA 5 765 5 765
DS 

RD RR2CT68TF 760 0 0
TGCTCAAGTCTTTGAAGATCGTTTCCGCAGGCTGTCCTGTATTCTTGGCTAGTTCGTTGA
AGAGGTAATCTCTTATCCTTGAAAGCTCTTTCGCTTCATTTTGGATATCATCAGCGTGAC
CACGGGCTGCACCAGCTGGTGACTGGAGGGCGATTCTAGACAATGGCATCGCAAACCGTT
GACCCTTTTCACCGGCAGCAAGAAGAAAACCAGCAAGGTTATAGGCAAGCCCAA*CACAA
TGCGTCCCAACCGGACTTTTCAAGCTCTTCATCGTATCATAGATAGCTAGACTTGGAGTT
AGATCACCGCCAGGGCCATTAAGGTACATATAAATCCTCCTGGAGTCATCAAGAGTATCG
AGATACAACATAGTTGCTAATATCTGGTTGCTAAACTCTTCGTCTATGTTTTGTCCAATG
AAGATCACACGCTCTCGATAAAGGGCGTTCCATATGTCAACCTATTGCCAAGTGCCTTCC
TCTCTGTTGCGGTAGGGAACTCTAGGTGTACCAATAGGCATCATCTTCACCCTTGACCTA
CTCGCTTTCCCCGTCCCGGATTGCAAACTCTTGTGAATCCTGCCATAGAACTCCTTGTTC
AAATTCTGATACCCATTTCTCAAAAAGCTTGAAGATTGAGGCTTCAACCCAGAGTAAAGC
TTGATGCTACAGCAGGGACTCAGAGAAGATTGGTGAAGTGTTGTGTTAAACGAGACCGCC
ATGGTCGTCGAGAGCTGTGTGTTAGAGAGACCAGAACT
CC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2AA60TF 776 0 0
TT
TGCTCAAGTCTTTGAAGATCGTTTCCGCAGGCTGTCCTGTATTCTTGGCTAGTTCGTTGA
AGAGGTAATCTCTTTTCCTTGAAAGCTCCTTTGCTTCATTTTGGATATCATCAGCCTGAC
CACGGGCTGCACCAGCTGGTGACTGGAGGGCGATTCTTGACAATGGCATCGCAAACCGTT
GACCCTTTTCACCGGCAGCAAGAAGAAAACCAGCAAGGTTATAGGCAAGCCCAA*CACAA
TGTGTCCCAACAGGACTTTTCAAGCTCTTCATCGTATCATAGATAGCTAGACTTGGAGTT
AGATCACCGCCAGGTCCATTAAGGTACATATAAATCCTCCTGGAGTCATCAAGAGTATCG
AGATACAACATAGTTGCTAATATCTGGTTGCTAAACTCTTCGTCAATGTTTTGTCCAATG
AAGATCACACGCTCTCGATAAAGGGCGTTCCAAATATCAACCCATTGCCAAGTGCCTTCC
TCTCTGTTTCGGTAGGGAACTCTAGGTGTACCAATAGGCATCATCTTCACCCTTGACCTA
CTCGCTTTCCCCGTCCCGGATTGCAAACTCTTGTGAATCCTGCCATAGAACTCCTTGTTC
AAATTCTGATACCCATTTCTCAAAAAGCTTGCAGATTGAGGCTTCAACCCAGAGTAAAGT
TTGATGCTACAGCACGGACTCAAAGAGGACTGGTGAAGGGTTGTGTTAAACGAGACCGCC
ATGGTCGTCGAGAGCTGTGTGTTAGAGAGACCAGAACTGGCTTTTGTGTTTTCC

QA 3 776 3 776
DS 



AS 2 10

CO CL628Contig1 871 6 27 U
GGTCAGAAAATTCAATATTAACTTGAACAGTTTACAGTTTTTATTTTCTTTACATGCATA
TTCATACAGGAGGAGCATTATAACAATTTTAAATCTTCTAGACTTAGCTAAACTTCTCGG
ATGTGCACAAAGATAATGTTATCAAACCCACGACTTATTCTCATCTTCTCATCTGTGTAG
AGAACTTGAAGCTTGATATTGTTTGTCAGTTCGATCGGATATCCAAACGGACCACCAATA
ATTGCTGCATCGCCCATCTTCAACTCATAGGTGCTACCTCCTGATTTCAAGAATTTGCCT
TTCATTGAGAATCTAAATGCTGGTATGATGTTAACTTCAAACTTTATTCTTCCATCCTTC
TCAATGATCTGCCTTCCCATAAGACCATTTGCTGCATTTTCAAGCCAACTATCTGTATAC
ATCTGTGAACTCCAAATCATTTGCCAGTTTCCCTCTAGAAGCTTATAATCATCTTCCTTG
GAGTTAGTATTATAAGCAAGAAACTCATCTATAGCCTCTGCTACTTCTTTGTCTTGAGAT
ATGGTAGCTAACAGTTTCTGCCTAGGAACGGTTGCTTTCTGAAGAACAAACGTTGTCCCC
TTGTTTCCCCTTGAGATCCTAAGGTTTCCTGAAGGCGACAAGTAAGTAGTATCTAACCAA
CCTTTTGCTTCATCACCAAGAAGTCTAAAAGGAACTGGATACGGAACTTTGAAAGGAAGG
AACTTCAAAGCAAAAGCTGCTCTATCGAAACGAAACAGAACCCTCTTGGCGTCTTTTATT
GAAGCAACAGCCTCAACTTTCAGCTCTCCAATGAAGTCAGAGAACTTAACAATGTTTGAA
ACACGAGGATCGTTTGTTGTCTTTAAGTATC


BQ
25 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 25 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 10 
25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV84JQ U 1
AF RR2H175JQ U 1
AF RR2GI29JQB U 1
AF RR2AQ75JQ U 1
AF RR2E971JQ U 1
AF RR2E971TF C 110
BS 1 54 RR2AQ75JQ
BS 55 55 RR2CV84JQ
BS 56 701 RR2AQ75JQ
BS 702 702 RR2E971JQ
BS 703 719 RR2AQ75JQ
BS 720 720 RR2E971JQ
BS 721 723 RR2AQ75JQ
BS 724 724 RR2GI29JQB
BS 725 728 RR2AQ75JQ
BS 729 729 RR2E971JQ
BS 730 731 RR2AQ75JQ
BS 732 732 RR2E971JQ
BS 733 734 RR2AQ75JQ
BS 735 735 RR2E971JQ
BS 736 763 RR2AQ75JQ
BS 764 765 RR2E971JQ
BS 766 770 RR2AQ75JQ
BS 771 771 RR2E971JQ
BS 772 776 RR2AQ75JQ
BS 777 777 RR2E971JQ
BS 778 779 RR2AQ75JQ
BS 780 780 RR2E971JQ
BS 781 782 RR2AQ75JQ
BS 783 783 RR2E971JQ
BS 784 806 RR2AQ75JQ
BS 807 823 RR2E971JQ
BS 824 871 RR2E971TF

RD RR2CV84JQ 517 0 0
GGTCAGAAAATTCAATATTAACTTGAACAGTTTACAGTTTTTATTTTCTTTACATGCATA
TTCATACAGGAGGAGCATTATAACAATTTTAAATCTTCTAGACTTAGCTAAACTTCTCGG
ATGTGCACAAAGATAATGTTATCAAACCCACGACTTATTCTCATCTTCTCATCTGTGTAG
AGAACTTGAAGCTTGATATTGTTTGTCAGTTCGGTCGGATATCCAAACGGACCACCAATA
ATTGCTGCATCGCCCATCTTCAACTCATAGGTGCTACCTCCTGATTTCAAGAATTTGCCT
TTCATTGAGAATCCAAATGCTGGTATGATGTTAACTTCAAACTTTATTCTTCCATCCTTC
TCAATGATCTGCCTTCCCATAAGACCATTTGCTGCATTTTCAAGCCAACTATCTGTATAC
ATCTGTGAACTCCAAATCATTTGCCAGTTTCCCT**AGAAGCTTATAATCATCTTCCTTG
GAGTTAGTATTATAAGCAAGAAACTCATCTATAGCCT

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2H175JQ 670 0 0
GGTCAGAAAATTCAATATTAACTTGAACAGCTTACAGTTTTTATTTTCTTTACATGCATA
TTCATACAGGAGGAGCATTATAACAATTTTAAATCTTCTAGACTTAGCTAAACTTCTCGG
ATGTGCACAAAGATAATGTTATCAAACCCACGACTTATTCTCATCTTCTCATCTGTGTAG
AGAACTTGAAGCTTGATATTGTTTGTCAGTTCGATCGGATATCCAAACGGACCACCAATA
ATTGCTGCATCGCCCATCATCAACTCATAGGTGCTACCTCCTGATTTCAAGAATTTGCCT
TTCATTGAGAATCTAAATGCTGGTATGATGTTAACTTCAAACTTTATTCTTCCATCCTTC
TCAATGATCTGCCTTCCCATAAGACCATTTGCTGCATTTTCAAGCCAACTATCTGTATAC
ATCTGTGAACTCCAAATCATTTGCCAGTTTCCCTCTAGAAGCTTATAATCATCTTCCTTG
GAGTTAGTATTATAAGCAAGAAACTCATCTATAGCCTCTGCTACTTCTTTGTCTTGAGAT
ATGGTAGCTAACAGTTTCTGCCTAGGAACGGTTGCTTTCTGAAGAACAAACGTTGTCCCC
TTGTTTCCCCTTGAGATCCTAAGGTTTCCTGAAGGCGACAAGTAAGTAGTATCTAACCAA
CCTTTTGCTT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2GI29JQB 758 0 0
GGTCAGAAGATTCAATATTAACTTGAACAGTTTACAGTTTTTATTTTCTTTACATGCATA
TTCATACAGGAGGAGCATTATAACAATTTTAAATCTTCTAGACTTAGCTAAACTTCTCGG
ATGTGCACAAAGATAATGTTATCAAACCCACGACTTATTCTCATCTTCTCATCTGTGTAG
AGAACTTGAAGCTTGATATTGTTTGTCAGTTCGATCGGATATCCAAACGGACCACCAATA
ATTGCTGCATCGCCCATCTTCAACTCATAGGTGCTACCTCCTGATTTCAAGAATTTGCCT
TTCATTGAGAATCTAAATGCTGGTATGATGTTAACTTCAAACTTTATTCTTCCATCCTTC
TCAATGATCTGCCTTCCCATAAGACCATTTGCTGCATTTTCAAGCCAACTATCTGTATAC
ATCTGTGAACTCCAAATCATTTGCCAGTTTCCCTCTAGAAGCTTATAATCATCTTCCTTG
GAGTTAGTATTATAAGCAAGAAACTCATCTATAGCCTCTGCTACTTCTTTGTCTTGAGAT
ATGGTAGCTAACAGTTTCTGCCTAGGAACGGTTGCTTTCTGAAGAACAAACGTTGTCCCC
TTATTTCCCCTTGAGATCCTAAGGTTTCCTGAAGGCGACAAGTAAGTAGTATCTAACCAA
CCTTTTGCTTCATCACCAAGAAGTCTAAAAGGAACTGGGTATGGAACTTTGAAAGGAAGA
AACTTCAATGCGAATGCTGCTCTATCGAAACGAA
CAGA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2AQ75JQ 806 0 0
GGTCAGAAAATTCAATATTAACTTGAACAGTTTACAGTTTTTATTTTCTTTACACGCATA
TTCATACAGGAGGAGCATTATAACAATTTTAAATCTTCTAGACTTAGCTAAACTTCTCGG
ATGTGCACAAAGATAATGTTATCAAACCCACGACTTATTCTCATCTTCTCATCTGTGTAG
AGAACTTGAAGCTTGATATTGTTTGTCAGTTCGATCGGATATCCAAACGGACCACCAATA
ATTGCTGCATCGCCCATCTTCAACTCATAGGTGCTACCTCCTGATTTCAAGAATTTGCCT
TTCATTGAGAATCTAAATGCTGGTATGATGTTAACTTCAAACTTTATTCTTCCATCCTTC
TCAATGATCTGCCTTCCCATAAGACCATTTGCTGCATTTTCAAGCCAACTATCTGTATAC
ATCTGTGAACTCCAAATCATTTGCCAGTTTCCCTCTAGAAGCTTATAATCATCTTCCTTG
GAGTTAGTATTATAAGCAAGAAACTCATCTATAGCCTCTGCTACTTCTTTGTCTTGAGAT
ATGGTAGCTAACAGTTTCTGCCTAGGAACGGTTGCTTTCTGAAGAACAAACGTTGTCCCC
TTGTTTCCCCTTGAGATCCTAAGGTTTCCTGAAGGCGACAAGTAAGTAGTATCTAACCAA
CCTTTTGCTTCATCACCAAGAAGTCTAAAAGGAACTGGATATGGAACTTTGAAAGGAAGA
AACCTCAATGCGAATGCTGCTCTATCGAAACGAAACAGAACCCGTTTGGCATCTTTGATG
GACGCAACAGCCTCAACTTTCAGCTC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2E971JQ 832 0 0
A
GTCAGAAAATTCAATATTAACTTGAACAGTTTACAGTTTTTATTTTCTTTACATGCATAT
TCATACAGGAGGAGCATTATAACAATTTTAAATCTTCTAGACTTAGCTAAACTTCTCGGA
TGTGCACAAAGATAATGTTATCAAACCCACGACTTATTCTCATCTTCTCATCTGTGTAGA
GAACTTGAAGCTTGATATTGTTTGTCAATTCGATCG*ATATCCAAACGGACCACCTATAA
TTGCTGCATCGTCCATCTTCAACTCATAGGTGCTACCTCCTGATTTCAAGAATTTGCCTT
TCATTGAGAATCTAAATGCTGGTATGATGTTAACTTCAAACTTTATTCTTCCATCCTTCT
CAATGATCTGCCTTCCCATAAGACCATTTGCTGCATTTTCAAGCCAACTATCTGTATACA
TCTGTGAACTCCAAATCATTTGCCAGTTTCCCTCTAGAAGCTTATAATCATCTTCCTTGG
AGTTAGTATTATAAGCAAGAAACTCATCTATAGCCTCTGCTACTTCTTTGTCTTGAGATA
TGGTAGCTAACAGTTTCTGCCTAGGAACGGTTGCTTTCTGAAGAACAAACGTTGTCCCCT
TGTTTCCCCTTGAGATCCTAAGGTTTCCTGAAGGCGACAAGTACGTAGTATCTAACCAGC
CTTTTGCTTCATCACCAAGAAGTCTAAAAGGAACTGGATACGGAACTTTGAAAGGAAGGA
ACTTCAAAGCAAAAGCTGCTCTATCGAAACGAAACAGAACCCTCTTGGCGTCTTTTATTG
AAGCA*CAGCCTCAACTTTCAGCTCTCCAATGAAGTCAGAGA
CTTACATGT

QA 2 823 2 823
DS 

RD RR2E971TF 762 0 0
TAAAC
TCTCGGATGTGCACAAAGATAATGT*ATCAAACCCACGACTTATTCTCATCTTCTCATCT
GTGTAGAGAACTTGAAGCTTGATATTGTTTGTCAATTCGATCG*ATATCCAAACGGACCA
CCTATAATTGCTGCATCGTCCATCTTCAACTCATAGGTGCTACCTCCTGATTTCAAGAAT
TTGCCTTTCATTGAGAATCTAAATGCTGGTATGATGTTAACTTCAAACTTTATTCTTCCA
TCCTTCTCAATGATCTGCCTTCCCATAAGACCATTTGCTGCATTTTCAAGCCAACTATCT
GTATACATCTGTGAACTCCAAATCATTTGCCAGTTTCCCTCTAGAAGCTTATAATCATCT
TCCTTGGAGTTAGTATTATAAGCAAGAAACTCATCTATAGCCTCTGCTACTTCTTTGTCT
TGAGATATGGTAGCTAACAGTTTCTGCCTAGGAACGGTTGCTTTCTGAAGAACAAACGTT
GTCCCCTTGTTTCCCCTTGAGATCCTAAGGTTTCCTGAAGGCGACAAGTACGTAGTATCT
AACCAGCCTTTTGCTTCATCACCAAGAAGTCTAAAAGGAACTGGATACGGAACTTTGAAA
GGAAGGAACTTCAAAGCAAAAGCTGCTCTATCGAAACGAAACAGAACCCTCTTGGCGTCT
TTTATTGAAGCAACAGCCTCAACTTTCAGCTCTCCAATGAAGTCAGAGAACTTAACAATG
TTTGAAACACGAGGATCGTTTGTTGTCTTTAAGTATC

QA 6 762 6 762
DS 



CO CL628Contig2 738 4 3 U
GGAAGACAATCAACAATGGCGTCTCTTAGATTCTTATACAGCGTAGAGATGTCGCCACCA
TGTCTATTAGGTCCATGCCCTCTTTCATCGTCTTCTCCGAGATACCATCTTCTTAACAGA
ACAAACAAGAGAGTAGACTCGTTCAGAAGCTTTAGAACTCTGCGTGTAACTTGTTCATCT
TCCTCTACCTTCACTGGAGGACAAACACAACAGTCGTCATTCAATGACGCTGAGATGAAA
CTCATTGACGCTTTGATCGGTATTCAAGGCCGTGGCAAATCTGCTTCTCCTAGACAGCTC
AATGATGTGGAATCTGCTGTGAAAGTTCTTGAAGGTTTAGAAGGCATTCCAAATCCTACA
GAGTCTGATTTAATCGAAGGTCGTTGGCAGTTAATGTTCACCACAAGACCTGGAACTGCT
TCTCCAATCCAGAGAACATTTACAGGAGTAGACGTGTTCACTGTCTTCCAAGATGTATAC
TTAAAGACAACAAACGATCCTCGTGTTTCAAACATTGTTAAGTTCTCTGACTTCATTGGA
GAGCTGAAAGTTGAGGCTGTTGCGTCCATCAAAGATGCCAAACGGGTTCTGTTTCGTTTC
GATAGAGCAGCATTCGCATTGAAGTTTCTTCCTTTCAAAGTTCCATATCCAGTTCCTTTT
AGACTTCTTGGTGATGAAGCAAAAGTTGGTTAGATACTACTTACTTGTCGCCTTCAGAAA
CCTTATGATCTCAAGGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI29TF U 33
AF RR2CV84TF U 6
AF RR2AQ75TF U 8
AF RR2H175TF U 1
BS 1 311 RR2H175TF
BS 312 312 RR2CV84TF
BS 313 738 RR2H175TF

RD RR2GI29TF 200 0 0
GGG
ATACAGCGTAGAGATGTCGCCACCATGTCTATTAGGTCCATGCCCTCTTTCATCGTCTTC
TCCGAGATACCATCTTCTTAACAGAACAAACAAGAGAGTAGACTCGTTCAGAAGCTTTAG
AACTCTGCGTGTAACTTGTTCATCTTCCTCTACCTTCACTGGAGGACAAACACAACAGTC
GTCATTCAATGACG
TGA

QA 4 197 4 197
DS 

RD RR2CV84TF 676 0 0
GGA
ATCAACAATGGCGTCTCTTAGATTCTTATACAGCGTAGAGATGTCGCCACCATGTCTATT
AGGTCCATGCCCTCTTTCATCGTCTTCTCCGAGATACCATCTTCTTAACAGAACAAACAA
GAGAGTAGACTCGTTCAGAAGCTTTAGAACTCTGCGTGTAACTTGTTCATCTTCCTCTAC
CTTCACTGGAGGACAAACACAACAGTCGTCATTCAATGACGCTGAGATGAAACTCATTGA
CGCTTTGATCGGTATTCAAGGCCGTGGCAAATCTGCTTCTCCTAGACAGCTCAATGATGT
GGAATCTGCTGTGAAAGTTCTTGAAGGTTTAGAAGGCATTCCAAATCCTACAGAGTCTGA
TTTAATCGAAGGTCGTTGGCAGTTAATGTTCACCACAAGACCTGGAACTGCTTCTCCAAT
CCAGAGAACATTTACAGGAGTAGACGTGTTCACTGTCTTCCAAGATGTATACTTAAAGAC
AACAAACGATCCTCGTGTTTCAAACATTGTTAAGTTCTCTGACTTCATTGGAGAGCTGAA
AGTTGAGGCTGTTGCGTCCATCAAAGATGCCAAACGGGTTCTGTTTCGTTTCGATAGAGC
AGCATTCGCATTGAAGTTTCTTCCTTTCAAAGTTCCATATCCAGTTCCTTTTAGACTTCT
TGGTGATGAAGCA

QA 4 676 4 676
DS 

RD RR2AQ75TF 672 0 0
G
ATCAACAATGGCGTCTCTTAGATTCTTATACAGCGTAGAGATGTCGCCACCATGTCTATT
AGGTCCATGCCCTCTTTCATCGTCTTCTCCGAGATACCATCTTCTTAACAGAACAAACAA
GAGAGTAGACTCGTTCAGAAGCTTTAGAACTCTGCGTGTAACTTGTTCATCTTCCTCTAC
CTTCACTGGAGGACAAACACAACAGTCGTCATTCAATGACGCTTAGATGAAACTCATTGA
CGCTTTGATCGGTATTCAAGGCCGTGGCAAATCTGCTTCTCCTAGACAGCTCAATGATGT
GGAATCTGCTGTGAAAGTTCTTGAAGGTTTAGAAGGCATTCCAAATCCTACAGAGTCTGA
TTTAATCGAAGGTCGTTGGCAGTTAATGTTCACCACAAGACCTGGAACTGCTTCTCCAAT
CCAGAGAACATTTACAGGAGTAGACGTGTTCACTGTCTTCCAAGATGTATACTTAAAGAC
AACAAACGATCCTCGTGTTTCAAACATTGTTAAGTTCTCTGACTTCATTGGAGAGCTGAA
AGTTGAGGCTGTTGCGTCCATCAAAGATGCCAAACGGGTTCTGTTTCGTTTCGATAGAGC
AGCATTCGCATTGAGGTTTCTTCCTTTCAAAGTTCCATATCCAGTTCCTTTTAGACTTCT
TGGTGATGAAG

QA 2 672 2 672
DS 

RD RR2H175TF 738 0 0
GGAAGACAATCAACAATGGCGTCTCTTAGATTCTTATACAGCGTAGAGATGTCGCCACCA
TGTCTATTAGGTCCATGCCCTCTTTCATCGTCTTCTCCGAGATACCATCTTCTTAACAGA
ACAAACAAGAGAGTAGACTCGTTCAGAAGCTTTAGAACTCTGCGTGTAACTTGTTCATCT
TCCTCTACCTTCACTGGAGGACAAACACAACAGTCGTCATTCAATGACGCTGAGATGAAA
CTCATTGACGCTTTGATCGGTATTCAAGGCCGTGGCAAATCTGCTTCTCCTAGACAGCTC
AATGATGTGGAGTCTGCTGTGAAAGTTCTTGAAGGTTTAGAAGGCATTCCAAATCCTACA
GAGTCTGATTTAATCGAAGGTCGTTGGCAGTTAATGTTCACCACAAGACCTGGAACTGCT
TCTCCAATCCAGAGAACATTTACAGGAGTAGACGTGTTCACTGTCTTCCAAGATGTATAC
TTAAAGACAACAAACGATCCTCGTGTTTCAAACATTGTTAAGTTCTCTGACTTCATTGGA
GAGCTGAAAGTTGAGGCTGTTGCGTCCATCAAAGATGCCAAACGGGTTCTGTTTCGTTTC
GATAGAGCAGCATTCGCATTGAAGTTTCTTCCTTTCAAAGTTCCATATCCAGTTCCTTTT
AGACTTCTTGGTGATGAAGCAAAAGTTGGTTAGATACTACTTACTTGTCGCCTTCAGAAA
CCTTATGATCTCAAGGGA

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 9

CO CL629Contig1 905 9 11 U
ACTTTAATGTCATTAATTCATTAAAAAACTCAAACCCTTCCAAATTATTAAAATCTAAAA
TGAGGAATGATAGGGATGAAGCTAAAAAGTGGGTCTCCAAAAACTTGTCAAGTAAATAAA
AATCTCGAACAGAAAGGAACAAAGGACAAGTTAAAGTTTCGCGACACAGGTGCTTTGGTC
TGTAAAACAAAACTAAACATTCAAAAGATGATAATGACGAGAATATAGTCTGTCTATTCC
TCTTCGACAATTTTGCTCTTCTCGCTTACATAGATACCATCAAGGAACTTCCTGATATCC
TTCTTCTTTACGTGACATTTCTGGTTGATAAGAGCACAAGACCTCGACACAAGCTCAATG
TCGTTACCATCAAGAACAATCTCATCCTTAACTTTCTCAGACCGAACAATGGTTACACCG
TCCAACATATCAACCTTTCTCACCTTCTTCTCACCAAGGAAGTTACGGATCTCGATAGAC
TTGCCCTCACCACCGATGGAAGCGTTGATGGGAAAATGAGCGTAGACGAACCTCATCTTG
TAACGGAAACCCCTCGTGACACCGGTGATGAGGTTATCGACGTGGCTGAGAGCGGTTCTG
ATAGACGCGCTTGATTTGCGAGATCCAAACCACGAATCGATCTTGAGCTTCCTCTTCCCA
CTCTCGGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGAGGTTCAGATGCTTGAAGTCGCGAACAAGT
TTGCCGCGAGGCCCTTCCACTTCGATCACCTTGGCGTTAACCTTGATGGTAATGCCTTCG
GGAATGTCCATCGTCTCGGAAGAAAGGATCGTCTTCATCGTCTCCTCACTTTT*CTTACT
CGCTCACACTCTGCTTTCGTCTACTCCACAGCTAAACAGCGGCGATAGAGTTTAAATGTA
CTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 20 50 50 50 35 50 50 50 50 50 20 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2AR01JQ U 1
AF RR2FV85JQ U 92
AF RR2FD37JQ U 92
AF RR2BM16TF C 199
AF RR2H101JQ U 91
AF RR2BM16JQ U 106
AF RR2FV85TF C 298
AF RR2FD37TF C 306
AF RR2AR01TF C 550
BS 1 151 RR2AR01JQ
BS 152 152 RR2H101JQ
BS 153 211 RR2AR01JQ
BS 212 212 RR2H101JQ
BS 213 488 RR2AR01JQ
BS 489 489 RR2H101JQ
BS 490 600 RR2AR01JQ
BS 601 833 RR2H101JQ
BS 834 834 RR2BM16JQ
BS 835 862 RR2H101JQ
BS 863 905 RR2AR01TF

RD RR2AR01JQ 600 0 0
ACTTTAATGTCATTAATTCATTAAAAAACTCAAACCCTTCCAAATTATTAAAATCTAAAA
TGAGGAATGATAGGGATGAAGCTAAAAAGTGGGTCTCCAAAAACTTGTCAAGTAAATAAA
AATCTCGAACAGAAAGGAACAAAGGACAAGTCAAAGTTTCGCGACACAGGTGCTTTGGTC
TGTAAAACAAAACTAAACATTCAAAAGATGACAATGACGAGAATATAGTCTGTCTATTCC
TCTTCGACAATTTTGCTCTTCTCGCTTACATAGATACCATCAAGGAACTTCCTGATATCC
TTCTTCTTTACGTGACATTTCTGGTTGATAAGAGCACAAGACCTCGACACAAGCTCAATG
TCGTTACCATCAAGAACAATCTCATCCTTAACTTTCTCAGACCGAACAATGGTTACACCG
TCCAACATATCAACCTTTCTCACCTTCTTCTCACCAAGGAAGTTACGGATCTCGATAGAC
TTGCCCTCCCCACCGATGGAAGCGTTGATGGGAAAATGAGCGTAGACGAACCTCATCTTG
TAACGGAAACCCCTCGTGACACCGGTGATGAGGTTATCGACGTGGCTGAGAGCGGTTCTG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2FV85JQ 608 0 0
GGTCTCCAAAAACTTGTCAAGTAAATAAAAA*CTCGAACAGAAAGGAACAAAGGACAAGC
TAA*GTTTCGCAACACGGGTGCTTTGGTCTGTAAAATAAAACTAAACATTCAAAAGATGA
TAATGACGAGAATATAGTCTGTCTATTCCTCTTCGACAATTTTGCTCTTCTCGCTTACAT
AGATACCATCAAGGAACTTCCTGATATCCTTCTTCTTTACGTGACATTTCTGGTTGATAA
GGGCACAAGACCTCGACACAAGCTCGATGTCGTTACCATCAAGAACAATCTCATCCTTAA
CTTTCTCAGACCGAACAATGGTTACACCGTCCAACATATCAACCTTTCTCACCTTCTTCT
CACCAAGGAAGTTACGGATCTCGATAGACTTGCCCTCACCACCGATGGAAGCGTTGATGG
GAAAATGAGCGTACACGAACCTCATCTTGTAACGGAAACCCCTCGTGACACCGGTGATGA
GGTTATCGACGTGGCTGAGAGCGGTTCTGATAGATGCGCTTGATTTGCGAGATCCAAACC
AGGAATCGATCTTGAGCTTCCTCTTCCCACTCTCCGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGA
GGTTCAGA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2FD37JQ 617 0 0
GGTCTCCAAAAACTTGTCAAGTAAATAAAAATCTCGAACAGAAAGGAACAAAGGACAAGT
TAAAGTTTCGCGACACAGGTGCTTTGGTCTGTAAAACAAAACTAAACATTCAAAAGATGA
TAATGACGAGAATATAGTCTGTCTATTCCTCTTCGACAATTTTGCTCTTCTCGCTTACAT
AGATACCATCAAGGAACTTCCTGATATCCTTCTTCTTTACGTGACATTTCTGGTTGATAA
GAGCACAAGACCTCGGCACAAGCTCAATGTCGTTACCATCAAGAACAATCTCATCCTTAA
CTTTCTCAGACCGAACAATGGTTACACCGTCCAACATATCAACCTTTCTCACCTTCTTCT
CACCAAGGAAGTTACGGATCTCGATAGACTTGCCCTCACCACCGATGGAAGCGTTGATGG
GAAAATGAGCGTAGACGAACCTCATCTTGTAACGGAAACCCCTCGCGACACCGGTGATGA
GGTTATCGACGTGGCTGAAAGCGGTTCTGATAGACGCGCTTGATTTGCGAGATCCAAACC
ACGAATCGATCTTGAGCTTCCTCTTCCCACTCTCGGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGA
GGTTCAGGTGCTTGAAG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2BM16TF 531 0 0
CA
TCAAAAGATGATAATGACGAGAATATAGTCTGTCTATTCCTCTTCGACAATTTTGCTCTT
CTCGCTTACATAGATACCATCAAGGAACTTCCTGATATCCTTCTTCTTTACGTGACATTT
CTGGTTGATAAGAGCACAAGACCTCGACACCAGCTCAATGTCGTTACCATCAAGAACAAT
CTCATCCTTAACTTTCTCAGACCGAACAATGGTTACACCGTCCAACATATCAACCTTTCT
CACCTTCTTCTCACCAAGGAAGTTACGGATCTCGATAGACTTGCCCTCACCACCGATGGA
AGCGTTGATGGGAAAATGAGCGTAGACGAACCTCATCTTGTAACGGAAACCCCTCGTGAC
ACCGGTGATGAGGTTATCGACGTGGCTGAGAGCGGTTCTGATAGACGCGCTTGATTTGCG
AGATCCAAACCACGAATCGATCTTGAGCTTCCTCTTCCCACTCTCGGCGTCCTTGATGAG
CTGGAAATCGAGGTTCAGATGCTTGAAGTCGCGAACAAGTTTGCCGCGA

QA 3 531 3 531
DS 

RD RR2H101JQ 774 0 0
G
GGTCTCCAAAAACTTGTCAAGTAAATAAAAATCTCGAACAGAAAGGAACAAAGGACAAGT
TAAAGTTTCGCGACACAGGTGCTTTGGTCTGTAAAACAAAACTAAACATTCAAAAGATGA
TAATGACGAGAATATAGTCTGTCTATTCCTCTTCGACAATTTTGCTCTTCTCGCTTACAT
AGATACCATCAAGGAACTTCCTGATATCCTTCTTCTTTACGTGACATTTCTGGTTGATAA
GAGCACAAGACCTGGACACAAGCTCAATGTCGTTACCATCAAGAACAATCTCATCCTTAA
CTTTCTCAGACCGAACAGTGGTTACACCGTCCAACATATCAACCTTTCTCACCTTCTTCT
CACCAAGGAAGTTACGGATCTCGATAGACTTGCCCTCACCACCGATGGAAGCGTTGATGG
GAAAATGAGCGTAGACGAACCTCATCTTGTAACGGAAACCCCTCGTGACACCGGTGATGA
GGTTATCGACGTGGCTGAAAGCGGTTCTGATAGACGCGCTTGATTTGCGAGATCCAAACC
ACGAATCGATCTTGAGCTTCCTCTTCCCACTCTCGGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGA
GGTTCAGATGCTTGAAGTCGCGAACAAGTTTGCCGCGAGGCCCTTCCACTTCGATCACCT
TGGCGTTAACCTTGATGGTAATGCCTTCGGGAATGTCCATCGTCTCGGAAGAAAGGATCG
TCTTCATCGTCTCCTCACTTTTTCTTACTCGCTCACACTCTGCTTTCGTCT
CC

QA 2 772 2 772
DS 

RD RR2BM16JQ 748 0 0
C
GTCAAGTAAATAAAAATCTCGAACAGAAAGGAACAAAGGACAAGTTAAAGTTTCGCGACA
CAGGTGCTTTGGTCTGTAAAACAAAACTAAACATTCAAAAGATGATAATGACGAGAATAT
AGTCTGTCTATTCCTCTTCGACAATTTTGCTCTTCTCGCTTACATAGATACCATCAAGGA
ACTTCCTGATATCCTTCTTCTTTACGTGACATTTCTGGTTGATAAGAGCACAAGACCTCG
ACACAAGCTCAATGTCGTTACCATCAAGAACAATCTCATCCTTAACTTTCTCAGACCGAA
CAATGGTTACACCGTCCAACATATCAACCTTTCTCACCTTCTTCTCACCAAGGAAGTTAC
GGATCTCGATAGACTTGCCCTCACCACCGATGGAAGCGTTGATGGGAAAATGAGCGTAGA
CGAACCTCATCTTGTAACGGAAACCCCTCGTGACACCGGTGATGAGGTTATCGACGTGGC
TGAAAGCGGTTCTGATAGACGCGCTTGATTTGCGAGATCCAAACCACGAATCGATCTTGA
GCTTCCTCTTCCCACTCTCGGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGAGGTTCAGATGCTTGA
AGTCGCGAACAAGTTTGCCGCGAGGCCCTTCCACTTCGATCACCTTGGCGTTAACCTTGA
TGGTAATGCCTTCGGGAATGTCCATCGTCTCGGAAGAAAGGATCGTCTTCATCGTCTCCT
CACTTTT*CTTACTCGCTCACACTCTG

QA 2 748 2 748
DS 

RD RR2FV85TF 554 0 0
TCA
TTCTTCTTTACGTGACATTTCTGGTTGATAAGGGCACAAGACCTCGACACAAGCTCGATG
TCGTTACCATCAAGAACAATCTCATCCTTAACTTTCTCAGACCGAACAATGGTTACACCG
TCCAACATATCAACCTTTCTCACCTTCTTCTCACCAAGGAAGTTACGGATCTCGATAGAC
TTGCCCTCACCACCGATGGAAGCGTTGATGGGAAAATGAGCGTACACGAACCTCATCTTG
TAACGGAAACCCCTCGTGACACCGGTGATGAGGTTATCGACGTGGCTGAGAGCGGTTCTG
ATAGATGCGCTTGATTTGCGAGATCCAAACCAGGAATCGATCTTGAGCTTCCTCTTCCCA
CTCTCCGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGAGGTTCAGATGCTTGAAGTCGCGAACGAGT
CTGCCGCGTGGCCCTTCCACTTCGATCACCTTGGCGTTAACCTTGATGGTAATGCCTTCG
GGAATGTCCATCGTCTCGGAAGAAAGGATCGTCTTCATCGTCTCCTCACTTTTTCT*ACT
CGCTCAC
CCTG

QA 4 550 4 550
DS 

RD RR2FD37TF 559 0 0
CTTTACGTGACATTTCTGGTTGATAAGAGCACAAGACCTCGGCACAAGCTCAATGTCGTT
ACCATCAAGAACAATCTCATCCTTAACTTTCTCAGACCGAACAATGGTTACACCGTCCAA
CATATCAACCTTTCTCACCTTCTTCTCACCAAGGAAGTTACGGATCTCGATAGACTTGCC
CTCACCACCGATGGAAGCGTTGATGGGAAAATGAGCGTAGACGAACCTCATCTTGTAACG
GAAACCCCTCGCGACACCGGTGATGAGGTTATCGACGTGGCTGAGAGCGGTTCTGATAGA
CGCGCTTGATTTGCGAGATCCAAACCACGAATCGATCTTGAGCTTCCTCTTCCCACTCTC
GGCGTCCTTGATGAGCTGGAAATCGAGGTTCAGGTGCTTGAAGTCGCGAACAAGTTTGCC
GCGAGGCCCTTCCACTTCGATCACCTTGGCGTTAACCTTGATGGTAATGCCTTCGGGAAT
GTCCATCGTCTCGGAAGAAAGGATCGTCTTCATCGACTCCTCACTTTT*CTTACTCGCTC
ACACTCTGCTTTCGTCT
CC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2AR01TF 356 0 0
CCCCTCGTGACACCGGTGATGAGGTTATCGACGTGGCTGAGAGCGGTTCTGATAGAAGCG
CTTGATTTGCGAGATCCAAACCACGAATCGATCTTGAGCTTCCTCTTCCCACTCTCGGCG
TCCTTGATGAGCTGGAAATCGAGGTTCAGATGCTTGAAGTCGCGAACAAGTTTGCCGCGA
GGCCCTTCCACTTCGATCACCTTGGCGTTAACCTTGATGGTAATGCCTTCGGGAATGTCC
ATCGTCTCGGAAGAAAGGATCGTCTTCATCGTCTCCTCACTTTT*CTTACTCGCTCACAC
TCTGCTTTCGTCTACTCCACAGCTAAACAGCGGCGATAGAGTTTAAATGTACTCCC

QA 1 356 1 356
DS 



AS 1 9

CO CL630Contig1 1297 9 20 U
GGGCATTGATCGTCTTCACCTAAACAACAAACACTGATTCTCGTAACGCCGCCATGTCTC
TCCTCTCAGATCTCGTCAACCTCAACCTCTCTGACTCCACCGAGAAAATCATCGCTGAAT
ACATATGGATCGGTGGATCTGGAATGGACATCAGAAGCAAAGCCAGGACACTCCCAGGAC
CAGTGAGCGACCCATCAAAGCTTCCTAAGTGGAACTACGACGGATCCAGTACCGGTCAGG
CCGCTGGAGATGATAGTGAAGTCATTATATACCCTCAAGCGATCTTCCGTGATCCGTTCA
GGAGAGGCAACAACATTCTGGTGATGTGTGATGCTTACACACCGGCCGGGAATCCAATTC
CGACCAACAAAAGGCACAACGCTGCTAAGATCTTCAGCACCTCCAAAGTTGCCTCCGAGG
AGCCTTGGTATGGGATTGAGCAAGAATACACATTGATGCAGAAGGGTGTGAACTGGCCTA
TTGGTTGGCCTGTTGGTGGCTTCCCTGGCCCACAGGGACCTTACTACTGTGGTGTCGGAG
CTGACAAAGCCATTGGTCGTGACATTGTGGATGCACACTACAAGGCCTGTCTTTACGCAG
GTATCAGCATCTCTGGTGTCAATGGAGAAGTCATGCCTGGCCAGTGGGAGTTCCAAGT*G
GTCCAGTTGAAGGTATCAGCGCTGGTGATCAAGTCTGGGTCGCTAGATTCCTTCTCGAGA
GGATCACTGAGATCTCTGGTGTAAATGTCAGCTTCGACCCAAAACCAGTCCCGGGTGACT
GGAACGGAGCTGGAGCTCACTGCAACTACAGTACGAAGTCGATGAGGAACGACGGAGGAT
TAGCAGTGATCAAGAAAGCCATAGAGAAGCTTCAGGTGAAGCACAAGGAGCACATCGCTG
CCTACGGTGAAGGCAACGAGCGTCGTCTCACGGGGAAGCACGAGACAGCTGACATCAACA
CGTTCTCTTGGGGAGTGGCGAACCGTGGAGCTTCGGTGAGAGTGGGACGTGACACTGAGA
AAGAAGGCAAAGGTTACTTCGAGGACAGAAGGCCGGCTTCTAACATGGATCCTTATGTCG
TTACGTCCATGATTGCTGAAACCACCATCCTCGGTTAGGAAGTCACACATTTTAGTAATG
TTTGGTTTTT*CCGGTTTGGTTTTATGATTTGAAGACTTTTGTGCTTGTGATTGCGGTCT
ATCTCGGTTTAAATAATTCTTATGATGACATTTTGTGTTTTTTT*CTTCTTCTTTTAGTT
TCGAATAATAATTAAAATAAAGTATTCTTGTGGTGAG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 0 25 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 

AF RR2DP91TF U 1
AF RR2BR33TF U 1
AF RR2ES94TF U 1
AF RR2BR56TF U 1
AF RR2BL30TF U 13
AF RR2BR56JQ C 538
AF RR2BL30JQ C 543
AF RR2DP91JQ C 698
AF RR2BR33JQ C 740
BS 1 596 RR2BR33TF
BS 597 672 RR2BR56TF
BS 673 673 RR2BR56JQ
BS 674 708 RR2BR56TF
BS 709 709 RR2BL30TF
BS 710 710 RR2BR56TF
BS 711 711 RR2BR56JQ
BS 712 712 RR2BR56TF
BS 713 713 RR2BL30TF
BS 714 736 RR2BR56TF
BS 737 964 RR2BR56JQ
BS 965 965 RR2BL30JQ
BS 966 1044 RR2BR56JQ
BS 1045 1045 RR2BL30JQ
BS 1046 1047 RR2BR56JQ
BS 1048 1048 RR2BL30JQ
BS 1049 1167 RR2BR56JQ
BS 1168 1168 RR2BL30JQ
BS 1169 1295 RR2BR56JQ
BS 1296 1297 RR2DP91JQ

RD RR2DP91TF 533 0 0
GGGCATTGATCGTCTTCACCTAAACAACAAACACTGATTCTCGTAACGCCGCCATGTCTC
TCCTCTCAGATCTCGTCAACCTCAACCTCTCTGACTCCACCGAGAAAATCATCGCTGAAT
ACATATGGATCGGTGGATCTGGAATGGACATCAGAAGCAAAGCCAGGACACTCCCAGGAC
CAGTGAGCGACCCATCAAAGCTTCCTAAGTGGAACTACGACGGATCCAGTACCGGTCAGG
CCGCTGGAGATGATAGTGAAGTCATTATATACCCTCAAGCGATCTTCCGTGATCCGTTCA
GGAGAGGCAACAACATTCTGGTGATGTGTGATGCTTACACACCGGCCGGGAATCCAATTC
CGACCAACAAAAGGCACAACGCTTCTAAGATCTTCAGCACCTCCAAAGTTGCCTCCGAGG
AGCCTTGGTATGGGATTGAGCAAGAATACACATTGATGCAGAAGGGTGTGAACTGGCCTA
TTGGTTGGCCTGTTGGTGGCTTCCCTGGCCCACAGGGACCTTACTACTGTGGT

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2BR33TF 596 0 0
GGGCATTGATCGTCTTCACCTAAACAACAAACACTGATTCTCGTAACGCCGCCATGTCTC
TCCTCTCAGATCTCGTCAACCTCAACCTCTCTGACTCCACCGAGAAAATCATCGCTGAAT
ACATATGGATCGGTGGATCTGGAATGGACATCAGAAGCAAAGCCAGGACACTCCCAGGAC
CAGTGAGCGACCCATCAAAGCTTCCTAAGTGGAACTACGACGGATCCAGTACCGGTCAGG
CCGCTGGAGATGATAGTGAAGTCATTATATACCCTCAAGCGATCTTCCGTGATCCGTTCA
GGAGAGGCAACAACATTCTGGTGATGTGTGATGCTTACACACCGGCCGGGAATCCAATTC
CGACCAACAAAAGGCACAACGCTGCTAAGATCTTCAGCACCTCCAAAGTTGCCTCCGAGG
AGCCTTGGTATGGGATTGAGCAAGAATACACATTGATGCAGAAGGGTGTGAACTGGCCTA
TTGGTTGGCCTGTTGGTGGCTTCCCTGGCCCACAGGGACCTTACTACTGTGGTGTCGGAG
CTGACAAAGCCATTGGTCGTGACATTGTGGATGCACACTACAAGGCCTGTCTTTAC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2ES94TF 656 0 0
GGGCATTGATCGTCTTCACCTAAACAA***ACACTGATTCTCGCAACGCCGCCATGTCTC
TCCTCTCAGATCTCGTCAACCTCAACCTCTCTGACTCCACCGAGAAAATCATCGCTGAAT
ACATATGGATCGGTGGATCTGGAATGGACATCAGGAGTAAAGCCAGGACGCTCCCAGGAC
CAGTGAGCGATCCATCAAAGCTTCCCAAGTGGAACTACGACGGATCCAGCACCGGTCAGG
CCGCTGGAGATGATAGTGAAGTCATTATATACCCTCAGGCGATCTTCCGTGATCCGTTCA
GGAGAGGCAACAACATTCTGGTGATGTGTGATGCTTACACGCCAGCTGGAAATCCAATTC
CGACCAACAAGAGACACAACGCTGCTAAGATCTTCAGCACCTCCAAAGTTGCCTCCGAGG
AGCCTTGGTATGGGATTGAGCAAGAATACACATTGATGCAGAAGGGTGTGAACTGACCTA
TTGGCTGGCCTGTTGGTGGCTTCCCTGGCCCACAGGGACCATACTACTGTGGTGTGGGAG
CTGACAAAGCCATTGGTCGTGACATTGTCGATGCACACTACAAGGCCTGTCTTTACGCAC
GTATCAGCATCTCTGGTGTCAATGGAGAAGTCATGCCTGGCCAGTGGGAGTTCCAA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2BR56TF 736 0 0
GGGCATTGATCGTCTTCACCTAAACAACAAACACTGATTCTCGTAACGCCGCCATGTCTC
TCCTCTCAGATCTCGTCAACCTCAACCTCTCTGACTCCACCGAGAAAATCATCGCTGAAT
ACATATGGATCGGTGGATCTGGAATGGACATCAGAAGCAAAGCCAGGACACTCCCAGGAC
CAGTGAGCGACCCATCAAAGCTTCCTAAGTGGAACTACGACGGATCCAGTACCGGTCAGG
CCGCTGGAGATGATAGTGAAGTCATTATATACCCTCAAGCGATCTTCCGTGATCCGTTCA
GGAGAGGCAACAACATTCTGGTGATGTGTGATGCTTACACACCGGCCGGGAATCCAATTC
CGACCAACAAAAGGCACAACGCTGCTAAGATCTTCAGCACCTCCAAAGTTGCCTCCGAGG
AGCCTTGGTATGGGATTGAGCAAGAATACACATTGATGCAGAAGGGTGTGAACTGGCCTA
TTGGTTGGCCTGTTGGTGGCTTCCCTGGCCCACAGGGACCTTACTACTGTGGTGTCGGAG
CTGACAAAGCCATTGGTCGTGACATTGTGGATGCACACTACAAGGCCTGTCTTTACGCAG
GTATCAGCATCTCTGGTGTCAATGGAGAAGTCATGCCTGGCCAGTGGGAGTTCCAAGT*G
GTCCAGTTGAAG*TATCAGCGCTGGTGATCAAGTCTGGGTCGCTAGATCC*T*CTCGAGA
GGATCACTGAGATCTC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2BL30TF 724 0 0
TCTTCACCTAAACAA*ACACACTGATTCTCGTAACGCCGCCATGTCTCTCCTCTCAGACC
TCGTCAACCTCAACCTCTCTGACTCCACCGAGAAAATCATCGCTGAATACATATGGATCG
GTGGATCTGGAATGGATATCAGAAGCAAAGCCAGGACACTCCCAGGACCAGTGAGCGACC
CATCAAAGCTTCCTAAGTGGAACTACGACGGATCCAGTACCGGTCAGGCCGCTGGAGATG
ATAGCGAAGTCATTATATACCCTCAAGTGATCTTCCGTGATCCGTTCAGGAGAGGCAACA
ACATTCTGGTGATGTGTGATGCTTACACACCGGCCGGGAATCCAATTCCGACCAACAAAA
GGCACAACGCTGCTAAGATCTTCAGCACCTCCAAAGTTGCCTCCGAGGAGCCTTGGTATG
GGATTGAGCAAGAGTACACATTGATGCAGAAGGGTGTGAACTGGCCTATTGGTTGGCCTG
TTGGTGGCTTCCCTGGCCCACAGGGACCAT**TACTGTGGTGTGGGAGCTGACAAAGCCA
TTGGTCGTGACATTGTGGATGCACACTACAATGCCTGTCTTTACGCAGGTATCAGCATCT
CTGGTGTCAATGGAGAAGTCATGCCTGGCCAGTGGGAGTTCCAAGT*CGTCCAGTTGAAG
*TATCAGCGCTGGTGATCAAGTCTGGGTCGCTAGATTC*TTCTCGAGAG*ATCACTGAGA
TCTC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2BR56JQ 758 0 0
GAGCTGACAAAGCCATTGGTCGTGACATTGTGGATGCACACTACAAGGCCTGTCTTTACG
CAGGTATCAGCATCTCTGGTGTCAATGGAGAAGTCATGCCTGGCCAGTGGGAGTTCCAAG
T*GGTCCAGTTGAAGGTATCAGCGCTGGTGATCAAGTCTGGGTCGCTAGATTCCTTCTCG
AGAGGATCACTGAGATCTCTGGTGTAAATGTCAGCTTCGACCCAAAACCAGTCCCGGGTG
ACTGGAACGGAGCTGGAGCTCACTGCAACTACAGTACGAAGTCGATGAGGAACGACGGAG
GATTAGCAGTGATCAAGAAAGCCATAGAGAAGCTTCAGGTGAAGCACAAGGAGCACATCG
CTGCCTACGGTGAAGGCAACGAGCGTCGTCTCACGGGGAAGCACGAGACAGCTGACATCA
ACACGTTTTCTTGGGGAGTGGCGAACCGTGGAGCTTCGGTGAGAGTGGGACGTGACACTG
AGAAAGAAGGCAAAGGTTACTTCGAGGGCATAAGGCCGGCTTCTAACATGGATCCTTATG
TCGTTACGTCCATGATTGCTGAAACCACCATCCTCGGTTAGGAAGTCACACATTTTAGTA
ATGTTTGGTTTTT*CCGGTTTGGTTTTATGGTTTGAAGACTTTTGTGCTTGTGATTGCGG
TCTATCTCGGTTTAAATAATTCTTATGATGACATTTTGTGTTTTTTT*CTTCTTCTTTTA
GTTTCGAATAATAATTAAAATAAAGTATTCTTGTGGTG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2BL30JQ 753 0 0
GACAAAGCCATTGGTCGTGACATTGTGGATGCACACTACAATGCCTGTCTTTACGCAGGT
ATCAGCATCTCTGGTGTCAATGGAGAAGTCATGCCTGGCCAGTGGGAGTTCCAAGTCGGT
CCAGTTGAAGGTATCAGCGCTGGTGATCAAGTCTGGGTCGCTAGATTCCTTCTCGAGAGG
ATCACTGAGATCTCTGGTGTAAATGTCAGCTTCGACCCAAAACCAGTCCCGGGTGACTGG
AACGGAGCTGGAGCTCACTGCAACTACAGTACGTAGTCGATGAGGAACGACGGAGGATTA
GCAGTGATAAAGAAAGCCATAGAGAAGCTTCAGGTGAAGCACAAGGAGCACATCGCTGCC
TACGGTGAAGGCAACGAGCGTCGTCTCACGGGGAAGCACGAGACGGCAGACATCAACACG
TTCTCTTGGGGAGTGGCGAACCGTGGAGCTTCGGTGAGAGTGGGACGTGACACTGAGAAA
GAAGGCAAAGGTTACTTCGAGGACAGAAGGCCGGCTTCTAACATGGATCCTTATGTCGTT
ACGTCCATGATTGCTGAAACCACCATCCTCGGTTAGGAAGTCACACATTTTAGTAATGTT
TGGTTTTTTCCGGTTTGGTTTTATGATTTGAAGACTTTTGTGCTTGTGATTGCGGTCTAT
CTCGGTTTAAATAATTTTTATGATGACATTTTGTGTTTTTTTTCTTCTTCTTTTAGTTTC
GAATAAT***TAAAATAAAGTATTCTTGTGGTG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2DP91JQ 600 0 0
GGTCGCTAGATTCCTTCTCGAGAGGATCACTGAGATCTCTGGTGTAAATGTCAGCTTCGA
CCCAAAACCAGTCCCGGGTGACTGGAACGGAGCTGGAGCTCACTGCAACTACAGTACGAA
GTCGATGAGGAACGACGGAGGATTAGCAGTGATCAAGAAAGCCATAGAGAAGCTTCAGGT
GAAGCACAAGGAGCACATCGCTGCCTACGGTGAAGGCAACGAGCGTCGTCTCACGGGGAA
GCACGAGACAGCTGACATCAACACGTTCTCTTGGGGAGTGGCGAACCGTGGAGCTTCGGT
GAGAGTGGGACGTGACACTGAGAAAGAAGGCAAAGGTTACTTCGAGGACAGAAGGCCGGC
TTCTAACATGGATCCTTATGTCGTTACGTCCATGATTGCTGAAACCACCATCCTCGGTTA
GGAAGTCACACATTTTAGTAATGTTTGGTTTCT*CCGGTTTGGTTTTATGATTTGAAGAC
TTTTGTGCTTGTGATTGCGGTCTATCTCGGTTTAAATAATTCTTATGATGACATTTTGTG
TTTTTTT*CTTCTTCTTTTAGTTTCGAATAATAATTAAAATAAAGTATTCTTGTGGTGAG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2BR33JQ 556 0 0
TGTAAATGTCAGCTTCGACCCAAAACCAGTCCCGGGTGACTGGAACGGAGCTGGAGCTCA
CTGCAACTACAGTACGAAGTCGATGAGGGACGACGGAGGATTAGCAGTGATCAAGAAAGC
CATAGAGAAGCTTCAGGTGAAGCACAAGGAGCACATCGCTGCCTACGGTGAAGACAACGA
GCGTCGTCTCACGGGGAAGCACGAGACAGCTGACATCAACACGTTTTCTTGGGGAGTGGC
GAACCGTGGAGCTTCGGTGAGAGTGGGACGTGACACTGAGAAAGAAGGCAAAGGTTACTT
CGAGGACAGAAGGCCGGCTTTTAACATGGATCCTTATGTCGTTACGTCCATGATTGCTGA
AACCACCATCCTCGGTTAGGAAGTCACACATTTTAGTAATGTTTGGTTTTT*CCGGTTTG
GTTTTATGATTTGAAGACTTTTGTGCTTGTGATTGCGGTCTATCTCGGTTTAAATAATTC
TTATGATGACATTTTGTGTTTTTTT*TTTTTTCTTTTAGTTTCGAATAATAATTAAAATA
AAGTATTCTTGTGG
CG

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 7

CO CL631Contig1 972 7 17 U
CTTGTTAGAAGGGTCTCAAAATTCACCATTTCAGAGACAAAAAAACAATACAAATACTGC
TGACAAAAAAAAAATACTAATACAAATACACTGTCCAACAACATGCTAAGTAGCTCTGCT
CTGTTCTTATAATGGGTGCATAAATGCAAAGACACTGTCCAACAAACACCAGAAACTAAA
TTACATCAAAACTTTTACCGCATGCTCAAAATGGCATATGGATGGAGCTGATCTAAAACA
TAATAGCAGTGTGACCACTCATGTTGCTTCTCTATACATATATATGACCAGACTAAATGA
ATAGCTTCAGAAGGTGGTGGCGATGGGAGTGGTTATGTCCTGAGCAGCCAATCTTTCAGA
GACACAAGCCAAGGATTTCAAGTTACACTTGATAAGCGATTCCACAAAGTAACAGGTCTC
ATCTTTAGTGTTGCCTTGAGGAACATCGACAACAAAAGATTCAATCACCACAGTCCCTGC
TCTCCCATCGATCATCTCCGGATGTACAGTCAAGATTGAAGAATAGTTCTTAAGTCTATG
ATCACCACCAATGATGTTGATACCGAGGATGCGTTCATCATCATCAAGCTGTTCCAATCT
CTCGGTACTAGTTGTAGCCGGGAGACCAGATTTGACGTTGACTTCTCTGAGACTACCGAT
CTCAGGAAGACCATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTTGTATTTCTGCGGCTGATC
AAATCTTCGGACAAGAGACCAAACGAGATGAACAGGGGCTTTAATGTATTTGACGAGAAC
AGAGGTACACTGATTCTCTCTGCAGTGGTGATGATGATGCAACCGTGCGTACTGCGCCGT
GACAAGAGCACCATGCATCTCTGAATCCTCTACGATGATCTCCTCCATCTCTTATCTTCC
TCGTGCCTTTAAGGAATCTGGTTTGCCCTCAATGGGAAATGGATAAGATGGAGAGGAAAG
GCAGGAGACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F242JQ U 12
AF RR2B047JQ U 1
AF RR2B771JQ U 57
AF RR2B771TF C 94
AF RR2B949JQ U 88
AF RR2B047TF C 193
AF RR2B949TF C 344
BS 1 202 RR2B047JQ
BS 203 203 RR2F242JQ
BS 204 238 RR2B047JQ
BS 239 239 RR2F242JQ
BS 240 309 RR2B047JQ
BS 310 310 RR2F242JQ
BS 311 358 RR2B047JQ
BS 359 359 RR2F242JQ
BS 360 804 RR2B047JQ
BS 805 862 RR2B771JQ
BS 863 911 RR2B949JQ
BS 912 926 RR2B047TF
BS 927 927 RR2B949TF
BS 928 938 RR2B047TF
BS 939 939 RR2B949TF
BS 940 952 RR2B047TF
BS 953 972 RR2B949TF

RD RR2F242JQ 732 0 0
GGTCTCAAAATTCACCATTTCAGAGACAAAAAAACAATACAAATACTGCTGACAAAAAAA
AA*TACTAATACAAATACACTGTCCAACAACATGCTAAGTAGCTCTGCTCTGTTCTTATA
ATGGGTGCATAAATGCAAAGACACTGTCCAACAAACACCAGAAACTAAATTACATCAAAA
CTTTTACCGCATGCTCAAAATGGCATATGGATGGAGCTGATCTAAAACATAATAGCAGTG
TGACCACTCATGTTGCTTCTCTATACATATATATGACCAGACTAAATGAATAGCTTCAGA
AGGTGGTGGCGATGGGAGTGGTTATGTCCTGAGCAGCCAATCTTTCAGAAACACAAGCCG
AGGATTTCAAGTTACACTTGATAAGCGATTCCACAAAGTAACAGGTCTCATCTTTAGTGT
TGCCTTGAGGAACATCGACAACAAAAGATTCAATCACCACAGTCCCTGCTCTCCCATCGA
TCATCTCCGGATGTACAGTCAAGATTGAAGAATAGTTCTTAAGTCTATGATCACCACCAA
TGATGTTGATACCGAGGATGCGTTCATCATCATCAAGCTGTTCCAATCTCTCGGTACTAG
TTGTAGCCGGGAGACCAGATTTGACGTTGACTTCTCTGAGACTACCGATCTCAGGAAGAT
CATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTTGTATTTCTGCGGCTGATCAAATCTTCGGA
CAAGAGACCAAA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2B047JQ 804 0 0
CTTGTTAGAAGGGTCTCAAAATTCACCATTTCAGAGACAAAAAAACAATACAAATACTGC
TGACAAAAAAAAAATACTAATACAAATACACTGTCCAACAACATGCTAAGTAGCTCTGCT
CTGTTCTTATAATGGGTGCATAAATGCAAAGACACTGTCCAACAAACACCAGAAACTAAA
TTACATCAAAACTTTTACCGCACGCTCAAAATGGCATATGGATGGAGCTGATCTAAAAAA
TAATAGCAGTGTGACCACTCATGTTGCTTCTCTATACATATATATGACCAGACTAAATGA
ATAGCTTCAAAAGGTGGTGGCGATGGGAGTGGTTATGTCCTGAGCAGCCAATCTTTCAAA
GACACAAGCCAAGGATTTCAAGTTACACTTGATAAGCGATTCCACAAAGTAACAGGTCTC
ATCTTTAGTGTTGCCTTGAGGAACATCGACAACAAAAGATTCAATCACCACAGTCCCTGC
TCTCCCATCGATCATCTCCGGATGTACAGTCAAGATTGAAGAATAGTTCTTAAGTCTATG
ATCACCACCAATGATGTTGATACCGAGGATGCGTTCATCATCATCAAGCTGTTCCAATCT
CTCGGTACTAGTTGTAGCCGGGAGACCAGATTTGACGTTGACTTCTCTGAGACTACCGAT
CTCAGGAAGACCATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTTGTATTTCTGCGGCTGATC
AAATCTTCGGACAAGAGACCAAACGAGATGAACAGGGGCTTTAATGTATTTGACGAGAAC
AGAGGTACACTGATTCTCTCTGCA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2B771JQ 806 0 0
GCTGCTGAC
AAAAAAAAATACTAATACAAATACACTGTCCAACAACATGCTAAGTAGCTCTGCTCTGTT
CTTATAATGGGTGCATAAATGCAAAGACACTGTCCAACAAACACCAGAAACTAAATTACA
TCAAAACTTTTACCGCATGCTCAAAATGGCATATGGATGGAGCTGATCTAAAACATAATA
GCAGTGTGACCACTCATGTTGCTTCTCTATACATATATATGACCAGACTAAATGAATAGC
TTCAGAAGGTGGTGGCGATGGGAGTGGTTATGTCCTGAGCAGCCAATCTTTCAGAAACAC
AAGCCAAGGATTTCAAGTTACACTTGATAAGCGATTCCACAAAGTAACAGGTCTCATCTT
TAGTGTTGCCTTGAGGAACATCGACAACAAAAGATTCAATCACCACAGTCCCTGCTCTCC
CATCGATCATCTCCGGATGTACAGTCAAGATTGAAGAATAGTTCTTAAGTCTATGATCAC
CACCAATGATGTTGATACCGAGGATGCGTTCATCATCATCAAGCTGTTCCAATCTCTCGG
TACTAGTTGTAGCCGGGAGACCAGATTTGACGTTGACTTCTCTGAGACTACCGATCTCAG
GAAGACCATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTTGTATTTCTGCGGCTGATCAAATC
TTCGGACAAGAGACCAAACGAGATGAACAGGGGCTTTAATGTATTTGACGAGAACAGAGG
TCCACTGATTCTCTCTGCAGTGGTGATGATGATGCAACCGTGCGTACTGCGCCGTGACAA
GAGCACCATGCATCTCT

QA 10 806 10 806
DS 

RD RR2B771TF 790 0 0
TCCAACAACATGCTAAGTAGCTCTGCTCTGTTCTTATAATGGGTGCATAAATGCAAAGAC
ACTGTCCAACAAACACCAGAAACTAAATTACATCAAAACTTTTACCGCATGCTCAAAATG
GCATATGGATGGAGCTGATCTAAAACATAATAGCAGTGTGACCACTCATGTTGCTTCTCT
ATACATATATATGACCAGACTAAATGAATAGCTTCAGAAGGTGGTGGCGATGGGAGTGGT
TATGTCCTGAGCAGCCAATCTTTCAGAGACACAAGCCAAGGATTTCAAGTTACACTTGAT
AAGCGATTCCACAAAGTAACAGGTCTCATCTTTAGTGTTGCCTTGAGGAACATCGACAAC
AAAAGATTCAATCACCACAGTCCCTGCTCTCCCATCGATCATCTCCGGATGTACAGTCAA
GATTGAAGAATAGTTCTTAAGTCTATGATCACCACCAATGATGTTGATACCGAGGATGCG
TTCATCATCATCAAGCTGTTCCAATCTCTCGGTACTAGTTGTAGCCGGGAGACCAGATTT
GACGTTGACTTCTCTGAGACTACCGATCTCAGGAAGACCATGAACTGTGCATCTGCTTAC
AAATGGTTTGTATTTCTGCGGCTGATCAAATCTTCGGACAAGAGACCAAACGAGATGAAC
AGGGGCTTTAATGTATTTGACGAGAACAGAGGTCCACTGATTCTCTCTGCAGTGGTGATG
ATGATGCAACCGTGCGTACTGCGCCGTGACAAGAGCACCATGCATCTCTGAATCCTCTAC
GATGATCTCC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2B949JQ 824 0 0
ACACTGTCCAACAACGTGCTAAGTAGCTCTGCTCTGTTCTTATAATGGGTGCATAAATGC
AAAGACACTGTCCAACAAACACCAGAAACTAAATTACATCAAAACTTTTACCGCATGCTC
AAAATGGCATATGGATGGAGCTGATCTAAAACATAATAGCAGTGTGACCACTCATGTTGC
TTCTCTATACATATATATGACCAGACTAAATGAATAGCTTCAGAAGGTGGTGGCGATGGG
AGTGGTTATGTCCTGAGCAGCCAATCTTTCAGAGACACAAGCCAAGGATTTCAAGTTACA
CTTGATAAGCGATTCCACAAAGTAACAGGTCTCATCTTTAGTGTTGCCTTGAGGAACATC
GACAACAAAAGATTCAATCACCACAGTCCCTGCTCTCCCATCGATCATCTCCGGATGTAC
AGTCAAGATTGAAGAATAGTTCTTAGGTCTATGATCACCACCAATGATGTTGATACCGAG
GATGCGTTCATCATCATCAAGCTGTTCCAATCTCTCGGTACTAGTTGTAGCCGGGAGACC
AGATTTGACGTTGACTTCTCTGAGACTACCGATCTCAGGAAGACCATGAACTGTGCATCT
GCTTACAAATGGTTTGTATTTCTGCGGCTGATCAAATCTTCGGACAAGAGACCAAACGAG
ATGAACAGGGGCTTTAATGTATTTGACGAGAACAGAGGTACGCTGATTCTCTCTGCAGTG
GTGATGATGATGCAACCGTGCGTACTGCGCCGTGACAAGAGCACCATGCATCTCTGAATC
CTCTACGATGATCTCCTCCATCTCTTATCTTCCTCGTGCCTTTA

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2B047TF 760 0 0
TTTTACCGCACGCTCAAAATGGCATATGGATGGAGCTGATCTAAAAAATAATAGCAGTGT
GACCACTCATGTTGCTTCTCTATACATATATATGACCAGACTAAATGAATAGCTTCAGAA
GGTGGTGGCGATGGGAGTGGTTATGTCCTGAGCAGCCAATCTTTCAGAGACACAAGCCAA
GGATTTCAAGTTACACTTGATAAGCGATTCCACAAAGTAACAGGTCTCATCTTTAGTGTT
GCCTTGAGGAACATCGACAACAAAAGATTCAATCACCACAGTCCCTGCTCTCCCATCGAT
CATCTCCGGATGTACAGTCAAGATTGAAGAATAGTTCTTAAGTCTATGATCACCACCAAT
GATGTTGATACCGAGGATGCGTTCATCATCATCAAGCTGTTCCAATCTCTCGGTACTAGT
TGTAGCCGGGAGACCAGATTTGACGTTGACTTCTCTGAGACTACCGATCTCAGGAAGACC
ATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTTGTATTTCTGCGGCTGATCAAATCTTCGGAC
AAGAGACCAAACGAGATGAACAGGGGCTTTAATGTATTTGACGAGAACAGAGGTACACTG
ATTCTCTCTGCAGTGGTGATGATGATGCAACCGTGCGTACCGCGCCGTGACAAGAGCACC
ATGCATCTCTGAATCCTCTACGATGATCTCCTCCATCTCTTATCTTCCTCGTGCCTTTAA
GGAATCTGGTTTGCTCTCAATGGGAAGTGGATAAGATGGA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2B949TF 629 0 0
GCAGCCAATCTTTCAGAGACACAAGCCAAGGATTTCAAGTTACACTTGATAAGCGATTCC
ACAAAGTAACAGGTCTCATCTTTAGTGTTGCCTTGAGGAACATCGACAACAAAAGATTCA
ATCACCACAGTCCCTGCTCTCCCATCGATCATCTCCGGATGTACAGTCAAGATTGAAGAA
TAGTTCTTAGGTCTATGATCACCACCAATGATGTTGATACCGAGGATGCGTTCATCATCA
TCAAGCTGTTCCAATCTCTCGGTACTAGTTGTAGCCGGGAGACCAGATTTGACGTTGACT
TCTCTGAGACTACCGATCTCAGGAAGACCATGAACTGTGCATCTGCTTACAAATGGTTTG
TATTTCTGCGGCTGATCAAATCTTCGGACAAGAGACCAAACGAGATGAACAGGGGCTTTA
ATGTATTTGACGAGAACAGAGGTACGCTGATTCTCTCTGCAGTGGTGATGATGATGCAAC
CGTGCGTACTGCGCCGTGACAAGAGCACCATGCATCTCTGAATCCTCTACGATGATCTCC
TCCATCTCTTATCTTCCTCGTGCCTTTAAGGAATCTGGTTTGCCCTCAATGGGAAATGGA
TAAGATGGAGAGGAAAGGCAGGAGACTCC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 7

CO CL632Contig1 1211 7 7 U
GGGGTGCCATAAGCTTTTAATTAAAGAGAAACACTTACAAAGCTTATATCTCTCTTACCT
CGAAGAGTTCGTCTTCTCCCTCCTATACAAATAAAAACCTAAATTATTCTTCCTACCAAA
AAAAAACTCTAAAACCATGGCTATCTTCAACACTCAAAACACATGGGCCTTCGCCTTCGG
CTTGCTCGGAAACATCATTTCCTTTGCTGTTTTCCTCTCCCCCGTGCCAACGTTCTATAG
GATTTGGAAGAAAAAAACCACAGAAGATTTTCAATCTCTTCCTTACGTGGTGGCGCTCTT
TAGCGCGATGCTTTGGCTCTATTATGCTACTCAGAAGAAAGATGTCTTCCTTCTCGTCAC
CATCAACTCCTTTGGTTGCTTCATCGAAACCATCTACATCGCCATATTCGTTGCCTTCGC
CACCAAGAAAGCGCGAATGTTAACGGTGAAGCTCTTGTTGCTAATGAACTTTGGAGGATT
CTGTCTGATTCTCCTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGG*TTCCACACGTGCGAAGATTA
TCGGAGGAATCTGTGTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCA
GAACGGTGATAAAGACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTA
CAATCAGTGCGGTCGTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAGGGATATTTACGTTGCTT
TCCCGAACGTGATTGGGTTTGTTCTCGGTGCACTTCAAATGATACTTTACGTGGTTTTCA
AATACTGCAAAACGCCGTCGGATTTGGTGGAGAAAGAACTCGAAGCCGCTAAGTTGCCGG
AGGTGAGTATTGATATGCTGAAGCTAGGGACATTGGCATCTCCTGAAGCAGCAGAGATCA
CAGTCGTACCAACTGCGAACAAGTGTATATGTAATGATCGGAAGACTGAAACTGAAAATG
GACAGCGAGTTAAAAACGGCAAACACTCCACTGCAGCTTGTTAAAAAACAGAAAAACTGT
TTGCCTATCTTTTGCATTGTTGACTTTGTACTCTATCTTAATATCATCATCTACGTGTGC
CAAGTCGAGGATTAATTATCTCGGGAATTACATTATCCTGAGTTGATTTTTCCCTTCTTC
TTTTAATTACTAGTGTAACTAAATTATCTGTTGGATATGAATATCACCTTATTTTCCCGT
TGAAAGGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP56TF U 230
AF RR2CW39TF U 5
AF RR2FE25TF U 1
AF RR2GP56JQ C 498
AF RR2CW39JQ C 571
AF RR2A033TF U 552
AF RR2FE25JQ C 602
BS 1 709 RR2FE25TF
BS 710 710 RR2GP56JQ
BS 711 775 RR2FE25TF
BS 776 921 RR2A033TF
BS 922 922 RR2GP56JQ
BS 923 1196 RR2A033TF
BS 1197 1211 RR2FE25JQ

RD RR2GP56TF 386 0 0
ACGTTCTATAGGATTTGGAAGAAAAAAACCACAGAAGATTTTCAATCTCTTCCTTACGTG
GTGGCGCTCTTTAGCGCGATGCTTTGGCTCTATTATGCTACTCAGAAGAAAGATGTCTTC
CTTCTCGTCACCATCAACTCCTTTGGTTGCTTCATCGAAACCATCTACATCGCCATATTC
GTTGCCTTCGCCACCAAGAAAGCGCGAATGTTAACGGTGAAGCTCTTGTTGCTAATGAAC
TTTGGAGGATTCTGTCTGATTCTCCTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGGGTTCCACACG
TGCGAAGATTATCGGAGGAATCTGTGTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCT
TAGCATTATCAGAACGGTGATAA
GAC

QA 1 383 1 383
DS 

RD RR2CW39TF 699 0 0
C
GCCATAAGCTTTTAATTAAAGAGAAACACTTACAAAGCTTATATCTCTCTTACCTCGAAG
AGTTCGTCTTCTCCCTCCTATACAAATAAAGACCTAAATTATTCTTCCTACCAAAAAAAA
ACTCTAAAACCATGGCTATCTTCAACACTCAAAACACATGGGCCTTCGCCTTCGGCTTGC
TCGGAAACATCATTTCCTTTGCTGTTTTCCTCTCCCCCGTGCCAACGTTCTATAGGATTT
GGAAGAAAAAAACCACAGAAGATTTTCAATCTCTTCCTTACGTGGTGGCGCTCTTTAGCG
CGATGCTTTGGCTCTATTATGCTACTCAGAAGAAAGATGTCTTCCTTCTCGTCACCATCA
ACTCCTTTGGTCGCTTCATCGAAACCATCTACATCGCCATATTCGTTGCCTTCGCCACCA
AGAAAGCGCGAATGTTAACGGTGAAGCTCTTGTTGCTAATGAACTTTGGAGGATTCTGTC
TGATTCTCCTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGG*TTCCACACGTGCGAAGATTATCGGA
GGAATCTGTGTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCAGAACG
GTGATAAAGACAAAA*GTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTACAATC
AGTGCGGTCGTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAG

QA 2 699 2 699
DS 

RD RR2FE25TF 775 0 0
GGGGTGCCATAAGCTTTTAATTAAAGAGAAACACTTACAAAGCTTATATCTCTCTTACCT
CGAAGAGTTCGTCTTCTCCCTCCTATACAAATAAAAACCTAAATTATTCTTCCTACCAAA
AAAAAACTCTAAAACCATGGCTATCTTCAACACTCAAAACACATGGGCCTTCGCCTTCGG
CTTGCTCGGAAACATCATTTCCTTTGCTGTTTTCCTCTCCCCCGTGCCAACGTTCTATAG
GATTTGGAAGAAAAAAACCACAGAAGATTTTCAATCTCTTCCTTACGTGGTGGCGCTCTT
TAGCGCGATGCTTTGGCTCTATTATGCTACTCAGAAGAAAGATGTCTTCCTTCTCGTCAC
CATCAACTCCTTTGGTTGCTTCATCGAAACCATCTACATCGCCATATTCGTTGCCTTCGC
CACCAAGAAAGCGCGAATGTTAACGGTGAAGCTCTTGTTGCTAATGAACTTTGGAGGATT
CTGTCTGATTCTCCTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGG*TTCCACACGTGCGAAGATTA
TCGGAGGAATCTGTGTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCA
GAACGGTGATAAAGACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTA
CAATCAGTGCGGTCGTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAGGGATATCTACGTTGCTT
TCCCGAACGTGATTGGGTTTGTTCTCGGTGCACTTCAAATGATACTTTACGTGGT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2GP56JQ 699 0 0
TCTGCCAATTCTTAGCAAAAGG*TTCCACACGTGCGAAGATTATCGGAGGAATCTGTGTC
GGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCAGAACGGTGATAAAGACA
AAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTACAATCAGTGCGGTCGTA
TGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAGGGATATTTACGTTGCTTTCCCGAACGTGATTGGG
TTTGTTCTCGGTGCACTTCAAATGATACTTTACGTGGTTTTCAAATACTGCAAAACGCCG
TCGGATTTGGTGGAGAAAGAACTCGAAGCCGCTAAGTTGCCGGAGGTGAGTATTGATATG
CTGAAGCTAGGGACATTGGCATCTCCTGAAGCAGCAGAGATCACAGTCGTACCAACTGCG
AACAAGTGTATATGTAATGATCGGAAGACTGAAACTGAAAATGGACAGCGAGTTAAAAAC
GGCAAACACTCCACTGCAGCTTGTTAAAAAACAGAAAAACTGTTTGCCTATCTTTTGCAT
TGTTGACTTTGTACTCTATCTTAATATCATCATCTACGTGTGCCAAGTCGAGGATTAATT
ATCTCGGGAATTACATTATCCTGAGTTGATTTTTCCCTTCTTCTTTTAATTACTAGTGTA
ACTAAATTATCTGTTGGATATGAATATCCCCTTATTTTC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2CW39JQ 612 0 0
GCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCAGAACGGTGATAAAGACAAAAAGTGTGGAGT
ACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTACAATCAGTGCGGTCGTATGGCTTCTTTATG
GTCTTGCTCTTAGGGATATTTACGTTGCTTTCCCGAACGTGATTGGGTTTGTTCTCGGTG
CACTTCAAATGATACTTTACGTGGTTTTCAAATACTGCAAAACGCCGTCGGATTTGGTGG
AGAAAGAACTCGAAGCCGCTAAGTTGCCGGAGGTGAGTATTGATATGCTGAAGCTAGGGA
CATTGGCATCTCCTGAAGCAGCAGAGATCACAGTCGTACCAACTGCGAACAAGTGTATAT
GTAATGATCGGAAGACTGAAACTGAAAATGGACAGCGAGTTAAAAACGGCAAACACTCCA
CTGCAGCTTGTTAAAAAACAGAAAAACTGTTTGCCTATCTTTTGCATTGTTGACTTTGTA
CTCTATCTTAATATCATCATCTACGTGTGCCAAGTCGAGGATTAATTATCTCGGGAATTA
CATTATCCTGAGTTGATTTTTCCCTTCTTCTTTTAATTACTAGTGTAACTAAATTATCTG
TTGGATATGAAT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2A033TF 647 0 0
G
GTGTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCAGAACGGTGATAA
AGACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTACAATCAGTGCGG
TCGTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAGGGATATCTACGTTGCTTTCCCGAACGTGA
TTGGGTTTGTTCTCGGTGCACTTCAAATGATACTTTACGTGGTTTTCAAATACTGCAAAA
CGCCGTCGGATTTGGTGGAGAAAGAACTCGAAGCCGCTAAGTTGCCGGAGGTGAGTATTG
ATATGCTGAAGCTAGGGACATTGGCATCTCCTGAAGCAGCAGAGATCACAGTCGTACCAA
CTGCGAACACGTGTATATGTAATGATCGGAAGACTGAAACTGAAAATGGACAGCGAGTTA
AAAACGGCAAACACTCCACTGCAGCTTGTTAAAAAACAGAAAAACTGTTTGCCTATCTTT
TGCATTGTTGACTTTGTACTCTATCTTAATATCATCATCTACGTGTGCCAAGTCGAGGAT
TAATTATCTCGGGAATTACATTATCCTGAGTTGATTTTTCCCTTCTTCTTTTAATTACTA
GTGTAACTAAATTATCTGTTGGATATGAATATCACCTTATTTTC
CC

QA 2 645 2 645
DS 

RD RR2FE25JQ 610 0 0
AACGGTGATAAAGACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTAC
AATCAGTGCGGTCGTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAGGGATATTTACGTTGCTTT
CCCGAACGTGATTGGGTTTGTTCTCGGTGCACTTCAAATGATACTTTACGTGGTTTTCAA
ATACTGCAAAACGCCGTCGGATTTGGTGGAGAAAGAACTCGAAGCCGCTAAGTTGCCGGA
GGTGAGTATTGATATGCTGAAGCTAGGGACATTGGCATCTCCTGAAGCAGCAGAGATCAC
AGTCGTACCAACTGCGAACAAGTGTATATGTAATGATCGGAAGACTGAAACTGAAAATGG
ACAGCGAGTTAAAAACGGCAAACACTCCACTGCAGCTTGTTAAAAAACAGAAAAACTGTT
TGCCTATCTTTTGCATTGTTGACTTTGTATTCTATCTTAATATCATCATCTACGTGTGCC
AAGTCGAGGATTAATTATCTCGGGAATTACATTATCCTGAGTTGATTTTTCCCTTCTTCT
TTTAATTACTAGTGTAACTAAATTATCTGTTGGATATGAATATCACCTTATTTTCCCGTT
GAAAGGTTAT

QA 1 610 1 610
DS 



AS 2 10

CO CL633Contig1 791 4 12 U
GGACATTAAATCTTAAAATAAGAAAGAGAGATAGAGAGAAAGGTGCGCAAGAGATGGAGA
TGGAGAAGTACAAGCCGGTGATGGCGTTAGTGCTGCTACAGTTCACATCTGCAGGAGTTG
CACTCTTCACCAAAGCTGCTTTCATGGAAGGACTCAACCCCACTGTCTTCGTAGTTTACC
GTCAAGCTATCGCTACTCTCTTCATCTGTCCCATCTCTTTCTTCTCCGCTTGGAGCAAAA
CAAGCAAACCTTCTCTTGGACTAAGAGGCTTTTGGTGGGTGGCTTTCACAGCTGTTTTTG
GTGTTACTGTGAATCAGAACGCTTATTTTAAAGGACTTGACTTATCTTCTTCATCCATGG
CTTGTGCCATGACCAATCTAATTCCTGCTGTCACCTTCATCATCTCCATCATTGTTGGAT
TCGAGAGGATAAAGAGGAGAAGTTTGAAAAGTGTAGCAAAGATAATAGGAACAGGTGTGT
GTGTGGGAGGAGCCATGGCAATGACTTTTCTAAGAGGACCTAAACTGCTCAACGCCCTGT
TAAACCAAGACAACGACACCACTTGGTTACTCGGTTGCTTATGTCTTCTCGTCAGCACAT
TTTCTTGGTCCTCCTGGTTGATCCTTCACGTTCCAATTGCTAATCATTGTCATGATCACT
TGTACACTTCATCCTGGACTTGTTTCTTGGCTACCATAGCCTCTTTCTTCATGGCTCTCG
CCTTAGAAAACTGACTTAACGTCCTGGAAGCTTGATTCCTCATTGAAACTCTCCTGCTGC
ATATACTCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 0 0 0 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR83TF U 1
AF RR2H659TF U 7
AF RR2F160TF U 1
AF RR2CH35TF U 1
BS 1 262 RR2AR83TF
BS 263 263 RR2CH35TF
BS 264 625 RR2AR83TF
BS 626 670 RR2CH35TF
BS 671 671 RR2F160TF
BS 672 721 RR2CH35TF
BS 722 722 RR2F160TF
BS 723 726 RR2CH35TF
BS 727 727 RR2F160TF
BS 728 728 RR2CH35TF
BS 729 729 RR2F160TF
BS 730 791 RR2CH35TF

RD RR2AR83TF 625 0 0
GGACATTAAATCTTAAAATAAGAAAGAGAGATAGAGAGAAAGGTGCGCAAGAGATGGAGA
TGGAGAAGTACAAGCCGGTGATGGCGTTAGTGCTGCTACAGTTCACATCTGCAGGAGTTG
CACTCTTCACCAAAGCTGCTTTCATGGAAGGACTCAACCCCACTGTCTTCGTAGTTTACC
GTCAAGCTATCGCTACTCTCTTCATCTGTCCCATCTCTTTCTTCTCCGCTTGGAGCAAAA
CAAGCAAACCTTCTCTTGGACTGAGAGGCTTTTGGTGGGTGGCTTTCACAGCTGTTTTTG
GTGTTACTGTGAATCAGAACGCTTATTTTAAAGGACTTGACTTATCTTCTTCATCCATGG
CTTGTGCCATGACCAATCTAATTCCTGCTGTCACCTTCATCATCTCCATCATTGTTGGAT
TCGAGAGGATAAAGAGGAGAAGTTTGAAAAGTGTAGCAAAGATAATAGGAACAGGTGTGT
GTGTGGGAGGAGCCATGGCAATGACTTTTCTAAGAGGACCTAAACTGCTCAACGCCCTGT
TAAACCAAGACAACGACACCACTTGGTTACTCGGTTGCTTATGTCTTCTCGTCAGCACAT
TTTCTTGGTCCTCCTGGTTGATCCT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2H659TF 619 0 0
G
AAATCTTAAAATAAGAAAGAGAGATAGAGAGAAAGGTGCGCAAGAGATGGAGATGGAGAA
GTACAAGCCGGTGATGGCGTTAGTGCTGCTACAGTTCACATCTGCAGGAGTTGCACTCTT
CACCAAAGCTGCTTTCATGGAAGGACTCAACCCCACTGTCTTCGTAGCTTACCGTCAAGC
TATCGCTACTCTCTTCATCTGTCCCATCTCTTTCTTCTCCGCTTGGAGCAAAACAAGCAA
ACCTTCTCTTGGACTAAGAGGCTTTTGGTGGGTGGCTTTCACAGCTGTTTTTGGTGTTAC
TGTGAATCAGAACGCTTATTTTAAAGGGCTTGACTTATCTTCTTCATCCATGGCTTGTGC
CATGACCAATCTTATTCCTGCTGTCACCTTCATCATCTCCATCATTGTTGGATTCGAGAG
GATAAAGAGTAGAAGTTTGAAAAGTGTAGCAAAGATAATAGGAACAGGTGTGTGTGTGGG
AGGAGCCATGGCAATGACTTTTCTAAGAGGACCTAAACTGCTCAACGCCCTGTTAAACCA
AGACAACGACACCACTTGGTTACTCGGTTGCTTATGTCTTCTCGTCAGCACATTTTCTTG
GTCCTCCTGGTTGATCCT

QA 2 619 2 619
DS 

RD RR2F160TF 731 0 0
GGACATT
AAATCTTAAAATAAGAAAGAGAGATAGAGAGAAAGGTGCGCAAGAGATGGAGATGGAGAA
GTACAAGCCGGTGATGGCGTTAGTGCTGCTACAGTTCACATCTGCAGGAGTTGCACTCTT
CACCAAAGCTGCTTTCATGGAAGGACTCAACCCCACTGTCTTCGTAGTTTACCGTCAAGC
TATCGCTACTCTCTTCATCTGTCCCATCTCTTTCTTCTCCGCTTGGAGCAAAACAAGCAA
ACCTTCTCTTGGACTGAGAGGCTTTTGGTGGGTGGCTTTCACAGCTGTTTTTGGTGTTAC
TGTGAATCAGAACGCTTATTTTAAAAGACTTGACTTATCTTCTTCATCCATGGCTTGTGC
CATGACCAATCTAATTCCTGCTGTCACCTTCATCATCTCCATCATTGTTGGATTCGAGAG
GATAAAGAGGAGAAGTTTGAAAAGTGTAGCAAAGATAATAGGAACAGGTGTGTGTGTGGG
AGGAGCCATGGCAATGACTTTTCTAAGAGGACCTAAACTGCTCAACGCCCTGTTAAACCA
AGACAACGACACCACTTGGTTACTCGGTTGCTTATGTCTTCTCGTCAGCACATTTTCTTG
GTCCTCCTGGTTGATCCTTCAGGTTCCAATTGCTAATCATTGTCATGATCACTTGTACAC
TTCATCCTGGACTTGTTTCTTGGCTACCATAGCCTCTTTCTTCATGGCTCTCGCCTTAGA
CAAC

QA 8 731 8 731
DS 

RD RR2CH35TF 791 0 0
GGACATT
AAATCTTAAAATAAGAAAGAGAGATAGAGAGAAAGGTGCGCAAGAGATGGAGATGGAGAA
GTACAAGCCGGTGATGGCGTTAGTGCTGCTACAGTTCACATCTGCAGGAGTTGCACTCTT
CACCAAAGCTGCTTTCATGGAAGGACTCAACCCCACTGTCTTCGTAGTTTACCGTCAAGC
TATCGCTACTCTCTTCATCTGTCCCATCTCTTTCTTCTCCGCTTGGATCAAAACAAGCAA
ACCTTCTCTTGGACTAAGAGGCTTTTGGTGGGTGGCTTTCACAGCTGTTTTTGGTGTTAC
TGTGAATCAGAACGCTTATTTTAAAGGGCTTGACTTATCTTCTTCATCCATGGCTTGTGC
CATGACCAATCTTATTCCTGCTGTCACCTTCATCATCTCCATCATTGTTGGATTCGAGAG
GATAAAGAGTAGAAGTTTGAAAAGTGTAGCAAAGATAATAGGAACAGGTGTGTGTGTGGG
AGGAGCCATGGCAATGACTTTTCTAAGAGGACCTAAACTGCTCAACGCCCTGTTAAACCA
AGACAACGACACCACTTGGTTACTCGGTTTCTTATGTCTTCTCGTCAGCACATTTTCTTG
GTCCTCCTGGTTGATCCTTCACGTTCCAATTGCTAATCATTGTCATGATCACTTGTACAC
TTCCTCCTGGACTTGTTTCTTGGCTACCATAGCCTCTTTCTTCATGGCTCTCGC*TTAGC
ACACTGACTTAACGTCCTGGAAGCTTGATTCCTCATTGAAACTCTCCTGCTGCATATACT
CTGG

QA 8 791 8 791
DS 



CO CL633Contig2 820 6 6 U
CTGTGAAACAAGTGCCCATTTCATTTTTACTCTGTCAAAAACTTATCCTTACACCCATCT
AGAATTTTGACTTTTGATGTGAGTTTACATGAGAAGAGGTTCTAAGAGCTCAGAACTACT
AAAAGCCCTGTCGCCAATCAGAATGGGAACAAAGTCAGATTGGGAGGTAGTGCTGTATTC
ATTTTGCAGTTTCAGGTCTGTTGCTTCTTCTTGATAGTCTTCGGTTTTGCCCCATAGAAC
AACGTAGAGACCAAAGATGATAGCCAAAGCCCCCAGCAAGCTCCCAAGGTAAGTCTTCTC
TTTTAGATACAGAGCGCCGAAGAAAGTGACAATGACAGTAGAAAGAGGGTTGAAGAGTGC
AGAGAAAAGAGGTCCTTTCCGCGACACGCACCAAGCTTGTAGAAAGAAAGACACTGCCAA
CTGGAGTCCAGAGTATATGCAGCAGGAGAGTTTCAATGAGGAATCAAGCTTCCAGGACGT
TAAGTCAGTGTTGCCTAAGGCGAGAGCCATGAAGAAAGAGGCTATGGTAGCCAAGAAACA
AGTCCAGGAGGAAGTGTACAAGTGATCATGACAATGATTAGCAATTGGAACCTGAAGGAT
CAACCAGGAGGACCAAGAAAATGTGCTGACGAGAAGACATAAGCAACCGAGTAACCAAGT
GGTGTCGTTGTCTTGGTTTAACAGGGCGTTGAGCAGTTTAGGTCCTCTTAGAAAAGTCAT
TGCCATGGCTCCTCCCACACACACACCTGTTCCTATTATCTTTGCTACACTTTTCAAACT
TCTACTCTTTATCCTCTCGAATCCAACAATGATGGAGATG


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 5 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 
40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 5 
5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2H659JQB U 4
AF RR2DE33JQ U 3
AF RR2CT21JQ U 1
AF RR2AR83JQ U 3
AF RR2CT21TF C 61
AF RR2F160JQ U 47
BS 1 481 RR2CT21JQ
BS 482 482 RR2H659JQB
BS 483 607 RR2CT21JQ
BS 608 608 RR2H659JQB
BS 609 798 RR2CT21JQ
BS 799 820 RR2AR83JQ

RD RR2H659JQB 677 0 0
C
GAAACAAGTGCCCATTTCATTTTTACTCTGTCAAAAACTTATCCTTACACCCATCTAGAA
TTTTGACTTTTGATGTGAGTTTACATGAGAAGAGGTTCTAAGAGCTCAGAACTACTAAAA
GCCCTGTCGCCAATCAGAATGGGAACAAAGTCAGATTGGGAGGTAGTGCTGTATTCATTT
TGCAGTTTCAGGTCTGTTGCTTCTTCTTGATAGTCTTCGGTTTTGCCCCATAGAACAACG
TAGAGACCAAAGATGATAGCCAAAGCCCCCAGCAAGCTCCCAAGGTAAGTCTTCTCTTTT
AGATACAGAGCGCCGAAGAAAGTGACAATGACAGTAGAAAGAGGGTTGAAGAGTGCAGAG
AAAAGAGGTCCTTTCCGCGACACGCACCAAGCTTGTAGAAAGAAAGACACTGCCAACTGG
AGTCCAGAGTATATGCAGCAGGAGAGTTTCAATGAGGAATCAAGCTTCCAGGACGTTAAG
TCAGTGTTGCCTAAGGCGAGAGCCATGAAGAAAGAGGCTATGGTAGCCAAGAAACAAGTC
CAGGGGGAAGTGTACAAGTGATCATGACAATGATTAGCAATTGGAACCTGAAGGATCAAC
CAGGAGGACCAAGAAAATGTGCTGACGAGAAGACATAAGCAACCGAGTAACCAAGTGGTG
TCGTTGTCTTGGTTTA

QA 2 677 2 677
DS 

RD RR2DE33JQ 678 0 0
GT
GAAACAAGTGCCCATTTCATTTTTACTCTGTCAAAAACTTATCCTTACACCCATCTAGAA
TTTTGACTTTTGATAAGAGTTTACATGAGAAGAGGTTCTAAGAGCTCAGAACTACTAAAA
GCCCTATCGCCAATCAGAATGGGAACAAAGTCAGATTGGGAGCTAGTGCTGTGTTCATTT
TGCAGTTTCAGGTCTGTTGCTTCTTCTTGATAGTCTTCGGTTTTGCCCCAGAGAACAATG
TAGAGACTAACGATGATAGCCAAAGCCCCCAGCAAGCTCCCAAGGTAAGTCTTCTCGTTT
AGATACAGAGCGCCGAAGAAAGTGACAATGACCGTAGAAAGAGGGTTGAAGAGTGCAGAG
AAAAGAGGTCCTTTCCGCGACACGCACCAAGCTTGTAGAAAGAAAGACACTGCGAGTTGG
AGTCCAGAGTAAATGCAGCAGGAGAGTTTCAACGAGGAATCAAGCTTCCAGGACGTAAAG
TCAGTGTTGCCTAAGGCGAGAGCCATGAAGAAAGAGGCTATGGTAGCCAAGGAACAAGTC
CAGGAGGAAGTGTACAAGTGATCATGACAATGATTAGCAATTGGAACCTGAAGGATCAAC
CAGGAGGACCAAGAAAATGTGCTGACGAGAAGACATAAGCAACCGAGTAACCAAGTGGTG
TCGTTGTCTTGGTTTA

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR2CT21JQ 798 0 0
CTGTGAAACAAGTGCCCATTTCATTTTTACTCTGTCAAAAACTTATCCTTACACCCATCT
AGAATTTTGACTTTTGATGTGAGTTTACATGAGAAGAGGTTCTAAGAGCTCAGAACTACT
AAAAGCCCTGTCGCCAATCAGAATGGGAACAAAGTCAGATTGGGAGGTAGTGCTGTATTC
ATTTTGCAGTTTCAGGTCTGTTGCTTCTTCTTGATAGTCTTCGGTTTTGCCCCATAGAAC
AACGTAGAGACCAAAGATGATAGCCAAAGCCCCCAGCAAGCTCCCAAGGTAAGTCTTCTC
TTTTAGATACAGAGCGCCGAAGAAAGTGACAATGACAGTAGAAAGAGGGTTGAAGAGTGC
AGAGAAAAGAGGTCCTTTCCGCGACACGCACCAAGCTTGTAGAAAGAAAGACACTGCCAA
CTGGAGTCCAGAGTATATGCAGCAGGAGAGTTTCAATGAGGAATCAAGCTTCCAGGACGT
TGAGTCAGTGTTGCCTAAGGCGAGAGCCATGAAGAAAGAGGCTATGGTAGCCAAGAAACA
AGTCCAGGAGGAAGTGTACAAGTGATCATGACAATGATTAGCAATTGGAACCTGAAGGAT
CAACCAG*AGGACCAAGAAAATGTGCTGACGAGAAGACATAAGCAACCGAGTAACCAAGT
GGTGTCGTTGTCTTGGTTTAACAGGGCGTTGAGCAGTTTAGGTCCTCTTAGAAAAGTCAT
TGCCATGGCTCCTCCCACACACACACCTGTTCCTATTATCTTTGCTACACTTTTCAAACT
TCTACTCTTTATCCTCTC

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2AR83JQ 818 0 0
GT
GAAACAAGTGCCAATTTCATTTTTACTCTGTCAAAAACTTATCCTTACACCCATCTAGAA
TTTTGACTTTTGATAAGAGTTTACATGAGAAGAGGTTCTAAGAGCTCAGAACTACTAAAA
GCCCTGTCGTCAATCATAATGGGAACAAAGTCAGATTGGGAGCTAGTGCTGTGTTCATTT
TGCAGTTTCAGGTCTGTTGCTTCTTCTTGATAGTCTTCGGTTTTGCCCCAGAGAACAATG
TAGAGACCAACGATGATAGCCAAAGCCCCCAGCAAGCTCCCAAGGTAAGTCTTCTCGTTT
AGATACAGAGCGCCGAAGAAAGTGACAATGACCGTAGAAAGAGGGTTGAAGAGTGCAGAG
AAAAGAGGTCCTTTCCGCGACACGCACCAAGCTTGTAGAAAGAAAGACACTGCGAGTTGG
AGTCCAGAGTATATGCAGCAGGAGAGTTTCAACGAGGAATCAAGCTTCCAGGACGTTAAG
TCAGTGTTGCCTAAGGCGAGAGCCATGAAGAAAGAGGCTATGGTAGCCAAGAAACAAGTC
CAGGATGAAGTGTACAAGTGATCATGACAATGATTAGCAATTGGAACCTGAAGGATCAAC
CAGGAGGACCAAGAAAATGTGCTGACGAGAAGACATAAGCAACCGAGTAACCAAGTGGTG
TCGTTGTCTTGGTTTAACAGGGCGTTGAGCAGTTTAGGTCCTCTTAGAAAAGTCATTGCC
ATGGCTCCTCCCACACACACACCTGTTCCTATTATCTTTGCTACACTTTTCAAACTTCTC
CTCTTTATCCTCTCGAATCCAACAATGATGGAGATG

QA 3 818 3 818
DS 

RD RR2CT21TF 751 0 0
TAG
ATTTTGACTTTTGATGTGAGTT*ACATGAGAAGAGGTTCTAAGAGCTCAGAACTACTAAA
AGCCCTGTCGCCAATCAGAATGGGAACAAAGTCAGATTGGGAGGTAGTGCTGTATTCATT
TTGCAGTTTCAGGTCTGTTGCTTCTTCTTGATAGTCTTCGGTTTTGCCCCATAGAACAAC
GTAGAGACCAAAGATGATAGCCAAAGCCCCCAGCAAGCTCCCAAGGTAAGTCTTCTCTTT
TAGATACAGAGCGCCGAAGAAAGTGACAATGACAGTAGAAAGAGGGTTGAAGAGTGCAGA
GAAAAGAGGTCCTTTCCGCGACACGCACCAAGCTTGTAGAAAGAAAGACACTGCCAACTG
GAGTCCAGAGTATATGCAGCAGGAGAGTTTCAATGAGGAATCAAGCTTCCAGGACGTTGA
GTCAGTGTTGCCTAAGGCGAGAGCCATGAAGAAAGAGGCTATGGTAGCCAAGAAACAAGT
CCAGGAGGAAGTGTACAAGTGATCATGACAATGATTAGCAATTGGAACCTGAAGGATCAA
CCAG*AGGACCAAGAAAATGTGCTGACGAGAAGACATAAGCAACCGAGTAACCAAGTGGT
GTCGTTGTCTTGGTTTAACAGGGCGTTGAGCAGTTTAGGTCCTCTTAGAAAAGTCATTGC
CATGGCTCCTCCCACACACACACCTGTTCCTATTATCTTTGCTACACTTTTCAAACTTCT
ACTCTTTATCCTCTCGAATCCAACAAT
C

QA 4 750 4 750
DS 

RD RR2F160JQ 774 0 0
CCTTACACCCATCTAGAATTTTGACTTTTGATAAGAGTTTACATGAGAAGAGGTTCTAAG
AGCTCAGAACTACTAAAAGCCCTGTCGCCAATCATAATGGGAACAAAGTCAGATTGGGAG
CTAGTGCTGTGTTCATTTTGCAGTTTCAGGTCTGTTGCTTCTTCTTGATAGTCTTCGGTT
TTGCCCCAGAGAACAATGTAGAGACCAACGATGATAGCCAAAGCCCCCAGCAAGCTCCCA
AGGTAAGTCTTCTCGTTTAGATACAGAGCGCCGAAGAAAGTGACAATGACCGTAGAAAGA
GGGTTGAAGAGTGCAGAGAAAAGAGGTCCTTTCCGCGACACGCACCAAGCTTGTAGAAAG
AAAGACACTGCGAGTTGGAGTCCAGAGTATATGCAGCAGGAGAGTTTCAACGAGGAATCA
AGCTTCCAGGACGTTAAGTCAGTGTTGTCTAAGGCGAGAGCCATGAAGAAAGAGGCTATG
GTAGCCAAGAAACAAGTCCAGGATGAAGTGTACAAGTGATCATGACAATGATTAGCAATT
GGAACCTGAAGGATCAACCAGGAGGACCAAGAAAATGTGCTGACGAGAAGACATAAGCAA
CCGAGTAACCAAGTGGTGTCGTTGTCTTGGTTTAACAGGGCGTTGAGCAGTTTAGGTCCT
CTTAGAAAAGTCATTGCCATGGCTCCTCCCACACACACACCTGTTCCTATTATCTTTGCT
ACACTTTTCAAACTTCTCCTCTTTATCCTCTCGAATCCAACAATGATGGAGATG

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 6

CO CL634Contig1 1159 6 16 U
CTAATAATAATGTCTCTATTGTTTCACTCAGTCCATCAATTGTGAAAACTAAAGTCTCAA
TGTTTAGATCTCTTTAGAGAGAGAGAAAAACAAGAATGATGTAGGACTCATGAGTCTGAT
CAAAATCAAATTATTCAAGCTCATAACTGGACACATTGCATTTGCAAGATATGATTGTTA
AACTGTTCAGAATAGTGAAAGCTCTCCAGCATCAACGGATCTCTTGACAAGCTTAGCCCA
TGATTCATTTGTTTCATGGATGATCTTCAAAGCATAGTCTTTGTTTGCTGGTTTGTCTCC
AAGACCAAACCTGTTAGCAGGCTTTCCATCTGGGATCTTGTAGTCTCTAAACCAGTCTCT
AATGGCTGTTAATGTACCCGGGAAATGTTTCTCAACATCATCAACATCATTGACAAGATG
AGCTTTTGGGTCATCCAAAGAAATGGCAACAATCTTCCAGTCTAGCTCTCCTTCATCAAT
CATAGCCAAAGCAGCCAAAGGCTTGATCTTTAGAACCTCGCCTATCTTCCTTTGAGCCTC
CCCAATCTCAACAACATCAACTGGATCATTATCACCAAAAGCTCCTTCAACTTCAGAGTT
AGCGTGAGATGGATCTTCCCATGTCTGTGGAAGCAACCCATAGTTCCAGTTTATGTTGTA
CGGATAGTATCTGAGCTTGCCCTTCTTAGTGTCTTGCTTAATAGGAGTGAAGTCTTCATC
AGTAGCAACCTCCATCTTTGCTTTAGACTCTTTAGGGATCTCAACTATAAAGTTGAAAAC
TCCATCTCCTAAGGTCAACGGTATATCATGCCATGGAGAAACCTTCTTTCCGGAACCATC
GAGGAAGAAAACACGATAATCAAGGGTTTCGGATTGACCATCTTCTTGAACCTTGACCTG
AGGATTGTAAATGGCAGTGCAAGAGAAGGGTCGCTGCTTCTTCGATTTCAACACCAAAGC
TGCTCTTCTGTTGAAGGAGAGAGCGCCGCATGATGATGTCTTGGCAGGGAGAAGGAAAGC
TCGTTTCGAGAGGAAACAGGAGGTGGGTTGTGTAGCTGCAGTGATCACTCTTGTGGCTGC
CATTTCTGTGGAGAGATTGAAAAAAAAAAGGGAGTAGTTGATGGATGGCCTTTCGTTTCA
CTCGCTGGCTCTCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H311JQ U 349
AF RR2DN06TF C 1
AF RR2AQ26JQ U 69
AF RR2F749JQ U 89
AF RR2H311TF C 551
AF RR2AQ26TF C 373
BS 1 77 RR2DN06TF
BS 78 189 RR2AQ26JQ
BS 190 190 RR2F749JQ
BS 191 276 RR2AQ26JQ
BS 277 277 RR2F749JQ
BS 278 416 RR2AQ26JQ
BS 417 417 RR2F749JQ
BS 418 484 RR2AQ26JQ
BS 485 485 RR2H311JQ
BS 486 512 RR2AQ26JQ
BS 513 513 RR2F749JQ
BS 514 677 RR2AQ26JQ
BS 678 729 RR2F749JQ
BS 730 730 RR2AQ26TF
BS 731 751 RR2F749JQ
BS 752 1159 RR2AQ26TF

RD RR2H311JQ 168 0 0
AAACCAGTCTCTAATGGCTGTTAATGTACCCGGGAAATGTTTCTCAACATCATCAACATC
ATTGACAAAATGAGCTTTTGGGTCATCCAAAAAAATGGCAACAATCTTCCAGTCTAGCTC
TCCTTCATCAATCATAGCCAAAGCAGCCAAAGGCTTGATCTTTA
AAAC

QA 1 164 1 164
DS 

RD RR2DN06TF 688 0 0
CTAATAATAATGTCTCTATTGTTTCACTCAGTCCATCAATTGTGAAAACTAAAGTCTCAA
TGTTTAGATCTCTTTAGAGAGAGAGAAAAACAAGAATGATGTAGGACTCATGAGTCTGAT
CAAAATCAAATTATTCAAGCTCATAACTGGACACATTGCATTTGCAAGATATGATTGTTA
AGCTGTTCAGAATAGTGAAAGCTCTCCAGCATCAACGGATCTCTTGACAAGCTTAGCCCA
TGATTCATTTGTTTCATGGATGATCTTCAAAGCATAGTCTTTGTTTGCTGGTTTGTCTCC
AAGACCAAACCTGTTAGCAGGCTTTCCATCTGGGATCTTGTAGTCTCTAAACCAGTCTCT
AATGGCTGTTAATGTACCCGGGAAATGTTTCTCAACATCATCAACATCATTGACAAGATG
AGCTTTTGGGTCATCCAAAGAAATGGCAACAATCTTCCAGTCTAGCTCTCCTTCATCAAT
CATAGCCAAAGCAGCCAAAGGCTTGATCTTTAGAACCTCGCCTATCTTCCTTTGAGCCTC
CCCAATCTCAACAACATCAACTGGATCATTATCACCAAAAGCTCCTTCAACT**AGAGTT
AGCGTGAGATGGATCTTCCCATGTCTGGGGAAGCAACCCATAGTTCCAGTTTATGTTGTA
CGGATAGTATCTGAGCTTGCCCTTCTT
C

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2AQ26JQ 609 0 0
TCTCTTTAA
AGAGAGAGAAAAACAAGAATGATGTAGGACTCATGAGTCTGATCAAAATCAAATTATTCA
AGCTCATAACTGGACACATTGCATTTGCAAGATATGATTGTTAAACTGTTCAAAATAGTG
AAAGCTCTCCAGCATCAACGGATCTCTTGACAAGCTTAGCCCATGATTCATTTGTTTCAT
GGATGATCTTCAAAGCATAATCTTTGTTTGCTGGTTTGTCTCCAAGACCAAACCTGTTAG
CAGGCTTTCCATCTGGGATCTTGTAGTCTCTAAACCAGTCTCTAATGGCTGTTAATGTAC
CCGGGAAATGTTTCTCAACATCATCAACATCATTGACAAAATGAGCTTTTGGGTCATCCA
AAGAAATGGCAACAATCTTCCAGTCTAGCTCTCCTTCATCAATCATAACCAAAGCAGCCA
AAGGCTTGATCTTTAAAACCTCGCCTATCTTCCTTTGAGCCTCCCCAATCTCAACAACAT
CAACTGGATCATTATCACCAAAAGCTCCTTCAACTTCAGAGTTAGCGTGAGATGGATCTT
CCCATGTCTGTGGAAGCAACCCATAGTTCCAGTTTATGTTGTACGGATAGTATCTGAGCT

QA 10 609 10 609
DS 

RD RR2F749JQ 663 0 0
GG
CAAGAATGATGTAGGACTCATGAGTCTAATCAAAATCAAATTATCCAAGCTCATAACTGG
ACACATTGCATTTGCAAGATATGATTGTTAAACTGTTCAGAATAGTGAAAGGTCTCCAGC
ATCAACGGATCTCTTGACAAGCTTAGCCCATGATTCATTTGTTTCATGGATGATCTTCAA
AGCATAGTCTTTGTTTGCTGGCTTGTCTCCAAGACCAAACCTGTTAGCAGGCTTTCCATC
TGGGATCTTGTAGTCTCTAAACCAGTCCCTAATGGCTGTTAATGTACCCGGGAAATGTTT
CTCAACATCATCAACATCATTGACAAGATGAGCTTTTGGGTCATCCAAAGAAATGGCAAC
AATCTTCCAGTCTAGCTCTCCTTCATCAATCATAGCCAAAGCAGCCAAAGGCTTGATCTT
TAGAACCTCGCCTATCTTCCTTTGAGCCTCCCCAATCTCAACAACATCAACTGGATCATT
ATCACCAAAAGCTCCTTCAACTTCAGAGTTAGCCTGAGATGGATCTTCCCATGTCTGTGG
AAGCAACCCATAGTTCCAGTTTATGTTGTACGGATAGTATCTGAGCTTGCCCTTCTTAGT
GTCTTGCTTAATAGGAGTGAAGTCTTCATCAGTAGCAACTTCCATCTTTGCTTTAGACTC
T

QA 3 663 3 663
DS 

RD RR2H311TF 590 0 0
ACAACATCAACTGGATCATTATCACCAAAAGCTCCTTCAACTTCAGAGTTAGCGTGAGAT
GGATCTTCCCATGTCTGTGGAAGCAACCCATAGTTCCAGTTTATGTTGTACGGATAGTAT
CTGAGCTTGCCCTTCTTAGTGTCCTGCTTAATAGGAGTGAAGTCTTCATCAGTAGCAACC
TCCATCTTTGCTTTAGACTCTTTAGGGATCTCAACTATAAAGTTGAAAACTCCATCTCCT
AAGGTCAACGGTATATCATGCCATGGAGAAACCTTCTTTCCGGAACCATCGAGGAAGAAA
ACACGATAATCAAGGGTTTCGGATTGACCATCTTCTTGAACCTTGACCTGAGGATTGTAA
ATGGCAGTGCAAGAGAAGGGTCGCTGCTTCTTCGATTTCAACACCAAAGCTGCTCTTCTG
TTGAAGGAGAGAGCGCCGCATGATGATGTCTTGGCAGGGAGAAGGAAAGCTCGTTTCGAG
AGGAAACAGGAGGTGGGTTGTGTAGCTGCAGTGATCACTCTTGTGGCTGCCATTTCTGTG
GAGAGATTGAAAAAAAAAAGGGAGTAGTTGATGGATGGCCTTTCGTTTC
C

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2AQ26TF 787 0 0
TGTACCCGGGAAATGTTTCTCAACATCATCAACATCATTGACAAGATGAGCTTTTGGGTC
ATCCAAAGAAATGGCAACAATCTTCCAGTCTAGCTCTCCTTCATCAATCATAGCCAAAGC
AGCCAAAGGCTTGATCTTTAGAACCTCGCCTATCTTCCTTTGAGCCTCCCCAATCTCAAC
AACATCAACTGGATCATTATCACCAAAAGCTCCTTCAACTTCAGAGTTAGCGTGAGATGG
ATCTTCCCATGTCTGTGGAAGCAACCCATAGTTCCAGTTTATGTTGTACGGATAGTATCT
GAGCTTGCCCTTCTTAGTGTCTTGCTTAATAGGAGTGAAGTCTTCATCAGTAGCAACCTC
CATCTTTGCTTTAGACTCTTTAGGGATCTCAACTATAAAGTTGAAAACTCCATCTCCTAA
GGTCAACGGTATATCATGCCATGGAGAAACCTTCTTTCCGGAACCATCGAGGAAGAAAAC
ACGATAATCAAGGGTTTCGGATTGACCATCTTCTTGAACCTTGACCTGAGGATTGTAAAT
GGCAGTGCAAGAGAAGGGTCGCTGCTTCTTCGATTTCAACACCAAAGCTGCTCTTCTGTT
GAAGGAGAGAGCGCCGCATGATGATGTCTTGGCAGGGAGAAGGAAAGCTCGTTTCGAGAG
GAAACAGGAGGTGGGTTGTGTAGCTGCAGTGATCACTCTTGTGGCTGCCATTTCTGTGGA
GAGATTGAAAAAAAAAAGGGAGTAGTTGATGGATGGCCTTTCGTTTCACTCGCTGGCTCT
CTCTCCC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 10

CO CL635Contig1 996 10 20 U
CTAAACACTATTAGATTTCATTGAAACGAACTAGATGTTACACAGGGAGAATTACAGAGC
TAGCGAGTTAAGCAAACTCCTAGAAAGCTTAAGCCAGCAGTAAACAGGACCTTACGCTGG
AGAATAAGACCGACAGAATTAAAGAAATTCTTCGGCAAGTACAACAAACATAATAGTCAC
AAGCTTAAAGTAAAAACTGATCAAAGAACTAGATCATAAACAACAAGACACCCAAGTAAT
GAGATAGACCGAGAGAGGAAGGAAGAGATAAGCGCACACCCATAAGCGAACTTTATTAAG
GGACGTCTGCATCTCGTTATATTGCTCCGGACCACCGCCTGACGAGCCACGAGACATCGC
AGAACCTAAACCCCGGAGGACGAAGAAGACCCAGCTTTTGACATTCGACCTCCACGCAAG
GTGCAAAACGAGCCGAGGCTCCAAATCCTTGAAAACGAGTCGGAAATAGAACTCGGAGAC
GGACAGAAGAACACACCTCTGAGACTGACCCGTCACAAGCGAAACCAAGGATAAGCACAA
CCTCCCAAACTCAGCAATCCATCACAAGAAGCAAGAAATAAACACATGCAGATCAAATCA
ACCCAACAAGATACTTTTGCTCAAACGAGCGAAAAATATATTTTTTGAGATGCAGAGGGT
TCAAAAGCGAGAGGTAGCAAGTTTAGACAGAAAGTCAAACCAGAACCGGAAGTACGATTC
CAAGAGAACCAACGACAAACACTGCTCCTCTCCAAAATCAAGATCTGCAATTCTGG*ATC
TAGAACTACCATCAGAGATACTCAAAGCCTAGATAGATACATGCAAAGTAAAACCGAATG
AGAAATACAAGACCGGACCGACGGCGGCTAACGGAGCCCTCACCGTCGGCCGGAGAAACC
AAAGCAAAGGTTTGTGAACTAGAGAGAAGGTAGAGAAAAAGTTAGAAAGAGAAAAAAATG
GTTTCTGAAGAGTCAGTAAAATTTAGTATTCATTCC


BQ
10 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
50 35 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 25 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2G159JQ U 3
AF RR2GZ04JQ U 1
AF RR2CP60JQ U 3
AF RR2CO45JQ U 3
AF RR2AN06JQ U 3
AF RR2AN06TF C 157
AF RR2CO45TF C 342
AF RR2GZ04TF C 523
AF RR2CP60TF C 266
AF RR2G159TF C 342
BS 1 15 RR2GZ04JQ
BS 16 16 RR2AN06JQ
BS 17 85 RR2GZ04JQ
BS 86 86 RR2AN06JQ
BS 87 171 RR2GZ04JQ
BS 172 172 RR2AN06JQ
BS 173 206 RR2GZ04JQ
BS 207 207 RR2AN06JQ
BS 208 434 RR2GZ04JQ
BS 435 435 RR2AN06JQ
BS 436 439 RR2GZ04JQ
BS 440 440 RR2AN06JQ
BS 441 606 RR2GZ04JQ
BS 607 776 RR2AN06JQ
BS 777 777 RR2CO45JQ
BS 778 863 RR2AN06JQ
BS 864 864 RR2AN06TF
BS 865 884 RR2AN06JQ
BS 885 936 RR2AN06TF
BS 937 996 RR2CP60TF

RD RR2G159JQ 358 0 0
AAACACTATTAGATTTCATTGAAACGAACTAGATGTTACACAGGGAGAATTACAGAGCTA
GCGAGTTAAGCAAACCCCTAGAAAGCTTAAGCCAGCAGTAAACAGGACCTTACGCTGGAG
AATAAGACCGACAGAATTAAAGAAATTCTTCGGCAAGTACAACAAACATAATAGTCACAA
GCTTAAAGTAAAAACTGATCAAAGAACTAGATCATAAACAACAAGACACCCAAGTAATGA
GATAGACCGAGAGAGGAAGGAAGAGATAAGCGCACACCCATAAGCGAACTTTATTAAGGG
ACGTCTGCATCTCGTTATATTGCTCCGGACCACCGCCTGACGAGCCACGAGACATCGC

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR2GZ04JQ 606 0 0
CTAAACACTATTAGACTTCATTGAAACGAACTAGATGTTACACAGGGAGAATTACAGAGC
TAGCGAGTTAAGCAAACTCCTAGAAGGCTTAAGCCAGCAGTAAACAGGACCTTACGCTGG
AGAATAAGACCGACAGAATTAAAGAAATTCTTCGGCAAGTACAACAAACATGATAGTCAC
AAGCTTAAAGTAAAAACTGATCAAAGGACTAGATCATAAACAACAAGACACCCAAGTAAT
GAGATAGACCGAGAGAGGAAGGAAGAGATAAGCGCACACCCATAAGCGAACTTTATTAAG
GGACGTCTGCATCTCGTTATATTGCTCCGGACCACCGCCTGACGAGCCACGAGACATCGC
AGAACCTAAACCCCGGAGGACGAAGAAGACCCAGCTTTTGACATTCGACCTCCACGCAAG
GTGCAAAACGAGCCAAGGCCCCAAATCCTTGAAAACGAGTCGGAAATAGAACTCGGAGAC
GGACAGAAGAACACACCTCTGAGACTGACCCGTCACAAGCGAAACCAAGGATAAGCACAA
CCTCCCAAACTCAGCAATCCATCACAAGAAGCAAGAAATAAACACATGCAGATCAAATCA
ACCCAA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2CP60JQ 715 0 0
G
AACACTATTAGATTTCATTGAAACGAACTAGATGTTACACAGGGAGAATTACAGAGCTAG
CGAGTTAAGCAAACTCCTAGAAAGCTTAAGCCAGCAGTAAACAGGACCTTACGCTGGAGA
ATAAGACCGACAGAATTAAAGAAATTCTTCGGCAAGTACAACAAACATAATAGTCACAAG
CTTAAAGTAAAAACTGATCAAAGAACTAGATCATAAACAACAAGACACCCAAGTAATGAG
ATAGACCGAGAGAGGAAGGAAGAGATAAGCGCACACCCATAAGCGAACTTTATTAAGGGA
CGTCTGCATCTCGTTATATTGCTCCGGACCACCGCCTGACGAGCCACGAGACATCGCAAA
ACCTAAACCCCGGAGGACGAAAAAGACCCAGCTTTTGACATTCGACCTCCACGCAAGGGG
CAAAACGAGCCGAGGCTCCAAATCCTTGAAAACGAGTCGGAAATAGAACTCGGAGACGGA
CAGAAGAACACACCTCTGAAACTGACCCGTCACAAGCGAAACCAAGGGTAAGCACAACCT
CCCAAACTCAGCAATCCATCACAAGAAGCAAGAAATAAACACATGCAGATCAAATCAACC
CAACAAGATACTTTTGCTCAAACGAGCGAAAAATATATTTTTTGAGATGCAGAGGGTACA
AAAGCGAGAGGTAGCAAGTTTAGACAGAAAGTCAAACCAGAACCGGAAGTACGA

QA 2 715 2 715
DS 

RD RR2CO45JQ 819 0 0
AAACACTATTAGATTTCATTGAAACGAACTAGATGTTACACAGGGAGAATTACAGAGCTA
GCGAGTTAAGCAAACTCCTAGAAAGCTTAAGCCAGCAGTAAACAGGACCTTACGCTGGAG
AATAAGACCGACAGAATTAAAGAAATTCTTCGGCAAGTACAACAAACATAATAGTCACAA
GCTTAAAGTAAAAACTGATCAAAGAACTAGATCATAAACAACAAGACACCCAAGTAATGA
GATAGACCGAGAGAGGAAGGAAGAGATAAGCGCACACCCATAAGCGAACTTTATTAAGGG
ACGTCTGCATCTCGTTATATTGCTCCGGACCACCGCCTGACGAGCCACGAGACATCGCAG
AACCTAAACCCCGGAGGACGAAGAAGACCCAGCTTTTGACATTCGACCTCCACGCAAGGG
GCAAAACGAGCCGAGGCTCCAAATCCTTGAAAACGAGTCGGAAATAGAACTCGGAGACGG
ACAGAAGAACACACCTCTGAGACTGACCCGTCACAAGCGAAACCAAGGATAAGCACAACC
TCCCAAACTCAGCAATCCATCACAAGAAGCAAGAAATAAACACATGCAGATCAAATCAAC
CCAACAAGATACTTTTGCTCAAACGAGCGAAAAATATATTTTTTGAGATGCAGAGGGTTC
AAAAGCGAGAGGTAGCAAGTTTAGACAGAAAGTCAAACCAGAACCGGAAGTGCGATTCCA
AGAGAACCAACGACAAACACTGCTCCTCTCCAAAATCAAGATCTGCAATTCTGG*ATCTA
GAACTACCATCAGAGATACTCAAAGCCTAGATAGATACA

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2AN06JQ 882 0 0
AAACACTATTAGATTTCATTGAAACGAACTAGATGTTACACAGGGAGAATTACAGAGCTA
GCGAGTTAAGCAAACTCCTAGAAAGCTTAAGCCAGCAGTAAACAGGACCTTACGCTGGAG
AATGAGACCGACAGAATTAAAGAAATTCTTCGGCAAGTACAACAAACATAATAGTCACAA
GCTTAAAGTAAAAACTGATCAAAGAACTAGATCATAAACAACAAGACACCCAAGTAATGA
GATAGACCGAGAGAGGAAGGAAGAGATAAGCGCACACCCATAAGCGAACTTTATTAAGGG
ACGTCTGCATCTCGTTATATTGCTCCGGACCACCGCCTGACGAGCCACGAGACATCGCAG
AACCTAAACCCCGGAGGACGAAGAAGACCCAGCTTTTGACATTCGACCTCCACGCAAGGT
GCAAACCGAGCCGAGGCTCCAAATCCTTGAAAACGAGTCGGAAATAGAACTCGGAGACGG
ACAGAAGAACACACCTCTGAGACTGACCCGTCACAAGCGAAACCAAGGATAAGCACAACC
TCCCAAACTCAGCAATCCATCACAAGAAGCAAGAAATAAACACATGCAGATCAAATCAAC
CCAACAAGATACTTTTGCTCAAACGAGCGAAAAATATATTTTTTGAGATGCAGAGGGTTC
AAAAGCGAGAGGTAGCAAGTTTAGACAGAAAGTCAAACCAGAACCGGAAGTACGATTCCA
AGAGAACCAACGACAAACACTGCTCCTCTCCAAAATCAAGATCTGCAATTCTGGGATCTA
GAACTACCATCAGAGATACTCAAAGCCTAGATAGATACATGCAAAGTAAAACCGAATGAG
AAATACAAGACCGGACCGACG*CGGCTAACGGAGCCCTCACC

QA 1 882 1 882
DS 

RD RR2AN06TF 780 0 0
AAGTACAACAAACATAATAGTCACAAGCT*AAAGTAAAAACTGATCAAAGAACTAGATCA
TAAACAACAAGACACCCAAGTAATGAGATAGACCGAGAGAGGAAGGAAGAGATAAGCGCA
CACCCATAAGCGAACTTTATTAAGGGACGTCTGCATCTCGTTATATTGCTCCGGACCACC
GCCTGACGAGCCACGAGACATCGCAGAACCTAAACCCCGGAGGACGAAGAAGACCCAGCT
TTTGACATTCGACCTCCACGCAAGGTGCAAACCGAGCCGAGGCTCCAAATCCTTGAAAAC
GAGTCGGAAATAGAACTCGGAGACGGACAGAAGAACACACCTTTGAGACTGACCCGTCAC
AAGCGAAACCAAGGATAAGCACAACCTCCCAAACTCAGCAATCCATCACAAGAAGCAAGA
AATAAACACATGCAGATCAAATCAACCCAACAAGATACTTTTGCTCAAACGAGCGAAAAA
TATATTTTTTGAGATGCAGAGGGTTCAAAAGCGAGAGGTAGCAAGTTTAGACAGAAAGTC
AAACCAGAACCGGAAGTACGATTCCAAGAGAACCAACGACAAACACTGCTCCTCTCCAAA
ATCAAGATCTGCAATTCTGG*ATCTAGAACTACCATCAGAGATACTCAAAGCCTAGATAG
ATACATGCAAAGTAAAACCGAATGAGAAATACAAGACCGGACCGACGGCGGCTAACGGAG
CCCTCACCGTCGGCCGGAGAAACCAAAGCAAAGGTTTGTGAACTAGAGAGAAGGTAGAGA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2CO45TF 617 0 0
ACGAGCCACGAGACATCGCAGAACATAAACCCCGGAGGACGAAGAAGACCCAGCTTTTGA
CATTCGACCTCCACGCAAGGTGCAAAACGAGCCGAGGCTCCAAATCCTTGAAAACGAGTC
GGAAATAGAACTCGGAGACGGACAGAAGAACACACCTCTGAGACTGACCCGTCACAAGCG
AAACCAAGGATAAGCACAACCTCCCAAACTCAGCAATCCATCACAAGAAGCAAGAAATAA
ACACATGCAGATCAAATCAACCCAACAAGATACTTTTGCTCAAACGAGCGAAAAATATAT
TTTTTGAGATGCAGAGGGTTCAAAAGCGAGAGGTAGCAAGTTTAGACAGAAAGTCAAACC
AGAACCGGAAGTGCGATTCCAAGAGAACCAACGACAAACACTGCTCCTCTCCAAAATCAA
GATCTGCAATTCTGG*ATCTAGAACTACCATCAGAGATACTCAAAGCCTAGATAGATACA
TGCAAAGTAAAACCGAATGAGAAATACAAGACCGGACCGACGGCGGCTAACGGAGCCCTC
ACCGTCGGCCGGAGAAACCAAAGCAAAGGTTTGTGAACTAGAGAGAAGGTAGAGAAAAAG
TTAGAAAGAGAAAAAAA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2GZ04TF 436 0 0
AACCAAGGATAAGCACAAC*TCCCAAACTCAGCAATCCATCACAAGAAGCAAGAAATAAA
CACATGCAGATCAAATCAACCCAACAAGATACTTTTGCTCAAACGAGCGAAAAATATATT
TTTTGAGATGCAGAGGGTTCAAAAGCGAGAGGTAGCAAGTTTAGACAGAAAGTCAAACCA
GAACCGGAAGTACGATTCCAAGAGAACCAACGACAAACACTGCTCCTCTCCAAAATCAAG
ATCTGCAATTCTGG*ATCTAGAACTACCATCAGAGATACTCAAAGCCTAGATAGATACAT
GCAAAGTAAAACCGAATGAGAAATACAAGACCGGACCGACGGCGGCTAACGGAGCCCTCA
CCGTCGGCCGGAGAAACCAAAGCAAAGGTTTGTGAACTAGAGAGAAGGTAGAGAAAAAGT
TAGAAAGAGAAAAAAA

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR2CP60TF 731 0 0
AGATAAGCGCACACCCATAAGCGA*CTTA**TAAGGGACGTCTGCATCTCGTTATATTGC
TCCGGACCACCGC*TGACGAGCCACGAGACATCGCAGAAC*TAAACCCCGGAGGACGAAG
AAGACCCAGCTTTTGACATTCGACCTCCACGCAAGGTGCAAAACGAGCCGAGGCTCCAAA
TCCTTGAAAACGAGTCGGAAATAGAACTCGGAGACGGACAGAAGAACACACCTCTGAGAC
TGACCCGTCACAAGCGAAACCAAGGATAAGCACAACCTCCCAAACTCAGCAATCCATCAC
AAGAAGCAAGAAATAAACACATGCAGATCAAATCAACCCAACAAGATACTTTTGCTCAAA
CGAGCGAAAAATATATTTTTTGAGATGCAGAGGGTACAAAAGCGAGAGGTAGCAAGTTTA
GACAGAAAGTCAAACCAGAACCGGAAGTACGATTCCAAGAGAACCAACGACAAACACTGC
TCCTCTCCAAAATCAAGATCTGCAATTCTGG*ATCTAGAACTACCATCAGAGATACTCAA
AGCCTAGATAGATACATGCAAAGTAAAACCGAATGAGAAATACAAGACCGGACCGACGGC
GGCTAACGGAGCCCTCACCGTCGGCCGGAGAAACCAAAGCAAAGGTTTGTGAACTAGAGA
GAAGGTAGAGAAAAAGTTAGAAAGAGAAAAAAATGGTTTCTGAAGAGTCAGTAAAATTTA
GTATTCATTCC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2G159TF 655 0 0
ACGAGCCACGAGACATCGCAGAAC*TAAACCCCGGAGGACGAAGAAGACCCAGCTTTTGA
CATTCGACCTCCACGCAAGGTGCAAAACGAGCCGAGGCTCCAAATCCTTGAAAACGAGTC
GGAAATAGAACTCGGAGACGGACAGAAGAACACACCTCTGAGACTGACCCGTCACAAGCG
AAACCAAGGATAAGCACAACCTCCCAAACTCAGCAATCCATCACAAGAAGCAAGAAATAA
ACACATGCAGATCAAATCAACCCAACAAGATACTTTTGCTCAAACGAGCGAAAAATATAT
TTTTTGAGATGCAGAGGGTTCAAAAGCGAGAGGTAGCAAGTTTAGACAGAAAGTCAAACC
AGAACCGGAAGTACGATTCCAAGAGAACCAACGACAAACACTGCTCCTCTCCAAAATCAA
GATCTGCAATTCTGG*ATCTAGAACTACCATCAGAGATACTCAAAGCCTAGATAGATACA
TGCAAAGTAAAACCGAATGAGAAATACAAGGCCGGACCGACGGCGGCTAACGGAGCCCTC
ACCGTCGGCCGGAGAAACCAAAGCAAAGGTTTGTGAACTAGAGAGAAGGTAGAGAAAAAG
TTAGAAAGAGAAAAAAATGGTTTCTGAAGAGTCAGTAAAATTTAGTATTCATTCC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 10

CO CL636Contig1 558 10 7 U
GGGTACAATACACATAATATACTTTCAAATTAAAAAAAAAAAAGAAAAGAGAAGAAGTAA
AAAA*TTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCCTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGATTGCCGGAAGATTTGCG
AAAACGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATGCATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCT
GCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTCATGCCCTATGCCAAAT
AAATATTACTAGATAACTTTCGGAGATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTAT
AATAAGTTTTCTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTAATTTTTT*GATAA
AAATCAATGAATCTTTTTGATAGTTTAATAATGTAAGAATAACATTAAATTTTATTACAA
TATATTAACCATTTTAAC


BQ
55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 45 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 45 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG65TF U 1
AF RR2F262JQ C 1
AF RR2EC70JQ C 1
AF RR2F262TF U 1
AF RR2G748JQ C 1
AF RR2G748TF U 1
AF RR2EC70TF U 1
AF RR2DJ57JQ C 1
AF RR2DJ57TF U 0
AF RR2H383TF U 1
BS 1 238 RR2AG65TF
BS 239 239 RR2F262TF
BS 240 478 RR2AG65TF
BS 479 501 RR2F262TF
BS 502 507 RR2EC70TF
BS 508 550 RR2DJ57TF
BS 551 558 RR2H383TF

RD RR2AG65TF 478 0 0
GGGTACAATACACATAATATACTTTCAAATTAAAAAAAAAAAAGAAAAGAGAAGAAGTAA
AAAA*TTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCCTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGATTGCCGGAAGATTTGTG
AAAACGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATGCATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCT
GCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTCATGCCCTATGCCAAAT
AAATATTACTAGATAACTTTCGGAGATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTAT
AATAAGTTTTCTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTAATTTTTT*GAT

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2F262JQ 501 0 0
GGGTACAATACACATAATATACTTTCAAATTAAAAAAAAAAAAGAAAAGAGAAGAAGTAA
AAAA*TTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCCTTGTTT
TTATTATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCTAATTTTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGATTGCCGGAAGATTTGGG
AAAACGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGGGATTATGCATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTTT
GCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTCATGCCCTATGCCAAAT
AAATATTACTAGATAACTTTCGGAGATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTAT
AATAAGTTTTTTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTAATTTTTT*GATAA
AAATCAATGAATTTTTTTGAT

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR2EC70JQ 509 0 0
GGGTACAATACACATAATATACTTTCAAATTAAAAAAAAAAA*GAAAAGAGAAGAAGTAA
AAAAATTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCCTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGATTGCCGGAAGATTTGCG
AAAACGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATGCATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCT
GCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTCATGCCCTATGCCAAAT
AAATATTACTAGATAACTTTCGGAGATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTAT
AATAAGTTTTCTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTAATTTTTT*GATAA
AAATCAATGAATCTTTTTGATAGTTTA
TT

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2F262TF 501 0 0
GGGTACAATACACATAATATACTTTCAAATTAAAAAAAAAAAAGAAAAGAGAAGAAGTAA
AAAA*TTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCCTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGATTGCCGGAAGATTTGCG
AAAACGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATGCATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCT
GCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTCATGCCCTATGCCAAAT
AAATATTACTAGATAACTTTCGGAGATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTAT
AATAAGTTTTCTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTAATTTTTT*GATAA
AAATCAATGAATCTTTTTGAT

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR2G748JQ 501 0 0
GGGTACAATACACATAATATACTTTCAAATTAAAAAAAAAAAAGAAAAGAGAAGAAGTAA
AAAA*TTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCCTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGATTGCCGGAAGATTTGCG
AAAACGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATGCATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCT
GCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTCATGCCCTATGCCAAAT
AAATATTACTAGATAACTTTCGGAGATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTAT
AATAAGTTTTCTATATAATTGAAATTTACAACAATTTCGATAAATTAATTTTTT*GATAA
AAATCAATGAATCTTTTTGA
C

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2G748TF 501 0 0
GGGTACAATACACATAATATACTTTCAAATTAAAAAAAAAAAAGAAAAGAGAAGAAGTAA
AAAA*TTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCCTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGATTGCCGGAAGATTTGCG
AAAACGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATGCATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCT
GCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTCATGCCCTATGCCAAAT
AAATATTACTAGATAACTTTCGGAGATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTAT
AATAAGTTTTCTATATAATTGAAATTTACAACAATTTCGATAAATTAATTTTTT*GATAA
AAATCAATGAATCTTTTTGA
C

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2EC70TF 509 0 0
GGGTACAATACACATAATATACTTTCAAATTAAAAAAAAAAA*GAAAAGAGAAGAAGTAA
AAAAATTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCCTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGATTGCCGGAAGATTTGCG
AAAACGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATGCATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCT
GCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTCATGCCCTATGCCAAAT
AAATATTACTAGATAACTTTCGGAGATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTAT
AATAAGTTTTCTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTAATTTTTT*GATAA
AAATCAATGAATCTTTTTGATAGTTTA
TT

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2DJ57JQ 550 0 0
GGGTACAATACACATAATATACTTTCAAATTAAAAAAAAAAA*GAAAAGAGAAGAAGTAA
AAAA*TTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCCTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCA*CAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGTCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGATTGCCGGAAGATTTGCG
AAAACGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATGCATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCT
GCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTCATGCCCTATGCCAAAT
AAATATTACTAGATAACTTTCGGAGATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTAT
AATAAGTTTTCTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTAATTTTTTTGATAA
AAATCAATGAATCTTTTTGATAGTTTAATAATGTAAGAATAACATTAAATTTTATTACAA
TATATTAACC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2DJ57TF 551 0 0
GGA
GTACAATACACATAATATACTTTCAAATTAAAAAAAAAAA*GAAAAGAGAAGAAGTAAAA
AA*TTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCCTTGTTCTT
ATTATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCA*CAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGAGG
CAGTCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGATTGCCGGAAGATTTGCGAA
AACGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATGCATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCTGC
CACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTCATGCCCTATGCCAAATAA
ATATTACTAGATAACTTTCGGAGATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTATAA
TAAGTTTTCTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTAATTTTTTTGATAAAA
ATCAATGAATCTTTTTGATAGTTTAATAATGTAAGAATAACATTAAATTTTATTACAATA
TATTAACC

QA 4 551 4 551
DS 

RD RR2H383TF 558 0 0
GGGTACAATACACATAATATACTTTCAAATTAAAAAAAAAAAAGAAAAGAGAAGAAGTAA
AAAA*TTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCCTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTTG***CACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGATTGCCGGAAGATTTGCG
AAAACGAGAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATGCATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCT
GCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTCATGCCCTATGCCAAAT
AAATATTACTAGATAACTTTCGGAGATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTAT
AATAAGTTTTCTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTAATTTTTT*GATAA
AAATCAATGAATCTTTTTGATAGTTTAATAATGTAAGAATAACATTAAATTTTATTACAA
TATATTAACCATTTTAAC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 7

CO CL637Contig1 814 7 8 U
GGGTTGTGCATTCTATTCCCTTCCACACAAAAAAAAGAGACATTACTTCTCAACTCTCCG
ATATTTTCTCCAAGAGAAATCTAAATTTGCAGTTCCTTTTCACTAGTTCTCGATGCTTTA
GAACTGAAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGATCGTTGGAGACGCGGCTGTGACTGAA
ACAGAGAAGAAATCCGAAAA*TGGAAGCTGGAGGATCCAACGTTAGATCTAGCTACTACA
ACGTCCTCGGTATTCGGAAAGATGCCTCTGTCTCCGATGTCCGCGCTGCTTACCGTAAGC
TCGCCATGAAATGGCATCCGGATAGATACGCGAGGAATCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCA
AACGTCGATTTCAGCAAATCCAAGAAGCCTATTCTGTTTTGAATGACGAGAATAAGCGCT
CGATGTATGACGCTGGACTCTACGATCCCCACGAAGATGACGACGATGACTTCTGCGACT
TCATGCAAGAGATGATCTCAATGATGAACAGTGTCAAAGGCGAGGGAGATAGCTTGGAGG
ACTTGCAACGGATGTTCACGGATATGGTTGGTGGAGATGGCGTGATCTTTGATTGTAACA
ACAATCCTAGGGACAGCAAAAGACCACGTGTTAATATCTCACGGAGTAGTGCTGCGATGC
GTTAGTGCTCTTGTTCTCTTTTGTGTTTGTGTCGTGTCGTTTCGCGTTGAACTGTATCAT
GCTAAGAACTCTCAAGTTCTCAATTGTCATTTC*GTGTTTTATGTTCTAGTGTCAATTCT
GAAGGCTATAAAATAAAATATCTCTGAAGTCTAA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 15 30 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 15 45 45 30 30 45 45 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB44JQ C 27
AF RR2CO50TF U 31
AF RR2G382TF U 25
AF RR2GQ69TF U 1
AF RR2AB44TF U 1
AF RR2CO50JQ C 162
AF RR2GQ69JQ C 444
BS 1 482 RR2AB44TF
BS 483 483 RR2G382TF
BS 484 784 RR2AB44TF
BS 785 785 RR2CO50JQ
BS 786 792 RR2AB44TF
BS 793 793 RR2CO50JQ
BS 794 805 RR2AB44TF
BS 806 814 RR2CO50JQ

RD RR2AB44JQ 689 0 0
ACAAAAAAAAGAGACATTACTTCTCAACTCTCCGATATTTTCTCCAAGAGAAATCTAAAT
TTGCAGTTCCTTTTCACTAGTTCTCGATGCTTTAGAACTGAAGAGTGAGAGAGAGAGAGA
GAGATAGATCGTTGGAGACGCGGCTGTGACTGAAACAGAGAAGAAATCCGAAAA*TGGAA
GCTGGAGGATCCAACGTTAGATCTAGCTACTACAACGTCCTCGGTATTCGGAAAGATGCC
TCTGTCTCCGATGTCCGCGCTGCTTACCGTAAGCTCGCCATGAAATGGCATCCGGATAGA
TACGCGAGGAATCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCAAACGTCGATTTCAGCAAATCCAAGAA
GCCTATTCTGTTTTGAATGACGAGAATAAGCGCTCGATGTATGACGCTGGACTCTACGAT
CCCCACGAAGATGACGACGATGACTTTTGCGACTTCGTGCAAGAGATGATCTCAATGATG
AACAGTGTCAAAGGCGAGGGAGATAGCTTGGAGGACTTGCAACGGATGTTCACGGATATG
GTTGGTGGAGATGGCGTGATCTTTGATTGTAACAACAATCCTAGGGACAGCAAAAGACCC
CGTGTTAATATCTCCCGGAGTAGTGCTGCGATGCGTTAGTGCTCTTGTTCTCTTTTGTGT
TTGTGTCGTGTCGTTTCGCGTTGAACTGT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2CO50TF 645 0 0
AAAAAAGAGACATTACTTCTCAACTCTCCGATATTTTCTCCAAGAGAAATCTAAATTTGC
AGTTCCTTTTCACTAGTTCTCGATGCTTTAGAACTGAAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGA**
TAGATCGTTGGAGACGCGGCTGTGACTGAAACAGAGAAGAAATCCGAAAA*TGGAAGCTG
GAGGATCCAACGTTAGATCTAGCTACTACAACGTCCTCGGTATTCGGAAAGATGCCTCTG
TCTCCGATGTCCGCGCTGCTTACCGTAAGCTCGCCATGAAATGGCATCCGGATAGATACG
CGAGGAATCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCAAACGTCGATTTCAGCAAATCCAAGAAGCCT
ATTCTGTTTTGAATGACGAGAATAAGCGCTCGATGTATGACGCTGGACTCTACGATCCCC
ACGAAGATGACGACGATGACTTCTGCGACTTCATGCAAGAGATGATCTCAATGATGAACA
GTGTCAAAGGCGAGGGAGATAGCTTGGAGGACTTGCAACGGATGTTCACGGATATGGTGG
GTGGAGATGGCGTGATCTTTGATTGTAACAACAATCCTAGGGACAGCAAAAGACCACGTG
TTAATATCTCACGGAGTAGTGCTGCGATGCGTTAGTGCTCTTGTT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2G382TF 756 0 0
GG
ACAAAAGAAAGAGACATTACTTCTCAACTCTCCGATATTTTCTCCAAGAGAAATCTAAAT
TTGCAGTTCCTTTTCACTAGTTCTCGATGCTTTAGAATCAAAGAGTGAGAGAGAGAGAGA
GAGATAGATCGTTGGAGACGCAGCTGTGACTGAAACATAGGAGAGATCCGAAAAATGGAA
GCTGGAGGATCCAACGTTAGATCTAGCTACTACAACGTCCTCGGTATTCGGAAAGATGCC
TCTGTCTCCGATGTCCGCGCTGCTTACCG****CTCGCCATGAAATGGCATCCGGATAGA
TACGCGAGGAATCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCAAACGTCGATTTCAGCAAATCCAAGAA
GCCTATTCTGTTTTGAATGACGAGAATAAGCGCTCGATGTGTGACGCTGGACTCTACGAT
CCCCACGAAGATGACGACGACGACTTCTGCGACTTCATGCAAGAGATGATCTCCATGATG
AACAATGTCAAAGGCGAGGGAGATAGCTTGGAGGACTTGCAACGGATGTTCACGGATATG
GTTGGTGGAGATAGCGTGATCTTTGACTGTAACAACAATCCAAGGGACAGCAAAAGACCA
CGTGTTAATATCTCACGGAGTAGTGCTGCGATGCGTTAGTTCTCTGTTTTGTGTTTGTGT
TTGTGTCGTGTCGTTCCGCGTTGAACTGTCTCATGCTAAGAAGTCTCAAGTTCTCA*TTG
TCATTTCAGTGTTTTATTTTCTAGTGTCAATTCT

QA 3 756 3 756
DS 

RD RR2GQ69TF 758 0 0
GG
GTTGTGCATTCTATTCCCTTCCACACGAAAAAAAGAGACATTACTTCTCAACTCTCCGAT
ATTTTCTCCAAGAGAAATCTAAATTTGCAGTTCCTTTTCACTAGTTCTCGATGCTTTAGA
ACTGAAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGA**TAGATCGTTGGAGACGCGGCTGTGACTGAAAC
AGAGAAGAAATCCGAAAA*TGGAAGCTGGAGGATCCAACGTTAGATCTAGCTACTACAAC
GTCCTCGGTATTCGGAAAGATGCCTCTGTCTCCGATGTCCGCGCTGCTTACCGTAAGCTC
GCCATGAAATGGCATCCGGATAGATACGCGAGGAATCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCAAA
CGTCGATTTCAGCAAATCCAAGAAGCCTATTCTGTTTTGAATGACGAGAATAAGCGCTCG
ATGTATGACGCTGGACTCTACGATCCCCACGAAGATGACGACGATGACTTCTGCGACTTC
ATGCAAGAGATGATCTCAATGATGAACAGTGTCAAAGGCGAGGGAGATAGCTTGGAGGAC
TTGCAACGGATGTTCACGGATATGGTTGGTGGAGATGGCGTGATCTTTGATTGTAACAAC
AATCCTAGGGACAGCAAAAGACCACGTGTTAATATCTCACGGAGTAGTGCTGCGATGCGT
TAGTGCCCTTGTTCTCTTTTGTGTTTGTGTCGTGTCGTTTCGCGTTGAACTGTATCATGC
TAAGAACTCTCAAGTTCTCA*TTGTCATTTC*GTGT

QA 3 758 3 758
DS 

RD RR2AB44TF 805 0 0
GGGTTGTGCATTCTATTCCCTTCCACACAAAAAAAAGAGACATTACTTCTCAACTCTCCG
ATATTTTCTCCAAGAGAAATCTAAATTTGCAGTTCCTTTTCACTAGTTCTCGATGCTTTA
GAACTGAAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGATCGTTGGAGACGCGGCTGTGACTGAA
ACAGAGAAGAAATCCGAAAA*TGGAAGCTGGAGGATCCAACGTTAGATCTAGCTACTACA
ACGTCCTCGGTATTCGGAAAGATGCCTCTGTCTCCGATGTCCGCGCTGCTTACCGTAAGC
TCGCCATGAAATGGCATCCGGATAGATACGCGAGGAATCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCA
AACGTCGATTTCAGCAAATCCAAGAAGCCTATTCTGTTTTGAATGACGAGAATAAGCGCT
CGATGTATGACGCTGGACTCTACGATCCCCACGAAGATGACGACGATGACTTCTGCGACT
TCGTGCAAGAGATGATCTCAATGATGAACAGTGTCAAAGGCGAGGGAGATAGCTTGGAGG
ACTTGCAACGGATGTTCACGGATATGGTTGGTGGAGATGGCGTGATCTTTGATTGTAACA
ACAATCCTAGGGACAGCAAAAGACCACGTGTTAATATCTCACGGAGTAGTGCTGCGATGC
GTTAGTGCTCTTGTTCTCTTTTGTGTTTGTGTCGTGTCGTTTCGCGTTGAACTGTATCAT
GCTAAGAACTCTCAAGTTCTCAATTGTCATTTC*GTGTTTTATGTTCTAGTGTCAATTCT
GAAG*CTATAAA*TAAAATATCTCT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2CO50JQ 653 0 0
AGACGCGGCTGTGACTGAAACAGAGAAGAAATCCGAAAA*TGGAAGCTGGAGGATCCAAC
GTTAGATCTAGCTACTACAACGTCCTCGGTATTCGGAAAGATGCCTCTGTCTCCGATGTC
CGCGCTGCTTACCGTAAGCTCGCCATGAAATGGCATCCGGATAGATACGCGAGGAATCCT
GGTGTCGCCGGAGAAGCCAAACGTCGATTTCAGCAAATCCAAGAAGCCTATTCTGTTTTG
AATGACGAGAATAAGCGCTCGATGTATGACGCTGGACTTTACGATCCCCACGAAGATGAC
GACGATGACTTCTGCGACTTCATGCAAGAGATGATCTCAATGATGAACAGTGTCAAAGGC
GAGGGAGATAGCTTGGAGGACTTGCAACGGATGTTCACGGATATGGTTGGTGGAGATGGC
GTGATCTTTGATTGTAACAACAATCCTAGGGACAGCAAAAGACCACGTGTTAATATCTCA
CGGAGTAGTGCTGCGATGCGTTAGTGCTCTTGTTCTCTTTTGTGTTTGTGTCGTGTCGTT
TCGCGTTGAACTGTATCATGCTAAGAACTCTCAAGTTCTCAATTGTCATTTC*GTGTTTT
ATGTTCTAGTGTCAATTCTGAAGGCTATAAAATAAAATATCTCTGAAGTCTAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2GQ69JQ 364 0 0
GATCCCCACGAAGATGACGACGATGACTTCTGCGACTTCATGCAAGAGATGATCTCAATG
ATGAACAGTGTCAAAGGCGAGGGAGATAGCTTGGAGGACTTGCAACGGATGTTCACGGAT
ATGGTTGGTGGAGATGGCGTGATCTTTGATTGTAACAACAATCCTAGGGACAGCAAAAGA
CCACGTGTTAATATCTCACGGAGTAGTGCTGCGATGCGTTAGTGCCCTTGTTCTCTTTTG
TGTTTGTGTCGTGTCGTTTCGCGTTGAACTGTATCATGCTAAGAACTCTCAAGTTCTCAA
TTGTCATTTC*GTGTTTTATGTTCTAGTGTCAATTCTGAAGGCTATAAAATAAAATATCT
CT
GC

QA 1 362 1 362
DS 



AS 1 10

CO CL638Contig1 815 10 10 U
GCTTCATCTTAAAGAATAATAATGGCAAAATTCGTCATCTTCTTTCTTGCCTCTGCTCTA
TGTTTGACCACCCTCCTTCACTTCGCGGCCGCTGATGCCGACGACCTCGACCGCTTCCAC
ATCAAGGGCTCCGTCTACTGCGACACCTGCCGTGTTCAATTCCAGACCCGCCTCAGTAAA
TTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTCGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACA
CTGAGCAAAGAAGCTGTGACCGACAAAGATGGAAACTATGAGATGGTAGTTATGGGAGAC
CACGAAGAGGAAGTGTGCGAGATCATCCTCGTCCAATCACCGGACGCAGAGTGTAGTGAA
GTGAACAATCAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCCAGGATCAGTCTCACGGCTAATGATGGA
ATTGTCTCCAACGAGATTCGAACCATTAACCCACTTGGATTCATGAGGAAGACTCCTCTC
GCTGATTGTCCTCAAGCTTTCAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCT
CTATATATTAATTATACCCATATATATCGATCTCTCAACAGTTTATTTTTGACAACTCTT
TCTATCTCTTATATAAAACTTTCTTTACATGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTAACGGT
GTTTTCTTTTGTTTATATCTTGTGTTTGTATTCCAGCAATTTTTCTTTTGTTGTTTTACC
CTTGGGTGTTCTTTTATTTTTTAAAGAATTGATCTGATTACCTTCCAAATTTGTAAGTTT
CGGAAGTTCTTGTTTTAAGAATGATTTGAACACGT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 40 40 45 45 45 50 50 50 20 50 50 20 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 30 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2E839TF U 1
AF RR2H828JQ C 39
AF RR2H828TF U 23
AF RR2CF19TF U 19
AF RR2E839JQ C 1
AF RR2B890TF U 3
AF RR2EP42TF U 4
AF RR2B890JQ C 140
AF RR2CF19JQ C 20
AF RR2EP42JQ C 24
BS 1 5 RR2E839JQ
BS 6 355 RR2E839TF
BS 356 356 RR2B890TF
BS 357 698 RR2E839TF
BS 699 699 RR2B890TF
BS 700 716 RR2E839TF
BS 717 742 RR2B890TF
BS 743 749 RR2CF19JQ
BS 750 750 RR2EP42JQ
BS 751 815 RR2CF19JQ

RD RR2E839TF 724 0 0
GCTTC
ATCTTAAAGAATAATAATGGCAAAATTCGTCATCTTCTTTCTTGCCTCTGCTCTATGTTT
GACCACCCTCCTTCACTTCGCGGCCGCTGATGCCGACGACCTCGACCGCTTCCACATCAA
GGGCTCCGTCTACTGCGACACCTGCCGTGTTCAATTCCAGACCCGCCTCAGTAAATTCCT
CGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTCGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGAG
CAAAGAAGCTGTGACCGACAAAGATGGAAACTATGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGA
AGAGGAAGTGTGCGAGATCATCCTCGTCCAATCACCGGACGCAGAGTGTAATGAAGTGAA
CAATCAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCCAGGATCAGTCTCACGGCTAATGATGGAATTGT
CTCCAACGAGATTCGAACCATTAACCCACTTGGATTCATGAGGAAGACTCCTCTCGCTGA
TTGTCCTCAAGCTTTCAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCTCTATA
TATTAATTATACCCATATATATCGATCTCTCAACAGTTTATTTTTGACAACTCTTTCTAT
CTCTTATATAAAACTTTCTTTACATGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTAACGGTGTTTT
CTTTTGTTTATATCTTGTGTTTGTATTCCAGCA*TTTTTCTTTTGTTGTTT
ACCCTTGG

QA 6 716 6 716
DS 

RD RR2H828JQ 663 0 0
CTTCTTTCTTGCCTCTGCTCTATGTTTGACCACCCTCCTTCACTTCGCGGCCGCTGATGC
CGACGACCTCGACCGCTTCCACATCAAGGGCTCCGTCTACTGCGACACCTGCCGTGTTCA
ATTCCAGACCCGCCTCAGTAAATTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTCGAGTGCAAGGG
TCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGAGCAAAGAAGCTGTGACCGACAAAGATGGAAACTA
TGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGCGAGATCATCCTCGTCCAATC
ACCGGACGCAGAGTGTAGTGAAGTGAACAATCAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCCAGGAT
CAGTCTCACGGCTAATGATGGAATTGTCTCCAACGAGATTCGAACCATTAACCCACTTGG
ATTCATGAGGAAGACTCCTCTCGCTGATTGTCCTCAAGCTTTCAAGGAGCTTGGAATCGT
CCCTGACGTCATCTTTTAAGCTCTATATATTAATTATACCCATATATATCGATCTCTCAA
CAGTTTATTTTTGACAACTCTTTCTATCTCTTATATAAAACTTTCTTTACATGTTGTCGT
CTGAGTTTACTTAACTAACGGTGTTTTCTTTTGTTTATATCTTGTGTTTGTATTCCAGCA
ATT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2H828TF 679 0 0
TGGCAAAATTCGTCATCTTCTTTCTTGCCTCTGCTCTATGTTTGACCACCCTCCTTCACT
TCGCGGCCGCTGATGCCGACGACCTCGACCGCTTCCACATCAAGGGCTCCGTCTACTGCG
ACACCTGCCGTGTTCAATTCCAGACCCGCCTCAGTAAATTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAA
AGCTCGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGAGCAAAGAAGCTGTGACCG
ACAAAGATGGAAACTATGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGCGAGA
TCATCCTCGTCCAATCACCGGACGCAGAGTGTAGTGAAGTGAACAATCAAGAGTTCCTAA
GAAACGCAGCCAGGATCAGTCTCACGGCTAATGATGGAATTGTCTCCAACGAGATTCGAA
CCATTAACCCACTTGGATTCATGAGGAAGACTCCTCTCGCTGATTGTCCTCAAGCTTTCA
AGGAGCTTGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCTCTATATATTAATTATACCCATA
TATATCGATCTCTCAACAGTTTATTTTTGACAACTCTTTCTATCTCTTATATAAAACTTT
CTTTACATGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTAACGGTGTTTTCTTTTGTTTATATCTTG
TGTTTGTATTCCAGCAATT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2CF19TF 701 0 0
GG
AATGGCAAAACTCATCATCTTCTTTCTTGCCTCTGCTCTATGTTTGACCACCCTCCTTCA
CTTCGCGGCCGCTGATGCCGACGACCTCGACCGCTTCCACATCAAGGGCTCCGTCTACTG
CGACCCCTGCCGTGTTCAATTCCAGACCCGCCTCAGTAAATTCCTCGAAGGGGCAAAGGT
AAAGCTCGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGAGCAAAGAAGCTGTGAC
CGACAAAGATGGAAACTATGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGCGA
GATCATCCTCGTCCAATCACCGGACGCAGAGTGTAGTGAAGTGAACAATCAAGAGTTCCT
AAGAAACGCAGCCAGGATCAGTCTCACGGCTAATGATGGAATTGTCTCCAACGAGATTCG
AACCATTAACCCACTTGGATTCATGAGGAAGACTCCTCTCGCTGATTGTCCTCAAGCTTT
CAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGTTCTATATATTAATTATACCCA
TATATATCGATCTCTCAACAGTTTATTTTTGACAACTCTTTCTATCTCTTATATAAAACT
TTCTTTACATGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTAACGGTGTTTTCTTTTGTTTATATCT
TGTGTTTGTATTCCAGCAATTTTTCTTTTGTTGTTT
ACC

QA 3 698 3 698
DS 

RD RR2E839JQ 742 0 0
GCTTCATCTTAAAGAATAATAATGGCAAAATTCGTCATCTTCTTTCTTGCCTCTGCTCTA
TGTTTGACCACCCTCCTTCACTTCGCGGCCGCTGATGCCGACGACCTCGACCGCTTCCAC
ATCAAGGGCTCCGTCTACTGCGACACCTGCCGTGTTCAATTCCAGACCCGCCTCAGTAAA
TTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTCGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACA
CTGAGCAAAGAAGCTGTGACCGACAAAGATGGAAACTATGAGATGGTAGTTATGGGAGAC
CACGAAGAGGAAGTGTGCGAGATCATCCTCGTCCAATCACCGGACGCAGAGTGTAATGAA
GTGAACAATCAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCCAGGATCAGTCTCACGGCTAATGATGGA
ATTGTCTCCAACGAGATTCGAACCATTAACCCACTTGGATTCATGAGGAAGACTCCTCTC
GCTGATTGTCCTCAAGCTTTCAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCT
CTATATATTAATTATACCCATATATATCGATCTCTCAACAGTTTATTTTTGACAACTCTT
TCTATCTCTTATATAAAACTTTCTTTACATGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTAACGGT
GTTTTCTTTTGTTTATATCTTGTGTTTGTATTCCAGCAATTTTTCTTTTGTTGTTTTACC
CTTGGGTGTTCTTTTATTTTTT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2B890TF 740 0 0
GGG
ATCTTAAAGAATAATAATGGCAAAATTCGTCATCTTCTTTCTTGCCTCTGCTCTATGTTT
GACCACCCTCCTTCACTTCGCGGCCGCTGATGCCGACGACCTCGACCGCTTCCACATCAA
GGGCTCCGTCTACTGCGACACCTGCCGTGTTCAATTCCAGACCCGCCTCAGTAAATTCCT
CGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTCGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGAG
CAAAGAAGCTGTGACCGACAAAGATGGAAACTATGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGA
AGAGGAAGTGTGCGAGATCATCCTCGTCCAATCACCGGACGCAGAGTGTAGTGAAGTGAA
CAATCAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCCAGGATCAGTCTCACGGCTAATGATGGAATTGT
CTCCAACGAGATTCGAACCATTAACCCACTTGGATTCATGAGGAAGACTCCTCTCGCTGA
TTGTCCTCAAGCTTTCAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCTCTATA
TATTAATTATACCCATATATATCGATCTCTCAACAGTTTATTTTTGACAACTCTTTCTAT
CTCTTATATAAAACTTTCTTTACATGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTAACGGTGTTTT
CTTTTGTTTATATCTTGTGTTTGTATTCCAGCAATTTTTCTTTTGTTGTTTTACCCTTGG
GTGTTCTTTTATTTTTT

QA 4 740 4 740
DS 

RD RR2EP42TF 733 0 0
GG
ATCTTAAAGAATAATAATGGCAAAATTCGTCATCTTCTTTCTTGCCTCTGCTCTATGTTT
GACCACCCTCCTTCACTTCGCGGCCGCTGATGCCGACGACCTCGACCGCTTCCACATCAA
GGGCTCCGTCTACTGCGACACCTGCCGTGTTCAATTCCAGACCCGCCTCAGTAAATTCCT
CGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTCGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGAG
CAAAGAAGCTGTGACCGACAAAGATGGAAACTATGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGA
AGAGGAAGTGTGCGAGATCATCCTCGTCCAATCACCGGACGCAGAGTGTAGTGAAGTGAA
CAATCAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCCAGGATCAGTCTCACGGCTAATGATGGAATTGT
CTCCAACGAGATTCGAACCATTAACCCACTTGGATTCATGAGGAAGACTCCTCTCGCTGA
TTGTCCTCAAGCTTTCAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCTCTATA
TATTAATTATACCCATATATATCGATCTCTCAACAGTTTATTTTTGACAACTCTTTCTAT
CTCTTATATAAAACTTTCTTTACATGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTAACGGTGTTTT
CTTTTGTCTATATCTTGTGTTTGTATTCCAGCAATTTTTCTTTTGTTGTTT*ACCCTTGG
GTGTTCTTT
AT

QA 3 731 3 731
DS 

RD RR2B890JQ 603 0 0
GCGACACCTGCCGTGTTCAATTCCAGACCCGCCTCAGTAAATTCCTCGAAGGGGCAAAGG
TAAAGCTCGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGAGCAAAGAAGCTGTGA
CCGACAAAGATGGAAACTATGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGCG
AGATCATCCTCGTCCAATCACCGGACGCAGAGTGTAGTGAAGTGAACAATCAAGAGTTCC
TAAGAAACGCAGCCAGGATCAGTCTCACGGCTAATGATGGAATTGTCTCCAACGAGATTC
GAACCATTAACCCACTTGGATTCATGAGGAAGACTCCTCTCGCTGATTGTCCTCAAGCTT
TCAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCTCTATATATTAATTATACCC
ATATATATCGATCTCTCAACAGTTTATTTTTGACAACTCTTTCTATCTCTTATATAAAAC
TTTCTTTACATGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTAACGGTGTTTTCTTTTGTTTATATC
TTGTGTTTGTATTCCAGCAATTTTTCTTTTGTTGTTTTACCCTTGGGTGTTCTTTTATTT
TTT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2CF19JQ 796 0 0
GGAAT
GCAAAACTCATCATCTTCTTTCTTGCCTCTGCTCTATGTTTGACCACCCTCCTTCACTTC
GCGGCCGCTGATGCCGACGACCTCGACCGCTTCCACATCAAGGGCTCCGTCTACTGCGAC
CCCTGCCGTGTTCAATTCCAGACCCGCCTCAGTAAATTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAG
CTCGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGAGCAAAGAAGCTGTGACCGAC
AAAGATGGAAACTATGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGCGAGATC
ATCCTCGTCCAATCACCGGACGCAGAGTGTAGTGAAGTGAACAATCAAGAGTTCCTAAGA
AACGCAGCCAGGATCAGTCTCACGGCTAATGATGGAATTGTCTCCAACGAGATTCGAACC
ATTAACCCACTTGGATTCATGAGGAAGACTCCTCTCGCTGATTGTCCTCAAGCTTTCAAG
GAGCTTGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGTTCTATATATTAATTATACCCATATA
TATCGATCTCTCAACAGTTTATTTTTGACAACTCTTTCTATCTCTTATATAAAACTTTCT
TTACATGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTAACGGTGTTTTCTTTTGTTTATATCTTGTG
TTTGTATTCCAGCAATTTTTCTTTTGTTGTTTTACCCTTGGGTGTTCTTTTATTTTTTAA
AGAAT*GATCTGATTACCTTCCAAATTTGTAAGTTTCGGAAGTTCTTGTTTTAAGAATGA
TTTGAACACGT

QA 6 796 6 796
DS 

RD RR2EP42JQ 792 0 0
TGGC
AAATTCGTCATCTTCTTTCTTGCCTCTGCTCTATGTTTGACCACCCCCCTTCACTTCGCG
GCCGCTGATGCCGACGACCTCGACCGCTTCCACATCAAGGGCTCCGTCTACTGCGACACC
TGCCGTGTTCAATTCCAGACCCGCCTCAGTAAATTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTC
GAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGAGCAAAGAAGCTGTGACCGACAAA
GATGGAAACTATGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGCGAGATCATC
CTCGTCCAATCACCGGACGCAGAGTGTAGTGAAGTGAACAATCAAGAGTTCCTAAGAAAC
GCAGCCAGGATCAGTCTCACGGCTAATGATGGAATTGTCTCCAACGAGATTCGAACCATT
AACCCACTTGGATTCATGAGGAAGACTCCTCTCGCTGATTGTCCTCAAGCTTTCAAGGAG
CTTGGAATCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCTCTATATATTAATTATACCCATATATAT
CGATCTCTCAACAGTTTATTTTTGACAACTCTTTCTATCTCTTATATAAAACTTTCTTTA
CATGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTAACGGTGTTTTCTTTTGTCTATATCTTGTGTTT
GTATTCCAGCAATTTTTCTTTTGTTGTTTTACCCTTGGGTGTTCTTTTATTTTTTAAAGA
ATTGATCTGATTACCTTCCAAATTTGTAAGTTTCGGAAGTTCTTGTTTTAAGAATGATTT
GAACACGT

QA 5 792 5 792
DS 



AS 1 10

CO CL639Contig1 636 10 5 U
TTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGAATAATCTCACTATTTGT
ATGTTAGTAATTGTTATGTGTTTAAGTTCGAAAAAAATTTCCGGGTGCAACCGGGTGGAG
TTCAAAAACGAACTTACGCCTCCTCGTAATTTCCAACTCAACTGCACATCGAACAGAAAG
GAAACAGTAAGTCTTCAAGATATAAAACCCAATGGTACATACGCGATTGATCCGGTTAAG
GAGACAGGACGTAAAAGAATAGTATGGCGTTGTTATTTAAGGGATGGCCCTCACTTTATT
GATATATTGAGAGCATACAGAGGAGCCGCCAGAGCTCGATGCAAACAGATACGCGCATAT
ATGGTTAAATCTGATGCCACTTACTTAGTGAGAAATAATAAACCGACCGATCAAAAATTT
GTTTGGATGTTGGCACGTACCTAAATAAGTCCTTTTTCAAAATCGGGGGTTATAATATAA
AAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATCAATCTTCTAGAAAAGAATAATAAAGTATGAGTTTA
TTTGATATATGTATTGTATCCATCTTTCAAATTATATCGCATTGCTTTTCCCTTATTTGT
GTATGAATTTTCTCTTCGAAACGACATTTCTTCGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 45 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ82JQ C 1
AF RR2CZ02TF U 16
AF RR2FG41JQ C 19
AF RR2FG41TF U 19
AF RR2GN66JQ C 18
AF RR2D469TF U 336
AF RR2GR09JQ C 101
AF RR2GN66TF U 18
AF RR2GR09TF U 18
AF RR2CP59TF U 21
BS 1 25 RR2GQ82JQ
BS 26 546 RR2CZ02TF
BS 547 592 RR2D469TF
BS 593 593 RR2GN66TF
BS 594 636 RR2CP59TF

RD RR2GQ82JQ 546 0 0
TTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGAATAATCTCACTATTTGT
ATGTTAGTAATTGTTACGTGTTTAAGTTCGAAAAAAATTTCCGGGTGCAACCGGGTGGAG
TTCAAAAACGAACTTACGCCTCCTCGTAATTTCCAACTCAACTGCACATCGAACAGAAAG
GAAACAGTAAGTTTTCAAGATATAAAACCCAATGGTACATACGCGATTGATCCGGTTAAG
GAGACAGGACGTAAAAGAATAGTATGGCGTTGTTATTTAAGGGATGGCCCTCACTTTATT
GATATATTGAGAGCATACAGAGGAGCCGCCAGAGCTCGATGCAAACAGATACGCGCATAT
ATGGTTAAATCTGATGCCACTTACTTAGTGAGAAATAATAAACCGACCGATCAAAAATTT
GTTTGGATGTTGGCACGTACCTAAATAAGTCCTTTTTCAAAATCGGGGGTTATAATATAA
AAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATCAATTTTCTAGAAAAGAATAATAAAGTATGAGTTTA
TTTGAT

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2CZ02TF 531 0 0
GGAAATCAAA
AAAAAAAAAAAAAAATGAATAATCTCACTATTTGTATGTTAGTAATTGTTATGTGTTTAA
GTTCGAAAAAAATTTCCGGGTGCAACCGGGTGGAGTTCAAAAACGAACTTACGCCTCCTC
GTAATTTCCAACTCAACTGCACATCGAACAGAAAGGAAACAGTAAGTCTTCAAGATATAA
AACCCAATGGTACATACGCGATTGATCCGGTTAAGGAGACAGGACGTAAAAGAATAGTAT
GGCGTTGTTATTTAAGGGATGGCCCTCACTTTATTGATATATTGAGAGCATACAGAGGAG
CCGCCAGAGCTCGATGCAAACAGATACGCGCATATATGGTTAAATCTGATGCCACTTACT
TAGTGAGAAATAATAAACCGACCGATCAAAAATTTGTTTGGATGTTGGCACGTACCTAAA
TAAGTCCTTTTTCAAAATCGGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATC
AATCTTCTAGAAAAGAATAATAAAGTATGAGTTTATTTGAT

QA 11 531 11 531
DS 

RD RR2FG41JQ 528 0 0
GGAAAATC
AAAAAAAAAAAAAATGAATAATCTCACTATTTGTATGTTAGTAATTGTTATGTGTTTAAG
TTCGAAAAAAATTTCCGGGTGCAACCGGGTGGAGTTCAAAAACGAACTTACGCCTCCTTG
TAATTTCCAACTCAACTGCACATCGAACAGAAAGGAAACAGTAAGTTTTCAAGATATAAA
ACCCAATGGTACATACGGGATTGATCCGGTTAAGGAGACAGGACGTAAAAGAATAGTATG
GGGTTGTTATTTAAGGGATGGCCCTCACTTTATTGATATATTGAGAGCATACAGAGGAGC
CGCCAGAGCTCGATGCAAACAGATACGGGCATATATGGTTAAATTTGATGCCACTTACTT
AGTGAGAAATAATAAACCGACCGATCAAAAATTTGTTTGGATGTTGGCACGTACCTAAAT
AAGTCCTTTTTCAAAATCGGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATCA
ATTTTTTAGAAAAGAATAATAAAGTATGAGTTTATTTGAT

QA 9 528 9 528
DS 

RD RR2FG41TF 528 0 0
GGAAAATC
AAAAAAAAAAAAAATGAATAATCTCACTATTTGTATGTTAGTAATTGTTATGTGTTTAAG
TTCGAAAAAAATTTCCGGGTGCAACCGGGTGGAGTTCAAAAACGAACTTACGCCTCCTCG
TAATTTCCAACTCAACTGCACATCGAACAGAAAGGAAACAGTAAGTCTTCAAGATATAAA
ACCCAATGGTACATACGCGATTGATCCGGTTAAGGAGACAGGACGTAAAAGAATAGTATG
GCGTTGTTATTTAAGGGATGGCCCTCACTTTATTGATATATTGAGAGCATACAGAGGAGC
CGCCAGAGCTCGATGCAAACAGATACGCGCATATATGGTTAAATCTGATGCCACTTACTT
AGTGAGAAATAATAAACCGACCGATCAAAAATTTGTTTGGATGTTGGCACGTACCTAAAT
AAGTCCTTTTTCAAAATCGGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATCA
ATCTTCTAGAAAAGAATAATAAAGTATGAGTTTATTTGAT

QA 9 528 9 528
DS 

RD RR2GN66JQ 576 0 0
GGAAAATC
AAAAAAAAAAAAAAATGAATAATCTCACTATTTGTATGTTAGTAATTGTTATGTGTTTAA
GTTCGAAAAAAATTTCCGGGTGCAACCGGGTGGAGTTCAAAAACGAACTTACGCCTCCTC
GTAATTTCCAACTCAACTACACATCGAACAGAAAGGAAACAGTAAGTCTTCAAGATATAA
AACCCAATGGTACATACGCGATTGATCCGGTTAAGGAGACAGGACGTAAAAGAATAGTAT
GGCGTTGTTATTTAAGGGATGGCCCTCACTTTATTGATATATTGAGAGCATACAGAGGAG
CCGCCAGAGCTCGATGCAAACAGATACGCGCATATATGGTTAAATCTGATGCCACTTACT
TAGTGAGAAATAATAAACCGACCGATCAAAAATTTGTTTGGATGTTGGCACGTACCTAAA
TAAGTCCTTTTTCAAAATCGGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATC
AATCTTCTAGAAAAGAATAATAAAGTATGAGTTTATTTGATATATGTATTGTATCCATCT
TTCAAATTATATCGCATTGCTTTTCCCT

QA 9 576 9 576
DS 

RD RR2D469TF 257 0 0
TCGATGCAAACAGATACGCGCATATATGGTTAAATCTGATGCCACTTACTTAGTGAGAAA
TAATAAACCGACCGATCAAAAATTTGTTTGGATGTTGGCACGTACCTAAATAAGTCCTTT
TTCAAAATCGGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATCAATCTTCTAG
AAAAGAATAATAAAGTATGAGTTTATTTGATATATGTATTGTATCCATCTTTCAAATTAT
ATCGCATTGCTTTTCCC

QA 1 257 1 257
DS 

RD RR2GR09JQ 493 0 0
CCGGGTGCAACCGGGTGGAGTTCAAAAACGAACTTACGCCTCCTCGTAATTTCCAACTCA
ACTACACATCGAACAGAAAGGAAACAGTAAGTCTTCAAGATATAAAACCCAATGGTACAT
ACGCGATTGATCCGGTTAAGGAGACAGGACGTAAAAGAATAGTATGGCGTTGTTATTTAA
GGGATGGCCCTCACTTTATTGATATATTGAGAGCATACAGAGGAGCCGCCAGAGCTCGAT
GCAAACAGATACGCGCATATATGGTTAAATCTGATGCCACTTACTTAGTGAGAAATAATA
AACCGACCGATCAAAAATTTGTTTGGATGTTGGCACGTACCTAAATAAGTCCTTTTTCAA
AATCGGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATCAATCTTCTAGAAAAG
AATAATAAAGTATGAGTTTATTTGATATATGTATTGTATCCATCTTTCAAATTATATCGC
ATTGCTTTTCCCT

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR2GN66TF 576 0 0
GGAAAATC
AAAAAAAAAAAAAAATGAATAATCTCACTATTTGTATGTTAGTAATTGTTATGTGTTTAA
GTTCGAAAAAAATTTCCGGGTGCAACCGGGTGGAGTTCAAAAACGAACTTACGCCTCCTC
GTAATTTCCAACTCAACTACACATCGAACAGAAAGGAAACAGTAAGTCTTCAAGATATAA
AACCCAATGGTACATACGCGATTGATCCGGTTAAGGAGACAGGACGTAAAAGAATAGTAT
GGCGTTGTTATTTAAGGGATGGCCCTCACTTTATTGATATATTGAGAGCATACAGAGGAG
CCGCCAGAGCTCGATGCAAACAGATACGCGCATATATGGTTAAATCTGATGCCACTTACT
TAGTGAGAAATAATAAACCGACCGATCAAAAATTTGTTTGGATGTTGGCACGTACCTAAA
TAAGTCCTTTTTCAAAATCGGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATC
AATCTTCTAGAAAAGAATAATAAAGTATGAGTTTATTTGATATATGTATTGTATCCATCT
TTCAAATTATATCGCATTGCTTTTCCCT

QA 9 576 9 576
DS 

RD RR2GR09TF 576 0 0
GGAAAATC
AAAAAAAAAAAAAAATGAATAATCTCACTATTTGTATGTTAGTAATTGTTATGTGTTTAA
GTTCGAAAAAAATTTCCGGGTGCAACCGGGTGGAGTTCAAAAACGAACTTACGCCTCCTC
GTAATTTCCAACTCAACTACACATCGAACAGAAAGGAAACAGTAAGTCTTCAAGATATAA
AACCCAATGGTACATACGCGATTGATCCGGTTAAGGAGACAGGACGTAAAAGAATAGTAT
GGCGTTGTTATTTAAGGGATGGCCCTCACTTTATTGATATATTGAGAGCATACAGAGGAG
CCGCCAGAGCTCGATGCAAACAGATACGCGCATATATGGTTAAATCTGATGCCACTTACT
TAGTGAGAAATAATAAACCGACCGATCAAAAATTTGTTTGGATGTTGGCACGTACCTAAA
TAAGTCCTTTTTCAAAATCGGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATC
AATCTTCTAGAAAAGAATAATAAAGTATGAGTTTATTTGATATATGTATTGTATCCATCT
TTCAAATTATATCGCATTGCTTTTCCCT

QA 9 576 9 576
DS 

RD RR2CP59TF 616 0 0
GGAAATC
AAAAAAAAAAAAATGAATAATCTCACTATTTGTATGTTAGTAATTGTTATGTGTTTAAGT
TCGAAAAAAATTTCCGGGTGCAACCGGGTGGAGTTCAAAAACGAACTTACGCCTCCTCGT
AATTTCCAACTCAACTGCACATCGAACTGAAAGGAAACAGTAAGTCTTCAAGATATAAAA
CCCAATGGTACATACGCGATTGATCCGGTTAAGGAGACAGGACGTAAAAGAATAGTATGG
CGTTGTTATTTAAGGGATGGCCCTCACTTTATTGACATATTGAGAGCATACAGAGGAGCC
GCCAGAGCTCGATGCAAACAGATACGCGCATATATGGTTAAATCTGATGCCACTTACTTA
GTGAGAAATAATAAACCGACCGATCAAAAATTTGTTTGGATGTTGGCACGTACCTAAATA
AGTCCTTTTTCAAAATCGGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATCAA
TCCTCTAGAAAAGAATAATAAAGTATGAGTTTATTTGATATATGTATTGTATCCATCTTT
CAAATTATATCGCATTGCTTTTCCCTTATTTGTGTATGAATTTTCTCTTCGAAACGACAT
TTCTTCGCT

QA 8 616 8 616
DS 



AS 1 8

CO CL640Contig1 1521 8 18 U
AACAAAGCTTCTTTTCATATTATCTTCCAACTCGAACGCTAAAGAGAAATTTTCATAAAA
AGAGAATAAAGTATAAAAAGTCCATTGAGAATCTAACAGATGACACTGCCTCCCAACTAA
TGCACATGCTCTGTCTCTCTTCTTTACAATATTCCCCATATCCCACAAACTATTATCCTC
AAAAACCAGATTAAACAAAATAAACCAAATACACACACATATATATTAAAAATAAGGCAC
AATCACACACACAAACAACTACTTTTGTACAAAAAACAACACCTAAAGTTAGGACCTCAA
ATCTATATATCACATGGTATATATAGTGCTACAATAATAACACATCAATATTATTATGAT
TACGTAAAACTAATAAATAAAGCCAATGTGACCAAAACAATGATCTTCTTTTGCCTATAG
ACCAGCTTTGGCCTTACACTCGAGATGTCTCGGGCAAGTGATCAAATGGTCGTTGGTCAA
ACCGGCGGCTTGCATTAACGAATGTATAACTGTCGGGCCAACGAATCTAAACCCACGACG
AACCATGTCTTTGCTTATGGTTTCTGATTTTGATGTCTTCACCGGAATCTTTTGGCAAGA
TGTGTATTCTGTGGTAACCGGTTTGTGCTTCATGAATTCCCAAATGTATTTGTTGAATGA
TCCAAAATCTTTTTTAACCTTGAGAATTTGTTTAGAGTTGTCAACAATTGCAAGGACTTG
GCTAAGGCCAATTCCATAGTCGTTGACTATCGACTGTATCTTCTTCTCGCTGAACTCTGC
GACAAGCTCTGCTTCGAAACCAGAGAAAGCCTCTCTAAAAGTGTTTCTTCTCTTCAAAAC
CGAAGTCCAG*TCGGATCCTACTTGAGCTCCGGTTAACACCAGAAGCTCAAACAGTAGGT
TGTCATCATGAACAGGAACTCCCCATTCTTCATCATGGTAAGCCACATAGATTGGATCTG
AACTTGTAGTGATGAAACTGCATCTCTTCTTCTTCTCATGTTCAACATTTAAGTTATTTT
CGTTTGATTTTACAGATTTTACTCTACCATAGTGAGAGATTTTCTTCTTTCTTTCGTCTT
GTTTCATAGCAACCTCTTGTCTTCGTGCAGCAGCTATACTTCCAGGTTGCTTCTGAACAG
TCATCAAGGACTTAACCTCTCTGCAGCCACCATCAGTGCTCTCTGGTAATTTCACCGGTT
TAGCAGCCTGTTTAGGTTTCTCATGACCGGCCAGTTTTCTTATGGGTTTTAAGTTGGGAG
ACAAAGGTGGAGAGTTTAGGGATATTTGTCTTGGTGACGCTAACTTTGATGCAATGGGAT
GTATCAAAGGTTTAGGAGGGGATTTCTTGAGTGAATTGCGTCGGTCTAAAGTGGGAACTT
GGTTCGATTTTGGTTGAAGAACCGGACGACCATTGATTTGGGAAATGGCTTCTTGGTTCA
TGTTCTTTGATTTTGAGGAACACATTTTCTTTCTCTCTAGCTTTGTGTTTTGAAGGATGA
TATGATAATGGGATGAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GQ05JQ U 1
AF RR2B871JQ U 202
AF RR2C967TF C 500
AF RR2GJ19JQB U 291
AF RR2B871TF C 725
AF RR2E758TF C 1068
AF RR2E758JQ U 1075
AF RR2GQ05TF C 745
BS 1 230 RR2GQ05JQ
BS 231 231 RR2B871JQ
BS 232 272 RR2GQ05JQ
BS 273 273 RR2B871JQ
BS 274 333 RR2GQ05JQ
BS 334 334 RR2B871JQ
BS 335 593 RR2GQ05JQ
BS 594 598 RR2B871JQ
BS 599 599 RR2GJ19JQB
BS 600 683 RR2B871JQ
BS 684 684 RR2GJ19JQB
BS 685 694 RR2B871JQ
BS 695 695 RR2GJ19JQB
BS 696 765 RR2B871JQ
BS 766 903 RR2GJ19JQB
BS 904 1074 RR2B871TF
BS 1075 1509 RR2E758JQ
BS 1510 1521 RR2B871TF

RD RR2GQ05JQ 606 0 0
AACAAAGCTTCTTTTCATATTATCTTCCAACTCGAACGCTAAAGAGAAATTTTCATAAAA
AGAGAATAAAGTATAAAAAGTCCATTGAGAATCTAACAGATGACACTGCCTCCCAACTAA
TGCACATGCTCTGTCTCTCTTCTTTACAATATTCCCCATATCCCACAAACTATTATCCTC
AAAAACCAGATTAAACAAAATAAACCAAATACACACACATATATATTAAAGATAAGGCAC
AATCACACACACAAACAACTACTTTTGTACAAGAAACAACACCTAAAGTTAGGACCTCAA
ATCTATATATCACATGGTATATATAGTGCTACAGTAATAACACATCAATATTATTATGAT
TACGTAAAACTAATAAATAAAGCCAATGTGACCAAAACAATGATCTTCTTTTGCCTATAG
ACCAGCTTTGGCCTTACACTCGAGATGTCTCGGGCAAGTGATCAAATGGTCGTTGGTCAA
ACCGGCGGCTTGCATTAACGAATGTATAACTGTCGGGCCAACGAATCTAAACCCACGACG
AACCATGTCTTTGCTTATGGTTTCTGATTTTGATGTCTTCACCGGAATCTTTT
TGGCAAGATGTGT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2B871JQ 564 0 0
AAACCAAATACACACACATATATATTAAAAATACGGCACAATCACACACACAAACAACTA
CTTTTGTACAAAAAACAACACCTAAAGTTAGGACCTCAAATCTATATATCACATGGTATA
TATAGTGCTACAATAATAACACATCAATATTATTATGATTACGTAAAACTAATAAATAAA
GCCAATGTGACCAAAACAATGATCTTCTTTTGCCTATAAACCAGCTTTGGCCTTACACTC
GAAATGTCTCGGGCAAGTGATCAAATGGTCGTTGGTCAAACCGGCGGCTTGCATTAACGA
ATGTATAACTGTCGGGCCAACGAATCTAAACCCACGACAAACCATGTCTTTGCTTATGGT
TTCTGATTTTGATGTCTTCCCCGGAATCTTTTGGCAAAATGTGTATTCTGTGGTAACCGG
TTTGTGCTTCATGAATTCCCAAATGTATTTGTTGAATGATCCAAAATCTTTTTTAACCTT
GAAAATTTGTTTAAAGTTGTCAACAATTGCAAGGACTTGGCTAAGGCCAATTCCATAGTC
GTTGACTATCGACTGTATCTTCTT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2C967TF 398 0 0
A
AATGTATAACTGTCGGGCCAACGAATCTAAACCCACGACGAACCATGTCTTTGCTTATGG
TTTCTGATTTTGATGTCTTCACCGGAATCTTTTGGCAAGATGTGTATTCTGTGGTAACCG
GTTTGTGCTTCATGAATTCCCAAATGTATTTGTTGAATGATCCAAAATCTTTTTTAACAT
TGAGAATTTGTTTAGAGTTGTCAACAATTGCAAGGACTTGGCTAAGGCCAATTCCATAGT
CGTTGACTATCGACTGTATCTTCTTCTCGCTGAACTCTGCGACAAGCTCTGCTTCGAAAC
CAGAGAAAGCCTCTCTAAAAGTGTTTCTTCTCTTCAAAACCGAAGTCCAG*TCGGATCCT
ACTTGAGCTCCGGTTAACACCAGAAGCTCAAACAGT
C

QA 2 397 2 397
DS 

RD RR2GJ19JQB 613 0 0
AGGACCTCAAATCTATATATCACATGGTATATATAGTGCTACAATAATAACACATCAATA
TTATTATGATTACGTAAAACTAATAAATAAAGCCAATGTGACCAAAACAATGATCTTCTT
TTGCCTATAGACCAGCTTTGGCCTTACACTCGAGATGTCTCGGGCAAGTGATCAAATGGT
CGTTGGTCAAACCGGCGGCTTGCATTAACGAATGTATAACTGTCGGGCCAACGAATCTAA
ACCCACGACAAACCATGTCTTTGCTTATGGTTTCTGATTTTGATGTCTTCACCGGAATCT
TTTGGCAAGATGTGTATTCTGTGGTAACCGGTTTGTGCTTCATGAATTCCCAAATGTATT
TGTTGAATGATCCAAAATCTCTTTTAACCTTGAGAATTTGTTTAGAGTTGTCAACAATTG
CAAGGACTTGGCTAAGGCCAATTCCATAGTCGTTGACTATCGACTGTATCTTCTTCTCGC
TGAACTCTGCGACAAGCTCTGCTTCGAAACCAGAGAAAGCCTCTCTAAAAGTGTTTCTTC
TCTTCAAAACCGAAGTCCAG*TCGGATCCTACTTGAGCTCCGGTTAACACCAGAAGCTCA
AACAGTAGGTTGT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2B871TF 797 0 0
AGGCCAATTCCATAGTCGTTGACTATCGACTGTATCTTCTTCTCGCTGAACTCTGCGACA
AGCTCTGCTTCGAAACCAGAGAAAGCCTCTCTAAAAGTGTTTCTTCTCTTCAAAACCGAA
GTCCAG*TCGGATCCTACTTGAGCTCCGGTTAACACCAGAAGCTCAAACAGTAGGTTGTC
ATCATGAACAGGAACTCCCCATTCTTCATCATGGTAAGCCACATAGATTGGATCTGAACT
TGTAGTGATGAAACTGCATCTCTTCTTCTTCTCATGTTCAACATTTAAGTTATTTTCGTT
TGATTTTACAGATTTTACTCTACCATAGTGAGAGATTTTCTTCTTTCTTTCGTCTTGTTT
CATAGCAACCTCTTGTCTTCGTGCAGCAGCTATACTTCCAGGTTGCTTCTGAACAGTCAT
CAAGGACTTAACCTCTCTGCAGCCACCATCAGTGCTCTCTGGTAATTTCACCGGTTTAGC
AGCCTGTTTAGGTTTCTCATGACCGGCCAGTTTTCTTATGGGTTTTAAGTTGGGAGACAA
AGGTGGAGAGTTTAGGGATATTTGTCTTGGTGACGCTAACTTTGATGCAATGGGATGTAT
CAAAGGTTTAGGAGGGGATTTCTTGAGTGAATTGCGTCGGTCTAAAGTGGGAACTTGGTT
CGATTTTGGCTGAAGAACCGGACGACCATTGATTTGGGAAATGGCTTCCTGGTTCATGTT
CTTTGATTTTGAGGAACACATTTTCTTTCTCTCTAGCTTTGTGTTTTGAAGGATGATATG
ATAATGGGATGAAACCC

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2E758TF 444 0 0
TTTT
TTTCGTCTTGTTTCATAGCAACCTCTTGTCTTCGTGCAGCAGCTATACTTCCAGGTTGCT
TCTGAACAGTCATCAAGGACTTAACCTCTCTGCAGCCACCATCAGTGCTCTCTGGTAATT
TCACCGGTTTAGCAGCCTGTTTAGGTTTCTCATGACCGGCCAGTTTTCTTATGGGTTTTA
AGTTGGGAGACAAAGGTGGAGAGTTTAGGGATATTTGTCTTGGTGACGCTAACTTTGATG
CAATGGGATGTATCAAAGGTTTAGGAGGGGATTTCTTGAGTGAATTGCGTCGGTCTAAAG
TGGGAACTTGGTTCGATTTTGGTTGAAGAACCGGACGACCATTGATTTGGGAAATGGCTT
CTTGGTTCATGTTCTTTGATTTTGAGGAACACATTTTCTTTCTCTCTAGCTTTGTGTTTT
GAAGGATGATATGATAAT
CC

QA 5 442 5 442
DS 

RD RR2E758JQ 437 0 0
CGTCTTGTTTCATAGCAACCTCTTGTCTTCGTGCAGCAGCTATACTTCCAGGTTGCTTCT
GAACAGTCATCAAGGACTTAACCTCTCTGCAGCCACCATCAGTGCTCTCTGGTAATTTCA
CCGGTTTAGCAGCCTGTTTAGGTTTCTCATGACCGGCCAGTTTTCTTATGGGTTTTAAGT
TGGGAGACAAAGGTGGAGAGTTTAGGGATATTTGTCTTGGTGACGCTAACTTTGATGCAA
TGGGATGTATCAAAGGTTTAGGAGGGGATTTCTTGAGTGAATTGCGTCGGTCTAAAGTGG
GAACTTGGTTCGATTTTGGTTGAAGAACCGGACGACCATTGATTTGGGAAATGGCTTCTT
GGTTCATGTTCTTTGATTTTGAGGAACACATTTTCTTTCTCTCTAGCTTTGTGTTTTGAA
GGATGATATGATAAT
CC

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR2GQ05TF 777 0 0
GACTATCGACTGTATCTC**TCTCGCTGA*CTCTGCGACAAGCTCCGCTTCGAAACCAGA
GAAG**CTCTCTAAAAGTGTT*CTTCTCTTCAAAACCGAAGTCCCGGTCGGATCCTACTT
GAGCTCCGGTTAACACCAGAAGCTCAAACAGTAGGTTGTCATCATGAACAGGAACTCCCC
ATTCTTCATCATGGTAAGCCACATAGATTGGATCTGAACTTGTAGTGATGAAACTGCATC
TCTTCTTCTTCTCATGTTCAACATTTAAGTTATTTTCGTTTGATTTTACAGATTTTACTC
TACCATAGTGAGAGATTTTCTTCTTTCTTTCGTCTTGTTTCATAGCAACCTCTTGCCTTC
GTGCAGCAGCTATACTTCCAGGTTGCTTCTGAACAGTCATCAAGGACTTAACCTCTCTGC
AGCCACCATCAGTGCTCTCTGGTAATTTCACCGGTTTAGCAGCCTGTTTAGGTTTCTCAT
GACCGGCCAGTTTTCTTATGGGTTTTAAGTTGGGAGACAAAGGTGGAGAGTTTAGGGATA
TTTGTCTTGGTGACGCTAACTTTGATGCAATGGGATGTATCAAAGGTTTAGGAGGGGATT
TCTTGAGTGAATTGCGTCGGTCTAAAGTGGGAACTTGGTTCGATTTTGGCTGAAGAACCG
GACGACCATTGATTTGGGAAATGGCTTCTTGGTTCATGTTCTTTGATTTTGAGGAACACA
TTTTCTTTCTCTCTAGCTTTGTGTTTTGAAGGATGATATGATAATGGGATGAAACCC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 2 10

CO CL641Contig1 533 6 5 U
GGACATCATCACACACAAAACAACCAATCAAAGCATCAATTAAGTTCTAAGCAAAAAGAG
AGAGAAAAAGAAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCAAGCCGGGCAAGCCACTGG
CCAGACTAAGGAGAAGGCAAGTGGTCTTATGGACAAGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCAGC
TCAAGACTCCATGCAACATGCTGGACAGCAGATGAAGCAGAAGGCACAAGGAGCTGCTGA
TGCGGTCAAGGACAAAACTGGCCTGAACAAGAACCATTGACAACTTTCAATTTTGATTTC
TAATATATCCTCCTCTTTTTGAGTTATTTAATAAATTTTGGAAGTGTTTTTTT*GGGTAA
TTTTGGAAGGGGTTTCAATTTATATATTAAATAAATTTTGTTAAAAAAATATTTAATAAA
TTTGGAAGGGTTTTTAATTCTCATTCCTGCTGTTTCTGATGTTATTTCCCTGATTTTTAT
GTAATTTTCTCCATATAAAATATCTGTTTTTTTTAATTGTGAAATATTATTAC


BQ
20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AK46JQ C 3
AF RR2E382TF U 6
AF RR2FJ71JQ C 1
AF RR2FJ71TF U 1
AF RR2AK46TF U 3
AF RR2FM73TF U 9
BS 1 7 RR2FJ71TF
BS 8 39 RR2E382TF
BS 40 40 RR2FJ71TF
BS 41 442 RR2E382TF
BS 443 533 RR2FJ71TF

RD RR2AK46JQ 376 0 0
GG
ATCATCACACACAAAACAACCAATCAAAGCATCAATTAAGTTTTAAGCAAAAAGAGAGAG
AAAAA*AAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCAAGCCGGGCAAGCCACTGGCCAG
ACTAAGGAGAAGGCAAGTGGTCTTATGGACAAGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCAGCTCAA
GACTCCATGCAACATGCTGGACAGCAGATGAAGCAGAAGGCACAAGGAGCTGCTGATGCG
GTCAAGGACAAAACTGGCCCGACCAAGAACCATTGACAACTTTCAATTTTGATTTCTAAT
ATATCCTCCTCTTTTTGAGTTATTTAATAAATTTTGGAAGTGTTTTTTTTGGGTAATTTT
GGAAGGGGTTTCAA

QA 3 376 3 376
DS 

RD RR2E382TF 438 0 0
GG
ATCACACACAAAACAACCAATCAAAGCATCAACTAAGTTCTAAGCAAAAAGAGAGAGAAA
AAGAAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCAAGCCGGGCAAGCCACTGGCCAGACT
AAGGAGAAGGCAAGTGGTCTTATGGACAAGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCAGCTCAAGAC
TCCATGCAACATGCTGGACAGCAGATGAAGCAGAAGGCACAAGGAGCTGCTGATGCGGTC
AAGGACAAAACTGGCCTGAACAAGAACCATTGACAACTTTCAATTTTGATTTCTAATATA
TCCTCCTCTTTTTGAGTTATTTAATAAATTTTGGAAGTGTTTTTTT*GGGTAATTTTGGA
AGGGGTTTCAATTTATATATTAAATAAATTTTGTTAAAAAAATATTTAATAAATTTGGAA
GGGTTTTTAATTCTC
C

QA 3 437 3 437
DS 

RD RR2FJ71JQ 533 0 0
GGACATCATCACACACAAAACAACCAATCAAAGCATCAATTAAGTTTTAAGCAAAAAGAG
AGAGAAAAAGAAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCAAGCCGGGCAAGCCACTGG
CTAGACTAAGGAGAAGGCAAGTGGTTTTATGGACAAGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCAGC
TCAAGACTCCATGCAACATGCTGGACAGCAGATGAAGCAGAAGGCACAAGGAGCTGCTGA
TGCGGTCAAGGACAAAACTGGCCTGAACAAGAACCATTGACAACTTTCAATTTTGATTTC
TAATATATCCTCCTCTTTTTGAGTTATTTAATAAATTTTGGAAGTGTTTTTTT*GGGTAA
TTTTGGAAGGGGTTTCAATTTATATATTAAATAAATTTTGTTAAAAAAATATTTAATAAA
TTTGGAAGGGTTTTTAATTCTCATTCCTGCTGTTTCTGATGTTATTTCCCTGATTTTTAT
GTAATTTTCTCCATATAAAATATCTGTTTTTTTTAATTGTGAAATATTATTAC

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2FJ71TF 533 0 0
GGACATCATCACACACAAAACAACCAATCAAAGCATCAATTAAGTTCTAAGCAAAAAGAG
AGAGAAAAAGAAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCAAGCCGGGCAAGCCACTGG
CTAGACTAAGGAGAAGGCAAGTGGTCTTATGGACAAGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCAGC
TCAAGACTCCATGCAACATGCTGGACAGCAGATGAAGCAGAAGGCACAAGGAGCTGCTGA
TGCGGTCAAGGACAAAACTGGCCTGAACAAGAACCATTGACAACTTTCAATTTTGATTTC
TAATATATCCTCCTCTTTTTGAGTTATTTAATAAATTTTGGAAGTGTTTTTTT*GGGTAA
TTTTGGAAGGGGTTTCAATTTATATATTAAATAAATTTTGTTAAAAAAATATTTAATAAA
TTTGGAAGGGTTTTTAATTCTCATTCCTGCTGTTTCTGATGTTATTTCCCTGATTTTTAT
GTAATTTTCTCCATATAAAATATCTGTTTTTTTTAATTGTGAAATATTATTAC

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2AK46TF 494 0 0
GG
ATCATCACACACAAAACAACCAATCAAAGCATCAATTAAGTTCTAAGCAAAAAGAGAGAG
AAAAA*AAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCAAGCCGGGCAAGCCACTGGCCAG
ACTAAGGAGAAGGCAAGTGGTCTTATGGACAAGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCAGCTCAA
GACTCCATGCAACATGCTGGACAGCAGATGAAGCAGAAGGCACAAGGAGCTGCTGATGCG
GTCAAGGACAAAACTGGCCCGAACAAGAACCATTGACAACTTTCAATTTTGATTTCTAAT
ATATCCTCCTCTTTTTGAGTTATTTAATAAATTTTGGAAGTGTTTTTTTTGGGTAATTTT
GGAAGGGGTTTCAATTTATATATTAAATAAATTTTGTTAAAAAAATATTTAATAAATTTG
GAAGGGTTTTTAATTCTCATTCCTGCTGTTTCTGATGTTATTTCCCTGATTTTTATGTAA
TTTTCTCCATAT

QA 3 494 3 494
DS 

RD RR2FM73TF 505 0 0
GG
ACACACAAAACAACCAATCAAAGCATCAATTAAGTTCTAAGCAAAAAGAGAGAGAAAAAG
AAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCAAGCCGGGCAAGCCACTGGCCAGACTAAG
GAGAAGGCAAGTGGTCTTATGGACAAGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCAGCTCAAGACTCC
ATGCAACATGCTGGACAGCAGATGAAGCAGAAGGCACAAGGAGCTGCTGATGCGGTCAAG
GACAAAACTGGCCTGAACAAGAACCATTGACAACTTTCAATTTTGATTTCTAATATATCC
TCCTCTTTTTGAGTTATTTAATAAATTTTGGAAGTGTTTTTTT*GGGTAATTTTGGAAGG
GGTTTCAATTTATATATTAAATAAATTTTGTTAAAAAAATATTTAATAAATTTGGAAGGG
TTTTTAATTCTCATTCCTGCTGTTTCTGATGTTATTTCCCTGATTTTTATGTAATTTTCT
CCATATAAAATATCTGTTTTTTT

QA 3 505 3 505
DS 



CO CL641Contig2 496 4 6 U
TGGAGAAAATTACATAAAAATCAGGGAAATAACATCAGAAACAGCAGGAATGAGAATTAA
AACCCCTTCCAAATTTATTAAATATTTTTTAACAAAATTTATTAAATATATAAATTAAAA
CCCCTTCCAAAATTACCCAAAAAAAAAACACTTCCAAATTTATTAAATAACTCAAAAAGA
GGAGGATATATTAGAAATTAAAATTGAAAGTTGTCAATGGTTCTTGTTCAGGCCAGTTTT
GTCCTTGACCGCATCAGCAGCTCCTTGTGCCTTCTGCTTCATCTGCTGTCCAGCATGTTG
CATGGAGTCTTGAGCTGAAGCAGCAGCATCTTTGGCCTTGTCCATAAGACCACTTGCCTT
CTCCTTAGTCTGGCCAGTGGCTTGCCCGGCTTGGTAGCTTAGGTTTTGCTTGTCTGACAT
TTTCTTTTTCTCTCTCTTTTTGCTTAGAACTTAATCTTGATGCTTTGATTGGTTGTTTTG
TGTGTGATGATGTCCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR2GL56TF C 1
AF RR2CV46JQ U 44
AF RR2DQ86JQ U 2
AF RR2DQ86TF C 2
BS 1 2 RR2GL56TF
BS 3 43 RR2DQ86JQ
BS 44 146 RR2CV46JQ
BS 147 148 RR2DQ86JQ
BS 149 495 RR2CV46JQ
BS 496 496 RR2GL56TF

RD RR2GL56TF 496 0 0
TGGAGAAAATTACATAAAAATCAGGGAAATAACATCAGAAACAGCAGGAATGAGAATTAA
AACCCCTTCCAAATTTATTAAATATTTTTTAACAAAATTTATTAAATATATAAATTAAAA
CCCCTTCCAAAATTACCCAAAAAAAAAACACTTCCAAATTTATTAAATAACTCAAAAAGA
GGAGGATATATTAGAAATTAAAATTGAAAGTTGTCAATGGTTCTTGTTCAGGCCAGTTTT
GTCCTTGACCGCATCAGCAGCTCCTTGTGCCTTCTGCTTCATCTGCTGTCCAGCATGTTG
CATGGAGTCTTGAGCTGAAGCAGCAGCATCTTTGGCCTTGTCCATAAGACCACTTGCCTT
CTCCTTAGTCTGGCCAGTGGCTTGCCCGGCTTGGTAGCTTAGGTTTTGCTTGTCTGACAT
TTTCTTTTTCTCTCTCTTTTTGCTTAGAACTTAATCTTGATGCTTTGATTGGTTGTTTTG
TGTGTGATGATGTCCC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2CV46JQ 452 0 0
GCAGGAATGAGAATTAAAACCCCTTCCAAATTTATTAAATATTTTTTAACAAAATTTATT
AAATATATAAATTAAAACCCCTTCCAAAATTACCCAAAAAAAA**CACTTCCAAATTTAT
TAAATAACTCAAAAAGAGGAGGATATATTAGAAATTAAAATTGAAAGTTGTCAATGGTTC
TTGTTCAGGCCAGTTTTGTCCTTGACCGCATCAGCAGCTCCTTGTGCCTTCTGCTTCATC
TGCTGTCCAGCATGTTGCATGGAGTCTTGAGCTGAAGCAGCAGCATCTTTGGCCTTGTCC
ATAAGACCACTTGCCTTCTCCTTAGTCTGGCCAGTGGCTTGCCCGGCTTGGTAGCTTAGG
TTTTGCTTGTCTGACATTTTCTTTTTCTCTCTCTTTTTGCTTAGAACTTAATCTTGATGC
TTTGATTGGTTGTTTTGTGTGTGATGATGTCC

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2DQ86JQ 494 0 0
C
GAGAAAATTACATAAAAATCAGGGAAATAACATCAGAAACAGCAGGAATGAGAATTAAAA
CCCCTTCCAAATTTATTAAATATTTTTTAACAAAATTTATTAAATATATAAATTAAAACC
CCTTCCAAAATTACCCAAAAAAAAAACACTTCCAAATTTATTAAATAACTCAAAAAGAGG
AGGATATATTAAAAATTAAAATTGAAAGTTGTCAATGGTTCTTGTTCAGGCCAGTTTTGT
CCTTGACCGCATCAGCAGCTCCTTGTGCCTTCTGCTTCATCTGCTGTCCAGCATGTTGCA
TGGAGTCTTGAGCTGAAGCAGCAGCATCTTTGGCCTTGTCCATAAAACCACTTGCCTTCT
CCTTAGTCTGGCCAGTGGCTTGCCCGGCTTGGTAGCTTAGGTTTTGCTTGTCTGACATTT
TCTTTTTCTCTCTCTTTTTGCTTAAAACTTAATCTTGATGCTTTGATTGGTTGTTTTGTG
TGTGATGATGTCC

QA 2 494 2 494
DS 

RD RR2DQ86TF 494 0 0
C
GAGAAAATTACATAAAAATCAGGGAAATAACATCAGAAACAGCAGGAATGAGAATTAAAA
CCCCTTCCAAATTTATTAAATATTTTTTAACAAAATTTATTAAATATATAAATTAAAACC
CCTTCCAAAATTACCCAAAAAAAAAACACTTCCAAATTTATTAAATAACTCAAAAAGAGG
AGGATATATTAGAAATTAAAATTGAAAGTTGTCAATGGTTCTTGTTCAGGCCAGTTTTGT
CCTTGACCGCATCAGCAGCTCCTTGTGCCTTCTGCTTCATCTGCTGTCCAGCATGTTGCA
TGGAGTCTTGAGCTGAAGCAGCAGCATCTTTGGCCTTGTCCATAAGACCACTTGCCTTCT
CCTTAGTCTGGCCAGTGGCTTGCCCGGCTTGGTAGCTTAGGTTTTGCTTGTCTGACATTT
TCTTTTTCTCTCTCTTTTTGCTTAGAACTTAATCTTGATGCTTTGATTGGTTGTTTTGTG
TGTGATGATGTCC

QA 2 494 2 494
DS 



AS 2 10

CO CL642Contig1 1046 4 8 U
TCTCGTGTTCACCTCGTGCCCATCCACTCCTCATTTTCCCAGATTCTTATCTTCTCTCGA
AAAAGATTTAAGCGAAGATGGCGAAGAACTACCCAGCTGTTAGCGAAGAGTACCAGAAGG
AGATTGAGAAGTGCAAGAGGAAGCTCAGAGGTTTGATCGCTGAGAAGAACTGTGCACCCA
TCATGGTCCGCCTCGCATGGCACTCTGCTGGAACATTCGATTGCGCTTCGAGGACCGGTG
GTCCCTTCGGAACAATGAGGTTTGACGATGAGCTAGCTCATGGAGCCAACAATGGTCTCC
ACATTGCTCTTAGGTTGTTGGCTCCTATCAGGGAGCAGTTCCCTACCATCTCCCATGCTG
ATTTCCATCAGCTTGCTGGTGTTGTGGCCGTTGAAGTCGCTGGTGGACCTGAAATTCCTT
TCCACCCCGGTAGAGAGGACAAGCCCCAGCCACCTCCAGAGGGACGTCTCCCTGATGCTA
CAAAGGGCTGTGACCACTTGAGGCAGGTCTTCTTAAAGCAGATGGGTTTAACTGACCAGG
ACATTGTCGCTTTGTCTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGCT
TCGAAGGCGCCTGGACTTCAAACCCTCTCATCTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAACTCT
TGAGCGGTGAGAAGGAAAGTCTTCTTCAGCTTCCTTCCGACAAGGCTCTATTGGACGATC
CCGTGCCCGTCCTCTTGTTGAGAAATACGCTGCTGGCGAGGAAGCATTTTTCGCTGATTA
CGCTGAGGCCCACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCGTAAGCTGCGTCATT
CCTTGTGTGATTCCCCCGAGACTCATGGCTGCTTTTGGGTTGGTGGAGGGTTTTGCATTC
CGTTTGAACTTTTGTCATTTGATTTGCTTAATGTACTCGATGGATCTGCGTAGCTTGTTT
TTTGGGTGGTATTGTGAGTTTGTCGCAGTTATGTTGCTCTTTTGCTGTGCTCAGACATTT
TAATAAATTATTAACTCTTCACTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ35TF U 4
AF RR2C938TF U 23
AF RR2A651TF U 1
AF RR2A651JQ C 250
BS 1 132 RR2A651TF
BS 133 133 RR2FZ35TF
BS 134 212 RR2A651TF
BS 213 213 RR2FZ35TF
BS 214 228 RR2A651TF
BS 229 229 RR2FZ35TF
BS 230 789 RR2A651TF
BS 790 1046 RR2A651JQ

RD RR2FZ35TF 579 0 0
GGG
GTTCACCTCGTGCCCATCCACTCCTCATTTTCCCAGATTCTTATCTTCTCTCGAAAAAGA
TTTAAGCGAAGATGGCGAAGAACTACCCAGCTGTTAGCGAAGAGTACCAGAAGGAGATTG
AGAAGTGCAAGAGGAAGCTCAGAGGTTTGATCGCTGAGAAGAACTGTGCACCCATCATGG
TCCGCCTCGCATGGCACTCTGCTGGAACATTCGATTGCGCTTCGAGGACCGGTGGTCCCT
TCGGAACAATGAGGTTTGACGATGAGCTAGCTCATGGGGCCAACAATGGTCTCCACATTG
CTCTTAGGTTGTTGGCTCCTATCAGGGAGCAGTTCCCTACCATCTCCCATGCTGATTTCC
ATCAGCTTGCTGGTGTTGTGGCCGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTCCTTTCCACC
CCGGTAGAGAGGACAAGCCCCAGCCACCTCCAGAGGGACGTCTCCCTGATGCTACAAAGG
GCTGTGACCACTTGAGGCAGGTCTTCTTAAAGCAGATGGGTTTAACTGACCAGGACATTG
TCGCTTTGTCTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCC

QA 4 579 4 579
DS 

RD RR2C938TF 579 0 0
TCCACTCCTCATTTTCCCAGATTCTTATCTTCTCTCGAAAAAGATTTAAGCGAAGATGGC
GAAGAACTACCCAGCTGTTAGCGAAGAGTACCAGAAGGAGATTGAGAAGTGCAAGAGGAA
GCTCAGAGGTTTGATCGCTGAGAAGAACTGTGCACCCATCATGGTCCGCCTCGCATGGCA
CTCTGCTGGAACATTCGATTGCGCTTCGAGGACCGGTGGTCCCTTCGGAACAATGAGGTT
TGACGATGAGCTAGCTCATGGAGCCAACAATGGTCTCCACATTGCTCTTAGGTTGTTGGC
TCCTATCAGGGAGCAGTTCCCTACCATCTCCCATGCTGATTTCCATCAGCTTGCTGGTGT
TGTGGCCGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTCCTTTCCACCCCGGTAGAGAGGACAA
GCCCCAGCCACCTCCAGAGGGACGTCTCCCTGATGCTACAAAGGGCTGTGACCACTTGAG
GCAGGTCTTCTTAAAGCAGATGGGTTTAACTGACCAGGACATTGTCGCTTTGTCTGGTGC
CCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGCTT

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2A651TF 789 0 0
TCTCGTGTTCACCTCGTGCCCATCCACTCCTCATTTTCCCAGATTCTTATCTTCTCTCGA
AAAAGATTTAAGCGAAGATGGCGAAGAACTACCCAGCTGTTAGCGAAGAGTACCAGAAGG
AGATTGAGAAGTACAAGAGGAAGCTCAGAGGTTTGATCGCTGAGAAGAACTGTGCACCCA
TCATGGTCCGCCTCGCATGGCACTCTGCTGGAGCATTCGATTGCGCTT*GAGGACCGGTG
GTCCCTTCGGAACAATGAGGTTTGACGATGAGCTAGCTCATGGAGCCAACAATGGTCTCC
ACATTGCTCTTAGGTTGTTGGCTCCTATCAGGGAGCAGTTCCCTACCATCTCCCATGCTG
ATTTCCATCAGCTTGCTGGTGTTGTGGCCGTTGAAGTCGCTGGTGGACCTGAAATTCCTT
TCCACCCCGGTAGAGAGGACAAGCCCCAGCCACCTCCAGAGGGACGTCTCCCTGATGCTA
CAAAGGGCTGTGACCACTTGAGGCAGGTCTTCTTAAAGCAGATGGGTTTAACTGACCAGG
ACATTGTCGCTTTGTCTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGCT
TCGAAGGCGCCTGGACTTCAAACCCTCTCATCTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAACTCT
TGAGCGGTGAGAAGGAAAGTCTTCTTCAGCTTCCTTCCGACAAGGCTCTATTGGACGATC
CCGTGCCCGTCCTCTTGTTGAGAAATACGCTGCTGGCGAGGAAGCATTTTTCGCTGATTA
CGCTGAGGC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2A651JQ 797 0 0
GAACAATGAGGTTTGACGATGAGCTAGCTCATGGAGCCAACAATGGTCTCCACATTGCTC
TTAGGTTGTTGGCTCCTATCAGGGAGCAGTTCCCTACCATCTCCCATGCTGATTTCCATC
AGCTTGCTGGTGTTGTGGCCGTTGAAGTCGCTGGTGGACCTGAAATTCCTTTCCACCCCG
GTAGAGAGGACAAGCCCCAGCCACCTCCAGAGGGACGTCTCCCTGATGCTACAAAGGGCT
GTGACCACTTGAGGCAGGTCTTCTTAAAGCAGATGGGTTTAACTGACCAGGACATTGTCG
CTTTGTCTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGCTTCGAAGGCG
CCTGGACTTCAAACCCTCTCATCTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAACTCTTGAGCGGTG
AGAAGGAAGGTCTTCTTCAGCTTCCTTCCGACAAGGCTCTATTGGACGATCCCGTGCCCG
TCCTCTTGTTGAGAAATACGCTGCTGGCGAGGAAGCATTTTTCGCTGATTACGCTGAGGC
CCACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCGTAAGCTGCGTCATTCCTTGTGTG
ATTCCCCCGAGACTCATGGCTGCTTTTGGGTTGGTGGAGGGTTTTGCATTCCGTTTGAAC
TTTTGTCATTTGATTTGCTTAATGTACTCGATGGATCTGCGTAGCTTGTTTTTTGGGTGG
TATTGTGAGTTTGTCGCAGTTATGTTGCTCTTTTGCTGTGCTCAGACATTTTAATAAATT
ATTAACTCTTCACTATT

QA 1 797 1 797
DS 



CO CL642Contig2 1067 6 22 U
GGAAAATAAAAAGTGTCTCGTGTTCGCCTCGTGCCCATCCACTCCTCATTTTCCCAGATT
CTTATCCTCTCTCGGAAAAGATTTAAGCGAAGATGGCGAAGAACTACCCAGCTGTTAGCG
AAGAGTACCAGAAGGAGATTGAGAAGTGCAAGAGGAAGCTCAGAGGTTTGATCGCTGAGA
AGAACTGTGCACCCATCATGGTCCGCCTCGCATGGCACTCTGCTGGAACATTCGATTGCG
CCTCGAGGACTGGTGGTCCCTT*CGGAACAATGAGGTTTGACGATGAGCTAGCTCATGGA
GCCAACAATGGTCTCCACATTGCTCTTAGGCTGTTGGCTCCTATCAGGGAGCAGTTCCCT
ACCATCTCCCATGCTGATTTCCATCAGCTTGCTGGTGTTGTGGCTGTTGAAGTCACTGGT
GGACCTGAAATTCCTTTCCACCCTGGTAGAGAGGACAAGCCCCAGCCACCTCCAGAGGGT
CGTCTCCCTGATGCCACCAAGGGTTGTGACCACTTGAGACAGGTCTTCTTAAAGCAGATG
GGTTTAACTGACCAGGACATTGTCGCTTTGTCTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCAC
AAGGATAGGTCTGGCTTCGAAGGTGCCTGGACTTCAAACCCTCTCATCTTCGACAACTCT
TACTTCAAGGAACTTTTGAGCGGTGAGAAGGAAGGTCTCCTTCAGCTCCCCTCTGACAAG
GCTCTATTGGACGATCCCGTTTTCCGTCCTCTTGTTGAGAAATACGCTGCTGACGAGGAA
GCATTTTTCGCTGATTACGCTGAGGCCCACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGAT
GCGTAAGTTGCGTCATTCCTTGTGTGATCCCCCCCGACACTCATGGCTGCTTTTGGGTTG
GTGGAGGTGTTTTGCATTCCGTTTGAACTTTTGTCATTTGATTTGCTTAATGTACTCTCG
ACGGATCTGCGTAGCTTGTTTTTTTGGGTGGTCTTGCGAGTTTGTCGCAGTTATGTTGCT
CTTTTGCTTTGCTCAGACATTTTAATAAATTAATAACTCTCACTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E708TF U 1
AF RR2B816TF U 31
AF RR2FQ02TF U 116
AF RR2B816JQ C 141
AF RR2FQ02JQ C 299
AF RR2E708JQ C 216
BS 1 66 RR2E708TF
BS 67 67 RR2B816TF
BS 68 255 RR2E708TF
BS 256 256 RR2B816TF
BS 257 353 RR2E708TF
BS 354 354 RR2B816TF
BS 355 355 RR2E708TF
BS 356 356 RR2B816TF
BS 357 381 RR2E708TF
BS 382 720 RR2B816TF
BS 721 721 RR2FQ02TF
BS 722 780 RR2B816TF
BS 781 781 RR2FQ02TF
BS 782 798 RR2B816TF
BS 799 799 RR2FQ02TF
BS 800 804 RR2B816TF
BS 805 805 RR2B816JQ
BS 806 848 RR2B816TF
BS 849 849 RR2FQ02TF
BS 850 900 RR2B816TF
BS 901 909 RR2FQ02TF
BS 910 1067 RR2B816JQ

RD RR2E708TF 381 0 0
GGAAAATAAAAAGTGTCTCGTGTTCGCCTCGTGCCCATCCACTCCTCATTTTCCCAGATT
CTTATCTTCTCTCGGAAAAGATTTAAGCGAAGATGGCGAAGAACTACCCAGCTGTTAGCG
AAGAGTACCAGAAGGAGATTGAGAAGTGCAAGAGGAAGCTCAGAGGTTTGATCGCTGAGA
AGAACTGTGCACCCATCATGGTCCGCCTCGCATGGCACTCTGCTGGAACATTCGATTGCG
CCTCGAGGACTGGTGATCCCTT*CGGAACAATGAGGTTTGACGATGAGCTAGCTCATGGA
GCCAACAATGGTCTCCACATTGCTCTTAGGCTGTTGGCTCCTATCAGGGAGCA*TCCCCT
ACCATCTCCCATGCTGATTTC

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR2B816TF 870 0 0
GG
GCCCATCCACTCCTCATTTTCCCAGATTCTTATCCTCTCTCGGAAAAGATTTAAGCGAAG
ATGGCGAAGAACTACCCAGCTGTTAGCGAAGAGTACCAGAAGGAGATTGAGAAGTGCAAG
AGGAAGCTCAGAGGTTTGATCGCTGAGAAGAACTGTGCACCCATCATGGTCCGCCTCGCA
TGGCACTCTGCTGGAACATTCGATTGCGCCTCGAGGACTGGTGGTCCCTT*CGGAACAAT
GAGGTTTGACGATGAGCTAGCTCATGGAGCCAACAATGGTCTCCACATTGCTCTTAGGCT
GTTGGCTCCTATCAGGGAGCAGTTCCCTACCATCTCCCATGCTGATTTCCATCAGCTTGC
TGGTGTTGTGGCTGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTCCTTTCCACCCTGGTAGAGA
GGACAAGCCCCAGCCACCTCCAGAGGGTCGTCTCCCTGATGCCACCAAGGGTTGTGACCA
CTTGAGACAGGTCTTCTTAAAGCAGATGGGTTTAACTGACCAGGACATTGTCGCTTTGTC
TGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGCTTCGAAGGTGCCTGGAC
TTCAAACCCTCTCATCTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAACTTTTGAGCGGTGAGAAGGA
AGGTCTCCTTCAGCTCCCCTCTGACAAG*CTCTATTGGACGATCCCGTTTTCCGTCCTCT
TGTTGAGAAATACGCTGCTGACGAGGAAACATTTTTCGCTGATTACACTGAG*CCCACTT
GAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCGTAAGT*GCGTCATTCCTTGTGTGATCCCC
CCCGACACTCATGGCTGCTTTTGGGTTG

QA 3 870 3 870
DS 

RD RR2FQ02TF 794 0 0
G
AGCGAAGAGTACCAGAAGGAGATTGAGAAGTGCAAGAGGAAGCTCAGAGGTTTGATCGCT
GAGAAGAACTGTGCGCCCATCATGGTCCGCCTCGCATGGCACTCTGCTGGAACATTCGAT
TGCGCCTCGAGGACTGGTGGTCCCTT*CGGAACAATGAGGTTTGACGATGAGCTAGCTCA
TGGAGCCAACAATGGTCTCCACATTGCTCTTAGGCTGTTGGCTCCTATCAGGGAGCAGTT
CCCTACCATCTCCCATGCTGATTTCCATCAGCTTGCTGGTGTTGTGGCTGTTGAAGTCAC
TGGTGGACCTGAAATTCCTTTCCACCCTGGTAGAGAGGACAAGCCCCAGCCACCTCCAGA
GGGTCGTCTCCCTGATGCCACCAAGGGTTGTGACCACTTGAGACAGGTCTTCTTAAAGCA
GATGGGTTTAACTGACCAGGACATTGTCGCTTTGTCTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATG
CCACAAGGATAGGTCTGGCTTCGAAGGTGCCTGGACTTCAAACCCTCTCATCTTCGACAA
CTCTTACTTCAAGGAACTTTTGAGCGGTGAGAAGGAAGGTCTCCTTCAGCTCCCCTCTGA
CAAGGCTCTATTGGACGATCCCGTTTTCCGTCCTCTTGTTGAGAAATACGCTGCTGACGA
GGAAGCATTTTTCGCTGATTACGCTGAG*CCCACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGC
TGATGCGTAAGTTGCGTCATTCCTTGTGTGATCTCCCCCGACACTCATGGCTGCTTTTGG
GTTGGTGGAGGTG

QA 2 794 2 794
DS 

RD RR2B816JQ 927 0 0
TGAG
AGTGCAAGAGGAAGCTCAGAGGTTTGATCGCTGAGAAGAACTGTGCACCCATCATGGTCC
GC*TCGCATGGCACTCTGCTGGAACATTCGATTGCGC*TCGAGGACTGGTGGTCCCTTTC
GGAACAATGAGGTTTGACGATGAGCTAGCTCATGGAGCCAACAATGGTCTCCACATTGCT
CTTAGGCTGTTGGCTCCTATCAGGGAGCAGTTCCCTACCATCTCCCATGCTGATTTCCAT
CAGCTTGCTGGTGTTGTGGCTGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTCCTTTCCACCCT
GGTAGAGAGGACAAGCCCCAGCCACCTCCAGAGGGTCGTCTCCCTGATGCCACCAAGGGT
TGTGACCACTTGAGACAGGTCTTCTTAAAGCAGATGGGTTTAACTGACCAGGACATTGTC
GCTTTGTCTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGCTTCGAAGGT
GCCTGGACTTCAAACCCTCTCATCTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAACTTTTGAGCGGT
GAGAAGGAAGGTCTCCTTCAGCTCCCCTCTGACAAGGCTCTATTGGACGATCCCGTTTTC
CGTCCTCTTGTTGAGAAATACGCTGCTGACGAGGAAACATTTTTCGCTGATTACACTGAG
GCCCACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCGTAAGTTGCGTCATTCCTTGTG
TGATCCCCCCCGACACTCATGGCTGCTTTTGGGTTGGTGGAGGTGTTTTGCATTCCGTTT
GAACTTTTGTCATTTGATTTGCTTAATGTACTCTCGACGGATCTGCGTAGCTTGTTTTTT
TGGGTGGTCTTGCGAGTTTGTCGCAGTTATGTTGCTCTTTTGCTTTGCTCAGACATTTTA
ATAAATTAATAACTCTCACTACT

QA 5 927 5 927
DS 

RD RR2FQ02JQ 766 0 0
GAGCCAACAATGGTCTCCACATTGCTCTTAGGCTGTTGGCTCCTATCAGGGAGCAGTTCC
CTACCATCTCCCATGCTGATTTCCATCAGCTTGCTGGTGTTGTGGCTGTTGAAGTCACTG
GTGGACCTGAAATTCCTTTCCACCCTGGTAGAGAGGACAAGCCCCAGCCACCTCCAGAGG
GTCGTCTCCCTGATGCCACCAAGGGTTGTGACCACTTGAGACAGGTCTTCTTAAAGCAGA
TGGGTTTAACTGACCAGGACATTGTCGCTTTGTCTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCC
ACAAGGATAGGTCTGGCTTCGAAGGTGCCTGGACTTCAAACCCTTTCATTTTCGACAACT
CTTACTTCAAGGAACTTTTGAGCGGTGAGAAGGAAGGTCTCCTTCAGCTCCCCTCTGACA
AGGCTCTATTGGACGATCCCGTTTTCCGTCCTCTTGTTGAGAAATACGCTGCTGACGAGG
AAGCATTTTTCGCTGATTACGCTGAGGCCCACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTG
ATGCGTAAGTTGCGTCATTCCTTGTGTGATCCCCCCCGACACTCATGGCTGCTTTTGGGT
TGGTGGAGGTGTTTTGCATTCCGTTTGAACTTTTGTCATTTGATTTGCTTAATGTACTCT
CGACGGATCTGCGTAGCTTGTTTTTTTGGGTGGTCTTGCGAGTTTGTCGCAGTTATGTTG
CTCTTTTGCTTTGCTCAGACATTTTAATAAATTAATAACTCT
CACT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2E708JQ 852 0 0
CACTCTGCTGAAACATTCGATTGCGCCTCGAGGACTGGTGATCCCTT*CGGAACAATGAG
GTTTGACGATGAGCTAGCTCATGGAGCCAACAATGGTCTCCACATTGCTCTTAGGCTGTT
GGCTCCTATCAGGGAGCAGTCCCCTACCATCTCCCATGCTGATTTCCATCAGCTTGCTGG
TGTTGTGGCTGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTCCTTTCCACCCTGGTAGAGAGGA
CAAGCCCCAGCCACCTCCAGAGGGTCGTCTCCCTGATGCCACCAAGGGTTGTGACCACTT
GAGACAGGTCTTCTTAAAGCAGATGGGTTTAACTGACCAGGACATTGTCGCTTTGTCTGG
TGCCCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGCTTCGAAGGTGCCTGGACTTC
AAACCCTCTCATCTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAACTTTTGAGCGGTGAGAAGGAAGG
TCTCCTTCAGCTCCCCTCTGACAAGGCTCTATTGGACGATCCCGTTTTCCGTCCTCTTGT
TGAGAAATACGCTGCTGACGAGGAAGCATTTTTCGCTGATTACGCTGAGGCCCACTTGAA
GCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCGTAAGTTGCGTCATTCCTTGTGTGATCCCCCCC
GACACTCATGGCTGCTTTTGGGTTGGTGGAGGTGTTTTGCATTCCGTTTGAACTTTTGTC
ATTTGATTTGCTTAATGTACTCTCGACGGATCTGCGTAGCTTGTTTTTTTGGGCGGTCTT
GCGAGTTTGTCGCAGTTATGTTGCTCTTTTGCTTTGCTCAGACATTTTAATAAATTAATA
ACTCT
CACTATC

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 9

CO CL643Contig1 777 9 8 U
AGTTATTAATTTTTAGTATTTATTAATTTATCGAGTATAAGCCACAACTCGCATTGTTGC
GCTTCATCTTAGAATTTCTATTACACAGTCTTTAATCATATCAAAAGACAATCTATTTAG
CTATACAGACGTCCTGTATGAACGACTCGTGATTAAGTAGACAAAAAAAAACTTCTAAAA
ATCTTAGTATTGATGTTTGATTCTTGAACAGATAATCTTAAGAAGAAGTAATGGAGTCAT
CTTCTTCATTTGAGTCTTCTCTATCCGAAGAAGAAGAATCAGCCGCTTTCTCAAACTCCA
CCATTTTCTCAAGT*GAGTCAAATTAAGCCGCAGGCTCCACTCCTGGTGGTGCCCTTCCG
TCAATTCCTTTAAGTTTCAGCCTTGCGACCATACTCCCCCCGGAACCCAAAAACTTTGAT
TCCTCATAAGGTGCCAGCGGAGTCCTAAAAGCAACATCCGCTGATCCCTGGTCGGCATCG
TTTATGGTCGAGACTAGGACGGTATCTGATCGTCTTCGAGCCCCCAACTTTCGTTCTTGA
TTAATGAAAACATCCTTGGCAAATGCTTTCGCAGTTGTTCGTCTTTCATAAATCCAAGAA
TTTCACCTCTGACTATGAAATACGAATGCCCCCGACTGTCCCTGTTAATCATTACTCCGA
TCCCGAAGGCCAACACAATAGGATCGAAATCCTATGATGTTATCCCATGCTAATGTATAC
AGAGCGTAGGCTTGCTTTGAGCACTCTAATTTCTTCAAAGTAACAGCGCCGGAGGCC


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 55 5 55 5 5 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EF18JQ U 1
AF RR2GM74JQ U 1
AF RR2H335JQ U 1
AF RR2H335TF C 1
AF RR2EF18TF C 1
AF RR2HA09JQ U 308
AF RR2HA09TF C 308
AF RR2BB05JQ U 307
AF RR2BB05TF C 307
BS 1 170 RR2EF18JQ
BS 171 171 RR2GM74JQ
BS 172 277 RR2EF18JQ
BS 278 278 RR2GM74JQ
BS 279 449 RR2EF18JQ
BS 450 450 RR2GM74JQ
BS 451 489 RR2EF18JQ
BS 490 777 RR2BB05JQ

RD RR2EF18JQ 489 0 0
AGTTATTAATTTTTAGTATTTATTAATTTATCGAGTATAAGCCACAACTCGCATTGTTGC
GCTTCATCTTAGAATTTCTATTACACAGTCTTTAATCATATCAAAAGACAATCTATTTAG
CTATACAGACGTCCTGTATGAACGACTCGTGATTAAGTAGACAAAAAAAA*CTTCTAAAA
ATCTTAGTATTGATGTTTGATTCTTGAACAGATAATCTTAAGAAGAAGTAATGGAGTCAT
CTTCTTCATTTGAGTCTTCTCTATCCGAAGAAGAAGAGTCAGCCGCTTTCTCAAACTCCA
CCATTTTCTCAAGT*GAGTCAAATTAAGCCGCAGGCTCCACTCCTGGTGGTGCCCTTCCG
TCAATTCCTTTAAGTTTCAGCCTTGCGACCATACTCCCCCCGGAACCCAAAAACTTTGAT
TCCTCATAAGGTGCCAGCGGAGTCCTAAAGGCAACATCCGCTGATCCCTGGTCGGCATCG
TTTATGGTC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2GM74JQ 489 0 0
AGTTATTAATTTTTAGTATTTATTAATTTATCGAGTATAAGCCACAACTCGCATTGTTGC
GCTTCATCTTAGAATTTCTATTACACAGTCTTTAATCATATCAAAAGACAATCTATTTAG
CTATACAGACGTCCTGTATGAACGACTCGTGATTAAGTAGACAAAAAAAAACTTCTAAAA
ATCTTAGTATTGATGTTTGATTCTTGAACAGATAATCTTAAGAAGAAGTAATGGAGTCAT
CTTCTTCATTTGAGTCTTCTCTATCCGAAGAAGAAGAATCAGCCGCTTTCTCAAACTCCA
CCATTTTCTCAAGT*GAGTCAAATTAAGCCGCAGGCTCCACTCCTGGTGGTGCCCTTCCG
TCAATTCCTTTAAGTTTCAGCCTTGCGACCATACTCCCCCCGGAACCCAAAAACTTTGAT
TCCTCATAAGGTGCCAGCGGAGTCCTAAAAGCAACATCCGCTGATCCCTGGTCGGCATCG
TTTATGGTC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2H335JQ 489 0 0
AGTTATTAATTTTTAGTATTTATTAATTTATCGAGTATAAGCCACAACTCGCATTGTTGC
GCTTCATCTTAGAATTTCTATTACACAGTCTTTAATCATATCAAAAGACAATCTATTTAG
CTATACAGACGTCCTGTATGAACGACTCGTGATTAAGTAGACAAAAAAAAACTTCTAAAA
ATCTTAGTATTGATGTTTGATTCTTGAACAGATAATCTTAAGAAGAAGTAATGGAGTCAT
CTTCTTCATTTGAGTCTTCTCTATCCGAAGAAGAAGAATCAGCCGCTTTCTCAAACTCCA
CCATTTTCTCAAGT*GAGTCAAATTAAGCCGCAGGCTCCACTCCTGGTGGTGCCCTTCCG
TCAATTCCTTTAAGTTTCAGCCTTGCGACCATACTCCCCCCGGAACCCAAAAACTTTGAT
TCCTCATAAGGTGCCAGCGGAGTCCTAAAAGCAACATCCGCTGATCCCTGGTCGGCATCG
TTTATGGTC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2H335TF 489 0 0
AGTTATTAATTTTTAGTATTTATTAATTTATCGAGTATAAGCCACAACTCGCATTGTTGC
GCTTCATCTTAGAATTTCTATTACACAGTCTTTAATCATATCAAAAGACAATCTATTTAG
CTATACAGACGTCCTGTATGAACGACTCGTGATTAAGTAGACAAAAAAAAACTTCTAAAA
ATCTTAGTATTGATGTTTGATTCTTGAACAGATAATCTTAAGAAGAAGTAATGGAGTCAT
CTTCTTCATTTGAGTCTTCTCTATCCGAAGAAGAAGAATCAGCCGCTTTCTCAAACTCCA
CCATTTTCTCAAGT*GAGTCAAATTAAGCCGCAGGCTCCACTCCTGGTGGTGCCCTTCCG
TCAATTCCTTTAAGTTTCAGCCTTGCGACCATACTCCCCCCGGAACCCAAAAACTTTGAT
TCCTCATAAGGTGCCAGCGGAGTCCTAAAAGCAACATCCGCTGATCCCTGGTCGGCATCG
TTTATGGTC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2EF18TF 489 0 0
AGTTATTAATTTTTAGTATTTATTAATTTATCGAGTATAAGCCACAACTCGCATTGTTGC
GCTTCATCTTAGAATTTCTATTACACAGTCTTTAATCATATCAAAAGACAATCTATTTAG
CTATACAGACGTCCTGTATGAACGACTCGTGATTAAGTAGACAAAAAAAA*CTTCTAAAA
ATCTTAGTATTGATGTTTGATTCTTGAACAGATAATCTTAAGAAGAAGTAATGGAGTCAT
CTTCTTCATTTGAGTCTTCTCTATCCGAAGAAGAAGAGTCAGCCGCTTTCTCAAACTCCA
CCATTTTCTCAAGT*GAGTCAAATTAAGCCGCAGGCTCCACTCCTGGTGGTGCCCTTCCG
TCAATTCCTTTAAGTTTCAGCCTTGCGACCATACTCCCCCCGGAACCCAAAAACTTTGAT
TCCTCATAAGGTGCCAGCGGAGTCCTAAAGGCAACATCCGCTGATCCCTGGTCGGCATCG
TTTATGGTC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2HA09JQ 270 0 0
CCCGTGTTGGGTCAAATTAAGCCGCAGGCTCCACTCCTGGTGGTGCCCTTCCGTCAATTC
CTTTAAGTTTCAGCCTTGCGACCATACTCCCCCCGGAACCCAAAAACTTTGATTTCTCAT
AAGGTGCCAGCGGAGTCCTAAAAGCAACATCCGCTGATCCCTGGTCGGCATCGTTTATGG
TTGAGACTAGGACGGTATCTGATCGTCTTCGAGCCCCCAACTTTCGTTCTTGATTAATGA
AAACATCCTTGGCAAATGCTTTCGCAGTT
C

QA 1 269 1 269
DS 

RD RR2HA09TF 270 0 0
CCCGTGTTGGGTCAAATTAAGCCGCAGGCTCCACTCCTGGTGGTGCCCTTCCGTCAATTC
CTTTAAGTTTCAGCCTTGCGACCATACTCCCCCCGGAACCCAAAAACTTTGATTTCTCAT
AAGGTGCCAGCGGAGTCCTAAAAGCAACATCCGCTGATCCCTGGTCGGCATCGTTTATGG
TTGAGACTAGGACGGTATCTGATCGTCTTCGAGCCCCCAACTTTCGTTCTTGATTAATGA
AAACATCCTTGGCAAATGCTTTCGCAGTT
C

QA 1 269 1 269
DS 

RD RR2BB05JQ 471 0 0
C
CCCGTGTTGAGTCAAATTAAGCCGCAGGCTCCACTCCTGGTGGTGCCCTTCCGTCAATTC
CTTTAAGTTTCAGCCTTGCGACCATACTCCCCCCGGAACCCAAAAACTTTGATTTCTCAT
AAGGTGCCAGCGGAGTCCTAAAAGCAACATCCGCTGATCCCTGGTCGGCATCGTTTATGG
TTGAGACTAGGACGGTATCTGATCGTCTTCGAGCCCCCAACTTTCGTTCTTGATTAATGA
AAACATCCTTGGCAAATGCTTTCGCAGTTGTTCGTCTTTCATAAATCCAAGAATTTCACC
TCTGACTATGAAATACGAATGCCCCCGACTGTCCCTGTTAATCATTACTCCGATCCCGAA
GGCCAACACAATAGGATCGAAATCCTATGATGTTATCCCATGCTAATGTATACAGAGCGT
AGGCTTGCTTTGAGCACTCTAATTTCTTCAAAGTAACAGCGCCGGAGGCC

QA 2 471 2 471
DS 

RD RR2BB05TF 471 0 0
C
CCCGTGTTGAGTCAAATTAAGCCGCAGGCTCCACTCCTGGTGGTGCCCTTCCGTCAATTC
CTTTAAGTTTCAGCCTTGCGACCATACTCCCCCCGGAACCCAAAAACTTTGATTTCTCAT
AAGGTGCCAGCGGAGTCCTAAAAGCAACATCCGCTGATCCCTGGTCGGCATCGTTTATGG
TTGAGACTAGGACGGTATCTGATCGTCTTCGAGCCCCCAACTTTCGTTCTTGATTAATGA
AAACATCCTTGGCAAATGCTTTCGCAGTTGTTCGTCTTTCATAAATCCAAGAATTTCACC
TCTGACTATGAAATACGAATGCCCCCGACTGTCCCTGTTAATCATTACTCCGATCCCGAA
GGCCAACACAATAGGATCGAAATCCTATGATGTTATCCCATGCTAATGTATACAGAGCGT
AGGCTTGCTTTGAGCACTCTAATTTCTTCAAAGTAACAGCGCCGGAGGCC

QA 2 471 2 471
DS 



AS 2 8

CO CL644Contig1 949 2 4 U
GAACCCCAAAGCGTCTCTCTTCATCTTCTTTCTCTTTCGTTTTTTTCTTAAATCGAAAAA
CCCTTCGATTATAATTGGATCTATTCTTCTTCCAATTCTTCATAAACGTCCCAAAGAGGA
TAAAGTCTGTTTCTTTCTGCAGAGAATCCTCCTCTCAGCAACTGGGTTTTTGAAGTTCTC
TACGAAAATTGATTTGGGTTTTCGTGAGGTTGAATTGGTGAAAAAGAGCCTATCTTGTGT
TCGATGATATTCCCCAGCGAGAGAAAAGGCGAAGACTTTTGATTCTTTTTTTGTATTTGT
TTTGTTGGAAGAGAGAGAGAGATGGCAGGTGGTGAAGATTGGATAGAACTCAAGTTTAGA
CTCGCAGATGGCACTGACATAGGTCCCACCAAGTACAATCAATCCATGACTGTTTCTTCT
CTCAAAGAGAAGATCATCTCTCAATGGCCTAAAGAGTCAGAAAACATTCCAAAGACTGTA
AATGATGTGAAGCTCATCAATGCCGGGAAGATACTAGACAACAACCGGACACTTGCTGAA
TCCAGGCTTCCCGTTGGCGAACTTCCCGGAATGGTCATCACTATGCATGTTGTTCTTCGC
CCTCCTACTTTAGACAAAAAGAGCGAAAAACTGCAGAATGATCCTCCAATGAAGAATCGA
TGCGCATGCACCATTTTGTAGCTGCAAGTAAATTGGATCATATAGAGAGATTTTAATCCT
TCATGATAAATGGCACTGGGTTGTGATGCTCCATGGAACAGGTGAGAAAGTTCCCTTACA
GGCATAGACATGAAAAAACAAAGGATCTTCACTACAGAACTTGTTTACATTTGTGTGGTT
GATAGTTTATTTTTCATCTTTTCTTCATTGTTTATCCAAAATGGCTCAAGAAAATGTACT
ACAATTCTTGAAGGATGTTTGGTTTTTTTAAATATAATACAATACGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ90TF U 1
AF RR2AJ90JQ C 175
BS 1 761 RR2AJ90TF
BS 762 762 RR2AJ90JQ
BS 763 835 RR2AJ90TF
BS 836 949 RR2AJ90JQ

RD RR2AJ90TF 835 0 0
GAACCCCAAAGCGTCTCTCTTCATCTTCTTTCTCTTTCGTTTTTTTCTTAAATCGAAAAA
CCCTTCGATTATAATTGGATCTATTCTTCTTCCAATTCTTCATAAACGTCCCAAAGAGGA
TAAAGTCTGTTTCTTTCTGCAGAGAATCCTCCTCTCAGCAACTGGGTTTTTGAAGTTCTC
TACGAAAATTGATTTGGGTTTTCGTGAGGTTGAATTGGTGAAAAAGAGCCTATCTTGTGT
TCGATGATATTCCCCAGCGAGAGAAAAGGCGAAGACTTTTGATTCTTTTTTTGTATTTGT
TTTGTTGGAAGAGAGAGAGAGATGGCAGGTGGTGAAGATTGGATAGAACTCAAGTTTAGA
CTCGCAGATGGCACTGACATAGGTCCCACCAAGTACAATCAATCCATGACTGTTTCTTCT
CTCAAAGAGAAGATCATCTCTCAATGGCCTAAAGAGTCAGAAAACATTCCAAAGACTGTA
AATGATGTGAAGCTCATCAATGCCGGGAAGATACTAGACAACAACCGGACACTTGCTGAA
TCCAGGCTTCCCGTTGGCGAACTTCCCGGAATGGTCATCACTATGCATGTTGTTCTTCGC
CCTCCTACTTTAGACAAAAAGAGCGAAAAACTGCAGAATGATCCTCCAATGAAGAATCGA
TGCGCATGCACCATTTTGTAGCTGCAAGTAAATTGGATCATATAGAGAGATTTTAATCCT
TCATGATAAATGGCACTGGGTTGTGATGCTCCATGGAACAG*TGAGAAAGTTCCCTTACA
GGCATAGACATGAAAAAACAAAGGATCTTCACTACAGAACTTGTTTACATTTGTG

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR2AJ90JQ 775 0 0
GTTCTCTACGAAAATTGATTTGGGTTTTCGTGAGGTTGAATTGGTGAAAAAGAGCCTATC
TTGTGTTCGATGATATTCCCCAGCGAGAGAAAAGGCGAAGACTTTTGATTCTTTTTTTGT
ATTTGTTTTGTTGGAAGAGAGAGAGAGATGGCAGGTGGTGAAGATTGGATAGAACTCAAG
TTTAGACTCGCAGATGGCACTGACATAGGTCCCACCAAGTACAATCAATCCATGACTGTT
TCTTCTCTCAAAGAGAAGATCATCTCTCAATGGCCTAAAGAGTCAGAAAACATTCCAAAG
ACTGTAAATGATGTGAAGCTCATCAATGCCGGGAAGATACTAGACAACAACCGGACACTT
GCTGAATCCAGGCTTCCCGTTGGCGAACTTCCCGGAATGGTCATCACTATGCATGTTGTT
CTTCGCCCTCCTACTTTAGACAAAAAGAGCGAAAAACTGCAGAATGATCCTCCAATGAAG
AATCGATGCGCATGCACCATTTTGTAGCTGCAAGTAAATTGGATCATATAGAGAGATTTT
AATCCTTCATGATAAATGGCACTGGGTTGTGATGCTCCATGGAACAGGTGAGAAAGTTCC
CTTACAGGCATAGACATGAAAAAACAAAGGATCTTCACTACAGAACTTGTTTACATTTGT
GTGGTTGATAGTTTATTTTTCATCTTTTCTTCATTGTTTATCCAAAATGGCTCAAGAAAA
TGTACTACAATTCTTGAAGGATGTTTGGTTTTTTTAAATATAATACAATACGTGC

QA 1 775 1 775
DS 



CO CL644Contig2 1265 6 7 U
CCAAACCGTGTTCTGCACGTATTGTATATATTTAAAAAAACAAACATCCTTCAAGAATTG
TAGTACATTTTCTTGAGCCACTTTGGATAAACAATGAAGAAAAGATGAAAAATAAATTAT
CAACCACACAAATGTAAACAAGTTCTGTAGTGAAGATCCTTTGTTTTTTTTTTTTCATGT
CTATGCCAGTAAGGGAACTTTCTCAGCTGTTCCATGGAGCATCACAACCCAGTGCTATTT
TATCATGAAGGATTAAAATCTCTCTATATGATCCAATTTACTTGCAGCTACAAAATGGCG
CATGCGCATCGATTCTTCATGGGAGGATCATTCTGCAGTTTTTCCCTCTTTTTGTCTAAA
GTAGGAGGGCGAAGAACAACATGCATAGTGATGACCATCCCGGGAAGTTCGCCAACGGGA
AGCCTGGATTCAGCAAGTGTCCTATTGTTGTCTAGTATCTTCCCGGCATTGATGAGCTTC
ACATCATTTACAGTCTTTGGAATGTTTTCTGAGTCTTTAGGCCATTGAGAGATGATCTTC
TCTTTGAGAGAAGAAACAGTCATAGATTGATTGTACTTGGTGGGACCTATGTCAGTGCCA
TCTGCGAGTCTAAACTTGAGTTCTATCCAATCTTCACCTGCCATCTCTCTCTCTCTCTAT
TCCACACAAAACCCAAATACAAAAAAGAATCAAAAGTCTTCGCCTTTTCTCTCTCTGGGG
AATATCATCGAACACAAGATAGGCTCTTTTTCACCAAAATTCAACCTAAATAAACGAAAA
CCCAAATCAAGTTTCGTAAGAAAACTTCAAAACCCAGTTGCTGAGAGGAGGATTCACTGC
TGAAAGAAACAGACTTTATCCTCTTTGGGACGGTCTATGAAGAAGAAGGACAGATCCAAT
TATAATTGAAGGGTTTTTCGATTTAAGAAAAAAACGAAAGAGAAAGAAGATGAAGAGAGA
CGCTTTGGGGTTGAAAGGCTGTGTCTTTGAGCAGCGGAGCACAAATTTTAATTTCTTTCT
TTCTCTAAGTGAGATTCTTCCTCGTTTTGACTTTTCTACCCTCAGTTAACCACACAAATT
ATGCTGACTTTTTCTTTTAATTTATCAAAGAATAAAATCTATAATTAACCTAGATTTGTT
TGATGGTGATATATATTGATAACGATAATGAGAAGATATTTTCTATATGTATATAATGCA
GATATTATTAAGTCTAAACTTTCTGGCCATGTTGTACAATATCAAAATGTACTAGTGGAT
TTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2CX62JQ U 376
AF RR2CX62TF C 362
AF RR2CU44JQ U 1
AF RR2CU44TF C 329
AF RR2AR65JQ C 688
AF RR2AR65TF U 688
BS 1 373 RR2CU44JQ
BS 374 374 RR2CU44TF
BS 375 528 RR2CU44JQ
BS 529 529 RR2CU44TF
BS 530 542 RR2CU44JQ
BS 543 688 RR2CU44TF
BS 689 1265 RR2AR65TF

RD RR2CX62JQ 103 0 0
ACAACATGCATAGTGATGACCATCCTGGGAAGTTCGCCAACGGGAAGCCTGGATTCCCCA
AGTGTCCTATTGTTGTCTAGTATCTTCCCGGCATTGATGA
ACT

QA 1 100 1 100
DS 

RD RR2CX62TF 172 0 0
TAGGAGGGCGAAGAACAACATGCATAGTGATGACCATCCTGGGAAGTTCGCCAACGGGAA
GCCTGGATTCAGCAAGTGTCCTATTGTTGTCTAGTATCTTCCCGGCATTGATGAGCTTCA
CATCATTTACAGTCTTTGGAATGTTTTCTGACTCTTTAGGCCATTGAGAGAT

QA 1 172 1 172
DS 

RD RR2CU44JQ 542 0 0
CCAAACCGTGTTCTGCACGTATTGTATATATTTAAAAAAACAAACATCCTTCAAGAATTG
TAGTACATTTTCTTGAGCCACTTTGGATAAACAATGAAGAAAAGATGAAAAATAAATTAT
CAACCACACAAATGTAAACAAGTTCTGTAGTGAAGATCCTTTGTTTTTTTTTTTTCATGT
CTATGCCAGTAAGGGAACTTTCTCAGCTGTTCCATGGAGCATCACAACCCAGTGCTATTT
TATCATGAAGGATTAAAATCTCTCTATATGATCCAATTTACTTGCAGCTACAAAATGGCG
CATGCGCATCGATTCTTCATGGGAGGATCATTCTGCAGTTTTTCCCTCTTTTTGTCTAAA
GTAGGAGGGCGAAAAACAACATGCATAGTGATGACCATCCCGGGAAGTTCGCCAACGGGA
AGCCTGGATTCAGCAAGTGTCCTATTGTTGTCTAGTATCTTCCCGGCATTGATGAGCTTC
ACATCATTTACAGTCTTTGGAATGTTTTCTGAGTCTTTAGGCCATTGAAAGATGATCTTC
TC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2CU44TF 563 0 0
CATTCTGCAGTTTT*CGCTCTTTT*GTCTAAAGTAGGAGGGCGAAGAACAACATGCATAG
TGATGACCATCCCGGGAAGTTCGCCAACGGGAAGCCTGGATTCAGCAAGTGTCCTATTGT
TGTCTAGTATCTTCCCGGCATTGATGAGCTTCACATCATTTACAGTCTTTGGAATGTTTT
CTGAGTCTTTAGGCCATTGAGAGATGATCTTCTCTTTGAGAGAAGAAACAGTCATAGATT
GATTGTACTTGGTGGGACCTATGTCAGTGCCATCTGCGAGTCTAAACTTGAGTTCTATCC
AATCTTCACCTGCCATCTCTCTCTCTCTCTATTCCACACAAAACCCAAATACAAAAAAGA
ATCAAAAGTCTTCGCCTCTTCTCTCTCTGGGGAATATCATCGAACACAAGATAGGCTCTT
TTTCACCAAAATTCAACCTAAATAAACGAAAACCCAAATCAAGTTTCGTAAGAAAACTTC
AAAACCCAGTTGCTGAGAGGAGGATTCACTGCTGAAAGAAACAGACTTTATCCTCTTTGG
GACG
GTCTATGAAGAAGAAGGAC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2AR65JQ 578 0 0
G
ATCAAAAGTCTTCGCCTTTTCTCTCTCTGGGGAATATCATCGAACACAAGATAGGCTCTT
TTTCACCAAAATTCAACCTAAATAAACGAAAACCCAAATCAAGTTTCGTAAGAAAACTTC
AAAACCCAGTTGCTGAGAGGAGGATTCACTGCTGAAAGAAACAGACTTTATCCTCTTTGG
GACGGTCTATGAAGAAGAAGGACAGATCCAATTATAATTGAAGGGTTTTTCGATTTAAGA
AAAAAACGAAAGAGAAAGAAGATGAAGAGAGACGCTTTGGGGTTGAAAGGCTGTGTCTTT
GAGCAGCGGAGCACAAATTTTAATTTCTTTCTTTCTCTAAGTGAGATTCTTCCTCGTTTT
GACTTTTCTACCCTCAGTTAACCACACAAATTATGCTGACTTTTTCTTTTAATTTATCAA
AGAATAAAATCTATAATTAACCTAGATTTGTTTGATGGTGATATATATTGATAACGATAA
TGAGAAGATATTTTCTATATGTATATAATGCAGATATTATTAAGTCTAAACTTTCTGGCC
ATGTTGTACAATATCAAAATGTACTAGTGGATTTCTC

QA 2 578 2 578
DS 

RD RR2AR65TF 578 0 0
G
ATCAAAAGTCTTCGCCTTTTCTCTCTCTGGGGAATATCATCGAACACAAGATAGGCTCTT
TTTCACCAAAATTCAACCTAAATAAACGAAAACCCAAATCAAGTTTCGTAAGAAAACTTC
AAAACCCAGTTGCTGAGAGGAGGATTCACTGCTGAAAGAAACAGACTTTATCCTCTTTGG
GACGGTCTATGAAGAAGAAGGACAGATCCAATTATAATTGAAGGGTTTTTCGATTTAAGA
AAAAAACGAAAGAGAAAGAAGATGAAGAGAGACGCTTTGGGGTTGAAAGGCTGTGTCTTT
GAGCAGCGGAGCACAAATTTTAATTTCTTTCTTTCTCTAAGTGAGATTCTTCCTCGTTTT
GACTTTTCTACCCTCAGTTAACCACACAAATTATGCTGACTTTTTCTTTTAATTTATCAA
AGAATAAAATCTATAATTAACCTAGATTTGTTTGATGGTGATATATATTGATAACGATAA
TGAGAAGATATTTTCTATATGTATATAATGCAGATATTATTAAGTCTAAACTTTCTGGCC
ATGTTGTACAATATCAAAATGTACTAGTGGATTTCTC

QA 2 578 2 578
DS 



AS 1 9

CO CL645Contig1 1147 9 41 U
ATACCCAATCCCGCGGATTAAACTCTAGTATTATAGTTACAAGACCTCAGTTATTACATA
AAAAATGAGGACTGCACTTGTAGTTGTGACTTTTCATATATATACAATATGAAACAACAT
CATATTTGTTGCAGAATGACAAAAATAAGTAAGAAAATAAAGATGATAGATATAT*AGTA
AACGAAGTTTACAAATTATCATGTTCAATTACCATTGCTCCTCTCCAGGTTTCACCGGCA
CCAACATCAATGGGAACGAGCATAGATGCAGGACCCGTGCACACAAAATATTGTTGCTTC
CCAAACTTGTCCCACATTGATCCTGGGGATCCCACGTACATGTCCTCGAACCCCATCCTT
ATCATCCTGAAGAACAATCCTCGTCCCTGATCAATGGTTTCATATTTAGAAGGTGGAGTG
TTATAGACGGCCTTAAGTCTCTCAGCCGGATGGGCACCATAGACTCTACTCATCTTCTTC
TCAAGAAGTGTAATAACAGAGTCTTCAACTGCCCAAACCCCTGGTTTTTCCCCATCTTCT
GACCCGAACCACCCGGAAGAGTCCGCCTTCATTGCCTCAGAAGGGGACAGTAGCTCGAAA
GGCGAAGACAATGGAGGGCTGGGGCAATAGGAGCAGCCCTTAAGCCCTTGAATTCCAGCA
CCACTCCGTTTCTTGAATCTCAAGGAACTTATAATCCCCGGTTTAAGGGAAACCGGTTTG
CGACCGTTGTTCTTCACCACCACTGCTGTTGCTATGCTTACTGGATAGAGAGAGACGATG
TAGGTTATGTCAAGAAATCCGGCCGTGCAGCTCAATTCAATCTGAAGAGCGTCAATGGCG
TCTGAATCAGTGTCCTTAACGGTCCAATCACAACCTGATAGTACTGAAGAAGCTTTTTCT
TCTTCGTTTATGATGACAAGACCAACCCCGCCTCTGGTTTTATTACCGTCCTCTACTGTG
TAAAGGACTTCCTCGAACCCATCGTCTTTCCAGTACACTTTTGGTTGATATGAAACAACA
TGAGCATCTGATAGACTCAGCTTTAAAGAGCTTCCGTTTCTGACCTTGAGCTCGACCATG
TTTGGTTCCGAGAATTTAATGCCTTTTCGTCCGAATTTTTCTTCAAGTCCTTCCGTTATT
GTCTGTG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 
40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB50JQ U 1
AF RR2G176JQ U 1
AF RR2CM95JQ U 3
AF RR2E947JQ U 74
AF RR2DO83JQ U 104
AF RR2E947TF C 299
AF RR2G176TF C 434
AF RR2GB50TF C 525
AF RR2CM95TF C 730
BS 1 133 RR2G176JQ
BS 134 134 RR2CM95JQ
BS 135 152 RR2G176JQ
BS 153 153 RR2CM95JQ
BS 154 264 RR2G176JQ
BS 265 265 RR2CM95JQ
BS 266 371 RR2G176JQ
BS 372 372 RR2CM95JQ
BS 373 413 RR2G176JQ
BS 414 414 RR2CM95JQ
BS 415 425 RR2G176JQ
BS 426 426 RR2CM95JQ
BS 427 440 RR2G176JQ
BS 441 446 RR2CM95JQ
BS 447 447 RR2E947JQ
BS 448 517 RR2CM95JQ
BS 518 518 RR2E947JQ
BS 519 570 RR2CM95JQ
BS 571 571 RR2E947JQ
BS 572 584 RR2CM95JQ
BS 585 585 RR2E947JQ
BS 586 608 RR2CM95JQ
BS 609 609 RR2E947JQ
BS 610 611 RR2CM95JQ
BS 612 612 RR2E947JQ
BS 613 617 RR2CM95JQ
BS 618 618 RR2E947JQ
BS 619 707 RR2CM95JQ
BS 708 708 RR2E947JQ
BS 709 719 RR2CM95JQ
BS 720 720 RR2E947JQ
BS 721 731 RR2CM95JQ
BS 732 732 RR2E947JQ
BS 733 762 RR2CM95JQ
BS 763 778 RR2E947JQ
BS 779 791 RR2DO83JQ
BS 792 829 RR2E947TF
BS 830 830 RR2G176TF
BS 831 1006 RR2E947TF
BS 1007 1089 RR2G176TF
BS 1090 1147 RR2CM95TF

RD RR2GB50JQ 398 0 0
ATACC
CAATCCCGCGGATTAAACTCTAGTATTATAGTTACAAGACCTCAGTTATTACATAAAAAA
TGAGGACTGCACTTGTAGTTGTGACTTTTCATATATATACAATATGAAACAACATCATAT
TTGTTGCAAAATGACAAAAATAAGTAAAAAAATAAAGATGATAGATATAT*AGTAAACGA
AGTTTACAAATTATCATGTTCAATTACCATTGCTCCTCTCCAGGTTTCACCGGCACCAAC
ATCAATGGGAACGAGCATAAATGCAGGACCCGTGCACACAAAATATTGTTGCTTCCCAAA
CTTGTCCCACATTGATCCTGGGGATCCCACGTACATGTCCTCGAACCCCATCCTTATCAT
CCTGAAAAACAATCCTCGTCCCTGATCAATGGT

QA 6 398 6 398
DS 

RD RR2G176JQ 440 0 0
ATACCCAATCCCGCGGATTAAACTCTAGTATTATAGTTACAAGACCTCAGTTATTACATA
AAAAATGAGGACTGCACTTGTAGTTGTGACTTTTCATATATATACAATATGAAACAACAT
CATATTTGTTGCAAAATGACAAAAATAAGTAAAAAAATAAAGATGATAGATATAT*AGTA
AACGAAGTTTACAAATTATCATGTTCAATTACCATTGCTCCTCTCCAGGTTTCACCGGCA
CCAACATCAATGGGAACGAGCATAAATGCAGGACCCGTGCACACAAAATATTGTTGCTTC
CCAAACTTGTCCCACATTGATCCTGGGGATCCCACGTACATGTCCTCGAACCCCATCCTT
ATCATCCTGAAAAACAATCCTCGTCCCTGATCAATGGTTTCATATTTAGAAGGGGGAGTG
TTATAAACGGCCTTAAGTCT

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR2CM95JQ 760 0 0
ACG
CAATCGCGCGGATTAAACTCTAGTATTATAGTTACAAGACCTCAGTTACTACATAGAAAA
TGAGGACTGCACTTGTAGTAGTGACTTTTCATATATATACAATATGAGACAACATCATAT
TTGTTGCAGAATGACAAAAATAAGTAAGAAAATAAAGATGATAGATATATTAGTAAACGA
AGTTTACAAATTATCATGTTCAATTACCATTGCTCCTCCCCAGGTTTCACCGGCACCAAC
ATCAATGGGAACGAGCATAGATGCAGGACCCGTGCACACAAAATATTGTTGCTTCCCAAA
CTTGTCCCACATTGATCCTGGGGATCCCACGTACATGTCCTCGAACCCCATCCTTATCAT
CCTGAAGAACAATCCTCGTCCCTGATCAATGGTTTCATATTTAGAAGGTGGAGTGTTATA
GACGGCCTTAAGTCTCTCAGCAGGATGGGCACCATAGACTCTACTCATCTTCTTCTCAAG
AAGTGTAATAACAGAGTCTTCAACTGCCCAAATCCCTGGTTTTTCCCCATCTTCTGACCC
GAACCACCCGGAAGAGTCCGCCTTCGTTGCCTCAGAAGGAGACAGTAGCTCGAAAGGCGA
AGATAACGGAGGACTGGGGCAATAGGAGCAGCCCTTAAGCCCTTGAATTCCAGCACCACT
CCGTTTCTTGAATCTCAAGGAACTTATAATCCCCGGTTTAAGCGAAACCGGTTTCCGACC
GTTGTTTTTCACCACCACTGCTGTTGCTATGCTTACT

QA 4 760 4 760
DS 

RD RR2E947JQ 705 0 0
GT
ACTTGTAGTTGTGACTTTTCATATATATACAATATGAAACAACATCATATTTGTTGCAGA
ATGACAAAAATAAGTAAGAAAATAAAGATGATAGATATAT*AGTAAACGAAGTTTACAAA
TTATCATGTTCAATTACCATTGCTCCTCTCCAGGTTTCACCGGCACCAACATCAATGGGA
ACGAGCATAGATGCAGGACCCGTGCACACAAAATATTGTTGCTTCCCAAACTTGTCCCAC
ATTGATCCTGGGGATCCCACGTACATGTCCTCGAACCCCATCCTTATCATCCTGAAGAAC
AATCCTCGTCCCTGATCAATGGTTTCATATTTAGAAGGTGGAGTGTTATAGACGGCCTTA
AGTCTCTCAGCCGGATGGGCACCATAGACTCTACTCATCTTCTTCTCAAGAAGTGTAATA
ACAGAGTCTTCAACTGCCCAAACCCCTGGTTTTTCCCCATCTTCTGACCCGAACCACCCG
GAAGAGTCCGCCTTCATTGCCTCAGAAGGGGACAGTAGCTCGAAAGGCGAAGACAATGGA
GGGCTGGGGCAATAGGAGCAGCCCTTAAGCCCTTGAATTCCAGCACCACTCCGTTTCTTG
AATCTCAAGGAACTTATAATCCCCGGTTTAAGGGAAACCGGTTTGCGACCGTTGTTCTTC
ACCACCA*TGCTGTTGCTATGCTTACTGGATAGAGAGAGACGA

QA 3 705 3 705
DS 

RD RR2DO83JQ 688 0 0
ACAC
TATGAAACAACATCATATTTGTTGCAGAATGACAAAA*TAAGTAAGAAAATAAAGATGAT
AGATATAT*AGTAAACGAAGTTTACAAATTATCATGTTCAATTACCATTGCTCCTCTCCA
GGTTTCACCGGCACCAACATCAATGGGAACGAGCATAGATGCAGGACCCGTGCACACAAA
ATATTGTTGCTTCCCAAACTTGTCCCACATTGATCCTGGGGATCCCACGTACATGTCCTC
GAACCCCATCCTTATCATCCTGAAGAACAATCCTCGTCCCTGATCAATGGTTTCATATTT
AGAAGGTGGAGTGTTGTAGACGGCCTTAAGTCTCTCAGCCGGATGGGCACCATAGACTCT
ACTCATCTTCTTCTCAAGAAGTGTAATAACAGAGTCTTCAACTGCCCAAATCCCTGGTTT
TTCCCCATCTTCTGACCCAAACCACCCGGAAGAGTCCGCCTTCATTGCCTCAGAAGGAGA
CAGCAGCTCGAAAGGCGAAGACAATGGAGGACTGGGGCAATAGGAGCAGCCCTTAAGCCC
TTGAATTCCAGCACCACTCCGTTTCTTGAATCTCAAGGAACTTATAATCCCCGGTTTAAG
GGAAACCGGTTTGCGACCGTTGTTCTTCACCACCACTGCTGTTGCTATGCTTACTGGATA
GAGAGAGACGATGTAGGTTATGTC

QA 5 688 5 688
DS 

RD RR2E947TF 709 0 0
TCCCAAACTTGTCCCACATTGATCCTGGGGATCCCACGTACATGTCCTCGAACCCCATCT
TTATCATC*TGAAGAACAATCCTCGTCCCTGATCAATGGTTTCATATTTAGAAGGTGGAG
TGTTATAGACGGCCTTAAGTCTCTCAGCCGGATGGGCACCATAGACTCTACTCATCTTCT
TCTCAAGAAGTGTAATAACAGAGTCTTCAACTGCCCAAACCCCTGGTTTTTCCCCATCTT
CTGACCCGAACCACCCGGAAGAGTCCGCCTTCATTGCCTCAGAAGGGGACAGTAGCTCGA
AAGGCGAAGACAATGGAGGGCTGGGGCAATAGGAGCAGCCCTTAAGCCCTTGAATTCCAG
CACCACTCCGTTTCTTGAATCTCAAGGAACTTATAATCCCCGGTTTAAGGGAAACCGGTT
TGCGACCGTTGTTCTTCACCACCA*TGCTGTTGCTATGCTTACTGGATAGAGAGAGACGA
TGTAGGTTATGTCAAGAAATCCGGCCGTGCAGCTCAATTCAATCTGAAGAGTGTCAATGG
CGTCTGAATCAGTGTCCTTAACGGTCCAATCACAACCTGATAGTACTGAAGAAGCTTTTT
CTTCTTCGTTTATGATGACAAGACCAACCCCGCCTCTGGTTTTATTACCGTCCTCTACTG
TGTAAAGGACTTCCTCGAACCCATCGTCTTTCCAGTACACTTTTGGTT
C

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2G176TF 656 0 0
TAAGTCTCTCAGC*GGATGGGCACCATAGACTCTACTCATCTTCTTCTCAAGAAGTGTAA
TAACAGAGTCTTCAACTGCCCAAACCCCTGGTTTTTCCCCATCTTCTGACCCGAACCACC
CGGAAGAGTCCGCCTTCATTGCCTCAGAAGGGGACAGTAGCTCGAAAGGCGAAGACAATG
GAGGGCTGGGGCAATAGGAGCAGCCCTTAAGCCCTTGAATTCCAGCACCACTCCGTTTCT
TGAATCTCAAGGAACTTATAATCCCCGGTTTAAGGGAAACCGGTTTGCGACCGTTGTTCT
TCACCACCACTGCTGTTGCTATGCTTACTGGATAGAGAGAGACGATGTAGGTTATGTCAA
GAAATCCGGCCGTGCAGCTCAATTCAATCTGAAGAGCGTCAATGGCGTCTGAATCAGTGT
CCTTAACGGTCCAATCACAACCTGATAGTACTGAAGAAGCTTTTTCTTCTTCGTTTATGA
TGACAAGACCAACCCCGCCTCTGGTTTTATTACCGTCCTCTACTGTGTAAAGGACTTCCT
CGAACCCATCGTCTTTCCAGTACACTTTTGGTTGATATGAAACAACATGAGCATCTGATA
GACTCAGCTTTAAAGAGCTTCCGTTTCTGACCTTGAGCTCGACCATGTTTGGTTCC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2GB50TF 565 0 0
TTTTTCCCCATCTTCTGACCCGAACCACCCGGAAGAGTCCGCCTTCATTGCCTCAGAAGG
GGACAGTAGCTCGAAAGGCGAAGACAATGGAGGGCTGGGGCAATAGGAGCAGCCCTTAAG
CCCTTGAATTCCAGCACCACTCCGTTTCTTGAATCTCAAGGAACTTATAATCCCCGGTTT
AAGGGAAACCGGTTTGCGACCGTTGTTCTTCACCACCACTGCTGTTGCTATGCTTACTGG
ATAGAGAGAGACGATGTAGGTTATGTCAAGAAATCCGGCCGTGCAGCTCAATTCAATCTG
AAGAGCGTCAATGGCGTCTGAATCAGTGTCCTTAACGGTCCAATCACAACCTGATAGTAC
TGAAGAAGCTTTTTCTTCTTCGTTTATGATGACAAGACCAACCCCGCCTCTGGTTTTATT
ACCGTCCTCTACTGTGTAAAGGACTTCCTCGAACCCATCGTCTTTCCAGTACACTTTTGG
TTGATATGAAACAACATGAGCATCTGATAGACTCAGCTTTAAAGAGCTTCCGTTTCTGAC
CTTGAGCTCGACCATGTTTGGTTCC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2CM95TF 418 0 0
TTT
TTCACCACCACTGCTGTTGCTATGCTTACTGGATAGAGAGAGACGATGTAGGTTATGTCG
AGAAATCCTGCCGTGCAGCTCAATTCAATCTGAAGAGCGTCAATGGCGTCTGAATCAGTG
TCCTTAACAGTCCAGTTACAACCTGATAGTACTGAAGAAGCTTTTTCTTCTTCGTTTATG
ATGACAAGACCAACCCCACCTCTGGTTTTATTACCGTCCTCTACTGTGTAAAGGACTTCC
TCGAATCCATCGTCTTTCCAGTACACTTTTGGTTGATATGAAACAACATGAGCGTCTGAT
AGACTCAGCTTTAAAGAGCTTCCGTTTCTGACCTTGAGCTCGACCATGTTCGGTTCCGAG
AATTTAATGCCTTTTCGTCCGAATTTTTCTTCAAGTCCTTCCGTTATTGTCTGTG

QA 4 418 4 418
DS 



AS 2 10

CO CL646Contig1 862 4 8 U
GGCCGGGTCCAAAACCGGGTACGGGTCGAAGTAAAAGTCGTTAATACAGCTAGCTAGGAT
CCGATAAAGACGGTGTCTCTCTCGTTTCCTCGCTGACACTTCTCTAATCTCTCTTCTTCT
TCTTCTTCCTCTTTCAAAAACAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGGAACAATGGCGGATCAGC
TCACCGACGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTG
ACGGTTGCATTACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTAGGACAGAACCCAA
CCGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAATGAAGTTGACGCTGATGGTAACGGCACCATTG
ATTTCCCCGAGTTCTTGAACCTCATGGCTCGCAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAG
AGCTCAAGGAGGCGTTCCGGGTGTTTGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTGCTG
AGCTTCGCCATGTGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGAGA
TGATCAAGGGAGCTGATGTTGATGGTGATGGCCAGATTAACTACGAGGAGTTTGTCAAGG
TCATGATGGCTAAGTGATTAAGGTTTTGGACCCAAAAAATGAAAAGTCCAAAACTTGGTT
TGCTGCCTCTATTCTTATATTACTGTTATGTTTTAAAATTCTTATTCATGGGACTCATGT
CTGCTTCCTTGTATGCTCTACATTTGAAGTCTGAACATTTCAAGTCTTTGCTTTGTTTTT
TTCTCATTGATCTTTTGTCAGTTGTAACTTGGTCTAGTTTCGGTGGTTTCTTATTGATGG
CCTCTAGTAAATGCATTGTACC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B759TF U 1
AF RR2H494TF U 5
AF RR2H494JQB C 570
AF RR2B759JQ C 503
BS 1 46 RR2B759TF
BS 47 47 RR2H494TF
BS 48 345 RR2B759TF
BS 346 346 RR2H494TF
BS 347 416 RR2B759TF
BS 417 417 RR2H494TF
BS 418 779 RR2B759TF
BS 780 862 RR2B759JQ

RD RR2B759TF 783 0 0
GGCCGGGTCCAAAACCGGGTACGGGTCGAAGTAAAAGTCGTTAATATAGCTAGCTAGGAT
CCGATAAAGACGGTGTCTCTCTCGTTTCCTCGCTGACACTTCTCTAATCTCTCTTCTTCT
TCTTCTTCCTCTTTCAAAAACAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGGAACAATGGCGGATCAGC
TCACCGACGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTG
ACGGTTGCATTACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTAGGACAGAACCCAA
CCGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAATGAAGTTGACGCTGATGTTAACGGCACCATTG
ATTTCCCCGAGTTCTTGAACCTCATGGCTCGCAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGTAAG
AGCTCAAGGAGGCGTTCCGGGTGTTTGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTGCTG
AGCTTCGCCATGTGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGAGA
TGATCAAGGGAGCTGATGTTGATGGTGATGGCCAGATTAACTACGAGGAGTTTGTCAAGG
TCATGATGGCTAAGTGATTAAGGTTTTGGACCCAAAAAATGAAAAGTCCAAAACTTGGTT
TGCTGCCTCTATTCTTATATTACTGTTATGTTTTAAAATTCTTATTCATGGGACTCATGT
CTGCTTCCTTGTATGCTCTACATTTGAAGTCTGAACATTTCAAGTCTTTGCTTTGTTTT
TTTC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2H494TF 763 0 0
GGGTCCAAAACCGGGTACGGGTCGAAGTAAAAGTCGTTAATACAGCTAGCTAGGATCCGA
TAAAGACGGTGTCTCTCTCGTTTCCTCGCTGACACTTCTCTAATCTCTCTTCTTCTTCTT
CTTCCTCTTTCAAAAACAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGGAACAATGGCGGATCAGCTCAC
CGACGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGACGG
TTGCATTACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTAGGACAGAACCCAACCGA
AGCAGAGCTTCAAGACATGATCAATGAAGTTGACGCTGATGGTAACGGCACCATTGATTT
CCCCGAGTTCTTGAACCTCATGGCTCGCAAGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGCT
CAAGGAGGCGTTCCGGGTGTTTGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTGCTGAGCT
TCGCCATGTGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGAGATGAT
CAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGCCAGATTAACTACGAGGAGTTTGTCAAGGTCAT
GATGGCTAAGTGATTAAG*TTTTGGACCCAAAAAATGAAAAGTCCAAAACTTGGTTTGCT
GCCTCTATTCTTATATTACTGTTATGTTTTAAA*TTCTTATTCATGGGACTCATGTCTGC
TTCCTTGTATGCTCTACATTTGAAGTCTGA*CATTTCAAGTC
A

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2H494JQB 154 0 0
GC
CCAGATTAACTACGAGGAGTTTGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGATTAAGGTTTTGGAC
CCAAAAAATGAAAAGTCCAAAACTTGGTTTGCTGCCTCTATTCTTATATTACTGTTATGT
TTTAAAATTTTTATTCATGGGACTCATGTCTG

QA 3 154 3 154
DS 

RD RR2B759JQ 360 0 0
CTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGAGATGATCAAGGGAGCTGATGTTGA
TGGTGATGGCCAGATTAACTACGAGGAGTTTGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGATTAAG
GTTTTGGACCCAAAAAATGAAAAGTCCAAAACTTGGTTTGCTGCCTCTATTCTTATATTA
CTGTTATGTTTTAAAATTCTTATTCATGGGACTCATGTCTGCTTCCTTGTATGCTCTACA
TTTGAAGTCTGAACATTTCAAGTCTTTGCTTTGTTTTTTTCTCATTGATCTTTTGTCAGT
TGTAACTTGGTCTAGTTTCGGTGGTTTCTTATTGATGGCCTCTAGTAAATGCATTGTACC

QA 1 360 1 360
DS 



CO CL646Contig2 859 6 10 U
GGGTCTCTCTCGTTTCCTCGCTGACACTTCTCTCTAATCTCTCTTCTTCTTCTTCCTCTT
TCAAAAACAAAAGAAAAAAA*GGAATCTAAAAGAAAGGAAAAAGGAACAATGGCGGATCA
GCTCACCGACGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGG
TGACGGTTGCATTACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTAGGACAGAACCC
AACCGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAATGAAGTTGACGCTGATGGTAACGGCACCAT
TGATTTCCCCGAGTTCTTGAACCTCATGGCTCGCAAGATGAAGGACACCGACTCAGAGGA
AGAGCTCAAGGAAGCGTTCCGGGTGTTTGATAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCAGC
TGAGCTTCGCCATGTGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGA
GATGATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGCCAGATTAACTACGAGGAGTTTGTCAA
GGTCATGATGGCTAAGTGATTAAGGTTTTGGACCCAAAAAA*TGAAAAGTTCCAAACTTG
GTTTGCTGCTGCCTCTATTCTTATATTACTGTTATGTTTTAAAATTCTTATTCATGGGAC
TCATGTCTGCTTCCCTGTGTGCTCTATTTTGAGTCTGGACATTTTCAAGTCTTTGCTTTG
TTTTCTTTTTTCAGTTGCTATTTTGTAAGTTGTAACTTGGTCTAGTTTCGGTGGTTTCTT
ATTGATGGTCTCTAGTAAAAGCATTGTATCATGGTTTTGTTAAATGCAGTTCTCCATTAA
AGTGGTCTCTTTCTCTCTC


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI72TF U 1
AF RR2E407TF U 1
AF RR2CD49TF U 1
AF RR2DI72JQ C 158
AF RR2E407JQ C 322
AF RR2CD49JQ C 4
BS 1 43 RR2CD49TF
BS 44 44 RR2DI72TF
BS 45 359 RR2CD49TF
BS 360 360 RR2DI72TF
BS 361 611 RR2CD49TF
BS 612 612 RR2E407TF
BS 613 723 RR2CD49TF
BS 724 726 RR2CD49JQ
BS 727 766 RR2CD49TF
BS 767 859 RR2CD49JQ

RD RR2DI72TF 559 0 0
GGG
TCTCTCTCGTTTCCTCGCTGGCACTTCTCTCTAATCTCTCTTCTTCTTCTTCCTCTTTCA
AAAACAAAAGAAAAAAA*GGAATCTAAAAGAAAAGAAAAAGGAACAATGGCGGATCAGCT
CACCGACGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGA
CGGTTGCATTACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTAGGACAGAACCCAAC
CGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAATGAAGTTGACGCTGATGGTAACGGCACCATTGA
TTTCCCCGAGTTCTTGAACCTCATGGCTCGCAAGATGAAGGACACCGACTCAGAGGAAGA
GCTCAAGGAAGCGTTCCGGGTGTTTGATAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCAGCTGA
GCTTCGCCATGTGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGAGAT
GATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGCCAGATTAACTACGAGGAGTTTGTCAAGGT
CATGATGGCTAAGTGA

QA 4 559 4 559
DS 

RD RR2E407TF 691 0 0
GGG
TCTCTCTCGTTTCCTCGCTGACACTTCTCTCTAATCTCTCTTCTTCTTCTTCCTCTTTCA
AAAACAAAAGAAAAAAAAGGAATCTAAAAGAAAAGAAAAAGGAACAATGGCGGATCAGCT
CACCGACGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGA
CGGTTGCATTACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTAGGACAGAACCCAAC
CGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAATGAAGTTGACGCTGATGGTAACGGCACCATTGA
TTTCCCCGAGTTCTTGAACCTCATGGCTCGCAAGATGAAGGACACCGACTCAGAGGAAGA
GCTCAAGGAAGCGTTCCGGGTGTTTGATAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCAGCTGA
GCTTCGCCATGTGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGAGAT
GATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGCCAGATTAACTACGAGGAGTTTGTCAAGGT
CATGATGGCTAAGTGATTAAGGTTTTGGACCCAAAAAAATGAAAAGTTCCAAACTTGGTT
TGCTGCTGCCTCTATTCTTATATTACTGTTATGTTTTAAA*TTCTTATTCATGGGACTCA
TGTCTGCTTCCCTGTGTGCTCTATTTTG

QA 4 691 4 691
DS 

RD RR2CD49TF 766 0 0
GGGTCTCTCTCGTTTCCTCGCTGACACTTCTCTCTAATCTCTCCTCTTCTTCTTCCTCTT
TCAAAAACAAAAGAAAAAAA*GGAATCTAAAAGAAAGGAAAAAGGAACAATGGCGGATCA
GCTCACCGACGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGG
TGACGGTTGCATTACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTAGGACAGAACCC
AACCGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAATGAAGTTGACGCTGATGGTAACGGCACCAT
TGATTTCCCCGAGTTCTTGAACCTCATGGCTCGCAAGATGAAGGACACCGACTCAGAGGG
AGAGCTCAAGGAAGCGTTCCGGGTGTTTGATAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCAGC
TGAGCTTCGCCATGTGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGA
GATGATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGCCAGATTAACTACGAGGAGTTTGTCAA
GGTCATGATGGCTAAGTGATTAAGGTTTTGGACCCAAAAAA*TGAAAAGTTCCAAACTTG
GTTTGCTGCTGTCTCTATTCTTATATTACTGTTATGTTTTAAAATTCTTATTCATGGGAC
TCATGTCTGCTTCCCTGTGTGCTCTATTTTGAGTCTGGACATTTTCAAGTCTTTGCTTTG
TTT**CTTTTTCAGTTGCTATTTTGTAAGTTGTAACTTGGTCTAGT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2DI72JQ 664 0 0
TTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGACGGTTGCATTACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTG
ATGCGTTCTCTAGGACAGAACCCAACCGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAATGAAGTT
GACGCTGATGGTAACGGCACCATTGATTTCCCCGAGTTCTTGAACCTCATGGCTCGCAAG
ATGAAGGACACCGACTCAGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCCGGGTGTTTGATAAGGAC
CAGAACGGTTTCATCTCAGCAGCTGAGCTTCGCCATGTGATGACAAACTTAGGTGAGAAG
CTCACTGACGAAGAGGTTGATGAGATGATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGCCAG
ATTAACTACGAGGAGTTTGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGATTAAGGTTTTGGACCCAA
AAAA*TGAAAAGTTCCAAACTTGGTTTGCTGCTGCCTCTATTCTTATATTACTGTTATGT
TTTAAAATTCTTATTCATGGGACTCATGTCTGCTTCCCTGTGTGCTCTATTTTGAGTCTG
GACATTTTCAAGTCTTTGCTTTGTTTTCTTTTTTCAGTTGCTATTTTGTAAGTTGTAACT
TGGTCTAGTTTCGGTGGTTTCTTATTGATGGTCTCTAATAAAAGCATTGTATCATGGTTT
TG
TC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2E407JQ 500 0 0
CCTCATGGCTCGCAAGATGAAGGACACCGACTCAGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCCG
GGTGTTTGATAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCAGCTGAGCTTCGCCATGTGATGAC
AAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGAGATGATCAAGGAAGCTGATGT
TGATGGTGATGGCCAGATTAACTACGAGGAGTTTGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGATT
AAGGTTTTGGACCCAAAAAAATGAAAAGTTCCAAACTTGGTTTGCTGCTGCCTCTATTCT
TATATTACTGTTATGTTTTAAAATTCTTATTCATGGGACTCATGTCTGCTTCCCTGTGTG
CTCTATTTTGAGTCTGGACATTTTCAAGTCTTTGCTTTGTTTTCTTTTTTCAGTTGCTAT
TTTGTAAGTTGTAACTTGGTCTAGTTTCGGTGGTTTCTTATTGATGGTCTCTAGTAAAAG
CATTGTATCATGGTTTTG
CT

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2CD49JQ 856 0 0
TCTCTCTCGTTTC*TCGCTGACACT*CTCTCTAATCTCTC*TCTTCTTCTTCCTCTTTCA
AAA*CAAAAGAAAAAA**GGAATCTAAAAGAAAGGAAAAAGGAACAATGGCGGATCAGCT
CACCGACGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCTTATTCGACAAGGATGGTGA
CGGTTGCATTACCACCAAGGAGCTGGGAACTGTGATGCGTTCTCTAGGACAGAACCCAAC
CGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAATGAAGTTGACGCTGATGGTAACGGCACCATTGA
TTTCCCCGAGTTCTTGAACCTCATGGCTCGCAAGATGAAGGACACCGACTCAGAGGGAGA
GCTCAAGGAAGCGTTCCGGGTGTTTGATAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCAGCAGCTGA
GCTTCGCCATGTGATGACAAACTTAGGTGAGAAGCTCACTGACGAAGAGGTTGATGAGAT
GATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGCCAGATTAACTACGAGGAGTTTGTCAAGGT
CATGATGGCTAAGTGATTAAGGTTTTGGACCCAAAAAA*TGAAAAGTTCCAAACTTGGTT
TGCTGCTGTCTCTATTCTTATATTACTGTTATGTTTTAAAATTCTTATTCATGGGACTCA
TGTCTGCTTCCCTGTGTGCTCTATTTTGAGTCTGGACATTTTCAAGTCTTTGCTTTGTTT
TCTTTTTTCAGTTGCTATTTTGTAAGTTGTAACTTGGTCTAGTTTCGGTGGTTTCTTATT
GATGGTCTCTAGTAAAAGCATTGTATCATGGTTTTGTTAAATGCAGTTCTCCATTAAAGT
GGTCTCTTTCTCTCTC

QA 1 856 1 856
DS 



AS 2 7

CO CL647Contig1 950 2 4 U
GGGGTCTCATAACCTCCACAAAAACCTCATCCATGGCGATCCGTACCTACATCTCAGCAA
CATCCACAACTCCGCCGATTCCTCAGGATCCTTCACGCAGTCCTCTCCCAACCAAAATCA
TTCTACCAAACAAGAAACCTGAGAAATGGTCCACCGGCGTCGCTCCCGGAGAGTACGGTG
GTCCTCCGACCACCACGAAGCTTCGTAAGTACTGGGGAGGAGAGAAAGAAGATCCCATTA
CCTCCAAGGACTTGATATGGAACAGAGATTTCATGGATCAGATGAAGAAACTGTTCGATT
CCCCTGATGATGCTCCTCTCGACCCATCTTCCTCTAAGGAAGAGTCATCTGGGTTTCTGA
GCTTTAATAGAGTTATGAGTCTTGACAGTATGGATGTTGATTTAAGCAAAGAGCTTGCTT
CGCCTTCTAAATCCGTCTTAAGAGATCTTGAAGCCTCCAAATCCGAAACCAACAGGCAGA
TGAGTAAAGCTAGAGTGTCTCCTAAATGGAAGCTGGCGCCAACACGTCGTGAGCAGGATA
AATGGGATAGAGCAACCAAGGCCGCAACTGGTGGCAGTGATGTGATGTTTAGGGAACTGA
AGCGGCCGCGTGGTGACCCCCAAGTGTTGGCTGCTGAATCCAGGGAACAATATTACAAGC
TGAAGGATAAGCTACAGCTTCTCACAGTTGGCATTGGTGGTGTAGGTTTAGTCTCTGCTT
ATATTTCATACACCCCAGAGATTACACTTAGTTTTGGTGCTGGCTTGATGGGTTCGTTAG
CATATATGAGAATGCGGTAACACTGTAGATGCCATGGCAGATGGAGCCAGAGGAGTTATG
AAAGGTGCATCTGGGCAGCCACGCTTACTTGTCCCCGTTGTGTTGGTTATGATATTCAAT
AGATGGAACGCATACTTGTTCCTGAGTATGGATTCATGCACTTGGAGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK90TF U 1
AF RR2C352TF U 219
BS 1 665 RR2DK90TF
BS 666 666 RR2C352TF
BS 667 691 RR2DK90TF
BS 692 950 RR2C352TF

RD RR2DK90TF 695 0 0
GGGGTCTCATAACCTCCACAAAAACCTCATCCATGGCGATCCGTACCTACATCTCAGCAA
CATCCACAACTCCGCCGATTCCTCAGGATCCTTCACGCAGTCCTCTCCCAACCAAAATCA
TTCTACCAAACAAGAAACCTGAGAAATGGTCCACCGGCGTCGCTCCCGGAGAGTACGGTG
GTCCTCCGACCACCACGAAGCTTCGTAAGTACTGGGGAGGAGAGAAAGAAGATCCCATTA
CCTCCAAGGACTTGATATGGAACAGAGATTTCATGGATCAGATGAAGAAACTGTTCGATT
CCCCTGATGATGCTCCTCTCGACCCATCTTCCTCTAAGGAAGAGTCATCTGGGTTTCTGA
GCTTTAATAGAGTTATGAGTCTTGACAGTATGGATGTTGATTTAAGCAAAGAGCTTGCTT
CGCCTTCTAAATCCGTCTTAAGAGATCTTGAAGCCTCCAAATCCGAAACCAACAGGCAGA
TGAGTAAAGCTAGAGTGTCTCCTAAATGGAAGCTGGCGCCAACACGTCGTGAGCAGGATA
AATGGGATAGAGCAACCAAGGCCGCAACTGGTGGCAGTGATGTGATGTTTAGGGAACTGA
AGCGGCCGCGTGGTGACCCCCAAGTGTTGGCTGCTGAATCCAGGGAACAATATTACAAGC
TGAAG*ATAAGCTACAGCTTCTCACAGTTGG
CATT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2C352TF 732 0 0
GGAGAGAAAGAAGATCCCATTACCTCCAAGGACTTGATATGGAACAGAGATTTCATGGAT
CAGATGAAGAAACTGTTCGATTCCCCTGATGATGCTCCTCTCGACCCATCTTCCTCTAAG
GAAGAGTCATCTGGGTTTCTGAGCTTTAATAGAGTTATGAGTCTTGACAGTATGGATGTT
GATTTAAGCAAAGAGCTTGCTTCGCCTTCTAAATCCGTCTTAAGAGATCTTGAAGCCTCC
AAATCCGAAACCAACAGGCAGATGAGTAAAGCTAGAGTGTCTCCTAAATGGAAGCTGGCG
CCAACACGTCGTGAGCAGGATAAATGGGATAGAGCAACCAAGGCCGCAACTGGTGGCAGT
GATGTGATGTTTAGGGAACTGAAGCGGCCGCGTGGTGACCCCCAAGTGTTGGCTGCTGAA
TCCAGGGAACAATATTACAAGCTGAAGGATAAGCTACAGCTTCTCACAGTTGGCATTGGT
GGTGTAGGTTTAGTCTCTGCTTATATTTCATACACCCCAGAGATTACACTTAGTTTTGGT
GCTGGCTTGATGGGTTCGTTAGCATATATGAGAATGCGGTAACACTGTAGATGCCATGGC
AGATGGAGCCAGAGGAGTTATGAAAGGTGCATCTGGGCAGCCACGCTTACTTGTCCCCGT
TGTGTTGGTTATGATATTCAATAGATGGAACGCATACTTGTTCCTGAGTATGGATTCATG
CACTTGGAGTCG

QA 1 732 1 732
DS 



CO CL647Contig2 1345 5 20 U
AAAGAAAGAAAAGTTGGAAAAAATATCATTGAGACAAAAGTATATCAATAATTAACTTGT
TTTTATACAGTTCATAAAAATGATCATCTTTATGAACTTATGATATCTCTTGGTAGTTTG
CTGCTATAATATGAGTTTATTAGTATGAATACATTTCCTTACAACATCTGACTTTGACCT
ACTCACCGGCCTTTGACCACATAACAATCTAACTTGTTTATATAGACACGGAAGTTGGTG
GCTTTAGACATCGGCCTTTTGAGTAGAAATGCTGATGGCTTCTTCTATGGCTTGAAAGAA
CGTAGCAATTTTGTAAGTAAAGAACCCAACCAACATTGGTATCAACTCCAAGTGCATGAA
TCCATACTCAGGAACAAGTATTGCGTTCCATCTATTGAATATCATAACCAACACAACGGG
GACAAGTAAGCGTGGCTGTCCAGATGCACCTTTCATAACTCCTCTGGCTCCATCTGCCAT
GGCATCTACAGTGTTACCCAGCATTCTCATATATGCTAACGAACCCATCAAGCCAGCACC
AAAACTAAGTGTAATCTCTGGGGTGTATGAAATATAAGCAGAGACTAAACCTACACCACC
AATACCAACTGTGAGAAGCTGTAGCTTATCCTTCAGCTTGTAATATTGTTCCCTGGATTC
AGCAGCCAACACTTCGGGGTCACCACGTGGCCGCCTCAGGTCCCTAAACATCACATCACT
GCCACCAGTTGCGGCCTTGGTTGCTCTATCCCATTTATCTTGCTCACGACGCGTAGGTGC
CAGCTTCCATTTAGGAGACACTCTAGCTTTACTCATCTGCCTGTTGGCTGGGGATTTGGA
GGCCTCAAGATCTCTTAAGACGGATTTAGAAGGCGAAGCAAGCTCTTTGCTTAAGTCAAC
ATCCATACTGTCAAGACTCATAACTCTATTAAAGCTCAGAAACCCAGATGACTCTTCCTT
AGAGGGAGATGGGTCGAGAGCATCATCATCAGGGGAATCGAACAGCTTCTTCATCTGATC
CATGAAGTCTCTGTTCCATATCAAGTCTTTGGAAGTAATGGGATCTTCTTTCTCTCCTCC
CCAGTACTTACGAAGCTTCGTGGTGGTCGGAGGACCACCGTACTCTCCGGGGGCGACGCC
GGTGGACCATTTCTCCGGTTTCTTGTTTGGTAGGATGATTTTGGTTGGGAGAGGACTGCG
TGAAGGGTCCTGAGGAATCGGCGGTGTGGTGGATGTTGCTGAGATGTAGGTACGGATCGC
CATGGATGAGGTTTTTGTGGAGGTTATGAGACGTCTCGGGTTAGTAGTGACGAAGAATGT
GTAGCGAGTGATTACGAGTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2DM47JQ U 1
AF RR2DR68JQ U 123
AF RR2H850JQ U 124
AF RR2H850TF C 607
AF RR2DR68TF C 763
BS 1 224 RR2DM47JQ
BS 225 225 RR2DR68JQ
BS 226 246 RR2DM47JQ
BS 247 247 RR2DR68JQ
BS 248 265 RR2DM47JQ
BS 266 266 RR2DR68JQ
BS 267 297 RR2DM47JQ
BS 298 298 RR2DR68JQ
BS 299 321 RR2DM47JQ
BS 322 322 RR2DR68JQ
BS 323 574 RR2DM47JQ
BS 575 757 RR2DR68JQ
BS 758 758 RR2H850JQ
BS 759 829 RR2DR68JQ
BS 830 830 RR2H850JQ
BS 831 870 RR2DR68JQ
BS 871 871 RR2H850JQ
BS 872 893 RR2DR68JQ
BS 894 919 RR2H850JQ
BS 920 1345 RR2H850TF

RD RR2DM47JQ 574 0 0
AAAGAAAGAAAAGTTGGAAAAAATATCATTGAGACAAAAGTATATCAATAATTAACTTGT
TTTTATACAGTTCATAAAAATGATCATCTTTATGAACTTATGATATCTCTTGGTAGTTTG
CTGCTATAATATGAGTTTATTAGTATGAATACATTTCCTTACAACATCTGACTTTGACCT
ACTCACCGGCCTTTGACCACATAACAATCTAACTTGTTTATATAAACACGGAAGTTGGTG
GCTTTAAACATCGGCCTTTTGAGTAAAAATGCTGATGGCTTCTTCTATGGCTTGAAAAAA
CGTAGCAATTTTGTAAGTAAAAAACCCAACCAACATTGGTATCAACTCCAAGTGCATGAA
TCCATACTCAGGAACAAGTATTGCGTTCCATCTATTGAATATCATAACCAACACAACGGG
GACAAGTAAGCGTGGCTGTCCAGATGCACCTTTCATAACTCCTCTGGCTCCATCTGCCAT
GGCATCTACAGTGTTACCCAGCATTCTCATATATGCTAACGAACCCATCAAGCCAGCACC
AAAACTAAGTGTAATCTCTGGGGTGTATGAAATA

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2DR68JQ 771 0 0
G
CTATAATATGAGTTTATTAGTATGAATACATTTCCTTACAACATCTGACTTTGACCTACT
CACCGGCCTTTGACCACATAACAATCTAACTTGTTTATATAGACATGGAAGTTGGTGGCT
TTAGACATCGGCCTTTTGAGTAGAAATGCTGATGGCTTCTTCTATGGCTTGAAAGAACGT
AGCAATTTTGTAAGTAAAGAACCCAACCAACATTGGTATCAACTCCAAGTGCATGAATCC
ATACTCAGGAACAAGTATTGCGTCCCATCTATTGAATATCATAACCAACACAACGGGGAC
AAGTAAGCGTGGCTGTCCAGATGCGCCTTTCATAACTCCTCTGGCTCCATCTGCCATGGC
ATCTACAGTGTTACCCAGCATTCTCATATATGCTAACGAACCCATCAAGCCAGCACCAAA
ACTAAGTGTAATCTCTGGGGTGTATGAAATATAAGCAGAGACTAAACCTACACCACCAAT
ACCAACTGTGAGAAGCTGTAGCTTATCCTTCAGCTTGTAATATTGTTCCCTGGATTCAGC
AGCCAACACTTCGGGGTCACCACGTGGCCGCCTCAGGTCCCTAAACATCACATCACTGCC
ACCAGTTGCGGCCTTGGTTGCTCTATCCCATTTACCTTGCTCACGACGCGTAGGTGCCAG
CTTCCATTTAGGAGACACTCTAGCTTTACTCATCTGCCTGTTGGCTTGGGATTTGGAGGC
CTCAAGATCTCTTAAGACGGATTTAGA*GGCGAAGCAAGCTCTTTGCTTA

QA 2 771 2 771
DS 

RD RR2H850JQ 796 0 0
CTATAATATGAGTTTATTAGTATGAATACATTTCCTTACAACATCTGACTTTGACCTACT
CACCGGCCTTTGACCACATAACAATCTAACTTGTTTATATAGACACGGAAGTTGGTGGCT
TTAGACATCGGCCTTTTGAGTAGAAATGCTGATGGCTTCTTCTGTGGCTTGAAAGAACGT
AGCAATTTTGTAAGTAAAGAACCCAACCAACATTGGTATCAACTCCAAGTGCATGAATCC
ATACTCAGGAACAAGTATTGCGTTCCATCTATTGAATATCATAACCAACACAACGGGGAC
AAGTAAGCGTGGCTGTCCAGATGCACCTTTCATAACTCCTCTGGCTCCATCTGCCATGGC
ATCTACAGTGTTACCCAGCATTATCATATATGCTAACGAACCCATCAAGCCAGCACCAAA
ACTAAGTGTAATCTCTGGGGTGTATGAAATATAAGCAGAGACTAAACCTACACCACCAAT
ACCAACTGTGAGAAGCTGTAGCTTATCCTTCAGCTTGTAATATTGTTCCCTGGATTCAGC
AGCCAACACTTCGGGGTCACCACGTGGCCGCCTCAGGTCCCTAAACATCACATCACTGCC
ACCAGTTGCGGCCTTGGTTGCTCTATCCCATTTATCTTGCTCACGACGCGTAGGTGCCAG
CTTCCATTTAG***ACACTCTAGCTTTACTCATCTGCCTGTTGGCTGGGGATTTGGAGGC
TTCAAGATCTCTTAAGACGGATTTAGAAGGCGAAGCAAGCTCTTTGCTTAAGTCAACATC
CATACTGTCAAGACTC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2H850TF 739 0 0
AACTGTGAGAAGCTGTAGCTTATC*TTCAGCTTGTAATATTGTTCCCTGGATTCAGCAGC
CAACACTTCGGGGTCACCACGTGGCCGCCTCAGGTCCCTAAACATCACATCACTGCCACC
AGTTGCGGCCTTGGTTGCTCTATCCCATTTATCTTGCTCACGACGCGTAGGTGCCAGCTT
CCATTTAG***ACACTCTAGCTTTACTCATCTGCCTGTTGGCTGGGGATTTGGAGGCTTC
AAGATCTCTTAAGACGGATTTAGAAGGCGAAGCAAGCTCTTTGCTTAAGTCAACATCCAT
ACTGTCAAGACTCATAACTCTATTAAAGCTCAGAAACCCAGATGACTCTTCCTTAGAGGG
AGATGGGTCGAGAGCATCATCATCAGGGGAATCGAACAGCTTCTTCATCTGATCCATGAA
GTCTCTGTTCCATATCAAGTCTTTGGAAGTAATGGGATCTTCTTTCTCTCCTCCCCAGTA
CTTACGAAGCTTCGTGGTGGTCGGAGGACCACCGTACTCTCCGGGGGCGACGCCGGTGGA
CCATTTCTCCGGTTTCTTGTTTGGTAGGATGATTTTGGTTGGGAGAGGACTGCGTGAAGG
GTCCTGAGGAATCGGCGGTGTGGTGGATGTTGCTGAGATGTAGGTACGGATCGCCATGGA
TGAGGTTTTTGTGGAGGTTATGAGACGTCTCGGGTTAGTAGTGACGAAGAATGTGTAGCG
AGTGATTACGAGTTCTCCC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2DR68TF 580 0 0
CTCACGACGCGTAGGTGCCAGCTTCCATTTAGGAGACACTCTAGCTTTACTCATCTGCCT
GTTGGCTTGGGATTTGGAGGCCTCAAGATCTCTTAAGACGGATTTAGAAGGCGAAGCAAG
CTCTTTGCTTAAGTCAACATCCATACTGTCAAGACTCATAACTCTATTAAAGCTCAGAAA
CCCAGATGACTCTTCCTTAGAGGGAGATGGGTCGAGAGCATCATCATCAGGGGAATCGAA
CAGCTTCTTCATCTGATCCATGAAGTCTCTGTTCCATATCAAGTCTTTGGAAGTAATGGG
ATCTTCTTTCTCTCCTCCCCAGTACTTACGAAGCTTCGTGGTGGTCGGAGGACCACCGTA
CTCTCCGGGGGCGACGCCGGTGGACCATTTCTCCGGTTTCTTGTTTGGTAGGATGATTTT
GGTTGGGAGAGGACTGCGTGAAGGGTCCTGAGGAATCGGCGGTGTGGTGGATGTTGCTGA
GATGTAGGTACGGATCGCCATGGATGAGGTTTTTGTGGAGGTTATGAGACGTCTCGGGTT
AGTAGTGACGAAGAATGTGTAGCGAGTGATTACGAGTTC
C

QA 1 579 1 579
DS 



AS 3 10

CO CL648Contig1 848 4 12 U
CATCCACAATGCTCCATTGTAATACAATTAATAAACAAAACAAAGGCAGTGTTAAATATG
ACTTTATTTGAGATGGGAAACACAAATGCTTTTCAAGTTTACTGGTCTCATATTTCAACA
AACAGAATCTTAATACCATTTCTTGCCTGTCCCCAACATAATACATTTAACACAACATCA
CACTAGTTTAGAGTTTACTGGTCGGCTTGGCCCTGGACCTCTTCTCCACAACACGAGAGA
GTTCCTTGACAGCATCTTTGGGTAAATGACGAGGTTTGCTAAGCCACTGTCCATTATCTA
CCATCATCGTCAGTCCATTCACATACTTCCCGGAATCACAGCTGAGGTAAATTGCAGCCA
TGGCGACATCCCACTTCTCACCGAGTTTATAGAGAGGTATATAATCTCCTGCTTTGTTCT
CAATCTCGTCAGGTCCAAGTTTACTCATCCCAGGTGTATCTCCGATGGGGCCTGGCGCAA
TCCCGTTCACTCTAATCTCGTAGTCAGTTCCCCACTCCAATGCCAAGTTCCTTGTCGTAG
CATCAACTGCAGCCTTGGCTGCAGAGACATGGACTTGGTACCAAGAAGCAGTGTAGTGCA
AAGTAGCACTAATGTTGAGAATCGAACCGCCGCCGCTTGACGAGTCTTTCCCGGGGCCTC
CTTTCTTGAGATACTTGAGTGCTTCACGGCACATGTTGAATGTTCCTACAGCGTCAATGT
CCAAAACTGTTCGGAAGCCATTGGTGGACAAATCCTCAGCAGCTGCGAGGAAGTTTCCAG
CTGCGGCGTTGACGAGGATATCAACCTTACCGAAATGGTTAAAAGTTGACTCGACGACTC
TTCTTGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW62JQ U 51
AF RR2DW15JQ U 50
AF RR2B005JQ U 1
AF RR2AW62TFB C 335
BS 1 280 RR2B005JQ
BS 281 281 RR2AW62JQ
BS 282 344 RR2B005JQ
BS 345 345 RR2AW62JQ
BS 346 480 RR2B005JQ
BS 481 481 RR2AW62JQ
BS 482 579 RR2B005JQ
BS 580 580 RR2AW62TFB
BS 581 725 RR2B005JQ
BS 726 726 RR2AW62TFB
BS 727 791 RR2B005JQ
BS 792 848 RR2AW62TFB

RD RR2AW62JQ 447 0 0
GTTAAATATGACTTTATTTGAGATGGGAAACACAAATGCTTTTCAAGTTTACTGGTCTCA
TATTTCAACAAACAGAATCTTAATACCATTTCTTGCCTGTCCCCAACATAATACATTTAA
CACAACATCACACTAGTTTAGAGTTTACTGGTCGGCTTGGCCCTGGACCTCTTCTCCACA
ACACGAGAGAGTTCCTTGACAGCATCTTTGGGTAAATGACGAGGTTTGCTAAGCCACTGT
CCATTATCTACCATCATCGTCAGTCCGTTCACATACTTCCCGGAATCACAGCTGAGGTAA
ATTGCAGCCATGGCGACATCCCACTTCTCACCGAGTTTATAAAAAGGTATATAATCTCCT
GCTTTGTTCTCAATCTCGTCAGGTCCAAGTTTACTCATCCCAGGTGTATCTCCGATGGGG
CCTGGCGCAATCCCGTTCACTCTAATC

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR2DW15JQ 512 0 0
A
GTTAAATGTGACTTTATTTGAGATGGGAAACACAAATGCTTTTCAAGTTTACTGGTCTCA
TATTTCAACAAACAGAGTCTTAATACCATTTCTTGCCTGTCCCCAACATAATACATT*AA
CACAACAACACACTAGTTTAGAGTTTACTGGTCGGCTTGGCCCTGGACCTCTTCTCCACA
ACACGAGAGAGTTCCTTGACAGCATCTTTGGGTAAATGACGAGGTTTGCTAAGCCACTGT
CCATTATCTACCATCATTGTCAGTCCATTCACATACTTCCCGGAATCACAGCTGAGGTGA
ATTGCAGCCATGGCGACATCCCACTTCTCACCAAGTTTATAGAGAGGTATATAATCTCCT
GCTTTGTTCTCAATCTCGTCAGGTCCAAGTTTACTCATCCCAGGTGTATCTCCGATGGGG
CCTGGCGCAATCCCGTTCACTCTAATCTCGTAGTCAGTTCCCCACTCCAATGCCAAGTTC
CTTGTCGTAGCATCAACTGCAGCCTTGGCTG

QA 2 512 2 512
DS 

RD RR2B005JQ 791 0 0
CATCCACAATGCTCCATTGTAATACAATTAATAAACAAAACAAAGGCAGTGTTAAATATG
ACTTTATTTGAGATGGGAAACACAAATGCTTTTCAAGTTTACTGGTCTCATATTTCAACA
AACAGAATCTTAATACCATTTCTTGCCTGTCCCCAACATAATACATTTAACACAACATCA
CACTAGTTTAGAGTTTACTGGTCGGCTTGGCCCTGGACCTCTTCTCCACAACACGAGAGA
GTTCCTTGACAGCATCTTTGGGTAAATGACGAGGTTTGCTGAGCCACTGTCCATTATCTA
CCATCATCGTCAGTCCATTCACATACTTCCCGGAATCACAGCTGGGGTAAATTGCAGCCA
TGGCGACATCCCACTTCTCACCGAGTTTATAGAGAGGTATATAATCTCCTGCTTTGTTCT
CAATCTCGTCAGGTCCAAGTTTACTCATCCCAGGTGTATCTCCGATGGGGCCTGGCGCAA
CCCCGTTCACTCTAATCTCGTAGTCAGTTCCCCACTCCAATGCCAAGTTCCTTGTCGTAG
CATCAACTGCAGCCTTGGCTGCAGAGACATGGACTTGGTGCCAAGAAGCAGTGTAGTGCA
AAGTAGCACTAATGTTGAGAATCGAACCGCCGCCGCTTGACGAGTCTTTCCCGGGGCCTC
CTTTCTTGAGATACTTGAGTGCTTCACGGCACATGTTGAATGTTCCTACAGCGTCAATGT
CCAAAGCTGTTCGGAAGCCATTGGTGGACAAATCCTCAGCAGCTGCGAGGAAGTTTCCAG
CTGCGGCGTTG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2AW62TFB 514 0 0
ATCACAGCTGAGGTAAAT*GCAGCCATGGCGACATCCCACTTCTCACCGAGTTTATAGAG
AGGTATATAATCTCCTGCTTTGTTCTCAATCTCGTCAGGTCCAAGTTTACTCATCCCAGG
TGTATCTCCGATGGGGCCTGGCGCAATCCCGTTCACTCTAATCTCGCAGTCAGTTCCCCA
CTCCAATGCCAAGTTCCTTGTCGTAGCATCAACTGCAGCCTTGGCTGCAGAGACATGGAC
TTGGTACCAAGAAGCAGTGTAGTGCAAAGTAGCACTAATGTTGAGAATCGAACCGCCGCC
GCTTGACGAGTCTTTCCCGGGGCCTCCTTTCTTGAGATACTTGAGTGCTTCACGGCACAT
GTTGAATGTTCCTACAGCGTCAATGTCCAAAACTGTTCGGAAGCCATTGGTGGACAAATC
CTCAGCAGCTGCGAGGAAGTTTCCAGTTGCGGCGTTGACGAGGATATCAACCTTACCGAA
ATGGTTAAAAGTTGACTCGACGACTCTTCTTGCA

QA 1 514 1 514
DS 



CO CL648Contig2 806 4 42 U
GGGGAAACCAAACACGAGTGGTCTTTCCTTATCATTTTGTATTCTTCTTCTTCTTAGCTA
TTGCGTGTCCTGACTCTTGAACTCGTGATCATGGACTCTCCGTTCAAGCCTGATGTACTG
AAAGGCAAGGTAGCTCTCATCACCGGCGGCGGATCCGGCATCGGCTTCGAGATCTCCTCT
CAGTTCGGCAAACACGGAGCTTCCATCGCCATCATGGGTCGCCGTAAACAAGTCCTCGAC
GACGCCGTCTCTAATCTCCGATCTCTAGGGATTCCGGCTGTTGGGTTTGAAGGAGATGTT
CGTAAGCCAGAGGATGCGAGAAGAGTCGTCGAATCAACTTTTAACCATTTCGGTAAGGTT
GATATTCTCGTCAACGCCGCCGCTGGAAACTTCCTCGCAGCTGCTGAGGATTTGTCCACC
AATGGCTTCCGAACAGTTTTGGACATTGATGCTGTAGGAACATTCAACATGTGCCGTGAA
GCACTCAAGTATCTCAAGAAAGGAGGCCCCGGGAGAGACTCGTCAAGCGGCACCGGCGGT
TCGATTCTCAACATTAGTGCTACTTTGCACTACACTGCTTCTTGGTACCAAATCCATGTC
TCTGCAGCCAAGGCTGCAGTCGATGCTACGACAAGGAACTTAGCATTGGAGTGGGGAACT
GACTACGAGATTAGAGTCAACGGTATTGCGCCAGGCCCCATCGGAGATACACCTGGGATG
AGTAAACTTGGACCTGACGAGATTGAGAACAAAGCTGGAGATATATACCTCTCTATAACT
CGGTGAGAGTGGGATGTCGCATGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW15TF U 32
AF RR2B005TF U 1
AF RR2HB03TF U 22
AF RR2E149TF U 22
BS 1 69 RR2B005TF
BS 70 70 RR2E149TF
BS 71 119 RR2B005TF
BS 120 120 RR2DW15TF
BS 121 194 RR2B005TF
BS 195 195 RR2E149TF
BS 196 241 RR2B005TF
BS 242 242 RR2E149TF
BS 243 284 RR2B005TF
BS 285 285 RR2E149TF
BS 286 287 RR2B005TF
BS 288 288 RR2E149TF
BS 289 317 RR2B005TF
BS 318 318 RR2E149TF
BS 319 332 RR2B005TF
BS 333 333 RR2E149TF
BS 334 365 RR2B005TF
BS 366 366 RR2E149TF
BS 367 380 RR2B005TF
BS 381 381 RR2E149TF
BS 382 436 RR2B005TF
BS 437 437 RR2E149TF
BS 438 449 RR2B005TF
BS 450 450 RR2E149TF
BS 451 514 RR2B005TF
BS 515 515 RR2E149TF
BS 516 531 RR2B005TF
BS 532 534 RR2E149TF
BS 535 585 RR2B005TF
BS 586 586 RR2E149TF
BS 587 591 RR2B005TF
BS 592 592 RR2E149TF
BS 593 620 RR2B005TF
BS 621 621 RR2E149TF
BS 622 641 RR2B005TF
BS 642 642 RR2E149TF
BS 643 677 RR2B005TF
BS 678 678 RR2E149TF
BS 679 683 RR2B005TF
BS 684 685 RR2E149TF
BS 686 753 RR2B005TF
BS 754 806 RR2E149TF

RD RR2DW15TF 263 0 0
TTTTTTTGT
ATTCTTCTTCTTCTTAGCTATTGCGTGTCTTGACTCTTGAACTCGTGATCGTGGACTCTC
CGTTCAAGCCTGATGTACTGAAAGGCAAGGTAGCTCTCATCACCGGCGGCGGATCCGGCA
TCGGCTTCGAGATCTCCTCTCAGTTCGGCAAACATGGAGCTTCCATCGCCATCATGGGTC
GCCGTAAACAAGTCCTCGACGCCGCCGTCTCTAATCTCCGATCTCTAGGG*TTCCGGCTG
TTGG
GTCGAAGGAG

QA 10 253 10 253
DS 

RD RR2B005TF 753 0 0
GGGGAAACCAAACACGAGTGGTCTTTCCTTATCATTTTGTATTCTTCTTCTTCTTAGCTA
TTGCGTGTCTTGACTCTTGAACTCGTGATCATGGACTCTCCGTTCAAGCCTGATGTACTC
AAAGGCAAGGTAGCTCTCATCACCGGCGGCGGATCCGGCATCGGCTTCGAGATCTCCTCT
CAGTTCGGCAAACATGGAGCTTCCATCGCCATCATGGGTCGCCGTAAACAAGTCCTCGAC
GCCGCCGTCTCTAATCTCCGATCTCTAGGGATTCCGGCTGTTGGATTCGAAGGAGATGTT
CGTAAGCCAGAGGATGCAAGAAGAGTCGTCGAGTCAACTTTTAACCATTTCGGTAAGGTT
GATATCCTCGTCAACGCCGCAGCTGGAAACTTCCTCGCAGCTGCTGAGGATTTGTCCACC
AATGGCTTCCGAACAGCTTTGGACATTGACGCTGTAGGAACATTCAACATGTGCCGTGAA
GCACTCAAGTATCTCAAGAAAGGAGGCCCCGGGAAAGACTCGTCAAGCGGC***GGCGGT
TCGATTCTCAACATTAGTGCTACTTTGCACTACACTGCTTCTTGGCACCAAGTCCATGTC
TCTGCAGCCAAGGCTGCAGTTGATGCTACGACAAGGAACTTGGCATTGGAGTGGGGAACT
GACTACGAGATTAGAGTGAACGGGGTTGCGCCAGGCCCCATCGGAGATACACCTGGGATG
AGTAAACTTGGACCTGACGAGATTGAGAACAAA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2HB03TF 708 0 0
GGGCCTTGATCATTTTCTA
ATTCTTCTTCTTCTTAGCTATTGCGTGTCCTGT*TCTTGAACTCGTGATCATGGACTCTC
CGTTCAAGCCTGATGTACTGAAAGGCAAGGTAGCTCTCATCACCGGCGGCGGATCCGGCA
TCGGCTTCGAGATCTCTTCTCAGTTCGGCAAACACGGAGCTTCCATCGCCATCATGGGTC
GCCGTAAACAAGTCCTCGACGACGCCGTCTCTAATCTCCGATCTCTAGGGATTCCGGCTG
TTGGGTTTGAAGGAGATGTTCGTAAGCCAGAGGACGCGAGAAGAGTCGTCGAATCAACTT
TTAACCATTTCGGTAAGGTTGATATTCTCGTCAACGCCGCCGCTGGAAACTTCCTCGCAG
CTGCTGAGGATTTGTCCACCAATGGCTTCCGAACAGTTTTGGACACTGATGCTGTAGGAA
CATTCAACATGTGCCGTGAAGCACTCAAGTATCTCAAGAAAGGAGGCCCCGGGAGAGACT
CGTCAAGCGGCACCGGCGGTTCGATTCTCAACATTAGTGCTACTTTGCACTACACTGCTT
CTTGGTACCAAATCCATGTCTCTGCAGCCAAGGCTGCAGTCGATGCTACGACAAGGAACT
*AGCATTGGAGTGGGGAACTGACTACGAGATTAGAGTCAACGGTATTGCGCCAGGCCCCA
TCGGAGATACACCTGGGATGAGTAAACTT

QA 20 708 20 708
DS 

RD RR2E149TF 785 0 0
GGGCCTTGATCATTTTCTA
ATTCTTCTTCTTCTTAGCTATTGCGTGTCCTGT*TCTTGAACTCGTGATCATGGACTCTC
CGTTCAAGCCTGATGTACTGAAAGGCAAGGTAGCTCTCATCACCGGCGGCGGATCCGGCA
TCGGCTTCGAGATCTCTTCTCAGTTCGGCAAACACGGAGCTTCCATCGCCATCATGGGTC
GCCGTAAACAAGTCCTCGACGACGCCGTCTCTAATCTCCGATCTCTAGGGATTCCGGCTG
TTGGGTTTGAAGGAGATGTTCGTAAGCCAGAGGATGCGAGAAGAGTCGTCGAATCAACTT
TTAACCATTTCGGTAAGGTTGATATTCTCGTCAACGCCGCCGCTGGAAACTTCCTCGCAG
CTGCTGAGGATTTGTCCACCAATGGCTTCCGAACAGTTTTGGACATTGATGCTGTAGGAA
CATTCAGCATGTGCCGTGAAGCACTCAAGTATCTCAAGAAAGGAGGCCCCGGGAGAGACT
CGTCAAGCGGCACCGGCGGTTCGATTCTCAACATTAGTGCTACTTTGCACTACACTGCTT
CTTGGTACCAAATCCATGTCTCTGCAGCCAAGGCTGCAGTCGATGCTACGACAAGGAACT
TAGCATTGGAGTGGGGAACTGACTACGAGATTAGAGTCAGCGGTATTGCGCCAGGCCCCA
TCGGAGATACACCTGGGATGAGTAA*CTTGGACCTGACGAGATTGA*AACAAAGCTGGAG
ATATATACCTCTCTATAACTCGGTGAGAGTGGGATGTCGCATGGCT

QA 20 785 20 785
DS 



CO CL648Contig3 547 2 4 U
GGCAGTGTTAAATGTGACTTTATTTGAGATGGGAAACACAAAGCAGTCTCATATCATACA
GTACTGTCTTCAACAAACAGAATCTTAATACCATTTCTTGCCTGTCCCCAACATAATACA
TTGCCATACTAATTTGGGATCTGAAACTCTAAAGTTTACTGGTCGGCTTGGCCCTGGACC
TCTTCTCCACCACACGAGAGAGTTCCTTGACAGCATCTTTGGGTAAATGACGAGGTTTGC
TAAGCCACTGTCCATTATCTACCATCATTGTCAGTCCATTCACATACTTCCCGGAATCAC
AGCTGAGGTAAATTGCAGCCATGGCGACATCCCACTTCTCACCGAGTTTATAAAGAGGTA
TATAATCTCCAGCTTTGTTTTCAATCTCCTCAGGTCCAAGTTTACTCATCCCAGGTGTAT
CTCCGATGGGGCCTGGCGCAATACCGCTGACTCTAATCTCGTAGTCAGTTCCCCACTCCA
ATGCTAAGTTCCTTGTCGTAACATCGACTGCAGCCTTGGCTGCAGAGACATGGATTTGGT
ACCAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E149JQ U 1
AF RR2HB03JQ U 7
BS 1 45 RR2E149JQ
BS 46 46 RR2HB03JQ
BS 47 455 RR2E149JQ
BS 456 547 RR2HB03JQ

RD RR2E149JQ 455 0 0
GGCAGTGTTAAATGTGACTTTATTTGAGATGGGAAACACAAAGCATTCTCATATCATACA
GTACTGTCTTCAACAAACAGAATCTTAATACCATTTCTTGCCTGTCCCCAACATAATACA
TTGCCATACTAATTTGGGATCTGAAACTCTAAAGTTTACTGGTCGGCTTGGCCCTGGACC
TCTTCTCCACCACACGAGAGAGTTCCTTGACAGCATCTTTGGGTAAATGACGAGGTTTGC
TAAGCCACTGTCCATTATCTACCATCATTGTCAGTCCATTCACATACTTCCCGGAATCAC
AGCTGAGGTAAATTGCAGCCATGGCGACATCCCACTTCTCACCGAGTTTATAAAGAGGTA
TATAATCTCCAGCTTTGTTTTCAATCTCCTCAGGTCCAAGTTTACTCATCCCAGGTGTAT
CTCCGATGGGGCCTGGCGCAATACCGCTGACTCTA

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR2HB03JQ 541 0 0
GC
TAAATGTGACTTTATTTGAGATGGGAAACACAAAGCAGTCTCATATCATACAGTACTGTC
TTCAACAAACAGAATCTTAATACCATTTCTTGCCTGTCCCCAACATAATACATTGCCATA
CTAATTTGGGATCTGAAACTCTAAAGTTTACTGGTCGGCTTGGCCCTGGACCTCTTCTCC
ACGACACGAGAGAGTTCCTTGACAGCATCTTTGGGTAAATGACGAGGTT*GCTAAGCCAC
TGTCCATTATCTACCATCATTGTCAGTCCATTCACATACTTCCCGGAATCACAGCTGAGG
TAAATTGCAGCCATGGCGACATCCCACTTCTCACCGAGTTTATAGAGAGGTATATAATCT
CCAGCTTTGTTTTCAATCTCGTCAGGTCCAAGTTTACTCATCCCAGGTGTATCTCCGATG
GGGCCTGGCGCAATACCGTTGACTCTAATCTCGTAGTCAGTTCCCCACTCCAATGCTAAG
TTCCTTGTCGTAACATCGACTGCAGCCTTGGCTGCAGAGACATGGATTTGGTACCAAGA

QA 3 541 3 541
DS 



AS 1 7

CO CL649Contig1 1031 7 27 U
GGCTAACACTTTTGAGTCTTGAAGAAAGGTCATCATCATCAACGTCGAGAATAATGGCTT
CTCTTTGTGCTTCTTCTGCCATTGCCGCCATATCTTCTCCTAGCTTCTTGGGAGGCAAGA
AACTAAGGCTGAACAAGAAGTTGAGTGTTCCAGCTGTTTCCAAATCAGCTGCGTCTGTGA
GGGCCGTTGCAGCGGATCCCGAGAGACCAATCTGGTTCCCTGGAAGCACTCCTCCTGAGT
GGCTCGACGGTAGCCTCCCTGGTGACTTCGGATTTGATCCTCTTGGTCTTTCATCTGACC
CGGATAGTCTAAAATGGAACGTACAAGCCGAGATAGTTCACTGCCGGTGGGCAATGCTAG
GCGCCGCCGGGATTTTTATCCCGGAGTTTCTAACCAAGATCGAGATCCTCAACACTCCGT
CGTGGTTCACCGCCGGAGAGCAAGAGTATTTCACGGACAAGACCACACTCTTCGTCGTTG
AGCTCATCTTGATAGGATGGGCCGAGGGACGTAGATGGGCCGATATCATTAAGCCCGGTA
GCGTCAACACTGACCCAATCTTCCCAAACAACAAACTGACGGGTACAGACGTTGGATACC
CGGGTGGGTTATGGTTCGACCCGTTGGGTTGGGG*ATCTGGTAGCCCGGCTAAGATCAAG
GAGCTGAGGACTAAAGAGATCAAGAACGGAAGGCTGGCTATGTTGGCAGTGATGGGTGCT
TGGTTCCAACATATCTACACTGGGACTGGTCCTATTGATAACCTTTTTGCACATCTTGCT
GATCCTGGTCATGCTACTATCTTCGCTGCTTTCACACCCAAGTGAGACGTCAAGAAAGGA
GGATTTGGGAGAGAGAATGCGTTTATGTGATCATGTTTGTACAAATATGGTTTTTGAACT
TAAAATATTATGTATTTAAGCAAATTGTGGTCGAATGGAAGTTAGGGTTCGCCGTGTCAC
TACTCTTTTCCTGACTAAATGCTCATACATTACATTGTGATTCGTGGTTATGATAGTCAA
TCTCTTCTATT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 40 10 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ05TF U 3
AF RR2BA96TF U 1
AF RR2G618TF U 3
AF RR2EZ05JQ C 477
AF RR2D436JQ C 545
AF RR2D436TF U 660
AF RR2G618JQ C 387
BS 1 397 RR2BA96TF
BS 398 398 RR2EZ05TF
BS 399 402 RR2BA96TF
BS 403 403 RR2G618TF
BS 404 426 RR2BA96TF
BS 427 427 RR2G618TF
BS 428 433 RR2BA96TF
BS 434 434 RR2EZ05TF
BS 435 490 RR2BA96TF
BS 491 491 RR2EZ05TF
BS 492 493 RR2BA96TF
BS 494 494 RR2EZ05TF
BS 495 508 RR2BA96TF
BS 509 509 RR2EZ05TF
BS 510 535 RR2BA96TF
BS 536 536 RR2EZ05TF
BS 537 556 RR2BA96TF
BS 557 557 RR2EZ05TF
BS 558 634 RR2BA96TF
BS 635 635 RR2EZ05TF
BS 636 693 RR2BA96TF
BS 694 694 RR2G618TF
BS 695 788 RR2BA96TF
BS 789 789 RR2D436TF
BS 790 817 RR2BA96TF
BS 818 991 RR2D436TF
BS 992 1031 RR2G618JQ

RD RR2EZ05TF 685 0 0
GG
AACACTTTTGAGTCTTGAAGAAAGGTCATCATCATCAACGTCGAGAATAATGGCTTCTCT
TTGTGCTTCTTCTGCCATTGCCGCCATATCTTCTCCTAGCTTCTTGGGAGGCAAGAAACT
AAGGCTGAACAAGAAGTTGAGTGTTCCAGCTGTTTCCAAATCAGCTGCGTCTGTGAGGGC
CGTTGCAGCGGATCCCGAGAGACCAATCTGGTTCCCTGGAAGCACTCCTCCTGAGTGGCT
CGACGGTAGCCTCCCTGGTGACTTCGGATTTGATCCTCTTGGTCTTTCATCTGACCCGGA
TAGTCT****TGGAACGTACAAGCCGAGATAGTTCACTGCCGGTGGGCAATGCTAGGCGC
CGCCGGGATTTTTATCCCGGAGTTTCTAACCAAGATCGGGATCCTCAACACTCCGTCGTG
GTACACCGCCGGAGAGCAAGAGTATTTCACGGACAAGACCACACTCTTCGTCGTTGAGCT
CATCTTGATAGGATGGGCCGAGGGACGTAGATGGGCCGATATCATTAAGCCCGGTAGCGT
CAACACTGACCCAATCTTCCCAAACAACAAACTGACGGGTACAGACGTTGGATACCCGGG
TGGGTTATGGTTCGACCCGTTGGGTTGGGG*ATCTGGTAGCCCGGATAAGATCAAGGAGC
TGAGGACTAAAGAGATCAAGAAC

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR2BA96TF 817 0 0
GGCTAACACTTTTGAGTCTTGAAGAAAGGTCATCATCATCAACGTCGAGAATAATGGCTT
CTCTTTGTGCTTCTTCTGCCATTGCCGCCATATCTTCTCCTAGCTTCTTGGGAGGCAAGA
AACTAAGGCTGAACAAGAAGTTGAGTGTTCCAGCTGTTTCCAAATCAGCTGCGTCTGTGA
GGGCCGTTGCAGCGGATCCCGAGAGACCAATCTGGTTCCCTGGAAGCACTCCTCCTGAGT
GGCTCGACGGTAGCCTCCCTGGTGACTTCGGATTTGATCCTCTTGGTCTTTCATCTGACC
CGGATAGTCTAAAATGGAACGTACAAGCCGAGATAGTTCACTGCCGGTGGGCAATGCTAG
GCGCCGCCGGGATTTTTATCCCGGAGTTTCTAACCAAAATCGGGATCCTCAACACTCCGT
CGTGGTACACCGCGGGAGAGCAAGAGTATTTCACGGACAAGACCACACTCTTCGTCGTTG
AGCTCATCTTAATCGGATGGGCCGAGGGTCGTAGATGGGCCGATATCATTAAGCCAGGTA
GCGTCAACACTGACCCTATCTTCCCAAACAACAAACTGACGGGTACAGACGTTGGATACC
CGGGTGGGTTATGGTTCGACCCGTTGGGTTGGGGGATCTGGTAGCCCGGCTAAGATCAAG
GAGCTGAGGACTAAAGAGATCAAGAACGGAAGGTTGGCTATGTTGGCAGTGATGGGTGCT
TGGTTCCAACATATCTACACTGGGACTGGTCCTATTGATAACCTTTTTGCACATCTTGCT
GATCCTGGCCATGCTACTATCTTCGCTGCTTTCACAC

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2G618TF 780 0 0
GG
AACACTTTTGAGTCTTGAAGAAAGGTCATCATCATCAACGTCGAGAATAATGGCTTCTCT
TTGTGCTTCTTCTGCCATTGCCGCCATATCTTCTCCTAGCTTCTTGGGAGGCAAGAAACT
AAGGCTGAACAAGAAGTTGAGTGTTCCAGCTGTTTCCAAATCAGCTGCGTCTGTGAGGGC
CGTTGCAGCGGATCCCGAGAGACCAATCTGGTTCCCTGGAAGCACTCCTCCTGAGTGGCT
CGACGGTAGCCTCCCTGGTGACTTCGGATTTGATCCTCTTGGTCTTTCATCTGACCCGGA
TAGTCTAAAATGGAACGTACAAGCCGAGATAGTTCACTGCCGGTGGGCAATGCTAGGCGC
CGCCGGGATTTTTATCCCGGAGTTTCTAACCAAGATCGAGATCCTCAACACTCCGTCGTG
GTTCACCGCCGGAGAGCAAGAGTATTTCACGGACAAGACCACACTCTTCGTCGTTGAGCT
CATCTTGATAGGATGGGCCGAGGGACGTAGATGGGCCGATATCATTAAGCCCGGTAGCGT
CAACACTGACCCAATCTTCCCAAACAACAAACTGACGGGTACAGACGTTGGATACCCGGG
TGGGTTATGGTTCGACCCGTTGGGTTGGGG*ATCTGGTAGCCCGGCTAAGATCAAG*AGC
TGAG*ACTAAAGAGATCAAGAACGGA*GTCTGGCTATGT*GGCAGTGATGGGTGCTTGGT
TC**ACATATCTACACTGGGACTGGTC*TATTGATAAC**TTTTGCACATCTTGCTGA

QA 3 780 3 780
DS 

RD RR2EZ05JQ 480 0 0
GTTGAGCTCATCTTGATAGGATGGGCCGAGGGACGTAGATGGGCCGATATCATTAAGCCC
GGTAGCGTCAACACTGACCCAATCTTCCCAAACAACAAACTGACGGGTACAGACGTTGGA
TACCCGGGTGGGTTATGGTTCGACCCGTTGGGTTGGGG*ATTTGGTAGCCCGGATAAGAT
CAAGGAGCTGAGGACTAAAGAGATCAAGAACGGAAGGCTGGCTATGTTGGCAGTGATGGG
TGCTTGGTTCCAACATATCTACACTGGGACTGGTCCTATTGATAACCTTTTTGCACATCT
TGCTGATCCTGGTCATGCTACTATTTTCGCTGCTTTCACACCCAAGTGAGACGTCAAGAA
AGGAGGATTTGGGAGGGGGAATGCGTTTGTGTGATCATGTTTGTACAAATATGGTTTTTG
AACTTAAAATATTGTGTATTTAAGCAAATGGTGGTCGAATGGAAGTTAGGGTTCGCCGTG

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2D436JQ 450 0 0
G
AACACTGACCCAATCTTCCCAAACAACAAACTGACGGGTACAGACGTTGGATACCCGGGT
GGGTTATGGTTCGACCCTTTGGGTTGGGG*ATCTGGTAGCCCGGCTAAGATCAAGGAGCT
GAGGACTAAAGAGATCAAGAACGGAAGGTTGGCTATGTTGGCAGTGATGGGTGCTTGGTT
CCAACATATATACACTGGGACTGGTCCTATCGATAACCTTTTTGCCCATCTTGCTGATCC
TGGTCATGCTACTATCTTCGCTGCTTTCACACCCAAGTGAGACGTCAAGAAAGGAGGATT
TGGGAGAGAGAATGCGTTTATGTGATCATGTTTGTACAAATATGGTTTTTGAACTTAAAA
TATTATGTATTTAAGCAAATTGTGGTCGAATGGAAGTTAGGGTTCGCCGTGTCACTACTC
TTTTCCTGACTAAATGCTCATACATT
GCG

QA 2 447 2 447
DS 

RD RR2D436TF 335 0 0
GGAGCTGAGGACTAAAGAGATCAAGAACGGAAGGTTGGCTATGTTGGCAGTGATGGGTGC
TTGGTTCCAACATATATACACTGGGACTGGTCCTATCGATAACCTTTTTGCCCATCTTGC
TGATCCTGGTCATGCTACTATCTTCGCTGCTTTCACACCCAAGTGAGACGTCAAGAAAGG
AGGATTTGGGAGAGAGAATGCGTTTATGTGATCATGTTTGTACAAATATGGTTTTTGAAC
TTAAAATATTATGTATTTAAGCAAATTGTGGTCGAATGGAAGTTAGGGTTCGCCGTGTCA
CTACTCTTTTCCTGACTAAATGCTCATACATT
GCG

QA 1 332 1 332
DS 

RD RR2G618JQ 645 0 0
TTTCTAACCAAGATCGAGATCCTCAACACTCCGTCGTGGTTCACCGCCGGAGAGCAAGAG
TATTTCACGGACAAGACCACACTCTTCGTCGTTGAGCTCATCTTGATAGGATGGGCCGAG
GGACGTAGATGGGCCGATATCATTAAGCCCGGTAGCGTCAACACTGACCCAATCTTCCCA
AACAACAAACTGACGGGTACAGACGTTGGATACCCGGGTGGGTTATGGTTCGACCCGTTG
GGTTGGGG*ATCTGGTAGCCCGGCTAAGATCAAGGAGCTGAGGACTAAAGAGATCAAGAA
CGGAAGTCTGGCTATGTTGGCAGTGATGGGTGCTTGGTTCCAACATATCTACACTGGGAC
TGGTCCTATTGATAACCTTTTTGCACATCTTGCTGATCCTGGTCATGCTACTATCTTCGC
TGCTTTCACACCCAAGTGAGACGTCAAGAAAGGAGAATTTGGGAGGGGGAATGCGTTTGT
GTGATCATGTTTGTACAAATATGGTTTTTGAACTTAAAATATTATGTATTTAAGCAAATG
GTGGTCGAGTGGAAGTTAGGGTTCGCCGTGACACTACTCTTTTCCTGACTAAATGCTCAT
ACATTACATTGTGATTCGTGGTTATGATAGTCAATCTCTTCTATT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 3 8

CO CL650Contig1 903 2 2 U
CTCAATCTAAAAATCTTTCAACAAATCTCTGAAAACATCAAATGGGGAAAGACGATAATC
CAAGTCCAGGTGAAACTGGAGCGGCGGCGACGGATCCGGCAAGGGAATGCGAGGGAAAAG
GAGCTTGTGAATTCAAACAGACTCGTTTCGCTGATACAATCATGCCTCATATCCTCAACT
TGTACGGGTCATGTGCAAAAGCAAACGATTTTGACATGTACGCGCCAAATGCTTCGTTTG
AGGACCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTTAAGCAAATCAAATCAGCATTTTACTCACTCT
CTAAGTTTTTTGGTGAGTCGAAGATTGTTGAATACCACGTTCAAGAAACTGATATTGCAC
CGGGGAGAAAAGAGGCTAGAATCTTCTTGTTTTAGCCTCTACTCGTTACTACTATAATAC
AATCTTAAGGGTAGCCTTATTATCACTATCTAACTAAAGGAAACAACCTGTGTGTGAATA
AAAAACAGATACTAATAGACAACAAACAACACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATA
TGATCTCTCTCATCAAACTCTCTGTCGAAAATGGGAAGATCGTCCGACACGAAGACTGGT
GGGACAAGAAACCTCCGAGGAACAGAGACACGGTTAACTTCCCATTAGTCGGTCGGTTTA
TGGAGATGGGTCGAAGAGGCATGATGCTAGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAG
ATCCTGACTCACACTGAATAAAGATGAATCATGGGTTCAGAAAAAAAAACAGTATATTAT
AGTGTCTAGGCTCTTCAAAACACTACTTAGCTTTTGAGGAACTTCTTCTATCAGTTTGGT
TTGGTTTTAAGTTTGTAATATGTTAAACGTGTGGTTTGTTATAAAGTCACCAAAATTCTC
CAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2AG10TF U 1
AF RR2AG10JQ C 70
BS 1 805 RR2AG10TF
BS 806 903 RR2AG10JQ

RD RR2AG10TF 805 0 0
CTCAATCTAAAAATCTTTCAACAAATCTCTGAAAACATCAAATGGGGAAAGACGATAATC
CAAGTCCAGGTGAAACTGGAGCGGCGGCGACGGATCCGGCAAGGGAATGCGAGGGAAAAG
GAGCTTGTGAATTCAAACAGACTCGTTTCGCTGATACAATCATGCCTCATATCCTCAACT
TGTACGGGTCATGTGCAAAAGCAAACGATTTTGACATGTACGCGCCAAATGCTTCGTTTG
AGGACCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTTAAGCAAATCAAATCAGCATTTTACTCACTCT
CTAAGTTTTTTGGTGAGTCGAAGATTGTTGAATACCACGTTCAAGAAACTGATATTGCAC
CGGGGAGAAAAGAGGCTAGAATCTTCTTGTTTTAGCCTCTACTCGTTACTACTATAATAC
AATCTTAAGGGTAGCCTTATTATCACTATCTAACTAAAGGAAACAACCTGTGTGTGAATA
AAAAACAGATACTAATAGACAACAAACAACACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATA
TGATCTCTCTCATCAAACTCTCTGTCGAAAATGGGAAGATCGTCCGACACGAAGACTGGT
GGGACAAGAAACCTCCGAGGAACAGAGACACGGTTAACTTCCCATTAGTCGGTCGGTTTA
TGGAGATGGGTCGAAGAGGCATGATGCTAGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAG
ATCCTGACTCACACTGAATAAAGATGAATCATGGGTTCAGAAAAAAAAACAGTATATTAT
AGTGTCTAGGCTCTTCAAAACACTA

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2AG10JQ 834 0 0
GTGAAACTGGAGCG
GCGGCGACGGATCCGGCAAGGGAATGCGAGGGAAAAGGAGCTTGTGAATTCAAACAGACT
CGTTTCGCTGATACAATCATGCCTCATATCCTCAACTTGTACGGGTCATGTGCAAAAGCA
AACGATTTTGACATGTACGCGCCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACACATGCTCAA
GGGGTTAAGCAAATCAAATCAGCATTTTACTCACTCTCTAAGTTTTTTGGTGAGTCGAAG
ATTGTTGAATACCACGTTCAAGAAACTGATATTGCACCGGGGAGAAAAGAGGCTAGAATC
TTCTTGTTTTAGCCTCTACTCGTTACTACTATAATACAATCTTAAGGGTAGCCTTATTAT
CACTATCTAACTAAAGGAAACAACCTGTGTGTGAATAAAAAACAGATACTAATAGACAAC
AAACAACACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATATGATCTCTCTCATCAAACTCTCT
GTCGAAAATGGGAAGATCGTCCGACACGAAGACTGGTGGGACAAGAAACCTCCGAGGAAC
AGAGACACGGTTAACTTCCCATTAGTCGGTCGGTTTATGGAGATGGGTCGAAGAGGCATG
ATGCTAGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGATCCTGACTCACACTGAATAAAG
ATGAATCATGGGTTCAGAAAAAAAAACAGTATATTATAGTGTCTAGGCTCTTCAAAACAC
TACTTAGCTTTTGAGGAACTTCTTCTATCAGTTTGGTTTGGTTTTAAGTTTGTAATATGT
TAAACGTGTGGTTTGTTATAAAGTCACCAAAATTCTCCAT

QA 15 834 15 834
DS 



CO CL650Contig2 804 4 26 U
GGAATTCATTTGTTAGTCTAAATCTTTCAACAAATCTCTGAAAACATCATCAATGGGGAA
AGACGATAATCCAAGTCCAGGTGAAACTGGAGCGGCCGCGGCGACGGATCCGGCAAGGGA
ATGCGAGGGAAAAGGAGCTTGTGAATTCAAACAGACTCGTTTCGCTGATACAATCATGCC
TCATATCCTCAACTTGTACG*GGTCATGTGCAAAAGCAAACGATTTTGACATGTACGCGC
CAAATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTTAAGCAAATCAAATCAG
CATTTTACTCACTCTCTAAGTTTTTTGGTGAGTCGAAGATTGTTGAATACCACGTTCAAG
AAACTGATATTGCACCGGGGAGAAAAGAGATACTAATAGACAACAAACAACACTACAAGA
TCATGGGAAAGGACATAGATATGATCTCTCTCATCAAACTCTCTGTCGAAAATGGGAAGA
TCGTCCGACACGAAGACTGGTGGGACAAGAAACCTCTGAGGAACAGAGACACGGTTAACT
TCCCATTAGTCGGTCGGTTTATGGAGATGGGTCGAAGAGGCATGATGCTAGCTACTCATG
CCATGATGGGTTTTGGTAAAGATCCTGACTCACACTGAATAAAGATGAATCATGGGTTCA
GAAAAAAAAACAGTATATTATAGTGTCTAGGCTCTTCAAAACACTACTTAGCTTTTGAGG
AACTTCTTCTATCAGTTTGGTTTGGTTTTAAGTTTGTAATATGTTAAACGTGTGGTTTGT
TATAAAGTCACCAAAATTCTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2C009TF U 1
AF RR2GP80TF U 4
AF RR2GP80JQ C 164
AF RR2BC65JQ C 167
BS 1 33 RR2C009TF
BS 34 34 RR2GP80TF
BS 35 42 RR2C009TF
BS 43 43 RR2GP80TF
BS 44 72 RR2C009TF
BS 73 73 RR2GP80TF
BS 74 246 RR2C009TF
BS 247 247 RR2GP80TF
BS 248 299 RR2C009TF
BS 300 300 RR2GP80TF
BS 301 363 RR2C009TF
BS 364 365 RR2GP80TF
BS 366 373 RR2C009TF
BS 374 374 RR2GP80TF
BS 375 482 RR2C009TF
BS 483 483 RR2GP80TF
BS 484 494 RR2C009TF
BS 495 495 RR2GP80TF
BS 496 547 RR2C009TF
BS 548 564 RR2GP80TF
BS 565 658 RR2GP80JQ
BS 659 659 RR2BC65JQ
BS 660 699 RR2GP80JQ
BS 700 700 RR2BC65JQ
BS 701 802 RR2GP80JQ
BS 803 804 RR2BC65JQ

RD RR2C009TF 547 0 0
GGAATTCATTTGTTAGTCTAAATCTTTCAACAA*TCTCTGAACACATCATCAATGGGGAA
AGACGATAATCCGAGTCCAGGTGAAACTGGAGCGGCCGCGGCGACGGATCCGGCAAGGGA
ATGCGAGGGAAAAGGAGCTTGTGAATTCAAACAGACTCGTTTCGCTGATACAATCATGCC
TCATATCCTCAACTTGTACG*GGTCATGTGCAAAAGCAAACGATTTTGACATGTACGCGC
CAAATGTTTCGTTTGAGGACCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTTAAGCAAATCAAATCAC
CATTTTACTCACTCTCTAAGTTTTTTGGTGAGTCGAAGATTGTTGAATACCACGTTCAAG
AAAGCGATATTGCCCCGGGGAGAAAAGAGATACTAATAGACAACAAACAACACTACAAGA
TCATGGGAAAGGACATAGATATGATCTCTCTCATCAAACTCTCTGTCGAAAATGGGAAGA
TCATCCGACACGAATACTGGTGGGACAAGAAACCTCTGAGGAACAGAGACACGGTTAACT
TCCCATT

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2GP80TF 567 0 0
TTTTTTCTCAATCTAA
AAATCTTTCAACAAATCTCTGAAAACATCA**AATGGGGAAAGACGATAATCCAAGTCCA
GGTGAAACTGGAGCGGC***GGCGACGGATCCGGCAAGGGAATGCGAGGGAAAAGGAGCT
TGTGAATTCAAACAGACTCGTTTCGCTGATACAATCATGCCTCATATCCTCAACTTGTAC
GAGGTCATGTGCAAAAGCAAACGATTTTGACATGTACGCGCCAAATGCTTCGTTTGAGGA
CCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTTAAGCAAATCAAATCAGCATTTTACTCACTCTCTAA
GTTTTTTGGTGAGTCGAAGATTGTTGAATACCACGTTCAAGAAACTGATATTGCACCGGG
GAGAAAAGAGATACTAATAGACAACAAACAACACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGA
TATGATCTCTCTCATCAAACTCTCTGTCGAAAATGGGAAGATCGTCCGACACGAAGACTG
GTGGGACAAGAAACCTCTGAGGAACAGAGACACGGTTAACTTCCCATTAGTCGGTCGGTT
TATGG
GAGATG

QA 17 561 17 561
DS 

RD RR2GP80JQ 641 0 0
GCTGATACAATCATGCCTCATATCCTCAACTTGTACG*GGTCATGTGCAAAAGCAAACGA
TTTTGACATGTACGCGCCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACACATGCTCAAGGGGT
TAAGCAAATCAAATCAGCATTTTACTCACTCTTTAAGTTTTTTGGTGAGTCGAAGATTGT
TGAATACCACGTTCAAGAAACTGATATTGCACCGGGGAGAAAAGAGATATTAATAGACAA
CAAACAACACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATATGATCTCTTTCATCAAACTTTC
TGTCGAAAATGGGAAGATCGTCCGACACGAAGACTGGTGGGACAAGAAACCTTTGAGGAA
CAGAGACACGGTTAACTTCCCATTAGTCGGTCGGTTTATGGAGATGGGTCGAAGAGGCAT
GATGCTAGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGATCCTGACTCACACTGAATAAA
GATGAATCATGGGTTTAGAAAAAAAAACAGTATATTATAGTGTCTAGGCTCTTCAAGACA
CTACTTAGCTTTTGAGGAACTTCTTCTATCAGTTTGGTTTGGTTTTAAGTTTGTAATATG
TTAAACGTGTGGTTTGTTATAAAGTCACCAAAATTCTCC
AC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2BC65JQ 638 0 0
GATACAATCATGCCTCATATCCTCAACTTGTACG*GGTCATGTGCAAAAGCAAACGATTT
TGACATGTACGCGCCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTTAA
GCAAATCAAATCAGCATTTTACTCACTCTCTAAGTTTTTTGGTGAGTCGAAGATTGTTGA
ATACCACGTTCAAGAAACTGATATTGCACCGGGGAGAAAAGAGATACTAATAGACAACAA
ACAACACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATATGATCTCTCTCATCAAACTCTCTGT
CGAAAATGGGAAGATCGTCCGACACGAAGACTGGTGGGACAAGAAACCTCTGAGGAACAG
AGACACGGTTAACTTCCCATTAGTCGGTCGGTTTATGGAGATGGGTCGAAGAGGCATGAT
GCTAGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGATCCTGACTCCCACTGAATAAAGAT
GAATCATGGGTTCAGAAAAAAAAACAGTATATTATAGTGTCTAGGCTCTTCAAAACACTA
CTTAGCTTTTGAGGAACTTCTTCTATCAGTTTGGTTTGGTTTTAAGTTTGTAATATGTTA
AACGTGTGGTTTGTTATAAAGTCACCAAAATTCTCCCC

QA 1 638 1 638
DS 



CO CL650Contig3 860 2 6 U
TTTTTTCTCAATCTAAAAATCTTTCAACAAATCTCTGAAAACATCAAATGGGGAAAGACG
ATAATCCAAGTCCAGGTGAAACTGGAGCGGCGGCGACGGATCCGGCAAGGGAATGCGAGG
GAAAAGGAGCTTGTGAATTCAAACAGACTCGTTTCGCTGATACAATCATGCCTCATATCC
TCAACTTGTGAGACCCCCAAATTATTTTTATGGCTTCTGTTTTAATTTTTGTCTTGATTT
TGTTCAGATTCTGATGATGCTATTGGGTTGTCCCATGACTGTTTCATAAGCTTTTCATTA
AAATTGTCTTATAGGTACGGGTCATGTGCAAAAGCAAACGATTTTGACATGTACGCGCCA
AATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTTAAGCAAATCAAATCAGCA
TTTTACTCACTCTCTAAGTTTTTTGATACTAATAGACAACAAACAACACTACAAGATCAT
GGGAAAGGACATAGATATGATCTCTCTCATCAAACTCTCTGTCGAAAATGGGAAGATCGT
CCGACACGAAGACTGGTGGGACAAGAAACCTCTGAGGAATAGAGACACGGTTAACTTCCC
ATTAGTCGGTCGGTTTATGGAGATGGGTCGAAGAGGCATGATGCTAGCTACTCATGCCAT
GATGGGTTTTGGTAAAGATCCTGACTCACACTGAATAAAGATGAATCATGGGTTCAGAAA
AAAAAACAGTATATTATAGTGTCTAGGCTCTTCAAAACACTACTTAGCTTTTGAGGAACT
TCTTCTATCAGTTTGGTTTGGTTTTAAGTTTGTAATATGTTAAACGTGTGGTTTGTTATA
AAGTCACCAAAATTCTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM32TF U 1
AF RR2EM32JQ C 226
BS 1 576 RR2EM32TF
BS 577 577 RR2EM32JQ
BS 578 589 RR2EM32TF
BS 590 590 RR2EM32JQ
BS 591 606 RR2EM32TF
BS 607 860 RR2EM32JQ

RD RR2EM32TF 606 0 0
TTTTTTCTCAATCTAAAAATCTTTCAACAAATCTCTGAAAACATCAAATGGGGAAAGACG
ATAATCCAAGTCCAGGTGAAACTGGAGCGGCGGCGACGGATCCGGCAAGGGAATGCGAGG
GAAAAGGAGCTTGTGAATTCAAACAGACTCGTTTCGCTGATACAATCATGCCTCATATCC
TCAACTTGTGAGACCCCCAAATTATTTTTATGGCTTCTGTTTTAATTTTTGTCTTGATTT
TGTTCAGATTCTGATGATGCTATTGGGTTGTCCCATGACTGTTTCATAAGCTTTTCATTA
AAATTGTCTTATAGGTACGGGTCATGTGCAAAAGCAAACGATTTTGACATGTACGCGCCA
AATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTTAAGCAAATCAAATCAGCA
TTTTACTCACTCTCTAAGTTTTTTGATACTAATAGACAACAAACAACACTACAAGATCAT
GGGAAAGGACATAGATATGATCTCTCTCATCAAACTCTCTGTCGAAAATGGGAAGATCGT
CCGACACGAAGACTGGTGGGACAAGAAACCTCTGAG*AATAGAGACACG*TTAACTTCCC
ATTAGT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2EM32JQ 635 0 0
TTTTTGTCTTGATTTTGTTCAGATTCTGATGATGCTATTGGGTTGTCCCATGACTGTTTC
ATAAGCTTTTCATTAAAATTGTCTTATAGGTACGGGTCATGTGCAAAAGCAAACGATTTT
GACATGTACGCGCCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTTAAG
CAAATCAAATCAGCATTTTACTCACTCTCTAAGTTTTTTGATACTAATAGACAACAAACA
ACACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATATGATCTCTCTCATCAAACTCTCTGTCGA
AAATGGGAAGATCGTCCGACACGAAGACTGGTGGGACAAGAAACCTCTGAGGAATAGAGA
CACGGTTAACTTCCCATTAGTCGGTCGGTTTATGGAGATGGGTCGAAGAGGCATGATGCT
AGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGATCCTGACTCACACTGAATAAAGATGAA
TCATGGGTTCAGAAAAAAAAACAGTATATTATAGTGTCTAGGCTCTTCAAAACACTACTT
AGCTTTTGAGGAACTTCTTCTATCAGTTTGGTTTGGTTTTAAGTTTGTAATATGTTAAAC
GTGTGGTTTGTTATAAAGTCACCAAAATTCTCCCC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 2 10

CO CL651Contig1 802 4 6 U
GGTCTCTCTCCTCCATCTTCATTCCCTCTCTGATCGCTACTTTCTGCAACGACGACATGG
CCATGCTCGGAGGCGTTCGCGATGTACCTGCTAACGAGAACAGCGTCGAGGTCGAGAGCC
TCGCTCGCTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAAGAGAATGCACTGCTAGAGTTTGCGA
GAGTGGTGAAGGCGAAAGAGCAAGTTGTAGCGGGAACGCTGCACCACCTGACTCTGGAGA
TCATTGAGGCTGGGAAGAAGAAGCTTTACGAAGCTAAAGTGTGGGTGAAGCCTTGGTTGA
ACTTCAAGGAGTTACAGGAGTTCAAGCCTGCTAGTAGTGATGATGGTGGTGCCTCTACTA
CCAATACCATCACTCCCTCCGATCTTGGCTGCAAGAAAGGTGAGCTTGAATCTGGATGGA
GGGAAGTTCCAGGAGATGATCCAGAAGTGCAGCACGTTGCTGATCACACTGTCAAGACCA
TCCAGCAGAGGTCTAACTCCTTGTTTCCTTATGAACTCCAGGAGGTTGTTCATGCTAACG
CTGAGGTCACCGGGGAGGCTGCAAAGTACAACATGCTTCTCAAGTTGAAGAGAGGAGAGA
AGGAGGAAAAGTTCAAGGTGGAGGTTCACAAGAACCATGAAGGTGTTCCTCATCTCAACC
ACATGGAGCAACACCATGACTAGTCCTTTATGTAATAATATTGGCTGTTTGCTTACTCTG
TAAGATATTTTAACTTCTGATGCAACTACTAAACCCTTAAAATAAAATACCAGAAGGAAG
GAATAAATTAAAAGTTACAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2AD09TF U 1
AF RR2AX49JQ C 151
AF RR2AX49TFB U 552
AF RR2AD09JQ C 387
BS 1 227 RR2AD09TF
BS 228 228 RR2AX49JQ
BS 229 615 RR2AD09TF
BS 616 616 RR2AX49TFB
BS 617 762 RR2AD09TF
BS 763 802 RR2AX49TFB

RD RR2AD09TF 762 0 0
GGTCTCTCTCCTCCATCTTCATTCCCTCTCTGATCGCTACTTTCTGCAACGACGACATGG
CCATGCTCGGAGGCGTTCGCGATGTACCTGCTAACGAGAACAGCGTCGAGGTCGAGAGCC
TCGCTCGCTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAAGAGAATGCACTGCTAGAGTTTGCGA
GAGTGGTGAAGGCGAAAGAGCAAGTTGTAGCGGGAACGCTGCACCACTTGACTCTGGAGA
TCATTGAGGCTGGGAAGAAGAAGCTTTACGAAGCTAAAGTGTGGGTGAAGCCTTGGTTGA
ACTTCAAGGAGTTACAGGAGTTCAAGCCTGCTAGTAGTGATGATGGTGGTGCCTCTACTA
CCAATACCATCACTCCCTCCGATCTTGGCTGCAAGAAAGGTGAGCTTGAATCTGGATGGA
GGGAAGTTCCAGGAGATGATCCAGAAGTGCAGCACGTTGCTGATCACACTGTCAAGACCA
TCCAGCAGAGGTCTAACTCCTTGTTTCCTTATGAACTCCAGGAGGTTGTTCATGCTAACG
CTGAGGTCACCGGGGAGGCTGCAAAGTACAACATGCTTCTCAAGTTGAAGAGAGGAGAGA
AGGAGGAAAAGTTCA*GGTGGAGGTTCACAAGAACCATGAAGGTGTTCCTCATCTCAACC
ACATGGAGCAACACCATGACTAGTCCTTTATGTAATAATATTGGCTGTTTGCTTACTCTG
TAAGATATTTTAACTTCTGATGCAACTACTAAACCCTTAAAA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2AX49JQ 652 0 0
G
GAAAGAGAATGCACTGCTAGAGTTTGCGAGAGTGGTGAAGGCGAAAGAGCAAGTTGTAGC
GGGAACGCTGCACCACCTGACTCTGGAGATCATTGAGGCTGGGAAGAAGAAGCTTTACGA
AGCTAAAGTGTGGGTGAAGCCTTGGTTGAACTTCAAGGAGTTACAGGAGTTCAAGCCTGC
TAGTAGTGATGATGGTGGTGTCTCTACTACCAATACCATCACTCCCTCCGATCTTGGCTG
CAAGAAAGGTGAGCTTGAATCTGGATGGAGGGAAGTTCCAGGAGATGATCCAGAAGTGCA
GCACGTTGCTGATCACGCTGTCAAGACCATCCAGCAGAGGTCTAACTCCTTGTTTCCTTA
TGAACTCCAGGAGGTTGTTCATGCTAACGCTGAGGTCACCGGGGAGGCTGCAAAGTACAA
CATGCTTCTCAAGTTGAAGAGAGGAGAGAAGGAGGAAAAGTTCAAGGTGGAGGTTCACAA
GAACCATGAAGGTGTTCTTCATCTCAACCACATGGAGCAACACCATGACTAGTCCTTTAT
GTAATAATATTGGCTGTTTGCTTACTCTGTAAGATATTTTAACTTCTGATGCAACTACTA
AACCCTTAAAATAAAATACCAGAAGGAAGGAATAAATTAAAAGTTACAGCC

QA 2 652 2 652
DS 

RD RR2AX49TFB 251 0 0
GGGGAGGCTGCAAAGTACAACATGCTTCTCAAGTTGAAGAGAGGAGAGAAGGAGGAAAAG
TTCAAGGTGGAGGTTCACAAGAACCATGAAGGTGTTCTTCATCTCAACCACATGGAGCAA
CACCATGACTAGTCCTTTATGTAATAATATTGGCTGTTTGCTTACTCTGTAAGATATTTT
AACTTCTGATGCAACTACTAAACCCTTAAAATAAAATACCAGAAGGAAGGAATAAATTAA
AAGTTACAGCC

QA 1 251 1 251
DS 

RD RR2AD09JQ 416 0 0
GGCTGCAAGAAAGGTGAGCTTGAATCTGGATGGAGGGAAGTTCCAGGAGATGATCCAGAA
GTGCAGCACGTTGCTGATCACACTGTCAAGACCATCCAGCAGAGGTCTAACTCCTTGTTT
CCTTATGAACTCCAGGAGGTTGTTCATGCTAACGCTGAGGTCACCGGGGAGGCTGCAAAG
TACAACATGCTTCTCAAGTTGAAGAGAGGAGAGAAGGAGGAAAAGTTCA*GGTGGAGGTT
CACAAGAACCATGAAGGTGTTCCTCATTTCAACCACATGGAGCAACACCATGACTAGTCC
TTTATGTAATAATATTGGCTGTTTGCTTACTCTGTAAGATATTTTAACTTCTGATGCAAC
TACTAAACCCTTAAAATAAAATACCAGAAGGAAGGAATAAATTAAAAGTTACAGCC

QA 1 416 1 416
DS 



CO CL651Contig2 822 6 6 U
GGATCGTTGTTTTCTCTCTCTCCTCCATCTTCATTCCCTCTCTGATCGCTACTTTCTGCA
ACGACGACATGGCCATGCTCGGAGGCGTTCGCGATGTACCTGCTAACGAGAACAGCGTCG
AGGTCGAGAGCCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAAGAGAATGCACTGC
TAGAGTTTGCGAGAGTGGTGAAGGCGAAAGAGCAAGTCGTGGCGGGAACGCTGCACCACC
TGACGCTGGAGATCATCGAGGCTGGGAAGAAGAAGCTTTACGAAGCCAAAGTGTGGGTGA
AGCCTTGGTTGAACTTCAAGGAGTTGCAGGAGTTCAAGCCTGCTAGTGATGATGGTGGTG
CCTCTACTACCAATACCATCACTCCCTCCGATCTTGGCTGCAAGAAAGGTGAGCTTGAAT
CTGGATGGAGGGAAGTTCCAGGAGATGATCCAGAAGTGCAGCACGTTGCTGATCATGCTG
TCAAGACCATCCAGCAGAGGTCTAACTCCTTGTTCCCTTATGAACTCCAGGAGGTTGTTC
ATGCTAACGCTGAGGTCACCGGGGAGGCTGCAAAGTACAACATGCTTCTCAAGTTGAAGA
GAGGAGAGAAGGAGGAGAAGTTCAAGGTGGAGGTTCACAAGAACCATGAAGGTGTTCTTC
ATCTCAACCACATGGAGCAACACCATGACTAGTTCTCTTCTCCTCTCCTCTGCTTATGTA
ATATTTGACTGTTTGCTTGCTCTGTAAAAGATATTTTAACTTCTGATGCAACTACTAAAC
CCTTAAAATAAAATACCAGAAGGAATAAATTAGAAGTTACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI76TF U 3
AF RR2C541TF U 1
AF RR2B882JQ C 174
AF RR2B882TF U 1
AF RR2FE76TF U 7
AF RR2FE76JQ C 122
BS 1 399 RR2B882TF
BS 400 400 RR2EI76TF
BS 401 542 RR2B882TF
BS 543 543 RR2C541TF
BS 544 785 RR2B882TF
BS 786 822 RR2FE76JQ

RD RR2EI76TF 510 0 0
GGGGTT
GTTTTCTCTCTCTCCTCCATCTTCATTCCCTCTCTGATCGCTACTTTCTGCAACGACGAC
ATGGCCATGCTCGGAGGCGTTCGCGATGTACCTGCTAACGAGAACAGCGTCGAGGTCGAG
AGCCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAAGAGAATGCACTGCTAGAGTTT
GCGAGAGTGGTGAAGGCGAAAGAGCAAGTCGTGGCGGGAACGCTGCACCACCTGACGCTG
GAGATCATCGAGGCTGGGAAGAAGAAGCTTTACGAAGCCAAAGTGTGGGTGAAGCCTTGG
TTGAACTTCAAGGAGTTGCAGGAGTTCAAGCCTGCTAGTGATGATGGTGGTGCCTCTACT
ACCAATACCATCACTCCCTCCGATCCTGGCTGCAAGAAAGGTGAGCTTGAATCTGGATGG
AGGGAAGTTCCAGGAGATGATCCAGAAGTGCAGCACGTTGCTGATCATGCTGTCAAGACC
ATCCAGCAGAGGTCTAACTCCTTG

QA 7 510 7 510
DS 

RD RR2C541TF 623 0 0
GGATCGTT
GTTTTCTCTCTCTCCTCCATCTTCATTCCCTCTCTGATCGCTACTTTCTGCAACGACGAC
ATGGCCATGCTCGGAGGCGTTCGCGATGTACCTGCTAACGAGAACAGCGTCGAGGTCGAG
AGCCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAAGAGAATGCACTGCTAGAGTTT
GCGAGAGTAGTGAAGGCGAAAGAGCAAGTCGTGGCGGGAACGCTGCACCACCTGACGCTG
GAGATCATCGAGGCTGGGAAGAAGAAGCTTTACGAAGCCAAAGTGTGGGTGAAGCCTTGG
TTGAACTTCAAGGAGTTGCAGGAGTTCAAGCCTGCTAGTGATGATGGTGGTGCCTCTACT
ACCAATACCATCACTCCCTCCGATCTTGGCTGCAAGAAAGGTGAGCTTGAATCTGGATGG
AGGGAAGTTCCAGGAGATGATCCAGAAGTGCAGCACGTTGCTGATCATGCTGTCAAGACC
ATCCAGCAGAGGTCTAACTCCTTGTTCCCTTATGAACTCCAGGAGGTTGTTCATGCTAAC
GCTGAGGTCACCGGGGAGGCTGCAAAGTACAACATGCTTCTCAAGTTGAAGAGAGGAGAG
AAGGAGGAGAAGTTC

QA 9 623 9 623
DS 

RD RR2B882JQ 603 0 0
GCACTGCTAGAGTTTGCGAGAGTGGTGAAGGCGAAAGAGCAAGTCGTGGCGGGAACGCTG
CACCACCTGACGCTGGAGATCATCGAGGCTGGGAAGAAGAAGCTTTACGAAGCCAAAGTG
TGGGTGAAGCCTTGGTTGAACTTCAAGGAGTTGCAGGAGTTCAAGCCTGCTAGTGATGAT
GGTGGTGCCTCTACTACCAATACCATCACTCCCTCCGATCTTGGCTACAAGAAAGGTGAG
CTTGAATCTGGATGGAGGGAAGTTCCAGGAGATGATCCAGAAGTGCAGCACGTTGCTGAT
CATGCTGTCAAGACCATCCAGCAGAGGTCTAACTCCTTGTTCCCTTATGAACTCCAGGAG
GTTGTTCATACTAACGCTGAGGTCACCGGGGAGGCTGCAAAGTACAACATGCTTCTCAAG
TTGAAGAGAGGAGAGAAGGAGGAGAAGTTCAAGGTGGAGGTTCACAAGAACCATGAAGGT
GTTCTTCATCTCAACCACATGGAGCAACACCATGACTAGTTCTCTTCTCCTCTCCTCTGC
TTATGTAATATTTGACTGTTTGCTTGCTCTGTAAAAGATATTTTAACTTCTGATGCA
ACTACT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2B882TF 792 0 0
GGATCGTTGTTTTCTCTCTCTCCTCCATCTTCATTCCCTCTCTGATCGCTACTTTCTGCA
ACGACGACATGGCCATGCTCGGAGGCGTTCGCGATGTACCTGCTAACGAGAACAGCGTCG
AGGTCGAGAGCCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAAGAGAATGCACTGC
TAGAGTTTGCGAGAGTGGTGAAGGCGAAAGAGCAAGTCGTGGCGGGAACGCTGCACCACC
TGACGCTGGAGATCATCGAGGCTGGGAAGAAGAAGCTTTACGAAGCCAAAGTGTGGGTGA
AGCCTTGGTTGAACTTCAAGGAGTTGCAGGAGTTCAAGCCTGCTAGTGATGATGGTGGTG
CCTCTACTACCAATACCATCACTCCCTCCGATCTTGGCTACAAGAAAGGTGAGCTTGAAT
CTGGATGGAGGGAAGTTCCAGGAGATGATCCAGAAGTGCAGCACGTTGCTGATCATGCTG
TCAAGACCATCCAGCAGAGGTCTAACTCCTTGTTCCCTTATGAACTCCAGGAGGTTGTTC
ATACTAACGCTGAGGTCACCGGGGAGGCTGCAAAGTACAACATGCTTCTCAAGTTGAAGA
GAGGAGAGAAGGAGGAGAAGTTCAAGGTGGAGGTTCACAAGAACCATGAAGGTGTTCTTC
ATCTCAACCACATGGAGCAACACCATGACTAGTTCTCTTCTCCTCTCCTCTGCTTATGTA
ATATTTGACTGTTTGCTTGCTCTGTAAAAGATATTTTAACTTCTGATGCAACTACTAAAC
CCTTA
AATAAAA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2FE76TF 779 0 0
GG
GTTTTCTCTCTCTCCTCCATCTTCATTCCCTCTCTGATCGCTACTTTCTGCAACGACGAC
ATGGCCATGCTCGGAGGCGTTCGCGATGTACCTGCTAACGAGAACAGCGTCGAGGTCGAG
AGCCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAAGAGAATGCACTGCTAGAGTTT
GCGAGAGTGGTGAAGGCGAAAGAGCAAGTCGTGGCGGGAACGCTGCACCACCTGACGCTG
GAGATCATCGAGGCTGGGAAGAAGAAGCTTTACGAAGCCAAAGTGTGGGTGAAGCCTTGG
TTGAACTTCAAGGAGTTGCAGGAGTTCAAGCCTGCTAGTGATGATGGTGGTGCCTCTACT
ACCAATACCATCACTCCCTCCGATCTTGGCTGCAAGAAAGGTGAGCTTGAATCTGGATGG
AGGGAAGTTCCAGGAGATGATCCAGAAGTGCAGCACGTTGCTGATCATGCTGTCAAGACC
ATCCAGCAGAGGTCTAACTCCTTGTTCCCTTATGAACTCCAGGAGGTTGTTCATGCTAAC
GCTGAGGTCACCGGGGAGGCTGCAAAGTACAACATGCTTCTCAAGTTGAAGAGAGGAGAG
AAGGAGGAGAAGTTCAAGGTGGAGGTTCACAAGAACCATGAAAGTGTTCTTCATCTCAAC
CACATGGAGCAACACCATGACTAGTTCTCTTCTCCTCTCCTCTGCTTATGTAATATTTGA
CTGTTTGCTTGCTCTGTAAA*GATATTTTAACTTCTGATGCA*CTACTAAACCCTTA

QA 3 779 3 779
DS 

RD RR2FE76JQ 701 0 0
GGTCGAGAGCCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAAGAGAATGCACTGCT
AGAGTTTGCGAGAGTGGTGAAGGCGAAAGAGCAAGTCGTGGCGGGAACGCTGCACCACCT
GACGCTGGAGATCATCGAGGCTGGGAAGAAGAAGCTTTACGAAGCCAAAGTGTGGGTGAA
GCCTTGGTTGAACTTCAAGGAGTTGCAGGAGTTCAAGCCTGCTAGTGATGATGGTGGTGC
CTCTACTACCAATACCATCACTCCCTCCGATCTTGGCTGCAAGAAAGGTGAGCTTGAATC
TGGATGGAGGGAAGTTCCAGGAGATGATCCAGAAGTGCAGCACGTTGCTGATCATGCTGT
CAAGACCATCCAGCAGAGGTCTAACTCCTTGTTCCCTTATGAACTCCAGGAGGTTGTTCA
TGCTAACGCTGAGGTCACCGGGGAGGCTGCAAAGTACAACATGCTTCTCAAGTTGAAGAG
AGGAGAGAAGGAGGAGAAGTTCAAGGTGGAGGTTCACAAGAACCATGAAGGTGTTCTTCA
TCTCAACCACATGGAGCAACACCATGACTAGTTCTCTTCTCCTCTCCTCTGCTTATGTAA
TATTTGACTGTTTGCTTGCTCTGTAAAAGATATTTTAACTTCTGATGCAACTACTAAACC
CTTAAAATAAAATACCAGAAGGAATAAATTAGAAGTTACAC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 7

CO CL652Contig1 1098 7 13 U
GGCGGACACAAACTAGAGAAGTCTTCTTCGAATCAGAGAGATTCTATCCCTTTATTAGAT
CCGGAAGTTTCTTGGCGAGAGAAGATGACAGTGATCGACATTCTGACCAGAGTTGACACG
ATCTGCAAGAAGTACGACAAGTACGACGTCGACAAACAGCGTGAGTCCAACATCTCCGGC
GATGACGCTTTCGCTCGTCTCTACGGAGCTTTCGAGACTCAAATCGAGACAGCTCTCGAG
AAAGCTGAGATTGTTACCAAGGAGAAGAACAGAGCTTCTGCGGTTGCGATGAACGCTGAG
ATCCGTCGCACAAAGGCTAGATTGTCTGAGGAAGTTCCCAAGCTGCAGAGACTTGCTCTC
AAGCGGGTAAAGGGCCTTACAACGGAAGAGCTTGCTGCGAGAAACGATTTGGTGCTTGCG
CTTCCGGCGAGGATCGAAGCTATACCTGATGGGACAGCGGGTGGTCCTAAAAGCACTACT
AGTGCTTGGGCTCCTTCTACAACGTCTCGTCCTGATATCAAGTTTGATTCAGATGGGCGT
TTTGATGATGATTACTTTCAAGAGTCTCATGAATCCAGCCAGTTCAAACAGGAGTTTGAG
ATGCGCAAAATTAAGCAGGACCAAGGTCTGGACATGATCTCCGAAGGTCTAGATGCTTTG
AAGAACATGGCATCTGATATGAACGAGGAGCTGGACCGTCAAGTTCCTCTGATGGATGAA
ATCGACTCAAAGGTTGACAGAGCAACCTCGGATCTTAAGAACACCAATGTTAGACTCAAA
GATACTGTGAACCAGCTGAGGTCAAGCAGGAACTTCTGCATCGATATTGTTCTGTTGTGT
ATTGTTCTGGGTATCGCTGCATACTTGTACAATGTACTGAAGTGATGAGATGAACAGGAA
AGGACCCATCACTACTCTCTCTTGCCATCTGCTATTAAAGTTTCTTACCCGAGTCAGTTT
GTGTGTGTGTGTTTGTGTGCCTGTTACTGGCGGTATTTGTTTGATCTTTTGACGAGAGTT
TCTTCTAAGTGTCAAGACTGTTCAAGTTGTTTCTTCTATTGAGTTATTTCCATGTTGTCC
ATGTCCATTACATGATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2E502TF U 1
AF RR2FS22TF U 3
AF RR2F144TF U 8
AF RR2DR41TF U 138
AF RR2FS22JQ C 515
AF RR2F144JQ C 516
AF RR2E502JQ C 549
BS 1 254 RR2E502TF
BS 255 255 RR2FS22TF
BS 256 282 RR2E502TF
BS 283 625 RR2FS22TF
BS 626 626 RR2F144TF
BS 627 646 RR2FS22TF
BS 647 647 RR2F144TF
BS 648 673 RR2FS22TF
BS 674 674 RR2F144TF
BS 675 753 RR2FS22TF
BS 754 763 RR2F144TF
BS 764 1097 RR2FS22JQ
BS 1098 1098 RR2E502JQ

RD RR2E502TF 282 0 0
GGCGGACACAAACTAGAGAAGTCTTCTTCGAATCAGAGAGATTCTATCCCTTTATTAGAT
CCGGAAGTTTCTTGGCGAGAGAAGATGACAGTGATCGACATTCTGACCAGAGTTGACACG
ATCTGCAAGAAGTACGACAAGTACGACGTCGACAAACAGCGTGAGTCCAACATCTCCGGC
GATGACGCTTTCGCTCGTCTCTACGGAGCTTTCGAGACTCAAATCGAGACAGCTCTCGAG
AAAGCTGAGATTGT*ACCAAGGAGAAGAACAGAGCTTCTGCG

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR2FS22TF 751 0 0
GGGACAC
AAACTAGAGAAGTCTTCTTCGAATCAGAGAGATTCTATCCCTTTATTAGATCCGGAAGTT
TCTTGGCGAGAGAAGATGACAGTGATCGACATTCTGACCAGAGTTGACACGATCTGCAAG
AAGTACGACAAGTACGACGTCGACAAACAGCGTGAGTCCAACATCTCCGGCGATGACGCT
TTCGCTCGTCTCTACGGGGCTTTCGAGACTCAAATCGAGACAGCTCTCGGGAAAGCTGAG
ATTGTTACCAAGGAGAAGAACAGAGCTTCTGCGGTTGCGATGAACGCTGAGATCCGTCGC
ACAAAGGCTAGATTGTCTGAGGAAGTTCCCAAGCTGCAGAGACTTGCTCTCAAGCGGGTA
AAGGGCCTTACAACGGAAGAGCTTGCTGCGAGAAACGATTTGGTGCTTGCGCTTCCGGCG
AGGATCGAAGCTATACCTGATGGGACAGCGGGTGGTCCTAAAAGCACTACTAGTGCTTGG
GCTCCTTCTACAACGTCTCGTCCTGATATCAAGTTTGATTCAGATGGGCGTTTTGATGAT
GATTACTTTCAAGAGTCTCATGAATCCAGCCAGTTCAAACAGGAGTTTGAGATGCGCAAA
ATTAAGCAGGACCAAG*TCTGGACATGATCTCCGAAG*TCTAGATGCTTTGAAGAACATG
GCATTTGATATGAACGAGGAGCTGGACCGTCAAGTTCCTCTGATGGATGAAATCGACTCA
AAGGTTGACAGAGCAACCTCGGAT

QA 8 751 8 751
DS 

RD RR2F144TF 759 0 0
GG
AAACTAGAGAAGTCTTCTTCGAATCAGAGAGATTCTATCCCTTTATTAGATCCGGAAGTT
TCTTGGCGAGAGAAGATGACAGTGATCGACATTCTGACCAGAGTTGACACGATCTGCAAG
AAGTACGACAAGTACGACGTCGACAAACAGCGTGAGTCCAACATCTCCGGCGATGACGCT
TTCGTTCGTCTCTACGGAGCTTTCGAGACTCAAATCGAGACAGCTTTCGAGAAAGCTGAG
ATTGTTACCAAGGAGAAGAACAGAGCTTCTGCGGTTGCGATGAACGCTGAGATCCGTCGC
ACAAAGGCTAGATTGTCTGAGGAAGTTCCCAAGCTGCAGAGACTTGCTCTCAAGCGGGTA
AAGGGCCTTACAACGGAAGAGCTTGCTGCGAGAAACGATTTGGTGCTTGCGCTTCCGGCG
AGGATCGAAGCTATACCTGATGGGACAGCGGGTGGTCCTAAAAGCACTACTAGTGCTTGG
GCTCCTTCTACAACGTCTCGTCCTGATATCAAGTTTGATTCAGATGGGCGTTTTGATGAT
GATTACTTTCAAGAGTCTCATAAATCCAGCCAGTTCAAACAGGAGTTTGAGATGCGCAAA
ATTAAGCAGGACCAAGGTCTGGACATGATCTCCGAAGGTCTAGATGCTTTGAAGAACATG
GCATCTGATATGAACGAGGAGCTGGACCGTCAAGTTCCTCTGATGGATGAAATCGACTCA
AAG*TTGACAGAGCAACCTCGGATCTTAAGAACA
TCA

QA 3 756 3 756
DS 

RD RR2DR41TF 589 0 0
G
AAGTACGACGTCGACAAACAGCGCGAGTCCAACATCTCCGGCGATGACGCTTTCGCTCGT
CTCTACGGAGCTTTCGAGACCCAAATCGAGACAGCTCTCGAGAAAGCTGAGATTGTTACC
AAGGAGAAGAACAGAGCTTCTGCGGTTGCGATGAACGCTGAGATCCGTCGCACAAAGGCT
AGATTGTCTGAGGAAGTTCCCAAGCTGCAGAGACTTGCTCTCAAGCGGGTAAAGGGTCTT
ACAACGGAAGAGCTTGCTGCGAGAAACGATTTGGTGCTCGCGCTTCCGGCTAGGATCGAA
GCTATACCTGATGGGACATCGGGTGGTCCTAAA*GCACTACTAGTGCTTGGGCTCCTTCT
ACAACATCTCGTCCTGATATCAAGTTTGATTCAGATGGGCGTTTTGATGATGATTGCTTT
CAAGAGTCGCATGAATCCAGCCAGTTCAAACAGGAGTTTGAGATGCGCAAAATTAAGCAG
GACCAAGGTCTGGACATGATCTCCGAAGGTCTAGATGCTTTGAAGAACATGGCATCTGAT
ATGAACGAGGAGCTGGATCGGCAAGTTCCTCTGATGGATGAAATCGAC

QA 2 589 2 589
DS 

RD RR2FS22JQ 584 0 0
ATATCAAGTTTGATTCAGATGGGCGTTTTGATGATGATTACTTTCAAGAGTCTCATGAAT
CCAGCCAGTTCAAACAGGAGTTTGAGATGCGCAAAATTAAGCAGGACCAAGGTCTGGACA
TGATCTCCGAAGGTCTAGATGCTTTGAAGAACATGGCATTTGATATGAACGAGGAGCTGG
ACCGTCAAGTTCCTCTGATGGATGAAATCGACTCAAAGGTTGACAGAGCAACCTCGGATC
TTAAGAACACCAATGTTAGACTCAAAGATACTGTGAACCAGCTGAGGTCAAGCAGGAACT
TCTGCATCGATATTGTTCTGTTGTGTATTGTTCTGGGTATCGCTGCATACTTGTACAATG
TACTGAAGTGATGAGATGAACAGGAAAGGACCCATCACTACTCTCTCTTGCCATCTGCTA
TTAAAGTTTCTTACCCGAGTCAGTTTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGCCTGTTACTGGCGGT
ATTTGTTTGATCTTTTGACGAGAGTTTCTTCTAAGTGTCAAGACTGTTCAAGTTGTTTCT
TCTATTGAGTTATTTCCATGTTGTCCATGTCCATTACATGATG
G

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2F144JQ 583 0 0
TATCAAGTTTGATTCAGATGGGCGTTTTGATGATGATTACTTTCAAGAGTCTCATAAATC
CAGCCAGTTCAAACAGGAGTTTGAGATGCGCAAAATTAAGCAGGACCAAGGTCTGGACAT
GATCTCCGAAGGTCTAGATGCTTTGAAGAACATGGCATCTGATATGAACGAGGAGCTGGA
CCGTCAAGTTCCTCTGATGGATGAAATCGACTCAAAGGTTGACAGAGCAACCTCGGATCT
TAAGAACACCAATGTTAGACTCAAAGATACTGTGAACCAGCTGAGGTCAAGCAGGAACTT
CTGCATCGATATTGTTCTGTTGTGTATTGTTCTGGGTATCGCTGCATACTTGTACAATGT
ACTGAAGTGATGAGATGAACAGGAAAGGACCCATCACTACTCTCTCTTGCCATCTGCTAT
TAAAGTTTCTTACCCGAGTCAGTTTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGCCTGTTACTGGCGGTA
TTTGTTTGATCTTTTGACGAGAGTTTCTTCTAAGTGTCAAGACTGTTCAAGTTGTTTCTT
CTATTGAGTTATTTCCATGTTGTCCATGTCCATTACATGATG
A

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2E502JQ 550 0 0
TGATTACTTTCAAGAGTCTCATGAATCCAGCCAGTTCAAACAGGAGTTTGAGATGCGCAA
AATTAAGCAGTACCAAGGTCTGGACATGATCTCCGAAGGTCTAGATGCTTTGAAGAACAT
GGCATCTGATATGAACGAGGAGCTGGACCGTCAAGTTCCTCTGATGGATGAAATCGACTC
AAAGGTTGACAGAGCAACCTCGGATCTTAAGAACACCAATGTTAGACTCAAAGATACTGT
GAACCAGCTGAGGTCAAGCAGGAACTTCTGCATCGATATTGTTCTGTTGTGTATTGTTCT
GGGTATCGCTGCATACTTGTACAATGTACTGAAGTGATGAGATGAACAGGAAAGGACCCA
TCACTACTCTCTCTTGCCATCTGCTATTAAAGTTTCTTACCCGAGTCAGTTTGTGTGTGT
GTGTTTGTGTGCCTGTTACTGGCGGTATTTGTTTGATCTTTTGACGAGAGTTTCTTCTAA
GTGTCAAGACTGTTCAAGCTGTTTCTTCTATTGAGTTATTTCCATGTTGTCCATGTCCAT
TACATGATGA

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 8

CO CL653Contig1 1238 8 26 U
GGGTAATCGTCTGTTATCGTTTCGGGGTCTCACTCGACTCTCTCTCTGCAACCAAACGAA
AAATGGAGGTAGCAGCAGCGACTGCGACGAGCTTCACAACGCTCCGAGCTCGTTCCTCAG
CGATAATCCCGTCTCCAACACGTAACCTGAGATCTAAAGTGAGATCTTCTTCGTCTTCTT
CTTCTCTCAGAGCTTCGGCCCTCTCGAACGGCTTACTCTCCCCGTATACCGGAGGAAGCA
TCTCTAGTGACTTCTGCGGCGCCAAGCTTCGTTCCCAATCGCTTAATCCGTTGAATATGT
CTAGCTCCAAGCCTAAGCGCGGTGTTGTCACCATGGTTATACCTTTTTCGAAAGGAAGTG
CACACGAACAACCTCCTCCTGATTTGGCATCTTATCTGTTCAAAAACCGGATTGTATATT
TGGGAATGTCTCTTGTACCTTCAGTCACTGAGTTGATACTCGCGGAGTTTCTTTACCTTC
AGTATGAAGACGAGGAAAAGCCTATTTACCTCTACATTAACTCAACAGGGACGACCAAGA
ATGGTGAGAAGTTGGGCTATGATACTGAGGCTTTTGCAATTTATGATGTCATGGGGTATG
TCAAACCACCAATCTTTACTCTTTGCGTTGGGAATGCTTGGGGTGAAGCTGCTTTGCTTC
TGACTGCCGGTGCTAAAGGAAATCGTTCAGCATTGCCCTCATCAACTATAATGATAAAAC
AGCCCATTGCTCGATTCCAAGGACAAGCAACCGATGTTGAAATTGCAAGGAAAGAAATCA
GGCACATAAAGACAGAAATGGTCAAGCTGTATTCAAAGCATATTGGTAAATCGCCGGAGC
AGATTGAAGCTGACATGAAACGCCCTAAATATTTTAGTCCCAGTGAGGCTGTTGAGTATG
GAATCATTGATAAGGTGGTTTACAACGAAAGGAGCAGCCAAGACAGAGGAGTAGTGTCCG
ACCTTAAAAAGGCACAACTCATCTAAATGTCAGAATCGTCTTCTTAAATCTCCCGTGATT
AACAGGTTGGTGATTTGACCGTGGATCAAGGGGACATCGACACAGAACCGAAGTAAAAAA
AAAAA*GGTGTTGAAAACATTACTTGTAGTACTGCAATTTTAGGGTTATTTGAACAGAAA
ACAAACCCATATGTGTAGGCTTGTGAATGCCTAGAAACAGAATTGGTGTATCTTCACTAT
GTTTCAAACATTTCAAATGAATCAATTTCATTACTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 10 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 0 10 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT79TF U 27
AF RR2GK06TF U 1
AF RR2FV61TF U 34
AF RR2A430TF U 46
AF RR2CT79JQ C 446
AF RR2GK06JQ C 1001
AF RR2FV61JQ C 671
AF RR2A430JQ C 518
BS 1 118 RR2GK06TF
BS 119 119 RR2FV61TF
BS 120 295 RR2GK06TF
BS 296 296 RR2CT79TF
BS 297 681 RR2GK06TF
BS 682 682 RR2FV61TF
BS 683 718 RR2GK06TF
BS 719 719 RR2A430TF
BS 720 735 RR2GK06TF
BS 736 752 RR2FV61TF
BS 753 781 RR2A430TF
BS 782 782 RR2CT79JQ
BS 783 839 RR2A430TF
BS 840 850 RR2CT79JQ
BS 851 851 RR2FV61JQ
BS 852 973 RR2CT79JQ
BS 974 974 RR2FV61JQ
BS 975 985 RR2CT79JQ
BS 986 986 RR2FV61JQ
BS 987 1052 RR2CT79JQ
BS 1053 1053 RR2FV61JQ
BS 1054 1084 RR2CT79JQ
BS 1085 1085 RR2GK06JQ
BS 1086 1099 RR2CT79JQ
BS 1100 1100 RR2GK06JQ
BS 1101 1238 RR2CT79JQ

RD RR2CT79TF 649 0 0
GTCTCACTC
GACTCTCTCTCTGCAACCAAACGAAAAATGGAGGTAGCAGCAGCGACTGCGACGAGCTTC
ACAACGCTCCGAGCTCGTTCCTCCGCGATAATCCCGTCTCCAACACGTAACCTGAGATCT
AAAGTGAGATCTTCTTCGTCTTCTTCTTCTCTCAGAGCTTCGGCCCTCTCGAACGGCTTA
CTCTCCCCGTATACCGTAGGAAGCATCTCTAGTGACTTCTGCGGCGCCAAGCTTCGTTCC
CAATCGCTTAATCCGTTGAATATGCCTAGCTCCAAGCCTAAGCGCGGTGTTGTCACCATG
GTTATACCTTTTTCGAAAGGAAGTGCACACGAACAACCTCCTCCTGATTTGGCATCTTAT
CTGTTCAAAAACCGGATTGTATATTTGGGAATGTCTCTTGTACCTTCAGTCACTGAGTTG
ATACTCGCGGAGTTTCTTTACCTTCAGTATGAAGACGAGGAAAAGCCTATTTACCTCTAC
ATTAACTCAACAGGGACGACCAAGAATGGTGAGAAGTTGGGCTATGATACTGAGGCTTTT
GCAATTTATGATGTCATGGGGTATGTCAAACCACCAATCTTTACTCTTTGCGTTGGGAAT
GCTTGGGGTGAAGCTGCTTTGCTTCTGACTGCCGGTGCTA

QA 10 649 10 649
DS 

RD RR2GK06TF 735 0 0
GGGTAATCGTCTGTTATCGTTTCGGGGTCTCACTCGACTCTCTCTCTGCAACCAAACGAA
AAATGGAGGTAGCAGCAGCGACTGCGACGAGCTTCACAACGCTCCGAGCTCGTTCCTCCG
CGATAATCCCGTCTCCAACACGTAACCTGAGATCTAAAGTGAGATCTTCTTCGTCTTCTT
CTTCTCTCAGAGCTTCGGCCCTCTCGAACGGCTTACTCTCCCCGTATACCGGAGGAAGCA
TCTCTAGTGACTTCTGCGGCGCCAAGCTTCGTTCCCAATCGCTTAATCCGTTGAACATGT
CTAGCTCCAAGCCTAAGCGCGGTGTTGTCACCATGGTTATACCTTTTTCGAAAGGAAGTG
CACACGAACAACCTCCTCCTGATTTGGCATCTTATCTGTTCAAAAACCGGATTGTATATT
TGGGAATGTCTCTTGTACCTTCAGTCACTGAGTTGATACTCGCGGAGTTTCTTTACCTTC
AGTATGAAGACGAGGAAAAGCCTATTTACCTCTACATTAACTCAACAGGGACGACCAAGA
ATGGTGAGAAGTTGGGCTATGATACTGAGGCTTTTGCAATTTATGATGTCATGGGGTATG
TCAAACCACCAATCTTTACTCTTTGCGTTGGGAATGCTTGGGGTGAAGCTGCTTTGCTTC
TGACTGCCGGTGCTAAAGGAA*TCGTTCAGCATTGCCCTCATCAACTATAATGATAAA*C
AGCCCATTGCTCGAT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2FV61TF 719 0 0
GG
GACTCTCTCTCTGCAGCCAAACGAAAAATGGAGGTAGCAGCAGCGACTGCGACGAGCTTC
ACAACGCTCCGAGCTCGTTCCTCAGCGATAATCCCGCCTCCAACACGTAACCTGAGATCT
AAATTGAGATCTTCTTCGTCTTCTTCTTCTCTCAGAGCTTC***CCTCTCGAACGGCTTA
CTCTCCCCGTATACCGGAGGAAGCATCTCTAGTGACTTCTGCGGCTCCAAACTTCGTTCC
GAATCGCTTAATCCGTTGAATAATTCTAGCTCCAAGCCTAAGCGCGGTGTTGTCACCATG
GTTATACCTTTTTCGAAAGGAAGTGCACACGAACAACCTCCTCCTGATTTGGCGTCTTAT
CTGTTCAAAAACCGGATTTTATATTTGGGAATGTCTCTTGTACCTTCAGTCACTGAGTTG
ATACTCGCGGAGTTTCTTTACCTTCAGTATGAAGACGAGGAAAAGCCTATTTACCTCTAC
ATTAACTCAACAGGGACGACCAAGAATGGTGAGAAGTTGGGCTATGATACTGAGGCTTTT
GCAATTTATGATGTCATGGGGTATGTCAAACCACCAATCTTTACTCTTTGCGTTGGGAAT
GCTTGGGGTGAAGCTGCTTTGCTTCCGACTGCCGGTGCTAAAGGAAATCGTTCAGCATTG
CCCTCATCAACTATAATGATAAA*CAGCCCATTGCTCGATTCCAAGGACAAGCAACC

QA 3 719 3 719
DS 

RD RR2A430TF 794 0 0
GGGCAA
CCAAACGAAAAATGGAGGTAGCAGCAGCGACTGCGACGAGCTTCACAACGCTCCGAGCTC
GTTCCTCAGCGATAATCCCGTCTCCAACACGTAACCTGAGATCTAAAGTGAGATCTTCTT
CGTCTTCTTCTTCTCTCAGAGCTTCGGCCCTCTCGAACGGCTTACTCTCCCCGTATACCG
GAGGAAGCATCTCTAGTGACTTCTGCGGCTCCAAGCTTCGTTCCGAATCGCTTAATCCGT
TGAATATGTCTAGCTCCAAGCCTAAGCGCGGTGTTGTCACCATGGTTATACCTTTTTCAA
AAGGAAGTGCACACGAACAACCTCCTCCTGATTTGGCGTCTTATCTTTTCAAAAACCGGA
TTGTGTATTTGGGAATGTCTCTTGTACCTTCAGTCACTGAGTTGATACTTGCGGAGTTTC
TTTACCTTCAGTATGAAGACGAGGAAAAGCCTATTTACCTCTACATAAACTCCACAGGGA
CGACCAAGAATGGTGAGAAGTTGGGCTATGATACGGAGGCTTTTGCAATTTATGATGTCA
TGGGGTATGTCAAACCACCAATCTTTACTCTTTGTGTTGGGAATGCTTGGGGTGAAGCTG
CTTTGCTTCTGACTGCTGGTGCTAAAGGAAATCGTTCTGCATTGCCCTCATCAACTATAA
TGATAAAACAGCCCATTGCTCGATTCCAAGGACAAGCAACCGATGTTGAAATTGCAAGGA
AAGAAATCAG*CACATAAAGACAGAAATGGTCAAGCTGTATTCAAAGCATATTGGTAAAT
CGCCGGAG

QA 7 794 7 794
DS 

RD RR2CT79JQ 793 0 0
TCACTGAG
TGATACTCGCGGAGTT*CTTTACCTTCAGTATGAAGACGAGGAAAAGCCTATTTACCTCT
ACATTAACTCAACAGGGACGACCAAGAATGGTGAGAAGTTGGGCTATGATACTGAGGCTT
TTGCAATTTATGATGTCATGGGGTATGTCAAACCACCAATCTTTACTCTTTGCGTTGGGA
ATGCTTGGGGTGAAGCTGCTTTGCTTCTGACTGCCGGTGCTAAAGGAAATCGTTCAGCAT
TGCCCTCATCAACTATAATGATAAAACAGCCCATTGCTCGATTCCAAGGACAAGCAACCG
ATGTTGAAATTGCAAGGAAAGAAATCAGGCACATAAAGACAGAAATGGTCAAGCTGTATT
CAAAGCATATTGGTAAATCGCCGGAGCAGATTGAAGCCGACATGAAACGCCCTAAATATT
TTAGTCCCAGTGAGGCTGTTGAGTATGGAATCATTGATAAGGTGGTTTACAACGAAAGGA
GCAGCCAAGACAGAGGAGTAGTGTCCGACCTTAAAAAGGCGCAACTCATCTAGATGTCAG
AATCGTCTTCTTAAATCTCCCGTGATTAACAGGTTGGTGATTTGACCGTGGATCAAGGGT
ACATCGACACAGAACCGAAGTAAAAAAAAAA**GGTGTTGAAAACACTACTTGTAGTACT
GCAATTTTAGGGTTATTTGAACAGAAAACAAACCCATATGTGTAGGCTTGTGAATGCCTA
GAAACAGAATTGGTGTATCTTCACTATGTTTCAAACATTTCAAATGAATCAATTTCATTA
CTAGT

QA 9 793 9 793
DS 

RD RR2GK06JQ 235 0 0
TTTTTA
AATCTCCCGTGATTAACAGGTTGGTGATTTGACCGTGGATCAAGGGTACATCGACACGGA
ACCGAAGTAAAAAAAAAAAAGGTGTTGAAAACATTACTTGTAGTACTGCAATTTTAGGGT
TATTTGAACAGAAAACAAACCCATATGTGTAGGCTTGTGAATGCCTAGAAACAGAATTGG
TGTATTTTCACTATGTTTCAAACATTTCAAATGAATCAATTTCATT
ACT

QA 7 232 7 232
DS 

RD RR2FV61JQ 562 0 0
TGCTAAAGGAAATCGTTCAGCATTGCCCTCATCAACTATAATGATAAAACAGCCCATTGC
TCGATTCCAAGGACAAGCAACCGATGTTGAAATTGCAAGGAAAGAAATCAGGCACATAAA
GACAGAAATGGTCAAGCTGTATTCAAAGCATATTGGTAAATCGCCGGAGCAGATTGAAGC
TGACATGAAACGCCCTAAATATTTTAGTCCCAGTGAGGCTGTTGAGTATGGAATCATTGA
TAAGGTGGTTTACAACGAAAGGAGCAGCCAGGACAGAGGAGTCGTGTCCGACCTTAAAAA
GGCACAACTCATCTAAATGTCAGAATCGTCTTCTTAAATCTCCCGTGATTAACAGGTTGG
TGATTTGACCGCGGATCAAGGGGACATCGACACAGAACCGAAGTAAAAAAAAAAA**GTA
TTGAAAACATTACTTGTGGTGCTGCAATTTTAGGGTTATTTGAACAGAAAACAAGCCCAT
ATGTGTAGGCTTGTGAATGCCTAGAAACAGATTTGGTGTATCTTCACTATGTTTCAAACA
TTTCAAATGAATCAATTTCATT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2A430JQ 720 0 0
A
AACTCCACAGGGACGACCAAGAATGGTGAGAAGTTGGGCTATGATACGGAGGCTTTTGCA
ATTTATGATGTCATGGGGTATGTCAAACCACCAATCTTTACTCTTTGTGTTGGGAATGCT
TGGGGTGAAGCTGCTTTGCTTCTGACTGCTGGTGCTAAAGGAAATCGTTCTGCATTGCCC
TCATCAACTATAATGATAAAACAGCCCATTGCTCGATTCCAAGGACAAGCAACCGATGTT
GAAATTGCAAGGAAAGAAATCAGGCACATAAAGACAGAAATGGTCAAGCTGTATTCAAAG
CATATTGGTAAATCGCCGGAGCAGATTGAAGCTGACATGAAACGCCCTAAATATTTTAGT
CCCAGTGAGGCTGTTGAGTATGGAATCATTGATAAGGTGGTTTACAACGAAAGGAGCAGC
CAAGACAGAGGAGTTGTGTCCGACCTTAAAAAGGCACAACTCATCTAAATGTCAGAATCT
TCTTCTTCAATCTCCCGTGGTTAACAGGTTGGTGATTTGACCGTGGATCAAGGGGACATC
GACACAGAACCGAAGTAAAAAAAAG***GTTGTTGAAAACATTACTTGTAGTACTGCAAT
TTTAGGGTTATTTGAACAGAAAACAAACCCATATGTGTAGGCTTGTGAATGCCTAGAAAC
AGAATTGGTGTATCTTCACTATGTTTCAAACATTTCAAATGAATCAATTTCATT
ACTAG

QA 2 715 2 715
DS 



AS 2 8

CO CL654Contig1 647 4 12 U
GGGTTAGCCACAACAACAGAAAATAGTGATCAAACCTCATGGCGTCTCTTGCAACCGTAG
CGGCCGTGAAACCATCCGTCGCCGTTAAAGGCCTTGGCGGCAGCTCACTCGCCGGAGCCA
AGCTCTCCTTCAAGCCTTCCCGCCTAAGCATCAAAACCAAATCAATCCGGTCTGGTGGTG
TGGTGACTAAGTATGGTGACAAAAGTGTCTACTTTGACTTAGAAGACTTGGGAAACACAA
CAGGTCAATGGGATCTATACGGCTCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCTCTTCAGAGCA
AGTTCTTTGAGACATTCGCTGCACCATTCACAAAGAGAGGATTGCTCCTCAAGTTCTTGA
TCATCGGAGGAGGATCTTTGCTTACTTACGTCAGCGCTTCCTCCACCGGAGATGTTCTTC
CCATAAAGAGAGGTCCTCAGGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTCGCGGCAAACTCTGATTTA
AATTCACGCATATGTTTTTGTTACCTTCTTTATCCCTCTTTATAATCCCATAAACATTTC
TCAATACTGCAAACTCTTTTAAGTGATTTTGATTGTATGTATATCCTGTTTTCTCTGTTA
CATTTCCTTTTTCCTAATTTTACAAATCTCAAGAATATTGCACAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 
25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2FG31JQ C 26
AF RR2FG31TF U 26
AF RR2AW66JQ C 1
AF RR2AW66TFB U 62
BS 1 27 RR2AW66JQ
BS 28 185 RR2FG31TF
BS 186 186 RR2AW66TFB
BS 187 388 RR2FG31TF
BS 389 389 RR2AW66TFB
BS 390 421 RR2FG31TF
BS 422 422 RR2AW66TFB
BS 423 424 RR2FG31TF
BS 425 425 RR2AW66TFB
BS 426 574 RR2FG31TF
BS 575 643 RR2AW66TFB
BS 644 647 RR2AW66JQ

RD RR2FG31JQ 564 0 0
GG
GATCAAACCTCATGGCGTCTCTTGCAACCGTAGCGGCCGTGAAACCATCCGTCGCCGTTA
AAGGCCTTGGCGGCAGCTCACTCGCCGGAGCCAAGCTCTCCTTCAAGCCTTCCCGCCTAA
GCATCAAAACCAAATCAATCCGGTCTGGTGGTGTGGTGGCTAAGTATGGTGACAAAAGTG
TCTACTTTGACTTAGAAGACTTGGGAAACACAACAGGTCAATGGGATCTATACGGCTCTG
ATGCTCCTTCTCCTTACAACCCTCTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTCGCTGCACCAT
TCACAAAGAGAGGATTGCTCCTCAAGTTCTTGATCATCGGAGGAGGATCTTTGCTTACTT
ATGTCAGCGCTTCCTCCACCGGAGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAGGAGAAGC
CTAAGCTCGGTCCTCGCGGCAAACTCTGATTTAAATTCACGCATATGTTTTTGTTACCTT
CTTTATCCCTCTTTATAATCCCATAAACATTTCTCAATACTGCAAACTCTTTTAAGTGAT
TTTGATT
CTGTTTCTCTGTTAC

QA 3 549 3 549
DS 

RD RR2FG31TF 564 0 0
GG
GATCAAACCTCATGGCGTCTCTTGCAACCGTAGCGGCCGTGAAACCATCCGTCGCCGTTA
AAGGCCTTGGCGGCAGCTCACTCGCCGGAGCCAAGCTCTCCTTCAAGCCTTCCCGCCTAA
GCATCAAAACCAAATCAATCCGGTCTGGTGGTGTGGTGGCTAAGTATGGTGACAAAAGTG
TCTACTTTGACTTAGAAGACTTGGGAAACACAACAGGTCAATGGGATCTATACGGCTCTG
ATGCTCCTTCTCCTTACAACCCTCTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTCGCTGCACCAT
TCACAAAGAGAGGATTGCTCCTCAAGTTCTTGATCATCGGAGGAGGATCTTTGCTTACTT
ATGTCAGCGCTTCCTCCACCGGAGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAGGAGAAGC
CTAAGCTCGGTCCTCGCGGCAAACTCTGATTTAAATTCACGCATATGTTTTTGTTACCTT
CTTTATCCCTCTTTATAATCCCATAAACATTTCTCAATACTGCAAACTCTTTTAAGTGAT
TTTGATT
CTGTTTCTCTGTTAC

QA 3 549 3 549
DS 

RD RR2AW66JQ 647 0 0
GGGTTAGCCACAACAACAGAAAATAGTGATCAAACCTCATGGCGTCTCTTGCAACCGCCG
CGACCGTGAAACCATCCGTCGCCGTTAAAGGCCTTGGCGGCAGCTCACTCGCCGGAGCCA
AGCTCTCCTTCAAGCCTTCCCGCCTAAGCATCAAAACCAAATCAATCCGGTCTGGTGGTG
TGGTGACTAAGTATGGTGACAAAAGTGTCTACTTTGACTTAGAAGACTTGGGAAACACAA
CAGGTCAATGGGATCTATACGGCTCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCTCTTCAGAGCA
AGTTCTTTGAGACATTCGCTGCACCATTCACGAAGAGAGGATTGCTCCTCAAGTTCTTGA
TCATCGGAGGAGGATCTTTGCTTACTTACGTCAGCGCTTCCTCCACCGGAGATGTTCTTC
CCATAAAGAGAGGTCCTCAGGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTCGCGGCAAACTCTGATTTA
AATTCATGCATATGTTTTTGTTACCTTCTTTATCCCTCTTTATAATCCCATAAACATTTC
TCAATACTGCAAACTCTTTTAAGTGATTTTGATTGTATGTATATCCTGTTTTCTCTGTTA
CATTTCCTTTTTCCTAATTTTACAAATCTCAAGAATATTGCACAAAA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2AW66TFB 582 0 0
GA
CCGTGAAACCATCCGTCGCCGTTAAAGGGCTTGGCGGGAGCTCACTCGCCGGAGCCAAGC
TCTCCTTCAAGCCTTCCCGCCTAAGCATCAAAACCAAATCAATCCGGTCTGGTGGTGTGG
TGACTAAGTATGGTGACAAAAGTGTCTACTTTGACTTAGAAGACTTGGGAAACACAACAG
GTCAATGGGATCTATACGGCTCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCTCTTCAGAGCAAGT
TCTTTGAGACATTCGCTGCACCATTCACGAAGAGAGGATTGCTCCTCAAGTTCTTGATCA
TCGGAGGAGGATCTTTGCTTACTTACGTCAGCGCTTCCTCCACCGGAGATGTTCTTCCCA
TAAAGAGAGGTCCTCAGGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTCGCGGCAAACTCTGATTTAAAT
TCATGCATATGTTTTTGTTACCTTCTTTATCCCTCTTTATAATCCCATAAACATTTCTCA
ATACTGCAAACTCTTTTAAGTGATTTTGATTGTATGTATATCCTGTTTTCTCTGTTACAT
TTCCTTTTTCCTAATTTTACAAATCTCAAGAATATTGCAC

QA 3 582 3 582
DS 



CO CL654Contig2 632 4 8 U
GGGAAAAGGAATGTAATAACAGAGAAACAGAATATACAATAAAATCAAAATCACTTAAAA
AGAGTTTGCAGTATTGAGAAATGTTTTTTGGGATTATAAAGAGGGAAAAGAAGGTAACAA
CAAAACATATGCATGAATCTTAAATCAGAGTTTGCCGCGAGGACCGAGCTTAGGCTTCTC
CTGAGGACCTCTCTTGATAGGAAGAACATCTCCGGTGGAGGAAGCGCTGACATAAGTAAG
CAAAGATCCTCCTCCGATGATCAAGAACTTGAGGAGCAATCCTCTCTTTGTGAATGGTGC
AGCGAATGTCTCAAAGAACTTGCTCTGAAGAGGGTTGTAAGGAGAAGGAGCATCAGAGCC
GTAGAGATCCCATTGACCTGTTGTGTTTCCCAAGTCTTCTAAGTCAAAGTAGACACTTTT
GTCACCATACTTAGCCACCACACCACCAGACCGGATTGATTTGGTTTTGATGCTTAGGCG
GGAAGGCTTGAAGGAGAGCTTGGCTCCAGCGAGCGAGCTGCCGCCAAGGCCTTTAACGGC
GACGGATGGTTTCACGGCGGCGACGGTTGCAAGAGACGCCATGAGGTTTGATCACTATTT
TCTGGTTGTTGTGGCTAACAATGGGTGATTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ20JQ U 1
AF RR2GZ20TF C 1
AF RR2BA43JQ U 37
AF RR2BA43TF C 165
BS 1 357 RR2GZ20JQ
BS 358 358 RR2BA43JQ
BS 359 363 RR2GZ20JQ
BS 364 364 RR2BA43JQ
BS 365 435 RR2GZ20JQ
BS 436 436 RR2BA43JQ
BS 437 626 RR2GZ20JQ
BS 627 632 RR2BA43JQ

RD RR2GZ20JQ 628 0 0
GGGAAAAGGAATGTAATAACAGAGAAACAGAATATACAATAAAATCAAAATCACTTAAAA
AGAGTTTGCAGTATTGAGAAATGTTTTTTGGGATTATAAAGAGGGAAAAGAAGGTAACAA
CAAAACATATGCATGAATCTTAAATCAGAGTTTGCCGCGAGGACCGAGCTTAGGCTTCTC
CTGAGGACCTCTCTTGATAGGAAGAACATCTCCGGTGGAGGAAGCGCTGACATAAGTAAG
CAAAGATCCTCCTCCGATGATCAAGAACTTGAGGAGCAATCCTCTCTTTGTGAATGGTGC
AGCGAATGTCTCAAAGAACTTGCTCTGAAGAGGGTTGTAAGGAGAAGGAGCATCAGAACC
GTAAAGATCCCATTGACCTGTTGTGTTTCCCAAGTCTTCTAAGTCAAAGTAGACACTTTT
GTCACCATACTTAGCTACCACACCACCAGACCGGATTGATTTGGTTTTGATGCTTAGGCG
GGAAGGCTTGAAGGAGAGCTTGGCTCCAGCGAGCGAGCTGCCGCCAAGGCCTTTAACGGC
GACGGATGGTTTCACGGCGGCGACGGTTGCAAGAGACGCCATGAGGTTTGATCACTATTT
TCTGGTTGTTGTGGCTAACAATGGGT
CC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2GZ20TF 628 0 0
GGGAAAAGGAATGTAATAACAGAGAAACAGAATATACAATAAAATCAAAATCACTTAAAA
AGAGTTTGCAGTATTGAGAAATGTTTTTTGGGATTATAAAGAGGGAAAAGAAGGTAACAA
CAAAACATATGCATGAATCTTAAATCAGAGTTTGCCGCGAGGACCGAGCTTAGGCTTCTC
CTGAGGACCTCTCTTGATAGGAAGAACATCTCCGGTGGAGGAAGCGCTGACATAAGTAAG
CAAAGATCCTCCTCCGATGATCAAGAACTTGAGGAGCAATCCTCTCTTTGTGAATGGTGC
AGCGAATGTCTCAAAGAACTTGCTCTGAAGAGGGTTGTAAGGAGAAGGAGCATCAGAGCC
GTAGAGATCCCATTGACCTGTTGTGTTTCCCAAGTCTTCTAAGTCAAAGTAGACACTTTT
GTCACCATACTTAGCTACCACACCACCAGACCGGATTGATTTGGTTTTGATGCTTAGGCG
GGAAGGCTTGAAGGAGAGCTTGGCTCCAGCGAGCGAGCTGCCGCCAAGGCCTTTAACGGC
GACGGATGGTTTCACGGCGGCGACGGTTGCAAGAGACGCCATGAGGTTTGATCACTATTT
TCTGGTTGTTGTGGCTAACAATGGGT
CC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2BA43JQ 596 0 0
CG
ATAAAATCAAAATCACTTAAAAAGAGTTTGCAGTATTGAGAAATGTTTTTTGGGATTATA
AAGAGGGAAAAGAAGGTAACAACAAAACATATGCATGAATCTTAAATCAGAGTTTGCCGC
GAGGACCGAGCTTAGGCTTCTCCTGAGGACCTCTCTTGATAGGAAGAACATCTCCGGTGG
AGGAAGCGCTGACATAAGTAAGCAAAGATCCTCCTCCGATGATCAAGAACTTGAGGAGCA
ATCCTCTCTTTGTGAATGGTGCAGCGAATGTCTCAAAGAACTTGCTCTGAAGAGGGTTGT
AAGGAGAAGGAGCATCAGAGCCGTAGAGATCCCATTGACCTGTTGTGTTTCCCAAGTCTT
CTAAGTCAAAGTAGACACTTTTGTCACCATACTTAGCCACCACACCACCAGACCGGATTG
ATTTGGTTTTGATGCTTAGGCGGGAAGGCTTGAAGGAGAGCTTGGCTCCAGCGAGCGAGC
TGCCGCCAAGGCCTTTAACGGCGACGGATGGTTTCACGGCGGCGACGGTTGCAAGAGACG
CCATGAGGTTTGATCACTATTTTCTGGTTGTTGTGGCTAACAATGGGTGATTCC

QA 3 596 3 596
DS 

RD RR2BA43TF 468 0 0
CGAGCTTAGGCTTCTCCTGAGGACCTCTCTTGATAGGAAGAACATCTCCGGTGGAGGAAG
CGCTGACATAAGTAAGCAAAGATCCTCCTCCGATGATCAAGAACTTGAGGAGCAATCCTC
TCTTTGTGAATGGTGCAGCGAATGTCTCAAAGAACTTGCTCTGAAGAGGGTTGTAAGGAG
AAGGAGCATCAGAGCCGTAGAGATCCCATTGACCTGTTGTGTTTCCCAAGTCTTCTAAGT
CAAAGTAGACACTTTTGTCACCATACTTAGCCACCACACCACCAGACCGGATTGATTTGG
TTTTGATGCTTAGGCGGGAAGGCTTGAAGGAGAGCTTGGCTCCAGCGAGCGAGCTGCCGC
CAAGGCCTTTAACGGCGACGGATGGTTTCACGGCGGCGACGGTTGCAAGAGACGCCATGA
GGTTTGATCACTATTTTCTGGTTGTTGTGGCTAACAATGGGT
GATTCC

QA 1 462 1 462
DS 



AS 2 4

CO CL655Contig1 722 2 20 U
GGCATCAAATCAAACTGATTCTCATTGATAACAACTTACTTTAACTCAACTCATTGTTAA
TATCAAGAAAAAGACACATTGATAATGTAGTTTCTTTTATTCGTTGAGACAGGCAACATC
TTTATTTGAGTATTCAAGCTCAGGTGGAAGGAACACAAGAAGAAGGACAAACAGCACACA
ATCGGTACTTCTTCAAGCTGCGTTTCCGGCTGTTGTCCCGATAGTCTTGAGATCAAAGAT
CTCGATCCAGTAGCCATCAGGATCCTTAATGAAGGCTATGTTCTTCATCTTTCCATCGTT
AGGTTTCTTGACAAACTCAACACCCAGTTGTTCAAATCTCTCGCATGCCTTGTGCACATC
ATCAACTGTAACCCCAATATGCCCAAATCCTTTAGGTTCGGAGTTCCCATTATGATAACC
TTTAAACTCGGGATCACTCTCTGTACCCCAGTTGTGAGTCAGCTCAATTGTTGCTGGTCG
ACCAAAGGTCCAAACAGTTCTCTCAGTTGGATCCGTTGGAGCTGTTGAAGTATCCTCATA
GCCCAGGAAGTACAAGCTGAATTTCATCTCAGAGAAATCTAGCCTCTTCAGTAATGACAT
TCCCAGGACACGTGAGTAAAAGTCAAGACTAGCCTTAGGGTCCTTCACACGAAACATAGT
CTGCTGCATGATATACCCTTTGGTAGCTTCATCACGAACCGTTGACAAGCCAGGATTGTT
TG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2CL79JQ U 1
AF RR2FM17JQ U 6
BS 1 41 RR2CL79JQ
BS 42 42 RR2FM17JQ
BS 43 128 RR2CL79JQ
BS 129 130 RR2FM17JQ
BS 131 145 RR2CL79JQ
BS 146 146 RR2FM17JQ
BS 147 190 RR2CL79JQ
BS 191 191 RR2FM17JQ
BS 192 267 RR2CL79JQ
BS 268 268 RR2FM17JQ
BS 269 318 RR2CL79JQ
BS 319 319 RR2FM17JQ
BS 320 495 RR2CL79JQ
BS 496 496 RR2FM17JQ
BS 497 531 RR2CL79JQ
BS 532 532 RR2FM17JQ
BS 533 537 RR2CL79JQ
BS 538 538 RR2FM17JQ
BS 539 557 RR2CL79JQ
BS 558 722 RR2FM17JQ

RD RR2CL79JQ 557 0 0
GGCATCAAATCAAACTGATTCTCATTGATAACAACTTACTT*AACTCAACTCATTGTTAA
TATCAAGAAAAAGACACATTGATAATGTAGTTTCTTTTATTCGTTGAGACAGGCAACATC
TTTATTTG**TATTCAAGCTCAGGTTGAAGGAACACAAGAAGAAGGACAAACAGCACACA
ATCGGTACTTTTTCAAGCTGCGTTTCCGGCTGTTGTCCCGATAGTCTTGAGATCAAAGAT
CTCGATCCAGTAGCCATCAGGATCCTTTATGAAGGCTATGTTCTTCATCTTTCCATCGTT
AGGTTTCTTGACAAACTCCACACCCAGTTGTTCAAATCTCTCGCATGCCTTGTGCACATC
ATCAACTGTAACCCCAATATGCCCAAATCCTTTAGGTTCGGAGTTCCCATTATGATAACC
TTTAAACTCGGGATCACTCTCTGTACCCCAGTTGTGAGTCAGCTCAATTGTTGCTGGTCG
ACCAAAGGTCCAAACCGTTCTCTCAGTTGGATCCGTTGGAGCTGTTGAAGTGTCCTCGTA
GCCCAGGAAGTACAAGC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2FM17JQ 717 0 0
CAAATCAAACTGATTCTCATTGATAACAACTTATTTTAACTCAACTCATTGTTAATATCA
AGAAAAAGACACATTGATAATGTAGTTTCTTTTATTCGTTGGGACAGGCAACATCTTTAT
TTGAGTATTCAAGCTCAGGTGGAAGGAACACAAGAAGAAG*ACAAACAGCACACAATCGG
TACTTCTTCAAGCTGCGTTTCCGGCTGTTGTCCCGATAGTCTTGAGATCAAAGATCTCGA
TCCAGTAGCCATCAGGATCCTTAATGAAGGCTATGTTCTTCATCTTTCCATCGTTAGGTT
TCTTGACAAACTCAACTCCCAGTTGTTCAAATCTCTCGCATGCCTTGTGCACATCATCAA
CTGTAACCCCAATATGCCCAAATCCTTTAGGTTCGGAGTTCCCATTATGATAACCTTTAA
ACTCGGGATCACTCTCTGTGCCCCAGTTGTGAGTCAGCTCAATTGTTGCTGGTCGACCAA
AGGTCCAAACAGTTCTCTCAGTTGGATCCGTTGGAGCTGTTGAAGTATCCTCATAGCCGA
GGAAGTACAAGCTGAATTTCATCTCAGAGAAATCTAGCCTCTTCAGTAATGACATTCCCA
GGACACGTGAGTAAAAGTCAAGACTAGCCTTAGGGTCCTTCACACGAAACATAGTCTGCT
GCATGATATACCCTTTGGTAGCTTCATCACGAACCGTTGACAAGCCAGGATTGTTTG

QA 1 717 1 717
DS 



CO CL655Contig2 733 2 3 U
TATCGTCGAGACAGGCAACATCTTTATTTGTATCAAGATCAGGTGGAAGGACACAAGAAG
AAGACAAACAGCACACAATCTGTACTTCTTCTCAGGCTGCGTTTCCGGCTGTTGTCCCGA
TAGTCTTGAGATCAAAGATCTCGATCCAGTAGCCATCAGGGTCTTTTATGAAGGCTATGT
TCTTCATCTTTCCATCGTTAGGTTTCTTGACAAACTCCACTCCCAGTTGTTCAAATCTCT
CGCATGCCTTGGGCACATCATCAACTGTAACCCCAATATGCCCAAATCCTTTAGGTTCGG
AGTTCCCATTATGATAACCTTTAAACTCGAAATCACTCTCTGTACCCCAGTTGTGAGTCA
GCTCAATTGTTGCTGGTCGACCAAAGGTCCAAACAGTTCTCTCAGTTGGATCCGTTGGAG
CTGTCGAAGTATCCTCGTAGCCGAGGAAGTACAAGCTGAATTTCATCTCAGAGAAATCTA
GCCTCTTCAGCAATGACATTCCAAGGATACGTGAGTAGAAGTCAAGACTAGCCTTAGGGT
CCTTCACCCGAAACATAGTCTGCTGCATGATGTACCCTTTGGTAGCTTCATCACGAACTG
TTGACAAGCCAGGATTGTTTGCTGGTGATTCCTTCGCTTCCGTCGCCATAGAGAACACAC
GAAGCTGATCAAATCTCGATGTACGATGAACCGACCGAGAGCTGTGTCTGTGTCTGTGAC
TGGAGGAGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H157JQ U 213
AF RR2H157TF C 1
BS 1 219 RR2H157TF
BS 220 341 RR2H157JQ
BS 342 733 RR2H157TF

RD RR2H157JQ 129 0 0
AACTCCC
CTCCCAGTTGTTCAAATCTCTCGCATGCCTTGGGCACATCATCAACTGTAACCCCAATAT
GCCCAAATCCTTTAGGTTCGGAGTTCCCATTATGATAACCTTTAAACTCGAAATCACTCT
CT

QA 8 129 8 129
DS 

RD RR2H157TF 733 0 0
TATCGTCGAGACAGGCAACATCTTTATTTGTATCAAGATCAGGTGGAAGGACACAAGAAG
AAGACAAACAGCACACAATCTGTACTTCTTCTCAGGCTGCGTTTCCGGCTGTTGTCCCGA
TAGTCTTGAGATCAAAGATCTCGATCCAGTAGCCATCAGGGTCTTTTATGAAGGCTATGT
TCTTCATCTTTCCATCGTTAGGTTTCTTGACAAACTCCACTCCCAGTTGTTCAAATCTCT
CGCATGCCTTGTGCACATCATCAACTGTAACCCCAATATGCCCAAATCCTTTAGGTTCGG
AGTTCCCATTATGATAACCTTTAAACTCGAGATCACTCTCTGTACCCCAGTTGTGAGTCA
GCTCAATTGTTGCTGGTCGACCAAAGGTCCAAACAGTTCTCTCAGTTGGATCCGTTGGAG
CTGTCGAAGTATCCTCGTAGCCGAGGAAGTACAAGCTGAATTTCATCTCAGAGAAATCTA
GCCTCTTCAGCAATGACATTCCAAGGATACGTGAGTAGAAGTCAAGACTAGCCTTAGGGT
CCTTCACCCGAAACATAGTCTGCTGCATGATGTACCCTTTGGTAGCTTCATCACGAACTG
TTGACAAGCCAGGATTGTTTGCTGGTGATTCCTTCGCTTCCGTCGCCATAGAGAACACAC
GAAGCTGATCAAATCTCGATGTACGATGAACCGACCGAGAGCTGTGTCTGTGTCTGTGAC
TGGAGGAGAGTCC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 2 8

CO CL656Contig1 1261 6 5 U
GCTGATTCCTCTCAATGAAATTTGCCATGTTGCACTAAGTTACTTACGGATGTATGCATG
CAGTCCAGGAACACTTTGGGGTAAACACCCATCCAAACGACTCCAACAAGAAAAGGTATA
AATATGAAAACTTCTCTGCCATTTAAATCGGAGAATTTATGGAGGAAATCGGGTTTTAAA
TTTCCAGAAACCACACGATTATATAGCCAAAGGGAATAGGCCGCACCTAAAATCATCCCA
AGCGCTGCTAATGTGGCTACTAAGCTATTTCTTTGGAAAGCTCCTACTAAGATGAGAAAT
TCCCCGATAAAGCTGCTAGTACCAGGTAAACTCATATTGGCCAAAGTAAAAAAAA*GAAA
ATGGTAGAGAAATTCGGCATGGTGCTCACTAAACCTCCGTAATATCTAACAAGTCGAGTC
TTATGTCGGTCATATAGAACACCAACACATAGAAAAAGGGCTGAAGAAACCAGTCCATGA
CTTAACATCAGTAGAATACTACCTCCAATTCCCTGTATGTTCGGACTAAACATACCAATA
GTCACCAGATTCATATGGGCTACTGAGGAGTAAGCAATGATCTTCTTTAGATCGATCTGT
CTTAAAGTGGTCAAGGAAGTATATATTATAGCAATCGCGCTTAAAGTATAAATGAAAGGA
GTAAAACAAAGTGTCGCTTCGGGAAACATGGGTATTGAAAATCTTAAAAACCCGTAGGTT
CCAAATTTTAAAAGAATTCCTGCCAAGATGACAGACCCTGCCGTAGGTGCCTCTACATGA
GCTTCGGGTAACCAAATATGAACTGGTACCATAGGCACTTTGACGGCGAAAGAGGCGAAA
AAAGCAATCCATAGAAAGATTTGGCGCCGCTCACTAAATTCTGTGGTTAATAATATTTGT
AAATCGGTGGTTCCTGTTTGGAAAAGAATCAACAGAATAGCTAATAGCATAAAAAGAGAT
CCAAGTAAAGTATAAAGGAAAAACTGATATGCTGCCTTGATCTTTCTTTGTCTCGAACCC
CATACTCCTATAATAATGGTAGAGTAAGGGGTGGCCCCAAAGCGGAATTGACCGGGGGTG
CTTGGTCGAAGCTCCAGTAGGTAGCCACTCCCTTCTCAGGGAACCGTACGTGAGACTTCC
GCATCATACGGCTCCGTCCCGAGCTTCCGTCGTCGGCCCTTGTCATTAGACCACTATCTA
TGCATGTATTTTTAGCCTGGACGATTATCCCTAACCTCGGTAGCTTACGAGTTTACGTCC
C


BQ
20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH95JQ U 1
AF RR2BC60JQ U 1
AF RR2GS55JQB U 1
AF RR2B089JQ U 1
AF RR2BC60TF C 196
AF RR2GS55TF C 626
BS 1 456 RR2BC60JQ
BS 457 457 RR2FH95JQ
BS 458 762 RR2BC60JQ
BS 763 1013 RR2BC60TF
BS 1014 1261 RR2GS55TF

RD RR2FH95JQ 518 0 0
GCTGATTCCTCTCAATGAAATTTGCCATGTTGCACTAAGTTACTTACGGATGTATGCATG
CAGTCCAGGAACACTTTGGGGTAAACACCCATCCAAACGACTCCAACAAGAAAAGGTATA
AATATGAAAACTTCTCTGCCATTTAAATCGGAGAATTTATGGAGGAAATCGGGTTTTAAA
TTTCCAGAAACCACACGATTATATAGCCAAAGGGAATAGGCCGCACCTAAAATCATCCCA
AGCGCTGCTAATGTGGCTACTAAGCTATTTCTTTGGAAAGCTCCTACTAAGATGAGAAAT
TCCCCGATAAAGCTGCTAGTACCAGGTAAACTCGTATTGGCCAAAGTAAAAAAAA*GAAA
ATGGTAGAGAAATTCGGCATGGTGCTCACTAAACCTCCATAATATCTAACAAGTCGAGTC
TTATGTCGGTCATATAGAACACCAACACATAGAAAAAGGGCTGAAGAAACCAGTCCATGA
CTTAACATCAGTAGAATACTACCTCCAATTCCCTGTAT

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2BC60JQ 762 0 0
GCTGATTCCTCTCAATGAAATTTGCCATGTTGCACTAAGTTACTTACGGATGTATGCATG
CAGTCCAGGAACACTTTGGGGTAAACACCCATCCAAACGACTCCAACAAGAAAAGGTATA
AATATGAAAACTTCTCTGCCATTTAAATCGGAGAATTTATGGAGGAAATCGGGTTTTAAA
TTTCCAGAAACCACACGATTATATAGCCAAAGGGAATAGGCCGCACCTAAAATCATCCCA
AGCGCTGCTAATGTGGCTACTAAGCTATTTCTTTGGAAAGCTCCTACTAAGATGAGAAAT
TCCCCGATAAAGCTGCTAGTACCAGGTAAACTCATATTGGCCAAAGTAAAAAAAA*GAAA
ATGGTAGAGAAATTCGGCATGGTGCTCACTAAACCTCCGTAATATCTAACAAGTCGAGTC
TTATGTCGGTCATATAGAACACCAACACATAGAAAA*GGGCTGAAGAAACCAGTCCATGA
CTTAACATCAGTAGAATACTACCTCCAATTCCCTGTATGTTCGGACTAAACATACCAATA
GTCACCAGATTCATATGGGCTACTGAGGAGTAAGCAATGATCTTCTTTAGATCGATCTGT
CTTAAAGTGGTCAAGGAAGTATATATTATAGCAATCGCGCTTAAAGTATAAATGAAAGGA
GTAAAACAAAGTGTCGCTTCGGGAAACATGGGTATTGAAAATCTTAAAAACCCGTAGGTT
CCAAATTTTAAAAGAATTCCTGCCAAGATGACAGACCCTGCC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2GS55JQB 751 0 0
GCTGATTCCTCTCAATGAAATTTGCCATGTTGCACTAAGTTACTTACGGATGTATGCATG
CAGTCCAGGAACACTTTGGGGTAAACACCCATCCAAACGACTCCAACAAGAAAAGGTATA
AATATGAAAACTTCTCTGCCATTTAAATCGGAAAATTTATGGAGGAAATCGGGTTTTAAA
TTTCCAGAAACCACACGATTATATAGCCAAAGGGAATAGGCCGCACCTAAAATCATCCCA
AGCGCTGCTAATGTGGCTACTAAGCTATTTCTTTGGAAAGCTCCTACTAAGATGAGAAAT
TCCCCGATAAAGCTGCTAGTACCAGGTAAACTCATATTGGCCAAAGTAAAAAAAAAGAAA
ATGGTAGAGAAATTCGGCATGGTGCTCACTAAACCTCCATAACATCTAACAAGTCGAGTC
TTATGTCGGTCATATAGAACACCAACACATAGAAAAAGAGCTGAAGAAACCAGTCCATGA
CTTAACATCAGTAGAATACTACCTCCAATTCCCTGTATGTTCAGACTAAACATACCAATA
GTCACCAGATTCATATGGGCTACTGAGGAGTAAGCAATGATCTTCTTTAGATCGATCTGT
CTTAAAGTGGTCAAGGAAGTATATATTATAGCAATCGCGCTTAAAGTATAAATGAAAGGA
GTAAAACAAAGTGTTGCTTCGGGAAACATGGGTATTGAAAATCTTAAAAACCCGTAGGTT
CCAAATTTTAAAAGAATTCCTGCCAAGATGA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2B089JQ 762 0 0
C
CTGATTCCTCTCAATGAAATTTGCCATGTTGCACTAAGTTACTTACGGATGTATGCATGC
AGTCCAGGAACACTTTGGGGTAAACACCCATCCAAACGACTCCAACAAGAAAAGGTATAA
ATATGAAAACTTCTCTGCCATTTAAATCGGAGAATTTATGGAGGAAATCGGGTTTTAAAT
TTCCAGAAACCACACGATTATATAGCCAAAGGGAATAGGCCGCACCTAAAATCATCCCAA
GCGCTGCTAATGTGGCTACTAAGCTATTTCTTTGGAAAGCTCCTACTAAGATGAGAAATT
CCCCGATAAAGCTGCTAGTACCAGGTAAACTCATATTGGCCAAAGTAAAAAAAAAGAAAA
TGGTAGAGAAATTCGGCATGGTGCTCACTAAACCTCCGTAATATCTAACAAGTCGAGTCT
TATGTCGGTCATATAGAACACCAACACATAGAAAAAGGGCTGAAGAAACCAGTCCATGAC
TTAACATCAGTAGAATACTACCTCCAATTCCCTGTATGTTCAGACTAAACATACCAATAG
TCACCAGATTCATATGGGCTACTGAGGAGTAAGCAATGATCTTCTTTAGATCGATCTGTC
TTAAAGTGGTCAAGGAAGTATATATTATAGCAATCGCGCTTAAAGTATAAATGAAAGGAG
TAAAACAAAGTGTCGCTTCGGGAAACATGGGTATTGAAAATCTTAAAAACCCGTAGGTTC
CAAATTTTAAAAGAATTCCTGCCAAGATGACGGATCCTGCC

QA 2 762 2 762
DS 

RD RR2BC60TF 820 0 0
CGATTATATAGCCAAAGGGAATAGGCCGCAC*TAAAATCATCCCAAGCGCTGCTAATGTG
GCTACTAAGCTATTTCTTTGGAAAGCTCCTACTAAGATGAGAAATTCCCCGATAAAGCTG
CTAGTACCAGGTAAACTCATATTGGCCAAAGTAAAAAAAA*GAAAATGGTAGAGAAATTC
GGCATGGTGCTCACTAAACCTCCGTAATATCTAACAAGTCGAGTCTTATGTCGGTCATAT
AGAACACCAACACATAGAAAA*GGGCTGAAGAAACCAGTCCATGACTTAACATCAGTAGA
ATACTACCTCCAATTCCCTGTATGTTCGGACTAAACATACCAATAGTCACCAGATTCATA
TGGGCTACTGAGGAGTAAGCAATGATCTTCTTTAGATCGATCTGTCTTAAAGTGGTCAAG
GAAGTATATATTATAGCAATCGCGCTTAAAGTATAAATGAAAGGAGTAAAACAAAGTGTC
GCTTCGGGAAACATGGGTATTGAAAATCTTAAAAACCCGTAGGTTCCAAATTTTAAAAGA
ATTCCTGCCAAGATGACAGACCCTGCCGTAGGTGCCTCTACATGAGCTTCGGGTAACCAA
ATATGAACTGGTACCATAGGCACTTTGACGGCGAAAGAGGCGAAAAAAGCAATCCATAGA
AAGATTTGGCGCCGCTCACTAAATTCTGTGGTTAATAATATTTGTAAATCGGTGGTTCCT
GTTTGGAAAAGAATCAACAGAATAGCTAATAGCATAAAAAGAGATCCAAGTAAAGTATAA
AGGAAAAACTGATATGCTGCCTTGATCTTTCTTTGTCT
AC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2GS55TF 636 0 0
A
TATAGCAATCGCGCTTAAAGTATAAATGAAAGGAGTAAAACAAAGTGTTGCTTCGGGAAA
CATGGGTATTGAAAATCTTAAAAACCCGTAGGTTCCAAATTTTAAAAGAATTCCTGCCAA
GATGACGGATCCTGCCGTAGGTGCCTCTACATGAGCTTCGGGTAACCAAATATGAACTGG
TACCATAGGCACTTTGACGGCGAAAGAGGCGAAAAAAGCAATCCATAGAAAGATTTGGCG
CCGCTCACTAAATTCTGTGGTTAATAATATTTGTAAATCGGTGGTTCCTGTTTGGAAAAG
AATCAACAGAATAGCTAATAGCATAAAAAGAGATCCAAGTAAAGTATAAAGGAAAAACTG
ATATGCTGCCTTGATCTTTCTTTGTCTCGAACCCCATACTCCTATAATAATGGTAGAGTA
AGGGGTGGCCCCAAAGCGGAATTGACCGGGGGTGCTTGGTCGAAGCTCCAGTAGGTAGCC
ACTCCCTTCTCAGGGAACCGTACGTGAGACTTCCGCATCATACGGCTCCGTCCCGAGCTT
CCGTCGTCGGCCCTTGTCATTAGACCACTATCTATGCATGTATTTTTAGCCTGGACGATT
ATCCCTAACCTCGGTAGCTTACGAGTTTACGTCCC

QA 2 636 2 636
DS 



CO CL656Contig2 602 2 2 U
GGCCGTATGATAGGTGGTAACTATCTTGTACGGTTCGGGGGGTAATCGGCGTACTCCGGG
AGAAATCTTTCGCTCTATCGAACATACAGGGAATTGGAGGTAGTATTCTACTGATGTTAA
GTCATGGACTGGTTTCTTCAGCCCTTTTTCTATGTGTTGGTGTTCTATATGACCGACATA
AGACTCGACTTGTTAGATATTATGGAGGTTTAGTGAGCACCATGCCGAATTTCTCTACCA
TTTTCTTTTTTTTTTACTTTGGCCAATATGAGTTTACCTGGTACTAGCAGCTTTATTGGG
GAATTTCTCATCTTAGTAGGAGCTTTCCAAAGAAATAGCTTAGTAGCCACATTAGCAGCG
CTTGGGATGATTTTAGGTGCGGCCTATTCCCTTTGGCTATATAATCGTGTGGTTTCTGGA
AATTTAAAACCCGATTTCCTCCATAAATTCTCCGATTTAAATGGCAGAGAAGTTTTCATA
TTTATACCTTTTCTTGTTGGAGTCGTTTGGATGGGTGTTTACCCCAAAGTGTTCCTGGAC
TGCATGCATACATCCGTAAGTAACTTAGTGCAACATGGCAAATTTCATTGAGAGGAATCA
GC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2EU94TF U 1
AF RR2EU94JQ C 1
BS 1 539 RR2EU94TF
BS 540 602 RR2EU94JQ

RD RR2EU94TF 539 0 0
GGCCGTATGATAGGTGGTAACTATCTTGTACGGTTCGGGGGGTAATCGGCGTACTCCGGG
AGAAATCTTTCGCTCTATCGAACATACAGGGAATTGGAGGTAGTATTCTACTGATGTTAA
GTCATGGACTGGTTTCTTCAGCCCTTTTTCTATGTGTTGGTGTTCTATATGACCGACATA
AGACTCGACTTGTTAGATATTATGGAGGTTTAGTGAGCACCATGCCGAATTTCTCTACCA
TTTTCTTTTTTTTTTACTTTGGCCAATATGAGTTTACCTGGTACTAGCAGCTTTATTGGG
GAATTTCTCATCTTAGTAGGAGCTTTCCAAAGAAATAGCTTAGTAGCCACATTAGCAGCG
CTTGGGATGATTTTAGGTGCGGCCTATTCCCTTTGGCTATATAATCGTGTGGTTTCTGGA
AATTTAAAACCCGATTTCCTCCATAAATTCTCCGATTTAAATGGCAGAGAAGTTTTCATA
TTTATACCTTTTCTTGTTGGAGTCGTTTGGATGGGTGTTTACCCCAAAGTGTTCCTGGA

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2EU94JQ 602 0 0
GGCCGTATGATAGGTGGTAACTATCTTGTACGGTTCGGGGGGTAATCGGCGTACTCCGGG
AGAAATCTTTCGCTCTATCGAACATACAGGGAATTGGAGGTAGTATTCTACTGATGTTAA
GTCATGGACTGGTTTCTTCAGCCCTTTTTCTATGTGTTGGTGTTCTATATGACCGACATA
AGACTCGACTTGTTAGATATTATGGAGGTTTAGTGAGCACCATGCCGAATTTCTCTACCA
TTTTCTTTTTTTTTTACTTTGGCCAATATGAGTTTACCTGGTACTAGCAGCTTTATTGGG
GAATTTCTCATCTTAGTAGGAGCTTTCCAAAGAAATAGCTTAGTAGCCACATTAGCAGCG
CTTGGGATGATTTTAGGTGCGGCCTATTCCCTTTGGCTATATAATCGTGTGGTTTCTGGA
AATTTAAAACCCGATTTCCTCCATAAATTCTCCGATTTAAATGGCAGAGAAGTTTTCATA
TTTATACCTTTTCTTGTTGGAGTCGTTTGGATGGGTGTTTACCCCAAAGTGTTCCTGGAC
TGCATGCATACATCCGTAAGTAACTTAGTGCAACATGGCAAATTTCATTGAGAGGAATCA
GC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 9

CO CL657Contig1 782 9 37 U
GGGGACGCTCTTTATCTTCAACCTCTCGACGTAAAAGCCCCAAGAAAGAAAAAAA*TGGC
TCTGGTTTTTCACTGTACATCTTGCAATTGGCTTCAGCGAAAGACGTTTCCGACGAATCG
GAGATATGCTCCGAACATCCGACGAGGAGCAACGAGGTGTGAGTTTAGAATTCCAGTAGA
AATCTCCAGTCCAGCAGATAGAGGATCCTTGGCTGTTCCTTCTCACAAGGTCACTGTACA
CGATCGTCAACGAGGAGTTGTTCACGAGTTTGAGGTTCCAGAGGATCAGTACATATTGCA
CTCAGCTGAATCTCAGAACATTAATCTTCCCTTTGCTTGCAGGCATGGTTGCTGTACTAG
CTGTGCCGTTCGTGTTAAATCTGGAGAGCTAAGGCAGCCACAAGCATTGGGAATATCAGC
TGAACTCAAGTCCCAGGGATATGCACTTCTGTGTGTGGGTTTCCCTACATCTGATCTTGA
AGTAGAAACACAAGATGAGGACGAGGTCTACTGGCTACAATTTGGAAGATACTTTGCTCG
TGGACCAATTGAGAGAGATGATTACGCCCTTGAACTCGCCATGGGAGACGAGTAGAAACA
ATAAGAGTTATAGAAGTGAGTGTTACTTTTTTAGTCCTGAATCTCGTGGTACATCCTTGT
AAACCTCTTGATGAACTCGACCATATTCTGAGAGAACTTCCCACCAGATCAAACATTTTA
TGAAAACTTATTGAACATTCCCACCATGAACTCCAAATTTCAAACATAACATATGTTTGC
AT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 30 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 5 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 15 45 45 5 45 30 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 5 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 40 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2D583JQ C 313
AF RR2AY23TFB U 347
AF RR2EI54TF U 1
AF RR2AY23JQ C 18
AF RR2D583TF U 19
AF RR2CJ90JQ C 66
AF RR2CJ90TF U 66
AF RR2BL83JQ C 66
AF RR2BL83TF U 66
BS 1 55 RR2EI54TF
BS 56 56 RR2D583TF
BS 57 91 RR2EI54TF
BS 92 92 RR2D583TF
BS 93 105 RR2EI54TF
BS 106 106 RR2D583TF
BS 107 113 RR2EI54TF
BS 114 114 RR2CJ90TF
BS 115 118 RR2EI54TF
BS 119 119 RR2D583TF
BS 120 127 RR2EI54TF
BS 128 128 RR2CJ90TF
BS 129 129 RR2EI54TF
BS 130 130 RR2D583TF
BS 131 214 RR2EI54TF
BS 215 215 RR2D583TF
BS 216 216 RR2EI54TF
BS 217 217 RR2D583TF
BS 218 222 RR2EI54TF
BS 223 223 RR2D583TF
BS 224 258 RR2EI54TF
BS 259 259 RR2CJ90TF
BS 260 287 RR2EI54TF
BS 288 288 RR2D583TF
BS 289 399 RR2EI54TF
BS 400 400 RR2AY23TFB
BS 401 450 RR2EI54TF
BS 451 451 RR2AY23TFB
BS 452 495 RR2EI54TF
BS 496 496 RR2AY23TFB
BS 497 689 RR2EI54TF
BS 690 690 RR2D583TF
BS 691 720 RR2EI54TF
BS 721 721 RR2D583TF
BS 722 725 RR2EI54TF
BS 726 736 RR2CJ90TF
BS 737 782 RR2BL83TF

RD RR2D583JQ 201 0 0
TCAGAACATTAATTTTCCCTTTGCTTGCAGGCATGGTTGTTGTACTAGCTGTCCCGTACG
TGTTAAATCTGGAGAGTTAAGGCAGC*ACAAGCATTAGGAATTTCAGCTGAACTCAAGTC
CCAGGGATATGCACTTCTGTGTGTGGGTTTCCCTACATCTGATCTTGAAGTAGAAACACA
AGATGAGGACGAGGTTTACTG

QA 1 201 1 201
DS 

RD RR2AY23TFB 343 0 0
GGTTGTTGTACTAGCTGTGCCGTACGTGTTAAATCTGGAGAGTTAAGGCAGCCACAAGCA
TTAGGAATATCAGCTGAACTCAAGTCCCAGGGATATGCACTTCTGCGTGTGGGTTTCCCT
ACATCTGATCTTGAAGTAGAAACACAAGATGAGGACGAGGTCTACTGGCTACAATTTGGA
AGATACTTTGCTCGTGGACCAATTGAGAGAGATGATTACGCCCTTGAACTCGCCATGGGA
GACGAGTAGAAACAATAAGAGTTATAGAAGCGAGTGTTACTTTTTTAGTCCTGGATCTCG
TGGTACATCCTTGTAAACCTCCTGATGAACTCGACCATATTCT

QA 1 343 1 343
DS 

RD RR2EI54TF 725 0 0
GGGGACGCTCTTTATCTTCAACCTCTCGACGTAAAAGCCCCAAGAAAGAAAAAAAATGGC
TCTGGTTTTTCACTGTACATCTTGCAATTGGATTCAGCGAAAGACTTTTCCGATGAATTG
GAGATATTCGCCGAACATCCGACGAGGAGCAACGAGGTGTGAGTTTAGAATTCCAGTAGA
AATCTCCAGTCCAGCAGATAGAGGATCCTTGGCTATGCCTTCGCACAAGGTCACTGTACA
CGATCGTCAACGAGGAGTCGTTCACGAGTTTGAGGTTCCAGAGGATCGGTACATATTGCA
CTCAGCTGAATCTCAGAACATTAATCTTCCCTTTGCTTGCAGGCATGGTTGCTGTACTAG
CTGTGCCGTTCGTGTTAAATCTGGAGAGCTAAGGCAGCCTCAAGCATTGGGAATATCAGC
TGAACTCAAGTCCCAGGGATATGCACTTCTCTGTGTGGGTTTCCCTACATCTGATCTTGA
AGTAGAAACACAAGACGAGGACGAGGTCTACTGGCTACAATTTGGAAGATACTTTGCTCG
TGGACCAATTGAGAGAGATGATTACGCCCTTGAACTCGCCATGGGAGACGAGTAGAAACA
ATAAGAGTTATAGAAGTGAGTGTTACTTTTTTAGTCCTGAATCTCGTGGTACATCCTTGT
AAACCTCTTGATGAACTCGACCATATTCTTAGAGAACTTCCCACCAGATCAAACATTTTA
CGAAA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2AY23JQ 719 0 0
GG
AACCTCTCGACGTAAAAGCCCCAAGAAAGAAAAAAA*TGGCTCTGGTTTTTCACTGTACA
TCTTGTAATTGGCTACAGCGAAAGACGTTTCCGATGAATCGGAGAGATTCTCCGAACATC
CGACGAGGAGCAACGAGGTGTGAGTTTAGAATTCCAGTAGAAATCTCCAGTCCAGCAGAT
AGAGGATCCTCGGCTGTTCCTTCTCACAAGGTCACTGTACACGATCGTCAACGAGGAGTC
GTTCACGAGTTTGAGGTTCCAGAGGATCAGTACATATTGCACTCAGCTGAATCTCAGAAC
ATTAATCTTCCCTTTGCTTGCAGGCATGGTTGTTGTACTAGCTGTGCCGTACGTGTTAAA
TCTGGAGAGTTAAGGCAGCCACAAGCATTAGGAATATCAGCTGAACTCAAGTCCCAGGGA
TATGCACTTCTGCGTGTGGGTTTCCCTACATCTGATCTTGAAGTAGAAACACAAGATGAG
GACGAGGTCTACTGGCTACAATTTGGAAGATACTTTGCTCGTGGACCAATTGAGAGAGAT
GATTACGCCCTTGAACTCGCCATGGGAGACGAGTAGAAACAATAAGAGTTATAGAAGCGA
GTGTTACTTTTTTAGTCCTGGATCTCGTGGTACATCCTTGTAAACCTCCTGATGAACTCG
ACCATATTCTGAGAGAACTTCCCACCAGATCAAACATTTTATGAAAACTTATTGAAC

QA 3 719 3 719
DS 

RD RR2D583TF 717 0 0
G
AACCTCTCGACGTAAAAGCCCCAAGAAAGAAAAAAA*TGGCTCTGGTTTTTCACTGTACA
TCTTGTAATTGGCTACAGCGAAAGACGTTTCCGATGAATCGGAGAGATTCTCCGAACATC
CGACGAGGAGCAACGAGGTGTGAGTTTAGAATTCCAGTAGAAATCTCCAGTCCAGCAGAT
AGAGGATCCTTGGCTGTTCCTTCTCACAAGGTCACTGTACACGATCGTCAACGAGGAGTC
GGTCACGAGTTTGAGGTTCCAGAGGATCAGTACATATTGCACTCAGCTGAATCTCAGAAC
ATTAATCTTCCCTTTGCTTGCAGGCATGGTTGTTGTACTAGCTGTGCCGTACGTGTTAAA
TCTGGAGAGTTAAGGCAGC*ACAAGCATTAGGAATATCAGCTGAACTCAAGTCCCAGGGA
TATGCACTTCTGTGTGTGGGTTTCCCTACATCTGATCTTGAAGTAGAAACACAAGATGAG
GACGAGGTCTACTGGCTACAATTTGGAAGATACTTTGCTCGTGGACCAATTGAGAGAGAT
GATTACGCCCTTGAACTCGCCATGGGAGACGAGTAGAAACAATAAGAGTTATAGAAGCGA
GTGTTACTTTTTTAGTCCTGGATCTCGTGGTACATCCTTGTAAACCTCCTGATGAACTCG
ACCATATTCTGAGAGAACTTCCCACCAGATCAAACATTTTATGAAA
CTTATTGACA

QA 2 707 2 707
DS 

RD RR2CJ90JQ 668 0 0
TTTTTCACTGTACATCTTGCAATTGGCTTCAGCGAAAGACGTTTCCGACGAATCGGAGAT
ATGCTCCGAACATCCGACGAGGAGCAACGAGGTGTGAGTTTAGAATTCCAGTAGAAATCT
CCAGTCCAGCAGATAGAGGATCCTTGGCTGTTCCTTCTCACAAGGTCACTGTACACGATC
GTCAACGAGGAGTTGTTCACGAGTTTGAGGTTCCAGAGGATCAGTACATATTGCACTCAG
CTGAATCTCAGAACATTAATCTTCCCTTTGCTTGCAGGCATGGTTGCTGTACTAGCTGTG
CTGTTCGTGTTAAATCTGGAGAGCTAAGGCAGCCACAAGCATTGGGAATATCAGCTGAAC
TCAAGTCCCAGGGATATGCACTTCTGTGTGTGGGTTTCCCTACATCTGATCTTGAAGTAG
AAACACAAGATGAGGACGAGGTCTACTGGCTACAATTTGGAAGATACTTTGCTCGTGGAC
CAATTGAGAGAGATGATTACGCCCTTGAACTCGCCATGGGAGACGAGTAGAAACAATAAG
AGTTATAGAAGTGAGTGCTACTTTTTTAGTCCTGAATCTCGTGGTACACCCTTGTAAACC
TCTTGATGAACTCGACCATATTCTGAGAGAACTTCCCACCAGATCAAACATTTTATGAAA
ACTTATTG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2CJ90TF 673 0 0
TTTTTCACTGTACATCTTGCAATTGGCTTCAGCGAAAGACGTTTCCGACGAATCGGAGAT
ATGCTCCGAACATCCGACGAGGAGCAACGAGGTGTGAGTTTAGAATTCCAGTAGAAATCT
CCAGTCCAGCAGATAGAGGATCCTTGGCTGTTCCTTCTCACAAGGTCACTGTACACGATC
GTCAACGAGGAGTTGTTCACGAGTTTGAGGTTCCAGAGGATCAGTACATATTGCACTCAG
CTGAATCTCAGAACATTAATCTTCCCTTTGCTTGCAGGCATGGTTGCTGTACTAGCTGTG
CTGTTCGTGTTAAATCTGGAGAGCTAAGGCAGCCACAAGCATTGGGAATATCAGCTGAAC
TCAAGTCCCAGGGATATGCACTTCTGTGTGTGGGTTTCCCTACATCTGATCTTGAAGTAG
AAACACAAGATGAGGACGAGGTCTACTGGCTACAATTTGGAAGATACTTTGCTCGTGGAC
CAATTGAGAGAGATGATTACGCCCTTGAACTCGCCATGGGAGACGAGTAGAAACAATAAG
AGTTATAGAAGTGAGTGCTACTTTTTTAGTCCTGAATCTCGTGGTACACCCTTGTAAACC
TCTTGATGAACTCGACCATATTCTGAGAGA*CTTCCCACCAGATCAAACATTTTATGAAA
ACTTATTGAAC
AA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2BL83JQ 717 0 0
TTTTTCACTGTACATCTTGCAATTGGCTTCAGCGAAAGACGTTCCCGACGAATCGGAGAT
ATGCTCCGAGCATCCGACGAGGAGCAACGAGGTGTGAGTTTAGAATTCCAGTAGAAATCT
CCAGTCCAGCAGATAGAGGATCCTTGGCTGTTCCTTCTCACAAGGTCACTGTACACGATC
GTCAACGAGGAGTTGTTCACGAGTTTGAGGTTCCAGAGGATCAGTACATATTGCACTCAG
CTGAATCTCAGAACATTAATCTTCCCTTTGCTTGCAGGCATGGTTGCTGTACTAGCTGTG
CTGTTCGTGTTAAATCTGGAGAGCTAAGGCAGCCACAAGCATTGGGAATATCAGCTGAAC
TCAAGTCCCAGGGATATGCACTTCTGTGTGTGGGTTTCCCTACATCTGATCTTGAAGTAG
AAACACAAGATGAGGACGAGGTCTACTGGCTACAATTTGGAAGATACTTTGCTCGTGGAC
CAATTGAGAGAGATGATTACGCCCTTGAACTCGCCATGGGAGACGAGTAGAAACAATAAG
AGTTATAGAAGTGAGTGTTACTTTTTTAGTCCTGAATCTCGTGGTGCATCCTTGTAAACC
TCTTGATGAACTCGACCATATTCTGAGAGAACTTCCCACCAGATCAAACATTTTATGAAA
ACTTATTGAACATTCCCACCATGAACTCCAAATTTCAAACATAACATATGTTTGCAT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2BL83TF 717 0 0
TTTTTCACTGTACATCTTGCAATTGGCTTCAGCGAAAGACGTTCCCGACGAATCGGAGAT
ATGCTCCGAGCATCCGACGAGGAGCAACGAGGTGTGAGTTTAGAATTCCAGTAGAAATCT
CCAGTCCAGCAGATAGAGGATCCTTGGCTGTTCCTTCTCACAAGGTCACTGTACACGATC
GTCAACGAGGAGTTGTTCACGAGTTTGAGGTTCCAGAGGATCAGTACATATTGCACTCAG
CTGAATCTCAGAACATTAATCTTCCCTTTGCTTGCAGGCATGGTTGCTGTACTAGCTGTG
CTGTTCGTGTTAAATCTGGAGAGCTAAGGCAGCCACAAGCATTGGGAATATCAGCTGAAC
TCAAGTCCCAGGGATATGCACTTCTGTGTGTGGGTTTCCCTACATCTGATCTTGAAGTAG
AAACACAAGATGAGGACGAGGTCTACTGGCTACAATTTGGAAGATACTTTGCTCGTGGAC
CAATTGAGAGAGATGATTACGCCCTTGAACTCGCCATGGGAGACGAGTAGAAACAATAAG
AGTTATAGAAGTGAGTGTTACTTTTTTAGTCCTGAATCTCGTGGTGCATCCTTGTAAACC
TCTTGATGAACTCGACCATATTCTGAGAGAACTTCCCACCAGATCAAACATTTTATGAAA
ACTTATTGAACATTCCCACCATGAACTCCAAATTTCAAACATAACATATGTTTGCAT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 9

CO CL658Contig1 827 9 8 U
GGAGCGCATGGACAATAGATAGTTAACATTATTTTCTAGTCAACTATGTATCCGTCTTTT
ATAATTATAAGCAAATTAAACATTGTTACATAGAAAAATATAATGTATAAAGCTTAGTAA
AAAGGCTATTTTATTTTTAGTTTCCGTATCATAAATTCTTAAGTTAATTATTACATGATT
TATATATGCTACATATTGAAACAGTATAAACCAACGTTTTTTATCAGGTGGGTGCAGGTG
CAGCCGCTGGTGCCGCTGCTGGATCTGCTGCTGGTGCTGCTTCAGCTGCAGGTGCAGCTG
CTGGTGCTGCTGCAGCTCCACCTGAAGCCATGCTACGATATTTATTAACGAGTCCTAGAA
TTTTTTTGAGAATTGCCAAACGTGAACCGCCGCCACCGCCACCCCCAAGTCTTGCTTTAA
TTCTATTTATTATAATTCTTCGTAACGGGTTTGAGGCCAATGTGACTTCTCCTGCAGTCC
TAAAGAGCCCCGTGATGAGACCTATGCCGGTCAGTCCGAGGGTGGTACCGGCCATGAGCC
CACTGGCTAGGAGGGTAGTGGTAATAGTGGCGGGTACGAGAATTGGACTAAATATGATGA
AAACTGGTGCGGATACGATTAATGCCACGGCTGAACCACCGAGTGTTACACAAGAAAGGG
CTAAGAAGACTAAGGAGGTCACGGAAGCTATAATAATCTTTATAACGTTCAGCAATGGGA
AGATAAAAGAGAACATTTTGAAGAAACGGCTAAATATCGATTGCTGAGAATGAGATTCGT
GTTGAACGAGTTCTTCGCTCATATTCTCAGATCGGATGGTTGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 15 45 45 45 45 30 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR2CW08JQ U 156
AF RR2BM30JQ U 167
AF RR2CF83JQ U 1
AF RR2F734JQ U 36
AF RR2F734TF C 31
AF RR2BM30TF C 222
AF RR2A819JQ U 36
AF RR2A819TF C 58
AF RR2CF83TF C 141
BS 1 294 RR2CF83JQ
BS 295 295 RR2BM30JQ
BS 296 357 RR2CF83JQ
BS 358 358 RR2F734JQ
BS 359 744 RR2CF83JQ
BS 745 768 RR2F734JQ
BS 769 823 RR2A819JQ
BS 824 827 RR2CF83TF

RD RR2CW08JQ 129 0 0
TTCTTAATTTAATTATTACATGATTTATATATGCTACATATTGAAACAGTATAAACCAAC
GTTTTTTATCAGGTGGGTGCAGGTGCAGCCGCTGGTGCCGCTGCTGGATCTGCTGCTGGT
GCTGCTTCA

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR2BM30JQ 447 0 0
ATTATTACATGATTTATATATGCTACATATTGAAACAGTATAAACCAACGTTTTTTATCA
GGGGGGTGCAGGGGCAGCCGCTGGGGCCGCTGCTGGATCTGCTGCTGGGGCTGCTTCAGC
TGCAGGGGCAGCTGCTGGTGCTGCTGCAGCTCCACCTGAAGCCATGCTACGATATTTATT
AACGAGTCCTAAAATTTTTTTGAAAATTGCCAAACGTTAACCGCCGCCACCGCCACCCCC
AAGTCTTGCTTTAATTCTATTTATTATAATTCTTCGTAACGGGTTTGAGGCCAATGTGAC
TTCTCCTGCAGTCCTAAAGAGCCCCGTGATGAAACCTATGCCGGTCAGTCCGAGGGTGGT
ACCGGCCATGAGCCCACTGGCTAGGAGGGTAGTGGTAATAGTGGCGGGTACGAAAATTGG
ACTAAATATGATGAAAACTGGTGCGGA

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR2CF83JQ 744 0 0
GGAGCGCATGGACAATAGATAGTTAACATTATTTTCTAGTCAACTATGTATCCGTCTTTT
ATAATTATAAGCAAATTAAACATTGTTACATAGAAAAATATAATGTATAAAGCTTAGTAA
AAAGGCTATTTTATTTTTAGTTTCCGTATCATAAATTCTTAAGTTAATTATTACATGATT
TATATATGCTACATATTGAAACAGTATAAACCAACGTTTTTTATCAGGTGGGTGCAGGTG
CAGCCGCTGGTGCCGCTGCTGGATCTGCTGCTGGTGCTGCTTCAGCTGCAGGTGTAGCTG
CTGGTGCTGCTGCAGCTCCACCTGAAGCCATGCTACGATATTTATTAACGAGTCCTAAAA
TTTTTTTGAGAATTGCCAAACGTGAACCGCCGCCACCGCCACCCCCAAGTCTTGCTTTAA
TTCTATTTATTATAATTCTTCGTAACGGGTTTGAGGCCAATGTGACTTCTCCTGCAGTCC
TAAAGAGCCCCGTGATGAGACCTATGCCGGTCAGTCCGAGGGTGGTACCGGCCATGAGCC
CACTGGCTAGGAGGGTAGTGGTAATAGTGGCGGGTACGAGAATTGGACTAAATATGATGA
AAACTGGTGCGGATACGATTAATGCCACGGCTGAACCACCGAGTGTTACACAAGAAAGGG
CTAAGAAGACTAAGGAGGTCACGGAAGCTATAATAATCTTTATAACGTTCAGCAATGGGA
AGATAAAAGAGAACATTTTGAAGA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2F734JQ 733 0 0
CTAGTCAACTATGTATCCGTCTTTTATAATTATAAGCAAATTAAACATTGTTACATAGAA
AAATATAATGTATAAAGCTTAGTAAAAAGGCTATTTTATTTTT***TTCCGTATCATAAA
TTATTAAGTTAATTATTACATGATTTATATATGCTACATATTGAAACAGTATAAACCAAC
GTTTTTTATCAGGTGGGTGCAGGTGCAGCCGCTGGTGCCGCTGCTGGATCTGCTGCTGGT
GCTGCTTCAGCTGCAGGTGCAGCTGCTGGTGCTGCTGCAGCTCCACCTGAAGCCATGCTA
CGATATTTATTAACGAGTCCTAGAATTTTTTTGAGAATTGCCAAACGTGAACCGCCGCCA
CCGCCACCCCCAAGTCTTGCTTTAATTCTATTTATTATAATTCTTCGTAACGGGTTTGAG
GCCAATGTGACTTCTCCTGCAGTCCTAAAGAGCCCCGTGATGAGACCTATGCCGGTCAGT
CCGAGGGTGGTACCGGCCATGAGCCCACTGGCTAGGAGGGTAGTGGTAATAGTGGCGGGT
ACGAGAATTGGACTAAATATGATGAAAACTGGTGCGGATACGATTAATGCCACGGCTGAA
CCACCGAGTGTTACACAAGAAAGGGCTAAGAAGACTAAGGAGGTCACGGAAGCTATAATA
ATCTTTATAACGTTCAGCAATGGGAAGATAAAAGAGAACATTTTGAAGAAACGGCTAAAT
ATCGATTGCTGAG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2F734TF 797 0 0
TTTTT
CTAGTCAACTATGTATCCGTCTTTTATAATTATAAGCAAATTAAACATTGTTACATAGAA
AA*TATAATGTATAAAGCTTAGTAAAAAGGCTATTTTATTTTT****TCCGTATCATAAA
TTATTAAGTTAATTATTACATGATTTATATATGCTACATATTGAAACAGTATAAACCAAC
GTTTTTTATCAGGTGGGTGCAGGTGCAGCCGCTGGTGCCGCTGCTGGATCTGCTGCTGGT
GCTGCTTCAGCTGCAGGTGCAGCTGCTGGTGCTGCTGCAGCTCCACCTGAAGCCATGCTA
CGATATTTATTAACGAGTCCTAGAATTTTTTTGAGAATTGCCAAACGTGAACCGCCGCCA
CCGCCACCCCCAAGTCTTGCTTTAATTCTATTTATTATAATTCTTCGTAACGGGTTTGAG
GCCAATGTGACTTCTCCTGCAGTCCTAAAGAGCCCCGTGATGAGACCTATGCCGGTCAGT
CCGAGGGTGGTACCGGCCATGAGCCCACTGGCTAGGAGGGTAGTGGTAATAGTGGCGGGT
ACGAGAATTGGACTAAATATGATGAAAACTGGTGCGGATACGATTAATGCCACGGCTGAA
CCACCGAGTGTTACACAAGAAAGGGCTAAGAAGACTAAGGAGGTCACGGAAGCTATAATA
ATCTTTATAACGTTCAGCAATGGGAAGATAAAAGAGAACATTTTGAAGAAACGGCTAAAT
ATCGATTGCTGAGAATGAGATTCGTGTTGAACGAGTTCTTCGCTCATATTCTCAGATCGG
ATGGTTGT
TCCC

QA 6 793 6 793
DS 

RD RR2BM30TF 586 0 0
TATCAGGTGGGTGCAGGTGCAGCCGCTGGTGCCGCTGCTGGATCTGCTGCTGGTGCTGCT
TCAGCTGCAGGTGCAGCTGCTGGTGCTGCTGCAGCTCCACCTGAAGCCATGCTACGATAT
TTATTAACGAGTCCTAGAATTTTTTTGAGAATTGCCAAACGTTAACCGCCGCCACCGCCA
CCCCCAAGTCTTGCTTTAATTCTATTTATTATAATTCTTCGTAACGGGTTTGAGGCCAAT
GTGACTTCTCCTGCAGTCCTAAAGAGCCCCGTGATGAGACCTATGCCGGTCAGTCCGAGG
GTGGTACCGGCCATGAGCCCACTGGCTAGGAGGGTAGTGGTAATAGTGGCGGGTACGAGA
ATTGGACTAAATATGATGAAAACTGGTGCGGATACGATTAATGCCACGGCTGAACCACCG
AGTGTTACACAAGAAAGGGCTAAGAAGACTAAGGAGGTCACGGAAGCTATAATAATCTTT
ATAACGTTCAGCAATGGGAAGATAAAAGAGAACATTTTGAAGAAACGGCTAAATATCGAT
TGCTGAGAATGAGATTCGTGTTGAACGAGTTCTTCGCTCATATTCT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2A819JQ 790 0 0
CTAGTCAACTATGTATCCGTCTTTTATAATTATAAGCAAATTAAACATTGTTACATAGAA
AAATATAATGTATAAAGCTTAGTAAAAAGGCTATTTTATTTTTAGTTTCCGTATCATAAA
TTCTTAAGTTAATTATTACATGATTTATATATGCTACATATTGAAACAGTATAAACCAAC
GTTTTTTATCAGGTGGGTGCAGGTGCAGCCGCTGGTGCCGCTGCTGGATCTGCTGCTGGT
GCTGCTTCAGCTGCAGGTGCAGCTGCTGGTGCTGCTGCAGCTCCACCTGAAGCCATGCTA
CGATATTTATTAACGAGTCCTAGAATTTTTTTGAGAATTGCCAAACGTGAACCGCCGCCA
CCGCCACCCCCAAGTCTTGCTTTAATTCTATTTATTATAATTCTTCGTAACGGGTTTGAG
GCCAATGTGACTTCTCCTGCAGTCCTAAAGAGCCCCGTGATGAGACCTATGCCGGTCAGT
CCGAGGGTGGTACCGGCCATGAGCCCACTGGCTAGGAGGGTAGTGGTAATAGTGGCGGGT
ACGAGAATTGGACTAAGTATGATGAAAACTGGTGCGGATACGATTAATGCCACGGCTGAA
CCACCGAGTGTTACACAAGAAAGGGCTAAGAAGACTAAGGAGGTCACGGAAGCTATAATA
ATCTTTATAACGTTCAGCAATGGGAAGATAAAAGAGAACATTTTGAAGAAACGGCTAAAT
ATCGATTGCTGAGAATGAGATTCGTGTTGAACGAGTTCTTCGCTCATATTCTCAGATCGG
ATGGTTGT
CC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2A819TF 768 0 0
TTTATAATTATAAGCAAATTAAACATTGTTACATAGAAAAATATAATGTATAAAGCTTAG
TAAAAAGGCTATTTTATTTTTAGTTTCCGTATCATAAATTCTTAAGTTAATTATTACATG
ATTTATATATGCTACATATTGAAACAGTATAAACCAACGTTTTTTATCAGGTGGGTGCAG
GTGCAGCCGCTGGTGCCGCTGCTGGATCTGCTGCTGGTGCTGCTTCAGCTGCAGGTGCAG
CTGCTGGTGCTGCTGCAGCTCCACCTGAAGCCATGCTACGATATTTATTAACGAGTCCTA
GAATTTTTTTGAGAATTGCCAAACGTGAACCGCCGCCACCGCCACCCCCAAGTCTTGCTT
TAATTCTATTTATTATAATTCTTCGTAACGGGTTTGAGGCCAATGTGACTTCTCCTGCAG
TCCTAAAGAGCCCCGTGATGAGACCTATGCCGGTCAGTCCGAGGGTGGTACCGGCCATGA
GCCCACTGGCTAGGAGGGTAGTGGTAATAGTGGCGGGTACGAGAATTGGACTAAGTATGA
TGAAAACTGGTGCGGATACGATTAATGCCACGGCTGAACCACCGAGTGTTACACAAGAAA
GGGCTAAGAAGACTAAGGAGGTCACGGAAGCTATAATAATCTTTATAACGTTCAGCAATG
GGAAGATAAAAGAGAACATTTTGAAGAAACGGCTAAATATCGATTGCTGAGAATGAGATT
CGTGTTGAACGAGTTCTTCGCTCATATTCTCAGATCGGATGGTTGT
CC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2CF83TF 687 0 0
G
TTCCGTATCATAAATTCTTAAGTTAATTATTACATGATTTATATATGCTACATATTGAAA
CAGTATAAACCAACGTTTTTTATCAGGTGGGTGCAGGTGCAGCCGCTGGTGCCGCTGCTG
GATCTGCTGCTGGTGCTGCTTCAGCTGCAGGTGTAGCTGCTGGTGCTGCTGCAGCTCCAC
CTGAAGCCATGCTACGATATTTATTAACGAGTCCTAGAATTTTTTTGAGAATTGCCAAAC
GTGAACCGCCGCCACCGCCACCCCCAAGTCTTGCTTTAATTCTATTTATTATAATTCTTC
GTAACGGGTTTGAGGCCAATGTGACTTCTCCTGCAGTCCTAAAGAGCCCCGTGATGAGAC
CTATGCCGGTCAGTCCGAGGGTGGTACCGGCCATGAGCCCACTGGCTAGGAGGGTAGTGG
TAATAGTGGCGGGTACGAGAATTGGACTAAATATGATGAAAACTGGTGCGGATACGATTA
ATGCCACGGCTGAACCACCGAGTGTTACACAAGAAAGGGCTAAGAAGACTAAGGAGGTCA
CGGAAGCTATAATAATCTTTATAACGTTCAGCAATGGGAAGATAAAAGAGAACATTTTGA
AGAAACGGCTAAATATCGATTGCTGAGAATGAGATTCGTGTTGAACGAGTTCTTCGCTCA
TATTCTCAGATCGGATGGTTGTTCCC

QA 2 687 2 687
DS 



AS 1 9

CO CL659Contig1 963 9 15 U
GACTACTAGGAAGAAATAGTAATTGTATTAGAAAAAGATTTTGAAGATGAGTGAACATCA
TTTTGTGTTTGTGCACGGTGCAGGGCATGGAGGATGGTGTTGGTACAAGCTCGCTAATTC
ACTGAGGAAGAATGGTCATAAGGCCACTTGCATCGACCTCAAGGGTGCTGGGATCAACAT
AACTGATCCAAACACTGTGTCCTCTCTTGATGACTACAACCAGCCTCTCAATGACTTCCT
ATCCCAACTTCCCCTCGACCAAAAGGTCATTCTAGTGAGCCACAGCGTTGGAGGAGGGAG
CATGACGGCTGCCATGTGCCAGTATCCTTCCAAAGTCTCCATGGCTGTTTACGTCGCAGC
AGCCATGGTCAAACCTGGTACTGTAATTCCCCCAGTTCTCAAGGAAGTATTGAAGATCTG
TTCAGGGCTGATTGAGTCGGAAGCTGAGAAGATATGGGACTTCACTTTTGGAAACGGACC
CGAGAACCTCCCAACAAGCATGATGATGAAACCTGAGTATGTCCAGGACAAGTATTACAA
CGAGAGCCCTATGGAGGATTACACACTGGCCACCACACTTCTGCGCCCAGCTCCTGTCAT
GGCATTTGCAGGCATAGTGGATATCCCAGCAGCACCAGAGGCTGACAAAATCCCAAGGGT
CTACGTTAAGACAGGCAAGGACCATATGTTCCAATCAAGTCGTCAGGACTTAATGGTTAC
CCTATGGCCTCCTGCTCAGTACTTCCTTCTTGAAGAGAGTGATCACTCTGCATTTTTCTC
ACAACCTGAAGCTCTCTACAAAATCCTCCTTGAAGCAGCCTCATCTATCTCTCCCTGATT
TCTCTTTACACATCTAGCTGGAACTCCTCCAAATCTATGTTTTTAATAGCTAATTGAATA
AAACTGGATCATATTCATATATATCATGAGACACAAGACAAGATCCAACAATGATTGCTA
TGT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2DZ42TF U 1
AF RR2FF22TF U 6
AF RR2DR18TF U 25
AF RR2FV07TF U 25
AF RR2DR18JQ C 580
AF RR2C235TF U 23
AF RR2C235JQ C 153
AF RR2FV07JQ C 277
AF RR2DZ42JQ C 331
BS 1 18 RR2DZ42TF
BS 19 19 RR2FF22TF
BS 20 266 RR2DZ42TF
BS 267 267 RR2FF22TF
BS 268 321 RR2DZ42TF
BS 322 322 RR2FF22TF
BS 323 333 RR2DZ42TF
BS 334 335 RR2FF22TF
BS 336 349 RR2DZ42TF
BS 350 611 RR2FF22TF
BS 612 706 RR2C235TF
BS 707 707 RR2C235JQ
BS 708 788 RR2C235TF
BS 789 920 RR2C235JQ
BS 921 963 RR2DZ42JQ

RD RR2DZ42TF 349 0 0
GACTACTAGGAAGAAATA*TAATTGTATTAGAAAAAGATTTTGAAGATGAGTGAACATCA
TTTTGTGTTTGTGCACGGTGCAGGGCATGGAGGATGGTGTTGGTACAAGCTCGCTAATTC
ACTGAGGAAGAATGGTCATAAGGCCACTTGCATCGACCTCAAGGGTGCTGGGATCAACAT
AACTGATCCAAACACTGTGTCCTCTCTTGATGACTACAACCAGCCTCTCAATGACTTCCT
ATCCCAACTTCCCCTCGACCAAAAGG*CATTCTAGTGAGCCACAGCGTTGGAGGAGGGAG
CATGACGGCTGCCATGTGCCA*TATCCTTCCAA**TCTCCATGGCTGTT

QA 1 349 1 349
DS 

RD RR2FF22TF 610 0 0
G
TAGGAAGAAATAGTAATTGTATTAGAAAAAGATTTTGAAGATGAGTGAACATCATTTTGT
GTTTGTGCACGGTGCAGGGCATGGAGGATGGTGTTGGTACAAGCTCGCTAATTCACTGAG
GAAGAATGGTCATAAGGCCACTTGCATCGACCTCAAGGGTGCTGGGATCAACATAACTGA
TCCAAACACTGTGTCCTCTCTTGATGACTACAACCAGCCTCTCAATGACTTCCTATCCCA
ACTTCCCCTCGACCAAAAGGTCATTCTAGTGAGCCACAGCGTTGGAGGAGGGAGCATGAC
GGCTGCCATGTGCCAGTATCCTTCCAAAGTCTCCATGGCTGTTTACGTCGCAGCAGCCAT
GGTCAAACCTGGTACTGTAATTCCCCCAGTTCTCAAGGAAGTATTGAAGATCTGTTCAGG
GCTGATTGAGTCGGAAGCTGAGAAGATATGGGACTTCACTTTTGGAAACGGACCCGAGAA
CCTCCCAACAAGCATGATGATGAAACCTGAGTATGTCCAGGACAAGTATTACAACGAGAG
CCCTATGGAGGATTACACACTGGCCACCACACTTCTGCGCCCAGCTCCTGTCATGGCATT
TGCAG
CATA

QA 2 606 2 606
DS 

RD RR2DR18TF 583 0 0
GG
ATTAGAAAAAGATTTTGAAGATGAGTGAACATCATTTTGTGTTTGTGCACGGTGCAGGGC
ATGGAGGATGGTGTTGGTACAAGCTCGCTAATTCACTGAGGAAGAATGGTCATAAGGCCA
CTTGCATCGACCTCAAGGGTGCTGGGATCAACATAACTGATCCAAACACTGTGTCCTCTC
TTGATGACTACAACCAGCCTCTCAATGACTTCCTATCCCAACTTCCCCTCGACCAAAAGG
TCATTCTAGTGAGCCACAGCGTTGGAGGAGGGAGCATGACGGCTGCCATGTGCCAGTATC
CTTCCAAAGTCTCCATGGCTGTTTACGTCGCAGCAGCCATGGTCAAACCTGGTACTGTAA
TTCCCCCAGTTCTCAAGGAAGTATTGAAGATCTGTTCAGGGCTGATTGAGTCGGAAGCTG
AGAAGATATGGGACTTCACTTTTGGAAACGGACCCGAGAACCTCCCAACAAGCATGATGA
TGAAACCTGAGTATGTCCAGGACAAGTATTACAACGAGAGCCCTATGGAGGATTACACAC
TGGCCACCACACTTCTGCGCCCAGCTCCTGTCATGGCATTT

QA 3 583 3 583
DS 

RD RR2FV07TF 650 0 0
GG
ATTAGAAAAAGATTTTGAAGATGAGTGAACATCATTTTGTGTTTGTGCACGGTGCAGGGC
ATGGAGGATGGTGTTGGTACAAGCTCGCTAATTCACTGAGGAAGAATGGTCATAAGGCCA
CTTGCATCGACCTCAAGGGTGCTGGGATCAACATAACTGATCCAAACACTGTGTCCTCTC
TTGATGACTACAACCAGCCTCTCAATGACTTCCTATCCCAACTTCCCCTCGACCAAAAGG
TCATTCTAGTGAGCCACAGCGTTGGAGGAGGGAGCATGACGGCTGCCATGTGCCAGTATC
CTTCCAAAGTCTCCATGGCTGTTTACGTCGCAGCAGCCATGGTCAAACCTGGTACTGTAA
TTCCCCCAGTTCTCAAGGAAGTATTGAAGATCTGTTCAGGGCTGATTGAGTCGGAAGCTG
AGAAGATATGGGACTTCACTTTTGGAAACGGACCCGAGAACCTCCCAACAAGCATGATGA
TGAAACATGAGTATGTCCAGGACAAGTATTACAACGAGAGCCCTATGGAGGATTACACAC
TGGCCACCACACTTCTGCGCCCAGCTCCTGTCATGGCATTTGCAGGCATAGTGGATATCC
CAGCAGCACCAGAGGCTGACAAAATCCCAAGGGTCTACGTTAAGACAG

QA 3 650 3 650
DS 

RD RR2DR18JQ 171 0 0
TT
TGCGCCCAGCTCCTGTCATGGCATTTGCAGGCATAGTGGATATCCCAGCAGCACCAGAGG
GTGACAAAATCCCAAGGGTTTACGTTAAGACAGGCAAGGACCATATGTTCCAATCAAGTT
GTCAGGACTTAATGGTTACCCTATGGCCTCCTGCTCAGTACTTCCTT
TT

QA 3 169 3 169
DS 

RD RR2C235TF 766 0 0
GGGT
ATTAGAAAAAGATTTTGAAGATGAGTGAACATCATTTTGTGTTTGTGCACGGTGCAGGGC
ATGGAGGATGGTGTTGGTACAAGCTCGCTAATTCACTGAGGAAGAATGGTCATAAGGCCA
CTTGCATCGACCTCAAGGGTGCTGGGATCAACATAACTGATCCAAACACTGTGTCCCCTC
TTGATGACTACAACCAGCCTCTCAATGACTTCCTATCCCAACTTCCCCTCGACCAAAAGG
TCATTCTAGTGAGCCACAGCGTTGGAGGAGGGAGCATGACGGCTGCCATGTGCCAGTATC
CTTCCAAAGTCTCCATGGCTGTTTACGTCGCAGCAGCCATGGTCAAACCTGGTACTGTAA
TTCCCCCAGTTCTCAAGGAAGTATTGAAGATCTGTTCAGGGCTGATTGAGTCGGAAGCTG
AGAAGATATGGGACTTCACTTTTGGAAACGGACCCGAGAACCTCCCAACAAGCATGATGA
TGAAACCTGAGTATGTCCAGGACAAGTATTACAACGATAGCCCTATGGAGGATTACACAC
TGGCCACCACGCTTCTGCGCCCAGCTCCTGTCATGGCATTTGCAGGCATAGTGGATATCC
CAGCAGCACCAGAGGCTGACAAAATCCCAAGGGTCTACGTTAAGACAGGCAAGGACCATA
TGTTCCAATCAAGTCGTCAG*ACTTAATGGTTACCCTATGGCCTCCTGCTCAGTACTTCC
TTCTTGAAGAGAGTGATCACTCTGCATTTTTCTCACAACCTG

QA 5 766 5 766
DS 

RD RR2C235JQ 768 0 0
ATCGA
CTCAAGGGTGCTGGGATCAACATAACTGATCCAAACACTGTGTCCCCTCTTGATGACTAC
AACCAGCCTCTCAATGACTTCCTATCCCAACTTCCCCTCGACCAAAAGGTCATTCTAGTG
AGCCACAGCGTTGGAGGAGGGAGCATGACGGCTGCCATGTGCCAGTATCCTTCCAAAGTC
TCCATGGCTGTTTACGTCGCAGCAGCCATGGTCAAACCTGGTACTGTAATTCCCCCAGTT
CTCAAGGAAGTATTGAAGATCTGTTCAGGGCTGATTGAGTCGGAAGCTGAGAAGATATGG
GACTTCACTTTTGGAAACGGACCCGAGAACCTCCCAACAAGCATGATGATGAAACCTGAG
TATGTCCAGGACAAGTATTACAACGATAGCCCTATGGAGGATTACACACTGGCCACCACG
CTTTTGCGCCCAGCTCCTGTCATGGCATTTGCAGGCATAGTGGATATCCCAGCAGCACCA
GAGGCTGACAAAATCCCAAGGGTCTACGTTAAGACAGGCAAGGACCATATGTTCCAATCA
AGTCGTCAGGACTTAATGGTTACCCTATGGCCTCCTGCTCAGTACTTCCTTCTTGAAGAG
AGTGATCACTCTGCATTTTTCTCACAACCTGAAGCTCTCTACAAAATCCTCCTTGAAGCA
GCCTCATCTATCTCTCCCTGATTTCTCTTTACACATCTAGCTGGAACTCCTCCAAATCTA
TGTTTTTAATAGCTAATTGAATAAAACTGGATCATATTCATAT

QA 6 768 6 768
DS 

RD RR2FV07JQ 636 0 0
GAGCCACAGCGTTGGAGGAGGGAGCATGACGGCTGCCATGTGCCAGTATCCTTCCAAAGT
CTCCATGGCTGTTTACGTCGCAGCAGCCATGGTCAAACCTGGTACTGTAATTCCCCCAGT
TCTCAAGGAAGTATTGAAGATCTGTTCAGGGCTGATTGAGTCGGAAGCTGAGAAGATATG
GGACTTCACTTTTGGAAACGGACCCGAGAACCTCCCAACAAGCATGATGATGAAACATGA
GTATGTCCAGGACAAGTATTACAACGAGAGCCCTATGGAGGATTACACACTGGCCACCAC
ACTTTTGCGCCCAGCTCCTGTCATGGCATTTGCAGGCATAGTGGATATCCCAGCAGCACC
AGAGGCTGACAAAATCCCAAGGGTTTACGTTAAGACAGGCAAGGACCATATGCTCCAATC
AAGTCGTCAGGACTTAATGGTTACCCTATGGCCTCCTGCTCAGTACTTCCTTCTTGAAGA
GAGTGATCACTTTGCATTTTTCTCACAACCTGAAGCTCTTTACAAAATCCTCCTTGAAGC
AGCCTCATCTATCTCTCCCTGATTTCTCTTTACACATCTAGCTGGAACTCCTCCAAATCT
ATGTTTTTAATAGCTAATTGAATAAAACTGGATCAT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2DZ42JQ 633 0 0
CAAAGTCTCCATGGCTGTTTACGTCGCAGCAGCCATGGTCAAACCTGGTACTGTAATTCC
CCCAGTTCTCAAGGAAGTATTGAAGATCTGTTCAGGGCTGATTGAGTCGGAAGCTGAGAA
GATATGGGACTTCACTTTTGGAAACGGACCCGAGAACCTCCCAACAAGCATGATGATGAA
ACCTGAGTATGTCCAGGACAAGTATTACAACGAGAGCCCTATGGAGGATTACACACTGGC
CACCACACTTCTGCGCCCAGCTCCTGTCATGGCATTTGCAGGCATAGTGGATATCCCAGC
AGCACCAGAGGCTGACAAAATCCCAAGGGTCTACGTTAAGACAGGCAAGGACCATATGTT
CCAATCAAGTCGTCAGGACTTAATGGTTACCCTATGGCCTCCTGCTCAGTACTTCCTTCT
TGAAGAGAGTGATCACTCTGCATTTTTCTCACAACCTGAAGCTCTCTACAAAATCCTCCT
TGAAGCAGCCTCATCTATCTCTCCCTGATTTCTCTTTACACATCTAGCTGGAACTCCTCC
AAATCTATGTTTTTAATAGCTAATTGAATAAAACTGGATCATATTCATATATATCATGAG
ACACAAGACAAGATCCAACAATGATTGCTATGT

QA 1 633 1 633
DS 



AS 2 6

CO CL660Contig1 804 3 37 U
GGGACACACTCGTCGCCCTAAAAGCTTTAATCGCTCTCTCGTCTTCTTCGCTTCTCCGTC
GCAACCGTTACCGTCAACTCGTTACCGATTGTATCAATGGAGTTCTGGGGTGTTGAAGTT
AAGGGTGGTGAGCCACTTAGGGTGGATCCTGGGAAGGATATGATTGTGCACATCTCACTG
GCTGCTCTAGGCGAGAAGAAAAACGGTGGAAACGAGCCTGTCCAGCTCTACACGAAAGTT
GAAGATCAAAAGCTTCTGATTGGGACGCTCTCGCATGATAAGTTTCCTCAGCTGTGCACG
GAGATTGTGTTGCCAAGGTCTTTTGAGCTGTCTCATAGCTGGAAGGATGGGAGTGTTTTC
TTCACCGGCTACATAGTTGATGCTCATGAATCTGATTCCGAGTCTGATGACGAGGAGCTT
GCTGAGCCAGCTGTTGCGAAATCAGGTGTGAAGCAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAATGAT
GATGCCAAGGCCGAGCAAGATGATGATGAGGATGAAGATAATAGTGATGATGAGGATGCT
GAATCTGAAGATGAGGAGGAAGAAAAGAAGGTTACAGTTGAAGCTGACGAGGATGATGAT
GATGAAGACTCATCTGACGATGAGGAAGATGAGGAAGATGACTCATCAGACGAGGAGACC
CCAGAGAAGAAGGTTGAAGAAGCCAAGAAGAGGCCTGCGGAAGCCAACACCTCGAAGACT
GCTTCAAACAAGAAGGCTAAATTCGTAACTCCTCAGAAATCAGAATCGAAGAAGCCACAC
GTCCACGTTGCGACTCGCATCATC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G469TF U 1
AF RR2DS62TF U 1
AF RR2AM18TF U 1
BS 1 12 RR2AM18TF
BS 13 13 RR2DS62TF
BS 14 16 RR2AM18TF
BS 17 17 RR2DS62TF
BS 18 76 RR2AM18TF
BS 77 77 RR2DS62TF
BS 78 191 RR2AM18TF
BS 192 192 RR2DS62TF
BS 193 272 RR2AM18TF
BS 273 273 RR2DS62TF
BS 274 295 RR2AM18TF
BS 296 296 RR2DS62TF
BS 297 309 RR2AM18TF
BS 310 310 RR2DS62TF
BS 311 347 RR2AM18TF
BS 348 348 RR2DS62TF
BS 349 398 RR2AM18TF
BS 399 399 RR2DS62TF
BS 400 502 RR2AM18TF
BS 503 503 RR2DS62TF
BS 504 509 RR2AM18TF
BS 510 510 RR2DS62TF
BS 511 519 RR2AM18TF
BS 520 520 RR2DS62TF
BS 521 542 RR2AM18TF
BS 543 543 RR2DS62TF
BS 544 575 RR2AM18TF
BS 576 576 RR2DS62TF
BS 577 605 RR2AM18TF
BS 606 608 RR2DS62TF
BS 609 620 RR2AM18TF
BS 621 621 RR2DS62TF
BS 622 626 RR2AM18TF
BS 627 627 RR2DS62TF
BS 628 638 RR2AM18TF
BS 639 639 RR2DS62TF
BS 640 804 RR2AM18TF

RD RR2G469TF 657 0 0
GGAC
CACACTCGTCGCCCTAAAAGCTTTAATCGCTCTCTCGTCTTCTTCGCTTCTCCGTCGCAA
CCGTTACCGTCAACTCGTTACCGATTGTATCAATGGAGTTCTGGGGTGTTGAAGTTAAGG
GTGGTGAGCCACTTAGGGTGGATCCTGGGAAGGATATGATTGTGCACATCTCACTGGCTG
CTCTAGGCGAGAAGAAAAACGGTGGAAACGAGCCTGTCCAGCTCCACACGAAAGTT*AAG
ATCAAAAGCTTCTGATTGGGACGCTCTCGCATGATAAGTTTCCTCAGCTGTGCACGGAGA
TTGTGTTGCCAAGGTCTTTTGAGCTGTCTCATAGCTGGAAGGATGGGAGTGTTTTCTTCA
CCGGCTACATAGTTGATGCTCATGAATCTGATTCCGAGTCTGATGACGAGGAGCTTGCTG
AGCCAGCTGTTGCGAAATCAGGTGTGAAGCAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAATGATGATG
CCAAGGCCGAGCAAGATGATGATGAGGATGAAGATAATAGTGATGATGAGGATGCTGAAT
CTGAAGATGAGGAGGAAGAAAAGAAGGTTACAGTTGAAGCTGACGAGGATGATGATGATG
AAGACTCATCTGACGATGAGGAAGATGAGGAAGATGACTCATCAGACGAG
AGA

QA 5 654 5 654
DS 

RD RR2DS62TF 667 0 0
GGAC
CACACTCGTCGCCCTAAAAGCTTTAATCGCTCTCTCGTCTTCTTCGCTTCTCCGTCGCAA
CCGTTACCGTCAACTCGTTACCGATTGTATCAATGGAGTTCTGGGGTGTTGAAGTTAAGG
GTGGTGAGCCACTTAGGGTGGATCCTGGGAAGGATATGATTGTGCACATCTCACTGGCTG
CTCTAGGCGAGAAGAAAAACGGTGGAAACGAGCCTGTCCAGCTCTACACGAAAGTTGAAG
ATCAAAAGCTTCTGATTGGGACGCTCTCGCATGATAAGTTTCCTCAGCTGTGCACGGAGA
TTGTGTTGCCAAGGTCTTTTGAGCTGTCTCATAGCTGGAAGGATGGGAGTGTTTTCTTCA
CCGGCTACATATTTGATGCTCATGAATCTGATTCCGAGTCTGATGACGAGGAGCTTGCTG
AGCCAGCTGTTGCGAAATCAGGTGTGAAGCAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAATGATGATG
CCAAGGCCGAGCAAGATGATGATGAGGATGAAGATAATAGTGATGATGAGGATGCTGAAT
CTGAAGATGAGGAGGAAGAAAAGAAGGTTACAGTTGAAGCTGACGAGGATGATGATGATG
AAGACTCATCTGACGATGAGGAAGATGAGGAAGATGACTCATCAGACGAGGAGACCC
AGAGAA

QA 5 661 5 661
DS 

RD RR2AM18TF 804 0 0
GGGACACACTCGGCGCTCTAAAAGCTTTAATCGCTCTCTCGTCTTCTTCGCTTCTCCGTC
GCAACCGTTACCGTCAGCTCGTTACCGATTGTATCAATGGAGTTCTGGGGTGTTGAAGTT
AAGGGTGGTGAGCCACTTAGGGTGGATCCTGGGAAGGATATGATTGTGCACATCTCACTG
GCTGCTCTAGGTGAGAAGAAAAACGGTGGAAACGAGCCTGTCCAGCTCTACACGAAAGTT
GAAGATCAAAAGCTTCTGATTGGGACGCTCTCACATGATAAGTTTCCTCAGCTGTACACG
GAGATTGTGCTGCCAAGGTCTTTTGAGCTGTCTCATAGCTGGAAGGACGGGAGTGTTTTC
TTCACCGGCTACATAGTTGATGCTCATGAATCTGATTCTGAGTCTGATGACGAGGAGCTT
GCTGAGCCAGCTGTTGCGAAATCAGGTGTGAAGCAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAATGAT
GATGCCAAGGCCGAGCAAGATGGTGATGATGATGAAGATGATAGTGATGATGAGGATGCT
GACTCTGAAGATGAGGAGGAAGAAAAGAAGGTTACGGTTGAAGCTGACGAGGATGATGAT
GATGA***CTCATCTGACGACGAGGATGATGAGGAAGACGACTCATCAGACGAGGAGACC
CCAGAGAAGAAGGTTGAAGAAGCCAAGAAGAGGCCTGCGGAAGCCAACACCTCGAAGACT
GCTTCAAACAAGAAGGCTAAATTCGTAACTCCTCAGAAATCAGAATCGAAGAAGCCACAC
GTCCACGTTGCGACTCGCATCATC

QA 1 804 1 804
DS 



CO CL660Contig2 668 3 1 U
AAAGGGTTCAGGATAGTTTCGTCTACCCTGACGATTAGGATAAAGATAACCAAAACTGGT
TCACTCGCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAAAACATCAAAAGTCTAAAGAGGATTATGGA
TAGTCTCTTTCTTCTTCATCAAATTTCAAGTAGCTGCACTGTGTTTGGCCTTCGTGTGAG
ACTGCAAGCCCATCTCCGAGTTAAACGTTCTGTTGCAGGAGCTGCATCCAAATGCACCTG
CAGACTTGGGTGTCTGCTGCTGCTGCTTCGAGGTCTCTCCATTACTTCCCGAGCTCTTTA
CTCCCTTTGATGGATGCGGAGTCGCAACGTGGACGTGTGGCTTCTTCGATTCTGATTTCT
GAGGAGTTACGAATTTAGCCTTCTTGTTTGAAGCAGTCTTCGAGGTGTTGGCTTCCGCAG
GCCTCTTCTTGGCTTCTTCAACCTTCTTCTCTGGGGTCTCCTCGTCTGATGACTCATCTT
CCTCATCTTCCTCATCGTCAGATGAGTCTTCATCATCATCCTCGTCAGCTTCAACCGTAA
CCTTCTTTTCTTCCTCCTCATCTTCAGAGTCAGCATCCTCATCATCAGTATCATCTTCGT
CCTCATCATCATCTTCCTCGGCCTTGGCATCATCATTAGGCAACTGAAAGTTCACCTGCT
TCACACCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2DS62JQ U 40
AF RR2AS77JQ U 1
AF RR2AS77TF C 1
BS 1 668 RR2AS77JQ

RD RR2DS62JQ 312 0 0
AAAAAA
ATAACTAAAACTGGTTCACTCCCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAAAACATCAAAAGTCT
AAAAAGGATTATGGATAGTCTCTTTCTTCTTCATCAAATTTCAAGTAGCTGCCCTGTGTT
TGGCCTTCGTGTGAAACTGCAAGCCCATCTCCAAATTAAACGTTCTGTTGCAGGAGCTGC
ATCCAAATGCACCTACAAACTTGGGTGTCTGCTGCTGCTGCTTCGAGGTCTCTCCATTAC
TTCCCGAGCTCTTTACTCCCTTTGATGGATGCGGAGTCCCAACGTGGACGTGTGGCTTCT
TCGATT

QA 7 312 7 312
DS 

RD RR2AS77JQ 668 0 0
AAAGGGTTCAGGATAGTTTCGTCTACCCTGACGATTAGGATAAAGATAACCAAAACTGGT
TCACTCGCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAAAACATCAAAAGTCTAAAGAGGATTATGGA
TAGTCTCTTTCTTCTTCATCAAATTTCAAGTAGCTGCACTGTGTTTGGCCTTCGTGTGAG
ACTGCAAGCCCATCTCCGAGTTAAACGTTCTGTTGCAGGAGCTGCATCCAAATGCACCTG
CAGACTTGGGTGTCTGCTGCTGCTGCTTCGAGGTCTCTCCATTACTTCCCGAGCTCTTTA
CTCCCTTTGATGGATGCGGAGTCGCAACGTGGACGTGTGGCTTCTTCGATTCTGATTTCT
GAGGAGTTACGAATTTAGCCTTCTTGTTTGAAGCAGTCTTCGAGGTGTTGGCTTCCGCAG
GCCTCTTCTTGGCTTCTTCAACCTTCTTCTCTGGGGTCTCCTCGTCTGATGACTCATCTT
CCTCATCTTCCTCATCGTCAGATGAGTCTTCATCATCATCCTCGTCAGCTTCAACCGTAA
CCTTCTTTTCTTCCTCCTCATCTTCAGAGTCAGCATCCTCATCATCAGTATCATCTTCGT
CCTCATCATCATCTTCCTCGGCCTTGGCATCATCATTAGGCAACTGAAAGTTCACCTGCT
TCACACCC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2AS77TF 668 0 0
AAAG
GGTTCAGGATAGTTTCGTCTACCCTGACGATTAGGATAAAGATAACCAAAACTGGTTCAC
TCGCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAAAACATCAAAAGTCTAAAGAGGATTATGGATAGT
CTCTTTCTTCTTCATCAGATTTCAAGTAGCTGCACTGTGTTTGGCCTTCGTGTGAGACTG
CAAGCCCATCTCCGAGTTAAACGTTCTGTTGCAGGAGCTGCATCCAAATGCACCTGCAGA
CTTGGGTGTCTGCTGCTGCTGCTTCGAGGTCTCTCCATTACTTCCCGAGCTCTTTACTCC
CTTTGATGGATGCGGAGTCGCAACGTGGACGTGTGGCTTCTTCGATTCTGATTTCTGAGG
AGTTACGAATTTAGCCTTCTTGTTTGAAGCAGTCTTCGAGGTGTTGGCTTCCGCAGGCCT
CTTCTTGGCTTCTTCAACCTTCTTCTCTGGGGTCTCCTCGTCTGATGACTCATCTTCCTC
ATCTTCCTCATCGTCAGATGAGTCTTCATCATCATCCTCGTCAGCTTCAACCGTAACCTT
CTTTTCTTCCTCCTCATCTTCAGAGTCAGCATCCTCATCATCAGTATCATCTTCGTCCTC
ATCATCATCTTCCTCGGCCTTGGCATCATCATTAGGCAACTGAAAGTTCACCTGCTTCAC
ACC
C

QA 5 667 5 667
DS 



AS 2 9

CO CL661Contig1 910 3 3 U
GGACATTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCACAACTCTCTCTCTCGAAAAAAAAAAGTCCCTC
TTCCTAGCTCGATTTCGATCTCAACTTTTCGTGTGGAATCGTTTGTGAATGGTGGAAACG
AATCCGATCAGTGGTGAGTTTACGCTTTCCCTTCAAATTCAAAGGGCGAGCCTCCTCCTT
CTCTCTGCATCCTCTGCTTTCTCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGCTGC
ATCGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGTTTTCTTAGGGTTTCTCTTTTATTTGGGA
TCCATCTACAGTTTCTTTTTTTTAAATCTCTCTTTAATCTCTACCAAAGATGTTGCTCTA
CAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTAATCAGCGTAACCGTTCTCGG
CAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGA
CACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTTCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAA
TGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGAT
TGGGTCGCTTGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAAGGTTGT
GGCCAAGGAAGGAGCAAGGAAAGGAGGGAGCTTTAAAGCTTGGATCAACAAGTCCTTCAG
CCTCAAAGTCTCCCCCCATTAAAAAAAGCTTTTTGTTTATTTTGTTTTTCAGACAAGACA
AGATCAATTTTTTATGTTTTGCATTTATGATTTGATTCCAATTGTCAAAAAAGCTTCCAT
TGGCATTGATGAAGCCTTGTTTCTTTTGTATCTATCATTCAACGGAAATAAAAGTTTCGA
ATTTCTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C987TF U 1
AF RR2GF28TF U -3
AF RR2C987JQ C 108
BS 1 641 RR2C987TF
BS 642 667 RR2GF28TF
BS 668 910 RR2C987JQ

RD RR2C987TF 641 0 0
GGACATTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCACAACTCTCTCTCTCGAAAAAAAAAAGTCCCTC
TTCCTAGCTCGATTTCGATCTCAACTTTTCGTGTGGAATCGTTTGTGAATGGTGGAAACG
AATCCGATCAGTGGTGAGTTTACGCTTTCCCTTCAAATTCAAAGGGCGAGCCTCCTCCTT
CTCTCTGCATCCTCTGCTTTCTCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGCTGC
ATCGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGTTTTCTTAGGGTTTCTCTTTTATTTGGGA
TCCATCTACAGTTTCTTTTTTTTAAATCTCTCTTTAATCTCTACCAAAGATGTTGCTCTA
CAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTAATCAGCGTAACCGTTCTCGG
CAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGA
CACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTTCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAA
TGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGAT
TGGGTCGCTTGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAAC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2GF28TF 681 0 0
GGAATCACATTCCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCACAACTCTCTCTCTCGAAAAAAAAA*GTCCCTCTTCCTAGCTCGATT
TCGATCTCAACTTTTCGTGTGGAATCGTTTGTGAATGGTGGAAACGAATCCGATCAGTGG
TGAGTTTACGCTTTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCCTCCTCCTTCTCTCTGCATCCTC
TGCTTTCTCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGCTGCATCGGCCTCGACCC
GTGAAACCCTAATCTCGTTTTCTTAGGGTTTCTCTTTTATTTGGGATCCATCTACAGTTT
CTTTTTTTTAAATCTCTCTTTAATCTCTACCAAAGATGTTGCTCTACAACAAGCAGAAGA
AGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTAATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGGTCCGA
TCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCAAGT
GCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTTCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTTCTTCTCT
ACTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGGTCGCTTGGTG
CGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAAGGTTGTGGCCAAG
AAGAGCAAGG

QA 19 671 19 671
DS 

RD RR2C987JQ 803 0 0
GAATGG
GGAAACGAATCCGATCAGTGGTGAGTTTACGCTTTCCCTTCAAATTCAAAGGGCGAGCCT
CCTCTTTCTCTCTGCATCCTCTGCTTTCTCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTT
CCGCTGCATCGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGTTTTCTTAGGGTTTCTCTTTTA
TTTGGGATCCATCTACAGTTTCTTTTTTTTAAATCTCTCTTTAATCTCTACCAAAGATGT
TGCTCTACAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTAATCAGCGTAACCG
TTCTCGGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTG
TTATCGACACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTTCCTCTCCTCGGATCCG
ATTTCAATGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGA
ATGCGATTGGGTCGCTTGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGA
AGGTTGTGGCCAAGGAAGGAGCAAGGAAAGGAGGGAGCTTTAAAGCTTGGATCAACAAGT
CCTTCAGCCTCAAAGTCTCCCCCCATTAAAAAAAGCTTTTTGTTTATTTTGTTTTTCAGA
CAAGACAAGATCAATTTTTTATGTTTTGCATTTATGATTTGATTCCAATTGTCAAAAAAG
CTTCCATTGGCATTGATGAAGCCTTGTTTCTTTTGTATCTATCATTCAACGGAAATAAAA
GTTTCGAATTTCTTTTC

QA 7 803 7 803
DS 



CO CL661Contig2 920 6 16 U
GGAACCACATTCCTTCTTCTTCTTAACAAGTCTCTCTCGAAAAAAAAAAGTCCCTCTTCC
TAGCTCGATTTCGATCTCAACTTTTCGTGTGGAATCGTTTGTGAATGGTGGAAACGAATC
CGATCAGTGGTGAGTTTACGCTTTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCTTCCTCCTTCTCC
CTCTCTCTGCATCATCTGCTTTCGCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGCT
GCATCGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGATTTCTAGGGTTTCTCTTTTATTTGGG
ATCCATCTACCGTTTTTTTT*GTTTTTTAAATATCTCTTTAATCTCTACCAAAGATGTTG
CTCTACAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTAATCAGCGTAACCGTT
CTCGGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTT
ATCGACACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGAT
TTCAATGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAAT
GCAATTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAAG
GTTGTGGCCAAGGAAGGAGCAAGGAAAGGAGGGAGCTTTAAAGCTTGGATCAACAAGTCC
TTCAGCCTCAAAGTCTCCACCCATTAAAAATGCTTTTTTGTTTATTTTTTTTTCAGACAA
AGACAAGATCAGTTTTTATGTTTTTT*GCATTTATGATTTGATTCCAATTGTCAAAAAA*
GCTTCCATTGGCATTGATGAAGCCTTGTTTCTTTTGTATCTATCATTCAACGGAAATAAA
AGTTTCAAATTTCTTTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 10 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2DP88TF U 1
AF RR2CN41TF U 24
AF RR2CL65TF U 2
AF RR2CL65JQ C 219
AF RR2CN41JQ C 231
AF RR2DP88JQ C 219
BS 1 461 RR2DP88TF
BS 462 462 RR2CL65TF
BS 463 549 RR2DP88TF
BS 550 550 RR2CL65TF
BS 551 571 RR2DP88TF
BS 572 590 RR2CL65TF
BS 591 591 RR2CN41TF
BS 592 646 RR2CL65TF
BS 647 647 RR2CL65JQ
BS 648 658 RR2CL65TF
BS 659 659 RR2CL65JQ
BS 660 669 RR2CL65TF
BS 670 672 RR2CL65JQ
BS 673 673 RR2CN41JQ
BS 674 917 RR2CL65JQ
BS 918 920 RR2DP88JQ

RD RR2DP88TF 571 0 0
GGAACCACATTCCTTCTTCTTCTTAACAAGTCTCTCTCGAAAAAAAAAAGTCCCTCTTCC
TAGCTCGATTTCGATCTCAACTTTTCGTGTGGAATCGTTTGTGAATGGTGGAAACGAATC
CGATCAGTGGTGAGTTTACGCTTTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCTTCCTCCTTCTCC
CTCTCTCTGCATCATCTGCTTTCGCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGCT
GCATCGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGATTTCTAGGGTTTCTCTTTTATTTGGG
ATCCATCTACCGTTTTTTTT*GTTTTTTAAATATCTCTTTAATCTCTACCAAAGATGTTG
CTCTACAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTAATCAGCGTAACCGTT
CTCGGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAGGATCTCGTCGCTTCTGTT
ATCGACACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGAT
TTCAATGACCTTCTTCTCTACTGTCCCATGG

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2CN41TF 617 0 0
TAACAAG
TCTCTCTCGAAAAAAAAAAGTCCCTCTTCCTAGCTCGATTTCGATCTCAACTTTTCGTGT
GGAATCGTTTGTGAATGGTGGAAACGAATCCGATCAGTGGTGAGTTTACGCTTTCCCTTC
AAATCCAAAGGGCGAGCTTCCTCCTTCTCCCTCTCTCTGCATCATCTGCTTTCGCTTCCG
GCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGCTGCATCGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATC
TCGATTTCTAGGGTTTCTCTTTTATTTGGGATCCATCTACCGTTTTTTTTTGTTTTTTAA
ATATCTCTTTAATCTCTACCAAAGATGTTGCTCTACAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAG
GGAAACCGGATCCTAATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTT
GCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGC
GAAGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATG
GTCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCAATTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTT
ACTCTGTGTA

QA 8 617 8 617
DS 

RD RR2CL65TF 668 0 0
GGACCACATTC
CTTCTTCTTCTTAACAAGTCTCTCTCGAAAAAAAAAAGTCCCTCTTCCTAGCTCGATTTC
GATCTCAACTTTTCGTGTGGAATCGTTTGTGAATGGTGGAAACGAATCCGATCAGTGGTG
AGTTTACGCTTTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCTTCCTCCTTCTCCCTCTCTCTGCAT
CATCTGCTTTCGCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGCTGCATCGGCCTCG
ACCCGTGAAACCCTAGTCTCGATTTCTAGGGTTTCTCTTTTATTTGGGATCCATCTACCG
TTTTTTTT*GTTTTTTAAATATCTCTTTAATCTCTACCAAAGATGTTGCTCTACAACAAG
CAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTAATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCC
GGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCT
CTCAAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTT
CTTCTCTACTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAGAGCGTGGAATGCAATTGGATCG
CTTGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAAC*AGAGGAGAAGA*GGTTGTGGCC

QA 12 668 12 668
DS 

RD RR2CL65JQ 700 0 0
AAAGAAGGCTGGTACTTCCGCTGCATCGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAGTCTCGATTTC
TAGGGTTTCTCTTTTATTTGGGATCCATCTACCGTTTTTTTT*GTTTTTTAAATATCTCT
TTAATCTCTACCAAAGATGTTGCTCTACAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCG
GATCCTAATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGA
GGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCG
CCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGTCGGACC
TGAAGCTTTAAGAGCGTGGAATGCAATTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTG
TAAGAAACCAGAGGAGAAGAAGGTTGTGGCCAAGTAAGGAGCAAGGAAAGGAGGGAGCTT
TAAAGCTTGGATCAACAAGTCCTTCAGCCTCAAAGTCTCCACCCATTAAAAATGCTTTTT
TGTTTATTTTTTTTTCAGACAAAGACAAGATCAGTTTTTATGTTTTTT*GCATTTATGAT
TTGATTCCAATTGTCAAAAAA*GCTTCCATTGGCATTGATGAAGCCTTGTTTCTTTTGTA
TCTATCATTCAACGGAAATAAAAGTTTCAAATTTCTTTT
C

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2CN41JQ 687 0 0
TACTTCCGCTGCATCGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGATTTCTAGGGTTTCTCT
TTTATTTGGGATCCATCTACCGTTTTTTTT*GTTTTTTAAATATCTCTTTAATCTCTACC
AAAGATGTTGCTCTACAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTAATCAG
CGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGT
CGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTCCCTCTCCT
CGGATCCGATTTCAATGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAG
CGCGTGGAATGCAATTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAACCAGA
GGAGAAGAAGGTTGTGGCCAAGGAAGGAGCAAGGAAAGGAGGGAGCTTTAAAGCTTGGAT
CAACAAGTCCTTCAGCCTCAAAGTCTCCACCCATTAAAAATGCTTTTTTGTTTATTTTTT
TTTCAGACAAAGACAAGATCAGTTTTTATGTTTTTT*GCATTTATGATTTGATTCCAATT
GTCAAAAAAAGCTTCCATTGGCATTGATGAAGCCTTGTTTCTTTTGTATCTATCATTCAA
CGGAAATAAAAATTTCAAATTTCTTTT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2DP88JQ 702 0 0
AAAGAAGGCTGGTACTTCCGCTGCATCGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGATTTC
TAGGGTTTCTCTTTTATTTGGGATCCATCTACCGTTTTTTTT*GTTTTTTAAATATCTCT
TTAATCTCTACCAAAGATGTTGCTCTACAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCG
GATCCTAATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGA
GGAGGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCG
CCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACCTTCTTCTCTACTGTCCCATGGTCGGACC
TGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCAATTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTG
TAAGAAACCATAGGAGAAGAAGGTTGTGGCCAAGGAAGGAGCAAGGAAAGGGGGGAGCTT
TAAAGCTTGGATCAACAAGTCCTTCAGCCTCAAAGTCTCCACCCATTAAAAATGCTTTTT
TGTTTATTTTTTTTTCAGACAAAGACAAGATCAGTTTTTATGTTTTTTTGCATTTATGAT
TTGATTCCAATTGTCAAAAA**GCTTCCATTGGCATTGATGAAGCCTTGTTTCTTTTGTA
TCTATCATTCAACGGAAATAAAAGTTTCAAATTTCTTTTCGC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 2 9

CO CL662Contig1 926 6 14 U
AAGAAGAGAACATTGTAGTTCTTTATTACACGATGATTAAAATCTCAGTAAACAAGAAAA
AGATGAAAGACTCGATGAATGAGCCATTACAACAAGAGAGCTGGGTCCTTATAACCAGGA
CCAATATTTTATTGAGAAACTTCAGTAATGCAAAACACACACGCCACTGAAGTCAGAGTT
TTGGTCCGATAATGTCTGATGACTCAGGAAGAAGCAGCCTTGGCAGCCTCAAGTCTGGAA
CTAACAGCCTCCCAAGACACAAGATTGTTCATGAATGTCTTTATGTAATCCGGTCTCCGG
TTCTGGAAGTCGAGATAGTAAGCATGCTCCCAGACATCAATGGTAAGCAGTGGGAAAGAG
CCGAGCACAAGGGGATTCACAGCATTTGGAGTTTTCACCACTTTGAGTTTGTTATCTGCG
TAAGCAAGCCAGGCCCAGCCAGCTCCAAACTGAGTGGCAGCAGCAGCATTGAACTCATCA
TAGAACTTCTCATAAGAAGTGAAATCCCTTTCAAGCAGAGCAAGAAGCTCTCCTGATGGC
TTTCCTCCACCACCCGGTTTCATTGATTCCCAGAAGAACTCGTGGTTCCATGCCTGAGCA
GCGTTGTTGAAAGGAGGGAGGAGGTCGCCATTGTTGTACGTGTTTTGGATGATATGCTCT
AAGGGCTTGCCTTCAAGCTCAGATCCAAGAACCTGTTTCTTGAGGTTGTCCACGTAAGCC
CTGTGGTGTTTTCCCCAGTGAAACTCCAGAGTTTGCTTGCTCATATGCGGCTCCAAAGCA
TCCAGAGGGTATGGAGGTGGCTTGAGGACGTAGTTTGCGGTTACAGCAGCTGAAGCAGCC
ATTTCTTTGTTGGGGATTGAAGAAGAGTAAGAGATCAGCAAAACTTGATCAGGAAGCAAC
TAAGTGGATCAGAGATAGGGAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 25 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW61JQ U 1
AF RR2DH07JQ U 4
AF RR2FE11JQ U 1
AF RR2FK72JQ U 2
AF RR2DH07TF C 156
AF RR2FK72TF C 252
BS 1 357 RR2DW61JQ
BS 358 359 RR2FE11JQ
BS 360 637 RR2DW61JQ
BS 638 638 RR2FE11JQ
BS 639 654 RR2DW61JQ
BS 655 655 RR2FE11JQ
BS 656 659 RR2DW61JQ
BS 660 680 RR2FE11JQ
BS 681 681 RR2FK72JQ
BS 682 761 RR2FE11JQ
BS 762 762 RR2FK72TF
BS 763 848 RR2DH07TF
BS 849 849 RR2FK72TF
BS 850 926 RR2DH07TF

RD RR2DW61JQ 659 0 0
AAGAAGAGAACATTGTAGTTCTTTATTACACGATGATTAAAATCTCAGTAAACAAGAAAA
AGATGAAAGACTCGATGAATGAGCCATTACAACAAGAGAGCTGGGTCCTTATAACCAGGA
CCAATATTTTATTGAGAAACTTCAGTAATGCAAAACACACACGCCACTGAAGTCAGAGTT
TTGGTCCGATAATGTCTGATGACTCAGGAAGAAGCAGCCTTGGCAGCCTCAAGTCTGGAA
CTAACAGCCTCCCAAGACACAAGATTGTTCATGAATGTCTTTATGTAATCCGGTCTCCGG
TTCTGGAAGTCGAGATAGTAAGCATGCTCCCAGACATCAATGGTAAGCAGTGGGAAAAGG
CCGAGCACAAGGGGATTCACAGCATTTGGAGTTTTCACCACTTTGAGTTTGTTATCTGCG
TAAGCAAGCCAGGCCCAGCCAGCTCCAAACTGAGTGGCAGCAGCAGCATTGAACTCATCA
TAGAACTTCTCATAAGAAGTGAAATCCCTTTCAAGCAGAGCAAGAAGCTCTCCTGATGGC
TTTCCTCCACCACCCGGTTTCATTGATTCCCAGAAGAACTCGTGGTTCCATGCCTGAGCA
GCGTTGTTGAAAGGAGGGAGGAGGTCGCCATTGTTGTGCGTGTTTTGGATGATACGCTC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2DH07JQ 669 0 0
GAGAG
AACATTGTAGTTCTTTATTACACGATGATTAAAATCTCAGTAAACAAGAAAAAGATGAAA
GACTCGATGAATGAGCCATTACAACAAGAGAGCTGGGTCCTTATAACCAGGACCAATATT
TTATTGAGAAACTTCAGTAATGCAAAACACACACGCCACTGAAGTCAGAGTTTTGGTCCG
ATAATGTCTGATGACTCAGGAAGAAGCAGCCTTGGCAGCCTCAAGTCTGGAACTAACAGC
CTCCCAAGACACAAGATTGTTCATGAATGTCTTTATGTAATCCGGTCTCCGGTTCTGGAA
GTCGAGATAGTAAGCATGCTCCCAGACATCAATGGTAAGCAGTGGGAAAGAGCCGAGCAC
AAGGGGATTCACAGCATTTGGAGTTTTCACCACTTTGAGTTTGTTATCTGCGTAAGCAAG
CCAGGCCCAGCCAGCTCCAAACTGAGTGGCAGCAGCAGCATTGAACTCATCATAGAACTT
CTCATAAGAAGTGAAATCCCTTTCAAGCAGAGCAAGAAGCTCTCCTGATGGCTTTCCTCC
ACCACCCGGTTTCATTGATTCCCAGAAGAACTCGTGGTTCCATGCCTGAGCAGCGTTGTT
GAAAGGAGGGAGGAGGTCGCCATTGTTGTACGTGTTTTGGATGATATGCTCTAAGGGCTT
GCCT

QA 6 669 6 669
DS 

RD RR2FE11JQ 761 0 0
AAGAAGAG
AACATTGTAGTTCTTTATTACACGATGATTAAAATCTCAGTAAACAAGAAAAAGATGAAA
GACTCGATGAATGAGCCATTACAACAAGAGAGCTGGGTCCTTATAACCAGGACCAATATT
TTATTGAGAAACTTCAGTAATGCAAAACACACACGCCACTGAAGTCAGAGTTTTGGTCCG
ATAATGTCTGATGACTCAGGAAGAAGCAGCCTTGGCAGCCTCAAGTCTGGAACTAACAGC
CTCCCAAGACACAAGATTGTTCATGAATGTCTTTATGTAATCCGGTCTCCGGTTCTGGAA
GTCGAGATAGTAAGCATGCTCCCAGACATCAATGGTAAGCAGTGGGAAAGAGCCGAGCAC
AAGGGGATTCACAGCATTTGGAGTTTTCACCACTTTGAGTTTGTTATCTGCGTAAGCAAG
CCAGGCCCAGCCAGCTCCAAACTGAGTGGCAGCAGCAGCATTGAACTCATCATAGAACTT
CTCATAAGAAGTGAAATCCCTTTCAAGCAGAGCAAGAAGCTCTCCTGATGGCTTTCCTCC
ACCACCCGGTTTCATTGATTCCCAGAAGAACTCGTGGTTCCATGCCTGAGCAGCGTTGTT
GAAAGGAGGGAGGAGGTCGCCATTGTCGTACGTGTTTTGGATGATATGCTCTAAGGGCTT
GCCTTCAAGCTCGGATCCAAGAACCTGTTTCTTGAGGTTGTCCACGTAAGCCCTGTGGTG
TTTTCCCCAGTGAAACTCCAGAGTTTGCTTGCT

QA 9 761 9 761
DS 

RD RR2FK72JQ 721 0 0
AAAAAAA
AACATTGTAGTTCTTTATTACATGATGATTAAAATCTCAGTAAACAAGAAAAAGATGAAA
GACTCGATGAATGAGCCATTACAACAAGAGAGCTGTGTCCTTATAACCAGGACCAATATT
TTATTGAGAAACTTCAGTAATGCAAAACACACACACCACTGAAGTCAGAGTTTTGGTCCG
ATAATGTCTGATGACTCAGGAAGAAGCAGCCTTGGCAGCCTCAAGTCTGGAACTAACAGC
CTCCCAAGACACCAAATTGTTCATGAATGTCTTTATGTAATCCGGTCTCCGGTTCTGGAA
GTCGAGATAGTAAGCATGCTCCCAGACATCAATGGTAAGCAATGGGAAAGAGCCGAGCAC
AAGGGGATTCACAGCATTTGGAGTTTTTACCACTTTGAGTTTGTTATCTGAGTAAGCAAG
CCAGGCCCAGCCAGCTCCAAACTGAGTGGCAGCAGCAGCATTGAACTCATCATAAAACTT
CTCATAAAAAGTGAAATCCCTTTCAAGCAGAGCAAGAAGCTCTCCTGATGGTTTTCCCCC
ACCACCCGGTTTCATTGATTCCCAGAAGAACTCGTGGTTCCAAGCCTGAGCAGCGTTGTT
GAAAGGAGGGAGCAGGTCGCCATTGTTGTAAGTGTTTTTGATGATATGCTCTAAGGGCTT
GCCTTCAAGCTCAGATCCAAGAACCTGTTTCTTGAGGTTGTCCACGTAAGCCCT

QA 8 721 8 721
DS 

RD RR2DH07TF 771 0 0
CACACACGCCACTGAAGTCAGAGTTT*GGTCCGATAATGTCTGATGACTCAGGAAGAAGC
AGCCTTGGCAGC*TCAAGTCTGGAACTAACAGCCTCCCAAGACACAAGATTGTTCATGAA
TGTCTTTATGTAATCCGGTCTCCGGTTCTGGAAGTCGAGATAGTAAGCATGCTCCCAGAC
ATCAATGGTAAGCAGTGG*AAAGAGCCGAGCACAAGGGGATTCACAGCATTTGGAGTTTT
CACCACTTTGAGTTTGTTATCTGCGTAAGCAAGCCAGGCCCAGCCAGCTCCAAACTGAGT
GGCAGCAGCAGCATTGAACTCATCATAGAACTTCTCATAAGAAGTGAAATCCCTTTCAAG
CAGAGCAAGAAGCTCTCCTGATGGCTTTCCTCCACCACCCGGTTTCATTGATTCCCAGAA
GAACTCGTGGTTCCATGCCTGAGCAGCGTTGTTGAAAGGAGGGAGGAGGTCGCCATTGTT
GTACGTGTTTTGGATGATATGCTCTAAGGGCTTGCCTTCAAGCTCGGATCCAAGAACCTG
TTTCTCGAGGTTGTCCACGTAAGCCCTGTGGTGTTTTCCCCAGTGAAACTCCAGAGTTTG
CTTGCTTATATGCGGCTCCAAAGCATCCAGAGGGTATGGAGGTGGCTTGAGGACGTAGTT
TGCGGTTACAGCAGCTGAAGCAGCCATTTCTTTTTTGGGGATTGAAGAAGAGTAAGAGAT
CAGCAAAACTTGATCAGGAAGCAACTAAGTGGATCAGAGATAGGGAATCCC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2FK72TF 667 0 0
CCAAGACACCAGATTGTTCATGAATGTCTTTATGTAATCCGGTCTCCGGTTCTGGAAGTC
GAGATAGTAAGCATGCTCCCAGACATCAATGGTAAGCAATGGGAAAGAGCCGAGCACAAG
GGGATTCACAGCATTTGGAGTTTTTACCACTTTGAGTTTGTTATCTGAGTAAGCAAGCCA
GGCCCAGCCAGCTCCAAACTGAGTGGCAGCAGCAGCATTGAACTCATCATAGAACTTCTC
ATAAGAAGTGAAATCCCTTTCAAGCAGAGCAAGAAGCTCTCCTGATGGTTTTCCCCCACC
ACCCGGTTTCATTGATTCCCAGAAGAACTCGTGGTTCCAAGCCTGAGCAGCGTTGTTGAA
AGGAGGGAGCAGGTCGCCATTGTTGTAAGTGTTTTTGATGATATGCTCTAAGGGCTTGCC
TTCAAGCTCAGATCCAAGAACCTGTTTCTTGAGGTTGTCCACGTAAGCCCTGTGGTGTTT
TCCCCAGTGAAACTCCAGAGTTTGCTTGCTCATATGCGGCTCCAAAGCATCCAGAGGGTA
TGGAGGTGGCTTGAGGACGTAGTTTGCGGTTACAGCAGCTGAAGCAGCCATTTTTTTGT*
*GGGATTGAAGAAGAGTAAGAGATCAGCAAAACTTGATCAGGAAGCAACTAAGTGGATCA
GAGAT
CC

QA 1 665 1 665
DS 



CO CL662Contig2 727 3 4 U
GGAAACCACAGATATCACTGGCGTGTGCTCTCCTCACTTGCCTTGAAACTAGAGCTTCAA
TCCCCAAAAAAGAAATGGCTGCTTCAGCTGCTGTAACCGCAAACTACGTCCTCAAGCCAC
CTCCATACCCTCTGGATGCTTTGGAGCCGCATATAAGCAAGCAAACTCTGGAGTTTCACT
GGGGAAAACACCACAGGGCTTACGTGGACAACCTCAAGAAACAGGTTCTTGGATCCGAGC
TTGAAGGCAAGCCCTTAGAGCATATCATCCAAAACACGTACAACAATGGCGACCTCCTCC
CTCCTTTCAACAACGCTGCTCAGGCATGGAACCACGAGTTCTTCTGGGAATCAATGAAAC
CGGGTGGTGGAGGAAAGCCATCAGGAGAGCTTCTTGCTCTGCTTGAAAGGGATTTCACTT
CTTATGAGAAGTTCTATGATGAGTTCAATGCTGCTGCTGCCACTCAGTTTGGAGCTGGCT
GGGCCTGGCTTGCTTACGCAGATAACAAACTCAAAGTGGTGAAAACTCCAAATGCTGTGA
ATCCCCTTGTGCTCGGCTCTTTCCCACTGCTTACCATTGATGTCTGGGAGCATGCTTACT
ATCTCGACTTCCAGAACCGGAGACCGGATTACATAAAGACATTCATGAACAATCTTGTGT
CTTGGGAGGCTGTTAGTTCCAGACTTGAGGCTGCCAAGGCTGCTTCTTCCTGAGTCATCA
GACATTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FE11TF U 1
AF RR2DW61TF U 26
AF RR2BG43TF U 6
BS 1 281 RR2FE11TF
BS 282 282 RR2BG43TF
BS 283 696 RR2FE11TF
BS 697 727 RR2BG43TF

RD RR2FE11TF 696 0 0
GGAAACCACAGATATCACTGGCGTGTGCTCTCCTCACTTGCCTTGAAACTAGAGCTTCAA
TCCCCAAAAAAGAAATGGCTGCTTCAGCTGCTGTAACCGCAAACTACGTCCTCAAGCCAC
CTCCATACCCTCTGGATGCTTTGGAGCCGCATATAAGCAAGCAAACTCTGGAGTTTCACT
GGGGAAAACACCACAGGGCTTACGTGGACAACCTCAAGAAACAGGTTCTTGGATCCGAGC
TTGAAGGCAAGCCCTTAGAGCATATCATCCAAAACACGTACGACAATGGCGACCTCCTCC
CTCCTTTCAACAACGCTGCTCAGGCATGGAACCACGAGTTCTTCTGGGAATCAATGAAAC
CGGGTGGTGGAGGAAAGCCATCAGGAGAGCTTCTTGCTCTGCTTGAAAGGGATTTCACTT
CTTATGAGAAGTTCTATGATGAGTTCAATGCTGCTGCTGCCACTCAGTTTGGAGCTGGCT
GGGCCTGGCTTGCTTACGCAGATAACAAACTCAAAGTGGTGAAAACTCCAAATGCTGTGA
ATCCCCTTGTGCTCGGCTCTTTCCCACTGCTTACCATTGATGTCTGGGAGCATGCTTACT
ATCTCGACTTCCAGAACCGGAGACCGGATTACATAAAGACATTCATGAACAATCTTGTGT
CTTGGGAGGCTGTTAGTTCCAGACTTGAGGCTGCCA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2DW61TF 649 0 0
G
GCTCTCCTCACTTGCCTTGAAACTAGAGCTTCAATCCCCAAAAAAGAAATGGCTGCTTCA
GCTGCTGTAACCGCAAACTACGTCCTCAAGCCACCTCCATACCCTCTGGATGCTTTGGAG
CCGCATATAAGCAAGCAAACTCTGGAGTTTCACTGGGGAAAACACCACAGGGCTTACGTG
GACAACCTCAAGAAACAGGTTCTTGGATCCGAGCTTGAAGGCAAGCCCTTAGAGCGTATC
ATCCAAAACACGCACAACAATGGCGACCTCCTCCCTCCTTTCAACAACGCTGCTCAGGCA
TGGAACCACGAGTTCTTCTGGGAATCAATGAAACCGGGTGGTGGAGGAAAGCCATCAGGA
GAGCTTCTTGCTCTGCTTGAAAGGGATTTCACTTCTTATGAGAAGTTCTATGATGAGTTC
AATGCTGCTGCTGCCACTCAGTTTGGAGCTGGCTGGGCCTGGCTTGCTTACGCAGATAAC
AAACTCAAAGTGGTGAAAACTCCAAATGCTGTGAATCCCCTTGTGCTCGGCTCTTTCCCA
CTGCTTACCATTGATGTCTGGGAGCATGCTTACTATCTCGACTTCCAGAACCGGAGACCG
GATTACATAAAGACATTCATGAACAATCTTGTGTCTTGGGAGGCTGTT

QA 2 649 2 649
DS 

RD RR2BG43TF 722 0 0
GG
ACAGATATCACTGGCGTGTGCTCTCCTCACTTGCCTTGAAACTAGAGCTTCAATCCCCAA
AAAAGAAATGGCTGCTTCAGCTGCTGTAACCGCAAACTACGTCCTCAAGCCACCTCCATA
CCCTCTGGATGCTTTGGAGCCGCATATAAGCAAGCAAACTCTGGAGTTTCACTGGGGAAA
ACACCACAGGGCTTACGTGGACAACCTCAAGAAACAGGTTCTTGGATCCGAGCTTGAAGG
CAAGCCCTTAGAGCATATCATCCAAAACACGTACAACAATGGCGACCTCCTCCCTCCTTT
CAACAACGCTGCTCAGGCATGGAACCACGAGTTCTTCTGGGAATCAATGAAACCGGGTGG
TGGAGGAAAGCCATCAGGAGAGCTTCTTGCTCTGCTTGAAAGGGATTTCACTTCTTATGA
GAAGTTCTATGATGAGTTCAATGCTGCTGCTGCCACTCAGTTTGGAGCTGGCTGGGCCTG
GCTTGCTTACGCAGATAACAAACTCAAAGTGGTTAAAACTCCAAATGCTGTGAATCCCCT
TGTGCTCGGCTCTTTCCCACTGCTTACCATTGATGTCTGGGAGCATGCTTACTATCTCGA
CTTCCAGAACCGGAGACCGGATTACATAAAGACATTCATGAACAATCTTGTGTCTTGGGA
GGCTGTTAGTTCCAGACTTGAGGCTGCCAAGGCTGCTTCTTCCTGAGTCATCAGACATTA

QA 3 722 3 722
DS 



AS 2 6

CO CL663Contig1 968 3 9 U
GGTCTTCAAAGCCATTTGCAACACTAAAAACATACATGATACATACAGTATGCTTACAGA
TTGGTAGAAATGTAACAAGATACAATACACTATAAAAATGCGTACAAATTGTTGTCCCAA
ACAAATTTTACCTAGGTATATACACCTTGTAAATCACATGCTATTATAGACGAAAGTAAT
AAGTAATTTCAAATTCAAATCAATAGTGAGCCGAGGTAATGGTAAAGTGATATAAATATA
GATGCAATATATGATTTCTTTGTTACAAAAGCCTAATTAATATAATCTTTTTGTCCATGA
GAAAATTAAAGACGGTTGGTTAGATATGTTATGTTGTAGGATTAAACAGCTGAATGGGAG
AATTGAAACTAAAATTTAAAAGTACCTCTGTGTCTCCATGGAGTATGTTGGATTAGGCCG
TGCGTTTGACTCCAGATCTGCTCAATAGTAAGATCTGAATTCATTCAAAATATGTCTGTA
TCGAGATATTTTGGTGAATTTGAGATCAAAAGGAATCAGTGAGTGTGTGAGAGAGAGCGA
GATGCAAAGACACAAAGGTGAGGGGAGAACCCGGGCTTAAAAAAATATGTTTCCCCGTGC
GAACTCCCCTCACAACAACACGAAACTATTTTTTTTTATTAACGAACTTTTTTGTGACCT
GCCATGCAAGCGCACCTGTCATGGCAAAGGTCGGATGACAAAGATGCTAATTCAGAACTC
AAGCCCTCTCTCATCAGAAAGCCTGTATCGTCCTTAACAAACATCTCATACATCCTTCAA
TACTCATATCATTTCACATATCTTCCCTCCTCTTCTCTCTTCTCCAGTCGCTCCTCCTTG
CCAATCGGATTCATCATCTCCCAGGCGCAAATCACAGATCCAACGAGGAGCCTCGCGATC
GGAGATCAGATCAGCTATTCAACCGATCCTGAGAGATCTCTCAGCAGCTACGATACGTCT
TCTAGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR15JQ U 1
AF RR2CH46JQ U 63
AF RR2CH46TF C 289
BS 1 160 RR2CR15JQ
BS 161 161 RR2CH46JQ
BS 162 397 RR2CR15JQ
BS 398 398 RR2CH46JQ
BS 399 457 RR2CR15JQ
BS 458 458 RR2CH46JQ
BS 459 558 RR2CR15JQ
BS 559 833 RR2CH46JQ
BS 834 968 RR2CH46TF

RD RR2CR15JQ 558 0 0
GGTCTTCAAAGCCATTTGCAACACTAAAAACATACATGATACATACAGTATGCTTACAGA
TTGGTAGAAATGTAACAAGATACAATACACTATAAAAATGCGTACAAATTGTTGTCCCAA
ACAAATTTTACCTAGGTATATACACCTTGTAAATCACATGTTATTATAGACGAAAGTAAT
AAGTAATTTCAAATTCAAATCAATAGTGAGCCGAGGTAATGGTAAAGTGATATAAATATA
GATGCAATATATGATTTCTTTGTTACAAAAGCCTAATTAATATAATCTTTTTGTCCATGA
GAAAATTAAAGACGGTTGGTTAGATATGTTATGTTGTAGGATTAAACAGCTGAATGGGAG
AATTGAAACTAAAATTTAAAAGTACCTCTGTGTCTCCGTGGAGTATGTTGGATTAGGCCG
TGCGTTTGACTCCAGATCTGCTCAATAGTAAGATCTGGATTCATTCAAAATATGTCTGTA
TCGAGATATTTTGGTGAATTTGAGATCAAAAGGAATCAGTGAGTGTGTGAGAGAGAGCGA
GATGCAAAGACACAAAGG

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2CH46JQ 771 0 0
GGTAGAAATGTAACAAGATACAATACACTATAAAAATGCGTACAAATTGTTGTCCCAAAC
AAATTTTACCTAGGTATATACACCTTGTAAATCACATGCTATTATAGACGAAAGTAATAA
GTAATTTCAAATTCAAATCAATAGTGAGCCGAGGTAATGGTAAAGTGATATAAATATAGA
TGCAATATATGATTTCTTTGTTACAAAAGCCTAATTAATATAATCTTTTTGTCCATGAGA
AAATTAAAGACGGTTGGTTAGATATGTTATGTTGTAGGATTAAACAGCTGAATGGGAGAA
TTGAAACTAAAATTTAAAAGTACCTCTGTGTCTCCATGGAGTATGTTGGATTAGGCCGTG
CGTTTGACTCCAGATCTGCTCAATAGTAAGATCTGAATTCATTCAAAATATGTCTGTATC
GAGATATTTTGGTGAATTTGAGATCAAAAGGAATCAGTGAGTGTGTGAGAGAGAGCGAGA
TGCAAAGACACAAAGGTGAGGGGAGAACCCGGGCTTAAAAAAATATGTTTCCCCGTGCGA
ACTCCCCTCACAACAACACGAAACTATTTTTTTTTATTAACGAACTTTTTTGTGACCTGC
CATGCAAGCGCACCTGTCATGGCAAAGGTCGGATGACAAAGATGCTAATTCAGAACTCAA
GCCCTCTCTCATCAGAAAGCCTGTATCGTCCTTAACAAACATCTCATACATCCTTCAATA
CTCATATCATTTCACATATCTTCCCTCCTCTTCTCTCTTCTCCAGTCGCTC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2CH46TF 680 0 0
TTTTGTC
CATGAGAAAATTAAAGACGGTTGGT*AGATATGTTATGTTGTAGGATTAAACAGCTGAAT
GGGAGAATTGAAACTAAAATTTAAAAGTACCTCTGTGTCTCCATGGAGTATGTTGGATTA
GGCCGTGCGTTTGACTCCAGATCTGCTCAATAGTAAGATCTGAATTCATTCAAAATATGT
CTGTATCGAGATATTTTGGTGAATTTGAGATCAAAAGGAATCAGTGAGTGTGTGAGAGAG
AGCGAGATGCAAAGACACAAAGGTGAGGGGAGAACCCGGGCTTAAAAAAATATGTTTCCC
CGTGCGAACTCCCCTCACAACAACACGAAACTATTTTTTTTTATTAACGAACTTTTTTGT
GACCTGCCATGCAAGCGCACCTGTCATGGCAAAGGTCGGATGACAAAGATGCTAATTCAG
AACTCAAGCCCTCTCTCATCAGAAAGCCTGTATCGTCCTTAACAAACATCTCATACATCC
TTCAATACTCATATCATTTCACATATCTTCCCTCCTCTTCTCTCTTCTCCAGTCGCTCCT
CCTTGCCAATCGGATTCATCATCTCCCAGGCGCAAATCACAGATCCAACGAGGAGCCTCG
CGATCGGAGATCAGATCAGCTATTCAACCGATCCTGAGAGATCTCTCAGCAGCTACGATA
CGTCTTCTAGCAC

QA 8 680 8 680
DS 



CO CL663Contig2 717 3 2 U
TTTTTTTCTTATTATTCTTTTCAATTTATTTCTCTGTGTTCATTAGATCTCTCAGCTATG
TCATCGTATCGGAGTCTTTCCGATTCAGATCGTCGGAGTTCAGCTCTCCATCCACGGATA
GGCCTCGTAACGGCATGGATCTAGTTTGATTCATGCCAGAAGACGCATCTTAGCTGCTGA
GATCTCTCAGGATCGGTTGAATAGCTGATCTGATCTCCGATCGCGAGGCTCCTCGTTGGT
TGGATCTGTGATTTGCGTCTCGGATTGATGATGAATCCGATTAGCAAGGAGGAGCGACTG
GAGAAGAGAGAAGAGGAGGGAGGCAGAGGAGGGAAGATATGTGAAATGATATGAGATGAT
TGAAGGATGTATGAGATGTTTGTTAAGGACGATACAGCCTTTCTGATGATGAGAGGGCTT
GAGTTCTGAATTAGCATCTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGTGCGCTTGCATGGC
AGGTCAAAAAAAGTTCCTTAATAAAAAAAAAA*TAGTTTCGTGTTGTTGTGAGGGGAGTT
CGCACGGGGAACATATTTTTTTAAGCCCGGGTTCTCCCCTCACCTTTGTGTCTTTGCATC
TCGCTCTCTCACACACTCACTGATTCCTTTTTGATCTCAAATTCACCAAAATATCTCGAT
ACAGACATATTTTGAATGGATCCAGATCTTACTATTGAGCAGATCTGGAGTCAAACG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC09TF U 1
AF RR2EK03TF U 1
AF RR2BR46TF U 22
BS 1 676 RR2DC09TF
BS 677 717 RR2EK03TF

RD RR2DC09TF 676 0 0
TTTTTTTCTTATTATTCTTTTCAATTTATTTCTCTGTGTTCATTAGATCTCTCAGCTATG
TCATCGTATCGGAGTCTTTCCGATTCAGATCGTCGGAGTTCAGCTCTCCATCCACGGATA
GGCCTCGTAACGGCATGGATCTAGTTTGATTCATGCCAGAAGACGCATCTTAGCTGCTGA
GATCTCTCAGGATCGGTTGAATAGCTGATCTGATCTCCGATCGCGAGGCTCCTCGTTGGT
TGGATCTGTGATTTGCGTCTCGGATTGATGATGAATCCGATTAGCAAGGAGGAGCGACTG
GAGAAGAGAGAAGAGGAGGGAGGCAGAGGAGGGAAGATATGTGAAATGATATGAGATGAT
TGAAGGATGTATGAGATGTTTGTTAAGGACGATACAGCCTTTCTGATGATGAGAGGGCTT
GAGTTCTGAATTAGCATCTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGTGCGCTTGCATGGC
AGGTCAAAAAAAGTTCCTTAATAAAAAAAAAA*TAGTTTCGTGTTGTTGTGAGGGGAGTT
CGCACGGGGAACATATTTTTTTAAGCCCGGGTTCTCCCCTCACCTTTGTGTCTTTGCATC
TCGCTCTCTCACACACTCACTGATTCCTTTTTGATCTCAAATTCACCAAAATATCTCGAT
ACAGACATATTTTGAA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2EK03TF 717 0 0
TTTTTTTCTTATTATTCTTTTCAATTTATTTCTCTGTGTTCATTAGATCTCTCAGCTATG
TCATCGTATCGGAGTCTTTCCGATTCAGATCGTCGGAGTTCAGCTCTCCATCCACGGATA
GGCCTCGTAACGGCATGGATCTAGTTTGATTCATGCCAGAAGACGCATCTTAGCTGCTGA
GATCTCTCAGGATCGGTTGAATAGCTGATCTGATCTCCGATCGCGAGGCTCCTCGTTGGT
TGGATCTGTGATTTGCGTCTCGGATTGATGATGAATCCGATTAGCAAGGAGGAGCGACTG
GAGAAGAGAGAAGAGGAGGGAGGCAGAGGAGGGAAGATATGTGAAATGATATGAGATGAT
TGAAGGATGTATGAGATGTTTGTTAAGGACGATACAGCCTTTCTGATGATGAGAGGGCTT
GAGTTCTGAATTAGCATCTTTGCCATCCGACCTTTGCCATGACAGGTGCGCTTGCATGGC
AGGTCAAAAAAAGTTCCTTAATAAAAAAAAAA*TAGTTTCGTGTTGTTGTGAGGGGAGTT
CGCACGGGGAACATATTTTTTTAAGCCCGGGTTCTCCCCTCACCTTTGTGTCTTTGCATC
TCGCTCTCTCACACACTCACTGATTCCTTTTTGATCTCAAATTCACCAAAATATCTCGAT
ACAGACATATTTTGAATGGATCCAGATCTTACTATTGAGCAGATCTGGAGTCAAACG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2BR46TF 658 0 0
CAATTTATTTCTCTGTGTTCATTAGATCTCTCAGCTATGTCATCGTATCGGAGTCTTTCC
GATTCAGATCGTCGGAGTTCAGCTCTCCATCCACGGATAGGCCTCGTAACGGCATGGATC
TAGTTTGATTCATGCCAGAAGACGCATCTTAGCTGCTGAGATCTCTCAGGATCGGTTGAA
TAGCTGATCTGATCTCCGATCGCGAGGCTCCTCGTTGGTTGGATCTGTGATTTGCGTCTC
GGATTGATGATGAATCCGATTAGCAAGGAGGAGCGACTGGAGAAGAGAGAAGAGGAGGGA
GGCAGAGGAGGGAAGATATGTGAAATGATATGAGATGATTGAAGGATGTATGAGATGTTT
GTTAAGGACGATACAGCCTTTCTGATGATGAGAGGGCTTGAGTTCTGAATTAGCATCTTT
GTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGTACGCTTGCATGGCAGGTCAAAAAAAGTTCCTTAA
TAAAAAAAAAAATAGTTTCGTGTTGTTGTGAGGGGAGTTCGCACGGGGAACATATTTTTT
TAAGCCCGGGTTCTCCCCTCACCTTTGTGTCTTTGCATCTCGCTCTCTCACACACTCACT
GATTCCTTTTTGATCTCAAATTCACCAAAATATCTCGATACAGACATATTTTGAATG
G

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 5

CO CL664Contig1 1201 5 10 U
GACTCTTCATAAACTTCAAATTCACCAAACATGATACACAAGGTTATCACCACTACAGAC
TTAGACCAAATACATTGAAGCTATCTAGTATTACCCTAAGTCACTTGATTGGACTTAACG
CTACTTGACCAAAGCTAACAATGTATTTTTTGACCACATCGAGAATGAATCCACCCCACA
ACCCGGAGTGAATCATCTCTTTGAACCCTTCATTCGACCACTATGACTTGAAAACAACTA
GTGACACAAAGACACAATCCAAACAAGCAGCATACCATTCTTCACCGAGCTATGGTCCCG
TAAGGTAGGATTTCTGCTCATGTCCCATTAGCATCAACACCATAGGCGCATTACTGATGA
CGGTTTGTATCAATTGGCGTTCATTGCTCCAGTCCTAAGCCAACTACGGACAGTAGTCCG
AATGAACCTAACACCTAAAAGCCATACAAGCCGAGGCAGAAACTGGACAGGCAAACCATA
ACATCAACATATATTCTATGACATGTATCCTGTGATGGTTCCAAATGGTGAGCGTCGAGT
CCGTGAACCAACAACATAATCTCCCAGGGAGCGTTACAGGTTGAAGTTAATGCCGCCATC
AATCAATACCTCGTTTCATAGGCCAAGCCGGAAGTGACTCCGGAATGAAAGTCGGACCTT
GGCGGTGAGGAACGCGAGTGGATCTCTTTCAAGCTTCAAACTGGTTTGAAACGCCTTCTA
TCAACCTCTAGTCGCACCTCTCCTCTACCAGCTAGCCGACCTCAGCAGGTAGGAGCATCC
GAGGTAATGGAGTCGTCTGACCTTGTTCACGCGCCACCGCCATGAAAGTGTACCCTAGAT
CTGAAAAGGGGAAAATTGATCTTGGTATACTTTCGATCCTAAACGCCGACTCTCCTCTCC
TAAACCTCTCCAAAGTCTCGTCGCCTCTCCAAACGAAATCAATGAACGACTTCGACAGAT
CTAATCGATCTGAGAAACGAACCACCACCACGGCAGAGAGGAAAACATATCGACTCAAGA
TTAGAGCAGGAGGAGGAAAGCAAAGGAAAAAGAGGGAAGGGGAAGGGGAAGGTCGCCTCC
GACGCCGCCGGCTAGGCGTGTCGGAGCTAGGGTTATGGTGCTTGTCGCTCTCTCGATCTC
TCTCTCTCTCGCGTGAAGTTTGAAGTTTATGAAGGGTTACTCTATGGTTTTTCTTTTATC
C


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2H277JQ U 1
AF RR2ES62JQ U 1
AF RR2AQ07JQ U 2
AF RR2AQ07TF C 439
AF RR2H277TF C 479
BS 1 763 RR2ES62JQ
BS 764 764 RR2AQ07JQ
BS 765 768 RR2ES62JQ
BS 769 769 RR2AQ07JQ
BS 770 779 RR2ES62JQ
BS 780 902 RR2AQ07JQ
BS 903 1135 RR2AQ07TF
BS 1136 1136 RR2H277TF
BS 1137 1168 RR2AQ07TF
BS 1169 1201 RR2H277TF

RD RR2H277JQ 686 0 0
A
ACTCTTCATAAACTTCAAATTCACCAAACATGATACACAAGGTTATCACCACTACAGACT
TAGACCAAATACATTGAAGCTATCTAGTATTACCCTAAGTCACTTGATTGGACTTAACGC
TACTTGACCAAAGCTAACAATGTATTTTTTGACCACATCGAGAATGAATCCACCCCACAA
CCCGGAGTGAATCATCTCTTTGAACCCTTCATTCGACCACTATGACTTGAAAACAACTAG
TGACACAAAGACACAATCCAAACAAGCAGCATACCATTCTTCACCGAGCTATGGTCCCGT
AAGGTAGGATTTCTGCTCATGTCCCATTAGCATCAACACCATAGGCGCATTACTGATGAC
GGTTTGTATCAATTGGCGTTCATTGCTCCAGTCCTAAGCCAACTACGGACAGTAGTCCGA
ATGAACCTAACACCTAAAAGCCATACAAGCCGAGGCAGAAACTGGACAGGCAAACCATAA
CATCAACATATATTCTATGACATGTATCCTGTGATGGTTCCAAATGGTGAGCGTCGAGTC
CGTGAACCAACAACATAATCTCCCAGGGAGCGTTATAGGTTGAAGTTAATGCCGCCATCA
ATCAATACCTCGTTTCATAGGCCAAGCCGGAAGTGACTCCGGAATGAAAGTCGGACCTTG
GCGGTGAGGAACGCGAGCGGATCTC

QA 2 686 2 686
DS 

RD RR2ES62JQ 779 0 0
GACTCTTCATAAACTTCAAATTCACCAAACATGATACACAAGGTTATCACCACTACAGAC
TTAGACCAAATACATTGAAGCTATCTAGTATTACCCTAAGTCACTTGATTGGACTTAACG
CTACTTGACCAAAGCTAACAATGTATTTTTTGACCACATCGAGAATGAATCCACCCCACA
ACCCGGAGTGAATCATCTCTTTGAACCCTTCATTCGACCACTATGACTTGAAAACAACTA
GTGACACAAAGACACAATCCAAACAAGCAGCATACCATTCTTCACCGAGCTATGGTCCCG
TAAGGTAGGATTTCTGCTCATGTCCCATTAGCATCAACACCATAGGCGCATTACTGATGA
CGGTTTGTATCAATTGGCGTTCATTGCTCCAGTCCTAAGCCAACTACGGACAGTAGTCCG
AATGAACCTAACACCTAAAAGCCATACAAGCCGAGGCAGAAACTGGACAGGCAAACCATA
ACATCAACATATATTCTATGACATGTATCCTGTGATGGTTCCAAATGGTGAGCGTCGAGT
CCGTGAACCAACAACATAATCTCCCAGGGAGCGTTACAGGTTGAAGTTAATGCCGCCATC
AATCAATACCTCGTTTCATAGGCCAAGCCGGAAGTGACTCCGGAATGAAAGTCGGACCTT
GGCGGTGAGGAACGCGAGTGGATCTCTTTCAAGCTTCAAACTGGTTTGAAACGCCTTCTA
TCAACCTCTAGTCGCACCTCTCCTCTACCAGCTAGCCGACCTCCGCAG*TAGGAGCATC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2AQ07JQ 901 0 0
ACTCTTCATAAACTTCAAATTCACCAAACATGATACACAAGGTTATCACCACTACAGACT
TAGACCAAATACATTGAAGCTATCTAGTATTACCCTAAGTCACTTGATTGGACTTAACGC
TACTTGACCAAAGCTAACAATGTATTTTTTGACCACATCGAGAATAAATCCACCCCACAA
CCCGGAGTGAATCATCTCTTTGAACCCTTCATTCGACCACTATGACTTGAAAACAACTAG
TGACACAAAGACACAATCCAAACAAGCAGCATACCATTCTTCACCGAGCTATGGTCCCGT
AAGGTAGGATTTCTGCTCATGTCCCATTAGCATCAACACCATAGGCGCATTACTGATGAC
GGTTTGTATCAATTGGCGTTCATTGCTCCAGTCCTAAGCCAACTACGGACAGTAGTCCGA
ATGAACCTAACACCTAAAAGCCATACAAGCCGAGGCAGAAACTGGACAGGCAAACCATAA
CATCAACATATATTCTATGACATGTATCCTGTGATGGTTCCAAATGGTGAGCGTCGAGTC
CGTGAACCAACAACATAATCTCCCAGGGAGCGTTACAGGTTGAAGTTAATGCCGCCATCA
ATCAATACCTCGTTTCATAGGCCAAGCCGGAAGTGACTCCGGAATGAAAGTCGGACCTTG
GCGGTGAGGAACGCGAGTGGATCTCTTTCAAGCTTCAAACTGGTTTGAAACGCCTTCTAT
CAACCTCTAGTCGCACCTCTCCTCTACCAGCTAGCCGACCTCAGCAGGTAGGAGCATCCG
AGGTAATGGAGTCGTCTGACCTTGTTCACGCGCCACCGCCATGAAAGTGTACCCTAGATC
TGAAAAGGGGAAAATTGATCTTGGTATACTTTCGATCCTAAACGCCGACTCTCCTCTCCT
A

QA 1 901 1 901
DS 

RD RR2AQ07TF 733 0 0
AAGCCATACAAGCCGAGGCAGAAACTGGACAGGCAAACCATAACATCAACATATATTCTA
TGACATGTATCCTGTGATGGTTCCAAATGGTGAGCGTCGAGTCCGTGAACCAACAACATA
ATCTCCCAGGGAGCGTTACAGGTTGAAGTTAATGCCGCCATCAATCAATACCTCGTTTCA
TAGGCCAAGCCGGAAGTGACTCCGGAATGAAAGTCGGACCTTGGCGGTGAGGAACGCGAG
TGGATCTCTTTCAAGCTTCAAACTGGTTTGAAACGCCTTCTATCAACCTCTAGTCGCACC
TCTCCTCTACCAGCTAGCCGACCTCAGCAGGTAGGAGCATCCGAGGTAATGGAGTCGTCT
GACCTTGTTCACGCGCCACCGCCATGAAAGTGTACCCTAGATCTGAAAAGGGGAAAATTG
ATCTTGGTATACTTTCGATCCTAAACGCCGACTCTCCTCTCCTAAACCTCTCCAAAGTCT
CGTCGCCTCTCCAAACGAAATCAATGAACGACTTCGACAGATCTAATCGATCTGAGAAAC
GAACCACCACCACGGCAGAGAGGAAAACATATCGACTCAAGATTAGAGCAGGAGGAGGAA
AGCAAAGGAAAAAGAGGGAAGGGGAAGGGGAAGGTCGCCTCCGACGCCGCCGGCTAGGCG
TGTCGGAGCTAGGGTTATGGTGCTTGTCGCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCGCGTGAAG
TTTGAAGTTT
TCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2H277TF 723 0 0
TAACATCAACATATAT*CTATGACATGTATCCTGTGATGGTTCCAAATGGTGAGCGTCGA
GTCCGTGAACCAACAACATAATCTCCCAGGGAGCGTTATAGGTTGAAGTTAATGCCGCCA
TCAATCAATACCTCGTTTCATAGGCCAAGCCGGAAGTGACTCCGGAATGAAAGTCGGACC
TTGGCGGTGAGGAACGCGAGCGGATCTCTTTCAAGCTTCAAACTGGTTTGAAACGCCTTC
TATCAACCTCTAGTCGCACCTCTCCTCTACCAGCTAGCCGACCTCCGCAGGTAGGAGCAT
CCGAGGTAATGGAGTCGTCTGACCTTGTTCACGCGCCACCGCCATGAAAGTGTACCCTAG
ATCTGAAAAGGGGAAAATTGATCTTGGTATACTTTCGATCCTAAACGCCGACTCTCCTCT
CCTAAACCTCTCCAAAGTCTCGTCGCCTCTCCAAACGAAATCAATGAACGACTTCGACAG
ATCTAATCGATCTGAGAAACGAACCACCACCACGGCAGAGAGGAAAACATATCGTCTCAA
GATTAGAGCAGGAGGAGGAAAGCAAAGGAAAAAGAGGGAAGGGGAAGGGGAAGGTCGCCT
CCGACGCCGCCGGCTAGGCGTGTCGGAGCTAGGGTTATGGTGCTTGTCGCTCTCTCGATC
TCTCTCTCTCTCGCGTGAAGTTTGAAGTTTATGAAGGGTTACTCTATGGTTTTTCTTTTA
TCC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 7

CO CL665Contig1 780 7 8 U
GGAAGCCAATCTTCTCACAATTCTTCACCATCTCTCTCTCTAGAAAAAACCTGAAGAAAT
TAAAAAACGCATCACAAGTTTGATCAATAAAGATGACTAAAGACAGGAAGATCGGAGTCG
CCATGGACTTCTCGGAGAGCAGCAAGAACGCACTGAGATGGGCCATCGACAACTTAGCTG
ATAAAGGAGACACGTTTTACATCATTCACGCGTTACTAACCTCAGAAGCTGGACCTCGTA
ACTCCCTCTGGCTCAAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTTTAGAGAACCAG
AGACTATGGAGAAATACGGTGTCAAAATCGATATACCAGTTCTTGACATGCTCGACACTG
GTTCGAGGCAGAAAGAGATTCATGTAGTGACGAAAATATACTGGGGAGATGCAAGAGAGA
AGCTGGTTGATGCTGCTAAATCTCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGAC
TCAGTGCCCTTCAAAGGATAATAATGGGAAGCGTAAGCAGCTTTGTGATTCAACACGCCC
CTTGCCCGGTCACCGTTGTCAAGGACTAAACAAAAGGCTGTGATCTCATATGTTCGATAA
AAAATAATAATCGCAATTTATGCTTTTAATAAAGTGAACTCTTTTCTTTCTTTGTTGTAT
TTGTATTTGAAATCATATCAATATATTAAGTTCAATAGTAGTTGTTGACACACGCAGACA
AATAGAATCGAGGAGATTCTTGTGTTTTTGGTTTATACAATACCAGAATACAATATGTAC


BQ
35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 
5 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H450TF U 1
AF RR2BN92TF U 1
AF RR2H956TF U 1
AF RR2FW18JQ C 1
AF RR2A061TF U 6
AF RR2FW18TF U 1
AF RR2BN92JQ C 68
BS 1 138 RR2BN92TF
BS 139 139 RR2H450TF
BS 140 593 RR2BN92TF
BS 594 594 RR2H956TF
BS 595 603 RR2BN92TF
BS 604 604 RR2H956TF
BS 605 697 RR2BN92TF
BS 698 780 RR2BN92JQ

RD RR2H450TF 552 0 0
GGAAGCCAATCTTCTCACAATTCTTCACCATCTCTCTCTCTAGAAAAAACCTGAAGAAAT
TAAAAAACGCATCACAAGTTTGATCAATAAAGATGACTAAAGACAGGAAGATCGGAGTCG
CCATGGACTTCTCGGAGAGCAGCAAGAACGCACTGAGATGGGCCATCGACAACTTAGCTG
ATAAAGGAGACACGTTTTACATCATTCACGCGTTACTAACCTCAGAAGCTGGACCTCGTA
ACTCCCTCTGGCTCAAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGGGTTTAGAGAACCAG
AGACTATGGAGAAATACGGTGTCAAAATCGATATACCAGTTCTTGACATGCTCGACACTG
GTTCGAGGCAGAAAGAGATTCATGTAGTGACGAAAATATACTGGGGAGATGCAAGAGAGA
AGCTGGTTGATGCTGCTAAATCTCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGAC
TCAGTGCCCTTCAAAGGATAATAATGGGAAGCGTAAGCAGCTTTGTGATTCAACACGCCC
CTTGCCCGGTCA

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2BN92TF 697 0 0
GGAAGCCAATCTTCTCACAATTCTTCACCATCTCTCTCTCTAGAAAAAACCTGAAGAAAT
TAAAAAACGCATCACAAGTTTGATCAATAAAGATGACTAAAGACAGGAAGATCGGAGTCG
CCATGGACTTCTCGGAGATCAGCAAGAACGCACTGAGATGGGCCATCGACAACTTAGCTG
ATAAAGGAGACACGTTTTACATCATTCACGCGTTACTAACCTCAGAAGCTGGACCTCGTA
ACTCCCTCTGGCTCAAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTTTAGAGAACCAG
AGACTATGGAGAAATACGGTGTCAAAATCGATATACCAGTTCTTGACATGCTCGACACTG
GTTCGAGGCAGAAAGAGATTCATGTAGTGACGAAAATATACTGGGGAGATGCAAGAGAGA
AGCTGGTTGATGCTGCTAAATCTCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGAC
TCAGTGCCCTTCAAAGGATAATAATGGGAAGCGTAAGCAGCTTTGTGATTCAACACGCCC
CTTGCCCGGTCACCGTTGTCAAGGACTAAACAAAAGGCTGTGATCTCATATGTACGATAA
AAA*TAATAATCGCAATTTATGCTTTTAATAAAGTGAACTCTTTTCTTTCTTTGTTGTAT
TTGTATTTGAAATCATATCAATATATTAAGTTCAATA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2H956TF 693 0 0
GGAAGCCAATCTTCTCACAATTCTTCACCATCTCTCTCTCTAGAAAAAACCTGAAGAAAT
TAAAAAACGCATCACAAGTTTGATCAATAAAGATGACTAAAGACAGGAAGATCGGAGTCG
CCATGGACTTCTCGGAGAGCAGCAAGAACGCACTGAGATGGGCCATCGACAACTTAGCTG
ATAAAGGAGACACGTTTTACATCATTCACGCGTTACTAACCTCAGAAGCTGGACCTCGTA
ACTCCCTCTGGCTCAAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGGGTTTAGAGAACCAG
AGACTATGGAGAAATACGGTGTCAAAATCGATATACCAGTTCTTGACATGCTCGACACTG
GTTCGAGGCAGAAAGAGATTCATGTAGTGACGAAAATATACTGGGGAGATGCAAGAGAGA
AGCTGGTTGATGCTGCTAAATCTCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGAC
TCAGTGCCCTTCAAAGGATAATAATGGGAAGCGTAAGCAGCTTTGTGATTCAACACGCCC
CTTGCCCGGTCACCGTTGTCAAGGACTAAACAAAAGGCTGTGATCTCATATGTTCGATAA
AAAATAATAATCGCAATTTATGCTTTTAATAAATTGAACTCTTTTCTTTCTTTGTTGTAT
TTGTATTTGAA*TCATATCA*TATATTAAGTTC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2FW18JQ 699 0 0
GGAAGCCAATCTTCT*ACAATTCTTCACCATCTCTCTCTCTAGAAAAAACCTGAAGAAA*
*AAAAAACGCATCACAAGTTTGATCAATGAAGATGACTAAAGACAGGAAGATCGGAGTCG
CCATGGACTTCTCGGAGAGCAGCAAGAACGCACTGAGATGGGCCATCGACAACTTAGCTG
ATAAAGGAGACACGTTTTACATCATTCACGCGTTACTAACCTCAGAAGCTGTACCTCGTA
ACTCCCTCTGGCTCAAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTTTAGAGAACCAG
AGACTATGGAGAAATACGGTGTCAAAATCGATATACCAGTTCTTGACATGCTCGACACTG
GTTCGAGGCAGAAAGAGATCCATGTAGTGACGAAAATATACTGGGGAGATGCAAGAGAGA
AGCTGGTTGATGCTGCTAAATCTCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGAC
TCAGTGCCCTTCAAAGGATAATAATGGGAAGCGTAGGCAGCTTTGTGATTCAACACGCCC
CTTGCCCGGTCACCGTTGTCAAGGACTAAACAAAAGGCTGTGATCTCATATGTTCGATAA
AAAATAATAATCGCAATTTATGCTTTTAATAAAGTGAACTCTTTTCTTTCTTTGTTGTAT
TTGTATTTGAAATCATATCAATATATTAAGTTCAATA
GC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2A061TF 692 0 0
GG
AATCTTCTCACAATTCTTCACCATCTCTCTCTCTAGAAAAAACCTGAAGAAATTAAAAAA
CGCATCACAAGTTTGATCAATAAAGATGACTAAAGACAGGAAGATCGGAGTCGCCATGGA
CTTCTCGGAGAGCAACAAGAACGCACTGAGATGGGCCATCGACAACTTAGCTGATAAAGG
AGACACGTTTTACATCATTCACGCGTTACTAACCTCAGAAGCTGGACCTCGTAACTCCCT
CTGGCTCAAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTTTAGAGAACCAGAGACTAT
GGAGAAATACGGTGTCAAAATCGATATACCAGTTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCGAG
GCAGAAAGAGATTCATGTAGTGACGAAAATATACTGGGGAGATGCAGGAGAGAAGCTGGT
TGATGCTGCTAAATCTCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGC
CCTTCAAAGGATAATAATGGGAAGCGTAAGCAGCTTTGTGATTCAACACGCCCCTTGCCC
GGTCACCGTTGTCAAGGACTAAACAAAAGGCTGTGATCTCATATGTTCGATAAAAAATAA
TAATCGCAATTTATGCTTTTAATAAAGTGAACTCTTTTCTTTCTTTGTTGTATTTGTATT
TGAAATCATATCAATATATTAAGTTCAATA

QA 3 692 3 692
DS 

RD RR2FW18TF 702 0 0
GGAAGCCAATCTTCT*ACAATTCTTCACCATCTCTCTCTCTAGAAAAAACCTGAAGAAA*
*AAAAAACGCATCACAAGTTTGATCAATGAAGATGACTAAAGACAGGAAGATCGGAGTCG
CCATGGACTTCTCGGAGAGCAGCAAGAACGCACTGAGATGGGCCATCGACAACTTAGCTG
ATAAAGGAGACACGTTTTACATCATTCACGCGTTACTAACCTCAGAAGCTGTACCTCGTA
ACTCCCTCTGGCTCAAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTTTAGAGAACCAG
AGACTATGGAGAAATACGGTGTCAAAATCGATATACCAGTTCTTGACATGCTCGACACTG
GTTCGAGGCAGAAAGAGATCCATGTAGTGACGAAAATATACTGGGGAGATGCAAGAGAGA
AGCTGGTTGATGCTGCTAAATCTCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGAC
TCAGTGCCCTTCAAAGGATAATAATGGGAAGCGTAGGCAGCTTTGTGATTCAACACGCCC
CTTGCCCGGTCACCGTTGTCAAGGACTAAACAAAAGGCTGTGATCTCATATGTTCGATAA
AAAATAATAATCGCAATTTATGCTTTTAATAAAGTGAACTCTTTTCTTTCTTTGTTGTAT
TTGTATTTGAAATCATATCAATATATTAAGTTCAATA
GCAAA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2BN92JQ 713 0 0
CGCATCACAAGTTTGATCAATAAAGATGACTAAAGACAGGAAGATCGGAGTCGCCATGGA
CTTCTCGGAGATCAGCAAGAACGCACTGAGATGGGCCATCGACAACTTAGCTGATAAAGG
AGACACGTTTTACATCATTCACGCGTTACTAACCTCAGAAGCTGGACCTCGTAACTCCCT
CTGGCTCAAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTTTAGAGAACCAGAGACTAT
GGAGAAATACGGTGTCAAAATCGATATACCAGTTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCGAG
GCAGAAAGAGATTCATGTAGTGACGAAAATATACTGGGGAGATGCAAGAGAGAAGCTGGT
TGATGCTGCTAAATCTCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGC
CCTTCAAAGGATAATAATGGGAAGCGTAAGCAGCTTTGTGATTCAACACGCCCCTTGCCC
GGTCACCGTTGTCAAGGACTAAACAAAAGGCTGTGATCTCATATGTACGATAAAAAATAA
TAATCGCAATTTATGCTTTTAATAAAGTGAACTCTTTTCTTTCTTTGTTGTATTTGTATT
TGAAATCATATCAATATATTAAGTTCAATAGTAGTTGTTGACACACGCAGACAAATAGAA
TCGAGGAGATTCTTGTGTTTTTGGTTTATACAATACCAGAATACAATATGTAC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 2 9

CO CL666Contig1 715 5 11 U
GGAACTCTCTCTTCCTGTCTCTGCATTCGATTCGTGAGAAGCAAAGAAAGAGAGAGAGAG
AGAGCTTCAATGGAGTTAGCTTCCTTCGTCGGTAGAGCTCTGTTCGTTTCCGTATTCCTT
CTCTCCGCATGGCAAGAGTTCAATGGGTTTGGCGATGACGGGGGTCGAGCAGCTAAATCC
TTAAAACCAAAGTACAATGCTTTTGTTAGCCACGTGACAACTCATACCGGCCAGCAATTG
CCACCAGTTGATATGAAGATTCTTGTTGCTGCTGCTATAGCCTTGAAAGGCATTGGTGGA
CTTTTGTTCCTCTTTGGCAGCTCTCTGGGAGCTTATCTCTTGCTTCTGCATCAAGCCGTT
GCCACCCCGATTCTGTGTGATTTCTACAACTACGATGTTGACAAAAAGGAATTCAGCCAA
CTGTTTTCCAAGTTTACTCAGAGTTTGGCACTCCTTGGGGCACTGCTCTTCTTCATTGGA
ATGAAGAATTCGAGGAGACATGGTAGGCAACTCCGGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAAGCA
AACTGATAAAAAATGATGTTTTTCATCGGGTTGTTCAAGCTTTTGTCTGTATTTTTATTT
TTATTTTGGAAACCATGAGGAGAGGCAAAATTTTTGCTTATTTCCTTGAAGCTTATTGAC
ACTTTTTGTAGAGACTTTTTGGTTCTCTAGAGAAATACCTTTTCAATTTCGGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS14TF U 1
AF RR2FR43JQ C 343
AF RR2FB33TF U 1
AF RR2FR43TF U 1
AF RR2DS14JQ C 319
BS 1 393 RR2DS14TF
BS 394 394 RR2FB33TF
BS 395 508 RR2DS14TF
BS 509 509 RR2FB33TF
BS 510 536 RR2DS14TF
BS 537 537 RR2FB33TF
BS 538 561 RR2DS14TF
BS 562 562 RR2FB33TF
BS 563 623 RR2DS14TF
BS 624 697 RR2FB33TF
BS 698 715 RR2DS14JQ

RD RR2DS14TF 623 0 0
GGAACTCTCTCTTCCTGTCTCTGCATTCGATTCGTGAGAAGCAAAGAAAGAGAGAGAGAG
AGAGCTTCAATGGAGTTAGCTTCCTTCGTCGGTAGAGCTCTGTTCGTTTCCGTATTCCTT
CTCTCCGCATGGCAAGAGTTCAATGGGTTTGGCGATGACGGGGGTCGAGCAGCTAAATCC
TTAAAACCAAAGTACAATGCTTTTGTTAGCCACGTGACAACTCATACCGGCCAGCAATTG
CCACCAGTTGATATGAAGATTCTTGTTGCTGCTGCTATAGCCTTGAAAGGCATTGGTGGA
CTTTTGTTCCTCTTTGGCAGCTCTCTGGGAGCTTATCTCTTGCTTCTGCATCAAGCCGTT
GCCACCCCGATTCTGTGTGATTTCTACAACTACAATGTTGACAAAAAGGAATTCAGCCAA
CTGTTTTCCAAGTTTACTCAGAGTTTGGCACTCCTTGGGGCACTGCTCTTCTTCATTGGA
ATGAAGAATTCGAGGAGACATGGTAGGCGACTCCGGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAGGCA
AACTGATAAAAAATGATGTTTGTCATCGGGTTGTTCAAGCTTTTGTCTGTATTTTTATTT
TTATTTTGGAAACCATGAGGAGA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2FR43JQ 271 0 0
TTTT
TGCATCAAGCCGTTGCCACCCCGATTTTGTGTGATTTTTACAACTACGATGTTGACAAAA
AGGAATTCAGCCAACTGTTTTCCAAGTTTACTCAGAGTTTGGCACTCCTTGGGGCACTGT
TTTTTTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGGGACATGGTAGGCAACTCCGGAAGAAGGCTC
CAAAAGCTAAAGCAAACTGATAAAAAATGATGTTTTTCATCGGGTTGTTCAAGCTTTTGT
TTGTATTTTTATTTTTATTTTGGAAAC

QA 5 271 5 271
DS 

RD RR2FB33TF 697 0 0
GGAACTCTCTCTTCCTGTCTCTGCATTCGATTCGTGAGAAGCAAAGAAAGAGAGAGAGAG
AGAGCTTCAATGGAGTTAGCTTCCTTCGTCGGTAGAGCTCTGTTCGTTTCCGTATTCCTT
CTCTCCGCATGGCAAGAGTTCAATGGGTTTGGCGATGACGGGGGTCGAGCAGCTAAATCC
TTAAAACCAAAGTACAATGCTTTTGTTAGCCGCGTGACAACTCATACCGGCCAGCAATTG
CCACCAGTTGATATGAAGATTCTTGTTGCTGCTGCTATAGCCTTGAAAGGCATTGGTGGA
CTTTTGTTCCTCTTTGGCAGCTCTCTGGGAGCTTATCTCTTGCTTCTGCATCAAGCCGTT
GCCACCCCGATTCTGTGTGATTTCTACAACTACGATGTTGACAAAAAGGAATTCAGCCAA
CTGTTTTCCAAGTTTACTCAGAGTTTGGCACTCCTTGGGGCACTGCTCTTCTTCATTGGA
ATGAAGAATTCGAGGAGACATGGTAGGCAACTCCGGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAAGCA
AACTGATAAAAAATGATGTTTTTCATCGGGTTGTTCAAGCTTTTGTCTGTATTTTTATTT
TTATTTTGGAAACCATGAGGAGAGGCAAAATTTTTGCTTATTTCCTTGAAGCTTATTGAC
ACTTTTTGTAGAGACTTTTTGGTTCTCTAGAGAAATA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2FR43TF 692 0 0
GGAACTCTCTCTTCCTGTCTCTGCATTCGATTCGTGAGAAGCAAAGAAAGAGAGAGAGAG
AGAGCTTCAATGGAGTTAGCTTCCTTCGTCGGTAGAGCTCTGTTCGTTTCCGTATTCCTT
CTCTCCGCATGGCAAGAGTTCAATGGGTTTGGCGATGACGGGGGTCGAGCAGCTAAATCC
TTAAAACCAAAGTACAATGCTTTTGTTAGCCACGTGACAACTCATACCGGCCAGCAATTG
CCACCAGTTGATATGAAGATTCTTGTTGCTGCTGCTATAGCCTTGAAAGGCATTGGTGGA
CTTTTGTTCCTCTTTGGCAGCTCTCTGGGAGCTTATCTCTTGCTTCTGCATCAAGCCGTT
GCCACCCCGATTCTGTGTGATTTCTACAACTACGATGTTGACAAAAAGGAATTCAGCCAA
CTGTTTTCCAAGTTTACTCAGAGTTTGGCACTCCTTGGGGCACTGCTCTTCTTCATTGGA
ATGAAGAATTCGAGGAGACATGGTAGGCAACTCCGGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAAGCA
AACTGATAAAAAATGATGTTTTTCATCGGGTTGTTCAAGCTTTTGTCTGTATTTTTATTT
TTATTTTGGAAACCATGAGGAGAGGCAAAATTTT*GCTTATTTCCTTGAAGCTTATTGAC
ACTTTT*GTAGAGACTTTT
GGTCTCTAGAGAA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2DS14JQ 397 0 0
AGCTCTCTGGGAGCTTATCTCTTGCTTCTGCATCAAGCCGTTGCCACCCCGATTCTGTGT
GATTTCTACAACTACGATGTTGACAAAAAGGAATTCAGCCAACTGTTTTCCAAGTTTACT
CAGAGTTTGGCACTCCTTGGGGCACTGCTCTTCTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGAGA
CATGGTAGGCAACTCCGGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAGGCAAACTGATAAAAAATGATG
TTTTTCATCGGGTTGTTCAAGCTTTTGTCTGTATTTTTATTTTTATTTTGGAAACCATGA
GGAGAGGCAAAATTTTTGCTTATTTCCTTGAAGCTTATTGACACTTTTTGTAGAGACTTT
TTGGTTCTTTAGAGAAATACCTTTTCAATTTCGGATT

QA 1 397 1 397
DS 



CO CL666Contig2 691 4 6 U
GGAACTCTCTCTTCCTGTCTCTGCCTTGGATTCGTGAGAAGCAAAGAAAGAGAGAGAGCT
TCAATGGAGTTAGCTTCCTTTGTCGGTAGAGCTCTGTTCGTTTCCGTATTCCTTCTCTCC
GCATGGCAAGAGTTCAATGGGTTTGGGGATGATGGGGGTCGAGCAGCTAAATCTTTAAGA
CCAAAGTACAATGCTTTTGTTAGCCACGTGACAACTCATACCGGCCAGCAATTGCCACCA
GTTGATATGAAGATTCTTATTGCTGCTGCAATCGCCTTGAAGGGCATTGGTGGACTTTTG
TTCGTCTTTGGCAGCTCTCTGGGAGCTTATCTCTTGCTTCTGCATCAAGCCGTTGCCACC
CCGATTCTGTATGATTTCTACAACTACGATGTTGACAAAAAGGAATTCAGCCAGCTGTTT
TCCAAGTTTACTCAGAGTTTGGCACTTCTTGGGGCACTGCTCTTCTTCATTGGAATGAAG
AATTCGAGGAGACATGGTAGGCAACTCCGGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAAGCAAACTGA
TAAAAAATGATGTTTTCATCGGGTTGTTCAAGCTTTTTGTCTGTATTTTTATTTTTTATT
TTGGAGACCATGAGGAGAGGCAAAATCTTGGCTTATTTCCTTGAGCTTATTGACACTTTT
TGTAGAGACTTTTTGGTTCTCTAGAGAAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H506TF U 1
AF RR2H506JQB C 268
AF RR2F301TF U 26
AF RR2F301JQ C 119
BS 1 233 RR2H506TF
BS 234 234 RR2F301TF
BS 235 348 RR2H506TF
BS 349 349 RR2F301TF
BS 350 633 RR2H506TF
BS 634 691 RR2F301TF

RD RR2H506TF 639 0 0
GGAACTCTCTCTTCCTGTCTCTGCCTTGGATTCGTGAGAAGCAAAGAAAGAGAGAGAGCT
TCAATGGAGTTAGCTTCCTTTGTCGGTAGAGCTCTGTTCGTTTCCGTATTCCTTCTCTCC
GCATGGCAAGAGTTCAATGGGTTTGGGGATGATGGGGGTCGAGCAGCTAAATCTTTAAGA
CCAAAGTACAATGCTTTTGTTAGCCACGTGACAACTCATACCGGCCAGCAATTACCACCA
GTTGATATGAAGATTCTTATTGCTGCTGCAATCGCCTTGAAGGGCATTGGTGGACTTTTG
TTCGTCTTTGGCAGCTCTCTGGGAGCTTATCTCTTGCTTCTGCATCAATCCGTTGCCACC
CCGATTCTGTATGATTTCTACAACTACGATGTTGACAAAAAGGAATTCAGCCAGCTGTTT
TCCAAGTTTACTCAGAGTTTGGCACTTCTTGGGGCACTGCTCTTCTTCATTGGAATGAAG
AATTCGAGGAGACATGGTAGGCAACTCCGGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAAGCAAACTGA
TAAAAAATGATGTTTTCATCGGGTTGTTCAAGCTTTTTGTCTGTATTTTTATTTTTTATT
TTGGAGACCATGAGGAGAGGCAAAATCTTGGCT
CAAAAA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2H506JQB 367 0 0
GCAATCGCCTTGAAGGGCATTGGTGGACTTTTGTTCGTCTTTGGCAGCTCTCTGGGAGCT
TATCTCTTGCTTCTGCATCAATCCGTTGCCACCCCGATTCTGTATGATTTCTACAACTAC
GATGTTGACAAAAAGGAATTCAGCCAGCTGTTTTCCAAGTTTACTCAGAGTTTGGCACTT
CTTGGGGCACTGCTCTTCTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGAGACATGGTAGGCAACTC
CGGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAAGCAAACTGATAAAAAATGATGTTTTCATCGGGTTGT
TCAAGCTTTTTGTCTGTATTTTTATTTTTTATTTTGGAGACCATGAGGAGAGGCAAAATC
TTGGCT
C

QA 1 366 1 366
DS 

RD RR2F301TF 666 0 0
GG
GGATTCGTGAGAAGCAAAGAAAGAGAGAGAGCTTCAATGGAGTTAGCTTCCTTTGTCGGT
AGAGCTCTGTTCGTTTCCGTATTCCTTCTCTCCGCATGGCAAGAGTTCAATGGGTTTGGG
GATGATGGGGGTCGAGCAGCTAAATCTTTAAGACCAAAGTACAATGCTTTTGTTAGCCAC
GTGACAACTCATACCGGCCAGCAATTGCCACCAGTTGATATGAAGATTCTTATTGCTGCT
GCAATCGCCTTGAAGGGCATTGGTGGACTTTTGTTCGTCTTTGGCAGCTCTCTGGGAGCT
TATCTCTTGCTTCTGCATCAAGCCGTTGCCACCCCGATTCTGTATGATTTCTACAACTAC
GATGTTGACAAAAAGGAATTCAGCCAGCTGTTTTCCAAGTTTACTCAGAGTTTGGCACTT
CTTGGGGCACTGCTCTTCTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGAGACATGGTAGGCAACTC
CGGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAAGCAAACTGATAAAAAATGATGTTTTCATCGGGTTGT
TCAAGCTTTTTGTCTGTATTTTTATTTTTTATTTTGGAGACCATGAGGAGAGGCAAAATC
TTGGCTTATTTCCTTGAGCTTATTGACACTTTTTGTAGAGACTTTTTGGTTCTCTAGAGA
AATA

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR2F301JQ 573 0 0
CCGCATGGCAAGAGTTCAATGGGTTTGGGGATGATGGGGGTCGAGCAGCTAAATCTTTAA
GACCAAAGTACAATGCTTTTGTTAGCCACGTGACAACTCATACCGGCCAGCAATTGCCAC
CAGTTGATATGAAGATTCTTATTGCTGCTGCAATCGCCTTGAAGGGCATTGGTGGACTTT
TGTTCGTCTTTGGCAGCTCTCTGGGAGCTTATCTCTTGCTTCTGCATCAAGCCGTTGCCA
CCCCGATTCTGTATGATTTCTACAACTACGATGTTGACAAAAAGGAATTCAGCCAGCTGT
TTTCCAAGTTTACTCAGAGTTTGGCACTTCTTGGGGCACTGCTCTTCTTCATTGGAATGA
AGAATTCGAGGAGACATGGTAGGCAACTCCGGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAAGCAAACT
GATAAAAAATGATGTTTTCATCGGGTTGTTCAAGCTTTTTGTCTGTATTTTTATTTTTTA
TTTTGGAGACCATGAGGAGAGGCAAAATCTTGGCTTATTTCCTTGAGCTTATTGACACTT
TTTGTAGAGACTTTTTGGTTCTCTAGAGAAATA

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 9

CO CL667Contig1 878 9 11 U
GGGCCAATAATACAGAGAGCAAGAGAGAAGAGCAATCGCAATAAACAAAAAAAAAAAAAA
AATCAGCAAAAAGCTAAAGAACCTCCTCAAGCATCAATGGCGATATCCAAGCTCCACCTC
CTCTTTCTTCTCTCACTTGTCAGTCTCTCCCTTCATCGTCCTGTTCTTTCCGACAACGAT
GAGGAAGACATTCTTCTTAGAGGCATCAACGAATATAGAACATCTCTAAACCTAACAACA
CTCACACATAACAACAACGCAGAATGTCTCGCTGACGAAATCGCAGACCAGTTCAAGAAC
CAACCATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCGAACCTGGTTTCCCA
GACTACCCTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCGCAACCAGAGGCGGTGAG
ATCATGCCAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCTTGTCTAATTTCACAAAG
TCACGGTACAACCAGAACCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCATTGGCATTGCTTCTGAT
GATAATTGGATTGTGGTCATCCTCACTACAAACACAACTGAGGGTGGCTATACTCC*GGC
TACTAAGGACAGTAACTCAGGAGCTTTCGCGTTTGGAGTTAATGGTGTCGTTTCTTCGTG
TTT*GTTGGTTCTTCTCTTTTCTTTCTTCATGTTTTGAGTTTCTTTTCTTGAATAATGAT
CTCGGTGTTCTTTCTTCATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTTTCATTGTCTATGTTC
TGAATAAATAATGTTTTTGGGTGAGAACATCTCATTGCATTTTTGTGTTATCTATATCGT
TTTGTTTTGATGGGATATATATTGTAGTACTGATCAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 
15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 10 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H513TF U 1
AF RR2G425TF U 1
AF RR2G425JQ C 279
AF RR2H513JQB C 248
AF RR2BB42TF U 41
AF RR2BB42JQ C 40
AF RR2AO04TF U 10
AF RR2AO04JQ C 14
AF RR2H251TF U 191
BS 1 57 RR2G425TF
BS 58 62 RR2AO04TF
BS 63 560 RR2G425TF
BS 561 561 RR2AO04TF
BS 562 602 RR2G425TF
BS 603 820 RR2AO04TF
BS 821 821 RR2H251TF
BS 822 828 RR2AO04TF
BS 829 829 RR2H251TF
BS 830 842 RR2AO04TF
BS 843 878 RR2H251TF

RD RR2H513TF 578 0 0
GGGCCAATAATACAGAGAGCAAGAGAGAAGAGCAATCGCAATAAACAAAAAAAAAAA***
**TCAGCAAAAAGCTAAAGAACCTCCTCAAGCATCAATGGCGATATCCAAGCTCCACCTC
CTCTTTCTTCTCTCACTTGTCAGTCTCTCCCTTCATCGTCCTGTTCTTTCCGACAACGAT
GAGGAAGACATTCTTCTTAGAGGCATCAACGAATATAGAACATCTCTAAACCTAACAACA
CTCACACATAACAACAACGCAGAATGTCTCGCTGACGAAATCGCAGACCAGTTCAAGAAC
CAACCATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCGAACCTGGTTTCCCA
GACTACCCTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCGCAACCAGAGGCGGTGAG
ATCATGCCAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCTTGTCTAATTTCACAAAG
TCACGGTACAACCAGAACCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCATTGGCATTGCTTCTGAT
GATAATTGGATTGTGGTCATACTCACTACAAACACAAC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2G425TF 602 0 0
GGGCCAATAATACAGAGAGCAAGAGAGAAGAGCAATCGCAATAAACAAAAAAAAAAA***
**TCAGCAAAAAGCTAAAGAACCTCCTCAAGCATCAATGGCGATATCCAAGCTCCACCTC
CTCTTTCTTCTCTCACTTGTCAGTCTCTCCCTTCATCGTCCTGTTCTTTCCGACAACGAT
GAGGAAGACATTCTTCTTAGAGGCATCAACGAATATAGAACATCTCTAAACCTAACAACA
CTCACACATAACAACAACGCAGAATGTCTCGCTGACGAAATCGCAGACCAGTTCAAGAAC
CAACCATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCGAACCTGGTTTCCCA
GACTACCCTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCGCAACCAGAGGCGGTGAG
ATCATGCCAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCTTGTCTAATTTCACAAAG
TCACGGTACAACCAGAACCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCATTGGCATTGCTTCTGAT
GATAATTGGATTGTGGTCATACTCACTACAAACACAACTGAGGGTGGCTATACTCC*GGC
TA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2G425JQ 558 0 0
AATCGCAGACCAGTTCAAGAACCAACCATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCC
TGGATCCGAACCTGGTTTCCCAGACTACCCTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACAC
AACCGCAACCAGAGGCGGTGAGATCATGCCAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCT
TGTCTTGTCTAATTTCACAAAGTCACGGTACAACCAGAACCTGAATGATTCTAAGTTCAC
TGGCATTGGCATTGCTTCTGATGATAATTGGATTGTGGTCATACTCACTACAAACACAAC
TGAGGGTGGCTATACTCC*GGCTACTAAGGACAGTAACTCAGGAGCTTTCGCGTTTGGAG
TTAATGGTGTCGTTTCTTCGTGTTT*GTTGGTTCTTCTCTTTTCTTTCTTCATGTTTTGA
GTTTCTTTTCTTGAATAATGATCTCGGTGTTCTTTCTTCATTTGTAGAGCCTCATTATGA
GTTTCTTTCATTGTCTATGTTCTGAATAAATAATGTTTTTGGGTGAAATCATCTCATTGC
ATTTTTGTGTTATCTATA

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2H513JQB 589 0 0
ATAACAACAACGCAGAATGTCTCGCTGACGAAATCGCAGACCAGTTCAAGAACCAACCAT
GCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCGAACCTGGTTTCCCAGACTACC
CTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCGCAACCAGAGGCGGTGAGATCATGC
CAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCTTGTCTAATTTCACAAAGTCACGGT
ACAACCAGAACCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCATTGGCATTGCTTCTGATGATAATT
GGATTGTGGTCATACTCACTACAAACACAACTGAGGGTGGCTATACTCC*GGCTACTAAG
GACAGTAACTCAGGAGCTTTCGCGTTTGGAGTTAATGGTGTCGTTTCTTCGTGTTT*GTT
GGTTCTTCTCTTTTCTTTCTTCATGTTTTGAGTTTCTTTTCTTGAATAATGATCTCGGTG
TTCTTTCTTCATTTGTAGAGCCTCATTATGAGTTTCTTTCATTGTCTATGTTCTGAATAA
ATAATGTTTTTGGGTGAAATCATCTCATTGCATTTTTGTGTTATCTATA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2BB42TF 765 0 0
GGAAAC
AAAAAAAAAAAAAAAATCAGCAAAAAGCTAAAGAACCTCCTCAAGCATCAATGGCGATAT
CCAAGCTCCACCTCCTCTTTCTTCTCTCACTTGTCAGTCTCTCCCTTCATCGTCCTGTTC
TTTCCGACAACGATGAGGAAGACATTCTTCTTAGAGGCATCAACGAATATAGAACATCTC
TAAACCTAACAACACTCACACATAACAACAACGCAGAATGTCTCGCTGACGAAATCGCAG
ACCAGTTCAAGAACCAACCATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCG
AACCTGGTTTCCCAGACTACCCTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCGCAA
CCAGAGGCGGTGAGATCATGCCAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCTTGT
CTAATTTCACAAAGTCACGGTACAACCAGAACCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCATTG
GCATTGCTTCTGATGATAATTGGATTGTGGTCATCCTCACTACAAACACAACTGAGGGTG
GCTATACTCCCGGCTACTAAGGACAGTAACTCAGGAGCTTTCGCGTTTGGAGTTAATGGT
GTCGTTTCTTCGTGTTTTGTTGGTTCTTCTCTTTTCTTTCTTCATGTTTTGAGTTTCTTT
TCTTGAATAATGATCTCGGTGTTCTTTCTTCATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTTT
CATTGTCTATGTTCTGAATAAATAATGTTTTTGGGT
AAG

QA 7 762 7 762
DS 

RD RR2BB42JQ 766 0 0
GGAAACA
AAAAAAAAAAAAAAAATCAGCAAAAAGCTAAAGAACCTCCTCAAGCATCAATGGCGATAT
CCAAGCTCCACCTCCTCTTTCTTCTCTCACTTGTCAGTCTCTCCCTTCATCGTCCTGTTC
TTTCCGACAACGATGAGGAAGACATTCTTCTTAGAGGCATCAACGAATATAGAACATCTC
TAAACCTAACAACACTCACACATAACAACAACGCAGAATGTCTCGCTGACGAAATCGCAG
ACCAGTTCAAGAACCAACCATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCG
AACCTGGTTTCCCAGACTACCCTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCGCAA
CCAGAGGCGGTGAGATCATGCCAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCTTGT
CTAATTTCACAAAGTCACGGTACAACCAGAACCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCATTG
GCATTGCTTCTGATGATAATTGGATTGTGGTCATCCTCACTACAAACACAACTGAGGGTG
GCTATACTCC*GGCTACTAAGGACAGTAACTCAGGAGCTTTCGCGTTTGGAGTTAATGGT
GTCGTTTCTTCGTGTTT*GTTGGTTCTTCTCTTTTCTTTCTTCATGTTTTGAGTTTCTTT
TCTTGAATAATGATCTCGGTGTTCTTTCTTCATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTTT
CATTGTCTATGTTCTGAATAAATAATGTTTTTGGGT
AAG

QA 8 763 8 763
DS 

RD RR2AO04TF 838 0 0
GGAC
AGAGAGCAAGAGAGAAGAGCAATCGCAATAAACAAAAAAAAAAAAAAAATCAGCAAAAAG
CTAAAGAACCTCCTCAAGCATCAATGGCGATATCCAAGCTCCACCTCCTCTTTCTTCTCT
CACTTGTCAGTCTCTCCCTTCATCGTCCTGTTCTTTCCGACAACGATGAGGAAGACATTC
TTCTTAGAGGCATCAACGAATATAGAACATCTCTAAACCTAACAACACTCACACATAACA
ACAACGCAGAATGTCTCGCTGACGAAATCGCAGACCAGTTCAAGAACCAACCATGCACAA
ACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCGAACCTGGTTTCCCAGACTACCCTAGGT
TCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCGCAACCAGAGGCGGTGAGATCATGCCAGCTT
GTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCTTGTCTAATTTCACAAAGTCACGGTACAACC
AGAACCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCATTGGCATTGCTTCTGATGATAATTGGATTG
TGGTCATCCTCACTACAAACACAACTGAGGGTGGCTATACTCC*GGCTACTAAGGACAGT
AACTCAGGAGCTTTCGCGTTTGGAGTTAATGGTGTCGTTTCTTCGTGTTT*GTTGGTTCT
TCTCTTTTCTTTCTTCATGTTTTGAGTTTCTTTTCTTGAATAATGATCTCGGTGTTCTTT
CTTCATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTTTCATTGTCTATGTTCTGAATAAATAATG
TTTTTGGGTGAGAACATCTCATTGCATCTTTGTGT*ATCTATATCGTTT
GTTTT

QA 5 833 5 833
DS 

RD RR2AO04JQ 855 0 0
AGAGAGCAAGAGAGAAGAGCAATCGCAATAAACAAAAAAAAAAAAAAAATCAGCAAAAAG
CTAAAGAACCTCCTCAAGCATCAATGGCGATATCCAAGCTCCACCTCCTCTTTCTTCTCT
CACTTGTCAGTCTCTCCCTTCATCGTCCTGTTCTTTCCGACAACGATGAGGAAGACATTC
TTCTTAGAGGCATCAACGAATATAGAACATCTCTAAACCTAACAACACTCACACATAACA
ACAACGCAGAATGTCTCGCTGACGAAATCGCAGACCAGTTCAAGAACCAACCATGCACAA
ACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCGAACCTGGTTTCCCAGACTACCCTAGGT
TCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAACCGCAACCAGAGGCGGTGAGATCATGCCAGCTT
GTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCTTGTCTAATTTCACAAAGTCACGGTACAACC
AGAACCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCATTGGCATTGCTTCTGATGATAATTGGATTG
TGGTCATCCTCACTACAAACACAACTGAGGGTGGCTATACTCC*GGCTACTAAGGACAGT
AACTCAGGAGCTTTCGCGTTTGGAGTTAATGGTGTCGTTTCTTCGTGTTT*GTTGGTTCT
TCTCTTTTCTTTCTTCATGTTTTGAGTTTCTTTTCTTGAATAATGATCTCGGTGTTCTTT
CTTCATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTTTCATTGTCTATGTTCTGAATAAATAATG
TTTTTGGGTGAGAACATCTCATTGCATCTTTGTGTTATCTATATCGTTTTGTTTTGATGG
GATATATATTGTAG
G

QA 1 854 1 854
DS 

RD RR2H251TF 688 0 0
AGGG
TCTTAGAGGCATCAACGAATATAGAACATCTCTAAACCTAACAACACTCACACATAACAA
CAACGCAGAATGTCTCGCTGACGAAATCGCGGACCAGTTCAAGAACCAACCATGCACAAA
CATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCCTGGATCCTAACCTGGTTTCCCAGACTACCCTAGGTT
CCTCACAAAATGCCACCTCGACACAACCGCAACCAGAGGCGGTGAGATCATGCCAGCTTG
TGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCTTGTCTAATTTCACAAAGTCACGGTACAACCA
GAACCTGAATGATTCTAAGTTCACTGGCATTGGCATTGCTTCTGATGATAATTGGATTGT
GGTCATCCTCACTACAAACACAACTGAGGGTGGCTATACTCC*GGCTACTAAGGACAGTA
ACTCAGGAGCTTTCGCGTTTGGAGTTAATGGTGTCGTTTCTTCGTGTTT*GTTGGTTCTT
CTCTTTTCTTTCTTCATGTTTTGAGTTTCTTTTCTTGAATAATGATCTCGGTGTTCTTTC
TTCATGTGTTGAGCCTCATTATGAGTTTCTTTCATTGTCTATGTTCTGAATAAATAATGT
TTTTGGGTGAGAACATCTCATTGCATTTTTGTGTTATCTATATCGTTTTGTTTTGATGGG
ATATATATTGTAGTACTGATCAGC

QA 5 688 5 688
DS 



AS 1 6

CO CL668Contig1 929 6 21 U
GGACTGACAACATCCAACACACACCTCTCGTTCACATCTTTCTTCTTTGTAGCAAACAGA
AAGGGAGAGAGAGGGAGAGAGAGATCGGAGAATACAATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGC
TGCGGCATCGCCGCCGTCTACCCTTCTCTTCTTTCTTCTTCAAAGTCTAAATTCGTCTCC
TCCGGATTTGCCCTCCCCAATGCCGGGAACGTTGGCCGTATCAGAATGGCTGCTCACTGG
ATGCCCGGCGAGCCACGTCCCGCTTACCTCGACGGTTCTGCTCCTGGTGACTTTGGGTTT
GACCCTCTTGGACTTGGAGAGGTTCCAGAGAACCTTGAGAGGTACAAAGAATCAGAGCTC
ATCCACTGTAGATGGGCTATGCTCGCTGTTCCAGGGATTTTGGTACCAGAGGCTTTGGGA
TACGGAAACTGGGTCAAGGCTCAAGAATGGGCAGCAGTACCTGGAGGACAAGCCACTTAC
TTGGGCAACCCGGTCCCATGGGGTACTCTGCCAACAATCTTGGCTATAGAGTTCTTAGCT
ATTGCCTTTGTTGAGCACCAGAGGAGCATGGAGAAAGACCCTGAGAAAAAGAAGTACCCG
GGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCCAAGAAGTTTGAGGAGTTGAAA
GTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGCGTTTGTAGGCTTCTGTGTGCAG
CAATCGGCTTACCCAGGGACAGGACCATTGGAGAACTTGGCTACCCACTTGGCTGATCCA
TGGCACAAAAACATCGGCGATATTGTTATCCCTCTGAACTAGTGACTTGTAAAAAAAATG
GTAGTAATGTGTCCTATGAGCTTCATGTGTATCAAAACTCTCTGTAATGAAAAGACAGAT
TGTGAAACCTATGATGTTTTGTCTTGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR22TF U 1
AF RR2EM16TF U 6
AF RR2BM18TF U 6
AF RR2H710TF U 18
AF RR2DR22JQ C 298
AF RR2H710JQB C 332
BS 1 563 RR2DR22TF
BS 564 564 RR2BM18TF
BS 565 585 RR2DR22TF
BS 586 666 RR2BM18TF
BS 667 667 RR2H710TF
BS 668 676 RR2BM18TF
BS 677 677 RR2H710TF
BS 678 683 RR2BM18TF
BS 684 684 RR2H710TF
BS 685 722 RR2BM18TF
BS 723 723 RR2H710TF
BS 724 729 RR2BM18TF
BS 730 730 RR2H710TF
BS 731 745 RR2BM18TF
BS 746 764 RR2H710TF
BS 765 765 RR2H710JQB
BS 766 784 RR2H710TF
BS 785 837 RR2DR22JQ
BS 838 838 RR2H710JQB
BS 839 873 RR2DR22JQ
BS 874 929 RR2H710JQB

RD RR2DR22TF 585 0 0
GGACTGACAACATCCAACACACACCTCTCGTTCACATCTTTCTTCTTTGTAGCAAACAGA
AAGGGAGAGAGAGGGAGAGAGAGATCGGAGAATACAATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGC
TGCGGCATCGCCGCCGTCTACCCTTCTCTTCTTTCTTCTTCAAAGTCTAAATTCGTCTCC
TCCGGATTTGCCCTCCCCAATGCCGGGAACGTTGGCCGTATCAGAATGGCTGCTCACTGG
ATGCCCGGCGAGCCACGTCCCGCTTACCTCGACGGTTCTGCTCCTGGTGACTTTGGGTTT
GACCCTCTTGGACTTGGAGAGGTTCCAGAGAACCTTGAGAGGTACAAAGAATCAGAGCTC
ATCCACTGTAGATGGGCTATGCTCGCTGTTCCAGGGATTTTGGTACCAGAGGCTTTGGGA
TACGGAAACTGGGTCAAGGCTCAAGAATGGGCAGCAGTACCTGGAGGACAAGCCACTTAC
TTGGGCAACCCGGTCCCATGGGGTACTCTGCCAACAATCTTGGCTATAGAGTTCTTAGCT
ATTGCCTTTGTTGAGCACCAGAG*AGCATGGAGAAAGACCCTGAG

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2EM16TF 629 0 0
AGGG
ACATCCAACACACACCTCTCGTTCACATCTTTCTTCTTTGTAGCAAACAGAAAGGGAGAG
AGAGGGAGAGAGAGATCGGAGAATACAATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGTTGCGGCATC
GCCGCCGTCTACCCTTCTCTTCTTTCTTCTTCAAAGTCTAAATTCGTCTCCTCCGGATTT
GCCCTCCCCAATGCCGGGAACGTTGGCCGTATCAGAATGGCTGCTCACTGGATGCCCGGC
GAGCCACGTCCCGCTTACCTCGACGGTTCTGCTCCTGGTGACTTTGGGTTTGACCCTCTT
GGACTTGGAGAGGTTCCAGAGAACCTTGAGAGGTACAAAGAATCAGAGCTCATCCACTGT
AGATGGGCTATGCTCGCTGTTCCAGGGATTTTGGTACCAGAGGCTTTGGGATACGGAAAC
TGGGCCAAGGCTCAAGAATGGGCAGCAGTACCTGGAGGACAAGCCACTTACTTGGGCAAT
CCGGTCCCACGGGGTACTCTGCCAACAATCTTGGCTATAGAGTTCTTAGCTATTGCCTTT
GTTGAGCACCAGAGGAGCATGGAGAAAGACCCTGAGAAAAAGAAGTACCCGGGAGGTGCA
TTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAG

QA 5 629 5 629
DS 

RD RR2BM18TF 742 0 0
AGGG
ACATCCAACACACACCTCTCGTTCACATCTTTCTTCTTTGTAGCAAACAGAAAGGGAGAG
AGAGGGAGAGAGAGATCGGAGAATACAATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGTTGCGGCATC
GCCGCCGTCTACCCTTCTCTTCTTTCTTCTTCAAAGTCTAAATTCGTCTCCTCCGGATTT
GCCCTCCCCAATGCCGGGAACGTTGGCCGTATCAGAATGGCTGCTCACTGGATGCCCGGC
GAGCCACGTCCCGCTTACCTCGACGGTTCTGCTCCTGGTGACTTTGGGTTTGACCCTCTT
GGACTTGGAGAGGTTCCAGAGAACCTTGAGAGGTACAAAGAATCAGAGCTCATCCACTGT
AGATGGGCTATGCTCGCTGTTCCAGGGATTTTGGTACCAGAGGCTTTGGGATACGGAAAC
TGGGCCAAGGCTCAAGAATGGGCAGCAGTACCTGGAGGACAAGCCACTTACTTGGGCAAT
CCGGTCCCACGGGGTACTCTGCCAACAATCTTGGCTATAGAGTTCTTAGCTATTGCCTTT
GTTGAGCACCAGAGGAGCATGGAGAAAGACCCTGAGAAAAAGAAGTACCCGGGAGGTGCA
TTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCCAAGAAGTTTGAGGAGTTGAAAGTTAAG*AG
ATCAAGA*CGGGAG*CTTGCGTTGTTGGCGTTTGTAGGCTTCTGTGTGCAGCA*TCGGCT
*ACCCAGGGACAGGAC
AT

QA 5 740 5 740
DS 

RD RR2H710TF 767 0 0
G
ACACACCTCTCGTTCACATCTTTCTTCTTTGTAGCAAACAGAAAGGGAGAGAG**GGAGA
GAGAGATCGGAGAATACAATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGCTGCGGCATCGCCGCCGTC
TACCCTTCTCTTCTTTCTTCTTCAAAGTCTAAATTCGTCTCCTCCGGATTTGCCCTCCCC
AATGCCGGGAACGTTGGCCGTATCAGAATGGCTGCTCACTGGATGCCCGGCGAGCCACGT
CCCGCTTACCTCGACGGTTCTGCTCCTGGTGACTTTGGGTTTGACCCTCTTGGACTTGGA
GAGGTTCCAGAGAACCTTGAGAGGTACAAAGAATCAGAGCTCATCCACTGTAGATGGGCT
ATGCTCGCTGTTCCAGGGATTTTGGTACCAGAGGCTTTGGGATACGGAAACTGGGTCAAG
GCTCAAGAATGGGCAGCAGTACCTGGAGGACAAGCCACTTACTTGGGCAACCCGGTCCCA
TGGGGTACTCTGCCAACAATCTTGGCTATAGAGTTCTTAGCTATTGCCTTTGTTGAGCAC
CAGAGGAGCATGGAGAAAGACCCTGAGAAAAAGAAGTACCCGGGAGGTGCATTTGACCCT
CTTGGATACTCCGAAGACCCCAAGAAGTTTGAGGAGTTGAAAGTTAAGGAGATCAAGAAC
GGGAGGCTTGCGTTGTTGGCGTTTGTAG*CTTCTGTGTGCAGCAATCGGCTTACCCAGGG
ACAGGACCATTGGAGAACTTGGCTAC*CACTTGGCTGATCCATGGC

QA 2 767 2 767
DS 

RD RR2DR22JQ 591 0 0
TTTGACCCTCTTGGACTTGGAGAGGTTCCAGAGAACCTTGAGAGGTACAAAGAATCAGAG
CTCATCCACTGTAGATGGGCTATGCTCGCTGTTCCAGGGATTTTGGTACCAGAGGCTTTG
GGATACGGAAACTGGGTCAAGGCTCAAGAATGGGCAGCAGTACCTGGAGGACAAGCCACT
TACTTGGGCAACCCGGTCCCATGGGGTATTCTGCCAACAATCTTGGCTATAGAGTTTTTA
GCTATTGCCTTTGTTGAGCACCAGAGGAGCATGGAGAAAGACCCTGAGAAAAAGAAGTAC
CCGGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCCAAGAAGTTTGAGGAGTTG
AAAGTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGCGTTTGTAGGCTTCTGTGTG
CAGCAATCGGCTTACCCAGGGACAGGACCATTGGAGAACTTGGCTACTCACTTGGCTGAT
CCATGGCACAAAAACATCGGCGATATTGTTATCCCTCTGAACTAGTGACTTGTAAAAAAA
*TGGTAGTAATGTGTCCTATGAGCTTCATGTGTATC
AAAACTTTCTGTAAT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2H710JQB 598 0 0
ACCTTGAGAGGTACAAAGAATCAGAGCTCATCCACTGTAGATGGGCTATGCTCGCTGTTC
CAGGGATTTTGGTACCAGAGGCTTTGGGATACGGAAACTGGGTCAAGGCTCAAGAATGGG
CAGCAGTACCTGGAGGACAAGCCACTTACTTGGGCAACCCGGTCCCATGGGGTACTCTGC
CAACAATTTTGGCTATAGAGTTTTTAGCTATTGCCTTTGTTGAGCACCAGAGGAGCATGG
AGAAAGACCCTGAGAAAAAGAAGTACCCGGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCG
AAGACCCCAAGAAGTTTGAGGAGTTGAAAGTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGGCTTGCGT
TGTTGGCGTTTGTAGGCTTCTGTGTGCAGCAATCGGCTTACCCAGGGACAGGACCATTGG
AGAACTTGGCTACCCACTTGGCTGATCCATGGCACAAAAACATTGGCGATATTGTTATCC
CTTTGAACTAGTGACTTGTAAAAAAAATGGTAGTAATGTGTCCTATGAGCTTCATGTGTA
TCAAAACTCTCTGTAATGAAAAGACAGATTGTGAAACCTATGATGTTTTGTCTTGGCG

QA 1 598 1 598
DS 



AS 2 9

CO CL669Contig1 758 3 1 U
GGTGGAGAACAGAACAGATACTGAAACTTTGCTCTGTTAACTACAATGGCTCACTTCCTA
GACCTTAACACTCTCACCAGCACCTGCTCTTTACCCTCGATTCCCAAACTACTTGATCGA
AGTAAAACGGGAAAATCCAGCGGCTTTGTTTGCAGGAAAACCGACAAAGTTCAGGAACAG
GATTCAGTACAGCTCACAAGACGGATGGCTTTGGGATTTGCTGTCTCCATATCTCTAACT
GGAGCTTTCGGCGAAAGTAATGTCTCTTTGGCACAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGAT
GGTCCTCTTCCAACTCCTCCTATTTACAACAACATCGTGAACGAGCAGACGGGAACGAGA
TCGTTCTTGAAGAAAGGAGTGTATGTAGCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAACATATAGA
GTTAAAAAGAATGCATTCGATCTCTTGGCAATGGAGGATTTGATCGGACCAGACACGTTA
AACTATGTTAAAAAGTACTTGAGGCTTAAGTCCACCTTCTTGTTCTACGATTTCGACAAC
CTCATCTCTGTTGCTGCCTCTCAAGACAAGCAGCCTCTCACTGATTTGGCCAATAGACTC
TTCGACAACTTTGAAAAGCTTGAAGATGCGGCTAAAAGGAAGAACTTAGCTGAGACATAA
GCGTGTTATAAAGATACAAAGTTAATTCTTCAAGAGTTATGATCAGAATGGCGTGAAAAG
CCCCAGTTCGGTTCTAAAGCACCGTTTTATTGCTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY95TF U 3
AF RR2DW12TF U 28
AF RR2E834TF U 1
BS 1 758 RR2E834TF

RD RR2BY95TF 602 0 0
GGGAGAAC
AGAACAGATACTGAAACTTTGCTCTGTTAACTACAATGGCTCACTTCCTAGACCTTGACA
CTCTCACCAGCACCTGCTCTTTACCCTCGATTCCCAAACTACTTGATCGAAGTAAAACGG
GAAAATCCAGCGGCTTTGTTTGCAGGAAAACCGACAAAGTTCAGGAACAGGATTCAGTAC
AGCTCACAAGACGGATGGCTTTGGGATTTGCTGTCTCCATATCTCTAACTGGAGCTTTCG
GCGAAAGTAATGTCTCTTTGGCACAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGATGGTCCTCTTC
CAACTCCTCCTATTTACAACAACATCGTGAACGAGCAGACGGGAACGAGATCGTTCTTGA
AGAAAGGAGTGTATGTAGCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAACATATAGAGTTAAAAAGA
ATGCATTCGATCTCTTGGCAATGGAGGATTTGATCGGACCAGACACGTTAAACTATGTTA
AAAAGTACTTGAGGCTTAAGTCCACCTTCTTGTTCTACGATTTCGACAACCTCATCTCTG
TTGCTGCCTCTCAAGACAAGCAGCCTCTCACTGATTTGGCCAATAGACTCTTCG

QA 9 602 9 602
DS 

RD RR2DW12TF 608 0 0
TTTGCTCTGTTAACTACAATGGCTCACTTCCTAGACCTTAACACTCTCACCAGCACCTGC
TCTTTACCCTCGATTCCCAAACTACTTGATCGAAGTAAAACGGGAAAATCCAGCGGCTTT
GTTTGCAGGAAAACCGACAAAGTTCAGGAACAGGATTCAGTACAGCTCACAAGACGGATG
GCTTTGGGATTTGCTGTCTCCATATCTCTAACTGGAGCTTTCGGCGAAAGTAATGTCTCT
TTGGCACAAGGCAACAATGGTTTTTGGATCGATGGTCCTCTTCCAACTCCTCCTATTTAC
AACAACATCGTGAACGAGCAGACGGGAACGAGATCGTTCTTGAAGAAAGGAGTGTATGTA
GCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAACATATAGAGTTAAAAAGAATGCATTCGATCTCTTG
GCAATGGAGGATTTGATCGGACCAGACACGTTAAACTATGTTAAAAAGTACTTGAGGCTT
AAGTCCACCTTCTTGTTCTACGATTTCGACAACCTCATCTCTGTTGCTGCCTCTCAAGAC
AAGCAGCCTCTCACTGATTTGGCCAATAGACTCTTCGACAACTTTGAAAAGCTTGAAGAT
GCGGCTAA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2E834TF 758 0 0
GGTGGAGAACAGAACAGATACTGAAACTTTGCTCTGTTAACTACAATGGCTCACTTCCTA
GACCTTAACACTCTCACCAGCACCTGCTCTTTACCCTCGATTCCCAAACTACTTGATCGA
AGTAAAACGGGAAAATCCAGCGGCTTTGTTTGCAGGAAAACCGACAAAGTTCAGGAACAG
GATTCAGTACAGCTCACAAGACGGATGGCTTTGGGATTTGCTGTCTCCATATCTCTAACT
GGAGCTTTCGGCGAAAGTAATGTCTCTTTGGCACAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGAT
GGTCCTCTTCCAACTCCTCCTATTTACAACAACATCGTGAACGAGCAGACGGGAACGAGA
TCGTTCTTGAAGAAAGGAGTGTATGTAGCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAACATATAGA
GTTAAAAAGAATGCATTCGATCTCTTGGCAATGGAGGATTTGATCGGACCAGACACGTTA
AACTATGTTAAAAAGTACTTGAGGCTTAAGTCCACCTTCTTGTTCTACGATTTCGACAAC
CTCATCTCTGTTGCTGCCTCTCAAGACAAGCAGCCTCTCACTGATTTGGCCAATAGACTC
TTCGACAACTTTGAAAAGCTTGAAGATGCGGCTAAAAGGAAGAACTTAGCTGAGACATAA
GCGTGTTATAAAGATACAAAGTTAATTCTTCAAGAGTTATGATCAGAATGGCGTGAAAAG
CCCCAGTTCGGTTCTAAAGCACCGTTTTATTGCTATTG

QA 1 758 1 758
DS 



CO CL669Contig2 913 6 14 U
GGATAGCAGCAAAGGATTAAAAAAAAAAAAAAGAGAAGAGAAGAGAACAGATACTGAAAC
TTTGCTCTGTTAACTACAATGGCTCACTTCCTAGACCTTAACACTCTCACCAGCACCTGC
TCTTTACCCTCGATTCCCAAACTACTTGATAGAAGTAAAACGGGAAAATCCAGCGGCTTT
GTTTGCAAGAAAACCGACAAAGTTCAGGAACAACA******ACAGCTCACAAGACGGATG
GCTTTGGGATTTGCTGTCTCCATATCTCTAACTGGAGCTTTCGGCGAAAGTAATGTCTCT
TTGGCACAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGATGGTCCTCTTCCAACTCCTCCTATTTAC
AACAACATCGTGAACGAGCAGACGGGAACGAGATCGTTCTTGAAGAAAGGAGTGTATGTA
GCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAACATATAGAGTTAAAAAGAATGCATTCGATCTCTTG
GCAATGGAGGATTTGATCGGACCAGACACGTTAAACTATGTTAAAAAGTACTTGAGGCTT
AAGTCCACCTTCTTGTTCTACGATTTCGACAACCTTATCTCTGTTGCTGCCTCTCAAGAC
AAGCAACCTCTCACTGATTTGGCCAATAGACTCTTCGACAACTTTGAAAAGCTTGAAGAT
GCAGCTAAAAGGAAGAACTTAGATGAGACAGAAGCGTGTTATAAAGATACAAAGTTAATT
CTTCAAGAGGTTATGATCAGAATGGCGTGAAAAGGCCCCAGTTCCGGTTCTAAAACACCG
TTTTAATTGCTATTGAAGAAGAGATGAAAATTC*ATGGTTCATAACTCTTTCATTGGTCA
TGAAAATGTAATATTAATTTGTCTTAATGTTTTGCTGCTGCCTTCACTATAATTCAAGTG
CTTAGGTTGAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 15 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI50TF U 41
AF RR2FC66TF U 1
AF RR2AU69TF U 48
AF RR2BC43TF U 49
AF RR2EI50JQ C 103
AF RR2E834JQ C 154
BS 1 301 RR2FC66TF
BS 302 302 RR2EI50TF
BS 303 669 RR2FC66TF
BS 670 670 RR2AU69TF
BS 671 731 RR2FC66TF
BS 732 732 RR2AU69TF
BS 733 741 RR2FC66TF
BS 742 752 RR2AU69TF
BS 753 754 RR2BC43TF
BS 755 755 RR2EI50JQ
BS 756 845 RR2BC43TF
BS 846 846 RR2EI50JQ
BS 847 859 RR2BC43TF
BS 860 913 RR2E834JQ

RD RR2EI50TF 630 0 0
AAG
AGAACAGATACTGAAACTTTGCTCTGTTAACTACAATGGCTCACTTCCTAGACCTTAACA
CTCTCACCAGCACCTGCTCTTTACCCTCGATTCCCAAACTACTTGATAGAAGTAAAACGG
GAAAATCCAGCGGCTTTGTTTGCAAGAAAACCGACAAAGTTCAGGAACAACA******AC
AGCTCACAAGACGGATGGCTTTGGGATTTGCTGTCTCCATATCTCTAACTGGAGCTTTCG
GCGAAAGTAATGTCTCTTTGGCACAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGATGGTCCTCTTC
CAACTCCTCCTATTTACAACAACATCGTGAACGAGCAGACGGGAACGAGATCGTTCTTGA
AGAAAGGAGTGTATGTAGCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAACATATAGAGTTAAAAAGA
ATGCATTCGAACTCTTGGCAATGGAGGATTTGATCGGACCAGACACGTTAAACTATGTTA
AAAAGTACTTGAGGCTTAAGTCCACCTTCTTGTTCTACGATTTCGACAACCTTATCTCTG
TTGCTGCCTCTCAAGACAAGCAACCTCTCACTGATTTGGCCAATAGACTCTTCGACAACT
TTGAAA*GCTTGAAGATGCAGCTAAA
G

QA 4 629 4 629
DS 

RD RR2FC66TF 748 0 0
GGATAGCAGCAAAGGATTAAAAAAAAAAAAAAGAGAAGAGAAGAGAACAGATACTGAAAC
TTTGCTCTGTTAACTACAATGGCTCACTTCCTAGACCTTAACACTCTCACCAGCACCTGC
TCTTTACCCTCGATTCCCAAACTACTTGATAGAAGTAAAACGGGAAAATCCAGCGGCTTT
GTTTGCAAGAAAACCGACAAAGTTCAGGAACAACA******ACAGCTCACAAGACGGATG
GCTTTGGGATTTGCTGTCTCCATATCTCTAACTGGAGCTTTCGGCGAAAGTAATGTCTCT
TCGGCACAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGATGGTCCTCTTCCAACTCCTCCTATTTAC
AACAACATCGTGAACGAGCAGACGGGAACGAGATCGTTCTTGAAGAAAGGAGTGTATGTA
GCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAACATATAGAGTTAAAAAGAATGCATTCGATCTCTTG
GCAATGGAGGATTTGATCGGACCAGACACGTTAAACTATGTTAAAAAGTACTTGAGGCTT
AAGTCCACCTTCTTGTTCTACGATTTCGACAACCTTATCTCTGTTGCTGCCTCTCAAGAC
AAGCAACCTCTCACTGATTTGGCCAATAGACTCTTCGACAACTTTGAAAAGCTTGAAGAT
GCAGCTAAAGGGAAGAACTTAGATGAGACAGAAGCGTGTTATAAAGATACAAAGTTAATT
CTTCAAGAGGT*ATGATCAGA
TGGCGTG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2AU69TF 705 0 0
G
AGATACTGAAACTTTGCTCTGTTAACTACAATGGCTCACTTCCTAGACCTTAACACTCTC
ACCAGCACCTGCTCTTTACCCTCGATTCCCAAACTACTTGATAGAAGTAAAACGGGAAAA
TCCAGCGGCTTTGTTTGCAAGAAAACCGACAAAGTTCAGGAACAACA******ACAGCTC
ACAAGACGGATGGCTTTGGGATTTGCTGTCTCCGTATCTCTAACTGGAGCTTTCGGCGAA
AGTAATGTCTCTTTGGCACAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGATGGTCCTCTTCCAACT
CCTCCTATTTACAACAACATTGTGAACGAGCAGACGGGAACGAGATCGTTCTTGAAGAAA
GGAGTGTATGTAGCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAACATATAGAGTTAAAAAGAATGCA
TTCGATCTCTTGGCAATGGAGGATTTGATCGGACCAGACACGTTAAACTATGTTAAAAAG
TACTTGAGGCTTAAGTCCACCTTCTTGTTCTACGATTTCGACAACCTTATCTCTGTTGCT
GCCTCTCAAGACAAGCAACCTCTCACTGATTTGGCCAATAGGCTCTTCGACAACTTTGAA
AAGCTTGAAGATGCAGCTAAAAGGAAGAACTTAGATGAGACAGAAGCGTGTTATAAAGAT
ACAAAGTTAATTCTTCAAGAGGTTATGATCAGAATGGCGTGAAA

QA 2 705 2 705
DS 

RD RR2BC43TF 820 0 0
GGACTGAA
AAACTTTGCTCTGTTAACTGCAATGGCCCACTTCCTAGACCTTAACACTCTCACCAGCTC
CTGCACTTTACCCTCGATTCCCAAACTGCTTGATAGAAGTAAAACGGGAAAATCCAGCGG
CTTTGTTTGCAAGAAAACCGACAAAGTTCATGAACAACA******ACAGCTCACAAGACG
GATGGCATTGGGATTTGCTGTCTCCATATCTCTAACTGGAGCTTTCGGCGAAAGTAATGT
CTCTTTGGCACAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGATGGTCCTCTTCCAACTCCTCCTAT
TTACAACAACATCGTGAACGAGCAGACGGGTACAAGAACGTTCTTGAAGAAAGGAGTGTA
TGTAGCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAACATATAGAGTTAAAAAGTATGCATTCGATCT
CTTGGCAATGGAGGATTTGATCGGACCAGACACGTTAAACTATGTTAAAAAGTACTTGAG
GCTTAAGTCCACCTTCTTGTTCTACGATTTCGACAACCTCATCTCTGTTGCTGCCTCTCA
AGACAAGCAGCCTCTCACTGATTTGGCCAATAGACTCTTCGACAACTTTGAAAAGCTTGA
AGATGCGGCTAAAAGGAAGAACTTAGCTGAGACAGAAGCGTGTTATAAAGATACAAAGTT
AATTCTTCAAGAGGTTATGATCAGAATGGCGTGAAAAG*CCCCAGTTCCGGTTCTAAAAC
ACCGTTTTAATTGCTATTGAAGAAGAGATGAAAATTC*ATGGTTCATAACTCTTTCATTG
GTCATGAAA*TGTAATATTAATT
TGTCTTAAT

QA 9 811 9 811
DS 

RD RR2EI50JQ 760 0 0
ACTCTCACCAGCAC*TGCTCTTTACCCTCGATTCCCAAACTACTTGATAGAAGTAAAACG
GGAAAATCCAGCGGCTTTGTTTGCAAGAAAACCGACAAAGTTCAGGAACAACA******A
CAGCTCACAAGACGGATGGCTTTGGGATTTGCTGTCTCCATATCTCTAACTGGAGCTTTC
GGCGAAAGTAATGTCTCTTTGGCACAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGATGGTCCTCTT
CCAACTCCTCCTATTTACAACAACATCGTGAACGAGCAGACGGGAACGAGATCGTTCTTG
AAGAAAGGAGTGTATGTAGCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAACATATAGAGTTAAAAAG
AATGCATTCGAACTCTTGGCAATGGAGGATTTGATCGGACCAGACACGTTAAACTATGTT
AAAAAGTACTTGAGGCTTAAGTCCACCTTCTTGTTCTACGATTTCGACAACCTTATCTCT
GTTGCTGCCTCTCAAGACAAGCAACCTCTCACTGATTTGGCCAATAGACTCTTCGACAAC
TTTGAAAAGCTTGAAGATGCAGCTAAAAGGAAGAACTTAGATGAGACAGAAGCGTGTTAT
AAAGATACAAAGTTAATTCTTCAAGAGGTTATGATCAGAATGGCGTGAAAAGGCCCCAGT
TCTGGTTCTAAAACACCGTTTTACTTGCTATTGAAGAAGAGATGATGATTCCATGGTTCA
TAACTCTTTCATTGGTCATGAAAATGTAATATTAATT
GCC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2E834JQ 760 0 0
AGTAAAACGGGAAAATCCAGCGGCTTTGTTTGCAGGAAAACCGACAAAGTTCAGGAACAG
GATTCAGTACAGCTCACAAGACGGATGGCTTTGGGATTTGCTGTCTCCATATCTCTAACT
GGAGCTTTCGGCGAAAGTAATGTCTCTTTGGCACAAGACAACAATGGTTTTTGGATCGAT
GGTCCTCTTCCAACTCCTCCTATTTACAACAACATCGTGAACGAGCAGACGGGAACGAGA
TCGTTCTTGAAGAAAGGAGTGTATGTAGCTGACATCGGGGCGAAAGGCAGAACATATAGA
GTTAAAAAGAATGCATTCGATCTCTTGGCAATGGAGGATTTGATCGGACCAGACACGTTA
AACTATGTTAAAAAGTACTTGAGGCTTAAGTCCACCTTCTTGTTTTACGATTTCGACAAC
CTCATTTCTGTTGCTGCCTCTCAAGACAAGCAGCCTCTCACTGATTTGGCCAATAGACTT
TTCGACAACTTTGAAAAGCTTGAAGATGCGGCTAAAAGGAAGAACTTAGCTGAGACATAA
GCGTGTTATAAAGATACAAAGTTAATTTTTCAAGAGGTTATGATCAGAATGGCGTGAAAA
GGCCCCAGTTCCGGTTTTAAAGCACCGTTTTAATTGCTATTGAAGAAGAGATGAAAATTC
*ATGGTTCATAACTCTTTCATTGGTCATGAAAATGTAATATTAATTTGTCTTAATGTTTT
GCTGCTGCCTTCACTATAATTCAAGTGCTTAGGTTGAGTG

QA 1 760 1 760
DS 



AS 2 6

CO CL670Contig1 1151 3 18 U
GCACATGCTTCAGTCCATTATTATTATTCAATCTTCATGTTTCAGAATTTCAAACAACAA
CAAAGTAGCACCCAAAGTTTGTTATGACAAAATACCATTCATTCCTAAGAAACCATGAAG
AAAAGTCGAGCAAAAGTTTCTCCAAAGCTCTAAATTCACTCTACTTTTATTGTACTCTAC
CCGCCATTATTCAAACCAGAGACCAGAACATAATCTTCTTGAGACAACCCATACATAATA
TCAAGCTTTCGATCAGAAAACATACCCCAGAAAAAATCAGTTCAGGGTTGAAGGACGCTT
GGCTTCTCGAGCCCTATGTTGTTAGGGAGTTTAAGCTCTGGTGGAGTTTCTCTCACAATA
CCAAGCATTGAGTCATACTCCTCGTCTTTTCCAGCATGCCTCTTGCGTAGAACCTTCTCA
AACTCGATCGCATTTAGTGGCTTTGCATTCTCTGCAGCGTGAACCTTCGCGAGGTTTGAG
TAGTTTTCAGCTGACTTTGGGATAAAATCAATTTCCTTACTCTTGAGCTTCCTGAGGAAC
TTCGCTGGGTTGCCTCCCC*ATATCTCTCCGGAAGGAATTCTAGTGTTTTGTCGCACAAG
CGCACCAGCAGCAACCAGGGCATGCTTTTCAACCACGACACCGTCCAGAACTGTCGCTCC
CATCCCGATAAAAGCCTCATCCTCAACAGTACATCCATGTAAAACAGCACTATGACCAAT
GGTTACATTGTCTCCGATGATGGTTGCAGGCACCTTCCCGCTTAAATTAGATTTCGCCAC
ATGCACAAGCGAGTTGTCTTGAATATTCGTTCCTGATCCAACACTAATGGTGTTCACATC
CCCTCGTAGTACGCATCCATACCAAATAGAAGATCCTCTTCCGATCTGGACGTTCCCAAT
GACTGAGGCGCCTGGTGCTACAAAAGCTTCCTGATCCACAACCGGAGCCTTATCGAACAC
GTTCATCAGCGTCCGATGCCTTGATAGTTGTTCTCGGAAGCAGTTTTTGCCTTGAAGGCG
ACATCCGAGGCGATCGAGAGCTTGACCGGTCTCACGGATCCAAAATCCGACGGAGTAGAA
TGCTCTTCCTAGGGTTCCCATTGGTCTTCGTCACCTTCCTAGAGTTCCACAGGCGAGGGA
ATCTACAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D872JQ U 1
AF RR2D071JQ U 7
AF RR2AB42TF C 417
BS 1 157 RR2D872JQ
BS 158 158 RR2D071JQ
BS 159 163 RR2D872JQ
BS 164 164 RR2D071JQ
BS 165 245 RR2D872JQ
BS 246 246 RR2D071JQ
BS 247 309 RR2D872JQ
BS 310 310 RR2D071JQ
BS 311 425 RR2D872JQ
BS 426 426 RR2D071JQ
BS 427 488 RR2D872JQ
BS 489 489 RR2D071JQ
BS 490 627 RR2D872JQ
BS 628 628 RR2D071JQ
BS 629 651 RR2D872JQ
BS 652 652 RR2D071JQ
BS 653 745 RR2D872JQ
BS 746 1151 RR2AB42TF

RD RR2D872JQ 745 0 0
GCACATGCTTCAGTCCATTATTATTATTCAATCTTCATGTTTCAGAATTTCAAACAACAA
CAAAGTAGCACCCAAAGTTTGTTATGACAAAATACCATTCATTCCTAAGAAACCATGAAG
AAAAGTCGAGCAAAAGTTTCTCCAAAGCTCTAAATTCCCTCTAGTTTTATTGTACTCTAC
CCGCCATTATTCAAACCAGAGACCAGAACATAATCTTCTTGAGACAACCCATACATAATA
TCAAGGTTTCGATCAGAAAACATACCCCAGAAAAAATCAGTTCAGGGTTGAAGGACGCTT
GGCTTCTCGGGCCCTATGTTGTTAGGGAGTTTAAGCTCTGGTGGAGTTTCTCTCACAATA
CCAAGCATTGAGTCATACTCCTCGTCTTTTCCAGCATGCCTCTTGCGTAGAACCTTCTCA
AACTCTATCGCATTTAGTGGCTTTGCATTCTCTGCAGCGTGAACCTTCGCGAGGTTTGAG
TAGTTTTCGGCTGACTTTGGGATAAAATCAATTTCCTTACTCTTGAGCTTCCTGAGGAAC
TTCGCTGGGTTGCCTCCCC*ATATCTCTCCGGAAGGAATTCTAGTGTTTTGTCGCACAAG
CGCACCAGCAGCAACCAGGGCATGCTTCTCAACCACGACACCGTCCAGAACCGTCGCTCC
CATCCCGATAAAAGCCTCATCCTCAACAGTACATCCATGTAAAACAGCACTATGACCAAT
GGTTACATTGTCTCCGATGATGGTT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2D071JQ 737 0 0
GCTTCAGTCCATTATTATTATTCAATCTTCATGTTTCAGAATTTCAAACAACAACATAGT
AGCACCCAAAGTTTGTTATGACAAAATACCATTCATTCCTAAGAAACCATGAAGAAAAGT
CGAGCTAAAGTTTCTCCAAAGCTGTAAATTCACTCTACTTTTATTGTACTCTACCTGCCA
TTATTCAAACCAGAGACCAGAACATAATCTTCTTGAGACAACTCATACATAATATCAAGC
TTTCGATCAGAAAACATACCCCAGAAAAAATCAGTTCAGGTTTTAAGGACGCTTGGCTTC
TCGAGCCCTATGTTGTTAGGGAGTTTAAGCTCTGGTGGAGTTTCTCTCGCAATACCAAGC
ATTGAGTCATACTCCTCGTCTTTTCCAGCATGCCTCTTGCGTAGAACCTTCTCAAACTCG
ATCGCATTTAGTGGCTTTGCATTTTCTGCAGCGTGAACCTTCGCGAGGTTTGAGTAGTTT
TCAGCTGACTTCGGGATAAAATCAATTTCCTTACTCTTGAGCTTCCTGAGGAACTTCGCT
GGGTTTCCTCCCC*ATATCTCTCCGGAAGGAATTCTAGTGTTCTGTCGCACAAGCGCACC
AGCAGCAACCAGGGCATGCTTTTCAACCACGACACCGTCCAGAACTGTCGCTCCCATCCC
GATAAAAGCCTCATCCTCAACAGTACATCCATGTAAAACAGCACTATGACCAATGGTTAC
ATTGTCTCCGATGATGG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2AB42TF 735 0 0
CTCAAACTCGATCGCATTTAGTGGCTTTGCATTCTCTGCAGCGTGAACTTTCGCGAGGTT
TGAGTAGTTTTCAGCTGACTTTGGGATAAAATCGATTTCCTTACTCTTGAGCTTCCTGAG
GAACTTTGCTGGGTTGCCTCCCCCATATCTCTCCGGAAGGAATTCTAGTGTTTTGTCGCA
CAAGCGCACCAGCAGCAACCAGGGCATGCTTTTCAACCACGGCACCGTCCAGAACTGTCG
CTCCCATCCCGATAAAAGCCTCATCCTCAACAGTACATCCATGTAAAACAGCACTATGAC
CAATGGTCACATTATCTCCGATGATGGTTGCAGGCACCTTCCCGCTTAAATTAGATTTCG
CCACATGCACAAGCGAGTTGTCTTGAATATTCGTTCCTGATCCAACACTAATGGTGTTCA
CATCCCCTCGTAGTACGCATCCATACCAAATAGAAGATCCTCTTCCGATCTGGACGTTCC
CAATGACTGAGGCGCCTGGTGCTACAAAAGCTTCCTGATCCACAACCGGAGCCTTATCGA
ACACGTTCATCAGCGTCCGATGCCTTGATAGTTGTTCTCGGAAGCAGTTTTTGCCTTGAA
GGCGACATCCGAGGCGATCGAGAGCTTGACCGGTCTCACGGATCCAAAATCCGACGGAGT
AGAATGCTCTTCCTAGGGTTCCCATTGGTCTTCGTCACCTTCCTAGAGTTCCACAGGCGA
GGGAATCTACAGTCC

QA 1 735 1 735
DS 



CO CL670Contig2 825 3 24 U
GGGACTCATTTTGTTCCCTTCACTTCCACCATCTTCCGCCTTCTTCACCGTAGATTCCCC
GCCTGTGGAACTCTAGGAAGGTGACGAAGACCAATGGGAACCCTAGGAAGAGCATTCTAC
TCCGTCGGATTTTGGATCCGTGAGACCGGTCAGGCTCTCGATCGCCTCGGATGTCGCCTT
CAAGGCAAAAACTGCTTCCGAGAACAACTATCAAGGCATCGGACGCTGATGAACGTGTTC
GATAAGGCTCCGGTTGTGGATAAGGAAGCTTTTGTAGCACCAAGCGCCTCAGTCATCGGG
AACGTTCAGATCGGAAGAGGATCTTCTATTTGGTATGGATGCGTACTACGAGGAGATGTG
AACACCATTAGTGTTGGATCAGGAACTAATATTCAGGACAACTCACTTGTGCACGTGGCA
AAATCTAACTTGAGCGGGAAGGTGCCTGCAACCATCATCGGAGACAATGTAACCATTGGT
CATAGTGCTGTTTTACATGGATGTACTGTTGAGGATGAGGCTTTTATCGGGATGGGAGCG
ACAGTTCTGGACGGTGTCGTGGTTGAAAAGCATGCCCTGGTTGCTGCTGGTGCGCTTGTG
CGACAGAACACTAGAATTCCTTCCGGAGAGATATGGGGAGGAAACCCAGCGAAGTTCCTC
AGGAAGCTCAAGAGTAAGGAAATTGATTTTATCCCGAAGTCAGCTGAAAACTACTCAAAC
CTCGCGAAAGTTCACGCTGCAGAAAATGCAAAGCCACTAAATGCGATCGAGTTTGAGAAG
CTACGCAAGAGCATGCTGGAAAGACGAGGAGTATGACTCATGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H829TF U 1
AF RR2D071TF U 73
AF RR2CM67TF U 25
BS 1 296 RR2H829TF
BS 297 297 RR2CM67TF
BS 298 518 RR2H829TF
BS 519 519 RR2CM67TF
BS 520 553 RR2H829TF
BS 554 554 RR2CM67TF
BS 555 606 RR2H829TF
BS 607 607 RR2CM67TF
BS 608 620 RR2H829TF
BS 621 662 RR2CM67TF
BS 663 663 RR2D071TF
BS 664 709 RR2CM67TF
BS 710 710 RR2D071TF
BS 711 728 RR2CM67TF
BS 729 729 RR2D071TF
BS 730 743 RR2CM67TF
BS 744 744 RR2D071TF
BS 745 745 RR2CM67TF
BS 746 746 RR2D071TF
BS 747 754 RR2CM67TF
BS 755 755 RR2D071TF
BS 756 778 RR2CM67TF
BS 779 780 RR2D071TF
BS 781 825 RR2CM67TF

RD RR2H829TF 620 0 0
GGGACTCATTTTGTTCCCTTCACTTCCACCATCTTCCGCCTTCTTCACCGTAGATTCCCC
GCCTGTGGAACTCTAGGAAGGTGACGAAGACCAATGGGAACCCTAGGAAGAGCATTCTAC
TCCGTCGGATTTTGGATCCGTGAGACCGGTCAGGCTCTCGATCGCCTCGGATGTCGCCTT
CAAGGCAAAAACTGCTTCCGAGAACAACTATCAAGGCATCGGACGCTGATGAACGTGTTC
GATAAGGCTCCGGTTGTGGATAAGGAAGCTTTTGTAGCACCAAGCGCCTCAGTCATTGGG
AACGTTCAGATCGGAAGAGGATCTTCTATTTGGTATGGATGCGTACTACGAGGAGATGTG
AACACCATTAGTGTTGGATCAGGAACTAATATTCAGGACAACTCACTTGTGCACGTGGCA
AAATCTAACTTGAGCGGGAAGGTGCCTGCAACCATCATCGGAGACAATGTAACCATTGGT
CATAGTGCTGTTTTACATGGATGTACTGTTGAGGATGACGCTTTTATCGGGATGGGAGCG
ACAGTTCTGGACG*TGTCGTGGTTGAAAAGCATGCCCTGGTTGCTGCTGGTGCGCTTGTG
CGACAGGACACTAGAATTCC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2D071TF 713 0 0
GG
AGGAAGGTGACGAAGACCAATGGGAACCCTAGGAAGAGCATTCTACTCCGTCGGATTTTG
GATCCGTGAGACCGGTCAGGCTCTCGATCGCCTCGGATGTCGCCTTCAAGGCAAAAACTG
CTTCCGAGAACAACTATCAAGGCATCGGACGCTGATGAACGTGTTCGATAAGGCTCCGGT
TGTGGATAAGGAAGCTTTTGTAGCACCAAGCGCCTCAGTCATCGGGAACGTTCAGATCGG
AAGAGGATCTTCTATTTGGTATGGATGCGTACTACGAGGAGATGTGAACACCATTAGTGT
TGGATCAGGAACTAATATTCAGGACAACTCACTTGTGCACGTGGCAAAATCTAACTTGAG
CGGGAAGGTGCCTGCAACCATCATCGGAGACAATGTAACCATTGGTCATAGTGCTGTTTT
ACATGGATGTACTGTTGAGGATGAGGCTTTTATCGGGATGGGAGCGACAGTTCTGGACGG
TGTCGTGGTTGAAAAGCATGCCCTGGTTGCTGCTGGTGCGCTTGTGCGACAGAACACTAG
AATTCCTTCCGGAGAGATATGGGGAGGAAACCCAGCGAAGTTCCTCAGGAAGCTCAAGAG
TAAGGAAATTGATTTTATCCCGAAGTCAGCTGAAAACTACTCAAACCTCGCGAAAGTTCA
CGCTGCAGAAAATGCAAAGCCACTAAATGCGATCGAGTTTGAGAAG
TTCTA

QA 3 708 3 708
DS 

RD RR2CM67TF 801 0 0
GGCACCATCTTCCGC
CTTCTTCACCGTAGATTCCCCGCCTGTGGAACTCTAGGAAGGTGACGAAGACCAATGGGA
ACCCTAGGAAGAGCATTCTACTCCGTCGGATTTTGGATCCGTGAGACCGGTCAGGCTCTC
GATCGCCTCGGATGTCGCCCTCAAGGCAAAAACTGTTTCCGAGAACAACTATCAAGGCAT
CGGACGCTGATGAACGTGTTCGATAAGGCTCCGGTTGTGGATAAGGAAGCTTTTGTAGCA
CCAAGCGCCTCAGTCATCGGGAACGTTCAGATCGGAAGAGGATCTTCTATTTGGTATGGA
TGCGTACTACGAGGAGATGTGAACACCATTAGTGTTGGATCAGGAACTAATATTCAGGAC
AACTCACTTGTGCACGTGGCAAAATCTAACTTGAGCGGGAAGGTGCCTGCAACCATCATC
GGAGACAATGTAACCATTGGTCATAGTGCTGTTTTACATGGATGTACTGTTGAGGATGAG
GCTTTTATCGGGATGGGAGCGACAGCTCTGGACGGTGTCGTGGTTGAAAAGCATGCCCTG
GTTGCTGCTGGTGCGCTTGTGCGACAGAACACTAGAATTCCTTCCGGAGAGATATGGGGA
GGAAACCCAGCGAAGTTCCTCAG*AAGCTCAAGAGTAAGGAAATTGATTTTATCCCGAAG
TCAGCTGAAA*CTACTCAAACCTCGCGAA*GTTCACGCTGCAGAGA*TGCAAAGC*ACTA
AATGCGATCGAGTTTGAGAGTCTACGCAAGAGCATGCTGGAAAGACGAGGAGTATGACTC
ATGCTG

QA 16 801 16 801
DS 



AS 2 8

CO CL671Contig1 597 2 2 U
GCGCCGACCACGAGAGAAGCCGGGAGTCTATAGAGGGCGCCTTCGAGAAGCTTCTCATGT
CTAGTTTCGTGGCGAGGAAGAAGACTAAGATCAACCTCAAGACGAGGTTGAAGAAGAGAG
TCGAGGAGTCTCCTCCGTGGCTCAAGGCTCTTTTTGATTTCGTTGAGATGCCTCCGATGG
ATACTGTGTTCAGAAGGCTGTTCCTTTTTGCCTTCATGGGTGGTTGGAGTATCATGAACT
CAGCTGAAGGCGGTCCTGCCTTTCAGGTGGCGGTGTCGTTGGTTGCTTGCGTATATTTCC
TGAATGAGAAGACAAAGAGCTTGGGGAGAGCTTTCTTAATCGGGTTTGGTGCGTTAGCGG
CTGGATGGTTCTGCGGTTCGCTAGTCATTCCCATGATTCCGACTGTTTTGATTAACCCGG
CATGGACACTGGAGCTCCTAACGTCACTGGTTGCTTATGCGTTTTTGTTTCTTTCTTGTA
CTTTCCTCAAGTAGAGTTGCTTTTTTTGTTTCTTTCTTGTACCTGATCTCGCCGGAAAAT
TGAACTTAAGTTCCATAACATTGGCTGGCTCTGTTAAAGTGTGGAATCAAGTTGAGG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DI33JQ C 1
AF RR2DI33TF U 1
BS 1 1 RR2DI33JQ
BS 2 597 RR2DI33TF

RD RR2DI33JQ 597 0 0
GCGCCGACCACGAGAGAAGCCGGGAGTCTATAGAGGGCGCCTTCGAGAAGCTTCTCATGT
CTAGTTTCGTGGCGAGGAAGAAGACTAAGATCAACCTCAAGACGAGGTTGAAGAAGAGAG
TCGAGGAGTCTCCTCCGTGGCTCAAGGCTCTTTTTGATTTCGTTGAGATGCCTCCGATGG
ATACTGTGTTCAGAAGGCTGTTCCTTTTTGCCTTCATGGGTGGTTGGAGTATCATGAACT
CAGCTGAAGGCGGTCCTGCCTTTCAGGTGGCGGTGTCGTTGGTTGCTTGCGTATATTTCC
TGAATGAGAAGACAAAGAGCTTGGGGAGAGCTTTCTTAATCGGGTTTGGTGCGTTAGCGG
CTGGATGGTTTTGCGGTTCGCTAGTCATTCCCATGATTCCGACTGTTTTGATTAACCCGG
CATGGACACTGGAGCTCCTAACGTCACTGGTTGCTTATGCGTTTTTGTTTCTTTCTTGTA
CTTTCCTCAAGTAGAGTTGCTTTTTTTGTTTCTTTCTTGTACCTGATCTCGCCGGAAAAT
TGAACTTAAGTTCCATAACATTGGCTGGCTCTGTTAAAGTGTGGAATCAAGTTGAGG

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2DI33TF 597 0 0
G
CGCCGACCACGAGAGAAGCCGGGAGTCTATAGAGGGCGCCTTCGAGAAGCTTCTCATGTC
TAGTTTCGTGGCGAGGAAGAAGACTAAGATCAACCTCAAGACGAGGTTGAAGAAGAGAGT
CGAGGAGTCTCCTCCGTGGCTCAAGGCTCTTTTTGATTTCGTTGAGATGCCTCCGATGGA
TACTGTGTTCAGAAGGCTGTTCCTTTTTGCCTTCATGGGTGGTTGGAGTATCATGAACTC
AGCTGAAGGCGGTCCTGCCTTTCAGGTGGCGGTGTCGTTGGTTGCTTGCGTATATTTCCT
GAATGAGAAGACAAAGAGCTTGGGGAGAGCTTTCTTAATCGGGTTTGGTGCGTTAGCGGC
TGGATGGTTCTGCGGTTCGCTAGTCATTCCCATGATTCCGACTGTTTTGATTAACCCGGC
ATGGACACTGGAGCTCCTAACGTCACTGGTTGCTTATGCGTTTTTGTTTCTTTCTTGTAC
TTTCCTCAAGTAGAGTTGCTTTTTTTGTTTCTTTCTTGTACCTGATCTCGCCGGAAAATT
GAACTTAAGTTCCATAACATTGGCTGGCTCTGTTAAAGTGTGGAATCAAGTTGAGG

QA 2 597 2 597
DS 



CO CL671Contig2 958 6 38 U
ATCCAATTTGGTTTGATCCCATACTTAGCCAACCAATGTTGTGAAACTCAACTCCAATTT
CCGGGTAAGAACAAGTACAAGAAAGCAACACAATGTCTGGACTAAAAAAA*GCAAACTAC
TTGAGGAAAGTACAAGAAAGAAACAAAAAGACATAAGCAACCAGTGACGTTAGGAGCTCC
AGTGTCCATGTCGGGTTAATGAAAGCCGTCGGTATCATGGGAATGACTAGCGAACCGCAG
AACCACCCGGCCATTAATGCACCAATCCCGATCAAGAAAGCTCTCCCTAAGCTCTTCGTC
TTCTCATTCAGGAAATATATGCAAGCAGCCAACGACACCGCCACCTGAAAGGCAGGACCG
CCTTCAGCTGAGTTCATGATACTCCAACCACCCATGAAAGCAAAAAGGAAGAGCCTTCTG
AACACAGTATCCATCGGAGGCATCTCAACGAAATCAAAAAGAGCCTTGAGCCACGGAGGA
GACTCCTCGACTCTCTTCTTCAACCTCGTCTTGAGGTTGATCTTAGTCTTCTTCCTCGCC
ACGAAACTAGACATGAGAAGCTTCTCGAATGCTCCCTCTATAGACTCTCGGCTCCTCTCG
TGGTCAGCGTACTGCTCCAAGAGGAAGTTGCGAGAGGCCCAGATCTCTTCCTCGGAAGCG
TAGGGGCTGATCCCTAGGCGCTTGTACGGGTCCCAGACTCTGGTCCGAGGGAACGTGGGG
ACGTTGCCTCCGTAGGGAGAATCAGCGGAGGAGGAGGGGCACCTAGGGGCTTTGAAGGTT
CTCCGAGGTAGTGACAGTGATTGATTTTGATTCCGTAAGAGAGAAAGCTTTGTTGACAGC
TTTGATGGAGCGATGAAGGGAGAAGATACTGTAGAGCCAGAGAGAAGAAGGGACGTCGAC
ATGGCTCCTCCTCCGTCGGTCTAACCGACGCCGTTTTCTTCTTTCAACTTATCCTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2FO73JQ U 1
AF RR2GD92JQ U 41
AF RR2AO68JQ U 38
AF RR2CE07TF C 291
AF RR2AO68TF C 349
AF RR2GD92TF C 349
BS 1 110 RR2FO73JQ
BS 111 111 RR2AO68JQ
BS 112 239 RR2FO73JQ
BS 240 240 RR2AO68JQ
BS 241 248 RR2FO73JQ
BS 249 249 RR2AO68JQ
BS 250 252 RR2FO73JQ
BS 253 253 RR2AO68JQ
BS 254 257 RR2FO73JQ
BS 258 258 RR2AO68JQ
BS 259 296 RR2FO73JQ
BS 297 297 RR2AO68JQ
BS 298 350 RR2FO73JQ
BS 351 351 RR2AO68JQ
BS 352 358 RR2FO73JQ
BS 359 359 RR2AO68JQ
BS 360 398 RR2FO73JQ
BS 399 399 RR2AO68JQ
BS 400 407 RR2FO73JQ
BS 408 408 RR2AO68JQ
BS 409 410 RR2FO73JQ
BS 411 411 RR2AO68JQ
BS 412 446 RR2FO73JQ
BS 447 447 RR2AO68JQ
BS 448 569 RR2FO73JQ
BS 570 570 RR2AO68JQ
BS 571 572 RR2FO73JQ
BS 573 573 RR2AO68JQ
BS 574 575 RR2FO73JQ
BS 576 576 RR2AO68JQ
BS 577 605 RR2FO73JQ
BS 606 606 RR2AO68JQ
BS 607 627 RR2FO73JQ
BS 628 628 RR2AO68JQ
BS 629 640 RR2FO73JQ
BS 641 854 RR2AO68JQ
BS 855 954 RR2CE07TF
BS 955 958 RR2AO68TF

RD RR2FO73JQ 640 0 0
ATCCAATTTGGTTTGATCCCATACTTAGCCAACCAATGTTGTGAAACTCAACTCCAATTT
CCGGGTAAGAACAAGTACAAGAAAGCAACACAATGTCTGGACTAAAAAAATGCAAACTAC
TTGAGGAAAGTACAAGAAAGAAACAAAAAGACATAAGCAACCAGTGACGTTAGGAGCTCC
AGTGTCCATGTCGGGTTAATGAAAGCCGTCGGTATCATGGGAATGACTAGCGAACCGCAA
AACCACCCCGCCGTTAACGCACCAATCCCGATCAAGAAAGCTCTCCCTAAGCTCTTGGTC
TTCTCATTCAGGAAATATATGCAAGCAGCCAACGACACCGCCACCTGAAAAGCAGGACAG
CCTTCAGCTGAGTTCATGATACTCCAACCACCCATGAAGGCAAAAAGAAACAGCCTTCTG
AACACAGTATCCATCGGAGGCATCTCGACGAAATCAAAAAGAGCCTTGAGCCACGGAGGA
GACTCCTCGACTCTCTTCTTCAACCTCGTCTTGAGGTTGATCTTAGTCTTCTTCCTCGCC
ACGAAACTAGACATGAGAAGCTTCTCGAACGCCCCTTCTATAGACTCTCGGCTCCTCTCG
TGGTCGGCGTACTGCTCCAAGAGGAAGCTGCGAGAGGCCC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2GD92JQ 600 0 0
GC
GAAACTCAACTCCAATTTCCGGGTAAGAACAAGTACAAGAAAGCAACACAATGTCTGGAC
TAAAAAAA*GCAAACTACTTGAGGAAAGTACAAGAAAGAAACAAAAAGACATAAGCAACC
AGTGACGTTAGGAGCTCCAGTGTCCATGTCGGGTTAATGAAAGCCGTCGGTATCATGGGA
ATGACTAGCGAACCGCAGAACCACCCGGCCATTAATGCACCAATCCCGATCAAGAAAGCT
CTCCCTAAGCTCTTCGTCTTCTCATTCAGGAAATATATGCAAGCAGCCAACGACACCGCC
ACCTGAAAGGCAGGGCCGCCTTCAGCTGAGTTCATGATACTCCAACCACCCATGAAAGCA
AAAAGGAAGAGCCTTCTGAACACAGTATCCATCGGAGGCATCTCAACGAAATCAAAAAGA
GCCTTGAGCCACGGAGGAAACTCCTCGACTCTCTTCTTCAACCTCGTCTTGAGGTTGATC
TTAGTCTTCTTCCTCGCCACGAAACTAGACATGAGAAGCTTCTCGAATGCTCCCTCTATA
GACTCTCGGCTCCTCTCGTGGTCAGCGTACTGCTCCAAGAGGAAGTTGCGAGAGGCCC

QA 3 600 3 600
DS 

RD RR2AO68JQ 817 0 0
GCTGT
GAAACTCAACTCCAATTTCCGAGTAAGAACAAGTACAAGAAAGCAACACAATGTCTGGAC
TAAAAAAA*GCAAACTACTTGAGGAAAGTACAAGAAAGAAACAAAAAGACATAAGCAACC
AGTGACGTTAGGAGCTCCAGTGTCCATGTCGGGTTAATGAAAGCCGTCGGTATCATGGGA
ATGACTAGCGAACCGCAGAACCACCCGGCCATTAATGCACCAATCCCGATCAAGAAAGCT
CTCCCTAAGCTCTTCGTCTTCTCATTCAGGAAATATATGCAAGCAGCCAACGACACCGCC
ACCTGAAAGGCAGGACCGCCTTCAGCTGAGTTCATGATACTCCAACCACCCATGAAAGCA
AAAAGGAAGAGCCTTCTGAACACAGTATCCATCGGAGGCATCTCAACGAAATCAAAAAGA
GCCTTGAGCCACGGAGGAGACTCCTCGACTCTCTTCTTCAACCTCGTCTCGAGGTTGATC
TTAGTCTTCTTCCTCGCCACGAAACTAGACATGAGAAGCTTCTCGAATGCTCCCTCTATA
GACTCTCGGCTCCTCTCGTGGTCAGCGTACTGCTCCAAGAGGAAGTTGCGAGAGGCCCAG
ATCTCTTCCTCGGAAGCGTAGGGGCTGATCCCTAGGCGCTTGTACGGGTCCCAGACTCTG
GTCCGAGGGAACGTGGGGACGTTGCCTCCGTAGGGAGAATCAGCGGAGGAGGAGGGGCAC
CTAGGGGCTTTGAAGGTTCTCCGAGGTAGTGACAGTGATTGATTTTGATTCCGTAAGAGA
GAAAGCTTTGTTGACAGCTTTGATGGAGCGAT

QA 6 817 6 817
DS 

RD RR2CE07TF 667 0 0
GCTCTTCGTCTTCTCATTCAGGAAATATATGCAAGCAGCCAACGACACCGCCACCTGAAA
GGCAGGACCGCCTTCAGCTGAGTTCATGATACTCCAACCACCCATGAAAGCAAAAAGGAA
GAGCCTTCTGAACACAGTATCCATCGGAGGCATCTCAACGAAATCAAAAAGAGCCTTGAG
CCACGGAGGAGACTCCTCGACTCTCTTCTTCAACCTCGTCTTGAGGTTGATCTTAGTCTT
CTTCCTCGCCACGAAACTAGACATGAGAAGCTTCTCGAATGCTCCCTCTATAGACTCTCG
GCTCCTCTCGTGGTCAGCGTACTGCTCCAAGAGGAAGTTGCGAGAGGCCCAGATCTCTTC
CTCGGAAGCGTAGGGGCTGATCCCTAGGCGCTTGTACGGGTCCCAGACTCTGGTCCGAGG
GAACGTGGGGACGTTGCCTCCGTAGGGAGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGCACCTAGGGGC
TTTGAAGGTTCTCCGAGGTAGTGACAGTGATTGATTTTGATTCAGTAAGAGAGAAAGCTT
TGTTGACAGCTTTGATGGAGCGATGAAGGGAGAAGATACTGTAGAGCCAGAGAGAAGAAG
GGACGTCGACATGGCTCCTCCTCCGTCGGTCTAACCGACGCCGTTTTCTTCTTTCAACTT
ATCC
TCC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2AO68TF 610 0 0
AAGGCAGGACCGCCTTCAGCTGAGTTCATGATACTCCAACCACCCATGAAAGCAAAAAGG
AAGAGCCTTCTGAACACAGTATCCATCGGAGGCATCTCAACGAAATCAAAAAGAGCCTTG
AGCCACGGAGGAGACTCCTCGACTCTCTTCTTCAACCTCGTCTCGAGGTTGATCTTAGTC
TTCTTCCTCGCCACGAAACTAGACATGAGAAGCTTCTCGAATGCTCCCTCTATAGACTCT
CGGCTCCTCTCGTGGTCAGCGTACTGCTCCAAGAGGAAGTTGCGAGAGGCCCAGATCTCT
TCCTCGGAAGCGTAGGGGCTGATCCCTAGGCGCTTGTACGGGTCCCAGACTCTGGTCCGA
GGGAACGTGGGGACGTTGCCTCCGTAGGGAGAATCAGCGGAGGAGGAGGGGCACCTAGGG
GCTTTGAAGGTTCTCCGAGGTAGTGACAGTGATTGATTTTGATTCCGTAAGAGAGAAAGC
TTTGTTGACAGCTTTGATGGAGCGATGAAGGGAGAAGATACTGTAGAGCCAGAGAGAAGA
AGGGACGTCGACATGGCTCCTCCTCCGTCGGTCTAACCGACGCCGTTTTCTTCTTTCAAC
TTATCCTCAC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2GD92TF 610 0 0
AAGGCAGGGCCGCTTTCAGCTGAGTTCATGATACTCCAACCACCCATGAAAGCAAAAAGG
AAGAGCCTTCTGAACACAGTATCCATCGGAGGCATCTCAACGAAATCAAAAAGAGCCTTG
AGCCACGGAGGAGACTCCTCGACTCTCTTCTTCAACCTCGTCTTGAGGTTGATCTTAGTC
TTCTTCCTCGCCACGAAACTAGACATGAGAAGCTTCTCGAATGCTCCCTCTATAGACTCT
CGGCTCCTCTCGTGGTCAGCGTACTGCTCCAAGAGGAAGTTGCGAGAGGCCCAGATCTCT
TCCTCGGAAGCGTAGGGGCTGATCCCTAGGCGCTTGTACGGGTCCCAGACTCTGGTCCGA
GGGAACGTGGGGACGTTGCCTCCGTAGGGAGAATCAGCGGAGGAGGAGGAGCACCTAGGG
GCTTTGAAGGTTCTCCGAGGTAGTGACAGTGATTGATTTTGATTCCGTAAGAGAGAAAGC
TTTGTTGACAGCTTTGATGGAGCGATGAAGGGAGAAGATACTGTAGAGCCAGAGAGAAGA
AGGGACGTCGACATGGTTCCTCCTCCGTCGGTCTAACCGACGCCGTTTTCTTCTTTCAAC
TTATCC
CTCC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 8

CO CL672Contig1 1075 8 16 U
GATATACAAACACACACACACACACACTTATAGGCAACGATGACAGAAGCTAGGCATAGG
AAATGGCATAAGTTTCAGACCAAGGATGAATTGTCGGTAGCAATGGCTAAGTACACTGCC
CATCTCTCGGAGAAGTTCTGTAAGGAGAAAGGCATTTTCACTGTTGTTCTCTCCGGCGGT
GGCCTCATCGACTGGCTCTGCAAGTTGTTGGAACCTCCCTACATAGATTCAGTCGAATGG
TCAAAGTGGCACGTCTTTTGGGTCGACGAGAGGGTTTGTTCATATGAAGATCCAGACAGC
AACTACAAACTCGCCATGGATGGTTTTCTCTCCAAGGTTGGGATTCCGAATGAGAACATC
TATGCAATCGACAAGCACTCTGCCGCTGATGGTAACGCGGAGCACTGCGCGGCGCTCTAC
GAGGAGTGTTTGAGGAACCTAGTGAAGCGAGACATAATCCCACTATGTCCAAATGGCAAG
TATCCTCAGTTCGATCTCCAGCTTCTAGGGATGGGTCCTGATGGCCACATGGCGTCTCTC
TTCCCGGGACATCCTCAGATCAATGTCAAGGACAAATGGGTAACTCACATTACCGACTCT
CCTAAACTGCCACCAAGGAGAATCACATTCACTTTACCGGTCATCAACTCAGCTTTGTAC
AATCTTATGGCCGTTTGCGACGACAACACAGAGCAATGTGCACGCTCCATCGCTGATATC
TTTAAGCACAACAATCTTGCTTTACCTGCTGCTCATCTTACTGCCCAAGTCGAAACTATG
TGGTACCTTGACAAAGCAGCTGCATCATTGCTTTAGAGAGCCAACACACATTAAATAGTG
TGTCCTTTACAGTAGCAATAATAATCTCTCCTGTCATGCTTTGTGGAGCTTGTTGTTGGA
GTTTGCTTGCATGTGTGTTAAATAAACGGCTAATAATGCATTTTGCGTATTTACTATACG
TACCAAAATGTATTGAAAGGCCGATTTGTTGTTTATGTCTATTTATGTATCTTGTGTTTG
AGTCACAGGCTATGAGCCTGTGGTATAATAATAATAAGTTCTTTCGAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D396TF U 2
AF RR2EP19TF U 1
AF RR2EC17TF U 61
AF RR2D569JQ C 417
AF RR2H785JQB C 569
AF RR2H785TF U 569
AF RR2D569TF U 417
AF RR2D396JQ C 422
BS 1 72 RR2EP19TF
BS 73 73 RR2D396TF
BS 74 651 RR2EP19TF
BS 652 652 RR2D396TF
BS 653 685 RR2EP19TF
BS 686 686 RR2EC17TF
BS 687 765 RR2EP19TF
BS 766 766 RR2D396TF
BS 767 767 RR2EP19TF
BS 768 768 RR2EC17TF
BS 769 808 RR2EP19TF
BS 809 823 RR2EC17TF
BS 824 824 RR2H785TF
BS 825 857 RR2EC17TF
BS 858 1062 RR2H785TF
BS 1063 1075 RR2D569TF

RD RR2D396TF 766 0 0
GGATATACAA
ACACACACACACACACTTATAGGCAACGATGACAGAAGCTAGGCATAGGAAATGGCATAA
GTTTCAGACCAAGGATGAATTGTCGGTAGCAATGGCTAAGTACACTGCCCATCTCTCGGA
GAAGTTCTGTAAGGAGAAAGGCATTTTCACTGTTGTTCTCTCCGGCGGTGGCCTCATCGA
CTGGCTCTGCAAGTTGTTGGAACCTCCCTACATAGATTCAGTCGAATGGTCAAAGTGGCA
CGTCTTTTGGGTCGACGAGAGGGTTTGTTCATATGAAGATCCAGACAGCAACTACAAACT
CGCCATGGATGGTTTTCTCTCCAAGGTTGGGATTCCGAATGAGAACATCTATGCAATCGA
CAAACACTCTGCCGCTGATGGTAACGCGGAGCACTGCGCGGCGCTCTACGAGGAGTGTTT
GAGGAACCTAGTGAAGCGAGACATAATCCCACTATGTCCAAATGGCAAGTATCCTCAGTT
CGATCTCCAGCTTCTAGGGATGGGTCCTGATGGCCACATGGCGTCTCTCTTCCCGGGACA
TCCTCAGATCAATGTCAAGGACAAATGGGTAACTCACATTACCGACTCTCCTAAACTGCC
ACCAAGGAGAATCACATTCACTTTACCGGTCATCAACTCAGCTTTGTACAATCTTATGGC
CGTTTGCGACGACA*CACAGAGCAATGTGCACGCTCCATCGCTGATATCTTTAAGCACAA
CAATCTTGCTTTACCTGCTGCTCATCTTACTGCCCA

QA 11 766 11 766
DS 

RD RR2EP19TF 808 0 0
GATATACAAACACACACACACACACACTTATAGGCAACGATGACAGAAGCTAGGCATAGG
AAATGGCATAAGCTTCAGACCAAGGATGAATTGTCGGTAGCAATGGCTAAGTACACTGCC
CATCTCTCGGAGAAGTTCTGTAAGGAGAAAGGCATTTTCACTGTTGTTCTCTCCGGCGGT
GGCCTCATCGACTGGCTCTGCAAGTTGTTGGAACCTCCCTACATAGATTCAGTCGAATGG
TCAAAGTGGCACGTCTTTTGGGTCGACGAGAGGGTTTGTTCATATGAAGATCCAGACAGC
AACTACAAACTCGCCATGGATGGTTTTCTCTCCAAGGTTGGGATTCCGAATGAGAACATC
TATGCAATCGACAAGCACTCTGCCGCTGATGGTAACGCGGAGCACTGCGCGGCGCTCTAC
GAGGAGTGTTTGAGGAACCTAGTGAAGCGAGACATAATCCCACTATGTCCAAATGGCAAG
TATCCTCAGTTCGATCTCCAGCTTCTAGGGATGGGTCCTGATGGCCACATGGCGTCTCTC
TTCCCGGGACATCCTCAGATCAATGTCAAGGACAAATGGGTAACTCACATTACCGACTCT
CCTAAACTGCCACCAAGGAGAATCACATTCACTTTACCGGTCATCAACTCATCTTTGTAC
AATCTTATGGCCGTTTGCGACGACA*CACAGAGCAATGTGCACGCTCCATCGCTGATATC
TTTAAGCACAACAATCTTGCTTTACCTGCTGCTCATCTTACTGCCAA*GTCGAAACTATG
TGGTACCTTGACAAAGCAGCTGCATCAT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2EC17TF 813 0 0
GG
ATGGCATAAGTTTCAGACCAAGGACGAATTGTCGGTAGCAATGGCTAAGTACACTGCCCA
TCTCTCGGAGAAGTTCTGTAAGGAGAAAGGCATTTTCACTGTTGTTCTCTCCGGCGGTGG
CCTCATCGACTGGCTCTGCAAGTTGTTGGAACCTCCCTACATAGATTCAGTCGAATGTTC
AAAGTGGCACGTCTTTTGGGTCGACGAGAGGGTTTGTTCATATGAAGATCCAGACAGCAA
CTACAAACTCGCCATGGATGGTTTTCTCTCCAAGGTTGGGATTCCGAATGAGAACATCTA
TGCAATCGACAAGCACTCTGCCGCTGATGGTAACGCGGAGCACTGCGCGGCGCTCTACGA
GGAGTGTTTGAGGAACCTAGTGAAGCGAGACATAATCCCACTATGTCCAAATGGCAAGTA
TCCTCAGTTCGATCTCCAGCTTCTAGGGATGGGTCCTGATGGCCACATGGCGTCTCTCTT
CCCGGGACATCCTCAGATCAATGTCAAGGACAAATGGGTAACTCACATTACCGACTCTCC
TAAACTGCCACCAAGGAGAATCACATTCACTTTACCGGTCATCAACTCAGCTTTGTACAA
TCTTATGGCCGTTTGCGACGACAACACAGAGCAATGTGCACGCTCCATCGCTGATATCTT
TAAGCACAACAATCTTGCTTTACCTGCTGCTCATCTTACTGCCCAAGTCGAAACTATGTG
GTACCTTGACAAAGCAGCTGCATCATTGCTTTAGAGAGCCA*CACACATTAAATAGTGTG
TCCTTTACAGTAGCA
TATATCTCTCTGTCAT

QA 3 797 3 797
DS 

RD RR2D569JQ 650 0 0
G
TACGAGGAGTGTTTGAGGAACCTAGTGAAGCGAGACATAATCCCACTATGTCCAAATGGC
AAGTATCCTCAGTTCGATCTCCAGCTTCTAGGGATGGGTCCTGATGGCCACATGGCGTCT
CTCTTCCCGGGACATCCTCAGATCAATGTCAAGGACAAATGGGTAACTCACATTACCGAC
TCTCCTAAACTGCCACCAAGGAGAATCACATTCACTTTACCGGTCATCAACTCAGCTTTG
TACAATCTTATGGCCGTTTGCGACGACAACACAGAGCAATGTGCACGCTCCATCGCTGAT
ATCTTTAAGCACAACAATCTTGCTTTACCTGCTGCTCATCTTACTGCCCAAGTCGAAACT
ATGTGGTACCTTGACAAAGCAGCTGCATCATTGCTTTAGAGAGCCAACACACATTAAATA
GTGTGTCCTTTACAGTAGCAATAATAATCTCTCCTGTCATGCTTTGTGGAGCTTGTTGTT
GGAGTTTGCTTGCATGTGTGTTAAATAAACGGCTAATAATGCATTTTGCGTATTTACTAT
ACGTACCAAAATGTATTGAAAGGCCGATTTGTTGTTTATGTCTATTTATGTATCTTGTGT
TTGAGTCACAGGCTATGAGCCTGTGGTATAATAATAATAAGTTCTTTCG

QA 2 650 2 650
DS 

RD RR2H785JQB 498 0 0
G
GGACAAATGGGTAACTCACATTACCGACTCTCCTAAACTGCCACCAAGGAGAATCACATT
CACTTTACCGGTCATCAACTCATCTTTGTACAATCTTATGGCCGTTTGGGACGACAACAC
AGAGCAATGTGCACGCTCCATCGCTGATATCTTTAAGCACAACAAGCTTGCCTTACCTGC
TGCTCATCTTACTGCCCAAGTCGAAACTATGTGGTACCTTGACAAAGCAGCTGCATCATT
GCTTTAGAGAGCCAACACACATTAAATAGTGTGTCCTTTACAGTAGCAATAATAATCTCT
CCTGTCATGCTTTGTGGAGCTTGTTGTTGGAGTTTGCTTGCATGTGTGTTAAATAAACGG
CTAATAATGCATTTTGCGTATTTACTATACGTACCAAAATGTATTGAAAGGCCGATTTGT
TGTTTATGTCTATTTATGTATCTTGTGTTTGAGTCACAGGCTATGAGCCTGTGGTATAAT
AATAATAAGTTCTTTCG

QA 2 498 2 498
DS 

RD RR2H785TF 494 0 0
G
GGACAAATGGGTAACTCACATTACCGACTCTCCTAAACTGCCACCAAGGAGAATCACATT
CACTTTACCGGTCATCAACTCATCTTTGTACAATCTTATGGCCGTTTGCGACGACAACAC
AGAGCAATGTGCACGCTCCATCGCTGATATCTTTAAGCACAACAAGCTTGCCTTACCTGC
TGCTCATCTTACTGCCCAAGTCGAAACTATGTGGTACCTTGACAAAGCAGCTGCATCATT
GCTTTAGAGAGCCAACACACATTAAATAGTGTGTCCTTTACAGTAGCAATAATAATCTCT
CCTGTCATGCTTTGTGGAGCTTGTTGTTGGAGTTTGCTTGCATGTGTGTTAAATAAACGG
CTAATAATGCATTTTGCGTATTTACTATACGTACCAAAATGTATTGAAAGGCCGATTTGT
TGTTTATGTCTATTTATGTATCTTGTGTTTGAGTCACAGGCTATGAGCCTGTGGTATAAT
AATAATAAGTTCT

QA 2 494 2 494
DS 

RD RR2D569TF 659 0 0
G
TACGAGGAGTGTTTGAGGAACCTAGTGAAGCGAGACATAATCCCACTATGTCCAAATGGC
AAGTATCCTCAGTTCGATCTCCAGCTTCTAGGGATGGGTCCTGATGGCCACATGGCGTCT
CTCTTCCCGGGACATCCTCAGATCAATGTCAAGGACAAATGGGTAACTCACATTACCGAC
TCTCCTAAACTGCCACCAAGGAGAATCACATTCACTTTACCGGTCATCAACTCAGCTTTG
TACAATCTTATGGCCGTTTGCGACGACAACACAGAGCAATGTGCACGCTCCATCGCTGAT
ATCTTTAAGCACAACAATCTTGCTTTACCTGCTGCTCATCTTACTGCCCAAGTCGAAACT
ATGTGGTACCTTGACAAAGCAGCTGCATCATTGCTTTAGAGAGCCAACACACATTAAATA
GTGTGTCCTTTACAGTAGCAATAATAATCTCTCCTGTCATGCTTTGTGGAGCTTGTTGTT
GGAGTTTGCTTGCATGTGTGTTAAATAAACGGCTAATAATGCATTTTGCGTATTTACTAT
ACGTACCAAAATGTATTGAAAGGCCGATTTGTTGTTTATGTCTATTTATGTATCTTGTGT
TTGAGTCACAGGCTATGAGCCTGTGGTATAATAATAATAAGTTCTTTCGAAAAAAAAA

QA 2 659 2 659
DS 

RD RR2D396JQ 645 0 0
AGGAGTGTTTGAGGAACCTAGTGAAGCGAGACATAATCCCACTATGTCCAAATGGCAAGT
ATCCTCAGTTCGATCTCCAGCTTCTAGGGATGGGTCCTGATGGCCACATGGCGTCTCTCT
TCCCGGGACATCCTCAGATCAATGTCAAGGACAAATGGGTAACTCACATTACCGACTCTC
CTAAACTGCCACCAAGGAGAATCACATTCACTTTACCGGTCATCAACTCAGCTTTGTACA
ATTTTATGGCCGTTTGCGACGACAACACAGAGCAATGTGCACGCTCCATCGCTGATATCT
TTAAGCACAACAATCTTGCTTTACCTGCTGCTCATCTTACTGCCCAAGTCGAAACTATGT
GGTACCTTGACAAAGCAGCTGCATCATTGCTTTAGAGAGCCAACACACATTAAATAGTGT
GTCCTTTACAGTAGCAATAATAATCTCTCCTGTCATGCTTTGTGGAGCTTGTTGTTGGAG
TTTGCTTGCATGTGTGTTAAATAAACGGCTAATAATGCATTTTGCGTATTTACTATACGT
ACCAAAATGTATTGAAAGGCCGATTTGTTGTTTATGTCTATTTATGTATCTTGTGTT*GA
GTCACAGGCTATGAGCCTGTGGTATAATAATAATAAGTTCTTTCG

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 9

CO CL673Contig1 792 9 11 U
GGGATCAAAAGTCTCAACATTTACGCCCAAATCGGCGAGAGAGAGAGAGAGCACAATGGA
AGGATGGGATCCGAGCACCAAATCGACCCTAACGCGAATCCCTCTTCTAACCACAAAGGC
GGGACCACGAGACGGCGACGCATGGAAACAGAGGCTGAAAGAAGAGTACAAATCTCTGAT
CGCGTACACACAGATGAACAAGTCCAACGACAACGACTGGTTCCGCATCTCCGCCTCCAA
TCCCGAAGGCACCCGCTGGACTGGCAAGTGCTGGTACGTTCACAACCTCCTCAAGTACGA
GTTCGATCTCCAGTTCGATATCCCCATCACGTACCCCGCCACTGCTCCCGAGCTTGAGTT
GCCTGAGATTGACGGCAAAACACAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGATTTGCTTGACTGT
GCATTTCAAGCCGCTCTGGGCTAAAAACTGCCCTAGGTTTGGTATAGCGCATGCACTTTG
TTTGGGGCTAGCTCCGTGGCTTGCTGCAGAAATTCCGATTCTTGTGGACTCGGGCATGAT
TAAGCACAAAGATGACGCAGCCTCATCTGCGGAATCTTAGTCTGTTTAACCTGTTTATCA
ATCTCAGAGTGAGGTGTTTATGTTTAATCAGTAATAGCTGAACTCAGAAATGATTAAGGT
GGATGCGTCTACCCTGTAAAACATTTACATGAAACCAAATAAAGATTTAAGCTATTGCAA
TCTTTTTGGTCGAATACTTGTACAACTTGAGAATGTATGATGTTCTTTCTTACTTTGGAA
CTGGTTTCTTGC


BQ
10 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 15 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C289TF U -3
AF RR2C661TF U 1
AF RR2BO36TF U 2
AF RR2C661JQ C 1
AF RR2A095JQ C -3
AF RR2A095TF U -3
AF RR2CT91TF U 47
AF RR2CT91JQ C 47
AF RR2BO36JQ C 2
BS 1 1 RR2C661JQ
BS 2 2 RR2C661TF
BS 3 49 RR2C289TF
BS 50 51 RR2C661TF
BS 52 294 RR2C289TF
BS 295 295 RR2A095TF
BS 296 304 RR2C289TF
BS 305 305 RR2A095TF
BS 306 654 RR2C289TF
BS 655 720 RR2A095TF
BS 721 792 RR2BO36JQ

RD RR2C289TF 658 0 0
GGAATC
GATCAAAAGTCTCAACATTTACGCCCAAATCGGCGAGAGAGAGAGAG**CACAATGGAAG
GATGGGATCCGAGCACCAAATCGACCCTAACGCGAATCCCTCTTCTAACCACAAAGGCGG
GACCACGAGACGGCGACGCATGGAAACAGAGGCTGAAAGAAGAGTACAAATCTCTGATCG
CGTACACACAGATGAACAAGTCCAACGACAACGACTGGTTCCGCATCTCCGCCTCCAATC
CCGAAGGCACCCGCTGGACTGGCAAGTGCTGGTACGTTCACAACCTCCTCAA*TACGAGT
TCAATCTCCAGTTCGATATCCCCATCACGTACCCCGCCACTGCTCCCGAGCTTGAGTTGC
CTGAGATTGACGGCAAAACACAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGATTTGCTTGACTGTGC
ATTTCAAGCCGCTCTGGGCTAAAAACTGCCCTAGGTTTGGTATAGCGCATGCACTTTGTT
TGGGGCTAGCTCCGTGGCTTGCTGCAGAAATTCCGATTCTTGTGGACTCGGGCATGATTA
AGCACAAAGATGACGCAGCCTCATCTGCGGAATCTTAGTCTGTTTAACCTGTTTATCAAT
CTCAGAGTGAGGTGTTTATGTTTAATCAGTAATAGCTGAACTCAGAAATGAT

QA 7 658 7 658
DS 

RD RR2C661TF 655 0 0
G
GGATCAAAAGTCTCAACATTTACGCCCAAATCGGCGAGAGAGAGAGAGAGCACAATGGAA
GGATGGGATCCGAGCACCAAATCGACCCTAACGCGAATCCCTCTTCTAACCACAAAGGCG
GGACCACGAGACGGCGACGCATGGAAACAGAGGCTGAAAGAAGAGTACAAATCTCTGATC
GCGTACACACAGATGAACAAGTCCAACGACAACGACTGGTTCCGCATCTCCGCCTCCAAT
CCCGAAGGCACCCGCTGGACTGGCAAGTGCTGGTACGTTCACAACCTCCTCAAGTACGAG
TTCGATCTCCAGTTCGATATCCCCATCACGTACCCCGCCACTGCTCCCGAGCTTGAGTTG
CCTGAGATTGACGGCAAAACACAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGATTTGCTTGACTGTG
CATTTCAAGCCGCTCTGGGCTAAAAACTGCCCTAGGTTTGGTATAGCGCATGCACTTTGT
TTGGGGCTAGCTCCGTGGCTTGCTGCAGAAATTCCGATTCTTGTGGACCCGGGCATGATT
AAGCACAAAGATGACGCAGCCTCATCTGCGGAATCTTAGTCTGTTTAACCTGTTTATCAA
TCTCAGAGTGAGGTGTTTATGTTTAATCAGTAATAGCTGAACTCAGAAATGATT

QA 2 655 2 655
DS 

RD RR2BO36TF 641 0 0
GGATCAAAAGTCTCAACATTTACGCCCAAATCGGCGAGAGAGAGAGAGAGCACAATGGAA
GGATGGGATCCGAGCACCAAATCGACCCTAACGCGAATCCCTCTTCTAACCACAAAGGCG
GGACCACGAGACGGCGACGCATGGAAACAGAGGCTGAAAGAAGAGTACAAATCTCTGATC
GCGTACACACAGATGAACAAGTCCAACGACAACGACTGGTTCCGCATCTCCGCCTCCAAT
CCCGAAGGCACCCGCTGGACTGGCAAGTGCTGGTACGTTCACAACCTCCTCAAGTACGAG
TTCGATCTCCAGTTCGATATCCCCATCACGTACCCCGTCACTGCTCCCGAGCTTGAGTTG
CCTGAGATTGACGGCAAAACACAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGATTTGCTTGACTGTG
CTTTTCAAGCCGCTCTGGGCTAAAAACTGCCCTAGGTTTGGTATAGCGCATGCACTTTGT
TTGGGGCTAGCTCCGTGGCTTGCTGCAGAAATTCCGATTCTTGTGGACTCGGGCATGATT
AAGCACAAAGATGACGCAGCCTCATCTGCGGAATCTTAGTCTGTTTAACCTGTTTATCAA
TCTCAGAGTGAGGTGTTTATGTTTAATCAGTAATAGCTGAA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2C661JQ 724 0 0
GGGATCAAAAGTCTCAACATTTACGCCCAAATCGGCGAGAGAGAGAGAGAGCACAATGGA
AGGATGGGATCCGAGCACCAAATCGACCCTAACGCGAATCCCTCTTCTAACCACAAAGGC
GGGACCACGAGACGGCGACGCATGGAAACAGAGGCTGAAAGAAGAGTACAAATCTCTGAT
CGCGTACACACAGATGAACAAGTCCAACGACAACGACTGGTTCCGCATCTCCGCCTCCAA
TCCCGAAGGCACCCGCTGGACTGGCAAGTGCTGGTACGTTCACAACCTCCTCAAGTACGA
GTTCGATCTCCAGTTCGATATCCCCATCACGTACCCCGCCACTGCTCCCGAGCTTGAGTT
GCCTGAGATTGACGGCAAAACACAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGATTTGCTTGACTGT
GCATTTCAAGCCGCTCTGGGCTAAAAACTGCCCTAGGTTTGGTATAGCGCATGCACTTTG
TTTGGGGCTAGCTCCGTGGCTTGCTGCAGAAATTCCGATTCTTGTGGACCCGGGCATGAT
TAAGCACAAAGATGACGCAGCCTCATCTGCGGAATCTTAGTCTGTTTAACCTGTTTATCA
ATCTCAGAGTGAGGTGTTTATGTTTAATCAGTAATAGCTGAACTCAGAAATGATTAAGGT
GGATGCGTCTACCCTGTAAAACATTTACATGAAACCAAATAAAGATTTAAGCTATTGCAA
TCTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2A095JQ 726 0 0
GGAATC
GATCAAAAGTCTCAACATTTACGCCCAAATCGGCGAGAGAGAGAGAG**CACAATGGAAG
GATGGGATCCGAGCACCAAATCGACCCTAACGCGAATCCCTCTTCTAACCACAAAG****
*********ACGGCGACGCATGGAAACAGAGGCTGAAAGAAGAGTACAAATCTCTGATCG
CGTACACACAGATGAACAAGTCCAACGATAACGACTGGTTCCGCATCTCCGCCTCCAATC
CCGAAGGCACCCGCTGGACTGGCAAGTGCTGGTACGTTCACAACCTCCTCAAGTACGAGT
TCGATCTCCAGTTCGATATCCCCATCACGTACCCCGCCACTGCTCCCGAGCTTGAGTTGC
CTGAGATTGACGGCAAAACACAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGATTTGCTTGACTGTGC
ATTTCAAGCCGCTCTGGGCTAAAAACTGCCCTAGGTTTGGTATAGCGCATGCACTTTGTT
TGGGGCTAGCTCCGTGGCTTGCTGCAGAAATTCCGATTCTTGTGGACTCGGGCATGATTA
AGCACAAAGATGACGCAGCCTCATCTGCGGAATCTTAGTCTGTTTAACCTGTTTATCAAT
CTCAGAGTGAGGTGTTTATGTTTAATCAGTAATAGCTGAACTCAGAAATGATTAAGGTGG
ATGCGTCTACCCTGTAAAACATTTACATGAAACCAAATAAAGATTTAAGCTATTGCAA
CC

QA 7 724 7 724
DS 

RD RR2A095TF 726 0 0
GGAATC
GATCAAAAGTCTCAACATTTACGCCCAAATCGGCGAGAGAGAGAGAG**CACAATGGAAG
GATGGGATCCGAGCACCAAATCGACCCTAACGCGAATCCCTCTTCTAACCACAAAG****
*********ACGGCGACGCATGGAAACAGAGGCTGAAAGAAGAGTACAAATCTCTGATCG
CGTACACACAGATGAACAAGTCCAACGATAACGACTGGTTCCGCATCTCCGCCTCCAATC
CCGAAGGCACCCGCTGGACTGGCAAGTGCTGGTACGTTCACAACCTCCTCAAGTACGAGT
TCGATCTCCAGTTCGATATCCCCATCACGTACCCCGCCACTGCTCCCGAGCTTGAGTTGC
CTGAGATTGACGGCAAAACACAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGATTTGCTTGACTGTGC
ATTTCAAGCCGCTCTGGGCTAAAAACTGCCCTAGGTTTGGTATAGCGCATGCACTTTGTT
TGGGGCTAGCTCCGTGGCTTGCTGCAGAAATTCCGATTCTTGTGGACTCGGGCATGATTA
AGCACAAAGATGACGCAGCCTCATCTGCGGAATCTTAGTCTGTTTAACCTGTTTATCAAT
CTCAGAGTGAGGTGTTTATGTTTAATCAGTAATAGCTGAACTCAGAAATGATTAAGGTGG
ATGCGTCTACCCTGTAAAACATTTACATGAAACCAAATAAAGATTTAAGCTATTGCAA
CC

QA 7 724 7 724
DS 

RD RR2CT91TF 677 0 0
GG
GAGCACAATGGAAGGATGGGATCCGAGCACCAAATCGACCCTAACGCGAATCCCTCTTCT
AACCACAAAGGCGGGACCACGAGACGGCGACGCATGGAAACAGAGGCTGAAAGAAGAGTA
CAAATCTCTGATCGCGTACACACAGATGAACAAGTCCAACGACAACGACTGGTTCCGCAT
CTCCGCCTCCAATCCCGAAGGCACCCGCTGGACTGGCAAGTGCTGGTACGTTCACAACCT
CCTCAAGTACGAGTTCGATCTCCAGTTCGATATCCCCATCACGTACCCCGCCACTGCTCC
CGAGCTTGAGTTGCCTGAGATTGACGGCAAAACACAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGAT
TTGCTTGACTGTGCATTTCAAGCCGCTCTGGGCTAAAAACTGCCCTAGGTTTGGTATAGC
GCATGCACTTTGTTTGGGGCTAGCTCCGTGGCTTGCTGCAGAAATTCCGATTCTTGTGGA
CTCGGGCATGATTAAGCACAAAGATGACGCAGCCTCATCTGCGGAATCTTAGTCTGTTTA
ACCTGTTTATCAATCTCAGAGTGAGGTGTTTATGTTTAATCAGTAATAGCTGAACTCAGA
AATGATTAAAGTGGATGCGTCTACCCTGTAAAACATTTACATGAAACCAAATAAAGATTT
AAGCTATTGCAA
AAA

QA 3 674 3 674
DS 

RD RR2CT91JQ 672 0 0
GG
GAGCACAATGGAAGGATGGGATCCGAGCACCAAATCGACCCTAACGCGAATCCCTCTTCT
AACCACAAAGGCGGGACCACGAGACGGCGACGCATGGAAACAGAGGCTGAAAGAAGAGTA
CAAATCTCTGATCGCGTACACACAGATGAACAAGTCCAACGACAACGACTGGTTCCGCAT
CTCCGCCTCCAATCCCGAAGGCACCCGCTGGACTGGCAAGTGCTGGTACGTTCACAACCT
CCTCAAGTACGAGTTCGATCTCCAGTTCGATATCCCCATCACGTACCCCGCCACTGCTCC
CGAGCTTGAGTTGCCTGAGATTGACGGCAAAACACAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGAT
TTGCTTGACTGTGCATTTCAAGCCGCTCTGGGCTAAAAACTGCCCTAGGTTTGGTATAGC
GCATGCACTTTGTTTGGGGCTAGCTCCGTGGCTTGCTGCAGAAATTCCGATTCTTGTGGA
CTCGGGCATGATTAAGCACAAAGATGACGCAGCCTCATCTGCGGAATCTTAGTCTGTTTA
ACCTGTTTATCAATCTCAGAGTGAGGTGTTTATGTTTAATCAGTAATAGCTGAACTCAGA
AATGATTAAGGTGGATGCGTCTACCCTGTAAAACATTTACATGAAACCAAATAAAGATTT
AAGCTATTGC

QA 3 672 3 672
DS 

RD RR2BO36JQ 791 0 0
GGATCAAAAGTCTCAACATTTACGCCCAAATCGGCGAGAGAGAGAGAGAGCACAATGGAA
GGATGGGATCCGAGCACCAAATCGACCCTAACGCGAATCCCTCTTCTAACCACAAAGGCG
GGACCACGAGACGGCGACGCATGGAAACAGAGGCTGAAAGAAGAGTACAAATCTCTGATC
GCGTACACACAGATGAACAAGTCCAACGACAACGACTGGTTCCGCATCTCCGCCTCCAAT
CCCGAAGGCACCCGCTGGACTGGCAAGTGCTGGTACGTTCACAACCTCCTCAAGTACGAG
TTCGATCTCCAGTTCGATATCCCCATCACGTACCCCGTCACTGCTCCCGAGCTTGAGTTG
CCTGAGATTGACGGCAAAACACAAAAGATGTATCGAGGTGGGAAGATTTGCTTGACTGTG
CTTTTCAAGCCGCTCTGGGCTAAAAACTGCCCTAGGTTTGGTATAGCGCATGCACTTTGT
TTGGGGCTAGCTCCGTGGCTTGCTGCAGAAATTCCGATTCTTGTGGACTCGGGCATGATT
AAGCACAAAGATGACGCAGCCTCATCTGCGGAATCTTAGTCTGTTTAACCTGTTTATCAA
TCTCAGAGTGAGGTGTTTATGTTTAATCAGTAATAGCTGAACTCAGAAATGATTAAGGTG
GATGCGTCTACCCTGTAAAACATTTACATGAAACCAAATAAAGATTTAAGCTATTGCAAT
CTTTTTGGTCGAATACTTGTACAACTTGAGAATGTATGATGTTCTTTCTTACTTTGGAAC
TGGTTTCTTGC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 9

CO CL674Contig1 592 9 7 U
GGAAAGACAACTAAGAACAGAAACTGCTAGAGTTTTTTTAAAAATTGAAAAACAGATCGC
CAAGAAAATTAAAGTTTATCACGTAAGAGGCGAAGAAAATGACGAGCATTGTGATGACTA
CATTGCCTCAGTTTAATGGTCTTCGTGCCAGCAAGATCTCTGCAGCTCCTGTTCAAGGCC
TGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGCAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGGTG
ACTTTATTGGTTCATCAACAAATTTGATAATGGTAACGTCGACAACCCTGATGTTGTTCG
CGGGAAGATTCGGACTTGCACCATCAGCGAATAGAAAAGCAACCGCCGGACTTAAGTTGG
AGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGAGACCCAGCCGGGTTCACGCTCGCTGACACGT
TGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGAGTAGGAGTTGTCCTTGGCCTCAAAAACA
TTGGTGCTATTTAAAACTTCTTTTATTGTGTATTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACA
AAATTCTCAAGAAACTGAGGGAGAGATCTAAATAAATCTTTAAGTGTCTTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2H845TF U 1
AF RR2H845JQ C 1
AF RR2BQ38TF U 33
AF RR2CF09JQ C 33
AF RR2BD07JQ C 40
AF RR2BD07TF U 40
AF RR2DL28TF U 33
AF RR2DD28TF U 33
AF RR2CF09TF U 33
BS 1 32 RR2H845TF
BS 33 90 RR2BQ38TF
BS 91 91 RR2H845TF
BS 92 449 RR2BQ38TF
BS 450 450 RR2H845TF
BS 451 571 RR2BQ38TF
BS 572 592 RR2CF09TF

RD RR2H845TF 540 0 0
GGAAAGACAACTAAGAACAGAAACTGCTAGAGTTTTTTTAAAAATTGAAAAACAGATCGC
CAAGAAAATTAAAGTTTATCACGTAAGAGGCGAAGAAAATGACGAGCATTGTGATGACTA
CATTGCCTCAGTTTAATGGTCTTCGTGCCAGCAAGATCTCTGCAGCTCCTGTTCAAGGCC
TGGCAGCTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGCAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGGTG
ACTTTATTGGTTCATCAACAAATTTTATAATGGTAACGTCGACAACCCTGATGTTGTTCG
CGGGAAGATTCGGACTTGCACCATCAGCGAATAGAAAAGCAACCGCCGGACTTAAGTTGG
AGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGAGACTCAGCCGGGTTCACGCTCGCTGACACGT
TGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGAGTAGGAGTTGTCCTTGGCCTCAAAAACA
TTGGTGCTATTTAAAACTTCTTTTATTGTGTATTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACA

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2H845JQ 592 0 0
GGAAAGACAACTAAGAACAGAAACTGCTAGAGTTTTTTTAAAAATTGAAAAACAGATCGC
CAAGAAAATTAAAGTTTATCACGTAAGAGGCGAAGAAAATGACGAGCATTGTGATGACTA
CATTGCCTCAGTTTAATGGTCTTCGTGCCAGCAAGATCTCTGCAGCTCCTGTTCAAGGCC
TGGCAGCTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGCAAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGGTG
ACTTTATTGGTTCATCAACAAATTTTATAATGGTAACGTCGACAACCCTGATGTTGTTCG
CGGGAAGATTCGGACTTGCACCATCAGCGAATAGAAAAGCAACCGCCGGACTTAAGTTGG
AGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGAGACTCAGCCGGGTTCACGCTCGCTGACACGT
TGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGAGTAGGAGTTGTCCTTGGCCTCAAAAACA
TTGGTGCTATTTAAAACTTCTTTTATTGTGTATTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACA
AAATTCTCAAGAAACTGAGGGAGAGATCTAAATAAATCTTTAAGTGTCTTAT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2BQ38TF 539 0 0
TTTTTTTAAAAATTGAAAAACAGATCGCCAAGAAAATTAAAGTTTATCACGTAAGAGGGG
AAGAAAATGACGAGCATTGTGATGACTACATTGCCTCAGTTTAATGGTCTTCGTGCCAGC
AAGATCTCTGCAGCTCCTGTTCAAGGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGCA
AATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGGTGACTTTATTGGTTCATCAACAAATTTGATAATG
GTAACGTCGACAACCCTGATGTTGTTCGCGGGAAGATTCGGACTTGCACCATCAGCGAAT
AGAAAAGCAACCGCCGGACTTAAGTTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGAGAC
CCAGCCGGGTTCACGCTCGCTGACACGTTGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCAGA
GTAGGAGTTGTCCTTGGCCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTCTTTTATTGTGTA
TTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAGAAACTGAGGGAGAGATCTAA

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2CF09JQ 560 0 0
TTTTTTTAAAAATTGAAAAACAGATCGCCAAGAAAATTAAAGTTTATCACGTAAGAGGCG
AAGAAAATGACGAGCATTGTGATGACTACATTGCCTCAGTTTAATGGTCTTCGTGCCAGC
AAGATCTCTGCAGCTCCTGTTCAAGGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGCA
AATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGGTGACTTTATTGGTTCATCAACAAATTTGATAATG
GTAACGTCGACAACCCTGATGTTGTTCGCGGGAAGATTCGGACTTGCACCATCAGCGAAT
AGAAAATCAACCGCCGGACTTAAGTTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGAGAC
CCAGCCGGGTTCACGCTCGCTGACACGTTGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGA
GTAGGAGTTGTCCTTGGCCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTCTTTTATTGTGTA
TTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAGAAACTGAGGGAGAGATCTAAA
TAAATCTTTAAGTGTCTTAT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2BD07JQ 512 0 0
AAAAATTGAAAAACAGATCGCCAAGAAAATTAAAGTTTATCACGTAAGAGGCGAAGAAAA
TGACGAGCATTGTGATGACTACATTGCCTCAGTTTAATGGTCTTCGTGCCAGCAAGATCT
CTGCAGCTCCTGTTCAAGGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGCAAATGGAG
CTTTGGGTGCAAAGTGTGGCGACTTTATTGGTTCATCAACAAATTTGATAATGGTAACGT
CGACAACCCTGATGTTGTTCGCGGGAAGATTCGGACTTGCACCATCAGCGAATAGAAAAG
CAACCGCCGGACTTAAGTTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGAGACCCAGCCG
GGTTCACGCTCGCTGACACGTTGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGAGTAGGAG
TTGTCCTTGGCCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTCTTTTATTGTGTATTTGTAA
CCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAG

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2BD07TF 512 0 0
AAAAATTGAAAAACAGATCGCCAAGAAAATTAAAGTTTATCACGTAAGAGGCGAAGAAAA
TGACGAGCATTGTGATGACTACATTGCCTCAGTTTAATGGTCTTCGTGCCAGCAAGATCT
CTGCAGCTCCTGTTCAAGGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGCAAATGGAG
CTTTGGGTGCAAAGTGTGGCGACTTTATTGGTTCATCAACAAATTTGATAATGGTAACGT
CGACAACCCTGATGTTGTTCGCGGGAAGATTCGGACTTGCACCATCAGCGAATAGAAAAG
CAACCGCCGGACTTAAGTTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGAGACCCAGCCG
GGTTCACGCTCGCTGACACGTTGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGAGTAGGAG
TTGTCCTTGGCCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTCTTTTATTGTGTATTTGTAA
CCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAG

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2DL28TF 537 0 0
TTTTTTTAAAAATTGAAAAACAGATCGCCAAGAAAATTAAAGTTTATCACGTAAGAGGCG
AAGAAAATGACGAGCATTGTGATGACTACATTGCCTCAGTTTAATGGTCTTCGTGCCAGC
AAGATCTCTGCAGCTCCTGTTCAAGGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGCA
AATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGGTGACTTTATTGGTTCATCAACAAATTTGATAATG
GTAACGTCGACAACCCTGATGTTGTTCGCGGGAAGATTCGGACTTGCACCATCAGCGAAT
AGAAAAGCAACCGCCGGACTTAAGTTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGAGAC
*CAGCCGGGTTCACGCTCGCTGACACGTTGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGA
GTAGGAGTTGTCCTTGGCCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTCTTTTATTGTGTA
TTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAGAAACTGAGGGAGAGATCT

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2DD28TF 539 0 0
TTTTTTTAAAAATTGAAAAACAGATCGCCAAGAAAATTAAAGTTTATCACGTAAGAGGCG
AAGAAAATGACGAGCATTGTGATGACTACATTGCCTCAGTTTAATGGTCTTCGTGCCAGC
AAGATCTCTGCAGCTCCTGTTCAAGGCCTGGCAACTGTTCAGCCCACGAGACGCAAGGCA
AATGGAGCTTTGTGTGCAAAGTGTGGTGACTTTATTGGTTCATCAACAAATTTGATAATG
GTAACGTCGACAACCCTGATGTTGTTCGCGGGAAGATTCGGACTTGCACCATCAGCGAAT
AGAAAAGCAACCGCCGGACTTAAGTTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGAGAC
CCAGCCGGGTTCACGCTCGCTGACACGTTGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGA
GTAGGAGTTGTCCTTGGCCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTCTTTTATTGTGTA
TTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAGAAACTGAGGGAGAGATCTAA

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2CF09TF 560 0 0
TTTTTTTAAAAATTGAAAAACAGATCGCCAAGAAAATTAAAGTTTATCACGTAAGAGGCG
AAGAAAATGACGAGCATTGTGATGACTACATTGCCTCAGTTTAATGGTCTTCGTGCCAGC
AAGATCTCTGCAGCTCCTGTTCAAGGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGCAAGGCA
AATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGGTGACTTTATTGGTTCATCAACAAATTTGATAATG
GTAACGTCGACAACCCTGATGTTGTTCGCGGGAAGATTCGGACTTGCACCATCAGCGAAT
AGAAAATCAACCGCCGGACTTAAGTTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGAGAC
CCAGCCGGGTTCACGCTCGCTGACACGTTGGCTTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGGA
GTAGGAGTTGTCCTTGGCCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAACTTCTTTTATTGTGTA
TTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAGAAACTGAGGGAGAGATCTAAA
TAAATCTTTAAGTGTCTTAT

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 9

CO CL675Contig1 659 9 3 U
GGCCCAAAAGACAGATCTCAAAAACAAAAAACACAGAAAAA*CAGAGAGATGGGTTTGGT
TACAGATGAAGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACACAGGGGATGAGTTATGCCGTGAGAA
GACGAAGGTGTTCCTCAAGGAAGTCAATATGCCTAATGGGTTATTGCCATTGAAGGACAT
AGAAGAGGTTGGATACGACAGAGAAACAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGAAGAGCAT
CACTCACAAGTTTGAAACTATTGGGAAACTTGTCTCTTACGGCACTGAGGTCACTGCTGT
TGTGGAAGTTGGAAAGATCAAGAAGCTGACCGGTGTTAAGGCCAAAGAGCTTCTTATTTG
GGTCACTCTCAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAACAAGTTCAGGTAAGATCAATTTCAG
GACACCGACTGGTCTCTCCAGGACTTTTCCAGTTTCAGCTTTTGTGGTTCCTGAGGTTGA
GAAGCCTGCAATGGTGAAGAACAATGCAACCACTGAAGTTAAAGAGGCTGTTGCAGTCAG
CGATGCTTAGTTACTTAAGCCGCACTCTCTATTTTTAATTATCTTAATCACGTAATACTT
TCTGCTTCCACTGCTTAATTTTCTACATTAATAAGAGTTATGATTCCACTTTAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 
55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 15 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 15 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL09TF U 1
AF RR2CE64JQ C 26
AF RR2CE64TF U 26
AF RR2FN67TF U 4
AF RR2G835JQ C 55
AF RR2CV12JQ C 4
AF RR2CV12TF U 4
AF RR2G835TF U 2
AF RR2GL09JQ C 3
BS 1 142 RR2GL09TF
BS 143 143 RR2CE64TF
BS 144 659 RR2GL09TF

RD RR2GL09TF 659 0 0
GGCCCAAAAGACAGATCTCAAAAACAAAAAACACAGAAAAA*CAGAGAGATGGGTTTGGT
TACAGATGAAGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACACAGGGGATGAGTTATGCCGTGAGAA
GACGAAGGTGTTCCTCAAGGAATTCAATATGCCTAATGGGTTATTGCCATTGAAGGACAT
AGAAGAGGTTGGATACGACAGAGAAACAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGAAGAGCAT
CACTCACAAGTTTGAAACTATTGGGAAACTTGTCTCTTACGGCACTGAGGTCACTGCTGT
TGTGGAAGTTGGAAAGATCAAGAAGCTGACCGGTGTTAAGGCCAAAGAGCTTCTTATTTG
GGTCACTCTCAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAACAAGTTCAGGTAAGATCAATTTCAG
GACACCGACTGGTCTCTCCAGGACTTTTCCAGTTTCAGCTTTTGTGGTTCCTGAGGTTGA
GAAGCCTGCAATGGTGAAGAACAATGCAACCACTGAAGTTAAAGAGGCTGTTGCAGTCAG
CGATGCTTAGTTACTTAAGCCGCACTCTCTATTTTTAATTATCTTAATCACGTAATACTT
TCTGCTTCCACTGCTTAATTTTCTACATTAATAAGAGTTATGATTCCACTTTAAAAAAA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2CE64JQ 625 0 0
GGAAACACAGA
AAAAA*CAGAGAGATGGGTTTGGTTACAGATGAAGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACAC
AGGGGATGAGTTATGCCGTGAGAAGACGAAGGTGTTCCTCAAGGAAGTCAATATGCCTAA
TGGGTTATTGCCATTGAAGGACATAGAAGAGGTTGGATACGACAGAGAAACAGGTGTTGT
GTGGCTGAAGCAGAAGAAGAGCATCACTCACAAGTTTGAAACTATTGGGAAACTTGTTTC
TTACGGCACCGAGGTCACTGCTGTGGTGGAAGTCGGAAAGATCAAGAAGCTGACCGGTGT
TAAGGCCAAAGAGCTTTTTATTTGGGTCACTCTCAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAAC
AAGTTCAGGTAAGATCAATTTCAGGACACCGACTGGTCTCTCCAGGACTTTTCCAGTTTC
AGCTTTTGTGGTTCCTGAGGTTGAGAAGCCTACAATGGTGAAGAACAATGCAACCACTGA
AGTTAAAGAGGCTGTTGCAGTCAGCGATGCTTAGTTACTTAAGCCGCACTCTCTATTTTT
AATTATCTTAATCACGTAATACTTTCTGCTTCTGCTGCTTAATTTTCTACATTAATAAGA
GTTATGATTCCACT

QA 12 625 12 625
DS 

RD RR2CE64TF 625 0 0
GGAAACACAGA
AAAAA*CAGAGAGATGGGTTTGGTTACAGATGAAGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACAC
AGGGGATGAGTTATGCCGTGAGAAGACGAAGGTGTTCCTCAAGGAAGTCAATATGCCTAA
TGGGTTATTGCCATTGAAGGACATAGAAGAGGTTGGATACGACAGAGAAACAGGTGTTGT
GTGGCTGAAGCAGAAGAAGAGCATCACTCACAAGTTTGAAACTATTGGGAAACTTGTCTC
TTACGGCACCGAGGTCACTGCTGTGGTGGAAGTCGGAAAGATCAAGAAGCTGACCGGTGT
TAAGGCCAAAGAGCTTCTTATTTGGGTCACTCTCAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAAC
AAGTTCAGGTAAGATCAATTTCAGGACACCGACTGGTCTCTCCAGGACTTTTCCAGTTTC
AGCTTTTGTGGTTCCTGAGGTTGAGAAGCCTACAATGGTGAAGAACAATGCAACCACTGA
AGTTAAAGAGGCTGTTGCAGTCAGCGATGCTTAGTTACTTAAGCCGCACTCTCTATTTTT
AATTATCTTAATCACGTAATACTTTCTGCTTCTGCTGCTTAATTTTCTACATTAATAAGA
GTTATGATTCCACT

QA 12 625 12 625
DS 

RD RR2FN67TF 644 0 0
GGAAAG
GACAGATCTCAAAAACAAAAAACACAGAAAAAACAGAGAGATGGGTTTGGTTACAGATGA
AGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACACGGGGGATGAGTTATGCCGTGAGAAGACGAAGGT
GTTCCTCAAGGAAGTCAATATGCCTAATGGGTTATTGCCATTGAAGGACATAGAAGAGGT
TGGATACGACAGAGAAACAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGAAGAGCATCACTCACAA
GTTTGAAACTATTGGGAAACTTGTCTCTTACGGCACCGAGGTCACTGCTGTGGTGGAAGT
CGGAAAGATCAAGAAGCTGACCGGTGTTAAGGCCAAAGAGCTTCTTATTTGGGTCACTCT
CAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAACAAGTTCAGGTAAGATCAATTTCAGGACACCGAC
TGGTCTCTCCAGGACTTTTCCAGTTTCAGCTTTTGTGGTTCCTGAGGTTGAGAAGCCTAC
GATGGTGAAGAACAATGCAACCACTGAAGTTAAAGAGGCTGTTGCAGTCAGCGATGCTTA
GTTACTTAAGCCGCACTCTCTATTTTTAATTATCTTAATCACGTAATACTTTCTGCTTCT
GCTGCTTAATTT*CTACATTAATAAGAGTTATGATTCC

QA 7 644 7 644
DS 

RD RR2G835JQ 596 0 0
TTTGGTTACAGATGAAGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACACAGGGGATGAGTTATGCCG
TGAGAAGACGAAGGTGTTCCTCAAGGAAGTCAATATGCCTAATGGGTTATTGCCATTGAA
GGACATAGAAGAGGTTGGATACGACAGAGAAACAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGAA
GAGCATCACTCACAAGTTTGAAACTATTGGGAAACTTGTCTCTTACGGCACTGAGGTCAC
TGCTGTTGTGGAAGTTGGAAAGATCAAGAAGCTGACCGGTGTTAAGGCCAAAGAGCTTCT
TATTTGGGTCACTCTCAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAACAAGTTCAGGTAAGATCAA
TTTCAGGACACCGACTGGTCTCTCCAGGACTTTTCCAGTTTCAGCTTTTGTGGTTCCTGA
GGTTGAGAAGCCTGCAATGGTGAAGAACAATGCAACCACTGAAGTTAAAGAGGCTGTTGC
AGTCAGCGATGCTTAGTTACTTAAGCCGCACTCTCTATTTTTAATTATCTTAATCACGTA
ATACTTTCTGCTTCCACTGCTTAATTTTCTACATTAATAAGAGTTATGATTCCACT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2CV12JQ 649 0 0
GG
AAAAGACAGATCTCAAAAACAAAAAACACAGAAAAA*CAGAGAGATGGGTTTGGTTACAG
ATGAAGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACACAGGGGATGAGTTATGCCGTGAGAAGACGA
AGGTGTTCCTCAAGGAAGTCAATATGCCTAATGGGTTATTGCCATTGAAGGACATAGAAG
AGGTTGGATACGACAGAGAAACAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGAAGAGCATCACTC
ACAAGTTTGAAACTATTGGGAAACTTGTCTCTTACGGCACTGAGGTCACTGCTGTTGTGG
AAGTTGGAAAGATCAAGAAGCTGACCGGTGTTAAGGCCAAAGAGCTTCTTATTTGGGTCA
CTCTCAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAACAAGTTCAGGTAAGATCAATTTCAGGACAC
CGACTGGTCTCTCCAGGACTCTTCCAGTTTCAGCTTTTGTGGTTCCTGAGGTTGAGAAGC
CTGCAATGGTGAAGAACAATGCAACCACTGAAGTTAAAGAGGCTGTTGCAGTCAGCGATG
CTTAGTTACTTAAGCCGCACTCTCTATTTTTAATTATCTTAATCACGTAATACTTTCTGC
TTCCACTGCTTAATTTTCTACATTAATAAGAGTTATGATTCCACT
AG

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR2CV12TF 649 0 0
GG
AAAAGACAGATCTCAAAAACAAAAAACACAGAAAAA*CAGAGAGATGGGTTTGGTTACAG
ATGAAGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACACAGGGGATGAGTTATGCCGTGAGAAGACGA
AGGTGTTCCTCAAGGAAGTCAATATGCCTAATGGGTTATTGCCATTGAAGGACATAGAAG
AGGTTGGATACGACAGAGAAACAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGAAGAGCATCACTC
ACAAGTTTGAAACTATTGGGAAACTTGTCTCTTACGGCACTGAGGTCACTGCTGTTGTGG
AAGTTGGAAAGATCAAGAAGCTGACCGGTGTTAAGGCCAAAGAGCTTCTTATTTGGGTCA
CTCTCAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAACAAGTTCAGGTAAGATCAATTTCAGGACAC
CGACTGGTCTCTCCAGGACTCTTCCAGTTTCAGCTTTTGTGGTTCCTGAGGTTGAGAAGC
CTGCAATGGTGAAGAACAATGCAACCACTGAAGTTAAAGAGGCTGTTGCAGTCAGCGATG
CTTAGTTACTTAAGCCGCACTCTCTATTTTTAATTATCTTAATCACGTAATACTTTCTGC
TTCCACTGCTTAATTTTCTACATTAATAAGAGTTATGATTCCACT
AG

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR2G835TF 649 0 0
GGCC
AAAAGACAGATCTCAAAAACAAAAAACACAGAAAAA*CAGAGAGATGGGTTTGGTTACAG
ATGAAGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACACAGGGGATGAGTTATGCCGTGAGAAGACGA
AGGTGTTCCTCAAGGAAGTCAATATGCCTAATGGGTTATTGCCATTGAAGGACATAGAAG
AGGTTGGATACGACAGAGAAACAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGAAGAGCATCACTC
ACAAGTTTGAAACTATTGGGAAACTTGTCTCTTACGGCACTGAGGTCACTGCTGTTGTGG
AAGTTGGAAAGATCAAGAAGCTGACCGGTGTTAAGGCCAAAGAGCTTCTTATTTGGGTCA
CTCTCAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAACAAGTTCAGGTAAGATCAATTTCAGGACAC
CGACTGGTCTCTCCAGGACTTTTCCAGTTTCAGCTTTTGTGGTTCCTGAGGTTGAGAAGC
CTGCAATGGTGAAGAACAATGCAACCACTGAAGTTAAAGAGGCTGTTGCAGTCAGCGATG
CTTAGTTACTTAAGCCGCACTCTCTATTTTTAATTATCTTAATCACGTAATACTTTCTGC
TTCCACTGCTTAATTTTCTACATTAATAAGAGTTATGATTCCACT

QA 5 649 5 649
DS 

RD RR2GL09JQ 650 0 0
CCC
AAAAGACAGATCTCAAAAACAAAAAACACAGAAAAA*CAGAGAGATGGGTTTGGTTACAG
ATGAAGTGAGAGCTAGGGCAGAGAAATACACAGGGGATGAGTTATGCCGTGAGAAGACGA
AGGTGTTCCTCAAGGAATTCAATATGCCTAATGGGTTATTGCCATTGAAGGACATAGAAG
AGGTTGGATACGACAGAGAAACAGGTGTTGTGTGGCTGAAGCAGAAGAAGAGCATCACTC
ACAAGTTTGAAACTATTGGGAAACTTGTTTCTTACGGCACTGAGGTCACTGCTGTTGTGG
AAGTTGGAAAGATCAAGAAGCTGACCGGTGTTAAGGCCAAAGAGCTTCTTATTTGGGTCA
CTCTCAATGAGCTTGTCTTGGAGCAGCCAACAAGTTCAGGTAAGATCAATTTCAGGACAC
CGACTGGTCTCTCCAGGACTTTTCCAGTTTCAGCTTTTGTGGTTCCTGAGGTTGAGAAGC
CTGCAATGGTGAAGAACAATGCAACCACTGAAGTTAAAGAGGCTGTTGCAGTCAGCGATG
CTTAGTTACTTAAGCCGCACTCTCTATTTTTAATTATCTTAATCACGTAATACTTTCTGC
TTCCACTGCTTAATTTTCTACATTAATAAGAGTTATGATTCCACT
TT

QA 4 648 4 648
DS 



AS 2 9

CO CL676Contig1 538 3 3 U
GACTCCTGAACAAGTTGCCTCCTACACCCTTAAGCTCCTCCGCAACAGGATCCCTCCTGC
CGTCCCCGGAATCATGTTCTTGTCCGGAGGACAGTCAGAGTTGGAGGCAACTTTGAACCT
GAACGCGATGAACCAGGCACCAAACCCATGGCACGTGTCCTTCTCCTACGCACGTGCTCT
CCAGAACACTTGTCTGAAAACATGGGGAGGCAGAGCTGAGAACGTGAACGCAGCTCAGAC
CACTCTCTTGGCTCGTGTGAAGGCCAACTCTTTGGCTCAGCTCGGAAAATACACCGGAGA
AGGTGAGTCTGAAGACGCTAAGGAGGGTATGTTCGTCAAAGGCTACACCTACTGAAGTCA
ACAATGTTGAAGAAGAAGAGATCATGATGCTGTGAAAGGAGACTGAAACAAATGTTTTGA
TGGCATTTGTTTTTTGCGTTTGGTTGTTATTATCATGTCGAATCATTTACTTTCTCTACT
AAAATTTGTATTAGCTACTCCTTTTAATAAAAGCTTTAATATATTGAAGTTATCTACC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B008JQ C 1
AF RR2B008TF U 1
AF RR2C101TF U 129
BS 1 1 RR2B008JQ
BS 2 505 RR2B008TF
BS 506 538 RR2C101TF

RD RR2B008JQ 517 0 0
GACTCCTGAACAAGTTGCCTCCTACACCCTTAAGCTCCTCCGCAACAGGATCCCTCCTGC
CGTCCCCGGAATCATGTTCTTGTCCGGAGGACAGTCAGAGTTGGAGGCAACTTTGAACCT
GAACGCGATGAACCAGGCACCAAACCCATGGCACGTGTCCTTTTCCTACGCACGTGCTCT
CCAGAACACTTGTCTGAAAACATGGGGAGGCAGAGCTGAGAACGTGAACGCAGCTCAGAC
CACTCTCTTGGCTCGTGTGAAGGCCAACTCTTTGGCTCAGCTCGGAAAATACACCGGAGA
AGGTGAGTCTGAAGACGCTAAGGAGGGTATGTTCGTCAAAGGCTACACCTACTGAAGTCA
ACAATGTTGAAGAAGAAGAGATCATGATGCTGTGAAAGGAGACTGAAACAAATGTTTTGA
TGGCATTTGTTTTTTGCGTTTGGTTGTTATTATCATGTCGAATCATTTACTTTCTCTACT
AAAATTTGTATTAGCTACTCCTTTT
TAATAATAAAGC

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR2B008TF 517 0 0
G
ACTCCTGAACAAGTTGCCTCCTACACCCTTAAGCTCCTCCGCAACAGGATCCCTCCTGCC
GTCCCCGGAATCATGTTCTTGTCCGGAGGACAGTCAGAGTTGGAGGCAACTTTGAACCTG
AACGCGATGAACCAGGCACCAAACCCATGGCACGTGTCCTTCTCCTACGCACGTGCTCTC
CAGAACACTTGTCTGAAAACATGGGGAGGCAGAGCTGAGAACGTGAACGCAGCTCAGACC
ACTCTCTTGGCTCGTGTGAAGGCCAACTCTTTGGCTCAGCTCGGAAAATACACCGGAGAA
GGTGAGTCTGAAGACGCTAAGGAGGGTATGTTCGTCAAAGGCTACACCTACTGAAGTCAA
CAATGTTGAAGAAGAAGAGATCATGATGCTGTGAAAGGAGACTGAAACAAATGTTTTGAT
GGCATTTGTTTTTTGCGTTTGGTTGTTATTATCATGTCGAATCATTTACTTTCTCTACTA
AAATTTGTATTAGCTACTCCTTTT
TAATAATAAAGC

QA 2 505 2 505
DS 

RD RR2C101TF 410 0 0
TGAACCAGGCACCAAACCCATGGCACGTGTCCTTCTCCTACGCACGTGCTCTCCAGAACA
CTTGTCTGAAAACATGGGGAGGCAGAGCTGAGAACGTGAACGCAGCTCAGACTACTCTCT
TGGCTCGTGCCAAGGCCAACTCTTTGGCTCAGCTCGGAAAATACACCGGAGAAGGTGAAT
CTGAAGACGCTAAGGAGGGTATGTTCGTCAAAGGCTACACCTACTGAAGTCAACAATGTT
GAAGAAGAAGAGATCATGATGCTGTGAAAGGAGACTGAAACAAATGTTTTGATGGCATTT
GTTTTTTGCGTTTGGTTGTTATTATCATGTCGAATCATTTACTTTCTCTACTAAA*TTTG
TATTAGCTACTCCTTTTAATAAAAGCTTTAATATATTGAAGTTATCTACC

QA 1 410 1 410
DS 



CO CL676Contig2 1394 6 18 U
AGAGAGAAGAGAATAGAGATAACATTTAACAAAAAGATGGCATCAACCTCCCTCCTCAAG
GCATCCCCAGTGTTGGACAAATCTGAGTGGGTCAAGGGCCAAAGCGTTCTCTTCCGCCAG
CCATCTTCCGCCGCCGTTGTCCTACGCAACCGCGCCACCTCCCTTACCGTCCGTGCCTCT
TCTTCCTACGCCGATGAGCTTGTTAAGACAGCGAAAACAATTGCGTCTCCTGGACGCGGA
ATCTTGGCGATGGACGAGTCAAACGCGACTTGCGGGAAGCGTTTGGACTCGATAGGGCTA
GAGAACACTGAGGCAAACCGTCAAGCATACAGGACATTGCTGGTCTCTGCACCAGGACTC
GGACAGTACATCTCAGGTGCAATCCTGTTCGAGGAGACTCTGTATCAGTCTACCACCGAA
GGCAAGAAAATGGTCGACGTCCTCGTTGAGCAGAACATCGTCCCCGGTATCAAAGTCGAC
AAGGGTTTGGTGCCACTTGTTGGCTCTAACAATGAGTCATGGTGCCAAGGACTCGATGGT
CTATCCTCTCGAACCGCTGCTTACTACCAACAGGGTGCTCGTTTCGCCAAATGGCGTACT
GCTGTGAGCATTCCCAACGGTCCGTCTGCTCTCGCAGTGAAAGAAGCTGCCTGGGGACTT
GCTCGATACGCTGCCATTTCACAGGACAGTGGATTGGTTCCAATAGTGGAGCCAGAGATA
TTGTTGGACGGAGAACACGACATTGACAGGACTTACGAAGTGGCAGAGAAGGTTTGGGCT
GAGGTTTTCTTTTACCTTGCTCAGAACAATGTCATGTTTGAAGGTATCCTCCTGAAGCCG
AGCATGGTGACTCCCGGAGCCGAGTCTAAGGACAGAGCTACTCCTGAACAAGTTGCCTCC
TACACCCTTAAACTCCTCCGCAACAGAATCCCTCCAGCCGTCCCTGGAATCATGTTCTTG
TCCGGAGGACAGTTTGAGTTGGAGGCAACATTGAACCTGAACGCGATGAACCAGGCACCA
AACCCGTGGCACGTGTCCTTCTCCTACGCACGTGCTCTGCAGAACACTTGTCTGAAAACA
TGGGGAGGCAGAGCTGAGAACGTGAACGCAGCTCAAACCACTCTCTTGGCTCGAGCCAAG
GCCAATTCATTGGCTCAGCTCGGAAAATACACCGGAGAAGGTGAGTCTGATGGGGCTAAG
GAGGGTATGTTCGTCAAAGACTACACCTACTGAAGACAACAATGTTGAAGAGGAGGTCAA
CGAAGCAAATGTTTTACTTACATTTGTTTTTTGAGTTTGGTTGTGTTATTATCATATGTC
AAAA*CACTTATATTTTCTATGCTTAAATTTGCATTAGCTACTCCTTTTAATATATTGAA
GTTATCTTATCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2HB38TF U 1
AF RR2H637TF U 654
AF RR2A534TF U 329
AF RR2H637JQB C 833
AF RR2HB38JQ C 626
AF RR2A534JQ C 679
BS 1 416 RR2HB38TF
BS 417 417 RR2A534TF
BS 418 421 RR2HB38TF
BS 422 635 RR2A534TF
BS 636 636 RR2HB38JQ
BS 637 973 RR2A534TF
BS 974 974 RR2HB38JQ
BS 975 1136 RR2A534TF
BS 1137 1246 RR2HB38JQ
BS 1247 1247 RR2A534JQ
BS 1248 1249 RR2HB38JQ
BS 1250 1250 RR2A534JQ
BS 1251 1324 RR2HB38JQ
BS 1325 1325 RR2A534JQ
BS 1326 1339 RR2HB38JQ
BS 1340 1340 RR2A534JQ
BS 1341 1392 RR2HB38JQ
BS 1393 1394 RR2A534JQ

RD RR2HB38TF 421 0 0
AGAGAGAAGAGAATAGAGATAACATTTAACAAAAAGATGGCATCAACCTCCCTCCTCAAG
GCATCCCCAGTGTTGGACAAATCTGAGTGGGTCAAGGGCCAAAGCGTTCTCTTCCGCCAG
CCATCTTCCGCCGCCGTTGTCCTACGCAACCGCGCCACCTCCCTTACCGTCCGTGCCTCT
TCTTCCTACGCCGATGAGCTTGTTAAGACAGCGAAAACAATTGCGTCTCCTGGACGCGGA
ATCTTGGCGATGGACGAGTCAAACGCGACTTGCGGGAAGCGTTTGGACTCGATAGGGCTA
GAGAACACTGAGGCAAACCGTCAAGCATACAGGACATTGCTGGTCTCTGCACCAGGACTC
GGACAGTACATCTCAGGTGCAATCCTGTTCGAGGAGACTCTGTATCAGTCTACCACGGAA
G

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR2H637TF 261 0 0
GGGACTTGCTCGATACGCTGCCATTTCACAGGACAGTGGATTGGTTCCAATAGTGGAGCC
AGAGATATTGTTGGACGGAGAACACGACATTGACAGGACTTACGAAGTGGCAGAGAAGGT
TTGGGCTGAGGTTTTCTTTTACCTTGCTCAGAACAATGTCATGTTTGAAGGTATCCTCCT
GAAGCCGAGCATGGTGACTCCCGGAGCCGAGTCTAAGGACAGAGCTACTCCTGAACAAGT
TGCCTCCTACACCCTTAAACT

QA 1 261 1 261
DS 

RD RR2A534TF 808 0 0
G
CAGGACATTGCTGGTCTCTGCACCAGGACTCGGACAGTACATCTCAGGTGCAATCCTGTT
CGAGGAGACTCTGTATCAGTCTACCACCGAAGGCAAGAAAATGGTCGACGTCCTCGTTGA
GCAGAACATCGTCCCCGGTATCAAAGTCGACAAGGGTTTGGTGCCACTTGTTGGCTCTAA
CAATGAGTCATGGTGCCAAGGACTCGATGGTCTATCCTCTCGAACCGCTGCTTACTACCA
ACAGGGTGCTCGTTTCGCCAAATGGCGTACTGCTGTGAGCATTCCCAACGGTCCGTCTGC
TCTCGCTGTGAAAGAAGCTGCCTGGGGACTTGCTCGATACGCTGCCATTTCACAGGACAG
TGGATTGGTTCCAATAGTGGAGCCAGAGATATTGTTGGACGGAGAACACGACATTGACAG
GACTTACGAAGTGGCAGAGAAGGTTTGGGCTGAGGTTTTCTTTTACCTTGCTCAGAACAA
TGTCATGTTTGAAGGTATCCTCCTGAAGCCGAGCATGGTGACTCCCGGAGCCGAGTCTAA
GGACAGAGCTACTCCTGAACAAGTTGCCTCCTACACCCTTAAACTCCTCCGCAACAGAAT
CCCTCCAGCCGTCCCTGGAATCATGTTCTTGTCCGGAGGACAGTCTGAGTTGGAGGCAAC
ATTGAACCTGAACGCGATGAACCAGGCACCAAACCCGTGGCACGTGTCCTTCTCCTACGC
ACGTGCTCTGCAGAACACTTGTCTGAAAACATGGGGAGGCAGAGCTGAGAACGTGAACGC
AGCTCAAACCACTCTCTTGGCTCGAGC

QA 2 808 2 808
DS 

RD RR2H637JQB 538 0 0
TGAAGCCGAGCATGGTGACTCCCGGAGCCGAGTCTAAGGACAGAGCTACTCCTGAACAAG
TTGCCTCCTACACCCTTAAACTCCTCCGCAACAGAGTCCCTCCAGCCGTCCCTGGAATCA
TGTTCTTGTCCGGAGGACAGTTTGAGTTGGAGGCAACATTGAACCTGAACGCGATGAACC
AGGCACCAAACCCGTGGCACGTGTCCTTTTCCTACGCACGTGCTTTGCAGAACACTTGTT
TGAAAACATGGG*AGGCAGAGCTGAGAACGTGAACGCAGCTCAAACCACTCTCTTGGCTC
GAGCCAAGGCCAATTCATTGGCTCAGCTCGGAAAATACACCAGAGAAGGTGAGTTTGATG
GGGCTAAGGAGGGTATGTTCGTCAAAGGCTACACCTACTGAAGACAACAATGTTGAAGAG
GAGGTCAACGAAGCAAATGTTTTACTTACATTTGTTTTTTGAGTTTGGTTGTGTTATTAT
CATATGTCAAAA*CACTTATATTTTTTATGCTTAAATTTGCATTAGCTACTCCTTTT
G

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2HB38JQ 769 0 0
CTGCTCTCGCAGTGAAAGAAGCTGCTTGGGGACTTGCTCGATACGCTGCCATTTCACAAG
ACAGTGGATTGGTTCCAATAGTGGAGCCAGAGATATTGTTGGACGGAGAACACGACATTG
ACAGGACTTACGAAGTAGCAGAGAAGGTTTGGGCTGAGGTTTTCTTTTACCTTGCTCAGA
ACAATGTCATGTTTGAAGATATCCTCCTGAAGCCGAGCATGGTGACTCCCGGAGCCGAGT
CTAAGGACAGAGCTACTCCTGAACAAGTTGCCTCCTACACCCTTAAGCTCCTCCGCAACA
GAATCCCTCCAGCCGTCCCTGGAATCATGTTCTTGTCCGGAGGACAGTTTGAGTTGGAGG
CAACTTTGAACCTGAACGCGATGAACCAGGCACCAAACCCGTGGCACGTGTCCTTCTCCT
ACGCACGTGCTCTGCAGAACACTTGTCTGAAGACATGGGGAGGCAGAGCTGAGAACGTGA
ACGCAGCTCAGACCACTCTCTTGGCTCGAGCCAAGGCCAATTCATTGGCTCAGCTCGGAA
AATACACCGGAGAAGGTGAGTCTGATGGGGCTAAGGAGGGTATGTTCGTCAAAGACTACA
CCTACTGAAGACAACAATGTTAAAAAGGAGGTCAACGAAGCAAATGTTTTACTTACATTT
GTTTTTTGAGTTTGGTTGTGTTATTATCATATGTCAAAAACACTTATATTTTCTCTGCTT
AAATTTGCATTAGCTACTCCTTTTAATATATTGAAGTTATCTTATCT
CG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2A534JQ 716 0 0
TCACAGGACAGTGGATTGGTTCCAATAGTGGAGCCAGAGATATTGTTGGACGGAGAACAC
GACATTGACAGGACTTACGAAGTGGCAGAGAAGGTTTGGGCTGAGGTTTTCTTTTACCTT
GCTCAGAACAATGTCATGTTTGAAGGTATCCTCCTGAAGCCGAGCATGGTGACTCCCGGA
GCCGAGTCTAAGGACAGAGCTACTCCTGAACAAGTTGCCTCCTACACCCTTAAACTCCTC
CGCAACAGAATCCCTCCAGCCGTCCCTGGAATCATGTTCTTGTCCGGAGGACAGTTTGAG
TTGGAGGCAACATTGAACCTGAACGCGATGAACCAGGCACCAAACCCGTGGCACGTGTCC
TTTTCCTACGCACGTGCTCTGCAGAACACTTGTCTGAAAACATGGGGAGGCAGAGCTGAG
AACGTGAACGCAGCTCAAACCACTCTCTTGGCTCGAGCCAAGGCCAATTCATTGGCTCAG
CTCGGAAAATAC***GGAGAAGGTGAGTCTGATGGGGCTAAGGAGGGTATGTTCGTCAAA
GACTACACCTACTGAAGGCAACAATGTTGAAGAGGAGGTCAACGAAGCAAATGTTTTACT
TACATTTGTTTTTTGAGTTTGGTTGTGTTATTATCATATGTCAAAA*CACTTATATTTTC
TATGCTTAAATTTGCATTAGCTACTCCTTTTGATATATTGAAGTTATCTTATCTTT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 7

CO CL677Contig1 638 7 3 U
GGCTCTCGCTCCGTCAAGCCAAAAACCCTAAAGAGGAAGAAGAGTGTGAGCAGCCAAAAT
GGTGCAGCGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCAAATCGAACCAGCACAG
GATCCTCAAAACCCCTGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCTAGTGG
ACCAAAATGCCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGA
GTACAAGAGATCTAGGTTGTCAAGGAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGT
TTTGTCTGCTTTGGCTGTTAGAGAAAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTCGAGGAGCAAAA
GATAGTGAAGAAGGTGTTGAAGCTCCAAAAGGCTAAGGAAAAGGGTGCTCCCAAGAACTA
GATCCCTATATAACAT**TTGTGTACTCTCTCGTCTTCCAAATTCTTAAGCTTTTTGTAT
TCGTTTGTCTTGACTTTGTCGACGTTTCAGCAAATCTTGGGTTTTGATTTCTCGTTTAAA
TGTCTGGTTTAACAATATCACGTTTCTACTCTGCTTCTTTGGTGTTTAACAATTTGTTTT
ATATTACTACTCGGTTAATAAATTTTGCAATTCAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 5 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW45JQ C 43
AF RR2BL58TF U 1
AF RR2CW45TF U 43
AF RR2FS66TF U 84
AF RR2DW96JQ C 10
AF RR2C337JQ C 1
AF RR2C337TF U 1
BS 1 528 RR2BL58TF
BS 529 564 RR2FS66TF
BS 565 638 RR2C337TF

RD RR2CW45JQ 402 0 0
AGTGTGAGCAGCCAAAATGGTGCAGCGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCAC
CAAATCTAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCTGGTGGCAAATTGACATTCCAGACCAC
TAAGAAGCGTGCAAGTGGACCAAAATGCCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCC
TCACTTGGGGCCTGCTGAGTACAAGAGATCTCGATTGTCTAGGAACAGGAGGACCGTGAA
CCGTGCTTATGGTGGTGTTTTGTCTGCTTTGGCTGTTAAAGAAAGAATCGTTCGTGCTTT
CCTTGTGAAGGAGCAAAAGATAGTGAAGAAGGTGTTGAAGCTCCAAAAGGCTAAGGAAAA
GGGTGCTCCCAAGAACTAGATCC*TATATAACAT**TTGTGT

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR2BL58TF 528 0 0
GGCTCTCGCTCCGTCAAGCCAAAAACCCTAAAGAGGAAGAAGAGTGTGAGCAGCCAAAAT
GGTGCAGCGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCAAATCGAACCAGCACAG
GATCCTCAAAACCCCTGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCTAGTGG
ACCAAAATGCCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGA
GTACAAGAGATCTAGGTTGTCAAGGAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGT
TTTGTCTGCTTTGGCTGTTAGAGAAAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTCGAGGAGCAAAA
GATAGTGAAGAAGGTGTTGAAGCTCCAAAAGGCTAAGGAAAAGGGTGCTCCCAAGAACTA
GATCCCTATATAACAT**TTGTGTACTCTCTCGTCTTCCAAATTCTTAAGCTTTTTGTAT
TCGTTTGTCTTGACTTTGTCGACGTTTCAGCAAATCTTGGGTTTTGAT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2CW45TF 474 0 0
AGTGTGAGCAGCCAAAATGGTGCAGCGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCAC
CAAATCTAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCTGGTGGCAAATTGACATTCCAGACCAC
TAAGAAGCGTGCAAGTGGACCAAAATGCCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCC
TCACTTGGGGCCTGCTGAGTACAAGAGATCTCGATTGTCTAGGAACAGGAGGACCGTGAA
CCGTGCTTATGGTGGTGTTTTGTCTGCTTTGGCTGTTAAAGAAAGAATCGTTCGTGCTTT
CCTTGTGAAGGAGCAAAAGATAGTGAAGAAGGTGTTGAAGCTCCAAAAGGCTAAGGAAAA
GGGTGCTCCCAAGAACTAGATCC*TATATAACAT**TTGTGTACTCT*TCGTCTTCCAAA
TTCTGAAGCTTTTTGTATTCGTTTGTCTTGGCTTTGTCGACGTTTCAGCAAATC

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2FS66TF 481 0 0
G
GCGTCACAGCTACGCCACCAAATCGAATCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCTGGTGGTAA
ATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCTAGTGGACCAAAATGCCCCGTTACCGGCAA
GCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGATCTAGGTTGTCAAG
GAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTGTCTGCTTTGGCTGTTAGAGA
AAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTCGAGGAGCAAAAGATAGTGAAGAAGGTGTTGAAGCT
CCAAAAGGCTAAGGAAAAGGGTGCTCCCAAGAACTAGATCCCTATATAACAT**TTGTGT
ACTCTCTCGTCTTCCAAATTCTTAAGCTTTTTGTATTCGTTTGTCTTGACTTTGTCGACG
TTTCAGCAAATCTTGGGTTTTGATTTCTCGTTTAAATGTCTGGTTTAACAATATCACGTT

QA 2 481 2 481
DS 

RD RR2DW96JQ 578 0 0
CAGCCA
AAGCCAAAAACCCTAA*GAGGAAGAAGAGTGTGAGCAGCCAAAATGGTGCAGCGTCTTGT
ATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCAAATCTAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCC
TGGTGGCAAATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCTAGTGGACCAAAATGCCCCGT
TACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGATCTAG
GTTGTCAAGGAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTGTCTGCGTTGGC
TGTTAGAGAAAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTCGAGGAGCAAAAGATAGTGAAGAAGGT
GTTGAAGCTCCAAAAGGCTAAGGAAAAGGGTGCTCCCAAGAACTAGA*CTCTATATAACA
ACATTGTGTACTTT*TCGTCTTCCAAATTCTTAAGCTTTTTGTATTCGTTTGTCTTGACT
TTGTCGACGTTTCAGCAAATCTTGGGTTTTGTTTTCTCGTTTAAATGTCTGGTTTAACAA
TATCACGTTTCTACTCTGCTTCTTTGGTGTTT

QA 7 578 7 578
DS 

RD RR2C337JQ 618 0 0
GGCTCTCGCTCCGTC
AAGCCAAAAACCCTAAAGAGGAAGAAGAGTGTGAGCAGCCAAAATGGTGCAGCGTCTTGT
ATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCATCAAATCGAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCC
TGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCTAGTGGACCAAAATGCCCCGT
TACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGATCTAG
GTTGTCAAGGAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTGTCTGCTTTGGC
TGTTAGAGAAAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTCGAGGAGCAAAAGATAGTGAAGAAGGT
GTTGAAGCTCCAAAAGGCTAAGGAAAAGGGTGCTCCCAAGAACTAGATCCCTATATAACA
T**TTGTGTACTCTCTCGTCTTCCAAATTCTTAAGCTTTTTGTATTCGTTTGTCTTGACT
TTGTCGACGTTTCAGCAAATCTTGGGTTTTGATTTCTCGTTTAAATGTCTGGTTTAACAA
TATCACGTTTCTACTCTGCTTCTTTGGTGTTTAACAATTTGTTTTATATTACTACTCGGT
TAA

QA 16 618 16 618
DS 

RD RR2C337TF 638 0 0
GGCTCTCGCTCCGTC
AAGCCAAAAACCCTAAAGAGGAAGAAGAGTGTGAGCAGCCAAAATGGTGCAGCGTCTTGT
ATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCATCAAATCGAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCC
TGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCTAGTGGACCAAAATGCCCCGT
TACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGATCTAG
GTTGTCAAGGAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTGTCTGCTTTGGC
TGTTAGAGAAAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTCGAGGAGCAAAAGATAGTGAAGAAGGT
GTTGAAGCTCCAAAAGGCTAAGGAAAAGGGTGCTCCCAAGAACTAGATCCCTATATAACA
T**TTGTGTACTCTCTCGTCTTCCAAATTCTTAAGCTTTTTGTATTCGTTTGTCTTGACT
TTGTCGACGTTTCAGCAAATCTTGGGTTTTGATTTCTCGTTTAAATGTCTGGTTTAACAA
TATCACGTTTCTACTCTGCTTCTTTGGTGTTTAACAATTTGTTTTATATTACTACTCGGT
TAATAAATTTTGCAATTCAAAGC

QA 16 638 16 638
DS 



AS 1 9

CO CL678Contig1 916 9 16 U
GGGAAACACTATAGAGCTCCGCTCCCAGTAATGGCGGCGACATGGACTTCTTTTGTAACC
TCCTTTTGTATTTATTCACCTTCTAATAAACCGTCGTCCTCATCGTTGAGCAGTCTGTCT
TTCCGGAGGCAAACAGTGCTCAGAACGAACAGATTTCCCAGGATATATGCGTTGTCTAGC
AACGACATCAAAGTCGGGACAAACATAGAAGTCGATGGTGCTCCCTGGCGTGTTCTGGAG
TTTCTTCATGTGAAGCCAGGCAAAGGTGCTGCTTTTGTCAGAACCAAAATCAGGAATTAC
GTCAATGGTAGCACCGTCGAGAGAACCTTTCGTGCCGGAATTACTATGGAAGAGGCAAAT
GTCTTCAAGGAGACCAAGCAATTCACTTATAAAGACGCCTCTCAGTTTGTTTTCATGGAC
TTGAGCAGTTATGAGGAAACACGTTTAAACGAGGCCGATATGGGCGACAAGACCAAATGG
CTTAAAGAGGGAATGGACTGCAATTTACTCTACTGGAAGGACAAGGTCATCGATTTTGAA
CTTCCCATTACAGTTCAGCTTAAAATTGTTGACGTTGATCCTGGTCTCCGAGGTGACACT
GCACAAGGTGGAACAAAACCTGCCACCCTCGAGACTGGTGCAGTTGTCAATGTACCCCTC
TTTGTCAATGTTGGTGAAGATATCATGGTGGACACGAGAACCGGTACCTACATGAGCCGG
GTCTGACACATCTTCCTTATTGCTAACGACTAAGGGACGTGAGATTTAATGAGCGGTTTT
GGTTAAGAGTCTGATTAGTTGAGTGAATTTCTATTATGGAATATATTGATTTCTTTGTTG
GTCAGTTATTACTATACCTGAGTAGTAAATCCCCACTTTACTTTTACCTGTGAGATTCGA
TCACTATGCTTTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 20 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ71TF U 19
AF RR2EA86TF U 1
AF RR2GW19TF U 9
AF RR2EN10TF U 6
AF RR2B907TF U 9
AF RR2EA86JQ C 105
AF RR2EN10JQ C 130
AF RR2DZ71JQ C 637
AF RR2GW19JQ C 128
BS 1 455 RR2EA86TF
BS 456 456 RR2EN10TF
BS 457 495 RR2EA86TF
BS 496 496 RR2EN10TF
BS 497 667 RR2EA86TF
BS 668 668 RR2EN10TF
BS 669 745 RR2EA86TF
BS 746 746 RR2EN10TF
BS 747 755 RR2EA86TF
BS 756 756 RR2B907TF
BS 757 785 RR2EN10TF
BS 786 786 RR2B907TF
BS 787 795 RR2EN10TF
BS 796 820 RR2B907TF
BS 821 884 RR2EA86JQ
BS 885 916 RR2GW19JQ

RD RR2DZ71TF 290 0 0
GG
GCTCCCAGTAATGGCGGCGACATGGACTTCTTTTGTAACCTCCTTTTGTATTTATTCACC
TTCTAATAAACCGTCGTCCTCATCGTTGAGCAGTCTGTCTTTCCGGAGGCAAACAGTGCT
CAGAACGAACAGATTTCCCAGGATATATGCGTTGTCTAGCAACGACATCAAAGTCGGGAC
AAACATAGAAGTCGATGGTGCTCCCTGGCGTGTTCTGGAGTTTCTTCATGTGAAGCCAGG
CAAAGGTGCTGCTTTTGTCAGAACCAAAATCAGGAATTACGTCGATGG

QA 3 290 3 290
DS 

RD RR2EA86TF 760 0 0
GGGAAACACTATAGAGCTCCGCTCCCAGTAATGGCGGCGACATGGACTTCTTTTGTAACC
TCCTTTTGTATTTATTCACCTTCTAATAAACCGTCGTCCTCATCGTTGAGCAGTCTGTCT
TTCCGGAGGCAAACAGTGCTCAGAACGAACAGATTTCCCAGGATATATGCGTTGTCTAGC
AACGACATCAAAGTCGGGACAAACATAGAAGTCGATGGTGCTCCCTGGCGTGTTCTGGAG
TTTCTTCATGTGAAGCCAGGCAAAGGTGCTGCTTTTGTCAGAACCAAAATCAGGAATTAC
GTCAATGGTAGCACCGTCGAGAGAACCTTTCGTGCCGGAATTACTATGGAAGAGGCAAAT
GTCTTCAAGGAGACCAAGCAATTCACTTATAAAGACGCCTCTCAGTTTGTTTTCATGGAC
TTGAGCAGTTATGAGGAAACACGTTTAAACGAGGCTGATATGGGCGACAAGACCAAATGG
CTTAAAGAGGGAATGAACTGCAATTTACTCTACTGGAAGGACAAGGTCATCGATTTTGAA
CTTCCCATTACAGTTCAGCTTAAAATTGTTGACGTTGATCCTGGTCTCCGAGGTGACACT
GCACAAGGTGGAACAAAACCTGCCACCCTCGAGACTGGTGCAGTTGTCAATGTACCCCTC
TTTGTCA*TGTTGGTGAAGATATCATGGTGGACACGAGAACCGGTACCTACATGAGCCGG
GTCTGACACATCTTCCTTATTGCTA*CGACTAAGG
ACGTG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2GW19TF 723 0 0
GGA
TAGAGCTCCGCTCCCAGTAATGGCGGCGACATGGACTTCTTTTGTAACCTCCTTTTGTAT
TTATTCACCTTCTAATAAACCGTCGTCCTCATCGTTGAGCAGTCTGTCTTTCCGGAGGCA
AACAGTGCTCAGAACGAACAGATTTCCCAGGATATATGCGTTGTCTAGCAACGACATCAA
AGTCGGGACAAACATAGAAGTCGATGGTGCTCCCTGGCGTGTTCTGGAGTTTCTTCATGT
GAAGCCAGGCAAAGGTGCTGCTTTTGTCAGAACCAAAATCAGGAATTACGTCAATGGTAG
CACCGTCGAGAGAACCTTTCGTGCCGGAATTACTATGGAAGAGGCAAATGTCTTCAAGGA
GACCAAGCAATTCACTTATAAAGACGCCTCTCAGTTTGTTTTCATGGACTTGAGCAGTTA
TGAGGAAACACGTTTAAACGAGGCCGATATGGGCGACAAGACCAAATGGCTTAAAGAGGG
AATGGACTGCAATTTACTCTGCTGGAAGGACAAGGTCATCGATTTTGAACTTCCCATTAC
AGTTCAGCTTAAAATTGTTGACGTTGATCCTGGTCTCCGAGGTGACACTGCACAAGGTGG
AACAAAACCTGCCACCCTCGAGACTGGTGCAGTTGTCAATGTACCCCTCTTTGTCAATGT
TGGTGAAGATATCATGGTGGACACGAGAACCGGTACCTACATGAGCCGGGTCTGACACAT

QA 4 723 4 723
DS 

RD RR2EN10TF 790 0 0
GGACTA
TAGAGCTCCGCTCCCAGTAATGGCGGCGACATGGACTTCTTTTGTAACCTCCTTTTGTAT
TTATTCACCTTCTAATAAACCGTCGTCCTCATCGTTGAGCAGTCTGTCTTTCCGGAGGCA
AACAGTGCTCAGAACGAACAGATTTCCCAGGATATATGCGTTGTCTAGCAACGACATCAA
AGTCGGGACAAACATAGAAGTCGATGGTGCTCCCTGGCGTGTTCTGGAGTTTCTTCATGT
GAAGCCAGGCAAAGGTGCTGCTTTTGTCAGAACCAAAATCAGGAATTACGTCAATGGTAG
CACCGTCGAGAGAACCTTTCGTGCCGGAATTACTATGGAAGAGGCAAATGTCTTCAAGGA
GACCAAGCAATTCACTTATAAAGACGCCTCTCAGTTTGTTTTCATGGACTTGAGCAGTTA
TGAGGAAACACGTTTAAACGAGGCCGATATGGGCGACAAGACCAAATGGCTTAAAGAGGG
GATGGACTGCAATTTACTCTACTGGAAGGACAAGGTCATCGATTTTGAACTTCCCATTAC
AGTTCAGCTTAAAATTGTTGACGTTGATCCTGGTCTCCGAGGTGACACTGCACAAGGTGG
AACAAAACCTGCCACCCTCGAGACTGGTGCAGTTGTCAATGTACCCCTCTTTGTCAATGT
TGGTGAAGATATCATGGTGGACACGAGAACCGGTACCTACATGAGCCGGGTCTGACACAT
CTTCCTTATTGCTAACGACTAAGG*ACGTGAGATTTAATGAGCGGTTTTGGTTA*GAGTC
TGAT

QA 7 790 7 790
DS 

RD RR2B907TF 816 0 0
GGG
TAGAGCTCCGCTCCCAGTAATGGCGGCGACATGGACTTCTTTTGTAACCTCCTTTTGTAT
TTATTCACCTTCTAATAAACCGTCGTCCTCATCGTTGAGCAGTCTGTCTTTCCGGAGGCA
AACAGTGCTCAGAACGAACAGATTTCCCAGGATATATGCGTTGTCTAGCAACGACATCAA
AGTCGGGACAAACATAGAAGTCGATGGTGCTCCCTGGCGTGTTCTGGAGTTTCTTCATGT
GAAGCCAGGCAAAGGTGCTGCTTTTGTCAGAACCAAAATCAGGAATTACGTCAATGGTAG
CACCGTCGAGAGAACCTTTCGTGCCGGAATTACTATGGAAGAGGCAAATGTCTTCAAGGA
GACCAAGCAATTCACTTATAAAGACGCCTCTCAGTTTGTTTTCATGGACTTGAGCAGTTA
TGAGGAAACACGTTTAAACGAGGCCGATATGGGCGACAAGACCAAATGGCTTAAAGAGGG
AATGGACTGCAATTTACTCTACTGGAAGGACAAGGTCATCGATTTTGAACTTCCCATTAC
AGTTCAGCTTAAAATTGTTGACGTTGATCCTGGTCTCCGAGGTGACACTGCACAAGGTGG
AACAAAACCTGCCACCCTCGAGACTGGTGCAGTTGTCAATGTACCCCTCTTTGTCAATGT
TGGTGAAGATATCATGGTGGACACGAGAACCGGTACCTACATGAGCCGGGTCTGACACAT
CTTCCTTATTGCTAACGACTAAGGGACGTGAGATTTAATGAGCGGTTTTGGTTAAGAGTC
TGATTAGTTGAGTGAATTTCTATTATGGA
TATA

QA 4 812 4 812
DS 

RD RR2EA86JQ 781 0 0
GTTGAGCAGTCTGTCTTTCCGGAGGCAAACAGTGCTCAGAACGAACAGATTTCCCAGGAT
ATATGCGTTGTCTAGCAACGACATCAAAGTCGGGACAAACATAGAAGTCGATGGTGCTCC
CTGGCGTGTTCTGGAGTTTCTTCATGTGAAGCCAGGCAAAGGTGCTGCTTTTGTCAGAAC
CAAAATCAGGAATTACGTCAATGGTAGCACCGTCGAGAGAACCTTTCGTGCCGGAATTAC
TATGGAAGAGGCAAATGTCTTCAAGGAGACCAAGCAATTCACTTATAAAGACGCCTCTCA
GTTTGTTTTCATGGACTTGAGCAGTTATGAGGAAACACGTTTAAACGAGGCTGATATGGG
CGACAAGACCAAATGGCTTAAAGAGGGAATGAACTGCAATTTACTCTACTGGAAGGACAA
GGTCATCGATTTTGAACTTCCCATTACAGTTCAGCTTAAAATTGTTGACGTTGATCCTGG
TCTCCGAGGTGACACTGCACAAGGTGGAACAAAACCTGCCACCCTCGAGACTGGTGCAGT
TGTCAATGTACCCCTCTTTGTCAATGTTGGTGAAGATATCATGGTGGACACGAGAACCGG
TACCTACATGAGCCGGGTCTGACACATCTTCCTTATTGCTAACGACTAAGGGACGTGAGA
TTTAATGAGCGGTTTTGGTTAAGAGTCTGATTAGTTGAGTGAATTTCTACTGTGGAATAT
ATTGATTTCTTTGTTGGTCAGTTATTACTATACCTGAGTAGTAAATCCCCACTTTACTTT
C

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2EN10JQ 763 0 0
CAAACAGTGCTCAGAACGAACAGATTTCCCAGGATATATGCGTTGTCTAGCAACGACATC
AAAGTCGGGACAAACATAGAAGTCGATGGTGCTCCCTGGCGTGTTCTGGAGTTTCTTCAT
GTGAAGCCAGGCAAAGGTGCTGCTTTTGTCAGAACCAAAATCAGGAATTACGTCAATGGT
AGCACCGTCGAGAGAACCTTTCGTGCCGGAATTACTATGGAAGAGGCAAATGTCTTCAAG
GAGACCAAGCAATTCACTTATAAAGACGCCTCTCAGTTTGTTTTCATGGACTTGAGCAGT
TATGAGGAAACACGTTTAAACGAGGCCGATATGGGCGACAAGACCAAATGGCTTAAAGAG
GGGATGGACTGCAATTTACTCTACTGGAAGGACAAGGTCATCGATTTTGAACTTCCCATT
ACAGTTCAGCTTAAAATTGTTGACGTTGATCCTGGTCTCCGAGGTGACACTGCACAAGGT
GGAACAAAACCTGCCACCCTCGAGACTGGTGCAGTTGTCAATGTACCCCTCTTTGTCAAT
GTTGGTGAAGATATCATGGTGGACACGAGAACCGGTACCTACATGAGCCGGGTCTGACAC
ATCTTCCTTATTGCTAACGACTAAGGGACGTGAGATTTAATGAGCGGTTTTGGTTAAGAG
TCTGATTAGTTGAGTGAATTTCTATTATGGAATATATTGATTTCTTTGTTGGTCAGTTAT
TACTATACCTGAGTAGTAAATCCCCACTTTACTTT
TACCTGTG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2DZ71JQ 230 0 0
GGTGCAGTTGTCAATGTACCCCTCTTTGTCAATGTTGGTGAAGATATCATGGTGGACACG
AGAACCGGTACCTACATGAGCCGGGTTTGACACATTTTCCTTATTGCTAACGACTAAGGG
ACGTGAGATTTAATGAGCGGTTTTGGTTAAGAGTTTGATTAGTTGAGTGAATTTTTATTA
TGGAATATATTGATTTTTTTGTTGGTCAGTTATTACTATACCTGAGTAGT

QA 1 230 1 230
DS 

RD RR2GW19JQ 789 0 0
GGCAAACAGTGCTCAGAACGAACAGATTTCCCAGGATATATGCGTTGTCTAGCAACGACA
TCAAAGTCGGGACAAACATAGAAGTCGATGGTGCTCCCTGGCGTGTTCTGGAGTTTCTTC
ATGTGAAGCCAGGCAAAGGTGCTGCTTTTGTCAGAACCAAAATCAGGAATTACGTCAATG
GTAGCACCGTCGAGAGAACCTTTCGTGCCGGAATTACTATGGAAGAGGCAAATGTCTTCA
AGGAGACCAAGCAATTCACTTATAAAGACGCCTCTCAGTTTGTTTTCATGGACTTGAGCA
GTTATGAGGAAACACGTTTAAACGAGGCCGATATGGGCGACAAGACCAAATGGCTTAAAG
AGGGAATGGACTGCAATTTACTCTGCTGGAAGGACAAGGTCATCGATTTTGAACTTCCCA
TTACAGTTCAGCTTAAAATTGTTGACGTTGATCCTGGTCTCCGAGGTGACACTGCACAAG
GTGGAACAAAACCTGCCACCCTCGAGACTGGTGCAGTTGTCAATGTACCCCTCTTTGTCA
ATGTTGGTGAAGATATCATGGTGGACACGAGAACCGGTACCTACATGAGCCGGGTCTGAC
ACATCTTCCTTATTGCTAACGACTAAGGGACGTGAGATTTAATGAGCGGTTTTGGTTAAG
AGTCTGATTAGTTGAGTGAATTTCTATTATGGAATATATTGATTTCTTTGTTGGTCAGTT
ATTACTATACCTGAGTAGTAAATCCCCACTTTACTTTTACCTGTGAGATTCGATCACTAT
GCTTTACTC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 2 7

CO CL679Contig1 1216 4 19 U
GGGACACACACAAAGGTCTCCTCCTCCATATGGCTAGATCCAATTAATCCTCTTGTTTCT
TTGGCTTGTGTCTGAGCTCGAACCTAAAGATAAGAATCCACCATCATGTCTTTAGCTCCG
ACCAGCTATCCATCTCTCTATTCACTGCCAAGAACCCAGACTAAGCAAAACCCTCCCTTG
ATCACTCAACCTAGTTTCATTTCGGTGAAGAGTCTCTTCCTTTCGAGCAATACCCATGTG
GCAAAACGGGGGAGTTTCGCTTTGAAAGCGTCGGAGACAAATTCAACAGCCAAACCTGAA
GCAGGAAAAGAGAAAGATGGTGGAGAAGAAGAAGAGAAGTACGAAACGTATGAGATAGAA
GTGGAGCAGCCTTATGGTTTGAAATTCAGGAAAGGAAGAGATGGTGGGACTTACATTGAT
GCTATTTTGCCCGGTGGTTTCGCCGATAAAACCGGCAAGTTCACAGTCGGCGACAGAGTT
ATTGCAACAAGTGCAGTGTTTGGGACAGAGATTTGGCCTGCAGCTGAGTACGGTAGGACT
ATGTACACCATCCGTCAGAGAATTGGTCCTTTGCTTATGCAAATGGAGAAGCGTTATGGT
AAGGTGGATGATTCTGGTGAGCTAACAGAGAAAGAGATAATCAGAGCAGAGAGAAATGCC
GGATTCATTAGCAGTAGGTTGAGAGAAATTCAGATGCAAAACTATCTGAGGAAGAAAGAA
CTGAAAGCTCAAAGGGAGAAGGATCTTCGTGAAGGGCTTCAGTTTTCCAAGAATGGTAAA
TATGAGGAAGCACTGGAGAGGTTTGAGTCTGCGTTAGGCTCCAAACCAACACCAGATGAA
GCATCAATTTCAAGTTACAATGTTGCTTGTTGCTACTCTAAGCTTAATCAGGTTCAAGCT
GGTCTCTCGGCTCTGGAAGAAGCATTGAAGTCAGGATATGAAGATTTCAAGAGAATCCGA
AGCGATCCAGATCTGGAAAACCTCAGGAAGTCGGAAGCTTTCGATCCACTTATGAAGCAG
TTTGATGAATCTTTCATCAACGAGAGTGCCATTAACGCCATCAAATCCTTGTTTGGCTTT
AACAAGAAATAGTTCACCACCTAAAGTTTATGTCTTTTGATGTGACCTGTTCATAGCTTC
TCTTCTCTCCTCTTCTTGGCTATATATATATATACTTGTGAGGAATTGTATTCAATCGTA
TAAGGTGTTCTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2C376TF U 1
AF RR2DL64TF U 62
AF RR2C376JQ C 457
AF RR2DL64JQ C 557
BS 1 243 RR2C376TF
BS 244 244 RR2DL64TF
BS 245 279 RR2C376TF
BS 280 280 RR2DL64TF
BS 281 325 RR2C376TF
BS 326 326 RR2DL64TF
BS 327 358 RR2C376TF
BS 359 359 RR2DL64TF
BS 360 675 RR2C376TF
BS 676 676 RR2DL64TF
BS 677 677 RR2C376TF
BS 678 678 RR2C376JQ
BS 679 700 RR2C376TF
BS 701 710 RR2DL64TF
BS 711 811 RR2C376JQ
BS 812 812 RR2DL64JQ
BS 813 1148 RR2C376JQ
BS 1149 1149 RR2DL64JQ
BS 1150 1216 RR2C376JQ

RD RR2C376TF 705 0 0
GGGACACACACAAAGGTCTCCTCCTCCATATGGCTAGATCCAATTAATCCTCTTGTTTCT
TTGGCTTGTGTCTGAGCTCGAACCTAAAGATAAGAATCCACCATCATGTCTTTAGCTCCG
ACCAGCTATCCATCTCTCTATTCACTGCCAAGAACCCAGACTAAGCAAAACCCTCCCTTG
ATCACTCAACCTAGTTTCATTTCGGTGAAGAGTCTCTTCCTTTCGAGCAATACCCATGTG
GCATAACGGGGGAGTTTCGCTTTGAAAGCGTCGGAGACAGATTCAACAGCCAAACCTGAA
GCAGGAAAAGAGAAAGATGGTGGAGGAGAAGAAGAGAAGTACGAAACGTATGAGATAGGA
GTGGAGCAGCCTTATGGTTTGAAATTCAGGAAAGGAAGAGATGGTGGGACTTACATTGAT
GCTATTTTGCCCGGTGGTTTCGCCGATAAAACCGGCAAGTTCACAGTCGGCGACAGAGTT
ATTGCAACAAGTGCAGTGTTTGGGACAGAGATTTGGCCTGCAGCTGAGTACGGTAGGACT
ATGTACACCATCCGTCAGAGAATTGGTCCTTTGCTTATGCAAATGGAGAAGCGTTATGGT
AAGGTGGATGATTCTGGTGAGCTAACAGAGAAAGAGATAATCAGAGCAGAGAGAAATGCC
GGATTCATTAGCAGTGG*TTGAGAGAAATTCAGATGCAAA
CTATC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2DL64TF 652 0 0
G
GGCTTGTGTCTGAGCTCGAACCTAAAGATAAGAATCCACCATCATGTCTTTAGCTCCGAC
CAGTTATCCATCTCTCTATTCACTGCCAAGAACCCAGACTAAGCAAAACCCTCCCTTGAT
CACTCAACCTAGTTTCATTTCGGTGAAGAGTCTCTTCCTTTCGAGCAATACCCATGTGGC
AAAACGGGGGAGTTTCGCTTTGAAAGCGTCGGAGACAAATTCAACAGCCAAACCTGAAGC
AGGAAAAGAGAAAGATGGTGGAGAAGAAGAAGAGAAGTACGAAACGTATGAGATAGAAGT
GGAGCAGCCTTATGGTTTGAAATTCAGGAAAGGAAGAGATGGTGGGACTTACATTGATGC
TATTTTGCCCGGTGGTTTCGCCGATAAAACCGGCAAGTTCACAGTCGGCGACAGAGTTAT
TGCAACAAGTGCAGTGTTTGGGACAGAGATTTGGCCTGCAGCTGAGTACGGTAGGACTAT
GTACACCATCCGTCAGAGAATTGGTCCTTTGCTTATGCAAATGGAGAAGCGTTATGGTAA
GGTGGATGATTCTGGTGAGCTAACAGAGAAAGAGATAATCAGAGCAGAGAGAAATGCCGG
ATTCATTAGCAGTAG*TTGAGAGAAATTCAGATGCAAAACTATCTGAG
AAG

QA 2 649 2 649
DS 

RD RR2C376JQ 760 0 0
AAGTTCACAGTCGGCGACAGAGTTATTGCAACAAGTGCAGTGTTTGGGACAGAGATTTGG
CCTGCAGCTGAGTACGGTAGGACTATGTACACCATCCGTCAGAGAATTGGTCCTTTGCTT
ATGCAAATGGAGAAGCGTTATGGTAAGGTGGATGATTCTGGTGAGCTAACAGAGAAAGAG
ATAATCAGAGCAGAGAGAAATGCCGGATTCATTAGCAGTAGGTTGAGAGAAATTCAGATG
CAAAACTATCTGAGGAAGAAAGAACTGAAAGCTCAAAGGGAGAAGGATCTTCGTGAAGGG
CTTCAGTTTTCCAAGAATGGTAAATATGAGGAAGCACTGGAGAGGTTTGAGTCTGTGTTA
GGCTCCAAACCAACACCAGATGAAGCATCAATTTCAAGTTACAATGTTGCTTGTTGCTAC
TCTAAGCTTAATCAGGTTCAAGCTGGTCTCTCGGCTCTGGAAGAAGCATTGAAGTCAGGA
TATGAAGATTTCAAGAGAATCCGAAGCGATCCAGATCTGGAAAACCTCAGGAAGTCGGAA
GCTTTCGATCCACTTATGAAGCAGTTTGATGAATCTTTCATCAACGAGAGTGCCATTAAC
GCCATCAAATCCTTGTTTGGCTTTAACAAGAAATAGTTCACCACCTAAAGTTTATGTCTT
TTGATGTGACCTGTTCATAGCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTTGGCTATATATATATATACT
TGTGAGGAATTGTATTCAATCGTATAAGGTGTTCTTTTTT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2DL64JQ 660 0 0
AGAGAATTGGTCCTTTGCTTATGCAAATGGAGAAGCGTTATGGTAAGGTGGATGATTCTG
GTGAGCTAACAGAGAAAGAGATAATCAGAGCAGAGAGAAATGCCGGATTCATTAGCAGTA
GGTTGAGAGAAATTCAGATGCAAAACTATCTGAGGAAGAAAGAACTGAAAGCTCAAAGGG
AGAAGGATCTTCGTGAAGGGCTTCAGTTTTCCAAGAATGGTAAATATGAGGAAGCACTGG
AGAGGTTTGAGTCTTCGTTAGGCTCCAAACCAACACCAGATGAAGCATCAATTTCAAGTT
ACAATGTTGCTTGTTGCTACTCTAAGCTTAATCGGGTTCAAGCTGGTCTCTCGGCTCTGG
AAGAAGCATTGAAGTCAGGATATGAAGATTTCAAGAGAATCCGAAGCGATCCAGATCTGG
AAAACCTCAGGAAGTCGGAAGCTTTCGATCCACTTATGAAGCAGTTTGATGAATCTTTCA
TCAACGAGAGTGCCATTAACGCCATCAAATCCTTGTTTGGCTTTAACAAGAAATAGTTCA
CCACCTAAAGTTTATGTCTTTTGATGTGACCTGTTCATAGCTTCTCTTCTCTCCTCTTCT
TGGCTATATATATATA**CTTGTGAGGAATTGTATTCAATCGTATAAGGTGTTCTTTTTT

QA 1 660 1 660
DS 



CO CL679Contig2 1108 3 25 U
GGCTTGAGTTTTACTTTCATTTCATATAAGAAAATACAAATTAAATGTAATGGTAAAGAG
AGATTCACATGTAAAAAAGAACACCTTATACGATTTTGAATACAATTCCTCACCAGTATA
TATATAGCCAAGAAGAGAAGAAAAGAGAAGCTATGAACTTGAGGTGGTGAACTATTTCTT
GTTAAAGCCAAACAAGGATTTGATAGCATTAATGGCACTCTCGTTGATGAAAGATTCATC
AAACTGCTTCATGAGTGGATCAAAAGCTTCCGACTTCCTGATGTTTTCCAGATCTGGATC
GCTTCGGATTCTCTTGAAATCTTCATATCCTGACTTCAATGCTTCTTCCAGAGCCGAGAG
ACCAGCTTGAACCTGATTAAGCTTAGAGTAGCAACAAGCAACATTGTAACTTGAAATTGA
TGCTTCATCTGGTGTTGGTTTGGAGCCTAACACAGACTCAAACCTCTCCAGTGCTTCCTC
ATATTTACCATTCTTGGAAAACTGAAGCCCTTCACGAAGATCCTTCTCCCGTTGAGCTTT
CAGTTCTTTCTTCCTCAGATAGTTTTGCATCTGAATTTCCCTCAACCTACTGCTAATGAA
TCCAGCATTTCTCTCAGCTCTGATTATCTCTTTCTCTGTTAGCTCACCAGAATCATCCAC
CTTACCATATCGTTTCTCCATTTGCATAAGCAAAGGACCAATCCTCTGACGGATGGTGTA
CATAGTACTACCGTACTCAGCTGCAGGCCAAATCTCTGTCCCAAACACTGCACTAGTGGC
AATAACTCTGTCGCCGACTGTGAACTTACCGGTTTTATCGGCGAAACCACCGGGCAAAAT
AGCATCAATGTAAGTCCCACCATCTCTTCCTTTCCTGAATTTCAAACCATAAGGCCGCTC
CACTTCTATCTCATACGTTTCGTAATTCTCTTATTCTTCTTCTTTTCCTTCTCCACCATC
TTTCTCTTTTCCTGCTTCAGGTTTGGCTGTTGAATCTGTCTCCGACGCTTTCAAAGCAAA
ATTCCCACGTTTTTCCACTTGGGTATTGCTCGAAAGGAAGAGATTTTTCACCGAAATGAA
ACTAGGTTGAGTGATCAAGGCATGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E056JQ U 1
AF RR2FH70JQ U 41
AF RR2DD69TF C 481
BS 1 95 RR2E056JQ
BS 96 97 RR2FH70JQ
BS 98 161 RR2E056JQ
BS 162 162 RR2FH70JQ
BS 163 183 RR2E056JQ
BS 184 184 RR2FH70JQ
BS 185 204 RR2E056JQ
BS 205 205 RR2FH70JQ
BS 206 207 RR2E056JQ
BS 208 208 RR2FH70JQ
BS 209 270 RR2E056JQ
BS 271 271 RR2FH70JQ
BS 272 584 RR2E056JQ
BS 585 585 RR2FH70JQ
BS 586 677 RR2E056JQ
BS 678 702 RR2FH70JQ
BS 703 703 RR2DD69TF
BS 704 774 RR2FH70JQ
BS 775 775 RR2DD69TF
BS 776 807 RR2FH70JQ
BS 808 808 RR2DD69TF
BS 809 838 RR2FH70JQ
BS 839 839 RR2DD69TF
BS 840 853 RR2FH70JQ
BS 854 1108 RR2DD69TF

RD RR2E056JQ 677 0 0
GGCTTGAGTTTTACTTTCATTTCATATAAGAAAATACAAATTAAATGTAATGGTAAAGAG
AGATTCACATGTAAAAAAGAACACCTTATACGATT**GAATACAATTCCTCACCAGTATA
TATATAGCCAAGAAGAGAAGAAAAGAGAAGCTATGAACTTGGGGTGGTGAACTATTTCTT
GTTGAAGCCAAACAAGGATTTGATGGCGTTAATGGCACTCTCGTTGATGAAAGATTCATC
AAACTGCTTCATGAGTGGATCAAAAGCTTCTGACTTCCTGATGTTTTCCAGATCTGGATC
GCTTCGGATTCTCTTGAAATCTTCATATCCTGACTTCAATGCTTCTTCCAGAGCCGAGAG
ACCAGCTTGAACCTGATTAAGCTTAGAGTAGCAACAAGCAACATTGTAACTTGAAATTGA
TGCTTCATCTGGTGTTGGTTTGGAGCCTAACACAGACTCAAACCTCTCCAGTGCTTCCTC
ATATTTACCATTCTTGGAAAACTGAAGCCCTTCACGAAGATCCTTCTCCCGTTGAGCTTT
CAGTTCTTTCTTCCTCAGATAGTTTTGCATCTGAATTTCCCTCA*CCTACTGCTAATGAA
TCCAGCATTTCTCTCAGCTCTGATTATCTCTTTCTCTGTTAGCTCACCAGAATCATCCAC
CTTACCATATCGTTTCT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2FH70JQ 813 0 0
CTGAC
TGTAATGGTAAAGAGAGATTCACATGTAAAAAAGAACACCTTATACGATTTTGAATACAA
TTCCTCACCAGTATATATATAGTCAAGAAGAGAAGAAAAGAGAAGCTATGAACTTGAGGT
GGTGAACTATTTCTTGTTAAAGCCAAACAAGGATTTGATAGCATTAATGGCACTCTCGTT
GATGAAAGATTCATCAAACTGCTTCATGAGTGGATCGAAAGCTTCCGACTTCCTGATGTT
TTCCAGATCTGGATCGCTTCGGATTCTCTTGAAATCTTCATATCCTGACTTCAATGCTTC
TTCCAGAGCCGTGAGACCAGCTTGAACCTGATTAAGTTTAGAGTAGCAACAAGCAACATT
GTAACTTGAAATTGATGCTTCATCTGGTGTTGGTTTGGAGCCTAACACAGACTCAAACCT
CTCCAGTGCTTCCTCATATTTACCATTCTTGGAAAACTGAAGCCCTTCACGAAGATCTTT
CTCCCGTTGAGCTTTCAGTTCTTTCTTCCTCAGATAGTTTTGCATCTGAATTTCCCTCAA
CCTACTGCTAATGAATCCGGCATTTCTCTCAGCTCTGATTATCTCTTTCTCTGTTAGCTC
ACCAGAATCATCAACCTTACCATATCGTTTCTCCATTTGCATAAGCAAAGGACCAATTCT
CTGACGGATGGTGTACATAGTACTACCGTACTCAGCTGCAGGCCAAATCTCTGTCCCAAA
CACTGCACTTGTGGCAATAACTCTGTCGCCGACTGTGAACTTGCCGGTTTTATCGGCGAA
ACCACCGGGCAAA*TAGCATCAATGTAA

QA 6 813 6 813
DS 

RD RR2DD69TF 628 0 0
ATATTTACCATTCTTGGAAAACTGAAGCCCTTCACGGAGATCCTTCTCCCGTTGAGCTTT
CAGTTCTTTCTTCCTCAGATAGTTTTGCATCTGAATTTCCCTCAACCTACTGCTAATGAA
TCCAGCATTTCTCTCAGCTCTGATTATTTCTTTCTCTGTTAGCTCACCAGAATCATCCAC
CTTACCATAACGCTTCTCCATTTGCATAAGCAAAGGACCAATCCTCTGACGGATGGTGTA
CATAGTCCTACCGTACTCAGCTGCAGGCCAAATCTCTGTCCCAAACACTGCACTAGTGGC
AATAACTCTGTCGCCGACTGTGAATTTACCGGTTTTATCGGCGAAACCACCGGGCAAAAT
AGCATCAATGTAAGTCCCACCATCTCTTCCTTTCCTGAATTTCAAACCATAAGGCCGCTC
CACTTCTATCTCATACGTTTCGTAATTCTCTTATTCTTCTTCTTTTCCTTCTCCACCATC
TTTCTCTTTTCCTGCTTCAGGTTTGGCTGTTGAATCTGTCTCCGACGCTTTCAAAGCAAA
ATTCCCACGTTTTTCCACTTGGGTATTGCTCGAAAGGAAGAGATTTTTCACCGAAATGAA
ACTAGGTTGAGTGATCAAGGCATGGTTC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 2 9

CO CL680Contig1 511 6 5 U
GGAATCAATCAATCAAAGCTCATTTATCATAAAAAAAAAAA**AGAACTACACTTCTTAT
AATAAAATCATGTCGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCT
AAAGAGAAGGCCGAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGAC
AAGACTGCTAACGCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCC
TCTGGTTTCATCCAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGAT
GGTGTCAAGAACACTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATGCACTTCTC
ATGTTATATTTTTCAATTTATTTGGAGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTC
TAAATAATTTTGTAATAAAATTTTGAATTTTTGTTTCAAAGACCTTGTAATAAGACATGC
ATAAGTAATAAAATGG*TGCGAGTTACCCAC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 10 10 

AF RR2C087TF U 1
AF RR2CG41JQ C 1
AF RR2CG41TF U 1
AF RR2B569TF U 12
AF RR2C090TF U 24
AF RR2EP69TF U 12
BS 1 96 RR2C087TF
BS 97 97 RR2CG41TF
BS 98 508 RR2C087TF
BS 509 509 RR2CG41TF
BS 510 511 RR2EP69TF

RD RR2C087TF 508 0 0
GGAATCAATCAATCAAAGCTCATTTATCATAAAAAAAAAAA**AGAACTACACTTCTTAT
AATAAAATCATGTCGAACTTGCAACAATCTTACAATACTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCT
AAAGAGAAGGCCGAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGAC
AAGACTGCTAACGCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCC
TCTGGTTTCATCCAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGAT
GGTGTCAAGAACACTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATGCACTTCTC
ATGTTATATTTTTCAATTTATTTGGAGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTC
TAAATAATTTTGTAATAAAATTTTGAATTTTTGTTTCAAAGACCTTGTAATAAGACATGC
ATAAGTAATAAAATGG*TGCGAGTTACC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2CG41JQ 509 0 0
GGAATCAATCAATCAAAGTTCATTTATCATAAAAAAAAAAAAAAGAACTACACTTCTTAT
AATAAAATCATGTCGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCT
AAAGAGAAGGCCGAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGAC
AAGACTGCTAACGCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCC
TCTGGTTTCATCCAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGAT
GGTGTCAAGAACACTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATGCACTTCTC
ATGTTATATTTTTCAATTTATTTGGAGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTC
TAAATAATTTTGTAATAAAATTTTGAATTTTTGTTTCAAAGACCTTGTAATAGGACATGC
ATAAGTAATAAAATGG*TGCGAGTTACCC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2CG41TF 509 0 0
GGAATCAATCAATCAAAGCTCATTTATCATAAAAAAAAAAAAAAGAACTACACTTCTTAT
AATAAAATCATGTCGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCT
AAAGAGAAGGCCGAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGAC
AAGACTGCTAACGCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCC
TCTGGTTTCATCCAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGAT
GGTGTCAAGAACACTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATGCACTTCTC
ATGTTATATTTTTCAATTTATTTGGAGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTC
TAAATAATTTTGTAATAAAATTTTGAATTTTTGTTTCAAAGACCTTGTAATAGGACATGC
ATAAGTAATAAAATGGGTGCGAGTTACCC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2B569TF 498 0 0
ATCAAAGCTCATTTATCATAAAAAAAAAAA**AGAACTACACTTCTTATAATAAAATCAT
GTCGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAAGAGAAGGC
CGAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAA
CGCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCTGGTTTCAT
CCAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAA
CACTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATGCACTTCTCATGTTATATTT
TTCAATTTATTTGGAGTTCTCTCTAAATTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAAATAATTTT
GTAATAAAATTTTGAATTTTTGTTTCAAAGACCTTGTAATAAGACATGCATAAGTAATAA
AATGG*TGCGAGTTACCC

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2C090TF 483 0 0
G
TATCATAAAAAAAAAAA**AGAACTACACTTCTTATAATAAAATCATGTCGAACTTGCAA
CAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAAGAGAAGGCCGAGCAATGGACT
GAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAACGCAGCTCAGTCC
ACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCTGGTTTCATCCAACAAACTGGA
GAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAACACTCTTGGAATG
AATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATGCACTTCTCATGTTATATTTTTCAATTTATTTG
GAGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAAATAATTTTGTAATAAAATTTT
GAATTTTTGTTTCAAGGACCTTGTAATAAGACATGCATAAGTAATAAAATGG*TGCGAGT
TA

QA 2 483 2 483
DS 

RD RR2EP69TF 500 0 0
ATCAAAGCTCATTTATCATAAAAAAAAAAA**AGAACTACACTTCTTATAATAAAATCAT
GTCGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAAGAGAAGGC
CGAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAA
CGCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCTGGTTTCAT
CCAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAA
CACTCTTGGAATGAATGAGAAAAAGAAATGAGAAATCAATGCACTTCTCATGTTATATTT
TTCAATTTACTTGGAGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAAATAATTTT
GTAATAAAATTTTGAATTTTTGTTTCAAAGACCTTGTAATAAGACATGCATAAGTAATAA
AATGG*TGCGAGTTACCCAC

QA 1 500 1 500
DS 



CO CL680Contig2 510 3 6 U
GGAATCAATCAATCAAAGCTCATTTATCATCCAGAAAAAAA*GAACCACACTTCTTATAA
TAAAATCATGTCGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAA
GGAGAAGGCCGAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAA
GACTGCTAACGCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGCCAACAACAAGCCTC
TGGTTTCATCCAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGG
TGTCAAGAACACTCTTGGAATGAATGAAAAGAAGAAATGAGAAATCAAATACACTTCTCA
TGTTATATTTGTCAATTTATTTGGAGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCT
AATTAATTTTGTAATAAAATTTTGAATTATTTTTTTCAAAGATCTTGTAATAAGACATGC
ATAAGTAATAAAATGGTGCGAGTTACCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 10 10 

AF RR2FV92TF U 1
AF RR2EU33TF U 12
AF RR2D690TF U 12
BS 1 403 RR2FV92TF
BS 404 404 RR2EU33TF
BS 405 474 RR2FV92TF
BS 475 475 RR2EU33TF
BS 476 508 RR2FV92TF
BS 509 510 RR2D690TF

RD RR2FV92TF 510 0 0
GGAATCAATCAATCAAAGCTCATTTATCATCCAGAAAAAAA*GAACCACACTTCTTATAA
TAAAATCATGTCGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAA
GGAGAAGGCCGAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAA
GACTGCTAACGCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGCCAACAACAAGCCTC
TGGTTTCATCCAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGG
TGTCAAGAACACTCTTGGAATGAATGAAAAGAAGAAATGAGAAATCAAATACACTTCTCA
TGTTATATTTGTCAATTTATTTGGAGTTCTCTCTAAAGTTCGAGCAATTCTTGCTTTTCT
AATTAATTTTGTAATAAAATTTTGAATTATTTTTTTCAAAGATCTTGTAATAAGGCATGC
ATAAGTAATAAAATGGTGCGAGTTACCC
AT

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2EU33TF 494 0 0
ATCAAAGCTCATTTATCATCCAGAAAAAAAAGAACCACACTTCTTATAATAAAATCATGT
CGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAGGAGAAGGCCG
AGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAACG
CAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGCCAACAACAAGCCTCTGGTTTCATCC
AACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAACA
CTCTTGGAATGAATGAAAAGAAGAAATGAGAAATCAAATACACTTCTCATGTTATATTTG
TCAATTTATTTGGAGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAATTAATTTTG
TAATAAAATTTTGAATTATTTTTTTCAAAGATCTTGTAATAAGACATGCATAAGTAATAA
AATGGTGCGAGTTA

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2D690TF 499 0 0
ATCAAAGCTCATTTATCATCCAGAAAAAAA*GAACCACACTTCTTATAATAAAATCATGT
CGAACTTGCAACAACCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAGGAGAAGGCCG
AGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAACG
CAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGCCAACAACAAGCCTCTGGTTTCATCC
AACAAACTA*AGAGTCAGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAACA
CTCTTGGAATGAATGAAAAGAAGAAATGAGAAATCAAATACACTTCTCATGTTATATTTG
TCAATTTATTTGGAGTTCTCTCTAAAGCTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAATTAATTTTG
TAATAAAATTTTGAATTATTTTTTTCAAAGATCATGTAATAAGACATGCATAAGTAATAA
AATGGTGCGAGTTACCCAT

QA 1 499 1 499
DS 



AS 3 9

CO CL681Contig1 1006 4 32 U
GGAATGCATAATTGGCTTCATAAGCTTTTAATTAAAATTCAAAATAACACAAATATGAAA
GTAAATTATTTGAGTGACATAACATTGATGAATAAACTGAGAAGTTCGAAAGACATAGAA
GCCTCCATATTATTGATAAAACAAATAGATCCTTTGAAGTATCATATCTCACCATCCCAT
AATTCTTCAAGAGACTTATAGGGGCTCAGTGTAGCATGAACGAAGAAGGAAGCATTCAAT
AACCTAGCCTGTTCAATCTCTGAAAACTTGGCAAACAAGTCATCAGGTATCGACCAGTCG
AAAATCTCAAAGTTCTCTCTGATTCTTCCTTCATTGGTGCTTTTAGGAAGAACACTGTTA
CCCATTTGTAGTCCCCAGCGAAGCGCTACTTGCGCTGGAGACTTTTCGAGTTTTTCAGCA
ACAGTATTCAATATTGGGTTCTTCAAAACATCGCTCTTGAGCCATGTTGTTCCTGGAGAA
CCCAATGGAGAGTATGCGGTGAGGTGAACTCCTTTGGATTTGCAGAACTCTCGTAGTTTA
GTCTGTTGCCAAGAAGGATGACATTCGACCTGATTAACGGCAGGAGGAGCACGAGCTAAC
TCTAAGAGAGTAGCTAGCTTCTTGGTGGAGAAGTTGCTTACTCCTATGGCTCGTGCCTTG
CCCGAGTCATAGAGTGCTTCCATCGCTTTCCATGTGCTAGAAATATCTACAGGCATAAGG
TCCTCGGGCTTAGCTCCAACAGAACCTTTCTTCATCCGTACAGGCCAGTGTATCAAATAG
AGATCGACATAGTCAAGCTGCAGATCCTGTAGGGTTCTTTTCAGTGCCGTAGATCTGAGC
GCAATCAATATGACGATATCCGATCTTAACAGCTGCCGCGACGGCATCACCGACAAGACC
AGGAGAGGCTTGCCATGTTCCCAAACCCACCGACGGGATCTTAGCGCCAGTGTTGAGCTC
GAAGAATCTAACTGCGTTAGCCATTATCAGAGGAGATGGAGTTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE93JQ U 1
AF RR2FQ49JQ U 46
AF RR2CX63JQ U 79
AF RR2CX63TF C 384
BS 1 125 RR2AE93JQ
BS 126 126 RR2FQ49JQ
BS 127 405 RR2AE93JQ
BS 406 406 RR2CX63JQ
BS 407 430 RR2AE93JQ
BS 431 431 RR2CX63JQ
BS 432 434 RR2AE93JQ
BS 435 435 RR2CX63JQ
BS 436 464 RR2AE93JQ
BS 465 465 RR2CX63JQ
BS 466 473 RR2AE93JQ
BS 474 474 RR2CX63JQ
BS 475 494 RR2AE93JQ
BS 495 495 RR2CX63JQ
BS 496 536 RR2AE93JQ
BS 537 537 RR2CX63JQ
BS 538 563 RR2AE93JQ
BS 564 564 RR2CX63JQ
BS 565 588 RR2AE93JQ
BS 589 589 RR2CX63JQ
BS 590 608 RR2AE93JQ
BS 609 609 RR2CX63JQ
BS 610 693 RR2AE93JQ
BS 694 721 RR2FQ49JQ
BS 722 722 RR2CX63JQ
BS 723 784 RR2FQ49JQ
BS 785 813 RR2CX63JQ
BS 814 814 RR2CX63TF
BS 815 847 RR2CX63JQ
BS 848 848 RR2CX63TF
BS 849 879 RR2CX63JQ
BS 880 1006 RR2CX63TF

RD RR2AE93JQ 693 0 0
GGAATGCATAATTGGCTTCATAAGCTTTTAATTAAAATTCAAAATAACACAAATATGAAA
GTAAATTATTTGAGTGACATAACATTGATGAATAAACTGAGAAGTTCGAAAGACATAGAA
GCCTCTATATTATTGATAAAACAAATAGATCCTTTGAAGTATCATATCTCACCATCCCAT
AATTCTTCAAGAGACTTATAGGGGCTCAGTGTAGCATGAACGAAGAAGGAAGCATTCAAT
AACCTAGCCTGTTCAATCTCTGAAAACTTGGCAAACAAGTCATCAGGTATCGACCAGTCG
AAAATCTCAAAGTTCTCTCTGATTCTTCCTTCATTGGTGCTTTTAGGAAGAACACTGTTA
CCCATTTGTAGTCCCCAGCGAAGCGCTACTTGCGCTGGAGACTTTCCGAGTTTTTCAGCA
ACAGTATTCAGTATAGGGTTCTTCAAAACATCGCTCTTGAGCCACGTTGTTCCCGGAGAA
CCCAATGGAGAGTACGCGGTGAGGTGAACTCCTTTGGATTTGCAGAACTCTCGTAGCTTA
GTCTGTTGCCAAGAAGGATGACACTCGACCTGATTAACGGCAGGAGGAACACGAGCTAAC
TCTAAGAGGGTAGCTAGCTTCTTGGTGGAGAAGTTGCTTACTCCTATGGCTCGTGCCTTG
CCCGAGTCATAGAGTGCTTCCATCGCTTTCCAT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2FQ49JQ 739 0 0
AG
CACAAATATGAAAGTAAATTATTTGAGTGACATAACATTGATGAATAAACTGAGAAGTTC
GAAAGACATAGAAGCCTCCATATTATTGATAAAACAAATAGATCCTTTGAAGTATCATAT
CTCACCATCCCATAATTCTTCAAGAGACTTATAGGGGCTCAGTGTAGCATGAATGAAGAA
GGAAGCATTCAATAACCTAGCCTGTTCAATCTCTGAAAACTTGGCAAACAAGTCATCAGG
TATCGACCAGTCGAAAATCTCAAAGTTCTCTCTGATTCTTCCTTCATTGGTGCTTTTAGG
AAGAACACTGTTACCCATTTGTAGTCCCCAGCGAAGCGCTACTTGCGCTGGAGACTTTCC
GAGTTTTTCAGCAACAGTATTCAGTATAGGGTTCTTCAAAACATCGCTCTTGAGCCACGT
TGTTCCCGGAGAACCCAATGGAGAGTACGCGGTGAGGTGAACTCCTTTGGATTTGCAGAA
CTCTCGTAGCTTAGTCTGTTGCCAAGAAGGATGACACTCGACCTGATTAACGGCAGGAGG
AACACGAGCTAACTCTAAGAGGGTAGCTAGCTTCTTGGTGGAGAAGTTGCTTACTCCTAT
GGCTCGTGCCTTGCCCGAGTCATAGAGTGCTTCCATCGCTTTCCATGTGCTAGAAATATC
TACAGGCATAAGGTTCTCGGGCTTAGCTCCAACAGAACCTTTCTTCATCCGTACAGGCCA
GTGTATCAAATAGAGAT

QA 3 739 3 739
DS 

RD RR2CX63JQ 801 0 0
ATAACATTCATGAATAAACTGAGAAGTTCGAAAGACATAGAAGCCTCCATATTATTGATA
AAACAAATAGATCCTTTGAAGTATCATATCTCACCATCCCATAATTCTTCAAGAGACTTA
TAGGGGCTCAGTGTATCATGAACGAAGAAGGAAGCATTCAATAACCTAGCCTGTTCAATC
TCTGAAAACTTGGCAAACAAGTCATCGGGTATCGACCAGTCGAAAACCTCAAAGTTCTCT
CTGATTCTTCCTTCATTGGTGCTTTTAGGAAGAACACTGTTACCCATTTGTAGTCCCCAG
CGAAGCGCGACTTGCGCTGGAGACTTTTCGAGTTTTTCAGCAACAGTATTCAATATTGGG
TTCTTCAAAACATCGCTCTTGAGCCATGTTGTTCCTGGAGAACCCAATGGAGAGTATGCG
GTGAGGTGAACTCCTTTGGATTTGCAGAACTCTCGTAGTTTAGTCTGTTGCCAAGAAGGA
TGACATTCGACCTGATTAACGGCAGGAGGAGCACGAGCTAACTCTAAGAGAGTAGCTAGC
TTCTTGGTGGAGAAGTTGCTTACTCCTATGGCTCGTGCCTTGCCCGAGTCATAGAGTGCT
TCCATCGCTTTCCATGTGCTAGAAATATCTACAGGCATAAGGTCCTCGGGCTTAGCTCCA
ACAGAACCTTTCTTCATCCGTACAGGCCAGTGTATCAAATAGAGATCGACATAGTCAAGC
TGCAGATCCTGTAGG*TTCTTTTCAGTGCCGTAGATCTGAGCGCAATCA*TATGACGATA
TCCGATCTTAACAGCTGCCGC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2CX63TF 623 0 0
CGCG
ACTTGCGCTGGAGACTTTTCGAGTTTT*CAGCAACAGTATTCAATATTGGGTTCTTCAAA
ACATCGCTCTTGAGCCATGTTGTTCCTGGAGAACCCAATGGAGAGTATGCGGTGAGGTGA
ACTCCTTTGGATTTGCAGAACTCTCGTAGTTTAGTCTGTTGCCAAGAAGGATGACATTCG
ACCTGATTAACGGCAGGAGGAGCACGAGCTAACTCTAAGAGAGTAGCTAGCTTCTTGGTG
GAGAAGTTGCTTACTCCTATGGCTCGTGCCTTGCCCGAGTCATAGAGTGCTTCCATCGCT
TTCCATGTGCTAGAAATATCTACAGGCATAAGGTCCTCGGGCTTAGCTCCAACAGAACCT
TTCTTCATCCGTACAGGCCAGTGTATCAAATAGAGATCGACATAGTCAAGCTGCAGATCC
TGTAGGGTTCTTTTCAGTGCCGTAGATCTGAGCGCAATCAATATGACGATATCCGATCTT
AACAGCTGCCGCGACGGCATCACCGACAAGACCAGGAGAGGCTTGCCATGTTCCCAAACC
CACCGACGGGATCTTAGCGCCAGTGTTGAGCTCGAAGAATCTAACTGCGTTAGCCATTAT
CAGAGGAGATGGAGTTCAA

QA 5 623 5 623
DS 



CO CL681Contig2 814 3 9 U
AGTTTTGTCTATTATTAATGAGTGAGGAGAAGTTGAGAAACGCTGTTTGCGTTTGAACCA
AACAGCAGTAGCGATCTTGAACTCCATCTCCTCTGACAATGGCTAACGCAGTTAGATTCT
TCGAGCTCAACACTGGCGCTAAGATCCCGTCGGTGGGTTTGGGAACATGGCAAGCCTCTC
CTGGTCTTGTCGGTGATGCCGTCGCCGCAGCTGTTAAGATCGGATATCGTCATATTGATT
GCGCTCAGATCTACGGCAACGAAAAAGAGATTGGGGCAGTTTTTAAAAAATTGTTTGAAG
ACAATGTAGTGAAACGCGAAGAGTTGTTCATCACTTCCAAGCTCTGGTGTACTGATCATG
ACCCTCAAGATGTGCCAGAGGCACTGAAAAGAACTCTACAGGATCTGCAGCTTGACTATG
TCGATCTCTATTTGATACACTGGCCTGTACGGATGAAGAAAGGTTCTGTTGGAGCTAAGC
CCGAGAACCTTATGCCTGTAGATATTTCTAGCACATGGAAAGCGATGGAAGCACTCTATG
ACTCGGGCAAGGCACGAGCCATAGGAGTAAGCAACTTCTCCACCAAGAAGATAGCTACCC
TCTTAGAGTTAGCTCGTGTGCCTCCTGCCGTTAATCAAGTCGAATGTCATCCTTCTTGGC
AACAGACTAAGCTACGAGAGTTCTGCAAATCCAAAGGAGTCCACCTCACCGCATACTCTC
CATTGGGTTCTCCAGGAACAACGTGGCTCAAAAGCGATGTTTTGAAGAACCCTATACTGA
ATACTGTTGCTGAAAACTCGGAAAGTCTCCAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE93TF U 1
AF RR2GW54TF U 50
AF RR2FQ49TF U 62
BS 1 163 RR2AE93TF
BS 164 164 RR2GW54TF
BS 165 258 RR2AE93TF
BS 259 562 RR2GW54TF
BS 563 563 RR2FQ49TF
BS 564 598 RR2GW54TF
BS 599 599 RR2FQ49TF
BS 600 758 RR2GW54TF
BS 759 814 RR2FQ49TF

RD RR2AE93TF 258 0 0
AGTTTTGTCTATTATTAATGAGTGAGGAGAAGTTGAGAAACGCTGTTTGCGTTTGAACCA
AACAGCAGTAGCGATCTTGAACTCCATCTCCTCTGACAATGGCTAACGCAGTTAGATTCT
TCGAGCTCAACACTGGCGCTAAGATCCCGTCGGTGGGTTTGGGGACATGGCAAGCCTCTC
CTGGTCTTGTCGGTGATGCCGTCGCCGCAGCTGTTAAGATCGGATATCGTCATATTGATT
GCGCTCAGATCTACGGCA

QA 1 258 1 258
DS 

RD RR2GW54TF 709 0 0
CGTTTGAACCAAACAGCAGTAGCGATCTTGAACTCCATCTCCTCAGATAATGGCTAACGC
AGTTAGATTCTTCGAGCTCAACACTGGCGCTAAGATCCCGTCGGTGGGTTTGGGAACATG
GCAAGCCTCTCCTGGTCTTGTCGGTGATGCCGTCGCGGCAGCTGTTAAGATCGGATATCG
TCATATTGATTGCGCTCAGATCTACGGCAACGAAAAAGAGATTGGGGCAGTTTTTAAAAA
ATTGTTTGAAGACAATGTAGTGAAACGCGAAGAGTTGTTCATCACTTCCAAGCTCTGGTG
TACTGATCATGACCCTCAAGATGTGCCAGAGGCACTGAAAAGAACTCTACAGGATCTGCA
GCTTGACTATGTCGATCTCTATTTGATACACTGGCCTGTACGGATGAAGAAAGGTTCTGT
TGGAGCTAAGCCCGAGAACCTTATGCCTGTAGATATTTCTAGCACATGGAAAGCGATGGA
AGCACTCTATGACTCGGGCAAGGCACGAGCCATTGGAGTAAGCAACTTCTCCACCAAGAA
GATAGCTACTCTCTTAGAGTTAGCTCGTGTGCCTCCTGCCGTTAATCAAGTCGAATGTCA
TCCTTCTTGGCAACAGACTAAGCTACGAGAGTTCTGCAAATCCAAAGGAGTCCACCTCAC
CGCATACTCTCCATTGGGTTCTCCAGGAACAACGTGGCTCAAAAGCGAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2FQ49TF 753 0 0
GG
AGCAGTAGCGATCTTGAACTCCATCTCCTCTGACAATGGCTAACGCAGTTAGATTCTTCG
AGCTCAACACTGGCGCTAAGATCCCGTCGGTGGGTTTGGGAACATGGCAAGCCTCTCCTG
GTCTTGTCGGTGATGCCGTCGCCGCAGCTGTTAAGATCGGATATCGTCATATTGATTGCG
CTCAGATCTACGGCAACGAAAAAGAGATTGGGGCAGTTTTTAAAAAATTGTTTGAAGACA
ATGTAGTGAAACGCGAAGAGTTGTTCATCACTTCCAAGCTCTGGTGTACTGATCATGACC
CTCAAGATGTGCCAGATGCACTGAAAAGAACTCTACAGGATCTGCAGCTTGACTATGTCG
ATCTCTATTTGATACACTGGCCTGTACGGATGAAGAAAGGTTCTGTTGGAGCTAAGCCCG
AGAACCTTATGCCTGTAGATATTTCTAGCACATGGAAAGCGATGGAAGCACTCTATGACT
CGGGCAAGGCACGAGCCATAGGAGTAAGCAACTTCTCCACCAAGAAGCTAGCTACCCTCT
TAGAGTTAGCTCGTGTTCCTCCTGCCGTTAATCAGGTCGAGTGTCATCCTTCTTGGCAAC
AGACTAAGCTACGAGAGTTCTGCAAATCCAAAGGAGTTCACCTCACCGCGTACTCTCCAT
TGGGTTCTCCGGGAACAACGTGGCTCAAGAGCGATGTTTTGAAGAACCCTATACTGAATA
CTGTTGCTGAAAACTCGGAAAGTCTCCAGCG

QA 3 753 3 753
DS 



CO CL681Contig3 596 2 9 U
TTCTTGGCAACAGATTAAGCTACGAGAGTTCTGCAAATCCAAAGGAGTCCACCTCACCGC
ATACTCTCCATTGGGTTCTCCAGGAACAACGTGGCTCAAAAGCGATGTTTTGAAGAACCC
TATACTGAATACTGTTGCTGATAAACTTGGAAAGTCTCCAGCGCAAGTAGCGCTACGCTG
GGGACTACAAATGGGTAACAGTGTTCTTCCTAAAAGCACCAATGAAGTGAGAATCAGAGA
GAACTTTGAGGTTTTTGATTGGTCCATACCCGATGACTTGTTTGCCAAGTTTTCAGAGAT
TGAACAGGCTAGGTTATTGACTGCTTCCTTCTTCGTTCATGAGACATTGAGCCCTTATAA
GTCTCTTCAAGAATTATGGGATGGTGAGATATGATACTTCAAATGATCTATTTGTTTTAT
CAATAATATGGAGGCTTCTATGTCTTTCGAACTTCTCAGTTTATTCATGAATGTTATGTC
ACTCAAATAATTTACTTTCATATTTGTGTTATTTTGAATTTTAATTAAAAGCTTATAAAG
CCAATTATGCATTCCTAATATATTTTAATCATCTTAAATAGAATGTGATGTTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV24TF U 27
AF RR2GW54JQ C 1
BS 1 27 RR2GW54JQ
BS 28 48 RR2DV24TF
BS 49 49 RR2GW54JQ
BS 50 99 RR2DV24TF
BS 100 100 RR2GW54JQ
BS 101 243 RR2DV24TF
BS 244 244 RR2GW54JQ
BS 245 508 RR2DV24TF
BS 509 596 RR2GW54JQ

RD RR2DV24TF 482 0 0
G
GTTCTGCAAATCCAAAGGAGTTCACCTCACCGCATACTCTCCATTGGGTTCTCCAGGAAC
AACGTGGCTCAAGAGCGATGTTTTGAAGAACCCTATACTGAATACTGTTGCTGATAAACT
TGGAAAGTCTCCAGCGCAAGTAGCGCTACGCTGGGGACTACAAATGGGTAACAGTGTTCT
TCCTAAAAGCACCAATGAAGTGAGAATCAGAGAGAATTTTGAGGTTTTTGATTGGTCCAT
ACCCGATGACTTGTTTGCCAAGTTTTCAGAGATTGAACAGGCTAGGTTATTGACTGCTTC
CTTCTTCGTTCATGAGACATTGAGCCCTTATAAGTCTCTTCAAGAATTATGGGATGGTGA
GATATGATACTTCAAATGATCTATTTGTTTTATCAATAATATGGAGGCTTCTATGTCTTT
CGAACTTCTCAGTTTATTCATGAATGTTATGTCACTCAAATAATTTACTTTCATATTTGT
G

QA 2 482 2 482
DS 

RD RR2GW54JQ 596 0 0
TTCTTGGCAACAGATTAAGCTACGAGAGTTCTGCAAATCCAAAGGAGTCCACCTCACCGC
ATACTCTCCATTGGGTTCTCCAGGAACAACGTGGCTCAAAAGCGATGTTTTGAAGAACCC
TATACTGAATACTGTTGCTGATAAACTTGGAAAGTCTCCAGCGCAAGTCGCGCTTCGCTG
GGGACTACAAATGGGTAACAGTGTTCTTCCTAAAAGCACCAATGAAGTGAGAATCAGAGA
GAACTTTGAGGTTTTTGATTGGTCCATACCCGATGACTTGTTTGCCAAGTTTTCAGAGAT
TGAACAGGCTAGGTTATTGACTGCTTCCTTCTTCGTTCATGAGACATTGAGCCCTTATAA
GTCTCTTCAAGAATTATGGGATGGTGAGATATGATACTTCAAATGATCTATTTGTTTTAT
CAATAATATGGAGGCTTCTATGTCTTTCGAACTTCTCAGTTTATTCATGAATGTTATGTC
ACTCAAATAATTTACTTTCATATTTGTGTTATTTTGAATTTTAATTAAAAGCTTATAAAG
CCAATTATGCATTCCTAATATATTTTAATCATCTTAAATAGAATGTGATGTTTCAC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 8

CO CL682Contig1 1100 8 12 U
GGATCTCTCTTTGATCAGGACTTATCAAAAGCACAAATAATGGCTCAAAAGGTGGAAGCA
CAAGGAGAGATGGGAGGAGATGTATGGGATGATGGTGTTTATGACGGCGTTAGAAAGGTG
CATGTAGGACAAGGCCAAGATGGTGTATCGTTTATCAATGCCGTGTACGAGAAGGGTTCT
CAGGAGGTTGAAGGAGGTGAACATGGAAATAAGACACTACTTGGATTCGAAACGTTCGAG
GTTGATGCAGACGACTACATCATAGCAGTGCAGGTAACCTACGACAAAATATTTGGCCAT
GAGTCCGATGTCATCACATCTATTACCTTCTATACATCCAAAGGGAAAGCCTCTCCACCC
TATGGATTAGAGACCGACAAAAAGTTTGTACTCAAGGAAAAAAA*CGGCGGTAAACTTCT
TGGGTTCCATGGACGCGCGGGAGAGGTTCTGCATGCTCTTGGTGCGTATTTCGTTACAAC
CACAACTCCTTTGACTCCTGCCAAGAAGCTTCCAGCAGTTGGTGGTGATGGAGGAACCGC
ATGGGATGATGGTGCTTACGATGGTGTTAGAAAGTTGTTTGTTGGACAAGCACAAGATGG
TATATCGGTCGTCAAGTTTGTGTACGACAAGGGAGCTGAGGAAATTATAGGAGATGAACA
TGGAAATAGTACTTTACTCGGATTCGAAGAGTTTGTACTTGACTATCCTAGTGAGTACAT
CACGTCAGTTGAAGGCACATATGATAAGATATTTGGGAGTGACTCTGAGGTCGTTACCAT
GCTTAGGTTCAAGACCAATAAGCAAACGTCTGCTCCCTTTGGAATTGAAGCTGGGACACC
CTTCGAACTCAAAGAGGAAGGCTCCAAGATCGTCGGGTTCCATGGAAAAGTCAGTGAGCT
GCTTCATCAGTTTGGAGTCCATGTCCTTCCAATCACTTATTGATCATCACATGTTTTCCT
TTCATTCCCTTCCATTAAGTTTCCTACCTTTTCTGTTCTGTTTGTTTATGTTTCCAGTGT
GTTATTGTCTCCTTTATGATGTTGTCATGTGTTTGATGCTATATATCTGTCTGCTTTAAT
AAAATGGTTGATATGAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ32TF U 115
AF RR2CY65TF U 60
AF RR2GX07TF U 1
AF RR2AP83TF U 244
AF RR2GX07JQ C 823
AF RR2EQ32JQ C 333
AF RR2FT72TF U 466
AF RR2FT72JQ C 494
BS 1 344 RR2GX07TF
BS 345 345 RR2CY65TF
BS 346 404 RR2GX07TF
BS 405 405 RR2CY65TF
BS 406 733 RR2GX07TF
BS 734 859 RR2AP83TF
BS 860 860 RR2FT72TF
BS 861 898 RR2AP83TF
BS 899 899 RR2FT72TF
BS 900 1016 RR2AP83TF
BS 1017 1092 RR2FT72TF
BS 1093 1100 RR2FT72JQ

RD RR2EQ32TF 237 0 0
G
AGGTGCATGTAGGACAAGGCCAAGATGGTGTATCGTTTATCAATGCCGTGTACGAGAAGG
GTTCTCAGGAGGTTGAAGGAGGTGAACATGGAAATAAGACACTACTTGGATTCGAAACGT
TCGAGGTTGATGCAGACGACTACATCATAGCAGTGCAGGTAACCTACGACAAAATATTTG
GCCATGAGTCCGATGTCATCACATCTATTACCTTCTATACATCCAAAGGGAAAGCC

QA 2 237 2 237
DS 

RD RR2CY65TF 534 0 0
ACAAGGAGGCG
TGGGAGGAGATGTATGGGATGATGGTGTTTATGACGGCGTTAGAAAGGTGCATGTAGGAC
AAGGCCAAGATGGTGTATCGTTTATCAATGCCGTGTACGAGAAGGGTTCTCAGGAGGTTG
AAGGAGGTGAACATGGAAATAAGACACTACTTGGATTCGAAACGTTCGAGGTTGATGCAG
ACGACTACATCATAGCAGTGCAGGTAACCTACGACAAAATATTTGGCCATGAGTCCGATG
TCATCACATCTATTACCTTCTATACATCCAAAGGGAAAGCCTCTCCACCCTATGGATTAG
AGACCGACAAAAAGTTTGTACTCAAGGAAAAAAA*CGGCGGTAAACTTCTTGGGTTCCAT
GGACGCGCGGGAGAGGTTCTGCATGCTCTTGGTGCGTATTTCGTTACAACCACAACTCCT
TTGACTCCTGCCAAGAAGCTTCCAGCAGTTGGTGGTGATGGAGGAACCGCATGGGATGAT
GGTGCTTACGATGGTGTTAGAAAGTTGTTTGTTGGACA
GCACA

QA 12 529 12 529
DS 

RD RR2GX07TF 733 0 0
GGATCTCTCTTTGATCAGGACTTATCAAAAGCACAAATAATGGCTCAAAAGGTGGAAGCA
CAAGGAGAGATGGGAGGAGATGTATGGGATGATGGTGTTTATGACGGCGTTAGAAAGGTG
CATGTAGGACAAGGCCAAGATGGTGTATCGTTTATCAATGCCGTGTACGAGAAGGGTTCT
CAGGAGGTTGAAGGAGGTGAACATGGAAATAAGACACTACTTGGATTCGAAACGTTCGAG
GTTGATGCAGACGACTACATCATAGCAGTGCAGGTAACCTACGACAAAATATTTGGCCAT
GAGTCCGATGTCATCACATCTATTACCTTCTATACATCCAAAGGAAAAGCCTCTCCACCC
TATGGATTAGAGACCGACAAAAAGTTTGTACTCAAGGAAAAAAAACGGCGGTAAACTTCT
TGGGTTCCATGGACGCGCGGGAGAGGTTCTGCATGCTCTTGGTGCGTATTTCGTTACAAC
CACAACTCCTTTGACTCCTGCCAAGAAGCTTCCAGCAGTTGGTGGTGATGGAGGAACCGC
ATGGGATGATGGTGCTTACGATGGTGTTAGAAAGTTGTTTGTTGGACAAGCACAAGATGG
TATATCGGTCGTCAAGTTTGTGTACGACAAGGGAGCTGAGGAAATTATAGGAGATGAACA
TGGAAATAGTACTTTACTCGGATTCGAAGAGTTTGTACTTGACTATCCTAGTGAGTACAT
CACGTCAGTTGAA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2AP83TF 773 0 0
GG
TGCAGACGACTACATCATAGCAGTGCAGGTAACCTACGACAAAATATTTGGCCATGAGTC
CGATGTCATCACATCTATTACCTTCTATACATCCAAAGGGAAAGCCTCTCCACCCTATGG
ATTAGAGACCGACAAAAAGTTTGTACTCAAGGAAAAAAA*CGGCGGTAAACTTCTTGGGT
TCCATGGACGCGCGGGAGAGGTTCTGCATGCTCTTGGTGCGTATTTCGTTACAACCACAA
CTCCTTTGACTCCTGCCAAGAAGCTTCCAGCAGTTGGTGGTGATGGAGGAACCGCATGGG
ATGATGGTGCTTACGATGGTGTTAGAAAGTTGTTTGTTGGACAAGCACAAGATGGTATAT
CGGTCGTCAAGTTTGTGTACGACAAGGGAGCTGAGGAAATTATAGGAGATGAACATGGAA
ATAGTACTTTACTCGGATTCGAAGAGTTTGTACTTGACTATCCTAGTGAGTACATCACGT
CAGTTGAAGGCACATATGATAAGATATTTGGGAGTGACTCTGAGGTCGTTACCATGCTTA
GGTTCAAGACCAATAAGCAAACGTCTGCTCCCTTTGGAATTGAAGCTGGGACACCCTTCG
AACTCAAAGAGGAAAGCTCCAAGATCGTCGGGTTCCATGGAAAAGTCAGTGAGTTGCTTC
ATCAGTTTGGAGTCCATGTCCTTCCAATCACTTATTGATCATCACATGTTTTCCTTTCAT
TCCCTTCCATTAAGTTTCCTACCTTTTCTGTTCTGTTTGTTTATGTTTCCA

QA 3 773 3 773
DS 

RD RR2GX07JQ 255 0 0
AATTGAAGCTGGGACACCCTTCGAACTCAAAGAGGAAGGCTCCAAGATCGTCGGGTTCCA
TGGAAAAGTCAGTGAGCTGCTTCATCAGTTTGGAGTCCATGTCCTTCCAATCACTTATTG
ATCATCACATGTTTTCCTTTCATTCCCTTCCATTAAGTTTCCTACCTTTTTTGTTCTGTT
TGTTTATGTTTCCAGTGTGTTATTGTCTCCTTTATGATGTTGTCATGTGTTTGATGCTAT
ATATCTGTCTGCTTT

QA 1 255 1 255
DS 

RD RR2EQ32JQ 763 0 0
TACATCCAAAGGGAAAGCCTCTCCACCTTATGGATTAGAGACCGACAAAAAGTTTGTACT
CAAGGAAAAAA**CGGCGGTAAGCTTCTTGGGTTCCATGGACGCGCGGGAGAGGTTCTGC
ATGCTCTTGGTGCGTATTTCGTTACAACCACAACTCCTTTGACTCCTGCCAAGAAGCTTC
CAGCAGTTGGTGGTGATGGAGGAACCGCATGGGATGATGGTGCTTACGATGGTGTTAGAA
AGTTGTTTGTTGGACAAGCACAAGATGGTATATCGGTCGTCAAGTTTGTGTACGACAAGG
GAGCTGAGGAAATTATAGGAGATGAACATGGAAATAGTACTTTACTCGGATTCGAAGAGT
TTGTACTTGACTATCCTAGTGAGTACATCACGTCAGTTGAAGGCACATATGATAAGATAT
TTGGGAGTGACTTTGAGGTCGTTACCATGCTTAGGTTCAAGACCAATAAGCAAACGTCTG
CTCCCTTTGGAATTGAAACTGGGACACCCTTCGAACTCAAAGAGGAAGGCTCCAAGATCG
TCGGGTTCCATGGAAAAGTCAGTGAGCTGCTTCATCAGTTTGGAGTCCATGTCCTTCCAA
TCACTTATTGATCATCACATGTTTTCCTTTCTTTCCCTTCCATTAAGTTTCTTACCTTTT
TTGTTCTGTTTGTTTATGTTTCCAGTGTGTTATTGTCTCCTTTATGATGTTGTCATGTGT
TTGATGCTATATATCTGTCTGCTTTAAAAAAACGGTTGAT
TTG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2FT72TF 635 0 0
GTATTTCGTTACAACCACAACTCCTTTGACTCCTGCCAAGAAGCTTCCAGCAGTTGGTGG
TGATGGAGGAACCGCATGGGATGATGGTGCTTACGATGGTGTTAGAAAGTTGTTTGTTGG
ACAAGCACAAGATGGTATATCGGTCGTCAAGTTTGTGTACGACAAGGGAGCTGAGGAAAT
TATAGGAGATGAACATGGAAATAGTACTTTACTCGGATTCGAAGAGTTTGTACTTGACTA
TCCTAGTGAGTACATCACGTCAGTTGAAGGCACATATGATAAGATATTTGGGAGTGACTC
TGAGGTCGTTACCATGCTTAGGTTCAAGACCAATAAGCAAACGTCTGCTCCCTTTGGAAT
TGAAGCTGGGACACCCTTCGAACTCAAAGAGGAAGGCTCCAAGATCGTCGGGTTCCATGG
AAAAGTCAGTGAGCTGCTTCATCAGTTTGGAGTCCATGTCCTTCCAATCACTTATTGATC
ATCACATGTTTTCCTTTCATTCCCTTCCATTAAGTTTCCTACCTTTTCTGTTCTGTTTGT
TTATGTTTCCAGTGTGTTATTGTCTCCTTTATGATGTTGTCATGTGTTTGATGCTATATA
TCTGTCTGCTTTAATAAAATGGTTGAT
ATGAACAC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2FT72JQ 607 0 0
ACTCCTGCCAAGAAGCTTCCAGCAGTTGGTGGTGATGGAGGAACCGCATGGGATGATGGT
GCTTACGATGGTGTTAGAAAGTTGTTTGTTGGACAAGCACAAGATGGTATATCGGTCGTC
AAGTTTGTGTACGACAAGGGAGCTGAGGAAATTATAGGAGATGAACATGGAAATAGTACT
TTATTCGGATTCGAAGAGTTTGTACTTGACTATCCTAGTGAGTACATCACGTCAGTTGAA
GGCACATATGATAAGATATTTGGGAGTGACTCTGAGGTCGTTACCATGCTTAGGTTCAAG
ACCAATAAGCAAACGTCTGCTCCCTTTGGAATTGAAGCTGGGACACCCTTCGAACTCAAA
GAGGAAGGCTCCAAGATCGTCGGGTTCCATGGAAAAGTCAGTGAGCTGCTTCATCAGTTT
GGAGTCCATGTCCTTCCAATCACTTATTGATCATCACATGTTTTCCTTTCATTCCCTTCC
ATTAAGTTTCCTACCTTTTCTGTTCTGTTTGTTTATGTTTCCAGTGTGTTATTGTCTCCT
TTATGATGTTGTCATGTGTTTGATGCTATATATCTGTCTGCTTTAATAAAATGGTTGATA
TGAACAC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 3 8

CO CL683Contig1 940 4 4 U
TGGGAGGGTTTACCTCCTGCAGCTAACTATCTATTCCTAGGAGATTACGTGGACCGTGGG
GAAGCAGAGTCTTGAAACCATCTGTCTTCTCCTTGCCTACAAGATCAAATACCCTGAGAA
CTTCTTCCTCCTGAGAGGCAACCACGAGTGTGCTTCCATCAACAGAATCTACGGATTCTA
CGACGAATGCAAACGCAGGTTCAGCGTGAGGCTCTGGAAAGTGTTTACAGATTCTTTCAA
CTGTCTCCCCGTGGCTGCTGTGATAGACGATAAGATACTGTGTATGCACGGTGGCCTTTC
TCCCGATCTGACCAACGTGGAGCAGATCAAGAACATTAAGCGGCCTACCGATGTTCCTGA
CTCTGGTTTGCTGTGCGATCTGCTTTGGTCTGATCCGAGCAAAGATGTGAAAGGGTGGGG
GATGAATGACCGTGGGGTTTCTTACACTTTTGGGCCTGATAAAGTCGCTGAGTTTTTGAT
AAAGAACGATATGGATCTCATCTGTCGTGCCCACCAGGTTGTAGAGGATGGTTATTAGTT
CTTTGCCGATAGACAGCTTGTTACTATATTTTCAGCTCCTAATTACTGTGGTGAATTCGA
TAATGCTGGTGCTATGATGAGTGTTGATGAGAGTTTAATGTGTTCTTTCCAAATTCTTAA
GCCTGCCGATCGGAGGCCTCGGTTCTTGTGAGTTAGAAACTCGCTGGTAAAAATACGAGA
GAGAGAGAGAGAGAGA******CATTTGACGCTCCCTGAGATTTTATCCTGAGGCCTTTG
CAAGAAGGCAGGGAAAAAAAACACATTGTTTACATGTTATATCATAATCTTATTTCAACT
CTTGTAATTTCTTTTTCTCAAAACTTTATATCATCTTCTTATTCTCTGACTCATATTAGA
CAGTAAACAAAAGTCTGCAAAGTTTTATTCTTTCATCCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B054TF U 1
AF RR2E714JQ C 307
AF RR2E714TF U 250
AF RR2B054JQ C 144
BS 1 198 RR2B054TF
BS 199 250 RR2B054JQ
BS 251 892 RR2E714TF
BS 893 940 RR2B054JQ

RD RR2B054TF 205 0 0
TGGGAGGGTTTACCTCCTGCAGCTAACTATCTATTCCTAGGAGATTACGTGGACCGTGGG
GAAGCAGAGTCTTGAAACCATCTGTCTTCTCCTTGCCTACAAGATCAAATACCCTGAGAA
CTTCTTCCTCCTGAGAGGCAACCACGAGTGTGCTTCCATCAACAGAATCTACGGATTCTA
CGACGAATGCAAACGCAG
TTCAGCG

QA 1 198 1 198
DS 

RD RR2E714JQ 586 0 0
TC
TGACCAACGTGGAGCAGATCAAGAACATTAAGCGGCCTACCGATGTTCCTGACTCTGGTT
TGCTGTGCGATCTGCTTTGGTCTGATCCGAGCAAAGATGTGAAAGGGTGGGGGATGAATG
ACCGTGGGGTTTCTTACACTTTTGGGCCTGATAAAGTCGCTGAGTTTTTGATAAAGAACG
ATATGGATCTCATCTGTCGTGCCCACCAGGTTGTAGAGGATGGTTATTAGTTCTTTGCCG
ATAGACAGCTTGTTACTATATTTTCAGCTCCTAATTACTGTGGTGAATTCGATAATGCTG
GTGCTATGATGAGTGTTGATGAGAGTTTAATGTGTTCTTTCCAAATTCTTAAGCCTGCCG
ATCGGAGGCCTCGGTTCTTGTGAGTTAGAAACTCGCTGGTAAAAATACGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGA******CATTTGACGCTCCCTGAGATTTTATCCTGAGGCCTTTGCAAGAAGG
CAGGGAAAAAAAACACATTGTTTACATGTTATATCATAATCTTATTTCAACTCTTGTAAT
TTCTTTTTCTCAAAACTTTATATCATCTTCTTATTCTCTGACTC

QA 3 586 3 586
DS 

RD RR2E714TF 643 0 0
G
GTGGCTGCTGTGATAGACGATAAGATACTGTGTATGCACGGTGGCCTTTCTCCCGATCTG
ACCAACGTGGAGCAGATCAAGAACATTAAGCGGCCTACCGATGTTCCTGACTCTGGTTTG
CTGTGCGATCTGCTTTGGTCTGATCCGAGCAAAGATGTGAAAGGGTGGGGGATGAATGAC
CGTGGGGTTTCTTACACTTTTGGGCCTGATAAAGTCGCTGAGTTTTTGATAAAGAACGAT
ATGGATCTCATCTGTCGTGCCCACCAGGTTGTAGAGGATGGTTATTAGTTCTTTGCCGAT
AGACAGCTTGTTACTATATTTTCAGCTCCTAATTACTGTGGTGAATTCGATAATGCTGGT
GCTATGATGAGTGTTGATGAGAGTTTAATGTGTTCTTTCCAAATTCTTAAGCCTGCCGAT
CGGAGGCCTCGGTTCTTGTGAGTTAGAAACTCGCTGGTAAAAATACGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGA******CATTTGACGCTCCCTGAGATTTTATCCTGAGGCCTTTGCAAGAAGGCA
GGGAAAAAAAACACATTGTTTACATGTTATATCATAATCTTATTTCAACTCTTGTAATTT
CTTTTTCTCAAAACTTTATATCATCTTCTTATTCTCTGACTC

QA 2 643 2 643
DS 

RD RR2B054JQ 797 0 0
ACGAGTGTGCTTCCATCAACAGAATCTACGGATTCTACGACGAATGCAAACGCAGGTTCA
GCGTGAGGCTCTGGAAAGTGTTTACAGATTCTTTCAACTGTCTCCCCGTGGCTGCTGTGA
TAGACGATAAGATACTGTGTATGCACGGTGGCCTTTCTCCCGATCTGACCAACGTGGAGC
AGATCAAGAACATTAAGCGGCCTACCGATGTTCCTGACTCTGGTTTGCTGTGCGATCTGC
TTTGGTCTGATCCGAGCAAAGATGTGAAAGGGTGGGGGATGAATGACCGTGGGGTTTCTT
ACACTTTTGGGCCTGATAAAGTCGCTGAGTTTTTGATAAAGAACGATATGGATCTCATCT
GTCGTGCCCACCAGGTTGTAGAGGATGGTTATGAGTTCTTTGCCGATAGACAGCTTGTTA
CTATATTTTCAGCTCCTAATTACTGTGGTGAATTCGATAATGCTGGTGCTATGATGAGTG
TTGATGAGAGTTTAATGTGTTCTTTCCAAATTCTTAAGCCTGCCGATCGGAGGCCTCGGT
TCTTGTGAGTTAGAAACTCGCTGGTAAAAATACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAC
ATTTGACGCTCCCTGAGATTTTATCCTGAGGCCTTTGCAAGAAGGCAGGGAAAAAAAACA
CATTGTTTACATGTTATATCATAATCTTATTTCAACTCTTGTAATTTCTTTTTCTCAAAA
CTTTATATCATCTTCTTATTCTCTGACTCATATTAGACAGTAAACAAAAGTCTGCAAAGT
TTTATTCTTTCATCCAG

QA 1 797 1 797
DS 



CO CL683Contig2 734 2 8 U
GGATCACACAGATATTCGTTGGAAATAAGAAAAAAAAAGTAAACTTGGAGGAAACAAAGG
CGAAAACTTTTATGGTCCAAAGATCGAGACACAGATCATCTTCTTCTTTTTTGGTTATCG
GGGCGATCGATTACTGTCCGAAAGGTTGAAACTTTTTGTTGTGTAGACAGAAGGGTGTTG
TTTTGGATCGTGGTCTTTTTGAATGGCGCAGGGAAGCATGGACCCTGCCGTTCTCGACGA
CATCATTCGTCGTCTGTTGGATTACAGAAACCCTAAGCCCGGAACCAAACAGGTCATGCT
CAACGAGTCTGAGATCCGACAGCTTTGTCTCGTCTCCAAAGAGATTTTCCTTCAGCAGCC
TAACCTCCTTGAGCTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGATATTCATGGACAGTACTC
AGATCTACTGAGGCTGTTTGAGTACAGAGGCTTCCCTCCAACAGCTAACTACCTCTTCCT
AGGAGACTACGTGGACCGCGGGAAGCAGAGCTTAGAGACCATCTGCCTCCTCCTCGCCTA
CAAAATCAAATACCCTGAGAACTTCTTCCTCCTAAGAGGCAACCACGAGTGCGCTTCCAT
CAACAGAATCTACGGATTCTACGACGAGTGCAAACGCAGGTTCAGCGTGAGACTCTGGAA
AGTGTTCACAGACTCTTTTAACTGCCTCCCCGTGGCTGCTGTGATAGACGATAAGATACT
GTGTATGCACGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW70TF U 1
AF RR2C102TF U 12
BS 1 119 RR2CW70TF
BS 120 120 RR2C102TF
BS 121 298 RR2CW70TF
BS 299 299 RR2C102TF
BS 300 445 RR2CW70TF
BS 446 446 RR2C102TF
BS 447 686 RR2CW70TF
BS 687 734 RR2C102TF

RD RR2CW70TF 686 0 0
GGATCACACAGATATTCGTTGGAAATAAGAAAAAAAAAGTAAACTTGGAGGAAACAAAGG
CGAAAACTTTTATGGTCCAAAGATCGAGACACAGATCATCTTCTTCTTTTTTGGTTATCT
GGGCGATCGATTACTGTCCGAAAGGTTGAAACTTTTTGTTGTGTAGACAGAAGGGTGTTG
TTTTGGATCGTGGTCTTTTTGAATGGCGCAGGGAAGCATGGACCCTGCCGTTCTCGACGA
CATCATTCGTCGTCTGTTGGATTACAGAAACCCTAAGCCCGGAACCAAACAGGTCATGTT
CAACGAGTCTGAGATCCGACAGCTTTGTCTCGTCTCCAAAGAGATTTTCCTTCAGCAGCC
TAACCTCCTTGAGCTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGATATTCATGGACAGTACTC
AGATCTACTGAGGCTGTTTGAGTACGGAGGCTTCCCTCCAACAGCTAACTACCTCTTCCT
AGGAGACTACGTGGACCGCGGGAAGCAGAGCTTAGAGACCATCTGCCTCCTCCTCGCCTA
CAAAATCAAATACCCTGAGAACTTCTTCCTCCTAAGAGGCAACCACGAGTGCGCTTCCAT
CAACAGAATCTACGGATTCTACGACGAGTGCAAACGCAGGTTCAGCGTGAGACTCTGGAA
AGTGTTCACAGACTCTTTTAACTGCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2C102TF 723 0 0
GG
ATTCGTTGGAAATAAGAAAAAAAA*GTAAACTTGGAGGAAACAAAGGCGAAAACTTTTAT
GGTCCAAAGATCGAGACACAGATCATCTTCTTCTTTTTTGGTTATCGGGGCGATCGATTA
CTGTCCGAAAGGTTGAAACTTTTTGTTGTGTAGACAGAAGGGTGTTGTTTTGGATCGTGG
TCTTTTTGAATGGCGCAGGGAAGCATGGACCCTGCCGTTCTCGACGACATCATTCGTCGT
CTGTTGGATTACAGAAACCCTAAGCCCGGAACCAAACAGGTCATGCTCAACGAGTCTGAG
ATCCGACAGCTTTGTCTCGTCTCCAAAGAGATTTTCCTTCAGCAGCCTAACCTCCTTGAG
CTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGATATTCATGGACAGTACTCAGATCTACTGAGG
CTGTTTGAGTACAGAGGCTTCCCTCCAACAGCTAACTACCTCTTCCTAGGAGACTACGTG
GACCGCGGGAAGCAGAGCTTAGAGACCATCTGCCTCCTCCTCGCCTACAAAATCAAATAC
CCTGAGAACTTCTTCCTCCTAAGAGGCAACCACGAGTGCGCTTCCATCAACAGAATCTAC
GGATTCTACGACGAGTGCAAACGCAGGTTCAGCGTGAGACTCTGGAAAGTGTTCACAGAC
TCTTTTAACTGCCTCCCCGTGGCTGCTGTGATAGACGATAAGATACTGTGTATGCACGTG
G

QA 3 723 3 723
DS 



CO CL683Contig3 761 2 23 U
AGATCATAAGAACATAAAAGGTTAAGAAGAGAAATGGTAAGAGTTCAAATAAGATGATGA
TGACGATAATATAACATTTAGACTTTCTTTTTTTTCTTTTGGCCTCTGAACAAAGTCTCA
GGGAGCTTCAAATGTCTCTCCCGCCAGGTTCTAACTCTTTTTGATCATAAGAACCGGGGC
CTCCGATCCGCAGGCTTAAGAATTTGGAAAGAGCACATCAAACTCTCATCAACACTCATC
ATCGCACCAGCATTGTCGAATTCACCACAGTAGTTTGGAGCTGAGAATATAGTAACAAGC
TGTCTATCTGCAAAGAACTCATACCCATCCTCTACAACCTGGTGGGCACGACAGATCAGA
TCCATATCGTTCTTGATAAGAAACTCAGCAACTTTATCAGGCCCAAACGTGTAAGAGACA
CCACGGTCGTTCATCCCCCAACCTTTGACATCTTTGCTCGGATCAGACCAAAGCAGATCA
CAGAACAAACCCGTGTCCGGAACATCGGTAGGTCTCTTAATAGTCTTGATCTGCTCCACG
CCGGTCAAATCGGGAGAAAGGCCACCGTGCATACACAGTATCTTATCGTCTATCACAGCA
GCCACGGGGAGGCAGTTAAAAGAGTCCGTGAACACTTTCCAGAGCCTCACGCTGAACCTG
CGTTTGCACTCGTCGTAGAATCCGTAGATTCTGTTGATCGAAGCGCACTCGTGGTTGCCT
CTTAGGAGGAAGAAGTTCTCAGGGTATTTGATTTTGTAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW70JQ U 91
AF RR2D287TF C 1
BS 1 90 RR2D287TF
BS 91 130 RR2CW70JQ
BS 131 131 RR2D287TF
BS 132 161 RR2CW70JQ
BS 162 162 RR2D287TF
BS 163 395 RR2CW70JQ
BS 396 396 RR2D287TF
BS 397 482 RR2CW70JQ
BS 483 483 RR2D287TF
BS 484 491 RR2CW70JQ
BS 492 492 RR2D287TF
BS 493 533 RR2CW70JQ
BS 534 534 RR2D287TF
BS 535 541 RR2CW70JQ
BS 542 542 RR2D287TF
BS 543 626 RR2CW70JQ
BS 627 627 RR2D287TF
BS 628 644 RR2CW70JQ
BS 645 645 RR2D287TF
BS 646 698 RR2CW70JQ
BS 699 699 RR2D287TF
BS 700 711 RR2CW70JQ
BS 712 761 RR2D287TF

RD RR2CW70JQ 621 0 0
TTTTTCTTTTGGCCTCTGAACAAAGTCTCAGGGAGCTTCATATGTCTCTCCCGCCAGGTT
CTAACTCTTTT*GATCATAAGAACCGGGGCCTCCGATCCGCAGGCTTAAGAATTTGGAAA
GAGCACATCAAACTCTCATCAACACTCATCATCGCACCAGCATTGTCGAATTCACCACAG
TAGTTTGGAGCTGAGAATATAGTAACAAGCTGTCTATCTGCAAAGAACTCATACCCATCC
TCTACAACCTGGTGGGCACGACAGATCAGATCCATATCGTTCTTGATAAGAAACTCAGCA
ACTTTGTCAGGCCCAAACGTGTAAGAGACACCACGGTCGTTCATCCCCCAACCTTTGACA
TCTTTGCTCGGATCAGACCAAAGCAGATCACATAACAAACCGGTGTCCGGAACATCGGTA
GGTCTCTTAATAGTCTTGATCTGTTCCACGCTGGTCAAATCGGGAGAAAGGCCACCGTGC
ATACACAGTATCTTATCGTCTATCACAGCAGCCACGGGGAGGCAGTTAAAAGAGTCTGTG
AACACTTTCCAGAGTCTCACGCTGAACCTGCGTTTGCACTCGTCGTAGAATCCGTAGATT
CTGTTGATGGAAGCGCACTCG

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2D287TF 761 0 0
AGATCATAAGAACATAAAAGGTTAAGAAGAGAAATGGTAAGAGTTCAAATAAGATGATGA
TGACGATAATATAACATTTAGACTTTCTTTTTTTTCTTTTGGCCTCTGAACAAAGTCTCA
GGGAGCTTCAAATGTCTCTCCCGCCAGGTTCTAACTGTTTTTGATCATAAGAACCGGGGC
CTCCGATCCGCAGGCTTAAGAATTTGGAAAGAGCACATCAAACTCTCATCAACACTCATC
ATCGCACCGGCATTGTCGAATTCACCACAGTAGTTTGGAGCTGAGAATATAGTAACAAGC
TGTCTATCTGCAAAGAACTCATACCCATCCTCTACAACCTGGTGGGCACGACAGATGAGA
TCCATATCGTTCTTGATAAGAAACTCAGCAACTTTATCAGGCCCAAACGTGTAAGAGACA
CCACGGTCGTTCATCCCCCACCCTTTTACATCTTTGCTCGGATCAGACCAAAGCAGATCA
CAGAGCAAACCCGTGTCCGGAACATCGGTAGGTCTCTTAATAGTCTTGATCTGCTCCACG
CCGGTCAAATCGGGAGAAAGGCCACCGTGCATACACAGTATCTTATCGTCTATGACAGCA
GCCACGGGGAGGCAGTTGAAAGAGTCCGT*AACACTTTCCAGAGCCTCACGCTGAACCTG
CGTTTGCACTCGTCGTAGAATCCGTAGATTCTGTTGATCGAAGCGCACTCGTGGTTGCCT
CTTAGGAGGAAGAAGTTCTCAGGGTATTTGATTTTGTAGGC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 8

CO CL684Contig1 1406 8 40 U
GGCTTCACAGACACAACAAACAAAACAAAGAAAGATAACAATAAAAAATCGCACAGCTCC
*TTGTCCGCGCGACGAATCTGATTAGGGTTTTTGAGAATCTTCACACACCTTCCGTGTTT
*GAATTTGCGATATCGGAATCAGCTGCAAAAAAGACATGATTTCTGATTCGATCACCAAC
GCATCTGCTTCTGCAGCCCCAAGCGCGAGGGATATGGGGAAGAAGAAAAGG***ACGAAC
AGGGCGGCGAAATTGAAACAGAGCAAGCTAGGTCTCCGCCGTGAGCAATGGCTTTCTCAA
GTTGCGATGATTAACAAAGGGGATAAGGAGGAGACGTGTCCCAATCGAAAAACTGGAAAT
GAAAAAACCGTTCAGAGAGATCTTCCGGTTGTGAATTTAGAAGGGCAGCGTGGAGAAGAA
GAAGCACATCGTCACGAGAGCTTTATGGAATCATCGCTTTCGAATAGCCCCAACAGTATC
CTCAATTCAATCCCTGATTTTAGCAGCGGGAGTAGCAGTGGGAGTGGTGGCTCTTGCTCT
GGTAATATCACAGAGGAAGAAGAAGAGGAGGATGCTCCTGCTGATGATGACAACGACGAC
GACGGTTGCTTGGATGACTGGGAGGCTTTTGCTGATGCTTTAGCAGCTGATGAAGAAAAA
AAGCATGAGAAAGTGAATCCTCCTCCTGAAGAGCATGTCAAGCAATCAGCTTCGGTTAGG
GACTCTGTCAGTGGTGGATCTGATGTGAAGCCGTCAAGGAAGCAGAAGAGCAACCAGGCG
TGGAGGGCAGACGATAAGCTCCGTCCTCAGGGTCTGCCTAATCTGGGAAAGCAGCGTAGT
TTTCCTGTCATGAACATGCATTTTAGTTCCGTGGCAGTGCCGTCTTCGTGCCCCATTTGC
TACGAGGATCTGGACTTGACGGATTCTAGTTTCCTGCCATGCCCTTGTGGATTCCGCCTC
TGCCTTTTCTGCCACAAGACGATCTGCGATGGAGATGGGCGTTGTCCAGGCTGCAGGAAG
CCGTATGAAAAGAACACAGTCAAGGTTGAGACTAGTGTTCACGCTGGTGGTCTGACTATT
AGGCTTGCTCGTTCCTCTAGCATGTTTTGCAGGTCTTGAAAAGTAAAAGAGGATGTGGGT
TTTCTCGGACTGTGTCTGTTTGTTTTCTCTCACTTTTTTTTTT*CTCCTTTCCCTTCGCA
TGTTCTATGTTTTTTCACATGTCTTTAAAAACTCTTTAGATATGGGTATAGCATTTGTCT
TTTGGCACCTAAGAACTATAATGTATGTTCTTCTATGTCAGTGACACTCTTCTTCGTCTG
AAACATGTGGTTGTGGTGATGTAGAGTGGTGTGTGTGAGTGAGTATATAAAGTGGTACAC
GAAATCGAAATGCATAAAGTTACAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP76TF U 10
AF RR2EL81TF U 10
AF RR2G194TF U 17
AF RR2D630TF U 1
AF RR2DP76JQ C 498
AF RR2G194JQ C 562
AF RR2AG77JQ C 582
AF RR2EL81JQ C 955
BS 1 60 RR2D630TF
BS 61 61 RR2DP76TF
BS 62 112 RR2D630TF
BS 113 113 RR2DP76TF
BS 114 120 RR2D630TF
BS 121 121 RR2DP76TF
BS 122 126 RR2D630TF
BS 127 127 RR2DP76TF
BS 128 128 RR2D630TF
BS 129 129 RR2DP76TF
BS 130 151 RR2D630TF
BS 152 152 RR2DP76TF
BS 153 286 RR2D630TF
BS 287 287 RR2DP76TF
BS 288 630 RR2D630TF
BS 631 631 RR2EL81TF
BS 632 661 RR2D630TF
BS 662 662 RR2DP76JQ
BS 663 687 RR2D630TF
BS 688 688 RR2G194TF
BS 689 713 RR2D630TF
BS 714 715 RR2DP76JQ
BS 716 720 RR2D630TF
BS 721 721 RR2DP76JQ
BS 722 748 RR2D630TF
BS 749 883 RR2DP76JQ
BS 884 884 RR2G194JQ
BS 885 959 RR2DP76JQ
BS 960 960 RR2AG77JQ
BS 961 968 RR2DP76JQ
BS 969 969 RR2AG77JQ
BS 970 983 RR2DP76JQ
BS 984 984 RR2AG77JQ
BS 985 1270 RR2DP76JQ
BS 1271 1289 RR2G194JQ
BS 1290 1290 RR2AG77JQ
BS 1291 1317 RR2G194JQ
BS 1318 1318 RR2AG77JQ
BS 1319 1337 RR2G194JQ
BS 1338 1406 RR2AG77JQ

RD RR2DP76TF 537 0 0
GGACAGACACAAC
AAACAAAGAAAGATAACAATAAAAAATCGCACAGCTCC*TTGTCCGCGCGACGAATCTGA
TTAGGGTTTTTGAGAATCTTCACACACCTTCCGTGTTT*GAATTTGCGATATCGGAATCA
GCTGCAAAAAAGACATGATTTCTGATTCGATCACCAACGCATCTGCTTCTGCAGCCCCAA
TCGCGAGGGATATGGGGAAGAAGAAAAGG***ACGAACAGGGCGGCGAAATTGAAACAGA
GCAAGCTAGGTCTCCGCCGTGAGCAATGGCTTTCTCAAGTTGCGATGATTAACAAAGGGG
ATAAGGAGGAGACGTGTCCCAATCGAAAAACTGGAAATGAAAAAACCGTTCAGAGAGATC
TTCCGGTTGTGAATTTAGAAGGGCAGCGTGGAGAAGAAGAAGCACATCGTCACGAGAGCT
TTATGGAATCATCGCTTTCGAATAGCCCCAACAGTATCCTCAATTCAATCCCTGATTTTA
GCAGCGGGAGTAGCAGTGGGAGTGGTGGCTCTTGCTCTGGTAAT

QA 14 537 14 537
DS 

RD RR2EL81TF 645 0 0
GGACAGACACAAC
AAACAAAGAAAGATAACAATAAAAAATCGCACAGCTCC*TTGTCCGCGCGACGAATCTGA
TTAGGGTTTTTGAGAATCTTCACACACCTTCCGTGTTT*GAATTTGCGATATCGGAATCA
GCTGCAAAAAAGACATGATTTCTGATTCGATCACCAACGCATCTGCTTCTGCAGCCCCAA
GCGCGAGGGATATGGGGAAGAAGAAAAGGCAGACGAACAGGGCGGCGAAATTGAAACAGA
GCAAGCTAGGTCTCCGCCGTGAGCAATGGCTTTCTCAAGTTGCGATGATTAACAAAGGGG
ATAAGGAGGAGACGTGTCCCAATCGAAAAACTGGAAATGAAAAAATCGTTCAGAGAGATC
TTCCGGTTGTGAATTTAGAAGGGCAGCGTGGAGAAGAAGAAGCACATCGTCACGAGAGCT
TTATGGAATCATCGCTTTCGAATAGCCCCAACAGTATCCTCAATTCAATCCCTGATTTTA
GCAGCGGGAGTAGCAGTGGGAGTGGTGGCTCTTGCTCTGGTAATATCACAGAGGAAGAAG
AAGAGGAGGATGCTCCTGCTGATGATGACAACGACGACGACGGTTGCTTGGATGACTGGG
AGGCTTTTGCTGATGCTTTAGCAGCTGATGAA

QA 14 645 14 645
DS 

RD RR2G194TF 694 0 0
GACAAC
AAACAAAGAAAGATAACAATAAAAAATCGCACAGCTCC*TTGTCCGCGCGACGAATCTGA
TTAGGGTTTTTGAGAATCTTCACACACCTTCCGTGTTT*GAATTTGCGATATCGGAATCA
GCTGCAAAAAAGACATGATTTCTGATTCGATCACCAACGCATCTGCTTCTGCAGCCCCAA
GCGCGAGGGATATGGGGAAGAAGAAAAGG***ACGAACAGGGCGGCGAAATTGAAACAGA
GCAAGCTAGGTCTCCGCCGTGAGCAATGGCTTTCTCAAGTTGCGATGATTAACAAAGGGG
ATAAGGAGGAGACGTGTCCCAATCGAAAAACTGGAAATGAAAAAACCGTTCAGAGAGATC
TTCCGGTTGTGAATTTAGAAGGGCAACGTGGAGAAGAAGAAGCACATCGTCACGAGAGCT
TTATGGAATCATCGCTTTCGAATAGCCCCAACAGTATCCTCAATTCAATCCCTGATTTTA
GCAGCGGGAGTAGCAGTGGGAGTGGTGGCTCTTGCTCTGGTAATATCACAGAGGAAGAAG
AAGAGGAGGATGCTCCTGCTGATGATGACAACGACGACGACGGTTGCTTGGATGACTGGG
AGGCTTTTGCTGATGCTTTAGCAGCTGATGAAGAAAAAA*GCATGAGAAAGTGAATCCTC
CTCCTGAAGAGCATGTCAAGCAATCAGC

QA 7 694 7 694
DS 

RD RR2D630TF 764 0 0
GGCTTCACAGACACAACAAACAAAACAAAGAAAGATAACAATAAAAAATCGCACAGCTCC
CTTGTCCGCGCGACGAATCTGATTAGGGTTTTTGAGAATCTTCACACACCTTTCGTGTTT
TGAATTAGAGATATCGGAATCAGCTGCAAAAGAGACATGATTTCTGATTCGATCACCAAC
GCATCTGCTTCTGCAGCCCCAAGCGCGAGGGATATGGGGAAGAAGAAAAGG***ACGAAC
AGGGCGGCGAAATTGAAACAGAGCAAGCTAGGTCTCCGCCGTGAGCGATGGCTTTCTCAA
GTTGCGATGATTAACAAAGGGGATAAGGAGGAGACGTGTCCCAATCGAAAAACTGGAAAT
GAAAAAACCGTTCAGAGAGATCTTCCGGTTGTGAATTTAGAAGGGCAGCGTGGAGAAGAA
GAAGCACATCGTCACGAGAGCTTTATGGAATCATCGCTTTCGAATAGCCCCAACAGTATC
CTCAATTCAATCCCTGATTTTAGCAGCGGGAGTAGCAGTGGGAGTGGTGGCTCTTGCTCT
GGTAATATCACAGAGGAAGAAGAAGAGGAGGATGCTCCTGCTGATGATGACAACGACGAC
GACGGTTGCTTGGATGACTGGGAGGCTTTTACTGATGCTTTAGCAGCTGATGAAGAAAAA
A*GCATGAGAAAGTGAATCCTCCTCCTCAAGAGCATGTCAAGCAATCAGCTTCTCTTAGG
*ACTCTGTCAGTGGTGGATCTGATGTGA
GCCGTCAGGAGCAGAG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2DP76JQ 774 0 0
TTTTAGCAGCGGGAGTAGCAGTGGGAGTGGTGGCTCTTGCTCTGGTAATATCACAGAGGA
AGAAGAAGAGGAGGATGCTCCTGCTGATGATGACAACGACGACGACGGTTGCTTGGATGA
CTGGGAGGCTTTTGCTGATGCTTTAGCAGCTGATGAAGAAAAAAAGCATGAGAAAGTGAA
TCCTCCTCCTGAAGAGCATGTCAAGCAATCAGCTTCGGTTAGGGACTCTGTCAGTGGTGG
ATTTGATGTGAAGCCGTCAAGGAAGCAGAAGAGCAACCAGGCGTGGAGGGCAGACGATAA
GCTCCGTCCTCAGGGTCTGCCTAATCTGGGAAAGCAGCGTAGTTTTCCTGTCATGAACAT
GCATTTTAGTTCCGTGGCAGTGCCGTTTTCGTGCCCCATTTGCTACGAGGATCTGGACTT
GACGGATTCTAGTTTCCTGCCATGCCCTTGTGGATTCCGCCTTTGCCTTTTTTGCCACAA
GACGATTTGCGATGGAGATGGGCGTTGTCCAGGCTGCAGGAAGCCGTATGAAAAGAACAC
AGTCAAGGTTGAGACTAGTGTTCACGCTGGTGGTCTGACTATTAGGCTTGCTCGTTCCTC
TAGCATGTTTTGCAGGTCTTGAAAAGTAAAAGAGGATGTGGGTTTTCTCGGACTGTGTCT
GTTTGTTTTCTCTCACTTTTTTTTTT*CTCCTTTCCCTTCGCATGTTCTATGTTTTTTCA
CATGTCTTTAAAAACTCTTTAGATATGGGTATAGCATTTGTCTTTTGGCACCT
G

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2G194JQ 777 0 0
GAAGAGGAGGATGCTC*TGCTGATGATGACAACGACGACGACGGTTGCTTGGATGACTGG
GAGGCTTTTGCTGATGCTTTAGCAGCTGATGAAGAAAAAAAGCATGAGAAAGTGAATCCT
CCTCCTGAAGAGCATGTCAAGCAATCAGCTTCGGTTAGGGACTCTGTCAGTGGTGGATCT
GATGTGAAGCCGTCAAGGAAGCAGAAGAGCAACCAGGCGTGGAAGGCAGACGATAAGCTC
CGTCCTCAGGGTCTGCCTAATCTGGGAAAGCAGCGTAGTTTTCCTGTCATGAACATGCAT
TTTAGTTCCGTGGCAGTGCCGTCTTCGTGCCCCATTTGCTACGAGGATCTGGACTTGACG
GATTCTAGTTCCCTGCCATGCCCTTGTGGATTCCGCCTTTGCCTTTTTTGCCACAAGACG
ATTTGCGATGGAGATGGGCGTTGTCCAGGCTGCAGGAAGCCGTATGAAAAGAACACAGTC
AAGGTTGAGACTAGTGTTCACGCTGGTGGTCTGACTATTAGGCTTGCTCGTTCCTCTAGC
ATGTTTTGCAGGTCTTGAAAAGTAAAAGAGGATGTGGGTTTTCTCGGACTGTGTCTGTTT
GTTTTCTCTCACTTTTTTTTTTTCTCCTTTCCCTTCGCATGTTTTATGTTTTTTCACATG
TCTTTAAAAACTCTTTAGATATGGGTATAGCATTTGTCTTTTGGCACCTAAGAACTATAA
TGTATGTTTTTCTATGTCAGTGACACTCTTCTTCGTTTGAAACATGTGGTTGTGGT
G

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2AG77JQ 825 0 0
TGATGATGACAACGACGACGACGGTTGCTTGGATGACTGGGAGGCTTTTGCTGATGCTTT
AGCAGCTGATGAAGAAAAAAAGCATGAGAAAGTGAATCCTCCTCCTGAAGAGCATGTCAA
GCAATCAGCTTCGGTTAGGGACTCTGTCAGTGGTGGATCTGATGTGAAGCCGTCAAGGAA
GCAGAAGAGCAACCAGGCGTGGAGGGCAGACGATAAGCTCCGTCCTCAGGGTCTGCCTAA
TTTGGGAAAACAGCGTAGTTTCCCTGTAATGAACATTCATTTTAGTTCCGTGGCGGTGCC
ATCTTCGTGCCCCATTTGCTACGAGGATCTGGACTTGACGGATTCTAGTTTCCTGCCATG
CCCTTGTGGATTCCGCCTCTGCCTTTTCTGCCACAAGACGATCTGCGATGGAGATGGGCG
TTGTCCAGGCTGCAGGAAGCCGTATGAAAAGAACACAGTCAAGGTTGAGACTAGTGTTCA
CGCTGGTGGTCTGACTATTAGGCTTGCTCGTTCCTCTAGCATGTTTTGCAGGTCTTGAAA
AGTAAAAGAGGATGTGGGTTTTCTCGGACTGTGTCTGTTTGGTTTCTCTCACTTTTTTTT
***CTCCTTTCCCTTCGCATGTTCTATGTTTTTTCACATGTCTTTAAAAACTCTTTAGAG
ATGGGTATAGCATTTGTCTTTTGGCACCTAAGAACTATAATGTATGTTCTTCTATGTCAG
TGACACTCTTCTTCGTCTGAAACATGTGGTTGTGGTGATGTAGAGTGGTGTGTGTGAGTG
AGTATATAAAGTGGTACACGAAATCGAAATGCATAAAGTTACAAT

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR2EL81JQ 439 0 0
CGCCTCTGCCTTTTCTGCCACAAGACGATCTGCGATGGAGATGGGCGTTGTCCAGGCTGC
AGGAAGCCGTATGAAAAGAACACAGTCAAGGTTGAGACTAGTGTTCACGCTGGTGGTCTG
ACTATTAGGCTTGCTCGTTCCTCTAGTATGTTTTGCAGGTCTTGAAAAGTAAAAGAGGAT
GTGGGTTTTCTCGGACTGTGTCTGTTTGTTTTCTCTCACTTTTTTTTTT*CTCCTTTCCC
TTCGCATGTTCTATGTTTTTTCACATGTCTTTAAAAACTCTTTAGATATGGGTATAGCAT
TTGTCTTTTGGCACCTAAGAACTATAATGTATGTTCTTCTATGTCAGTGACACTCTTCTT
CGTCTGAAACATGTGGTTGTGGTTATGTAGAGTGGTGTGTGTGAGTGAGTATTTAAAGTG
GTACACGAAATTGAAATGC

QA 1 439 1 439
DS 



AS 2 5

CO CL685Contig1 1195 3 14 U
GGGGTATTCATTGCTTGCTGTCGAGAAAACATAGTGAGAAAGAGAGACAATGGCGACGGT
ACCTCTGTTCACCCAGTTTCCCTGCAAAACTCTAGTTCCATCCTCTCCGAACTCTAAACT
CCAATCAAAAGCTCCGACGCTAGTGCCCGTAAACCCAATCAACCGGCGGTCGGAGGTTAG
AACCACTGTCCATCGGCCGGATTTCAAGGTCCGAGTTAGCGACGTTAACGACGAGTGGGG
TCCTGATGCGTCGGAGAGAGGGTCTAACGTATCGGTGGCCGAGAAAGTAGCAGAAGAAGC
GATTGAATCCGTGGAGGAGACGGAGCGGCTGAAGAGATCGCTAGCGGATTCTTTGTACGG
AACAGATCGAGGTCTTAGCGCGTCGAGCGAGACCAGAGCCGAGATCAGTGAGCTCATCAC
GCAGCTCGAGTCCAACAACCCTAATCCAGCTCCGAACGATGCTCTGTTTCTCCTCAGCGG
CAAATGGATTCTCGCTTACACATCGTTCGTTGGTCTGTTCCCGTTGCTCTCACGCAGAAT
CTCACCGTTGGTCAAAGTGG*ATGAGATCTCACAAACCATCGACTCGGAGAGCTTCACCG
TACAAAACTCTGTCCGCTTCGCTGGTCCCCTTGCCACGACATCGTTTAGCACCAACGCTA
AGTTCGAAGTCCAAAGTCCAAAACGCGTCCAGATCAAGTTTGAGCAAGGTGTTATCGGGA
CTCCTCAGCTAACGGATTCGATAGAGATCCCCGAGTTCGTGGAGGTTCCTGGTCAGAAAA
TCGATCTCAACCCCATTAGAGGATTACTCACGTCTGTCCAGGACACGGCTTCTTCAGTGG
CGAGAACCATTTCAAGCCAACCACCGTTGAAATTCTCTTTGCCTGCAGACAGAGCGCAGT
CGTGGCTGCTCACGACTTATCTCGACAAAGACCTTCGGATCTCGAGAGGCGATGGTGGAA
GCATTTTTGTGCTTATCAAAGAAGGCAGCTCTCTCTTAAACCCTTAAAAAACATTGTAAA
GTAAAATCTATATAGAACCATGTCTGTATTTAATAGTTAAGTGTTATTGTTGGAGAGTTA
TGATATGATGGTTGTTGTGTATTCAGGGTTTAAATGTTTGATAATTTTGGCTTATAAAGT
TGTAAAAGGTCTCTGATACAGTATGTTATTATTGCACAAACCGATTTTGTTACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ66TF U 60
AF RR2FM77TF U 1
AF RR2BV18JQ C 447
BS 1 458 RR2FM77TF
BS 459 459 RR2CZ66TF
BS 460 559 RR2FM77TF
BS 560 560 RR2CZ66TF
BS 561 679 RR2FM77TF
BS 680 680 RR2BV18JQ
BS 681 708 RR2FM77TF
BS 709 709 RR2BV18JQ
BS 710 751 RR2FM77TF
BS 752 752 RR2BV18JQ
BS 753 766 RR2FM77TF
BS 767 768 RR2BV18JQ
BS 769 789 RR2FM77TF
BS 790 1195 RR2BV18JQ

RD RR2CZ66TF 596 0 0
TACCTCTGTTCACCCAGTTTCCCTGCAAAACTCTAGTTCCATCCTCTCCGAACTCTAAAC
TCCAATCAAAAGCTCTGACGCTAGTGCCCGTAAACCCAATCAACCGGCGGTCGGAGGTTA
GAACCACTGTCCATCGGCCGGATTTCAAGGTCCGAGTTAGCGACGTTAACGACGAGTGGG
GTCCTGATGCGTCGGAGAGAGGGTCTAACGTATCGGTGGCCGAGAAAGTAGCAGAAGAAG
CGATTGAATCCGTGGAGGAGACGGAGCGGCTGAAGAGATCGCTAGCGGATTCTTTGTACG
GAACAGATCGAGGTCTTAGCGCGTCGAGCGAGACCAGAGCCGAGATCAGTGAGCTCATCA
CGCAGCTCGAGTCCAACAACCCTAATCCAGCTCCGAACGATGCTCTGTTTCTCCTCAGCG
GCAAATGGATTCTCGCTTACACATCGTTCGTTGGTCTGTTCCCGTTGCTCTCACGCAGAA
TCTCACCGTTGGTCAAAGTGGGATGAGATCTCACAAACCATCGACTCGGAGAGCTTCACC
GTACAAAACTCTGTCCGCTTCGCTGGTCCCCTTGCCACGACATCGTTTAGCACCAA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2FM77TF 794 0 0
GGGGTATTCATTGCTTGCTGTCGAGAAAACATAGTGAGAAAGAGAGACAATGGCGACGGT
ACCTCTGTTCACCCAGTTTCCCTGCAAAACTCTAGTTCCATCCTCTCCGAACTCTAAACT
CCAATCAAAAGCTCCGACGCTAGTGCCCGTAAACCCAATCAACCGGCGGTCGGAGGTTAG
AACCACTGTCCATCGGCCGGATTTCAAGGTCCGAGTTAGCGACGTTAACGACGAGTGGGG
TCCTGATGCGTCGGAGAGAGGGTCTAACGTATCGGTGGCCGAGAAAGTAGCAGAAGAAGC
GATTGAATCCGTGGAGGAGACGGAGCGGCTGAAGAGATCGCTAGCGGATTCTTTGTACGG
AACAGATCGAGGTCTTAGCGCGTCGAGCGAGACCAGAGCCGAGATCAGTGAGCTCATCAC
GCAGCTCGAGTCCAACAACCCTAATCCAGCTCCGAACGGTGCTCTGTTTCTCCTCAGCGG
CAAATGGATTCTCGCTTACACATCGTTCGTTGGTCTGTTCCCGTTGCTCTCACGCAGAAT
CTCACCGTTGGTCAAAGTGA*ATGAGATCTCACAAACCATCGACTCGGAGAGCTTCACCG
TACAAAACTCTGTCCGCTTCGCTGGTCCCCTTGCCACGACATCGTTTAGCACCAACGCTA
AGTTCGAAGTCCAAAGTCCTAAACGCGTCCAGATCAAGTTTGAGCAAG*TGTTATCGGGA
CTCCTCAGCTAACGGATTCGATAGAGATCCCTGAGTTCGTGGAGGT**CTGGTCAGAAAA
TCGATCTCA
CCCCA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2BV18JQ 749 0 0
CAGCTCCGAACGATGCTCTGTTTCTCCTCAGCGGCAAATGGATTCTCGCTTACACGTCGT
TCGTTGGTCTGTTCCCGTTGCTCTCACGTAGAATCTCACCGTTGGTCAAAGTGG*ATGAG
ATCTCACAAACCATCGACTCCGACAGCTTCACTGTACAAAACTCTGTCCGGTTCGCTGGT
CCCCTTGCTACGACATCGTTTAGCACCAACGCTAAGTTCGAAGTCCAAAGTCCAAAACGT
GTCCAGATCAAGTTTGAGCAAGGTGTTATCGGGACTCCTCAGCTAACGGATTCGATAGAG
ATCCCCGAGTTCGTGGAGGTTCTTGGTCAGAAAATCGATCTCAACCCCATTAGAGGATTA
CTCACGTCTGTCCAGGACACGGCTTCTTCAGTGGCGAGAACCATTTCAAGCCAACCACCG
TTGAAATTCTCTTTGCCTGCAGACAGAGCGCAGTCGTGGCTGCTCACGACTTATCTCGAC
AAAGACCTTCGGATCTCGAGAGGCGATGGTGGAAGCATTTTTGTGCTTATCAAAGAAGGC
AGCTCTCTCTTAAACCCTTAAAAAACATTGTAAAGTAAAATCTATATAGAACCATGTCTG
TATTTAATAGTTAAGTGTTATTGTTGGAGAGTTATGATATGATGGTTGTTGTGTATTCAG
GGTTTAAATGTTTGATAATTTTGGCTTATAAAGTTGTAAAAGGTCTCTGATACAGTATGT
TATTATTGCACAAACCGATTTTGTTACAG

QA 1 749 1 749
DS 



CO CL685Contig2 980 2 6 U
GGATTCATTGCTTGCTGTGAAGAAAACATAGTGAGAGAGAGAGACAAAAATGGCGACGGT
ACCTCTGTTCACCCAGTTTCCATGCAAAACTCTAGCTCCAAGCTCCTCCAACTCTAAACT
CCAACCAAAATCTCCGACTCTAGTGCCCGTAAATCCAATCAACCGGTGGTCGGAGGTTAG
AACCACTGTCCATCGGCCGGATTTCAAGGTCCGAGTTAGCGACGTTAACGACGTTAACGT
ATCTGTGGCGGAGAGAGTAGCAGAAGAAGCCATCGAATCAGTGGAAGAGACGGAGCGGCT
GAAGAGATCGCTAGCGGATTCTTTGTACGGGACAGATCGAGGTCTTAGCGCATCGAGCGA
GGTGAGAGCCGAGATCAGTGAGCTGATCACGCAGCTCGAGTCCAACAACCCTAATCCAGC
TCCGAACGATGCTCTGTTTCTCCTCAGCGGCAAATGGATTCTCGCTTACACGTCGTTCGT
TGGTCTGTTCCCGTTGCTCTCACGTAGAATCTCACCGTTGGTCAAAGTGGATGAGATCCC
CGAGTTCGTGGAGGTTCTTGGTCAGAAAATCGATCTCAACCCCATTAGAGGATTACTCAC
GTCTGTCCAGGACACGGCTTCTTCAGTGGCGAGAACCATTTCAAGCCAACCACCGTTGAA
ATTCTCTTTGCCGCAGACAGAGCGCAGTCGTGGCTGCTCACGACTTATCTCGACAAAGAC
CTTCGGATCTCGAGAGGCGATGGTGGAAGCATTTTTGTGCTTATCAAAGAAGGCAGCTCT
CTCTTAAACCCTTAAAAAACATTGTAAAGTAAAATCTATATAGAACCATGTCTGTATTTA
ATAGTTAAGTGTTATTGTTGGAGAGTTATGATATGATGGTTGTTGTGTATTCAGGGTTTA
AATGTTTGATAATTTTGGCTTATAAAGTTGTAAAAGGTCTCTGATACAGTATGTTATTAC
TTGCACAAACCGATTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU31TF U 1
AF RR2GU31JQB C 415
BS 1 716 RR2GU31TF
BS 717 717 RR2GU31JQB
BS 718 736 RR2GU31TF
BS 737 737 RR2GU31JQB
BS 738 770 RR2GU31TF
BS 771 980 RR2GU31JQB

RD RR2GU31TF 785 0 0
GGATTCATTGCTTGCTGTGAAGAAAACATAGTGAGAGAGAGAGACAAAAATGGCGACGGT
ACCTCTGTTCACCCAGTTTCCATGCAAAACTCTAGCTCCAAGCTCCTCCAACTCTAAACT
CCAACCAAAATCTCCGACTCTAGTGCCCGTAAATCCAATCAACCGGTGGTCGGAGGTTAG
AACCACTGTCCATCGGCCGGATTTCAAGGTCCGAGTTAGCGACGTTAACGACGTTAACGT
ATCTGTGGCGGAGAGAGTAGCAGAAGAAGCCATCGAATCAGTGGAAGAGACGGAGCGGCT
GAAGAGATCGCTAGCGGATTCTTTGTACGGGACAGATCGAGGTCTTAGCGCATCGAGCGA
GGTGAGAGCCGAGATCAGTGAGCTGATCACGCAGCTCGAGTCCAACAACCCTAATCCAGC
TCCGAACGATGCTCTGTTTCTCCTCAGCGGCAAATGGATTCTCGCTTACACGTCGTTCGT
TGGTCTGTTCCCGTTGCTCTCACGTAGAATCTCACCGTTGGTCAAAGTGGATGAGATCCC
CGAGTTCGTGGAGGTTCTTGGTCAGAAAATCGATCTCAACCCCATTAGAGGATTACTCAC
GTCTGTCCAGGACACGGCTTCTTCAGTGGCGAGAACCATTTCAAGCCAACCACCGTTGAA
ATTCTCTTTGCCGCAGACAGAGCGCAGTCGTGGCTGCTCACGACTTATCTCGACAA*GAC
CTTCGGATCTCGAGAG*CGATGGTGGAAGCATTTTTGTGCTTATCAAAGA
GCAGCTCTCTCTAAC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2GU31JQB 566 0 0
TCCAGCTCCGAACGATGCTCTGTTTCTCCTCAGCGGCAAATGGATTCTCGCTTACACGTC
GTTCGTTGGTCTGTTCCCGTTGCTCTCACGTAGAATCTCACCGTTGGTCAAAGTGGATGA
GATCCCCGAGTTCGTGGAGGTTCTTGGTCAGAAAATCGATCTCAACCCCATTAGAGGATT
ACTCACGTCTGTCCAGGACACGGCTTCTTCAGTGGCGAGAACCATTTCAAGCCAACCACC
GTTGAAATTCTCTTTGCCGCAGACAGAGCGCAGTCGTGGCTGCTCACGACTTATCTCGAC
AAAGACCTTCGGATCTCGAGAGGCGATGGTGGAAGCATTTTTGTGCTTATCAAAGAAGGC
AGCTCTCTCTTAAACCCTTAAAAAACATTGTAAAGTAAAATCTATATAGAACCATGTCTG
TATTTAATAGTTAAGTGTTATTGTTGGAGAGTTATGATATGATGGTTGTTGTGTATTCAG
GGTTTAAATGTTTGATAATTTTGGCTTATAAAGTTGTAAAAGGTCTCTGATACAGTATGT
TATTACTTGCACAAACCGATTTTGTC

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 9

CO CL686Contig1 564 9 4 U
GGACATCACCTTTCCTTTAAGAGTTTAAAACCATTATCAGTTAAGTGCTAAAAAAAAACC
ATTATCAATTCACTTCAATCATATATGATGAGAAAAACCCCTCAACTCTCGTTTACAGTC
TTGACTATCTTCATCAGTCTTGTGCTAGGAACGATGGCAAATGTATTAAAAGAAGAGAGA
AAATGGTGTGATGAACAAAATCTCCCTGTAAATAAAGATGGGATATGTGTAGAATCTGAA
TGCCAAAAAAGTTGTCGTGAGAAACGCGGACCTAAGACGAAGAGTGTATGCTTTGGGTCA
AAAACCAGAAAACCTATGCATTGCATTTGCGCAATTTCTTGTTAACGTGCTGGTTAAGTA
TGGTGAACAAATATGATGCTCAACAATAATATCTTTGAAGTATTTTTTACATTTTTGTTC
TGTTATTTTTTCTTTAACACTATAATATTTTTATCGAAAGCCTTATAATAAAGTAATGTA
GTTGACATGTAAATAAAGTATTGAAATGTTCGTTTCGGATTTGTTGCATTATTTATAATA
ATTAATAACATAAATGTTAATCAG


BQ
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2DS06TF U 1
AF RR2G170JQ C 1
AF RR2G170TF U 1
AF RR2HB57JQ C 1
AF RR2EK17JQ C 1
AF RR2EK17TF U 1
AF RR2BS35TF U 1
AF RR2G287TF U 1
AF RR2G938TF U 1
BS 1 222 RR2BS35TF
BS 223 223 RR2DS06TF
BS 224 559 RR2BS35TF
BS 560 564 RR2G938TF

RD RR2DS06TF 466 0 0
GGACATCACCTTTCCTTTAAGAGTTTAAAACCATTATCAGTTAAGTGCTAAAAAAAAACC
ATTATCAATTCACTTCAATCATATATGATGAGAAAAACCCCTCAACTCTCGTTTACAGTC
TTGACTATCTTCATCAGTCTTGTGCTAGGAACGATGGCAAATGTATTAAAAGAAGAGAGA
AAATGGTGTGATGAACAAAATCTCCCTGTAAATAAAGATGGGATATGTGTAGAATCTGAA
TGCCAAAAAAGTTGTCGTGAGAAACGCGGACCTAAGACGAAGAGTGTATGCTTTGGGTCA
AAAACCAGAAAACCTATGCATTGCATTTGCGCAATTTCTTGTTAACGTGCTGGTTAAGTA
TGGTGAACAAATATGATGCTCAACAATAATATCTTTGAAGTATTTTTTACATTTTTGTTC
TGTTATTTTTTCTTTAACACTATAATATTTTTATCGAAAGCCTTAT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR2G170JQ 489 0 0
GGACATCACCTTTCCTTTAAGAGTTTAAAACCATTATCAGTTAAGTGCTAAAAAAAA*CC
ATTATCAATTCACTTCAATCATATATGATGAGAAAAACCCCTCAACTCTCGTTTACATTC
TTGACTATTTTCATCAGTCTTGTGCTAGGAACGATGGCAAATGTATTAAAAGAAGAGAGA
AAATGGTGTGATGAACAAAATCTCCCTGTAAATAAAGATGGGATATGTGTAGAATTTGAA
TGCCAAAAAAGTTGTCGTGAGAAACGCGGACCTAAGACGAAGAGTGTATGCTTTGGGTCA
AAAACCAGAAAACCTATGCATTGCATTTGCGCAATTTCTTGTTAACGTGCTGGTTAAGTA
TGGTGAACAAATATGATGCTCAACAATAATATCTTTGAAGTATTTTTTACATTTTTGTTC
TGTTATTTTTTCTTTAACACTATAATATTTTTATCGAAAGCCTTATAATAAAGTAATGTA
GTTGACATG

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2G170TF 489 0 0
GGACATCACCTTTCCTTTAAGAGTTTAAAACCATTATCAGTTAAGTGCTAAAAAAAA*CC
ATTATCAATTCACTTCAATCATATATGATGAGAAAAACCCCTCAACTCTCGTTTACATTC
TTGACTATCTTCATCAGTCTTGTGCTAGGAACGATGGCAAATGTATTAAAAGAAGAGAGA
AAATGGTGTGATGAACAAAATCTCCCTGTAAATAAAGATGGGATATGTGTAGAATCTGAA
TGCCAAAAAAGTTGTCGTGAGAAACGCGGACCTAAGACGAAGAGTGTATGCTTTGGGTCA
AAAACCAGAAAACCTATGCATTGCATTTGCGCAATTTCTTGTTAACGTGCTGGTTAAGTA
TGGTGAACAAATATGATGCTCAACAATAATATCTTTGAAGTATTTTTTACATTTTTGTTC
TGTTATTTTTTCTTTAACACTATAATATTTTTATCGAAAGCCTTATAATAAAGTAATGTA
GTTGACATG

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2HB57JQ 489 0 0
GGACATCACCTTTCCTTTAAGAGTTTAAAACCATTATCAGTTAAGTGCTAAAAAAAA*CC
ATTATCAATTCACTTCAATCATATATGATGAGAAAAACCCCTCAACTCTCGTTTACATTC
TTGACTATCTTCATCAGTCTTGTGCTAGGAACGATGGCAAATGTATTAAAAGAAGAGAGA
AAATGGTGTGATGAACAAAATCTCCCTGTAAATAAAGATGGGATATGTGTAGAATTTGAA
TGCCAAAAAAGTTGTCGTGAGAAACGCGGACCTAAGACGAAGAGTGTATGCTTTGGGTCA
AAAACCAGAAAACCTATGCATTGCATTTGCGCAATTTCTTGTTAACGTGCTGGTTAAGTA
TGGTGAACAAATATGATGCTCAACAATAATATCTTTGAAGTATTTTTTACATTTTTGTTC
TGTTATTTTTTCTTTAACACTATAATATTTTTATCGAAAGCCTTATAATAAAGTAATGTA
GTTGACATG

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2EK17JQ 490 0 0
GGACATCACCTTTCCTTTAAGAGTTTAAAGCCATTATCAGTTAAGTGCTAAAAAAAAACC
ATTATCAATTCACTTCAATCATATATGATGAGAAAAACCCCTCAACTCTCGTTTACAGTC
TTGACTATTTTCATCAGTCTTGTGCTAGGAACGATGGCAAATGTATTAAAAGAAGAGAGA
AAATGGTGTGATGAACAAAATCTCCCTGTAAATAAAGATGGGATATGTGTAGAATCTGAA
TGCCAAAAAAGTTGTCGTGAGAAACGCGGACCTAAGACGAAGAGTGTATGCTTTGGGTCA
AAAACCAGAAAACCTATGCATTGCATTTGCGCAATTTCTTGTTAACGTGCTGGTTAAGTA
TGGTGAACAAATACGATTCTCAACAATAATATCTTTGAAGTATTTTTTACATTTTTGTTC
TGTTATTTTTTCTTTAACACTATAATATTTTTATCGAAAGCCTTATAATAAAGTAATGTA
GTTGACATGT

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR2EK17TF 490 0 0
GGACATCACCTTTCCTTTAAGAGTTTAAAGCCATTATCAGTTAAGTGCTAAAAAAAAACC
ATTATCAATTCACTTCAATCATATATGATGAGAAAAACCCCTCAACTCTCGTTTACAGTC
TTGACTATCTTCATCAGTCTTGTGCTAGGAACGATGGCAAATGTATTAAAAGAAGAGAGA
AAATGGTGTGATGAACAAAATCTCCCTGTAAATAAAGATGGGATATGTGTAGAATCTGAA
TGCCAAAAAAGTTGTCGTGAGAAACGCGGACCTAAGACGAAGAGTGTATGCTTTGGGTCA
AAAACCAGAAAACCTATGCATTGCATTTGCGCAATTTCTTGTTAACGTGCTGGTTAAGTA
TGGTGAACAAATACGATTCTCAACAATAATATCTTTGAAGTATTTTTTACATTTTTGTTC
TGTTATTTTTTCTTTAACACTATAATATTTTTATCGAAAGCCTTATAATAAAGTAATGTA
GTTGACATGT

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR2BS35TF 559 0 0
GGACATCACCTTTCCTTTAAGAGTTTAAAACCATTATCAGTTAAGTGCTAAAAAAAAACC
ATTATCAATTCACTTCAATCATATATGATGAGAAAAACCCCTCAACTCTCGTTTACAGTC
TTGACTATCTTCATCAGTCTTGTGCTAGGAACGATGGCAAATGTATTAAAAGAAGAGAGA
AAATGGTGTGATGAACAAAATCTCCCTGTAAATAAAGATGGGGTATGTGTAGAATCTGAA
TGCCAAAAAAGTTGTCGTGAGAAACGCGGACCTAAGACGAAGAGTGTATGCTTTGGGTCA
AAAACCAGAAAACCTATGCATTGCATTTGCGCAATTTCTTGTTAACGTGCTGGTTAAGTA
TGGTGAACAAATATGATGCTCAACAATAATATCTTTGAAGTATTTTTTACATTTTTGTTC
TGTTATTTTTTCTTTAACACTATAATATTTTTATCGAAAGCCTTATAATAAAGTAATGTA
GTTGACATGTAAATAAAGTATTGAAATGTTCGTTTCGGATTTGTTGCATTATTTATAATA
ATTAATAACATAAATGTTA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2G287TF 563 0 0
GGACATCACCTTTCCTTTAAGAGTTTAAAACCATTATCAGTTAAGTGCTAAAAAAAAACC
ATTATCAATTCACTTCAATCATATATGATGAGAAAAACCCCTCAACTCTCGTTTACAGTC
TTGACTATCTTCATCAGTCTTGTGCTAGGAACGATGGCAAATGTATTAAAAGAAGAGAGA
AAATGGTGTGATGAACAAAATCTCCCTGTAAATAAAGATGGGATATGTGTAGAATCTGAA
TGCCAAAAAAGTTGTCGTGAGAAACACGGACCTAAGACGAAGAGTGTATGCTTTGGGTCA
AAAACCAGAAAACCTATGCATTGCATTTGCGCAATTTCTTGTTAACGTGCTGGTTAAGTA
TGGTGAACAAATATGATGCTCAACAATAATATCTTTGAAGTATTTTTTACATTTTTGTTC
TGTTATTTTTTCTTTAACACTATAATATTTTTATCGAAAGCCTTATAATAAAGTAATGTA
GTTGACATGTAAATAAAGTATTGAAATGTTCGTTTCGGATTTGTTGCATTATTTATAATA
ATTAATAACATAAATGTTA
ATCA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2G938TF 564 0 0
GGACATCACCTTTCCTTTAAGAGTTTAAAACCATTATCAGTTAAGTGCTAAAAAAAAACC
ATTATCAATTCACTTCAATCATATATGATGAGAAAAACCCCTCAACTCTCGTTTACAGTC
TTGACTATCTTCATCAGTCTTGTGCTAGGAACGATGGCAAATGTATTAAAAGAAGAGAGA
AAATGGTGTGATGAACAAAATCTCCCTGTAAATAAAGATGGGATATGTGTAGAATCTGAA
TGCCAAAAAAGTTGTCGTGAGAAACACGGACCTAAGACGAAGAGTGTATGCTTTGGGTCA
AAAACCAGAAAACCTATGCATTGCATTTGCGCAATTTCTTGTTAACGTGCTGGTTAAGTA
TGGTGAACAAATATGATGCTCAACAATAATATCTTTGAAGTATTTTTTACATTTTTGTTC
TGTTATTTTTTCTTTAACACTATAATATTTTTATCGAAAGCCTTATAATAAAGTAATGTA
GTTGACATGTAAATAAAGTATTGAAATGTTCGTTTCGGATTTGTTGCATTATTTATAATA
ATTAATAACATAAATGTTAATCAG

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 9

CO CL687Contig1 707 9 10 U
GGATATGCGTCACTCTATTTAAAACCGGAAACCCTAATTCCCCTCGGATCAGAACTCTGC
TCAAGCCGTCGAAAATGTCGAAGCGAGGACGTGGAGGAACATCGGGTAACAAGTTCAGGA
TGTCGCTAGGTCTTCCAGTGGCGGCGACAGTGAACTGCGCCGACAACACCGGTGCCAAGA
ACCTTTACATCATTTCGGTGAAAGGAATCAAAGGTCGTCTTAACCGATTGCCTTCTGCTT
GCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTCAAGAAGGGAAAGCCTGATCTCCGTAAAAAGG
TTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCGTGGCGCCGAAAGGATGGTGTCTTCA
TGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATTGTCAACCCCAAGGGAGAAATGAAAGGTTCTG
CTATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGATCTCTGGCCGAGGATTGCTAGTGCTG
CCAATGCCATTGTCTAATGATCAGTGCAATTACTAGTCTGTCTTTGCTGGTTTTTGATTA
TCATTCTAAACTTTGTTGGAGTTTTTGTAGTTTTGTTATTGAAATTAAACCTGGTCATGA
TCAAAGTTTTGTTCTTGCAACTGCTCATCGCTAGAACTTGTTAGCCTTGAGATACTTTGA
TTGTTCTTCGCTACACTATCTGCCAATGCTCACCATTCTTGCTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 10 10 10 

AF RR2DV79JQ C 221
AF RR2GS24TF U 46
AF RR2DV79TF U 46
AF RR2FF43TF U 1
AF RR2BK32JQ C 46
AF RR2BK32TF U 46
AF RR2FF43JQ C 51
AF RR2DJ21TF U 46
AF RR2DJ21JQ C 244
BS 1 45 RR2FF43TF
BS 46 47 RR2BK32TF
BS 48 297 RR2FF43TF
BS 298 298 RR2BK32TF
BS 299 508 RR2FF43TF
BS 509 509 RR2BK32TF
BS 510 571 RR2FF43TF
BS 572 572 RR2BK32TF
BS 573 704 RR2FF43TF
BS 705 707 RR2DJ21JQ

RD RR2DV79JQ 382 0 0
TAACCGATTGCCTTCTGCTTGCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTCAAGAAGGGAAA
GCCTGATCTCCGTAAAAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCGTGGCG
CCGAAAGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATTGTCAACCCCAA
GGGAGAAATGAAAGGTTCTGCTATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGATCTCTG
GCCGAGGATTGCTAGTGCTGCCAATGCCATTGTCTAATGATCAGTGCAATTACTAGTCTG
TCTTTGCTGGTTTTTGATTATCATTCTAAACTTTGTTGGAGTTTTTGTAGTTTTGTTATT
GAAATTAAACCTGGTCATGA
CC

QA 1 380 1 380
DS 

RD RR2GS24TF 555 0 0
GGATCAGAACTCTGCTCAAGCCGTCGAAAATGTCGAAGCGAGGACGTGGAGGAACATCGG
GTAACAAGTTCAGGATGTCGCTAGGTCTTC*AGTGGCGGCGACAGTGAACTGCGCCGACA
ACACCGGTGCCAAGAACCTTTACATCATTTCGGTGAAAGGAATCAAAGGTCGTCTTAACC
GATTGCCTTCTGCTTGCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTCAAGAAGGGAAAGCCTG
ATCTCCGTAAAAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCGTGGCGCCGAA
AGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATTGTCAACCCCAAGGGAG
AAATGAAAGGTTCTGCTATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGATCTCTGGCCGA
GGATTGCTAGTGCTGCCAATGCCATTGTCTAATGATCAGTGCAATTACTAGTCTGTCTTT
GCTGGTTTTTGATTATCATTCTAAACTTTGTTGGAGTTTTTGTAGTTTTGTTATTGAAAT
TAAACCTGGTCATGA

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2DV79TF 557 0 0
GGATCAGAACTCTGCTCAAGCCGTCGAAAATGTCGAAGCGAGGACGTGGAGGAACATCGG
GTAACAAGTTCAGGATGTCGCTAGGTCTTCCAGTGGCGGCGACAGTGAACTGCGCCGACA
ACACCGGTGCCAAGAACCTTTACATCATTTCGGTGAAAGGAATCAAAGGTCGTCTTAACC
GATTGCCTTCTGCTTGCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTCAAGAAGGGAAAGCCTG
ATCTCCGTAAAAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCGTGGCGCCGAA
AGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATTGTCAACCCCAAGGGAG
AAATGAAAGGTTCTGCTATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGATCTCTGGCCGA
GGATTGCTAGTGCTGCCAATGCCATTGTCTAATGATCAGTGCAATTACTAGTCTGTCTTT
GCTGGTTTTTGATTATCATTCTAAACTTTGTTGGAGTTTTTGTAGTTTTGTTATTGAAAT
TAAACCTGGTCATGA
CC

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2FF43TF 706 0 0
GGATATGCGTCACTCTATTTAAAACCGGAAACCCTAATTCCCCTCTTATCAGAACTCTGC
TCAAGCCGTCGAAAATGTCGAAGCGAGGACGTGGAGGAACATCGGGTAACAAGTTCAGGA
TGTCGCTAGGTCTTCCAGTGGCGGCGACAGTGAACTGCGCCGACAACACCGGTGCCAAGA
ACCTTTACATCATTTCGGTGAAAGGAATCAAAGGTCGTCTTAACCGATTGCCTTCTGCTT
GCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTCAAGAAGGGAAAGCCTGATCTCCGTAAAA*GG
TTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCGTGGCGCCGAAAGGATGGTGTCTTCA
TGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATTGTCAACCCCAAGGGAGAAATGAAAGGTTCTG
CTATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGATCTCTGGCCGAGGATTGCTAGTGCTG
CCAATGCCATTGTCTAATGATCAGTGCAGTTACTAGTCTGTCTTTGCTGGTTTTTGATTA
TCATTCTAAACTTTGTTGGAGTTTTTGTAGTCTTGTTATTGAAATTAAACCTGGTCATGA
TCAAAGTTTTGTTCTTGCAACTGCTCATCGCTAGAACTTGTTAGCCTTGAGATACTTTGA
TTGTTCTTCGCTACACTATCTGCCAATGCTCACCATTCTTGCTG
AC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2BK32JQ 657 0 0
GGATCAGAACTCTGCTCAAGCCGTCGAAAATGTCGAAGCGAGGACGTGGAGGAACATCGG
GTAACAAGTTCAGGATGTCGCTAGGTCTTCCAGTTGCGGCGACAGTGAACTGCGCCGACA
ACACCGGTGCCAAGAACCTTTACATCATTTCGGTGAAAGGAATCAAAGGTCGTCTTAACC
GATTGCCTTCTGCTTGCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTCAAGAAGGGAAAGCCTG
ATCTCCGTAAAAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCGTGGCGCCGAA
AGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATTGTCAACCCCAAGGGAG
AAATGAAAGGTTCTGCTATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGATCTCTGGCCGA
GGATTGCTAGTGCTGCCAATGCCATTGTCTAATGATCAGTGCAATTACTAGTCTGTCTTT
GCTGGTTTTTGATTATCATTCTAAACTTTGTTGGAGTTTTTGTAGTTTTGTTATTGAAAT
TAAACCTGGTCATGATCAAAGTTTTGTTCTTGCAACTGCTCATCGCTAGAACTTGTTAGC
CTTGAGATACTTTGATTGTTCTTCGCTACACTATCTGCCAATGCTCACCATTCTTGC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2BK32TF 666 0 0
GGATCAGAACTCTGCTCAAGCCGTCGAAAATGTCGAAGCGAGGACGTGGAGGAACATCGG
GTAACAAGTTCAGGATGTCGCTAGGTCTTCCAGTTGCGGCGACAGTGAACTGCGCCGACA
ACACCGGTGCCAAGAACCTTTACATCATTTCGGTGAAAGGAATCAAAGGTCGTCTTAACC
GATTGCCTTCTGCTTGCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTCAAGAAGGGAAAGCCTG
ATCTCCGTAAAAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCGTGGCGCCGAA
AGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATTGTCAACCCCAAGGGAG
AAATGAAAGGTTCTGCTATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGATCTCTGGCCGA
GGATTGCTAGTGCTGCCAATGCCATTGTCTAATGATCAGTGCAATTACTAGTCTGTCTTT
GCTGGTTTTTGATTATCATTCTAAACTTTGTTGGAGTTTTTGTAGTTTTGTTATTGAAAT
TAAACCTGGTCATGATCAAAGTTTTGTTCTTGCAACTGCTCATCGCTAGAACTTGTTAGC
CTTGAGATACTTTGATTGTTCTTCGCTACACTATCTGCCAATGCTCACCATTCTTGC
AAAAAAAAA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2FF43JQ 654 0 0
AGAACTCTGCTCAAGCCGTCGAAAATGTCGAAGCGAGGACGTGGAGGAACATCGGGTAAC
AAGTTCAGGATGTCGCTAGGTCTTCCAGTGGCGGCGACAGTGAACTGCGCCGACAACACC
GGTGCCAAGAACCTTTACATCATTTCGGTGAAAGGAATCAAAGGTCGTCTTAACCGATTG
CCTTCTGCTTGCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTCAAGAAGGGAAAGCCTGATCTC
CGTAAAA*GGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCGTGGCGCCGAAAGGAT
GGTGTCTTCATGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATTGTCAACCCCAAGGGAGAAATG
AAAGGTTCTGCTATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGATCTCTGGCCGAGGATT
GCTAGTGCTGCCAATGCCATTGTCTAATGATCAGTGCAGTTACTAGTCTGTCTTTGCTGG
TTTTTGATTATCATTCTAAACTTTGTTGGAGTTTTTGTAGTCTTGTTATTGAAATTAAAC
CTGGTCATGATCAAAGTTTTGTTCTTGCAACTGCTCATCGCTAGAACTTGTTAGCCTTGA
GATACTTTGATTGTTCTTCGCTACACTATCTGCCAATGCTCACCATTCTTGCTG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2DJ21TF 662 0 0
GGATCAGAACTCTGCTCAAGCCGTCGAAAATGTCGAAGCGAGGACGTGGAGGAACATCGG
GTAACAAGTTCAGGATGTCGCTAGGTCTTCCAGTGGCGGCGACAGTGAACTGCGCCGACA
ACACCGGTGCCAAGAACCTTTACATCATTTCGGTGAAAGGAATCAAAGGTCGTCTTAACC
GATTGCCTTCTGCTTGCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTCAAGAAGGGAAAGCCTG
ATCTCCGTAAAAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCGTGGCGCCGAA
AGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATTGTCAACCCCAAGGGAG
AAATGAAAGGTTCTGCTATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGATCTCTGGCCGA
GGATTGCTAGTGCTGCCAATGCCATTGTCTAATGATCAGTGCAATTACTAGTCTGTCTTT
GCTGGTTTTTGATTATCATTCTAAACTTTGTTGGAGTTTTTGTAGTTTTGTTATTGAAAT
TAAACCTGGTCATGATCAAAGTTTTGTTCTTGCAACTGCTCATCGCTAGAACTTGTTAGC
CTTGAGATACTTTGATTGTTCTTCGCTACACTATCTGCCAATGCTCACCATTCTTGCTG
AGC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2DJ21JQ 464 0 0
TCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTCAAGAAGGGAAAGCCTGATCTCCGTAAAAAGGTTA
TGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCGTGGCGCCGAAAGGATGGTGTCTTCATGT
ACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATTGTCAACCCCAAGGGAGAAATGAAAGGTTCTGCTA
TCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGATCTCTGGCCGAGGATTGCTAGTGCTGCCA
ATGCCATTGTCTAATGATCAGTGCAATTACTAGTCTGTCTTTGCTGGTTTTTGATTATCA
TTCTAAACTTTGTTGGAGTTTTTGTAGTTTTGTTATTGAAATTAAACCTGGTCATGATCA
AAGTTTTGTTCTTGCAACTGCTCATCGCTAGAACTTGTTAGCCTTGAGATACTTTGATTG
TTCTTCGCTACACTATCTGCCAATGCTCACCATTCTTGCTGAGC

QA 1 464 1 464
DS 



AS 1 8

CO CL688Contig1 1075 8 36 U
GGATTCTGCTTCGCATTAAAAGCTAACCTTTCTTCTCACTTTACCGAGAAAATCTGAGAA
AAAAA**AAGCGAAAAGGCGAAGAATTTGAGCATGAAGGCCGTGAAAAGTCCGATCCACA
CGGTGTGGTCATGGGTGAGGAGGCAACCACCGAAGGTGAAGGCTTTTCTCGCTGTGGTCA
CCGGCATGGCGGCTTTGGTTCTGCTCAGATTCATTGTTCACGATCACGACAATCTCTTCG
TCGCCGCCGAAGCTGTTCACTCCATCGGGATCTGCGTTCTCATCTACAAACTCATGAAAG
AAAAAA*CCTGCGCTGGATTGTCACTGAAATCTCAGGAGCTCACGGCGATATTTCTAG*C
TGTTAGGCTGTATTGCAGCTTTGTGATGGAATATGATATACACACCGTTCTGGATCTGGC
TACTCTGGGAACAACTCTCTGGGTTATATTTATGATCCGGTTTAAGTTGAAGGCCAGTTA
CATGGAGGACAAAGACAACTTTGCTCTCTATTATGTGCTTGTACCGTGTGTTGTGCTGGC
TGTGTTGATCCATCCATCGACCTCTCACAACATATTAAACAGGATTTCGTGGGCATTGTG
TGTATACCTTGAAGCTGTTTCAGTACTGCCTCAGCTGCGAGTGATGCAGAACACCAAGAT
TGTTGAACCGTTCACGGCGCATTATGTATTTGCACTTGGAGTAGCAAGGTTCCTAAGCTG
TGCCCACTGGGTTTTACAGGTTGTGGACACGAGGGGAAGATTGCTTGTAGCATTAGGTTA
TGGATTGTGGCCATCAATGGTTCTCATCTCAGAAATTGTTCAAACTTTCATCCTTGCAGA
TTTCTGTTACTACTACGTCAAAAGCGTTTTTGGAGGGCAGCTTGTTCTCAGGCTTCCGTC
TGGAGTAGTATAAGTTACTATCAGTGATGTAATACGGAAAGAGAC**ATCATTTTTTTCC
TTTACATTTGATCTTAACGTTTGTGTCTGAGATGACTTGGTAACGAATTAGTTTCACTGT
GTTGTATATTTTGTTGACTATTGACTGGTGTTTCAATGTCTTTCCGGTTGCTTTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 20 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 25 50 50 50 50 20 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 20 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM65TF U 1
AF RR2E565TF U 57
AF RR2AU41TF U 1
AF RR2C543TF U 1
AF RR2G278TF U 1
AF RR2G278JQ C 205
AF RR2AU41JQ C 248
AF RR2E565JQ C 447
BS 1 12 RR2AU41TF
BS 13 13 RR2C543TF
BS 14 64 RR2AU41TF
BS 65 65 RR2C543TF
BS 66 68 RR2AU41TF
BS 69 69 RR2C543TF
BS 70 172 RR2AU41TF
BS 173 173 RR2C543TF
BS 174 217 RR2AU41TF
BS 218 218 RR2C543TF
BS 219 262 RR2AU41TF
BS 263 263 RR2C543TF
BS 264 474 RR2AU41TF
BS 475 475 RR2G278TF
BS 476 501 RR2AU41TF
BS 502 502 RR2C543TF
BS 503 522 RR2AU41TF
BS 523 523 RR2G278TF
BS 524 624 RR2AU41TF
BS 625 625 RR2C543TF
BS 626 627 RR2AU41TF
BS 628 628 RR2C543TF
BS 629 654 RR2AU41TF
BS 655 655 RR2G278TF
BS 656 734 RR2AU41TF
BS 735 741 RR2C543TF
BS 742 742 RR2G278JQ
BS 743 744 RR2C543TF
BS 745 745 RR2G278TF
BS 746 750 RR2C543TF
BS 751 751 RR2G278TF
BS 752 761 RR2C543TF
BS 762 762 RR2G278JQ
BS 763 772 RR2G278TF
BS 773 1060 RR2G278JQ
BS 1061 1075 RR2E565JQ

RD RR2DM65TF 647 0 0
GGATTCTGCTTCGCATTAAAAGTTAACCTTTCTTCTCACTTTACCTAGAAAATCTGAGAA
AAAAA**AAGCGAAAAGGCCAAGAATTTGAGCATGAAGGCCGTGAAAAGTCCGATCCACA
CGGTGTGGTCATGGGTGAGGAGGCAACCACCGAAGGTGAAGGCTTTTCTCGCTGTGGTCA
CCGGCATGGCGGCTTTGGTTCTGCTCAGATTCATTGTTCACGATCACGACAATCTCTTCG
TCGCCGCCGAAGCTGTTCACTCCATTGGGATCTGCGTTCTCATCTACAAACTCATGAAAG
AAAAAA*CCTGCGCTGGATTGTCACTGAAATCTCAGGAGCTCACGGCGATATTTCTAG*C
TGTAAGGCTGTATTGCAGCTTTGTGATGGAATATGATATACACACCGTTCTGGATCTGGC
TACTCTGGGAACAACTCTCTGGGTTATATTTATGATCCGGTTTAAGTTGAAGGCTAGTTA
CATGGAGGACAAAGACAACTTTGCTCTCTATTATGTGCTTGTGCCCTGTGTTGTGTTGGC
TGTGTTGATCCATCCATCGACCTCTCACAACATATTAAACAGGATTTCGTGGGCATTGTG
TGTATACCTTGAAGCTGTTTCAGTACTGCCTCAGCTGCGAGTGATGC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2E565TF 647 0 0
GGGAG
AAAAAAAAGCGAAAAGGCGACGAATTTGAGCATGAAGGCCGTGAAAAGTCCGATCCACAC
GGTGTGGTCATGGGTGAGGAGGCAACCACCGAAGGTGAAGGCTTTTCTCGCTGTGGTCAC
CGGCATGGCGGCTTTGGTTCTGCTCAGATTCATTGTTCACGATCACGACAATCTCTTCGT
CGCCGCCGAAGCTGTTCACTCCATCGGGATCTGCGTGCTCATCTACAAACTCATGAAAGA
AAAAA*CCTGCGCTGGATTGTCACTGAAATCTCAGGAGCTCACGGCGATATTTCTAG*CT
GTTAGGCTGTATTGCAGCTTTGTGATGGAATATGATATACACACCGTTCTGGATCTGGCT
ACTCTGGGAACAACTCTCTGGGTTATTTTTATGATCCGGTTTAAGTTGAAGGCCAGTTAC
ATGGAGGACAAAGACAACTTTGCTCTCTATTATGTGCTTGTACCGTGTGTTGTGCTGGCT
GTGTTGATCCATCCATCGACCTCTCACAACATATTAAACAGGATTTCTTGGGCATTGTGT
GTATACCTTGAAGCTGTTTCAGTACTGCCTCAGCTGCGAGTGATGCAGAACACCAAGATT
GTTGAACCGTTCACGGCGCATTATGTATTTGCACTTGGAGTA

QA 6 647 6 647
DS 

RD RR2AU41TF 734 0 0
GGATTCTGCTTCTCATTAAAAGCTAACCTTTCTTCTCACTTTACCGAGAAAATCTGAGAA
AAAA***AGGCGAAAAGGCGAAGAATTTGAGCATGAAGGCCGTGAAAAGTCCGATCCACA
CGGTGTGGTCATGGGTGAGGAGGCAACCACCGAAGGTGAAGGCTTTTCTCGCGGTGGTCA
CCGGCATGGCGGCTTTGGTTCTGCTCAGATTCATTGTCCACGATCACGACAATCTCTTCG
TCGCCGCCGAAGCTGTTCACTCGATCGGGATCTGCGTTCTCATCTACAAACTCATGAAAG
AAAAAA*CCTGCGCTGGATTGTCACTGAAATCTCAGGAGCTCACGGCGATATTTCTAG*C
TGTTAGGCTGTATTGCAGCTTTGTGATGGAATATGATATACACACCGTTCTGGATCTGGC
TACTCTGGGAACAACTCTCTGGGTTATATTTATGATCCGGTTTAAGTTGAAGGCTAGTTA
CATGGAGGACAAAGACAACTTCGCTCTCTATTATGTGCTTGTGCCGTGTGTTGTGCTGGC
TGTGTTGATCCATCCATCGACCTCTCACAACATATTAAACAGGATTTCGTGGGCATTGTG
TGTATACCTTGAAGCTGTTTCAGTGCTACCTCAGCTGCGAGTGATGCAGAACACAAAGAT
TGTTGAACCGTTCACGGCGCATTATGTATTTGCACTTGGAGTAGCAAGGTTCCTAAGCTG
TGCCCACTGGGTTT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2C543TF 768 0 0
GGATTCTGCTTCGCATTAAAAGTTAACCTTTCTTCTCACTTTACCGAGAAAATCTGAGAA
AAAAAAAAAGCGAAAAGGCCAAGAATTTGAGCATGAAGGCCGTGAAAAGTCCGATCCACA
CGGTGTGGTCATGGGTGAGGAGGCAACCACCGAAGGTGAAGGCTTTTCTCGCTGTGGTCA
CCGGCATGGCGGCTGTGGTTCTGCTCAGATTCATTGTTCACGATCACGACAATCTCTTCG
TCGCCGCCGAAGCTGTTCACTCCATTGGGATCTGCGTTCTCATCTACAAACTCATGAAAG
AAAAAAACCTGCGCTGGATTGTCACTGAAATCTCAGGAGCTCACGGCGATATTTCTATTC
TGTAAGGCTGTATTGCAGCTTTGTGATGGAATATGATATACACACCGTTCTGGATCTGGC
TGCTCTGGGAACAACTCTCTGGGTTATATTTATGATCCGGTTTAAGTTGAAGGCTAGTTA
TATGGAGGACAAAGACAACTTTGCTCTCTATTATGTGCTTGTGCCCTGTGTTGTGTTGGC
TGTGTTGATCCATCCATCGACCTCTCACAACATATTAAACAGGATTTCGTGGGCATTGTG
TGTATACCTTGAAGCTGTTTCAGTACTGCCTCAGCTGCGAGTGATGCAGA*CACAAAGAT
TGTTGAACCGTTCACTGCGCATTATGTATTTGCACTTGGAGTAGCAAG*TTCCTTAGCTG
TGCCCACTGGGTTTTACAGGT*GTCGACACCAGGGGAAGAT
GCTTGTA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2G278TF 772 0 0
GGATTCTGCTTCTCATTAAAAGCTAACCTTTCTTCTCACTTTACCGAGAAAATCTGAGAA
AAAA***AAGCGAAAAGGCGACGAATTTGAGCATGAAGGCCGTGAAAAGTCCGATCCACA
CGGTGTGGTCATGGGTGAGGAGGCAACCACCGAAGGTGAAGGCTTTTCTCGCTGTGGTCA
CCGGCATGGCGGCTTTGGTTCTGCTCAGATTCATTGTTCACGATCACGACAATCTCTTCG
TCGCCGCCGAAGCTGTTCACTCCATCGGGATCTGCGTGCTCATCTACAAACTCATGAAAG
AAAAAAACCTGCGCTGGATTGTCACTGAAATCTCAGGAGCTCACGGCGATATTTCTAG*C
TGTTAGGCTGTATTGCAGCTTTGTGATGGAATATGATATACACACCGTTCTGGATCTGGC
TACTCTGGGAACAACTCTCTGGGTTATTTTTATGATCCGGTTTAAGTTGAAGGCCAGTTA
CATGGAGGACAAAGACAACTTTGCTCTCTATTATGTGCTTGTACCGTGTGCTGTGCTGGC
TGTGTTGATCCATCCATCGACCTCTCACAACATATTAAACAGGATTTCTTGGGCATTGTG
TGTATACCTTGAAGCTGTTTCAGTACTGCCTCAGCTGCGAGTGATGCAGA*CACCAAGAT
TGTTGAACCGTTCACGGCGCATTATGTATTTGCACTTGGAGTAGCAAG*TTCCTAAGCTG
TGCCCACTGGGTTTTACAGTT*GTGGACACGAAGGGAAGAT*GCTTGTAGCA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2G278JQ 857 0 0
GCTCAGATCATT
TTCACGATCACGACAATCTCTTCGTCGCCGC*GAAGCTGTTCACTCCATCGGGATCTGCG
TGCTCATCTACAAACTCATGAAAGAAAAAAACCTGCGCTGGATTGTCACTGAA*TCTCAG
GAGCTCACGGCGATATTTCTAG*CTGTTAGGCTGTATTGCAGCTTTGTGATGGAATATGA
TATACACACCGTTCTGGATCTGGCTACTCTGGGAACAACTCTCTGGGTTATTTTTATGAT
CCGGTTTAAGTTGAAGGCCAGTTACATGGAGGACAAAGACAACTTTGCTCTCTATTATGT
GCTTGTACCGTGTGCTGTGCTGGCTGTGTTGATCCATCCATCGACCTCTCACAACATATT
AAACAGGATTTCTTGGGCATTGTGTGTATACCTTGAAGCTGTTTCAGTACTGCCTCAGCT
GCGAGTGATGCAGAACACCAAGATTGTTGAACCGTTCACGGCGCATTATGTATTTGCACT
TGGAGTAGCAAGGTTCCTAAGCTGTGCCCACTGGGTTTTACAGGTTGTGGACACGAGGGG
AAGATTGCTTGTAGCATTAGGTTATGGATTGTGGCCATCAATGGTTCTCATCTCAGAAAT
TGTTCAAACTTTCATCCTTGCAGATTTCTGTTACTACTACGTCAAAAGCGTTTTTGGAGG
GCAGCTTGTTCTCAGGCTTCCGTCTGGAGTAGTATAAGTTACTATCAGTGATGTAATACG
GAAAGAGAC**ATCATTTTTTTCCTTTACATTTGATCTTAACGTTTGTGTCTGAGATGAC
TTGGTAACGAATTAGTTTCACTGTGTTGTATATTTTGTTGACTATTGACTGGTGTTTCAA
TGTC
G

QA 13 856 13 856
DS 

RD RR2AU41JQ 792 0 0
CGAAGCTGTTCACTCGATCGGGATCTGCGTTCTCATCTACAAACTCATGAAAGAAAAAA*
CCTGCGCTGGATTGTCACTGAAATCTCAGGAGCTCACGGCGATATTTCTAG*CTGTTAGG
CTGTATTGCAGCTTTGTGATGGAATATGATATACACACCGTTCTGGATCTGGCTACTCTG
GGAACAACTCTCTGGGTTATATTTATGATCCGGTTTAAGTTGAAGGCTAGTTACATGGAG
GACAAAGACAACTTCGCTCTCTATTATGTGCTTGTGCCGTGTGTTGTGCTGGCTGTGTTG
ATCCATCCATCGACCTCTCACAACATATTAAACAGGATTTCGTGGGCATTGTGTGTATAC
CTTGAAGCTGTTTCAGTGCTACCTCAGCTGCGAGTGATGCAGAACACAAAGATTGTTGAA
CCGTTCACGGCGCATTATGTATTTGCACTTGGAGTAGCAAGGTTCCTAAGCTGTGCCCAC
TGGGTTTTACAGGTTGTCGACACCAGGGGAAGATTGCTTGTAGCATTAGGTTATGGATTG
TGGCCATCAATGGTTCTCATCTCAGAAATTGTTCAAACTTTCATCCTGGCAGACTTCTGT
TACTACTACGTCAAAAGCGTTTTTGGAGGGCAGCTTGTTCTAAGGCTTCCGTCTGGAGTA
GTATAAGTTACTATCAGTGATGTAATACGGAAAGAGACGGATCATTTTTTTTCTTTACAT
TTAATCTCAACGTTTGTGTCTGAGATGACTTGGTAACGAATTAGTTTCACTGTGTTGTAT
ATTTTGTTGACT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2E565JQ 629 0 0
TTTTTATGATCCGGTTTAAGTTGAAGGCCAGTTACATGGAGGACAAAGACAACTTTGCTC
TCTATTATGTGCTTGTACCGTGTGTTGTGCTGGCTGTGTTGATCCATCCATCGACCTCTC
ACAACATATTAAACAGGATTTCTTGGGCATTGTGTGTATACCTTGAAGCTGTTTCAGTAC
TGCCTCAGCTGCGAGTGATGCAGAACACCAAGATTGTTGAACCGTTCACGGCGCATTATG
TATTTGCACTTGGAGTAGCAAGGTTCCTAAGCCGTGCCCACTGGGTTTTACAGGTTGTGG
ACACGAGGGGAAGATTGCTTGTAGCATTAGGTTATGGATTGTGGCCATCAATGGTTCTCA
TCTCAGAAATTGTTCAAACTTTCATCCTTGCAGATTTCTGTTACTACTACGTCAAAAGCG
TTTTTGGAGGGCAGCTTGTTCTCAGGCTTCCGTCTGGAGTAGTATAAGTTACTATCAGTG
ATGTAATACGGAAAGAGAC**ATCATTTTTTTCCTTTACATTTGATCTTAACGTTTGTGT
CTGAGATGACTTGGTAACGAATTAGTTTCACTGTGTTGTATATTTTGTTGACTATTGACT
GGTGTTTCAATGTCTTTCCGGTTGCTTTT

QA 1 629 1 629
DS 



AS 2 9

CO CL689Contig1 707 4 1 U
ATACTGTTACACACACACAAACAAAGATGGCAAACTTGAGTACACTCGTTGGTTGCCTTG
CCATCATCTTCTTCACTGTTGCTGCACCTGCCTCCTCAGCCACTCATTCTGTCGAATGGT
CGCTTGGGGAGGACTATAGCTCCTTGGCTACCGGGAAACCTTATGCCATTGGCGATACCA
TCGTGTTCGACTACGGTGCGGGTCACACGGTGGACGAAGTGAGTGAAAGTGACTACAAAA
GTTGCACATTGGGGAACTCAATTTCTTCCGACAGTAGCGGAACCACAAGCATGGCTCTCA
AGACAGTTGGCTTTCACTACTTCATTTGCGCTATCCCCGGCCACTGTGCCGGTGGCATGA
AGCTCTCTGTCAATGTAGGTGCAGCATCCTCTTCAGACGGTGGCGGTGACAGTGGTGGCA
GTACCACCCCCAAAACTACGCCTTCTCCAACCTCAGAGAGCAGGAAGGCTTCTCCAACCG
CTTCAGCCACTGCTGTGTTGAAGCCGTTCAAGGCTTTGGTTGTGACTTGCGTTGTTGTAT
TATTATATGCTTTGGCTCTTTCTTAGTTGTCTTTAATTTCTTTTTGGTTTGGTTTGGCTC
CTTTGAAAGTCCAGGCTAGAGGCAGTGCTATGAACCCTATTACACTGTATGCTTCTTGTT
GTGATTAATTATTCTATGATATTTAATTTTGCTCTGTTCGTATTTAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS23TF U 1
AF RR2F082TF U 1
AF RR2F082JQ C 111
AF RR2FK54TF U 1
BS 1 707 RR2F082TF

RD RR2GS23TF 570 0 0
ATACTGTTACACACACACAAACAAAGATGGCAAACTTGC**ACACTCGTTGGTTGCCTTG
CCATCATCTTCTTCACTGTTGCTGCACCTGCCTCCTCAGCCACTCATTCTGTCGAATGGT
CGCTTGGGGAGGACTATAGCTCCTTGGCTACCGGGAAACCTTATGCCATTGGCGATACCA
TCGTGTTCAACTACGGTGCGGGTCACACGGTGGACGAAGTGAGTGAAAGTGACTACAAAA
GTTGCACATTGGGGAACTCAATTTCTTCCGACAGTAGCGGAACCACAAGCATAGCTCTCA
AGACAGCTGGCTTTCACTACTTCATTTGCGCTATCCCCGGCCACTGTGCCGGTGGCATGA
AGCTCTCTGTCAATGTAGGTGCAGCATCCTCTTCAGACGGTGGCGGTGACAGTGGTGGCA
GTACCACCCCCAAAACTACACCTTCTCCAACCTCAGAGAGCAGGAAGGCTGCTCCAACCG
CTTCAGCCACTGCTGTGTTGAAGCCGTTCAAGGCTTTGGTTGTGACTTGCGTTGTTGTAT
TATTATATGCTTTGGCTCTTTCTTAGTTGT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2F082TF 707 0 0
ATACTGTTACACACACACAAACAAAGATGGCAAACTTGAGTACACTCGTTGGTTGCCTTG
CCATCATCTTCTTCACTGTTGCTGCACCTGCCTCCTCAGCCACTCATTCTGTCGAATGGT
CGCTTGGGGAGGACTATAGCTCCTTGGCTACCGGGAAACCTTATGCCATTGGCGATACCA
TCGTGTTCGACTACGGTGCGGGTCACACGGTGGACGAAGTGAGTGAAAGTGACTACAAAA
GTTGCACATTGGGGAACTCAATTTCTTCCGACAGTAGCGGAACCACAAGCATGGCTCTCA
AGACAGTTGGCTTTCACTACTTCATTTGCGCTATCCCCGGCCACTGTGCCGGTGGCATGA
AGCTCTCTGTCAATGTAGGTGCAGCATCCTCTTCAGACGGTGGCGGTGACAGTGGTGGCA
GTACCACCCCCAAAACTACGCCTTCTCCAACCTCAGAGAGCAGGAAGGCTTCTCCAACCG
CTTCAGCCACTGCTGTGTTGAAGCCGTTCAAGGCTTTGGTTGTGACTTGCGTTGTTGTAT
TATTATATGCTTTGGCTCTTTCTTAGTTGTCTTTAATTTCTTTTTGGTTTGGTTTGGCTC
CTTTGAAAGTCCAGGCTAGAGGCAGTGCTATGAACCCTATTACACTGTATGCTTCTTGTT
GTGATTAATTATTCTATGATATTTAATTTTGCTCTGTTCGTATTTAA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2F082JQ 595 0 0
GTCGAATGGTCGCTTGGGGAGGACTATAGCTCCTTGGCTACCGGGAAACCTTATGCCATT
GGCGATACCATCGTGTTCGACTACGGTGCGGGTCACACGGTGGACGAAGTGAGTGAAAGT
GACTACAAAAGTTGCACATTGGGGAACTCAATTTCTTCCGACAGTAGCGGAACCACAAGC
ATGGCTCTCAAGACAGTTGGCTTTCACTACTTCATTTGCGCTATCCCCGGCCACTGTGCC
GGTGGCATGAAGCTTTCTGTCAATGTAGGTGCAGCATCCTCTTCAGACGGTGGCGGTGAC
AGTGGTGGCAGTACCACCCCCAAAACTACGCCTTCTCCAACCTCAGAGAGCAGGAAGGCT
TCTCCAACCGCTTCAGCCACTGCTGTGTTGAAGCCGTTCAAGGCTTTGGTTGTGACTTGC
GTTGTTGTATTATTATATGCTTTGGCTCTTTTTTAGTTGTCTTTAATTTCTTTTTGGTTT
GGTTTGGCTCCTTTGAAAGTCCAGGCTAGAGGCAGTGCTATGAACCCTATTACACTGTAT
GCTTCTTGTTGTGATTAATTATTCTATGATATTTAATTTTGCTCTGTT
CGTATTT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2FK54TF 690 0 0
ATACTGTTACACACACACAAACAAAGATGGCAAACTTGAGTACACTCGTTGGTTGCCTTG
CCATCATCTTCTTCACTGTTGCTGCACCTGCCTCCTCAGCCACTCATTCTGTCGAATGGT
CGCTTGGGGAGGACTATAGCTCCTTGGCTACCGGGAAACCTTATGCCATTGGCGATACCA
TCGTGTTCAACTACGGTGCGGGTCACACGGTGGACGAAGTGAGTGAAAGTGACTACAAAA
GTTGCACATTGGGGAACTCAATTTCTTCCGACAGTAGCGGAACCACAAGCATAGCTCTCA
AGACAGCTGGCTTTCACTACTTCATTTACGCTATCCCCGGCCACTGTGCCGGTGGCATGA
AGCTCTCTGTCAATGTAGGTGCAGCATCCTCTTCAGACGGTGGCGGTGACAGTGGTGGCA
GTACCACCCCCAAAACTACACCTTTTCCAACCTCAGAGAGCAGGAAGGCTGCTCCAACCG
CTTCAGCCACTGCTGTGTTGAAGCCGTTCAAGGCTTTGGTTGTGACTTGCGTTGTTGTAT
TATTATATGCTTTGGCTCTTTCTTAGTTGTCTTTAATTTCTTTTTGGTTTGGTTTGGCTC
CTTTGAAAGTCCAGGCTAGAGGCAGTGCTATGAACCCTATTACACTGTATGCTTCTTGTT
GTGATTAAT*ATTCTATGATATTTAATTTT

QA 1 690 1 690
DS 



CO CL689Contig2 1137 5 9 U
AACAGAGAAAAATTAAATATCATAGAATAATTAATCACAACAAGAAGCATACAGTGTAAT
AGGGTTCATAGCACTGCCTCTAGCCTGGACTTTCAAAGGAGCCAAACCAAACCAAAAAGA
AATTAAAGACAACTAAGAAAGAGCCAAAGCATATAATAATACAACAACGCAAGTCACAAC
CAAAGCCTTGAACGGCTTCAACACAGCAGTGGCTGAAGCGGTTGGAGCAGCCTTCCTGCT
CTCTGAGGTTGGAGAAGGTGTAGTTTTGGGGGTGGTACTGCCACCACTGTCACCGCCACC
GTCTGAAGAGGATGCTGCACCTACATTGACAGAGAGCTTCATGCCACCGGCACAGTGGCC
GGGGATAGCGCAAATGAAGTAGTGAAAGCCAGCTGTCTTGAGAGCTATGCTTGTGGTTCC
GCTACTGTCGGAAGAAATTGAGTTCCCCAATGTGCAACTTTTGTAGTCACTTTCACTCAC
TTCGTCCACCGTGTGACCCGCACCGTAGTTGAACACTTTATGCAACACAATGGTATATAT
GCATATATTACAACTAAAATTATGATCATTGTTTTTTATAATGGTTATGAAGTTCTAGGA
CCGAAGGTCAGTAGTCAGTACTCTCCATAGGACATGATCTAAACCATGTTAATTTAATTC
TCTTTAAGAGAGTAGATTCCTCCTAACAAAAATCGAATATGCAACCCTTTATACTTTTTT
GTCAGTGGATCTAACTCTTCCTTGGTATTTTTGTTCTCGTTTGCAAGTAAACTTTTCCAG
ATGAAACACAGTGTAGTGTGTTCATCAAACTCTAGTTTTTTCTTTTGTTAATTGTAAATG
CAAACATTAAGAAACAAAAATATTGGTTATCCTCTTAGTGTGATAATTTCACATGTAAAT
GCAAATGCATATATTAGGGTTTGACATGCATACGAGAGGCTATATTGTACATACCGATGG
TATCGCCAATGGCATAAGGTTTCCCGGTAGCCAAGGAGCTATAGTCCTCCCCAAGCGACC
ATTCGACAGAATGAGTGGCTGAGGAGGCAGGTGCAGCAACAGTGAAGAAGATGATGGCAA
GGCAACCAACGAGTGTACTCAAGTTTGCCATCTTTGTTTGTGTGTGTGTAACAGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GS23JQB U 19
AF RR2HB93JQ U 1
AF RR2GK19JQ U 18
AF RR2HB93TF C 448
AF RR2GK19TF C 492
BS 1 222 RR2HB93JQ
BS 223 223 RR2GS23JQB
BS 224 374 RR2HB93JQ
BS 375 375 RR2GS23JQB
BS 376 582 RR2HB93JQ
BS 583 757 RR2GK19JQ
BS 758 1067 RR2HB93TF
BS 1068 1068 RR2GK19TF
BS 1069 1137 RR2HB93TF

RD RR2GS23JQB 414 0 0
ATCATAGAATAATTAATCACAACAAGAAGCATACAGTGTAATAGGGTTCATAGCACTGCC
TCTAGCCTGGACTTTCAAAGGAGCCAAACCAAACCAAAAAGAAATTAAAGACAACTAAAA
AAGAGCCAAAGCATATAATAATACAACAACGCAAGTCACAACCAAAGCCTTGAACGGCTT
CAACACAGCAGTGGCTGAAGCGGTTGGAGCAGCCTTCCTGCTCTCTGAGGTTGGAGAAGG
TGTAGTTTTGGGGGTGGTACTGCCACCACTGTCACCGCCACCGTCTGAAGAGGATGCTGC
ACCTACATTGACAGAGAGCTTCATGCCACCGGCACAGTGGCCGGGGATAGCGCAAATGAA
GTAGTGAAAGCCAGCTGTCTTGAGAGCTATGCTTGTGGTTCCGCTACTGTCGGA

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR2HB93JQ 582 0 0
AACAGAGAAAAATTAAATATCATAGAATAATTAATCACAACAAGAAGCATACAGTGTAAT
AGGGTTCATAGCACTGCCTCTAGCCTGGACTTTCAAAGGAGCCAAACCAAACCAAAAAGA
AATTAAAGACAACTAAGAAAGAGCCAAAGCATATAATAATACAACAACGCAAGTCACAAC
CAAAGCCTTGAACGGCTTCAACACAGCAGTGGCTGAAGCGGTAGGAGCAGCCTTCCTGCT
CTCTGAGGTTGGAGAAGGTGTAGTTTTGGGGGTGGTACTGCCACCACTGTCACCGCCACC
GTCTGAAGAGGATGCTGCACCTACATTGACAGAGAGCTTCATGCCACCGGCACAGTGGCC
GGGGATAGCGCAAACGAAGTAGTGAAAGCCAGCTGTCTTGAGAGCTATGCTTGTGGTTCC
GCTACTGTCGGAAGAAATTGAGTTCCCCAATGTGCAACTTTTGTAGTCACTTTCACTCAC
TTCGTCCACCGTGTGACCCGCACCGTAGTTGAACACTTTATGCAACACAATGGTATATAT
GCATATATTACAACTAAAATTATGATCATTGTTTTTTATAAT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2GK19JQ 740 0 0
TATCGTAGAATAATTAATCACAACAAGAAGCATACAGTGTAATAGGGTTCATAGCACTGC
CTCTAGCCTGGACTTTCAAAGGAGCCAAACCAAACCAAAAAGAGATTAAAGACAACTAAG
AAAGAGCCAAGGCATATAATAATACAACGACGCAAGTCACAACCAAAGCCTTGAACGGCT
TCAACACAGCAGTGGCTGAAGCGGTTGGAGCAGCCTTCCTGCTCTCTGAGGTTGGAGAAG
GTGTAGTTTTGGGGGTGGTACTGCCACCACTGTCACCGCCACCGTCTGAAGAGGATGCTG
CACCTACATTGACAGAGAGCTTCATGCCACCGGCACAGTGGCCGGGGATAGCGCAAATGA
AGTAGTGAAAGCCAGCTGTCTTGAGAGCTATGCTTGTGGTTCCGCTACTGTCGGAAGAAA
TTGAGTTCCCCAATGTGCAACTCTTGTAGTCACTTTCACTCACTTCGTCCACCGTGTGAC
CCGCACCGTAGTTGAACACTTTATGCAACACAATGGTATATATGCATATATTACAACTAA
AATTATGATCATTGTTTTTTATAATGGTTATGAAGTTCTAGGACCGAAGGTCAGTAGTCA
GTACTCTCCATAGGACATGATCTAAACCATGTTAATTTAATTCTCTTTAAGAGAGTAGAT
TCCTCCTAACAAAAATCGAATATGCAACCCTTTATACTTTTTTGTCAGTGGATCTAACTC
TTCCTTGGTATTTTTGTTCT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2HB93TF 690 0 0
CAATGTGCAACTTTTGTAGTCACTTTCACTCACTTCGTCCACCGTGTGACCCGCACCGTA
GTTGAACACTTTATGCAACACAATGGTATATATGCATATATTACAACTAAAATTATGATC
ATTGTTTTTTATAATGGTTATGAAGTTCTAGGACCGAAGGTCAGTAGTCAGTACTCTCCA
TAGGACATGATCTAAACCATGTTAATTTAAATCTCTTTAAGAGAGTAGATTCCTCCTAAC
AAAAATCGAATATGTAACCCTTTATACTTTTTTGTCAGTGGATCTAACTCTTCCTTGGTA
TTTTTGTTCTCGTTTGCAAGTAAACTTTTCCAGATGAAACACAGTGTAGTGTGTTCATCA
AACTCTAGTTTTTTCTTTTGTTAATTGTAAATGCAAACATTAAGAAACAAAAATATTGGT
TATCCTCTTAGTGTGATAATTTCACATGTAAATGCAAATGCATATATTAGGGTTTGACAT
GCATACGAGAGGCTATATTGTACATACCGATGGTATCGCCAATGGCATAAGGTTTCCCGG
TAGCCAAGGAGCTATAGTCCTCCCCAAGCGACCATTCGACAGAATGAGTGGCTGAGGAGG
CAGGTGCAGCAACAGTGAAGTAGATGATGGCAAGGCAACCAACGAGTGTACTCAAGTTTG
CCATCTTTGTTTGTGTGTGTGTAACAGTAT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2GK19TF 646 0 0
TGTGACCCGCAC*GTAGTTGAACACTTTATGCAACACAATGGTATATATGCATATATTAC
AACTAAAATTATGATCATTGTTTTTTATAATGGTTATGAAGTTCTAGGAC*GAAGGTCAG
TAGTCAGTACTCTCCATAGGACATGATCTAAACCATGTTAATTTAATTCTCTTTAAGAGA
GTAGATTCCTCCTAACAAAAATCGAATATGCAACCCTTTATACTTTTTTGTCAGTGGATC
TAACTCTTCCTTGGTATTTTTGTTCTCGTTTGCAAGTAAACTTTTCCAGATGAAACACAG
TGTAGTGTGTTCATCAAACTCTAGTTTTTTCTTTTGTTAATTGTAAATGCAAACATTAAG
AAACAAAAATATTGGTTATCCTCTTAGTGTGATAATTTCACATGTAAATGCAAATGCATA
TATTAGGGTTTGACATGCATACGAGAGGCTATATTGTACATACCGATGGTATCGCCAATG
GCATAAGGTTTCCCGGTAGCCAAGGAGCTATAGTCCTCCCCAAGCGACCATTCGACAGAA
TGAGTGGCTGAGGAGGCAGGTGCAGCAACAGTGAAGAAGATGATGGCAAGGCAACCAACG
AGTGTACTCAAGTTTGCCATCTTTGTTTGTGTGTGTGTAACAGTAT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 6

CO CL690Contig1 872 6 27 U
CCTTGATAACATGTAATGGGTACACTATTATGCGAAAAGAAGGCATTATCTTGCAGTAGT
GTCATAGAAACATGCTTGAAACAACCATAACATTCTAGAAATTGTAAAACAAAAAGATTA
TTATTTTGATAAATGCAACGATACTTCATATACTTCTTCCCACTTTTCAATTGGCTTTTG
ACTCAATCACCTTCTTGGCGAAAGAAGGCAAGCAGAACGCAGCTGAATGAATCTCAGCGT
TGTAGAACTTCAAGGGTCCATATGATTTGCTGGAGCTGTCATCAATGGGGTTGACAGGGT
GTTTGAAGTCAACGTCAGGTCCCTCAGTTGAACAAAGCATAAATCCAATAACCCCACTAG
GGTATGTTGGAACACTGGTCCACGCGTAGTTCACAGAGCCCTTGAAGATCTCACGACAAT
TGGAAACAATGTCCTCGATGATGTCCATGTGAAGCCACAAGCTTTCGGCCTGAGTGCACA
CAACTCCACCAGGGCGAAGAGCTCTAGCCACGGATTGGAAGAAAGGTTTCTCAAACAGCT
CCTTTGCAGGACCAATTGGATCTGATGAATCGACAATGACTGCATCGTATGAACCTTCAG
CAGCATTCTTCAAGTAAGCAACACCATCGCCAATGACGAGGTTCACACGAGGATCCTCGA
ATCCAATTGCTACATCAGGGAAAAAC*TGCTTAGAGACATCAACGACCATTTTATCAATC
TCACACATGTCAATCTGCTCAACAGAAGCATGGCGTGCAACTTCCCGCAGGACACCTCCA
TCTCCTCCTCCAATCACCAAGACCTTCTTAGGGTTAGGGATAGAGGACAAAGGAAGATGA
GTGATCATCTCCTGATAAGCGAATTCGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C758JQ U 56
AF RR2F884JQ U 32
AF RR2CQ43JQ U 1
AF RR2AH36JQ U 28
AF RR2FR11TF C 195
AF RR2F884TF C 203
BS 1 66 RR2CQ43JQ
BS 67 67 RR2F884JQ
BS 68 142 RR2CQ43JQ
BS 143 143 RR2AH36JQ
BS 144 161 RR2CQ43JQ
BS 162 162 RR2AH36JQ
BS 163 187 RR2CQ43JQ
BS 188 188 RR2AH36JQ
BS 189 370 RR2CQ43JQ
BS 371 371 RR2AH36JQ
BS 372 383 RR2CQ43JQ
BS 384 384 RR2F884JQ
BS 385 604 RR2CQ43JQ
BS 605 605 RR2AH36JQ
BS 606 611 RR2CQ43JQ
BS 612 612 RR2AH36JQ
BS 613 661 RR2CQ43JQ
BS 662 769 RR2AH36JQ
BS 770 770 RR2FR11TF
BS 771 794 RR2AH36JQ
BS 795 809 RR2FR11TF
BS 810 810 RR2F884TF
BS 811 824 RR2FR11TF
BS 825 825 RR2F884TF
BS 826 857 RR2FR11TF
BS 858 858 RR2F884TF
BS 859 872 RR2FR11TF

RD RR2C758JQ 350 0 0
GTAGTGTCATAGAAACATGCTTGAAACAACCATAACATTCTAGAAATTGTAAAACAAAAA
GATTTTTATTTTGATAAATGCAACGATACTTCATATACTTCTTCCCACTTTTCAATTGGC
TTTTGACTCAATCACCTTCTTGGCGAAAGAAGGCAAGCAGAACGCAGCTGAATGAATCTC
AGCGTTGTAGAACTTCAAGGGTCCATATGATTTGCTGGAGCTGTCATCAATGGGGTTGAC
AGGGTGTTTGAAGTCAACGTCAGGTCCCTCAGTTGAACATAGCATAAATCCAATAACCCC
ACTAGGGTATGTTGGAACACTGGTCCACGCGTAGTTCACAGAGCCCTTGA

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR2F884JQ 555 0 0
GCAAAAAGAAGGCAT
TATCTTGCAGTAGTGTCATAGAAACATGCTTGAAACAACCATAACATTCTAGAAATTGTA
AAACAAAAAGATTATTATTTTGATAAATGCAACGATCCTTCATATACTTCTTCCC*CTTT
TCAATTGGCTTTTGACTCAATGACCTTCTTGGCGAAAGAAGGCAAGCAGAACGCAGCTGA
ATGAATCTCAGCGTTGTAGAACTTCAAGGGTCCATATGATTTGCTGGAGCTGTCATCAAT
GGGGTTGACAGGGTGTT*GAAGTCAACGTCAGGTCCCTCAGTTGAACAAAGCATAAATCC
AATAACCCCACTAGGGTATGTTGGGACACTGGTCCACGCGTAGTTCACAGAGCCCTTGAA
GATCTCACGACAATTGGAAACAATGTCCTCGATGATGTCCATGTGAAGCCACAAGCTTTC
GGCCTGAGTGCACACAACTCCACCAGGGCGAAGAGCTCTAGCCACGGATTGGAAGAAAGG
TTTCTCAAACAGCTCCTTTGCAGGACCAATTGGATCTGATGAATCGACAATGACTGCATC

QA 16 555 16 555
DS 

RD RR2CQ43JQ 661 0 0
CCTTGATAACATGTAATGGGTACACTATTATGCGAAAAGAAGGCATTATCTTGCAGTAGT
GTCATAAAAACATGCTTGAAACAACCATAACATTCTAGAAATTGTAAAACAAAAAGATTA
TTATTTTGATAAATGCAACGATCCTTCATATACTTCTTCCC*CTTTTCAATTGGCTTTTG
ACTCAATGACCTTCTTGGCGAAAGAAGGCAAGCAGAACGCAGCTGAATGAATCTCAGCGT
TGTAGAACTTCAAGGGTCCATATGATTTGCTGGAGCTGTCATCAATGGGGTTGACAGGGT
GTTTGAAGTCAACGTCAGGTCCCTCAGTTGAACAAAGCATAAATCCAATAACCCCACTAG
GGTATGTTGGGACACTGGTCCACACGTAGTTCACAGAGCCCTTGAAGATCTCACGACAAT
TGGAAACAATGTCCTCGATGATGTCCATGTGAAGCCACAAGCTTTCGGCCTGAGTGCACA
CAACTCCACCAGGGCGAAGAGCTCTAGCCACGGATTGGAAGAAAGGTTTCTCAAACAGCT
CCTTTGCAGGACCAATTGGATCTGATGAATCGACAATGACTGCATCGTATGAACCTTCAG
CAGCGTTCTTCGAGTAAGCAACACCATCGCCAATGACGAGGTTCACACGAGGATCCTCGA
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2AH36JQ 768 0 0
ATGCGAAAAGAAGGCATTA
TATCTTGCAGTAGTGTCATAGAAACATGCTTGAAACAACCATAACATTCTAGAAATTGTA
AAACAAAAAGATTTTTATTTTGATAAATGCAACGATACTTCATATACTTCTTCCCACTTT
TCAATTGGCTTTTGACTCAATCACCTTCTTGGCGAAAGAAGGCAAGCAGAACGCAGCTGA
ATGAATCTCAGCGTTGTAGAACTTCAAGGGTCCATATGATTTGCTGGAGCTGTCATCAAT
GGGGTTGACAGGGTGTTTGAAGTCAACGTCAGGTCCCTCAGTTGAACATAGCATAAATCC
AATAACCCCACTAGGGTATGTTGGAACACTGGTCCACGCGTAGTTCACAGAGCCCTTGAA
GATCTCACGACAGTTGGAAACAATGTCTTCGATGATGTCCATGTGAAGCCACAAGCTTTC
GGCCTGAGTGCACACAACTCCACCAGGGCGAAGAGCTCTAGCCACGGATTGGAAGAAAGG
CTTCTCAAACAGCTCCTTTGCAGGACCAATTGGATCTGATGAATCAACAATGACTGCATC
GTATGAACCTTCAGCAGCATTCTTCAAGTAAGCAACACCATCGCCAATGACGAGGTTGAC
ACGAGGATCCTCGAATCCAATTGCTACATCAGGGAAAAAC*TGCTTAGAGACATCAACGA
CCATTTTATCAATCTCACACATGTCAATCTGCTCAACAGAAGCATGGCGTGCAACTTCCC
GCAAGACACCTCCATCTCCTCCTCCAAT
G

QA 20 767 20 767
DS 

RD RR2FR11TF 678 0 0
TTGGCGAAAGAAGGCAAGCAGAACGCAGCTAAATGAATCTCAGCGTTGTAGAACTTCAAG
GGTCCATATGATTTGCTGGAGCTGTCATCGATGGGGTTGACAGGGTGTTTGAAGTCAACG
TCAGGTCCCTCAGTTGAACATAGCATAAATCCAATAACCCCACTAGGGTATGTTGGAACA
CTGGTCCACGCGTAGTTCACAGAGCCCTTGAAGATCTCACGACAATTGGAAACAATGTCT
TCGATGATGTCCATGTGAAGCCACAAGCTTTCGGCCTGAGTGCACACAACTCCACCAGGG
CGAAGAGCTCTAGCCACGGATTGGAAGAAAGGTTTCTCAAACAGCTCCTTTGCAGGGCCA
ATTGGATCTGATGAGTCAACAATGACTGCATCGTATGATCCTTCAGCAGCATTCTTCAAG
TAAGCAACACCATCGCCAATGACGAGGTTCACACGAGGATCCTCGAATCCAATTGCTACA
TCAGGGAAAAAC*TGCTTAGAGACATCAACGACCATCTTATCAATCTCACACATATCAAT
CTGCTCAACAGAAGCATGGCGTGCAACTTCCCGCAGGACACCTCCATCTCCTCCTCCAAT
CACCAAGACCTTCTTTGGGTTAGGGATAGATGACAAAGGAAGATGAGTGATCATCTCCTG
ATAGGCGAATTCGTCTCC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2F884TF 665 0 0
AGAAGGCAAGCAGAACGCAGCTGAATGAATCTCAGCGTTGTAGAACTTCAAGGGTCCATA
TGATTTGCTGGAGCTGTCATCAATGGGGTTGACAGGGTGTT*GAAGTCAACGTCAGGTCC
CTCAGTTGAACAAAGCATAAATCCAATAACCCCACTAGGGTATGTTGGGACACTGGTCCA
CGCGTAGTTCACAGAGCCCTTGAAGATCTCACGACAATTGGAAACAATGTCCTCGATGAT
GTCCATGTGAAGCCACAAGCTTTCGGCCTGAGTGCACACAACTCCACCAGGGCGAAGAGC
TCTAGCCACGGATTGGAAGAAAGGTTTCTCAAACAGCTCCTTTGCAGGACCAATTGGATC
TGATGAATCGACAATGACTGCATCGTATGAACCTTCAGCAGCGTTCTTCAAGTAAGCAAC
ACCATCGCCAATGACGAGGTTCACACGAGGATCCTCGAATCCAATTGCTACATCAGGGAA
AAAAATGCTTAGAGACATCAACGACCATTTTATCAATCTCACACATGTCAATCTGCTCAA
CAGAAGCATGGCGTGCAACTTCCCGCAGGACACCTCCATCTCCTCCTCCAATCACCAAGA
CCTTCTTAGGGTTAGGGATAGAGGACAGAGGAAGATGAGTGATCATCTCCTGATAAGCGC
ATTC
C

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 9

CO CL691Contig1 1122 9 9 U
GGGCGCCGCACTCTCTCTCTCTCAGATTGATTCCTCTCAAAACCAACCCTTCTCCCCCAA
AGTTAATTTCAGTAGCAATCATGGCTGATGAGAATAATGAGTTGAAGGAGGTCAAGGACG
AGCAAGAACTCGCACCCTTTGACCCAACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGTTGTCATTC
AAGATCCCATCGAGGAACCTACTGAGTCACCGGCCGAGCCATCTGATTCATTGCCTGCTA
GTGATGGTGGCCTTGACGGTCCATCTTTCGGAACCAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGCCTG
TTGAATCAAACTCATTGGATGATGAAAGTGTCGATGCTCCAGAAGATTTGGAGGAGCATC
CCAATGAAGAGGAAGAGGCAGAGGGAATTGATTTGCAGCAGCAGCAGCAACGTTATCCCT
GGGAGGGAAGTGATAGGGATTACATATATGACGAGCTTCTTGGTAGAGTCTTTAACATTC
TCCGTGAGAACAATCCGGAGCTTGCTGGAGATAGGCGTCGTACTGTTATGAGGCCTCCCC
AAGTTCTTCGTGAAGGGACAAAGAAGACAGTGTTTGTCAACTTCATGGACCTTTGCAAGA
CGATGCATCGTCAACCGGACCATGTGATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGGGAACAAGTG
GTTCGCTTGATGGGCAGCAAAGATTGGTTGTCAAGGGAAGATTTGCACCCAAGAATTTTG
AGGGGATTTTGCGTCGTTATGTCACTGAGTACGTCATTTGCCTTGGTTGTAAGAGCCCGG
ACACAATTCTCTCAAAGGAGAATTGTCTCTTCTTTCTCAGATGCGAGAAGTGTGGATCTG
GACGATCTGTGGCGCAGATCAAAGCTGGTTTTGTTGCTCGTGTTGGTCGCAGAAAGACTT
GAGGAATTGGACGGTGAACTGAGTGGTCTTTTTGTTTTGGGAAACTACAGAGCTTGTTAT
GCAGTTGAAATACCTGTGTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTATTGTTTCTGAATGTGAG
CAATAATCTGGAGACAAGATTTCACATCAAATATGATCAAAACCTTCTACTTTGTTAGAT
TCATGTGGGTCACTAAAATCCATGGAGTGTCTTTTTACTTTC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2EL04TF U 3
AF RR2GU70TF U 1
AF RR2GE25TF U 1
AF RR2FS58TF U 1
AF RR2FS58JQ C 321
AF RR2GL25TF U 378
AF RR2GU70JQB C 554
AF RR2EL04JQ C 304
AF RR2GL25JQ C 657
BS 1 171 RR2FS58TF
BS 172 172 RR2EL04TF
BS 173 305 RR2FS58TF
BS 306 306 RR2GU70TF
BS 307 779 RR2FS58TF
BS 780 954 RR2GL25TF
BS 955 1045 RR2EL04JQ
BS 1046 1046 RR2GL25JQ
BS 1047 1122 RR2EL04JQ

RD RR2EL04TF 186 0 0
GG
GCCGCACTCTCTCTCTCTCAGATTGATTCCTCTCGAAACCAACCCTTCTCCCCCAAAGTT
AATTTCAGTAGCAATCATGGCTGATGAGAATAATGAGTTGAAGGAGGTCAAGGACGAGCA
AGAACTCGCACCCTTTGACCCAACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGTTGTCATTCAAGA
TCCC

QA 3 186 3 186
DS 

RD RR2GU70TF 609 0 0
GGGC
GCCGCACTCTCTCTCTCTCAGATTGATTCCTCTCAAAACCAACCCTTCTCCCCCAAAGTT
AATTTCAG***CAATCATGGCTGATGAGAATAATGAGTTGAAGGAGGTCAAGGACGAGCA
AGAACTCGCACCCTTTGACCCAACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGTTGTCATTCAAGA
TCCCATCGAGGAACCTACTGAGTCACCGGCCGAGCCATCTGATTCATTGCCTGCTAGTGA
TGGTGGCCTTGACGGTCCATCTTTCGGAACCAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGCCTGTTGA
ATCAAACTCATTGGATGATGAAAGTGTCGATGCTCCAGAAGATTTGGAGGAGCATCCCAA
TGAAGAGGAAGAGGCAGAGGGAATTGATTTGCAGCAGCAGCAGCAACGTTATCCCTGGGA
GGGAAGTGATAGGGATTACATATATGACGAGCTTCTTGGTAGAGTCTTTAACATTCTCCG
TGAGAACAATCCGGAGCTTGCTGGAGATAGGCGTCGTACTGTTATGAGGCCTCCCCAAGT
TCTTCGTGAAGGGACAAAGAAGACAGTGTTTGTCAACTTCATGGACCTTTGCAAGACGAT
GCATC

QA 5 609 5 609
DS 

RD RR2GE25TF 692 0 0
GGGC
GCCGCACTCTCTCTCTCTCAGATTGATTCCTCTCAAAACCAACCCTTCTCCCCCAAAGTT
AATTTCAGTAGCAATCATGGCTGATGAGAATAATGAGTTGAAGGAGGTCAAGGACGAGCA
AGAACTCGCACCCTTTGACCCAACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGTTGTCCTTCAAGA
TCCCATCGAGGAACCAACTGAGTCACCGGCCGAGCCATCTGATCCATTGCCTGCTAATGA
TGGTGGTCTTGACGGTCCATCTTTCGGAACCAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGCCTGTTGA
ATCAAGCTCATTGGATGAAGAAAGTGTCGATGCTCCAGAAGATTTGGAGGAGCATCCTAA
CGAAGAGGAAGAGGCAGAAGGAATTGATTTGCAGCAGCAGCAGCAACGTTATCCCTGGGA
GGGAAGTGATAGGGATTACATTTATGACGAGCTTCTTGGTAGAGTCTTCAACACTCTCCG
TGAGAACAATCCGGAGCTTGCTGGAGATAGGCGTCGTACTGTTATGAGGCCTCCCCAAGT
TCTTCGTGAAGGGACAAAGAAGACAGTGTTTGTCAACTTCATGGACCTTTGCAAGACGAT
GCATCGTCAACCGGACCATGTGATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGGGAACCAGTGGTTC
GCTTGATGGACAGCAAAGATTGGTTGTC

QA 5 692 5 692
DS 

RD RR2FS58TF 779 0 0
GGGCGCCGCACTCTCTCTCTCTCAGATTGATTCCTCTCAAAACCAACCCTTCTCCCCCAA
AGTTAATTTCAGTAGCAATCATGGCTGATGAGAATAATGAGTTGAAGGAGGTCAAGGACG
AGCAAGAACTCGCACCCTTTGACCCAACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGCTGTCATTC
AAGATCCCATCGAGGAACCTACTGAGTCACCGGCCGAGCCATCTGATTCATTGCCTGCTA
GTGATGGTGGCCTTGACGGTCCATCTTTCGGAACCAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGCCTG
TTGAAACAAACTCATTGGATGATGAAAGTGTCGATGCTCCAGAAGATTTGGAGGAGCATC
CCAATGAAGAGGAAGAGGCAGAGGGAATTGATTTGCAGCAGCAGCAGCAACGTTATCCCT
GGGAGGGAAGTGATAGGGATTACATATATGACGAGCTTCTTGGTAGAGTCTTTAACATTC
TCCGTGAGAACAATCCGGAGCTTGCTGGAGATAGGCGTCGTACTGTTATGAGGCCTCCCC
AAGTTCTTCGTGAAGGGACAAAGAAGACAGTGTTTGTCAACTTCATGGACCTTTGCAAGA
CGATGCATCGTCAACCGGACCATGTGATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGGGAACAAGTG
GTTCGCTTGATGGGCAGCAAAGATTGGTTGTCAAGGGAAGATTTGCACCCAAGAATTTTG
AGGGGATTTTGCGTCGTTATGTCACTGAGTACGTCATTTGCCTTGGTTGTAAGAGCCCG

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2FS58JQ 483 0 0
GATGAAAGTGTCGATGCTCCAGAAGATTTGGAGGAGCATCCCAATGAAGAGGAAGAGGCA
GAGGGAATTGATTTGCAGCAGCAGCAGCAACGTTATCCCTGGGAGGGAAGTGATAGGGAT
TACATATATGACGAGCTTCTTGGTAGAGTCTTTAACATTCTCCGTGAGAACAATCCGGAG
CTTGCTGGAGATAGGCGTCGTACTGTTATGAGGCCTCCCCAAGTTCTTCGTGAAGGGACA
AAGAAGACAGTGTTTGTCAACTTCATGGACCTTTGCAAGACGATGCATCGTCAACCGGAC
CATGTGATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGGGAACAAGTGGTTCGCTTGATGGGCAGCAA
AGATTGGTTGTCAAGGGAAGATTTGCACCCAAGAATTTTGAGGGGATTTTGCGTCGTTAT
GTCACTGAGTACGTCATTTGCCTTGGTTGTAAGAGCCCGGACACAATTCTCTCAAAGGAG
AAT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR2GL25TF 577 0 0
GCAGAGGGAATTGATTTGCAGCAGCAGCAGCAACGTTATCCCTGGGAGGGAAGTGATAGG
GATTACATATATGACGAGCTTCTTGGTAGAGTCTTTAACATTCTCCGTGAGAACAATCCG
GAGCTTGCTGGAGATAGGCGTCGTACTGTTATGAGGCCTCCCCAAGTTCTTCGTGAAGGG
ACAAAGAAGACAGTGTTTGTCAACTTCATGGACCTTTGCAAGACGATGCATCGTCAACCG
GACCATGTGATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGGGAACAAGTGGTTCGCTTGATGGGCAG
CAAAGATTGGTTGTCAAGGGAAGATTTGCACCCAAGAATTTTGAGGGGATTTTGCGTCGT
TATGTCACTGAGTACGTCATTTGCCTTGGTTGTAAGAGCCCGGACACAATTCTCTCAAAG
GAGAATTGTCTCTTCTTTCTCAGATGCGAGAAGTGTGGATCTGGACGATCTGTGGCGCAG
ATCAAAGCTGGTTTTGTTGCTCGTGTTGGTCGCAGAAAGACTTGAGGAATTGGACGGTGA
ACTGAGTGGTCTTTTTGTTTTGGGAAACTACAGAGCT

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2GU70JQB 525 0 0
AGGGACAAAGAAGACAGTGTTTGTCAACTTCATGGACCTTTGCAAGACGATGCATCGTCA
ACCGGACCATGTGATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGGGAACAAGTGGTTCGCTTGATGG
GCAGCAAAGATTGGTTGTCAAGGGAAGATTTGCACCCAAGAATTTTGAGGGGATTTTGCG
TCGTTATGTCACTGAGTACGTCATTTGCCTTGGTTGTAAGAGCCCGGACACAATTCTCTC
AAAGGAGAATCGTCTCTTCTTTTTCAGATGCGAGAAGTGTGGATCTGGACGATCTGTGGC
GCAGATCAAAGCTGGTTTTGTTGCTCGTGTTGGTCGCAGAAAGACTTGAGGAATTGGACG
GTGAACTGAGTGGTCTTTTTGTTTTGGGAAACTACAGAGCTTGTTATGCAGTTGAAATAC
CTGTGTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTATTGTTTCTGAATGTGAGCAATAATCTGGAG
ACAAGATTTCACATCAAATATGATCAAAACCTTTTACTTTGTTAG

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2EL04JQ 819 0 0
AAT
CAAACTCATTGGATGATGAAAGTGTCGATGCTCCAGAAGATTTGGAGGAGCATCCCAATG
AAGAGGAAGAGGCAGAGGGAATTGATTTGCAGCAGCAGCAGCAACGTTATCCCTGGGAGG
GAAGTGATAGGAATTACATATATGACGAGCTTCTTGGTAGAGTCTTTAACATTCTCCGTG
AGAACAATCCGGAGCTTGCTGGAGATAGGCGTCGTACTGTTATGAGGCCTCCCCAAGTTC
TTCGTGAAGGGACAAAGAAGACAGTGTTTGTCAACTTCATGGACCTTTGCAAGACGATGC
ATCGTCAACCGGACCATGTGATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGGGAACAAGTGGTTCGC
TTGATGGGCAGCAAAGATTGGTTGTCAAGGGAAGATTTGCACCCAAGAATTTTGAGGGGA
TTTTGCGTCGTTATGTCACTGAGTACGTCATTTGCCTTGGTTGTAAGAGCCCTGACACAA
TTCTCTCAAAGGAGAATCGTCTCTTCTTTCTCAGATGCGAGAAGTGTGGATCTGGACGAT
CTGTGGCGCAGATCAAAGCTGGTTTTGTTGCTCGTGTTGGTCGCAGAAAGACTTGAGGAA
TTGGACGGTGAACTGAGTGGTCTTTTTGTTTTGGGAAACTACAGAGCTTGTTATGCAGTT
GAAATACCTGTGTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTATTGTTTCTGAATGTGAGCAATAA
TCTGGAGACAAGATTTCACGTCAAATATGATCAAAACCTTCTACTTTGTTAGATTCATGT
GGGTCACTAAAATCCATGGAGTGTCTTTTTACTTTC

QA 4 819 4 819
DS 

RD RR2GL25JQ 466 0 0
AGTGGTTCGCTTGATGGGCAGCAAAGATTGGTTGTCAAGGGAAGATTTGCACCCAAGAAT
TTTGAGGGGATTTTGCGTCGTTATGTCACTGAGTACGTCATTTGCCTTGGTTGTAAGAGC
CCGGACACAATTCTCTCAAAGGAGAATTGTTTCTTCTTTTTCAGATGCGAGAAGTGTGGA
TCTGGACGATCTGTGGCGCAGATCAAAGCTGGTTTTGTTGCTCGTGTTGGTCGCAGAAAG
ACTTGAGGAATTGGACGGTGAACTGAGTGGTCTTTTTGTTTTGGGAAACTACAGAGCTTG
TTATGCAGTTGAAATACCTGTGTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTATTGTTTCTGAATG
TGAGCAATAATCTGGAGACAAGATTTCACATCAAATATGATCAAAACCTTCTACTTTGTT
AGATTCATGTGGGTCACTAAAATCCATGGAGTGTCTTTTTACTT
CC

QA 1 464 1 464
DS 



AS 2 7

CO CL692Contig1 1258 4 15 U
GGGTAGCAGTCATTACGAGCCCTCGAGTCTACCTTACCTTTTACCATCCGAGTCGAGGAG
AAGAAGAAGTAGAAGAATCTGTGAGCAATGGCAATGGCTGTTTTCCGTCGCGAAGGGAGG
CGTCTCCTCCCTTCAATCGCCGCTCGCCCAATCGCCGCCATCCGATCTCCTCTCTCTTCT
GACCAGGAGGAAGGACCTCTTGGAGTTCGTTCTATCTCAACTCAAGTTGTGCGTAACCGG
ATGAAGAGTGTGAAGAACATCCAAAAGATCACAAAGGCCATGAAGATGGTTGCTGCTTCT
AAGCTAAGAGCTGTTCAAGGCAGAGCTGAGAACTCCCGTGGACTTTGGCAGCCTTTTACT
GCTCTTCTTGGAGACAATCCCAGCATTGATGTGAAGAAGAGTGTAGTGGTTACTCTCTCT
TCTGACAAGGGTCTCTGTGGTGGAATCAACTCCACCGTTGTTAAAGTGAGCAGGGCTTTG
TACAAGTTGAATGCTGGTCCTGAAAAGGACGTGAAGTTTGTTATTGTCGGGGAGAAAGCA
AAGGCTATAATGTTCCGTGACTCAAAGAACGACATTTCCCTTACTGTAACAGAGCTGAAT
AAGAATCCACTCAACTATGCTCAGGTCTCAGTTTTAGCTGATGACATCCTGAAGAACGTT
GAGTTCGATGCTTTGCGCATTGTTTACAACAAGTTCCATTCTGTCGTCGCATTTCTACCG
ACTGTGGCCACTGTTTTGTCACCTGAGATTATTGAGAAGGAGTCTGAAGTGGGAGGAAAG
CTCGGTGAGCTCGACTCATACGAGATTGAAGGTGGTGAAACAAAGGGAGAAATCCTGCAG
AATCTGGCCGAGTTCCAATTCTCTTGTGTAATGTTCAATGCGGTGCTGGAGAATGCGTGT
AGTGAGATGGGAGCTAGGATGTCTGCCATGGACAGCTCAAGCAGAAACGCAGGAGAAATG
CTTGACCGTCTCACCCTCACTTACAACAGGACTCGTCAAGCTTCTATCACAACAGAGCTT
ATCGAGATTATCTCTGGAGCCTCTGCACTTGAAGCCGCTAAATAAGCACGTTCTTGTTTG
CGTTGACTTGGTTTTTGATACTCGTCCACCTTGAAGGAGATAGTGTGTTTTGAATTCTCT
AAGGACTACTGAATCAGTTTACCTTTGCTGGCTTCTCGTTGAGGCTACCAGTCTTTGGCT
CAAAGGATTTTTCATAATAATATCCCTGTAATTTCCAGCAGGATTACTAATAATTGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C354TF U 1
AF RR2G414TF U 203
AF RR2BD29JQ C 452
AF RR2C354JQ C 501
BS 1 374 RR2C354TF
BS 375 375 RR2G414TF
BS 376 620 RR2C354TF
BS 621 713 RR2G414TF
BS 714 714 RR2BD29JQ
BS 715 742 RR2G414TF
BS 743 743 RR2BD29JQ
BS 744 759 RR2G414TF
BS 760 760 RR2BD29JQ
BS 761 810 RR2G414TF
BS 811 811 RR2BD29JQ
BS 812 821 RR2G414TF
BS 822 1107 RR2BD29JQ
BS 1108 1108 RR2C354JQ
BS 1109 1258 RR2BD29JQ

RD RR2C354TF 620 0 0
GGGTAGCAGTCATTACGAGCCCTCGAGTCTACCTTACCTTTTACCATCCGAGTCGAGGAG
AAGAAGAAGTAGAAGAATCTGTGAGCAATGGCAATGGCTGTTTTCCGTCGCGAAGGGAGG
CGTCTCCTCCCTTCAATCGCCGCTCGCCCAATCGCCGCCATCCGATCTCCTCTCTCTTCT
GACCAGGAGGAAGGACCTCTTGGAGTTCGTTCTATCTCAACTCAAGTTGTGCGTAACCGG
ATGAAGAGTGTGAAGAACATCCAAAAGATCACAAAGGCCATGAAGATGGTTGCTGCTTCT
AAGCTAAGAGCTGTTCAAGGCAGAGCTGAGAACTCCCGTGGACTTTGGCAGCCTTTTACT
GCTCTTCTTGGAGATAATCCCAGCATTGATGTGAAGAAGAGTGTAGTGGTTACTCTCTCT
TCTGACAAGGGTCTCTGTGGTGGAATCAACTCCACCGTTGTTAAAGTGAGCAGGGCTTTG
TACAAGTTGAATGCTGGTCCTGAAAAGGACGTGAAGTTTGTTATTGTCGGGGAGAAAGCA
AAGGCTATAATGTTCCGTGACTCAAAGAACGACATTTCCCTTACTGTAACAGAGCTGAAT
AAGAATCCACTCAACTATGC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2G414TF 619 0 0
GAGTTCGTTCTATCTCAACTCAAGTTGTGCGTAACCGGATGAAGAGTGTGAAGAACATCC
AAAAGATCACAGAGGCCATGAAGATGGTTGCTGCTTCTAAGCTAAGAGCTGTTCAAGGCA
GAGCTGAGAACTCCCGTGGACTTTGGCAGCCTTTTACTGCTCTTCTTGGAGACAATCCCA
GCATTGATGTGAAGAAGAGTGTAGTGGTTACTCTCTCTTCTGACAAGGGTCTTTGTGGTG
GAATTAACTCCACTGTTGTTAAAGTGAGCAGGGCTTTGTACAAGTTGAATGCTGGTCCTG
AAAAGGACGTGAAGTTTGTTATTGTCGGGGAGAAAGCAAAGGCTATAATGTTCCGTGACT
CAAAGAACGACATCTCCCTTACTGTTACAGAGCTGAATAAGAACCCACTCAACTATGCTC
AGGTCTCAGTTTTAGCTGATGACATCCTGAAGAACGTTGAGTTCGATGCTTTGCGCATTG
TTTACAACAAGTTCCATTCTGTCGTCGCATTCCTACCGACTGTGGCCACTGTTTTGTCAC
TTGAGATTATTGAGAAG*AGTCTGAAGTGGGAGGAAAGCTCGGTGAGCTCGACTCATACG
AGATTGAAAGTGGTGAAAC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2BD29JQ 807 0 0
CACCC
GTTGTTAAAGTGAGCAGGGCTTTGTACAAGTTGAATGCTGGTCCTGAAAAGGACGTGAAG
TTTGTTATTGTCGGGGAGAAAGCAAAGGCTATAATGTTCCGTGACTCAAAGAACGACATT
TCCCTTACTGTAACAGAGCTGAATAAGAATCCACTCAACTATGCTCAGGTCTCAGTTTTA
GCTGATGACATCCTGAAGAACGTTGAGTTCGATGCTTTGCGCATTGTTTACAACAAGTTC
CATTCTGTCGTCGCATTTCTACCGACTGTGGCCACTGTTTTGTCACCTGAGATTATTGAG
AAGGAGTCTGAAGTGGGAGGAAAGCTCGGTGAGCTCGACTCATACGAGATTGAAGGTGGT
GAAACAAAGGGAGAAATCCTGCAGAATCTGGCCGAGTTCCAATTCTCTTGTGTAATGTTC
AATGCGGTGCTGGAGAATGCGTGTAGTGAGATGGGAGCTAGGATGTCTGCCATGGACAGC
TCAAGCAGAAACGCAGGAGAAATGCTTGACCGTCTCACCCTCACTTACAACAGGACTCGT
CAAGCTTCTATCACAACAGAGCTTATCGAGATTATCTCTGGAGCCTCTGCACTTGAAGCC
GCTAAATAAGCACGTTCTTGTTTGCGTTGACTTGGTTTTTGATACTCGTCCCCCTTGAAG
GAGATAGTGTGTTTTGAATTCTCTAAGGACTACTGAATCAGTTTACCTTTGCTGGCTTCT
CGTTGAGGCTACCAGTCTTTGGCTCAAAGGATTTTTCATAATAATATCCCTGTAATTTCC
AGCAGGATTACTAATAATTGCA

QA 6 807 6 807
DS 

RD RR2C354JQ 745 0 0
TGAAAAGGACGTGAAGTTTGTTATTGTCGGGGAGAAAGCAAAGGCTATAATGTTCCGTGA
CTCAAAGAACGACATTTCCCTTACTGTAACAGAGCTGAATAAGAATCCACTCAACTATGC
TCAGGTCTCAGTTTTAGCTGATGACATCCTGAAGAACGTTGAGTTCGATGCTTTGCGCAT
TGTTTACAACAAGTTCCATTCTGTCGTCGCATTTCTACCGACTGTGGCCACTGTTTTGTC
ACCTGAGATTATTGAGAAGGAGTCTGAAGTGGGAGGAAAGCTCGGTGAGCTCGACTCATA
CGAGATTGAAGGTGGTGAAACAAAGGGAGAAATCCTGCAGAATCTGGCCGAGTTCCAATT
CTCTTGTGTAATGTTCAATGCGGTGCTGGAGAATGCGTGTAGTGAGATGGGAGCTAGGAT
GTCTGCCATGGACAGCTCAAGCAGAAACGCAGGAGAAATGCTTGACCGTCTCACCCTCAC
TTACAACAGGACTCGTCAAGCTTCTATCACAACAGAGCTTATCGAGATTATCTCTGGAGC
CTCTGCACTTGAAGCCGCTAAATAAGCACGTTCTTGTTTGCGTTGACTTGGTTTTTGATA
CTCGTCCACCTTGAAGGAGATAGTGTGTTTTGAATTCTCTAAGGACTACTGAATCAGTTT
ACCTTTGCTGGCTTCTCGTTGAGGCTACCAGTCTTTGGCTCAAAGGATTTTTCATAATAA
TATCCCTGTAATTTCCAGCAGGATT

QA 1 745 1 745
DS 



CO CL692Contig2 694 3 12 U
GGAAATCAAAACAAAAATGCAATTATTAGTAATCCTGCTGGAAATTACAGGGATATTATT
ATGAAAAATCCTTTGAGCAAAGACTGGTAGCCTCAACAAGAAGCCAGCGAAGGAAAACTG
ATTCAGTAGTCCTTAGAGAATTCAAAACACACTATGTCTCCTTCAAGGTGGATAGATATC
AAAGCCAAGTTAACGCAAACAAGAATGTGCTTATTTAGCGGCTTCAAGTGCAGAGGCTCC
AGAGATAATCTCGATAAGCTCTGTTGTGATAGAAGCTTGACGAGTCCTGTTGTAAGTTAG
GGTGAGACGGTCAAGCATTTCTCCTGCGTTTCTGCTTGAGCTGTCCATGGCAGACATCCT
AGCTCCCATCTCACTACACGCATTCTCCAGCACCGCATTGAACATTACACAAGAGAACTG
GAACTCGGCCAGATTCTGCAGGATTTCTCCCTTTGTTTCACCACCTTCAATCTCGTATGA
GTCGAGCTCACCGAGCTTTCCTCCCACTTCAGACTCCTTCTCAATAATCTCAGGTGACAA
AACAGTGGCCACAGTCGGTAGAAATGCGACGACAGAATGGAACTTGTTGTAAACAATGCG
CAAAGCATCGAACTCAACGTTCTTCAGGATGTCATCAGCTAAAACTGAGACCTGAGCATA
GTTGAGTGGGTTCTTATTCAGCTCTGTAACAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB96JQ U 1
AF RR2G414JQ U 23
AF RR2CX37TF C 39
BS 1 313 RR2CB96JQ
BS 314 314 RR2G414JQ
BS 315 351 RR2CB96JQ
BS 352 352 RR2G414JQ
BS 353 435 RR2CB96JQ
BS 436 436 RR2G414JQ
BS 437 566 RR2CB96JQ
BS 567 567 RR2G414JQ
BS 568 587 RR2CB96JQ
BS 588 588 RR2G414JQ
BS 589 687 RR2CB96JQ
BS 688 694 RR2CX37TF

RD RR2CB96JQ 691 0 0
GGAAATCAAAACAAAAATGCAATTATTAGTAATCCTGCTGGAAATTACAGGGATATTATT
ATGAAAAATCCTTTGAGCAAAGACTGGTAGCCTCAACAAGAAGCCAGCGAAGGAAAACTG
ATTCAGTAGTCCTTAGAGAATTCAAAACACACTATGTCTCCTTCAAGGTGGATAGATATC
AAAGCCAAGTTAACGCAAACAAGAATGTGCTTATTTAGCGGCTTCAAGTGCAGAGGCTCC
AGAGATAATCTCGATAAGCTCTGTTGTGATAGAAGCTTGACGAGTCCTGTTGTAAGTTAG
GGTGAGACGGTCAGGCATTTCTCCTGCGTTTCTGCTTGAGCTGTCCATGGCGGACATCCT
AGCTCCCATCTCACTACACGCATTCTCCAGCACCGCATTGAACATTACACAAGAGAACTG
GAACTCGGCCAGATTTTGCAGGATTTCTCCCTTTGTTTCACCACCTTCAATCTCGTATGA
GTCGAGCTCACCGAGCTTTCCTCCCACTTCAGACTCCTTCTCAATAATCTCAGGTGACAA
AACAGTGGCCACAGTCGGTAGAAATGAGACGACAGAATGGAACTTGTAGTAAACAATGCG
CAAAGCATCGAACTCAACGTTCTTCAGGATGTCATCAGCTAAAACTGAGACCTGAGCATA
GTTGAGTGGGTTCTTATTCAGCTCTGT
AACA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2G414JQ 653 0 0
TTATTAGTAATCCTGCTGGAAATTACAGGGATATTATTATGAAAAATCCTTTGAGCAAAG
ACTGGTAGCCTCAACAAGAAGCCAGCGAAGGAAAACTGATTCAGTAGTCCTTAGAGAATT
CAAAACACACTATGTCTCCTTCAAGGTGGATAGATATCAAAGCCAAGTTAACGCAAACAA
GAATGTGCTTATTTAGCGGCTTCAAGTGCAGAGGCTCCAGAGATAATCTCGATAAGCTCT
GTTGTGATAGAAGCTTGACGGGTCCTGTTGTAAGTTAGGGTGAGACGGTCAAGCATTTCT
CCTGCGTTTCTGCTTGAGCTGTCCATGGCAGACATCCTAGCTCCCATCTCACTACACGCA
TTCTCCAGCACCGCATTGAACATTACACAAGAGAACTGGAACTCGGCCAGATTCTGCAGG
ATTTCTCCCTTTGTTTCACCACCTTCAATCTCGTATGAGTCGAGCTCACCGAGCTTTCCT
CCCACTTCAGACTCCTTCTCAATAATCTCAAGTGACAAAACAGTGGCCACAGTCGGTAGG
AATGCGACGACAGAATGGAACTTGTTGTAAACAATGCGCAAAGCATCGAACTCAACGTTC
TTCAGGATGTCATCAGCTAAAACTGAGACCTGAGCATAGTTGAGTGGGTTCTT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2CX37TF 656 0 0
TGGAAATTACAGGGATATTATTATGAAAAATCCTTTGAGCAAAGACTGGTAGCCTCAACA
AGAAGCCAGCGAAGGAAAACTGATTCAGTAGTCCTTAGAGAATTCAAAACACACTATGTC
TCCTTCAAGGTGGATAGATATCAAAGCCAAGTTAACGCAAACAAGAATGTGCTTATTTAG
CGGCTTCAAGTGCAGAGGCTCCAGAGATAATCTCGATAAGCTCTGTTGTGATAGAAGCTT
GACGAGTCCTGTTGTAAGTTAGGGTGAGACGGTCAAGCATTTCTCCTGCGTTTCTGCTTG
AGCTGTCCATGGCAGACATCCTAGCTCCCATCTCACTACACGCATTCTCCAGCACCGCAT
TGAACATTACACAAGAGAACTGGAACTCGGCCAGATTCTGCAGGATTTCTCCCTTTGTTT
CACCACCTTCAATCTCGTATGAGTCGAGCTCACCGAGCTTTCCTCCCACTTCAGACTCCT
TCTCAATAATCTCAGGTGACAAAACAGTGGCCACAGTCGGTAGAAATGCGACGACAGAAT
GGAACTTGTTGTAAACAATGCGCAAAGCATCGAACTCAACGTTCTTCAGGATGTCATCAG
CTAAAACTGAGACCTGAGCATAGTTGAGTGGGTTCTTATTCAGCTCTGTAACAGTC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 2 9

CO CL693Contig1 855 4 5 U
GGGGAAAGTAGGATAAGCATTGAGTTATTACCGAGAAATGGTGCCAGAGGCAAGAACTGA
GATCTTACTAAACCAGACCAAGACCAAGCCCAATGATGGAAGACAAGACTTAGACACAAC
AGTACACAAGAAGAGAGTCTGAAAGCGATTGAATTATACATGAAGAAAAAAAACCATTAT
CTCTGTCCATGTTATTACGCAGCCATGGTGACAGCTTCTGCTGCTGTGGCAGGGACATAC
CAACCGTGGTGGATCTCAACAGCCTTTTTCCTCCTAGCCAACCGAGACTTCCTACGTGCA
CCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAACCTTCACTGCCTTGTCTATAGCAGAGTAAGCCTCT
CCTATCAGTTTCTCCACGGTTACAATCTCGTCAGGTACTGCATCTGTCTTTTTCTTGAGC
CCATCAAGTGCTTCCAAAACCTTCTTCATCCGTGTGCGGGCTTCGGACTTTTTAGACTTG
TTGTAAACGCGCCTCTTCTCGGCTTGGCGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTTTCTTC
GTCGGAGCAACCTCGCACACAATCGATTGCCTTGCTAGCTTCTTCTTCTCTACCCACATA
TTCCCGGAGGAGAAGGCGACACATTGAGAAACGCTCTGAGCGAAGCTA*GGGAGGAGGAG
GAGCAGACACCACGACGAGTGGAGAAGGAAGAAGTTGGAGATAAAGCTCCGTTAAGAGAA
AGGGATTTGAATCTGGGATTGAGTGTCGCAGCACAGGATGAAAGACACTGGACTAATGTC
GCCATGGATCCTCTTCTACTACCGAACACAACACCAGTTCTCTGCTCTCGTAATTGGCTC
TCGGACTTGTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F867JQ U 1
AF RR2EJ91JQ U 95
AF RR2F867TF C 287
AF RR2EJ91TF C 158
BS 1 286 RR2F867JQ
BS 287 287 RR2EJ91JQ
BS 288 345 RR2F867JQ
BS 346 683 RR2EJ91JQ
BS 684 855 RR2EJ91TF

RD RR2F867JQ 345 0 0
GGGGAAAGTAGGATAAGCATTGAGTTATTACCGAGAAATGGTGCCAGAGGCAAGAACTGA
GATCTTACTAAACCAGACCAAGACCAAGCCCAATGATGGAAGACAAGACTTAGACACAAC
AGTACACAAGAAGAGAGTCTGAAAGCGATTGAATTATACATGAAGAAAAAAAACCATTAT
CTCTGTCCATGTTATTACGCAGCCATGGTGACAGCTTCTGCTGCTGTGGCAGGGACATAC
CAACCGTGGTGGATCTCAACAGCCTTTTTCCTCCTAGCCAACCGAGGCTTCCTACGTGCA
CCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAACCTTCACTGCCTTGTCTATA

QA 1 345 1 345
DS 

RD RR2EJ91JQ 598 0 0
GG
TGGAAGACAAGACTTAGACACAACAGTACACAAGAAGAGAGTCTGAAAGCGATTGAATTA
TACATGAAGAAAAAAA*CCATTATCTCTGTCCATGTTATTACGCAGCCATGGTGACAGCT
TCTGCTGCTGTGGCAGGGACATACCAACCGTGGTGGATCTCAACAGCCTTTTTCCTCCTA
GCCAACCGAGACTTCCTACGTGCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAACCTTCACTGCC
TTGTCTATAGCAGAGTAAGCCTCTCCTATCAGTTTCTCCACGGTTACAATCTCGTCAGGT
ACTGCATCTGTCTTTTTCTTGAGCCCATCAAGTGCTTCCAAAACCTTCTTCATCCGTGTG
CGGGCTTCGGACTTTTTAGACTTGTTGTAAACGCGCCTCTTCTCGGCTTGGCGAGCTCTC
TTGGCAGCTGAATCAGCTTTCTTCGTCGGAGCAACCTCGCACACAATCGATTGCCTTGCT
AGCTTCTTCTTCTCTACCCACATATTCCCGGAGGAGAAGGCGACACATTGAGAAACGCTC
TGAGCGAAGCTA*GGGAGGAGGAGGAGCAGACACCACGACGAGTGGA
GAAGGAAGA

QA 3 589 3 589
DS 

RD RR2F867TF 539 0 0
G
CTTCCTACGTGCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAACCTTCACTGCCT*GTCTATAGC
AGAGTAAGCCTCTCCTATCAGTTTCTCCACGGTTACAATCTCGTCAGGTACTGCATCTGT
CTTCTTCTTGAGCCCATCAAGTGCTTCCAAAACCTTCTTCATCCGTGTGCGGGCTTCGGA
CTTTTTAGACTTGTTGTAAACGCGCCTCTTCTCGGCTTGGCGAGCTCTCTTGGCAGCTGA
ATCAGCTTTCTTCGTCGGAGCAGCCTCGCACACAATCGATTGCCTTGCTAGCTTCTTCTT
CTCTACCCACATATTCCCGGAGGAGAAGGCGACACATTGAGAAACGCTCTGAGCGAAGCT
AAGGGAGGAGGAGGAGCAGACACCACGACGAGTGGAGAAGGAAGAAGTTGGAGATAAAGC
TCCGTTAAGAGAAAGGGATTTGAATTTGGGATTGAGTGTCGCAGCACAGGATGAAAGACA
CTGGACTAATGTCGCCATGGATCCTCTTCTACTACCGAACA
CAACACCAGTTCTCTCC

QA 2 522 2 522
DS 

RD RR2EJ91TF 698 0 0
ATACATGAAG
AAAAAACCATTATCTCTGTCCATGTTATTACGCAGCCATGGTGACAGCTTCTGCTGCTGT
GGCAGGGACATACCAACCGTGGTGGATCTCAACAGCCTTTTTCCTCCTAGCCAACCGAGA
CTTCCTACGTGCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAACCTTCACTGCCTTGTCTATAGC
AGAGTAAGCCTCTCCTATCAGTTTCTCCACGGTTACAATCTCGTCAGGTACTGCATCTGT
CTTTTTCTTGAGCCCATCAAGTGCTTCCAAAACCTTCTTCATCCGTGTGCGGGCTTCGGA
CTTTTTAGACTTGTTGTAAACGCGCCTCTTCTCGGCTTGGCGAGCTCTCTTGGCAGCTGA
ATCAGCTTTCTTCGTCGGAGCAACCTCGCACACAATCGATTGCCTTGCTAGCTTCTTCTT
CTCTACCCACATATTCCCGGAGGAGAAGGCGACACATTGAGAAACGCTCTGAGCGAAGCT
A*GGGAGGAGGAGGAGCAGACACCACGACGAGTGGAGAAGGAAGAAGTTGGAGATAAAGC
TCCGTTAAGAGAAAGGGATTTGAATCTGGGATTGAGTGTCGCAGCACAGGATGAAAGACA
CTGGACTAATGTCGCCATGGATCCTCTTCTACTACCGAACACAACACCAGTTCTCTGCTC
TCGTAATTGGCTCTCGGACTTGTGTTCC

QA 11 698 11 698
DS 



CO CL693Contig2 720 5 8 U
GATGGAAGACAATAAGCTTAGACACAACAGTACACAAAGTCTGAAAGCGATTGAATTATA
CATTACAAAAAAAAAAA*CGTTATCTCTGTCCATGTTGTTTACGCAGCCATGGTGACAGC
TTCTGCTGCTGGAGCTGTTGCTGTGGCAGGGACATACCAACCGTGGTGGATCTCAACAGC
CTTTTTCTCTCCTAGCCAACCGAGACTTCCTACGTGCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTC
TAACCTTGACAGCTTTGTCTATAGCAGAGTAAGCCTCTCCTATGAGTTTCTCCACGGTTA
CAATCTCGTCAGGTACCGCATCTGCCTTCTTCTTGAGCCCATCAAGTGCTTCCAAAACCT
TCTTCATCCGTGTGCGGGCTTCGGACTTTTTAGACTTGTTGTAAACGCGCCTCTTCTCGG
ATTGGCGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTTTCTTGGTGGGAGCAGCCTCGCACACAA
TCGATAGCCTCGCTGGCTTATTCTTCTGTACCCACATATTCCCGGAGGAGAAGGCGACGC
ATTGAGAAACGCTCTGAGCGAAGCTAAGGGAAGAGGAGCAGACACCACGACGAGTGGACA
AAGAAGCTCCGTTAAGAGAAAGGGATTTGAATTTGGGATTGAGTGTCGCACAGGATGAAA
GACACTGGACTAATGTCGCCATGGATCCTCTTCTACTACCGAACAACATCAGTTCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN70JQ U 151
AF RR2AF79JQ U 284
AF RR2FM76JQ U 1
AF RR2AF79TF C 6
AF RR2FM76TF C 3
BS 1 186 RR2FM76JQ
BS 187 187 RR2EN70JQ
BS 188 266 RR2FM76JQ
BS 267 267 RR2FM76TF
BS 268 420 RR2FM76JQ
BS 421 421 RR2AF79JQ
BS 422 566 RR2FM76JQ
BS 567 720 RR2FM76TF

RD RR2EN70JQ 122 0 0
GACATACCAACCGTGGTGGATCTCAACAGCCTTTTTC*CTCCTAGCCAACCGAGACTTCC
TACGTGCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAACCTTGACAGCTTTGTCTATAG
GGGAGTAA

QA 1 114 1 114
DS 

RD RR2AF79JQ 225 0 0
GAGTTTCTCCCCGGTTACAATCTCGTCAGGGACCGCATCTGCCTTCTTCTTGAGCCCATC
AAGTGCTTCCAAAACCTTCTTCATCCGTGTGCGGGCTTCGGACTTTTTAGACTTGTTGTA
AACGCGCCTCTTCTCGGATTGGCGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTTTCTTGGTGGG
AGCAGCCTCCCACACAATCGATAGCCTCGCTGGCTTATTCTTCTG

QA 1 225 1 225
DS 

RD RR2FM76JQ 577 0 0
GATGGAAGACAATAAGCTTAGACACAACAGTACACAAAGTCTGAAAGCGATTGAATTATA
CATTACAAAAAAAAAAA*CGTTATCTCTGTCCATGTTGTTTACGCAGCCATGGTGACAGC
TTCTGCTGCTGGAGCTGTTGCTGTGGCAGGGACATACCAACCGTGGTGGATCTCAACAGC
CTTTTTTTCTCCTAGCCAACCGAGACTTCCTACGTGCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTC
TAACCTTGACAGCTTTGTCTATAGCAAAGTAAGCCTCTCCTATGAGTTTCTCCACGGTTA
CAATCTCGTCAGGTACCGCATCTGCCTTCTTCTTGAGCCCATCAAGTGCTTCCAAAACCT
TCTTCATCCGTGTGCGGGCTTCGGACTTTTTAGACTTGTTGTAAACGCGCCTCTTCTCGG
CTTGGCGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTTTCTTGGTGGGAGCAGCCTCGCACACAA
TCGATAGCCTCGCTGGCTTATTCTTCTGTACCCACATATTCCCGGAGGAGAAGGCGACGC
ATTGAGAAACGCTCTGAGCGAAGCTA
AGGGAAGAGGA

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2AF79TF 545 0 0
AAGACAATAAGTTTAGACACAACAGTACACAAAGTATGAAAGCGATTGAATTATACATTA
CAAAAAAAAAAAACATTATCTCTGTCCATGTTGTTTACGCAGCCATGGTGACAGCTTCTG
CTGCTGGAGCTGTTGCTGTGGCAGGGACATACCAACCGTGGTGGATCTCAACAGCCTTTT
TC*CTCCTAGCCAACCGAGACTTCCTACGTGCACCAGTTTTCTTGTGTAGCGCTCTAACC
TTGACAGCTTTGTCTATAGCAGAGTAAGCCTCTCCTATGAGTTTCTCCACGGTTACAATC
TCGTCAGGTACCGCATCTGCCTTCTTCTTGAGCCCATCAAGTGCTTCCAAAACCTTCTTC
ATCCGTGTGCGGGCTTCGGACTTTTTAGACTTGTTGTAAACGCGCCTCTTCTCGGATTGG
CGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTTTCTTGGTGGGAGCAGCCTCGCACACAATCGAT
AGCCTCGCTGGCTTATTCTTCTGTACCCACATATTCCCGGAGGAGAAGGCGACGCATTGA
GAAAC

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2FM76TF 718 0 0
ATG
AAGACAATAAGCTTAGACACAACAGTACACAAAGTCTGAAAGCGATTGAATTATACATTA
CAAAAAAAAAAA*CGTTATCTCTGTCCATGTTGTTTACGCAGCCATGGTGACAGCTTCTG
CTGCTGGAGCTGTTGCTGTGGCAGGGACATACCAACCGTGGTGGATCTCAACAGCCTTTT
TTTCTCCTAGCCAACCGAGACTTCCTACGTGCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAACC
TTGACAGCTTTGTCTATAGCAGAGTAAGCCTCTCCTATGAGTTTCTCCACGGTTACAATC
TCGTCAGGTACCGCATCTGCCTTCTTCTTGAGCCCATCAAGTGCTTCCAAAACCTTCTTC
ATCCGTGTGCGGGCTTCGGACTTTTTAGACTTGTTGTAAACGCGCCTCTTCTCGGCTTGG
CGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTTTCTTGGTGGGAGCAGCCTCGCACACAATCGAT
AGCCTCGCTGGCTTATTCTTCTGTACCCACATATTCCCGGAGGAGAAGGCGACGCATTGA
GAAACGCTCTGAGCGAAGCTAAGGGAAGAGGAGCAGACACCACGACGAGTGGACAAAGAA
GCTCCGTTAAGAGAAAGGGATTTGAATTTGGGATTGAGTGTCGCACAGGATGAAAGACAC
TGGACTAATGTCGCCATGGATCCTCTTCTACTACCGAACAACATCAGTTCTCTCC

QA 4 718 4 718
DS 



AS 1 6

CO CL694Contig1 856 6 7 U
GGAAAATGGTTTCAGTGTAACAATCCATAGCAAATCCATCGAGCTTCGAAACGAATCTGC
TGTGGGATCTCAAAGATCAACTGGAGAGAACTCAAGAATGTCAGGCTTTCACGGGACTCA
TGATTCATGTCCTTTGGTGAAGAACATTCTTCTTCTAGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGC
TGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGCCTACTCATGCTGCCAAGTTGACTTTCGAGAAGTA
TGTCTTCTCCAAGACCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGAAGCTGAGATCACATTGTTGGA
CAGTAATATCATTGTCTACAAGTTCGCCCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGA
AAATGAAAACGAGCTTGTCTTGTCTTCCGTTCTTCAAGGCTTTTTCGATGCTGTTGCGCT
TCTTCTGAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAGGCTCTTGAGAACTTGGATCTCATCTTTCT
ATGCCTGGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAACAGACCCTAACGTCATTGC
GGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACTGAAGCTAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACATTAAC
TCAAGCACTGGCAACAGCTCGGGAACATCTGGCAAGAAGTCTGCTTACATGAGTTCCCAC
CTCATATGCATTGCATGCCCACACATAATAGAATGTTCTATGAAGAGGACCTCTCATGGG
ATTTGTCTCCCGGTTTTATAATCTTGTAATAATGATGTGTGCAAATGCTGGAATATTTTT
GAAGACCGGATATTGCAGTATGAAGACTTGTTTCTTTACTTCAAAATATTTTCATTACTT
ATTTCTGCAATTTCTC


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD03TF U 1
AF RR2EA94TF U 1
AF RR2BJ33TF U 2
AF RR2EA94JQ C 3
AF RR2BJ33JQ C 49
AF RR2FH14TF U 696
BS 1 334 RR2EA94TF
BS 335 335 RR2GD03TF
BS 336 468 RR2EA94TF
BS 469 469 RR2GD03TF
BS 470 745 RR2EA94TF
BS 746 814 RR2BJ33TF
BS 815 856 RR2FH14TF

RD RR2GD03TF 686 0 0
GGA
AAATGGTTTCAGTGTAACAATCCATAGCAAATCCATCGAGCTTCGAAACGAATCTGCTGT
GGGATCTCAAAGATCAACTGGAGAGAACTCAAGAATGTCAGGCTTTCACGGGACTCATGA
TTCATGTCCTTTGGTGAAGAACATTCTTCTTCTAGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGT
CAAGTATTACTCCGATGACTGGCCTACTCATGCTGCCAAGTTGACTTTCGAGAAGTATGT
CTTCTCCAAGACCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGAAGCTGAGATCACATTGTTGGACAG
TAATATCATTGTCTACAAGTTCGCCCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGAAAA
TGAAAACGAGCTTGTCTTGTCTTCCGTTCTTCAAGGCTTTTTCGATGCTGTTGCGCTTCT
TCTGAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAGGCTCTTGAGAACTTGGATCTCATCTTTCTATG
CCTGGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAACAGACCCTAACGTCATTGCGGG
GAAAGTAGCAATGCAGAGCACTGAAGCTAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACATTAACTCA
AGCACTGGCAACAGCTCGGGAACATCTGGCAAGAAGTCTGCTTACATGAGTTCCCACCTC
ATATGCATTGCATGCCCACACAT

QA 4 686 4 686
DS 

RD RR2EA94TF 745 0 0
GGAAAATGGTTTCAGTGTAACAATCCATAGCAAATCCATCGAGCTTCGAAACGAATCTGC
TGTGGGATCTCAAAGATCAACTGGAGAGAACTCAAGAATGTCAGGCTTTCACGGGACTCA
TGATTCATGTCCTTTGGTGAAGAACATTCTTCTTCTAGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGC
TGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGCCTACTCATGCTGCCAAGTTGACTTTCGAGAAGTA
TGTCTTCTCCAAGACCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGAAGCTGAGATCACATTGTTGGA
CAGTAATATCATTGTCTACAAGTTCGCCCAGGACTTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGA
AAATGAAAACGAGCTTGTCTTGTCTTCCGTTCTTCAAGGCTTTTTCGATGCTGTTGCGCT
TCTTCTGAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAGGCTCTTGAGAACTTGGACCTCATCTTTCT
ATGCCTGGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAACAGACCCTAACGTCATTGC
GGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACTGAAGCTAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACATTAAC
TCAAGCACTGGCAACAGCTCGGGAACATCTGGCAAGAAGTCTGCTTACATGAGTTCCCAC
CTCATATGCATTGCATGCCCACACATAATAGAATGTTCTATGAAGAGGACCTCTCATGGG
ATTTGTCTCCCGGTTTTATAATCTT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2BJ33TF 813 0 0
GG
AAATGGTTTCAGTGTAACAATCCATAGCAAATCCATCGAGCTTCGAAACGAATCTGCTGT
GGGATCTCAAAGATCAACTGGAGAGAACTCAAGAATGTCAGGCTTTCACGGGACTCATGA
TTCATGTCCTTTGGTGAAGAACATTCTCCTTCTAGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGT
CAAGTATTACTCCGATGACTGGCCTACTCATGCTGCCAAGTTGACTTTCGAGAAGTATGT
CTTCTCCAAGACCTCTAGGACCAATGCTCGCACTGAAGCTGAGATCACATTGTTGGACAG
TAATATCATTGTCTACAAGTTCGCCCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGAAAA
TGAAAACGAGCTTGTCTTGTCTTCCGTTCTTCAAGGCTTTTTCGATGCTGTTGCGCTTCT
TCTGAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAGGCTCTTGAGAACTTGGATCTCATCTTTCTATG
CCTGGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAACAGACCCTAACGTCATTGCGGG
GAAAGTAGCAATGCAGAGCACTGAAGCTAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACATTAACTCA
AGCACTGGCAACAGCTCGGGAACATCTGGCAAGAAGTCTGCTTACATGAGTTCCCACCTC
ATATGCATTGCATGCCCACACATAATAGAATGTTCTATGAAGAGGACCTCTCATGGGATT
TGTCTCCCGGTTTTATAATCTTGTAATAATGATGTGTGCAAATGCTGGAATATTTTTGAA
GACCGGATATTGCAGTATGAAGACTTGTTTC

QA 3 813 3 813
DS 

RD RR2EA94JQ 820 0 0
G
AAATGGTTTCAGTGTAACAATCCATAGCAAATCCATCGAGCTTCGAAACGAATCTGCTGT
GGGATCTCAAAGATCAACTGGAGAGAACTCAAGAATGTCAGGCTTTCACGGGACTCATGA
TTCATGTCCTTTGGTGAAGAACATTCTTCTTCTAGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGT
CAAGTATTACTCCGATGACTGGCCTACTCATGCTGCCAAGTTGACTTTCGAGAAGTATGT
CTTCTCCAAGACCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGAAGCTGAGATCACATTGTTGGACAG
TAATATCATTGTCTACAAGTTCGCCCAGGACTTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGAAAA
TGAAAACGAGCTTGTCTTGTCTTCCGTTCTTCAAGGCTTTTTCGATGCTGTTGCGCTTCT
TCTGAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAGGCTCTTGAGAACTTGGACCTCATCTTTCTATG
CCTGGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAACAGACCCTAACGTCATTGCGGG
GAAAGTAGCAATGCAGAGCACTGAAGCTAGTGGTTCACTCTCTGAACAGACATTAACTCA
AGCACTGGCAACAGCTCGGGAACATCTGGCAAGAAGTCTGCTTACATGAGTTCCCACCTC
ATATGCATTGCATGCCCACACATAATAGAATGTTCTATGAAGAGGACCTCTCATGGGATT
TGTCTCCCGGTTTTATAATCTTGTAATAATGATGTGTGCAAATGCTGGAATATTTTTGAA
GACCGGATATTGCAGTATGAAGACTTGTTTCTTT
ACTCC

QA 2 815 2 815
DS 

RD RR2BJ33JQ 769 0 0
AAACGAATCTGCTGTGGGATCTCAAAGATCAACTGGAGAGAACTCAAGAATGTCAGGCTT
TCACGGGACTCATGATTCATGTCCTTTGGTGAAGAACATTCTCCTTCTAGACTCTGAAGG
GAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGCCTACTCATGCTGCCAAGTTGAC
TTTCGAGAAGTATGTCTTCTCCAAGACCTCTAGGACCAATGCTCGCACTGAAGCTGAGAT
CACATTGTTGGACAGTAATATCATTGTCTACAAGTTCGCCCAGGACCTTCACTTCTTTGT
TACTGGAGGCGAAAATGAAAACGAGCTTGTCTTGTCTTCCGTTCTTCAAGGCTTTTTCGA
TGCTGTTGCGCTTCTTTTGAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAGGCTCTTGAGAACTTGGA
TCTCATCTTTCTATGCCTGGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAACAGACCC
TAACGTCATTGCGGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACTGAAGCTAGTGGTTCACTCTCTGA
ACAGACATTAACTCAAGCACTGGCAACAGCTCGGGAACATCTGGCAAGAAGTCTGCTTAC
ATGAGTTCCCACCTCATATGCATTGCATGCCCACACATAATAGAATGTTCTATGAAGAGG
ACCTCTCATGGGATTTGTCTCCCGGTTTTATAATCTTGTAATAATGATGTGTGCAAATGC
TGGAATATTTTTGAAGACCGGATATTGCAGTATGAAGACTTGTTTC
TTT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2FH14TF 161 0 0
G
TCTATGAAGAGGACCTCTCATGGGATTTGTCTCCCGGTTTTATAATCTTGTAATAATGAT
GTGTGCAAATGCTGGAATATTTTTGAAGACCGGATATTGCAGTATGAAGACTTGTTTCTT
TACTTCAAAATATTTTCATTACTTATTTCTGCAATTTCTC

QA 2 161 2 161
DS 



AS 1 8

CO CL695Contig1 671 8 11 U
GGATCCCAAAACCTAAATCTCCACTTCCGCCTCTTCGTTCCCGAGAAAG*TCAAAGAAAG
AGAGATTCACGATGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCAGCCGCCG
CGGAGAAGCCAGCGGAGGAAGAGAAGGTAGCGGAGAAAGCACCAGCGGAGAAGAAGCCCA
AGGCCGGAAAGAAGCTACCGAAGGACCCCTCCGCCGTCGCCGGAGACAAGAAGAAGAAGC
GCTCCAAGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTCAAGCAGGTTC
ACCCCGACATCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACA
TCTTCGAGAAGCTTGCTCAGGAAGCGTCCAAACTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACGA
TTACTTCTCGCGAGATCCAGACAGCGGTTAGACTTGTTCTTCCTGGTGAGCTTGCTAAGC
ACG*CCGTGTCTGAAGGAACCAAGGCTGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATGAAAAAT
CTCTTGTTAGGATTCTAGATCTGAGCGCTTTT*GGGTTTGTCTTTTGGTACCGATTATGC
TTATCTTAGCTCTATGATGCGGTGACTTTGTAAGAACATATGAATGATTAATCGTCTCTT
TTGTTTTTATC


BQ
40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 5 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 30 10 10 10 10 10 

AF RR2BR53TF U 1
AF RR2DW68JQ C 20
AF RR2DW68TF U 1
AF RR2AH18JQ C 1
AF RR2AH18TF U 1
AF RR2BR53JQ C 1
AF RR2CS72TF U 1
AF RR2BD53TF U 439
BS 1 68 RR2DW68TF
BS 69 69 RR2AH18TF
BS 70 206 RR2DW68TF
BS 207 207 RR2AH18TF
BS 208 219 RR2DW68TF
BS 220 220 RR2AH18TF
BS 221 319 RR2DW68TF
BS 320 320 RR2AH18TF
BS 321 655 RR2DW68TF
BS 656 666 RR2AH18TF
BS 667 671 RR2BD53TF

RD RR2BR53TF 335 0 0
GGATCTCAAAACCTAATTCTCCACTTCCACCTCTTCGTTCCCGAGAAAAATCAAAGAAAG
AGAGATTCACGATGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCTGCCGCCG
CGGAGAAGCCAGTGGAGGAAGAGAAGGTAGCGGAGAAAGCACCAGCGGAGAAGAAGCCCA
AGGCCGGAAAGAAGCTACCGAAGGACCCCTCCGCCGTCGCCGGAGACAAGAAGAAGAAGC
GCTCCAAGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTCAAGCAAGTCC
ACCCCGACATCGGGAACTCGAGCAAGGCCATGGGG

QA 1 335 1 335
DS 

RD RR2DW68JQ 636 0 0
TCCACTTCCGCCTCTTCGTTCCCGAGAAAG*TCAAAGAAAGAGAGATTCTCGATGGCACC
AAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCAGCCGCCGCGGAGAAGCCAGCGGAGGA
AGAGAAGGTAGCGGAGAAAGCACCAGCGGAGAAGAAGCCCAAGGCCGGAAAGAAGCTACC
GAAGGACTCCTCCGCCGTCGTCGGAGACAAGAAGAAGAAGCGCTCCAAGAAGAGCGTGGA
GACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTCAAGCAGGTTCACCCCGACATCGGGATCTC
AAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGAAGCTTGCTCA
GGAAGCGTCCAAACTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACGATTACTTCTCGCGAGATCCA
GACAGCGGTTAGACTTGTTCTTCCTGGTGAGCTTGCTAAGCACG*CCGTGTCTGAAGGAA
CCAAGGCTGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATGAAAAATCTCTTGTTAGGATTCTAGA
TCTGAGCGCTTTT*GGGTTTGTCTTTTGGTACCGATTATGCTTATCTTAGCTCTATGATG
CGGTGACTTTGTAAGAACATATGAATGATTAATCGT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2DW68TF 655 0 0
GGATCCCAAAACCTAAATCTCCACTTCCGCCTCTTCGTTCCCGAGAAAG*TCAAAGAAAG
AGAGATTCTCGATGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCAGCCGCCG
CGGAGAAGCCAGCGGAGGAAGAGAAGGTAGCGGAGAAAGCACCAGCGGAGAAGAAGCCCA
AGGCCGGAAAGAAGCTACCGAAGGACTCCTCCGCCGTCGTCGGAGACAAGAAGAAGAAGC
GCTCCAAGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTCAAGCAGGTTC
ACCCCGACATCGGGATCTCAAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACA
TCTTCGAGAAGCTTGCTCAGGAAGCGTCCAAACTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACGA
TTACTTCTCGCGAGATCCAGACAGCGGTTAGACTTGTTCTTCCTGGTGAGCTTGCTAAGC
ACG*CCGTGTCTGAAGGAACCAAGGCTGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATGAAAAAT
CTCTTGTTAGGATTCTAGATCTGAGCGCTTTT*GGGTTTGTCTTTTGGTACCGATTATGC
TTATCTTAGCTCTATGATGCGGTGACTTTGTAAGAACATATGAATGATTAATCGT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2AH18JQ 666 0 0
GGATCCCAAAACCTAAATCTCCACTTCCGCCTCTTCGTTCCCGAGAAAG*TCAAAGAAAG
AGAGATTCACGATGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCAGCCGCCG
CGGAGAAGCCAGCGGAGGAAGAGAAGGTAGCGGAGAAAGCACCAGCGGAGAAGAAGCCCA
AGGCCGGAAAGAAGCTACCGAAGGACCCCTCCGCCGTCGCCGGAGACAAGAAGAAGAAGC
GCTCCAAGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTCAAGCAGGTTC
ACCCCGACATCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACA
TCTTCGAGAAGCTTGCTCAGGAAGCGTCCAAACTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACGA
TTACTTCTCGCGAGATCCAGACAGCGGTTAGACTTGTTCTTCCTGGTGAGCTTGCTAAGC
ACG*CCGTGTCTGAAGGAACCAAGGCTGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATGAAAAAT
CTCTTGTTGGGATTCTAGATCTGAGCGCTTTT*GGGTTTGTCTTTTGGTACCGATTATGC
TTATCTTAGCTCTATGATGCGGTGACTTTGTAAGAACATATGAATGATTAATCGTCTCTT
TTGTTT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2AH18TF 666 0 0
GGATCCCAAAACCTAAATCTCCACTTCCGCCTCTTCGTTCCCGAGAAAG*TCAAAGAAAG
AGAGATTCACGATGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCAGCCGCCG
CGGAGAAGCCAGCGGAGGAAGAGAAGGGAGCGGAGAAAGCACCAGCGGAGAAGAAGCCCA
AGGCCGGAAAGAAGCTACCGAAGGACCCCTCCGCCGTCGCCGGAGACAAGAAGAAGAAGC
GCTCCAAGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTCAAGCAGGTTC
ACCCCGACATCGGGATCTCGAGCAAGGGCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACA
TCTTCGAGAAGCTTGCTCAGGAAGCGTCCAAACTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACGA
TTACTTCTCGCGAGATCCAGACAGCGGTTAGACTTGTTCTTCCTGGTGAGCTTGCTAAGC
ACG*CCGTGTCTGAAGGAACCAAGGCTGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATGAAAAAT
CTCTTGTTGGGATTCTAGATCTGAGCGCTTTT*GGGTTTGTCTTTTGGTACCGATTATGC
TTATCTTAGCTCTATGATGCGGTGACTTTGTAAGAACATATGAATGATTAATCGTCTCTT
TTGTTT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2BR53JQ 668 0 0
GGATCTCAAAACCTAATTCTCCACTTCCACCTCTTCGTTCCCGAGAAAAATCAAAGAAAG
AGAGATTCACGATGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCTGCCGCCG
CGGAGAAGCCAGTGGAGGAAGAGAAGGTAGCGGAGAAAGCACCAGCGGAGAAGAAGCCCA
AGGCTGGAAAGAAGCTACCGAAGGACCCCTCCGCCGTCGCCGGAGACAAGAAGAAGAAGC
GCTCCAAGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTCAAGCAAGTCC
ACCCCGACATCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACA
TCTTCGAGAAGCTTGCTCAGGAAGCGTCCAAACTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACGA
TTACTTCTCGCGAGATCCAGACAGCGGTTAGACTCGTTCTTCCTGGTGAGCTTGCTAAGC
ACG*CCGTGTCTGAAGGAGCCAAGGCTGTGACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATGAAAAAT
CTCTTGTTAGGATTCTAGATCTGAGCGCTTTT*GGGTTTGTCTTTTGGTACCGATTATGC
TTATCTTAGCTTTATGATTCGGTGACTTTGTAAGAATATATGAATGATTAATCGTCTCTT
TTGTTT
TT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2CS72TF 665 0 0
GGATCTCAAAACCTAATTCTCCACTTCCACCTCTTCGTTCCCGAGAAAAATCAAAGAAAG
AGAGATTCACGATGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAACCAGCAGAGAAGAAACCTGCCGCCG
CGGAGAAGCCAGTGGAGGAAGAGAAGGTAGCGGAGAAAGCACCAGCGGAGAAGAAGCCCA
AGGCCGGAAAGAAGCTACCGAAGGACCCCTCCGCCGTCGCCGGAGACAAGAAGAAGAAGC
GCTCCAAGAAGAGCGTGGAGACGTACAGGATCTACATCTTCAAGGTGCTCAAGCAAGTCC
ACCCCGACATCGGGATCTCGAGCAAGGCC*TGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACA
TCTTCGAGAAGCTTGCTCAGGAAGCGTCCAAACTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACGA
TTACTTCTCGCGAGATCCAGACAGCGGTTAGACTCGTTCTTCCTGGTGAGCTTGCTAAGC
ACG*CCGTGTCTGAAGGAACCAAGGCTGTGACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATGAAAAAT
CTCTTGTTAGGATTCTAGATCTGAGCGCTTTT*GGGTTTGTCTTTTGGTACCGATTATGC
TTATCTTAGCTTTATGATTCGGTGACTTTGTAAGAACATATGAATGATTAATCGTCTCTT
TTGTT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2BD53TF 233 0 0
AGACAGCGGTTAGACTCGTTCTTCCTGGTGAGCTTGCTAAGCACGTCCGTGTCTGAAGGA
ACCAAGGCTGTGACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATGAAAAATCTCTTGTTAGGATTCTAG
ATCTGAGCGCTTTTTGGGTTTGTCTTTTGGTACCGATTATGCTTATCTTAGCTTTATGAT
TCGGTGACTTTGTAAGAACATATGAATGATTAATCGTCTCTTTCGTTTTTATC

QA 1 233 1 233
DS 



AS 1 8

CO CL696Contig1 1164 8 9 U
GGAACCACACAACAGAGAAGCAAAAGAAAAACCATTTTTTGGAAAGAAAAAAAACTCCAA
AGAAAGTAGATATGGCGAAGGACGTGGAAGCCGTTTCTGGAGAAGGGTTTCAGACAAGAG
ACTATCAAGATCCACCACCGGCGCCTCTGTTTGATCCGGAGGAGCTGACCAAGTGGTCTT
TTTACAGAGCAGTCATTGCCGAGTTCGTTGCTACTCTCCTCTTCTTGTACATCACCGTTT
TGACAGTCATCGGTTACAAGATTCAGACCGATAGTACTGCCGGCGGCGTTGACTGCGGTG
GAGTTGGTATCCTAGGTATCGCTTGGGCTTTTGGTGGCATGATCTTCATCCTTGTTTACT
GCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATTAACCCGGCAGTGACATTTGGGCTACTCTTGG
CACGTAAAGTGTCGTTGGTTAGAGCCATATTGTACATGGTAGCTCAGTGTTTGGGTGCGA
TATGTGGAGTTGGGTTCGTCAAAGCCTTCCAAAGCTCTTACTACGTCCGTTACGGCGGTG
GAGCCAACTCTCTAGCCGACGGCTACAGCACAGGAACCGGCCTCGCCGCAGAGATCATTG
GTACTTTTGTTCTTGTCTACACCGTCTTCTCCGCCACTGACCCTAAACGCAGTGCCAGAG
ACTCCCACGTTCCAGTGTTGGCGCCACTTCCAATTGGATTTGCGGTGTTCATGGTGCACT
TGGCTACCATTCCCATCACCGGAACTGGTATTAACCCGGCAAGGAGTTTCGGAGCAGCCG
TTATCTTCAACGAGAGCAAGCCCTGGGATGACCACTGGATATTTTGGGTGGGACCATTTA
TTGGAGCTGCGATTGCTGCATTCTACCACCAGTTCGTTCTGAGGGCTTCAGGTTCCAAGT
CTCTTGGATCTTTCAGAAGTGCTGCAAACGTCTAAATAATCACTCATCTCCACCGTAGCA
GATTCTGAAATAATAAAGATGATAAATCTTTTTTCTCTATGTACAAAATTATCCAAATCA
GTTCCAGTCTGTTATTTTCTTAAATGTGTGTTTTCTACTTGCTCTTTTTCGTTGAGTGTA
ATTGTTCTTATATTAGGCCAATGCCAAGTTTATCAAGTGACTGGAATTGAAAATAAAAAA
AGGTTATGGTTGAGTTTGCGTTTT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F655TF U 1
AF RR2DP13TF U 2
AF RR2CF33TF U 35
AF RR2G651TF U 35
AF RR2BI67TF U 40
AF RR2G651JQ C 403
AF RR2DP13JQ C 402
AF RR2F655JQ C 491
BS 1 530 RR2F655TF
BS 531 667 RR2CF33TF
BS 668 668 RR2G651TF
BS 669 700 RR2CF33TF
BS 701 704 RR2G651TF
BS 705 829 RR2BI67TF
BS 830 962 RR2DP13JQ
BS 963 963 RR2F655JQ
BS 964 1164 RR2DP13JQ

RD RR2F655TF 530 0 0
GGAACCACACAACAGAGAAGCAAAAGAAAAACCATTTTTTGGAAAGAAAAAAAACTCCAA
AGAAAGTAGATATGGCGAAGGACGTGGAAGCCGTTTCTGGAGAAGGGTTTCAGACAAGAG
ACTATCAAGATCCACCACCGGCGCCTCTGTTTGATCCGGAGGAGCTGACCAAGTGGTCTT
TTTACAGAGCAGTCATTGCCGAGTTCGTTGCTACTCTCCTCTTCTTGTACATCACCGTTT
TGACAGTCATCGGTTACAAGATTCAGACCGATAGTACTGCCGGCGGCGTTGACTGCGGTG
GAGTTGGTATCCTAGGTATCGCTTGGGCTTTTGGTGGCATGATCTTCATCCTTGTTTACT
GCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATTAACCCGGCAGTGACATTTGGGCTACTCTTGG
CACGTAAAGTGTCGTTGGTTAGAGCCATATTGTACATGGTAGCTCAGTGTTTGGGTGCGA
TATGTGGAGTTGGGTTCGTCAAAGCCTTCCAAAGCTCTTACTACGTCCGT

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2DP13TF 515 0 0
GAACCACACAACAGAGAAGCAAAAGAAAAACCATTTTTTGGAAAGAAAAAAAACTCCAAA
GAAAGTAGATATGGCGAAGGACGTGGAAGCCGTTTCTGGAGAAGGGTTTCAGACAAGAGA
CTATCAAGATCCACCACCGGCGCCTCTGTTTGATCCGGAGGAGCTGACCAAGTGGTCTTT
TTACAGAGCAGTCATTGCCGAGTTCGTTGCTACTCTCCTCTTCTTGTACATCACCGTTTT
GACAGTCATCGGTTACAAGATTCAGACCGATAGTACTGCCGGCGGCGTTGACTGCGGTGG
AGTTGGTATCCTAGGTATCGCTTGTGCTTTTGGTGGCATGATCTTCATCCTTGTTTACTG
CACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATTAACCCGGCAGTGACATTTGGGCTACTCTTGGC
ACGTAAAGTGTCGTTGGTTAGAGCCATATTGTACATGGTAGCTCAGTGTTTGGGTGCGAT
ATGTGGAGTTGGGTTCGTCAAAGCCTTCCAA
GGCT

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2CF33TF 666 0 0
TTTTTTGGAAAGAAAAAAAACTCCAAAGAAAGTAGATATGGCGAAGGACGTGGAAGCCGT
TTCTGGAGAAGGGTTTCAGACAAGAGACTATCAAGATCCACCACCGGCGCCTCTGTTTGA
TCCGGAGGAGCTGACCAAGTGGTCTTTTTACAGAGCAGTCATTGCCGAGTTCGTTGCTAC
TCTCCTCTTCTTGTACATCACCGTTTTGACAGTCATCGGTTACAAGATTCAGACCGATAG
TACTGCCGGCGGCGTTGACTGCGGTGGAGTTGGTATCCTAGGTATCGCTTGGGCTTTTGG
TGGCATGATCTTCATCCTTGTTTACTGTACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATTAACCC
GGCAGTGACATTTGGGCTACTCTTGGCACGTAAAGTGTCGTTGGTTAGAGCCATATTGTA
CATGGTAGCTCAGTGTTTGGGTGCGATATGTGGAGTTGGGTTCGTCAAAGCCTTCCAAAG
CTCTTACTACGTCCGTTACGGCGGTGGAGCCAACTCTCTAGCCGACGGCTACAGCACAGG
AACCGGCCTCGCCGCAGAGATCATTGGTACTTTTGTTCTTGTCTACACCGTCTTCTCCGC
CACTGACCCTAAACGCAGTGCCAGAGACTCCCATGTTCCAGTGTTGGCGCCACTTCCAAT
TGGATT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2G651TF 674 0 0
TTTTTTGGAAAGAAAAAAAACCCCAAAGAAAGTAGATATGGCGAAGGACGTGGAAGCCGT
TTCTGGAGAAGGGTTTCAGACAAGAGACTATCAAGATCCACCACCGGCGCCTCTGTTTGA
TCCGGAGGAGCTGACCAAGTGGTCTTTTTACAGAGCAGTCATTGCCGAGTTCGTTGCTAC
TCTCCTCTTCTTGTACATCACCGTTTTGACAGTCATCGGTTACAAGATTCAGACCGATAG
TACTGCCGGCGGCGTTGACTGCGGTGGAGTTGGTATCCTAGGTATCGCTTGGGCTTTTGG
TGGCATGATCTTCATCCTTGTTTACTGCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATTAACCC
GGCAGTGACATTTGGGCTACTCTTGGCACGTAAAGTGTCGTTGGTTAGAGCCATATTGTA
CATGGTAGCTCAGTGTTTGGGTGCGATATGTGGAGTTGGGTTCGTCAAAGCCTTCCAAAG
CTCTTACTACGTCCGTTACGGCGGTGGAGCCAACTCTCTAGCCGACGGCTACAGCACAGG
AACCGGCCTCGCCGCAGAGATCATTGGTACTTTTGTTCTTGTCTACACCGTCTTCTCCGC
CACTGACCCTAAACGCAGTGCCAGAGACTCCCACGTTCCAGTGTTGGCGCCACTTCCAAT
TGGATTTGCG
TGTT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2BI67TF 790 0 0
GGAAAGA
AAAAAAAACTCCAAAGAAAGTAGATATGGCGAAGGACGTGGAAGCCGTTTCTGGAGAAGG
GTTTCAGACAAGAGACTATCAAGATCCACCACCGGCGCCTCTGTTTGATCCGGAGGAGCT
GACCAAGTGGTCTTTTTACAGAGCAGTCATTGCCGAGTTCGTTGCTACTCTCCTCTTCTT
GTACATCACCGTTTTGACAGTCATCGGTTACAAGATTCAGACCGATAGTACTGCCGGCGG
CGTTGACTGCGGTGGAGTTGGTATCCTAGGTATCGCTCGGGCTTTTGGTGGCATGATCTT
CATCCTTGTTTACTGCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATTAACCCGGCAGTGACATT
TGGGCTACTCTTGGCACGTAAAGTGTCGTTGGTTAGAGCCATATTGTACATGGTAGCTCA
GTGTTTGGGTGCGATATGTGGAGTTGGGTTCGTCAAAGCCTTCCAAAGCTCTTACTACGT
CCGTTACGGCGGTGGAGCCAACTCTCTAGCCGACGGCTACAGCACAGGAACCGGCCTCGC
CGCAGAGATCATTGGTACTTTTGTTCTTGTCTACACCGTCTTCTCCGCCACTGACCCTAA
ACGCAGTGCCAGAGACTCCCACGTTCCAGTGTTGGCGCCACTTCCAATTGGATTTGCGGT
GTTCATGGTGCACTTGGCTACCATTCCCATCACCGGAACTGGTATTAACCCGGCAAGGAG
TTTCGGAGCAGCCGTTATCTTCAACGAGAGCAAGCCCTGGGATGACCACTGGATATTTTG
GGT

QA 8 790 8 790
DS 

RD RR2G651JQ 697 0 0
CATTTGGGCTACTCTTGGCACGTAAAGTGTCGTTGGTTAGAGCCATATTGTACATGGTAG
CTCAGTGTTTGGGTGCGATATGTGGAGTTGGGTTCGTCAAAGCCTTCCAAAGCTCTTACT
ACGTCCGTTACGGCGGTGGAGCCAACTCTCTAGCCGACGGCTACAGCACAGGAACCGGCC
TCGCCGCAGAGATCATTGGTACTTTTGTTCTTGTCTACACCGTCTTCTCCGCCACTGACC
CTAAACGCAGTGCCAGAGACTCCCACGTTCCAGTGTTGGCGCCACTTCCAATTGGATTTG
CGGTGTTCATGGTGCACTTGGCTACCATTCCCATCACCGGAACTGGTATTAACCCGGCAA
GGAGTTTCGGAGCAGCCGTTATCTTCAACGAGAGCAAGTCCTGGGATGACCACTGGATAT
TTTGGGTGGGACCATTTATTGGAGCTGCGATTGCTGCATTCTACCACCAGTTCGTTCTGA
GGGCTTCAGGTTCCAAGTCTCTTGGATCTTTCAGAAGTGCTGCAAACGTCTAAATAATCA
CTCATCTCCACCGTAGCAGATTCCGAAATAATAAAGATGATAAATCTTTTTTCTCTATGT
ACAAAATTATCCAAATCAGTTCCAGTCTGTTATTTTCTTAAATGTGTGTTTTCTACTTGC
TCTTTTTCGTTGAGTGTAATTGTTCTTATATTAGGCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2DP13JQ 763 0 0
ACATTTGGGCTACTCTTGGCACGTAAAGTGTCGTTGGTTAGAGCCATATTGTACATGGTA
GCTCAGTGTTTGGGTGCGATATGTGGAGTTGGGTTCGTCAAAGCCTTCCAAGGCTCTTAC
TACGTCCGTTACGGCGGTGGAGCCAACTCTCTAGCCGACGGCTACAGCACAGGAACCGGC
CTCGCCGCAGAGATCATTGGTACTTTTGTTCTTGTCTACACCGTCTTCTCCGCCACTGAC
CCTAAACGCAGTGCCAGAGACTCCCACGTTCCAGTGTTGGCGCCACTTCCAATTGGATTT
GCGGTGTTCATGGTGCACTTGGCTACCATTCCCATCACCGGAACTGGTATTAACCCGGCA
AGGAGTTTCGGAGCAGCCGTTATCTTCAACGAGAGCAAGCCCTGGGATGACCACTGGATA
TTTTGGGTGGGACCATTTATTGGAGCTGCGATTGCTGCATTCTACCACCAGTTCGTTCTG
AGGGCTTCAGGTTCCAAGTCTCTTGGATCTTTCAGAAGTGCTGCAAACGTCTAAATAATC
ACTCATCTCCACCGTAGCAGACTCTGAAATAATAAAGATGATAAATCTTTTTTCTCTATG
TACAAAATTATCCAAATCAGTTCCAGTCTGTTATTTTCTTAAATGTGTGTTTTCTACTTG
CTCTTTTTCGTTGAGTGTAATTGTTCTTATATTAGGCCAATGCCAAGTTTATCAAGTGAC
TGGAATTGAAAATAAAAAAAGGTTATGGTTGAGTTTGCGTTTT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2F655JQ 662 0 0
TGGGTTCGTCAAAGCCTTCCAAAGCTCTTACTACGTCCGTTACGGCGGTGGAGCCAACTC
TCTAGCCGACGGCTACAGCACAGGAACCGGCCTCGCCGCAGAGATCATTGGTACTTTTGT
TCTTGTCTACACCGTCTTCTCCGCCACTGACCCTAAACGCAGTGCCAGAGACTCCCACGT
TCCAGTGTTGGCGCCACTTCCAATTGGATTTGCGGTGTTCATGGTGCACTTGGCTACCAT
TCCCATCACCGGAACTGGTATTAACCCGGCAAGGAGTTTCGGAGCAGCCGTTATCTTCAA
CGAGAGCAAGCCCTGGGATGACCACTGGATATTTTGGGTGGGACCATTTATTGGAGCTGC
GATTGCTGCATTCTACCACCAGTTCGTTCTGAGGGCTTCAGGTTCCAAGTCTCTTGGATC
TTTCAGAAGTGCTGCAAACGTCTAAATAATCACTCATCTCCACCGTAGCAGATTCTGAAA
TAATAAAGATGATAAATCTTTTTTCTCTATGTACAAAATTATCCAAATCAGTTCCAGTCT
GTTATTTTCTTAAATGTGTGTTTTCTACTTGCTCTTTTTCGTTGAGTGTAATTGTTCTTA
TATTAGGCCAATGCCAAGTTTATCAAGTGACTGGAATTGAAAATAAAAAAAGGTTATGGT
TG

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 7

CO CL697Contig1 1393 7 14 U
GGGTACAAGATCATACTTTCCCTTTAGTCCTCTGTTGAGAATCATCCAATTGAATCTTAC
GAAAACTTTTAAGA***TGAGGTCGCTTCAGTCACCGATTGTTTGTCCAAGTGTTCGTCC
CAGACAAGTGGGTGTGTCTGCTTCACTTGTCAACTCCACTGTTTCGAGACCTAGGCTTCT
CAGGAACCAGTTTTGGGGTCATCAGACCAGAATTGTCAAGTCCCAGGTTGCTACAGTGAT
GGTACGGAGGGGTAAGGGTGTACAGTGTCTTTTCAGCTCGCATTCAGATGGTAACGGAAG
CACAGCAGAGAATTTCAACGAGAACGATGAAGATTATGTCAAGTCTAGTGTACTTGAATC
TGCTGAGGTAAGAAGTGGACCAGATGGTTTTGTGGTGAAGATGAGAGACGGTAGGCAACT
TCGTTGTGTTCACAATAATCCTCAGGGAGGGAATCTTCCTAGTTATGCACCACACTCTGC
TATTGTGCTGAAAATGGAAGATGGAACTGGTCTTCTTCTTCCTATTATCGTCTTGGAGAT
GCCAAGTGTATTACTGATGGCAGCATTGACGAATGTGAAAATAGCAAGGCCAACTATGTA
CGAAGTGGCGATGGAGATGGTAGATAAAATGGGATACGAGGTTCGACTTGTTAGAGTTAC
CACTAGAGTTCACGAGGCGTATTACGCACAGTTATTCCTTTCAAAGGTGGGGGATAAGTC
TGATTGTGTAAGCTTCGATCTTCGTCCTTCGGATGCTATTAATATAGCTGTCAGGTGCAA
GGTACCCATCCAAGTGAACAAGTTTCTAGCTTATAGTGATGGAATGAGAGTCATCGAGTC
TGGAAAACTATCAAAGCAAACACCTGCTTCTGATGGTTTATTACATACTGAACTAGACCG
GCCAAATGGTCAGCCTTGTCTTGATACAAAAGAGTTTGATCTCTTGAACCACATGATGCA
AGCCGTTAACGAAGAACGGTATGATGAAGCAGCTGAGTGGAGAGACAAGCTCGGCCAGTT
TCAAGCGAAACGCAAACTAAGGAAATACACGTGATCGACAGAGCAGTTCCGAGACAAATG
TATTTATAAAAGCAGTAGTATTATTGTAAATAATAAAGAAGCCATTGCTTAGAAGCTGCG
ATCAAAGTGATGGAAACGGACGCTTCCAACTTGCAAAAAGAAATAATCTCTTCAGTGTGA
TGGAGAATGCTCGTCTATCATACACTTGTGCACGTTGTTAGTAAGTTCCCGAAGATAAGA
AAAAGACATAATATCTTGTATATGTAGTTTGTTATCGTGTGAAACCAATCAGTGATGTGT
AACATAATCATACATTTATCATCTCTCGTAATTAGATTAATAAATCTTCATGGATTGGAA
AGTCTTAACTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG27TF U 1
AF RR2AI60TF U 1
AF RR2B505TF U 1
AF RR2C251TF U 831
AF RR2B505JQ C 526
AF RR2AI60JQ C 526
AF RR2GG27JQB C 684
BS 1 74 RR2AI60TF
BS 75 77 RR2B505TF
BS 78 407 RR2AI60TF
BS 408 409 RR2B505TF
BS 410 623 RR2AI60TF
BS 624 626 RR2B505TF
BS 627 706 RR2AI60TF
BS 707 707 RR2B505TF
BS 708 755 RR2AI60TF
BS 756 896 RR2B505TF
BS 897 949 RR2C251TF
BS 950 950 RR2AI60JQ
BS 951 1359 RR2C251TF
BS 1360 1393 RR2AI60JQ

RD RR2GG27TF 486 0 0
GGGTACAAGATCATACTTTCCCTTTAGTCCTCCGTTGAGAATCATCCAATTGAATCTTAC
GAAAACTTTTAAGA***TTAGGTCGCTTCAGTCACCGATTGTTTGTCCAAGTGTTCGTCC
CAGACAAGTGGGTGTGTCTGCTTCACTTGTCAACTCCACTGTTTCGAGACCTAGGCTTCT
CAGGAACCAGTTTTGGGGTCATCAGACCAGAATTGTCAAGTCCCAGGTTGCTACAGTGAT
GGTACGGAGGGGTAAGGGTGTACAGTGTCTTTTCAGCTCGCATTCAGATGGTAACGGAAG
CACAGCAGAGAATTTCAACGAGAACGATGAAGATTATGTCAAGTCTAGTGTACTTGAATC
TGCTGAGGTAAGAAGTGGACCAGATGGTTTTGTGGTGAAGATGAGAGACGGTAGGCAACT
TCGTTGTGTTCACAATAATCCTCAGGGAGGGAATCTTCCTAGTTATGCACCACACTCTGC
TATTGT

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR2AI60TF 755 0 0
GGGTACAAGATCATACTTTCCCTTTAGTCCTCTGTTGAGAATCATCCAATTGAATCTTAC
GAAAACTTTTAAGAAGATGAGGTCGCTTCAGTCACCGATTGTTTGTCCAAGTGTTCGTCC
CAGACAAGTGGGTGTGTCTGCTTCACTTGTCAACTCCACTGTTTCGAGACCTAGGCTTCT
CAGGAACCAGTTTTGGGGTCATCAGACCAGAATTGTCAAGTCCCAGGTTGCTACAGTGAT
GGTACGGAGGGGTAAGGGTGTACAGTGTCTTTTCAGCTCGCATTCAGATGGTAACGGAAG
CACAGCAGAGAATTTCAACGAGAACGATGAAGATTATGTCAAGTCTAGTGTACTTGAATC
TGCTGAGGTAAGAAGTGGACCAGATGGTTTTGTGGTGAAGATGAGAG**GGTAGGCAACT
TCGTTGTGTTCACAATAATCCTCAGGGAGGGAATCTTCCTAGTTATGCACCACACTCTGC
TATTGTGCTGAAAATGGAAGATGGAACTGGTCTTCTTCTTCCTATTATCGTCTTGGAGAT
GCCAAGTGTATTACTGATGGCAGCATTGACGAATGTGAAAATAGCAAGGCCAACTATGTA
CGAAGTGGCGATGGAGATGGTAG***AAATGGGATACGAGGTTCGACTTGTTAGAGTTAC
CACTAGAGTTCACGAGGCGTATTACGCACAGTTATTCCTTTCAAAG*TGGGGGATAAGTC
TGATTGTGTAAGCTTCGATCTTCGTCCTTCGGATG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2B505TF 896 0 0
GGGTACAAGATCATACTTTCCCTTTAGTCCTCTGTTGAGAATCATCCAATTGAATCTTAC
GAAAACTTTTAAGA***TGAGGTCGCTTCAGTCACCGATTGTTTGTCCAAGTGTTCGTCC
CAGACAAGTGGGTGTGTCTGCTTCACTTGTCAACTCCACTGTTTCGAGACCTAGGCTTCT
CAGGAACCAGTTTTGGGGTCATCAGACCAGAATTGTCAAGTCCCAGGTTGCTACAGTGAT
GGTACGGAGGGGTAAGGGTGTACAGTGTCTTTTCAGCTCGCATTCAGATGGTAACGGAAG
CACAGCAGAGAATTTCAACGAGAACGATGAAGATTATGTCAAGTCTAGTGTACTTGAATC
TGCTGAGGTAAGAAGTGGACCAGATGGTTTTGTGGTGAAGATGAGAGACGGTAGGCAACT
TCGTTGTGTTCACAATAATCCTCAGGGAGGGAATCTTCCTAGTTATGCACCACACTCTGC
TATTGTGCTGAAAATGGAAGATGGAACTGGTCTTCTTCTTCCTATTATCGTCTTGGAGAT
GCCAAGTGTATTACTGATGGCAGCATTGACGAATGTGAAAATAGCAAGGCCAACTATGTA
CGAAGTGGTGATGGAGATGGTAGATAAAATGGGATACGAGGTTCGACTTGTTAGAGTTAC
CACTAGAGTTCACGGGGCGTATTACGCACAGTTATTCCTTTCAAAGGTGGGGGATAAGTC
TGATTGTGTAAGCTTCGATCTTCGTCCTTCGGATGCTATTAATATAGCTGTCAGGTGCAA
GGTACCCATCCAAGTGAACAAGTTTCTAGCTTATAGTGATGGAATGAGAGTCATCGAGTC
TGGAAAACTATCAAAGCAAACACCTGCTTCTGATGGTTTATTACATACTGAACTAG

QA 1 896 1 896
DS 

RD RR2C251TF 529 0 0
G
CATCGAGTCTGGAAAGCTGTCAAAGCAAACACCTGCTTCTGATGGTTTATTACATACTGA
ACTAGACCGGCCAAATGGTCAGCCTTGTCTTGATACAAAAGAGTTTGATCTCTTGAACAA
CATGATGCAAGCCGTTAACGAAGAACGGTATGATGAAGCAGCTGAGTGGAGAGACAAGCT
CGGCCAGTTTCAAGCGAAACGCAAACTAAGGAAATACACGTGATCGACAGAGCAGTTCCG
AGACAAATGTATTTATAAAAGCAGTAGTATTATTGTAAATAATAAAGAAGCCATTGCTTA
GAAGCTGCGATCAAAGTGATGGAAACGGACGCTTCCAACTTGCAAAAAGAAATAATCTCT
TCAGTGTGATGGAGAATGCTCGTCTATCATACACTTGTGCACGTTGTTAGTAAGTTCCCG
AAGATAAGAAAAAGACATAATATCTTGTATATGTAGTTTGTTATCGTGTGAAACCAATCA
GTGATGTGTAACATAATCATACATTTATCATCTCTCGTAATTAGATTA

QA 2 529 2 529
DS 

RD RR2B505JQ 823 0 0
TATCGTCTTGGAGATGCCAAGTGTATTACTGATGGCAGCATTGACGAATGTGAAAATAGC
AAGGCCAACTATGTACGAAGTGGTGATGGAGATGGTAGATAAAATGGGATACGAGGTTCG
ACTTGTTAGAGTTACCACTAGAGTTCACGGGGCGTATTACGCACAGTTATTCCTTTCAAA
GGTGGGGGATAAGTCTGATTGTGTAAGCTTCGATCTTCGTCCTTCGGATGCTATTAATAT
AGCTGTCAGGTGCAAGGTACCCATCCAAGTGAACAAGTTTCTAGCTTATAGTGATGGAAT
GAGAGTCATCGAGTCTGGAAAACTATCAAAGCAAACACCTGCTTTTGATGGTTTATTACA
TACTGAACTAGACCGGCCAAATGGTCAGCCTTGTCTTGATACAAAAGAGTTTGATCTCTT
GAACCACATGATGCAAGCCGTTAACGAAGAACGGTATGATGAAGCAGCTGAGTGGAGAGA
CAAGCTCGGCCAGTTTCAAGCGAAACGCAAACTAAGGAAATACACGTGATCGACAGAGCA
GTTCCGAGACAAATGTATTTATAAAAGCAGTAGTATTATTGTAAATAATAAAGAAGCCAT
TGCTTAGAAGCTGCGATCAAAGTGATGGAAACGGACGCTTCCAACTTGCAAAAAGAAATA
ATCTCTTCAGTGTGATGGAGAATGCTCGTCTATCATACACTTGTGCACGTTGTTAGTAAG
TTCCCGAAGATAAGAAAAAGACATAATATCTTGTATATGTAGTTTGTTATCGTGTGAAAC
CAATCAGTGATGTGTAACATAATCATACATTTATCATCTCTCG

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR2AI60JQ 868 0 0
TATCGTCTTGGAGATGCCAAGTGTATTACTGATGGCAGCATTGACGAATGTGAAAATAGC
AAGGCCAACTATGTACGAAGTGGCGATGGAGATGGTAG***AAATGGGATACGAGGTTCG
ACTTGTTAGAGTTACCACTAGAGTTCACGAGGCGTATTACGCACAGTTATTCCTTTCAAA
GGTGGGGGATAAGTCTGATTGTGTAAGCTTCGATCTTCGTCCTTCGGATGCTATTAATAT
AGCTGTCAGGTGCAAGGTACCCATCCAAGTGAACAAGTTTCTAGCTTATAGTGATGGAAT
GAGAGTCATCGAGTCTGGAAAACTATCAAAGCAAACACCTGCTTCTGATGGTTTATTACA
TACTGAACTAGACCGGCCAAATGGTCAGCCTTGTCTTGATACAAAAGAGTTTGATCTCTT
GAACCACATGATGCAAGCCGTTAACGAAGAACGGTATGATGAAGCAGCTGAGTGGAGAGA
CAAGCTCGGCCAGTTTCAAGCGAAACGCAAACTAAGGAAATACACGTGATCGACAGAGCA
GTTCCGAGACAAATGTATTTATAAAAGCAGTAGTATTATTGTAAATAATAAAGAAGCCAT
TGCTTAGAAGCTGCGATCAAAGTGATGGAAACGGACGCTTCCAACTTGCAAAAAGAAATA
ATCTCTTCAGTGTGATGGAGAATGCTCGTCTATCATACACTTGTGCACGTTGTTAGTAAG
TTCCCGAAGATAAGAAAAAGACATAATATCTTGTATATGTAGTTTGTTATCGTGTGAAAC
CAATCAGTGATGTGTAACATAATCATACATTTATCATCTCTCGTAATTAGATTAATAAAT
CTTCATGGATTGGAAAGTCTTAACTTTG

QA 1 868 1 868
DS 

RD RR2GG27JQB 703 0 0
ACGCACAGTTATTCCTTTCAAAGGTGGGGGATAAGTCTGATTGCGTAAGCTTCGATCTTC
GTCCTTCGGATGCTATTAATATAGCTGTCAGGTGCAAGGTACCCATCCAAGTGAACAAGT
TTCTAGCTTATAGTGATGGAATGAGAGTCATCGAGTCTGGAAAACTATCAAAGCAAACAC
CTGCTTCTGATGGTTTATTACATACTGAACTAGACCGGCCAAATGGTCAGCCTTGTCTTG
ATACAAAAGAGTTTGATCTCTTGAACCACATGATGCAAGCCGTTAACGAAGAACGGTATG
ATGAAGCAGCTGAGTGGAGAGACAAGCTCGGCCAGTTTCAAGCGAAACGCAAACTAAGGA
AATACACGTGATCGACAGAGCAGTTCCGAGACAAATGTATTTATAAAAGCAGTAGTATTA
TTGTAAATAATAAAGAAGCCATTGCTTAGAAGCTGCGATCAAAGTGATGGAAACGGACGC
TTCCAACTAGCAAAAAGAAATAATCTCTTCAGTGTGATGGAGAATGCTCGTCTATCATAC
ACTTGTGCACGTTGTTAGTAAGTTCCCGAAGATAAGAAAAAGACATAATATCTTGTATAT
GTAGTTTGTTATCGTGTGAAACCAATCAGTGATGTGTAACATAATCATACATTTATCATC
TCTCGTAATTAGATTAATAAATCTTCATGGATTGGAAAGTCTT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 2 9

CO CL698Contig1 1181 6 15 U
CTAATCAATCCATGGCCTTCATAGAAAGAACGAAACCGGATAGTATAATACAAACTTATC
AAGTGCTAGGAGATAGGACATAAGAGAAGATTCAACAGAAAACAAAGAGATGCATAAGAA
GAACAAAGCTCAACATTCTAGCCAACTGATTGAACCATAGCAATTACTGGCTGGAAAAGT
GAAGAAGCTCTCTAGAAGACAACAGTGTCAAGCATGGTGCCTAGTGTCTGAACAATGTTG
GAAGACATCAAGTTGGAAACATGTTCTTCCAGATGCTTCTTCGCGTCTTGTCTTCCCACA
TTCACAATCGCCAGTTTCTCTGGTGACAACTCGTCCTCCTCTTGCACCGCCTTGTTATAC
TTAGCAGCCAAGCTCAACATTTCCTGAACGGTCTGTTCGTTTGTCTTGGAGTGAGTGTCA
AAGCGTCTTAGCGTCAGGCCATCAGTCCATTTCTTCTTGTGGAGGTTTAGTAACATCTTC
TCCTCGAGCTCGTTCTTCCTGTAGTTGATGGCTATTGAGTAATAGTGTCTGTTCAGTCCA
TGAATCAAAGCCTGGATCGATGGCTTGTTCAGGTGGCCAAGGTTGGACGTTGTTTGACGA
GGCTCTTGCCCAAGCATAATGGTCTGAGGGTTTATCGAGCGGAACGCATCAATCACCACT
TTACCCTTCACACTCTGAATAGGATCAACCACCACTGCGACAGCTCGCTGGTTCAAAGCT
TCAAAACTCTGTTGAGTATTAATATCAACACCGGAAAGCCAGCATCCAAACCCAGGATGT
GAATGATACCAACCCACCACCATTTCAGGTCTGCCAGTCTGTTTAAGCATGTCGAGCATA
TTAGTCTGGAAAACATGATCAACAGCTTCAACGCTAACACCAGTCCCACTCTGAGGCATC
GCGAAAACATCCACAACCCTAACAGTGTACTCATCCACGAACTCTCCCAGCATCAACCCC
ATCACCTCCATAGGCACTCCAGCTCTCCCGTGTTTGAGCATCTTGAGGAGAGCGAGAGAG
GAGATGTAGACTTGTTCCGAGGTGTCGAGAGTGGGGGAATCTGGAGATGCGTGGCCTAGA
CCGCCGCCGGCACCGAAGATTCGCTGTAATCTCTCCATAATCTCAGATGAAAATCAGTCG
TGTTCTTCTCTGGGAATAAGAATTGAGAGATCTTATAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F108JQ U 10
AF RR2E941JQ U 5
AF RR2E819JQ U 1
AF RR2FQ89JQ U 25
AF RR2F108TF C 394
AF RR2FF73TF C 502
BS 1 198 RR2E819JQ
BS 199 199 RR2F108JQ
BS 200 452 RR2E819JQ
BS 453 453 RR2F108JQ
BS 454 518 RR2E819JQ
BS 519 519 RR2F108JQ
BS 520 535 RR2E819JQ
BS 536 536 RR2F108JQ
BS 537 548 RR2E819JQ
BS 549 549 RR2F108JQ
BS 550 575 RR2E819JQ
BS 576 576 RR2F108JQ
BS 577 804 RR2E819JQ
BS 805 1145 RR2F108TF
BS 1146 1181 RR2FF73TF

RD RR2F108JQ 637 0 0
CCATGGCCTTCATAGAAAGAACGAAACCGGATAGTATAATACAAACTTATCAAGTGCTAG
GAGATAGGACATAAGAGAAGATTCAACAGAAAACAAAGAGATGCATAAGAAGAACAAAGC
TCAACATTCTAGCCAACTGATTGAACCATAGCAGTTATTGGCTGGGAAAGTGAAGAAACT
CTCTAAAAGACAACAGTGTCAAGCATGGTGCCGAGTGTCTGAACAATGTTGGAAGACATC
AAGTTGGAAACATGTTCTTCCAGATGCTTCTTTGCGTCTTGTCTTCCCACATTCACAATC
GCCAGTTTCTCCGGTGACAACTCGTCCTCCTCTTGTACCGCCTTGTTATAATTAGCAGCC
AAGCTCAACATTTCCTGCACCGTCTGTTCGTTTGTCTTGGAGTGGGTGTCAAAGCGTCTT
AGCGTCAGGCCATCAGTCCATTTCTTCTTGTGGAGGTTTAGTAACATCTTCTCCTCGAGC
TCGTTCTTCCTGTAGTTGATGGCTATTGAGTAATAGTGTCTGTTCAGTCCATGAATCAAA
GCCTGGATCGATGGCTTGTTCAGGTGGCCAAGGTTGGACGTTGTTTGACGAGGCTCTTGC
CCAAGCATAATGGTCTGAGGGTTTATCGAGCGGAA
GG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2E941JQ 767 0 0
TCAAT
CCATGGCCTTCATAGAAAGAACGAAACCGGATAGTATAATACAAACTTATCAAGTGCTAG
GAGATAGGACATAAGAGAAGATTCAACAGAAAACAAAGAGATGCATAAGAAGAACAAAGC
TCAACATTCTAGCCAACTGATTGAACCATAGCAATTACTGGCTGGAAAAGTGAAGAAGCT
CTCTAGAAGACAACAGTGTCAAGCATGGTGCCTAGTGTCTGAACAATGTTGGAAGACATC
AAGTTGGAAACATGTTCTTCCAGATGCTTCTTCGCGTCTTGTCTTCCCACATTCACAATC
GCCAGTTTCTCTGGTGACAACTCGTCCTCCTCTTGCACCGCCTTGTTATACTTAGCGGCA
AAGCTCAACATTTCCTGAACGGTCTGTTCGTTTGTCTTGGAGTGAGTGTCAAAGCGTCTT
AGCGTCAGGCCATCAGTCCATTTTTTCTTGTGGAGGTTTAGTAACATCTTCTCCTCGAGC
TCGTTCTTCCTGTAGTTGATGGCTATTGAATAATAGTGTCTGTTCAATCCATGAATCAAG
GCCTGGATCGATGGCTTGTTCAGGTGTCCAAGGTTGGACGTTGTTTGACGAGGCTCTTGC
CCAAGCATAATGGTCTGAGGGTTTATCGAGCGGAACGCATCAATCACCACTTTACCCTTC
ACACTCTGAATAGGATCAACCACCACTGCGACAGCTCGCTGGTTCAA*GCTTCAAAACTC
TGTTGAGTATTAATATCAACACCGGAAAGCCAGCATCCAAAC

QA 6 767 6 767
DS 

RD RR2E819JQ 804 0 0
CTAATCAATCCATGGCCTTCATAGAAAGAACGAAACCGGATAGTATAATACAAACTTATC
AAGTGCTAGGAGATAGGACATAAGAGAAGATTCAACAGAAAACAAAGAGATGCATAAGAA
GAACAAAGCTCAACATTCTAGCCAACTGATTGAACCATAGCAATTACTGGCTGGAAAAGT
GAAGAAGCTCTCTAGAAGCCAACAGTGTCAAGCATGGTGCCTAGTGTCTGAACAATGTTG
GAAGACATCAAGTTGGAAACATGTTCTTCCAGATGCTTCTTCGCGTCTTGTCTTCCCACA
TTCACAATCGCCAGTTTCTCTGGTGACAACTCGTCCTCCTCTTGCACCGCCTTGTTATAC
TTAGCAGCCAAGCTCAACATTTCCTGAACGGTCTGTTCGTTTGTCTTGGAGTGAGTGTCA
AAGCGTCTTAGCGTCAGGCCATCAGTCCATTTTTTCTTGTGGAGGTTTAGTAACATCTTC
TCCTCGAGCTCGTTCTTCCTGTAGTTGATGGCTATTGAATAATAGTGTCTGTTCAATCCA
TGAATCAAGGCCTGGATCGATGGCTTGTTCAGGTGTCCAAGGTTGGACGTTGTTTGACGA
GGCTCTTGCCCAAGCATAATGGTCTGAGGGTTTATCGAGCGGAACGCATCAATCACCACT
TTACCCTTCACACTCTGAATAGGATCAACCACCACTGCGACAGCTCGCTGGTTCAAAGCT
TCAAAACTCTGTTGAGTATTAATATCAACACCGGAAAGCCAGCATCCAAACCCAGGATGT
GAATGATACCAACCCACCACCATT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2FQ89JQ 763 0 0
G
AAGAACGAAACCGGATAGTATAATACAAACTTATCAAGTGCTAGGAGATAGGACATAAGA
GAAGATTCAACAGAAAACAAAGAGATGCATAAGAAGAACAAAGCTCAACATTCTAGCCAA
CTGATTGAACCATAGCAATTACTGGCTGGAAAAGTGAAGAAGCTCTCTAGAAGACAACAG
TGTCAAGCATGGTGCCTAGTGTCTGAACAATGTTGGAAGACATCAAGTTGGAAACATGTT
CTTCCAGATGCTTCTTCGCGTCTTGTCTTCCCACATTCACAATCGCCAGTTTCTCTGGTG
ACAACTCGTCCTCCTCTTGCACCGCCTTGTTATACTTAGCAGCCAAGCTCAACATTTCCT
GAACGGTCTGTTCGTTTGTCTTGGAGTGAGTGTCAAAGCGTCTTAGCGTCAGGCCATCAG
TCCATTTTTTCTTGTGGAGGTTTAGTAACATCTTCTCCTCGAGCTCGTTCTTCCTGTAGT
TGATGGCTATTGAATAATAGTGTCTGTTCAATCCATGAATCAAGGCCTGGATCGATGGCT
TGTTCAGGTGTCCAAGGTTGGAAGTTGTTTGACGAGGCTCTTGCCCAAGCATAATGGTCT
GAGGGTTTATCGAGCGGAACGCATCAATCACCGCTTTACCCTTCACACTCTGAATAGGAT
CAACCACCACTGCGACAGCTCGCTGGTTCAAAGCTTCAAAACTCTGTTGAGTATTAATAT
CAACACCGGAAAGCCAGCATCCAAACCCAGGATGTGAATGAT

QA 2 763 2 763
DS 

RD RR2F108TF 753 0 0
TGTTCGTTTGTCTTGGAGTGGGTGTCAAAGCGTCTTAGCGTCAGGCCATCAGTCCATTTC
TTCTTGTGGAGGTTTAGTAACATCTTCTCCTCGAGCTCGTTCTTCCTGTAGTTGATGGCT
ATTGAGTAATAGTGTCTGTTCAGTCCATGAATCAAAGCCTGGATCGATGGCTTGTTCAGG
TGGCCAAGGTTGGACGTTGTTTGACGAGGCTCTTGCCCAAGCATAATGGTCTGAGGGTTT
ATCGAGCGGAAGGCATCAATCACCACTTTGCCCTTCACACTCTGAATAGGATCAACCACC
ACTGCGACAGCTCGCTGGTTCAAAGCTTCAAAACTCTGTTGAGTGTTAATATCAACACCG
GAAAGCCAGCATCCAAACCCAGGATGTGAATGATACCAACCCACCACCATTTCAGGTCTG
CCAGTCTGTTTAAGCATGTCGAGCATATTAGTCTGGAAAACATGATCAACAGCTTCAACG
CTAACACCAGTCCCACTCTGAGGCATCGCGAAAACATCCACAACCCTAACAGTGTACTCA
TCCACGAACTCTCCCAGCATCAACCCCATCACCTCCATAGGCACTCCAGCTCTCCCGTGT
TTGAGCATCTTGAGGAGAGCGAGAGAGGAGATGTAGACTTGTTCCGAGGTGTCGAGAGTG
GGGGAATCTGGAGATGCGTGGCCTAGACCGCCGCCGGCACCGAAGATTCGCTGTAATCTC
TCCATAATCTCAGATGAAAATCAGTCGTGTTC
C

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2FF73TF 680 0 0
TAGTTGATGGCTATTGAGTAATAGTGTCTGTTCAGTCCATGAATCAAAGCCTGGATCGAT
GGCTTGTTCAGGTGGCCAAGGTTGGACGTTGTTTGACGAGGCTCTTGCCCAAGCATAATG
GTCTGAGGGTTTATCGAGCGGAAGGCATCAATCACCACTTTGCCCTTCACACTCTGAATA
GGATCAACCACCACTGCGACAGCTCGCTGGTTCAAAGCTTCAAAACTCTGTTGAGTGTTA
ATATCAACACCGGAAAGCCAGCATCCAAACCCAGGATGTGAATGATACCAACCCACCACC
ATTTCAGGTCTGCCAGTCTGTTTAAGCATGTCGAGCATATTAGTCTGGAAAACATGATCA
ACAGCTTCAACGCTAACACCAGTCCCACTCTGAGGCATCGCGAAAACATCCACAACCCTA
ACAGTGTACTCATCCACGAACTCTCCCAGCATCAACCCCATCACCTCCATAGGCACTCCA
GCTCTCCCGTGTTTGAGCATCTTGAGGAGAGCGAGAGAGGAGATGTAGACTTGTTCCGAG
GTGTCGAGAGTGGGGGAATCTGGAGATGCGTGGCCTAGACCGCCGCCGGCACCGAAGATT
CGCTGTAATCTCTCCATAATCTCAGATGAAAATCAGTCGTGTTCTTCTCTGGGAATAAGA
ATTGAGAGATCTTATAGACC

QA 1 680 1 680
DS 



CO CL698Contig2 744 3 13 U
GGAACACGACTGACTGATTTCATCTGTGAGATTATGGAGAGATTACAGCGAATCTTCGGT
GCCGGCGGGGGTCTAGGCCACGCCTCTCCTGATTCCCCTACTCTCGACACCTCGGAGCAA
GTCTACATCTCCTCTCTCGCTCTCCTCAAGATGCTCAAACACGGGAGAGCTGGAGTGCCT
ATGGAGGTGATGGGGTTGATGCTGGGAGAGTTCGTGGATGAGTACACTGTTAGGGTTGTG
GATGTTTTTGCGATGCCTCAGAGTGGGACTGGTGTTAGTGTTGAAGCTGTTGATCATGTT
TTCCAGACTAATATGCTTGACATGCTTAAACAGACTGGAAGACCTGAAATGGTGGTGGGT
TGGTATCATTCACATCCTGGGTTTGGATGCTGGCTTTCCGGTGTTGATATTAATACTCAA
CAGAGTTTTGAAGCTTTGAACCAGCGAGCTGTCGCAGTGGTGGTTGATCCTATTCAGAGT
GTGAAGGGTAAAGCGGTGATTGATGCGTTCCGCTCGATAAACCCTCAGACCATTATGCTT
GGGCAAGAGCCTCGTCAAACAACTTCCAACCTTGGACACCTGAACAAGCCATCGATCCAG
GCCTTGATTCATGGATTGAACAGACACTATTATTCAATAGCCATCAACTACAGGAAGAAC
GAGCTCGAGGAGAAGATGTTACTAAACCTCCACAAGAAAAATGGACTGATGGCCTGACGC
TAGACGCTTTGACACTCACTCCAA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E819TF U 1
AF RR2E941TF U 4
AF RR2FQ89TF U 4
BS 1 62 RR2E819TF
BS 63 63 RR2E941TF
BS 64 211 RR2E819TF
BS 212 212 RR2E941TF
BS 213 221 RR2E819TF
BS 222 222 RR2E941TF
BS 223 236 RR2E819TF
BS 237 351 RR2E941TF
BS 352 352 RR2FQ89TF
BS 353 363 RR2E941TF
BS 364 364 RR2FQ89TF
BS 365 385 RR2E941TF
BS 386 744 RR2FQ89TF

RD RR2E819TF 240 0 0
GGAACACGACTGACTGATTTCATCTGTGAGATTATGGAGAGATTACAGCGAATCTTCGGT
GCTGGCGGGGGTCTAGGCCACGCCTCTCCTGATTCCCCTACTCTCGACACCTCGGAGCAA
GTCTACATCTCCTCTCTCGCTCTCCTCAAGATGCTCAAACACGGGAGAGCTGGAGTGCCT
ATGGAGGTGATGGGGTTGATGCTGGGAGAGT*CGTGGATGA*TACACTGTTAGGGT
GTGG

QA 1 236 1 236
DS 

RD RR2E941TF 382 0 0
GG
ACGACTGACTGATTTCATCTGTGAGATTATGGAGAGATTACATCGAATCTTCGGTGCCGG
CGGGGGTCTAGGCCACGCCTCTCCTGATTCCCCTACCCTCGACACCTCGGAGCAAGTCTA
CATCTCCTCTCTCGCTCTCCTCAAGATGCTCAAACACGGGAGAGCTGGAGTGCCTATGGA
GGTGATGGGGTTGATGCTGGGAGAGTTCGTGGATGAGTACACTGTTAGGGTTGTGGATGT
TTTTGCGATGCCTCAGAGTGGGACTGGTGTTAGTGTTGAAGCTGTTGATCATGTTTTCCA
GACTAATATGCTTGACATGCTTAAACAGACTGGAAGACCTGAAATG*TGGTGGGTTGG*A
TCATTCACATCCTGGGTTTG

QA 3 382 3 382
DS 

RD RR2FQ89TF 741 0 0
GG
ACGACTGACTGATTTCATCTGTGAGATTATGGAGAGATTACAGCGAATCTTCGGTGCCGG
CGGGGGTCTAGGCCACGCCTCTCCTGATTCCCCTACTCTCGACACCTCGGAGCAAGTCTA
CATCTCCTCTCTCGCTCTCCTCAAGATGCTCAAACACGGGAGAGCTGGAGTGCCTATGGA
GGTGATGGGGTTGATGCTGGGAGAGTTCGTGGATGAGTACACTGTTAGGGTTGTGGATGT
TT**GCGATGCCTCAGAGTGGGACTGGTGTTAGTGTTGAAGCTGTTGATCATGTTTTCCA
GACTAGTATGCTTGACATGCTTAAACAGACTGGAAGACCTGAAATGGTGGTGGGTTGGTA
TCATTCACATCCTGGGTTTGGATGCTGGCTTTCCGGTGTTGATATTAATACTCAACAGAG
TTTTGAAGCTTTGAACCAGCGAGCTGTCGCAGTGGTGGTTGATCCTATTCAGAGTGTGAA
GGGTAAAGCGGTGATTGATGCGTTCCGCTCGATAAACCCTCAGACCATTATGCTTGGGCA
AGAGCCTCGTCAAACAACTTCCAACCTTGGACACCTGAACAAGCCATCGATCCAGGCCTT
GATTCATGGATTGAACAGACACTATTATTCAATAGCCATCAACTACAGGAAGAACGAGCT
CGAGGAGAAGATGTTACTAAACCTCCACAAGAAAAATGGACTGATGGCCTGACGCTAGAC
GCTTTGACACTCACTCCAA

QA 3 741 3 741
DS 



AS 2 9

CO CL699Contig1 780 7 7 U
GGAGGACAGGAGAGGAGAAACTTAAAAGCTCCAGAGAGATTTTCCCCAGATTTCAATTTT
CTACGTGAGTGACGATGGCGCTTCGTGCTACAACTCAAGCGACTGCTCGTATCGCGACGA
ATCTCGGACGTGTAGGTCGGACTTTCTCAACTGACGCGGTGGTGGAGTCGGATTACAAGC
GCGGCGAGATCGGTAGTGTCTCCGGAATCCCGGAGGAGCATCTTGCACGAAAGGTGATAA
TATACTCACCAGCAAGAACAGCGACACAGCAAGGATCTGGAAAACTTGGGAAATGGAAGA
TCAATTTCGTCTCCACCCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGATGGACTTCTACAGGTG
ACCCTTATGCCAATGTTGGTGACTCCGCTCTTGGTTTTGATTCTGAGGAAGCTGCTAAGT
CTTTTGCTCAGCGTCATGGCTGGGATTATGTGGTCAAGAGTCCCAAAACACCGTTATTGA
AGGCTAAGTCTTACTCAGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGAT
CGTTACATCATCTTCTTCTTCCATTTCTCGACCCAAAGGAGACACTTCGCTTTGATATAA
ATGGAAGGCGCTCATTTTTATTCGTTACTTTTAGCATCTGTGAGCTTTTTCTCTGAACTA
TTATCCATGGTTGGATTTTACTTTTGTTTTTCTCTATCTTCCCTTATTACTACACAATAA
TATGATGATGATGATGACAAACACACACCTCCTTTGGTATTTCATCAAGCTTTTATGGCT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 45 45 45 45 30 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 10 35 10 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2FY04TF U 11
AF RR2EE89TF U 2
AF RR2BJ29JQ C 313
AF RR2BJ29TF U 1
AF RR2H476TF U 13
AF RR2H476JQB C 146
AF RR2EE89JQ C 423
BS 1 10 RR2BJ29TF
BS 11 11 RR2EE89TF
BS 12 162 RR2BJ29TF
BS 163 164 RR2FY04TF
BS 165 757 RR2BJ29TF
BS 758 778 RR2H476TF
BS 779 780 RR2H476JQB

RD RR2FY04TF 593 0 0
GGA
GGAGAAACTTAAAAGCCCCAGAGAGATTTTCCCCAGATTTCAATTTTCTACGTGAGTGAC
GATGGCGCTTCGTGCTACAACTCAAGCGACTGCTCGTATCGCGACGAATCTCGGACGTGT
AGGTCGGACTTTCTCAACTGACGCGGTGGTGGAGTCGGATTACAAGCGCGGCGAGATCGG
TAGTGTCTCCGGAATCCCGGAGGAGCATCTTGCACGAAAGGTGATAATATACTCACCAGC
AAGAACAGCGACACAGCAAGGATCTGGAAAACTTGGGAAATGGAAGATCAATTTCGTCTC
CACCCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGATGGACTTCTACAGGTGACCCTTATGCCAA
TGTTGGTGACTCCGCTCTTGGTTTTGATTCTGAGGAAGCTGCTAAGTCTTTTGCTCAGCG
TCATGGCTGGGATTATGTGGTCAAGAGTCCCAAAACACCGTTATTGAAGGCTAAGTCTTA
CTCAGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATCGTTACATCATCT
TCTTCTTCCATTTCTCGACCCAAAG*AGACACTTCGCTTTGATATAAATG

QA 4 593 4 593
DS 

RD RR2EE89TF 645 0 0
GG
GGACAGGAGAGGAGAAACTTAAAAGCTCCAGAGAGATTTTCCCCAGATTTCAATTTTCTA
CGTGAGTGACGATGGCGCTTCGTGCAACAACTCAAGCGACTGCTCGTATCGCGACGAATC
TCGGACGTGTAGGTCGGACTTTCTCAACTGACGCGGTGGTGGAGTCGGATTACAAGCGCG
GCGAGATCGGTAGTGTCTCCCGAATCCCGGAGGAGCATCTTGCACGAAAGGTGATAATAT
ACTCACCAGCAAGAACAGCGACACAGCAAGGATCTGGAAAACTTGGGAAATGGAAGATCA
ATTTCGTCTCCACCCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGATGGACTTCTACAGGTGACC
CTTATGCCAATGTTGGTGACTCCGCTCTTGGTTTTGATTCTGAGGAAGCTGCTAAGTCTT
TTGCTCATCGTCATGGCTGGGATTATGTGGTCAAGAGTCCCAAAACACCGTTATTGAAGG
CTAAGTCTTACTCAGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATCGC
TACATCATCTTCTTCTTCCATTTCTCGACCCAAAGGAGACACTTCGCTTTGATATAAATG
GAAGGCGCTCATTTTTATTCGTTACTTTTAGCATCTGTGAGCT

QA 3 645 3 645
DS 

RD RR2BJ29JQ 381 0 0
CCACCCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGATGGACTTTTACAGGTGACCCTTATGCCA
ATGTTGGGGACTCCGCTCTTGGTTTTGATTTTGAGGAAGCTGCTAAGTTTTTTGTTCAGC
GTCATGGCTGGGATTATGTGGTCAAGAGTCCCAAAACACCGTTATTGAAGGGTAAGTTTT
ATTCAGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATCGTTACATCATT
TTTTTTTTCCATTTCTCGACCCAAAGGAGACACTTCGCTTTGATATAAATGGAAGGCGCT
CATTTTTATTCGTTACTTTTAGCATTTGTGAGCTTTTTTTTTGAACTATTATCCATGGTT
GGATTTTACTTTTGTTTTT
TT

QA 1 379 1 379
DS 

RD RR2BJ29TF 757 0 0
GGAGGACAGGGGAGGAGAAACTTAAAAGCTCCAGAGAGATTTTCCCCAGATTTCAATTTT
CTACGTGAGTGACGATGGCGCTTCGTGCTACAACTCAAGCGACTGCTCGTATCGCGACGA
ATCTCGGACGTGTAGGTCGGACTTTCTCAACTGACGCGGTGG**GAGTCGGATTACAAGC
GCGGCGAGATCGGTAGTGTCTCCGGAATCCCGGAGGAGCATCTTGCACGAAAGGTGATAA
TATACTCACCAGCAAGAACAGCGACACAGCAAGGATCTGGAAAACTTGGGAAATGGAAGA
TCAATTTCGTCTCCACCCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGATGGACTTCTACAGGTG
ACCCTTATGCCAATGTTGGTGACTCCGCTCTTGGTTTTGATTCTGAGGAAGCTGCTAAGT
CTTTTGCTCAGCGTCATGGCTGGGATTATGTGGTCAAGAGTCCCAAAACACCGTTATTGA
AGGCTAAGTCTTACTCAGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGAT
CGTTACATCATCTTCTTCTTCCATTTCTCGACCCAAAGGAGACACTTCGCTTTGATATAA
ATGGAAGGCGCTCATTTTTATTCGTTACTTTTAGCATCTGTGAGCTTTTTCTCTGAACTA
TTATCCATGGTTGGATTTTACTTTTGTTTTTCTCTATCTTCCCTTATTACTACACAATAA
TATGATGATGATGATGACAAACACACACCTCCTTTGG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2H476TF 768 0 0
G
GGAGAAACTTAAAAGCTCCAGAGAGATTTTCCCCAGATTTCAATTTTCTACGTGAGTGAC
GATGGCGCTTCGTGCTACAACTCAAGCGACTGCTCGTATCGCGACGAATCTCGGACGTGT
AGGTCGGACTTTCTCAACTGACGCGGTGGTGGAGTCGGATTACAAGCGCGGCGAGATCGG
TAGTGTCTCCGGAATCCCGGAGGAGCATCTTGCACGAAAGGTGATAATATACTCACCAGC
AAGAACAGCGACACAGCAAGGATCTGGAAAACTTGGGAAATGGAAGATCAATTTCGTCTC
CACCCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGATGGACTTCTACAGGTGACCCTTATGCCAA
TGTTGGTGACTCCGCTCTTGGTTTTGATTCTGAGGAAGCTGCTAAGTCTTTTGCTCAGCG
TCATGGCTGGGATTATGTGGTCAAGAGTCCCAAAACACCGTTATTGAAGGCTAAGTCTTA
CTCAGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATCGTTACATCATCT
TCTTCTTCCATTTCTCGACCCAAAGGAGACACTTTGCTTTGATATAAATGGAAGGCGCTC
ATTTTTATTCGTTACTTTTAGCATCTGTGAGCTTTTTCTCTGAACTATTATCCATGGTTA
GATTTTACTTTTGTTTTTCTCTATCTTCCCTTATTACTACACAATA*TATGATGATGATG
ATGACAA*CACACACCTCCTTTGGTATTTCATCAAGCTTTTATGG
CT

QA 2 766 2 766
DS 

RD RR2H476JQB 635 0 0
CTCAACTGACGCGGTGGTGGAGTCGGATTACAAGCGCGGCGAGATCGGTAGTGTCTCCGG
AATCCCGGAGGAGCATCTTGCACGAAAGGTGATAATATACTCACCAGCAAGAACAGCGAC
ACAGCAAGGATCTGGAAAACTTGGGAAATGGAAGATCAATTTCGTCTCCACCCTCAAGTG
GGAGAATCCATTGATGGGATGGACTTCTACAGGTGACCCTTATGCCAATGTTGGTGACTC
CGCTCTTGGTTTTGATTCTGAGGAAGCTGCTAAGTCTTTTGCTCAGCGTCATGGCTGGGA
TTATGTGGTCAAGAGTCCCAAAACACCGTTATTGAAGGCTAAGTCTTACTCAGACAACTT
CAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATCGTTACATCATCTTCTTCTTCCATT
TCTCGACCCAAAGGAGACACTTTGCTTTGATATAAATGGAAGGCGCTCATTTTTATTCGT
TACTTTTAGCATCTGTGAGCTTTTTTTTTGAACTATTATCCATGGTTAGATTTTACTTTT
GTTTTTCTCTATCTTCCCTTATTACTACACAATAATATGATGATGATGATGACAAACACA
CACCTCCTTTGGTATTTCATCAAGCTTTTATGGCT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2EE89JQ 357 0 0
TTTGCTCATCGTCATGGCTGGGATTATGTGGTCAAGAGTCCCAAAACACCGTTATTGAAG
GCTAAGTCTTACTCAGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATCG
CTACATCATCTTCTTCTTCCATTTCTCGACCCAAAGGAGACACTTCGCTTTGATATAAAT
GGAAGGCGCTCATTTTTATTCGTTACTTTTAGCATCTGTGAGCTTTTTCTCCGAACTATT
ATCCATGGTTGGATTTTACTTTTGTTTTTCTCTATCTTCCCTTATTACTACACAATAATA
TGATGATGATGATGACAAACACACACCTCCTTTGGTATTTCATCAAGCTTTTATGG
C

QA 1 356 1 356
DS 



CO CL699Contig2 781 2 2 U
GGAGGACAGGAGAGGAAAAACTTAAAAGCTCCAAAGAGATTTTTTTCCCAGATTTCCAAC
TTTCTACGTGACGATGGCGCTTCGTGCTACTACTCAAGCGACTGCTCGTATCGCGGCGAA
TCTCGGACGTGTAGCTCGGCCTTTCTCAAGTGACGCGGTGGTGGAGTCGGATTACAAGCG
CGGTGAGATCGGTAGTGTCTCCGGAATCCCAGAGGAGCATCTTGCACGAAAGGTGATAAT
ATACTCACCAGCTAGAACAGCGACGCAGCAAGGATCTGGAAAACTTGGGAAATGGAAGAT
CAATTTCGTCTCCACCCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGATGGACTTCTACAGGTGA
CCCTTATGCCAATGTTGGTGACTCCGCTCTTGGTTTCGATTCTGAGGAAGCTGCTAAGTC
TTTTGCTCAGCGTCATGGCTGGGATTATGTGGTCAAGGAGCCCAAAACACCGTTGTTGAA
GGCTAAGTCTTACTCTGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATC
AGTGCATCATCTTCGTCCATCTCTCGACCAAAAGGAGACACTTCGCTTTGAAGGCTCTCA
TTTTTATTCGTCATTTTAGCATCTGTGAGCTTTTTCACTGAACTATATCCATGGTTGGAT
TTTTACTTTTTTTTTTCTATTTTCCCTTATTACTACTACACAATAATATGATGATGATGA
TGATGACAAACACACCTCCTTGGGTATTTCATCAAGCTTTTATGGTTAATTTTACTTGAT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2DP86TF U 1
AF RR2DP86JQ C 126
BS 1 753 RR2DP86TF
BS 754 781 RR2DP86JQ

RD RR2DP86TF 753 0 0
GGAGGACAGGAGAGGAAAAACTTAAAAGCTCCAAAGAGATTTTTTTCCCAGATTTCCAAC
TTTCTACGTGACGATGGCGCTTCGTGCTACTACTCAAGCGACTGCTCGTATCGCGGCGAA
TCTCGGACGTGTAGCTCGGCCTTTCTCAAGTGACGCGGTGGTGGAGTCGGATTACAAGCG
CGGTGAGATCGGTAGTGTCTCCGGAATCCCAGAGGAGCATCTTGCACGAAAGGTGATAAT
ATACTCACCAGCTAGAACAGCGACGCAGCAAGGATCTGGAAAACTTGGGAAATGGAAGAT
CAATTTCGTCTCCACCCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGATGGACTTCTACAGGTGA
CCCTTATGCCAATGTTGGTGACTCCGCTCTTGGTTTCGATTCTGAGGAAGCTGCTAAGTC
TTTTGCTCAGCGTCATGGCTGGGATTATGTGGTCAAGGAGCCCAAAACACCGTTGTTGAA
GGCTAAGTCTTACTCTGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATC
AGTGCATCATCTTCGTCCATCTCTCGACCAAAAGGAGACACTTCGCTTTGAAGGCTCTCA
TTTTTATTCGTCATTTTAGCATCTGTGAGCTTTTTCACTGAACTATATCCATGGTTGGAT
TTTTACTTTTTTTTTTCTATTTTCCCTTATTACTACTACACAATAATATGATGATGATGA
TGATGACAAACACACCTCCTTGGGTATTTCATC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2DP86JQ 656 0 0
GACGTGTAGCTCGGCCTTTCTCAAGTGACGCGGTGGTGGAGTCGGATTACAAGCGCGGTG
AGATCGGTAGTGTCTCCGGAATCCCAGAGGAGCATCTTGCACGAAAGGTGATAATATACT
CACCAGCTAGAACAGCGACGCAGCAAGGATCTGGAAAACTTGGGAAATGGAAGATCAATT
TCGTCTCCACCCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGATGGACTTCTACAGGTGACCCTT
ATGCCAATGTTGGTGACTCCGCTCTTGGTTTCGATTCTGAGGAAGCTGCTAAGTCTTTTG
CTCAGCGTCATGGCTGGGATTATGTGGTCAAGGAGCCCAAAACACCGTTGTTGAAGGCTA
AGTCTTACTCTGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATCAGTGC
ATCATCTTCGTCCATCTCTCGACCAAAAGGAGACACTTCGCTTTGAAGGCTCTCATTTTT
ATTCGTCATTTTAGCATCTGTGAGCTTTTTCACTGAACTATATCCATGGTTGGATTTTTA
CTTTTTTTTTTCTATTTTCCCTTATTACTACTACACAATAATATGATGATGATGATGATG
ACAAACACACCTCCTTGGGTATTTCATCAAGCTTTTATGGTTAATTTTACTTGATC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 8

CO CL700Contig1 761 8 3 U
GGGCGCCACCACTAAACCCGACTCTAGCTCTCACTATCTCT**CTCTCTCCGCGACATTT
CACGGTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAAC
AACTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAATTCAGCAAAGAG
AAGAACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACA
GTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAG
AAGCAGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGG
ATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAA
TTCGCTCTTGCAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCC
AAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTT*CTTTTGGAAGTTA
AAAAGATTTTGCTGAACATGTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATTACACTATGC
TCCTTTTCAAAAGGAGTTAAGTTTTTCTTATGCTTATGTTTCATGTGTGTTTTGTTGGAT
CTATTTTATCAAATCAAGAAATTGATAAAACCTCTGTTAGTCTTGTCCAACGAACATGCC
TGTGTCTATGCAGTTGAAAATAATGAGAATACTTGTTTGCG


BQ
10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 20 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP45TF U 5
AF RR2FR20JQ C 1
AF RR2EP45JQ C 55
AF RR2CP17TF U 1
AF RR2E319TF U 446
AF RR2ET43TF U 3
AF RR2DA66TF U 1
AF RR2DA66JQ C 23
BS 1 683 RR2CP17TF
BS 684 735 RR2DA66TF
BS 736 761 RR2DA66JQ

RD RR2EP45TF 597 0 0
GCCACCATTAAATCCGAGTCTAGCTCTCACTACCTCTGTCTCTCTCCGCGAAATTTCACG
GTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACAACT
GTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGAAGAGGCAACGCTAAGGTTCAATTCAGCAAAGAGAAGA
ACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGA
CCATCCAGCCAGCTGACAAGGGAGAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGC
AGAACAAGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGGATGT
CCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCG
CTCTTGCAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGC
AAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTTCTTTTGGAAGTTAAAAA
GATTTTGCTGAACATGTTTTATCTATGATTTGTTTTGTTGAATCGTTACACTAT
TTT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2FR20JQ 588 0 0
GGGC
GCCACCACTAAACCCGACTCTAGCTCTCACTATCTCT**CTCTTTCCGCGACATTTCACG
GTTTGGAAATGGCGACAGTTTCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACAACT
GTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAATTCAGCAAAGAGAAGA
ACAATTTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGA
CCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGC
AGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGGATGT
CCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCG
CTCTTGCAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGC
AAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTT*CTTTTGGAAGTTAAAAA
GATTTTGCTGAACATGTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATC

QA 5 588 5 588
DS 

RD RR2EP45JQ 579 0 0
AA
ATTTCACGGTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGAC
CAACAACTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGAAGAGGCAACGCTAAGGTTCAATTCAGCAA
AGAGAAGAACAATTTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAA
GACAGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGGAGAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGAC
CAAGAAGCAGAACAAGCCTAAGGTTTCTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCC
CAGGATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAA
GAAATTCGCTCTTGCAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGG
TGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTTCTTTTGGAA
GTTAAAAAGATTTTGCTGAACATGTTTTATTTATGATTTGTTTTGTTGAATCGTTACACT
ATTTTCCTTTTCAAAAGGAGC*AAGTTTTTCTTATGC

QA 3 579 3 579
DS 

RD RR2CP17TF 683 0 0
GGGCGCCACCACTAAACCCGACTCTAGCTCTCACTATCTCT**CTCTCTCCGCGACATTT
CACGGTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAAC
AACTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAATTCAGCAAAGAG
AAGAACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACA
GTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAG
AAGCAGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGG
ATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAA
TTCGCTCTTGCAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCC
AAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTT*CTTTTGGAAGTTA
AAAAGATTTTGCTGAACATGTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATTACACTATGC
TCCTTTTCAAAAGGAGTTAAGTTTTTCTTATGCTTATGTTTCATGTGTGTTTTGTTGGAT
CTATTTTATCAAATCAAGAAATT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2E319TF 241 0 0
G
CAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGC
TTTTTCCAGAATATGTTCTT*CTTTTGGAAGTTAAAAAGATTTTGCTGAACATGTTTTAT
CTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATTACACTATGCTCCTTTTCAAAAGGAGTTAAGTTTTT
CTTATGCTTATGTTTCATGTGTGTTTTGTTGGATCTATTTTATCAAATCAAGAAATTG
AT

QA 2 239 2 239
DS 

RD RR2ET43TF 682 0 0
GG
GCCACCACTAAACCCGACTCTAGCTCTCACTATCTCT**CTCTCTCCGCGACATTTCACG
GTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACAACT
GTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAATTCAGCAAAGAGAAGA
ACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGA
CCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGC
AGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGGATGT
CCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCG
CTCTTGCAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGC
AAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTT*CTTTTGGAAGTTAAAAA
GATTTTGCTGAACATGTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATTACACTATGCTCCT
TTTCAAAAGGAGTTAAGTTTTTCTTATGCTTATGTTTCATGTGTGTTTTGTTGGATCTAT
TTTATCAAGTCAAGAAATTG

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR2DA66TF 735 0 0
CGGC
GCCACCACTAAACCCGACTCTAGCTCTCACTATCTCT**CTCTCTCCGCGACATTTCACG
GTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACAACT
GTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAATTCAGCAAAGAGAAGA
GCAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGA
CCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGC
AGAACAAGCCTAAGGTGTCTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGGATGT
CCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCG
CTCTTGCAAGACTCGGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGC
AAAAAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTT*CTTTTGGAAGTTAAAAA
GATTTTGCTGAACATGTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATTACACTATGCTCCT
TTTCAAAAGGAGTTAAGTTTTTCTTATGCTTATGTTTCATGTGTGTTTTGTTGGATCTAT
TTTATCAAATCAAGAAATTGATAAAACCTCTGTTAGTCTTGTCCAACGAACATGCCTGTG
TCTATGCAGTT

QA 5 735 5 735
DS 

RD RR2DA66JQ 739 0 0
TCTAGCTCTCACTATCTCT**CTCTCTCCGCGACATTTCACGGTTTGGAAATGGCGACAG
TTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACAACTGTTTCTTGGTCAAACAGT
TCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAATTCAGCAAAGAGAAGAGCAATCTCTGCAACCTTA
ACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGACCATCCAGCCAGCTGACA
AGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAGCCTAAGGTGT
CTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGGATGTCCAAGGCTGTTGCTAACC
AGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCTCTTGCAAGACTCGGTG
TCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAAAAACCGTCAAGCTT
AAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTT*CTTTTGGAAGTTAAAAAGATTTTGCTGAACATGTT
TTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATTACACTATGCTCCTTTTCAAAAGGAGTTAAGT
TTTTCTTATGCTTATGTTTCATGTGTGTTTTGTTGGATCTATTTTATCAAATCAAGAAAT
TGATAAAACCTCTGTTAGTCTTGTCCAACGAACATGCCTGTGTCTATGCAGTTGAAAATA
ATGAGAATACTTGTTTGCG

QA 1 739 1 739
DS 



AS 3 7

CO CL701Contig1 836 3 5 U
CATTCATCTAGTAGAGATATTCTTATTTCTTTCTTTGGTACGTGAAAAGCATGAAACAAA
AACTAAATCGACAATGTATAGAAGAACTAAACAGAAATAACAACAGACATAAAAAAAAGT
CCACAAAACACCGACTCTACAGACTGTATCAGTTTATATATAGAGAGTCTGTCGACTCCT
ATACACTCTCAGGGCTTTGCCTTTTAAGCTGAAGCAACGAACGAGCTCAAGATATTTCTC
TTGAGAGTTAATTCATCAGCTTTCACCGGACTTATCGACTTGCCAAGGACGCGTCCAAGC
CGCTCGACTTCTTTTGTAGCATAGCCTGAACCTTTTTCTATATAGCTCTTTGCGAGTTTC
GAGTAAAGCTTCCCATACCTTGTTGTGGACCCCTTAAGGTTACTAGCTTCCTCTTCGATG
CGAGACAAGATTGCCTTCTTCTCATCTTCACTGGCTGCAACTAGCTCCTTTACCAATGCA
TCTAAGCTTTCAACTATACCAGCCTTTGAAGTAAGCTGCCCTTGACTGTCTCTGCTGGTC
CCAACTTTCTCATTAATGAAGCTTACAAAGTCATCCAAGTCTCTTCCACCCTCATAATCT
TGACCGGCTTTGTTGTCTTTTGGGAAGAACTTTAGTGTTGGGAATCCACTTACTCCATAC
TTCTCGCCGAGGCTTTTGTGTGCATCAGCATCCAAGTTGGCAATTACTACACCTTCTTCC
TGCTTAAACACCGTCGCTACCTTCTCATATACAGGAGCGAGGGACTTGCAGTGGCCGCAC
CATGGGGCATAAAATTCGACGAGGACATCTTTGTTCTGATCCAGTACATCTCATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB04TF C 2
AF RR2GB04JQ U 11
AF RR2C107JQ U 1
BS 1 117 RR2C107JQ
BS 118 118 RR2GB04JQ
BS 119 141 RR2C107JQ
BS 142 142 RR2GB04JQ
BS 143 836 RR2C107JQ

RD RR2GB04TF 720 0 0
TTTTTTTTT
GTAGAGATAT*CTTATTTCTTTCTTTGGTACGTGAAAAGCATGAAACAAAAACTAAATCG
ACAATGTATAGAAGAACTAAACAGAAATAACAACAGACATAAAAAAAAGTCCACAAAACA
CCGACTCTACAGACTGTATCAGTTTATATATAGAGAGTCTGTCGACTCCTATACACTCTC
AGGGCTTTGCCTTTTAAGCTGAAGCAACGAACGAGCTCAAGATATTTCTCTTGAGAGTTA
ATTCATCAGCTTTCACCGGACTTATCGACTTGCCAAGGACGCGTCCAAGCCGCTCGACTT
CTTTTGTAGCATAGCCTGAACCTTTTTCTATATAGCTCTTTGCGAGTTTCGAGTAAAGCT
TCCCATACCTTGTTGTGGACCCCTTAAGGTTACTAGCTTCCTCTTCGATGCGAGACAAGA
TTGCCTTCTTCTCATCTTCACTGGCTGCAACTAGCTCCTTTACCAATGCATCTAAGCTTT
CAACTATACCAGCCTTTGAAGTAAGCTGCCCTTGACTGTCTCTGCTGGTCCCAACTTTCT
CATTAATGAAGCTTACAAAGTCATCCAAGTCTCTTCCACCCTCATAATCTTGACCGGCTT
TGTTGTCTTTTGGGAAGAACTTTAGTGTTGGGAATCCACTTACTCCATACTTCTCGCCGA
GGCTTTTGTGTGCATCAGCATCCAAGTTGGCAATTACTACACCTTCTTCC
C

QA 10 719 10 719
DS 

RD RR2GB04JQ 707 0 0
GTAGAGATATTCTTATTTCTTTCTTTGGTACGTGAAAAGCATGAAACAAAAACTAAATCG
ACAATGTATAGAAGAACTAAACAGAAATAACAACAGACATAAAAAAAAGTCCACAAAACA
CCGACTCTACAGACTGTATCAGTTTATATATAGAGAGTCTGTCGACTCCTATACACTCTC
AGGGCTTTGCCTTTTAAGCTGAAGCAACGAACGAGCTCAAGATATTTCTCTTGAGAGTTA
ATTCATCAGCTTTCACCGGACTTATCGACTTGCCAAGGACGCGTCCAAGCCGCTCGACTT
CTTTTGTAGCATAGCCTGAACCTTTTTCTATATAGCTCTTTGCGAGTTTCGAGTAAAGCT
TCCCATACCTTGTTGTGGACCCCTTAAGGTTACTAGCTTCCTCTTCGATGCGAGACAAGA
TTGCCTTCTTCTCATCTTCACTGGCTGCAACTAGCTCCTTTACCAATGCATCTAAGCTTT
CAACTATACCAGCCTTTGAAGTAAGCTGCCCTTGACTGTCTCTGCTGGTCCCAACTTTCT
CATTAATGAAGCTTACAAAGTCATCCAAGTCTCTTCCACCCTCATAATCTTGACCGGCTT
TGTTGTCTTTTGGGAAGAACTTTAGTGTTGGGAATCCACTTACTCCATACTTCTCGCCGA
GGCTTTTGTGTGCATCAGCATCCAAGTTGGCAATTACTACACCTTCT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2C107JQ 836 0 0
CATTCATCTAGTAGAGATATTCTTATTTCTTTCTTTGGTACGTGAAAAGCATGAAACAAA
AACTAAATCGACAATGTATAGAAGAACTAAACAGAAATAACAACAGACATAAAAAAA*GT
CCACAAAACACCGACTCTACAAACTGTATCAGTTTATATATAGAGAGTCTGTCGACTCCT
ATACACTCTCAGGGCTTTGCCTTTTAAGCTGAAGCAACGAACGAGCTCAAGATATTTCTC
TTGAGAGTTAATTCATCAGCTTTCACCGGACTTATCGACTTGCCAAGGACGCGTCCAAGC
CGCTCGACTTCTTTTGTAGCATAGCCTGAACCTTTTTCTATATAGCTCTTTGCGAGTTTC
GAGTAAAGCTTCCCATACCTTGTTGTGGACCCCTTAAGGTTACTAGCTTCCTCTTCGATG
CGAGACAAGATTGCCTTCTTCTCATCTTCACTGGCTGCAACTAGCTCCTTTACCAATGCA
TCTAAGCTTTCAACTATACCAGCCTTTGAAGTAAGCTGCCCTTGACTGTCTCTGCTGGTC
CCAACTTTCTCATTAATGAAGCTTACAAAGTCATCCAAGTCTCTTCCACCCTCATAATCT
TGACCGGCTTTGTTGTCTTTTGGGAAGAACTTTAGTGTTGGGAATCCACTTACTCCATAC
TTCTCGCCGAGGCTTTTGTGTGCATCAGCATCCAAGTTGGCAATTACTACACCTTCTTCC
TGCTTAAACACCGTCGCTACCTTCTCATATACAGGAGCGAGGGACTTGCAGTGGCCGCAC
CATGGGGCATAAAATTCGACGAGGACATCTTTGTTCTGATCCAGTACATCTCATCG

QA 1 836 1 836
DS 



CO CL701Contig2 710 2 4 U
GGAACAAGAGAAGAGAGAGCAAAAAAACTACACACTTTGTACCAAAATACTGTAAGTATC
TCAAAAAATGGGGAAATCTCAGATCTGGTATGGTGTAGCGTTAGTGGCGTTGGTAGTGGT
GTCAGCCGTAGCAGACGATGTGGTTGTGTTGACGGAAGAGAGCTTTGAGAAGGAGGTTGG
TAAAGATAAAGGAGCTCTCGTCGAGTTTTACGCTCCCTGGCGTGGGCACTGCAAGAAACT
AGCTCCAGAGTATGAAAAGCTTGCTGCCAGCTTCAAGAAGGCCAAGTCTGTCTTGATTGC
TAAGGTCGATTGTGATGAACATAAGACCGTCTGCACTAAGTATGATGTTAGTGGATATCC
CACCATTAAATGGTTTCCTAAAGGCTCTCTTGAACCTCAAAAGTACGAGGGTGCACGCAA
TGCTGAAGCTTTGGCTGAATTTGTCAACAAGGAAGGAGGTACCAACGTCAAATTAGCTGC
AGTTCCACAAAATGTAGTCGTGTTAACACCTGATAACTTCGACGCGATTGTGCTGGATCA
GAACAAAGATGTCTTGGTCGAGTTTTATGCCCCTTGGTGCGGCCACTGCAAGTCCCTCGC
TCCTACATACGAAAAGGTAGCAACGGTGTTTAAGCAGAAGAAGTGTAGTCATTGCCAACT
TGGATGCTGATGCACACAAAAGCCTTGGCGAGAAGTATGGAGTAAGTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC89TF U 1
AF RR2CO40TF U 28
BS 1 134 RR2DC89TF
BS 135 135 RR2CO40TF
BS 136 633 RR2DC89TF
BS 634 710 RR2CO40TF

RD RR2DC89TF 633 0 0
GGAACAAGAGAAGAGAGAGCAAAAAAACTACACACTTTGTACCAAAATACTGTAAGTATC
TCAAAAAATGGGGAAATCTCAGATCTGGTATGGTGTAGCGTTAGTGGCGTTGGTAGTGGT
GTCAGCCGTAGCAGGCGATGTGGTTGTGTTGACGGAAGAGAGCTTTGAGAAGGAGGTTGG
TAAAGATAAAGGAGCTCTCGTCGAGTTTTACGCTCCCTGGCGTGGGCACTGCAAGAAACT
AGCTCCAGAGTATGAAAAGCTTGCTGCCAGCTTCAAGAAGGCCAAGTCTGTCTTGATTGC
TAAGGTCGATTGTGATGAACATAAGACCGTCTGCACTAAGTATGATGTTAGTGGATATCC
CACCATTAAATGGTTTCCTAAAGGCTCTCTTGAACCTCAAAAGTACGAGGGTGCACGCAA
TGCTGAAGCTTTGGCTGAATTTGTCAACAAGGAAGGAGGTACCAACGTCAAATTAGCTGC
AGTTCCACAAAATGTAGTCGTGTTAACACCTGATAACTTCGACGCGATTGTGCTGGATCA
GAACAAAGATGTCTTGGTCGAGTTTTATGCCCCTTGGTGCGGCCACTGCAAGTCCCTCGC
TCCTACATACGAAAAGGTAGCAACGGTGTTTAA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2CO40TF 683 0 0
GG
ACACACTTTGTACCAAAATACTGTAAGTATCTCAAAAAATGGGGAAATCTCAGATCTGGT
ATGGTGTAGCGTTAGTGGCGTTGGTAGTGGTGTCAGCCGTAGCAGACGATGTGGTTGTGT
TGACGGAAGAGAGCTTTGAGAAGGAGGTTGGTAAAGATAAAGGAGTTCTCGTCGAGTTTT
ACGCTCCCTGGTGTGGGCACTGCAAGAAACTAGCTCCAGAGTATGAAAAGCTTGCTGCCA
GCTTCAAGAAGGCCAAGTCTGTCTTGATTGCTAAGGTCGATTGTGATGAACATAAGACCG
TCTGCACTAAGTATGATGTTAGTGGATATCCCACCATTAAATGGTTTCCTAAAGGCTCTC
TTGAACCTCAAAAGTACGAGGGTGCACGCAATGCTGAAGCTTTGGCTGAATTTGTCAACA
AGGAAGGAGGTACCAACGTCAAATTAGCTGCAGTTCCACAAAATGTAGTCGTGTTAACAC
CTGATAACTTCGATGCGATTGTGCTGGATCAGAACAAAGATGTCTTGGTCGAGTTTTATG
CCCCTTGGTGCGGCCACTGCAAGTCCCTCGCTCCTACATACGAAAAGGTAGCAACGGTGT
TTAAGCAGAAGAAGTGTAGTCATTGCCAACTTGGATGCTGATGCACACAAAAGCCTTGGC
GAGAAGTATGGAGTAAGTGGA

QA 3 683 3 683
DS 



CO CL701Contig3 1110 2 10 U
CATCTAGTAGAGATATTCTTATTTCTTTCTTTTGTAGGTGAAAAGCCTGAAACTGGATCC
ATATAAAACAAAAACTAAATCGATAATGTATAGAGGAACTAAACAGAAATAACAACAGAC
ATAAAAAAAGTCCACAAAACACCGACTCTACAAACTGTATCAGTTTAATATAGAGAGTCT
GTCGACTCCTATACACTCTCAGGGCTTTGCCTTTTAAGCTGAAGCAACGAACGTGGTCAA
GATATTTCTCTTGAGAGTTAATTCATCAGCTTTCACTGGATTTATCGACTTGCCAAGGAC
GCGTCCAAGCCGCTCGACTTCTTTTGTAGCATAGCCTGAACCTTTTTCTATATAGCTCTT
TGCGAGTTTCGAGTAAAGCTTCCCATACCTTGTTGTGGACCCCTTAAGGTTACTAGCTTC
CTCTTCGATGCGAGACAAGATTGCCTTTTTCTCATCTTCACTGGCTGCAACTAGCTCCTT
TACCAACGCATCTAAGCTTTCAACTATACCAGCCTTTGAAGTAAGCTGCCCTTGACTGTC
TCTGATGGTCCCAACTTTCTCATTAATGAAGCTTACAAAGTCATCTAAGTCTCTTCCACC
CTCATAATCTTGACCGGCTTTGTTGTCTTTTGGGAAGAACTTTAGTGTTGGGAATCCACT
TACTCCCATACTTCTCGCCGAGGCTTTTGTGTGCATCAGCATCTAAGTTGGCAATTACTA
CACCTTCTTCCTGCTTAAACACCGTCGCTACCTTCTCATATACAGGAGCGAGGGACTTGC
AGTGGCCGCACCATGGGGCATAAAACTCGACGAGGACATCTTTGTTGACATATTCAGCCA
ATGCTTCAGCATTGCGTGCACCTTCATACTTTTGGGGTTCAAGAGAGCCTTTAGGAAACC
ACTGAATGGTGGGATAACCACTAACACCATATTTAGTGCAGACGCTCTTATGCTCATCAC
AATCTACCTTTGCAATCAAGACAGACTTAGCTTTCTTGAAGCTTGCCCCAAGCTTTTCAT
ACTCTGGAGCAAGTTTCTTGCAGTGACCACACCAGGGAGCGTAAAACTCGACAAGAGCTC
CTTTATCTTTACCAACCTCCTTCTCGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC66JQ U 1
AF RR2DH41TF C 446
BS 1 469 RR2GC66JQ
BS 470 470 RR2DH41TF
BS 471 518 RR2GC66JQ
BS 519 519 RR2DH41TF
BS 520 544 RR2GC66JQ
BS 545 545 RR2DH41TF
BS 546 666 RR2GC66JQ
BS 667 667 RR2DH41TF
BS 668 826 RR2GC66JQ
BS 827 1110 RR2DH41TF

RD RR2GC66JQ 826 0 0
CATCTAGTAGAGATATTCTTATTTCTTTCTTTTGTAGGTGAAAAGCCTGAAACTGGATCC
ATATAAAACAAAAACTAAATCGATAATGTATAGAGGAACTAAACAGAAATAACAACAGAC
ATAAAAAAAGTCCACAAAACACCGACTCTACAAACTGTATCAGTTTAATATAGAGAGTCT
GTCGACTCCTATACACTCTCAGGGCTTTGCCTTTTAAGCTGAAGCAACGAACGTGGTCAA
GATATTTCTCTTGAGAGTTAATTCATCAGCTTTCACTGGATTTATCGACTTGCCAAGGAC
GCGTCCAAGCCGCTCGACTTCTTTTGTAGCATAGCCTGAACCTTTTTCTATATAGCTCTT
TGCGAGTTTCGAGTAAAGCTTCCCATACCTTGTTGTGGACCCCTTAAGGTTACTAGCTTC
CTCTTCGATGCGAGACAAGATTGCCTTTTTCTCATCTTCACTGGCTGCATCTAGCTCCTT
TACCAACGCATCTAAGCTTTCAACTATACCAGCCTTTGGAGTAAGCTGCCCTTGACTGTC
TCTGCTGGTCCCAACTTTCTCATTAATGAAGCTTACAAAGTCATCTAAGTCTCTTCCACC
CTCATAATCTTGACCGGCTTTGTTGTCTTTTGGGAAGAACTTTAGTGTTGGGAATCCACT
TACTCC*ATACTTCTCGCCGAGGCTTTTGTGTGCATCAGCATCTAAGTTGGCAATTACTA
CACCTTCTTCCTGCTTAAACACCGTCGCTACCTTCTCATATACAGGAGCGAGGGACTTGC
AGTGGCCGCACCATGGGGCATAAAACTCGACGAGGACATCTTTGTT

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2DH41TF 665 0 0
CTT
TTCTCATCTTCACTGGCTGCAACTAGCTCCTTTACCAACGCATCTAAGCTTTCAACTATA
CCAGC*TTTGAAGTAAGCTGCCCTTGACTGTCTCTGATG*TCCCAACTTTCTCATTAATG
AAGCTTACAAAGTCATCTAAGTCTCTTCCACCCTCATAATCTTGACCGGCTTTGTTGTCT
TTTGGGAAGAACTTTAGTGTTGGGAATCCACTTACTCCCATACTTCTCGCCGAGGCTTTT
GTGTGCATCAGCATCTAAGTTGGCAATTACTACACCTTCTTCCTGCTTAAACACCGTCGC
TACCTTCTCATATACAGGAGCGAGGGACTTGCAGTGGCCGCACCATGGGGCATAAAACTC
GACGAGGACATCTTTGTTGACATATTCAGCCAATGCTTCAGCATTGCGTGCACCTTCATA
CTTTTGGGGTTCAAGAGAGCCTTTAGGAAACCACTGAATGGTGGGATAACCACTAACACC
ATATTTAGTGCAGACGCTCTTATGCTCATCACAATCTACCTTTGCAATCAAGACAGACTT
AGCTTTCTTGAAGCTTGCCCCAAGCTTTTCATACTCTGGAGCAAGTTTCTTGCAGTGACC
ACACCAGGGAGCGTAAAACTCGACAAGAGCTCCTTTATCTTTACCAACCTCCTTCTCGAA
GC

QA 4 665 4 665
DS 



AS 1 9

CO CL702Contig1 802 9 26 U
GGGGGTGAATGAGAATAAACTCCCTTATGAATCCCTAGAGCACTCATTTAGCAAAAATCG
AATCGGAATCTCAGTGA*****CAGAGAGTCAAATTCGACCGAGCAAAGATGACGGAGGC
GATGATAAGGAAGAAGGCAGGGATGGCGAGCGTGAAGGACATGCCTCTGCTTCAAGATGG
TCCGCCACCGGGTGGATTCGCGCCGGTTCGATATGCTCGCCGGATATCCAATACGGGTCC
TAGCGCGATGGCTATTTTCCTTACCGTTTCTGGTGCATTTGCTTGGGGGATGTACCAGGT
CGGCCAGGGTAACAAGATCCGCAGGGCGTTGAAGGAAGAGAAATATGCTGCTCGTAGAGC
TATACTTCCCATTCTTCAAGCTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTCCGAGTGGAAAAAGTA
TCTGGACTACGAGGCAGATGTAATGAAGGATGTTCCGGGATGGAAAGTTGGCGAGAACGT
TTATAATTCTGGTCGTTGGATGCCACCGGCGACTGGGGAACTCCGTCCTGATGTCTGGTG
ATG*TCTTCTCAGTTTCTCACAAATGCATTTGATGA****TGATGGTGATGAATGAATGA
ATTGTTTCAGTGAGGGTTAATAACATGTTTTTGTTTTATCTTTTTCACTGGGTAATAAGA
AGAAGAATGATTCAACAGACAGTTGCTCTTGTACTGGTTTTGCTGGAAATTTAATCGTTG
TGTGTGTTTGTTTATGTAATTGTTCCAATGGTAAAATGAGACAAAAAAACAGCTTTTATC
AACAATCATTCAAGATTGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 0 0 0 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2H529TF U 44
AF RR2EA69TF U 58
AF RR2H237TF U 1
AF RR2H237JQ C 39
AF RR2EA69JQ C 58
AF RR2EE29TF U 74
AF RR2D364TF U 138
AF RR2H529JQB C 219
AF RR2D364JQ C 523
BS 1 82 RR2H237TF
BS 83 86 RR2EA69TF
BS 87 405 RR2H237TF
BS 406 406 RR2H529TF
BS 407 462 RR2H237TF
BS 463 463 RR2EA69TF
BS 464 542 RR2H237TF
BS 543 544 RR2EA69TF
BS 545 576 RR2H237TF
BS 577 580 RR2EA69TF
BS 581 595 RR2H237TF
BS 596 596 RR2EA69TF
BS 597 629 RR2H237TF
BS 630 630 RR2EA69TF
BS 631 680 RR2H237TF
BS 681 682 RR2EE29TF
BS 683 702 RR2H237TF
BS 703 703 RR2EE29TF
BS 704 708 RR2H237TF
BS 709 709 RR2EE29TF
BS 710 733 RR2H237TF
BS 734 742 RR2EE29TF
BS 743 743 RR2D364TF
BS 744 768 RR2EE29TF
BS 769 769 RR2H237JQ
BS 770 802 RR2D364TF

RD RR2H529TF 374 0 0
GG
ATTTAGCAAAAATCGAATCGGAATCTCAG**A*********GAGTCAAATTCGACCGAGC
AAAGATGACGGAGGCGATGATAAGGAAGAAGGCAGGGATGGCGAGCGTGAAGGACATGCC
TCTGCTTCAAGATGGTCCGCCACCGGGTGGATTCGCGCCAGTTCGATATGCTCGCCGGAT
ATCCAATACGGGTCCTAGCGCGATGGCTATTTTCCTTACCGTTTCTGGTGCATTTGCTTG
GGGGATGTACCAGGTCGGCCAGGGTAACAAGATCCGCAGGGCGTTGAAGGAAGAGAAATA
TGCTGCTCGTAGAGCTATACTTCCCATTCTTCAAGCTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTC
CGAGTGGAAAAA

QA 3 374 3 374
DS 

RD RR2EA69TF 602 0 0
GGGAATCGGAATCTCAGTGATCGACCAGAGAGTCAAATTCGACCGAGCAAAGATGACGGA
GGCGATGATAAGGAAGAAGGCAGGGATGGCGAGCGTGAAGGACATGCCTCTGCTTCAAGA
TGGTCCGCCACCGGGTGGATTCGCGCCGGTTCGATATGCTCGCCGGATATCCAATACGGG
TCCTAGCGCGATGGCTATTTTCCTTACCGTTTCTGGTGCATTTGCTTGGGGGATGTACCA
GGTCGGCCAGGGTAACAAGATCCGCAGGGCGTTGAAGGAAGAGAAATATGCTGCTCGTAG
AGCTATACTTCCCATTCTTCAAGCTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTCCGAGTGGAAAAA
GTATCTGGACTACGAGGCAGATGTAATGAAGGATGTTCCGGGATGGAAAGTTGGCGAGAA
CGTTTATAATTCTGGTCGTTGGATGCCACCGGCGACTGGGGAACTCCTTCCTGATGTCTG
GTGATG*TCTTCTCAGTTTCTCACAAATGCATTTGATGA****TGATGGTGATGAATGAA
TGAATTGTTTCAGTGAGGGTTAATAACATGTTTTTGTTTTATCTTTTTCACTGGGTAATA
AG

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2H237TF 733 0 0
GGGGGTGAATGAGAATAAACTCCCTTATGAATCCCTAGAGCACTCATTTAGCAAAAATCG
AATCGGAATCTCAGTGA*********GAGTCAAATTCGACCGAGCAAAGATGACGGAGGC
GATGATAAGGAAGAAGGCAGGGATGGCGAGCGTGAAGGACATGCCTCTGCTTCAAGATGG
TCCGCCACCGGGTGGATTCGCGCCGGTTCGATATGCTCGCCGGATATCCAATACGGGTCC
TAGCGCGATGGCTATTTTCCTTACCGTTTCTGGTGCATTTGCTTGGGGGATGTACCAGGT
CGGCCAGGGTAACAAGATCCGCAGGGCGTTGAAGGAAGAGAAATATGCTGCTCGTAGAGC
TATACTTCCCATTCTTCAAGCTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTCTGAGTGGAAAAAGTA
TCTGGACTACGAGGCAGATGTAATGAAGGATGTTCCGGGATG*AAAGTTGGCGAGAACGT
TTATAATTCTGGTCGTTGGATGCCACCGGCGACTGGGGAACTCCGTCCTGATGTCTGGTG
ATCCTCTTCTCAGTTTCTCACAAATGCATTTGATGAATGATGATGGTGATGAATGGATGA
ATTGTTTCAGTGAGGGTTAATAACATGTTCTTGTTTTATCTTTTTCACTGGGTAATAAGA
AGAAGAATGATTCAACAGACG*TTGCTCTTGTACTGGTTTTGATGGAACTTTAATCGTTG
TGTGTGTTTGTTT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2H237JQ 742 0 0
AGCACTC
ATTTAGCAAAAATCGAATCGGAATCTCAGTGA*********GAGTCAAATTCGACCGAGC
AAAGATGACGGAGGCGATGATAAGGAAGAAGGCAGGGATGGCGAGCGTGAAGGACATGCC
TCTGCTTCAAGATGGTCCGCCACCGGGTGGATTCGCGCCGGTTCGATATGCTCGCCGGAT
ATCCAATACGGGTCCTAGCGCGATGGCTATTTTCCTTACCGTTTCTGGTGCATTTGCTTG
GGGGATGTACCAGGTCGGCCAGGGTAACAAGATCCGCAGGGCGTTGAAGGAAGAGAAATA
TGCTGCTCGTAGAGCTATACTTCCCATTCTTCAAGCTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTC
TGAGTGGAAAAAGTATCTGGACTACGAGGCAGATGTAATGAAGGATGTTCCGGGATG*AA
AGTTGGCGAGAACGTTTATAATTCTGGTCGTTGGATGCCACCGGCGACTGGGGAACTCCG
TCCTGATGTCTGGTGATCCTCTTCTCAGTTTCTCACAAATGCATTTGATGAATGATGATG
GTGATGAATGGATGAATTGTTTCAGTGAGGGTTAATAACATGTTCTTGTTTTATCTTTTT
CACTGGGTAATAAGAAGAAGAATGATTCAACAGACGGTTGCTCTTGTACTGGTTTTGATG
GAACTTTAATCGTTGTGTGTGTTTGTTTATGTAATTGTTCCAATGGTAAAATGAGACAAA
AAAACAGCTTTTATC

QA 8 742 8 742
DS 

RD RR2EA69JQ 723 0 0
GGGAATCGGAATCTCAGTGATCGACCAGAGAGTCAAATTCGACCGAGCAAAGATGACGGA
GGCGATGATAAGGAAGAAGGCAGGGATGGCGAGCGTGAAGGACATGCCTCTGCTTCAAGA
TGGTCCGCCACCGGGTGGATTCGCGCCGGTTCGATATGCTCGCCGGATATCCAATACGGG
TCCTAGCGCGATGGCTATTTTCCTTACCGTTTCTGGTGCATTTGCTTGGGGGATGTACCA
GGTCGGCCAGGGTAACAAGATCCGCAGGGCGTTGAAGGAAGAGAAATATGCTGCTCGTAG
AGCTATACTTCCCATTCTTCAAGCTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTCCGAGTGGAAAAA
GTATCTGGACTACGAGGCAGATGTAATGAAGGATGTTCCGGGATGGAAAGTTGGCGAGAA
CGTTTATAATTCTGGTCGTTGGATGCCACCGGCGACTGGGGAACTCCTTCCTGATGTCTG
GTGATG*TCTTCTCAGTTTCTCACAAATGCATTTGATGA****TGATGGTGATGAATGAA
TGAATTGTTTCAGTGAGGGTTAATAACATGTTTTTGTTTTATCTTTTTCACTGGGTAATA
AGAAGAAGAATGATTCAACAGACAGTTGCTCTTGTACTGGTTTTGCTGGAAATTTAATCG
TTGTGTGTGTTTGTTTATGTAATTGTTCCAATGGTAAAATGAGACAAAAAAACAGCTTTT
ATC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2EE29TF 695 0 0
GGGGAATCT
CAGAGAGTCAAATTCGACCGAGCAAAGATGACGGAGGCGATGATAAGGAAGAAGGCAGGG
ATGGCGAGCGTGAAGGACATGCCTCTGCTTCAAGATGGTCCGCCACCGGGTGGATTCGCG
CCGGTTCGATATGCTCGCCGGATATCCAATACGGGTCCTAGCGCGATGGCTATTTTCCTT
ACCGTTTCTGGTGCATTTGCTTGGGGGATGTACCAGGTCGGCCAGGGTAACAAGATCCGC
AGGGCGTTGAAGGAAGAGAAATATGCTGCTCGTAGAGCTATACTTCCCATTCTTCAAGCT
GAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTCCGAGTGGAAAAAGTATCTGGACTACGAGGCAGATGTA
ATGAAGGATGTTCCGGGATGGAAAGTTGGCGAGAACGTTTATAATTCTGGTCGTTGGATG
CCACCGGCGACTGGGGAACTCCGTCCTGATGTCTGGTGATG*TCTTCTCAGTTTCTCACA
AATGCATTTGATGA****TGATGGTGATGAATGAATGAATTGTTTCAGTGAGGGTTAATA
ACATGTTTTTGTTTTATCTTTTTCACTGGGTAATAAGAAGAAGAATGATTCAACAGACAG
TTGCTCTTGTACTGGTTTTGCTGGAAATTTAATCGTTGTGTGTGTTTGTTTATGTAATTG
CTCCAATGGTAAAATGAGACAAAAAA

QA 10 695 10 695
DS 

RD RR2D364TF 665 0 0
CAGGGATGGCGAGCGTGAAGGACATGCCTCTGCTTCAAGATGGTCCGCCACCGGGTGGAT
TCGCGCCGGTTCGATATGCTCGCCGGATATCCAATACGGGTCCTAGCGCGATGGCTATTT
TCCTTACCGTTTCTGGTGCATTTGCTTGGGGGATGTACCAGGTCGGCCAGGGTAACAAGA
TCCGCAGGGCGTTGAAGGAAGAGAAATATGCTGCTCGTAGAGCTATACTTCCCATTCTTC
AAGCTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTCCGAGTGGAAAAAGTATCTGGACTACGAGGCAG
ATGTAATGAAGGATGTTCCGGGATGGAAAGTTGGCGAGAACGTTTATAATTCTGGTCGTT
GGATGCCACCGGCGACTGGGGAACTCCGTCCTGATGTCTGGTGATG*TCTTCTCAGTTTC
TCACAAATGCATTTGATGA****TGATGGTGATGAATGAATGAATTGTTTCAGTGAGGGT
TAATAACATGTTTTTGTTTTATCTTTTTCACTGGGTAATAAGAAGAAGAATGATTCAACA
GACAGTTGCTCTTGTACTGGTTTTGCTGGAAATTTAATCGTTGTGTGTGTTTGTTTATGT
AATTGTTCCAATGGTAAAATGAGACAAAAAA*CAGCTTTTATCAACAATCATTCAAGATT
GGTTT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2H529JQB 584 0 0
GCCGGATATCCAATACGGGTCCTAGCGCGATGGCTATTTTCCTTACCGTTTCTGGTGCAT
TTGCTTGGGGGATGTACCAGGTCGGCCAGGGTAACAAGATCCGCAGGGCGTTGAAGGAAG
AGAAATATGCTGCTCGTAGAGCTATACTTCCCATTCTTCAAGCTGAAGAAGATGAAAGGT
TTGTGTCCGAGTGGAAAAAGTATCTGGACTACGAGGCAGATGTAATGAAGGATGTTCCGG
GATGGAAAGTTGGCGAGAACGTTTATAATTCTGGTCGTTGGATGCCACCGGCGACTGGGG
AACTCCGTCCTGATGTCTGGTGATG*TCTTCTCAGTTTCTCACAAATGCATTTGATGA**
**TGATGGTGATGAATGAATGAATTGTTTCAGTGAGGGTTAATAACATGTTTTTGTTTTA
TCTTTTTCACTGGGTAATAAGAAGAAGAATGATTCAACAGACAGTTGCTCTTGTACTGGT
TTTGCTGGAAATTTAATCGTTGTGTGTGTTTGTTTATGTAATTGTTCCAATGGTAAAATG
ATACAAAAAAACAGCTTTTATCAACAATCATTCAAGATTGGTTT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2D364JQ 280 0 0
CCGTCCTGATGTCTGGTGATG*TCTTCTCAGTTTCTCACAAATGCATTTGATGA****TG
ATGGTGATGAATGAATGAATTGTTTCAGTGAGGGTTAATAACATGTTTTTGTTTTATCTT
TTTCACTGGGTAATAAGAAGAAGAATGATTCAACAGACAGTTGCTCTTGTACTGGTTTTG
CTGGAAATTTAATCGTTGTGTGTGTTTGTTTATGTAATTGTTCCAATGGTAAAATGAGAC
AAAAAAACAGCTTTTATCAACAATCATTCAAGATTGGTTT

QA 1 280 1 280
DS 



AS 2 7

CO CL703Contig1 772 2 4 U
GGAACCTCCATTTGAAGCTCCGATCTCTCTTTCTTTTATTTTTCCCTCTAAATCTCTCCC
TAACAGATTCCTCCAACTCTCATCTTCTTCCGTCAGAATCCATGGATATCGCTTCTTCAT
CTCTCTGTCAAGCTCACAAGATCTCTCTCACGCGTCAACCCTCTCCCCCGGTCAACTCCT
GCTCCCTTGGCTCTGTCTCTGTCATCGGATTTTCGCTTCCGCAGATCAGCTCAGCTAAAT
GTCTTCGGAAACGAAGCTCCTCCGGGTTTGTAAGAGCTTGCGTTGCTGTTGAACAGAAGA
CACGGACTGCTATCATCAGAATTGGCACTAGGGGAAGTCCTCTAGCACTTGCTCAAGCAT
ACGAGACACGATCCAAGCTCCAGGCAATACACCCTGAACCCACCCAAGATGGAGCTATTC
ACATCGAGATCATCAAAACCACCGGTGATAAGATTCTCTCTCAGCCGCTTGCTGACATTG
GTGGGAAGGGGCTTTTCACCAAAGAGATAGACGAGGCCTTGATTAACGGCCATATCGACA
TAGCAGTCCATTCCATGAAAGACGTCCCCACTTATCTACCTGAGAAAACGGTTTTGCCTT
GTAACCTTGTGCGTGAGGATGTCAGAGATGCTTTTATTTGTCTCACTGCTGCCTCCTTAG
CTGATCTTCCAGCTGGAAGCGTTGTGGGAACGGCTTCTCTCAGAGAAAGTCGCAGATACT
CCACAAGTATCCTTCATTAGCTGTTGAGGAAACTTTAGGGGTAATGTGCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA87TF U 1
AF RR2AE57TF U 44
BS 1 399 RR2AA87TF
BS 400 400 RR2AE57TF
BS 401 699 RR2AA87TF
BS 700 772 RR2AE57TF

RD RR2AA87TF 699 0 0
GGAACCTCCATTTGAAGCTCCGATCTCTCTTTCTTTTATTTTTCCCTCTAAATCTCTCCC
TAACAGATTCCTCCAACTCTCATCTTCTTCCGTCAGAATCCATGGATATCGCTTCTTCAT
CTCTCTGTCAAGCTCACAAGATCTCTCTCACGCGTCAACCCTCTCCCCCGGTCAACTCCT
GCTCCCTTGGCTCTGTCTCTGTCATCGGATTTTCGCTTCCGCAGATCAGCTCAGCTAAAT
GTCTTCGGAAACGAAGCTCCTCCGGGTTTGTAAGAGCTTGCGTTGCTGTTGAACAGAAGA
CACGGACTGCTATCATCAGAATTGGCACTAGGGGAAGTCCTCTAGCACTTGCTCAAGCAT
ACGAGACACGATCCAAGCTCCAGGCAATACACCCTGAACTCACCCAAGATGGAGCTATTC
ACATCGAGATCATCAAAACCACCGGTGATAAGATTCTCTCTCAGCCGCTTGCTGACATTG
GTGGGAAGGGGCTTTTCACCAAAGAGATAGACGAGGCCTTGATTAACGGCCATATCGACA
TAGCAGTCCATTCCATGAAAGACGTCCCCACTTATCTACCTGAGAAAACGGTTTTGCCTT
GTAACCTTGTGCGTGAGGATGTCAGAGATGCTTTTATTTGTCTCACTGCTGCCTCCTTAG
CTGATCTTCCAGCTGGAAGCGTTGTGGGAACGGCTTCTC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2AE57TF 729 0 0
CCCTCTAAATCTCTCCCTAACAGATTCCTCCAACTCTCATCTTCTTCCGTCAGAATCCAT
GGATATCGCTTCTTCATCTCTCTGTCAAGCTCACAAGATCTCTCTCACGCGTCAACCCTC
TCCCCCGGTCAGCTCCTGCTCCCTTGGCTCTGTCTCTGTCATCGGATTTTCGCTTCCGCA
GATCAGCTCAGCTAAATGTCTTCGGAAACGAAGCTCCTCCGGGTTTGTAAGAGCTTGCGT
TGCTGTTGAACAGAAGACACGGACTGCTATCATCAGAATTGGTACTAGGGGAAGTCCTCT
AGCACTTGCTCAAGCATACGAGACACGATCCAAGCTCCAGGCAATACACCCTGAACCCAC
CCAAGATGGAGCTATTCACATCGAGATCATCAAAACCACCGGTGATGAGATTCTCTCTCA
GCCGCTTGCTGACATTGGTGGGAAGGGGCTTTTCACCAAAGAGATAGACGAGGCCTTGAT
TAACGGCCATATCGACATAGCAGTCCATTCCATGAAAGACGTCCCCACTTATCTACCTGA
GAAAACGGTTTTGCCTTGTAACCTTGTGCGTGAGGATGTCAGAGATGCTTTTATTTGTCT
CACTGCTGCCTCCTTAGCTGATCTTCCAGCTGGAAGCGTTGTGGGAACGGCTTCTCTCAG
AGAAAGTCGCAGATACTCCACAAGTATCCTTCATTAGCTGTTGAGGAAACTTTAGGGGTA
ATGTGCAGA

QA 1 729 1 729
DS 



CO CL703Contig2 1285 5 26 U
GAGAACGAGTTTCATAGTGGACGAAAAAGGTACAATTGCAAGAGGAAATTTATCTCTGCA
TACAAGAAAACAATCAATACAAGATGGTTATCTCTCTCTCTAAATCAAAAAAGTTACAAC
AGATTTAAGAGGAAGAAAAGGG*ATCTATCTATGATGTTGGAAAACTCCTAAACCCCTAG
ACTCTGT*****CCATGTCCACAGCCC*TTC*TCATTTTCTTCCTCCTCTTCTTCGAATG
GCTTAGTTGCCAAAGAAGCCTGGACCAGCACGAGAAAGCAGTTCTTGACCGGCGTCTTTT
CCCATCTTCACC*ATGTCCTCAAACACGTATGGTCCTTTTCTTGAGGTCTCAAGAACTCG
GGTACCGTCAGGTGATGCAACCAATCCTCTGAAATAGCAGTTGCCTTCTTCGTCCTTGGC
CGCGTATCCAGCAA*TCGGAGTACGACATGAGCCGTCCAGTGTTTCAAGAAACGCTCTCT
CGCATGC*AACCGCTAGTCTTGTTTCCTCGTGGTTTAATGAGGCTAAGTAATTTGCCATT
TTATCATCATCCGTTCTACAGGCAA*TTCCAATAGCTCCTTGAGCAACAGCTGGTAGCAT
ATCATCGAGCGATAGTATAGCTGCAACATTCTCTGTCATGCTCAGTCTTTTAAGACCTGC
TAGTGCTAATAGAGTTGCGTGGACTTTCCCTCCTTGAAGCTTCGATAGCCTCGTCTGCAC
ATTACCCCTAAAGTTTTCCTCAACAGCTAATGAAGGATACTTGTGGAGTATCTGCGACTT
TCTCCTGAGAGAAGCCGTTCCCACAACGCTTCCAGCTGGAAGATCAGCTAAGGAGGCAGC
AGTGAGACAAATAAAAGCATCTCTGACATCCTCACGCACAAGGTTACAAGGCAAAACCGT
TTTCTCAGGTAGATAAGTGGGGACGTCTTTCATGGAATGGACTGCTATGTCGATATGGCC
GTTTATCAAGGCCTCGTCTATCTCTTTGGTGAAAAGACCTTTCCCACCAATGTCAGCGAG
CGGCTGAGAGAGAATCTTATCACCGGTGGTTTTGATAATCTCGATGTGAATAGCTCCATC
TTCGGTGAGTTCAGGGTGTATCGCCTGGAGCTTGGCTCGTGTCTCGTATGCTTGAGCAAG
CGCTAGAGGACTTCCCCTTGTGCCAATTCTGATGATAGCAGTACGGGTTTTCTGTTCAAC
AGCAACACAAGCTCTTACAGACCCGGAGGAGCTTCGCTTCCGGAGACATTTAGCTGAGCT
GATCTGCGGAAGCGAGAATCCGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV72JQ U 43
AF RR2BM93JQ U 1
AF RR2AE57JQ U 81
AF RR2AM40TF C 182
AF RR2CV72TF C 572
BS 1 131 RR2BM93JQ
BS 132 132 RR2CV72JQ
BS 133 209 RR2BM93JQ
BS 210 211 RR2CV72JQ
BS 212 216 RR2BM93JQ
BS 217 217 RR2AE57JQ
BS 218 287 RR2BM93JQ
BS 288 288 RR2AE57JQ
BS 289 333 RR2BM93JQ
BS 334 334 RR2AE57JQ
BS 335 366 RR2BM93JQ
BS 367 367 RR2CV72JQ
BS 368 515 RR2BM93JQ
BS 516 516 RR2AE57JQ
BS 517 557 RR2BM93JQ
BS 558 558 RR2AE57JQ
BS 559 795 RR2BM93JQ
BS 796 796 RR2AE57JQ
BS 797 832 RR2BM93JQ
BS 833 833 RR2AE57JQ
BS 834 850 RR2BM93JQ
BS 851 851 RR2AE57JQ
BS 852 876 RR2BM93JQ
BS 877 904 RR2AE57JQ
BS 905 933 RR2AM40TF
BS 934 1285 RR2CV72TF

RD RR2CV72JQ 659 0 0
GGGAAA
TTTATCTCTGCATACAAGAAAACAATCAATACAAGATGGTTATCTCTCTCT**AAATCAA
AAAAGTTACAACAGATTTAAGAGGAAGAAAAGGG*ATCTATCTATGATGTTGGAAA*CTC
CTAAACCCCTAGACTCTGT*****CCATGTCCACAGCCC*TTCTTCATCTTCTTCCTCCT
CTTCTTCGAATCGCTTAGTTGCCAAAGAAGCCTGGACCAGCACGGGAAAGCAGTTCTTGC
CCCGCGTCTTTTCCCATCTTCACC*ATGTCCTCAAACACGTATGGACCTTTTCTTGAGGT
CTCAAGAACTCGGGTACCGTCAGGTGATGCAACCAATCCTCTGAAATAGCAGTTGCCTTC
TTCGTCCTTGGCCGCGTATCCAGCAA*TCGGAGTACGACATGAGCCGTCCAGTGTTTCAA
GAAACGCTCTCTCGCATGC*AACCGCTAGTCTTGTTTCCTCGTGGTTCAATGAGGCTAAG
TAATTTGCCATTTTATCATCATCCGTTCTGCAGGCAA*TTCCAATAGCTCCTTGAGCAAC
AGCTGGTAGCATATCATCGAGCGATAGTATAGCTGCAACATTCTCTGTCATGCTCAGTCT
TTTAAGACCTGCTAGTGCTAATAGAGTTGCGTGGACTTTCCCTCCTTGAAGCT

QA 7 659 7 659
DS 

RD RR2BM93JQ 876 0 0
GAGAACGAGTTTCATAGTGGACGAAAAAGGTACAATTGCAAGAGGAAATTTATCTCTGCA
TACAAGAAAACAATCAATACAAGATGGTTATCTCTCTCTCTAAATCAAAAAAGTTACAAC
AGATTTAAGAG*AAGAAAAGGG*ATCTATCTATGATGTTGGAAAACTCCTAAACCCCTAG
ACTCTGT*****CCATGTCCACAGCCC*T***TCATCTTCTTCCTCCTCTTCTTCGAATG
GCTTAGTTGCCAAAGAAGCCTGGACCAGCACGAGAAAGCAGTTCTTGCCCGGCGTCTTTT
CCCATCTTCACC*ATGTCCTCAAACACGTATGGACCTTTTCTTGAGGTCTCAAGAACTCG
GGTACCATCAGGTGATGCAACCAATCCTCTGAAATAGCAGTTGCCTTCTTCGTCCTTGGC
CGCGTATCCAGCAA*TCGGAGTACGACATGAGCCGTCCAGTGTTTCAAGAAACGCTCTCT
CGCATGC*AACCGCTAGTCTTGTTTCCTCGTGGTTCAATGAGGCTAAGTAATTTGCCATT
TTATCATCATCCGTTCTGCAGGCAA*TTCCAATAGCTCCTTGAGCAACAGCTGGTAGCAT
ATCATCGAGCGATAGTATAGCTGCAACATTCTCTGTCATGCTCAGTCTTTTAAGACCTGC
TAGTGCTAATAGAGTTGCGTGGACTTTCCCTCCTTGAAGCTTCGATAGCCTCGTCTGCAC
ATTACCCCTAAAGTTTTCCTCAACAGCTAATGAAGGATACTTGTGGAGTATCTGCGACTT
TCTCCTGAGAGAAGCTGTTCCCACAACGCTTCCAGCTGGAAGATCAGCTAAG*AGGCAGC
AGTGAGACAA*TAAAAGCATCTCTGACATCCTCACG

QA 1 876 1 876
DS 

RD RR2AE57JQ 824 0 0
ACAAGAAGGTTA
TCTCTCTCTAAATCAAAAAAGTTACAACAGATTTAAAAGGAAAAAAAGGGGATCTATCTA
TGATGTTGGAAAACTCCTAAGCCCCTAAACTCTGTTCTGTCCATGTCCACAGCCCCTTCT
TCATTTTCTTCCTCCTCTTCTTCGAATGGCTTAGTTGCCAAAGAAGCCTGGACCAGCACG
AAAAAGCAGTTCTTGACCGGCGTCTTTTCCCATCTTCACC*ATGTCCTCAAACACGTATG
GTCCTTTTCTTGAGGTCTCAAGAACTCGGGTACCGTCAGGTGATGCAACCAATCCTCTGA
AATAGCAGTTGCCTTCTTCGTCCTTGGCCGCGTATCCAGCAA*TCGGAGTACGACATGAG
CCGTCCAGTGTTTCAAGAAACGCTCTCTCGCATGC*AACCGCTAGTCTTGTTTCCTCGTG
GTTTAATGAGGCTAAGTAATTTGCCATTTTATCATCATCCGTTCTACAGGCAA*TTCCAA
TAGCTCCTTGAGCAACAGCTGGTAGCATATCATCGAGCGATAGTATAGCTGCAACATTCT
CTGTCATGCTCAGTCTTTTAAGACCTGCTAGTGCTAATAGAGTTGCGTGGACTTTCCCTC
CTTGAAGCTTCGATAGCCTCGTCTGCACATTACCCCTAAAGTTTTCCTCAACAGCTAATG
AAGGATACTTGTGGAGTATCTGCGACTTTCTCCTGAGAGAAGCCGTTCCCACAACGCTTC
CAGCTGGAAGATCAGCTAAGGAGGCAGCAGTGAGACAAATAAAAGCATCTCTGACATCCT
CACGCACAAGGTTACAAGGCAAAACCGTTTTC

QA 13 824 13 824
DS 

RD RR2AM40TF 752 0 0
ACTCTGTTCTGTCC
TGTCCACAGCCCTTTC*TCATTTTCTTCCTCCTCTTCTTCGAATGGCTTAGTTGCCAAAG
AAGCCTGGACCAGCACGAGAAAGCAGTTCTTGACCGGCGTCTTTTCCCATCTTCACCCAT
GTCCTCAAACACGTATGGTCCTTTTCTTGAGGTCTCAAGAACTCGGGTACCGTCAGGTGA
TGCAACCAATCCTCTGAAATAGCAGTTGCCTTCTTCGTCCTTGGCCGCGTATCCAGCAAA
TCGGAGTACGACATGAGCCGTCCAGTGTTTCAAGAAACGCTCTCTCGCATGCGAACCGCT
AGTCTTGTTTCCTCGTGGTTTAATGAGGCTAAGTAATTTGCCATTTTATCATCATCCGTT
CTACAGGCAAATTCCAATAGCTCCTTGAGCAACAGCTGGTAGCATATCATCGAGCGATAG
TATAGCTGCAACATTCTCTGTCATGCTCAGTCTTTTAAGACCTGCTAGTGCTAATAGAGT
TGCGTGGACTTTCCCTCCTTGAAGCTTCGATAGCCTCGTCTGCACATTACCCCTAAAGTT
TTCCTCAACAGCTAATGAAGGATACTTGTGGAGTATCTGCGACTTTCTCCTGAGAGAAGC
CGTTCCCACAACGCTTCCAGCTGGAAGATCAGCTAAGGAGGCAGCAGTGAGACAAATAAA
AGCATCTCTGACATCCTCACGCACAAGGTTACAAGGCAAAACCGTTTTCTCAGGTAGATA
AGTGGGGACGTCTTTCAT

QA 15 752 15 752
DS 

RD RR2CV72TF 714 0 0
ATAGCTCCTTGAGCAACAGCTGGTAGCATATCATCGAGCGATAGTATAGCTGCAACATTC
TCTGTCATGCTCAGTCTTTTAAGACCTGCTAGTGCTAATAGAGTTGCGTGGACTTTCCCT
CCTTGAAGCTTCGATAGCCTCGTCTGCAAATTACCCCTAAAGTTCTCCTCAACAGCTAAC
GAAGGATACTTGTGGAGTATCTGCGACTTTCTCCTGAGAGAAGCCGTTCCCACAACGCTT
CCAGCTGGAAGATCAGCTAAGGAGGCAGCAGTGAGACAAATAAAAGCATCTCTGACATCC
TCACGCACAAGGTTACAAGGCAAAACCGTTTTCTCAGGTAGATAAGTGGGGACGTCTTTC
ATGGAATGGACTGCTATGTCGATATGGCCGTTTATCAAGGCCTCGTCTATCTCTTTGGTG
AAAAGACCTTTCCCACCAATGTCAGCGAGCGGCTGAGAGAGAATCTTATCACCGGTGGTT
TTGATAATCTCGATGTGAATAGCTCCATCTTCGGTGAGTTCAGGGTGTATCGCCTGGAGC
TTGGCTCGTGTCTCGTATGCTTGAGCAAGCGCTAGAGGACTTCCCCTTGTGCCAATTCTG
ATGATAGCAGTACGGGTTTTCTGTTCAACAGCAACACAAGCTCTTACAGACCCGGAGGAG
CTTCGCTTCCGGAGACATTTAGCTGAGCTGATCTGCGGAAGCGAGAATCCGATC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 2 5

CO CL704Contig1 724 3 2 U
GCACAAAGCTCAAAAGTCTTGTATTTAATAAAAATCTGTTGCTAGATTTACACATTTGGT
AACAAAATGGTTGATAAAGATCACAACTCATGAGAATGTGTTTACAAGACAAACAGGAAT
GAGAAAATACCAGTGGAGAGAGAGAAAGAGAAAAATTAACCGGATTAAGCAACAGAGATA
GAGGACAAGAGACCATCAATGTAGTCCTTAAGCTTGGCCTTTGTAATAGCACCTTCCCTT
CTGCTACCTGGCACTTCCTTACCATCCTTGAACAGTATAAAATGCGGTAAACCATAAACC
TTGTACTCTGCTATTAACTTAGGATTCGCGTCGTGATCGATCTTCACAATCGTCAACCTG
TCATCATACTCCTGAGATAAAGCTTCCGTAGCTGGATAGACCAGCTTGCAGGGACCGCAC
CAAGTGGCGACGAAATTAACCAGAACCGGCCGGTCCGATTCGAGAACCGTGCTGGTGAAC
TCACTCTCTCCGATCTCCTTGATTCCTCCGCATCTTATCGCCGTATTGGAGATTGCTCTG
GTTCTTTTACCACCGGACTTGAACGAGAGTATGTGGCGGTTAGACGCGGAGGATGCGACC
TGCGCTGAGCTCAGAGGTTTGGCGGATACGGAGGAAGCTGAGCGAATTGGAGCGAGATGT
GATCGGATAAGAACCGACGAGCTGGAGACGATACAATCCATTGCTTCTTCCTTCTCGCTT
TTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2GE35JQ U 7
AF RR2EC82JQ U 1
AF RR2GE35TF C 3
BS 1 571 RR2EC82JQ
BS 572 724 RR2GE35TF

RD RR2GE35JQ 353 0 0
G
GCTCAAAAGTCTTGTATTTAATAAAAATCTGTTGCTAGATTTACACATTTGGTAACAAAA
TGGTTGATAAAGATCACAACTCATGAGAATGTGTTTACAAGACAAACAGGAATGAGAAAA
TACCAGTGGAGAGAGAGAAAGAGAAAAATTAACCGGATTAAGCAACAGAGATAGAGGACA
AGAGACCATCAATGTAGTCCTTAAGCTTGGCCTTTGTAATAGCACCTTCCCTTCTGCTAC
CTGGCACTTCCTTACCATCCTTGAACAGTATAAAATGCGGTAAACCATAAACCTTGTACT
CTGCTATTAACTTAGGATTCGCGTCGTGATCGATCTTCACAATCGTCAACCT

QA 2 353 2 353
DS 

RD RR2EC82JQ 571 0 0
GCACAAAGCTCAAAAGTCTTGTATTTAATAAAAATCTGTTGCTAGATTTACACATTTGGT
AACAAAATGGTTGATAAAGATCACAACTCATGAGAATGTGTTTACAAGACAAACAGGAAT
GAGAAAATACCAGTGGAGAGAGAGAAAGAGAAAAATTAACCGGATTAAGCAACAGAGATA
GAGGACAAGAGACCATCAATGTAGTCCTTAAGCTTGGCCTTTGTAATAGCACCTTCCCTT
CTGCTACCTGGCACTTCCTTACCATCCTTGAACAGTATAAAATGCGGTAAACCATAAACC
TTGTACTCTGCTATTAACTTAGGATTCGCGTCGTGATCGATCTTCACAATCGTCAACCTG
TCATCATACTCCTGAGATAAAGCTTCCGTAGCTGGATAGACCAGCTTGCAGGGACCGCAC
CAAGTGGCGACGAAATTAACCAGAACCGGCCGGTCCGATTCGAGAACCGTGCTGGTGAAC
TCACTCTCTCCGATCTCCTTGATTCCTCCGCATCTTATCGCCGTATTGGAGATTGCTCTG
GTTCTTTTACCACCGGACTTGAACGAGAGTA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2GE35TF 722 0 0
TTTTG
GCTCAAAAGTCTTGTATTTAATAAAAATCTGTTGCTAGATTTACACATTTGGTAACAAAA
TGGTTGATAAAGATCACAACTCATGAGAATGTGTTTACAAGACAAACAGGAATGAGAAAA
TACCAGTGGAGAGAGAGAAAGAGAAAAATTAACCGGATTAAGCAACAGAGATAGAGGACA
AGAGACCATCAATGTAGTCCTTAAGCTTGGCCTTTGTAATAGCACCTTCCCTTCTGCTAC
CTGGCACTTCCTTACCATCCTTGAACAGTATAAAATGCGGTAAACCATAAACCTTGTACT
CTGCTATTAACTTAGGATTCGCGTCGTGATCGATCTTCACAATCGTCAACCTGTCATCAT
ACTCCTGAGATAAAGCTTCCGTAGCTGGATAGACCAGCTTGCAGGGACCGCACCAAGTGG
CGACGAAATTAACCAGAACCGGCCGGTCCGATTCGAGAACCGTGCTGGTGAACTCACTCT
CTCCGATCTCCTTGATTCCTCCGCATCTTATCGCCGTATTGGAGATTGCTCTGGTTCTTT
TACCACCGGACTTGAACGAGAGTATGTGGCGGTTAGACGCGGAGGATGCGACCTGCGCTG
AGCTCAGAGGTTTGGCGGATACGGAGGAAGCTGAGCGAATTGGAGCGAGATGTGATCGGA
TAAGAACCGACGAGCTGGAGACGATACAATCCATTGCTTCTTCCTTCTCGCTTTTAC

QA 6 722 6 722
DS 



CO CL704Contig2 542 2 3 U
GGGCATCAAGTGAACATCATCATCATCATCGTCCACTGAGGAGGAAGAAGCAATGGACTG
TATCGTCTCCAGCTCGACGGTTCTTATCCGATCACATCTAGCTCCAATTCGTTCAGCTTC
CTCCGTATCCGCCAAACCTCTGAGCTCAGCACAGGTCGCATCCTCCGCGTCTAACCGCCG
CATACTCTCGTTCAATTCCCGTCTCAGAAGAACAAGAGCACTCTCCACTACGGCGATAAG
ATGCGGAGGAATCAAGGAGATCGGAGAGAGTGAGTTCACCAGCACGGTTCTCGAATCGGA
CCGGCCGGTTCTGGTTAATTTCGTCGCCACGTGGTGCGGTCCCTGCAAGCTGGTCTATCC
AGCTACGGAAGCTTTATCTCAGGAGTATGATGACAGGTTGACGATTGTGAAGATTGATCA
CGACGCGAATCCCAATTTGATAGCAGAGTACAAGGTTTATGGTTTACCGCATTTTATACT
GTTCAAGGATGGTAAGGAAGTGCCAGGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTATTACAAAGGCCAA
GC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2DR56TF U 4
AF RR2FR34TF U 1
BS 1 70 RR2FR34TF
BS 71 71 RR2DR56TF
BS 72 542 RR2FR34TF

RD RR2DR56TF 143 0 0
GGGCATCAAGTGAA
CATCATCATCATCGTCCACTGAGGAGGAAGAAGCAATGGACTGTATCGTCTCCAGCTCGA
CGGTTCTTATCCGATCACATCTAGCTCCAATTCGTTCAGCTTCCTCCGTGTCCGCCAAAC
CTCTGAGCT

QA 15 143 15 143
DS 

RD RR2FR34TF 542 0 0
GGGCATCAAGTGAACATCATCATCATCATCGTCCACTGAGGAGGAAGAAGCAATGGACTG
TATCGTCTCCTGCTCGACGGTTCTTATCCGATCACATCTAGCTCCAATTCGTTCAGCTTC
CTCCGTATCCGCCAAACCTCTGAGCTCAGCACAGGTCGCATCCTCCGCGTCTAACCGCCG
CATACTCTCGTTCAATTCCCGTCTCAGAAGAACAAGAGCACTCTCCACTACGGCGATAAG
ATGCGGAGGAATCAAGGAGATCGGAGAGAGTGAGTTCACCAGCACGGTTCTCGAATCGGA
CCGGCCGGTTCTGGTTAATTTCGTCGCCACGTGGTGCGGTCCCTGCAAGCTGGTCTATCC
AGCTACGGAAGCTTTATCTCAGGAGTATGATGACAGGTTGACGATTGTGAAGATTGATCA
CGACGCGAATCCCAATTTGATAGCAGAGTACAAGGTTTATGGTTTACCGCATTTTATACT
GTTCAAGGATGGTAAGGAAGTGCCAGGTAGCAGAAGGGAAGGTGCTATTACAAAGGCCAA
GC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 2 7

CO CL705Contig1 1045 4 9 U
GGATCCAAAGACAAGAGTTTTCTAGTAACTCGGAAAGCGTGACTCGCTCTGAAGACTCAG
TTCGACTTGTGAATCAGCGAGAGTATTGTGATCGGAGGTGGAGAAATGTCGACGGTGGTT
GATCGGAGTGTATCAACGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGT
GAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTGGTGACGACATCAAAGTGGTTCCGT
GACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGAGTATGAGTTCTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAG
GAGCTAATCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATATACCGTTAGAGGTAACGAATCAGAT
GTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGGGGAGTTTAGGAAAGTGAAGCTTTAC
AGATCTAATGTGTCTTGTTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATAC
TGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCACAAAAAAGAAAACAAAAAAA
CAAAAAAAAAAATCTATCAGCCTTGGTGAAAAAGGGTTGTAGAAAGTGTTAGGAGAAAGA
ATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCGTGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGTTCTGTA
CTACTTTCTTCCTCTGATTAGGTGAATATTCTTCCGTTATGAATATTCTTCCTCTGATTA
TGTGAATATTTCCGTTATGGCGGCATCAGTCGAGGATGTCTTTCGCGAGCTGTTCTTGAG
GAGCCATTCTCTTAGATCTGATCATCGGGTTCTGCTAATTCTCCGGGGTTCAGGTCTCGT
GCTTCAACGTGGTTCCAAATTTTGTGGCAAGTGTTTGTACTGAATTGCTGTGTCTTATGG
GTTTGTTGCTCTGCTTGTAGTTGTTCTCCTTGTATTGCTTAGACTTGAGTAGGTGTTTTG
GTTTTTTTTTGCATCTTCTGTTCCTTGATTCTATGTAGTTCTGTCAAAAAAAAAGAAATG
GTAATAAATTTTAATATTTTTACCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A493TF U 1
AF RR2FP54TF U 1
AF RR2FP54JQ C 337
AF RR2A493JQ C 267
BS 1 521 RR2A493TF
BS 522 718 RR2FP54TF
BS 719 719 RR2A493JQ
BS 720 780 RR2FP54TF
BS 781 899 RR2A493JQ
BS 900 900 RR2FP54JQ
BS 901 969 RR2A493JQ
BS 970 970 RR2FP54JQ
BS 971 1045 RR2A493JQ

RD RR2A493TF 521 0 0
GGATCCAAAGACAAGAGTTTTCTAGTAACTCGGAAAGCGTGACTCGCTCTGAAGACTCAG
TTCGACTTGTGAATCAGCGAGAGTATTGTGATCGGAGGTGGAGAAATGTCGACGGTGGTT
GATCGGAGTGTATCAACGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGT
GAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTGGTGACGACATCAAAGTGGTTCCGT
GACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGAGTATGAGTTCTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAG
GAGCTAATCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATATACCGTTAGAGGTAACGAATCAGAT
GTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGGGGAGTTTAGGAAAGTGAAGCTTTAC
AGATCTAATGTGTCTTGTTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATAC
TGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCAC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2FP54TF 783 0 0
GGATCCAAAGACAAGAGTTTTCTAGTAACTCGGAAAGCGTGACTCGCTCTGAAGACTCAG
TTCGACTTGTGAATCAGCGAGAGTATTGTGATCGGAGGTGGAGAAATGTCGACGGTGGTT
GATCGGAGTGTATCAACGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGT
GAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTGGTGACGACATCAAAGTGGTTCCGT
GACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGAGTATGAGTTCTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAG
GAGCTAATCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATATACCGTTAGAGGTAACGAATCAGAT
GTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGGGGAGTTTAGGAAAGTGAAGCTTTAC
AGATCTAATGTGTCTTGTTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATAC
TGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCACAAAAAAGAAAACAAAAAAA
CAAAAAAAAAAATCTATCAGCCTTGGTGAAAAAGGGTTGTAGAAAGTGTTAGGAGAAAGA
ATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCGTGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGTTCTGTA
CTACTTTCTTCCTCTGATTAGGTGAATATTCTTCCGTTATGAATATTCTTCCTCTGAT*A
TGTGAATATTTCCGTTATGGCGGCATCAGTCGAGGATGTCTTTCGCGAGCTGTTCTTGAG
AGC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2FP54JQ 662 0 0
ACCGTTAGAGGTAACGAATCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGGG
GAGTTTAGGAAAGTGAAGCTTTACAGATCTAATGTGTCTTGTTCTACAAAGTATAACCAG
AAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGT
CGCACAAAAAAGAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAAATCTATCAGCCTTGGTGAAAAAGGG
TTGTAGAAAGTGTTAGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCGTGAATGAGAAA
CTCATCTTTGCTTGTTGTTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTAGGTGAATATTCTTCCG
TTATGAATATTCTTCCTCTGATTATGTGAATATTTCCGTTATGGCGGCATCAGTCGAGGA
TGTCTTTCGCGAGCTGTTCTTGAGGAGCCATTCTCTTAGATCTGATCATCGGGTTCTGCT
AATTCTCCGGGGTTCAGGTCTCGTGCTTCAACGTGGTTCCAAATTTTGTGGCAAGTGTTT
GTACTGAATTGCTGTGTCTTATGGGTTTGTTGCTCTGCTTGTAGTTGTTCTCCTTGTATT
GCTTAGACTTGAGTAGGTGTTTTGGTTTTTTTTTGCATCTTCTGTTCCTTGATTCTATGT
AG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2A493JQ 779 0 0
GTATGAGTTCTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAATCATGACCGAGGCTGAGAT
GGGTGGATATACCGTTAGAGGTAACGAATCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCT
GAGCATGGGGGAGTTTAGGAAAGTGAAGCTTTACAGATCTAATGTGTCTTGTTCTACAAA
GTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCA
GCCTCGGAGTCGCACAAAAAAGAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAAATCTATCAGCCTTGG
TGAAAAAGGGTTGTAGAAAGTGTTAGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCGT
GAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGTTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTAGGTGAA
TATCCTTCCGTTATGAATATTCTTCCTCTGATTATGTGAATATTTCCGTTATGGCGGCAT
CAGTCGAGGATGTCTTTCGCGAGCTGTTCTTGAGGAGCCATTCTCTTAGATCTGATCATC
GGGTTCTGCTAATTCTCCGGGGTTCAGGTCTCGTGCTTCAACGTGGTTCCAAATTTTGTG
GCAAGTGTTTGTACTGAATTGCTGTGTCTTATGTGTTTGTTGCTCTGCTTGTAGTTGTTC
TCCTTGTATTGCTTAGACTTGAGTAGGTGTTTTGGTTTTTTTT*GCATCTTCTGTTCCTT
GATTCTATGTAGTTCTGTCAAAAAAAAAGAAATGGTAATAAATTTTAATATTTTTACCG

QA 1 779 1 779
DS 



CO CL705Contig2 737 3 2 U
GGATCCAAAGACAAGAGTTTTCTTAGTAACTCGGAAAGCGCGACTCTCTCTGAAGACTCA
GCTCGACTTGTGAATCAGCGAGAGGTACGTAATTTCTTATTTATATCTCATGACTATCAG
TTCGAGAGGTGGTATGTATGTAGTCCCTGAACTTTTGTAGTATTGTGATCGGAGGTGGAA
AAAATGTCGACGGTGGTAGATGGGAGTGTATCGACGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTC
GATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTGGTGACG
ACATCCAAGTGGTTCCGTGACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGAGTATGAGTTCTCAGAT
ATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAATCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATCTACCGTG
ACAGGTAGCGAATCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCT
CTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTT
ATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCACAAAAAAGAAAACAAA
AAAACAAAAAAAAAATCTATCAGCCTCGGTGAAAAAAGGTTGTAGAAAGTGTCTGGAGAG
AGAATAAAAGCTAATCTTTGTGTTTTCGTGAATGAGAAACTTATCTTTGCTTCGTGTTCT
GTTGTACTACTTTCTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B566TF U 1
AF RR2EQ22TF U 1
AF RR2EQ22JQ C 214
BS 1 585 RR2B566TF
BS 586 737 RR2EQ22JQ

RD RR2B566TF 585 0 0
GGATCCAAAGACAAGAGTTTTCTTAGTAACTCGGAAAGCGCGACTCTCTCTGAAGACTCA
GCTCGACTTGTGAATCAGCGAGAGGTACGTAATTTCTTATTTATATCTCATGACTATCAG
TTCGAGAGGTGGTATGTATGTAGTCCCTGAACTTTTGTAGTATTGTGATCGGAGGTGGAA
AAAATGTCGACGGTGGTAGATGGGAGTGTATCGACGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTC
GATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTGGTGACG
ACATCCAAGTGGTTCCGTGACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGAGTATGAGTTCTCAGAT
ATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAATCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATCTACCGTG
ACAGGTAGCGAATCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCT
CTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTT
ATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCAC

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2EQ22TF 585 0 0
GGATCCAAAGACAAGAGTTTTCTTAGTAACTCGGAAAGCGCGACTCTCTCTGAAGACTCA
GCTCGACTTGTGAATCAGCGAGAGGTACGTAATTTCTTATTTATATCTCATGACTATCAG
TTCGAGAGGTGGTATGTATGTAGTCCCTGAACTTTTGTAGTATTGTGATCGGAGGTGGAA
AAAATGTCGACGGTGGTAGATGGGAGTGTATCGACGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTC
GATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTGGTGACG
ACATCCAAGTGGTTCCGTGACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGAGTATGAGTTCTCAGAT
ATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAATCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATCTACCGTG
ACAGGTAGCGAATCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCT
CTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTT
ATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCAC

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2EQ22JQ 524 0 0
ACGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTC
TCGCCCAAGTGGTGGGAGCTGGTGACGACATCCAAGTGGTTCCGTGACTTCTGGCTCAGT
GCCAACTCGGAGTATGAGTTTTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAATCATGACC
GAGGCTGAGATGGGTGGATCTACCGTGACAGGTAGCGAATCAGATGTTGGTAGGTACTTG
AAGGTCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAAGTA
TAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCC
TCGGAGTCGCACAAAAAAGAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAATCTATCAGCCTCGGTGAA
AAAAGGTTGTAGAAAGTGTCTGGAGAGAGAATAAAAGCTAATCTTTGTGTTTTCGTGAAT
GAGAAACTTATCTTTGCTTCGTGTTCTGTTGTACTACTTTCTTC

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 9

CO CL706Contig1 713 9 5 U
GGATAACTCAAAATATCTACGAACACAAGAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTA
CCGCACGAATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTT
TCAAGTGGAAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGA
ACTCAAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAGCAT
CTAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACA
AATATCTCGACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTA
ACGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGC
AGGTCTCGTCTCATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGGGAAA
GATCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTG
CTGGAGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAACAAAAAA
CATGAACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACACAAGTG
TTTGTGTATGTCAATGGCACTACCAAATGATATAAGTTTCATTTGGAACAAAA


BQ
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL23JQ C 22
AF RR2CL23TF U 1
AF RR2AX32TFB U 1
AF RR2CJ40JQ C 1
AF RR2CJ40TF U 1
AF RR2CE70TF U -1
AF RR2D692JQ C 1
AF RR2D692TF U 1
AF RR2CE70JQ C 48
BS 1 122 RR2AX32TFB
BS 123 123 RR2CL23TF
BS 124 682 RR2AX32TFB
BS 683 696 RR2CE70TF
BS 697 713 RR2D692TF

RD RR2CL23JQ 634 0 0
AACACAAGAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTACCGCACGAATCGGGAGCTGGT
CATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTTTCAAGTGGAAGCTACCAAAGG
CAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGAACTCAAACTTCCGATGGAGGA
AAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAGCATCTAGAGTTCCGACATCAGTAC
CGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACAAATATCTGGACGTGAGGACAC
CGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTAACGTGCCTTACATGTACAGAG
TCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTTTAAGGCAGGTCTCGTCTCATTTCAGGA
AACACGACGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGGGAAAGATCTCTCATGGCTTCCACTG
AACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTGCTGGAGGGTACGTTGCCTGGA
CAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAACAAAAAACATGAACCTATCCGTTTGTAA
ATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACAC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2CL23TF 655 0 0
GGATAACTCAAAATATCTACGAACACAAGAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTA
CCGCACGAATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTT
TCAAGTGGAAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGA
ACTCAAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAGCAT
CTAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACA
AATATCTCGACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTA
ACGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGC
AGGTCTCGTCTCATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGGGAAA
GATCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTG
CTGGAGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAACAAAAAA
CATGAACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACAC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2AX32TFB 682 0 0
GGATAACTCAAAATATCTACGAACACAAGAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTA
CCGCACGAATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTT
TCGAGTGGAAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGA
ACTCAAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAGCAT
CTAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACA
AATATCTCGACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTA
ACGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGC
AGGTCTCGTCTCATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGGGAAA
GATCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTG
CTGGAGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAACAAAAAA
CATGAACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACACAAGTG
TTTGTGTATGTCAATGGCACTA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2CJ40JQ 706 0 0
GGATAACTCAAAATATCTACGAACACAAGAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTA
CCGCACGAATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTT
TCAAGTGGAAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGA
ACTCAAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAGCAT
CTAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACA
AATATCTCGACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTA
ACGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGC
AGGTCTCGTCTCATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGGGAAA
GATCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACCGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTG
CTGGAGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAACAAAAAA
CATGAACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACACAAGTG
TTTGTGTATGTCAATGGCACTACCAAATGATATAAGTTTCATTTGG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2CJ40TF 679 0 0
GGATAACTCAAAATATCTACGAACACAAGAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTA
CCGCACGAATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTT
TCAAGTGGAAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGA
ACTCAAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAGCAT
CTAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACA
AATATCTCGACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTA
ACGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGC
AGGTCTCGTCTCATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGGGAAA
GATCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACCGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTG
CTGGAGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAACAAAAA*
CATGAACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTT*CAACACAAGTG
TTTGTGTATGTCAATGGCA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2CE70TF 698 0 0
GGAT
ATAACTCAAAATATCTACGAACACAAGAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTACC
GCACGAATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCCTTC
AAGTGGAAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGAAC
TCAAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAGCATCT
AGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACAAA
TATCTCGACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTAAC
GTGCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAGTGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGCAG
GTCTCGTCTCATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGGGAAAGA
TCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTGCT
GGAGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAGAACAAAAAACA
TGAACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACACAAGTGTT
TGTGTATGTCAATGGCACTACCAAATGATATAAG

QA 5 698 5 698
DS 

RD RR2D692JQ 706 0 0
GGATAACTCAAAATATCTACGAACACAAGAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTA
CCGCACGAATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTT
TCAAGTGGAAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGA
ACTCAAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAGCAT
CTAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACA
AATATCTCGACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTA
ACGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGC
AGGTCTCGTCTCATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGGGAAA
GATCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTG
CTGGAGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAACAAAAAA
CATGAACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACACAAGTG
TTTGTGTGTGTCAATGGCACTACCAAATGATATAAGTTTCATTTGG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2D692TF 713 0 0
GGATAACTCAAAATATCTACGAACACAAGAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTA
CCGCACGAATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTT
TCAAGTGGAAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGA
ACTCAAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAGCAT
CTAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACA
AATATCTCGACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTA
ACGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGC
AGGTCTCGTCTCATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGGTTGTGAGAGCGGGGAAA
GATCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACATTG
CTGGAGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAACAAAAAA
CATGAACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACACAAGTG
TTTGTGTGTGTCAATGGCACTACCAAATGATATAAGTTTCATTTGGAACAAAA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2CE70JQ 659 0 0
ACTTTAAACACTACCGCACGAATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAA
GTGTGTGAATCCTTCAAGTGGAAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTT
GCAGATCGTCAGAACTCAAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTT
GCGGCGGAAGCATCTAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCT
CAAGCAGGATACAAATATCTCGACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCG
TGTAGTGCTATTAACGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAGTGGTTAAGAACCCG
AGTTTTTTAAGGCAGGTCTCGTCTCATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGGTTGT
GAGAGCGGGGAAAGATCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGG
GTTACAGACATTGCTGGAGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAG
TGAGAACAAAAAACATGAACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGT
TTCAACACAAGTGTTTGTGTATGTCAATGGCACTACCAAATGATATAAGTTTCATTTGG

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 9

CO CL707Contig1 858 9 8 U
GGATCCATGCCACTTCTCTTTCTCTTGTCTTGGTAAAGTTTTGGGATCTTACACCACAAC
AACCACAACAAACAACAACCATATATTTGTCCTATTTGTATCATTTGTCCCCTTGTGTTC
TTTATCTTAAGGAAAGTAAAATCTTGATTAATCTGAATAATGATGGGTGCAAATGATGGG
AGAAGAACGCCTTTAATGAATCTTGGGGTTCAAGTATCGATGAGAGTGTTAGCCATTGGC
ACTGCATTGGCCTCCATGGGGCTCACGATCACTAATCATGAAGTCGCCTCTGTTTATGGC
ATTAATTTTGAGGCTAAATACGACTACTCATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTACGCAGAA
ATAGCTATCGCCGGCATGACATTGTTTACGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGA
AGAGGACTTGTTTTTGCACTCTTCTTCTTTGATTTGCTCACGACGTTGACGGCTATATCG
TCTTTCTCTGCGGCCATGTCGGATGGTTACATCGGAAAGTATGGTAATACACACGCCGGT
TGGCTACCGATATGCGGCTACGTCCATAATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCT
TTGTCCTTCGCATCTTTTCTCCTCTTGTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCAGCTGCT
CGTCATTTCTGATTAACTTTCTTTACGTTTTCATATTATACATTTGCTTAAGTTCTCATG
ATTTTTCAAGCTTTCTTATATACTTACTATTATAAGATGAAAAATCAAAAGAAAGAAATT
GTATCCTTCCGTGAAATGTTTGTCCTTGAGACTCTTGTTATTTGTTATGTTCAAGTCTCG
TCTTCATTTGTTTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BB96TF U 83
AF RR2DT36TF U 1
AF RR2E881TF U 19
AF RR2A518TF U 19
AF RR2GL80TF U 25
AF RR2DT36JQ C 335
AF RR2E881JQ C 115
AF RR2BB96JQ C 115
AF RR2A518JQ C 335
BS 1 85 RR2DT36TF
BS 86 86 RR2A518TF
BS 87 503 RR2DT36TF
BS 504 642 RR2A518TF
BS 643 643 RR2E881TF
BS 644 759 RR2A518TF
BS 760 763 RR2GL80TF
BS 764 858 RR2BB96JQ

RD RR2BB96TF 138 0 0
ATATTTGTCCTATTTGTATCATTTGTCCCCTTGTGTTCTTTATCTTAAGGAAAGTAAAAT
CTTGATTAATCTGAATAATGATGGGTGCAAATGATGGGAGAAGAACGCCTTTAATGAATC
TTGGGGTTCAAGTATCGA

QA 1 138 1 138
DS 

RD RR2DT36TF 503 0 0
GGATCCATGCCACTTCTCTTTCTCTTGTCTTGGTAAAGTTTTGGGATCTTACACCACAAC
AACCACAACAAACAACAACCATATACTTGTCCTATTTGTATCATTTGTCCCCTTGTGTTC
TTTATCTTAAGGAAAGTAAAATCTTGATTAATCTGAATAATGATGGGTGCAAATGATGGG
AGAAGAACGCCTTTAATGAATCTTGGGGTTCAAGTATCGATGAGAGTGTTAGCCATTGGC
ACTGCATTGGCCTCCATGGGGCTCACGATCACTAATCATGAAGTCGCCTCTGTTTATGGC
ATTAATTTTGAGGCTAAATACGACTACTCATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTACGCAGAA
ATAGCTATCGCCGGCATGACATTGTTTACGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGA
AGAGGACTTGTTTTTGCACTCTTCTTCTTTGATTTGCTCACGACGTTGACGGCTATATCG
TCTTTCTCTGCGGCCATGTCGGA

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2E881TF 688 0 0
TTTCTCTT
GTCTTGGTAAAGTTTTGGGATCTTACACCACAACAACCACAACAAACAACAACCATATAT
TTGTCCTATTTGTATCATTTGTCCCCTTGTGTTCTTTATCTTAAGGAAAGTAAAATCTTG
ATTAATCTGAATAATGATGGGTGCAAATGATGGGAGAAGAACGCCTTTAATGAATCTTGG
GGTTCAAGTATCGATGAGAGTGTTAGCCATTGGCACTGCATTGGCCTCCATGGGGCTCAC
GATCACTAATCATGAAGTCGCCTCTGTTTATGGCATTAATTTTGAGGCTAAATACGACTA
CTCATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTACGCAGAAATAGCTATCGCCGGCATGACATTGTT
TACGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGAAGAGGACTTGTTTTTGCACTCTTCTT
CTTTGATTTGCTCACGACGTTGACGGCTATATCGTCTTTCTCTGCGGCCATGTCGGATGG
TTACATCGGAAAGTATGGTAATACACACGCCGGTTGGCTACCGATATGCGGCTACGTCCA
TAATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCTTTGTCCTTCGCATCTTTTCTCCTCTT
GTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCAGCTGCTCGTCATTTCTGATTAGCTTTCTTTAC
GTTTTCATATTATACATTTG

QA 9 688 9 688
DS 

RD RR2A518TF 741 0 0
TTTCTCTT
GTCTTGGTAAAGTTTTGGGATCTTACACCACAACAACCACAACAAACAACAACCATATAT
TTGTCCTATTTGTATCATTTGTCCCCTTGTGTTCTTTATCTTAAGGAAAGTAAAATCTTG
ATTAATCTGATTAATGATGGGTGCAAATGATGGGAGAAGAACGCCTTTAATGAATCTTGG
GGTTCAAGTATCGATGAGAGTGTTAGCCATTGGCACTGCATTGGCCTCCATGGGGCTCAC
GATCACTAATCATGAAGTCGCCTCTGTTTATGGCATTAATTTTGAGGCTAAATACGACTA
CTCATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTACGCAGAAATAGCTATCGCCGGCATGACATTGTT
TACGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGAAGAGGACTTGTTTTTGCACTCTTCTT
CTTTGATTTGCTCACGACGTTGACGGCTATATCGTCTTTCTCTGCGGCCATGTCGGATGG
TTACATCGGAAAGTATGGTAATACACACGCCGGTTGGCTACCGATATGCGGCTACGTCCA
TAATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCTTTGTCCTTCGCATCTTTTCTCCTCTT
GTTCATCCTTACAGTCCTAACTGCCTCAGCTGCTCGTCATTTCTGATTAACTTTCTTTAC
GTTTTCATATTATACATTTGCTTAAGTTCTCATGATTTTTCAAGCTTTCTTATATACTTA
CTATTATAAGATG

QA 9 741 9 741
DS 

RD RR2GL80TF 741 0 0
GG
GTCTTGGTAAAGTTTTGGGATCTTACACCACAACAACCGCAACAAACAACAACCATATAT
TTGTCCTATTTGTATCATTTGTCCCCTTGTGTTCTTTATCTTAAGGAAAGTAAAATCTTG
ATTAATCTGAATAATGATGGGTGCAAATGATGGGAGAAGAACGCCTTTAATGAATCTTGG
GGTTCAAGTATCGATGAGAGTGTTAGCCATTGGCACTGCATTGGCCTCCATGGGGCTCAC
GATCACTAATCATGAAGTCGCCTCTGTTTATGGCATTAATTTTGAGGCTAAATACGACTA
CTCATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTACGCAGAAATAGCTATCGCCGGCATGACATTGTT
TACGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGAAGAGGACTTGTTTTTGCACTCTTCTT
CTTTGATTTGCTCACGACGTTGACGGCTATATCGTCTTTCTCTGCGGCCATGTCGGATGG
TTACATCGGAAAGTATGGTAATACACACGCCGGTTGGCTACCGATATGCGGCTACGTCCA
CAATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCTTTGTCCTTCGCATCTTTTCTCCTCTT
GTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCAGCTGCTCGTCATTTCTGATTAACTTTCTTTGC
GTCTTCATATTATACATTTGCTTAAGTTCTCATGATTTTTCAAGCTTTCTTATATACTTA
CTATTATAAGATGAAAA
TC

QA 3 739 3 739
DS 

RD RR2DT36JQ 457 0 0
CCTTTAGGTATTTGGTGTACGCAGAAATAGCTATCGCCGGCATGACATTGTTTACGCTCG
TATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGAAGAGGACTTGTTTTTGCACTCTTCTTCTTTGATT
TGCTCACGACGTTGACGGCTATATCGTCTTTCTCTGCGGCCATGTCGGATGGTTACATCG
GAAAGTATGGTAATACACACGCCGGTTGGCTACCGATATGCGGCTACGTCCATAATTACT
GTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCTTTGTCCTTCGCATCCTTTCTCCTCTTGTTCATCC
TTACAGTCTTAACTGCCTCAGCTGCTCGTCATTTCTGATTAACTTTCTTTACGTTTTCAT
ATTATACATTTGCTTAAGTTCTCATGATTTTTCAAGCTTTCTTATATACTTACTATTATA
AGATGAAAAATCAAAAGAAAGAAATTGTATCCTTCC
C

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR2E881JQ 718 0 0
GTGTTCTTTATCTTAAGGAAAGTAAAATCTTGATTAATCTGAATAATGATGGGTGCAAAT
GATGGGAGAAGAACGCCTTTAATGAATCTTGGGGTTCAAGTATCGATGAGAGTGTTAGCC
ATTGGCACTGCATTGGCCTCCATGGGGCTCACGATCACTAATCATGAAGTCGCCTCTGTT
TATGGCATTAATTTTGAGGCTAAATACGACTACTCATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTAC
GCAGAAATAGCTATCGCCGGCATGACATTGTTTACGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTC
CGTAGAAGAGGACTTGTTTTTGCACTCTTCTTCTTTGATTTGCTCACGACGTTGACGGCT
ATATCGTCTTTCTCTGCGGCCATGTCGGATGGTTACATCGGAAAGTATGGTAATACACAC
GCCGGTTGGCTACCGATATGCGGCTACGTCCATAATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCA
CTCGCTTTGTCCTTCGCATCTTTTCTCCTCTTGTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCA
GCTGCTCGTCATTTCTGATTAGCTTTCTTTACGTTTTCATATTATACATTTGCTTAAGTT
CTCATGATTTTTCAAGCTTTCTTATATACTTACTATTATAAGATGAAAAATCAAAAGAAA
GAAATTGTATCCTTCCGTTAAATGTTTGTCCTTGAGACTCTTGTTATTTGTTATGT
CC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2BB96JQ 744 0 0
GTGTTCTTTATCTTAAGGAAAGTAAAATCTTGATTAATCTGAATAATGATGGGTGCAAAT
GATGGGAGAAGAACGCCTTTAATGAATCTTGGGGTTCAAGTATCGATGAGAGTGTTAGCC
ATTGGCACTGCATTGGCCTCCATGGGGCTCACGATCACTAATCATGAAGTCGCCTCTGTT
TATGGCATTAATTTTGAGGCTAAATACGACTACTCATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTAC
GCAGAAATAGCTATCGCCGGCATGACATTGTTTACGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTC
CGTAGAAGAGGACTCGTTTTTGCACTCTTCTTCTTTGATTTGCTCACGACGTTGACGGCT
ATATCGTCTTTCTCTGCGGCCATGTCGGATGGTTACATCGGAAAGTATGGTAATACACAC
GCCGGTTGGCTACCGATATGCGGCTACGTCCATAATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCA
CTCGCTTTGTCCTTCGCATCTTTTCTCCTCTTGTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCA
GCTGCTCGTCATTTCTGATTAACTTTCTTTACGTTTTCATATTATACATTTGCTTAAGTT
CTCATGATTTTTCAAGCTTTCTTATATACTTACTATTATAAGATGAAAAATCAAAAGAAA
GAAATTGTATCCTTCCGTGAAATGTTTGTCCTTGAGACTCTTGTTATTTGTTATGTTCAA
GTCTCGTCTTCATTTGTTTTTACC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2A518JQ 510 0 0
CCTTTAGGTATTTGGTGTACGCAGAAATAGCTATCGCCGGCATGACATTGTTTACGCTCG
TATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGAAGAGGACTTGTTTTTGCACTCTTTTTCTTTGATT
TGCTCACGACGTTGACGGCTATATCGTCTTTTTTTGCGGCCATGTCGGATGGTTACATCG
GAAAGTATGGTAATACACACGCCGGTTGGCTACCGATATGCGGCTACGTCCATAATTACT
GTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCTTTGTCCTTCGCATCTTTTCTCCTCTTGTTCATCC
TTACAGTCCTAACTGCCTCAGCTGCTCGTCATTTTTGATTAACTTTCTTTACGTTTTCAT
ATTATACATTTGCTTAAGTTCTCATGATTTTTCAAGCTTTTTTATATACTTACTATTATA
AGATGAAAAATCAAAAGAAAGAAATTGTATCCTTCCGTGAAATGATTGTCCTTGAGACTC
TTGTTATTTGTTATGTTCAAGTTTCGTCTT

QA 1 510 1 510
DS 



AS 2 7

CO CL708Contig1 831 3 28 U
GGTAAAGACTCTGATGATCAAAATGCTGCTTGGAATGTTCCACTTGAGGCATGTATGCAC
AAAGTGGCAGAAGAGTCAACAAAACGTGGAGCAGTTTGGCCTGAAAGATGGCCAGAGAGA
GTAGAGACTGCTCCTCAGTGGTTGGAATCTCAGGAAGGTGTATATGGAAAACCTGCACCA
GAGGATTTCACAGCAGACCATGAACGTTGGAAGACTATTGTTTCAAAGTCATACCTCAAC
GGTATGGGAATCGATTGGTCTTATGTGAGAAACGTGATGGACATGAGAGCTGTCTATGGA
GGTTTTGCTGCTGCATTGAAGGATCTGAAACTTTGGGTGATGAATGTAGTTCCTATCGAC
TCACCAGATACGCTTCCAATCATATATGAACGTGGTTTGTTTGGAATCTACCATGACTGG
TGTGAATCATTCAGCACTTACCCTCGAACTTACGACCTCCTTCATGCTGATCATCTTTTC
TCTTCTCTGAAGAAGAGGTGCAACTTGGTGTCGGTAATGGCTGAAGTGGACAGGATTCTT
AGACCGCAAGGAACGTTTATAGTAAGAGATGACATGGAAACAATTGGGGAAATTGAGAAG
ATGGTGAAATCTCTGCAATGGAATGTAAAACTGTCACAATCCAAAGATGGAGAAGGAGTG
CTCTCTGTTCAGAAGTCATGGTGGCGTCCTACAGAGGTCGAGACCATTACATCTGCAATA
GCAAAAGCAGGAGAGGTTTAAAATAGTTTTATGAGTAAGATGTTTCTTTTATGATCACAC
GTTGATTGTTTACTTGTATTATTAGTCCAATATTTTGCATTTACGAAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB53TF U 198
AF RR2BT62TF U 1
AF RR2BZ15TF U 112
BS 1 161 RR2BT62TF
BS 162 162 RR2BZ15TF
BS 163 203 RR2BT62TF
BS 204 204 RR2BZ15TF
BS 205 221 RR2BT62TF
BS 222 222 RR2BZ15TF
BS 223 248 RR2BT62TF
BS 249 249 RR2BZ15TF
BS 250 251 RR2BT62TF
BS 252 252 RR2BZ15TF
BS 253 353 RR2BT62TF
BS 354 354 RR2BZ15TF
BS 355 356 RR2BT62TF
BS 357 357 RR2BZ15TF
BS 358 386 RR2BT62TF
BS 387 387 RR2BZ15TF
BS 388 455 RR2BT62TF
BS 456 456 RR2BZ15TF
BS 457 485 RR2BT62TF
BS 486 486 RR2BZ15TF
BS 487 576 RR2BT62TF
BS 577 577 RR2BZ15TF
BS 578 641 RR2BT62TF
BS 642 642 RR2BZ15TF
BS 643 671 RR2BT62TF
BS 672 672 RR2BZ15TF
BS 673 717 RR2BT62TF
BS 718 831 RR2BZ15TF

RD RR2AB53TF 436 0 0
CCATGAACGTTGGAAGACTATTGTTTCAAAGTCATACCTCAACGGTATGGGAATCGATTG
GTCTTATGTGAGAAACGTGATGGACATGAGAGCTGTCTATGGAGGTTTTGCTGCTGCATT
GAAGGATCTGAAACTTTGGGTGATGAATGTAGTTCCTATCGACTCACCAGATACGCTTCC
AATCATTTATGAACGTGGTTTGTTTGGAATCTACCATGACTGGTGTGAATCATTCAGCAC
TTACCCTCGAACTTACGACCTCCTTCATGCTGATCATCTTTTCTCTTCTCTGAAGAAGAG
GTGCAACTTGGTGTCGGTAATGGCTGAAGTGGACAGGATTCTTAGACCGCAAGGAACGTT
TATAGTAAGAGATGACATGGAAACAATTGGGGAAATTGAGAAGATGGTGAAATCTCTGCA
*TGGAATGTAAA
CTGT

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR2BT62TF 721 0 0
GGTAAAGACTCTGATGATCAAAATGCTGCTTGGAATGTTCCACTTGAGGCATGTATGCAC
AAAGTGGCAGAAGAGTCAACAAAACGTGGAGCAGTTTGGCCTGAAAGATGGCCAGAGAGA
GTAGAGACTGCTCCTCAGTGGTTGGAATCTCAGGAAGGTGTTTATGGAAAACCTGCACCA
GAGGATTTCACAGCAGACCATGAGCGTTGGAAGACTATTGTCTCAAAGTCATACCTCAAC
GGTATGGGTATTGATTGGTCTTATGTGAGAAACGTGATGGACATGAGAGCTGTCTATGGA
GGTTTTGCTGCTGCATTGAAGGATCTGAAACTTTGGGTGATGAATGTAGTTCCCATTGAC
TCACCAGATACGCTTCCAATCATATACGAACGTGGTTTGTTTGGAATCTACCATGACTGG
TGTGAATCATTCAGCACTTACCCTCGAACTTACGATCTCCTTCATGCTGATCATCTTTTC
TCTTCACTGAAGAAGAGGTGCAACTTGGTGTCGGTAATGGCTGAAGTGGACAGGATTCTT
AGACCGCAAGGAACGTTTATAGTAAGAGATGACATGAAAACAATTGGGGAAATTGAGAAG
ATGGTGAAATCTCTGCAATGGAATGTAAAACTGTCACAATCTAAAGATGGAGAAGGAGTG
CTCTCTGTTCA*AAGTCATGGTGGCGTCCTACAGAGGTCGAGACCATTACATCTGCA
TAGC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2BZ15TF 720 0 0
GGA
GAGAGAGTAGAGGCTGCTCCTCAGTGGTTGGAATCTCAGGAAGGTGTATATGGAAAACCT
GCACCAGAGGATTTCACAGCAGACCATGAACGTTGGAAGACTATTGTTTCAAAGTCATAC
CTCAACGGTATGGCAATCGATTGGTCTTATGTGAGAAACGTGATGGACATGAGAGCTGTC
TATGGAGGTTTTGCTGCTGCATTGAAGGATCTGAAACTTTGGGTGATGAATGTAGTTCCT
ATCGACTCACCAGATACGCTTCCAATCATATATGAACGTGGTTTGTTTGGAATCTACCAT
GACTGGTGTGGATCATTCAGCACTTACCCTCGAACTTATGACCTCCTTCATGCTGATCAT
CTTTTCTCTTCTCTGAAGAAGAGGTGCAACTTGGTGTCGGTAATGGCTGAAGTTGACAGG
ATTCTTAGACCGCAAGGAACGTTTATAGTAAGAGATGACATGGAAACAATTGGGGAAATT
GAGAAGATGGTGAAATCTCTGCAATGGAATGTAAAACTGTCACAATCCAAAGATGGTGAA
GGAGTGCTCTCTGTTCAGAAGTCATGGTGGCGTCCTACAGAGGTCGAGACCATTACATCT
GCAATAGCAAAAGCAGGAGAGGTTTAAAATAGTTTTATGAGTAAGATGTTTCTTTTATGA
TCACACGTTGATTGTTTACTTGTATTATTAGTCCAATATTTTGCATTTACGAAAATT

QA 4 720 4 720
DS 



CO CL708Contig2 1607 4 12 U
AGGACCAAATCAAAAACTCATAAAAGTTTACACTTTTGAAACAAGTGTCTTGTATACAAA
TACAATTTTCGTAAATGCAAAATATTGGACTAATAATACAAGTAAACAATCAACGTGTGA
TCACAAAAAAAACATCTTACTCATAAAACTATTTTAAACCTCTCCTGCTTTTGCTATTGC
AGATGTAATGGTCTCGACCTCTGTAGGACGCCACCATGACTTCTGAACAGAGAGCACTCC
TTCACCATCTTTGGATTGTGACAGTTTTACATTCCATTGCCGAGATTTCACCATCTTCTC
AATTTCCCCAATTGTTTCCATGTCATCTCTTACTATAAACGTTCCTTGCGGTCTAAGAAT
CCTGTCAACTTCAGCCATTACCGACACCAAGTTGCACCTCTTCTTCAGAGAAGAGAAAAG
ATGATCAGCATGAAGGAGGTCGTAAGTTCGAGGGTAAGTGCTGAATGATTCACACCAGTC
ATGGTAGATTCCAAACAAACCACGTTCATATATGATTGGAAGCGTATCTGGTGCAGGTTT
TCCATATACACCTTCCTGAGATTCCAACCACTGAGGAGCAGCCTCTACTCTCTCCGGCCA
TCTTTCAGGCCAAACTGCTCCACGTTTTGATGAATCTTCTGCCACTTTGTGCATACATGC
CTCAAGTGGAACATTCCAAGCAGCATAGATCATCAGAGTCTTTGCATAGAGGTGGCTCGT
TCTGAGATCTTTGGTTGTAGCATTCATTCGACATTGGCTTTTGGTAAACGGCAGCACTAA
CTTCATTCAGTTCATCTTTCTTAATCGTCTTTAACTCCCAGCACATTGCCTTTGTGAGCT
TTGACATTGCTTTCCATATGCTAACGTCTTCTTCGTCCTTCCTGTAAACTGGAGTTGCCG
ACCAGACAAAGAAACAACCTGGCCTCAATGCACGGTTCAATTCCAATAGTAGTTTACCAC
CTTCAATATGCCAAGGGACTCTACAACGAGCACAGTGGATAAGGTCGAAAACAGATCCTG
GAAAAGGCAATCTCTTGGTTCCCATAACGTTTGACATTGCAGGGATACCACGTTCCAAAG
CAAACTGCACCTGCGCCTCGTGTTCATCTTTGGGAGCAAATGACAAAGCAAGCACATCTC
TGTCAAAAAGATATCCTCCGAAGCTAGCAACACCACACCCAACATCCAATATAACACGTG
TTCTGTTTCCCCAAGCAATGTCAGGATATGACTCTTGGAGGAAATCGATGTAGTGGAGAG
CACCGTTCTTGAACTGAGTACCACCACCAGGGAATGTTAAGTATTCACCACTCATCTTCA
CCCAGTTTTGATGTCCTTTGACTTCTGCAAGCTTCATGTGAGGAACATTGGTATACCAGA
TCTTTTCTCTGCTCTTAGGCCATTTGATGGATCGCTTATACCCTTCGGGAAGAGAAACAA
GGCAGCTTGGGGCTTCCTCGGGACAATGCCTCTCACGATGCTCATAATGCTTTCTGGCGA
GCTTCCTGATAGCTTCCCAGTTGTCAAGGCAAGGGATGTAGTCTGGTCCAGCAGTGACAT
TGCATACTTTCCATTTGATAGAGGAGACTTGAGCTTTCTTCTCGTTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ15JQ U 1
AF RR2CK25JQ U 1
AF RR2CK25TF C 203
AF RR2BC09TF C 814
BS 1 123 RR2BZ15JQ
BS 124 124 RR2CK25JQ
BS 125 280 RR2BZ15JQ
BS 281 281 RR2CK25JQ
BS 282 283 RR2BZ15JQ
BS 284 284 RR2CK25JQ
BS 285 412 RR2BZ15JQ
BS 413 692 RR2CK25JQ
BS 693 915 RR2CK25TF
BS 916 916 RR2BC09TF
BS 917 936 RR2CK25TF
BS 937 1607 RR2BC09TF

RD RR2BZ15JQ 412 0 0
AGGACCAAATCAAAAACTCATAAAAGTTTACACTTTTGAAACAAGTGTCTTGTATACAAA
TACAATTTTCGTAAATGCAAAATATTGGACTAATAATACAAGTAAACAATCAACGTGTGA
TCATAAAAAAAACATCTTACTCATAAAACTATTTTAAACCTCTCCTGCTTTTGCTATTGC
AGATGTAATGGTCTCGACCTCTGTAGGACGCCACCATGACTTCTGAACAGAGAGCACTCC
TTCACCATCTTTGGATTGTGACAGTTTTACATTCCATTGCAGAAATTTCACCATCTTCTC
AATTTCCCCAATTGTTTCCATGTCATCTCTTACTATAAACGTTCCTTGCGGTCTAAGAAT
CCTGTCAACTTCAGCCATTACCGACACCAAGTTGCACCTCTTCTTCAGAGAA

QA 1 412 1 412
DS 

RD RR2CK25JQ 692 0 0
A
GGACCAAATCAAAAACTCATAAAAGTTTACACTTTTGAGACAAGTGTCTTGTATACAAAT
ACAATTTTCGTAAATGCAAAATATTGGACTAATAATACAAGTAAACAATCAACGTGTGAT
CACAAAAGAAACATCTTACTCATAAAACTATTTTAAACCTCTCCTGCTTTTGCTATTGCA
GATGTAATGGTCTCGACCTCTGTAGGACGCCACCATGACTTCTGAACAGAGAGCACTCCT
TCACCATCTTTGGATTGTGACAGTTTTACATTCCATTGCCGAGATTTCACCATCTTCTCA
ATTTCCCCAATTGTTTCCATGTCATCTCTTACTATAAACGTTCCTTGCGGTCTAAGAATC
CTGTCAACTTCAGCCATTACCGACACCAAGTTGCACCTCTTCTTCAGAGAAGAGAAAAGA
TGATCAGCATGAAGGAGGTCGTAAGTTCGAGGGTAAGTGCTGAATGATTCACACCAGTCA
TGGTAGATTCCAAACAAACCACGTTCATATATGATTGGAAGCGTATCTGGTGCAGGTTTT
CCATATACACCTTCCTGAGATTCCAACCACTGAGGAGCAGCCTCTACTCTCTCCGGCCAT
CTTTCAGGCCAAACTGCTCCACGTTTTGATGAATCTTCTGCCACTTTGTGCATACATGCC
TCAAGTGGAACATTCCAAGCAGCATAGATCA

QA 2 692 2 692
DS 

RD RR2CK25TF 736 0 0
GTAGGACGCCACCATGACTTCTGAACAGAGAGCACTC*TTCACCATCTTTGGATTGTGAC
AGTTTTACATTCCATTGCCGAGATTTCACCATCTTCTCAATTTCCCCAATTGTTTCCATG
TCATCTCTTACTATAAACGTTCCTTGCGGTCTAAGAATCCTGTCAACTTCAGCCATTACC
GACACCAAGTTGCACCTCTTCTTCAGAGAAGAGAAAAGATGATCAGCATGAAGGAGGTCG
TAAGTTCGAGGGTAAGTGCTGAATGATTCACACCAGTCATGGTAGATTCCAAACAAACCA
CGTTCATATATGATTGGAAGCGTATCTGGTGCAGGTTTTCCATATACACCTTCCTGAGAT
TCCAACCACTGAGGAGCAGCCTCTACTCTCTCCGGCCATCTTTCAGGCCAAACTGCTCCA
CGTTTTGATGAATCTTCTGCCACTTTGTGCATACATGCCTCAAGTGGAACATTCCAAGCA
GCATAGATCATCAGAGTCTTTGCATAGAGGTGGCTCGTTCTGAGATCTTTGGTTGTAGCA
TTCATTCGACATTGGCTTTTGGTAAACGGCAGCACTAACTTCATTCAGTTCATCTTTCTT
AATCGTCTTTAACTCCCAGCACATTGCCTTTGTGAGCTTTGACATTGCTTTCCATATGCT
AACGTCTTCTTCGTCCTTCCTGTAAACTGGAGTTGCCGACCAGACAAAGAAACCACCTGG
CCTCAATGCACGGT
CC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2BC09TF 794 0 0
ACTCCCAGCACAT*GCCTTTGTGAGCTTTGACATTGCTTTCCATATGCTAACGTCTTCTT
CGTC*TTCCTGTAAACTGGAGTTGCCGACCAGACAAAGAAACAACCTGGCCTCAATGCAC
GGTTCAATTCCAATAGTAGTTTACCACCTTCAATATGCCAAGGGACTCTACAACGAGCAC
AGTGGATAAGGTCGAAAACAGATCCTGGAAAAGGCAATCTCTTGGTTCCCATAACGTTTG
ACATTGCAGGGATACCACGTTCCAAAGCAAACTGCACCTGCGCCTCGTGTTCATCTTTGG
GAGCAAATGACAAAGCAAGCACATCTCTGTCAAAAAGATATCCTCCGAAGCTAGCAACAC
CACACCCAACATCCAATATAACACGTGTTCTGTTTCCCCAAGCAATGTCAGGATATGACT
CTTGGAGGAAATCGATGTAGTGGAGAGCACCGTTCTTGAACTGAGTACCACCACCAGGGA
ATGTTAAGTATTCACCACTCATCTTCACCCAGTTTTGATGTCCTTTGACTTCTGCAAGCT
TCATGTGAGGAACATTGGTATACCAGATCTTTTCTCTGCTCTTAGGCCATTTGATGGATC
GCTTATACCCTTCGGGAAGAGAAACAAGGCAGCTTGGGGCTTCCTCGGGACAATGCCTCT
CACGATGCTCATAATGCTTTCTGGCGAGCTTCCTGATAGCTTCCCAGTTGTCAAGGCAAG
GGATGTAGTCTGGTCCAGCAGTGACATTGCATACTTTCCATTTGATAGAGGAGACTTGAG
CTTTCTTCTCGTTC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 9

CO CL709Contig1 822 9 13 U
GGGTCGCCCGCATCTCTCTCTGTTTATTTATTCTTATCTCCTTTGCACTCTCCAAAGAGA
GAAACCAGCTAATAATCAAATCTCAAGATGAATAGGGAGAAGTTGATGAAGATGGCCAAC
ACTGTCC*GCACTGGCGGAAAGGGTACAGTAAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGAC
CAATACAACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTGAAGAGAATTGGAGTTAACTCCAT
TCCAGGAATTGAAGAAGTTAACATCTTTAAAGATGATGTTGTTATTCAGTTCACCAATCC
TAAGGTTCAAGCTTCAATTGCTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAA
AAAATTGGAAGATATCCTTCCTCAAATCCTCAGCCAACTCGGGCCAGACAACATGGACAA
TCTGAGGAAGCTAGCAGAGCAGCTGAAGAAGCAACCTCCTGGTGAAGGTAATGCCTCAGC
AACCATCCAAGAGGAGGATGACGATGATGTCCCAGACCTTGTAGCTGGTGAGACATTCGA
AGCTGCCGCTGCTGAAGAGAAAGTACCGGCTGCTGCTCCTGCTGCTGCCGCGTCTTCCTA
GACAAGAAAAAAAGCACTTGGATTTCTGCGTATCTTTATATATGTTTGTTCTCTCCATCC
TTTTCTTTTGTAGTGTTTCCGACCAGATTCTACTTTCCCAGATAATGATTTTAAGGTTTT
CTTTTTTTATCTAATTGATTATTTCACTGGTGGTTCTCGTGTCTCCATTTCTTACATGGA
TTGGATTGGATCTGATGTGACACATTTGTCACTTTTCTTACC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 25 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 25 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 25 55 55 55 25 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS34TF U 1
AF RR2F586TF U 1
AF RR2AU35TF U 33
AF RR2D533TF U 1
AF RR2F586JQ C 24
AF RR2D533JQ C 90
AF RR2AE91JQ C 45
AF RR2AE91TF U 45
AF RR2AU35JQ C 45
BS 1 475 RR2D533TF
BS 476 476 RR2GS34TF
BS 477 489 RR2D533TF
BS 490 490 RR2GS34TF
BS 491 612 RR2D533TF
BS 613 613 RR2AU35TF
BS 614 715 RR2D533TF
BS 716 716 RR2AE91TF
BS 717 727 RR2D533TF
BS 728 728 RR2AE91TF
BS 729 739 RR2D533TF
BS 740 748 RR2AE91TF
BS 749 822 RR2AU35JQ

RD RR2GS34TF 675 0 0
GGGC
CGCCCGCATCTCTCTCTGTTTATTTATTCTTATCTCCTTTTCACTCTCCAAAGAGAGAAC
CCAGCTAATAATCAAATCTCAAGATGAATAGGGAGAAGTTGATGAAGATGGCCAACACTG
TCC*GCACTGGCGGAAAGGGTACAGTAAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAAT
ACAACTGATGGCAAGAAGCTTCAAAGCACCTTGAAGAGAATTGGAGTTAACTCCATTCCA
GGAATTGAAGAAGTTAACATCTTTAAAGATGATGTTGTTATTCAGTTCACCAATCCTAAG
GTTCAAGCTTCAATTGCTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAA
TTGGAAGATATCCTTCCTCAAATCCTCAGCCAACTCGGGCCAGACAACATGGACAATCTG
AGGAAGCTAGCAGAGCAGCTGAAGAAGCAACCTCCTGGTGAAGGTAATGCCTCAGCAACC
ATCCAAGAGGAGGATGACGATGATGTCCCAGACCTTGTAGCTGGTGAGACATTCGAAGCT
GCCGCTGCTGAAGAGAAAGTACCGGCTGCTGCTCCTGCTGCTGCCGCGTCTTCCTAGACA
AGAAAAAA*GCACTTGGATTTCTGCGTATCTTTATATATGTTTGTTCTCTC*ATCCTTT*
CTTTTGTAGTG

QA 5 675 5 675
DS 

RD RR2F586TF 666 0 0
GGGC
CGCCCGCATCTCTCTCTGTTTATTTATTCTTATCTCCTTTGCACTCTCCAAAGAGAGAAA
CCAGCTAATAATCAAATCTCAAGATGAATAGGGAGAAGTTGATGAAGATGGCCAACACTG
TCC*GCACTGGCGGAAAGGGTACAGTAAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAAT
ACAACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTGAAGAGAATTGGAGTTAACTCCATTCCA
GGAATTGAAGAAGTTAACATCTTTAAAGATGATGTTGTTATTCAGTTCACCAATCCTAAG
GTTCAAGCTTCAATTACTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAA
TTGGAAGATATCCTTCCTCAAATCCTCAGCCAACTCGGGCCAGACAACATGGACAATCTG
AGGAAGCTAGCAGAGCAGCTGAAGAAGCAACCTCCTGGTGAAGGTAATGCCTCAGCAACC
ATCCAAGAGGAGGATGACGATGATGTCCCAGACCTTGTAGCTGGTGAGACATTCGAAGCT
GCCGCTGCTGAAGAGAAAGTACCGGCTGCTGCTCCTGCTGCTGCCGCGTCTTCCTAGACA
AGAAAAAA*GCACTTGGATTTCTGCGTATCTTTATATATGTTTGTTCTCTCCATCCTTTT
CT

QA 5 666 5 666
DS 

RD RR2AU35TF 676 0 0
CTTATCTCCTTTCCACTCTCCAAAGAGAGAAACCAGCTAATAATCAAATCTCAAGATGAA
TAGGGAGAAGTTGATGAAGATGGCCAACACTGTCC*GCACTGGCGGAAAGGGTACAGTTA
GAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACAACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCA
CCTTGAAGAGAATTGGAGTTAACTCCATTCCAGGAATTGAAGAAGTTAACATCTTTAAAG
ATGATGTTGTTATTCAGTTCACCAATCCTAAGGTTCAAGCTTCAATTGCTGCGAACACAT
GGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGATATCCTTCCTCAAATCCTCA
GCCAACTCGGGCCAGACAACATGGACAATCTGAGGAAGCTAGCAGAGCAGTTGAAGAAGC
AACCTCCTGGTGAAGGCAATGCCTCAGCAACCATTCAAGAGGAGGATGACGATGATGTCC
CAGATCTTGTAGCTGGTGAGACATTCGAAGCTGCTGCGGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTC
CTGCTGCTGCTGCTGCTGCGTCTTCCTAGACAA*AAAAAAAGCACTTGGATTTCTGCGTA
TCTTTATATATGTTTGTTCTCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGTTTCCGACCAGATTCTA
CTTTCCCAGATAATGA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2D533TF 750 0 0
GGGTCGCCCGCATCTCTCTCTGTTTATTTATTCTTATCTCCTTTGCACTCTCCAAAGAGA
GAAACCAGCTAATAATCAAATCTCAAGATGAATAGGGAGAAGTTGATGAAGATGGCCAAC
ACTGTCC*GCACTGGCGGAAAGGGTACAGTAAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGAC
CAATACAACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTGAAGAGAATTGGAGTTAACTCCAT
TCCAGGAATTGAAGAAGTTAACATCTTTAAAGATGATGTTGTTATTCAGTTCACCAATCC
TAAGGTTCAAGCTTCAATTGCTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAA
AAAATTGGAAGATATCCTTCCTCAAATCCTCAGCCAACTCGGGCCAGACAACATGGACAA
TCTGAGGAAGCTAGCAGAGCAGCTGAAGAAGCAACCTCCTGGTGAAGGTAATGCCCCAGC
AACCATCCAGGAGGAGGATGACGATGATGTCCCAGACCTTGTAGCTGGTGAGACATTCGA
AGCTGCCGCTGCTGAAGAGAAAGTACCGGCTGCTGCTCCTGCTGCTGCCGCGTCTTCCTA
GACAAGAAAAAA*GCACTTGGATTTCTGCGTATCTTTATATATGTTTGTTCTCTCCATCC
TTTTCTTTTGTAGTGTTTCCGACCAGATTCTACTTTCCCAGATAATGATTTTAAG*TTTT
CTTTTTT*ATCTAATTGAT
ATTTCAAAAAA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2F586JQ 725 0 0
TTATTTATTCTTATCTCCTTTGCACTCTCCAAAGAGAGAAACCAGCTAATAATCAAATCT
CAAGATGAATAGGGAGAAGTTGATGAAGATGGCCAACACTGTCC*GCACTGGCGGAAAGG
GTACAGTAAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACAACTGATGACAAGAAGC
TTCAAAGCACCTTGAAGAGAATTGGAGTTAACTCCATTCCAGGAATTGAAGAAGTTAACA
TCTTTAAAGATGATGTTGTTATTCAGTTCACCAATCCTAAGGTTCAAGCTTCAATTACTG
CAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGATATCCTTCCTC
AAATCCTCAGCCAACTCGGGCCAGACAACATGGACAATCTGAGGAAGCTAGCAGAGCAGC
TGAAGAAGCAACCTCCTGGTGAAGGTAATGCCTCAGCAACCATCCAAGAGGAGGATGACG
ATGATGTCCCAGACCTTGTAGCTGGTGAGACATTCGAAGCTGCCGCTGCTGAAGAGAAAG
TACCGGCTGCTGCTCCTGCTGCTGCCGCGTCTTCCTAGACAAGAAAAAAAGCACTTGGAT
TTCTGCGTATCTTTATATATGTTTGTTCTCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGTTTCCGAC
CAGATTCTACTTTCCCAGATAATGATTTTAAGGTTTTCTTTTTTTATCTAATTGATTATT
TCACT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2D533JQ 642 0 0
GAATAGGGAGAAGTTGATGAAGATGGCCAACACTGTCCCGCACTGGCGGAAAGGGTACAG
TAAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACAACTGATGACAAGAAGCTTCAAA
GCACCTTGAAGAGAATTGGAGTTAACTCCATTCCAGGAATTGAAGAAGTTAACATCTTTA
AAGATGATGTTGTTATTCAGTTCACCAATCCTAAGGTTCAAGCTTCAATTGCTGCAAACA
CATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGATATCCTTCCTCAAATCC
TCAGCCAACTCGGGCCAGACAACATGGACAATTTGAGGAAGCTAGCAGAGCAGCTGAAGA
AGCAACCTCCTGGTGAAGGTAATGCCCCAGCAACCATCCAGGAGGAGGATGACGATGATG
TCCCAGACCTTGTAGCTGGTGAGACATTCGAAGCTGCCGCTGCTGAAGAGAAAGTACCGG
CTGCTGCTCCTGCTGCTGCCGCGTCTTCCTAGACAAGAAAAAAAGCACTTGGATTTCTGC
GTATCTTTATATATGTTTGTTCTCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGTTTCCGACCAGATT
CTACTTTCCCAGATAATGATTTTAAGGTTTTCTTTTTTTATC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2AE91JQ 711 0 0
GCACTCTCCAAAGAGAGAAACCAGCTAATAATCAAATCTCAAGATGAAT*GGGAGAAGTT
GATGAAGATGGCCAACACTGTCC*GCACTGGCGGAAAGGGTACAGTAAGAAGAAAGAAGA
AGGCTGTGCACAAGACCAATACAACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTGAAGAGAA
TTGGAGTTAACTCCATTCCAGGAATTGAAGAAGTTAACATCTTTAAAGATGATGTTGTTA
TTCAGTTCACCAATCCTAAGGTTCAAGCTTCAATTGCTGCAAACACATGGGTTGTTAGCG
GTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGATATCCTTCCTCAAATCCTCAGCCAACTCGGGC
CAGACAACATGGACAATCTGAGGAAGCTAGCAGAGCAGCTGAAGAAGCAACCTCCTGGTG
AAGGTAATGCCTCAGCAACCATCCAAGAGGAGGATGACGATGATGTCCCAGACCTTGTAG
CTGGTGAGACATTCGAAGCTGCCGCTGCTGAAGAGAAAGTACCGGCTGCTGCTCCTGCTG
CTGCCGCGTCTTCCTAGACAAGAAAAAAAGCACTTGGATTTCTGCGTATCTTTATATATG
TTTGTTCTCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGTTTCCGACCAGATTCTACTTTCCCAGATA
ATGATTTTAAGGTTTTCTTTTTTTATCTAATTGATTATTTCACT
GGTGGCT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2AE91TF 710 0 0
GCACTCTCCAAAGAGAGAAACCAGCTAATAATCAAATCTCAAGATGAAT*GGGAGAAGTT
GATGAAGATGGCCAACACTGTCC*GCACTGGCGGAAAGGGTACAGTAAGAAGAAAGAAGA
AGGCTGTGCACAAGACCAATACAACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTGAAGAGAA
TTGGAGTTAACTCCATTCCAGGAATTGAAGAAGTTAACATCTTTAAAGATGATGTTGTTA
TTCAGTTCACCAATCCTAAGGTTCAAGCTTCAATTGCTGCAAACACATGGGTTGTTAGCG
GTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGATATCCTTCCTCAAATCCTCAGCCAACTCGGGC
CAGACAACATGGACAATCTGAGGAAGCTAGCAGAGCAGCTGAAGAAGCAACCTCCTGGTG
AAGGTAATGCCTCAGCAACCATCCAAGAGGAGGATGACGATGATGTCCCAGACCTTGTAG
CTGGTGAGACATTCGAAGCTGCCGCTGCTGAAGAGAAAGTACCGGCTGCTGCTCCTGCTG
CTGCCGCGTCTTCCTAGACAAGAAAAAAAGCACTTGGATTTCTGCGTATCTTTATATATG
TTTGTTCTCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGTTTCCGACCAGATTCTACTTTCCCAGATA
ATGATTTTAAGGTTTTCTTTTTTTATCTAATTGATTATTTCACT
GGTGGC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2AU35JQ 778 0 0
C
CACTCTCCAAAGAGAGAAACCAGCTAATAATCAAATCTCAAGATGAATAGGGAGAAGTTG
ATGAAGATGGCCAACACTGTCC*GCACTGGCGGAAAGGGTACAGTTAGAAGAAAGAAGAA
GGCTGTGCACAAGACCAATACAACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTGAAGAGAAT
TGGAGTTAACTCCATTCCAGGAATTGAAGAAGTTAACATCTTTAAAGATGATGTTGTTAT
TCAGTTCACCAATCCTAAGGTTCAAGCTTCAATTGCTGCGAACACATGGGTTGTTAGCGG
TTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGATATCCTTCCTCAAATCCTCAGCCAACTCGGGCC
AGACAACATGGACAATCTGAGGAAGCTAGCAGAGCAGTTGAAGAAGCAACCTCCTGGTGA
AGGCAATGCCTCAGCAACCATTCAAGAGGAGGATGACGATGATGTCCCAGATCTTGTAGC
TGGTGAGACATTCGAAGCTGCTGCGGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTCCTGCTGCTGCTGC
TGCTGCGTCTTCCTAGACAA*AAAAAAAGCACTTGGATTTCTGCGTATCTTTATATATGT
TTGTTCTCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGTTTCCGACCAGATTCTACTTTCCCAGATAA
TGATTTTAAGGTTTTCTTTTTT*ATCTAATTGATTATTTCACTGGTGGTTCTCGTGTCTC
CATTTCTTACATGGATTGGATTGGATCTGATGTGACACATTTGTCACTTTTCTTACC

QA 2 778 2 778
DS 



AS 1 9

CO CL710Contig1 870 9 18 U
GGACTCTTCAAAGTCTCCACCACACACTTCTTCTCCATTAAAACTTTTTTCTCACATCTC
TCATAAACACCCAAAGAGCAAAAAAAAGAGAGAGAGAAGAAACTCACAATGGCCACTCCC
TTCTCTACCTTGACACCTTTTCTTTTCATACTCCTTCTCTCCATCCCTATCGTTCTTGGC
GCTTCTCATCACCACACTGCGGCTCCAGCTCCTGCCGTAGACTGTTCGATGCTCATACTC
AACATGGCTGATTGTTTGTCTTTCGTTTCCGCTGGAGGCACGGAGGCTAAGCCGGCTAGT
TCGTGCTGCAACGGGCTTAAGACGGTGCTCAAGACCGACGCAGAGTGTCTCTGTGAGGCG
TTTAAAAGCAGCGCTTCTCTAGGCGTTACCTTGAACATGACTAAAGCAACTACACTTCCC
GCTGCATGCAAGCTTCACGCTCCTTCCATCGCTGCTTGTGGATTGTCCGTCGCTCCTACT
ATGGCTCCAGGTCTTGCTCCAGGAGGAGCTGTTGCAGCAGCTGGACCCGACTTAGTTAAT
GTTCTAGCTCCAAACCCATCTCCAGGGAACGACGGATCTTCCTTGGTTCCGATCTCCTTC
ACCACCGTACTCAGTGCTGCGTTCTTCCTATTGTTCTTGTCTCGTGTCTGAAAAAAGCCT
TATTCACCAGCTAGATTTGGTTGTATGAAATGGCTTTGGGTTTTCATGACTTTAGTTTTG
CGTGTCTTTTGAGTCTTCTGTGTTCAGAC*******CATGTCGGTTTCTGTTCTTAGTTT
TACTCTTAATTATGTTTCCATTGGTCCTTTATAAGAGCATCTCTGATTACTCTTATATTG
ATGGTTATTAAATTTCTAGTTTTCCTAAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 10 

AF RR2AL54JQ C 396
AF RR2AP90TF U 1
AF RR2BX19TF U 1
AF RR2D632TF U 69
AF RR2AL54TF U 104
AF RR2D632JQ C 135
AF RR2BX19JQ C 155
AF RR2AB43JQ C 231
AF RR2AB43TF U 231
BS 1 173 RR2AP90TF
BS 174 174 RR2BX19TF
BS 175 488 RR2AP90TF
BS 489 489 RR2BX19TF
BS 490 517 RR2AP90TF
BS 518 518 RR2BX19TF
BS 519 759 RR2AP90TF
BS 760 766 RR2BX19TF
BS 767 767 RR2AL54TF
BS 768 780 RR2D632TF
BS 781 781 RR2AL54TF
BS 782 813 RR2D632TF
BS 814 814 RR2AL54TF
BS 815 827 RR2D632TF
BS 828 828 RR2AL54TF
BS 829 845 RR2D632TF
BS 846 867 RR2AL54TF
BS 868 870 RR2AB43JQ

RD RR2AL54JQ 103 0 0
TGACTAAAAGCA
AACTACACTTCCCGCTGCATGCAAGCTTCACGCTCCTTCCATCGCTGCTTGTGGATTGTC
CGTCGCTCCTACTATGGCTCCAGGTCTTGCT

QA 13 103 13 103
DS 

RD RR2AP90TF 759 0 0
GGACTCTTCAAAGTCTCCACCACACACTTCTTCTCCATTAAAACTTTTTTCTCACATCTC
TCATAAACACCCAAAGAGCAAAAAAAAGAGAGAGAGAAGAAACTCACAATGGCCACTCCC
TTCTCTACCTTGACACCTTTTCTTTTCATACTCCTTCTCTCCATCCCTATCGTCCTTGGC
GCTTCTCATCACCACACTGCGGCTCCAGCTCCTGCCGTAGACTGTTCGATGCTCATACTC
AACATGGCTGATTGTTTGTCTTTCGTTTCCGCTGGAGGCACGGAGGCTAAGCCGGCTAGT
TCGTGCTGCAACGGGCTTAAGACGGTGCTCAAGACCGACGCAGAGTGTCTCTGTGAGGCG
TTTAAAAGCAGCGCTTCTCTAGGCGTTACCTTGAACATGACTAAAGCAACTACACTTCCC
GCTGCATGCAAGCTTCACGCTCCTTCCATCGCTGCTTGTGGATTGTCCGTCGCTCCTACT
ATGGCTCCTGGTCTTGCTCCAGGAGGAGCTGTTGCAGTAGCTGGACCCGACTTAGTTAAT
GTTCTAGCTCCAAACCCATCTCCAGGGAACGACGGATCTTCCTTGGTTCCGATCTCCTTC
ACCACCGTACTCAGTGCTGCGTTCTTCCTATTGTTCTTGTCTCGTGTCTGAAAAAAGCCT
TATTCACCAGCTAGATTTGGTTGTATGAAATGGCTTTGGGTTTTCATGACTTTAGTTTTG
CGTGTCTTTTGAGTCTTCTGTGTTCAGAC*******CAT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2BX19TF 785 0 0
GGACTCTTCAAAGTCTCCACCACACACTTCTTCTCCATTAAAACTTTTTTCTCACATCTC
TCATAAACACCCAAAGAGCAAAAAAAAGAGAGAGAGAAGAAACTCACAATGGCCACTCCC
TTCTCTACCTTGACACCTTTTCTTTTCATACTCCTTCTCTCCATCCCTATCGTTCTTGGC
GCTTCTCATCACCACACTGCGGCTCCAGCTCCTGCCGTAGACTGTTCGATGCTCATACTC
AACATGGCTGATTGTTTGTCTTTCGTTTCCGCTGGAGGCACGGAGGCTAAGCCGGCTAGT
TCGTGCTGCAACGGGCTTAAGACGGTGCTCAAGACCGACGCAGAGTGTCTCTGTGAGGCG
TTTAAAAGCAGCGCTTCTCTAGGCGTTACCTTGAACATGACTAAAGCAACTACACTTCCC
GCTGCATGCAAGCTTCACGCTCCTTCCATCGCTGCTTGTGGATTGTCCGTCGCTCCTACT
ATGGCTCCAGGTCTTGCTCCAGGAGGAGCTGTTGCAGCAGCTGGACCCGACTTAGTTAAT
GTTCTAGCTCCAAACCCATCTCCAGGGAACGACGGATCTTCCTTGGTTCCGATCTCCTTC
ACCACCGTACTCAGTGCTGCGTTCTTCCTATTGTTCTTGTCTCGTGTCTGAAAAA*GCCT
TATTCACCAGCTAGATTTGGTTGTATGAAATGGCTTTGGGTTTTCATGACTTTAGTTTTG
CGTGTCTTT*GAGTCTTCTGTGT*CAGAC*******CATGTCGGTT
CTGTCTAGTTTACTCTTAA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2D632TF 789 0 0
GGACCCAAAGAGC
AAAAAAGAGAGAGAGAAGAAACTCACAATGGCCACTCCCTTCTCTACCTTGACACCTTTT
CTTTTCATACTCCTTCTCTCCATCCCTATCGTTCTTGGCGCTTCTCATCACCACACTGCG
GCGCCAGCTCCTGCCGTAGACTGTTCGATGCTCATACTCAACATGGCTGATTGTTTGTCT
TTCGTTTCCGCTGGAGGCACGGAGGCTAAGCCGGCTAGTTCGTGCTGCAACGGGCTTAAG
ACGGTGCTCAAGACCGACGCAGAGTGTCTCTGTGAGGCGTTTAAAAGCAGCGCTTCTCTA
GGCGTTACCTTGAACATGACTAAAGCAACTACACTTCCCGCTGCATGCAAGCTTCACGCT
CCTTCTATCGCTGCTTGTGGATTGTCCGTCGCTCCTACTATGGCTCCAGGTCTTGCTCCA
GGAGGAGCTGTTGCAGCTGCTGGACCCGACTTAGTTAATGTTCTAGCTCCAAACCCATCT
CCAGGGAACGACGGATCTTCCTTGGTTCCGATCTCCTTCACCACCGTACTCAGTGCTGCG
TTCTTCCTATTGTTCTTGTCTCGTGTCTGAAAAAAGCCTTATTCACCAGCTAGATTTGGT
TGTATGAAATGGCTTTGGGTTTTCATGACTTTAGTTTTGCGTGTCTTTTGAGTCTTCTGT
GTTCAGACTTCAGACCATGTCGGTT*CTGTTCTTAGTTT*ACTCTTAATTATGTTTCCAT
TGGTCCTTTATA*GAGCATCTCTGAT*ACTCTTATATTGATGGT
ATAAATTTCTAG

QA 14 777 14 777
DS 

RD RR2AL54TF 764 0 0
GG
ACAATGGCCACTCCCTTCTCTACCTTGACACCTTTTCTTTTCATACTCCTTCTCTCCATC
CCTATCGTTCTTGGCGCTTCTCATCACCACACTGCGGCTCCAGCTCCTGCCGTAGACTGT
TCGATGCTCATACTCAACATGGCTGATTGTTTGTCTTTCGTTTCCGCTGGAGGCACGGAG
CCTAAGCCGGCTAGTTCGTGCTGCAACGGGCTTAAGACGGTGCTCAAGACTGACGCAGAG
TGTCTCTGTGAGGCGTTTAAAAGCAGCGCTTCTCTAGGCGTTACCTTGAACATGACTAAA
GCAACTACACTTCCCGCTGCATGCAAGCTTCACGCTCCTTCCATCGCTGCTTGTGGATTG
TCCGTCGCTCCTACTATGGCTCCAGGTCTTGCTCCAGGAGGAGCTGTTGCAGCAGCTGGA
CCCGACTTAGTTAATGTTCTAGCTCCAAACCCATCTCCAGGGAACGACGGATCTTCCTTG
GTTCCGATCTCCTTCACCACCGTACTCAGTGCTGCGTTCTTCCTATTGTTCTTGTCTCGT
GTCTGAAAAAAGCCTTATTCACCAGCTAGATTTGGCTGTATGAAATGGCTTTGGGTTTTC
ATGACTTTAGTTTTGCGTGTCTTTTGAGTCTTCTGTGTTCAGAC*******CATGTCGGT
TTCTGTTCTTAGTTTTACTCTTAATTATGTTTCCATTGGTCCTTTATAAGAGCATCTCTG
ATTACTCTTATATTGATGGTTATTAAATTTCTAGTTTTCCTA

QA 3 764 3 764
DS 

RD RR2D632JQ 732 0 0
ACG
TTTTCTTTTCATACTCCTTCTCTCCATCCCTATCGTTCTTGGCGCTTCTCATCACCACAC
TGCGGCGCCAGCTCCTGCCGTAGACTGTTCGATGCTCATACTCAACATGGCTGATTGTTT
GTCTTTCGTTTCCGCTGGAGGCACGGAGGCTAAGCCGGCTAGTTCGTGCTGCAACGGGCT
TAAGACGGTGCTCAAGACCGACGCAGAGTGTCTCTGTGAGGCGTTTAAAAGCAGCGCTTC
TCTAGGCGTTACCTTGAACATGACTAAAGCAACTACACTTCCCGCTGCATGCAAGCTTCA
CGCTCCTTCTATCGCTGCTTGTGGATTGTCCGTCGCTCCTACTATGGCTCCAGGTCTTGC
TCCAGGAGGAGCTGTTGCAGCTGCTGGACCCGACTTAGTTAATGTTCTAGCTCCAAACCC
ATCTCCAGGGAACGACGGATCTTCCTTGGTTCCGATCTCCTTCACCACCGTACTCAGTGC
TGCGTTCTTCCTATTGTTCTTGTCTCGTGTCTGAAAAAAGCCTTATTCCCCAGCTAGATT
TGGTTGTATGAAATGGCTTTGGGTTTTCATGACTTTAGTTTTGCGTGTCTTTTGAGTCTT
CTGTGTTCAGACTTCAGACCATGTCGGTTTCTGTTCTTAGTTTTACTCTTAATTATGTTT
CCATTGGTCCTTTATAAGAGCATCTCTGATTACTCTTATATTGATGGTTATTAAATTTCT
AGTTTTCCT

QA 4 732 4 732
DS 

RD RR2BX19JQ 716 0 0
TTCTCTCCATCCCTATCGTTCTTGGCGCTTCTCATCACCACACTGCGGCTCCAGCTCCTG
CCGTAGACTGTTCGATGCTCATACTCAACATGGCTGATTGTTTGTCTTTCGTTTCCGCTG
GAGGCACGGAGGCTAAGCCGGCTAGTTCGTGCTGCAACGGGCTTAAGACGGTGCTCAAGA
CCGACGCAGAGTGTCTCTGTGAGGCGTTTAAAAGCAGCGCTTCTTTAGGCGTTACCTTGA
ACATGACTAAAGCAACTACACTTCCCGCTGCATGCAAGCTTCACGCTCCTTCCATCGCTG
CTTGTGGATTGTCCGTCGCTCCTACTATGGCTCCAGGTCTTGCTCCAGGAGGAGCTGTTG
CAGCAGCTGGACCCGACTTAGTTAATGTTCTAGCTCCAAACCCATCTCCAGGGAACGACG
GATCTTCCTTGGTTCCGATCTCCTTCACCACCGTACTCAGTGCTGCGTTCTTCCTATTGT
TCTTGTCTCGTGTCTGAAAAAAGCCTTATTCACCAGCTAGATTTGGTTGTATGAAATGGC
TTTGGGTTTTCATGACTTTAGTTTTGCGTGTCTTTTGAGTCTTCTGTGTTCAGAC*****
**CATGTCGGTTTCTGTTCTTAGTTTTACTCTTAATTATGTTTCCATTGGTCCTTTATAA
GAGCATCTCTGATTACTCTTATATTGATGGTTATTAAATTTCTAGTTTTCCTA
AGC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2AB43JQ 640 0 0
AGGG
ATACTCAACATGGCTGATTGTTTGTCTTTCGTTTCCGCTGGAGGCACGGAGGCTAAGCCG
GCTAGTTCGTGCTGCAACGGGCTTAAGACGGTGCTCAAGACCGACGCAGAGTGTCTCTGT
GAGGCGTTTAAAAGCAGCGCTTCTCTAGGCGTTACCTTGAACATGACTAAAGCAACTACA
CTTCCCGCTGCATGCAAGCTTCACGCTCCTTCCATCGCTGCTTGTGGATTGTCCGTCGCT
CCTACTATGGCTCCAGGTCTTGCTCCAGGAGGAGCTGTTGCAGCAGCTGGACCCGACTTA
GTTAATGTTCTAGCTCCAAACCCATCTCCAGGGAACGACGGATCTTCCTTGGTTCCGATC
TCCTTCACCACCGTACTCAGTGCTGCGTTCTTCCTATTGTTCTTGTCTCGTGTCTGAAAA
AAGCCTTATTCACCAGCTAGATTTGGTTGTATGAAATGGCTTTGGGTTTTCATGACTTTA
GTTTTGCGTGTCTTTTGAGTCTTCTGTGTTCAGAC*******CATGTCGGTTTCTGTTCT
TAGTTTTACTCTTAATTATGTTTCCATTGGTCCTTTATAAGAGCATCTCTGATTACTCTT
ATATTGATGGTTATTAAATTTCTAGTTTTCCTAAGC

QA 5 640 5 640
DS 

RD RR2AB43TF 640 0 0
AGGG
ATACTCAACATGGCTGATTGTTTGTCTTTCGTTTCCGCTGGAGGCACGGAGGCTAAGCCG
GCTAGTTCGTGCTGCAACGGGCTTAAGACGGTGCTCAAGACCGACGCAGAGTGTCTCTGT
GAGGCGTTTAAAAGCAGCGCTTCTCTAGGCGTTACCTTGAACATGACTAAAGCAACTACA
CTTCCCGCTGCATGCAAGCTTCACGCTCCTTCCATCGCTGCTTGTGGATTGTCCGTCGCT
CCTACTATGGCTCCAGGTCTTGCTCCAGGAGGAGCTGTTGCAGCAGCTGGACCCGACTTA
GTTAATGTTCTAGCTCCAAACCCATCTCCAGGGAACGACGGATCTTCCTTGGTTCCGATC
TCCTTCACCACCGTACTCAGTGCTGCGTTCTTCCTATTGTTCTTGTCTCGTGTCTGAAAA
AAGCCTTATTCACCAGCTAGATTTGGTTGTATGAAATGGCTTTGGGTTTTCATGACTTTA
GTTTTGCGTGTCTTTTGAGTCTTCTGTGTTCAGAC*******CATGTCGGTTTCTGTTCT
TAGTTTTACTCTTAATTATGTTTCCATTGGTCCTTTATAAGAGCATCTCTGATTACTCTT
ATATTGATGGTTATTAAATTTCTAGTTTTCCTA
AGC

QA 5 637 5 637
DS 



AS 1 9

CO CL711Contig1 729 9 10 U
GGGAGAGAGAGGATGATGACTATGATGATGTCTCTCCCCAAAATGAAACTATCTTCTCTC
CAACCTCATCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCACCAGCTAAGGCGTCGTCTCCG
AGCTCAACCATAAGCACCACGGCATCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCACAAGA
AGAAGAAGATCAACGGCGGAAAGATCCACCAGAACCAAACTTGAAAAGACGCAACCTTTG
GGTCTGGAGAAGAAGCAATTAAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTTGATG
ATGGCTCTGGTAATGGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCT
CTGATGGAAGAGTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTTACCGTCAGC
ACGGGAGCTCTCTCCGCTGTCTTTGAGCCCATCTTCGAACTCCTCAAGAACCCAATCTCC
GCCGTTCTCATCGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGTCTCCCAAGTCGTCTCG
GCCATGGTTGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTATGGATACTGAGAGAGAGAGAGAGTT
TGTTTGTTTTCTCTTTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATTGAT
ACTCTGTTTATGCATTAGTCTTATAATCTTTATTTGATTTTTGTTACATTTTATTTGACA
TAAAAAGGG


BQ
10 30 30 30 30 30 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 25 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN91JQ C 1
AF RR2D316TF U 2
AF RR2D316JQ C 117
AF RR2AN91TF U 1
AF RR2GC73TF U 2
AF RR2CD06TF U 7
AF RR2CD06JQ C 7
AF RR2C086TF U 6
AF RR2C086JQ C 117
BS 1 1 RR2AN91JQ
BS 2 356 RR2D316TF
BS 357 357 RR2AN91TF
BS 358 538 RR2D316TF
BS 539 539 RR2AN91TF
BS 540 674 RR2D316TF
BS 675 676 RR2AN91TF
BS 677 706 RR2GC73TF
BS 707 721 RR2C086TF
BS 722 729 RR2C086JQ

RD RR2AN91JQ 676 0 0
GGGAGAGAGAGGATGATGACTATGATGATGTCTCTCCCCAAAATGAAACTATCTTCTCTC
CAACCTCATCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCACCAGCTAAGGCGTCGTCTCCG
AGCTCAACCATAAGCACCACGGCATCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCACAAGA
AGAAGAAGATCAACGGCGGAAAGATCCACCAGAACCAAACTTGAAAAGACGCAACCTTTG
GGTCTGGAGAAGAAGCAATTAAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTTGATG
ATGGCTCTGGTAATGGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCT
CTGATGGAAGAGTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTTACCGTCAGC
ACGGGAGCTCTCTCCGCTGTCTTTGAGCCCATCTTCGAACTCCTCAAGAACCCAATCTCC
GCCGTTCTCATCGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGTCTCCCAAGTCGTCTCG
GCCATGGTTGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTATGGATACTGAGAGAGAGAGAGAGTT
TGTTTGTTTTCTCTTTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATTGAT
ACTCTGTTTATGCATT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2D316TF 678 0 0
GGAGAGAGAGGATGATGACTATGATGATGTCTCTCCCCAAAATGAAACTATCTTCTCTCC
AACCTCATCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCACCAGCTAAGGCGTCGTCTCCGA
GCTCAACCATAAGCACCACGGCATCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCACAAGAA
GAAGAAGATCAACGGCGGAAAGATCCACCAGAACCAAACTTGAAAAGACGCAACCTTTGG
GTCTGGAGAAGAAGCAATTAAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTTGATGA
TGGCTCTGGTAATGGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGCCCTC
TGATGGAAGAGTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTTACCGTCAGCA
CGGGAGCTCTCTCCGCTGTCTTTGAGCCCATCTTCGAACTCCTCAAGAACCCAATCTCCG
CCGTTCTCATCGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGTCTCCCAAGTCGTCTTGG
CCATGGTTGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTATGGATACTGAGAGAGAGAGAGAGTTT
GTTTGTTTTCTCTTTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATTGATA
CTCTGTTTATGCA
AAAAA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2D316JQ 557 0 0
TCCGAGCTCAACCATAAGCACCACGGCATCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCAC
AAGAAGAAGAAGATCAACGGCGGAAAGATCCACCAGAACCAAACTTGAAAAGACGCAACC
TTTGGGTCTGGAGAAGAAGCAATTAAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTT
GATGATGGCTCTGGTAATGGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGG
CCCTCTGATGGAAGAGTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTTACCGT
CAGCACGGGAGCTCTTTCCGCTGTCTTTGAGCCCATCTTCGAACTCCTCAAGAACCCAAT
TTCCGCCGTTCTCATCGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGTCTCCCAAGTCGT
CTTGGCCATGGTTGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTATGGATACTGAGAGAGAGAGAG
AGTTTGTTTGTTTTCTCTTTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCAT
TGATACTCTGTTTATGC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2AN91TF 676 0 0
G
GGAGAGAGAGGATGATGACTATGATGATGTCTCTCCCCAAAATGAAACTATCTTCTCTCC
AACCTCATCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCACCAGCTAAGGCGTCGTCTCCGA
GCTCAACCATAAGCACCACGGCATCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCACAAGAA
GAAGAAGATCAACGGCGGAAAGATCCACCAGAACCAAACTTGAAAAGACGCAACCTTTGG
GTCTGGAGAAGAAGCAATTAAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTTGATGA
TGGCTCTGGTAATGGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCTC
TGATGGAAGAGTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTTACCGTCAGCA
CGGGAGCTCTCTCCGCTGTCTTTGAGCCCATCTTCGAACTCCTCAAGAACCCAATCTCCG
CCGTTCTCATCGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGTCTCCCAAGTCGTCTCGG
CCATGGTTGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTATGGATACTGAGAGAGAGAGAGAGTTT
GTTTGTTTTCTCTTTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATTGATA
CTCTGTTTATGCATT

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR2GC73TF 711 0 0
GGAGAGAGAGGATGATGACTATGATGATGTCTCTCCCCAAAATGAAGCTATCTTCTCTCC
AACCTCATCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCACCAGCTAAGGCGTCGTCTCCGA
GCTCAACCATAAGCACCACGGCATCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCACAAGAA
GAAGAAGATCAACGGCGGAAAGATCCACCAGAACCAAACTTGAAAAGACGCAACCTTTGG
GTCTGGAGAAGAAGCAATTAAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTTGATGA
TGGCTCTGGTAATGGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCTC
TGATGGAAGAGTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTATGCACTTACCGTCAGCA
CGGGAGCTCTCTCCGCTGTCTTTGAGCCCATCTTCGAACTCCTCAAGAACCCAATCTCCG
CCGTTCTCATCGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGTCTCCCAAGTCGTCTCGG
CCATGGTTGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTATGGATACTGAGAGAGAGAGAGAGTTT
GTTTGTTTTCTCTTTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATTGATA
CTCTGTTTATGCATTAGTCTTATAATCTTTATTTGATTTTTGTTA
CATTTT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2CD06TF 701 0 0
GG
GAGGATGATGACTATGATGATGTCTCTCCCCAAAATGAAACTATCTTCTCTCCAACCTCA
TCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCACCAGCTAAGGCGTCGTCTCCGAGCTCAAC
CATAAGCACCACGGCATCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCACAAGAAGAAGAAG
ATCAACGGCGGAAAGATCCACCAGAACCAAACTTGAAAAGACGCAACCTTTGGGTCTGGA
GAAGAAGCAATTAAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTTGATGATGGCTCT
GGTAATGGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCTCTGATGGA
AGAGTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTTACCGTCGGCACGGGAGC
TCTCTCCGCTGTCTTTGGGCCCATCTTCGAGCTCCTCAAGAACCCAATCTCCGCCGTTCT
CATCGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGTCTCCCAAGTCGTCTCGGCCATGGT
TGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTATGGATACTGAGAGAGAGAGAGAGTTTGTTTGTT
TTCTCTTTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATTGATACTCTGTT
TATGCATTAGTCTTATAATCTTTATTTGATTTTTGTTA
A

QA 3 700 3 700
DS 

RD RR2CD06JQ 699 0 0
GG
GAGGATGATGACTATGATGATGTCTCTCCCCAAAATGAAACTATCTTCTCTCCAACCTCA
TCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCACCAGCTAAGGCGTCGTTTCCGAGCTCAAC
CATAAGCACCACGGCATCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCACAAGAAGAAGAAG
ATCAACGGCGGAAAGATCCACCAGAACCAAACTTGAAAAGACGCAACCTTTGGGTCTGGA
GAAGAAGCAATTAAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTTGATGATGGCTCT
GGTAATGGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCTCTGATGGA
AGAGTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTTACCGTCGGCACGGGAGC
TCTCTCCGCTGTCTTTGGGCCCATCTTCGAGCTCCTCAAGAACCCAATCTCCGCCGTTCT
CATCGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGTCTCCCAAGTCGTCTCGGCCATGGT
TGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTATGGATACTGAGAGAGAGAGAGAGTTTGTTTGTT
TTCTCTTTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATTGATACTCTGTT
TATGCATTAGTCTTATAATCTTTATTTGATTTTTGTT

QA 3 699 3 699
DS 

RD RR2C086TF 716 0 0
G
GAGAGGATGATGACTATGATGATGTCTCTCCCCAAAATGAAACTATCTTCTCTCCAACCT
CATCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCACCAGCTAAGGCGTCGTCTCCGAGCTCA
ACCATAAGCACCACGGCATCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCACAAGAAGAAGA
AGATCAACGGCGGAAAGATCCACCAGAACCAAACTTGAAAAGACGCAACCTTTGGGTCTG
GAGAAGAAGCAATTAAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTTGATGATGGCT
CTGGTAATGGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCTCTGATG
GAAGAGTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTTACCGTCAGCACGGGA
GCTCTCTCCGCTGTCTTTGAGCCCATCTTCGAACTCCACAAGAACCCAATCTCCGCCGTT
CTCATCGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGTCTCCCAAGTCGTCTCGGCCATG
GTTGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTATGGATACTGAGAGAGAGAGAGAGTTTGTTTG
TTTTCTCTTTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATTGATACTCTG
TTTATGCATTAGTCTTATAATCTTTATTTGATTTTTGTTACATTTTATTTGACAT

QA 2 716 2 716
DS 

RD RR2C086JQ 613 0 0
TCCGAGCTCAACCATAAGCACCACGGCATCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCAC
AAGAAGAAGAAGATCAACGGCGGAAAGATCCACCAGAACCAAACTTGAAAAGACGCAACC
TTTGGGTCTGGAGAAGAAGCAATTAAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTT
GATGATGGCTCTGGTAATGGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGG
TCCTCTGATGGAAGAGTTTTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTTACCGT
CAGCACGGGAGCTCTTTCCGCTGTCTTTGAGCCCATCTTCGAACTCCACAAGAACCCAAT
TTCCGCCGTTCTCATCGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTTTACATCGTCTCCCAAGTCGT
TTCGGCCATGGTTGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTATGGATACTGAGAGAGAGAGAG
AGTTTGTTTGTTTTCTCTTTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCAT
TGATACTCTGTTTATGCATTAGTCTTATAATCTTTATTTGATTTTTGTTACATTTTATTT
GACATAAAAAGGG

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 7

CO CL712Contig1 860 7 10 U
AAAAATGAACGTCTCATGCTATAAATTTGGAATCAAGTTTGCTTATGGTTTATAGAAAAA
AAAAAATAGCCTCTAAAGTGGCGAAACACAAACAATGTTCGAGAAACGAGACATTCATTA
AGAAAAGAGGACAATTGCGTGACTCTGCAACTCAACCTACGTAGTGAGTTCCATGATGGC
GGAAACGATATCTCCATCATTGGCTTTAAGAGCCTTAGTGGCTTTGGCCTTGGAAACACC
AGCCTGAGTCATCACGAGCTCAACATCCTTGGCTTCAACACCGGTCTCATCAACATCATC
ATCATCTTCGTCCTCCTCTTGTGCAGCAACCGCGGCTG***CTTCAGAGGCATCGGCGTT
AGGGATCATAGAAGCAACGTCCGGCATCTTGAACCTCTGAGCAGCTTGAGCTTGTAGCTG
AAAGCTCATATCATCAATCTTGGCCTCACCGAATATCACATAGGTCTCAGAGTTGGGACT
CTTGAACACATCCGGCTTCGAGATGACAAACAAAACATTCTTTGATCTTTTGATAGTCAC
TCTGCTAACATCGGTGACAGGTTTCATTCCAAGTTTCAGCATAGCTTTGCGGCTTTTCTT
CTCGCTTCTGCTTTGTTTAGAGCTCTCATTGTCACCAGCTCCATCGACGTTGTCATCGTC
ATCGTCATCCACATCGTCGTCTTCATCTCCGTCTTTGACATCCTCAACGACAACATCATC
TTCCTTCTCGAGCCTCATTTGCTCTTTGATGGATTCCTCAATCTTAACTTCTTCAACAAC
AGGGCCTGGCATCTTCTTCTTCTTCTGCAACCTCTTATCTTCTTCAAACGAAACCCTTTT
AGAACAGCGCAGTGAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 
15 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2H143JQ U 43
AF RR2GB91JQ U 29
AF RR2BZ16JQ U 43
AF RR2G782JQ U 1
AF RR2GB91TF C 234
AF RR2H143TF C 131
AF RR2G782TF C 203
BS 1 209 RR2G782JQ
BS 210 210 RR2GB91JQ
BS 211 346 RR2G782JQ
BS 347 347 RR2GB91JQ
BS 348 370 RR2G782JQ
BS 371 371 RR2BZ16JQ
BS 372 469 RR2G782JQ
BS 470 470 RR2GB91JQ
BS 471 733 RR2G782JQ
BS 734 860 RR2H143TF

RD RR2H143JQ 323 0 0
TTATGGTTTAAA
AAAAAAAAAAAATAGCCTCTAAAGTGGCGAAACACAAACAATGTTCGAGAAACGAGACAT
TCATTAAGAAAAGAGGACAATTGCGTGACTCTGCAACTCAACCTACGTAGTGAGTTCCAT
GATGGCGGAAACGATATCTCCATCATTGGCTTTAAGAGCCTTAGTGGCTTTGGCCTTGGA
AACACCAGCCTGAGTCATCACGAGCTCAACATCCTTGGCTTCAACACCGGTCTCATCAAC
ATCATCATCATCTTCGTCCTCCTCTTGTGCAGCAACCGCGGCTG***CTTCAAAGGCATC
GGCGTTAGGGA

QA 13 323 13 323
DS 

RD RR2GB91JQ 590 0 0
GGAATCAAGTTTGTTTATGGTTTATAGAAGAAAAAAA*TAGCCTTTAAAGTGGCGAAACA
CAAACAATGTTCGAGAAACGAGACATACATTAAGAAAAGAGGACAATAGCGTGACTCTGC
AACTCAACCTACGTAGTGAGTTCCATGATGGCGGAAACGATATCTCCATCATTGGCTTTA
AGAGCCTTAGTGGCTTTGGCCTTGGAAACACCGGCCTGAGTCATCACGAGCTCAACATCC
TTAGCTTCAACACCGGTCTCATCAACATCATCATCATCTTCGTCCTCCTCTTGTGCAGCA
ACCGCGGCTGCTGCTTCAGAAGCATCGGCGTTAGGGATCATAAAAGCAACGTCGGGCATC
TTGAACCTCTGAGCAGCTTGAGCTTGTAGCTGAAAGCTCATATCATCAATCTTGGCCTCA
CCGAATATCACATAAGTCTCAGAGTTGGGACTCTTGAACACATCCGGCTTCGAAATGACA
AACAAAACATTCTTTGATCTCTTGATAGTCACTCTGCTAACATCTGTGACAGGTTTCATT
CCAAGTTTCAGCATAGCTTTGCGGCTTTTCTTCTCGCTTCTGCTTTGTTT

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2BZ16JQ 666 0 0
TTATGGTTTATAGAAAAAAAAAAATAGCCTCTAAAGTGGCGAAACACAAACAATGTTCGA
GAAACGAGACATTCATTAAGAAAAGAGGACAATTGCGTGACTCTGCAACTCAACCTACGT
AGTGAGTTCCATGATGGCGGAAACGATATCTCCATCATTGGCTTTAAGAGCCTTAGTGGC
TTTGGCCTTGGAAACACCAGCCTGAGTCATCACGAGCTCAACATCCTTGGCTTCAACACC
GGTCTCATCAACATCATCATCATCTTCGTCCTCCTCTTGTGCAGCAACCGCGGCTG***C
TTCAGAGGCATCGGCGTTAGGGATCATAGAAGCAACGTCCGGCATCTTGAACCTCTGAGC
AGCTTGAGCTTGTAGCTGAAAGCTCATATCATCAATCTTGGCCTCACCGAATATCACATA
GGTCTCAAAGTTGGGACTCTTGAACACATCCGGCTTCGAGATGACAAACAAAACATTCTT
TGATCTTTTGATAGTCACTCTGCTAACATCGGTGACAGGTTTCATTCCAAGTTTCAGCAT
AGCTTTGCGGCTTTTCTTCTCGCTTCTGCTTTGTTTAGAGCTCTCATTGTCACCAGCTCC
ATCGACGTTGTCATCGTCATCGTCATCCACATCGTCGTCTTCATCTCCGTCTTTGACATC
CTCAAC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2G782JQ 737 0 0
AAAAATGAACGTCTCATGCTATAAATTTGGAATCAAGTTTGCTTATGGTTTATAGAAAAA
AAAAAATAGCCTCTAAAGTGGCGAAACACAAACAATGTTCGAGAAACGAGACATTCATTA
AGAAAAGAGGACAATTGCGTGACTCTGCAACTCAACCTACGTAGTGAGTTCCATGATGGC
GGAAACGATATCTCCATCATTGGCTTTAAAAGCCTTAGTGGCTTTGGCCTTGGAAACACC
AGCCTGAGTCATCACGAGCTCAACATCCTTGGCTTCAACACCGGTCTCATCAACATCATC
ATCATCTTCGTCCTCCTCTTGTGCAGCAACCGCGGCTG***CTTCAAAGGCATCGGCGTT
AGGGATCATAAAAGCAACGTCCGGCATCTTGAACCTCTGAGCAGCTTGAGCTTGTAGCTG
AAAGCTCATATCATCAATCTTGGCCTCACCGAATATCACATAGGTCTCAAAGTTGGGACT
CTTGAACACATCCGGCTTCGAGATGACAAACAAAACATTCTTTGATCTTTTGATAGTCAC
TCTGCTAACATCGGTGACAGGTTTCATTCCAAGTTTCAGCATAGCTTTGCGGCTTTTCTT
CTCGCTTCTGCTTTGTTTAGAGCTCTCATTGTCACCAGCTCCATCGACGTTGTCATCGTC
ATCGTCATCCACATCGTCGTCTTCATCTCCGTCTTTGACATCCTCAACGACAACATCATC
TTCCTTCTCGAGC
CTCA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2GB91TF 599 0 0
AAACACCGGC*TGAGTCATCACGAGCTCAACATCTTTAGCTTCAACACCGGTCTCATCAA
CATCATCATCATCTTCGTCCTCCTCTTGTGCAGCAACCGCGGCTGCTGCTTCAGAAGCAT
CGGCGTTAGGGATCATAGAAGCAACGTCGGGCATCTTGAACCTCTGAGCAGCTTGAGCTT
GTAGCTGAGAGCTCATATCATCAATCTTGGCCTCACCGAATATCACATAAGTCTCAGAGT
TGGGACTCTTGAACACATCCGGCTTCGAAATGACAAACAAAACATTCTTTGATCTCTTGA
TAGTCACTCTGCTAACATCTGTGACAGGTTTCATTCCAAGTTTCAGCATAGCTTTGCGGC
TTTTCTTCTCGCTTCTGCTTTGTTTAGAACTCTCATTGTCACCAGCTCCATCGACGTTGT
CATCGTCATCGTCATCCACATCGTCGTCTTCATCTCCGTCTTTGACATCCTCAACGACAA
CATCATCTTCCTTCTCGAGCTTCATTTGCTCTTTGATGGATTCCTCAATCTTAACTTCTT
CAACAACAGGGCCTGGCATCTTCTTCGTCTTCTACAACCTCTTATCTTCTTC
CAAAAAA

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2H143TF 730 0 0
ACAATTGCGTGACTCTGCAACTCAAC*TACGTAGTGAGT*CCATGATGGCGGAAACGATA
TCTCCATCATTGGCTTTAAGAGCCT*AGTGGCTTTGGCCTTGGAAACACCAGC*TGAGTC
ATCACGAGCTCAACATCCTTGGCTTCAACACCGGTCTCATCAACATCATCATCATCTTCG
TCCTCCTCTTGTGCAGCAACCGCGGCTG***CTTCAGAGGCATCGGCGTTAGGGATCATA
GAAGCAACGTCCGGCATCTTGAACCTCTGAGCAGCTTGAGCTTGTAGCTGAGAGCTCATA
TCATCAATCTTGGCCTCACCGAATATCACATAGGTCTCAGAGTTGGGACTCTTGAACACA
TCCGGCTTCGAGATGACAAACAAAACATTCTTTGATCTTTTGATAGTCACTCTGCTAACA
TCGGTGACAGGTTTCATTCCAAGTTTCAGCATAGCTTTGCGGCTTTTCTTCTCGCTTCTG
CTTTGTTTAGAGCTCTCATTGTCACCAGCTCCATCGACGTTGTCATCGTCATCGTCATCC
ACATCGTCGTCTTCATCTCCGTCTTTGACATCCTCAACGACAACATCATCTTCCTTCTCG
AGCCTCATTTGCTCTTTGATGGATTCCTCAATCTTAACTTCTTCAACAACAGGGCCTGGC
ATCTTCTTCTTCTTCTGCAACCTCTTATCTTCTTCAAACGAAACCCTTTTAGAACAGCGC
AGTGAAACCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2G782TF 658 0 0
GCTTTAAGAGCTTTAGTGGCTTTGGC*TTGGAAACACCAGC*TGAGTCATCACGAGCTCA
ACATCTTTGGCTTCAACACCGGTCTCATCAACATCATCATCATCTTCGTCCTCCTCTTGT
GCAGCAACCGCGGCTG***CTTCAGAGGCATCGGCGTTAGGGATCATAGAAGCAACGTCC
GGCATCTTGAACCTCTGAGCAGCTTGAGCTTGTAGCTGAGAGCTCATATCATCAATCTTG
GCCTCACCGAATATCACATAGGTCTCAGAGTTGGGACTCTTGAACACATCCGGCTTCGAG
ATGACAAACAAAACATTCTTTGATCTTTTGATAGTCACTCTGCTAACATCGGTGACAGGT
TTCATTCCAAGTTTCAGCATAGCTTTGCGGCTTTTCTTCTCGCTTCTGCTTTGTTTAGAG
CTCTCATTGTCACCAGCTCCATCGACGTTGTCATCGTCATCGTCATCCACATCGTCGTCT
TCATCTCCGTCTTTGACATCCTCAACGACAACATCATCTTCCTTCTCGAGCCTCATTTGC
TCTTTGATGGATTCCTCAATCTTAACTTCTTCAACAACAGGGCCTGGCATCTTCTTCTTC
TTCTGCAACCTCTTATCTTCTTCAAACGAAACCCTTTTAGAACAGCGCAGTGAAACCC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 9

CO CL713Contig1 543 9 4 U
GGAAATATATCTAACAAACAACAGTCTCACTTCTAAAATCATATATTTTTAGAATACATA
ACAGATAAAGAAGAAGAAGATGGTATCAATTTCCAGCTCTTCCAAATCTTCCACAATCAT
GAAGCTGGTGGTGATGGTGGCTGTGGTCTTGATGGTGACGGTGGTGGATGGACAGAGCTG
CAATACCCACTTGAGTGGACTGAACGTGTGTGGTGAGTTCGTAGTTCCAGGAGCAGACAC
GACGAACCCGAGTGCCGAGTGTTGCAATGCTCTTGAGGCAGTGCCGAGCGACTGCATTTG
CAACACATTTCGCATTGCCTCTAGGCTTCCCACTCGCTGCAACATACCTACACTTTCATG
CAACTGATGATATGGACGTTGTTATATCTATGAGAAGCAGGGAGGGAGATCAACAACAAT
ATAGTATTTAATGAATAAAAACTCGAAGTTTTCTCGTTTCGTTCTGCCAGTTGCTGTAAA
ACCAATGGGTTTCGAATAAAAAATAGAAACTGAATAATCTTGAAGTGAAATTATAAATCT
TCA


BQ
10 10 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 5 55 55 55 55 40 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 25 25 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2BL63JQ C 159
AF RR2BL63TF U 1
AF RR2GG55JQB C 388
AF RR2HA06TF U 11
AF RR2BP27JQ C 1
AF RR2BP27TF U 1
AF RR2GG55TF U 11
AF RR2BH22TF U 3
AF RR2H793TF U 2
BS 1 151 RR2BL63TF
BS 152 152 RR2BP27TF
BS 153 527 RR2BL63TF
BS 528 543 RR2H793TF

RD RR2BL63JQ 321 0 0
CGGTGGTGGATGGACAGAGCTGCAATACCCACTTGAGTGGACTGAACGTGTGTGGTGAGT
TTGTAGTTCCAGGAGCAGACACGACGAACCCGAGTGCCGAGTGTTGCAATGCTCTTGAGG
CAGTGCCGAGGGACTGCATTTGCAACACATTTCGCATTGCCTTTAGGCTTCCCACTCGGT
GCAACATACCTACACTTTCATGCAAATGATGATATGGACGTTGTTATATTTATGAGAAGC
AGGGAGGGAAATCAACAACAATATAGTATTTAATGAATAAAAACTCGAAGTTTTTTCGTT
TTGTTTTGCCAGTTGCTGTAA

QA 1 321 1 321
DS 

RD RR2BL63TF 527 0 0
GGAAATATATCTAACAAACAACAGTCTCACTTCTAAAATCATATATTTTTAGAATACATA
ACAGATAAAGAAGAAGAAGATGGTATCAATTTCCAGCTCTTCCAAATCTTCCACAATCAT
GAAGCTGGTGGTGATGGTGGCTGTGGTCTTGGTGGTGACGGTGGTGGATGGACAGAGCTG
CAATACCCACTTGAGTGGACTGAACGTGTGTGGTGAGTTCGTAGTTCCAGGAGCAGACAC
GACGAACCCGAGTGCCGAGTGTTGCAATGCTCTTGAGGCAGTGCCGAGCGACTGCATTTG
CAACACATTTCGCATTGCCTCTAGGCTTCCCACTCGCTGCAACATACCTACACTTTCATG
CAACTGATGATATGGACGTTGTTATATCTATGAGAAGCAGGGAGGGAGATCAACAACAAT
ATAGTATTTAATGAATAAAAACTCGAAGTTTTCTCGTTTCGTTCTGCCAGTTGCTGTAAA
ACCAATGGGTTTCGAATAAAAAATAGAAACTGAATAATCTTGAAGTG

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2GG55JQB 147 0 0
T
TATGGGAAGCAGGGGGGGAGATCAACAACAATATAGTATTTAATGAATAAAAACTCGAAG
TTTTTTCGTTTCGTTTTGCCAGTTGCTGTAAAACCAATGGGTTTGGAATAAAAAATAGAA
ACTGAATAATTTTGAAG
GGAAATTTT

QA 2 138 2 138
DS 

RD RR2HA06TF 493 0 0
GG
AACAAACAACAGTCTCACTTCTAAAATCATATATTTTTAGAATACATAACAGATAAAGAA
GAAGAAGATGGTATCAATTTCCAGCTCTTCCAAATCTTCCACAATCATGAAGCTGGTGGT
GATGGTGGCTGTGGTCTTGGTGGTGACGGTGGTGGATGGACAGAGCTGCAATACCCACTT
GAGTGGACTGAACGTGTGTGGTGAGTTCGTAGTTCCAGGAGCAGACACGACGAACCCGAG
TGCCGAGTGTTGCAATGCTCTTGAGGCAGTGCCGAGCGACTGCATTTGCAACACATTTCG
CATTGCCTCTAGGCTTCCCACTCGCTGCAACATACCTACACTTTCATGCAACTGATGATA
TGGACGTTGTTATATCTATGAGAAGCAGGGAGGGAGATCAACAACAATATAGTATTTAAT
GAATAAAAACTCGAAGTTTTCTCGTTTCGTTCTGCCAGTTGCTGTAAAACCAATGGGTTT
CGAATAAAAAA

QA 3 493 3 493
DS 

RD RR2BP27JQ 526 0 0
GGA
AATATATCTAACAAACAACAGTCTCACTTCTAAAATCATATATTTTTAGAATACATAACA
GATAAAGAAGAAGAAGATGGTATCAATTTCCAGCTCTTCCAAATCTTCCACAATCATGAA
GCTGGTGGTGATGGTGGCTGTGGTCTTGATGGTGACGGTGGTGGATGGACAGAGCTGCAA
TACCCACTTGAGTGGACTGAACGTGTGTGGTGAGTTCGTAGTTCCAGGAGCAGACACGAC
GAACCCGAGTGCCGAGTGTTGCAATGCTCTTGAGGCAGTGCCGAGCGACTGCATTTGCAA
CACATTTCGCATTGCCTCTAGGCTTCCCACTCGCTGCAACATACCTACACTTTCATGTAA
CTGATGATATGGACGTTGTTATATCTATGAGAAGCAGGGAGGGAGATCAACAACAATATA
GTATTTAATGAATAAAAACTCGAAGTTTTCTTGTTTCGTTTTGCCAGTTGCTGTAAAACC
AATGGGTTTCGAATAAAAAATAGAAACTGAATAATCTTGAAG
G

QA 4 525 4 525
DS 

RD RR2BP27TF 526 0 0
GGA
AATATATCTAACAAACAACAGTCTCACTTCTAAAATCATATATTTTTAGAATACATAACA
GATAAAGAAGAAGAAGATGGTATCAATTTCCAGCTCTTCCAAATCTTCCACAATCATGAA
GCTGGTGGTGATGGTGGCTGTGGTCTTGATGGTGACGGTGGTGGATGGACAGAGCTGCAA
TACCCACTTGAGTGGACTGAACGTGTGTGGTGAGTTCGTAGTTCCAGGAGCAGACACGAC
GAACCCGAGTGCCGAGTGTTGCAATGCTCTTGAGGCAGTGCCGAGCGACTGCATTTGCAA
CACATTTCGCATTGCCTCTAGGCTTCCCACTCGCTGCAACATACCTACACTTTCATGTAA
CTGATGATATGGACGTTGTTATATCTATGAGAAGCAGGGAGGGAGATCAACAACAATATA
GTATTTAATGAATAAAAACTCGAAGTTTTCTTGTTTCGTTCTGCCAGTTGCTGTAAAACC
AATGGGTTTCGAATAAAAAATAGAAACTGAATAATCTTGAAG
G

QA 4 525 4 525
DS 

RD RR2GG55TF 525 0 0
GG
AACAAACAACAGTCTCACTTCTAAAATCATATATTTTTAGAATACATAACAGATAAAGAA
GAAGAAGATGGTATCAATTTCCAGCTCTTCCAAATCTTCCACAATCATGAAGCTGGTGGT
GATGGTGGCTGTGGTCTTGGTGGTGACGGTGGTGGATGGACAGAGCTGCAATACCCACTT
GAGTGGACTGAACGTGTGTGGTGAGTTCGTAGTTCCAGGAGCAGACACGACGAACCCGAG
TGCCGAGTGTTGCAATGCTCTTGAGGCAGTGCCGAGCGACTGCATTTGCAACACATTTCG
CATTGCCTCTAGGCTTCCCACTCGCTGCAACATACCTACACTTTCATGCAACTGATGATA
TGGACGTTGTTATATCTATGAGAAGCAGGGAGGGAGATCAACAACAATATAGTATTTAAT
GAATAAAAACTCGAAGTTTTCTCGTTTCGTTCTGCCAGTTGCTGTAAAACCAATGGGTTT
CGAATAAAAAATAGAAACTGAATAATCTTGAAGTGAAATT
ATC

QA 3 522 3 522
DS 

RD RR2BH22TF 525 0 0
GG
ATATATCTAACAAACAACAGTCTCACTTCTAAAATCATATATTTTTAGAATACATAACAG
ATAAAGAAGAAGAAGATGGTATCAATTTCCAGCTCTTCCAAATCTTCCACAATCATGAAG
CTGGTGGTGATGGTGGCTGTGGTCTTGATGGTGACGGTGGTGGATGGACAGAGCTGCAAT
ACCCACTTGAGTGGACTGAACGTGTGTGGTGAGTTCGTAGTTCCAGGAGCAGACACGACG
AACCCGAGTGCCGAGTGTTGCAATGCTCTTGAGGCAGTGCCGAGCGACTGCATTTGCAAC
ACATTTCGCATTGCCTCTAGGCTTCCCACTCGCTGCAACATACCTACACTTTCATGCAAC
TGATGATATGGACGTTGTTATATCTATGAGAAGCAGGGAGGGAGATCAACAACAATATAG
TATTTAATGAATAAAAACTCGAAGTTTTCTTGTTTCGTTCTGCCAGTTGCTGTAAAACCA
ATGGGTTTCGAATAAAAAATAGAAACTGAATAATCTTGAAGTG

QA 3 525 3 525
DS 

RD RR2H793TF 542 0 0
GG
AATATATCTAACAAACAACAGTCTCACTTCTAAAATCATATATTTTTAGAATACATAACA
GATAAAGAAGAGGAAGATGGTATCAATTTCCAGCTCTTCCAAATCTTCCACAATCATGAA
GCTGGTGGTGATGGTGGCTGTGGTCTTGATGGTGACGGTGGTGGATGGACAGAGCTGCAA
TACCCACTTGAGTGGACTGAACGTGTGTGGTGAGTTCGTAGTTCCAGGAGCAGACACGAC
GAACCCGAGTGCCGAGTGTTGCAATGCTCTTGAGGCAGTGCCGAGCGGCTGCATTTGCAA
CACATTTCGCATTGCCTCTAGGCTTCCCACTCGCTGCAACATACCTACACTTTCATGCAA
CTGATGATATGGACGTTGTTATATCTATGAGAAGCAGGGAGGGAGATCAACAACAATATA
GTATTTAATGAATAAAAACTCGAAGTTTTCTTGTTTCGTTCTGCCAGTTGCTGTAAAACC
AATGGGTTTCGAATAAAAAATAGAAACTGAATAATCTTGAAGTGAAATTATAAATCTTCA

QA 3 542 3 542
DS 



AS 1 6

CO CL714Contig1 1037 6 24 U
GGCACGCGAGGTAGACGAAGAAGAGGAGGCTAAATCGAGGAGTGGCGCATTTTAGCCGTC
CGCATAACCGTCCGAGGCTGTCTCTCCTCTCCGACTACATCTCCGTTTCTTCTCTTCCTT
TCATCATCGTCGGAATCGAATCGAATCGATGGCTGCTCCACCTGCTAGGGCCAGAGCCGA
TTATGATTATCTCATTAAGCTTCTTCTGATTGGAGACAGTGGTGTGGGTAAAAGTTGCCT
ACTTCTACGTTTCTCTGATGGATCCTTCACCACTAGCTTCATCACCACCATTGGCATTGA
CTTTAAGATCAGAACGATTGAGCTTGATGGGAAACGTATCAAGCTCCAGATTTGGGACAC
TGCTGGTCAAGAACGCTTCCGCACTATCACCACTGCTTATTACCGTGGGGCAATGGGCAT
TTTGCTTGTCTATGATGTCACAGACGAGTCTTCCTTCAACAACATTAGAAACTGGATTCG
TAATATCGAACAACATGCTTCTGATAATGTTAACAAGATCTTGGTTGGTAACAAGGCTGA
CATGGATGAAAGCAAGAGGGCTGTACCTACAGCAAAGGGTCAGGCTCTTGCTGATGAGTA
CGGAATTAAGTTCTTCGAAACAAGTGCTAAGACAAACCTAAACGTGGAAGAAGTTTTCTT
CTCGATAGGGAGGGACATCAAGCAGAGGCTTTCTGACACTGACTCCAGGGCTGAGCCTGC
GACGATTAAGATAAGCCAGACAGACCAGGCAGCAGGTGCCGGGCAAGCCACACAGAAGTC
TGCATGCTGTGGAACTTAAAAGAAAGTTGTAAAATTGAAGTTTTAAGACGAGAGGAAAAA
AAGAAAAAGATGTCCTGTCCCTGCTGGGTGCCTTGTTTTATCCCAACATTTCTGATTCGT
TCTAAAATGCCTTTTCCTACTTGTACGAAGGTTTTAATCGAAACTTGTATTCTTCTTTTT
ACTATGTTGCTTATCTTTTCGACGATGACTGAATAGTTATATTTCTTTTGCTCTTTAATT
TAGTATATTTGACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F739TF U 1
AF RR2E526TF U 42
AF RR2B402TF U 35
AF RR2BW43TF U 47
AF RR2B402JQ C 182
AF RR2F739JQ C 269
BS 1 70 RR2F739TF
BS 71 72 RR2B402TF
BS 73 75 RR2F739TF
BS 76 76 RR2B402TF
BS 77 171 RR2F739TF
BS 172 172 RR2B402TF
BS 173 174 RR2F739TF
BS 175 175 RR2B402TF
BS 176 399 RR2F739TF
BS 400 400 RR2B402TF
BS 401 534 RR2F739TF
BS 535 535 RR2B402TF
BS 536 573 RR2F739TF
BS 574 748 RR2B402TF
BS 749 765 RR2B402JQ
BS 766 766 RR2F739JQ
BS 767 853 RR2B402JQ
BS 854 854 RR2F739JQ
BS 855 891 RR2B402JQ
BS 892 892 RR2F739JQ
BS 893 974 RR2B402JQ
BS 975 975 RR2F739JQ
BS 976 1029 RR2B402JQ
BS 1030 1037 RR2F739JQ

RD RR2F739TF 573 0 0
GGCACGCGAGGTAGACGAAGAAGAGGAGGCTAAATCGAGGAGTGGCGCATTTTAGCCGTC
CGCATAACCGAACGACGCTGTCTCTCCTCTCCGACTACATCTCCGTTTCTTCTCTTCCTT
TCATCATCGTCGGAATCGAATCGAATCGATGGCTGCTCCACCTGCTAGGGCTAGGGCCGA
TTATGATTATCTCATTAAGCTTCTTCTGATTGGAGACAGTGGTGTGGGTAAAAGTTGCCT
ACTTCTACGTTTCTCTGATGGATCCTTCACCACTAGCTTCATCACCACCATTGGCATTGA
CTTTAAGATCAGAACGATTGAGCTTGATGGGAAACGTATCAAGCTCCAGATTTGGGACAC
TGCTGGTCAAGAACGCTTCCGCACTATCACCACTGCTTACTACCGTGGGGCAATGGGCAT
TTTGCTTGTCTATGATGTCACAGACGAGTCTTCCTTCAACAACATTAGAAACTGGATTCG
TAATATCGAACAACATGCTTCTGATAATGTTAACAAGATCTTGGTTGGTAACAAAGCTGA
CATGGATGAAAGCAAGAGGGCTGTACCTACAGC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2E526TF 537 0 0
GGGGCGC
ATTTTAGCCGTCCGCATAACCGTCCGAGGCTGTCTCTCCTCTCCGACTACATCTCCGTTT
CTTCTCTTCCTTTCATCATCGTCGGAATCGAATCGAATCGATGGCTGCTCCACCTGCTAG
GGCCAGAGCCGATTATGATTATCTCATTAAGCTTCTTCTGATTGGAGACAGTGGTGTGGG
TAAAAGTTGCCTACTTCTACGTTTCTCTGATGGATCCTTCACCACTAGCTTCATCACCAC
CATTGGCATTGACTTTAAGATCAGAACGATTGAGCTTGATGGGAAACGTATCAAGCTCCA
GATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAACGCTTCCGCACTATCACCACTGCTTATTACCGTGG
GGCAATGGGCATTTTGCTTGTCTATGATGTCACAGACGAGTCTTCCTTCAACAACATTAG
AAACTGGATTCGTAATATCGAACAACATGCTTCTGATAATGTTAACAAGATCTTGGTTGG
TAACAAAGCTGACATGGATGAAAGCAAGAGGGCTGTACCTACAGCAAAGG

QA 8 537 8 537
DS 

RD RR2B402TF 714 0 0
GGGAGGAGT
GGCGCATTTTAGCCGTCCGCATAACCGTCCGAGGCTGTCTCTCCTCTCCGACTACATCTC
CGTTTCTTCTCTTCCTTTCATCATCGTCGGAATCGAATCGAATCGATGGCTGCTCCACCT
GCTAGGGCCAGAGCCGATTATGATTATCTCATTAAGCTTCTTCTGATTGGAGACAGTGGT
GTGGGTAAAAGTTGCCTACTTCTACGTTTCTCTGATGGATCCTTCACCACTAGCTTCATC
ACCACCATTGGCATTGACTTTAAGATCAGGACGATTGAGCTTGATGGGAAACGTATCAAG
CTCCAGATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAACGCTTCCGCACTATCACCACTGCTTATTAC
CGTGGGGCAATGGGCATTTTGCTTGTCTATGATGTCACAGACGAGTCTTCCTTCAACAAC
ATTAGAAACTGGATTCGTAATATCGAACAACATGCTTCTGATAATGTTAACAAGATCTTG
GTTGGTAACAAGGCTGACATGGATGAAAGCAAGAGGGCTGTACCTACAGCAAAGGGTCAG
GCTCTTGCTGATGAGTACGGAATTAAGTTCTTCGAAACAAGTGCTAAGACAAACCTAAAC
GTGGAAGAAGTTTTCTTCTCGATAGGGAGGGACATCAAGCAGAGGCTTTCTGACACTGAC
TCCAGGGCTGAGCCTGCGACGATTAAGATAAGCCAGACAGACCAG

QA 10 714 10 714
DS 

RD RR2BW43TF 686 0 0
GG
ATTTTAGCCGTCCGCATAACCGTCCGAGGCTGTCTCTCCTCTCCGACTACATCTCCGTTT
CTTCTCTTCCTTTCATCATCGTCGGAATCGAATCGAATCGATGGCTGCTCCACCTGCTAG
GGCCAGAGCCGATTATGATTATCTCATTAAGCTTCTTCT**TTGGAGACAGTGGTGTGGG
TAAAAGTTGCCTACTTCTACGTTTCTCTGATGGATCCTTCACCACTAGCTTCATCACCAC
CATTGGCATTGACTTTAAGATCAGAACGATTGAGCTTGATGGGAAACGTATCAAGCTCCA
GATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAACGCTTCCGCACTATCACCACTGCTTATTACCGTGG
GGCAATGGGCATTTTGCTTGTCTATGATGTCACAGACGAGTCTTCCTTCAACAACATTAG
AAACTGGATTCGTAATATCGAACAACATGCTTCTGATAATGTTAACAAGATCTTGGTTGG
TAACAAGGCTGACATGGATGAAAGCAAGAGGGCTGTACCTACAGCAAAGGGTCAGGCTCT
TGCTGATGAGTACGGAATTAAGTTCTTCGAAACAAGTGCTAAGACAAACCTAAACGTGGA
AGAAGTTTTCTTCTCGATAGGGAGGGACATCAAGCAGAG*CTTTCTGACACTGACTCCAG
GGCTGAGCCTGCGACGAT
AAGATA

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR2B402JQ 853 0 0
TATGACTATCTCATTAAGCTTCTTCTGATTGGAGACAGTGGTGTGGGTAAAAGTTGCCTA
CTTCTACGTTTCTCTGATGGATCCTTCACCACTAGCTTCATCACCACCATTGGCATTGAC
TTTAAGATCAGGACGATTGAGCTTGATGGGAAACGTATCAAGCTCCAGATTTGGGACACT
GCTGGTCAAGAACGCTTCCGCACTATCACCACTGCTTATTACCGTGGGGCAATGGGCATT
TTGCTTGTCTATGATGTCACAGACGAGTCTTCCTTCAACAACATTAGAAACTGGATTCGT
AATATCGAACAACATGCTTCTGATAATGTTAACAAGATCTTGGTTGGTAACAAGGCTGAC
ATGGATGAAAGCAAGAGGGCTGTACCTACAGCAAAGGGTCAGGCTCTTGCTGATGAGTAC
GGAATTAAGTTCTTCGAAACAAGTGCTAAGACAAACCTAAACGTGGAAGAAGTTTTCTTC
TCGATAGGGAGGGACATCAAGCAGAGGCTTTCTGACACTGACTCCAGGGCTGAGCCTGCG
ACGATTAAGATAAGCCAGACAGACCAGGCAGCAGGTGCCGGGCAGGCCACACAGAAGTCT
GCATGCTGTGGAACTTAAAAGAAAGTTGTAAAATTGAAGTTTTAAGACGAGAGGAAAAAA
AGAAAAAGATGTTCTGTCCCTGCTGGGTGCCTTGTTTTATCCCAACATTTTTGATTCGTT
CTAAAATGCCTTTTCCTACTTGTACGAAGGTTTTAATCGAAACTTGTATTCTTCTTTTTA
CTATGTTGCTTATTTTTTCGACGATGACTGAATAGTTATATTTCTTTTGCTCTTTAATTT
AGTATATT
GACTT

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR2F739JQ 769 0 0
ACCACTAGCTTCATCACCACCATTGGCATTGACTTTAAGATCAGAACGATTGAGCTTGAT
GGGAAACGTATCAAGCTCCAGATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAACGCTTCCGCACTATC
ACCACTGCTTACTACCGTGGGGCAATGGGCATTTTGCTTGTCTATGATGTCACAGACGAG
TCTTCCTTCAACAACATTAGAAACTGGATTCGTAATATCGAACAACATGCTTCTGATAAT
GTTAACAAGATCTTGGTTGGTAACAAGGCTGACATGGATGAAAGCAAGAGGGCTGTACCT
ACAGCAAAGGGTCAGGCTCTTGCTGATGAGTACGGAATCAAGTTCTTCGAAACAAGTGCT
AAGACAAACCTAAACGTGGAAGAAGTTTTCTTCTCGATAGGGAGGGACATCAAGCAGAGG
CTTTCTGACACTGACTCCAGGGCTGAGCCTGCGACGATTAAGATAAGCCAAACAGACCAG
GCAGCTGGTGCCGGGCAAGCCACGCAGAAGTCTGCATGCTGTGGAACTTAAAAGAAAGTT
GTAAAATTGAAGTTTTAAGACGAGAGGAAAAAAA*ACCAAGATGTCCTGTCCCTGCTGGG
TGCCTTGTTTTATTCCAACATTTCTGATTCGTTCTAAAATGGCTTTTCCTATTTGTACGA
AGGTTTTAATCGAAACTTGTATTCTTCTTTTTACTATGTTGCTTATCTTTTCGACGATGA
CTGAATAGTTATATTTCTTTTGCTCTTTAATTTAGTATATTTGACTTCC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 6

CO CL715Contig1 1039 6 10 U
CGGTTTAAAAGTATTACGTTAACGAATTAATACAATGCAAACGAATCAATAAAATTTAAT
GTGATCTACAATAAAATGAATATAATTTTATAGCAATAAAAAAAAGTAGAATTTTGTTCT
GCTCTCAACTCTTTTACTCTCTATGCAGCAGCTAAGCACTCTTTTGGAAGACCTTGAGGG
AATCTCTTTGAATCCGTACAATAGTTGTATATCATATAGTTTTTCTGCACCCATCTCATC
CTTTCTTGACCAGTCGAGTCGAGCTCCTGGGACAACCACGAGCCAGTGGTCCCTTGTTTC
GAGACATCAGGGCAAGACGACTTGCCGTTCGACCAAACACAAGCTTCTTGGTTGAAGCCA
CGGTACGAAGCAGTGAAAGGAGCTTTAGACCAATCAGTTTTGACCAAACCACCTCTCGTG
GCCCAGTCATCAGCGTTCCAGAGACTAGAGTACATTCTCATTGGTCGATTCTTGGGGAAC
AGAGTGCCAATAGATTCCATGTTCTTGAATTCTCTAATGGGAGTTCCATCGACGGTGAAA
ATGATTCGTTGTGGGTTCCACAGAATGGTGTAAGTGTGGAAATCAGCTGTTGGGTCGAAC
CAGAGTTTAAACTGCTGTTCTTTGTCTCCTTTGCCTTGTGTGTATACATTTGTGTGTAGT
GTGTAAGGATCTCCACTTACGTTTCCCAAAAACTCGAAATCAATCTCGTCCCATGTTGTT
CCAGGTGATTTCAAGTAAAGGGTTGTGACTGTTCCGGCTGAGTTTCCAGGGACGAGTTTC
ATTTGCATGTCGATTTTACCGAACAAGTACTCGTTCTTGGATTGAAAGCCAGAGCCAGAG
GATTTGTCTAGAGATAAAGTGAGAAGCTCTCCATTGTTCGTGATCTGTCCACGTCCATCT
CCCCATGTGATCTCTACGTCTCTTTGGAAGTTAGCTGAAACAGAGGAGATGACGATAAGA
GAAATAAACAGAGGAAGTAAGTAACTGTTTGCCATTTTCAGAGATTTATTTCTTCTTTTT
TTTCCTATTGGAGTTTTGA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ15JQ U 1
AF RR2DL03JQ U 2
AF RR2A334TF C 297
AF RR2E533JQ U 36
AF RR2DL03TF C 302
AF RR2CX51TF C 672
BS 1 15 RR2DZ15JQ
BS 16 16 RR2DL03JQ
BS 17 155 RR2DZ15JQ
BS 156 156 RR2DL03JQ
BS 157 308 RR2DZ15JQ
BS 309 309 RR2DL03JQ
BS 310 446 RR2DZ15JQ
BS 447 663 RR2E533JQ
BS 664 879 RR2DL03TF
BS 880 1039 RR2CX51TF

RD RR2DZ15JQ 446 0 0
CGGTTTAAAAGTATTGCGTTAACGAATTAATACAATGCAAACGAATCAATAAAATTTAAT
GTGATCTACAATAAAATGAATATAATTTTATAGCAATAAAAAAAAGTAGAATTTTGTTCT
GCTCTCAACTCTTTTACTCTCTATGCAGCAGCTAAACACTCTTTTGGAAGACCTTGAGGG
AATCTCTTTGAATCCGTACAATAGTTGTATATCATATAGTTTTTCTGCACCCATCTCATC
CTTTCTTGACCAGTCGAGTCGAGCTCCTGGGACAACCACGAGCCAGTGGTCCCTTGTTTC
GAGACATCGGGGCAAGACGACTTGCCGTTCGACCAAACACAAGCTTCTTGGTTGAAGCCA
CGGTACGAAGCAGTGAAAGGAGCTTTAGACCAATCAGTTTTGACCAAACCACCTCTCGTG
GCCCAGTCATCAGCGTTCCAGAGACT

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR2DL03JQ 443 0 0
GGTTTAAAAGTATTACGTTAACGAATTAATACAATGCAAACGAATCAATAAAATTTAATG
TGATCTACAATAAAATGAATATAATTTTATAGCAATAAAAAAAAGTAGAATTTTGTTCTG
CTCTCAACTCTTTTACTCTCTATGCAGCAGCTAAGCACTCTTTTGGAAGACCTTGAGGGA
ATCTCTTTGAATCCGTACAATAGTTGTATGTCATATAGTTTTTCTGCACCCATCTCATCC
TTTCTTGACCAGTCGAGTCGAGCTCCTGGGACAACCACGAGCCAGTGGTCCCTTGTTTCG
AGACATCAGGGCAAGACGACTTGCCGTTCGACCAAACACAAGCTTCTTGGTTGAAGCCAC
GATACGAAGCAGTGAAAGGAGCTTTAGACCAATCAGTTTTGACCAAACCACCTCTCGTGG
CCCAGTCATCAGCGTTCCAGA
AA

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR2A334TF 214 0 0
TTTCGAGACATCAGGGCAAGACGACTTGCCGTTCGACCAAACACAAGCTTCTTGGTTGAA
GCCACGGTACGAAGCAGTGAAAGGAGCTTTAGACCAATCAGTTTTGACCAAACCACCTCT
CGTGGCCCAGTCATCAGCGTTCCAGAGACTAGAGTACATTCTCATTGGTCGATTCTTGGG
GAACAGAGTGCCAATAGATTCCATGTTCTTGAAT

QA 1 214 1 214
DS 

RD RR2E533JQ 628 0 0
C
GCAAACGAATCAATAAAATTTAATGTGATCTACAATAAAATGAATATAATTTTATAGCAA
TAAAAAAAAGTAGAATTTTGTTCTGCTCTCAACTCTTTTACTCTCTATGCAGCAGCTAAG
CACTCTTTTGGAAGACCTTGAGGAAATCTCTTTGAATCCGTACAATAGTTGTATATCATA
TAGTTTTTCTGCACCCATCTCATCCTTTCTTGACCAGTCGAGTCGAGCTCCTGGGAAAAC
CACGAGCCAGTGGTCCCTTGTTTCGAGACATCAGGGCAAGACGACTTGCCGTTCGACCAA
ACACAAGCTTCTTGGTTGAAGCCACGGTACGAAGCAGTGAAAGGAGCTTTATACCAATCA
GTTTTGACCAAACCACCTCTCGTGGCCCAGTCATCAGCGTTCCAGAGACTAGAGTACATT
CTCATTGGTCGATTCTTGGGGAACAGAGTGCCAATAGATTCCATGTTCTTGAATTCTCTA
ATGGGAGTTCCATCGACGGTGAAAATGATTCGTTGTGGGTTCCACAGAATGGTGTAAGTG
TGGAAATCAGCTGTTGGGTCGAACCAGAGTTTAAACTGCTGTTCTTTGTCTCCTTTGCCT
TGTGTGTATACATTTGTGTGTAGTGTG

QA 2 628 2 628
DS 

RD RR2DL03TF 580 0 0
AGACATCAGGGCAAGACGACTTGCCGTTCGACCAAACACAAGCTTCTTGGTTGAAGCCAC
GATACGAAGCAGTGAAAGGAGCTTTAGACCAATCAGTTTTGACCAAACCACCTCTCGTGG
CCCAGTCATCAGCGTTCCAGAGACTAGAGTACATTCTCATTGGCCGATTCTTGGGGAACA
GAGTGCCAATAGATTCCATGTTCTTGAATTCTCTAATGGGAGTTCCATCGACGGTGAAAA
TGATTCGTTGTGGGTTCCACAGAATGGTGTAAGTGTGGAAATCAGCTGTTGGGTCGAACC
AGAGTTTAAACTGCTGTTCTTTGTCTCCTTTGCCTTGTGTGTATACATTTGTGTGTAGTG
TGTAAGGATCTCCACTTACGTTTCCCAAAAACTCGAAATCAATCTCGTCCCATGTTGTTC
CAGGTGATTTCAAGTAAAGGGTTGTGACTGTTCCGGCTGAGTTTCCAGGGACGAGTTTCA
TTTGCATGTCGATTTTACCGAACAAGTACTCGTTCTTGGATTGAAAGCCAGAGCCAGAGG
ATTTGTCTAGAGATAAAGTGAGAAGCTCTCCATTGTTC
CC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2CX51TF 368 0 0
TCCACTTACGTTTCCCAAAAACTCGACATCAATCTCGTCCCATGTTGTTCCAGGTGATTT
CAAGTAAAGGGTTGTGACTGTTCCGGCTGAGTTTCCAGGGACGAGTTTCATTTGCATGTC
GATTTTACCGAACAAGTACTCGTTCTTGGATTGAAAGCCAGAGCCAGAGGATTTGTCTAG
AGATAAAGTGAGAAGCTCTCCATTGTTCGTGATCTGTCCACGTCCATCTCCCCATGTGAT
CTCTACGTCTCTTTGGAAGTTAGCTGAAACAGAGGAGATGACGATAAGAGAAATAAACAG
AGGAAGTAAGTAACTGTTTGCCATTTTCAGAGATTTATTTCTTCTTTTTTTTCCTATTGG
AGTTTTGA

QA 1 368 1 368
DS 



AS 1 4

CO CL716Contig1 1135 4 8 U
GGGTAACTCATTGGTGTTCTTCATTTGATTTCGAGAGGTCAATAAAGTGACCAACTTTTG
TTGCTTTTTAATCTCATTCAATCAAAACCCCTCTGCACTTTTCTCTCCTTCTTCTTCTTC
ATCTCAAGAATCTCTGAGTCTTC*****CTCCTGTAGACAGACATGGATGCTGTTTCACC
TCTCAGAGCTCTGTGTGGAACCGGTGCTCAATACTCCGGGACTAGAATCGATCACGGGCT
TTCTGGGTTTTGTTCATTTTCTCAGGAAAACAAATCAAAATTGAAACTTTCGCCAGTTAT
GAGCCTAGATTTGAAGGAACATCCCATGTCTTCAAACCAAACACTCACCGCCTTGTCTTC
TTCTTCCTATGTTGTTCCTACAAAGACATCATCAATTGGTATGAGTAGAGGGATGAGGTG
GTGGGAGAAGTCAACGAAAGACAACATGTTAGAGATTCACTCTGCTAATCATCTTGTTGA
CTCTTTGCTTAACGCTGGTGATAGATTAGTTGTTCTTGATTTCTACTCTCCTGGTTGTGG
TGGCTGCAAATCTCTCCACCCAAAGATCTGTCAATTGGCTGAATCAAACCCAAACGTGAT
GTTTCTCAAAGTGAATCAAGAAGAGCTTAGAACAATGTGTCATGGCCTTAACGTCCACGT
GCTTCCTTTCTTTAAGTTCTATAGAGGAGCAGAGGGTAAACTGTGTAGTTTCAGCTGCAC
CATCGCCACCATTAATAAGTTCAAGAAAGCTTTGGACAAGCACGGTAGCGAGAGATGCAG
CCTCGGGCCAGCGAAAGGCTTAGACAGTAAGGAGCTCATGGCTTTAGCGTCTGTAGGGGA
ACTGAAAATGAATCTGGATGTGTTGTTGTCGTCATCATCAGCTAGCAACTTCTGTTATGA
AACAGAGCAACAGCATCAGAAGATGGTGGTATGAAAAGAGATGGGTCTTTTCCATCAGGG
TTCTTATTGATTTGTAGATATGATTGTTGATTAGTATGATTGTGTTTTTTGCTTAGAATC
TATGGTTAGTTATTATAGTTTACTAGTAACCTAGTAACAATGCCTTATAACTTCAAAACA
TTGAACTTAAGGTTTTGTTTCAAATCTTTGGTCTTCAAATTTACATAATTATCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A567TF U 1
AF RR2EA93TF U 67
AF RR2AG48TF U 25
AF RR2BX11JQ C 382
BS 1 489 RR2A567TF
BS 490 490 RR2EA93TF
BS 491 774 RR2A567TF
BS 775 775 RR2EA93TF
BS 776 798 RR2A567TF
BS 799 799 RR2BX11JQ
BS 800 805 RR2A567TF
BS 806 1135 RR2BX11JQ

RD RR2A567TF 807 0 0
GGGTAACTCATTGGTGTTCTTCATTTGATTTCGAGAGGTCAATAAAGTGACCAACTTTTG
TTGCTTTTTAATCTCATTCAATCAAAACCCCTCTGCACTTTTCTCTCCTTCTTCTTCTTC
ATCTCAAGAATCTCTGAGTCTTC*****CTCCTGTAGACAGACATGGATGCTGTTTCACC
TCTCAGAGCTCTGTGTGGAACCGGTGCTCAATACTCCGGGACTAGAATCGATCACGGGCT
TTCTGGGTTTTGTTCATTTTCTCAGGAAAACAAATCAAAATTGAAACTTTCGCCAGTTAT
GAGCCTAGATTTGAAGGAACATCCCATGTCTTCAAACCAAACACTCACCGCCTTGTCTTC
TTCTTCCTATGTTGTTCCTACAAAGACATCATCAATTGGTATGAGTAGAGGGATGAGGTG
GTGGGAGAAGTCAACGAAAGACAACATGTTAGAGATTCACTCTGCTAATCATCTTGTTGA
CTCTTTGCTCAACGCTGGTGATAGATTAGTTGTTCTTGATTTCTACTCTCCTGGTTGTGG
TGGCTGCAAATCTCTCCACCCAAAGATCTGTCAATTGGCTGAATCAAACCCAAACGTGAT
GTTTCTCAAAGTGAATCAAGAAGAGCTTAGAACAATGTGTCATGGCCTTAACGTCCACGT
GCTTCCTTTCTTTAAGTTCTATAGAGGAGCAGAGGGTAAACTGTGTAGTTTCAGCTGCAC
CATCGCCACCATTAATAAGTTCAAGAAAGCTTTGGACAAGCACGGTAGCGAGAGGTGCAG
CCTCGGGCCAGCGAAAGGTTTAGAC
CG

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2EA93TF 726 0 0
TTTTTTCTC
ATTCAATCAAAACCCCTCTGCACTTTTCTCTC*TCCTTCTTCTCCATCTCAAGAATCTCT
TCATCATCTTCTTCTCCTGTAGACAGACATGGATGCTATTTCACCTCTCAGAGCTGTGTG
TGGAACCGGTGCTCAATACTCCGGGACTAGAATCGATCACGGGCTTTCTGGGTTTTGTTC
ATTTTCTCAGGAAAACAAATCAAAATTGAAACTTTCGCCAGTTATGAGCCTAGATTTGAA
GGAACATCCCATGTCTTCAAACCAAACACTCACCGCCTTGTCTTCTTCTTCCTATGTTGT
TCCTACAAAGACATCATCAATTGGTATGAGTAGAGGAATGAAGTGGTGGGAGAAGTCAAC
GAAAGACAACATGTTGGAGATTCACTCTGCTAATCATCTTGTTGACTCTTTGCTTAACGC
TGGTGATAGATTAGTTGTTCTTGATTTCTACTCTCCTGGTTGTGGTGGCTGCAAATCTCT
CCACCCAAAGATCTGTCAATTGGCTGAATCAAACCCAAACGTGATGTTTCTCAAAGTGAA
TCAAGAAGAGCTTAGAACAATGTGTCATGGCCTTAACGTCCATGTGCTTCCTTTCTTTAA
GTTCTATAGAGCAGCAGAGGGTAAACTGTGTAGTTTCAGCTGCACCATCGCCACCATTAA
TAAGTTCAAGAAAGCTTTGGACAAGCACGGCAGCGAAAGATGTAGCCTCGGGCCAGC

QA 10 726 10 726
DS 

RD RR2AG48TF 765 0 0
GG
GATTTCGAGAGGTCAATAAAGTGACCAACTTTTGTTGCTTTTTAATCTCATTCAATCAAA
ACCCCTCTGCACTTTTCTCTCCTTCTTCTTCTTCATCTCAAGAATCTCTGAGTCTTC***
**CTCCTGTAGACAGACATGGATGCTGTTTCACCTCTCAGAGCTCTGTGTGGAACCGGTG
CTCAATACTCCGGGACTAGAATCGATCACGGGCTTTCTGGGTTTTGTTCATTTTCTCAGG
AAAACAAATCAAAATTGAAACTTTCGCCAGTTATGAGCCTAGATTTGAAGGAACATCCCA
TGTCTTCAAACCAAACACTCACCGCCTTGTCTTCTTCTTCCTATGTTGTTCCTACAA*GA
CATCATCAATTGGTATGAGTAGAGGGATGAGGTGGTGGGAGAAGTCAACGAAAGACAACA
TGTTAGAGATTCACTCTGCTAATCATCTTGTTGACTCTTTGCTCAACGCTGGTGATAGAT
TAGTTGTTCTTGATTTCTACTCTCCTGGTTGTGGTGGCTGCAAATCTCTCCACCCAAAGA
TCTGTCAATTGGCTGAATCAAACCCAAACGTGATGTTTCTCAA*GTGAATCAAGAAGAGC
TTAGAACAATGTGTCATGGCCTTAACGTCCACGTGCTTCCTTTCTTTAAGTTCTATAGAG
GAGCAGAGGGTAAACTGTGTAGTTTCAGCTGCACCATCGCCACCATTAATAAGTTCAAGA
AAGCTTTGGACAAGCACGGTAGCGAGAG*TGCAGCCTCGG
CCA

QA 3 762 3 762
DS 

RD RR2BX11JQ 754 0 0
AAAGACATCATCAATTGGTATGAGTAGAGGGATGAGATGGTGGGAGAAGTCAACGAAAGT
CAACATGTTAGAGATTCACTCTGCTAATCATCTCGTTGACTCTTTGCTTAACGCTGGTGA
TAGATTAGTTGTTCTTGATTTCTACTCTCCCGGTTGTGGTGGCTGCAAATCTCTCCACCC
AAAGATCTGTCAATTGGCTGAATCAAACCCAAACGTGATTTTTCTCAAAGTGAATCAAGA
AGAGCTTAGAACAATGTGTCATGGCCTTAACGTCCACGTGCTTCCTTTCTTTAAGTTCTA
TAGAGGAGCAGAGGGTAAACTGTGTAGTTTCAGCTGCACCATCGCCACCATCAATAAGTT
CAAGAAAGCTTTGGACAAGCACGGTAGCGAGAGTTGCAGCCTCGGGCCAGCGAAAGGCTT
AGACAGTAAGGAGCTCATGGCTTTAGCGTCTGTAGGGGAACTGAAAATGAATCTGGATGT
GTTGTTGTCGTCATCATCAGCTAGCAACTTCTGTTATGAAACAGAGCAACAGCATCAGAA
GATGGTGGTATGAAAAGAGATGGGTCTTTTCCATCAGGGTTCTTATTGATTTGTAGATAT
GATTGTTGATTAGTATGATTGTGTTTTTTGCTTAGAATCTATGGTTAGTTATTATAGTTT
ACTAGTAACCTAGTAACAATGCCTTATAACTTCAAAACATTGAACTTAAGGTTTTGTTTC
AAATCTTTGGTCTTCAAATTTACATAATTATCTG

QA 1 754 1 754
DS 



AS 2 8

CO CL717Contig1 872 5 10 U
GGGTTGGCTCTCGACATGTCGACCTCTCCTTATGTGAGGATCGGAGATGAGTCTTGTCTT
TCTGAAATCTATTTCTGGGGATCTCGACTTGTTCTTTTGATCTCTGGTAAGATTGTTCAA
CGAAGAAGATGATGAAGATGCAGCGAATTGGTGTGGTGGCGTTTTTGGTGGCTCTATCTG
CGATTGAATTTGGATTGACTTCTGCCAATACCGTTCCGGCTTTCCTCTGGTCTCCACATC
TCCAGCGTGGTAATAATGGTGAAGTGGATGAGGGTGTAAACTATCAGGTGATGTCTGCGA
AGGATCTAGTAGGCTCTGTTTTCACTCAAGGAGGATGGTCTAACTTTCTGTGCTCGGAAA
AGAAAGTTGAGCAATCTGTTGACGTTGCACTTGTGTTCATCGGCAGAGAGTTAGTGTCTT
CTGATGTTTCTTCGAAAAGGAATTCGGACCCTGCCCTTGTTAACACATTGAATAGTCTGT
TTACTGCTTCCAACTTCTCATTGGCATTCCCATATATTGCTGCGCCAGAGGAAGAAAGGA
TGGAGACTTTGTTGCTTTCAGGGCTTAAAGAAGCTTGCCCTAACAATGTAGGAGTCAGCA
ATATTGTCTTCTCTGATTCTTGCTTTGTTGAAGATGGAACAGTTCAGAAACTATCAGACT
TGCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAGAGAAACAAGG*AAAGAAGGAGAAACT
GACTTGGTTGTGCTCTGTT*CTGAGGGTTCCGAATCAATTAGTGAATCTGGCCACTCACA
TTCAGAGCGTGAAAGCATTTCGGACTTGTTAGTTCAGTAGACATCTGGCAGTAAAATACA
GCTCTTATGTTCTGATCTTATTGGTACACATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT53TF U 1
AF RR2CZ28TF U 1
AF RR2AA23TF U 47
AF RR2G125TF U 65
AF RR2EX66TF U 99
BS 1 124 RR2BT53TF
BS 125 203 RR2CZ28TF
BS 204 204 RR2AA23TF
BS 205 699 RR2CZ28TF
BS 700 704 RR2AA23TF
BS 705 705 RR2G125TF
BS 706 739 RR2AA23TF
BS 740 740 RR2G125TF
BS 741 801 RR2AA23TF
BS 802 872 RR2EX66TF

RD RR2BT53TF 124 0 0
GGGTTGGCTCTCGACATGTCGACCTCTCCTTATGTGAGGATCGGAGATGAGTCTTGTCTT
TCTGAAATCTATTTCTGGGGATCTCGACTTGTTCTTTTGATCTCTGGTAAGATTGTTCAA
CGAA

QA 1 124 1 124
DS 

RD RR2CZ28TF 699 0 0
GGGTTGGCTCTCGACATGTCGACCTCTCCTTATGTGAGGATCGGAGATGAGTCTTGTCTT
TCTGAAATCTATTTCTGGGGATCTCGACTTGTTCTTTTGATCTCTGGTAAGATTGTTCAA
CGAAGAAGATGATGAAGATGCAGCGAATTGGTGTGGTGGCGTTTTTGGTGGCTCTATCTG
CGATTGAATTTGGATTGACTTCTACCAATACCGTTCCGGCTTTCCTCTGGTCTCCACATC
TCCAGCGTGGTAATAATGGTGAAGTGGATGAGGGTGTAAACTATCAGGTGATGTCTGCGA
AGGATCTAGTAGGCTCTGTTTTCACTCAAGGAGGATGGTCTAACTTTCTGTGCTCGGAAA
AGAAAGTTGAGCAATCTGTTGACGTTGCACTTGTGTTCATCGGCAGAGAGTTAGTGTCTT
CTGATGTTTCTTCGAAAAGGAATTCGGACCCTGCCCTTGTTAACACATTGAATAGTCTGT
TTACTGCTTCCAACTTCTCATTGGCATTCCCATATATTGCTGCGCCAGAGGAAGAAAGGA
TGGAGACTTTGTTGCTTTCAGGGCTTAAAGAAGCTTGCCCTAACAATGTAGGAGTCAGCA
ATATTGTCTTCTCTGATTCTTGCTTTGTTGAAGATGGAACAGTTCAGAAACTATCAGACT
TGCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAGAGAAA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2AA23TF 755 0 0
GG
GAGTCTTGTCTTTCTGAAATCTATTTCTGGGGATCTCGACTTGTTCTTTTGATCTCTGGT
AAGATTGTTCAACGAAGAAGATGATGAAGATGCAGCGAATTGGTGTGGTGGCGTTTTTGG
TGGCTCTATCTGCGATTGAATTTGGATTGACTTCTGCCAATACCGTTCCGGCTTTCCTCT
GGTCTCCACATCTCCAGCGTGGTAATAATGGTGAAGTGGATGAGGGTGTAAACTATCAGG
TGATGTCTGCGAAGGATCTAG***GCTCTGTTTTCACTCAAGGAGGATGGTCTAACTTTC
TGTGCTCGGAAAAGAAAGTTGAGCAATCTGTTGACGTTGCACTTGTGTTCATCGGCAGAG
AGTTAGTGTCTTCTGATGTTTCTTCGAAAAGGAATTCGGACCCTGCCCTTGTTAACACAT
TGAATAGTCTGTTTACTGCTTCCAACTTCTCATTGGCATTCCCATATATTGCTGCGCCAG
AGGAAGAAAGGATGGAGACTTTGTTGCTTTCAGGGCTTAAAGAAGCTTGCCCTAACAATG
TAGGAGTCAGCAATATTGTCTTCTCTGATTCTTGCTTTGTTGAAGATGGAACAGTTCAGA
AACTATCAGACTTGCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAGAGAAACAAGGGAAA
GAAGGAGAAACTGACTTGGTTGTGCTCTGTTTCTGAGGGTTCCGAATCAATTAGTGAATC
TGGCCACTCACATTCAGAGCGTGAAAGCATTTC

QA 3 755 3 755
DS 

RD RR2G125TF 732 0 0
GG
ATCTATTTCTGGGGATCTCGACTTGTTCTTTTGATCTCTGGTAAGATTGTTCAACGAAGA
AGATGATGAAGATGCAGCGAATTGGTGTGGTGGCGTTTTTGGTGGCTCTATCTGCGATTG
AATTTGGATTGACTTCTGCCAATACCGTTCCGGCTTTCCTCTGGTCTCCACATCTCCAGC
GTGGTAATAATGGTGAAGTGGATGAGGGTGTAAACTATCAGGTGATGTCTGCGAAGGATC
TAGTAGGCTCTGTTTTCACTCAAGGAGGATGGTCTAACTTTCTGTGCTCGGAAAAGAAAG
TTGAGCAATCTGTTGACGTTGCACTTGTGTTCATCGGCAGAGAGTTAGTGTCTTCTGATG
TTTCTTCGAAAAGGAATTCGGACCCTGCCCTTGTTAGCACATTGAATAGTCTGTTTACTG
CTTCCAACTTCTCATTGGCATTCCCATATATTGCTGCGCCAGAGGAAGAAAGGATGGAGA
CTTTGTTGCTTTCAGGGCTTAAAGAAGCTTGCCCTAACAATGTAGGAGTCAGCAATATTG
TCTTCTCTGATTCTTGCTTTGTTGAAGATGGAACAGTTCAGAAACTATCAGACTTGCAGT
CTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAGAGAAACAAG**AAAGAAG*AGAAACTGACTTG
GTTGTGCTCTGTT*CTGAGGGTTCCGAATCAATTAGTGAATCTGGCCACTCACATTCAGA
GCGTGAAAGC

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR2EX66TF 774 0 0
GATCTCTGGTGAGATTGTTCAACGAAGAAGATGATGAAGATGCAGCGAATTGGTGTGGTG
GCGTTTTTGGTGGCTCTATCTGCGATTGAATTTGGATTGACTTCTGCCAATACCGTTCCG
GCTTTCCTCTGGTCTCCACATCTCCAGCGTGGTAATAATGGTGAAGTGGATGAGGATGTA
AACTATCAGGTGATGTCTGCGAAGGATCTAGTAGGCTCTGTTTTCACTCAAGGAGGATGG
TCTAACTTTCTGTGCTCGGAAAAGAAAGTTGAGCAATCTGTTGACGTTGCACTTGTGTTC
ATCGGCAGAGAGTTAGTGTCTTCTGATGTTTCTTCGAAAAGGAATTCGGACCCTGCCCTT
GTTAACACATTGAATAGTCTGTTTACTGCTTCCAACTTCTCATTGGCATTCCCATATATT
GCTGCGCCAGAGGAAGAAAGGATGGAGACTTTGTTGCTTTCAGGGCTTAAAGAAGCTTGC
CCTAACAATGTAGGAGTCAGCAATATTGTCTTCTCTGATTCTTGCTTTGTTGAAGATGGA
ACAATTCAGAAACTATCAGACTTGCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAGAGAA
ACAAGG*AAAGAAGGAGAAACTGACTTGGTTGTGCTCTGTT*CTGAGGGTTCCGAATCAA
TTAGTGAATCTGGCCACTCACATTCAGAGCGTGAAAGCATTTCGGACTTGTTAGTTCAGT
AGACATCTGGCAGTAAAATACAGCTCTTATGTTCTGATCTTATTGGTACACATC

QA 1 774 1 774
DS 



CO CL717Contig2 1109 3 11 U
ACAAACTTTATAAAAGAATATAGTTGTTCTTCCAGTCTCTCTCTGGTTCTTTTACTCGTT
CTCCATTATTAATTTATAACGTTAAGGAAAGACTCACAAACAAGATGAATAAATGTTACA
AGGGGATTTTTTTATCGCATATCCATTTTTGTTTTTGAGATGTAACAATCGACATTGAGA
TACCTTTTTCACCATACGCACTATGCAGAAGAAAAGAAAGACCCGTCCACAAGCAAAAAG
CAAAGCAAAAGGGGGGGGTGACTCTTTTAGAAGTCAACTGCTCAAGAATCTTGAGGAGTC
TCGAATCTAGTTGGGGTATCAATACCCGCCATACAACAAAGTCCACTGATAAGGATGAGA
AGGAAAACGATTCCCACTAGTATGCCCTCCAAAAGTGATGACTTAAATTTGCAGAGTTCA
TCACAGGTTGTGGAAACACCAACACTGCTGTTTCCTGTAGCGCTTTCAGCTAGAAACCTT
TGGAGAGTTTTGTAAGATGTGTACCAATAAGGATCAGAAACATAAAGAGCTGTATATTTA
CTGCCAGATTGTTCTACTGAACTAACAAGTTCCGAAATGCTTTCACGCTCTGAATGTGAG
TGGCCAGATTCACTAATTGATTCGGAACCCTCAGAACAGAGCACAACCAAGTCAGTTTCT
CCTTCTTTCCTTGTTTCTCTTCTAGCAAGCAAATGATCTTTGAAAGACTGCAAGTCTGAT
AGTTTCTGAACTGCTCCATCTTCAACAAAGCAAGAATCAGAGAAGACAACATTGCTGACT
CCAACATTGTTAGGGCAAGCTTCTTTGAGACCTGAAAGCAGTAAATTCTCCATCCTTTCA
TCCTCTGGCGCAGCAATATATGGGAATGCCAATGAGAAGTTGGAAGCAGTAAACAGACTA
TTCAATGTGTTAACAAGGGCAGGGTCCGAACTCCTTTTCGAAGAAACATCAGAAGACACT
AACTCTCTGCCGATGAACACAAGTGCAACGTCAACAGCTTGCTCAACTTTCTTCTCCGAG
CACAGAAAGTTAGACCATCCTCCTTGATTGAAAACAGAGCCTACAAGATCCTTCGCAGAC
AGCACCTGGTAGTTTACACCCTCATCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX66JQ U 1
AF RR2AA23JQ U 190
AF RR2G049TF C 392
BS 1 314 RR2EX66JQ
BS 315 315 RR2AA23JQ
BS 316 728 RR2EX66JQ
BS 729 733 RR2AA23JQ
BS 734 734 RR2G049TF
BS 735 769 RR2AA23JQ
BS 770 770 RR2G049TF
BS 771 782 RR2AA23JQ
BS 783 783 RR2G049TF
BS 784 787 RR2AA23JQ
BS 788 1109 RR2G049TF

RD RR2EX66JQ 728 0 0
ACAAACTTTATAAAAGAATATAGTTGTTCTTCCAGTCTCTCTCTGGTTCTTTTACTCGTT
CTCCATTATTAATTTATAACGTTAAGGAAAGACTCACAAACAAGATGAATAAATGTTACA
AGGGGATTTTTTTATCGCATATCCATTTTTGTTTTTGAGATGTAACAATCGACATTGAGA
TACCTTTTTCACCATACGCACTATGCAGAAGAAAAGAAAGACCCGTCCACAAGCAAAAAG
CAAAGCAAAAGGGGGGGGTGACTCTTTTAGAAGTCAACTGCTCAAGAATCTTGAGGAGTC
TCGAATCTAGTTGGTGTATCAATACCCGCCATACAACAAAGTCCACTGATAAGGATGAGA
AGGAAAACGATTCCCACTAGTATGCCCTCCAAAAGTGATGACTTAAATTTGCAGAGTTCA
TCACAGGTTGTGGAAACACCAACACTGCTGTTTCCTGTAGCGCTTTCAGCTAGAAACCTT
TGGAGAGTTTTGTAAGATGTGTACCAATAAGGATCAGAAACATAAAGAGCTGTATATTTA
CTGCCAGATTGTTCTACTGAACTAACAAGTTCCGAAATGCTTTCACGCTCTGAATGTGAG
TGGCCAGATTCACTAATTGATTCGGAACCCTCAGAACAGAGCACAACCAAGTCAGTTTCT
CCTTCTTTCCTTGTTTCTCTTCTAGCAAGCAAATGATCTTTGAAAGACTGCAAGTCTGAT
AGTTTCTG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2AA23JQ 598 0 0
CACCATACGCACTATGCAGAAGAAAAGAAAGACCCGTCCACAAGCAAAAAGCAAAGCAAA
AGGGGGGGGTGACTCTTTTAGAAGTCAACTGCTCAAGAATCTTGAGGAGTCTCGAATCTA
GTTGGGGTATCAATACCCGCCATACAACAAAGTCCACTGATGAGGATGAGAAGGAAAACG
ATTCCCACTAGTATGCCCTCCAAAAGTGATGACTTAAATTTGCAGAGTTCATCACAGGTT
GTGGAAACACCAACACTGCTGTTTCCTGTAGCGCTTTCAGCTAGAAACCTTTGGAGAGTT
TTGTAAGATGTGTACCAATAAGGATCAGAAACATAAAGAGCTGTATATTTACTGCCAGAT
TGTTCTACTGAACTAACAAGTTCCGAAATGCTTTCACGCTCTGAATGTGAGTGGCCAGAT
TCACTAATTGATTCGGAACCCTCAGAACAGAGCACAACCAAGTCAGTTTCTCCTTCTTTC
CTTGTTTCTCTTCTAGCAAGCAAATGATCTTTGAAAGACTGCAAGTCTGATAGTTTCTGA
ACTGTTCCATCTTCAACAAAGCAAGAATCAGAGAAGACAATATTGCTGACTCCTACAT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2G049TF 718 0 0
AAAGTGATGACTTAAATTTGCAGAGTTCATCACAGGTTGTGGAAACACCAACACTGCTGT
TTC*TGCAGCGCTTTCAGCTAGAAAC*TTTGGAGAGTTTTGTAAGATGTGTACCAATAAG
GATCAGAAACATAAAGAGCTGTATATTTACTGCCAGATTGTTCTACAGAACTAACAAGTT
CCGAAATGCTTTCACGCTCTGAATGTGAGTGGCCAGATTCACTAATTGATTGGGAACCCT
CAGAACAGAGCACAACCAAGTCAGTTTCTCCTTCTTTTCTTGTTTCTCTTCTAGCAAGCA
AATGATCTTTGAAAGACTGCAAGTCTGATAGTTTCAGAATTGCTCCATCTTCAACAGAGC
AAGAATCAGAGAAGACAACATTGCTGACTCCAACATTGTTAGGGCAAGCTTCTTTGAGAC
CTGAAAGCAGTAAATTCTCCATCCTTTCATCCTCTGGCGCAGCAATATATGGGAATGCCA
ATGAGAAGTTGGAAGCAGTAAACAGACTATTCAATGTGTTAACAAGGGCAGGGTCCGAAC
TCCTTTTCGAAGAAACATCAGAAGACACTAACTCTCTGCCGATGAACACAAGTGCAACGT
CAACAGCTTGCTCAACTTTCTTCTCCGAGCACAGAAAGTTAGACCATCCTCCTTGATTGA
AAACAGAGCCTACAAGATCCTTCGCAGACAGCACCTGGTAGTTTACACCCTCATCCAC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 9

CO CL718Contig1 1258 9 35 U
GGAAAATAGTCCGAGCTAGAGAAGTTTGTCTTGATGAGAAATGGAAGCTCAAATTCTGTT
TCTCTATTTCTCACTCCTCGTTCTCTCTCTAAATTTCTTATTTCAGTATATCAAACCAAG
CCTAAGCCGCATGTTCCAGCCTTCTCTTGAAACTCAAGCCAAGGCCGCCATTTTATCAAG
AAAAGAAGTAGCCGAGTTTCTTGATTCTCCCATTGTGGAAGTAGTAGAAGATGAAGATAT
AAATACAACTTCTAGTTCCACGTTCGATTTTGATCCATACATGACGAGTAAAGCCGATGC
AGTGAACAAAGCTCTAGACGAAGCCATACCTGCCGGGGAGCCACTCAAGATCCACGAAGC
CATGCGTTACTCTGTTCTTGCAGCCGGTAAACGTGTAAGGCCTATTCTCTGCCTCGCTTC
TTGTGAGCTAGTAGGCGGCGAAGAAAATGCCGCGATGCCAGCGGCTTGTGCGGTTGAGAT
GATCCACACCATGTCTCTTATCAAAGACGACTTGCCTTGTATGGACAATGACGATCTGCG
TCGTGGGAAGCCCACCACTCACAAAGCCTACGGCGAAGGAGTCGCCATTCTCTCCGGAGG
AGCTCTCTTGTCTCTTGCGTTTGAGCACATGACAACGGCGGAGATATCCTCGGATAGAAT
GGTTTGGGCGGTCAGGGAGCTGGCTAGGTCCATTGGAACTAGAGGGCTAGTCGCGGGACA
AGCCAAGGACATAAGTAGTGAAGGTTTGGAGTTGAACGACGTCGGTTTAGAGCATTTGGA
GTTTATCCATGTACACAAAACTGCTGTTTTGTTGGAAACTGCTGCGGTTCTTGGAGCCAT
TATTGGTGGTGGATCTGATGAAGAGATTGAGAGTGTAAGAAAGTTTGCCAGGTGCATTGG
ATTGTTGTTTCAGGTGGTGGATGATATTTTGGACGAGACCAAGTCGTCAGAGGAATTGGG
AAAAACCGCCGGAAAAGATCAGCTACTTGGAAAGCTGACGTACCCCAAGCTGATGGGGTT
GGAGAAATCCAAAGAATTTGTTAAGAGATTGACTAAAGATGCACGTCAACATCTTCATGG
GTTTACTACGGAGAAGGTGGCACCTTTAGTAGCTCTTACTAATTTTATTGCCAATAGAAA
TAAATGAAATGTTATGTCTTTTAGAACTTCGATTGTTTGTTTTGTTGTGTCGGGTTTATG
CATACATGCTAAAACAGTGTGCTTACTTTTAACTTTTAAGTGTAACCACGTTTTTATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 35 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2FA39TF U 5
AF RR2GJ72TF U 6
AF RR2B716TF U 1
AF RR2AS66TF U 15
AF RR2AV24TF U 224
AF RR2B716JQ C 454
AF RR2AS66JQ C 486
AF RR2GJ72JQB C 520
AF RR2AV24JQ C 538
BS 1 117 RR2B716TF
BS 118 118 RR2FA39TF
BS 119 246 RR2B716TF
BS 247 247 RR2FA39TF
BS 248 312 RR2B716TF
BS 313 313 RR2FA39TF
BS 314 447 RR2B716TF
BS 448 448 RR2FA39TF
BS 449 453 RR2B716TF
BS 454 454 RR2FA39TF
BS 455 537 RR2B716TF
BS 538 538 RR2FA39TF
BS 539 570 RR2B716TF
BS 571 571 RR2GJ72TF
BS 572 739 RR2B716TF
BS 740 764 RR2AS66TF
BS 765 765 RR2AV24TF
BS 766 804 RR2AS66TF
BS 805 805 RR2AV24TF
BS 806 806 RR2AS66TF
BS 807 807 RR2AV24TF
BS 808 828 RR2AS66TF
BS 829 913 RR2AV24TF
BS 914 914 RR2B716JQ
BS 915 948 RR2AV24TF
BS 949 960 RR2B716JQ
BS 961 961 RR2GJ72JQB
BS 962 1007 RR2B716JQ
BS 1008 1008 RR2AS66JQ
BS 1009 1148 RR2B716JQ
BS 1149 1149 RR2AS66JQ
BS 1150 1214 RR2B716JQ
BS 1215 1215 RR2GJ72JQB
BS 1216 1257 RR2B716JQ
BS 1258 1258 RR2AS66JQ

RD RR2FA39TF 549 0 0
GGG
AGTCCGAGCTAGAGAAGTTTGTCTTGATGAGAAATGGAAGCTCAAATTCTGTTTCTCTAT
TTCTCACTCCTCGTTCTCTCTCTAAATTTCTTATTTCAGTATATCAAACCAAGGCTAAGC
CGCATGTTCCAGCCTTCTCTTGAAACTCAAGCCAAGGCCGCCATTTTATCAAGAAAAGAA
GTAGCCGAGTTTCTTGATTCTCCCATTGTGGAAGTAGTAGAAGATGAAGATATAAATACA
ACTTCTAGTTCCACGTTCGATTTTGATCCATACATGACGAGTAAAGCCGATGCAGTGAAC
AAAGCTCTAGACGAAGCCATACCTGCCGGGGAGCCACTCAAGATCCACGAAGCCATGCGT
TACTCTGTTCTTGCAGCCGGTAAACGTGTAAGGCCTATTCTCTGCCTCGCTTCTTGTGAG
CTAGTAGGCGGCGAAGAAAATGCCGCGATGCCAGCGGCTTGTGCGGTTGAGATGATCCAT
ACCATGTCTCTTATCAAAGACGACTTGCCTTGTATGGACAATGACGATCTGCGTCGTGGG
AAGCCC

QA 4 549 4 549
DS 

RD RR2GJ72TF 649 0 0
GG
AGTCCGAGCTAGAGAAGTTTGTCTTGATGAGAAATGGAAGCTCAAATTCTGTTTCTCTAT
TTCTCACTCCTCGTTCTCTCTCTAAATTTCTTATTTCAGTATATCAAACCAAGGCTAAGC
CGCATGTTCCAGCCTTCTCTTGAAACTCAAGCCAAGGCCGCCATTTTATCAAGAAAAGAA
GTAGCCGAGTTTCTTGATTCTCCCATTGTGGAAGTAGTAGAGGATGAAGATATAAATACA
ACTTCTAGTTCCACGTTCGATTTTGATCCATACATGACGAGTAAAGCCGATGCAGTGAAC
AAAGCTCTAGACGAAGCCATACCTGCCGGGGAGCCACTCAAGATCCACGAAGCCATGCGT
TACTCTGTTCTTGCAGCCGGTAAACGTGTAAGGCCTATTCTCTGCCTCGCTTCTTGTGAG
CTAGTAGGCGGCGAAGAAAATGCCGCGATGCCAGCGGCTTGTGCGGTTGAGATGATCCAT
ACCATGTCTCTTACCAAAGACGACTTGCCTTGTATGGACAATGACGATCTGCGTCGTGGG
AAGCCCACCACTCACAAAGCCTACGGCGAAGGAGTCGCCATTCTCTCCGGAGGAGCTCTC
TTGTCTCTTGCGTTTGAGCACATGACAACGGCGGAGATATCCTCGGA

QA 3 649 3 649
DS 

RD RR2B716TF 739 0 0
GGAAAATAGTCCGAGCTAGAGAAGTTTGTCTTGATGAGAAATGGAAGCTCAAATTCTGTT
TCTCTATTTCTCACTCCTCGTTCTCTCTCTAAATTTCTTATTTCAGTATATCAAACCGAG
CCTAAGCCGCATGTTCCAGCCTTCTCTTGAAACTCAAGCCAAGGCCGCCATTTTATCAAG
AAAAGAAGTAGCCGAGTTTCTTGATTCTCCCATTGTGGAAGTAGTAGAAGATGAAGATAT
AAATACCACTTCTAGTTCCACGTTCGATTTTGATCCATACATGACGAGTAAAGCCGATGC
AGTGAACAAAGCCCTAGACGAAGCCATACCTGCCGGGGAGCCACTCAAGATCCACGAAGC
CATGCGTTACTCTGTTCTTGCAGCCGGTAAACGTGTAAGGCCTATTCTCTGCCTCGCTTC
TTGTGAGCTAGTAGGCGGCGAAGAAAACGCCGCTATGCCAGCGGCTTGTGCGGTTGAGAT
GATCCACACCATGTCTCTTATCAAAGACGACTTGCCTTGTATGGACAATGACGATCTACG
TCGTGGGAAGCCCACCACTCACAAAGCCTATGGCGAAGGAGTCGCCATTCTCTCCGGAGG
AGCTCTCTTGTCTCTTGCGTTTGAGCACATGACAACGGCGGAGATATCCTCGGATAGAAT
GGTTTGGGCGGTCAGGGAGCTGGCTAGGTCCATTGGAACTAGAGGGCTAGTCGCGGGACA
AGCCAAGGACATAAGTAGT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2AS66TF 815 0 0
GG
TAGAGAAGTTTGTCTTGATGAGAAATGGAAGCTCAAATTCTGTTTCTCTATTTCTCACTC
CTCGTTCTCTCTCTAAATTTCTTATTTCAGTATATCAAACCGAGCCTAAGCCGCATGTTC
CAGCCTTCTCTTAAAACTCAAGCCAAGGCCGCCATTTTATCAAGAAAAGAAGTAGCCGAG
TTTCTTGATTCTCCCATTGTGGAAGTAGTAGAAGATGAAGATATAAATACCACTTCTAGT
TCCACGTTCGATTTTGATCCATACATGACGAGTAAAGCCGATGCAGTGAACAAAGCCCTA
GACGAAGCCATACCTGCCGGGGAGCCACTCAAGATCCACGAAGCCATGCGTTACTCTGTT
CTTGCAGCCGGTAAACGTGTAAGGCCTATTCTCTGCCTCGCTTCTTGTGAGCTAGTAGGC
GGCGAAGAAAACGCCGCGATGCCAGCGGCTTGTGCGGTTGAGATGATCCACACCATGTCT
CTTATCAAAGACGACTTGCCTTGTATGGACAATGACGATCTACGTCGTGGGAAGCCCACC
ACTCACAAAGTCTATGGCGAAGGAGTCGCCATTCTCTCCGGAGGAGCTCTCTTGTCTCTT
GCGTTTGAGCACATGACAACGGCGGAGATATCCTCGGATAGAATGGTTTGGGCGGTCAGG
GAGCTGGCTAGTTCCATTGGAACTAGAGGGCTAGTCGCGGGACAAGCCAAG*ACATAAGT
AGTGAAGGTTTGGAGTTGAACGACGTCG*TTTAGAGCATTTGGAGTTTATCCATGTACAC
AAAACTGC*GGTTTGTTGGAAACTGCTGCGGT
C

QA 3 814 3 814
DS 

RD RR2AV24TF 725 0 0
GTAGAAGATGAAGATATAAATACAACTTCTAGTTCCACGTTCGATTTTGATCCATACATG
ACGAGTAAAGCCGATGCAGTGAACAAAGCTCTAGACGAAGCCATACCTGCCGGGGAGCCA
CTCAAGATCCACGAAGCCATGCGTTACTCTGTTCTTGCAGCCGGTAAACGTGTAAGGCCT
ATTCTCTGCCTCGCTTCTTGTGAGCTAGTAGGCGGCGAAGAAAATGCCGCGATGCCAGCG
GCTTGTGCGGTTGAGATGATCCATACCATGTCTCTTATCAAAGACGACTTGCCTTGTATG
GACAATGACGATCTGCGTCGTGGGAAGCCCACCACTCACAAAGCCTACGGCGAAGGAGTC
GCCATTCTCTCCGGAGGAGCTCTCTTGTCTCTTGCGTTTGAGCACATGACAACGGCGGAG
ATATCCTCGGATAGAATGGTTTGGGCGGTCAGGGAACTGGCTAGGTCCATTGGAACTAGA
GGGTTAGTCGCGGGACAAGCCAAGGACATAAGTAGTGAAGGTTTGGAGTTGAACGACGTC
GGTTTAGAGCATTTGGAGTTTATCCATGTACATAAAACTGCTGTTTTGTTGGAAACTGCT
GCGGTTCTTGGAGCCATTATTGGTGGTGGATCTGATGAAGAGATTGAGAGTGTAAGAAAG
TTTGCCAGGTGCATTGGATTGTTGTTTCAG*TGGTGGATGATATTTTGGACGAGACCAAG
TCGTC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2B716JQ 804 0 0
T
ATGCCAGCGGCTTGTGCGGTTGAGATGATCCACACCATGTCTCTTATCAAAGACGACTTG
CCTTGTATGGACAATGACGATCTACGTCGTGGGAAGCCCACCACTCACAAAGCCTATGGC
GAAGGAGTCGCCATTCTCTCCGGAGGAGCTCTCTTGTCTCTTGCGTTTGAGCACATGACA
ACGGCGGAGATATCCTCGGATAGAATGGTTTGGGCGGTCAGGGAGCTGGCTAGGTCCATT
GGAACTAGAGGGCTAGTCGCGGGACAAGCCAAGGACATAAGTAGTGAAGGTTTGGAGTTG
AACGACGTCGGTTTAGAGCATTTGGAGTTTATCCATGTACACAAAACTGCGGTTTTGTTG
GAAACTGCTGCGGTTCTTGGAGCCATTATTGGTGGTGGATCTGATGAAGAGATTGAGAGT
GTAAGAAAGTTTGCTAGGTGCATTGGATTGTTGTTTCAGGTGGTTGATGATATTTTGGAC
GAGACCAAGTCGTCAGAGGAATTGGGGAAAACCGCCGGAAAAGATCAGCTACTTGGAAAG
CTGACGTACCCCAGGCTGATGGGGTTGGAGAAATCCAAAGAATTTGTTAAGAGATTGACT
AAAGATGCACGTCAACATCTTCATGGGTTTACTACGGAGAAGGTGGCACCTTTAGTAGCT
CTTACTAATTTTATTGCCAATAGAAATAAATGAAGTGTTATGTCTTTTAGAACTTCGATT
GTTTGTTTTGTTGTGTCGGGTTTATGCATACATGCTAAAATAGTGTGCTTACTTTTAACT
TTTAAGTGTAACCACGTTTTTAT

QA 2 804 2 804
DS 

RD RR2AS66JQ 773 0 0
ACACCATGTCTCTTATCAAAGACGACTTGCCTTGTATGGACAATGACGATCTACGTCGTG
GGAAGCCCACCACTCACAAAGTCTATGGCGAAGGAGTCGCCATTCTCTCCGGAGGAGCTC
TCTTGTCTCTTGCGTTTGAGCACATGACAACGGCGGAGATATCCTCGGATAGAATGGTTT
GGGCGGTCAGGGAGCTGGCTAGTTCCATTGGAACTAGAGGGCTAGTCGCGGGACAAGCCA
AGGACATAAGTAGTGAAGGTTTGGAGTTGAACGACGTCGGTTTAGAGCATTTGGAGTTTA
TCCATGTACACAAAACTGCGGTTTTGTTGGAAACTGCTGCGGTTCTTGGAGCCATTATTG
GTGGTGGATCTGATGAAGAGATTGAGAGTGTAAGAAAGTTTGCTAGGTGCATTGGATTGT
TGTTTCAGGTGGTTGATGATATTTTGGACGAGACCAAGTCGTCAGAGGAATTGGGGAAAA
CCGCCGGAAAAGATCAGCTACTTGGAAAGCTGACGTACCCCAAGCTGATGGGGTTGGAGA
AATCCAAAGAATTTGTTAAGAGATTGACTAAAGATGCACGTCAACATCTTCATGGGTTTA
CTACGGAGAAGGTGGCACCTTTAGTAGCTCTTACTAATTTTATTGCCAATAGAAATAAAT
GAAATGTTATGTCTTTTAGAACTTCGATTGTTTGTTTTGTTGTGTCGGGTTTATGCATAC
ATGCTAAAATAGTGTGCTTACTTTTAACTTTTAAGTGTAACCACGTTTTTATA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2GJ72JQB 739 0 0
TATGGACAATGACGATCTGCGTCGTGGGAAGCCCACCACTCACAAAGCTTACGGCGAAGG
AGTCGCCATTCTCTCCGGAGGAGCTCTCTTGTCTCTTGCGTTTGAGCACATGACAACGGC
GGAGATATCCTCGGATAGAATGGTTTGGGCGGTCAGGGAACTGGCTAGGTCCATTGGAAC
TAGAGGGTTAGTCGCGGGACAAGCCAAGGACATAAGTAGTGAAGGTTTGGAGTTGAACGA
CGTCGGTTTAGAGCATTTGGAGTTTATCCATGTACATAAAACTGCTGTTTTGTTGGAAAC
TGCTGCGGTTCTTGGAGCCATTATTGGTGGTGGATCTGATGAAGAGATTGAGAGTGTAAG
AAAGTTTGCCAGGTGCATTGGATTGTTGTTTCAGGTGGTGGATGATATTTTGGACGAGAC
CAAGTCGTCGGAGGAATTGGGAAAAACCGCCGGAAAAGATCAGCTACTTGGAAAGCTGAC
GTACCCCAAGCTGATGGGGTTGGAGAAATCCAGAGAATTTGTTAAGAGATTGACTATAGA
TGCACGTCAACATCTTCATGGGTTTACTACGGAGAAGGTGGCACCTTTAGTAGCTCTTAC
TAATTTTATTGCCAATAGAAATAAATGAAATGTTATGTCTTTTAGAACTTTGATTGTTTG
TTTTGTTGTGTCGGGTTTATGTATACATGCTAAAACAGTGTGCTTACTTTTAACTTTTAA
GTGTAACCATGTTTTTAT
A

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2AV24JQ 700 0 0
GCGTCGTGGGAAGCCCACCACTCACAAAGCCTACGGCGAAGGAGTCGCCATTCTCTCCGG
AGGAGCTCTCTTGTCTCTTGCGTTTGAGCACATGACAACGGCGGAGATATCCTCGGATAG
AATGGTTTGGGCGGTCAGGGAACTGGCTAGGTCCATTGGAACTAGAGGGTTAGTCGCGGG
ACAAGCCAAGGACATAAGTAGTGAAGGTTTGGAGTTGAACGACGTCGGTTTAGAGCATTT
GGAGTTTATCCATGTACATAAAACTGCTGTTTTGTTGGAAACTGCTGCGGTTCTTGGAGC
CATTATTGGTGGTGGATCTGATGAAGAGATTGAGAGTGTAAGAAAGTTTGCCAGGTGCAT
TGGATTGTTGTTTCAGGTGGTGGATGATATTTTGGACGAGACCAAGTCGTCGGAGGAATT
GGGAAAAACCGCCGGAAAAGATCAGCTACTTGGAAAGCTGACGTACCCCAAGCTGATGGG
GTTGGAGAAATCCAGAGAATTTGTTAAGAGATTGACTATAGATGCACGTCAACATCTTCA
TGGGTTTACTACGGAGAAGGTGGCACCTTTAGTAGCTCTTACTAATTTTATTGCCAATAG
AAATAAATGAAATGTTATGTCTTTTAGAACTTTGATTGTTTGTTTTGTTGTGTCGGGTTT
ATGTATACATGCTAAAACAGTGTGCTTACTTTTAACTTTT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 8

CO CL719Contig1 871 8 25 U
GGACACAACAACAACAACAACAATGGCCACTTCAAGAACATTCATGTCCTCTACTCTGTT
CATTTTCTTCCTTGTCATGGCAACAACCAATGGTCAGGCTCCAGCTCCAACCCCTTCAGG
TCCAACCAACATAACCGCAGTCCTAGAAAAGGCTGGTCAATTCACAATGTTCATAAGACT
CCTCAAGAGCACCCAAGCCGCAGACCAAATCAACACTCAGCTCAATTCTTCCTCCAGCCA
AGGCCTAACCGTGTTTGCCCCTACCGACAACGCATTTAGCAGCCTCAAATCCGGAACCTT
GAACTCGTTATCCGACCAGCAAAAGGTCCAGCTTGTTCAGTTCCATGTCCTTCCTACACT
CTTGACCATGCCTCAGTTCCAAACCGTTAGTAACCCCTTACGCACGCAAGCTGGTGATGG
CCAAAACGGTGAATTCCCTCTTAACATCACTAGCTCCGGTAACCAAGTCAACATCACCAC
GGGAGTTGTCAGCGCAACGGTAGCTAACTCTGTCTACACCGATAAGCAGCTTGCTGTGTA
TCAAGTGGATCAAGTTTTGCTACCGTTAGCAATGTTTGGTTCAAGCTCAGCGCCTGCTCC
TGCGCCTGAGAAAGGTGGCTTGGTGTCGAAAGGTTCAGCTCCAAGTGGTGATGATGGAGG
AGATTCTACTGATTCATCAGATACAGAGAGAATCAGATATTGGTTCATCTCCACCATGGC
AGCCATTGCTGCTTCTTCTATGTGGATATAACACCATATTTGATTTTAAGAATAACGAAT
GAGCTTTAAATTTTGTTGTAATTTGAGTTTTGTGTTATCATGTTATTGTTTTGGTTCAAA
AAATTACGATTGAGATTGCACAATATTTTCG


BQ
10 10 10 10 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 15 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D669TF U 1
AF RR2CD68TF U 3
AF RR2FA48TF U 1
AF RR2FF54TF U 6
AF RR2CD68JQ C 120
AF RR2FF54JQ C 146
AF RR2D669JQ C 147
AF RR2FA48JQ C 294
BS 1 561 RR2D669TF
BS 562 562 RR2FA48TF
BS 563 614 RR2D669TF
BS 615 615 RR2FA48TF
BS 616 630 RR2D669TF
BS 631 684 RR2FA48TF
BS 685 685 RR2CD68TF
BS 686 736 RR2FA48TF
BS 737 737 RR2FF54TF
BS 738 750 RR2FA48TF
BS 751 751 RR2CD68JQ
BS 752 766 RR2FA48TF
BS 767 768 RR2FF54TF
BS 769 771 RR2CD68JQ
BS 772 778 RR2FF54TF
BS 779 779 RR2CD68JQ
BS 780 789 RR2FF54TF
BS 790 791 RR2CD68JQ
BS 792 800 RR2FF54TF
BS 801 801 RR2CD68JQ
BS 802 810 RR2FF54TF
BS 811 811 RR2FF54JQ
BS 812 815 RR2FF54TF
BS 816 857 RR2CD68JQ
BS 858 871 RR2D669JQ

RD RR2D669TF 630 0 0
GGACACAACAACAACAACAACAATGGCCACTTCAAGAACATTCATGTCCTCTACTCTGTT
CATTTTCTTCCTTGTCATGGCAACAACCAATGGTCAGGCTCCAGCTCCAACCCCTTCAGG
TCCAACCAACATAACCGCAGTCCTAGAAAAGGCTGGTCAATTCACAATGTTCATAAGACT
CCTCAAGAGCACCCAAGCCGCAGACCAAATCAACACTCAGCTCAATTCTTCCTCCAGCCA
AGGCCTAACCGTGTTTGCCCCTACCGACAACGCATTTAGCAGCCTCAAATCCGGAACCTT
GAACTCGTTATCCGACCAGCAAAAGGTCCAGCTTGTTCAGTTCCATGTCCTTCCTACACT
CTTGACCATGCCTCAGTTCCAAACCGTTAGTAACCCCTTACGCACGCAAGCTGGTGATGG
CCAAAACGGTGAATTCCCTCTTAACATCACTAGCTCCGGTAACCAAGTCAACATCACCAC
GGGAGTTGTCAGCGCAACGGTAGCTAACTCTGTCTACACCGATAAGCAGCTTGCTGTGTA
TCAAGTGGATCAAGTTTTGCTGCCGTTAGCAATGTTTGGTTCAAGCTCAGCGCCTGCTCC
TGCGCCTGAGAAAG*TGGCTTGGTGTCGAA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2CD68TF 712 0 0
GG
ACAACAACAACAACAACAATGGCCACTTCAAGAACATTCATGTCCTCTACTCTGTTCATT
TTCTTCCTTGTCATGGCAACAACCAATGGTCAGGCTCCAGCTCCAACCCCTTCAGGTCCA
ACCAACATAACCGCAGTCCTAGAAAAGGCTGGTCAATTCACAATGTTCATAAGACTCCTC
AAGAGCACCCAAGCCGCAGACCAAATCAACACTCAGCTCAATTCTTCCTCCAGCCAAGGC
CTAACCGTGTTTGCCCCTACCGACAACGCATTTAGCAGCCTCAAATCCGGAACCTTGAAC
TCGTTATCCGACCAGCAAAAGGTCCAGCTTGTTCAGTTCCATGTCCTTCCTACACTCTTG
ACCATGCCTCAGTTCCAAACCGTTAGTAACCCCTTACGCACGCAAGCTGGTGATGGCCAA
AACGGTGAATTCCCTCTTAACATCACTAGCTCCGGTAACCAAGTCAACATCACCACGGGA
GTTGTCAGCGCAACGGTAGCTAACTCTGTCTACACCGATAAGCAGCTTGCTGTGTATCAA
GTGGATCAAGTTTTGCTGCCGTTAGCAATGTTTGGTTCAAGCTCAGCGCCTGCTCCTGCG
CCTGAGAAAGGTGGCTTGGTGTCGAAAGGTTCAGCTCCAAGTGGTGATGATGGAGGAGAT
TCTACTGATTCATCAGATACAGAGAGAATCAGATATTGGTTCATCTCCAC

QA 3 712 3 712
DS 

RD RR2FA48TF 772 0 0
GGAC
ACAACAACAACAACAACAATGGCCACTTCAAGAACATTCATGTCCTCTACTCTGTTCATT
TTCTTCCTTGTCATGGCAACAACCAATGGTCAGGCTCCAGCTCCAACCCCTTCAGGTCCA
ACCAACATAACCGCAGTCCTAGAAAAGGCTGGTCAATTCACAATGTTCATAAGACTCCTC
AAGAGCACCCAAGCCGCAGACCAAATCAACACTCAGCTCAATTCTTCCTCCAGCCAAGGC
CTAACCGTGTTTGCCCCTACCGACAACGCATTTAGCAGCCTCAAATCCGGAACCTTGAAC
TCGTTATCCGACCAGCAAAAGGTCCAGCTTGTTCAGTTCCATGTCCTTCCTACACTCTTG
ACCATGCCTCAGTTCCAAACCGTTAGTAACCCCTTACGCACGCAAGCTGGTGATGGCCAA
AACGGTGAATTCCCTCTTAACATCACTAGCTCCGGTAACCAAGTCAACATCACCACGGGA
GTTGTCAGCGCAACGGTGGCTAACTCTGTCTACAGCGATAAGCAGCTTGCTGTGTATCAA
GTGGATCAAGTTTTGCTACCGTTAGCAATGTTTGGTTCAAGCTCGGCTCCTGCTCCTGCG
CCTGAGAAAGGTGGCTTGGTTTCGAAAGGTTCAGCTCCAAGTGGTGATGATGGAGGAGAT
TCTACTGATTCATCAGATACGGAGAGAATCAGATATTGGTTCATCTCCACCATGGCAGCC
ATTGCTGCTTCT*CTATGTGGATATA*CACCATATTTGATTT
AAGATA

QA 5 766 5 766
DS 

RD RR2FF54TF 820 0 0
G
AACAACAACAACAACAATGGCCACTTCAAGAACATTCATGTCCTCTACTCTGTTCATTTT
CTTCCTTGTCATGGCAACAACCAATGGTCAGGCTCCAGCTCCAACCCCTTCAGGTCCAAC
CAACATAACCGCAGTCCTAGAAAAGGCTGGTCAATTCACAATGTTCATAAGACTCCTCAA
GAGCACCCAAGCCGCATACCAAATCAACACTCAGCTCAATTCTTCCTCCAGCCAAGGCCT
AACCGTGTTTGCCCCTACCGACAACGCATTTAGCAGCCTCAAATCCGGAACCTTGAACTC
GTTATCCGACCAGCAAAAGGTCCAGCTTGTTCAGTTCCATGTCCTTCCTACACTCTTGAC
CATGCCTCAGTTCCAAACCGTTAGTAACCCCTTACGCACGCAAGCTGGTGATGGCCAAAA
CGGTGAATTCCCTCTTAACATCACTAGCTCCGGTAACCAGGTCAACATCACCACGGGAGT
TGTCAGCGCAACGGTGGCTAACTCTGTCTACAGCGATAAGCAGCTTGCTGTGTATCAAGT
GGATCAAGTTTTGCTACCGTTAGCAATGTTTGGTTCAAGCTCAGCACCTGCTCCTGCGCC
TGAGAAAGGTGGCTTGGTTTCGAAAGGTTCAGCTCCAAATGGTGATGATGGAGGAGATTC
TACTGATTCATCAGATACAGAGAGAATCAGATATTGGTTCGTCTCCACCATTGCAGCCAT
TGCTGCTTCTTCTATGTGGATATA*CACTATATTTGATTTTAG**ATAACGA*TGAGCTT
TAA**TTTGTTGTA*TTTGAGTTT*GTGT
ATCATGTTAT

QA 2 810 2 810
DS 

RD RR2CD68JQ 740 0 0
GTCCAACCAACATAACCGCAGTCCTAGAAAAGGCTGGTCAATTCACAATGTTCATAAGAC
TCCTCAAGAGCACCCAAGCCGCAGACCAAATCAACACTCAGCTCAATTCTTCCTCCAGCC
AAGGCCTAACCGTGTTTGCCCCTACCGACAACGCATTTAGCAGCCTCAAATCCGGAACCT
TGAACTCGTTATCCGACCAGCAAAAGGTCCAGCTTGTTCAGTTCCATGTCCTTCCTACAC
TCTTGACCATGCCTCAGTTCCAAACCGTTAGTAACCCCTTACGCACGCAAGCTGGTGATG
GCCAAAACGGTGAATTCCCTCTTAACATCACTAGCTCCGGTAACCAAGTCAACATCACCA
CGGGAGTTGTCAGCGCAACGGTAGCTAACTCTGTCTACACCGATAAGCAGCTTGCTGTGT
ATCAAGTGGATCAAGTTTTGCTGCCGTTAGCAATGTTTGGTTCAAGCTCAGCGCCTGCTC
CTGCGCCTGAGAAAGGTGGCTTGGTGTCGAAAGGTTCAGCTCCAAGTGGTGATGATGGAG
GAGATTCTACTGATTCATCAGATACAGAGAGAATCAGATATTGGTTCATCTCCACCATGG
CAGCCATTGCCGCTTCTTCTATGTGGATATAACACCATATTTGATTTTAAGAATAACGAA
TGAGCTTTAAATTTTGTTGTAATTTGAGTTTCGTGTTATCATGTTATTGTTTTGGTTCAA
AAAATTACGATTGAGATT
AC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2FF54JQ 716 0 0
GAAAAGGCTGGTCAATTCACAATGTTCATAAGACTCCTCAAGAGCACCCAAGCCGCATAC
CAAATCAACACTCAGCTCAATTCTTCCTCCAGCCAAGGCCTAACCGTGTTTGCCCCTACC
GACAACGCATTTAGCAGCCTCAAATCCGGAACCTTGAACTCGTTATCCGACCAGCAAAAG
GTCCAGCTTGTTCAGTTCCATGTCCTTCCTACACTCTTGACCATGCCTCAGTTCCAAACC
GTTAGTAACCCCTTACGCACGCAAGCTGGTGATGGCCAAAACGGTGAATTCCCTCTTAAC
ATCACTAGCTCCGGTAACCAGGTCAACATCACCACGGGAGTTGTCAGCGCAACGGTGGCT
AACTCTGTCTACAGCGATAAGCAGCTTGCTGTGTATCAAGTGGATCAAGTTTTGCTACCG
TTAGCAATGTTTGGTTCAAGCTCAGCACCTGCTCCTGCGCCTGAGAAAGGTGGCTTGGTT
TCGAAAGGTTCAGCTCCAAATGGTGATGATGGAGGAGATTCTACTGATTCATCAGATACA
GAGAGAATCAGATATTGGTTCGTCTCCACCATTGCAGCCATTGCTGCTTCTTCTATGTGG
ATATAACACTATATTTGATTTTAAGAATAACGAATGAGCTTTAAATTTTGTTGTAATTTG
AGTTTTGTGTTATCATGTTATTGTTTTGGTTCAAAAAATTACGATTGAGATT
GCAC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2D669JQ 725 0 0
AAAAGGCTGGTCAATTCACAATGTTCATAAGACTCCTCAAGAGCACCCAAGCCGCAGACC
AAATCAACACTCAGCTCAATTCTTCCTCCAGCCAAGGCCTAACCGTGTTTGCCCCTACCG
ACAACGCATTTAGCAGCCTCAAATCCGGAACCTTGAACTCGTTATCCGACCAGCAAAAGG
TCCAGCTTGTTCAGTTCCATGTCCTTCCTACACTCTTGACCATGCCTCAGTTCCAAACCG
TTAGTAACCCCTTACGCACGCAAGCTGGTGATGGCCAAAACGGTGAATTCCCTCTTAACA
TCACTAGCTCCGGTAACCAAGTCAACATCACCACGGGAGTTGTCAGCGCAACGGTAGCTA
ACTCTGTCTACACCGATAAGCAGCTTGCTGTGTATCAAGTGGATCAAGTTTTGCTGCCGT
TAGCAATGTTTGGTTCAAGCTCAGCGCCTGCTCCTGCGCCTGAGAAAGGTGGCTTGGTGT
CGAAAGGTTCAGCTCCAAGTGGTGATGATGGAGGAGATTCTACTGATTCATCAGATACAG
AGAGAATCAGATATTGGTTCATCTCCACCATGGCAGCCATTGCTGCTTCTTCTATGTGGA
TATAACACCATATTTGATTTTAAGAATAACGAATGAGCTTTAAATTTTGTTGTAATTTGA
GTTTTGTGTTATCATGTTATTGTTTTGGTTCAAAAAATTACGATTGAGATTGCACAATAT
TTTCG

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2FA48JQ 566 0 0
GAACCTTGAACTCGTTATCCGACCAGCAAAAGGTCCAGCTTGTTCAGTTCCATGTCCTTC
CTACACTCTTGACCATGCCTCAGTTCCAAACCGTTAGTAACCCCTTACGCACGCAAGCTG
GTGATGGCCAAAACGGTGAATTCCCTCTTAACATCACTAGCTCCGGTAACCAAGTCAACA
TCACCACGGGAGTTGTCAGCGCAACGGTGGCTAACTCTGTTTACAGCGATAAGCAGCTTG
CTGTGTATCAAGTGGATCAAGTTTTGCTACCGTTAGCAATGTTTGGTTCAAGCTCGGCTC
CTGCTCCTGCGCCTGAGAAAGGTGGCTTGGTTTCGAAAGGTTCAGCTCCAAGTGGTGATG
ATGGAGGAGATTCTACTGATTCATCAGATACGGAGAGAATCAGATATTGGTTCATCTCCA
CCATGGCAGCCATTGCTGCTTCTTCTATGTGGATATAACACCATATTTGATTTTAAGAAT
AACGAATGAGCTTTAAATTTTGTTGTAATTTGAGTTTTGTGTTATCATGTTATTGTTTTG
GTTCAAAAAATTACGATTGAGATT
GC

QA 1 564 1 564
DS 



AS 3 9

CO CL720Contig1 730 2 2 U
GGGTATCTAAAAGTAAACTACTATTACGATCATCATCGTCGTTCTGTTTCTTTATCTTCG
ATTTGATTATTATATCTTAGTTTTTGTATCTACTAGTATTTGATTATTGTAGATTTTGAT
TGTAGTTTAAGGAGGAGAGAGATGGCTTCAGAGAAGAAGGTTCTAGGATTCGAAGAAGTT
TCACAGCACAACAAAACCAAAGACTGTTGGCTCATTATCTCCGGCAAGGTGTATGATGTG
ACCCCATTCATGGATGATCATCCTGGAGGCGATGAAGTCTTGTTGTCCTCAACAGGGAAA
GATGCTACGAATGACTTTGAAGACGTTGGACACAGCGACACCGCAAGGGACATGATGGAG
AAGTACTACATTGGCGAGATCGATTCGTCTACTGTTCCAGCCACAAGGGCATACGTTGCA
CCTTCCCAACCCGCTTACAACCAAGACAAGACACCAGAGTTCATCATCAAGATTCTCCAG
TTCCTTGTCCCAATCTTGATCTTGGGTCTCGCACTTCTTGTCCGTCAATATACCAAGAAA
GAGTAGATACAGAGGCTTTGCATTTTTTGCTTGCCACTGGATAACTCTTTTCTGATTTCT
CTCTGTATTTGCAAAAAAAAGAATACAGTTACTGTTGTTTCATGTTTGGTCCTAGACTGT
ATCTCTGTCCTTAAAAATGATTCTTGTTGAAACTACTACGAAGTAATAATCAGTGTGTTT
GCTTAGTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2AP65JQ C 1
AF RR2AP65TF U 1
BS 1 729 RR2AP65TF
BS 730 730 RR2AP65JQ

RD RR2AP65JQ 730 0 0
GGGTATCTAAAAGTAAACTACTATTACGATCATCATCGTCGTTCTGTTTCTTTATCTTCG
ATTTGATTATTATATCTTAGTTTTTGTATCTACTAGTATTTGATTATTGTAGATTTTGAT
TGTAGTTTAAGGAGGAGAGAGATGGCTTCAGAGAAGAAGGTTCTAGGATTCGAAGAAGTT
TCACAGCACAACAAAACCAAAGACTGTTGGCTCATTATCTCCGGCAAGGTGTATGATGTG
ACCCCATTCATGGATGATCATCCTGGAGGCGATGAAGTCTTGTTGTCCTCAACAGGGAAA
GATGCTACGAATGACTTTGAAGACGTTGGACACAGCGACACCGCAAGGGACATGATGGAG
AAGTACTACATTGGCGAGATCGATTCGTCTACTGTTCCAGCCACAAGGGCATACGTTGCA
CCTTCCCAACCCGCTTACAACCAAGACAAGACACCAGAGTTCATCATCAAGATTCTCCAG
TTCCTTGTCCCAATCTTGATCTTGGGTCTCGCACTTCTTGTCCGTCAATATACCAAGAAA
GAGTAGATACAGAGGCTTTGCATTTTTTGCTTGCCACTGGATAACTCTTTTCTGATTTCT
CTCTGTATTTGCAAAAAAAAGAATACAGTTACTGTTGTTTCATGTTTGGTCCTAGACTGT
ATCTCTGTCCTTAAAAATGATTCTTGTTGAAACTACTACGAAGTAATAATCAGTGTGTTT
GCTTAGTCCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2AP65TF 730 0 0
GGGTATCTAAAAGTAAACTACTATTACGATCATCATCGTCGTTCTGTTTCTTTATCTTCG
ATTTGATTATTATATCTTAGTTTTTGTATCTACTAGTATTTGATTATTGTAGATTTTGAT
TGTAGTTTAAGGAGGAGAGAGATGGCTTCAGAGAAGAAGGTTCTAGGATTCGAAGAAGTT
TCACAGCACAACAAAACCAAAGACTGTTGGCTCATTATCTCCGGCAAGGTGTATGATGTG
ACCCCATTCATGGATGATCATCCTGGAGGCGATGAAGTCTTGTTGTCCTCAACAGGGAAA
GATGCTACGAATGACTTTGAAGACGTTGGACACAGCGACACCGCAAGGGACATGATGGAG
AAGTACTACATTGGCGAGATCGATTCGTCTACTGTTCCAGCCACAAGGGCATACGTTGCA
CCTTCCCAACCCGCTTACAACCAAGACAAGACACCAGAGTTCATCATCAAGATTCTCCAG
TTCCTTGTCCCAATCTTGATCTTGGGTCTCGCACTTCTTGTCCGTCAATATACCAAGAAA
GAGTAGATACAGAGGCTTTGCATTTTTTGCTTGCCACTGGATAACTCTTTTCTGATTTCT
CTCTGTATTTGCAAAAAAAAGAATACAGTTACTGTTGTTTCATGTTTGGTCCTAGACTGT
ATCTCTGTCCTTAAAAATGATTCTTGTTGAAACTACTACGAAGTAATAATCAGTGTGTTT
GCTTAGTCC
A

QA 1 729 1 729
DS 



CO CL720Contig2 662 5 8 U
TTTTGGACTAAGCAAACACACTGATTATTACTTCGTAGTAGTTTCAACAAGAATCATTTT
TAAGGACAGAGATACAGTCTAGGACCAAACATGAAACAACAGTAACTGTATTCTTTTTTT
TTGCAAATACAGAGAGAAATCAGAAAAGAGTTATCCAGTGGCAAGCAAAAAATGCAAAGC
CTCTGTATCTACTCTTTCTTGGTATATTGACGGACAAGAAGTGCGAGACCCAAGATCAAG
ATTGGGACAAGGAACTGGAGAATCTTGATGATGAACTCTGGTGTCTTGTCTTGGTTGTAA
GCGGGTTGGGAAGGTGCAACGTATGCCCTTGTGGCTGGAACAGTAGACGAATCGATCTCG
CCAATGTAGTACTTCTCCATCATGTCCCTTGCGGTGTCGCTGTGTCCAACGTCTTCAAAG
TCATTCGTAGCATCTTTCCCTGTTGAGGACAACAAGACTTCATCGCCTCCAGGATGATCA
TCCATGAATGGGGTCACATCATACACCTTGCCGGAGATAATGAGCCAACAGTCTTTGGTT
TTGTTGTGCTGTGAAACTTCTTCGAATCCTAGAACCTTCTTCTCTGAAGCCATCTCTCTC
CTCCTTAAATTTTAGATTCAGAGTTTCGATAGCTTCGAGGCTCCTCACCCTGTAATCAGC
CC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 

AF RR2GS86JQB U 12
AF RR2EE13JQ U 5
AF RR2GW65JQ U 3
AF RR2EE13TF C 1
AF RR2GS86TF C 26
BS 1 4 RR2EE13TF
BS 5 253 RR2EE13JQ
BS 254 254 RR2GS86JQB
BS 255 452 RR2EE13JQ
BS 453 453 RR2GS86JQB
BS 454 613 RR2EE13JQ
BS 614 635 RR2GW65JQ
BS 636 662 RR2EE13TF

RD RR2GS86JQB 501 0 0
GCAAACACACCGATTATTACTTCGTAGTAGTTTCAACAAGAATCATTTTTAAGGACAGAG
ATACAGTCTAGGACCAAACATGAAACAACAGTAACTGTATTCTTTTTTTTTGCAAATACA
GAGAGAAATCAGAAAAGAGTTATCCAGTGGCAAGCAAAAAATGCAAAGCCTCTGTATCTA
CTCTTTCTTGGTATATTGACGGACAAGAAGTGCGAGACCCAAGATCAAGATTGGGACAAG
GAACTGGAGAATCTTGATGATGAACTCTGGTGTCTTGTCTTGGTTGTAAGCGGGTTGGGA
AGGTGCAACGTATGCCCTTGTGGCTGGAACAGTAGACGAATCGATCTCGCCAATGTAGTA
CTTCTCCATCATGTCCCTTGCGGTGTCGCTGTGTCCAACGTCTTCAAAGTCATTCGTAGC
ATCTTTCCCTGTTGAGGACAACAAGACTTCATCGCCTCCAGGATGATCATCCATGAATGG
GGTCACATCATACACCTTGCC

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR2EE13JQ 609 0 0
GGACTAAGCAAACACACTGATTATTACTTCGTAGTAGTTTCAACAAGAATCATTTTTAAG
GACAGAGATACAGTCTAGGACCAAACATGAAACAACAGTAACTGTATTCTTTTTTTTTGC
AAATACAGAGAGAAATCAGAAAAGAGTTATCCAGTGGCAAGCAAAAAATGCAAAGCCTCT
GTATCTACTCTTTCTTGGTATATTGACGGACAAGAAGTGCGAGACCCAAGATCAAGATTG
GGACAAGGAGCTGGAGAATCTTGATGATGAACTCTGGTGTCTTGTCTTGGTTGTAAGCGG
GTTGGGAAGGTGCAACGTATGCCCTTGTGGCTGGAACAGTAGACGAATCGATCTCGCCAA
TGTAGTACTTCTCCATCATGTCCCTTGCGGTGTCGCTGTGTCCAACGTCTTCAAAGTCAT
TCGTAGCATCTTTCCCTGTTGAGGACAAAAAGACTTCATCGCCTCCAGGATGATCATCCA
TGAATGGGGTCACATCATACACCTTGCCGGAGATAATGAGCCAACAGTCTTTGGTTTTGT
TGTGCTGTGAAACTTCTTCGAATCCTAGAACCTTCTTCTCTGAAGCCATCTCTCTCCTCC
TTAAATTTT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2GW65JQ 633 0 0
AG
GGACTAAGCAAACACACTGATTATTACTTCGTAGTAGCTTCAACAAGAATCATTTTTAAG
GACAGAGATACAGTCTAGGACCAAACATGAAACAACAGTAACTGTATTCTTTTTTTTTGC
AAATACAGAGAGAAATCAGAAAAGAGTTATCCAGTGGCAAGCAAAAAATGCAAAGCCTCT
GTATCTACTCTTTCTTGGTATATTGACGGACAAGAAGTGCGAGACCCAAGATCAAGATTG
GGACAAGGAACTGGAGAATCTTGATGATGAACTCTGGTGTCTTGTCTTGGTTGTAAGCGG
GTTGGGAAGGTGCAACGTATGCCCTTGTGGCTGGAACAGTAGACGAATCGATCTCGCCAA
TGTAGTACTTCTCCATCATGTCCCTTGCGGTGTCGCTGTGTCCAACGTCTTCAAAGTCAT
TCGTAGCATCTTTCCCTGTTGAGGACAACAAGACTTCATCGCCTCCAGGATGATCATCCA
TAAATGGGGTCACATCATACACCTTGCCGGAGATAATGAGCCAACAGTCTTTGGTTTTGT
TGTGCTGTGAAACTTCTTCGAATCCTAGAACCTTCTTCTCTGAAGCCATCTCTCTCCTCC
TTAAATTTTAGATTCAGAGTTTCGATAGCTT

QA 3 633 3 633
DS 

RD RR2EE13TF 662 0 0
TTTTGGACTAAGCAAACACACTGATTATTACTTCGTAGTAGTTTCAACAAGAATCATTTT
TAAGGACAGAGATACAGTCTAGGACCAAACATGAAACAACAGTAACTGTATTCTTTTTTT
TTGCAAATACAGAGAGAAATCAGAAAAGAGTTATCCAGTGGCAAGCAAAAAATGCAAAGC
CTCTGTATCTACTCTTTCTTGGTATATTGACGGACAAGAAGTGCGAGACCCAAGATCAAG
ATTGGGACAAGGAGCTGGAGAATCTTGATGATGAACTCTGGTGTCTTGTCTTGGTTGTAA
GCGGGTTGGGAAGGTGCAACGTATGCCCTTGTGGCTGGAACAGTAGACGAATCGATCTCG
CCAATGTAGTACTTCTCCATCATGTCCCTTGCGGTGTCGCTGTGTCCAACGTCTTCAAAG
TCATTCGTAGCATCTTTCCCTGTTGAGGACAAAAAGACTTCATCGCCTCCAGGATGATCA
TCCATGAATGGGGTCACATCATACACCTTGCCGGAGATAATGAGCCAACAGTCTTTGGTT
TTGTTGTGCTGTGAAACTTCTTCGAATCCTAGAACCTTCTTCTCTGAAGCCATCTCTCTC
CTCCTTAAATTTTAGATTCAGAGTTTCGATAGCTTCGAGGCTCCTCACCCTGTAATCAGC
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2GS86TF 637 0 0
TATTACTTCGTAGTAGTTTCAACAAGAATCATTTTTAAGGACAGAGATACAGTCTAGGAC
CAAACATGAAACAACAGTAACTGTATTCTTTTTTTTTGCAAATACAGAGAGAAATCAGAA
AAGAGTTATCCAGTGGCAAGCAAAAAATGCAAAGCCTCTGTATCTACTCTTTCTTGGTAT
ATTGACGGACAAGAAGTGCGAGACCCAAGATCAAGATTGGGACAAGGAACTGGAGAATCT
TGATGATGAACTCTGGTGTCTTGTCTTGGTTGTAAGCGGGTTGGGAAGGTGCAACGTATG
CCCTTGTGGCTGGAACAGTAGACGAATCGATCTCGCCAATGTAGTACTTCTCCATCATGT
CCCTTGCGGTGTCGCTGTGTCCAACGTCTTCAAAGTCATTCGTAGCATCTTTCCCTGTTG
AGGACAACAAGACTTCATCGCCTCCAGGATGATCATCCATGAATGGGGTCACATCATACA
CCTTGCCGGAGATAATGAGCCAACAGTCTTTGGTTTTGTTGTGCTGTGAAACTTCTTCGA
ATCCTAGAACCTTCTTCTCTGAAGCCATCTCCCTCCTCCTTAAATTTTAGATTCAGAGTT
TCGATAGCTTCGAGGCTCCTCACCCTGTAATCAGCCC

QA 1 637 1 637
DS 



CO CL720Contig3 650 2 1 U
GGAATTAAGTAGGTGAGGAACACCAGTTTCTTCCGTCTTTTGCTGATTACAGGTTTAAGG
AGGAGAGAGATGGCTTCAGAGAAGAAGGTTCTAGGATTCGAAGAAGTTTCACAGCACAAC
AAAACCAAAGACTGTTGGCTCATTATCTCCGGCAAGGTGTATGATGTGACCCCATTCATG
GATGATCATCCTGGAGGCGATGAAGTCTTGTTGTCCTCAACAGGGAAAGATGCTACGAAT
GACTTTGAAGACGTTGGACACAGCGACACCGCAAGGGACATGATGGAGAAGTACTACATT
GGCGAGATCGATTCGTCTACTGTTCCAGCCACAAGGGCATACGTTGCACCTTCCCAACCC
GCTTACAACCAAGACAAGACACCAGAGTTCATCATCAAGATTCTCCAGTTCCTTGTCCCA
ATCTTGATCTTGGGTCTCGCACTTCTTGTCCGTCAATATACCAAGAAAGAGTAGATACAG
AGGCTTTGCATTTTTTGCTTGCCACTGGATAACTCTTTTCTGATTTCTCTCTGTATTTGC
AAAAAAAAGAATACAGTTACTGTTGTTTCATGTTTGGTCCTAGACTGTATCTCTGTCCTT
AAAAATGATTCTTGTTGAAACTACTACGAAGTAATAATCAGTGTGTTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FL71JQ C 1
AF RR2FL71TF U 1
BS 1 650 RR2FL71TF

RD RR2FL71JQ 650 0 0
GGAATTAAGTAGGTGAGGAACACCAGTTTCTTCCGTCTTTTGCTGATTACAGGTTTAAGG
AGGAGAGAGATGGCTTCAGAGAAGAAGGTTCTAGGATTCGAAGAAGTTTCACAGCACAAC
AAAACCAAAGACTGTTGGCTCATTATTTCCGGCAAGGTGTATGATGTGACCCCATTCATG
GATGATCATCCTGGAGGCGATGAAGTCTTGTTGTCCTCAACAGGGAAAGATGCTACGAAT
GACTTTGAAGACGTTGGACACAGCGACACCGCAAGGGACATGATGGAGAAGTACTACATT
GGCGAGATCGATTCGTCTACTGTTCCAGCCACAAGGGCATACGTTGCACCTTCCCAACCC
GCTTACAACCAAGACAAGACACCAGAGTTCATCATCAAGATTCTCCAGTTCCTTGTCCCA
ATCTTGATCTTGGGTCTCGCACTTCTTGTCCGTCAATATACCAAGAAAGAGTAGATACAG
AGGCTTTGCATTTTTTGCTTGCCACTGGATAACTCTTTTCTGATTTCTCTCTGTATTTGC
AAAAAAAAGAATACAGTTACTGTTGTTTCATGTTTGGTCCTAGACTGTATCTCTGTCCTT
AAAAATGATTCTTGTTGAAACTACTACGAAGTAATAATCAGTGTGTTTGC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2FL71TF 650 0 0
GGAATTAAGTAGGTGAGGAACACCAGTTTCTTCCGTCTTTTGCTGATTACAGGTTTAAGG
AGGAGAGAGATGGCTTCAGAGAAGAAGGTTCTAGGATTCGAAGAAGTTTCACAGCACAAC
AAAACCAAAGACTGTTGGCTCATTATCTCCGGCAAGGTGTATGATGTGACCCCATTCATG
GATGATCATCCTGGAGGCGATGAAGTCTTGTTGTCCTCAACAGGGAAAGATGCTACGAAT
GACTTTGAAGACGTTGGACACAGCGACACCGCAAGGGACATGATGGAGAAGTACTACATT
GGCGAGATCGATTCGTCTACTGTTCCAGCCACAAGGGCATACGTTGCACCTTCCCAACCC
GCTTACAACCAAGACAAGACACCAGAGTTCATCATCAAGATTCTCCAGTTCCTTGTCCCA
ATCTTGATCTTGGGTCTCGCACTTCTTGTCCGTCAATATACCAAGAAAGAGTAGATACAG
AGGCTTTGCATTTTTTGCTTGCCACTGGATAACTCTTTTCTGATTTCTCTCTGTATTTGC
AAAAAAAAGAATACAGTTACTGTTGTTTCATGTTTGGTCCTAGACTGTATCTCTGTCCTT
AAAAATGATTCTTGTTGAAACTACTACGAAGTAATAATCAGTGTGTTTGC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 2 8

CO CL721Contig1 979 3 8 U
GAAAATGAACAAGAAAAAAAAGTAATTCAAACTTACAAACCATTTAGCATTCAGCATTAT
CTCCCATTTGCCGTCCCTAATATGGCTAATCAAAAAACATAAACACCCATCATAGTTCTA
CAAATCAACCCACAAACCATTTTGGAAAACTAAAAACACTTAAAAACAAAAGACAAATAA
AAAAACACATCAAATAGAGCCATAACATAATTAAGTACATAACCCTAATAAGCCATAAGA
TTAGTTCTTCACTGGTTGGTCTTATGTCTGTGAGATAGAGAATCACTCGGTTTCTATGTT
CATGCTAAGCTCCTCAAGCTTCTTTAACCTCAGCTTCTCGCTTTCTCCAACCAACTCCAT
TAGCTTGGTGAGCAACTGAACTTTCTCACGATTCTTCTCATTGAATGTATCCAATGCTTC
TTTGTACTCCCTTTCCTTCTTTTGAACTGTTGCGCCTAATGGTTTGAGTTCTTTGTTGAC
GCTATCGATTTTCTTACGCACCCAAGAAACTTCCTTCCTCATTGGATCTGCCATAGACTC
AAGCTCCTCGCGGATGTTGGCGAGACGTCTGGTTTCTTCCTCGACACGACCAAGCTGAGT
CTTGACCCGTTCACGAACCTCCATTTTCCTCTTCTCGATCTCATCCTCTTTAGCCCTAAA
AGCAGAGAGAGCAGAACGAGCCATCTCCTCCTCTTCTCTAGACATCTGACTGCTGAAGCT
GAAGCTCACCATCTGCTGGTTCTGCGGCTGAGCAGGATCCCTACTCTGCATCTTCGGTTT
CTCTTCTTCTTCTTCCTTGTGGTTGGTATTGTTATTGCTACTCTTCTTCTTCTTCCTCAA
GCCGCAGCAAGAACGCGACTGATGCAGTTCCTCTGTGGAACTCCGGTGGGGTTCTTCGAT
TGAACCTATTTCTACTTGTTGGGGGTTGGATCGAAGCAACAGCCTTTTGTAATTGAGTTT
TTGAAGGTCTATTCTCTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ81JQ U 1
AF RR2BK10JQ U 1
AF RR2BK10TF C 183
BS 1 85 RR2BK10JQ
BS 86 86 RR2DQ81JQ
BS 87 755 RR2BK10JQ
BS 756 756 RR2BK10TF
BS 757 776 RR2BK10JQ
BS 777 777 RR2BK10TF
BS 778 788 RR2BK10JQ
BS 789 979 RR2BK10TF

RD RR2DQ81JQ 739 0 0
GAAAATGAACAAGAAAAAAAAGTAATTCAAACTTACAAACCATTTAGCATTCAGCATTAT
CTCCCATTTGCCGTCCCTAATATGGCTAATCAAAAAACATAAACACCCATCATAGTTCTA
CAAATCAACCCACAAACCATTTTGGAAAACTAAAAACACTTAAAAACAAAAGACAAATAA
AAAAACACATCAAATAGAGCCATAACATAA****GTACATAACCCTAATAAGCCATAAGA
TTAGTTCTTCACTGGTTGGTCTTATGTCTGTGAGATAGAGAATCACTCGGTTTCTATGTT
CATGCTAAGCTCCTCAAGCTTCTTTAACCTCAGCTTCTCGCTTTCTCCAACCAACTCCAT
TAGCTCGGTGAGCAGCTGAACTTTCTCACGATTCTTCTCATTGAATGTATCCAATGCTTC
TTTGTACTCCCTTTCCTTCTTTTGAACTGTTGCGCCTAATGGTTTGAGGTCTTTGTTGAC
GCTATCGATCTTCTTACGCACCCAAGAAACTTCCTTCCTCATTGGATCTGCCATAAACTC
AAGCTCCTCGCGGATGTTGGCGAGACGTCTGGTTTCTTCCTCGACACGACCAAGCTGAGT
CTTGACCCGTTCACGAACCTCCATTTTCCTCTTCTCGATCTCATCCTCTTTAGCCCTAAA
CGCAGAGAGAGCAGAACGAGCCATCTCCTCCTCTTCTCTAGACATCTGACTGCTGAAGCT
GAAGCTCACCATCTGCTGG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2BK10JQ 788 0 0
GAAAATGAACAAGAAAAAAAAGTAATTCAAACTTACAAACCATTTAGCATTCAGCATTAT
CTCCCATTTGCCGTCCCTAATATGGTTAATCAAAAAACATAAACACCCATCATAGTTCTA
CAAATCAACCCACAAACCATTTTGGAAAACTAAAAACACTTAAAAACAAAAGACAAATAA
AAAAACACATCAAATAGAGCCATAACATAATTAAGTACATAACCCTAATAAGCCATAAGA
TTAGTTCTTCACTGGTTGGTCTTATGTCTGTGAGATAGAGAATCACTCGGTTTCTATGTT
CATGCTAAGCTCCTCAAGCTTCTTTAACCTCAGCTTCTCGCTTTCTCCAACCAACTCCAT
TAGCTTGGTGAGCAACTGAACTTTCTCACGATTCTTCTCATTGAATGTATCCAATGCTTC
TTTGTACTCCCTTTCCTTCTTTTGAACTGTTGCGCCTAATGGTTTGAGTTCTTTGTTGAC
GCTATCGATTTTCTTACGCACCCAAGAAACTTCCTTCCTCATTGGATCTGCCATAGACTC
AAGCTCCTCGCGGATGTTGGCGAGACGTCTGGTTTCTTCCTCGACACGACCAAGCTGAGT
CTTGACCCGTTCACGAACCTCCATTTTCCTCTTCTCGATCTCATCCTCTTTAGCCCTAAA
AGCAGAGAGAGCAGAACGAGCCATCTCCTCCTCTTCTCTAGACATCTGACTGCTGAAGCT
GAAGCTCACCATCTGCTGGTTCTGCGGCTGAGCAG*ATCCCTACTCTGCATCTTCG*TTT
CTCTTCTT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2BK10TF 797 0 0
AAACACATCAAATAGAGCCATA*CATAATTAAGTACATAACC*TAATAAGCCATAAGATT
AGTTCTTCACTGGTTGGTCTTATGTCTGTGAGATAGAGAATCACTCGGTTTCTATGTTCA
TGCTAAGCTCCTCAAGCTTCTTTAAC*TCAGCTTCTCGCTTTCTCCAACCAACTCCATTA
GCTTGGTGAGCAACTGAACTTTCTCACGATTCTTCTCATTGAATGTATCCAATGCTTCTT
TGTACTCCCTTTCCTTCTTTTGAACTGTTGCGCCTAATGGTTTGAGTTCTTTGTTGACGC
TATCGATTTTCTTACGCACCCAAGAAACTTCCTTCCTCATTGGATCTGCCATAGACTCAA
GCTCCTCGCGGATGTTGGCGAGACGTCTGGTTTCTTCCTCGACACGACCAAGCTGAGTCT
TGACCCGTTCACGAACCTCCATTTTCCTCTTCTCGATCTCATCCTCTTTAGCCCTAAAAG
CAGAGAGAGCAGAACGAGCCATCTCCTCCTCTTCTCTAGACATCTGACTGCTGAAGCTGA
AGCTCACCATCTGCTGGTTCTGCGGCTGAGCAGGATCCCTACTCTGCATCTTCGGTTTCT
CTTCTTCTTCTTCCTTGTGGTTGGTATTGTTATTGCTACTCTTCTTCTTCTTCCTCAAGC
CGCAGCAAGAACGCGACTGATGCAGTTCCTCTGTGGAACTCCGGTGGGGTTCTTCGATTG
AACCTATTTCTACTTGTTGGGGGTTGGATCGAAGCAACAGCCTTTTGTAATTGAGTTTTT
GAAGGTCTATTCTCTCC

QA 1 797 1 797
DS 



CO CL721Contig2 1045 5 27 U
GAGAGAGAGAAGAGACCTTCAAAAACTCAATTACAAAAGGCTGTTGCTTCGATTCAATCC
CCAACAAGTAAAAATAGGTTCAATCGAAGAACCCCACTGGAGTTCCACAGAGGAACTGCA
TCAGTCGCGTTCCTGCTGCGGCTTGAGGAAGAAGAAGAAGAGTAGCAATAACAATAACAA
CCACAAGGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAGAAACCGAAGATGCAGAGTAGGGATCCTGC
TCAGCCGCAGAACCAGCAGATGGTGAGCTTCAGCTTCAGCAGTCAGATGTCTAGAGAAGA
GGAGGAGATGGCTCGTTCTGCTCTTTCTGCGTTTAGGGCTAAAGAGGATGAGATCGAGAA
GAGGAAAATGGAGGTTCGTGAACGGGTCGAGACTCAGCTTGGTCGTGTCGAGGAAGAAAC
CAGACGTCTCGCCAACATCCGCGAGGAGCTTGAGTCTATGGCAGATCCAATGAGGAAGGA
AGTTTCTTGGGTGCGTAAGAAGATCGATAGCGTCAACAAAGAACTCAAACCATTAGGCGC
AACAGTTCAAAAGAAGGAGAGGGAGTACAAAGAAGCATTGGATACATTCAATGAGAAGAA
TCGTGAGAAAGTTCAGCTGCTCACCAAGCTAATGG*AGTTGGTTGGAGAAAGCGAGAAGC
TGAG*TTGAAGAAGCTTGAGGAGCTTAGCATGAACATAGAAACCGAGTGAGACTCTTATC
TCACAGACATAAGACCAACCAGTGAAGAACTAACTGGGCTTATTAGGTTATGTACTTATG
TTATGGCTCTATTTGATGTATTTTTTTTATTTGTCTTTTGTCTTTAAGTGTTTTTAGTTT
TCCAGAGTGGTTTGTGGGTTGATATGTAGAACTATGATGGGTGTTTATGTTTTTTGATTA
ACCATATTAGGTAAGGCAAATGGGAGATAATGCTGAATGCTAAAATGGTTTGTAATTGAA
TTATCTTTATTTTCTTGTTCTTTTTTCAAATGTTATTTTATTATATTTCAGTTTTTAGCT
TTATTTTAATTTCTTTTCCCCCCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2C427TF U 1
AF RR2DP06TF U 10
AF RR2DE29TF U 10
AF RR2DP06JQ C 205
AF RR2DE29JQ C 313
BS 1 388 RR2C427TF
BS 389 389 RR2DE29TF
BS 390 450 RR2C427TF
BS 451 451 RR2DE29TF
BS 452 512 RR2C427TF
BS 513 513 RR2DE29TF
BS 514 551 RR2C427TF
BS 552 552 RR2DE29TF
BS 553 635 RR2C427TF
BS 636 636 RR2DE29TF
BS 637 680 RR2C427TF
BS 681 681 RR2DP06TF
BS 682 693 RR2C427TF
BS 694 694 RR2DE29TF
BS 695 731 RR2C427TF
BS 732 735 RR2DE29TF
BS 736 736 RR2DP06JQ
BS 737 748 RR2DE29TF
BS 749 749 RR2DP06JQ
BS 750 752 RR2DE29TF
BS 753 753 RR2DP06TF
BS 754 766 RR2DE29TF
BS 767 767 RR2DP06JQ
BS 768 781 RR2DE29TF
BS 782 782 RR2DP06JQ
BS 783 793 RR2DE29TF
BS 794 1045 RR2DP06JQ

RD RR2C427TF 748 0 0
GAGAGAGAGAAGAGACCTTCAAAAACTCAATTACAAAAGGCTGTTGCTTCGATTCAATCC
CCAACAAGTAAAAATAGGTTCAATCGAAGAACCCCACTGGAGTTCCACAGAGGAACTGCA
TCAGTCGCGTTCCTGCTGCGGCTTGAGGAAGAAGAAGAAGAGTAGCAATAACAATAACAA
CCACAAGGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAGAAACCGAAGATGCAGAGTAGGGATCCTGC
TCAGCCGCAGAACCAGCAGATGGTGAGCTTCAGCTTCAGCAGTCAGATGTCTAGAGAAGA
GGAGGAGATGGCTCGTTCTGCTCTTTCTGCGTTTAGGGCTAAAGAGGATGAGATCGAGAA
GAGGAAAATGGAGGTTCGTGAACGGGTCAAGACTCAGCTTGGTCGTGTCGAGGAAGAAAC
CAGACGTCTCGCCAACATCCGCGAGGAGCTCGAGTCTATGGCAGATCCAATGAGGAAGGA
AGTTTCTTGGGTGCGTAAGAAGATCGATAGCGCCAACAAAGAACTCAAACCATTAGGCGC
AACAGTTCAAA*GAAGGAGAGGGAGTACAAAGAAGCATTGGATACATTCAATGAGAAGAA
TCGTGAGAAAGTTCAGCTGCTCACCAAGCTAATGGGAGTTGGTTGGAGAAAGCGAGAAGC
TGAG*TTGAAGAAGCTTGAG*AGCTTAGCATGA*CATAGAAACCGAGTGAGACTCTTATC
TCACAGACATA
GACAACAGTGAGACTAC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2DP06TF 762 0 0
GG
GAGACCTTCAAAAACTCAATTACAAAAGGCTGTTGCTTCGATTCAATCCCCAACAAGTAA
AAATAGGTTCAATCGAAGAACCCCACTGGAGTTCCACAGAGGAACTGCATCAGTCGCGTT
CCTGCTGCGGCTTGAGGAAGAAGAAGAAGAGTAGCAATAACAATAACAACCACAAGGAAG
AAGAAAAAGAAGAAGAAGAGAAACCGAAGATGCAGAGTAGGGATCCTGCTCAGCCGCAGA
ACCAGCAGATGGTGAGCTTCAGCTTCAGCAGTCAGATGTCTAGAGAAGAGGAGGAGATGG
CTCGTTCTGCTCTTTCTGCGTTTAGGGCTAAAGAGGATGAGATCGAGAAGAGGAAAATGG
AGGTTCGTGAACGGGTCGAGACTCAGCTTGGTCGTGTCGAGGAAGAAACCAGACGTCTCG
CCAACATCCGCGAGGAGCTTGAGTCTATGGCAGATCCAATGAGGAAGGAAGTTTCTTGGG
TGCGTAAGAGGATCGATAGCGTCAACAAAGAACTCAAACCATTAGGCGCAACAGTTCAAA
AGAAGGAGAGGGAGTACAAAGAAGCATTGGATACATTCAATGAGAAGAATCGTGAGAAAG
TTCAGCTACTCACCAAGCTAATGG*AGTTGGTTGGAGAAAGCGAGAAGCTGAG*TTGAAG
AAGCTTGAGGAGCTTAGCATGAACATAGAAACCGAGTGAGACTCTTATCTCACAGACATA
AGAC*AACCAGTGAAGA*CTAACTGGGCTTATTAG
TTATG

QA 3 757 3 757
DS 

RD RR2DE29TF 788 0 0
GG
GAGACCTTCAAAAACTCAATTACAAAAGGCTGTTGCTTCGATTCAATCCCCAACAAGTAA
AAATAGGTTCAATCGAAGAACCCCACTGGAGTTCCACAGAGGAACTGCATCAGTCGCGTT
CCTGCTGCGGCTTGAGGAAGAAGAAGAAGAGTAGCAATAACAATAACAACCACAAGGAAG
AAGAAAAAGAAGAAGAAGAGAAACCGAAGATGCAGAGTAGGGATCCTGCTCAGCCGCAGA
ACCAGCAGATGGTGAGCTTCAGCTTCAGCAGTCAGATGTCTAGAGAAGAGGAGGAGATGG
CTCGTTCTGCTCTTTCTGCGTTTAGGGCTAAAGAGGATGAGATCGAGAAGAGGAAAATGG
AGGTTCGTGAACGGGTCGAGACTCAGCTTGGTCGTGTCGAGGAAGAAACCAGACGTCTCG
CCAACATCCGCGAGGAGCTTGAGTCTATGGCAGATCCAATGAGGAAGGAAGTTTCTTGGG
TGCGTAAGAAGATCGATAGCGTCAACAAAGAACTCAAACCATTAGGCGCAACAGTTCAAA
AGAAGGAGAGGGAGTACAAAGAAGCATTGGATACATTCAATGAGAAGAATCGTGAGAAAG
TTCAGCTGCTCACCAAGCTAATGG*AGTTGGTTGGAGAAAGCGAGAAGCTGAG*TTGAAG
AAGCTTGAG*AGCTTAGCATGAACATAGAAACCGAGTGAGACTCTTATCTCACAGACATA
AGAC*AACCAGTGAAGA*CTA*CTGGGCTTATTAG*TTATGTACTTATGT*ATGGCTCTA
TT
GATG

QA 3 784 3 784
DS 

RD RR2DP06JQ 841 0 0
AGAGAGAGAAA
CGAAGATGCAGAGTAGGGATCCTGCTCAGCCGCAGAACCAGCAGATGGTGAGCTTCAGCT
TCAGCAGTCAGATGTCTAGAGAAGAGGAGGAGATGGCTCGTTCTGCTCTTTCTGCGTTTA
GGGCTAAAGAGGATGAGATCGAGAAGAGGAAAATGGAGGTTCGTGAACGGGTCGAGACTC
AGCTTGGTCGTGTCGAGGAAGAAACCAGACGTCTCGCCAACATCCGCGAGGAGCTTGAGT
CTATGGCAGATCCAATGAGGAAGGAAGTTTCTTGGGTGCGTAAGAGGATCGATAGCGTCA
ACAAAGAACTCAAACCATTAGGCGCAACAGTTCAAAAGAAGGAGAGGGAGTACAAAGAAG
CATTGGATACATTCAATGAGAAGAATCGTGAGAAAGTTCAGCTACTCACCAAGCTAATGG
*AGTTGGTTGGAGAAAGCGAGAAGCTGAGGTTGAAGAAGCTTGAGGAGCTTAGCATGAAC
ATAGAAACCGAGTGAGACTCTTATCTCACAGACATAAGACCAACCAGTGAAGAACTAACT
GGGCTTATTAGGTTATGTACTTATGTTATGGCTCTATTTGATGTATTTTTTTTATTTGTC
TTTTGTCTTTAAGTGTTTTTAGTTTTCCAGAGTGGTTTGTGGGTTGATATGTAGAACTAT
GATGGGTGTTTATGTTTTTTGATTAACCATATTAGGTAAGGCAAATGGGAGATAATGCTG
AATGCTAAAATGGTTTGTAATTGAATTATCTTTATTTTCTTGTTCTTTTTTCAAATGTTA
TTTTATTATATTTCAGTTTTTAGCTTTATTTTAATTTCTTTTCCCCCCAG

QA 12 841 12 841
DS 

RD RR2DE29JQ 731 0 0
TCGTTCTGCTCTTTCTGCGTTTAGGGCTAAAGAGGATGAGATCGAGAAGAGGAAAATGGA
GGTTCGTGAACGGGTCGAGACTCAGCTTGGTCGTGTCGAGGAAGAAACCAGACGTCTCGC
CAACATCCGCGAGGAGCTTGAGTCTATGGCAGATCCAATGAGGAAGGAAGTTTCTTGGGT
GCGTAAGAAGATCGATAGCGTCAACAAAGAACTCAAACCATTAGGCGCAACAGTTCAAAA
GAAGGAGAGGGAGTACAAAGAAGCATTGGATACATTCAATGAGAAGAATCGTGAGAAAGT
TCAGCTGCTCACCAAGCTAATGG*AGTTGGTTGGAGAAAGCGAGAAGCTGAGGTTGAAGA
AGCTTGAGGAGCTTAGCATGAACATAGAAACCGAGTGAGACTCTTATCTCACAGACATAA
GACCAACCAGTGAAGAACTAACTGGGCTTATTAGGTTATGTACTTATGTTATGGCTCTAT
TTGATGTATTTTTTTTATTTGTCTTTTGTCTTTAAGTGTTTTTAGTTTTCCAGAGTGGTT
TGTGGGTTGATATGTAGAACTATGATGGGTGTTTATGTTTTTTGATTAACCATATTAGGT
AAGGCAAATGGGAGATAATGCTGAATGCTAAAATGGTTTGTAATTGAATTATCTTTATTT
TCTTGTTCTTTTTTCAAATGTTATTTTATTATATTTCAGTTTTTAGCTTTATTTTAATTT
CTTTTCCCCCC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 2 8

CO CL722Contig1 708 2 6 U
GGACTCATTCACTCAACAGCCCACTCCACTCAAAAACAAAATGGGAGAAGCCGCAGGAGG
CAAGAGATGGAACTTTGGGGCCAACGAGGTCGTTGAGCTATCTTGTTCCCAGTACGTCCG
CTATTATATGAACGTCCTCGCTGATAACCTCGACCCCAATGACAACAGACCTGTCATCCC
TCTTGCACACGGCGATCCCGCTCCCTTCCCCTCCTTCCGTACCGATCCAGCCGCAGTGGA
AGCCATCTCCGATGCTCTTCATTCGGGGCAGTTTAACCATTATGCTAACACTTCTGGTCT
TCCTATCGCCAGGAAGGCTGTTGCAGAGCACCTCTCCCTGGGTCTCTCTTACCAGATCAG
TCCAGATGATGTTCATCTGACAGCTGGTGGTCATAACGCCATCGATGTCTTGATCTCCAC
GCTGGCGGTTCCAGGGGCCAACATTCTGCTGCCTAGGCCAAGTTACCCAATGTACAATGC
CCGAGCAGGTTTCAGCAAGCTTGAGATCCGTAGCTATGACCTCCTTCCAGAGAAAGGTTG
GGAGGTCGATCTTGATGTAGTCGAAGCTCTTGCAGATGACAAAACCGTTGCTATAGTTGT
TGTCACCCCTTGCAATCCATGCGGAAACGTTTTCTCCCGTCAACATCTTCAAAAGATTGC
AGAAACTGCTAGCAAACTTGGAATACTTGTGATCGCAGACGAAGTCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C183TF U 1
AF RR2F968TF U 9
BS 1 289 RR2C183TF
BS 290 290 RR2F968TF
BS 291 664 RR2C183TF
BS 665 665 RR2F968TF
BS 666 702 RR2C183TF
BS 703 708 RR2F968TF

RD RR2C183TF 706 0 0
GGACTCATTCACTCAACAGCCCACTCCACTCAAAAACAAAATGGGAGAAGCCGCAGGAGG
CAAGAGATGGAACTTTGGGGCCAACGAGGTCGTTGAGCTATCTTGTTCCCAGTACGTCCG
CTATTATATGAACGTCCTCGCTGATAACCTCGACCCCAATGACAACAGACCTGTCATCCC
TCTTGCACACGGCGATCCCGCTCCCTTCCCCTCCTTCCGTACCGATCCAGCCGCAGTGGA
AGCCATCTCCGATGCTCTTCATTCGGGGCAGTTTAACCATTATGCTAACGCTTCTGGTCT
TCCTATCGCCAGGAAGGCTGTTGCAGAGCACCTCTCCCTGGGTCTCTCTTACCAGATCAG
TCCAGATGATGTTCATCTGACAGCTGGTGGTCATAACGCCATCGATGTCTTGATCTCCAC
GCTGGCGGTTCCAGGGGCCAACATTCTGCTGCCTAGGCCAAGTTACCCAATGTACAATGC
CCGAGCAGGTTTCAGCAAGCTTGAGATCCGTAGCTATGACCTCCTTCCAGAGAAAGGTTG
GGAGGTCGATCTTGATGTAGTCGAAGCTCTTGCAGATGACAAAACCGTTGCTATAGTTGT
TGTCACCCCTTGCAATCCATGCGGAAACGTTTTCTCCCGTCAACATCTTCAAAAGATTGC
AGAA*CTGCTAGCAAACTTGGAATACTTGTGATCGCAGACGA
GTCT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2F968TF 700 0 0
GG
ACTCAACAGCCCACTCCACTCAAAAACAAAATGGGAGAAGCCGCAGGAGGCAAGAGATGG
AACTTTGGGGCCAACGAGGTCGTTGAGCTATCTTGTTCCCAGTACGTCCGCTATTATATG
AACGTCCTCGCTGATAACCTCGACCCCAATGACAACAGACCTGTCATCCCTCTTGCACAC
GGCGATCCCGCTCCCTTCCCCTCCTTCCGTACCGATCCAGCCGCAGTGGAAGCCATCTCC
GATGCTCTTCATTCGGGGCAGTTTAACCATTATGCTAACACTTCTGGTCTTCCTATCGCC
AGGAAGGCTGTTGCAGAGCACCTCTCCCTGGGTCTCTCTTACCAGATCAGTCCAGATGAT
GTTCATCTGACAGCTGGTGGTCATAACGCCATCGATGTCTTGATCTCCACGCTGGCGGTT
CCAGGGGCCAACATTCTGCTGCCTAGGCCAAGTTACCCAATGTACAATGCCCGAGCAGGT
TTCAGCAAGCTTGAGATCCGTAGCTATGACCTCCTTCCAGAGAAAGGTTGGGAGGTCGAT
CTTGATGTAGTCGAAGCTCTTGCAGATGACAAAACCGTTGCTATAGTTGTTGTCACCCCT
TGCAATCCATGCGGAGACGTTTTCTCCCGTCAACATCTTCAAAAGATTGCAGAAACTGCT
AGCAAACTTGGAATACTTGTGATCGCAGACGAAGTCTA

QA 3 700 3 700
DS 



CO CL722Contig2 1451 6 28 U
GGATTCACTCAACAGCCCACTCCACTCAAAAACACAAATGGGAGAAGCCGGAGGAGACAA
GAGATGGAACTTTGGGGCCAACGAGGTCGTTGAGCTATCTTGTTCCCAGTACGTCCGCTA
TTATATGAACGTCCTCGCTGATAACCTCGACCCCAATGACAACAGACCTGTCATCCCTCT
TGCACACGGCGATCCCGCTCCCTTCCCCTCCTTCCGTACCGATCCAGCCGCAGTGGAAGC
CATCTCCGATGCTCTTCATTCGAGGCTGTTGCAGAGCACCTCTCCCTGGGTCTCTCTTAC
CAGATCAGTCCAGATGATGTTCATCTGACAGCTGGTGGTCATAACGCCATCGATGTCTTG
ATCTCCACACTCGCGGTTCCAGGCGCCAACATTCTGCTGCCTAGGCCAAGTTACCCAATG
TACAATGCCCGAGCAGGTTTCAGCAAGCTTGAGATCCGTAGCTATGACCTCCTTCCAGAG
AAAGGTTGGGAGGTCGATCTTGATGTAGTCGAAGCTCTTGCAGATGACAAAACCGTTGCT
ATAGTTGTTGTCACCCCTTGCAATCCATGCGGAAACGTTTTCTCCCGTCAACATCTTCAA
AAGATTGCAGAAACTGCTAGCAAACTTGGAATACTTGTGATCGCAGACGAAGTCTACAGG
AATATAACATTTGGGGAGACCCCATTTGTGTCCATGGCTGAGTTTGCAGAGATTGTGCCA
GTGATGTTGTTAGGTTCAATATCAAAGAGGTGGCTCGTCCCTGGCTGGAGGTTTGGCTGG
ATGGTCACCGTTGACCCTCATAACATCATGAAAGACTCTGGGCTTGTTCATAGTCTCGTC
AACGTCCTCAACATGTCGATAGATCCCGTAACTTTTATTCAGGGGGCAATGCCTGATATC
CTTGAGAAGACAAAAGAGGAATTCTTCTCGTCGAAAATGGAAATACTAAGAGAATGTGCA
GAGACTTGTTACGAGGAGATAAAGAAGATCCCTTGCATGAGTTGCCCTTACAAACCAGAG
GCGTCAATGTTCACTATGGTGAAGTTAGAGCCTTCGGTTCTTGAAGATATAAAGGATGAT
TTGGAATTCTGCTGCAAGTTGGCTAAAGAGGAATCGTTGATGATCCTACCAGGCCGATCT
GTGGGGTTTAAGAATTGGCTACGCATCACCTTTGCGGTGGAGCCAGCGCTCCTAAAAGAT
GGGCTTTCCAGGCTAAACAAGTTTGCACAGAGACACTCCAAGAAGAAGCTGCAGCCATGA
GAATCTCTCTCTCATTTTTCTCCACACCTCAAGCAAATCAGTGTGTGACATTGTTTTTTT
TAAAAAAAAACATTGTTGGTGTTTGTAATAAAACTTGTATTTTTAAATATATGTTGTACT
GTTTGTAGTGACTCTTATCACGAGAGCCCAAGTTGCTGATTCGAATGAAAGGAATCTTTT
TTTTTTTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F791TF U 1
AF RR2GQ74TF U 365
AF RR2AC43TF U 375
AF RR2AC43JQ C 596
AF RR2C183JQ C 716
AF RR2F968JQ C 925
BS 1 656 RR2F791TF
BS 657 668 RR2GQ74TF
BS 669 669 RR2AC43TF
BS 670 692 RR2GQ74TF
BS 693 693 RR2AC43TF
BS 694 698 RR2GQ74TF
BS 699 699 RR2AC43TF
BS 700 711 RR2GQ74TF
BS 712 712 RR2AC43TF
BS 713 770 RR2GQ74TF
BS 771 771 RR2AC43TF
BS 772 836 RR2GQ74TF
BS 837 837 RR2AC43TF
BS 838 965 RR2GQ74TF
BS 966 966 RR2AC43TF
BS 967 987 RR2GQ74TF
BS 988 1132 RR2AC43TF
BS 1133 1133 RR2AC43JQ
BS 1134 1153 RR2AC43TF
BS 1154 1154 RR2AC43JQ
BS 1155 1176 RR2AC43TF
BS 1177 1179 RR2AC43JQ
BS 1180 1195 RR2AC43TF
BS 1196 1319 RR2AC43JQ
BS 1320 1320 RR2C183JQ
BS 1321 1397 RR2AC43JQ
BS 1398 1398 RR2C183JQ
BS 1399 1451 RR2AC43JQ

RD RR2F791TF 656 0 0
GGATTCACTCAACAGCCCACTCCACTCAAAAACACAAATGGGAGAAGCCGGAGGAGACAA
GAGATGGAACTTTGGGGCCAACGAGGTCGTTGAGCTATCTTGTTCCCAGTACGTCCGCTA
TTATATGAACGTCCTCGCTGATAACCTCGACCCCAATGACAACAGACCTGTCATCCCTCT
TGCACACGGCGATCCCGCTCCCTTCCCCTCCTTCCGTACCGATCCAGCCGCAGTGGAAGC
CATCTCCGATGCTCTTCATTCGAGGCTGTTGCAGAGCACCTCTCCCTGGGTCTCTCTTAC
CAGATCAGTCCAGATGATGTTCATCTGACAGCTGGTGGTCATAACGCCATCGATGTCTTG
ATCTCCACACTCGCGGTTCCAGGCGCCAACATTCTGCTGCCTAGGCCAAGTTACCCAATG
TACAATGCCCGAGCAGGTTTCAGCAAGCTTGAGATCCGTAGCTATGACCTCCTTCCAGAG
AAAGGTTGGGAGGTCGATCTTGATGTAGTCGAAGCTCTTGCAGATGACAAAACCGTTGCT
ATAGTTGTTGTCACCCCTTGCAATCCATGCGGAAACGTTTTCTCCCGTCAACATCTTCAA
AAGATTGCAGAAACTGCTAGCAAACTTGGAATACTTGTGATCGCAGACGAAGTCTA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2GQ74TF 623 0 0
CCACACTC
GCGGTTCCAGGCGCCAACATTCTGCTGCCTAGGCCAAGTTACCCAATGTACAATGCCCGA
GCAGGTTTCAGCAAGCTTGAGATCCGTAGCTATGACCTCCTTCCAGAGAAAGGTTGGGAG
GTCGATCTTGATGTAGTCGAAGCTCTTGCAGATGACAAAACCGTTGCTATAGTTGTTGTC
ACCCCTTGCAATCCATGCGGAAACGTTTTCTCCCGTCAACATCTTCAAAAGATTGCAGAA
ACTGCTAGCAAACTTGGAATACTTGTGATCGCAGACGAAGTCTACAGGAATATAACCTTT
GGGGAGACCCCATTTGTGTCAATGGCCGAGTTTGCAGAGGTTGTGCCAGTGATGTTGTTA
GGTTCAATATCAAAGAGGTGGCTCGTCCCTGGCTGGAGATTTGGCTGGATGGTCACCGTT
GACCCTCATAACATCATGAAAGACTCTGGGCTTGTTCATAGTCTTGTCAACGTCCTCAAC
ATGTCGATAGATCCCGTAACTTTTATTCAGGGGGCAATGCCTGATATCCTTGAGAAGACA
AAAGAGGAATTCTTCTCGTCGAAAATGGAAATACTAAGAGAATGTGCAGAGACATGTTAC
GAGGAGATAAAGAAG

QA 9 623 9 623
DS 

RD RR2AC43TF 825 0 0
GGTTCCAGGGGCCAACATTCTGCTGCCTAGGCCAAGTTACCCAATGTACAATGCCCGAGC
AGGTTTCAGCAAGCTTGAGATCCGTAGCTATGACCTCCTTCCAGAGAAGGGTTGGGAGGT
CGATCTTGATGTAGTCGAAGCTCTTGCTGATGACAAAACCGTTGCTATAGTTGTTGTCAC
CCCTTGCAATCCATGCGGAAACGTTTTCTCCCGTCAACATCTTCAAAAGATTGCAGAAAC
TGCTAGCAAACTTGGAATACTTGTGATCGCAGACGAAGTCTACAGGAATATAACATTTGG
GGAGACCCCATTTGTGTCCATGGCTGAGTTTGCAGAGATTGTGCCAGTGATGTTGTTAGG
TTCAATATCAAAGAGGTGGCTCGTCCCTGGCTGGAGGTTTGGCTGGATGGTCACCGTTGA
CCCTCATAACATCATGAAAGACTCTGGGCTTGTTCATAGTCTCGTCAACGTCCTCAACGT
GTCGATAGATCCCGTAACTTTTATTCGGGGGGCAATGCCTGATATCCTTGAGAAGACAAA
AGAGGAATTCTTCTCGTCGAAAATGGAAATACTAAGAGAATGTGCAGAGACTTGTTACGA
GGAGATAAGGAAGATCCCTTGCATGAGTTGCCCTTACAAACCAGAGGCGTCAATGTTCAC
TATGGTGAAGTTAGAGCCTTCGGTTCTTGAAGATATAAAGGATGATTTGGAATTCTGCTG
CAAGTTGGCTAAAGAGGAATCGTTGATGATCCTACCAG*CCGATCTGTGGGGTTTAAGA*
TTGGCTACGCATCACCTTTGCGT**GAGCCAGCGCTCCTAA
GATG

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR2AC43JQ 856 0 0
TCA
AAAAGATTGCAGAAACTGCTAGCAAACTTGGAATACTTGTGATCGCAGACGAAGTCTACA
GGAATATAACATTTGGGGAGACCCCATTTGTGTCCATGGCTGAGTTTGCAGAGATTGTGC
CAGTGATGTTGTTAGGTTCAATATCAAAGAGGTGGCTCGTCCCTGGCTGGAGGTTTGGCT
GGATGGTCACCGTTGACCCTCATAACATCATGAAAGACTCTGGGCTTGTTCATAGTCTCG
TCAACGTCCTCAACGTGTCGATAGATCCCGTAACTTTTATTCGGGGGGCAATGCCTGATA
TCCTTGAGAAGACAAAAGAGGAATTCTTCTCGTCGAAAATGGAAATACTAAGAGAATGTG
CAGAGACTTGTTACGAGGAGATAAGGAAGATCCCTTGCATGAGTTGCCCTTACAAACCAG
AGGCGTCAATGTTCACTATGGTGAAGTTAGAGCCTTCGGTTCTTGAAGATATAAAGGATG
ATTTGGAATTTTGCTGCAAGTTGGCTAAAGAGGAATCGTTGATGATCCTACCAGGCCGAT
CTGTGGGGTTTAAGAATTGGCTACGCATCACCTTTGCGGTGGAGCCAGCGCTCCTAAAAG
ATGGGCTTTCCAGGCTAAACAAGTTTGCACAGAGACACTCCAAGAAGAAGCTGCAGCCAT
GAGAATCTCTCTCTCATTTTTCTCCACACCTCAAGCAAATCAGTGTGTGACATTGTTTTT
TCTAAAAAAAAACATTGTTGGTGTTTGTAATAAAACTTGTATTTTTAAATATATGTTGTA
CTGTTTGTAGTGACTCTTACCACGAGAGCCCAAGTTGCTGATTCGAATGAAAGGAATCTT
TTTTTTTTTAAGG

QA 4 856 4 856
DS 

RD RR2C183JQ 734 0 0
TGCCAGTGATGTTGTTAGGTTCAATATCAAAGAGGTGGCTCGTCCCTGGCTGGAGGTTTG
GCTGGATGGTCACCGTTGACCCTCATAACATCATGAAAGACTCTGGGCTTGTTCATGGTC
TCGTCAACGTCCTCAACATGTCGATAGATCCCGTAACTTTTATTCAGGGGGCAATGCCTG
ATATCCTTGAGAAGACAAAAGAGGGATTCTTCTCGTCGAAAATGGAAATACTAAGAGAAT
GTGCAGAGACTTGTTACGAGGAGATAAAGAAGATCCCTTGCATGAGTTGCCCTTACAAAC
CAGAGGCGTCAATGTTCACTATGGTGAAGTTAGAGCCTTCGGTTCTTGAAGATATAAAGG
ATGATTTGGAATTCTGCTGCAAGTTGGCTAAAGAGGAATCGTTGATGATCCTACCAGGCC
GATCTGTGGGGTTTAAGAATTGGCTACGCATCACCTTTGCGGTGGAGCCAGCGCTCCTAA
AAGATGGGCTTTCCAGGCTAAACAAGTTTGCACAGAGACACTCCAAGAAGAAGCTGCAGC
CATGAGAATCTCTCTCTCATTCTTCTCCACACCTCAAGCAAATCAGTGTGTGACATTGTT
TTTTTTAAAAAAAAACATTGTTGGTGTTTGTAATAAAACTTGTATTTTTAAATATATGTT
GTACTGTTTGTAGTGACTCTTATCACGAGAGCCCAAGTTGCTGATTCGAATGAAAGGAAT
CTTTTTTTT
TAAGG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2F968JQ 525 0 0
TTCTCGTCGAAAATGGAAATACTAAGAGAATGTGCAGAGACTTGTTACGAGGAGATAAAG
AAGATCCCTTGCATGAGTTGCCCTTACAAACCAGAGGCGTCAATGTTCACTATGGTGAAG
TTAGAGCCTTCGGTTCTTGAAGATATAAAGGATGATTTGGAATTTTGCTGCAAGTTGGCT
AAAGAGGAATCGTTGATGATCCTACCAGGCCGATCTGTGGG*TTTAAGAATTGGCTACGC
ATCACCTTTGCGGTGGAGCCAGCGCTCCTAAAAGATGGGCTTTCCAGGCTAAACAAGTTT
GCACAGAGACACTCCAAGAAGAAGCTGCAGCCATGAGAATCTCTCTCTCATTTTTCTCCA
CACCTCAAGCAAATCAGTGTGTGACATTGTTTTTTTTAAAAAAAAACATTGTTGGTGGTT
GTAATAAAACTTGTATTTTTAAATATATGTTGTACTGTTTGTAGTGACTCTTATCACGAG
AGCCCAAGTTGCTGATTCGAATGAAAGGAATCTTTTTTTT
TAAGG

QA 1 520 1 520
DS 



AS 2 9

CO CL723Contig1 662 6 3 U
GAAGAGCGTAAAAGGTACTTTATCACAGCCGCAGGAGTAGCTCACTGAAACAAAGTTCCC
ATAGATACCGCATCAAAGACAGAGAGAAGCGTTTATGGGTATTAAAAAGATGAACTTATT
TCATAGTAAATCGACCCTTAAGATCTGAGAATGAAAAGGAAAAATCAAATATCATGAAAC
TAGATTTTCAAACACAAGCAATATGGAGATGATATCCCATCTTTCCTTTGATGTTTTCAT
CTTCTTGCTTTTTTCGTCGTAATCATTCTTTGGCAACAACAGGCTCCACATCAGATGCAA
AATCGTTTTTGATTTTACGAGCAAGCTGGTACATGCCAGTCCCAGCCATAGCAACATTGA
CACTAAAGAGGTTCCAGTTTTTGGGAGTGATAACCATGCTGTAACGAGACCAGATAACTC
CAGTGCATGTAACAGCAATCTGTTGAGGGTAGGATATTTTGTCAGTAGGTTTAGCAAAGT
CTGCAATGTTAGCAATGCTTATTCCCCACTTGAACGTTGGCGCCCAGAAATGAATTGTTT
TAGGACCGGCAGGGTGATTCCACAGAGCTTGAAGCCTCGATGTCGCCATTTGATGATATT
CGATCAATCAATCCTCTCTCTCCCCACCAGATTCTCTTTTTTTCCTTTCCTCCGTCTCTT
CC


BQ
10 10 10 10 10 30 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2F409JQ U 1
AF RR2F409TF C 1
AF RR2CG05JQ U 4
AF RR2CG05TF C 6
AF RR2CI75TF C 9
AF RR2CI75JQ U 6
BS 1 287 RR2F409JQ
BS 288 556 RR2CG05JQ
BS 557 662 RR2CI75JQ

RD RR2F409JQ 288 0 0
GAAGAGCGTAAAAGGTACTTTATCACAGCCGCAGGAGTAGCTCACTGAAACAAAGTTCCC
ATAGATACCGCATCAAAGACAGAGAGAAGCGTTTATGGGTATTAAAAAGATGAACTTATT
TCATAGTAAATCGACCCTTAAGATCTGAGAATGAAAAGGAAAAATCAAATATCATGAAAC
TAGATTTTCAAACACAAGCAATATGGAGATGATATCCCATCTTTCCTTTGATGTTTTCAT
CTTCTTGCTTTTTTCGTCGTAATCATTCTTTGGCAACAACAGGCTCC
C

QA 1 287 1 287
DS 

RD RR2F409TF 288 0 0
GAAGA
GCGTAAAAGGTACTTTATCACAGCCGCAGGAGTAGCTCACTGAAACAAAGTTCCCATAGA
TACCGCATCAAAGACAGAGAGAAGCGTTTATGGGTATTAAAAAGATGAACTTATTTCATA
GTAAATCGACCCTTAAGATCTGAGAATGAAAAGGAAAAATCAAATATCATGAAACTAGAT
TTTCAAACACAAGCAATATGGAGATGATATCCCATCTTTCCTTTGATGTTTTCATCTTCT
TGCTTTTTTCGTCGTAATCATTCTTTGGCAACAACAGGCTCC
C

QA 6 287 6 287
DS 

RD RR2CG05JQ 553 0 0
GC
GCGTAAAAGGTACTTTATCACAGCCGCAGGAGTAGCTCACTGAAACAAAGTTCCCATAGA
TACCGCATCAAAGACAGAGAGAAGCGTTTATGGGTATTAAAAAGATGAACTTATTTCATA
GTAAATCGACCCTTAAGATCTGAGAATGAAAAGGAAAAATCAAATATCATGAAACTAGAT
TTTCAAACACAAGCAATATGGAGATGATATCCCATCTTTCCTTTGATGTTTTCATCTTCT
TGCTTTTTTCGTCGTAATCATTCTTTGGCAACAACAGGCTCCACATCAGATGCAAAATCG
TTTTTGATTTTACGAGCAAGCTGGTACATGCCAGTCCCAGCCATAGCAACATTGACACTA
AAGAGGTTCCAGTTTTTGGGAGTGATAACCATGCTGTAACGAGACCAGATAACTCCAGTG
CATGTAACAGCAATCTGTTGAGGGTAGGATATTTTGTCAGTAGGTTTAGCAAAGTCTGCA
ATGTTAGCAATGCTTATTCCCCACTTGAACGTTGGCGCCCAGAAATGAATTGTTTTAGGA
CCGGCAGGGTG

QA 3 553 3 553
DS 

RD RR2CG05TF 650 0 0
GCGTAAAAGGTACTTTATCACAGCCGCAGGAGTAGCTCACTGAAACAAAGTTCCCATAGA
TACCGCATCAAAGACAGAGAGAAGCGTTTATGGGTATTAAAAAGATGAACTTATTTCATA
GTAAATCGACCCTTAAGATCTGAGAATGAAAAGGAAAAATCAAATATCATGAAACTAGAT
TTTCAAACACAAGCAATATGGAGATGATATCCCATCTTTCCTTTGATGTTTTCATCTTCT
TGCTTTTTTCGTCGTAATCATTCTTTGGCAACAACAGGCTCCACATCAGATGCAAAATCG
TTTTTGATTTTACGAGCAAGCTGGTACATGCCAGTCCCAGCCATAGCAACATTGACACTA
AAGAGGTTCCAGTTTTTGGGAGTGATAACCATGCTGTAACGAGACCAGATAACTCCAGTG
CATGTAACAGCAATCTGTTGAGGGTAGGATATTTTGTCAGTAGGTTTAGCAAAGTCTGCA
ATGTTAGCAATGCTTATTCCCCACTTGAACGTTGGCGCCCAGAAATGAATTGTTTTAGGA
CCGGCAGGGTGATTCCACAGAGCTTGAAGCCTCGATGTCGCCATTTGATGATATTCAATC
AATCAATCCTCTC*CTCCCCACCAGATTCTCTTTTTTTCCTTTCCTCC
CC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2CI75TF 654 0 0
TAAAAGGTACTTTATCACAGCCGCAGGAGTAGCTCACTGAAACAAAGTTCCCATAGATAC
CGCATCAAAGACAGAGAGAAGCGTTTATGGGTATTAAAAAGATGAACTTATTTCATAGTA
AATCGACCCTTAAGATCTGAGAATGAAAAGGAAAAATCAAATATCATGAAACTAGATTTT
CAAACACAAGCAATATGGAGATGATATCCCATCTTTCCTTTGATGTTTTCATCTTCTTGC
TTTTTTCGTCGTAATCATTCTTTGGCAACAACAGGCTCCACATCAGATGCAAAATCGTTT
TTGATTTTACGAGCAAGCTGGTACATGCCAGTCCCAGCCATAGCAACATTGACACTAAAG
AGGTTCCAGTTTTTGGGAGTGATAACCATGCTGTAACGAGACCAGATAACTCCAGTGCAT
GTAACAGCAATCTGTTGAGGGTAGGATATTTTGTCAGTAGGTTTAGCAAAGTCTGCAATG
TTAGCAATGCTTATTCCCCACTTGAACGTTGGCGCCCAGAAATGAATTGTTTTAGGACCG
GCAGGGTGATTCCACAGAGCTTGAAGCCTCGATGTCGCCATTTGATGATATTCGATCAAT
CAATCCTCTCTCTCCCCACCAGATTCTCTTTTTTTCCTTTCCTCC
GTCTCTTCC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2CI75JQ 657 0 0
C
CGTAAAAGGTACTTTATCACAGCCGCAGGAGTAGCTCACTGAAACAAAGTTCCCATAGAT
ACCGCATCAAAGACAGAGAGAAGCGTTTATGGGTATTAAAAAGATGAACTTATTTCATAG
TAAATCGACCCTTAAGATCTGAGAATGAAAAGGAAAAATCAAATATCATGAAACTAGATT
TTCAAACACAAGCAATATGGAGATGATATCCCATCTTTCCTTTGATGTTTTCATCTTCTT
GCTTTTTTCGTCGTAATCATTCTTTGGCAACAACAGGCTCCACATCAGATGCAAAATCGT
TTTTGATTTTACGAGCAAGCTGGTACATGCCAGTCCCAGCCATAGCAACATTGACACTAA
AGAGGTTCCAGTTTTTGGGAGTGATAACCATGCTGTAACGAGACCAGATAACTCCAGTGC
ATGTAACAGCAATCTGTTGAGGGTAGGATATTTTGTCAGTAGGTTTAGCAAAGTCTGCAA
TGTTAGCAATGCTTATTCCCCACTTGAACGTTGGCGCCCAGAAATGAATTGTTTTAGGAC
CGGCAGGGTGATTCCACAGAGCTTGAAGCCTCGATGTCGCCATTTGATGATATTCGATCA
ATCAATCCTCTCTCTCCCCACCAGATTCTCTTTTTTTCCTTTCCTCCGTCTCTTCC

QA 2 657 2 657
DS 



CO CL723Contig2 642 3 2 U
GGATCTGGTGGGGAGAGAGAAGATAGGCGACGATTGATTGATTGATAGAATATTTATCAA
ATGGCGACATCGAGGCTTCAAGCTCTGTGGAATCACCCTGCCGGTCCTAAAACCATTCAT
TTCTGGGCGCCAACGTTCAAGTGGGGAATAAGCATTGCTAACATTGCAGACTTTGCTAAA
CCTACTGACAAAATATCCTACCCTCAACAGATTGCTGTTACATGCACTGGAGTTATCTGG
TCTCGTTACAGTATGGTTATCACTCCCAAAAACTGGAACCTGTTTAGTGTCAATGTTGCT
ATGGCTGGGACTGGCATGTACCAGCTTGCTCGTAAAATCAAAAACGATTTTGCATCTGAT
GTGGAGCCTGTTGTTGCCAAAGAATGATTACGACGAAAAAACAAGAAGATGAAAGCATCA
AAGGAAAAATGGGACATCATCATCATATTGCTTGTGTTTGAAAATCTAGTTTCATGATAT
TTGATTTCTCCTTTTCATTCCCAGATCTTATTGGGTCGAATCACCAAATAAGTTTTCTTT
TTAATACCCATAATGCTTTTCTCTCTGTCTTTGATGCGGTATCTATGGACAGTTTGTGAC
AGTGAGCTACTCCTGCGGCTTTGATAAGTACCGTTTAAGCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU85TF U 1
AF RR2FU85JQ C 1
AF RR2DI09TF U 11
BS 1 532 RR2FU85TF
BS 533 642 RR2DI09TF

RD RR2FU85TF 532 0 0
GGATCTGGTGGGGAGAGAGAAGATAGGCGACGATTGATTGATTGATAGAATATTTATCAA
ATGGCGACATCGAGGCTTCAAGCTCTGTGGAATCACCCTGCCGGTCCTAAAACCATTCAT
TTCTGGGCGCCAACGTTCAAGTGGGGAATAAGCATTGCTAACATTGCAGACTTTGCTAAA
CCTACTGACAAAATATCCTACCCTCAACAGATTGCTGTTACATGCACTGGAGTTATCTGG
TCTCGTTACAGTATGGTTATCACTCCCAAAAACTGGAACCTGTTTAGTGTCAATGTTGCT
ATGGCTGGGACTGGCATGTACCAGCTTGCTCGTAAAATCAAAAACGATTTTGCATCTGAT
GTGGAGCCTGTTGTTGCCAAAGAATGATTACGACGAAAAAACAAGAAGATGAAAGCATCA
AAGGAAAAATGGGACATCATCATCATATTGCTTGTGTTTGAAAATCTAGTTTCATGATAT
TTGATTTCTCCTTTTCATTCCCAGATCTTATTGGGTCGAATCACCAAATAAG

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2FU85JQ 549 0 0
GGATCTGGTGGGGAGAGAGAAGATAGGCGACGATTGATTGATTGATAGAATATTTATCAA
ATGGCGACATCGAGGCTTCAAGCTCTGTGGAATCACCCTGCCGGTCCTAAAACCATTCAT
TTCTGGGCGCCAACGTTCAAGTGGGGAATAAGCATTGCTAACATTGCAGACTTTGCTAAA
CCTACTGACAAAATATCCTACCCTCAACAGATTGCTGTTACATGCACTGGAGTTATCTGG
TCTCGTTACAGTATGGTTATCACTCCCAAAAACTGGAACCTGTTTAGTGTCAATGTTGCT
ATGGCTGGGACTGGCATGTACCAGCTTGCTCGTAAAATCAAAAACGATTTTGCATCTGAT
GTGGAGCCTGTTGTTGCCAAAGAATGATTACGACGAAAAAACAAGAAGATGAAAGCATCA
AAGGAAAAATGGGACATCATCATCATATTGCTTGTGTTTGAAAATCTAGTTTCATGATAT
TTGATTTCTCCTTTTCATTCCCAGATCTTATTGGGTCGAATCACCAAATAAGTTTTCTTT
TTAATACCC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2DI09TF 632 0 0
GGGAGAGAGAAGATAGGCGACGATTGATTGATTGATAGAATATTTATCAAATGGCGACAT
CGAGGCTTCAAGCTCTGTGGAATCACCCTGCCGGTCCTAAAACCATTCATTTCTGGGCGC
CAACGTTCAAGTGGGGAATAAGCATTGCTAACATTGCAGACTTTGCTAAACCTACTGACA
AAATATCCTACCCTCAACAGATTGCTGTTACATGCACTGGAGTTATCTGGTCTCGTTACA
GCATGGTTATCACTCCCAAAAACTGGAACCTGTTTAGTGTCAATGTTGCTATGGCTGGGA
CTGGCATGTACCAGCTTGCTCGTAAAATCAAAAACGATTTTGTATCTGATGTGGAGCCTG
TTGTTGCCAAAGAATGATTACGACGAAAAAACAAGAAGATGAAAGCATCAAAGGAAAGAT
GGGACATCATCATCACATTGCTTGTGTTTGAAAATCTAGTTTCATGATATTTGATTTCTC
CTTTTCATTCCCAGATCTTATTGGGTCGAATCACCAAATAAGTTTTCTTTTTAATACCCA
TAATGCTTTTCTCTCTGTCTTTGATGCGGTATCTATGGACAGTTTGTGACAGTGAGCTAC
TCCTGCGGCTTTGATAAGTACCGTTTAAGCTC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 9

CO CL724Contig1 1150 9 12 U
GGAGATGAGAAAATAGCAAAGAGTTTGCGTAAACGTCGCTCTCAAACCTCATCTCATACT
CATCGTTTTCGTATGAGTTTTTGTAGCCCAAACAATCTTCCTTTCTACAGTTTATAATAT
AAGAATCAATACGTCCTTCGTAATCTCCGCATCGTATCTCTTATATAACTCATCTCTCTA
AACATAAAAAAATGTTCCTCTCCGTTAACTCTAACGGTCATGTCAACTAATACCGTCGTC
CCTCTCCGTCGCAGATCTAACGGATATCACACTAACGGAGTGGCCTTAAACGGAATGGAG
AACGTTGTCAAGAAAACCGACGACTGCTACACCAACGGCAACGGAGGAGGAGGAGGGAAG
AGCAAGGCGTCGTTTCTGACGTGGACCATGCGTGACGTTGTCTACGTGGCGAGATACCAT
TGGATACCGTGTTTCTTTGCGCTCGGAGTTCTGTTCTTTATGGGCGTTGAGTACACGCTC
CAGATGGTTCCGGCGAAGTCTGAGCCGTTTGATATTGGGTTTGTGGTCACGCGCTCTCTG
AACCGTGTCTTGGCGAGTTCACCGGATCTTAACACCCTTTTAGCGGCTCTAAACACGGTA
TTCGTCGCGATGCAAACGACGTATATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGAAGACC*ACG
AGCCACTATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTTGTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCA
GCTCCCTCTCCCTCAGGATTTTTTAGGATCAGGAGTTGATTTTCCGGTGGGAAATGTCTC
ATTCTTCCTCTTCTATTCTGGTCACGTCGCTGGTTCAATGATCGCATCCTTGGACATGAG
GAGAATGCAGAGGTTAAGACTAGCGATGCTTTTTGACATCCTCAACGTATTACAATCGAT
CAGGCTGCTTGGGACGAGAGGACACTACACAATCGATCTTGCGGTAGGAGTTGGAGCTGG
GATTCTCTTTGACTCTTTGGCCGGGAAATACGAGGAGATGATGAGCAAGAGACAGAATTT
AGGCAATGGTTTTAGTTTGATTTCTAAAGACTCGCTACTCAATTAATCTTTTGTTTTCAT
TTTAAATGTTTAGTTGAACTTCAACATATTTGGTTTAGTTAAAGTCTAATGAATTACATT
TATTTCTGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 25 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2FM16TF U 1
AF RR2C696TF U 1
AF RR2GL61TF U 149
AF RR2B238TF U 149
AF RR2AK77TF U 192
AF RR2AK77JQ C 347
AF RR2FM16JQ C 361
AF RR2GL61JQ C 387
AF RR2C696JQ C 505
BS 1 651 RR2C696TF
BS 652 652 RR2B238TF
BS 653 736 RR2C696TF
BS 737 899 RR2B238TF
BS 900 928 RR2AK77JQ
BS 929 929 RR2FM16JQ
BS 930 995 RR2AK77JQ
BS 996 996 RR2FM16JQ
BS 997 1002 RR2AK77JQ
BS 1003 1135 RR2FM16JQ
BS 1136 1147 RR2GL61JQ
BS 1148 1150 RR2C696JQ

RD RR2FM16TF 630 0 0
GGAGATGAGAAAATAGCAAAGAGTTTGCGTAAACGTCGCTCTCAAACCTCATCTCATACT
CATCGTTTTCGTATGAGTTTTTGTAGCCCAAACAATCTTCCTTTCTACAGTTTATAATAT
AAGAATCAATACGTCCTTCGTAATCTCCGCATCGTATCTCTTATATAACTCATCTCTCTA
AACATAAAAAAATGTTCCTCTCCGTTAACTCTAACGGTCATGTCAACTAATACCGTCGTC
CCTCTCCGTCGCAGATCTAACGGATATCACACTAACGGAGTGGCCTTAAACGGAATGGAG
AACGTTGTCAAGAAAACCGACGACTGCTACACCAACGGCAACGGAGGAGGAGG***GAAG
AGCAAGGCGTCGTTTCTGACGTGGACCATGCGTGACGTTGTCTACGTGGCGAGATACCAT
TGGATACCGTGTTTCTTTGCGCTCGGAGTTCTGTTCTTTATGGGCGTTGAGTACACGCTC
CAGATGGTTCCGGCGAAGTCTGAGCCGTTTGATATTGGGTTTGTGGTCGCGCGCTCTCTG
AACCGTGTCTTGGCGAGTTCACCGGATCTTAACACCCTTTTAGCGGCTCTAAACACGGTA
TTCGTCGCGATGCAAACGACGTATATTGTA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2C696TF 737 0 0
GGAGATGAGAAAATAGCAAAGAGTTTGCGTAAACGTCGCTCTCAAACCTCATCTCATACT
CATCGTTTTCGTATGAGTTTTTGTAGCCCAAACAATCTTCCTTTCTACAGTTTATAATAT
AAGAATCAATACGTCCTTCGTAATCTCCGCATCGTATCTCTTATATAACTCATCTCTCTA
AACATAAAAAAATGTTCCTCTCCGTTAACTCTAACGGTCATGTCAACTAATACCGTCGTC
CCTCTCCGTCGCAGATCTAACGGATATCACACTAACGGAGTGGCCTTAAACGGAATGGAG
AACGTTGTCAAGAAAACCGACGACTGCTACACCAACGGCAACGGAGGAGGAGGAGGGAAG
AGCAAGGCGTCGTTTCTGACGTGGACCATGCGTGACGTTGTCTACGTGGCGAGATACCAT
TGGATACCGTGTTTCTTTGCGCTCGGAGTTCTGTTCTTTATGGGCGTTGAGTACACGCTC
CAGATGGTTCCGGCGAAGTCTGAGCCGTTTGATATTGGGTTTGTGGTCACGCGCTCTCTG
AACCGTGTCTTGGCGAGTTCACCGGATCTTAACACCCTTTTAGCGGCTCTAAACACGGTA
TTCGTCGCGATGCAAACGACGTATATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGAGGACC*ACG
AGCCACTATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTTGTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCA
GCTCCCTCTCCCTCAG
A

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2GL61TF 584 0 0
GG
ATCGTATCTCTTATATAACTCATCTCTCTAAACATAAAAAAATGTTCCTCTCCGTTAACT
CTAACGGTCATGTCAACTAATACCGTCGTCCCTCTCCGTCGCAGATCTAACGGATATCAC
ACTAACGGAGTGGCCTTAAACGGAATGGAGAACGTTGTCAAGAAAATCGACGACTGCTAC
ACCAACGGCAACGGAGGAGGAGGAGGGAAGAGCAAGGCGTCGTTTCTGACGTGGACCATG
CGTGACGTTGTCTACGTGGCGAGATACCATTGGATACCGTGTTTCTTTGCGCTCGGAGTT
CTGTTCTTTATGGGCGCTGAGTACACGCTCCAGATGGTTCCGGCGAAGTCTGAGCCGTTT
GATATTGGGTTTGTGGCCACGCGCTCTCTGAACCGTGTCTTGGCGAGTTCACCGGATCTT
AACACCCTTTTAGCGGCTCTAAACACGGTATTCGTCGCGATGCAAACGGCGTATATTGTA
TGGACATGGTTGATGGAAGGAAGACC*ACGAGCCACTATCTCGGCTTGCTTCATGTTTAC
TTGTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTCCC

QA 3 584 3 584
DS 

RD RR2B238TF 751 0 0
GG
ATCGTATCTCTTATATAACTCATCTCTCTAAACATAAAAAAATGTTCCTCTCCGTTAACT
CTAACGGTCATTTCAACTAATACCGTCGTCCCTCTCCGTCGCAGATCTAACGGATATCAC
ACTAACGGAGTGGCCTTAAACGGAATGGAGAACGTTGTCAAGAAAACCGACGACTGCTAC
ACCAACGGCAACGGAGGAGGAGGAGGGAAGAGCAAGGCGTCGTTTCTGACGTGGACCATG
CGTGACGTTGTCTACGTGGCGAGATACCATTGGATACCGTGTTTCTTTGCGCTCGGAGTT
CTGTTCTTTATGGGCGTTGAGTACACGCTCCAGATGGTTCCGGCGAAGTCTGAGCCGTTT
GATATTGGGTTTGTGGTCACGCGCTCTCTGAACCGTGTCTTGGCGAGTTCACCGGATCTT
AACACCCTTTTAGCGGCTCTAAACACGGTATTCGTCGCGATGCAAACGACGTATATTGTA
TGGACATGGTTGATGGAAGGAAGACC*ACGAGCCACTATCTCGGCTTGCTTCATGTTTAC
TTGTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTCCCTCAGGATTTTTTAGGATC
AGGAGTTGATTTTCCGGTGGGAAATGTCTCATTCTTCCTCTTCTATTCTGGTCACGTCGC
TGGTTCAATGATCGCATCCTTGGACATGAGGAGAATGCAGAGGTTAAGACTAGCGATGCT
TTTTGACATCCTCAACGTATTACAATCGA

QA 3 751 3 751
DS 

RD RR2AK77TF 708 0 0
GG
GTTCCTCTCCGTTAACTCTAACGGTCATGTCAACTAATACCGTCGTCCCTCTCCGTCGCA
GATCTAACGGATATCACACCAACGGAGTGGCCTTAAACGGAATGGAGAACGTTGTCAAGA
AAACCGACGACTGCTACACCAACGGCAACGGAGGAGGAGGAGGGAAGAGCAAGGCGTCGT
TTCTGACGTGGACCATGCGTGACGTTGTCTACGTGGCGAGATACCATTGGATACCGTGTT
TCTTTGCGCTCGGAGTTCTGTTCTTTATGGGCGTTGAGTACACGCTCCAGATGGTTCCGG
CGAAGTCTGAGCCGTTTGATATTGGGTTTGTGGCCACGCGCTCCCTGAACCGTGTCTTGG
CGAGTTCACCGGATCTTAACACCTTTTTAGCGGCTCTAAACACGGTATTCGTCGCGATGC
AAACGACGTATATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGAAGACC*ACGAGCCACTATCTCG
GCTTGCTTCATGTTTACTTGTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTCCCT
CAGGATTTTTTAGGATCAGGAGTTGATTTTCCGGTGGGAAATGTCTCATTCTTCCTCTTC
TATTCTGGTCACGTCGCTGGTTCAATGATCGCATCCTTGGACATGAGGAGAATGCAGAGG
TTAAGACTAGCGATGCTTTTTGACATCCTCAACGTATTACAATCGA

QA 3 708 3 708
DS 

RD RR2AK77JQ 656 0 0
GAGGAGGAGGGAAGAGCAAGGCGTCGTTTCTGACGTGGACCATGCGTGACGTTGTCTACG
TGGCGAGATACCATTGGATACCGTGTTTCTTTGCGCTCGGAGTTCTGTTCTTTATGGGCG
TTGAGTACACGCTCCAGATGGTTCCGGCGAAGTCTGAGCCGTTTGATATTGGGTTTGTGG
CCACGCGCTCCCTGAACCGTGTCTTGGCGAGTTCACCGGATCTTAACACCTTTTTAGCGG
CTCTAAACACGGTATTCGTCGCGATGCAAACGACGTATATTGTATGGACATGGTTGATGG
AAGGAAGACCCACGAGCCACTATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTTGTCGCGGCATTCTT
GGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTCCCTCAGGATTTTTTAGGATCAGGAGTTGATTTTCCG
GTGGGAAATGTCTCATTCTTCCTCTTCTATTCTGGTCACGTCGCTGGTTCAATGATCGCA
TCCTTGGACATGAGGAGAATGCAGAGGTTAAGACTAGCGATGCTTTTTGACATCCTCAAC
GTATTACAATCGATCAGGCTGCTTGGGACGAGAGGACACTACCCAATCGATCTTGCGGTA
GGAGTTGGAGCTGGGATTCTCTTTGACTCTTTGGCCGGGAAATACGAGGGGATGAT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2FM16JQ 775 0 0
AGCAAGGCGTCGTTTCTGACGTGGACCATGCGTGACGTTGTCTACGTGGCGAGATACCAT
TGGATACCGTGTTTCTTTGCGCTCGGAGTTCTGTTCTTTATGGGCGTTGAGTACACGCTC
CAGATGGTTCCGGCGAAGTCTGAGCCGTTTGATATTGGGTTTGTGGTCGCGCGCTCTCTG
AACCGTGTCTTGGCGAGTTCACCGGATCTTAACACCCTTTTAGCGGCTCTAAACACGGTA
TTCGTCGCGATGCAAACGACGTATATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGAAGGCC*ACG
AGCCACTATCCCGGCTTGCTTCATGTTTACTTGTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCA
GCTCCCTCTCCCTCAGGATTTTTTAGGATCAGGAGTTGATTTTCCGGTGGGAAATGTCTC
ATTCTTCCTCTTCTATTCTGGTCACGTCGCTGGTTCAATGATCGCATCCTTGGACATGAG
GAGAATGCAGAGGTTAAGACTAGCGATGCTTTTTGACATCCTCAACGTATTACAATCGAT
CAGGCTGCTTGGGACGAGAGGACACTACACAATCGATCTTGCGGTAGGAGTTGGAGCTGG
GATTCTCTTTGACTCTTTGGCCGGGAAATACGAGGAGATGATGAGCAAGAGACAGAATTT
AGGCAATGGTTTTAGTTTGATTTCTAAAGACTCGCTACTCAATTAATCTTTTGTTTTCAT
TTTAAATGTTTAGTTGAACTTCAACATATTTGGTTTAGTTAAAGTCTAATGAATT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2GL61JQ 761 0 0
CATGCGTGACGTTGTCTACGTGGCGAGATACCATTGGATACCGTGTTTCTTTGCGCTCGG
AGTTCTGTTCTTTATGGGCGCTGAGTACACGCTCCAGATGGTTCCGGCGAAGTCTGAGCC
GTTTGATATTGGGTTTGTGGCCACGCGCTCTCTGAACCGTGTCTTGGCGAGTTCACCGGA
TCTTAACACCCTTTTAGCGGCTCTAAACACGGTATTCGTCGCGATGCAAACGGCGTATAT
TGTATGGACATGGTTGATGGAAGGAAGACC*ACGAGCCACTATCTCGGCTTGCTTCATGT
TTACTTGTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTCCCTCAGGATTTTTTAG
GATCAGGAGTTGATTTTCCGGTGGGAAATGTCTCATTCTTCCTCTTCTATTCTGGTCACG
TCGCTGGTTCAATGATCGCATCCTTGGACATGAGGAGAATGCAGAGGTTAAGACTAGCGA
TGCTTTTTGACATCCTCAACGTATTACAATCGATCAGGCTGCTTGGGACGAGAGGACACT
ACACAATCGATCTTGCGGTAGGAGTTGGAGCTGGGATTCTCTTTGACTCTTTGGCCGGGA
AATACGAGGAGATGATGAGCAAGAGACAGAATTTAGGCAATGGTTTTAGTTTGATTTCTA
AAGACTCGCTACTCAATTAATCTTTTGTTTTCATTTTAAATGTTTAGTTGAACTTCAACA
TATTTGGTTTAGTTAAAGTCTAATGAATTACATTTATTTCT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2C696JQ 646 0 0
CCGTTTGATATTGGGTTTGTGGTCACGCGCTCTCTGAACCGTGTCTTGGCGAGTTCACCG
GATCTTAACACCCTTTTAGCGGCTCTAAACACGGTATTCGTCGCGATGCAAACGACGTAT
ATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGAGGACC*ACGAGCCACTATCTCGGCTTGCTTCAT
GTTTACTTGTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTCCCTCAGGATTTTTT
AGGATCAGGAGTTGATTTTCCGGTGGGAAATGTCTCATTCTTCCTCTTCTATTCCGGTCA
CGTCGCTGGTTCAATGATCGCATCCTTGGACATGAGGAGAATGCAGAGGTTAAGACTAGC
GATGCTTTTTGACATCCTCAACGTATTACAATCGATCAGGCTGCTTGGGACGAGAGGACA
CTACACAATCGATCTTGCGGTAGGAGTTGGAGCTGGGATTCTCTTTGACTCTTTGGCCGG
GAAATACGAGGAGATGATGAGCAAGAGACAGAATTTAGGCAATGGTTTTAGTTTGATTTC
TAAAGACTCGCTACTCAATTAATCTTTTGTTTTCATTTTAAATGTTTAGTTGAACTTCAA
CATATTTGGTTTAGTTAAAGTCTAATGAATTACATTTATTTCTGCC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 7

CO CL725Contig1 1397 7 48 U
CCTTCAAACGAGATAAGCTATGATAAGATTTT*AAAATATAGCATAAACATACCAACTCC
CATGAACATAAACATAAAACTTGTCAACTGCACTGGAGAAGCCAGGTCATATCATATAAA
AGTAAATGAGAAAAAAAAAG**GGGGTCTCTGAGTTTAGGAGGGAGGAGGAATGGAATTG
ATATGTTTCTTCTT*CCACTATTGTTCTTCAAACTCGTGCATGTGATCTAGAAGATAGTT
AGCTGCAAGTTCTTCATTCTTGTTGCACGCAAAGAAAACTTCCAAGACCATCGCACGATC
AAACCCCATCGCTTCGAGCCGTTCAATGGCTTCACGTTCTTCAGGTGTGACGGTAACAGC
TTGTGGCATGGCTGCTTCCAACTGTTCCATGGCGTTCTCTTCTCCCTAGACAGGTTCATT
TATCAAGCGTAGGAAGTCGCCCTGGTGCTCTTGAATTAAACGCACAAGCTGCGGGTTTTG
TTTACCGAGCTCCTGAAGCATAGGCTGTAGAATCTGAGGGTTCGCTTGTACCATACCTCG
TAGGGCTTGGAACTGTTGACTGTTACGCAGGAAATCAAGATTACCAGCTCCAGCACCAGC
GTCTGCAGCGGGCATGCCCTGAGGGAACAGATCTAATGGATTTGCGTTTGGACCACCAGT
TGCAGGAACAGGAGCAGCTTCTTGTTGGGTCTGTGCTAGAGGATTTGCAGCCTGTCCACC
CGTAGCTGGGGCTTGAGGGGCTGGCGGGATTTCAGCTTGAGCAGGGATTCCTGAGTATAG
ATATTCAACAGCTCTTTCAGGGTTGTTAAATGCGGCTCTCAGGGCTCGGGTAACGGTGTC
ACGGTCCCAACTGCCTCCACCCATGTCAAGAATTTGCTGAACAGTGGACTCTAGATGATT
TCCAGCAACAAGGTTTGACGCTGCTTGACCATACACATCTGTCTGCGTCGAAGTAGCAGC
AGCAGTAGGTGCTGCAAAGGTTGCAGCTACACTTGTAGGTTCTGGAACTGAGACAGTTGG
AGCAGCCACCTGAGGTGTAGCTACCGTCTGTGCAGGCTGAGCCTGAGGTGCAGGTGCAGA
TGCAGTTGATGTCCCGCTTGAAGAAACCTTGGCCTTAGACAACATGATGACAATGAAACT
GTTGTCAACAACGTTGTTCTGTTCCAATGTAGTCTCATCCTTGAGAACTTTTCCTTGGTG
GATTAGCATCTGCTGAGCCGCCGGGTATTGCGCACCTTGATGACTTTCTATTCTTCTTTT
AGTTTCAGAGATCGTATCCGCAGGATTCACTTCGATCTCGAAGTTGGTCCCCTTGAGAGT
CTTGACGAAGATCTTCATCGTATCCTTTAGGAGGAAAACTTGAGAGAAGAGAGTAGGTTT
CGAGAAGCAAAGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 15 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F548JQ U 1
AF RR2BY68JQ U 5
AF RR2F718JQ U 2
AF RR2AZ90JQ U 2
AF RR2AZ90TFB C 716
AF RR2F718TF C 369
AF RR2F548TF C 634
BS 1 26 RR2F548JQ
BS 27 27 RR2AZ90JQ
BS 28 32 RR2F548JQ
BS 33 33 RR2AZ90JQ
BS 34 38 RR2F548JQ
BS 39 39 RR2AZ90JQ
BS 40 140 RR2F548JQ
BS 141 142 RR2AZ90JQ
BS 143 194 RR2F548JQ
BS 195 195 RR2AZ90JQ
BS 196 276 RR2F548JQ
BS 277 277 RR2F718JQ
BS 278 279 RR2F548JQ
BS 280 280 RR2AZ90JQ
BS 281 284 RR2F548JQ
BS 285 285 RR2AZ90JQ
BS 286 309 RR2F548JQ
BS 310 310 RR2AZ90JQ
BS 311 336 RR2F548JQ
BS 337 337 RR2AZ90JQ
BS 338 407 RR2F548JQ
BS 408 408 RR2F718JQ
BS 409 438 RR2F548JQ
BS 439 439 RR2AZ90JQ
BS 440 477 RR2F548JQ
BS 478 478 RR2AZ90JQ
BS 479 486 RR2F548JQ
BS 487 487 RR2AZ90JQ
BS 488 495 RR2F548JQ
BS 496 496 RR2AZ90JQ
BS 497 509 RR2F548JQ
BS 510 510 RR2AZ90JQ
BS 511 513 RR2F548JQ
BS 514 514 RR2AZ90JQ
BS 515 516 RR2F548JQ
BS 517 517 RR2AZ90JQ
BS 518 528 RR2F548JQ
BS 529 529 RR2AZ90JQ
BS 530 630 RR2F548JQ
BS 631 631 RR2AZ90JQ
BS 632 669 RR2F548JQ
BS 670 671 RR2AZ90JQ
BS 672 672 RR2F548JQ
BS 673 673 RR2AZ90JQ
BS 674 715 RR2F548JQ
BS 716 880 RR2AZ90JQ
BS 881 1030 RR2F718TF
BS 1031 1397 RR2F548TF

RD RR2F548JQ 715 0 0
CCTTCAAACGAGATAAGCTATGATAATATTTTTAAAATGTAGCATAAACATACCAACTCC
CATGAACATAAACATAAAACTTGTCAACTGCACTGGAGAAGCCAGGTCATATCATATAAA
AGTAAATGAGAAAAAAAAAGATGGGGTCTCTGAGTTTAGGAGGGAGGAGGAATGGAATTG
ATATGTTTCTTCTTTCCACTATTGTTCTTCAAACTCGTGCATGTGATCTAGAAGATAGTT
AGCTGCAAGTTCTTCATTCTTGTTGCACGCAAAGAACACCTCCATGACCATCGCACGATC
AAACCCCATTGCTTCGAGCCGTTCAATGGCTTCACGCTCTTCAGGTGTGACGGTAACAGC
TTGTGGCATGGCTGCTTCCAACTGTTCCATGGCGTTCTCTTCTCCCTCGACAGGTTCATT
TATCAAGCGTAGGAAGTCACCCTGGTGCTCTTGAATTAAACGCACAAGCTGCGGGTTCTG
TTTACCAAGCTCCTGCAGCATAGGCTGTAAAATTTGTGGGTTCGCTTGGACCATACCTCG
TAGGGCTTGGAACTGTTGACTGTTACGCAGGAAATCAAGATTACCAGCTCCAGCACCAGC
GTCTGCAGCGGGCATGCCCTGAGGGAACAGGTCTAATGGATTTGCGTTTGGACCACCAGT
TGCAGGAACTTGGGCAGCTTCTTGTTGGGTCTGTGCTAGAGGATTTGCAGCCTGT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2BY68JQ 704 0 0
CG
AACGAAATAAGCTATGATAAAATTTT*AAAATATAGCATAAACATACCAACTCCCATGAA
CATAAACATAAAACTTGTCAACTGCACTGGAAAAGCCAGGTCATATCATATAAAAGTAAA
TGAAAAAAAAAAAA**GGGGTCTCTGAATTTAGGAGGGAGGAGGAATGGAATTGATATGT
TTCTTCTT*CCACTATTGTTCTTCAAACTCGTGCATGTGATCTAAAAAATAGTTAGCTGC
AAGTTCTTCATTCTTGTTGCACGCAAAGAAAACTTCCAAGACCATCGCACGATCAAACCC
CATCGCTTCGAGCCGTTCAATGGCTTCACGTTCTTCAGGTGTGACGGTAACAGCTTGTGG
CATGGCTGCTTCCAACTGTTCCATGGCGTTCTCTTCTCCCTCGACAGGTTCATTTATCAA
GCGTAGGAAGTCCCCCTGGTGCTCTTGAATTAAACGCACAAGCTGCGGGTTTTGTTTACC
GAGCTCCTGAAGCATAGGCTGTAAAATCTGAGGGTTCGCTTGTACCATACCTCGTAGGGC
TTGGAACTGTTGACTGTTACGCAGGAAATCAAGATTACCAGCTCCAGCACCAGCGTCTGC
AGCGGACATGCCCTGAGGGAACAGATCTAATGGATTCGCGTTTGGACCACCAGTTGCAGG
AACAGGAGCAGCTTCTTGTTGGGTCTGTGCTAGAGGATTTGC

QA 3 704 3 704
DS 

RD RR2F718JQ 808 0 0
CCTCA
AACGAGATAAGCTATGATAAGATTTT*AAAATATAGCATAAACATACCAACTCCCATGAA
CATAAACATAAAACTTGTCAACTGCACTGGAGAAGCCAGGTCATATCATATAAAAGTAAA
TGAGAAAAAAAAAG***GGGTCTCTGAGTTTAGGAGGGAGGAGGAATGGAATTGATATGT
TTCTTCTT*CCACTATTGTTCTTCAAACTCGTGCATGTGATCTAGAAGATAGTTAGCTGC
AAGTTCTTCATTCTTGTTGCACGCAAAGAAAACTTCCAAGACCATCGCACGATCAAACCC
CATCGCTTCGAGCCGTTCAATGGCTTCACGTTCTTCAGGTGTGACGGTAACAGCTTGTGG
CATGGCTGCTTCCAACTGTTCCATGGCGTTCTCTTCTCCCTAGACAGGTTCATTTATCAA
GCGTAGGAAGTCGCCCTGGTGCTCTTGAATTAAACGCACAAGCTGCGGGTTTTGTTTACC
GAGCTCCTGAAGCATAGGCTGTAGAATCTGAGGGTTCGCTTGTACCATACCTCGTAGGGC
TTGGAACTGTTGACTGTTACGCAGGAAATCAAGATTACCAGCTCCAGCACCAGCGTCTGC
AGCGGGCATGCCCTGAGGGAACAGATCTAATGGATTTGCGTTTGGACCACCAGTTGCAGG
AACAGGAGCAGCTTCTTGTTGGGTCTGTGCTAGAGGATTTGCAGCCTGTCCACCCGTAGC
TGGGGCTTGAGGGGCTGGCGGGATTTCAGCTTGAGCAGG*ATTCCTGAGTATAGATATTC
AACAGCTCTTTCAGG
TTGTTAAT

QA 6 800 6 800
DS 

RD RR2AZ90JQ 879 0 0
CTTCA
AACGAGATAAGCTATGATAAGATTTT*AAAATATAGCATAAACATACCAACTCCCATGAA
CATAAACATAAAACTTGTCAACTGCACTGGAGAAGCCAGGTCATATCATATAAAAGTAAA
TGAGAAAAAAAAAG***GGGTCTCTGAGTTTAGGAGGGAGGAGGAATGGAATTGATATGT
TTCTTCTT*CCACTATTGTTCTTCAAACTCGTGCATGTGATCTAGAAGATAGTTAGCTGC
AAGTTCTTCATTCTTGTTGCACGCAAAGAAGACTTCCAAGACCATCGCACGATCAAACCC
CATCGCTTCGAGCCGTTCAATGGCTTCACGTTCTTCAGGTGTGACGGTAACAGCTTGTGG
CATGGCTGCTTCCAACTGTTCCATGGCGTTCTCTTCTCCCTCGACAGGTTCATTTATCAA
GCGTAGGAAGTCGCCCTGGTGCTCTTGAATTAGACGCACAAGCTGCGGGTTTTGTTTACC
GAGCTCCTGAAGCATAGGCTGTAGAATCTGAGGGTTCGCTTGTACCATACCTCGTAGGGC
TTGGAACTGTTGACTGTTACGCAGGAAATCAAGATTACCAGCTCCAGCACCAGCGTCTGC
AGCGGGCATGCCCTGAGGGAACAGATCTAATGGATTTGCGTTTGGACCACCAGTTGCAGG
AACAGGAGCAGCTTCTTGTTGGGTCTGTGCTAGAGGATTTGCAGCCTGTCCACCCGTAGC
TGGGGCTTGAGGGGCTGGCGGGATTTCAGCTTGAGCAGGGATTCCTGAGTATAGATATTC
AACAGCTCTTTCAGGGTTGTTAAATGCGGCTCTCAGGGCTCGGGTAACGGTGTCACGGTC
CCAACTGCCTCCACCCATGTCAAGAATTTGCTGA

QA 6 879 6 879
DS 

RD RR2AZ90TFB 136 0 0
CCACCCGTAGCTGGGGCTTGAGGGGCTGGCGGGATTTCAGCTTGAGCAGGGATTCCTGAG
TATAGATATTCAACAGCTCTTTCAGGGTTGTTAAATGCGGCTCTCAGGGCTCGGGTAACG
GTGTCACGGTCCCAAC

QA 1 136 1 136
DS 

RD RR2F718TF 662 0 0
TGGCTGCTTCCAACTGTTCCATGGCGT*CTCT*CTCCCTAGACAGGTTCATTTATCAAGC
GTAGGAAGTCGCCCTGGTGCTCTTGAATTAGACGCACAAGCTGCGGGTTTTGTTTACCGA
GCTC*TGAAGCATAGGCTGTAGAATCTGAGGGTTCGCTTGTACCATACCTCGTAGGGCTT
GGAACTGTTGACTGTTACGCAGGAAATCAAGATTACCAGCTCCAGCACCAGCGTCTGCAG
CGGGCATGCCCTGAGGGAACAGATCTAATGGATTTGCGTTTGGACCACCAGTTGCAGGAA
CAGGAGCAGCTTCTTGTTGGGTCTGTGCTAGAGGATTTGCAGCCTGTCCACCCGTAGCTG
GGGCTTGAGGGGCTGGCGGGATTTCAGCTTGAGCAGGGATTCCTGAGTATAGATATTCAA
CAGCTCTTTCAGGGTTGTTAAATGCGGCTCTCAGGGCTCGGGTAACGGTGTCACGGTCCC
AACTGCCTCCACCCATGTCAAGAATTTGCTGAACAGTGGACTCTAGATGATTTCCAGCAA
CAAGGTTTGACGCTGCTTGACCATACACATCTGTCTGCGTCGAAGTAGCAGCAGCAGTAG
GTGCTGCAAAGGTTGCAGCTACACTTGTAGGTTCTGGAACTGAGACAGTTGGAGCAGCCA
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2F548TF 764 0 0
TAATGGATTTGCGTTTGGACCACCAGTTGCAGGAACTTGGGCAGCTTCTTGTTGGGTCTG
TGCTAGAGGATTTGCAGCCTGTCCACCAGTAGCTGGGGTTTGAGGGGCTGGCGGGATTTC
AGCTTGAGCAGGGATTCCTGAGTAGAGATATTCAACAGCTCTTTCAGAGTTGTTAAATGC
GGCTCTCAGGGCTCGGGTAACAGTGTCACGGTCCCAACTACCTCCACCCATGTCGAGAAT
TTGCTGAACAGTGGACTCTAGATGATTTCCAGCAACAAGGTTTGACGCTGCTTGACCATA
CACATCTGTCTGCGTCGAAGTAGCAGCAGCTGTAGGTGCTGCAACGGTTGCAGCTACACT
TGTAGGTTCTGGAACTGAGACAGTTGGAGCAGCCACCTGAGGTGTAGCTACCGTCTGTGC
AGGCTGAGCCTGAGGTGCAGGTGCAGATGCAGTTGATGTCCCGCTTGAAGAAACCTTGGC
CTTAGACAACATGATGACAATGAAACTGTTGTCAACAACGTTGTTCTGTTCCAATGTAGT
CTCATCCTTGAGAACTTTTCCTTGGTGGATTAGCATCTGCTGAGCCGCCGGGTATTGCGC
ACCTTGATGACTTTCTATTCTTCTTTTAGTTTCAGAGATCGTATCCGCAGGATTCACTTC
GATCTCGAAGTTGGTCCCCTTGAGAGTCTTGACGAAGATCTTCATCGTATCCTTTAGGAG
GAAAACTTGAGAGAAGAGAGTAGGTTTCGAGAAGCAAAGTATCC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 8

CO CL726Contig1 863 8 13 U
CGGGGGGTGCCCTAGCTTCTCACACAGCCGTCTGTATCACAGAGGAGGCGACAATATGGT
GCACGTTTGCTACTACCGCAACTATGGAAAAACATTCAAGGGACCGCGTCGTCCTTTCGA
GAAGGAGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCG
TGAGCTCTGGAGAGTGCAGTACTCTTTGAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGGGATCTTCT
GACACTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTTCTCCGTAAGAT
GAACCGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGAC
CGTTGAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACAATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAA
GTCGATTCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTT
GGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGATTCTCAGAAACACATTGACTTTGCTCT
GACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGAAGAGTGAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGC
CTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCT
CACCTGGTTTAGCTATGGAGCAATCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAG
TGGATTGTTCTGTGTTTTCTTTCGCTATTCTCCTGTCCAACTTTTT*ACTTGATTGTTTA
CAAACATCATCTCTTAAAAGTTTTGTTTCTTTCTTATGCTGAGATCCCAAAAACTCATAT
AGCAATAATATCTTACATTGCCT


BQ
10 10 10 10 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 15 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 25 25 40 40 15 40 15 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW29TF U 1
AF RR2CI33TF U 5
AF RR2AA02TF U 5
AF RR2F669TF U 1
AF RR2H658JQB C 98
AF RR2CI33JQ C 213
AF RR2DD50JQ C 137
AF RR2BW29JQ C 129
BS 1 682 RR2BW29TF
BS 683 683 RR2CI33TF
BS 684 714 RR2BW29TF
BS 715 715 RR2CI33TF
BS 716 737 RR2BW29TF
BS 738 739 RR2CI33TF
BS 740 740 RR2BW29TF
BS 741 742 RR2F669TF
BS 743 757 RR2BW29TF
BS 758 758 RR2F669TF
BS 759 778 RR2BW29TF
BS 779 799 RR2H658JQB
BS 800 863 RR2BW29JQ

RD RR2BW29TF 794 0 0
CGGGGGGTGCCCTAGCTTCTCACACAGCCGTCTGTATCACAGAGGAGGCGACAATATGGT
GCACGTTTGCTACTACCGCAACTATGGAAAAACATTCAAGGGACCGCGTCGTCCTTTCGA
GAAGGAGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCG
TGAGCTCTGGAGAGTGCAGTACTCTTTGAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGGGATCTTCT
GACACTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTTCTCCGTAAGAT
GAACCGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGAC
CGTTGAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACAATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAA
GTCGATTCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTT
GGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGATTCTCAGAAACACATTGACTTTGCTCT
GACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGAAGAGTGAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGC
CTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCT
CACCTGGTTTAGCTATGGAGCA*TCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATT*CTCAG
TGGATTGTTCTGTGTTTCTT**CGCTATTCTCCTGTC*AACTTTTT*ACTTGATTGTT
ACAACATCATCTCTTA

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2CI33TF 736 0 0
GGGTGCCCTAGCTTCTCACACAGCCGTTTCTATCACAGAGGAGGCGACAGTATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGCAACTATGGAAAAACATTCAAGGGACCACGTCGTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTAGTTGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAG
CTCTGGAGAGTGCAGTACTCTCTTAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGGGATCTTCTCACA
CTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCACTACTCCGTAAGATGAAC
CGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTT
GAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCG
ATTCATCACTCTCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAGTTGGTG
GACATTCCTTCGTTCATGGCGAGACTTGATTCTCAGAAACACATTGACTTTGCTCTGACC
AGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCGGGAAGAGTGAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCCTCC
AAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACC
TGTTTTAGCTATGGAGCAATCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGGA
TTGTTCTGTGTTTTCT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2AA02TF 720 0 0
GGGTGCCCTAGCTTCTCACACAGCCGTCTGTATCACAGAGGAGGCGACAATATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGCAACTATGGAAAAACATTCAAGGGACCGCGTCTTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAG
CTCTGGAGAGTGCAGTACTCTTTGAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGGGATCTTCTGACA
CTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTTCTCCGTAAGATGAAC
CGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTT
GAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACAATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCG
ATTCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTG
AACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGATTCTCAGAAACACATTGACTTTGCTCTGACC
AGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGAAGAGTGAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCCTCC
AAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACC
TGGTTTAGCTATGGAGCAATCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGGA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2F669TF 779 0 0
GGGTTC
GTGCCCTAGCTTCTCACACAGCCGTCTGTATCACAGAGGAGGCGACAATATGGTGCACGT
TTGCTACTACCGCAACTATGGAAAAACATTCAAGGGACCGCGTCGTCCTTTCGAGAAGGA
GCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCTGTAACAAGCGTGAGCT
CTGGAGAGTGCAGTACTCTTTGAGCCGTATCCGCAACGCCGCTAGGGATCTTCTGACACT
CGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTTCTCCGTAAGATGAACCG
TTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTGCGTCTTGGCTTTGACCGTTGA
GAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACAATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGAT
TCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTGAA
CATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGATTCTCAGAAACACATTGACTTTGCTCTGACCAG
TCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGAAGAGTGAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCCTCCAA
GAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACCTG
GTTTAGCTATGGAGCAATCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGGATT
GTTCTGTGTTTTCTTTCGCTATTCTCCTGTCCAACTTTTT*ACTTGATTGTT
T

QA 7 778 7 778
DS 

RD RR2H658JQB 703 0 0
AAGGGACCGCGTCGTCCTTTCGAGAAGGAGCGTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGC
GAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAGCTCTGGAGAGTGCAGTACTCTTTGAGCCGTATC
CGTAACGCCGCTAGGGATCTTCTGACACTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAA
GGTGAGGCGCTTCTCCGTAAGATGAACCGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACAAG
CTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTTGAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACAATT
GTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGATTCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGG
CATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGATTCT
CAGAAACACATTGACTTTGCTCTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGAAGAGTG
AAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGAT
GACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACCTGGTTTAGCTATGGAGCAATCTGCCTTTTGATC
ATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGGATTGTTCTGTGTTTTCTTTCGCTATTCTCCTGTC
CAACTTTTTTACTTGATTGTTTACAAACATCATCTCTTAAAA
G

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2CI33JQ 589 0 0
GTATCCGTAACGCCGCTAGGGATCTTCTCACACTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCT
TCGAAGGTGAGGCACTACTCCGTAAGATGAACCGTTACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGA
ACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTTGAGAATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGA
CCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGATTCATCACTCTCGTGTCCTCATCAGGC
AGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAGTTGGTGGACATTCCTTCGTTCATGGCGAGACTTG
ATTTTCAGAAACACATTGACTTTGCTCTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCGGGAA
GAGTGAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATG
GTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACCTGTTTTAGCTATGGAGCAATCTGCCTTT
TGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGGATTGTTCTGTGTTTTCTTTCGGT*TTCTC
ATGTCCAACTTTTT*ACTT*ATTGTTTACAAACATCATCTCTTAAAA
AG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2DD50JQ 664 0 0
TCCGAGCTGAAGCTAGTTGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAGCTCTGGAGAGTG
CAGTACTCTCTTAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGGGATCTTCTCACACTCGACGAGAAG
AACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTACTCCGTAAGATGAACCGTTACGGTCTT
CTCGATGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTTGAGAATTTCCTC
GAGCGTAGGCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGATTCATCACTCT
CGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAGTTGGTGAACATTCCTTCG
TTCATGGTGAGACTTGATTTTCAGAAACACATTGACTTTGCTCTGACCAGTCCCTTCGGT
GGTGGCCGTCCGGGAAGAGTGAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAAAGCCTCT
GGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACCTGTTTTAGCTAT
GGAGCAATCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGGATTGTTCTGTGTT
TTCTTTCGGT*TTCTCATGTCCAACTTTTT*ACTT*ATTGTTTACAAACATCATCTCTTA
AAA
A

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2BW29JQ 735 0 0
GTCTCGACTCCGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGTAACAAGCGTGAGCTCT
GGAGAGTGCAGTACTCTTTGAGCCGTATCCGTAACGCCGCTAGGGATCTTCTGACACTCG
ACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGTGAGGCGCTTCTCCGTAAGATGAACCGTT
ACGGTCTTCTCGATGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCTTTGACCGTTGAGA
ATTTCCTCGAGCGTAGGCTTCAGACAATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGATTC
ATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGGAAGCAGTTGGTGAACA
TTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGATTTTCAGAAACACATTGACTTTGCTCTGACCAGTC
CCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGAAGAGTGAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCCTCCAAGA
AAGCCTCTGGTGGTGATGCAGATGGTGATGACGAAGAGTAATTCTAACTCCTCACCTGGT
TTAGCTATGGAGCAATCTGCCTTTTGATCATTTGTAGTTTGTTATTTCTCAGTGGATTGT
TCTGTGTTTTCTTTCGCTATTCTCCTGTCCAACTTTTTTACTTGATTGTTTACAAACATC
ATCTCTTAAAAGTTTTGTTTCTTTCTTATGCTGAGATCCCAAAAACTCATATAGCAATAA
TATCTTACATTGCCT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 9

CO CL727Contig1 754 9 14 U
GGGAACTCATTCTATAAGTAATCTAGAGAAGTATTTTCCCATCTGTAAGAAATGGCACAA
GCGATGTTGAAGCCTTCTCTACAAGGAGAGATTAAGGCAGACGTTGAGATCAAAGCTCCA
GCCACAAAGTTCTATCACATGTTCGCAGTGAGACCACAAGACGTGTCTAAAGCCAGTCTT
GAAAACCTCAAGGGATGTCGTGTGGAAGAGGGAGAGATGGGCAAAGTTGGCACTCTCCTC
ACCTGGAACTACGTCCTGGATGGCAAGCCAATGGTGGCCAATGAGAGGATCGAGGCAGTG
GAACCGAAGAACAATATGATAAAGTTTAGAGTACTGGAGGGAGATCTGATGAAAGAGTTC
AAGAGCTTCCTATGCACGATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTGGAGGTGTGGTG
AAATGGCGCTTGGAATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCCCCCGGAGTCTCTGCTC
CAAGCGTGTGTCAAAACGACCAAAGGAATCGACGAAATGCTTTTGTCTAATGAGTAGATA
CTCATTAAATATCTATACATGTATCTATCTTTATGTATTTGAGTGTTTTATATCAATAAT
GTAATCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGTATCTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTT*
ATATCAATAATGTACTCTCTAGATCTTAAGAGATGTGATATGAAAGTGTTACGAGATACA
TCTATCTAGTTAAATAAAACTATATCTTTATGCT


BQ
10 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR2B891JQ C 1
AF RR2B891TF U 1
AF RR2CN30TF U 16
AF RR2FA86TF U -1
AF RR2CF68TF U 2
AF RR2C514TF U 2
AF RR2CF68JQ C 2
AF RR2C514JQ C 82
AF RR2F122JQ C 118
BS 1 1 RR2B891JQ
BS 2 97 RR2B891TF
BS 98 98 RR2C514TF
BS 99 216 RR2B891TF
BS 217 218 RR2C514TF
BS 219 261 RR2B891TF
BS 262 262 RR2C514TF
BS 263 433 RR2B891TF
BS 434 434 RR2C514TF
BS 435 659 RR2B891TF
BS 660 660 RR2C514TF
BS 661 719 RR2B891TF
BS 720 753 RR2C514TF
BS 754 754 RR2F122JQ

RD RR2B891JQ 719 0 0
GGGAACTCATTCTATAAGTAATCTAGAGAAGTATTTTCCCATCTGTAAGAAATGGCACAA
GCGATGTTGAAGCCTTCTCTACAAGGAGAGATTAAGGTAGACGTTGAGATCAAAGCTCCA
GCCACAAAGTTCTATCACATGTTCGCAGTGAGACCACAAGACGTGTCTAAAGCCAGTCTT
GAAAACCTCAAGGGATGTCGTGTGGAAGAGGGAGAG**GGGCAAAGTTGGCACTCTCCTC
ACCTGGAACTACGTCCTGGATAGCAAGCCAATGGTGGCCAATGAGAGGATCGAGGCAGTG
GAACCGAAGAACAATATGATAAAGTTTAGAGTACTGGAGGGAGATCTGATGAAAGAGTTC
AAGAGCTTCCTATGCACGATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTGGAGGTGTGGTG
AAATGGCGCTTGGGATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCCCCCGGAGTTTTTGCTC
CAAGCGTGTGTCAAAACGACCAAAGGAATCGACGAAATGCTTTTGTCTAATGAGTAGATA
CTCATTAAATATCTATACATGTATCTATCTTTATGTATTTGAGTGTTTTATATCAATAAT
GTAATCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGTATCTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTTT
ATATCAATAATGTACTCTCTAGATCTTAAGAGATGTGATATGAAAGTGTTACGAGATAC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2B891TF 719 0 0
G
GGAACTCATTCTATAAGTAATCTAGAGAAGTATTTTCCCATCTGTAAGAAATGGCACAAG
CGATGTTGAAGCCTTCTCTACAAGGAGAGATTAAGGTAGACGTTGAGATCAAAGCTCCAG
CCACAAAGTTCTATCACATGTTCGCAGTGAGACCACAAGACGTGTCTAAAGCCAGTCTTG
AAAACCTCAAGGGATGTCGTGTGGAAGAGGGAGAG**GGGCAAAGTTGGCACTCTCCTCA
CCTGGAACTACGTCCTGGATAGCAAGCCAATGGTGGCCAATGAGAGGATCGAGGCAGTGG
AACCGAAGAACAATATGATAAAGTTTAGAGTACTGGAGGGAGATCTGATGAAAGAGTTCA
AGAGCTTCCTATGCACGATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTGGAGGTGTGGTGA
AATGGCGCTTGGGATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCCCCCGGAGTCTCTGCTCC
AAGCGTGTGTCAAAACGACCAAAGGAATCGACGAAATGCTTTTGTCTAATGAGTAGATAC
TCATTAAATATCTATACATGTATCTATCTTTATGTATTTGAGTGTTTTATATCAATAATG
TAATCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGTATCTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTTTA
TATCAATAATGTACTCTCTAGATCTTAAGAGATGTGATATGAAAGTGTTACGAGATAC

QA 2 719 2 719
DS 

RD RR2CN30TF 680 0 0
AAGTAATCTAGAGAAGTATTTTCCCATCTGTAAGAAATGGCACAAGCGATGTTGAAGCCT
TCTCTACAAGGAGAGATTAAGGCAGACGTTGAGATCAAAGCTCCAGCCACAAAGTTCTAT
CACATGTTCGCAGTGAGACCACAAGACGTGTCTAAAGCCAGTCTTGAAAACCTCAAGGGA
TGTCGTGTGGAAGAGGGAGAGATGGGCAAAGTTGGCACTCTCCTCACCTGGAACTACGTC
CTGGATGGCAAGCCAATGGTGGCCAATGAGAGTATCGAGGCAGTGGAACCGAAGAACAAT
ATGATAAAGTTTAGAGTACTGGAGGGAGATCTGATGAAAGAGTTCAAGAGCTTCCTATGC
ACGATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTGGAGGTGTGGTGAAATGGCGCTTGGAA
TACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCCCCCGGAGTCTCTGCTCCAAGCGTGTGTCAAA
ACGACCAAAGGAATCGACGAAATGCTTTTGTCTAATGAGTAGATACTCATTAAATATCTA
TACATGTATCTATCTTTATGTATTTGAGTGTTTTATATCAATAATGTAATCTCTAGATCT
AAAGAGATGTGATATGTATCTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTT*ATATCAATAATGTAC
TCTCTAGATCTTAAGAGATG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2FA86TF 697 0 0
GGACT
AACTCATTCTATAAGTAATCTAGAGAAGTATTTTCCCATCTGTAAGAAATGGCACAAGCG
ATGTTGAAGCCTTCTCTACAAGGAGAGATTAAGGCAGACGTTGAGATCAAAGCTCCAGCC
ACAAAGTTCTATCACATGTTCGCAGTGAGACCACAAGACGTGTCTAAAGCCATTCTTGAA
AACCTCAAGGGATGTCGTGTGGAAGAGGGAGAGATGGGCAAAGTTGGCACTCTCCTCACC
TGGAACTACGTCCTGGATGGCAAGCCAATGGTGGCCAATGAGAGGATCGAGGCAGTGGAA
CCGAAGAACAATATGATAAAGTTTAGAGTACTGGAGGGAGATCTGATGAAAGAGTTCAAG
AGCTTCCTATGCACGATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTGGAGGTGTGGTGAAA
TGGCGCTTGGAATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCCCCCGGAGTCTCTGCTCCAA
GCGTGTGTCAAAACGACCAAAGGAATCGACGAAATGCTTTTGTCTAATGAGTAGATACTC
ATTAAATATCTATACATGTATCTATCTTTATGTATTTGAGTGTTTTATATCAATAATGTA
ATCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGTATCTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTT*ATA
TCAATAATGTACTCTCTAGATCTTAAGAGATG

QA 6 697 6 697
DS 

RD RR2CF68TF 693 0 0
GGAACTCATTCTATAAGTAATCTAGAGAAGTATTTTCCCATCTGTAAGAAATGGCACAAG
CGATGTTGAAGCCTTCTCTACAAGGAGAGATTAAGGCAGACGTTGAGATCAAAGCTCCAG
CCACAAAGTTCTATCACATGTTCGCAGTGAGACCACAAGACGTGTCTAAAGCCAGTCTTG
AAAACCTCAAGGGATGTCGTGTGGAAGAGGGAGAGATGGGCAAAGTTGGCACTCTCCTCA
CCTGGAACTACGTCCTGGATGGCAAGCCAATGGTGGCCAATGAGAGGATCGAGGCAGTGG
AACCGAAGAACAATATGATAAAGTTTAGAGTACTGGAGGGAGATCTGATGAAAGAGTTCA
AGAGCTTCCTATGCACGATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTGGAGGTGTGGTGA
AATGGCGCTTGGAATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCCCCCGGAGTCTCTGCTCC
AAGCGTGTGTCAAAACGACCAAAGGAATCGACGAAATGCTTTTGTCTAATGAGTAGATAC
TCATTAAATATCTATACATGTATCTATCTTTATGTATTTGAGTGTTTTATATCAATAATG
TAATCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGTATCTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTT*A
TATCAATAATGTACTCTCTAGATCTTAAGAGAT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2C514TF 752 0 0
GGAACTCATTCTATAAGTAATCTAGAGAAGTATTTTCCCATCTGTAAGAAATGGCACAAG
CGATGTCGAAGCCTTCTCTACAAGGAGAGATTAAGGCAGACGTTGAGATCAAAGCTCCAG
CCACAAAGTTCTATCACATGTTCGCAGTGAGACCACAAGACGTGTCTAAAGCCAGTCTTG
AAAACCTCAAGGGATGTCGTGTGGAAGAGGGAGAGATGGGCAAAGTTGGCACTCTCCTCA
CCTGGAACTACGTCCTGGATGGCAAGCCAATGGTGGCCAATGAGAGGATCGAGGCAGTGG
AACCGAAGAACAATATGATAAAGTTTAGAGTACTGGAGGGAGATCTGATGAAAGAGTTCA
AGAGCTTCCTATGCACGATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTGGAGGTGTGGTGA
AATGGCGCTTGGAATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGACTCCCCCGGAGTCTCTGCTCC
AAGCGTGTGTCAAAACGACCAAAGGAATCGACGAAATGCTCTTGTCTAATGAGTAGATAC
TCATTAAATATCTATGCATGTATCTATCTTTATGTATTTGAGTGTTTTATATCAATAATG
TAATCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGTATCTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTT*A
TATCAATAATGTACTCTCTAGATCTTAAGAGATGTGATATGAAAGTGTTACGAGATACAT
CTATCTAGTTAAATAAAACTATATCTTTATGC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2CF68JQ 752 0 0
GGAACTCATTCTATAAGTAATCTAGAGAAGTATTTTCCCATCTGTAAGAAATGGCACAAG
CGATGTTGAAGCCTTCTCTACAAGGAGAGATTAAGGCAGACGTTGAGATCAAAGCTCCAG
CCACAAAGTTCTATCACATGTTCGCAGTGAGACCACAAGACGTGTCTAAAGCCAGTCTTG
AAAACCTCAAGGGATGTCGTGTGGAAGAGGGAGAGATGGGCAAAGTTGGCACTCTCCTCA
CCTGGAACTACGTCCTGGATGGCAAGCCAATGGTGGCCAATGAGAGGATCGAGGCAGTGG
AACCGAAGAACAATATGATAAAGTTTAGAGTACTGGAGGGAGATCTGATGAAAGAGTTCA
AGAGCTTCCTATGCACGATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTGGAGGTGTGGTGA
AATGGCGCTTGGAATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCCCCCGGAGTCTCTGCTCC
AAGCGTGTGTCAAAACGACCAAAGGAATCGACGAAATGCTTTTGTCTAATGAGTAGATAC
TCATTAAATATCTATACATGTATCTATCTTTATGTATTTGAGTGTTTTATATCAATAATG
TAATCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGTATCTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTT*A
TATCAATAATGTACTCTCTAGATCTTAAGAGATGTGATATGAAAGTGTTACGAGATACAT
CTATCTAGTTAAATAAAACTATATCTTTATGC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2C514JQ 672 0 0
CAAGGAGAGATTAAGGCAGACGTTGAGATCAAAGCTCCAGCCACAAAGTTCTATCACATG
TTCGCAGTGAGACCACAAGACGTGTCTAAAGCCAGTCTTGAAAACCTCAAGGGATGTCGT
GTGGAAGAGGGAGAGATGGGCAAAGTTGGCACTCTCCTCACCTGGAACTACGTCCTGGAT
GGCAAGCCAATGGTGGCCAATGAGAGGATCGAGGCAGTGGAACCGAAGAACAATATGATA
AAGTTTAGAGTACTGGAGGGAGATCTGATGAAAGAGTTCAAGAGCTTCCTATGCACGATC
CAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTGGAGGTGTGGTGAAATGGCGCTTGGAATACGAG
AGGATTGACGAAAACGTGACTCCCCCGGAGTCTCTGCTCCAAGCGTGTGTCAAAACGACC
AAAGGAATCGACGAAATGCTCTTGTCTAATGAGTAGATACTCATTAAATATCTATGCATG
TATCTATCTTTATGTATTTGAGTGTTTTATATCAATAATGTAATCTCTAGATCTAAAGAG
ATGTGATATGTATCTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTT*ATATCAATAATGTACTCTCTA
GATCTTAAGAGATGTGATATGAAAGTGTTACGAGATACATCTATCTAGTTAAATAAAACT
ATATCTTTATGC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2F122JQ 637 0 0
G
CAGCCACAAAGTTCTATCACATGTTCGCAGTGAGACCACAAGACGTGTCTAAAGCCAGTC
TTGAAAACCTCAAGGGATGTCGTGTGGAAGAGGGAGAGATGGGCAAAGTTGGCACTCTCC
TCACCTGGAACTACGTCCTGGATGGCAAGCCAATGGTGGCCAATGAGAGGATCGAGGCAG
TGGAACCGAAGAACAATATGATAAAGTTTAGAGTACTGGAGGGAGATCTGATGAAAGAGT
TCAAGAGCTTCCTATGCACGATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTGGAGGTGTGG
TGAAATGGCGCTTGGAATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCCCCCGGAGTCTCTGC
TCCAAGCGTGTGTCAAAACGACCAAAGGAATCGACGAAATGCTTTTGTCTAATGAGTAGA
TACTCATTAAATATCTATACATGTATCTATCTTTATGTATTTGAGTGTTTTATATCAATA
ATGTAATCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGTATCTATCTTTATGTATTTGGGTGTTT
T*ATATCAATAATGTACTCTCTAGATCTTAAGAGATGTGATATGAAAGTGTTACGAGATA
CATCTATCTAGTTAAATAAAACTATATCTTTATGCT

QA 2 637 2 637
DS 



AS 2 9

CO CL728Contig1 822 5 11 U
GGGACTTCAACCGACGCACATCTCATCATCAATTCATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGA
TCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACG
CTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGATAATGATGATGACGCAGAGGGACAAGATG
GAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGC
TGAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCGTGTTACCGTTAAGAAGAGCAAGA
ATATCATGTTTGTCATTTCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATCAGACACGTACG
TGATCTTCGGAGAGGCCAAGATCGAGGACTTGAGCTCTCAGATCCAGTCACAAGCGGCCG
AGCAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGATCTCAAAGGGTGAGTCGTCCTCCAGCG
CTGCAGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGAGGAAGGAGTTGAGCCAAAAG
ACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGCAGTGAAGGCTCTCA
AGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATGGAGCTTACCACCTAAACAAACTTCT
TTTGTGTGGTTTAACTTGAGTTATATGTCCCAGAGATTGTCAAAAAGGATTCCGGAATTT
TTTTTTGACGTTTATGTTTTCTTTCAAGTATTTTCAATGTTGTATTAGTAAACCTCATAA
ATTATTGAATTTAAGTGTTTGCAATTTACTGATTTGAGTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE31TF U 1
AF RR2AI24TF U 1
AF RR2GS52JQB C 72
AF RR2CE31JQ C 111
AF RR2D759TF U 175
BS 1 13 RR2AI24TF
BS 14 14 RR2CE31TF
BS 15 52 RR2AI24TF
BS 53 53 RR2CE31TF
BS 54 152 RR2AI24TF
BS 153 153 RR2CE31TF
BS 154 479 RR2AI24TF
BS 480 480 RR2CE31TF
BS 481 756 RR2AI24TF
BS 757 785 RR2D759TF
BS 786 822 RR2CE31JQ

RD RR2CE31TF 695 0 0
GGGACTTCAACCGACGCACATCTCATCATCAATTCATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGA
TCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACG
CTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGATAATGATGATGACGCAGAGGGACAAGATG
GAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGC
TGAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCGTGTTACCGTTAAGAAGAGCAAGA
ATATCATGTTTGTCATTTCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATCAGACACGTACG
TGATCTTCGGAGAGGCCAAGATCGAGGACTTGAGCTCTCAGATCCAGTCACAAGCGGCCG
AGCAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGATCTCAAAGGGTGAGTCGTCCTCCAGCG
CTGCAGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGAGGAAGGAGTTGAGCCAAAAG
ACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGCAGTGAAGGCTCTCA
AGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATGGAGCTTACCACCTAAACAAACTTCT
TTTGTGTGGTTTAACTTGAGTTATATGTCCCAGAG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2AI24TF 756 0 0
GGGACTTCAACCGGCGCACATCTCATCATCAATTCATCATGACTACCGAAGATAAAGAGA
TCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACG
CTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGATGATGATGATGACGCAGAGGGACAAGATG
GAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGC
TGAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCGTGTTACCGTTAAGAAGAGCAAGA
ATATCATGTTTGTCATTTCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATCAGACACGTACG
TGATCTTCGGAGAGGCCAAGATCGAGGACTTGAGCTCTCAGATCCAGTCACAAGCGGCCG
AGCAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGATCTCAAAGGGTGAGTCGTCCTCCAGCA
CTGCAGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGAGGAAGGAGTTGAGCCAAAAG
ACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGCAGTGAAGGCTCTCA
AGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATGGAGCTTACCACCTAAACAAACTTCT
TTTGTGTGGTTTAACTTGAGTTATATGTCCCAGAGATTGTCAAAAAGGATTCCGGAATTT
TTTTTTGACGTTTATGTTTTCTTTCAAGTATTTTCA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2GS52JQB 715 0 0
AAATTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGCTGATGACAAC
GATGAGGATGACTCCGATGATGATGATGATGACGCAGAGGGACAAGAAGGAGAAGCAGGA
GGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGCTGAAGCTTGGA
ATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCGTGTTACCGTCAAGAAGAGCAAGAATATCATGTTT
GTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATCAGACACGTACGTGATCTTCGGA
GAGGCCAAGATCGAGGACTTAAGCTTTCAGATCCAGTCACAAGCGGCAGAGCAGTTCAAG
GCTCCAGATTTCAGCAGCATGATCTCAAAGGGTGAGTCGTCGTCCAGCGCTGCAG***TG
GTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGAGGAAGGAGTTGAGCCAAAAGACATTGAGTTG
GTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGCAGTGAAGGCTCTCAAGGCTGCTGAT
GGAGATATTGTTTCTGCTATCATGGAGCTTACCACCTAAACAAACTTCTCTTGCGTGGTT
TAACTTGAGTTATATGTCCCAGAGATTGTCAAAAAGGATTC*GGAATTTTTTTTGGACTT
TCATGCTTTCTTTTAAGTATTTTCAATGTTGTATTAGTAAACCTCATAAATTAT
T

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2CE31JQ 712 0 0
GTTGAGGACGCTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGATAATGATGATGACGCAGAG
GGACAAGATGGAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGAGAAGAAGAGTCGC
AAAGCTATGCTGAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCGTGTTACCGTTAAG
AAGAGCAAGAATATCATGTTTGTCATTTCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATCA
GACACGTACGTGATTTTCGGAGAGGCCAAGATCGAGGACTTGAGCTTTCAGATCCAGTCA
CAAGCGGCCGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATTTCAGCAGCATGATCTCAAAGGGTGAGTCG
TCCTCCAGCGCTGCAGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGAGGAAGGAGTT
GAGCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGCAGTG
AAGGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTTTCTGCTATCATGGAGCTTACCACCTAA
ACAAACTTCTTTTGTGTGGTTTAACTTGAGTTATATGTCCCAGAGATTGTCAAAAAGGAT
TCCGGAATTTTTTTTTGACGTTTATGTTTTCTTTCAAGTATTTTCAATGTTGTATTAGTA
AACCTCATAAATTATTGAATTTAAGTGTTTGCAATTTACTGATTTGAGTTCC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2D759TF 611 0 0
G
AGATGGAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGAGAAGAAGAGTCGCAAAGC
TATGCTGAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCGTGTTACCGTTAAGAAGAG
CAAGAATATCATGTTTGTCATTTCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGCCCTGCATCAGACAC
GTACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGATCGAGGACTTGAGCTCTCAGATCCAGTCACAAGC
GGCCGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGATCTCAAAGGGTGAGTCGTCCTC
CAGCGCTGCAGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGAGGAAGGAGTTGAGCC
AAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGCAGTGAAGGC
TCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATGGAGCTTACCACCTAAACAAA
CTTCTTTTGTGTGGTTTAACTTGAGTTATATGTCCCAGAGATTGTCAAAAAGGATTCCGG
AATTTTTTTTTGACGTTTATGTTTTCTTTCAAGTATTTTCAATGTTGTATTAGTAAACCT
CATAAATTAT

QA 2 611 2 611
DS 



CO CL728Contig2 820 4 4 U
GGAAGGTTTCCGCACAGTTCACACACACACTCTCTCGACTTCAACCGACGCACATATCAT
CATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGA
TCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGCTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGATGA
TGATGATGACGCAGAGGGACAAGAAGGAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAG
CGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGCTGAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAG
CCGTGTTACCGTCAAGAAGAGTAAGAATATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGTT
CAAGAGTCCAGCATCAGACACGTACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGATCGAGGACTTAAG
CTCTCAGATCCAGTCACAAGCGGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGAT
CTCAAAGGGTGAGTCGTCATCCAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGA
CGAGGAAGGAGTTGAGCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAG
GCCAAGAGCAGTGAAGGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATGGA
GCTTACCACCTAAACAAACTTGTTTTGTGTGGTTTAACTTGAGTTATGTCCCAGAGATTG
TCAAAAGGATTCGGAATTTTTTTTGACTTTCATGCTTTCTTTTAAGTATTTTCAATGTTG
TATTAGTAAACCTCATAAATTATTGAATTTAAGTGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS52TF U 1
AF RR2EL92TF U 8
AF RR2D578TF U 1
AF RR2D578JQ C 136
BS 1 34 RR2D578TF
BS 35 36 RR2GS52TF
BS 37 724 RR2D578TF
BS 725 820 RR2D578JQ

RD RR2GS52TF 620 0 0
GGAAGGT
TTCCGCACAGTTCACACACACACTCTCTCGACTTCAACCGACGCACATATCATCATCATG
ACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGAT
AAGCCTGAAGTTGAGGACGCTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGATGATGATGATGAT
GACGCAGAGGGACAAGAAGGAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGAGAAG
AAGAGTCGCAAAGCTATGCTGAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCGTGTT
ACCGTCAAGAAGAGCAAGAATATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGC
CCTGCATCAGACACGTACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGATCGAGGACTTAAGCTCTCAG
ATCCAGTCACAAGCGGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGATCTCAAAG
GGTGAGTCGTCGTCCAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGAGGAA
G*AGTTGAGCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAG*AGTGCCTAG*CCAAGA
GCAGTGAAG
CTCT

QA 8 616 8 616
DS 

RD RR2EL92TF 647 0 0
TTCCGCACAGTTCACACACACACTCTCTCGACTTCAACCGACGCACATATCATCATCATG
ACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGAT
AAGCCTGAAGTTGAGGACGCTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGATGATGATGATGAT
GACGCAGAGGGACAAGAAGGAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGAGAAG
AAGAGTCGCAAAGCTATGCTGAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCGTGTT
ACCGTCAAGAAGAGCAAGAATATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGC
CCTGCATCAGACACGTACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGATCGAGGACTTAAGCTCTCAG
ATCCAGTCACAAGCGGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGATCTCAAAG
GGTGAGTCGTCGTCCAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGAGGAA
GGAGTTGAGCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCCAAGA
GCAGTGAAGGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTAT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2D578TF 724 0 0
GGAAGGTTTCCGCACAGTTCACACACACACTCTC**GACTTCAACCGACGCACATATCAT
CATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGA
TCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGCTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGATGA
TGATGATGACGCAGAGGGACAAGAAGGAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAG
CGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGCTGAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAG
CCGTGTTACCGTCAAGAAGAGTAAGAATATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGTT
CAAGAGTCCAGCATCAGACACGTACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGATCGAGGACTTAAG
CTCTCAGATCCAGTCACAAGCGGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGAT
CTCAAAGGGTGAGTCGTCATCCAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGA
CGAGGAAGGAGTTGAGCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAG
GCCAAGAGCAGTGAAGGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATGGA
GCTTACCACCTAAACAAACTTGTTTTGTGTGGTTTAACTTGAGTTATGTCCCAGAGATTG
TCAA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2D578JQ 685 0 0
AGTTGAGGACGCTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGATGATGATGATGACGCAGA
GGGACAAGAAGGAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGAGAAGAAGAGTCG
CAAAGCTATGCTGAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCGTGTTACCGTCAA
GAAGAGTAAGAATATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGTCCAGCATC
AGACACGTACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGATCGAGGACTTAAGCTCTCAGATCCAGTC
ACAAGCGGCAGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGATCTCAAAGGGTGAGTC
GTCATCCAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGAGGAAGGAGTTGA
GCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGCAGTGAA
GGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATGGAGCTTACCACCTAAAC
AAACTTGTTTTGTGTGGTTTAACTTGAGTTATGTCCCAGAGATTGTCAAAAGGATTCGGA
ATTTTTTTTGACTTTCATGCTTTCTTTTAAGTATTTTCAATGTTGTATTAGTAAACCTCA
TAAATTATTGAATTTAAGTGTTTGC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 9

CO CL729Contig1 485 9 10 U
GGAGATATTTATTATTACAATAAGACGAAGTCTGCATTTGTGCAAGTA**AAAAAAATAT
AATCCATACTGAATCATGAGGTCTAGTAATATTTTCATGGTTTCTTGTGTTTTCATTGTA
CTCGTCCTCAGCAATGTTCAAGATGTGAGTGCAAATGCTTGTTATGCCGTGGAAGAACTT
GTGGGTTGCAGTCCCTCTGCATGTCTTGCCAAAGCTAAAACGTATCCACGCATGGCTAAG
AGAGGAGGACTTAAATGCAAATGTGAGAATCCAAAAACGTGTTACTGCGACTGGACATGT
AAACCTTAATAAATAAGTTTTTTATTTTATTTCTAAAATTTACAATTAAATAATACATAA
GAAGCTTGCAAATGTTGAAATCTCAGATAAAACTTTGTGAAGACTGTCGAATATTATTTT
GTACCTAATTGCTTCTTGTTTTATAACTTAGTAAAATTATTTTTATTATTCAAAAAGTGC
TTGGC


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2DZ80TF U 65
AF RR2EA45JQ C 1
AF RR2DX95TF U 157
AF RR2DB39JQ C 2
AF RR2D328TF U 9
AF RR2DB39TF U 2
AF RR2EU65JQ C 18
AF RR2EA45TF U 1
AF RR2EU65TF U 18
BS 1 3 RR2EA45JQ
BS 4 10 RR2DB39TF
BS 11 65 RR2D328TF
BS 66 168 RR2DZ80TF
BS 169 169 RR2DX95TF
BS 170 352 RR2DZ80TF
BS 353 439 RR2DX95TF
BS 440 451 RR2DB39TF
BS 452 467 RR2EA45TF
BS 468 485 RR2EU65TF

RD RR2DZ80TF 288 0 0
G
ATACTGAATCATGAGGTCTAGTAATATTTTCATGGTTTCTTGTGTTTTCATTGTACTCGT
CCTCAGCAATGTTCAAGATGTGAGTGCAAATGCTTGTTATGCC*TGGAAGAACTTGTGGG
TTGCAGTCCCTCTGCATGTCTTGCCAAAGCTAAAACGTATCCACGCATGGCTAAGAGAGG
AGGACTTAAATGCAAATGTGAGAATCCAAAAACGTGTTACTGCGACTGGACATGTAAACC
TTAATAAATAAGTTTTTTATTTTATTTCTAAAATTTACAATTAAATA

QA 2 288 2 288
DS 

RD RR2EA45JQ 467 0 0
GGAGATATTTATTATTACAATAAGACGAAGTCTGCATTTGTGCAAGTAGAAAAAAAATAT
AATCCATACTGAATCATGAGGTCTAGTAATATTTTCATGGTTTCTTGTGTTTTCATTGTA
CTCGTCCTCAGCAATGTTCAAGATGTGAGTGCAAATGCTTGTTATGCCGTGGAAGAACTT
GTGGGTTGCAGTCCCTCTGCATGTCTTGCCAAAGCTAAAACGTATCCACGCATGGCTAAG
AGAGGAGGACTTAAATGCAAATGTGAGAATCCAAAAACGTGTTACTGCGACTGGACATGT
AAACCTTAATAAATAAGTTTTTTATTTTATTTCTAAAATTTACAATTAAATAATACATAA
GAAGCTTGCAAATGTTGAAATCTCAGATAAAACTTTGTGAAGACTGTCGAATATTATTTT
GTACCTAATTGCTTCTTGTTTTATAACTTAGTAAAATTATTTTTATT

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2DX95TF 283 0 0
GCTTGTTATGCCGTGGAAGAACTTGTGGGTTGCAGTCCCTCTGCATGTCTTGCCAAAGCT
AAAACGTATCCACGCATGGCTAAGAGAGGAGGACTTAAATGCAAATGTGAGAATCCAAAA
ACGTGTTACTGCGACTGGACATGTAAACCTTAATAAATAAGTTTTTTATTTTATTTCTAA
AATTTACAATTAAATAATACATAAGAAGCTTGCAAATGTTGAAATCTCAGATAAAACTTT
GTGAAGACTGTCGAATATTATTTTGTACCTAATTGCTTCTTGT

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR2DB39JQ 450 0 0
GG
GATATTTATTATTACAATAAGACGAAGTCTGCATTTGTGCAAGTA**AAAAAAATATAAT
CCATACTGAATCATGAGGTCTAGTAATATTTTCATGGTTTCTTGTGTTTTCATCGTACTC
GTCCTCAGCAATGTTCAAGATGTGAGTGCAAATGCTTGTTATGCCGTGGAAGAACTTGTG
GGTTGCAGTCCCTCTGCATGTCTTGCCAAAGCTAAAACGTATCCACGCATGGCTAAGAGA
GGAGGACTTAAATGCAAATGTGAGAATCCAAAAACGTGTTACTGCGACTGGACATGTAAA
CCTTAATAAATAAGTTTTTTATTTTATTTCTAAAATTTACAATTAAATAATACATAAGAA
GCTTGCAAATGTTGAAATCTCAGATAAAACTTTGTGAAGACTGTCGAATATTATTTTGTA
CCTAATTGTTTCTTGTTTTATAACTTAG

QA 3 450 3 450
DS 

RD RR2D328TF 417 0 0
GG
ATTATTACAATAAGACGAAGTCTGCATTTGTGCAAGTA**AAAAAAATATAATCCATACT
GAATCATGAGGTCTAGTAATATTTTCATGGTTTCTTGTGTTTTCATTGTACTCGTCCTCA
GCAATGTTCAAGATGTGAGTGCAAATGCTTGTTATGCCGTGGAACAACTTGTGGGTTGCA
GTCCCTCTGCATGTCTTGCCAAAGCTAAAACGTATCCACGCATGGCTAAGAGAGGAGGAC
TTAAATGCAAATGTGAGAATCCAAAAACGTGTTACTGCGACTGGACATGTAAACCTTAAT
AAATAAGTTTTTTATTTTATTTCTAAAATTTACAATTAAATAATACATAAGAAGCTTGCA
AATGTTGAAATCTCAGATAAAACTTTGTGAAGACTGTCGAATATTATTTTGTACC

QA 3 417 3 417
DS 

RD RR2DB39TF 450 0 0
GG
GATATTTATTATTACAATAAGACGAAGTCTGCATTTGTGCAAGTA**AAAAAAATATAAT
CCATACTGAATCATGAGGTCTAGTAATATTTTCATGGTTTCTTGTGTTTTCATCGTACTC
GTCCTCAGCAATGTTCAAGATGTGAGTGCAAATGCTTGTTATGCCGTGGAAGAACTTGTG
GGTTGCAGTCCCTCTGCATGTCTTGCCAAAGCTAAAACGTATCCACGCATGGCTAAGAGA
GGAGGACTTAAATGCAAATGTGAGAATCCAAAAACGTGTTACTGCGACTGGACATGTAAA
CCTTAATAAATAAGTTTTTTATTTTATTTCTAAAATTTACAATTAAATAATACATAAGAA
GCTTGCAAATGTTGAAATCTCAGATAAAACTTTGTGAAGACTGTCGAATATTATTTTGTA
CCTAATTGTTTCTTGTTTTATAACTTAG

QA 3 450 3 450
DS 

RD RR2EU65JQ 434 0 0
CAATAAGACGAAGTCTGCATTTGTGCAAGTA**AAAAAAATATAATCCATACTGAATCAT
GAGGTCTAGTAATATTTTCATGGTTTCTTGTGTTTTCATTGTACTCGTCCTCAGCAATGT
TCAAGATGTGAGTGCAAATGCTTGTTATGCCGTGGAAGAACTTGTGGGTTGCAGTCCCTC
TGCATGTCTTGCCAAAGCTAAAACGTATCCACGCATGGCTAAGAGAGGAGGACTTAAATG
CAAATGTGAGAATCCAAAAACGTGTTACTGCGACTGGACATGTAAACCTTAATAAATAAG
TTTTTTATTTTATTTCTAAAATTTACAATTAAATAATACATAAGAAGCTTGCAAATGTTG
AAATCTCAGATAAAACTTTGTGAAGACTGTCGAATATTATTTTGTACCTAATTGCTTCTT
GTTTTATAACTTAG

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR2EA45TF 467 0 0
GGA
GATATTTATTATTACAATAAGACGAAGTCTGCATTTGTGCAAGTAGAAAAAAAATATAAT
CCATACTGAATCATGAGGTCTAGTAATATTTTCATGGTTTCTTGTGTTTTCATTGTACTC
GTCCTCAGCAATGTTCAAGATGTGAGTGCAAATGCTTGTTATGCCGTGGAAGAACTTGTG
GGTTGCAGTCCCTCTGCATGTCTTGCCAAAGCTAAAACGTATCCACGCATGGCTAAGAGA
GGAGGACTTAAATGCAAATGTGAGAATCCAAAAACGTGTTACTGCGACTGGACATGTAAA
CCTTAATAAATAAGTTTTTTATTTTATTTCTAAAATTTACAATTAAATAATACATAAGAA
GCTTGCAAATGTTGAAATCTCAGATAAAACTTTGTGAAGACTGTCGAATATTATTTTGTA
CCTAATTGCTTCTTGTTTTATAACTTAGTAAAATTATTTTTATT

QA 4 467 4 467
DS 

RD RR2EU65TF 468 0 0
CAATAAGACGAAGTCTGCATTTGTGCAAGTA**AAAAAAATATAATCCATACTGAATCAT
GAGGTCTAGTAATATTTTCATGGTTTCTTGTGTTTTCATTGTACTCGTCCTCAGCAATGT
TCAAGATGTGAGTGCAAATGCTTGTTATGCCGTGGAAGAACTTGTGGGTTGCAGTCCCTC
TGCATGTCTTGCCAAAGCTAAAACGTATCCACGCATGGCTAAGAGAGGAGGACTTAAATG
CAAATGTGAGAATCCAAAAACGTGTTACTGCGACTGGACATGTAAACCTTAATAAATAAG
TTTTTTATTTTATTTCTAAAATTTACAATTAAATAATACATAAGAAGCTTGCAAATGTTG
AAATCTCAGATAAAACTTTGTGAAGACTGTCGAATATTATTTTGTACCTAATTGCTTCTT
GTTTTATAACTTAGTAAAATTATTTTTATTATTCAAAAAGTGCTTGGC

QA 1 468 1 468
DS 



AS 2 9

CO CL730Contig1 948 7 13 U
GGGATTCGATCCTTGCTCAAATCAAACTAAAGAAAAGAGAAGATGAGTAGCATTGGAACT
GGATACGATCTGTCGGTGACGACATTCTCACCGGATGGGCGTGTTTTCCAGATCGAGTAC
GCTGCCAAAGCTGTCGACAACAGTGGAACCGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATT
GTTATGGGTGTGGAGAAACTAATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCTAACAGGAGA
ATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCAGCTGATGGCAGG
CAAATTGTTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGCT
GTACCAGTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATCTGTGTACCCTTTAT
TGGTGGCTCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGACCT
CAATTGTACATGATCGAGCCATCGGGCATATCATACAGATATTTTGGTGCCGCCATTGGC
AAAGGCAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGATGACATGC
AAAGAAGGCGTTATTGAAGTGGCCAAAATCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAGAC
AAGGCATTTGAATTGGAGATGAGCTGGATATGTGAGGAGTCTAAACGAGAGCATCAGAAG
GTCCCTGATGATCTTCTGGAAGAAGCAAAGACGGCAGCTAAAACTGCACTCGAGGAGATG
GATGCTGACTAAACTGAGAAAAAATGGGTTTAAATTAGTTTTTTGTTTTGTTTAATGCAA
CGTTTGGTGGTGTTCTGTTGTAAGACTTTGAATTTTGTCTCTAAAGGGGCAACTGTTGCA
GTTTCTCATGAACCTTTCGTCATTATTGATATCGACAGTTTCTTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2CG64TF U 1
AF RR2DS83TF U 39
AF RR2CV03TF U 1
AF RR2BP46TF U 6
AF RR2EA96TF U 168
AF RR2AY58TFB U 233
AF RR2CG64JQ C 257
BS 1 164 RR2CG64TF
BS 165 165 RR2CV03TF
BS 166 563 RR2CG64TF
BS 564 564 RR2CV03TF
BS 565 606 RR2CG64TF
BS 607 607 RR2CV03TF
BS 608 641 RR2CG64TF
BS 642 663 RR2CV03TF
BS 664 664 RR2EA96TF
BS 665 715 RR2CV03TF
BS 716 829 RR2EA96TF
BS 830 943 RR2AY58TFB
BS 944 948 RR2CG64JQ

RD RR2CG64TF 641 0 0
GGGATTCGATCCTTGCTCAAATCAAACTAAAGAAAAGAGAAGATGAGTAGCATTGGAACT
GGATACGATCTGTCGGTGACGACATTCTCACCGGATGGGCGTGTTTTCCAGATCGAGTAC
GCTGCCAAAGCTGTCGACAACAGTGGAACCGTTGTTGGAATCAAATGCAAGGACGGGATT
GTTATGGGTGTGGAGAAACTAATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCTAACAGGAGA
ATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCAGCTGATGGCAGG
CAAATTGTTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGCT
GTACCAGTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATCTGTGTACCCTTTAT
TGGTGGCTCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGACCT
CAATTGTACATGATCGAGCCATCGGGCATATCATACAGATATTTTGGTGCCGCCATTGGC
AAAGGCAAACAAGCTGCTAAAACTGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGATGACATGC
AAAGAAAGCGTTATTGAAGTGGCCAAAATCATTTACAAGCT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2DS83TF 584 0 0
GAAGATGAGTAGCATTGGAACTGGATACGATCTGTCGGTGACGACATTCTCACCGGATGG
GCGTGTTTTCCAGATCGAGTACGCTGCCAAAGCTGTCGACAACAGTGGAACCGTTGTTGG
AATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTTATGGGTGTGGAGAAACTAATAGCATCAAAGATGAT
GCTACCAGGATCTAACAGGAGAATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGC
TGGGCTTGCAACTGATGGCAGGCAAATTGTTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTA
CGAAAGTGTTTATGGGGACGCTGTACCAGTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTA
CGTTCATCTGTGTACCCTTTATTGGTGGCTCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGG
TGGTTATGATAAAGATGGACCTCAATTGTACATGATCGAGCCATCGGGCATATCATACAG
ATATTTTGGTGCCGCCATTGGCAAAGGCAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAACT
GAAATTATCTGAGATGACATGCAAAGAAAGCGTTATTGAAGTGG

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2CV03TF 715 0 0
GGGATTC
GATCCTTGCTCAAATCAAACTAAAGAAAAGAGAAGATGAGTAGCATTGGAACTGGATACG
ATCTGTCGGTGACGACATTCTCACCGGATGGGCGTGTTTTCCAGATCGAGTACGCTGCCA
AAGCTGTCGACAACAGTGGAACCGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTTATGG
GTGTGGAGAAACTAATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCTAACAGGAGAATCCATT
CTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCAGCTGATGGCAGGCAAATTG
TTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGCTGTACCAG
TGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATCTGTGTACCCTTTATTGGTGGC
TCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGACCTCAATTGT
ACATGATCGAGCCATCGGGCATATCATACAGATATTTTGGTGCCGCCATTGGCAAAGGCA
AACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGATGACATGCAAAGAAG
GCGTTATTGAAGTGGCCAAA*TCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAGACAAG*CAT
TTGAATTGGAGATGAGCTGGATATGTGAGGAGTCTAAACGAGAGCATC

QA 8 715 8 715
DS 

RD RR2BP46TF 710 0 0
GG
GATCCTTGCTCAAATCAAACTAAAGAAAAGAGAAGATGAGTAGCATTGGAACTGGATACG
ATCTGTCGGTGACGACATTCTCACCGGATGGGCGTGTTTTCCAGATCGAGTACGCTGCCA
AAGCTGTCGACAACAGTGGAACCGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTTATGG
GTGTGGAGAAATTAATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCTAACAGGAGAATCCATT
CTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCAGCTGATGGCAGGCAAATTG
TTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGCTGTACCAG
TGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATCTGTGTACCCTTTATTGGTGGC
TCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGACCTCAATTGT
ACATGATCGAGCCATCGGGCATATCATACAGATATTTTGGTGCCGCCATTGGCAAAGGCA
AACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGATGACATGCAAAGAAG
GCGTTATTGAAGTGGCCAAAATCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAGACAAG*CAT
TTGAATTGGAGATGAGCTGGATACGTGAGGAGTCTAAACGAGAGCATC

QA 3 710 3 710
DS 

RD RR2EA96TF 675 0 0
G
AAGGACGGGATTGTTATGGGTGTGGAGAAACTAATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGA
TCTAACAGGAGAATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCA
GCTGATGGCAGGCAAATTGTTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTT
TATGGGGACGCTGTACCAGTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATCTG
TGTACCCTTTATTGGTGGCTCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGAT
AAAGATGGACCTCAATTGTACATGATCGAGCCATCGGGCATATCATACAGATATTTTGGT
GCCGCCATTGGCAAAGGCAAACAAGCTGCTAAAACGGAAGTTGAGAAACTGAAATTATCT
GAGATGACATGCAAAGAAGGCGTTATTGAAGTGGCCAAAATCATTTACAAGCTACATGAT
GAAGCCAAAGACAAGGCATTTGAATTGAAGATGAGCTGGATATGTGAGGAGTCTAAACGA
GAACATCAGAAGGTCCCTGATGATCTTCTGGAAGAAGCAAAGACGGCAGCTAAAACTGCA
CTCGAGGAGATGGATGCTGACTAAACTGAGAAAAAATGGGTTTAAATTAGTTTTTTGTTT
T
GTTTAATATCTTT

QA 2 662 2 662
DS 

RD RR2AY58TFB 711 0 0
G
CAGGAGAATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCAGCTGA
TGGCAGGCAAATTGTTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTCATGG
GGACGCTGTACCAGTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATCTGTGTAC
CCTTTATTGGTGGCTCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGA
TGGACCTCAATTGTACATGATCGAGCCATCGGGCATATCATACAGATATTTTGGTGCCGC
CATTGGCAAAGGCAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGAT
GACATGCAAAGAAGGCGTTATTGAAGTGGCCAAAATCATTTACAAGCTACATGATGAAGC
CAAAGACAAGGCATTTGAATTGGAGATGAGCTGGATATGTGAGGAGTCCAAACGAGAGCA
TCAGAAGGTCCCTGATGATCTTCTGGAAGAAGCAAAGACGGCAGCTAAAACTGTACTCGA
GGAGATGGATGCTGACTAAACTGAGAAAAAATGGGTTTAAATTAGTTTTTTGTTTTGTTT
AATGCAACGTTTGGTGGTGTTCTGTTGTAAGACTTTGAATTTTGTCTCTAAAGGGGCAAC
TGTTGCAGTTTCTCATGAACCTTTCGTCATTATTGATATCGACAGTTTCT

QA 2 711 2 711
DS 

RD RR2CG64JQ 692 0 0
GTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCAGCTGATGGCAGGCAAATTGTTGCAAGGG
CCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGCTGTACCAGTGAAGGAAC
TTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATCTGTGTACCCTTTATTGGTGGCTCAGGCCTT
TTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGACCTCAATTGTACATGATCG
AGCCATCGGGCATATCATACAGATATTTTGGTGCCGCCATTGGCAAAGGCAAACAAGCTG
CTAAAACTGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTTATTG
AAGTGGCCAAAATCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAGACAAGGCATTTGAATTGG
AGATGAGCTGGATATGTGAGGAGTCTAAACGAGAGCATCAGAAGGTCCCTGATG*TCTTC
TGGAAGAAGCAAAGACGGCAGCTAAAACTGCACTCGAGGAGATGGATGCTGACTAAACTG
AGAAAAAATGGGTTTAAATTAGTTTTTTGTTTTGTTTAATGCAACGTTTGGTGGTGTTCT
GTTGTAAGACTTTGAATTTTGTCTCTAA*GGGGCAACTGTTGCAGTTTCTCATGAACCTT
TCGTCATTATTGATATCGACAGTTTCTTCTAC

QA 1 692 1 692
DS 



CO CL730Contig2 723 2 3 U
TTTTTTTTAGAGAAACTGTCGATATCAATAATGACGAAAGGTTTCATGAGAAACTGTAAC
AAATTGCCCCTAGAGACAAAATTCAAAGTCTTACAACAGAACCACCACCAAACGTTGCAT
TAAACCAAAAAAAAAAAAACTAATTGAACCCATTTTTTCTCAGTTTAGTCAGCATCCATC
TCCTCGAGTGCAGTTTTAGCTGCCGTCTTTGCTTCTTCCAAAAAATCATCAGGGACCTTC
TGATGCTCTCGTTTAAACTCCTCACATATCCAGCTCATCTCCAATTCAAATGCCTTGTCT
TTGGCTTCATCATGTAGCTTGTAAATGATTTTTGCCACTTCAATAACGCCTTCTTTGCAT
GTCATCTCAAATAATTTCAGTTTCTCAATTTCCGTTTTAGCAGCTTGTTTGCCTTTGCCA
ATGGCAGCACCAAAATATCTGTATGATATGCCCGATGGCTCGATCATGTACAACTGAGGT
CCATCTTTATCATAACCACCAAGAATGACCCCACATCCAAAAGGCCTGAGCCATCAATAA
AGGGTACACAAATGAACGTAGCTTGCAACACGCTCGGAAAGTTCCTTCACTGGTACAGCG
TCCCCATAAACACTTTCGTAACTTCTGGCTTCAGATTTGGCCCTTGCAACAATTTGCCTG
CCATCAGATGCAAGCCCAGCAACAGCCATGCCAGCATGACGATGAACAGAATGGATTCTC
CTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2FO84JQ U 9
AF RR2FO84TF C 1
BS 1 10 RR2FO84TF
BS 11 699 RR2FO84JQ
BS 700 723 RR2FO84TF

RD RR2FO84JQ 691 0 0
AG
AGAAACTGTCGATATCAATAATGACGAAAGGTTTCATGAGAAACTGTAACAAATTGCCCC
TAGAGACAAAATTCAAAGTCTTACAACAGAACCACCACCAAACGTTGCATTAAACCAAAA
AAAAAAAAACTAATTGAACCCATTTTTTCTCAGTTTAGTCAGCATCCATCTCCTCGAGTG
CAGTTTTAGCTGCCGTCTTTGCTTCTTCCAAAAAATCATCAGGGACCTTCTGATGCTCTC
GTTTAAACTCCTCACATATCCAGCTCATCTCCAATTCAAATGCCTTGTCTTTGGCTTCAT
CATGTAGCTTGTAAATGATTTTTGCCACTTCAATAACGCCTTCTTTGCATGTCATCTCAA
ATAATTTCAGTTTCTCAATTTCCGTTTTAGCAGCTTGTTTGCCTTTGCCAATGGCAGCAC
CAAAATATCTGTATGATATGCCCGATGGCTCGATCATGTACAACTGAGGTCCATCTTTAT
CATAACCACCAAGAATGACCCCACATCCAAAAGGCCTGAGCCATCAATAAAGGGTACACA
AATGAACGTAGCTTGCAACACGCTCGGAAAGTTCCTTCACTGGTACAGCGTCCCCATAAA
CACTTTCGTAACTTCTGGCTTCAGATTTGGCCCTTGCAACAATTTGCCTGCCATCAGATG
CAAGCCCAGCAACAGCCATGCCAGCATGA

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR2FO84TF 723 0 0
TTTTTTTTAGAGAAACTGTCGATATCAATAATGACGAAAGGTTTCATGAGAAACTGTAAC
AAATTGCCCCTAGAGACAAAATTCAAAGTCTTACAACAGAACCACCACCAAACGTTGCAT
TAAACCAAAAAAAAAAAAACTAATTGAACCCATTTTTTCTCAGTTTAGTCAGCATCCATC
TCCTCGAGTGCAGTTTTAGCTGCCGTCTTTGCTTCTTCCAGAAGATCATCAGGGACCTTC
TGATGCTCTCGTTTAGACTCCTCACATATCCAGCTCATCTCCAATTCAAATGCCTTGTCT
TTGGCTTCATCATGTAGCTTGTAAATGATTTTTGCCACTTCAATAACGCCTTCTTTGCAT
GTCATCTCAGATAATTTCAGTTTCTCAATTTCCGTTTTAGCAGCTTGTTTGCCTTTGCCA
ATGGCAGCACCAAAATATCTGTATGATATGCCCGATGGCTCGATCATGTACAACTGAGGT
CCATCTTTATCATAACCACCAAGAATGACCCCACATCCAAAAGGCCTGAGCCATCAATAA
AGGGTACACAAATGAACGTAGCTTGCAACACGCTCGGAAAGTTCCTTCACTGGTACAGCG
TCCCCATAAACACTTTCGTAACTTCTGGCTTCAGATTTGGCCCTTGCAACAATTTGCCTG
CCATCAGATGCAAGCCCAGCAACAGCCATGCCAGCATGACGATGAACAGAATGGATTCTC
CTC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 9

CO CL731Contig1 566 9 15 U
TAGTTACTCTGTGTTGTGGGGCAGCGGACGGCACGAGCTTCACCGAAGATCGAAAATGGT
GAACATTCCAAAGACAAAGAAGACTTACTGTAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTT
GCACAAGGTGACCCAGTACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTCG
TTATGACCGCAAGCAATCTGGTTATGGTGGTCAGACCAAACCCGTCTTCCACAAGAAGGC
TAAGACGACCAAGAAGATTGTGCTGAGGCTCCAATGCCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCA
ACACTCAATTAAGAGGTGCAAGCACTTTGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAAC
ATCTCTCTTTTAAGTTGTTTCCTCTATCTTACCTTTTTTTTTT**ATCTTTTGTTTGGTA
CTTGTCTTGCTTGGGCATTCGAAATACGTTTTGAATCTTCAAAAAA*TGGTTATGGACCT
ATGATCTTTTAATTAAGAGGACATTTTCGTATGTGATATCGTGAACCTAGTTATTACAGA
CATTAATGAAATTCATTTGCTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 10 10 

AF RR2H951TF U 18
AF RR2G096JQ C 18
AF RR2G096TF U 18
AF RR2GM57TF U 1
AF RR2E962JQ C 17
AF RR2GE87JQ C 18
AF RR2H951JQ C 18
AF RR2GE87TF U 18
AF RR2E962TF U 17
BS 1 17 RR2GM57TF
BS 18 19 RR2G096TF
BS 20 201 RR2GM57TF
BS 202 202 RR2G096TF
BS 203 385 RR2GM57TF
BS 386 386 RR2G096TF
BS 387 394 RR2GM57TF
BS 395 395 RR2G096TF
BS 396 447 RR2GM57TF
BS 448 448 RR2G096TF
BS 449 514 RR2GM57TF
BS 515 515 RR2G096TF
BS 516 561 RR2GM57TF
BS 562 564 RR2GE87TF
BS 565 566 RR2E962JQ

RD RR2H951TF 449 0 0
GGGGCAGCGGACGGCACGAGCTTCACCGAAGATCGAAAATGGTGAACATTCCAAAGACAA
AGAAGACTTACTGTAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCACAAGGTGACCCAGT
ACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTCGTTATGACCGCAAGCAAT
CTGGTTATGGTGGTCAGACCAAACCCGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACGACCAAGAAGA
TTGTGCTGAGGCTCCAATGCCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCAACACTCAATTAAGAGGT
GCAAGCACTTTGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACATCTCTCTTTTAAGTTG
TTTCCTCTATCTTACCTTTTTTTTTTTTATCTTTTGTTTGGTGCTTGTCTTGCTTGGGCA
TTCCAAATACGTTTTGAATCTTCAAAAAA

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2G096JQ 498 0 0
GGGGCAGCGGACGGCACGAGCTTCACCGAAGATCGAAAATGGTGAACATTCCAAAGACAA
AGAAGACTTACTGTAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCACAAGGTGACCCAGT
ACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTCGTTATGACCGCAAGCAAT
CTGGTTATGGTGGTCAGACCAAACCCGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACGACCAAGAAGA
TTGTGCTGAGGCTCCAATGCCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCAACACTCAATTAAGAGGT
GCAAGCACTTTGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACATCTCTCTTTTAAGTTG
TTTCCTCTATCTTACCTTTTTTTTTTT*ATCTTTTGTTTGGTACTTGTCTTGCTTGGGCA
TTCGAAATACGTTTTGAATCTTCAAAAAA*TGGTTATGGACCTATGATCTTTTAATTAAG
AGGACATTTTCGTATGTG

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2G096TF 498 0 0
GGGGCAGCGGACGGCACGAGCTTCACCGAAGATCGAAAATGGTGAACATTCCAAAGACAA
AGAAGACTTACTGTAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCACAAGGTGACCCAGT
ACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTCGTTATGACCGCAAGCAAT
CTGGTTATGGTGGTCAGACCAAACCCGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACGACCAAGAAGA
TTGTGCTGAGGCTCCAATGCCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCAACACTCAATTAAGAGGT
GCAAGCACTTTGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACATCTCTCTTTTAAGTTG
TTTCCTCTATCTTACCTTTTTTTTTTT*ATCTTTTGTTTGGTACTTGTCTTGCTTGGGCA
TTCGAAATACGTTTTGAATCTTCAAAAAA*TGGTTATGGACCTATGATCTTTTAATTAAG
AGGACATTTTCGTATGTG

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2GM57TF 561 0 0
TAGTTACTCTGTGTTGTTTGGCAGCGGACGGCACGAGCTTCACCGAAGATCGAAAATGGT
GAACATTCCAAAGACAAAGAAGACTTACTGTAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTT
GCACAAGGTGACCCAGTACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTCG
TTATGACCGCAAGCAATCTGGATATGGTGGTCAGACCAAACCCGTCTTCCACAAGAAGGC
TAAGACGACCAAGAAGATTGTGCTGAGGCTCCAATGCCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCA
ACACTCAATTAAGAGGTGCAAGCACTTTGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAAC
ATCTCTCTTTTAAGTTGTTTCCTCTGTCTTACCTCTTTTTTTT**ATCTTTTGTTTGGTA
CTTGTCTTGCTTGGGCATTCGAAATACATTTTGAATCTTCAAAAAA*TGGTTATGGACCT
ATGATCTTTTAATTAAGAGGACATTTTCGTATGTAATATCGTGAACCTAGTTATTACAGA
CATTAATGAAATTCATTTGCT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2E962JQ 550 0 0
G
GGGGCAGCGGACGGCACGAGCTTCACCGAAGATCGAAAATGGTGAACATTCCAAAGACAA
AGAAGACTTACTGTAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCACAAGGTGACCCAGT
ACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTCGTTATGACCGCAAGCAAT
CTGGTTATGGTGGTC*GACCAAACCCGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACGACCAAGAAGA
TTGTGCTGAGGCTCCAATGCCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCAACACTCAATTAAGAGGT
GCAAGCACTTTGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACATCTCTCTTTTAAGCTG
TTTCCTCTATCTTACCTTTTTTTTTT**ATCTTTTGTTTGGTACTTGTCTTGCTTGGGCA
TTCGAAATACGTTTTGAATCTTCAAAAAAATGGTTATGGACCTATGATCTTTTAATTAAG
AGGACATTTTCGTATGTGATATCGTGAACCTAGTTATTACAGACATTAATGAAATTCATT
TGCTTTTAC

QA 2 550 2 550
DS 

RD RR2GE87JQ 547 0 0
GGGGCAGCGGACGGCACGAGCTTCACCGAAGATCGAAAATGGTGAACATTCCAAAGACAA
AGAAGACTTACTGTAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCACAAGGTGACCCAGT
ACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTCGTTATGACCGCAAGCAAT
CTGGATATGGTGGTCAGACCAAACCCGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACGACCAAGAAGA
TTGTGCTGAGGCTCCAATGCCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCAACACTCAATTAAGAGGT
GCAAGCACTTTGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACATCTCTCTTTTAAGTTG
TTTCCTCTGTCTTACCTCTTTTTTTT**ATCTTTTGTTTGGTACTTGTCTTGCTTGGGCA
TTCGAAATACATTTTGAATCTTCAAAAAA*TGGTTATGGACCTATGATCTTTTAATTAAG
AGGACATTTTCGTATGTAATATCGTGAACCTAGTTATTACAGACATTAATGAAATTCATT
TGCTTTT

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2H951JQ 547 0 0
GGGGCAGCGGACGGCACGAGCTTCACCGAAGATCGAAAATGGTGAACATTCCAAAGACAA
AGAAGACTTACTGTAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCACAAGGTGACCCAGT
ACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTCGTTATGACCGCAAGCAAT
CTGGTTATGGTGGTCAGACCAAACCCGTTTTCCACAAGAAGGCTAAGACGACCAAGAAGA
TTGTGCTGAGGCTCCAATGCCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCAACACTCAATTAAGAGGT
GCAAGCACTTTGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACATCTCTCTTTTAAGTTG
TTTCCTCTATCTTACCTTTTTTTTTTTTATCTTTTGTTTGGTGCTTGTCTTGCTTGGGCA
TTCGAAATACGTTTTGAATCTTCAAAAAA*TGGTTATGGACCTATGATCTTTTAATTAAG
AGGACATTTTCGTATGTGATATCGTGAACCTAGTTATTACAGACATTAATGAAATTCATT
TGCTTTT

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2GE87TF 547 0 0
GGGGCAGCGGACGGCACGAGCTTCACCGAAGATCGAAAATGGTGAACATTCCAAAGACAA
AGAAGACTTACTGTAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCACAAGGTGACCCAGT
ACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTCGTTATGACCGCAAGCAAT
CTGGATATGGTGGTCAGACCAAACCCGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACGACCAAGAAGA
TTGTGCTGAGGCTCCAATGCCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCAACACTCAATTAAGAGGT
GCAAGCACTTTGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACATCTCTCTTTTAAGTTG
TTTCCTCTGTCTTACCTCTTTTTTTT**ATCTTTTGTTTGGTACTTGTCTTGCTTGGGCA
TTCGAAATACATTTTGAATCTTCAAAAAA*TGGTTATGGACCTATGATCTTTTAATTAAG
AGGACATTTTCGTATGTAATATCGTGAACCTAGTTATTACAGACATTAATGAAATTCATT
TGCTTTT

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2E962TF 550 0 0
G
GGGGCAGCGGACGGCACGAGCTTCACCGAAGATCGAAAATGGTGAACATTCCAAAGACAA
AGAAGACTTACTGTAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCACAAGGTGACCCAGT
ACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTCGTTATGACCGCAAGCAAT
CTGGTTATGGTGGTC*GACCAAACCCGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACGACCAAGAAGA
TTGTGCTGAGGCTCCAATGCCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCAACACTCAATTAAGAGGT
GCAAGCACTTTGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACATCTCTCTTTTAAGCTG
TTTCCTCTATCTTACCTTTTTTTTTT**ATCTTTTGTTTGGTACTTGTCTTGCTTGGGCA
TTCGAAATACGTTTTGAATCTTCAAAAAAATGGTTATGGACCTATGATCTTTTAATTAAG
AGGACATTTTCGTATGTGATATCGTGAACCTAGTTATTACAGACATTAATGAAATTCATT
TGCTTTT
AC

QA 2 548 2 548
DS 



AS 2 8

CO CL732Contig1 850 2 14 U
AGAAGAAAAGCGCACATAAAACTAAGGAAACATACCAAGAAGATAAGAATATGAACTCAT
AAACGTTCCCGTATCTAAGAACAAAGTGATTGCAGTTTATTAAATCTTCAAAATCAGACT
CTACTCGCAGGAGCTTTCATTGCGAGAGGCATTGTTCTTATTCCAAACAAACACTATTCG
AAAGACAAAACTAAAAGTGTTTTTATCAATTCTCTTTACTACTTCTTGACAAAGGTAACA
CCTTTCGCAATACTCCCTCCAAGCTCTTTCTTCGCCTTCTCTAATCCCATCCTCTCGTAT
TCGTTCAATGGTCCGAGACCATACACTTCATCGACCCCACATCTTCCTAGACGCACCTTT
GATGCGAAGAAGGGAAGCTCAGTCACATGAGAAGCCACAAATGCGCACTCGACAATGTTT
GCATCGCCTCGTAGACCCCTGAGACAAGCATCTGCAAACTTCACTGCTGCGTAAGCCATT
GATAGTGTTGCAGAACCTGCACCAGCTTTTGCCTCGACAACTTCAGTGCCACCATTTTGG
ATGCGGTCTGTGAGATATTCAATCTCTTTCTGAGTGAAAGAGCAAGGAGGCTTCACCTGA
GAAAGCAGAGGCAAGATTGTAACTCCTGCGTGTCCTCCAACGACCGGAACATCAACTTCT
CGAGGATCAAGACTCATTACTTCCGCCACAAACGTATTAGCTCTAACAACATCAAGCATG
GTAACTCCCATGAGTTTCTTCGGATCAAAAGTACCAGCTTTCTTGAAAACCTCGGCTGCG
ATTGGCACGGTGGAGTTCACGGGATTACTGATGATATTGACAATCGCTTTGGGACAGCAC
TTGGCTATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN58JQ U 1
AF RR2D218JQ U 75
BS 1 170 RR2BN58JQ
BS 171 171 RR2D218JQ
BS 172 185 RR2BN58JQ
BS 186 186 RR2D218JQ
BS 187 320 RR2BN58JQ
BS 321 321 RR2D218JQ
BS 322 392 RR2BN58JQ
BS 393 393 RR2D218JQ
BS 394 551 RR2BN58JQ
BS 552 552 RR2D218JQ
BS 553 722 RR2BN58JQ
BS 723 724 RR2D218JQ
BS 725 736 RR2BN58JQ
BS 737 850 RR2D218JQ

RD RR2BN58JQ 736 0 0
AGAAGAAAAGCGCACATAAAACTAAGGAAACATACCAAGAAGATAAGAATATGAACTCAT
AAACGTTCCCGTATCTAAGAACAAAGTGATTGCAGTTTATTAAATCTTCAAAATCAGACT
CTACTCGCAGGAGCTTTCATTGCGAGAGGCATTGTTCTTATTCCAAACAATCACTATTCG
AAAGATAAAACTAAAAGTGTTTTTATCAATTCTCTTTACTACTTCTTGACAAAGGTAACA
CCTTTCGCAATACTCCCTCCAAGCTCTTTCTTCGCCTTCTCTAATCCCATCCTCTCGTAT
TCGTTCAATGGTCCGAGACCGTACACTTCATCGACCCCACATCTTCCTAGACGCACCTTT
GATGCGAAGAAGGGAAGCTCAGTCACATGAGAGGCCACAAATGCGCACTCGACAATGTTT
GCATCGCCTCGTAGACCCCTGAGACAAGCATCTGCAAACTTCACTGCTGCGTAAGCCATT
GATAGTGTTGCAGAACCTGCACCAGCTTTTGCCTCGACAACTTCAGTGCCACCATTTTGG
ATGCGGTCTGTTAGATATTCAATCTCTTTCTGAGTGAAAGAGCAAGGAGGCTTCACCTGA
GAAAGCAGAGGCAAGATTGTAACTCCTGCGTGTCCTCCAACGACCGGAACATCAACTTCT
CGAGGATCAAGACTCATTACTTCCGCCACAAACGTATTAGCTCTAACAACATCAAGCATG
GTGGCTCCCATGAGTT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2D218JQ 776 0 0
CTAAGAACAAAGTGATTGCAGTTTATTAAATCTTCAAAATCAGACTCTACTCGCAGGAGC
TTTCATTGCGAG**GCATTGTTCTTATTCCAAACAAACACTATTCGAAAGACAAAACTAA
AAGTGTTTTTATCAATTCTCTTTACTACTTCTTGACAAAGGTAACACCTTTCGCAATACT
CCCTCCAAGCTCTTTCTTCGCCTTCTCTAATCCCATCCTCTCGTATTCGTTCAATGGTCC
GAGACCATACACTTCATCGACCCCACATCTTCCTAGACGCACCTTTGATGCGAAGAAGGG
AAGCTCAGTCACATGAGAAGCCACAAATGCGCACTCGACAATGTTTGCATCGCCTCGTAG
ACCCCTGAGACAAGCATCTGCAAATTTCACTGCTGCGTAAGCCATTGATAGTGTTGCAGA
ACCTGCACCAGCTTTTGCCTCGACAACTTCAGTGCCACCATTTTGGATGCGGTCTGTGAG
ATATTCAATCTCTTTCTGAGTGAAAGAGCAAGGAGGTTTCACCTGAGAAAGCAGAGGCAA
GATTGTAACTCCTGCGTGTCCTCCAACGACCGGAACATCAACTTCTCGAGGATCAAGACT
CATTACTTCCGCCACAAACGTATTAGCTCTAACAACATCAAGCATGGTAACTCCCATGAG
TTTCTTCGGATCAAAAGTACCAGCTTTCTTGAAAACCTCGGCTGCGATTGGCACGGTGGA
GTTCACGGGATTACTGATGATATTGACAATCGCTTTGGGACAGCACTTGGCTATAG

QA 1 776 1 776
DS 



CO CL732Contig2 1384 6 34 U
GGGGTCGTAAGTACGATGGATCGAGAAGAAGGCGCCGTGAAGGAAGAAGAAGATAAGCTC
TCTGGTTACGCCACGCTTCCCAATACATTATAACCATTTCTGACGTCATCTTCTATCTTT
ATCCAATATATAAAACCTGTCGTGCCGATTCCTCTTCTTCAGACAATCAAATAATCAAAC
CTTCAATCGAAGCCAAAAAAGA*AAAGAAGA**CAGAGCCATGGATGCAAACCAACGAAT
CGCAAGAATCTCTGCTCATCTCAACCCTCCTAACCTCGATCAGAATGGTTCCGGGTCGGA
TCTGAGACGGGTGGGTTGTCGGGCGAAAGGCGGGTCTCCAGGATTCAAAGTGGCGATACT
TGGAGCAGCGGGAGGGATAGGACAGCCACTAGCGATGTTGATGAAAATGAATCCTCTGGT
CTCGCTTCTTCATCTCTACGACGTTGCTAACGCTCCTGGTGTCACCGCTGATATTAGTCA
CATGGACACTAGTGCCATCGTTCGTGGATTTCTCGGGCAACCGCAATTAGAGGAGGCACT
TACGGGTATGGATCTAGTGATTATACCAGCTGGAGTTCCGAGGAAGCCAGGGATGACGAG
GGATGATCTTTTCAACATCAACGCTGGCATCGTGAGGACGCTCTCTGAAGCTATAGCCAA
GTGTTGTCCCAAAGCGATTGTGAATATCATCAGTAATCCGGTGAACTCCACGGTGCCGAT
CGCAGCCGAGGTTTTCAAGAAAGCTGGTACTTTTGATCCTAAGAAACTCATGGGAGTCAC
CATGCTTGATGTTGTTAGAGCTAATACGTTTGTGGCGGAAGTAATGAGTCTTGATCCTCG
AGAAGTTGATGTTCCGGTCGTTGGAGGACACGCAGGAGTTACAATCTTGCCTCTGCTTTC
TCAGGCGAAGCCTCCTTGCTCTTTCACTCAGAAAGAGATTGAATATCTAACAGACCGCAT
CCAAAATGGTGGCACTGAAGTTGTCGAGGCAAAAGCTGGTGCAGGTTCTGCAACACTATC
AATGGCTTACGCAGCAGTGAAGTTTGCAGATGCTTGTCTCAGGGGTCTACGAGGCGATGC
AAACATTGTCGAGTGCGCATTTGTGGCCTCTCATGTGACTGAGCTTCCCTTCTTCGCATC
AAAGGTGCGTCTAGGAAGATGTGGGGTCGATGAAGTGTACGGTCTCGGACCATTGAACGA
ATACGAGAGGATGGGATTAGAGAAGGCGACGAAAGAGCTTGGAGGGAGTATTGCGAAAGG
TGTTACCTTTGTCAAGAAGTAGTAAAGAGAATTGATAAAAACACTTTTAGTTTTATCTTT
CGAATAGTGATTGTTTGGAATAAGAACAATGCCTCTCGCAATGAAAGCTCCTGCGAGTAG
AGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 15 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2C317TF U 328
AF RR2DN16TF U 1
AF RR2CL38TF U 37
AF RR2BN58TF U 159
AF RR2D218TF U 160
AF RR2EI38JQ C 591
BS 1 162 RR2DN16TF
BS 163 163 RR2CL38TF
BS 164 363 RR2DN16TF
BS 364 364 RR2CL38TF
BS 365 397 RR2DN16TF
BS 398 398 RR2CL38TF
BS 399 405 RR2DN16TF
BS 406 406 RR2CL38TF
BS 407 432 RR2DN16TF
BS 433 433 RR2CL38TF
BS 434 526 RR2DN16TF
BS 527 527 RR2CL38TF
BS 528 555 RR2DN16TF
BS 556 556 RR2CL38TF
BS 557 621 RR2DN16TF
BS 622 622 RR2CL38TF
BS 623 624 RR2DN16TF
BS 625 625 RR2CL38TF
BS 626 639 RR2DN16TF
BS 640 640 RR2CL38TF
BS 641 663 RR2DN16TF
BS 664 664 RR2CL38TF
BS 665 683 RR2DN16TF
BS 684 684 RR2CL38TF
BS 685 700 RR2DN16TF
BS 701 701 RR2CL38TF
BS 702 712 RR2DN16TF
BS 713 713 RR2CL38TF
BS 714 723 RR2DN16TF
BS 724 726 RR2CL38TF
BS 727 780 RR2BN58TF
BS 781 781 RR2D218TF
BS 782 852 RR2BN58TF
BS 853 1384 RR2EI38JQ

RD RR2C317TF 109 0 0
AGGCGGGTCTCCAGGATTCAAAGTGGCGATACTTGGCGCAGCGGGAGGGATAGGACAGCC
ACTAGCGATGCTGATGAAGATGAATCCTCTGGTCTCGCTTCTTCA
CCTC

QA 1 105 1 105
DS 

RD RR2DN16TF 726 0 0
GGGGTCGTAAGTACGATGGATCGAGAAGAAGGCGCCGTGAAGGAAGAAGAAGATAAGCTC
TCTGGTTACGCCACGCTTCCCAATACATTATAACCATTTCTGACGTCATCTTCTATCTTT
ATCCAATATATAAAACCTGTCGTGCCGATTCCTCTTCTTCAGGCAATCAAATAATCAAAC
CTTCAATCGAAGCCAAAAAAGA*AAAGAAGA**CAGAGCCATGGATGCAAACCAACGAAT
CGCAAGAATCTCTGCTCATCTCAACCCTCCTAACCTCGATCAGAATGGTTCCGGGTCGGA
TCTGAGACGGGTGGGTTGTCGGGCGAAAGGCGGGTCTCCAGGATTCAAAGTGGCGATACT
TGGCGCAGCGGGAGGGATAGGACAGCCACTAGCGATGCTGATGAAGATGAATCCTCTGGT
CTCGCTTCTTCACCTCTACGACGTTGCTAACGCTCCTGGTGTCACCGCTGATATTAGTCA
CATGGACACTAGTGCCATCGTTCGTGGATTTCTCGGGCAACCGCAACTAGAGGAGGCACT
TACGGGTATGGATCTGGTGATTATACCAGCTGGAGTTCCGAGGAAGCCAGGGATGACGAG
GGATGATCTTTTCAACATCAATGCCGGCATCGTGAGGACACTCTCTGAAGCTATAGCCAA
GTGCTGTCCCAAAGCGATTGTGA*TATCATCAGTAATCCG*TGAACTCCACG*TGCCGAT
CGC
GGT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2CL38TF 690 0 0
GG
GAAGGAAGAAGAAGATAAGCTCTCTGGTTACGCCACGCTTCCCAATACATTATAACCATT
TCTGACGTCATCTTCTATCTTTATCCAATATATAAAACCTGTCGTGCCGATTCCTCTTCT
TCAGACAATCAAATAATCAAACCTTCAATCGAAGCCAAAAAAGA*AAAGAAGA**CAGAG
CCATGGATGCAAACCAACGAATCGCAAGAATCTCTGCTCATCTCAACCCTCCTAACCTCG
ATCAGAATGGTTCCGGGTCGGATCTGAGACGGGTGGGTTGTCGGGCGAAAGGCGGGTCTC
CAGGATTCAAAGTGGCGATACTTGGAGCAGCGGGAGGGATAGGACAGCCACTAGCGATGT
TGATGAAAATGAATCCTCTGGTGTCGCTTCTTCATCTCTACGACGTTGCTAACGCTCCTG
GTGTCACCGCTGATATTAGTCACATGGACACTAGTGCCATCGTTCGTGGATTTCTCGGTC
AACCGCAATTAGAGGAGGCACTTACGGGTATGGATCTAGTGATTATACCAGCTGGAGTTC
CGAGGAAGCCAGGGATGACGAGGGATGATCTTTTCAACATCAACGCTGGCATCGTGAGGA
CGCTCTCTGAAGCTATAGCCAAGTGTTGTCCCAAAGCGATTGTGAATATCATCAGTAATC
CGGTGAACTCCACGGTGCCGATCGCAGC

QA 3 690 3 690
DS 

RD RR2BN58TF 694 0 0
GG
AGACAATCAAATAATCAAACCTTCAATCGAAGCCAAAAAAGA*AAAGAAGA**CAGAGCC
ATGGATGCAAACCAACGAATCGCAAGAATCTCTGCTCATCTCAACCCTCCTAACCTCGAT
CAGAATGGTTCCGGGTCGGATCTGAGACGGGTGGGTTGTCGGGCGAAAGGCGGGTCTCCA
GGATTCAAAGTGGCGATACTTGGAGCAGCGGGAGGGATAGGACAGCCACTAGCGATGTTG
ATGAAAATGAATCCTCTGGTGTCGCTTCTTCATCTCTACGACGTTGCTAACGCTCCTGGT
GTCACCGCTGATATTAGTCACATGGACACTAGTGCCATCGTTCGTGGATTTCTCGGTCAA
CCGCAATTAGAGGAGGCACTTACGGGTATGGATCTAGTGATTATACCAGCTGGAGTTCCG
AGGAAGCCAGGGATGACGAGGGATGATCTTTTCAACATCAACGCTGGCATCGTGAGGACG
CTCTCTGAAGCTATAGCCAAGTGTTGTCCCAAAGCGATTGTGAATATCATCAGTAATCCG
GTGAACTCCACGGTGCCGATCGCAGCCGAGGTTTTCAAGAAAGCTGGTACTTTTGATCCT
AAGAAACTCATGGGAGTCAC*ATGCTTGATGTTGTTAGAGCTAATACGTTTGTGGCGGAA
GTAATGAGTCTTGATCCTCGAGAAGTTGATGT

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR2D218TF 692 0 0
G
AGACAATCAAATAATCAAACCTTTAATCGAAGCAAAAAAAAAGAAAGAAGAAGCAGAGCT
ATGGATGCAAACCAACGAATCGCAAGAATCTCTGCTCATCTCAACCCCCCTAACCTCGAT
CAGATTGGCTCCGGGTCGGATCTGAGACGGGTGGGTTGTCGGGCGAAAGGCGGGTCTCCC
GGATTCAAAGTGGCGATACTTGGAGCAGCGGGAGGGATAGGACAACCACTAGCGATGTTG
ATGGAAATGAATCCTCTGGTCTCGCTTCTCCATCTCTACGACGTTGCTAACGCTCCTGGT
GTCACCGCTGATATTAGTCACATGGACACTAGTGCCATCGTTTGTGGATTTCTCGGGCAA
CCGCAGTTAGAGGAGGCACTAACGGGTATGGATCTAGTGATTATACCAGCTGGAGTTCCG
AGGAAGCCAGGGATGACGAGGGATGATCTTTTCAACATCAACGCTGGAATCGTGAGGACG
CTCTCTGAAGCTATAGCCAAGTGCTGTCCCAAAGCGATTGTCAATATCATCAGTAATCCC
GTGAACTCCACCGTGCCAATCGCAGCCGAGGTTTTCAAGAAAGCTGGTACTTTTGATCCG
AAGAAACTCATGGGAGTTACCATGCTTGATGTTGTTAGAGCTAATACGTTTGTGGCGGAA
GTAATGAGTCTTGATCCTCGAGAAGTTGATG

QA 2 692 2 692
DS 

RD RR2EI38JQ 794 0 0
GGATGACGAGGGATGATCTTTTCAACATCAACGCTGGCATCGTGAGGACGCTCTCTGAAG
CTATAGCCAAGTGTTGTCCCAAAGCGATTGTGAATATCATCAGTAATCCGGTGAACTCCA
CGGTGCCGATCGCAGCCGAGGTTTTCAAGAAAGCTGGTACTTTTGATCCTAAGAAACTCA
TGGGAGTCACCATGCTTGATGTTGTTAGAGCTAATACGTTTGTGGCGGAAGTAATGAGTC
TTGATCCTCGAGAAGTTGATGTTCCGGTCGTTGGAGGACACGCAGGAGTTACAATCTTGC
CTCTGCTTTCTCAGGCGAAGCCTCCTTGCTCTTTCACTCAGAAAGAGATTGAATATCTAA
CAGACCGCATCCAAAATGGTGGCACTGAAGTTGTCGAGGCAAAAGCTGGTGCAGGTTCTG
CAACACTATCAATGGCTTACGCAGCAGTGAAGTTTGCAGATGCTTGTCTCAGGGGTCTAC
GAGGCGATGCAAACATTGTCGAGTGCGCATTTGTGGCCTCTCATGTGACTGAGCTTCCCT
TCTTCGCATCAAAGGTGCGTCTAGGAAGATGTGGGGTCGATGAAGTGTACGGTCTCGGAC
CATTGAACGAATACGAGAGGATGGGATTAGAGAAGGCGACGAAAGAGCTTGGAGGGAGTA
TTGCGAAAGGTGTTACCTTTGTCAAGAAGTAGTAAAGAGAATTGATAAAAACACTTTTAG
TTTTATCTTTCGAATAGTGATTGTTTGGAATAAGAACAATGCCTCTCGCAATGAAAGCTC
CTGCGAGTAGAGTC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 9

CO CL733Contig1 1342 9 12 U
GGGACACACAAACCCAAAGTTTCATTAGCATTAACCTCAGAATGAAAATGGGTAGTGCTA
AATCAGCCATACTAATCTTCTTATTATCAGTGGGCATCGCATCTTGCGCCATTGCCATGG
ACATGTCCGTCGTTTCCTACGATGACGATCACCAAGTAACCGCTGGTCCCGGCCGCCGCA
GCAGCGTTTTTGATTCCGAGGCATCGTTGATATTCGAGTCATGGATGGTCAAGCACGGGA
AGGTGTACGAGTCCGTCGCCGAGAAGGAACGGCGTTTAACGATTTTCGAGGACAACCTTC
GTTTCATCACTAGCCGCAACGCTGAAAACTTTGGTTATCGGCTTGGTTTGAACCGGTTTG
CAGATTTGTCCCTCCATGAATACGGACACATTTGCCATGGGGCTGATCCGAGACCACCTA
AGAACCATGTTTTCATGACTAGCAGCAACCGATACAAGACTAGTGCTGGTGATGTGCTTC
CTAAGTCTGTTGACTGGAGGAAGGAAGGAGCAGTGACTGAAGTCAAAGATCAAGGCCATT
GCAGGAGTTGTTGGGCTTTCTCGACGGTGGGGGCAGTGGAAGGCTTAAACAAGATCGTGA
CAGGAGAGTTAGTCACTTTGTCCGAGCAAGATTTGATCAACTGTAACAAAGAAAATAATG
GTTGCGGAGGAGGTAAAGTCGAGACTGCCTATGAGTACATAGTTAACAATGGTGGTCTTG
GTACAAACAGAGATTATCCTTATAAGGCTGTTAATGGAGTATGCCACGCCGGCCTCAAGG
AAAACAACAAGAATGTTATGATTGATGGGTATGAGAATTTGCCTTCCAACGACGAGCTTT
CTCTAATGAAAGCGGTTGCTCACCAGCCTGTAACAGCCATTATCGATTCAAGCAGCAGAG
AATTTCAGCTTTATGAATCAGGAGTATTTGATGGAACGTGCGAAACAAACCTAAACCATG
GAGTTGTTGTGGTTGGGTATGGAACCGACAACAGTCGTGACTATTGGATCGTGAGGAACT
CATGGGGAAACACTTGGGGAGAAGCTGGCTACATGAAGATGGCTCGCAACATTGCAAACC
CAAGAGGATTATGTGGTATCGCGATGCGAGCTGCATACCCCCTCAAGAACTCGGCTTCTA
ACGATATAAGGTCCATGGCCTAATAATTTGAACTAAATGTATGTGTTATGCGAGGGTTCG
AGTGAGCGAACAACCTATTCGACTTTGAAGCAAAAATAATGTTGTCAATGGGTTTTATTT
TGTAATATATTTTGTAATTGTTGATTTGGAGTATTGTAATATTATGAATATTTCGTTTGG
GAATAATATTTCCTCTTTCGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS84TF U 1
AF RR2H941TF U 6
AF RR2CT69TF U 4
AF RR2BP74TF U 4
AF RR2H518TF U 6
AF RR2CT69JQ C 906
AF RR2BP74JQ C 588
AF RR2H941JQ C 595
AF RR2H518JQB C 585
BS 1 65 RR2DS84TF
BS 66 66 RR2BP74TF
BS 67 411 RR2DS84TF
BS 412 412 RR2BP74TF
BS 413 530 RR2DS84TF
BS 531 654 RR2BP74TF
BS 655 655 RR2H518TF
BS 656 701 RR2BP74TF
BS 702 726 RR2H518TF
BS 727 1196 RR2H518JQB
BS 1197 1197 RR2CT69JQ
BS 1198 1342 RR2H518JQB

RD RR2DS84TF 530 0 0
GGGACACACAAACCCAAAGTTTCATTAGCATTAACCTCAGAATGAAAATGGGTAGTGCTA
AATCAACCATACTAATCTTCTTATTATCAGTGGGCATCGCATCTTGCGCCATTGCCATGG
ACATGTCCGTCGTTTCCTACGATGACGATCACCAAGTAACCGCTGGTCCCGGCCGCCGCA
GCAGCGTTTTTGATTCCGAGGCATCGTTGATATTCGAGTCATGGATGGTCAAGCACGGGA
AGGTGTACGAGTCCGTCGCCGAGAAGGAACGGCGTTTAACGATTTTCGAGGACAACCTTC
GTTTCATCACTAGCCGCAACGCTGAAAACTTTGGTTATCGGCTTGGTTTGAACCGGTTTG
CAGATTTGTCCCTCCATGAATACGGACACATTTGCCATGGGGCTGATCCGATACCACCTA
AGAACCATGTTTTCATGACTAGCAGCAACCGATACAAGACTAGTGCTGGTGATGTGCTTC
CTAAGTCTGTTGACTGGAGGAAGGAAGGAGCAGTGACTGAAGTCAAAGAT

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2H941TF 534 0 0
GG
ACAAACCCAAAGTTTCATTAGCATTAACCTCAGAATGAAAATGGGTAGTGCTAAATCAGC
CATACTAATCTTCTTTTTATCAGTGGGCATCGCATCTTGCGCCATTGCCATGGACATGTC
CGTCGTTTCCTACGATGACGATCACCAAGTAACCGCTGGTCCCGGCCGCCGCAGCAGCGT
TTTTGATTCCGAGGCATCGTTGATATTCGAGTCATGGATGGTCAAGCACGGGAAGGTGTA
CGAGTCCGTCGCCGAGAAGGAACGGCGTTTAACGATTTTCGAGGACAACCTTCGTTTCAT
CACTAGCCGCAACGCTGAAAACTTTGGTTATCGGCTTGGTTTGAACCGGTTTGCAGATTT
GTCCCTCCATGAATACGGACACATTTGCCATGGGGCTGATCCGAGACCACCTAAGAACCA
TGTTTTCATGACTAGCAGCAACCGATACAAGACTAGTGCTGGTGATGTGCTTCCTAAGTC
TGTTGACTGGAGGAAGGAAGGAGCAGTGACTGAAGTCAAAGATCAAG
CCATT

QA 3 529 3 529
DS 

RD RR2CT69TF 647 0 0
GGAC
ACAAACCCAAAGTTTCATTAGCATTAACCTCAGAATGAAAATGGGTAGTGCTAAATCAGC
CATACTAATCTTCTTATTATCAGTGGGCATCGCATCTTGCGCCATTGCCATGGACATGTC
CGTCGTTTCCTACGATGACGATCACCAAGTAACCGCTGGTCCCGGCCGCCGCAGCAGCGT
TTTTGATTCCGAGGCATCGTTGATATTCGAGTCATGGATGGTCAAGCACGGGAAGGTGTA
CGAGTCCGTCGCCGAGAAGGAACGGCGTTTAACGATTTTCGAGGACAACCTTCGTTTCAT
CACTAGCCGCAACGCTGAAAACTTTGGTTATCGGCTTGGTTTGAACCGGTTTGCAGATTT
GTCCCTCCATGAATACGGACACATTTGCCATGGGGCTGATCCGAGACCACCTAAGAACCA
TGTTTTCATGACTAGCAGCAACCGATACAAGACTAGTGCTGGTGATGTGCTTCCTAAGTC
TGTTGACTGGAGGAAGGAAGGAGCAGTGACTGAAGTCAAAGATCAAGGCCATTGCAGGAG
TTGTTGGGCTTTCTCGACGGTGGGGGCAGTGGAAGGCTTAAACAAGATCGTGACAGGAGA
GTTAGTCACTTTGTCCGAGCAAGATTTGATCAACTGTAACAAA

QA 5 647 5 647
DS 

RD RR2BP74TF 698 0 0
GGAC
ACAAACCCAAAGTTTCATTAGCATTAACCTCAGAATGAAAATGGGTAGTGCTAAATCAGC
CATACTAATCTTCTTATTATCAGTGGGCATCGCATCTTGCGCCATTGCCATGGACATGTC
CGTCGTTTCCTACGATGACGATCACCAAGTAACCGCTGGTCCCGGCCGCCGCAGCAGCGT
TTTTGATTCCGAGGCATCGTTGATATTCGAGTCATGGATGGTCAAGCACGGGAAGGTGTA
CGGGTCCGTCGCCGAGAAGGAACGGCGTTTAACGATTTTCGAGGACAACCTTCGTTTCAT
CACTAGCCGCAACGCTGAAAACTTTGGTTATCGGCTTGGTTTGAACCGGTTTGCAGATTT
GTCCCTCCATGAATACGGACACATTTGCCATGGGGCTGATCCGAGACCACCTAAGAACCA
TGTTTTCATGACTAGCAGCAACCGATACAAGACTAGTGCTGGTGATGTGCTTCCTAAGTC
TGTTGACTGGAGGAAGGAAGGAGCAGTGACTGAAGTCAAAGATCAAGGCCATTGCAGGAG
TTGTTGGGCTTTCTCGACGGTGGGGGCAGTGGAAGGCTTAAACAAGATCGTGACAGGAGA
GTTAGTCACTTTGTCCGAGCAAGATTTGATCAACTGTAACAAAGAAA*TAATGGTTGCGG
AGGAGGTAAAGTCGAGACTGCCTATGAGTACATA

QA 5 698 5 698
DS 

RD RR2H518TF 733 0 0
GG
ACAAACCCAAAGTTTCATTAGCATTAACCTCAGAATGAAAATGGGTAGTGCTAAATCAGC
CATACTAATCTTCTTATTATCAGTGGGCATCGCATCTTGCGCCATTGCCATGGACATGTC
CGTCGTTTCCTACGATGACGATCACCAAGTAACCGCTGGTCCCGGCCGCCGCAGCAGCGT
TTTTGATTCCGAGGCATCGTTGATATTCGAGTCATGGATGGTCAAGCACGGGAAGGTGTA
CGAGTCCGTCGCCGAGAAGGAACGGCGTTTAACGATTTTCGAGGACAACCTTCGTTTCAT
CACTAGCCGCAACGCTGAAAACTTTGGTTATCGGCTTGGTTTGAACCGGTTTGCAGATTT
GTCCCTCCATGAATACGGACACATTTGCCATGGGGCTGATCCGAGACCACCTAAGAACCA
TGTTTTCATGACTAGCAGCAACCGATACAAGACTAGTGCTGGTGATGTGCTTCCTAAGTC
TGTTGACTGGAGGAAGGAAGGAGCAGTGACTGAAGTCAAAGATCAAGGCCATTGCAGGAG
TTGTTGGGCTTTCTCGACGGTGGGGGCAGTGGAAGGCTTAAACAAGATCATGACAGGAGA
GTTAGTCACTTTGTCCGAGCAAGATTTGATCAACTGTAACAAAGAAAATAATGGTTGCGG
AGGAG*TAAAGTCGAGACTGCCTATGAGTACATAGTTAACAATGGTGGTCTTGGTACAA
CAGAGATATCCT

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR2CT69JQ 416 0 0
CAGCTTTATGAATCAGGAGTATTTGATGGAACGTGCGAAACAAACCTAAACCATGGAGTT
GTTGTGGTTGGGTATGGAACCGACAACAGTCGTGACTATTGGATCGTGAGGAACTCATGG
GGAAACACTTGGGGAGAAGCTGGCTACATGAAGATGGCTCGCAACATTGCAAACCCAAGA
GGATTATGTGGTATCGCGATGCGAGCTGCGTACCCCCCCAAGAACTCGGCTTCTAACGAT
ATAAGGTCCATGGCCTAATAATTTGAACTAAATGTATGTGTTATGCGAGGGTTCGAGTGA
GCGAACAACCTATTTGACTTTGAAGCAAAAATAATGTTGTCAATGGGTTTTATTTTGTAA
TATATTTTGTAATTGTTGATTTGGAGTATTGTAATATTATGAATATTTCGTTTGG
G

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR2BP74JQ 704 0 0
AACAAGATCGTGACAGGAGAGTTAGTCACTTTGTCCGAGCAAGATTTGATCAACTGTAAC
AAAGAAAATAATGGTTGCGGAGGAGGTAAAGTCGAGACTGCCTATGAGTACATAGTTAAC
AATGGTGGTCTTGGTACAAACAGAGATTATCCTTATAAGGCTGTTAATGGAGTATGCCAC
GCCGGCCTCAAGGAAAACAACAAGAATGTTATGATTGATGGGTATGAGAATTTGCCTTCC
AACGACGAGCTTTCTCTAATGAAAGCGGTTGCTCACCAGCCTGTAACAGCCATTATCGAT
TCAAGCAGCAGAGAATTTCAGCTTTATGAATCAGGAGTATTTGATGGAACGTGCGAAACA
AACCTAAACCATGGAGTTGTTGTGGTTGGGTATGGAACCGACAACAGTCGTGACTATTGG
ATCGTGAGGAACTCATGGGGAAACTCTTGGGGAGAAGCTGGCTACATGAAGATGGCTCGC
AACATTGCAAACCCAAGAGGATTATGTGGTATCGCGATGCGAGCTGCATACCCCCTCAAG
AACTCGGCTTCTAACGATATAAGGTCCATGGCCTAATAATTTGAACTAAATGTATGTGTT
ATGCGAGGGTTCGAGTGAGCGAACAACCTATTCGACTTTGAAGCAAAAATAATGTTGTCA
ATGGGTTTTATTTTGTAATATATTTTGTAATTGTTGATTTGGAG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2H941JQ 727 0 0
TCGTGACAGGAGGGTTAGCCACTTTGTCCGAGCAAGATTTGATCAACTGTAACAAAGAAA
ATAATGGTTGCGGAGGAGGTAAAGTCGAGACTGCCTATGAGTACATAGTTAACAATGGTG
GTCTTGGTACAAACAGAGATTATCCTTATAAGGCTGTTAATGGAGTATGCCACGCCGGCC
TCAAGGAAAACAACAAGAATGTTATGATTGATGGGTATGAGAATTTGCCTTCCAACGACG
AGCTTTCTTTAATGAAAGCGGTTGCTCACCAGCCTGTAACAGCCATTATCGATTCAAGCA
GCAGAGAATTTCAGCTTTATGAATCAGGAGTATTTGATGGAACGTGCGAAACGAACCTAA
ACCATGGAGTTGTTGTGGTTGGGTATGGAACCGACAACAGTCGTGACTATTGGATCGTGA
GGAACTCATGGGGAAACACTTGGGGAGAAGCTGGCTACATGAAGATGGCTCGCAACATTG
CAAACCCAAGAGGATTATGTGGTATCGCGATGCGAGCTGCATACCCCCTCAAGAACTCGG
CTTCTAACGATATAAGGTCCATGGCCTAATAATTTGAACTAAATGTATGTGTTATGCGAG
GGTTCGAGTGAGCGAACAACCTATTCGACTTTGAAGCAAAAATAATGTTGTCAATGGGTT
TTATTTTGTAATATATTTTGTAATTGTTGATTTGGAGTATTGTAATATTATGAATATTTC
GTTTGG
C

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2H518JQB 758 0 0
TTAAACAAGATCATGACAGGAGAGTTAGTCACTTTGTCCGAGCAAGATTTGATCAACTGT
AACAAAGAAAATAATGGTTGCGGAGGAGGTAAAGTCGAGACTGCCTATGAGTACATAGTT
AACAATGGTGGTCTTGGTACAAACAGAGATTATCCTTATAAGGCTGTTAATGGAGTATGC
CACGCCGGCCTCAAGGAAAACAACAAGAATGTTATGATTGATGGGTATGAGAATTTGCCT
TCCAACGACGAGCTTTCTCTAATGAAAGCGGTTGCTCACCAGCCTGTAACAGCCATTATC
GATTCAAGCAGCAGAGAATTTCAGCTTTATGAATCAGGAGTATTTGATGGAACGTGCGAA
ACAAACCTAAACCATGGAGTTGTTGTGGTTGGGTATGGAACCGACAACAGTCGTGACTAT
TGGATCGTGAGGAACTCATGGGGAAACACTTGGGGAGAAGCTGGCTACATGAAGATGGCT
CGCAACATTGCAAACCCAAGAGGATTATGTGGTATCGCGATGCGAGCTGCATACCCCCTC
AAGAACTCGGCTTCTAACGATATAAGGTCCATGGCCTAATAATTTGAACTAAATGTATGT
GTTATGCGAGGGATCGAGTGAGCGAACAACCTATTCGACTTTGAAGCAAAAATAATGTTG
TCAATGGGTTTTATTTTGTAATATATTTTGTAATTGTTGATTTGGAGTATTGTAATATTA
TGAATATTTCGTTTGGGAATAATATTTCCTCTTTCGTG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 9

CO CL734Contig1 1306 9 31 U
TCTTCTTACATCGATCGTGTTCAGAAATCATATTCATTACACAACTCTTTCTCTCTCTCT
GACTTGGATTCTTTTATAACATGTGGTGATCCCTACAGAGACGAGTAGAAGCAAAGAATA
TTAATAGAAATGATGAAAATGAATGTAGGAACGACGCCCTCCGTTGTCGGCAGCGTCGGT
GGAGTTAGCGGCAATGAATGGGAGTCCCGACCTGGAGGAATGGTTGTGCAAAGACGAACG
GATCAGAGCTCCGATTCGCCACGTGTCATCCGCGTCCGGGTCAAATACTTGTCGGTTTAC
CACGAGATCAACATCAACTCCCAATCTAGCTTCGGAGAGTTGAAGAAGGTGTTGTCTGGT
CAGACCGGACTTCACCATGAAGACATGAAGATTCTGTACAAAGACAAGGAGAGAGATTCG
AAGATGTTTCTTGATCTTTGCGGTGTTAAAGATCGGTCAAAGCTTGTTCTTAAGGAAGAT
CCAATGGCTCAGGAGAAACGTCTCCTCGAGAAAAGGAAAAACGCCGTCGTTGAGAAAGCT
ATGAAATCAATCGCCGACATTAGTCTCGAAGTCGACAGGCTCGCCGGACAGGTGTCGGCG
TTCGAGACGGTGATTAATAAAGGAGGTAAAGTTGAAGAGAAGAGTCTCGTGAATCTGATT
GAGATGTTGATGAATCAGTTGCTGAGACTTGACGCCATAACTGCTGATGGAGATGTGAAG
CTAAAGAGGAAGATGCAGGTGAAAAGAGTTCAGACGTACGTTGAAACACTTGATGTCTTG
AAAGTCAAAAACTCGACCAAAAAAGTCGACATTAACAAGTCGGTGCGCCACAAACCGCAA
ACGCAGACGCAATATCAGCAACGCGATTTGTTATCGTTTGTTGATGAAGAGGTGGAGGAG
GAGCCTAGGAGGGACTCGGGCGCGTCGTCCTCTTCGGGTACTCCAGCGATTGGAACGAAT
AATTGGGAGACGATGCTTGATTCCACATCGGCGGCTAAGGCACCGGTTGAACCGGTTAAA
CCGGTCCCTCCAAGATTCAAATGGGAGTTCTTCGATTAAGCTATAATACACTATCATACG
TACACGATAAATATGTATTTTTCTCCGATTTCATGTGATTTGTGATTGATCTTGGCAATT
TTATTTTGGTTTGTTTAGAATATTTTTTGTTGGTCTTCCCTTGAAGTCAATTCACAAATA
ACAAGGGGAGTTTCAACAAATATAGTTTTTTCATCATCATCATAATCCCATCATTGTAAT
ACCTAAAGATATTTGGATTTTCTTTACTAATACAGTAAAAGTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 30 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 10 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E940TF U 262
AF RR2DY80TF U 277
AF RR2GK74TF U 1
AF RR2BV35TF U 87
AF RR2ER39TF U 94
AF RR2GK74JQ C 601
AF RR2BV35JQ C 524
AF RR2ER39JQ C 676
AF RR2BT76JQ C 718
BS 1 144 RR2GK74TF
BS 145 145 RR2BV35TF
BS 146 161 RR2GK74TF
BS 162 162 RR2BV35TF
BS 163 255 RR2GK74TF
BS 256 256 RR2BV35TF
BS 257 321 RR2GK74TF
BS 322 323 RR2BV35TF
BS 324 508 RR2GK74TF
BS 509 509 RR2BV35TF
BS 510 512 RR2GK74TF
BS 513 513 RR2BV35TF
BS 514 528 RR2GK74TF
BS 529 530 RR2BV35TF
BS 531 652 RR2GK74TF
BS 653 653 RR2BV35TF
BS 654 724 RR2GK74TF
BS 725 725 RR2BV35TF
BS 726 738 RR2GK74TF
BS 739 739 RR2BV35JQ
BS 740 744 RR2BV35TF
BS 745 745 RR2ER39TF
BS 746 777 RR2BV35TF
BS 778 790 RR2ER39TF
BS 791 791 RR2BV35JQ
BS 792 803 RR2ER39TF
BS 804 1146 RR2BV35JQ
BS 1147 1147 RR2GK74JQ
BS 1148 1228 RR2BV35JQ
BS 1229 1229 RR2ER39JQ
BS 1230 1306 RR2BV35JQ

RD RR2E940TF 214 0 0
G
GTGTCATCCGCGTCCGGGTCAAATACTTGTCGGTTTACCACGAGATCAACATCAACTCCC
AATCTAGCTTCGGAGAGTTGAAGAAGGTGTTGTCTGGTCAGACCGGACTTCACCATGAAG
ACATGAAGATTCTGTACAAAGACAAGGAGAGAGATTCGAAGATGTTTCTTGATCTTTGCG
GTGTTAAAGATCGGTCAAAGCTTGTTCTTAAGG

QA 2 214 2 214
DS 

RD RR2DY80TF 245 0 0
GGA
GTCAAATACTTGTCGGTTTACCACGAGATCAACATCAACTCCCAATCTAGCTTCGGAGAG
TTGAAGAAGGTGTTGTCTGGTCAGACCGGACTTCACCATGAAGACATGAAGATTCTGTAC
AAAGACAAGGAGAGAGATTCGAAGATGTTTCTTGATCTTTGCGGTGTTAAAGATCGGTCA
AAGCTTGTTCTTAAGGAAGATCCAATGGCTCAGGAGAAACGTCTCCTCGAGAAAAGGAAA
AA

QA 4 245 4 245
DS 

RD RR2GK74TF 742 0 0
TCTTCTTACATCGATCGTGTTCAGAAATCATATTCATTACACAACTCTTTCTCTCTCTCT
GACTTGGATTCTTTTATAACATGTGGTGATCCCTACAGAGACGAGTAGAAGCAAAGAATA
TTAATAGAAATGATGAAAATGAATATAGGAACGACGCCCTCTGTTGTCGGCAGCGTCGGT
GGAGTTAGCGGCAATGAATGGGAGTCCCGACCTGGAGGAATGGTTGTGCAAAGACGAACG
GATCAGAGCTCCGATGCGCCACGTGTCATCCGCGTCCGGGTCAAATACTTGTCGGTTTAC
CACGAGATCAACATCAACTCCTGATCTAGCTTCGGAGAGTTGAAGAAGGTGTTGTCTGGT
CAGACCGGACTTCACCATGAAGACATGAAGATTCTGTACAAAGACAAGGAGAGAGATTCG
AAGATGTTTCTTGATCTTTGCGGTGTTAAAGATCGGTCAAAGCTTGTTCTTAAGGAAGAT
CCAATGGCTCAGGAGAAACGTCTCCTCGCGAAGAGGAAAAACGCCGTCACTGAGAAAGCT
ATGAAATCAATCGCCGACATTAGTCTCGAAGTCGACAGGCTCGCCGGACAGGTGTCGGCG
TTCGAGACGGTGATTAATAAAGGAGGTAAAGTTGAAGAGAAGAGTCTCGTGA*TCTGATT
GAGATGTTGATGAATCAGTTGCTGAGACTTGACGCCATAACTGCTGATGGAGATGTGAAG
CTAA*GAGGAAGATGCAG*G
GA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2BV35TF 691 0 0
TGTTCGGTCAGAGACG
GAGTAGAAGCAAAGAATATTAATAGAAATGATGAAAATGAATGTAGGAACGACGCCCTCC
GTTGTCGGCAGCGTCGGCGGAGTTAGCGGCAATGAATGGGAGTCCCGACCTGGAGGAATG
GTTGTGCAAAGACGAACGGATCAGAGCTCCGATTCGCCACGTGTCATCCGCGTCCGGGTC
AAATACTTGTCGGTTTACCACGAGATCAACATCAACTCCCAATCTAGCTTCGGAGAGTTG
AAGAAGGTGTTGTCTGGTCAGACCGGACTTCACCATGAAGACATGAAGATTCTGTACAAA
GACAAGGAGAGAGATTCGAAGATGTTTCTTGATCTTTGCGGTGTTAAAGATCGGTCAAAG
CTTGTTCTTAAGGAAGATCCAATGGCTCAGGAGAAACGTCTCCTCGAGAAAAGGAAAAAC
GCCGTCGTTGAGAAAGCTATGAAATCAATCGCCGACATTAGTCTCGAAGTCGACAGGCTC
GCCGGACAGGTGTCGGCGTTCGAGACGGTGATTAATAAAGGAGGTAAAGTTGAAGAGAAG
AGTCTCGTGAATCTGATTGAGATGTTGATGAATCAGTTGCTGAGACTTGACGCCATAACT
GCTGATGGAGATGTGAAGCTAAAGAGGAAGATGCAG*TGAAA*GAGTTCAGACGTACGTT
GAAACACTTGATGTC

QA 17 691 17 691
DS 

RD RR2ER39TF 710 0 0
GGAGAGACG
GAGTAGAAGCAAAGAATATTAATAGAAATGATGAAAATGAATGTAGGAACGACGCCCTCC
GTTGTCGGCAGCGTCGGTGGAGTTAGCGGCAATGAATGGGAGTCCCGACCTGGAGGAATG
GTTGTGCAAAGACGAACGGATCAGAGCTCCGATTCGCCACGTGTCATCCGCGTCCGGGTC
AAATACTTGTCGGTTTACCACGAGATCAACATCAACTCCCAATCTAGCTTCGGAGAGTTG
AAGAAGGTGTTGTCTGGTCAGACCGGACTTCACCATGAAGACATGAAGATTCTGTACAAA
GACAAGGAGAGAGATTCGAAGATGTTTCTTGATCTTTGCGGTGTTAAAGATCGGTCAAAG
CTTGTTCTTAAGGAAGATCCAATGGCTCAGGAGAAACGTCTCCTCGAGAAAAGGAAAAAC
GCCGTCGTTGAGAAAGCTATGAAATCAATCGCCGACATTAGTCTCGAAGTCGACAGGCTC
GCCGGACAGGTGTCGGCGTTCGAGACGGTGATTAATAAAGGAGGTAAAGTTGAAGAGAAG
AGTCTCGTGAATCTGATTGAGATGTTGATGAATCAGTTGCTGAGACTTGACGCCATAACT
GCTGATGGAGATGTGAAGCTAAAGAGGAAGATGCAG*TGAAAAGAGTTCAGACGTACGTT
GAAACACTTGATGTCTTGAAAGTCAAAA*CTCGACCAAAAA

QA 10 710 10 710
DS 

RD RR2GK74JQ 575 0 0
TTCGAGACGGTGATTAATAAAGGAGGTAAAGTTGAAGAGAAGAGTCTCGTGAATCTGATT
GAGATGTTGATGAATCAGTTGCTGAGACTTGACGCCATAACTGCTGATGGAGATGTGAAG
CTAAAGAGGAAGATGCAGGTGAAAAGAGTTCAGACGTACGTTGAAACACTTGATGTCTTG
AAAGTCAAAAACTCGACCAAAAAAGTCGACATTAACAAGTCGGTGCGCCACAAACCGCAA
ACGCAGACGCAATATCAGCAACGCGATTTGTTATCGTTTGTTGATGAAGAGGTGGAGGAG
GAGCCTAGGAGGGACTCGGGCGCGTCGTCCTCTTCGGGTACTCCAGCGATTGGAACGAAT
AATTGGGAGACGATGCTTGATTCCACATCGGCGGCTAAGGCACCGGTTGAACCGGTTAAA
CCGGTCCCTCCAAGATTCAAATGGGAGTTCTTCGATTAAGCTATAATACACTATCATACG
TACACGATAAATATGTATTTTTCTCCGATTTCATGTGATTTGTGATTGATCTTGGCAATT
TTTTTTTGGTTTGTTTAGAATATTTTTTGTTGGTC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2BV35JQ 783 0 0
CCGTCGT
TGAGAAAGCTATGAAATCAATCGCCGACATTAGTCTCGAAGTCGACAGGCTCGCCGGACA
GGTGTCGGCGTTCGAGACGGTGATTAATAAAGGAGGTAAAGTTGAAGAGAAGAGTCTCGT
GAATCTGATTGAGATGTTGATGAATCAGTTGCTGAGACTTGACGCCATAACTGCTGATGG
AGATGTGAAGCTAAAGAGGAAGATGCAGGTGAAAAGAGTTCAGACGTACGTTGAAACACT
TGATGTCTTGAAAGTCAAAAACTCGACCAAAAAAGTCGACATTAACAAGTCGGTGCGCCA
CAAACCGCAAACGCAGACGCAATATCAGCAACGCGATTTGTTATCGTTTGTTGATGAAGA
GGTGGAGGAGGAGCCTAGGAGGGACTCGGGCGCGTCGTCCTCTTCGGGTACTCCAGCGAT
TGGAACGAATAATTGGGAGACGATGCTTGATTCCACATCGGCGGCTAAGGCACCGGTTGA
ACCGGTTAAACCGGTCCCTCCAAGATTCAAATGGGAGTTCTTCGATTAAGCTATAATACA
CTATCATACGTACACGATAAATATGTATTTTTCTCCGATTTCATGTGATTTGTGATTGAT
CTTGGCAATTTTATTTCGGTTTGTTTAGAATATTTTTTGTTGGTCTTCCCTTGAAGTCAA
TTCACAAATAACAAGGGGAGTTTCAACAAATATAGTTTCTTCATCATCATCATAATCCCA
TCATTGTAATACCTAAAGATATTTGGATTTTCTTTACTAATACAGTAAAAGTTACG

QA 8 783 8 783
DS 

RD RR2ER39JQ 630 0 0
CAGTTGCTGAGACTTGACGCCATAACTGCTGATGGAGATGTGAAGCTAAAGAGGAAGATG
CAGGTGAAAAGAGTTCAGACGTACGTTGAAACACTTGATGTCTTGAAAGTCAAAAACTCG
ACCAAAAAAGTCGACATTAACAAGTCGGTGCGCCACAAACCGCAAACGCAGACGCAATAT
CAGCAACGCGATTTGTTATCGTTTGTTGATGAAGAGGTGGAGGAGGAGCCTAGGAGGGAC
TCGGGCGGGTCGTCCTTTTCGGGTACTCCAGCGATTGGAACGAATAATTGGGAGACGATG
CTTGATTCCACATCGGCGGCTAAGGCACCGGTTGAACCGGTTAAACCGGTCCCTCCAAGA
TTCAAATGGGAGTTTTTCGATTAAGCTATAATACACTATCATACGTACACGATAAATATG
TATTTTTTTCCGATTTCATGTGATTTGTGATTGATCTTGGCAATTTTATTTTGGTTTGTT
TAGAATATTTTTTGTTGGTCTTCCCTTGAAGTCAATTCACAAATAACAAGGGGAGTTTCA
ACAAATATAGTTTTTTCATCATCATCATAATCCCATCATTGTAATACCTAAAGATATTTG
GATTTTCTTTACTAATACAGTAAA
GTTACG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2BT76JQ 568 0 0
AAGCTAAAGAGGAAGATGCAGGTGAAAAGAGTTCAGACGTACGTTGAAACACTTGATGTC
TTGAAAGTCAAAAACTCGACCAAAAAAGTCGACATTAACAAGTCGGTGCGCCACAAACCG
CAAACGCAGACGCAATATCAGCAACGCGATTTGTTTTCGTTTGTTGATGAAGAGGTGGAG
GAGGAGCCTAGGAGGGACTCGGGCGGGTTGTCCTTTTCGGGTACTCCAGCGATTGGAACG
AATAATTGGGAGACGATGCTTGATTCCACATCGGCGGGTAAGGCACCGGTTGAACCGGTT
AAACCGGTCCCTCCAAGATTCAAATGGGAGTTTTTCGATTAAGCTATAATACACTATCAT
ACGTACACGATAAATATGTATTTTTTTCCGATTTCATGTGATTTGTGATTGATCTTGGCA
ATTTTATTTTGGTTTGTTTAGAATATTTTTTGTTGGTCTTCCCTTGAAGTCAATTCACAA
ATAACAAGGGGAGTTTCAACAAATATAGTTTTTTCATCATCATCATAATCCCATCATTGT
AATACCTAAAGATATTTGGATTTTCTTT

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 9

CO CL735Contig1 560 9 13 U
GGATACAATAAAAATAACATACCTTCAAATTCAAAAAAAAA**AGAAAGAGAAAAAGTAA
AAAAAGTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTCGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCAAATTCAGGGAGAAAATCTTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGATTTGCA
TCGAAAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCGCGTGTGTT
TCTGCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCCTATGCCA
AATAAATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTAT
TATAATAAGTTTTACATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTTGAT
AAAATCAATGAATCTTTTTGATAGGTTAATAATGTAAGAATAACATTAATTTTATTACAA
TATATTAACCATTTTAACAA


BQ
40 40 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 
55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AN65TF U 1
AF RR2CD65JQ C 4
AF RR2CD65TF U 4
AF RR2DO52TF U -2
AF RR2FW85TF U 1
AF RR2B945JQ C 1
AF RR2CJ77JQ C 1
AF RR2CJ77TF U 1
AF RR2B945TF U 1
BS 1 142 RR2AN65TF
BS 143 143 RR2CD65TF
BS 144 205 RR2AN65TF
BS 206 206 RR2CD65TF
BS 207 291 RR2AN65TF
BS 292 292 RR2CD65TF
BS 293 298 RR2AN65TF
BS 299 299 RR2CD65TF
BS 300 444 RR2AN65TF
BS 445 480 RR2CD65TF
BS 481 509 RR2FW85TF
BS 510 542 RR2CJ77TF
BS 543 560 RR2B945TF

RD RR2AN65TF 444 0 0
GGATACAATAAAAATAACATACCTTCAAATTCAAAAAAAAA**AGAAAGAGAAAAAGTAA
AAAAAGTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTCGAGGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCAAATTCAGGGAGAAAATCCTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGATTTGCA
TCGAAAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCACGTGTGCT
TCTGCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCCTATGCCA
AATAAATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTAT
TATAATAAGTTTTACATATAATTG

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR2CD65JQ 477 0 0
G
ACAATAAAAATAACATACCTTCAAATTCAAAAAAAAA**AGAAAGAGAAAAAGTAAAAAA
AGTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTCTTAT
TATCTTTTCTGCTTTCGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGAGGCA
GCCAAATTCAGGGAGAAAATCTTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGATTTGCATCGA
AAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCGCGTGTGTTTCTG
CCACTTTCCATGTTAATCAACAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCCTATGCCAAATA
AATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTATA
ATAAGTTTTACATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTTGAT

QA 2 477 2 477
DS 

RD RR2CD65TF 477 0 0
G
ACAATAAAAATAACATACCTTCAAATTCAAAAAAAAA**AGAAAGAGAAAAAGTAAAAAA
AGTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTCTTAT
TATCTTTTCTGCTTTCGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGAGGCA
GCCAAATTCAGGGAGAAAATCTTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGATTTGCATCGA
AAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCGCGTGTGTTTCTG
CCACTTTCCATGTTAATCAACAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCCTATGCCAAATA
AATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTATA
ATAAGTTTTACATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTTGAT

QA 2 477 2 477
DS 

RD RR2DO52TF 481 0 0
GGCTC
ATACAATAAAAATAACATACCTTCAAATTCAAAAAAAAA***GAAAGAGAGAAAGTAAAA
AAAGTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTCTT
ATTATCTTTTCTGCTTTCGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCACGCAAGAGG
CAGCCAAATTCAGGGAGAAAATCTTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGGTTTGCATC
GAAAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCGCGTGTGTTTT
TGCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCCTATGCCAAA
TAAATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTA
TAATAAGTTTTACATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTTG

QA 6 481 6 481
DS 

RD RR2FW85TF 513 0 0
GGATACAATAAAAATAACATACCTTCAAATTCAAAAAAAAA***GAAAGAGAAAAAGTAA
AAAAAGTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTCGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCAAATTCAGGGAGAAAATCTTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGATTTGCA
TCGAAAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCGCGTGTGTT
TCTGCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCCTATGCCA
AATAAATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTAT
TATAATAAGTTTTACATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTTGAT
AAAATCAATGAATCTTTTTGATAGGTTAA
AAAA

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2B945JQ 558 0 0
GGATACAATAAAAATAACATACCTTCAAATTCAAAAAAAAA***GAAAGAGAAAAAGTAA
AAAAAGTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCTTCACCTTCCTCTTCGTTGTTC
TTATCATCTTTTCTGCTTTCGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCAAATTCAGGGAGAAAATCTTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGATTTGCA
TCGAAAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCGCGTGTGTT
TCTGCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCCTATGCCA
AATAAATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGACTAAAGTTCATTTCAATATCAT
TATAATAAGTTTTACATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTTGAT
AAAATCAATGAATCTTTTTGATAGGTTAATAATGTAAGAATAACATTAATTTTATTACAA
TATATTAACCATTTTAAC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2CJ77JQ 543 0 0
GGATACAATAAAAATAACATACCTTCAAATTCAAAAAAAAAAAAGAAAGAGAAAAAGTAA
AAAAAATAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTCGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCAAATTCAGGGAGAAAATCTTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGATTTGCA
TCGAAAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCGCGTGTGTT
TCTGTCACTTTCCATGTTAATCAGCAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCCTATGCCA
AATAAATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTAT
TATAATAAGTTTTACATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTTGAT
AAAATCAATGAATCTTTTTGATAGGTTAATAATGTAAGAATAACATTAATTTTATTACAA
TA
C

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2CJ77TF 543 0 0
GGATACAATAAAAATAACATACCTTCAAATTCAAAAAAAAAAAAGAAAGAGAAAAAGTAA
AAAAAATAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTC
TTATTATCTTTTCTGCTTTCGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCAAATTCAGGGAGAAAATCTTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGATTTGCA
TCGAAAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCGCGTGTGTT
TCTGTCACTTTCCATGTTAATCAGCAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCCTATGCCA
AATAAATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTAT
TATAATAAGTTTTACATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTTGAT
AAAATCAATGAATCTTTTTGATAGGTTAATAATGTAAGAATAACATTAATTTTATTACAA
TA
C

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2B945TF 560 0 0
GGATACAATAAAAATAACATACCTTCAAATTCAAAAAAAAA***GAAAGAGAAAAAGTAA
AAAAAGTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCTTCACCTTCCTCTTCGTTGTTC
TTATCATCTTTTCTGCTTTCGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGA
GGCAGCCAAATTCAGGGAGAAAATCTTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGATTTGCA
TCGAAAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCGCGTGTGTT
TCTGCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCCTATGCCA
AATAAATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGACTAAAGTTCATTTCAATATCAT
TATAATAAGTTTTACATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTTGAT
AAAATCAATGAATCTTTTTGATAGGTTAATAATGTAAGAATAACATTAATTTTATTACAA
TATATTAACCATTTTAACAA

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 8

CO CL736Contig1 737 8 24 U
GGATTGAGATTTCATCTTCTTCTTTCTTGGTTTAGAAAACTTCAAACAAACCCAAAATTT
CTTATAAAA*AAAAATTCTCTCCAGAGAGATGGCTGTGGGAATCCTCGAGGTTGATCTGA
TCAGTGGGAAAGGTCTCAAACGATCTGAACTTTTTGGTAAGATAGATCCGTATGTTGAGA
TCCATTACAAAGGACAAACCCGCAAAAGCAGCGTTGATAAAGATGGAGGTAGAAATCCTA
CATGGAATGAGAAACTGAAATGGAGAGCAGAGTTTCCTGGCTCCGGCGGCGACTACAAAC
TCGTTGTCAAAGTCATGGACCATGATACTTTCTCCGCCGACGATCCCATCGGCGAAGCTA
CAGTATACGTGAAAGAGTTATTGGAAATGGGAGTGGAGAAAGGAACGGCTGAGCTAAGGC
CGACCAAGTACAACGTTGTCGACACCGATCTCTCATTTGTCGGCGAGATTCTCCTTGGAG
TATCTTACTCTGTTATGCAAGACAGAGGAATCGATGGAGAAGAGTTTGGTGGATGGAAGC
ATAGCCAGTTTGATTAATTTCTCCTTTAGATTGCTCGTTTATACTTTCCAGGTTTTACAT
TTAGTGTGAAAACATTAAGCATTTCTTATTTTCGACAAAAAAACTCTTAACACATATTGT
ATGTCATCTGTGTGTTGTGGTGAATCTCATTGTATTTAATTTCAGTATTCAAGAAAGTGT
AAAACGTTGAGCCAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 10 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 35 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2E794JQ C 1
AF RR2BR95TF U 46
AF RR2B924TF U 29
AF RR2E794TF U 1
AF RR2G987TF U 38
AF RR2C302JQ C 38
AF RR2C302TF U 38
AF RR2G987JQ C 38
BS 1 28 RR2E794TF
BS 29 45 RR2B924TF
BS 46 69 RR2BR95TF
BS 70 70 RR2B924TF
BS 71 75 RR2BR95TF
BS 76 76 RR2B924TF
BS 77 302 RR2BR95TF
BS 303 303 RR2B924TF
BS 304 304 RR2BR95TF
BS 305 305 RR2B924TF
BS 306 349 RR2BR95TF
BS 350 350 RR2B924TF
BS 351 362 RR2BR95TF
BS 363 363 RR2B924TF
BS 364 460 RR2BR95TF
BS 461 461 RR2B924TF
BS 462 472 RR2BR95TF
BS 473 473 RR2B924TF
BS 474 640 RR2BR95TF
BS 641 641 RR2B924TF
BS 642 680 RR2BR95TF
BS 681 701 RR2B924TF
BS 702 719 RR2E794TF
BS 720 737 RR2C302TF

RD RR2E794JQ 720 0 0
GGATTGAGATTTCATCTTCTTCTTTCTTGGTTTAGAAAACTTCAAACAAACCCAAAATTT
CTTATAAAAGAAAAAATCTCTCCAGAG**ATGGCTGTGGGAATCCTCGAGGTTGATCTGA
TCAGTGGGAAAGGTCTCAAACGATCTGAACTTTTTGGTAAGATAGATCCGTATGTTGAGA
TCCATTACAAAGGACAAACCCGCAAAAGCAGCGTTGATAAAGATGGAGGTAGAAATCCTA
CATGGAATGAGAAACTGAAATGGAGAGCAGAGTTTCCTGGCTCCGGCGGCGACTACAAAC
TCATCGTCAAAGTCATGGACCATGATACTTTCTCAGCCGACGATCCCATTGGCGAAGCTA
CAATATACGTGAAAGAGTTATTGGAAATGGGAGTGGAGAAAGGAACGGCTGAGCTAAGGC
CGACCAAGTACAACGTTGTTGACACCGATCTCTCATTTGTCGGCGAGATTCTTCTTGGAG
TATCTTACTCTGTTATGCAAGACAGAGGAATCGATGGAGAAGAGTTTGGTGGATGGAAGC
ATAGCCAGTTTGATTAATTTCTCCGTTAGATTGCTCGTTTATACTTTCCAGGTTTTACAT
TTAGTGTGAAAACATTAAGCATTTCTTATTTTCGACAAAAAAACTCTTAACACATATTGT
ATGTCATCTGTGTGTTGTGGTGAATCTCATTGTATTTAATTTCAGTATTCAAGAAAGTG
C

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2BR95TF 635 0 0
ACAAACCCAAAATTTCTTATAAAAGAAAAAATCTCTCCAGAGAGATGGCTGTGGGAATCC
TCGAGGTTGATCTGATCAGTGGGAAAGGTCTCAAACGATCTGAACTTTTTGGTAAGATAG
ATCCGTATGTTGAGATCCATTACAAAGGACAAACCCGCAAAAGCAGCGTTGATAAAGATG
GAGGTAGAAATCCTACATGGAATGAGAAACTGAAATGGAGAGCAGAGTTTCCTGGCTCCG
GCGGCGACTACAAACTCATCGTCAAAGTCATGGACCATGATACTTTCTCCGCCGACGATC
CCATTGGCGAAGCTACAATATACGTGAAAGAGTTATTGGAAATGGGAGTGGAGAAAGGAA
CGGCTGAGCTAAGGCCGACCAAGTACAACGTTGTCGACACCGATCTCTCATTTGTTGGCG
AGATTCTTCTTGGAGTATCTTACTCTGTTATGCAAGACAGAGGAATCGATGGAGAAGAGT
TTGGTGGATGGAAGCATAGCCAGTTTGATTAATTTCTCCTTTAGATTGCTCGTTTATACT
TTCCAGGTTTTACATTTAGTGTGAAAACATTAAGCATTTCTTATTTTCGACAAAAGAACT
CTTAACACATATTGTATGTCATCTGTGTGTTGTGG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2B924TF 673 0 0
GGTTTAGAAAACTTCAAACAAACCCAAAATTTCTTATAAAA**AAAATTCTCTCCAGAGA
GATGGCTGTGGGAATCCTCGAGGTTGATCTGATCAGTGGGAAAGGTCTCAAACGATCTGA
ACTTTTTGGTAAGATAGATCCGTATGTTGAGATCCATTACAAAGGACAAACCCGCAAAAG
CAGCGTTGATAAAGATGGAGGTAGAAATCCTACATGGAATGAGAAACTGAAATGGAGAGC
AGAGTTTCCTGGCTCCGGCGGCGACTACAAACTCGTTGTCAAAGTCATGGACCATGATAC
TTTCTCCGCCGACGATCCCATCGGCGAAGCTACAGTATACGTGAAAGAGTTATTGGAAAT
GGGAGTGGAGAAAGGAACGGCTGAGCTAAGGCCGACCAAGTACAACGTTGTCGACACCGA
TCTCTCATTTGTCGGCGAGATTCTCCTTGGAGTATCTTACTCTGTTATGCAAGACAGAGG
AATCGATGGAGAAGAGTTTGGTGGATGGAAGCATAGCCAGTTTGATTAATTTCTCCTTTA
GGTTGCTCGTTTATACTTTCCAGGTTTTACATTTAGTGTGAAAACATTAAGCATTTCTTA
TTTTCGACAAAAAAACTCTTAACACATATTGTATGTCATCTGTGTGTTGTGGTGAATCTC
ATTGTATTTAATT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2E794TF 720 0 0
GGATTGAGATTTCATCTTCTTCTTTCTTGGTTTAGAAAACTTCAAACAAACCCAAAATTT
CTTATAAAAGAAAAAATCTCTCCAGAG**ATGGCTGTGGGAATCCTCGAGGTTGATCTGA
TCAGTGGGAAAGGTCTCAAACGATCTGAACTTTTTGGTAAGATAGATCCGTATGTTGAGA
TCCATTACAAAGGACAAACCCGCAAAAGCAGCGTTGATAAAGATGGAGGTAGAAATCCTA
CATGGAATGAGAAACTGAAATGGAGAGCAGAGTTTCCTGGCTCCGGCGGCGACTACAAAC
TCATCGTCAAAGTCATGGACCATGATACTTTCTCAGCCGACGATCCCATTGGCGAAGCTA
CAATATACGTGAAAGAGTTATTGGAAATGGGAGTGGAGAAAGGAACGGCTGAGCTAAGGC
CGACCAAGTACAACGTTGTTGACACCGATCTCTCATTTGTCGGCGAGATTCTTCTTGGAG
TATCTTACTCTGTTATGCAAGACAGAGGAATCGATGGAGAAGAGTTTGGTGGATGGAAGC
ATAGCCAGTTTGATTAATTTCTCCGTTAGATTGCTCGTTTATACTTTCCAGGTTTTACAT
TTAGTGTGAAAACATTAAGCATTTCTTATTTTCGACAAAAAAACTCTTAACACATATTGT
ATGTCATCTGTGTGTTGTGGTGAATCTCATTGTATTTAATTTCAGTATTCAAGAAAGTG
C

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2G987TF 681 0 0
AACTTCAAACAAACCCAAAATTTCTTATAAAA**AAAATTCTCTCCAGAGAGATGGCTGT
GGGAATCCTCGAGGTTGATCTGATCAGTGGGAAAGGTCTCAAACGATCTGAACTTTTTGG
TAAGATAGATCCGTATGTTGAGATCCATTACAAAGGACAAACCCGCAAAAGCAGCGTTGA
TAAAGATGGAGGTAGAAATCCTACATGGAATGAGAAACTGAAATGGAGAGCAGAGTTTCC
TGGCTCCGGCGGCGACTACAAACTCGTTGTCAAAGTCATGGACCATGATACTTTCTCCGC
CGACGATCCCATCGGCGAAGCTACAGTATACGTGAAAGAGTTATTGGAAATGGGAGTGGA
GAAAGGAACGGCTGAGCTAAGGCCGACCAAGTACAACGTTGTCGACACCGATCTCTCATT
TGTCGGCGAGATTCTCCTTGGAGTATCTTACTCTGTTATGCAAGACAGAGGAATCGATGG
AGAAGAGTTTGGTGGATGGAAGCATAGCCAGTTTGATTAATTTCTCCTTTAGATTGCTCG
TTTATACTTTCCAGGTTTTACATTTAGTGTGAAAACATTAAGCATTTCTTATTTTCGACA
AAA*AACTCTTAACACATATTGTATGTCATCTGTGTGTTGTGGTGAATCTCATTGTATTT
AATTTCAGTATTCA
GAAAGTG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2C302JQ 696 0 0
AACTTCAAACAAACCCAAAATTTCTTATAAAA**AAAATTCTCTCCAGAGAGATGGCTGT
GGGAATCCTCGAGGTTGATCTGATCAGTGGGAAAGGTCTCAAACGATCTGAACTTTTTGG
TAAGATAGATCCGTATGTTGAGATCCATTACAAAGGACAAACCCGCAAAAGCAGCGTTGA
TAAAGATGGAGGTAGAAATCCTACATGGAATGAGAAACTGAAATGGAGAGCAGAGTTTCC
TGGCTCCGGCGGCGACTACAAACTCGTTGTCAAAGTCATGGACCATGATACTTTTTCCGC
CGACGATCCCATCGGCGAGGCTACAGTATACGTGAAAGAGTTATTGGAAATGGGAGTGGA
GAAAGGAACGGCTGAGCTAAGGCCGACCAAGTACAACGTTGTCGACACCGATCTCTCATT
TGTCGGCGAGATTCTCCTTGGAGTATCTTACTCTGTTATGCAAGACAGAGGAATCGATGG
AGAAGAGTTTGGTGGATGGAAGCATAGCCAGTTTGATTAATTTCTCCTTTAGATTGCTCG
TTTATACTTTCCAGGTTTTACATTTAGTGTGAAAACATTAAGCATTTCTTATTTTCGACA
AAAAAACTCTTAACACATATTGTATGTCATCTGTGTGTTGTGGTGAATCTCATTGTATTT
AATTTCAGTATTCAAGAAAGTGTAAAACGTTGAGCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2C302TF 700 0 0
AACTTCAAACAAACCCAAAATTTCTTATAAAA**AAAATTCTCTCCAGAGAGATGGCTGT
GGGAATCCTCGAGGTTGATCTGATCAGTGGGAAAGGTCTCAAACGATCTGAACTTTTTGG
TAAGATAGATCCGTATGTTGAGATCCATTACAAAGGACAAACCCGCAAAAGCAGCGTTGA
TAAAGATGGAGGTAGAAATCCTACATGGAATGAGAAACTGAAATGGAGAGCAGAGTTTCC
TGGCTCCGGCGGCGACTACAAACTCGTTGTCAAAGTCATGGACCATGATACTTTCTCCGC
CGACGATCCCATCGGCGAGGCTACAGTATACGTGAAAGAGTTATTGGAAATGGGAGTGGA
GAAAGGAACGGCTGAGCTAAGGCCGACCAAGTACAACGTTGTCGACACCGATCTCTCATT
TGTCGGCGAGATTCTCCTTGGAGTATCTTACTCTGTTATGCAAGACAGAGGAATCGATGG
AGAAGAGTTTGGTGGATGGAAGCATAGCCAGTTTGATTAATTTCTCCTTTAGATTGCTCG
TTTATACTTTCCAGGTTTTACATTTAGTGTGAAA*CATTAAGCATTTCTTATTTTCGACA
AAA*AACTCTTAACACATATTGTATGTCATCTGTGTGTTGTGGTGAATCTCATTGTATTT
AATTTCAGTATTCAAGAAAGTGTAAAACGTTGAGCCAAAA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2G987JQ 697 0 0
AACTTCAAACAAACCCAAAATTTCTTATAAAA*AAAAATTCTCTCCAGAGAGATGGCTGT
GGGAATCCTCGAGGTTGATCTGATCAGTGGGAAAGGTCTCAAACGATCTGAACTTTTTGG
TAAGATAGATCCGTATGTTGAGATCCATTACAAAGGACAAACCCGCAAAAGCAGCGTTGA
TAAAGATGGAGGTAGAAATCCTACATGGAATGAGAAACTGAAATGGAGAGCAGAGTTTCC
TGGCTCCGGCGGCGACTACAAACTCGTTGTCAAAGTCATGGACCATGATACTTTCTCCGC
CGACGATCCCATCGGGGAAGCTACAGTATACGTGAAAGAGTTATTGGAAATGGGAGTGGA
GAAAGGAACGGCTGAGCTAAGGCCGACCAAGTACAACGTTGTCGACACCGATCTCTCATT
TGTCGGCGAGATTCTCCTTGGAGTATCTTACTCTGTTATGCAAGACAGAGGAATCGATGG
AGAAGAGTTTGGTGGATGGAAGCATAGCCAGTTTGATTAATTTCTCCTTTAGATTGCTCG
TTTATACTTTCCAGGTTTTACATTTAGTGTGAAAACATTAAGCATTTCTTATTTTCGACA
AAAAAACTCTTAACACATATTGTATGTCATCTGTGTGTTGTGGTGAATCTCATTGTATTT
AATTTCAGTATTCAAGAAAGTGCAAAACGTTGAGCC
G

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 9

CO CL737Contig1 791 9 6 U
GGGACATCTCACTAGTCGTCTCTAGCAAATCATGGCATCTCCTGTAGAGAAACAACTCCT
CAAATCCCTCTTCTCATTCTTCTTATTAGTTCTACTCTTTTCCGATACCGTTTTCTCGTC
CCGAAAAACATTGGATCAGAGAAAGCCATGCAAACACTTCTCTTTCTACTTCCATGACAT
CCTCTACGATGGCGACAACGTAGCAAACGCAACCTCGGCCGCTATCGTGAGCCCTCCGGG
GTTAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATTTTTGATGGCCCCATAACAATGGACAA
GAACTATCTCTCAGAACCCGTGGCTCGCGCGCAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAGAC
GGACTTCAACTCGTGGTTTTCCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACGGAACACAAAGGCAC
ATTGAATGTAATGGGTGCTGACTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTTGG
TGGGACTGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGTATCGCTACATTCGTGACGGATATATTTCA
AGGGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATATTAAACTATATGAATGTTACTAACTAAT
TACATGTTTTATTTTGAAAATTGTGTGCTGACACAGAGATAAAATGTGTTCCTATTGATA
AGTAAGTGGTTTTCGCTTTTGTTTTGCAGTTTATTGTATGTTTGTGCTTTAAATAATTCA
TGTTATCCCGATTGTAGAAGTCATAATGAGCAAAAAATGTTTCCAGCAAATTATATAATT
TAGATGAAAAC


BQ
10 10 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP26TF U 1
AF RR2BX58TF U 1
AF RR2FV05JQ C 81
AF RR2A876TF U 0
AF RR2B584TF U 2
AF RR2FV05TF U 3
AF RR2B584JQ C 55
AF RR2BX58JQ C 46
AF RR2ET50TF U 0
BS 1 156 RR2BX58TF
BS 157 157 RR2FP26TF
BS 158 445 RR2BX58TF
BS 446 446 RR2FP26TF
BS 447 740 RR2BX58TF
BS 741 791 RR2ET50TF

RD RR2FP26TF 660 0 0
GG
GACATCTCACTAGTCGTCTCTAGCAAATCATGGCATCTCCTGTAGAGAAACAACTCCTCA
AATCCCTCTTCTCATTCTTCTTATTAGTTCTACTCTTTTCCGATACCGTTTTCTCGTCCC
GAAAAACATTGGATCAGAGAAAGCCATGCAAACACTTCTCTTTCTACTTCCATGACATCC
TCTACGATGGCGACAACGTAGCAAACGCAACCTCGGCCGCTATCGTGAGCCCTCCGGGGT
TAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATTTTTGATGGCCCCATAACAATGGACAAGA
ACTATCTCTCAGAACCCGTGGCTCGCGCGCAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAGACGG
ACTTCAACTCGTGGTTTTCCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACGGAACACAAAGGCACAT
TGAATGTAATGGGTGCTGACTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTTGGTG
GGACTGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGTATCGCTACATTCGTGACGGATATATTTCAAG
GGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATATTAAACTATATGAATGTTACTAACTAATTA
CATGTTTTATTTTGAAAATTGTGTGCTGACACAGAGATAAAATGTGTTCCTATTGATA

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR2BX58TF 751 0 0
GGGACATCTCACTAGTCGTCTCTAGCAAATCATGGCATCTCCTGTAGAGAAACAACTCCT
CAAATCCCTCTTCTCATTCTTCTTATTAGTTCTACTCTTTTCCGATACCGTTTTCTCGTC
CCGAAAAACATTGGATCAGAGAAAGCCATGCAAACATTTCTCTTTCTACTTCCATGACAT
CCTCTACGATGGCGACAACGTAGCAAACGCAACCTCGGCCGCTATCGTGAGCCCTCCGGG
GTTAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATTTTTGATGGCCCCATAACAATGGACAA
GAACTATCTCTCAGAACCCGTGGCTCGCGCGCAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAGAC
GGACTTCAACTCGTGGTTTTCCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACGGAACACAAAGGCAC
ATTGAATGTAATGGGTGCTGACTTGGTGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTTGG
TGGGACTGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGTATCGCTACATTCGTGACGGATATATTTCA
AGGGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATATTAAACTATATGAATGTTACTAACTAAT
TACATGTTTTATTTTGAAAATTGTGTGCTGACACAGAGATAAAATGTGTTCCTATTGATA
AGTAAGTGGTTTTCGCTTTTGTTTTGCAGTTTATTGTATGTTTGTGCTTTAAATAATTCA
TGTTATCCCGATTGTAGAAG
CCTTAATGAAC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2FV05JQ 644 0 0
TCTTATTAGTTCTACTCTTTTCCGATACCGTTTTCTCGTCCCGAAAAACATTGGATCAGA
GAAAGCCATGCAAACACTTCTCTTTCTACTTCCATGACATCCTCTACGATGGCGACAACG
TAGCAAACGCAACCTCGGCCGCTATCGTGAGCCCTCCGGGGTTAGGAAACTTCAAGTTCG
GTAAGTTTGTGATTTTTGATGGCCCCATAACAATGGGCAAGAACTATCTTTCAGAACCCG
TGGCTCGCGCGCAAGGCTTCTATTTTTATGACATGAAGACGGACTTCAACTCGTGGTTTT
CCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACGGAACACAAAGGCACATTGAATGTAATGGGTGCTG
ACTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTTGGTGGGACTGGTGATTTTTTCA
TGGCTCGTGGTATCGCTACATTCGTGACGGATATATTTCAAGGGGCTAAGTATTTCCGTG
TTAAGATGGATATTAAACTATATGAATGTTACTAACTAATTACATGTTTTATTTTGAAAA
TTGTGTGCTGACACAGAGATAAAATGTGTTCCTATTGATAAGTAAGTGGTTTTCGCTTTT
GTTTTGCAGTTTATTGTATGTTTGTGCTTTAAATAATTCATGTT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2A876TF 736 0 0
GGAC
ACATCTCACTAGTCGTCTCTAGCTAATCATGGCATCTCTTGTAGAGAAACAACTCCTCAA
ATCCCTCTTCTCATTCTTCTTATTAGTTCTACTCTTTTCCGATACCGTTTTCTCGTCCCG
AAAAACATTGGATCAGAGAAAGCCATGCAAGCATTTCTCTTTCTACTTCCATGACATCCT
CTACGATGGCGACAACGTAGCAAACGCAACCTCGGCCGCTATCGTGAGCCCTCCGGGATT
AGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATTTTTGATGGCCCCATAACAATGGACAAGAA
CTATCTCTCAGAACCCGTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAGACGGA
CTTCAACTCGTGGTTTTCCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACGGAACACAAAGGCACATT
GAATGTAATGGGTGCGGACTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTTGGTGG
GACTGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGTATCGCTACATTCGTGACGGATATATTTCAAGG
GTCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATATTAAACTATATGAATGTTACTAACTAACTAC
ATGTTTTATTTTGAAAATTGTGTGCTGACACAGAGATAAAATGTGTTACTATTGATAAGT
AAGTGGTTTTTGTTTTTGTTTTACAGTTTATTGTATGTTTGTGCTTTATATAATTCATGT
TATCCCGATT
AT

QA 5 734 5 734
DS 

RD RR2B584TF 733 0 0
G
GACATCTCACTAGTCGTCTCTAGCAAATCATGGCATCTCCTGTAGAGAAACAACTCCTCA
AATCCCTCTTCTCATTCTTCTTATTAGTTCTACTCTTTTCCGATACCGTTTTCTCGTCCC
GAAAAACATTGGATCAGAGAAAGCCATGCAAACACTTCTCTTTCTACTTCCATGACATCC
TCTACGATGGCGACAACGTAGCAAACGCAACCTCGGCCGCTATCGTGAGCCCTCCGGGGT
TAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATTTTTGATGGCCCCATAACAATGGACAAGA
ACTATCTCTCAGAACCCGTGGCTCGCGCGCAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAGACGG
ACTTCAACTCGTGGTTTTCCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACGGAACACAAAGGCACAT
TGAATGTAATGGGTGCTGACTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTTGGTG
GGACTGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGTATCGCTACATTCGTGACGGATATATTTCAAG
GGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATATTAAACTATATGAATGTTACTAACTAATTA
CATGTTTTATTTTGAAAATTGTGTGCTGACACAGAGATAAAATGTGTTCCTATTGATAAG
TAAGTGGTTTTCGCTTTTGTTTTGCAGTTTATTGTATGTTTGTGCTTTAAATAATTCATG
TTATCCCGATTG

QA 2 733 2 733
DS 

RD RR2FV05TF 722 0 0
GACATCTCACTAGTCGTCTCTAGCAAATCATGGCATCTCCTGTAGAGAAACAACTCCTCA
AATCCCTCTTCTCATTCTTCTTATTAGTTCTACTCTTTTCCGATACCGTTTTCTCGTCCC
GAAAAACATTGGATCAGAGAAAGCCATGCAAACACTTCTCTTTCTACTTCCATGACATCC
TCTACGATGGCGACAACGTAGCAAACGCAACCTCGGCCGCTATCGTGAGCCCTCCGGGGT
TAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATTTTTGATGGCCCCATAACAATGGGCAAGA
ACTATCTCTCAGAACCCGTGGCTCGCGCGCAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAGACGG
ACTTCAACTCGTGGTTTTCCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACGGAACACAAAGGCACAT
TGAATGTAATGGGTGCTGACTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTTGGTG
GGACTGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGTATCGCTACATTCGTGACGGATATATTTCAAG
GGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATATTAAACTATATGAATGTTACTAACTAATTA
CATGTTTTATTTTGAAAATTGTGTGCTGACACAGAGATAAAATGTGTTCCTATTGATAAG
TAAGTGGTTTTCGCTTTTGTTTTGCAGTTTATTGTATGTTTGTGCTTTAAATAATTCATG
TT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2B584JQ 699 0 0
ACTCCTCAAATCCCTCTTCTCATTCTTCTTATTAGTTCTACTCTTTTCCGATACCGTTTT
CTCGTCCCGAAAAACATTGGATCAGAGAAAGCCATGCAAACACTTCTCTTTCTACTTCCA
TGACATCCTCTACGATGGCGACAACGTAGCAAACGCAACCTCGGCCGCTATCGTGAGCCC
TCCGGGGTTAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATTTTTGATGGCCCCATAACAAT
GGACAAGAACTATCTCTCAGAACCCGTGGCTCGCGCGCAAGGCTTCTATTTTTATGACAT
GAAGACGGACTTCAACTCGTGGTTTTCCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACGGAACACAA
AGGCACATTGAATGTAATGGGTGCTGACTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGT
CGTTGGTGGGACTGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGTATCGCTACATTCGTGACGGATAT
ATTTCAAGGGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATATTAAACTATATGAATGTTACTA
ACTAATTACATGTTTTATTTTGAAAATTGTGTGCTGACACAGAGATAAAATGTGTTCCTA
TTGATAAGTAAGTGGTTTTCGCTTTTGTTTTGCAGTTTATTGTATGTTTGTGCTTTAAAT
AATTCATGTTATCCCGATTGTAGAAG
CCTTAATGAACAA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2BX58JQ 708 0 0
AGAGAAACAACTCCTCAAATCCCTCTTCTCATTCTTCTTATTAGTTCTACTCTTTTCCGA
TACCGTTTTCTCGTCCCGAAAAACATTGGATCAGAGAAAGCCATGCAAACATTTCTCTTT
CTACTTCCATGACATCCTCTACGATGGCGACAACGTAGCAAACGCAACCTCGGCCGCTAT
CGTGAGCCCTCCGGGGTTAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATTTTTGATGGCCC
CATAACAATGGACAAGAACTATCTCTCAGAACCCGTGGCTCGCGCGCAAGGCTTCTATTT
CTATGACATGAAGACGGACTTCAACTCGTGGTTTTCCTACACCTTGGTGTTTAACTCGAC
GGAACACAAAGGCACATTGAATGTAATGGGTGCTGACTTGGTGATGGAGCCGACAAGAGA
TCTATCGGTCGTTGGTGGGACTGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGTATCGCTACATTCGT
GACGGATATATTTCAAGGGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATATTAAACTATATGA
ATGTTACTAACTAATTACATGTTTTATTTTGAAAATTGTGTGCTGACACAGAGATAAAAT
GTGTTCCTATTGATAAGTAAGTGGTTTTCGCTTTTGTTTTGCAGTTTATTGTATGTTTGT
GCTTTAAATAATTCATGTTATCCCGATTGTAGAAG
CCTTAATGAACAA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2ET50TF 792 0 0
GGAC
ACATCTCACTAGTCGTCTCTAGCTAATCATGGCATCTCTTGTAGAGAAACAACTCCTCAA
ATCCCTCTTCTCATTCTTCTTATTAGTTCTACTCTTTTCCGATACCGTTTTCTCGTCCCG
AAAAACATTGGATCAGAGAAAGCCATGCAAGCATTTCTCTTTCTACTTCCATGACATCCT
CTACGATGGCGACAACGTAGCAAACGCAACCTCGGCCGCTATCGTGAGCCCTCCGGGATT
AGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATTTTTGATGGCCCCATAACAATGGACAAGAA
CTATCTCTCAGAACCCGTGGCTCGCGCACAAGGCTTCT*TTTCTATGACATGAAGACGGA
CTTCAACTCGTGGTTTTCCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACGGAACACAAAGGCACATT
GAATGTAATGGGTGCGGACTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTTGGTGG
GACTGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGTATCGCTACATTCGTGACGGATATATTTCAAGG
GGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATATTAAACTATATGAATGTTACTAACTAACTAC
ATGTTTTATTTTGAAAATTGTGTGCTGACACAGAGATAAAATGTGTTACTATTGATAAGT
AAGTGGTTTTTGTTTTTGTTTTACAGTTTATTGTATGTTTGTGCTTTATATAATTCATGT
TATCCCGATTATAGAAGTCATAATGAGCAAAAAATGTTTCCAGCAAATTATATAATTTAG
ATGAAAAC

QA 5 792 5 792
DS 



AS 2 7

CO CL738Contig1 823 3 5 U
CCTTACAGGAAGATAACTTGAGAGAGAGATGGGCTGTATTCACTTCGAGTCGGCAGATCC
ACGTACACTTTCTGCCCAACCAAATGACGAAACATCCAACACAGTCTTTGAAGAACAAGA
GGAGCAAGGAGGAGGAATCCAAGAAGCTTGGTCCGAGATTAAGAACAGCTGTGGAAACGG
CGAGAGTAGACACAAGCTTATGAAGAAGAAGAGCCATGTGTTGCTGGAAGGTTACGTGGA
GGCTCAAGATGATCAAGAAGATCTGACGAGAGCCAATAGCTTGACGGATGACGATCTTGA
GGAGCTAAAAGGTTGTTTAGACCTAGGGTTTGGGTTTAGCTACGACGAGATCCCTGAGCT
CTGCAACACTCTGCCTGCTTTAGAGCTATGTTACTCCATGTCCCAGAAGTTCTTAGATGA
TAATAAGCAAACCCACCAAGAGAACTCGCCACTGCCGCCGCCGCCACCGACGACCACGAC
CAGTCCAGTTGCTAACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAAAGC
TAGACTCAAGTACTGGGCACAAACCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTGTGTAGCTGAACAAT
AATCATCATTATCATCTTGTCTGAACATATATTTGATTGAACCAGAAAACATCTACTGAT
CAGACTTTTCTTTGCATGAATGAAGTCTCTGCCACTTTTAGCTGAGAATAGACCTGCATT
GTGTCCATGGAGAAACTGGTTTGGCTTTTTTACTTTTTACTCCTATGTATACCCTTTAGC
CTAACGTTTGTAATAAACTGGAAATAAATGTGTCATTGTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2A589TF U 1
AF RR2DO93JQ C 290
AF RR2DO93TF U 290
BS 1 552 RR2A589TF
BS 553 553 RR2DO93TF
BS 554 792 RR2A589TF
BS 793 822 RR2DO93TF
BS 823 823 RR2DO93JQ

RD RR2A589TF 793 0 0
CCTTACAGGAAGATAACTTGAGAGAGAGATGGGCTGTATTCACTTCGAGTCGGCAGATCC
ACGTACACTTTCTGCCCAACCAAATGACGAAACATCCAACACAGTCTTTGAAGAACAAGA
GGAGCAAGGAGGAGGAATCCAAGAAGCTTGGTCCGAGATTAAGAACAGCTGTGGAAACGG
CGAGAGTAGACACAAGCTTATGAAGAAGAAGAGCCATGTGTTGCTGGAAGGTTACGTGGA
GGCTCAAGATGATCAAGAAGATCTGACGAGAGCCAATAGCTTGACGGATGACGATCTTGA
GGAGCTAAAAGGTTGTTTAGACCTAGGGTTTGGGTTTAGCTACGACGAGATCCCTGAGCT
CTGCAACACTCTGCCTGCTTTAGAGCTATGTTACTCCATGTCCCAGAAGTTCTTAGATGA
TAATAAGCAAACCCACCAAGAGAACTCGCCACTGCCGCCGCCGCCACCGACGACCACGAC
CAGTCCAGTTGCTAACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAAAGC
TAGACTCAAGTATTGGGCACAAACCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTGTGTAGCTGAACAAT
AATCATCATTATCATCTTGTCTGAACATATATTTGATTGAACCAGAAAACATCTACTGAT
CAGACTTTTCTTTGCATGAATGAAGTCTCTGCCACTTTTAGCTGAGAATAGACCTGCATT
GTGTCCATGGAGAAACTGGTTTGGCTTTTTTACTTTTTACTCCTATGTATACCCTTTAGC
CTAACGTTTGTA
T

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2DO93JQ 534 0 0
GACGATCTTGAGGAGCTAAAAGGTTGTTTAGACCTAGGGTTTGGGTTTAGCTACGACGAG
ATCCCTGAGCTCTGCAACACTCTGCCTGCTTTAGAGCTATGTTACTCCATGTCCCAGAAG
TTCTTAGATGATAATAAGCAAACCCACCAAGAGAACTCGCCACTGCCGCCGCCGCCACCG
ACGACCACGACCAGTCCAGTTGCTAACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGAT
GATGTAAAAGCTAGACTCAAGTACTGGGCACAAACCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTGTGT
AGCTGAACAATAATCATCATTATCATCTTGTCTGAACATATATTTGATTGAACCAGAAAA
CATCTACTGATCAGACTTTTCTTTGCATGAATGAAGTTTCTGCCACTTTTAGCTGAGAAT
AGACCTGCATTGTGTCCATGGAGAAACTGGTTTGGCTTTTTTACTTTTTACTCCTATGTA
TACCCTTTAGCCTAACGTTTGTAATAAACTGGAAATAAATGTGTCATTGTTACC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2DO93TF 534 0 0
GACGATCTTGAGGAGCTAAAAGGTTGTTTAGACCTAGGGTTTGGGTTTAGCTACGACGAG
ATCCCTGAGCTCTGCAACACTCTGCCTGCTTTAGAGCTATGTTACTCCATGTCCCAGAAG
TTCTTAGATGATAATAAGCAAACCCACCAAGAGAACTCGCCACTGCCGCCGCCGCCACCG
ACGACCACGACCAGTCCAGTTGCTAACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGAT
GATGTAAAAGCTAGACTCAAGTACTGGGCACAAACCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTGTGT
AGCTGAACAATAATCATCATTATCATCTTGTCTGAACATATATTTGATTGAACCAGAAAA
CATCTACTGATCAGACTTTTCTTTGCATGAATGAAGTCTCTGCCACTTTTAGCTGAGAAT
AGACCTGCATTGTGTCCATGGAGAAACTGGTTTGGCTTTTTTACTTTTTACTCCTATGTA
TACCCTTTAGCCTAACGTTTGTAATAAACTGGAAATAAATGTGTCATTGTTAC
C

QA 1 533 1 533
DS 



CO CL738Contig2 792 4 8 U
GGGAACCTTACAGGAAGATAACTCGAGAGAGAGAGATGGGTTGTATTCACTTCGAGTCGG
CAGATCCACGTACACTTTCTGCCCAACCAAATGACGAAACATCCAACACAGTCTTTGAAG
AACAAGAGGAGCAAGGAGGAGGAATCCAAGAAGCTTGGTCCGAGATTAAGAACAGCTGTG
GAAACGGCGAGAGTAGACACAAGCTTATGAAGAAGAAGAGCCATGTGTTGCTGGAAGGTT
ACGTGGAGGCTCAAGATGATCAAGAAGATCTGACGAGAGCCAAGAGCTTGACGGATGACG
ATCTTGAGGAGCTAAAAGGTTGTTTAGACCTAGGGTTTGGGTTTAGCTACGACGAGATCC
CTGAGCTCTGCAACACTCTGCCTGCTTTAGAGCTATGTTACTCCATGTCCCAGAAGTTCT
TAGATGATAATAAGCAAACCCACCAAGAGAACTCGCCGCTGCCGCCACCGACGACCACGA
CCAGTCCAGTTGCTAACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAAAG
CTAGACTCAAGTACTGGGCACAAACCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTGTGTAGCTGAACAA
GAATCATCATCATCATCATCTTGTCTGAACATATATTT*GGTTGAACCAGAAAACATCTA
CTAATCAGACTTTTCTTTGCATGAATATGTAAGTGTAGTAAATATCCTTAGCCTAACGTT
TGTAATAAACTGGAAATAAATGTGTCATTGTTACTAAATAAAACTTTCCAACTCTTTCTC
TACAAATCCCTC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY62TF U 6
AF RR2B381TF U 1
AF RR2BY62JQ C 23
AF RR2AW64TFB U 55
BS 1 23 RR2B381TF
BS 24 24 RR2BY62TF
BS 25 181 RR2B381TF
BS 182 182 RR2BY62TF
BS 183 638 RR2B381TF
BS 639 639 RR2BY62TF
BS 640 755 RR2B381TF
BS 756 792 RR2AW64TFB

RD RR2BY62TF 679 0 0
CCTTACAGGAAGATAACTCGAGAGAGAGAGATGGGTTGTATTCACTTCGAGTCGGCAGAT
CCACGTACACTTTCTGCCCAACCAAATGACGAAACATCCAACACAGTCTTTGAAGAACAA
GAGGAGCAAGGAGGAGGAATCCAAGAAGCTTGGTCCGAGATTAAGAACAGCTGTGGAAAC
GGCGAGAGTAGACACAAGCTTATGAAGAAGAAGAGCCATGTGTTGCTGGAAGGTTACGTG
GAGGCTCAAGATGATCAAGAAGATCTGACGAGAGCCAAGAGCTTGACGGATGACGATCTT
GAGGAGCTAAAAGGTTGTTTAGACCTAGGGTTTGGGTTTAGCTACGACGAGATCCCTGAG
CTCTGCAACACTCTGCCTGCTTTAGAGCTATGTTACTCCATGTCCCAGAAGTTCTTAGAT
GATAATAAGCAAACCCACCAAGAGAACTCGCCGCTGCCGCCACCGACGACCACGACCAGT
CCAGTTGCTAACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAAAGCTAGA
CTCAAGTACTGGGCACAAACCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTGTGTAGCTGAACAAGAATC
ATCATCATCATCATCTTGTCTGAACATATATTT*GGTTGAACCAGAAAACATCTACTAAT
CAGACTTTTCTTTGCATGA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2B381TF 755 0 0
GGGAACCTTACAGGAAGATAACTTGAGAGAGAGAGATGGGTTGTATTCACTTCGAGTCGG
CAGATCCACGTACACTTTCTGCCCAACCAAATGACGAAACATCCAACACAGTCTTTGAAG
AACAAGAGGAGCAAGGAGGAGGAATCCAAGAAGCTTGGTCCGAGATTAAGAACAGCTGTG
GGAACGGCGAGAGTAGACACAAGCTTATGAAGAAGAAGAGCCATGTGTTGCTGGAAGGTT
ACGTGGAGGCTCAAGATGATCAAGAAGATCTGACGAGAGCCAAGAGCTTGACGGATGACG
ATCTTGAGGAGCTAAAAGGTTGTTTAGACCTAGGGTTTGGGTTTAGCTACGACGAGATCC
CTGAGCTCTGCAACACTCTGCCTGCTTTAGAGCTATGTTACTCCATGTCCCAGAAGTTCT
TAGATGATAATAAGCAAACCCACCAAGAGAACTCGCCGCTGCCGCCACCGACGACCACGA
CCAGTCCAGTTGCTAACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAAAG
CTAGACTCAAGTACTGGGCACAAACCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTGTGTAGCTGAACAA
GAATCATCATCATCATCATCTTGTCTGAACATATATTTTGGTTGAACCAGAAAACATCTA
CTAATCAGACTTTTCTTTGCATGAATATGTAAGTGTAGTAAATATCCTTAGCCTAACGTT
TGTAATAAACTGGAAATAAATGTGTCATTGTTACT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2BY62JQ 756 0 0
TC
GAGAGAGAGAGATGGGTTGTATTCACTTCGAGTCGGCAGATCCACGTACACTTTCTGCCC
AACCAAATGACGAAACATCCAACACAGTCTTTGAAGAACAAGAGGAGCAAGGAGGAGGAA
TCCAAGAAGCTTGGTCCGAGATTAAGAACAGCTGTGGAAACGGCGAGAGTAGACACAAGC
TTATGAAGAAGAAGAGCCATGTGTTGCTGGAAGGTTACGTGGAGGCTCAAGATGATCAAG
AAGATCTGACGAGAGCCAAGAGCTTGACGGATGACGATCTTGAGGAGCTAAAAGGTTGTT
TAGACCTAGGGTTTGGGTTTAGCTACGACGAGATCCCTGAGCTCTGCAACACTCTGCCTG
CTTTAGAGCTATGTTACTCCATGTCCCAGAAGTTCTTAGATGATAATAAGCAAACCCACC
AAGAGAACTCGCCGCTGCCGCCACCGACGACCACGACCAGTCCAGTTGCTAACTGGAAGA
TCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAAAGCTAGACTCAAGTACTGGGCACAAA
CCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTGTGTAGCTGAACAAGAATCATCATCATCATCATCTTGT
CTGAACATATATTT*GGTTGAACCAGAAAACATCTACTAATCAGACTTTTCTTTGCATGA
ATATGTAAGTGTAGTAAATATCCTTAGCCTAACGTTTGTAATAAACTGGAAATAAATGTG
TCATTGTTACTAAATAAAACTTTCCAACTCTTTC

QA 3 756 3 756
DS 

RD RR2AW64TFB 738 0 0
AGTCGGCAGATCCACGTACACTTTCTGCCCAACCAAATGACGAAACATCCAACACAGTCT
TTGAAGAACAAGAGGAGCAAGGAGGAGGAATCCAAGAAGCTTGGTCCGAGATTAAGAACA
GCTGTGGAAACGGCGAGAGTAGACACAAGCTTATGAAGAAGAAGAGCCATGTGTTGCTGG
AAGGTTACGTGGAGGCTCAAGATGATCAAGAAGATCTGACGAGAGCCAAGAGCTTGACGG
ATGACGATCTTGAGGAGCTAAAAGGTTGTTTAGACCTAGGGTTTGGGTTTAGCTACGACG
AGATCCCTGAGCTCTGCAACACTCTGCCTGCTTTAGAGCTATGTTACTCCATGTCCCAGA
AGTTCTTAGATGATAATAAGCAAACCCACCAAGAGAACTCGCCGCTGCCGCCACCGACGA
CCACGACCAGTCCAGTTGCTAACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATG
TAAAAGCTATACTCAAGTACTGGGCACAAACCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTGTGTAGCT
GAACAAGAATCATCATCATCATCATCTTGTCTGAACATATATTT*GGTTGAACCAGAAAA
CATCTACTAATCAGACTTTTCTTTGCATGAATATGTAAGTGTAGTAAATATCCTTAGCCT
AACGTTTGTAATAAACTGGAAATAAATGCGTCATTGTTACTAAATAAAACTTTCCAACTC
TTTCTCTACAAATCCCTC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 8

CO CL739Contig1 1312 8 16 U
GGGAAAAGGATAAATCATTTCTGAACATTCATCTTCTCCTTCTTCCTCTCTGTTTTCCAC
AAAGCTTTCTCCTTTCAATGGCGACTCTTAGCTTCAACACCACTCGTATGCGAACACCTT
CACTCCCCAGAATCTCCAGATCATCTTCTTTCACAAAACCCATCAAAACCCATCTCTCCT
CCTCCTCCTCCTCCCAAACCTTATCCAAACGCCGCCGTTTCGTCTCTCGTTCCTTACCGG
AGAGCTTTACGAAAGAAGAGACCGTCGTCATCAAACAGGAGGAAGAAACCGAAGACGATG
ATCCTACGTCGGAACTGAGTTATCTTGATCCGGAAACAGATGCAGAGAGCATAAAAGAGT
GGGAACTCGATTTCTGCTCGAGGCCGATTCTTGATTCGAGAGGGAAGAAGATATGGGAGC
TTGTGGTTTGCGATGCTTCGCTCTCGCTTCAAGTCACCAAGTACTTTCCCAACAATGTCA
TCAACAGTATTACACTCAAAGACGCTATTGTTTCCATCACACAAGACTTGGGTGTTCCTC
TCCCTGAGAAGATTCGTTTCTTCAGGTCACAGATGCAAACCATTATCACAAAAGCTTGCA
AAGAGCTTGCTATAAAGGAAGTGCCTAGTAAACGGTGTCTGTCTCTGTTTCTATGGTTGC
AAGAACGTTATGACACTGTGTACACGCGTCATCCCGGTTTCCAGAAGGGATCATTGCCTC
TTCTGTCTCTAGACAACCCTTTTCCAATGAATCTTCCTGAGAATTTGTTTGGGGAGAAAT
GGGCGTTTGTTCAGTTACCTTACTCAGCTGTTAGAGAAGAGATCTCAGACTTTGAGGAGA
AGTTTGTGTTTGGTGCAACCTTAGACTTGGATTTGCTTGGCATTGACGTTGATGAGAACA
CACTGATCCCTGGTCTCTCTGTTGCTTCTTCACGTGCAAAACCTCTAGCAGCTTGGATGA
ATGGTCTTGAGGTGTGTTCTATCGAAGCAGACAGTACAAAAGGATGTTTGATTCTAGCCG
TTGGGATCTCGACAAGGTATGTCTACGCAACGTACAAGAAAACACCTGTTACTACTGATG
AAGCTGAAGCTTGGGAGTCTGCGAAGAAAGCAAGTGGAGGTTTGCATTTTCTTGCAATTC
AAGATGACTTGGATTCTGATGACTGTGTTGGCTTTTGGCTTCTTATTGATTTGCCACCAC
CTCCTGTTTAATTTCACTTTGGTAAATTGGTAATAACCATGTTTTGCTATTTAGTAAGCG
AGTAGAACTGTGGGTTTCTCTCACTCTTGAAAGAAATAGTTTACATGAAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW35TFB U 80
AF RR2CQ53TF U 10
AF RR2EY59TF U 1
AF RR2FF64TF U 205
AF RR2CQ53JQ C 591
AF RR2AQ66JQ C 409
AF RR2EY59JQ C 564
AF RR2AW35JQ C 555
BS 1 145 RR2EY59TF
BS 146 146 RR2AW35TFB
BS 147 189 RR2EY59TF
BS 190 191 RR2AW35TFB
BS 192 608 RR2EY59TF
BS 609 609 RR2AW35TFB
BS 610 739 RR2EY59TF
BS 740 940 RR2FF64TF
BS 941 941 RR2AQ66JQ
BS 942 963 RR2FF64TF
BS 964 964 RR2AQ66JQ
BS 965 965 RR2EY59JQ
BS 966 967 RR2AQ66JQ
BS 968 968 RR2EY59JQ
BS 969 1247 RR2AQ66JQ
BS 1248 1312 RR2AW35JQ

RD RR2AW35TFB 622 0 0
GGCGACTCTTAGCTTCAACACCACTCGTATGCGAACACCTTCACTCCCCAGAATCTCCAG
ATCATCTTCTTTCACAAAACCCATCAAAACCCATCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCAAAC
CTTATCCAAACGCCGCCGTTTCGTCTCTCGTTCCTTACCGGAGAGCTTTACGAAAGAAGA
GACCGTCGTCATCAAACAGGAGGAAGAAACCGAAGACGATGATCCTACGTCGGAACTGAG
TTATCTTGATCCGGAAACAGATGCAGAGAGCATAAAAGAGTGGGAACTCGATTTCTGCTC
GAGGCCGATTCTTGATTCGAGAGGGAAGAAGATATGGGAGCTTGTGGTTTGCGATGCTCC
GCTCTCGCTTCAAGTCACCAAGTACTTTCCCAACAATGTCATCAACAGTATTACACTCAA
AGACGCTATTGTTTCCATCACACAAGACTTGGGTGTTCCTCTCCCTGAGAAGATTCGTTT
CTTCAGGTCACAGATGCAAACCATTATCACAAAAGCTTGCAAAGAGCTTGCTATAAAGGA
AGTGCCTAGTAAACGGTGTCTGTCTCTGTTTCTATGGTTGCAAGAACGTTATGACACTGT
GTACACGCGTCATCCCGGTTTC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2CQ53TF 683 0 0
GG
AAATCATTTCTGAACATTCATCTTCTCCTTCTTCCTCTCTGTTTTCCACAAAGCTTTCTC
CTTTCAATGGCGACTCTTAGCTTCAACACCACTCGTATGCGAACACCTTCACTCCCCAGA
ATCTCCAGATCGTCTTCTTTCACAAAACCCATCAAAACCCATCTCTCCTCCTCCTCCTCC
TCCCAAACCTTATCCAAACGCCGCCGTTTCGTCTCTCGTTCCTTACCGGAGAGCTTTACG
AAAGAAGAGACCGTCGTCATCAAACAGGAGGAAGAAACCGAAGACGATGATCCTACGTCG
GAACTGAGTTATCTTGATCCGGAAACAGATGCAGAGAGCATAAAAGAGTGGGAACTCGAT
TTCTGCTCGAGGCCGATTCTTGATTCGAGAGGGAAGAAGATATGGGAGCTTGTGGTTTGC
GATGCTTCGCTCTCGCTTCAAGTCACCAAGTACTTTCCCAACAATGTCATCAACAGTATT
ACACTCAAAGACGCTATTGTTTCCATCACACAAGACTTGGGTGTTCCTCTCCCTGAGAAG
ATTCGTTTCTTCAGGTCACAGATGCAAACCATTATCACAAAAGCTTGCAAAGAGCTTGCT
ATAAAGGAAGTGCCTAGTAAACGGTGTCTGTCTCTGTTTCTATGGTTGCAAGAACGTTAT
GACACTGTGTACACGCGTCAT

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2EY59TF 739 0 0
GGGAAAAGGATAAATCATTTCTGAACATTCATCTTCTCCTTCTTCCTCTCTGTTTTCCAC
AAAGCTTTCTCCTTTCAATGGCGACTCTTAGCTTCAACACCACTCGTATGCGAACACCTT
CACTCCCCAGAATCTCCAGATCATCCTCTTTCACAAAACCCATCAAAACCCATCTCTCCT
CCTCCTCCT**TCCCAAACCTTATCCAAACGCCGCCGTTTCGTCTCTCGTTCCTTACCGG
AGAGCTTTACGAAAGAAGAGACCGTCGTCATCAAACAGGAGGAAGAAACCGAAGACGATG
ATCCTACGTCGGAACTGAGTTATCTTGATCCGGAAACAGATGCAGAGAGCATAAAAGAGT
GGGAACTCGATTTCTGCTCGAGGCCGATTCTTGATTCGAGAGGGAAGAAGATATGGGAGC
TTGTGGTTTGCGATGCTTCGCTCTCGCTTCAAGTCACCAAGTACTTTCCCAACAATGTCA
TCAACAGTATTACACTCAAAGACGCTATTGTTTCCATCACACAAGACTTGGGTGTTCCTC
TCCCTGAGAAGATTCGTTTCTTCAGGTCACAGATGCAAACCATTATCACAAAAGCTTGCA
AAGAGCTTTCTATAAAGGAAGTGCCTAGTAAACGGTGTCTGTCTCTGTTTCTATGGTTGC
AAGAACGTTATGACACTGTGTACACGCGTCATCCCGGTTTCCAGAAGGGATCATTGCCTC
TTCTGTCTCTAGACAACCC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2FF64TF 759 0 0
G
CAAACGCCGCCGTTTCGTCTCTCGTTCCTTACCGGAGAGCTTTACGAAAGAAGTGACCGT
CGTCATCAAACAGGAGGAAGAAACCGAAGACGATGATCCTACGTCGGAACTGAGTTATCT
TGATCCGGAAACAGATGCAGAGAGCATAAAAGAGTGGGAACTCGATTTCTGCTCGAGGCC
GATTCTTGATTCGAGAGGGAAGAAGATATGGGAGCTTGTGGTTTGCGATGCTTCGCTCTC
GCTTCAAGTCACCAAGTACTTTCCCAACAATGTCATCAACAGTATTACACTCAAAGACGC
TATTGTTTCCATCGCACAAGACTTGGGTGTTCCTCTCCCTGAGAAGATTCGTTTCTTCAG
GTCACAGATGCAAACCATTATCACAAAAGCTTGCAAAGAGCTTGCTATAAAGGAAGTGCC
TAGTAAACGGTGTCTGTCTCTGTTTCTATGGTTGCAAGAACGTTATGACACTGTGTACAC
GCGTCATCCCGGTTTCCAGAAGGGATCATTGCCTCTTCTGTCTCTAGACAACCCTTTTCC
AATGAATCTTCCTGAGAATTTGTTTGGGGAGAAATGGGCGTTTGTTCAGTTACCTTACTC
AGCTGTTAGAGAAGAGATCTCAGACTTTGAGGAGAAGTTTGTGTTTGGTGCAACCTTAGA
CTTGGATTTGCTTGGCATTGACGTTGATGAGAACACACTGATCCCTGGTCTCTCTGTTGC
TTCTTCACGTGCAAA*CCTCTAGCAGCTTGGATGAATG

QA 2 759 2 759
DS 

RD RR2CQ53JQ 585 0 0
AAAGCTTGCAAAGAGCTTGCTATAAAGGAAGTGCCTAGTAAACGGTGTCTGTCTCTGTTT
CTATGGTTGCAAGAACGTTATGACACTGTGTACACGCGTCATCCCGGTTTCCAGAAGGGA
TCATTGCTTCTTCTGTCTCTAGACAACCCTTTTCCAATGAATCTTCCTGAGAATTTGTTT
GGGGAGAAATGGGCGTTTGTTCAGTTACCTTATTCAGCTGTTAGAGAAGAGATTTCAGAC
TTTGAGGAGAAGTTTGTGTTTGGTGCAACCTTAGACTTGGATTTGCTTGGCATTGACGTT
GATGAGAACACACTGATCCCTGGTCTTTCTGTTGCTTCTTCACGTGCAAAACCTCTAGCA
GCTTGGATGAATGGTCTTGAGGTGTGTTCTATCGAAGCAGACAGTACAAAAGGATGTTTG
ATTCTAGCCGTTGGGATCTCGACAAGGTATGTTTACGCAACGTACAAGAAAACACCTGTT
ACTACTGATGAAGCTGAAGCTTGGGAGTCTGCGAAGAAAGCAAGTGGAGGTTTGCATTTT
CTTGCAATTCAAGATGACTTGGATTCTGATGACTGTGTTGGCTTT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2AQ66JQ 840 0 0
AGATATGGGAGCTTGTGGTTTGCGATGCTTCGCTCTCGCTTCAAGTCACCAAGTACTTTC
CCAACAATGTCATCAACAGTATTACACTCAAAGACGCTATTGTTTCCATCACACAAGACT
TGGGTGTTCCTCTCCCTGAGAAGATTCGTTTCTTCAGGTCACAGATGCAAACCATTATCA
CAAAAGCTTGCAAAGAGCTTGCTATAAAGGAAGTGCCTAGTAAACGGTGTCTGTCTCTGT
TTCTATGGTTGCAAGAACGTTATGACACTGTGTACACGCGTCATCCCGGTTTCCAGAAGG
GATCATTGCCTCTTCTGCCTCTAGACAACCCTTTTCCAATGAATCTTCCTGAGAATTTGT
TTGGGGAGAAATGGGCGTTTGTTCAGTTACCTTACTCAGCTGTTAGAGAAGAGATCTCAG
ACTTTGAGGAGAAGTTTGTGTTTGGTGCAACCTTAGACTTGGATTTGCTTGGCATTGACG
TTGATGAGAACACACTGATCCCTGGTCTCTCTGTTGCTTCTTCACGTGCAAAACCTCTAG
CAGCTTGGATGAATGGCCTCGAGGTGTGTTCTATCGAAGCAGACAGTACAAAAGGATGTT
TGATTCTAGCCGTTGGGATCTCGACAAGGTATGTCTACGCAACGTACAAGAAAACACCTG
TTACTACTGATGAAGCTGAAGCTTGGGAGTCTGCGAAGAAAGCAAGTGGAGGTTTGCATT
TTCTTGCAATTCAAGATGACTTGGATTCTGATGACTGTGTTGGCTTTTGGCTTCTTATTG
ATTTGCCACCACCTCCTGTTTAATTTCACTTTGGTAAATTGGTAATAACCATGTTTTGC
C

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR2EY59JQ 685 0 0
AGGTCACAGATGCAAACCATTATCACAAAAGCTTGCAAAGAGCTTTCTATAAAGGAAGTG
CCTAGTAAACGGTGTCTGTCTCTGTTTCTATGGTTGCAAGAACGTTATGACACTGTGTAC
ACGCGTCATCCCGGTTTCCAGAAGGGATCATTGCCTCTTCTGTCTCTAGACAACCCTTTT
CCAATGAATCTTCCTGAGAATTTGTTTGGGGAGAAATGGGCGTTTGTTCAGTTACCTTAC
TCAGCTGTTAGAGAAGAGATCTCAGACTTTGAGGAGAAGTTTGTGTTTGGTGCAACCTTA
GACTTGGATTTGCTTGGCATTGATGTTGATGAGAACACACTGATCCCTGGTCTCTCTGTT
GCTTCTTCACGTGCAAAACCTCTAGCAGCTTGGATGAATGGTCTTGAGGTGTGTTCTATC
GAAGCAGACAGTACAAAAGGATGTTTGATTCTAGCCGTTGGGATCTCGACAAGGTATGTC
TACGCAACGTACAAGAAAACACCTGTTACTACTGATGAAGCTGAAGCTTGGGAGTCTGCG
AAGAAAGCAAGTGGAGGTTTGCATTTTCTTGCAATTCAAGATGACTTGGATTCTGATGAC
TGTGTTGGCTTTTGGCTTCTTATTGATTTGCCACCACCTCCTGTTTAATTTCACTTTGGT
AAATTGGTAATAACCATGTTTTGC
C

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2AW35JQ 758 0 0
CGTTTCTTCAGGTCACAGATGCAAACCATTATCACAAAAGCTTGCAAAGAGCTTGCTATA
AAGGAAGTGCCTAGTAAACGGTGTCTGTCTCTGTTTCTATGGTTGCAAGAACGTTATGAC
ACTGTGTACACGCGTCATCCCGGTTTCCAGAAGGGATCATTGCCTCTTCTGTCTCTAGAC
AACCCTTTTCCAATGAATCTTCCTGAGAATTTGTTTGGGGAGAAATGGGCGTTTGTTCAG
TTACCTTACTCAGCTGTTAGAGAAGAGATCTCAGACTTTGAGGAGAAGTTTGTGTTTGGT
GCAACCTTAGACTTGGATTTGCTTGGCATTGACGTTGATGAGAACACACTGATCCCTGGT
CTCTCTGTTGCTTCTTCACGTGCAAAACCTCTAGCAGCTTGGATGAATGGTCTTGAGGTG
TGTTCTATCGAAGCAGACAGTACAAAAGGATGTTTGATTCTAGCCGTTGGGATCTCGACA
AGGTATGTTTACGCAACGTACAAGAAAACACCTGTTACTACTGATGAAGCTGAAGCTTGG
GAGTCTGCGAAGAAAGCAAGTGGAGGTTTGCATTTTCTTGCAATTCAAGATGACTTGGAT
TCTGATGACTGTGTTGGCTTTTGGCTTCTTATTGATTTGCCCCCCCCTCCTGTTTAATTT
CACTTTGGTAAATTGGTAATAACCATGTTTTGCTATTTAGTAAGCGAGTAGAACTGTGGG
TTTCTCTCACTCTTGAAAGAAATAGTTTACATGAAAAT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 8

CO CL740Contig1 713 8 17 U
GGACCTCACTCTCATTCTATAAGTAAACTAAAGAAGTATTTGATCATTTGAAAAAATGGC
ACAGGCAATGTTGAAGCCCTCTTTACAAGGAGAGGTTGAGGCAGATATTGAGATCAAAGC
TCCAGCCACGAAATTCTATCACATGTTTGCAGTGAGACCACAAGATGTGTCTAAAGCCTC
TCCTGAAAATGTCCAGAGATGTAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGAAGAGTTGGCACTCT
CGTCACCTGGAACTATTTTCATGATGGGAAGCCAAAGTTTGCTAGGGAGATGATCGAGGC
AGTGGACCCAAAAATGAATATGATAAAGTTCAGAGTGATAGAGGGAGATCTGATGGAAGA
GTTCAAGAACTTCCTATTCAAGATCCAGGTGACCCCTAAGAAAGGAGGACTTGGAGGTGT
GGTGAAATGGAGCATGTCATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCACCCAGAGTCTCT
GCTCAAACTGTGTGTCAAAATGGCCAAAGACATCGACGAAATGCTTTTGTCTAAGGAATA
GATATTCGTCAATTATCGGTTTATGTATCTATATTTATGTCTTTGG*******GTGTTTT
TTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTTAAATCAATAATGTGCTCTCTCTAGATCTAAAGAGA
TGTAAGTGATATAAAAGTGTGTAATCATAATATCTGTCTTTTACGAAAAAAAA


BQ
30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 25 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G595TF U 1
AF RR2BQ21JQ C 1
AF RR2G595JQ C 551
AF RR2E127JQ C 173
AF RR2AU81TF U 1
AF RR2E127TF U 1
AF RR2DJ67TF U 1
AF RR2BQ21TF U 1
BS 1 4 RR2E127TF
BS 5 66 RR2AU81TF
BS 67 67 RR2E127TF
BS 68 69 RR2AU81TF
BS 70 70 RR2E127TF
BS 71 118 RR2AU81TF
BS 119 119 RR2E127TF
BS 120 123 RR2AU81TF
BS 124 124 RR2E127TF
BS 125 300 RR2AU81TF
BS 301 301 RR2E127TF
BS 302 431 RR2AU81TF
BS 432 432 RR2E127TF
BS 433 557 RR2AU81TF
BS 558 558 RR2E127TF
BS 559 697 RR2AU81TF
BS 698 713 RR2BQ21TF

RD RR2G595TF 628 0 0
GGACCTCACTCTCATTCTATAAGTAAACTAAAGAAGTATTTGATCATTTGAAAAAATGGC
ACAGGCAATGTTGAAGCCCTCTTTACAAGGAGAGGTTGAGGCAGAT**TGAGATCAAAGC
TCCAGCCACGAAATTCTATCACATGTTTGCAGTGAGACCACAAGATGTGTCTAAAGCCTC
TCCTGAAAATGTCCAGAGATGTAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGAAGAGTTGGCACTCT
CGTCACCTGGAACTATTTTCATGATGGGAAGCCAAAGTTTGCTAGGGAGATGATCGAGGC
AGTGGACCCAAAAATGAATATGATAAAGTTCAGAGTGATAGAGGGAGATCTGATGGAAGA
GTTCAAGAACTTCCTATTCAAGATCCAGGTGACCCCTAAGAAAGGAGGACTTGGAGGTGT
GGTGAAATGGAGCATGTCATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCACCCAGAGTCTCT
GCTCAAACTGTGTGTCAAAATGGCCAAAGACATCGACGAAATGCTTTTGTCTAAGGAATA
GATATTCGTCAATTATCGGTTTATGTATCTATATTTATGTCTTTGG*******GTGTTTT
TTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTTAAA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2BQ21JQ 705 0 0
GGACCTCACTCTCATTCTATAAGTAAACTAAAGAAGTATTTGATCATTTGAAAAAATGGC
ACAGGCAATGTTGAAGCCCTCTTTACAAGGAGAGGTTGAGGCAGATATTGAGATCAAAGC
TCCAGCCACGAAATTCTATCACATGTTTGCAGTGAGACCACAAGATGTGTCTAAAGCCTC
TCCTGAAAATGTCCAGAGATGTAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGAAGAGTTGGCACTCT
CGTCACCTGGAACTATTTTCATGATGGGAAGCCAAAGTTTGCTAGGGAGATGATCGAGGC
AGTGGACCCAAAAATGAATATGATAAAGTTCAGAGTGATAGAGGGAGATCTGATGGAAGA
GTTCAAGAACTTCCTATTCAAGATCCAGGTGACCCCTAAGAAGGGAGGACTTGGAGGTGT
GGTGAAATGGAGCATGTCATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCACCCAGAGTCTCT
GCTCAAACTGTGTGTCAAAATGGCCAAAGACATCGACGAAATGCTTTTGTCTAAGGAATA
GATATTCGTCAATTATCGGTTTATGTATCTATATTTATGTCTTTGG*******GTGTTTT
TTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTTAAATCAATAATGTGCTCTCTCTAGATCTAAAGAGA
TGTAAGTGATATAAAAGTGTGTAATCATAATATCTGTCTTTTA
CG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2G595JQ 126 0 0
AATTATCGGTTTATGTATCTATATTTATGTCTTTGG*******GTGTTTTTTATTTTTAT
GTATTTGGGTGTTTTAAATCAATAATGTGCTCTCTCTAGATCTAAAGAGATGTAAGTGAT
ATAAAA

QA 1 126 1 126
DS 

RD RR2E127JQ 520 0 0
AAAGCCTCTCCTGAAAATGTCCAGAGATGTAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGAAGAGTT
GGCACTCTCGTCACCTGGAACTATTTTCATGATGGGAAGCCAAAGTTTGCTAGGGAGATG
ATCGAGGCAGTGGACCCAAAAATGAATATGATAAAGTTCAGAGTGATAGAGGGAGATTTG
ATGGAAGAGTTCAAGAACTTCCTATTCAAGATCCAGGTGACCCCTAAGAAAGGAGGACTT
GGAGGTGTGGTGAAATGGAGCATGTCATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCACCCA
GAGTCTCTGCTCAAACTGTGTGTCAAAATGGCCAAAGACATCGACGAAATGCTTTTGTCT
AAGGAATAGATATTCGTCAATTATCGGTTTATGTATCTATATTTATGTCTTTGG******
*GTGTTTTTTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTTAAATCAATAATGTGCTCTCTCTAGATC
TAAAGAGATGTAAGTGATATAAAAGTGTGTAATCATAATA

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2AU81TF 697 0 0
GGAT
CTCACTCTCATTCTATAAGTAAACTAAAGAAGTATTTGATCATTTGAAAAAATGGCACAG
GCGATATTGAAGCCCTCTTTACAAGGAGAGGTTGAGGCAGATATTGAGATCAAATCTCCG
GCCACGAAATTCTATCACATGTTTGCAGTGAGACCACAAGATGTGTCTAAAGCCTCTCCT
GAAAATGTCCAGAGATGTAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGAAGAGTTGGCACTCTCGTC
ACCTGGAACTATTTTCATGATGGGAAGCCAAAGTTTGCTAGGGAGATGATCGAGGCGGTG
GACCCAAAAATGAATATGATAAAGTTCAGAGTGATAGAGGGAGATCTGATGGAAGAGTTC
AAGAACTTCCTATTCAAGATCCAGGTGACCCCTAAGAAAGGAGGACTTGGAGGTGTGGTG
AAATGGAACATGTCATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCACCCAGAGTCTCTGCTC
AAACTGTGTGTCAAAATGGCCAAAGACATCGACGAAATGCTTTTGTCTAAGGAATAGATA
TTCGTCAATTATCTGTTTATGTATCTATATTTATGTCTTTGG*******GTGTTTTTTAT
CTTTATGTATTTGGGTGTTTTAAATCAATAATGTGCTCTCTCTAGATCTAAAGAGATGTA
AGTGATATAAAAGTGTGTAATCATAATATCTGT

QA 5 697 5 697
DS 

RD RR2E127TF 692 0 0
GGACCTCACTCTCATTCTATAAGTAAACTAAAGAAGTATTTGATCATTTGAAAAAATGGC
ACAGGCAATGTTGAAGCCCTCTTTACAAGGAGAGGTTGAGGCAGATATTGAGATCAAAGC
TCCAGCCACGAAATTCTATCACATGTTTGCAGTGAGACCACAAGATGTGTCTAAAGCCTC
TCCTGAAAATGTCCAGAGATGTAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGAAGAGTTGGCACTCT
CGTCACCTGGAACTATTTTCATGATGGGAAGCCAAAGTTTGCTAGGGAGATGATCGAGGC
AGTGGACCCAAAAATGAATATGATAAAGTTCAGAGTGATAGAGGGAGATCTGATGGAAGA
GTTCAAGAACTTCCTATTCAAGATCCAGGTGACCCCTAAGAAAGGAGGACTTGGAGGTGT
GGTGAAATGGAGCATGTCATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCACCCAGAGTCTCT
GCTCAAACTGTGTGTCAAAATGGCCAAAGACATCGACGAAATGCTTTTGTCTAAGGAATA
GATATTCGTCAATTATCGGTTTATGTATCTATATTTATGTCTTTGG*******GTGTTTT
TTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTTAAATCAATAATGTGCTCTCTCTAGATCTAAAGAGA
TGTAAGTGATATAAAAGTGTGTAATCATAATA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2DJ67TF 694 0 0
GGAT
CTCACTCTCATTCTATAAGTAAACTAAAGAAGTATTTGATCATTTGAAAAAATGGCACAA
GCAATGTTGAAGCCCTCTTTACAAGGAGAGGTTGAGGCAGATATTGAGATCAAAGCTTCG
GCCACGAAATTCTATCACATGTTTGCAGTGAGACCACAAGATGTGTCTAAAGCCTCTCCT
GAAAATGTCCAGAGATGCAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGAAGAGTTGGCACTCTCGTC
ACCTGGAACTATTTTCATGATGGGAAGCCAAATTTTGCTAGGGAGATGATCGAGGCAGTG
GACCCAAAAATGAATATGATAAAGTTCAGAGTGATAGAGGGAGATCTGATGGAAGAGTTC
AAGAACTTCCTATTCAAGATCCAGGTGACCCCTAAGAAAGGAGGACCTGGAGGTGTGGTG
AAATGGAACATGTCATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCACCCAGAGTCTCTGCTT
AAACTGTGTGTCAAAATGGCCAAAGACATCGACGAAATGCTTTTGTCTAAG*AATAGATA
TTCGTCAATTATCTGTTTATGTATCTATATTTATGTCTTTGGACTTTGGGTGTTTTTTAT
CTTTATGTATTTGGGTGTTTTAAATCAATAATGTGCTCTCTCTAGATCTAA*GAGATGTA
AGTGATATAAAAGTGTGTA
TCATATATCTG

QA 5 683 5 683
DS 

RD RR2BQ21TF 713 0 0
GGACCTCACTCTCATTCTATAAGTAAACTAAAGAAGTATTTGATCATTTGAAAAAATGGC
ACAGGCAATGTTGAAGCCCTCTTTACAAGGAGAGGTTGAGGCAGATATTGAGATCAAAGC
TCCAGCCACGAAATTCTATCACATGTTTGCAGTGAGACCACAAGATGTGTCTAAAGCCTC
TCCTGAAAATGTCCAGAGATGTAGTGTGCAAGAGGGAGAGATGGGAAGAGTTGGCACTCT
CGTCACCTGGAACTATTTTCATGATGGGAAGCCAAAGTTTGCTAGGGAGATGATCGAGGC
AGTGGACCCAAAAATGAATATGATAAAGTTCAGAGTGATAGAGGGAGATCTGATGGAAGA
GTTCAAGAACTTCCTATTCAAGATCCAGGTGACCCCTAAGAAGGGAGGACTTGGAGGTGT
GGTGAAATGGAGCATGTCATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCACCCAGAGTCTCT
GCTCAAACTGTGTGTCAAAATGGCCAAAGACATCGACGAAATGCTTTTGTCTAAGGAATA
GATATTCGTCAATTATCGGTTTATGTATCTATATTTATGTCTTTGG*******GTGTTTT
TTATCTTTATGTATTTGGGTGTTTTAAATCAATAATGTGCTCTCTCTAGATCTAAAGAGA
TGTAAGTGATATAAAAGTGTGTA*TCATAATATCTGTCTTTTACGAAAAAAAA

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 9

CO CL741Contig1 962 9 11 U
GGGAAGTTTTCCAAGATTTATATGTTAATTATTCAAAACACAAAAAGCAGTAAAAGTAGC
ATCTTAGCA*********TTAGAGAGAATGAAAAAAA*TCAACCTCACTCAAAGTACCCT
CGGGTACTATAGTAGGATATACAATAGCAGTTTTCTTGTTCTCCAAACAAGAAACAAGAA
AAAGCCCTAACTTAGAAGTCATTAGAAAGAAGTGGTTCATTTCCACTGCTAGCCATAAAG
ATAGTGTCATAAACAATAGCTGCGATTGCTGCACCAATAAATGGACCGAACCAATAGACC
CAATGGTTCGTCCAAGTCCAGCTCACCACAGCCGGACCAAATGAAACCGCCGGGTTCATC
GACGCACCGTCGAAAGCACCACCAACCAGAATATTAGCTCCAACTATCAACCCAATTGCC
AATGGAGCAATGATTCCTATATCACCTTTCTTGGGATCTACGGCAGTAGCGTAAACGGTG
TACACTAACCCAAACGTCATCACAATCTCGAAAACCACTGCGTTCCACGGCTCAACTCCA
TGGGAAAGAGAAAACGCTGTTGTTTCCATCCCACCAGTGCTTACCTTGAGCAACAAGCAA
GCTACGACTGCTCCAAGTAATTGAGCGATCCAGTAAAGTATAGCTCTTAACAACGTTATG
TTTCCACCCACGAAAGCTCCGAATGTAACCGCAGGGTTTACATGGCCGCCTGAAATGTTT
GCACCGACTGAAACCGCCACGAACAATGCAAATGCATGAGACAAAGACGCGGCCACTAAA
CCGGAAGGTGTAGCTGGACCATCTCCTGTTAGCTTTCCGTAAGCCATACCGGAACCTTGA
CCCGCAAAAACGAATATAACCATGGAGAAAAACTCCGCCAAAGCCGCTCTGATCGCATCT
GGATGGCTAGCTTCTCCTGGCGTTCCAATAGCGATTCTGTTGATAGCCATTGTTACAAAA
AA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 20 
20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E852JQ U 1
AF RR2FZ19JQ U 11
AF RR2F295JQ U 47
AF RR2AB22JQ U 5
AF RR2AP91JQ U 81
AF RR2AP91TF C 123
AF RR2FZ19TF C 227
AF RR2AB22TF C 282
AF RR2E852TF C 657
BS 1 69 RR2E852JQ
BS 70 78 RR2AB22JQ
BS 79 85 RR2E852JQ
BS 86 86 RR2AB22JQ
BS 87 106 RR2E852JQ
BS 107 107 RR2AB22JQ
BS 108 690 RR2E852JQ
BS 691 815 RR2AB22JQ
BS 816 923 RR2AP91JQ
BS 924 956 RR2AP91TF
BS 957 962 RR2E852TF

RD RR2E852JQ 690 0 0
GGGAAGTTTTCCAAGATTTATATGTTAATTATTCAAAACACAAAAAGCAGTAAAAGTAGC
ATCTTAGCACATGAAACATTAGAGATAATGAAAAAAA*TCAACCTCTCTCAAAGTACCCT
CGGGTACTATAGTAGGATATACAATAGCAGTTTTCTTGTTCTCCAAACAAGAAACAAGAA
AAAGCCCTAACTTAGAAGTCATTAGAAAGAAGTGGTTCATTTCCACTGCTAGCCATAAAG
ATAGTGTCATAAACAATAGCTGCGATTGCTGCACCAATAAATGGACCGAACCAATAGACC
CAATGGTTCGTCCAAGTCCAGCTCACCACAGCCGGACCAAATGAAACCGCCGGGTTCATC
GACGCACCGTCGAAAGCACCACCAACCAGAATATTAGCTCCAACTATCAACCCAATTGCC
AATGGAGCAATGATTCCTATATCACCTTTCTTGGGATCTACGGCAGTAGCGTAAACGGTG
TACACTAACCCAAACGTCATCACAATCTCGAAAACCACTGCGTTCCACGGCTCAACTCCA
TGGGAAAGAGAAAACGCTGTTGTTTCCATCCCACCAGTGCTTACCTTGAGCAACAAGCAA
GCTACGACTGCTCCAAGTAATTGAGCGATCCAGTAAAGTATAGCTCTTAACAACGTTATG
TTTCCACCCACGAAAGCTCCGAATGTAACC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2FZ19JQ 680 0 0
CCAAGATTTATATGTTAATTATTCAAAACACAAAAAGCAGTAAAAGTAGCATCTTAGCA*
********TTAGAGAGAATGAAAAAAA*TCAACCTCACTCAAAGTACCCTCGGGTACTAT
AGTAGGATATACAATAGCAGTTTTCTTGTTCTCCAAACAAGAAACAAGAAAAAGCCCTAA
CTTAGAAGTCATTAGAAAGAAGTGGTTCATTTCCACTGCTAGCCATAAAGATAGTGTCAT
AAACAATAGCTGCGATTGCTGCACCAATAAATGGACCGAACCAATAGACCCAATGGTTCG
TCCAAGTCCAGCTCACCACAGCCGGGCCAAATGAAACCGCCGGGTTCATCGACGCACCGT
CGAAAGCACCACCAACCAGAATATTAGCTCCAACTATCAACCCAATTGCCAATGGAGCAA
TGATTCCTATATCACCTTTCTTGGGATCTACGGCAGTAGCGTAAACGGTGTACACTAACC
CAAACGTCATCACAATCTCGAAAACCACTGCGTTCCACGGCTCAACTCCATGGGAAAGAG
AAAACGCTGTTGTTTCCATCCCACCAGTGCTTACCTTGAGCAACAAGCAAGCTACGACTG
CTCCAAGTAATTGAGCGATCCAGTAAAGTATAGCTCTTAACAACGTTATGTTTCCACCCA
CGAAAGCTCCGAATGTAACC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2F295JQ 716 0 0
GT
AGTAAAAGTAGCATCTTAGCA*********TTAGAGAGAATGAAAAAAA*TCAACCTCAC
TCAAAGTACCCTCGGGTACTATAGTAGGATATACAATAGCAGTTTTCTTGTTCTCCAAAC
AAGAAACAAGAAAAAGCCCTAACTTAGAAGTCATTAGAAAGAAGTGGTTCATTTCCACTG
CTAGCCATAAAGATAGTGTCATAAACAATAGCTGCGATTGCTGCACCAATAAATGGACCG
AACCAATAGACCCAATGGTTCGTCCAAGTCCAGCTCACCACAGCCGGACCAAATGAAACC
GCCGGGTTCATCGACGCACCGTCGAAAGCACCACCAACCAGAATATTAGCTCCAACTATC
AACCCAATTGCCAATGGAGCAATGATTCCTATATCACCTTTCTTGGGATCTACGGCAGTA
GCGTAAACGGTGTACACTAACCCAAACGTCATCACAATCTCGAAAACCACTGCGTTCCAC
GGCTCAACTCCATGGGAAAGAGAAAACGCTGTTGTTTCCATCCCACCAGTGCTTACCTTG
AGCAACAAGCAAGCTACGACTGCTCCAAGTAATTGAGCGATCCAGTAAAGTATAGCTCTT
AACAACGTTATGTTTCCACCCACGAAAGCTCCGAATGTAACCGCAGGGTTTACATGGCCG
CCTGAAATGTTTGCGCCGACTGAAACCGCCACGAACAATGCAAATGCATGAGAC

QA 3 716 3 716
DS 

RD RR2AB22JQ 811 0 0
AGTTTT
CCAAGATTTATATGTTAATTATTCAAAACACAAAAAGCAGTAAAAGTAGCATCTTAGCA*
********TTAGAGAGAATGAAAAAAAATCAACCTCACTCAAAGTACCCTCGGGTACTAT
AGTAGGATATACAATAGCAGTTTTCTTGTTCTCCAAACAAGAAACAAGAAAAAGCCCTAA
CTTAGAAGTCATTAGAAAGAAGTGGTTCATTTCCACTGCTAGCCATAAAGATAGTGTCAT
AAACAATAGCTGCGATTGCTGCACCAATAAATGGACCGAACCAATAGACCCAATGGTTCG
TCCAAGTCCAGCTCACCACAGCCGGACCAAATGAAACCGCCGGGTTCATCGACGCACCGT
CGAAAGCACCACCAACCAGAATATTAGCTCCAACTATCAACCCAATTGCCAATGGAGCAA
TGATTCCTATATCACCTTTCTTGGGATCTACGGCAGTAGCGTAAACGGTGTACACTAACC
CAAACGTCATCACAATCTCGAAAACCACTGCGTTCCACGGCTCAACTCCATGGGAAAGAG
AAAACGCTGTTGTTTCCATCCCATCAGTGCTTACCTTGAGCAACAAGCAAGCTACGACTG
CTCCAAGTAATTGAGCGATCCAGTAAAGTATAGCTCTTAACAACGTTATGTTTCCACCCA
CGAAAGCTCCGAATGTAACCGCAGGGTTTACATGGCCGCCTGAAATGTTTGCACCGACTG
AAACCGCCACGAACAATGCAAATGCATGAGACAAAGACGCGGCCACTAAACCGGAAGGTG
TAGCTGGACCATCTCCTGTTAGCTT

QA 7 811 7 811
DS 

RD RR2AP91JQ 843 0 0
AGAGATAATGAAAAAAA*TCAACCTCTCTCAAAGTACCCTCGGGTACTATAGTAGGATAT
ACAATAGCAGTTTTCTTGTTCTCCAAACAAGAAACAAGAAAAAGCCCTAACTTAGAAGTC
ATTAGAAAGAAGTGGTTCATTTCCACTGCTAGCCATAAAGATAGTGTCATAAACAATAGC
TGCGATTGCTGCACCAATAAATGGACCGAACCAATAGACCCAATGGTTCGTCCAAGTCCA
GCTCACCACAGCCGGACCAAATGAAACCGCCGGGTTCATCGACGCACCGTCGAAAGCACC
ACCAACCAGAATATTAGCTCCAACTATCAACCCAATTGCCAATGGAGCAATGATTCCTAT
ATCACCTTTCTTGGGATCTACGGCAGTAGCGTAAACGGTGTACACTAACCCAAACGTCAT
CACAATCTCGAAAACCACTGCGTTCCACGGCTCAACTCCATGGGAAAGAGAAAACGCTGT
TGTTTCCATCCCACCAGTGCTTACCTTGAGCAACAAGCAAGCTACAACTGCTCCAAGTAA
TTGAGCGATCCAGTAAAGTATAGCTCTTAACAACGTTATGTTTCCACCCACGAAAGCTCC
GAATGTAACCGCAGGGTTTACATGGCCGCCTGAAACGTTTGCACCGACTGAAACCGCCAC
GAACAATGCAAATGCATGAGACAAAGACGCGGCCACTAAACCGGAAGGTGCAGCTGGACC
ATCTCCTGTTAGCTTTCCGTAAGCCATACCGGAACCTTGACCCGCAAAAACGAATATAAC
CATGGAGAAAAACTCCGCCAAAGCCGCTCTGATCGCATCTGGATGGCTAGCTTCTCCTGG
CGT

QA 1 843 1 843
DS 

RD RR2AP91TF 834 0 0
GGTACTATAGTAGGATATACAATAGCAGTTTTCTG**TCTCCAAACAAGAAACA*GAAAA
AGCC*TAC**TAGAAGTCATTAGAAAGAAGTGGTTCATTTCCACTGCTAGCCATAAAGAT
AGTGTCATAAACAATAGCTGCGATTGCTGCACCAATAAATGGACCGAACCAATAGACCCA
ATGGTTCGTCCAAGTCCAGCTCACCACAGCCGGACCAAATGAAACCGCCGGGTTCATCGA
CGCACCGTCGAAAGCACCACCAACCAGAATATTAGCTCCAACTATCAACCCAATTGCCAA
TGGAGCAATGATTCCTATATCACCTTTCTTGGGATCTACGGCAGTAGCGTAAACGGTGTA
CACTAACCCAAACGTCATCACAATCTCGAAAACCACTGCGTTCCACGGCTCAACTCCATG
GGAAAGAGAAAACGCTGTTGTTTCCATCCCACCAGTGCTTACCTTGAGCAACAAGCAAGC
TACAACTGCTCCAAGTAATTGAGCGATCCAGTAAAGTATAGCTCTTAACAACGTTATGTT
TCCACCCACGAAAGCTCCGAATGTAACCGCAGGGTTTACATGGCCGCCTGAAACGTTTGC
ACCGACTGAAACCGCCACGAACAATGCAAATGCATGAGACAAAGACGCGGCCACTAAACC
GGAAGGTGCAGCTGGACCATCTCCTGTTAGCTTTCCGTAAGCCATACCGGAACCTTGACC
CGCAAAAACGAATATAACCATGGAGAAAAACTCCGCCAAAGCCGCTCTGATCGCATCTGG
ATGGCTAGCTTCTCCTGGCGTTCCAATAGCGATTCTGTTGATAGCCATTGTTAC

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR2FZ19TF 736 0 0
TGCTAGCCATAAAGATAGTGTCATAAACAATAGCTGCGATTGCTGCACCAATAAATGGAC
CGAACCAATAGACCCAATGGTTCGTCCAAGTCCAGCTCACCACAGCCGGGCCAAATGAAA
CCGCCGGGTTCATCGACGCACCGTCGAAAGCACCACCAACCAGAATATTAGCTCCAACTA
TCAACCCAATTGCCAATGGAGCAATGATTCCTATATCACCTTTCTTGGGATCTACGGCAG
TAGCGTAAACGGTGTACACTAACCCAAACGTCATCACAATCTCGAAAACCACTGCGTTCC
ACGGCTCAACTCCATGGGAAAGAGAAAACGCTGTTGTTTCCATCCCACCAGTGCTTACCT
TGAGCAACAAGCAAGCTACGACTGCTCCAAGTAATTGAGCGATCCAGTAAAGTATAGCTC
TTAACAACGTTATGTTTCCACCCACGAAAGCTCCGAATGTAACCGCAGGGTTTACATGGC
CGCCTGAAATGTTTGCACCGACTGAAACCGCCACGAACAATGCAAATGCATGAGACAAAG
ACGCGGCCACTAAACCGGAAGGTGTAGCTGGACCATCTCCTGTTAGCTTTCCGTAAGCCA
TACCGGAACCTTGACCCGCAAAAACGAATATAACCATGGAGAAAAACTCCGCCAAAGCCG
CTCTGATCGCATCTGGATGGCTGGCTTCTCCTGGCGTTCCAATAGCGATTCTGTTGATAG
CCATTGTTAC
AAAAAA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2AB22TF 675 0 0
TGGACCGAACCAATAGACCCAATGGTTCGTCCAAGTCCAGCTCACCACAGCCGGACCAAA
TGAAACCGCCGGGTTCATCGACGCACCGTCGAAAGCACCACCAACCAGAATATTAGCTCC
AACTATCAACCCAATTGCCAATGGAGCAATGATTCCTATATCACCTTTCTTGGGATCTAC
GGCAGTAGCGTAAACGGTGTACACTAACCCAAACGTCATCACAATCTCGAAAACCACTGC
GTTCCACGGCTCAACTCCATGGGAAAGAGAAAACGCTGTTGTTTCCATCCCATCAGTGCT
TACCTTGAGCAACAAGCAAGCTACGACTGCTCCAAGTAATTGAGCGATCCAGTAAAGTAT
AGCTCTTAACAACGTTATGTTTCCACCCACGAAAGCTCCGAATGTAACCGCAGGGTTTAC
ATGGCCGCCTGAAATGTTTGCACCGACTGAAACCGCCACGAACAATGCAAATGCATGAGA
CAAAGACGCGGCCACTAAACCGGAAGGTGTAGCTGGACCATCTCCTGTTAGCTTTCCGTA
AGCCATACCGGAACCTTGACCCGCAAAAACGAATATAACCATGGAGAAAAACTCCGCCAA
AGCCGCTCTGATCGCATCTGGATGGCTAGCTTCTCCTGGCGTTCCAATAGCGATTCTGTT
GATAGCCATTGTTAC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2E852TF 306 0 0
GTTATGTTTCCACCA
GAAAGCTCCGAATGTA*CCGCAGGGTTTACATGGCCGCCTGAAACGTTTGCACCGACTGA
AACCGCCACGAACAATGCAAATGCATGAGACAAAGACGCGGCCACTAAGCCGGAAGGTGT
AGCTGGACCATCTCCTGTTAGCTTTCCGTAAGCCATACCGGAACCTTGACCCGCAAAAAC
GAATATAACCATGGAGAAAAACTCCGCCAAAGCCGCTCTGATCGCATCTGGATGGCTAGC
TTCTCCTGGCGTTCCAATAGCGATTCTGTTGATAGCCATTGTTACAAAAAA

QA 16 306 16 306
DS 



AS 3 9

CO CL742Contig1 735 2 2 U
GGATGGCCTCTATTTCTAGAGTTTTGCCGACACACGGCAGAGTAAGGAGCCAATGGCTTC
CTGCTCTCACTACGACAAGATCTCAAACTCAATCTTTAGATTCTCTAAACCTGTTTCCTG
TTAGTAAAACTGGAATAAGTTTGAGGGTTCAGAGCAGTAAACCTTTAAGCTCTGTCTTTG
CGCTTGACTCAGCTTCCTCCAGGAGCAGCAAGGTTGCTTGCAATGCTGCTGCAGATCTGT
CTGGTGAAAGCAGCAGTCCTAAGGAACTCAGCCAGTACGAGAAGACTATTGAGCTTTTGA
CCACTCTTTTCCCGCTTTGGGTTATTTTGGGAACACTTGTTGGCATCTTCAAGCCATCTT
TGGTTACATGGCTGGAAACGAACCTATTTACTCTAGGTCTGGGGTTTCTCATGCTCTCCA
TGGGGTTAACTCTTACCTTTGAAGACTTCAGAAGATGCTTACGTAATCCTTGGACGGTTG
GGGTTGGTTTTCTTGCTCAGTATATGATCAAACCAGTGCTAGGTTTTCTCATTGCAATGA
CACTTAAGCTTTCGGCACCTCTTGCAACTGGTCTTATCCTGGTCTCATGACAACGTGTTC
AACCATTGGAGCTATTATAATGACTCCTCTTCTCACTAAGCTTCTTGCTGGCCAGTTTGT
TCCTGTTGATGCTGCTGGACTTGCTCTTAGCACTTTTCAAGTAGTGTTGGTGCCTACTAT
AGTTGGAGTCTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB33TF U 1
AF RR2EK14TF U 130
BS 1 589 RR2CB33TF
BS 590 735 RR2EK14TF

RD RR2CB33TF 602 0 0
GGATGGCCTCTATTTCTAGAGTTTTGCCGACACACGGCAGAGTAAGGAGCCAATGGCTTC
CTGCTCTCACTACGACAAGATCTCAAACTCAATCTTTAGATTCTCTAAACCTGTTTCCTG
TTAGTAAAACTGGAATAAGTTTGAGGGTTCAGAGCAGTAAACCTTTAAGCTCTGTCTTTG
CGCTTGACTCAGCTTCCTCCAGGAGCAGCAAGGTTGCTTGCAATGCTGCTGCAGATCTGT
CTGGTGAAAGCAGCAGTCCTAAGGAACTCAGCCAGTACGAGAAGACTATTGAGCTTTTGA
CCACTCTTTTCCCGCTTTGGGTTATTTTGGGAACACTTGTTGGCATCTTCAAGCCATCTT
TGGTTACATGGCTGGAAACGAACCTATTTACTCTAGGTCTGGGGTTTCTCATGCTCTCCA
TGGGGTTAACTCTTACCTTTGAAGACTTCAGAAGATGCTTACGTAATCCTTGGACGGTTG
GGGTTGGTTTTCTTGCTCAGTATATGATCAAACCAGTGCTAGGTTTTCTCATTGCAATGA
CACTTAAGCTTTCGGCACCTCTTGCAACTGGTCTTATCCTGGTCTCATG
CTGCCCTGGAGGA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2EK14TF 606 0 0
G
TGGAATAAGTTTGAGGGTTCAGAGCAGTAAACCTTTAAGCTCTGTCTTTGCGCTTGACTC
AGCTTCCTCCAGGAGCAGCAAGGTTGCTTGCAATGCTGCTGCAGATCTGTCTGGTGAAAG
CAGCAGTCCTAAGGAACTCAGCCAGTACGAGAAGACTATTGAGCTTTTGACCACTCTTTT
CCCGCTTTGGGTTGTTTTGGGAACACTTGTTGGCATCTTCAAGCCATCTTTGGTTACATG
GCTGGAAACGGACCTATTTACTCTAGGTCTGGGGTTTCTCATGCTCTCCATGGGGTTAAC
TCTTACCTTTGAAGACTTCAGAAGATGTTTACGTAATCCTTGGACGGTTGGGGTTGGTTT
TCTTGCTCAGTATATGATCAAACCAGTGCTAGGTTTTCTCATTGCAATGACACTTAAGCT
TTCGGCACCTCTTGCAACTGGTCTTATCCTGTTCTCATGACAACGTGTTCAACCATTGGA
GCTATTATAATGACTCCTCTTCTCACTAAGCTTCTTGCTGGCCAGTTTGTTCCTGTTGAT
GCTGCTGGACTTGCTCTTAGCACTTTTCAAGTAGTGTTGGTGCCTACTATAGTTGGAGTC
TTGGC

QA 2 606 2 606
DS 



CO CL742Contig2 988 3 20 U
GGTTTTCTTGCTCAGTATATGATCAAACCAGTGCTATGTTTTCTCATTGCAATGACACTT
AAGCTTTCGGCACCACTTGCAACTGGTCTTATTCTGGTCTCATGCTGCCCTGGAGGACAG
GCGTCTAACGTTGCAACCTACATTTCCAAGGGGAACGTTGCGCTCTCTGTACTCATGACA
ACGTGTTCAACCATTGGGGCTATTATAATGACTCCTCTTCTCACTAAGCTTCTTGCTGGC
CAGCTTGTTCCCGTTGATGCTGCTGGACTTGCTCTTAGCACTTTTCAAGTAGTGTTGGTG
CCTACTATAGTTGGAGTTTTGGCCAATGAGTTCTTTCCTAAATTCACGTCGAAGATTATA
TCAGTGACACCTCTAATCGGAGTCATTCTGACCACTCTTCTCTGTGCTAGCCCTATTGGA
CAAGTTTCAGCGGTTTTGAAAACACAAGGAGCTCAGCTTATACTCCCAGTGGCACTCCTT
CATGCTGCAGCCTTTGCAATTGGCTATTGGATTTCAAAGTTCTCTTTCGGCGAGTCCACG
TCTCGCACCATTTCTATTGAATGTGGAATGCAAAGCTCAGCGCTGGGGTTCTTGCTAGCA
CAAAAGCATTTCACAAACCCTCTTGTGGCTGTTCCTTCTGCAGTCAGTGTCGTCTGCATG
GCGCTCGGCGGGAGTGGCTTAGCCGTGTTCTGGAGGAACCAACCGATTCCAGAAGATGAC
AAGGATGACTTCAAAGAGTGAAAGAATGAAGTAGGAGAATCTATTTTGTGTGGTTTGTTG
TAATGTTTGTAGACTTGCTCCCTTGGATTTTTATTGAAAGACATAAAACAAAATCTGTGT
TAGGAAGACAAAAGCAAGATCTTGCATGTTTGATTCGTTGTCAATTTTTTGTTTTGGGTT
ATTATGATGAACTATAGATTATCCATCTACTTGTATTAATTTATTTGGCAAGACATGCCT
CCTGCTGTGATGTGCTGCTAGCCCAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM78TF U 1
AF RR2EM78JQ C 662
AF RR2FG92TF U 271
BS 1 539 RR2EM78TF
BS 540 540 RR2FG92TF
BS 541 555 RR2EM78TF
BS 556 558 RR2FG92TF
BS 559 594 RR2EM78TF
BS 595 595 RR2FG92TF
BS 596 618 RR2EM78TF
BS 619 619 RR2FG92TF
BS 620 697 RR2EM78TF
BS 698 698 RR2FG92TF
BS 699 701 RR2EM78TF
BS 702 702 RR2FG92TF
BS 703 727 RR2EM78TF
BS 728 742 RR2FG92TF
BS 743 743 RR2EM78JQ
BS 744 745 RR2FG92TF
BS 746 746 RR2EM78JQ
BS 747 831 RR2FG92TF
BS 832 832 RR2EM78JQ
BS 833 988 RR2FG92TF

RD RR2EM78TF 727 0 0
GGTTTTCTTGCTCAGTATATGATCAAACCAGTGCTATGTTTTCTCATTGCAATGACACTT
AAGCTTTCGGCACCACTTGCAACTGGTCTTATTCTGGTCTCATGCTGCCCTGGAGGACAG
GCGTCTAACGTTGCAACCTACATTTCCAAGGGGAACGTTGCGCTCTCTGTACTCATGACA
ACGTGTTCAACCATTGGGGCTATTATAATGACTCCTCTTCTCACTAAGCTTCTTGCTGGC
CAGCTTGTTCCCGTTGATGCTGCTGGACTTGCTCTTAGCACTTTTCAAGTAGTGTTGGTG
CCTACTATAGTTGGAGTTTTGGCCAATGAGTTCTTTCCTAAATTCACGTCGAAGATTATA
TCAGTGACACCTCTAATCGGAGTCATTCTGACCACTCTTCTCTGTGCTAGCCCTATTGGA
CAAGTTTCAGCGGTTTTGAAAACACAAGGAGCTCAGCTTATACTCCCAGTGGCACTCCTT
CATGCTGCAGCCTTTGCAATTGGCTATTGGATTTCAAAGTTCTCTTTCGGCGAGTCCACT
TCTCGCACCATTTCTC**GAATGTGGAATGCAAAGCTCAGCGCTGGGGTTCTTGTTAGCA
CAAAAGCATTTCACAAACTCTCTTGTGGCTGTTCCTTCTGCAGTCAGTGTCGTCTGCATG
GCGCTCGGCGGGAGTGGCTTAGCCGTGTTCTGGAGGACCCA*CCGATTCCAGAAGATGAC
AAGGATG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2EM78JQ 241 0 0
CGCTCGGCGGGAGTGGTTTAGCCGTGTTCTGGAGGAACCAACCGATTCCAGAAGATGACA
AGGATGACTTCAAAGAGTGAAAGAATGAAGTAGGAGAATTTATTTTGTGTGGTTTGTTGT
AATGTTTGTAGACTTGCTCCCTTGGATTTTTATTGAAAGACATAAAACAAAATCTGTGTT
AGGAAGACAAAAGCAAGATCTTGCATGTTTGATTCGTTGTCAATTTTT*GTTTTGGG
TTAC

QA 1 237 1 237
DS 

RD RR2FG92TF 718 0 0
GCTCTTAGCACTTTTCAAGTAGTGTTGGTGCCTACTATAGTTGGAGTTTTGGCCAATGAG
TTCTTTCCTAAATTCACGTCGAAGATTATATCAGTGACACCTCTAATCGGAGTCATTCTG
ACCACTCTTCTCTGTGCTAGCCCTATTGGACAAGTTTCAGCGGTTTTGAAAACACAAGGA
GCTCAGCTTATACTCCTAGTGGCACTCCTTCATGCTGCAGCCTTTGCAATTGGCTATTGG
ATTTCAAAGTTCTCTTTCGGCGAGTCTACGTCTCGCACCATTTCTATTGAATGTGGAATG
CAAAGCTCAGCGCTGGGGTTCTTGCTAGCACAAAAGCATTTCACAAACCCTCTTGTGGCT
GTTCCTTCTGCAGTCAGTGTCGTCTGCATGGCGCTCGGCGGGAGTGGCTTAGCCGTGTTC
TGGAGGAACCAACCGATTCCAGAAGGTGACAAGGATGACTTCAAAGAGTGAATGATTGAA
GTAGGAGAATCTATTTTGTGTGGTTTGTTGTAATGTTTGTAGACTTGCTCCCTTGGATTT
TTATTGAAAGACATAAAACAAGATCTGTGTTAGGAAGACAAAAGCAAGATCTTGCATGTT
TGATTCGTTGTCAATTTTTTGTTTTGGGTTATTATGATGAACTATAGATTATCCATCTAC
TTGTATTAATTTATTTGGCAAGACATGCCTCCTGCTGTGATGTGCTGCTAGCCCAAGA

QA 1 718 1 718
DS 



CO CL742Contig3 844 4 4 U
GGTCTTATCCTGGTCTCATGCTGCCCTGGAGGACAGGCCTCCAACGTTGCAACCTACATT
TCCAAGGGGAACGTTGCGCTCTCTGTTCTCATGACAACGTGTTCAACCATTGGAGCTATT
ATAATGACTCCTCTTCTCACTAAGCTTCTTGCTGGCCAGCTTGTTCCTGTTGATGCTGCT
GGACTTGCTCTTAGCACTTTTCAAGTAGTGTTGGTGCCTACTATAGTTGGAGTTTTGGCC
AATGAGTTCTTTCCTAAATTCACGTCGAAGATTATATCAGTGACACCTCTAATTGGAGTC
ATTCTGACCACTCTTCTCTGTGCTAGCCCTATTGGACAAGTTTCAGCGGTTTTGAAAACA
CAAGGAGCTCAACTTATACTCCCTGTGGCACTCCTTCACGCTGCAGCCTTTGCTATTGGC
TATTGGATTTCAAAGTTCTCTTTCGGCGAGTCTACGTCCCGTACCATTTCTATAGAGTGT
GGAATGCAAAGCTCAGCGCTGGGGTTCTTGCTAGCACAAAAGCATTTCACAAACCCTCTT
GTGGCTGTTCCTTCTGCAGTCAGTGTTGTCTGCATGGCGCTCGGCGGGAGTGGCTTAGCC
GTGTTCTGGAGGAACCAACCGATTCCAGAAGATGACAAGGATGACTTCAAAGAGTGAAAG
AATGAATTGAAGTAGGAGAATCTATTTTGTGTGGTTTGTTGTAATGTTTGTAGACTTGCT
CCCTTGGATTTTTATTGAAAGACATAAAACAAGATCTGTGTTAGGAAGACAAAAGCAAGA
TCTTGCATGTTTGATTCGTTGTCAATTTTTGTTTTGGGTTATTATGCTGAACTATAGATT
ATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2EP83TF U 1
AF RR2CX11TF U 57
AF RR2EP83JQ C 64
AF RR2EK14JQ C 117
BS 1 607 RR2EP83TF
BS 608 666 RR2CX11TF
BS 667 810 RR2EP83JQ
BS 811 844 RR2EK14JQ

RD RR2EP83TF 607 0 0
GGTCTTATCCTGGTCTCATGCTGCCCTGGAGGACAGGCCTCCAACGTTGCAACCTACATT
TCCAAGGGGAACGTTGCGCTCTCTGTTCTCATGACAACGTGTTCAACCATTGGAGCTATT
ATAATGACTCCTCTTCTCACTAAGCTTCTTGCTGGCCAGCTTGTTCCTGTTGATGCTGCT
GGACTTGCTCTTAGCACTTTTCAAGTAGTGTTGGTGCCTACTATAGTTGGAGTTTTGGCC
AATGAGTTCTTTCCTAAATTCACGTCGAAGATTATATCAGTGACACCTCTAATTGGAGTC
ATTCTGACCACTCTTCTCTGTGCTAGCCCTATTGGACAAGTTTCAGCGGTTTTGAAAACA
CAAGGAGCTCAACTTATACTCCCTGTGGCACTCCTTCACGCTGCAGCCTTTGCTATTGGC
TATTGGATTTCAAAGTTCTCTTTCGGCGAGTCTACGTCCCGTACCATTTCTATAGAGTGT
GGAATGCAAAGCTCAGCGCTGGGGTTCTTGCTAGCACAAAAGCATTTCACAAACCCTCTT
GTGGCTGTTCCTTCTGCAGTCAGTGTTGTCTGCATGGCGCTCGGCGGGAGTGGCTTAGCC
GTGTTCT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2CX11TF 615 0 0
GATTTCC
AAGGGGAACGTTGCGCTCTCTGTTCTCATGACAACGTGTTCAACCATTGGAGCTATTATA
ATGACTCCT*TTCTCACTAAGCTTCTTGCTGGCCAGCTTGTTCCTGTTGATGCTGCTGGA
CTTGCTCTTAGCACTTTTCAAGTAGTGTTGGTGCCTACTATAGTTGGAGTTTTGGCCAAT
GAGTTCTTTCCTAAATTCACGTCGAAGATTATATCAGTGACACCTCTAATTGGAGTCATT
CTGACCACTCTTCTCTGTGCTAGCCCTATTGGACAAGTTTCAGCGGTTTTGAAAACACAA
GGAGCTCAACTTATACTCCCTGTGGCACTCCTTCACGCTGCAGCCTTTGCTATTGGCTAT
TGGATTTCAAAGTTCTCTTTCGGCGAGTCTACGTCCCGTACCATTTCTATAGAGTGTGGA
ATGCAAAGCTCAGCGCTGGGGTTCTTGCTAGCACAAAAGCATTTCACAAACCCTCTTGTG
GCTGTTCCTTCTGCAGTCAGTGTTGTCTGCATGGCGCTCGGCGGGAGTGGCTTAGCCGTG
TTCTGGAGGAACCAACCGATTCCAGAAGATGACAAGGATGACTTCAAAGAGTGAAAGAAT
GAA
TTGAA

QA 8 610 8 610
DS 

RD RR2EP83JQ 755 0 0
AAGGGGAACGTTGCGCTCTCTGTTCTCATGACAACGTGTTCAACCATTGGAGCTATTATA
ATGACTCCTCTTCTCACTAAGCTTCTTGCTGGCCAGCTTGTTCCTGTTGATGCTGCTGGA
CTTGCTCTTAGCACTTTTCAAGTAGTGTTGGTGCCTACTATAGTTGGAGTTTTGGCCAAT
GAGTTCTTTCCTAAATTCACGTCGAAGATTATATCAGTGACACCTCTAATTGGAGTCATT
CTGACCACTCTTCTCTGTGCTAGCCCTATTGGACAAGTTTCAGCGGTTTTGAAAACACAA
GGAGCTCAACTTATACTCCCTGTGGCACTCCTTCACGCTGCAGCCTTTGCTATTGGCTAT
TGGATTTCAAAGTTCTCTTTCGGCGAGTCTACGTCCCGTACCATTTCTATAGAGTGTGGA
ATGCAAAGCTCAGCGCTGGGGTTCTTGCTAGCACAAAAGCATTTCACAAACCCTCTTGTG
GCTGTTCCTTCTGCAGTCAGTGTTGTCTGCATGGCGCTCGGCGGGAGTGGCTTAGCCGTG
TTCTGGAGGAACCAACCGATTCCAGAAGATGACAAGGATGACTTCAAAGAGTGAAAGAAT
GAATTGAAGTAGGAGAATCTATTTTGTGTGGTTTGTTGTAATGTTTGTAGACTTGCTCCC
TTGGATTTTTATTGAAAGACATAAAACAAGATCTGTGTTAGGAAGACAAAAGCAAGATCT
TGCATGTTTGATTCGTTGTCAATTTTT
GTTTTGGG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2EK14JQ 728 0 0
TATTATAATGACTCCTCTTCTCACTAAGCTTCTTGCTGGCCAGTTTGTTCCTGTTGATGC
TGCTGGACTTGCTCTTAGCACTTTTCAAGTAGTGTTGGTGCCTACTATAGTTGGAGTCTT
GGCCAATGAGTTCTTTCCTAAATTCACGTCGAAGATTATATCAGTGACACCTCTAATTGG
AGTCATTCTGACCACTCTTCTCTGTGCTAGCCCTATTGGACAAGTTTCAGCGGTTTTGAA
AACACAAGGAGCTCAACTTATACTCCCTGTGGCACTCCTTCACGCTGCAGCCTTTGCTAT
TGGCTATTGGATTTCAAAGTTCTCTTTCGGCGAGTCTACGTCCCGTACCATTTCTATAGA
GTGTGGAATGCAAAGCTCAGCGCTGGGGTTCTTGCTAGCACAAAAGCATTTCACAAACCC
TCTTGTGGCTGTTCCTTCTGCAGTCAGTGTTGTCTGCATGGCGCTCGGCGGGAGTGGCTT
AGCCGTGTTCTGGAGGAACCAACCGATTCCAGAAGATGACAAAGATGACTTCAAAGAGTG
AAAGAATGAATTGATGTAGGAGAATCTATTTTGTGTGGTTTGTTGTAATGTTTGTAGACT
TGCTCCCTTGGATTTTTATTGAAAGACATAAAACAAGATCTGTGTTAGGAAGACAAAAGC
AAGATCTTGCATGTTTGATTCGTTGTCAATTTTTGTTTTGGGTTATTATGCTGAACTATA
GATTATCC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 8

CO CL743Contig1 1002 8 7 U
ACGAAGAATATTGAGATTCGTTATCAAAGATCTCAAGAAATATCCATAAATTGCTATCGA
TCCAACTCCGACATTTCATAAAATAACAACAGCTGTTGCTAGGAAATCCACTAGAGTACA
AAGTAATTTAACATGACACGAAATAACATAAAAAGAAAGCCTTATTGAAAGATCTCCAGG
CAGCATGTGGATGATTAGGCTTCTTTACCAGGAGCCTTCAGCACCAGCAGTCGGATTGTT
GAACGCCTTGAATTCCCAGAATGTCTTCAATGAGTATGGCTGAAAAACCGTCACGCCTTC
TTCTGTGATCTTCGCGATCTGAAGCTTGTTAATAGCAGATCTGTCACGGTAGAGAAGCAC
ACGCATACATTTCTCAAGGAGCTTGACACCATCTTCAAAGCTTAGATCCGCATGCCACTC
ATCACGAAGAATTGGCCTGGCGAGATGGTTTCCAAATCCGGTGGCAACATGATTGTCCTC
GAAACTAACACCAATCATTGACACCATGCCAAGGTAAGTTTCGCCATTTTTGACACCTCC
AAGGACGAGAGTGTTCCAGAGAGGGTTAAACTTGTTGCGACGGTTGTACATCACTCGGGT
CAGATAGTTGTGCACCTCTTTTGGTCCCAGAGAGTTACCATCATCCCACATGCTATCATT
CAACACGAGCTCATCAAGATAACGGAGAATCTCCTGAAAGTCACTGATCTCTCCACTGGC
GCCGAGAAGAGAATGCTTACCAATAGCCTTCATTCTCTCAATGTTCTTGTACCTTAAGGT
GGATCCATATGAACCTCCCATGTCGGAAGCCATTAAAACCCCATCTTTGTACTTGATTGC
GACGATCGAAGTCCCAGTAACATATGGATACAGTGTTCTTTGTGAATCAGCTTCTGCGTT
CTTCACGGAATCTCCGTTCTCGATCGGAATGGTAAAAGTCATCTTTTTTCTTCTTCTTCT
TCTTCGAGAGAGGTTAGGTTCTTTTCTTCTAAGATCTCCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2F376JQ U 4
AF RR2G603JQ U 29
AF RR2EF48JQ U 1
AF RR2GS29JQB U 58
AF RR2AG09JQ U 17
AF RR2F376TF C 300
AF RR2EF48TF C 411
AF RR2G603TF C 301
BS 1 614 RR2EF48JQ
BS 615 803 RR2AG09JQ
BS 804 871 RR2F376TF
BS 872 872 RR2EF48TF
BS 873 968 RR2F376TF
BS 969 969 RR2EF48TF
BS 970 1002 RR2F376TF

RD RR2F376JQ 356 0 0
AAA
AATATTGAGATTCGTTATCAAAGATCTCAAGAAATATCCATAAATTGCTATCGATCCAAC
TCCGACATTTCATAAAATAACAACAGCTGTTGCTAGGAAATCCACTAGAGTACAAAGTAA
TTTAACATGACACGAAATAACATAAAAAGAAAGCCTTATTGAAAGATCTCCAGGCAGCAT
GTGGATGATTAGGCTTCTTTACCAGGAGCCTTCAGCACCAGCAGTCGGATTGTTGAACGC
CTTGAATTCCCAGAATGTCTTCAATGAGTATGGCTGAAAAACCGTCCCGCCTTCTTCTGT
GATCTTCGCGATCTGAAGCTTGTTAATAGCAAATCTGTCACGGTAGAAAAGCA

QA 4 356 4 356
DS 

RD RR2G603JQ 402 0 0
GGTC
TCAAGAAATATCCATAAATTGCTATCGATCCAACTCCGACATTTCATAAAATAACAACAG
CTGTTGCTAGGAAATCCACTAGAGTACAAAGTAATTTAACATGACACGAAATAACATAAA
AAGAAAGCCTTATTGAAAGATCTCCAGGCAGCATGTGGATGATTAGGCTTCTTTACCAGG
AGCCTTCAGCACCAGCAGTCGGATTGTTGAACGCCTTGAATTCCCAGAATGTCTTCAATG
AGTATGGCTGAAAAACCGTCACGCCTTCTTCTGTGATCTTCGCGATCTGAAGCTTGTTAA
TAGCAGATCTGTCACGGTAGAGAAGCACACGCATACATTTCTCAAGGAGCTTGACACCAT
CTTCAAAGCTTAGATCCGCATGCCACTCATCACGAAGA

QA 5 402 5 402
DS 

RD RR2EF48JQ 614 0 0
ACGAAGAATATTGAGATTCGTTATCAAAGATCTCAAGAAATATCCATAAATTGCTATCGA
TCCAACTCCGACATTTCATAAAATAACAACAGCTGTTGCTAGGAAATCCACTAGAGTACA
AAGTAATTTAACATGACACGAAATAACATAAAAAGAAAGCCTTATTGAAAGATCTCCAGG
CAGCATGTGGATGATTAGGCTTCTTTACCAGGAGCCTTCAGCACCAGCAGTCGGATTGTT
GAACGCCTTGAATTCCCAGAATGTCTTCAATGAGTATGGCTGAAAAACCGTCACGCCTTC
TTCTGTGATCTTCGCGATCTGAAGCTTGTTAATAGCAGATCTGTCACGGTAGAGAAGCAC
ACGCATACATTTCTCAAGGAGCTTGACACCATCTTCAAAGCTTAGATCCGCATGCCACTC
ATCACGAAGAATTGGCCTGGCGAGATGGTTTCCAAATCCGGTGGCAACATGATTGTCCTC
GAAACTAACACCAATCATTGACACCATGCCAAGGTAAGTTTCGCCATTTTTGACACCTCC
AAGGACGAGAGTGTTCCAGAGAGGGTTAAACTTGTTGCGACGGTTGTACATCACTCGGGT
CAGATAGTTGTGCA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2GS29JQB 587 0 0
CGATCCAACTCCGACATTTCATAAAATAACAACAGCTGTTGCTAGGAAATCCACTAGAGT
ACAAAGTAATTTAACATGACACGAAATAACATAAAAAGAAAGCCTTATTGAAAGATCTCC
TGGCAGCATGTGGATGATTAGGCTTCTTTACCAGGAGCCTTCAGCACCAGCAGTCGGATT
GTTGAACGCCTTGAATTCCCAGAATGTCTTCAATGAGTAGGGCTGAAAAACCGTCACGCC
TTCTTCTGTGATCTTCGCGATCTGAAGCTTGTTAATAGCAAATCTGTCACGGTAGAGAAG
CACACGCATACATTTCTCAAGGAGCTTGACACCATCTTCAAAGCTTAAATCCGCATGCCA
CTCATCACGAAGAATTGGCCTGGCGAGATGGTTTCCAAATCCGGTGGCAACATGATTGTC
CTCGAAACTAACACCAATCATTGACACCATGCCAAGGTAAGTTTCGCCATTTTTGACACC
TCCAAGGACGAGAGTGTTCCAGAGAGGGTTAAACTTGTTGCGACGGTTGTACATCACTCG
GGTCAGATAGTTGTGCACCTCTTTTGGTCCCAGAGAGTTACCATCAT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2AG09JQ 787 0 0
CA
CGTTACCAAAGATGTCAAGAAATATCCATAAATTGCTATCGATCCAACTCCGAAATTTCA
TGAAATAACAACAGCTGTTGCTAGGAAATCCACTAGAGTACAAAGTAATTTAACATGACA
CGAAATAAAATAAAAAGAAAGCCTTCTTGAAAGATCTCCAGGCAGCATGTGGATGATTAG
GCTTCTTTACCAGGAGCCTTCAGCACCAGCAGTCGGATTGTTGAACGCCTTGAATTCCCA
AAATGTCTTCAATGAGTATGGCTGAAAAACCGTCACGCCTTCTTCTGTGATCTTAGCTAT
CTGAAGCTTGTTAATAGCAGATCTGTCACGGTAGAGAAGCACACGCATACATTTCTCAAG
GAGCTTGACACCATCTTCAAAGCTTAGATCCGCATGCCACTCATCACGAAGAATAGGCCT
GGCGAGATGGTTTCCAAATCCGGTGGCAACATGATTGTCCTCGAAACTAACACCAATCAT
TGACACCATGCCGAGGTAAGTTTCGCCATTCTTGACACCTCCAAGGACGAGAGTGTTCCA
GAGAGGGTTAAACTTGTTGCGACGGTTGTACATCACTCGGGTCAGATAGTTGTGCACCTC
TTTTGGTCCCAGAGAGTTACCATCATCCCACATGCTATCATTCAACACGAGCTCATCAAG
ATAACGGAGAATCTCCTGAAAGTCACTGATCTCTCCACTGGCGCCGAGAAGAGAATGCTT
ACCAATAGCCTTCATTCTCTCAATGTTCTTGTACCTTAAGGTGGATCCATATGAACCTCC
CATGT

QA 3 787 3 787
DS 

RD RR2F376TF 703 0 0
CTTCTGTGATCTTCGCGATCTGAAGCTTGTTAATAGCAGATCTGTCACGGTAGAGAAGCA
CACGCATACATTTCTCAAGGAGCTTGACACCATCTTCAAAGCTTAGATCCGCATGCCACT
CATCACGAAGAATTGGCCTGGCGAGATGGTTTCCAAATCCGGTGGCAACATGATTGTCCT
CGAAACTAACACCAATCATTGACACCATGCCAAGGTAAGTTTCGCCATTTTTGACACCTC
CAAGGACGAGAGTGTTCCAGAGAGGGTTAAACTTGTTGCGACGGTTGTACATCACTCGGG
TCAGATAGTTGTGCACCTCTTTTGGTCCCAGAGAGTTACCATCATCCCACATGCTATCAT
TCAACACGAGCTCATCAAGATAACGGAGAATCTCCTGAAAGTCACTGATCTCTCCACTGG
CGCCGAGAAGAGAATGCTTACCAATAGCCTTCATTCTCTCAATGTTCTTGTACCTTAAGG
TGGATCCATATGAACCTCCCATGTCGGAAGCCATTAAAACCCCATCTTTGTACTTGATTG
CGACGATCGAAGTCCCAGTAACATATGGATACGGTGTTCTTTGTGAATCAGCTTCTGCGT
TCTTCACGGAATCTCCGTTCTCGATCGGAATGGTAAAAGTCATCTTTTTTCTTCTTCTTC
TTCTTCGAGCGAGGTTAGGTTCTTTTCTTCTAAGATCTCCCCT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2EF48TF 589 0 0
CATGCCACTCATCACGAAGAATTGGCCTGGCGAGATGGTTTCCAAATCCGGTGGCAACAT
GATTGTCCTCGAAACTAACACCAATCATTGACACCATGCCAAGGTAAGTTTCGCCATTTT
TGACACCTCCAAGGACGAGAGTGTTCCAGAGAGGGTTAAACTTGTTGCGACGGTTGTACA
TCACTCGGGTCAGATAGTTGTGCACCTCTTTTGGTCCCAGAGAGTTACCATCATCCCACA
TGCTATCATTCAACACGAGCTCATCAAGATAACGGAGAATCTCCTGAAAGTCACTGATCT
CTCCACTGGCGCCGAGAAGAGAATGCTTACCAATAGCCTTCATTCTCTCAATGTTCTTGT
ACCTTAAGGTGGATCCATATGAACCTCCCATGTCGGAAGCCATTAAAACCCCATCTTTGT
ACTTGATTGCGACGATCGAAGTCCCAGTAACATATGGATACAGTGTTCTTTGTGAATCAG
CTTCTGCGTTCTTCACGGAATCTCCGTTCTCGATCGGAATGGTAAAAGTCATCTTTTTTC
TTCTTCTTCTTCTTCGAGAGAGGTTAGGTTCTTTTCTTCTAAGATCT
CC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2G603TF 683 0 0
TTCTGTGATCTTCGCGATCTGAAGCTTGTTAATAGCAGATCTGTCACGGTAGAGAAGCAC
ACGCATACATTTCTCAAGGAGCTTGACACCATCTTCAAAGCTTAGATCCGCATGCCACTC
ATCACGAAGAATTGGCCTGGCGAGATGGTTTCCAAATCCGGTGGCAACATGATTGTCCTC
GAAACTAACACCAATCATTGACACCATGCCAAGGTAAGTTTCGCCATTTTTGACACCTCC
AAGGACGAGAGTGTTCCAGAGAGGGTTAAACTTGTTGCGACGGTTGTACATCACTCGGGT
CAGATAGTTGTGCACCTCTTTTGGTCCCAGAGAGTTACCATCATCCCACATGCTATCATT
CAACACGAGCTCATCAAGATAACGGAGAATCTCCTGAAAGTCACTGATCTCTCCACTGGC
GCCGAGAAGAGAATGCTTACCAATAGCCTTCATTCTCTCAATGTTCTTGTACCTTAAGGT
GGATCCATATGAACCTCCCATGTCGGAAGCCATTAAAACCCCATCTTTGTACTTGATTGC
GACGATCGAAGTCCCAGTAACATATGGATACAGTGTTCTTTGTGAATCAGCTTCTGCGTT
CTTCACGGAATCTCCGTTCTCGATCGGAATGGTAAAAGTCATCTTTTTTCTTCTTCTTCT
TCTTCGAGAGAGGTTAGGTTC
CC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 2 8

CO CL744Contig1 935 5 23 U
CCATCAAACATTAAAAATTTAGAATAAGAAAAAAGAAGCAAAATGAACACAAAATGTCAA
ATTATAAAACCAAATTATAGATAAGTTTCAGGGCATCTGATACAAAGAGATTGAAGAAAC
CTCTTCTGCAGATGCCATAAAGGTTT*ACATTATACTACCACTCTCCATTTATTTTCTCC
GAACCAGTAATCTCTAAACCGATATAGTTAAAATATAAAGAGTGTTGTAGAGAGGATTAT
TAGAAAACATCGGTCATGTAAACGAGACTACCGGAGGAGAGAATTAAAGGATGGTTTCTT
TTATAGATTACTTCCACTTCTTGAATTTGCCTCCTCCTCCAAACATGCCATGTTTCCCGT
GCTTTCCATGCTTGAACTTGCCTCCATGCTTGCCTCCATGCTTCCCGTGCTTGAATTTAC
CATGACCACCATGCCCATACCCATGAGATGCATGACCAACGTGGCCAAACCCTCC***GT
GCCCTGCATGCCCGTAAGGGTTGTGTGATGCATGACCAACGTGGTGAGCTCCATAGGCTG
CTGCGGCGGCACCAGCTGCACCAGCAATCATACCTCCGAGTCCACCACTAGAATGTCCTG
AGTGGTGAGGCGCAGGATAGCCTGCAGGAGGATAACCACCGTGACCTGGAGCAGGAGGAT
AACCACCAGGTCCAGGAGGGTAAGCACCGGGTGGGTAACCAGCAGGTGGATAGCCTCCAG
CTGGAGGATACCCTTGTTGTGGAGGGTATCCAGCGGGTGGGTAACCTCCAGGAGCGGGTG
GGTAATGATGTCCACCTCCTGGAAACCCATGAAACCCTTTGTCTTGCTCGTCATGATGCT
TGTCTTTACCTCCTCCCATTTTTCTTTTTAACTCAGATTATAACAACCGACAGACAGGAA
TTGAGAAGATTGTTTCGGAACGAATTGGTGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B536TF C 71
AF RR2EV32JQ U 104
AF RR2GH55JQB U 1
AF RR2GT41JQB U 63
AF RR2B564TF C 78
BS 1 99 RR2GH55JQB
BS 100 100 RR2GT41JQB
BS 101 229 RR2GH55JQB
BS 230 230 RR2GT41JQB
BS 231 242 RR2GH55JQB
BS 243 243 RR2EV32JQ
BS 244 331 RR2GH55JQB
BS 332 332 RR2EV32JQ
BS 333 448 RR2GH55JQB
BS 449 449 RR2GT41JQB
BS 450 475 RR2GH55JQB
BS 476 478 RR2GT41JQB
BS 479 490 RR2GH55JQB
BS 491 491 RR2GT41JQB
BS 492 610 RR2GH55JQB
BS 611 611 RR2GT41JQB
BS 612 619 RR2GH55JQB
BS 620 620 RR2GT41JQB
BS 621 646 RR2GH55JQB
BS 647 647 RR2GT41JQB
BS 648 695 RR2GH55JQB
BS 696 701 RR2GT41JQB
BS 702 935 RR2B564TF

RD RR2B536TF 370 0 0
CAAATTA
TAGATAAGTTTCAGGGCATCTGCTACAAAGAGATTGAAGAAACCTCTTCTGCAGATGCCA
TAAAGGTTT*ACATTATACTACCACTCTCCATTTATTTTCTCCGAACCAGTAATCTCTAA
ACCGATATAGTTAAAATATAAAGAGTGTTGTAGAGAGGATTATTAGAAAACATCGGTCAT
GTAAACGAGACTACCGGAGGAGAGAATTAAAGGATGGTTTCTCTTATAGATTACTTCCAC
TTCTTGAATTTGCCTCCTCCTCCAAACATGCCATGTTTCCCGTGCTTTCCATGCTTGAAC
TTGCCTCCATGCTTGCCTCCATGCTTCCCGTGCTTGAATTTACCATGACCACCATGCCCA
TAC

QA 8 370 8 370
DS 

RD RR2EV32JQ 508 0 0
AAAGAGATTGAAGAAACCTCTTCTGCAGATGCCATAAAGGTTT*ACATTATACTACCACT
CTCCATTTATTTTCTCCGAACCAGTAATCTCTAAACCGATATAGTTAAAATATAAAGAGT
GTTGTAAAGAGGATTATTAGAAAACATCGGTCATGTAAACGAGACTACCGGAGGAGAGAA
TTAAAGGATGGTTTCTTTTATAGATTACTTCCACTTCTTGAATTTGCCTCCTCCTCCAAA
CATGCCATGTTTCCCGTGCTTTCCATGCTTGAACTTGCCTCCATGCTTGCCTCCATGCTT
CCCGTGCTTGAATTTACCATGACCACCATGCCCATACCCATGAAAGGCATGACCAACGTG
GCCAAACCCTCCTCCGTGCCATGCATGACCGTAAGGGTTGTGTGATGCATGACCAACGTG
GTGAGCTCCATAGGCTGCTGCGGCGGCACCAGCTGCACCAGCAATCATACCTTCGAGTCC
ACCACTAGAATGTCCTGAGTGGTGAGGA

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2GH55JQB 695 0 0
CCATCAAACATTAAAAATTTAGAATAAGAAAAAAGAAGCAAAATGAACACAAAATGTCAA
ATTATAAAACCAAATTATAGATAAGTTTCAGGGCATCTGCTACAAAGAGATTGAAGAAAC
CTCTTCTGCAGATGCCATAAAGGTTT*ACATTATACTACCACTCTCCATTTATTTTCTCC
GAACCAGTAATCTCTAAACCGATATAGTTAAAATATAAAGAGTGTTGTAAAGAGGATTAT
TAAAAAACATCGGTCATGTAAACGAGACTACCGGAGGAGAGAATTAAAGGATGGTTTCTT
TTATAGATTACTTCCACTTCTTGAATTTGCCCCCTCCTCCAAACATGCCATGTTTCCCGT
GCTTTCCATGCTTGAACTTGCCTCCATGCTTGCCTCCATGCTTCCCGTGCTTGAATTTAC
CATGACCACCATGCCCATACCCATGAGAGGCATGACCAACGTGGCCAAACCCTCCTCCGT
GCCCTGCATGACCGTAAGGGTTGTGTGATGCATGACCAACGTGGTGAGCTCCATAGGCTG
CTGCGGCGGCACCAGCTGCACCAGCAATCATACCTCCGAGTCCACCACTAGAATGTCCTG
AGTGGTGAGGAGCAGGATATCCTGCAGGAGGATAACCACCGTGACCGGGAGCAGGAGGAT
AACCACCAGGTCCAGGAGGGTAAGCACCGGGTGGG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2GT41JQB 639 0 0
G
ATAAAACCAAATTATAGATAAGTTTCAGGGCATCTGATACAAAGAGATTGAAGAAACCTC
TTCTGCAGATGCCATAAGGTTTTTACATTATACTACCACTCTCCATTTATTTTCTCCGAA
CCAGTAATCTCTAAACCGATATAGTTAAAGTATAAAGAGTGTTGTAGAGAGGATTATTAG
AAAACATCGGTCAGGTAAATGAGACTACCGGAGGAGAGAATCAAAGGATGGTTTCTTTTA
TAGATTACTTCCACTTCTTGAATTTGCCTCCTCCTCCAAACATGCCATGTTTCCCGTGCT
TTCCATGCTTGAACTTGCCTCCATGCTTGCCTCCATGCTTTCCGTGCTTGAACTTACCAT
GACCACCATGACCATACCCATGAGATGCATGACCAACGTGGCCAAACCCTCC***GTGCC
CTGCATGCCCGTAAGGGTTGTGTGATGCATGACCAACGTGGTGAGCTCCATAGGCTGCTG
CGGCGGCACC*GCTGCACCAGCAATCATACCTCCGAGTCCACCACTAGAATGTCCTGAGT
GGTGAGGCGCAGGATAGCCTGCAGGAGGATAACCACCGTGACCTGGAGCAGGAGGATAAC
CACCAGGTCCAGGAGGGTAAGCACCGGGTGGGTAACCA

QA 2 639 2 639
DS 

RD RR2B564TF 858 0 0
TAGATAAGTTTCAGGGCATCTGATACAAAGAGATTGAAGAAACCTCTTCTGCAGATGCCA
TAAGGTTTTTACATTATACTACCACTCTCCATTTATTTTCTCCGAACCAGTAATCTCTAA
ACCGATATAGTTAAAGTATAAAGAGTGTTGTAGAGAGGATTATTAGAAAACATCGGTCAG
GTAAATGAGACTACCGGAGGAGAGAATCAAAGGATGGTTTCTTTTATAGATTACTTCCAC
TTATTGAATTTGCCTCCTCCTCCAAACATGCCATGCTTCCCGTGCTTTCCATGCTTGAAC
TTGCCTCCATGCTTGCCTCCATGCTTTCCGTGCTTGAACTTACCATGACCACCATGACCA
TACCCATGAGATGCATGACCAACGTGGCCAGACCCTCC***GTGCCCTGCATGCCCGTAA
GGGTTGTGTGATGCATGACCAACGTGGTGAGCTCCATAGGCTGCTGCGGCGGAACCAGCT
GCACCAGCAATCATACCTCCGAGTCCACCACTAGAATGTCCTGAGTGGTGAGGCGCAGGA
TAGCCTGCAGGAGGATAACCACCGTGACCTGGAGCAGGAGGATAACCACCAGGTCCAGGA
GGGTAAGCACCGGGTGGGTAACCAGCAGGTGGATAGCCTCCAGCTGGAGGATACCCTTGT
TGTGGAGGGTATCCAGCGGGTGGGTAACCTCCAGGAGCGGGTGGGTAATGATGTCCACCT
CCTGGAAACCCATGAAACCCTTTGTCTTGCTCGTCATGATGCTTGTCTTTACCTCCTCCC
ATTTTTCTTTTTAACTCAGATTATAACAACCGACAGACAGGAATTGAGAAGATTGTTTCG
GAACGAATTGGTGAACCC

QA 1 858 1 858
DS 



CO CL744Contig2 820 3 3 U
GGTGATCACCAATTCGTTCCGAAACAATCTTCTCAATTCCTGTCGGTTGTTATAATCTGA
GTTAAAAAAGAAAATGGGAGGTGGTAAAGACAAGCATCATGATGAGCAAGACAAAGGGTT
TCATGGGTTTCCAGGAGGTGGACATCATTACCCACCCGCTCCTGGTGGTTACCCACCCGC
TGGATACCCTCCACAACAAGGGTATCCTCCAGCTGGAGGTTATCCACCTGCTGGTTACCC
ACCCGGTGCTTACCCTCCTGGACCTGGTGGTTATCCTCCTGCTCCCGGTCACGGTGGTTA
TCCTCCTGCAGGATATCCTGCTCCTCACCACTCAGGACATTCTAGTGGTGGACTCGGAGG
TATGATTGCTGGTGCAGCTGGTGCCGCCGCAGCAGCCTATGGAGCTCACCACGTTGGTCA
TGCATCACACAACCCTTACGGTCATGCAGGGCACGGAGGAGGGTTTGGCCACGTTGGTCA
TGCCTCTCATGGGTATGGGCATGGTGGTCATGGTAAATTCAAGCACGGGAAGCATGGAGG
CAAGCATGGAGGCAAGTTCAAGCATGGAAAGCACGGGAAACATGGCATGTTTGGAGGAGG
AGGCAAATTCAAGAAGTGGAAGTAATCTATAAAAGAAACCATCCTTTAATTCTCTCCTCC
GGTAGTCTCGTTTACATGACCGATGTTTTCTAATAATCCTCTCTACACACTCTTTATATT
TAACTATATCGGTTTAGAGATACTGGTTCGGAGAAAAAAATGGAGAGTGTAGTATAATGT
AAACCTTTATGCATCTGCAGAAGAGTTCTTCATCTCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV32TF U 2
AF RR2CC81TF U 3
AF RR2GH55TF U 1
BS 1 600 RR2GH55TF
BS 601 601 RR2EV32TF
BS 602 820 RR2GH55TF

RD RR2EV32TF 655 0 0
GGGA
TCACCAATTCGTTCCGAAACAATCTTCTCAATTCCTGTCGGTTGTTATAATCTGAGTTAA
AAAAGAAAATGGGAGGTGGTAAAGACAAGCATCATGATGAGCAATACAAAGGGTTTCATG
GGTTTCCAGGAGGTGGACATCATTACCCACCCGCTCCTGGTGGTTACCCACCCGCTGGAT
ACCCTCCACAACAAGGGTATCCTCCAGCTGGAGGTTATCCACCTGCTGGTTACCCACCCG
GTGCTTACCCTCCTGGACCTGGTGGTTATCCTCCTGCTCCCGGTCACGGTGGTTATCCTC
CTGCAGGATATCCTGCTCCTCACCACTCAGGACATTCTAGTGGTGGACTCGGAGGTATGA
TTGCTGGTGCAGCTGGTGCCGCCGCAGCAGCCTATGGAGCTCACCACGTTGGTCATGCAT
CACACAACCCTTACGGTCATGCATGGCACGGAGGAGGGTTTGGCCACGTTGGTCATGCCT
CTCATGGGTATGGGCATGGTGGTCATGGTAAATTCAAGCACGGGAAGCATGGAGGCAAGC
ATGGAGGCAAGTTCAAGCATGGAAAGCACGGGAAACATGGCATGTTTGGAGGAGGAGGCA
AATTCAAGAAGTGGAAGTAATCTATAAAAGAAACCATCCTTTAATTCTCTC

QA 5 655 5 655
DS 

RD RR2CC81TF 688 0 0
GGA
TCACCAATTCGTTCCGAAACAATCTTCTCAATTCCTGTCGGTTGTTATAATCTGAGTTAA
AAAAGAAAATGGGAGGTGGTAAAGACAAGCATCATGATGAGCAAGACAAAGGGTTTCATG
GGTTTCCAGGAGGTGGACATCATTACCCACCCGCTCCTGGTGGTTACCCACCCGCTGGAT
ACCCTCCACAACAAGGGTATCCTCCAGCTGGAGGTTATCCACCTGCTGGTTACCCACCCG
GTGCTTACCCTCCTGGACCTGGTGGTTATCCTCCTGCTCCCGGTCACGGTGGTTATCCTC
CTGCAGGATATCCTGCTCCTCACCACTCAGGACATTCTAGTGGTGGACTCGGAGGTATGA
TTGCTGGTGCAGCTGGTGCCGCCGCAGCAGCCTATGGAGCTCACCACGTTGGTCATGCAT
CACACAACCCTTACGGTCATGCAGGGCACGGAGGAGGGTTTGGCCACGTTGGTCATGCCT
CTCATGGGTATGGGCATGGTGGTCATGGTAAATTCAAGCACGGGAAGCATGGAGGCAAGC
ATGGAGGCAAGTTCAAGCATGGAAAGCACGGGAAACATGGCATGTTTGGAGGAGGAGGCA
AATTCAAGAAGTGGAAGTAATCTATAAAAGAAACCATCCTTTAATTCTCTCCTCCGGTAG
TCTCGTTTACATGACCGATGTTTTC

QA 4 688 4 688
DS 

RD RR2GH55TF 820 0 0
GGTGATCACCAATTCGTTCCGAAACAATCTTCTCAATTCCTGTCGGTTGTTATAATCTGA
GTTAAAAAAGAAAATGGGAGGTGGTAAAGACAAGCATCATGATGAGCAAGACAAAGGGTT
TCATGGGTTTCCAGGAGGTGGACATCATTACCCACCCGCTCCTGGTGGTTACCCACCCGC
TGGATACCCTCCACAACAAGGGTATCCTCCAGCTGGAGGTTATCCACCTGCTGGTTACCC
ACCCGGTGCTTACCCTCCTGGACCTGGTGGTTATCCTCCTGCTCCCGGTCACGGTGGTTA
TCCTCCTGCAGGATATCCTGCTCCTCACCACTCAGGACATTCTAGTGGTGGACTCGGAGG
TATGATTGCTGGTGCAGCTGGTGCCGCCGCAGCAGCCTATGGAGCTCACCACGTTGGTCA
TGCATCACACAACCCTTACGGTCATGCAGGGCACGGAGGAGGGTTTGGCCACGTTGGTCA
TGCCTCTCATGGGTATGGGCATGGTGGTCATGGTAAATTCAAGCACGGGAAGCATGGAGG
CAAGCATGGAGGCAAGTTCAAGCATGGAAAGCACGGGAAACATGGCATGTTTGGAGGAGG
GGGCAAATTCAAGAAGTGGAAGTAATCTATAAAAGAAACCATCCTTTAATTCTCTCCTCC
GGTAGTCTCGTTTACATGACCGATGTTTTCTAATAATCCTCTCTACACACTCTTTATATT
TAACTATATCGGTTTAGAGATACTGGTTCGGAGAAAAAAATGGAGAGTGTAGTATAATGT
AAACCTTTATGCATCTGCAGAAGAGTTCTTCATCTCTTTG

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 9

CO CL745Contig1 485 9 5 U
GCATCAACTACGATAAAATGTTGGGTATAAACGATTACATTAATCCAAACGTTTACATTG
CTTCATAAACATAGTTTGATAAAATATTATTTATCTTCCGTACTCGTTATTTATTTATTT
AGTTAATTATAAAATCTCTAGATTATTAGCAACTTGGATAAGGAACACCACAAGCGGATA
GGAGTTTGCGAGAGTTGGGAGAGCTAATGTACTGAGCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAACC
CACACAAGCATGGCTGTTGCTCCTTCAGATTTGCACAACAATCACCCGAGGGTTGGCCTC
CTCCTGTAATCGCTGCCAGGCAAGGCTGAAGCTGCTTGGCGTCACATGCCGCTCCAACAG
CAGTGTCTACCACTTCAGTTGGAGCCGCAAATGATGGCGAAAGAATGACCAAAACCATGA
GTGTCAATGCCAAGATCTTCATGACTAGTTAGTTAGTTTTGTATGATAAAATTGTTTGAA
TTTTA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 

AF RR2FN26JQ U 1
AF RR2FN26TF C 1
AF RR2F349JQ U 10
AF RR2GM55JQ U 23
AF RR2H125JQ U 23
AF RR2GM55TF C 23
AF RR2H125TF C 23
AF RR2E610JQ U 24
AF RR2E610TF C 24
BS 1 22 RR2FN26JQ
BS 23 23 RR2GM55JQ
BS 24 151 RR2FN26JQ
BS 152 152 RR2F349JQ
BS 153 485 RR2FN26JQ

RD RR2FN26JQ 485 0 0
GCATCAACTACGATAAAATGTTAGGTATAAACGATTACATTAATCCAAACGTTTACATTG
CTTCATAAACATAGTTTGATAAAATATTATTTATCTTCCGTACTCGTTATTTATTTATTT
AGTTAATTATAAAATCTCTAGATTATTAGCAGCTTGGATAAGGAACACCACAAGCGGATA
GGAGTTTGCGAGAGTTGGGAGAGCTAATGTACTGAGCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAACC
CACACAAGCATGGCTGTTGCTCCTTCAGATTTGCACAACAATCACCCGAGGGTTGGCCTC
CTCCTGTAATCGCTGCCAGGCAAGGCTGAAGCTGCTTGGCGTCACATGCCGCTCCAACAG
CAGTGTCTACCACTTCAGTTGGAGCCGCAAATGATGGCGAAAGAATGACCAAAACCATGA
GTGTCAATGCCAAGATCTTCATGACTAGTTAGTTAGTTTTGTATGATAAAATTGTTTGAA
TTTTA

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2FN26TF 485 0 0
GCATCAACTACGATAAAATGTTAGGTATAAACGATTACATTAATCCAAACGTTTACATTG
CTTCATAAACATAGTTTGATAAAATATTATTTATCTTCCGTACTCGTTATTTATTTATTT
AGTTAATTATAAAATCTCTAGATTATTAGCAGCTTGGATAAGGAACACCACAAGCGGATA
GGAGTTTGCGAGAGTTGGGAGAGCTAATGTACTGAGCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAACC
CACACAAGCATGGCTGTTGCTCCTTCAGATTTGCACAACAATCACCCGAGGGTTGGCCTC
CTCCTGTAATCGCTGCCAGGCAAGGCTGAAGCTGCTTGGCGTCACATGCCGCTCCAACAG
CAGTGTCTACCACTTCAGTTGGAGCCGCAAATGATGGCGAAAGAATGACCAAAACCATGA
GTGTCAATGCCAAGATCTTCATGACTAGTTAGTTAGTTTTGTATGATAAAATTGTTTGAA
TTTTA

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2F349JQ 476 0 0
C
CGATAAAATGTTAGGTATAAACGATTACATTAATCCAAACGTTTACATTGCTTCATGAAC
ATAGTTTGATAAAATATTATTTATCTTCCGTACTCGTTATTTATTTATTTAGTTAATTAT
AAAATCTCTAGATTATTAGCAACTTGGATAAGGAACACCACAAGCGGATAGGAGTTTGCG
AGAGTTGGGAGAGCTAATGTACTGAGCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAACCCACACAAGCA
TGGCTGTTGCTCCTTCAGATTTGCACAACAATCACCCGAGGGTTGGCCTCCTCCTGTAAT
CGCTGCCAGGCAAGGCTGAAGCTGCTTGGCGTCACATGCCGCTCCAACAGCAGTGTCTAC
CACTTCAGTTGGAGCCGCAAATGATGGCGAAAGAATGACCAAAACCATGAGTGTCAATGC
CAAGATCTTCATGACTAGTTAGTTAGTTTTGTATGATAAAATTGTTTGAATTTTA

QA 2 476 2 476
DS 

RD RR2GM55JQ 463 0 0
GGGTATAAACGATTACATTAATCCAAACGTTTACATTGCTTCATAAACATAGTTTGATAA
AATATTATTTATCTTCCGTACTCGTTATTTATTTATTTAGTTAATTATAAAATCTCTAGA
TTATTAGCAACTTGGATAAGGAACACCACAAGCGGATAGGAGTTTGCGAGAGTTGGGAGA
GCTAATGTACTGAGCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAACCCACACAAGCATGGCTGTTGCTC
CTTCAGATTTGCACAACAATCACCCGAGGGTTGGCCTCCTCCTGTAATCGCTGCCAGGCA
AGGCTGAAGCTGCTTGGCGTCACATGCCGCTCCAACAGCAGTGTCTACCACTTCAGTTGG
AGCCGCAAATGATGGCGAAAGAATGACCAAAACCATGAGTGTCAATGCCAAGATCTTCAT
GACTAGTTAGTTAGTTTTGTATGATAAAATTGTTTGAATTTTA

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2H125JQ 463 0 0
GGGTATAAACGATTACATTAATCCAAACGTTTACATTGCTTCATAAACATAGTTTGATAA
AATATTATTTATCTTCCGTACTCGTTATTTATTTATTTAGTTAATTATAAAATCTCTAGA
TTATTAGCAACTTGGATAAGGAACACCACAAGCGGATAGGAGTTTGCGAGAGTTGGGAGA
GCTAATGTACTGAGCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAACCCACACAAGCATGGCTGTTGCTC
CTTCAGATTTGCACAACAATCACCCGAGGGTTGGCCTCCTCCTGTAATCGCTGCCAGGCA
AGGCTGAAGCTGCTTGGCGTCACATGCCGCTCCAACAGCAGTGTCTACCACTTCAGTTGG
AGCCGCAAATGATGGCGAAAGAATGACCAAAACCATGAGTGTCAATGCCAAGATCTTCAT
GACTAGTTAGTTAGTTTTGTATGATAAAATTGTTTGAATTTTA

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2GM55TF 463 0 0
GGGTATAAACGATTACATTAATCCAAACGTTTACATTGCTTCATAAACATAGTTTGATAA
AATATTATTTATCTTCCGTACTCGTTATTTATTTATTTAGTTAATTATAAAATCTCTAGA
TTATTAGCAACTTGGATAAGGAACACCACAAGCGGATAGGAGTTTGCGAGAGTTGGGAGA
GCTAATGTACTGAGCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAACCCACACAAGCATGGCTGTTGCTC
CTTCAGATTTGCACAACAATCACCCGAGGGTTGGCCTCCTCCTGTAATCGCTGCCAGGCA
AGGCTGAAGCTGCTTGGCGTCACATGCCGCTCCAACAGCAGTGTCTACCACTTCAGTTGG
AGCCGCAAATGATGGCGAAAGAATGACCAAAACCATGAGTGTCAATGCCAAGATCTTCAT
GACTAGTTAGTTAGTTTTGTATGATAAAATTGTTTGAATTTTA

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2H125TF 463 0 0
GGGTATAAACGATTACATTAATCCAAACGTTTACATTGCTTCATAAACATAGTTTGATAA
AATATTATTTATCTTCCGTACTCGTTATTTATTTATTTAGTTAATTATAAAATCTCTAGA
TTATTAGCAACTTGGATAAGGAACACCACAAGCGGATAGGAGTTTGCGAGAGTTGGGAGA
GCTAATGTACTGAGCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAACCCACACAAGCATGGCTGTTGCTC
CTTCAGATTTGCACAACAATCACCCGAGGGTTGGCCTCCTCCTGTAATCGCTGCCAGGCA
AGGCTGAAGCTGCTTGGCGTCACATGCCGCTCCAACAGCAGTGTCTACCACTTCAGTTGG
AGCCGCAAATGATGGCGAAAGAATGACCAAAACCATGAGTGTCAATGCCAAGATCTTCAT
GACTAGTTAGTTAGTTTTGTATGATAAAATTGTTTGAATTTTA

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2E610JQ 462 0 0
GGTATAAACGATTACATTAATCCAAACGTTTACATTGCTTCATAAACATAGTTTGATAAA
ATATTATTTATCTTCCGTACTCGTTATTTATTTATTTAGTTAATTATAAAATCTCTAGAT
TATTAGCAACTTGGATAAGGAACACCACAAGCGGATAGGAGTTTGCGAGAGTTGGGAGAG
CTAATGTACTGAGCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAACCCACACAAGCATGGCTGTTGCTCC
TTCAGATTTGCACAACAATCACCCGAGGGTTGGCCTCCTCCTGTAATCGCTGCCAGGCAA
GGCTGAAGCTGCTTGGCGTCACATGCCGCTCCAACAGCAGTGTCTACCACTTCAGTTGGA
GCCGCAAATGATGGCGAAAGAATGACCAAAACCATGAGTGCCAATG**AAGATCTTCATG
ACTAGTTAGTTAGTTTTGTATGATAAAATTGTTTGAATTTTA

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2E610TF 462 0 0
GGTATAAACGATTACATTAATCCAAACGTTTACATTGCTTCATAAACATAGTTTGATAAA
ATATTATTTATCTTCCGTACTCGTTATTTATTTATTTAGTTAATTATAAAATCTCTAGAT
TATTAGCAACTTGGATAAGGAACACCACAAGCGGATAGGAGTTTGCGAGAGTTGGGAGAG
CTAATGTACTGAGCAAACGCAGGGTTCTTAGCAAACCCACACAAGCATGGCTGTTGCTCC
TTCAGATTTGCACAACAATCACCCGAGGGTTGGCCTCCTCCTGTAATCGCTGCCAGGCAA
GGCTGAAGCTGCTTGGCGTCACATGCCGCTCCAACAGCAGTGTCTACCACTTCAGTTGGA
GCCGCAAATGATGGCGAAAGAATGACCAAAACCATGAGTGCCAATG**AAGATCTTCATG
ACTAGTTAGTTAGTTTTGTATGATAAAATTGTTTGAATTTTA

QA 1 462 1 462
DS 



AS 2 9

CO CL746Contig1 704 6 42 U
GGACAAACACGTAGCAGCTCATTCCTCTCTCTCTCTCT******ATTTTCAAACCCTACG
AGAGATCTTCTTCGTCAAAAGAATCGAGCAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGGCTGATACC
AAGAGCACCAAGCTCGCTGTGAACAAGAAGCCTGCAAAGGCAAGCAAAGCGGCGGCTAAG
GATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTTCCAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGATTTCCGT
CAGACTTACAAGAAGGATCATCCCAATAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGGAAAGCTGGT
GGACAAAAGTGGAAATCCTTATCCGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGCTGAC
AACCGCAAAGTTGAGTACGAGAAGAACATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGT
CCAAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTTAATGATGAGGATGAT
GCCGATGATGGGAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAGTTTAGTA*GCATAATATAGG
ACGCTGCAAGGATCTCAAGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAGTTG
TTTTAAATGGTTTTT**CTTTTCTTACTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGCGAGTGTAA
TGAGAGATTTGCAGCTCAATATTAAACCATTTAGCTTTTTTTTC


BQ
10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
0 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM40TF U 2
AF RR2A853TF U 1
AF RR2GY61TF U 1
AF RR2AY63JQ C 1
AF RR2AY63TFB U 1
AF RR2DM40JQ C 62
BS 1 1 RR2GY61TF
BS 2 25 RR2DM40TF
BS 26 26 RR2GY61TF
BS 27 38 RR2DM40TF
BS 39 41 RR2GY61TF
BS 42 43 RR2DM40TF
BS 44 44 RR2GY61TF
BS 45 107 RR2DM40TF
BS 108 108 RR2A853TF
BS 109 126 RR2DM40TF
BS 127 127 RR2GY61TF
BS 128 128 RR2DM40TF
BS 129 129 RR2GY61TF
BS 130 221 RR2DM40TF
BS 222 222 RR2A853TF
BS 223 263 RR2DM40TF
BS 264 264 RR2A853TF
BS 265 275 RR2DM40TF
BS 276 276 RR2A853TF
BS 277 290 RR2DM40TF
BS 291 291 RR2A853TF
BS 292 317 RR2DM40TF
BS 318 318 RR2A853TF
BS 319 320 RR2DM40TF
BS 321 321 RR2A853TF
BS 322 323 RR2DM40TF
BS 324 324 RR2A853TF
BS 325 377 RR2DM40TF
BS 378 378 RR2GY61TF
BS 379 452 RR2DM40TF
BS 453 453 RR2A853TF
BS 454 527 RR2DM40TF
BS 528 528 RR2A853TF
BS 529 549 RR2DM40TF
BS 550 550 RR2A853TF
BS 551 615 RR2DM40TF
BS 616 617 RR2A853TF
BS 618 650 RR2DM40TF
BS 651 689 RR2GY61TF
BS 690 690 RR2AY63TFB
BS 691 696 RR2GY61TF
BS 697 704 RR2DM40JQ

RD RR2DM40TF 649 0 0
GACAAACACGTAGCAGCTCATTCCCCTCTCTCTCTCTCTC**TATTTTCAAACCCTACGA
GAGATCTTCTTCGTCAAAAGAATCGAGCAATGAAAGGAGGTAAATCGAAGGCTGATACCA
AGAGCTCTAAGCTCGCTGTGAACAAGAAGCCTGCAAAGGCAAGCAAAGCGGCGGCTAAGG
ATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTTCCAGTGCCTTCTTCGTCTTCATGGAGGATTTCCGTC
AGACTTACAAGAAGGATCATCCTAATAACAAATCCGTTGCTGCTGTTGGAAAAGCTGGTG
GACAAAAGTGGAAATCTTTGTCTGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGCTGACA
ACCGCAAAGTTGAGTATGAGAAGAACATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTC
CAAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCTGTGTCTGAGGTTAATGATGAGGATGATG
CCGATGATGGGAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAGTTTAGTAAGCATAATATAGGA
CGCTGCAACGATCTCAAGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAGTTGT
TTTAAATGGTTTTTTTCTTTTCTTACTGATTCTACGTGTAATGGAAAAA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2A853TF 642 0 0
GG
ACAAACACGTAGCAGCTCATTCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTTCAAACCCTACGAG
AGATCTTCTTCGTCAAAAGAATCGAGCAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGGCTGATACCAA
GAGCTCTAAGCTCGCTGTGAACAAGAAGCCTGCAAAGGCAAGCAAAGCGGCGGCTAAGGA
TCCTAACAAACCAAAGAGGCCTTCCAGCGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGATTTCCGTCA
GACTTACAAGAAGGATCATCCCAATAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGGAAAGCTGGTGG
ACAAAAGTGGAAATCCTTATCCGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGCTGACAA
CCGCAAAGTTGAGTATGAGAAGAACATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCC
AAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTTAATGATGAGGATGATGC
CGATGATGGGAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAGTTTAGTA*GCATAATATAGGAC
GCTGCAAGGATCTCAAGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAGTTGTT
TTAAATGGTTTTT**CTTTTCTTACTGATTCTACGTGTAA

QA 3 642 3 642
DS 

RD RR2GY61TF 698 0 0
GGACAAACACGTAGCAGCTCATTCCTCTCTCTCTCT********ATTTTCAAACCCTACG
AGAGATCTTCTTCGTCAAAAGAATCGAGCAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGGCTGATACC
AAGAGCACCAAGCTCGCTGTGAACAAGAAGCCTGCAAAGGCAAGCAAAGCGGCGGCTAAG
GATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTTCCAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGATTTCCGT
CAGACTTACAAGAAGGATCATCCCAATAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGGAAAGCTGGT
GGACAAAAGTGGAAATCCTTATCCGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGCTGAC
AACCGCAAAGTTGAGTACGAGAAGAACATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGT
CCAAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTTGATGATGAGGATGAT
GCCGATGATGGGAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAGTTTAGTA*GCATAATATAGG
ACGCTGCAAGGATCTCAAGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAGTTG
TTTTAAATGGTTTTT**CTTTTCTTACTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGCGAGTGTAA
TGAGAGATTTGCAGCTCAATATTAAACCACTTAGCT
TT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2AY63JQ 697 0 0
G
GACAAACACGTAGCAGCTCATTCCTCTCTCTCTCTCT******ATTTTCAAACCCTACGA
GAGATCTTCTTCGTCAAAAGAATCGAGCAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGGCCGATACCA
AGAGCACCAAGCTCGCTGTGAACAAGAAGCCTGCAAAGGCAAGCAAAGCGGCGGCTAAGG
ATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTTCCAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGATTTCCGTC
AGACTTACAAGAAGGATCATCCCAATAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGGAAAGCTGGTG
GACAAAAGTGGAAACCCTTATCCGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGCTGACA
ACCGCAAAGTTGAGTACGAGAAGAACATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTC
CAAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTTAATGATGAGGATGATG
CCGATGATGGGAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAGTTTAGTA*GCATAATATAGGA
CGCTGCAAGGATCTCAAGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAGTTGT
TTTAAATGGTTTTT**CTTTTCTTACTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGCGAGTGTAAT
GAGAGATTTGCAGCTCAATATTAAACCATTTAGCT
C

QA 2 696 2 696
DS 

RD RR2AY63TFB 697 0 0
G
GACAAACACGTAGCAGCTCATTCCTCTCTCTCTCTCT******ATTTTCAAACCCTACGA
GAGATCTTCTTCGTCAAAAGAATCGAGCAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGGGCGATACCA
AGAGCACCAAGCTCGCTGTGAACAAGAAGCCTGCAAAGGCAAGCAAAGCGGCGGCTAAGG
ATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTTCCAGTGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGATTTCCGTC
AGACTTACAAGAAGGATCATCCCAATAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGGAAAGCTGGTG
GACAAAAGTGGAAACCCTTATCCGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGCTGACA
ACCGCAAAGTTGAGTACGAGAAGAACATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTC
CAAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTTAATGATGAGGATGATG
CCGATGATGGGAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAGTTTAGTA*GCATAATATAGGA
CGCTGCAAGGATCTCAAGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAGTTGT
TTTAAATGGTTTTT**CTTTTCTTACTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGCGAGTGTAAT
GAGAGATTTGCAGCTCAATATTAAACCATTTAGCT
C

QA 2 696 2 696
DS 

RD RR2DM40JQ 643 0 0
GAGATCTTCTTCGTCAAAAGAATCGAGCAATGAAAGGAGGTAAATCGAAGGCTGATACCA
AGAGCTCTAAGCTCGCTGTGAACAAGAAGCCTGCAAAGGCAAGCAAAGCGGCGGCTAAGG
ATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTTCCAGTGCCTTCTTCGTCTTCATGGAGGATTTCCGTC
AGACTTACAAGAAGGATCATCCTAATAACAAATCCGTTGCTGCTGTTGGAAAAGCTGGTG
GACAAAAGTGGAAATCTTTGTCTGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGCTGACA
ACCGCAAAGTTGAGTATGAGAAGAACATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTC
CAAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCTGTGTCTGAGGTTAATGATGAGGATGATG
CCGATGATGGGAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAGTTTAGTAAGCATAATATAGGA
CGCTGCAACGATCTCAAGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAGTTGT
TTTAAATGGTTTTTTTCTTTTCTTACTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGCGAGTGTAAT
TAGAGATTTGCAGCTCAATATTAAACCATTTAGCTTTTTTTTC

QA 1 643 1 643
DS 



CO CL746Contig2 693 3 7 U
GGAATCACAAACACGTAGCAGCTCATTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTTCAAACCC
TACGAGAGATCTTCTTCGTCAAAAGAATCGAGCAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGACGGA
TACCAAGAGCTCTAAGCTCGCTGTGAACAAGAAGCCTGCAAAGGCAAGCAAAGCGGCGGC
TAAGGATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTTCCAGCGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGATTT
CCGTCAGACTTACAAGAAGGATCATCCCAATAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGAAAAGC
TGGTGGACAAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGC
TGACAACCGCAAAGTCGAGTATGAGAAGAACATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGA
AGGTCCAAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTTAATGATGAGGA
TGATGCCGATGATGGGAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAGTTTAGTAGCATAATAT
AGGACGCTGCAAGGATCTCACGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAG
TTGTTTTAAATGGTTTTTTTTTTTATTTCTTACTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGCGA
GTGTAATGAGAGATTTGCAGCTCAATATTAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H665TF U 25
AF RR2FE45TF U 5
AF RR2F288TF U 1
BS 1 46 RR2F288TF
BS 47 48 RR2FE45TF
BS 49 91 RR2F288TF
BS 92 92 RR2FE45TF
BS 93 140 RR2F288TF
BS 141 141 RR2FE45TF
BS 142 693 RR2F288TF

RD RR2H665TF 132 0 0
TCATT
CCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTTCAAACCCTACGAGAGATCTTCTTCGTCAAAAGAATC
GAGCAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGACGGATACCAAGAGCTCTAAGCTCGCTGTGAACA
AGAAGCC

QA 6 132 6 132
DS 

RD RR2FE45TF 652 0 0
GG
ACAAACACGTAGCAGCTCATTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTTCAAACCCTACGAG
AGATCTTCTTCGTCAAAAGAATCGAGCAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGACGGATACCAA
GAGCTCTAAGCTCGCTGTGAACAAGAAGCCTGCAAAGGCAAGCAAAGCGGCGGCTAAGGA
TCCTAACAAACCAAAGAGGCCTTCCAGCGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGATTTCCGTCA
GACTTACAAGAAGGATCATCCCAATAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGAAAAGCTGGTGG
ACAAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGCTGACAA
CCGCAAAGTCGAGTATGAGAAGAACATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCC
AAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTTAATGATGAGGATGATGC
CGATGATGGGAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAGTTTAGTAGCATAATATAGGACG
CTGCAAGGATCTCACGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAGTTGTTT
TAAATGGTTTTTTTTTT*ATTTCTTACTGATTCTACGTGTAATGGAAAAA

QA 3 652 3 652
DS 

RD RR2F288TF 693 0 0
GGAATCACAAACACGTAGCAGCTCATTCCTCTCTCTCTCTCTCTCT**ATTTTCAAACCC
TACGAGAGATCTTCTTCGTCAAAAGAATCGATCAATGAAAGGAGGTAAATCAAAGACGGA
TACCAAGAGCTCTAAGCTCGATGTGAACAAGAAGCCTGCAAAGGCAAGCAAAGCGGCGGC
TAAGGATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTTCCAGCGCCTTCTTCGTTTTCATGGAGGATTT
CCGTCAGACTTACAAGAAGGATCATCCCAATAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGAAAAGC
TGGTGGACAAAAGTGGAAATCCTTGTCTGACACTGAGAAGGCTCCCTACGTTGCTAAGGC
TGACAACCGCAAAGTCGAGTATGAGAAGAACATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGA
AGGTCCAAAGGAGGACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTTAATGATGAGGA
TGATGCCGATGATGGGAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAGTTTAGTAGCATAATAT
AGGACGCTGCAAGGATCTCACGCATGTTCTTTCTTGTTTTCTCTTATAATGTTAACGAAG
TTGTTTTAAATGGTTTTTTTTTTTATTTCTTACTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGCGA
GTGTAATGAGAGATTTGCAGCTCAATATTAAAC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 9

CO CL747Contig1 628 9 10 U
GGAGGGCTCCCATTTCAGCGCTGTTACATATAAAAACCCTTCATTGTTTCATTTGTAGCG
GCTGCTTCTCCTCCGAGGTCGAACCCAAGAAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAGCAACACA
AGTGAAGACTGGTCTGTTCGTTGGATTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGTT
GGCTCCTCGTCCCAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGGTC
TTTGATCAGGGAAGTTGCTGGGTTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAA
GGTTGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCAAAGAGGAAGCTTGGTACCCACAAGAG
AGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGG
TGGTGTTACTGAGAAGAAGAAGTAATCATCTTTCAAGTCTGATTTGTTGTCTGAGCTTTG
TTGCTTTTTGGAACTCATTAAGTTTTGGTTAACTCTTTCAAATTAGCTTATATGCTCAAA
CAATCTTTGTGCTGTGTTTTGTTATTAATATGGATTAATGTTTGTTTCACTCTTCAGCTT
TCTCGTTAAGCATCTTAAAATCTTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 25 55 55 55 40 55 55 55 55 5 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2GX24TF U 62
AF RR2DA94TF U 73
AF RR2BC45JQ C 29
AF RR2G055JQ C 73
AF RR2G055TF U 197
AF RR2BC45TF U 74
AF RR2GE34TF U 1
AF RR2DD17TF U 73
AF RR2DD17JQ C 162
BS 1 111 RR2GE34TF
BS 112 112 RR2GX24TF
BS 113 375 RR2GE34TF
BS 376 376 RR2GX24TF
BS 377 492 RR2GE34TF
BS 493 493 RR2DA94TF
BS 494 508 RR2GE34TF
BS 509 509 RR2DA94TF
BS 510 626 RR2GE34TF
BS 627 628 RR2DD17JQ

RD RR2GX24TF 413 0 0
GG
GCTTCTCCTCCGAGGTCGAACCCAAGAAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAGCAACACAAGT
GAAGACTGGTCTGTTCGTTGGATTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGTTGGC
TCCTCGTCCCAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGGTCTTT
GATCAGGGAAGTTGCTGGGTTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGT
TGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCAAAGAGGAAGCTTGGTACCCACAAGAGAGC
CAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGGTGG
TGTTACTGAGAAGAAGAAGTAATCAGCTTTCAGGTCTGATTTGTTGTCTGA

QA 3 413 3 413
DS 

RD RR2DA94TF 520 0 0
GG
GAGGTCGAACCCAAGAAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAGCAACACAAGTGAAGACTGGTC
TGTTCGTTGGATTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGTGAGTTGGCTCCTCGTCCCA
ACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGGTCTTTGATCAGGGAAG
TTGCTGGGTTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGTAAAGACA
AGAGGGCTCTTAAGGTTGCAAAGAGGAAGCTTGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGA
GAGAGGAGGTGTCTAGTGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGGTGGTGTTACTGAGA
AGAAGAAGTAATCATCTTTCAAGTCTGATTTGTTGTCTGAGCTTTGTTGCTTTTTGGAAC
TCATTAAGTTTTGGTTAACTCTTTCAAATTAGCTTATATGCTCAAACAATCTTTGTGCTG
TGTTTTGTTATTAATATGGATTAATGTTTGTTTCACTC

QA 3 520 3 520
DS 

RD RR2BC45JQ 560 0 0
G
ATAAAAACCCTTCATTGTTTCATTTGTAGCGGCTGCTTCTCCTCCGAGGTCGAACCCAAG
AAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAGCAACACAAGTGAAGACTGGTCTGTTCGTTGGATTGA
ACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGTTGGCTCCTCGTCCCAACTCTCGCAAAGGGA
AAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGATCTTTGATCAGGGAAGTTGCTGGGTTTGCTC
CATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGG
TTGCAAAGAGGAAGCTTGGTACCCACAAGGGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTA
GTGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGGTGGTGTTACTGAGAAGAAGAAGTAATCAT
CTTTTAAGTCTGATTTGTTGTCTGAGCTTTGTTGCTTTTTGGAACTCATTAAGTTTTGGT
TAACTCTTTCAAATTAGCTTATATGCTCAAACAATCTTTGTGCTGTGTTTTGTTATTAAT
ATGGATTAATGTTTGTTTC

QA 2 560 2 560
DS 

RD RR2G055JQ 516 0 0
GG
GAGGTCGAACCCAAGAAGAAGAAGAGAAAACAATG*CAGCAACACAAGTGAAGACTGGTC
TGTTCGTTGGATTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGTTGGCTCCTCGTCCCA
ACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGATCTTTGATCAGGGAAG
TTGCTGGGTTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGTAAAGACA
AGAGGGCTCTTAAGGTTGCAAAGAGGAAGCTTGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGA
GAGAGGAGATGTCTAGTGTTTTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGGTGGTGTTACTGAGA
AGAAGAAGTAGTCATCTTTTAAGTCTGATTTGTTGTCTGAGCTTTGTTGCTTTTTGGAAC
TCATTAAGTTTTGGTTAACTCTTTCAAATTAGCTTATATGCTCAAACAATCTTTGTGCTG
TGTTTTGTTATTAATATGGATTAATGTTTGTTTC

QA 3 516 3 516
DS 

RD RR2G055TF 392 0 0
TCTCGCAAAGAAAAAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGATCTTTGATCAGGGAAGTT
GCTGGGTTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGTAAAGACAAG
AGGGCTCTTAAGGTTGCAAAGAGGAAGCTTGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGA
GAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGGTGGTGTTACTGAGAAG
AAGAAGTAGTCATCTTTTAAGTCTGATTTGTTGTCTGAGCTTTGTTGCTTTTTGGAACTC
ATTAAGTTTTGGTTAACTCTTTCAAATTAGCTTATATGCTCAAACAATCTTTGTGCTGTG
TTTTGTTATTAATATGGATTAATGTTTGTTTC

QA 1 392 1 392
DS 

RD RR2BC45TF 515 0 0
CGAGGTCGAACCCAAGAAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAGCAACACAAGTGAAGACTGGT
CTGTTCGTTGGATTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGTTGGCTCCTCGTCCC
AACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGATCTTTGATCAGGGAA
GTTGCTGGGTTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGTAAAGAC
AAGAGGGCTCTTAAGGTTGCAAAGAGGAAGCTTGGTACCCACAAGGGAGCCAAGCGAAAG
AGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGGTGGTGTTACTGAG
AAGAAGAAGTAATCATCTTTTAAGTCTGATTTGTTGTCTGAGCTTTGTTGCTTTTTGGAA
CTCATTAAGTTTTGGTTAACTCTTTCAAATTAGCTTATATGCTCAAACAATCTTTGTGCT
GTGTTTTGTTATTAATATGGATTAATGTTTGTTTC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2GE34TF 626 0 0
GGAGGGCTCCCATTTCAGCGCTGTTACATATAAAAACCCTTCATTGTTTCATTTGTAGCG
GCTGCTTCTCCTCCGAGGTCGAACCCAAGAAGAAGAAGAGAAAACAATGGCGGCAACACA
AGTGAAGACTGGTCTGTTCGTTGGATTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGTT
GGCTCCTCGTCCCAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGGTC
TTTGATCAGGGAAGTTGCTGGGTTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAA
GGTTGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCAAAGAGGAAGCTTGGTACCCACAAGAG
AGCCAAGCGAAAGAGGGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGG
TGGTGTTACTGAGAAGAAGAAGTAATCATCTTTCAAGTCTGATTTGTTGTCTGAGCTTTG
TTGCTTTTTGGAGCTCATTAAGTTTTGGCTAACTCTTTCAAATTAGCTTATATGCTCAAA
CAATCTTTGTGCTGTGTTTTGTTATTAATATGGATTAATGTTTGTTTCACTCTTCAGCTT
TCTCGTTAAGCATCTTAAAATCTTCA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2DD17TF 556 0 0
GG
GAGGTCGAACCCAAGAAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAGCAACACAAGTGAAGACTGGTC
TGTTCGTTGGATTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGTTGGCTCCTCGTCCCA
ACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGGTCTTTGATCAGGGAAG
TTGCTGGGTTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGTAAAGACA
AGAGGGCTCTTAAGGTTGCAAAGAGGAAGCTTGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGA
GAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGGTGGTGTTACTGAGA
AGAAGGAGTAATCATCTTTCAAGTCTGATTTGTTGTCTGAGCTTTGTTGCTTTTTGGAAC
TCATTAAGTTTTGGTTAACTCTTTCAAATTAGCTTATATGCTCAAACAATCTTTGTGCTG
TGTTTTGTTATTAATATGGATTAATGTTTGTTTCACTCTTCAGCTTTCTCGTTAAGCATC
TTAAAATCTTCA
CC

QA 3 554 3 554
DS 

RD RR2DD17JQ 467 0 0
TCGTCACAAGACGCGAGTTGGCTCCTCGTCCCAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGA
GGACGTTGTTCATCAGGTCTTTGATCAGGGAAGTTGCTGGGTTTGCTCCATACGAGAAGA
GAATCACTGAGCTTTTCAAGGTTGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCAAAGAGGA
AGCTTGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCA
AGATGAGGTCTGGTGGTGGTGGTGTTACTGAGAAGAAGGAGTAATCATCTTTCAAGTCTG
ATTTGTTGTCTGAGCTTTGTTGCTTTTTGGAACTCATTAAGTTTTGGTTAACTCTTTCAA
ATTAGCTTATATGCTCAAACAATCTTTGTGCTGTGTTTTGTTATTAATATGGATTAATGT
TTGTTTCACTCTTCAGCTTTCTCGTTAAGCATCTTAAAATCTTCACC

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 9

CO CL748Contig1 665 9 17 U
GGGCTCCCGTCAGGATAAAACCCTAGAAGGAGGATAAAGAAAGAGCGTGAAAAATGGTGC
AGCGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACAGGATCC
TCAAAACCCCTGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACCAAGAAACGTGCCAGTGGACCTA
AATGTCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACA
AGAGGTCTCGATTATCCAGAAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGT
CTGCTTTGGCTGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAAGAGCAAAAGATTG
TGAAGAAGGTCTTGAAGCTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGGCGCTCCCAAGAACTAGAAAT
CCTATTTTCACTTTTTATTTTATTAAAAAAA*TGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTA
CTGGTTGCAGAATATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTTA
ATTCGTTTTTGGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTATACTTTCTCC
TTTCAATTTTCTTTTCACATTTCATTGTTTCTATTCTTGTGAAGTTTACTTGTTTGTCAA
AAAAA


BQ
30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2G537TF U 1
AF RR2GO67JQ C 1
AF RR2G537JQ C 251
AF RR2D522TF U 14
AF RR2FV72JQ C -4
AF RR2FV72TF U -4
AF RR2GO67TF U 0
AF RR2H759JQB C 1
AF RR2H759TF U 1
BS 1 163 RR2G537TF
BS 164 164 RR2FV72TF
BS 165 268 RR2G537TF
BS 269 269 RR2D522TF
BS 270 346 RR2G537TF
BS 347 347 RR2D522TF
BS 348 399 RR2G537TF
BS 400 400 RR2D522TF
BS 401 439 RR2G537TF
BS 440 441 RR2D522TF
BS 442 486 RR2G537TF
BS 487 487 RR2D522TF
BS 488 583 RR2G537TF
BS 584 584 RR2D522TF
BS 585 618 RR2G537TF
BS 619 658 RR2GO67TF
BS 659 665 RR2H759TF

RD RR2G537TF 618 0 0
GGGCTCCCGTCAGGATAAAACCCTAGAAGGAGGATAAAGAAAGAGCGTGAAAAATGGTGC
AGCGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACAGGATCC
TCAAAACCCCTGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACCAAGAAGCGTGCCAGTGGACCTA
AATGTCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACA
AGAGGTCTCGATTATCCAGAAACAGGAGAACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGT
CTGCTTTGGCTGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAAAAGATTG
TGAAGAAGGTCTTGAAGCTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTCGCTCCCAAGAACTAGAAAT
CCTATTTTCACTTTTTATT**ATTAAAAAAA*TGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTA
CTGGTTACAGAATATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTTA
ATTCGTTTTTGGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGCGTGTTATACTTTCTCC
TTTCAATTTTCTTTTCAC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2GO67JQ 658 0 0
GGGCTCCCGTCAGGATAAAACCCTAGAAGGAGGATAAAGAAAGAGCGTGAAAAATGGTGC
AGCGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACGGGATCC
TCAAAACCCCTGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACCAAGAAACGTGCCAGTGGACCTA
AATGTCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACA
AGAGGTCTCGATTATCCAGAAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGT
CTGCTTTGGCTGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAAGAGCAAAAGATTG
TGAAGAAGGTCTTGAAGCTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGGCGCTCCCAAGAACTAGAAAT
CCTATTTTCACTTTTTATTTTATTAAAAAAAATGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTA
CTGGTTGCAGAATATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTTA
ATTCGTTTTTGGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTATACTTTCTCC
TTTCAATTTTCTTTTCACATTTCATTGTTTCTATTCTTGTGAAGTTTACTTGTTTGTC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2G537JQ 368 0 0
ATTATCCAGAAACAGGAGAACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGTCTGCTTTGGC
TGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAAAAGATTGTGAAGAAGGT
TTTGAAGCTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTCGCTCCCAAGAACTAGAAATCCTATTTTCA
CTTTTTATT**ATTAAAAAAA*TGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTACTGGTTACAG
AATTTGAGAGAAACATTAGGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTTAATTCGTTTTT
GGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGCGTGTTATACTTTCTCCTTTCAATTTT
CTTTTCAC

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR2D522TF 596 0 0
GATAAAACCCTAGAAGGAGGATAAAGAAAGAGCGTGAAAA*TGGTGCAGCGTCTTGTATA
CCGTTCTCGTCACAGCTACGCTACCAAATCCAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCTGG
TGGTAAATTGACATTCCAGACCACCAAGAAGCGTGCCAGTGGACCTAAATGTCCCGTTAC
CGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTCGATT
ATCCAGAAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGTCTGCTTTGGCTGT
TAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAAGAGCAAAAGATTGTGAAGAAGGTCTT
GAAGCTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGGCGCTCCCAAGAACTAGAAATCCTATTTTCACTT
TTTATTTTATTAAAAAA**TGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTACTGGTTGCAGAAT
ATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTTAATTCGTTTTTGGT
CCTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTATACTTTCTCCTTTCAATTT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2FV72JQ 606 0 0
GGCCTCT
GCTCCCGTCAGGATAAAACCCTAGAAGGAGGATAAAGAAAGAGCGTGAAAAATGGTGCAG
CGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACAGGATCCTC
AAAACCCCTGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACCAAGAAACGTGCCAGTGGACCTAAA
TGTCCCGTTACCGGCAAGGGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAG
AGGTCTCGATTATCCAGAAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGTTT
GCTTTGGCTGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAAGAGCAAAAGATTGTG
AAGAAGGTCTTGAAGCTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGGCGCTCCCAAGAACTAGAAATCC
TATTTTCACTTTTTATTTTATTAAAAAA**TGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTACT
GGTTGCAGAATATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTTAAT
TCGTTTTTGGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTATACTTTCTCCT

QA 8 606 8 606
DS 

RD RR2FV72TF 606 0 0
GGCCTCT
GCTCCCGTCAGGATAAAACCCTAGAAGGAGGATAAAGAAAGAGCGTGAAAAATGGTGCAG
CGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACAGGATCCTC
AAAACCCCTGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACCAAGAAACGTGCCAGTGGACCTAAA
TGTCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAG
AGGTCTCGATTATCCAGAAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGTCT
GCTTTGGCTGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAAGAGCAAAAGATTGTG
AAGAAGGTCTTGAAGCTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGGCGCTCCCAAGAACTAGAAATCC
TATTTTCACTTTTTATTTTATTAAAAAA**TGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTACT
GGTTGCAGAATATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTTAAT
TCGTTTTTGGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTATACTTTCTCCT

QA 8 606 8 606
DS 

RD RR2GO67TF 659 0 0
GGA
GCTCCCGTCAGGATAAAACCCTAGAAGGAGGATAAAGAAAGAGCGTGAAAAATGGTGCAG
CGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACGGGATCCTC
AAAACCCCTGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACCAAGAAACGTGCCAGTGGACCTAAA
TGTCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAG
AGGTCTCGATTATCCAGAAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGTCT
GCTTTGGCTGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAAGAGCAAAAGATTGTG
AAGAAGGTCTTGAAGCTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGGCGCTCCCAAGAACTAGAAATCC
TATTTTCACTTTTTATTTTATTAAAAAAAATGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTACT
GGTTGCAGAATATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTTAAT
TCGTTTTTGGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTATACTTTCTCCTT
TCAATTTTCTTTTCACATTTCATTGTTTCTATTCTTGTGAAGTTTACTTGTTTGTC

QA 4 659 4 659
DS 

RD RR2H759JQB 658 0 0
GGGCTCCCGTCAGGATAAAACCCTAGAAGGAGGATAAAGAAAGAGCGTGAAAAATGGTGC
AGCGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACGGGATCC
TCAAAACCCCTGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACCAAGAAACGTGCCAGTGGACCTA
AATGTCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACA
AGAGGTCTCGATTATCCAGAAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGT
CTGCTTTGGCTGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAAGAGCAAAAGATTG
TGAAGAAGGTCTTGAAGCTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGGCGCTCCCAAGAACTAGAAAT
CCTATTTTCACTTTTTATTTTATTAAAAAAAATGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTA
CTGGTTGCAGAATATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTTA
ATTCGTTTTTGGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTATACTTTCTCC
TTTCAATTTTCTTTTCACATTTCATTGTTTCTATTCTTGTGAAGTTTACTTGTTTGTC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2H759TF 665 0 0
GGGCTCCCGTCAGGATAAAACCCTAGAAGGAGGATAAAGAAAGAGCGTGAAAAATGGTGC
AGCGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACGGGATCC
TCAAAACCCCTGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACCAAGAAACGTGCCAGTGGACCTA
AATGTCCCGTTACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACA
AGAGGTCTCGATTATCCAGAAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCGTACGGTGGTGTTTTGT
CTGCTTTGGCTGTTAGGGAGAGAATCGTCCGTGCTTTCCTTGTGGAAGAGCAAAAGATTG
TGAAGAAGGTCTTGAAGCTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGGGCGCTCCCAAGAACTAGAAAT
CCTATTTTCACTTTTTATTTTATTAAAAAAAATGTTGTGGCTTTGTTCTAGCAATAGTTA
CTGGTTGCAGAATATGAGAGAAACATTATGTATTCGTCGCAGTTCTCAAGCTTTTTTTTA
ATTCGTTTTTGGTCTTGACTCTGTCGACATTTCGCAAATCTTGTGTGTTATACTTTCTCC
TTTCAATTTTCTTTTCACATTTCATTGTTTCTATTCTTGTGAAGTTTACTTGTTTGTCAA
AAAAA

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 6

CO CL749Contig1 874 6 24 U
GGAACATGCCAAGTAGAAGTTTTGAAGAGGACAAGGAACAATGGCGAAGTCACTCCTTTG
TTCATCAGCCCTAAACTCATTCTTCTCCTCCACTCTCTCCTCGCCAACTTCTTCCAGGAA
CAACCAAATCGCATGCTCAGGAAACATCAAGAACCAGACATCGTCT***CTTTCATGGAA
CAGACGAGAGTTGTCACTTGGTTTTATGAGCACCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAA
CGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAATGCAGCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAAGAGCT
TCTGGAGAAAGTGAAGCAAGACCGGAAAAAGAGGATTGAGAGACAGGCTGTTCTTAACTC
TGCTGTCAAAGAAAAGGGGTATTTGCAGGATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGACA
AGCCATTGAGAACAATGATCTACCAGCTGCTGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTGATAC
CGAATGGGTCAAAACCGCTAACTTGGCTTTCACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAGAGAA
TACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCTCTAGCTTCTCTTGTTACATCAGTGAACAAGAA
CGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCGTTCGTGTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAATGGTC
GAGCTTGACTGGTCTTTTAGGACAGCTCAAGGGCATTTGATAGGCTGCCTACCAATTTGT
TTACTTTTGTGTTGTAATTTTCTGAACATTCTGTCAACAAAAGAAAGAAATATCCTTTAA
AAAATACATCCTCTTAAAATATTTGGTTATCAACATTTGTTCATACTTGGCTTGCATTGG
CACATTAAAAATGAATTAAAAATAATTTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 30 30 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 0 
0 20 0 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 0 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW09TF U 20
AF RR2EG76TF U 1
AF RR2CF43TF U 115
AF RR2EG76JQ C 177
AF RR2GM94TF U 261
AF RR2FZ56JQ C 127
BS 1 132 RR2EG76TF
BS 133 133 RR2DW09TF
BS 134 654 RR2EG76TF
BS 655 655 RR2CF43TF
BS 656 680 RR2EG76TF
BS 681 681 RR2CF43TF
BS 682 703 RR2EG76TF
BS 704 704 RR2CF43TF
BS 705 736 RR2EG76TF
BS 737 737 RR2CF43TF
BS 738 756 RR2EG76TF
BS 757 758 RR2CF43TF
BS 759 759 RR2GM94TF
BS 760 760 RR2FZ56JQ
BS 761 778 RR2GM94TF
BS 779 779 RR2FZ56JQ
BS 780 782 RR2GM94TF
BS 783 784 RR2FZ56JQ
BS 785 786 RR2GM94TF
BS 787 787 RR2FZ56JQ
BS 788 797 RR2GM94TF
BS 798 798 RR2FZ56JQ
BS 799 799 RR2GM94TF
BS 800 874 RR2FZ56JQ

RD RR2DW09TF 459 0 0
GGAGGA
AGAGGACAAGGAACAATGGCGAAGTCACTCCTTTGTTCATCAGCCCTAAACTCATTCTTC
TCCTCCACTCTCTCCTCGCCAACTTCTTCCAGGAACAACCAAATCGCATGCTCAGGAAAC
ATCAAGAACCAGACATCGTCT***CTTTCATGGAACAGACGAGAGTTGTCACTTGGTTTT
ATGAGCACCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAAT
ACAGCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAAGAGCTTCTGGAGAAAGTGAAGCAAGACCGG
AAAAAGAGGATTGAGAGACAGGCTGTTCTTAACTCTGCTGTCAAAGAAAAGGGGTATTTG
CAGGATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCATTGAGAACAATGATCTACCA
GCTGCTGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTGAT

QA 7 459 7 459
DS 

RD RR2EG76TF 756 0 0
GGAACATGCCAAGTAGAAGTTTTGAAGAGGACAAGGAACAATGGCGAAGTCACTCCTTTG
TTCATCAGCCCTAAACTCATTCTTCTCCTCCACTCTCTCCTCGCCAACTTCTTCCAGGAA
CAACCAAATCGCGTGCTCAGGAAACATCAAGAACCAGACATCGTCT***CTTTCATGGAA
CAGACGAGAGTTGTCACTTGGTTTTATGAGCACCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAA
CGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAATGCAGCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAAGAGCT
TCTGGAGAAAGTGAAGCAAGACCGGAAAAAGAGGATTGAGAGACAGGCTGTTCTTAACTC
TGCTGTCAAAGAAAAGGGGTATTTGCAGGATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGACA
AGCCATTGAGAACAATGATCTACCAGCTGCTGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTGATAC
CGAATGGGTCAAAACCGCTAACTTGGCTTTCACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAGAGAA
TACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCTCTAGCTTCTCTTGTTACATCAGTGAACAAGAA
CGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCGTTCGTGTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAGTGGTC
GAGCTTGACTGGTCTTTTAG*ACAGCTCAAGGGCATTTGATAG*CTGCCTACCAATTTGT
TTACTTTTGTGTTGTA*TTTTCTGAACATTCTGTCA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2CF43TF 644 0 0
G
AGGAACAACCAAATCGCATGCTCAGGAAACATCAAGAACCAGACATCGTCT***CTTTCA
TGGAACAGACGAGAGTTGTCACTTGGTTTTATGAGCACCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTT
GGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAATGCAGCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAA
GAGCTTCTGTAGAAAGTGAAGCAAGACCGGAAAAAGAGGATTGAGAGACAGGCTGTTCTT
AACTCTGCTGTCAAAGAAAAGGGGTATTTGCAGGATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTA
GGACAAGCCATTGAGAACAATGATCTACCAGCTGCTGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGT
GATACCGAATGGGTCAAAACCGCTAACTTGGCTTTCACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAA
GAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCTCTAGCTTCTCTTGTTACATCAGTGAAC
CAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCGTTCGTGTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAA
TGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAGGACAGCTCAAGGGCATTTGATAGGCTGCCTACCAA
TTTGTTTACTTTTGTGTTGTAATTTTCTGAACATTCTGTCAAC

QA 2 644 2 644
DS 

RD RR2EG76JQ 603 0 0
GGAACAGACGAGAGTTGTCACTTGGTTTTATGAGCACCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTG
GTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAATGCAGCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAAG
AGCTTCTGGAGAAAGTGAAGCAAGACCGGAAAAAGAGGATTGAGAGACAGGCTGTTTTTA
ACTTTGCTGTCAAAGAAAAGGGGTATTTGCAGGATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAG
GACAAGCCATTGAGAACAATGATTTACCAGCTGCTGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTG
ATACCGAATGGGTCAAAACCGCTAACTTGGCTTTCACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAG
AGAATACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCTCTAGCTTCTCTTGTTACATCAGTGAACA
AGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCGTTCGTGTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAGT
GGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAGGACAGCTCAAGGGCATTTGATAGGCTGCCTACCAAT
TTGTTTACTTTTGTGTTGTAATTTTTTGAACATTCTGTCAACAAAAGAAAGAAATATCCT
TTG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2GM94TF 539 0 0
G
GAATGCAGCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAAGAGCTTCTGGAGAAAGTGAAGCAAGA
TCGGAAAAAGAGGATTGAGAGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGTA
TTTGCAAGATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCATTGAGAACAATGATCT
ACCAGCTGCAGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACAGCTAA
CTTGGCTTTCACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAA
TTCATCTTTAGCTTCTCTTGTTACATCAGTGAACAGGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCT
CGCGTTCGTGTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAGG
ACAGCTCAAGGGCATCTGATAGGCTGCCTACCA*TTTGTTTACTTTTGT*TTGTAATTTT
CTGAACATTGTGTCAACAGAAGAAAGAAATATCCTTTGAAAGTTATATCCTCTTAACA

QA 2 539 2 539
DS 

RD RR2FZ56JQ 748 0 0
AATCGCTTGCTCAGGAAACATCAAGAACCAGACATCGTCTTCTCTGTCATGGAACAGACG
AGAGTTGTCGCTTGGTTTTATGAGCAGCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAG
AAGAAGCCGCGACGCGAATGCAGCGATTCTCGAAGCTGATGACGATGAAGAGCTTCTGGA
GAAAGTGAAGCAAGATCGGAAAAAGAGGATTGAGAGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGT
TAAAGAAAAGGGGTATTTGCAAGATCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGACAAGCCAT
TGAGAACAATGATCTACCAGCTGCAGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTGATACCGAATG
GGTCAAAACAGCTAACTTGGCTTTCACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAGAGAATACAGA
GGTGGAGACATTTAATTCATCTTTAGCTTCTCTTGTTACATCAGTGAACAAGAACGATCT
AGAGTCATCTAAGCTCGCGTTCGTGTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAATGGTCGAGCTT
GACTGGTCTTTTAGGACAGCTCAAGGGCATCTGATAGGCTGCCTACCAATTTGTTTACTT
TCGTGTTGTAATTTTCTGAACATTGTGTCAACAAAAGAAAGAAATATCCTTTAAAAAATT
CATCTTCTTAGATTATTTGGTTATCAACATTTGTTCATACTTGGCTTGCATTGGCACATT
AAAAATGAATTAAAAATAATTTTTTTTC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 2 8

CO CL750Contig1 743 4 6 U
CTCGTGCGTTCTCATCCAGAGAGGAAGACTCAGGCATTTTCATAGCTAAAACGCTTCTTT
CCCAAAGGGGTATCCTGAGAACACAAAGGATAACAAACTATGGCCAAGGGAGTTGCAGTC
TTGAACAGCAGCGAGGGTGTTAAGGGGACTATCTTCTTCACCCAGGATGGAAACGGTGCG
ACCACTGTGACTGGTACAGTTTCTGGACTTAAACCTGGTCTACATGGTTTCCATGTCCAT
GCTCTTGGTGACACCACTAACGGCTGCATGTCTACCGGTCCACATTTCAACCCTGAAGGT
AAACAACACGGTGCCCCTGAGGATGCTAATCGACATGCTGGCGATCTAGGAAACATCATT
GTTGGAGATGATGGAACTGCCACCTTCACAATCACTGACAGCCAGATTCCTCTTGATGGA
CCAAACTCTATTGTGGGAAGGGCTGTTGTTGTCCACGCTGACCCTGATGACCTCGGAAAG
GGAGGCCATGAATTCAGCTTGGCTACCGGAAATGCAGGCGGCCGTGTTGCTTGTGGTATT
ATTGGTCTTCAAGGTTAAGCTATCACTTTACCAAGGAAGATAGTGATGTAATAAGGAGGT
CATATACCTCCAGACCTGGCTAGTTTGTGTGTGCGTGTGTGTGGCTCCTTTGTGGATCAA
ACGCATTTTATTTAAGACCAAAAAAAAACAGAGAAAATTCCTAATATTTTCATGAATAAC
AAGAGCAAATGTGAGCTTATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL06TF U 19
AF RR2FV29TF U 1
AF RR2FV29JQ C 267
AF RR2GL06JQ C 477
BS 1 492 RR2FV29TF
BS 493 493 RR2FV29JQ
BS 494 554 RR2FV29TF
BS 555 555 RR2FV29JQ
BS 556 678 RR2FV29TF
BS 679 743 RR2FV29JQ

RD RR2GL06TF 327 0 0
GGGAGGAAGACTCA
GGCATTTTCATAGCTAAAACGCTTCTTTCCCAAAGGGGTATCCTGAGAACACAAAGGATA
ACAAACTATGGCCAAGGGAGTTGCAGTCTTGAACAGCAGCGAGGGTGTTAAGGGGACTAT
CTTCTTCACCCAGGATGGAAACGGTGCGACCACTGTGACTGGTACAGTTTCTGGACTTAA
ACCTGGTCTACATGGTTTCCATGTCCATGCTCTTGGTGACACCACTAACGGCTGCATGTC
TACCGGTCCACATTTCAACCCTGAAGGTAAACAACACGGTGCCCCTGAGGATGCTAATCG
ACATGCTGGCGAT

QA 15 327 15 327
DS 

RD RR2FV29TF 680 0 0
CTCGTGCGTTCTCATCCAGAGAGGAAGACTCAGGCATTTTCATAGCTAAAACGCTTCTTT
CCCAAAGGGGTATCCTGAGAACACAAAGGATAACAAACTATGGCCAAGGGAGTTGCAGTC
TTGAACAGCAGCGAGGGTGTTAAGGGGACTATCTTCTTCACCCAGGATGGAAACGGTGCG
ACCACTGTGACTGGTACAGTTTCTGGACTTAAACCTGGTCTACATGGTTTCCATGTCCAT
GCTCTTGGTGACACCACTAACGGCTGCATGTCTACCGGTCCACATTTCAACCCTGAAGGT
AAACAACACGGTGCCCCTGAGGATGCTAATCGACATGCTGGCGATCTAGGAAACATCATT
GTTGGAGATGATGGAACTGCCACCTTCACAATCACTGACAGCCAGATTCCTCTTGATGGA
CCAAACTCTATTGTGGGAAGGGCTGTTGTTGTCCACGCTGACCCTGATGACCTCGGAAAG
GGAGGCCATGAACTCAGCTTGGCTACCGGAAATGCAGGCGGCCGTGTTGCTTGTGGTATT
ATTGGTCTTCAAGGCTAAGCTATCACTTTACCAAGGAAGATAGTGATGTAATAAGGAGGT
CATATACCTCCAGACCTGGCTAGTTTGTGTGTGCGTGTGTGTGGCTCCTTTGTGGATCAA
ACGCATTTTATTTAAGAC
CA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2FV29JQ 477 0 0
CATGTCTACCGGTCCACATTTCAACCCTGAAGGTAAACAACACGGTGCCCCTGAGGATGT
TAATCGACATGCTGGCGATTTAGGAAACATCATTGTTGGAGATGATGGAACTGCCACCTT
CACAATCACTGACAGCCAGATTCCTCTTGATGGACCAAACTTTATTGTGGGAAGGGCTGT
TGTTGTCCACGCTGACCCTGATGACCTCGGAAAGGGAGGCCATGAATTCAGCTTGGCTAC
CGGAAATGCAGGCGGCCGTGTTGCTTGTGGTATTATTGGTTTTCAAGGTTAAGCTATCAC
TTTACCAAGGAAGATAGTGATGTAATAAGGAGGTCATATACCTCCAGACCTGGCTAGTTT
GTGTGTGGGTGTGTGTGGCTCCTTTGTGGATCAAACGCATTTTATTTAAGACCAAAAAAA
AACAGAGAAAATTCCTAATATTTTCATGAATAACAAGAGCAAATGTGAGCTTATATC

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2GL06JQ 252 0 0
AAAGGGAGGCCATGAATTCAGCTTGGCTCCCGGAAATGCAGGCGGCCGTGTTGCTTGTGG
TATTATTGGTCTTCAAGGTTAAGCTATCACTTTACCAAGGAAAATAGTGATGTAATAAGG
AGGTCATATACCTCCAGACCTGGCTAGTTTGTGTGTGCGTGTGTGTGGCTCCTTTGTGGA
TCAAACGCATTTTATTTAAGACCAAAAAAAAACAGAGAAAATTCCTAATATTTTCGTGAA
TAACAAGAGCA
A

QA 1 251 1 251
DS 



CO CL750Contig2 742 4 4 U
GATATAAGTTCACATCTGCTCTTGTTATTCATGAAAATAGTAGGAATTTTCTCTGTTTTT
TTTGGTCTTAAATAAAATGCATTTGATCCACAAAGGAGCCACACACAAACTAGCCAGGTG
TAGAGGTATATGACCTCCTTATTACATCACTATCTTCCTCGATAAAGTGACAGCTTAGCC
CTGAAGACCAATAATGCCGCAAGCAACACGGCCGCCTGCATTTCCAGTAGCCAAGCTGAG
TTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCCTTCCCAC
AATAGAGTTTGGTCCACTAAGAGGAATCTGGCAGTCAGTGATTGTGAAGGTGGCAGTTCC
ATCATCTCCAACAGTGATGTTTCCTAGATCACCAGCATGTCGATTAGCATCCTCCGGGGC
ACCGTGTTGTTTACCATCAGGGTTGAAATGTGGACCGGTAGACATGCAACCGTTAGTGGT
GTCACCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGTAGACCAGGTTTAAGTCCAGAAACTGTTCC
AGTCACAGTGGTCACACCGTCTCCTTCCTGGGTGAAGAAGATAGTCCCTTTAACACCCTC
GCTGCTGTTTAAAACTGCAACTCCCTCGGCCATAGTTTGTTATCCTTTGTGATCTCAGGG
TACCCCTTTGGGAAAGAAGATTTTTAGCTATGAAAATGCCCGAATCTTCTTCTCTCGATG
AGATGTGTGTGTGTGTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FG12JQ U 6
AF RR2G981JQ U 1
AF RR2FG12TF C 63
AF RR2G981TF C 185
BS 1 402 RR2G981JQ
BS 403 403 RR2FG12JQ
BS 404 679 RR2G981JQ
BS 680 742 RR2FG12TF

RD RR2FG12JQ 522 0 0
GAGT
TCACATCTGCTCTTGTTATTCATGAAAATAGTAGGAATTTTCTCTGTTTTTTTTGGTCTT
AAATAAAATGCATTTGATCCACAAAGGAGCCACACACAAACTAGCCAGGTGTAAAGGTAT
ATGACCTCCTTATTACATCACTATCTTCCTCGATAAAGTGACAGCTTAACCCTGAAAACC
AATAATGCCGCAAGCAACACGGCCGCCTGCATTTCCAGTAGCCAAGCTGAGTTCATGGCC
TCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCCTTCCCACAATAGAGTT
TGGTCCACTAAAAGGAATCTGGCAGTCAGTGATTGTGAAGGTGGCAGTTCCATCCTCTCC
AACAGTGATGTTTCCTAAATCACCAGCATGTCGATTAACATCCTCCGGGGCACCGTGTTG
TTTACCATCAGGGTTGAAATGTGGACCGGTAAACATGCAACCGTTAGTGGTGTCACCAAG
AGCATGGACATGGAAACCATGTAAACCAGGTTTAAGTC

QA 5 522 5 522
DS 

RD RR2G981JQ 681 0 0
GATATAAGTTCACATCTGCTCTTGTTATTCATGAAAATAGTAGGAATTTTCTCTGTTTTT
TTTGGTCTTAAATAAAATGCATTTGATCCACAAAGGAGCCACACACAAACTAGCCAGGTG
TAGAGGTATATGACCTCCTTATTACATCACTATCTTCCTCGATAAAGTGACAGCTTAGCC
CTGAAGACCAATAATGCCGCAAGCAACACGGCCGCCTGCATTTCCAGTAGCCAAGCTGAG
TTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCCTTCCCAC
AATAGAGTTTGGTCCACTAAGAGGAATCTGGCAGTCAGTGATTGTGAAGGTGGCAGTTCC
ATCATCTCCAACAGTGATGTTTCCTAGATCACCAGCATGTCGGTTAGCATCCTCCGGGGC
ACCGTGTTGTTTACCATCAGGGTTGAAATGTGGACCGGTAGACATGCAACCGTTAGTGGT
GTCACCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGTAGACCAGGTTTAAGTCCAGAAACTGTTCC
AGTCACAGTGGTCACACCGTCTCCTTCCTGGGTGAAGAAGATAGTCCCTTTAACACCCTC
GCTGCTGTTTAAAACTGCAACTCCCTCGGCCATAGTTTGTTATCCTTTGTGATCTCAGGG
TACCCCTTTGGGAAAGAAG
AT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2FG12TF 680 0 0
TGGTCTTAAATAAAATGCATTTGATCCACAAAGGAGCCACACACAAACTAGCCAGGTGTA
GAGGTATATGACCTCCTTATTACATCACTATCTTCCTCGATAAAGTGACAGCTTAGCCCT
GAAGACCAATAATGCCGCAAGCAACACGGCCGCCTGCATTTCCAGTAGCCAAGCTGAGTT
CATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCCTTCCCACAA
TAGAGTTTGGTCCACTAAGAGGAATCTGGCAGTCAGTGATTGTGAAGGTGGCAGTTCCAT
CATCTCCAACAGTGATGTTTCCTAGATCACCAGCATGTCGATTAGCATCCTCCGGGGCAC
CGTGTTGTTTACCATCAGGGTTGAAATGTGGACCGGTAGACATGCAACCGTTAGTGGTGT
CACCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGTAGACCAGGTTTAAGTCCAGAAACTGTTCCAG
TCACAGTGGTCACACCGTCTCCTTCCTGGGTGAAGAAGATAGTCCCTTTAACACCCTCGC
TGCTGTTTAAAACTGCAACTCCCTTGGCCATAGTTTGTTATCCTTTGTGATCTCAGGGTA
CCCCTTTGGGAAAGAAGATTTTTAGCTATGAAAATGCCCGAATCTTCTTCTCTCGATGAG
ATGTGTGTGTGTGTGTTTCC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2G981TF 558 0 0
AGACCAATAATGCCGCAAGCAACACGGCCGCCTGCATTTCCAGTAGCCAAGCTGAGTTCA
TGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCCTTCCCACAATA
GAGTTTGGTCCACTAAGAGGAATCTGGCAGTCAGTGATTGTGAAGGTGGCAGTTCCATCA
TCTCCAACAGTGATGTTTCCTAGATCACCAGCATGTCGGTTAGCATCCTCCGGGGCACCG
TGTTGTTTACCATCAGGGTTGAAATGTGGACCGGTAGACATGCAACCGTTAGTGGTGTCA
CCAAGAGCATGGACATGGAAACCATGTAGACCAGGTTTAAGTCCAGAAACTGTTCCAGTC
ACAGTGGTCACACCGTCTCCTTCCTGGGTGAAGAAGATAGTCCCTTTAACACCCTCGCTG
CTGTTTAAAACTGCAACTCCCTCGGCCATAGTTTGTTATCCTTTGTGATCTCAGGGTACC
CCTTTGGGAAAGAAGATTTTTAGCTATGAAAATGCCCGAATCTTCTTCTCTCGATGAGAT
GTGTGTGTGTGTGTTTCC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 8

CO CL751Contig1 1646 8 15 U
GGATGCCCAGTTGGCCAGTTCAATCACATATACAATATCTATTTTCATTTTCCTTTCTGT
CGGCATAAGAAAGAAAGAAAATGGGATCTCATGCCGTTTCTCCCGCCCGGAAACAACACG
TAGTTTGCGTGCCTTACCCAGCTCAAGGCCATATCAATCCGATGATGAAAGTGGCTAAAC
TCCTCCACGCCAAAGGCTTCTATGTTACCTTTGTCAACACCATCTACAACCACAACCGTC
TCCTCCGGTCCCGTGGGTCCAACGCCTTAGATGGGCTTCCTTCCTTCCAGTTCGAGTCCA
TCCCTGACGGTCTACCGGAGACTGACGTGGACGTCACACAGGATATCCCTTCCCTTTGCG
AGTCCACTCCGAAGAATAGTCTCGCACCGTTCAAGGAGCTTCTTCGACGGATCAACGTCC
AAGATGAAGTCCCTCCAGTGAGCTGTATTGTGTCCGACGGTTGTATGAGCTTTACTCTTG
ATGCTGCGGAGGAGCTCGGTGTCCCCGAGGTTCTATTTTGGACCACAAGTGCTTGTGGCT
TATTGGCTTATTTACACTACCATCGCTTCGTCGAGAAAGGCTTATCTCCACTGAAAGATG
AGAGTTACTTGACAAAGGAGCATTTAGACACAATTATAGATTGGATTCCATCCATGAAGA
ACCTAAGACTAAAAGACATCCCTAGCTTCATCCGTACGACTAACCCTAACGACATAATGC
TCAACTTCCTCATCCGTGAGACCGACCGAGCCAAACGTGCTTCTGCTATCATTCTCAACA
CGTTCGACGATCTCGAGCATGACGTCATCCAATCCATGCAATCTATCGTACCTCCGGTTT
ACTCTATTGGACCGCTCCATCTACAAGTGAAACAACAAATTAGTGAGGACAGTGAACTAG
GACGAATAGGATCAAACCTGTGGAAAGAAGAGACAGCATGTATGGATTGGCTCAATACCA
AAGCTCCAAACAGCGTTGTTTACGTTAACTTTGGGAGCATAACTGTGATGACGGCGAAGC
AGCTTGTGGAGTTTGCTTGGGGCTTGGCGGCCACGGGAAAAGAGTTTTTGTGGGTGATAC
GGCCAGATTTAGTGGCCGGTGATGTGGCAATGGTTCCACCTGAGTTTCTAACGGAGACGG
CAGACCGGAGGATGCTGGCGAGTTGGTGTCCTCAGGAGGAAGTCCTTTCCCATCCGGCGG
TCGGAGGGTTCTTAACACATTGTGGATGGAACTCGACGCTTGAAAGTATTTGCGGAGGAG
TTCCAATGGTGTGTTGGCCATTTTTCGCAGAGCAGCAAACAAATTGTAAGTTTTGTTGTG
ACGAGTGGGAGATTGGTGTTGAGATCGGTGGAGATGTGAAGAGGGAGGAGGTTGAGGCGG
TGGTTAGGGAGTTGATGGATGGAGAGAAGGGTAAGAAAATGAGAGAGAAGGCGGAGGAGT
GGCGGAGCTTGGCTGAGAAAGCGACTGAGTGTAAGCGTGGTTCATCAGTTGTAAATTTTG
ACAAGGTTGTTAAGGTTCTTTTAGGAGAGTAAAGATTCTATGATTAAACTATCGTTTTCA
GTTTTTTTTTTCTTCCTTATCAAATCCTCTGTGAACCCTGTGATGATATCCTCCTAAATT
ATCAATTCGAAATGTTATATGGACAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 5 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM42TF U 15
AF RR2EO87TF U 1
AF RR2AI19TF U 1
AF RR2GR05TF U 1
AF RR2GK50TF U 820
AF RR2AI19JQ C 734
AF RR2EO87JQ C 836
AF RR2GR05JQ C 1195
BS 1 795 RR2AI19TF
BS 796 811 RR2GR05TF
BS 812 820 RR2AI19JQ
BS 821 826 RR2GK50TF
BS 827 827 RR2AI19JQ
BS 828 1191 RR2GK50TF
BS 1192 1192 RR2AI19JQ
BS 1193 1315 RR2GK50TF
BS 1316 1316 RR2AI19JQ
BS 1317 1413 RR2GK50TF
BS 1414 1544 RR2AI19JQ
BS 1545 1570 RR2EO87JQ
BS 1571 1571 RR2GR05JQ
BS 1572 1600 RR2EO87JQ
BS 1601 1646 RR2GR05JQ

RD RR2CM42TF 706 0 0
CCAGTTCAATCACATATACA*TATCTATTTTCATTTTCCTTTCTGTCGGCATAAGAAAGA
AAGAAAATGGGATCTCATGCCGTTCCTCCCGCCCGGAAACAACACGTAGTTTGCGTGCCT
TACCCAGCTCAAGGCCATATCAATCCGATGATGAAAGTGGCTAAACTCCTCCACGCCAAA
GGCTTCTATGTTACCTTTGTCAACACCATCTACAACCACAACCGTCTCCTCCGGTCCCGT
GGGTCCAACGCCTTAGATGGGCTTCCTTCCTTCCAGTTCGAGTCCATCCCTGACGGTCTA
CCGGAGACTGACGTGGACGTCACACAGGATATCCCTTCCCTTTGCGAGTCCACTCCGAAG
AATAGTCTCGCACCGTTCAAGGAGCTTCTTCGACGGATCAACGTCCAAGATGAAGTCCCT
CCAGTGAGCTGTATTGTGTCCGACGGTTGTATGAGCTTTACTCTTGATGCTGCGGAGGAG
CTCGGTGTCCCCGAGGTTCTATTTTGGACCACAAGTGCTTGTGGCTTATTGGCTTATTTA
CACTACCATCGCTTCGTCGAGAAAGGCTTATCTCCACTGAAAGATGAGAGTTACTTGACA
AAGGAGCATTTAGACACAATTATAGATTGGATTCCATCCATGAAGAACCTAAGACTAAAA
GACATCCCTAGCTTCATCCGTACGACTAACCCTAACGACATAATGC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2EO87TF 729 0 0
GGATGCCTAGTTGGCCAGTTCAATCACATATACAATATCTATTTTCCTTTTCCTTTCTGT
CGGCATAAGAAAGAAAGAAAATGGGATCTCATGCCGTTTCTCCCGCCCGGAAACAACACG
TAGTTTGCGTGCCTTACCCAGCTCAAGGCCATATCAATCCGATGATGAAAGTGGCTAAAC
TCCTCCACGCCAAAGGCTTCTATGTTACCTTTGTCAACACCATCTACAACCACAAGCGTC
TCCTCCGGTCCCGTGGGTCCAACGCCTTAGATGGGCTTCCTTCCTTCCAGTTCGAGTCCA
TCCCTGACGGTCTACCGGAGACTGACGTGGACGTCACACAGGATATCCCTTCCCTTTGCG
AGTCCACTCCGAAGAATGGTCTCGCACCGTTCAAGGAGCTTCTTCGACGGATCAACGTCC
AAGATGAAGTCCCTCCAGTGAGCTGTATTGTGTCCGACGGTTGTATGAGCTTTACTCTTG
ATGCTGCGGAGGAGCTCGGTGTCCCCGAGGTTCTATTTTGGACCACAAGTGCTTGTGGCT
TATTGGCTTATTTACACTACCATCGCTTCGTCGAGAAAGGCTTATCTCCACTGAAAGATG
AGAGTTACTTGACAAAGGAGCATTTAGACACAATTATAGATTGGATTCCATCCATGAAGA
ACCTAAGACTAAAAGACATCCCTAGCTTCATCCGTACGACTAACCCTAACGACATAATGC
TCA
ACTTCT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2AI19TF 795 0 0
GGATGCCCAGTTGGCCAGTTCAATCACATATACAATATCTATTTTCATTTTCCTTTCTGT
CGGCATAAGAAAGAAAGAAAATGGGATCTCATGCCGTTTCTCCCGCCCGGAAACAACACG
TAGTTTGCGTGCCTTACCCAGCTCAAGGCCATATCAATCCGATGATGAAAGTGGCTAAAC
TCCTCCACGCCAAAGGCTTCTATGTTACCTTTGTCAACACCATCTACAACCACAACCGTC
TCCTCCGGTCCCGTGGGTCCAACGCCTTAGATGGGCTTCCTTCCTTCCAGTTCGAGTCCA
TCCCTGACGGTCTACCGGAGACTGACGTGGACGTCACACAGGATATCCCTTCCCTTTGCG
AGTCCACTCCGAAGAATAGTCTCGCACCGTTCAAGGAGCTTCTTCGACGGATCAACGTCC
AAGATGAAGTCCCTCCAGTGAGCTGTATTGTGTCCGACGGTTGTATGAGCTTTACTCTTG
ATGCTGCGGAGGAGCTCGGTGTCCCCGAGGTTCTATTTTGGACCACAAGTGCTTGTGGCT
TATTGGCTTATTTACACTACCATCGCTTCGTCGAGAAAGGCTTATCTCCACTGAAAGATG
AGAGTTACTTGACAAAGGAGCATTTAGACACAATTATAGATTGGATTCCATCCATGAAGA
ACCTAAGACTAAAAGACATCCCTAGCTTCATCCGTACGACTAACCCTAACGACATAATGC
TCAACTTCCTCATCCGTGAGACCGACCGAGCCAAACGTGCTTCTGCTATCATTCTCAACA
CGTTCGACGATCTCG

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2GR05TF 821 0 0
GGATGCCCAGTTGGCCAGTTCAATCACATATACAATATCTATTTTCATTTTCCTTTCTGT
CGGCATAAGAAAGAAAGAAAATGGGATCTCATGCCGTTTCTCCCGCCCGGAAACAACACG
TAGTTTGCGTGCCTTACCCAGCTCAAGGCCATATCAATCCGATGATGAAAGTGGCTAAAC
TCCTCCACGCCAAAGGCTTCTATGTTACCTTTGTCAACACCATCTACAACCACAACCGTC
TCCTCCGGTCCCGTGGGTCCAACGCCTTAGATGGGCTTCCTTCCTTCCAGTTCGAGTCCA
TCCCTGACGGTCTACCGGAGACTGACGTGGACGTCACACAGGATATCCCTTCCCTTTGCG
AGTCCACTCCGAAGAATAGTCTCGCACCGTTCAAGGAGCTTCTTCGACGGATCAACGTCC
AAGATGAAGTCCCTCCAGTGAGCTGTATTGTGTCCGACGGTTGTATGAGCTTTACTCTTG
ATGCTGCGGAGGAGCTCGGTGTCCCCGAGGTTCTATTTTGGACCACAAGTGCTTGTGGCT
TATTGGCTTATTTACACTACCATCGCTTCTTCGAGAAAGGCTTATCTCCACTGAAAGATG
AGAGTTACTTGACAAAGGAGCATTTAGACACAATTATAGATTGGATTCCATCCATGAAGA
ACCTAAGACTAAAAGACATCCCTAGCTTCATCCGTACGACTAACCCTAACGACATAATGC
TCA*CTTCCTCATCCGTGAGACCGACCGAGCCAAACGTGCCTCTGCTATCATTCTCA*CA
CGTTCGACGATCTCGAGCATGACGTCATCCA
TCATGCATCT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2GK50TF 594 0 0
G
ATCTATTGTACCTCCGGTTTACTCTATTGGACCGCTCCATCTACAAGTGAAACAACAAAT
TAGTGAGGACAGTGAACTAGGACGAATAGGATCAAACCTGTGGAAAGAAGAGACAGCATG
TATGGATTGGCTCAATACCAAAGCTCCAAACAGCGTTGTTTACGTTAACTTTGGGAGCAT
AACTGTGATGACGGCGAAGCAGCTTGTGGAGTTTGCTTGGGGCTTGGCGGCCACGGGAAA
AGAGTTTTTGTGGGTGATACGGCCAGATTTAGTGGCCGGTGATGTGGCAATGGTTCCACC
TGAGTTTCTAACGGAGACGGCAGACCGGAGGATGCTGGCGAGTTGGTGTCCTCAGGAGGA
AGTCCTTTCCCCTCCGGCGGTCGGAGGGTTCTTAACACATTGTGGATGGAACTCGACGCT
TGAAAGTATTTGCGGAGGAGTTCCAATGGTGTGTTGGCCATTTTTCGCAGAGCAGCAAAC
AAATTGTAAGTTTTGCTGTGACGAGTGGGAGATTGGTGTTGAGATCGGTGGAGATGTGAA
GAGGGAGGAGGTTGAGGCGGTGGTTAGGGAGTTGATGGATGGAGAGAAGGGTA

QA 2 594 2 594
DS 

RD RR2AI19JQ 812 0 0
CCGTGAGACCGACCGAGCCAAACGTGCTTCTGCTATCATTCTCAACACGTTCGACGATCT
CGAGCATGACGTCATCCAATCCATGCAATCTATCGTACCTCCGGTTTACTCTATTGGACC
GCTCCATCTACAAGTGAAACAACAGATCAGTGAGGATAGTGAACTAGGACGAGTGGGATC
AAACCTGTGGAAAGAAGAGACAGCATGTATAGATTGGCTCAATACCAAAGCTCCAAACAG
CGTTGTTTACGTTAACTTTGGGAGCATAACTGTGATGACGGCGAAGCAGCTTGTGGAGTT
TGCTTGGGGTTTGGCGGCCACGGGAAAAGAGTTTTTGTTGGTGATACGGCCAGATTTAGT
GGCCGGTGATGTGGCAATGGTACCCCCTGAGTTTCTAACTGAGACAGCGGACCGGAGGAT
GCTGGCGAGTTGGTGTCCTCAGGAGGAAGTCCTCTCTCATCCGGCGGTCGGAGGGTTCTT
AACACACAATGGATGGAACTCAACGCTTGAAAGTATTTGCGGAGGAGTTCCAATGGTGTG
TTGGCCATTTTTCGCAGAGCAGCAAACAAATTGTAAGTTTTGTTGTGACGAGTGGGAGAT
TGGTGTTGAGATCGGTGGAGATGTGAAGAGGGAGGAGGTTGAGGCGGTGGTTAGGGAGTT
GATGGATGGAGAGAAGGGTAAGAAAATGAGAGAGAAGGCGGAGGAGTGGCGGAGCTTGGC
TGAGAAAGCGACTGAGTGTAAGCGTGGTTCATCAGTTGTAAATTTTGACAAGGTTGTTAA
GGTTCTTTTAGGAGAGTAAAGATTCTATGAT
C

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2EO87JQ 767 0 0
GGTTTACTCTATTGGACCGCTCCATCTACAAGTGAAACAACAAATTAGTGAGGACAGTGA
ACTAGGACGAATAGGATCAAACCTGTGGAAAGAAGAGACAGCATGTATGGATTGGCTCAA
TACCAAAGCTCCAAACAGCGTTGTTTACGTTAACTTTGGGAGCATAACTGTGATGACGGC
GAAGCAGCTTGTGGAGTTTGCTTGGGGCTTGGCGGCCACGGGAAAAGAGTTTTTGTGGGT
GATACGGCCAGATTTAGTGGCCGGTGATGTGGCAATGGTTCCACCTGAGTTTCTAACGGA
GACGGCAGACCGGAGGATGCTGGCGAGTTGGTGTCCTCAGGAGGAAGTCCTTTCCCATCC
GGCGGTCGGAGGGTTCTTAACACATTGTGGATGGAACTCGACGCTTGAAAGTATTTGCGG
AGGAGTTCCAATGGTGTGTTGGCCATTTTTCGCAGAGCAGCAAACAAATTGTAAGTTTTG
TTGTGACGAGTGTGAGATTGGTGTTGAGATCGGTGGAGATGTGAAGAGGGAGGAGGTTGA
GGCGGTGGTTAGGGAGTTGATGGATGGAGAGAAGGGTAAAAAAATGAGAGAGAAGGCGGA
GGAGTGGCGGAGCTTGGCTGAGAAAGCGACTGAGTGTAAGCGTGGTTCATCAGTTGTAAA
TTTTGACAAGGTTGTTAAGGTTCTTTTAGGAGAGTAAAGATTCTCTGATTAAACTATCGT
TTTCAGTTTTTTTTT*CTTCCTTATCAAATCCTCTGTGAACCCTG
CG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2GR05JQ 452 0 0
CGGCGGTCGGAGGGTTCTTAACACACAATGGATGGAACTCAACGCTTGAAAGTATTTGCG
GAGGAGTTCCAATGGTGTGTTGGCCATTTTTCGCAGAGCAGCAAACAAATTGTAAGTTTT
GTTGTGACGAGTGGGAGATTGGTGTTGAGATCGGTGGAGATGTGAAGAGGGAGGAGGTTG
AGGCGGTGGTTAGGGAGTTGATGGATGGAGAGAAGGGTAAGAAAATGAGAGAGAAGGCGG
AGGAGTGGCGGAGCTTGGCTGAGAAAGCGACTGAGTGTAAGCGCG*TTCATCAGTTGTAA
ATTTTGACAAGGTGGTTAAGGTTCTTTTAGGAGAGTAAAGATTCTATGATTAAACTATCG
TTTTCAGTTTTTTTTTTCTTCCTTATCAAATCCTCTGTGAACCCTGTGATGATATCCTCC
TAAATTATCAATTCGAAATGTTATATGGACAC

QA 1 452 1 452
DS 



AS 2 8

CO CL752Contig1 677 3 26 U
AACTCTCAAAAATGATTTATGTTGAACTTTTGAGATGTTCTTCTTTGTTTACAAGTTACA
TTGATTGCCTTAAGCAATAGCAAAGGAGAGGGCACGCACATACGTTCATACATACACACA
TTTTACACATGGAATAACAATAGAAGCAACTTAGGACACTGGACCAGAAACCAGAGGACT
TGATGTTTGTTTTAACTTAGTTTCTGGACTTGAAGGGGATTGCTCTGATGACAATCACAT
GGTAAAGAGCAGCAAGTGCAGCACCAATGAAAGGTCCAACCCAAAACACCCAGTGGTCGT
CCCAGGAATGGTCTTTGTTGTAAATGATTGCAGCTCCGAGACTTCTAGCTGGGTTGATGC
CTGTGCCAGTGATTGGGATGGTTGCTAAGTGAACCAAGAAAACCGCAAACCCGATTGGGA
GTGGTGCAAGAATAGGGACATGAGAGTCACGGGCGTTTCTCTTGGCGTCAGTGGCTGAAA
AAACTGTGTAAACGAGGACGAATGTACCGATGATTTCAGCACCAAGACCACTACCTTTGG
TGTATCCATGAGCCACAGTGTTGGCTCCTCCTCCTAGAGCCTGGTATTGATTAGGCTGGA
AACCTTTAACCACACCAGCTCCGCATATGGCTCCCAAGCACTGCATCACTATGTAGTACA
AAGCTCTGGTGAGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE36JQ U 5
AF RR2DW01JQ U 1
AF RR2EE40JQ U 14
BS 1 33 RR2DW01JQ
BS 34 34 RR2GE36JQ
BS 35 79 RR2DW01JQ
BS 80 80 RR2GE36JQ
BS 81 133 RR2DW01JQ
BS 134 134 RR2GE36JQ
BS 135 142 RR2DW01JQ
BS 143 143 RR2GE36JQ
BS 144 166 RR2DW01JQ
BS 167 167 RR2GE36JQ
BS 168 199 RR2DW01JQ
BS 200 200 RR2GE36JQ
BS 201 246 RR2DW01JQ
BS 247 247 RR2GE36JQ
BS 248 254 RR2DW01JQ
BS 255 255 RR2GE36JQ
BS 256 337 RR2DW01JQ
BS 338 338 RR2GE36JQ
BS 339 339 RR2DW01JQ
BS 340 340 RR2GE36JQ
BS 341 397 RR2DW01JQ
BS 398 398 RR2GE36JQ
BS 399 443 RR2DW01JQ
BS 444 444 RR2GE36JQ
BS 445 516 RR2DW01JQ
BS 517 677 RR2EE40JQ

RD RR2GE36JQ 471 0 0
C
TCAAGAATGATTTATGTTGAACTTTTGAGATGTTCTTCTTTGTTTACAAGTTACATTGAT
TGCCTTAAGCAATAGCAAAGGAGAGGGCACGCACGTACGTTCATACATACACACATTTTA
CACATGGAATAACAATAGAAGCAACTTAGGACACTGGACCAGAAACCAGAGGACTTGATG
TTTGTTTTAACTTAGTTTCTGGACTTGAAGGGGATTGCTCTGATGACAATCACATGGTAA
AGAGCAGCAAGTGCAGCACCAATGAAAGGTCCAACCCAAAACACCCAGTGGTCGTCCCAG
GAATGGTCTTTGTTGTAAATGATTGCAGCTCCGAGACTTCTAGCTGGGTTGATGCCTGTG
CCAGTGATTGGGATGGTTGCTAAGTGAACCAAGAAAACCGCAAACCCGATTGGGAGTGGT
GCAAGAATAGGGACATGAGAGTCACGGGCGTTTCTCTTGGCGTCAGTGGC

QA 2 471 2 471
DS 

RD RR2DW01JQ 516 0 0
AACTCTCAAAAATGATTTATGTTGAACTTTTGAAATGTTCTTCTTTGTTTACAAGTTACA
TTGATTGCCTTAAGCAATAACAAAGGAGAGGGCACGCACATACGTTCATACATACACACA
TTTTACACATGGAGTAACAATAAAAGCAACTTAGGACACTGGACCAAAAACCAGAGGACT
TGATGTTTGTTTTAACTTATTTTCTGGACTTGAAGGGGATTGCTCTGATGACAATCACAT
GGTAAAAAGCAGCATGTGCAGCACCAATGAAAGGTCCAACCCAAAACACCCAGTGGTCGT
CCCAGGAATGGTCTTTGTTGTAAATGATTGCAGCTCCAAAACTTCTAGCTGGGTTGATGC
CTGTGCCAGTGATTGGGATGGTTGCTAAGTGAACCAAAAAAACCGCAAACCCGATTGGGA
GTGGTGCAAGAATAGGGACATGAAAGTCACGGGCGTTTCTCTTGGCGTCAGTGGCTGAAA
AAACTGTGTAAACGAGGACGAATGTACCGATGATTT

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2EE40JQ 664 0 0
GATTTATGTTGAACTTTTGAGATGTTCTTCTTTGTTTACAAGTTACATTGATTGCCTTAA
GCAATAGCAAAGGAGAGGGCACGCACATACGTTCATACATACACACATTTTACACATGGA
ATAACAATAGAAGCAACTTAGGACACTGGACCAGAAACCAGAGGACTTGATGTTTGTTTT
AACTTAGTTTCTGGACTTGAAGGGGATTGCTCTGATGACATTCACATGGTAAAGAGCAGC
AAGTGCAGCACCAATGAAAGGTCCAACCCAAAACACCCAGTGGTCGTCCCAGGAATGGTC
TTTGTTGTAGATGATTGCAGCTCCGAGACTTCTAGCTGGGTTGATGCCTGTGCCAGTGAT
TGGGATGGTTGCTAAGTGAACCAAGAAAACCGCAAACCCGATTGGGAGTGGTGCAAGAAT
AGGGACATGAGAGTCACGGGCGTTTCTCTTGGCGTCAGTGGCTGAGAAAACTGTGTAAAC
GAGGACGAATGTACCGATGATTTCAGCACCAAGACCACTACCTTTGGTGTATCCATGAGC
CACAGTGTTGGCTCCTCCTCCTAGAGCCTGGTATTGATTAGGCTGGAAACCTTTAACCAC
ACCAGCTCCGCATATGGCTCCCAAGCACTGCATCACTATGTAGTACAAAGCTCTGGTGAG
TGAC

QA 1 664 1 664
DS 



CO CL752Contig2 1146 5 12 U
AGGGACCACAAACAGAGAAGAAAACCAAAATCAAAACTACTGGCTTTTGTCTGAGAGAGA
TCGAACAAAAGATGGAAGGCAAGGAAGAAGATGTTAGAGTTGGAGCTAACAAGTTCCCAG
AGAGGCAACCAATCGGGACTTCAGCTCAGAGCGACAAGGACTACAACGAGCCACCACCGG
CTCCTCTGTTCGAGCCTGGTGAGCTTTCTTCATGGTCCTTCTGGCGAGCTGGTATTGCTG
AGTTTATAGCTACTTTCCTCTTCCTCTACATCACTGTTTTGACCGTCATGGGAGTTAAAA
GATCACCGAACATGTGTGCTTCCGTCGGAATCCAAGGTATTGCTTGGGCCTTCGGTGGTA
TGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACCGCCGGTATTTCCGGTGGACACCTCAACCCAGCGG
TCACTTTTGGTCTGTTCTTAGCCAGGAAGCTGTCACTCACCAGAGCTTTGTACTACATAG
TGATGCAGTGCTTGGGAGCCATATGCGGAGCTGGTGTGGTTAAAGGTTTCCAGCCTAATC
AATACCAGGCTCTAGGAGGAGGAGCCAACACTGTGGCTCCTGGATACACCAAAGGTAGTG
GTCTTGGTGCTGAAATCATCGGTACATTCGTCCTCGTTTACACAGTTTTCTCAGCCACTG
ACGCCAAGAGAAACGCCCGTGACTCTCATGTCCCTATTCTTGCACCACTCCCAATCGGGT
TTGCGGTTTTCTTGGTTCACTTAGCAACCATCCCAATCACTGGAACAGGCATCAACCCAG
CTAGAAGTCTCGGAGCTGCAATCATCTACAACAAAGACCATTCCTGGGACGACCACTGGG
TGTTTTGGGTTGGACCCTTCATTGGTGCTGCACTTGCTGCTCTTTACCATGTGATTGTCA
TCAGAGCAATCCCCTTCAAGTCCAGAAACTAAGTTAAAACAAAACATCAAGTCCTCTGGT
TTCTGGTCCAGTGTCTTGAGTTGCTTCTATTGTTATTCCATATGTGTAAAATATGTGTAT
GTATGAACGTATGTGCGTGCCCTCTCCTTTGCTTAAGGCAATCAATGTAACTTGTAAACA
AAGAAGAACATCTCAAAAGTTCAACATAAATCATTCTTGAAAGTTATGAAATGTTTTATT
TCTTAG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE36TF U 1
AF RR2DW01TF U 3
AF RR2EK50TF U 20
AF RR2EK50JQ C 390
AF RR2FV33TF U 587
BS 1 322 RR2GE36TF
BS 323 323 RR2DW01TF
BS 324 352 RR2GE36TF
BS 353 407 RR2DW01TF
BS 408 408 RR2EK50TF
BS 409 579 RR2DW01TF
BS 580 693 RR2EK50TF
BS 694 1012 RR2FV33TF
BS 1013 1013 RR2EK50JQ
BS 1014 1075 RR2FV33TF
BS 1076 1076 RR2EK50JQ
BS 1077 1146 RR2FV33TF

RD RR2GE36TF 352 0 0
AGGGACCACAAACAGAGAAGAAAACCAAAATCAAAACTACTGGCTTTTGTCTGAGAGAGA
TCGAACAAAAGATGGAAGGCAAGGAAGAAGATGTTAGAGTTGGAGCTAACAAGTTCCCAG
AGAGGCAACCAATCGGGACTTCAGCTCAGAGCGACAAGGACTACAACGAGCCACCACCGG
CTCCTCTGTTCGAGCCTGGTGAGCTTTCTTCATGGTCCTTCTGGCGAGCTGGTATTGCTG
AGTTTATAGCTACTTTCCTCTTCCTCTACATCACTGTTTTGACCGTCATGGGAGTTAAAA
GATCACCGAACATGTGTGCTTCTGTCGGAATCCAAGGTATTGCTTGGGCCTT

QA 1 352 1 352
DS 

RD RR2DW01TF 581 0 0
GGACCACAAACAGAGAAGAAAACCAAAATCAAAACTACTGGCTTTTGTCTGAGAGAGATC
GAACAAAAGATGGAAGGCAAGGAAGAAGATGTTAGTGTTGGAGCTAACAAGTTCCCAGAG
AGGCAACCAATCGGGACTTCAGCTCAGAGCGACAAGGACTACAACGAGCCACCACCGGCT
CCTCTGTTCGAGCCTGGTGAGCTTTCTTCATGGTCCTTCTGGCGAGCTGGTATTGCTGAG
TTTATAGCTACTTTCCTCTTCCTCTACATCACTGTTTTGACCGTCATGGGAGTTAAAAGA
TCACCGAACATGTGTGCTTCCGTCGGAATCCAAGGTATTGCTTGGGCCTTCGGTGGTATG
ATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACCGCCGGTATTTCCGGTGGACACATCAACCCAGCGGTC
ACTTTTGGTCTGTTCTTAGCCAGGAAGCTGTCACTCACCAGAGCTTTGTACTACATAGTG
ATGCAGTGCTTGGGAGCCATATGCGGAGCTGGTGTGGTTAAAGGTTTCCAGCCTAATCAA
TACCAGGCTCTAGGAGGAGGAGCCAACACTGTGGCTC
ATGG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2EK50TF 676 0 0
GAAAACCAAAATCAAAACTACTGTTTTTTGTCTGAGAGAGATCGAACAGAAGATGGAAGG
CAAGGAAGAAGATGTTAGGGTTGGAGCTAACAAGTTCCCAGAGAGACAACCAATCGGGAC
TTCAGCTCAGAGCGACAAGGACTACAACGAGCCACCACCGGCTCCTCTGTTCGAGCCTGG
TGAGCTTTCGCCATGGTCCTTCTGGCGAGCTGGTATCGCTGAGTTTATAGCTACTTTCCT
CTTCCTCTACATCACTGTTTTGACCGTCATGGGAGTTAAAAGATCACCGAACATGTGTGC
TTCCGTCGGAATCCAAGGTATTGCTTGGGCCTTCGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTA
CTGCACCGCCGGTATTTCCGGTGGACACCTCAACCCAGCGGTCACTTTTGGTCTGTTCTT
AGCCAGGAAGCTGTCACTCACCAGAGCTTTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTGGGAGC
CATATGCGGAGCTGGTGTGGTTAAAGGTTTCCAGCCTAATCAATACCAGGCTCTAGGAGG
AGGAGCCAACACTGTGGCTCCTGGATACACCAAAGGTAGTGGTCTTGGTGCTGAAATCAT
CGGTACATTCGTCCTCGTTTACACAGTTTTCTCAGCCACTGACGCCAAGAGAAACGCCCG
TGACTCTCATGTCC
TA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2EK50JQ 739 0 0
GGTATTTCCGGTGGACACCTCAACCCAGCGGTCACTTTTGGTCTGTTCTTAGCCAGGAAG
CTGTCACTCACCAGAGCTTTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTGGGAGCCATATGCGGA
GCTGGTGTGGTTAAAGGTTTCCAGCCTAATCAATACCAGGCTCTAGGAGGAGGAGCCAAC
ACTGTGGCTCCTGGATACACCAAAGGTAGTGGTCTTGGTGCTGAAATCATCGGTACATTC
GTCCTCGTTTACACAGTTTTCTCAGCCACTGACGCCAAGAGAAACGCCCGTGACTCTCAT
GTCCCTATTCTTGCACCACTCCCAATCGGGTTTGCGGTTTTCTTGGTTCACTTAGCAACC
ATCCCAATCACTGGAACAGGCATCAACCCAGCTAGAAGTTTCGGAGCTGCAATCATCTAC
AACAAAGACCATTCCTGGGACGACCACTGGGTGTTTTGGGTTGGACCCTTCATTGGTGCT
GCACTTGCTGCTCTTTACCATGTGATTGTCATCAGAGCAATCCCCTTCAAGTCCAGAAAC
TAAGTTAAAACAAAACATCAAGTCCTCTGGTTTCTGGTCCAGTGTCTTGAGTTGCTTTTA
TTGTTATTCCATATGTGTAAAATATGTGTATGTATGAACGTATGTGCGTGCCCTCTCCTT
TGCTTAAGGCAATCAATGTAACTTGTAAGCAAAGAAGAACATCTCAAAAGTTCAACATAA
ATCATTCTTGA
AAGTTATG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2FV33TF 560 0 0
G
ACCAAAGGTAGTGGTCTTGGTGCTGAAATCATCGGTACATTCGTCCTCGTTTACACAGTT
TTCTCAGCCACTGACGCCAT*AGAAACGCCCGTGACTCTCATGTCCCTATTCTTGCACCA
CTCCCAATCGGGTTTGCGGTTTTCTTGGTTCACTTAGCAACCATCCCAATCACTGGAACA
GGCATCAACCCAGCTAGAAGTCTCGGAGCTGCAATCATCTACAACAAAGACCATTCCTGG
GACGACCACTGGGTGTTTTGGGTTGGACCCTTCATTGGTGCTGCACTTGCTGCTCTTTAC
CATGTGATTGTCATCAGAGCAATCCCCTTCAAGTCCAGAAACTAAGTTAAAACAAAACAT
CAAGTCCTCTGGTTTCTGGTCCAGTGTCTTGAGTTGCTTCTATTGTTATTCCATATGTGT
AAAATGTGTGTATGTATGAACGTATGTGCGTGCCCTCTCCTTTGCTTAAGGCAATCAATG
TAACTTGTGAACAAAGAAGAACATCTCAAAAGTTCAACATAAATCATTCTTGAAAGTTAT
GAAATGTTTTATTTCTTAG

QA 2 560 2 560
DS 



AS 3 9

CO CL753Contig1 621 2 2 U
GGGAATCATCATGTTCAAGAACTTACCTAGGCATCAGTTCGGTAACCTTCAGAGCAAGAT
GTTTCCAGCTTATTTCACTCTTGTTGGTTCTTGCTGCGCTATTTCACTCTCTGCCTTTGG
GTATCTGCATCCATGGAAGTCTTCTTCTGCTGTGGAGAAGTATCAGCTAGGCTTCCTTGT
CTCCGCTTTTGCTTTCAACCTCACTAATTTGCTCGTCTTCACTCCCATGACCATCGATAT
GATGAAGCAAAGGCACAAGGTAGAGAGAGAAAACAACATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTC
CAAGAACAGGGAGAAGGCAAAGACTATCCCTCAGCTAGCTGCCATGAACAAGAAGTTTGG
TATGATTCACGGCTTATCGTCGCTTTCTAACATCTTTTCTTTTGGAAGCCTTGCCATGCA
TTCTTGGTACCTTGCTGGGAAGATGGATCTCTAAGTGTCTCACAAAGGTCCGAGCTTTTA
TGCCTCCCTTTGTCAATATAATCTCTTGCTTTGTAAAATCTCAAAACAGTTTGTTATTGT
GATATCGTTTTTTTCTTTCTTTTAAACAGCTAGATGTTCCTTTTTTTCTCTGAAATAATT
GATGTGTGAATGCTATTACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BM19JQ C 1
AF RR2BM19TF U 30
BS 1 29 RR2BM19JQ
BS 30 621 RR2BM19TF

RD RR2BM19JQ 621 0 0
GGGAATCATCATGTTCAAGAACTTACCTAGGCATCAGTTCGGTAACCTTCAGAGCAAGAT
GTTTCCAGCTTATTTCACTCTTGTTGGTTCTTGCTGCGCTATTTCACTCTCTGCCTTTGG
GTATCTGCATCCATGGAAGTCTTCTTCTGCTGTGGAGAAGTATCAGCTAGGCTTCCTTGT
CTCCGCTTTTGCTTTCAACCTCACTAATTTGCTCGTCTTCACTCCCATGACCATCGATAT
GATGAAGCAAAGGCACAAGGTAGAGAGAGAAAACAACATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTC
CAAGAACAGGGAGAAGGCAAAGACTATCCCTCAGCTAGCTGCCATGAACAAGAAGTTTGG
TATGATTCACGGCTTATCGTCGCTTTCTAACATCTTTTCTTTTGGAAGCCTTGCCATGCA
TTCTTGGTACCTTGCTGGGAAGATGGATCTCTAAGTGTCTCACAAAGGTCCGAGCTTTTA
TGCCTCCCTTTGTCAATATAATCTCTTGCTTTGTAAAATCTCAAAACAGTTTGTTATTGT
GATATCGTTTTTTTCTTTCTTTTAAACAGCTAGATGTTCCTTTTTTTCTCTGAAATAATT
GATGTGTGAATGCTATTACAC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2BM19TF 592 0 0
GGCATCAGTTCGGTAACCTTCAGAGCAAGATGTTTCCAGCTTATTTCACTCTTGTTGGTT
CTTGCTGCGCTATTTCACTCTCTGCCTTTGGGTATCTGCATCCATGGAAGTCTTCTTCTG
CTGTGGAGAAGTATCAGCTAGGCTTCCTTGTCTCCGCTTTTGCTTTCAACCTCACTAATT
TGCTCGTCTTCACTCCCATGACCATCGATATGATGAAGCAAAGGCACAAGGTAGAGAGAG
AAAACAACATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTCCAAGAACAGGGAGAAGGCAAAGACTATCC
CTCAGCTAGCTGCCATGAACAAGAAGTTTGGTATGATTCACGGCTTATCGTCGCTTTCTA
ACATCTTTTCTTTTGGAAGCCTTGCCATGCATTCTTGGTACCTTGCTGGGAAGATGGATC
TCTAAGTGTCTCACAAAGGTCCGAGCTTTTATGCCTCCCTTTGTCAATATAATCTCTTGC
TTTGTAAAATCTCAAAACAGTTTGTTATTGTGATATCGTTTTTTTCTTTCTTTTAAACAG
CTAGATGTTCCTTTTTTTCTCTGAAATAATTGATGTGTGAATGCTATTACAC

QA 1 592 1 592
DS 



CO CL753Contig2 782 3 2 U
AAGTAAAACTTAGGCATTACTCTTCTGTAATAGTATTCACACATCAATTATTTCAGAGAA
AAAGAAAACATCTAGTGTTTAAAAGAAAAAAAATGGTATCATTATAACAAACTGTTTCAC
CTTCTGGTATTATAATCTTACAAAGCAAGAGATTTTATTCATGAAGGGAGGCATAGAAGG
TCAGACCTTTGTGACAAGAAACTTAGAGATCCATCTTCCCAGCAAGGTACCAAGAATGCA
TGGCAAGGCTTCCAAAAGAGAAGATGTTAGCCAGCGATGATAACCCGTGAATCATACCAA
ACTTCTTGTTCATGGCAGCTAGCTGAGGGATAGTCTTTGCCTTCTCCCTGTTCTTGGACC
AACCAACTTCATCTCCAATGTTGTTCTCTCTCTCTACTTTGTGCCTTTGCTTCATCATAT
CGATGGTCATGGGAGTGAAGACGAGCAAATTGGTGAGATTGAAAGCAAAAGCCGAGACAA
GGAACCCTAGCTGATACTTCTCAACAGCAGAAGAAGACTTCCATGGATGCAGATACCCAA
AGGCAGAGAGTGAAATAGCACAGCAAGAACCAACAAGAGTGAAATAAGCTGGAAACATCT
TGCTCTGAAGGTTACCGAACTGATGCCTCG*TAAGTTCTTGAACATGATGATTCCGCCGA
TGAAGGTAGCCCAGAGAGCAGCTCCCCAAGCTGTAGCGAAGCTGAGTAGATGAGCTAGCT
TCACCAATATCAAAACCATCGCTGAATTCTCGCCCTTCGACAGTGATCCGAATGTCTCCG
GT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2G404JQ U 1
AF RR2H993JQ U 1
AF RR2FG44JQ U 79
BS 1 653 RR2G404JQ
BS 654 782 RR2FG44JQ

RD RR2G404JQ 653 0 0
AAGTAAAACTTAGGCATTACTCTTCTGTAATAGTATTCACACATCAATTATTTCAGAGAA
AAAGAAAACATCTAGTGTTTAAAAGAAAAAAAATGGTATCATTATAACAAACTGTTTCAC
CTTCTGGTATTATAATCTTACAAAGCAAGAGATTTTATTCATGAAGGGAGGCATAGAAGG
TCAGACCTTTGTGACAAGAAACTTAGAGATCCATCTTCCCAGCAAGGTACCAAGAATGCA
TGGCAAGGCTTCCAAAAGAGAAGATGTTAGCCAGCGATGATAACCCGTGAATCATACCAA
ACTTCTTGTTCATGGCAGCTAGCTGAGGGATAGTCTTTGCCTTCTCCCTGTTCTTGGACC
AACCAACTTCATCTCCAATGTTGTTCTCTCTCTCTACTTTGTGCCTTTGCTTCATCATAT
CGATGGTCATGGGAGTGAAGACGAGCAAATTGGTGAGATTGAAAGCAAAAGCCGAGACAA
GGAACCCTAGCTGATACTTCTCAACAGCAGAAGAAGACTTCCATGGATGCAGATACCCAA
AGGCAGAGAGTGAAATAGCACAGCAAGAACCAACAAGAGTGAAATAAGCTGGAAACATCT
TGCTCTGAAGGTTACCGAACTGATGCCTCG*TAAGTTCTTGAACATGATGATT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2H993JQ 636 0 0
AAGTAAAACTTAGGCATTACTCTTCTGTAATAGTATTCACACATCAATTATTTCAGAGAA
AAAGAAAACATCTAGTGTTTAAAAGAAAAAAAATGGTATCATTATAACAAACTGTTTCAC
CTTCTGGTATTATAATCTTACAAAGCAAGAGATTTTATTCATGAAGGGAGGCATAGAAGG
TCAGACCTTTGTGACAAGAAACTTAGAGATCCATCTTCCCAGCAAGGTACCAAGAATGCA
TGGCAAGGCTTCCAAAAGAGAAGATGTTAGCCAGCGATGATAACCCGTGAATCATACCAA
ACTTCTTGTTCATGGCAGCTAGCTGAGGGATAGTCTTTGCCTTCTCCCTGTTCTTGGACC
AACCAACTTCATCTCCAATGTTGTTCTCTCTCTCTACTTTGTGCCTTTGCTTCATCATAT
CGATGGTCATGGGAGTGAAGACGAGCAAATTGGTGAGATTGAAAGCAAAAGCCGAGACAA
GGAACCCTAGCTGATACTTCTCAACAGCAGAAGAAGACTTCCATGGATGCAGATACCCAA
AGGCAGAGAGTGAAATAGCACAGCAAGAACCAACAAGAGTGAAATAAGCTGGAAACATCT
TGCTCTGAAGGTTACCGAACTGATGCCTCG*TAAGT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2FG44JQ 704 0 0
AAAAGAA
AAAAAAAATGGTATCATTATAACAAACTGTTTCACCTTCTGGTATTATAATCTTACAAAG
CAAGAGATTTTATTCATGAAGGGAGGCATAGAAGGTCAGACCTTTGTGACAAGAAACTTA
GAGATCCATCTTCCCAGCAAGGTACCAAGAATGCATGGCAAGGCTTCCAAAAGAGAAGAT
GTTAGCCAGCGATGATAACCCGTGAATCATACCAAACTTCTTGTTCATGGCAGCTAGCTG
AGGGATAGTCTTTGCCTTCTCCCTGTTCTTGGACCAACCAACTTCATCTCCAATGTTGTT
CTCTCTCTCTACTTTGTGCCTTTGCTTCATCATATCGATGGTCATGGGAGTGAAGACGAG
CAAATTGGTGAGATTGAAAGCAAAAGCCGAGACAAGGAACCCTAGCTGATACTTCTCAAC
AGCAGAAGAAGACTTCCATGGATGCAGTTACCCAAAGGCAGAGAGTGAAATAGCACAGCA
AGAACCAACAAGAGTGAAATAAGCTGGAAACATCTTGCTCTGAAGGTTACCGAACTGATG
CCTCGGTAAGTTCTTGAACATGATGATTCCGCCGATGAAGGTAGCCCAGAGAGCAGCTCC
CCAAGCTGTAGCGAAGCTGAGTAGATGAGCTAGCTTCACCAATATCAAAACCATCGCTGA
ATTCTCGCCCTTCGACAGTGATCCGAATGTCTCCGGT

QA 8 704 8 704
DS 



CO CL753Contig3 896 4 42 U
GGAAGCAGAGACTTTACTCAGAATCTACACAACAATTTTATTTTGGAGAAAGAGTGATCA
TCGGAAGCATCATCTCGGCGATGGGTTGGCTGACGAGATTCTTAACAGCGGTAGCGTTTT
TAGCCGCCGGAGTAATATTCTCACCGGAGACATTCGGATCACTGTCGAAGGGCGAGAATT
CAGCGATGGTTTTGATATTGGTGAAGCTAGCTCATCTACTCAGCTTCGCTACAGCTTGGG
GAGCTGCTCTCTGGGCTACCTTCATCGGCGGAATCATCATGTTCAAGAACTTACCTAGGC
ATCAGTTCGGTAACCTTCAGAGCAAGATGTTTCCAGCTTATTTCACTCTTGTTGGTTCTT
GCTGCGCTATTTCACTCTCTGCGTTTGGGTATCTGCATCCATGGAAGTCATCTTCTTCTG
TGGAGAAGTATCAGCTAGGGTTCCTTGTCTCGGCTTTTGCTTTCAACCTCACTAATTTGC
TCGTCTTCACCCCCATGACCACCGATATGATGAAGCAAAGGCATAAAGTAGAGAGAGAGA
ACAATATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTCCAAGAACCGGGAAAAGGCAAAGACTATCCCTC
AGCTAGCTGCCATGAACAAGAAGTTTGGTATGATTCACGGCTTGTCATCTCTCGCTAACA
TCTTTTCTTTTGGAAGCCTTGCCATGCATTCTTGGTAC*TTGCTGGGAAGATGGATCTCT
AAGTGTCTTGTCACAAAGGTCTCAGCTTTTATGCCTCCCTTCATGAATAAAATCTCTTGC
TTTGTAAGATTATTATACCACAAGGCGAAACAGTTTGTTATAATGATATCGTTTTTTTTT
CTTTTAAACACTAGATGGTTTCTTTTTCTCTGAAATAGTTTATGTGTGAATGCTAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 0 0 0 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G404TF U 1
AF RR2AX18TFB U 27
AF RR2H993TF U 1
AF RR2AX18JQ C 40
BS 1 294 RR2G404TF
BS 295 296 RR2AX18TFB
BS 297 364 RR2G404TF
BS 365 365 RR2AX18TFB
BS 366 382 RR2G404TF
BS 383 383 RR2AX18TFB
BS 384 409 RR2G404TF
BS 410 410 RR2AX18TFB
BS 411 416 RR2G404TF
BS 417 417 RR2AX18TFB
BS 418 421 RR2G404TF
BS 422 422 RR2AX18TFB
BS 423 466 RR2G404TF
BS 467 467 RR2AX18TFB
BS 468 472 RR2G404TF
BS 473 473 RR2AX18TFB
BS 474 490 RR2G404TF
BS 491 491 RR2AX18TFB
BS 492 501 RR2G404TF
BS 502 502 RR2AX18TFB
BS 503 523 RR2G404TF
BS 524 524 RR2AX18TFB
BS 525 544 RR2G404TF
BS 545 545 RR2AX18TFB
BS 546 575 RR2G404TF
BS 576 576 RR2AX18TFB
BS 577 580 RR2G404TF
BS 581 581 RR2AX18TFB
BS 582 640 RR2G404TF
BS 641 641 RR2AX18TFB
BS 642 643 RR2G404TF
BS 644 644 RR2AX18TFB
BS 645 649 RR2G404TF
BS 650 650 RR2AX18TFB
BS 651 652 RR2G404TF
BS 653 653 RR2AX18TFB
BS 654 664 RR2G404TF
BS 665 665 RR2AX18TFB
BS 666 724 RR2G404TF
BS 725 725 RR2AX18TFB
BS 726 734 RR2G404TF
BS 735 896 RR2AX18JQ

RD RR2G404TF 734 0 0
GGAAGCAGAGACTTTACTCAGAATCTACACAACAATTTTATTTTGGAGAAAGAGTGATCA
TCGGAAGCATCATCTCGGCGATGGGTTGGCTGACGAGATTCTTAACAGCGGTAGCGTTTT
TAGCCGCCGGAGTAATATTCTCACCGGAGACATTCGGATCACTGTCGAAGGGCGAGAATT
CAGCGATGGTTTTGATATTGGTGAAGCTAGCTCATCTACTCAGCTTCGCTACAGCTTGGG
GAGCTGCTCTCTGGGCTACCTTCATCGGCGGAATCATCATGTTCAAGAACTTACG*AGGC
ATCAGTTCGGTAACCTTCAGAGCAAGATGTTTCCAGCTTATTTCACTCTTGTTGGTTCTT
GCTGTGCTATTTCACTCTCTGCCTTTGGGTATCTGCATCCATGGAAGTCTTCTTCTGCTG
TTGAGAAGTATCAGCTAGGGTTCCTTGTCTCGGCTTTTGCTTTCAATCTCACCAATTTGC
TCGTCTTCACTCCCATGACCATCGATATGATGAAGCAAAGGCACAAAGTAGAGAGAGAGA
ACAACATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTCCAAGAACAGGGAGAAGGCAAAGACTATCCCTC
AGCTAGCTGCCATGAACAAGAAGTTTGGTATGATTCACGGGTTATCATCGCTGGCTAACA
TCTTCTCTTTTGGAAGCCTTGCCATGCATTCTTGGTAC*TTGCTGGGAAGATGGATCTCT
AAGTTTCTTGTCAC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2AX18TFB 702 0 0
GG
ACAACAATTTTATTTTGGAGAAAGAGTGATCATCGGAAGCATCATCTCGGCGATGGGTTG
GGTGACGAGATTCTTAACAGCGGTAGCGTTTTTAGCCGCCGGAGTAATATTCTCACCGGA
GACATTCGGATCACTGTCGAAGGGCGAGAATTCAGCGATGGTTTTGATATTGGTGAAGCT
AGCTCATCTACTCAGCTTCGCTACAGCTTGGGGAGCTGCTCTCTGGGCTACCTTCATCGG
CGGAATCATCATGTTCAAGAACTTACCTAGGCATCAGTTCGGTAACCTTCAGAGCAAGAT
GTTTCCAGCTTATTTCACTCTTGTTGGTTCTTGCTGCGCTATTTCACTCTCTGCGTTTGG
GTATCTGCATCCATGGAAGTCATCTTCTTCTGTGGAGAAGTATCAGCTAGGGTTCCTTGT
CTCGGCTTTTGCTTTCAACCTCACTAATTTGCTCGTCTTCACCCCCATGACCACCGATAT
GATGAAGCAAAGGCATAAAGTAGAGAGAGAGAACAATATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTC
CAAGAACCGGGAAAAGGCAAAGACTATCCCTCAGCTAGCTGCCATGAACAAGAAGTTTGG
TATGATTCACGGCTTGTCATCTCTCGCTAACATCTTTTCTTTTGGAAGCCTTGCCATGCA
TTCTTGGTAC*TTGCTGGGAAGATGGATCTCTAAGTGTCT

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR2H993TF 728 0 0
GGAAGCAGAGACTTTACTCAGAATCTACACAACAATTTTATTTTGGAGAAAGAGTGATCA
TCGGAAGCATCATCTCGGCGATGGGTTGGCTGACGAGATTCTTAACAGCGGTAGCGTTTT
TAGCCGCCGGAGTAATATTCTCACCGGAGACATTCGGATCACTGTCGAAGGGCGAGAATT
CAGCGATGGTTTTGATATTGGTGAAGCTAGCTCATCTACTCAGCTTCGCTACAGCTTGGG
GAGCTGCTCTCTGGGCTACCTTCATCGGCGGAATCATCATGTTCAAGAACTTACG*AGGC
ATCAGTTCGGTAACCTTCAGAGCAAGATGTTTCCAGCTTATTTCACTCTTGTTGGTTCTT
GCTGTGCTATTTCACTCTCTGCCTTTGGGTATCTGCATCCATGGAAGTCTTCTTCTGCTG
TTGAGAAGTATCAGCTAGGGTTCCTTGTCTCGGCTTTTGCTTTCAATCTCACCAATTTGC
TCGTCTTCACTCCCATGACCATCGATATGATGAAGCAAAGGCACAAAGTAGAGAGAGAGA
ACAACATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTCCAAGAACAGGGAGAAGGCAAAGACTATCCCTC
AGCTAGCTGCCATGAACAAGAAGTTTGGTATGATTCACGGGTTATCATCGCTGGCTAACA
TCTTCTCTTTTGGAAGCCTTGCCATGCATTCTTGGTAC*TTGCTGGGAAGATGGATCTCT
AAGTTTCT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2AX18JQ 857 0 0
TA
TTTGGAGAAAGAGTGATCATCGGAAGCATCATCTCGGCGATGGGTTGGCTGACGAGATTC
TTAACAGCGGTAGCGTTTTTAGCCGCCGGAGTAATATTCTCACCGGAGACATTCGGATCA
CTGTCGAAGGGCGAGAATTCAGCGATGGTTTTGATATTGGTGAAGCTAGCTCATCTACTC
AGCTTCGCTACAGCTTGGGGAGCTGCTCTCTGGGCTACCTTCATCGGCGGAATCATCATG
TTCAAGAACTTACCTAGGCATCAGTTCGGTAACCTTCAGAGCAAGATGTTTCCAGCTTAT
TTCACTCTTGTTGGTTCTTGCTGCGCTATTTCACTCTCTGCGTTTGGGTATCTGCATCCA
TGGAAGTCATCTTCTTCTGTGGAGAAGTATCAGCTAGGGTTCCTTGTCTCGGCTTTTGCT
TTCAACCTCACTAATTTGCTCGTCTTCACCCCCATGACCACCGATATGATGAAGCAAAGG
CATAAAGTAGAGAGAGAGAACAATATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTCCAAGAACCGGGAA
AAGGCAAAGACTATCCCTCAGCTAGCTGCCATGAACAAGAAGTTTGGTATGATTCACGGC
TTGTCATCTCTCGCTAACATCTTTTCTTTTGGAAGCCTTGCCATGCATTCTTGGTACCTT
GCTGGGAAGATGGATCTCTAAGTGTCT***CACAAAGGTCTCAGCTTTTATGCCTCCCTT
CATGAATAAAATCTCTTGCTTTGTAAGATTATTATACCACAAGGCGAAACAGTTTGTTAT
AATGATATCGTTTTTTTTTCTTTTAAACACTAGATGGTTTCTTTTTCTCTGAAATAGTTT
ATGTGTGAATGCTAT

QA 3 857 3 857
DS 



AS 2 7

CO CL754Contig1 1139 5 13 U
CGACAAAACGAGGGGTCGTTTTATTATTACAATATTTTACATATTTAGAATATAGCGACG
GGTATAAGCTAATAATAATA***AGTACACTGCAGTACATATTTAACAAATAACAAATGC
ACAATCACAAATACTAGCGCTCCAAATATGTCATAGTATTATTCGCGGTTCATATCATCG
CTGCTTAGAGAGCTGTTGCAGCCATATAGCTTTTGCGATACGCAGCTGCGTATGCTGGAT
AGAACATTTGGCTAACCCCTTCCGCCTTAAGATGAGGAATCAACATTTTCATAGACAAAC
CAAAAAGTCTGAGGCTATGCCAAATGCGAAGAGGAGATGGGAATGGAGAGAGCAATTGAC
CAATGGAGGATAGAGTAATACCACAAAGATGAAAGATGAGAGAGAGTGGCCGAGGGTTCA
TGCCTCCGAGCAGAGCCATCATGCCTGACGTGCGAAAGCCGCCACTAGAGAGGTAATCAA
AACAGCCTTGTCGCATCGCTTCTTTTGCTTCGTCCGTCGATGCAACTAGCACTTGAGAAA
ATGCATTTCCTAGTGTGTTCACCGTCGCTGACATTGGCTTTCGGATGATATAAAATGACT
TAATAACTTCTGAGATTTTGTTTGCATCACCAAGGTTTCGCAATGGCTGGAGAAGGCGGC
GTAGGATGAGAATGTCAGACAATAAAACCATCATTCCAGACGCAATTGCTGGGTGACGCA
TGTTGAATGCATCTCCCAATACAATCACTCCTTGCTTCTCGCTCAAAGTAGCTTCCATTC
TCTTTGTTGGCATTGCTTTTATTTGTGCTCCCTCATCAATTCCTTTCAAAAATATTTTGC
GGAATTCTGGAGGTATCTGAGGAGCCATAGTATTTTTCAAATAAGCAGCCATTTCACCAT
TTGAAATAGAAGGAATATTTCCGGGAAAAATCTCCATAGCACAACGAACATCGGTGCTGC
TTATTTGATACAACATGGTGAAGGAGGGTTTAGACATTATCAACTTTAACTTTTCAGGAT
CTTCAAGCTGACAATTCTTTGAGACGTAACCAACTTGGTACGACAGAATCTCCGCATTGT
TGTCGTTAACAGACCGACGAAGGTTTGAATAGCAACCGTCACATACCACAGTCAGAGGC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE59JQ U 60
AF RR2AC11JQ U 1
AF RR2ES13JQ U 1
AF RR2GE59TF C 333
AF RR2C748TF C 509
BS 1 174 RR2AC11JQ
BS 175 175 RR2GE59JQ
BS 176 354 RR2AC11JQ
BS 355 355 RR2GE59JQ
BS 356 491 RR2AC11JQ
BS 492 492 RR2ES13JQ
BS 493 700 RR2AC11JQ
BS 701 701 RR2GE59TF
BS 702 795 RR2AC11JQ
BS 796 796 RR2GE59TF
BS 797 817 RR2AC11JQ
BS 818 977 RR2GE59TF
BS 978 1139 RR2C748TF

RD RR2GE59JQ 303 0 0
GGGTATAAACTAATAATAGTA***AGCACACTGCAGTACATATTTAACAAATAACAAATG
CACAACCACAAATACTAGCGCTCCAAATATGTCATAGTATTATTCGCGGTTCATATCATC
GCTGCTTAGAGAGCTGTTGCAGCCATATAGCTTTTGCGATACGCAGCTGCGTATGCTGGA
TACAACATTTGGCTAACCCCTTCCGCCTTAAGATGAGGAACCAACATTTTCATAGACAAA
CCAAAAAGTCTGAGGCTATGCCAAATGCGAAGAGGAGATGGGAATGGAGAGAGCAATTGA
CCA

QA 1 303 1 303
DS 

RD RR2AC11JQ 817 0 0
CGACAAAACGAGGGGTCGTTTTATTATTACAATATTTTACATATTTAGAATATAGCGACG
GGTATAAGCTAATAATAATA***AGTACACTGCAGTACATATTTAACAAATAACAAATGC
ACAATCACAAATACTAGCGCTCCAAATATGTCATAGTATTATTCGCGGTTCATACCATCG
CTGCTTAGAGAGCTGTTGCAGCCATATAGCTTTTGCGATACGCAGCTGCGTATGCTGGAT
AGAACATTTGGCTAACCCCTTCCGCCTTAAGATGAGGAATCAACATTTTCATAGACAAAC
CAAAAAGTCTGAGGCTATGCCAAATGCGAAGAGGAGATGGGAATGGAGAGAGCAGTTGAC
CAATGGAGGATAGAGTAATACCACAAAGATGAAAGATGAGAGAGAGTGGCCGAGGGTTCA
TGCCTCCGAGCAGAGCCATCATGCCTGACGTGCGAAAGCCGCCACTAGAGAGGTAATCAA
AACAGCCTTGTTGCATCGCTTCTTTTGCTTCGTCCGTCGATGCAACTAGCACTTGAGAAA
ATGCATTTCCTAGTGTGTTCACCGTCGCTGACATTGGCTTTCGGATGATATAAAATGACT
TAATAACTTCTGAGATTTTGTTTGCATCACCAAGGTTTCGCAATGGCTGGAGAAGGCGGC
GTAGGATGAGAATGTCAGACAATAAAACCATCATTCCAGATGCAATTGCTGGGTGACGCA
TGTTGAATGCATCTCCCAATACAATCACTCCTTGCTTCTCGCTCAAAGTAGCTTCCATTC
TCTTTGTTGGCATTGTTTTTATTTGTGCTCCCTCATC

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2ES13JQ 818 0 0
CA
ACAAAACGAGGGGTCGTTTTATTATTACAATATTTTACATATTTAGAATATAGCGACGGG
TATAAGCTAATAATAATAATAAGTACACTGCAGTACATATTTAACAAATAACAAATGCAC
AATCACAAATACTAGCGCTCCAAATATGTCATAGTATTATTCGCGGTTCATATCATCGCT
GCTTAGAGAGCTGTTGCAGCCATATAGCTTTTGCGATACGCAGCTGCGTATGCTGGATAG
AACATTTGGCTAACCCCTTCCGCCTTAAGATGAGGAATCAACATTTTCATAGACAAACCA
AAAAGTCTGAGGCTATGCCAAATGCGAAGAGGAGATGGGAATGGAGAGAGCAGTTGACCA
ATGGAGGATAGAGTAATACCACAAAGATGAAAGATGAGAGAGAGTGGCCGAGGGTTCATG
CCTCCGAGCAGAGCCATCATGCCTGACGTGCGAAAGCCGCCACTAGAGAGGTAATCAAAA
CAGCCTTGTCGCATCGCTTCTTTTGCTTCGTCCGTCGATGCAACTAGCACTTGAGAAAAT
GCATTTCCTAGTGTGTTCACCGTCGCTGACATTGGCTTTCGGATGATATAAAATGACTTA
ATAACTTCTGAGATTTTGTTTGCATCACCAAGGTTTCGCAATGGCTGGAGAAGGCGGCGT
AGGATGAGAATGTCAGACAATAAAACCATCATTCCAGATGCAATTGCTGGGTGACGCATG
TTGAATGCATCTCCCAATACAATCACTCCTTGCTTCTCGCTCAAAGTAGCTTCCATTCTC
TTTGTTGGCATTGTTTT*ATTTGTGCTCCCTCATC
G

QA 3 817 3 817
DS 

RD RR2GE59TF 646 0 0
GGAGATGGGAATGGAGAGAGCAATTGACCAATGGAGGATAGAGTAATACCACAAAGATGA
AAGATGAGAGAAAGTGGCCGAGGGTTCATGCCTCCGAGCAGAGCCATCATGCCTGACGTG
CGAAAGCCGCCACTAGAGAGGTAATCAAAACAGCCTTGTCGCATCGCTTCTTTTGCTTCG
TCCGTCGATGCAACTAGCACTTGAGAAAATGCATTTCCTAGTGTGTTCACCGTCGCTGAC
ATTGGCTTTCGGATGATATAAAATGACTTAATAACTTCTGAGATTTTGTTTGCATCACCA
AGGTTTCGCAATGGCTGGAGAAGGCGGCGTAGGATGAGAATGTCAGACAATAAAACCATC
ATTCCAGACGCAATTGCTGGGTGACGCATGTTGAATGCATCTCCCAATACAATCACTCCT
TGCTTCTCGCTCAAAGTAGCTTCCATTCTCTTTGTTGGCATTGCTTTTATTTGCGCTCCC
TCATCAATTCCTTTCAAAAATATTTTGCGGAATTCTGGAGGTATCTGAGGAGCCATAGTA
TTTTTCAAATAAGCAGCCATTTCACCATTTGAAATAGAAGGAATATTTCCGGGAAAAATC
TCCATAGCACAACGAACATCGGTGCTGCTTATTTGATACAACATG
C

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2C748TF 631 0 0
TTCGTCCGTCGATGCAACTAGCACTTGAGAAAATGCATTTCTTAGTGTGTTCACCGTCGC
TGACATTGGCTTTCGGATGATATAAAATGACTTAATAACTTCTGAGATTTTGTTTGCATC
ACCAAGGTTTCGCAATGGCTGGAGAAGGCGGCGTAGGATGAGAATGTCAGACAATAAAAC
CATCATTCCAGACGCAATTGCTGGGTGACGCATGTTGAATGCATCTCCCAATACAATCAC
TCCTTGCTTCTCGCTCAAAGTAGCTTCCATTCTCTTTGTTGGCATTGCTTTTATTTGTGC
TCCCTCATCAATTCCTTTCAAAAATATTTTGCGGAATTCTGGAGGTATCTGAGGAGCCAT
AGTATTTTTCAAATAAGCAGCCATTTCACCATTTGAAATAGAAGGAATATTTCCGGGAAA
AATCTCCATAGCACAACGAACATCGGTGCTGCTTATTTGATACAACATGGTGAAGGAGGG
TTTAGACATTATCAACTTTAACTTTTCAGGATCTTCAAGCTGACAATTCTTTGAGACGTA
ACCAACTTGGTACGACAGAATCTCCGCATTGTTGTCGTTAACAGACCGACGAAGGTTTGA
ATAGCAACCGTCACATACCACAGTCAGAGGC

QA 1 631 1 631
DS 



CO CL754Contig2 780 2 10 U
GGACATCTCATAAATCATATCGAGGACTAATTATTAGATATGGATCGAGCTTTTACGCAC
GTTTGTTTGTGGACGCTACTCGTCTTTGTGGTGACTTGGACAGTGTTCTACGTCAACAAC
AGGAGGAAGAAGGTGACGAAGTTAGCAGATGTGGCGACAGAGGAGAGAGAAGACGGTGGT
GGTACTGATGTAATCATCGTCGGAGCTGGTGTTGGTGGTTCAGCTCTCGCCTACGCTCTT
GCAAAGGATGGGCGTAGAGTACATGTGATAGAGAGGGACATGAGGGAGCCAGTGAGAATG
ATGGGTGAGTTTATGCAACCCGGAGGACGACTCTTGCTTTCTAAGCTTGGTCTTCAAGAT
TGTTTGGAGGGAATTGATGAACAACTAGCCACAGGCTTAGCAGTTTATAAGGACGGACAA
AAATCAATCGTGTCTTTTCCGGAGGACAACGAGTTTCCTTATGAACCTACTGCTCGAACT
TTTTATAATGGCCGTTTTGTTCAGAGACTGCGCCAAAAGGCTTCTTCGCTCCCCAATGTA
CGACTTGAAGAAGGGACTGTAAAATCTCTCATAGAAGAGAAAGGAGTGATCAAAGGAGTG
ACATACAATAATAGCGCACGCGAAGAAACGACTGCATTTGCACCTCTAACTGTGGTATGC
GACGGTTGCTATTCAAACCTCCGTCGGTCTGTTAACGACAACAATGCGGAGGTTCTGTCG
TACCAAGTTGGTTACGTCTCAAAGAATTGTCAGCTTGAAGATCCTGACAAATTAAAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES13TF U 1
AF RR2AC11TF U 124
BS 1 233 RR2ES13TF
BS 234 234 RR2AC11TF
BS 235 244 RR2ES13TF
BS 245 245 RR2AC11TF
BS 246 252 RR2ES13TF
BS 253 253 RR2AC11TF
BS 254 713 RR2ES13TF
BS 714 714 RR2AC11TF
BS 715 738 RR2ES13TF
BS 739 780 RR2AC11TF

RD RR2ES13TF 738 0 0
GGACATCTCATAAATCATATCGAGGACTAATTATTAGATATGGATCGAGCTTTTACGCAC
GTTTGTTTGTGGACGCTACTCGTCTTTGTGGTGACTTGGACAGTGTTCTACGTCAACAAC
AGGAGGAAGAAGGTGACGAAGTTAGCAGATGTGGCGACAGAGGAGAGAGAAGACGGTGGT
GGTACTGATGTAATCATCGTCGGAGCTGGTGTTGGTGGTTCAGCTCTCGCCTATGCTCTT
GCAATGGATGGGTGTAGAGTACATGTGATAGAGAGGGACATGAGGGAGCCAGTGAGAATG
ATGGGTGAGTTTATGCAACCCGGAGGACGACTCTTGCTTTCTAAGCTTGGTCTTCAAGAT
TGTTTGGAGGGAATTGATGAACAACTAGCCACAGGCTTAGCAGTTTATAAGGACGGACAA
AAATCAATCGTGTCTTTTCCGGAGGACAACGAGTTTCCTTATGAACCTACTGCTCGAACT
TTTTATAATGGCCGTTTTGTTCAGAGACTGCGCCAAAAGGCTTCTTCGCTCCCCAATGTA
CGACTTGAAGAAGGGACTGTAAAATCTCTCATAGAAGAGAAAGGAGTGATCAAAGGAGTG
ACATACAATAATAGCGCACGCGAAGAAACGACTGCATTTGCACCTCTAACTGTGGTATGC
GACGGTTGCTATTCAAACCTCCGTCGGTCTGTTAACGACAACAATGCGGAGGT*CTGTCG
TACCAAGTTGGTTACGTC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2AC11TF 657 0 0
G
GGAAGAAGGTGACGAAGTTAGCAGATGTGGCGACAGAGGAGAGAGAAGACGGTGGTGGTA
CTGATGTAATCATCGTCGGAGCTGGTGTTGGTGGTTCAGCTCTCGCCTACGCTCTTGCAA
AGGATGGGCGTAGAGTACATGTGATAGAGAGGGACATGAGGGAGCCAGTGAGAATGATGG
GTGAGTTTATGCAACCCGGAGGACGACTCTTGCTTTCTAAGCTTGGTCTTCAAGATTGTT
TGGAGGGAATTGATGAACAACTAGCCACAGGCTTAGCAGTTTATAAGGACGGACAAAAAT
CAATCGTGTCTTTTCCGGAGGACAACGAGTTTCCTTATGAACCTACTGCTCGAACTTTTT
ATAATGGCCGTTTTGTTCAGAGACTGCGCCAAAAGGCTTCTTCGCTCCCCAATGTACGAC
TTGAAGAAGGGACTGTAAAATCTCTCATAGAAGAGAAAGGAGTGATCAAAGGAGTGACAT
ACAATAATAGCGCAGGCGAAGAAACGACTGCATTTGCACCTCTAACTGTGGTATGCGACG
GTTGCTATTCAAACCTCCGTCGGTCTGTTAACGACAACAATGCGGAGGTTCTGTCGTACC
AAGTTGGTTACGTCTCAAAGAATTGTCAGCTTGAAGATCCTGACAAATTAAAGTTG

QA 2 657 2 657
DS 



AS 1 8

CO CL755Contig1 1006 8 18 U
GGAAAACAAACTGTTCCATTTATTATCACAAGACTTGAGGTCACTGACACAACCCAACAA
ACATGGATTCTGATATGTAAACCATACATCTTCATCATAACTAAGAAATCTATATAAGCT
TTTCAGGGTATCATGCTACACAGCACAACAGCAAGACAAGGTGTTTATAGCAGGCCTGTG
ATGAATGACAACAAAGAGGTTTTGATACGTTCCAACAAATCCCACATCGTATAGACTCCA
TTCCGGCAAACCAGAGGGAAGCGATTCACTTTGACACTACGGATGGAAGAATATTTGGCA
CACGCTCCAGGCAGTTTGTTACCTTTGTAAGCCTTGCAGATGTAGCTTATGAAGTTTTCA
TAATCCTCATAAAGTGGCTGACCATCCACAACAACCCAGGGAACGTATTTATGAGGCGGC
TCAAGTGCACTAGTTTCTGCAGCATACTGCAACTGAAGCTCTTTCCCATGTCCACTGCTG
AGGCAATCCGATACATGTTTTGAGTTCAGATTGAGCTTATCATAACAAGTCTCCCACTTT
TTGTACTTGTGTTCAATCACCAAACTCTCAACACAGTAAATGAACGGGAAATGATCACTC
AATTCAGGCCAAACATCAATCGCACAAGCTTCTACCGTGTCCAAGAAGCATTCATATGCA
CCGTGCTGGCAAACGACGGTGACATTATCGGAGCGGAGCTTGGTGTTGCCCCAGGGAGAC
AGATGGAGGTCGACGATTGATATGAGATCGTCTTCGAAGAGCTTTGTGAGGTGGTTTACT
ATGAAGGAAGAACAGTATGGACATAGAGACTCGTAGTACAGTCCCAGCGAGACTTTCTGC
GAAGAAGATGGTTTAGATATTCCAGAAAGATCAGGTGATGATGATGATG***CAAGGCAG
AGAAGAGAAACGTAGCAGACTAGGAGAACAAGTTTGATTGTTGGCCTCGACGCCATAGAT
GCAAAGACAAAAGCTGTTGTTGTCTCTCTGAATGACTATTCGATCC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP95JQ U 52
AF RR2DM08TF C 1
AF RR2BQ52JQ U 2
AF RR2C137JQ U 2
AF RR2GC16JQ U 2
AF RR2GC16TF C 254
AF RR2BP95TF C 327
AF RR2BQ52TF C 328
BS 1 1 RR2DM08TF
BS 2 51 RR2BQ52JQ
BS 52 104 RR2BP95JQ
BS 105 105 RR2BQ52JQ
BS 106 161 RR2BP95JQ
BS 162 162 RR2BQ52JQ
BS 163 174 RR2BP95JQ
BS 175 590 RR2BQ52JQ
BS 591 591 RR2C137JQ
BS 592 710 RR2BQ52JQ
BS 711 731 RR2C137JQ
BS 732 770 RR2GC16JQ
BS 771 960 RR2GC16TF
BS 961 971 RR2BP95TF
BS 972 972 RR2BQ52TF
BS 973 983 RR2BP95TF
BS 984 984 RR2BQ52TF
BS 985 1006 RR2BP95TF

RD RR2BP95JQ 123 0 0
ACCCAACAAACATGGATTCTGATATGTAAACCATACATCTTCATCATAACTAAAAAATCT
ATATAAGCTTTTCAGGGTATCATGCTACACAGCACAACAGCAAGACAAGGGGTTTATAGC
AGG

QA 1 123 1 123
DS 

RD RR2DM08TF 360 0 0
GGAAAACAAACTGTTCCATTTATTATCACAAGACTTGAGGTCACTGACACAACCCAACAA
ACATGGATTCTGATATGTAAACCATACATCTTCATCATAACTAAGAAATCTATATAAGCT
TTTCAGGGTATCATGCTACACAGCACAACAGCAAGACAAGGTGTTTATAGCAGGCCTGTG
ATGAATGACAACAAAGAGGTTTTGATACGTTCCAACAAATCCCACATCGTATAGACTCCA
TTCCGGCAAACCAGAGGGAAGCGATTCACTTTGACACTACGGATGGAAGAATATTTGGCA
CACGCTCCAGGCAGTTTGTTACCTTTGTAAGCCTTGCAGATGTAGCTTATGAAGTTTTC
C

QA 1 359 1 359
DS 

RD RR2BQ52JQ 709 0 0
GAAAACAAACTGTTCCATTTATTATCACAAGACTTGAGGTCACTGACACAACCCAACAAA
CATGGATTCTGATATGTAAACCATACATCTTCATCATAACTAAGAAATCTATATAAGCTT
TTCAGGGTATCATGCTACACAGCACAACAGCAAGACAAGGTGTTTATAGCAGGCCTGTGA
TGAATGACAACAAAGAGGTTTTGATACGTTCCAACAAATCCCACATCGTATAGACTCCAT
TCCGGCAAACCAGAGGGAAGCGATTCACTTTGACACTACGGATGGAAGAATATTTGGCAC
ACGCTCCAGGCAGTTTGTTACCTTTGTAAGCCTTGCAGATGTAGCTTATGAAGTTTTCAT
AATCCTCATAAAGTGGCTGACCATCCACAACAACCCAGGGAACGTATTTATGAGGCGGCT
CAAGTGCACTAGTTTCTGCAGCATACTGCAACTGAAGCTCTTTCCCATGTCCACTGCTGA
GGCAATCCGATACATGTTTTGAGTTCAGATTGAGCTTATCATAACAAGTCTCCCACTTTT
TGTACTTGTGTTCAATCACCAAACTCTCAACACAGTAAATGAACGGGAA*TGATCACTCA
ATTCAGGCCAAACATCAATCGCACAAGCTTCTACCGTGTCCAAGAAGCATTCATATGCAC
CGTGCTGGCAAACGACGGTGACATTATCGGAGCGGAGCTTGGTGTTGCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2C137JQ 730 0 0
GAAAACAAACTGTTCCATTTATTATCACAAGACTTGAGGTCACTGACACAACCCAACAAA
CATGGATTCTGATATGTAAACCATACATCTTCATCATAACTAAGAAATCTATATAAGCTT
TTCAGGGTATCATGCTACACAGCACAACAGCAAGACAAGGTGTTTATAGCAGGCCTGTGA
CGAATGACAACAAAGAGGTTTTGATACGTTCCGACAAATCCCACATCGTATAGACTCTAT
TCCGGCAAACCAGAGGGAAGCGATTCACTTTGACACTACGGATGGAAGAATATTTGGCAC
ACGCTCCAGGCAGTTTGTTACCTTTGTAAGCCTTGCAGATGTAGCTTATGAAGTTTTCAT
AATCTTCATAAAGTGGCTGACCATCCACGACAACCCAAGGAACGTATTTATGAGGTGGCT
CAAGTGCACTAGTTTCTGCAGCATAATGCAACTGAAGCTCTTTCCCATGTCCACTGCTGA
GGCAATCCGATACATGTTTTGAGTTCAGATTGAGCTTCTCATGACAAGTCTCCCACTTTT
TATACTTGTGTTCAATCACCAAGCTCTCAACACAGTAAATGAACGGGAAATGATCGCTCA
ATTCAGGCCAAACATCAATCGCACAAGCTTCTACCGTGTCCAAGAAGCATTCATATGCAC
CGTGTTGGCAAACGACGGTGACATTATCGGAGCGGAGCTTGGTGTTGCCCCAGGGAGACA
GATGGAGGTC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2GC16JQ 769 0 0
GAAAACAAACTGTTCCATTTATTATCACAAGACTTGAGGTCACTGACACAACCCAACAAA
CATGGATTCTGATATGTAAACCATACATCTTCATCATAACTAAGAAATCTATATAAGCTT
TTCAGGGTATCATGCTACACAGCACAACAGCAAGACAAGGTGTTTATAGCAGGCCTGTGA
TGAATGACAACAAAGAGGTTTTGATACGTTCCAACAAATCCCACATCGTATAGACTCCAT
TCCGGCAAACCAGAGGGAAGCGATTCACTTTGACACTACGGATGGAAGAATATTTGGCAC
ACGCTCCAGGCAGTTTGTTACCTTTGTAAGCCTTGCAGAAGTAGCTTATGAAGTTTTCTT
AATCCTCATAAAGTGGCTGACCATCCACAACAACCCAGGGAACGTATTTATGAGGCGGCT
CAAGTGCACTAGTTTCTGCAGCATACTGCAACTGAAGCTCTTTCCCATGTCCACTGCTGA
GGCAATCCGATACATGTTTTGAGTTCAGATTGAGCTTATCATAACAAGTCTCCCACTTTT
AGTACTTGTGTTCAATCACCAAACTCTCAACACAGTAAATGAACGGGAAATGATCACTCA
ATTCAGGCCAAACATCAATCGCACAAGCTTCTACCGTGTCCAAGAAGCATTCATATGCAC
CGTGCTGGCAAACGACGGTGACATTATCGGAGCGGAGCTTGGTGTTGCCCCAGGGAGACA
GATGGAGGTCGACGATTGATATGAGATCGTCTTCGAAGAGCTTTGTGAG

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2GC16TF 709 0 0
GAGGGAAGCGATTCACTT*GACACTACGGATGGAAGAATATTTGGCACACGCTCCAGGCA
GTTTGTTACCTTTGTAAGCCTTGCAGATGTAGCTTATGAAGTTTTCTTAATCCTCATAAA
GTGGCTGACCATCCACAACAACCCAGGGAACGTATTTATGAGGCGGCTCAAGTGCACTAG
TTTCTGCAGCATACTGCAACTGAAGCTCTTTCCCATGTCCACTGCTGAGGCAATCCGATA
CATGTTTTGAGTTCAGATTGAGCTTATCATAACAAGTCTCCCACTTTTAGTACTTGTGTT
CAATCACCAAACTCTCAACACAGTAAATGAACGGGAAATGATCACTCAATTCAGGCCAAA
CATCAATCGCACAAGCTTCTACCGTGTCCAAGAAGCATTCATATGCACCGTGCTGGCAAA
CGACGGTGACATTATCGGAGCGGAGCTTGGTGTTGCCCCAGGGAGACAGATGGAGGTCGA
CGATTGATATGAGATCGTCTTCGAAGAGCTTTGTGAGGTGGTTTACTATGAAGGAAGAAC
AGTATGGACATAGAGACTCGTAGTACAGTCCCAGCGAGACTTTCTGCGAAGAAGATGGTT
TAGATATTCCAGAAAGATCAGGTGATGATGATGATG***CAAGGCAGAGAAGAGAAACGT
AGCAGACTAGGAGAACAAGTTTGATTGTTGGCCTCGACGCCATAGAT
CC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2BP95TF 680 0 0
GTAAGCCTTGCAGATGTAGCTTATGAAGTTTTCATAATCCTCATAAAGTGGCTGACCATC
CACAACAACCCAGGGAACGTATTTATGAGGCGGCTCAAGTGCACTAGTTTCTGCAGCATA
CTGCAACTGAAGCTCTTTCCCATGTCCACTGCTGAGGCAATCCGATACATGTTTTGAGTT
CAGATTGAGCTTCTCATAACAAGTCTCCCACTTTTTGTACTTGTGTTCAGTCACCAAGCT
CTCAATACAGTAAATGAACGGGAAATGATCGCTCAATTCAGGCCAAACATCAATCGCGCA
AGCTTCTACCGTGTCCAAGAAGCATTCATATGCACCGTGCTGGCAAACGACGGTGGCATT
ATCGGAGCGGAGCTTGGTGTTGCCCCAGGGAGACAGATGGAGGTCCACGATTGATATGAG
ATCGTCTTCGAAGAGCTTTGTGAGGTGGTTTACTATGAAGGAAGAACAGTATGGACATAG
AGACTCGTAGTACAGTCCCAGCGAGACTTTCTGCGAAGAAGATGGTTTAGATATTCCAGA
AAGATCAGGTGATGATGATGATGATACAAAACAGAGAAGAGAAACGTGGCAGACTACGAG
AACAAGTTTGATCGTCGGCATCGACGCCATAGATGCAAAGACAAA*GCTGTTGTTGTGTC
TCTGAATGACTATTCGATCC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2BQ52TF 678 0 0
GTAAG
CTTGCAGATGTAGCTTATGAAGTTTTCATAATCCTCATAAAGTGGCTGACCATCCACAAC
A*CCCAGGGAACGTATTTATGAGGCGGCTCAAGTGCACTAGTTTCTGCAGCATACTGCAA
CTGAAGCTCTTTCCCATGTCCACTGCTGAGGCAATCCGATACATGTTTTGAGTTCAGATT
GAGCTTATCATAACAAGTCTCCCACTTTTTGTACTTGTGTTCAATCACCAAACTCTCAAC
ACAGTAAATGAACGGGAA*TGATCACTCAATTCAGGCCAAACATCAATCGCACAAGCTTC
TACCGTGTCCAAGAAGCATTCATATGCACCGTGCTGGCAAACGACGGTGACATTATCGGA
GCGGAGCTTGGTGTTGCCCCAGGGAGACAGATGGAGGTCGACGATTGATATGAGATCGTC
TTCGAAGAGCTTTGTGAGGTGGTTTACTATGAAGGAAGAACAGTATGGACATAGAGACTC
GTAGTACAGTCCCAGAGAGACTTTCTGCGAAGAAGATGGTTTGGATATTCCAGAAAGATC
AGGTGATGATGATGATG***CAAGGCAGAGAAGAGAAACGTAGCAGACTAGGAGAACAAG
TTTGATTGTTGGCCTCGACGCCATAGATGCAAAGACAAAAGCTGTTGTTGTCTCTCTGAA
T
ACTATTCGATCC

QA 6 666 6 666
DS 



AS 1 8

CO CL756Contig1 1383 8 19 U
GGGAACCCCATTCGTCTAGAAATTTGCCTATATATGCAGGCACGCATAGCACTTCCTTCT
CACTGCAATACAAACTATAGATCATCAACAAATTTAAATTAAAAAAACGAGAGCAGTGTT
TTATACGACCACCATCTTGAAATGGGTCTAACTGTGTCACTTGAAGACACCGTAAGAACA
GAGGCAAAGAGCCACAGCAACGTTCACTTAGTTTTGGTTGATGGAATGTCTAAGCTAATG
ACTCGACAAGTTGAGAATTTTGTGTCATCGGATATCTATGTTGGTGGTCTAAAATGGAAC
ATCATTATGACCGCATATGAGGACTCCCTATACTTTGGTCTGATGATCAGGGACAGCAAG
TGTATCGGTTCTAATTGGAAAGTCAATTGCACCGTCAAACTTACCCTATACTCTGATACT
TCTTCACTCCTTCATGGAAACCACCAGACTCCGGTTTGTTTCGAGGCAAACAATACTCAT
GTACTGATAAGCATCCCACTCAATAGCCTGAAGGAGTCATATACTGTGAACGACAAATCG
GTTTTCTCAGCCGAGATCACAGAAGTCAAACCGAGATTCCTGGACGTTACCAGTATACCT
CGAACCATAGGGACAGCAGAAAGAATTAAACTGACGGAGGTGGAGAGTAACAAGTCTAAA
TTCACCTGGAAGATTACTCGTTTTTCGTCCTTCACTGGTGAAAATAATTCATCGTACCAG
TTCACGGTTGGACCACGGAGATGGTACCTAAGGATGTGCCCAGAAGGAACCTTAGAGGGG
AAAGGAAATTCGTTGTCTTTGTATTTGCATGCTTCCGATTACGTGATCAGTCCAAAGACA
CATACGTTGGCCGTCTTTAAACTGCGAGTGCTGGACCAACTCAAGCGCAATCACCATGAA
TTAGACCAGCAGCTCTGGTTTGGCTCTGATGGCCATAAAGGAGAACCCAAGTTTTTGGCG
CTGGACAAACTGCACAAGGCTTCAAACGGATTTCTGGTGAACGATACAATATATATCGGT
GTTGAGTTTTTCTATGTCTCCACAACTGAGAATATGATCTGATTGGTATCAATTGATTG*
AATCAAGACCACAAGAATAAATAGCCTGGAGAGGAACTTATCACCTATTATATTATATAC
TACTTTGCATATCGTGGTGTGTTTCGATATACAAAA*TAAAATATCACCAAATCGGTTGC
TTGTACTGTCTGGGATGATAACATTCAACCGAATCTGATGTTATGTCTTATGTATTCCCA
TGAGGAGAAAGCTGCTTTGTGTGTGAGCTTATGTAACTTTCTTCTGCAATATTTACGTAT
ATGTGTAGTATATGTGTGCCTGCTCACAGACCTACCATTTAAAATCTTCAATGCCTTTTT
TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 10 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2G352TF U 1
AF RR2EV87TF U 60
AF RR2FA66TF U 92
AF RR2EV87JQ C 1027
AF RR2C034TF U 644
AF RR2B315JQ C 556
AF RR2FA66JQ C 694
AF RR2G352JQ C 574
BS 1 443 RR2G352TF
BS 444 703 RR2EV87TF
BS 704 704 RR2FA66TF
BS 705 751 RR2EV87TF
BS 752 752 RR2C034TF
BS 753 762 RR2EV87TF
BS 763 763 RR2C034TF
BS 764 766 RR2EV87TF
BS 767 767 RR2C034TF
BS 768 774 RR2EV87TF
BS 775 1061 RR2C034TF
BS 1062 1062 RR2B315JQ
BS 1063 1148 RR2C034TF
BS 1149 1149 RR2B315JQ
BS 1150 1264 RR2C034TF
BS 1265 1265 RR2B315JQ
BS 1266 1284 RR2C034TF
BS 1285 1326 RR2B315JQ
BS 1327 1383 RR2G352JQ

RD RR2G352TF 443 0 0
GGGAACCCCATTCGTCTAGAAATTTGCCTATATATGCAGGCACGCATAGCACTTCCTTCT
CACTGCAATACAAACTATAGATCATCAACAAATTTAAATTAAAAAAACGAGAGCAGTGTT
TTATACGACCACCATCTTGAAATGGGTCTAACTGTGTCACTTGAAGACACCGTAAGAACA
GAGGCAAAGAGCCACAGCAACGTTCACTTAGTTTTGGTTGATGGAATGTCTAAGCTAATG
ACTCGACAAGTTGAGAATTTTGTGTCATCGGATATCTATGTTGGTGGTCTAAAATGGAAC
ATCATTATGACCGCATATGAGGACTCCCTATACTTTGGTCTGATGATCAGGGACAGCAAG
TGTATCGGTTCTAATTGGAAAGTCAATTGCACCGTCAAACTTACCCTATACTCTGATACT
TCTTCACTCCTTCATGGAAACCA

QA 1 443 1 443
DS 

RD RR2EV87TF 715 0 0
GG
ACTGCAATACAAACTATAGATCATCAACAAATTTAAATTAAAAAAACGAGAGCAGTGTTT
TATACGACCACCATCTTGAAATGGGTCTAACTGTGTCACTTGAAGACACCGTAAGAACAG
AGGCAAAGAGCCACAGCAACGTTCACTTAGTTTTGGTTGATGGAATGTCTAAGCTAATGA
CTCGACAAGTTGAGAATTTTGTGTCATCGGATATCTATGTTGGTGGTCTAAAATGGAACA
TCATTATGACCGCATATGAGGACTCCCTATACTTTGGTCTGATGATCAGGGACAGCAAGT
GTATCGGTTCTAATTGGAAAGTCAATTGCACCGTCAAACTTACCCTATACTCTGATACTT
CTTCACTCCTTCATGGAAACCACCAGACTCCGGTTTGTTTCGAGGCAAACAATACTCATG
TACTGATAAGCATCCCACTCAATAGCCTGAAGGAGTCATATACTGTGAACGACAAATCGG
TTTTCTCAGCCGAGATCACAGAAGTCAAACCGAGATTCCTGGACGTTACCAGTATACCTC
GAACCATAGGGACAGCAGAAAGAATTAAACTGACGGAGGTGGAGAGTAACAAGTCTAAAT
TCACCTGGAAGATTACTCGTTTTTCGTCCTTCACTGGTGAAA*TAATTCATCGTACCAGT
TCACGGTTGGACCACGGAGATGGTACCTAAAGATGTGCCCACAAGTAACCTTA

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR2FA66TF 655 0 0
TTTTTTTCTTG
AAAAACGATAGCAATGTCTTATACGACCACCATCTTGAAATGGGTCTAACTGTGTCACTT
GAAGACACCGTAAGAACAGAGGCAAAGAGCCACAGCAACGTTCACTTAGTTTTGGTTGAT
GGAATGTCTAAGCTAATGACTCGACAAGTTGAGAATTTTGTGTCATCGGATATCTATGTT
GGTGGTCTAAAATGGAACATCATTATGACCGCATATGAGGACTCCCTATACTTTGGTCTG
ATGATCAGAGACAGCAAGTGTATCGGTTCTAATTGGAAAGTCAATTGCACCGTCAAACTT
ACCCTATACTCTGATACTTCTTCACTCCTTCATGGAAACCACCAGACTGCGGTTTGTTTT
GAGGCAAACAATACTCATGTACTGATAAGCATCCCACTCAATAGCCTGAAGGAGTCATAT
ATTGTGAACGACAAATCGGTTTTCTCAGCCGAGATCACAGAAGTCAAACCGAGATTCCTG
GACGTTACCAGTATACCTCGAACCATAGGGACAGCAGAAAGAATTAAACTGACGGAGGTG
GAGAGTAACAAGTCTAAATTCACCTGGAAGATTACTCGTTTTTCGTCCTTCACTGGTGAA
AATAATTCATCGTACCAGTTCACGGTTGGACCACGGAGATGGTA

QA 12 655 12 655
DS 

RD RR2EV87JQ 220 0 0
TTTTTCTATGTCTCCACAACTGAGAATATGATCTGACTGGTATCAATTGATTGGAATCAA
GACCACAAGAATAAATAGCCTGGAGAGGAACTTATCACCTATTATATTATATACTACTTC
GCATATCGTGGTGTGTTTCGATATACAAAAATAAAATATCACCAAATCGGTTGCTTGTAC
TGTCTGGGATGATAACATTCAACCGAATCTGATGTTATGT

QA 1 220 1 220
DS 

RD RR2C034TF 650 0 0
AGAGTAACAAGTCTAAATTCACCTGGAAGATTACTCGTTTTTCGTCCTTCACTGGTGAAA
ATAATTCATCGTACCAGTTCACGGTTGGACCACGGAGATGGTACCTAAGGATGTGCCCAG
AAGGAACCTTAGAGGGGAAAGGAAATTCGTTGTCTTTGTATTTGCATGCTTCCGATTACG
TGATCAGTCCAAAGACACATACGTTGGCCGTCTTTAAACTGCGAGTGCTGGACCAACTCA
AGCGCAATCACCATGAATTAGACCAGCAGCTCTGGTTTGGCTCTGATGGCCATAAAGGAG
AACCCAAGTTTTTGGCGCTGGACAAACTGCACAAGGCTTCAAACGGATTTCTGGTGAACG
ATACAATATATATCGGTGTTGAGTTTTTCTATGTCTCCACAACTGAGAATATGATCTGGT
TGGTATCAATTGATTG*AATCAAGACCACAAGAATAAATAGCCTGGAGAGGAACTTATCA
CCTATTATATTATATACTACTTTGCGTATCGTGGTGTGTTTCGATATACAAAA*TAAAAT
ATCACCAAATCGGTTGCTTGTACTGTCTGGGATGATAACATTCAACCGAATCTGATGTTA
TGTCTTATGTATTCCCATGAG*AGAAAGCTGCTTTGTGTGT
GAGCTTATG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2B315JQ 776 0 0
ATCACAGAAGTCAAACCGAGATTCCTGGACGTTACCAGTATACCTCGAACCATAGGGACA
GCAGAAAGAATTAAACTGACGTAGGTGGAGAGTAACAAGTCTAAATCCACCTGGAAGATT
ACTCGTTTTTCGTCCTTCACTGATGAAAATAATTCATCGTACCAGTTCACGGTTGGACCA
CGGAGATGGTACCTAAGGATGTGCCCAGAAGGAACCTTAGAGGGGAAAGGAAATTCGTTG
TCTTTGTATCTGCATGCTTCCGATTACGTGATCAGTCCAAAGACACATACGTTGGCCGTC
TTTAAACTGCGAGTGCTGGACCAACTCAAGCGCAATCACCATGAATTAGACCAGCAGCTC
TGGTTTGGCTCTGATGGCCATAAAGGAGAACCCAAGTTTTTGGCGCTGGACAAACTGCAC
AAGGCTTCAAACGGATTTCTGGTGAACGATACAATATATATCGGTGTTGAGTTTTTCTAT
GTCTCCACAACTGAGAATATGATCTGAT*GGTATCAATTGATTG*AATCAAGACCACAAG
AATAAATAGCCTGGAGAGGAACTTATCACCTATTATATTATATACTACTTTGCATATCGT
GGTGTGTTTCGATATACAAAA*TAAAATATCACCAAATCGGTTGCTTGTACTGTCTGGGA
TGATAACATTCAACCGAATCTGATGTTATGTCTTATGTATTCCCATGAGGAGAAAGCTGC
TTTGTGTGTGAGCTTATGTAACTTTCTTCTGCAATATTTACGTATATGTGT
TTAGC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2FA66JQ 638 0 0
ACTGGTGAAAATAATTCATCGTACCAGTTCACGGTTGGACCACGGAGATGGTACCTAAGG
ATGTGCCCAGAAGGAACCTTAGAGGGGAAAGGAAATTCGTTGTCTTTGTATCTGCATGCT
TCCGATTACGTGATCAGTCCAAAGACACATACGTTGGCCGTCTTTAAACTGCGAGTGCTG
GACCAACTCAAGCGCAATCACCATGAATTAGACCAGCAGCTCTGGTTTGGCTCTGATGGC
CATAAAGGAGAACCCAAGTTTTTGGCGCTGGACAAACTGCACAAGGCTTCAAACGGATTT
TTGGTGAACGATACAATATATATCGGTGTTGAGTTTTTCTATGTCTCCACAACTGAGAAT
ATGATCTGATTGGTATCAATTGATTG*AATCAAGACCACAAGAATAAATAGCCTGGAGAG
GAACTTATCACCTATTATATTATATACTACTTTGCATATCGTGGTGTGTTTCGATATACA
AAA*TAAAATATCGCCAAATCGGTTGCTTGTACTGTCTGGGATGATAACATTCAACCGAA
TCTGATGTTATGTCTTATGTATTCCCATGAGGAGAAAGCTGCTTTGTGTGTGAGCTTATG
TAACTTTCTTCTGCAATATTTACGTATATGTGT
TTAGC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2G352JQ 810 0 0
AGATTCCTGGGCGTTACCAGTATACCTCGAACCATAGG*ACAGCAGAAAGAATTAAACTG
ACGGAGGTGGAGAGTAACAAGTCTAAATTCACCTGGAAGATTACTCGTTTTTCGTCCTCC
ACTGGTGAAAATAATTCATCGTACCAGTTCACGGTTGGACCACGGAGATGGTACCTAAGG
ATGTGCCCACAAGGAACCTTAGAGGGGAAAGGAAATTCATTGTCTTTGTATTTGCATGCT
TCCGATTACGTGACCAGTCCAAAGACAAATACGTTGGCCGTCTTTAAACTGCGAGTGCTG
GACCAACTCAAGCGCAATCACCATGAATTAGACCAGCAGCTCTGGTTTGGCTCTGATGGC
CATAAAGGAGAACCCAAGTTTTTGGCGCTGGACAAACTGCACAAGGCTTCAAACGGATTT
CTGGTGAACGATACGATATATATCGGTGTTGAGTTTTTCTATGTCTCCACAACTGAGAAT
ATGATCTGACTGGTATCAATTGATTGGAATCAAGACCACAAGAATAAATAGCCTGGAGAG
GAACTTATCACCTATTATATTATATACTACTTCGCATATCGTGGTGTGTTTCGATATACA
AAAATAAAATATCACCAAATCGGTTGCTTGTACTGTCTGGGATGATAACATTCAACCGAA
TCTGATGTTATGTCTTATGTATTCTCACGAGGAGAAAGCTGCTTTGTGTGTCTGCTTA*G
TAACTTTCTTCTGCAATATTTACGTATGTGTGTAGTATATGTGTGCCTGCTCACAGACCT
ACCATTTAAAATCTTCAATGCCTTTTTTCC

QA 1 810 1 810
DS 



AS 2 9

CO CL757Contig1 594 4 3 U
AGGGCGACACTTGGGAGTTGGAGCAAACGACGAAGCAAAGCTCACGATGGCAAGGATTAA
GGTTCATGAGCTTAGAGAGAGATCGAAGACGGATCTTCAGAGCCAGCTTCAGGAGTTCAA
GGCTGAACTCGCCCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGAGGTGCCCCTAACAAGCTTTC
CAAAATCAAGGTCGTGAGGAAATCAATTGCTCAGGTATTGACAGTGATCTCACAGAAGCA
GAAATTAGCACTAAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCTTGCCTCTTGATCTTCGTCC
CAAGAAGACACGTGCTATCCGTAGACGTCTGACCAAGCATCAGTCTTCCTTAAAGACAGA
GCGTGAGAAGAAGAAAGAGATGTATTTCCCTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTT
TCAATGTTTCATTCTCCAGGATTCCTTACTAGGAATGATTCAGCTTTTTGATTATTCACT
TATTTTGTCCACCTTTGTTTTTTTACTCAAGTTTTGTCATGTAACAGTTAAATCTATCTC
TCACTCCTCGAAAACATTGTTTCGTAATAATTGAAATTGAACCAGTTCTTGGCT


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 

AF RR2E342JQ C 1
AF RR2E342TF U 1
AF RR2DS11TF U 3
AF RR2DS11JQ C 86
BS 1 2 RR2E342JQ
BS 3 593 RR2E342TF
BS 594 594 RR2DS11TF

RD RR2E342JQ 593 0 0
AGGGCGACACTTGGGAGTTGGAGCAAACGACGAAGCAAAGCTCACGATGGCAAGGATTAA
GGTTCATGAGCTTAGAGAGAGATCGAAGACGGATCTTCAGAGCCAGCTTCAGGAGTTCAA
GGCTGAACTCGCCCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGAGGTGCCCCTAACAAGCTTTC
CAAAATCAAGGTCGTGAGGAAATCAATTGCTCAGGTATTGACAGTGATCTCACAGAAGCA
GAAATTAGCACTAAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCTTGCCTCTTGATCTTCGTCC
CAAGAAGACACGTGCTATCCGTAGACGTCTGACCAAGCATCAGTCTTCCTTAAAGACAGA
GCGTGAGAAGAAGAAAGAGATGTATTTCCCTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTT
TCAATGTTTCATTCTCCAGGATTCCTTACTAGGAATGATTCAGCTTTTTGATTATTCACT
TATTTTGTCCACCTTTGTTTTTTTACTCAAGTTTTGTCATGTAACAGTTAAATCTATCTC
TCACTCCTCGAAAACATTGTTTCGTAATAATTGAAATTGAACCAGTTCTTGGC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2E342TF 593 0 0
AG
GGCGACACTTGGGAGTTGGAGCAAACGACGAAGCAAAGCTCACGATGGCAAGGATTAAGG
TTCATGAGCTTAGAGAGAGATCGAAGACGGATCTTCAGAGCCAGCTTCAGGAGTTCAAGG
CTGAACTCGCCCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGAGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCA
AAATCAAGGTCGTGAGGAAATCAATTGCTCAGGTATTGACAGTGATCTCACAGAAGCAGA
AATTAGCACTAAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCTTGCCTCTTGATCTTCGTCCCA
AGAAGACACGTGCTATCCGTAGACGTCTGACCAAGCATCAGTCTTCCTTAAAGACAGAGC
GTGAGAAGAAGAAAGAGATGTATTTCCCTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTTTC
AATGTTTCATTCTCCAGGATTCCTTACTAGGAATGATTCAGCTTTTTGATTATTCACTTA
TTTTGTCCACCTTTGTTTTTTTACTCAAGTTTTGTCATGTAACAGTTAAATCTATCTCTC
ACTCCTCGAAAACATTGTTTCGTAATAATTGAAATTGAACCAGTTCTTGGC

QA 3 593 3 593
DS 

RD RR2DS11TF 592 0 0
GGCGACACTTGGGAGTCGGAGCAAACGACGAAGCAATGCTCACGATGGTAAGGATTAAGG
TTCATGAGCTTAGAGAGAGATCGAAGACGGATCTTCAGAGCCAGCTTCAGGAGTTCAAGG
CTGAGCTCGCCCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGAGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCA
AAATCAAGGTCGTGAGGAAATCAATTGCTCAGGTATTGACAGTGATCTCACAGAAGCAGA
AATTAGCACTAAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCTTGCCTCTTGATCTTCGTCCCA
AGAAGACACGTGCTATCCGTAGACGTCTGACCAAGCATCAGTCTTCCTTAAAGACAGAGC
GTGAGAAGAAGAAAGAGATGTATTTCCCTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTTTC
AATGTTTCATTCTCCAGTATTCCTTACTAGGAATGATTCAGCTTTTTGATTATTCACTTA
TTTTGTCCACCTTTGTTTTTTTACTCAAGTTTTGTCATGTAACAGTTAAATCTATCTCTC
ACTCCTCGAAAACATTGTTTCGTAATAATTGAAATTGAACCAGTTCTTGGCT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2DS11JQ 509 0 0
AAGACGGATCTTCAGAGCCAGCTTCAGGAGTTCAAGGCTGAGCTCGCCCTCCTCCGTGTC
GCTAAAGTCACCGGAGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAAATCAAGGTCGTGAGGAAATCA
ATTGCTCAGGTATTGACAGTGATCTCACAGAAGCAGAAATTAGCACTAAGAGAAGCATAC
AAGAACAAGAAGTTCTTGCCTCTTGATCTTCGTCCCAAGAAGACACGTGCTATCCGTAGA
CGTCTGACCAAGCATCAGTCTTCCTTAAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAAGAGATGTAT
TTCCCTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTTTCAATGTTTCATTCTCCAGTATTCC
TTACTAGGAATGATTCAGCTTTTTGATTATTCACTTATTTTGTCCACCTTTGTTTTTTTA
CTCAAGTTTTGTCATGTAACAGTTAAATCTATCTCTCACTCCTCGAAAACATTGTTTCGT
AATAATTGAAATTGAACCAGTTCTTGGCT

QA 1 509 1 509
DS 



CO CL757Contig2 628 5 24 U
GGGGGGGACACTTGGGAGTTGGAGCCAGAAACAAAAACGAGGAAGCAGAAGAGTTCAACA
CCAGAAAGCAAAGCTCACGATGGCAAGGATTAAGGTTCATGAGCTTAGAGAGAGATCGAA
GACGGATCTTCAGAGCCAGCTTCAGGAGTTCAAGGCCGAGCACGCCCTCCTCCGTGTTGC
TAAAGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAAATCAAGGTCGTGAGGAAATCCAT
TGCTCAGGTATTGACAGTGATCTCACAGAAGCAGAAATTAGCACTAAGAGAAGCATACAA
GAACAAGAAGTTCTTGCCTCTTGATCTTCGTCCCAAGAAGACACGTGCTATCCGTAGACG
TCTTACCAAGCATCAGTCTTCCTTAAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAAGAGATGTATTT
CCCTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTTTCAATGTTTCATTCTCCAGGATTCCTT
ACTAGGAATGATTCAGCTTTTTGATTATTCACTTATTTTGTCCACCTTTGTTTTTTTACT
CAAGTTTTGTCATGTAACAGTTAAATCTATCTCTCACTCCTCGAAAACATTGTTTCGTAA
TAATTGAAATTGAACCAGTTCTTGGCTC


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 

AF RR2CR45JQ C 327
AF RR2EV23JQ C 1
AF RR2EG59TF U 3
AF RR2CR45TF U 3
AF RR2EV23TF U 1
BS 1 2 RR2EV23JQ
BS 3 97 RR2EG59TF
BS 98 100 RR2CR45TF
BS 101 156 RR2EG59TF
BS 157 157 RR2EV23TF
BS 158 161 RR2EG59TF
BS 162 162 RR2EV23TF
BS 163 177 RR2EG59TF
BS 178 178 RR2CR45TF
BS 179 192 RR2EG59TF
BS 193 193 RR2CR45TF
BS 194 229 RR2EG59TF
BS 230 230 RR2CR45TF
BS 231 237 RR2EG59TF
BS 238 238 RR2CR45TF
BS 239 329 RR2EG59TF
BS 330 330 RR2CR45TF
BS 331 381 RR2EG59TF
BS 382 382 RR2CR45TF
BS 383 384 RR2EG59TF
BS 385 385 RR2CR45TF
BS 386 625 RR2EG59TF
BS 626 627 RR2EV23TF
BS 628 628 RR2EV23JQ

RD RR2CR45JQ 239 0 0
TTT
GTCCCAAGAAGACACGTGCTATCCGTAGACGTTTTACCAAGCATCAGTTTTCCTTAAAGA
CAGAGCGTGAGAAGAAGAAAGAGATGTATTTCCCTTTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTTT
AGTTTCAATGTTTCATTTTCCAGGATTCCTTACTGGGAATGATTCACCTTTTTGATTATT
CACTTATTTTGTCCACCTTTGTTTTTTTACTCAAGTTTTGTCATGTAACAGTTAAA

QA 4 239 4 239
DS 

RD RR2EV23JQ 628 0 0
GGGGGGGACACTTGGGAGTTGGAGCCAGAAACAAAAACGAGGAAGCAGAAGAGTTCAACA
CCAGAAAGCAAAGCTCACGATGGCAAGGATTAAGGTTCATGAGCTTAGAGAGAGATCGAA
GACGGATCTTCAGAGCCAGCTTCAGGAGTTCAAGGCCGAGCACGCCCTCCTCCGTGTTGC
TAAAGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAAATCAAGGTCGTGAGGAAATCCAT
TGCTCAGGTATTGACAGTGATCTCACAGAAGCAGAAATTAGCACTAAGAGAAGCATACAA
GAACAAGAAGTTCTTGCCTCTTGATCTTCGTCCCAAGAAGACACGTGCTATCCGTAGACG
TCTTACCAAGCATCAGTCTTCCTTAAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAAGAGATGTATTT
CCCTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTTTCAATGTTTCATTCTCCAGGATTCCTT
ACTAGGAATGATTCAGCTTTTTGATTATTCACTTATTTTGTCCACCTTTGTTTTTTTACT
CAAGTTTTGTCGTGTAACAGTTAAATCTATCTCTCACTCCTCGAAAACATTGTTTCGTAA
TAATTGAAATTGAACCAGTTCTTGGCTC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2EG59TF 623 0 0
GGGGGACACTTGGGAGTTGGAGCCAGAAACAAAAACGAGGAAGCAGAAGAGTTCAACACC
AGAAAGCAAAGCTCACGATGGCAAGGATTAAGGTT***GAGCTTAGAGAGAGATCGAAGA
CGGATCTTCAGAGCCAGCTTCAGGAGTTCAAGGCTGAGCTCGCCCTCCTCCGTGTCGCTA
AAGTCACCGGAGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAAATCAAGGTCGTGGGGAAATCAATTG
CTCAGGTATTGACAGTGATCTCACAGAAGCAGAAATTAGCACTAAGAGAAGCATACAAGA
ACAAGAAGTTCTTGCCTCTTGATCTTCTTCCCAAGAAGACACGTGCTATCCGTAGACGTC
TTACCAAGCATCAGTCTTCTTTGAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAAGAGATGTATTTCC
CTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTTTCAATGTTTCATTCTCCAGGATTCCTTAC
TAGGAATGATTCAGCTTTTTGATTATTCACTTATTTTGTCCACCTTTGTTTTTTTACTCA
AGTTTTGTCATGTAACAGTTAAATCTATCTCTCACTCCTCGAAAACATTGTTTCGTAATA
ATTGAAATTGAACCAGTTCTTGG

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2CR45TF 614 0 0
GGGGGACACTTGGGAGTTGGAGCCAGAAACAAAAACGAGGAA*CAGAAGAGTTCAACACC
AGAAAGCAAAGCTCACGATGGCAAGGATTAAGGTTCATGAGCTTAGAGAGAGATCGAAGA
CGGATCTTCAGAGCCAGCTTCAGGAGTTCAAGGCTGAGCTCGCCCTCCTCCGTGTTGCTA
AAGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAAATCAAGGTCGTGAGGAAATCCATTG
CTCAGGTATTGACAGTGATCTCACAGAAGCAGAAATTAGCACTAAGAGAAGCATACAAGA
ACAAGAAGTTCTTGCCTCTTGATCTTTGTCCCAAGAAGACACGTGCTATCCGTAGACGTC
TTACCAAGCATCAGTCTTCCTTAAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAAGAGATGTATTTCC
CTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTTTCAATGTTTCATTCTCCAGGATTCCTTAC
TGGGAATGATTCACCTTTTTGATTATTCACTTATTTTGTCCACCTTTGTTTTTTTACTCA
AGTTTTGTCATGTAACAGTTAAATCTATCTCTCACTCCTCGAAAACATTGTTTCGTAATA
ATTGAAATTGAACC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2EV23TF 628 0 0
GG
GGGGGACACTTGGGAGTTGGAGCCAGAAACAAAAACGAGGAAGCAGAAGAGTTCAACACC
AGAAAGCAAAGCTCACGATGGCAAGGATTAAGGTTCATGAGCTTAGAGAGAGATCGAAGA
CGGATCTTCAGAGCCAGCTTCAGGAGTTCAAGGCCGAGCACGCCCTCCTCCGTGTTGCTA
AAGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCCAAAATCAAGGTCGTGAGGAAATCCATTG
CTCAGGTATTGACAGTGATCTCACAGAAGCAGAAATTAGCACTAAGAGAAGCATACAAGA
ACAAGAAGTTCTTGCCTCTTGATCTTCGTCCCAAGAAGACACGTGCTATCCGTAGACGTC
TTACCAAGCATCAGTCTTCCTTAAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAAGAGATGTATTTCC
CTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTTTCAATGTTTCATTCTCCAGGATTCCTTAC
TAGGAATGATTCAGCTTTTTGATTATTCACTTATTTTGTCCACCTTTGTTTTTTTACTCA
AGTTTTGTCGTGTAACAGTTAAATCTATCTCTCACTCCTCGAAAACATTGTTTCGTAATA
ATTGAAATTGAACCAGTTCTTGGCT
C

QA 3 627 3 627
DS 



AS 3 8

CO CL758Contig1 965 4 12 U
GGGTCCACCCACTATCCTCAACCATGGCCGTCGGGAAGAACAAGAGAATCTCTAAGGGAA
GAAAGGGAGGCAAGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATTGGTATGATATCA
AGGCTCCCTCTCTCTTCACCCAGAGAAATGTCGGAAAGACACTTGTTTCCAGAACTCAGG
GTACCAAGATTGCATCAGAGGGTCTGAAACACAGAGTTTTCGAGGTGTCTCTTGCTGATC
TCAACAAGGATGAGGACCAAGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTCCAGG
GAAGGAACATCTTGACCCAGTTCTGGGGTATGGACTTCACAACCGACAAGCTCAGGTCCT
TGGTTAAAAAGTGGCAGACTTTGATCGAGTCTCACGTCGATGTTAAAACCACCGATAACT
ACACGCTGAGGCTTTTCTGCATCGCCTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAAAGAA
CTTGCTACGCTCAATCCAGCCAGATCCGTCAGATCCGCAGCAAGATGAGGGAGATCATGA
TCAAGGAAGCTTCGTCTTGTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAGTCCA
TTGGGAAGGATATTGAGAAGGCAACTCAGGGAATCTATCCTCTTCAGAACGTCTTCATCC
GTAAGGTCAAGATCCTCAAGGCTCCCAAATTCGACCTCGGAAAGCTCATGGAGGTTCACG
GAGACTACACAGCAGAGGATGTTGGTGTGAAGGTAGACAGGCCGGCTGATGAGATTGTTG
AGGAACCTACTGAGATTATTGGAGCTTAAGAGAGGGTTTCTGAAGAAGTGTTCAAACTGA
GATCGTTTTTTCATCTAAAACTTTTTAGTATCTTTTATTAACACTCGTTTGATTCCCTAG
TTTCTTTTTGGTGTATTGATGACTTTTTTTTCGTATGAACTTGCTGAGTTTTGGATAATT
TATGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2C425TF U 1
AF RR2E052TF U 425
AF RR2AY81TFB U 1
AF RR2AY81JQ C 433
BS 1 34 RR2AY81TFB
BS 35 35 RR2C425TF
BS 36 139 RR2AY81TFB
BS 140 140 RR2C425TF
BS 141 394 RR2AY81TFB
BS 395 395 RR2C425TF
BS 396 406 RR2AY81TFB
BS 407 407 RR2C425TF
BS 408 433 RR2AY81TFB
BS 434 434 RR2C425TF
BS 435 733 RR2AY81TFB
BS 734 965 RR2AY81JQ

RD RR2C425TF 616 0 0
GGGTCCACCCACTATCCTCAACCATGGCCGTCGGGAAGAACAAGAGAATCTCTAAGGGAA
GAAAGGGAGGGAAGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATTGGTATGATATCA
AGGCTCCCTCTCTCTTCACCCAGAGAAATGTCGGAAAGACACTTGTTTCCAGAACTCAGG
GTACCAAGATTGCATCAGAGGGTCTGAAACACAGAGTTTTCGAGGTGTCTCTTGCTGATC
TCAACAAGGATGAGGACCAAGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTCCAGG
GAAGGAACATCTTGACCCAGTTCTGGGGTATGGACTTCACAACCGACAAGCTCAGGTCCT
TGGTTAAAAAGTGGCAGACTTTGATCGAGTCTCACGTCGATGTTAAAACCACCGATAACT
ACACGCTGAGGCTTTTCTGCATCGCCTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGAA
CTTGCTACGCTCAATCGAGCCAGATCCGTCAGATCCGCAGCAAGATGAGGGAGATCATGA
TCAAGGAAGCTTCGTCTTGTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAATCTA
TTGGGAAGGATATTGA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2E052TF 192 0 0
GCTGAGGCTTTTCTGCATCGCCTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTG
CTACGCTCAATCCAGCCAGATCCGTCAGATCCGCAGCAAGATGAGGGAGATCATGATCAA
GGAAGCTTCGTCCTGTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAATCTATTGG
GAAGGAGATTGA

QA 1 192 1 192
DS 

RD RR2AY81TFB 733 0 0
GGGTCCACCCACTATCCTCAACCATGGCCGTCGGTAAGAACAAGAGAATCTCTAAGGGAA
GAAAGGGAGGCAAGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATTGGTATGATATCA
AGGCTCCCTCTCTCTTCACTCAGAGAAATGTCGGAAAGACACTTGTTTCCAGAACTCAGG
GTACCAAGATTGCATCAGAGGGTCTGAAACACAGAGTTTTCGAGGTGTCTCTTGCTGATC
TCAACAAGGATGAGGACCAAGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTCCAGG
GAAGGAACATCTTGACCCAGTTCTGGGGTATGGACTTCACAACCGACAAGCTCAGGTCCT
TGGTTAAAAAGTGGCAGACTTTGATCGAGTCTCATGTCGATGTTAAGACCACCGATAACT
ACACGCTGAGGCTCTTCTGCATCGCCTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAAAGAA
CTTGCTACGCTCAATCCAGCCAGATCCGTCAGATCCGCAGCAAGATGAGGGAGATCATGA
TCAAGGAAGCTTCGTCTTGTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAGTCCA
TTGGGAAGGATATTGAGAAGGCAACTCAGGGAATCTATCCTCTTCAGAACGTCTTCATCC
GTAAGGTCAAGATCCTCAAGGCTCCCAAATTCGACCTCGGAAAGCTCATGGAGGTTCACG
GAGACTACACAGC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2AY81JQ 533 0 0
TC
TTCTGCATCGCCTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAAAGAACTTGTTACGCTCAA
TCCAGCCAGATCCGTCAGATCCGCAGCAAGATGAGGGAGATCATGATCAAGGAAGCTTCG
TCTTGTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAGTCCATTGGGAAGGATATT
GAGAAGGCAACTCAGGGAATCTATCCTCTTCAGAACGTCTTCATCCGTAAGGTCAAGATC
CTCAAGGCTCCCAAATTCGACCTCGGAAAGCTCATGGAGGTTCACGGAGACTACACAGCA
GAGGATGTTGGTGTGAAGGTAGACAGGCCGGCTGATGAGATTGTTGAGGAACCTACTGAG
ATTATTGGAGCTTAAGAGAGGGTTTCTGAAGAAGTGTTCAAACTGAGATCGTTTTTTCAT
CTAAAACTTTTTAGTATCTTTTATTAACACTCGTTTGATTCCCTAGTTTCTTTTTGGTGT
ATTGATGACTTTTTTTTCGTATGAACTTGCTGAGTTTTGGATAATTTATGC

QA 3 533 3 533
DS 



CO CL758Contig2 642 2 1 U
GCCACCGACAAACTCAGGTCCTTGGTTAAAAAGTGGTAGACTTTGATCGAGTCTCATGTT
GATGTCAAGACCACTGACAACTACACACTAAGGCTTTTCTGCATTGCCTTCACCAAGAGA
CGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGCTATGCTCAATCCAGCCAGATCCGTCAGATCCGC
AGCAAGATGAGGGAGATCATGATCAAGGAAGCTTCGTCTTGTGACCTCAAGGATCTTGTT
GCCAAGTTTATTCCCGAATCTATTGGGAAGGACATTGAGAAGGCAACTCAGGGAATCTAC
CCTCTTCAGAACGTTTTCATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAAGGCTCCCAAATTCGACCTT
GGAAAGCTCATGGAGGTTCACGGAGACTACACAGCGGAGGATGTCGGTGTGAAGGTTGAC
AGGCCGGCCGATGAGACTGCTGTGGAAGAACCTACTGAGATCATTGGAGCTTAAGAGATG
TTTTCGAATAAATGTTGAATTTGAGCTATCTTTTTCTTTTTCTAAAACGTTAGTTTTCTT
TAATGCTTTGTGCCTTTTTTGACACTCGTTTTGGACCCTCAGCTTCTTTCTTTTTGTTTG
GTGTAAAACTTGAGTTTTGGATAATGCTACATCTTTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GR55TF U 1
AF RR2GR55JQ C 90
BS 1 642 RR2GR55TF

RD RR2GR55TF 642 0 0
GCCACCGACAAACTCAGGTCCTTGGTTAAAAAGTGGTAGACTTTGATCGAGTCTCATGTT
GATGTCAAGACCACTGACAACTACACACTAAGGCTTTTCTGCATTGCCTTCACCAAGAGA
CGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGCTATGCTCAATCCAGCCAGATCCGTCAGATCCGC
AGCAAGATGAGGGAGATCATGATCAAGGAAGCTTCGTCTTGTGACCTCAAGGATCTTGTT
GCCAAGTTTATTCCCGAATCTATTGGGAAGGACATTGAGAAGGCAACTCAGGGAATCTAC
CCTCTTCAGAACGTTTTCATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAAGGCTCCCAAATTCGACCTT
GGAAAGCTCATGGAGGTTCACGGAGACTACACAGCGGAGGATGTCGGTGTGAAGGTTGAC
AGGCCGGCCGATGAGACTGCTGTGGAAGAACCTACTGAGATCATTGGAGCTTAAGAGATG
TTTTCGAATAAATGTTGAATTTGAGCTATCTTTTTCTTTTTCTAAAACGTTAGTTTTCTT
TAATGCTTTGTGCCTTTTTTGACACTCGTTTTGGACCCTCAGCTTCTTTCTTTTTGTTTG
GTGTAAAACTTGAGTTTTGGATAATGCTACATCTTTTTTTCC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2GR55JQ 553 0 0
A
AGGCTTTTCTGCATTGCCTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGCTAT
GCTCAATCCAGCCAGATCCGTCAGATCCGCAGCAAGATGAGGGAGATCATGATCAAGGAA
GCTTCGTCTTGTGACCTCAAGGATCTTGTTGCCAAGTTTATTCCCGAATCTATTGGGAAG
GACATTGAGAAGGCAACTCAGGGAATCTACCCTCTTCAGAACGTTTTCATCCGTAAAGTC
AAGATCCTCAAGGCTCCCAAATTCGCCCTTGGAAAGCTCATGGAGGTTCACGGAGACTAC
ACAGCGGAGGATGTCGGTGTGAAGGTTGACAGGCCGGCCGATGAGACTGCTGTGGAAGAA
CCTACTGAGATCATTGGAGCTTAAGAGATGTTTTCGAATAAATGTTGAATTTGAGCTATC
TTTTTCTTTTTCTAAAACGTTAGTTTTCTTTAATGCTTTGTGCCTTTTTTGACACTCGTT
TTGGACCCTCAGCTTCTTTCTTTT*GTTTGGTGTAAAACTTGAGTTTTGGATAATGCTAC
ATCTTTTTTTCC

QA 2 553 2 553
DS 



CO CL758Contig3 440 2 5 U
CATAAATTATCCAAACTCGCAAGTTCATACTAAATAAAAAGTCATCAATACACCAAAAAG
AAACAGGGGAATCAAACGAGTGTGAATAAAAGATACTAAAAAAGTTTTAAATGAAAAAAT
GATCTCTCAGTTTTGACATTTCTTCTCTCTTAAGCTCCAATAATCTCAGTTGGTTCCTCG
ACAGTCTCATCAACCGGCCTGTCAACCTTCACACCAACATCTTCTGCTGTGTAATCTCCG
TGAACCTCCATGAGCTTTCCAAGGTCGAATTTGGGAGCCTTGAGGATCTTGACTTTACGG
ATGAAGACATTCTGAAGAGGGTAGATGCCCTGAGTTGCCTTCTCAATCTCCTTCCCAATA
GATTCTGGAATAAACTTGGCAACAAGCTCCTTGAGGTCACAGGACGAAGCTTCCTTGATC
ATGATCTCCCTCATCTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E052JQ U 4
AF RR2GV68JQB U 1
BS 1 192 RR2GV68JQB
BS 193 193 RR2E052JQ
BS 194 233 RR2GV68JQB
BS 234 234 RR2E052JQ
BS 235 440 RR2GV68JQB

RD RR2E052JQ 318 0 0
AAATTATCCAAACTC
GCAAGTTCATACTAAATAAAAAGTCATCAATACACCAAAAAGAAACAGGGGAATCAAACG
AGTGTGAATAAAAGATACTAAAAAAGTTTTAGATGAAAAAATGATCTCTCAGTTTTGACA
TTTCTTCTCTCTTAAGCTCCAATAATCTCAGTTGGTTCCTCGACAGTCTCATCAACCGGC
CTGTCAACCTTCACACCAACATCTTCTGCTGTGTAATCTCCGTGAACCTCCATGAGCTTT
CCAAGGTCGAATTTGGGAGCCTTGAGGATCTTGACTTTACGGATGAAGACATTCTGAAGA
GGG

QA 16 318 16 318
DS 

RD RR2GV68JQB 440 0 0
CATAAATTATCCAAACTCGCAAGTTCATACTAAATAAAAAGTCATCAATACACCAAAAAG
AAACAGGGGAATCAAACGAGTGTGAATAAAAGATACTAAAAAAGTTTTAAATGAAAAAAT
GATCTCTCAGTTTTGACATTTCTTCTCTCTTAAGCTCCAATAATCTCAGTTGGTTCCTCG
ACAGTCTCATCAGCCGGCCTGTCAACCTTCACACCAACATCTTCTGCTGTGTAGTCTCCG
TGAACCTCCATGAGCTTTCCAAGGTCGAATTTGGGAGCCTTGAGGATCTTGACTTTACGG
ATGAAGACATTCTGAAGAGGGTAGATGCCCTGAGTTGCCTTCTCAATCTCCTTCCCAATA
GATTCTGGAATAAACTTGGCAACAAGCTCCTTGAGGTCACAGGACGAAGCTTCCTTGATC
ATGATCTCCCTCATCTTGCT

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 8

CO CL759Contig1 919 8 19 U
GGAGACTTTCACATCTCTTCTTTCTCTCTGTCGGATAAACATCACAACCCCAGAAGATAA
AGCATCCACCTTTAGGGCAAATTTCATCATCATCAGAACCATGTCTTACGATTACCTCTT
CAAGTACATCATCATCGGCGACACAGGTGTCGGAAAATCGTGCCTGCTTCTTCAATTTAC
AGACAAGAGGTTCCAACCAGTCCACGATCTCACCATTGGTGTCGAGTTCGGTGCTCGTAT
GGTCACCGTCGATGGACGTCCCTTAAAACTCCAAATTTGGGACACCGCTGGACAAGAGTC
GTTTAGATCCATCACTAGATCGTATTACAGAGGAGCAGCTGGAGCGTTACTTGTTTACGA
CATCACCAGGAGAGAGACGTTTAACCATTTGGCGAGCTGGTTAGAGGATGCTAGGCAACA
TGCTAATCCCAACATGAGTATTATGCTGATTGGGAACAAATGCGATCTTGGTCACAAGAG
AGCTGTTAGCAAAGAGGAAGGAGAACAGTTTGCTAAAGAGCATGGACTCTTGTTCTTAGA
AGCTTCTGCTAGAACTGCTCAAAACGTTGAGGAGGCCTTCATAAAGACAGCAGCAAAGAT
CCTCCAGAACATTCAGGACGGCGTCTTTGATGTATCCAATGAGTCATCTGGGATCAAGGT
TGGCTACGGGCGTCCTCAAGGTGCAGCCGGAGGTAGAGATGGTGCGATCTCTCAAGGAGG
TGGCTGTTGTGGTTAAAAGTCATCTCAAGATTTGTCAAAAGTCACACACATATCTGATGT
AATCTACTGATTCAGTAACTACTCTTTGTTTTTTTTCATTAATCTCTGCAAATGGATAAA
AACAGAATGTATAGTTTCCCTTTCTTCTTTGTCTTTACCAAAAAAAAACTAAACCGGTGC
ATTTGAGAGAAGTCTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 0 0 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC80TF U 1
AF RR2GD47TF U 24
AF RR2AH75TF U 44
AF RR2FY88TF U 50
AF RR2FY88JQ C 650
AF RR2GC80JQ C 120
AF RR2EA87TF U 136
AF RR2EA87JQ C 175
BS 1 50 RR2GC80TF
BS 51 51 RR2GD47TF
BS 52 73 RR2GC80TF
BS 74 74 RR2GD47TF
BS 75 88 RR2GC80TF
BS 89 89 RR2GD47TF
BS 90 92 RR2GC80TF
BS 93 95 RR2GD47TF
BS 96 394 RR2GC80TF
BS 395 395 RR2GD47TF
BS 396 653 RR2GC80TF
BS 654 747 RR2EA87TF
BS 748 748 RR2GC80JQ
BS 749 815 RR2EA87TF
BS 816 816 RR2GC80JQ
BS 817 841 RR2EA87TF
BS 842 842 RR2GC80JQ
BS 843 878 RR2EA87TF
BS 879 919 RR2EA87JQ

RD RR2GC80TF 653 0 0
GGAGACTTTCACATCTCTTCTTTCTCTCTGTCGGATAAACATCACAACCC*AGAAGATAA
AGCATCCACCTTTCGGGCAAATTTCATCGTCA***GAACCATGTCTTACGATTACCTCTT
CAAGTACATCATCATCGGCGACACAGGTGTCGGAAAATCGTGCCTGCTTCTTCAATTTAC
AGACAAGAGGTTCCAACCAGTCCACGATCTCACCATTGGTGTCGAGTTCGGTGCTCGTAT
GGTCACCGTCGATGGACGTCCCTTAAAACTCCAAATTTGGGACACCGCTGGACAAGAGTC
GTTTAGATCCATCACTAGATCGTATTACAGAGGAGCAGCTGGAGCGTTACTTGTTTACGA
CATCACCAGGAGAGAGACGTTTAACCATTTGGCGGGCTGGTTAGAGGATGCTAGGCAACA
TGCTAATCCCAACATGAGTATTATGCTGATTGGGAACAAATGCGATCTTGGTCACAAGAG
AGCTGTTAGCAAAGAGGAAGGAGAACAGTTTGCTAAAGAGCATGGACTCTTGTTCTTAGA
AGCTTCTGCTAGAACTGCTCAAAACGTTGAGGAGGCCTTCATAAAGACAGCAGCAAAGAT
CCTCCAGAACATTCAGGACGGCGTCTTTGATGTATCCAATGAGTCATCTGGGA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2GD47TF 630 0 0
GGATA
TGTCGGATAAACATCACAACCCCAGAAGATAAAGCATCCACCTTTAGGGCAAATTTCATC
ATCATCAGAGCCATGTCTTACGATTACCTCTTCAAGTACATCATCATCGGCGACACAGGT
GTCGGAAAATCGTGCCTGCTTCTGCAATTTACAGACAAGAGGTTCCAACCAGTCCACGAT
CTCACCATTGGTGTCGAGTTCGGTGCTCGTATGGTCACCGTCGATGGACGCCCCTTAAAA
CTCCAAATTTGGGACACCGCTGGACAAGAGTCGTTTAGATCCATCACTAGATCGTACTAC
AGAGGAGCAGCTGGAGCGTTACTTGTTTACGACATCACCAGGAGAGAGACGTTTAACCAT
TTGGCCAGCTGGTTAGAGGATGCTAGGCAACATGCTAATCCCAACATGAGTATTATGCTG
ATTGGGAACAAATGCGATCTTGGTCACAAGAGAGCTGTTAGCAAAGAGGAAGGAGAACAG
TTTGCTAAAGAGCATGGACTCTTGTTCTTAGAAGCTTCTGCTAGAACTGCTCAAAACGTT
GAGGAGGCCTTCATAAAGACAGCAGCAAAGATCCTCCAGAACATTCAGGACGGCGTCTTT
GATGTATCCAATGAGTCATCTGGGA

QA 6 630 6 630
DS 

RD RR2AH75TF 589 0 0
GGAACCCC
AGAAGATAAAGCATCCACCTTTAGGGCAAATTTCATCATCATCAGAGCCATGTCTTACGA
TTACCTCTTCAAGTACATCATCATCGGCGACACAGGTGTCGGAAAATCGTGTCTGCTTCT
TCAATTTACAGACAAGAGGTTCCAACCAGTCCACGATCTCACCATTGGTGTCGAGTTCGG
TGCTCGGATGGTCACCGTCGATGGACGCCCCCTAAAACTCCAAATTTGGGACACCGCTGG
ACAAGAGTCTTTTAGATCCATCACTAGATCGTACTACAGAGGAGCAGCTGGAGCGTTACT
TGTTTACGACATCACCAGGAGAGAGACGTTTAACCATCTGGCGAGCTGGTTAGAGGATGC
TAGGCAACATGCTAATCCCAACATGAGTATTATGTTGATTGGGAACAAATGCGATCTTGG
TCACAAGAGAGCTGTTAGCAAAGAGGAAGGAGAACAGTTTGCTAAAGAGCATGGACTCTT
GTTCTTAGAAGCTTCTGCTAGAACTGCTCAAAACGTCGAGGAGGCCTTCATAAAGACAGC
AGCAAAGATCCTCCAGAACATTCAGGACGGTGTCTTTGATG

QA 9 589 9 589
DS 

RD RR2FY88TF 604 0 0
GG
AGAAGATAAAGCATCCACCTTTCGGGCAAATTTCATCGTCA***GAACCATGTCTTACGA
TTACCTCTTCAAGTACATCATCATCGGCGACACAGGTGTCGGAAAATCGTGCCTGCTTCT
TCAATTTACAGACAAGAGGTTCCAACCAGTCCACGATCTCATCATTGGTGTCGAGTTCGG
TGCTCGTATGGTCACCGTCGATGGACGTCCCTTAAAACTCCAAATTTGGGACACCGCTGG
ACAAGAGTCGTTTAGATCCATCACTAGATCGTATTACAGAGGAGCAGCTGGAGCGTTACT
TGTTTACGACATCACCAGGAGAGAGGCGTTTAACCATTTGGCGAGCTGGTTAGAGGATGC
TAGGCAACATGCTAATCCCAACATGAGTATTATGCTGATTGGGAACAAATGCGATCTTGG
TCACAAGAGAGCTGTTAGCAAAGAGGAAGGAGAACAGTTTGCTAAAGAGCATGGACTCTT
GTTCTTAGAAGCTTCTGCTAGAACTGCTCAAAACGTTGAGGAGGCCTTCATAAAGACAGC
AGCAAAGATCCTCCAGAACATTCAGGACGGCGTCTTTGATGTATCCAATGAGTCATCTGG
GA

QA 3 604 3 604
DS 

RD RR2FY88JQ 129 0 0
GGGATCAAGGTTGGCTACGGGCGTCCACAAGGTGCAGCCGGAGGAAGAGATGGTGCGATC
TCTCAAGGAGGTGGCTGTTGTGGTTAAAAGTCATCTCAAGATTTGTCAAAAGTCACACAC
ATATCTGAT

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR2GC80JQ 747 0 0
TCAAGTACATCATCATCGGCGACACAGGTGTCGGAAAATCGTGCCTGCTTCTTCAATTTA
CAGACAAGAGGTTCCAACCAGTCCACGATCTCACCATTGGTGTCGAGTTCGGTGCTCGTA
TGGTCACCGTCGATGGACGTCCCTTAAAACTCCAAATTTGGGACACCGCTGGACAAGAGT
CGTTTAGATCCATCACTAGATCGTATTACAGAGGAGCAGCTGGAGCGTTACTTGTTTACG
ACATCACCAGGAGAGAGACGTTTAACCATTTGGCGGGCTGGTTAGAGGATGCTAGGCAAC
ATGCTAATCCCAACATGAGTATTATGCTGATTGGGAACAAATGCGATCTTGGTCACAAGA
GAGCTGTTAGCAAAGAGGAAGGAGAACAGTTTGCTAAAGAGCATGGACTCTTGTTCTTAG
AAGCTTCTGCTAGAACTGCTCAAAACGTTGAGGAGGCCTTCATAAAGACAGCAGCAAAGA
TCCTCCAGAACATTCAGGACGGCGTCTTTGATGTATCCAATGAGTCATCTGGGATCAAGG
TTGGCTACGGGCGTCCTCAAGGTGCAGCCGGAGGAAGAGATGGTGCGATCTCTCAAGGAG
GTGGCTGTTGTGGTTAAAAGTCATCTCAAGATTTGTCAAAAGTCACACACATATCTGATG
TAATCTACTGATTCAGTAACTACTCTTTGTTTTTTTTCATTAATCTCTGCAAATGGATAA
AAACAGAATGTATAGTTTCCCTTT
CTC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2EA87TF 751 0 0
G
GGCGACACAGGTGTCGGAAAATCGTGCCTGCTTCTTCAATTTACAGACAAGAGGTTCCAA
CCAGTCCACGATCTCACCATTGGTGTCGAGTTCGGTGCTCGTATGGTCACCGTCGATGGA
CGTCCCTTAAAACTCCAAATTTGGGACACCGCTGGACAAGAGTCGTTTAGATCCATCACT
AGATCGTATTACAGAGGAGCAGCTGGAGCGTTACTTGTTTACGACATCACCAGGAGAGAG
ACGTTTAACCATTTGGCGAGCTGGTTAGAGGATGCTAGGCAACATGCTAATCCCAACATG
AGTATTATGCTGATTGGGAACAGATGCGATCTTGGTCACAAGAGAGCTGTTAGCAAAGAG
GAAGGAGAACAGTTTGCTAAAGAGCATGGACTCTTGTTCTTAGAAGCTTCTGCTAGAACT
GCTCAAAACGTTGAGGAGGCCTTCATAAAGACAGCAGCAAAGATCCTCCAGAACATTCAG
GACGGCGTCTTTGATGTATCCAATGAGTCATCTGGGATCAAGGTTGGCTACGGGCGTCCT
CAAGGTGCAGCCGGAGGTAGAGATGGTGCGATCTCTCAAGGAGGTGGCTGTTGTGGTTAA
AAGTCATCTCACGATTTGTCAAAAGTCACACACATATCTGATGTAATCTACTGATTCAGT
AACTACTCTTTGTTTTTTT*CATTAATCTCTGCAAATGGATAAAA*CAGAATGTATAGTT
TCCCTTTCTTCTTTGTCTTTAC
AAAAAAAA

QA 2 743 2 743
DS 

RD RR2EA87JQ 745 0 0
ATTTACAGACAAGAGGTTCCAACCAGTCCACGATCTCACCATTGGTGTCGAGTTCGGTGC
TCGTATGGTCACCGTCGATGGACGTCCCTTAAAACTCCAAATTTGGGACACCGCTGGACA
AGAGTCGTTTAGATCCATCACTAGATCGTATTACAGAGGAGCAGCTGGAGCGTTACTTGT
TTACGACATCACCAGGAGAGAGACGTTTAACCATTTGGCGAGCTGGTTAGAGGATGCTAG
GCAACATGCTAATCCCAACATGAGTATTATGCTGATTGGGAACAGATGCGATCTTGGTCA
CAAGAGAGCTGTTAGCAAAGAGGAAGGAGAACAGTTTGCTAAAGAGCATGGACTCTTGTT
CTTAGAAGCTTCTGCTAGAACTGCTCAAAACGTTGAGGAGGCCTTCATAAAGACAGCAGC
AAAGATCCTCCAGAACATTCAGGACGGCGTCTTTGATGTATCCAATGAGTCATCTGGGAT
CAAGGTTGGCTACGGGCGTCCTCAAGGTGCAGCCGGAGGTAGAGATGGTGCGATCTCTCA
AGGAGGTGGCTGTTGTGGTTAAAAGTCATCTCAGGATTTGTCAAAAGTCACACACATATC
TGATGTAATCTACTGATTCAGTAACTACTCTTTGTTTTTTTTCATTAATCTCTGCAAATG
GATAAAAACAGAATGTATAGTTTCCCTTTTTTCTTTGTCTTTACCAAAAAAAAACTAAAC
CGGTGCATTTGAGAGAAGTCTCTGC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 2 7

CO CL760Contig1 802 2 6 U
GAATCCGAGAACTCGCCTTCTGCTATCCCAACCTTGTTCCTTCAATGGCGACTTCTTCTC
TATCAACTCTTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAGATTCTCTTTCGG
CAAAGTTATCCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAACGAGACAGTCGTCCC
CACTTCTCTCCTCAACCCCGAGATTTCTCACCGTCATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCG
GAGGCAAAGCCAAGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTCGAGGCCGGGAAAGCAA
CTCCGGCTCCTCCGGTAGGTCCGGCGCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTTCT
GCAAGGACTACAATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCCTGTCGAAATCA
CTGTCTTCGATGATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTTTTGT
TGCTTAAGGCTGCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGGGG
TGATAACAATAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCAGAGAAGCTGCCCGATCTGAACTGCA
CGACCATTGAATCCGCTATGAGAATCATTGCAGGAACTGCAGCTAACATGGGGATCGACA
TAGACCCTCCAGTTCTTGAACCCAAAAAGAAAGCAGTTTTGTTGTAAAAGCCTGCACTGT
AGTTTCTGTGCTTTTGTTTGTTTCTAAATGTAATTTCCGACAAGACACTTGAGAGATCTC
CATTTGAACATTATCTTGCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS54TF U 1
AF RR2AS54JQ C 44
BS 1 633 RR2AS54TF
BS 634 634 RR2AS54JQ
BS 635 762 RR2AS54TF
BS 763 763 RR2AS54JQ
BS 764 780 RR2AS54TF
BS 781 802 RR2AS54JQ

RD RR2AS54TF 780 0 0
GAATCCGAGAACTCGCCTTCTGCTATCCCAACCTTGTTCCTTCAATGGCGACTTCTTCTC
TATCAACTCTTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAGATTCTCTTTCGG
CAAAGTTATCCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAACGAGACAGTCGTCCC
CACTTCTCTCCTCAACCCCGAGATTTCTCACCGTCATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCG
GAGGCAAAGCCAAGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTCGAGGCCGGGAAAGCAA
CTCCGGCTCCTCCGGTAGGTCCGGCGCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTTCT
GCAAGGACTACAATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCCTGTCGAAATCA
CTGTCTTCGATGATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTTTTGT
TGCTTAAGGCTGCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGGGG
TGATAACAATAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCAGAGAAGCTGCCCGATCTGAACTGCA
CGACCATTGAATCCGCTATGAGAATCATTGCAG*AACTGCAGCTAACATGGGGATCGACA
TAGACCCTCCAGTTCTTGAACCCAAAAAGAAAGCAGTTTTGTTGTAAAAGCCTGCACTGT
AGTTTCTGTGCTTTTGTTTGTTTCTAAATGTAATTTCCGACA*GACACTTGAGAGATCTC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2AS54JQ 759 0 0
AATGGCGA
CTTCTTCTCTATCAACTCTTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAGATT
CTCTTTCGGCAAAGTTATCCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAACGAGAC
AGTCGTCCCCACTTCTCTCCTCAACCCCGAGATTTCTCACCGTCATCGCCATGGCTCCAC
CCAAACCCGGAGGCAAAGCCAAGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTCGAGGCCG
GGAAAGCAACTCCGGCTCCTCCGGTAGGTCCGGCGCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTA
TGGCTTTCTGCAAGGACTACAATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCCTG
TCGAAATCACTGTCTTCGATGATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGCTT
CGGTTTTGTTGCTTAAGGCTGCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGATA
AAGTTGGGGTGATAACAATAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCAGAGAAGCTGCCCGATC
TGAACTGCACGACCATTGAATCCGCTATGAGAATCATTGCAGGAACTGCAGCTAACATGG
GGATCGACATAGACCCTCCAGTTCTTGAACCCAAAAAGAAAGCAGTTTTGTTGTAAAAGC
CTGCACTGTAGTTTCTGTGCTTTTGTTTGTTTCTAAATGTAATTTCCGACAAGACACTTG
AGAGATCTCCATTTGAACATTATCTTGCGTC

QA 9 759 9 759
DS 



CO CL760Contig2 820 5 21 U
GGAATCCGAGAACTCGCCTTCTGCTATCACAACCTTACTCCTTCAATGGCTTCTTCTTCT
CTATCAACGCTTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAAATTCTCTTTCG
GCAAAGTTATCCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAAAGAGACAGTCCCCA
CTTCTCTCCTCAACCCCGAGATTCCTCACAGTTATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCGGA
GGCAAAGCCAAGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTTGAGGCCGGGAAAGCAACT
CCGGCTCCTCCGGTAGGTCCGGCGCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTTCTGC
AAGGACTACAATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCCTGTCGAAATCACT
GTCTTCGATGATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTATTGTTG
CTTAAGGCTGCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGGGGTG
ATAACAATAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCAGAGAAGCTGCCCGATCTGAACTGCACG
ACCATTGAATCCGCTATGAGAATCATTGCAGGAACTGCAGCTAACATGGGGATCGACATA
GACCCTCCAGTTCTTGAACCCAAAAAGAAAGCAGTTTTGTTGTAAAAGCCTGCACTGTAG
TTTCTGTGCTTTTGTTTGTTTCTAAATGTAATTTCCAACAAGACACTTGAGAGATCTCCA
TTTGAACATTATCTTGCGTGGTACCAGAGTCTTGGTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2C360TF U 1
AF RR2H326TF U 1
AF RR2C360JQ C 88
AF RR2BJ51JQ C 227
AF RR2BJ51TF U 227
BS 1 45 RR2C360TF
BS 46 46 RR2H326TF
BS 47 630 RR2C360TF
BS 631 631 RR2H326TF
BS 632 632 RR2BJ51TF
BS 633 680 RR2H326TF
BS 681 682 RR2BJ51TF
BS 683 706 RR2H326TF
BS 707 707 RR2BJ51TF
BS 708 745 RR2H326TF
BS 746 746 RR2BJ51TF
BS 747 750 RR2H326TF
BS 751 751 RR2BJ51TF
BS 752 757 RR2H326TF
BS 758 760 RR2BJ51TF
BS 761 785 RR2H326TF
BS 786 786 RR2BJ51TF
BS 787 803 RR2H326TF
BS 804 804 RR2BJ51TF
BS 805 817 RR2H326TF
BS 818 820 RR2BJ51JQ

RD RR2C360TF 630 0 0
GGAATCCGAGAACTCGCCTTCTGCTATCACAACCTTACTCCTTCA*TGGCTTCTTCTTCT
CTATCAACGCTTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAAATTCTCTTTCG
GCAAAGTTATCCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAAAGAGACAGTCCCCA
CTTCTCTCCTCAACCCCGAGATTCCTCACAGTTATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCGGA
GGCAAAGCCAAGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTTGAGGCCGGGAAAGCAACT
CCGGCTCCTCCGGTAGGTCCGGCGCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTTCTGC
AAGGACTACAATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCCTGTCGAAATCACT
GTCTTCGATGATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTATTGTTG
CTTAAGGCTGCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGGGGTG
ATAACAATAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCAGAGAAGCTGCCCGATCTGAACTGCACG
ACCATTGAATCCGCTATGAGAATCATTGCA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2H326TF 817 0 0
GGAATCC
GAGAACTCGCCTTCTGCTATCACAACCTTACTCCTTCAATGGCTTCTTCTTCTCTATCAA
CGCTTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAAATTCTCTTTCGGCAAAGT
TATCCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCGGTTCCTGGGAAAGAGACAGTCCCCACTTCTCT
CCTCAACCCCGAGATTTCTCACAGTTATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCGGAGGCAAAG
CCAAGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTTGAGGCCGGGAAAGCAACTCCGGCTC
CTCCGGTAGGTCCGGCGCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTTCTGCAAGGACT
ACAATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCCTGTCGAAATCACTGTCTTCG
ATGATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTATTGTTGCTTAAGG
CTGCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGGGGTGATAACAA
TAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCAGAGAAGCTGCCCGATCTGAACTGCACGACCATTG
AATCCGCTATGAGAATCATTGCAG*AACTGCAGCTAACATGGGGATCGACATAGACCCTC
CAGTTCTTGAACC**AAAAGAAAGCAGTTTTGTTGTAAA*GCCTGCACTGTAGTTTCTGT
GCTTTTGTTTGTTTCTAA*TGTA*TTTCCA**CAGACACTTGAGAGATCTCCATTTGA*C
ATTATCTTGCGTGGTATCAGAGTCTTGGTG

QA 8 817 8 817
DS 

RD RR2C360JQ 715 0 0
TCTTCTCTTCATCCCAAATCAAATTCTCTTTCGGCAAAGTTATCCTCCAAAGCAAATGTA
TCAGTCCAGTTCCTGGGAAAGAGACAGTCCCCACTTCTCTCCTCAACCCCGAGATTCCTC
ACAGTTATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCGGAGGCAAAGCCAAGAAAGTTGTGGGGCTG
ATAAAACTGGCTCTTGAGGCCGGGAAAGCAACTCCGGCTCCTCCGGTAGGTCCGGCGCTT
GGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTTCTGCAAGGACTACAATGCTAGAACCGCTGAT
AAAGCTGGTTACATCATTCCTGTCGAAATCACTGTCTTCGATGATAAGAGCTTCACCTTT
ATCCTCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTATTGTTGCTTAAGGCTGCAGGTGTTGAGAAGGGA
TCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGGGGTGATAACAATAGACCAGCTTCGCACAATC
GCAGCAGAGAAGCTGCCCGATCTGAACTGCACGACCATTGAATCCGCTATGAGAATCATT
GCAGGAACTGCAGCTAACATGGGGATCGACATAGACCCTCCAGTTCTTGAACCCAAAAAG
AAAGCAGTTTTGTTGTAAAAGCCTGCACTGTAGTTTCTGTGCTTTTGTTTGTTTCTAAAT
GTAATTTCCAACAAGACACTTGAGAGATCTCCATTTGAACATTATCTTGCGTGGT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2BJ51JQ 594 0 0
G
ACCCAAACCCGGAGGCAAAGCCAAGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTTGAGGC
CGGGAAAGCAACTCCGGCTCCTCCGGTAGGTCCGGCGCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACAT
TATGGCTTTCTGCAAGAACTACAATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCC
TGTCGAAATCACTGTCTTCGATGATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGC
TTCGGTATTGTTGCTTAAGGCTGCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGA
TAAAGTTGGGGTGATAACAATAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCAGAGAAGCTGCCCGA
TCTGAACTGCACGACCATTGAATCCGCTATGAGAATCATTGCAGGAACTGCAGCTAACAT
GGGGATCGACATAGACCCTCCAGTTCTTGAACCCAAAAAGAAAGCAGTTTTGTTGTAAAA
GCCTGCACTGTAGTTTCTGTGCTTTTGTTTGTTTCTAAATGTAATTTCCAACAAGACACT
TGAGAGATCTCCATTTGAACATTATCTTGCGTGGTACCAGAGTCTTGGTGTGC

QA 2 594 2 594
DS 

RD RR2BJ51TF 594 0 0
G
ACCCAAACCCGGAGGCAAAGCCAAGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTTGAGGC
CGGGAAAGCAACTCCGGCTCCTCCGGTAGGTCCGGCGCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACAT
TATGGCTTTCTGCAAGAACTACAATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCC
TGTCGAAATCACTGTCTTCGATGATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGC
TTCGGTATTGTTGCTTAAGGCTGCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGA
TAAAGTTGGGGTGATAACAATAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCAGAGAAGCTGCCCGA
TCTGAACTGCACGACCATTGAATCCGCTATGAGAATCATTGCAGGAACTGCAGCTAACAT
GGGGATCGACATAGACCCTCCAGTTCTTGAACCCAAAAAGAAAGCAGTTTTGTTGTAAAA
GCCTGCACTGTAGTTTCTGTGCTTTTGTTTGTTTCTAAATGTAATTTCCAACAAGACACT
TGAGAGATCTCCATTTGAACATTATCTTGCGTGGTACCAGAGTCTTGGTG
TGC

QA 2 591 2 591
DS 



AS 2 9

CO CL761Contig1 750 3 12 U
GGGAATGTGAAACGTGATCCAGAAGTTCATTTGTTAGGTAATTGACAAAGGCCATTCTAA
AACACATTGGAGAGAACACATAGAATGGAAAAACTTTTGAAACATGATTCTTGTTTTCAT
CTGTTCTTTTAACATCTACAAAAAGGAAGTAGTTGGATTAAAACAAAAACTTGAATCAAC
GTGAGCTGGGAAAGCCGAGCTTCTTGGGCTTAGTTAAAGATTTGCAGAAAGAAGAGAAAG
CTCCTTTGATCTCTTCATGGATGGGGAGAGCCAAAGAGAGTGGTAAATCATCTCTGAAAC
TTCTGGTTTGATCATCATGTCTCAAGTAGACAGAGTGAGCTAAAGCTGTTTCCCTTTTGT
TAAGTCCTTCGAGGATGAAAGAAAAGGCACCAAAAGTGACACAGCTTTGTAGCATTGCTT
GTGGTGCACCGGGGTAACTAAGAGCAAGGCCAGTGCAGCATCCAGCAATTCCAACGTTAA
TGGCATCATCTTTCCCTCGCAGTTTCTTGAGAAGACAAACAACCAAACTGTGCACTCCAG
ATAAAATTGCAAAATTCTTTGCAGACTGACCCGCATCAGCAAATGATCCCTTAAATCCTT
TCTTCTTAAACAATCCAGAACCATATCCGAATATAGAGCCCATGACGGCGCCGCCAGCAG
CATCTCCGGCGAAACGGCCGAGACAAACGGCGGTAGAAGGGAGTGTCAGTGCGTTGGAAG
AGTCTTGATTGGTCAAATCATTAGCGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU60JQ U 1
AF RR2DA30JQ U 69
AF RR2BW78JQ U 99
BS 1 113 RR2BU60JQ
BS 114 114 RR2DA30JQ
BS 115 259 RR2BU60JQ
BS 260 260 RR2DA30JQ
BS 261 279 RR2BU60JQ
BS 280 280 RR2DA30JQ
BS 281 326 RR2BU60JQ
BS 327 327 RR2DA30JQ
BS 328 550 RR2BU60JQ
BS 551 551 RR2DA30JQ
BS 552 742 RR2BU60JQ
BS 743 750 RR2BW78JQ

RD RR2BU60JQ 742 0 0
GGGAATGTGAAACGTGATCCAGAAGTTCATTTGTTAGGTAATTGACAAAGGCCATTCTAA
AACACATTGGAGAGAACACATAGAATGGAAAAACTTTTGAAACATGATTCTTGGTTTCAT
CTGTTCTTTTAACATCTACAAAAAGGAAGTAGTTGGATTAAAACAAAAACTTGAATCAAC
GTGAGCTGGGAAAGCCGAGCTTCTTGGGCTTAGTTAAAGATTTGCAGAAAGAAGAGAAAG
CTCCTTTGATCTCTTCATGAATGGGGAGAGCCAAAGAGAATGGTAAATCATCTCTGAAAC
TTCTGGTTTGATCATCATGTCTCAAGCAGACAGAGTGAGCTAAAGCTGTTTCCCTTTTGT
TAAGTCCTTCGAGGATGAAAGAAAAGGCACCAAAAGTGACACAGCTTTGTAGCATTGCTT
GTGGTGCACCGGGGTAACTAAGAGCAAGGCCAGTGCAGCATCCAGCAATTCCAACGTTAA
TGGCATCATCTTTCCCTCGCAGTTTCTTGAGAAGACAAACAACCAAACTGTGCACTCCAG
ATAAAATTGCGAAATTCTTTGCAGACTGACCCGCATCAGCAAATGATCCCTTAAATCCTT
TCTTCTTAAACAATCCAGAACCATATCCGAATATAGAGCCCATGACGGCGCCGCCAGCAG
CATCTCCGGCGAAACGGCCGAGACAAACGGCGGTAGAAGGGAGTGTCAGTGCGTTGGAAG
AGTCTTGATTGGTCAAATCATT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2DA30JQ 674 0 0
GGAGAGAACACATAGAATGGAAAAACTTTTGAAACATGATTCTTGTTTTCATCTGTTCTT
TTAACATCTACAAAAAGGAAGTAGTTGGATTAAAACAAAAACTTGAATCAACGTGAGCTG
GGAAAGCCGAGCTTCTTGGGCTTAGTTAAAGATTTGCAGAAAGAAGAGAAAGCTCCTTTG
ATCTCTTCATGGATGGGGAGAGCCAAAGAGAGTGGTAAATCATCTCTGAAACTTCTGGTT
TGATCATCATGTCTCAAGTAGACAGAGTGAGCTAAAGCTGTTTCCCTTTTGTTAAGTCCT
TCGAGGATGAAAGAAAAGGCACCAAAAGTGACACAGCTTTGTAGCATTGCTTGTGGTGCA
CCGGGGTAACTAAGAGCAAGGCCAGTGCAGCATCCAGCAATTCCAACGTTAATGGCATCA
TCTTTCCCTCGCAGTTTCTTGAGAAGACAAACAACCAAACTGTGCACTCCAGATAAAATT
GCAAAATTCTTTGCAGACTGACCCGCATCAGCAAATGATCCCTTAAATCCTTTCTTCTTA
AACAATCCAGAACCATATCCGAATATAGAGCCCATGACGGCGCCGCCAGCAGCATCTCCG
GCGAAACGGCCGAGACAAACGGCGGTAGAAGGGAGTGTCAGTGCGTTGGAAGAGTCTTGA
TTGATCAAATCATT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2BW78JQ 652 0 0
GAAACAT
GATTCTTGTTTTCATCTGTTCTTTTAACATCTACAAAAAGGAAGTAGTTGGATTAAAACA
AAAACTTGAATCAACGTGAGCTGGGAAAGCCGAGCTTCTTGGGCTTAGTTAAAGATTTGC
AGAAAGAAGAGAAAGCTCCTTTGATCTCTTCATGGATGGGGAGAGTCAAAGAGAGTGGTA
AATCATCTCTGAGACTTCTGGTTTGATCATCATGTCTCAAGTAGACAGAGTGAGCTAAAG
CTGTTTCCCTTTTGTTAAGTCCTTCGAGGATGAAAGAAAAGGCACCAAAAGTGACACAGC
TTTGTAGCATTGCTTGTGGTGCACCGGGGTAACTAAGAGCAAGGCCAGTGCAGCATCCAG
CAATTCCAACGTTAATGGCATCATCTTTCCCTCGCAGTTTCTTGAGAAGACAAACAACCA
AACTGTGCACTCCAGATAAAATTGCAAAATTCTTTGCAGACTGACCCGCATCAGCAAATG
ATCCCTTAAATCCTTTCTTCTTAAACAATCCAGAACCATATCCGAATATAGAGCCCATGA
CGGCGCCGCCAGCAGCATCTCCGGCGAAACGGCCGAGACAAACGGCGGTAGAAGGGAGTG
TCAGTGCGTTGGAAGAGTCTTGATTGGTCAAATCATTAGCGTTTG

QA 8 652 8 652
DS 



CO CL761Contig2 834 6 34 U
GGAGAACAAAATTTGGAAGATTAGGTAGAAAGAAAGCGAAGGAAACAAACCGTATCTTCA
GGCTTCAGCTTCAGCTATGGCGGCCGAGAATCCTCCTTCAAGCGCTGTAGATTTCGACAC
GAGTCTCGATTCCGGTTCAAACCACAACCCAAACGCTAATGATTTGACCAATCAAGACTC
TTCCAACGCACTGACACTCCCTTCTACCGCCGTTTGTCTCGGCCGTTTCGCCGGAGATGC
TGCTGGCGGCGCCGTCATGGGCTCTATATTCGGCTATGGTTCTGGATTGTTTAAGAAGAA
AGGATTTAAGGGATCATTTGCTGATGCGGGTCAGTCTGCAAAGAATTTTGCAATTTTATC
TGGAGTGCACAGTTTGGTTGTTTGTCTTCTGAAGAAACTGCGAGGGAAAGATGATGCCAT
TAACGTTGGAATTGCTGGATGCTGCACTGGCCTTGCTCTTAGTTACCCCGGTGCACCACA
AGCAATGCTACAAAGCTGTGTCACTTTTGGTGCCTTTTCTTTCATCCTCGAAGGACTCAA
CAAAAGGCAAACAGCTTTAGCTCAATCTGTCTACTTGAGACATGATGATCAAACCAGAAG
TCTCAGAGATGATTTACCACTCTCTTTGGCTCTCCCCATCCATGAAGACATCAAAGGAGC
TTTCTCTTCTTTCTGCAAATCTTTAACCAAACCCAAGAAGGTCGCCTTTCCCAGCTCACG
TTGATTCAAGTTTTTTTTAATCCAACTAC***CTTTTTGTAGATGTTAAAAGAACAGATG
AAAACAAGAATCTATGTTTCAAAAGTTTTCCATCCAATGTCTTTTAAAATGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 25 5 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 35 35 35 15 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU60TF U 21
AF RR2DA30TF U 1
AF RR2BW78TF U 36
AF RR2E349TF U 50
AF RR2F783TF U 51
AF RR2F783JQ C 222
BS 1 167 RR2DA30TF
BS 168 168 RR2BU60TF
BS 169 273 RR2DA30TF
BS 274 274 RR2E349TF
BS 275 390 RR2DA30TF
BS 391 391 RR2E349TF
BS 392 537 RR2DA30TF
BS 538 538 RR2E349TF
BS 539 547 RR2DA30TF
BS 548 548 RR2E349TF
BS 549 564 RR2DA30TF
BS 565 565 RR2E349TF
BS 566 648 RR2DA30TF
BS 649 649 RR2E349TF
BS 650 687 RR2DA30TF
BS 688 688 RR2E349TF
BS 689 690 RR2DA30TF
BS 691 691 RR2E349TF
BS 692 700 RR2DA30TF
BS 701 701 RR2E349TF
BS 702 704 RR2DA30TF
BS 705 705 RR2E349TF
BS 706 734 RR2DA30TF
BS 735 735 RR2E349TF
BS 736 749 RR2DA30TF
BS 750 752 RR2E349TF
BS 753 770 RR2DA30TF
BS 771 771 RR2E349TF
BS 772 784 RR2DA30TF
BS 785 792 RR2E349TF
BS 793 803 RR2F783TF
BS 804 804 RR2F783JQ
BS 805 828 RR2F783TF
BS 829 834 RR2F783JQ

RD RR2BU60TF 717 0 0
GG
AGGTAGAAAGAAAGCGAAGGAAACAAACCGTATCTTCAGGCTTCAGCTTCAGCTATGGCG
GCCGAGAATCCTCCTTCAAGCGCTGTAGATTTCGACACGAGTCTCGATTCCGGTTCAAAC
CACAACCCAAACGCTAATGATTTGACCAATCAAGACTCTTCCAACGCACTGACACTCCCT
TCTACCGCCGTTTGTCTCGGCCGTTTCGCCGGAGATGCTGCTGGCGGCGCCGTCATGGGC
TCTATATTCGGATATGGTTCTGGATTGTTTAAGAAGAAAGGATTTAAGGGATCATTTGCT
GATGCGGGTCAGTCTGCAAAGAATTTCGCAATTTTATCTGGAGTGCACAGTTTGGTTGTT
TGTCTTCTCAAGAAACTGCGAGGGAAAGATGATGCCATTAACGTTGGAATTGCTGGATGC
TGCACTGGCCTTGCTCTTAGTTACCCCGGTGCACCACAAGCAATGCTACAAAGCTGTGTC
ACTTTTGGTGCCTTTTCTTTCATCCTCGAAGGACTTAACAAAAGGGAAACAGCTTTAGCT
CACTCTGTCTGCTTGAGACATGATGATCAAACCAGAAGTCTCAGAGATGATTTACCATTC
TCTTTGGCTCTCCCCATTCATGAAGAGATCAAAGGAGCTTTCTCTTCTTTCTGCAAATCT
TTAACTAAGCCCAAGAAGCTCGGCTTTCCCAGCTCACGTTGATTCAAGTTTT
GTT

QA 3 714 3 714
DS 

RD RR2DA30TF 786 0 0
GGAGAACAAAATTTGGAAGATTAGGTAGAAAGAAAGCGAAGGAAACAAACCGTATCTTCA
GGCTTCAGCTTCAGCTATGGCGGCCGAGAATCCTCCTTCAAGCGCTGTAGATTTCGACAC
GAGTCTCGATTCCGGTTCAAACCACAACCCAAACGCTAATGATTTGATCAATCAAGACTC
TTCCAACGCACTGACACTCCCTTCTACCGCCGTTTGTCTCGGCCGTTTCGCCGGAGATGC
TGCTGGCGGCGCCGTCATGGGCTCTATATTCGGATATGGTTCTGGATTGTTTAAGAAGAA
AGGATTTAAGGGATCATTTGCTGATGCGGGTCAGTCTGCAAAGAATTTTGCAATTTTATC
TGGAGTGCACAGTTTGGTTGTTTGTCTTCTCAAGAAACTGCGAGGGAAAGATGATGCCAT
TAACGTTGGAATTGCTGGATGCTGCACTGGCCTTGCTCTTAGTTACCCCGGTGCACCACA
AGCAATGCTACAAAGCTGTGTCACTTTTGGTGCCTTTTCTTTCATCCTCGAAGGACTTAA
CAAAAGGGAAACAGCTTTAGCTCACTCTGTCTACTTGAGACATGATGATCAAACCAGAAG
TCTCAGAGATGATTTACCACTCTCTTTGGCTCTCCCCATCCATGAAGAGATCAAAGGAGC
TTTCTCTTCTTTCTGCAAATCTTTAACTAAGCCCAAGAAGCTCGGCTTTCCCAGCTCACG
TTGATTCAAGTTTTGTTTAATCCAACTACTTCCTTTTTGTAGATGTTAAA*GAACAGATG
AAAA
AA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2BW78TF 749 0 0
GG
GAAGGAAACAAACCGTATCTTCAGGCTTCAGCTTCAGCTATGGCGGC*GAGAATCCTCCT
TCAAGCGCTGTAGATTTCGACACGAGTCTCGATTCCGGTTCAAACCACAACCCAAACGCT
AATGATTTGACCAATCAAGACTCTTCCAACGCACTGACACTCCCTTCTACCGCCGTTTGT
CTCGGCCGTTTCGCCGGAGATGCTGCTGGCGGCGCCGTCATGGGCTCTATATTCGGATAT
GGTTCTGGATTGTTTAAGAAGAAAGGATTTAAGGGATCATTTGCTGATGCGGGTCAGTCT
GCAAAGAATTTTGCAATTTTATCTGGAGTGCACAGTTTGGTTGTTTGTCTTCTCAAGAAA
CTGCGAGGGAAAGATGATGCCATTAACGTTGGAATTGCTGGATGCTGCACTGGCCTTGCT
CTTAGTTACCCCGGTGCACCACAAGCAATGCTACAAAGCTGTGTCACTTTTGGTGCCTTT
TCTTTCATCCTCGAAGGACTTAACAAAAGGGAAACAGCTTTAGCTCACTCTGTCTACTTG
AGACATGATGATCAAACCAGAAGTCTCAGAGATGATTTACCACTCTCTTTGACTCTCCCC
ATCCATGAAGAGATCAAAGGAGCTTTCTCTTCTTTCTGCAAATCTTTAACTAAGCCCAAG
AAGCTCGGCTTTCCCAGCTCACGTTGATTCAAGTTTTGTTTAATCCAACTACTTC*TTTT
TGTAGATGTAAAA*GAACAGATGAAA
C

QA 3 748 3 748
DS 

RD RR2E349TF 749 0 0
GG
GTATCTCCAGCCTTCAGCTTCAGCTATGGCGGCCGAGAATCCTCCTTCAAGCGCTGTAGA
CTTCGACACGAGTCTCGATTCCGGTTCAAACCATAACCCAAACGCTAATGATTTGACCAA
TCAAGACTATTCAAACGCACTGACACTCCCTTCTACCGCCGTTTGTCTCGGCCGTTTCGC
CGGAGATGCTGCTGGCGGCGCCGTCATGGGCTCTATATTCGGCTATGGTTCTGGATTGTT
TAAGAAGAAAGGATTTAAGGGATCATTTGCTGATGCGGGTCAGTCTGCAAAGAATTTTGC
AATTTTATCTGGAGTGCACAGTTTGGTTGTTTGTCTTCTGAAGAAACTGCGAGGGAAAGA
TGATGCCATTAACGTTGGAATTGCTGGATGCTGCACTGGCCTTGCTCTTAGTTACCCCGG
TGCACCACAAGCAATGCTACAAAGCTGTGTCACTTTTGGTGCCTTTTCTTTCATCCTCGA
AGGACTCAACAAAAGGCAAACAGCTTTAGCTCAATCTGTCTACTTGAGACATGATGATCA
AACCAGAAGTCTCAGAGATGATTTACCACTCTCTTTGGCTCTCCCCATCCATGAAGACAT
CAAAGGAGCTTTCTCTTCTTTCTGCAAATCTTTAACCAAACCCAAGAAGGTCGCCTTTCC
CAGCTCACGTTGATTCAAGTTTTTTTTA*TCCAACTAC***CTTTTTGTAGATGTTAAAA
GAACAGATGAAAACAAGAATC
TATGTT

QA 3 743 3 743
DS 

RD RR2F783TF 783 0 0
G
GTATCTCCAGCCTTCAGCTTCAGCTATGGCGGCCGAGAATCCTCCTTCAAGCGCTGTAGA
CTTCGACACGAGTCTCGATTCCGGTTCAAACCATAACCCAAACGCTAATGATTTGACCAA
TCAAGACTATTCAAACGCACTGACACTCCCTTCTACCGCCGTTTGTCTCGGCCGTTTCGC
CGGAGATGCTGCTGGCGGCGCCGTCATGGGCTCTATATTCGGCTATGGTTCTGGATTGTT
TAAGAAGAAAGGATTTAAGGGATCATTTGCTGATGCGGGTCAGTCTGCAAAGAATTTTGC
AATTTTATCTGGAGTGCACAGTTTGGTTGTTTGTCTTCTGAAGAAACTGCGAGGGAAAGA
TGATGCCATTAACGTTGGAATTGCTGGATGCTGCACTGGCCTTGCTCTTAGTTACCCCGG
TGCACCACAAGCAATGCTACAAAGCTGTGTCACTTTTGGTGCCTTTTCTTTCATCCTCGA
AGGACTCAACAAAAGGCAAACAGCTTTAGCTCAATCTGTCTACTTGAGACATGATGATCA
AACCAGAAGTCTCAGAGATGATTTACCACTCTCTTTGGCTCTCCCCATCCATGAAGACAT
CAAAGGAGCTTTCTCTTCTTTCTGCAAATCTTTAACCAAACCCAAGAAAGTCGCCTTTCC
CAGCTCACGTTGATTCAAGTTTTTTTTA*TCCAACTAC***CTTTTTGTAGATGTTAAA*
GAACAGATGAAAACAAGAATCTATGTTTCAAA*GTTTTCCATCCAATGTCTTTTAAA
TGACC

QA 2 778 2 778
DS 

RD RR2F783JQ 613 0 0
GCCGTTTCGCCGGAGATGCTGCTGGCGGCGCCGTCATGGGCTCTATATTCGGCTATGGTT
CTGGATTGTTTAAGAAGAAAGGATTTAAGGGATCATTTGCTGATGCGGGTCAGTCTGCAA
AGAATTTTGCAATTTTATCTGGAGTGCACAGTTTGGTTGTTTGTCTTCTGAAGAAACTGC
GAGGGAAAGATGATGCCATTAACGTTGGAATTGCTGGATGCTGCACTGGCCTTGCTCTTA
GTTACCCCGGTGCACCACAAGCAATGCTACAAAGCTGTGTCACTTTTGGTGCCTTTTCTT
TCATCCTCGAAGGACTCAACAAAAGGCAAACAGCTTTAGCTCAATCTGTCTACTTGAGAC
ATGATGATCAAACCAGAAGTTTCAGAGATGATTTACCACTCTCTTTGGCTCTCCCCATCC
ATGAAGACATCAAAGGAGCTTTTTCTTCTTTCTGCAAATCTTTAACCAAACCCAAGAAGG
TCGCCTTTCCCAGCTCACGTTGATTCAAGTTTTTTTTTATCCAACTAC***CTTTTTGTA
GATGTTAAAAGAACAGATGAAAACAAGAATCTATGTTTCAAAAGTTTTCCATCCAATGTC
TTTTAAAATGACC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 9

CO CL762Contig1 624 9 32 U
GGGACACAACAAAACTCAAAACACACATTATCTTCATTGAGTTCTCTCATATTATAATCA
TCTCGAGAAATATGGCGATTTCAAAAGCCCTTATTGCTTCTCTTCTCATAT***CACTTA
TTGTTCTCCAACTCGTCCAGGCCGATGTGGAAAATTCAAACAAAAAGAA*GGGTTACGGC
AGTAAAATTGATTGTGGAAGTGCTTGTGTAGCAAGGTGCAGGCTCTCAAGTAGACCTAAC
CTTTGCCACAGAGCCTGCGGGACTTGTTGCGCAAGATGCAACTGTGTGCCACCTGGTACA
TATGGAAACTATGACAAGTGTGAGTGCTACGCTACCCTCACCACCCACGGTGGTCGCCGC
AAGTGCCCTTAAGTAAATTTAACACTCTCAAATTGCTGCGGATGTTGAATTTCGATACTA
TGTCGTTTTACTTGTTAGTACTTGTTTGCATATATTTGTATGTGGATCGAATAAGTCATG
AGAACCGTACGGCGTCTTTGTGTGTGGTGCTGTTT**TATTAATTGGTCTATTTGTTGCA
AGTTTTTT*GGTTTTTCATTTGTTGCGTGAAATAATCCCCTTGTATTATTTCGTTTTCTA
AATAAAGTTATGTTGCTTTTATAT


BQ
10 40 40 40 40 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 40 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 30 30 30 10 10 

AF RR2FG82JQ C 1
AF RR2F067JQ C 101
AF RR2BB37JQ C 2
AF RR2A527TF U 4
AF RR2AB77TF U 6
AF RR2G932TF U 2
AF RR2BB37TF U 2
AF RR2F067TF U 2
AF RR2FG82TF U 1
BS 1 1 RR2FG82JQ
BS 2 5 RR2G932TF
BS 6 154 RR2A527TF
BS 155 155 RR2G932TF
BS 156 166 RR2A527TF
BS 167 167 RR2AB77TF
BS 168 169 RR2A527TF
BS 170 170 RR2AB77TF
BS 171 196 RR2A527TF
BS 197 197 RR2AB77TF
BS 198 227 RR2A527TF
BS 228 228 RR2AB77TF
BS 229 274 RR2A527TF
BS 275 275 RR2AB77TF
BS 276 299 RR2A527TF
BS 300 300 RR2G932TF
BS 301 308 RR2A527TF
BS 309 309 RR2AB77TF
BS 310 355 RR2A527TF
BS 356 356 RR2AB77TF
BS 357 440 RR2A527TF
BS 441 441 RR2AB77TF
BS 442 515 RR2A527TF
BS 516 517 RR2AB77TF
BS 518 524 RR2A527TF
BS 525 525 RR2AB77TF
BS 526 548 RR2A527TF
BS 549 549 RR2AB77TF
BS 550 618 RR2A527TF
BS 619 619 RR2G932TF
BS 620 622 RR2F067TF
BS 623 624 RR2FG82JQ

RD RR2FG82JQ 624 0 0
GGGACACAACAAAACTCAAAACACACATTATCTTCATTGAGTTCTCTCATATTATAATCA
TCTCGAGAAATATGGCGATTTCAAAAGCCCTTATTGCTTCTCTTCTCATAT***CACTTA
TTGTTCTCCAACTCGTCCAGGCCGATGTGGAAAATTCAAACAAAAAGAA*GGGTTACGGC
AGTAAAATTGATTGTGGAAGTGCTTGTGTAGCAAGGTGCAGGCTCTCAAGTAGACCTAAC
CTTTGCCACAGAGCCTGCGGGACTTGTTGCGCAAGATGCAACTGTGTGCCACCTGGTACA
TATGGAAACTATGACAAGTGTGAGTGCTACGCTACCCTCACCACCCACGGTGGTCGCCGC
AAGTGCCCTTAAGTAAATTTAACACTCTCAAATTGCTGCGGATGTTGAATTTCGATACTA
TGTCGTTTTACTTGTTAGTACTTGTTTGCATATATTTGTATGTGGATCGAATAAGTCATG
AGAACCGTACGGCGTCTTTGTGTGTGGTGCTGTTT**TATTAATTGGTCTATTTGT*GCA
AGTTTTTT*GGTTTTTCATTTGTTGCGTGAAATAATCCCCTTGTATTATTTCGTTTTCTA
AATAAAGTTATGTTGCTTTTATAT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2F067JQ 522 0 0
TCTTCTCATAT***CACTTATTGTTCTCCAACTCGTCCAGGCCGATGTGGAAAATTCAAA
CAAAAAGAA*GGGTTACGGCAGTAAAATTGATTGTGGAAGTGCTTGTGTAGCAAGGTGCA
GGCTCTCAAGTAGACCTAACCTTTGCCACAGAGCCTGCGGGACTTGTTGCGCAAGATGCA
ACTGTGTGCCACCTGGTACATATGGAAACTATGACAAGTGTGAGTGCTACGCTACCCTCC
CCACCCACGGTGGTCGCCGCAAGTGCCCTTAAGTAAATTTAACACTCTCAAATTGCTGCG
GATGTTGAATTTCGATACTATGTCGTTTTGCTTGTTAGTACTTGTTTGCATATATTTGTA
TGTGGATCGAATAAGTCATGAGAACCGTACGGCGTCTTTGTGTGTGGTGCTGTTT**TAT
TAATTGGTCTATTTGTTGCAAGTTTTTT*GGTTTTTCATTTGTTGCGTGAAATAATCCCC
TTGTATTATTTCGTTTTTTAAATAAAGTTATGTTGCTTTTAT

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2BB37JQ 619 0 0
GGACACAACAAAACTCAAAACACACATTATCTTCATTGAGTTCTCTCATATTATAATCAT
CTCGAGAAATATGGCGATTTCAAAAGCCCTTATTGCTTCTCTTCTCATAT***CACTTAT
TGTTCTCCAACTCGTCCAGGCCGATGTGGAAAATTCAAACAAAAAGAA*GGGTTACGGCA
GTAAAATTGATTGTGGAAGTGCTTGTGTAGCAAGGTGCAGGCTCTCAAGTAGACCTAACC
TTTGCCACAGAGCCTGCGGGACTTGTTGCGCAAGATGCAACTGTGTGCCACCTGGTACAT
ATGGAAACTATGACAAGTGTGAGTGTTACGCTACCCTCACCACCCACGGTGGTCGCCGCA
AGTGCCCTTAAGTAAATTTAACACTCTCAAATTGCTGCGGATGTTGAATTTCGATACTAT
GTCGTTTTACTTGTTAGTACTTGTTTGCATATATTTGTATGTGGATCGAATAAGTCATGA
GAACCGTACGGCGTCTTTGTGTGTGGTGCTGTTT**TATTAATTGGTCTATTTGTTGCAA
GTTTTTT*GGTTTTTCATTTGTTGCGTGAAATAATCCCCTTGTATTATTTCGTTTTCTAA
ATAAAGTTATGTTGCTTT
C

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2A527TF 615 0 0
GG
ACAACAAAACTCAAAACACACATTATCTTCATTGAGTTCTCTCATATTATAATCATCTCG
AGAAATATGGCGATTTCAAAAGCCCTTATTGCTTCTCTTCTCATAT***CACTTATTGTT
CTCCAACTCGTCCAGGCCGATGTGGAAAACTCAAACAAAAAAAAAGGGTTACGGCAGTAA
AATTGATTGTGAAAGTGCTTGTGTAGCAAGGTGCAGGCTCTCGAGTAGACCTAACCTTTG
CCACAGAGCCTGCGGGACTTGTTGCGCAAAATGCAACTGTGTGCCACCTGGTACCTATGG
AAATTATGACAAGTGTGAGTGCTACGCTACCCTCACCACCCACGGTGGTCACCGCAAGTG
CCCTTAAGTAAATTTAACACTCTCAAATTGCTGCGGATGTTGAATTTCGATACTATGTCG
TTTTACTTGTTAGTATTTGTTTGCATATATTTGTATGTGGATCGAATAAGTCATGAGAAC
CGTACGGCGTCTTTGTGTGTGGTGCTGTTTTTTATTAATGGGTCTATTTGTTGCAAGTTT
TTTTGGTTTTTCATTTGTTGCGTGAAATAATCCCCTTGTATTATTTCGTTTTCTAAATAA
AGTTATGTTGCTT

QA 3 615 3 615
DS 

RD RR2AB77TF 613 0 0
GG
AACAAAACTCAAAACACACATTATCTTCATTGAGTTCTCTCATATTATAATCATCTCGAG
AAATATGGCGATTTCAAAAGCCCTTATTGCTTCTCTTCTCATATTATCACTTATTGTTCT
CCAACTCGTCCAGGCCGATGTGGAAAACTCAAACAAAAAGAA*AGGTTACGGCAGTAAAA
TTGATTGTGGAAGTGCTTGTGTAGCAAGGTGCAGGCTCTCAAGTAGACCTAACCTTTGCC
ACAGAGCCTGCGGGACTTGTTGCGCAAGATGCAACTGTGTGCCACCTGGTACGTATGGAA
ACTACGACAAGTGTGAGTGCTACGCTACCCTCACCACCCACGGTGGTCGCCGCAAGTGCC
CTTAAGTAAATTTAACACTCTCAAATTGCTGCGGATGTTAAATTTCGATACTATGTCGTT
T*ACTTGTTAGTACTTGTTTGCATATATTTGTATGTGGATCGAATAAGTCATGAGAACCG
TACGGCGTCTTTGTGTGTGGTGCTGTTT**TATTAATTGGTCTATTTGTTGCAAGTTTTT
T*GATTTTTCATTTGTTGCGTGAAATAATCCCCTTGTATTATTTCGTTTTCTAAATAAAG
TTATGTTGCTT

QA 3 613 3 613
DS 

RD RR2G932TF 618 0 0
GGACACAACAAAACTCAAAACACACATTATCTTCATTGAGTTCTCTCATATTATAATCAT
CTCGAGAAATATGGCGATTTCAAAAGCCCTTATTGCTTCTCTTCTCATAT***CACTTAT
TGTTCTCCAACTCGTCCAGGCCGATGTGGAAAATCCAAACAAAAAGAA*GGGTTACGGCA
GTAAAATTGATTGTGGAAGTGCTTGTGTAGCAAGGTGCAGGCTCTCAAGTAGACCTAACC
TTTGCCACAGAGCCTGCGGGACTTGTTGCGCAAGATGCAACTGTGTGCCACCTGGTACAT
ATGGAAACTATGACATGTGTGAGTGTTACGCTACCCTCACCACCCACGGTGGTCGCCGCA
AGTGCCCTTAAGTAAATTTAACACTCTCAAATTGCTGCGGATGTTGAATTTCGATACTAT
GTCGTTTTACTTGTTAGTACTTGTTTGCATATATTTGTATGTGGATCGAATAAGTCATGA
GAACCGTACGGCGTCTTTGTGTGTGGTGCTGTTT**TATTAATTGGTCTATTTGTTGCAA
GTTTTTT*GGTTTTTCATTTGTTGCGTGAAATAATCCCCTTGTATTATTTCGTTTTCTAA
ATAAAGTTATGTTGCTTT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2BB37TF 619 0 0
GGACACAACAAAACTCAAAACACACATTATCTTCATTGAGTTCTCTCATATTATAATCAT
CTCGAGAAATATGGCGATTTCAAAAGCCCTTATTGCTTCTCTTCTCATAT***CACTTAT
TGTTCTCCAACTCGTCCAGGCCGATGTGGAAAATTCAAACAAAAAGAA*GGGTTACGGCA
GTAAAATTGATTGTGGAAGTGCTTGTGTAGCAAGGTGCAGGCTCTCAAGTAGACCTAACC
TTTGCCACAGAGCCTGCGGGACTTGTTGCGCAAGATGCAACTGTGTGCCACCTGGTACAT
ATGGAAACTATGACAAGTGTGAGTGTTACGCTACCCTCACCACCCACGGTGGTCGCCGCA
AGTGCCCTTAAGTAAATTTAACACTCTCAAATTGCTGCGGATGTTGAATTTCGATACTAT
GTCGTTTTACTTGTTAGTACTTGTTTGCATATATTTGTATGTGGATCGAATAAGTCATGA
GAACCGTACGGCGTCTTTGTGTGTGGTGCTGTTT**TATTAATTGGTCTATTTGTTGCAA
GTTTTTT*GGTTTTTCATTTGTTGCGTGAAATAATCCCCTTGTATTATTTCGTTTTCTAA
ATAAAGTTATGTTGCTTT
C

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2F067TF 621 0 0
GGACACAACAAAACTCAAAACACACATTATCTTCATTGAGTTCTCTCATATTATAATCAT
CTCGAGAAATATGGCGATTTCAAAAGCCCTTATTGCTTCTCTTCTCATAT***CACTTAT
TGTTCTCCAACTCGTCCAGGCCGATGTGGAAAATTCAAACAAAAAGAA*GGGTTACGGCA
GTAAAATTGATTGTGGAAGTGCTTGTGTAGCAAGGTGCAGGCTCTCAAGTAGACCTAACC
TTTGCCACAGAGCCTGCGGGACTTGTTGCGCAAGATGCAACTGTGTGCCACCTGGTACAT
ATGGAAACTATGACAAGTGTGAGTGCTACGCTACCCTCACCACCCACGGTGGTCGCCGCA
AGTGCCCTTAAGTAAATTTAACACTCTCAAATTGCTGCGGATGTTGAATTTCGATACTAT
GTCGTTTTGCTTGTTAGTACTTGTTTGCATATATTTGTATGTGGATCGAATAAGTCATGA
GAACCGTACGGCGTCTTTGTGTGTGGTGCTGTTT**TATTAATTGGTCTATTTGTTGCAA
GTTTTTT*GGTTTTTCATTTGTTGCGTGAAATAATCCCCTTGTATTATTTCGTTTTCTAA
ATAAAGTTATGTTGCTTTTAT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2FG82TF 624 0 0
G
GGACACAACAAAACTCAAAACACACATTATCTTCATTGAGTTCTCTCATATTATAATCAT
CTCGAGAAATATGGCGATTTCAAAAGCCCTTATTGCTTCTCTTCTCATAT***CACTTAT
TGTTCTCCAACTCGTCCAGGCCGATGTGGAAAATTCAAACAAAAAGAA*GGGTTACGGCA
GTAAAATTGATTGTGGAAGTGCTTGTGTAGCAAGGTGCAGGCTCTCAAGTAGACCTAACC
TTTGCCACAGAGCCTGCGGGACTTGTTGCGCAAGATGCAACTGTGTGCCACCTGGTACAT
ATGGAAACTATGACAAGTGTGAGTGCTACGCTACCCTCACCACCCACGGTGGTCGCCGCA
AGTGCCCTTAAGTAAATTTAACACTCTCAAATTGCTGCGGATGTTGAATTTCGATACTAT
GTCGTTTTACTTGTTAGTACTTGTTTGCATATATTTGTATGTGGATCGAATAAGTCATGA
GAACCGTACGGCGTCTTTGTGTGTGGTGCTGTTT**TATTAATTGGTCTATTTGT*GCAA
GTTTTTT*GGTTTTTCATTTGTTGCGTGAAATAATCCCCTTGTATTATTTCGTTTTCTAA
ATAAAGTTATGTTGCTTTTAT
AT

QA 2 622 2 622
DS 



AS 1 5

CO CL763Contig1 1121 5 23 U
AACAATAACCTACCATGGATTTTCATAAAATTAAGAAACGAAACACACAACAATTTATCA
ATATGGGAAAATTACTCAAGAATAAAAGCGAAGAACAAACAAAATGAGTACAATACCAAC
TTTCTTAGTTTCTTTGACAATTTTTTCGGCATCATCTACCGGATTCAGCAAAAGGACATA
CACAAATACATTCTTTTGAGAATCCTAACATATATATGTTAAGTATTTATACTTTTGTAT
ACACTTCACATCTGTCAAGAAAACAAATGTGAAAATGCACTTGTAAGCTTTCTTTATTGC
TTGGATGATGGTGAAAGAGATCACCGTCTCAAGGTCTCCATGACGTAATCCGCATAGAGA
TCCATGGAATGCTGAACTGCTTCATAGGCTGCTGTAGCGGGAAGGAAGTCGTTAACGGCT
ACTTCCTTGTTCTCGTTTT*CTTATAGTCTTCAAAGAAACGACGAATCTCAGCCAGACGA
TGAGGTGGAAGCTCCTTGATGTCATTGTAATGACGGTACTCTGGATCGTCGGCGCAGACA
GCAATGATCTTGTCGTCTTTCTCACCCTGATCAATCATTGGCATAAGACCAATAGCTTTG
GCCCGAAGAAAGCATCCTGGGATCACCGGTTCCTGCATGATGACAAGAACATCAATAGGG
TCATTGTCCTCACAAAGTGTACGCGGAATGAACCCGTAGTTGTGTGGGTACACAACAGAT
GAGTAAAGAATACGGTCCACCTTGATGAGACCAGTAGTTTTGTCAAGTTCATACTTCACC
TTGCTCCCCTTTCCTATCTCAACCACACAGTTGAAGATTACTGGAGCTTCAGGTCCTATC
TCAAGATCATGCCAGGGGTGTGCAGCAACTGATCTATGGGTCAAGGACGAAAGTATCCTC
TCATTAAGAGGAGGAACTGAAGCCTGTTTCTCCGCATAGTTCTTGGTAGCAGCAATCTCA
ATCGGTGGCGCCATATCTGAGCAAAAAGTGACGAACGAAGAAGAGAACACAGGCACAGAT
CTCGAGAAGAAGGAACTCAAGAAGCACTGATGCAGAGAGAAAAAAGAGACTAAAGGAAAG
CTAAAAGAGAATGTAGGCTGTAAACTATACGCGTTCCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2E540JQ U 106
AF RR2GF73JQ U 65
AF RR2FX89JQ U 1
AF RR2FX89TF C 411
AF RR2EL63TF C 458
BS 1 88 RR2FX89JQ
BS 89 89 RR2GF73JQ
BS 90 439 RR2FX89JQ
BS 440 440 RR2E540JQ
BS 441 536 RR2FX89JQ
BS 537 537 RR2FX89TF
BS 538 730 RR2FX89JQ
BS 731 749 RR2FX89TF
BS 750 750 RR2EL63TF
BS 751 788 RR2FX89TF
BS 789 789 RR2EL63TF
BS 790 914 RR2FX89TF
BS 915 915 RR2EL63TF
BS 916 990 RR2FX89TF
BS 991 991 RR2EL63TF
BS 992 1053 RR2FX89TF
BS 1054 1054 RR2EL63TF
BS 1055 1069 RR2FX89TF
BS 1070 1070 RR2EL63TF
BS 1071 1085 RR2FX89TF
BS 1086 1086 RR2EL63TF
BS 1087 1118 RR2FX89TF
BS 1119 1121 RR2EL63TF

RD RR2E540JQ 430 0 0
GG
GTACAATACCAACTTTCTTAGTTTCTTTGACAATTTTTTCGGCATCATCTACCGGATTCA
GCAAAAGGACATACACAAATACATTCTTTTGAGAATCCTAACATATATATGTTAAGTATT
TATACTTTTGTATACACTTCACATCTGTCAAGAAAACAAATGTGAAAATGCACTTGTAAG
CTTTCTTTATTGCTTGGATGATGGTGAAAGAGATCACCGTCTCAAGGTCTCCATGACGTA
ATCCGCATAGAGATCCATGGAATGCTGAACTGCTTCATAGGCTACTGTAGCGGGAAGGAA
GTCGTTAACGGCTACTTCCTTGTTCTCGTTTT*CTTATAGTCTTCAAAGAAACGACGAAT
CTCAGCCAGACGATGAGGTGGAAGCTCCTTGATGTCATTGTAATGACGGTACTCTGGATC
GTCGGCGC

QA 3 430 3 430
DS 

RD RR2GF73JQ 471 0 0
GGGAAAATTACTCAAGAATAAAAGCGAAGAACAAACAAGATGGGTACAATACCAACGTTC
TTAGTTTCTTTGACAATTTTTTCGGCATCATCTACCGGATTCAGCAAAAGGACATACACA
AATACATTCTTTTGAGAACCCTAACATATATATGT*AAGTATTTTTACTTTTGTATACAC
TTCACATCTGTCAAGAAAACAAATGTGAAAATGCAGTTGGAAACTTTCTTTATTGCTTGG
ATGATGGTGAAAGAGATCACCGTCTCAAGGTCTCCATGACGTAATCCGCATACAGATCCA
TGGAATGCTGAACTGCTTCATAGGCTGCTGTAGCTGGAAGGAAGTCGTTAACGGCTACTT
CCTTGTTCTCGTTTTTCTTATAGTCTTCAAAGAAACGACGAATCTCAGCCAGACGATGAG
GTGGAAGCTCCTTGATGTCAATGTAATGACGGTACTCTGGATCGTCGGCGC

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR2FX89JQ 730 0 0
AACAATAACCTACCATGGATTTTCATAAAATTAAGAAACGAAACACACAACAATTTATCA
ATATGGGAAAATTACTCAAGAATAAAAGTGAAGAACAAACAAAATGAGTACAATACCAAC
TTTCTTAGTTTCTTTGACAATTTTTTCGGCATCATCTACCGGATTCAGCAAAAGGACATA
CACAAATACATTCTTTTGAGAATCCTAACATATATATGTTAAGTATTTATACTTTTGTAT
ACACTTCACATCTGTCAAGAAAACAAATGTGAAAATGCACTTGTAAGCTTTCTTTATTGC
TTGGATGATGGTGAAAGAGATCACCGTCTCAAGGTCTCCATGACGTAATCCGCATAGAGA
TCCATGGAATGCTGAACTGCTTCATAGGCTGCTGTAGCGGGAAGGAAGTCGTTAACGGCT
ACTTCCTTGTTCTCGTTTTTCTTATAGTCTTCAAAGAAACGACGAATCTCAGCCAGACGA
TGAGGTGGAAGCTCCTTGATGTCATTGTAATGACGGTACTCTGGATCGTCGGCGCAAACA
GCAATGATCTTGTCGTCTTTCTCACCCTGATCAATCATTGGCATAAGACCAATAGCTTTG
GCCCGAAGAAAGCATCCTGGGATCACCGGTTCCTGCATGATGACAAGAACATCAATAGGG
TCATTGTCCTCACAAAGTGTACGCGGAATGAACCCGTAGTTGTGTGGGTACACAACAGAT
GAGTAAAGAA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2FX89TF 710 0 0
GTTAACGGCTACTTCCTTGTTCTCGTTTT*CTTATAGTCTTCAAAGAAACGACGAATCTC
AGCCAGACGATGAGGTGGAAGCTCTTTGATGTCATTGTAATGACGGTACTCTGGATCGTC
GGCGCAGACAGCAATGATCTTGTCGTCTTTCTCACCCTGATCAATCATTGGCATAAGACC
AATAGCTTTGGCCCGAAGAAAGCATCCTGGGATCACCGGTTCCTGCATGATGACAAGAAC
ATCAATAGGGTCATTGTCCTCACAAAGTGTACGCGGAATGAACCCGTAGTTGTGTGGGTA
CACAACAGATGAGTAAAGAATACGGTCCACCTTGATGAGCCCAGTAGTTTTGTCAAGTTC
ATACTTCACCTTGCTCCCTTTTCCTATCTCAACCACACAGTTGAAGATTACTGGAGCTTC
AGGTCCTATCTCAAGATCATGCCAGGGGTGTGCAGCAACTGATCTATGGGTCAAGGACGA
AAGTATCCTCTCATTAAGAGGAGGCACTGAAGCCTGTTTCTCCGCATAGTTCTTGGTAGC
AGCAATCTCAATCGGTGGCGCCATATCTGAGCAAAAAGTGGCGAACGAAGAAGAGAACAC
AGGCACAGATCTCGAGAAGAAGGAACTCAAGAAGCACTGATGCGGAGAGAAAAAAGAGAG
TAAAGGAAAGCTAAAGGAGAATGTAGGCTGTAAACTATACGCGTTCCC
CC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2EL63TF 664 0 0
AACGACGAATCTCAGCCAGACGATGAGGTGGAAGCTCCTTGACGTCATTGTAATGACGGT
ACTCTGGATCGTCGGCGCAGACAGCAATGATCTTGTCGTCTTTCTCACCCTGATCGATCA
TTGGCATAAGACCAATAGCTTTGGCCCGAAGAAAGCATCCTGGGATCACCGGTTCCTGCA
TGATGACAAGAACATCAATAGGGTCATTGTCCTCACAGAGGGTACGCGGAATGAACCCAT
AGTTGTGTGGGTACACAACAGATGAGTAAAGAATACGGTCCACCTTGATGAGACCAGTAG
TTTTGTCGAGTTCATACTTCACTTTGCTCCCCTTTCCTATCTCAACCACACAGTTGAAGA
TTACTGGAGCTTCAGGTCCTATCTCAAGATCATGCCATGGGTGTGCAGCAACTGATCTAT
GTGTCAAGGACGAAAGTATCCTCTCATTAAGAGGAGGAACTGAAGTCTGTTTCTCCGCAT
AGTTCTTGGTAGCAGCAATCTCAATCGGTGGCGCCATATCTGA*CAAAAAGTGACGAACG
AAGAAGAGAACACAGGCACAGATCTCGAGAAGAAGGAACTCAAGAAGCACTGATGCAGAG
AGAAAAA*GAGACTAAAGGAAAGCTAAAAGAGAATGTAGGCTGTAAACTATACGCGTTCC
CCCC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 9

CO CL764Contig1 1056 9 24 U
GGGATTATCAATAACTCTTTCTCTCTCTAAGACACCACACAAAGAACAGAGTTTCTTTCT
TTGAAGACTAACCTAGTTAAGAAATGGAAAACGTCGGAGTTTGTGATGAGTTTGTTAACC
TAAAGGCAACAGAGCTGAGACTGGGATTACCAGGAACAGAAGATGGAGGTGAAGAAGAGA
AACAAAAGGTTCCTTGCGGTAGAAGCAACAAAAGAGCCTTGCCTGAAACTGAGAAAGATA
TTGAATCTACTGGAAAAACAGAAACAGCTTCACCTCCAAAGGCTCAGATTGTTGGATGGC
CACCTGTAAGATCTTACAGGAAGAACAATATTCAGACA***AAGAAAAATGAATCTGAAG
GTCAAGGAATGTATGTGAAAGTAAGTATGGATGGTGCTCCCTATCTGAGGAAGATAGATC
TAACGGTGTATAAGCAATATTCAGAATTGATGAAATCACTTGAAAACATGTTTAAATTCT
CTGTGGGGGAATATTTTGAGAGAGAAGGATATAAAGGCTCAGACTTTGTGCCTACTTATG
AAGACAAAGATGGTGATTGGATGCTTGTTGGAGATGTTCCTTGGG*AGATGTTTGTTTCG
TCTTGTAAGAGGCTAAGGATCATGAAAGGATCAGAAGCTAAAGGTCTCGGTTGTAGTGTT
TAATAAAAGAAGATTCAGAAACAGAGTTTTTT*TCTGTTTTCTCTGTTTTGTAAGAGCTT
TGAAACTGCTTGGGTTTTCGGGGGAAGATGTGTCTTACGAACATAACTGTGAATCTTTTC
CTCATCGGTTAAAATATTCACTTTCTTGTGGTGTTCTTGATTCTGATGATAACAAATGTA
CCAGAGAGAAGGCTTAAACGGTGTTAAGCATAATTGTGAGGAAAGGTCTAAATCTAAACT
CTAGTTGTGTAGATCTATGTTGTGTGCTATTGAAAGTTCTAAATCTGAACATTGTGTTTT
CTTTTTTTTTATGTAACAGAAACCATTTTTGTGTTGTGGTTTTCTTTTCTCTTTTTTTGC
TAGATTTGTGTTTAACTTTTTGAGAAATGCATTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 30 45 45 0 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI52TF U 1
AF RR2DN95TF U 2
AF RR2C415TF U 5
AF RR2DH91TF U 5
AF RR2A071TF U 147
AF RR2DN95JQ C 225
AF RR2C415JQ C 622
AF RR2DH91JQ C 544
AF RR2EI52JQ C 355
BS 1 94 RR2EI52TF
BS 95 95 RR2C415TF
BS 96 190 RR2EI52TF
BS 191 191 RR2DN95TF
BS 192 199 RR2EI52TF
BS 200 200 RR2DN95TF
BS 201 236 RR2EI52TF
BS 237 597 RR2DN95TF
BS 598 644 RR2C415TF
BS 645 645 RR2DH91TF
BS 646 670 RR2C415TF
BS 671 671 RR2DH91TF
BS 672 691 RR2C415TF
BS 692 692 RR2DH91TF
BS 693 709 RR2C415TF
BS 710 710 RR2DH91TF
BS 711 713 RR2C415TF
BS 714 714 RR2A071TF
BS 715 724 RR2C415TF
BS 725 725 RR2DH91TF
BS 726 735 RR2C415TF
BS 736 769 RR2DH91TF
BS 770 815 RR2DN95JQ
BS 816 1056 RR2EI52JQ

RD RR2EI52TF 236 0 0
GGGATTATCAATAACTCTTTCTCTCTCTAAGACACCACACAAAGAACAGAGTTTCTTTCT
TTGAAGACTAACCTAGTTAAGAAATGGAAAACGTTGGAGTTTGTGATGAGTTTGTTAACC
TAAAGGCAACAGAGCTGAGACTGGGATTACCAGGAACAGAAGATGGAGGTGAAGAAGAGA
AACAAAAGGT*CCTTGCGG*AGAAGCAACAAAAGAGCCTTGCCTGAAACTGAGAAA

QA 1 236 1 236
DS 

RD RR2DN95TF 596 0 0
GGATT
ATCAATAACTCTTTCTCTCTCTAAGACACCACACAAAGAACAGAGTTTCTTTCTTTGAAG
ACTAACCTAGTTAAGAAATGGAAAACGTTGGAGTTTGTGATGAGTTTGTTAACCTAAAGG
CAACAGAGCTGAGACTGGGATTACCAGGAACAGAAGATGGAGGTGAAGAAGAGAAACAAA
AGGTTCCTTGCGGTAGAAGCAACAAAAGAGCCTTGCCTGAAACTGAGAAAGATATTGAAT
CTACTGGAAAAACAGAAACAGCTTCACCTCCAAAGGCTCAGATTGTTGGATGGCCACCTG
TAAGATCTTACAGGAAGAACAATATTCAGACA***AAGAAAAATGAATCTGAAGGTCAAG
GAATGTATGTGAAAGTAAGTATGGATGGTGCTCCCTATCTGAGGAAGATAGATCTAACGG
TGTATAAGCAATATTCAGAATTGATGAAATCACTTGAAAACATGTTTAAATTCTCTGTGG
GGGAATATTTTGAGAGAGAAGGATATAAAGGCTCAGACTTTGTGCCTACTTATGAAGACA
AAGATGGTGATTGGATGCTTGTTGGAGATGTTCCTTGGG*AGATGTTTGTT

QA 6 596 6 596
DS 

RD RR2C415TF 731 0 0
GG
ATCAATAACTCTTTCTCTCTCTAAGACACCACACAAAGAACAGAGTTTCTTTCTTTGAAG
ACTAACCTAGTTAAGAAATGGAAAACGTCGGAGTTTGTGATGAGTTTGTTAACCTAAAGG
CAACAGAGCTGAGACTGGGATTACCAGGAACAGAAGATGGAGGTGAAGAAGAGAAACAAA
AGGTTCCTTGCGGTAGAAGCAACAAAAGAGCCTTGCCTGAAACTGAGAAAGATATTTAAT
CTACTGGAAAAACAGAAACAGCTTCTCCTCCAAAGGCTCAGATTGTTGGATGGCCACCTG
TAAGATCTTACAGGAAGAACAATATCCAGACA***AAGAAAAATGAATCTGAAGGTCAAG
GAATGTATGTGAAAGTAAGTATGGATGGTGCTCCTTATCTGAGGAAGATATATCTAACGG
TGTATAAGCAATATTCAGAATTGATGAAATCACTTGAAAACATGTTTAAATTCTCTGTGG
GAGAATATTTTGAGAGAGAAGGATATAAAGGCTCAGACTTTGTGCCTACTTATGAAGACA
AAGATGGTGATTGGATGCTTGTTGGAGATGTTCCTTGGGGAGATGTTTGTTTCGTCTTGT
AAGAGGCTAAGGATCATGAAAGGATCAGAAGCTAAAGGGCTCGGTTGTAGTGTTTAATAA
AAGA*GATTCAGAAACAGAGTTTTT**TCTGTTTTCTCTGTTT*GTA*GAGCTTTGAA*C
TGCTTGGGT

QA 3 731 3 731
DS 

RD RR2DH91TF 765 0 0
GG
ATCAATAACTCTTTCTCTCTCTAAGACACCACACAAAGAACAGAGTTTCTTTCTTTGAAG
ATTAACCTAGTTAAGAAATGGAAAACGTCGGAGTTTGTGATGAGTTTGTTAACCTAAAGG
CAACGGAGCTTAGACTGGGATTACCAGGAACAGAAGATGGGGGTGAAGAAGAGAAACAAA
AGGTTTCTTGCGGTAGAAGCAACAAAAGAGCCTTGCCTGAAACTGAGAAAGATATTGAAT
CTACTGGAAAAACAGAAACAGCTTCTCCTCCAAAGGCTCAGATTGTTGGATGGCCACCTG
TAAGATCTTACAGGAAGAACAATATTCAGACAACAAAGAAAAATGAGTCTGAAGGTCAAG
GAATGTATGTGAAAGTAAGTATGGATGGTGCTCCCTATCTGAGGAAGATAGATCTAACGG
TGTATAAGCAATATTCTGAATTGATGAAATCACTTGAAAACATGTTTAAATTCTCTGTGG
GAGAATATTTTGAGCGAGAAGAATATAAAGGCTCAGACTTTGTGCCTACTTATGAAGACA
AAGATGGTGATTGGATGCTTGTTGGAGATGTTCCTTGGG*AGATGTTTGTTTCGTCTTGT
AAGAGGCTAAAGATCATGAAAGGATCAGAGGCTAAAGGTCTCGGTTGTAGTGTTTGATAA
AAGAAGATTCAGAAACAGAGTTTTTTTTCTGTTTTCTCTGTTTTGTA*GAGCTTTGAAAC
TGCTTGGGTTTTCGGGGGAAGATGTGTCTTACGAACATAACTG

QA 3 765 3 765
DS 

RD RR2A071TF 587 0 0
TTACCAGGAACAGAAGATGGAGGTGAAGAAGAGAAACAAAAGGTTCCTTGCGGTAGAAGC
AACAAAAGAGCCTTGCCTGAAACTGAGAAAGATATTGAATCTACTGGGAAAACAGAAACA
GCTTCTCCTCCAAAGGCTCAGATTGTTGGATGGCCACCTGTAAGATCTTACAGGAAGAAC
AATATTCAGACAACAAAGAAAAATGAATCTGAAGGTCAAGGAATGTATGTGAAAGTAAGT
ATGGATGGTGCTCCCTATCTGAGGAAGATAGATCTAACGGTGTATAAGCAATATTCAGAA
TTGATGAAATCACTTGAAAACATGTTTAAATTCTCTGTGGGGGAATATTTTGAGAGAGAA
GGATATAAAGGCTCAGACTTTGTGCCTACTTATGAAGACAAAGATGGTGATTGGATGCTT
GTTGGAGATGTTCCTTGGG*AGATGTTTGTTTCGTCTTGTAAGAGGCTAAGGATCATGAA
AGGATCAGAAGCTAAGGGTCTCGGTTGTAGTGTTTAATAAAAGAAGATTCAGAAACAGAG
TTTTTTTTCTGTTTTCTCTGTTTTGTAAGAGCTTTGAAACTGCTTGG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2DN95JQ 591 0 0
GAAACTGAGAAAGATATTGAATCTACTGGAAAAACAGAAACAGCTTCACCTCCAAAGGCT
CAGATTGTTGGATGGCCACCTGTAAGATCTTACAGGAAGAACAATATTCAGACA***AAG
AAAAATGAATCTGAAGGTCAAGGAATGTATGTGAAAGTAAGTATGGATGGTGCTCCCTAT
CTGAGGAAGATAGATCTAACGGTGTATAAGCAATATTCAGAATTGATGAAATCACTTGAA
AACATGTTTAAATTCTCTGTGGGGGAATATTTTGAGAGAGAAGGATATAAAGGCTCAGAC
TTTGTGCCTACTTATGAAGACAAAGATGGTGATTGGATGCTTGTTGGAGATGTTCCTTGG
G*AGATGTTTGTTTCGTCTTGTAAGAGGCTAAGGATCATGAAAGGATCAGAAGCTAAAGG
TTTCGGTTGTAGTGTTTAATAAAAGAAGATTCAGAAACAGAGTTTTTT*TCTGTTTTCTC
TGTTTTGTAAGAGCTTTGAAACTGCTTGGGTTTTCGGGGGAAGATGTGTCTTACGAACAT
AACTGTGAATCTTTTCCTCATCGGTTAAAATATTCACTTTCTTGTGGTGTT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2C415JQ 289 0 0
ATGAAAGGTTCAGAAGCTAAAGGGCTCGGTTGTAGTGTTTAATAAAAGAAGATTCAGAAA
CAGAGTTTTTT*TCTGTTTTCTCTGTTTTGTAAGAGCTTTGAAACTGCTTGGGTTTTCGG
GGGAAGATGTGTCTTACGAACATAACTGTTATTCTTTTCCTCATCGGTTAAAATATTCAC
TTTCTTGTGGTGTTCTTGATTCTGATGATAACAAATGTACCAGAGAGAAGGCTTAAACGG
TGTTAAGCATAATTGTGAGGAAAGGTCTAAATCTAAACTCTAGTTGTGT

QA 1 289 1 289
DS 

RD RR2DH91JQ 398 0 0
ACAAAGATGGTGATTGGATGCTTGTTGGAGATGTTCCTTGGG*AGATGTTTGTTTCGTCT
TGTAAGAGGCTAAGGATCATGAAAGGATCAGAGGCTAAAGGTTTCGGTTGTAGTGTTTGA
TAAAAGAAGATTCAGAAACAGAGTTTTTTTTCTGTTTTTTCTGTTTTGTAAGAGCTTTGA
AACTGCTTGGGTTTTCGGGGGAAGATGTTTCTTACGAACATAACTGTGAATCTTTTCCTC
ATCGGTTAAAATATTCACTTTCTTGTGGTGTTCTTGATTCTGATGATAACAAATGTCCCA
GAGAGAAGGCTTAAACGGTGTTAAGCATAATTGTGAGGAAATGTCTAAATTTAAACTCTA
GTTGTGTAGATCTATGTTGTGTGCTATTGAAAGTTCTA

QA 1 398 1 398
DS 

RD RR2EI52JQ 702 0 0
CTGAAGGTCAAGGAATGTATGTGAAAGTAAGTATGGATGGTGCTCCCTATCTGAGGAAGA
TAGATCTAACGGTGTATAAGCAATATTCAGAATTGATGAAATCACTTGAAAACATGTTTA
AATTCTCTGTGGGGGAATATTTTGAGAGAGAAGGATATAAAGGCTCAGACTTTGTGCCTA
CTTATGAAGACAAAGATGGTGATTGGATGCTTGTTGGAGATGTTCCTTGGG*AGATGTTT
GTTTCGTCTTGTAAGAGGCTAAGGATCATGAAAGGATCAGAAGCTAAAGG**TCGGTTGT
AGTGTTTAATAAAAGAAGATTCAGAAACAGAGTTTTTT*TCTGTTTTCTCTGTTTTGTAA
GAGCTTTGAAACTGCTTGGGTTTTCGGGGGAAGATGTGTCTTACGAACATAACTGTGAAT
CTTTTCCTCATCGGTTAAAATATTCACTTTCTTGTGGTGTTCTTGATTCTGATGATAACA
AATGTACCAGAGAGAAGGCTTAAACGGTGTTAAGCATAATTGTGAGGAAAGGTCTAAATC
TAAACTCTAGTTGTGTAGATCTATGTTGTGTGCTATTGAAAGTTCTAAATCTGAACATTG
TGTTTTCTTTTTTTTTATGTAACAGAAACCATTTTTGTGTTGTGGTTTTCTTTTCTCTTT
TTTTGCTAGATTTGTGTTTAACTTTTTGAGAAATGCATTACC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 2 9

CO CL765Contig1 757 4 7 U
AAGATTTTGAAAAACTTATTATTGAAATATAGAAGAGCATCATAATAAACATTACACACA
CACAAACATGCACACTACACAAATATAGAGAGAAGTAGTCATCATGTAGCCTAATAGGGG
AGCTAGGAGAAAGTTTTGATATAAAAATGTCAAAAAGATATATATGAAGAAAGTTTCAAA
TAGAGTTGGTGTCATAAGGTAACCAACCCAACATGTAATTATTCTCACTTGGTCCTGCTC
CCATTCCATGATCTTGCTGTTGCCCCTGATGATACCCGATTTGAAAGATGGGTTCGTATT
CCAAAGGCTGGAAGAAAGCTTGTTGTTGTGGTTGATGACGCCCATAGTCAACAACATCTT
CTTCTTGGTTCGGGTTGAGTTGGAATGGCATCTGATACCCATCAGCTAACCTGAGCCTTA
GAGATTTATTTGTCTCATTAAGCATGCGCTCCTTACTCTGGAGATCATTGAGCTGGTCGA
GCATGAACTGTGTCCTGAGAGCTCTGATCTGCTTCAAAGAAGAATCAAGCTGTCTCTCAA
GTGACTCAAGCTCCTTTGTACTAAGTGGTCCAAGATCTTCTCCCAATAGATTCCTTTGGG
TTCTCTGTAAGGCGTCGTAACGCTCCTTAAGCTTGAGATACTCCTGCTGGCTACCAAGTT
CAACTGCTAAGGCTTCTCTTGAAGGCACATTGGGCTCTGGCGGTCCGTAGTTGCACTTTT
GGTACCTCTCCAATGTCTTAAGCGTGCTCGAGTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU02JQ U 9
AF RR2DH62JQ U 9
AF RR2B285JQ U 3
AF RR2CF10JQ U 1
BS 1 420 RR2CF10JQ
BS 421 421 RR2BU02JQ
BS 422 580 RR2CF10JQ
BS 581 581 RR2BU02JQ
BS 582 654 RR2CF10JQ
BS 655 655 RR2B285JQ
BS 656 757 RR2CF10JQ

RD RR2BU02JQ 599 0 0
GAAAAACTTATTATTGAAATATAGAAGAGCATCATAATAAACATTACACACACACAAACA
TGCACACTACACAAATATAGAGAGAAGTAGTCATCATGTAGCCTAATAGGGGAGCTAGGA
GAAAGTTTTGATATAAAAATGTCAAAAAGATATATATGAAGAAAGTTTCAAATAGAGTTG
GTGTCATAAGGTAACCAACCCAACATGTAATTATTCTCACTTGGTCCTGCTCCCATTCCA
TGATCTTGCTGTTGCCCCTGATGATACCCGATTTGAAAGATGGGTTCGTATTCCAAAGGC
TGGAAGAAAGCTTGTTGTTGTGGTTGATGACGCCCATAGTCAACAACATCTTCTTCTTGG
TTCGGGTTGAGTTGGAATGGCATCTGATACCCATCAGCTAACCTGAGCCTTAGAGATTTA
TTTGTCTCATTAAGCATGCGCTCCTTACTCTGGAGATCATTGAGCTGGTCGAGCATGAAC
TGTGTCCTGAGAGCTCTGATCTGCTTCAAGGAAGAATCAAGCTGTCTCTCAAGTGACTCA
AGCTCCTTTGTACTAAGTGGTCCAAGATCTTCTCCCAATAGATTCCTTTGGGTTCTCTG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2DH62JQ 621 0 0
GAAAAACTTATTATTGAAATATAGAAGAGCATCATAATAAACATTACACACACACAAACA
TGCACACTACACAAATATAGAGAGAAGTAGTCATCATGTAGCCTAATAGGGGAGCTAGGA
GAAAGTTTTGATATAAAAATGTCAAAAAGATATATATGAAGAAAGTTTCAAATAGAGTTG
GTGTCATAAGGTAACCAACCCAACATGTAATTATTCTCACTTGGTCCTGCTCCCATTCCA
TGATCTTGCTGTTGCCCCTGATGATACCCGATTTGAAAGATGGGTTCGTATTCCAAAGGC
TGGAAGAAAGCTTGTTGTTGTGGTTGATGACGCCCATAGTCAACAACATCTTCTTCTTGG
TTCGGGTTGAGTTGGAATGGCATCTGATACCCATCAGCTAACCTGAGCCTTAGAGATTTA
TTTGTCTCATTAAGCATGCGCTCCTTACTCTGGAGATCATTGAGCTGGTCGAGCATGAAC
TGTGTCCTGAGAGCTCTGATCTGCTTCAAAGAAGAATCAAGCTGTCTCTCAAGTGACTCA
AGCTCCTTTGTACTAAGTGGTCCAAGATCTTCTCCCAATAGATTCCTTTGGGTTCTCTGT
AAGGCGTCGTAACGCTCCTTA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2B285JQ 661 0 0
GATTTT
GAAAAACTTATTATTGAAATATAAAAGAGCATCATAATAAACATTACACACACACAAACA
TGCACACTACACAAATATAGAGAGAAGTAGTCATCATGTAGCCTAATAGGGGAGCTAGGA
GAAAGTTT*GATATAAAAATGTCAAAAAGATATATATGAAGAAAGTTTCAAATAGAGTTG
GTGTCATAAGGTAACCAACCCAACATGTAATTATTCTCACTTGGTCCTGCTCCCATTCCA
TGATCTTGCTGTTGCCCCTGATGATACCCAATTTGAAAGATGGGTTCGTATTCCAAAGGC
TGGAAAAAAGCTTGTTGTTGTGGTTGATGACGCCCATAATCAACAACATCTTCTTCTTGG
TTCGGGTTGAGTTGGAATGGCATCTGATACCCATCAGCTAACCTGAGCCTTAGAGATTTA
TTTGTCTCATTAAGCATGCGCTCCTTACTCTGGAGATCATTGAGCTGGTCGAGCATGAAC
TGTGTCCTGAGAGCTCTGATCTGCTTCAAAAAAGAATCAAGCTGTCTCTCAAGTGACTCA
AGCTCCTTTGTACTAAGTGGTCCAAGATCTTCTCCCAATAGATTCCTTTGGGTTCTATGT
AAGGCGTCGTAACGCTCCTTAAGCTTGAGATACTCCTGCTGGCTACCAAGTTCAA

QA 7 661 7 661
DS 

RD RR2CF10JQ 757 0 0
AAGATTTTGAAAAACTTATTATTGAAATATAGAAGAGCATCATAATAAACATTACACACA
CACAAACATGCACACTACACAAATATAGAGAGAAGTAGTCATCATGTAGCCTAATAGGGG
AGCTAGGAGAAAGTTTTGATATAAAAATGTCAAAAAGATATATATGAAGAAAGTTTCAAA
TAGAGTTGGTGTCATAAGGTAACCAACCCAACATGTAATTATTCTCACTTGGTCCTGCTC
CCATTCCATGATCTTGCTGTTGCCCCTGATGATACCCGATTTGAAAGATGGGTTCGTATT
CCAAAGGCTGGAAGAAAGCTTGTTGTTGTGGTTGATGACGCCCATAGTCAACAACATCTT
CTTCTTGGTTCGGGTTGAGTTGGAATGGCATCTGATACCCATCAGCTAACCTGAGCCTTA
AAGATTTATTTGTCTCATTAAGCATGCGCTCCTTACTCTGGAGATCATTGAGCTGGTCGA
GCATGAACTGTGTCCTGAGAGCTCTGATCTGCTTCAAAGAAGAATCAAGCTGTCTCTCAA
GTGACTCAAGCTCCTTTGTACTAAGTGGTCCAAGATCTTCCCCCAATAGATTCCTTTGGG
TTCTCTGTAAGGCGTCGTAACGCTCCTTAAGCTTGAGATACTCCTGCTGGCTACTAAGTT
CAACTGCTAAGGCTTCTCTTGAAGGCACATTGGGCTCTGGCGGTCCGTAGTTGCACTTTT
GGTACCTCTCCAATGTCTTAAGCGTGCTCGAGTTACT

QA 1 757 1 757
DS 



CO CL765Contig2 798 5 7 U
GGTAAGAGAGAAAGAAAAAATGGGAAGAGGGAGAGTAGAGTTGAAGAGGATAGAGAACAA
GATCAATAGGCAAGTGACGTTTGCAAAAAGAAGGAATGGTGTTTTGAAGAAAGCATACGA
GCTTTCCGTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAATAGAGGAAAACT
GTACGAGTTTTGCAGTAACTCGAGCACGCTTAAGACATTGGAGAGGTACCAAAAGTGCAA
CTACGGACCGCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGAGAAGCCTTAGCAGTTGAACTTAGTAG
CCAGCAGGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCCTTACAGAGAACCCAAAGGAA
TCTATTGGGAGAAGATCTTGGACCACTTAGTACAAAGGAGCTTGAGTCACTTGAGAGACA
GCTTGATTCTTCTTTGAAGCAGATCAGAGCTCTCAGGACACAGTTCATGCTCGACCAGCT
CAATGATCTCCAGAGTAAGGAGCGCATGCTTAATGAGACAAATAAATCTCTAAGGCTCAG
GTTAGCTGATGGGTATCAGATGCCATTCCAACTCAACCCGAACCAAGAAGAAGATGTTGT
TGACTATGGGCGTCATCAACCACAACAACAAGCTTTCTTCCAGCCTTTGGAATACGAACC
CATCTTTCAAATCGGGTATCATCAGGG*CAACAGCAAGATCATGGAATGGGAGCAGGACC
AAGTGAGATAATACATGTTGGGTTGGTACCTTATGACACAACTCTATTTGAACTTCTTCA
TATATATCTTTTGACATT


BQ
10 10 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF10TF U 2
AF RR2B285TF U 2
AF RR2BU02TF U 6
AF RR2DH62TF U 2
AF RR2GK89TF U 1
BS 1 554 RR2GK89TF
BS 555 555 RR2CF10TF
BS 556 696 RR2GK89TF
BS 697 697 RR2B285TF
BS 698 716 RR2GK89TF
BS 717 717 RR2DH62TF
BS 718 798 RR2GK89TF

RD RR2CF10TF 680 0 0
GG
AAGAGAGAAAGAAAAAATGGGAAGAGGGAGAGTAGAGTTGAAGAGGATAGAGAACAAGAT
CAATAGGCAAGTGACGTTTGCAAAAAGAAGGAATGGTGTTTTGAAGAAAGCATACGAGCT
TTCCGTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAATAGAGGAAAACTGTA
CGAGTTTTGCAGTAACTCGAGCACGCTTAAGACATTGGAGAGGTACCAAAAGTGCAACTA
CGGACCGCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGAGAAGCCTTAGCAGTTGAACTTAGTAGCCA
GCAGGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCCTTACAGAGAACCCAAAGGAATCT
ATTGGGGGAAGATCTTGGACCACTTAGTACAAAGGAGCTTGAGTCACTTGAGAGACAGCT
TGATTCTTCTTTGAAGCAGATCAGAGCTCTCAGGACACAGTTCATGCTCGACCAGCTCAA
TGATCTCCAGAGTAAGGAGCGCATGCTTAATGAGACAAATAAATCTCTAAGGCTCAGGTT
AGCTGATGGGTATCAGATGCCATTCCAACTCAACCCGAACCAAGAAGAAGATGTTGTTGA
CTATGGGCGTCATCAACCACAACAACAAGCTTTCTTCCAGCCTTTGGAATACGAACCCAT
CTTTCAAATCGGGTATCA

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR2B285TF 712 0 0
GG
AAGAGAGAAAGAAAAAATGGGAAGAGGGAGAGTAGAGTTGAAGAGGATAGAGAACAAGAT
CAATAGGCAAGTGACGTTTGCAAAAAGAAGGAATGGTGTTTTGAAGAAAGCATACGAGCT
TTCCGTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAATAGAGGAAAACTGTA
CGAGTTTTGCAGTAACTCGAGCACGCTTAAGACATTGGAGAGGTACCAAAAGTGCAACTA
CGGACCGCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGAGAAGCCTTAGCAGTTGAACTTGGTAGCCA
GCAGGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCCTTACATAGAACCCAAAGGAATCT
ATTGGGAGAAGATCTTGGACCACTTAGTACAAAGGAGCTTGAGTCACTTGAGAGACAGCT
TGATTCTTCTTTGAAGCAGATCAGAGCTCTCAGGACACAGTTCATGCTCGACCAGCTCAA
TGATCTCCAGAGTAAGGAGCGCATGCTTAATGAGACAAATAAATCTCTAAGGCTCAGGTT
AGCTGATGGGTATCAGATGCCATTCCAACTCAACCCGAACCAAGAAGAAGATGTTGTTGA
CTATGGGCGTCATCAACCACAACAACAAGCTTTCTTCCAGCCTTTGGAATACGAACCCAT
CTTTCAAATTGGGTATCATCAGGGGCAACAGCAAGATCATGGAATGGGAG

QA 3 712 3 712
DS 

RD RR2BU02TF 728 0 0
GG
GAGAAAGAAAAAATGGGAAGAGGGAGAGTAGAGTTGAAGAGGATAGAGAACAAGATCAAT
AGGCAAGTGACGTTTGCAAAAAGAAGGAATGGTGTTTTGAAGAAAGCATACGAGCTTTCC
GTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAATAGAGGAAAACTGTACGAG
TTTTGCAGTAACTCGAGCACGCTTAAGACATTAGAGAGGTACCAAAAGTGCAACTACGGA
CCGCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGAGAAGCCTTAGCAGTTGAACTTAGTAGCCAGCAG
GAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCCTTACAGAGAACCCAAAGGAATCTATTG
GGAGAAGATCTTGGACCACTTAGTACAAAGGAGCTTGAGTCACTTGAGAGACAGCTTGAT
TCTTCCTTGAAGCAGATCAGAGCTCTCAGGACACAGTTCATGCTCGACCAGCTCAATGAT
CTCCAGAGTAAGGAGCGCATGCTTAATGAGACAAATAAATCTCTAAGGCTCAGGTTAGCT
GATGGGTATCAGATGCCATTCCAACTCAACCCGAACCAAGAAGAAGATGTTGTTGACTAT
GGGCGTCATCAACCACAACAACAAGCTTTCTTCCAGCCTTTGGAATACGAACCCATCTTT
CAAATCGGGTATCATCAGGG*CAACAGCAAGATCATGGAATGGGAGCAG
ACAAGTGAGATAATACA

QA 3 711 3 711
DS 

RD RR2DH62TF 731 0 0
GG
AAGAGAGAAAGAAAAAATGGGAAGAGGGAGAGTAGAGTTGAAGAGGATAGAGAACAAGAT
CAATAGGCAAGTGACGTTTGCAAAAAGAAGGAATGGTGTTTTGAAGAAAGCATACGAGCT
TTCCGTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAATAGAGGAAAACTGTA
CGAGTTTTGCAGTAACTCGAGCACGCTTAAGACATTGGAGAGGTACCAAAAGTGCAACTA
CGGACCGCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGAGAAGCCTTAGCAGTTGAACTTAGTAGCCA
GCAGGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCCTTACAGAGAACCCAAAGGAATCT
ATTGGGAGAAGATCTTGGACCACTTAGTACAAAGGAGCTTGAGTCACTTGAGAGACAGCT
TGATTCTTCTTTGAAGCAGATCAGAGCTCTCAGGACACAGTTCATGCTCGACCAGCTCAA
TGATCTCCAGAGTAAGGAGCGCATGCTTAATGAGACAAATAAATCTCTAAGGCTCAGGTT
AGCTGATGGGTATCAGATGCCATTCCAACTCAACCCGAACCAAGAAGAAGATGTTGTTGA
CTATGGGCGTCATCAACCACAACAACAAGCTTTCTTCCAGCCTTTGGAATACGAACCCAT
CTTTCAAATCGGGTATCATCAGGG*CAACAGCAAGATCATGGAATGGGAGCAGGACCAAG
TGAGA
TAAT

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR2GK89TF 798 0 0
GGTAAGAGAGAAAGAAAAAATGGGAAGAGGGAGAGTAGAGTTGAAGAGGATAGAGAACAA
GATCAATAGGCAAGTGACGTTTGCAAAAAGAAGGAATGGTGTTTTGAAGAAAGCATACGA
GCTTTCCGTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAATAGAGGAAAACT
GTACGAGTTTTGCAGTAACTCGAGCACGCTTAAGACATTGGAGAGGTACCAAAAGTGCAA
CTACGGACCGCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGAGAAGCCTTAGCAGTTGAACTTAGTAG
CCAGCAGGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCCTTACAGAGAACCCAAAGGAA
TCTATTGGGAGAAGATCTTGGACCACTTAGTACAAAGGAGCTTGAGTCACTTGAGAGACA
GCTTGATTCTTCTTTGAAGCAGATCAGAGCTCTCAGGACACAGTTCATGCTCGACCAGCT
CAATGATCTCCAGAGTAAGGAGCGCATGCTTAATGAGACAAATAAATCTCTAAGGCTCAG
GTTAGCTGATGGGTGTCAGATGCCATTCCAACTCAACCCGAACCAAGAAGAAGATGTTGT
TGACTATGGGCGTCATCAACCACAACAACAAGCTTTCTTCCAGCCTTTGGAATACGAACC
CATCTTTCAAATCGGGTATCATCAGGG*CAACAGCA*GATCATGGAATGGGAGCAG*ACC
AAGTGAGATAATACATGTTGGGTTGGTACCTTATGACACAACTCTATTTGAACTTCTTCA
TATATATCTTTTGACATT

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 9

CO CL766Contig1 439 9 10 U
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAAA*GTAACAAAACTACCAAACAAAAAGAAGAAAATA
AACCCTTTCAGGTCTCAACTAAAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGCGGAGTTCTTTTC
GCTGCTGCTTCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCACCAGGACCC
GCCGCAAGCGGAGCCTCTGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTT
GTGTCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAAATTGATTTC
TCTACCATGTCCGATTGTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAATACATGAAGA
GCTAATAATTTGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATA
AATGTGTTCTTCTATTCCT


BQ
45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A726TF U 1
AF RR2AS93TF U 1
AF RR2BB03TF U 1
AF RR2BP91TF U 1
AF RR2BP91JQ C 1
AF RR2EK88JQ C 1
AF RR2EK88TF U 1
AF RR2GW26JQ C 3
AF RR2GW26TF U 3
BS 1 26 RR2A726TF
BS 27 27 RR2AS93TF
BS 28 129 RR2A726TF
BS 130 130 RR2AS93TF
BS 131 185 RR2A726TF
BS 186 186 RR2AS93TF
BS 187 291 RR2A726TF
BS 292 292 RR2AS93TF
BS 293 433 RR2A726TF
BS 434 439 RR2BB03TF

RD RR2A726TF 433 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAAAAGTAACAAAACTACCAAACAAAAAGAAGAAAATA
AACCCTTTCAGGTCTCAACTAAAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGCGGAGTTCTTTTC
GCTGCTGCTCCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCACCAGGACCC
GCCGCGAGCGGAGCCTCTGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTT
GTGTCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAA*TTGATTTC
TCTACCATGTCCGATTGTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAATACATGAAGA
GCTAATAATTTGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATA
AATGTGTTCTTCT

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR2AS93TF 433 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAA***GTAACAAAACTACCAAACAAAAAGAAGAAAATA
AACCCTTTCAGGTCTCAACTAAAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGCGGAGTTCTTTTC
GCTGCTGCTTCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCACCAGGACCC
GCCGCAAGCGGAGCCTCTGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTT
GTGTCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAAATTGATTTC
TCTACCATGTCCGATTGTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAATACATGAAGA
GCTAATAATTTGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATA
AATGTGTTCTTCT

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR2BB03TF 439 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAAA*GTAACAAAACTACCAAACAAAAAGAAGAAAATA
AACCCTTTCAGGTCTCAACTAAAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGCGGAGTTCTTTTC
GCTGCTGCTTCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCACCAGGACCC
GCCGCAAGCGGAGCCTCTGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTT
GTGTCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAAATTGATTTC
TCTACCATGTCCGATTGTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAATACATGAAGA
GCTAATAATTTGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATA
AATGTGTTCTTCTATTCCT

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2BP91TF 433 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAAA*GTAACAAAACTACCAAACAAAAAGAAGAAAATA
AACCCTTTCAGGTCTCAACTAAAAATGGAGATGGAGAAGATTGCCTGCGGAGTTCTTTTC
GCTGCTGCTTCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCACCAGGACCC
GCCGCAAGCGGAGCCTCTGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGT*GGGGCTTCCCTT
GTGTCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAA*TTGATTTC
TCTACCATGTCCGATTGTGAACGTGTTGTTTAGACAGGTAAAGTGAATAATACATGAAGA
GCTAATAATTTGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATA
AATGTGTTCTTCT

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR2BP91JQ 433 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAAA*GTAACAAAACTACCAAACAAAAAGAAGAAAATA
AACCCTTTCAGGTTTCAACTAAAAATGGAGATGGAGAAGATTGCCTGCGGAGTTTTTTTC
GCTGCTGCTTCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCACCAGGACCC
GCCGCAAGCGGAGCCTCTGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGT*GGGGCTTCCCTT
GTGTCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAA*TTGATTTT
TTTACCATGTCCGATTGTGAACGTGTTGTTTAGACAGGTAAAGTGAATAATACATGAAGA
GCTAATAATTTGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATA
AATGTGTT
TTTTT

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR2EK88JQ 433 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAAA*GTAACAAAACAACCAAACAAAAAGAAGAAAATA
AACCCTTTCAGGTTTCAACTAAAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGCGGAGTTCTTTTC
GCTGCTGCTTCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCAC*AGGACCC
GCCGCAAGCGGAGCCTCTGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTT
GTGTCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAAATTGATTTC
TCTACCATGTCCGATTGTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAATACATGAAGA
GCTAATAATTTGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATA
AATGTGTTTTTCT

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR2EK88TF 433 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAAA*GTAACAAAACAACCAAACAAAAAGAAGAAAATA
AACCCTTTCAGGTCTCAACTAAAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGCGGAGTTCTTTTC
GCTGCTGCTTCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCAC*AGGACCC
GCCGCAAGCGGAGCCTCTGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTT
GTGTCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAAATTGATTTC
TCTACCATGTCCGATTGTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAATACATGAAGA
GCTAATAATTTGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATA
AATGTGTTCTTCT

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR2GW26JQ 431 0 0
G
GACCTGCAAGAAACAAAAAAAAA*GTAACAAAACTACCAAACAAAAAGAAGAAAATAAAC
CCTTTCAGGTCTCAACTAAAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGCGGAGTTCTTTTCGCT
GCTGCTTCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCACCAGGACCCGCC
GCAAGCGGAGCCTCTGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTTGTG
TCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAAATTGATTTCTCT
ACCATGTCCGATTGTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAATACATGAAGAGCT
AATAATTTGATTATGATCAGGCAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATAAAT
GTGTTCTTCT

QA 2 431 2 431
DS 

RD RR2GW26TF 431 0 0
G
GACCTGCAAGAAACAAAAAAAAA*GTAACAAAACTACCAAACAAAAAGAAGAAAATAAAC
CCTTTCAGGTCTCAACTAAAAATGGAGATGAAGAAGATTGCCTGCGGAGTTCTTTTCGCT
GCTGCTTCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCACCAGGACCCGCC
GCAAGCGGAGCCTCTGTAGCCGTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTTGTG
TCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAAATTGATTTCTCT
ACCATGTCCGATTGTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAATACATGAAGAGCT
AATAATTTGATTATGATCAGGCAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATAAAT
GTGTTCTTCT

QA 2 431 2 431
DS 



AS 1 4

CO CL767Contig1 795 4 12 U
ATCTGATTCAAGAATTCTTACAAAAGTAAAACAACGGTTGTAAGAGTTTAGGCATCTTGA
CAACTTCCGATACCGAAATGTTGCGTTCTAAAAGTTTCAAAAACATTTTCAACTGTGTTA
CATTACACCAGCGGCATGTATATATATATTTATTCCAATTTAAAAAAAA*TCTAAAAATA
TTTAAAGAAAGTGAAAACAGAAAGCAAAACTCGGTGCCGGAGTCCGTGGTGGTGCTCATG
GTCTTCATCACCGTGACCATCCGGAGGCCCTCCAGGACCAACCACTTCCAGCTCAAAGTA
CTGAGTGCAGACAGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACCACACAACGTC
GTGTTCATCCTCGCCTTCGCCACCAGGGCATCCCACAATTCGCTTGTCATAGTAGGACTT
CACAATAGCTGGAGCTTCCTTAGTTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCGATATCAAGCAG
CCTCCTCCCCTCGAGTTCAGCTTCAAGCTCTTCCTTCTCGTGTCCAGTAGCGATGGGCAT
TACATCCTCCACCTTCTTATTCACAGAAGTCTCTACTACTGGTTCGGAGCCGAAATGGCG
AGGGATGACGGAAGAAGAAGCAGAAATGGCTGATCGATTGGCAGCGAGGTATAAGCCAGC
GGGTCTCGAGGTGGCGGTTATCGATCGACAGGGAGGAGAAGCAGCGGCGACATCAGCGGC
TAGGGTTTTGAGACCGGAGGAGATGATTCTTCTCCACATGGTGTGACGAAACGATGGATG
GACTTAGGGACTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL88JQ U 24
AF RR2EW74JQ U 1
AF RR2AH21JQ U 20
AF RR2AH21TF C 154
BS 1 169 RR2EW74JQ
BS 170 170 RR2AH21JQ
BS 171 204 RR2EW74JQ
BS 205 205 RR2AH21JQ
BS 206 224 RR2EW74JQ
BS 225 225 RR2AH21JQ
BS 226 423 RR2EW74JQ
BS 424 424 RR2AH21JQ
BS 425 590 RR2EW74JQ
BS 591 591 RR2AH21JQ
BS 592 633 RR2EW74JQ
BS 634 795 RR2AH21TF

RD RR2FL88JQ 565 0 0
AAGTAAAACAACGGTTGTAAGAGTTTAGGCATCTTGACAACTTCCGATACCGAAATGTTG
CGTTCTAAAAGTTTCAAAAACATTTTCAACTGTGTTACATTACACCAGCGGCATGTATAT
ATATATTTATTCCAATTTAAAAAAAA*TCTAAAAATATTTAAAGAAAGTGAAAACAGAAA
GCAAAACTCGGTGCCGGAGTCAGTGGTGGTGCTCATGGTCTTCATCACCGTGACCATCCG
GAGGCCCTCCAGGACCAACCACTTCCAGCTCAAAGTACTGAGTGCAGACAGGGCATTCAA
AAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACCACACAACGTCGTGTTCATCCTCGCCTTCGCCAC
CAGGGCATCCCACAATTCGCTTGTCATAGTAGGACTTCACAATAGCTGGAGCTTCCTTAG
TTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCGATATCAAGCAGCCTCCTCCCCTCGAGTTCAGCTT
CAAGCTCTTCCTTCTCGTGTCCAGTAGCGATGGGCATTACATCCTCCACCTTCTTATTCA
CAGAAGTCTCTACTACTGGTTCGGA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2EW74JQ 633 0 0
ATCTGATTCAAGAATTCTTACAAAAGTAAAACAACGGTTGTAAGAGTTTAGGCATCTTGA
CAACTTCCGATACCGAAATGTTGCGTTCTAAAAGTTTCAAAAACATTTTCAACTGTGTTA
CATTACACCAGCGGCATGTATATATATATTTATTCCAATTTAAAAAAAAATCTAAAAATA
TTTAAAGAAAGTGAAAACAGAAAGAAAAACTCGGTGCCGGAGTCAGTGGTGGTGCTCATG
GTCTTCATCACCGTGACCATCCGGAGGCCCTCCAGGACCAACCACTTCCAGCTCAAAGTA
CTGAGTGCAGACAGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACCACACAACGTC
GTGTTCATCCTCGCCTTCGCCACCAGGGCATCCCACAATTCGCTTGTCATAGTAGGACTT
CACGATAGCTGGAGCTTCCTTAGTTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCGATATCAAGCAG
CCTCCTCCCCTCGAGTTCAGCTTCAAGCTCTTCCTTCTCGTGTCCAGTAGCGATGGGCAT
TACATCCTCCACCTTCTTATTCACAGAAGTCTCTACTACTGGTTCGGAGCTGAAATGGCG
AGGGATGACGGAAGAAGAAGCAGAAATGGCTGA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2AH21JQ 599 0 0
ACAA
AAGTAAAACAACGGTTGTAAGAGTTTAGGCATCTTGACAACTTCCGATACCGAAATGTTG
CGTTCTAAAAGTTTCAAAAACATTTTCAACTGTGTTACATTACACCAGCGGCATGTATAT
ATATATTTATTCCAATTTAAAAAAAA*TCTAAAAATATTTAAAGAAAGTGAAAACAGAAA
GCAAAACTCGGTGCCGGAGTCCGTGGTGGTGCTCATGGTCTTCATCACCGTGACCATCCG
GAGGCCCTCCAGGACCAACCACTTCCAGCTCAAAGTACTGAGTGCAGACAGGGCATTCAA
AAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACCACACAACGTCGTGTTCATCCTCGCCTTCGCCAC
CAGGGCATCCCACAATTCGCTTGTCATAGTAGGACTTCACAATAGCTGGAGCTTCCTTAG
TTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCGATATCAAGCAGCCTCCTCCCCTCGAGTTCAGCTT
CAAGCTCTTCCTTCTCGTGTCCAGTAGCGATGGGCATTACATCCTCCACCTTCTTATTCA
CAGAAGTCTCTACTACTGGTTCGGAGCCGAAATGGCGAGGGATGACGGAAGAAGA

QA 5 599 5 599
DS 

RD RR2AH21TF 642 0 0
TCCAATTTAAAAAAAA*TCTAAAAATATTTAAAGAAAGTGAAAACAGAAAGCAAAACTCG
GTGCCGGAGTCCGTGGTGGTGCTCATGGTCTTCATCACCGTGACCATCCGGAGGCCCTCC
AGGACCAACCACTTCCAGCTCAAAGTACTGAGTGCAGACAGGGCATTCAAAAGACTTTCC
TTTCTCCAGCCAGAACCACACAACGTCGTGTTCATCCTCGCCTTCGCCACCAGGGCATCC
CACAATTCGCTTGTCATAGTAGGACTTCACAATAGCTGGAGCTTCCTTAGTTCCAAAAGG
ACCTTCAGGGAAGTCGATATCAAGCAGCCTCCTCCCCTCGAGTTCAGCTTCAAGCTCTTC
CTTCTCGTGTCCAGTAGCGATGGGCATTACATCCTCCACCTTCTTATTCACAGAAGTCTC
TACTACTGGTTCGGAGCCGAAATGGCGAGGGATGACGGAAGAAGAAGCAGAAATGGCTGA
TCGATTGGCAGCGAGGTATAAGCCAGCGGGTCTCGAGGTGGCGGTTATCGATCGACAGGG
AGGAGAAGCAGCGGCGACATCAGCGGCTAGGGTTTTGAGACCGGAGGAGATGATTCTTCT
CCACATGGTGTGACGAAACGATGGATGGACTTAGGGACTCCC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 3 8

CO CL768Contig1 813 2 12 U
GGGACAAGACAGTCGAGGGTGGAGCCTTGTTGACTAGTTTCGGATCAAAGTAAAGTACAC
CATTTCAACAGTAAAAGGAACATGCTTCGAGAGGTGGACATGTTTCTTCTATTGACATAC
ACATATGTATTCAACTACTGGGAACAAGAAAAGCAACAACAACAGAGATTAATATGTCAT
GAACTCTTCTCTTCCAGTAAGATCTGTAACTCCAAATCTTCACTTCCTCTCTTGATCGCT
AGTTTCACATTATCACCCACACTATACTCATCCAATACCTCCATCAATTCAGCTTTGCTT
CTCACGGATTTATCATCAACTGCAACAATGATATCTCCAAGTACTATATTACCAGCAAAA
CCTCGGGATGTTGGACGTAGCCCTGCCTTTGCAGCCAGACTATCTCCAGGCACCTGAAGT
ACAAGAGCTCCATTACGAACATTGAGTTGATTAGCTACTTGATCTGGAGCTAACTCTATG
TTAATACCAGCTCGAAGGACTTTGGTGAATTGGATTAGTTGAGGAACAATCTTCAATACA
GTTGATGACGGTATTGCAAATCCAACACCAGCAGATGTTCCTGTCTGTGTGTATATGGCT
GTGTTGATACCAATTAAGTTTCCTTTTGAATCGAGCAGAGGACCTCCACTGTTTCCCGGG
TTAATAGCTGCATCGGTTTGAATCCCGCCACCAATGGTAACACCGGTTTGGCTAAAAATG
TCACGGTTAAGACCGCTGATGACACCGACCGTAAGGGTGTGGTCAAAACCAAACGGGTTC
CCAATTGCTAAACACTGCTGCCCAACTTTAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH01JQ U 1
AF RR2FY90JQ U 46
BS 1 121 RR2BH01JQ
BS 122 122 RR2FY90JQ
BS 123 198 RR2BH01JQ
BS 199 199 RR2FY90JQ
BS 200 248 RR2BH01JQ
BS 249 249 RR2FY90JQ
BS 250 280 RR2BH01JQ
BS 281 281 RR2FY90JQ
BS 282 386 RR2BH01JQ
BS 387 387 RR2FY90JQ
BS 388 566 RR2BH01JQ
BS 567 813 RR2FY90JQ

RD RR2BH01JQ 566 0 0
GGGACAAGACAGTCGAGGGTGGAGCCTTGTTGACTAGTTTCGGATCAAAGTAAAGTACAC
CATTTCAACAGTAAAAGGAACATGCTTCGAGAGGTGGACATGTTTCTTCTATTGACATAC
ATATATGTATTCAACTACTGGGAACAAGAAAAGCAACAACAACAGAGATTAATATGTCAT
GAACTCTTCTCTTCCAGTGAGATCTGTAACTCCAAATCTTCACTTCCTCTCTTGATCGCT
AGTTTCACCTTATCACCCACACTATACTCATCCAATACCTTCATCAATTCAGCTTTGCTT
CTCACGGATTTATCATCAACTGCAACAATGATATCTCCAAGTACTATATTACCAGCAAAA
CCTCGGGATGTTGGACGTAGCCCTGCTTTTGCAGCCAGACTATCTCCAGGCACCTGAAGT
ACAAGAGCTCCATTACGAACATTGAGTTGATTAGCTACTTGATCTGGAGCTAACTCTATG
TTAATACCAGCTCGAAGGACTTTGGTGAATTGGATTAGTTGAGGAACAATCTTCAATACA
GTTGATGACGGTATTGCAAATCCAAC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2FY90JQ 768 0 0
CAAAGTAAAGTACACCATTTCAACAGTAAAAGGAACATGCTTCGAGAGGTGGACATGTTT
CTTCTATTGACATACACATATGTATTCAACTACTGGGAACAAGAAAAG*AACAAGAACAG
AGATTAATATGTCATGAACTCTTCTCTTCCAGTAAGATCTGTAACTCCAAATCTTCACTT
CCTCTCTTGATCGCTAGTTTCACATTATCACCCACACTATACTCATCCAATACCTCCATC
AATTCAGCTTTGCTTTTCACGGGTTTATCATCAACTGCAACAATGATATCTCCAAGTACT
ATATTACCAGCAAAACCTCGGGATGTTGGACGTAGCCCTGCCTTTGCAGCCAGACTATCT
CCGGGCACCTGAAGTACAAGAGCTCCATTACGAACATTGAGTTGATTAGCTACTTGATCT
GGAGCTAACTCTATGTTAATACCAGCTCGAAGGACTTTGGTGAATTGGATTAGTTGAGGA
ACAATCTTCAGTACAGTTGATGATGGTATTGCAAATCCAACACCAGCAGATGTTCCTGTC
TGTGTGTATATGGCTGTGTTGATACCAATTAAGTTTCCTTTTGAATCGAGCAGAGGACCT
CCACTGTTTCCCGGGTTAATAGCTGCATCGGTTTGAATCCCGCCACCAATGGTAACACCG
GTTTGGCTAAAAATGTCACGGTTAAGACCGCTGATGACACCGACCGTAAGGGTGTGGTCA
AAACCAAACGGGTTCCCAATTGCTAAACACTGCTGCCCAACTTTAAGA

QA 1 768 1 768
DS 



CO CL768Contig2 1481 4 38 U
GGAGAGTTTGTCGGAGAAAGATGCAGGTGATTGCGTCCTGCTCTTTGCGACCTGAGAATG
ATTTTGTGGGTCGACGACAGCTTCTCTCCTCCGCGTGCTCCAGAATCTCCCAAGGCGACG
TCGTTTCAGACCGACCAGCTTCTTCAGTGAAGATTGGTCAAGATTGGAAGTCGAATTTGC
ATGAATTAGCCATGAAAAGTAGTGTCCCTTCGACCACAAGGCGAATCTTGTTGACAAGTA
TATTCATGAACCTGTGCTGTAATCCTTCAAGGTACTTATCAGCACTAGCACTTGGCGATC
CATCTGTTGCGACAGTTGAAGATGTAACCCCACCTGTTGTTTTCCCAGCTGGACCTCTTT
TCCCTACCGAGGGGAGAATTGTTCAACTGTTTGAGAAGAATACTTACTCTGTTGTCAACA
TATTTGATGTGACATTACGGCCTCAGCTCAAAATGACGGGTGTGGTTGAGATACCTGAAG
GAAATGGCTCTGGAGTAGTTTGGGATGAACAGGGATACATTGTGACCAATTATCACGTTA
TTGGCAATGCTCTTTCAAGAAATCCAAGCCCTGGTGATGTAGTTGGTCGTGTCAATATTC
TTACATCTGATGGGGTACAGAAGAATTTCGAAGGGAAACTTGTTGGTGCTGATCGTGCTA
AGGATCTTGCTGTCTTGAAGGTAGAAGCACCCGAAACACTCCTTAAACCGATCAGAGTTG
GACAATCAAATTCTCTTAAAGTTGGGCAGCAGTGTTTAGCAATTGGGAACCCGTTTGGTT
TTGACCACACCCTTACGGTCGGTGTCATCAGCGGTCTTAACCGTGACATTTTTAGCCAAA
CCGGTGTTACCATTGGTGGTGGGATTCAAACCGATGCAGCTATTAACCCGGGAAACAGTG
GAGGTCCTCTGCTAGATTCAAAAGGAAACTTAATTGGTATCAACACAGCCATATACACAC
AGACAGGAACATCTGCTGGTGTTGGATTTGCAATACCGTCATCAACTGTATTGAAGATTG
TTCCTCAACTAATCCAATTCACCAAAGTCCTTCGAGCTGGTATTAACATAGAGTTAGCTC
CAGATCAAGTAGCTAATCAACTCAATGTTCGTAATGGAGCTCTTGTACTTCAGGTGCCTG
GAGATAGTCTGGCTGCAAAAGCAGGGTTACGTCCAACATCCCGAGGTTTTGCTGGTAATA
TAGTACTTGGAGATATCATTGTTGCAGTTGATGATAAACCCGTGAAAAGCAAAGCTGAAT
TGATGAAGGTATTGGATGAGTATAGCGTGGGTGATAAGGTGAAGCTAGCGATAAAGAGAG
GAAGTGAAGATTTGGAGTTACAGATCTCATTGGAAGAGAAGAGTTCATGACATTATTAAT
CCCTCTGTTGTTTCTTTCTCGTTTCCAGTCGTTGAATACATATATGTAATGTCAATAGAA
GAAACATGTCCACCTCTCGAAGCATGTTCCTTTTACTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP93TF U 1
AF RR2FY90TF U 1
AF RR2BH01TF U 368
AF RR2DP93JQ C 706
BS 1 312 RR2DP93TF
BS 313 313 RR2FY90TF
BS 314 327 RR2DP93TF
BS 328 328 RR2FY90TF
BS 329 389 RR2DP93TF
BS 390 390 RR2FY90TF
BS 391 409 RR2DP93TF
BS 410 410 RR2FY90TF
BS 411 439 RR2DP93TF
BS 440 440 RR2FY90TF
BS 441 496 RR2DP93TF
BS 497 497 RR2FY90TF
BS 498 509 RR2DP93TF
BS 510 510 RR2FY90TF
BS 511 574 RR2DP93TF
BS 575 575 RR2FY90TF
BS 576 625 RR2DP93TF
BS 626 662 RR2FY90TF
BS 663 663 RR2BH01TF
BS 664 680 RR2FY90TF
BS 681 681 RR2BH01TF
BS 682 691 RR2FY90TF
BS 692 692 RR2BH01TF
BS 693 724 RR2FY90TF
BS 725 725 RR2BH01TF
BS 726 729 RR2FY90TF
BS 730 730 RR2BH01TF
BS 731 739 RR2FY90TF
BS 740 740 RR2BH01TF
BS 741 761 RR2FY90TF
BS 762 762 RR2BH01TF
BS 763 781 RR2FY90TF
BS 782 782 RR2BH01TF
BS 783 793 RR2FY90TF
BS 794 811 RR2BH01TF
BS 812 812 RR2DP93JQ
BS 813 1113 RR2BH01TF
BS 1114 1481 RR2DP93JQ

RD RR2DP93TF 627 0 0
GGAGAGTTTGTCGGAGAAAGATGCAGGTGATTGCGTCCTGCTCTTTGCGACCTGAGAATG
ATTTTGTGGGTCGACGACAGCTTCTCTCCTCCGCGTGCTCCAGAATCTCCCAAGGCGACG
TCGTTTCAGACCGACCAGCTTCTTCAGTGAAGATTGGTCAAGATTGGAAGTCGAATTTGC
ATGAATTAGCCATGAAAAGTAGTGTCCCTTCGACCACAAGGCGAATCTTGTTGACAAGTA
TATTCATGAACCTGTGCTGTAATCCTTCAAGGTACTTATCAGCACTAGCACTTGGCGATC
CATCTGTTGCGAGAGTTGAAGATGTAAGCCCACCTGTTGTTTTCCCAGCTGGACCTCTTT
TCCCTACCGAGGGGAGAATTGTTCAACTGCTTGAGAAGAATACTTACTCCGTTGTCAACA
TATTTGATGTGACATTACGTCCTCAGCTCAAAATGACGGGTGTGGTTGAGATACCTGAAG
GAAATGGCTCTGGAGTGGTTTGGGATGAAAAGGGATACATTGTGACCAATTATCACGTTA
TTGGCAATGCTCTTTCAAGAAATCCAAGCCCTGGCGATGTAGTTGGTCGTGTCAATATTC
TTACATCTGATGGGGTACAGAAGAA
TT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2FY90TF 793 0 0
GGAGAGTTT
GTCGGAGAAAGATGCAGGTGATTGCGTCCTGCTCTTTGCGACCTGAGAATGATTTTGTGG
GTCGACGACAGCTTCTCTCCTCCGCGTGCTCCAGAATCTCCCAAGGCGACGTCGTTTCAG
ACCGACCAGCTTCTTCAGTGAAGGTTGGTCAAGATTGGAAGTCGAGTTTGCATGAGTTAG
CCATGAAAAGTAGTGTCCCTTCGACCACAAGGCGAATCTTGTTGACAAGTATATTCATGA
ACCTGTGCTGTAATCCTTCAAGGTACTTATCAGCACTAGCACTTGGCGATCCATCTGTTG
CGACAGTTGAAGATGTAACCCCACCTGTTGTTTTCCCAGCTGGACCTCTTTTCCCTACCG
AGGGGAGAATTGTTCAACTGTTTGAGAAGAATACTTACTCTGTTGTCAACATTTTTGATG
TGACATTACGGCCTCAGCTCAAAATGACGGGTGTGGTTGAGATACCTGAAGGAAATGGCT
CTGGAGTAGTTTGGGATGAACAGGGATACATTGTGACCAATTATCACGTTATTGGCAATG
CTCTTTCAAGAAATCCAAGCCCTGGTGATGTAGTTGGTCGTGTCAATATTCTTACATCTG
ATGGGGTACAGAAGAATTTCGAAGGGAAACTTGTTGGTGCTGATCGTGCTAAG*ATCTTG
CTGTCTTGAAG*TAGAAGCACCTGAAACACTCCTTAAACCGATCAGAGTTGGACA*TCAA
*TTCTCTTAA*GTTGGGCAGCAGTGTTTAGCA*TTGGGAACCCGTTTGGTTT*GACCACA
CCCT

QA 10 793 10 793
DS 

RD RR2BH01TF 746 0 0
G
GAGGGGAGAATTGTTCAACTGTTTGAGAAGAATACTTACTCTGTTGTCAACATATTTGAT
GTGACATTACGGCCTCAGCTCAAAATGACGGGTGTGGTTGAGATACCTGAAGGAAATGGC
TCTGGAGTAGTTTGGGATGAACAGGGATACATTGTCACCAATTATCACGTTATTGGCAAT
GCTCTTTCAAGAAATCCAAGCCCTGGTGATGTAGTTGGTCGTGTCAATATTCTTACATCT
GATGGGGTGCAGAAGAATTTCGAAGGGAAACTTGTTGGTGCTGATCGTGCTAAGGATCTT
GCTGTCTTGAAGGTAGAAGCACCCGAAACACTCCTTAAACCGATCAGAGTTGGACAATCA
AATTCTCTTAAAGTTGGGCAGCAGTGTTTAGCAATTGGGAACCCGTTTGGTTTTGACCAC
ACCCTTACGGTCGGTGTCATCAGTGGTCTTAACCGTGACATTTTTAGCCAAACCGGTGTT
ACCATTGGTGGTGGGATTCAAACCGATGCAGCTATTAACCCGGGAAACAGTGGAGGTCCT
CTGCTAGATTCAAAAGGAAACTTAATTGGTATCAACACAGCCATATACACACAGACAGGA
ACATCTGCTGGTGTTGGATTTGCAATACCGTCATCAACTGTATTGAAGATTGTTCCTCAA
CTAATCCAATTCACCAAAGTCCTTCGAGCTGGTATTAACATAGAGTTAGCTCCAGATCAA
GTAGCTAATCAACTCAATGTTCGTA

QA 2 746 2 746
DS 

RD RR2DP93JQ 776 0 0
AACCGATCAGAGTTGGACAATCAAATTCTCTTAAAGTCGGGCAGCAGTGTTTAGCAATTG
GGAACCCGTTTGGTTTTGACCATACCCTTACGGTCGGTGTCATCAGCGGTCTTAACCGTG
ACATTTTTAGCCAAACCGGTGTTACCATTGGTGGTGGGATTCAAACCGATGCAGCTATTA
ACCCGGGAAACAGTGGAGGTCCTCTGCTCGATTCAAAAGGAAACTTAATTGGTATCAACA
CAGCCATATACACACAGACAGGAACATCTGCTGGTGTTGGATTTGCAATACCGTCATCAA
CTGTATTGAAGATTGTTCCTCAACTAATCCAATTCACCAAAGTCCTTCGAGCTGGTATTA
ACATAGAGTTAGCTCCAGATCAAGTAGCTAATCAACTCAATGTTCGTAATGGAGCTCTTG
TACTTCAGGTGCCTGGAGATAGTCTGGCTGCAAAAGCAGGGTTACGTCCAACATCCCGAG
GTTTTGCTGGTAATATAGTACTTGGAGATATCATTGTTGCAGTTGATGATAAACCCGTGA
AAAGCAAAGCTGAATTGATGAAGGTATTGGATGAGTATAGCGTGGGTGATAAGGTGAAGC
TAGCGATAAAGAGAGGAAGTGAAGATTTGGAGTTACAGATCTCATTGGAAGAGAAGAGTT
CATGACATTATTAATCCCTCTGTTGTTTCTTTCTCGTTTCCAGTCGTTGAATACATATAT
GTAATGTCAATAGAAGAAACATGTCCACCTCTCGAAGCATGTTCCTTTTACTGTTG

QA 1 776 1 776
DS 



CO CL768Contig3 1076 2 4 U
GGAGAGTTTGTCGGAGAAAGATGCAGATGATTGCGTCCTGCTCTTTGCGACCTGAGAATG
ATTTTGTGGGTCGACGACAGCTTCTCTCCTCCGCGTGCTCCAGAATCTCCCAAGGCGACG
TCGTTTCAGACCGACCAGCTTCTTCAGTGAAGGTTGGTCAAGATTGGAAGTCGAGTTTGC
ATGAGTTAGTCATGAAAAGTAGTGTCCCTTCGACCACAAGGCGAATCTTGTTGACAAGTA
TATTCATGAACCTGTGCTGTAATCCTTCAAGGTACTTATCAGCACTAGCACTTGGCGATC
CATCTGTTGCGACAGTTGAAGATGTAACCCCACCTGTTGTTTTCCCAGCTGGACCTCTTT
TCCCTACCGAGGGGAGAATTGTTCAACTGTTTGAGAAGAATACTTACTCTGTTGTCAACA
TTTTTGATGTGACATTACGGCCTCAGCTCAAAATGACGGGTGTGGTTGAGATACCTGAAG
GAAATGGCTCTGGAGTAGTTTGGGATGAACAGGGATACATTGTGACCAATTATCACGTTA
TTGGCAATGCTCTTTCAAGAAATCCAAGTCCTGGTGATGTAGTTGGTCGTGTCAATATTC
TTACATCTGATGGGGTACAGAAGAACTTCGAGCTGGTATTAACATAGAGTTAGCTCCAGA
TCAAGTAGCTAATCAACTCAATGTTCGTAATGGAGCTCTTGTACTTCAGGTGCCTGGAGA
TAGTCTGGCTGCAAAGGCAGGGCTACGTCCAACATCCCGAGGTTTTGCTGGTAATATAGT
ACTTGGAGATATCATTGTTGCAGTTGATGATAAACCCGTGAAAAGCAAAGCTGAATTGAT
GAAGGTATTGGATGAGTATAGTGTGGGTGATAATGTGAAACTAGCGATCAAGAGAGGAAG
TGAAGATTTGGAGTTACAGATCTTACTGGAAGAGAAGAGTTCATGACATATTAATCTCTG
TTCTTGTTCTTTTCTTGTTCCCAGTAGTTGAATACATATATGTATGTCAATAGAAGAAAC
ATGTCCACCTCTCGAAGCATGTTCCTTTTACTGTTGAAATGGTGTACTTTACTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB77TF U 1
AF RR2HB77JQ C 318
BS 1 639 RR2HB77TF
BS 640 640 RR2HB77JQ
BS 641 703 RR2HB77TF
BS 704 1076 RR2HB77JQ

RD RR2HB77TF 703 0 0
GGAGAGTTTGTCGGAGAAAGATGCAGATGATTGCGTCCTGCTCTTTGCGACCTGAGAATG
ATTTTGTGGGTCGACGACAGCTTCTCTCCTCCGCGTGCTCCAGAATCTCCCAAGGCGACG
TCGTTTCAGACCGACCAGCTTCTTCAGTGAAGGTTGGTCAAGATTGGAAGTCGAGTTTGC
ATGAGTTAGTCATGAAAAGTAGTGTCCCTTCGACCACAAGGCGAATCTTGTTGACAAGTA
TATTCATGAACCTGTGCTGTAATCCTTCAAGGTACTTATCAGCACTAGCACTTGGCGATC
CATCTGTTGCGACAGTTGAAGATGTAACCCCACCTGTTGTTTTCCCAGCTGGACCTCTTT
TCCCTACCGAGGGGAGAATTGTTCAACTGTTTGAGAAGAATACTTACTCTGTTGTCAACA
TTTTTGATGTGACATTACGGCCTCAGCTCAAAATGACGGGTGTGGTTGAGATACCTGAAG
GAAATGGCTCTGGAGTAGTTTGGGATGAACAGGGATACATTGTGACCAATTATCACGTTA
TTGGCAATGCTCTTTCAAGAAATCCAAGTCCTGGTGATGTAGTTGGTCGTGTCAATATTC
TTACATCTGATGGGGTACAGAAGAACTTCGAGCTGGTAT*AACATAGAGTTAGCTCCAGA
TCAAGTAGCTAATCAACTCAATGTTCGTAATGGAGCTCTTGTA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2HB77JQ 759 0 0
GAAGATGTAACCCCACCTGTTGTTTTCCCAGCTGGACCTCTTTTCCCTACCGAGGGGAGA
ATTGTTCAACTGTTTGAGAAGAATACTTACTCTGTTGTCAACATTTTTGATGTGACATTA
CGGCCTCAGCTCAAAATGACGGGTGTGGTTGAGATACCTGAAGGAAATGGCTCTGGAGTA
GTTTGGGATGAACAGGGATACATTGTGACCAATTATCACGTTATTGGCAATGCTCTTTCA
AGAAATCCAAGTCCTGGTGATGTAGTTGGTCGTGTCAATATTCTTACATCTGATGGGGTA
CAGAAGAACTTCGAGCTGGTATTAACATAGAGTTAGCTCCAGATCAAGTAGCTAATCAAC
TCAATGTTCGTAATGGAGCTCTTGTACTTCAGGTGCCTGGAGATAGTCTGGCTGCAAAGG
CAGGGCTACGTCCAACATCCCGAGGTTTTGCTGGTAATATAGTACTTGGAGATATCATTG
TTGCAGTTGATGATAAACCCGTGAAAAGCAAAGCTGAATTGATGAAGGTATTGGATGAGT
ATAGTGTGGGTGATAATGTGAAACTAGCGATCAAGAGAGGAAGTGAAGATTTGGAGTTAC
AGATCTTACTGGAAGAGAAGAGTTCATGACATATTAATCTCTGTTCTTGTTCTTTTCTTG
TTCCCAGTAGTTGAATACATATATGTATGTCAATAGAAGAAACATGTCCACCTCTCGAAG
CATGTTCCTTTTACTGTTGAAATGGTGTACTTTACTTTG

QA 1 759 1 759
DS 



AS 2 9

CO CL769Contig1 802 7 16 U
GGATCTCTTGCAGCGGCACCACCACATCCCCGGAGGCTACAATGGGTATCGATTTGATCG
CTGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGGACAGCTCCTAAGTCCGATGATGTCTACCTCA
AGCTTATTGTCAAGCTTTACCGGTTTCTGGTGAGAAGAACTCAGAGCAAGTTCGACGCAG
TGATCTTGAAGAGGCTTTTCATGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCTCTGTCTAGAC
TCGTCGAGTTCATGACCGGCAAGGAAGATAAGATTGCTGTCTTGGTTGGAACCATCACCG
ATGATTTGAGAGTACATGAGATCCCAGCTATCAAAGTTACAGCCTTGAGGTTCACAGAGA
GAGCAAGAGCTCGCATTGAGAAAGCTGGTGGTGAATGTTTAACCTTTGACCAGCTTGCTC
TCAGAGCTCCTTTGGGACAGAACACTGTTCTTCTTAGAGGACCTAAGAACTCACGTGAGG
CTGTGAAGCATTTTGGTCCAGCACCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCATATGTTC
GGTCCAAGGGAAGGAAGTTCGAGAAAGCCAGAGGAAAGAGGAAGAGCCGTGGATTCAAGG
TTTAAGAACATTGTCTGTGTCATTGAACTTGATCCTATTGTGTTGTTGCTTCTTCATCTC
TTTCATAATCGGATTTTTGTTAGAGAATTGTGTTTTTTTTT*CAGTGCCTTGTTTCAGAC
AATATCTAAAGTTTGTGACTACTGTTGAGCTTATTACAATACTGAGCTTTACTATGTTTA
TCAAGCTTCACATTCTTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 10 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 
15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ68TF U 8
AF RR2EF28JQ C 121
AF RR2D464TF U -2
AF RR2EF28TF U -2
AF RR2DQ68JQ C 35
AF RR2D984TF U 1
AF RR2D984JQ C 243
BS 1 17 RR2D984TF
BS 18 19 RR2D464TF
BS 20 107 RR2D984TF
BS 108 108 RR2DQ68TF
BS 109 205 RR2D984TF
BS 206 206 RR2D464TF
BS 207 359 RR2D984TF
BS 360 360 RR2DQ68TF
BS 361 598 RR2D984TF
BS 599 599 RR2D464TF
BS 600 653 RR2D984TF
BS 654 654 RR2D464TF
BS 655 677 RR2D984TF
BS 678 678 RR2EF28JQ
BS 679 786 RR2D984TF
BS 787 802 RR2D984JQ

RD RR2DQ68TF 562 0 0
GGGCAGCGGCGG
CACCACATCCCCGGAGGCTACAATGGGTATCGATTTGATCGCTGGAGGTAAGAGCAAGAA
GACCAAAAGGACAGCTCCTAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTATTGTCAAGCTTTA
CCGGTTTCTGGTGAGAAGAACTCAGAGCAAGTTCGACGCAGTGATCTTGAAGAGGCTTTT
CATGAGTAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCTCTGTCTAGACTCGTCGAGTTCATGACCGG
CAAGGAAGATAAGATTGCTGTCTTGGTTGGAACCATCACCGATGATTTGAGAGTACATGA
GATCCCAGCTATCAAAGTTACAGCCTTGAGGTTCACAGAGAGAGCAAGAGCTCGCATTGA
GAAAGCTGGTGGTGAATGTTTAACCTTTGACCAGCTTGCTCTCAGAGCTCCTTTGGGACA
GAACACTGTTCTTCTTAGAGGACCTAAGAACTCACGTGAGGCTGTGAAGCATTTTGGTCC
AGCACCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCATATGTTCGGTCCAAGGGAAGGAAGTT
CGAGAAAGCC

QA 13 562 13 562
DS 

RD RR2EF28JQ 653 0 0
AGCTTATTGTCAAGCTTTACCGGTTTCTGGTGAGAAGAACTCAGAGCAAGTTCGACGCAG
TGATCTTGAAGAGGCTTTTCATGAGCAAAGTCAACAAAGTTCCTCTTTCTCTGTCTAGAC
TCGTCGAGTTCATGACCGGCAAGGAAGATAAGATTGCTGTCTTGGTTGGAACCATCACCG
ATGATTTGAGAGTACACGAGATCCCAGCTATCAAAGTTACGGCCTTGAGGTTCACAGAGA
GAGCCAGAGCTCGCATTGAGAAAGCTGGTGGTGAATGCTTAACTTTTGACCAGCTTGCTC
TCAGAGCTCCTTTGGGACAGAACACTGTTCTTCTTAGAGGACCTAAGAACTCACGTGAGG
CTGTGAAGCATTTTGGTCCAGCACCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCATATGTTC
GGTCCAAGGGAAGGAAGTTCGAGAAAGCCAGAGGAAAGAGGAAGAGCCGTGGATTCAAGG
TTTAAGAACATTGTCTGTGTCATTGAACTTGATCCTATTGTGTTGTTGCTTCTTCATCTC
TTTCATAATCGGATTTTTGTTAGAGAATTGTGTTTTTTTTT*CAGTGCCTTGCTTCAGAC
AATATCTAAAGTTTGTGACTACTGTTGAGCTTATTACAATACTGAGCTTTAC
C

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2D464TF 752 0 0
GGATCTCTTGCAGCGGCGG
CACCACCACATCCCCGGAGGTTACGATGGGTATCGATTTGATCGCTGGAGGTAAGAGCAA
GAAGACCAAAAGGACAGCTCCTAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTATTGTCAAGCT
TTACCGGTTTCTGGTGAGAAGAACTCAGAGCAAGTTCGACGCAGTGATCTTGAAGAGGCT
TTTCATGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCTCTGTCTAGACTCGTCGAGTTCATGAC
CGGCAAGGAAGATAAGATTGCTGTCTTGGTTGGAACCATCACCGATGATTTGAGAGTACA
CGAGATCCCAGCTATCAAAGTTACGGCCTTGAGGTTCACAGAGAGAGCCAGAGCTCGCAT
TGAGAAAGCTGGTGGTGAATGCTTAACTTTTGACCAGCTTGCTCTCAGAGCTCCTTTGGG
ACAGAACACTGTTCTTCTTAGAGGACCTAAGAACTCACGTGAGGCTGTGAAGCATTTTGG
TCCAGCACCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCATATGTTCGGTCCAAGGGAAGGAA
GTTCGAGAAAGCCAGAGGAAAGAGGAAGAGCCGTGGATTCAAGGTTTAAGAACATTGTCT
GTGTCATTGAACTTGATCCTATTGTGTTGTTGCTTCTTCATCTCTTTCATAATCGGATTT
T*GTTAGAGAATTGTGCTTTTTTT**CAGTGCCTTG*TTCAGACA*TATCTAAAGTTTGT
GACTACTGTTGAG

QA 20 752 20 752
DS 

RD RR2EF28TF 771 0 0
GGATCTCTTGCAGCGGCGG
CACCACCACATCCCCGGAGGTTACGATGGGTATCGATTTGATCGCTGGAGGTAAGAGCAA
GAAGACCAAAAGGACAGCTCCTAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTATTGTCAAGCT
TTACCGGTTTCTGGTGAGAAGAACTCAGAGCAAGTTCGACGCAGTGATCTTGAAGAGGCT
TTTCATGAGCAAAGTCAACAAAGTTCCTCTTTCTCTGTCTAGACTCGTCGAGTTCATGAC
CGGCAAGGAAGATAAGATTGCTGTCTTGGTTGGAACCATCACCGATGATTTGAGAGTACA
CGAGATCCCAGCTATCAAAGTTACGGCCTTGAGGTTCACAGAGAGAGCCAGAGCTCGCAT
TGAGAAAGCTGGTGGTGAATGCTTAACTTTTGACCAGCTTGCTCTCAGAGCTCCTTTGGG
ACAGAACACTGTTCTTCTTAGAGGACCTAAGAACTCACGTGAGGCTGTGAAGCATTTTGG
TCCAGCACCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCATATGTTCGGTCCAAGGGAAGGAA
GTTCGAGAAAGCCAGAGGAAAGAGGAAGAGCCGTGGATTCAA*GTTTAAGAACATTGTCT
GTGTCATTGAACTTGATCCTATTGTGTTGTTGCTTCTTCATCTCTTTCATAATCGGATTT
T*GTTAGAGAATTGTGTTTTTTTT**CAGTGCCTTGCTTCAGACA*TATCTAAAGTT*GT
GACTACTGTTGAGCT
ATACATACTGAGCTTAC

QA 20 754 20 754
DS 

RD RR2DQ68JQ 738 0 0
G
GCTACAATGGGTATCGATTTGATCGCTGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGGACAGCT
CCTAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTATTGTCAAGCTTTACCGGTTTCTGGTGAGA
AGAACTCAGAGCAAGTTCGACGCAGTGATCTTGAAGAGGCTTTTCATGAGTAAAGTCAAC
AAAGCTCCTCTTTCTCTGTCTAGACTCGTCGAGTTCATGACCGGCAAGGAAGATAAGATT
GCTGTCTTGGTTGGAACCATCACCGATGATTTGAGAGTACATGAGATCCCAGCTATCAAA
GTTACAGCCTTGAGGTTCACAGAGAGAGCAAGAGCTCGCATTGAGAAAGCTGGTGGTGAA
TGTTTAACCTTTGACCAGCTTGCTTTCAGAGCTCCTTTGGGACAGAACACTGTTCTTCTT
AGAGGACCTAAGAACTCACGTGAGGCTGTGAAGCATTTTGGTCCAGCACCTGGTGTGCCA
CACAGTCACTCCAAGCCATATGTTCGGTCCAAGGGAAGGAAGTTCGAGAAAGCCAGAGGA
AAGAGGAAGAGCCGTGGATTCAAGGTTTAAGAACATTGTCTGTGTCATTGAACTTGATCC
TATTGTGTTGTTGCTTCTTCATCTCTTTCATAATCGGATTTTTGTTAGAGAATTGTGTTT
TTTTTT*CAGTGCCTTGTTTCAGACAATATCTAAAGTTTGTGACTACTGTTGAGCTTATT
ACAATACTGAGCTTTAC

QA 2 738 2 738
DS 

RD RR2D984TF 786 0 0
GGATCTCTTGCAGCGGCGGCACCACATCCCCGGAGGCTACAATGGGTATCGATTTGATCG
CTGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGGACAGCTCCTAAGTCCGATAATGTCTACCTCA
AGCTTATTGTCAAGCTTTACCGGTTTCTGGTGAGAAGAACTCAGAGCAAGTTCGACGCAG
TGATCTTGAAGAGGCTTTTCATGAGTAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCTCTGTCTAGAC
TCGTCGAGTTCATGACCGGCAAGGAAGATAAGATTGCTGTCTTGGTTGGAACCATCACCG
ATGATTTGAGAGTACATGAGATCCCAGCTATCAAAGTTACAGCCTTGAGGTTCACAGAGT
GAGCAAGAGCTCGCATTGAGAAAGCTGGTGGTGAATGTTTAACCTTTGACCAGCTTGCTC
TCAGAGCTCCTTTGGGACAGAACACTGTTCTTCTTAGAGGACCTAAGAACTCACGTGAGG
CTGTGAAGCATTTTGGTCCAGCACCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCATATGTTC
GGTCCAAGGGAAGGAAGTTCGAGAAAGCCAGAGGAAAGAGGAAGAGCCGTGGATTCAAAG
TTTAAGAACATTGTCTGTGTCATTGAACTTGATCCTATTGTGTTGTTGCTTCTCCATCTC
TTTCATAATCGGATTTT*GTTAGAGAATTGTGTTTTTTTTT*CAGTGCCTTGTTTCAGAC
AATATCTAAAGTTTGTGACTACTGTTGAGCTTATTACAATACTGAGCTTTACTATGTTTA
TCAAGC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2D984JQ 560 0 0
GTCGAGTTCATGACCGGCAAGGAAGATAAGATTGCTGTCTTGGTTGGAACCATCACCGAT
GATTTGAGAGTACATGAGATCCCAGCTATCAAAGTTACAGCCTTGAGGTTCACAGAGTGA
GCAAGAGCTCGCATTGAGAAAGCTGGTGGTGAATGTTTAACCTTTGACCAGCTTGCTCTC
AGAGCTCCTTTGGGACAGAACACTGTTCTTCTTAGAGGACCTAAGAACTCACGTGAGGCT
GTGAAGCATTTTGGTCCAGCACCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCATATGTTCGG
TCCAAGGGAAGGAAGTTCGAGAAAGCCAGAGGAAAGAGGAAGAGCCGTGGATTCAAGGTT
TAAGAACATTGTCTGTGTCATTGAACTTGATCCTATTGTGTTGTTGCTTCTCCATCTCTT
TCATAATCGGATTTTTGTTAGAGAATTGTGTTTTTTTTTTCAGTGCCTTGTTTCAGACAA
TATCTAAAGTTTGTGACTACTGTTGAGCTTATTACAATACTGAGCTTTACTATGTTTATC
AAGCTTCACATTCTTTCCCC

QA 1 560 1 560
DS 



CO CL769Contig2 606 2 5 U
AATCCACGGCTCTTCCTCTTTCCTCTGGCTTTCTCGAACTTCTTTCCCTTGGACCGAACA
TACGGCTTGGAGTGACTGTGTGGCACACCAGGAGCAGGGCCAAAATGCTTCACGGCTTCA
CGTGAGTTCTTAGGTCCTCTAAAAAAAACAGTGTTCTGTCCCAAAGGAGCACTGAGAGCA
AGCTGGTCAAAGGTCAAGCATTCACCACCAGCTTTCTCAATCCGAGCTCTGGCTCTCTCT
GTGAACCTCAAGGCAGTAACTTTGATAGCTGGGATCTCGTGTACCCTCAAATCATCGGTG
ATGGTTCCAACCAAGACAGCAATCTTATCTTCCTTGCCGGTCATGAACTCGACGAGCCTG
GATAGAGAAAGGGGAGCTTTGTTGACTTTGCTCATGAAAAGCCTCTTCAAGATCACTGCA
TTGAACTTGCTCTGTGTTCTCCTTACCAGAAACCTGTAAAGCTTGACGGTAAGCTTGAGG
TAGACATCGTCCGACTTTGGAGCTGTCCTTTTGGTCTTCTTGCTCTTACCTCCTGCGATC
AAATCTATTCCCATTGTAGCGTCCGGGGATGTGGTGGTGGTGCCGCCGCCGTCGAAGCTT
GCGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO35JQ U 96
AF RR2DE75TF C 1
BS 1 99 RR2DE75TF
BS 100 190 RR2CO35JQ
BS 191 191 RR2DE75TF
BS 192 253 RR2CO35JQ
BS 254 606 RR2DE75TF

RD RR2CO35JQ 158 0 0
AGGG
CCAAAATGCTTCACGGCTTCACGTGAGTTCTTAGGTCCTCTAAAAAAAACAGTGTTCTGT
CCCAAAGGAGCACTGAGAGCAAGCTGGTCAAGGGTCAAGCATTCACCACCAGCTTTCTCA
ATCCGAGCTCTGGCTCTCTCTGTGAACCTCAAGG

QA 5 158 5 158
DS 

RD RR2DE75TF 606 0 0
AATCCACGGCTCTTCCTCTTTCCTCTGGCTTTCTCGAACTTCTTTCCCTTGGACCGAACA
TACGGCTTGGAGTGACTGTGTGGCACACCAGGAGCAGGGCCAAAATGCTTCACGGCTTCA
CGTGAGTTCTTAGGTCCTCTAAGAAGAACAGTGTTCTGTCCCAAAGGAGCACTGAGAGCA
AGCTGGTCAAAGGTCAAGCATTCACCACCAGCTTTCTCAATCCGAGCTCTGGCTCTCTCT
GTGAACCTCAAGGCAGTAACTTTGATAGCTGGGATCTCGTGTACCCTCAAATCATCGGTG
ATGGTTCCAACCAAGACAGCAATCTTATCTTCCTTGCCGGTCATGAACTCGACGAGCCTG
GATAGAGAAAGGGGAGCTTTGTTGACTTTGCTCATGAAAAGCCTCTTCAAGATCACTGCA
TTGAACTTGCTCTGTGTTCTCCTTACCAGAAACCTGTAAAGCTTGACGGTAAGCTTGAGG
TAGACATCGTCCGACTTTGGAGCTGTCCTTTTGGTCTTCTTGCTCTTACCTCCTGCGATC
AAATCTATTCCCATTGTAGCGTCCGGGGATGTGGTGGTGGTGCCGCCGCCGTCGAAGCTT
GCGCCC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 2 8

CO CL770Contig1 806 6 10 U
GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATACGG
CGGAGAGATTCCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCTGCTGATGA
TGATGCCGCTAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATAGAGGACGAAGC
TGCTGCTCTTCGTGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCCCAAGATGCTGG
TACTGTAGCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGG
CAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACACTTCCAATCATGTGGCAC
AGTCCACCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGT
CGAGTTTGTTGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTTAATGAATCAGAGTTACA
TGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCAAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCG
CGGAAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCCTATATGTA
TTCACCATATGGATATGGGAAAGTTCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATA
CCAATAAAACCATCATGGTTGCTTTTATTATATCCATCCATTGTCTGAGCTTTCAATGAC
TTCTCGCTCTCTTTGTTTAAGAACTTTGCGATAAAACATTTCGAATCTTGAATTGTTTCT
ACAAGTTTCATATCGTCCTTTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA70TF U 1
AF RR2EH21TF U 2
AF RR2BQ49TF U 300
AF RR2ES48JQ C 291
AF RR2BQ49JQ C 9
AF RR2ES48TF U 291
BS 1 386 RR2FA70TF
BS 387 387 RR2EH21TF
BS 388 571 RR2FA70TF
BS 572 572 RR2EH21TF
BS 573 755 RR2FA70TF
BS 756 757 RR2ES48TF
BS 758 758 RR2BQ49JQ
BS 759 779 RR2ES48TF
BS 780 780 RR2BQ49JQ
BS 781 806 RR2ES48TF

RD RR2FA70TF 759 0 0
GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATACGG
CGGAGAGATTCCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCTGCTGATGA
TGATGCCGCTAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATAGAGGACGAAGC
TGCTGCTCTTCGTGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCCCAAGATGCTGG
TACTGTAGCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGG
CAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACACTTCCAATCATGTGGCAC
AGTCCACCGAGTGACAATTCTGACAGGCAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGT
CGAGTTTGTTGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTTAATGAATCAGAGTTACA
TGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCAAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCG
CGGAAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCTGCAGACCTTTCATGTCTCCCTATATGTA
TTCACCATATGGATATGGGAAAGTTCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATA
CCAATAAAACCATCATGGTTGCTTTTATTATATCCATCCATTGTCTGAGCTTTCAATGAC
TTCTCGCTCTCTTTGTTTAAGAACTTTGCGATAAA
CATT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2EH21TF 749 0 0
GGGAGAGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATACGGCGGAGAGAT
TCCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCTGCTGATGATGATGCCGC
TAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATAGAGGACGAAGCTGCTGCTCT
TCGTGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCCCAAGATGCTGGTACTGTAGC
AGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCAATGTTGA
TTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACACTTCCAATCATGTGGCACAGTCCACCG
AGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGTCGAGTTTGT
TGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTTAATGAATCAGAGTTACATGGTCGTCA
GATAAAGGTGATGCCCAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGCGGAAGAAG
ATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCCTATATGTATTCACCATA
TGGATATGGGAAAGTTCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATACCAATAAAA
CCATCATGGTTGCTTTTAT*ATATCCATCCATTGTCTGAGCTTTCAATGACTTCTCGCTC
TCTTTGTTTA*GAACTTTGCG

QA 9 749 9 749
DS 

RD RR2BQ49TF 475 0 0
GCAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACACTTCCAATCATGTGGCA
CAGTCCACAGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATG
TCGAGTTTGTTGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTTAATGAATCAGAGTTAC
ATGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCAAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCC
GCGGAAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGGCCTTTCATGTCTCTCTATATGT
ATTCACCATATGGATATGGGAAAGTTCCTAGGTTCAGAAG*CCAATGCGTTACATGCCAT
ACCAATAAAACCATCATGGTTGCTTTTAT*ATATCCATCCATTGTCTGAGCTTTCAATGA
CTTCTCGCTCTCTTTGTTTAAGA*CTTTGCGATAAA
CATTTCGATCTTGATTGTT

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR2ES48JQ 453 0 0
TTTTTGTTGGCAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAAT
CATGCGGCACAGTCCACCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGT
TCGCTTATGTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAAT
CAGAGTTACATGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGA
AACAGTTCCGTGGTAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTC
CGTATATGTATTCTCCATATGGATATGGGAAAGTTCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTT
ACATGCCATACCAATAAAACCATCATGGTTGCTTTTATTATATCCATCCATTGTTTGAGC
TTTCAATGACTTCTCCTTCTCTTTGTTTAAGAA

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR2BQ49JQ 794 0 0
G
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCGATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATACGGCGGAGAGAT
TCCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCTGCTGATGATGATGCCGC
TAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATAGAGGACGAAGCTGCTGCTCT
TCGTGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCCCAAGATGCTGGTACTGTAGC
AGCAGATCAAGCAGGCGAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCAATGTTGA
TTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACACTTCCAATCATGTGGCACAGTCCACAG
AGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGTCGAGTTTGT
TGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTTAATGAATCAGAGTTACATGGTCGTCA
GATAAAGGTGATGCCAAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGCGGAAGAAG
ATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGGCCTTTCATGTCTCCCTATATGTATTCACCATA
TGGATATGGGAAAGTTCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATACCAATAAAA
CCATCATGGTTGCTTTTATTATATCCATCCATTGTCTGAGCTTTCAATGACTTCTCGCTC
TCTTTGTTTAAGAACTTTGCGATAAAACATTTCGAATCTTGAATTGTTTTTACAAGTTTC
ATATCGTCC
CTTT

QA 2 790 2 790
DS 

RD RR2ES48TF 516 0 0
TTTTTGTTGGCAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAAT
CATGCGGCACAGTCCACCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGT
TCGCTTATGTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAAT
CAGAGTTACATGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGA
AACAGTTCCGTGGTAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTC
CGTATATGTATTCTCCATATGGATATGGGAAAGTTCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTT
ACATGCCATACCAATAAAACCATCATGGTTGCTTTTATTATATCCATCCATTGTTTGAGC
TTTCAATGACTTCTCCTTCTCTTTGTTTAAGAACTTTGCTATAAAACTTTTCGAATCTTG
AATTGTTTC*ACAAGTTTCATATCGTCCTTTTGATC

QA 1 516 1 516
DS 



CO CL770Contig2 854 2 4 U
GGGCGACGGGGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGGCTATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATA
CGGTGGAGAGATTCCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCCGCTGA
TGATGATGCCGCTAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGACGA
AGCTGCTGCTCTTCGTGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGC
TGGGACTGTAGCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGCTCTGTTTTTGT
TGGCAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGG
CACAGTCCACCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTA
TGTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTT
ACATGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTT
CCGTGGTAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATAT
GTATTCTCCATATGGATATGGGAAAGTTCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCC
ATACCAATAAAACCATCATGGCTGCTTTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCAATGACT
TCTCGCTCTCTTTGTTTAAGAACTTTGCAATCTTGAATTGTTTTACAAGTTTCATATCGT
TTGATCAGTGATGATACATTTTTGTTATGTGTTACATTATGCGGATGGGTTTAATATCAG
TTGAAATTATGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG80TF U 1
AF RR2FG80JQ C 47
BS 1 642 RR2FG80TF
BS 643 643 RR2FG80JQ
BS 644 713 RR2FG80TF
BS 714 854 RR2FG80JQ

RD RR2FG80TF 713 0 0
GGGCGACGGGGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGGCTATGGAGGAAGAGGAGCACGAGGTATA
CGGTGGAGAGATTCCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCCGCTGA
TGATGATGCCGCTAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAAGAGATTGAGGACGA
AGCTGCTGCTCTTCGTGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGC
TGGGACTGTAGCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGCTCTGTTTTTGT
TGGCAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGG
CACAGTCCACCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTA
TGTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTT
ACATGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTT
CCGTGGTAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATAT
GTATTCTCCATATGGATATGGGAAAGTTCCTAGGTTCAGAAG*CCAATGCGTTACATGCC
ATACCAATAAAACCATCATGGCTGCTTTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2FG80JQ 808 0 0
GAGCACGAGGTATACGG*GGAGAGAT*CCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGAC
ATGACTGCCGCTGATGATGATGCCGCTAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAA
GAGATTGAGGACGAAGCTGCTGCTCTTCGTGAGATGCAGGCCAAGGTTGAGAAGGATATG
GGACCTCAAGATGCTGGGACTGTAGCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCT
CGCTCTGTTTTTGTTGGCAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACAT
TTCCAATCATGCGGCACAGTCCACCGAGTGACAATTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCA
AAGGGGTTCGCTTATGTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTG
AACGAATCAGAGTTACATGGTCGTCAGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCT
GGATTGAAACAGTTCCGTGGTAGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTC
ATGTCTCCGTATATGTATTCTCCATATGGATATGGGAAAGTTCCTAGGTTCAGAAGGCCA
ATGCGTTACATGCCATACCAATAAAACCATCATGGCTGCTTTATATCCATCCATTGTTTG
AGCTTTCAATGACTTCTCGCTCTCTTTGTTTAAGAACTTTGCAATCTTGAATTGTTTTAC
AAGTTTCATATCGTTTGATCAGTGATGATACATTTTTGTTATGTGTTACATTATGCGGAT
GGGTTTAATATCAGTTGAAATTATGTTT

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 9

CO CL771Contig1 1233 9 12 U
GGGTGGTCAGGGTGGAGCGTGCATAGCACACGAAAATGGTGCGATCACCACGAAAAGGTT
ATCCCTTTGCAAGGCTTTGACACATCCACAAATAATAAAAAAAACTTCTCTTTACTCTTT
GCTTCGTCTCAAAAATCGCATGCAACAACAACACCATCGAAGTTCATCCCTCTTCGCGTA
TTAACTAGAATCAAAACAAGCTTCTTCTTCTTCTT***TTTTTTTTTTTTGGTAAAACTT
CTTCTTCTTCTTCTTCTTGGTTTGAGATGGCATCCTCTAGTGCGGTTTCAGGAGCTACTA
CTGTCTCTTCCTTCTTCACCAAAACCTCTTCAACTTCAAACCCATCTCCCAAACTCCACT
CCTCCTCTCCTCTTCTCTTTCCCCAGAAAACTGTGTTTCATGGAGTTTCGTTGGGAGATT
CCAAGAAGAGTGTATCAGAGATCTTCGCTGTATCCGACAGAAAGATCGGAGTGTTATTAA
ACGGGTCGAGAAGATTCCAAGTCAAAGCGAGGACAGCAGCTTCGAAAACCATAGAGGTTG
AAGTGGACAAGCCTTTGGGTCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATCA
CTGGTGTGGAAGGAGGTGGGAACGCAGCAAAAGCTGGGCTTAAATCTGGAGATCAAGTTC
TGTACACAAGCAGCTTCTTTGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACTA
AAACCGCTATTCAGGCCAAACCTGATTCTGTCTACTTTGTTGTCAGCAGAGGTGCAGAAG
TTGATGTGAAGAAGCTAAATAAGCGTCCAGCTCCTCCTCGGTTTGGAAGAAAGTTAACCG
AGACTCAGAAGACAAGAGCTACTCACATTTGTCTTGATTGTGGATTCATATACACTTTAC
CAAAACCTTTTGATGAACAGCCGGATACATACGTATGTCCTCAATGTATAGCACCAAAGA
AAAGGTTTGCAAGGTATGACGTGAACACAGGGAAGGCCATAGGAGGAGGACTGCCTCCGA
TTGGTGTTATCGTTGGCTTATTGGCCAGTCTTGGAGCTGTTGGAGCTCTGCTTGTGTATG
GTCTTCAGTGACATTTTATAGAGCTTGTATAAATTGTCTATCAAACAAGTCCTTGATTAA
GTTTTGTGATTCCAAACCAAGAATGAATGTTGATGACTTGATGACATCAACTTGAGAAAA
TTTTAAATATTTATCAAGCATATTTGTATGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX49TF U 1
AF RR2G356TF U 138
AF RR2CL76TF U 86
AF RR2AH71TF U 129
AF RR2D693TF U 136
AF RR2AG22TF U 270
AF RR2BK78TF U 361
AF RR2CL76JQ C 574
AF RR2AH71JQ C 372
BS 1 227 RR2BX49TF
BS 228 230 RR2AH71TF
BS 231 576 RR2BX49TF
BS 577 687 RR2CL76TF
BS 688 688 RR2AH71TF
BS 689 766 RR2CL76TF
BS 767 832 RR2AH71TF
BS 833 960 RR2AG22TF
BS 961 993 RR2BK78TF
BS 994 1046 RR2AH71JQ
BS 1047 1047 RR2CL76JQ
BS 1048 1233 RR2AH71JQ

RD RR2BX49TF 576 0 0
GGGTGGTCAGGGTGGAGCGTGCATAGCACACGAAAATGGTGCGATCACCACGAAAAGGTT
ATCCCTTTGCAAGGCTTTGACACATCCACAAATAATAAAAAAAACTTCTCTTTACTCTTT
GCTTCGTCTCAAAAATCGCATGCAACAACAACACCATCGAAGTTCATCCCTCTTCGCGTA
TTAACTAGAATCAAAACAAGCTTCTTCTTCTTCTT***TTTTTTTTT***GGTAAAACTT
CTTCTTCTTCTTCTTCTTGGTTTGAGATGGCATCCTCTAGTGCGGTTTCAGGAGCTACTA
CTGTCTCTTCCTTCTTCACCAAAACCTCTTCAACTTCAAACCCATCTCCCAAACTCCACT
CCTCCTCTCCTCTTCTCTTTCCCCAGAAAACTGTGTTTCATGGAGTTTCGTTGGGAGATT
CCAAGAAGAGTGTATCAGAGATCTTCGCTGTATCCGACAGAAAGATCGGAGTGTTATTAA
ACGGGTCGAGAAGATTCCAAGTCAAAGCGAGGACAGCAGCTTCGAAAACCATAGAGGTTG
AAGTGGACAAGCCTTTGGGTCTGACTCTTGGACAGA

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2G356TF 473 0 0
GG
ATGCAACAACAACACCATCGAAGTTCATCCCTCTTCGCGTATTAACTAGAATCAAAACAA
GCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGTAAAACTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTG
GTTTGAGATGGCATCCTCTAGTGCGGTTTCAGGAGCTACTACTGTCTCTTCCTTCTTCAC
CAAAACCTCTTCAACTTCAAACCCATCTCCCAAACTCCACTCCTCCTCTCCTCTTCTCTT
TCCCCAGAAAACTGTGTTTCATGGAGTTTCGTTGGGAGATTCCAAGAAGAGTGTATCAGA
AATCTTCGCTGTATCCGACAGAAAGATCGGAGTGTTATTAAACGGGTCGAGAAGATTCCA
AGTCAAAGCGAGGACAGCAGCTTCCAAAACCATAGAGGTTGAAGTGGACAAGCCTTTGGG
TCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATCACTGGTGTGGA

QA 3 473 3 473
DS 

RD RR2CL76TF 681 0 0
GG
ACAAATAATAAAAAAAACTTCTCTTTACTCTTTGCTTCGTCTCAAAAATCGCATGCAACA
ACAACACCATCGAAGTTCATCCCTCTTCGCGTATTAACTAGAATCAAAACAAGCTTCTTC
TTCTTCTT***TTTTTTTTT***GGTAAAACTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTGGTTTGAGA
TGGCATCCTCTAGTGCGGTTTCAGGAGCTACTACTGTCTCTTCCTTCTTCACCAAAACCT
CTTCAACTTCAAACCCATCTCCCAAACTCCACTCCTCCTCTCCTCTTCTCTTTCCCCAGA
AAACTGTGTTTCATGGAGTTTCGTTGGGAGATTCCAAGAAGAGTGTATCAGAGATCTTCG
CTGTATCCGACAGAAAGATCGGAGTGTTATTAAACGGGTCGAGAAGATTCCAAGTCAAAG
CGAGGACAGCAGCTTCGAAAACCATAGAGGTTGAAGTGGACAAGCCTTTGGGTCTGACTC
TTGGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATCACTGGTGTGGAAGGAGGTGGGAACGCAG
CAAAAGCTGGGCTTAAATCTGGAGATCAAGTTCTGTACACAAGCAGCTTCTTTGGAGATG
GGCTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACTAAAACCGCTATTCAGGCCAAACCTGATT
CTGTCTACTTTGTTGTCAG

QA 3 681 3 681
DS 

RD RR2AH71TF 704 0 0
GGAAAAATC
GCATGCAACAACAACACCATCGAAGTTCATCCCTCTTCGCGTATTAACTAGAATCAAAAC
AAGCTTCTTCTTCTTCTT***TTTTTTTTTTTTGGTAAAACTTCTTCTTCTTCTTCTTCT
TGGTTTGAGATGGCATCCTCTAGTGCGGTTTCAGGAGCTACTACTGTCTCTTCCTTCTTC
ACCAAAACCTCTTCAACTTCAAACCCATCTCCCAAACTCCACTCCTCCTCTCCTCTTCTC
TTTCCCCAGAAAACTGTGTTTCATGGAGTTTCGTTGGGAGATTCCAAGAAGAGTGTATCA
GAAATCTTCGCTGTATCCGACAGAAAGATCGGAGTGTTATTAAGCGGGTCGAGAAGATTC
CAAGTCAAAGCGAGGACAGCAGCTTCGAAAACCATAGAGGTTGAAGTGGACAAGCCTTTG
GGTCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATCACTGGTGTGGAAGGAGGT
GGGAACGCAGCAAAAGCTGGGCTTAAATCTGGAGATCAAGTTCTGTACACAAGCAGCTTC
TTTGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACTAAAACCGCTATTCAGGCC
AAACCTGATTCTGTCTACTTTGTTGTCAGCAGAGGTGCAGAAGTTGATGTGAAGAAGCTA
AATAAGCGTCCAGCTCCTCCTCGGTTTGGAAGAAA

QA 10 704 10 704
DS 

RD RR2D693TF 686 0 0
GG
GCATGCAACAACAACACCATCGAAGTTCATCCCTCTTCGCGTATTAACTAGAATCAAAAC
AAGCTTCTTCTTCTTCTT***TTTTTTTTTTTTGGTAAAACTTCTTCTTCTTCTTCTT**
*GGTTTGAGATGGCATCCTCTAGTGCGGTTTCAGGAGCTACTACTGTCTCTTCCTTCTTC
ACCAAAACCTCTTCAACTTCAAACCCATCTCCCAAACTCCACTCCTCCTCTCCTCTTCTC
TTTCCCCAGAAAACTGTGTTTCATGGAGTTTCGTCGGGAGATTCCAAGAAGAGTGTATCA
GAGATCTTCGCTGTATCCGACAGAAAGATCGGAGTGTTATTAAACGGGTCGAGAAGATTC
CAAGTCAAAGCGAGGACAGCAGCTTCGAAAACCATAGAGGTTGAAGTGGACAAGCCTTTG
GGTCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATCACTGGTGTGGAAGGAGGT
GGGAACGCAGCAAAAGCTGGGCTTAAATCTGGAGATCAAGTTCTGTACACAAGCAGCTTC
TTTGGAGATGAACTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACTAAAACCGCTATTCAGGCC
AAACCTGATTCTGTCTACTTTGTTGTCAGCAGAGGTGCAGAAGTTGATGTGAAGAAGCTA
AATAAGCGTCCAGCTCCTCCTCGG

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR2AG22TF 691 0 0
GCATCCTCTAGTGCGGTTTCAGGAGCTACTACTGTCTCTTCCTTCTTCACCAAAACCTCT
TCAACTTCAAACCCATCTCCCAAACTCCACTCCTCCTCTCCTCTTCTCTTTCCCCAGAAA
ACTGTGTTTCATGGAGTTTCGTTGGGAGATTCCAAGAAGAGTGTATCAGAGATCTTCGCT
GTATCCGACAGAAAGATCGGAGTGTTATTAAACGGGTCGAGAAGATTCCAAGTCAAAGCG
AGGACAGCAGCTTCGAAAACCATAGAGGTTGAAGTGGACAAGCCTTTGGGTCTGACTCTT
GGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATCACTTGTGTGGAAGGAGGTGGGAACGCAGCA
AAAGCTGGGCTTAAATCTGGAGATCAAGTTCTGTACACAAGCAGCTTCTTTGGAGATGAG
CTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACTAAAACCGCTATTCAGGCCAAACCTGATTCT
GTCTACTTTGTTGTCAGCAGAGGTGCAGAAGTTGATGTGAAGAAGCTAAATAAGCGTCCA
GCTCCTCCTCGGTTTGGAAGACAGTTAACCGAGACTCAGAAGACAAGAGCTACTCACATT
TGTCTTGATTGTGGATTCATATACACTTTACCAAAACCTTTTGATGAACAGCCGGATACA
TACGTATGTCCTCAATGTATAGCACCAAAGA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2BK78TF 633 0 0
G
CTCCTCTCCTCTTCTCTTTCCCCAGAAAACTGTGTTTCATGGAGTTTCGTTGGGAGATTC
CAAGAAGAGTGTATCAGAGATCTTCGCTGTATCCGACAGAAAGATCGGAGCGTTATTAAA
CGGGTCGAGAAGATTCCAAGTCAAAGCGAGGACAGCAGCTTCGAAAACCATAGAGGTTGA
AGTGGACAAGCCTTTGGGTCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATCAC
TGGTGTGGAAGGAGGTGGGAACGCAACAAAAGCTGGGCTTAAATCTGGAGATCAAGTTCT
GTACACAAGCAGCTTCTTTGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACTAA
AACCGCTATTCAGGCCAAACCTGATTCTGTCTACTTTGTTGTCAGCAGAGGTGCAGAAGT
TGATGTGAAGAAGCTAAATAAGCGTCCAGCTCCTCCTCGGTTTGGAAGAAAGTTAACCGA
GACTCAGAAGACAAGAGCTACTCACATTTGTCTTGATTGTGGATTCATATACACTTTACC
AAAACCTTTTGATGAACAGCCGGATACATACGTATGTCCTCAATGTATAGCACCAAAGAA
AAGGTTTGCAAGGTATGACGTGAACACAGGGA

QA 2 633 2 633
DS 

RD RR2CL76JQ 627 0 0
AGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATCACTGGTGTGGAAGGAGGTGGGAACGCAGCAAAAG
CTGGGCTTAAATCTGGAGATCAAGTTCTGTACACAAGCAGCTTCTTTGGAGATGGGCTTT
GGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACTAAAACCGCTATTCAGGCCAAACCTGATTCTGTCT
ACTTTGTTGTCAGCAGAGGTGCAGAAGTTGATGTGAAGAAGCTAAATAGGCGTCCAGCTC
CTCCTCGGTTTGGAAGAAAGTTAACCGAGACTCAGAAGACAAGAGCTACTCACATTTGTC
TTGATTGTGGATTCATATACACTTTACCAAAACCTTTTGATGAACAGCCGGATACATACG
TATGTCCTCAATGTATAGCACCAAAGAAAAGGTTTGCAAGGTATGACGTGAACACAGGGA
AGGCCATAGGAGGAGGACTGCCTCCGATTGGTGTTATCGTTGGCTTATTGGCCAGTCTTG
GAGCTGTTGGAGCTCTGCTTGTGTATGGTCTTCAGTGACATTTTATAGAGCTTGTATAAA
TTGTCTATCAAACAAGTCCTTGATTAAGTTTTGTGATTCCAAACCAAGAATGAATGTTGA
TGACTTGATGACATCAACTTGAGAAAA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2AH71JQ 862 0 0
CTTCTCTTTCCCCAGAAAACTGTGTTTCATGGAGTTTCGTTGGGAGATTCCAAGAAGAGT
GTATCAGAGATCTTCGCTGTATCCGACAGAAAGATCGGAGTGTTATTAAGCGGGTCGAGA
AGATTCCAAGTCAAAGCGAGGACAGCAGCTTCGAAAACCATAGAGGTTGAAGTGGACAAG
CCTTTGGGTCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATCACTGGTGTGGAA
GGAGGTGGGAACGCAGCAAAAGCTGGGCTTAAATCTGGAGATCAAGTTCTGTACACAAGC
AGCTTCTTTGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACTAAAACCGCTATT
CAGGCCAAACCTGATTCTGTCTACTTTGTTGTCAGCAGAGGTGCAGAAGTTGATGTGAAG
AAGCTAAATAAGCGTCCAGCTCCTCCTCGGTTTGGAAGAAAGTTAACCGAGACTCAGAAG
ACAAGAGCTACTCACATTTGTCTTGATTGTGGATTCATATACACTTTACCAAAACCTTTT
GATGAACAGCCGGATACATACGTATGTCCTCAATGTATAGCACCAAAGAAAAGGTTTGCA
AGGTATGACGTGAACACAGGGAAGGCCATAGGAGGAGGACTGCCTCCGATTGGTGTTATC
GTTGGCTTATTGGCCGGTCTTGGAGCTGTTGGAGCTCTGCTTGTGTATGGTCTTCAGTGA
CATTTTATAGAGCTTGTATAAATTGTCTATCAAACAAGTCCTTGATTAAGTTTTGTGATT
CCAAACCAAGAATGAATGTTGATGACTTGATGACATCAACTTGAGAAAATTTTAAATATT
TATCAAGCATATTTGTATGGTT

QA 1 862 1 862
DS 



AS 3 7

CO CL772Contig1 914 3 36 U
GGGTCCTACTCCCAACTACACAACTTCAATGCCCCAATCTCTTCCTTTCTTCTTACTCCT
CTTCCTCCTCTCTATTTAAATCTTCCTCTTCTTTCTCTCTCACTCTCTCAATTTCCTCAT
CCGTGTCTTCCTCGTTTTCTCCGCTTTAAGCCATGAAAGTCACCGTCGTCTCCCGCAGCG
GCAGAGAAGTTCTCAAAGCCCCCCTCGACCTCCCCGATTCGGCGACTGTTGCTGATCTGC
AGGAAGCTTTTCACAAGAGAGCTAAGAAGTTCTACCCATCGAGGCAAAGACTGACTCTTC
CCGTGGCTCCTGGGTCAAAGGACAAACCTGTTGTCCTCAACAGCAAGAAGTCACTCAAAG
AGTACTGCGATGGGAACACAGACTCCTTAACCGTAGTCTTCAAGGACTTGGGAGCACAAG
TCTCATACCGCACGCTCTTCTTCTTCGAGTACCTCGGCCCACTCTTGATCTACCCTGTCT
TCTATTACTTCCCTGTTTACAAATACCTCGGCTACGGCCAAGACCGTGTGATCCACCCGG
TCCAGACCTACGCTATGTACTACTGGTGCTTTCACTACTTCAAACGTATCATGGAGACGT
TCTTCGTCCACAGGTTCAGCCACGCTACTTCACCGATCGGGAACGTGTTCAGGAACTGTG
CTTACTACTGGACCTTTGGTGCTTACATTGCGTACTACGTGAACCATCCTTTATACACAC
CGGTTAGTGACCTTCAGATGAAGATTGGTTTCGGGTTTGGTTTGGTTTGCCAAGTCGCCA
ACTTCTACTGTCACATTCTGTTGAAGAATCTTAGAGACCCTAGTGGAGCTGGAGGGTACC
AGATCCCACGTGGTTTCCTCTTCAACATTGTCACGTGTGCAAATTACACGACCGAGATTA
CAGTGGCTAGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ42TF U 1
AF RR2A439TF U 108
AF RR2EX15TF U 109
BS 1 121 RR2EJ42TF
BS 122 122 RR2EX15TF
BS 123 123 RR2EJ42TF
BS 124 124 RR2EX15TF
BS 125 175 RR2EJ42TF
BS 176 176 RR2EX15TF
BS 177 181 RR2EJ42TF
BS 182 182 RR2EX15TF
BS 183 223 RR2EJ42TF
BS 224 224 RR2EX15TF
BS 225 277 RR2EJ42TF
BS 278 278 RR2EX15TF
BS 279 365 RR2EJ42TF
BS 366 366 RR2EX15TF
BS 367 484 RR2EJ42TF
BS 485 485 RR2EX15TF
BS 486 517 RR2EJ42TF
BS 518 519 RR2EX15TF
BS 520 595 RR2EJ42TF
BS 596 596 RR2EX15TF
BS 597 611 RR2EJ42TF
BS 612 612 RR2EX15TF
BS 613 648 RR2EJ42TF
BS 649 691 RR2EX15TF
BS 692 692 RR2A439TF
BS 693 839 RR2EX15TF
BS 840 840 RR2A439TF
BS 841 857 RR2EX15TF
BS 858 858 RR2A439TF
BS 859 864 RR2EX15TF
BS 865 865 RR2A439TF
BS 866 871 RR2EX15TF
BS 872 872 RR2A439TF
BS 873 882 RR2EX15TF
BS 883 884 RR2A439TF
BS 885 914 RR2EX15TF

RD RR2EJ42TF 648 0 0
GGGTCCTACTCCCAACTACACAACTTCAATGCCCCAATCTCTTCCTTTCTTCTTACTCCT
CTTCCTCCTCTCTATTTAAATCTTCCTCTTCTTTCTCTCTCACTCTCTCAATTTCCTCAT
CTGGGTCTTCCTCGTTTTCTCCGCTTTAAGCCATGAAAGTCACCGTCGTCTCCCGTAGCG
GTAGAGAAGTTCTCAAAGCCCCCCTCGACCTCCCCGATTCGGCAACTGTTGCTGATCTGC
AGGAAGCTTTTCACAAGAGAGCTAAGAAGTTCTACCCGTCGAGGCAAAGACTGACTCTTC
CCGTGGCTCCTGGGTCAAAGGACAAACCTGTTGTCCTCAACAGCAAGAAGTCACTCAAAG
AGTACCGCGATGGGAACACAGACTCCTTAACCGTAGTCTTCAAGGACTTGGGAGCACAAG
TCTCATACCGCACGCTCTTCTTCTTCGAGTACCTCGGCCCACTCTTGATCTACCCTGTCT
TCTACTACTTCCCTGTTTACAAATACCTCGGCTACGGAGAAGACCGTGTGATCCACCCGG
TCCAGACCTACGCTATGTACTACTGGTGCTTTCACTACTTCAAACGTATCATGGAAACGT
TCTTCGTCCACCGGTTCAGCCACGCTACTTCACCGATCGGGAACGTGT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2A439TF 785 0 0
GGAATC
TCCTCATCCGTGTCTTCCTCGTTTTCTCCGCTTTAAGCCATGAAAGTCACCGTCGTCTCC
CGCAGCGGCAGAGAAGTTCTCAAAGCCCCCCTCGACCTCCCCGATTCGGCGACTGTTTCT
GATCTGCAGGAAGCATTTCACAAGAGAGCTAAGAAGTTCTACCCATCGAGGCAAAGACTT
ACTCTTCCCGTGGCTCCTGGGTCAAAGGACAAACCTGTTGTCCTCAACAGCAAGAAGTCA
CTCAAAGAGTACTGCGATGGGAACACAGACTCCTTAACCGTTGTCTTCAAGGACTTGGGA
GCACAAGTCTCATACCGCACGCTCTTCTTCTTCGAGTACCTAGGCCCACTCTTGATCTAC
CCTGTCTTCTATTACTTCCCTGTTTACAAATACCTCGGCTATGGCCAAGACCGTGTGATC
CACCCGGTCCAGGCCTACGCTATGTACTACTGGTGCTTTCACTACTTCAAACGTATCATG
GAGACGTTCTTCGTCCACAGGTTCAGCCACGCTACTTCGCCGATCGGGAACGTGTTCAGG
AACTGTGCTTACTACTGGACCTTTGGTGCTTACATTGCGTATTACGTGAACCATCCTTTG
TACACGCCGGTTAGTGACCTTCAGATGAAGATTGGTTTCGGGTTTGGTTTGGTTTGCCAA
GTCGCGAACTTCTACTGTCACATTCTGTTGAAGAATCTTAGAGACCCTAGTGGAGCTGGA
GGGTACCAGATCCCACGTGGTTTCCTCTTCAACATTGTCACGTGTGCTAATTACACGAC

QA 7 785 7 785
DS 

RD RR2EX15TF 806 0 0
G
AATTTCCTCATCCGTGTCTTCCTCGTTTTCTCCGCTTTAAGCCATGAAAGTCACCGTCGT
CTCCCGCAGCGGCAGAGAAGTTCTCAAAGCCCCCCTCGACCTCCCCGATTCGGCGACTGT
TGCTGATCTGCAGGAAGCTTTTCACAAGAGAGCTAAGAAGTTTTACCCATCGAGGCAAAG
ACTGACTCTTCCCGTGGCTCCTGGGTCAAAGGACAAACCTGTTGTCCTCAGCAGCAAGAA
ATCACTCAAAGAGTACTGTGATGGGAACACAGACTCCTTAACCGTAGTCTTCAAGGACTT
GGGAGCACAAGTCTCATACCGCACGCTCTTCTTCTTCGAGTACCTCGGCCCGCTCTTGAT
CTACCCGGTCTTCTATTACTTCCCTGTTTACAAATACCTCGGCTACGGCCAAGATCGTGT
GATCCACCCGGTCCAGACCTACGCTATGTACTACTGGTGCTTTCACTACTTCAAACGCAT
CATGGAGACGTTCTTCGTCCACAGGTTCAGCCACGCAACTTCACCTATCGGGAACGTGTT
CAGGAACTGTGCTTACTACTGGACCTTTGGTGCTTACATTGCTTACTACGTGAACCATCC
TTTATACACACCGGTTAGTGACCTTCAGATGAAGATTGGTTTCGGGTTTGGTTTGGTTTG
CCAAGTCGCCAACTTCTACTGTCACATTCTGTTGAAGAATCTTAGAGACCCTAGTGGAGC
TGGAGGGTAC*AGATCCCACGTGGTTTC*TCTTCA*CATTGTTACGTGTGCAA**TACAC
GACCGAGATTACAGTGGCTAGGATC

QA 2 806 2 806
DS 



CO CL772Contig2 665 2 4 U
TTTTTTTACGCGAGAAACGATTAAAGAAGCAAAGTGTCTAAAATCTCTAAACTTACAAAC
ATCTCAAAACAAAAGTGATAACAAATACAGAGAAAGAACAAAGATCTTTCAAATCTCTTT
TACAACCTTATTAAGAAAAGCTTTTAAACTGATAGAACGAAGATCATAACGATAAGTCTT
CTACAGGAATGGAGGCAATATCACCCATCTTCTTGGATACTTTGGCTTCCCATCTTTCCC
ATCAAATATCTTTCTCAGACGGCTATGCTTTCCAAGAGCCCAGTTGGTCATAATCAGAGC
AGCAACAGCTAAAAAAACATATCCTGCAACGGTCTGAGTAGCGATGTTGAATCCTAGCCA
CTGGTAAATCTCGGTCGTGTAATTGGCACACGTAACAATGTTGAAGAGGAAACCACGTGG
GATCTGGTACCCTCCAGCTCCACTAGGGTCTCTAAGATTCTTCAACAGAATGTGACAGTA
GAAGTTGGCGACTTGGCAAACCAAACCAAACCCGAAACCAATCTTCATCTGAAGGTCACT
AACCGGTGTGTATAAAGGATGGTTCACGTAGTAAGCAATGTAAGCACCAAAGGTCCAGTA
GTAAGCACAGTTCCTGAACACGTTCCCGATAGGTGAAGTTGCGTGGCTGAACCTGTGGAC
GAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2EX15JQ U 1
AF RR2EW20JQ U 26
BS 1 312 RR2EX15JQ
BS 313 313 RR2EW20JQ
BS 314 652 RR2EX15JQ
BS 653 665 RR2EW20JQ

RD RR2EX15JQ 652 0 0
TTTTTTTACGCGAGAAACGATTAAAGAAGCAAAGTGTCTAAAATCTCTAAACTTACAAAC
ATCTCAAAACAAAAGTGATAACAAATACAGAGAAAGAACAAAGATCTTTCAAATCTCTTT
TACAACCTTATTAAGAAAAGCTTTTAAACTGATAGAACGAAGATCATAACGATAAGTCTT
CTACAGGAATGGAGGCAATATCACCCATCTTCTTGGATACTTTGGCTTCCCATCTTTCCC
ATCAAATATCTTTCTCAGACGGCTATGCTTTCCAAGAGCCCAGTTGGTCATAATCAGAGC
AGCAACAGCTAAGAAAACATATCCTGCAACGGTCTGAGTAGCGATGTTGAATCCTAGCCA
CTGGTAAATCTCGGTCGTGTAATTGGCACACGTAACAATGTTGAAGAGGAAACCACGTGG
GATCTGGTACCCTCCAGCTCCACTAGGGTCTCTAAGATTCTTCAACAGAATGTGACAGTA
GAAGTTGGCGACTTGGCAAACCAAACCAAACCCGAAACCAATCTTCATCTGAAGGTCACT
AACCGGTGTGTATAAAGGATGGTTCACGTAGTAAGCAATGTAAGCACCAAAGGTCCAGTA
GTAAGCACAGTTCCTGAACACGTTCCCGATAGGTGAAGTTGCGTGGCTGAAC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2EW20JQ 640 0 0
AAAGCA
AAGTGTCTAAAATCTCTAAACTTACAAACATCTCAAAACAAAAGTGATAACAAATACAGA
GAAAGAACAAAGATCTTTCAAATCTCTTTTACAACCTTATTAAGAAAAGCTTTTAAACTG
ATAGAACGAAGATCATAACGATAAGTCTTCTACAGGAATGGAGGCAATATCACCCATCTT
CTTGGATACTTTGGCTTCCCATCTTTCCCATCAAATATCTTTCTCAGACGGCTATGCTTT
CCAAGAGCCCAGTTGGTCATAATCAGAGCAGCAACAGCTAAAAAAACATATCCTGCAACG
GTCTGAGTAGCGATGTTGAATCCTAGCCACTGGTAAATCTCGGTCGTGTAATTGGCACAC
GTAACAATGTTGAAGAGGAAACCACGTGGGATCTGGTACCCTCCAGCTCCACTAGGGTCT
CTAAGATTCTTCAACAGAATGTGACAGTAGAAGTTGGCGACTTGGCAAACCAAACCAAAC
CCGAAACCAATCTTCATCTGAAGGTCACTAACCGGTGTGTATAAAGGATGGTTCACGTAG
TAAGCAATGTAAGCACCAAAGGTCCAGTAGTAAGCACAGTTCCTGAACACGTTCCCGATA
GGTGAAGTTGCGTGGCTGAACCTGTGGACGAAGA

QA 7 640 7 640
DS 



CO CL772Contig3 852 2 16 U
GCGTGAGAAACGATTAAAGAAGCAAGTGTCTAAAATCTCTAAACTTACAAAACATCTCAA
AACAAAAGTGATAACAAAATACAGAGAAAAACAAACATCTTTCAAATCTCTTTTACAAAC
TTATTAAGAAAGCTTTTAAACTGATAGAACGAAGATCACAACGATGAGTCTTCTACAAGA
ATGGAGGCAATATCACCCATCTTCTTGGATACTTTGGCTTCCCATCTTTCCCATCAAATA
TCTTTCTCAAACGGCTGTGCTTCCCAAGAGCCCAGTTGGTCATAATCAGAGCAGCAACAG
CTAAAAAAACATATCCTGCAACGGTCTGAGTAGCGATGTTGAATCCTAGCCACTGGTAAA
TCTCTGTCGTGTAATTAGCACACGTAACAATGTTGAAGAGGAAACCACGTGGGATCTGGT
ACCCTCCAGCGCCACTAGGGTCTCTAAGATTCTTCAACAGAATGTGACAGTAGAAGTTCG
CGACTTGGCAAACCAAACCAAACCCGAAACCAATCTTCATCTGAAGGTCACTAACCGGCG
TGTACAAAGGATGGTTCACGTAATACGCAATGTAAGCACCAAAGGTCCAGTAGTAAGCAC
AGTTCCTGAACACGTTCCCGATCGGCGAAGTAGCGTGGCTGAACCTGTGGACGAAGAACG
TCTCCATGATACGTTTGAAGTAGTGAAAGCACCAGTAGTACATAGCGTAGGCCTGGACCG
GGTGGATCACACGGTCTTGGCCATAGCCGAGGTATTTGTAAACAGGGAAGTAATAGAAGA
CAGGGTAGATCAAGAGTGGGCCTAGGTACTCGAAGAAGAAGAGCGTGCGGTATGAGACTT
GTGCTCCCAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH66JQ U 1
AF RR2A439JQ U 28
BS 1 55 RR2FH66JQ
BS 56 56 RR2A439JQ
BS 57 86 RR2FH66JQ
BS 87 87 RR2A439JQ
BS 88 90 RR2FH66JQ
BS 91 91 RR2A439JQ
BS 92 262 RR2FH66JQ
BS 263 263 RR2A439JQ
BS 264 421 RR2FH66JQ
BS 422 422 RR2A439JQ
BS 423 538 RR2FH66JQ
BS 539 539 RR2A439JQ
BS 540 547 RR2FH66JQ
BS 548 548 RR2A439JQ
BS 549 621 RR2FH66JQ
BS 622 852 RR2A439JQ

RD RR2FH66JQ 621 0 0
GCGTGAGAAACGATTAAAGAAGCAAGTGTCTAAAATCTCTAAACTTACAAAACATTTCAA
AACAAAAGTGATAACAAAATACAGAGGAAACCAAACATCTTTCAAATCTCTTTTACAAAC
TTATTAAGAAAGCTTTTAAACTGATAGAACGAAGATCACAACGATGAGTCTTCTACAAGA
ATGGAGGCAATATCACCCATCTTCTTGGATACTTTGGCTTCCCATCTTTCCCATCAAATA
TCTTTCTCAAACGGCTGTGCTTTCCAAGAGCCCAGTTGGTCATAATCAGAGCAGCAACAG
CTAAAAAAACATATCCTGCAACGGTCTGAGTAGCGATGTTGAATCCTAGCCACTGGTAAA
TCTCTGTCGTGTAATTAGCACACGTAACAATGTTGAAGAGGAAACCACGTGGGATCTGGT
AGCCTCCAGCGCCACTAGGGTCTCTAAGATTCTTCAACAGAATGTGACAGTAGAAGTTCG
CGACTTGGCAAACCAAACCAAACCCGAAACCAATCTTCATCTGAAGGTCACTAACCGGTG
TGTACAAGGGATGGTTCACGTAATACGCAATGTAAGCACCAAAGGTCCAGTAGTAAGCAC
AGTTCCTGAACACGTTCCCGA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2A439JQ 825 0 0
GC
CTAAAATCTCTAAACTTACAAAACATCTCAAAACAAAAGTGATAACAAA*TACAGAGAAA
AACAAACATCTTTCAAATCTCTTTTACAACCTTATTAAGAAAGCTTTTAAACTGATAGAA
CGAAGATCACAACGATGAGTCTTCTACAAGAATGGAGGCAATATCACCCATCTTCTTGGA
TACTTTGGCTTCCCATCTTTCCCATCAAATATCTTTCTCAGACGGCTGTGCTTCCCAAGA
GCCCAGTTTGTCATAATCAGAGCAGCAACAGCTAAGAAAACATATCCTGCAACGGTCTGA
GTAGCGATGTTGAATCCTAGCCACTGGTAAATCTCTGTCGTGTAATTAGCACACGTGACA
ATGTTGAAGAGGAAACCACGTGGGATCTGGTACCCTCCAGCTCCACTAGGGTCTCTAAGA
TTCTTCAACAGAATGTGACAGTAGAAGTTCGCGACTTGGCAAACCAAACCAAACCCGAAA
CCAATCTTCATCTGAAGGTCACTAACCGGCGTGTACAAAGGATGGTTCACGTAATACGCA
ATGTAAGCACCAAAGGTCCAGTAGTAAGCACAGTTCCTGAACACGTTCCCGATCGGCGAA
GTAGCGTGGCTGAACCTGTGGACGAAGAACGTCTCCATGATACGTTTGAAGTAGTGAAAG
CACCAGTAGTACATAGCGTAGGCCTGGACCGGGTGGATCACACGGTCTTGGCCATAGCCG
AGGTATTTGTAAACAGGGAAGTAATAGAAGACAGGGTAGATCAAGAGTGGGCCTAGGTAC
TCGAAGAAGAAGAGCGTGCGGTATGAGACTTGTGCTCCCAAGT

QA 3 825 3 825
DS 



AS 1 6

CO CL773Contig1 1541 6 18 U
GGAGGATTAAAAACCCTAGAATCCGTCAACGCCGTGACTATTCTCTCTCTCTACATTTTC
TCTTTGTTTTCGGCGATTGATTTTCATTTTTTCGTAAGACAAATCAAAAGATGAGGGGAT
TGGTGAAGAAGCTCGTGTCCAGATCTCTCTCCATCTCCGGCAAATGGCAGCAGCAACAGC
TTCGTCGTCTCAACATCCACGAGCATCAGGGAGCTGAGCTGATGGGTAAATACGGAGTGA
ATGTGCCAAAGGGAGTCGCTGTTTCTTCCTTGGATGAAGTTAAAAAGGCTATCGACCAAG
TTTTCCCTAATGAAAGCGAGCTGGTCGTTAAGAGCCAGATCTTGGCTGGTGGAAGAGGTC
TTGGGACATTCAAGAGTGGCCTCAAGGGTGGTGTTCACATTGTCAACCGTGACCAGGTTC
AAGATATTGCTGGTAAGATGCTTGGACAAGTACTCGTCACCAAACAAACTGGTTCTCAAG
GCAAAGTTGTCAGCAAGGTCTACTTGTGTGAGAAATTGTCACTCGTCAATGAGATGTACT
TTTCCATCATTCTGGACCGTAAATCTGCTGGACCGTTGATAATTGCCTGTAAAAAGGGTG
GTACCAGCATTGAAGATCTTGCTGAGAAGTTTCCTGACATGATTATCAAGGTACCGATCG
ATGTATTTGCTGGAATTACTGATGAAGATGCTGCTAAAGTTGTGGATGGTCTGGCTCCGA
AAGCCGCTGACAGAAAAGATTCGATTGAACAAGTGAAGAAGCTATACGAACTCTTCCGCA
AGACTGACTGCACAATGTTGGAAATCAACCCACTCGCTGAGACATCCACTAATCAATTGG
TAGCTGCCGATGCCAAGTTGAACTTTGATGATAACGCTGCTTTCCGTCAGAAAGAGATCT
TTGCTCTTCGTGATCCAACACAGGAGGATCCACGAGAGGTGGCTGCTGCAAAAGTTGACC
TGAACTATATCGGATTAGATGGAGAGATTGGTTGCATGGTGAATGGTGCTGGATTGGCCA
TGGCAACCATGGACATCATTAAACTGCACGGTGGGACTCCTGCAAATTTCCTTGATGTTG
GTGGAAATGCTTCTGAACACCAGGTAGTGGAGGCGTTTAAGATACTGACGTCGGACGATA
AAGTGAAAGCAATCTTGGTGAACATATTCGGTGGGATAATGAAATGTGATGTGATTGCTA
GTGGAATTGTGAATGCTGCTAAAGAGGTGTCACTGAAAGTACCAGTGGTGGTTCGTCTAG
AAGGAACAAACGTTGAACAGGGGAAGAGAATCCTCAAGGAAAGTGGAATGAAACTCATAA
CGGCTGATGATTTGGATGATGCTGCAGAGAAAGCTGTCAAAGCATTAGCTAATTAAGCTT
ATTGAGGAGATTGTTTACTCTCTCTGCCCCTCTTTATACAATAAGCTTTTTTTGAGAGTT
TTTTTTATCTATGTTTCTCAACCATCTTTATGGTCGACGCAATCGCATATTGCTGCGGAT
ATAATTTCTGAAACAGATCAATAATGAACTGGTCTCTCTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2AN82TF U 1
AF RR2A264TF U 1
AF RR2E585TF U 760
AF RR2E585JQ C 802
AF RR2A264JQ C 611
AF RR2CJ55JQ C 715
BS 1 32 RR2A264TF
BS 33 33 RR2AN82TF
BS 34 113 RR2A264TF
BS 114 114 RR2AN82TF
BS 115 142 RR2A264TF
BS 143 143 RR2AN82TF
BS 144 203 RR2A264TF
BS 204 204 RR2AN82TF
BS 205 231 RR2A264TF
BS 232 232 RR2AN82TF
BS 233 861 RR2A264TF
BS 862 862 RR2E585TF
BS 863 873 RR2A264TF
BS 874 874 RR2E585TF
BS 875 884 RR2A264TF
BS 885 1492 RR2E585TF
BS 1493 1493 RR2CJ55JQ
BS 1494 1541 RR2A264JQ

RD RR2AN82TF 835 0 0
GGAGGATTAAAAACCCTAGAATCCGTCAACGCCGTGACTATTCTCTCTCTCTACATTTTC
TCTTTGTTTTCGGCGATTGATTTTCATTTTTTCGTAAGACAAATCAAAAGATGAGGGGAT
TGGTGAAGAAGCTCGTGTCCAGATCTCTCTCCATCTCCGGCAAATGGCAGCAGCAACAGC
TTCGTCGTCTCAACATCCACGAGCATCAGGGAGCTGAGCTGATGGGTAAATACGGAGTGA
ATGTGCCAAAGGGAGTCGCTGTTTCTTCCTTGGATGAAGTTAAAAAGGCTATCGACCAAG
TTTTCCCTAATGAAAGCGAGCTGGTCGTTAAGAGCCAGATCTTGGCTGGTGGAAGAGGTC
TTGGGACATTCAAGAGTGGCCTCAAGGGTGGTGTTCACATTGTCAACCGTGACCAGGTTC
AAGATATTGCTGGTAAGATGCTTGGACAAGTACTCGTCACCAAAC****TGGTTCTCAAG
GCAAAGTTTTCAGCAAGGTCTACTTGTGTGAGAAATTGTCACTCGTCAATGAGATGTACT
TTTCCATCATTCTGGACCGTAAATCTGCTGGACCGTTGATAATTGCCTGTAAAAAGGGTG
GTACCAGCATTGAAGATCTTGCTGAGAAGTTTCCTGACATGATTATCAAGGTACCGATCG
ATGTATTTGCTGGAATTACTGATGAAGATGCTGCTAAAGTTGTGGATGGTCTGGCTCCGA
AAGCCGCTGACAGAAAAGATTCGATTGAACAAGTGAAGAAGCTATACGAACTCTTCCGCA
AGACTGACTGCACAATGTTGGAAATCAACCCACTCGCTGAGACATCCACTAATCA

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR2A264TF 891 0 0
GGAGGATTAAAAACCCTAGAATCCGTCAACGCTGTGACTATTCTCTCTCTCTACATTTTC
TCTTTGTTTTCGGCGATTGATTTTCATTTTTTCGTAAGACAAATCAAAAGATGTGGGGAT
TGGTGAAGAAGCTCGTGTCCAGGTCTCTCTCCATCTCCGGCAAATGGCAGCAGCAACAGC
TTCGTCGTCTCAACATCCACGAGTATCAGGGAGCTGAGCTGATGGGTAAAT*CGGAGTGA
ATGTGCCAAAGGGAGTCGCTGTTTCTTCCTTGGATGAAGTTAAAAAGGCTATCGACCAAG
TTTTCCCTAATGAAAGCGAGCTGGTCGTTAAGAGCCAGATCTTGGCTGGTGGAAGAGGTC
TTGGGACATTCAAGAGTGGCCTCAAGGGTGGTGTTCACATTGTCAACCGTGACCAGGTTC
AAGATATTGCTGGTAAGATGCTTGGACAAGTACTCGTCACCAAACAAACTGGTTCTCAAG
GCAAAGTTGTCAGCAAGGTCTACTTGTGTGAGAAATTGTCACTCGTCAATGAGATGTACT
TTTCCATCATTCTGGACCGTAAATCTGCTGGACCGTTGATAATTGCCTGTAAAAAGGGTG
GTACCAGCATTGAAGATCTTGCTGAGAAGTTTCCTGACATGATTATCAAGGTACCGATCG
ATGTATTTGCTGGAATTACTGATGAAGATGCTGCTAAAGTTGTGGATGGTCTGGCTCCGA
AAGCCGCTGACAGAAAAGATTCGATTGAACAAGTGAAGAAGCTATACGAACTCTTCCGCA
AGACTGACTGCACAATGTTGGAAATCAACCCACTCGCTGAGACATCCACTAATCAATTGG
TAGCTGCCGATGCCAAGTTGA*CTTTGATGATA*CGCTGCTTTC
GTCAGAA

QA 1 884 1 884
DS 

RD RR2E585TF 736 0 0
AGCTATACGAACTCTTCCGCAAGACTGACTGCACAATGTTGGAAATCAACCCACTCGCTG
AGACATCCACTAATCAATTGGTAGCTGCCGATGCCAAGTTGAACTTTGATGATAACGCTG
CTTTCCGTCAGAAAGAGATCTTTGCTCTTCGTGATCCAACACAGGAGGATCCACGAGAGG
TGGCTGCTGCAAAAGTTGACCTGAACTATATCGGATTAGATGGAGAGATTGGTTGCATGG
TGAATGGTGCTGGATTGGCCATGGCAACCATGGACATCATTAAACTGCACGGTGGGACTC
CTGCAAATTTCCTTGATGTTGGTGGAAATGCTTCTGAACACCAGGTAGTGGAGGCGTTTA
AGATACTGACGTCGGACGATAAAGTGAAAGCAATCTTGGTGAACATATTCGGTGGGATAA
TGAAATGTGATGTGATTGCTAGTGGAATTGTGAATGCTGCTAAAGAGGTGTCACTGAAAG
TACCAGTGGTGGTTCGTCTAGAAGGAACAAACGTTGAACAGGGGAAGAGAATCCTCAAGG
AAAGTGGAATGAAACTCATAACGGCTGATGATTTGGATGATGCTGCAGAGAAAGCTGTCA
AAGCATTAGCTAATTAAGCTTATTGAGGAGATTGTTTACTCTCTCTGCCCCTCTTTATAC
AATAAGCTTTTTTTGAGAGTTTTTTTTATCTATGTTTCTCAACCATCTTTATGGTCGACG
CAATCGCATATTG
CTG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2E585JQ 647 0 0
AAATCAACCCACTCGCTGAGACATCCACTAATCAATTGGTAGCTGCCGATGCCAAGTTGA
ACTTTGATGATAACGCTGCTTTCCGTCAGAAAGAGATCTTTGCTCTTCGTGATCCAACAC
AGGAGGATCCACGAGAGGTGGCTGCTGCAAAAGTTGACCTGAACTATATCGGATTAGATG
GAGAGATTGGTTGCATGGTGAATGGTGCTGGATTGGCCATGGCAACCATGGACATCATTA
AACTGCACGGTGGGACTCCTGCAAATTTCCTTGATGTTGGTGGAAATGCTTCTGAACACC
AGGTAGTGGAGGCGTTTAAGATACTGACGTCGGACGATAAAGTGAAAGCAATCTTGGTGA
ACATATTCGGTGGGATAATGAAATGTGATGTGATTGCTAGTGGAATTGTGAATGCTGCTA
AAGAGGTGTCACTGAAAGTACCAGTGGTGGTTCGTCTAGAAGGAACAAACGTTGAACAGG
GGAAGAGAATCCTCAAGGAAAGTGGAATGAAACTCATAACGGCTGATGATTTGGATGATG
CTGCAGAGAAAGCTGTCAAAGCATTAGCTAATTAAGCTTATTGAGGAGATTGTTTACTCT
CTCTGCCCCTCTTTATACAATAAGCTTTTTTTGAGAGTTTTTTTT
AT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2A264JQ 931 0 0
CATTGAGATCTGCTGAG
AGTTTCCTGACATGATTATCAAGGTACCGATCGATGTATTTGCTGGAATTACTGATGAAG
ATGCTGCTAAGGTTGTGGATGGTCTGGCTCCGAAAGCCGCTGACAGAAAAGATTCGATTG
AACAAGTGAAGAAGCTATACGAACTCTTCCGCAAGACTGACTGCACAATGTTGGAAATCA
ACCCACTCGCTGAGACATCCACTAATCAATTGGTAGCTGCCGATGCCAAGTTGAACTTTG
ATGATAACGCTGCTTTCCGTCAGAAAGAGATCTTTGCTCTTCGTGATCCAACACAGGAGG
ATCCACGAGAGGTGGCTGCTGCAAAAGTTGACCTGAACTATATCGGATTAGATGGAGAGA
TTGGTTGCATGGTGAATGGTGCTGGATTGGCCATGGCAACCATGGACATCATTAAACTGC
ACGGTGGGACTCCTGCAAATTTCCTTGATGTTGGTGGAAATGCTTCTGAACACCAGGTAG
TGGAGGCGTTTAAGATACTGACGTCGGACGATAAAGTGAAAGCAATCTTGGTGAACATAT
TCGGTGGGATAATGAAATGTGATGTGATTGCTAGTGGAATTGTGAATGCTGCTAAAGAGG
TGTCACTGAAAGTACCAGTGGTGGTTCGTCTAGAAGGAACAAACGTTGAACAGGGGAAGA
GAATCCTCAAGGAAAGTGGAATGAAACTCATAACGGCTGATGATTTGGATGATGCTGCAG
AGAAAGCTGTCAAAGCATTAGCTAATTAAGCTTATTGAGGAGATTGTTTACTCTCTCCGC
CCCTCTTTATACAAGAAGCTTTTTTTGAGAGTTTTTTT**TCTCTGTTTCTCAACCATCT
TTATGGTCAACGCAATCGCATATTGTTGCGGATATAATTTCTGAAACAGATCAATAATGA
ACTGGTCTCTCTTT

QA 18 931 18 931
DS 

RD RR2CJ55JQ 824 0 0
CTCCGAAAGCCGCTGACAGAAAAGATTCGATTGAACAAGTGAAGAAGCTATACGAACTCT
TCCGCAAGACTGACTGCACAATGTTGGAAATCAACCCACTCGCTGAGACATCCACTAATC
AATTGGTAGCTGCCGATGCCAAGTTGGACTTTGATGATAACGCTGCTTTCCGTCAGAAAG
AGATCTTTGCTCTTCGTGATCCAACACAGGAGGATCCACGAGAGGTGGCTGCTGCAAAAG
TTGACCTGAACTATATCGGATTAGATGGAGAGATTGGTTGCATGGTGAATGGTGCTGGAT
TGGCCATGGCAACCATGGACATCATTAAACTGCACGGTGGGACTCCTGCAAATTTCCTTG
ATGTTGGTGGAAATGCTTCTGAACACCAGGTAGTGGAGGCGTTTAAGATACTGACGTCGG
ACGATAAAGTGAAAGCAATCTTGGTGAACATATTCGGTGGGATAATGAAATGTGATGTGA
TTGCTAGTGGAATTGTGAATGCTGCTAAAGAGGTGTCACTGAAAGTACCAGTGGTGGTTC
GTCTAGAAGGAACAAACGTTGAACAGGGGAAGAGAATCCTCAAGGAAAGTGGAATGAAAC
TCATAACGGCTGATGATTTGGATGATGCTGCAGAGAAAGCTGTCAAAGCATTAGCTAATT
AAGCTTATTGAGGAGATTGTTTACTCTCTCTGCCCCTCTTTATACAATAAGCTTTTTTTG
AGAGTTTTTTTTATCTATGTTTCTCAACCATCTTTATGGTCGACGCAATCGCATATTGCT
GCGGATATAATTTCTGAAACAGATCAATAATGAACTGTTCTCTC

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 9

CO CL774Contig1 440 9 27 U
GGGGCACATCTAAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAGTCCTAATAAACTTGTAAA
GAGAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTT
ACAAGCATGCAATGGAGCCAGTGTTGACGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAGATTCATTTG
CTTCACAGCCTGTTCCATAGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGAGGAATGTTT
GACCAAGTGCGGTCTCCCAAAACGACCTTCTAAACCAACATCATCTCCATCAACTTCTAC
CACCGCTTGATCTGATCTTATTCTATTTGTGATTTGTGTCTTTATTGCTAAGGATGTCAT
CTTTATGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATACCATAAATTTTCTGATTA
TATAACTGGTTTTATCTTGG


BQ
10 45 45 45 45 55 55 55 55 40 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B487JQ C 2
AF RR2B487TF U 2
AF RR2BV71JQ C 2
AF RR2BV71TF U 2
AF RR2BO41JQ C 4
AF RR2BO41TF U 4
AF RR2AP12JQ C 2
AF RR2AP12TF U 2
AF RR2GR51TF U 1
BS 1 11 RR2GR51TF
BS 12 12 RR2B487TF
BS 13 41 RR2GR51TF
BS 42 42 RR2B487TF
BS 43 140 RR2GR51TF
BS 141 141 RR2B487TF
BS 142 186 RR2GR51TF
BS 187 187 RR2B487TF
BS 188 207 RR2GR51TF
BS 208 208 RR2B487TF
BS 209 231 RR2GR51TF
BS 232 232 RR2B487TF
BS 233 253 RR2GR51TF
BS 254 254 RR2B487TF
BS 255 292 RR2GR51TF
BS 293 293 RR2B487TF
BS 294 313 RR2GR51TF
BS 314 314 RR2B487TF
BS 315 320 RR2GR51TF
BS 321 321 RR2B487TF
BS 322 356 RR2GR51TF
BS 357 357 RR2B487TF
BS 358 403 RR2GR51TF
BS 404 404 RR2B487TF
BS 405 413 RR2GR51TF
BS 414 414 RR2BV71TF
BS 415 440 RR2GR51TF

RD RR2B487JQ 403 0 0
GGGCACATCTAAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAGTCCTAATAAACTTGTAAAG
AGAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTA
CAAGCATGCAATGGGGCCAGTGTTGACGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAGATTCATTTGC
TTCACAGCCTGTTCCATAGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGAGGAATGTTTG
ACCAAGTGCGGTCTCCCAAAACGACCTTCTAAACCAACATCATCTCCATCAACTTCTACC
ACCGCTTGATCTGATCTTATTCTATTTGTGATTTGTGTCTTTATTGCTAAGGATGTCATC
TTTATGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATACC

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2B487TF 403 0 0
GGGCACATCTAAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAGTCCTAATAAACTTGTAAAG
AGAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTA
CAAGCATGCAATGGGGCCAGTGTTGACGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAGATTCATTTGC
TTCACAGCCTGTTCCATAGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGAGGAATGTTTG
ACCAAGTGCGGTCTCCCAAAACGACCTTCTAAACCAACATCATCTCCATCAACTTCTACC
ACCGCTTGATCTGATCTTATTCTATTTGTGATTTGTGTCTTTATTGCTAAGGATGTCATC
TTTATGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATACC

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2BV71JQ 418 0 0
GGGCACATCTAAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAGTCCTAATAAACTTGTAAAG
AGAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTA
CAAGCATGCAATGGAGCCAGTGTTGACGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAGATTCATTTGC
TTCACAGCCTGTTCCATAGCCTGCGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGAGGAATGTTTG
ACCAAGTGCGGTCTCCCAAAACGACCTTTTAAACCAACATCATCTCCATCAACTTCTACC
ACCGCTTGATCTGATCTTATTCTATTTGTGATTTGTGTCTTTATTGCTAAGGATGTCATC
TTTATGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATACCATAAACTTTCTGATT

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR2BV71TF 418 0 0
GGGCACATCTAAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAGTCCTAATAAACTTGTAAAG
AGAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTA
CAAGCATGCAATGGAGCCAGTGTTGACGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAGATTCATTTGC
TTCACAGCCTGTTCCATAGCCTGCGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGAGGAATGTTTG
ACCAAGTGCGGTCTCCCAAAACGACCTTCTAAACCAACATCATCTCCATCAACTTCTACC
ACCGCTTGATCTGATCTTATTCTATTTGTGATTTGTGTCTTTATTGCTAAGGATGTCATC
TTTATGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATACCATAAACTTTCTGATT

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR2BO41JQ 416 0 0
GG
ACATTTAAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAGTCCTAATAAACTTGTAAAGAGAA
AAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTACAAG
CATGCAATGGAGCCAGTGTTGACGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAGATTCATTTGCTTCA
CAGCCTGTTCCATAGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGAGGAATGTTTGACCA
AGTGCGGTCTCCCAAAACGACCTTTTAAACCAACATCATTTCCATCAACTTCTACCACCG
CTTGATCTGATCTTATTCTATTTGTGATTTGTGTCTTTATTGCTAAGGATGTCATCTTTA
TGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATACCATAAATTTTTTGATT

QA 3 416 3 416
DS 

RD RR2BO41TF 416 0 0
GG
ACATCTAAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAGTCCTAATAAACTTGTAAAGAGAA
AAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTACAAG
CATGCAATGGAGCCAGTGTTGACGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAGATTCATTTGCTTCA
CAGCCTGTTCCATAGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGAGGAATGTTTGACCA
AGTGCGGTCTCCCAAAACGACCTTCTAAACCAACATCATCTCCATCAACTTCTACCACCG
CTTGATCTGATCTTATTCTATTTGTGATTTGTGTCTTTATTGCTAAGGATGTCATCTTTA
TGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATACCATAAATTTTCTGATT

QA 3 416 3 416
DS 

RD RR2AP12JQ 405 0 0
GGGCACATCTCAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAGTCCTAATAAACTTGTAAAG
AGAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTA
CAAGCATGCAATGGAGCCAATGTTGACGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAGATTCATTTGC
TTCACGGCCTGTTCCATAGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGAAGAATGTTTG
ACCAAGTGCGGTATCCCAAAACGACCTTCTAAACCAACATCATCTCCATCACCTTCTACC
ACCGCTTGATCTAATCTTATTCTATTTGTGATTTGTGTCTTTATTGCTAAGGATGCCATC
TTTATGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATAC
GAT

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR2AP12TF 405 0 0
GGGCACATCTCAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAGTCCTAATAAACTTGTAAAG
AGAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTA
CAAGCATGCAATGGAGCCAATGTTGACGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAGATTCATTTGC
TTCACGGCCTGTTCCATAGCCTGTGGCAAACAAAACAAACCTTGTTACGAAGAATGTTTG
ACCAAGTGCGGTATCCCAAAACGACCTTCTAAACCAACATCATCTCCATCACCTTCTACC
ACCGCTTGATCTAATCTTATTCTATTTGTGATTTGTGTCTTTATTGCTAAGGATGCCATC
TTTATGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATAC
GAT

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR2GR51TF 440 0 0
GGGGCACATCTCAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAATCCTAATAAACTTGTAAA
GAGAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTT
ACAAGCATGCAATGGAGCCAATGTTGACGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAGATTCATTTG
CTTCACGGCCTGTTCCATAGCCTGTGGTAAACAAAACAAACCTTGTTACGAAGAATGTTT
GACCAAGTGCGGTATCCCAAAACGACCTTCTAAACCAACATCATCTCCATCACCTTCTAC
CACCGCTTGATCTAATCTTACTCTATTTGTGATTTGTGTCTTTATTGCTAAGGATGCCAT
CTTTATGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATACGATAAATTTTATGATTA
TATAACTGGTTTTATCTTGG

QA 1 440 1 440
DS 



AS 2 8

CO CL775Contig1 702 2 3 U
AGAGATAATAGTTGAAGTTTTATAATCCGAGAAAGGTACTGAAAGATTCTCTTACACAAC
AGAGACTAAACTGTCTCATGAAACATCAGTCTCTCTAACAGACAAAATGAAAGAAAGCCA
CTTGGTGTCAAGATTCGAAGTAGACGCAAAGCGGATTAAATGCTGCATCACCCGTATCGA
GAGAGTCTCCCTCAAAGACGACTAATGACTGCTTCAACTTCCTGTGGAGTGTAGAGATGG
TAAGCTGGAGCTACCTTGGCAATGTCCACATTATTTGGAGTCACCTTTTCTTCCATAACT
TGCTTGAGGATAGATACAGCGATCGTCTCAGCTTCATCAAGTGACAGATCTTTATTGAAC
TGCTCTTGAAGAGAACTATCAGCTCCTTCTGATCCTGAACCAATCGCTTTTGCATTGCAC
TGCCAGAACGTTCCAGACGGATCCGTGTAGTACAAGCTCGGTCCATTTTCATCATGACCA
GCAATGAGAAGGGAGACTCCAAACGGCCGAGACATTGATTCTTCATCTCCTTCACCAAAC
CGTAATGCCAGATCACACAGCGCTTGGGTAGTGGACTCTACAGTCATTGGCTCGCCATAC
GAGAATCTGTGGTTTTGAGTCTCAACTCTTGCATGCTCAACAAGTGTGCGGGCATCAGCA
ATTAAGCCGCTCATGGCACAGCCAATATGGTCATCAATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW04JQ U 22
AF RR2BE14JQ U 1
BS 1 158 RR2BE14JQ
BS 159 159 RR2BW04JQ
BS 160 702 RR2BE14JQ

RD RR2BW04JQ 359 0 0
ATAATCCGAGAAAGGTACTGAAAGATTCTCTTACACAACAGAGACTAAACTGTCTCATGA
AACATCAGTCTCTCTAACAGACAAAATGAAAGAAAGCCACTTGGTGTCAAGATTCGAAGT
AGACGCAAAGCGGATTAAATGCTGCATCACCCGTATCGAGAGAGTCTCCCTCAAAGACGA
CTAATGACTGCTTCAACTTCCTGTGGAGTGTAGAGATGGTAAGCTGGAGCTACCTTGGCA
ATGTCCACATTATTTGGAGTCACCTTTTCTTCCATAACTTGCTTGAGGATAGATACAGCG
ATCGTCTCAGCTTCATCAAGTGACAGATCTTTATTGAATTGCTCTTGAAGAGAACTATC

QA 1 359 1 359
DS 

RD RR2BE14JQ 702 0 0
AGAGATAATAGTTGAAGTTTTATAATCCGAGAAAGGTACTGAAAGATTCTCTTACACAAC
AGAGACTAAACTGTCTCATGAAACATCAGTCTCTCTAACAGACAAAATGAAAGAAAGCCA
CTTGGTGTCAAGATTCGAAGTAGACGCAAAGCGGATTAGATGCTGCATCACCCGTATCGA
GAGAGTCTCCCTCAAAGACGACTAATGACTGCTTCAACTTCCTGTGGAGTGTAGAGATGG
TAAGCTGGAGCTACCTTGGCAATGTCCACATTATTTGGAGTCACCTTTTCTTCCATAACT
TGCTTGAGGATAGATACAGCGATCGTCTCAGCTTCATCAAGTGACAGATCTTTATTGAAC
TGCTCTTGAAGAGAACTATCAGCTCCTTCTGATCCTGAACCAATCGCTTTTGCATTGCAC
TGCCAGAACGTTCCAGACGGATCCGTGTAGTACAAGCTCGGTCCATTTTCATCATGACCA
GCAATGAGAAGGGAGACTCCAAACGGCCGAGACATTGATTCTTCATCTCCTTCACCAAAC
CGTAATGCCAGATCACACAGCGCTTGGGTAGTGGACTCTACAGTCATTGGCTCGCCATAC
GAGAATCTGTGGTTTTGAGTCTCAACTCTTGCATGCTCAACAAGTGTGCGGGCATCAGCA
ATTAAGCCGCTCATGGCACAGCCAATATGGTCATCAATTTCC

QA 1 702 1 702
DS 



CO CL775Contig2 1000 6 34 U
GGATGACAAACTTGTAAAAGCATCCCAGTTTCTTCGATTTGGTCCGATCAATCAGAGCTG
GGTTTACAGATCGAAGAAGAAGA*********TGTTTCTCACTAGGACCGAGTATGACAG
AGGAGTCAACACTTTTTCTCCTGAAGGCAGGTTATTCCAAGTCGAGTATGCCATTGAAGC
TATCAAGCTGGGTTCTACTGCAATAGGAGTAAAGACAAAAGAGGGAGTTGTGCTTGCTGT
CGAGAAGCGTATCACCTCCCCTTTACTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTATGGAAAT
TGATGACCATATTGGCTGTGCCATGAGCGGCTTAATTGCTGATGCCCGCACACTTGTTGA
GCATGCTAGAGTTGAGACTCAAAACCACAGATTCTCGTATGGCGAGCCAATGACTGTAGA
GTCCACTACCCAAGCGCTGTGTGATCTCGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATC
AATGTCTCGGCCGTTTGGAGTCTCCCTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAATGGACCGAG
CTTGTACTACACGGATCCGTCTGGAACGTTCTGGCAGTGCAATGCAAAGGCGATTGG*TT
CGGGGTCAGAAGGAGCTGATAGTTCTCTTCAAGAGCAATTCAACAAAGATCTGTCACTTG
ATGAAGCTGAGACGATCGCTGTATCTATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAAAAGGTGACTC
CAAATAATGTGGACATTGCGAAGGTAGCTCCAGCGTACCATCTCTACACTCCACAGGAAG
TTGAAGCAGTCATTAGTCGTCTTTGAGGGAGATTCTCTCAATACGGATGATGCATCTAAT
CCCCTTCCGCTTTTCGTCTACTTCGAATCTTGACACCAAGTGGCTTTCTTTCACTTTGTC
TGTTAGAGAGACTGATGTTCCATGAGACAGTTTAGTCTCTTGTTGTGTAAGAGAATCTTT
CAGTACCTTTCTCGGATTATAAAACTTCAACTATTATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 20 20 20 5 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2BE14TF U 1
AF RR2GE90TF U 12
AF RR2GR74TF U 52
AF RR2GW66TF U 44
AF RR2GE90JQ C 217
AF RR2GR74JQ C 370
BS 1 40 RR2BE14TF
BS 41 41 RR2GE90TF
BS 42 48 RR2BE14TF
BS 49 49 RR2GE90TF
BS 50 63 RR2BE14TF
BS 64 64 RR2GE90TF
BS 65 83 RR2BE14TF
BS 84 92 RR2GE90TF
BS 93 108 RR2BE14TF
BS 109 109 RR2GE90TF
BS 110 183 RR2BE14TF
BS 184 184 RR2GE90TF
BS 185 204 RR2BE14TF
BS 205 205 RR2GE90TF
BS 206 366 RR2BE14TF
BS 367 367 RR2GE90TF
BS 368 447 RR2BE14TF
BS 448 448 RR2GE90TF
BS 449 450 RR2BE14TF
BS 451 451 RR2GE90TF
BS 452 588 RR2BE14TF
BS 589 589 RR2GE90TF
BS 590 599 RR2BE14TF
BS 600 637 RR2GE90TF
BS 638 638 RR2GW66TF
BS 639 689 RR2GE90TF
BS 690 713 RR2GW66TF
BS 714 714 RR2GE90JQ
BS 715 731 RR2GW66TF
BS 732 732 RR2GE90JQ
BS 733 742 RR2GW66TF
BS 743 743 RR2GE90JQ
BS 744 765 RR2GW66TF
BS 766 1000 RR2GE90JQ

RD RR2BE14TF 599 0 0
GGATGACAAACTTGTAAAAGCATCCCAGTTTCTTCGATTTTGTCCGATAAATCAGAGCTG
GGTGTACAGATCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGTTTCTCACTAGGACGGAGTATGACAG
AGGAGTCAACACTTTTTCTCCTGAAGGCAGGTTATTCCAAGTCGAGTATGCCATTGAAGC
TATTAAGCTGGGTTCTACTGCAATTGGAGTAAAGACAAAAGAGGGAGTTGTGCTTGCTGT
CGAGAAGCGTATCACCTCCCCTTTACTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTATGGAAAT
TGATGACCATATTGGCTGTGCCATGAGCGGCTTAATTGCTGATGCCCGCACACTTGTTGA
GCATGCAAGAGTTGAGACTCAAAACCACAGATTCTCGTATGGCGAGCCAATGACTGTAGA
GTCCACTACCCAAGCGCTGTGTGATCTGGCATTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATC
AATGTCTCGGCCGTTTGGAGTCTCCCTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAATGGACCGAG
CTTGTACTACACGGATCCGTCTGGAACGTTCTGGCAGTGCAATGCAAAAGCGATTGG*T

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2GE90TF 678 0 0
GG
GTAAAAGCATCCCAGTTTCTTCGATTTGTTCCGATCAATCAGAGCTGGGTTTACAGATCG
AAGAAGAAGA*********TGTTTCTCACTAGGACCGAGTATGACAGAGGAGTCAACACT
TTTTCTCCTGAAGGCAGGTTATTCCAAGTCGAGTATGCCATTGAAGCTATCAAGCTGGGT
TCTACTGCAATAGGAGTAAAGACAAAAGAGGGAGTTGTGCTTGCTGTCGAGAAGCGTATC
ACCTCCCCTTTACTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTATGGAAATTGATGACCATATT
GGCTGTGCCATGAGCGGCTTAATTGCTGATGCCCGCACACTTGTTGAGCATGCTAGAGTT
GAGACTCAAAACCACAGATTCTCGTATGGCGAGCCAATGACTGTAGAGTCCACTACCCAA
GCGCTGTGTGATCTCGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATCAATGTCTCGGCCG
TTTGGAGTCTCCCTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAATGGACCGAGCTTGTACTACACG
GATCCGTCTGGAACGTTCTGGCAGTGCAATGCAAAGGCGATTGG*TTCGGGGTCAGAAGG
AGCTGATAGTTCTCTTCAAGAGCA*TTCAACAAAGATCTGTCACTTGATGAAGCTGAGAC
GATCGCTGTATCTATC

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR2GR74TF 660 0 0
GG
AGAGCTGGGTTTACAGATCGAAGAAGAAGA*********TGTTTCTCACTAGGACCGAGT
ATGACAGAGGAGTCAACACTTTTTCTCCTGAAGGCAGGTTATTCCAAGTCGAGTATGCCA
TTGAAGCTATCAAGCTGGGTTCTACTGCAATAGGAGTAAAGACAAAAGAGGGAGTTGTGC
TTGCTGTCGAGAAGCGTATCACCTCCCCTTTACTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTA
TGGAAATTGATGACCATATTGGCTGTGTCATGAGCGGCTTAATTGCTGATGCCCGCACAC
TTGTTGAGCATGCTAGAGTTGAGACTCAAAACCACAGATTCTCGTATGGCGAGCCAATGA
CTGTAGAGTCCACTACCCAAGCGCTGTGTGATCTCGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATG
AAGAATCAATGTCTCGGCCGTTTGGAGTCTCCCTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAATG
GACCGAGCTTGTACTACACGGATCCGTCTGGAACGTTCTGGCAGTGCAATGCAAAGGCGA
TTGG*TTCGGGGTCAGAAGGAGCTGATAGTTCTCTTCAAGAGCAATTCAACAAAGATCTG
TCACTTGATGAAGCTGAGACGATCGCTGTATCTATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAAA

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR2GW66TF 722 0 0
GG
GATCAATCAGAGCTGGGTTTACAGATCGAAGAAGAAGA*********TGTTTCTCACTAG
GACCGAGTATGACAGAGGAGTCAACACTTTTTCTCCTGAAGGCAGGTTATTCCAAGTCGA
GTATGCGATTGAAGCTATCAAGCTGGGTTCTACTGCAATAGGAGTAAAGACAAAAGAGGG
AGTTGTGCTTACTGTCGAGAAGCGTATCACCTCCCCTTTACTGGAGCCGAGCAGTGTGGA
GAAGATTATGGAAATTGATGACCATATTGGCTGTGCCATGAGCGGCTTAATTGCTGATGC
CCGCACACTTGTTGAGCATGCTAGAGTTGAGACTCAAAACCACAGATTCTCGTATGGCGA
GCCAATGACTGTAGAGTCCACTACCCAAGCGCTGTGTGATCTCGCTTTACGGTTTGGTGA
AGGAGATGAAGAATCAATGTCTCGGCCGTTTGGAGTCTCCCTTCTCATTGCTGGTCATGA
TGAAAATGGACCGAGCTTGTACTACACGGATCCGTCTGGAACGTTCAGGCAGTGCAATGC
AAAGGCGATTGGGTTCGGGGTCAGAAGGAGCTGATAGTTCTCTTCAAGAGCAATTCAACA
AAGATCTGTCACTTGATGAAGCTGAGACGATCGCTGTATCTATCCTCAAGCAAGTTATGG
AAGAAAAG*TGACTCCAAATAATGTG*ACATTGCGAAAGTAGCTCCAGCGTACCATCTCT

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR2GE90JQ 784 0 0
AAAAGAGGGAGTTGTGCTTGCTGTCGAGAAGCGTATCACCTCCCCTTTACTGGAGCCGAG
CAGTGTGGAGAAGATTATGGAAATTGATGACCATATTGGCTGTGCCATGAGCGGCTTAAT
TGCTGATGCCCGCACACTTGTTGAGCATGCTAGAGTTGAGACTCAAAACCACAGATTCTC
GTATGGCGAGCCAATGACTGTAGAGTCCACTACCCAAGCGCTGTGTGATCTCGCTTTACG
GTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATCAATGTCTCGGCCGTTTGGAGTCTCCCTTCTCATTGC
TGGTCATGATGAAAATGGACCGAGCTTGTACTACACGGATCCGTCTGGAACGTTCTGGCA
GTGCAATGCAAAGGCGATTGG*TTCGGGGTCAGAAGGAGCTGATAGTTCTCTTCAAGAGC
AATTCAACAAAGATCTGTCACTTGATGAAGCTGAGACGATCGCTGTATCTATCCTCAAGC
AAGTTATGGAAGAAAAGGTGACTCCAAATAATGTGGACATTGCGAAGGTAGCTCCAGCGT
ACCATCTCTACACTCCACAGGAAGTTGAAGCAGTCATTAGTCGTCTTTGAGGGAGATTCT
CTCAATACGGATGATGCATCTAATCCCCTTCCGCTTTTCGTCTACTTCGAATCTTGACAC
CAAGTGGCTTTCTTTCACTTTGTCTGTTAGAGAGACTGATGTTCCATGAGACAGTTTAGT
CTCTTGTTGTGTAAGAGAATCTTTCAGTACCTTTCTCGGATTATAAAACTTCAACTATTA
TCCC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2GR74JQ 631 0 0
AGTTGAGACTCAAAACCACAGATTCTCGTATGGCGAGCCAATGACTGTAGAGTCCACTAC
CCAAGCGCTGTGTGATCTCGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATCAATGTTTCG
GCCGTTTGGAGTCTCCCTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAATGGACCGAGCTTGTACTA
CACGGATCCGTCTGGAACGTTCTGGCAGTGCAATGCAAAGGCGATTGG*TTCGGGGTCAG
AAGGAGCTGATAGTTCTCTTCAAGAGCAATTCAACAAAGATCTGTCACTTGATGAAGCTG
AGACGATCGCTGTATCTATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAAAAGGTGACTCCAAATAATG
TGGACATTGCGAAGGTAGCTCCAGCGTACCATCTTTACACTCCACAGGAAGTTGAAGCAG
TCATTAGTCGTCTTTGAGGGAGATTCTCTCAATACGGATGATGCATCTAATCCCCTTCCG
CTTTTCGTCTACTTCGAATCTTGACACCAAGTGGCTTTCTTTCACTTTGTCTGTTAGAGA
GACTGATGTTCCATGAGACAGTTTAGTCTCTTGTTGTGTAAGAGAATCTTTCAGTACCTT
TCTCGGATTATAAAACTTCAACTATTATC
CC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 8

CO CL776Contig1 872 8 42 U
GGAGCCGTCTTCGTCTCTGAGGTACGCACCGATTCTAGTCTCTG**AGATAACAAAGACT
T**TTTTTTT*AAAAAGGCATTTGAAAGAGACAAAACATGTCTGGTGAAGAGGCTGCTGC
TCCAGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGTTATCCCGGAGGACATGGATTTGTT
GACCGCATTGGAGTTGACTCTCAGGAAATCACGTGCTCATGGTGGTGTTGTTCGTGGTCT
TCATGAAAGCGCTAAGCTTATCGAGAAGCGTGTGGCTCAGCTTTGCGTCTTGGCTGAAGA
CTGCAACCAGCCTGATTACGTCAAGCTTGTGAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAACATCAA
CTTGCTTACTGTTCCAAGTGCCAAGACCCTCGGCGAATGGGCTGGTCTCTGTAAGATTGA
CTCTGAGGGTAATGCTAGAAAGGTTGTTGGATGCTCCTGTCTTGTAGTCAAGGACTACGG
TGAGGACACGACTGCACTCAACATTGTCAAGAAGCACATCGAATCTAACTAAGTTTTAAG
AAGGATTTGAAATCTCGATTTACAAATGTTTTCGTTCCCTAATTCTCTCAATGCTGTTTT
CTACTGGTTTTGATATTTACTATGTTAGCAGACACCTCTCCAGATTTGTTTGGAATATAA
ACAAGTTTTGCTGTTATGTAGGATCTACTACTTTCTTAGGTTATCTCTGCCCAATTTCAT
TAGAAGGTTGATAAGCTTACAGATTAATTTTAATCAAGTTTATGATAATTATATTTTGAT
GATATGCAATGGATAGATTCTTAACAATATCAAAAACATGTATTATAAGTTTACAAAATC
GATTGTTTTGTCAACTATAACAGTCCATCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 40 40 40 25 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 25 5 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 10 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 45 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV20TF U 1
AF RR2F593TF U 22
AF RR2GS41TF U 22
AF RR2BH60TF U 22
AF RR2FG40JQ C 22
AF RR2FG40TF U 22
AF RR2F593JQ C 75
AF RR2BH60JQ C 221
BS 1 37 RR2DV20TF
BS 38 38 RR2BH60TF
BS 39 41 RR2DV20TF
BS 42 43 RR2BH60TF
BS 44 44 RR2DV20TF
BS 45 46 RR2BH60TF
BS 47 47 RR2DV20TF
BS 48 48 RR2BH60TF
BS 49 69 RR2DV20TF
BS 70 70 RR2BH60TF
BS 71 115 RR2DV20TF
BS 116 116 RR2BH60TF
BS 117 155 RR2DV20TF
BS 156 157 RR2BH60TF
BS 158 261 RR2DV20TF
BS 262 262 RR2BH60TF
BS 263 282 RR2DV20TF
BS 283 283 RR2BH60TF
BS 284 285 RR2DV20TF
BS 286 286 RR2BH60TF
BS 287 288 RR2DV20TF
BS 289 289 RR2BH60TF
BS 290 312 RR2DV20TF
BS 313 313 RR2BH60TF
BS 314 330 RR2DV20TF
BS 331 331 RR2BH60TF
BS 332 465 RR2DV20TF
BS 466 466 RR2BH60TF
BS 467 495 RR2DV20TF
BS 496 496 RR2BH60TF
BS 497 504 RR2DV20TF
BS 505 505 RR2BH60TF
BS 506 577 RR2DV20TF
BS 578 578 RR2BH60TF
BS 579 579 RR2DV20TF
BS 580 580 RR2BH60TF
BS 581 633 RR2DV20TF
BS 634 634 RR2BH60TF
BS 635 637 RR2DV20TF
BS 638 689 RR2BH60TF
BS 690 752 RR2F593JQ
BS 753 872 RR2BH60JQ

RD RR2DV20TF 637 0 0
GGAGCCGTCTTCGTCTCTGAGGTACGCACCGATTCTAATCTGGGCAATATAACAAAGACT
T**TTTTTT**AAAAAGGCATTTGAAAGAGACAAAACATGTCTGGTGAAGAGGCTACTGC
TCCAGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCGATCCCGGAGGACATGGATTTGTT
GACCGCATTGGAGTTGACTCTCAGGAAATCACGTGCTCATGGTGGTGTTGTTCGTGGTCT
TCATGAAAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTGGCTCAGCTCTGTGTATTGGCTGAAGA
CTGCAACCAGCCAGATTACGTCAAGCTTGTTAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAACATCAA
CTTGCTTACTGTTCCAAGTGCCAAGACCCTCGGCGAATGGGCTGGTCTCTGTAAGATTGA
CTCTGAGGGTAATGCTAGAAAGGTTGTTGGATGCTCCTGTCTTGTGGTCAAGGACTACGG
TGAGGACACGACTGCCCTCAACATCGTCAAGAAGCACATCGAATCTAACTAAGTTTTAAG
AAGGATTTGAAATCTCGATTTACAAATGTTTTCGTTCTCAAATTCTCTCAATGCTGTTTT
CTACTGGTTTTGATATTTACTATGTTAGCAGACTCCT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2F593TF 618 0 0
GGGCAGCCGTCTTCGT
GTCTCTG**AGATAACAAAGACTTTCTTTTTTTTTAAAAGGCATTTGAAAGAGACAAAAC
ATGTCTGGTGAAGAGGCTGCTGCTCCAGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGTT
ATCCCGGAGGACATGGATTTGTTGACCGCATTGGAGTTGACTCTCAGGAAATCACGTGCT
CATGGTGGTGTTGTTCGTGGTCTTCATGAAAGCGCTAAGCTTATCGAGAAGCGTGTGGCT
CAGCTTTGCGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTGATTACGTCAAGCTTGTGAAGGCT
CTCTGCGCTGATCACAACATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCCAAGACCCTCGGCGAA
TGGGCTGGTCTCTGTAAGATTGACTCTGAGGGTAATGCTAGAAAGGTTGTTGGATGCTCC
TGTCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGACACGACTGCACTCAACATTGTCAAGAAGCAC
ATCGAATCTAACTAAGTTTTAAGAAGGATTTGAAATCTCGATTTACAAATGTTTTCGTTC
CCTAATTCTCTCAATGCTGTTTTCTACTGGTTTTGATATTTACTATGTTAGCAGACACCT
CT

QA 17 618 17 618
DS 

RD RR2GS41TF 632 0 0
GGGCAGCCGTCTTCGT
GTCTCTG**AGATAACAAAGACTT***TTTTTTTTAAAAGGCATTTGAAAGAGACAAAAC
ATGTCTGGTGAAGAGGCTGCTGCTCCAGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGTT
ATCCCGGAGGACATGGATTTGTTGACCGCATTGGAGTTGACTCTCAGGAAATCACGTGCT
CATGGTGGTGTTGTTCGTGGTCTTCATGAAAGCGCTAAGCTTATCGAGAAGCGTGTGGCT
CAGCTTTGCGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTGATTACGTCAAGCTTGTGAAGGCT
CTCTGCGCTGATCACAACATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCCAAGACCCTCGGCGAA
TGGGCTGGTCTCTGTAAGATTGACTCTGAGGGTAATGCTAGAAAGGTTGTTGGATGCTCC
TGTCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGACACGACTGCACTCAACATTGTCAAGAAGCAC
ATCGAATCTAACTAAGTTTTAAGAAGGATTTGAAATCTCGATTTACAAATGTTTTCGTTC
CCTAATTCTCTCAATGCTGTTTTCTACTGGTTTTGATATTTACTATGTTAGCAGACACCT
CTCCAGATTTGTTTGG

QA 17 632 17 632
DS 

RD RR2BH60TF 674 0 0
GGGCAGCCGTCTTCGT
GTCTCTG**AGATAACAAAGACTT**TTTTTTTTTAAAAGGCATTTGAAAGAGACAAAAC
ATGTCTGGTGAAGAGGCTGCTGCTCCAGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGTT
ATCCCGGAGGACATGGATTTGTTGACCGCATTGGAGTTGACTCTCAGGAAATCACGTGCT
CATGGTGGTGTTGTTCGTGGTCTTCATGAAAGCGCTAAGCTTATCGAGAAGCGTGTGGCT
CAGCTTTGCGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTGATTACGTCAAGCTTGTGAAGGCT
CTCTGCGCTGATCACAACATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCCAAGACCCTCGGCGAA
TGGGCTGGTCTCTGTAAGATTGACTCTGAGGGTAATGCTAGAAAGGTTGTTGGATGCTCC
TGTCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGACACGACTGCACTCAACATTGTCAAGAAGCAC
ATCGAATCTAACTAAGTTTTAAGAAGGGTTTGAAATCTCGATTTACAAATGTTTTCGTTC
CCTAATTCTCTCAATGCTGTTTTCTACTGGTTTTGATATTTACTATGTTAGCAGACACCT
CTCCAGATTTGTTTGGAATATAAACAAGTTTTGCTGTTATGTAGGATCTACT
ACTTTC

QA 17 668 17 668
DS 

RD RR2FG40JQ 654 0 0
GGGTGCAGCCGTCTTC
GTCTCTG**AGATAACAAAGACTT**TTTTTTT*AAAAAGGCATTTGAAAGAGACAAAAC
ATGTCTGGTGAAGAGGCTACTGCTCCGGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCG
ATCCCGGAGGACATGGATTTGTTGACCGCATTGGAGTTGACTCTCAGGAAATCACGTGCT
CATGGTGGTGTTGTTCGTGGTCTTCATGAAAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTGGCT
CAGCTCTGTGTATTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCAGATTACGTCAAGCTTGTTAAGGCT
CTTTGCGCTGATCACAACATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCCAAGACCCTCGGCGAA
TGGGCTGGTCTCTGTAAGATTGACTCTGAGGGTAGTGCTAGAAAGGTTGTTGGATGCTCC
TGTCTTGTGGTCAAGGACTACGGTGAGGACACGACTGCCCTCAACATCGTCAAGAAGCAC
ATCGAATCTAACTAAGTTTTAAGAAGGATTTGAAATCTCGATTTACAAATGTTTTCGTTC
TCAAATTCTCTCAATGCTGTTTTCTACTGGTTTTGATATTTACTATGTTAGCAGACTCCT
CCCCAGATTTGTTTGGAATATAAACAAGTTTTGCTGTT

QA 17 654 17 654
DS 

RD RR2FG40TF 654 0 0
GGGTGCAGCCGTCTTC
GTCTCTG**AGATAACAAAGACTT**TTTTTTT*AAAAAGGCATTTGAAAGAGACAAAAC
ATGTCTGGTGAAGAGGCTACTGCTCCGGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCG
ATCCCGGAGGACATGGATTTGTTGACCGCATTGGAGTTGACTCTCAGGAAATCACGTGCT
CATGGTGGTGTTGTTCGTGGTCTTCATGAAAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTGGCT
CAGCTCTGTGTATTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCAGATTACGTCAAGCTTGTTAAGGCT
CTCTGCGCTGATCACAACATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCCAAGACCCTCGGCGAA
TGGGCTGGTCTCTGTAAGATTGACTCTGAGGGTAGTGCTAGAAAGGTTGTTGGATGCTCC
TGTCTTGTGGTCAAGGACTACGGTGAGGACACGACTGCCCTCAACATCGTCAAGAAGCAC
ATCGAATCTAACTAAGTTTTAAGAAGGATTTGAAATCTCGATTTACAAATGTTTTCGTTC
TCAAATTCTCTCAATGCTGTTTTCTACTGGTTTTGATATTTACTATGTTAGCAGACTCCT
CCCCAGATTTGTTTGGAATATAAACAAGTTTTGCTGTT

QA 17 654 17 654
DS 

RD RR2F593JQ 678 0 0
AAGGCATTTGAAAGAGACAAAACATGTCTGGTGAAGAGGCTGCTGCTCCAGTTGTTGTTC
CTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGTTATCCCGGAGGACATGGATTTGTTGACCGCATTGGAGT
TGACTCTCAGGAAATCACGTGCTCATGGTGGTGTTGTTCGTGGTCTTCATGAAAGCGCTA
AGCTTATCGAGAAGCGTGTGGCTCAGCTTTGCGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTG
ATTACGTCAAGCTTGTGAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAACATCAACTTGCTTACTGTTC
CAAGTGCCAAGACCCTCGGCGAATGGGCTGGTCTCTGTAAGATTGACTCTGAGGGTAATG
CTAGAAAGGTTGTTGGATGCTCCTGTCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGACACGACTG
CACTCAACATTGTCAAGAAGCACATCGAATCTAACTAAGTTTTAAGAAGGATTTGAAATC
TCGATTTACAAATGTTTTCGTTCCCTAATTCTCTCAATGCTGTTTTCTACTGGTTTTGAT
ATTTACTATGTTAGCAGACACCTCTCCAGATTTGTTTGGAATATAAACAAGTTTTGCTGT
TATGTAGGATCTACTACTTTCTTAGGTTATCTCTGCCCAATTTCATTAGAAGGTTGATAA
GCTTACAGATTAATTTTA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2BH60JQ 652 0 0
GGTGGTGTTGTTCGTGGTCTTCATGAAAGCGCTAAGCTTATCGAGAAGCGTGTGGCTCAG
CTTTGCGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTGATTACGTCAAGCTTGTGAAGGCTCTC
TGCGCTGATCACAACATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCCAAGACCCTCGGCGAATGG
GCTGGTCTCTGTAAGATTGACTCTGAGGGTAATGCTAGAAAGGTTGTTGGATGCTCCTGT
CTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGACACGACTGCACTCAACATTGTCAAGAAGCACATC
GAATCTAACTAAGTTTTAAGAAGGGTTTGAAATCTCGATTTACAAATGTTTTCGTTCCCT
AATTCTCTCAATGCTGTTTTCTACTGGTTTTGATATTTACTATGTTAGCAGACACCTCTC
CAGATTTGTTTGGAATATAAACAAGTTTTGCTGTTATGTAGGATCTACTACTTTCTTAGG
TTATCTCTGCCCAATTTCATTAGAAGGTTGATAAGCTTACAGATTAATTTTAATCAAGTT
TATGATAATTATATTTTGATGATATGCAATGGATAGATTCTTAACAATATCAAAAACATG
TATTATAAGTTTACAAAATCGATTGTTTTGTCAACTATAACAGTCCATCCAC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 2 8

CO CL777Contig1 725 5 9 U
GGATCTCATGCAATACAAAGCATTTTCCAAACCTAATCGAATCGAATCGAATCCAGATTT
GTGGTTTTTGTTACCTCAAGAAGGAGAATCAATGGCGCCCAAGGCAGAGAAGAAGCCCGC
GGAGAAGAAACCAGCCGAGGAGAAAGCTCCGTCGGAGAAGAAACCGAAGGCCGGGAAGAA
GCTCCCCAAGGAAGCGGGCGGCGCGGGAGGTGACAAGAAGAAGAAGATGAAGAAGAAGAG
CGTCGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAGGTCCACCCCGACATCGG
GATCTCGAGCAAGGCGATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGATATCTTCGAGAAGCT
TGCCGGCGAGTCGTCGAAGCTTGCGAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACTTCTAGGGA
GATTCAGACCGCGGTGAGACTCGTGTTGCCTGGAGAGTTGGCGAAACACGCTGTCTCCGA
GGGAACCAAGGCCGTTACCAAGTTTACGAGCTCTTGAGCTATATGAGTTAGGGTTTCTCC
CTCTTGATAATTCAATGTCTGAATTAGAGTTAGAAAAATTGTCTTTTCATGTTTTCCAGC
ATCGTTTTGTTTGCAATCTCGTTTTGTAATTAAAGGTATTGATATGTCTGAATCTATGTT
ATCTCTTTTTTTCCTTTTCCTTCCGGTCTTATTCTTATTTTATAATCGAAGTCTGTGTTT
TTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2AS62TF U 1
AF RR2DW33TF U 348
AF RR2DW33JQ C 348
AF RR2BH79JQ C 1
AF RR2BH79TF U 1
BS 1 106 RR2AS62TF
BS 107 107 RR2BH79TF
BS 108 108 RR2AS62TF
BS 109 109 RR2BH79TF
BS 110 369 RR2AS62TF
BS 370 370 RR2DW33TF
BS 371 563 RR2AS62TF
BS 564 630 RR2DW33TF
BS 631 725 RR2BH79TF

RD RR2AS62TF 563 0 0
GGATCTCATGCAATACAAAGCATTTTCCAAACCTAATCGAATCGAATCGAATCCAGATTT
GTGGTTTTTGTTACCTCAAGAAGGAGAATCAATGGCGCCCAAGGCA*ATAAGAAGCCCGC
GGAGAAGAAACCAGCCGAGGAGAAAGCTCCGTCGGAGAAGAAACCGAAGGCCGGGAAGAA
GCTCCCCAAGGAAGCGGGCGGCGCGGGAGGTGACAAGAAGAAGAAGATGAAGAAGAAGAG
CGTCGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAGGTCCACCCCGACATCGG
GATCTCGAGCAAGGCGATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGATATCTTCGAGAAGCT
TGCCGGCGAATCGTCGAAGCTTGCGAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACTTCTAGGGA
GATTCAGACCGCGGTGAGACTCGTGTTGCCTGGAGAGTTGGCGAAACACGCTGTCTCCGA
GGGAACCAAGGCCGTTACCAAGTTTACGAGCTCTTGAGCTATATGAGTTAGGGTTTCTCC
CTCTTGATAATTCAATGTCTGAA

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2DW33TF 283 0 0
G
CTTCGAGAAGCTTGCCGGCGAGTCGTCGAAGCTTGCGAGGTACAACAAGAAGCCTACGAT
CACTTCTAGGGAGATTCAGACCGCGGTGAGACTCGTGTTGCCTGGAGAGTTGGCGAAACA
CGCTGTCTCCGAGGGAACCAAGGCCGTTACCAAGTTCACGAGCTCTTGAGCTATATGAGT
TAGGGTTTCTCCCTCTTGATAATTCAATGTCTGAATTAGAGTTAGAAAAATTGTCTTTTC
ATGTTTTCCAGCATCGTTTTGTTTGCAATCTCGTTTTGTAAT

QA 2 283 2 283
DS 

RD RR2DW33JQ 332 0 0
G
CTTCGAGAAGCTTGCCGGCGAGTCGTCGAAGCTTGCGAGGTACAACAAGAAGCCTACGAT
CACTTCTAGGGAGATTCAGACCGCGGTGAGACTCGTGTTGCCTGGAGAGTTGGCGAAACA
CGCTGTCTCCGAGGGAACCAAGGCCGTTACCAAGTTCACGAGCTCTTGAGCTATATGAGT
TAGGGTTTCTCCCTCTTGATAATTCAATGTCTGAATTAGAGTTAGAAAAATTGTCTTTTC
ATGTTTTCCAGCATCGTTTTGTTTGCAATCTCGTTTTGTAATTAAAGGTATTGATATGTC
TGAATCTATGTTAT
CTCTTTTTTTCCTTTTC

QA 2 315 2 315
DS 

RD RR2BH79JQ 725 0 0
GGATCTCATGCAAT
ACAAAGCATTTTCCAAACCTAATCGAATCGAATCGAATCCAGATTTGTGGTTTTTGTTAC
CTCAAGAAGGAGAATCAATGGCGCCCAAGGCAGAGAAGAAGCCCGCGGAGAAGAAACCAG
CCGAGGAGAAAGCTCCGTCGGAGAAGAAACCGAAGGCCGGGAAGAAGCTCCCCAAGGAAG
CGGGCGGCGCGGGAGGTGACAAGAAGAAGAAGATGAAGAAGAAGAGCGTCGAGACGTACA
AGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAGGTCCACCCCGACATCGGGATCTCGAGCAAGG
CGATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGATATCTTCGAGAAGCTTGCCGGCGAGTCGT
CGAAGCTTGCGAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACTTCTAGGGAGATTCAGACCGCGG
TGAGACTCGTGTTGCCTGGAGAGTTGGCGAAACACACTGTCTCCGAGGGAACCAAGGCCG
TTACCAAGTTTACGAGCTCTTGAGCTATATGAGTTAGGGTTTCTCCCTCTTGATAATTCA
ATGTCTGAATTAGAGTTAGAAAAATTGTCTTTTCATGTTTTCCAGCATCGTTTTGTTTGC
AATCTCGTTTTGTAATTAAAGGTATTGATATGTCTGAATCTATGTTATCTCTTTTTTTCC
TTTTCCTTCCGGTCTTATTCTTATTTTATAATCGAAGTCTGTGTTTTTAGC

QA 15 725 15 725
DS 

RD RR2BH79TF 725 0 0
GGATCTCATGCAAT
ACAAAGCATTTTCCAAACCTAATCGAATCGAATCGAATCCAGATTTGTGGTTTTTGTTAC
CTCAAGAAGGAGAATCAATGGCGCCCAAGGCAGAGAAGAAGCCCGCGGAGAAGAAACCAG
CCGAGGAGAAAGCTCCGTCGGAGAAGAAACCGAAGGCCGGGAAGAAGCTCCCCAAGGAAG
CGGGCGGCGCGGGAGGTGACAAGAAGAAGAAGATGAAGAAGAAGAGCGTCGAGACGTACA
AGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAGGTCCACCCCGACATCGGGATCTCGAGCAAGG
CGATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGATATCTTCGAGAAGCTTGCCGGCGAGTCGT
CGAAGCTTGCGAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACTTCTAGGGAGATTCAGACCGCGG
TGAGACTCGTGTTGCCTGGAGAGTTGGCGAAACACACTGTCTCCGAGGGAACCAAGGCCG
TTACCAAGTTTACGAGCTCTTGAGCTATATGAGTTAGGGTTTCTCCCTCTTGATAATTCA
ATGTCTGAATTAGAGTTAGAAAAATTGTCTTTTCATGTTTTCCAGCATCGTTTTGTTTGC
AATCTCGTTTTGTAATTAAAGGTATTGATATGTCTGAATCTATGTTATCTCTTTTTTTCC
TTTTCCTTCCGGTCTTATTCTTATTTTATAATCGAAGTCTGTGTTTTTAGC

QA 15 725 15 725
DS 



CO CL777Contig2 711 3 6 U
AAAATTAACACAAACAATTGCTAAAAATACAGACTTCGATTATAAAATAAGAGAATAACA
TAGATTCAGACATATCAATACCTGTAATTACAAAAACGAGATTGCAAACGAAACGATACT
GGAAAACATGAAAAGACGATTTTTCTAACTCTAATTCAGACATTGAAGATCAAGAGGAAA
ACTCTAACACATATAGCTCAAGAGCTCGTAAACTTGGTAACGGCCTTGGTTCCCTCCGAG
ACAGCGTGTTTCGCCAACTCTCCAGGCAACACGAGTCTTACCGCGGTCTGAATCTCCCTA
GAAGTGATGGTAGGCTTCTTGTTGTACCTCGCAAGCTTTGACGACTCACCAGCGAGCTTC
TCGAAGATGTCGTTGATGAAGCTGTTCATGATCCCCATCGCCTTGCTCGAGATCCCGATG
TCGGGGTGGACCTGCTTCAGGACCTTGAAGATGTAGATCTTGTACGTCTCGACGCTCTTT
TTCTTCATCTTCTTCTTCTTGTCACCTCCTGTGCCGCCGGCTTCCTTGGGGAGCTTCTTC
CCGGCCTTTGGTTTCTTCTCCGCCGGAGCTTTCTCCTCGGCTGGTTTCTTCTCCGCGGGT
TTCTCCTCTGCCTTGGGCGCCATTGATTCTCTTTCTTGAGGTAACAAAAACCACAAATCT
GGATTCGATTCGATTAGATTAGGTTTGGAAAATGCTTTGTTATTGCGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR88JQ U 1
AF RR2AR43JQ U 20
AF RR2AR43TF C 20
BS 1 278 RR2DR88JQ
BS 279 279 RR2AR43JQ
BS 280 511 RR2DR88JQ
BS 512 512 RR2AR43JQ
BS 513 597 RR2DR88JQ
BS 598 711 RR2AR43JQ

RD RR2DR88JQ 598 0 0
AAAATTAACACAAACAATTGCTAAAAATACAGACTTCGATTATAAAATAAGAGAATAACA
TAGATTCAGACATATCAATACCTGTAATTACAAAAACGAGATTGCAAACGAAACGATACT
GGAAAACATGAAAAGACGATTTTTCTAACTCTAATTCAGACATTGAAGATCAAGAGGAAA
ACTCTAACACATATAGCTCAAGAGCTCGTAAACTTGGTAACGGCCTTGGTTCCCTCCGAG
ACAGCGTGTTTCGCCAACTCTCCAGGCAACACGAGTCTCACCGCGGTCTGAATCTCCCTA
GAAGTGATGGTAGGCTTCTTGTTGTACCTCGCAAGCTTTGACGACTCACCAGCGAGCTTC
TCGAAGATGTCGTTGATGAAGCTGTTCATGATCCCCATCGCCTTGCTCGAGATCCCGATG
TCGGGGTGGACCTGCTTCAGGACCTTGAAGATGTAGATCTTGTACGTCTCGACGCTCTTT
TTCTTCATCTTCTTCTTCTTGTCACCTCCTGCGCCGCCGGCTTCCTTGGGGAGCTTCTTC
CCGGCCTTTGGTTTCTTCTCCGCCGGAGCTTTCTCCTCGGCTGGTTTCTTCTCCGCG
C

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2AR43JQ 692 0 0
GCTAAAAATACAGACTTCGATTATAAAATAAGAGAATAACATAGATTCAGACATATCAAT
ACCTGTAATTACAAAAACGAGATTGCAAACGAAACGATACTGGAAAACATGAAAAGACGA
TTTTTCTAACTCTAATTCAGACATTGAAGATCAAGAGGAAAACTCTAACACATATAGCTC
AAGAGCTCGTAAACTTGGTAACGGCCTTGGTTCCCTCCGAGACAGCGTGTTTCGCCAACT
CTCCAGGCAACACGAGTCTTACCGCGGTCTGAATCTCCCTAGAAGTGATGGTAGGCTTCT
TGTTGTACCTCGCAAGCTTTGACGACTCACCAGCGAGCTTCTCGAAGATGTCGTTGATGA
AGCTGTTCATGATCCCCATCGCCTTGCTCGAGATCCCGATGTCGGGGTGGACCTGCTTCA
GGACCTTGAAGATGTAGATCTTGTACGTCTCGACGCTCTTTTTCTTCATCTTCTTCTTCT
TGTCACCTCCTGTGCCGCCGGCTTCCTTGGGGAGCTTCTTCCCGGCCTTTGGTTTCTTCT
CCGCCGGAGCTTTCTCCTCGGCTGGTTTCTTCTCCGCGGGTTTCTCCTCTGCCTTGGGCG
CCATTGATTCTCTTTCTTGAGGTAACAAAAACCACAAATCTGGATTCGATTCGATTAGAT
TAGGTTTGGAAAATGCTTTGTTATTGCGTTCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2AR43TF 692 0 0
GCTAAAAATACAGACTTCGATTATAAAATAAGAGAATAACATAGATTCAGACATATCAAT
ACCTGTAATTACAAAAACGAGATTGCAAACGAAACGATACTGGAAAACATGAAAAGACGA
TTTTTCTAACTCTAATTCAGACATTGAAGATCAAGAGGAAAACTCTAACACATATAGCTC
AAGAGCTCGTAAACTTGGTAACGGCCTTGGTTCCCTCCGAGACAGCGTGTTTCGCCAACT
CTCCAGGCAACACGAGTCTTACCGCGGTCTGAATCTCCCTAGAAGTGATGGTAGGCTTCT
TGTTGTACCTCGCAAGCTTTGACGACTCACCAGCGAGCTTCTCGAAGATGTCGTTGATGA
AGCTGTTCATGATCCCCATCGCCTTGCTCGAGATCCCGATGTCGGGGTGGACCTGCTTCA
GGACCTTGAAGATGTAGATCTTGTACGTCTCGACGCTCTTTTTCTTCATCTTCTTCTTCT
TGTCACCTCCTGTGCCGCCGGCTTCCTTGGGGAGCTTCTTCCCGGCCTTTGGTTTCTTCT
CCGCCGGAGCTTTCTCCTCGGCTGGTTTCTTCTCCGCGGGTTTCTCCTCTGCCTTGGGCG
CCATTGATTCTCTTTCTTGAGGTAACAAAAACCACAAATCTGGATTCGATTCGATTAGAT
TAGGTTTGGAAAATGCTTTGT
TATTGCGTTCC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 2 7

CO CL778Contig1 819 4 3 U
GGACAACATTCATCACCATCATCTTGATTTTCAAATCTCTAACTACTTCTCTTCCTTCCT
TGTCCCTCTGTAATCTCGGGCAAAGAGATGACTTTCACAGCTATGAGGAGAGACCATGGA
ACTCTTCAAGCTATGGTCGGATCCGATCTCAACGAGCTAGCTACCGCTGCTAAGAATCTA
GTTAATCACACCTTCATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATT
GCTTCAATCGCCGCCATATACTTGTTGGTCTTGGATCGAACTAATTGAAAGACGAATATG
CTCACATCACTTTTGATTCCTTACATCTTCTTCAGTCTTCCTTCCGTGATCTTTGGCCTT
TTCAGAGGAGATGTTGGTAAATGGATCGCGTTTGTAGCTGTTGTGGTACAACTCTTCTTC
CCTAAACACTTCCGAGAATGGTTTGAATTACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATCGTGGTG
GCTCCAGGACTAATCGCCGGCACATTCAGAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCATATGCTTA
TTGATCGGATGTTACTTGCTCCAAGAACATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCA
TTCACAAAAGCTCATGGCATCTCCAACACACTTGGGATCATTGCTCTCGTCGTCTTTCCC
ATATGGGCTCTTGCCTTTTAAGACAACTCTCTGTTTTATTTTCCCATTTGTTTTTATTTA
TGTAATAGTGTGATGATTTGTATGATTCTGTGTCTCTCATAACTTCTCAACCAATGTGGT
AAAAAGAAATAATCTAAGCTCTGCTCTTGGAAAAGATTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2A784TF U 1
AF RR2BD74TF U 1
AF RR2BD74JQ C 1
AF RR2A784JQ C 72
BS 1 677 RR2A784TF
BS 678 780 RR2BD74TF
BS 781 819 RR2BD74JQ

RD RR2A784TF 677 0 0
GGACAACATTCATCACCATCATCTTGATTTTCAAATCTCTAACTACTTCTCTTCCTTCCT
TGTCCCTCTGTAATCTCGGGCAAAGAGATGACTTTCACAGCTATGAGGAGAGACCATGGA
ACTCTTCAAGCTATGGTCGGATCCGATCTCAACGAGCTAGCTACCGCTGCTAAGAATCTA
GTTAATCACACCTTCATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATT
GCTTCAATCGCCGCCATATACTTGTTGGTCTTGGATCGAACTAATTGAAAGACGAATATG
CTCACATCACTTTTGATTCCTTACATCTTCTTCAGTCTTCCTTCCGTGATCTTTGGCCTT
TTCAGAGGAGATGTTGGTAAATGGATCGCGTTTGTAGCTGTTGTGGTACAACTCTTCTTC
CCTAAACACTTCCGAGAATGGTTTGAATTACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATCGTGGTG
GCTCCAGGACTAATCGCCGGCACATTCAGAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCATATGCTTA
TTGATCGGATGTTACTTGCTCCAAGAACATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCA
TTCACAAAAGCTCATGGCATCTCCAACACACTTGGGATCATTGCTCTCGTCGTCTTTCCC
ATATGGGCTCTTGCCTT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2BD74TF 780 0 0
GGACAACATTCATCACCATCATCTTGATTTTCAAATCTCTAACTACTTCTCTTCCTTCCT
TGTCCCTCTGTAATCTCGGGCAAAGAGATGACTTTCACAGCTATGAGGAGAGACCATGGA
ACTCTTCAAGCTATGGTCGGATCCGATCTCAACGAGCTAGCTACCGCTGCTAAGAATCTA
GTTAATCACACCTTCATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATT
GCTTCAATCGCCGCCATATACTTGTTGGTCTTGGATCGAACTAATTGAAAGACGAATATG
CTCACATCACTTTTGATTCCTTACATCTTCTTCAGTCTTCCTTCCGTGATCTTTGGCCTT
TTCAGAGGAGATGTTGGTAAATGGATCGCGTTTGTAGCTGTTGTGGTACAACTCTTCTTC
CCTAAACACTTCCGAGAATGGTTTGAATTACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATCGTGGTG
GCTCCAGGACTAATCGCCGGCACATTCAGAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCATATGCTTA
TTGATCGGATGTTACTTGCTCCAAGAACATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCA
TTCACAAAAGCTCATGGCATCTCCAACACACTTGGGATCATTGCTCTCGTCGTCTTTCCC
ATATGGGCTCTTGCCTTTTAAGACAACTCTCTGTTTTATTTTCCCATTTGTTTTTATTTA
TGTAATAGTGTGATGATTTGTATGATTCTGTGTCTCTCATAACTTCTCAACCAATGTGGT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2BD74JQ 819 0 0
GGACAACATTCATCACCATCATCTTGATTTTCAAATCTCTAACTACTTCTCTTCCTTCCT
TGTCCCTCTGTAATCTCGGGCAAAGAGATGACTTTCACAGCTATGAGGAGAGACCATGGA
ACTCTTCAAGCTATGGTCGGATCCGATCTCAACGAGCTAGCTACCGCTGCTAAGAATCTA
GTTAATCACACCTTCATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATT
GCTTCAATCGCCGCCATATACTTGTTGGTCTTGGATCGAACTAATTGAAAGACGAATATG
CTCACATCACTTTTGATTCCTTACATCTTCTTCAGTCTTCCTTCCGTGATCTTTGGCCTT
TTCAGAGGAGATGTTGGTAAATGGATCGCGTTTGTAGCTGTTGTGGTACAACTCTTCTTC
CCTAAACACTTCCGAGAATGGTTTGAATTACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATCGTGGTG
GCTCCAGGACTAATCGCCGGCACATTCAGAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCATATGCTTA
TTGATCGGATGTTACTTGCTCCAAGAACATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCA
TTCACAAAAGCTCATGGCATCTCCAACACACTTGGGATCATTGCTCTCGTCGTCTTTCCC
ATATGGGCTCTTGCCTTTTAAGACAACTCTCTGTTTTATTTTCCCATTTGTTTTTATTTA
TGTAATAGTGTGATGATTTGTATGATTCTGTGTCTCTCATAACTTCTCAACCAATGTGGT
AAAAAGAAATAATCTAAGCTCTGCTCTTGGAAAAGATTC

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2A784JQ 748 0 0
AATCTCGGGCAAAGAGATGACTTTCACAGCTATGAGGAGAGACCATGGAACTCTTCAAGC
TATGGTCGGATCCGATCTCAACGAGCTAGCTACCGCTGCTAAGAATCTAGTTAATCACAC
CTTCATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATTGCTTCAATCGC
CGCCATATACTTGTTGGTCTTGGATCGAACTAATTGAAAGACGAATATGCTCACATCACT
TTTGATTCCTTACATCTTCTTCAGTCTTCCTTCCGTGATCTTTGGCCTTTTCAGAGGAGA
TGTTGGTAAATGGATCGCGTTTGTAGCTGTTGTGGTACAACTCTTCTTCCCTAAACACTT
CCGAGAATGGTTTGAATTACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATCGTGGTGGCTCCAGGACT
AATCGCCGGCACATTCAGAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCATATGCTTATTGATCGGATG
TTACTTGCTCCAAGAACATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCATTCACAAAAGC
TCATGGCATCTCCAACACACTTGGGATCATTGCTCTCGTCGTCTTTCCCATATGGGCTCT
TGCCTTTTAAGACAACTCTCTGTTTTATTTTCCCATTTGTTTTTATTTATGTAATAGTGT
GATGATTTGTATGATTCTGTGTCTCTCATAACTTCTCAACCAATGTGGTAAAAAGAAATA
ATCTAAGCTCTGCTCTTGGAAAAGATTC

QA 1 748 1 748
DS 



CO CL778Contig2 781 3 4 U
GGACAACATTCGTCACTATCAAATCTCTAACCACTTCTCTTCCTTGTTCCTCTGTAATCT
CGGGCGGCAAGAGATGACTTTCACAGCGATGAGGAGGGACCATGGAACCCTTCAAGCTAT
GGTCGGATCCGATCTCAACGAGCTAGCTACTGCTGCTAAGAATCTAGTTAATCACACCTT
CATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATTGCTTCAATAGCCGC
CATATACTTGTTGGTCTTGGATCGAACTAATTGGAAGACAAATATGCTCACATCTCTTTT
GATTCCTTACATCTTCTTCAGTCTTCCTTCTGCTATCTTTGGCCTTTTCAGAGGAGATGT
TGGTAAATGGATCGCGTTTGTAGCTGTTGTTGTACAACTCTTCTTCCCTAAACACTTCCG
AGAATGGTTTGAACTACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATAGTGGTGGCTCCAGGACTAAT
CGCCGGCACATTCAGAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCATATGCTTATTGATCGGATGTTA
CTTGCTCCAAGAACATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCATTCACTAAAGCTCA
TGGCATCTCCAACACACTTGGGATCATTGCTCTTGTCGTCTTTCCCGTTTGGGCTCTTGC
CTTTTAAGACAACTCTCTGTTTTATTTCCCATTTGTTTTTATTTTCTGTAATAAGTGTGA
TGATTTATATGATTCTGCGTCTCTCATAACTTGTCAACCAATGTGGTGTTTGTTAGTGTG
G


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2AO52TF U 1
AF RR2C205TF U 1
AF RR2C205JQ C 1
BS 1 294 RR2AO52TF
BS 295 295 RR2C205TF
BS 296 767 RR2AO52TF
BS 768 781 RR2C205JQ

RD RR2AO52TF 780 0 0
GGACAACATTCGTCACTATCAAATCTCTAACCACTTCTCTTCCTTGTTCCTCTGTAATCT
CGGGCGGCAAGAGATGACTTTCACAGCGATGAGGAGGGACCATGGAACCCTTCAAGCTAT
GGTCGGATCCGATCTCAACGAGCTAGCTACTGCTGCTAAGAATCTAGTTAATCACACCTT
CATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATTGCTTCAATAGCCGC
CATATACTTGTTGGTCTTGGATCGAACTAATTGGAAGACAAATATGCTCACATCACTTTT
GATTCCTTACATCTTCTTCAGTCTTCCTTCTGCTATCTTTGGCCTTTTCAGAGGAGATGT
TGGTAAATGGATCGCGTTTGTAGCTGTTGTTGTACAACTCTTCTTCCCTAAACACTTCCG
AGAATGGTTTGAACTACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATAGTGGTGGCTCCAGGACTAAT
CGCCGGCACATTCAGAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCATATGCTTATTGATCGGATGTTA
CTTGCTCCAAGAACATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCATTCACTAAAGCTCA
TGGCATCTCCAACACACTTGGGATCATTGCTCTTGTCGTCTTTCCCGTTTGGGCTCTTGC
CTTTTAAGACAACTCTCTGTTTTATTTCCCATTTGTTTTTATTTTCTGTAATAAGTGTGA
TGATTTATATGATTCTGCGTCTCTCATAACTTGTCAACCAATGTGGT
GTTTGTTAGTGTG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2C205TF 756 0 0
GGACAACATTCGTCACTATCAAATCTCTAACCACTTCTCTTCCTTGTTCCTCTGTAATCT
CGGGCGGCAAGAGATGACTTTCACAGCGATGAGGAGGGACCATGGAACCCTTCAAGCTAT
GGTCGGATCCGATCTCAACGAGCTAGCTACTGCTGCTAAGAATCTAGTTAATCACACCTT
CATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATTGCTTCAATAGCCGC
CATATACTTGTTGGTCTTGGATCGAACTAATTGGAAGACAAATATGCTCACATCTCTTTT
GATTCCTTACATCTTCTTCAGTCTTCCTTCTGCTATCTTTGGCCTTTTCAGAGGAGATGT
TGGTAAATGGATCGCGTTTGTAGCTGTTGTTGTACAACTCTTCTTCCCTAAACACTTCCG
AGAATGGTTTGAACTACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATAGTGGTGGCTCCAGGACTAAT
CGCCGGCACATTCAGAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCATATGCTTATTGATCGGATGTTA
CTTGCTCCAAGAACATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCATTCACTAAAGCTCA
TGGCATCTCCAACACACTTGGGATCATTGCTCTTGTCGTCTTTCCCGTTTGGGCTCTTGC
CTTTTAAGACAACTCTCTGTTT*ATTTCCCATTTGTTTTA**TTTCTGTAATAAGTGTGA
TGATTTATATGATTCTGCGTCTCTCATA
CTTGTCAC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2C205JQ 781 0 0
GGACAACATTCGTCACTATCAAATCTCTAACCACTTCTCTTCCTTGTTCCTCTGTAATCT
CGGGCGGCAAGAGATGACTTTCACAGCGATGAGGAGGGACCATGGAACCCTTCAAGCTAT
GGTCGGATCCGATCTCAACGAGCTAGCTACTGCTGCTAAGAATCTAGTTAATCACACCTT
CATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATTGCTTCAATAGCCGC
CATATACTTGTTGGTCTTGGATCGAACTAATTGGAAGACAAATATGCTCACATCTCTTTT
GATTCCTTACATCTTCTTCAGTCTTCCTTCTGCTATCTTTGGCCTTTTCAGAGGAGATGT
TGGTAAATGGATCGCGTTTGTAGCTGTTGTTGTACAACTCTTCTTCCCTAAACACTTCCG
AGAATGGTTTGAACTACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATAGTGGTGGCTCCAGGACTAAT
CGCCGGCACATTCAGAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCATATGCTTATTGATCGGATGTTA
CTTGCTCCAAGAACATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCATTCACTAAAGCTCA
TGGCATCTCCAACACACTTGGGATCATTGCTCTTGTCGTCTTTCCCGTTTGGGCTCTTGC
CTTTTAAGACAACTCTCTGTTTTATTTCCCATTTGTTTTTATTTTCTGTAATAAGTGTGA
TGATTTATATGATTCTGCGTCTCTCATAACTTGTCAACCAATGTGGTGTTTGTTAGTGTG
G

QA 1 781 1 781
DS 



AS 2 6

CO CL779Contig1 258 2 5 U
AAGCTGAATAACCTGTCCGAGTTCAGAGTCTTGAACCACTGTTCCGTTGCAACAAAACTC
TTTCTTGGATCCTTAAGTATCTTGCTGTAACTATACTCTTTCTTCAACCCCTGGACAGTT
GTCAAGCTTTTCCTACCATTGCGCTGCTGCACACGGATGTGGACGTACTCTTTTGTTCCT
GCACCTGAGTCCTCAACATTCGCATCAGCAAACGGGTGGAAGGCAGTAGGGATCTGGGAA
TCAAGCTCAGACATGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC62JQ U 29
AF RR2AC62TF C 1
BS 1 28 RR2AC62TF
BS 29 150 RR2AC62JQ
BS 151 151 RR2AC62TF
BS 152 200 RR2AC62JQ
BS 201 258 RR2AC62TF

RD RR2AC62JQ 172 0 0
TCTTGAACCACTGTTCCGTTGCAACAAAACTCTTTCTTGGATCCTTAAGTATCTTGCTGT
AACTATACTCTTTCTTCAACCCCTGGACAGTTGTCAAGCTTTTCCTACCATTGCGCTGCT
GCCCACGGATGTGGACGTACTCTTTTGTTCCTGCACCTGAGTCCTCAACATT

QA 1 172 1 172
DS 

RD RR2AC62TF 258 0 0
AAGCTGAATAACCTGTCCGAGTTCAGAGTCTTGAACCACTGTTCCGTTGCAACAAAACTC
TTTTTTGGATCCTTAAGTATCTTGCTGTAACTATACTCTTTCTTCAACCCCTGGACAGTT
GTCAAGCTTTTCCTACCATTGCGCTGCTGCACACGGATGTGGACGTACTCTTTTGTTCCT
GCACCTGAGTCCTCAACATTCGCATCAGCAAACGGGTGGAAGGCAGTAGGGATCTGGGAA
TCAAGCTCAGACATGAAA

QA 1 258 1 258
DS 



CO CL779Contig2 711 4 2 U
GGGTCTGCACCGAAGCAAAAAGTTTCAGACTTGATCCAAATCTAGGGGTTCTTCTCCGAT
AATCAGATCATCGAAACCCTATTTTCGAATCAGGTCTCAGTTTCTCCGTGGTTTGCCCCT
CAGATCAACAAAGTTTCATGTCTGAGCTTGATTCCCAGATCCCTACTGCCTTCGACCCGT
TTGCTGATGCGAATGTTGAGGACTCAGGTGCAGGAACAAAAGAGTACGTCCACATACGTG
TGCAGCAGCGAAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACTGTCCAGGGGTTGAAGAAAGAGTATA
GTTACAGCAAGATACTTAAGGATCTCAAGAAAGAGTTTTGTTGCAACGGAACAGTCGTTC
AAGACTCTGAACTCGGGCAGGTTATTCAGCTTCAAGGAGACCAGAGGAAGAACGTCTCCA
CGTTCCTAGTCCAGGCTGGGCTAGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTTTCTGAG
CTGCATTGTCCCTAAGTCTGTTTGCCTTAATTCTGTTATAAGTGTGTATCAATCACTATT
GTTATCCTTCCCTTTCCAAAACATTCCCTCAACTTCTTCTTTGATCTCTTGTTGCTTGGT
TTGTTTCGATTTAGACTCGGTATGATATTAAGAGACTATCTTTATGTACTTGTGCGACTC
TTGCTGCTTGTTTAATAAATAGATATGAAATTGTTGAATAACGGTTTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FB48TF U 1
AF RR2BU71JQ C 31
AF RR2AM87JQ C 438
AF RR2BU71TF U 31
BS 1 646 RR2FB48TF
BS 647 711 RR2BU71TF

RD RR2FB48TF 646 0 0
GGGTCTGCACCGAAGCAAAAAGTTTCAGACTTGATCCAAATCTAGGGGTTCTTCTCCGAT
AATCAGATCATCGAAACCCTATTTTCGAATCAGGTCTCAGTTTCTCCGTGGTTTGCCCCT
CAGATCAACAAAGTTTCATGTCTGAGCTTGATTCCCAGATCCCTACTGCCTTCGACCCGT
TTGCTGATGCGAATGTTGAGGACTCAGGTGCAGGAACAAAAGAGTACGTCCACATACGTG
TGCAGCAGCGAAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACTGTCCAGGGGTTGAAGAAAGAGTATA
GTTACAGCAAGATACTTAAGGATCTCAAGAAAGAGTTTTGTTGCAACGGAACAGTCGTTC
AAGACTCTGAACTCGGGCAGGTTATTCAGCTTCAAGGAGACCAGAGGAAGAACGTCTCCA
CGTTCCTAGTCCAGGCTGGGCTAGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTTTCTGAG
CTGCATTGTCCCTAAGTCTGTTTGCCTTAATTCTGTTATAAGTGTGTATCAATCACTATT
GTTATCCTTCCCTTTCCAAAACATTCCCTCAACTTCTTCTTTGATCTCTTGTTGCTTGGT
TTGTTTCGATTTAGACTCGGTATGATATTAAGAGACTATCTTTATG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2BU71JQ 681 0 0
GG
GATCCAAATCTAGGGGTTCTTCTCCGATAATCAGATCATCGAAACCCTATTTTCGAATCA
GGTCTCAGTTTCTCCGTGGTTTGCCCCTCAGATCAACAAAGTTTCATGTCTGAGCTTGAT
TCCCAGATCCCTACTGCCTTCGACCCGTTTGCTGATGCGAATGTTGAGGACTCAGGTGCA
GGAACAAAAGAGTACGTCCACATACGTGTGCAGCAGCGAAATGGTAGGAAAAGCTTGACA
ACTGTCCAGGGGTTGAAGAAAGAGTATAGTTACAGCAAGATACTTAAGGATCTCAAGAAA
GAGTTTTGTTGCAACGGAACAGTCGTTCAAGACTCTGAACTCGGGCAGGTTATTCAGCTT
CAAGGAGACCAGAGGAAGAACGTCTCCACGTTCCTAGTCCAGGCTGGGCTAGTGAAGAAG
GACAACATCAAGATCCATGGTTTTTGAGCTGCATTGTCCCTAAGTCTGTTTGCCTTAATT
CTGTTATAAGTGTGTATCAATCACTATTGTTATCCTTCCCTTTCCAAAACATTCCCTCAA
CTTCTTCTTTGATCTCTTGTTGCTTGGTTTGTTTCGATTTAGACTCGGTATGATATTAAG
AGACTATCTTTATGTACTTGTGCGACTCTTGCTGCTTGTTTAATAAATAGATATGAAATT
GTTGAATAACGGTTTTACT

QA 3 681 3 681
DS 

RD RR2AM87JQ 233 0 0
GGGCTAGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTTTTTGAGCGGCATTGTCCCTAAGT
CTGTTTCCCTTAATTTTGTTATAAGTGTGTATCAATCACTATTGTTATCCTTCCCTTTCC
AAAACATTCCCTCAACTTTTTTTTTGATCTCTTGTTGCTTGGTTTGTTTCGATTTAGACT
CGGTATGATATTAAGAGACTATCTTTATGTACTTGTGCGACTCTTGCGGCTTG

QA 1 233 1 233
DS 

RD RR2BU71TF 681 0 0
GG
GATCCAAATCTAGGGGTTCTTCTCCGATAATCAGATCATCGAAACCCTATTTTCGAATCA
GGTCTCAGTTTCTCCGTGGTTTGCCCCTCAGATCAACAAAGTTTCATGTCTGAGCTTGAT
TCCCAGATCCCTACTGCCTTCGACCCGTTTGCTGATGCGAATGTTGAGGACTCAGGTGCA
GGAACAAAAGAGTACGTCCACATACGTGTGCAGCAGCGAAATGGTAGGAAAAGCTTGACA
ACTGTCCAGGGGTTGAAGAAAGAGTATAGTTACAGCAAGATACTTAAGGATCTCAAGAAA
GAGTTTTGTTGCAACGGAACAGTCGTTCAAGACTCTGAACTCGGGCAGGTTATTCAGCTT
CAAGGAGACCAGAGGAAGAACGTCTCCACGTTCCTAGTCCAGGCTGGGCTAGTGAAGAAG
GACAACATCAAGATCCATGGTTTCTGAGCTGCATTGTCCCTAAGTCTGTTTGCCTTAATT
CTGTTATAAGTGTGTATCAATCACTATTGTTATCCTTCCCTTTCCAAAACATTCCCTCAA
CTTCTTCTTTGATCTCTTGTTGCTTGGTTTGTTTCGATTTAGACTCGGTATGATATTAAG
AGACTATCTTTATGTACTTGTGCGACTCTTGCTGCTTGTTTAATAAATAGATATGAAATT
GTTGAATAACGGTTTTACT

QA 3 681 3 681
DS 



AS 1 8

CO CL780Contig1 633 8 4 U
GAAGAAACTAAAATATATTATTATTATTAGAGCATAGTTTATATACATTATTTCATGTTT
TCTGTACACATCAACGCCCAATCGAACGTCCTTAGGGAAGTACATAGGCTGATTGCTTGC
TTAAATAACTAATAAGAAGATGATATGCGAAGTACAGAAAGAAGGTAGAATGAAATATCC
AGTAAGAGATAGAGAGAGATCTTCTATGGAGATCCATATCCAAATGTGTTTTCTCCACTG
TAAGTGACATAGAGGAACCCGTCCTCCTCCTTTTTATCTTCGCACACTGCAGACATCAAC
GCACCTGTTGGAGGAAGAACATTGTCCACAAATATAAAGATAGCCTTCTCTGCGCTCAGT
TTGATTCTTTTGCGAATCACATACACGAATTGCCCTACTGTCAAATCCGCCGGGACTAGG
TATTTTTTCTTGTCAATGGTTGGTATATCACTCTTCTCAGCCTTCTCAACAATCACCGGA
ATCCTATCTGGATACTTCTCTCTAATCCGAGCAGCTTCTGCGCTTCTCTTCTCTAGGTCA
TGCTCTTGCTTGAACGTGCTTTTTGCCATTACTTCTTTCACACCCTGTTGATTACAAAGA
CGAAAGCTTTTCTTCGATCAAAACACAACTCCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR2FS12JQ U 20
AF RR2E106JQ U 1
AF RR2DU17JQ U 1
AF RR2DU17TF C 1
AF RR2DC86JQ U 20
AF RR2E106TF C 95
AF RR2DC86TF C 20
AF RR2FS12TF C 20
BS 1 282 RR2DU17JQ
BS 283 283 RR2DC86JQ
BS 284 604 RR2DU17JQ
BS 605 633 RR2DC86JQ

RD RR2FS12JQ 475 0 0
ATTATTATTAGAGCATAGTTTATATACATTATTTCATGTTTTCTGTACACATCAACGCCC
AATCGAACGTCCTTAGGGAAGTACATAGGCTGATTGCTTGCTTAAATAACTAATAAGAAG
ATGATATGCGAAGTACAGAAAGAAGGTAGAATGAAATATCCAGTAAGAGATAGAGAGAGA
TCTTCTATGGAGATCCATATCCAAATGTGTTTTCTCCACTGTAAGTGACATAGAGGAACC
CGTCCTCCTCCTTTTTATCTTCGCACACTGCAGACATCAACGCACCTGTTGGAGGAAGAA
CATTGTCCACAAATATAAAGATAGCCTTCTCTGCGCTCAGTTTGATTCTTTTGCGAATCA
CATACACGAATTGCCCTACTGTCAAATCCGCCGGGACTAGGTATTTTTTCTTGTCAATGG
TTGGTATATCACTCTTCTCAGCCTTCTCAACAATCACCGGAATCCTATCTGGATA

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2E106JQ 564 0 0
GG
AGAAACTAAAATATATTATTATTATTAGAGCATAGTTTATATACATTATTTCATGTTTTC
TGTACACATCAACGCCCAATCGAACGTCCTTAGGGAAGTACATAGGCTGATTGCTTGCTT
AAATAACTAATAAGAAGATGATATGCGAAGTACAGAAAGAAGGTAGAATGAAATATCCAG
TAAGAGATAGAGAGAGATCTTCTATGGAGATCCATATCCAAATGTGTTTTCTCCACTGTA
AGTGACATAGAGGAACCCGTCCTCCTCCTTTTTATCTTCGTACACTGCAGACATCAACGC
ACCTGTTGGAGGAAGAACATTGTCCACAAATATAAAGATAGCCTTCTCTGCGCTCAGTTT
CATTCTTTTGCGAATCACATACACGAATTGCCCTACTGTCAAATCCGCCGGGACTAGGTA
TTTTTTCTTGTCAATGGTTGGTATATCACTCTTCTCAGCCTTCTCAACAATCACCGGAAT
CCTATCTG*ATACTTCTCTCTAATCCGAGCAGCTTCTGCGCTTCTCTTCTCTAGGTCATA
CTCTTGCTTGAACGTGCTTTTT

QA 3 564 3 564
DS 

RD RR2DU17JQ 604 0 0
GAAGAAACTAAAATATATTATTATTATTAGAGCATAGTTTATATACATTATTTCATGTTT
TCTGTACACATCAACGCCCAATCGAACGTCCTTAGGGAAGTACATAGGCTGATTGCTTGC
TTAAATAACTAATAAGAAGATGATATGCGAAGTACAGAAAGAAGGTAGAATGAAATATCC
AGTAAGAGATAGAGAGAGATCTTCTATGGAGATCCATATCCAAATGTGTTTTCTCCACTG
TAAGTGACATAGAGGAACCCGTCCTCCTCCTTTTTATCTTCGTACACTGCAGACATCAAC
GCACCTGTTGGAGGAAGAACATTGTCCACAAATATAAAGATAGCCTTCTCTGCGCTCAGT
TTGATTCTTTTGCGAATCACATACACGAATTGCCCTACTGTCAAATCCGCCGGGACTAGG
TATTTTTTCTTGTCAATGGTTGGTATATCACTCTTCTCAGCCTTCTCAACAATCACCGGA
ATCCTATCTGGATACTTCTCTCTAATCCGAGCAGCTTCTGCGCTTCTCTTCTCTAGGTCA
TGCTCTTGCTTGAACGTGCTTTTTGCCATTACTTCTTTCACACCCTGTTGATTACAAAGA
CGAA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2DU17TF 629 0 0
GA
AGAAACTAAAATATATTATTATTATTAGAGCATAGTTTATATACATTATTTCATGTTTTC
TGTACACATCAACGCCCAATCGAACGTCCTTAGGGAAGTACATAGGCTGATTGCTTGCTT
AAATAACTAATAAGAAGATGATATGCGAAGTACAGAAAGAAGGTAGAATGAAATATCCAG
TAAGAGATAGAGAGAGATCTTCTATGGAGATCCATATCCAAATGTGTTTTCTCCACTGTA
AGTGACATAGAGGAACCCGTCCTCCTCCTTTTTATCTTCGTACACTGCAGACATCAACGC
ACCTGTTGGAGGAAGAACATTGTCCACAAATATAAAGATAGCCTTCTCTGCGCTCAGTTT
GATTCTTTTGCGAATCACATACACGAATTGCCCTACTGTCAAATCCGCCGGGACTAGGTA
TTTTTTCTTGTCAATGGTTGGTATATCACTCTTCTCAGCCTTCTCAACAATCACCGGAAT
CCTATCTGGATACTTCTCTCTAATCCGAGCAGCTTCTGCGCTTCTCTTCTCTAGGTCATG
CTCTTGCTTGAACGTGCTTTTTGCCATTACTTCTTTCACACCCTGTTGATTACAAAGACG
AAAGCTTTTCTTCGATCAAAACAC
CCC

QA 3 626 3 626
DS 

RD RR2DC86JQ 614 0 0
ATTATTATTAGAGCATAGTTTATATACATTATTTCATGTTTTCTGTACACATCAACGCCC
AATCGAACGTCCTTAGGGAAGTACATAGGCTGATTGCTTGCTTAAATAACTAATAAGAAG
ATGATATGCGAAGTACAGAAAGAAGGTAGAATGAAATATCCAGTAAGAGATAGAGAGAGA
TCTTCTATGGAGATCCATATCCAAATGTGTTTTCTCCACTGTAAGTGACATAGAGGAACC
CGTCCTCCTCCTTTTTATCTTCGCACACTGCAGACATCAACGCACCTGTTGGAGGAAGAA
CATTGTCCACAAATATAAAGATAGCCTTCTCTGCGCTCAGTTTGATTCTTTTGCGAATCA
CATACACGAATTGCCCTACTGTCAAATCCGCCGGGACTAGGTATTTTTTCTTGTCAATGG
TTGGTATATCACTCTTCTCAGCCTTCTCAACAATCACCGGAATCCTATCTGGATACTTCT
CTCTAATCCGAGCAGCTTCTGCGCTTCTCTTCTCTAGGTCATGCTCTTGCTTGAACGTGC
TTTTTGCCATTACTTCTTTCACACCCTGTTGATTACAAAGACGAAAGCTTTTCTTCGATC
AAAACACAACTCCC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2E106TF 538 0 0
GGGAAGTACATAGGCTGATTGCTTGCTTAAATAACTAATAAGAAGATGATATGCGAAGTA
CAGAAAGAAGGTAGAATGAAATATCCAGTAAGAGATAGAGAGAGATCTTCTATGGAGATC
CATATCCAAATGTGTTTTCTCCACTGTAAGTGACATAGAGGAACCCGTCCTCCTCCTTTT
TATCTTCGTACACTGCAGACATCAACGCACCTGTTGGAGGAAGAACATTGTCCACAAATA
TAAAGATAGCCTTCTCTGCGCTCAGTTTCATTCTTTTGCGAATCACATACACGAATTGCC
CTACTGTCAAATCCGCCGGGACTAGGTATTTTTTCTTGTCAATGGTTGGTATATCACTCT
TCTCAGCCTTCTCAACAATCACCGGAATCCTATCTG*ATACTTCTCTCTAATCCGAGCAG
CTTCTGCGCTTCTCTTCTCTAGGTCATACTCTTGCTTGAACGTGCTTTTTGCCATTACTT
CTTTCACACCCTGTTGATTACAAAGACGAAAGCTTTTCTTCGATCAAAACACAACTCC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2DC86TF 614 0 0
ATTATTATTAGAGCATAGTTTATATACATTATTTCATGTTTTCTGTACACATCAACGCCC
AATCGAACGTCCTTAGGGAAGTACATAGGCTGATTGCTTGCTTAAATAACTAATAAGAAG
ATGATATGCGAAGTACAGAAAGAAGGTAGAATGAAATATCCAGTAAGAGATAGAGAGAGA
TCTTCTATGGAGATCCATATCCAAATGTGTTTTCTCCACTGTAAGTGACATAGAGGAACC
CGTCCTCCTCCTTTTTATCTTCGCACACTGCAGACATCAACGCACCTGTTGGAGGAAGAA
CATTGTCCACAAATATAAAGATAGCCTTCTCTGCGCTCAGTTTGATTCTTTTGCGAATCA
CATACACGAATTGCCCTACTGTCAAATCCGCCGGGACTAGGTATTTTTTCTTGTCAATGG
TTGGTATATCACTCTTCTCAGCCTTCTCAACAATCACCGGAATCCTATCTGGATACTTCT
CTCTAATCCGAGCAGCTTCTGCGCTTCTCTTCTCTAGGTCATGCTCTTGCTTGAACGTGC
TTTTTGCCATTACTTCTTTCACACCCTGTTGATTACAAAGACGAAAGCTTTTCTTCGATC
AAAACACAACTCC
C

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2FS12TF 614 0 0
ATTATTATTAGAGCATAGTTTATATACATTATTTCATGTTTTCTGTACACATCAACGCCC
AATCGAACGTCCTTAGGGAAGTACATAGGCTGATTGCTTGCTTAAATAACTAATAAGAAG
ATGATATGCGAAGTACAGAAAGAAGGTAGAATGAAATATCCAGTAAGAGATAGAGAGAGA
TCTTCTATGGAGATCCATATCCAAATGTGTTTTCTCCACTGTAAGTGACATAGAGGAACC
CGTCCTCCTCCTTTTTATCTTCGCACACTGCAGACATCAACGCACCTGTTGGAGGAAGAA
CATTGTCCACAAATATAAAGATAGCCTTCTCTGCGCTCAGTTTGATTCTTTTGCGAATCA
CATACACGAATTGCCCTACTGTCAAATCCGCCGGGACTAGGTATTTTTTCTTGTCAATGG
TTGGTATATCACTCTTCTCAGCCTTCTCAACAATCACCGGAATCCTATCTGGATACTTCT
CTCTAATCCGAGCAGCTTCTGCGCTTCTCTTCTCTAGGTCATGCTCTTGCTTGAACGTGC
TTTTTGCCATTACTTCTTTCACACCCTGTTGATTACAAAGACGAAAGCTTTTCTTCGATC
AAAACACAACTCC
C

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 8

CO CL781Contig1 904 8 13 U
CCAATCACGGAACAAAATCAGAATATATTTTTGTCAATATTGCAGAGACAAGAAGAGTTA
ACAAGAGATTGAATACATAATTTTTTTTTTGAAGAAAGAGAATGAATTACATACAATGGA
AAACACAAGAGCGATAGAGAAAGAAGCAAACAAAAGATGAAAAGCAGATATGTTTCTAGA
CATCCTTGGCGATAAGATCACCATTGAGTAACGCTCTGTAAGCAGCAACGGGCCAAATGA
AACCTCGGAAGATGAGACGACTAGCCAATGGAACATCGATAATGATCTCTTTCATCGCTG
GTTTCTTCTCATCACTGATCGCTATCAAGTAGCTTCTTCCGACCCACCCGATCCATCCAG
CAATGTAGAGGAAGAGAAGTCCTGGAGTTATGAACTCCCCCC*AATGCCGCTGGTCTCCG
TTCACTATCAAGTGTGGTAGCCCGTCTGCACCGCAGAGGAGCCCGTACTTTCCGTAGTTG
TCGAACCTGCGCTTGGTCTTTTCGATCTGAGCGTTAAGAGCAAGAGCAGGGGCGCTTTCA
GGAGCGTAGAGCTTAAGAGATGATTGGAGCTTCTTGATCTGTTGCTTCTCCCTCTTGGCG
AACTGTTTCGACTCCTTGCAAGGGGTTAGTCCCGAGATATCAGCGGCGGCTGGCATCGGA
GCTGAGAGGAGGATGGAAGAGAGAGCTACCGCCGCGGATAAAGCCTTCATTGACTGATGT
TGCTGCGGCGTTGCGGATTTGTCATCGGAGCAGACGAATCTCGCGGAGGATTTAGGTACG
GATTGGGTGAGTGACTTGTTGAGGACGAGGTTCGTCGGGATCGTGAGCAACATGACTGGC
TCTTAGGATTTCGAAAGTTCGTACTTCTTAGGGAGGATAGAGAGAAGCGGGGAGATGAGA
TTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
25 25 25 

AF RR2AI21JQ U 260
AF RR2GU65JQB U 1
AF RR2G906JQ U 1
AF RR2DR54JQ U 91
AF RR2AI21TF C 119
AF RR2DR54TF C 273
AF RR2G906TF C 191
AF RR2GU65TF C 248
BS 1 189 RR2G906JQ
BS 190 190 RR2DR54JQ
BS 191 319 RR2G906JQ
BS 320 320 RR2DR54JQ
BS 321 771 RR2G906JQ
BS 772 846 RR2DR54JQ
BS 847 847 RR2AI21TF
BS 848 872 RR2DR54JQ
BS 873 873 RR2AI21TF
BS 874 891 RR2DR54JQ
BS 892 892 RR2AI21TF
BS 893 901 RR2DR54JQ
BS 902 904 RR2AI21TF

RD RR2AI21JQ 196 0 0
ACTAGCCAATGGAACATCGATAATGATCTCTTTCATCGCTGGTTTCTTCTCATCACTGAT
CGCTATCAAGTAGCTTCTTCCGACCCACCCGATCCATCCAGCAATGTAAAGGAAAAAAAG
TCCTGGAGTTATGAACTCCCCCC*AATGCCGCTGGTCTCCGTTCACTATCAAGTATGGTA
GCCCGTCTGCCCCGCA

QA 1 196 1 196
DS 

RD RR2GU65JQB 663 0 0
CCAATCACGGAACAAAATCAGAATATATTTTTGTCAATATTGCAGAGACAAGAAGAGTTA
ACAAGAGATTGAATACATAATTTTTTTTTTGAAGAAAGAGAATGAATTACATACAATGGA
AAACACAAGAGCGATAGAGAAAGAAGCAAACAAAAGATGAAAAGCAGATATGTTTCTAGA
CATCCTTGGTGATAAGATCACCATTGAGTAACGCTCTGTAAGCAGCAACGGGCCAAATGA
AACCTCGGAAGATGAGACGACTAGCCAATGGAACATCGATAATGATCTCTTTCATCGCTG
GTTTCTTCTCATCACTGAT*GCTATCAAGTAGCTTCTTCCGACCCACCCGATCCATCCAG
CAATGTAGAGGAAGAGAAGTCCTGGAGTTATGAACTCCCCCC*AATGCCGCTGGTCTCCG
TTCACTATCAAGTGTGGTAGCCCGTCTGCACCGCAGAGGAGCCCGTACTTTCCGTAGTTG
TCGAACCTGCGCTTGGTCTTTTCGATCTGAGCGTTAAGAGCAAGAGCAGGGGCGCTTTCA
GGAGCGTAGAGCTTAAGAGATGATTGGAGCTTCTTGATCTGTTGCTTCTCCCTCTTGGCG
AACTGTTTCGACTCCTTGCAAGGGGTTAGTCCCGAGATATCAGCGGCGGCTGGCATCGGA
GCT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2G906JQ 771 0 0
CCAATCACGGAACAAAATCAGAATATATTTTTGTCAATATTGCAGAGACAAGAAGAGTTA
ACAAGAGATTGAATACATAATTTTTTTTTTGAAGAAAGAGAATGAATTACATACAATGGA
AAACACAAGAGCGATAGAGAAAGAAGCAAACAAAAGATGAAAAGCAGATATGTTTCTAGA
CATCCTTGGTGATAAGATCACCATTGAGTAACGCTCTGTAAGCAGCAACGGGCCAAATGA
AACCTCGGAAGATGAGACGACTAGCCAATGGAACATCGATAATGATCTCTTTCATCGCTG
GTTTCTTCTCATCACTGAT*GCTATCAAGTAGCTTCTTCCGACCCACCCGATCCATCCAG
CAATGTAGAGGAAGAGAAGTCCTGGAGTTATGAACTCCCCCC*AATGCCGCTGGTCTCCG
TTCACTATCAAGTGTGGTAGCCCGTCTGCACCGCAGAGGAGCCCGTACTTTCCGTAGTTG
TCGAACCTGCGCTTGGTCTTTTCGATCTGAGCGTTAAGAGCAAGAGCAGGGGCGCTTTCA
GGAGCGTAGAGCTTAAGAGATGATTGGAGCTTCTTGATCTGTTGCTTCTCCCTCTTGGCG
AACTGTTTCGACTCCTTGCAAGGGGTTAGTCCCGAGATATCAGCGGCGGCTGGCATCGGA
GCTGAGAGGAGGATGGAAGAGAGAGCTACCGCCGCGGATAAAGCCTTCATTGACTGATGT
TGCTGCGGCGTTGCGGATTTGTCATCGGAGCAGACGAATCTCGCGGAGGAT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2DR54JQ 812 0 0
GAAGAAAGAGAATGAATTACATACAATGGAAAACACAAGAGCGATAGAGAAAGAAGCAAA
CAAAAGATGAAAAGCAGATATGTTTCTAGACATCCTTGGCGATAAGATCACCATTGAGTA
ACGCTCTGTAAGCAGCAACGGGCCAAATGAAACCTCGGAAGATGAGACGACTAGCCAATG
GAACATCGATAATGATCTCTTTCATCGCTGGTTTCTTCTCATCACTGATCGCTATCAAGT
AGCTTCTTCCGACCCACCCGATCCATCCAGCAATGTAGAGGAAGAGAAGTCCTGGAGTTA
TGAACTCCCCCC*AATGCCGCTGGTCTCCGTTCACTATCAAGTGTGGTAGCCCGTCTGCA
CCGCAGAGGAGCCCGTACTTTCCGTAGTTGTCGAACCTGCGCTTGGTCTTTTCGATCTGA
GCGTTAAGAGCAAGAGCAGGGGCGCTTTCAGGAGCGTAGAGCTTAAGAGATGATTGGAGC
TTCTTGATCTGTTGCTTCTCCCTCTCGGCGAACTGTTTCGACTCCTTACAAGGGGTTAGT
CCCGAGATATCAGCGGCGGCTGGCATCGGAGCTGAGAGGAGGATGGAAGAGAGAGCTACC
GCCGAGGATAAAGCCTTCATTGACTGATGTTGCTGCGGCGTTGCGGATTTGTCATCGGAG
CAGACGAATCTCGCGGAGGATTTAGGTACGGATTGGGTGAGTGACTTGTTGAGGACGAGG
TTCGTCGGGATCGTGAGCAACATGACTGGCTCTTAG*ATTTCGAAAGTTCGTACTTCTTA
GG*AGGATAGAGAGAAGCGGG*AGATGAGAT
C

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2AI21TF 786 0 0
GAAAACACAAGAGCGATAGAGAAAGAAGCAAACAAAAGATGAAAAGCAGATATGTTTCTA
GACATCCTTGGCGATAAGATCACCATTGAGTAACGCTCTGTAAGCAGCAACGGGCCAAAT
GAAACCTCGGAAGATGAGACGACTAGCCAATGGAACATCGATAATGATCTCTTTCATCGC
TGGTTTCTTCTCATCACTGATCGCTATCAAGTAGCTTCTTCCGACCCACCCGATCCATCC
AGCAATGTAGAGGAAGAGAAGTCCTGGAGTTATGAACTCCCCCC*AATGCCGCTGGTCTC
CGTTCACTATCAAGTATGGTAGCCCGTCTGCACCGCAGAGGAGCCCGTACTTTCCGTAGT
TGTCGAACCTGCGCTTGGTCTTTTCGATCTGAGCGTTAAGAGCAAGAGCAGGGGCGCTTT
CAGGAGCGTAGAGCTTAAGAGATGATTGGAGCTTCTTGATCTGTTGCTTCTCCCTCTTGG
CGAACTGTTTCGACTCCTTGCAAGGGGTTAGTCCCGAGATATCAGCGGCGGCTGGCATCG
GAGCTGAGAGGAGGATGGAAGAGAGAGCTACCGCCGCGGATAAAGCCTTCATTGACTGAT
GTTGCTGCGGCGTTGCGGATTTGTCATCGGAGCAGACGAATCTCGCGGAGGATTTAGGTA
CGGATTGGGTGAGTGACTTGTTGAGGACGAGGTTCGTCGGGATCGTGGGCGACATGACTG
GCTCTTAGGATTTCGAAAGTTCGTACTTCTTAGGGAGGATAGAGAGAAGCGGGGAGATGA
GATTCC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2DR54TF 632 0 0
ACATCGATAATGATCTCTTTCATCGCTGGTTTCTTCTCATCACTGATCGCTATCAAGTAG
CTTCTTCCGACCCACCCGATCCATCCAGCAATGTAGAGGAAGAGAAGTCCTGGAGTTATG
AACTCCCCCC*AATGCCGCTGGTCTCCGTTCACTATCAAGTGTGGTAGCCCGTCTGCACC
GCAGAGGAGCCCGTACTTTCCGTAGTTGTCGAACCTGCGCTTGGTCTTTTCGATCTGAGC
GTTAAGAGCAAGAGCAGGGGCGCTTTCAGGAGCGTAGAGCTTAAGAGATGATTGGAGCTT
CTTGATCTGTTGCTTCTCCCTCTCGGCGAACTGTTTCGACTCCTTACAAGGGGTTAGTCC
CGAGATATCAGCGGCGGCTGGCATCGGAGCTGAGAGGAGGATGGAAGAGAGAGCTACCGC
CGAGGATAAAGCCTTCATTGACTGATGTTGCTGCGGCGTTGCGGATTTGTCATCGGAGCA
GACGAATCTCGCGGAGGATTTAGGTACGGATTGGGTGAGTGACTTGTTGAGGACGAGGTT
CGTCGGGATCGTGAGCAACATGACTGGCTCTTAGGATTTCGAAAGTTCGTACTTCTTAGG
GAGGATAGAGAGAAGCGGGGAGATGAGATTCC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2G906TF 714 0 0
GATAAGATCACCATTGAGTA*CGCTCTGTAAGCAGCAACGGGCCAAATGAAACCTCGGAA
GATGAGACGACTAGCCAATGGAACATCGATAATGATCTCTTTCATCGCTGGTTTCTTCTC
ATCACTGAT*GCTATCAAGTAGCTTCTTCCGACCCACCCGATCCATCCAGCAATGTAGAG
GAAGAGAAGTCCTGGAGTTATGAACTCCCCCC*AATGCCGCTGGTCTCCGTTCACTATCA
AGTGTGGTAGCCCGTCTGCACCGCAGAGGAGCCCGTACTTTCCGTAGTTGTCGAACCTGC
GCTTGGTCTTTTCGATCTGAGCGTTAAGAGCAAGAGCAGGGGCGCTTTCAGGAGCGTAGA
GCTTAAGAGATGATTGGAGCTTCTTGATCTGTTGCTTCTCCCTCTTGGCGAACTGTTTCG
ACTCCTTGCAAGGGGTTAGTCCCGAGATATCAGCGGCGGCTGGCATCGGAGCTGAGAGGA
GGATGGAAGAGAGAGCTACCGCCGCGGATAAAGCCTTCATTGACTGATGTTGCTGCGGCG
TTGCGGATTTGTCATCGGAGCAGACGAATCTCGCGGAGGATTTAGGTACGGATTGGGTGA
GTGACTTGTTGAGGACGAGGTTCGTCGGGATCGTGAGCGACATGACTGGCTCTTAGGATT
TCGAAAGTTCGTACTTCTTAGGGAGGATAGAGAGAAGCGGGGAGATGAGATTCC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2GU65TF 657 0 0
GAAGATGAGACGACTAGCCAATGGAACATCGATAATGATCTCTTTCATCGCTGGTTTCTT
CTCATCACTGAT*GCTATCAAGTAGCTTCTTCCGACCCACCCGATCCATCCAGCAATGTA
GAGGAAGAGAAGTCCTGGAGTTATGAACTCCCCCCCAATGCCGCTGGTCTCCGTTCACTA
TCAAGTGTGGTAGCCCGTCTGCACCGCAGAGGAGCCCGTACTTTCCGTAGTTGTCGAACC
TGCGCTTGGTCTTTTCGATCTGAGCGTTAAGAGCAAGAGCAGGGGCGCTTTCAGGAGCGT
AGAGCTTAAGAGATGATTGGAGCTTCTTGATCTGTTGCTTCTCCCTCTTGGCGAACTGTT
TCGACTCCTTGCAAGGGGTTAGTCCCGAGATATCAGCGGCGGCTGGCATCGGAGCTGAGA
GGAGGATGGAAGAGAGAGCTACCGCCGCGGATAAAGCCTTCATTGACTGATGTTGCTGCG
GCGTTGCGGATTTGTCATCGGAGCAGACGAATCTCGCGGAGGATTTAGGTACGGATTGGG
TGAGTGACTTGTTGAGGACGAGGTTCGTCGGGATCGTGAGCGACATGACTGGCTCTTAGG
ATTTCGAAAGTTCGTACTTCTTAGGGAGGATAGAGAGAAGCGGGGAGATGAGATTCC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 5

CO CL782Contig1 1226 5 6 U
GAAAATATGAACAAAATAAAATACAAAATGATGATATTATGAGAGAGTAAAAGTATCCCC
AACAGTTTTTTTCAGTACATTTGGACAATAATAATAACTTATTAAATTGAGAGAGAGGTA
CATCAAATCAAACAGATGACTCACTTTGGCTGTACCTTATTACCATCAAAACGAAAACAT
ACAAAAGAAAAACAACAACGAATCAAAAACATATAACACAGCATAGAGCCGGGAGATTCA
CGACGTTCGCAGGGGATAAAACTCGATCGATCGAACCAAACCACCGATAAATAGAATACC
GACCACTATGATAGTTGTTTGGCTCAAACACACACAAGACAACACTTAAAACTTGTGGAG
ACTCTCTGATAGCTTACCGAGTTTCATCCTCCAAGGCACGGAATCCAGCACTGAGATCCT
CGTACAGTTTCTTGAATTTAGCCACAAGTGCAGCCTCACCTTCTGCTGGATCTTCGAACT
TCTGAGATACTAAACGGTAGAAAAGATCTCCCAAGCGATGCTTGATCAGAGTGTAAGTGA
TCTTTTGACCGTCCATCCCAGCTGCTCTTTCAACCGCCTGATTGGCTAGGTTGTAGAAAT
GGATAATGTTACGCATCATCCACACAGACTTGTAGAAAGGGCAGAACTTGTCATACGGTG
TGAAAGCGTTTTGAGCAAGGTAGTCTTCCCTCAACAACTTAGCTGTTTCCAAGGTGATTT
TGTCACCTTCTGCTAGTGCATCTTTTCCCACAAGCTGGACAATTTCATTAAGATCATCTT
CCCTCTGCAACACCTCTCTGGCTTTTGTCCTGATGTTGATGAAATCTGGATCGAACTTCT
CATAGAAAGATTCTAATGCCGTCGAATACTTTGAGTAGGAAATCAACCAATTAACAGAAG
GGAAATGCTTTCTCTGGGCAAGCTTTTTGTCCAAACCCCAGAAGACCTGCACAATACTAA
GGGTTGCAGAAGTCACAGGGTCTGAAAAGTCTCCACCAGGAGGTGAAACAGCACCAACAA
TTGTGACACTGCCATCACGTTCTGGTCCACCGAGACATTTTACTTTACCAGCACGTTCAT
AGAAAGATGCTAAACGTGCTGCTAGATAGGCAGGATATCCACTGTCCGCAGGCATTTCAG
CCAGCCGTCCTGAAATTTCTCTCAATGCTTCTGCCCAACGGGAAGTCGAGTCTGCCATCA
TACTAACATTGTATCCCATCTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ14JQ U 83
AF RR2EQ14TF C 83
AF RR2AR95JQ U 19
AF RR2CF58JQ U 1
AF RR2CF58TF C 602
BS 1 218 RR2CF58JQ
BS 219 219 RR2EQ14JQ
BS 220 330 RR2CF58JQ
BS 331 331 RR2EQ14JQ
BS 332 826 RR2CF58JQ
BS 827 1226 RR2CF58TF

RD RR2EQ14JQ 469 0 0
GGACAATAATAATAACTTATTAAATTGAGAGAGAGGTACATCAAATCAAACAGATGACTC
ACTTTGGCTGTACCTTATTACCATCAAAACGAAAACATACAAAAGAAAAACAACAACGAA
TCAAAAACATATAACACAGCATAGAGCCGGGAGATTCACGACGTTCGCAGGGGATAAAAC
TCGATCGATCGAACCAAACCACCGATAAATAGAATACCGACCACTATGATAGTTGTTTGG
CTCAAACACACACAAGACAACACTTAAAACTTGTGGAGACTCTCTGATAGCTTACCGAGT
TTCATCCTCCAAGGCACGGAATCCAGCACTGAGATCCTCGTACAGTTTCTTGAATTTAGC
CACAAGTGCAGCCTCACCTTCTGCTGGATCTTCGAACTTCTGAGATACTAAACGGTAGAA
AAGATCTCCCAAGCGATGCTTGATCAGAGTGTAAGTGATCTTTTGACC
C

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR2EQ14TF 469 0 0
GGACAATAATAATAACTTATTAAATTGAGAGAGAGGTACATCAAATCAAACAGATGACTC
ACTTTGGCTGTACCTTATTACCATCAAAACGAAAACATACAAAAGAAAAACAACAACGAA
TCAAAAACATATAACACAGCATAGAGCCGGGAGATTCACGACGTTCGCAGGGGATAAAAC
TCGATCGATCGAACCAAACCACCGATAAATAGAATACCGACCACTATGATAGTTGTTTGG
CTCAAACACACACAAGACAACACTTAAAACTTGTGGAGACTCTCTGATAGCTTACCGAGT
TTCATCCTCCAAGGCACGGAATCCAGCACTGAGATCCTCGTACAGTTTCTTGAATTTAGC
CACAAGTGCAGCCTCACCTTCTGCTGGATCTTCGAACTTCTGAGATACTAAACGGTAGAA
AAGATCTCCCAAGCGATGCTTGATCAGAGTGTAAGTGATCTTTTGACC
C

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR2AR95JQ 691 0 0
AAATACAAAATGATGATATTATGAGAGAGTAAAAGTATCCCCAACAGTTTTTTTCAGTAC
ATTTGGACAATAATAATAACTTATTAAATTGAGAGAGAGGTACATCAAATCAAACAGATG
ACTCACTTTGGCTGTACCTTATTACCATCAAAACGAAAACATACAAAAGAAAAACAACAA
CGAATCAAAAACATATAACACAGCATAGAGCCGGGAGATTCACGACGTTCGCAGGGGATA
AAACTCGATCGATCGAACCAAACCACCGATAAATAGAATACCGACCACTATGATAGTTGT
TTGGCTCAAACACACACAAGACAACACTTAAAACTTGTGGAGACTCTCTGATAGCTTACC
GAGTTTCATCCTCCAAGGCACGGAATCCAGCACTGAGATCCTCGTACAGTTTCTTGAATT
TAGCCACAAGTGCAGCCTCACCTTCTGCTGGATCTTCGAACTTCTGAGATACTAAACGGT
AGAAAAGATCTCCCAAGCGATGCTTGATCAGAGTGTAAGTGATCTTTTGACCGTCCATCC
CAGCTGCTCTTTCAACCGCCTGATTGGCTAGGTTGTAGAAATGGATAATGTTACGCATCA
TCCACACAGACTTGTAGAAAGGGCAGAACTTGTCATACGGTGTGAAAGCGTTTTGAGCAA
GGTAGTCTTCCCTCAACAGCTTAGCTGTTTC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2CF58JQ 827 0 0
GAAAATATGAACAAAATAAAATACAAAATGATGATATTATGAGAGAGTAAAAGTATCCCC
AACAGTTTTTTTCAGTACATTTGGACAATAATAATAACTTATTAAATTGAGAGAGAGGTA
CATCAAATCAAACAGATGACTCACTTTGGCTGTACCTTATTACCATCAAAACGAAAACAT
ACAAAAGAAAAACAACAACGAATCAAAAACATATAACAAAGCATAGAGCCGGGAGATTCA
CGACGTTCGCAGGGGATAAAACTCGATCGATCGAACCAAACCACCGATAAATAGAATACC
GACCACTATGATAGTTGTTTGGCTCAAACAGACACAAGACAACACTTAAAACTTGTGGAG
ACTCTCTGATAGCTTACCGAGTTTCATCCTCCAAGGCACGGAATCCAGCACTGAGATCCT
CGTACAGTTTCTTGAATTTAGCCACAAGTGCAGCCTCACCTTCTGCTGGATCTTCGAACT
TCTGAGATACTAAACGGTAGAAAAGATCTCCCAAGCGATGCTTGATCAGAGTGTAAGTGA
TCTTTTGACCGTCCATCCCAGCTGCTCTTTCAACCGCCTGATTGGCTAGGTTGTAGAAAT
GGATAATGTTACGCATCATCCACACAGACTTGTAGAAAGGGCAGAACTTGTCATACGGTG
TGAAAGCGTTTTGAGCAAGGTAGTCTTCCCTCAACAACTTAGCTGTTTCCAAGGTGATTT
TGTCACCTTCTGCTAGTGCATCTTTTCCCACAAGCTGGACAATTTCATTAAGATCATCTT
CCCTCTGCAACACCTCTCTGGCTTTTGTCCTGATGTTGATGAAATC
T

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2CF58TF 625 0 0
GATAATGTTACGCATCATCCACACAGACTTGTAGAAAGGGCAGAACTTGTCATACGGTGT
GAAAGCGTTTTGAGCAAGGTAGTCTTCCCTCAACAACTTAGCTGTTTCCAAGGTGATTTT
GTCACCTTCTGCTAGTGCATCTTTTCCCACAAGCTGGACAATTTCATTAAGATCATCTTC
CCTCTGCAACACCTCTCTGGCTTTTGTCCTGATGTTGATGAAATCTGGATCGAACTTCTC
ATAGAAAGATTCTAATGCCGTCGAATACTTTGAGTAGGAAATCAACCAATTAACAGAAGG
GAAATGCTTTCTCTGGGCAAGCTTTTTGTCCAAACCCCAGAAGACCTGCACAATACTAAG
GGTTGCAGAAGTCACAGGGTCTGAAAAGTCTCCACCAGGAGGTGAAACAGCACCAACAAT
TGTGACACTGCCATCACGTTCTGGTCCACCGAGACATTTTACTTTACCAGCACGTTCATA
GAAAGATGCTAAACGTGCTGCTAGATAGGCAGGATATCCACTGTCCGCAGGCATTTCAGC
CAGCCGTCCTGAAATTTCTCTCAATGCTTCTGCCCAACGGGAAGTCGAGTCTGCCATCAT
ACTAACATTGTATCCCATCTCTCTC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 8

CO CL783Contig1 1043 8 13 U
GTATACACAAGACAGAATCTATACAAGCAAATTTTTACACATAAAAATTCCGTCTTATTA
CAACAGAGACAAAGAAATAGTTGAAAAAAATGAGATTCTTTTATTTATGTAAAACAATAT
AACATTGATTGAGCTTCACGCACGAATATTTGGG***GTAT*GTAACAGAAGCAAGAACA
AAGGAACACCAAAGATCTCCGAGGTTTCTGGCTAACGCTTATTTGACATGCCGAGTAATT
AACACAACTTTGGAGACAGGAAGACGAATGGTATAATTATTATGAGACACGGATGATTAG
AGCCCAAACAGGGTAGACAAGAAGAAGGATGATCCCCAAAGTGTTCGAAACTCCACGGGG
CTGCGTGAACGAGTTCCTGAACCCACCAGACACTCGGATATGTTCTTGAAGAAGGTAACA
ACCAATGAAAAGGCTGATGACAGAGCCGATCCAGCCTCCGCGTATATGGTGAACAAGGAA
GTTTGGAGAAACTACCAGCAGAAGGATCAGAGAACCAGGCATCTCAAGCCAGTCTGGGAA
ATGCTTAGGGAAGAAAAGTCTGAGTACAACTGCAACGAAAGCTATCCATTTCCCAACGTC
TCCACTGAGGAAGTTAAAGATGACACCAGGAAGGGTGAGGAAGATGTATGGAATCAAGAG
TGAAGTAAGCATCTTGGTTCTCCAGTTGGTACGATCCAATATCAACAAGTAAATGGCGGA
GAAAGAAGCGATCCATTTGACAAAGGAGACGCCAAAGGCTAAACCACCGAGGTTCGAAAC
ATCGGTGAGGAGTTTCTTGGCAGCGATCTTGAGCTCCTCCACGTCGGAATTGACTAAAGC
AGCCGCATCCACGTCTGTCTTCATCGCCAGATAATCCACACGCCCCATCCCTTTGTTCAC
GATAATACTCTCGATCTTCGTAATGATAATTTCAAGATTTTATATGAATTTTGATTTTCT
TATAAATTGAAAATAATAATAATAATAATCGTACAGCTATGTTTTAGCTATCCAGATTGT
CTGTCTTCTCAGGAGTGATCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F205JQ U 176
AF RR2CL40JQ U 91
AF RR2BZ11JQ U 1
AF RR2BQ19JQ U 83
AF RR2CL40TF C 538
AF RR2BZ11TF C 342
AF RR2BQ19TF C 274
AF RR2AC46TF C 209
BS 1 151 RR2BZ11JQ
BS 152 152 RR2CL40JQ
BS 153 435 RR2BZ11JQ
BS 436 436 RR2CL40JQ
BS 437 489 RR2BZ11JQ
BS 490 490 RR2CL40JQ
BS 491 511 RR2BZ11JQ
BS 512 512 RR2F205JQ
BS 513 570 RR2BZ11JQ
BS 571 571 RR2CL40JQ
BS 572 751 RR2BZ11JQ
BS 752 823 RR2BQ19JQ
BS 824 1043 RR2AC46TF

RD RR2F205JQ 430 0 0
GAACAAAGGAACACCAAAGATCTCCGAGGTTTCTGGCTAACGCTTATTTGACATGCCGAG
TAATTAACACAACTTTGGAGACAGGAAGACGAATGGTATAATTATTATGAGACACGGATG
AT*AGAGCCCAAACAGGGTAGACAAGAAGAAGGATGATCCCCAAAGTGTTCGAAACTCCA
CGGGGCTGCGTGAACGAGTTCCTGAACCCACCAGACACTCGGATATGTTCTTGAAGAAGG
TAACAACCAATGAAAAGGCTAATGACAGAGCCGATCCAGCCTCCGCGTATATGGTGAACA
AGGAAGTTTGGAGAGACTACCAGCAGAAGGATCAGAGAACCAGGCATCTCAAGCCAGTCT
GGGAAATGCTTAGGGAAGAAAAGTCTGAGTACAACAGCAACGAAAGCTATCCATTTCCCA
ACGTCTCCAC

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2CL40JQ 590 0 0
TGAGATTCTTTTATTTATGTAAAACAATATAACATTGATTGAGCTTCACGCACGAATATT
TGGGTATGTATTGTAACAGAAGCAAGAACAAAGGAACACCAAAGATCTCCGAGGTTTCTG
GCTAACGCTTATTTGACATGCCGAGTAATTAACACAACTTTGGAGACAGGAAGACGAATG
GTATAATTATTATGAGACACGGATGATTAGAGCCCAAACAGGGTAGACAAGAAGAAGGAT
GATCCCCAAAGTGTTCGAAACTCCACGGGGCTGCGTGAACGAGTTCCTGAACCCACCAGA
CACTCGGATATGTTCTTGAAGAAGGTAACAACCAATGAAAAGGCTGATGACAGAGCCGAT
CCAGCCTCCGCGTATATGGTGAACAAGGAAGTTTGGAGAAACTACCAGCAGAAGGATCAG
AAAACCAGGCATCTCAAGCCAATCTGGGAAGTGCTTAGGGAAAAAAAGTCTGAGTACAAC
TGCAACGAAAGCTATCCATTTCCCAACGTCTCCACTGAGGAAGTTAAAGATCACACCAGG
AAGGGTGAGGAAGATGTATGGAATCAAGAGTGAAGTAAGCATCTTGGTTC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2BZ11JQ 751 0 0
GTATACACAAGACAGAATCTATACAAGCAAATTTTTACACATAAAAATTCCGTCTTATTA
CAACAGAGACAAAGAAATAGTTGAAAAAAATGAGATTCTTTTATTTATGTAAAACAATAT
AACATTGATTGAGCTTCACGCACGAATATTTTGG***GTAT*GTAACAGAAGCAAGAACA
AAGGAACACCAAAGATCTCCGAGGTTTCTGGCTAACGCTTATTTGACATGCCGAGTAATT
AACACAACTTTGGAGACAGGAAGACGAATGGTATAATTATTATGAGACACGGATGATTAG
AGCCCAAACAGGGTAGACAAGAAGAAGGATGATCCCCAAAGTGTTCGAAACTCCACGGGG
CTGCGTGAACGAGTTCCTGAACCCACCAGACACTCGGATATGTTCTTGAAGAAGGTAACA
ACCAATGAAAAGGCTAATGACAGAGCCGATCCAGCCTCCGCGTATATGGTGAACAAGGAA
GTTTGGAGAGACTACCAGCAGAAGGATCAGAAAACCAGGCATCTCAAGCCAGTCTGGGAA
ATGCTTAGGGAAGAAAAGTCTGAGTACAACAGCAACGAAAGCTATCCATTTCCCAACGTC
TCCACTGAGGAAGTTAAAGATGACACCAGGAAGGGTGAGGAAGATGTATGGAATCAAGAG
TGAAGTAAGCATCTTGGTTCTCCAGTTGGTACGATCCAATATCAACAAGTAAATGGCGGA
GAAAGAAGCGATCCATTTGACAAAGGAGACG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2BQ19JQ 741 0 0
GAAAAAAATGAGATTCTTTTATTTATGTAAAACAATATAATATTGATTGAGCTTCACGCA
CGAATATTTGGG****TAT*GTAACAGAAGCAAGAACAAAGGAACACCAAAGATCTCCGA
GGTTTCTGGCTAACGCTTATTTGACATGCCGAGTAATTAACACAACTTTGGAGACGGGAA
GACGAATGGTATAATTATTATGAGACACGGATGATCAGAGCCCAAACAGGGTAGACAAGA
AGAAGGATGATCCCCAAAGTGTTTGAAACTCCACGGGGCTGCGTGAACGAGTTCCTGAAC
CCACCTGACACTCGGATATGTTCTTGAAGAAGGTAACAACCAATGAAAAGGCTGATGACA
GAGTCGATCCAGCCTCCGCGTATATGGTGAA**AGGAAGTTTGGAGAAACTACCAGCAGA
AGGATCAGAGAACCAGGCATCTCAAGCCAGTCTGGGAAATGCTTAGGGAAGAAAAGTCTG
AGTACAACTGCAACGAAAGCTATCCATTTCCCAACGTCTCCACTGAGGAAGTTAAAGATG
ACACCAGGAAGGGTGAGGAAGATGTATGGAATCAAGAGTGAAGTAAGCATCTTGGTTCTC
CAGTTGGTACGGTCCAATATCAACAAGTAAATGGCGGAGAAAGAAGCGATCCATTTGACA
AAGGAGACGCCAAAGGCTAAACCACCGAGGTTCGAAACATCGGTGAGGAGTTTCTTGGCA
GCGATCTTGAGCTCCTCCACG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2CL40TF 347 0 0
GAAG
TGCTTAGGGAAGAAAAGTCTGAGTACAACTGCAACGAAAGCTATCCATTTCCCAACGTCT
CCACTGAGGAAGTTAAAGATCACACCAGGAAGGGTGAGGAAGATGTATGGAATCAAGAGT
GAAGTAAGCATATTGGTTCTCCAATTGGTACGATCCAATATCAACAAGTAAATGGCGGAG
AAAGAAGCGATCCATTTGACGAAGGAGACGCCAAAGGCTAAACCGCCGAGGTTCGAAACA
TCGGTGAGGAGTTTCTTGGCAGCGATCTTGAGCTCCTCCACGTCGGAATTGACTAAAGCA
GCCGTATCCACGTCTGTCTTCATCGCCAGATAATCCACACGCC

QA 5 347 5 347
DS 

RD RR2BZ11TF 571 0 0
TGTTCGAAACTCCACGGGGCTGCGTGAACGAGTTCCTGAACCCACCAGACACTCGGATAT
GTTCTTGAAGAAGGTAACAACCAATGAAAAGGCTAATGACAGAGCCGATCCAGCCTCCGC
GTATATGGTGAACAAGGAAGTTTGGAGAGACTACCAGCAGAAGGATCAGAGAACCAGGCA
TCTCAAGCCAGTCTGGGAAATGCTTAGGGAAGAAAAGTCTGAGTACAACAGCAACGAAAG
CTATCCATTTCCCAACGTCTCCACTGAGGAAGTTAAAGATGACACCAGGAAGGGTGAGGA
AGATGTATGGAATCAAGAGTGAAGTAAGCATCTTGGTTCTCCAGTTGGTACGATCCAATA
TCAACAAGTAAATGGCGGAGAAAGAAGCGATCCATTTGACAAAGGAGACGCCAAAGGCTA
AACCACCGAGGTTCGAAACATCGGTGAGGAGTTTCTTGGCAGCGATCTTGAGCTCCTCCA
CGTCGGAATTGACTAAAGCAGCCGCATCCACGTCTGTCTTCATCGCCAGATAATCCACAC
GCCCCATCCCTTTGTTCACGATAATACTC
CC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2BQ19TF 688 0 0
AT
ATTATTATGAGACACGGATGATCAGAGCCCAAACAGG*TAGACAAGAAGAAGGATGATCC
CCAAAGTGTTTGAAACTCCACGGGGCTGCGTGAACGAGTTCCTGAACCCACCTGACACTC
GGATATGTTCTTGAAGAAGGTAACAACCAATGAAAAGGCTGATGACAGAGTCGATCCAGC
CTCCGCGTATATGGTGAA**AGGAAGTTTGGAGAAACTACCAGCAGAAGGATCAGAGAAC
CAGGCATCTCAAGCCAGTCTGGGAAATGCTTAGGGAAGAAAAGTCTGAGTACAACTGCAA
CGAAAGCTATCCATTTCCCAACGTCTCCACTGAGGAAGTTAAAGATGACACCAGGAAGGG
TGAGGAAGATGTATGGAATCAAGAGTGAAGTAAGCATCTTGGTTCTCCAGTTGGTACGGT
CCAATATCAACAAGTAAATGGCGGAGAAAGAAGCGATCCATTTGACAAAGGAGACGCCAA
AGGCTAAACCACCGAGGTTCGAAACATCGGTGAGGAGTTTCTTGGCAGCGATCTTGAGCT
CCTCCACGTCGGAATTGACTAAAGCAGCCGCATCCACGTCTGTCTTCATCGCCAGATAAT
CCACACGCCCCATCCCTTTGTTCACGATAATACTCTCGATCTTCGTAATGATAATTTCAA
GATTTTATATGAATTTTGATTTTCTT

QA 3 688 3 688
DS 

RD RR2AC46TF 835 0 0
TGGCTAACGCTTATTTGACATGCCGAGTAATTAACACAACTTTGGAGACAGGAAGACGAA
TGGTATAATTATTATGAGACACGGATGATTAGAGCCCAAACAGGGTAGACAAGAAGAAGG
ATGATCCCCAAAGTGTTTGAAACTCCACGGGGCTGCGTGAACGAGTTCCTGAACCCACCT
GACACTCGGATATGTTCTTGAAGAAGGTAACAACCAATGAAAAGGCTGATGACAGAGCCG
ATCCAGCCTCCGCGTATATGGTGAACAAGGAAGTTTGGAGAAACTACCAGCAGAAGGATC
AGAGAACCAGGCATCTCAAGCCAGTCTGGGAAATGCTTAGGGAAGAAAAGTCTGAGTACA
ACTGCAACGAAAGCTATCCATTTCCCAACGTCTCCACTGAGGAAGTTAAAGATGACACCA
GGAAAGGTGAGGAAGATGTATGGAATCAAGAGTGAAGTAAGCATCTTGGTTCTCCAGTTG
GTACGGTCCAATATCAACAAGTAAATGGCGGAGAAAGAAGCGATCCATTTGACAAAGGAG
ACGCCAAAGGCTAAACCACCGAGGTTCGAAACATCGGTGAGGAGTTTCTTGGCAGCGATC
TTGAGCTCCTCCACGTCGGAATTGACTAAAGCAGCCGCATCCACGTCTGTCTTCATCGCC
AGATAATCCACACGCCCCATCCCTTTGTTCACGATAATACTCTCGATCTTCGTAATGATA
ATTTCAAGATTTTATATGAATTTTGATTTTCTTATAAATTGAAAATAATAATAATAATAA
TCGTACAGCTATGTTTTAGCTATCCAGATTGTCTGTCTTCTCAGGAGTGATCCCC

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 5

CO CL784Contig1 1145 5 12 U
GGAGAGGAAGAAGAGGTATATCCATGGCTCTTCTCTCTCCATCTTTCTCCTCTCCAAGCT
ATCGTCTTTTCAGGAGGAGGAGCAACAACATATCGAACAAGTATCAACAACATGGAGGAG
AATCAAAGGAGATGATGATATCTCCTTCTCGTATTTCCACGAGATCGGAGGGACTTTCTC
GTAGGGATTTAGTGCTAATTGGTCTCTCTTCTCCCTTGTCTACGCTTTTGCCTCTGTCTT
CTTCTCCTGTCACTTTTGCTGCAGAAGAAGAAG***CAGGGAAAATGGGTTCGATGGTGG
ATGATATCAATGCTTATTCTTATGCTTACCCACTCGACCTTCCATCCGAGAAGCTTGTCT
TCAAATGGGTTGAATCAAGAAAGCCTGAACGTTACTCTTCAGCTGCGCCACTCTCTCCTG
ATGCGCGTCTACGGATTGTTTCTGAACGACTTGACCTCATCGACAACCTAGTCATTTCTA
TTTCGATAGGGCCCCCAAACCCAAGCTTCCTAACTTCAAAAGACAAGAAAACATGGACTG
CCAAAGACGTTGCTGACTCTGTTCTCTCTGATAAATCAGCTTTGCGTGTCACTTCAAGTC
AGCGTCTAGAAGAGAGCTCAGTTCTTGATGCTCATTCTACCGATATTGATGGGGAGCCTT
ACTGGTACTACGAGTACCTTGTCCGCAAATCACCTACCAAAATCGCTGAAGCATCAAAGA
TGTACAGACACTACATTTCTTCAACAGCTGAACGTGATGGGTACTTATACACCATGAATG
CCTCAACCCTTGGCAAGCAATGGGACATGATGGGACCGGTGTTAGAAAGAGCAGTTGAGT
CCTTTAGGCTTCTTCCTCCCACTGATAGTTATGTTCCTCCATTCAAGGATCCATGGAGGT
TTTGGTGATACTTCCATCTACTCTACCTCAAAGCTTTTCTTCATCAAAATTGCTTCTTCT
TTTTTTTTGAAACTGTAGTTAAAATTTGATAGGAGAGATTCAGAATCTTGATAGCTCTCT
CATTCTCAGTTGTATTAAAAAGCCACGGGGACTAGTCTTCCCCAACTTTGAAGATCTTGT
TTACTGCCCAATGTATTGAGAGAGTTGTATATTTGCATGACTTCTAAACTCATCCAAGGA
ATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2EU61TF U 1
AF RR2ET35TF U 11
AF RR2AE88TF U 111
AF RR2ET35JQ C 486
AF RR2EU61JQ C 428
BS 1 273 RR2EU61TF
BS 274 276 RR2ET35TF
BS 277 666 RR2EU61TF
BS 667 726 RR2ET35TF
BS 727 727 RR2AE88TF
BS 728 743 RR2ET35TF
BS 744 744 RR2AE88TF
BS 745 754 RR2ET35TF
BS 755 781 RR2AE88TF
BS 782 782 RR2EU61JQ
BS 783 843 RR2AE88TF
BS 844 1145 RR2EU61JQ

RD RR2EU61TF 666 0 0
GGAGAGGAAGAAGAGGTATATCCATGGCTCTTCTCTCTCCATCTTTCTCCTCTCCAAGCT
ATCGTCTTTTCAGGAGGAGGAGCAACAACATATCGAACAAGTATCAACAACATGGAGGAG
AATCAAAGGAGATGATGATATCTCCTTCTCGTATTTCCACGAGATCGGAGGGACTTTCTC
GTAGGGATTTAGTGCTAATTGGTCTCTCTTCTCCCTTGTCTACGCTTTTGCCTCTGTCTT
CTTCTCCTGTCACTTTTGCTGCAGAAGAAGAAGAAGCAGGGAAAATGGGTTCGATGGTGG
ATGATATCAATGCTTATTCTTATGCTTACCCACTCGACCTTCCATCCGAGAAGCTTGTCT
TCAAATGGGTTGAATCAAGAAAGCCTGAACGTTACTCTTCAGCTGCGCCACTCTCTCCTG
ATGCGCGTCTACGGATTGTTTCTGAACGACTTGACCTCATCGACAACCTAGTCATTTCTA
TTTCGATAGGGCCCCCAAACCCAAGCTTCCTAACTTCAAAAGACAAGAAAACATGGACTG
CCAAAGACGTTGCTGACTCTGTTCTCTCTGATAAATCAGCTTTGCGTGTCACTTCAAGTC
AGCGTCTAGAAGAGAGCTCAGTTCTTGATGCTCATTCTACCGATATTGATGGGGAGCCTT
ACTGGT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2ET35TF 744 0 0
GGGAGGT
ATATCCATGGCTCTTCTCTCTCCATCTTTCTCCTCTCCAAGCTATCGTCTTTTCAGGAGG
AGGAGCAACAACATATCGAGCAAGTATCAACAACATGGAGGAGAATCAAAGGAGATGATG
ATATCTCCTTCTCGTATTTCCACGAGATCGGAGGGACTTTCTCGTAGGGATTTAGTGCTA
ATTGGTCTCTCTTCTCCCTTGTCTACGCTTTTGCCTCTGTCTTCTTCTCCTGTCACTTTT
GCTGCAGAAGAAGAAG***CAGGGAAAATGGGTTCGATGGTGGATGATATCAATGCTTAT
TCTTATGCTTACCCACTCGACCTTCCATCCGAGAAGCTTGTCTTCAAATGGGTTGAATCA
AGAAAGCCTGAACGTTACTCTTCAGCTGCGCCACTCTCTCCTGATGCGCGTCTACGGATT
GTTTCTGAACGACTTGACCTCATCGACAACCTAGTCATTTCTATTTCGATAGGGCCCCCA
AACCCAAGCTTCCTAACTTCAAAAGACAAGAAAACATGGACTGCCAAAGACGTTGCTGAC
TCTGTTCTCTCTGATAAATCAGCTTTGCGTGTCACTTCAAGTCAGCGTCTAGAAGAGAGC
TCAGTTCTTGATGCTCATTCTACCGATATTGATGGGGAGCCTTACTGGTACTACGAGTAC
CTTGTCCGCAAATCACCTACCAAAATCGCTGAAGCATCAAAGATGTACATACACTACATT
TCTTCA*CAGCTGAACG

QA 8 744 8 744
DS 

RD RR2AE88TF 733 0 0
G
ATGGAGGAGAATCAAAGGAGATGATGATATCTCCTTCTCGTATTTCCACGAGATCGGAGG
GACTTTATCGTAGGGATTTAGTGCTAATTGGTCTCTCTTCTCCCTTGTCTACGCTTTTGC
CTCTGTCTTCTTCTCCTGTCACTTTTGCTGCAGAAGAAGAAG***CAGGGAAAATGGGTT
CCATGGTGGATGATATCAATGCTTATTCTTATGCTTATCCACTCGAGTTGCCATCCGAGA
AGCTTGTCTTCAAATGGGTTGAGTCAAGAAAGCCTGAACGTTACTCTTCAGCTGCGCCAC
TCTCTCCTGATGCGCGTCTACGGATTGTTTCTGAACGACTTGACCTCATCGACAACCTAG
TCATTTCTATTTCGATAGGTCCCCCAAACCCAAGCTTCCTAACATCAAAAGACAAGAAAT
CATGGACTGCCAAAGACGTTGCTGACTCTGTTCTCTCTGATAAATCAGCTTTGCGTGTCA
CTTCAAGTCAGCGTCTAGAAGAGAGCTCGGTTCTTGATGCACATTCTACTGATATTGATG
GGGAGCCTTACTGGTACTACGAGTACCTTGTCCGCAAATCACCTATCAAAATCGCTGAAG
CATCAAAGATGTACAGACACTACATTTCTTCAACAGCTGAACGTGATGGGTACTTATACA
CCATGAATGCATCAACCCTTGGCAAGCAATGGGACATGATGGGACCGGTGTTAGAAAGAG
CAGTTGAGTCCT

QA 2 733 2 733
DS 

RD RR2ET35JQ 646 0 0
ATAGGGCCCCCAAACCCAAGCTTCCTAACTTCAAAAGACAAGAAAACATGGACTGCCAAA
GACGTTGCTGACTCTGTTCTCTCTGATAAATCAGCTTTGCGTGTCACTTCAAGTCAGCGT
CTAGAAGAGAGCTCAGTTCTTGATGCTCATTCTACCGATATTGATGGGGAGCCTTACTGG
TACTACGAGTACCTTGTCCGCAAATCACCTACCAAAATCGCTGAAGCATCAAAGATGTAC
ATACACTACATTTCTTCAACAGCTGAACGTGGTGGGTACTTATACACCATGAATGCCTCA
ACCCTTGGCAAGCTATGGGACATGATGGGACCGGTGTTAGAAAGAGCAGCTGAGTCCTTT
AGGCTTCTTCCTCCTACTGATAGTTATGTTCCTCCATTCAAGGATCCATGGAGGTTTTGG
TGATACTTCCATCTACTCTACCTCAAAGCTTTTCTTCATCAAAATTGCTTCTTCTTTTTT
TT*GAAACTGTAGTTAAAATTTGATAGGAGAGATTCAGAATCTTGATAGCTCTCTCATTC
TCAGTTGTATTAAAAAGCCACGGGGACTAGTCTTCCCCAACTTTGAAGATCTTGTTTACT
GCCCAATGTATTGAGAGAGTTGTATATTTGCATGACTTCTAAACTC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2EU61JQ 718 0 0
TCTACGGATTGTTTCTGAACGACTTGACCTCATCGACAACCTAGTCATTTCTATTTCGAT
AGGGCCCCCAAACCCAAGCTTCCTAACTTCAAAAGACAAGAAAACATGGACTGCCAAAGA
CGTTGCTGACTCTGTTCTCTCTGATAAATCAGCTTTGCGTGTCACTTCAAGTCAGCGTCT
AGAAGAGAGCTCAGTTCTTGATGCTCATTCTACCGATATTGATGGGGAGCCTTACTGGTA
CTACGAGTACCTTGTCCGCAAATCACCTACCAAAATCGCTGAAGCATCAAAGATGTACAG
ACACTACATTTCTTCAACAGCTGAACGTGATGGGTACTTATACACCATGAATGCCTCAAC
CCTTGGCAAGCAATGGGACATGATGGGACCGGTGTTAGAAAGAGCAGTTGAGTCCTTTAG
GCTTCTTCCTCCCACTGATAGTTATGTTCCTCCATTCAAGGATCCATGGAGGTTTTGGTG
ATACTTCCATCTACTCTACCTCAAAGCTTTTCTTCATCAAAATTGCTTCTTCTTTTTTTT
TGAAACTGTAGTTAAAATTTGATAGGAGAGATTCAGAATCTTGATAGCTCTCTCATTCTC
AGTTGTATTAAAAAGCCACGGGGACTAGTCTTCCCCAACTTTGAAGATCTTGTTTACTGC
CCAATGTATTGAGAGAGTTGTATATTTGCATGACTTCTAAACTCATCCAAGGAATAAA

QA 1 718 1 718
DS 



AS 2 8

CO CL785Contig1 1405 6 35 U
GGAATCTTCTGAGATAACTTGTGCACACAATCGAATCTCCGATAAGAAGTCGTGTCTTCC
ATACGGACAAGAACTCCGTTCTCACTCGATTAACACCTAAAAAATTGATCAGATTCTCCA
AACCATCAATCGCGAAAGATCACTCAAAACAATGTTTTCGCAAAAGCTTCACGAAGCATT
CAAAGGCACGGTGGAGAGGATGACCGGTCCTCGCACGATCACGGCGTTCAAGGAGAAGGG
AGTACTCAGCGTCAGCGAGTTCGTCCTCGCCGGAGACAATCTCGTCTCCAAGTGCCCTAC
TTGGTCATGGGAATCTGGTGACCCAAGCAAGAGGAAGCCATACTTACCCTTGGAGAAACA
GTTTTTGATTACTAGAAACGTACCTTGTCTACGGAGAGCTGCATCTGTGGCAGAGGAGTA
CGAAGCTGCGGGAGGTGAAGTGTTGGTTGATGACGAAGATAATGATGGTTGGCTTGCTAC
ACATGGGAAACCTAAAGATAAAGGCAGTGAAGATGAGAACTTGCCGTCAATGGATGCCTT
GGATATAAACGAGAAAAGCGGTATACGGTCGATACCTACGTATTTTGGAGCTGGGGAGGA
GGATGATGATATTCCAGATATGG*AAGAGTTTGATGAGGCTGACAATGTGGTGGAAAATG
ATCCGGCAACTCTTCAGTCAACTTATCTTGTGGCTCATGAACCTGATGACGATAACATTC
TCCGAACTCGTACTTATGATATCAGCATAACGTATGATAAGTATTACCAAACGCCTCGTG
TTTGGCTGACCGGTTATGATGAGTCAAGGATGCTGCTGCA*CCTGAACTTGTGATGGAGG
ATGTAAGCCAAGACCATGCTCGTAAGACGGTCACAATTGAAGATCATCCACACTTGCCTG
GGAAACATGCTTCAGTCCATCCATGTCGACATGGAGCTGTTATGAAGAAGATCATTGACG
TATTAATGTCCCGTGGAGTCGAACCTGAAGTTGACAAGTACCTGTTCCTGTTCTTGAAGT
TCATGGCATCAGTTATTCCAACAATCGAGTATGATTACACAATGGACTTTGATCTCGGTA
GCTCAAGCACCTAATTACTGGTGTCATGGATGGCTTGGTGGCTCTGCACACTGTACATAA
AGAACTGTCATCATTTTCTTTTTTCTTCAAAAGGAACTGTAAGGTGTTGTTGTGTTTTGA
TCACACGTTTATCTGCTGATGTTTATGCAGATCAATAGTAATTTGCCATTGATCAGATCA
ATAGTAATTTGCCATTGATCAGAACTGATCCAGTGTCGTTCAGAAAACAAAATGCGAATG
TAACTTTATTCTCACATCTAATTTAATAGTGTGTTTTGGTACTCCTGCTCATGGCAAAGT
TGGGATTAATGTTTCAAATGTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 0 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM91TF U 40
AF RR2GF50TF U 140
AF RR2D528TF U 126
AF RR2AC67TF U 1
AF RR2D528JQ C 731
AF RR2AC67JQ C 1168
BS 1 85 RR2AC67TF
BS 86 87 RR2EM91TF
BS 88 90 RR2AC67TF
BS 91 91 RR2EM91TF
BS 92 99 RR2AC67TF
BS 100 102 RR2EM91TF
BS 103 121 RR2AC67TF
BS 122 123 RR2EM91TF
BS 124 127 RR2AC67TF
BS 128 128 RR2EM91TF
BS 129 136 RR2AC67TF
BS 137 138 RR2EM91TF
BS 139 243 RR2AC67TF
BS 244 244 RR2EM91TF
BS 245 259 RR2AC67TF
BS 260 262 RR2EM91TF
BS 263 324 RR2AC67TF
BS 325 325 RR2EM91TF
BS 326 327 RR2AC67TF
BS 328 328 RR2EM91TF
BS 329 453 RR2AC67TF
BS 454 454 RR2EM91TF
BS 455 480 RR2AC67TF
BS 481 481 RR2EM91TF
BS 482 544 RR2AC67TF
BS 545 545 RR2EM91TF
BS 546 558 RR2AC67TF
BS 559 559 RR2EM91TF
BS 560 623 RR2AC67TF
BS 624 624 RR2EM91TF
BS 625 852 RR2AC67TF
BS 853 1289 RR2D528JQ
BS 1290 1290 RR2AC67JQ
BS 1291 1358 RR2D528JQ
BS 1359 1405 RR2AC67JQ

RD RR2EM91TF 732 0 0
G
GATAAGAAGTCGTGTCTTCCATACGGACAAGAACTCCGTTCTCTCTCGATTAATACCTAA
AAAATTGATCAGATTCTCCAAAC**TCAATCGCGAGAGATCACTCAAAACAATGTTTTCG
CAAAAGCTTCACGAAGCATTCAAAGGCACGGTGGAGAGGATGACCGGTCCTCGCACGATC
ACGGCTTTCGAGGAGAAGGGAGTACTCAGCGTCAGCGAGTTCGTCCTCGCCGGAGACAAT
CTCGTCTCCAAGTGCCCTACTTGGTCATGGGAATCTGGTGACCCAAGCAAGAGGAAGCCA
TACTTACCCTTGGAGAAACAGTTTTTGATTACTAGAAACGTACCTTGTCTACGGAGAGCT
GCATCTGTGGCAGAGGAGTACGAAGCTGCTGGAGGTGAAGTGTTGGTTGATGACGAAGAT
AATGATGGTTGGCTTGCTACACATGGGAAACCTAAAGATAAAGGCAGTGAAGATGAGGAC
TTGCCGTCAATGGATGCCTTGGATATAAACGAGAGAAGCGGTATACGGTCGATACCTACG
TATTTTGGAGCTGGGGATGATGATGATGATATTCCAGATATGG*AAGAGTTTGATGAGGC
TGACAATGTGGTGGAAAATGATCCGGCAACTCTTCAGTCAACTTATCTTGTTGCTCATGA
ACCTGATGACGATAACATTCTCCGAACTCGTACTTATGATATCAGCATAACGTATGATAA
GTATTACCAAA

QA 2 732 2 732
DS 

RD RR2GF50TF 602 0 0
G
CACTCAAAACAATGTTTTCGCAAAAGCTTCACGAAGCATTCAAAGGCACGGTGGAGAGGA
TGACCGGTCCTCGCACGATCACGGCTTTCAAGGAGAAGGGAGTACTCAGCGTCAGCGAGT
TCGTCCTCGCCGGAGACAATCTCGTCTCCAAGTGCCCTACTTGGTCATGGGAATCTGGTG
ACCCAAGCAAGAGGAAGCCATACTTACCCTTGGAGAAACAGTTTTTGATTACTAGAAACG
TACCTTGTCTACGGAGAGCTGCATCTGTGGCAGAGGAGTACGAAGCTGCTGGAGGTGAAG
TGTTGGTTGATGACGAAGATAATGATGGTTGGCTTGCTACACATGGGAAGCCTAAAGATA
AAGGCAGTGAAGATGAGAACTTGCCGTCAATGGATGCCTTGGATATAAACGAGAGAAGCG
GTATACGGTCGATACCTACGTATTTTGGAGCTGGGGATGATGATGATGATATTCCAGATA
TGG*AAGAGTTTGA*GAGGCTGACAATGTGGTGGAAAATGATCCGGCAACTCTTCAGTCA
ACTTATCTTGTTGCTCATGAACCTGATGACGATAACATTCTCCGAACTCGTACTTATGAT
A

QA 2 602 2 602
DS 

RD RR2D528TF 711 0 0
GATCGATCGCGAA
ATCACTCAAAACAATGTTTTCGCAAAAGCTTCACGAAGCATTCAAAGGCACGGTGGAGAG
GATGACCGGTCCTCGCACGATCACGGCGTTCAAGGAGAAGGGAGTCCTCAGCGTCAGCGA
GTTCGTCCTCGCCGGAGACAATCTCGTCTCCAAGTGCCCTACTTGGTCATGGGAATCTGG
TGACCCGAGCAAGAGGAAGCCATACTTACCCTTGGAGAAACAGTTTTTGATTACTAGAAA
CGTACCTTGTCTACGGAGAGCTGCATCTG**GCAGAGGAGTACGAAGCTGCGGGAGGTGA
AGTGTTGGTTGATGATGAAGATAATGATGGTTGGCTTGCTACTCATGGGAAACCTAAAGA
TAAAGGCAGTGAAGATGAGAACTTGCCGTCAATGGATGCCTTGGATGTAAACGAGAAAAG
GGGTATACGGTCGATGCCTACGTATTTTGGAGCTGGGGAGGAGGATGATGATATTCCAGA
TATGG*AAGAGTTTGATGAGGCTGACAATGTGGTGGAAAATGATCCGGCAACTCTTCAGT
CAACTTATCTTGTGGCTCATGAACCTGATGACGATAACATTCTCCGAACTCGTACTTATG
ATATCAGCATAACGTATGATAAGTATTACCAAACGCCTCGTGTTTGGCTGACCGGTTATG
ATGAGTCAAGGATGCTGCTGCA*CCTGAACTTGT
GATG

QA 14 707 14 707
DS 

RD RR2AC67TF 852 0 0
GGAATCTTCTGAGATAACTTGTGCACACAATCGAATCTCCGATAAGAAGTCGTGTCTTCC
ATACGGACAAGAACTCCGTTCTCAC**GAT*AACACCTA***AATTGATCAGATTCTCCA
ATTCATCGATCGCGAA**ATCACTCAAAACAATGTTTTCGCAAAAGCTTCACGAAGCATT
CAAAGGCACGGTGGAGAGGATGACCGGTCCTCGCACGATCACGGCGTTCAAGGAGAAGGG
AGTCCTCAGCGTCAGCGAGGGAGTCCTCGCCGGAGACAATCTCGTCTCCAAGTGCCCTAC
TTGGTCATGGGAATCTGGTGACCCGAGTAAGAGGAAGCCATACTTACCCTTGGAGAAACA
GTTTTTGATTACTAGAAACGTACCTTGTCTACGGAGAGCTGCATCTGTGGCAGAGGAGTA
CGAAGCTGCGGGAGGTGAAGTGTTGGTTGATGATGAAGATAATGATGGTTGGCTTGCTAC
TCATGGGAAACCTAAAGATAAAGGCAGTGAAGATGAGAACTTGCCGTCAATGGATGCCTT
GGATGTAAACGAGAAAAGGGGTATACGGTCGATACCTACGTATTTTGGAGCTGGGGAGGA
GGATGATGATATTCCAGATATGGGAAGAGTTTGATGAGGCTGACAATGTGGTGGAAAATG
ATCCGGCAACTCTTCAGTCAACTTATCTTGTGGCTCATGAACCTGATGACGATAACATTC
TCCGAACTCGTACTTATGATATCAGCATAACGTATGATAAGTATTACCAAACGCCTCGTG
TTTGGCTGACCGGTTATGATGAGTCAAGGATGCTGCTGCA*CCTGAACTTGTGATGGAGG
ATGTAAGCCAAG

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR2D528JQ 630 0 0
TACTTATGATATCAGCATAACGTATGATAAGTATTACCAAACGCCTCGTGTTTGGCTGAC
CGGTTATGATGAGTCAAGGATGCTGCTGCAACCTGAACTTGTGATGGAGGATGTAAGCCA
AGACCATGCTCGTAAGACGGTCACAATTGAAGATCATCCACACTTGCCTGGGAAACATGC
TTCAGTCCATCCATGTCGACATGGAGCTGTTATGAAGAAGATCATTGACGTATTAATGTC
CCGTGGAGTCGAACCTGAAGTTGACAAGTACCTGTTCCTGTTCTTGAAGTTCATGGCATC
AGTTATTCCAACAATCGAGTATGATTACACAATGGACTTTGATCTCGGTAGCTCAAGCAC
CTAATTACTGGTGTCATGGATGGCTTGGTGGCTCTGCACACTGTACATAAAGAACTGTCA
TCATTTTCTTTTTTCTTCAAAAGGAACTGTAAGGTGTTGTTGTGTTTTGATCACACGTTT
ATCTGCTGATGTTTATGCAGATCAATAGTAATTTGCCATTGATCAGATCAATAGTAATTT
GCCATTGATCAGAACTGATTCAGTGTCGTTCAGAAAACAAAATGCGAATGTAACTTTATT
CTCACATCTAATTTAATAGTGTGTTTTG
AC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2AC67JQ 238 0 0
CAAAAGGAACTGTAAGGTGTTGTTGTGTTTTGATCACACGTTTATTTGCTGATGTTTATG
CAGATCAATAGTAATTTGCCATTGATCAGATCAATAGTAATTTGCCATTGATCAGAACTG
ATCCAGTGTCGTTCAGAAAACAAAATGGGAATGTAACTTTATTCTCACATTTAATTTAAT
AGTGTGTTTTGGTACTCCTGCTCATGGCAAAGTTGGGATTAATGTTTCAAATGTAAGG

QA 1 238 1 238
DS 



CO CL785Contig2 624 2 6 U
CGGTGTACCAAAAACACACTATTAAATTAGATGTGAGAATAAAGTTACATTCACATTTTG
TTTTCCGATCAATGGTGAATTACTATTGATCTGCATAAACTTCAGCAGATGAACGTGTGA
TCAAAACACAACAACACCTTACAGTTCCTTTTGAAGAAAAAAGAAAATGATGACAGTTCT
TTATGTACAGTGTGCAGAGCCACCAAGCCATCCATGACACCAGTAATTAGGTGCTTGAGC
TACCGAGATCAAAGTCCATTGTGTAATCATACTCGATTGTTGGAATAACTGATGCCATGA
ACTTCAAGAACAGGAAAAGGTACTTGTCAACTTCAGGTTCCACTCCACGGGACATTAAAA
CATCAATGATCTTCTTCATAACAGCTCCATGTCGACATGGATGGACTGAAGCATGTTTCC
CAGGCAAGTGTGGATGATCTTCTATTGTGACCGTCTTACGAGCATGGTCTTGGCTTACAT
CCTCCATTACAAGTTCAGGTTGCAGCAGCATCCTTGACTCATCATAACCGGTTAGCCAAA
CACGAGGAGTTTGGTAATACTTATCATACGTTATGCTGATATCATAAGTACGAGTTCGGA
GAATGTTATCGTCATCAGGTTCAT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF50JQ U 1
AF RR2EM91JQ U 2
BS 1 65 RR2GF50JQ
BS 66 66 RR2EM91JQ
BS 67 157 RR2GF50JQ
BS 158 158 RR2EM91JQ
BS 159 381 RR2GF50JQ
BS 382 624 RR2EM91JQ

RD RR2GF50JQ 381 0 0
CGGTGTACCAAAAACACACTATTAAATTAGATGTGAGAATAAAGTTACATTCACATTTTG
TTTTCTGATCAATGGTGAATTACTATTGATCTGCATAAACTTCAGCAGATGAACGTGTGA
TCAAAACACAACAACACCTTACAGTTCCTTTTGAAGAGAAAAGAAAATGATGACAGTTCT
TTATGTACAGTGTGCAGAGCCACCAAGCCATCCATGACACCAGTAATTAGGTGCTTGAGC
TACCGAGATCAAAGTCCATTGTGTAATCATACTCGATTGTTGGAATAACTGATGCCATGA
ACTTCAAGAACAGGAAAAGGTACTTGTCAACTTCAGGTTCCACTCCACGGGACATTAAAA
CATCAATGATCTTCTTCATAA

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR2EM91JQ 623 0 0
GGG
GTACCAAAAACACACTATTAAATTAGATGTGAGAATAAAGTTACATTCACATTTTGTTTT
CCGATCAATGGTGAATTACTATTGATCTGCATAAACTTCAGCAGATGAACGTGTGATCAA
AACACAACAACACCTTACAGTTCCTTTTGAAGAAAAAAGAAAATGATGACAGTTCTTTAT
GTACAGTGTGCAGAGCCACCAAGCCATCCATGACACCAGTAATTAGGTGCTTGAGCTACC
GAGATCAAAGTCCATTGTGTAATCATACTCGATTGTTGGAATAACTGATGCCATGAACTT
CAAGAACAGGAAAAGGTACTTGTCAACTTCAGGTTCTACTCCACGGGACATTAAAACATC
AATGATCTTCTTCATAACAGCTCCATGTCGACATGGATGGACTGAAGCATGTTTCCCAGG
CAAGTGTGGATGATCTTCTATTGTGACCGTCTTACGAGCATGGTCTTGGCTTACATCCTC
CATTACAAGTTCAGGTTGCAGCAGCATCCTTGACTCATCATAACCGGTTAGCCAAACACG
AGGAGTTTGGTAATACTTATCATACGTTATGCTGATATCATAAGTACGAGTTCGGAGAAT
GTTATCGTCATCAGGTTCAT

QA 4 623 4 623
DS 



AS 1 6

CO CL786Contig1 1159 6 23 U
AATAAGGAATTTGTGAGATAAACCAAAGCGTCTTTCTAATTTTATTGAAAACACCAATTT
ATTGTAAACACCAGTTCTAAAACAAAGGATGAACAATTTTCTTTAGTTCAAACTTGACTA
AGCAATAAAGATTAAGAAGCTCTCAAACGTCCACAGTGAGTTTGGTGTCAAGGTGAGTGA
ACTCTTGGAAGAAAGCTTTGAAGTGTTCGTATGAATGCTTCACGTCGTCCGCAGCACACA
TCTCACGGATGCTATGCATCGAGAGCTGAGGAGCTCCAACATCAACCGTCCTTATCCCCA
CACTGCTTGCTAGGATTGGACCAATGGTCGATCCACAAGCCATATCATTACGTACCACGA
AATCCTGAACAGGGAGATTATGTTTCTCTGCTATCTCTCTGAACACAAATGAAGTCACTG
AATTAGTTGCGTAGCGTTGATTTGCATTGTGTTTGATGACAAGCCCTCCATGCATCTTTG
GCTGATGATTCTCATCGTGTTTGTCCATAAAGTTTGGATGTAAAGCATGAGCCATGTCAG
CGGACACAAGCAAACTTTTTTGAATCGCTTTCTTGAGCACCTTAGCGTCAGAGCTGAAGC
AACTTGTGATGTGTGACATAGCATCAATCATGACAGGGGATCCAGCTCCTTGCGCTGAAT
TGGAACCAACTTCCTCATGATCAAATAATGCCACCATTCTTACTCCACTTTCTTCCTCTA
GGTCACTTCCAGAGGACGTTGCATCTATAAGTGCCTTTAGAGAACAAAATGACATGCAGA
GATTATCTAGCCTTCCTGAGAAAATAAACTCTTTTGCTGCACCACCTAGAACGCTTGGCT
GAGTGTCACACACTTGCAGCTCAAAATAGCAAATCTCATCAGGTTTACAACCCAGTGCGT
TTGCAATGATCTCCATTAGAAGTGGGTGATGCTTTGATTTTGAACTAGTTTCAGTACACT
TCTTTCCTCCCTCATCTTCACCGCCTTCCACTGGCACTTTATTGACCTCCGCCTTTATAG
CCGTTGCGAGTAATGGAACAAGGTGTGTCTGAGTGTTAGGCTTAAAACCTTCACTGTTCA
CATTCCTGTCCAAGTGAATGGCCAGGGTAGGAACCCCCATGATAGGATCCTCAATCCTGA
CAAGACGATGAGAATATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP56JQ U 1
AF RR2EO46JQ U 13
AF RR2CG42JQ U 20
AF RR2GJ83JQB U 20
AF RR2EO46TF C 368
AF RR2EP56TF C 507
BS 1 41 RR2EP56JQ
BS 42 43 RR2CG42JQ
BS 44 47 RR2EP56JQ
BS 48 48 RR2CG42JQ
BS 49 94 RR2EP56JQ
BS 95 95 RR2CG42JQ
BS 96 117 RR2EP56JQ
BS 118 118 RR2EO46JQ
BS 119 205 RR2EP56JQ
BS 206 206 RR2EO46JQ
BS 207 420 RR2EP56JQ
BS 421 421 RR2EO46JQ
BS 422 507 RR2EP56JQ
BS 508 508 RR2EO46JQ
BS 509 670 RR2EP56JQ
BS 671 671 RR2CG42JQ
BS 672 685 RR2EP56JQ
BS 686 730 RR2CG42JQ
BS 731 746 RR2GJ83JQB
BS 747 808 RR2EO46TF
BS 809 809 RR2EP56TF
BS 810 907 RR2EO46TF
BS 908 1159 RR2EP56TF

RD RR2EP56JQ 685 0 0
AATAAGGAATTTGTGAGATAAACCAAAGCGTCTTTCTAATT**ATTGTAAACACCAATTT
ATTGTAAACACCAGTTCTAAAACAAAGGATGAACGATTTTCTTTAGTTCAAACTTGATTA
AGCAATAAAGATTAAGAAGCTCTCAAACGTCCACAGTGAGTTTGGTGTCAAGGTGAGTGA
ACTCTTGGAAGAAAGCTTTGAAGTGGTCGTATGAATGCTTCACGTCGTCCGCAGCACACA
TCTCACGGATGCTATGCATCGAGAGCTGAGGAGCTCCAACATCAACCGTCCTTATCCCCA
CACTGCTTGCTAGGATTGGACCAATGGTCGATCCACAAGCCATATCATTACGTACCACGA
AATCCTGAACAGGGAGATTATGTTTCTCTGCTATCTCTCTGAACACAAATGAAGTCACTG
CATTAGTTGCGTAGCGTTGATTTGCATTGTGTTTGATGACAAGCCCTCCATGCATCTTTG
GCTGATGATTCTCATCGTGTTTGTCCACAAAGTTTGGATGTAAAGCATGAGCCATGTCAG
CGGACACAAGCAAACTTTTTTGAATCGCTTTCTTGAGCACCTTAGCGTCAGAGCTGAAGC
AACTTGTGATGTGTGACATAGCATCAATCATGACAGGGGATCCAGCTCCTTGCGCTGAAT
TGGAACCAACCTCCTCATGATCAAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2EO46JQ 655 0 0
GTGAGATAA
ACCAAAGCGTCTTTCTAATT**ATTGTAAACACCAATTTATTGTAAACACCAGTTCTAAA
ACAAAGGATGAACGATTTTCTTTAGTTCAAACTTGACTAAGCAATAAAGATTAAGAAGCT
CTCAAACGTCCACAGTGAGTTCGGTGTCAAGGTGAGTGAAGTCTTGGAAGAAAGCTTTGA
AGTGTTCGTATGAATGCTTCACGTCGTCCGCAGCACACATCTCACGGATGCTATGCATCG
AGAGCTGAGGAGCTCCAACATCAACCGTCCTTATCCCCACACTACTTGCTAGGATTGGAC
CAATGGTCGATCCACAAGCCATATCATTACGTACCACGAAATCCTGAACAGGGAGATTAT
GTTTCTCTGCTATCTCTCTGAACACAAATGAAGTCACTGAATTAGTTGCGTAGCGTTGAT
TTGCATTGTGTTTGATGACAAGTCCTCCATGCATCTTTGGCTGATGATTCTCATCGTGTT
TGTCCATAAAGTTTGGATGTAAAGCATGAGCCATGTCAGCGGACACAAGCAAACTTTTCT
GAATAGCTTTCTTGAGCACCTTAGCGTCAGAGCTGAAGCAACTTGTGATGTGTGACATAG
CATCAATCATGACAGGGGATCCAG*TCCTTGCGCTGAATTGGAACC

QA 10 655 10 655
DS 

RD RR2CG42JQ 711 0 0
AC
ACCAAAGCGTCTTTCTAATTTTATTGAAAACACCAATTTATTGTAAACACCAGTTCTGAA
ACAAAGGATGAACAATTTTCTTTAGTTCAAACTTGACTAAGCAATAAAGATTAAAAAGCT
CTCAAACGTCCACAGTGAGTTTGGTGTCAAGGTGAGTGAACTCTTGGAAAAAAGCTTTGA
AGTGTTCGTATGAATGCTTCACGTCGTCCGCGGCACACATCTCACGGATGCTATGCATCG
AGAGCTGAGGAGCTCCAACATCAACCGTCCTTATCCCCACACTGCTTGCTAGGATTGGAC
CAATGGTCGATCCACAAGCCATATCATTACGTACCACGAAATCCTGAACAGGGAGATTAT
GTTTCTCTGCTATCTCTCTGAACACAAATGAAGTCACTGCATTAGTTGCGTAGCGTTGAT
TTGCATTGTGTTTGATGACAAGCCCTCCATGCATCTTTGGCTGATGATTCTCTTCGTGTT
TGTCCATAAAGTTTGGATGTAAAGCATGAGCCATATCAGCGGACACAAGCAAACTTTTTT
GAATCGCTTTCTTGAGCACCTTAGCGTCAGAGCTGAAGCAACTTGTGATGTGTGACAGAG
CATCAATCATGACAGGGGATCCAGCTCCTTGCGCTGAATTGGAACCAACTTCCTCATGAT
CAAATAATGCCACCATTCTTACTCCACTTTCTTCCTCTAGGTCACTTCC

QA 3 711 3 711
DS 

RD RR2GJ83JQB 727 0 0
AC
ACCAAAGCGTCTTTCTAATTTTATTGAAAACACCAATTTATTGTAAACACCAGTTCTGAA
ACAAAGGATGAACAATTTTCTTTAGTTCAAACTTGACTAAGCAATAAAGATTAAGAAGCT
CTCAAACGTCCACAGTGAGTTTGGTGTCAAGGTGAGTGAACTCTTGGAAGAAAGCTTTGA
AGTGTTCGTATGAATGTTTCACGTCGTCCGCGGCACACATCTCACGGATGCTATGCATCG
AGAGCTGAGGAGCTCCAACATCAACCGTCCTTATCCCCACACTGCTTGCTAGGATTGGAC
CAATGGTCGATCCACAAGCCATATCATTACGTACCACGAAATCCTGAACAGGGAGATTAT
GTTTCTCTGCTATCTCTCTGAACACAAATGAAGTCACTGCATTAGTTGCGTAGCGTTGAT
TTGCATTGTGTTTGATGACAAGCCCTCCATGCATCTTTGGCTGATGATTCTCTTCGTGTT
TGTCCATAAAGTTTGGATGTAAAGCATGAGCCATATCAGCGGACACAAGCAAACTTTTTT
GAATCGCTTTCTTGAGCACCTTAGCGTCAGAGCTGAAGCAACTTGTGATGTGTGACAGAG
CATCAATCATGACAGGGGATCCAGCTCCTTGCGCTGAATTGGAACCAACTTCCTCATGAT
CAAATAATGCCACCATTCTTACTCCACTTTCTTCCTCTAGGTCACTTCCAGAGGACGTTG
CATCT

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR2EO46TF 541 0 0
AACAGGGAGATTATGTTTCTCTGCTATCTCTCTGAACACAAATGAAGTCACTGAATTAGT
TGCGTAGCGTTGATTTGCATTGTGTTTGATGACAAGTCCTCCATGCATCTTTGGCTGATG
ATTCTCATCGTGTTTGTCCATAAAGTTTGGATGTAAAGCATGAGCCATGTCAGCGGACAC
AAGCAAACTTTTCTGAATAGCTTTCTTGAGCACCTTAGCGTCAGAGCTGAAGCAACTTGT
GATGTGTGACATAGCATCAATCATGACAGGGGATCCAG*TCCTTGCGCTGAATTGGAACC
AACTTCCTCATGATCAAATAATGCCACCATTCTTACTCCACTTTCTTCCTCTAGGTCACT
TACAGAGGACGTTGCATCTATAAGTGCCTTTAGAGAACAAAATGACATGCAGAGATTATC
TAGCCTTCCTGAGAAAATAAATTCTTTTGCTGCACCACCTAGAACGCTTGGCTGAGTGTC
ACACACTTGCAGCTCAAAATAGCAAATCTCATCAGGTTTACAACCCAGTGCGTTTGCAAT
C

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2EP56TF 653 0 0
AC
AAAGTTTGGATGTAAAGCATGAGCCATGTCAGCGGACACAAGCAAACTTTTTTGAATCGC
TTTCTTGAGCACCTTAGCGTCAGAGCTGAAGCAACTTGTGATGTGTGACATAGCATCAAT
CATGACAGGGGATCCAGCTCCTTGCGCTGAATTGGAACCAACCTCCTCATGATCAAATAA
TGCCACCATTCTTACTCCACTTTCTTCCTCTAGGTCACTTCCAGAGGACGTTGCATCTAT
AAGTGCCTTTAGGGAGCAAAATGACATGCAGAGATTATCTAGCCTTCCTGAGAAAATAAA
CTCTTTTGCTGCACCACCTAGAACGCTTGGCTGAGTGTCACACACTTGCAGCTCAAAATC
GCAAATCTCATCAGGTTTACAACCCAGTGCGTTTGCAATGATCTCCATTAGAAGTGGGTG
ATGCTTTGATTTTGAACTAGTTTCAGTACACTTCTTTCCTCCCTCATCTTCACCGCCTTC
CACTGGCACTTTATTGACCTCCGCCTTTATAGCCGTTGCGAGTAATGGAACAAGGTGTGT
CTGAGTGTTAGGCTTAAAACCTTCACTGTTCACATTCCTGTCCAAGTGAATGGCCAGGGT
AGGAACCCCCATGATAGGATCCTCAATCCTGACAAGACGATGAGAATATGC

QA 3 653 3 653
DS 



AS 2 7

CO CL787Contig1 658 2 11 U
GGCCCGCAGAGGAAGCTAGAGGAAGAAAGAAAGAAAGAGGAACAACGAAGGAAGAGAAAT
AATGGAGTCTCCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGTGTGAAGAGAGACGCTCTTCG
ATTCGGTCTCAACGGCGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCTTA
CGAATCTGGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGAACAATCATTGGGCATACCTACGG
GTCTGCACTTCCATTGAAGATGGATATGGACAGACAAATTCTCTCACGGTTTCAAAGACC
TCCTGGACCAATTCCATCGTCAATGCTCGGGTTAGAAGTCTACACAGGAGCCATTGATAA
CTTTGGTTTTGAGGATTACTTAAATGATCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCGGTAGA
CTTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATCTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGTTT
CATGTGAGGCACCCTCATTGGTGGTGGTTTGTTGGATGTTACGTCATTTTAGCTTTTGAA
TGATGATTGAATCAAGTGTGTCAACTTATTTCGACGTTAGACTTCTACTATAAAGTTTGA
AATCAGATGAAACTGAGCAATTAATATTGTGGATTAATTCTAGTATGGTGGTGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK64TF U 42
AF RR2AB91TF U 1
BS 1 89 RR2AB91TF
BS 90 90 RR2FK64TF
BS 91 239 RR2AB91TF
BS 240 240 RR2FK64TF
BS 241 504 RR2AB91TF
BS 505 505 RR2FK64TF
BS 506 506 RR2AB91TF
BS 507 507 RR2FK64TF
BS 508 515 RR2AB91TF
BS 516 516 RR2FK64TF
BS 517 658 RR2AB91TF

RD RR2FK64TF 563 0 0
ACATCGAA
GGAAGAGAAATAATGGAGTCTCCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGTGTGAAGAGA
GACGCTCTTCGATTCGGTCTCAACGGCGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTC
GAATCCTCTTACGAATCTGGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGAACAATCATTGGG
CATACCTACGGGTCTGCACTTCCATTGAAGATGGATATGGACAGACAAATTCTCTCACGG
TTTCAAAGACCTCCTGGACCTATTCCATCGTCAATGCTCGGGTTAGAAGTCTATACAGGA
GCCATTGATAACTTTGGTTTTGAGGATTACTTAAATGATCCTCGTGACTCGGAGACATTC
AAGCCTGTAGACTTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATCTCAAAGGGCCCGGTT
GCCCCAAGTTTCATGTGAGGCACCCTCATTGGTGGTGGTTTGTTGGATGTTACGTCATTT
TAGCTTTTGAATGATGATTGAATCAAGTGTGTGAACTTATTTCGACGTTAGACTTCTACT
ATAAAGTTTG
AAACC

QA 9 558 9 558
DS 

RD RR2AB91TF 658 0 0
GGCCCGCAGAGGAAGCTAGAGGAAGAAAGAAAGAAAGAGGAACAACGAAGGAAGAGAAAT
AATGGAGTCTCCGAAGAAGATAGCTCATGGGATCGGTGGTGTGAAGAGAGACGCTCTTCG
ATTCGGTCTCAACGGCGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCTTA
CGAATCTGGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGAACAATCATTGGGCATACCTACGT
GTCTGCACTTCCATTGAAGATGGATATGGACAGACAAATTCTCTCACGGTTTCAAAGACC
TCCTGGACCAATTCCATCGTCAATGCTCGGGTTAGAAGTCTACACAGGAGCCATTGATAA
CTTTGGTTTTGAGGATTACTTAAATGATCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCGGTAGA
CTTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATCTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGTTT
CATGTGAGGCACCCTCATTGGTGG*GTTTTGTTGGGTGTTACGTCATTTTAGCTTTTGAA
TGATGATTGAATCAAGTGTGTCAACTTATTTCGACGTTAGACTTCTACTATAAAGTTTGA
AATCAGATGAAACTGAGCAATTAATATTGTGGATTAATTCTAGTATGGTGGTGATTCC

QA 1 658 1 658
DS 



CO CL787Contig2 765 5 10 U
GGGCCCGCAGAGGAAGCTAGAGGAAGAAAGAAAGAAAGAGGAACATCGAAGGGAAGAGAA
GTAATGGAGTCTCCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGCGTGAAGAGAGACGCTCTT
CGATTCGGTCTCAACGGCGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCT
TACGAATCTGGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGAACAATCATAGGGCATACCTAC
GGGTCTGCACTTCCATTGAAGATGGATATGGACAGACAAATTCTCTCACGGTTTCAAAGA
CCTCCTGGACCTATTCCATCGTCAATGCTCGGGTTAGAAGTCTACACAGGATCCATTGAT
AACTTTGGTTTTGAGGATTACTTAAATGATCCTCATGACTCGGAGACATTCAAGCCGGTA
GACTTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATCTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGT
TTCATGTGAGGCAGCACCCTCATGGGTTTTGTTGGATGTTACGTCATTTTAGCTTTTGAA
TGATGATGAATCAAGTGTGTGAACTTATTTCGACGTTTGACTTCAACTCTAAAGTTTGTA
ATCAGATGAAACTGGGCAATTGATATGGTGGATTAATTCTAGTATGCTGATTCCAACAAA
TAGTAGAATCACCCGGACTTCATTTTCAATTCTGTTATATCATCTGTTGGACCAAAATAT
TTCTGTGATATTTTTTTTCCATTTCTTATTATGTTTCTTCTACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP29TF U 1
AF RR2GR59TF U 7
AF RR2D612JQ C 191
AF RR2D612TF U 8
AF RR2GR59JQ C 430
BS 1 179 RR2AP29TF
BS 180 180 RR2GR59TF
BS 181 326 RR2AP29TF
BS 327 327 RR2GR59TF
BS 328 394 RR2AP29TF
BS 395 395 RR2D612TF
BS 396 652 RR2AP29TF
BS 653 712 RR2GR59TF
BS 713 732 RR2D612TF
BS 733 765 RR2GR59JQ

RD RR2AP29TF 652 0 0
GGGCCCGCAGAGGAAGCTAGAGGAAGAAAGAAAGAAAGAGGAACATCGAAGGGAAGAGAA
GTAATGGAGTCTCCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGCGTGAAGAGAGACGCTCTT
CGATTCGGTCTCAACGGCGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCC
TACGAATCTGGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGAACAATCATAGGGCATACCTAC
GGGTCTGCACTTCCATTGAAGATGGATATGGACAGACAAATTCTCTCACGGTTTCAAAGA
CCTCCTGGACCTATTCCATCGTCAATACTCGGGTTAGAAGTCTACACAGGATCCATTGAT
AACTTTGGTTTTGAGGATTACTTAAATGATCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCGGTA
GACTTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATCTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGT
TTCATGTGAGGCAGCACCCTCATGGGTTTTGTTGGATGTTACGTCATTTTAGCTTTTGAA
TGATGATGAATCAAGTGTGTGAACTTATTTCGACGTTTGACTTCAACTCTAAAGTTTGTA
ATCAGATGAAACTGGGCAATTGATATGGTGGATTAATTCTAGTATGCTGATT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2GR59TF 707 0 0
GGA
GAGGAAGCTAGAGGAAGAAAGAAAGAAAGAGGAACATCGAAGGGAAGAGAAGTAATGGAG
TCTCCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGCGTGAAGAGAGACGCTCTTCGATTCGGT
CTCAACGGCGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCTTACGAATCT
GGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGAACAATCATAGGGCATACCTACGGGTCTGCA
CTTCCATTGAAGATGGATATGGACAGACAAATTCTCTCACGGTTTCAAAGACCTCCTGGA
CCTATTCCATCGTCAATGCTCGGGTTAGAAGTCTACACAGGATCCATTGATAACTTTGGT
TTTGAGGATTACTTAAATGATCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCGGTAGACTTCCAC
CACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATCTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGTTTCATGTGA
GGCAGCACCCTCATGGGTTTTGTTGGATGTTACGTCATTTTAGCTTTTGAATGATGATGA
ATCAAGTGTGTGAACTTATTTCGACGTTTGACTTCAACTCTAAAGTTTGTAATCAGATGA
AACTGGGCAATTGATATGGTGGATTAATTCTAGTATGCTGATTCCAACAAATAGTAGAAT
CACCCGGACTTCATTTTCAATTCTGTTATATCATCTGTTGGAC
A

QA 4 706 4 706
DS 

RD RR2D612JQ 514 0 0
GAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGAACAATCATAGGGCATACCTACGGGTCTGCAC
TTCCATTGAAGATGGATATGGACAGACAAATTCTCTCACGGTTTCAAAGACCTCCTGGAC
CTATTCCATCGTCAATGCTCGGGTTAGAAGTCTACACAGGATCCATTGATAACTTTGGTT
TTGAGGATTACTTAAATGATCCTCATGATTCGGAGACATTCAAGCCGGTAGACTTCCACC
ACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATCTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGTTTCATGTGAG
GCAGCACCCTCATGGGTTTTGTTGGATGTTACGTCATTTTAGCTTTTGAATGATGATGAA
TCAAGTGTGTGAACTTATTTCGACGTTTGACTTCAACTCTAAAGTTTGTAATCAGATGAA
ACTGGGCAATTGATATGGTGGATTAATTTTAGTATGCTGATTCCAACAAATAGTAGAATC
ACCCGGACTTCATTTTCAATTCTGTTATATCATC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2D612TF 725 0 0
GG
GAGGAAGCTAGAGGAAGAAAGAAAGAAAGAGGAACATCGAAGGGAAGAGAAGTAATGGAG
TCTCCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGCGTGAAGAGAGACGCTCTTCGATTCGGT
CTCAACGGCGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCTTACGAATCT
GGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGAACAATCATAGGGCATACCTACGGGTCTGCA
CTTCCATTGAAGATGGATATGGACAGACAAATTCTCTCACGGTTTCAAAGACCTCCTGGA
CCTATTCCATCGTCAATGCTCGGGTTAGAAGTCTACACAGGATCCATTGATAACTTTGGT
TTTGAGGATTACTTAAATGATCCTCATGACTCGGAGACATTCAAGCCGGTAGACTTCCAC
CACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATCTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGTTTCATGTGA
GGCAGCACCCTCATGGGTTTTGTTGGATGTTACGTCATTTTAGCTTTTGAATGATGATGA
ATCAAGTGTGTGAACTTATTTCGACGTTTGACTTCAACTCTAAAGTTTGTAATCAGATGA
AACTGGGCAATTGATATGGTGGATTAATTCTAGTATGCTGATTCCAACAAATAGTAGAAT
CACCCGGACTTCATTTTCAATTCTGTTATATCATCTGTTGGACCAAAATATTTCTGTGAT
ATT

QA 3 725 3 725
DS 

RD RR2GR59JQ 336 0 0
CACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATCTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGTTTCATGTGA
GGCAGCACCCTCATGGGTTTTGTTGGATGTTACGTCATTTTAGCTTTTGAATGATGATGA
ATCAAGTGTGTGAACTTATTTCGACGTTTGACTTCAACTCTAAAGTTTGTAATCAGATGA
AACTGGGCAATTGATATGGTGGATTAATTTTAGTATGCTGATTCCAACAAATAGTAGAAT
CACCCGGACTTCATTTTCAATTCTGTTATATCATCTGTTGGACCAAAATATTTCTGTGAT
ATTTTTTTTCCATTTCTTATTATGTTTCTTCTACTT

QA 1 336 1 336
DS 



AS 1 6

CO CL788Contig1 1102 6 9 U
GGACCTCAACAACTAATCCACTACAATGTCTTCTTCTTATTCTTCACTCACACTCTTCTT
CTTCTTTGCTTCCACATTCCTCTACACTTCATCAAACTCATTCAACATCACAAACATCTT
AAACCAGAACAATGAGTTCTCCACTTTCAACAACCTCCTCTCCCAAACCGGACTCGCTTC
CACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTTTCCAACGACGCAATGAGCAT
GTTTTCCTCCCAATCAACCGAAGACAACAAGAAAAGCCTCGGCCTCCACATCGTTCTAGA
CTACTACGACATCAAGAAACTCAGAAGCATTAAATCAGTGATACTCACCACTCTCTTCCA
AGCAAGCGGTCAAGCTAAAGGCCTGCAAGGGTTCGTGAACGCAACCGTTATGAACAACGG
TGACGTTATGTTCGGATCTGCGGTTCGTGGATCCGGCCTTGACTCTAAGCTTATAGACTC
TGTTGCGACACATCCATATAACATCTCGGTGCTTCATATTAGTAGTTACATATCTATCAT
GGATCCCGAAGGTCCTAAAGATCATGGTTCTTCATCTTCACCACTTCCTGTACAACCTCC
TGGTGATGATGATTACGAATATGACGAGCCACCGTCTCCACCTTCCTCTACTACTAAGCC
TTTTGTTGCTGCTGCTACTGCTGCTACCGCTAAGCCACCTTCTTCTGCAAAAGACAACTC
AACAACAAGTGGAGTTCCAGCGATTAGTATTCCTAACCTGGCGTTTGTGTTTGTGATCTC
ATCCTTTTGGTGCTTCATGACGGTCTGGTGATGTGATGGCTAAGATTTGATGAATAAACC
AGATCAGCTTTCTGAAAGCCAGAAAAAAAATGGAGATTAGCAGCAAAGCTTTCAAGCTTT
TTTCACACAAAAGAACACTTCAAGCTTCACAAGCTCTATGGAATTGGAATAAAGCAACAA
AATCCAAAGAAGAAATAAAGTGATTGATGATTCAATAAGGGATGAAGAATGTTGTAATAA
CTCAAAAGTTCTTTATTTATTTGGAAGCTTGGATAAGTTTCTAAGAGATTTCAATTGGCG
CAATAAAATGTTTATTATTTAA


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK55TF U 1
AF RR2CO73TF U 1
AF RR2FV31TF U 1
AF RR2FV31JQ C 464
AF RR2CO73JQ C 321
AF RR2GR77TF U 500
BS 1 711 RR2CO73TF
BS 712 712 RR2GR77TF
BS 713 744 RR2CO73TF
BS 745 750 RR2FV31TF
BS 751 751 RR2GR77TF
BS 752 771 RR2FV31TF
BS 772 772 RR2GR77TF
BS 773 796 RR2FV31TF
BS 797 1102 RR2GR77TF

RD RR2EK55TF 547 0 0
GG
ACCTCAACAACTAATCCACTACAATGTCTTCTTCTTATTCTTCACTCACACTCTTCTTCT
TCTTTGCTTCCACATTCCTCTACACTTCATCAAACTCATTCAACATCACAAACATCTTAA
ACCAGAACAATGAGTTCTCCACTTTCAACAACCTCCTCTCCCAAACCGGACTCGCTTCCA
CCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTTTCCAACGACGCAATGAGCATGT
TTTCCTCCCAATCAACCGAAGACAACAAGAAAAGCCTCGGCCTCCACATCGTTCTAGACT
ACTACGACATCAAGAAACTCAGAAGCATTAAATCAGTGATACTCACCACTCTCTTCCAAG
CAAGCGGTCAAGCTAAAGGCCTGCAAGGGTTCGTGAACGCAACCGTTATGAACAACGGTG
ACGTTATGTTCGGATCTGCGGTTCGTGGATCCGGCCTTGACTCTAAGCTTATAGACTCTG
TTGCGACACATCCATATAACATCTCGGTGCTTCATATTAGTAGTTGCATATCTATCATGG
ATCCC

QA 3 547 3 547
DS 

RD RR2CO73TF 748 0 0
GGACCTCAACAACTAATCCACTACAATGTCTTCTTCTTATTCTTCACTCACACTCTTCTT
CTTCTTTGCTTCCACATTCCTCTACACTTCATCAAACTCATTCAACATCACAAACATCTT
AAACCAGAACAATGAGTTCTCCACTTTCAACAACCTCCTCTCCCAAACCGGACTCGCTTC
CACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTTTCCAACGACGCAATGAGCAT
GTTTTCCTCCCAATCAACCGAAGACAACAAGAAAAGCCTCGGCCTCCACATCGTTCTAGA
CTACTACGACATCAAGAAACTCAGAAGCATTAAATCAGTGATACTCACCACTCTCTTCCA
AGCAAGCGGTCAAGCTAAAGGCCTGCAAGGGTTCGTGAACGCAACCGTTATGAACAACGG
TGACGTTATGTTCGGATCTGCGGTTCGTGGATCCGGCCTTGACTCTAAGCTTATAGACTC
TGTTGCGACACATCCATATAACATCTCGGTGCTTCATATTAGTAGTTACATATCTATCAT
GGATCCCGAAGGTCCTAAAGATCATGGTTCTTCATCTTCACCACTTCCTGTACAACCTCC
TGGTGATGATGATTACGAATATGACGAGCCACCGTCTCCACCTTCCTCTACTACTAAGCC
TTTTGTTGCTGCTGCTACTGCTGCTACCGCTAAGCCACCTTCTTCTGCAAA*GACAACTC
AACAACAAGTGGAGTTCCAGCGAT
AGTA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2FV31TF 796 0 0
GG
ACCTCAACAACTAATCCACTACAATGTCTTCTTCTTATTCTTCACTCACACTCTTCTTCT
TCTTTGCTTCCACATTCCTCTACACTTCATCAAACTCATTCAACATCACAAACATCTTAA
ACCAGAACAATGAGTTCTCCACTTTCAACAACCTCCTCTCCCAAACCGGACTCGCTTCCA
CCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTTTCCAACGACGCAATGAGCATGT
TTTCCTCCCAATCAACCGAAGACAACAAGAAAAGCCTCGGCCTCCACATCGTTCTAGACT
ACTACGACATCAAGAAACTCAGAAGCATTAAATCAGTGATACTCACCACTCTCTTCCAAG
C****GGTCAAGCTAAAGGCCTGCAAGGGTTCGTGAACGCAACCGTTATGAACAACGGTG
ACGTTATGTTCGGATCTGCGGTTCGTGGATCCGGCCTTGACTCTAAGCTTATAGACTCTG
TTGCGACACATCCATATAACATCTCGGTGCTTCATATTAGTAGTTACATATCTATCATGG
ATCCCGAAGGTCCTAAAGATCATGGTTCTTCATCTTCACCACTTCCTGTACAACCTCCTG
GTGATGATGATTACGAATATGACGAGCCACCGTCTCCACCTTCCTCTACTACTAAGCCTT
TTGTTGCTGCTGCTACTGCTGCTACCGCTAAGCCACCTTCTTCTGCAAA*GACAACTCAA
CAACAAGTGGAGTTCCAGCGATTAGTAT*CCTAACCTGGCGTTTGTGTT*GTGATCTCAT
CCTTTTGGTGCTTC

QA 3 796 3 796
DS 

RD RR2FV31JQ 609 0 0
TCTAAGCTTATAGACTCTGTTGCGACACATCCATATAACATCTCGGTGCTTCATATTAGT
AGTTACATATCTATCATGGATCCCGAAGGTCCTAAAGATCATGGTTCTTCATCTTCACCA
CTTCCTGTACAACCTCCTGGTGATGATGATTACGAATATGACGAGCCACCGTCTCCACCT
TCCTCTACTACTAAGCCTTTTGTTGCTGCTGCTACTGCTGCTACCGTTAAGCCACCTTTT
TCTGCAAAAGACAACTCAACAACAAGTGGAGTTCCAGCGATTAGTATTCCTAACCTGGCG
TTTGTGTTTGTGATCTCATCCTTTTGGTGCTTCATGACGGTCTGGTGATGTGATGGCTAA
GATTTGATGAATAAACCAGATCAGCTTTCTGAAAGCCAGAAAAAAAATGGAGATTAGCAG
CAAAGCTTTCAAGCTTTTTTCACACAAAAGAACACTTCAAGCTTCACAAGCTCTATGGAA
TTGGAATAAAGCAACAAGATCCAAAGAAGAAATAAAGTGATTGATGATTCAATAAGGGAT
GAAGAATGTTGTAATAACTCAAAAGTTCTTTATTTATTTGGAAGCTTGGATAAGTTTCTA
AGAGATTTC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2CO73JQ 761 0 0
TCAGAAGCATTAAATCAGTGATACTCACCACTCTCTTCCAAGCAAGCGGTCAAGCTAAAG
GCCTGCAAGGGTTCGTGAACGCAACCGTTATGAACAACGGTGACGTTATGTTCGGATCTG
CGGTTCGTGGATCCGGCCTTGACTCTAAGCTTATAGACTCTGTTGCGACACATCCATATA
ACATCTCGGTGCTTCATATTAGTAGTTACATATCTATCATGGATCCCGAAGGTCCTAAAG
ATCATGGTTCTTCATCTTCACCACTTCCTGTACAACCTCCTGGTGATGATGATTACGAAT
ATGACGAGCCACCGTCTCCACCTTCCTCTACTACTAAGCCTTTTGTTGCTGCTGCTACTG
CTGCTACCGCTAAGCCACCTTTTTCTGCAAAAGACAACTCAACAACAAGTGGAGTTCCAG
CGATTAGTATTCCTAACCTGGCGTTTGTGTTTGTGATCTCATCCTTTTGGTGCTTCATGA
CGGTCTGGTGATGTGATGGCTAAGATTTGATGAATAAACCAGATCAGCTTTCTGAAAGCC
AGAAAAAAA*TGGAGATTAGCAGCAAAGCTTTCAAGCTTTTTTCACACAAAAGAACACTT
CAAGCTTCACAAGCTCTATGGAATTGGAATAAAGCAACAAAATCCAAAGAAGAAATAAAG
TGATTGATGATTCAATAAGGGATGAAGAATGTTGTAATAACTCAAAAGTTCTTTATTTAT
TTGGAAGCTTGGATAAGTTTCTAAGAGATTTCAATTGGCGC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2GR77TF 603 0 0
GG
CATCTCGGTGCTTCATATTAGTAGTTACATATCTATCATGGATCCCGAAGGTCCTAAAGA
TCATGGTTCTTCATCTTCACCACTTCCTGTACAACCTCCTGGTGATGATGATTACGAATA
TGACGAGCCACCGTCTCCACCTTCCTCTACTACTAAGCCTTTTGTTGCTGCTGCTACTGC
TGCTACCGCTAAGCCACCTTCTTCTGCAAAAGACAACTCAACAACAAGTGGAGTTCCAGC
GATTAGTATTCCTAACCTGGCGTTTGTGTTTGTGATCTCATCCTTTTGGTGCTTCATGAC
GGTCTGGTGATGTGATGGCTAAGATTTGATGAATAAACCAGATCAGCTTTCTGAAAGCCA
GAAAAAAAATGGAGATTAGCAGCAAAGCTTTCAAGCTTTTTTCACACAAAAGAACACTTC
AAGCTTCACAAGCTCTATGGAATTGGAATAAAGCAACAAAATCCAAAGAAGAAATAAAGT
GATTGATGATTCAATAAGGGATGAAGAATGTTGTAATAACTCAAAAGTTCTTTATTTATT
TGGAAGCTTGGATAAGTTTCTAAGAGATTTCAATTGGCGCAATAAAATGTTTATTATTTA
A

QA 3 603 3 603
DS 



AS 2 6

CO CL789Contig1 793 2 1 U
GGACCTTGTGTCTCCTTTGAAATGAAGAAACTTTTATGGAGTCTGACTCTCTTTGGTGTC
ATCTTAATCCTCCCTGTTAATGGGGAGTTTGATAAAATGGAGAAGTTCACAGATTTTAAT
GGGACAAATGTGTATCAGACCGAAAATCATGATGTCAATTCCAAAGCAAATGTTACAATG
GTAGGACTCACGCTCATTAAAAATGCTGCTCTGAGATCAGCAGTGTGTCTGGATGGAAGT
CCTGCCGGTTATCATTTTCATCCCGGGTCTGGTTCAGGAGCAAAGAATTGGCTCGTTCAT
TTGGAGGGAGGCGAATGGTGTAGTGACATTGAAAGTTGTGAATACAGCAAAAGAACTCGT
CACGGATCGTCCAAGCATATGGAGAAAAAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGACAAA
GCCTCCGAAAATCCAGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTACTGTGACGGT
GGATCCTTTATGGGAGACAATGAAAATAAGGATGCAAAACTCCAGTTTAGAGGAAAGAAA
ATATGGAGTGCTTTGATGACAGATTTGTTGAGGAATGGAATGAGAGGTGCAAAGCAGGGT
CTGCTCTCTGGATGTTCTGCCGGAGCCTTGCAGCAATATTCCAATGTGATGACTTTAAGC
GTTTTCTCAGTTCTTCCACCAGAACTAAATGTCTGAGTGATGCTGGCTTTTTCGTTGATG
CCACCGATGTCTCTGGAGATCGATCTCTTAGAAGTTATACACCGATGTATACATTACAGA
GTATTACAAACGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW84TF U 1
AF RR2C793TF U 1
BS 1 793 RR2C793TF

RD RR2DW84TF 279 0 0
GGACCTT
GTGTCTCCTTTGAAATGAAGAAACTTTTATGGAGTCTGACTCTCTTTGGTGTCATCTTAA
TCCTCCCTGTTAATGGGGAGTTTGATAAAATGGAGAAGTTCACAGATTTTAATGGGACAA
ATGTGTATCAGACCGAAAATCATGATGTCAATTCCAAAGCAAATGTTACAATGGTAGGAC
TCACGCTCATTAAAAATGCTGCTCTGAGATCAGCAGTGTGTCTGGATGGAAGTCCTGCCG
GTTATCATTTTCATCCCGGGTCTGGTTCAGGA

QA 8 279 8 279
DS 

RD RR2C793TF 793 0 0
GGACCTTGTGTCTCCTTTGAAATGAAGAAACTTTTATGGAGTCTGACTCTCTTTGGTGTC
ATCTTAATCCTCCCTGTTAATGGGGAGTTTGATAAAATGGAGAAGTTCACAGATTTTAAT
GGGACAAATGTGTATCAGACCGAAAATCATGATGTCAATTCCAAAGCAAATGTTACAATG
GTAGGACTCACGCTCATTAAAAATGCTGCTCTGAGATCAGCAGTGTGTCTGGATGGAAGT
CCTGCCGGTTATCATTTTCATCCCGGGTCTGGTTCAGGAGCAAAGAATTGGCTCGTTCAT
TTGGAGGGAGGCGAATGGTGTAGTGACATTGAAAGTTGTGAATACAGCAAAAGAACTCGT
CACGGATCGTCCAAGCATATGGAGAAAAAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGACAAA
GCCTCCGAAAATCCAGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTACTGTGACGGT
GGATCCTTTATGGGAGACAATGAAAATAAGGATGCAAAACTCCAGTTTAGAGGAAAGAAA
ATATGGAGTGCTTTGATGACAGATTTGTTGAGGAATGGAATGAGAGGTGCAAAGCAGGGT
CTGCTCTCTGGATGTTCTGCCGGAGCCTTGCAGCAATATTCCAATGTGATGACTTTAAGC
GTTTTCTCAGTTCTTCCACCAGAACTAAATGTCTGAGTGATGCTGGCTTTTTCGTTGATG
CCACCGATGTCTCTGGAGATCGATCTCTTAGAAGTTATACACCGATGTATACATTACAGA
GTATTACAAACGA

QA 1 793 1 793
DS 



CO CL789Contig2 853 4 11 U
CAGAAGTTTTCTAATAGCAATAGTTCATACTAATTTTTACACGACCAATTTGGTTAGGGA
AATCGTTTTGGTTATTCTACTTTATTTCGGGTTTTTTTTGTTGTAAAGAAGAATGAAAGA
AGGATTTGAATGCCAAAAAAATAGAAACCAAAACAAATCTATCCTTTAGATTAAATTGCG
GCAAGTCTTGTCACAAGGATAAGCACAGTCTATTAATTTTGCTCCTCCTCTTTCGAAAAA
CCAATCTCCCACAGCAACTGCAATCCTCTTGTTCTTAATCGAAGGAGAGTTTTTGGAATA
CCATGTGTCCTGGTTCTCTGTTTGACAATGAGAAAAGCACGAGTTAAGAAACACTCCATT
CTTACGTTGCTCTTTGAATGCACCGAGCAACTTCACCATCTGAGACCTGAACCCTTGAAA
GAACTTGATCTGGGATGCATTGCACTTGGCGATGTTAAATGTACAGTTAGACCAACTTCC
AGTTGGATCTGCAGATTTAGAAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCACGTATCGTATGCAGC
ATTTAGAATAAACAATGGAGCCTTGACTTGGTTTACTAGGTTTTGCGCGAAAAAACACGA
AGTTGGACTACGATGATCTAAACAGCCATCAGGGAGATCGTTTGTAATACTCTGTAATTG
TATTACATCGGTGTATAACTTTCTAAGAGATCGATCTCCAGAGACATCGGTGGCATCAAC
GAAAAAGCCAGCATCACTCAGACATTTAGTTCTGGTGGAAGAACTGAGAAAAAGCTTAAA
GTCATCACATTGGAATATTGCTGCAAGCCCCGGCAGAACATCCAGAGAGCAGACCCTGCT
TTGCCCTCTCATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV36JQ U 1
AF RR2DW84JQ U 1
AF RR2C793JQ U 92
AF RR2CC44JQ U 1
BS 1 270 RR2CC44JQ
BS 271 271 RR2CV36JQ
BS 272 585 RR2CC44JQ
BS 586 586 RR2C793JQ
BS 587 670 RR2CC44JQ
BS 671 671 RR2C793JQ
BS 672 769 RR2CC44JQ
BS 770 770 RR2C793JQ
BS 771 794 RR2CC44JQ
BS 795 795 RR2C793JQ
BS 796 853 RR2CC44JQ

RD RR2CV36JQ 498 0 0
CAGAAGTTTTCTAATAGCAATAGTTCATACTAATTTTTACACGACCAATTTGGTTAGGGA
AATCGTTTTGGTTATTCTACTTTATTTCGGGTTTTTTTTGTTGTAAAGAAAAATGAAAGA
AGGATTTGAATGCCAAAAAAATAAAAACCAAAACAAATCTATCCTTTAAATTAAATTGCG
GCAAGTCTTGTCACAAGGATAAGCACAGTCTATTAATTTTGCTCCTCCTCTTTCGAAAAA
CCAATCTCCCACAGCAACTGCAATCCTCTTGTTCTTAATCGAAGGAGAGTTTTTGGAATA
CCATGTGTCCTGGTTCTCTGTTTGACAATGAGAAAAGCACGAGTTAAAAAACACTCCATT
CTTACGTTGCTCTTTGAATGCACCGAGCAACTTCACCATCTGAAACCTGAACCCTTGAAA
GAACTTGATCTGGGATGCATTGCACTTGGCGATGTTAAATGTACAGTTAGACCAACTTCC
AGTTGGATCTGCAGATTT

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2DW84JQ 584 0 0
CAGAAGTTTTCTAATAGCAATAGTTCATACTAATTTTTACACGACCAATTTGGTTAGGGA
AATCGTTTTGGTTATTCTACTTTATTTCGGGTTTTTTTTGTTGTAAAGAAGAATGAAAGA
AGGATTTGAATGCCAAAAAAATAGAAACCAAAACAAATCTATCCTTTAGATTAAATTGCG
GCAAGTCTTGTCACAAGGATAAGCACAGTCCATTAATTTTGCTCCTCCTCTTTCGAAAAA
CCAATCTCCCACAGCAACTGCAATCCTCTTGTTCTTAATCGAAGGAGAGTTTTTGGAATA
CCATGTGTCCTGGTTCTCTGTTTGACAATGAGAAAAGCACGAGTTAAGAAACACTCCATT
CTTACGTTGCTCTTTGAATGCACCGAGCAACTTCACCATCTGAGACCTGAACCCTTGAAA
GAACTTGATCTGGGATGCATTGCACTTGGCGATGTTAAATGTACAGTTAGACCAACTTCC
AGTTGGATCTGCAGATTTAGAAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCACGTATCGTATGCAGC
ATTTAGAATAAACAATGGAGCCTTGACTTGGTTTACTAGGTTTT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2C793JQ 720 0 0
TTTTTTTTGTTGTAAAGAAGAATGAAAGAAGGATTTGAATGCCAAAAAAATAGAAACCAA
AACAAATCTATCCTTTAGATTAAATTGCGGCAAGTCTTGTCACAAGGATAAGCACAGTCT
ATTAATTTTGCTCCTCCTCTTTCGAAAAACCAATCTCCCACAGCAACTGCAATCCTCTTG
TTCTTAATCGAAGGAGAGTTTTTGGAATACCATGTGTCCTGGTTCTCTGTTTGACAATGA
GAAAAGCACGAGTTAAGAAACACTCCATTCTTACGTTGCTCTTTGAATGCACCGAGCAAC
CTCACCATCTGAGACCTGAACCCTTGAAAGAACTTGATCTGGGATGCATTGCACTTGGCG
ATGTTAAATGTACAGCTAGACCAACTTCCAGTTGGATCTGCAGATTTAGAAGCTAAACTC
TCTTGGATCTGCCACGTATCGTATGCAGCATTTAGAATAAACAATGGAGCCTTGACTTGG
TTTACTAGGTTTTGCGCGAAAAAACACGAAGTTGGACTACGATTATCTAAACAGCCATCA
GGGAGATCGTTTGTAATACTCTGTAATTGTATTACATCGGTGTATAACTTTCTAAGAGAT
CGATCTCCAGAGACATCGGTGGCATCAACGAAAAAGCCAGCATCACTCAGACATTTAGTT
CTGGTGGAAGAACTGAGAAAACGCTTAAAGTCATCACATTGGAATATTGCTGCAAGGC
CT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2CC44JQ 853 0 0
CAGAAGTTTTCTAATAGCAATAGTTCATACTAATTTTTACACGACCAATTTGGTTAGGGA
AATCGTTTTGGTTATTCTACTTTATTTCGGGTTTTTTTTGTTGTAAAGAAGAATGAAAGA
AGGATTTGAATGCCAAAAAAATAGAAACCAAAACAAATCTATCCTTTAGATTAAATTGCG
GCAAGTCTTGTCACAAGGATAAGCACAGTCTATTAATTTTGCTCCTCCTCTTTCGAAAAA
CCAATCTCCCACAGCAACTGCAATCCTCTTCTTCTTAATCGAAGGAGAGTTTTTGGAATA
CCATGTGTCCTGGTTCTCTGTTTGACAATGAGAAAAGCACGAGTTAAGAAACACTCCATT
CTTACGTTGCTCTTTGAATGCACCGAGCAACTTCACCATCTGAGACCTGAACCCTTGAAA
GAACTTGATCTGGGATGCATTGCACTTGGCGATGTTAAATGTACAGTTAGACCAACTTCC
AGTTGGATCTGCAGATTTAGAAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCACGTATCGTATGCAGC
ATTTAGAATAAACAATGGAGCCTTGACTTGGTTTACTAGGTTTTGTGCGAAAAAACACGA
AGTTGGACTACGATGATCTAAACAGCCATCAGGGAGATCGTTTGTAATACTCTGTAATTG
TATTACATCGTTGTATAACTTTCTAAGAGATCGATCTCCAGAGACATCGGTGGCATCAAC
GAAAAAGCCAGCATCACTCAGACATTTAGTTCTGGTGGAAGAACTGAGATAAAGCTTAAA
GTCATCACATTGGA*TATTGCTGCAAGCCCCGGCAGAACATCCAGAGAGCAGACCCTGCT
TTGCCCTCTCATT

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 6

CO CL790Contig1 1104 6 17 U
TTGATGAATGAATATAAACACATAAGTTACAATATCTCAGTACAAATTTCAAATTGTTGA
ACATCATATTTTCATTCACTAATGATAAAGCAATTTGAGTTTTAGTAATGTGAGTAGAAA
TTGTTAAGTATTGATCCACTTCATATCACCATGATCTAGTCTCATATTCAGTTTACTGTC
CTCGACTCTGTTCTGTCTTAAACCATTTTAGAACCCAACAAAACTAACCAAAATCCCGAG
AACCAGAACAGCACCAAAACTCAAACCGGTGTTAGAAGCAGAAGTAGGTGGTTCAACTTC
ATCAGCTGCTGCCATTTTCTTCTTACCAGCATTCCCAGGAGCCGGAGCAGGAGAACCATC
TTCTGATGAGGCTGATGCAGGTGCGGCTTCTGGAGCTGCACCAGGAGGAGAATCTGCGTA
ATCCTCCTCCTCAGATGGTCCAGGAGCTGGAGTGGTTGCAGCCTTCTTGGGAGATGGAGT
CGGTGGTGATGACATGGGTGGTGGTGGAGGAACGTTAACAGGAGATCCGAGTCCAGGAGC
CACAATGGGCATGCTGATTTGGATCACAGAGAGATTGTACGGGTTGCGGAACACGGTTGT
GATGTATTCAGCGGTTTGAGGAGCGCCTTTCACACCAGACCCAAAGTAAATCTTTCCGTT
AGTTTTGGTGCAGTTGAGGAAACCGTTTTGCTGCTGGCCCAAACCGGTAGATTGGTAGAG
GGTAGTGAGCAATGTGCTCCTGTCCTTGAGTGCCTTGAGCTTGAGTTCATCAAAGTAGTC
AAGAACTACATGATTCATAAGAACGTTCTTGAGCTCCTCCTCGGGTCTACCAGAAATGGA
ACCGATAGCATCGTTGCTAAGAGCCAGCACGGTAATTGTCTGACGTTTGTTGATAATTGG
TGTAAGCTCGGTCTTGGCGAAAAGCTCGATCATGGTGCTGAATTCAGGGTATTTCTCGAG
TGCTCGGGTTATGTTAACCGCTGATACAATGGAAGAAACACCTAATAAGATGGTGAGACA
GAGGAGAGAAGAGGAAGCCTTGAGACCCATTTTTCGGGTGTTTATTTTTATCACCCTTAT
TTTTCTTGAAATCTCAATGCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D131JQ U 1
AF RR2GJ75JQB U 112
AF RR2AF08JQ U 112
AF RR2AF08TF C 346
AF RR2CB47TF C 477
AF RR2D131TF C 484
BS 1 124 RR2D131JQ
BS 125 125 RR2AF08JQ
BS 126 308 RR2D131JQ
BS 309 309 RR2AF08JQ
BS 310 368 RR2D131JQ
BS 369 369 RR2AF08JQ
BS 370 457 RR2D131JQ
BS 458 458 RR2AF08JQ
BS 459 552 RR2D131JQ
BS 553 553 RR2AF08JQ
BS 554 671 RR2D131JQ
BS 672 717 RR2AF08JQ
BS 718 718 RR2GJ75JQB
BS 719 736 RR2AF08JQ
BS 737 737 RR2GJ75JQB
BS 738 942 RR2AF08JQ
BS 943 1104 RR2AF08TF

RD RR2D131JQ 671 0 0
TTGATGAATGAATATAAACACATAAGTTACAATATCTCAGTACAAATTTCAAATTGTTGA
ACATCATATTTTCATTCACTAATGATAAAGCAATTTGAGTTTTAGTAATGTGAGTAGAAA
TTGTCAAGTATTGATCCACTTCATATCACCATGATCTAGTCTCATATTCAGTTTACTGTC
CTCGACTCTGTTCTGTCTTAAACCATTTTAGAACCCAACAAAACTAACCAAAATCCCGAG
AACCAGAACAGCACCAAAACTCAAACCGGTGTTAGAAGCAGAAGTAGGTGGTTCAACTTC
ATCAGCTGATGCCATTTTCTTCTTACCAGCATTCCCAGGAGCCGGAGCAGGAGAACCATC
TTCTGATGGGGCTGATGCAGGTGCGGCTTCTGGAGCTGCACCAGGAGGAGAATCTGCGTA
ATCCTCCTCCTCAGATGGTCCAGGAGCTGGAGTGGTTACAGCCTTCTTGGGAGATGGAGT
CGGTGGTGATGACATGGGTGGTGGTGGAGGAACGTTAACAGGAGATCCGAGTCCAGGAGC
CACAATGGGCATACTGATTTGGATCACAGAGAGATTGTACGGGTTGCGGAACACGGTTGT
GATGTATTCAGCGGTTTGAGGAGCGCCTTTCACACCAGACCCAAAGTAAATCTTTCCGTT
AGTTTTGGTGC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2GJ75JQB 755 0 0
GAGTAGAAATTGTTAAGTATTGATCCACTTCATATCACCATGATCTAGTCTCATATTCAG
TTTACTGTCCTCGACTCTGTTCTGTCTTAAACCATTTTAGAACCCAACAAAACTAACCAA
AATCCCGAGAACCAGAACAGCACCAAAACTCAAACCGGTGTTAGAAGCAGAAGTAGGTGG
TTCAACTTCATCAGCTGCTGCCATTTTCTTCTTACCAGCATTCCCAGGAGCCGGAGCAGG
AGAACCATCTTCTGATGGGGCTGATGCAGGTGCGGCTTCTGGAGCTGCACCAGGAGGAGA
ATCTGCGTAATCCTCCTCCTCAGATGGTCCAGGAGCTGGAGTGGTTGCAGCCTTCTTGGG
AGATGGAGTCGGTGGTGATGACATGGGTGGTGGTGGAGGAACGTTAACAGGAGATCCGAG
TCCAGGAGCCACAATGGGCATGCTGATTTGGATCACAGAGGGATTGTACGGGTTGCGGAA
CACGGTTGTGATGTATTCAGCGGTTTGAGGAGCGCCTTTCACACCAGACCCAAAGTAAAT
CTTTCCGTTAGTTTTGGTGCAGTTGAGGAAACCGTTTTGCTGCTGGCCCAAACCGGTAGA
TTGGTAGAGGGTAGTGAGCAATGTGCTCCTGTCCTTGAGTGCCTTGAGCTTGAGTTCATC
AAAGTAGTCAAGAACTACATGATTCATAAGAACGTTCTTGAGCTCCTCCTCGGGTCTACC
AGAAATGGAACCGATAGCATCGTTGCTAAGAGCCA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2AF08JQ 831 0 0
GAGTAGAAATTGTTAAGTATTGATCCACTTCATATCACCATGATCTAGTCTCATATTCAG
TTTACTGTCCTCGACTTTGTTCTGTCTTAAACCATTTTAGAACCCAACAAAACTAACCAA
AAACCCGAGAACCAGAACAGCACCAAAACTCAAACCGGTGTTAGAAGCAGAAGTAGGTGG
TTCAACTTCATCAGCTGCTGCCATTTTCTTCTTACCAGCATTCCCAGGAGCCGGAGCAGG
AGAACCATCTTCTGATGAGGCTGATGCAGGTGCGGCTTCTGGAGCTGCACCAGGAGGAGA
ATCTGCGTAATCCTCCTCCTCAGATGGTCCAGGAGCTGGAGTGGTTGCAGCCTTCTTGGG
AGATGGAGTCGGTGGTGATGACATGGGTGGTGG*GGAGGAATGTTAACAGGAGATCCGAG
TCCAGGAGCCACAATGGGCATGCTGATTTGGATCACAGAGAGATTGTACGGGTTGCGGAA
CACGGTTGTGATGTATTCAGCGGTCTGAGGAGAGCCTT*CACACCAGACCCGAAGTAAAT
CTTTCCGTTAGTTTTGGTGCAGTTGAGGAAACCGTTTTGCTGCTGGCCCAAACCGGTAGA
TTGGTAAAGGGTAGTGAGCAATGTGATCCTGTCCTTGAGTGCCTTGAGCTTGAGTTCATC
AAAGTAGTCAAGAACTACATGATTCATAAGAACGTTCTTGAGCTCCTCCTCGGGTCTACC
AGAAATGGAACCGATAGCATCGTTGCTAAGAGCCAGCACGGTAATTGTCTGACGTTTGTT
GATAATTGGTGTAAGCTCGGTCTTGGCGAAAAGCTCGATCATGGTGCTGAA

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR2AF08TF 759 0 0
AGCAGGAGAACCATCTTCTGATGAGGCTGATGCAGGTGCGGCTTCTGGAGCTGCACCAGG
AGGAGAATCTGCGTAATCCTCCTCCTCAGATGGTCCAGGAGCTGGAGTGGTTGCAGCCTT
CTTGGGAGATGGAGTCGGTGGTGATGACATGGGTGGTGG*GGAGGAATGTTAACAGGAGA
TCCGAGTCCAGGAGCCACAATGGGCATGCTGATTTGGATCACAGAGAGATTGTACGGGTT
GCGGAACACGGTTGTGATGTATTCAGCGGTCTGAGGAGAGCCTT*CACACCAGACCCGAA
GTAAATCTTTCCGTTAGTTTTGGTGCAGTTGAGGAAACCGTTTTGCTGCTGGCCCAAACC
GGTAGATTGGTAAAGGGTAGTGAGCAATGTGATCCTGTCCTTGAGTGCCTTGAGCTTGAG
TTCATCAAAGTAGTCAAGAACTACATGATTCATAAGAACGTTCTTGAGCTCCTCCTCGGG
TCTACCAGAAATGGAACCGATAGCATCGTTGCTAAGAGCCAGCACGGTAATTGTCTGACG
TTTGTTGATAATTGGTGTAAGCTCGGTCTTGGCGAAAAGCTCGATCATGGTGCTGAATTC
AGGGTATTTCTCGAGTGCTCGGGTTATGTTAACCGCTGATACAATGGAAGAAACACCTAA
TAAGATGGTGAGACAGAGGAGAGAAGAGGAAGCCTTGAGACCCATTTTTCGGGTGTTTAT
TTTTATCACCCTTATTTTTCTTGAAATCTCAATGCCTCC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2CB47TF 628 0 0
GAGTCGGTGGTGATGACATGGGTGGTGGTGGAGGAATGTTAACAGGAGATCCGAGTCCAG
GAGCCACAATGGGCATGCTGATTTGGATCACAGAGAGATTGTACGGGTTGCGGAACACGG
TTGTGATGTATTCAGCGGTTTGAGGAGCGCCTTTCACACCAGACCCAAAGTAAATCTTTC
CGTTAGTTTTGGTGCAGTTGAGGAAACCGTTTTGCTGCTGGCCCAAACCGGTAGATTGGT
AGAGGGTAGTGAGCAATGTGCTCCTGTCCTTGAGTGCCTTGAGCTTGAGTTCATCAAAGT
AGTCAAGAACTACATGATTCATAAGAACGTTCTTGAGCTCCTCCTCGGGTCTACCAGAAA
TGGAACCGATAGCATCGTTGCTAAGAGCCAGCACGGTAATTGTCTGACGTTTGTTGATAA
TTGGTGTAAGCTCGGTCTTGGCGAAAAGCTCGATCATGGTGCTGAATTCAGGGTATTTCT
CGAGTGCTCGGGTTATGTTAACCGCTGATACAATGGAAGAAACACCTAATAAGATGGTGA
GACAGAGGAGAGAAGAGGAAGCCTTGAGACCCATTTTTCGGGT*TTTATTTTTATCACCC
TTATTTTTCTTGAAATCTCAATGCCTCC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2D131TF 621 0 0
TGGTGATGACATGGGTGGTGGTGGAGGAACGTTAACAGGAGATCCGAGTCCAGGAGCCAC
AATGGGCATACTGATTTGGATCACAGAGAGATTGTACGGGTTGCGGAACACGGTTGTGAT
GTATTCAGCGGTTTGAGGAGCGCCTTTCACACCAGACCCAAAGTAAATCTTTCCGTTAGT
TTTGGTGCAGTTGAGGAAACCGTTTTGCTGCTGGCCCAAACCGGTAGATTGGTAGAGGGT
AGTGAGCAATGTGCTCCTGTCCTTGAGTGCCTTGAGCTTGAGTTCATCAAAGTAGTCAAG
AACTACATGATTCATAAGAACGTTCTTGAGCTCCTCCTCGGGTCTACCAGAAATGGAACC
GATAGCATCGTTGCTAAGAGCCAGCACGGTAATTGTCTGACGTTTGTTGATAATTGGTGT
AAGCTCGGTCTTGGCGAAAAGCTCGATCATGGTGCTGAATTCAGGGTATTTCTCGAGTGC
TCGGGTTATGTTAACCGCTGATACAATGGAAGAAACACCTAATAAGATGGTGAGACAGAG
GAGAGAAGAGGAAGCCTTGAGACCCATTTTTCGGGTGTTTATTTTTATCACCCTTATTTT
TCTTGAAATCTCAATGCCTCC

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 5

CO CL791Contig1 790 5 10 U
AAGAGAGTACTGAGATCTAAAATTGAAAGACATTGTGATTCCAAGATCTTTTGTGCATGT
GCACGTGACTGTGTGTGACACAGAGTGCAGCAGCACGTGACATCTTAAGAATCCACCCAA
AACAAGTTTGGTGACAAGGTTTTCTTTTCTCAAAGAAAATAAAAGACATGAAAAACACTG
CAACAAAAGGACAAGAACTAGAAACAAACAAAAAGCAAACTGAGAAGAAATCTGCTCTGG
CCAGCTTCACTCGACCATCTCTCATTCTGGATTCCGAGCCAAGAAGAAGTACATTGGCGT
GAATATCTCCCTCCTTCCACCGTCGACTAATCCTTCTGCGGCCTTCTCCAGAAAATCTGA
AACCCTTTGGCTTCCTTTAGGCGCAAGCCTTATGTACTCAAGGACCTTGACCATGTTTTT
AGTTATGAACCGTCCAACAGCTGTTAGGCGGAAGCTACTGAGCGAAAAGTGGTTTTTGTC
CAGAGGTAAGTACCATGGGACTGGCGAGTCCTCCGCCAGATCCTTTTCCCATATCACTTC
AAAACCGGCCTGCTTCAAGGCTTCGAGGCATTTTGAAGTCAGCCTAATGTCAGGGAGACC
ATCTCCGATTTCTATCTCTGCCTTTATTTTCTGATGCTGGGCGTTAGCAGGGTCAAATGC
ATCAGTCATGCACCACTCATAGGCAGCAAAACATTGTCCGGGCTTTAGCACTCTGAAGAT
CTCTTTGTAGAATCCATATGCATCAGTGCGTGGCAGTTGCCTCTATGGCATAACAGCATC
AAAAGTGTTT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM41JQ U 88
AF RR2FJ46JQ U 87
AF RR2AM41TF C 21
AF RR2ER27JQ U 1
AF RR2CM70JQ U 2
BS 1 174 RR2ER27JQ
BS 175 175 RR2AM41JQ
BS 176 270 RR2ER27JQ
BS 271 271 RR2AM41JQ
BS 272 384 RR2ER27JQ
BS 385 385 RR2FJ46JQ
BS 386 387 RR2ER27JQ
BS 388 388 RR2FJ46JQ
BS 389 742 RR2ER27JQ
BS 743 790 RR2CM70JQ

RD RR2AM41JQ 209 0 0
CAGCAGCACGTGACATCTTAAGAATCCACCCAAAACAAGTTTGGTGACAAGGTTTTCTTT
TCTCAAAGAAAATAAAAGACATGAAAAACACTGCAACAAAAGGACAAGAACTAGAAACAA
ACAAAAAGCAAACTGAGAAGAAATCTGCTCTGGCCAGCTTCACTCGACCATCTCTCATTC
TGGATTCCGAGCCAAGAAGAAGTACATTG

QA 1 209 1 209
DS 

RD RR2FJ46JQ 394 0 0
GCAGCAGCACGTGACATCTTAAGAATCCACCCAAAACAAGTTTGGTGACAAGGTTTTCTT
TTCTCAAAAAAAATAAAAAACATGAAAAACACTGCAACAAAAGGACAAGAACTAAAAACA
AACAAAAAGCAAACTGAAAAAAAATCTGCTCTGGCCAGCTTCACTCGACCATCTCTCATT
CTGGCTTCCGAGCCAAGAAAAAATACATTGGCGTGAATATCTCCCTCCTTCCACCGTCCA
CTAATCCTTCTGCGGCCTTCTCCAAAAAATCTGAAACCCTTTGGCTTCCTTTAGGCGCAA
GCCTTATGTACTCAAGGACCTTGACCATGTTTTTAGTTATGAACCGTCCAACAGCTGTTA
GGCGGAAGCTACTGAGCGAAAAGTGGTTTT
AGTC

QA 1 390 1 390
DS 

RD RR2AM41TF 504 0 0
AATTGAAAGACATTGTGATTCCAAGGTCTTTTGTGCATGTGCACGTGACTGTGTGTGACA
CAGAGTGCAGCAGCACGTGACATCTTAAGAATCCACCCAAAACAAGTTTGGTGACAAGGT
TTTCTTTTCTCAAAGAAAATAAAAGACATGAAAAACACTGCAACAAAAGGACAAGAACTA
GAAACAAACAAAAAGCAAACTGAGAAGAAATCTGCTCTGGCCAGCTTCACTCGACCATCT
CTCATTCTGGATTCCGAGCCAAGAAGAAGTACATTGGCGTGAATATCTCCCTCCTTCCAC
CGTCGACTAATCCTTCTGCGGCCTTCTCCAGAAAATCTGAAACCCTTTGGCTTCCTTTAG
GCGCAAGCCTTATGTACTCAAGGACCTTGACCATGTTTTTAGTTATGAACCGTCCAACAG
CTGTTAGGCGGAAGCTACTGAGCGAAAAGTGGTTTTTGTCCAGAGGTAAGTACCATGGGA
CTGGCGAGTCCTCCGCCAGATCC
C

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2ER27JQ 742 0 0
AAGAGAGTACTGAGATCTAAAATTGAAAGACATTGTGATTCCAAGATCTTTTGTGCATGT
GCACGTGACTGTGTGTGACACAGAGTGCAGCAGCACGTGACATCTTAAGAATCCACCCAA
AACAAGTTTGGTGACAAGGTTTTCTTTTCTCAAAGAAAATAAAAGACATGAAAA*CACTG
CAACAAAAGGACAAGAACTAGAAACAAACAAAAAGCAAACTGAGAAGAAATCTGCTCTGG
CCAGCTTCACTCGACCATCTCTCATTCTGGCTTCCGAGCCAAGAAGAAGTACATTGGCGT
GAATATCTCCCTCCTTCCACCGTCGACTAATCCTTCTGCGGCCTTCTCCAGAAAATCTGA
AACCCTTTGGCTTCCTTTAGGCGCGAGTCTTATGTACTCAAGGACCTTGACCATGTTTTT
AGTTATGAACCGTCCAACAGCTGTTAGGCGGAAGCTACTGAGCGAAAAGTGGTTTTTGTC
CAGAGGTAAGTACCATGGGACTGGCGAGTCCTCCGCCAGATCCTTTTCCCATATCACTTC
AAAACCGGCCTGCTTCAAGGCTTCGAGGCATTTTGAAGTCAGCCTAATGTCAGGGAGACC
ATCTCCGATTTCTATCTCTGCCTTTATTTTCTGATGCTGGGCGTTAGCAGGGTCAAATGC
ATCAGTCATGCACCACTCATAGGCAGCAAAACATTGTCCGGGCTTTAGCACTCTGAAGAT
CTCTTTGTAGAATCCATATGCA

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2CM70JQ 789 0 0
AGAGAGTACTGAGATCTAAAATTGAAAGACATTGTGATTCCAAGATCTTTTGTGCATGTG
CACGTGACTGTGTGTGACACAGAGTGCAGCAGCACGTGACATCTTAAGAATCCACCCAAA
ACAAGTTTGGTGACAAGGTTTTCTTTTCTCAAAGAAAATAAAAGACATGAAAA*CACTGC
AACAAAAGGACAAGAACTAGAAACAAACAAAAAGCAAACTGAGAAGAAATCTGCTCTGGC
CAGCTTCACTCGACCATCTCTCATTCTGGCTTCCGAGCCAAGAAGAAGTACATTGGCGTG
AATATCTCCCTCCTTCCACCGTCGACTAATCCTTCTGCGGCCTTCTCCAGAAAATCTGAA
ACCCTTTGGCTTCCTTTAGGCGCGAGTCTTATGTACTCAAGGACCTTGACCATGTTTTTA
GTTATGAACCGTCCAACAGCTGTTAGGCGGAAGCTACTGAGCGAAAAGTGGTTTTTGTCC
AGAGGTAAGTACCATGGGACTGGCGAGTCCTCCGCCAGATCCTTTTCCCATATCACTTCA
AAACCGGCCTGCTTCAAGGCTTCGAGGCATTTTGAAGTCAGCCTAATGTCAGGGAGACCA
TCTCCGATTTCTATCTCTGCCTTTATTTTCTGATGCTGGGCGTTAGCAGGGTCAAATGCA
TCAGTCATGCACCACTCATAGGCAGCAAAACATTGTCCGGGCTTTAGCACTCTGAAGATC
TCTTTGTAGCATCCATATGCATCAGTGCGTGGCAGTTGCCTCTATGGCATAACAGCATCA
AAAGTGTTT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 8

CO CL792Contig1 1015 8 30 U
GGATCATCATCAATCACTACTACAAGATCTCCTCTGTTTTTTTTTTTGCTTCTTCTCCCA
ATCGTCATTTGTTAGGTGGCTAAAGATGAACGACGCAGATGTGTCTAGACAGATCCAGCA
GATGGTGAGGTTTATCCGCCAGGAAGCCGAAGAAAAGGCCAATGAGATCTCCGTCTCCGC
TGAAGAAGAATTCAACATAGAGAAGTTGCAGCTGGTCGAGGCAGAGAAGAAGAAGATTAG
ACAGGAGTATGAGAAGAAGGAGAAGCAGGTCGATGTCCGAAGGAAGATTGATTACTCAAT
GCAATTGAACGCATCGAGGATCAAAGTTCTGCAAGCGCAAGATGACATTGTCAATGCAAT
GAAAGAAGAGGCTGCAAAGCAACTCCTCAAAGTCAGCGAACATGGCTTCTTCAACCATCA
TCACCATCAGTACAAACATCTCTTGAAGCATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTAGACTGAA
AGAGCCTTCAGTGTTACTGCGTTGTCGCCAAGAAGACCTTCACATAGTGGAGTCGATGCT
TGACGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAGCAAAGGTTCATGCTCCTGAGATTATAGT
TGACAAGGACATTTTCCTTCCTCCTGCTCCTTCCGAAGATGATCCTCATGCTCCTTTCTG
TGCTGGAGGAGTGGTGCTGGCTTCTCGTGATGGGAAAATCGTGTGTGAAAACACTCTTGA
TGCGAGGTTGGAGGTCGCTTTCCGCAAGAAACTCCCTGAGATTCGAAAGGCGCTCTTTGG
CCAGGTTGGGGCAGCTTGATTGATGATGAGTGACTCCAACTTTGAACCATGAGAGCAGGT
AATGGCTCCATTATCTACCATCCATTCTTTCTATTACCAATTTTAAACTCTGTGTTATAT
GTTAATGGGCCTTTGCTTTTTGTCAATGGACCTTGGCCTACCTTGGCCTTTGTGTGGTGA
TGTTATAAATAAATACTTTGTTGAATGTACCTTTTCTTCTCATAAATGTTTCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU05TF U 1
AF RR2CE51TF U 52
AF RR2FB88TF U 59
AF RR2CO96TF U 213
AF RR2CE51JQ C 153
AF RR2FB88JQ C 188
AF RR2CO96JQ C 213
AF RR2FU05JQ C 333
BS 1 105 RR2FU05TF
BS 106 106 RR2CE51TF
BS 107 150 RR2FU05TF
BS 151 151 RR2CE51TF
BS 152 211 RR2FU05TF
BS 212 212 RR2CE51TF
BS 213 243 RR2FU05TF
BS 244 244 RR2CE51TF
BS 245 267 RR2FU05TF
BS 268 268 RR2CE51TF
BS 269 699 RR2FU05TF
BS 700 700 RR2CE51TF
BS 701 710 RR2FU05TF
BS 711 711 RR2FB88TF
BS 712 722 RR2FU05TF
BS 723 728 RR2CE51TF
BS 729 729 RR2FB88TF
BS 730 733 RR2CE51TF
BS 734 734 RR2FB88TF
BS 735 750 RR2CE51TF
BS 751 751 RR2FB88TF
BS 752 762 RR2CE51TF
BS 763 817 RR2FB88TF
BS 818 838 RR2CO96TF
BS 839 839 RR2CE51JQ
BS 840 886 RR2CO96TF
BS 887 887 RR2CE51JQ
BS 888 951 RR2CO96TF
BS 952 987 RR2CE51JQ
BS 988 1015 RR2CO96JQ

RD RR2FU05TF 722 0 0
GGATCATCATCAATCACTACTACAAGATCTCCTCTGTTTTTTTTTTTGCTTCTTCTCCCA
ATCGTCATTTGTTAGGTGGCTAAAGATGAACGACGCAGATGTGTCCAGACAGATCCAGCA
GATGGTGAGGTTTATCCGCCAGGAAGCCGAGGAAAAGGCCAATGAGATCTCCGTCTCCGC
TGAAGAAGAATTCAACATAGAGAAGTTGCAGTTGGTCGAGGCAGAGAAGAAGAAGATTAG
ACAAGAGTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGTCGATGTCCGAAGGAAGATTGATTACTCAAT
GCAATTGAACGCATCGAGGATCAAAGTTCTGCAAGCGCAAGATGACATTGTCAATGCAAT
GAAAGAAGAGGCTGCAAAGCAACTCCTCAAAGTCAGCGAACATGGCTTCTTCAACCATCA
TCACCATCAGTACAAACATCTCTTGAAGCATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTAGACTGAA
AGAGCCTTCAGTGTTACTGCGTTGTCGCCAAGAAGACCTTCACATAGTGGAGTCGATGCT
TGACGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAGCAAAGGTTCATGCTCCTGAGATTATAGT
TGACAAGGACATTTTCCTTCCTCCTGCTCCTTCCGAAGATGATCCTCATGCTCCTTTCTG
TGCTGGAGGAGTGGTGCTGGCTTCTCGTGATGGGAAAATTGTGTGTGAAA*CACTCTTGA
TG

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2CE51TF 711 0 0
GGCTCCCCA
ATCGTCATTTGTTAGGTGGCTAAAGATGAACGACGCAGATGTGTCTAGACAGATCCAGCA
GATGGTGAGGTTTATCCGCCAGGAAGCCGAAGAAAAGGCCAATGAGATCTCCGTCTCCGC
TGAAGAAGAATTCAACATAGAGAAGTTGCAGCTGGTCGAGGCAGAGAAGAAGAAGATTAG
ACAGGAGTATGAGAAGAAGGAGAAGCAGGTCGATGTCCGAAGGAAGATTGATTACTCAAT
GCAATTGAACGCATCGAGGATCAAAGTTCTGCAAGCTCAAGATGACATTGTCAATGCAAT
GAAAGAAGAGGCTGCAAAGCAACTCCTCAAAGTCAGCGAACATGGCTTCTTCAACCATCA
TCACCATCAGTACAAACATCTCTTGAAGCATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTAGACTGAA
AGAGCCTTCAGT*TTACTGCGTTGTCGCCAAGAAGACCTTCACATAGTGGAGTCGATGCT
TGACGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAGCAAAGGTTCATGCTCCTGAGATTATAGT
TGACGAGGACATTTTCCTTCCTCCTGCTCCTTCCGAAGATGATCCTCATGCTCCTTTCTG
TGCTGGAGGAGTGGTGCTGGCTTCTCGTGATGGGAAAATCGTGTGTGAAA*CACTCTTGA
TGCGAGGT*GGAGTTCGCTTTCCGCAAGAA*CTCCCTGAGAT

QA 10 711 10 711
DS 

RD RR2FB88TF 759 0 0
GG
ATCGTCATTTGTTAGGTGGCTAAAGATGAACGACGCAGATGTGTCTAGACAGATCCAGCA
GATGGTGAGGTTTATCCGCCAGGAAGCCGAAGAAAAGGCCAATGAGATCTCCGTCTCCGC
TGAAGAAGAATTCAACATAGAGAAGTTGCAGCTGGTCGAGGCAGAGAAGAAGAAGATTAG
ACAGGAGTATGAGAAGAAGGAGAAGCAGGTCGATGTCCGAAGGAAGATTGATTACTCAAT
GCAATTGAACGCATCGAGGATCAAAGTTCTGCAAGCTCAAGATGACATTGTCAATGCAAT
GAAAGAAGAGGCTGCAAAGCAACTCCTCAAAGTCAGCGAACATGGCTTCTTCAACCATCA
TCACCATCAGTACAAACATCTCTTGAAGCATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTAGACTGAA
AGAGCCTTCAGTGTTACTGCGTTGTCGCCAAGAAGACCTTCACATAGTGGAGTCGATGCT
CGACGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAGCAAAGGTTCATGCTCCTGAGATTATAGT
TGACAAGGACATTTTCCTTCCTCCTGCTCCTTCCGAAGATGATCCTCATGCTCCTTTCTG
TGCTGGAGGAGTGGTGCTGGCTTCTCGTGATGGGAAAATCGTGTGTGAAAACACTCTTGA
TGCGAGGTTGGAGGTCGCTTTCCGCAAGAAACTCCCTGAGATTCGAAAGGCGCTCTTTGG
CCAGGTTGGGGCAGCTTGATTGATGATGAGTGACTCC

QA 3 759 3 759
DS 

RD RR2CO96TF 739 0 0
G
GGTCGAGGCAGAGAAGAAGAAGATTAGACAAGAGTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGTCGA
TGTCCGAAGGAAGATTGATTACTCAATGCAATTGAACGCATCGAGGATCAAAGTTCTGCA
AGCGCAAGATGACATTGTCAATGCAATGAAAGAAGAGGCTGCAAAGCAACTCCTCAAAGT
CAGCGAACATGGCTTCTTCAACCATCATCACCATCAGTACAAACATCTCTTGAAGCATCT
CATTGTTCAGTGTTTGCTTAGACTGAAAGAGCCTTCAGTGTTACTGCGTTGTCGCCAAGA
AGACCTTCACATAGTGGAGTCGATGCTTGACGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAGC
AAAGGTTCATGCTCCTGAGATTATAGTTGACAAGGACATTTTCCTTCCTCCTGCTCCTTC
CGAAGATGATCCTCATGCTCCTTTCTGTGCTGGAGGAGTGGTGCTGGCTTCTCGTGATGG
GAAAATTGTGTGTGAAAACACTCTTGATGCGAGGTTGGAGGTCGCTTTCCGCAAGAAACT
CCCTGAGATTCGAAAGGCGCTCTTTGGCCAGGTTGGGGCAGCTTGATTGATGATGAGTGA
CCCCAACTTTGAACCATGAGAGCAG*TAATGGCTCCATTATCTACCATCCATTCTTTCTA
TTACCAATTTTAA*CTCTGTGTTATATGTTAATGGGCCTTTGCTTTTTGTCAATGGACCT
TGGCCTACCTTGGCCTTT

QA 2 739 2 739
DS 

RD RR2CE51JQ 836 0 0
AAAAGGCCAATGAGATCTCTGTCTCCGCTGAAGAAGAATTCAACATAGAGAAGTTGCAGC
TG*TCGAGGCAGAGAAGAAGAAGATTAGACAGGAGTATGAGAAGAAGGAGAAGCAGGTCG
ATGTCCGAAGGAAGATTGATTACTCAATGCAATTGAACGCATCGAGGATCAAAGTTCTGC
AAGCTCAAGATGACATTGTCAATGCAATGAAAGAAGAGGCTGCAAAGCAACTCCTCAAAG
TCAGCGAACATGGCTTCTTCAACCATCATCACCATCAGTACAAACATCTCTTGAAGCATC
TCATTGTTCAGTGTTTGCTTAGACTGAAAGAGCCTTCAGT*TTACTGCGTTGTCGCCAAG
AAGACCTTCACATAGTGGAGTCGATGCTTGACGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAG
CAAAGGTTCATGCTCCTGAGATTATAGTTGACGAGGACATTTTCCTTCCTCCTGCTCCTT
CCGAAGATGATCCTCATGCTCCTTTCTGTGCTGGAGGAGTGGTGCTGGCTTCTCGTGATG
GGAAAATCGTGTGTGAAAACACTCTTGATGCGAGGTTGGAGTTCGCTTTCCGCAAGAAAC
TCCCTGAGATTCGAAAGGCGCTCTTTGGCCAGGTTGGGGCAGCTTGGTTGATGATGAGTG
ACTCCAGCTTTGAACCATGAGAGCAGGTAATGGCTCCATTATCTACCATCCATTCTTTCT
ATTACCAATTTTAAACTCTGTGTTATATGTTAATGGGCCTTTGCTTTTTGTCAATGGACC
TTGGCCTACCTTGGCCTTTGTGTGGTGATGTTATAAATAAATACTTTGTTGAATG
T

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR2FB88JQ 788 0 0
GAATTCAACATAGAGAAGTTGCAGCTGGTCGAGGCAGAGAAGAAGAAGATTAGACAGGAG
TATGAGAAGAAGGAGAAGCAGGTCGATGTCCGAAGGAAGATTGATTACTCAATGCAATTG
AACGCATCGAGGATCAAAGTTCTGCAAGCTCAAGATGACATTGTCAATGCAATGAAAGAA
GAGGCTGCAAAGCAACTCCTCAAAGTCAGCGAACATGGCTTCTTCAACCATCATCACCAT
CAGTACAAACATCTCTTGAAGCATCTCATTGTTCAGTGTTTGCTTAGACTGAAAGAGCCT
TCAGTGTTACTGCGTTGTCGCCAAGAAGACCTTCACATAGTGGAGTCGATGCTCGACGAT
GCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAGCAAAGGTTCATGCTCCTGAGATTATAGTTGACAAG
GACATTTTCCTTCCTCCTGCTCCTTCCGAAGATGATCCTCATGCTCCTTTCTGTGCTGGA
GGAGTGGTGCTGGCTTCTCGTGATGGGAAAATCGTGTGTGAAAACACTCTTGATGCGAGG
TTGGAGGTCGCTTTCCGCAAGAAACTCCCTGAGATTCGAAAGGCGCTCTTTGGCCAGGTT
GGGGCAGCTTGATTGATGATGAGTGACTCCAGCTTTGAACCATGAGAGCAGGTAATGGCT
CCATTATCTACCATCCATTCTTTCTATTACCAATTTTAAATTCTGTGTTATATGTTAATG
GGCCTTTGCTTTTTGTCAATGGACCTTGGCCTACCTTGGCCTTTGTGTGGTGATGTTATA
AATAAATA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2CO96JQ 803 0 0
G
GGTCGAGGCAGAGAAGAAGAAGATTAGACAAGAGTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGTCGA
TGTCCGAAGGAAGATTGATTACTCAATGCAATTGAACGCATCGAGGATCAAAGTTCTGCA
AGCGCAAGATGACATTGTCAATGCAATGAAAGAAGAGGCTGCAAAGCAACTCCTCAAAGT
CAGCGAACATGGCTTCTTCAACCATCATCACCATCAGTACAAACATCTCTTGAAGCATCT
CATTGTTCAGTGTTTGCTTAGACTGAAAGAGCCTTCAGTGTTACTGCGTTGTCGCCAAGA
AGACCTTCACATAGTGGAGTCGATGCTTGACGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAGC
AAAGGTTCATGCTCCTGAGATTATAGTTGACAAGGACATTTTCCTTCCTCCTGCTCCTTC
CGAAGATGATCCTCATGCTCCTTTCTGTGCTGGAGGAGTGGTGCTGGCTTCTCGTGATGG
GAAAATTGTGTGTGAAAACACTCTTGATGCGAGGTTGGAGGTCGCTTTCCGCAAGAAACT
CCCTGAGATTCGAAAGGCGCTCTTTGGCCAGGTTGGGGCAGCTTGATTGATGATGAGTGA
CCCCAACTTTGAACCATGAGAGCAGGTAATGGCTCCATTATCTACCATCCATTCTTTCTA
TTACCAATTTTAAACTCTGTGTTATATGTTAATGGGCCTTTGCTTTTTGTCAATGGACCT
TGGCCTACCTTGGCCTTTGTGTGGTGATGTTATAAATAAATACTTTGTTGAATGTACCTT
TTCTTCTCATAAATGTTTCTAT

QA 2 803 2 803
DS 

RD RR2FU05JQ 656 0 0
AAGCGCAAGATGACATTGTCAATGCAATGAAAGAAGAGGCTGCAAAGCAACTCCTCAAAG
TCAGCGAACATGGCTTCTTCAACCATCATCACCATCAGTACAAACATCTCTTGAAGCATC
TCATTGTTCAGTGTTTGCTTAGACTGAAAGAGCCTTCAGTGTTACTGCGTTGTCGCCAAG
AAGACCTTCACATAGTGGAGTCGATGCTTGACGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAG
CAAAGGTTCATGCTCCTGAGATTATAGTTGACAAGGACATTTTCCTTCCTCCTGCTCCTT
CCGAAGATGATCCTCATGCTCCTTTTTGTGCTGGAGGAGTGGTGCTGGCTTCTCGTGATG
GGAAAATTGTGTGTGAAAACACTCTTGATGGGAGGTTGGAGGTCGCTTTCCTCAAGAAAC
TCCCTGAGATTCGAAAGGCGCTCTTTGGCCAGGTTGGGGCAGCTTGATTGATGATGAGTG
ACTCCAACTTTGAACCATGAGAGCAGGTAATGGCTCCATTATCTACCATCCATTCTTTCT
ATTACCAATTTTAAACTCTGTGTTATATGTTAATGGGCCTTTGCTTTTTGTCAATGGACC
TTGGCCTACCTTGGCCTTTGTGTGGTGATGTTATAAATAAATACTTTGTTGAATG
G

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 4

CO CL793Contig1 1098 4 12 U
GGATAGGGAAAGTGGTTTTCTGATTTGTTTTCAGCGGCGAGATTACGAGAAGAATGATGA
ATGCGTCCGGGTTAACTCTAGCTCCCCCGAAATTTCACATTCGATGGCGTTCACATCAAT
TTGGTACATCTCAGAGAAGCTCTCAAGCTTTAGCTGTTCGTCGTGATGCAGCAGCTTGTC
CTCTTCTTCAAAGGGCTTGTTTAGCACTTTCTACACAAAGAAGCAATGCTTTGATCGTCC
GTGCCATGAGTGCTTCCTTTGGTGATCTCTCAGACGATTCTTCTGCTGTTTTCCCTCGGA
TCAATGTGAAAGACCCATACAAACGTCTTGGGATAAGCCGGATGGCATCCGAGGACGAGA
TTCAAGGCGCCAGGAACTTTCTCATTCAGCAGTACGCTTGTCACAAACCCAGTGTCGACG
CCATCGAATCAGCTCACGACAAGATCATCATGCAGAAGTTCCACGAGAGGAAAAACCCGA
AGATCGATATAAACAAGAAGGTTCGCCAGGTGAGACAGTCCAAAGCTGTGAGCTTTGTGT
TCGACAGATTCCAAACTCCTCCCACTGCTTTCCTTGTCAAAACGGCAGCCACGTTTGCGG
TTCTCGGAGCTCTTACGGTTCTGTTCCCGACGGAAGAAGGACCCACTCTGCAGGTTTTGT
TATCTGTGATAGCTACGGTTTACTTCATCCACCAGAGGCTGAAGAAGAAGCTCTGGTCTT
TCCTTTACGGGATTGGTTCTTTCATCTTCTCGTGGCTGATTGGGACTTTCTTGATGGTGT
CTGTGATCCCGCCCTTCATCAAGGGACCAAGAGGTTTCGAAGCCATGTCTTCGCTCTTGA
GCTACGTTTTGCTTTGGGTGGCTTCGAGCTACCTTAGGTAGAGTAGCATTCTAGCTCTTC
TCTTCACCCCCTTTTTGGGTCGCAATAGTATTATTATTATCTCGGGTATGTATGTGAAGT
ACACACAAAATGAGAAACTGAATCATGGTCCTCATGTGGCGTAGAGAAAGATTTTTTTTG
TTCTTGAATGATTTCCATGAGAAGACCTCAATCTCTTTCGCGGTTTAATATCTAAAGTCG
CGTCTTCCTTTGTCGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C959TF U 1
AF RR2C845TF U 7
AF RR2A891TF U 152
AF RR2A891JQ C 283
BS 1 39 RR2C959TF
BS 40 40 RR2C845TF
BS 41 398 RR2C959TF
BS 399 399 RR2A891TF
BS 400 630 RR2C959TF
BS 631 631 RR2C845TF
BS 632 637 RR2C959TF
BS 638 638 RR2C845TF
BS 639 648 RR2C959TF
BS 649 693 RR2C845TF
BS 694 926 RR2A891TF
BS 927 1098 RR2A891JQ

RD RR2C959TF 648 0 0
GGATAGGGAAAGTGGTTTTCTGATTTGTTTTCAGCGGCGGGATTACGAGAAGAATGATGA
ATGCGTCCGGGTTAACTCTAGCTCCCCCGAAATTTCACATTCGATGGCGTTCACATCAAT
TTGGTACATCTCAGAGAAGCTCTCAAGCTTTAGCTGTTCGTCGTGATGCAGCAGCTTGTC
CTCTTCTTCAAAGGGCTTGTTTAGCACTTTCTACACAAAGAAGCAATGCTTTGATCGTCC
GTGCCATGAGTGCTTCCTTTGGTGATCTCTCAGACGATTCTTCTGCTGTTTTCCCTCGGA
TCAATGTGAAAGACCCATACAAACGTCTTGGGATAAGCCGGATGGCATCCGAGGACGAGA
TTCAAGGCGCCAGGAACTTTCTCATTCAGCAGTACGCTGGTCACAAACCCAGTGTCGACG
CCATCGAATCAGCTCACGACAAGATCATCATGCAGAAGTTCCACGAGAGGAAAAACCCGA
AGATCGATATAAACAAGAAGGTTCGCCAGGTGAGACAGTCCAAAGCTGTGAGCTTTGTGT
TCGACAGATTCCAAACTCCTCCCACTGCTTTCCTTGTCAAAACGGCAGCCACGTTTGCGG
TTCTCGGAGCTCTTACGGTTCTGTTCCCGATGGAAGA*GGACCCACTC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2C845TF 687 0 0
GGAAAGTGGTTTTCTGATTTGTTTTCAGCGGCGAGATTACGAGAAGAATGATGAATGCGT
CCGGGTTAACTCTAGCTCCCCCGAAATTTCACATTCGATGGCGTTCACATCAATTTGGTA
CATCTCAGAGAAGCTCTCAAGCTTTAGCTGTTCGTCGTGATGCAGCAGCTTGTCCTCTTC
TTCAAAGGGCTTGTTTAGCACTTTCTACACAAAGAAGCAATGCTTTGATCGTCCGTGCCA
TGAGTGCTTCCTTTGGTGATCTCTCAGACGATTCTTCTGCTGTTTTCCCTCGGATCAATG
TGAAAGACCCATACAAACGTCTTGGGATAAGCCGGATGGCATCCGAGGACGAGATTCAAG
GCGCCAGGAACTTTCTCATTCAGCAGTACGCTGGTCACAAACCCAGTGTCGACGCCATCG
AATCAGCTCACGACAAGATCATCATGCAGAAGTTCCACGAGAGGAAAAACCCGAAGATCG
ATATAAACAAGAAGGTTCGCCAGGTGAGACAGTCCAAAGCTGTGAGCTTTGTGTTCGACA
GATTCCAAACTCCTCCCACTGCTTTCCTTGTCAAAACGGCAGCCACGTTTGCGGTTCTCG
GAGCTCTTACGGTTCTGTTCCCGACGGAAGAAGGACCCACTCTGCAGGTTTTGTTATCTG
TGATAGCTACGGTTTACTTCATCCACC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2A891TF 775 0 0
GGCTGTTCGTCG
TGATGCAGCAGCTTGTCCTCTTCTTCAAAGGGCTTGTTTAGCACTTTCTACACAAAGAAG
CAATGCTTTGATCGTCCGTGCCATGAGTGCTTCCTTTGGTGATCTCTCAGACGATTCTTC
TGCTGTTTTCCCTCGGATCAATGTGAAAGACCCATACAAACGTCTTGGGATAAGCCGGAT
GGCATCCGAGGACGAGATTCAAGGCGCCAGGAACTTTCTCATTCAGCAGTACGCTTGTCA
CAAACCCAGTGTCGACGCCATCGAATCAGCTCACGACAAGATCATCATGCAGAAGTTCCA
CGAGAGGAAAAACCCGAAGATCGATATAAACAAGAAGGTTCGCCAGGTGAGACAGTCCAA
AGCTGTGAGCTTTGTGTTCGACAGATTCCAAACTCCTCCCACTGCTTTCCTTGTCAAAAC
GGCAGCCACGTTTGCGGTTCTCGGAGCTCTTACGGTTCTGTTCCCGACGGAAGAAGGACC
CACTCTGCAGGTTTTGTTATCTGTGATAGCTACGGTTTACTTCATCCACCAGAGGCTGAA
GAAGAAGCTCTGGTCTTTCCTTTACGGGATTGGTTCTTTCATCTTCTCGTGGCTGATTGG
GACTTTCTTGATGGTGTCTGTGATCCCGCCCTTCATCAAGGGACCAAGAGGTTTCGAAGC
CATGTCTTCGCTCTTGAGCTACGTTTTGCTTTGGGTGGCTTCGAGCTACCTTAGGTAGAG
TAGCATTCTAGCTCTTCTCTTCACCCCCTTTTTGGGTCGCAAT

QA 13 775 13 775
DS 

RD RR2A891JQ 816 0 0
CTGCTGTTTTCCCTCGGATCAATGTGAAAGACCCATACAAACGTCTTGGGATAAGCCGGA
TGGCATCCGAGGACGAGATTCAAGGCGCCAGGAACTTTCTCATTCAGCAGTACGCTTGTC
ACAAACCCAGTGTCGACGCCATCGAATCAGCTCACGACAAGATCATCATGCAGAAGTTCC
ACGAGAGGAAAAACCCGAAGATCGATATAAACAAGAAGGTTCGCCAGGTGAGACAGTCCA
AAGCTGTGAGCTTTGTGTTCGACAGATTCCAAACTCCTCCCACTGCTTTCCTTGTCAAAA
CGGCAGCCACGTTTGCGGTTCTCGGAGCTCTTACGGTTCTGTTCCCGACGGAAGAAGGAC
CCACTCTGCAGGTTTTGTTATCTGTGATAGCTACGGTTTACTTCATCCACCAGAGGCTGA
AGAAGAAGCTCTGGTCTTTCCTTTACGGGATTGGTTCTTTCATCTTCTCGTGGCTGATTG
GGACTTTCTTGATGGTGTCTGTGATCCCGCCCTTCATCAAGGGACCAAGAGGTTTCGAAG
CCATGTCTTCGCTCTTGAGCTACGTTTTGCTTTGGGTGGCTTCGAGCTACCTTAGGTAGA
GTAGCATTCTAGCTCTTCTCTTCACCCCCTTTTTGGGTCGCAATAGTATTATTATTATCT
CGGGTATGTATGTGAAGTACACACAAAATGAGAAACTGAATCATGGTCCTCATGTGGCGT
AGAGAAAGATTTTTTTTGTTCTTGAATGATTTCCATGAGAAGACCTCAATCTCTTTCGCG
GTTTAATATCTAAAGTCGCGTCTTCCTTTGTCGGCG

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 7

CO CL794Contig1 1282 7 28 U
CGGACAAATAAGATCTATCTGCTTATTTCTTCGAAGATTATGAATAAAGTTACATAAGCG
TTAGAAAAAGTGAAGAACAAGAAAAAAAAGATCAATGCGTTTTTTATAAGAAGAAAAAAT
TACTTAAGGGATAATCATATCATAGACATGTCAATTTCATGTACATACGATTAACCATAT
ACTATTTTGAAATCAATTTGATAAAAGTAAAAATAATGA**AAAAAAAAACAGGAAAGTA
AATGTTGCAAATGCCTCTCATCATTCAAATGAACAGAATAATTCAAACTCTT**GTTGCA
TTATTTCGCAAAAGTTAACTTAGGCTCCAGCGTAAGGGTTGGCAGGTTTAGGTGTGTTTT
TCACGAGACCACACTGGAGGCTTGTCTCAGGCATGTTGTATTCATCTCTAAGTGATTTCT
CTGGAGACAAGATACTAGCGTAAAGCTGCTGTCCTAAGTAACGTCTCTCGGTGTTCTCAG
ATCGAATGTTCCACATTCCACAGTTATCAAATGTGAGCAAGATTGCTGCCCAACACTTTG
GGTAGACTTGGACTGTGTGTCTGCTCACTGCGTCCAAGAGGTTGTAGTTCTTTCTCTTCT
CTGGGGTCCAAGTCCCTGGCTCAACAGCAACGGCGAAGAAAGAGTAACCGTCCAAGTGCC
AAGACTGAACAGTCTTCTCGTGATTCTCGAACACCACCTCAACGAAGGTACGGTGAGTGA
TGTTAAGAACGTTTGGCTCGATCCTGATGTTCTTGATCTCTTCTGGGGTAGGGTTATCGG
TGATGATGTTGTACTTAAAGACCTTGTCGGCAATACCAAAGTACTCAGCAAGCTTCAAAG
GGGTTTCGGGCTCTGTGTGGGAGACTCCGTTCAATGCGTACCTAAGCTTACCATCGATCT
TGCCCTGAGTGCTCACGAGCTTGATTGTGCGTGTGATGTTGATCTTTCCATAATGGTAAG
ATCCCTGAGGGTTAGGCCTAGCTGCACTAGCGGTCAAGTTCCACCTGAAGGATCGGAACT
GGTTCAAAGACCAAGCCCATCCGACAGGACCAGCAGGAAGCTGCGTAGAGGCAGGTCCAT
TGCCTCCTTCGTAGCGGAGAAGTCCTGTCGTTGTAACAATCTTCTTCAAGAACCTAGAGG
ATGCAACCATGTAGTAATCTTTAGGTTCTTGATTAGCCGTGACGATGGTACCGAAGCACT
GGCCAACGTGAACGTCAAGCGAGTCGTAATCGTTTTGAAGAACGTGTGATCCTTCCATCT
CAACAAGCTTCATCTTGTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX68JQ U 138
AF RR2EO56JQ U 1
AF RR2FL26JQ U 122
AF RR2FL26TF C 122
AF RR2ED47JQ U 83
AF RR2EO56TF C 528
AF RR2ED47TF C 607
BS 1 144 RR2EO56JQ
BS 145 145 RR2ED47JQ
BS 146 196 RR2EO56JQ
BS 197 197 RR2ED47JQ
BS 198 219 RR2EO56JQ
BS 220 221 RR2ED47JQ
BS 222 229 RR2EO56JQ
BS 230 230 RR2DX68JQ
BS 231 243 RR2EO56JQ
BS 244 245 RR2ED47JQ
BS 246 262 RR2EO56JQ
BS 263 264 RR2ED47JQ
BS 265 282 RR2EO56JQ
BS 283 283 RR2FL26JQ
BS 284 292 RR2EO56JQ
BS 293 294 RR2ED47JQ
BS 295 361 RR2EO56JQ
BS 362 362 RR2ED47JQ
BS 363 544 RR2EO56JQ
BS 545 545 RR2ED47JQ
BS 546 568 RR2EO56JQ
BS 569 569 RR2ED47JQ
BS 570 729 RR2EO56JQ
BS 730 800 RR2ED47JQ
BS 801 1027 RR2EO56TF
BS 1028 1028 RR2ED47TF
BS 1029 1192 RR2EO56TF
BS 1193 1282 RR2ED47TF

RD RR2DX68JQ 134 0 0
TATCATATACATGTCAATTTCATGTACATACGATTAACCATATACTATTTTGAAATCAAA
TGGATAAAAGTAAAAATAATGAGAAAAAAAAAACAGGAAAGTAAATCGTGCAAATGCCTC
TCATC
CATCAAATG

QA 1 125 1 125
DS 

RD RR2EO56JQ 729 0 0
CGGACAAATAAGATCTATCTGCTTATTTCTTCGAAGATTATGAATAAAGTTACATAAGCG
TTAGAAAAAGTGAAGAACAAGAAAAAAAAGATCAATGCGTTTTTTATAAGAAGAAAAAAT
TACTTAAGGGATAATCATATCATATACATGTCAATTTCATGTACATACGATTAACCATAT
ACTATTTTGAAATCAAATTGATAAAAGTAAAAATAATGAGAAAAAAAAA*CAGGAAAGTA
AATCGTGCAAATGCCTCTCATCGATCAAATGAACAGAATAATCCAAACTCTTTTGTTGCA
TTATTTCGCAAAAGTTAACTTAGGCTCCAGCGTAAGGGTTGGCAGGTTTAGGTGTGTTTT
TGACGAGACCACACTGGAGGCTTGTCTCAGGCATGTTGTATTCATCTCTAAGTGATTTCT
CTGGAGACAAGATACTAGCGTAAAGCTGCTGTCCTAAGTAACGTCTCTCGGTGTTCTCAG
ATCGAATGTTCCACATTCCACAGTTATCAAATGTGAGCAAGATTGCTGCCCAACACTTTG
GGTAAACTTGGACTGTGTGTCTGCTCACCGCGTCCAAGAGGTTGTAGTTCTTTCTCTTCT
CTGGGGTCCAAGTCCCTGGCTCAACAGCAACGGCGAAGAAAGAGTAACCGTCCAAGTGCC
AAGACTGAACAGTCTTCTCGTGATTCTCGAACACCACCTCAACGAAGGTACGGTGAGTGA
TGTTAAGAA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2FL26JQ 625 0 0
ACTTAAGGGATAATCATATCATAGACATGTCAATTTCATGTACATACGATTAACCATATA
CTATTTTGAAATCAATTTGATAAAAGTAAAAATAATGA***AAAAAAAACAGGAAAGTAA
ATGTTGCAAATGCCTCTCATCATTCAAATGAACAGAATAATTCAAACTCTT**GTTGCAT
TATTTCGCAAAAGTTAACTTAGGCTCCAGCGTAAGGGTTGGCAGGTTTAGGTGTGTTTTT
CACGAAACCACACTGGAGGCTTGTCTCAGGCATGTTGTATTCATCTCTAAGTGATTTCTC
TGGAGACAAGATACTAGCGTAAAGCTGCTGTCCTAAGTAACGTCTCTCGGTGTTCTCAGA
TCGAATGTTCCACATTCCACAGTTATCAAATGTGAGCAAGATTGCTGCCCAACACTTTGG
GTAGACTTGGACTGTGTGTCTGCTCACTGCGTCCAAGAGGTTGTAGTTCTTTCTCTTCTC
TGGGGTCCAAGTCCCTGGCTCAACAGCAACGGCGAAAAAAGAGTAACCGTCCAAGTGCCA
AGACTGAACAGTCTTCTCGTGATTCTCGAACACCACCTCAACGAAGGTACGGTGAGTGAT
GTTAAGAACGTTTGGCTCGATCCT
C

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2FL26TF 625 0 0
ACTTAAGGGATAATCATATCATAGACATGTCAATTTCATGTACATACGATTAACCATATA
CTATTTTGAAATCAATTTGATAAAAGTAAAAATAATGA***AAAAAAAACAGGAAAGTAA
ATGTTGCAAATGCCTCTCATCATTCAAATGAACAGAATAATTCAAACTCTT**GTTGCAT
TATTTCGCAAAAGTTAACTTAGGCTCCAGCGTAAGGGTTGGCAGGTTTAGGTGTGTTTTT
CACGAGACCACACTGGAGGCTTGTCTCAGGCATGTTGTATTCATCTCTAAGTGATTTCTC
TGGAGACAAGATACTAGCGTAAAGCTGCTGTCCTAAGTAACGTCTCTCGGTGTTCTCAGA
TCGAATGTTCCACATTCCACAGTTATCAAATGTGAGCAAGATTGCTGCCCAACACTTTGG
GTAGACTTGGACTGTGTGTCTGCTCACTGCGTCCAAGAGGTTGTAGTTCTTTCTCTTCTC
TGGGGTCCAAGTCCCTGGCTCAACAGCAACGGCGAAGAAAGAGTAACCGTCCAAGTGCCA
AGACTGAACAGTCTTCTCGTGATTCTCGAACACCACCTCAACGAAGGTACGGTGAGTGAT
GTTAAGAACGTTTGGCTCGATCCT
C

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2ED47JQ 718 0 0
AAAAAAAGATCAATGCGTTTTTTATAAGAAGAAAAAATTACTTAAGGGATAATCATATCA
TAGACATGTCAATTTCATGTACATACGATTAACCATATACTATTTTGAAATCAATTTGAT
AAAAGTAAAAATAATGA**AAAAAAAAACAGGAAAGTAAATGTTGCAAATGCCTCTCATC
ATTCAAATGAACAGAATAATCCAAACTCTT**GTTGCATTATTTCGCAAAAGTTAACTTA
GGCTCCAGCGTAAGGGTTGGCAGGTTTAGGTGTGTTTTTCACGAGACCACACTGGAGGCT
TGTCTCAGGCATGTTGTATTCATCTCTAAGTGATTTCTCTGGAGACAAGATACTAGCGTA
AAGCTGCTGTCCTAAGTAACGTCTCTCGGTGTTCTCAGATCGAATGTTCCACATTCCACA
GTTATCAAATGTGAGCAAGATTGCTGCCCAACACTTTGGGTAGACCTGGACTGTGTGTCT
GCTCACTGCGTCCAAGAGGTTGTAGTTCTTTCTCTTCTCTGGGGTCCAAGTCCCTGGCTC
AACAGCAACGGCGAAGAAAGAGTAACCGTCCAAGTGCCAAGACTGAACAGTCTTCTCGTG
ATTCTCGAACACCACCTCAACGAAGGTACGGTGAGTGATGTTAAGAACGTTTGGCTCGAT
CCTGATGTTCTTGATCTCTTCTGGGGTAGGGTTATCGGTGATGATGTTGTACTTAAAG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2EO56TF 666 0 0
GCCCAACACTTTGGGTA*ACTTGGACTGTGTGTCTGCTCACCGCGTCCAAGAGGTTGTAG
TTCTTTCTCTTCTCTGGGGTCCAAGTCCCTGGCTCAACAGCAACGGCGAAGAAAGAGTAA
CCGTCCAAGTGCCAAGACTGAACAGTCTTCTCGTGATTCTCGAACACCACCTCAACGAAG
GTACGGTGAGTGATGTTAAGAACGTTTGGCTCGATCCTGATGTTCTTGATCTCTTCTGGG
GTAGGGTTATCGGTGATGATGTTGTACTTAAAGACCTTGTCGGCAATACCAAAGTACTCA
GCAAGCTTCAAAGGGGTTTCGGGCTCTGTGTGGGAGACTCCGTTCAATGCGTACCTAAGC
TTACCATCGATCTTGCCCTGAGTGCTCACGAGCTTGATTGTGCGTGTGATGTTGATCTTT
CCATAATGGTAAGATCCCTGAGGGTTAGGCCTAGCTGCACTAGCGGTCAAGTTCCACCTG
AAGGATCGGAACTGGTTCAACGACCAAGCCCATCCGACAGGACCAGCAGGAAGCTGCGTA
GAGGCAGGTCCATTGCCTCCTTCGTAGCGGAGAAGTCCTGTCGTTGTAACAATCTTCTTC
AAGAACCTAGAGGATGCAACCATGTAGTAATCTTTAGGTTCTTGATTAGCCGTGACGATG
GTACC
C

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2ED47TF 676 0 0
TCCAAGTCCCTGGCTCAACAGCAACGGCGAAGAAAGAGTAACCGTCCAAGTGCCAAGACT
GAACAGTCTTCTCGTGATTCTCGAACACCACCTCAACGAAGGTACGGTGAGTGATGTTAA
GAACGTTTGGCTCGATCCTGATGTTCTTGATCTCTTCTGGGGTAGGGTTATCGGTGATGA
TGTTGTACTTAAAGACCTTGTCGGCAATACCAAAGTACTCAGCAAGCTTCAAAGGGGTTT
CGGGCTCTGTGTGGGAGACTCCGTTCAATGCGTACCTAAGCTTACCATCGATCTTGCCCT
GAGTGTTCACGAGCTTGATTGTGCGTGTGATGTTGATCTTTCCATAATGGTAAGATCCTT
GAGGGTTTGGCCTAGCTGCACTAGCGGTCAAGTTCCACCTGAATGATCG*AACTGGTTCA
AAGACCAAGCCCATCCGACAGGACCAGCAGGAAGCTGCGTAGAGGCAGGTCCATTGCCTC
CTTCGTAGCGGAGAAGTCCTGTCGTTGTAACAATCTTCTTCAAGAACCTAGAGGATGCAA
CCATGTAGTAATCTTTAGGTTCTTGATTAGCCGTGACGATGGTACCGAAGCACTGGCCAA
CGTGAACGTCAAGCGAGTCGTAATCGTTTTGAAGAACGTGTGATCCTTCCATCTCAACAA
GCTTCATCTTGTGATC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 5

CO CL795Contig1 1531 5 9 U
AGGGTTGTTATTATGTTCAATAATATTCAATTTGTTCTTCGTACAATGCACTTGTCACTT
TCTATATGCTTGTCTTGTTGATCTTGGATTGCATTTCTATAAACTAACAGAGATTTGGCC
CTTAAATTCTTTCTTCTTCTAATTGATTTTTTTGTGTACAATTACAAACATATTGTCCGG
AACATTATAAAAGTGTTTTGTAACTGAACTTGTTACTTATTTGTGGAGTCATCATCATCA
TCATCATCTTCATACCTGTGTACATCCAGCTTCCATGTCCCATCATCCATTTGAACCATC
CCGCTGTTTGCAAGACACCTCCACGTACTCGGCACTAAGTACTTATCCTTCAGAGCATCC
AACCCTTTATTCACCAACGAAACATCCCGACCAATCTCCAGTCTAAACACCCCGGATTTG
TCTTGCATCCCTGCTATCCCGTGCAGGTATATCTCCAGGTTATGGTAGTTCCTCCAGTTC
AGAGACCGTTTGAGGTAAGTCGACTTCAGCGTATTGATCTGCAGCATCTCGCCTACTTCT
GCATACAGGAAGAGTGGATAGTTCGGTGCGATGTCCGGAACGTTTACTATTCTTAGGATG
TTTAGGTCTTTGTGTGAGTTGACAGTTCTTTTGAAGTCTTGGTCCCCGATTCGAGGGCAC
CCGAAAGCGAAAACTGTGATGGGAACTTGTTTGCTTTGAAGACCTGCCTCGATCTTGTTT
TTCCTGCTGTGGACAAGATCCGCAGCTGCTAGAGTTGACATTACTCCTCCCAAGCTGTGG
CCTGTGAAAGTGATGCTTACTTCTTCGTTCTTGTATACTTCTAGCAGTCTCTTGAGCTCT
GCTTGTACCTGTTCTCGTGCGCTACTTGTGTCATAAGGAGACATAGCATCAGAAGCTGTA
TAAACATCAAGCCAGCCACTTCCAATACGAGGCACGTGTTTGGAGTCGGTCACAGGAAAA
ACTTTGACACCTGACTCGAGAGGAAAATCGAAGTCGTTAGCCCATTCGTACGGCTGAAGA
GTTCCTCTCCAAGCTACAACAATATCTCTCCTCCCTAACATCGCCTTCCCCTCGTCTGTA
GCTACCGCAATGTAACCCATCCAGTTAGTCTGCACGCGTGACGCTTTCTTCGACAAAGAC
CTGACGATGAAACAGAGCGGTAGCTTTATAGAAGCTGTTGCGTAGATGTACTTAGTCACA
TTGTACCTGAAAGGATTGGCTTTAAGGTAGCCGGTTCGAGCGTGGATTTGACTCTTGGGG
TAATAACAATCACCGCAGTATTCGGACTTACGGTCCCAGTTAAAGGCGTCATAACCAACC
TGAGCCATCTCGCCATAGTGGATGAGGTAGCGACGCAAGTCGGAGTCAAGTGGATCAAGC
AGGCCTTCCATTTGTTTTGGCCGCTTAGCACTTCCCATCTCTTTGGTATGTCTTCCAACA
TGTTTTCGCCTTAGTAATTTTCACCAACCTTTCTTTTTTTGGGCAACAACATTGCTACTT
GTGTGAGAGAACTTGATAATACGTGAAGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D694JQ U 1
AF RR2EE83JQ U 117
AF RR2A276JQ U 171
AF RR2A276TF C 536
AF RR2EE83TF C 975
BS 1 475 RR2D694JQ
BS 476 656 RR2EE83JQ
BS 657 657 RR2A276JQ
BS 658 707 RR2EE83JQ
BS 708 708 RR2A276JQ
BS 709 804 RR2EE83JQ
BS 805 1038 RR2A276JQ
BS 1039 1242 RR2A276TF
BS 1243 1531 RR2EE83TF

RD RR2D694JQ 479 0 0
AGGGTTGTTATTATGTTCAATAATATTCAATTTGTTCTTCGTACAATGCACTTGTCACTT
TCTATATGCTTGTCTTGTTGATCTTGGATTGCATTTCTATAAACTAACAGAGATTTGGCC
CTTAAATTCTTTCTTCTTCTAATTGATTTTTTTGTGTACAATTACAAACATATTGTCCGG
AACATTATAAAAGTGTTTTGTAACTGAACTTGTTACTTATTTGTGGAGTCATCATCATCA
TCATCATCTTCATACCTGTGTACATCCAGCTTCCATGTCCCATCATCCATTTGAACCATC
CCGCTGTTTGCAAGACACCTCCACGTACTCGGCACTAAGTACTTATCCTTCAGAGCATCC
AACCCTTTATTCACCAACGAAACATCCCGACCAATCTCCAGTCTAAACACCCCGGATTTG
TCTTGCATCCCTGCTATCCCGTGCAGGTATATCTCCAGGTTATGGTAGTTCCTCC
AGTT

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2EE83JQ 688 0 0
GGCCCTTAGATTCTTTCTTCTTCTAATTGATTTTTTTGTGTACAATTACAAACATATTGT
CCGGAACATTATAAAAGTGTTTTGTAACTGAACTTGTTACTTATTTGTGGAGTCATCATC
ATCATCATCATCTTCATACCTGTGTACATCCAGCTTCCATGTCCCATCATCCATTTGAAC
CATCCCGCTGTTTGCAAGACACCTCCACGTACTCGGCACTAAGTACTTATCCTTCAGAGC
ATCCAACCCTTTATTCACCAACGAAACATCCCGACCAATCTCCAGTCTAAACACCCCGGA
TTTGTCTTGCATCCCTGCTATCCCGTGCAGGTATATCTCCAGGTTATGGTAGTTCCTCCA
GTTCAGAGACCGTTTGAGGTAAGTCGACTTCAGCGTATTGATCTGCAGCATCTCGCCTAC
TTCTGCATACAGGAAGAGTGGATAGTTCGGTGCGATGTCCGGAACGTTTACTATTCTTAG
GATGTTTAGGTCTTTGTGTGAGTTGACAGTTCTTTTGAAGTCTTGGTCCCCGATTCGAGG
ACACCCGAAAGCGAAAACTGTGATGGGAACTTGTTTGCTTTGAAGACCTGCTTCGATCTT
GTTTTTCCTGCTGTGGACAAGATCCGCAGCTGCTAGAGTTGACATTACTCCTCCCAAGCT
GTGGCCTGTGAAAGTGATGCTTACTTCT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2A276JQ 868 0 0
TATTGTCCGGAACATTATAAAAGTGTTTTGTAACTGAACTTGTTACTTATTTGTGGAGTC
ATCATCATCATCATCATCTTCATACCTGTGTACATCCAGCTTCCATGTCC*ATCATCCAT
TTGAACCAGCCCGCTGTTTGCAAGACACCTCCACGTACTCGGCACTAAGTACTTATCCTT
CAGAGCATCCAACCCTTTATTCACCAACGAAACATCCCGACCAATCTCCAGTCTAAACAC
CCCGGATTTGTCTTGCATCCCTGCTATCCCGTGCAGGTATATCCCCAGGTTATGGTAGTT
CCTCCAGTTCAGAGACCGTTTGAGGTAAGTCGACTTCAGCGTATTGATCTGCAGCATCTC
GCCTACTTCTGCATACAGGAAGAGTGGATAGTTCGGTGCGATGTCCGGAACGTTTACTAT
TCTTAGGATGTTTAGGTCTTTGTGTGAGTTGACAGTTCTTTTGAAGTCTTGGTCCCCGAT
TCGAGGGCACCCGAAAGCGAAAACTGTGATGGGAACTTGTTTGCTTTGAAGACCTGCCTC
GATCTTGTTTTTCCTGCTGTGGACAAGATCCGCAGCTGCTAGAGTTGACATTACTCCTCC
CAAGCTGTGGCCTGTGAAAGTGATGCTTACTTCTTCGTTCTTGTATACTTCTAGCAGTCT
CTTGAGCTCTGCTTGTACCTGTTCTCGTGCGCTACTTGTGTCATAAGGAGACATAGCATC
AGAAGCTGTATAAACATCAAGCCAGCCACTTCCAATACGAGGCACGTGTTTGGAGTCGGT
CACAGGAAAAACTTTGACACCTGACTCGAGAGGAAAATCGAAGTCGTTAGCCCATTCGTA
CGGCTGAAGAGTTCCTCTCCAAGCTACA

QA 1 868 1 868
DS 

RD RR2A276TF 708 0 0
CTTCTGCATACAGGAAGAGTGGATAGTTCGGTGCGATGTCCGGAACGTTTACTATTCTTA
GGATGTTTAGGTCTTTGTGTGAGTTGACAGTTCTTTTGAAGTCTTGGTCCCCGATTCGAG
GGCACCCGAAAGCGAAAACTGTGATGGGAACTTGTTTGCTTTGAAGACCTGCCTCGATCT
TGTTTTTCCTGCTGTGGACAAGATCCGCAGCTGCTAGAGTTGACATTACTCCTCCCAAGC
TGTGGCCTGTGAAAGTGATGCTTACTTCTTCGTTCTTGTATACTTCTAGCAGTCTCTTGA
GCTCTGCTTGTACCTGTTCTCGTGCGCTACTTGTGTCATAAGGAGACATAGCATCAGAAG
CTGTATAAACATCAAGCCAGCCACTTCCAATACGAGGCACGTGTTTGGAGTCGGTCACAG
GAAAAACTTTGACACCTGACTCGAGAGGAAAATCGAAGTCGTTAGCCCATTCGTACGGCT
GAAGAGTTCCTCTCCAAGCTACAACAATATCTCTCCTCCCTAACATCGCCTTCCCCTCGT
CTGTAGCTACCGCAATGTAACCCATCCAGTTAGTCTGCACGCGTGACGCTTTCTTCGACA
AAGACCTGACGATGAAACAGAGCGGTAGCTTTATAGAAGCTGTTGCGTAGATGTACTTAG
TCACATTGTACCTGAAAGGATTGGCTTTAAGGTAGCCGGTTCGAGCG
C

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2EE83TF 557 0 0
CTCGAGAGGAAAATCGAAGTCGTTAGCCCATTCGTACGGCTGAAGAGTTCCTCTCCAAGC
TACAACAATATCTCTCCTCCCTAACATCGCCTTCCCCTCGTCTGTAGCTACCGCAATGTA
ACCCATCCAGTTAGTCTGCACGCGTGACGCTTTCTTCGACAAAGACCTGACGATGAAACA
GAGCGGTAGCTTTATAGAAGCTGTTGCGTAGATGTACTTAGTCACATTGTACCTGAAAGG
ATTGGCTTTAAGGTAGCCGGTTCGAGCGTGGATTTGACTCTTGGGGTAATAACAATCACC
GCAGTATTCGGACTTACGGTCCCAGTTAAAGGCGTCATAACCAACCTGAGCCATCTCGCC
ATAGTGGATGAGGTAGCGACGCAAGTCGGAGTCAAGTGGATCAAGCAGGCCTTCCATTTG
TTTTGGCCGCTTAGCACTTCCCATCTCTTTGGTATGTCTTCCAACATGTTTTCGCCTTAG
TAATTTTCACCAACCTTTCTTTTTTTGGGCAACAACATTGCTACTTGTGTGAGAGAACTT
GATAATACGTGAAGGCC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 8

CO CL796Contig1 915 8 14 U
GGAGACCAAGGAAGAACCGATCCCCATAACCACTACCACATATACAAGAAAACAAA*ACA
CAAGACTATCAATCAATCTCCACTCTTCGTCAATGGCTTCTCTGAAGCTTTCACCTTCTT
CGCCAATCTCTATCCCTAAGAGCAGTGGATATGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTCTTG
TCCGGGCTGAGCAGTCTCCGTCTTCCTCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGAGAC
GTGTGGTGGTAACGTTGGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCATTGCTTAGTAAAGCTCCAT
CATCATTTGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATGCAT
ATGCCTTTGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTAT
ACAAAGATGTGATTGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCAAAC
AGACTATCAAAGATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAGTTT
TGGCACCACCAAATCAGAAGACAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATGGGA
AGACTTATTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCCGCCATGCTTTGG
GCATAATTACAGTTTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCTAATGAGAGGA
GGTGGG*AGAAGATGAAAGATAGGCTTCACACTGTGATAGATTCTTTCAAGATCACTGTT
TGAAAAAATATCAAGTTTGGTTTGGTCACTTTATGTTTTGAAAAAGCCTGAGTTGTATTT
TTTGTTCATTCTTCCTCTCTCTTTCCCTTAACATTATTCTTCTCCGTTAAGAGAGATTCA
ATACTCTGACTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA60TF U 6
AF RR2H978TF U 57
AF RR2A941TF U 1
AF RR2BI07TF U 6
AF RR2H822TF U 57
AF RR2BA84TF U 58
AF RR2A941JQ C 195
AF RR2BA84JQ C 347
BS 1 56 RR2A941TF
BS 57 57 RR2BI07TF
BS 58 81 RR2A941TF
BS 82 82 RR2BI07TF
BS 83 726 RR2A941TF
BS 727 727 RR2BI07TF
BS 728 782 RR2A941TF
BS 783 824 RR2BI07TF
BS 825 825 RR2BA84TF
BS 826 835 RR2BI07TF
BS 836 842 RR2BA84TF
BS 843 843 RR2A941JQ
BS 844 902 RR2BA84TF
BS 903 915 RR2A941JQ

RD RR2HA60TF 623 0 0
GG
AAGGAAGAACCGATCCCCATAACCACTACCACATATACAAGAAAACAAA*ACACAAGACT
ATCAATCAATCTCCACTCTTCGTCAATGGCTTCTCTGAAGCTTTCACCTTCTTCGCCAAT
CTCTATCCCTAAGAGCAGTGGATGTGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTCTTGTCCGGGC
TGAGCAGTCTCCGTCTTCCTCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGAGACGTGTGGT
GGTAACGTTAGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCATTGCTTAGTAAAGCTCCATCATCATT
TGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATGCATATGCCTT
TGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTATACAAAGA
TGTGATTGAGCCTTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCAAACAGACTAT
CAAAGATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAGTTTTGGCACC
ACCAAATCAGAAGACTACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATGGGAAGACTTA
TTATCAGTTTGAGTTCACTGC

QA 3 623 3 623
DS 

RD RR2H978TF 658 0 0
G
ACACAAGACTATCAATCAATCTCCACTCTTCGTCAATGGCTTCTCTGAAGCTTTCACCTT
CTTCGCCAATCTCTATCCCTAAGAGCAGTGGATATGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTC
TTGTCCGGGCTGAGTAGTCTCCGTCTTCCTCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGA
GACGTGTGGTGGTAACGTTGGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCATTGCTTAGTAAAGCTC
CATCATCATTTGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATG
CATATGCCTTTGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGG
TATACAAAGATGTGATTGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCA
AACAGACTATCAAAGATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAG
TTTTGGCACCACCAAATCAGAAGACAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATG
GGAAGACTTATTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCCGCCATGCTT
TGGGCATAATTACAGTTTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCTA
TGA

QA 2 655 2 655
DS 

RD RR2A941TF 782 0 0
GGAGACCAAGGAAGAACCGATCCCCATAACCACTACCACATATACAAGAAAACAAACACA
CAAGACTATCAATCAATCTCCTCTCTTCGTCAATGGCTTCTCTGAAGCTTTCACCTTCTT
CGCCAATCTCTATCCCTAAGAGCAGTGGATATGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTCTTG
TCCGGGCTGAGCAGTCTCCGTCTTCCTCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGAGAC
GTGTGGTGGTAACGTTGGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCATTGCTTAGTAAAGCTCCAT
CATCATTTGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATGCAT
ATGCCTTTGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTAT
ACAAAGATGTGATTGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCAAAC
AGACTATCAAAGATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAGTTT
TGGCACCACCAAATCAGAAGACAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATGGGA
AGACTTATTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCCGCCATGCTTTGG
GCATAATTACAGTTTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCTAATGAGAGGA
GGTGGGGAGAAGATGAAAGATAGGCTTCACACTGTGATAGATTCTTTCAAGATCACTGTT
TG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2BI07TF 830 0 0
GG
AAGGAAGAACCGATCCCCATAACCACTACCACATATACAAGAAAACAAA*ACACAAGACT
ATCAATCAATCTCCACTCTTCGTCAATGGTTTCTCTGAAGCTTTCACCTTCTTCGCCAAT
CTCTATCCCTAAGAGCAGTGGATGTGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTCTTGTCCGGGC
TGAGCAGTCTCCGTCTTCCTCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGAGACGTGTGGT
GGTAACGTTAGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCATTGCTTAGTAAAGCTCCATCATCATT
TGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATGCATATGCCTT
TGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTATACAAAGA
TGTGATTGAGCCTTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCAAACAGACTAT
CAAAGATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAGTTTTGGCACC
ACCAAATCAGAAGACTACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATGGGAAGACTTA
TTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACTCGCCATGCTTTGGGCGTAAT
TACAGTTTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCTAATGAGAGGAGGTGGG*
AGAAGATGAAAGATAGGCTTCACACTGTGATAGATTCTTTCAAGATCACTGTTTGAAAAA
ATATCAAGTTTGGTTTGGTCACTTTATGTTTTGAAAA*GCCTGAGTTG

QA 3 830 3 830
DS 

RD RR2H822TF 730 0 0
G
ACACAAGACTATCAATCAATCTCCACTCTTCGTCAATGGCTTCTCTGAAGCTTTCACCTT
CTTCGCCAATCTCTATCCCTAAGAGCAGTGGATATGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTC
TTGTCCGGGCTGAGTAGTCTCCGTCTTCCTCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGA
GACGTGTGGTGGTAACGTTGGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCATTGCTTAGTAAAGCTC
CATCATCATTTGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATG
CATATGCCTTTGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGG
TATACAAAGATGTGATTGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCA
AACAGACTATCAAAGATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAG
TTTTGGCACCACCAAATCAGAAGACAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATG
GGAAGACTTATTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCCGCCATGCTT
TGGGCATAATTACAGTTTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCTA*TGAGA
GGAGGTGGG*AGAAGATGAAAGATAG*CTTCACACTGTGATAGATTCTTTCA*GATCACT
GTTTGAAAA

QA 2 730 2 730
DS 

RD RR2BA84TF 852 0 0
GG
ACAAGACTATCAATCAATCTCCACTCTTCGTCAATGGCTTCTCTGAAGCTTTCACCTTCT
TCGCCAATCTCTATCCCTAAGAGCAGTGGATACGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTCTT
GTCCGGGCTGAGCAGTCTCCGTCTTCCTCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGAGA
CGTGTGGTGGTAACGTTGGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCATTGCTTAGTAAAGCTCCA
TCATCATTTGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATGCA
TATGCCTTTGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTA
TACAAAGATGTGATTGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCAAA
CAGACTATCAAAGATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAGTT
TTGGCACCACCAAATCAGAAGACAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATGGG
AAGACTTATTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCCGCCATGCTTTG
GGCATAATTACAGTTTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCTAATGAGAGG
AGGTGGG*AGAAGATGAAAGATAGGCTTCACACTGTGATAGATTCTTTCAAGATCACTGT
TTGAAAAA*TATCAAGTTTGGTTTGGTCACTTTATGTTTTGAAAAAGCCTGAGTTGTATT
TTT*GTTCATTCTTCCTCTCTCTTTCCCTTAACATTATTCTTCTCCGTTAAGAGAGATTC
AAT
ACTCTGA

QA 3 845 3 845
DS 

RD RR2A941JQ 721 0 0
TCTCCGTCTTCCTCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGAGACGTGTGGTGGTAACG
TTGGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCATTGCTTAGTAAAGCTCCATCATCATTTGCTGCA
GAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATGCATATGCCTTTGTATAT
CCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTATACAAAGATGTGATT
GAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCAAACAGACTATCAAAGAT
TTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAGTTTTGGCACCACCAAAT
CAGAAGACAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATGGGAAGACTTATTATCAG
TTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCCGCCATGCTTTGGGCATAATTACAGTT
TTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCTAATGAGAGGAGGTGGG*AGAAGAT
GAAAGATAGGCTTCACACTGTGATAGATTCTTTCAAGATCACTGTTTGAAAAAATATCAA
GTTTGGTTTGGTCACTTTATGTTTTGAAAAAGCCTGAGTTGTATTTTTTGTTCATTCTTC
CTCTCTCTTTCCCTTAACATTATTCTTCTCCGTTAAGAGAGATTCAATACTCTGACTTCA
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2BA84JQ 556 0 0
CAATAAGGATGCATATGCCTTTGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGG
TCAAGACAAGGTATACAAAGATGTGATTGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGAT
CCCTACTAGCAAACAGACTATCAAAGATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACT
GGTAAAGAAAGTTTTGGCACCACCAAATCAGAAGACAACTTTTATTGATGCATCAGAGCA
TGAAGTTGATGGGAAGACTTATTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACAC
CCGCCATGCTTTGGGCATAATTACAGTTTTTAATGGAAAATTTTACACATTGACAACTGG
GGCTAATGAGAGGAGGTGGG*AGAAGATGAAAGATAGGCTTCACACTGTGATAGATTCTT
TCAAGATCACTGTTTGAAAAAATATCAAGTTTGGTTTGGTCACTTTATGTTTTGAAAAAG
CCTGAGTTGTATTTTTTGTTCATTTTTCCTCTCTCTTTCCCTTAACATTATTTTTTTCCG
TTAAGAGAGATTCAAT

QA 1 556 1 556
DS 



AS 2 7

CO CL797Contig1 865 4 4 U
GGATTGTCTGAAAGAGAGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAAAGCAGCAGCCATGGAGA
ACGACAGAGAAAAACAAATATACTTAGCGAAGCTCTCCGAGCAAACCGAACGATACGATG
AGATGGTTGAGGCGATGAAGAAAGTTGCTCAGCTTGACGTGGAGCTCACGGTGGAGGAGA
GGAATCTCGTCTCTGTTGGGTACAAGAACGTGATCGGCGCGAAGAGAGCCTCGTGGAGGA
TACTATCTTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGTCCAAGGGGAACGAGGAGAATGTCAAGAGGA
TCAAGAATTATCGCAAGAGCGTTGAAGACGAGCTTGCTAAAGTTT*GTAATGACATCTTG
TCTGTCATTGACAAACATCTCATCCCTTCGTCTAAGGCTGTCGAATCTACAGTCTTTTTC
TACAAAATGAAAGGAGATTATTATCGGTATCTGGCAGAGTTTAGTTCTGGTGATGAACGC
AAGGAAGCTGCAGATCAGTCTCTTGAGGCATATAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGAGACT
GGTTTAGCACCCACACATCCAGTTAGACTTGGCCTGGCGCTGAACTTTTCAGTTTTCTAC
TATGAGATCTTGAACTCTCCTGAAAGTGCATGTCAGTTGGCTAAGCAAGCATTCGATGAT
GGAATCGCGGAACTTGACAGCCTGAACGAGGAATCATACAAGGACAGTACTCTTATCATG
CAGCTACTTAGAGACAATCTCACTTTGTGGACTTCTGACCTCCCAGAGTAAGGAGGTGAT
GAGCCTCAAGAAGAGAAATGAATCCTGAATCTGTCTGTGAAAAGAGAAACGGCTCTTGGT
CCCTCCTAAATCATAAACCGAAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 30 15 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN22TF U 13
AF RR2A804TF U 1
AF RR2BF29TF U 13
AF RR2A804JQ C 139
BS 1 46 RR2A804TF
BS 47 47 RR2BF29TF
BS 48 766 RR2A804TF
BS 767 865 RR2A804JQ

RD RR2FN22TF 331 0 0
GGGTCTGAAAAGG
GAAGAAGAAGAAGACAAAAGCAGCAGCCATGGAGAACGACAGAGAAAAACAAATATACTT
AGCGAAGCTCTCCGAGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCGATGAAGAAAGT
TGCTGAGCTTGACGTGGAGCTCACGGTGGAGGAGAGGAATCTCGTGTCTGTTGGG*ACAA
GAACGTGATCGGCGCAAAGAGAGCTTCGTGGAGGATACTATCTTCCATCGAGCAGAAGGA
AGA*TCCAAGGGGAACGAGGAGAATG*CAAGAGGATCAAGAATTATCGTAAAA*TGTTGA
AGATGA*CTTGCTAAAGT

QA 14 331 14 331
DS 

RD RR2A804TF 766 0 0
GGATTGTCTGAAAGAGAGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAAAGCCGCAGCCATGGAGA
ACGACAGAGAAAAACAAATATACTTAGCGAAGCTCTCCGAGCAAACCGAACGATACGATG
AGATGGTTGAGGCGATGAAGAAAGTTGCTCAGCTTGACGTGGAGCTCACGGTGGAGGAGA
GGAATCTCGTCTCTGTTGGGTACAAGAACGTGATCGGCGCGAAGAGAGCCTCGTGGAGGA
TACTATCTTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGTCCAAGGGGAACGAGGAGAATGTCAAGAGGA
TCAAGAATTATCGCAAGAGCGTTGAAGACGAGCTTGCTAAAGTTT*GTAATGACATCTTG
TCTGTCATTGACAAACATCTCATCCCTTCGTCTAAGGCTGTCGAATCTACAGTCTTTTTC
TACAAAATGAAAGGAGATTATTATCGGTATCTGGCAGAGTTTAGTTCTGGTGATGAACGC
AAGGAAGCTGCAGATCAGTCTCTTGAGGCATATAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGAGACT
GGTTTAGCACCCACACATCCAGTTAGACTTGGCCTGGCGCTGAACTTTTCAGTTTTCTAC
TATGAGATCTTGAACTCTCCTGAAAGTGCATGTCAGTTGGCTAAGCAAGCATTCGATGAT
GGAATCGCGGAACTTGACAGCCTGAACGAGGAATCATACAAGGACAGTACTCTTATCATG
CAGCTACTTAGAGACAATCTCACTTTGTGGACTTCTGACCTCCCAG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2BF29TF 754 0 0
GGGTCTAAAAAGG
GAAGAAGAAGAAGACAAAAGCAGCAGCCATGGAGAACGACAGAGAAAAACAAATATACTT
AGCGAAGCTCTCCGAGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCGATGAAGAAAGT
TGCTGAGCTTGACGTGGAGCTCACGGTGGAGGAGAGGAATCTCGTGTCTGTTGGGTACAA
GAACGTGATCGGCGCAAAGAGAGCTTCGTGGAGGATACTATCTTCCATCGAGCAGAAGGA
AGAGTCCAAGGGGAACGAGGAGAATGTCAAGAGGATCAAGAATTATCGTAAGAGTGTTGA
AGATGAGCTTGCTAAAGTTTTGTAATGACATCTTGTCTGTCATTGATAAGCATCTCATCC
CTTCGTCTAAGGCTGTCGAATCTACAGTCTTTTTCTACAAAATGAAAGGAGATTATTATC
GGTATCTGGCAGAGTTTAGTTCTGGTGATGAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAGTCTCTAG
AGGCATATAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGAGACTGGTTTAGCACCCACACATCCAGTTA
GACTTGGCCTGGCGCTGAACTTTTCTGTTTTCTACTATGAGATCTTGAACTCTCCTGAAA
GTGCATGTCAGTTGGCTAAGCAAGCATTTGACGATGGAATCGCAGAGCTTGATAGTCTAA
ACGAGGAATCATACAAGGACAGCACTCTTATCATGCAGCTACTCAGAGACAATCTCACTT
TGTGGACTTCTGACCTCCCAG

QA 14 754 14 754
DS 

RD RR2A804JQ 727 0 0
AGAAAGTTGCTCAGCTTGACGTG*AGCTCACGGTGGAGGAGAGGAATCTCGTCTCTGTTG
GGTACAAGAACGTGATCGGCGCGAAGAGAGCCTCGTGGAGGATACTATCTTCCATCGAGC
AGAAGGAAGAGTCCAAGGGGAACGAGGAGAATGTCAAGAGGATCAAGAATTATCGCAAGA
GCGTTGAAGACGAGCTTGCTAAAGTTT*GTAATGACATCTTGTCTGTCATTGACAAACAT
CTCATCCCTTCGTCTAAGGCTGTCGAATCTACAGTCTTTTTCTACAAAATGAAAGGAGAT
TATTATCGGTATCTGGCAGAGTTTAGTTCTGGTGATGAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAG
TCTCTTGAGGCATATAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGAGACTGGTTTAGCACCCACACAT
CCAGTTAGACTTGGCCTGGCGCTGAACTTTTCAGTTTTCTACTATGAGATCTTGAACTCT
CCTGAAAGTGCATGTCAGTTGGCTAAGCAAGCATTCGATGATGGAATCGCGGAACTTGAC
AGCCTGAACGAGGAATCATACAAGGACAGTACTCTTATCATGCAGCTACTTAGAGACAAT
CTCACTTTGTGGACTTCTGACCTCCCAGAGTAAGGAGGTGATGAGCCTCAAGAAGAGAAA
TGAATCCTGAATCTGTCTGTGAAAAGAGAAACGGCTCTTGGTCCCTCCTAAATCATAAAC
CGAAGAC

QA 1 727 1 727
DS 



CO CL797Contig2 759 3 10 U
CAACTTTTGAAAGACAAAACTAAGTGAAATAGACAAAACATCACGAGAGAGTTTAAGATA
GGTAGCGATATGTTGTAGAACGTTAATGATCTGAAAACATCATCAGGGAAGACATTAATA
TTAAAAAGAAGAAATTACACTTTTTCAGTGTTTAGAGCTGAAGACGCTTGCTGTCTTCGG
TTTATGATTTAGGATGCACCAAGAGCCGTTTCTCTTCTCACAGAGAGATTCAGGATTCAT
TTCTCTTCTTGAGGCTCATCACCTTTGGATGGCTCGTCTCCTTCCTCTGGGAGGTCAGAA
GTCCACAAAGTGAGATTGTCTCTGAGTAGCTGCATGATAAGAGTGCTGTCCTTGTATGAT
TCCTCGTTTAGACTATCAAGCTCTGCGATTCCATCGTCAAATGCTTGCTTAGCCAACTGA
CATGCACTTTCAGGAGAGTTCAAGATCTCATAGTAGAAAACAGAAAAGTTCAGCGCCAGG
CCAAGTCTAACTGGATGTGTGGGTGCTAAACCAGTCTCTGCAGCAGCAACAGCAGCCTTA
TATGCCTCTAGAGACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGTTCATCACCAGAACTAAACTCTGCC
AGATACCGATAATAATCTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACTGTAGATTCGACAGCCTTA
GACGAAGGGATGAGATGCTTATCAATGACAGACAAGATGTCATTACAAACTTTAGCAAGC
TCATCTTCAACACTCTTACGATAATTCTTGATCCTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF29JQ U 173
AF RR2ED59JQ U 1
AF RR2FN22JQ U 9
BS 1 43 RR2ED59JQ
BS 44 44 RR2FN22JQ
BS 45 217 RR2ED59JQ
BS 218 218 RR2BF29JQ
BS 219 247 RR2ED59JQ
BS 248 248 RR2BF29JQ
BS 249 291 RR2ED59JQ
BS 292 292 RR2BF29JQ
BS 293 737 RR2ED59JQ
BS 738 759 RR2FN22JQ

RD RR2BF29JQ 256 0 0
GTCTTCGGTTTATGATTTAGGATGCACCAAGAGCCGTTTTTCTTCTCACAGAGAGATTCA
GGATTCATTTCTCTTCTTGAGGCTCATCACCTTTGGATGGCTCGTCTCCTTCCTCTGGGA
GGTCAGAAGTCCACAAAGTGAGATTGTCTCTGAGTAGCTGCATGATAAGAGTGCTGTCCT
TGTATGATTCCTCGTTTAGACTATCAAGCTCTGCGATTCCATCGTCAAATGCTTGCTTAG
CCAACTGACATGCACT

QA 1 256 1 256
DS 

RD RR2ED59JQ 737 0 0
CAACTTTTGAAAGACAAAACTAAGTGAAATAGACAAAACATCATGAGAGAGTTTAAGATA
GGTAGCGATATGTTGTAGAACGTTAATGATCTGAAAACATCATCAGGGAAGACATTAATA
TTAAAAAGAAGAAATTACACTTTTTCAGTGTTTAGAGCTGAAGACGCTTGCTGTCTTCGG
TTTATGATTTAGGATGCACCAAGAGCCGTTTCTCTTCACACAGAGAGATTCAGGATTCAT
TTCTCTTATTGAGGCTCATCACCTTTGGATGGCTCGTCTCCTTCCTCTGGG*GGTCAGAA
GTCCACAAAGTGAGATTGTCTCTGAGTAGCTGCATGATAAGAGTGCTGTCCTTGTATGAT
TCCTCGTTTAGACTATCAAGCTCTGCGATTCCATCGTCAAATGCTTGCTTAGCCAACTGA
CATGCACTTTCAGGAGAGTTCAAGATCTCATAGTAGAAAACAGAAAAGTTCAGCGCCAGG
CCAAGTCTAACTGGATGTGTGGGTGCTAAACCAGTCTCTGCAGCAGCAACAGCAGCCTTA
TATGCCTCTAGAGACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGTTCATCACCAGAACTAAACTCTGCC
AGATACCGATAATAATCTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACTGTAGATTCGACAGCCTTA
GACGAAGGGATGAGATGCTTATCAATGACAGACAAGATGTCATTACAAACTTTAGCAAGC
TCATCTTCAACACTCTT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2FN22JQ 751 0 0
GAAAGACAAAACTAAGTGAAATAGACAAAACATCACGAGAGAGTTTAAGATAGGTAGCGA
TATGTTGTAGAACGTTAATGATCTGAAAACATCATCAGGGAAGACATTAATATTAAAAAG
AAGAAATTACACTTTTTCAGTGTTTAGAGCTGAAGACGCTTGCTGTCTTCGGTTTATGAT
TTAGGATGCACCAAGAGCCGTTTCTCTTCTCACAGAGAGATTCAGGATTCATTTCTCTTC
TTGAGGCTCATCACCTTTGGATGGCTCGTCTCCTTCCTCTGGGAGGTCAGAAGTCCACAA
AGTGAGATTGTCTCTGAGTAGCTGCATGATAAGAGTGCTGTCCTTGTACGATTCCTCGTT
TAGACTATCAAGCTCAGCGATTCCATCGTCAAGTGCTTGTTTAGCCAATTGGCATGCACT
TTCAGGAGAGTTCAAGATCTCATAGTAGAAAACTGAAAAGTTCAGCGCCAGGCCAAGTCT
AGCTGGATGTGTGGGTGCTAAACCAGTCTCTGCAGCAGCAACAGCAGCCTTATATGCCTC
TAGAGACTGATCTGCAGCTTCCTTGCGTTCATCACCAGAACTAAACTCTGCCAGATACCG
ATAATAATCTCCTTTCATTTTGTAGAAAAAGACTGTAGATTCGACAGCCTTAGACGAAGG
GATGAGATGCTTATCAATGACAGACAAGATGTCATTACAAACTTTAGCAAGCTCATCTTC
AACACTTTTACGATAATTCTTGATCCTCTTG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 7

CO CL798Contig1 1209 7 11 U
TTTTTTTGGGGGGGGGAAGGGTTTTTTTTTTTGGGGGGGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCCAACTTGTTGTGAGACAAATAGGTCAAA
AGAACCTAAAGATGTTCTCACATTTATGTCTATTCTCCAAGCTAAATAGGATCATCTACC
TACCTCCCATGGACCTTCAACTACCTGTGCTCCTTTCAAAACCAACTCTATTTGCATCTT
CAAACTTGGCTCAGCTGCTTGATTCACCACCCGATGCCAAGTTTGCGGGAGGATATTGAA
GCCCACACTGAAGGCCCACTTATGATCCATTAAGAAGTGTCTCAATAGTTCTGTGTTAGG
GTTTCTAGACTGATATAAATATGTTGTTAGTTGTTCTTTAGTTGTAACTTTGCTGCCGTG
AAAGGCAGCTCCTCTTCTCTATTTATGAAATACAATTTCTATCTATTTTGTTCTTGAAGA
CAACCTAAAGTCCTTACCTTTCTTGTTCTACATTGCACAATAAAGCTTTAATAAGCTATC
TTCATTTCTGTCTCAATAAAGCTCTTTGAGCATTTCTACAAATGTTATCATGGTATCAGA
GCACCAGGGATTAGATCTTGGTGTCTCTAGACTTCTTCTCAACTTCTCACATGTTCCATC
AGTCACCCCCTTCTCCAAGAGCTGCTTTTGTCTCGGTCTAGCACCAAGAGAAACAAGACT
CGAGCTTTTCCTGTGAAGAGTGCTTCTATTTCACAAGGGAGACCGGTTTGTTGGTTGCCT
GCAAGTGGGTTCTCTACAACTCTTCAGAACGTGGGTTATCTGCAAGCTTAACCAGGAAAT
CATCAAGCTTTCTCCATCTCTAAGTCACGGTAAAGTGACTTATTATCACACCAAAAAAAA
AAAAAAA****AATGGTTGATTGTTCTTGTGGTGGTTT*CTGGCTGGTTAGATAGTAGGA
TTGAACTCAGGAAGCTATATAATGCAACTGGAACGTTTTGGGTTTGATAATAATGAGATC
AGTGGCAGCAAGTCTCTGTTTTTGATGAGTGCGCACAAGATGTTTGGTTAAATGTCTAAG
AGAAAAACAGATTGTGAAACTGAAGAGTTTTTGATGGCATATGGATAGGAAATAGAGAGT
TGAGGTTTAGGCAGTTGTAGAATGGATATTCTCTTTGGTGGTGAGATAGCTTAGTCTAGT
TAGGAGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 10 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2C340JQ C 1
AF RR2E808JQ C 30
AF RR2E494TF U 410
AF RR2CO54TF U 410
AF RR2C340TF U 455
AF RR2BJ23TF U 410
AF RR2BJ23JQ C 556
BS 1 87 RR2C340JQ
BS 88 88 RR2E808JQ
BS 89 268 RR2C340JQ
BS 269 269 RR2E808JQ
BS 270 304 RR2C340JQ
BS 305 305 RR2E808JQ
BS 306 411 RR2C340JQ
BS 412 637 RR2BJ23TF
BS 638 638 RR2C340TF
BS 639 1146 RR2BJ23TF
BS 1147 1209 RR2BJ23JQ

RD RR2C340JQ 463 0 0
TTTTTTTGGGGGGGGGAAGGGTTTTTTTTTTTGGGGGGGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCCCCAACTTGTTGTGAGACAAATAGGTCAAA
AGAACCTAAAGATGTTCTCACATTTATGTCTATTCTCCAAGCTAAATAGGATCATCTACC
TACCTCCCATGGACCTTCAACTACCTGTGCTCCTTTCAAAACCAACTCTATTTGCATCTT
CAAACTTGGCTCAGCTGCTTGATTCACCCCCCGATGCCAAGTTTGCGGGAGGATATTGAA
GCCCCCACTGAAGGCCCACTTATGATCCATTAAGAAGTGTCTCAATAGTTCTGTGTTAGG
GTTTCTAGACTGATATAAATATGTTGTTAGTTGTTCTTTAGTTGTAACTTTGCTGCCGTG
AAAGGCAGCTCCTTTTCTCTATTTATGAAATACAATTTCTATC

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2E808JQ 435 0 0
CTTTCCTTTAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAATCCCCAACTTGTT
GTGAGACAAATAGGTCAAAAGAACCTAAAGATGTTCTCACATTTATGTCTATTCTCCAAG
CTAAATAGGATCATCTACCTACCTCCCATGGACCTTCAACTACCTGTGCTCCTTTCAAAA
CCAACTCTATTTGCATCTTCAAACTTGGCTCAGCTGCTTGATTCACCACCCGATGCCAAG
TTTGCGGGAGGGTATTGAAGCCCACACTGAAGGCCCACTTATGATCCATTAAGAAGTGTC
TCAATAGTTCTGTGTTAGGGTTTCTAGACTGATATAAATATGTTGTTAGTTGTTCTTTAG
TTGTAACTTTGCTGCCGTGAAAGGCAGCTCCTCTTCTCTATTTATGAAATACAATTTCTA
TC
C

QA 13 434 13 434
DS 

RD RR2E494TF 327 0 0
GG
GCTGCCGTGAAAGGCAGCTCCTCTTCTCTATTTATGAAATACAATTTCTATCTATTTTGT
TCTTGAAGACAACCTAAAGTCCTTACCTTTCTTGTTCTACATTGCACAATAAAGCTTTAA
TAAGCTATCTTCATTTCTGTCTCAATAAAGCTCTTTGAGCATTTCTACAAATGTTATCAT
GGTATCAGAGCACCAGGGATTAGATCTTGGTGTCTCTAGACTTCTTCTCAACTTCTCACA
TGTTCCATCAGTCACCCCCTTCTCCAAGAGCTGCTTTTGTCTCGGTCTAGCACTAA*AGA
AACAAGACTCGAGCTTTTCCTGTGA

QA 3 327 3 327
DS 

RD RR2CO54TF 669 0 0
GG
GCTGCCGTGAAAGGCAGCTCCTCTTCTCTATTTATGAAATACAATTTCTATCTATTTTGT
TCTTGAAGACAACCTAAAGTCCTTACCTTTCTTGTTCTACATTGCACAATAAAGCTTTAA
TAAGCTGTCTTCATTTCTGTCTCAATAAAGCTCTTTGAGCATTTCTACAAATGTTATCAT
GGTATCAGAGCACCAGGGATTAGATCTTGGTGTCTCTAGACTTCTTCTCAACTTCTCACA
TGTTCCATCAGTCACCCCCTTCTCCAAGAGCTGCTTTTGTCTCGGTCTAGCACCAAGAGA
AACAAGACTCGAGCTTTTCCTGTGAAGAGTGCTTCTATTTCACAAGGGAGACCGGTTTGT
TGGTTGCCTGCAAGTGGGTTCTCTACAACTCTTCAGAACGTGGGTTATCTGCAAGCTTAA
CCAGGAAATCATCAAGCTTTCTCCATCTCTAAGTCACGGTAAAGTGACTTATTATCACAC
CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGGTTGATTGTTCTTGTGGTGGTTTGCTGGCTGGTTAG
ATAGTAGGATTGAACTCAGGAAGCTATATAATGCAACTGGAACGTTTTGGGTTTGATAAT
AATGAGATCAGTGGCAGCAAGTCTCTGTTTTTGATGAGTGCGCACAAGATGTTTGGTTAA
ATGTCTA

QA 3 669 3 669
DS 

RD RR2C340TF 651 0 0
ATTTCTATCTATTTTGTTCTTGAAGACAACCTAAAGTCCTTACCTTTCTTGTTCTACATT
GCACAATAAAGCTTTAATAAGCTATCTTCATTTCTGTCTCAATAAAGCTCTTTGAGCATT
TCTACAAATGTTATCATGGTATCAGAGCACCAGGGATTAGATCTTGGTGTCTCTAGACTT
CTTCTCAACTTCTCACATGTTCCATCAGTCACCCCCTTCTCCAAGAGCTGCTTTTGTCTC
GGTCTAGCACCAAGAGAAACAAGACTCGAGCTTTTCCTGTGAAGAGTGCTTCTATTTCAC
AAGGGAGACCGGTTTGTTGGTTGCCTGCAAGTGGGTTCTCTACAACTCTTCAGAACGTGG
GTTATCTGCAAGCTTAACCAGGAAATCATCAAGCTTTCTCCATCTCTAAGTCACGGTAAA
GTGACTTATTATCACACCAAAAAAAAAAAAAAA****AATGGTTGATTGTTCTTGTGGTG
GTTTGCTGGCTGGTTAGATAGTAGGATTGAACTCAGGAAGCTATATAATGCAACTGGAAC
GTTTTGGGTTTGATAATAATGAGATCAGTGGCAGCAAGTCTCTGTTTTTGATGAGTGCAC
ACAAGATGTTTGGTTAAATGTCTAAGAGAAAA*CAGATTGTGAAACTGA
GA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2BJ23TF 737 0 0
GG
GCTGCCGTGAAAGGCAGCTCCTCTTCTCTATTTATGAAATACAATTTCTATCTATTTTGT
TCTTGAAGACAACCTAAAGTCCTTACCTTTCTTGTTCTACATTGCACAATAAAGCTTTAA
TAAGCTATCTTCATTTCTGTCTCAATAAAGCTCTTTGAGCATTTCTACAAATGTTATCAT
GGTATCAGAGCACCAGGGATTAGATCTTGGTGTCTCTAGACTTCTT*TCAACTTCTCACA
TGTTCCATCAGTCACCCCCTTCTCCAAGAGCTGCTTTTGTCTCGGTCTAGCACCAAGAGA
AACAAGACTCGAGCTTTTCCTGTGAAGAGTGCTTCTATTTCACAAGGGAGACCGGTTTGT
TGGTTGCCTGCAAGTGGGTTCTCTACAACTCTTCAGAACGTGGGTTATCTGCAAGCTTAA
CCAGGAAATCATCAAGCTTTCTCCATCTCTAAGTCACGGTAAAGTGACTTATTATCACAC
CAAAAAAAAAAAAAAA****AATGGTTGATTGTTCTTGTGGTGGTTT*CTGGCTGGTTAG
ATAGTAGGATTGAACTCAGGAAGCTATATAATGCAACTGGAACGTTTTGGGTTTGATAAT
AATGAGATCAGTGGCAGCAAGTCTCTGTTTTTGATGAGTGCGCACAAGATGTTTGGTTAA
ATGTCTAAGAGAAAAACAGATTGTGAAACTGAAGAGTTTTTGATGGCATATGGATAGGAA
ATAGAGAGTTGAGGT

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR2BJ23JQ 654 0 0
ATAAAGCTCTTTGAGCATTTCTACAAATGTTATCATGGTATCAGAGCACCAGGGATTAGA
TCTTGGTGTCTCTAGACTTCTT*TCAACTTCTCACATGTTCCATCAGTCACCCCCTTCTC
CAAGAGCTGCTTTTGTTTCGGTCTAGCACCAAGAGAAACAAGACTCGAGCTTTTCCTGTG
AAGAGTGCTTTTATTTCACAAGGGAGACCGGTTTGTTGGTTGCCTGCAAGTGGGTTTTTT
ACAACTTTTCAGAACGTGGGTTATTTGCAAGCTTAACCAGGAAATCATCAAGCTTTCTCC
ATCTTTAAGTCACGGTAAAGTGACTTATTATCACACCAAAAAAAAAAAAAAA****AATG
GTTGATTGTTCTTGTGGTGGTTT*CTGGCTGGTTAGATAGTAGGATTGAACTCAGGAAGC
TATATAATGCAACTGGAACGTTTTGGGTTTGATAATAATGAGATCAGTGGCAGCAAGTCT
CTGTTTTTGATGAGTGCGCACAAGATGTTTGGTTAAATGTCTAAGAGAAAAACAGATTGT
GAAACTGAAGAGTTTTTGATGGCATATGGATAGGAAATAGAGAGTTGAGGTTTAGGCAGT
TGTAGAATGGATATTCTCTTTGGTGGTGAGATAGCTTAGTCTAGTTAGGAGGAT

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 8

CO CL799Contig1 919 8 11 U
GGTCCTCAGAGATTTTCAGATAGTGTCCGAACGTCGAAACAACAACATGAAGACATCTCC
ACAAAGATTCCTTTTTCCTTTTTCCATAGCTTCGATCTTCCTCCAATGGCTGTCAACTCT
CCCATTTCGTCTCACCCAAGAACACAGTTTCTCTCCAACCCTGTTCTCCCTCGCTTTCGC
CGGTCATACTCCGCCGTGAAATCACCAGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCTCCCCAG
AAAAAGGTGAACAAGTACGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTATTC
TTCGAAGGAAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTA
CTAAGCAACGTTGAGAAATCTGGCCTTCTCTCAAAAGCAGAGGACTTGGGGGTCACGTTG
TCATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTCTTCTCAAAAGCAGAGGAGCTAGGTCTTCTCAGTCTC
CTTGAGACTTTAGCCGGTACATCTCCCGCGGTCTTGGCCTCGGCTGCATTACCGGCTCTG
ACGGCTGCTATTGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCT
CAAGCGGTTTTGGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTTGGGTCTGTT
GTTTTGGATGGACTCCAAGAAGCTGATTGAGTGTTTCCTCTGTAAACAAAACACAACTAA
AAACATTGTTGTGCAAGAGTTAGTGCAATTGTTTTTTGTAATAAGTTTCTATAGAAGAAG
GACTCTAGCTTCTTAAAGCCTTAATGAAAATAGTATCTGGTTCACCCAACTCGTGTGTTA
AAGTTTTCCCTAGTTCATCTGATTAGATGTATCCACTTTCATCTTTGTCAAAGAACATGA
AAGCTTGTCTGAAATATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 5 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA43TF U 1
AF RR2CJ48TF U 72
AF RR2GK37TF U 103
AF RR2G046TF U 132
AF RR2GK37JQ C 103
AF RR2G046JQ C 105
AF RR2BE95JQ C 384
AF RR2CJ48JQ C 251
BS 1 581 RR2HA43TF
BS 582 582 RR2CJ48TF
BS 583 695 RR2HA43TF
BS 696 696 RR2CJ48TF
BS 697 710 RR2HA43TF
BS 711 722 RR2CJ48TF
BS 723 723 RR2G046TF
BS 724 767 RR2GK37TF
BS 768 777 RR2G046TF
BS 778 827 RR2GK37JQ
BS 828 919 RR2CJ48JQ

RD RR2HA43TF 712 0 0
GGTCCTCAGAGATTTTCAGATAGTGTCCGAACGTCGAAACAACAACATGAAGACATCTCC
ACAAAGATTCCTTTTTCCTTTTTCCATAGCTTCGATCTTCCTCCAATGGCTGTCAACTCT
CCCATTTCGTCTCACCCAAGAACACAGTTTCTCTCCAACCCTGTTCTCCCTCGCTTTCGC
CGGTCATACTCCGCCGTGAAATCACCAGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCTCCCCAG
AAAAAGGTGAACAAGTACGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTATTC
TTCGAAGGAAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTA
CTAAGCAACGTTGAGAAATCTGGCCTTCTCTCAAAAGCAGAGGACTTGGGGGTCACGTTG
TCATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTCTTCTCAAAAGCAGAGGAGCTAGGTCTTCTCAGTCTC
CTTGAGACTTTAGCCGGTACATCTCCCGCGGTCTTGGCCTCGGCTGCATTACCGGCTCTG
ACGGCTGCTATTGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCGACTACTCTGGTGGTTGCT
CAAGCGGTTTTGGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTTGGGTCTGTT
GTTTTGGATGGACTCCAAGAAGCTGATTGAGTGTT*CCTCTGTAAACAAA
CA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2CJ48TF 653 0 0
TTTTTCCTTTTTCCATAGCTTCGATCTTCCTCCAATGGCTGTCAACTCTCCCATTTCGTC
TCACCCAAGAACACAGTTTCTCTCCAACCCTGTTCTCCCTCGCTTTCGCCGGTCATACTC
CGCCGTGAAATCACCAGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCTCCCCAGAAAAAGGTGAA
CAAGTACGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGAAG
CGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAACGT
TGAGAAATCTGGCCTTCTCTCAAAAGCAGAGGACTTGGGGGTCACGTTGTCATCTCTTGA
GAAGCTTGGTGTCTTCTCAAAAGCAGAGGAGCTAGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACTTT
AGCCGGTACATCTCCCGCGGTCTTGGCCTCGGCTGCATTACCGGCTCTGACGGCTGCTAT
TGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTTTT
GGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTTGGGTCTGTTGTTTTGGATGG
ACTCCAAGAAGCTGATTGAGTGTTTCCTCTGTAAACAAAACACAACTAAAA*A

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2GK37TF 665 0 0
GG
AATGGCTGTCAACTCTCCCATTTCGTCTCACCCAAGAACACAGTTTCTCTCCAACCCTGT
TCTCCCTCGCTTTCGCCGGTCATACTCCGCCGTGAAATCACCAGCAGCCTTCTCCGTCGT
CTCAATGGCTCCCCAGAAAAAGGTGAACAAGTACGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTA
CGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGAAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCT
GGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAACGTTGAGAAATCTGGCCTTCTCTCAAAAGCAGAGGA
CTTGGGGGTCACGTTGTCATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTCTTCTCAAAAGCAGAGGAGCT
AGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACTTTAGCCGGTACATCTCCCGCGGTCTTGGCCTCGGC
TGCATTACCGGCTCTGACGGCTGCTATTGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAAC
TACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTTTTGGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTT
GTTGGTTGGGTCTGTTGTTTTGGATGGACTCCAAGAAGCTGATTGAGTGTTTCCTCTGTA
AACAAAACACAACTAAAA*CATTGTTGTGCAAGAGTTAGTGCAATTGTTTTTTGTAATAA
GTT

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR2G046TF 646 0 0
TCACCCGAGAACACAGTTTCTCTCCAACCCCGTTCTCCCTCGCTTTCGCCGGTCATACTC
CGCCGTGAAATCACCAGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCTCCCCAGAAAAAGGTGAA
CAAGTACGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGAAG
CGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAACGT
TGAGAAATCTGGCCTTCTCTCAAAAGCAGAGGACTTGGGGGTCACGTTGTCATCTCTTGA
GAAGCTTGGTGTCTTCTCAAAAGCCGAGGAGCTAGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACTTT
AGCCGGTACATCTCCCGCGGTCTTGGCCTCGGCTGCATTACCGGCTCTGACGGCTGCTAT
TGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTTTT
GGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTTGGGTCTGTTGTTTTGGATGG
ACTCCAAGAAGCTGATTGAGTGTTTCCTCTGTAAACAAAACACAACTAAAAACATTGTTG
TGCAAGAGTTAGTGCAATTGTTTTTTGTAATAAGTTTCTATAGAAG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2GK37JQ 726 0 0
GG
AATGGCTGTCAACTCTCCCATTTCGTCTCACCCAAGAACACAGTTTCTCTCCAACCCTGT
TCTCCCTCGCTTTCGCCGGTCATACTCCGCCGTGAAATCACCAGCAGCCTTCTCCGTCGT
CTCAATGGCTCCCCAGAAAAAGGTGAACAAGTACGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTA
CGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGAAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCT
GGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAACGTTGAGAAATCTGGCCTTCTCTCAAAAGCAGAGGA
CTTGGGGGTCACGTTGTCATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTCTTCTCAAAAGCAGAGGAGCT
AGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACTTTAGCCGGTACATCTCCCGCGGTCTTGGCCTCGGC
TGCATTACCGGCTCTGACGGCTGCTATTGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAAC
TACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTTTTGGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTT
GTTGGTTGGGTCTGTTGTTTTGGATGGACTCCAAGAAGCTGATTGAGTGTTTCCTCTGTA
AACAAAACACAACTAAAA*CATTGTTGTGCAAGAGTTAGTGCAATTGTTTTTTGTAATAA
GTTTCTATAGAAGAAGGACTCTAGCTTCTTAAAGCCTTAATGAAAATAGTATCTGGTTCA
CCC
C

QA 3 725 3 725
DS 

RD RR2G046JQ 723 0 0
AATGGCTGTCAACGCTCCCATATCGTCTCACCCGAGAACACAGTTTCTCTCCAACCCCGT
TCTCCCTCGCTTTCGCCGGTCATACTCCGCCGTGAAATCACCAGCAGCCTTCTCCGTCGT
CTCAATGGCTCCCCAGAAAAAGGTGAACAAGTACGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTA
CGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGAAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCT
GGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAACGTTGAGAAATCTGGCCTTCTCTCAAAAGCAGAGGA
CTTGGGGGTCACGTTGTCATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTCTTCTCAAAAGCCGAGGAGCT
AGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACTTTAGCCGGTACATCTCCCGCGGTCTTGGCCTCGGC
TGCATTACCGGCTCTGACGGCTGCTATTGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAAC
TACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTTTTGGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTT
GTTGGTTGGGTCTGTTGTTTTGGATGGACTCCAAGAAGCTGATTGAGTGTTTCCTCTGTA
AACAAAACACAACTAAAAACATTGTTGTGCAAGAGTTAGTGCAATTGTTTTTTGTAATAA
GTTTCTATAGAAGAAGGACTCTAGCTTCTTAAAGCCTTAATGAAAATAGTATCTGGTTCA
CCC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2BE95JQ 444 0 0
CCTTCTCTCAAAAGCAGAGGACTTGGGGGTCACGTTGTCATCTCTTGAGAAGCTTGGTGT
CTTCTCAAAAGCAGAGGAGCTAGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACTTTAGCCGGTACATC
TCCCGCGGTCTTGGCCTCGGCTGCATTACCGGCTCTGACGGCTGCTATTGTAGCCGTGGT
GCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTTTTGGGCGGTGCTTT
TGCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTTGGGTCTGTTGTTTTGGATGGACTCCAAGAAGC
TGATTGAGTGTTTCCTCTGTAAACAAAACACAACTAAAAACATTGTTGTGCAAGAGTTAG
TGCAATTGTTTTTTGTAATAAGTTTCTATAGAAGAAGGACTCTAGCTTCTTAAAGCCTTA
ATGAAAATAGTATCTGGTTCACCC

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR2CJ48JQ 669 0 0
ACAAGTACGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGAA
GCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAACG
TTGAGAAATCTGGCCTTCTCTCAAAAGCAGAGGACTTGGGGGTCACGTTGTCATCTCTTG
AGAAGCTTGGTGTCTTCTCAAAAGCAGAGGAGCTAGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACTT
TAGCCGGTACATCTCCCGCGGTCTTGGCCTCGGCTGCATTACCGGCTCTGACGGCTGCTA
TTGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTTT
TGGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTTGGGTCTGTTGTTTTGGATG
GACTCCAAGAAGCTGATTGAGTGTTTCCTCTGTAAACAAAACACAACTAAAAACATTGTT
GTGCAAGAGTTAGTGCAATTGTTTTTTGTAATAAGTTTCTATAGAAGAAGGACTCTAGCT
TCTTAAAGCCTTAATGAAAATAGTATCTGGTTCACCCAACTCGTGTGTTAAAGTTTTCCC
TAGTTCATCTGATTAGATGTATCCACTTTCATCTTTGTCAAAGAACATGAAAGCTTGTCT
GAAATATTC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 2 7

CO CL800Contig1 1465 3 7 U
GGAATAAGATTAGACCTTCGCGTCACTCATCTCCCTCGACGATCTCCCAACTCCTCTTTC
TCTCTCTGTTCATTTGATCTCTCTCTGTCTCTGTCTACGAGACTTTCGGAATCGAACCAT
GGATGAAGAGTACGAGGTCATTGTTCTTGGAACCGGTCTTAAGGAGTGCATCCTCAGCGG
TCTCCTCTTCGTCGATGGTGTCAAGGTGCTTCACATGGACAGAAACGATTACTATGGTGG
AGAATCAACTTCGCTTAATCTCAATCAGCTTTGGAAGAAGTTCAGGGGTGAAGAGAAGGC
TCCTGAACATTTAGGCGCTAGCAGGGACTACAATGTTGACATGATGCCTAAGTTTATGAT
GGGAAATGGAAAGCTTGTTCGTACCCTTATTCACACTGACGTTACAAAGTATTTGTCCTT
TAAAGCCGTTGATGGAAGCTATGTTTTCGTCAAAGGCAAGGTTCAAAAGGTGCCAGTCAC
TCCTATGGAGGCCCTGAAATCTCCTCTCATGGGTATATTTGAGAAACGTCGAGCTGGCAA
GTTTTTCAGTTATGTTCAGGATTACGACGAGCAGGATCCCAAAACACACAACGGCATGGA
TTTGACCAAACTTACAACTAAGGAACTCATTGCGAAATTTGGTCTTGATGACAACACCAT
TGACTTTATTGGTCACGCAGTGGCACTTCACACTAATGACCAACATCTCAATCAACCCGC
CTTGGATACCGTTATGAGAATGAAGCTCTATGCGGAATCTCTTGCTCGTTTCCAAGGAAC
CTCTCCATATATTTATCCTCTCTATGGGCTGGGAGAACTACCTCAGGCATTGCACGACTG
AGTGCTGTATATGGTGGCACATATATGCTGTGCAAACCTGAGTGCAAGGTAGAGTTTGAT
GAAGAAGGTAAGGTTATTGGTGTAACATCTGAGGGAGAGACTGCCAAATGCAAAAAGATT
GTGTGTGACCCTTCCTACCTTCCAAACAAGGTTAGGAAGATTGGTAGAGTTGCTCGGGCC
ATCGCAATTATGAGCCACCCTATTCCAAACACCAATGATTCTCACTCAGTGCAGGTCATC
ATACCTCAGAAGCAGTTGGGCCGCAAATCAGACATGTATGTCTTCTGCTGTTCCTACTCC
CACAACGTTGCTCCCAAGGGAAAATTCATCGCATTTGTATCTACAGATGCAGAGACTGAT
AACCCTCAGACCGAGCTAAAGGCTGGAGTTGATTTCTTGGGTCCTGTTGATGAGATATTT
TTTGACATGTATGATAGATACGAGCCTGTCAACGAGCCAGCTTTGGACAACTGCTTTATA
TCAACGAGCTATGATGCTACAACACACTTCGAGACAACTGTTACTGATGTGTTGAACATG
TATACCCTAATCACTGGAAAGCAACTGGACCTAAGTGTTGATTTGAGTGCAGCAAGCGCT
GCAGAGGAGTGAGGGTGTATTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK80TF U 1
AF RR2CK61TF U 564
AF RR2CK61JQ C 982
BS 1 622 RR2DK80TF
BS 623 623 RR2CK61TF
BS 624 653 RR2DK80TF
BS 654 654 RR2CK61TF
BS 655 700 RR2DK80TF
BS 701 1208 RR2CK61TF
BS 1209 1465 RR2CK61JQ

RD RR2DK80TF 700 0 0
GGAATAAGATTAGACCTTCGCGTCACTCATCTCCCTCGACGATCTCCCAACTCCTCTTTC
TCTCTCTGTTCATTTGATCTCTCTCTGTCTCTGTCTACGAGACTTTCGGAATCGAACCAT
GGATGAAGAGTACGAGGTCATTGTTCTTGGAACCGGTCTTAAGGAGTGCATCCTCAGCGG
TCTCCTCTTCGTCGATGGTGTCAAGGTGCTTCACATGGACAGAAACGATTACTATGGTGG
AGAATCAACTTCGCTTAATCTCAATCAGCTTTGGAAGAAGTTCAGGGGTGAAGAGAAGGC
TCCTGAACATTTAGGCGCTAGCAGGGACTACAATGTTGACATGATGCCTAAGTTTATGAT
GGGAAATGGAAAGCTTGTTCGTACCCTTATTCACACTGACGTTACAAAGTATTTGTCCTT
TAAAGCCGTTGATGGAAGCTATGTTTTCGTCAAAGGCAAGGTTCAAAAGGTGCCAGTCAC
TCCTATGGAGGCCCTGAAATCTCCTCTCATGGGTATATTTGAGAAACGTCGAGCTGGCAA
GTTTTTCAGTTATGTTCAGGATTACGACGAGCAGGATCCCAAAACACACAACGGCATGGA
TTTGACCAAACTTACAACTAAG*AACTCATTGCGAAATTTGGTCTTGATGACA*CACCAT
TGACTTTATTGGTCACGCAGTGGCACTTCACACTAATGAC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2CK61TF 653 0 0
G
CGACGAGCAGGATCCCAAAACACACAACGGCATGGATTTGACCAAACTTACAACTAAGGA
ACTCATTGCGAAATTTGGTCTTGATGACAACACCATTGACTTTATTGGTCACGCAGTGGC
ACTTCACACTAATGACCAACATCTCAATCAACCCGCCTTGGATACCGTTATGAGAATGAA
GCTCTATGCGGAATCTCTTGCTCGTTTCCAAGGAACCTCTCCATATATTTATCCTCTCTA
TGGGCTGGGAGAACTACCTCAGGCATTGCACGACTGAGTGCTGTATATGGTGGCACATAT
ATGCTGTGCAAACCTGAGTGCAAGGTAGAGTTTGATGAAGAAGGTAAGGTTATTGGTGTA
ACATCTGAGGGAGAGACTGCCAAATGCAAAAAGATTGTGTGTGACCCTTCCTACCTTCCA
AACAAGGTTAGGAAGATTGGTAGAGTTGCTCGGGCCATCGCAATTATGAGCCACCCTATT
CCAAACACCAATGATTCTCACTCAGTGCAGGTCATCATACCTCAGAAGCAGTTGGGCCGC
AAATCAGACATGTATGTCTTCTGCTGTTCCTACTCCCACAACGTTGCTCCCAAGGGAAAA
TTCATCGCATTTGTATCTACAGATGCAGAGACTGATAACCCTCA
GACCGAGC

QA 2 645 2 645
DS 

RD RR2CK61JQ 484 0 0
CCA
AACAAGGTTAGGAAGATTGGTAGAGTTGCTCGGGCCATCGCAATTATGAGCCACCCTATT
CCAAACACCAATGATTCTCACTCAGTGCAGGTCATCATACCTCAGAAGCAGTTGGGCCGC
AAATCAGACATGTATGTTTTTTGCTGTTCCTACTCCCACAACGTTGCTCCCAAGGGAAAA
TTCATCGCATTTGTATTTACAGATGCAGAGACTGATAACCCTCAGACCGAGCTAAAGGCT
GGAGTTGATTTCTTGGGTCCTGTTGATGAGATATTTTTTGACATGTATGATAGATACGAG
CCTGTCAACGAGCCAGCTTTGGACAACTGCTTTATATCAACGAGCTATGATGCTACAACA
CACTTCGAGACAACTGTTACTGATGTGTTGAACATGTATACCCTAATCACTGGAAAGCAA
CTGGACCTAAGTGTTGATTTGAGTGCAGCAAGCGCTGCAGAGGAGTGAGGGTGTATTTTT
T

QA 4 484 4 484
DS 



CO CL800Contig2 767 4 4 U
GAAACACGTTTGTATTCAGAAAACAATAACGAGAGTAATAAGTGAACACAAAGTAATGAC
AAAGAAAAAGTCTTAACCGAATTCAACATTAAGGGGAACTATCATGAGCACTGGTCTTGT
TTGGTCTTTCAAACCCAAAAGAGAAAAAAAGAAGAAAAACACAAAAGCAAGAGTCGAAAC
AACAACTAGAGAGAGCGAACCGGTGGTTCCCTCATTCCTCTTCAGTACTTGCTGCACTCA
GATCCACACTTAGGTCCAGTTGCTTTCCAGTGATTAGAGTATACATGTTCAACACATCAG
CAACGGTTGTCTCGAAGTGAGTTGTAGCATCATAGCTGGTTGATATAAAGCAGTTGTCCA
ACTCAGGCTCGTTGACAGGCTCATATCTATCATAGACGTCGAAAAATATCTCATCAACAG
GACCCAACAAATCAATTCCAGCCTTCAGTTCAGTTTGAGGGTTATCAGTCTCTGCATCTG
TCGACACAAATGCGATGAACTTTCCCTTGGGAGCAACGTTGTGGGAGTACGAACAGCAGA
ACACATACATGTCTGATTTACGGGCCAACTGCTTCTGAGGTATGATGACCTGAACCGAGT
GAGAGTCATTGGTGTTTGGAATAGGGTGGCTCATAATAGCAATGGCCCGAGCAACCCTTC
CAATCTTTCTAACCTTGTTGGGCAGGTAAGAAGGGTCACAGACAATCTTTTTGCATCTTG
CAGTCTCTCCCTCAGATGTTACACCAGTAACCTTACCTTCTTCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2F961JQ U 17
AF RR2CW47JQ U 88
AF RR2G890JQ U 1
AF RR2G890TF C 82
BS 1 66 RR2G890JQ
BS 67 67 RR2F961JQ
BS 68 763 RR2G890JQ
BS 764 767 RR2G890TF

RD RR2F961JQ 521 0 0
CAA
AAAACAATAACGAGAGTAATAAGTGAACACAAAGTAATGACAAAGAAAAAGTCTTAACCG
AATTCAACATTAAGGGGAACTATCATGAGCACTGGTCTTGTTTGGTCTTTCAAACCCAAA
AGAGAAAAAAAGAAAAAAAACACAAAAGCAAGAGTCGAAACAACAACTAGAGAGAGCGAA
CCGGTGGTTCCCTCATTCCTCTTCAGTACTTGCTGCACTCAGATCCAAACTTAGGTCCAG
TTGCTTTCCAGTGAT*AGAGTATACATGTTCAACACATCAGCAACGGTTGTCTCGAAGTG
AGTTGTAGCATCATAGCTGGTTGATATAAAGCAGTTGTCCAACTCAGGCTCGTTGAAAGG
CTCATATCTATCATAGACGTCGAAAAATATCTCATCAACAGGACCCAACAAATCAATTCC
AGCCTTCAGTTCAGTTTGAGGGTTATCAGTCTCTGCATCTGTCGACACAAATGCGATGAA
CTTTCCCTTGGGAGCAACGTTGTGGGAGTACGAACAGC

QA 4 521 4 521
DS 

RD RR2CW47JQ 479 0 0
ATTAAGGGGAAATATCATGAGCACTGGTCTTGTTTGGTCTTTCAAACCCAAAAGA*AAAA
AAAGAAGAAAAACACAAAAGCAAGAGTCGAAACAACAACTAGAGAGAGCGAACCGGTGGT
TCCCTCATTCCTCTTCAGTACTTGCTGCACTCAGATCCACACTTAGGTCCAGTTGCTTTC
CAGTGATTAGAGTATACATGTTCAACACATCAGCAACGGTTGTCTCGAAGTGAGTTGTAG
CATCATAGCTGGTTGATATAAAGCAGTTGTCCAACTCAGGCTCGTTGACAGGCTCATATC
TATCATAAACGTCGAAAAATATCTCATCAACAGGACCCAACAAATCAGTTCCAGCCTTTA
GTTCAGTTTGAGGGTTATCAGTCTCTGCATCTGCCGACACAAATGCGATGAACTTTCCCT
TGGGAGCAACGTTGTGGGAGTACGAACAGCAAAACACATACATGTCTGATTT
ACGGGCC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2G890JQ 766 0 0
GAAACACGTTTGTATTCAGAAAACAATAACGAGAGTAATAAGTGAACACAAAGTAATGAC
AAAGAAGAAGTCTTAACCGAATTCAACATTAAGGGGAACTATCATGAGCACTGGTCTTGT
TTGGTCTTTCAAACCCAAAAGAGAAAAAAAGAAGAAAAACACAAAAGCAAGAGTCGAAAC
AACAACTAGAGAGAGCGAACCGGTGGTTCCCTCATTCCTCTTCAGTACTTGCTGCACTCA
GATCCACACTTAGGTCCAGTTGCTTTCCAGTGATTAGAGTATACATGTTCAACACATCAG
CAACGGTTGTCTCGAAGTGAGTTGTAGCATCATAGCTGGTTGATATAAAGCAGTTGTCCA
ACTCAGGCTCGTTGACAGGCTCATATCTATCATAGACGTCGAAAAATATCTCATCAACAG
GACCCAACAAATCAATTCCAGCCTTCAGTTCAGTTTGAGGGTTATCAGTCTCTGCATCTG
TCGACACAAATGCGATGAACTTTCCCTTGGGAGCAACGTTGTGGGAGTACGAACAGCAGA
ACACATACATGTCTGATTTACGGGCCAACTGCTTCTGAGGTATGATGACCTGAACCGAGT
GAGAGTCATTGGTGTTTGGAATAGGGTGGCTCATAATAGCAATGGCCCGAGCAACCCTTC
CAATCTTTCTAACCTTGTTGGGCAGGTAAGAAGGGTCACAGACAATCTTTTTGCATCTTG
CAGTCTCTCCCTCAGATGTTACACCAGTAACCTTACCTTCTTC
GTC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2G890TF 686 0 0
TTCAAC
ATTAAGGGGAACTATCATGAGCACTGGTCTTGTTTGGTCTTTCAAACCCAAAAGAGAAAA
AAAGAAGAAAAACACAAAAGCAAGAGTCGAAACAACAACTAGAGAGAGCGAACCGGTGGT
TCCCTCATTCCTCTTCAGTACTTGCTGCACTCAGATCCACACTTAGGTCCAGTTGCTTTC
CAGTGATTAGAGTATACATGTTCAACACATCAGCAACGGTTGTCTCGAAGTGAGTTGTAG
CATCATAGCTGGTTGATATAAAGCAGTTGTCCAACTCAGGCTCGTTGACAGGCTCATATC
TATCATAGACGTCGAAGAATATCTCATCAACAGGACCCAACAAATCAATTCCAGCCTTCA
GTTCAGTTTGAGGGTTATCAGTCTCTGCATCTGTCGACACAAATGCGATGAACTTTCCCT
TGGGAGCAACGTTGTGGGAGTACGAACAGCAGAACACATACATGTCTGATTTACGGGCCA
ACTGCTTCTGAGGTATGATGACCTGAACCGAGTGAGAGTCATTGGTGTTTGGAATAGGGT
GGCTCATAATAGCAATGGCCCGAGCAACCCTTCCAATCTTTCTAACCTTGTTGGGCAGGT
AAGAAGGGTCACAGACAATCTTTTTGCATCTTGCAGTCTCTCCCTCAGATGTTACACCAG
TAACCTTACCTTCTTCGTCC

QA 7 686 7 686
DS 



AS 1 8

CO CL801Contig1 941 8 16 U
TTTTTTTTCCCGTCTCCTAGCTGACTAAATAACCCCTCTTTCTTTACTCTCTCTCTCTCT
GCTCAAATCGAAATTAGGGTTCGAAGTTTGACGGCGAGAAGATGAGTGCTTCAAGGTTCA
TAAAGTGCGTCACCGTCGGTGACGGCGCCGTCGGCAAGACTTGTCTACTCATCTCCTACA
CAAGCAACACTTTCCCCACTGATTATGTGCCAACTGTGTTTGATAATTTCAGCGCTAATG
TGATTGTTGATGGGAACACCATCAACTTAGGATTGTGGGACACTGCAGGACAAGAGGACT
ATAATAGACTAAGACCATTGAGCTATCGTGGTGCTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTC
TCGTCAGCAAAGCTAGCTATGAAAATGTTGCTAAAAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATT
ACGCTCCTGGTGTTCCCATCATCCTTGTTGGAACAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGC
AGTACTTTGTTGAGCACCCTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTGA
AGAAGCTTGTTGGAGCTTCTGCTTATATAGAATCCAGTGCAAAGACACAACAGAATGTAA
AAGCTGTCTTTGATGCGGCTATTAAAGTAGTTCTCCAGCCACCTAAAAACAAGAAGAAAA
AGAAGAGAAAGTCTCAGAAAGGCTGTTCTATATTGTGATTCCAGAGAAGAAGAAACACAC
AGTTATAAATTTATAACTAATCCTTGTTTCCGAGTGCTACGGACCCATTTTTCTTACTTC
CATGAAACAGGAATCTGTTGTTTTGTAGTCTGAATACTGACATCAGAAGAAACTCATTGG
TCTTTATTTGAGGTTGTATTCTTGTTTGCATTCCGAATATGTAAATATATGATGATACCA
CGTTTGCTTTTGATTCCATTATAGAGACTATTTACTGCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA61TF U 1
AF RR2CV93TF U 52
AF RR2FT51TF U 17
AF RR2FW44TF U 59
AF RR2B147TF U 55
AF RR2B147JQ C 180
AF RR2CV93JQ C 230
AF RR2HA61JQ C 248
BS 1 425 RR2HA61TF
BS 426 426 RR2FT51TF
BS 427 649 RR2HA61TF
BS 650 710 RR2FT51TF
BS 711 711 RR2B147TF
BS 712 772 RR2FT51TF
BS 773 773 RR2B147TF
BS 774 784 RR2FT51TF
BS 785 790 RR2B147TF
BS 791 791 RR2FW44TF
BS 792 792 RR2B147TF
BS 793 793 RR2B147JQ
BS 794 831 RR2B147TF
BS 832 832 RR2B147JQ
BS 833 848 RR2B147TF
BS 849 941 RR2B147JQ

RD RR2HA61TF 649 0 0
TTTTTTTTCCCGTCTCCTAGCTGACTAAATAACCCCTCTTTCTTTACTCTCTCTCTCTCT
GCTCAAATCGAAATTAGGGTTCGAAGTTTGACGGCGAGAAGATGAGTGCTTCAAGGTTCA
TAAAGTGCGTCACCGTCGGTGACGGCGCCGTCGGCAAGACTTGTCTACTCATCTCCTACA
CAAGCAACACTTTCCCCACTGATTATGTGCCAACTGTGTTTGATAATTTCAGCGCTAATG
TGATTGTTGATGGGAACACCATCAACTTAGGATTGTGGGACACTGCAGGACAAGAGGACT
ATAATAGACTAAGACCATTGAGCTATCGTGGTGCTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTC
TCGTCAGCAAAGCTAGCTATGAAAATGTTGCTAAAAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATT
ACGCTTCTGGTGTTCCCATCATCCTTGTTGGAACAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGC
AGTACTTTGTTGAGCACCCTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTGA
AGAAGCTTGTTGGAGCTTCTGCTTATATAGAATCCAGTGCAAAGACACAACAGAATGTAA
AAGCTGTCTTTGATGCGGCTATTAAAGTAGTTCTCCAGCCACCTAAAAA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2CV93TF 556 0 0
GGTCT
CTCTGCTCAAATCGAAATTAGGGTTCGAAGTTTGACGGCGAGAAGATGAGTGCTTCAAGG
TTCATAAAGTGCGTCACCGTCGGTGACGGCGCCGTCGGCAAGACTTGTCTATTCATCTCC
TACACAAGCAACACTTTCCCCACTGATTATGTGCCAACTGTGTTTGATAATTTCAGCGCT
AATGTGATTGTTGATGGGAACACCATCAACTTAGGATTGTGGGACACTGCAGGACAAGAG
GACTATAATAGACTAAGACCATTGAGCTATCGTGGTGCTGATGTCTTCTTGCTCGCATTC
TCTCTCGTCAGCAAAGCTAGCTATGAAAATGTTGCTAAAAAGTGGGTTCCTGAACTCAGA
CATTACGCTCCTGGTGTTCCCATCATCCTTGTTGGAACAAAGCTTGATCTTCGAGATGAT
AAGCAGTACTTTGTTGAGCACCCTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAA
CTGAAGAAGCTTGTTGGAGCTTCTGCTTATATAGAATCCAGTGCAAAGACACAACAGAAT
GTAAAAGCTGT

QA 6 556 6 556
DS 

RD RR2FT51TF 768 0 0
GG
AGCTGACTAAATAACCCCTCTTTCTTTACTCTCTCTCTCTCTGCTCAAATCGAAATTAGG
GTTCGAAGTTTGACGGCGAGAAGATGAGTGCTTCAAGGTTCATAAAGTGCGTCACCGTCG
GTGACGGCGCCGTCGGCAAGACTTGTCTACTCATCTCCTACACAAGCAACACTTTCCCCA
CTGATTATGTGCCAACTGTGTTTGATAATTTCAGCGCTAATGTGATTGTTGATGGGAACA
CCATCAACTTAGGATTGTGGGACACTGCAGGACAAGAGGACTATAATAGACTAAGACCAT
TGAGCTATCGTGGTGCTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTCTCGTCAGCAAAGCTAGCT
ATGAAAATGTTGCTAAAAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATTACGCTCCTGGTGTTCCCA
TCATCCTTGTTGGAACAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGCAGTACTTTGTTGAGCACC
CTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTGAAGAAGCTTGTTGGAGCTT
CTGCTTATATAGAATCCAGTGCAAAGACACAACAGAATGTAAAAGCTGTCTTTGATGCGG
CTATTAAAGTAGTTCTCCAGCCACCTAAAAACAAGAAGAAAAAGAAGAGAAAGTCTCAGA
AAGGCTGTTCTATATTGTGATTCCAGAGAAGA*GAAACACACAGTTATAAATTTATAACT
AATCCTTGTTTCCGAGTGCTACGGACCCATTTTT*TTACTTCCATG

QA 3 768 3 768
DS 

RD RR2FW44TF 773 0 0
GG
GCTCAAATCGAAATTAGGGTTCGAAGTTTGACGGCGAGAAGATGAGTGCTTCAAGGTTCA
TAATGTGCGTCACCGTCGGTGACGGCGCCGTCGGCAAGACTTGTCTACTCATCTCCTACA
CAAGCAACACTTTCCCCACTGATTATGTGCCAACTGTGTTTGATAATTTCAGCGCTAATG
TGATTGTTGATGGGAACACCATCAACTTAGGATTGTGGGACACTGCAGGACAAGAGGACT
ATAATAGACTAAGACCATTGAGCTATCGTGGTGCTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTC
TCGTCAGCAAAGCTAGCTATGAAAATGTTGCTAAAAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATT
ACGCTCCTGGTGTTCCCATCATCCTTGTTGGAACAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGC
AGTACTTTGTTGAGCACCCTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTGA
AGAAGCTTGTTGGAGCTTCTGCTTATATAGAATCCAGTGCAAAGACACAACAGAATGTAA
AAGCTGTCTTTGATGCAGCTATTAAAGTAGTTCTCCAGCCACCTAAAAACAAGAAGAAAA
AGAAGAGAAAGTCTCAGAAAGGCTGTTCTATATTGTGATTCCAGAGAAGAAGAAACACAC
AGTTATAAATTTATAACTAATCCTTGTTTCCGAGTGCTACG*ACCCATTTTTCTTACTTC
CATGAAACAGGA*TCTGTTGTTTTGTAGTCTGAATACTGACATCA
TAAAAA

QA 3 767 3 767
DS 

RD RR2B147TF 794 0 0
GG
CTCTGCTCAAATCGAAATTAGGGTTCGAAGTTTGACGGCGAGAAGATGAGTGCTTCAAGG
TTCATAAAGTGCGTCACCGTCGGTGACGGCGCCGTCGGCAAGACTTGTCTACTCATCTCC
TACACAAGCAACACTTTCCCCACTGATTATGTGCCAACTGTGTTTGATAATTTCAGCGCT
AATGTGATTGTTGATGGGAACACCATCAACTTAGGATTGTGGGACACTGCAGGACAAGAG
GACTATAATAGACTAAGACCATTGAGCTATCGTGGTGCTGATGTCTTCTTGCTCACATTC
TCTCTCGTCAGCAAAGCTAGCTATGAAAATGTTGCTAAAAAGTGGGTTCCTGAACTCAGA
CATTACGCTCCTGGTGTTCCCATCATCCTTGTTGGAACAAAGCTTGATCTTCGAGATGAT
AAGCAGTACTTTGTTGAGCACCCTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAA
CTGAAGAAGCTTGTTGGAGCTTCTGCTTATATAGAATCCAGTGCAAAGACATAACAGAAT
GTAAAAGCTGTCTTTGATGCGGCTATTAAAGTAGTTCTCCAGCCACCTAAAAACAAGAAG
AAAAAGAAGAGAAAGTCTCAGAA*GGCTGTTCTATATTGTGATTCCAGAGAAGAAGAAAC
ACACAGTTATAAATTTATAACTAATCCTTGTTTCCGAGTGCTACGGACCCATTTTTCTTA
CTTCCATGAAACAGAA*TCTGTTGTTTTGTAGTCTGAATACTGACATCAGAAGAA*CTCA
TTGGTCTTTATT

QA 3 794 3 794
DS 

RD RR2B147JQ 762 0 0
ACAAGCAACACTTTCCCCACTGATTATGTGCCAACTGTGTTTGATAATTTCAGCGCTAAT
GTGATTGTTGATGGGAACACCATCAACTTAGGATTGTGGGACACTGCAGGACAAGAGGAC
TATAATAGACTAAGACCATTGAGCTATCGTGGTGCTGATGTCTTCTTGCTCACATTCTCT
CTCGTCAGCAAAGCTAGCTATGAAAATGTTGCTAAAAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACAT
TACGCTCCTGGTGTTCCCATCATCCTTGTTGGAACAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAG
CAGTACTTTGTTGAGCACCCTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTG
AAGAAGCTTGTTGGAGCTTCTGCTTATATAGAATCCAGTGCAAAGACATAACAGAATGTA
AAAGCTGTCTTTGATGCGGCTATTAAAGTAGTTCTCCAGCCACCTAAAAACAAGAAGAAA
AAGAAGAGAAAGTCTCAGAA*GGCTGTTCTATATTGTGATTCCAGAGAAGAAGAAACACA
CAGTTATAAATTTATAACTAATCCTTGTTTCCGAGTGCTACGGACCCATTTTTCTTACTT
CCATGAAACAGGAATCTGTTGTTTTGTAGTCTGAATACTGACATCAGAAGAAACTCATTG
GTCTTTATTTGAGGTTGTATTCTTGTTTGCATTCCGAATATGTAAATATATGATGATACC
ACGTTTGCTTTTGATTCCATTATAGAGACTATTTACTGCGCC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2CV93JQ 700 0 0
CAGCGCTAATGTGATTGTTGATGGGAACACCATCAACTTAGGATTGTGGGACACTGCAGG
ACAAGAGGACTATAATAGACTAAGACCATTGAGCTATCGTGGTGCTGATGTCTTCTTGCT
CGCATTCTCTCTCGTCAGCAAAGCTAGCTATGAAAATGTTGCTAAAAAGTGGGTTCCTGA
ACTCAGACATTACGCTCCTGGTGTTCCCATCATCCTTGTTGGAACAAAGCTTGATTTTCG
AGATGATAAGCAGTACTTTGTTGAGCACCCTGGAGCTGTGCCTATATTTACTGCTCAGGG
TGAAGAACTGAAGAAGCTTGTTGGAGCTTCTGCTTATATAGAATCCAGTGCAAAGACACA
ACAGAATGTAAAAGCTGTCTTTGATGCGGCTATTAAAGTAGTTCTCCAGCCACCTAAAAA
CAAGAAGAAAAAGAAGAGAAAGTTTCAGAAAGGCTGTTCTATATTGTGATTCCAGAGAAG
AAGAAACACACAGTTATAAATTTATAACTAATCCTTGTTTCCGAGTGCTACGGACCCATT
TTTTTTACTTCCATGAAACAGGAATCTGTTGTTTTGTAGTCTGAATACTGACATCAGAAG
AAACTCATTGGTCTTTATTTGAGGTTGTATTCTTGTTTGCATTCCGAATATGTAAATATA
TGATGATACCACGTTTGCTTTTGATTCCATTATAGAGACT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2HA61JQ 658 0 0
TGATGGGAACACCATCAACTTAGGATTGTGGGACACTGCAGGACAAGAGGACTATAATAG
ACTAAGACCATTGAGCTATCGTGGTGCTGATGTCTTCTTGCTCGCATTCTCTCTCGTCAG
CAAAGCTAGCTATGAAAATGTTGCTAAAAAGTGGGTTCCTGAACTCAGACATTACGCTTC
TGGTGTTCCCATCATCCTTGTTGGAACAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGCAGTACTT
TGTTGAGCACCCTGGAGCTGTGCCTATATCTACTGCTCAGGGTGAAGAACTGAAGAAGCT
TGTTGGAGCTTCTGCTTATATAGAATCCAGTGCAAAGACACAACAGAATGTAAAAGCTGT
CTTTGATGCGGCTATTAAAGTAGTTCTCCAGCCACCTAAAAACAAGAAGAAAAAGAAGAG
AAAGTCTCAGAAAGGCTGTTCTATATTGTGACTCCAGAGAAGAAGAAACACACAGTTATA
AATTTATAACTAATCCTTGTTTCCGAGTGCTACGGACCCATTTTTCTTACTTCCATGAAA
CAGGAATCTGTTGTTTTGTAGTCTGAATACTGACATCAGAAGAAACTCATTGGTCTTTAT
TTGAGGTTGTATTCTTGTTTGCATTCCGAATATGTAAATATATGATGATACCACGT
CG

QA 1 656 1 656
DS 



AS 2 8

CO CL802Contig1 924 2 4 U
GGATTTTGCTAGGGTTCCAATCAGATATCTGCAACAACAACAAAAATGGCGTTGGCTGGT
CGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAGACCGTCGCCGTCTCAGATTCCGTCTCCTCT
GCGAGATCTTATCCCAGTGAACGTCCTCTTATCCCTGCGTTGAGAGATTATGCAACAGCT
TCAGCTCAGAAAACTGGCAATGTTAAGGTGCCAGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAAC
TTTGCTTCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAGATGAATTCCTTGGAAAAGATTGAGTCG
GATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCGATGAAGACCAGCCCTACTTTCTCACAGTTTACTAAG
GATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTGCTGCTATTGTCGATGTTTGTGACAAAGCA
AAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAG
AACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGCTGACAACAGCACATAGGGGAGACGTC
AAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCCCCTGCTGAGGAGAAGGAACTCAAAGAG
ACACTTCAGGAGATCATTGGAGAAAGGAAGAAAGTAACTGTGGAACAGAAGATTGATCCG
AGCATATATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTCCAACAAAAGGTGTTGGACACGTCAATCAGG
ACAAGAGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAACCTGTTGACCTCAGCAACCTCTGA
AAATATATCCTCGAGAGAGTTTTCCCTTAAAAACATGTTTGTGTGATGCTGCAAACCCAG
TTGACAAAATAAAACATTATGACCCCTCCACCTGGGAAACAATTACATTGTCGTTTTTGA
AATTTGTTATTGCATTTTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU72TF U 1
AF RR2BU72JQ C 398
BS 1 699 RR2BU72TF
BS 700 700 RR2BU72JQ
BS 701 715 RR2BU72TF
BS 716 924 RR2BU72JQ

RD RR2BU72TF 715 0 0
GGATTTTGCTAGGGTTCCAATCAGATATCTGCAACAACAACAAAAATGGCGTTGGCTGGT
CGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAGACCGTCGCCGTCTCAGATTCCGTCTCCTCT
GCGAGATCTTATCCCAGTGAACGTCCTCTTATCCCTGCGTTGAGAGATTATGCAACAGCT
TCAGCTCAGAAAACTGGCAATGTTAAGGTGCCAGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAAC
TTTGCTTCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAGATGAATTCCTTGGAAAAGATTGAGTCG
GATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCGATGAAGACCAGCCCTACTTTCTCACAGTTTACTAAG
GATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTGCTGCTATTGTCGATGTTTGTGACAAAGCA
AAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAG
AACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGCTGACAACAGCACATAGGGGAGACGTC
AAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCCCCTGCTGAGGAGAAGGAACTCAAAGAG
ACACTTCAGGAGATCATTGGAGAAAGGAAGAAAGTAACTGTGGAACAGAAGATTGATCCG
AGCATATATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTCCAACAAAAG*TGTTGGACACGTCAA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2BU72JQ 527 0 0
TTGTCGATGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTTTCTTTGT
TAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGCTGA
CAACAGCACATAGGGGAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCCCCTG
CTGAGGAGAAGGAACTCAAAGAGACACTTCAGGAGATCATTGGAGAAGGGAAGAAAGTAA
CTGTGGAACAGAAGATTGATCCGAGCATATATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTCCAACAAA
AGGTGTTGGACACGTCAATCAGGACAAGAGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAAC
CTGTTGACCTCAGCAACCTCTGAAAATATATCCTCGAGAGAGTTTTCCCTTAAAAACATG
TTTGTGTGATGCTGCAAACCCAGTTGACAAAATAAAACATTATGACCCCTCCACCTGGGA
AACAATTACATTGTCGTTTTTGAAATTTGTTATTGCATTTTGTTTCC

QA 1 527 1 527
DS 



CO CL802Contig2 1010 6 6 U
GGGATCGGCTTTTAATCATTTGCTAGGGTTCCAATCAGATATCTGCAACAACAAAAAAAT
GGCTTTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAGACCGTCGCCGTCTCAGA
TTCCGTCTCCTCTGCGAGATCTTATCCCAGTGGACGTCCTCTTATCCCTGCGTTGAGAGA
CTATGCAACAGCTTCAGCTCAGAAAACCGGCAATGTTAAGGTGCCAGTGGCTTTAGTTGG
TGAATCTGGCAACTTTGCGTCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAAATGAATTCCTTGGA
AAAGATTGAGTCGGATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCGATGAAGACCAGCCCTACTTTCTC
ACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTGCTGCTATTGTCGATGT
TTGTGACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTATCTTTGTTAGCTGAGAA
TGGGAAGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGCTGACAACAGCACA
TAGGGGAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCACTTCCCCCTGCTGAGGAGAA
GGAACTTAGGGAGACACTTCAGGAGATCATTGGAGAAGGGAAGAAAGTAACCGTGGAACA
GAAGATTGATCCGAGTATCTATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTCCAACAAAAGGTGTTGGA
CATGTCAATCAGGACAAGAGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAACCTGTTGACCT
CAGCAACCTCTGAAAATCTATCCTTGATAGAGTTTTCCCTTACGAAACATGTTTTGTGAT
GCTGCAAACCCAGTTCAAAAATAAAACATTATGACCCTCTCCACCTGGGAAACAATTACA
TTGTCGTTTTTTGAAATTTGTCATTGCATTTTGTTTCCAATTGTTGTTTGCTTCAAAATA
AGCTTTTGGAGATTATTTACATATGAGAGAATAAATAGTCAAATTTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G735TF U 1
AF RR2CU86TF U 43
AF RR2CP20TF U 43
AF RR2CU86JQ C 246
AF RR2G735JQ C 413
AF RR2CP20JQ C 343
BS 1 522 RR2G735TF
BS 523 523 RR2CU86TF
BS 524 620 RR2G735TF
BS 621 703 RR2CP20TF
BS 704 1002 RR2CU86JQ
BS 1003 1010 RR2CP20JQ

RD RR2G735TF 620 0 0
GGGATCGGCTTTTAATCATTTGCTAGGGTTCCAATCAGATATCTGCAACAACAAAAAAAT
GGCTTTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAGACCGTCGCCGTCTCAGA
TTCCGTCTCCTCTGCGAGATCTTATCCCAGTGGACGTCCTCTTATCCCTGCGTTGAGAGA
CTATGCAACAGCTTCAGCTCAGAAAACCGGCAATGTTAAGGTGCCAGTGGCTTTAGTTGG
TGAATCTGGCAACTTTGCGTCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAAATGAATTCCTTGGA
AAAGATTGAGTCGGATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCGATGAAGACCAGCCCTACTTTCTC
ACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTGCTGCTATTGTCGATGT
TTGTGACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTATCTTTGTTAGCTGAGAA
TGGGAAGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATACAGCTGACAACAGCACA
TAGGGGAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCACTTCCCCCTGCTGAGGAGAA
GGAACTTAGGGAGACACTTC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2CU86TF 563 0 0
GG
GCAACAACAAAAAAATGGCTTTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAGA
CCGTCGCCGTCTCAGATTCCGTCTCCTCTGCGAGATCTTATCCCAGTGGACGTCCTCTTA
TCCCTGCGTTGAGAGACTATGCAACAGCTTCAGCTCAGAAAACCGGCAATGTTGAGGTGC
CAGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTTGCGTCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGA
AAATGAATTCCTTGGAAAAGATTGAGTCGGATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCGATGAAGA
CCAGCCCTACTTTCTCACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTG
CTGCTATTGTCGATGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTAT
CTTTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGC
AGCTGACAACAGCACATAGGGGAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCACTTC
CCCCTGCTGAGGAGAAGGAAC

QA 3 563 3 563
DS 

RD RR2CP20TF 664 0 0
GG
GCAACAACAAAAAAATGGCTTTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAGA
CCGTCGCCGTCTCAGATTCCGTCTCCTCTGCGAGATCTTATCCCAGTGGACGTCATCTTA
TCCCTGCGTTGAGAGACTATGCAACAGCTTCAGCTCAGAAAACCGGCAATGTTAAGGTGC
CAGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTTGCGTCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGA
AAATGAATTCCTTGGAAAAGATTGAGTCGGATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCGATGAAGA
CCAGCCCTACTTTCTCACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTG
CTGCTATTGTCGATGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTAT
CTTTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGC
AGCTGACAACAGCACATAGGGGAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCACTGTC*TGCCACTTC
CCCCTGCTGAGGAGAAGGAACTTAGGGAGACACTTCAGGAGATCATTGGAGAAGGGAAGA
AAGTAACCGTGGAACAGAAGATTGATCCGAGTATCTATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTC
AAC

QA 3 661 3 661
DS 

RD RR2CU86JQ 764 0 0
CTGGCAACTTTGCGTCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAAATGAATTCCTTGGAAAAGA
TTGAGTCGGATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCGATGAAGACCAGCCCTACTTTCTCACAGT
TTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTGCTGCTATTGTCGATGTTTGTG
ACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTATCTTTGTTAGCTGAGAATGGGA
AGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGCTGACAACAGCACATAGGG
GAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCACTTCCCCCTGCTGAGGAGAAGGAAC
TTAGGGAGACACTTCAGGAGATCATTGGAGAAGGGAAGAAAGTAACCGTGGAACAGAAGA
TTGATCCGAGTATCTATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTCCAACAAAAGGTGTTGGACATGT
CAATCAGGACAAGAGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAACCTGTTGACCTCAGCA
ACCTCTGAAAATCTATCCTTGATAGAGTTTTCCCTTACGAAACATGTTTTGTGATGCTGC
AAACCCAGTTCAAAAATAAAACATTATGACCCTCTCCACCTGGGAAACAATTACATTGTC
GTTTTTTGAAATTTGTCATTGCATTTTGTTTCCAATTGTTGTTTGCTTCAAAATAAGCTT
TTGGAGATTATTTACATATGAGAGAATAAATAGTCAA
TTTGGCC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2G735JQ 597 0 0
GTCGATGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTATCTTTGTTA
GCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATACAGCTGACA
ACAGCACATAGGGGAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCACTTCCCCCTGCT
GAGGAGAAGGAACTTAGGGAGACACTTCAGGAGATCATTGGAGAAGGGAAGAAAGTAACC
GTGGAACAGAAGATTGATCCGAGTATCTATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTCCAACAAAAG
GTGTTGGACATGTCAATCAGGACAAGAGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAACCT
GTTGACCTCAGCAACCTCTGAAAATCTATCCTTGATAGAGTTTTCCCTTACGAAACATGT
TTTGTGATGCTGCAAACCCAGTTCAAAAATAAAACATTATGACCCTCTCCACCTGGGAAA
CAATTACATTGTCGTTTTTTGAAATTTGTCATTGCATTTTGTTTCCAATTGTTGTTTGCT
TCAAAATAAGCTTTTGGAGATTATTTACATATGAGAGAATAAATAGTCAA
TTTGGTC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2CP20JQ 668 0 0
GACCAGCCCTACTTTCTCACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACT
TGCTGCTATTGTCGATGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCT
ATCTTTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCAT
GCAGCTGACAACAGCACATAGGGGAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCACTGTC*TGCCACT
TCCCCCTGCTGAGGAGAAGGAACTTAGGGAGACACTTCAGGAGATCATTGGAGAAGGGAA
GAAAGTAACCGTGGAACAGAAGATTGATCCGAGTATCTATGGAGGGCTAATAGTAGAGTT
CCAACAAAAGGTGTTGGACATGTCAATCAGGACAAGAGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCT
CCGTGAACCTGTTGACCTCAGCAACCTCTGAAAATCTATCCTTGATAGAGTTTTCCCTTA
CGAAACATGTTTTGTGATGCTGCAAACCCAGTTCAAAAATAAAACACTATGACCCTCTCC
ACCTGGGAAACAATTACATTGTCGTTTTTTGAAATTTGTCATTGCATTTTGTTTCCAATT
GTTGTTTGCTTCAAAATAAGCTTTTGGAGATTATTTACATATGAGAGAATAAATAGTCAA
ATTTGGTC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 8

CO CL803Contig1 807 8 6 U
GGGAACTGTCACTTTTGTTAGCTGAGAGCTCTATTTGTCTTCACTCTTGAGAGAATCGAA
TCGAGAGAAGAAAATGGAGAAGGTGTTAACGAAAGTGACGAGCTTTAAAGTGGGAGGATC
ATGGGTTTCGAAGAAAGCAAAGGAAGAGCTCTCCAACATCACCAATGACCTCACCACTTT
CTCTAGTACCGTTGAAGAGAAAGCCAAATGGGTTTTCAACAAGCTTAAAGGAAAGCCACT
CAAAAGCTTACCAGAACTACTCAAAGAGTACAACTTACCACCAGGACTCTTCCCACAAAA
CATAATCTGCTACGAATTCGACGAGACCAAGAACAAACTCACTGTCTTCTTTGCTACACC
CTGCGAAGTCACATTCAAAGACGGATCAGCGATAAGATACGCTACACGTGTTAAAGGGAT
CTTGCTTAGAGGGAAACTGATGGGCGTGGAAGGGATGAAGACGAAAGTGTTGGTTTGGGT
TAAAGTCACGACAGTCTCTGTGGAGAGCTCGAAGTCCGACAAGCTCTGGTTCACTGCAGG
TGTCAAGAAATCTCGGTCTAAGAATGTTTACGACACACCTCATGACGCTATCAAAGTCGT
TGGAGAGTTCTAAAATATGTTGTTTTCAACGGCTTATTACCATATTTGATTCATAATTTT
CATAATTGGTTATTTGGTTTTATTTGAGTATTGGGATTAAGAGGTATATATAACTCTCAT
CTTGGTGAAATGCGTTTCTTGTTGGCCACCCTAAATCTCTCATGTGTTTTTGCTTTACAC
TTATTTAGTGACTTATAACGTCGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 20 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 15 45 45 45 45 45 45 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 45 45 45 45 45 15 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 40 40 10 10 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FE44TF U 2
AF RR2FT61TF U 1
AF RR2C003TF U 5
AF RR2C003JQ C 23
AF RR2FT61JQ C 131
AF RR2FE44JQ C 126
AF RR2F129JQ C 64
AF RR2F129TF U 64
BS 1 412 RR2FT61TF
BS 413 413 RR2FE44TF
BS 414 694 RR2FT61TF
BS 695 698 RR2C003TF
BS 699 699 RR2C003JQ
BS 700 807 RR2F129TF

RD RR2FE44TF 621 0 0
GGAACT
GTCACTTTTGTTAGCTGAGAGCTCTATTTGTCTTCACTCTTGAGAGAATCGAATCGAGAG
AAGAAAATGGAGAAGGTGTTAACGAAAGTGACGAGCTTTAAAGTGGGAGGATCATGGGTT
TCGAAGAAAGCAAAGGAAGAGCTCTCCAACATCACCAATGACCTCACCACTTTCTCTAGT
ACCGTTGAAGAGAAAGCCAAATGGGTTTTCAACAAGCTTAAAGGAAAGCCACTCAAAAGC
TTACCAGAACTACTCAAAGAGTACGACTTACCACCAGGACTCTTCCCACAAAACATAATC
TGCTACGAATTCGACGAGACCAAGAACAAACTCACTGTCTTCTTTGCTACACCCTGCGAA
GTCACATTCAAAGACGGATCAGCGATAAGATACGCTACACGTGTTAAAGGGATCTTGCTT
AGAGGGAAACTGATGGGCGTGGAAGGGATGAAGACGAAAGTGTTGGTTTGGGTTAAAGTC
ACGACAGTCTCTGTGGAGAGCTCGAAGTCCGACAAGCTCTGGTTCACTGCAGGTGTCAAG
AAATCTCGGTCTAAGAATGTTTACGACACACCTCATGACGCTATCAAAGTCGTTGGAGAG
TTCTAAAATATGT
GT

QA 7 619 7 619
DS 

RD RR2FT61TF 694 0 0
GGGAACTGTCACTTTTGTTAGCTGAGAGCTCTATTTGTCTTCACTCTTGAGAGAATCGAA
TCGAGAGAAGAAAATGGAGAAGGTGTTAACGAAAGTGACGAGCTTTAAAGTGGGAGGATC
ATGGGTTTCGAAGAAAGCAAAGGAAGAGCTCTCCAACATCACCAATGACCTCACCACTTT
CTCTAGTACCGTTGAAGAGAAAGCCAAATGGGTTTTCAACAAGCTTAAAGGAAAGCCACT
CAAAAGCTTACCAGAACTACTCAAAGAGTACAACTTACCACCAGGACTCTTCCCACAAAA
CATAATCTGCTACGAATTCGACGAGACCAAGAACAAACTCACTGTCTTCTTTGCTACACC
CTGCGAAGTCACATTCAAAGACGGATCAGCGATAAGATACGCTACACGTGTTGAAGGGAT
CTTGCTTAGAGGGAAACTGATGGGCGTGGAAGGGATGAAGACGAAAGTGTTGGTTTGGGT
TAAAGTCACGACAGTCTCTGTGGAGAGCTCGAAGTCCGACAAGCTCTGGTTCACTGCAGG
TGTCAAGAAATCTCGGTCTAAGAATGTTTACGACACACCTCATGACGCTATCAAAGTCGT
TGGAGAGTTCTAAAATATGTTGTTTTCAACGGCTTATTACCATATTTGATTCATAATTTT
CATAATTGGTTATTTGGTTTTATTTGAGTATTGG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2C003TF 694 0 0
GGG
GTCACTTTTGTTAGCTGAGAGCTCTATTTGTCTTCACTCTTGAGAGAATCGAATCGAGAG
AAGAAAATGGAGAAGGTGTTAACGAAAGTGACGAGCTTTAAAGTGGGAGGATCATGGGTT
TCGAAGAAAGCAAAGGAAGAGCTCTCCAACATCACCAATGACCTCACCACTTTCTCTAGT
ACCGTTGAAGAGAAAGCCAAATGGGTTTTCAACAAGCTTAAAGGAAAGCCACTCAAAAGC
TTACCAGAACTACTCAAAGAGTACAACTTACCACCAGGACTCTTCCCACAAAACATAATC
TGCTACGAATTCGACTAGACCAAGAACAAACTCACTGTCTTCTTTGCTACACCCTGCGAA
GTCACATTCAAAGACGGATCAGCGATAAGATACGCTACACGTGTTAAAGGGATCTTGCTT
AGAGGGAAACTGATGGGCGTGGAAGGGATGAAGACGAAAGTGTTGGTTTGGGTTAAAGTC
ACGACAGTCTCTGTGGAGAGCTCGAAGTCCGACAAGCTCTGGTTCACTGCAGGTGTCAAG
AAATCTCGGTCTAAGAATGTTTACGACACACCTCATGACGCTATCAAAGTCGTTGGAGAG
TTCTAAAATATGTTGTTTTCAACGGCTTATTACCATATTTGATTCATAATTTTCATAATT
GGTTATTTGGTTTTATTTGAGTATTGGGATT

QA 4 694 4 694
DS 

RD RR2C003JQ 730 0 0
TGAGAGCTCTATTTGTCTTCACTCTTGAGAGAATCGAATCGAGAGAAGAAAATGGAGAAG
GTGTTAACGAAAGTGACGAGCTTTAAAGTGGGAGGATCATGGGTTTCGAAGAAAGCAAAG
GAAGAGCTCTCCAACATCACCAATGACCTCACCACTTTCTCTAGTACCGTTGAAGAGAAA
GCCAAATGGGTTTTCAACAAGCTTAAAGGAAAGCCACTCAAAAGCTTACCAGAACTACTC
AAAGAGTACAACTTACCACCAGGACTCTTCCCACAAAACATAATCTGCTACGAATTCGAC
TAGACCAAGAACAAACTCACTGTCTTCTTTGCTACACCCTGCGAAGTCACATTCAAAGAC
GGATCAGCGATAAGATACGCTACACGTGTTAAAGGGATCTTGCTTAGAGGGAAACTGATG
GGCGTGGAAGGGATGAAGACGAAAGTGTTGGTTTGGGTTAAAGTCACGACAGTCTCTGTG
GAGAGCTCGAAGTCCGACAAGCTCTGGTTCACTGCAGGTGTCAAGAAATCTCGGTCTAAG
AATGTTTACGACACACCTCATGACGCTATCAAAGTCGTTGGAGAGTTCTAAAATATGTTG
TTTTCAACGGCTTATTACCATATTTGATTCATAATTTTCATAATTGGTTATTTGGTTTTA
TTTGAGTATTGGGATTAAGAGGTATATATAACTCTCATCTTGGTTAAATGCGTTTCTTGT
TGGCCACCC
T

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2FT61JQ 597 0 0
AAGAAAGCAAAGGAAGAGCTCTCCAACATCACCAATGACCTCACCACTTTCTCTAGTACC
GTTGAAGAGAAAGCCAAATGGGTTTTCAACAAGCTTAAAGGAAAGCCACTCAAAAGCTTA
CCAGAACTACTCAAAGAGTACAACTTACCACCAGGACTCTTCCCACAAAACATAATCTGC
TACGAATTCGACGAGACCAAGAACAAACTCACTGTCTTCTTTGCTACACCCTGCGAAGTC
ACATTCAAAGACGGATCAGCGATAAGATACGCTACACGTGTTGAAGGGATCTTGCTTAGA
GGGAAACTGATGGGCGTGGAAGGGATGAAGACGAAAGTGTTGGTTTGGGTTAAAGTCACG
ACAGTCTCTGTGGAGAGCTCGAAGTCCGACAAGCTCTGGTTCACTGCAGGTGTCAAGAAA
TCTCGGTCTAAGAATGTTTACGACACACCTCATGACGCTATCAAAGTCGTTGGAGAGTTC
TAAAATATGTTGTTTTCAACGGCTTATTACCATATTTGATTCATAATTTTCATAATTGGT
TATTTGGTTTTATTTGAGTATTGGGATTAAGAGGTATATATAACTCTCATCTTGGTT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2FE44JQ 626 0 0
TTTCGAAGAAAGCAAAGGAAGAGCTCTCCAACATCACCAATGACCTCACCACTTTCTCTA
GTACCGTTGAAGAGAAAGCCAAATGGGTTTTCAACAAGCTTAAAGGAAAGCCACTCAAAA
GCTTACCAGAACTACTCAAAGAGTACGACTTACCACCAGGACTCTTCCCACAAAACATAA
TCTGCTACGAATTCGACGAGACCAAGAACAAACTCACTGTCTTCTTTGCTACACCCTGCG
AAGTCACATTCAAAGACGGATCAGCGATAAGATACGCTACACGTGTTAAAGGGATCTTGC
TTAGAGGGAAACTGATGGGCGTGGAAGGGATGAAGACGAAAGTGTTGGTTTGGGTTAAAG
TCACGACAGTCTCTGTGGAGAGCTCGAAGTCCGACAAGCTCTGGTTCACTGCAGGTGTCA
AGAAATCTCGGTCTAAGAATGTTTACGACACACCTCATGACGCTATCAAAGTCGTTGGAG
AGTTCTAAAATATGTTGTTTTCAACGGCTTATTACCATATTTGATTCATAATTTTCATAA
TTGGTTATTTGGTTTTATTTGAGTATTGGGATTAAGAGGTATATATAACTCTCATCTTGG
TTAAATGCGTTTCTTGTTGGCCACCC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2F129JQ 744 0 0
G
GAGAAGAAAATGGAGAAGGTTTTAACGAAAGTGACGAGCTTTAAAGTGGGAGGATCATGG
GTTTCGAAGAAAGCCAAGGAAGAGCTCTCCAACATCACCGATGACCTCACCACTTTCTCT
AGTACCATTGAAGAGAAAGCCAAATGGGTTTTCAACAAGCTTAAAGGAAAGCCACTCAAA
AGCTTACCAGAACTACTCAAAGAATACAACTTACCACCAGGACTCTTCCCACAAAACATA
ATCTGCTACGAATTCGACGAGACCAAGAACAAACTCACTGTCTTCTTTGCTACACCCTGC
GAAGTCACATTCAAAGATGGATCAGCGATAAGATACGCTACACGCGTTAAAGGGATCTTG
CTTAGAGGGAAACTGATGGGCGTGGAAGGGATGAAGACGAAAGTGTTGGTTTGGGTTAAA
GTCACGACGGTCTCAGTCGAGAGCTCGAAGTCCGACAAGCTCTGGTTCACTGCAGGTGTC
AAGAAATCTCGGTCTAAGAATGTTTACGACACACCTCATGACGCTATCAAAGTCGTTGGA
GAGTTCTAAAATATGTTGTTTTCAACGGTTCATTACC**********CATAAAATTCATA
ATTGGTTATTTGGTTTTATTTGCGTATTGGGA***AGAGGTATATATAACTCTCATCTTG
GTGAAATGCGTTTCTTGTTGGCCACCCTAAATCTCTCATGTGTTTTTGCTTTACACTTAT
TTAGTGACTTATAACGTCGTACC

QA 2 744 2 744
DS 

RD RR2F129TF 744 0 0
G
GAGAAGAAAATGGAGAAGGTTTTAACGAAAGTGACGAGCTTTAAAGTGGGAGGATCATGG
GTTTCGAAGAAAGCCAAGGAAGAGCTCTCCAACATCACCGATGACCTCACCACTTTCTCT
AGTACCATTGAAGAGAAAGCCAAATGGGTTTTCAACAAGCTTAAAGGAAAGCCACTCAAA
AGCTTACCAGAACTACTCAAAGAATACAACTTACCACCAGGACTCTTCCCACAAAACATA
ATCTGCTACGAATTCGACGAGACCAAGAACAAACTCACTGTCTTCTTTGCTACACCCTGC
GAAGTCACATTCAAAGATGGATCAGCGATAAGATACGCTACACGCGTTAAAGGGATCTTG
CTTAGAGGGAAACTGATGGGCGTGGAAGGGATGAAGACGAAAGTGTTGGTTTGGGTTAAA
GTCACGACGGTCTCAGTCGAGAGCTCGAAGTCCGACAAGCTCTGGTTCACTGCAGGTGTC
AAGAAATCTCGGTCTAAGAATGTTTACGACACACCTCATGACGCTATCAAAGTCGTTGGA
GAGTTCTAAAATATGTTGTTTTCAACGGTTCATTACC**********CATAAAATTCATA
ATTGGTTATTTGGTTTTATTTGCGTATTGGGA***AGAGGTATATATAACTCTCATCTTG
GTGAAATGCGTTTCTTGTTGGCCACCCTAAATCTCTCATGTGTTTTTGCTTTACACTTAT
TTAGTGACTTATAACGTCGTACC

QA 2 744 2 744
DS 



AS 1 8

CO CL804Contig1 699 8 32 U
GCTATTAAATTATGCTTCATATATAAAAAGAAAACATCAAACCACCTTCGTACACTAATA
TCACACACAAACTTCAGTTCAGGCATGGACTTAGAAAGACAGCTAAGATAAATACATGTC
TTTGCACTTACATTATTAAATATTACA**TGAGCCGCAAAAGATATATGTTTAAACGGTG
CATCTTATGGGATACCGATGATGGGGAAGAATGGAAGATAATAGCTCGTGGGAGCCAGCC
CCCACTCCGGAGGAACAGGCAAATCAACGGTCTTGGACGAACTGAAAGATCTGAGGCTTC
TTGGACATGATTTCAAGAAGATTAACTTCGAAGAGAGACCATATTTGTCACCTTCGAGCT
TAACAATCTTCGACATAATGTTCCTTTTGGAAGCATAAAGTTGCTTGAAGCTACCTTGGA
GCTCCGCTTCGCAATCCGATTTGACTCTCGAGGGAAGTTCCGACATAAACTCGCCCTTCT
TGTCGGTTGAGACGGTGAAACGCGTCTTGGAGTGGCTACAACTAACGCTGATCACGATTC
CTGAATAATCGTAATCACTGGGACAGTCGTAACAAGAGACTTTTCCTTCGACGAGCGAAA
CCGAGACCACGAGGGAAGATGAGATCAAAGCTGCCGTGAACAGGAACAAAGCTAGGAAAC
TTAACTGCATAGCCATTGGAGAAGGGATAGGTGAACCCC


BQ
30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 20 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B773JQ U 1
AF RR2B773TF C 1
AF RR2GJ81JQB U 1
AF RR2GJ81TF C 1
AF RR2FG57JQ U 2
AF RR2FG57TF C 2
AF RR2AL96JQ U 26
AF RR2AL96TF C 49
BS 1 93 RR2B773JQ
BS 94 94 RR2GJ81JQB
BS 95 147 RR2B773JQ
BS 148 149 RR2GJ81JQB
BS 150 154 RR2B773JQ
BS 155 155 RR2GJ81JQB
BS 156 211 RR2B773JQ
BS 212 212 RR2GJ81JQB
BS 213 322 RR2B773JQ
BS 323 323 RR2GJ81JQB
BS 324 347 RR2B773JQ
BS 348 348 RR2GJ81JQB
BS 349 370 RR2B773JQ
BS 371 371 RR2GJ81JQB
BS 372 383 RR2B773JQ
BS 384 384 RR2GJ81JQB
BS 385 388 RR2B773JQ
BS 389 389 RR2GJ81JQB
BS 390 409 RR2B773JQ
BS 410 410 RR2GJ81JQB
BS 411 457 RR2B773JQ
BS 458 458 RR2GJ81JQB
BS 459 472 RR2B773JQ
BS 473 473 RR2GJ81JQB
BS 474 534 RR2B773JQ
BS 535 535 RR2GJ81JQB
BS 536 659 RR2B773JQ
BS 660 660 RR2GJ81JQB
BS 661 674 RR2B773JQ
BS 675 680 RR2GJ81JQB
BS 681 692 RR2FG57JQ
BS 693 699 RR2AL96JQ

RD RR2B773JQ 675 0 0
GCTATTAAATTATGCTTCATATATAAAAAGAAAACATCAAACCACCTTCGTACACTAATA
TCACACACAAACTTCAGTTCAGGCATGGACTTAAAAAGACAGCTAAGATAAATACATGTC
TTTGCACTTACATTATTAAATATTACACATGAGC*GCAAAAGATATATGTTTAAACGGTG
CATCTTATGGGATACCGATGATGGGGAAGAAGGGAAGATAATAGCTCGTGGGAGCCAGCC
CCCACTCCGGAGGAACAGGCAAATCAACGGTCTTGGACGAACTGAAAGATCTGAGGCTTC
TTGGACATGATTTCAAGAAGATCAACTTCGAAGAGAGACCATATTTGCCACCTTCGAGCT
TAACAATCTTGGACATAATGTTCTTTTTTGAAGCATAAAGTTGCTTGAAACTACCTTGGA
GCTCCGCTTCGCAATCCGATTTGACTCTCGAGGGAAGCTCCGACATAAACTCTCCCTTCT
TGTCGGTTGAGACGGTGAAACGCGTCTTGGAGTGGCTACAACTAACGCTGATCATGATTC
CTGAATAATCGTAATCACTGGGACAGTCGTAACAAGAGACTTTTCCTTCGACGAGCGAAA
CCGAGACCACGAGGGAAGATGAGATCAAAGCTGCCGTGAACAGGAACAAAGCTAGGAAAT
TTAACTGCATAGCC
C

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2B773TF 675 0 0
GCTATTAAATTATGCTTCATATATAAAAAGAAAACATCAAACCACCTTCGTACACTAATA
TCACACACAAACTTCAGTTCAGGCATGGACTTAAAAAGACAGCTAAGATAAATACATGTC
TTTGCACTTACATTATTAAATATTACACATGAGC*GCAAAAGATATATGTTTAAACGGTG
CATCTTATGGGATACCGATGATGGGGAAGAAGGGAAGATAATAGCTCGTGGGAGCCAGCC
CCCACTCCGGAGGAACAGGCAAATCAACGGTCTTGGACGAACTGAAAGATCTGAGGCTTC
TTGGACATGATTTCAAGAAGATCAACTTCGAAGAGAGACCATATTTGCCACCTTCGAGCT
TAACAATCTTGGACATAATGTTCTTTTTTGAAGCATAAAGTTGCTTGAAACTACCTTGGA
GCTCCGCTTCGCAATCCGATTTGACTCTCGAGGGAAGCTCCGACATAAACTCTCCCTTCT
TGTCGGTTGAGACGGTGAAACGCGTCTTGGAGTGGCTACAACTAACGCTGATCATGATTC
CTGAATAATCGTAATCACTGGGACAGTCGTAACAAGAGACTTTTCCTTCGACGAGCGAAA
CCGAGACCACGAGGGAAGATGAGATCAAAGCTGCCGTGAACAGGAACAAAGCTAGGAAAT
TTAACTGCATAGCC
C

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2GJ81JQB 680 0 0
GCTATTAAATTATGCTTCATATATAAAAAGAAAACATCAAACCACCTTCGTACACTAATA
TCACACACAAACTTCAGTTCAGGCATGGACTTAGAAAGACAGCTAAGATAAATACATGTC
TTTGCACTTACATTATTAAATATTACA**TGAGCCGCAAAAGATATATGTTTAAACGGTG
CATCTTATGGGATACCGATGATGGGGAAGAATGGAAGATAATAGCTCGTGGGAGCCAGCC
CCCACTCCGGAGGAACAGGCAAATCAACGGTCTTGGACGAACTGAAAGATCTGAGGCTTC
TTGGACATGATTTCAAGAAGATTAACTTCGAAGAGAGACCATATTTGTCACCTTCGAGCT
TAACAATCTTCGACATAATGTTCCTTTTGGAAGCATAAAGTTGCTTGAAGCTACCTTGGA
GCTCCGCTTCGCAATCCGATTTGACTCTCGAGGGAAGTTCCGACATAAACTCGCCCTCCT
TGTCGGTTGAGACGGTGAAACGCGTCTTGGAGTGGCTACAACTAACGCTGATCACGATTC
CTGAATAATCGTAATCACTGGGACAGTCGTAACAAGAGACTTTTCCTTCGACGAGCGAAA
CCGAGACCACGAGGGAAGATGAGATCAAAGCTGCCGTGAACAGGAACAAAGCTAGGAAAC
TTAACTGCATAGCCATTGGA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2GJ81TF 695 0 0
GCTATTAAATTATGCTTCATATATAAAAAGAAAACATCAAACCAC*TTCGTACACTAATA
TCACACACAAACTTCAGTTCAGGCATGGACTTAGAAAGACAGCTAAGATAAATACATGTC
TTTGCACTTACATTATTAAATATTACA**TGAGCCGCAAAAGATATATGTTTAAACGGTG
CATCTTATGGGATACCGATGATGGGGAAGAATGGAAGATAATAGCTCGTGGGAGCCAGCC
CCCACTCCGGAGGAACAGGCAAATCAACGGTCTTGGACGAACTGAAAGATCTGAGGCTTC
TTGGACATGATTTCAAGAAGATTAACTTCGAAGAGAGACCATATTTGTCACCTTCGAGCT
TAACAATCTTCGACATAATGTTCCTTTTGGAAGCATAAAGTTGCTTGAAGCTACCTTGGA
GCTCCGCTTCGCAATCCGATTTGACTCTCGAGGGAAGTTCCGACATAAACTCGCCCTCCT
TGTCGGTTGAGACGGTGAAACGCGTCTTGGAGTGGCTACAACTAACGCTGATCACGATTC
CTGAATAATCGTAATCACTGGGACAGTCGTAACAAGAGACTTTTCCTTCGACGAGCGAAA
CCGAGACCACGAGGGAAGATGAGATCAAAGCTGCCGTGAACAGGAACAAAGCTAGGAAAC
TTAACTGCATAGCCATTGGAGAAGGGATAGGT
GCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2FG57JQ 693 0 0
CTATTAAATTATGCTTCATATATAAAAAGAAAACATCAAACCACCTTCGTACACTAATAT
CACACACAAACTTCAGTTCAGGCATGGACTTAAAAAGACAGCTAAAATAAATACATGTCT
TTGCACTTACATTATTAAATATTACA**TGAGCCGCAAAAGATATATGTTTAAACGGTGC
ATCTTATGGGATACCGATGATGGGGAAGAATGGAAGATAATAGCTCGTGGGAGCCAGCCC
CCACTCCGGAGGAACAGGCAAATCAACGGTCTTGGACGAACTGAAAGATCTGAGGCTTCT
TGGACATGATTTCAAGAAAATTAACTTCGAAAAGAGACCATATTTGTCACCTTCGAGCTT
AACAATCTTCGACATAATGTTCCTTTTGGAAGCATAAAGTTGCTTGAAGCTACCTTGGAG
CTCCGCTTCGCAATCCGATTTGACTCTCGAGGGAAGTTCCGACATAAACTCGCCCTTCTT
GTCGGTTGAGACGGTGAAACACGTCTTGGAGTGGCTACAACTAACGCTGATCACGATTCC
TGAATAATCGTAATCACTGGGACAGTCGTAACAAGAGACTTTTCCTTCGACGAGCGAAAC
CGAGACCACGAGGGAAGATGAGATCAAAGCTGCCGTGAACAGGAACAAAGCTAGGAAACT
TAACTGCATAGCCATTGGAGAAGGGATAGGT
CC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2FG57TF 693 0 0
CTATTAAATTATGCTTCATATATAAAAAGAAAACATCAAACCAC*TTCGTACACTAATAT
CACACACAAACTTCAGTTCAGGCATGGACTTAGAAAGACAGCTAAGATAAATACATGTCT
TTGCACTTACATTATTAAATATTACA**TGAGCCGCAAAAGATATATGTTTAAACGGTGC
ATCTTATGGGATACCGATGATGGGGAAGAATGGAAGATAATAGCTCGTGGGAGCCAGCCC
CCACTCCGGAGGAACAGGCAAATCAACGGTCTTGGACGAACTGAAAGATCTGAGGCTTCT
TGGACATGATTTCAAGAAGATTAACTTCGAAGAGAGACCATATTTGTCACCTTCGAGCTT
AACAATCTTCGACATAATGTTCCTTTTGGAAGCATAAAGTTGCTTGAAGCTACCTTGGAG
CTCCGCTTCGCAATCCGATTTGACTCTCGAGGGAAGTTCCGACATAAACTCGCCCTTCTT
GTCGGTTGAGACGGTGAAACACGTCTTGGAGTGGCTACAACTAACGCTGATCACGATTCC
TGAATAATCGTAATCACTGGGACAGTCGTAACAAGAGACTTTTCCTTCGACGAGCGAAAC
CGAGACCACGAGGGAAGATGAGATCAAAGCTGCCGTGAACAGGAACAAAGCTAGGAAACT
TAACTGCATAGCCATTGGAGAAGGGATAGGT
CC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2AL96JQ 674 0 0
AAAAGAAAACATCAAACCACCTTCGTACACTAATATCACACACAAACTTCAGTTCAGGCA
TGGACTTAGAAAGACAGCTAAGATAAATACATGTCTTTGCACTTACATTATTAAATATTA
CA**TGAGCCGCAAAAGATATATGTTTAAACGGTGCATCTTATGGGATACCGATGATGGG
GAAGAATGGAAGATAATAGCTCGTGGGAGCCAGCCCCCACTCCGGAGGAACAGGCAAATC
AACGGTCTTGGACGAACTGAAAGATCTGAGGCTTCTTGGACATGATTTCAAGAAGATTAA
CTTCGAAGAGAGACCATATTTGTCACCTTCGAGCTTAACAATCTTCGACATAATGTTCCT
TTTGGAAGCATAAAGTTGCTTGAAGCTACCTTGGAGCTCCGCTTCGCAATCCGATTTGAC
TCTCGAGGGAAGTTCCGACATAAACTCGCCCTTCTTGTCGGTTGAGACGGTGAAACGCGT
CTTGGAGTGGCTACAACTAACGCTGATCACGATTCCTGAATAATCGTAATCACTGGGACA
GTCGTAACAAGAGACTTTTCCTTCGACGAGCGAAACCGAGACCACGAGGGAAGATGAGAT
CAAAGCTGCCGTGAACAGGAACAAAGCTAGGAAACTTAACTGCATAGCCATTGGAGAAGG
GATAGGTGAACCCC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2AL96TF 650 0 0
CGTACACTAATATCACACACAAACTTCAGTTCAGGCATGGACTTAGAAAGACAGCTAAGA
TAAATACATGTCTTTGCACTTACATTATTAAATATTACA**TGAGCCGCAAAAGATATAT
GTTTAAACGGTGCATCTTATGGGATACCGATGATGGGGAAGAATGGAAGATAATAGCTCG
TGGGAGCCAGCCCCCACTCCGGAGGAACAGGCAAATCAACGGTCTTGGACGAACTGAAAG
ATCTGAGGCTTCTTGGACATGATTTCAAGAAGATTAACTTCGAAGAGAGACCATATTTGT
CACCTTCGAGCTTAACAATCTTCGACATAATGTTCCTTTTGGAAGCATAAAGTTGCTTGA
AGCTACCTTGGAGCTCCGCTTCGCAATCCGATTTGACTCTCGAGGGAAGTTCCGACATAA
ACTCGCCCTTCTTGTCGGTTGAGACGGTGAAACGCGTCTTGGAGTGGCTACAACTAACGC
TGATCACGATTCCTGAATAATCGTAATCACTGGGACAGTCGTAACAAGAGACTTTTCCTT
CGACGAGCGAAACCGAGACCACGAGGGAAGATGAGATCAAAGCTGCCGTGAACAGGAACA
AAGCTAGGAAACTTAACTGCATAGCCATTGGAGAAGGGATAGGT
GAACCC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 2 6

CO CL805Contig1 670 2 2 U
GGGGATAGATTAGAGACAACAAAAATGGCAACGGTACCTTTGTTCACCCAATTTCCCTGC
AAAACCCTAGTTTCAAGCCCTTCAAACCCTAAACATCAATCTAAATCTCCTATTCTATTG
CCCATTAGTTTGTTCAATCGGCGACCTCAGGCTGGAATCGCTGTTCATCGGTCAGATTTC
AAGGTCCGAGCCAGTGACGTCAATGACGAGTGGGGTCCGGATTCCAAGGGACGAGGCGGT
GACGTTGAAGACGAGTGGGGTCCCGAGAGAGGAACGAACTCATCGGTGGCGGAGAAAGAA
GCAGAAGAAGCCATCGAATCTGCAGAGGAGACGGAGCGGCTTAAGAGAGTGCTAGCCGGT
TCTTTTTATGGAACAGATCGAGGTTTAAACGCGTCGAGTGAGACGAGAGCTGAGATCAGT
GAGCTGATAACGCAGCTGGAGGGGAAGAACCCTAACCCAGCTCCTAACGAAGCTCTGTTT
CTCCTCAACGGCAAATGGATTCTCGCCTATACATCGTTTGTTGGTCTGTTCCCGTTGCTC
TCACGCAGAATCTCACCGTTGGTTAAAGTGGATGAGATCTCACAAACCATTGATTCCGAC
AGCTTCACCGTACACAACTCTGTCCGGTTCGCTGGTCCACTTGCCACAACATCGCTTAGC
ACCAACGCCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E671TF U 1
AF RR2GN59TF U 1
BS 1 245 RR2E671TF
BS 246 670 RR2GN59TF

RD RR2E671TF 257 0 0
GGGGATAGATTAGAGACAACAAAAATGGCAACGGTACCTTTGTTCACCCAATTTCCCTGC
AAAACCCTAGTTTCAAGCCCTTCAAACCCTAAACATCAATCTAAATCTCCTATTCTATTG
CCCATTAGTTTGTTCAATCGGCGACCTCAGGCTGGAATCGCTGTTCATCGGTCAGATTTC
AAGGTCCGAGCCAGTGACGTCAATGACGAGTGGGGTCCGGATTCCAAGGGACGAGGCGGT
GACGT
GAAGACGATGGG

QA 1 245 1 245
DS 

RD RR2GN59TF 670 0 0
GGGGATAGATTAGAGACAACAAAAATGGCAACGGTACCTTTGTTCACCCAATTTCCCTGC
AAAACCCTAGTTTCAAGCCCTTCAAACCCTAAACATCAATCTAAATCTCCTATTCTATTG
CCCATTAGTTTGTTCAATCGGCGACCTCAGGCTGGAATCGCTGTTCATCGGTCAGATTTC
AAGGTCCGAGCCAGTGACGTCAATGACGAGTGGGGTCCGGATTCCAAGGGACGAGGCGGT
GACGTTGAAGACGAGTGGGGTCCCGAGAGAGGAACGAACTCATCGGTGGCGGAGAAAGAA
GCAGAAGAAGCCATCGAATCTGCAGAGGAGACGGAGCGGCTTAAGAGAGTGCTAGCCGGT
TCTTTTTATGGAACAGATCGAGGTTTAAACGCGTCGAGTGAGACGAGAGCTGAGATCAGT
GAGCTGATAACGCAGCTGGAGGGGAAGAACCCTAACCCAGCTCCTAACGAAGCTCTGTTT
CTCCTCAACGGCAAATGGATTCTCGCCTATACATCGTTTGTTGGTCTGTTCCCGTTGCTC
TCACGCAGAATCTCACCGTTGGTTAAAGTGGATGAGATCTCACAAACCATTGATTCCGAC
AGCTTCACCGTACACAACTCTGTCCGGTTCGCTGGTCCACTTGCCACAACATCGCTTAGC
ACCAACGCCA

QA 1 670 1 670
DS 



CO CL805Contig2 828 4 2 U
CTGTCGGTATAGCAAAACCCTTAACCGGACGGTTCAGTTACGTATGTATATATATTACAT
TTATATATCCGGGAGCAACATCCATCATAACTCCCAACTATGTAGTAAAGTACATA****
***ACAGTTACAACACTTGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATGTTACTGTACGAATG
TGATGTGAGTAAAGATGACTTAAGGGTTTAAGAGAGAGCTTCCCTCTCTGATGAGCACAA
AGACGCTTCCACCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAGATAAGTCGTGAGCA
GCCATGACTGTGCACTGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAAAGGTGGCTGGCTTGAAATAG
TTCTCGCCACTGAAGAAGCCGTGTCTTGGACAGATGTAAGTAACCCTCTGATGGGGTTGA
GGTCGATTTTTTGACCAAGAACCTCGACGAACTCCGGGATTTCAATCGAATCCGTTAGTT
GTGGAGTCCCGATAATGCCTTGCTCAAACTTGACCTGGACGCGCTTAGGACTTCGGACTT
CGAATTTAGCGTTGGTGCTAAACGATGTTGTGGCAAGTGGACCAGCGAACCGGACAGAGT
TGTGTACGGTGAAGCTGTCGGAATCAATGGTTTGTGAGATCTCATCCACTTTAACCAACG
GTGAGATTCTGCGTGAGAGCAACGGGAACAGACCAACAAACGATGTATAGGCGAGAATCC
ATTTGCCGTTGAGGAGAAACAGAGCTTCGTTAGGAGCTGGGTTAGGGTTCTCCCCCTCGA
GCTGCGTTATCAGCTCACTGATCTCCGCTCTCGTCTCACTCGATGCGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E671JQ U 11
AF RR2GB94JQ U 1
AF RR2GB94TF C 1
AF RR2H168JQ U 69
BS 1 542 RR2GB94JQ
BS 543 828 RR2H168JQ

RD RR2E671JQ 509 0 0
AGCAAAACCCTTAACCGGACGGTTCAGTTACGTATGTATATATATTACATTTATATATCC
GGGAGCAACATCCATCATAACTCCCAACTATGTAGTAAAGTACATA*******ACAGTTA
CAACACTTGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATGTTACTGTACGAATGTGATGTGAGT
AAAGATGACTTAAGGGTTTAAGAAAGAGCTTCCCTCTCTGATGAGCACAAAGACGCTTCC
ACCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAGATAAGTCGTGAGCAGCCATGACTG
TGCACTGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAAAGGTGGCTGGCTTGAAATAGTTCTCGCCAC
TGAAGAAGCCGTGTCTTGGACAGATGTAAGTAACCCTCTGATGGGGTTGAGGTCGATTTT
TTGACCAAGAACCTCGACGAACTCCGGGATTTCAATCGAATCCGTTAGTTGTGGAGTCCC
GATAATGCCTTGCTCAAACTTGACCTGGA

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2GB94JQ 543 0 0
CTGTCGGTATAGCAAAACCCTTAACCGGACGGTTCAGTTACGTATGTATATATATTACAT
TTATATATCCGGGAGCAACATCCATCATAACTCCCAACTATGTAGTAAAGTACATA****
***ACAGTTACAACACTTGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATGTTACTGTACGAATG
TGATGTGAGTAAAGATGACTTAAGGGTTTAAGAGAGAGCTTCCCTCTCTGATGAGCACAA
AGACGCTTCCACCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAGATAAGTCGTGAGCA
GCCATGACTGTGCACTGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAAAGGTGGCTGGCTTGAAATAG
TTCTCGCCACTGAAGAAGCCGTGTCTTGGACAGATGTAAGTAACCCTCTGATGGGGTTGA
GGTCGATTTTTTGACCAAGAACCTCGACGAACTCCGGGATTTCAATCGAATCCGTTAGTT
GTGGAGTCCCGATAATGCCTTGCTCAAACTTGACCTGGACGCGCTTAGGACTTCGGACTT
CG
C

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2GB94TF 543 0 0
CTGTCGGTATAGCAAAACCCTTAACCGGACGGTTCAGTTACGTATGTATATATATTACAT
TTATATATCCGGGAGCAACATCCATCATAACTCCCAACTATGTAGTAAAGTACATA****
***ACAGTTACAACACTTGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATGTTACTGTACGAATG
TGATGTGAGTAAAGATGACTTAAGGGTTTAAGAGAGAGCTTCCCTCTCTGATGAGCACAA
AGACGCTTCCACCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAGATAAGTCGTGAGCA
GCCATGACTGTGCACTGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAAAGGTGGCTGGCTTGAAATAG
TTCTCGCCACTGAAGAAGCCGTGTCTTGGACAGATGTAAGTAACCCTCTGATGGGGTTGA
GGTCGATTTTTTGACCAAGAACCTCGACGAACTCCGGGATTTCAATCGAATCCGTTAGTT
GTGGAGTCCCGATAATGCCTTGCTCAAACTTGACCTGGACGCGCTTAGGACTTCGGACTT
CG
C

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2H168JQ 760 0 0
G
CGGGAGCAACATCCATCATAACTCCCAACTATGTAGTAAAGTACATATTACATAACAGTT
ACAACACTTGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATGTTACTGTACGGATGTGATG**AG
TAAAGATGACTTAAGGGTTTAAGAGAGAGTTTCCCTCTCTGATGAGCACAAAGACGCTTC
CACCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAGATAAGTCGTGAGCAGCCATGACT
GTGCACTGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAACGGTGGCTGGCTTGGAATAGTTCTTGCCA
CGGAAGAAGCCGTGTCTTGGACCGATGTAAGTAGCCCTCTAATGGGGTTGAGGTCGATTT
TTTGACCAAGAACCTCGACGAACTCCGGGATTTCAATCGAATCCGTTAGTTGTGGAGTCC
CGATAATGCCTTGCTCAAACTTGACCTGGACGCGTTTAGGACTTCGGACTTCGAATTTAG
CGTTGGTGCTAAACGATGTTGTGGCAAGTGGACCAGCGAACCGGACAGAGTTGTGTACGG
TGAAGCTGTCGGAATCAATGGTTTGTGAGATCTCATCCACTTTAACCAACGGTGAGATTC
TGCGTGAGAGCAACGGGAACAGACCAACAAACGATGTATAGGCGAGAATCCATTTGCCGT
TGAGGAGAAACAGAGCTTCGTTAGGAGCTGGGTTAGGGTTCTCCCCCTCGAGCTGCGTTA
TCAGCTCACTGATCTCCGCTCTCGTCTCACTCGATGCGT

QA 2 760 2 760
DS 



AS 1 7

CO CL806Contig1 1014 7 12 U
TTTTTATTTCTCCACTTCGCTCCTTCCTTCCTTCCTCGTCTCTCCATTATCGTCGTTGCC
TCGATCCGTAACATCAAAGCGATTGATTAAGTTGCAATGGGAGACAGTCAGTACTCGTTT
TCACTCACTACCTTCAGCCCTTCAGGGAAGCTGGTTCAGATTGAGCATGCTCTAACTGCT
GTTGGATCAGGCCAGACATCTTTAGGAATCAAAGCTTCAAACGGAGTTGTTATTGCTACT
GAAAAGAAGCTTCCATCTATTCTTGTTGATGAAGCCTCTGTTCAAAAGATTCAGCATTTG
ACTCCCAACATTGGAGTTGTATACAGTGGTATGGGTCCTGATTTCCGGGTTCTTGTGCGG
AAGAGTAGGAAGCAGGCCGAGCAATATCTCCGCTTGTACAAAGAACCTATCCCTGTCACT
CAACTTGTGAGGGAAACTGCTACGGTCATGCAAGAGTTCACTCAGTCAGGTGGTGTGAGG
CCGTTTGGAGTTTCTCTTCTAGTGGCTGGGTATGATGACAAGGGACCACAGCTGTACCAG
GTGGATCCGTCTGGTTCTTATTTCTCATGGAAAGCTTCGGCAATGGGGAAGAATGTTTCG
AATGCCAAGACATTTCTCGAGAAGAGGTACACAGAAGATATGGAGCTTGATGATGCGATT
CATACGGCTATATTGACACTGAA*GGAAGGTTTCGAGGGAGAAATCTCGAGCAAGAACAT
TGAGATTGGCAAGATTGGCGCTGACAAAGTCTTTAGGGTACTAACACCGGCAGAGATCGA
CGATTACTTGGCTGAGGTCGAGTAAAACTTTCACTTGGCCGCTCAACAAACCTGGAGTTG
AATCTCATTACTGTCTTTTTACTTTTGTGCCTAGTCGGACCAAAAAAA*CAGATGGTTCT
TGCGTTTGTAAAACTTTTCGAACTTGTTAAAACTCGAGACCCTGTTTAGTTTTCATTCGT
TTAGACAATGTTCAAATCCACAATCAGAAGTCATGCACACAAATTACTTTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C795TF U 1
AF RR2HA86TF U 1
AF RR2A665TF U 12
AF RR2AA71TF U 4
AF RR2AA71JQ C 165
AF RR2A665JQ C 136
AF RR2C795JQ C 342
BS 1 626 RR2C795TF
BS 627 627 RR2HA86TF
BS 628 684 RR2C795TF
BS 685 685 RR2AA71TF
BS 686 692 RR2C795TF
BS 693 693 RR2AA71TF
BS 694 713 RR2C795TF
BS 714 752 RR2AA71TF
BS 753 869 RR2A665JQ
BS 870 870 RR2AA71JQ
BS 871 1000 RR2A665JQ
BS 1001 1014 RR2C795JQ

RD RR2C795TF 713 0 0
TTTTTATTTCTCCACTTCGCTCCTTCCTTCCTTCCTCGTCTCTCCATTATCGTCGTTGCC
TCGATCCGTAACATCAAAGCGATTGATTAAGTTGCAATGGGAGACAGTCAGTACTCGTTT
TCACTCACTACCTTCAGCCCTTCAGGGAAGCTGGTTCAGATTGAGCATGCTCTAACTGCT
GTTGGATCAGGCCAGACATCTTTAGGAATCAAAGCTTCAAACGGAGTTGTTATTGCTACT
GAAAAGAAGCTTCCATCTATTCTTGTTGATGAAGCCTCTGTTCAAAAGATTCAGCATTTG
ACTCCCAACATTGGAGTTGTATACAGTGGTATGGGTCCTGATTTCCGGGTTCTTGTGCGG
AAGAGTAGGAAGCAGGCCGAGCAATATCTCCGCTTGTACAAAGAACCTATCCCTGTCACT
CAACTTGTGAGGGAAACTGCTACGGTCATGCAAGAGTTCACTCAGTCAGGTGGTGTGAGG
CCGTTTGGAGTTTCTCTTCTAGTGGCTGGGTATGATGACAAGGGACCACAGCTGTACCAG
GTGGATCCGTCTGGTTCTTATTTCTCATGGAAAGCTTCGGCAATGGGGAAGAATGTTTCG
AATGCCAAGACATTTCTCGAGAAGAG*TACACAGAAGATATGGAGCTTGATGATGCGATT
CATACGGCTATATTGACACTGAA**GAAGGTT*CGAGGGAGAAATCTCGAGCA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2HA86TF 663 0 0
TTTTTA
TTTCTCCACTTCGCTCCTTCCTTCCTTCCTCGTCTCTCCATTATCGTCGTTGCCTCGATC
CGTAACATCAAAGCGATTGATTAAGTTGCAATGGGAGACAGTCAGTACTCGTTTTCACTC
ACTACCTTCAGCCCTTCAGGGAAGCTGGTTCAGACTGAGCATGCTCTAACTGCTGTTGGA
TCAGGCCAGACATCTTTAGGAATCAAAGCTTCAAACGGAGTTGTTATTGCTACTGAAAAG
AAGCTTCCATCTATTCTTGTTGATGGAGCCTCTGTTCAAAAGATTCAGCATTTGACTCCC
AACATTGGAGTTGTATACAGTGGTATGGGTCCTGATTTCCGGGTTCTTGTGCGGAAGAGT
AGGAAGCAGGCCGAGCAATATCTCCGCTTGTACAAAGAACCTATCCCTGTCACTCAACTT
GTGAGGGAAACTGCTACGGTCATGCAAGAGTTCACTCAGTCAGGTGGTGTGAGGCCGTTT
GGAGTTTCTCTTCTAGTGGCTGGGTATGATGACAAGGGACCACAGCTGTACCAGGTGGAT
CCGTCTGGTTCTTATTTCTCATGGAAAGCTTCGGCAATGGGGAAGAATGTTTCGAATGCC
AAGACATTTCTCGAGAAGAGGTACACAGAAGATATGGAGCTTGATGATGCGATTCAT

QA 7 663 7 663
DS 

RD RR2A665TF 670 0 0
GG
ACTTCGCTCCTTCCTTCCTTCCTCGTCTCTCCATTATCGTCGTTGCCTCGATCCGTAACA
TCAAAGCGATTGATTAAGTTGCAATGGGAGACAGTCAGTACTCGTTTTCACTCACTACCT
TCAGCCCTTCAGGGAAGCTGGTTCAGATTGAGCATGCTCTAACTGCTGTTGGATCAGGCC
AGACATCTTTAGGAATCAAAGCTTCAAACGGAGTTGTTATTGCTACTGAAAAGAAGCTTC
CATCTATTCTTGTTGATGAAGCCTCTGTTCAAAAGATTCAGCATTTGACTCCCAACATTG
GAGTTGTATACAGTGGTATGGGTCCTGATTTCCGGGTTCTTGTGCGGAAGAGTAGGAAGC
AGGCCGAGCAATATCTCCGCTTGTACAAAGAACCTATCCCTGTCACTCAACTTGTGAGGG
AAACTGCTACGGTCATGCAGGAGTTCACTCAGTCAGGTGGTGTGAGGCCGTTTGGAGTTT
CTCTTCTAGTGGCTGGGTATGATGACAAGGGACCACAGCTGTACCAGGTGGATCCGTCTG
GTTCTTATTTCTCATGGAAAGCTTCGGCAATGGGGAAGAATGTTTCGAATGCCAAGACAT
TTCTCGAGAAGAGGTACACAGAAGATATGGAGCTTGATGATGCGATTCATACGGCTATAT
TGACACTG

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR2AA71TF 749 0 0
GAT
TTTCTCCACTTCGCTCCTTCCTTCCTTCCTCGTCTCTCCATTATCGTCGTTGCCTCGATC
CGTAACATCAAAGCGATTGATTAAGTTGCAATGGGAGACAGTCAGTACTCGTTTTCACTC
ACTACCTTCAGCCCTTCAGGGAAGCTGGTTCAGATTGAGCATGCTCTAACTGCTGTTGGA
TCAGGCCAGACATCTTTAGGAATCAAAGCTTCAAACGGAGTTGTTATTGCTACTGAAAAG
AAGCTTCCATCTATTCTTGTTGATGAAGCCTCTGTTCAAAAGATTCAGCATTTGACTCCC
AACATTGGAGTTGTATACAGTGGTATGGGTCCTGATTTCCGGGTTCTTGTGCGGAAGAGT
AGGAAGCAGGCCGAGCAATATCTCCGCTTGTACAAAGAACCTATCCCTGTCACTCAACTT
GTGAGGGAAACTGCTACGGTCATGCAAGAGTTCACTCAGTCAGGTGGTGTGAGGCCGTTT
GGAGTTTCTCTTCTAGTGGCTGGGTATTATGACAAGGGACCACAGCTGTACCAGGTGGAT
CCGTCTGGTTCTTATTTCTCATGGAAAGCTTCGGCAATGGGGAAGAATGTTTTGAATGCC
AAGACATTTCTCGAGAAGAGGTACACAGAAGATATGGAGCTTGATGATGCGATTCATACG
GCTATATTGACACTGAAAGGAAGGTTTCGAGGGAGAAATCTCGAGCAAGAACATTGAGAT
TGGCAAGATTGGCGCTGACAAAGTCT

QA 4 749 4 749
DS 

RD RR2AA71JQ 789 0 0
GCATGCTCTAACTGCTGTTGGATCAGGCCAGACATCTTTAGGAATCAAAGCTTCAAACGG
AGTTGTTATTGCTACTGAAAAGAAGCTTCCATCTATTCTTGTTGATGAAGCCTCTGTTCA
AAAGATTCAGCATTTGACTCCCAACATTGGAGTTGTATACAGTGGTATGGGTCCTGATTT
CCGGGTTCTTGTGCGGAAGAGTAGGAAGCAGGCCGAGCAATATCTCCGCTTGTACAAAGA
ACCTATCCCTGTCACTCAACTTGTGAGGGAAACTGCTACGGTCATGCAAGAGTTCACTCA
GTCAGGTGGTGTGAGGCCGTTTGGAGTTTCTCTTCTAGTGGCTGGGTATTATGACAAGGG
ACCACAGCTGTACCAGGTGGATCCGTCTGGTTCTTATTTCTCATGGAAAGCTTCGGCAAT
GGGGAAGAATGTTTTGAATGCCAAGACATTTCTCGAGAAGAGGTACACAGAAGATATGGA
GCTTGATGATGCGATTCATACGGCTATATTGACACTGAA*GGAAGGTTTCGAGGGAGAAA
TCTCGAGCAAGAACATTGAGATTGGCAAGATTGGCGCTGACAAAGTCTTTAGGGTACTAA
CACCGGCAGAGATCGACGATTACTTGGCTGAGGTCGAGTAAAACTTTCACTTGGCCGCTC
AACAAACCTGGAGTTGAATCTCATTACTGTCTTTTTACTTTTGTGCCTAGTCGGACCAAA
AAAA*CAGATGGTTCTTGCGTTTGTAAAACTTTTCGAACTTGTTAAAACTCGAGACCCTG
TTTAGTTTT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2A665JQ 865 0 0
AGCCCTTCAGGGAAGCTGGTTCAGATTGAGCATGCTCTAACTGCTGTTGGATCAGGCCAG
ACATCTTTAGGAATCAAAGCTTCAAACGGAGTTGTTATTGCTACTGAAAAGAAGCTTCCA
TCTATTCTTGTTGATGAAGCCTCTGTTCAAAAGATTCAGCATTTGACTCCCAACATTGGA
GTTGTATACAGTGGTATGGGTCCTGATTTCCGGGTTCTTGTGCGGAAGAGTAGGAAGCAG
GCCGAGCAATATCTCCGCTTGTACAAAGAACCTATCCCTGTCACTCAACTTGTGAGGGAA
ACTGCTACGGTCATGCAGGAGTTCACTCAGTCAGGTGGTGTGAGGCCGTTTGGAGTTTCT
CTTCTAGTGGCTGGGTATGATGACAAGGGACCACAGCTGTACCAGGTGGATCCGTCTGGT
TCTTATTTCTCATGGAAAGCTTCGGCAATGGGGAAGAATGTTTCGAATGCCAAGACATTT
CTCGAGAAGAGGTACACAGAAGATATGGAGCTTGATGATGCGATTCATACGGCTATATTG
ACACTGAA*GGAAGGTTTCGAGGGAGAAATCTCGAGCAAGAACATTGAGATTGGCAAGAT
TGGCGCTGACAAAGTCTTTAGGGTACTAACACCGGCAGAGATCGACGATTACTTGGCTGA
GGTCGAGTAAAACTTTCACTTGGCCGCTCAACAAACCTGGAGTTGAATCTCATTACTGTC
TTTTTACTTTTGTGTCTAGTCGGACCAAAAAAA*CAGATGGTTCTTGCGTTTGTAAAACT
TTTCGAACTTGTTAAAACTCGAGACCCTGTTTAGTTTTCATTCGTTTAGACAATGTTCAA
ATCCACAATCAGAAGTCATGCACAC

QA 1 865 1 865
DS 

RD RR2C795JQ 673 0 0
TTTCCGGGTTCTTGTGCGGAAGAGTAGGAAGCAGGCCGAGCAATATCTCCGCTTGTACAA
AGAACCTATCCCTGTCACTCAACTTGTGAGGGAAACTGCTACGGTCATGCAAGAGTTCAC
TCAGTCAGGTGGTGTGAGGCCGTTTGGAGTTTCTCTTCTAGTGGCTGGGTATGATGACAA
GGGACCACAGCTGTACCAGGTGGATCCGTCTGGTTCTTATTTCTCATGGAAAGCTTCGGC
AATGGGGAAGAATGTTTCGAATGCCAAGACATTTCTCGAGAAGAGGTACACAGAAGATAT
GGAGCTTGATGATGCGATTCATACGGCTATATTGACACTGAA*GGAAGGTTTCGAGGGAG
AAATCTCGAGCAAGAACATTGAGATTGGCATGATTGGCGCTGACAAAGTCTTTAGGGTAC
TAACACCGGCAGAGATCGACGATTACTTGGCTGAGGTCGAGTAAAACTTTCACTTGGCCG
CTCAACAAACCTGGAGTTGAATCTCATTACTGTCTTTTTACTTTTGTGCCTAGTCGGACC
AAAAAAAACAGATGGTTCTTGCGTTTGTAAAACTTTTCGAACTTGTTAAAACTCGAGACC
CTGTTTAGTTTTCATTCGTTTAGACAATGTTCAAATCCACAATCAGAAGTCATGCACACA
AATTACTTTGGCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 2 8

CO CL807Contig1 752 2 3 U
GGGAAGCAAGGAACTGAGGAACAGATCTGAAGAAGATGGAGTACGTGTTCGGTCTCGTTG
GTAATGGATTCGCTATTGTTGCGGCGGATACGTCGGCGGTTCACAGCATCCTTGTCCACA
AGAACAACGAGGACAAGATCATGCTCCTTGACTCTCACAAGCTCATCGCCGCAAGCGGCG
AGCCTGGTGACCGGGTTCAGTTTACGGAGTATGTACAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGT
TCCGAAACGGGATCCCTTTGACTACCGCTGCTGCTGCCAACTTCACTCGTGGTGAGCTCG
CCACTGCTCTGCGAAAGAACCCGTACTCTGTGAACATCCTGATGGCTGGCTACTACAAAG
AAGCAGGGGCATCTCTCTACTACATTGACTACATTGCAACTCTTCACAAGGTTGACAAGG
GAGCTTTCGGTTACGGCTCTTACTTCTCCCTCTCCACTATGGACAGGCACTTCCGCTCCG
ACATGTCTGTTGACGAAGCCATCGAGTTGGTCGACAAGTGCATACTCGAGATCAGGTCCA
GGCTGGTCATCGCACCGCCGAACTTTGTGATCAAGATCGTCGACAAGGATGGAGCTCGCG
AACACGCTTGGCGTCAGTCTGTACAAGATGTCACCACTGCTGCTGTCTAAAACTCTCTCT
TATGTTTGGTTGACATTTGCTTTAATGTTTGAACTTGGCAAATTAGTTCCCATATGACTG
TTTTAAACTTTGAAATGAAAACATTTTTACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP69TF U 1
AF RR2CP69JQ C 1
BS 1 19 RR2CP69JQ
BS 20 703 RR2CP69TF
BS 704 752 RR2CP69JQ

RD RR2CP69TF 704 0 0
GGGAAGCAAGGAACTGAGG
AACAGATCTGAAGAAGATGGAGTACGTGTTCGGTCTCGTTGGTAATGGATTCGCTATTGT
TGCGGCGGATACGTCGGCGGTTCACAGCATCCTTGTCCACAAGAACAACGAGGACAAGAT
CATGCTCCTTGACTCTCACAAGCTCATCGCCGCAAGCGGCGAGCCTGGTGACCGGGTTCA
GTTTACGGAGTATGTACAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTCCGAAACGGGATCCCTTT
GACTACCGCTGCTGCTGCCAACTTCACTCGTGGTGAGCTCGCCACTGCTCTGCGAAAGAA
CCCGTACTCTGTGAACATCCTGATGGCTGGCTACTACAAAGAAGCAGGGGCATCTCTCTA
CTACATTGACTACATTGCAACTCTTCACAAGGTTGACAAGGGAGCTTTCGGTTACGGCTC
TTACTTCTCCCTCTCCACTATGGACAGGCACTTCCGCTCCGACATGTCTGTTGACGAAGC
CATCGAGTTGGTCGACAAGTGCATACTCGAGATCAGGTCCAGGCTGGTCATCGCACCGCC
GAACTTTGTGATCAAGATCGTCGACAAGGATGGAGCTCGCGAACACGCTTGGCGTCAGTC
TGTACAAGATGTCACCACTGCTGCTGTCTAAAACTCTCTCTTATGTTTGGTTGACATTTG
CTTTAATGTTTGAACTTGGCAAAT
A

QA 20 703 20 703
DS 

RD RR2CP69JQ 752 0 0
GGGAAGCAAGGAACTGAGGAACAGATCTGAAGAAGATGGAGTACGTGTTCGGTCTCGTTG
GTAATGGATTCGCTATTGTTGCGGCGGATACGTCGGCGGTTCACAGCATCCTTGTCCACA
AGAACAACGAGGACAAGATCATGCTCCTTGACTCTCACAAGCTCATCGCCGCAAGCGGCG
AGCCTGGTGACCGGGTTCAGTTTACGGAGTATGTACAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGT
TCCGAAACGGGATCCCTTTGACTACCGCTGCTGCTGCCAACTTCACTCGTGGTGAGCTCG
CCACTGCTCTGCGAAAGAACCCGTACTCTGTGAACATCCTGATGGCTGGCTACTACAAAG
AAGCAGGGGCATCTCTCTACTACATTGACTACATTGCAACTCTTCACAAGGTTGACAAGG
GAGCTTTCGGTTACGGCTCTTACTTCTCCCTCTCCACTATGGACAGGCACTTCCGCTCCG
ACATGTCTGTTGACGAAGCCATCGAGTTGGTCGACAAGTGCATACTCGAGATCAGGTCCA
GGCTGGTCATCGCACCGCCGAACTTTGTGATCAAGATCGTCGACAAGGATGGAGCTCGCG
AACACGCTTGGCGTCAGTCTGTACAAGATGTCACCACTGCTGCTGTCTAAAACTCTCTCT
TATGTTTGGTTGACATTTGCTTTAATGTTTGAACTTGGCAAATTAGTTCCCATATGACTG
TTTTAAACTTTGAAATGAAAACATTTTTACTT

QA 1 752 1 752
DS 



CO CL807Contig2 750 6 7 U
GGCAAGTAAAAATGTTTTCATTTCAAAGTTTAAAACAGTCATATGGGAACTAATTTGCCA
AGTTCAAACATTAAAGCAAATGTCAACCAAACATAACAGAGACTTAAACAGCAGCAGTGG
TGACATCTTGTACAGACTGACGCCAAGCGTGCTCGCGAGCTCCATCCTTGTCGACGATCT
TGATCACAAAGTTCGGCGGCGCAATGACCAGTCTCGACCTGATCTCGAGTATGCACTTGT
CGACCAATTCGATGGCTTCTTCAACAGACATGTCGGCGCGGAAGTGCCTGTCCATGGTGG
AGAGGGAGAAGTAGGAGCCGTAACCGAAAGCACCCTTGTCAACCTTGTGAAGAGTTGCAA
TGTAGTCAATGTAGTAAAGAGATGCCCCTGCTTCTTTGTCGTAGCCAGCCATCAGGATGT
TCACAGAGTACGGGTTCTTTCTTAAAGCAGTGGCGAGCTCACCACGAGTGAAGTTAGCTG
CAGCAGCTGTAGTCAAAGGGATCCCGTTCCGGAACTGATACAGTGACACATTCTTCTGTA
CATACTCCGTGAACTGAACCCGGTCACCAGGCTCGCCGCTTGCAGCGATGAGCTTGTGAG
AGTCAAGGAGCATGATCTTGTCCTCGTTGTTCTTGTGGACAAGGATGCTGTGTACCGCCG
ATGTATCCGCCGCAACGATAGCGAATCCATTACCAACGAGACCGAACACGCACTCCATCT
CTCTTCAGATCTGTTGGTTAGTTCCTTTCC


BQ
10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2FT68JQ U 1
AF RR2FT68TF C 1
AF RR2HB45JQ U 1
AF RR2D771JQ U 2
AF RR2HB45TF C 39
AF RR2D771TF C 2
BS 1 572 RR2FT68JQ
BS 573 573 RR2HB45JQ
BS 574 612 RR2FT68JQ
BS 613 613 RR2HB45JQ
BS 614 722 RR2FT68JQ
BS 723 724 RR2HB45JQ
BS 725 750 RR2D771JQ

RD RR2FT68JQ 722 0 0
GGCAAGTAAAAATGTTTTCATTTCAAAGTTTAAAACAGTCATATGGGAACTAATTTGCCA
AGTTCAAACATTAAAGCAAATGTCAACCAAACATAACAGAGACTTAAACAGCAGCAGTGG
TGACATCTTGTACAGACTGACGCCAAGCGTGCTCGCGAGCTCCATCCTTGTCGACGATCT
TGATCACAAAGTTCGGCGGCGCAATGACCAGTCTCGACCTGATCTCGAGTATGCACTTGT
CGACCAATTCGATGGCTTCTTCAACAGACATGTCGGCGCGGAAGTGCCTGTCCATGGTGG
AGAGGGAGAAGTAGGAGCCGTAACCGAAAGCACCCTTGTCAACCTTGTGAAGAGTTGCAA
TGTAGTCAATGTAGTAAAGAGATGCCCCTGCTTCTTTGTCGTAGCCAGCCATCAGGATGT
TCACAGAGTACGGGTTCTTTCTTAAAGCAGTGGCGAGCTCACCACGAGTGAAGTTAGCTG
CAGCAGCTGTAGTCAAAGGGATCCCGTTCCGGAACTGATACAGTGACACATTCTTCTGTA
CATACTCCGTGAACTGAACCCGGTCACCAGGCCCGCCGCTTGCAGCGATGAGCTTGTGAG
AGTCAAGGAGCACGATCTTGTCCTCGTTGTTCTTGTGGACAAGGATGCTGTGTACCGCCG
ATGTATCCGCCGCAACGATAGCGAATCCATTACCAACGAGACCGAACACGCACTCCATCT
CT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2FT68TF 750 0 0
G
GCAAGTAAAAATGTTTTCATT*CAAAGTTTAAAACAGTCATATGGGAACTAATTTGCCAA
GTTCAAACATTAAAGCAAATGTCAACCAAACATAACAGAGACTTAAACAGCAGCAGTGGT
GACATCTTGTACAGACTGACGCCAAGCGTGCTCGCGAGCTCCATCCTTGTCGACGATCTT
GATCACAAAGTTCGGCGGCGCAATGACCAGTCTCGACCTGATCTCGAGTATGCACTTGTC
GACCAATTCGATGGCTTCTTCAACAGACATGTCGGCGCGGAAGTGCCTGTCCATGGTGGA
GAGGGAGAAGTAGGAGCCGTAACCGAAAGCACCCTTGTCAACCTTGTGAAGAGTTGCAAT
GTAGTCAATGTAGTAAAGAGATGCCCCTGCTTCTTTGTCGTAGCCAGCCATCAGGATGTT
CACAGAGTACGGGTTCTTTCTTAAAGCAGTGGCGAGCTCACCACGAGTGAAGTTAGCTGC
AGCAGCTGTAGTCAAAGGGATCCCGTTCCGGAACTGATACAGTGACACATTCTTCTGTAC
ATACTCCGTGAACTGAACCCGGTCACCAGGCCCGCCGCTTGCAGCGATGAGCTTGTGAGA
GTCAAGGAGCACGATCTTGTCCTCGTTGTTCTTGTGGACAAGGATGCTGTGTACCGCCGA
TGTATCCGCCGCAACGATAGCGAATCCATTACCAACGAGACCGAACACGCACTCCATCTC
TCTTCAGATCTGTTGGTTAGTTCCTTTCC

QA 2 750 2 750
DS 

RD RR2HB45JQ 724 0 0
A
GCAAGTAAAAATGTTTTCATTTCAAAGTTTAAAACAGTCATATGGGAACTAATTTGCCAA
GTTCAAACATTAAAGCAAATGTCAACCAAACATAACAGAGACTTAAACAGCAGCAGTGGT
GACATCTTGTACAGACTGACGCCAAGCGTGCTCGCGAGCTCCATCCTTGTCGACGATCTT
GATCACAAAGTTCGGCGGCGCAATGACCAGTCTCGACCTGATCTCGAGTATGCACTTGTC
GACCAATTCGATGGCTTCTTCAACAGACATGTCGGCGCGGAAGTGCCTGTCCATGGTGGA
GAGGGAGAAGTAGGAGCCGTAACCGAAAGCACCCTTGTCAACCTTGTGAAGAGTTGCAAT
GTAGTCAATGTAGTAAAGAGATGCCCCTGCTTCTTTGTCGTAGCCAGCCATCAGGATGCT
CACAGAGTACGGGTTCTTTCTTAAAGCAGAGGCGAGCTCACCACGAGTGAAGTTAGCTGC
AGCAGCTGTAGTCAAAGGGATCCCGTTCCGGAACTGATACAGTGACACATTCTTCTGTAC
ATACTCCGTGAACTGAACCCGGTCACCAGGCTCGCCGCTTGCAGCGATGAGCTTGTGAGA
GTCAAGGAGCATGATCTTGTCCTCGTTGTTCTTGTGGACAAGGATGCTGTGTACCGCCGA
TGTATCCGCCGCAACGATAGCGAATCCATTACCAACGAGACCGAACACGCACTCCATCTC
TCT

QA 2 724 2 724
DS 

RD RR2D771JQ 749 0 0
GCAAGTAAAAATGTTTTCATTTCAAAGTTTAAAACAGTCATATGGGAACTAATTTGCCAA
GTTCAAACATTAAAGCAAATGTCAACCAAACATAACAGAGACTTAAACAGCAGCAGTGGT
GACATCTTGTACAGACTGACGCCAAGCGTGCTCGCGAGCTCCATCCTTGTCGACGATCTT
GATCACAAAGTTCGGCGGCGCAATGACCAGTCTCGACCTGATCTCGAGTATGCACTTGTC
GACCAATTCGATGGCTTCTTCAACAGACATATCGGCGCGGAAGTGCCTGTCCATGGTGGA
GAGGGAGAAGTAGGAGCCGTAACCGAAAGCACCCTTGTCAACCTTGTGAAGAGTTGCAAT
GTAGTCAATGTAGTAAAGAGATGCCCCTGCTTCTTTGTCGTAGCCAGCCATCAGGATGTT
CACAGAGTACGGGTTCTTTCTTAAAGCAGTGGCGAGCTCACCACGAGTGAAGTTAGCTGC
AGCAGCTGTAGTCAAAGGGATCCCGTTCCGGAACTGATACAGTGACCCATTCTTCTGTAC
ATACTCCGTGAACTGAACCCGGTCACCAGGCTCGCCGCTTGCAGCGATGAGCTTGTGAGA
GTCAAGGAGCATGATCTTGTCCTCGTTGTTCTTGTGGACAAGGATGCTGTGTACCGCCGA
TGTATCCGCCGCAACGATAGCGAATCCATTACCAACGAGACCGAACACGCACTCCATCTC
TCTTCAGATCTGTTGGTTAGTTCCTTTCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2HB45TF 712 0 0
TCATATGGGAACTAATTTGCCAAGTTCAAACATTAAAGCAAATGTCAACCAAACATAACA
GAGACTTAAACAGCAGCAGTGGTGACATCTTGTACAGACTGACGCCAAGCGTGCTCGCGA
GCTCCATCCTTGTCGACGATCTTGATCACAAAGTTCGGCGGCGCAATGACCAGTCTCGAC
CTGATCTCGAGTATGCACTTGTCGACCAATTCGATGGCTTCTTCAACAGACATGTCGGCG
CGGAAGTGCCTGTCCATGGTGGAGAGGGAGAAGTAGGAGCCGTAACCGAAAGCACCCTTG
TCAACCTTGTGAAGAGTTGCAATGTAGTCAATGTAGTAAAGAGATGCCCCTGCTTCTTTG
TCGTAGCCAGCCATCAGGATGCTCACAGAGTACGGGTTCTTTCTTAAAGCAGAGGCGAGC
TCACCACGAGTGAAGTTAGCTGCAGCAGCTGTAGTCAAAGGGATCCCGTTCCGGAACTGA
TACAGTGACACATTCTTCTGTACATACTCCGTGAACTGAACCCGGTCACCAGGCTCGCCG
CTTGCAGCGATGAGCTTGTGAGAGTCAAGGAGCATGATCTTGTCCTCGTTGTTCTTGTGG
ACAAGGATGCTGTGTACCGCCGATGTATCCGCCGCAACGATAGCGAATCCATTACCAACG
AGACCGAACACGCACTCCATCTCTCTTCAGATCTGTTGGTTAGTTCCTTTCC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2D771TF 749 0 0
GCAAGTAAAAATGTTTTCATT*CAAAGTTTAAAACAGTCATATGGGAACTAATTTGCCAA
GTTCAAACATTAAAGCAAATGTCAACCAAACATAACAGAGACTTAAACAGCAGCAGTGGT
GACATCTTGTACAGACTGACGCCAAGCGTGCTCGCGAGCTCCATCCTTGTCGACGATCTT
GATCACAAAGTTCGGCGGCGCAATGACCAGTCTCGACCTGATCTCGAGTATGCACTTGTC
GACCAATTCGATGGCTTCTTCAACAGACATATCGGCGCGGAAGTGCCTGTCCATGGTGGA
GAGGGAGAAGTAGGAGCCGTAACCGAAAGCACCCTTGTCAACCTTGTGAAGAGTTGCAAT
GTAGTCAATGTAGTAAAGAGATGCCCCTGCTTCTTTGTCGTAGCCAGCCATCAGGATGTT
CACAGAGTACGGGTTCTTTCTTAAAGCAGTGGCGAGCTCACCACGAGTGAAGTTAGCTGC
AGCAGCTGTAGTCAAAGGGATCCCGTTCCGGAACTGATACAGTGACCCATTCTTCTGTAC
ATACTCCGTGAACTGAACCCGGTCACCAGGCTCGCCGCTTGCAGCGATGAGCTTGTGAGA
GTCAAGGAGCATGATCTTGTCCTCGTTGTTCTTGTGGACAAGGATGCTGTGTACCGCCGA
TGTATCCGCCGCAACGATAGCGAATCCATTACCAACGAGACCGAACACGCACTCCATCTC
TCTTCAGATCTGTTGGTTAGTTCCTTTCC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 2 8

CO CL808Contig1 679 2 2 U
GGAACTCACAAAAAAAATCAAGAAAACATCTCTAAGTCTCCCTAAGTCTTCTAAGCACAT
AAAAAAATGGCCTCAACAGCTCTCTCAAGCTCCATCGTCGGAACATCCTTCCTCCGCCGT
CAAACAGCTCCTATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACTCAATCCCTCTTCGGT
CTCAAATCTGGCACAGCACGCGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCTACATACAAGGTCAAG
TTCGTCACTCCTGAAGGAGAGCAAGAGGTTGAGTGCGACGACGACGTCTACGTCCTCGAC
GCTGCTGAGGAAGCCGGAATCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCTGGTTCTTGCTCGAGC
TGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGATCTGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGAT
GACCAGATTGCTGAAGGATTCGTTCTCACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTACC
ATTGAGACCCACAGAGAAGAAGACATTGTTTAAGACAAAAGCTCCGTAACATGCTGCTTT
TGATGGTTTGATAATCATTGTCTTGACATTTTGGGTTGAGTGTGTTGCTACTTAGTAAAA
TCTATTGTTATCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTGGCCAACCTTTTGGTAAGATCAATGGA
TATTAAAATTATGATCATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2AH69JQ C 1
AF RR2AH69TF U 1
BS 1 676 RR2AH69TF
BS 677 679 RR2AH69JQ

RD RR2AH69JQ 679 0 0
GGAACTCACAAAAAAAATCAAGAAAACATCTCTAAGTCTCCCTAAGTCTTCTAAGCACAT
AAAAAAATGGCCTCAACAGCTCTCTCAAGCTCCATCGTCGGAACATCCTTCCTCCGCCGT
CAAACAGCTCCTATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACTCAATCCCTCTTCGGT
CTCAAATCTGGCACAGCACGCGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCTACATACAAGGTCAAG
TTCGTCACTCCTGAAGGAGAGCAAGAGGTTGAGTGCGACGACGACGTCTACGTCCTCGAC
GCTGCTGAGGAAGCCGGAATCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCTGGTTCTTGCTCGAGC
TGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGATCTGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGAT
GACCAGATTGCTGAAGGATTCGTTCTCACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTACC
ATTGAGACCCACAGAGAAGAAGACATTGTTTAAGACAAAAGCTCCGTAACATGCTGCTTT
TGATGGTTTGATAATCATTGTCTTGACATTTTGGGTTGAGTGTGTTGCTACTTAGTAAAA
TCTATTGTTATCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTGGCCAACCTTTTGGTAAGATCAATGGA
TATTAAAATTATGATCATC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2AH69TF 679 0 0
GGAACTCACAAAAAAAATCAAGAAAACATCTCTAAGTCTCCCTAAGTCTTCTAAGCACAT
AAAAAAATGGCCTCAACAGCTCTCTCAAGCTCCATCGTCGGAACATCCTTCCTCCGCCGT
CAAACAGCTCCTATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACTCAATCCCTCTTCGGT
CTCAAATCTGGCACAGCACGCGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCTACATACAAGGTCAAG
TTCGTCACTCCTGAAGGAGAGCAAGAGGTTGAGTGCGACGACGACGTCTACGTCCTCGAC
GCTGCTGAGGAAGCCGGAATCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCTGGTTCTTGCTCGAGC
TGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGATCTGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGAT
GACCAGATTGCTGAAGGATTCGTTCTCACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTACC
ATTGAGACCCACAGAGAAGAAGACATTGTTTAAGACAAAAGCTCCGTAACATGCTGCTTT
TGATGGTTTGATAATCATTGTCTTGACATTTTGGGTTGAGTGTGTTGCTACTTAGTAAAA
TCTATTGTTATCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTGGCCAACCTTTTGGTAAGATCAATGGA
TATTAAAATTATGATC
ATC

QA 1 676 1 676
DS 



CO CL808Contig2 680 6 7 U
GGCCACAAGTCATAACTAACAAAAAAATCAAGAAAACATCTCTAAAGTCTTTTAAGCACA
TTAAAAAATGGCCTCAACAGCTCTCTCAAGCGCCATCGTCGGAACATCCTTCCTCCGCCG
TCAAACAGCTCCTATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACTCAATCCCTCTTCGG
TCTCAAATCTGGCACAGCACGCGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCTACATACAAGGTCAA
GTTCGTCACTCCTGAAGGAGAGCAAGAGGTTGAGTGCGACGACGACGTCTACGTCCTCGA
CGCTGCTGAGGAAGCAGGAATCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCTGGTTCTTGCTCGAG
CTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGATCTGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGA
TGACCAGATTGCTGAAGGATTCGTTCTCACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTAC
CATTGAGACCCACAGAGAAGAAGACATTGTTTAAGACAAAAGCTACATAACATGCTGCTT
TTGATGGTTTGATAATCACTGTCTTTACATTTTGGG*TTGAGTGTGTTGCTACTTAGTAA
AAATCTATTGCTGTTTGTTGTAATTGTTCTTGGTTTGGCCAACCTTTTGGTAAGATAAAT
GGATAATTAAATTTATGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 

AF RR2CX31JQ C 323
AF RR2BL52TF U 1
AF RR2CX31TF U 12
AF RR2CT45JQ C 5
AF RR2CT45TF U 5
AF RR2BL52JQ C 87
BS 1 576 RR2BL52TF
BS 577 577 RR2CX31TF
BS 578 602 RR2BL52TF
BS 603 603 RR2CX31TF
BS 604 658 RR2BL52TF
BS 659 659 RR2CX31TF
BS 660 680 RR2BL52TF

RD RR2CX31JQ 315 0 0
GACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCTGGTTCTTGCTCGAGCTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCT
GGATCTGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGATGACCAGATTGCTGAAGGATTC
GTTCTCACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTACCATTGAGACCCACAGAGAAGAA
GACATTGTTTAAGACAAAAGCTACATAACATGCTGCTTTTGATGGTTTGATAATCACTGT
CTTTACATTTTGGG*TTGAGTGTGTTGCTACTTAGTAAAAATCTATTGCTGTTTGTTGTA
ATTGTTCTTGGTTTG

QA 1 315 1 315
DS 

RD RR2BL52TF 680 0 0
GGCCACAAGTCATAACTAACAAAAAAATCAAGAAAACATCTCTAAAGTCTTTTAAGCACA
TTAAAAAATGGCCTCAACAGCTCTCTCAAGCGCCATCGTCGGAACATCCTTCCTCCGCCG
TCAAACAGCTCCTATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACTCAATCCCTCTTCGG
TCTCAAATCTGGCACAGCACGCGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCTACATACAAGGTCAA
GTTCGTCACTCCTGAAGGAGAGCAAGAGGTTGAGTGCGACGACGACGTCTACGTCCTCGA
CGCTGCTGAGGAAGCAGGAATCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCTGGTTCTTGCTCGAG
CTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGATCTGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGA
TGACCAGATTGCTGAAGGATTCGTTCTCACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTAC
CATTGAGACCCACAGAGAAGAAGACATTGTTTAAGACAAAAGCTACATAACATGCTGCTT
TTGATGGTTTGATAATCACTGTCTTTACATTTTGGGGTTGAGTGTGTTGCTACTTAGTAA
AA*TCTATTGCTGTTTGTTGTAATTGTTCTTGGTTTGGCCAACCTTTTGGTAAGATAA*T
GGATAATTAAATTTATGATC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2CX31TF 669 0 0
GG
AACTAACAAAAAAATCAAGAAAACATCTCTAAAGTCTTTTAAGCACATTAAAAAATGGCC
TCAACAGCTCTCTCAAGCGCCATCGTCGGAACACTCTTCCTCCGCCGTCAAACAGCTCCT
ATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACTCAATCCCTCTTCGGTCTCAAATCTGGC
ACAGCACGCGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCTACATACAAGGTCAAGTTCGTCACTCCT
GAAGGAGAGCAAGAGGTTGAGTGCGACGACGACGTCTACGTCCTCGACGCTGCTGAGGAA
GCAGGAATCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCTGGTTCTTGCTCGAGCTGTGCAGGTAAA
GTTGTGTCTGGATCTGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGATGACCAGATTGCT
GAAGGATTCGTTCTCACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTACCATTGAGACCCAC
AGAGAAGAAGACATTGTTTAAGACAAAAGCTACATAACATGCTGCTTTTGATGGTTTGAT
AATCACTGTCTTTACATTTTGGG*TTGAGTGTGTTGCTACTTAGTAAAAATCTATTGCTG
TTTGTTGTAATTGTTCTTGGTTTGGCCAACCTTTTGGTAAGATAAATGGATAATTAAATT
TATGATC

QA 3 669 3 669
DS 

RD RR2CT45JQ 676 0 0
GGAAGTCAT
AACTAACAAAAAAATCAAGAAAACATCTCTAAAGTCTTTTAAGCACATTAAAAAATGGCC
TCAACAGCTCTCTCAAGCGCCATCGTCGGAACATCCTTCCTCCGCCGTCGAACAGCTCCT
ATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACTCAATCCCTCTTCGGTCTCAAATCTGGC
ACAGCACGCGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCTACATACAAGGTCAAGTTCGTCACTCCT
GAAGGAGAGCAAGAGGTTGAGTGCGACGACGACGTCTACGTCCTCGACGCTGCTGAGGAA
GCAGGAATCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCTGGTTCTTGCTCGAGCTGTGCAGGTAAA
GTTGTGTCTGGATCTGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGATGACCAGATTGCT
GAAGGATTCGTTCTCACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTACCATTGAGACCCAC
AGAGAAGAAGACATTGTTTAAGACAAAAGCTACATAACATGCTGCTTTTGATGGTTTGAT
AATCACTGTCTTTACATTTTGGG*TTGAGTGTGTTGCTACTTAGTAAAAATCTATTGCTG
TTTGTTGTAATTGTTCTTGGTTTGGCCAACCTTTTGGTAAGATAAATGGATAATTAAATT
TATGA
CC

QA 10 674 10 674
DS 

RD RR2CT45TF 676 0 0
GGAAGTCAT
AACTAACAAAAAAATCAAGAAAACATCTCTAAAGTCTTTTAAGCACATTAAAAAATGGCC
TCAACAGCTCTCTCAAGCGCCATCGTCGGAACATCCTTCCTCCGCCGTCGAACAGCTCCT
ATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACTCAATCCCTCTTCGGTCTCAAATCTGGC
ACAGCACGCGGTGGACGCGTCACAGCCATGGCTACATACAAGGTCAAGTTCGTCACTCCT
GAAGGAGAGCAAGAGGTTGAGTGCGACGACGACGTCTACGTCCTCGACGCTGCTGAGGAA
GCAGGAATCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCTGGTTCTTGCTCGAGCTGTGCAGGTAAA
GTTGTGTCTGGATCTGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGATGACCAGATTGCT
GAAGGATTCGTTCTCACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTACCATTGAGACCCAC
AGAGAAGAAGACATTGTTTAAGACAAAAGCTACATAACATGCTGCTTTTGATGGTTTGAT
AATCACTGTCTTTACATTTTGGG*TTGAGTGTGTTGCTACTTAGTAAAAATCTATTGCTG
TTTGTTGTAATTGTTCTTGGTTTGGCCAACCTTTTGGTAAGATAAATGGATAATTAAATT
TATGA
CC

QA 10 674 10 674
DS 

RD RR2BL52JQ 594 0 0
CAAGCGCCATCGTCGGAACATCCTTCTTCCGCCGTCAAACAGCTCCTATCAGCCTCCGTT
CCCTCCCCTTAGCCAACACTCAATCCCTCTTCGGTCTCAAATCTGGCACAGCACGCGGTG
GACGCGTCACAGCCATGGCTACATACAAGGTCAAGTTCGTCACTCCTGAAGGAGAGCAAG
AGGTTGAGTGCGACGACGACGTTTACGTCCTCGACGCTGCTGAGGAAGCAGGAATCGACT
TGCCTTACTCTTGCCGTGCTGGTTCTTGCTCGAGCTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGAT
CTGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGATGACCAGATTGCTGAAGGATTCGTTC
TCACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTACCATTGAGACCCACAGAGAAGAAGACA
TTGTTTAAGACAAAAGCTACATAACATGCTGCTTTTGATGGTTTGATAATCACTGTCTTT
ACATTTTGGG*TTGAGTGTGTTGCTACTTAGTAAAAATCTATTGCTGTTTGTTGTAATTG
TTCTTGGTTTGGCCAACCTTTTGGTAAGATAAATGGATAATTAAATTTATGATC

QA 1 594 1 594
DS 



AS 2 7

CO CL809Contig1 1316 4 9 U
GGGAAGAAAAAAATTATCATATATGGGCACTCATACGAGAAATCCCAAGGCCTAGTTTAC
GGATACATATCATTAAACAACAAAGGAAACTTGAGAGGCAAGAAAACAACACAGTCCATA
AATTAAAAAAAGGCCCTAAGAATGAGTCGTCAAACGAATTAAAAGAAGTGAAATCTTTCA
ATCTTTTCTTCCCTGAGGGAACTCATCTTCGTTTCAAATCTCTGGAGATAGCTCTGATGG
TGGAAGGTGTAGTCCTGCAGCATCCTCCTATAAGTTTAGCTCCAAGGTCACGCCATTTCG
GTGCAAACATCTCAAACTCAGCATCACCAAAGCATTGCGATGGCAGCCATTTTTTGGCTT
TCCCGTCCCAAACCTCTCCACTATTTGGGTACACAACGATGGCCTTCTTGGTCAGCTTGG
AGAATTTGCGAATCAGATTGTCCATGAACTGAGGAGGTGAACAGTTAATGCCAACAGCGC
AAATGTTGTTGCTTTTGTTAAGGGTTTCAAGGCATTCCTCAAAGCTCTCACCTGAAGGAG
CATTCTCACCATCTACAGATGTGAAGCAGATCCACGCTGGGATTTGCACATTCTCTTCCT
CCAGCACCTCAACGCACGCCTGAGCCTCGAGTTTATTAGGTATGGTTTCGAAAGCGAGAA
GATCTGGACTAGCTTCCACTAGGACTTGGATTCTCCTCCTGTGGAAGTCTTTTAGTTTAT
CCAAGCTTACATCCTCTCCATAGCTTCCACTGTACTCAGAGCCATCAGCGAGATAAGCTC
CATAGCTACCAATAGAAGCAGCTACAAGAGCTCTGTTATAGCTGTGTCCTGAGGTTTTGC
TGACATTGTCCCAGAATCTATCACGGGCTTCAACAGCTAGTTTCACGCTCTTTTGTAGTA
AAGACTCGCTCTCTTCCATCGACAATCCTCTTGAGAGAAAGCCAGGGATTGTAGCCTGAT
AAGATGAAGTAACCACAATGTCTGAACCAGCCTCCAAATATTCCATATGAACCCGCTTGA
TGAGTTCAGGATCTTTGATGAGAGATAAGGCACTCCACAGAGGGTCGTTAATGGCGGCGC
CGTGAATCTCGAGCTGGGTTGCGAAACCACCGTCGACCACCGCACAGCCGCCGCATTTCT
CTATCAAATCTTCCAACAATGCAGATTTCTTCTCTAAACCCATGACTCAAAAAAAACCAA
TGTATCTCGCAAACCCTAACAACGAGAAACTTTGAGATTTTCTTGTCTCGTGAAATCGGA
GAATCAACGCCGCTTTTGTTGGTGAAGATTGTGTTTTTCCCCCTTACAATGGATCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI14JQ U 1
AF RR2A343JQ U 3
AF RR2A343TF C 553
AF RR2CI14TF C 630
BS 1 130 RR2CI14JQ
BS 131 131 RR2A343JQ
BS 132 818 RR2CI14JQ
BS 819 829 RR2A343JQ
BS 830 844 RR2A343TF
BS 845 845 RR2CI14TF
BS 846 1195 RR2A343TF
BS 1196 1196 RR2CI14TF
BS 1197 1316 RR2A343TF

RD RR2CI14JQ 818 0 0
GGGAAGAAAAAAATTATCATATATGGGCACTCATACGAGAAATCCCAAGGCCTAGTTTAC
GGATACATATCATTAAACAACAAAGGAAACTTGAGAGGCAAGAAAACAACACAGTCCATA
AATTAAAAAA*GGCCCTAAGAATGAGTCGTCAAACGAATTAAAAGAAGTGAAATCTTTCA
ATCTTTTCTTCCCTGAGGGAACTCATCTTCGTTTCAAATCTCTGGAGATAGCTCTGATGG
TGGAAGGTGTAGTCCTGCAGCATCCTCCTATAAGTTTAGCTCCAAGGTCACGCCATTTCG
GTGCAAACATCTCAAACTCAGCATCACCAAAGCATTGCGATGGCAGCCATTTTTTGGCTT
TCCCGTCCCAAACCTCTCCACTATTTGGGTACACAACGATGGCCTTCTTGGTCAGCTTGG
AGAATTTGCGAATCAGATTGTCCATGAACTGAGGAGGTGAACAGTTAATGCCAACAGCGC
AAATGTTGTTGCTTTTGTTAAGGGTTTCAAGGCATTCCTCAAAGCTCTCACCTGAAGGAG
CATTCTCACCATCTACAGATGTGAAGCAGATCCACGCTGGGATTTGCACATTCTCTTCCT
CCAGCACCTCAACGCACGCCTGAGCCTCGAGTTTATTAGGTATGGTTTCGAAAGCGAGAA
GATCTGGACTAGCTTCCACTAGGACTTGGATTCTCCTCCTGTGGAAGTCTTTTAGTTTAT
CCAAGCTTACATCCTCTCCATAGCTTCCACTGTACTCAGAGCCATCAGCGAGATAAGCTC
CATAGCTACCAATAGAAGCAGCTACAAGAGCTCTGTTA

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2A343JQ 827 0 0
GG
AGAAAAAAATTATCATATATGGGCACTCATACGAGAAATCCCAAGGCCTAGTTTACGGAT
ACATATCATTAAACAACAAAGGAAACTTGAGAGGCAAGAAAACAACACAGTCCATAAATT
AAAAAAAGGCCCTAAGAATGAGTCGTCAAACGAATTAAAAGAAGTGAAATCTTTCAATCT
TTTCTTCCCTGAGGGAACTCATCTTCGTTTCAAATCTCTGGAGATAGCTCTGATGGTGGA
AGGTGTAGTCCTGCAGCATCCTCCTATAAGTTTAGCTCCAAGGTCACGCCATTTCGGTGC
AAACATCTCAAACTCAGCATCACCAAAGCATTGCGATGGCAGCCATTTTTTGGCTTTCCC
GTCCCAAACCTCTCCACTATTTGGGTACACAACGATGGCCTTCTTGGTCAGCTTGGAGAA
TTTGCGAATCAGATTGTCCATGAACTGAGGAGGTGCACAGTTAATGCCAACAGCGCAAAT
GTTGTTGCTTTTGTTAAGGGTTTCAAGGCATTCCTCAAAGCTCTCACCTGAAGGAGCATT
CTCACCATCTACAGATGTGAAGCAGATCCACGCTGGGATTTGCACATTCTCTTCCTCCAG
CACCTCAACGCACGCCTGAGCCTCGAGTTTATTAGGTATGGTTTCGAAAGCGAGAAGATC
TGGACTAGCTTCCACTAGGACTTGGATTCTCCTCCTGTGGAAGTCTTTTAGTTTATCCAA
GCTTACATCCTCTCCATAGCTTCCACTGTACTCAGAGCCATCAGCGAGATAAGCTCCATA
GCTACCAATAGAAGCAGCTACAAGAGCTCTGTTATAGCTGTGTCC

QA 3 827 3 827
DS 

RD RR2A343TF 764 0 0
CTACAGATGTGAAGCAGATCCACGCTGGGATTTGCACATTCTCTTCCTCCAGCACCTCAA
CGCACGCCTGAGCCTCGAGTTTATTAGGTATGGTTTCGAAAGCGAGAAGATCTGGACTAG
CTTCCACTAGGACTTGGATTCTCCTCCTGTGGAAGTCTTTTAGTTTATCCAAGCTTACAT
CCTCTCCATAGCTTCCACTGTACTCAGAGCCATCAGCGAGATAAGCTCCATAGCTACCAA
TAGAAGCAGCTACAAGAGCTCTGTTATAGCTGTGTCCTGAGGTTTTGCTGACTTTGTCCC
AGAATCTATCACGGGCTTCAACAGCTAGTTTCACGCTCTTTTGTAGTAAAGACTCGCTCT
CTTCCATCGACAATCCTCTTGAGAGAAAGCCAGGGATTGTAGCCTGATAAGATGAAGTAA
CCACAATGTCTGAACCAGCCTCCAAATATTCCATATGAACCCGCTTGATGAGTTCAGGAT
CTTTGATGAGAGATAAGGCACTCCACAGAGGGTCGTTAATGGCGGCGCCGTGAATCTCGA
GCTGGGTTGCGAAACCACCGTCGACCACCGCACAGCCGCCGCATTTCTCTATCAAATCTT
CCAACAATGCAGATTTCTTCTCTAAACCCATGACTCAAAAAAACCCAATGTATCTCGCAA
ACCCTAACAACGAGAAACTTTGAGATTTTCTTGTCTCGTGAAATCGGAGAATCAACGCCG
CTTTTGTTGGTGAAGATTGTGTTTTTCCCCCTTACAATGGATCC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2CI14TF 680 0 0
AGTTTATTAGGTATGGTTTCGAAAGCGAGAAGATCTGGACTAGCTTCCACTAGGACTTGG
ATTCTCCTCCTGTGGAAGTCTTTTAGTTTATCCAAGCTTACATCCTCTCCATAGCTTCCA
CTGTACTCAGAGCCATCAGCGAGATAAGCTCCATAGCTACCAATAGAAGCAGCTACAAGA
GCTCTGTTATAGCTGTGTCCTGAGGTTTTGCTGACATTGTCCCAGAATCTATCACGGGCT
TCAACAGCTAGTTTCACGCTCTTTTGTAGTAAAGACTCGCTCTCTTCCATCGACAATCCT
CTTGAGAGAAAGCCAGGGATTGTAGCCTGATAAGATGAAGTAACCACAATGTCTGAACCA
GCCTCCAAATATTCCATATGAACCCGCTTGATGAGTTCAGGATCTTTGATGAGAGATAAG
GCACTTCACAGAGGGTCGTTAATGGCGGCGCCGTGAATCTCGAGCTGGGTTGCGAAACCA
CCGTCGACCACCGCACAGCCGCCGCATTTCTCTATCAAATCTTCCAACAATGCAGATTTC
TTCTCTAAACCCATGACTCAAAAAAAACCAATGTATCTCGCAAACCCTAACAACGAGAAA
CTTTGAGATTTTCTTGTCTCGTGAAATCGGAGAATCAACGCCGCTTTTGTTGGTGAAGAT
TGTGTTTTTC
CCCCTTACCC

QA 1 670 1 670
DS 



CO CL809Contig2 869 3 4 U
GCGGAAAGAATAAAATCATCATTTATGGGCACTCATACGAGAAAGCCCAAGGCCTAGTTT
TACGGATACATACCATTAAACAACAAAGGAAACTTGAGAGGCAAGAAAACAACACAGATC
CATAAATAAAAGAAGCCCTAAGAATGAGTCGTCAAACGAATTAAAGAAGTGAAATCTTTC
AATCTCTTCTTCCCTGAGGGAACTCATCTTCGTTTCAAATCTCTGGAGATAGCTCTGATG
GTGGAAGGTGTAGTCCTGCAGCATCCTCCTATAAGTTTAGCTCCAAGGTCACGCCATTTC
GGTGCAAACATCTCAAACTCAGCATCACCAAAGCATTGCGATGGAAGCCATTTTTTGGCT
TTCCCGTCCCAAACCTCTCCACTATTTGGGTACACAACGATGGCCTTCTTGGTAAGCTTG
GAGAATTTGAGAATCAGATCGTCCATGAACTGAGGAGGTGCACAGTTAATGCCAACAGCG
CAAATGTTGTTGCTTTTGTTAAGGGTTTCAAGGCATTCCTCAAAGCTCTCGCCTGAAGGA
GCATTCTCACCATCTACAGAAGTGAAGCAGATCCACGCTGGGGTTTGCACATTCTCTTCC
TCCAGGACCTCAACGCACGCCTGAGCCTCGAGTTTATTAGGTATGGTTTCGAAAGCTAGA
AGATCAGGACTAGCTTCCACTAGGACTTGGATTCTCTATCAAATCTTCCAACAATGCAGA
TTTCTTCTCTAAACCCATGACTCGAAAAAAAACCCAAATGTATCTCGCAAACCCTAAAAA
CGAGAAACTTTGAGATTTTCTTGTCTCGTGAAATCGGAGAATCAACGCCGCTTTTGTTGG
TGAAGATTGTGTTTTTCTTCCTTACAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW21JQ U 4
AF RR2EC09JQ U 1
AF RR2DW21TF C 559
BS 1 575 RR2EC09JQ
BS 576 576 RR2DW21JQ
BS 577 679 RR2EC09JQ
BS 680 869 RR2DW21TF

RD RR2DW21JQ 637 0 0
GAA
AGAATAAAATTATCATTTATGGGCACTCATACGAGAAAGCCCAAGGCCTAGTTTTACGGA
TACATACCATTAAACAACAAAGGAAACTTGAGAGGCAAGAAAACAACACAGATCCATAAA
TAAAA*AAGCCCTAAGAATGAGTCGTCAAACGAATTAAAGAAGTGAAATCTTTCAATCTC
TTCTTCCCTGAGGGAACTCATCTTCGTTTCAAATCTCTGGAGATAGCTCTGATGGTGGAA
GGTGTAGTCCTGCAGCATCCTCCTATAAGTTTAGCTCCAAGGTCACGCCATTTCGGTGCA
AACATCTCAAACTCAGCATCACCAAAGCATTGCGATGGCAGCCATTTTTTGGCTTTCCCG
TCCCAAACCTCTCCACTATTTGGGTACACAACGATGGCCTTCTTGGTAAGCTTGGAGAAT
TTGAGAATCAGATCGTCCATGAACTGAGGAGGTGCACAGTTAATGCCAACAGCGCAAATG
TTGTTGCTTTTGTTAAGGGTTTTAAGGCATTCCTCAAAGCTCTCGCCTGAAGGAGCATTC
TCACCATCTACAGAAGTGAAGCAGATCCACGCTGGGGTTTGCACATTCTCTTCCTCCAGG
ACCTCAACGCACGCCTGAGCCTCGAGTTTATTAG

QA 4 637 4 637
DS 

RD RR2EC09JQ 679 0 0
GCGGAAAGAATAAAATCATCATTTATGGGCACTCATACGAGAAAGCCCAAGGCCTAGTTT
TACGGATACATACCATTAAACAACAAAGGAAACTTGAGAGGCAAGAAAACAACACAGATC
CATAAATAAAAGAAGCCCTAAGAATGAGTCGTCAAACGAATTAAAGAAGTGAAATCTTTC
AATCTCTTCTTCCCTGAGGGAACTCATCTTCGTTTCAAATCTCTGGAGATAGCTCTGATG
GTGGAAGGTGTAGTCCTGCAGCATCCTCCTATAAGTTTAGCTCCAAGGTCACGCCATTTC
GGTGCAAACATCTCAAACTCAGCATCACCAAAGCATTGCGATGGAAGCCATTTTTTGGCT
TTCCCGTCCCAAACCTCTCCACTATTTGGGTACACAACGATGGCCTTCTTGGTAAGCTTG
GAGAATTTGAGAATCAGATCGTCCATGAACTGAGGAGGTGCACAGTTAATGCCAACAGCG
CAAATGTTGTTGCTTTTGTTAAGGGTTTCAAGGCATTCCTCAAAGCTCTCGCCTGAAGGA
GCATTCTCACCATCTACAGAAGTGAAGCAGATCCA*GCTGGGGTTTGCACATTCTCTTCC
TCCAGGACCTCAACGCACGCCTGAGCCTCGAGTTTATTAGGTATGGTTTCGAAAGCTAGA
AGATCAGGACTAGCTTCCA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2DW21TF 311 0 0
GAA
GTGAAGCAGATCCACGCTGGGGTTTGCACATTCTCTTCCTCCAGG*CCTCAACGCACGCC
TGAGCCTCGAGTTTATTAGGTATGGTTTCGAAAGCTAGAAGATCAGGACTAGCTTCCACT
AGGACTTGGATTCTCTATCAAATCTTCCAACAATGCAGATTTCTTCTCTAAACCCATGAC
TCGAAAAAAAACCCAAATGTATCTCGCAAACCCTAAAAACGAGAAACTTTGAGATTTTCT
TGTCTCGTGAAATCGGAGAATCAACGCCGCTTTTGTTGGTGAAGATTGTGTTTTTCTTCC
TTACAATC

QA 4 311 4 311
DS 



AS 2 8

CO CL810Contig1 787 2 4 U
GGGTCAGCAAAATGTCTTCTTCTTCCTCATAACGAAACAAACAGATCAGCACGACAAAAA
AGAAGAAGAATCCTAATCGTGAGTTCTCAAACAGAACGATGATTCATATTGTTCAAGTAG
TGATTCTCTGTCTCTCCATCGCCGCCGTGATCTCGATCTCCACCACCGATGACGAGTCTA
TATACGAGATCCTCAAGGAGAACGGATTGCCATCAGGTATATTCCCTAAAGGCGTGACTG
AGTTCAACTTCGACGTCAAAACGGGACGGTTCTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATG
CCAAGTACGAGACAGAGCTGCGTTACGAGGCGAATGTTACGGGGACGATAAGCGACGCTC
ACATCGGTGATTTGTCGGGGATATCGGCGCAAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAG
GAATCAGAGTCGACGTGCCGAGCTCTGGCCTTATATACTTCGACGTTGGTGTTGTTCGCA
AGCAATACTCGCTGTCTTTGTTCGATACTCCTAGAGATTGTGTTGCGGTTCGCGGTGAAA
ATGAGGTTCAGGCTTCTACGTTGTCATTGTATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAATA
TTATCTAGCGAGATTTTTAAGAAATGTCTTCATATACTATACCAGAAAGATAGACAGATG
TTCTCATCAATTCTTGAAAATACTTTGTACTGTTTTTTTTGGTCTCAAATCTTAAAGCAT
GATTCAAGTCAAATGCTTCCCGTTCCAGTTCTGTTTTCTGTATTGTATTTTCAGATCGTG
AGGGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG09TF U 1
AF RR2C557TF U 27
BS 1 558 RR2BG09TF
BS 559 559 RR2C557TF
BS 560 698 RR2BG09TF
BS 699 787 RR2C557TF

RD RR2BG09TF 711 0 0
GGGTCAGCAAAATGTCTTCTTCTTCCTCATAACGAAACAAACAGATCAGCACGACAAAAA
AGAAGAAGAATCCTAATCGTGAGTTCTCAAACAGAACGATGATTCATATTGTTCAAGTAG
TGATTCTCTGTCTCTCCATCGCCGCCGTGATCTCGATCTCCACCACCGATGACGAGTCTA
TATACGAGATCCTCAAGGAGAACGGATTGCCATCAGGTATATTCCCTAAAGGCGTGACTG
AGTTCAACTTCGACGTCAAAACGGGACGGTTCTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATG
CCAAGTACGAGACAGAGCTGCGTTACGAGGCGAATGTTACGGGGACGATAAGCGACGCTC
ACATCGGTGATTTGTCGGGGATATCGGCGCAAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAG
GAATCAGAGTCGACGTGCCGAGCTCTGGCCTTATATACTTCGACGTTGGTGTTGTTCGCA
AGCAATACTCGCTGTCTTTGTTCGATACTCCTAGAGATTGTGTTGCGGTTCGCGGTGAAA
ATGAGGTTCAGGCTTCTATGTTGTCATTGTATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAATA
TTATCTAGCGAGATTTTTAAGAAATGTCTTCATATACTATACCAGAAAGATAGACAGATG
TTCTCATCAATTCTTGAAAATACTTTGTACTGTTTTTT
TTTGGTCTCAAAT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2C557TF 761 0 0
GG
ATAACGAAACAAACAGATCAGCACGACAAAAAAGAAGAAGAATCCTAATCGTGAGTTCTC
AAACAGAACGATGATTCATATTGTTCAAGTAGTGATTCTCTGTCTCTCCATCGCCGCCGT
GATCTCGATCTCCACCACCGATGACGAGTCTATATACGAGATCCTCAAGGAGAACGGATT
GCCATCAGGTATATTCCCTAAAGGCGTGACTGAGTTCAACTTCGACGTCAAAACGGGACG
GTTCTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATGCCAAGTACGAGACAGAGCTGCGTTACGA
GGCGAATGTTACGGGGACGATAAGCTACGCTCACATCGGTGATTTGTCGGGGATATCGGC
GCAAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAGGAATCAGAGTCGACGTGCCGAGCTCTGG
CCTTATATACTTCGACGTTGGTGTTGTTCGCAAGCAATACTCGCTGTCTTTGTTCGATAC
TCCTAGAGATTGTGTTGCGGTTCGCGGTGAAAATGAGGTTCAGGCTTCTACGTTGTCATT
GTATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAA*TATTATCTAGCGAGATTTTTAAGAAATGTC
TTCATATACTATACCAGAAAGATAGACAGATGTTCTCATCAATTCTTGAAA*TACTTTGT
ACTGTTTTTTTTGGTCTCAAATCTTAAAGCATGATTCAAGTCAAATGCTTCCCGTTCCAG
TTCTGTTTTCTGTATTGTATTTTCAGATCGTGAGGGGAC

QA 3 761 3 761
DS 



CO CL810Contig2 1014 6 5 U
GGAAGCTGTCAGCAAAATGTCTTCTTCTTCCTCATAACGAAACAAACAGATCAGCACGAC
AAAAAAGAAGAATCCTAATCGTGAGTTCTGAAACAGAACGATGATTCGTTTAGTTCAAAT
AACGATTCTCTATTTCTCCATCGCCGCCGTGATCTCGATCTCCACCACCGATGACGAGTC
TATATACGAGATCCTCAAGGAGAACGGATTGCCGTCAGGTATATTCCCTAAAGGCGTGAC
GGAGTTCAACTTCGACGTCAAAACGGGACGGTTCTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGA
TGCCAAGTACGAGACGGAGCTGCGCTACGAGGCTAACGTTACGGGGACGATAAGTGACGC
TCACATCGGTGATTTGTCGGGGATATCGGCGCAAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAA
AGGAATCAGAGTCGACGTGCCGAGCTCTGGCCTTATCTACTTCGACGTTGGTGTTGTTCG
CAAGCAATACTCGCTGTCTTTGTTCGATACTCCTAGAGATTGCGTTGCGGTTCGCGGTGA
AAATCAGGTTCAGGCTTCTATGTTGTCATTGTATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAA
TATTATCTAGCGAGATTTTTAAGAAATGTCTTCATATACTATACCAGAAAGATAGACCGA
TGTTCTCATCAATTCTTGAAAATACTTTGTACTGTTTT***TTGGTCTCAAATCTTAAAG
CATGATTCAAGGTCAAATGCTTCCCATTCCAGTTCTGTTTTCTGTATTGTATTTTTCAGA
TCGTGAGGGGGACTGAACCGAGAGAATCTGTGAGCGGAAGTTAGATGG*AAGAAAAAAAA
AA*CATTATCTGGTTTGTTTGGAAAAGATGTTGAAGGACTGGTCCATATGTGGTTGAAGT
GATTGATGATAACAGTGATGTGAGGTGATGAATGTTTTTCTTTATTGTATTTATGTGCCT
GTGTATTCGCAGATATTATCCTACATATAGCCAAATAAGTCTCTGGAGTTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 5 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM21TF U 23
AF RR2EM58TF U 1
AF RR2CF49TF U 93
AF RR2EM58JQ C 219
AF RR2C557JQ C 275
AF RR2BM21JQ C 318
BS 1 729 RR2EM58TF
BS 730 840 RR2CF49TF
BS 841 841 RR2EM58JQ
BS 842 842 RR2C557JQ
BS 843 1014 RR2EM58JQ

RD RR2BM21TF 673 0 0
TCTTCTTCCTCATAACGAAACAAACAGATCAGCACGACAAAAAAGAAGAATCCTAATCGT
GAGTTCTGAAACAGAACGATGATTCGTTTAGTTCAAATAACGATTCTCTATTTCTCCATC
GCCGCCGTGATCTCGATCTCCACCACCGATGACGAGTCTATATACGAGATCCTCAAGGAG
AACGGATTGCCGTCAGGTATATTCCCTAAAGGCGTGACGGAGTTCAACTTCGACGTCAAA
ACGGGACGGTTCTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATGCCAAGTACGAGACGGAGCTG
CGCTACGAGGCTAACGTTACGGGGACGATAAGTGACGCTCACATCGGTGATTTGTCGGGG
ATATCGGCGCAAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAGGAATCAGAGTCGACGTGCCG
AGCTCTGGCCTTATCTACTTCGACGTTGGTGTTGTTCGCAAGCAATACTCGCTGTCTTTG
TTCGATACTCCTAGAGATTGCGTTGCGGTTCGCGGTGAAAATCAGGTTCAGGCTTCTATG
TTTTCATTGTATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAATATTATCTAGCGAGATTTTTAA
GAAATGTCTTCATATACTATACCAGAAAGATAGACCGATGTTCTCACCAATTCTTGAAA*
TACTTTGTACTGT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2EM58TF 729 0 0
GGAAGCTGTCAGCAAAATGTCTTCTTCTTCCTCATAACGAAACAAACAGATCAGCACGAC
AAAAAAGAAGAATCCTAATCGTGAGTTCTGAAACAGAACGATGATTCGTTTAGTTCAAAT
AACGATTCTCTATTTCTCCATCGCCGCCGTGATCTCGATCTCCACCACCGATGACGAGTC
TATATACGAGATCCTCAAGGAGAACGGATTGCCGTCAGGTATATTCCCTAAAGGCGTGAC
GGAGTTCAACTTCGACGTCAAAACGGGACGGTTCTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGA
TGCCAAGTACGAGACGGAGCTGCGCTACGAGGCTAACGTTACGGGGACGATAAGTGACGC
TCACATCGGTGATTTGTCGGGGATATCGGCGCAAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAA
AGGAATCAGAGTCGACGTGCCGAGCTCTGGCCTTATCTACTTCGACGTTGGTGTTGTTCG
CAAGCAATACTCGCTGTCTTTGTTCGATACTCCTAGAGATTGCGTTGCGGTTCGCGGTGA
AAATCAGGTTCAGGCTTCTATGTTGTCATTGTATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAA
TATTATCTAGCGAGATTTTTAAGAAATGTCTTCATATACTATACCAGAAAGATAGACCGA
TGTTCTCATCAATTCTTGAAAATACTTTGTACTGTTTT***TTGGTCTCAAATCTTAAAG
CATGATTCA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2CF49TF 748 0 0
GG
AGAACGATGATTCGTTTAGTTCAAATAACGATTCTCTATTTCTCCGTCGCCGCCGTGATC
TCGATCTCCACCACCGATGACGAGTCTATATACGAGATCCTCAAGGAGAACGGATTGCCG
TCAGGTATATTCCCTAAAGGCGTGACGGAGTTCAACTTCGACGTCAAAACGGGACGGTTC
TCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATGCCAAGTACGAGACGGAGCTGCGCTACGAGGCT
AACGTTACGGGGACGATAAGTGACGCTCACATCGGTGATTTGTCGGGGATATCGGCGCAA
GACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAGGAATCAGAGTCGACGTGCCGAGCTCTGGCCTT
ATCTACTTCGACGTTGGTGTTGTTCGCAAGCAATACTCGCTGTCTTTGTTCGATACTCCT
AGAGATTGCGTTGCGGTTCGCGGTGAAAATCAGGTTCAGGCTTCTATGTTGTCATCGTAT
CAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAATATTATCTAGCGAGATTTTTAAGAAATGTCTTCA
TATACTATACCAGAAAGATAGACCGATGTTCTCATCAATTCTTGAAAATACTTTGTACTG
TTTT***TTGGTCTCAAATCTTAAAGCATGATTCAAGGTCAAATGCTTCCCATTCCAGTT
CTGTTTTCTGTATTGTATTTTTCAGATCGTGAGGGGGACTGAACCGAGAGAATCTGTGAG
CGGAAGTTAGATGG*AAGAAAAAAAA

QA 3 748 3 748
DS 

RD RR2EM58JQ 796 0 0
AGTATA
TCCCTAAAGGCGTGACGGAGT*CAACTTCGACGTCAAA*CGGGACGGTTCTCTGTTTATT
TGAACCGCCCCTGCGATGCCAAGTACGAGACGGAGCTGCGCTACGAGGCTAACGTTACGG
GGACGATAAGTGACGCTCACATCGGTGATTTGTCGGGGATATCGGCGCAAGACCTGTTCC
TGTGGTTTCCGGTTAAAGGAATCAGAGTCGACGTGCCGAGCTCTGGCCTTATCTACTTCG
ACGTTGGTGTTGTTCGCAAGCAATACTCGCTGTCTTTGTTCGATACTCCTAGAGATTGCG
TTGCGGTTCGCGGTGAAAATCAGGTTCAGGCTTCTATGTTGTCATTGTATCAAGTAGATG
AAACTACTGGGAGAAATATTATCTAGCGAGATTTTTAAGAAATGTCTTCATATACTATAC
CAGAAAGATAGACCGATGTTCTCATCAATTCTTGAAAATACTTTGTACTGTTTT***TTG
GTCTCAAATCTTAAAGCATGATTCAAGGTCAAATGCTTCCCATTCCAGTTCTGTTTTCTG
TATTGTATTTTTCAGATCGTGAGGGGGACTGAACCGAGAGAATCTGTGAGCGGAGGTTAG
ATGG*AAGAAAAAAAAA**CATTATCTGGTTTGTTTGGAAAAGATGTTGAAGGACTGGTC
CATATGTGGTTGAAGTGATTGATGATAACAGTGATGTGAGGTGATGAATGTTTTTCTTTA
TTGTATTTATGTGCCTGTGTATTCGCAGATATTATCCTACATATAGCCAAATAAGTCTCT
GGAGTTCACT

QA 7 796 7 796
DS 

RD RR2C557JQ 732 0 0
TCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATGCCAAGTACGAGACAGAGCTGCGTTACGAGGCG
AATGTTACGGGGACGATAAGCTACGCTCACATCGGTGATTTGTCGGGGATATCGGCGCAA
GACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAGGAATCAGAGTCGACGTGCCGAGCTCTGGCCTT
ATATACTTCGACGTTGGTGTTGTTCGCAAGCAATACTCGCTGTCTTTGTTCGATACTCCT
AGAGATTGTGTTGCGGTTCGCGGTGAAAATGAGGTTCAGGCTTCTACGTTGTCATTGTAT
CAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAATATTATCTAGCGAGATTTTTAAGAAATGTCTTCA
TATACTATACCAGAAAGATAGACAGATGTTCTCATCAATTCTTGAAAATACTTTGTACTG
TTTTTTTTTGGTCTCAAATCTTAAAGCATGATTCAAGGTCAAATGCTTCCCGTTCCAGTT
CTGTTTTCTGTATTGTATTTTTCAGATCGTGAGGGGGACTGAACCGAGAGAATCTGTGAG
CGGAAGTTAGATGGGAAGAAAAAAAAAAACATTGTCTGGTTTGTTTGGAAAAGATGTTGA
AGGACTGGTCCATATGTGGTTGAAGTGATTGATGATAACAGTGATGTGAGGTGATGAATG
TTTTTCTTTATTGTATTTATGTGCCTGTGTATTCGCAGATATTATCCTACATATAGCCAA
ATAAGTCTCTG
C

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2BM21JQ 694 0 0
AGCTGCGCTACGAGGCTAACGTTACGGGGACGATAAGTGACGCTCACATCGGTGATTTGT
CGGGGATATCGGCGCAAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAGGAATCAGAGTCGACG
TGCCGAGCTCTGGCCTTATCTACTTCGACGTTGGTGTTGTTCGCAAGCAATACTCGCTGT
CTTTGTTCGATACTCCTAGAGATTGCGTTGCGGTTCGCGGTGAAAATCAGGTTCAGGCTT
CTATGTTTTCATTGTATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAATATTATCTAGCGAGATT
TTTAAGAAATGTCTTCATATACTATACCAGAAAGATAGACCGATGTTCTCACCAATTCTT
GAAAATACTTTGTACTGTTTT***TTGGTCTCAAATCTTAAAGCATGATTCAAGGTCAAA
TGCTTCCCATTCCAGTTCTGTTTTCTGTATTGTATTTTTCAGATCGTGAGGGGGACTGAA
CCGAGAGAATCTGTGAGCGGAAGTTAGATGG*AAGAAAAAAAAAA*CATTATCTGGTTTG
TTTGGAAAAGATGTTGAAGGACTGGTCCATATGTGGTTGAAGTGATTGATGATAACAGTG
ATGTGAGGTGATGAATGTTTTTCTTTATTGTATTTATGTGCCTGTGTATTCGCAGATATT
ATCCTACATATAGCCAAATAAGTCTCTG
GAGTCC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 3 7

CO CL811Contig1 788 2 4 U
GGAGATATTAACGAAGGTTGCTTTGCTTTGGGGCTGTTGTAAAAAAGATCACGATCGCAA
CTTGTGTGACAGAGATTCAGATATGGCTTGGTTAGCTAGATCCATCGCGAACTCACTCAA
GCTCGACGAGGACGACGACGATGTCGAGAAGCCACGGCCTGGTGGTGATGATGAGTCATC
CGTTCAGAATCAATCGGTGTCGGAGTCACAGTCTCCTCGAGGAGTTAAGGAAGACATCTC
GGAGCTTACCAAGACCTTGAGAAGCCAATTCTGGGGCGTAGCTTCGTTCCTCTCGCAGCA
ACCGTCTCCATCTCCGGATCTCCAGGAGGAGAGGGATCGTCAGAGTCCAGATCATCCGGA
GGAGGAGGAGGACGAGGATCTGATCGCCGGGATTAGGAACGATTTCGCGGAGATCGGAGG
GAGGTTCAGGACTGGGATTTCGAAGCTCTCTGAGAACTTAGCGTCGAATTTCTTACAGTT
GGGCTCAGAAGGAGTGGATCCGAAGGGTTACGGTGACGTAATCGGAGTGACCGATGAGGT
AGTTGCTTTTGTGAGGGATCTCGCGATGAATCCTGATACTTGGTTGGATCTTCCTTTACC
TGATGATGATGATACCTATGATGAGTTTGAAATGAGTGATGATCAGCACGAGCATGCTGT
GGCCGTGGAAAGGCTTGTACCGAGCCTTGCTTCTTTGAGGATTGAGCTTTGCCCTGAGTA
CATGAGTGAGATTGCTTCTGGTTGATTTACTTTGTGCTTTTGCATCCTAACTCACCCACA
CGATGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D219TF U 1
AF RR2G428TF U 69
BS 1 672 RR2D219TF
BS 673 673 RR2G428TF
BS 674 687 RR2D219TF
BS 688 788 RR2G428TF

RD RR2D219TF 687 0 0
GGAGATATTAACGAAGGTTGCTTTGCTTTGGGGCTGTTGTAAAAAAGATCACGATCGCAA
CTTGTGTGACAGAGATTCAGATATGGCTTGGTTAGCTAGATCCATCGCGAACTCACTCAA
GCTCGACGAGGACGACGACGATGTCGAGAAGCCACGGCCTGGTGGTGATGATGAGTCATC
CGTTCAGAATCAATCGGTGTCGGAGTCACAGTCTCCTCGAGGAGTTAAGGAAGACATCTC
GGAGCTTACCAAGACCTTGAGAAGCCAATTCTGGGGCGTAGCTTCGTTCCTCTCGCAGCA
ACCGTCTCCATCTCCGGATCTCCAGGAGGAGAGGGATCGTCAGAGTCCAGATCATCCGGA
GGAGGAGGAGGACGAGGATCTGATCGCCGGGATTAGGAACGATTTCGCGGAGATCGGAGG
GAGGTTCAGGACTGGGATTTCGAAGCTCTCTGAGAACTTAGCGTCGAATTTCTTACAGTT
GGGCTCAGAAGGAGTGGATCCGAAGGGTTACGGTGACGTAATCGGAGTGACCGATGAGGT
AGTTGCTTTTGTGAGGGATCTCGCGATGAATCCTGATACTTGGTTGGATCTTCCTTTACC
TGATGATGATGATACCTATGATGAGTTTGAAATGAGTGATGATCAGCACGAGCATGCTGT
GGCCGTGGAAAG*CTTGTACCGAGCCT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2G428TF 720 0 0
AC
AGAGATTCAGATATGGCTTGGTTAGCTAGATCCATCGCGAACTCACTCAAGCTCGACGAG
GACGACGACGATGTCGAGAAGCCACGGCCTGGTGGTGATGATGAGTCATCCGTTCAGAAT
CAATCGGTGTCGGAGTCACAGTCTCCTCGAGGAGTTAAGGAAGACATCTCGGAGCTTACC
AAGACCTTGAGAAGCCAATTCTGGGGCGTAGCTTCGTTCCTCTCGCAGCAACCGTCTCCA
TCTCCGGATCTCCAGGAGGAGAGGGATCGTCAGAGTCCAGATCATCCGGAGGAGGAGGAG
GACGAGGATCTGATCGCCGGGATTAGGAACGATTTCGCGGAGATCGGAGGGAGGTTCAGG
ACTGGGATTTCGAAGCTCTCTGAGAACTTAGCGTCGAATTTCTTACAGTTGGGCTCAGAA
GGAGTGGATCCGAAGGGTTACGGTGACGTAATCGGAGTGACCGATGAGGTAGTTGCTTTT
GTGAGGGATCTCGCGATGAATCCTGATACTTGGTTGGATCTTCCTTTACCTGATGATGAT
GATACCTTTGATGAGTTTGAAATGAGTGATGATCAGCACGAGCATGCTGTGGCCGTGGAA
AGGCTTGTACCGAGCCTTGCTTCTTTGAGGATTGAGCTTTGCCCTGAGTACATGAGTGAG
ATTGCTTCTGGTTGATTTACTTTGTGCTTTTGCATCCTAACTCACCCACACGATGCCT

QA 3 720 3 720
DS 



CO CL811Contig2 1080 3 9 U
ACAAACATTTTGGAGTTTCTAATAAAGCCCTCGTATGAGTTTTCATCGAACAGATTTTTT
GATAGACTTGAGAGATTTTATGTTTATATAACCAAAAGAACACTAGAGGTGGTCATTTGT
ATTACATTTCATCGACATCAAGACAAATGGTTTGATTCTGTTGTTCTCTTTTTACCTGAC
CCGCGTTGCCGTCTTATATCTGTACCCAGTCTGGCGAACTAGAGTTAGTAGATCTCTTAG
AACTCACGGGTACGTCTCTTTCCTCGTCATCATCATCTTCTTCTAGATCACTGAATGACA
CATCTTCTTCGTCTTCACCAAGAGGATGCTTAG*AGTTACTCCTCCTTCCATGCCGCTCA
CAGCATCTGAACTCTCTTCATCGTTCAACCAATCATCTGCGTCTTCTTCTTCTTCTTCTA
CGTCCTCAGCTTGCACATTGACAAATCTAGACGAAGAAGAAGAATCAGTTGATGAGTTTC
TTTCTTCAATGACAGATTTGTCAACGACTTGTATCTC***CTTGCTCTCAACTGGGTGCT
TGTCTGTCTCAAACTCCTGCGGATTTACGGTTTTACCAGCTAATGACTCCTGTGAAGGGT
TATAAGGCACGGTAAGAGGTTCAACCACTGCAGCGTTAGCTTCAGAACTCTCTGCTTCTT
CCACAGGTGCTCTGTTTGATTTCTGTAACTCGTGAGATAACATTGCTCTTGCTTCGAGTA
CCTGAGGAGTGGAGAGAAGCAAGGCATCGTGTTGGCTGAGTTTAGGATGCAAAAGCACAA
AGTAAATCAACCAGAAGCAATTCTCACTCATGTACTCAGGGCAAAGCTCAATCCTCAAAG
AAGCAAGGCTCGGTACAAGCCTTTCAACAGCCACAGCATGCTCGTGCTGATCATCACTCA
TTTCAAACTCATCAAAGGTACCATCATCATCATCATCATCATCAGGTAAAGGAAGATCCA
ACCAAGTATCGGGATTCATCGCGAGATCCCTCACGAACGCAACTACCTCCTCGGTCACTC
CGATTACGTCATCGTAAACCTTCGGATCCACTCCTTCTGAGCCCAGCTGTAAGAAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F391JQ U 1
AF RR2BC66JQ U 44
AF RR2F391TF C 313
BS 1 59 RR2F391JQ
BS 60 60 RR2BC66JQ
BS 61 146 RR2F391JQ
BS 147 147 RR2BC66JQ
BS 148 238 RR2F391JQ
BS 239 239 RR2BC66JQ
BS 240 704 RR2F391JQ
BS 705 907 RR2BC66JQ
BS 908 1080 RR2F391TF

RD RR2F391JQ 706 0 0
ACAAACATTTTGGAGTTTCTAATAAAGCCCTCGTATGAGTTTTCATCGAACAGATTTTT*
GATAGACTTGAGAGATTTTATGTTTATATAACCAAAAGAACACTAGAGGTGGTCATTTGT
ATTACATTTCATCGACATCAAGACAA*TGGTTTGATTCTGTTGTTCTCTTTTTACCTGAC
CCGCGTTGCCGTCTTATATCTGTACCCAGTCTGGCGAACTAGAGTTAGTAGATCTCTTGG
AACTCACGGGTACGTCTCTTTCCTCGTCATCATCATCTTCTTCTAGATCACTGAATGACA
CATCTTCTTCGTCTTCACCAAGAGGATGCTTAG*AGTTACTCCTCCTTCCATGCCGCTCA
CAGCATCTGAACTCTCTTCATCGTTCAACCAATCATCTGCGTCTTCTTCTTCTTCTTCTA
CGTCCTCAGCTTGCACATTGACAAATCTAGACGAAGAAGAAGAATCAGTTGATGAGTTTC
TTTCTTCAATGACAGATTTGTCAACGACTTGTATCTC***CTTGCTCTCAACTGGGTGCT
TGTCTGTCTCAAACTCCTGCGGATTTACGGTTTTACCAGCTAATGACTCCTGTGAAGGGT
TATAAGGCACGGTAAGAGGTTCAACCACTGCAGCGTTAGCTTCAGAACTCTCTGCTTCTT
CCACAGGTGCTCTGTTTGATTTCTGTAACTCGTGAGATAACATT
GC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2BC66JQ 864 0 0
CATCGAACAGATTTTTTGATAGACTTGAGAGATTTTATGTTTATATAACCAAAAGAACAC
TAGAGGTGGTCATTTGTATTACATTTCATCGACATCAAGACAAATGGTTTGATTCTTTTG
TTCTCTTTTTACCTGACCTGCGTTGCTGTCTTATATCTGTACCCAGTCTGGTGAACTAGA
GTTAGTAGATCTCTTAGAACTCACGGGTACGTCTCTTTCCTCGTCGTCGTCATCTTCT**
*AGATCACTGAATGACACATCTTCTTCGTCTTCACCAATAGGATGCTTAGTAGTTACTCC
TCCTTCCATGCCGCTCACCGCATCTGAACTCTCTTCATCGTTCAACCAATCATCTGCGTC
TTCTTCTTCTTCT***ACGTCCTCAGCTTGCACATTGACAAATCTAGACGACGAAGAAGA
ATCAGTTGATGAGTTTCTTTCTTCAATGACAGATTTGTCAACGACTTGTATCTCCTCCTT
GCTCTCAACTGGGTGCTTGTCTGTCTCAAACTCCTGCGGATTTACGGTTTTACCAGCTAA
TGACTCCTGTGAAGGGTTATAAGGCACGGTAAGAGGTTCAACCACTGCAGCATTAGCTTC
AGAACTCTCTGCTGCTTCCACAGGTGCTCTGGTTGATTTCTGTAACTCGTGAGATAACAT
TGCTCTTGCTTCGAGTACCTGAGGAGTGGAGAGAAGCAAGGCATCGTGTTGGCTGAGTTT
AGGATGCAAAAGCACAAAGTAAATCAACCAGAAGCAATTCTCACTCATGTACTCAGGGCA
AAGCTCAATCCTCAAAGAAGCAAGGCTCGGTACAAGCCTTTCAACAGCCACAGCATGCTC
GTGCTGATCATCACTCATTTCAAA

QA 1 864 1 864
DS 

RD RR2F391TF 768 0 0
TC
TCACCAAGAGGATGCTTAG*AGTTACTCCTCCTTCCATGCCGCTCACAGCATCTGAACTC
TCTTCATCGTTCAACCAATCATCTGCGTCTTCTTCTTCTTCTTCTACGTCCTCAGCTTGC
ACATTGACAAATCTAGACGAAGAAGAAGAATCAGTTGATGAGTTTCTTTCTTCAATGACA
GATTTGTCAACGACTTGTATCTC***CTTGCTCTCAACTGGGTGCTTGTCTGTCTCAAAC
TCCTGCGGATTTACGGTTTTACCAGCTAATGACTCCTGTGAAGGGTTATAAGGCACGGTA
AGAGGTTCAACCACTGCAGCGTTAGCTTCAGAACTCTCTGCTTCTTCCACAGGTGCTCTG
TTTGATTTCTGTAACTCGTGAGATAACATTGCTCTTGCTTCGAGTACCTGAGGAGTGGAG
AGAAGCGAGGCATCGTGTTGGCTGAGTTTAGGATGCAAAAGCACAAAGTAAATCATCCAG
AAGCAATTCTCACTCATGTATTCAGGGCAAAGCTCAATCCTCAAAGAAGCAAGGCTCGGT
ACAAGCCTTTCAACAGCCACAGCATGCTCGTGCTGATCATCACTCATTTCAAACTCATCA
AAGGTACCATCATCATCATCATCATCATCAGGTAAAGGAAGATCCAACCAAGTATCGGGA
TTCATCGCGAGATCCCTCACGAACGCAACTACCTCCTCGGTCACTCCGATTACGTCATCG
TAAACCTTCGGATCCACTCCTTCTGAGCCCAGCTGTAAGAAATTCC

QA 3 768 3 768
DS 



CO CL811Contig3 633 2 6 U
GTGACTTGGAGATTCTATGTTTATATAACCAAAAGAACACTAAAGGTCATTTGTATTACA
TTTCATCGGACATGAAGACAATGGTTTTGATTCTTTTGTTCTCTTCTTACCCGACCTGCG
TCGCTGTCTTATATCTGTACCCAGTCTGGCGAACTAAAGTTGGTAGATCTCTTAAAACTC
ACGGGTACGTCTCTTTCCTCGTCATCATCATCTTCTAGATCACTGAATGACACATCTTCT
TCGTCTTCACCAATAGGATGCTTAGTAGTTACTCATCCTTCCATGCCGCTCACAGCATCT
GAACTCTCTTCATCGTTCAACCAATCATCTGCGTCTTCTTCCTCTTCTTCTACGTCCTCA
GCTTGCACATTGACAAATATAGATGAAAAAAAAAAATCAGTTGATGAGTTTCTTTCTTCA
ATGACAGATTTGTCAACCACTTGTATCTCCTTGCTCTCAACTGGGTGCTTGTCTGTCTCA
AACTCCTGCGGATTTACGGTTTTACCAGCTAATGACTCCTGTGAAGGGTTATAAGGCACG
GTAAGAGGTTCAACCACTGCAGCATTAGCTTCAGAACTCTCTGCTGCTTCCACAGGTGCT
CTGTTTGATTTCTGTAACTCGTGAGATAACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G428JQ U 1
AF RR2D219JQ U 2
BS 1 121 RR2G428JQ
BS 122 122 RR2D219JQ
BS 123 378 RR2G428JQ
BS 379 379 RR2D219JQ
BS 380 541 RR2G428JQ
BS 542 633 RR2D219JQ

RD RR2G428JQ 541 0 0
GTGACTTGGAGATTCTATGTTTATATAACCAAAAGAACACTAAAGGTCATTTGTATTACA
TTTCATCGGACATGAAGACAATGGTTTTGATTCTTTTGTTCTCTTCTTACCCGACCTGCG
TTGCTGTCTTATATCTGTACCCAGTCTGGCGAACTAAAGTTGGTAGATCTCTTAAAACTC
ACGGGTACGTCTCTTTCCTCGTCATCATCATCTTCTAGATCACTGAATGACACATCTTCT
TCGTCTTCACCAATAGGATGCTTAGTAGTTACTCATCCTTCCATGCCGCTCACAGCATCT
GAACTCTCTTCATCGTTCAACCAATCATCTGCGTCTTCTTCCTCTTCTTCTACGTCCTCA
GCTTGCACATTGACAAATCTAGATGAAAAAAAAAAATCAGTTGATGAGTTTCTTTCTTCA
ATGACAGATTTGTCAACCACTTGTATCTCCTTGCTCTCAACTGGGTGCTTGTCTGTCTCA
AACTCCTGCGGATTTACGGTTTTACCAGCTAATGACTCCTGTGAAGGGTTATAAGGCACG
G

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR2D219JQ 632 0 0
GGACTTG
GAGATTTTATGTTTATATAACCAAAAGAACACTAAAGGTCATTTGTATTACATTTCATCG
GACATGAAGACAATGGTTTTGATTCTTTTGTTCTCTTCTTACCCGACCTGCGTCGCTGTC
TTATATCTGTACCCAGTCTGGCGAACTAGAGTTGGTAGATCTCTTAGAACTCACGGGTAC
GTCTCTTTCCTCGTCATCATCATCTTCTAGATCACTGAATGACACATCTTCTTCGTCTTC
ACCAATAGGATGCTTAGTAGTTACTCCTCCTTCCATGCCGCTCACAGCATCTGAACTCTC
TTCATCGTTCAACCAATCATCTGCGTCTTCTTCCTCTTCTTCTACGTCCTCAGCTTGCAC
ATTGACAAATATAGATGAAGAAGAAGAATCAGTTGATGAGTTTCTTTCTTCAATGACAGA
TTTGTCAACCACTTGTATCTCCTTGCTCTCAACTGGGTGCTTGTCTGTCTCAAACTCCTG
CGGATTTACGGTTTTACCAGCTAATGACTCCTGTGAAGGGTTATAAGGCACGGTAAGAGG
TTCAACCACTGCAGCATTAGCTTCAGAACTCTCTGCTGCTTCCACAGGTGCTCTGTTTGA
TTTCTGTAACTCGTGAGATAACATT

QA 8 632 8 632
DS 



AS 2 8

CO CL812Contig1 1177 6 7 U
GAGCCAGTGCATGATGATGTTTTCATGATTGCAATACCAGTTTGCTTTACTCAAATACTG
AATTCCACAAGATTAAAATTGCGATAACATAAAAGCACTTCCCACAAGGAGATAAAACAT
AAAATAAAACCGGTCTTAGTTCCAAGAACATCTACTAAAAAACCAAAACATCTCATTGCT
CCCCTCACTTCACTTAGGCTCTGCCCTTTCCTTTTCCCTTGTTGCTCTTGTTGTTAGAAC
CAAACTGCTTGTTGCCTCCTGAGTTGAATGGCTTCTTGTTAGCACCAGATGATTGACCTC
CAGATTTGGGACTCTGGTTAGCATTCATAGGACTCTTTCCACCCTTTTTAGCTGGGTGTG
GTGTAGCTGTGTGCCCTCCTTTCTTCTTCTCCTCTGTTTTCTGAGGGGTAGCTGCTACTG
CGGGTTTAGCCTTCTTTGCAGAGACAGGTGTTGCAGATTCATTCTGCCTCTTCTTGTTGC
TGCTTGGCTCAGGCTTCTTAGGGGTATCATCCTCTTCTTCCTCCTCAGAATCATCTCCCT
CATCTGAATCATCTGAATCAACATCCATTCCTTTCTCAGAATCAGATTCATCGTCTTCAG
AATCACCCTCCTCGTCAGAGTCATCATCATCCTCGTCTGATTCAGGCTTCACTTCAGGAA
CCTTGGCCTTTGGTTTCGAGTCAATGGTAACAGCACTCGAAGCAGGTGCTGCTTTAGCAC
TTCCATTGGTCGTCGTGACAGTGGAGACAGTCGAAGCTGCGGGAACCGCCACTTCCTCCT
CCTCTTCCTCTGAATCAGAAGGGAAATCCTCCTCTTCATCGAGGTTAGGAGACTTGTATC
CAATGAAGTGGACGCTTCCCTTTGAGGAGTGTGAGAGCTCAAACTCCTTCTCAAAGACGA
GATCGAAGCTGATCTGGGGGATGTTGTCCTGAGAAAGAGTTCCAATCACAAGCTTCTTCC
CATCAACGGTCACGTACAAGAGGGCAGTCTCACCCTTCTTCCCTTTATCAAGAGATGCTT
GTGAAACGTGGATGAGACAGTTCTCTTCAGGTTCCACTTTAAGTGGCTTCCCTGCCTTAA
CCTCAGCTCCCCAGAATTCCATTTGATGTTGAAGGTTGAAGAGAGATTCGAGAGAGAGAG
GCAAAGGAGTTTAGGGCTGCGAGATAGAAAGCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CM82JQ U 1
AF RR2DI24JQ U 31
AF RR2A109JQ U 27
AF RR2A109TF C 435
AF RR2CM82TF C 505
AF RR2DI24TF C 505
BS 1 69 RR2CM82JQ
BS 70 70 RR2A109JQ
BS 71 701 RR2CM82JQ
BS 702 796 RR2A109JQ
BS 797 877 RR2A109TF
BS 878 878 RR2CM82TF
BS 879 1177 RR2A109TF

RD RR2CM82JQ 701 0 0
GAGCCAGTGCATGATGATGTTTTCATGATTGCAATACCAGTTTGCTTTACTCAAATACTG
AATTCCACAGGATTAAAATTGCGATAACATAAAAGCACTTCCCACAAGGAGATAAAACAT
AAAATAAAACCGGTCTTAGTTCCAAGAACATCTACTAAAAAACCAAAACATCTCATTGCT
CCCCTCACTTCACTTAGGCTCTGCCCTTTCCTTTTCCCTTGTTGCTCTTGTTGTTAGAAC
CAAACTGCTTGTTGCCTCCTGAGTTGAATGGCTTCTTGTTAGCACCAGATGATTGACCTC
CAGATTTGGGACTCTGGTTAGCATTCATAGGACTCTTTCCACCCTTTTTAGCTGGGTGTG
GTGTAGCTGTGTGCCCTCCTTTCTTCTTCTCCTCTGTTTTCTGAGGGGTAGCTGCTACTG
CGGGTTTAGCCTTCTTTGCAGAGACAGGTGTTGCAGATTCATTCTGCCTCTTCTTGTTGC
TGCTTGGCTCAGGCTTCTTAGGGGTATCATCCTCTTCTTCCTCCTCAGAATCATCTCCCT
CATCTGAATCATCTGAATCAACATCCATTCCTTTCTCAGAATCAGATTCATCGTCTTCAG
AATCACCCTCCTCGTCAGAGTCATCATCATCCTCGTCTGATTCAGGCTTCACTTCAGGAA
CCTTGGCCTTTGGTTTCGAGTCAATGGTAACAGCACTCGAA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2DI24JQ 735 0 0
GCAATACCAGTTTGCTTTACTCAAATACTGAATTCCACAAGATTAAAATTGCGATAACAT
AAAAGCACTTCCCACAAGGAGATAAAACATAAAATAAAACCGGTCTTAGTTCCAAGAACA
TCTACTAAAAAACCAAAACATCTCATTGCTCCCCTCACTTCACTTAGGCTCTGCCCTTTC
CTTTTCCCTTGTTGCTCTTGTTGTTAGAACCAAACTGCTTGTTGCCTCCTGAGTTGAATG
GCTTCTTGTTAGCACCAGATGATTGACCTCCAGATTTGGGACTCTGGTTAGCATTCATAG
GACTCTTTCCACCCTCTTTAGCTGGGTGTGGTGTAGCTGTGTGCCCTCCTTTCTTCTTCT
CCTCTGTTTTCTGAGGGGTAGCTGCTACTGCGGGTTTAGCCTTCTTTGCAGAGACAGGTG
TTGCAGATTCATTCTGCCTCTTCTTGTTGCTGCTTGGCTCAGGCTTCTTAGGGGTATCAT
CCTCTTCTTCCTCCTCAGAATCATCTCCCTCATCTGAATCATCTGAATCAACATCCATTC
CTTTCTCAGAATCAGATTCATCGTCTTCAGAATCACCCTCCTCGTCAGAGTCATCATCAT
CCTCGTCTGATTCAGGCTTCACTTCAGGAACCTTGGCCTTTGGTTTCGAGTCAATGGTAA
CAGCACTCGAAGCAGGTGCTGCTTTAGCACTTCCATTGGTCGTCGTGACAGTGGAGACAG
TCGAAGCTGCGGGAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2A109JQ 770 0 0
GATT
GCAATACCAGTTTGCTTTACTCAAATACTGAATTCCACAAGATTAAAATTGCGATAACAT
AAAAGCACTTCCCACAAGGAGATAAAACATAAAATAAAACCGGTCTTAGTTCCAAGAACA
TCTACTAAAAAACCAAAACATCTCATTGCTCCCCTCACTTCACTTAGGCTCTGCCCTTTC
CTTTTCCCTTGTTGCTCTTGTTGTTAGAACCAAACTGCTTGTTGCCTCCTGAGTTGAATG
GCTTCTTGTTAGCACCAGATGATTGACCTCCAGATTTGGGACTCTGGTTAGCATTCATAG
GACTCTTTCCACCCTTTTTAGCTGGGTGTGGTGTAGCTGTGTGCCCTCCTTTCTTCTTCT
CCTCTGTTTTCTGAGGGGTAGCTGCTACTGCGGGTTTAGCCTTCTTTGCAGAGACAGGTG
TTGCAGATTCATTCTGCCTCTTCTTGTTGCTGCTTGGCTCAGGCTTCTTAGGGGTATCAT
CCTCTTCTTCCTCCTCAGAATCATCTCCCTCATCTGAATCATCTGAATCAACATCCATTC
CTTTCTCAGAATCAGATTCATCGTCTTCAGAATCACCCTCCTCGTCAGAGTCATCATCAT
CCTCGTCTGATTCAGGCTTCACTTCAGGAACCTTGGCCTTTGGTTTCGAGTCAATGGTAA
CAGCACTCGAAGCAGGTGCTGCTTTAGCACTTCCATTGGTCGTCGTGACAGTGGAGACAG
TCGAAGCTGCGGGAACCGCCACTTCCTCCTCCTCTTCCTCTGAATC

QA 5 770 5 770
DS 

RD RR2A109TF 743 0 0
TTTGCAGAGACAGGTGTTGCAGATTCATTCTGCCTCTTCTTGTTGCTGCTTGGCTCAGGC
TTCTTAGGGGTATCATCCTCTTCTTCCTCCTCAGAATCATCTCCCTCATCTGAATCATCT
GAATCAACATCCATTCCTTTCTCAGAATCAGATTCATCGTCTTCAGAATCACCCTCCTCG
TCAGAGTCATCATCATCCTCGTCTGATTCAGGCTTCACTTCAGGAACCTTGGCCTTTGGT
TTCGAGTCAATGGTAACAGCACTCGAAGCAGGTGCTGCTTTAGCACTTCCATTGGTCGTC
GTGACAGTGGAGACAGTCGAAGCTGCGGGAACCGCCACTTCCTCCTCCTCTTCCTCTGAA
TCAGAAGGGAAATCCTCCTCTTCATCGAGGTTAGGAGACTTGTATCCAATGAAGTGGACG
CTTCCCTTTGAGGAGTGTGAGAGGTCAAACTCCTTCTCAAAGACGAGATCGAAGCTGATC
TGGGGGATGTTGTCCTGAGAAAGAGTTCCAATCACAAGCTTCTTCCCATCAACGGTCACG
TACAAGAGGGCAGTCTCACCCTTCTTCCCTTTATCAAGAGATGCTTGTGAAACGTGGATG
AGACAGTTCTCTTCAGGTTCCACTTTAAGTGGCTTCCCTGCCTTAACCTCAGCTCCCCAG
AATTCCATTTGATGTTGAAGGTTGAAGAGAGATTCGAGAGAGAGAGGCAAAGGAGTTTAG
GGCTGCGAGATAGAAAGCTGTCC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2CM82TF 673 0 0
TATCATCCTCTTCTTCCTCCTCAGAATCATCTCCCTCATCTGAATCATCTGAATCAACAT
CCATTCCTTTCTCAGAATCAGATTCATCGTCTTCAGAATCACCCTCCTCGTCAGAGTCAT
CATCATCCTCGTCTGATTCAGGCTTCACTTCAGGAACCTTGGCCTTTGGTTTCGAGTCAA
TGGTAACAGCACTCGAAGCAGGTGCTGCTTTAGCACTTCCATTGGTCGTCGTGACAGTGG
AGACAGTCGAAGCTGCGGGAACCGCCACTTCCTCCTCCTCTTCCTCTGAATCAGAAGGGA
AATCCTCCTCTTCATCGAGGTTAGGAGACTTGTATCCAATGAAGTGGACGCTTCCCTTTG
AGGAGTGTGAGAGCTCAAACTCCTTCTCAAAGACGAGATCGAAGCTGATCTGGGGGATGT
TGTCCTGAGAAAGAGTTCCAATCACAAGCTTCTTCCCATCAACGGTCACGTACAAGAGGG
CAGTCTCACCCTTCTTCCCTTTATCAAGAGATGCTTGTGAAACGTGGATGAGACAGTTCT
CTTCAGGTTCCACTTTAAGTGGCTTCCCTGCCTTAACCTCAGCTCCCCAGAATTCCATTT
GATGTTGAAGGTTGAAGAGAGATTCGAGAGAGAGAGGCAAAGGAGTTTAGGGCTGCGAGA
TAGAAAGCTGTCC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2DI24TF 673 0 0
TATCATCCTCTTCTTCCTCCTCAGAATCATCTCCCTCATCTGAATCATCTGAATCAACAT
CCATTCCTTTCTCAGAATCAGATTCATCGTCTTCAGAATCACCCTCCTCGTCAGAGTCAT
CATCATCCTCGTCTGATTCAGGCTTCACTTCAGGAACCTTGGCCTTTGGTTTCGAGTCAA
TGGTAACAGCACTCGAAGCAGGTGCTGCTTTAGCACTTCCATTGGTCGTCGTGACAGTGG
AGACAGTCGAAGCTGCGGGAACCGCCACTTCCTCCTCCTCTTCCTCTGAATCAGAAGGGA
AATCCTCCTCTTCATCGAGGTTAGGAGACTTGTATCCAATGAAGTGGACGCTCCCCTTTG
AGGAGTGTGAGAGCTCAAACTCCTTCTCAAAGACGAGATCGAAGCTGATCTGGGGGATGT
TGTCCTGAGAAAGAGTTCCAATCACAAGCTTCTTCCCATCAACGGTCACGTACAAGAGGG
CAGTCTCACCCTTCTTCCCTTTATCAAGAGATGCTTGTGAAACGTGGATGAGACAGTTCT
CTTCAGGTTCCACTTTAAGTGGCTTCCCTGCCTTAACCTCAGCTCCCCAGAATTCCATTT
GATGTTGAAGGTTGAAGAGAGATTCGAGAGAGAGAGGCAAAGGAGTTTAGGGCTGCGAGA
TAGAAAGCTGTCC

QA 1 673 1 673
DS 



CO CL812Contig2 1154 2 6 U
GGACAGCTTTCTCTCTCGCAGCCCTAAACTCCTCTGCCTCTCTCTGCCTCTCTCTCGAAT
CTCTCTTCCACCTTCAACATCAAATGGAATTCTGGGGAGCTGAGGTTAAGGCAGGGAAGC
CACTTAAAGTGGAACCTGAAGAGAACTGTCTCATCCACGTTTCACAGGCATCTCTTGATA
AAGGGAAGAAGGGTGAGACTGCCCTCTTGTACGTGACCGTTGATGGGAAGAAGCTTGTGA
TTGGAACTCTTTCTCAGGACAACATCCCCCAGATCAGCTTTGATCTCGTCTTTGAGAAGG
AGTTTGAGCTCTCCCACTCGTCAAAGGGAAGCGTCCACTTCATTGGATACAAGTCTCCCA
ACCTCGATGAAGAGGAGGAGTTCCCTTCTGATTCTGAGGAAGAGGAGGAGGAAGTGGCGG
TTCCCGCAGCTTCCACGGTCTCCACTGTCACGACGACCAATGGAAGTGCTAAAGCAGCAC
CTGCTTCGAGTGCTGTTACCATTGATTCGAAACCAAAGGCCAATGTTCCTGAAGTGAAGC
CTGAATCAGACGAGGATGATGATGACTCTGACGAGGGGGATGGTTCTGAAGATGAATCTG
ATTCTGAGAAAGGAATGGATGTTGATTCAGATGATTCAGATGAGGGAGATGATTCTGAGG
AGGAAGAAGAGGATGATACCCCTAAGAAGCCTGAGCCAAGCAGCAACAAGAAGAGGCAGA
ATGAATCCGCAACACCTGTCTCTGCAAAGAAGGCTAAACCCGCAGTAGCAGCTACCCCTC
AGAAAACAGAGGAGAAGAAGAAAGGAGGGCACACAGCTACACCACACCCAGCTAAAAAGG
GTGGAAAGAGTCCTGTGAATGCTAACCAGAGTCCCAAATCTGGAGGTCAATCATCCGGTG
CTAACAAGAAGCAATTCAACTCAGGAGGCAACAAGCAGTTTGGTTCTAACAACAAGAGCA
ACAAGGAAAAGGAAAGGGCAGAGCCTAAGTGAAGTGGAGGGAGCAATAAGATGTTTCGGT
TTTTTAGTAGATGTTCTTGGAACTAAGACCGGTTTTATTTTATGTTTTATCTCCTTGTGG
GAAGTGCTTTTATGTTAACGCAATTTTAATGTTATGGAATTCAGTATTTGAGTAAGAAAA
CTGGTATTGCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F116TF U 1
AF RR2F116JQ C 485
BS 1 724 RR2F116TF
BS 725 725 RR2F116JQ
BS 726 752 RR2F116TF
BS 753 753 RR2F116JQ
BS 754 781 RR2F116TF
BS 782 1154 RR2F116JQ

RD RR2F116TF 781 0 0
GGACAGCTTTCTCTCTCGCAGCCCTAAACTCCTCTGCCTCTCTCTGCCTCTCTCTCGAAT
CTCTCTTCCACCTTCAACATCAAATGGAATTCTGGGGAGCTGAGGTTAAGGCAGGGAAGC
CACTTAAAGTGGAACCTGAAGAGAACTGTCTCATCCACGTTTCACAGGCATCTCTTGATA
AAGGGAAGAAGGGTGAGACTGCCCTCTTGTACGTGACCGTTGATGGGAAGAAGCTTGTGA
TTGGAACTCTTTCTCAGGACAACATCCCCCAGATCAGCTTTGATCTCGTCTTTGAGAAGG
AGTTTGAGCTCTCCCACTCGTCAAAGGGAAGCGTCCACTTCATTGGATACAAGTCTCCCA
ACCTCGATGAAGAGGAGGAGTTCCCTTCTGATTCTGAGGAAGAGGAGGAGGAAGTGGCGG
TTCCCGCAGCTTCCACGGTCTCCACTGTCACGACGACCAATGGAAGTGCTAAAGCAGCAC
CTGCTTCGAGTGCTGTTACCATTGATTCGAAACCAAAGGCCAATGTTCCTGAAGTGAAGC
CTGAATCAGACGAGGATGATGATGACTCTGACGAGGGGGATGGTTCTGAAGATGAATCTG
ATTCTGAGAAAGGAATGGATGTTGATTCAGATGATTCAGATGAGGGAGATGATTCTGAGG
AGGAAGAAGAGGATGATACCCCTAAGAAGCCTGAGCCAAGCAGCAACAAGAAGAGGCAGA
ATGA*TCCGCAACACCTGTCTCTGCAAAGAAG*CTAAACCCGCAGTAGCAGCTACCCCTC
A

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2F116JQ 670 0 0
TTCGAGTGCTGTTACCATTGATTCGAAACCAAAGGCCAATGTTCCTGAAGTGAAGCCTGA
ATCAGACGAGGATGATGATGACTCTGACGAGGGGGATGGTTCTGAAGATGAATCTGATTC
TGAGAAAGGAATGGATGTTGATTCAGATGATTCAGATGAGGGAGATGATTCTGAGGAGGA
AGAAGAGGATGATACCCCTAAGAAGCCTGAGCCAAGCAGCAACAAGAAGAGGCAGAATGA
ATCCGCAACACCTGTCTCTGCAAAGAAGGCTAAACCCGCAGTAGCAGCTACCCCTCAGAA
AACAGAGGAGAAGAAGAAAGGAGGGCACACAGCTACACCACACCCAGCTAAAAAGGGTGG
AAAGAGTCCTGTGAATGCTAACCAGAGTCCCAAATCTGGAGGTCAATCATCCGGTGCTAA
CAAGAAGCAATTCAACTCAGGAGGCAACAAGCAGTTTGGTTCTAACAACAAGAGCAACAA
GGAAAAGGAAAGGGCAGAGCCTAAGTGAAGTGGAGGGAGCAATAAGATGTTTCGGTTTTT
TAGTAGATGTTCTTGGAACTAAGACCGGTTTTATTTTATGTTTTATCTCCTTGTGGGAAG
TGCTTTTATGTTAACGCAATTTTAATGTTATGGAATTCAGTATTTGAGTAAGAAAACTGG
TATTGCAATC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 8

CO CL813Contig1 674 8 11 U
GCGACACACAAACACTTAGTACAATATATCAAAAGCTTTGAAGAAACATTAAGAAGGCAA
AGAAATCACACGAAATATATTATATCAAATTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGTCACAAG
TTTATCTAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATCGCCGTCGTGACTCCATCTGCGA
ACGCGATAAGGAAGTCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGACCA
ATATGGAAGTTCAAGAACTTGGAAGGTATTGCGTGGAACAATTCAATCTACAGGAACAGA
GCGAGAAAGGAAACGTAGCTTCCATTGTGAAAAGAGAAACGGTCGTGTCGAATCCGTTGA
CGTTTAGCCGAGTTGTGTCGGCTCAGCAACAGGTCGTGGCCGGTCTTAAATACTATCTAA
GGATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTGTTGTGGTTGTTC
AACCATGGCTCCATTCTAAGAAGTTGCTTGGTTTCACACCTGTTGCTACTCCTATCTACT
AACTTTCTTTTTT*GAGAAAAGACACGAGAGGTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGGG
TTAGTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTTTACGTTCATAAATAAAAACAAAAGACTTGTT
GGAGAACCAAAAAA


BQ
10 10 30 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV20TF U -4
AF RR2AI11TF U 6
AF RR2BZ04JQ C 1
AF RR2BZ04TF U 1
AF RR2D659JQ C -3
AF RR2B454TF U 2
AF RR2B454JQ C 2
AF RR2D659TF U -3
BS 1 2 RR2BZ04JQ
BS 3 78 RR2BZ04TF
BS 79 79 RR2CV20TF
BS 80 191 RR2BZ04TF
BS 192 192 RR2CV20TF
BS 193 193 RR2BZ04TF
BS 194 194 RR2CV20TF
BS 195 553 RR2BZ04TF
BS 554 554 RR2CV20TF
BS 555 663 RR2BZ04TF
BS 664 674 RR2D659TF

RD RR2CV20TF 652 0 0
GGGATCTC
ACACACAAACACTTAGTACAATATATCAAAAGCTTCGAAGAAACATTAAGAAGGCAAAGA
AATCACACGAAATATATTATATCAAATTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGTCACAAGTTT
ATCTAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATCGCCGTCGTGACTCCATCTGCGAACG
CGATAAGGAAGTCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGACCAATA
TGGAAGTTCAAGAACTTGGAAGGTATTGCGTGGAACAATTCAATCTACAGGAACAGAGCG
AGAAAGGAAACGTAGCTTCCATTGTGAAAAGAGAAACGGTCGTGTCGAATCCGTTGACGT
TTAGCCGAGTTGTGTCGGCTCAGCAACAGTTCGTGGCCGGTCTTAAATACTATCTAAGGA
TTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACAAGCAGGATGTTCGACTCGGTTGTGGTTGTTCAAC
CATGGCTCCATTCTAAGAAGTTGCTTGGTTTCACACCTGTTGCTGCTCCTATCTACTAAC
TTTCTTTTTT*GAGAAAAGACACGAGAGGTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGGGTTA
GTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTTTACGTTCATAAATAAAAA

QA 9 652 9 652
DS 

RD RR2AI11TF 624 0 0
GG
ACAAACACTTAGTACAATATATCAAAAGCTTTGAAGAAACATTAAGAAGGCAAAGAAATC
ACACGAAATATATTATATCAAATTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGTCACAAGTTTATCT
AAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATCGCCGTCGTGACTCCATCTGCGAACGCGAT
AAGGAAGTCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGACCAATATGGA
AGTTCAAGAACTTGGAAGGTATTGCGTGGAACAATTCAATCTACAGGAACAGAGCGAGAA
AGGAAACGTAGCTTCCATTGTGAAAAGAGAAACGGTCGTGTCGAATCCGTTGACGTTTAG
CCGAGTTGTGTCGGCTCAGCAACAGGTCGTGGCCGGTCTTAAATACTATCTAAGGATTGA
AGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTGTTGTGGTTGTTCAACCATG
GCTCCATTCTAAGAAGTTGCTTGGTTTCACACCTGTTGCTACTCCTATCTACTAACTTTC
TTTTTT*GAGAAAAGACACGAGAGGTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGGGTTAGTGG
CTGGTTTTGTAATATGATGTTT

QA 3 624 3 624
DS 

RD RR2BZ04JQ 662 0 0
GCGACACACAAACACTTAGTACAATATATCAAAAGCTTTGAAGAAACATTAAGAAGGCAA
AGAAATCACACGAAATATGTTATATCAAATTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGTCACAAG
TTTATCTAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATCGCCGTCGTGACTCCATCTGCGA
ACGCGATAAGGGAATCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGACCA
ATATGGAAGTTCAAGAACTTGGAAGGTATTGCGTGGAACAATTCAATCTACAGGAACAGA
GCGAGAAAGGAAACGTAGCTTCCATTGTGAAAAGAGAAACGGTCGTGTCGAATCCGTTGA
CGTTTAGCCGAGTTGTGTCGGCTCAGCAACAGGTCGTGGCCGGTCTTAAATACTATCTAA
GGATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTGTTGTGGTTGTTC
AACCATGGCTCCATTCTAAGAAGTTGCTTGGTTTCACACCTGTTGCTACTCCTATCTACT
AACTTTCTTTTTTTGAGAAAAGACACGAGAGGTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGGG
TTAGTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTTTACGTTCATAAATAAAAACAAAAGACTTGTT
GG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2BZ04TF 671 0 0
GC
GACACACAAACACTTAGTACAATATATCAAAAGCTTTGAAGAAACATTAAGAAGGCAAAG
AAATCACACGAAATATGTTATATCAAATTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGTCACAAGTT
TATCTAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATCGCCGTCGTGACTCCATCTGCGAAC
GCGATAAGGGAATCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGACCAAT
ATGGAAGTTCAAGAACTTGGAAGGTATTGCGTGGAACAATTCAATCTACAGGAACAGAGC
GAGAAAGGAAACGTAGCTTCCATTGTGAAAAGAGAAACGGTCGTGTCGAATCCGTTGACG
TTTAGCCGAGTTGTGTCGGCTCAGCAACAGGTCGTGGCCGGTCTTAAATACTATCTAAGG
ATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTGTTGTGGTTGTTCAA
CCATGGCTCCATTCTAAGAAGTTGCTTGGTTTCACACCTGTTGCTACTCCTATCTACTAA
CTTTCTTTTTTTGAGAAAAGACACGAGAGGTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGGGTT
AGTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTTTACGTTCATAAATAAAAACAAAAGACTTGTTGG
A
AAAAAAAA

QA 3 663 3 663
DS 

RD RR2D659JQ 672 0 0
GGATCTC
ACACACAAACACTTAGTACAATATATCAAAAGCTTTGAAGAAACATTAAGAAGGCAAAGA
AATCACACGAAATATATTATATCAAATTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGTCACAAGTTT
ATCTAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATCGCCGTCGTGACTCCATCTGCGAACG
CGATAAGGAAGTCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGACCAATA
TGGAAGTTCAAGAACTTGGAAGGTATTGCGTGGAACAATTCAATCTACAGGAACAGAGCG
AGAAAGGAAACGTAGCTTCCATTGTGAAAAGAGAAACGGTCGTGTCGAATCCGTTGACGT
TTAGCCGAGTTGTGTCGGCTCAGCAACAGGTCGTGGCCGGTCTTAAATACTATCTAAGGA
TTGAAGTGCCTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTGTTGTGGTTGTTCAAC
CATGGCTCCATTCTAAGAAGTTGCTTGGTTTCACACCTGTTGCTACTCCTATCTACTAAC
TTTCTTTTTT*GAGAAAAGACACGAGAGGTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGGGTTA
GTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTTTACGTTCATAAATAAAAACAAAAGACTTGTTGGA
GAACC

QA 8 667 8 667
DS 

RD RR2B454TF 663 0 0
G
GACACACAAACACTTAGTACAATATATCAAAAGCTTTGAAGAAACATTAAGAAGGCAAAG
AAATCACACGAAATATATTATATCAAATTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGTCACAAGTT
TATCTAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATCGCCGTCGTGACTCCATCTGCGAAC
GCGATAAGGAAGTCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGACCAAT
ATGGAAGTTCAAGAACTTGGAAGGTATTGCGTGGAACAATTCAATCTACAGGAACAGAGC
GAGAAAGGAAACGTAGCTTCCATTGTGAAAAGAGAAACGGTCGTGTCGAATCCGTTGACG
TTTAGCCGAGTTGTGTCGGCTCAGCAACAGGTCGTGGCCGGTCTTAAATACTATCTAAGG
ATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTGTTGTGGTTGTTCAA
CCATGGCTCCATTCTAAGAAGTTGCTTGGTTTCACACCTGTTGCTACTCCTATCTACTAA
CTTTCTTTTTT*GAGAAAAGACACTAGAGGTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGGGTT
AGTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTTTACGTTCATAAATAAAAACAAAAGACTTGTTGG
A
G

QA 2 662 2 662
DS 

RD RR2B454JQ 663 0 0
G
GACACACAAACACTTAGTACAATATATCAAAAGCTTTGAAGAAACATTAAGAAGGCAAAG
AAATCACACGAAATATATTATATCAAATTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGTCACAAGTT
TATCTAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATCGCCGTCGTGACTCCATCTGCGAAC
GCGATAAGGAAGTCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGACCAAT
ATGGAAGTTCAAGAACTTGGAAGGTATTGCGTGGAACAATTCAATCTACAGGAACAGAGC
GAGAAAGGAAACGTAGCTTCCATTGTGAAAAGAGAAACGGTCGTGTCGAATCCGTTGACG
TTTAGCCGAGTTGTGTCGGCTCAGCAACAGGTCGTGGCCGGTCTTAAATACTATCTAAGG
ATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTGTTGTGGTTGTTCAA
CCATGGCTCCATTCTAAGAAGTTGCTTGGTTTCACACCTGTTGCTACTCCTATCTACTAA
CTTTCTTTTTT*GAGAAAAGACACTAGAGGTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGGGTT
AGTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTTTACGTTCATAAATAAAAACAAAAGACTTGTTGG
GG

QA 2 661 2 661
DS 

RD RR2D659TF 678 0 0
GGATCTC
ACACACAAACACTTAGTACAATATATCAAAAGCTTTGAAGAAACATTAAGAAGGCAAAGA
AATCACACGAAATATATTATATCAAATTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGTCACAAGTTT
ATCTAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATCGCCGTCGTGACTCCATCTGCGAACG
CGATAAGGAAGTCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGACCAATA
TGGAAGTTCAAGAACTTGGAAGGTATTGCGTGGAACAATTCAATCTACAGGAACAGAGCG
AGAAAGGAAACGTAGCTTCCATTGTGAAAAGAGAAACGGTCGTGTCGAATCCGTTGACGT
TTAGCCGAGTTGTGTCGGCTCAGCAACAGGTCGTGGCCGGTCTTAAATACTATCTAAGGA
TTGAAGTGCCTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTGTTGTGGTTGTTCAAC
CATGGCTCCATTCTAAGAAGTTGCTTGGTTTCACACCTGTTGCTACTCCTATCTACTAAC
TTTCTTTTTT*GAGAAAAGACACGAGAGGTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGGGTTA
GTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTTTACGTTCATAAATAAAAACAAAAGACTTGTTGGA
GAACCAAAAAA

QA 8 678 8 678
DS 



AS 1 8

CO CL814Contig1 1322 8 14 U
GGATCTCTACACTTCTCAATTATTAGTATCATCACTCAGAGAAAAATTCTCAGCCCTATT
CTCTTATTATTTATCCATAATGGGAGAGGTTGTGAAGACGGAGGCGTACGGATTGGCTGT
AAAAGACGAATCTGGAGTTCTCTCGCCTTTCAGTTTCTCAAGAAGGGAGACGGGAGAGAA
GGATGTGAGGTTCAAAGTGTTGTTCTGTGGAATTTGCCACACTGACTTAAGCATGGCAAA
AAACGAGTGGGGGTTTACTACTTATCCTCTCGTCCCCGGTCATGAAATAGTGGGCGTGGT
GACTGAAGTCGGAGCCAAAGTGACTAAATTCAACGCCGGAGACAAAGTCGGAGTTGGTTA
TATGGTCAGCTCGTGCCGGTCATGTGAAACCTGCACCGATGACCAAGAGAACTACTGTCC
AAAAATGATCCTAACGTCCGGAGCCAAGTACTACGATGACACTATAACATATGGTGGTTA
CTCCGACCACATGGTTTGTGAAGAGGACTACATCATCCGTATTCCAGACAATCTTCCGTT
AGACGCTACCGCGCCACTACTCTGCGCTGGGACCACGGTCTATTCCCCGATGAAGTATCA
CGGGCTCCTCAAGCCGGGTATGCACATCGG*TGTGGTGGGCCTAGGTGGCTTAGGTCATG
TAGCTGTGAAATTTGCTAAGGCTATGGGTACTAAGGTTACGGTTATTAGTACTTCGGATA
GGAAGAGAGACGAGGCCATTAATCGGCTTGGTGCGGATCTGTTCTTGGTGAGCCGTGACC
CGGAGCAGATGAAGGATGTAATGGGGACTATGGATGGTATTGTTGATACCGTATCTGCGA
CTCATTCACTTCTCCCGCTTTTTGATTTGCTTAAATATAACGGTAAACTAATTATGCTTG
GTGCACCTGATAAACCACTTGAGCTTCCGGTTATGCCTCTCATCGTGGGGAAGAAGATGG
TGGTTGGAAGTATGGTAGGAGGGATAAAAGAGACTCAAGAGATGATGGATCTGGCCGGAA
AACACAACATCACGGCAGACATTGAGCTTATCTCTGCAGATTATGTCAACACTGCCATGG
AACGGCTCGAGAAGGCTGACGTTAGATACCGTTTTGTGATTGATGTTGCCAACACGTTGA
AGCCTACTCCTTAATTATAAAGCTTAAGAATTAAATTTCCCCAGAAGCCTTTCTTTTCTT
GTTTGGTTTGTTGTAATATGTTACTTGTTGTTTGTCTGTAGCACTAATATTGTGCCCTAT
AAATTGAATCAACTTGAATGTAATGTTTGCTATATTAATAAGATCTTGGGATGTTTAATT
CG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2E409TF U 50
AF RR2DY68TF U 7
AF RR2AA67TF U 9
AF RR2F272TF U 1
AF RR2D615TF U 7
AF RR2DY68JQ C 591
AF RR2E409JQ C 573
AF RR2D615JQ C 525
BS 1 33 RR2F272TF
BS 34 34 RR2D615TF
BS 35 228 RR2F272TF
BS 229 229 RR2D615TF
BS 230 654 RR2F272TF
BS 655 655 RR2D615JQ
BS 656 680 RR2F272TF
BS 681 681 RR2D615JQ
BS 682 691 RR2D615TF
BS 692 799 RR2D615JQ
BS 800 800 RR2DY68JQ
BS 801 834 RR2D615JQ
BS 835 835 RR2DY68JQ
BS 836 1322 RR2D615JQ

RD RR2E409TF 139 0 0
GG
AGCCCTATTCTCTTATTATTTATCCATAATGGGAGAGGTTGTGAAGACGGAGGCGTACGG
ATTGGCTGTAAAAGACGAATCTGGAGTTCTCTCGCCTTTCAGTTTCTCAAGAAGGGAGAC
GGGAGAGAAGG
TGTGAG

QA 3 133 3 133
DS 

RD RR2DY68TF 613 0 0
GGAC
ACTTCTCAATTATTAGTATCATCACTCAGAGAAAAATTCTCAGCCCTATTCTCTTATTAT
TTATCCATAATGGGAGAGGTTGTGAAGACGGAGGCGTACGGATTGGCTGTAAAAGACGAA
TCTGGAGTTCTCTCGCCTTTCAGTTTCTCAAGAAGGGAGACGGGAGAGAAGGATGTGAGG
TTCAAAGTGTCGTTCTGTGGAATTTGCCACACTGACTTAAGCATGGCAAAAAACGAGTGG
GGGTTTACTACTTATCCTCTCGTCCCCGGTCATGAAATAGTGGGCGTGTTGACTGAAGTC
GGAGCCAAAGTGACTAAATTCAACGCCGGAGACAAAGTCGGAGTTGGTTATATGGTCAGC
TCGTGCCGGTCATGTGAAACCTGCACCGATGACCAAGAGAACTGCTGTCCAAAAATGATC
CTAACGTCCGGAGCCAAGTACTACGATGACACTATAACATATGGTGGTTACTCCGACCAC
ATGGTTTGTGAAGAGGACTACATCATCCGTATTCCAGACAATCTTCCGTTAGACGCTACC
GCGCCACTACTCTGCGCTGGGACCACGGTCTATTCCCCGATGAAGTATCACGGGCTCCTC
AAGCCGGGT

QA 5 613 5 613
DS 

RD RR2AA67TF 633 0 0
GG
ACTTCTCAATTATTAGTATCATCACTCAGAGAAAAATTCTCAGCCCTATTCTCTTATTAT
TTATCCATAATGGGAGAGGTTGTGAAGACGGAGGCGTACGGATTGGCTGTAAAAGACGAA
TCTGGAGTTCTCTCGCCTTTCAGTTTCTCAAGAAGGGAGACGGGAGAGAAGGATGTGAGG
TTCAAAGTGTTGTTCTGTGGAATTTGCCACACTGACTTAAGCATGGCAAAAAACGAGTGG
GGGTTTACTACTTATCCTCTCGTCCCCGGTCATGAAATAGTGGGCGTGGTGACTGAAGTC
GGAGCCAAAGTGACTAAATTCAACGCCGGAGACAAAGTCGGAGTTGGTTATATGGTCAGC
TCGTGCCGGTCATGTGAAACCTGCACCGATGACCAAGAGAACTACTGTCCAAAAATGATC
CTAACGTCCGGAGCCAAGTACTACGATGACACTATAACATATGGTGGTTACTCCGACCAC
ATGGTTTGTGAAGAGGACTACATCATCCGTATTCCAGACAATCTTCCGTTAGACGCTACC
GCGCCACTACTCTGCGCTGGGACCACGGTCTATTCCCCGATGAAGTATCACGGGCTCCTC
AAGCCGGGTATGCACATCGGGTGTGGTGGGC

QA 3 633 3 633
DS 

RD RR2F272TF 688 0 0
GGATCTCTACACTTCTCAATTATTAGTATCATCGCTCAGAGAAAAATTCTCAGCCCTATT
CTCTTATTATTTATCCATAATGGGAGAGGTTGTGAAGACGGAGGCGTACGGATTGGCTGT
AAAAGACGAATCTGGAGTTCTCTCGCCTTTCAGTTTCTCAAGAAGGGAGACGGGAGAGAA
GGATGTGAGGTTCAAAGTGTTGTTCTGTGGAATTTGCCACACTGACTTGAGCATGGCAAA
AAACGAGTGGGGGTTTACTACTTATCCTCTCGTCCCCGGTCATGAAATAGTGGGCGTGGT
GACTGAAGTCGGAGCCAAAGTGACTAAATTCAACGCCGGAGACAAAGTCGGAGTTGGTTA
TATGGTCAGCTCGTGCCGGTCATGTGAAACCTGCACCGATGACCAAGAGAACTACTGTCC
AAAAATGATCCTAACGTCCGGAGCCAAGTACTACGATGACACTATAACATATGGTGGTTA
CTCCGACCACATGGTTTGTGAAGAGGACTACATCATCCGTATTCCAGACAATCTTCCGTT
AGACGCTACCGCGCCACTACTCTGCGCTGGGACCACGGTCTATTCCCCGATGAAGTATCA
CGGGCTCCTCAAGCCGGGTATGCACATCGG*TGTGGTGGGCCTAGGTGGCTTAG*TCATG
TAGCTGTGAAATTTGCTAAG
CTATGGGT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2D615TF 685 0 0
GGAC
ACTTCTCAATTATTAGTATCATCACTCAGAGAAAAATTCTCAGCCCTATTCTCTTATTAT
TTATCCATAATGGGAGAGGTTGTGAAGACGGAGGCGTACGGATTGGCTGTAAAAGACGAA
TCTGGAGTTCTCTCGCCTTTCAGTTTCTCAAGAAGGGAGACGGGAGAGAAGGATGTGAGG
TTCAAAGTGTTGTTCTGTGGAATTTGCCACACTGACTTAAGCATGGCAAAAAACGAGTGG
GGGTTTACTACTTATCCTCTCGTCCCCGGTCATGAAATAGTGGGCGTGGTGACTGAAGTC
GGAGCCAAAGTGACTAAATTCAACGCCGGAGACAAAGTCGGAGTTGGTTATATGGTCAGC
TCGTGCCGGTCATGTGAAACCTGCACCGATGACCAAGAGAACTACTGTCCAAAAATGATC
CTAACGTCCGGAGCCAAGTACTACGATGACACTATAACATATGGTGGTTACTCCGACCAC
ATGGTTTGTGAAGAGGACTACATCATCCGTATTCCAGACAATCTTCCGTTAGACGCTACC
GCGCCACTACTCTGCGCTGGGACCACGGTCTATTCCCCGATGAAGTATCACGGGCTCCTC
AAGCCGGGTATGCACATCGG*TGTGGTGGGCCTAGGTGGCTTAG*TCATGTAGCTGTGAA
ATTTGCTAAG*CTATGGGTAC

QA 5 685 5 685
DS 

RD RR2DY68JQ 732 0 0
TGAAGTATCACGGGCTCCTCAAGCCGGGTATGCACATCGG*TGTGGTGGGCCTAGGTGGC
TTAGGTCATGTAGCTGTGAAATTTGCTAAGGCTATGGGTACTAAGGTTACGGTTGTTAGT
ACTTCGGGTAGGAAGAGAGACGAGGCCATTAATCGGCTTGGTGCGGATCCGTTCTTGGTG
AACCGTGACCCGGAGCAGATGAAGGATGTAATGGGGACTATGGATGGTATTGTTGATACC
GTATCTGCGACTCATTCACTTCTCCCGCTTTTTGATTTGCTTAAATATAACGGTAAACTA
ATTATGCTTGGTGCACCTGATAAACCACTTGAGCTTCCGGTTATGCCTCTCATCGTGGGG
AAGAAGATGGTGGTTGGAAGTATGGTAGGAGGGATAAAAGAGACTCAAGAGATGATGGAT
CTGGCCGGAAAACACAACATCACGGCAGACATTGAGCTTATCTCTGCAGATTATGTCAAC
ACTGCCATGGAACGGCTCGAGAAGGCTGACGTTAGATACCGTTTTGTGATTGATGTTGCC
AACACGTTGAAGCCTACTCCTTAATTATAAAGCTTAAGAATTAAATTTCCCCAGAAGCCT
TTCTTTTCTTGTTTGGTTTGTTGTAATATGTTACTTGTTGTTTGTCTGTAGCACTAATAT
TGTGCCCTATAAATTGAATCAACTTGAATGTAATGTTTGCTATATTAATAAGATCTTGGG
ATGTTT
AATTCG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2E409JQ 744 0 0
CCACGGTCTATTCCCCGATGAAGTATCACGGGCTCCTCAAGCCGGGTATGCACATCGG*T
GTGGTGGGCCTAGGTGGCTTAGGTCATGTAGCTGTGAAATTTGCTAAGGCTATGGGTACT
AAGGTTACGGTTATTAGTACTTCGGATAGGAAGAGAGACGAGGCCATTAATCGGCTTGGT
GCGGATCTGTTCTTGGTGAGCCGTGACCCGGAGCAGATGAAGGATGTAATGGGGACTATG
GATGGTATTGTTGATACCGTATCTGCGACTCATTCACTTCTCCCGCTTTTTGATTTGCTT
AAATATAACGGTAAACTAATTATGCTTGGTGCACCTGATAAACCACTTGAGCTTCCGGTT
ATGCCTCTCATCGTGGGGAAGAAGATGGTGGTTGGAAGTATGGTAGGAGGGATAAAAGAC
ACTCAAGAGATGATGGATCTGGCCGGAAAACACAACATCACGGCAGACATTGAGCTTATC
TCTGCAGATTATGTCAACACTGCCATGGAACGGCTCGAGAAGGCTGACGTTAGATACCGT
TTTGTGATTGATGTTGCCAACACGTTGAAGCCTACTCCTTAATTATAAAGCTTAAGAATT
AAATTTCCCCAGAAGCCTTTCTTTTCTTGTTTGGTTTGTTGTAATATGTTACTTGTTGTT
TGTCTGTAGCACTAATATTGTGCCCTATAAATTGAATCAACTTGAATGTAATGTTTGCTA
TATTAATAAGATCTTGGGATGTTT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2D615JQ 798 0 0
CAGACAATCTTCCGTTAGACGCTACCGCGCCACTACTCTGCGCTGGGACCACGGTCTATT
CCCCGATGAAGTATCACGGGCTCCTCAAGCCGGGTATGCACATCGG*TGTGGTGGGCCTA
GGTGGCTTAGGTCATGTAGCTGTGAAATTTGCTAAGGCTATGGGTACTAAGGTTACGGTT
ATTAGTACTTCGGATAGGAAGAGAGACGAGGCCATTAATCGGCTTGGTGCGGATCTGTTC
TTGGTGAGCCGTGACCCGGAGCAGATGAAGGATGTGATGGGGACTATGGATGGTATTGTT
GATACCGTATTTGCGACTCATTCACTTCTCCCGCTTTTTGATTTGCTTAAATATAACGGT
AAACTAATTATGCTTGGTGCACCTGATAAACCACTTGAGCTTCCGGTTATGCCTCTCATC
GTGGGGAAGAAGATGGTGGTTGGAAGTATGGTAGGAGGGATAAAAGAGACTCAAGAGATG
ATGGATCTGGCCGGAAAACACAACATCACGGCAGACATTGAGCTTATCTCTGCAGATTAT
GTCAACACTGCCATGGAACGGCTCGAGAAGGCTGACGTTAGATACCGTTTTGTGATTGAT
GTTGCCAACACGTTGAAGCCTACTCCTTAATTATAAAGCTTAAGAATTAAATTTCCCCAG
AAGCCTTTCTTTTCTTGTTTGGTTTGTTGTAATATGTTACTTGTTGTTTGTCTGTAGCAC
TAATATTGTGCCCTATAAATTGAATCAACTTGAATGTAATGTTTGCTATATTAATAAGAT
CTTGGGATGTTTAATTCG

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 4

CO CL815Contig1 1284 4 5 U
GTTCATGTAAAAACAATATACTAAGAAAAAACATGACCTGGTCAAGAAGAATACAAGACT
CAGGCAAACATTGGTTGAGATGCTTTATTCAAATAACTGTAATAAACTGAAGAAAAACAA
AAAGGACCAGTTTCTCTGCAAGAAGAGAATAGAGTGCTGAGATGTAATATATGGAGATTG
AAATGTGTGTTTGATGCTTGTACACAATCCATTTATTTTTAACGAGCGTCCTTGGACAAA
TAGCCGTGAGCTTCAACTTTCCTTGCGTTGCGAAGCTCATCAACTCCATCTCCTCTCTCA
AACACAGCCGCTGCACCCATCCCCGTCCCAATGCACATCGACACTACCCCAAAACGACAG
TCTTTTCCACGGCGTTTCATCTCGTGCAACAAAGTAGCAACGCAACGTGCTCCTGTAGCG
CCTAAAGGATGTCCTATGACCATTGCGCCACCGTTGACATCGATTTTCTCTGCGTCTAGT
CCCAATTTGTTACGGCAATAAACAAACTGAGATGCAAATGCCTCGTTGATCTCAAACAAG
TCGATATCATCGAGTTCTAAACCAGCAGCCTTAACTGCAGCTGGAATGGCAACTGCTGGA
CCGACACCCATGATTGCTGGGTCAACACCAACTGCAGCAAATGTCCTGAACACACCAAGA
ACGGGAAGTCCTTTTTGCGTAGCAACACTTCTCCTCATGAGGAGAACCGCTCCTGCACCA
TCACTTACTTGGCTGGAGTTTCCAGCAGTTGTGGTGCCATCCTTTTTAAACACTGGCTTC
AGCTTCCCAAGTGTAGCAAGGGTTGTGCTTGGTCGGATCCCATCATCAACGGAAACTGTA
ATGGGTGTCTCATCTCCTGTCTTTGGGTCAACAAGCTTGGTTTTAACAGGAATTATCTCA
TCCTTGAATTTACCAGCAGCAGTAGCAGCAGCTGCCTTTCTGTGCGAGTCAACAGCAGCT
TGATCTTGCTCCTGCCTTGAGACACCAAAGCGGTGTGCTACATTTTCTGAAGTAACACCC
ATAGGGAGAAGACAGTTCTGTGCTTGCTCAAACTTCTTCACCGCTGGGTTGACTGACCCT
TCCCATGCCATAGGATTAGTAGTCATGGACTCCAATCCAGCCCCAATACCAATATCATAA
AATCCAGCTTTGATGGCAGCGGCAACGTCAGCAACAGCCTGAAGCCCAGACGAGCACTGT
CTATTCACAGTCCTCACAGCCACGGTTTCAGGGAAGCCAGCATAGAAAGCAGACATCCTG
CACTCACTGGCTCTCTGGGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM58JQ U 1
AF RR2FM58TF C 124
AF RR2AJ02JQ U 22
AF RR2AN93TF C 677
BS 1 78 RR2FM58JQ
BS 79 79 RR2AJ02JQ
BS 80 681 RR2FM58JQ
BS 682 740 RR2AJ02JQ
BS 741 1284 RR2AN93TF

RD RR2FM58JQ 681 0 0
GTTCATGTAAAAACAATATACTAAGAAAAAACATGACCTGGTCAAGAAGAATACAAGACT
CAGGCAAACATTGGTTGATATGCTTTATTCAAATAACTGTAATAAACTGAAGAAAAACAA
AAAGGACCAGTTTCTCTGCAAGAAGAGAATAGAGTGCTGAGATGTAATATATGGAGATTG
AAATGTGTGTTTGATGCTTGTACACAATCCATTTATTTTTAACGAGCGTCCTTGGACAAA
TAGCCGTGAGCTTCAACTTTCCTTGCGTTGCGAAGCTCATCAACTCCATCTCCTCTCTCA
AACACAGCCGCTGCACCCATCCCCGTCCCAATGCACATCGACACTACCCCAAAACGACAG
TCTTTTCCACGGCGTTTCATCTCGTGCAACAAAGTAGCAACGCAACGTGCTCCTGTAGCG
CCTAAAGGATGTCCTATGACCATTGCGCCACCGTTGACATCGATTTTCTCTGCGTCTAGT
CCCAATTTGTTACGGCAATAAACAAACTGAGATGCAAATGCCTCGTTGATCTCAAACAAG
TCGATATCATCGAGTTCTAAACCAGCAGCCTTAACTGCAGCTGGAATGGCAACTGCTGGA
CCGACACCCATGATTGCTGGGTCAACACCAACTGCAGCAAATGTCCTGAACACACCAAGA
ACGGGAAGTCCTTTTTGCGTA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2FM58TF 597 0 0
GGACCAGTTTCTCTGCAAGAAGAGAATAGAGTGCTGAGATGTAATATATGGAGATTGAAA
TGTGTGTTTGATGCTTGTACACAATCCATTTATTTTTAACGAGCGTCCTTGGACAAATAG
CCGTGAGCTTCAACTTTCCTTGCGTTGCGAAGCTCATCAACTCCATCTCCTCTCTCAAAC
ACAGCCGCTGCACCCATCCCCGTCCCAATGCACATCGACACTACCCCAAAACGACAGTCT
TTTCCACGGCGTTTCATCTCGTGCAACAAAGTAGCAACGCAACGTGCTCCTGTAGCGCCT
AAAGGATGTCCTATGACCATTGCGCCACCGTTGACATCGATTTTCTCTGCGTCTAGTCCC
AATTTGTTACGGCAATAAACAAACTGAGATGCAAATGCCTCGTTGATCTCAAACAAGTCG
ATATCATCGAGTTCTAAACCAGCAGCCTTAACTGCAGCTGGAATGGCAACTGCTGGACCG
ACACCCATGATTGCTGGGTCAACACCAACTGCAGCAAATGTCCTGAACACACCAAGAACG
GGAAGTCCTTTTTGCGTAGCAACACTTCTCCTCATGAGGAGAACCGCTCCTGCACC
C

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2AJ02JQ 719 0 0
TAAGAAAAAACATGACCTGGTCAAGAAGAATACAAGACTCAGGCAAACATTGGTTGCGAT
GCTTTATTCAAATAACTGTAATAAACTGAAGAAAAACAAAAAGGACCAGTTTCTCTGCAA
GAAGAGAATAGAGTGCTGAGATGTAATATATGGAGATTGAAATGTGTGTTTGATGCTTGT
ACACAATCCATTTATTTTTAACGAGCGTCCTTGGACAAATAGCCGTGAGCTTCAACTTTC
CTTGCGTTGCGAAGCTCATCAACTCCATCTCCTCTCTCAAACACAGCCGCTGCACCCATC
CCCGTCCCAATGCACATCGACACTACCCCAAAACGACAGTCTTTTCCACGGCGTTTCATC
TCGTGCAACAAAGTAGCAACGCAACGTGCTCCTGTAGCGCCTAAAGGATGTCCTATGGCC
ATTGCGCCACCGTTGACATTGATTTTCTCTGCGTCTAGTCCCAATTTGTTACGGCAATAA
ACAAACTGAGATGCAAATGCCTCGTTGATCTCAAACAAGTCGATATCATCGAGTTCTAAA
CCAGCAGCCTTAACTGCAGCTGGAATGGCAACTGCTGGACCGACACCCATGATTGCTGGG
TCAACACCAACTGCAGCAAATGTCCTGAACACACCAAGAACGGGAAGTCCTTTTTGCGTA
GCAACACTTCTCCTCATGAGGAGAACCGCTCCTGCACCATCACTTACTTGGCTGGAGTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2AN93TF 608 0 0
GCGTAGCAACACTTCTCCTCATGAGGAGAAACGCTCCTGCACCATCACTTACTTGGCTGG
AGTTTCCAGCAGTTGTGGTGCCATCCTTTTTAAACACTGGCTTCAGCTTCCCAAGTGTAG
CAAGGGTTGTGCTTGGTCGGATCCCATCATCAACGGAAACTGTAATGGGTGTCTCATCTC
CTGTCTTTGGGTCAACAAGCTTGGTTTTAACAGGAATTATCTCATCCTTGAATTTACCAG
CAGCAGTAGCAGCAGCTGCCTTTCTGTGCGAGTCAACAGCAGCTTGATCTTGCTCCTGCC
TTGAGACACCAAAGCGGTGTGCTACATTTTCTGAAGTAACACCCATAGGGAGAAGACAGT
TCTGTGCTTGCTCAAACTTCTTCACCGCTGGGTTGACTGACCCTTCCCATGCCATAGGAT
TAGTAGTCATGGACTCCAATCCAGCCCCAATACCAATATCATAAAATCCAGCTTTGATGG
CAGCGGCAACGTCAGCAACAGCCTGAAGCCCAGACGAGCACTGTCTATTCACAGTCCTCA
CAGCCACGGTTTCAGGGAAGCCAGCATAGAAAGCAGACATCCTGCACTCACTGGCTCTCT
GGGAACCC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 8

CO CL816Contig1 1307 8 10 U
GCTTGCATTGCATCTACACCTCTTTAGTAATAACGGTGTTACATTATAAATGCTGACAAT
GATAATAAAAGGGTGATTCAAACCAAAAGTGAAAAACACTCGAGCAATAATCGTTGAGAG
ATAATTGTTTTTATTTGGAACAAGATATCACAAAACTGAGGCATGGACCAATAACTTAGT
TGAAGTCTGGCTTCTCAGGGTAGGTGCAGCCAGATCTTTGGATCACCACGTTGGACGCGT
AGCATCCGGCTTTCACGCACTCCTCAATGGACTTCTCTTTCACCAACTGTGACATGAATC
CTCCCACAAATGCATCACCTGCACCGTTGGTGTCAACAAGCTTCTCCTTTGGGAGAGGGA
TCACAGGGTATTTTGTCACCTTTCCATCTTCAGCAACGACCACTGGGTCTGCCCCTTGTG
TAATGACGGTGGTCCTCTTGTACGTTCCAGTGGCCTTGGGAAGCTGTGAAATCTTGATGG
CTATTTGCTCTACATCTTCTGTCTCCCAGCCATGAACCCTTGAGAAGGTTATTGCCTCTG
TCTCGTTGCCAAAAACAAAGTCCATGTACGGCAAAAACTTCTCCTGAGCATCTTTGAAGA
ATTCACAGATGAAGGGGGCAGAGAGGTTCATTGTGAAGACCTTGTTGTTAGCAGCAGCAT
GCTCAGACACCAACTGAATGGATTCAGGGGATACAGTGAGGAAGAATCCAGCAATGTAGT
AGAACTTGGCCTTCTCAACTAGTGCCCAGTTTTCAGGCTTCTTGAGGTGGTCAACCTTGT
AGCAGTTAGCAGCAGAGAGATTAGCAATAAGAGACCTTTCTCCACCAACAACACAGACAC
CACAAGTTCCAGTTGGTGCAGATTCATCTTCATAGTAGTGAACATTGAGACCAGCAGCAG
TAGCATCCTTCTTCATAGCCTCACCGTATTTGTCCTTTCCAATGGAGCCCATGTAACTGG
TTGCCCCAGGAATTTGAAGCATCCACTGAGCCACTTTGATGGAGTTCTGAGTAGCACCTC
CGGCAATGTATTCAACATTGAACTTGCTACTCATCTCTTCATACATGGGCAAATGTTTCT
CCTCAGCGAGAATCGCATTGTTCAACTTCACGTCGTATTTGGTGAGGAAATCCTCGTCTA
CAACGGCAGAGATATCGAGGAGAGGGTTTCCCATTCCCAGAAGGATTCCATCGTAGTTTT
TAGAGCCAGCCATGACGTTGATGATGATGATGAATCTGAGATTTGATACAGAGGAGAAAG
GTTTAGATTCAGATCTGTTTATGGATGAGAGTGAAAGCCCTCTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO92JQ U 26
AF RR2DX27JQ U 26
AF RR2FF85JQ U 1
AF RR2CR96JQ U 60
AF RR2DX27TF C 460
AF RR2FF85TF C 466
AF RR2CO92TF C 600
AF RR2CR96TF C 764
BS 1 617 RR2FF85JQ
BS 618 650 RR2CR96JQ
BS 651 793 RR2DX27TF
BS 794 794 RR2FF85TF
BS 795 856 RR2DX27TF
BS 857 857 RR2FF85TF
BS 858 1021 RR2DX27TF
BS 1022 1266 RR2FF85TF
BS 1267 1282 RR2CO92TF
BS 1283 1307 RR2CR96TF

RD RR2CO92JQ 524 0 0
A
GTAATAACGGTGTTACATTATAAATGCTGACAATGATAATAAAAGGGTGATTCAAACCAA
AAGTGAAAAACACTCGAGCAATAATCGTTGAGAGATAATTGTTTTTATTTGGAACAAGAT
ATCACAAAACTGAGGCATGGACCAATAACTTAGTTGAAGTCTGGCTTCTCAGGGTAGGTG
CAGCCAGATCTTTGGATCACCACGTTGGACGCGTAGCATCCGGCTTTCACGCACTCCTCA
ATGGACTTCTCTTTCGCCAACTGTGACATGAATCCTCCCACAAATGCATCACCTGCACCG
TTGGTGTCAACAAGCTTCTCCTTTGGGAGAGGGATCACAGGGTATTTTGTCACCTTTCCA
TCTTCAGCAACGACCACTGGGTCTGCCCCTTGTGTAATGACGGTGGTCCTCTTGTACGTT
CCAGTGGCCTTGGGAAGCTGTGAAATCTTGATGGCTATTTGCTCTACATCTTCTGTCTCC
CAGCCATGAACCCTTGAGAAG*TTATTGCCTCTGTCTCGTTGC

QA 2 524 2 524
DS 

RD RR2DX27JQ 529 0 0
G
GTAATAACGGCGTTACATTATAAATGCTGACAATGATAATAAAAGGGTGATTCAAACCAA
AAGTGAAAAACACTCGAGCAATAATCGTTGAGAGATAATTGTTTTTATTTGGAACAAGGT
ATCACAAAACTGAGGCATGGACCAATAACTTAGTTGAAGTCTGGCTTCTCAGGGTAGGTG
CAGCCAGATCTTTGGATCACCACGTTGGACGCGTAGCATCCGGCTTTCACGCACTCCTCA
ATGGACTTCTCTTTCACCAACTGTGACATGAATCCTCCCACAAATGCATCACCTGCACCG
TTGGTGTCAACAAGCTTCTCCTTTGGGAGAGGGATCACAGGGTATTTTGTCACCTTTCCA
TCTTCAGCAACGACCACTGGGTCTGCCCCTTGTGTAATGACGGTGGTACTCTTGTACGTT
CCAGTGGCCTTGGGAAGCTGTGAAATCTTGATGGCTATTTGCTCTACATCTTCTGTCTCC
CAGCCATGAACCCTTGAGAAGGTTATTGCCTCTGTCTCGTTGCCAAAA

QA 2 529 2 529
DS 

RD RR2FF85JQ 617 0 0
GCTTGCATTGCATCTACACCTCTTTAGTAATAACGGTGTTACATTATAAATGCTGACAAT
GATAATAAAAGGGTGATTCAAACCAAAAGTGAAAAACACTCGAGCAATAATCGTTGAGAG
ATAATTGTTTTTATTTGGAACAAGATATCACAAAACTGAGGCATGGACCAATAACTTAGT
TGAAGTCTGGCTTCTCAGGGTAGGTGCAGCCAGATCTTTGGATCACCACGTTGGACGCGT
AGCATCCGGCTTTCACGCACTCCTCAATGGACTTCTCTTTCACCAACTGTGACATGAATC
CTCCCACAAATGCATCACCTGCACCGTTGGTGTCAACAAGCTTCTCCTTTGGGAGAGGGA
TCACAGGGTATTTTGTCACCTTTCCATCTTCAGCAACGACCACTGGGTCTGCCCCTTGTG
TAATGACGGTGGTCCTCTTGTACGTTCCAGTGGCCTTGGGAAGCTGTGAAATCTTGATGG
CTATTTGCTCTACATCTTCTGTCTCCCAGCCATGAACCCTTGAGAAGGTTATTGCCTCTG
TCTCGTTGCCAAAAACAAAGTCCATGTACGGCAAAAACTTCTCCTGAGCATCTTTGAAGA
ATTCACAGATGAAGGGG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2CR96JQ 591 0 0
C
GATAATAAAAGGGTGATTCAAACCAAAAGTGAAAAACACTCGAGCAATAATCGTTGAGAG
ATAATTGTTTTTATTTGGAACAAGATATCACAAAACTGAGGCATGGACCAATAACTTAGT
TGAAGTCTGGCTTCTCAGGGTAGGTGCAGCCAGATCTTTGGATCACCACGTTGGACGCGT
AGCATCCGGCTTTCACGCACTCCTCAATGGACTTCTCTTTCACCAACTGTGACATGAATC
CTCCCACAAATGCATCACCTGCACCGTTGGTGTCAACAAGCTTCTCCTTTGGGAGAGGGA
TCACAGGGTATTTTGTCACCTTTCCATCTTCAGCAACGACCACTGGGTCTGCCCCTTGTG
TAATGACGGTGGTCCTCTTGTACGTTCCAGTGGCCTTGGGAAGCTGTGAAATCTTGATGG
CTATTTGCTCTACATCTTCTGTCTCCCAGCCATGAACCCTTGAGAAGGTTATTGCCTCTG
TCTCGTTGCCAAAAACAAAGTCCATGTACGGCAAAAACTTCTCCTGAGCATCTTTGAAGA
ATTCACAGATGAAGGGGGCAGAGAGGTTCATTGTGAAGACCTTGTTGTTA

QA 2 591 2 591
DS 

RD RR2DX27TF 563 0 0
GAAGCTGTGAAATCTTGATGGCTATTTGCTCTACATCTTCTGTCTCCCAGCCATGAACCC
TTGAGAAGGTTATTGCCTCTGTCTCGTTGCCAAAAACAAAGTCCATGTACGGCAAAAACT
TCTCCTGAGCATCTTTGAAGAATTCACAGATGAAGGGGGCAGAGAGGTTCATTGTGAAGA
CCTTGTTGTTAGCAGCAGCATGCTCAGACACCAACTGAATGGATTCAGGGGATACAGTGA
GGAAGAATCCAGCAATGTAGTAGAACTTGGCCTTCTCAACTAGTGCCCAGTTTTCAGGCT
TCTTGAGGTGGTCAACCTTGTAGCAGTTAGCAGCGGAGAGATTAGCAATAAGAGACCTTT
CTCCACCAACAACACAGACACCACAAGTTCCAGTTGGCGCAGATTCATCTTCATAGTAGT
GAACATTGAGACCAGCAGCAGTAGCATCCTTCTTCATAGCCTCACCGTATTTGTCCTTTC
CAATGGAGCCCATGTAACTGGTTGCCCCAGGAATTTGAAGCATCCACTGAGCCACTTTGA
TGGAGTTCTGAGTAGCACCTCC
C

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2FF85TF 801 0 0
GTGAAATCTTGATGGCTATTTGCTCTACATCTTCTGTCTCCCAGCCATGA*CCCTTGAGA
AGGTTATTGC*TCTGTCTCGTTGCCAAAA*CAAAGTCCATGTACGGCAAAAACTTCTC*T
GAGCATCTTTGAAGAATTCACAGATGAAGGGGGCAGAGAGGTTCATTGTGAAGACCTTGT
TGTTAGCAGCAGCATGCTCAGACACCAACTGAATGGATTCAGGGGATACAGTGAGGAAGA
ATCCAGCAATGTAGTAGGACTTGGCCTTCTCAACTAGTGCCCAGTTTTCAGGCTTCTTGA
GGTGGTCAACCTTGTAGCA**TAGCAGCAGAGAGATTAGCAATAAGAGACCTTTCTCCAC
CAACAACACAGACACCACAAGTTCCAGTCGGTGCAGATTCATCTTCATAGTAGTGAACAT
TGAGACCAGCAGCAGTAGCATCCTTCTTCATAGCCTCACCGTATTTGTCCTTTCCAATGG
AGCCCATGTAACTGGTTGCCCCAGGAATTTGAAGCATCCACTGAGCCACTTTGATGGAGT
TCTGAGTAGCACCTCCGGCAATGTATTCAACATTGAACTTGCTACTCATCTCTTCATACA
TGGGCAAATGTTTCTCCTCAGCGAGAATCGCATTGTTCAACTTCACGTCGTATTTGGTGA
GGAAATCCTCGTCTACAACGGCAGAGATATCGAGGAGAGGGTTTCCCATTCCCAGAAGGA
TTCCATCGTAGTTTTTAGAGCCAGCCATGACGTTGATGATGATGATGAATCTGAGATTTG
ATACAGAGGAGAAAGGTTTAG

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2CO92TF 685 0 0
AATTCACAGATGAAGGGGGCAGAGAGGTTCATTGTGAAGACCTTGTTGTTAGCAGCAGCA
TGCTCAGACACCAACTGAATGGATTCAGGGGATACAGTGAGGAAGAATCCAGCAATGTAG
TAGAACTTGGCCTTCTCAACTAGTGCCCAGTTTTCAGGCTTCTTGAGGTGGTCAACCTTG
TAGCAGTTAGCAGCAGAGAGATTAGCAATAAGAGACCTTTCTCCACCAACAACACAGACA
CCACAAGTTCCAGTTGGTGCAGATTCATCTTCATAGTAGTGAACATTGAGACCAGCAGCA
GTAGCATCCTTCTTCATAGCCTCACCGTATTTGTCCTTTCCAATGGAGCCCATGTAACTG
GTTGCCCCAGGAATTTGAAGCATCCACTGAGCCACTTTGATGGAGTTCTGAGTAGCACCT
CCGGCAATGTATTCAACATTGAACTTGCTACTCATCTCTTCATACATGGGCAAATGTTTC
TCCTCAGCGAGAATCGCATTGCTCAACTTCACGTCGTATTTGGTGAGGAAATCCTCGTCT
ACAACGGCAGAGATATCGAGGAGAGGGTTTCCCATTCCCAGAAGGATTCCATCGTAGTTT
TTAGAGCCAGCCATGACGTTGATGATGATGATGAATCTGAGATTTGATACAGAGGAGAAA
GGTTTAGATTCAGATCTGTTTAT
CC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2CR96TF 544 0 0
GAGGTGGTCAACCTTGTAGCAGTTAGCAGCAGAGAGATTAGCAATAAGAGACCTTTCTCC
ACCAACAACACAGACACCACAAGTTCCAGTTGGTGCAGATTCATATTCATAGTAGTGAAC
ATTGAGACCAGCAGCAGTAGCATCCTTCTTCATAGCCTCACCGTATTTGTCCTTTCCAAT
GGAGCCCATGTAACTGGTTGCCCCAGGAATTTGAAGCATCCACTGAGCCACTTTGATGGA
GTTCTGAGTAGCACCTCCGGCAATGTATTCAACATTGAACTTGCTACTCATCTCTTCATA
CATGGGCAAATGCTTCTCCTCAGCGAGAATCGCATTGTTCAACTTCACGTCGTATTTGGA
GAGGAAATCCTCGTCTACAACGGCAGAGATATCGAGGAGAGGGTTTCCCATTCCCAGAAG
GATTCCATCGTAGTTTTTAGAGCCAGCCATGACGTTGATGATGATGATGAATCTGAGATT
TGATACGGAGGAGAAAGGTTTAGATTCAGATCTGTTTATGGATGAGAGTGAAAGCCCTCT
CCCT

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 6

CO CL817Contig1 981 6 20 U
GGAAATACGTTTCAAAAAACAAAAACGGTATACGTAAACCGAATAATCGCGCGCGAGTCC
ATCTGAAAGTAGAAAGATGCATGCGGTGAGGTCGGCGTTAGGTGATATGGTGATAACCTT
TTTCTGGGTTATTCTCTCGGCGACGTTTGGGTTACAAACGGCGGCGATTGTTTCCGCAGC
CGGGTTTCATGGCATCACCTGGGCACCTACGGTGATTACGACGGTGCTTGTTTTTTTCTC
TAGCTCGGTTTTCACGGTTATTGGAAATTTCCTCGGTGGCGCTAGCTTCAACCCCTGTGG
AAACGCGGCGTTTTATACCGCCGGCGTTTCTGGAGATTCTCTCTTCTCCTTGGCTATTAG
ATCTCCGGCTCAGGCAGTTGGTGCAGCCGGAGGTGCGATAACTATCATGGAGATGATACC
AGAAGAATATAAGACTATGATTGGAGGGCGTCCTTCATTCAGAGTTGATGCACACAGTGG
AGCTATCTCAGAATTGATTCTAAGTTTTTGTGTTACATTTTTGGTATTGCTAATTATCCT
AAGAGGTCCTCGGAAACTGCTTGCTAAAACTTTCTTGCTCGCTATAGCTACCGTTTCAGT
GTTCATCGCAGGGTCTAAATTTACTAGACCATTCATGAATCCTGCCATTTCTTGTCTCGT
GGATGCAGGCATTTGGGTGGGCATATATACACAAGTCACACAACACATGGAACCATTTCT
ATGTGTATTGGTTCAGCTCCTTCACCGGAGCAATTTTGTCTGCGATTCTCTTTCGGAGTC
TATTTCCACCGCCACTTCCGGTCCAGAAAAAACAGAAGAAAGCTTGAGTAAATAGGAAGA
ACATAACTCAAAATTTCACGAATTATAATATACTATTTGTTGTATGTTTTTGAGTTGTAG
TCGTACGGATCTCCTTGTCGTCATTTGTACTTTGTAAACTCATGTCCTCTATTTTGTTCT
CAATGGATTCACTCTCCTCCG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DB14TF U 1
AF RR2EL39TF U 1
AF RR2GT03TF U 1
AF RR2GQ03TF U 1
AF RR2GQ03JQ C 322
AF RR2GT03JQB C 362
BS 1 198 RR2DB14TF
BS 199 199 RR2GQ03TF
BS 200 408 RR2DB14TF
BS 409 409 RR2EL39TF
BS 410 424 RR2DB14TF
BS 425 425 RR2GQ03TF
BS 426 493 RR2DB14TF
BS 494 494 RR2GQ03TF
BS 495 510 RR2DB14TF
BS 511 511 RR2EL39TF
BS 512 584 RR2DB14TF
BS 585 585 RR2EL39TF
BS 586 607 RR2DB14TF
BS 608 609 RR2EL39TF
BS 610 610 RR2GQ03TF
BS 611 649 RR2EL39TF
BS 650 713 RR2GQ03TF
BS 714 714 RR2GQ03JQ
BS 715 723 RR2GQ03TF
BS 724 981 RR2GQ03JQ

RD RR2DB14TF 607 0 0
GGAAATACGTTTCAAAAAACAAAAACGGTATACGTAAACCGAATAATCGCGCGCGAGTCC
ATCTGAAAGTAGAAAGATGCATGCGGTGAGGTCGGCGTTAGGTGATATGGTGATAACCTT
TTTCTGGGTTATTCTCTCGGCGACGTTTGGGTTACAAACGGCGGCGATTGTTTCCGCAGC
CGGGTTTCATGGCATCACTTGGGCACCTACGGTGATTACGACGGTGCTTGTTTTTTTCTC
TAGCTCGGTTTTCACGGTTATTGGAAATTTCCTCGGTGGCGCTAGCTTCAACCCCTGTGG
AAACGCGGCGTTTTATACCGCCGGCGTTTCTGGAGATTCTCTCTTCTCCTTGGCTATTAG
ATCTCCGGCTCAGGCAGTTGGTGCAGCCGGAGGTGCGATAACTATCATTGAGATGATACC
AGAAAAATATAAGACTATGATTGGAGGGCGTCCTTCATTCAGAGTTGATGCACACAGTGG
AGCTATCTCAGAAGTGATTCTAAGTTTTTGCGTTACATTTTTGGTATTGCTAATTATCCT
AAGAGGTCCTCGGAAACTGCTTGCTAAAACTTTCTTGCTCGCTAGAGCTACCGTTTCAGT
GTTCATC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2EL39TF 649 0 0
GGAAATACGTTTCAAAAAACAAAAACGGTATACGTAAACCGAATAATCGCGCGCGAGTCC
ATCTGAAAGTAGAAAGATGCATGCGGTGAGGTCGGCGTTAGGTGATATGGTGATAACCTT
TTTCTGGGTTATTCTCTCGGCGACGTTTGGGTTACAAACGGCGGCGATTGTTTCCGCAGC
CGGGTTTCATGGCATCACTTGGGCACCTACGGT*ATTACGACGGTGCTTGTTTTTTTCTC
TAGCTCGGTTTTCACGGTTATTGGAAATTTCCTCGGTGGCGCTAGCTTCAACCCCTGTGG
AAACGTGGCGTTTTATACCGCCGGCGTTTCTGGAGATTCTCTCTTCTCCTTGGCTATTAG
ATCTCCGGCTCAGGCAGTTAGTGCAGCCGGAGGTGCGATAACTATCATGGAGATAATACC
AGAAAAATATAAGACTATGATTGGAGGGCGTCCTTCATTCAGAGTTGATGCACACAGTGG
AGCTATCTCAGAAGTGATTCTAAGTTTTTGTGTTACATTTTTGGTATTGCTAATTATCCT
AAGAGGTCCTCGGAAACTGCTTGCTAAAACTTTCTTGCTCGCTATAGCTACCGTTTCAGT
GTTCATCGCGGGGTCTAAATTTACTAGACCATTCATGAATCCTGCCATT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2GT03TF 709 0 0
GGAAATACGTTTCAAAAAACAAAAACGGTATACGTAAACCGAATAATCGCGCGCGAGTCC
ATCTGAAAGTAGAAAGATGCATGCGGTGAGGTCGGCGTTAGGTGATATGGTGATAACCTT
TTTCTGGGTTATTCTCTCGGCGACGTTTGGGTTACAAACGGCGGCGATTGTTTCCGCAGC
CGGGTTTCATGGCATCACCTGGGCACCTACGGTGATTACGACGGTGCTTGTTTTTTTCTC
TAGCTCGGTTTTCACGGTTATTGGAAATTTCCTCGGTGGCGCTAGCTTCAACCCCTGTGG
AAACGCGGCGTTTTATACCGCCGGCGTTTCTGGAGATTCTCTCTTCTCCTTGGCTATTAG
ATCTCCGGCTCAGGCAGTTGGTGCAGCCGGAGGTGCGATAACTATCATGGAGATGATACC
AGAAGAATATAAGACTATGATTGGAGGGCGTCCTTCATTCAGAGTTGATGCACACAGTGG
AGCTATCTCAGAATTGATTCTAAGTTTTTGTGTTACATTTTTGGTATTGCTAATTATCCT
AAGAGGTCCTCGGAAACTGCTTGCTAAAACTTTCTTGCTCGCTATAGCTACCGTTTCAGT
GTTCATCGCAGGGTCTAAATTTACTAGACCATTCATGAATCCTGCCATTTCTTGTCTCGT
GGATGCAG*CATTTGGGTGGGCATATATACACAAGTCACACAACACATG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2GQ03TF 723 0 0
GGAAATACGTTTCAAAAAACAAAAACGGTATACGTAAACCGAATAATCGCGCGCGAGTCC
ATCTGAAAGTAGAAAGATGCATGCGGTGAGGTCGGCGTTAGGTGATATGGTGATAACCTT
TTTCTGGGTTATTCTCTCGGCGACGTTTGGGTTACAAACGGCGGCGATTGTTTCCGCAGC
CGGGTTTCATGGCATCACCTGGGCACCTACGGTGATTACGACGGTGCTTGTTTTTTTCTC
TAGCTCGGTTTTCACGGTTATTGGAAATTTCCTCGGTGGCGCTAGCTTCAACCCCTGTGG
AAACGCGGCGTTTTATACCGCCGGCGTTTCTGGAGATTCTCTCTTCTCCTTGGCTATTAG
ATCTCCGGCTCAGGCAGTTGGTGCAGCCGGAGGTGCGATAACTATCATGGAGATGATACC
AGAAGAATATAAGACTATGATTGGAGGGCGTCCTTCATTCAGAGTTGATGCACACAGTGG
AGCTATCTCAGAATTGATTCTAAGTTTTTGTGTTACATTTTTGGTATTGCTAATTATCCT
AAGAGGTCCTCGGAAACTGCTTGCTAAAACTTTCTTGCTCGCTATAGCTACCGTTTCAGT
GTTCATCGCAGG*TCTAAATTTACTAGACCATTCATGAATCCTGCCATTTCTTGTCTCGT
GGATGCAGGCATTTGGGTGGGCATATATACACAAGTCACACAACACATGGAAC*ATTTCT
ATG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2GQ03JQ 660 0 0
CGGCGTTTCTGGAGATTCTCTCTTCTCCTTGGCTATTAGATCTCCGGCTCAGGCAGTTGG
TGCAGCCGGAGGTGCGATAACTATCATGGAGATGATACCAGAAGAATATAAGACTATGAT
TGGAGGGCGTCCTTCATTCAGAGTTGATGCACACAGTGGAGCTATCTCAGAATTGATTCT
AAGTTTTTGTGTTACATTTTTGGTATTGCTAATTATCCTAAGAGGTCCTCGGAAACTGCT
TGCTAAAACTTTCTTGCTCGCTATAGCTACCGTTTCAGTGTTCATCGCAGGGTCTAAATT
TACTAGACCATTCATGAATCCTGCCATTTCTTGTCTCGTGGATGCAGGCATTTGGGTGGG
CATATATACACAAGTCACACAACACATGGAACCATTTCTATGTGTATTGGTTCAGCTCCT
TCACCGGAGCAATTTTGTCTGCGATTCTCTTTCGGAGTCTATTTCCACCGCCACTTCCGG
TCCAGAAAAAACAGAAGAAAGCTTGAGTAAATAGGAAGAACATAACTCAAAATTTCACGA
ATTATAATATACTATTTGTTGTATGTTTTTGAGTTGTAGTCGTACGGATCTCCTTGTCGT
CATTTGTACTTTGTAAACTCATGTCCTCTATTTTGTTCTCAATGGATTCACTCTCCTCCG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2GT03JQB 620 0 0
TCTCCGGCTCAGGCAGTTGGTGCAGCCGGAGGTGCGATAACTATCATGGAGATGATACCA
GAAGAATATAAGACTATGATTGGAGGGCGTCCTTCATTCAGAGTTGATGCACACAGTGGA
GCTATCTCAGAATTGATTCTAAGTTTTTGTGTTACATTTTTGGTATTGCTAATTATCCTA
AGAGGTCCTCGGAAACTGCTTGCTAAAACTTTCTTGCTCGCTATAGCTACCGTTTCAGTG
TTCATCGCAGGGTCTAAATTTACTAGACCATTCATGAATCCTGCCATTTCTTGTCTCGTG
GATGCAGGCATTTGGGTGGGCATATATACACAAGTCACACAACACATGGAACCATTTCTA
TGTGTATTGGTTCAGCTCCTTCACCGGAGCAATTTTGTTTGCGATTCTCTTTCGGAGTCT
ATTTCCACCGCCACTTCCGGTCCAGAAAAAACAGAAGAAAGCTTGAGTAAATAGGAAGAA
CATAACTCAAAATTTCACGAATTATAATATACTATTTGTTGTATGTTTTTGAGTTGTAGT
CGTACGGATCTCCTTGTCGTCATTTGTACTTTGTAAACTCATGTCCTCTATTTTGTTCTC
AATGGATTCACTCTCCTCCG

QA 1 620 1 620
DS 



AS 2 7

CO CL818Contig1 849 3 2 U
GATATAAAATGGGGTAATGATATATCATCTGAGGTAAGGAGTTACGAACTTGGTGGAAAT
ATAATCACCTGATACTAACATAATAAAGTTTTTTGGATGAGACATGAGAGGATGAAAATA
TAATCACAGATTCACAATGCAACACTCTATTCGATAACATTGGTGGAAAGTAGCTAATCA
TATTTATTTCGATGATGGTTGTTGAACTTAGTGAATATTGAAAAGGGGTCTATGATATTT
TATGAAACAGAGATAGCGAAGTTGCTTGTATCATTCATGCTACTTGTTGAATTTCTTGAT
CCCTTGTTGCCAAATCGAAATAAAGGTACCCATTTTCTTCTTCTCTAGTGCTAATCCAAT
ATCAACACTGTTGCTCCCATCTCTTGACTCGGAAAAGGCAATGGAACCACCAGTTTCAAT
GTGCACCAACTCCATTTTGCAAGGTTTTCCTAACCCAAAATCCATATCATATAGTCCAAG
TTTAGGAGCTCCTGCAATGGAGGTTGGAAAACGTGACATGACCCATTTAAGTACTCCTTG
TCCCCAACTTGGTGCTGTTTTCAACAAATCGCTTGATAACATCTCTTTGATTCTCCACGT
GATTGCGTCTGAAGCAACCAAGAATCCTTTTTCTCCAAGCAAGTCTCGTTCTTGACAGAT
ACGATACCTGCAATCCACATTAATCATCAAGTTGAAAATTTCTTCTTCTTTGTAGTAACC
CAACTCTTGAGATTGTCTATCAAATTCCGGCTCATTGTAAAAGTAGCTCTAACCATGTTT
CTTATGCAGATTCCTCTTCCAGGGAAGATGGTGACCTGTATCACCATCATTGGCCGTGTC
TGAATACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D327JQ U 1
AF RR2D327TF C 1
AF RR2CW59JQ U 110
BS 1 581 RR2D327JQ
BS 582 849 RR2CW59JQ

RD RR2D327JQ 582 0 0
GATATAAAATGGGGTAATGATATATCATCTGAGGTAAGGAGTTACGAACTTGGTGGAAAT
ATAATCACCTGATACTAACATAATAAAGTTTTTTGGATGAGACATGAGAGGATGAAAATA
TAATCACAGATTCACAATGCAACACTCTATTCGATAACATTGGTGGAAAGTAGCTAATCA
TATTTATTTCGATGATGGTTGTTGAACTTAGTGAATATTGAAAAGGGGTCTATGATATTT
TATGAAACAGAGATAGCGAAGTTGCTTGTATCATTCATGCTACTTGTTGAATTTCTTGAT
CCCTTGTTGCCAAATCGAAATAAAGGTACCCATTTTCTTCTTCTCTAGTGCTAATCCAAT
ATCAACACTGTTGCTCCCATCTCTTGACTCGGAAAAGGCAATGGAACCACCAGTTTCAAT
GTGCACCAACTCCATTTTGCAAGGTTTTCCTAACCCAAAATCCATATCATATAGTCCAAG
TTTAGGAGCTCCTGCAATGGAGGTTGGAAAACGTGACATGACCCATTTAAGTACTCCTTG
TCCCCAACTTGGTGCTGTTTTCAACAAATCGCTTGATAACA
C

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2D327TF 582 0 0
GATATAAAATGGGGTAATGATATATCATCTGAGGTAAGGAGTTACGAACTTGGTGGAAAT
ATAATCACCTGATACTAACATAATAAAGTTTTTTGGATGAGACATGAGAGGATGAAAATA
TAATCACAGATTCACAATGCAACACTCTATTCGATAACATTGGTGGAAAGTAGCTAATCA
TATTTATTTCGATGATGGTTGTTGAACTTAGTGAATATTGAAAAGGGGTCTATGATATTT
TATGAAACAGAGATAGCGAAGTTGCTTGTATCATTCATGCTACTTGTTGAATTTCTTGAT
CCCTTGTTGCCAAATCGAAATAAAGGTACCCATTTTCTTCTTCTCTAGTGCTAATCCAAT
ATCAACACTGTTGCTCCCATCTCTTGACTCGGAGAAGGCAATGGAACCACCAGTTTCAAT
GTGCACCAACTCCATTTTGCAAGGTTTTCCTAACCCAAAATCCATATCATATAGTCCAAG
TTTAGGAGCTCCTGCAATGGAGGTTGGAAAACGTGACATGACCCATTTAAGTACTCCTTG
TCCCCAACTTGGTGCTGTTTTCAACAAATCGCTTGATAACA
C

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2CW59JQ 740 0 0
AGGA
GAAAATATAATCACAGATTCACAATGGAACACTCTATTCGATAACATTGGTGGAAAGTAG
CTAATCATATTTATTTCGATGATGGTTGTTGAACTTAGTGAATATTGAAAAGGGGTCTAT
GATATTTTATGAAACAGAGATAGCGAAGTTGCTTGTATCATTCATGCTACTTGTTGAATT
TCTTGATCCCTTGTTGCCAAATCGAAATAAAGGTACCCATTTTCTTCTTCTCTAGTGCTA
ATCCAATATCAACACCGTTGCTCCCATCTCTTGACTCGGAAAAGGCAATGGAACCACCAG
TTTCAATGTGCACCAACTCCATTTTGCAAGGTTTTCCTAACCCAAAATCCATATCATATA
GTCCAAGTTTAGGAGCTCCTGCAATGGAGGTTGGAAAACGTGACATGACCCATTTACGTA
CTCCTTGTCCCCAACTTGGTGCTGTTTTCAACAAATCGCTTGATAACATCTCTTTGATTC
TCCACGTGATTGCGTCTGAAGCAACCAAGAATCCTTTTTCTCCAAGCAAGTCTCGTTCTT
GACAGATACGATACCTGCAATCCACATTAATCATCAAGTTGAAAATTTCTTCTTCTTTGT
AGTAACCCAACTCTTGAGATTGTCTATCAAATTCCGGCTCATTGTAAAAGTAGCTCTAAC
CATGTTTCTTATGCAGATTCCTCTTCCAGGGAAGATGGTGACCTGTATCACCATCATTGG
CCGTGTCTGAATACCC

QA 5 740 5 740
DS 



CO CL818Contig2 853 4 6 U
GTGAAAATATAATCACAGATTCACAATGCAACACTCTATTCGATAACATTGGTGGAAAGT
AGCTAATCATATTTATTTCGATGATGGTTGTTGAACTTAGTGAATATTGAAAAGGGGTCT
ATGATATTTTATGAAACAGAGATAGCGAAGTTGCTTGTATCATTCATGCTACTTGTTGAA
TTTCTTGATCCCTTGTTGCCAAATCGAAATAAAGGTACCCATTTTCTTCTTCTCTAGTGC
TAATCCAATATCAACACCGTTGCTCCCATCTCTTGACTCGGAGAAGGCAATGGAACCACC
AGTTTCAATGTGCACCAACTCCATTTTGCAAGGTTTTCCTAACCCAAAATCCATATCATA
TAGTCCAAGTTTAGGAGCTCCTGCAATGGAGGTTGGAAAACGTGACATGACCCATTTACG
TACTCCTTGTCCCCAACTTGGTGCTGTTTTCAACAAATCGCTTGATAACATCTCTTTGAT
TCTCCACGTGATTGCGTCTGAAGCAACCAAGAATCCTTTTTCTCCAAGCAAGTCTCGTTT
CTTGACAGATACGATACCAGGAGCCATACAGTTTCCAAAGTATGTGGGTGGTATCGGTTC
TGTGAACTTGATACGATTCCTGCAATCCACATTAATCATCAAGTTGAAAATTTCTTCTTC
TTTGTCTTCCACCTTGTCCTCTGTTTCACTACTGTCTTGAACAAGTGTCTTGATCAAGTT
TACCCAAGTGAAAGCTAGAGTTACCACAAAGGTCGAAACAGGAGATTGATTCTCAGACTG
CTCTGTAGTAACCCAACTTTTGAGATTGTCTATCAAATTCCGGCTCATTGTAAAAGTAGC
TCTAACCATGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI90JQ U 61
AF RR2DI90TF C 61
AF RR2DS13JQ U 1
AF RR2H120JQ U 109
BS 1 268 RR2DS13JQ
BS 269 269 RR2DI90JQ
BS 270 415 RR2DS13JQ
BS 416 416 RR2DI90JQ
BS 417 611 RR2DS13JQ
BS 612 853 RR2H120JQ

RD RR2DI90JQ 462 0 0
G
GCTAATCATATTTATTTCGATGATGGTTGTTGAACTTAGTGAATATTGAAAAGGGGTCTA
TGATATTTTATGAAACAGAGATAGCGAAGTTGCTTGTATCATTCATGCTACTTGTTGAAT
TTCTTGATCCCTTGTTGCCAAATCGAAATAAAGGTACCCATTTTCTTCTTCTCTAGTGCT
AATCCAATATCAACACCGTTGCTCCCATCTCTTGACTCGGAGAAGGCAATGGAACCACCA
GTTTCAATGTGCACCAACTCCATTTTGCAAGGTTTTCCTAACCCAAAATCCATATCATAT
AGTCCAAGTTTAGGAGCTCCTGCAATGGAGGTTGGAAAACGTGACATGACCCATTTACGT
ACTCCTTGTCCCCAACTTGGTGCTGTTTTCAACAAATCGCTTGATAACATCTCTTTGATT
CTCCACGTGATTGCGTCTGAAGCAACCAAGAATCCTTTTTC

QA 2 462 2 462
DS 

RD RR2DI90TF 505 0 0
G
GCTAATCATATTTATTTCGATGATGGTTGTTGAACTTAGTGAATATTGAAAAGGGGTCTA
TGATATTTTATGAAACAGAGATAGCGAAGTTGCTTGTATCATTCATGCTACTTGTTGAAT
TTCTTGATCCCTTGTTGCCAAATCGAAATAAAGGTACCCATTTTCTTCTTCTCTAGTGCT
AATCCAATATCAACACCGTTGCTCCCATCTCTTGACTCGGAGAAGGCAATGGAACCACCA
GTTTCAATGTGCACCAACTCCATTTTGCAAGGTTTTCCTAACCCAAAATCCATATCATAT
AGTCCAAGTTTAGGAGCTCCTGCAATGGAGGTTGGAAAACGTGACATGACCCATTTACGT
ACTCCTTGTCCCCAACTTGGTGCTGTTTTCAACAAATCGCTTGATAACATCTCTTTGATT
CTCCACGTGATTGCGTCTGAAGCAACCAAGAATCCTTTTTCTCCAAGCAAGTCTCGTTTC
TTGACAGATACGATACC
AGGAGCC

QA 2 498 2 498
DS 

RD RR2DS13JQ 611 0 0
GTGAAAATATAATCACAGATTCACAATGCAACACTCTATTCGATAACATTGGTGGAAAGT
AGCTAATCATATTTATTTCGATGATGGTTGTTGAACTTAGTGAATATTGAAAAGGGGTCT
ATGATATTTTATGAAACAGAGATAGCGAAGTTGCTTGTATCATTCATGCTACTTGTTGAA
TTTCTTGATCCCTTGTTGCCAAATCGAAATAAAGGTACCCATTTTCTTCTTCTCTAGTGC
TAATCCAATATCAACACCGTTGCTCCCACCTCTTGACTCGGAGAAGGCAATGGAACCACC
AGTTTCAATGTGCACCAACTCCATTTTGCAAGGTTTTCCTAACCCAAAATCCATATCATA
TAGTCCAAGTTTAGGAGCTCCTGCAATGGAGGTTGGAAAACGTGACATGACCCATCTACG
TACTCCTTGTCCCCAACTTGGTGCTGTTTTCAACAAATCGCTTGATAACATCTCTTTGAT
TCTCCACGTGATTGCGTCTGAAGCAACCAAGAATCCTTTTTCTCCAAGCAAGTCTCGTTT
CTTGACAGATACGATACCAGGAGCCATACAGTTTCCAAAGTATGTGGGTGGTATCGGTTC
TGTGAACTTGA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2H120JQ 745 0 0
GAAAAGGGGTCTATGATATTTTATGAAACAGAGATAGCGAAGTTACTTGTATCATTCATG
CTACTTGTTGAATTTCTTGATCCCTTGTTGCCAAATCGAAATAAAGGTACCCATTTTCTT
CTTCTCTAGTGCTAATCCAATATCAACACCGTTGCTCCCATCTCTTGACTCGGAGAAGGC
AATGGAACCACCAGTTTCAATGTGCACCAACTCCATTTTGCAAGGTTTTCCTAACCCAAA
ATCCATATCATATAGTCCAAGTTTAGGAGCTCCTGCAATGGAGGTTGGAAAACGTGACAT
GACCCATTTACGTACTCCTTGTCCCCAACTTGGTGCTGTTTTCAACAAATCGCTTGATAA
CATCTCTTTGATTCTCCACGTGATTGCGTCTGAAGCAACCAAGAATCCTTTTTCTCCAAG
CAAGTCTCGTTTCTTGACAGATACGATACCAGGAGCCATACAGTTTCCAAAGTATGTGGG
TGGTATCGGTTCTGTGAACTTGATACGATTCCTGCAATCCACATTAATCATCAAGTTGAA
AATTTCTTCTTCTTTGTCTTCCACCTTGTCCTCTGTTTCACTACTGTCTTGAACAAGTGT
CTTGATCAAGTTTACCCAAGTGAAAGCTAGAGTTACCACAAAGGTCGAAACAGGAGATTG
ATTCTCAGACTGCTCTGTAGTAACCCAACTTTTGAGATTGTCTATCAAATTCCGGCTCAT
TGTAAAAGTAGCTCTAACCATGTTC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 8

CO CL819Contig1 693 8 7 U
GGACGAAACTCACTATAGAGAGATAAAAAAAAAACTTGAGAGCAAGAGAAAAAA*GGGTT
GTCGTCTCTACACCTTCTCCGGTAGACGACGTTGGTGTCGTTTGTACTGTGAGAAGGTGG
GTTTCTGTTTTCCATGGTTTAAGTTCCCTTCTCTTCTCTAGATGTACTCAAATCTGGTCT
ATAGCTTCAGTCCTGTGGATTGAGCGGAGAAAATGAAATCGGAATCCACCGACACAGATC
TCGTCAGATCTATGATGTGTGGTGTTAGTCAACGGTTACTGGCTGTATTGAGGAGGTTCG
GGCTCGGATGGCTTCGTTTGGCCTTGCCGAAGTGTGGAGGCGCGTGGAGAGTCTTATCAG
AGGTCAATGGCGAGTTTAGGTTGGATCTGGAGACTGGAGAATAAGCTATAGCGACGGTTG
TGTATGGCTAACAGACCGGTTTCTTTTCTCTCGATTGGTATTGTTTCACATCTTGGGTTT
TTAGTATATGGTATTTTTAGTTGTTTTTCCCTTATGTCTCAAAGTTCTTTGTTAAAGTTT
GTTTCTGGGGTTGTAATCTTTTAACCGCCAGCTAGTGGCTCCGGGATTGGTGTGTGCTTT
AATCGCCGGCTTAGTTTGGTCTTTAAATCTTATGTTTCGGTGTTGTAATCCCCGTTCGGA
TTTGAAATCATGATAATAAAATTTCAGATGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 

AF RR2DY10TF U 12
AF RR2H977TF U 1
AF RR2FL34JQ C 13
AF RR2FL34TF U 123
AF RR2B194JQ C 75
AF RR2DY10JQ C 355
AF RR2H977JQ C 190
AF RR2B194TF U 14
BS 1 33 RR2H977TF
BS 34 34 RR2DY10TF
BS 35 330 RR2H977TF
BS 331 331 RR2FL34TF
BS 332 577 RR2H977TF
BS 578 692 RR2FL34TF
BS 693 693 RR2FL34JQ

RD RR2DY10TF 282 0 0
GGATAGAGAGATAA
AAAAAAAAACTTGAGAGCAAGAGAAAAAA*GGGTTGTCGTCCCTACACCTTCTCCGGTAG
ACGACGTTGGTGTCGTTTGTACTGTGAGAAGGTGGGTTTCTGTTTTCCATGGTTTAAGTT
CCCTTCTCTTCTCTAGATGTACTCAAATCTGGTCTATAGCTTCAGTCCTGTGGATTGAGC
GGAGAAAATGAAATCGGAATCCACCGACACAGATCTCGTCAGATCTATGATGTGTGGTGT
TAGTCAACGGTTACTGGCTGTATTGAGG

QA 15 282 15 282
DS 

RD RR2H977TF 579 0 0
GGACGAAACTCACTATAGAGAGATAAAAAAAAA*CTTGAGAGCAAGAGAAAAAA*GGGTT
GTCGTCTCTACACCTTCTCCGGTAGACGACGTTGGTGTCGTTTGTACTGTGAGAAGGTGG
GTTTCTGTTTTCCATGGTTTAAGTTCCCTTCTCTTCTCTAGATGTACTCAAATCTGGTCT
ATAGCTTCAGTCCTGTGGATTGAGCGGAGAAAATGAAATCGGAATCCACCGACACAGATC
TCGTCAGATCTATGATGTGTGGTGTTAGTCAACGGTTACTGGCTGTATTGAGGAGGTTCG
GGCTCGGATGGCTTCGTTTGGCCTTGCCGAGGTGTGGAGGCGCGTGGAGAGTCTTATCAG
AGGTCAATGGCGAGTTTAGGTTGGATCTGGAGACTGGAGAATAAGCTATAGCGACGGTTG
TGTATGGCTAACAGACCGGTTTCTTTTCTCTCGATTGGTATTGTTTCACATCTTGGGTTT
TTAGTATATGGTATTTTTAGTTGTTTTTCCCTTATGTCTCAAAGTTCTTTGTTAAAGTTT
GTTTCTGGGGTTGTAATCTTTTAACCGCCAGCTAGTG
AC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2FL34JQ 681 0 0
GG
ATAGAGAGATAAAAAAAAAACTTGAGAGCAAGAGAAAAAAAGGGTTGTCGTCTCTACACC
TTCTCCGGTAGACGACGTTGGTGTCGTTTGTACTGTGAGAAGGTGGGTTTCTGTTTTCCA
TGGTTTAAGTTCCCTTCTCTTCTCTAGATGTACTCAAATCTGGTCTATAGCTTCAGTCCT
GTGGATTGAGCGGAGAAAATGAAATCGGAATCCACCGACACAGATCTCGTCAGATCTATG
ATGTGTGGTGCTAGTCAACGGTTACTGGCTGTATTGAGGAGGTTCGGGCTCGGATGGCTT
CGTTTGGCCTTGCCGAAGTGTGGAGGCGCGTGGAGAGTCTTATCAGAGGTCAATGGCGAG
TTTAGGTTGGATCTGGAGACTGGAGAATAAGCTATAGCGACGGTTGTGTATGGCTAACAG
ACCGGTTTCTTTTCTCTCGATTGGTATTGTTTCACATCTTGGGTTTTTAGTATATGGTAT
TTTTAGTTGTTTTTCCCTTATGTCTCAAAGTTCTTTGTTAAAGTTTGTTTCTGGGGTTGT
AATCTTTTAACCGCCAGCTAGTGGCTCCGGGATTGGTGTGTGCTTTAATCGCCGGCTTAG
TTTGGTCTTTAAATCTTATGTTTCGGTGTTGTAATCCCCGTTCGGATTTGAAATCATGAT
AATAAAATTTCAGATGACG

QA 3 681 3 681
DS 

RD RR2FL34TF 571 0 0
TTCTGTTTTCCATGGTTTAAGTTCCCTTCTCTTCTCTAGATGTACTCAAATCTGGTCTAT
AGCTTCAGTCCTGTGGATTGAGCGGAGAAAATGAAATCGGAATCCACCGACACAGATCTC
GTCAGATCTATGATGTGTGGTGCTAGTCAACGGTTACTGGCTGTATTGAGGAGGTTCGGG
CTCGGATGGCTTCGTTTGGCCTTGCCGAAGTGTGGAGGCGCGTGGAGAGTCTTATCAGAG
GTCAATGGCGAGTTTAGGTTGGATCTGGAGACTGGAGAATAAGCTATAGCGACGGTTGTG
TATGGCTAACAGACCGGTTTCTTTTCTCTCGATTGGTATTGTTTCACATCTTGGGTTTTT
AGTATATGGTATTTTTAGTTGTTTTTCCCTTATGTCTCAAAGTTCTTTGTTAAAGTTTGT
TTCTGGGGTTGTAATCTTTTAACCGCCAGCTAGTGGCTCCGGGATTGGTGTGTGCTTTAA
TCGCCGGCTTAGTTTGGTCTTTAAATCTTATGTTTCGGTGTTGTAATCCCCGTTCGGATT
TGAAATCATGATAATAAAATTTCAGATGAC
G

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2B194JQ 618 0 0
TTCTCCGGTAGACGACGTTGGTGTCGTTTGTACTGTGAGAAGGTGGGTTTCTGTTTTCCA
TGGTTTAAGTTCCCTTCTCTTCTCTAGATGTACTCAAATCTGGTCTATAGCTTCAGTCCT
GTGGATTGAGCGGAGAAAATGAAATCGGAATCCACCGACACAGATCTCGTCAGATCTATG
ATGTGTGGTGTTAGTCAACGGTTACTGGCTGTATTGAGGAGGTTCGGGCTCGGATGGCTT
CGTTTGGCCTTGCCGAAGTGTGGAGGCGCGTGGAGAGTCTTATCAGAGGTCAATGGCGAG
TTTAGGTTGGATCTGGAGACTGGAGAATAAGCTATAGCGACGGTTGTGTATGGCTAACAG
ACCGGTTTCTTTTCTCTCGATTGGTATTGTTTCACATCTTGGGTTTTTAGTATATGGTAT
TTTTAGTTGTTTTTCCCTTATGTCTCAAAGTTCTTTGTTAAAGTTTGTTTCTGGGGTTGT
AATCTTTTAACCGCCAGCTAGTGGCTCCGGGATTGGTGTGTGCTTTAATCGCCGGCTTAG
TTTGGTCTTTAAATCTTATGTTTCGGTGTTGTAATCCCCGTTCGGATTTGAAATCATGAT
AATAAAATTTCAGATGAC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2DY10JQ 329 0 0
TATCAGAGGTCAATGGGGAGTTTAGGTTGGATCTGGAGACTGGAGAATAAGCTATAGCGA
CGGTTGTGTATGGCTAACAGACCGGTTTCTTTTCTCTCGATTGGTATTGTTTCACATCTT
GGGTTTTTAGTATATGGTATTTTTAGTTGTTTTTCCCTTATGTCTCAAAGTTTTTTGTTA
AAGTTTGTTTCTGGGGTTGTAATCTTTTAACCCCCAGCTAGTGGCTCCGGGATTGGTGTG
TGCTTTAATCGCCGGCTTAGTTTGGTCTTTAAATCTTATGTTTCGGTGTTGTAATCCCCG
TTCGGATTTGAAATCATGATAATAAAATT

QA 1 329 1 329
DS 

RD RR2H977JQ 503 0 0
GTCCTGTGGATTGAGCGGAGAAAATGAAATCGGAATCCACCGACACAGATCTCGTCAGAT
CTATGATGTGTGGTGTTAGTCAACGGTTACTGGCTGTATTGAGGAGGTTCGGGCTCGGAT
GGCTTCGTTTGGCCTTGCCGAGGTGTGGAGGCGCGTGGAGAGTCTTATCAGAGGTCAATG
GCGAGTTTAGGTTGGATCTGGAGACTGGAGAATAAGCTATAGCGACGGTTGTGTATGGCT
AACAGACCGGTTTCTTTTCTCTCGATTGGTATTGTTTCACATCTTGGGTTTTTAGTATAT
GGTATTTTTAGTTGTTTTTCCCTTATGTCTCAAAGTTCTTTGTTAAAGTTTGTTTCTGGG
GTTGTAATCTTTTAACCGCCAGCTAGTGACTCCGGGATTGGTGTGTGCTTTAATCGCCGG
CTTAGTTTGGTCTTTAAATCTTATGTTTCGGTGTTGTAATCCCCGTTCGGATTTGAAATC
ATGATAATAAAATTTCAGATGAC

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2B194TF 679 0 0
GGATAGAGAGAT
AAAAAAAAACTTGAGAGCAAGAGAAAAAA*GGGTTGTCGTCTCTACACCTTCTCCGGTAG
ACGACGTTGGTGTCGTTTGTACTGTGAGAAGGTGGGTTTCTGTTTTCCATGGTTTAAGTT
CCCTTCTCTTCTCTAGATGTACTCAAATCTGGTCTATAGCTTCAGTCCTGTGGATTGAGC
GGAGAAAATGAAATCGGAATCCACCGACACAGATCTCGTCAGATCTATGATGTGTGGTGT
TAGTCAACGGTTACTGGCTGTATTGAGGAGGTTCGGGCTCGGATGGCTTCGTTTGGCCTT
GCCGAAGTGTGGAGGCGCGTGGAGAGTCTTATCAGAGGTCAATGGCGAGTTTAGGTTGGA
TCTGGAGACTGGAGAATAAGCTATAGCGACGGTTGTGTATGGCTAACAGACCGGTTTCTT
TTCTCTCGATTGGTATTGTTTCACATCTTGGGTTTTTAGTATATGGTATTTTTAGTTGTT
TTTCCCTTATGTCTCAAAGTTCTTTGTTAAAGTTTGTTTCTGGGGTTGTAATCTTTTAAC
CGCCAGCTAGTGGCTCCGGGATTGGTGTGTGCTTTAATCGCCGGCTTAGTTTGGTCTTTA
AATCTTATGTTTCGGTGTTGTAATCCCCGTTCGGATTTGAAATCATGATAATAAAATTTC
AGATGAC

QA 13 679 13 679
DS 



AS 2 8

CO CL820Contig1 776 4 20 U
GGAGACAACGCGAAGCTTCTCTTTACGCGATGGCGTCTATTTTCAGACCTTCAGTTTCAC
TTGTTCTACGACCAAAGGTGACTTGCACGAATCATCATCACTCTACGATAGAACGATTTG
ACTTTCAGAAGAACAAGAGTCAGAGAAAAGAAAGGCTCAATGGTAGGTGGTCATGTGGCT
TGAAGGCTAATCAAGCACAAGGGTCAGCTGAAGGGATCAGTGTGGTACAAGAGAAAGAGG
TTAACAATAAAACCGATTATGGAGTTGTTGGGGTACACCACGTTGGTCTGCTCTGCGAAA
ACTTAGAACGGTCACTGGAGTTTTACCAGAACATTCTAGGCCTTGAGATAAACGAGGCAA
GACCACATGATAAGCTTCCGTATAGAGGAGCATGGTTATGGGTAGGCTCGGAGATGATTC
ATTTAATGGAACTTCCAAATCCTGATCCATTAACAGGCAGACCCGAGCACGGAGGCCGGG
ATCGACACGCTTGTATCGCAATCCGTGATGTCTCAAATCTTAAACAGATTTTGGACAAAG
CTGGGATTGAGTATACGATGAGTAGGTCAGGGAGGCCAGCGATATTCACTCGTGATCCAG
ACGCAAACGCTCTTGAGTTTACTCAAGTTTGATTCTTGAGTCTCTCTTCTTTTATAGATA
TATAAGTTGCAGATAGATACTTAAATACTGTTCAAGTCTCGCCCTTCAAATTTGTGTATG
TTTGGATCAGTTTCATTAAGCATCCCTTATTTATAAAACAAGATGCAACATTCAGC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CP29JQ C 39
AF RR2CP29TF U 67
AF RR2AO53JQ C 1
AF RR2AO53TF U 1
BS 1 2 RR2AO53JQ
BS 3 66 RR2AO53TF
BS 67 132 RR2CP29TF
BS 133 133 RR2AO53TF
BS 134 141 RR2CP29TF
BS 142 142 RR2AO53TF
BS 143 178 RR2CP29TF
BS 179 179 RR2AO53TF
BS 180 298 RR2CP29TF
BS 299 299 RR2AO53TF
BS 300 430 RR2CP29TF
BS 431 431 RR2AO53TF
BS 432 648 RR2CP29TF
BS 649 649 RR2AO53TF
BS 650 662 RR2CP29TF
BS 663 663 RR2AO53TF
BS 664 675 RR2CP29TF
BS 676 679 RR2AO53TF
BS 680 697 RR2CP29TF
BS 698 776 RR2AO53TF

RD RR2CP29JQ 696 0 0
ATTTTCAGACCTTCAGTTTCACTTGATCTACGACCAAAGGTGACTTGCACGAATCATCAT
CACTCTACGATAGAACGATTTGACTTTCAGAAGAGCAAGAGTCTGAGAAAAGAAAGGCTC
AATGGTAGGTGGTCATGTGGTTTGAAGGCTAATCAAGCACAAGGGTCAGCTGAAGGGATC
AGTGTGGTACAAGAGAAAGAGGTTAACAATAAAACCGATTATGGAGTTGTTGGGGTACAC
CACGTTGGTCTGCTCTGCGAGAACTTAGAACGGTCACTGGAGTTTTACCAGAACATTTTA
GGCCTTGAGATAAACGAGGCAAGACCACATGATAAGCTTCCGTATAGAGGAGCATGGTTA
TGGGTAGGCTCGGAGATGATTCATTTAATGGAGCTTCCAAATCCTGATCCATTAACAGGC
AGACCCGAGCACGGAGGCCGGGATCGACACGCTTGTATCGCAATCCGTGATGTCTCAAAT
CTTAAACAGATTTTGGACAAAGCTGGGATTGAGTATACGATGAGTAGGTCAGGGAGGCCA
GCGATATTCACTCGTGATCCAGACGCAAACGCTCTTGAGTTTACTCAAGTTTGATTCTTG
AGTCTCTCTTTTTTTATAGATATA*AAGTTGCAGATA****CTTAAATACTGTTCAAGTC
TCACCCTTCAAATTTGTGTGT
CGGTTTGGATCAGTT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2CP29TF 631 0 0
TACGACCAAAGGTGACTTGCACGAATCATCATCACTCTACGATAGAACGATTTGACTTTC
AGAAGAGCAAGAGTCTGAGAAAAGAAAGGCTCAATGGTAGGTGGTCATGTGGTTTGAAGG
CTAATCAAGCACAAGGGTCAGCTGAAGGGATCAGTGTGGTACAAGAGAAAGAGGTTAACA
ATAAAACCGATTATGGAGTTGTTGGGGTACACCACGTTGGTCTGCTCTGCGAGAACTTAG
AACGGTCACTGGAGTTTTACCAGAACATTCTAGGCCTTGAGATAAACGAGGCAAGACCAC
ATGATAAGCTTCCGTATAGAGGAGCATGGTTATGGGTAGGCTCGGAGATGATTCATTTAA
TGGAGCTTCCAAATCCTGATCCATTAACAGGCAGACCCGAGCACGGAGGCCGGGATCGAC
ACGCTTGTATCGCAATCCGTGATGTCTCAAATCTTAAACAGATTTTGGACAAAGCTGGGA
TTGAGTATACGATGAGTAGGTCAGGGAGGCCAGCGATATTCACTCGTGATCCAGACGCAA
ACGCTCTTGAGTTTACTCAAGTTTGATTCTTGAGTCTCTCTTTTTTTATAGATATA*AAG
TTGCAGATA****CTTAAATACTGTTCAAGT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2AO53JQ 776 0 0
GGAGACAACGCGAAGCTTCTCTTTACGCGATGGCGTCTATTTTCAGACCTTCAGTTTCAC
TTGTTCTACGACCCAAGGTGACTTGCACGAATCATCATCACTCTACGATAGAACGATTTG
ACTTTCAGAAGAACAAGAGTGAGAGAAAAGAAAGGCTCAATGGTAGGTGGTCATGTGGCT
TGAAGGCTAATCAAGCACAAGGGTCAGCTGAAGGGATCAGTGTGGTACAAGAGAAAGAGG
TTAACAATTAAACCGATTATGGAGTTGTTGGGGTACACCACGTTGGTCTGCTCTGCGAAA
ACTTAGAACGGTCACTGGAGTTTTACCAGAATATTTTAGGCCTTGAGATAAACGAGGCGA
GACCACATGATAAGCTTCCGTATAGAGGAGCATGGTTATGGGTAGGCTCGGAGATGATTC
ATTTAATGGAACTTCCAAATCCTGATCCATTAACAGGCAGACCTGAGCACGGAGGCCGGG
ATCGACACGCTTGTATCGCAATCCGTGATGTTTCAATTCTTAAACATATTTTGGACAAAG
CTGGGATTGAGTATACGATGAGTAGGTCAGGGAGGCCAGCGATATTTACTCGTGATCCAG
ACGCAAACGCTCTTGAGTTTACTCAAGTTTGATTCTTGAGTCTCTCTTCTTT*ATAGATA
TATAAGTTGTAGATAGATACTTAAATACTGTTCAAGTCTCGCCCTTCAAATTTGTGTATG
TTTGGATCAGTTTCATTAAGCATCCCTTATTTATAAAACAAGATGCAACATTCAGC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2AO53TF 776 0 0
GG
AGACAACGCGAAGCTTCTCTTTACGCGATGGCGTCTATTTTCAGACCTTCAGTTTCACTT
GTTCTACGACCCAAGGTGACTTGCACGAATCATCATCACTCTACGATAGAACGATTTGAC
TTTCAGAAGAACAAGAGTGAGAGAAAAGAAAGGCTCAATGGTAGGTGGTCATGTGGCTTG
AAGGCTAATCAAGCACAAGGGTCAGCTGAAGGGATCAGTGTGGTACAAGAGAAAGAGGTT
AACAATTAAACCGATTATGGAGTTGTTGGGGTACACCACGTTGGTCTGCTCTGCGAAAAC
TTAGAACGGTCACTGGAGTTTTACCAGAATATTCTAGGCCTTGAGATAAACGAGGCGAGA
CCACATGATAAGCTTCCGTATAGAGGAGCATGGTTATGGGTAGGCTCGGAGATGATTCAT
TTAATGGAACTTCCAAATCCTGATCCATTAACAGGCAGACCTGAGCACGGAGGCCGGGAT
CGACACGCTTGTATCGCAATCCGTGATGTTTCAATTCTTAAACATATTTTGGACAAAGCT
GGGATTGAGTATACGATGAGTAGGTCAGGGAGGCCAGCGATATTTACTCGTGATCCAGAC
GCAAACGCTCTTGAGTTTACTCAAGTTTGATTCTTGAGTCTCTCTTCTTT*ATAGATATA
TAAGTTGTAGATAGATACTTAAATACTGTTCAAGTCTCGCCCTTCAAATTTGTGTATGTT
TGGATCAGTTTCATTAAGCATCCCTTATTTATAAAACAAGATGCAACATTCAGC

QA 3 776 3 776
DS 



CO CL820Contig2 781 4 5 U
TTCTTACTCATTTGTTGAGAGCCTAAAAGAAACAGACAACGCGAAGCTTCTCTTTACGCG
ATGGCGTCTATTTTCAGACCTTCAGTTTCACTTGATCTACGACCAAAGGTGACCTGCACG
AATCATGATCACTCGACGATAGAACGAATTGACTTTCAGAAGAACAAGAGTCTGAGAAAA
GAAAGGCTCAATGGTAGGTGGTCATGTGGCTTGAAGGCTAATCAAGCACAAGGGTCAGCT
GAAGGGATCAGTGTGGTACAAGAGAAAGAGGTTAACAATCAAACCGATTATGGAGTTGTT
GGGGTACACCACGTTGGTCTGCTCTGCGAGAACTTAGAACGGTCGCTGGAGTTTTACCAG
GACATTCTAGGCCTTGAGATAAACGAGGCAAGACCACATGATAAGCTTCCGTATAAAGGA
GCATGGTTATGGGTAGGCTCGGAGATGATTCATTTAATGGAGCTTCCAAATCCTGATCCA
TTAACAGGCAGACCCGAGCACGGAGGCCGGGATCGACACGCTTGTATCGCAATCCGTGAT
GTTTCAATTCTTAAACAGATTTTGGACAAAGCTGGGATTGATTATACGATGAGTAGGTCA
GGGAGGCCAGCGATATTCACTCGTGATCCAGACGCAAACGCTCTTGAGTTTACTCAAGTT
TGATTCTTGAGTCTCTCTTCTTTATAGATATATAGTTGAAGATACTTAAATACTGTTCAA
GTCTCACCCTTCACATTTGTGTGTTTGGATCAGTTTCATTAAGCATAACACCTTATTTAA
G


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BW15TF U 1
AF RR2BW15JQ C 2
AF RR2AA20TF U 54
AF RR2AA20JQ C 54
BS 1 354 RR2BW15TF
BS 355 355 RR2AA20TF
BS 356 759 RR2BW15TF
BS 760 766 RR2AA20TF
BS 767 781 RR2AA20JQ

RD RR2BW15TF 777 0 0
TTCTTACTCATTTGTTGAGAGCCTAAAAGAAACAGACAACGCGAAGCTTCTCTTTACGCG
ATGGCGTCTATTTTCAGACCTTCAGTTTCACTTGATCTACGACCAAAGGTGACCTGCACG
AATCATGATCACTCGACGATAGAACGAATTGACTTTCAGAAGAACAAGAGTCTGAGAAAA
GAAAGGCTCAATGGTAGGTGGTCATGTGGCTTGAAGGCTAATCAAGCACAAGGGTCAGCT
GAAGGGATCAGTGTGGTACAAGAGAAAGAGGTTAACAATCAAACCGATTATGGAGTTGTT
GGGGTACACCACGTTGGTCTGCTCTGCGAGAACTTAGAACGGTCGCTGGAGTTT*ACCAG
GACATTCTAGGCCTTGAGATAAACGAGGCAAGACCACATGATAAGCTTCCGTATAAAGGA
GCATGGTTATGGGTAGGCTCGGAGATGATTCATTTAATGGAGCTTCCAAATCCTGATCCA
TTAACAGGCAGACCCGAGCACGGAGGCCGGGATCGACACGCTTGTATCGCAATCCGTGAT
GTTTCAATTCTTAAACAGATTTTGGACAAAGCTGGGATTGATTATACGATGAGTAGGTCA
GGGAGGCCAGCGATATTCACTCGTGATCCAGACGCAAACGCTCTTGAGTTTACTCAAGTT
TGATTCTTGAGTCTCTCTTCTTTATAGATATATAGTTGAAGATACTTAAATACTGTTCAA
GTCTCACCCTTCACATTTGTGTGTTTGGATCAGTTTCAT
AAGCATACACCTTATTAT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2BW15JQ 779 0 0
TCTTACTCATTTGTTGAGAGCCTAAAAGAAACAGACAACGCGAAGCTTCTCTTTACGCGA
TGGCGTCTATTTTCAGACCTTCAGTTTCACTTGATCTACGACCAAAGGTGACCTGCACGA
ATCATGATCACTCGACGATAGAACGAATTGACTTTCAGAAGAACAAGAGTCTGAGAAAAG
AAAGGCTCAATGGTAGGTGGTCATGTGGCTTGAAGGCTAATCAAGCACAAGGGTCAGCTG
AAGGGATCAGTGTGGTACAAGAGAAAGAGGTTAACAATCAAACCGATTATGGAGTTGTTG
GGGTACACCACGTTGGTCTGCTCTGCGAGAACTTAGAACGGTCGCTGGAGTTT*ACCAGG
ACATTCTAGGCCTTGAGATAAACGAGGCAAGACCACATGATAAGCTTCCGTATAAAGGAG
CATGGTTATGGGTAGGCTCGGAGATGATTCATTTAATGGAGCTTCCAAATCCTGATCCAT
TAACAGGCAGACCCGAGCACGGAGGCCGGGATCGACACGCTTGTATCGCAATCCGTGATG
TTTCAATTCTTAAACAGATTTTGGACAAAGCTGGGATTGATTATACGATGAGTAGGTCAG
GGAGGCCAGCGATATTCACTCGTGATCCAGACGCAAACGCTCTTGAGTTTACTCAAGTTT
GATTCTTGAGTCTCTCTTCTTTATAGATATATAGTTGAAGATACTTAAATACTGTTCAAG
TCTCACCCTTCACATTTGTGTGTTTGGATCAGTTTCATTAAGCAT
AACACCTTATTTAT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2AA20TF 726 0 0
GG
ACGCGATGGCGTCTATTTTCAGACCTTCAGTTTCACTTGATCTACGACCAAAGGTGACCT
GCACGAATCATGATCACTCGACGATAGAACGAATTGACTTTCAGAAGAACAAGAGTCTGA
GAAAAGAAAGGCTCAATGGTAGGTGGTCATGTGGCTTGAAGGCTAATCAAGCACAAGGGT
CAGCTGAAGGGATCAGTGTGGTACAAGAGAAAGAGGTTAACAATCAAACCGATTATGGAG
TTGTTGGGGTACACCACGTTGGTCTGCTCTGCGAGAACTTAGAACGGTCGCTGGAGTTTT
ACCAGGACATTCTAGGCCTTGAGATAAACGAGGCAAGACCACATGATAAGCTTCCGTATA
AAGGAGCATGGTTATGGGTAGGCTCGGAGATGATTCATTTAATGGAGCTTCCAAATCCTG
ATCCATTAACAGGCAGACCCGAGCACGGAGGCCGGGATCGACACGCTTGTATCGCAATCC
GTGATGTTTCAATTCTTAAACAGATTTTGGACAAAGCTGGGATTGATTATACGATGAGTA
GGTCAGGGAGGCCAGCGATATTCACTCGTGATCCAGACGCAAACGCTCTTGAGTTTACTC
AAGTTTGATTCTTGAGTCTCTCTTCTTTATAGATATATAGTTGAAGATACTTAAATACTG
TTCAAGTCTCACCCTTCACATTTGTGTGTTTGGATCAGTTTCATTAAGCAT
AACACCTTATTTA

QA 3 713 3 713
DS 

RD RR2AA20JQ 728 0 0
GG
ACGCGATGGCGTCTATTTTCAGACCTTCAGTTTCACTTGATCTACGACCAAAGGTGACCT
GCACGAATCATGATCACTCGACGATAGAACGAATTGACTTTCAGAAGAACAAGAGTCTGA
GAAAAGAAAGGCTCAATGGTAGGTGGTCATGTGGCTTGAAGGCTAATCAAGCACAAGGGT
CAGCTGAAGGGATCAGTGTGGTACAAGAGAAAGAGGTTAACAATCAAACCGATTATGGAG
TTGTTGGGGTACACCACGTTGGTTTGCTTTGCGAGAACTTAGAACGGTCGCTGGAGTTTT
ACCAGGACATTTTAGGCCTTGAGATAAACGAGGCAAGACCACATGATAAGCTTCCGTATA
AAGGAGCATGGTTATGGGTAGGCTCGGAGATGATTCATTTAATGGAGCTTCCAAATCCTG
ATCCATTAACAGGCAGACCCGAGCACGGAGGCCGGGATCGACACGCTTGTATCGCAATCC
GTGATGTTTCAATTCTTAAACAGATTTTGGACAAAGCTGGGATTGATTATACGATGAGTA
GGTCAGGGAGGCCAGCGATATTCACTCGTGATCCAGACGCAAACGCTCTTGAGTTTACTC
AAGTTTGATTCTTGAGTCTCTCTTCTTTATAGATATATAGTTGAAGATACTTAAATACTG
TTCAAGTCTCACCCTTCACATTTGTGTGTTTGGATCAGTTTCATTAAGCATAACACCTTA
TTTAAG

QA 3 728 3 728
DS 



AS 1 7

CO CL821Contig1 715 7 4 U
GGGACATACAGTTGTTTCTTCCTGAATTCTCTAATCTCTTGATCAAATGGGGAGCGAGGA
AGTCGTGGTGGTTGGAGGGGAGAGAGCAGGAGCTGCGATCGTGTATGGAGCGGAGGAGTG
TTATAAGAAGTCGGTGGAGCTTCTAGAGGAGCTAGGGTTTCCAAAAGGTGTGATGCCTTT
GAAGAACCTCGTGGAGTGTGGAAGAGTTAGAGCCACGGGTTTCGTGTGGATGAAACAAAG
CACTCCTTACGAACATTTCTTCGAAGCCACCAACACTCGCGTTTCTTACGCTGTTGAGGT
CACCGCATATGTCGACAAGGGTTGTATGAAGAAGATGACAGGGGTGAAGAGTAAGCAGAT
GTTAATGTGGGTACCGATTGTGGAGATGACTTTGAAGGAGCCAAAGAGCGAGAAGATCTA
CTTCAAAACTCCGATGGGACTCGGCAAGGCTTATCATGTTACCTTATACATGGATGAGGA
AGAGAAACGCAACTTTTACTTGGAGAATCCCAAAAAA*TAAAACATTTTATTATGATAAA
TAAATTATATTTCCGGTTGCTTTTGATATGTTTCTGTTTTCACTCTTATCAGGTTGCTTT
CTATGCCATTACTAAAAAAATTATGTTGACAATTATGAAAAGAAGTAAAATTCGTTTTGT
GATGCAATGGTTATAATTTGTAATTGAAATCGATAAAGAAAAATAATTTCAGTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 
45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR2G260TF U 1
AF RR2FP94TF U 6
AF RR2F821TF U 3
AF RR2G260JQ C 355
AF RR2F821JQ C 256
AF RR2G533JQ C 46
AF RR2G533TF U 5
BS 1 361 RR2G260TF
BS 362 702 RR2F821TF
BS 703 703 RR2G533TF
BS 704 715 RR2F821TF

RD RR2G260TF 361 0 0
GGGACATACAGTTGTTTCTTCCTGAATTCTCTAATCTCTTGATCAAATGGGGAGCGAGGA
AGTCGTGGTGGTTGGAGGGGAGAGAGCAGGAGCTGCGATCGTGTATGGAGCGGAGGAGTG
TTATAAGAAGTCGGTGGAGCTTCTAGAGGAGCTAGGGTTTCCAAAAGGTGTGATGCCTTT
GAAGAACCTCGTGGAGTGTGGAAGAGTTAGAGCCACGGGTTTCGTGTGGATGAAACAAAG
CACTCCTTACGAACATTTCTTCGAAGCCACCAACACTCGCGTTTCTTACGCTGTTGAGGT
CACCGCATATGTCGACAAGGGTTGTATGAAGAAGATGACAGGGGTGAAGAGTAAGCAGAT
G

QA 1 361 1 361
DS 

RD RR2FP94TF 583 0 0
GG
ACAGTTGTTTCTTCCTGAATTCTCTAATCTCTTGATCAAATGGGGAGCGAGGAAGTCGTG
GTGGTTGGAGGGGAGAGAGCAGGAGCTGCGATCGTGTATGGAGCGGAGGAGTGTTATAAG
AAGTCGGTGGAGCTTCTAGAGGAGCTAGGGTTTCCAAAAGGTGTGATGCCTTTGAAGAAC
CTCGTGGAGTGTGGAAGAGTTAGAGCCACGGGTTTCGTGTGGATGAAACAAAGCACTCCT
TACGAACATTTCTTCGAAGCCACCAACACTCGCGTTTCTTACGCTGTTGAGGTCACCGCA
TATGTCGACAAGGGTTGTATGAAGAAGATGACAGGGGTGAAGAGTAAGCAGATGTTAATG
TGGGTACCGATTGTGGAGATGACTTTGAAGGAGCCAAAGAGCGAGAAGATCTACTTCAAA
ACTCCGATGGGACTCGGCAAGGCTTATCATGTTACCTTATACATGGATGAGGAAGAGAAA
CGCAACTTTTACTTGGAGAATCCCAAAAAAATAAAACATTTTATTATGATAAATAAATTA
TATTTCCGGTTGCTTTTGATATGTTTCTGTTTTCACTCTTA

QA 3 583 3 583
DS 

RD RR2F821TF 713 0 0
GGGAT
ACAGTTGTTTCTTCCTGAATTCTCTAATCTCTTGATCAAATGGGGAGCGAGGAAGTCGTG
GTGGTTGGAGGGGAGAGAGCAGGAGCTGCGATCGTGTATGGAGCGGAGGAGTGTTATAAG
AAGTCGGTGGAGCTTCTAGAGGAGCTAGGGTTTCCAAAAGGTGTGATGCCTTTGAAGAAC
CTCGTGGAGTGTGGAAGAGTTAGAGCCACGGGTTTCGTGTGGATGAAACAAAGCACTCCT
TACGAACATTTCTTCGAAGCCACCAACACTCGCGTTTCTTACGCTGTTGAGGTCACCGCA
TATGTCGACAAGGGTTGTATGAAGAAGATGACAGGGGTGAAGAGTAAGCAGATGTTAATG
TGGGTACCGATTGTGGAGATGACTTTGAAGGAGCCAAAGAGCGAGAAGATCTACTTCAAA
ACTCCGATGGGACTCGGCAAGGCTTATCATGTTACCTTATACATGGATGAGGAAGAGAAA
CGCAACTTTTACTTGGAGAATCCCAAAAAA*TAAAACATTTTATTATGATAAATAAATTA
TATTTCCGGTTGCTTTTGATATGTTTCTGTTTTCACTCTTATCAGGTTGCTTTCTATGCC
ATTACTAAAAAAATTATGTTGACAATTATGAAAAGAAGTAAAATTCGTTTTGTGATGCAA
TGGTTATAATTTGTAATTGAAATCGATAAAGAAAA*TAATTTCAGTTA

QA 6 713 6 713
DS 

RD RR2G260JQ 322 0 0
GCAGATGTTAATGTGGGTACCGATTGTGGAGATGACTTTGAAGGAGCCAAAGAGCGAGAA
GATTTACTTCAAAATTCCGATGGGACTTGGCAAGGCTTATCATGTTACCTTATACATGGA
TGAGGAAGAGAAACGCAACTTTTACTTGGGGAATCCCAAAAAA*TAAAACATTTTATTAT
GATAAATAAATTATATTTCCGGTTGCTTTTGACATGTTTCTGTTTTCACTCTTATCAGGT
TGCTTTTTATGCCATTACTAAAAAAATTATGTTGACAATTATGAAAAGAAGTAAAATTCG
TTTTGTGATGCAATGGTTATAA

QA 1 322 1 322
DS 

RD RR2F821JQ 459 0 0
TTTTTTT
GAAGCCACCAACACTCGCGTTTCTTACGCTGTTGAGGTCCCCGCATATGTCGACAAGGGT
TGTATGAAGAAGATGACAGGGGTGAAGAGTAAGCAGATGTTAATGTGGGTACCGATTGTG
GAGATGACTTTGAAGGAGCCAAAGAGCGAGAAGATTTACTTCAAAATTCCGATGGGACTC
GGCAAGGCTTATCATGTTACCTTATACATGGATGAGGAAGAGAAACGCAACTTTTACTTG
GAGAATCCCAAAAAA*TAAAACATTTTTTTATGATAAATAAATTATATTTCCGGTTGCTT
TTGATATGTTTTTGTTTTCACTTTTATCAGGTTGCTTTTTATGCCATTACTAAAAAAATT
ATGTTGGCAATTATGAAAAGAAGTAAAATTCGTTTTGTGATGCAATGGTTATAATTTGTA
ATTGAAATCGATAAAGAAAAATAATTTCAGTT

QA 8 459 8 459
DS 

RD RR2G533JQ 669 0 0
AATGGGGAGCGAGGAAGTCGTGGTGGTTGGAGGGGAGAGAGCAGGAGCTGCGATCGTGTA
TGGAGCGGAGGAGTGTTATAAGAAGTCGGTGGAGCTTCTAGAGGAGCTAGGGTTTCCAAA
AGGTGTGATGCCTTTGAAGAACCTCGTGGAGTGTGGAAGAGTTAGAGCCACGGGTTTCGT
GTGGATGAAACAAAGCACTCCTTACGAACATTTCTTCGAAGCCACCAACACTCGCGTTTC
TTACGCTGTTGAGGTCACCGCATATGTCGACAAGGGTTGTATGAAGAAGATGACAGGGGT
GAAGAGTAAGCAGATGTTAATGTGGGTACCGATTGTGGAGATGACTTTGAAGGAGCCAAA
GAGCGAGAAGATCTACTTCAAAACTCCGATGGGACTCGGCAAGGCTTATCATGTTACCTT
ATACATGGATGAGGAAGAGAAACGCAACTTTTACTTGGAGAATCCCAAAAAA*TAAAACA
TTTTATTATGATAAATAAATTATATTTCCGGTTGCTTTTGATATGTTTCTGTTTCCACTC
TTATCAGGTTGCTTTCTATGCCATTACTAAAAAAATTATGTTGACAATTATGAAAAGAAG
TAAAATTCGTTTTGTGATGCAATGGTTATAATTTGTAATTGAAATCGATAAAGAAAAATA
ATTTCAGTT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2G533TF 710 0 0
GAT
ACAGTTGTTTCTTCCTGAATTCTCTAATCTCTTGATCAAATGGGGAGCGAGGAAGTCGTG
GTGGTTGGAGGGGAGAGAGCAGGAGCTGCGATCGTGTATGGAGCGGAGGAGTGTTATAAG
AAGTCGGTGGAGCTTCTAGAGGAGCTAGGGTTTCCAAAAGGTGTGATGCCTTTGAAGAAC
CTCGTGGAGTGTGGAAGAGTTAGAGCCACGGGTTTCGTGTGGATGAAACAAAGCACTCCT
TACGAACATTTCTTCGAAGCCACCAACACTCGCGTTTCTTACGCTGTTGAGGTCACCGCA
TATGTCGACAAGGGTTGTATGAAGAAGATGACAGGGGTGAAGAGTAAGCAGATGTTAATG
TGGGTACCGATTGTGGAGATGACTTTGAAGGAGCCAAAGAGCGAGAAGATCTACTTCAAA
ACTCCGATGGGACTCGGCAAGGCTTATCATGTTACCTTATACATGGATGAGGAAGAGAAA
CGCAACTTTTACTTGGAGAATCCCAAAAAA*TAAAACATTTTATTATGATAAATAAATTA
TATTTCCGGTTGCTTTTGATATGTTTCTGTTTCCACTCTTATCAGGTTGCTTTCTATGCC
ATTACTAAAAAAATTATGTTGACAATTATGAAAAGAAGTAAAATTCGTTTTGTGATGCAA
TGGTTATAATTTGTAATTGAAATCGATAAAGAAAAATAATTTCAGTT

QA 4 710 4 710
DS 



AS 1 8

CO CL822Contig1 860 8 13 U
GGATCACATCCAGTACCAGTTACAACACAGAAAATAAATTACTCATCTCTGCTCTATAGT
TTGATATACATTTGTCTTTTGTAATCCTAAAAACATGGCAATCCTCAGGAACAAAAACAT
AACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCATTGTGGTGTCTCCAATTGCTAATGCTCAGCT
TGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTATTTTTAA
TATCCAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGTCACTTC
CGTTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAATGTTTC
AAGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTATCTTTTC
TCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCACCAGCTG
CAACGCCAGCCTCCCTGCCGGTGGATTACTCACGGCACCTTTAGCTCTACTCGGAGCCAC
TTCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCGTCCCAAA
TCCCTTTGGCCTCGTCGGTTAAGTATGCTTTATATTTGATCACGTACGGTGTGTTTCCCT
TCTGTTTGTTTTACGTTTTGTGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGCATGAAT
AAGGTCTACATAATAATTAAGGCGTATGTCTTTATCTTTCAAAGTATTGTTGTTGTAACT
TCCTTTTACCCACGTTTAATTTGCATTTGTAATGCTGTAACGAAATGTGATAAAATAATA
TGAAAAGAACTTCCTTGTCT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 0 45 45 0 0 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 
30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E170TF U 1
AF RR2BL92TF U 1
AF RR2EE38TF U 1
AF RR2CM18TF U 9
AF RR2FA33TF U 2
AF RR2A106TF U 27
AF RR2CM18JQ C 283
AF RR2E170JQ C 115
BS 1 152 RR2BL92TF
BS 153 153 RR2E170TF
BS 154 492 RR2BL92TF
BS 493 493 RR2EE38TF
BS 494 607 RR2BL92TF
BS 608 608 RR2EE38TF
BS 609 639 RR2BL92TF
BS 640 718 RR2EE38TF
BS 719 721 RR2FA33TF
BS 722 722 RR2A106TF
BS 723 723 RR2E170JQ
BS 724 736 RR2FA33TF
BS 737 860 RR2E170JQ

RD RR2E170TF 599 0 0
G
GATCACATCCAGTACCAGTTACAACACAGAAAATAAATTACTCATCTCTGCTCTATAGTT
TGATATACATTTGTCTTTTGTAATCCTAAAAACATGGCAATCCTCAGGAACAAAAACATA
ACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCATTGTGGTGTCTCCAATTGCTAATGCTCAGCTT
GGTGG***TCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTATTTTTAAT
ATCCAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGTCACTTCC
GTTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAATGTTTCA
AGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTATCTTTTCT
CCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACTACCCCTCTCACCAGCTGC
AACGCCAGCCTTCCTGCCGGTGGATTACCCACGGCACCTTTAGCTCTACTCGGAGCCACT
TCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCGTCCCAA

QA 2 599 2 599
DS 

RD RR2BL92TF 639 0 0
GGATCACATCCAGTACCAGTTACAACACAGAAAATAAATTACTCATCTCTGCTCTATAGT
TTGATATACATTTGTCTTTTGTAATCCTAAAAACATGGCAATCCTCAGGAACAAAAACAT
AACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCATTGCGGTGTCTCCAATTGCTAATGCTCAGCT
TGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTATTTTTAA
TATCCAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGTCACTTC
CGTTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAATGTTTC
AAGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTATCTTTTC
TCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCACCAGCTG
CAACGCCAGCCTTCCTGCCGGTGGATTACTCACGGCACCTTTAGCTCTACTCGGAGCCAC
TTCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCGTCCCAAA
TCCCTTTTGCCTCGTCGGTTAAGTATGCTTTATATTTGA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2EE38TF 731 0 0
G
GATCACATCCAGTACCAGTTACAACACAGAAAATAAATTACTCATCTCTGCTCTATAGTT
TGATATACATTTGTCTTTTGTAATCCTAAAAACATGGCAATCCTCAGGAACAAAAACATA
ACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCATTGTGGTGTCTCCAATTGCTAATGCTCAGCTT
GGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTATTTTTAAT
ATCCAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGTCACTTCC
GTTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAATGTTTCA
AGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTATCTTTTCT
CCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCACCAGCTGC
AACGCCAGCCTCCCTGCCGGTGGATTACTCACGGCACCTTTAGCTCTACTCGGAGCCACT
TCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCGTCCCAAAT
CCCTTTGGCCTCGTCGGTTAAGTATGCTTTATATTTGATCACGTACGGTGTGTTTCCCTT
CTGTTTGTTTTACGTTTTGTGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGCATGA
TAAGTCTACATAA

QA 2 718 2 718
DS 

RD RR2CM18TF 711 0 0
TCCAGTACCAGTT*CAACACAGAAAATAAATTACTCATCTCTGCTCTATAGTTTGATATA
CATTTGTCTTTTGTAATCCTAAAAACGTGGCAATCCTCAGGAACAAAAACATAACTTTCT
CATTGATCTTGATGTGTCTCATTGTGGTGTCTCCAATTGCTAATGCTCAGCTTGGCGGGC
TTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTATTTTTAATATCCAAG
GTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGTCACTTCCGTTCCTC
CCCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAATGTTTCAAGTACGA
CTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTATCTTTTCTCCTTCAA
CACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCACCAGCTGCAACGCCA
GCCTCCCTGCCGGTGGATTACTCACGGCACCTTTAGCTCTACTCGGAGCCACTTCCAGCA
ACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCGTCCCAAATCCCTTTG
GCCTCGTCGGTTAAGTATGCTTTATATTTGATCACGTACG*TGTGTTTCCCCTCTGTTTG
TTTTACGTTTTGTGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGCATGAA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2FA33TF 737 0 0
GATCACATCCAGTACCAGTTACAACACAGAAAATAAATTACTCATCTCTGCTCTATAGTT
TGATATACATTTGTCTTTTGTAATCCTAAAAACATGGCAATCCTCAGGAACAAAAACATA
ACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCATTGTGGTGTCTCCAATTGCTAATGCTCAGCTT
GGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTATTTTTAAT
ATCCAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGTCACTTCC
GTTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAATGTTTCA
AGCACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTATCTTTTCT
CCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCACCAGCTGC
AACGCCAGCCTCCCTGCCGGTGGATTACTCACGGCACCTTTAGCTCTACTCGGAGCCACT
TCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCGTCCCAAAT
CCCTTTGGCCTCGTCGGTTAAGTATGCTTTATATTTGATCACGTACGGTGTGTTTCCCTT
CTGTTTGTTTTACGTTTTGTGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGCATGAATA
G*GTCTACATAATAA
TT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2A106TF 710 0 0
ACAGAAAATAAAT*ACTCATCTCTGCTCTATAGTTTGATATACATTTGTCTTTTGTAATC
CTAAAAACATGGCAATCCTCAGGAACAAAAACATAACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTC
TCATTGTGGTGTCTCCAATTGCTAATGCTCAGCTTGGTGG***TCTTGGCGGGCTTCTTG
GCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTATTTTTAATATCCAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTG
TCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGTCACTTCCGTTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGG
GAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAATGTTTCAAGTACGACTACGAACGCTAATGGAG
TATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTATCTTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTT
GTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCACCAGCTGCAACGCCAGCCTTCCTGCCGGTGGAT
TACTCACGGCACCTTTAGCTCTACTCGGAGCCACTTCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCG
ACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCGTCCCAAATCCCTTTGGCCTCGTCGGTTAAGTAT
GCTTTATGTTTGATCACGTACGGTGTGTTTCCCTTCTGTTTGTTTTACGTTTTGTGTCAT
GACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGCATGAATAACGTCTACATAATAA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2CM18JQ 483 0 0
TACCAATAACGTCACTTCCGTTCCTCCCCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTG
CGCTGGGCAAAATGTTTCAAGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTAC
TATGGGCACTATCTTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCAC
GACCCCTCTCACCAGCTGCAACGCCAGCCTCCCTGCCGGTGGATTACTCACGGCACCTTT
AGCTCTACTCGGAGCCACTTCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCT
CTTTAGCGTCGTCCCAAATCCCTTTGGCCTCGTCGGTTAAGTATGCTTTATATTTGATCA
CGTACGGTGTGTTTCCCCTCTGTTTGTTTTACGTTTTGTGTCATGACCAATAATGTTTGC
TTGCCTATGCGCATGAATAAGGTCTACATAATAATTAAGGCGTATGTCTTTATCTTTCAA
AGT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR2E170JQ 746 0 0
AAACATAACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCATTGTGGTGTCTCCAATTGCTAATGC
TCAGCTTGGTGG***TCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTAT
TTTTAATATCCAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGT
CACTTCCGTTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAA
TGTTTCAAGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTAT
CTTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACTACCCCTCTCAC
CAGCTGCAACGCCAGCCTTCCTGCCGGTGGATTACCCACGGCACCTTTAGCTCTACTCGG
AGCCACTTCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCGT
CCCAAATCCCTTTGGCCTCGTCGGTTAAGTATGCTTTATGTTTGATCACGTACGGTGTGT
TTCCCTTCTGTTTGTTTTACGTTTTGTGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGC
ATGAATAAGGTCTACATAATAATTAAGGCGTATGTCTTTATCTTTCAAAGTATTGTTGTT
GTAACTTCCTTTTACCCACGTTTAATTTGCATTTGTAATGCTGTAACGAAATGTGATAAA
ATAATATGAAAAGAACTTCCTTGTCT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 7

CO CL823Contig1 1324 7 14 U
GCACAAAATTCCAGATGTTATCCATATTTCAACTTATAATAAATTGCACAATATCCAAAA
TACAAGAGAAGAGAAACTTATTATTGGTTTTATCACATGCCATATATCAAACCTTATCCA
GCTGGATCTCTTAAATTATTGAACACAAGGATAAACAAACTTAACATAGTTTCTCAAGCA
GATTTATTTGAACTGACATTAACAACCTTCGTATCTTTGATTAGTTGTCTTGGGGCTCTG
AGTCATCCGCCGATTTCACTGACTTGGACACGTATGTAACCGGTTTTTTTT*GGTTCTCA
TTTACTGTCAAGTTAAATATCTCTGGCCTTGAGTAATGTCCGACCACATCGAAGTATAAC
TTGGCACGTGCGATGTCACCAAGATCAAGATCAGCAGTGATGAGACCCTCTGATTCAAAG
TTTGGTCCGGCGAGTATCTTTCCCAATGGTGAAATAATGACACTACCGCCCTGGGAGACA
ATAGTGTCTTGGTGTTCACCGTCGTACATGCCGCTGCTTGGGTCGGTGAACAAGTAATCA
GCATGGTCAGGGAAATCTTTACGCAGAGAGAACTGGCAAGCCGACAAAACGAAGCATCCA
CCCTCAATTGCAATGTGCATCATAGACGATTGCCAATTCTTGGTACCGTCAGCAGTAGGT
GCACAGTATAATTCAATTCCTTTCCCGTACAAGGCAGTTCTGAAGAGAGGCATCCTGTTT
TCC*AGCAGATAGCAGCACCGAGTTTGCCAAGGGGGGTGTCGTAGACAGGGATGGTTGAT
CCATCCCCGCAACCCCATATGCAACGTTCCAGAGATGTGGGCATGACTTTACGGTGCTTG
CCCAAGAAGCGACCTTCGGAACTGAAAAAAAGGGCTGTGCAGTAGAGTGTATACCCATCC
TTCTCTATCGCTCCCATCACCAGGTACACTTTGTGTTTCCTTGCCATCTCCGCCAGCTTG
TCTACCTCAGGGCCGGGAACCGCGATGGCAGAAGCATGATATTTGCGGAAAGAGTCACCA
CCATCTTCGTTATGAACACCAACCGCTATGCCAAACCTATATCCACGAGGATAGCCACCG
ATATACCCCTCGGGGAACAGCACCAGCTGCGCTCCATCACTGGCCGCCTCTGCAATAAAC
TTCTCTGCCTTTTCTATAGTTTTGGGAGTATCGTTGTAGACGATGGAGACCTGGACGATG
GTAGCTCGAACGATGGTAGATGGCATGTCGCGAAAAGTAGGAGCAGTGCCTTTGAGAGCT
TTTGACATATCTTCAGTACTAGACATATTTACTTGACTTCTGTTACCTCGTAGGTTGGTG
ATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2DJ54JQ U 1
AF RR2E079JQ U 92
AF RR2DS48JQ U 77
AF RR2GG10JQB U 108
AF RR2DS48TF C 586
AF RR2GG10TF C 607
AF RR2E079TF C 801
BS 1 527 RR2DJ54JQ
BS 528 528 RR2DS48JQ
BS 529 590 RR2DJ54JQ
BS 591 689 RR2DS48JQ
BS 690 829 RR2GG10JQB
BS 830 887 RR2DS48TF
BS 888 888 RR2GG10TF
BS 889 1175 RR2DS48TF
BS 1176 1231 RR2GG10TF
BS 1232 1232 RR2E079TF
BS 1233 1243 RR2GG10TF
BS 1244 1244 RR2E079TF
BS 1245 1277 RR2GG10TF
BS 1278 1324 RR2E079TF

RD RR2DJ54JQ 590 0 0
GCACAAAATTCCAGATGTTATCCATATTTCAACTTATAATAAATTGCACAATATCCAAAA
TACAAGAGAAGAGAAACTTATTATTGGTTTTATCACATGCCATATATCAAACCTTATCCA
GCTGGATCTCTTAAATTATTGAACACAAGGATAAACAAACTTAACATAGTTTCTCAAGCA
GATTTATTTGAACTGACATTAACAACCTTCGTATCTTTGATTAGTTGTCTTGGGGCTCTG
AGTCATCCGCCGATTTCACTGACTTGGACACGTATGTAACCGGTTTTTTTT*GGTTCTCA
TTTACTGTCAAGTTAAATATCTCTGGCCTTGAGTAATGTCCGACCACATCGAAGTATAAC
TTGGCACGTGCGATGTCACCAAGATCAAGATCAGCAGTGATGAGACCCTCTGATTCAAAG
TTTGGTCCGGCGAGTATCTTTCCCAATGGTGAAATAATGACACTACCGCCCTGGGAGACA
ATAGTGTCTTGGTGTTCACCGTCGTACATGCCGCTGCTTGGGTCGGTAAACAAGTAATCA
GCATGGTCAGGGAAATCTTTACGCAGAGAGAACTGGCAAGCCGACAAAAC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2E079JQ 473 0 0
ATCACATGCCATATATCAAACCTTATCCAGCTGGATCTCTTAAATTATTGAACACAAGGA
TAAACAAACTTAACATAGTTTCTCAAGCAGATTTATTTGAACTGACATTAACAACCTTCG
TATCTTTGATTAGTTGTCTTGGGGCTCTGAGTCATCCGCCGATTTCACTGACTTGGACAC
GTATGTAACCGGTTTTTTTT*GGTTCTCATTTACTGTCAAGTTAAATATCTCTGGCCTTG
AGTAATGTCCGACCACATCGAAGTATAACTTGGCACGTGCGATGTCACCAAGATCAAGAT
CAGCAGTGATGAGACCCTCTGATTCAAAGTTTGGTCCGGCGAGTATCTTTCCCAATGGTG
AAATAATGACACTACCGCCCTGGGAGACAATAGTGTCTTGGTGTTCACCGTCGTACATGC
CGCTGCTTGGGTCGGTGAACAAGTAATCAGCATGGTCAGGGAAATCTTTACGC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2DS48JQ 613 0 0
CTTATTATTGGTTTTATCACATGCCATATATCAAACCTTATCCAGCTGGATCTCTTAAAT
TATTGAACACAAGGATAAACAAACTTAACATAGTTTCTCAAGCAGATTTATTTGAACTGA
CATTAACAACCTTCGTATCTTTGATTAGTTGTCTTGGGGCTCTGAGTCATCCGCCGATTT
CACTGACTTGGACACGTATGTAACCGGTTTTTTTT*GGTTCTCATTTACTGTCAAGTTAA
ATATCTCTGGCCTTGAGTAATGTCCGACCACATCGAAGTATAACTTGGCACGTGCGATGT
CACCAAGATCAAGATCAGCAGTGATGAGACCCTCTGATTCAAAGTTTGGTCCGGCGAGTA
TCTTTCCCAATGGTGAAATAATGACACTACCGCCCTGGGAGACAATAGTGTCTTGGTGTT
CACCGTCGTACATGCCGCTGCTTGGGTCGGTGAACAAGTAATCAGCATGGTCAGGGAAAT
CTTTACGCAGAGAGAACTGGCAAGCCGACAAAACGAAGCATCCACCCTCAATTGCAATGT
GCATCATAGACGATTGCCAATTCTTGGTACCGTCAGCAGTAGGTGCACAGTATAATTCAA
TTCCTTTCCCGTA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2GG10JQB 722 0 0
CAAACCTTATCCAGCTGGATCTCTTAAATTATTGAACACAAGGATAAACAAACTTAACAT
AGTTTCTCAAGCAAATTTATTTGGACTGACATTAACAACCTTCGTATCTTTGATTAGTTG
TCTTGGGGCTCTGAGTCATCCGCCGATTTCACTGACTTGGACACGTATGTAACCGGTTTT
TTTTTGGTTCTCATTTACTGTCAAGTTAAATATCTCTGGCCTTGAGTAATGTCCGACCAC
ATCGAAGTATAACCTGGCACGTGCGATGTCACCAAGATCAAGATCAGCAGTGATGAAACC
CTCTGATTCAAAGTTTGGTCCGGCGAGTATCTTTCCCAATGGTGAAATAATGACACTACC
GCCCTGGGAGACAATAGTGTCTTGGTGTTCACCGTCGTACATGCCGCTGCTTGGGTCGGT
GAACAAGTAATCAGCATGGTCAGGGAAATCTTTACGCAAAGAGAACTGGCAAGCCGACAA
AACGAAGCATCCACCCTCAATTGCAATGTGCATCATAGACGATTGCCAATTCTTGGTACC
GTCAGCAGTAGGTGCACAGTATAATTCAATTCCTTTCCCGTACAAGGCAGTTCTGAAGAG
AGGCATCCTGTTTTCC*AGCAGATAGCAGCACCGAGTTTGCCAAGGGGGGTGTCGTAGAC
AGGGATGGTTGATCCATCCCCGCAACCCCATATGCAACGTTCCAGAGATGTGGGCATGAC
TT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2DS48TF 591 0 0
AAAACGAAGCATCCACCCTCAATTGCAATGTGCATCATAGACGATTGCCAATTCTTGGTA
CCGTCAGCAGTAGGTGCACAGTATAATTCAATTCCTTTCCCGTACAAGGCAGTTCTGAAG
AGAGGCATCCTGTTTTCCCAGCAGATAGCAGCACCGAGTTTGCCAAGGGGGGTGTCGTAG
ACAGGGATGGTTGATCCATCCCCGCAACCCCATATGCAACGTTCCAGAGATGAGGGCATG
ACTTTACGGTGCTTGCCCAAGAAGCGACCTTCGGAACTGAAAAAAAGGGCTGTGCAGTAG
AGCGTATACCCATCCTTCTCTATCGCTCCCATCACCAGGTACACTTTGTGTTTCCTTGCC
ATCTCCGCCAGCTTGTCTACCTCAGGGCCGGGAACCGCGATGGCAGAAGCATGATATTTG
CGGAAAGAGTCACCACCATCTTCGTTATGAACACCAACCGCTATGCCAAACCTATATCCA
CGAGGATAGCCACCGATATACCCCTCGGGGAACAGCACCAGCTGCGCTCCATCACTGGCC
GCCTCTGCAATAAACTTCTCTGCCTTTTCTATAGTTTTGGGAGTATCGTT
C

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2GG10TF 673 0 0
ATTGCAATGTGCATCATAGACGATTGCCAATTCTTGGTACCGTCAGCAGTAGGTGCACAG
TATAATTCAATTCCTTTCCCGTACAAGGCAGTTCTGAAGAGAGGCATCCTGTTTTCC*AG
CAGATAGCAGCACCGAGTTTGCCAAGGGGGGTGTCGTAGACAGGGATGGTTGATCCATCC
CCGCAACCCCATATGCAACGTTCCAGAGATGTGGGCATGACTTTACGGTGCTTGCCCAAG
AAGCGACCTTCGGAACTGAAAAAAAGGGCTGTGCAGTAGAGTGTATACCCATCCTTCTCT
ATCGCTCCCATCACCAGGTACACTTTGTGTTTCCTTGCCATCTCCGCCAGCTTGTCTACC
TCAGGGCCGGGAACCGCAATGGCAGAAGCATGATATTTGCGGAAAGAGCCACCACCATCT
TCGTTATGAACACCAACCGCTATGCCAAACCTATATCCACGAGGATAGCCACCGATATAC
CCCTCGGGGAACAGCACCAGCTGCGCTCCATCACTGGCCGCCTCTGCAATAAACTTCTCT
GCCTTTTCTATAGTTTTGGGAGTATCGTTGTAGACGATGGAGACCTGGACGATGGTAGCT
CGAACGATGGTAGATGGCATGTCGCTAAAAGTAGGAGTAGTGCCTTTGAGAGCTTTTGAC
ATATCTTCAGT
CC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2E079TF 524 0 0
GCAACGTTCCAGAGATGTGGGCATGACTTTACGGTGCTTGCCCAAGAAGCGACCTTCGGA
ACTGAAGAAAAGGGCTGTGCAGTAGAGTGTATACCCATCCTTCTCTATCGCTCCCATCAC
CAGGTAGACTTTGTGTTTCCTTGCCATCTCCGCCAGCTTGTCTACTTCAGGGCCGGGAAC
CGCGATGGCAGAAGCATGATATTTGCGGAAAGAGTCACCACCATCTTCGTTATGAACACC
AACCGCTATGCCAAACCTATATCCACGAGGATAGCCACCGATATACCCCTCGGGGAACAG
CACCAGCTGCGCTCCATCACTGGCCGCCTCTGCAATATACTTCTCTGCCTTTTCTATAGT
TTTGGGAGTATCGTTGTAGACGGTGGAGGCCTGGACGATGGTAGCTCGAACGATGGTAGA
TGGCATGTCGCGAAAAGTAGGAGCAGTGCCTTTGAGAGCTTTTGACATATCTTCAGTACT
AGACATATTTACTTGACTTCTGTTACCTCGTAGGTTGGTGATCC

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 5

CO CL824Contig1 1387 5 11 U
GCATTACTTACCTATTCACAGAGATGCTCCTGCTTTGGTTGATCTAGCCACTGGGCAAGA
GATCCTTGCTACGGGTATTAAGGTTGTTGATCTGCTTGCTCCTTACCAAAGAGGAGGAAA
GATTGGGCTCTTTGGTGGTGCTGGTGTCGGGAAAACGGTGCTCATTATGGAACTGATTAA
CAATGTCGCCAAAGCTCATGGTGGTTTCTCTGTGTTTGCTGGTGTGGGAGAACGAACCCG
TGAAGGCAATGACCTGTACGGAGAAATGATTGAGAGTGGTGTCATCAAGCTAGGCGAGAA
CCAGTCTGAGAGCAAATGTGCTCTTGTGTACGGACAAATGAACGAGCCCCCGGGTGCCCG
TGCCCGTGTTGGACTTACTGGTTTGACCGTTGCTGAGTACTTCCGTGATGCCGAAGGCCA
AGATGTGTTGCTCTTCATTGATAACATTTTCCGTTTCACTCAGGCCAACTCTGAAGTGTC
TGCTTTGCTCGGACGTATCCCATCTGCTGTGGGTTACCAGCCAACTCTGGCTTCTGATCT
TGGTGCTCTTCAAGAGCGAATCACAACCACCAAGAAAGGTTCCATCACATCAGTCCAAGC
CATCTATGTCCCTGCTGACGATCTGACAGATCCTGCTCCAGCCACAACTTTCGCTCACTT
GGATGCCACAACTGTGCTCTCGAGACAGATTTCTGAGCTTGGTATCTATCCTGCTGTGGA
TCCTCTGGATTCAACATCCCGTATGCTGTCGCCTCACATTCTGGGAGAGGAGCACTACAA
CACGGCTCGTGGTGTGCAGAAAGTGCTTCAGAACTACAAGAATCTGCAAGATATTATTGC
CATTCTGGGTATGGATGAGCTAAGTGAAGATGACAAGCTTACCGTTGCTCGTGCCCGTAA
GATCCAGAGATTCTTGAGTCAGCCATTCCACGTTGCTGAGATCTTCACTGGTGCCCCCGG
AAAATACGTCGACCTGAAGGAAAACATCAACAGTTTCCAGGGTTTACTCGATGGCAAGTA
CGATGATCTTCCTGAACAATCATTTTACATGGTTGGTGGAATCGACGAGGTGGTTGCCAA
GGCAGAGAAGATCTCCAAGGAGGCAGCAGCTTAAGGGGATGCTTCATACTTCTCTTTTTC
TTGTTTTCTTGACAATAACGAGAAAAAAAAAACAAAAGCTTTAGGCAATGCTGCTAAATG
CATTGCGATTCCCATCATTTGTGAGTGTGAGAGCTGCGAGAGATCATGCTGAACATATTC
ACACTCACTGTTACTCAAATTTTTGGTTCTTTTTGCATCCTTTACTTGTTGAAATAAAAG
TTTTAAGACTCGCAGACTCTAAACTGCAATGTATTATTATTTCTATTTATTGAGATCTCT
TTCTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B739TF U 1
AF RR2B554TF U 360
AF RR2B739JQ C 454
AF RR2H419TF U 862
AF RR2H419JQB C 944
BS 1 363 RR2B739TF
BS 364 364 RR2B554TF
BS 365 387 RR2B739TF
BS 388 388 RR2B554TF
BS 389 399 RR2B739TF
BS 400 400 RR2B554TF
BS 401 807 RR2B739TF
BS 808 1004 RR2B554TF
BS 1005 1005 RR2H419TF
BS 1006 1096 RR2B554TF
BS 1097 1387 RR2H419TF

RD RR2B739TF 809 0 0
GCATTACTTACCTATTCACAGAGATGCTCCTGCTTTGGTTGATCTAGCCACTGGGCAAGA
GATCCTTGCTACGGGTATTAAGGTTGTTGATCTGCTTGCTCCTTACCAAAGAGGAGGAAA
GATTGGGCTCTTTGGTGGTGCTGGTGTCGGGAAAACGGTGCTCATTATGGAACTGATTAA
CAATGTCGCCAAAGCTCATGGTGGTTTCTCTGTGTTTGCTGGTGTGGGAGAACGAACCCG
TGAAGGCAATGACCTGTACGGAGAAATGATTGAGAGTGGTGTCATCAAGCTAGGCGAGAA
CCAGTCTGAGAGCAAATGTGCTCTTGTGTACGGACAAATGAACGAGCCCCCGGGTGCCCG
TGCTCGTGTTGGACTTACTGGTTTGACTGTTGCTGAGTATTTCCGTGATGCCGAAGGCCA
AGATGTGTTGCTCTTCATTGATAACATTTTCCGTTTCACTCAGGCCAACTCTGAAGTGTC
TGCTTTGCTCGGACGTATCCCATCTGCTGTGGGTTACCAGCCAACTCTGGCTTCTGATCT
TGGTGCTCTTCAAGAGCGAATCACAACCACCAAGAAAGGTTCCATCACATCAGTCCAAGC
CATCTATGTCCCTGCTGACGATCTGACAGATCCTGCTCCAGCCACAACTTTCGCTCACTT
GGATGCCACAACTGTGCTCTCGAGACAGATTTCTGAGCTTGGTATCTATCCTGCTGTGGA
TCCTCTGGATTCAACATCCCGTATGCTGTCGCCTCACATTCTGGGAGAGGAGCACTACAA
CACGGCTCGTGGTGTGCAGAAAGTGCT
TC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2B554TF 737 0 0
GTGCCCGTGTTGGACTTACTGGTTTGACCGTTGCTGAGTACTTCCGTGATGCCGAAGGTC
AAGATGTGTTGCTGTTCATTGATAACATTTTCCGTTTCACTCAGGCCAACTCTGAAGTGT
CTGCTTTGCTCGGACGTATCCCATCTGCTGTGGGTTACCAGCCAACTCTTGCTTCCGATC
TTGGTGCTCTTCAAGAGAGAATCACAACCACCAAGAAAGGTTCCATCACATCAGTCCAAG
CCATCTATGTTCCTGCTGATGATTTGACAGATCCTGCTCCAGCCACAACATTTGCTCACT
TGGATGCCACAACTGTGCTCTCGAGACAGATTTCTGAACTTGGTATCTATCCTGCTGTGG
ATCCTCTGGATTCGACATCTCGTATGCTGTCGCCTCACATTCTTGGAGAGGAGCACTACA
ACACGGCTCGTGGTGTGCAGAAAGTGCTTCAGAACTACAAGAATCTGCAAGATATTATTG
CCATTCTGGGTATGGATGAGCTAAGTGAAGATGACAAGCTTACCGTTGCTCGTGCCCGTA
AGATCCAGAGATTCTTGAGTCAGCCATTCCACGTTGCTGAGATCTTCACTGGTGCCCCCG
GAAAATACGTCGACCTGAAGGAAAACATCAACAGTTTCCAGGGTTCACTCGATGGCAAGT
ACGATGATCTTCCTGAACAATCATTTTACATGGTTGGTGGAATCGACGAGGTGGTTGCCA
AGGCAGAGAAGATCTCC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2B739JQ 915 0 0
TTTCACTCAGGCCAACTCTGAAGTGTCTGCTTTGCTCGGACGTATCCCATCTGCTGTGGG
TTACCAGCCAACTCTGGCTTCTGATCTTGGTGCTCTTCAAGAGCGAATCACAACCACCAA
GAAAGGTTCCATCACATCAGTCCAAGCCATCTATGTCCCTGCTGACGATCTGACAGATCC
TGCTCCAGCCACAACTTTCGCTCACTTGGATGCCACAACTGTGCTCTCGAGACAGATTTC
TGAGCTTGGTATCTATCCTGCTGTGGATCCTCTGGATTCAACATCCCGTATGCTGTCGCC
TCACATTCTGGGAGAGGAGCACTACAACACGGCTCGTGGTGTGCAGAAAGTGCTTCAGAA
CTACAAGAATCTGCAAGATATTATTGCCATTCTGGGTATGGATGAGCTAAGTGAAGATGA
CAAGCTTACTGTTGCTCGTGCCCGTAAGATCCAGAGATTCTTGAGTCAGCCATTCCATGT
TGCTGAGATCTTCACTGGTGCCCCCGGAAAATACGTCGACCTGAAGGAAAACATCAACAG
TTTCCAGGGTTTGCTCGATGGTAAGTACGATGATCTTCCTGAACAATCATTTTACATGGT
TGGTGGCATCGACGAGGTGGTTGCCAAGGCAGAGAAGATCTCCAAGGAGGCAGCAGCTTA
AGGGGATGCTTCATACTTCTCTTTTTCTTGTTTTATTGACAATAACGA***AAAAAAAAC
AAAAGCTTTAGGCAGTGCTGCTAAATGCATTGTGATTCCCATCATTTGTGAGTGTGAGAG
CTGCGAGAGATCATGCTGAACATATTCA**CTCACTGTTACTCAAATTTTTGGTTCTTTT
TGCATCCTTTACTTGTTGAAATAAAAGTTTTAAGACTTGCAGACTCTTAACTGCAATGTA
TTATTATTTCGATTT

QA 1 915 1 915
DS 

RD RR2H419TF 526 0 0
AAGTGAAGATGACAAGCTTACCGTTGCTCGTGCCCGTAAGATCCAGAGATTCTTGAGTCA
GCCATTCCACGTTGCTGAGATCTTCACTGGTGCCCCCGGAAAATACGTCGACCTGAAGGA
AAACATCAACAGTTTCCAGGGTTTACTCGATGGCAAGTACGATGATCTTCCTGAACAATC
ATTTTACATGGTTGGTGGAATCGACGAGGTGGTTGCCAAGGCAGAGAAGATCTCCAAGGA
GGCAGCAGCTTAAGGGGATGCTTCATACTTCTCTTTTTCTTGTTTTCTTGACAATAACGA
GAAAAAAAAAACAAAAGCTTTAGGCAATGCTGCTAAATGCATTGCGATTCCCATCATTTG
TGAGTGTGAGAGCTGCGAGAGATCATGCTGAACATATTCACACTCACTGTTACTCAAATT
TTTGGTTCTTTTTGCATCCTTTACTTGTTGAAATAAAAGTTTTAAGACTCGCAGACTCTA
AACTGCAATGTATTATTATTTCTATTTATTGAGATCTCTTTCTCCG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2H419JQB 444 0 0
TTCACTGGTGCCCCCGGAAAATACGTCGACCTGAAGGAAAACATCAACAGTTTCCAGGGT
TTACTCGATGGCAAGTACGATGATCTTCCTGAACAATCATTTTACATGGTTGGTGGAATC
GACGAGGTGGTTGCCAAGGCAGAGAAGATCTCCAAGGAGGCAGCAGCTTAAGGGGATGCT
TCATACTTCTCTTTTTCTTGTTTTCTTGACAATAACGAGAAAAAAAAAACAAAAGCTTTA
GGCAATGCTGCTAAATGCATTGCGATTCCCATCATTTGTGAGTGTGAGAGCTGCGAGAGA
TCATGCTGAACATATTCACACTCACTGTTACTCAAATTTTTGGTTCTTTTTGCATCCTTT
ACTTGTTGAAATAAAAGTTTTAAGACTCGCAGACTCTAAACTGCAAAGTATTATTATTTC
TATTTATTGAGATCTCTTTCTCCG

QA 1 444 1 444
DS 



AS 1 8

CO CL825Contig1 880 8 6 U
GGGCAATATCTCAAATACATACCACAAAGCTAGAGACAAAGAAATACATCAGAAATACAA
AAATGGATAGGCTTCTTCGCTTCTTTGTAGCCAAAGTCATCTTATTTGCTTTAGCATCTT
CATTTGTATCTTGTTACGACCCAGGTCCTCTTCAAGACTTTTGTGTCGCCGTCGATGACG
TTAATGGCGTTTTCGTGAACGGAAAATTCTGCAAAGACCCAAAATACGTGAAGGCCGAGG
ATTTCTTTACTTCCGGACTGAACATCGCCGGAAACACCATGAACCGCGTCGGCTCCAACG
TTACCAACGTTAACGTCGACAGAATCCCCGGACTCAACACCCTCGGAGTCTCTCTTGTCC
GTATTGACTTTGCCCCGGGAGGTCAAAACCCGCCACACACGCATCCACGAGCCACGGAGA
TCCTCGTCCTTGTTGAAGGAACGCTCTTAGTAGGGTTTGTAACGTCGAACCAAGACAACA
ATAGATTGTTCTCGAAGGTTCTTTATCCAGGGGATGTGTTTGTGTTTCCCATCGGGATGA
TCCATTTCCAAGTGAACATTGGGAGGACGAACGCGGTTGCGTTTGCTGGTCTCGGAAGCC
AAAACCCCGGTACGATCACAATCGCAGACGCGGTTTTTGGTTCAACGCCTTTGATCATGC
CGGAGATTTTGGCTAAAGCGTTTCAGCTGGATGTGAACGTGGTTAGGTTTCTCGAAGCAA
GGTTTTCTTCTAAGTACGATCATCATTATTAATAAGATTAAAGGAGTGAATTAACAAAAG
AAAGATAAAAGGAACGACGTGAAATGTAAAATACGAATAAATGGTGTGATGTGGTATGTA
ATATAGTGTGTGAAAATTGAAATAAAACAATTAAGGCGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2DC57TF U 3
AF RR2DH72TF U 15
AF RR2D332TF U 24
AF RR2G468TF U 6
AF RR2AA14TF U 1
AF RR2AA14JQ C 77
AF RR2DC57JQ C 430
AF RR2G468JQ C 89
BS 1 39 RR2AA14TF
BS 40 40 RR2DC57TF
BS 41 336 RR2AA14TF
BS 337 337 RR2DC57TF
BS 338 722 RR2AA14TF
BS 723 880 RR2AA14JQ

RD RR2DC57TF 493 0 0
GGAAC
ATCTCAAATACATACCACAAAGCTAGAGACAAAGAAATACATCAGAAATACAAAAATGGA
TAGGCTTCTTCGCTTCTTTGTAGCCAAGGTCATCTTATTTGCTTTAGCATCTTCATTTGT
ATCTTGTTACGACCCAGGTCCTCTTCAAGACTTTTGTGTCGCCGTCGATGACGTTAATGG
CGTTTTCGTGAACGGAAAATTCTGCAAAGACCCAAAATACGTGAAGGCCGAGGATTTCTT
TACTTCCGGACTGAACATCGCCGGAAACACCATGAACCGCGTCGGCTCCAACGTTACCAA
CGTTAACGTCGACAGAATCCCCGGACTCAACACCCTCGGAGTCTCTCTTGTCCGTATTGA
CTTTGCCCCGGGAGGTCAAAACCCGCCACACACGCATCCACGAGCCACGGAGATCCTCGT
CCTTGTTGAAAGAACGCTCTTAGTAGGGTTTGTAACGTCGAACCAAGACAACAATAGATT
GTTCTCGA

QA 6 493 6 493
DS 

RD RR2DH72TF 633 0 0
GG
ACATACCACAAAGCTAGAGACAAAGAAATACATCAGAAATACAAAAATGGATAGGCTTCT
TCGCTTCTTTGTAGCCAAAGTCATCTTATTTGCTTTAGCATCTTCATTTGTATCTTGTTA
CGACCCAGGTCCTCTTCAAGACTTTTGTGTCGCCGTCGATGACGTTAATGGCGTTTTCGT
GAACGGAAAATTCTGCAAAGACCCAAAATACGTGAAGGCCGAGGATTTCTTTACTTCCGG
ACTGAACATCGCCGGAAACACCATGAACCGCGTCGGCTCCAACGTTACCAACGTTAACGT
CGACAGAATCCCCGGACTCAACACCCTCGGAGTCTCTCTTGTCCGTATTGACTTTGCCCC
GGGAGGTCAAAACCCGCCACACACGCATCCACGAGCCACGGAGATCCTCGCCCTTGTTGA
AGGAACGCTCTTAGTAGGGTTTGTAACGTCGAACCAAGACAACAATAGATTGTTCTCGAA
GGTTCTTTATCCAGGGGATGTGTTTGTGTTTCCCATCGGGATGATCCATTTCCAAGTGAA
CATTGGGAGGACGAACGCGGTTGCGTTTGCTGGTCTCGGAAGCCAAAACCCCGGTACGAT
CACAATCGCAGACGCGGTTTTTGGTTCAACG

QA 3 633 3 633
DS 

RD RR2D332TF 679 0 0
G
CAAAGCTAGAGACAAAGAAATACATCAGAAATACAAAAATGGATAGGCTTCTTCGCTTCT
TTGTAGCCAAAGTCATCTTATTTGCTTTAGCATCTTCATTTGTATCTTGTTACGACCCAG
GTCCTCTTCAAGACTTTTGTGTCGCCGTCGATGACGTTAATGGTTTTTTCGTGAACGGAA
AATTCTGCAAAGACCCAAAATACGTGAAGGCCGAGGATTTCTTTACTTCCGGACTGAACA
TCGCCGGAAACACCATGAACCGCGTCGGCTCCAACGTTACCAACGTTAACGTCGACAGAA
TCCCCGGACTCAACACCCTCGGAGTCTCTCTTGTCCGTATTGACTTTGCCCCGGGAGGTC
AAAACCCGCCACACACGCATCCACGAGCCACGGAGATCCTCGTCCTTGTTGAAGGAACGC
TCTTAGTAGGGTTTGTAACGTCGAACCAAGACAACAATAGATTGTTCTCGAAGGTTCTTT
ATCCAGGGGATGTGTTTGTGTTTCCCATCGGGATGATCCATTTCCAAGTGAACATTGGGA
GGACGAACGCGGTTGCGTTTGCTGGTCTCGGAAGCCAAAACCCCGGTACGATCACAATCG
CAGACGCGGTTTTTGGTTCAACGCCTTTGATCATGCCGGAGATTTTGGCTAAAGCGTT*C
AGCTGGATGTGAACGTGG

QA 2 679 2 679
DS 

RD RR2G468TF 697 0 0
GG
ATCTCAAATACATACCACAAAGCTAGAGACAAAGAAATACATCAGAAATACAAAAATGGA
TAGGCTTCTTCGCTTCTTTGTAGCCAAAGTCATCTTATTTGCTTTAGCATCTTCATTTGT
ATCTTGTTACGACCCAGGTCCTCTTCAAGACTTTTGTGCCGCCGTCGATGACGTTAATGG
CGTTTTCGTGAACGGAAAATTCTGCAAAGACCCAAAATACGTGAAGGCCGAGGATTTCTT
TACTTCCGGACTGAACATCGCCGGAAACACCATGAACCGCGTCGGCTCCAACGTTACCAA
CGCTAACGTCGACAGAATCCCCGGACTCAACACCCTCGGAGTCTCTCTTGTCCGTATTGA
CTTTGCCCCGGGAGGTCAAAACCCGCCACACACGCATCCACGAGCCACGGAGATCCTCGT
CCTTGTTGAAGGAACGCTCTTAGTAGGGTTTGTAACGTCGAACCAAGACAACAATAGATT
GTTCTCGAAGGTTCTTTATCCAGGGGATGTGTTTGTGTTTCCCATCGGGATGATCCATTT
CCAAGTGAACATTGGGAGGACGAACGCGGTTGCGTTTGCTGGTCTCGGAAGCCAAAACCC
CGGTACGATCACAATCGCAGACGCGGTTTTTGGTTCA*CGCCTTTGATCATGCCGGAGAT
TTTGGCTAAAGCGTTTCAGCTGGATGTGAACGTGG

QA 3 697 3 697
DS 

RD RR2AA14TF 722 0 0
GGGCAATATCTCAAATACATACCACAAAGCTAGAGACAA*GAAATACATCAGAAATACAA
AAATGGATAGGCTTCTTCGCTTCTTTGTAGCCAAAGTCATCTTATTTGCTTTAGCATCTT
CATTTGTATCTTGTTACGACCCAGGTCCTCTTCAAGACTTTTGTGTCGCCGTCGATGACG
TTAATGGCGTTTTCGTGAACGGAAAATTCTGCAAAGACCCAAAATACGTGAAGGCCGAGG
ATTTCTTTACTTCCGGACTGAACATCGCCGGAAACACCATGAACCGCGTCGGCTCCAACG
TTACCAACGTTAACGTCGACAGAATCCCCGGACTCATCACCCTCGGAGTCTCTCTTGTCC
GTATTGACTTTGCCCCGGGAGGTCAAAACCCGCCACACACGCATCCACGAGCCACGGAGA
TCCTCGTCCTTGTTGAAGGAACGCTCTTAGTAGGGTTTGTAACGTCGAACCAAGACAACA
ATAGATTGTTCTCGAAGGTTCTTTATCCAGGGGATGTGTTTGTGTTTCCCATCGGGATGA
TCCATTTCCAAGTGAACATTGGGAGGACGAACGCGGTTGCGTTTGCTGGTCTCGGAAGCC
AAAACCCCGGTACGATCACAATCGCAGACGCGGTTTTTGGTTCAACGCCTTTGATCATGC
CGGAGATTTTGGCTAAAGCGTTTCAGCTGGATGTGAACGTGGTTAGGTTTCTCGAAGCAA
GG

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2AA14JQ 804 0 0
TCGCTTCTTTGTAGCCAAAGTCATCTTATTTGCTTTAGCATCTTCATTTGTATCTTGTTA
CGACCCAGGTCCTCTTCAAGACTTTTGTGTCGCCGTCGATGACGTTAATGGCGTTTTCGT
GAACGGAAAATTCTGCAAAGACCCAAAATACGTGAAGGCCGAGGATTTCTTTACTTCCGG
ACTGAACATCGCCGGAAACACCATGAACCGCGTCGGCTCCAACGTTACCAACGTTAACGT
CGACAGAATCCCCGGACTCATCACCCTCGGAGTCTCTCTTGTCCGTATTGACTTTGCCCC
GGGAGGTCAAAACCCGCCACACACGCATCCACGAGCCACGGAGATCCTCGTCCTTGTTGA
AGGAACGCTCTTAGTAGGGTTTGTAACGTCGAACCAAGACAACAATAGATTGTTCTCGAA
GGTTCTTTATCCAGGGGATGTGTTTGTGTTTCCCATCGGGATGATCCATTTCCAAGTGAA
CATTGGGAGGACGAACGCGGTTGCGTTTGCTGGTCTCGGAAGCCAAAACCCCGGTACGAT
CACAATCGCAGACGCGGTTTTTGGTTCAACGCCTTTGATCATGCCGGAGATTTTGGCTAA
AGCGTTTCAGCTGGATGTGAACGTGGTTAGGTTTCTCGAAGCAAGGTTTTCTTCTAAGTA
CGATCATCATTATTAATAAGATTAAAGGAGTGAATTAACAAAAGAAAGATAAAAGGAACG
ACGTGAAATGTAAAATACGAATAAATGGTGTGATGTGGTATGTAATATAGTGTGTGAAAA
TTGAAATAAAACAATTAAGGCGCT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2DC57JQ 451 0 0
TTGTTGAAAGAACGCTCTTAGTAGGGTTTGTAACGTCGAACCAAGACAACAATAGATTGT
TCTCGAAGGTTCTTTATCCAGGGGATGTGTTTGTGTTTCCCATCGGGATGATCCATTTCC
AAGTGAACATTGGGAGGACGAACGCGGTTGCGTTTGCTGGTCTCGGAAGCCAAAACCCCG
GTACGATCACAATCGCAGACGCGGTTTTTGGTTCAACGCCTTTGATCATGCCGGAGATTT
TGGCTAAAGCGTTTCGGCTGGATGTGAACGTGGTTAGGTTTCTCGAAGCAAGGTTTTCTT
CTAAGTACGATCATCATTATTAATAAGATTAAAGGAGTGAATTAACAAAAGAAAGATAAA
AGGAACGACGTGAAATGTAAAATACGAATAAATGGTGTGATGTGGTATGTAATATAGTGT
GTGAAAATTGAAATAAAACAATTAAGGCG
GC

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2G468JQ 790 0 0
AGCCAAAGTCATCTTATTTGCTTTAGCATCTTCATTTGTATCTTGTTACGACCCAGGTCC
TCTTCAAGACTTTTGTGCCGCCGTCGATGACGTTAATGGCGTTTTCGTGAACGGAAAATT
CTGCAAAGACCCAAAATACGTGAAGGCCGAGGATTTCTTTACTTCCGGACTGAACATCGC
CGGAAACACCATGAACCGCGTCGGCTCCAACGTTACCAACGCTAACGTCGACAGAATCCC
CGGACTCAACACCCTCGGAGTCTCTCTTGTCCGTATTGACTTTGCCCCGGGAGGTCAAAA
CCCGCCACACACGCATCCACGAGCCACGGAGATCCTCGTCCTTGTTGAAGGAACGCTCTT
AGTAGGGTTTGTAACGTCGAACCAAGACAACAATAGATTGTTCTCGAAGGTTCTTTATCC
AGGGGATGTGTTTGTGTTTCCCATCGGGATGATCCATTTCCAAGTGAACATTGGGAGGAC
GAACGCGGTTGCGTTTGCTGGTCTCGGAAGCCAAAACCCCGGTACGATCACAATCGCAGA
CGCGGTTTTTGGTTCAACGCCTTTGATCATGCCGGAGATTTTGGCTAAAGCGTTTCAGCT
GGATGTGAACGTGGTTAGGTTTCTCGAAGCAAGGTTTTCTTCTAAGTACGATCATCATTA
TTAATAAGATTAAAGGAGTGAATTAACAAAAGAAAGATAAAAGGAACGACGTGAAATGTA
AAATACGAATAAATGGTGTGATGTGGTATGTAATATAGTGTGTGAAAATTGAAATAAAAC
AATTAAGGCG

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 8

CO CL826Contig1 998 8 11 U
GGACAGGAAAAAAAAGTGTTAACAACCAAATTCTTGGAGTAAAAAAAAACATGGGGAAGA
TCGAAGTTGGAAGTGTGGGTGACTCGTTCAGCGTTGCATCTCTAAAGGCTTACTTGTCTG
AGTTTATCGCAACTTTTATCTTTGTATTCGCTGGCGTTGGCTCAGCTATCGCTTTTGGCA
AGCTAACATCCGATGCCGCCTTGGACCCAGCTGGTCTTGTGGCTATTGCGGTGGCTCACG
CATTTGCCTTGTTTGTTGGGGTTTCGGTTGCTGCTAACATCTCTGGTGGGCACC*TTAAC
CCTGCCGTGACTCTCGGTCTTGCCGTTGGAGGAAACATAACACTGATCACAGGTTTCTTA
TACTGGATCGCTCAGTGTCTTGGATCCATCGTTGCTTGCCTTCTCCTTGTCTTTGTTACC
AATGGAGAGAGCGTACCGACCCATGGAGTCGGAGCCGGTTTAGGAGCACTGGAAGGTATC
GTGATGGAGATCGTTGTGACATTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGCCACAGCTGCTGAT
CCAAAGAAGGGATCGCTAGGAACCATTGCTCCAATCGCTATCGGTTTCATCGTTGGTGCC
AACATCCTCGCTGCTGGTCCTTTCAGCGGTGGCTCCATGAACCCAGCGAGGTCGTTCGGA
CCAGCTGTTGTCAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTACTGGGTGGGTCCACTCGTT
GGTGGTGCACTTGCTGGACTCATCTACGGCGATGTGTTCATTGGTTCTTACCAAGAAGTT
TAAACCCGCGAGGTCCGAGTTTGATTAAACGGATTTGTGATTTCTTGATGTTTGCTTTGA
TTTTGTGTTTGATTGTGTATGTTTGATGTCTATGCCTGCGTCTCTACAAGATTGCATGTA
GAGAAAAAGTTGTCTTAAAAAAAGAAGAAGTTATATCTTGTTAATAATAAAAAAATGTAA
ATATATTTTCTACTTTATATGGCAAAACTGAATCAGCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2AY94TFB U 288
AF RR2FE29TF U 1
AF RR2A454TF U 3
AF RR2DA65TF U 656
AF RR2FE29JQ C 401
AF RR2DA65JQ C 656
AF RR2A454JQ C 204
AF RR2CJ54TF U 349
BS 1 54 RR2FE29TF
BS 55 55 RR2A454TF
BS 56 690 RR2FE29TF
BS 691 691 RR2A454TF
BS 692 701 RR2FE29TF
BS 702 825 RR2A454TF
BS 826 826 RR2DA65TF
BS 827 846 RR2A454TF
BS 847 942 RR2DA65TF
BS 943 994 RR2CJ54TF
BS 995 998 RR2A454JQ

RD RR2AY94TFB 302 0 0
GGGCA
CC*TTAACCCTGCCGTGACTCTCGGTCTTGCCGTTGGAGGAAACATAACACTGATCACAG
GTTTCTTATACTGGATCGCTCAGTGTCTTGGATCCATCGTTGCTTGCCTTCTCCTTGTCT
TTGTTACCAATGGAGAGAGCGTACCGACCCATGGAGTCGGAGCCGGTTTAGGAGCACTGG
AAGGTATCGTGATGGAGATCGTTGTGACATTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGCCACAG
CTGCTGATCCAAAGAAGGGATCGCTAGGAACCATTGCTCCAATCGCTATCGGTTTCA

QA 6 302 6 302
DS 

RD RR2FE29TF 701 0 0
GGACAGGAAAAAAAAGTGTTAACAACCAAATTCTTGGAGTAAAAAAAAACATGGTGAAGA
TCGAAGTTGGAAGTGTGGGTGACTCGTTCAGCGTTGCATCTCTAAAGGCTTACTTGTCTG
AGTTTATCGCAACTTTTATCTTTGTATTCGCTGGCGTTGGCTCAGCTATCGCTTTTGGCA
AGCTAACATCCGATGCCGCCTTGGACCCAGCTGGTCTTGTGGCTATTGCGGTGGCTCACG
CATTTGCCTTGTTTGTTGGGGTTTCGGTTGCTGCTAACATCTCTGGTGGGCACC*TTAAC
CCTGCCGTGACTCTCGGTCTTGCCGTTGGAGGAAACATAACACTGATCACAGGTTTCTTA
TACTGGATCGCTCAGTGTCTTGGATCCATCGTTGCTTGCCTTCTCCTTGTCTTTGTTACC
AATGGAGAGAGCGTACCGACCCATGGAGTCGGAGCCGGTTTAGGAGCACTGGAAGGTATC
GTGATGGAGATCGTTGTGACATTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGCCACAGCTGCTGAT
CCAAAGAAGGGATCGCTAGGAACCATTGCTCCAATCGCTATCGGTTTCATCGTTGGTGCC
AACATCCTCGCTGCTGGTCCTTTCAGCGGTGGCTCCATGAACCCAGCGAGGTCGTTCGGA
CCAGCTGTTGTCAGTGGAGACTTGTCACAA*TCTGGATCTA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2A454TF 844 0 0
GG
AGGAAAAAAAAGTGTTAACAACCAAATTCTTGGAGTAAAAAAAAACATGGGGAAGATCGA
AGTTGGAAGTGTGGGTGACTCGTTCAGCGTTGCATCTCTAAAGGCTTACTTGTCTGAGTT
TATCGCAACTTTTATCTTTGTATTCGCTGGCGTTGGCTCAGCTATCGCTTTTGGCAAGCT
AACATCCGATGCCGCCTTGGACCCAGCTGGTCTTGTGGCTATTGCGGTGGCTCACGCATT
TGCCTTGTTTGTTGGGGTTTCGGTTGCTGCTAACATCTCTGGTGGGCACC*TTAACCCTG
CCGTGACTCTCGGTCTTGCCGTTGGAGGAAACATAACACTGATCACAGGTTTCTTATACT
GGATCGCTCAGTGTCTTGGATCCATCGTTGCTTGCCTTCTCCTTGTCTTTGTTACCAATG
GAGAGAGCGTACCGACCCATGGAGTCGGAGCCGGTTTAGGAGCACTGGAAGGTATCGTGA
TGGAGATCGTTGTGACATTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGCCACAGCTGCTGATCCAA
AGAAGGGATCGCTAGG***CATTGCTCCAATCGCTATCGGTTTCATCGTTGGTGCCAACA
TCCTCGCTGCTGGTCCTTTCAGCGGTGGCTCCATGAACCCAGCGAGGTCGTTCGGACCAG
CTGTTGTCAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTACTGGGTGGGTCCACTCGTTGGTG
GTGCACTTGCTGGACTCATCTACGGCGATGTGTTCATTGGTTCTTACCAAGAAGTTTAAA
CCCGCGAGGTCCGAGTTTGATTAAACGGATTTGTGATTTCT*GATGTTTGCTTTGATTTT
GT

QA 3 844 3 844
DS 

RD RR2DA65TF 287 0 0
G
CGGACCAGCTGTTGTCAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTACTGGGTGGGTCCACT
CGTTGGTGGTGCACTTGCTGGACTCATCTACGGCGATGTGTTCATTGGTTCTTACCAAGA
AGTTTAAACCCGCGAGGTCCGAGTTTGATTAAACGGATTTGTGATTTCTTGATGTTTGCT
TTGATTTTGTGTTTGATTGTGTATGTTTGATGTCTATGCCTGCGTCTCTACAAGATTGCA
TGTAGAGAAAAAGTTGTCTTAAAAAAAGAAGAAGTTATATCTTGTT

QA 2 287 2 287
DS 

RD RR2FE29JQ 557 0 0
TTCTCCTTGTCTTTGTTACCAATGGAGAGAGCGTACCGACCCATGGAGTCGGAGCCGGTT
TAGGAGCACTGGAAGGTATCGTGATGGAGATCGTTGTGACATTTGCTTTGGTCTACACCG
TTTACGCCACAGCTGCTGATCCAAAGAAGGGATCGCTAGGAACCATTGCTCCAATCGCTA
TCGGTTTCATCGTTGGTGCCAACATCCTCGCTGCTGGTCCTTTCAGCGGTGGCTCCATGA
ACCCAGCGAGGTCGTTCGGACCAGCTGTTGTCAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCT
ACTGGGTGGGTCCACTCGTTGGTGGTGCACTTGCTGGACTCATTTACGGCGATGTGTTCA
TTGGTTCTTACCAAGAAGTTTAAACCCGCGAGGTCCGAGTTTGATTAAACGGATTTGTGA
TTTCTTGATGTTTGCTTTGATTTTGTGTTTGATTGTGTATGTTTGATGTCTATGCCTGCG
TCTCTACAAGATTGCATGTAGAGAAAAAGTTGTCTTAAAAAAAGAAGAAGTTATATCTTG
TTAATAATAAAAAAATG

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2DA65JQ 287 0 0
G
CGGACCAGCTGTTGTCAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTACTGGGTGGGTCCACT
CGTTGGTGGTGCACTTGCTGGACTCATTTACGGCGATGTGTTCATTGGTTCTTACCAAGA
AGTTTAAACCCGCGAGGTCCGAGTTTGATTAAACGGATTTGTGATTTCTTGATGTTTGCT
TTGATTTTGTGTTTGATTGTGTATGTTTGATGTCTATGCCTGCGTCTCTACAAGATTGCA
TGTAGAGAAAAAGTTGTCTTAAAAAAAGAAGAAGTTATATCTTGTT

QA 2 287 2 287
DS 

RD RR2A454JQ 795 0 0
GACCCAGCTGGTCTTGTGGCTATTGCGGTGGCTCACGCATTTGCCTTGTTTGTTGGGGTT
TCGGTTGCTGCTAACATCTCTGGTGGGCACCCTTAACCCTGCCGTGACTCTCGGTCTTGC
CGTTGGAGGAAACATAACACTGATCACAGGTTTCTTATACTGGATCGCTCAGTGTCTTGG
ATCCATCGTTGCTTGCCTTCTCCTTGTCTTTGTTACCAATGGAGAGAGCGTACCGACCCA
TGGAGTCGGAGCCGGTTTAGGAGCACTGGAAGGTATCGTGATGGAGATCGTTGTGACATT
TGCTTTGGTCTACACCGTTTACGCCACAGCTGCTGATCCAAAGAAGGGATCGCTAGG***
CATTGCTCCAATCGCTATCGGTTTCATCGTTGGTGCCAACATCCTCGCTGCTGGTCCTTT
CAGCGGTGGCTCCATGAACCCAGCGAGGTCGTTCGGACCAGCTGTTGTCAGTGGAGACTT
GTCACAAATCTGGATCTACTGGGTGGGTCCACTCGTTGGTGGTGCACTTGCTGGACTCAT
CTACGGCGATGTGTTCATTGGTTCTTACCAAGAAGTTTAAACCCGCGAGGTCCGAGTTTG
ATTAAACGGATTTGTGATTTCTTGATGTTTGCTTTGATTTTGTGTTTGATTGTGTATGTT
TGATGTCTATGCCTGCGTCTCTACAAGATTGCATGTAGAGAAAAAGTTGTCTTAAAAAAA
GAAGAAGTTATATCTTGTTAATAATAAAAAAATGTAAATATATTTTCTACTTTATATGGC
AAAACTGAATCAGCT

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2CJ54TF 646 0 0
G
CAGGTTTCTTATACTGGATCGCTCAGTGTCTTGGATCCATCGTTGCTTGCCTTCTCCTTG
TCTTTGTTACCAATGGAGAGAGCGTACCGACCCATGGAGTCGGAGCCGGTTTAGGAGCAC
TGGAAGGTATCGTGATGGAGATCGTTGTGACATTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGCCA
CAGCTGCTGATCCAAAGAAGGGATCGCTAGGAACCATTGCTCCAATCGCTATCGGTTTCA
TCGTTGGTGCCAACATCCTCGCTGCTGGTCCTTTCAGCGGTGGCTCCATGAACCCAGCGA
GGTCGTTCGGACCAGCTGTTGTCAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTACTGGGTGG
GTCCACTCGTTGGTGGTGCACTTGCTGGACTCATCTACGGCGATGTGTTCATTGGTTCTT
ACCAAGAAGTTTAAACCCGCGAGGTCCGAGTTTGATTAAACGGATTTGTGATTTCTTGAT
GTTTGCTTTGATTTTGTGTTTGATTGTGTATGTTTGATGTCTATGCCTGCGTCTCTACAA
GATTGCATGTAGAGAAAAAGTTGTCTTAAAAAA*GAAGAAGTTATATCTTGTTAATAATA
AAAAAATGTAAATATATTTTCTACTTTATATGGCAAAACTGAATC

QA 2 646 2 646
DS 



AS 2 8

CO CL827Contig1 810 5 18 U
TTTTTCTTTTGGGGGGGGTTATTAAGAGAGAAAAAAAAAGGGCAGAAGAGAAATCGGGAG
AGAACGGAGAAGGAAGGAAGGCGATGGCGGCGGAAGAAGAAAACGAGTTCTACCTGAGGT
ACTATGTGGGACACAAGGGGAAATTCGGACACGAGTTCCTGGAGTTCGAGTTTAGACCGG
ACGGTAAACTCCGTTACGCAAATAACTCGAACTACAAGAACGATACGATGATCCGGAAGG
AGGTGTTTCTCACCCCCGCCGTTCTCAACGAATGCAAGCGTATCGTCTCCGAGAGCGAGA
TAATGAAAGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCGTGTTGGAAGGCAAGAGCTTG
AGATCGTGATGGGAAATGAGCATATCTCCTTTGCTACATCTAAGATTGGTTCTCTCGTTG
ATGTCCAGAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTTTTACTATCTTGTTCAGGACT
TGAAATGTCTTGTTTTTTCGCTCATCTCGCTGCACTTCAAGATCAAGCCTATTTAGAGAA
GAAACCAGTTGAGCTACTGGGAGCATGGACCTGAAGTTTGGTTGCTTTTATTTTTCTGGC
TCATGCTTGTTTCTTGTGTTGTTAACTTGAAAACCCTGAGTGTTTCACTCGTATGCTGTT
TTTTTTTTCTTGTTGTTGCAATGAATCTTAAATGAGCGTTGTTATTGGAAATGGACACAA
CGGTTTGGCACTTGTAAGCAGTGGGCTTTGCCCAGGTGCTGTTATTTTCGAGACTAAATT
GAGGACAGGCGTAATCAGTTGCCAAGCTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D709TF U 1
AF RR2D889TF U 1
AF RR2D889JQ C 11
AF RR2CT53TF U 127
AF RR2D709JQ C 148
BS 1 56 RR2D709TF
BS 57 57 RR2D889TF
BS 58 60 RR2D709TF
BS 61 61 RR2D889TF
BS 62 159 RR2D709TF
BS 160 160 RR2D889TF
BS 161 406 RR2D709TF
BS 407 407 RR2D889TF
BS 408 491 RR2D709TF
BS 492 492 RR2D889TF
BS 493 632 RR2D709TF
BS 633 633 RR2D889TF
BS 634 660 RR2D709TF
BS 661 691 RR2D889TF
BS 692 692 RR2CT53TF
BS 693 718 RR2D889TF
BS 719 728 RR2CT53TF
BS 729 810 RR2D709JQ

RD RR2D709TF 660 0 0
TTTTTCTTTTGGGGGGGGTTATTAAGAGAGAAAAAAAAAGGGCAGAAGAGAAATCGTGAG
GGAACGGAGAAGGAAGGAAGGCGATGGCGGCGGAAGAAGAAAACGAGTTCTACCTGAGGT
ACTATGTGGGACACAAGGGGAAATTCGGACACGAGTTCCAGGAGTTCGAGTTTAGACCGG
ACGGTAAACTCCGTTACGCAAATAACTCGAACTACAAGAACGATACGATGATCCGGAAGG
AGGTGTTTCTCACCCCCGCCGTTCTCAACGAATGCAAGCGTATCGTCTCCGAGAGCGAGA
TAATGAAAGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCGTGTTGGAAGGCAAGAGCTTG
AGATCGTGATGGGAAATGAGCATATCTCCTTTGCTACATCTAAGATCGGTTCTCTCGTTG
ATGTCCAGAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTTTTACTATCTTGTTCAGGACT
TGAAATGTCTTTTTTTTTCGCTCATCTCGCTGCACTTCAAGATCAAGCCTATTTAGAGAA
GAAACCAGTTGAGCTACTGGGAGCATGGACCTGAAGTTTGGTTGCTTTTATTTTTCTGGC
TCATGCTTGTTTCTTGTGTTGTTAACTTGAAA*CCCTGAGTGTTTCACTCGTATGCTGTT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2D889TF 718 0 0
TTTTTCTTTTGGGGGGG*TTATTAAGAGAGAAAAAAAAAGGGCAGAAGAGAAATCGGGAG
AGAACGGAGAAGGAAGGAAGGCGATGGCGGCGGAAGAAGAAAACGAGTTCTACCTGAGGT
ACTATGTGGGACACAAGGGGAAATTCGGACACGAGTTCCTGGAGTTCGAGTTTAGACCGG
ACGGTAAACTCCGTTACGCAAATAACTCGAACTACAATAACGATACGATGATCCGGAAGG
AGGTGTTTCTCACCCCCGCCGTTCTCAACGAATGCAAGCGTATCGTCTCCGAGAGCGAGA
TAATGAAAGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCGTGTTGGAAGGCAAGAGCTTG
AGATCGTGATGGGAAATGAGCATATCTCCTTTGCTACATCTAAGATTGGTTCTCTCGTTG
ATGTCCAGAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTTTTACTGTCTTGTTCAGGACT
TGAAATGTCTTGTTTTTTCGCTCATCTCGCTGCACTTCAAGATCAAGCCTATTTAGAGAA
GAAACCAGTTGAGCTACTGGGAGCATGGACCTGAAGTTTGGTTGCTTTTATTTTTCTGGC
TCATGCTTGTTTCTTGTGTTGTTAACTTGAAAACCCTGAGTGTTTCACTCGTATGCTGTT
TTTTTTTTCTTGTTGTTGCAATGAATCTTAA*TGAGCGTTGTTATTGGAAATGGACAC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2D889JQ 718 0 0
T
GGGGGGGTTATTAAGAGAGAAAAAAAAAGGGCAGAAGAGAAATCGGGAGAGAACGGAGAA
GGAAGGAAGGCGATGGCGGCGGAAGAAGAAAACGAGTTCTACCTGAGGTACTATGTGGGA
CACAAGGGGAAATTCGGACACGAGTTCCTGGAGTTCGAGTTTAGACCGGACGGTAAACTC
CGTTACGCAAATAACTCGAACTACAATAACGATACGATGATCCGGAAGGAGGTGTTTCTC
CCCCCCGCCGTTCTCAACGAATGCAAGCGTATCGTCTCCGAGAGCGAGATAATGAAAGAA
GATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCGTGTTGGAAGGCAAGAGCTTGAGATCGTGATG
GGAAATGAGCATATCTCCTTTGCTACATCTAAGATTGGTTCTCTCGTTGATGTCCAGAGC
AGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTTTTACTGTCTTGTTCAGGACTTGAAATGTCTT
GTTTTTTCGCTCATCTCGCTGCACTTCAAGATCAAGCCTATTTAGAGAAGAAACCAGTTG
AGCTACTGGGAGCATGGACCTGAAGTTTGGTTGCTTTTATTTTTCTGGCTCATGCTTGTT
TCTTGTGTTGTTAACTTGAAAACCCTGAGTGTTTCACTCGTATGCTGTTTTTTTTTTCTT
GTTGTTGCAATGAATCTTAAATGAGCGTTGTTATTGGAAATGGACACAACGGTTTGG

QA 2 718 2 718
DS 

RD RR2CT53TF 602 0 0
G
GGGACACAAGGGGAAATTCGGACACGAGTTCCTGGAGTTCGAGTTTAGACCGGACGGTAA
ACTCCGTTACGCAAATAACTCGAACTACAAGAACGATACGATGATCCGGAAGGAGGTGTT
TCTCACCCCCGCCGTTCTCAACGAATGCAAGCGTATCGTCTCCGAGAGCGAGATAATGAA
AGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCGTGTTGGAAGACAAGAGCTTGAGATCGT
GATGGGAAATGAGCATATCTCCTTTGCTACATCTAAGATTGGTTCTCTCGTTGATGTCCA
GAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTTTTACTATCTTGTTCAGGACTTGAAATG
TCTTGTTTTT*CGCTCATCTCGCTGCACTTCAAGATCAAGCCTATTTAGAGAAGAAACCA
GTTGAGCTACTGGGAGCATGGACCTGAAGTTTGGTTGCTTTTATTTTTCTGGCTCATGCT
TGTTTCTTGTGTTGTTAACTTGAAAACCCTGAGTGTTTCACTCGTATGCTGTTTTTTTTT
TCTTGTTGTTGCAATGAATCTTAAATGAGCGTTGTTATTGGAA*TGGACACAACGGTTTG
G

QA 2 602 2 602
DS 

RD RR2D709JQ 663 0 0
GACACGAGTTCCAGGAGTTCGAGTTTAGACCGGACGGTAAACTCCGTTACGCAAATAACT
CGAACTACAAGAACGATACGATGATCCGGAAGGAGGTGTTTCTCACCCCCGCCGTTCTCA
ACGAATGCAAGCGTATCGTCTCCGAGAGCGAGATAATGAAAGAAGATGATTTTAAGTGGC
CGGAACCTGACCGTGTTGGAAGGCAAGAGCTTGAGATCGTGATGGGAAATGAGCATATCT
CCTTTGCTACATCTAAGATCGGTTCTCTCGTTGATGTCCAGAGCAGTGATGATCCTGAAG
GTCTTCGCATCTTTTACTATCTTGTTCAGGACTTGAAATGTCTTTTTTTTTCGCTCATCT
CGCTGCACTTCAAGATCAAGCCTATTTAGAGAAGAAACCAGTTGAGCTACTGGGAGCATG
GACCTGAAGTTTGGTTGCTTTTATTTTTTTGGCTCATGCTTGTTTCTTGTGTTGTTAACT
TGAAAACCCTGAGTGTTTCACTCGTATGCTGTTTTTTTTTTCTTGTTGTTGCAACGAATC
TTAAATGAGCGTTGTTATTGGAAATGGACACAACGGTTTGGCACTTGTAAGCAGTGGGCT
TTGCCCAGGTGCTGTTATTTTCGAGACTAAATTGAGGACAGGCGTAATCAGTTGCCAAGC
TTG

QA 1 663 1 663
DS 



CO CL827Contig2 780 3 14 U
GGGGCAGAAGAGAAATCGGGAGAGACGGAGAAGAAGGAAGGCGATGGCGGCGGAAGAAGA
AAACGAGTTCTACCTGAGGTACTATGTGGGACACAAGGGGAAATTTGGACACGAGTTCCT
GGAGTTCGAGTTTAGACCGGACGGTAAACTCCGTTACGCAAATAACTCGAACTACAAGAA
CGATACGATGATCCGGAAGGAGGTCTTTCTCACCCCCGCCGTTCTCAACGAGTGCAAGCG
TATCGTCTCCGAGAGCGAGATAATGAAAGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCG
TGTTGGAAGGCAAGAGCTTGAGATCGTGATGGGAAATGAGCATATCTCCTTTGCTACATC
TAAGATTGGTTCTCTCGTTGATGTCCAGAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTT
TTACTATCTTGTTCAGGACTTGAAGTGTCTTGTTTTTTCGCTCATCTCGCTGCACTTCAA
GATCAAGCCTATTTAGAGATGAAGACATTTGAGTTACTGGGAGCATGTGCCTGAAGTTCG
GTTGCTTTTATGTTTCTGGCTAGTTTCTTGTGTTGTTAACTTGAAAACCCTGAGTGTTTC
ACTCGTATTCTGTTTTTTTCTTTTCTTCTTGTTGCAATGAATCTTAAATGAGCGTTGGTA
TTGGAAATGGACACGACGGTTTGGTACTTGTAAGCAGTGGGCTTTGCCCAGATGCTGTTA
TTTTCGAGACTAAATTGAGGACAGGCGTAATCAGTTGCCAAGCTTATCTTTCATCTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G557TF U 1
AF RR2BB78TF U 4
AF RR2G557JQ C 140
BS 1 73 RR2G557TF
BS 74 74 RR2BB78TF
BS 75 120 RR2G557TF
BS 121 121 RR2BB78TF
BS 122 618 RR2G557TF
BS 619 619 RR2BB78TF
BS 620 626 RR2G557TF
BS 627 627 RR2BB78TF
BS 628 678 RR2G557TF
BS 679 679 RR2G557JQ
BS 680 707 RR2G557TF
BS 708 708 RR2G557JQ
BS 709 718 RR2G557TF
BS 719 780 RR2G557JQ

RD RR2G557TF 727 0 0
GGGGCAGAAGAGAAATCGGGAGAGACGGAGAAGAAGGAAGGCGATGGCGGCGGAAGAAGA
AAACGAGTTCTACTTGAGGTACTATGTGGGACACAAGGGGAAATTTGGACACGAGTTCCT
TGAGTTCGAGTTTAGACCGGACGGTAAACTCCGTTACGCAAATAACTCGAACTACAAGAA
CGATACGATGATCCGGAAGGAGGTCTTTCTCACCCCCGCCGTTCTCAACGAGTGCAAGCG
TATCGTCTCCGAGAGCGAGATAATGAAAGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCG
TGTTGGAAGGCAAGAGCTTGAGATCGTGATGGGAAATGAGCATATCTCCTTTGCTACATC
TAAGATTGGTTCTCTCGTTGATGTCCAGAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTT
TTACTATCTTGTTCAGGACTTGAAGTGTCTTGTTTTTTCGCTCATCTCGCTGCACTTCAA
GATCAAGCCTATTTAGAGATGAAGACATTTGAGTTACTGGGAGCATGTGCCTGAAGTTCG
GTTGCTTTTATGTTTCTGGCTAGTTTCTTGTGTTGTTAACTTGAAAACCCTGAGTGTTTC
ACTCGTATTCTGTTTTTT*CTTTTCT*CTTGTTGCAATGAATCTTAAATGAGCGTTGGTA
TTGGAAATGGACACGACG*TTTGGTACTTGTAAGCAGTGGGCTTTGCTCAGATGCTGT
ATTTCGAGA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2BB78TF 673 0 0
GGAAAAGG
GAAATCGGGAGAGCCGGAGAAGAAGGAAGGCGATGGCGGCGGAAGAAGAAAACGAGTTCT
ACCTGAGGTACTATGTGGGACACAAGGGGAAATTTGGACACGAGTTCCTGGAGTTCGAGT
TTAGACCGGACGGTAAGCTCCGTTACGCAAATAACTCGAACTACAAGAACGATACGATGA
TCCGTAAGGAGGTGTTTCTCACCCCCGCCGTTCTCAACGAGTGCAAGCGTATCGTCTCCG
AGAGCGAGATAATGAAAGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCAGACCGTGTTGGAAGGC
AAGAGCTTGAGATCGTGATGGGAAATGAGCATATCTCCTTTGCTACATCTAAGATTGGTT
CTCTCGTTGATGTCCAGAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTTTTACTATCTTG
TTCAGGACTTGAAGTGTCTTGTTTTTTCGCTCATCTCGCTGCACTTCAAGATCAAGCCTA
TTTAGAGATGAAGACATTTGAGTTACTGGGAGCATGTGCCTGAAGTTCGGTTGCTTTTAT
GTTTCTGGCTAGTTTCTTGTGTTGTTAACTTGAAAACCCTGAGTGTTTCACTCGTATTCT
GTTTTTTTCTTTTCTTCTTGTTGCAATGAATCTTAAATGAGCGTTGGTATTGGAAATGGA
CAC
GA

QA 9 671 9 671
DS 

RD RR2G557JQ 641 0 0
GACGGTAAACTCCGTTACGCAAATAACTCGAACTACAAGAACGATACGATGATCCGGAAG
GAGGTCTTTCTCACCCCCGCCGTTCTCAACGAGTGCAAGCGTATCGTCTCCGAGAGCGAG
ATAATGAAAGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCGTGTTGGAAGGCAAGAGCTT
GAGATCGTGATGGGAAATGAGCATATCTCCTTTGCTACATCTAAGATTGGTTCTCTCGTT
GATGTCCAGAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTTTTACTATCTTGTTCAGGAC
TTGAAGTGTCTTGTTTTTTCGCTCATCTCGCTGCACTTCAAGATCAAGCCTATTTAGAGA
TGAAGACATTTGAGTTACTGGGAGCATGTGCCTGAAGTTCGGTTGCTTTTATGTTTCTGG
CTAGTTTCTTGTGTTGTTAACTTGAAAACCCTGAGTGTTTCACTCGTATTCTGTTTTTTT
CTTTTCTTCTTGTTGCAATGAATCTTAAATGAGCGTTGGTATTGGAAATGGACACGACGG
TTTGGTACTTGTAAGCAGTGGGCTTTGCCCAGATGCTGTTATTTTCGAGACTAAATTGAG
GACAGGCGTAATCAGTTGCCAAGCTTATCTTTCATCTAGCT

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 8

CO CL828Contig1 877 8 5 U
GGGTAACTCAAAACTGTATTCTGTGAGAGATTTTACATTTAAGAGTTCAAAAGAAAAGAG
TTCAATATGGGAAGAGTTGATTATTTGGCCATGAAGACTGAGGAGGAAACCGCGGCTAAC
CTGATCAATTCTGATCTGAATGAGTTTGTCGACGCCGCGAAGAAGCTCGTGAAAGATGCA
ACGATGCTAGGCGGTTTAAGTTTTGGCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCA
GCCATCTATCTGTTGATATTGGATCGGACCAACTGGAAAACCAAAATGTTGACTACCCTT
TTGGTGCCATACATCTTTCTCACACTTCCTTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGGGGAGAT
TTTGGGAAATGGATTGCTCTCATTTCGATCACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTTT
CCAGATTGGTTTGAGATTCCAGCAGCTTTGATCCTTCTTCTGGTGGTTGCACCTAGTCTC
ATAGCTGGGACAGTAAGAGAAAGTTGGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGT
TACCTTTTCCATGAACATATCAAAGCTTCTGATGGATTCAGAAACGCTTTAACTCAGAAA
CATGGACTCTCCAATACTATTGGG*ATCGTTGCTCTCCTTGTTTACCCGGTTTGGACCAT
ATTTTTTAACATCTTCTAAGTTCTAACTCTATTCTACTACCCATTGGCCTGGAAACACCT
TCAACATTCTGTGTCTTGCTTTCATTTGATAAAGTGCGAATTGTTTATGTGTTTTAGCAG
CATTTGTGTTTGGGAAAATCTTCATTGAACAAAAGAAGATCCACTTGTGATGTGTAAGAT
ATATGGGTTTGCGTTGTATATCGCTTGGTGTGTTAAA


BQ
10 10 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2CL57TF U 4
AF RR2BM50TF U 1
AF RR2CD19TF U 1
AF RR2CL02TF U 0
AF RR2H535TF U 1
AF RR2CD19JQ C 90
AF RR2CL57JQ C 115
AF RR2BM50JQ C 127
BS 1 709 RR2BM50TF
BS 710 757 RR2CD19TF
BS 758 766 RR2H535TF
BS 767 876 RR2CD19JQ
BS 877 877 RR2BM50JQ

RD RR2CL57TF 642 0 0
TAACTCAAAACTGTATTCTGTGAGAGATTTTACATTTAAGAGTTCAAAAGAAAAGAGTTC
AATATGGGAAGAGTCGATTATTTGGCCATGAAGACTGAGGAGGAAACCGCGGCTAACCTG
ATCAATTCTGATCTGAATGAGTTCGTCGACGCCGCGAAGAAGCTCGTGAAAGATGCAACG
ATGCTAGGCGGTTTAAGCTTTGGCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCAGCC
ATCTATCTGTTGATATTGGATCGGACCAACTGGAAAACCAAAATGTTGACTACCCTTTTG
GTGCCATACATCTTTCTCACACTTCCTTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGGGGAGATTTT
GGGAAATGGATTGCTCTCATTTCGATCACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTT*CCA
GATTGGTTGGAGATTCCAGCAGCTTTGATCCTTCTTCTGGTGGTTGCACCTAGTCTCATA
GCTGGGACAGTAAGAGAAAGTTGGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGTTAC
CTTTTCCATGAACATATCAAAGCTTCTGATGGATTCAGAAACGCTTTAACTCAGAAACAT
GGACTCTCCAATACTATTGGG*ATTGTTGCTCTCCTCGTTTA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2BM50TF 709 0 0
GGGTAACTCAAAACTGTATTCTGTGAGAGATTTTACATTTAAGAGTTCAAAAGAAAAGAG
TTCAATATGGGAAGAGTTGATTATTTGGCCATGAAGACTGAGGAGGAAACCGCGGCTAAC
CTGATCAATTCTGATCTGAATGAGTTTGTCGACGCCGCGAAGAAGCTCGTGAAAGATGCA
ACGATGCTAGGCGGTTTAAGTTTTGGCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCA
GCCATCTATCTGTTGATATTGGATCGGACCAACTGGAAAACCAAAATGTTGACTACCCTT
TTGGTGCCATACATCTTTCTCACACTTCCTTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGGGGAGAT
TTTGGGAAATGGATTGCTCTCATTTCGATCACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTTT
CCAGATTGGTTTGAGATTCCAGCAGCTTTGATCCTTCTTCTGGTGGTTGCACCTAGTCTC
ATAGCTGGGACAGTAAGAGAAAGTTGGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGT
TACCTTTTCCATGAACATATCAAAGCTTCTGATGGATTCAGAAACGCTTTAACTCAGAAA
CATGGACTCTCCAATACTATTGGG*ATCGTTGCTCTCCTTGTTTACCCGGTTTGGACCAT
ATTTTTTAACATCTTCTAAGTTCTAACTCTATTCTACTACCCATTGGCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2CD19TF 757 0 0
GGG
TAACTCAAAACTGTATTCTGTGAGAGATTTTACATTTAAGAGTTCAAAAGAAAAGAGTTC
AATATGGGAAGAGTTGATTATTTGGCCATGAAGACTGAGGAGGAAACCGCGGCTAACCTG
ATCAATTCTGATCTGAATGAGTTTGTCGACGCCGCGAAGAAGCTCGTGAAAGATGCAACG
ATGCTAGGCGGTTTAAGTTTTGGCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCAGCC
ATCTATCTGTTGATATTGGATCGGACCAACTGGAAAACCAAAATGTTGACTACCCTTTTG
GTGCCATACATCTTTCTCACACTTCCTTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGGGGAGATTTT
GGGAAATGGATTGCTCTCATTTTGATCACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTTTCCA
GATTGGTTTGAGATTCCAGCAGCTTTGATCCTTCTTCTGGTGGTTGCACCTAGTCTCATA
GCTGGGACAGTAAGAGAAAGTTGGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGTTAC
CTTTTCCATGAACATATCAAAGCTTCTGATGGATTCAGAAACGCTTTAACTCAGAAACAT
GGACTCTCCAATACTATTGGG*ATCGTTGCTCTCCTTGTTTACCCGGTTTGGACCATATT
TTTTAACATCTTCTAAGTTCTAACTCTATTCTACTACCCATTGGCCTGGAAACACCTTCA
ACATTCTGTGTCTTGCTTTCATTTGATAAAGTGC

QA 4 757 4 757
DS 

RD RR2CL02TF 737 0 0
AGGGG
AACTCAAAACTGTATTCTGTGAGAGATTTTACATTTAAGAGTTCAAAAGAAAAGAGTTCA
ATATGGGAAGAGTTGATTATTTGGCCATGAAGACTGAGGAGGAAACCGCGGCTAACCTGA
TCAATTCTGATCTGAATGAGTTTGTCGACGCCGCGAAGAAGCTCGTGAAAGATGCAACGA
TGCTAGGCGGTTTAAGTTTTGGCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCAGCCA
TCTATCTGTTGATATTGGATCGGACCAACTGGAAAACCAAAATGTTGACTACCCTTTTGG
TGCCATACATCTTTCTCACACTTCCTTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGGGGAGATTTTG
GGAAATGGATTGCTCTCATTTCGATCACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTTTCCAG
ATTGGTTTGAGATTCCAGCAGCTTTGATCCTTCTTCTGGTGGTTGCACCTAGTCTCATAG
CTGGGACAGTAAGAGAAAGTTGGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGTTACC
TTTTCCATGAACATATCAAAGCTTCTGATGGATTCAGAAACGCTTTAACTCAGAAACATG
GACTCTCCAATACTATTGGG*ATCGTTGCTCTCCTTGTTTACCCGGTTTGGACCATATTT
TT*AACATCTTCTAAGTTCTAACTCTATTCTACTACCCATTGGCCTGGAAACACCTTCAA
CATTCTGTGTCT

QA 6 737 6 737
DS 

RD RR2H535TF 776 0 0
GGG
TAACTCAAAACTGTATTCTGTGAGAGATTTTACATTTAAGAGTTCAAAAGAAAAGAGTTC
AATATGGGAAGAGTTGATTATTTGGCCATGAAGACTGAGGAGGAAACCGCGGCTAACCTG
ATCAATTCTGATCTGAATGAGTTTGTCGACGCCGCGAAGAAGCTCGTGAAAGATGCAACG
ATGCTAGGCGGTTTAAGTTTTGGCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCAGCC
ATCTATCTGTTGATATTGGATCGGACCAACTGGAAAACCAAAATGTTGACTACCCTTTTG
GTGCCATACATCTTTCTCACACTTCCTTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGGGGAGATTTT
GGGAAATGGATTGCTCTCATTTCGATCACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTTTCCA
GATTGGTTTGAGATTCCAGCAGCTTTGATCCTTCTTCTGGTGGTTGCACCTAGTCTCATA
GCTGGGACAGTAAGAGAAAGTTGGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGTTAC
CTTTTCCATGAACATATCAAAGCTTCTGATGGATTCAGAAACGTTTTAACTCAGAAACAT
GGACTCTCCAATACTATTGGGGATCGTTGCTCTCCTTGTTTACCCGGTTTGGACCATATT
TTTTAACATCTTCTAAGTTCTAACTCTATTCTACTACCCATTGGCCTGGAAACACCTTCA
ACATTCTGTGTCTTGCTTTCATTTGATAAAGTGCGAATTGTTT
ATGTGTTTTA

QA 4 766 4 766
DS 

RD RR2CD19JQ 787 0 0
CATGAAGACTGAGGAGGAAACCGCGGCTAAC*TGATCAATTCTGATCTGAATGAGTTTGT
CGACGCCGCGAAGAAGCTCGTGAAAGATGCAACGATGCTAGGCGGTTTAAGTTTTGGCAC
GTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCAGCCATCTATCTGTTGATATTGGATCGGAC
CAACTGGAAAACCAAAATGTTGACTACCCTTTTGGTGCCATACATCTTTCTCACACTTCC
TTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGGGGAGATTTTGGGAAATGGATTGCTCTCATTTTGAT
CACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTTTCCAGATTGGTTTGAGATTCCAGCAGCTTT
GATCCTTCTTCTGGTGGTTGCACCTAGTCTCATAGCTGGGACAGTAAGAGAAAGTTGGGT
TGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGTTACCTTTTCCATGAACATATCAAAGCTTC
TGATGGATTCAGAAACGCTTTAACTCAGAAACATGGACTCTCCAATACTATTGGG*ATCG
TTGCTCTCCTTGTTTACCCGGTTTGGACCATATTTTTTAACATCTTCTAAGTTCTAACTC
TATTCTACTACCCATTGGCCTGGAAACACCTTCAACATTCTGTGTCTTGCTTTCATTTGA
TAAAGTGCGAATTGTTTATGTGTTTTAGCAGCATTTGTGTTTGGGAAAATCTTCATTGAA
CAAAAGAAGATCCACTTGTGATGTGTAAGATATATGGGTTTGCGTTGTATATCGCTTGGT
GTGTTAA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2CL57JQ 762 0 0
GGCTAA
CTGATCAATTCTGATCTGAATGAGTTCGTCGACGCCGCGAAGAAGCTCGTGAAAGATGCA
ACGATGCTAGGCGGTTTAAGCTTTGGCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCA
GCCATCTATCTGTTGATATTGGATCGGACCAACTGGAAAACCAAAATGTTGACTACCCTT
TTGGTGCCATACATCTTTCTCACACTTCCTTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGGGGAGAT
TTTGGGAAATGGATTGCTCTCATTTCGATCACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTT*
CCAGATTGGTTGGAGATTCCAGCAGCTTTGATCCTTCTTCTGGTGGTTGCACCTAGTCTC
ATAGCTGGGACAGTAAGAGAAAGTTGGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGT
TACCTTTTCCATGAACATATCAAAGCTTCTGATGGATTCAGAAACGCTTTAACTCAGAAA
CATGGACTCTCCAATACTATTGGG*ATTGTTGCTCTCCTCGTTTACCCGGTTTGGACCAT
CTTTTTTAACATCTTCTAAGTTCTAACTCTATTCTACTACCCATTGGCCTGGAAACACCT
TCAACATTCTGTGTCTTGCTTTCATTCGATAAAGTGCGAATTGTTT**GTGTTTTAGCAG
CATTTGTGTTTGGGAAAATCTTCATTGAACAAAAGAAGATTCACTTGTGATGTGTAAGAT
ATATGGGTTTGTGTTGTATATCGCTTGGTGTGTTAA

QA 7 762 7 762
DS 

RD RR2BM50JQ 751 0 0
CAA
TCTGATCTGAATGAGTT*GTCGACGCCGCGAAGAAGCTCGTGAAAGATGCAACGATGCTA
GGCGGTTTAAGTTTTGGCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCAGCCATCTAT
CTGTTGATATTGGATCGGACCAACTGGAAAACCAAAATGTTGACTACCCTTTTGGTGCCA
TACATCTTTCTCACACTTCCTTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGGGGAGATTTTGGGAAA
TGGATTGCTCTCATTTCGATCACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTTTCCAGATTGG
TTTGAGATTCCAGCAGCTTTGATCCTTCTTCTGGTGGTTGCACCTAGTCTCATAGCTGGG
ACAGTAAGAGAAAGTTGGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGTTACCTTTTC
CATGAACATATCAAAGCTTCTGATGGATTCAGAAACGCTTTAACTCAGAAACATGGACTC
TCCAATACTATTGGG*ATCGTTGCTCTCCTTGTTTACCCGGTTTGGACCATATTTTTTAA
CATCTTCTAAGTTCTAACTCTATTCTACTACCCATTGGCCTGGAAACCCCTTCAACATTC
TGTGTCTTGCTTTCATTTGATAAAGTGCGAATTGTTTATGTGTTTTAGCAGCATTTGTGT
TTGGGAAAATCTTCATTGAACAAAAGAAGATCCACTTGTGATGTGTAAGATATATGGGTT
TGCGTTGTATATCGCTTGGTGTGTTAAA

QA 4 751 4 751
DS 



AS 2 8

CO CL829Contig1 1363 4 5 U
CGGAGACTATTGGTAACATTTTGCATAATAGAGAAAAGAGTTGGAAAATTCTGCATTTCT
GTATACAACATTGGAAGCTACAAAGTTGCAAACTTATAAAAATTATTACACTTTTT*AAC
TACTAGTCCAAGTGGTTGCAGAGGTCAGTGAACAAGGACATGTGTAGAGAAAAAGAGGTC
ATTTCCTTGCATGCTCAGGGATTAAGCGATGACGCAGTTCAACAGATGCACCAGCCAATT
CTTGAGCTGTGAAATCAAACAATGGAGGAAGTGCTCTTCCATTAGGCAAGGATGCGTTGG
GGTCTCTCAGAGCATCAAAGAACGGGTGCGCACATGCTTCAAGCGCTGAGCATCTCAGGT
TTGGTGAATACTGGAGGAGTCTAGAGCCAAGATCCAATGCTTCAGGCGGTACCTGTCTAC
TAAAAATCTTGTGCCATGGCTGAGGTTTTATCTGTGGGAACTTGAAATCATTGTAACTAG
GGTTCATGTTCTTTATCTCTTCTCTTGCTGGTGTTCCCAAAACCTTAATGATCTCCACCA
ATTGATCAACACTAGTCTCTCCAGGGAACAAAGGATGTCCAAGAAAAAGCTCAGCCATTA
CACAACCTACAGACCACATATCGATGGCGGTTGTGTACTCAGTTGCTCCAAAGATGAGTT
CTGGAGCTCTGTAATACCTTGAGCATATGTAAGATATATTGGGTTCTCCAGGAATCAGCA
TTTTCGCGCTTCCAAAGTCACATATCTTCACCTCATGTGTAACATTATTCACCAATAAGT
TTTGTGGTTTAATGTCACGGTGGCACACTCCAACAGCTCGATGTAGATAGTTCACAGCGC
GGCAAATCTGATATGTGTAGAGCTGAATATAGATCAGGGGCATCTGATGATTCATCTTGG
TGTAAGATCTTGATGCACGGTATATAGTCTCAGGTACATACTCGAGAACAAGGTTGAGAT
AAAGCTCGTCTTTCTCAGTGGTGGAGAAGAAAGAATGCTTGAGCTCAACGACGTTAGGAT
GGTCGAGCATTCGCATGATCTGAAGCTCTCTGTTTTTGTATCTCTTGTCTTGTAACACTT
TCTTGATTGCTACTTTTTCTTCTGTCTCTAAGCACTTAGCCTGAAATACAACACCGAATG
AGCCAGTGCCAATTACATGTTCAGCTCTGTACGAGATTGTCTTGTCTATCTGATCATTCA
GACCCTTCTTTGTGGTTGTAATAATCCGACCAGACTCTGTCCCATTTCCCTTGATGACAC
CACTGTCCGAATCCTATATCAAAGCCGAAGAAAAGAAGTTGAACATCATTAATTCATCAT
CATTAATTAGCTCAAAATTATCAAAATGCAGAGATCACAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY47JQ U 1
AF RR2FX07JQ U 43
AF RR2H452JQB U 39
AF RR2EY47TF C 687
BS 1 171 RR2EY47JQ
BS 172 172 RR2H452JQB
BS 173 567 RR2EY47JQ
BS 568 774 RR2H452JQB
BS 775 1363 RR2EY47TF

RD RR2EY47JQ 567 0 0
CGGAGACTATTGGTAACATTTTGCATAATAGAGAAAAGAGTTGGAAAATTCTGCATTTCT
GTATACAACATTGGAAGCTACAAAGTTGCAAACTTATAAAAATTATTACACTTTTT*AAC
TACTAGTCCAAGTGGTTGCAGAGGTCAGTGAACAAGGACATGTGTAGAGAAGAAGAGGTC
ATTTCCTTGCATGCTCAGGGATTAAGCGATGACGCAGTTCAACAGATGCACCAGCCAATT
CTTGAGCTGTGAAATCAAACAATGGAGGAAGTGCTCTTCCATTAGGCAAGGATGCGTTGG
GGTCTCTCAGAGCATCAAAGAACGGGTGCGCACATGCTTCAAGCGCTGAGCATCTCAGGT
TTGGTGAATACTGGAGGAGTCTAGAGCCAAGATCCAATGCTTCAGGCGGTACCTGTCTAC
TAAAAATCTTGTGCCATGGCTGAGGTTTTATCTGTGGGAACTTGAAATCATTGTAACTAG
GGTTCATGTTCTTTATCTCTTCTCTTGCTGGTGTTCCCAAAACCTTAATGATCTCCACCA
ATTGATCAACACTAGTCTCTCCAGGGA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2FX07JQ 671 0 0
GGAAAATTCTGCATTTCTGTATACAACAATGGAAGCTACAAAGCTGCAAACTTATAAAAA
TTATTACACTTTTTTAACTACTAGTCCGAGTGGTTGCAGAGGTCAGTGAACAAGGACATG
TGTAGAGAAAAAGAGGTCATTTCCTTGCATGCTCAGGGATTAAGCGATGACGAAGTTCAA
CAGATGCACCAGCCAATTCTTGAGCTGTGAAATCAAACAATGGAGGAAGTGCTCTTCCAT
TGGGCAAGGATGCGTTGGGGTCTCTCAGAACATCAAAGAACGGGTGTGCACATGCTTCAA
GCGCTGAGCATCTCAGGTTTGGTGAATACTGGAGGAGTCTAGAGCCAAGATCCGATGCTT
CAGGAGGTACCTGTCTACTAAATATCTTGTGCCATGGCTGAAGTTTTATCTGTGGGAACT
TGAAATCATTGTAACTAGGGTTCATGTTCTTTATCTCTTCTCTTGCTGGTGTTCCTAAAA
CCTTAATGATCTCCACCAATTGATCAACACTAGTCTCTCCAGGGAACAGAGGATGTCCAA
GAAAAAGTTCAGCCATTACACAACCTACAGACCACATATCGATGGCGGTTGTGTACTCAG
TTGCTCCAAAGATGAGTTCTGGAGCTCTGTAATACCTTGAGCATATGTAAGATATATTGG
GTTCTCC
CGGA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2H452JQB 736 0 0
CGTT
GGAAAATTCTGCATTTCTGTATACAACATTGGAAGCTACAAAGTTGCAAACTTATAAAAA
TTATTACACTTTTT*AACTACTAGTCCAAGTGGTTGCAGAGGTCAGTGAACAAGGACATG
TGTAGAGAAAAAGAGGTCATTTCCTTGCATGCTCAGGGATTAAGCGATGACGCAGTTCAA
CAGATGCACCAGCCAATTCTTGAGCTGTGAAATCAAACAATGGAGGAAGTGCTCTTCCAT
TAGGCAAGGATGCGTTGGGGTCTCTCAAAGCATCAAAGAACGGGTGCGCACATGCTTCAA
GCGCTGAGCATCTCAGGTTTGGTGAATACTGGAGGAGTCTAGAGCCAAGATCCAATGCTT
CAGGCGGTACCTGTCTACTAAAAATCTTGTGCCATGGCTGAGGTTTTATCTGTGGGAACT
TGAAATCATTGTAACTAGGGTTCATGTTCTTTATCTCTTCTCTTGCTGGTGTTCCCAAAA
CCTTAATGATCTCCACCAATTGATCAACACTAGTCTCTCCAGGGAACAAAGGATGTCCAA
GAAAAAGCTCAGCCATTACACAACCTACAGACCACATATCGATGGCGGTTGTGTACTCAG
TTGCTCCAAAGATGAGTTCTGGAGCTCTGTAATACCTTGAGCATATGTAAGATATATTGG
GTTCTCCAGGAATCAGCATTTTCGCGCTTCCAAAGTCACATATCTTCACCTCATGTGTAA
CATTATTCACCA

QA 5 736 5 736
DS 

RD RR2EY47TF 677 0 0
ATGTAAGATATATTGGGTTCTCCAGGAATCAGCATTTTCGCGCTTCCAAAGTCACATATC
TTCACCTCATGTGTAACATTATTCACCAATAAGTTTTGTGGTTTAATGTCACGGTGGCAC
ACTCCAACAGCTCGATGTAGATAGTTCACAGCGCGGCAAATCTGATATGTGTAGAGCTGA
ATATAGATCAGGGGCATCTGATGATTCATCTTGGTGTAAGATCTTGATGCACGGTATATA
GTCTCAGGTACATACTCGAGAACAAGGTTGAGATAAAGCTCGTCTTTCTCAGTGGTGGAG
AAGAAAGAATGCTTGAGCTCAACGACGTTAGGATGGTCGAGCATTCGCATGATCTGAAGC
TCTCTGTTTTTGTATCTCTTGTCTTGTAACACTTTCTTGATTGCTACTTTTTCTTCTGTC
TCTAAGCACTTAGCCTGAAATACAACACCGAATGAGCCAGTGCCAATTACATGTTCAGCT
CTGTACGAGATTGTCTTGTCTATCTGATCATTCAGACCCTTCTTTGTGGTTGTAATAATC
CGACCAGACTCTGTCCCATTTCCCTTGATGACACCACTGTCCGAATCCTATATCAAAGCC
GAAGAAAAGAAGTTGAACATCATTAATTCATCATCATTAATTAGCTCAAAATTATCAAAA
TGCAGAGATCACAAAAA

QA 1 677 1 677
DS 



CO CL829Contig2 787 4 11 U
GGAGAGATTTCTCATTCATTACCAAAAGAAATGGGTGATGACAAGGATTCGGACAGTGGT
ATCATCAAGGGAAATGGGACAGAGTCTGGTCGGATTATTACAACCACAAAGAAGGGTCTG
AATGATCAGATAGACAAGACAATCTCGTACAAAGCTGAACATGTAATTGGCACTGGCTCA
TTCGGTGTTGTATTTCAGGCTAAGTGCTTAGAGACAGAAGAAAAAGTAGCAATCAAGAAA
GTGTTACAAGACAAGAGATACAAAAACAGAGAGCTTCAGATCATGCGAATGCTCGACCAT
CCTAACGTCGTTGAGCTCAAGCATTCTTTCTTCTCCACCACCGAGAAAGACGAGCTTTAT
CTCAACCTTGTTCTCGAGTATGTACCTGAGACTATATACCGGGCATCAAGATCTTACACC
AAGATGAATCATCAGATGCCCCTGATCTATATTCAGCTCTACACATATCAGATTTGCCGC
GCTGTGAACTATCTACATCGAGCTGTTGGAGTGTGCCACCGTGACATTAAACCACAAAAC
CTATTGGTGAATAATGTTACACATGAGGTGAAGATATGTGACTTTGGAAGCGCAAAAATA
CTGATTCCGGGAGAACCCAATATATCTTACATATGCTCAAGGTATTACAGAGCTCCAGAA
CTCATCTTTGGAGCAACTGAGTACACAACCGCCATCGATATGTGGTCTGTAGGTGTGTAA
TGGCTGAACTTTTTCTTGGACATCCTCTGTCCCTGGAGAGACTAGTGTTGATCAATTGGT
GGAGATC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE07TF U 1
AF RR2DF78TF U 42
AF RR2H452TF U 4
AF RR2FX07TF U 1
BS 1 191 RR2FX07TF
BS 192 192 RR2GE07TF
BS 193 215 RR2FX07TF
BS 216 216 RR2GE07TF
BS 217 245 RR2FX07TF
BS 246 246 RR2GE07TF
BS 247 263 RR2FX07TF
BS 264 264 RR2GE07TF
BS 265 464 RR2FX07TF
BS 465 465 RR2GE07TF
BS 466 787 RR2FX07TF

RD RR2GE07TF 563 0 0
GGAGA
GATTTCTCATTCATTACCAAAAGAAATGGGTGATGACAAGGATTCGGACAGTGGTATCAT
CAAGGGAAATGGGACAGAGTCTGGTCGGATTATTACAACCACAAAGAAGGGTCTGAATGA
TCAGATAGACAAGACAATCTCGTACAGAGCTGAACATGTAATTGGCACTGGCTCATTCGG
TGTTGTATTTCAGGCTAAGTGCTTAGAGACAGAAGAAAAAGTAGCAATCAAGAAAGTGTT
ACAAGACAAGAGATACAAAAACAGAGAGCTTCAGATCATGCGAATGCTCGACCATCCTAA
CGTCGTTGAGCTCAAGCATTCTTTCTTCTCCACCACTGAGAAAGACGAGCTTTATCTCAA
CCTTGTTCTCGAGTATGTACCTGAGACTATATACCGTGCATCAAGATCTTACACCAAGAT
GAATCATCAGATGCCCCTGATCTATATTCAGCTCTACACATATCAGATTTGCCGCGCTGT
GAACTATCTACACCGAGCTGTTGGAGTGTGCCACCGTGACATTAAACCACAAAACCTATT
GGTGAATAATGTTACACA

QA 6 563 6 563
DS 

RD RR2DF78TF 557 0 0
G
AAGGATTCGGACAGTGGTATCATCAAGGGAAATGGGACAGAGTCTGGTCGGATTATTACA
ACCACAAAGAAGGGTCTGAATGATCAGATAGACAAGACAATCTCGTACAAAGCTGAACAT
GTAATTGGCACTGGCTCATTCGGTGTTGTCTTTCAGGCTAAGTGCTTAGAGACGGAAGAA
AAAGTAGCAATCAAGAAAGTGTTGCAAGACAAGAGATACAAGAACAGAGAGCTTCAGATC
ATGCGAATGCTCGACCATCCTAACGTCGTTGAGCTCAAGCATTCTTTCTTCTCCACCACC
GAGAAAGACGAGCTTTATCTCAACCTTGTTCTCGAGTATGTACCTGAGACTATATACCGG
GCATCAAGATCTTACACCAAGATGAATCATCAGATGCCCCTGATCTATATTCAGCTCTAC
ACGTATCAGATTTGCCGCGCTGTGAACTATCTACATCGAGCTGTTGGAGTGTGCCACCGT
GACATTAAACCACAAAACCTATTGGTGAATAATGTTACACATGAGGTGAAGATATGTGAC
TTTGGAAGCGCAAAAA

QA 2 557 2 557
DS 

RD RR2H452TF 725 0 0
GG
GATTCCTCATTCATTACCAAAAGAAATGGGTGATGACAAGGATTCGGACAGTGGTATCAT
CAAGGGAAATGGGACAGAGTCTGGTCGGATTATTACAACCACAAAGAAGGGTCTGAATGA
TCAGATAGACAAGACAATCTCGTACAGAGCTGAACATGTAATTGGCACTGGCTCATTCGG
TGTTGTATTTCAGGCTAAGTGCTTAGAGACAGAAGAAAAAGTAGCAATCAAGAAAGTGTT
ACAAGACAAGAGATACAAAAACAGAGAGCTTCAGATCATGCGAATGCTCGACCATCCTAA
CGTCGTTGAGCTCAAGCATTCTTTCTTCTCCACCACTGAGAAAGACGAGCTTTATCTCAA
CCTTGTTCTCGAGTATGTACCTGAGACTATATACCGTGCATCAAGATCTTACACCAAGAT
GAATCATCAGATGCCCCTGATCTATATTCAGCTCTACACATATCAGATTTGCCGCGCTGT
GAACTATCTACATCGAGCTGTTGGAGTGTGCCACCGTGACATTAAACCACAAAACCTATT
GGTGAATAATGTTACACATGAGGTGAAGATATGTGACTTTGGAAGCGCGAAAATGCTGAT
TCCTGGAGAACCCAATATATCTTACATATGCTCAAGGTATTACAGAGCTCCAGAACTCAT
CTTTGGAGCAACTGAGTACACAACCGCCATCGATATGTGGTCTGTAGGTGTGTAATGGCT
GA
G

QA 3 724 3 724
DS 

RD RR2FX07TF 787 0 0
GGAGAGATTTCTCATTCATTACCAAAAGAAATGGGTGATGACAAGGATTCGGACAGTGGT
ATCATCAAGGGAAATGGGACAGAGTCTGGTCGGATTATTACAACCACAAAGAAGGGTCTG
AATGATCAGATAGACAAGACAATCTCGTACAAAGCTGAACATGTAATTGGCACTGGCTCA
TTCGGTGTTGTCTTTCAGGCTAAGTGCTTAGAGACGGAAGAAAAAGTAGCAATCAAGAAA
GTGTTGCAAGACAAGAGATACAAGAACAGAGAGCTTCAGATCATGCGAATGCTCGACCAT
CCTAACGTCGTTGAGCTCAAGCATTCTTTCTTCTCCACCACCGAGAAAGACGAGCTTTAT
CTCAACCTTGTTCTCGAGTATGTACCTGAGACTATATACCGGGCATCAAGATCTTACACC
AAGATGAATCATCAGATGCCCCTGATCTATATTCAGCTCTACACGTATCAGATTTGCCGC
GCTGTGAACTATCTACATCGAGCTGTTGGAGTGTGCCACCGTGACATTAAACCACAAAAC
CTATTGGTGAATAATGTTACACATGAGGTGAAGATATGTGACTTTGGAAGCGCAAAAATA
CTGATTCCGGGAGAACCCAATATATCTTACATATGCTCAAGGTATTACAGAGCTCCAGAA
CTCATCTTTGGAGCAACTGAGTACACAACCGCCATCGATATGTGGTCTGTAGGTGTGTAA
TGGCTGAACTTTTTCTTGGACATCCTCTGTCCCTGGAGAGACTAGTGTTGATCAATTGGT
GGAGATC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 2 6

CO CL830Contig1 938 4 8 U
GGGTGTCTGTTTCTCTGTTTTGTTCTTCTCTGATTCTTACCATTGCTCCACCAACTGTCT
CTTGATTTCTTGAGTTAGTTTTCCCCCTTCACCCGGAAAAGAGGGAAAAAGTTTCGATCT
TGTTGTTTGGAGTAATGGTGGGTGCTCTGTTTGTTGTTGGCTCATCGGTGATGGATTCAT
GTCTATGTCTGGATGCTCAGACCAGGACCACCAGGAGCAAGAAGAAGATCCTTGGCAGTG
CAAGAAAGCTGGAACTTGGGAGCTCCTTTACTGGTTCAGGCATTGTTTTCAGGATTTCTT
CCAAGAAGCGTGTCCCAACAAGGATTGCGAATCGAAGAAAGAAGCTCTTGATTGTGAATG
AGGACGTCGCTGGGAACTACGATGATACCTTCGGGGATGTCAAAACGAACCTTGTTAACT
ATTTCACATACAAAGCTGTGAGGACGGTTCTTCATCAGCTCTACGAAATGAATCCTCCTC
AATACACTTGGTTCTATAATTACGTCGTATCGAACAGACCAACCGATGGTAAACGATTCC
TCCGCAAACTCGGAAAGGAAAATCAGGAGCTTGCAGAAAGAGTGATGATCACGCGTCTCC
ACTTGTATGGCAAGTGGATCAAGAAATGCGACCATGGGAAGATATACCAAGATATATCGG
ATGAGAACTTGGCGTTGATGCGTGAACGCCTCATGGAGACGGTGATATGGCCTTCCGATG
ACTCGAACTCCGAGGTTATTGGCTGAAGAAGGCTGTGTCACAAACGCAGCATTTACTTTG
CTTTCGTCAACTCGCTTCACAATTTTAGGATCTTGAGTTTCTTTTAGTTTGATTTACATA
TAATGAATCATTAATGATACAGTCATTGAGCATTGTGTATATCAGTATATGTATCTATTC
TTTCTTGGCATGTACTACTATTTATGACAATAGGGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2EF11TF U 1
AF RR2C859TF U 128
AF RR2EF11JQ C 275
AF RR2C859JQ C 347
BS 1 252 RR2EF11TF
BS 253 253 RR2C859TF
BS 254 375 RR2EF11TF
BS 376 376 RR2C859TF
BS 377 559 RR2EF11TF
BS 560 873 RR2C859TF
BS 874 934 RR2EF11JQ
BS 935 938 RR2C859JQ

RD RR2EF11TF 559 0 0
GGGTGTCTGTTTCTCTGTTTTGTTCTTCTCTGATTCTTACCATTGCTCCACCAACTGTCT
CTTGATTTCTTGAGTTAGTTTTCCCCCTTCACCCGGAAAAGAGGGAAAAAGTTTCGATCT
TGTTGTTTGGAGTAATGGTGGGTGCTCTGTTTGTTGTTGGCTCATCGGTGATGGATTCAT
GTCTATGTCTGGATGCTCAGACCAGGACCACCAGGAGCAAGAAGAAGATCCTTGGCAGTG
CAAGAAAGCTGGGACTTGGGAGCTCCTTTACTGGTTCAGGCATTGTTTTCAGGATTTCTT
CCAAGAAGCGTGTCCCAACAAGGATTGCGAATCGAAGAAAGAAGCTCTTGATTGTGAATG
AGGACGTCGCTGGGAGCTACGATGATACCTTCGGGGATGTCAAAACGAACCTTGTTAACT
ATTTCACATACAAAGCTGTGAGGACGGTTCTTCATCAGCTCTACGAAATGAATCCTCCTC
AATACACTTGGTTCTATAATTACGTCGTATCGAACAGACCAACCGATGGTAAACGATTCC
TCCGCAAACTCGGAAAGGA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2C859TF 748 0 0
G
GGAGTAATGGTGGGTGCTCTGTTTGTTGTTGGCTCATCGGTGATGGATTCATGTCTATGT
CTGGATGCTCAGACCAGGACCACCAGGAGCAAGAAGAAGATCCTTGGCAGTGCAAGAAAG
CTGGAACTTGGGAGCTCCTTTACTGGTTCAGGCATTGTTTTCAGGATTTCTTCCAAGAAG
CGTGTCCCAACAAGGATTGCGAATCGAAGAAAGAAGCTCTTGATTGTGAATGAGGACGTC
GCTGGGAACTACGATGATACCTTCGGGGATGTCAAAACGAACCTTGTTAACTATTTCACA
TACAAAGCTGTGAGGATGGTTCTTCATCAGCTCTACGAAATGAATCCTCCTCAATACACT
TGGTTCTATAATTACGTCGTATCGAACAGACCAACCGATGGTAAACGATTCCTCCGCAAA
CTCGGAAAGGAAAATCAGGAGCTTGCAGAAAGAGTGATGATCACGCGTCTCCACTTGTAT
GGCAAGTGGATCAAGAAATGCGACCATGGGAAGATATACCAAGATATATCGGATGAGAAC
TTGGCGTTGATGCGTGAACGCCTCATGGAGACGGTGATATGGCCTTCCGATGACTCGAAC
TCCGAGGTTATTGGCTGAAGAAGGCTGTGTCACAAACGCAGCATTTACTTTGCTTTCGTC
AACTCGCTTCACAATTTTAGGATCTTGAGTTTCTTTTAGTTTGATTTACATATAATGAAT
CATTAATGATACAGTCATTGAGCAT
GT

QA 2 746 2 746
DS 

RD RR2EF11JQ 661 0 0
TTCAGGCATTGTTTTCAGGATTTCTTCCAAGAAGCGTGTCCCAACAAGGATTGCGAATCG
AAGAAAGAAGCTCTTGATTGTGAATGAGGACGTCGCTGGGAGCTACGATGATACCTTCGG
GGATGTCAAAACGAACCTTGTTAACTATTTCACATACAAAGCTGTGAGGACGGTTCTTCA
TCAGCTCTACGAAATGAATCCTCCTCAATACACTTGGTTCTATAATTACGTCGTATCGAA
CAGACCAACCGATGGTAAACGATTCCTCCGCAAACTCGGAAAGGAAAATCAGGAGCTTGC
AGAAAGAGTGATGATCACGCGTCTCCACTTGTATGGCAAGTGGATCAAGAAATGCGACCA
TGGGAAGATATACCAAGATATATCGGATGAGAACTTGGCGTTGATGCGTGAACGCCTCAT
GGAGACGGTGATATGGCCTTCCGATGACTCGAACTCCGAGGTTATTGGCTGAAGAAGGCT
GTGTCACAAACGCAGCATTTACTTTGCTTTCGTCAACTCGCTTCACAATTTTAGGATCTT
GAGTTTCTTTTAGTTTGATTTACATATAATGAATCATTAATGATACAGTCATTGAGCATT
GTGTATATCAGTATATGTATCTATTCTTTCTTGGCATGTACTACTATTTATGACAATAGG
C

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2C859JQ 592 0 0
CTTGATTGTGAATGAGGACGTCGCTGGGAACTACGATGATACCTTCGGGGATGTCAAAAC
GAACCTTGTTAACTATTTCACATACAAAGCTGTGAGGATGGTTCTTCATCAGCTTTACGA
AATGAATCCTCCTCAATACACTTGGTTCTATAATTACGTCGTATCGAACAGACCAACCGA
TGGTAAACGATTCCTCCGCAAACTCGGAAAGGAAAATCAGGAGCTTGCAGAAAGAGTGAT
GATCACGCGTCTCCACTTGTATGGCAAGTGGATCAAGAAATGCGACCATGGGAAGATATA
CCAAGATATATCGGATGAGAACTTGGCGTTGATGCGTGAACGCCTCATGGAGACGGTGAT
ATGGCCTTCCGATGACTCGAACTCCGAGGTTATTGGCTGAAGAAGGCTGTGTCACAAACG
CAGCATTTACTTTGCTTTCGTCAACTCGCTTCACAATTTTAGGATCTTGAGTTTCTTTTA
GTTTGATTTACATATAATGAATCATTAATGATACAGTCATTGAGCATTGTGTATATCAGT
ATATGTATCTATTCTTTCTTGGCATGTACTACTATTTATGACAATAGGGAAA

QA 1 592 1 592
DS 



CO CL830Contig2 814 2 6 U
CATCGAAAAAGAGGGAAAAGTTTTGATCTTGTTGTTTGGAGTAATGGTGGGTGCTCTGTT
TGTTGTTGGCTCATCGGTGATGGATTCACGTCTATGTCTGGATGCTCAGACCAGGACCAG
GAGCAAGAAGAAGATCCTTGGCAGTGCAAGAAAGCTGGAACTAGGGAGCTCCTTTACTGG
TTCAGGCATTGTTTTCAGGATTTCTTCTAAGAAGCGTGTCCCAAGGATTGCGAATCGAAG
AAAGAAGCTCTTGATTGTGAGTGAAGACGTTGCTGGGAACTACGATGATACCTTCGGGGA
TGTCAAAACGAACCTTGTTAACTATTTCACATACAAAGCTGTGAGGACGGTTCTTCATCA
GCTCTACGAAATGAATCCTCCTCAATACACTTGGTTCTATAATTACGTCGTATCGAACAG
ACCAACCGATGGTAAACGATTCCTCCGCAAACTCGGCAAGGAAAATCAGGAGCTTGCAGA
AAGAGTGATGATCACGCGTCTACACTTGTATGGCAAGTGGATCAAGAAATGCGACCATGG
GAAGATATACCAAGATATATCGGATGAGAACTTGGCGTTGATGCGTGAACGCCTCATGGA
GACCGTGATATGGCCTTCCGATGACTCGAACTCAGAGGTTGTTGGTTGAACAAAGCTGTC
ATAACGCAGCGATTTGCTTTCGTCAATTCGCTTCACAATTTTAGGACCTTGAGTTTCTTC
TCTTAGTTTGATTTACATATAATGATACAGTCATTGAGCATTGTGTATATCAGTATATGT
ATCTATTCTTTCTTGGCATGTACTACTATTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX33JQ C 1
AF RR2E983TF U 111
BS 1 115 RR2GX33JQ
BS 116 258 RR2E983TF
BS 259 259 RR2GX33JQ
BS 260 690 RR2E983TF
BS 691 691 RR2GX33JQ
BS 692 814 RR2E983TF

RD RR2GX33JQ 804 0 0
CATCGAAAAAGAGGGAAAAGTTTTGATCTTGTTGTTTGGAGTAATGGTGGGTGCTCTGTT
TGTTGTTGGCTCATCGGTGATGGATTCACGTCTATGTCTGGATGCTCAGACCAGGACCAG
GAGCAAGAAGAAGATCCTTGGCAGTGCAAGAAAGCTGGAACTAGGGAGCTCCTTTACTGG
TTCAGGCATTGTTTTCAGGATTTCTTCTAAGAAGCGTGTCCCAAGGATTGCGAATCGAAG
AAAGAAGCTCTTGATTTTGAGTGAAGACGTTGCTGGGAACTACGATGATACCTTCGGGGA
TGTCAAAACGAACCTTGTTAACTATTTCACATACAAAGCTGTGAGGACGGTTCTTCATCA
GCTCTACGAAATGAATCCTCCTCAATACACTTGGTTCTATAATTACGTCGTATCGAACAG
ACCAACCGATGGTAAACGATTCCTCCGCAAACTCGGCAAGGAAAATCAGGAGCTTGCAGA
AAGAGTGATGATCACGCGTCTACACTTGTATGGCAAGTGGATCAAGAAATGCGACCATGG
GAAGATATACCAAGATATATCGGATGAGAACTTGGCGTTGATGCGTGAACGCCTCATGGA
GACCGTGATATGGCCTTCCGATGACTCGAACTCAGAGGTTGTTGGTTGAACAAGGCTGTC
ATAACGCAGCGATTTGCTTTCGTCAATTCGCTTCACAATTTTAGGACCTTGAGTTTCTTC
TCTTAGTTTGATTTACATATAATGATACAGTCATTGAGCATTGTGTATATCAGTATATGT
ATCTATTCTTTCTTGGCATGTACT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2E983TF 704 0 0
AGGGG
ACCAGGAGCAAGAAGAAGATCCTTGGCAGTGCAAGAAAGCTGGAACTAGGGAGCTCCTTT
ACTGGTTCAGGCATTGTTTTCAGGATTTCTTCTAAGAAGCGTGTCCCAAGGATTGCGAAT
CGAAGAAAGAAGCTCTTGATTGTTAGTGAAGACGTTGCTGGGAACTACGATGATACCTTC
GGGGATGTCAAAACGAACCTTGTTAACTATTTCACATACAAAGCTGTGAGGACGGTTCTT
CATCAGCTCTACGAAATGAATCCTCCTCAATACACTTGGTTCTATAATTACGTCGTATCG
AACAGACCAACCGATGGTAAACGATTCCTCCGCAAACTCGGCAAGGAAAATCAGGAGCTT
GCAGAAAGAGTGATGATCACGCGTCTACACTTGTATGGCAAGTGGATCAAGAAATGCGAC
CATGGGAAGATATACCAAGATATATCGGATGAGAACTTGGCGTTGATGCGTGAACGCCTC
ATGGAGACCGTGATATGGCCTTCCGATGACTCGAACTCAGAGGTTGTTGGTTGAACAAAG
CTGTCATAACGCAGCGATTTGCTTTCGTCAATTCGTTTCACAATTTTAGGACCTTGAGTT
TCTTCTCTTAGTTTGATTTACATATAATGATACAGTCATTGAGCATTGTGTATATCAGTA
TATGTATCTATTCTTTCTTGGCATGTACTACTATTTATG

QA 6 704 6 704
DS 



AS 2 6

CO CL831Contig1 1109 2 2 U
GATTAGTAAAAACTTTATAGTGGAAATGATAATTAAGAGAGGATTCTACAGGCAAACACA
CACAAATAGAGATGCTTATGGTGTTCTAGCGACACACAATAGGACACTGTTATCGAGTTA
ACTATTTAAGCACACACTCAGAGAAAGTTACAGAGAGCAAAACATAGAGAAAGAGAGCTA
CACAGAGACCATATGGACGCATGCAGTTTCAGAATCATGTTTATTTGGCTTCATCATCAG
CCTTTAGGGTTCACCACCGCCTGAGTCTGGTTCAGTCCATACTTTTCTCTGATGCGAGAG
CTCCAGTTTTCACTCTTGCTAGGCCCAGCAGAAGCTTGGTTTGCTTGAGAACCAAGAAGT
GGATCCCAAGCTCTACTCCTCGGGTTCTCGTAGTCTTCCTCATCGTCAAGCTCGGGTCTC
TTAGGTGAAACCATAGCTCTGAAAACCATGGCTAGTAGCAGTGACAGTAGCTGGGCGACT
ACTACAGCAGCCCCGACCCATTTGCATATATCAATGTTGTCCTCAATGAAAGCCCGAAGA
CTATTGAGCTCTCCAGTTGGATCATACGGAAGATCCTTTTCCCAGTGACGATCAATGGCG
ATGAATGCAACAAGGGCAGCTTCAAGGAGAATGAGCAGAGTTTTGAGAATAGAGTAGAAA
CACAAGCAACAGGTATTGATAGCTTCAGCAGCAATGAAACCAATGAAGGTAACAATGCAG
ACCAATACACCAACCGCCATAAAAGAGTAGATGAACCATGGAGCAGGAAGGTCCAAGGAA
CGGAGGCTAAACCCATGATCACCACCACCACTAGACCCTAGAACGACGCTCGCCATGAGA
CCAGCAGGATTATTCAAAGTGGGAGGATCGACGGGGACGTGACGGTGGAATTGATCGAGC
ATCCATATGGAGTAGATGATGATGGAAACACCGAAGAAAGCTTGAACGAAATTGAGGATC
TTGAGAGTTGAGGCGAACGAAATATGACAGCAATTATGCCTCATTTCTTCTTTCGATTAC
GAAAAGATGATTGATTGATAGATGGATGGATAAACCCGGAAGCTTTTTTTTCAAAGGTCG
TCTTCTTGGCTGTAAAGGTGTCTGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F074JQ U 1
AF RR2BT32TF C 540
BS 1 756 RR2F074JQ
BS 757 1109 RR2BT32TF

RD RR2F074JQ 756 0 0
GATTAGTAAAAACTTTATAGTGGAAATGATAATTAAGAGAGGATTCTACAGGCAAACACA
CACAAATAGAGATGCTTATGGTGTTCTAGCGACACACAATAGGACACTGTTATCGAGTTA
ACTATTTAAGCACACACTCAGAGAAAGTTACAGAGAGCAAAACATAGAGAAAGAGAGCTA
CACAGAGACCATATGGACGCATGCAGTTTCAGAATCATGTTTATTTGGCTTCATCATCAG
CCTTTAGGGTTCACCACCGCCTGAGTCTGGTTCAGTCCATACTTTTCTCTGATGCGAGAG
CTCCAGTTTTCACTCTTGCTAGGCCCAGCAGAAGCTTGGTTTGCTTGAGAACCAAGAAGT
GGATCCCAAGCTCTACTCCTCGGGTTCTCGTAGTCTTCCTCATCGTCAAGCTCGGGTCTC
TTAGGTGAAACCATAGCTCTGAAAACCATGGCTAGTAGCAGTGACAGTAGCTGGGCGACT
ACTACAGCAGCCCCGACCCATTTGCATATATCAATGTTGTCCTCAATGAAAGCCCGAAGA
CTATTGAGCTCTCCAGTTGGATCATACGGAAGATCCTTTTCCCAGTGACGATCAATGGCG
ATGAATGCAACAAGGGCAGCTTCAAGGAGAATGAGCAGAGTTTTGAGAATAGAGTAGAAA
CACAAGCAACAGGTATTGATAGCTTCAGCAGCAATGAAACCAATGAAGGTAACAATGCAG
ACCAATACACCAACCGCCATAAAAGAGTAGATGAAC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2BT32TF 570 0 0
ACTATTGAGCTCTCCAGTTGGATCATACGGAAGATCCTTTTCCCAGTGACGATCAATGGC
GATGAATGCAGCAAGGGCAGCTTCAAGTAGAATGAGCAGAGTTTTGAGAATAGAGTAGAA
ACACAAGCAACAGGTATTGATAGCTTCAGCAGCAATGAAACCAATGAAGGTAACAATGCA
GACCAATACACCAACCGCCATAAAAGAGTAGATGAACCATGGAGCAGGAAGGTCCAAGGA
ACGGAGGCTAAACCCATGATCACCACCACCACTAGACCCTAGAACGACGCTCGCCATGAG
ACCAGCAGGATTATTCAAAGTGGGAGGATCGACGGGGACGTGACGGTGGAATTGATCGAG
CATCCATATGGAGTAGATGATGATGGAAACACCGAAGAAAGCTTGAACGAAATTGAGGAT
CTTGAGAGTTGAGGCGAACGAAATATGACAGCAATTATGCCTCATTTCTTCTTTCGATTA
CGAAAAGATGATTGATTGATAGATGGATGGATAAACCCGGAAGCTTTTTTTTCAAAGGTC
GTCTTCTTGGCTGTAAAGGTGTCTGTCTCC

QA 1 570 1 570
DS 



CO CL831Contig2 1086 4 24 U
GGGATGACGGACACCTTTACAGCCAAGAAGACGACCTTTGAAAAAAAGCTTCCGGGTTTA
TCCATCAATCAATCAATCTTCTTTTCGTAATCGGAAAAAATGAGGCATAATTGCTGCCAT
ATTTCGTTCGCCTCAACTCTCAAGATCCTCAATTTCGTTCAAGCTTTCTTCGGTGTTTCC
ATCATCATCTACTCCATATGGATGCTCGATCAATACCACCGTCACGTCCCCGTCGATCCT
CCCACTTTGAACAATCCTGCTGGTCTCATGGCGAGCGTCGTTCTAGGGTCTAGTGGTGGT
GGTGGTCATCATGGGTTTAGCCTCCGTTCCTTAGACCTTCCTGCTCCATGGTTCATCTAC
TCTTTTATGGCGGTTGGTGTATTGGTCTGCATTGTTACCTTCATTGGTTTCATTGCTGCT
GAAGCTATCAATACCTGTTGCTTGTGTTTCTACTCTATTCTCAAAACTCTGCTCATTCTA
CTTGAAGCTGCCCTTGTTGCATTCATCGCCATTGATCGTCACTGGGAAAAGGATCTTCCG
TATGATCCAACTGGAGAGCTCAATAGTCTTCGGGCTTTCATTGAGGACAACATTGATATA
TGCAAATGGGTCGGGGCTGCTGTAGTAGTCGTCCAGCTACTGTCACTGCTACTAGCCATG
GTTCTCAGAGCTATGGTTTCACCTAAGAGACCCGAGCTTGACGATGAGGAAGACTACGAG
AACCCGAGGAGTAGAGCTTGGGATCCACTTCTTGGTTCTCAAGCAAACCAGGCTTCTGCT
GGGCCTAGCAAGAGTGAAAACTGGAGCTCTCGCATCAGAGAAAAGTATGGACTGAACCAG
ACTCAGGCGGTGGTGAACCCTAAAGACTGATGAAGAAGCCAAATAAACATGATTCTGAAA
CTGCATGCGTCCATATGGTCTCTGTGTAGCTCTCTTTCTCTATGTTTTGCTCTCTATAAC
TTTCTCTTAGTGTGCTTAAATAGTTAACTCGACAACAGTGTCCTATTGTGTGCCACACCA
ACCGCATAAGCATCTCTATTTGTGTGTTTGCCTGTAGATACCTCTCTAAATTATCATTTC
CACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2F074TF U 1
AF RR2AG56TF U 90
AF RR2AG56JQ C 326
AF RR2DD76JQ C 368
BS 1 120 RR2F074TF
BS 121 121 RR2AG56TF
BS 122 131 RR2F074TF
BS 132 132 RR2AG56TF
BS 133 212 RR2F074TF
BS 213 213 RR2AG56TF
BS 214 251 RR2F074TF
BS 252 252 RR2AG56TF
BS 253 272 RR2F074TF
BS 273 273 RR2AG56TF
BS 274 303 RR2F074TF
BS 304 306 RR2AG56TF
BS 307 332 RR2F074TF
BS 333 333 RR2AG56TF
BS 334 479 RR2F074TF
BS 480 480 RR2AG56TF
BS 481 631 RR2F074TF
BS 632 632 RR2AG56TF
BS 633 770 RR2F074TF
BS 771 842 RR2AG56TF
BS 843 865 RR2AG56JQ
BS 866 866 RR2DD76JQ
BS 867 1066 RR2AG56JQ
BS 1067 1086 RR2DD76JQ

RD RR2F074TF 774 0 0
GGGATGACGGACACCTTTACAGCCAAGAAGACGACCTTTGAAAAAAAGCTTCCGGGTTTA
TCCATCAATCAATCAATCTTCTTTTCGTAATCGGAAAAAATGAGGCATAATTGCTGCCAT
GTTTCGTTCGCTTCAACTCTCAAGATCCTCAATTTCGTTCAAGCTTTCTTCGGTGTTTCC
ATCATCATCTACTCCATATGGATGCTCGATCAGTACCACCGTCACGTCCCCGTCGATCCT
CCCACTTTGAATAATCCTGCTGGTCTCATGGCTAGCGTCGTTCTAGGGTCTAGTGGTGGT
GGT***CATCATGGGTTTAGCCTCCGTTCCTTGGACCTTCCTGCTCCATGGTTCATCTAC
TCTTTTATGGCGGTTGGTGTATTGGTCTGCATTGTTACCTTCATTGGTTTCATTGCTGCT
GAAGCTATCAATACCTGTTGCTTGTGTTTCTACTCTATTCTCAAAACTCTGCTCATTCTC
CTTGAAGCTGCCCTTGTTGCATTCATCGCCATTGATCGTCACTGGGAAAAGGATCTTCCG
TATGATCCAACTGGAGAGCTCAATAGTCTTCGGGCTTTCATTGAGGACAACATTGATATA
TGCAAATGGGTCGGGGCTGCTGTAGTAGTCGCCCAGCTACTGTCACTGCTACTAGCCATG
GTTCTCAGAGCTATGGTTTCACCTAAGAGACCCGAGCTTGACGATGAGGAAGACTACGAG
AACCCGAGGAGTAGAGCTTGGGATCCACTTCTTGGTTCTCAAGCAAACCA
AGCT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2AG56TF 753 0 0
GAAAGAAG
AAATGAGGCATAATTGTTGCCATATTTCGTTCGCCTCAACTCTCAAGATCCTCAATTTCG
TTCAAGCTTTCTTCGGTGTTTCCATCATCATCTACTCCATATGGATGCTCGATCAATTCC
ACCGTCACGTCCCCGTCGATCCTCCCACTTTGAACAATCCTGCTGGTCTCATGGCGAGCG
TCGTTCTAGGGTCTAGTGGTGGTGGTGGTGATCATGGGTTTAGCCTCCGTTCCTTAGACC
TTCCTGCTCCATGGTTCATCTACTCTTTTATGGCGGTTGGTGTATTGGTCTGCATTGTTA
CCTTCATTGGTTTCATTGCTGCTGAAGCTATCAATACCTGTTGCTTGTGTTTCTACTCTA
TTCTCAAAACTCTGCTCATTCTACTTGAAGCTGCCCTTGTTGCATTCATCGCCATTGATC
GTCACTGGGAAAAGGATCTTCCGTATGATCCAACTGGAGAGCTCAATAGTCTTCGGGCTT
TCATTGAGGACAACATTGATATATGCAAATGGGTCGGGGCTGCTGTAGTAGTCGTCCAGC
TACTGTCACTGCTACTAGCCATGGTTCTCAGAGCTATGGTTTCACCTAAGAGACCCGAGC
TTGACGATGAGGAAGACTACGAGAACCCGAGGAGTAGAGCTTGGGATCCACTTCTTGGTT
CTCAAGCAAACCAGGCTTCTGCTGGGCCTAGCAAGAGTGAAAACTGGAGCTCTCGCATCA
GAGAAAAGTATGGACTGAACCAGAC

QA 9 753 9 753
DS 

RD RR2AG56JQ 742 0 0
GTTCCTTAGACCTTCCTGCTCCATGGTTCATCTACTCTTTTATGGCGGTTGGTGTATTGG
TCTGCATTGTTACCTTCATTGGTTTCATTGCTGCTGAAGCTATCAATACCTGTTGCTTGT
GTTTCTACTCTATTCTCAAAACTCTGCTCATTCTACTTGAAGCTGCCCTTGTTGCATTCA
TCGCCATTGATCGTCACTGGGAAAAGGATCTTCCGTATGATCCAACTGGAGAGCTCAATA
GTCTTCGGGCTTTCATTGAGGACAACATTGATATATGCAAATGGGTCGGGGCTGCTGTAG
TAGTCGTCCAGCTACTGTCACTGCTACTAGCCATGGTTCTCAGAGCTATGGTTTCACCTA
AGAGACCCGAGCTTGACGATGAGGAAGACTACGAGAACCCGAGGAGTAGAGCTTGGGATC
CACTTCTTGGTTCTCAAGCAAACCAGGCTTCTGCTGGGCCTAGCAAGAGTGAAAACTGGA
GCTCTCGCATCAGAGAAAAGTATGGACTGAACCAGACTCAGGCGGTGGTGAACCCTAAAG
GCTGATGAAGAAGCCAAATAAACATGATTCTGAAACTGCATGCGTCCATATGGTCTCTGT
GTAGCTCTCTTTCTCTATGTTTTGCTCTCTATAACTTTCTCTTAGTGTGCTTAAATAGTT
AACTCGACAACAGTGTCCTATTGTGTGCCACACCAACCGCATAAGCATCTCTATTTGTGT
GTTTGCCTGTAGATACCTCTC
C

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2DD76JQ 719 0 0
TGGCGGTCGGTGTATTGGTCTGCATTGTTACCTTCATTGGTTTCATTGCTGCTGAAGCTA
TCAATACCTGTTGCTTGTGTTTCTACTCTATTCTCAAAACTCTGCTCATTCTACTTGAAG
CTGCCCTTGTTGCATTCATCGCCATTGATCGTCACTGGGAAAAGGATCTTCCGTATGATC
CAACTGGAGAGCTCAATAGTCTTCGGGCTTTCATTGAGGACAACATTGATATATGCAAAT
GGGTCGGGGCTGCTGTAGTAGTCGTCCAGCTACTGTCACTGCTACTAGCCATAGTTCTCA
GAGCTATGGTTTCACCTAAGAGACCCGAGCTTGACGATGAGGAAGACTACGAGAACCCGA
GGAGTAGAGCTTGGGATCCACTTCTTGGTTCTCAAGCAAACCAGGCTTCTGCTGGGCCTA
GCAAGAGTGAAAACTGGAGCTCTCGCATCAGAGAAAAGTATGGACTGAACCAGACTCAGG
CGGTGGTGAACCCTAAAGACTGATGATGAAGCCAAATAAACATGATTCTGAAACTGCATG
CGTCCATATGGTCTCTGTGTAGCTCTCTTTCTCTATGTTTTGCTCTCTATAACTTTCTCT
TAGTGTGCTTAAATAGTTAACTCGACAACAGTGTCCTATTGTGTGCCACACCAACCGCAT
AAGCATCTCTATTTGTGTGTTTGCCTGTAGATACCTCTCTAAATTATCATTTCCACTAC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 2 7

CO CL832Contig1 704 2 1 U
GCGACAGGAGTGTCACTCAACATAACAAGCATCTCTGCATTCCTAAACACCTCAACAGAA
GCTCCAAACTTTGTGGTCGAACTCATACAGAGCAGTCCCACGTCGCTCGTTCTCATCCTC
GACCTCCCTCATCGCAAGGACCTCGTTCGTCACCCTGGCTATCTCGAGACATATTACCAA
GACACCGCTCTCGATACTCATCGCCAGTCACTCCTCAAGCTTCCCGAGGTCAAACCCTAC
GTCTCGCCTTCTCTCTTTGTCCGCTCTGCTTTCTCTCCTACCGCTTCCATGCTTAAAATC
GACGCGGAGGAAGGGGAGAGGTTGGAGGAGATTTTGAGGGAGCATGTGAGTCCAGCTGCT
AAGCAAGTCCTTGAGGTTTGGCTTGAGCGTTGCGCGAGGGAGGAAGAGAAGAGAGTGTTG
GGAGAAGAAGAGAAGTTAGAGTTGGAAAGAAGAGACAAAAGCTTCAGAAGGAAGAGCATA
GAGGAAGATTTGGATTTACAGTTTCCGAGAATGTTTGGAGAAGAAGTTTCTTCGCGTGTT
ATACACGCTATCAAAGAAGCTTTCGGGGTTCTCTAGATTATTATATCAGTTAAAGACTTA
GCTAATTATCGTCATTGTACTAATAATATACAACGTAAACAATATCTTTATAAAGCCTTA
CAAGTAAATAGCGTTCGTAACGCAGCTTGTGAAAACGTTTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AS42TF U 1
AF RR2AS42JQ C 0
BS 1 704 RR2AS42TF

RD RR2AS42TF 704 0 0
GCGACAGGAGTGTCACTCAACATAACAAGCATCTCTGCATTCCTAAACACCTCAACAGAA
GCTCCAAACTTTGTGGTCGAACTCATACAGAGCAGTCCCACGTCGCTCGTTCTCATCCTC
GACCTCCCTCATCGCAAGGACCTCGTTCGTCACCCTGGCTATCTCGAGACATATTACCAA
GACACCGCTCTCGATACTCATCGCCAGTCACTCCTCAAGCTTCCCGAGGTCAAACCCTAC
GTCTCGCCTTCTCTCTTTGTCCGCTCTGCTTTCTCTCCTACCGCTTCCATGCTTAAAATC
GACGCGGAGGAAGGGGAGAGGTTGGAGGAGATTTTGAGGGAGCATGTGAGTCCAGCTGCT
AAGCAAGTCCTTGAGGTTTGGCTTGAGCGTTGCGCGAGGGAGGAAGAGAAGAGAGTGTTG
GGAGAAGAAGAGAAGTTAGAGTTGGAAAGAAGAGACAAAAGCTTCAGAAGGAAGAGCATA
GAGGAAGATTTGGATTTACAGTTTCCGAGAATGTTTGGAGAAGAAGTTTCTTCGCGTGTT
ATACACGCTATCAAAGAAGCTTTCGGGGTTCTCTAGATTATTATATCAGTTAAAGACTTA
GCTAATTATCGTCATTGTACTAATAATATACAACGTAAACAATATCTTTATAAAGCCTTA
CAAGTAAATAGCGTTCGTAACGCAGCTTGTGAAAACGTTTACTC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2AS42JQ 705 0 0
GCGACAG
GGAGTGTCACTCAACATAACAAGCATCTCTGCATTCCTAAACACCTCAACAGAAGCTCCA
AACTTTGTGGTCGAACTCATACAGAGCAGTCCCACGTCGCTCGTTCTCATCCTCGACCTC
CCTCATCGCAAGGACCTCGTTCGTCACCCTGGCTATCTCGAGACATATTACCAAGACACC
GCTCTCGATACTCATCGCCAGTCACTCCTCAAGCTTCCCGAGGTCAAACCCTACGTCTCG
CCTTCTCTCTTTGTCCGCTCTGCTTTCTCTCCTACCGCTTCCATGCTTAAAATCGACGCG
GAGGAAGGGGAGAGGTTGGAGGAGATTTTGAGGGAGCATGTGAGTCCAGCTGCTAAGCAA
GTCCTTGAGGTTTGGCTTGAGCGTTGCGCGAGGGAGGAAGAGAAGAGAGTGTTGGGAGAA
GAAGAGAAGTTAGAGTTGGAAAGAAGAGACAAAAGCTTCAGAAGGAAGAGCATAGAGGAA
GATTTGGATTTACAGTTTCCGAGAATGTTTGGAGAAGAAGTTTCTTCGCGTGTTATACAC
GCTATCAAAGAAGCTTTCGGGGTTCTCTAGATTATTATATCAGTTAAAGACTTAGCTAAT
TATCGTCATTGTACTAATAATATACAACGTAAACAATATCTTTATAAAGCCTTACAAGTA
AATAGCGTTCGTAACGCAGCTTGTGAAAACGTTTACTC

QA 8 705 8 705
DS 



CO CL832Contig2 1109 5 12 U
GGACAGCCACATATAATAAAAGGATGGCGATGATATTATGCAACACTCTCTACACTTCTT
CTCCGCCCTTTCTCTCGCCGTTAACTTCGATACGATCAAAACCGCCGCGATTCTCAAAGT
CACTCACAGTCCGAGCTCAATTCCAGTCCATGGATGATCATCAAAACGATCTTCTCCGTC
AGAAATTCATGGAGTTTCCATACGTCTCGCCCACGCGCAGGGCTCTAATGGTTGATCTCA
TGTCGACGTTGGAGGATCGCCTCCACTCGCAACTCCTTCCCTGTACCCTCCCGCCTGATG
TAAGGAACTTCAAGAACCCCAACGGTTCCGCCGAAGCGTCTCTTCACATCAGATCCGGCG
AGAAATCTTCTCCGATTGATTTTGTTATAGGAAGTTGGATACACGTCAAGATTCCGACAG
GAGTGTCACTCAACATAACAAGCATCTCTGCATTCCTAAACACCTCAACAGAAGCTCCAA
ACTTTGTGGTCGAACTCATACAGAGCAGTCCCACGTCGCTCGTTCTCATCCTCGACCTCC
CTCATCGCAAAGACCTCGTTCGTCACCCTGGTTATCTCGAGACATATTACCAAGACACTG
CTCTCGATACTCATCGCCAGTCACTCCTCAAGCTTCCCGAGGTCAAACCCTACGTCTCGC
CTTCTCTCTTTGTCCGCTCTGCTTTCTCTCCTACCGCTTCCATGCTTAAAATCGACGCGG
AGGAAGGGGAGAGGTTGGAGAAGATTTTGAGGGAGCATGTGAGTCCAGCTGCTAAGCAAG
TCCTCGAGGTTTGGCTGGAGCGTTGCGTGAAGGAGGAAGAGGGAGAGAGGAGAGTGGTGG
GAGAAGAAGAGAAGTTGGAGTTGGAAAGAAGAGATAAAAGCTTCAGAAAGAAGAGCATAG
AGGAAGATTTGGATTTACAGTTTCCGAGAATGTTTGGAGAAGAAGTTTCTTCGCGTGCTA
TACACGCTATCAAGGAAGCTTTCGGGGTTCTCTAGATTATTATATCAGTTAAAGACTTAG
CCAATTATCGTCATTGTACTAATAATATACAACTTAAACAATATCTTTATAAAACCTTAC
AAGCAAATAGCGTTCGTACAACAGTCTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D582TF U 1
AF RR2GM18TF U 1
AF RR2E007TF U 3
AF RR2E007JQ C 400
AF RR2D582JQ C 529
BS 1 132 RR2D582TF
BS 133 133 RR2GM18TF
BS 134 267 RR2D582TF
BS 268 268 RR2GM18TF
BS 269 728 RR2D582TF
BS 729 729 RR2E007TF
BS 730 764 RR2D582TF
BS 765 788 RR2E007TF
BS 789 789 RR2E007JQ
BS 790 803 RR2E007TF
BS 804 1083 RR2E007JQ
BS 1084 1109 RR2D582JQ

RD RR2D582TF 764 0 0
GGACAGCCACATATAATAAAAGGATGGCGATGATATTATGCAACACTCTCTACACTTCTT
CTCCGCCCTTTCTCTCGCCGTTAACTTCGATACGATCAAAACCGCCGCGATTCTCAAAGT
CACTCACAGTCCTAGCTCAATTCCAGTCCATGGATGATCATCAAAACGATCTTCTCCGTC
AGAAATTCATGGAGTTTCCATACGTCTCGCCCACGCGCAGGGCTCTAATGGTTGATCTCA
TGTCGACGTTGGAGGATCGCCTCCACTAGCAACTCCTTCCCTGTACCCTCCCGCCTGATG
TAAGGAACTTCAAGAACCCCAACGGTTCCGCCGAAGCGTCTCTTCACATCAGATCCGGCG
AGAAATCTTCTCCGATTGATTTTGTTATAGGAAGTTGGATACACGTCAAGATTCCGACAG
GAGTGTCACTCAACATAACAAGCATCTCTGCATTCCTAAACACCTCAACAGAAGCTCCAA
ACTTTGTGGTCGAACTCATACAGAGCAGTCCCACGTCGCTCGTTCTCATCCTCGACCTCC
CTCATCGCAAAGACCTCGTTCGTCACCCTGGTTATCTCGAGACATATTACCAAGACACTG
CTCTCGATACTCATCGCCAGTCACTCCTCAAGCTTCCCGAGGTCAAACCCTACGTCTCGC
CTTCTCTCTTTGTCCGCTCTGCTTTCTCTCCTACCGCTTCCATGCTTAAAATCGACGCGG
AGGAAGGG*AGAGGTTGGAGAAGATTTTGAGGGAGCATGTGAGT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2GM18TF 722 0 0
GGAC
AGCCACATATAAAGAAAAGATGGCGATGATATTATGCAACACTCTCTACTCTTCTTCTCC
GCCCTTTCTCTCGCCGTTAACTTCGATACGATCAAAACCGCCGCGATTCTCAAAGTCACT
CACAGTCCGAGCTCAATTCCAGTCCATGGATGATCATCAAAACGATCTTCTCCGTCAGAA
ATTCATGGAGTTTCCATACGTCTCGCCCACGCGCAGGGCTCTAATGGCTGATCTCATGTC
GACGTTGGAGGATCGCCTCCACTCGCAACTCCTTCCCTGTACCCTCCCTCCGGATGTACG
GAACTTCAAGAACCCTAACGGTTCCGCCGAAGCGTCTCTTCACATCAGATCCGGCGAGAA
ATCTTCTCCGATTGATTTTGTTATAGGAAGTTGGATACACGTCAAGGTTCCGACAGGAGT
GTCACTCAACATAACAAGCATCTCTGCATTCCTAAACACCTCAACAGAAGCTCCAAACTT
TGTGGTCGAACTCATACAGAGCAGTCCCACGTCGCTCGTTCTCATCCTCGACCTCCCCCA
TCGCAAAGACCTCGTTCGTCACCCTGGCTATCTCGAGACATATTACCAAGACACCGCTCT
CGATACTCATCGCCAGTCACTCCTCAAGCTTCCCGAGGTCAAACCCTACGTCTCGCCTTC
TCTCTTTGTCCGCTCTGCTTTCTCTCCTACCGCTTCCATGCTTAAA*TCGACGCGGAG

QA 5 722 5 722
DS 

RD RR2E007TF 812 0 0
GG
AGCCACATATAATAAAAGGATGGCGATGATATTATGCAACACTCTCTACACTTCTTCTCC
GCCCTTTCTCTCGCCGTTAACTTCGATACGATCAAAACCGCCGCGATTCTCAAAGTCACT
CACAGTCCGAGCTCAATTCCAGTCCATGGATGATCATCAAAACTATCTTCTCCGTCAGAA
ATTCATGGAGTTTCCATACGTCTCGCCCACGCGCAGGGCTCTAATGGTTGATCTCATGTC
GACGTTGGAGGATCGCCTCCACTCGCAGCTCCTTCCCTGTACCCTCCCGCCTGATGTAAG
GAACTTCAAGAACCCCAACGGTTCCGCCGAAGCGTCTCTTCACATCAGATCCGGCGAGAA
ATCTTCTCCGATTGATTTTGTTATAGGAAGTTGGATACACGTCAAGATTCCGACAGGAGT
GTCACTCAACATAACAAGCATCTCTGCATTCCTAAACACCTCAACAGAAGCTCCAAACTT
TGTGGTCGAACTCATACAGAGCAGTCCCACGTCGCTCGTTCTCATCCTCGACCTCCCTCA
TCGCAAAGACCTCGTTCGTCACCCTGGTTATCTCGAGACATATTACCAAGACACTGCTC*
*GATACTCATCGCCAGTCACTCCTCAAGCTTCCCGAGGTCAAACCCTACGTCTCGCCTTC
TCTCTTTGTCCGCTCTGCTTTCTCTCCTACCGCTTCCATGCTTAAAATCGACGCGGAGGA
AGGGGAGAGGTTGGAGGAGATTTTGAGG*AGCATGTGAGTCCAGCTGCTAAGCAAGTCCT
CGAG*TTTGGCTGGAGCGT
GCGTGAAGAGA

QA 3 801 3 801
DS 

RD RR2E007JQ 685 0 0
TACACGTCAAGATTCCGACAGGAGTGTCACTCAACATAACAAGCATCTCTGCATTCCTAA
ACACCTCAACAGAAGCTCCAAACTTTGTGGTCGAACTCATACAGAGCAGTCCCACGTCGC
TCGTTCTCATCCTCGACCTCCCTCATCGCAAAGACCTCGTTCGTCACCCTGGTTATCTCG
AGACATATTACCAAGACACTGCTC**GATACTCATCGCCAGTCACTCCTCAAGCTTCCCG
AGGTCAAACCCTACGTCTCGCCTTCTCTCTTTGTCCGCTCTGCTTTCTCTCCTACCGCTT
CCATGCTTAAAATCGACGCGGAGGAAGGGGAGAGGTTGGAGGAGATTTTGAGGGAGCATG
TGAGTCCAGCTGCTAAGCAAGTCCTCGAGGTTTGGCTGGAGCGTTGCGTGAAGGAGGAAG
AGGGAGAGAGGAGAGTGGTGGGAGAAGAAGAGAAGTTGGAGTTGGAAAGAAGAGATAAAA
GCTTCAGAAAGAAGAGCATAGAGGAAGATTTGGATTTACAGTTTCCGAGAATGTTTGGAG
AAGAAGTTTCTTCGCGTGCTATACACGCTATCAAGGAAGCTTTCGGGGTTCTCTAGATTA
TTATATCAGTTAAAGACTTAGCCAATTATCGTCATTGTACTAATAATATACAACTTAAAC
AATATCTTTATAAAACCTTACAAG
C

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2D582JQ 581 0 0
TCCTCGACCTCCCTCATCGCAAAGACCTCGTTCGTCACCCTGGTTATCTCGAGACATATT
ACCAAGACACTGCTCTCGATACTCATCGCCAGTCACTCCTCAAGCTTCCCGAGGTCAAAC
CCTACGTCTCGCCTTCTCTCTTTGTCCGTTCTGCTTTCTCTCCTACCGCTTCCATGCTTA
AAATCGACGCGGAGGAAGGGGAGAGGTTGGAGAAGATTTTGAGGGAGCATGTGAGTCCAG
CTGCTAAGCAAGTCCTCGAGGTTTGGCTGGAGCGTTGCGTGAAGGAGGAAGAGGGAGAGA
GGAGAGTGGTGGGAGAAGAAGAGAAGTTGGAGTTGGAAAGAAGAGATAAAAGCTTCAGAA
AGAAGAGCATAGAGGAAGATTTGGATTTACAGTTTCCGAGAATGTTTGGAGAAGAAGTTT
CTTCGCGTGCTATACACGCTATCAAGGAAGCTTTCGGGGTTCTCTAGATTATTATATCAG
TTAAAGACTTAGCCAATTATCGTCATTGTACTAATAATATACAACTTAAACAATATCTTT
ATAAACCCTTACAAGCAAATAGCGTTCGTACAACAGTCTCC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 2 8

CO CL833Contig1 1332 4 8 U
GGGAGACAGAGTCAGTTTGTGTGTCAGGTGAAGAGAGAGACGAGAAGATGGAGAACACAG
ACGAACTCGTGTCCATTGAGCTACCAGCTCCTGCTTCATGGAAGAAACTGTTTTATCCGA
AAAGAGCAGGTACACCGAGGAAGACAGAGATTGTGTTCATGGCTCCAACGGGTGAGGAGA
TCAGCTCACGCAAGCAGCTTGAGCAGTACCTCAAGGCTCATCCTGGGAACCCTGTCATCT
CTGAGTTTGACTGGACAACTGGGGAAAGTCCAAGGCGGTCGTCTAGGATCAGCCAGAAGG
TGAAGGCTACAACCCCCACTCCTGACAGAGAACCTCACATGAAGAAAAGGAGATCTTCTC
TCACTAAGAAGGACATGAAAGAGGCTGCTGAGAAGGAGAACAAGGAGGGTGAAAAGAGTG
AGGCTGAGAAGGAGGGTGGAGCAGAAGTGGCAGAGGCTGAGAAAGAGAACAAGGAGGGTG
AAAAGAGTGAGGCTGGAAAGAAAGAGGGAGAGGTTGTGACTGACAAGAAAGAGCCCATGG
AAGTTGATACCTCTGAGGTGGAGAATAAGACTGAGGCGGAGAACAAGGAGGGAGAAGCTG
TGACGGACAAGAAAGAGCCCATGGTAGTGGATACCTCTGAGGTGGAGAACAAGGAGGGGG
AAGCTGTGACGGACAAGAAAGAGCCAATGGAAGTGGATACCACTGAGGTCGAGAAGAAGA
CTGAGAGTGGAGGAATAGCTGAAGAACCTCCCAAGGTTGAAGAACCACAGGAAGTTGTTG
CTGATGGGGAGAATAAGCTTGCAGAGAAAGAGACTGAGAACAAGGGAAGCGTGGCAGCAG
CAGAAGCAAACGGAGAAAAGAATGAGTCCAGCCTTGATGCTGAAGCTAATAAGGGAAATG
AAACCGAAGAAGCTGACGAGAAGAAGACAGATGGTGAGCCTAACCTTGACGCAGAAGTTA
ACAAGGGGAATGGAACGCAAGAAGCTGATGAGAAGAAGGCAGAAGAAGCTGTAGCGGAGG
AGAAAAGTAACGACGTGAAGGGGGAAGACAGAGAGGTGAATCAAGTTCAACAGCAACAGG
GTGCTGCAGCGTCAGTGAGCTGTTAAAAAAGACCACCTATAGAGCACCACAGAACGTGCA
AGAAGAGTTTGTTGTTTGTATGATTTCAGGTGTAGTAGCCATTGACATTATGAGTGGTTG
GTTGTTGTATGTGCTTGTAGAAGAACTAGTGTGTCTCATCTCTCTGTAGTTCAGTTCATA
ATTATCATCATTAGACTCGTGTACTTTTGTACTTTTGGTGTGTTGTTAATGTTTGGCATT
TTAGTTTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK48TF U 1
AF RR2AU67TF U 19
AF RR2DK48JQ C 644
AF RR2AU67JQ C 636
BS 1 707 RR2DK48TF
BS 708 708 RR2AU67JQ
BS 709 742 RR2AU67TF
BS 743 786 RR2AU67JQ
BS 787 787 RR2DK48JQ
BS 788 936 RR2AU67JQ
BS 937 937 RR2DK48JQ
BS 938 1332 RR2AU67JQ

RD RR2DK48TF 714 0 0
GGGAGACAGAGTCAGTTTGTGTGTCAGGTGAAGAGAGAGACGAGAAGATGGAGAACACAG
ACGAACTCGTGTCCATTGAGCTACCAGCTCCTGCTTCATGGAAGAAACTGTTTTATCCGA
AAAGAGCAGGTACACCGAGGAAGACAGAGATTGTGTTCATGGCTCCAACGGGTGAGGAGA
TCAGCTCACGCAAGCAGCTTGAGCAGTACCTCAAGGCTCATCCTGGGAACCCTGTCATCT
CTGAGTTTGACTGGACAACTGGGGAAAGTCCAAGGCGGTCGTCTAGGATCAGCCAGAAGG
TGAAGGCTACAACCCCCACTCCTGACAGAGAACCTCACATGAAGAAAAGGAGATCTTCTC
TCACTAAGAAGGACATGAAAGAGGCTGCTGAGAAGGAGAACAAGGAGGGTGAAAAGAGTG
AGGCTGAGAAGGAGGGTGGAGCAGAAGTGGCAGAGGCTGAGAAAGAGAACAAGGAGGGTG
AAAAGAGTGAGGCTGGAAAGAAAGAGGGAGAGGTTGTGACTGACAAGAAAGAGCCCATGG
AAGTTGATACCTCTGAGGTGGAGAATAAGACTGAGGCGGAGAACAAGGAGGGAGAAGCTG
TGACGGACAAGAAAGAGCCCATGGTAGTGGATACCTCTGAGGTGGAGAACAAGGAGGGGG
AAGCTGTGACGGACAAGAAAGAGCCAATGGAAGTGGATACCACTGAG
GTCGAGA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2AU67TF 732 0 0
GG
GTGTCAGGTGAAGAGAGAGACGAGAAGATGGAGAACACAGACGAACTCGTGTCCATTGAG
CTACCAGCTCCTGCTTCATGGAAGAAACTGTTTTATCCGAAAAGAGCAGGTACACCGAGG
AAGACAGAGATTGTGTTCATGGCTCCAACGGGTGAGGAGATCAGCTCACGCAAGCAGCTT
GAGCAGTACCTCAAGGCTCATCCTGGGAACCCTGTCATCTCTGAGTTTGACTGGACAACT
GGGGAAAGTCCAAGGCGGTCGTCTAGGATCAGCCAGAAGGTGAAGGCTACAACCCCCACT
CCTGACAGAGAACCTCACATGAAGAAAAGGAGATCTTCTCTCACTAAGAAGGACATGAAA
GAGGCTGCTGAGAAGGAGAACAAGGAGGGTGAAAAGAGTGAGGCTGAGAAGGAGGGTGGA
GCAGAAGTGGCAGAGGCTGAGAAAGAGAACAAGGAGGGTGAAAAGAGTGAGGCTGGAAAG
AAAGAGGGAGAGGTTGTGACTGACAAGAAAGAGCCCATGGAAGTTGATACCTCTGAGGTG
GAGAATAAGACTGAGGCGGAGAACAAGGAGGGAGAAGCTGTGACGGACAAGAAAGAGCCC
ATGGTAGTGGATACCTCTGAGGTGGAGAACAAGGAGGGGGAAGCTGTGACGGACAAGAAA
GAGCCAATGGAAGTGGATACCACTGAG*TCGAGAAGAAGACTGAGAGTGGAGGAATAGCT
GA
GAACCTCC

QA 3 724 3 724
DS 

RD RR2DK48JQ 679 0 0
GGAGAACAAGGAGGGGGAAGCTGTGACGGACAAGAAAGAGCCAATGGAAGTGGATACCAC
TGAGGTCGAGAAGAAGACTGAGAGTGGAGGAATAGCTGAAGAACCTCCCAAGGTTGAAGA
ACCACAGGAAGTTGTTGCTGATGGGGAGAATAAGCTTGCAGAGAAAGAGACTGAGAACAA
GGGAAGCGTGGCAGCAGCAGAAGCAAACGGAGAAAAGAATGAGTCCAGCCTTGATGCTGA
AGCTAATAAGGGAAATGAAACCGAAGAAGCTGACGAGAAGAAGACAGATGGTGAGCCTAA
CCTTGACGCAGAAGTTAACAAGGGGAATGGAACGCAAGAAGCTGATGAGAAGAAGGCAGA
AGAAGCTGTAGCGGAGGAGAAAAGTAACGACGTGAAGGGGGAAGACAGAGAGGTGAATCA
AGTTCAACAGCAACAGGGTGCTGCAGCGTCAGTGAGCTGTTAAAAAAGACCACCTATAGA
GCACCACAGAACGTGCAAGAAGAGTTTGTTGTTTGTATGATTTCAGGTGTAGTAGCCATT
GACATTATGAGTGGTTGGTTGTTGTATGTGCTTGTAGAAGAACTAGTGTGTCTCATCTCT
CTGTAGTTCAGTTCATAATTATCATCATTAGACTCGTGTACTTTTGTACTTTTGGTGTGT
TGTTAATGTTTGGC
ATTTT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2AU67JQ 697 0 0
TCTGAGGT
GGAGAACAAGGAGGGGGAAGCTGTGACGGACAAGAAAGAGCCAATGGAAGTGGATACCAC
TGAGGTCGAGAAGAAGACTGAGAGTGGAGGAATAGCTGAAGAACCTCCCAAGGTTGAAGA
ACCACAGGAAGTTGTTGCTGATGTGGAGAATAAGCTTGCAGAGAAAGAGACTGAGAACAA
GGGAAGCGTGGCAGCAGCAGAAGCAAACGGAGAAAAGAATGAGTCCAGCCTTGATGCTGA
AGCTAATAAGGGAAATGAAACCGAAGAAGCTGACGAGAAGAAGACAGATGGTGTGCCTAA
CCTTGACGCAGAAGTTAACAAGGGGAATGGAACGCAAGAAGCTGATGAGAAGAAGGCAGA
AGAAGCTGTAGCGGAGGAGAAAAGTAACGACGTGAAGGGGGAAGACAGAGAGGTGAATCA
AGTTCAACAGCAACAGGGTGCTGCAGCGTCAGTGAGCTGTTAAAAAAGACCACCTATAGA
GCACCACAGAACGTGCAAGAAGAGTTTGTTGTTTGTATGATTTCAGGTGTAGTAGCCATT
GACATTATGAGTGGTTGGTTGTTGTATGTGCTTGTAGAAGAACTAGTGTGTCTCATCTCT
CTGTAGTTCAGTTCATAATTATCATCATTAGACTCGTGTACTTTTGTACTTTTGGTGTGT
TGTTAATGTTTGGCATTTTAGTTTGTTTC

QA 9 697 9 697
DS 



CO CL833Contig2 1443 4 3 U
GGACGCAAACATATCCATTAGTCACAGGGGTTGTTCTTGCAGCAGTTCTTATTACCAGAA
AGGAAATAAAGTCGTAACCTTTGTCTTAAAAAAAGATAAGAAGGTGGTTATAGTGAGGGA
GACAGAGTCAGTTTGTGTGTCAGGTGAAAAGGGAGACGAGAAGATGGAGAACACAGACGA
ACTCGTGTCCATTGAGCTACCAGCTCCTGCTTCATGGAAGAAACTGTTTTATCCGAAAAG
AGCAGGTACACCGAGGAAGACAGAGATTGTGTTCATGGCTCCAACTGGTGAGGAGATTAG
CTCACGCAAGCAGCTTGAGCAGTACCTCAAGGCTCATCCTGGGAACCCTGTCATCTCTGA
GTTCGACTGGACAACTGGGGAGAGTCCAAGGCGGTCGTCTAGGATCAGCCAGAAGGTGAA
GGCTACAACCCCCACTCCTGACAGGGAACCTCACATGAAGAAAAGGAGATCTTCTCTCAC
TAAGAAGGACATGAAGGAGGCTGCTGAGAAGGAGAACAAGGAGGGTGAAAAGACTGAGGG
TGGAGCAGAAGTGGCAGAGGCTGATAAAGAGAACAAAGAGGGTGAAAAGAGCGAGGCTGG
AAAGAAAGAGGGAGAAGTTGTGACGGACAAGAAAGAGGCCATGGAAGTTGATACCTCTGA
GGGGGAGAAGAAGCCTGAGGCTGAAAACAAGGAGGAAGAGGGTGTGATGGACAAGAAAGA
GCCCATGGAAGTTGATACCTCTGAGGTTGAGAAGAAGACTGAGGCAGAGGAGAACAAGGA
GGGGGAAGCTGTGACGGACAAGAAAGAGGCAATGGAAGTGGATACCACTGAGGTTGAGAA
GAAGACTGAGAGTGGAGGAATAGCTGAAGAGCCTCCCAAGGTTGAAAAACCACAGGAAGT
TGTTGCGGATGGGGAGAATAAGCCTGCAGAGAAAGAGACTGAGAACAAGGGCAGCGTGGC
AGCAGCAGAAGCAAACGGAGAAAAGAATGAGCCTAACCTTGATGCAGAAGCTACTAAGGG
AGATGAAACCAAAGAAGCTGACGAGAAGAAGACAGATGGTGAGCCTAACCTTGACGCTGA
AGTTAACAAGGGGAATGGAACGCAAGAAGCTGATGAGAAGAAGGCAGAAGAAGCTGTAGC
CGAGGAGAAAAGTAACGACGTGAAGGGGGAAGACAGAGAGGTGAATCAAGTTCAACAGCA
ACAGGGTGCTGCAGCGTCAGTGAGCTGTTAAAAAAGACCACCTATAGAGCACGTTACAGA
ACGTGCAAGAAGAGTTTGTTGTTTGTATGATTTCAGGTGTAGTAGCCATTGACATTATGA
GTGGTTGGTTGTTGTATGTGCTTGTAGAAGAACTAGTGTGTCTCTCTATCTGTAGTTCAG
TTCATAATTATCATCATTAGACTCGTGTACTTGTGTACTTTTGGTGTGTTGTTAATGTTT
GGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2EE69TF U 1
AF RR2D684TF U 574
AF RR2D684JQ C 1026
AF RR2EE69JQ C 701
BS 1 657 RR2EE69TF
BS 658 1200 RR2D684TF
BS 1201 1443 RR2EE69JQ

RD RR2EE69TF 657 0 0
GGACGCAAACATATCCATTAGTCACAGGGGTTGTTCTTGCAGCAGTTCTTATTACCAGAA
AGGAAATAAAGTCGTAACCTTTGTCTTAAAAAAAGATAAGAAGGTGGTTATAGTGAGGGA
GACAGAGTCAGTTTGTGTGTCAGGTGAAAAGGGAGACGAGAAGATGGAGAACACAGACGA
ACTCGTGTCCATTGAGCTACCAGCTCCTGCTTCATGGAAGAAACTGTTTTATCCGAAAAG
AGCAGGTACACCGAGGAAGACAGAGATTGTGTTCATGGCTCCAACTGGTGAGGAGATTAG
CTCACGCAAGCAGCTTGAGCAGTACCTCAAGGCTCATCCTGGGAACCCTGTCATCTCTGA
GTTCGACTGGACAACTGGGGAGAGTCCAAGGCGGTCGTCTAGGATCAGCCAGAAGGTGAA
GGCTACAACCCCCACTCCTGACAGGGAACCTCACATGAAGAAAAGGAGATCTTCTCTCAC
TAAGAAGGACATGAAGGAGGCTGCTGAGAAGGAGAACAAGGAGGGTGAAAAGACTGAGGG
TGGAGCAGAAGTGGCAGAGGCTGATAAAGAGAACAAAGAGGGTGAAAAGAGCGAGGCTGG
AAAGAAAGAGGGAGAAGTTGTGACGGACAAGAAAGAGGCCATGGAAGTTGATACCTC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2D684TF 627 0 0
GAAG
GAGGGTGAAAAGAGCGAGGCTGGAAAGAAAGAGGGAGTAGTTGTGACGGACAAGAAAGAG
GCCATGGAAGTTGATACCTCTGAGGGGGAGAAGAAGCCTGAGGCTGAAAACAAGGAGGAA
GAGGGTGTGATGGACAAGAAAGAGCCCATGGAAGTTGATACCTCTGAGGTTGAGAAGAAG
ACTGAGGCAGAGGAGAACAAGGAGGGGGAAGCTGTGACGGACAAGAAAGAGGCAATGGAA
GTGGATACCACTGAGGTTGAGAAGAAGACTGAGAGTGGAGGAATAGCTGAAGAGCCTCCC
AAGGTTGAAAAACCACAGGAAGTTGTTGCGGATGGGGAGAATAAGCCTGCAGAGAAAGAG
ACTGAGAACAAGGGCAGCGTGGCAGCAGCAGAAGCAAACGGAGAAAAGAATGAGCCTAAC
CTTGATGCAGAAGCTACTAAGGGAGATGAAACCAAAGAAGCTGACGAGAAGAAGACAGAT
GGTGAGCCTAACCTTGACGCTGAAGTTAACAAGGGGAATGGAACGCAAGAAGCTGATGAG
AAGAAGGCAGAAGAAGCTGTAGCCGAGGAGAAAAGTAACGACGTGAAGGGGGAAGACAGA
GAGGTGAATCAAGTTCAACAGCA

QA 5 627 5 627
DS 

RD RR2D684JQ 188 0 0
AAACCAAAGAAGCTGACGAGAAGAAGACAGATGGTGAGCCTAACCTTGACGCTGAAGTTA
ACAAGGGGAATGGAACGCAAGAAGCTGATGAGAAGAAGGCAGAAGAAGCTGTAGCCGAGG
AGAAAAGTAACGACGTGAAGGGGGAAGACAGAGAGGTGAATCAAGTTCAACAGCAACAGG
GTGGTGCA

QA 1 188 1 188
DS 

RD RR2EE69JQ 743 0 0
GGTGTGATG
GACAAGAAAGAGCCCATGGAAGTTGATACCTCTGAGGTTGAGAAGAAGACTGAGGCAGAG
GAGAACAAGGAGGGGGAAGCTGTGACGGACAAGAAAGAGGCAATGGAAGTGGATACCACT
GAGGTTGAGAAGAAGACTGAGAGTGGAGGAATAGCTGAAGAGCCTCCCGAGGTTGAAAAA
CCACAGGAAGTTGTTGCGGATGGGGAGAATAAGCCTGCAGAGAAAGAGACTGAGAACAAG
GGCAGCGTGGCAGCAGCAGAAGCAAACGGAGAAAAGAATGAGCCTAACCTTGATGCAGAA
GCTACTAAGGGAGATGAAACCAAAGAAGCTGACGAGAAGAAGACAGATGGTGAGCCTAAC
CTTGACGCTGAAGTTAACAAGGGGAATGGAACGCAAGAAGCTGATGAGAAGAAGGCAGAA
GAAGCTGTAGCCGAGGAGAAAAGTAACGACGTGAAGGGGGAAGACAGAGAGGTGAATCAA
GTTCAACAGCAACAGGGTGCTGCAGCGTCAGTGAGCTGTTAAAAAAGACCACCTATAGAG
CACGTTACAGAACGTGCAAGAAGAGTTTGTTGTTTGTATGATTTCAGGTGTAGTAGCCAT
TGACATTATGAGTGGTTGGTTGTTGTATGTGCTTGTAGAAGAACTAGTGTGTCTCTCTAT
CTGTAGTTCAGTTCATAATTATCATCATTAGACTCGTGTACTTGTGTACTTTTGGTGTGT
TGTTAATGTTTGGC

QA 10 743 10 743
DS 



AS 1 8

CO CL834Contig1 647 8 6 U
GGAACAACAACGAGATAAGTCTTTATTGTTTGTTGGCCTGAGAAACATGGCGTCTTTAGC
AACCGTCGCCGCCGTTCAACCCTCCACCGCCATCAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTGGC
CGGAGCTAAGCTCTTTATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAAATCCTCAAGAGC
TGGTGCCGTGGTTGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGG
TAACACAACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTATAACCCACT
TCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCGGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAA
GTTCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCGACCGGTGA
TGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCAAGCT
TTAAATTAGCTTTTTAAAATCCATTCAAAATGTCATGAAACTTTCTATTCAATTCTGTGA
ACCCTTTTTAATGATCTATGTATATTGCGCTGTATAAGTTGCTTTCTAAGCTAGTGAATT
ATGAGAATCAGATATGATGAATCAATGAAAATTGTCTTTCAAGTCTG


BQ
30 30 30 30 30 30 0 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP96TF U 7
AF RR2FP96JQ C 7
AF RR2CH76JQ C 1
AF RR2CH76TF U 1
AF RR2CS13TF U 1
AF RR2G586TF U 1
AF RR2GR16JQ C 7
AF RR2GR16TF U 7
BS 1 88 RR2CH76TF
BS 89 89 RR2CS13TF
BS 90 517 RR2CH76TF
BS 518 518 RR2CS13TF
BS 519 621 RR2CH76TF
BS 622 647 RR2G586TF

RD RR2FP96TF 567 0 0
GGAACGAGATAAGTCTTTATTGTTTGTTGGCCTGAGAAACATGGCGTCTTTAGCAACCGT
CGCCGCCGTTCAACCCTCCACCGCCATCAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTGGCCGGAGC
TAAGCTCTTTATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAAATCCTCAAGAGCTGGTGC
CGTGGTTGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACAC
AACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTATAACCCACTTCAGAG
CAAGTTCTTTGAGACATTTGCGGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAAGTTCTT
GATTCTTGGAGGTGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCAACCGGTGATGTTCT
TCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCAAGCTTTAAAT
TAGCTTTTTAAAATCCATTCAAAATGTCATGAAACTTTCTATTCAATTCTGTGAACCCTT
TTTAATGATCTATGTATATTGCGCTG
A

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2FP96JQ 566 0 0
GGAACGAGATAAGTCTTTATTGTTTGTTGGCCTGAGAAACATGGCGTCTTTAGCAACCGT
CGCCGCCGTTCAACCCTCCACCGCCATCAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTGGCCGGAGC
TAAGCTCTTTATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAAATCCTCAAGAGCTGGTGC
CGTGGTTGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACAC
AACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTATAACCCACTTCAGAG
CAAGTTCTTTGAGACATTTGCGGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAAGTTCTT
GATTCTTGGAGGTGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCAACCGGTGATGTTCT
TCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCAAGCTTTAAAT
TAGCTTTTTAAAATCCATTCAAAATGTCATGAAACTTTCTATTCAATTCTGTGAACCCTT
TTTAATGATCTATGTATATTGCGCTG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2CH76JQ 626 0 0
GGAACAACAACGAGATAAGTCTTTATTGTTTGTTGGCCTGAGAAACATGGCGTCTTTAGC
AACCGTCGCCGCCGTTCAACCCTCCACCACCATCAAAGGACTCGGAGGAAGCTTTCTGGC
CGGAGTTAAGCTCTTTATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAAATCCTCAAGAGC
TGGTGCCGTGGTTGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGG
TAACACAACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTATAACCCACT
TCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCGGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAA
GTTCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCGACCGGTGA
TGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCAAGCT
TTAAATTAGCTTTTTAAAATCCATTCAAAATGTCATGGAACTTTCTATTCAATTCTGTGA
ACCCTTTTTAATGATCTATGTATATTGCGCTGTATAAGTTGCTTTCTAAGCTAGTGAATT
ATGAGAATCAGATATGATGAA
CCAAA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2CH76TF 623 0 0
GGAACAACAACGAGATAAGTCTTTATTGTTTGTTGGCCTGAGAAACATGGCGTCTTTAGC
AACCGTCGCCGCCGTTCAACCCTCCACCACCATCAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTGGC
CGGAGCTAAGCTCTTTATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAAATCCTCAAGAGC
TGGTGCCGTGGTTGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGG
TAACACAACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTATAACCCACT
TCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCGGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAA
GTTCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCGACCGGTGA
TGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCAAGCT
TTAAATTAGCTTTTTAAAATCCATTCAAAATGTCATGGAACTTTCTATTCAATTCTGTGA
ACCCTTTTTAATGATCTATGTATATTGCGCTGTATAAGTTGCTTTCTAAGCTAGTGAATT
ATGAGAATCAGATATGATGAA
CC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2CS13TF 621 0 0
GGAACAACAACGAGATAAGTCTTTATTGTTTGTTGGCCTGAGAAAC*TGGCGTCTTTAGC
AACCGTCGCCGCCGTTCAACCCTCCACCGCCATCAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTGGC
CGGAGCTAAGCTCTTTATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAAATCCTCAAGAGC
TGGTGCCGTGGTTGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGG
TAACACAACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTATAACCCACT
TCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCGGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAA
GTTCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCGACCGGTGA
TGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCAAGCT
TTAAATTAGCTTTTTAAAATCCATTCAAAATGTCATGAAACTTTCTATTCAATTCTGTGA
ACCCTTTTTAATGATCTATGTATATTGCGCTGTATAAGTTGCTTTCTAAGCTAGTGAATT
ATGAGAATCAGATATGATGAA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2G586TF 647 0 0
GGAACAACAACGAGATAAGTCTTTATTGTTTGTTGGCCTGAGAAACATGGCGTCTTTAGC
AACCGTCGCCGCCGTTCAACCCTCCACCGCCACCAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTGGC
CGGAGCTAAGCTCTTTATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTGCAAACCCAAATCCTCAAGAGC
TGGTGCCGTGGTTGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGG
TAACACAACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTATAACCCACT
TCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCGGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAA
GTTCTTGATTCTTGGAGGTGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCGACCGGTGA
TGTTCTTCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCTGTCCTAGGGGCAAGCT
TTAAATTAGCTTTTTAAAATCCATTCAAAATGTCATGAAACTTTCTATTCAATTCTGTGA
ACCCTTTTTAATGATCTATGTATATTGCGCTGTATAAGTTGCTTTCTAAGCTAGTGAATT
ATGAGAATCAGATATGATGAATCAATGAAAATTGTCTTTCAAGTCTG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2GR16JQ 621 0 0
GGAACGAGATAAGTCTTTATTGTTTGTTGGCCTGAGAAACATGGCGTCTTTAGCAACCGT
CGCCGCCGTTCAACCCTCCACCGCCATCAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTGGCCGGAGC
TAAGCTCTTTATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAAATCCTCAAGAGCTGGTGC
CGTGGTTGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACAC
AACAGGACAATGGGACTTGTATGGATTTGATGCTCCTTCTCCTTATAACCCACTTCAGAG
CAAGTTCTTTGAGACATTTGCGGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAAGTTCTT
GATTCTTGGAGGTGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTTCTTCCTCGACCGGTGATGTTCT
TCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCAAGCTTTAAAT
TAGCTTTTTAAAATCCATTCAAAATGTCATGAAACTTTCTATTCAATTCTGTGAACCCTT
TTTAATGATCTATGTATATTGCGCTGTATAAGTTGCTTTCTAAGCTAGTGAATTATGAGA
ATCAGATATGATGAA
TCAATG

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2GR16TF 621 0 0
GGAACGAGATAAGTCTTTATTGTTTGTTGGCCTGAGAAACATGGCGTCTTTAGCAACCGT
CGCCGCCGTTCAACCCTCCACCGCCATCAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTGGCCGGAGC
TAAGCTCTTTATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAAATCCTCAAGAGCTGGTGC
CGTGGTTGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTGTACTTTGATTTAGAAGATTTGGGTAACAC
AACAGGACAATGGGACTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTATAACCCACTTCAGAG
CAAGTTCTTTGAGACATTTGCGGCTCCTTTCACAAAGAGAGGTTTGCTTCTCAAGTTCTT
GATTCTTGGAGGTGGCTCTTTGCTTACTTATGTCAGTTCTTCCTCGACCGGTGATGTTCT
TCCTATCAAGAGAGGTCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTAGGGGCAAGCTTTAAAT
TAGCTTTTTAAAATCCATTCAAAATGTCATGAAACTTTCTATTCAATTCTGTGAACCCTT
TTTAATGATCTATGTATATTGCGCTGTATAAGTTGCTTTCTAAGCTAGTGAATTATGAGA
ATCAGATATGATGAA
TCAATG

QA 1 615 1 615
DS 



AS 2 8

CO CL835Contig1 790 5 23 U
GGAAACACACTTGCGAAGCTTCTTCTTCTTCTCCTTTAGTAAATTGAAGTGAGAGGTGTG
TTAAAGGCGCATTTTCTCGGATCTCAGATCTTAGATCTCAAACACCATTGTTCTCTTCAT
CCTCT*AACATATTGATCCAAGAGAT*TTTGAATAGCTTTTGAGGTTGCTATA**AATGG
CGAGAAGGCAAGTAGGTTCAACACGACGTGTAGGAGATGGTGGAAGCTTCCCTTTTGCTG
GAGCTTTGCACTCCAAGTCTCGCTCTTCTCCACTTTTATCTATTTGCCTTGTTCTCGTGG
GGGCTTGCCTACTCATTGGTTATGCTTACAGTGGCCCAGGACTCTTTAAGAGTATCAAAG
AAGTCAGCAAAGTTACAGGTGACTATTCTTGCACATCAGAAGTCCAAAGAGCCGTTTCTG
TTCTTAACAAGGCCTATGGAGATGGGATGCGCAAGGTCTTGCACGTTGGCCCTGAGACAT
GCTCTGTCGTTTCCACTCTCTTGAAAGAAGACGAGACTGAAGCATGGGGTGTGGAACCTT
ATGACATCGAGGATGCTGACTCTCAATGCAAGGGTCTTGTCAGCAAAGGCCTTGTACGTG
TCGCTGATATCAAGTTCCCTCTCCCCTACAAG*CGAAATCCTTCTCTCTTGTGATCGTCT
CAGATGCTCTCGACTATCTCTCTCC*AAGTATCTGAACAAGACCGTCCCTGAACTCGCAA
GGGTCGCTTCAGATGGTCTTGTTCTTTTTGCAGTCTCCCTGGTCAGCAGAGAGCTAAGTT
GCTGAATTGT


BQ
10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2DW10TF U 1
AF RR2FI75TF U -1
AF RR2FF70TF U 1
AF RR2EE87TF U 1
AF RR2FC18TF U 2
BS 1 125 RR2DW10TF
BS 126 126 RR2EE87TF
BS 127 146 RR2DW10TF
BS 147 147 RR2EE87TF
BS 148 156 RR2DW10TF
BS 157 157 RR2EE87TF
BS 158 158 RR2DW10TF
BS 159 160 RR2EE87TF
BS 161 168 RR2DW10TF
BS 169 169 RR2EE87TF
BS 170 173 RR2DW10TF
BS 174 175 RR2EE87TF
BS 176 424 RR2DW10TF
BS 425 425 RR2EE87TF
BS 426 433 RR2DW10TF
BS 434 434 RR2EE87TF
BS 435 464 RR2DW10TF
BS 465 617 RR2EE87TF
BS 618 618 RR2FI75TF
BS 619 708 RR2EE87TF
BS 709 709 RR2FC18TF
BS 710 768 RR2EE87TF
BS 769 790 RR2FC18TF

RD RR2DW10TF 464 0 0
GGAAACACACTTGCGAAGCTTCTTCTTCTTCTCCTTTAGTAAATTGAAGTGAGAGGTGTG
TTAAAGGCGCATTTTCTCGGATCTCAGATCTTAGATCTCAAACACCATTGTTCTCTTCAT
CCTCTTAACATATTGATCCAAGAGATATTTGAATAGGT**TGAGGTTGGTATATCAATGG
CGAGAAGGCAAGTAGGTTCAACACGACGTGTAGGAGATGGTGGAAGCTTCCCTTTTGCTG
GAGCTTTGCACTCCAAGTCTCGCTCTTCTCCACTTTTATCTATTTGCCTTGTTCTCGTGG
GGGCTTGCCTACTCATTGGTTATGCTTACAGTGGCCCAGGACTCTTTAAGAGTATCAAAG
AAGTCAGCAAAGTTACAGGTGACTATTCTTGCACATCAGAAGTCCAAAGAGCCGTTTCTG
TTCTGAACAAGGCTTATGGAGATGGGATGCGCAAGGTCTTGCAC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2FI75TF 629 0 0
GGAA
AAACACACTTGCGAAGCTTCTTCTTCTTCTCCTTTAGTAAATTGAAGTGAGAGGTGTGTT
AAAGGCGCATTTTCTCGGATCTCAGATCTTAGATCTCAAACACCATTGTTCTCTTCATCC
TCT*AACATATTGATCCAAGAGAT*TTTGAATAGCTTTTGAGGTTGCTATA**AATGGCG
AGAAGGCAAGTAGGTTCAACACGACGTGTAGGAGATGGTGGAAGCTTCCCTTTTGCTGGA
GCTTTGCATTCCAAGTCTCGCTCTTCTCCACTTTTATCTATTTGCCTTGTTCTCGTGGGG
GCTTGCCTACTCATTGGTTATGCTTACAGTGGCCCAGGAATCTTTAAAAGTATCAAAGAA
GTCAGCAAAGTTACAGGTGACTATTCTTGCACATCAGAAGTCCAAAGAGCCGTTTCTGTT
CTTAACAAGGCCTATGGAGATGGGATGCGCAAGGTCTTGCACGTTGGCCCTGAGACATGC
TCTGTCGTTTCCACTCTCTTGAAAGAAGACGAGACTGAAGCATGGGGTGTGGAACCTTAT
GACATCGAGGATGCTGACTCTCAATACAAGGGTCTTGTCAGCAAAGGCCTTGTACGTGTC
GCTGATATCAAGTTCCCTCTCCCCT

QA 5 629 5 629
DS 

RD RR2FF70TF 716 0 0
G
GAAACACACTTGCGAAGCTTCTTCTTCTTCTCCTTTAGTAAATTGAAGTGAGAGGTGTGT
TAAAGGCGCATTTTCTCGGATCTCAGATCTTAGATCTCAAACACCATTGTTCTCTTCATC
CTCTTAACATATTGATCCAAGAGAT*TTTGAATAGCTTTTGAGGTTGCTATA**AATGGC
GAGAAGGCAAATAGGTTCAACACGACGTGTAGGAGATGGTGGAAGCTTCCCTTTTGCTGG
AGCTTTGCACTCCAAGTCTCGCTCTTCTCCACTTTTATCTATTTGCCTTGTTCTCGTGGG
GGCTTGCCTACTCATTGGTTATGCTTACAGTGGCCCAGGACTCTTTAAGAGTATCAAAGA
AGTCAGCAAAGCTACAGGTGACTATTCTTGCACATCAGAAGTCCAAAGAGCCGTTTCTGT
TCTTAACAAGGCATATGGAGATGGGATGCGCAAGGTCTTGCACGTTGGCCCTGAGACTTG
CTCTGTCGTTTCCACTCTCTTGAAGGAAGACGAGACTGAAGCATGGGGTGTCGAACCCTA
TGACATCGAGGATGCTGATTCTCACTGCAAGGGTCTTGTCAGCAAAGGCCTTGTACGTGT
CGCTGATATCAAGTTCCCTCTCCCCTACAAG*CGAAATCCTTCTCTCTTGTGATCGTCTC
GGATGCTCTCGACTATCTCTCTCC*AAGTACCTCAACAAGACCGT
TCCTGACTCG

QA 2 706 2 706
DS 

RD RR2EE87TF 768 0 0
G
GAAACACACTTGCGAAGCTTCTTCTTCTTCTCCTTTAGTAAATTGAAGTGAGAGGTGTGT
TAAAGGCGCATTTTCTCGGATCTCAGATCTTAGATCTCAAACACCATTGTTCTCTTCATC
CTCT*AACATATTGATCCAAGAGAT*TTTGAATAGCTTTTGAGGTTGCTATA**AATGGC
GAGAAGGCAAGTAGGTTCAACACGACGTGTAGGAGATGGTGGAAGCTTCCCTTTTGCTGG
AGCTTTGCACTCCAAGTCTCGCTCTTCTCCACTTTTATCTATTTGCCTTGTTCTCGTGGG
GGCTTGCCTACTCATTGGTTATGCTTACAGTGGCCCAGGAATCTTTAAAAGTATCAAAGA
AGTCAGCAAAGTTACAGGTGACTATTCTTGCACATCAGAAGTCCAAAGAGCCGTTTCTGT
TCTTAACAAGGCCTATGGAGATGGGATGCGCAAGGTCTTGCACGTTGGCCCTGAGACATG
CTCTGTCGTTTCCACTCTCTTGAAAGAAGACGAGACTGAAGCATGGGGTGTGGAACCTTA
TGACATCGAGGATGCTGACTCTCAATGCAAGGGTCTTGTCAGCAAAGGCCTTGTACGTGT
CGCTGATATCAAGTTCTCTCTCCCCTACAAG*CGAAATCCTTCTCTCTTGTGATCGTCTC
AGATGCTCTCGACTATCTCTCTCC*AAGTATCTGAACAAGACCGTCC*TGAACTCGCAAG
GGTCGCTTCAGATGGTCTTGTTCTTTTTGCAGTCTCCCTGGTCAGCA

QA 2 768 2 768
DS 

RD RR2FC18TF 789 0 0
GAAACACACTTGCGAAGCTTCTTCTTCTTCTCCTTTAGTAAATTGAAGTGAGAGGTGTGT
TAAAGGCGCATTTTCTCTGATCTCAGATCTTAGATCTCAAACACCATTGTTCTCTTCATC
CTCT*AACATATTGATCCAAGAGAT*TTTGAATAGCTTTTGAGGTTGCTATA**AATGGC
GAGAAGGCAAGTAGGTTCAACACGACGTGTGGGAGATGGTGGAAGCTTCCCATTTGCTGG
AGCTTTGCACTCCAAGTCTCGCTCTTCTCCACTTTTATCTATTTGCCTTGTTCTCGTGGG
CGCTTGCCTACTCATTGGTTATGCTTACAGTGGCCCAGGACTCTTTAAGAGTATCAAAGA
AGTCAGCAAAGTTACAGGTGACTATTCTTGCACATCAGAAGTCCAAAGAGCCGTTTCTGT
TCTTAACAAGGCCTATGGAGATGGGATGCGCAAGGTCCTGCACGTTGGCCCTGAGACATG
CTCTGTCGTTTCCACTCTCTTGAAAGAAGACGAGACTGAAGCATGGGGTGTGGAACCTTA
T***ATCGAGGATGCTGACTCTCAATGCAAGGGTCTTGTCAGCAAAGGCCTTGTACGTGT
CGCTGATATCAAGTTCCCTCTCCCCTACAAGGCGAAATCCTTCTCTCTTGTGATCGTCTC
AGATGCTCTCGACTATCTCTCTCCCAAGTATCTGAACAAGACCGTCCCTGAACTCGCAAG
GGTCGTTTCAGATGGTCTTGTTCTTTTTGCAGTCTCCCTGGTCAGCAGAGAGCTAAGTTG
CTGAATTGT

QA 1 789 1 789
DS 



CO CL835Contig2 642 3 7 U
GATTATTGGTAACAACGATTGATTAAAATTCAATAAAGAAAAAACTGTGTTGATGGATAC
AACATGACAAAAAAAATAAAAACTGACTTGTTACAAAATACAAGGAGAATATCGCTTACG
CTATTTTTTTGTTGTTCTTGTTTCGGGAGTGG*CTCTACGTGTGAATGTGCTTTAAGTGT
GGGGGCTTGGTGGTGGCTGGTTAATGTAGTGGCTTAAGGTGGAAGACTTGGCAGGCTGGT
TTGTATAACCCTTTGGAAACAGCCTGTTCAAACTTCTTGCTTGGTCCTTCGTTTTCTTCT
AAACTTGTCTGCACGAAGAATCGGTTCCACCACGAAGCGCTACGCATTTTAGCGGGACGA
CCGAACTTAGACAATTCAGCAACTTTAGCTCTCTGCTGACCAGGGAGACCTGCAAAAAGA
ACAAGACCATCTGAAGCCACCCTTGCGAGTTCAGGGACGGTCTTGTTCAGATACTTGGGA
GAGAGATAGTCTAGAGCATCTGAGACGATCACAGGAGAGAAGGATTTCGCCTTGTAGGGG
AGAGGGAACTTGATATCAGCGACACGTACAAGGCCTTTGCTGACAAGACCCTTGTATTGA
GAGTCAGCATCCTCGATGTCATAAGGTTCCACACCCCATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF70JQ U 8
AF RR2DW10JQ U 21
AF RR2FI75JQ U 1
BS 1 76 RR2FI75JQ
BS 77 78 RR2FF70JQ
BS 79 129 RR2FI75JQ
BS 130 130 RR2FF70JQ
BS 131 248 RR2FI75JQ
BS 249 249 RR2DW10JQ
BS 250 642 RR2FI75JQ

RD RR2FF70JQ 219 0 0
GGTAACAACGATTGATTAAAATTCAATAAAGAAAAAACTGTGTTGATGGATACAACATGA
CAAAAAAAATAAAAACTGACTTGTTACAAAATACAAGGAGAATATCGCTTACGCTATTTT
TTTGTTGTTCTTGTTTCGGGAGTGG*CTCTACGTGTGAATGTGCTTTTAGTGTGGGGGCT
TGGTGGTGGCTGGTTAATGTAGTGGCTTAAGGTGGAAGA

QA 1 219 1 219
DS 

RD RR2DW10JQ 460 0 0
GG
TTAAAATTCAATAAAGAAAAAACTGTGTTGATGGATACAACATGACAAAAAAA*TAAAAA
CTGACTTGTTACAAAATACAAGGAGAATATCGCTTACGCTATTTTTTTGTTGTTCTTGTT
TCGGGAGTGGGCTCTACGTGTGAATGTACTTTAAGTGTGGGGGCTTGGTGGTGGCTGGTT
AATGTAGTGGCTTAAGGTGGAAGACTTGGCAGGCTGGTTTGTATGACCCTTTGGAAACAG
CCTGTTCAAACTTCTTGCTTGGTCCTTCGTTTTCTTCTAAACTTGTCTGCACGAAGAATC
GGTTCCACCACGAAGCGCTACGCATTTTAGCGGGACGACCGAACTTGGACAATTCAGCAA
CTTTAGCTCTCTGCTGACCAGGGAGACCTGCAAAAAGAACAAGACCATCTGAAGCGACCC
TTGCGAGTTCAGGGACGGTCTTGTTGAGGTACTTGG
GA

QA 3 458 3 458
DS 

RD RR2FI75JQ 642 0 0
GATTATTGGTAACAACGATTGATTAAAATTCAATAAAGAAAAAACTGTGTTGATGGATAC
AACATGACAAAAAAAAAGAAAACTGACTTGTTACAAAATACAAGGAGAATATCGCTTACG
CTATTTTTTAGTTGTTCTTGTTTCGGGAGTGG*CTCTACGTGTGAATGTGCTTTAAGTGT
GGGGGCTTGGTGGTGGCTGGTTAATGTAGTGGCTTAAGGTGGAAGACTTGGCAGGCTGGT
TTGTATAATCCTTTGGAAACAGCCTGTTCAAACTTCTTGCTTGGTCCTTCGTTTTCTTCT
AAACTTGTCTGCACGAAGAATCGGTTCCACCACGAAGCGCTACGCATTTTAGCGGGACGA
CCGAACTTAGACAATTCAGCAACTTTAGCTCTCTGCTGACCAGGGAGACCTGCAAAAAGA
ACAAGACCATCTGAAGCCACCCTTGCGAGTTCAGGGACGGTCTTGTTCAGATACTTGGGA
GAGAGATAGTCTAGAGCATCTGAGACGATCACAGGAGAGAAGGATTTCGCCTTGTAGGGG
AGAGGGAACTTGATATCAGCGACACGTACAAGGCCTTTGCTGACAAGACCCTTGTATTGA
GAGTCAGCATCCTCGATGTCATAAGGTTCCACACCCCATGCT

QA 1 642 1 642
DS 



AS 2 6

CO CL836Contig1 606 2 5 U
ATGAAAAATATTCTGATACAGAAGGGAGCTAAACAATTTCAGCCAAACACAAACATTCAT
TGGGGTTTAAGAGTTCATTGACCTCGTTTCCTACATTACACTATCCAAGCGAGAGGGCTA
AATCACAAAATGCGTTTTACCAAATATAATAAGCAAAGATCTTCAAAAACCAACAGGACT
TTGCAGCTTAGAGGAGGTGATTTGTGTTTAAAGGAAGTAGTCAGGTGTCCTTCGGGTCAC
ATCTGGTTCTCCTCTCCTTGGGGCCGGTTCAAACTGAATGAAGGTGTGGTTCCTGCAGTC
ATCGACCTCGAGAATGGAGGCCATGTTTCCACAGCGATAGCAATAGTTTGGTGCGCTGAA
AATGGTAACCACCTTTTGCTCGGAGAGGGGCTTGCACTGCATGAGCTGAGAGATCTGCTC
ATCTAAATTGAGTGTTGCGTCCGTCGGAATCGAATTTGCGCCCATTACTGCGTCTTCTTC
CTCTAGTCGGATTGGATCGGGAAAGCAGATCAAAGGTTTCCCAGATTGATTGGGGGCAGC
CCCTAACCCTTAATTCGATGGATTTTACACCTTTTCTGTCTCTTGCTTCGAGTCAGAGAA
AATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX01JQ U 36
AF RR2DK83TF C 1
BS 1 35 RR2DK83TF
BS 36 99 RR2EX01JQ
BS 100 100 RR2DK83TF
BS 101 308 RR2EX01JQ
BS 309 606 RR2DK83TF

RD RR2EX01JQ 273 0 0
ATTTCAGCCAAACACAAACATTCATTGGGGTTTAAGAGTTCATTGACCTCGTTTCCTACA
TTACGCTATCCAAGCGAGAGGGCTAAATCACAAAATGCGTTTTACCAAATATAATAAGCA
AAGATCTTCAAAAACCAACAGGACTTTGCAGCTTAGAGGAGGTGATTTGTGTTTAAAGGA
AGTAGTCAGGTGTCCTTCGGGTCACATCTGGTTCTCCTCTCCTTGGGGCCGGTTCAAACT
GAATGAAGGTGTGGTTCCTGCAGTCATCGACCT

QA 1 273 1 273
DS 

RD RR2DK83TF 606 0 0
ATGAAAAATATTCTGATACAGAAGGGAGCTAAACAATTTCAGCCAAACACAAACATTCAT
TGGGGTTTAAGAGTTCATTGACCTCGTTTCCTACATTACACTATCCAAGCGAGAGGGCTA
AATCACAAAATGCGTTTTACCAAATATAATAAGCAGAGATCTTCAAAAACCAACAGGACT
TTGCAGCTTAGAGGAGGTGATTTGTGTTTAAAGGAAGTAGTCAGGTGTCCTTCGGGTCAC
ATCTGGTTCTCCTCTCCTTGGGGCCGGTTCAAACTGAATGAAGGTGTGGTTCCTGCAGTC
ATCGACCTCGAGAATGGAGGCCATGTTTCCACAGCGATAGCAATAGTTTGGTGCGCTGAA
AATGGTAACCACCTTTTGCTCGGAGAGGGGCTTGCACTGCATGAGCTGAGAGATCTGCTC
ATCTAAATTGAGTGTTGCGTCCGTCGGAATCGAATTTGCGCCCATTACTGCGTCTTCTTC
CTCTAGTCGGATTGGATCGGGAAAGCAGATCAAAGGTTTCCCAGATTGATTGGGGGCAGC
CCCTAACCCTTAATTCGATGGATTTTACACCTTTTCTGTCTCTTGCTTCGAGTCAGAGAA
AATCCC

QA 1 606 1 606
DS 



CO CL836Contig2 1308 4 10 U
CCGAGAAAATAATCTCATATGAAAAATATTCTGATACAGAAGGGAGCTAAACAATTTCAG
CCAAACACAAACATTCATTGGGGTTTAAGAGTTCATTGACCTCGTTTCCTACATTACACT
ATCCAAGCGAGAGGGCTAAATCACAAAATGCGTTTTACCAAATATAATAAGCAGAGATCT
TCAAAAACCAACAGGACTTTGCAGCTTAAAGGAGGTGATTTGTGTTTAAAGGAAGTAGTC
AGGTGTCCTTCGGGTCACATCTGGTTCTCCTCTCCTTGGGGCCGGTTCAAACTGAATGAA
GGTGTGGTTCCTGCAGTCATCGACCTCGAGAATGGAGGCCATGTTTCCACAGCGATAGCA
ATAGTTTGGTGCGCTGAAAATGGTAACCACCTTTTGCTCATGTGCCCAGTTGAAACCCTC
CATAACCAGCTGATGCGCTCGAGCAATGAGTTTTAAGCTGTTGGAGTGGTTGAATTGTTC
GGAAATGTCCTGACCAAATGTATATCCGGCACCACGAGGAGAGATTCCCCAGCCACATCT
GTCATCAGGATCAGACCATAATAAGTCACACATCGGCCCTTCATGTGGAACTTCTTGAAC
TCGATCGAAGTTCCTAATGTTGTCAAGGGTCTCGATAGACGGCGACAATCCACCGTGAAG
GCAGAATATTTCGGACTCCACCAAGGCTGTCAGTGGGAAATAGTCAAAGAGGTCTGTGAA
TATCTTCCAAACATTTGCATTTCCATACTTTCGCAGGCATTCGTCATAAAATCCATAAAC
TTGAGTAATCTGACGACTTTCATGGTTTCCTCTAAGAATAGTGATTCTCTGAGGATACCG
TACTTTCAAGCCAACTAACAGCGTAACAGTTTCGACAGAATAATATCCACGGTCGACATA
GTCTCCCATAAATAGATAGTTGGTATCAGGGCACATTCCTCCAATACGGAAAAGCTCAGC
AAGATCATGGAACTGTCCATGAATATCACCACAGATTGTCACTGGGCTTTTGACAGACTG
AACGTTGCTTTCATCCATCAAGATCTCCTTAGCTTTCTCGCATAATGATTTAACCTGTTG
CTCGGAGAGGGGCTTGCACTGCATGAGCTGAGAGATCTGCTCATCTAAATTGAGTGTTGC
GTCCGTCGGAATCGAATTTGCGCCCATTACTGCGTCTTCTTCCTCTAGTCGGATCGGGAA
AACAGATCAAAGGTTTCCCAGATTGATTGGGGGCAGCCCCTAACCCTTAATTTGATGGAT
TTTACACCTTTTCTGTCTCTTGCTTCGAGTCAGAGAAAATAGAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G113JQ U 1
AF RR2FY89JQ U 34
AF RR2G113TF C 534
AF RR2FY89TF C 650
BS 1 657 RR2G113JQ
BS 658 703 RR2FY89JQ
BS 704 754 RR2G113TF
BS 755 755 RR2FY89TF
BS 756 957 RR2G113TF
BS 958 958 RR2FY89TF
BS 959 1230 RR2G113TF
BS 1231 1231 RR2FY89TF
BS 1232 1300 RR2G113TF
BS 1301 1308 RR2FY89TF

RD RR2G113JQ 657 0 0
CCGAGAAAATAATCTCATATGAAAAATATTCTGATACAGAAGGGAGCTAAACAATTTCAG
CCAAACACAAACATTCATTGGGGTTTAAGAGTTCATTGACCTCGTTTCCTACATTACACT
ATCCAAGCGAGAGGGCTAAATCACAAAATGCGTTTTACCAAATATAATAAGCAGAGATCT
TCAAAAACCAACAGGACTTTGCAGCTTAAAGGAGGTGATTTGTGTTTAAAGGAAGTAGTC
AGGTGTCCTTCGGGTCACATCTGGTTCTCCTCTCCTTGGGGCCGGTTCAAACTGAATGAA
GGTGTGGTTCCTGCAGTCATCGACCTCGAGAATGGAGGCCATGTTTCCACAGCGATAGCA
ATAGTTTGGTGCGCTGAAAATGGTAACCACCTTTTGCTCATGTGCCCAGTTGAAACCCTC
CATAACCAGCTGATGCGCTCGAGCAATGAGTTTTAAGCTGTTGGAGTGGTTGAATTGTTC
GGAAATGTCCTGACCAAATGTATATCCGGCACCACGAGGAGAGATTCCCCAGCCACATCT
GTCATCAGGATCAGACCATAATAAGTCACACATCGGCCCTTCATGTGGAACTTCTTGAAC
TCGATCGAAGTTCCTAATGTTGTCAAGGGTCTCGATAGACGGCGACAATCCACCGTG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2FY89JQ 670 0 0
ATACAGAAGGGAGCTAAACAATTTCAGCCAAACACAAACATTCATTGGGGTTTAAGAGTT
CATTGACCTCGTTTCCTACATTACACTATCCAAGCGAGAGGGCTAAATCACAAAATGCGT
TTTACCAAATATAATAAGCAGAGATCTTCAAAAACCAACAGGACTTTGCAGCTTAGAGGA
GGTGATTTGTGTTTAAAGGAAGTAGTCAGGTGTCCTTCGGGTCACATCTGGTTCTCCTCT
CCTTGGGGCCGGTTCAAACTGAATGAAGGTGTGGTTCCTGCAGTCATCGACCTCGAGAAT
GGAGGCCATGTTTCCACAGCGATAGCAATAGTTTGGTGCGCTGAAAATGGTAACCACCTT
TTGCTCATGTGCCCAGTTGAAACCCTCCATAACCAGCTGATGTGCTCGAGCAATGAGTTT
TAAGCTGTTGGAGTGGTTGAATTGTTCGGAAATGTCCTGACCAAATGTATATCCGGCACC
ACGAGGAGAGATTCCCCAGCCACATCTGTCATCAGGATCAGACCATAATAAGTCACACAT
CGGCCCTTCATGTGGAACTTCTTGAACTCGATCGAAGTTCCTAATGTTGTCAAGGGTCTC
GATAGACGGCGACAATCCACCGTGAAGGCAGAATATTTCGGACTCCACCAAGGCTGTCAG
TGGGAAATAG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2G113TF 770 0 0
CACATCTGTCATCAGGATCAGACCATAATAAGTCACACATCGGCCCTTCATGTGGAACTT
CTTGAACTCGATCGAAGT*CCTAATGTTGTCAAGGGTCTCGATAGACGGCGACAATCCAC
CGTGAAGGCAGAATATTTCGGACTCCACCAAGGCTGTCAGTGGGAAATAGTCAAAGAGGT
CTGTGAATATCTTCCAAACATTTGCATTTCCATACTTTCGCGGGCATTCGTCATAAAATC
CATAAACTTGAGTAATCTGACGACTTTCATGGTTTCCTCTAAGAATAGTGATTCTCTGAG
GATACCGTACTTTCAAGCCAACTAACAGCGTAACAGTTTCGACAGAATAATATCCACGGT
CGACATAGTCTCCCATAAATAGATAGTTGGTATCAGGGCACATTCCTCCAATACGGAAAA
GCTCTGCAAGATCATGGAACTGTCCATGAATATCACCACAGATTGTCACTGGGCTTTTGA
CAGACTGAACGTTGCTTTCATCCATCAAGATCTCCTTAGCTTTCTCGCATAATGATTTAA
CCTGTTGCTCGGAGAGGGGCTTGCACTGCATGAGCTGAGAGATCTGCTCATCTAAATTGA
GTGTTGCGTCCGTCGGAATCGAATTTGCGCCCATTACTGCGTCTTCTTCCTCTAGTCGGA
TCGGGAAAACAGATCAAAGGTTTCCCAGATTGATTGGTGGCAGCCCCTAACCCTTAATTT
GATGGATTTTACACCTTTTCTGTCTCTTGCTTCGAGTCAGAGAAAAT
CCC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2FY89TF 659 0 0
TCCA
CGTGAAGGCAGAATATTTCGGACTCCACCAAGGCTGTCAGTGGGAAATAGTCAAAGAGGT
CTGTGAATATCTTCCAAACATTTGCATTTCCATACTTTCGCAGGCATTCGTCATAAAATC
CATAAACTTGAGTAATCTGACGACTTTCATGGTTTCCTCTAAGAATAGTGATTCTCTGAG
GATACCGTACTTTCAAGCCAACTAACAGCGTAACAGTTTCGACAGAATAATATCCACGGT
CGACATAGTCTCCCATAAATAGATAGTTGGTATCAGGGCACATTCCTCCAATACGGAAAA
GCTCAGCAAGATCATGGAACTGTCCATGAATATCACCACAGATTGTCACTGGGCTTTTGA
CAGGCTGAACGTTGCTTTCATCCATCAAGATCTCCTTAGCTTTCTCGCATAATGATTTAA
CCTGTTGCTCGGAGAGGGGCTTGCACTGCATGAGCTGAGAGATCTGCTCATCTAAATTGA
GTGTTGCGTCCGTCGGAATCGGATTTGCGCCCATTACTGCGTCTTCTTCCTCTAGTCGGA
TCGGGAAAACAGATCAAAGGTTTCCCAGATTGATTGGGGGCAGCCCCTAACCCTTAATTT
GATGGTTTTTACACCTTTTCTGTCTCTTGCTTCGAGTCAGAGAAAATAGAAATCC

QA 5 659 5 659
DS 



AS 1 8

CO CL837Contig1 914 8 20 U
GGGAGCATCTCAGGAAGTAAGCCAAAATGAGTAAGCTCCAGAGTGAAGCCGTGAGAGAGG
CAATATCCGCCATGATCACTCACTGCAAGGAGACAAAGCCTCGCAAGTTCACCGAGACCA
TCGAACTCCAGATTGGTCTTAAGAACTACGACCCACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGTT
CAGTCAAGTTGCCTCACATCCCAAGGCCTAAGATGAAGATTTGCATACTCGGTGATGCCC
AGCACGTTGAAGAGGCTGAGAAGATTGGATTAGAGTCTATGGATGTGGAAGCACTTAAGA
AGCTGAACAAGAACAAAAAGCTTGTTAAGAAGCTAGCAAAGAAGTTCCATGCTTTCCTTG
CTTCTGAATCCGTTATCAAACAGATTCCTCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGCAG
GAAAGTTCCCGACTCTTGTTAGCCACCAAGAGTCTTTGGAAGCCAAAGTGAACGAGACAA
AGGCAACAGTGAAGTTCCAGCTCAAGAAGGTTCTTTGCATGGGTGTCGCTGTTGGGAACC
TTGACATGGAGGAGAAGCAGATCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTCGTCT
CACTATTGAAGAAGAACTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACAATGGGTC
CACCTAACCGTGTGTTCTAAGATTATTATTATCTCAAAGTTTCTCTTAAGTTATCATCAG
AGGCTGAGAGTAGATTTGATTTTCACTTCTGTCGTCAGCCTTCTTCCTCTTGGATTACTT
CCAGAATCCTTACTTTTGTAGGATCCAAGATTTTCTTAAAAGACAGTTTTGTTTCTATTA
TTATTAGTGGTTTTTTCCTAAGTTTACAAGATAAATATGTCAAATTATCTTATATCACAA
CAAAAAAGCTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 0 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES86TF U 4
AF RR2G111TF U 1
AF RR2CC06TF U 5
AF RR2GL92TF U 5
AF RR2ES86JQ C 63
AF RR2BC80TF U 239
AF RR2GL92JQ C 392
AF RR2G111JQ C 391
BS 1 226 RR2G111TF
BS 227 227 RR2ES86TF
BS 228 294 RR2G111TF
BS 295 295 RR2ES86TF
BS 296 760 RR2G111TF
BS 761 766 RR2GL92TF
BS 767 767 RR2BC80TF
BS 768 775 RR2GL92TF
BS 776 776 RR2BC80TF
BS 777 781 RR2GL92TF
BS 782 782 RR2BC80TF
BS 783 785 RR2GL92TF
BS 786 786 RR2BC80TF
BS 787 807 RR2GL92TF
BS 808 808 RR2BC80TF
BS 809 813 RR2GL92TF
BS 814 814 RR2BC80TF
BS 815 828 RR2GL92TF
BS 829 835 RR2BC80TF
BS 836 914 RR2G111JQ

RD RR2ES86TF 717 0 0
GGGATCCG
AGGAAGTAAGCCAAAATGAGTAAGCTCCAGAGTGAAGCCGTGAGAGAGGCGATATCCGCC
ATGATCACTCACTGCAAGGAGACAAAGCCTCGCAAGTTCACCGAGACCATCGAACTCCAG
ATTGGTCTTAAGAACTACGACCCTCAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGTTCCGTCAAGTTG
CCTCACATTCCTAGGCCTCAGATGAAGATTTGCATACTCGGTGATGCCCAGCACGTTGAA
GAGGCTGAGAAGATTGGATTGGAGTCTATGGACGTGGAAGCACTTAAGAAGCTGAACAAG
AACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTAGCAAAGAAGTTCCATGCTTTCCTTGCTTCTGAATCC
GTTATCAAACAGATTCCTCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGCAGGAAAGTTCCCG
ACTCTTGTTAGCCACCAAGAGTCTTTGGAAGCCAAAGTGAACGAGACAAAGGCAACAGTG
AAGTTCCAGCTCAAGAAGGTTCTTTGCATGGGTGTCGCTGTTGGGAACCTTGACATGGAG
GAGAAGCAGATCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTCGTCTCGCTATTGAAG
AAGAACTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACAATGGGTCCACCTAACCGT
GTGTTCTAAGATTATTATTATCTCAAAGTTTCTCTTAAGTTATCATCAG

QA 9 717 9 717
DS 

RD RR2G111TF 762 0 0
GGGAGCATCTCAGGAAGTAAGCCAAAATGAGTAAGCTCCAGAGTGAAGCCGTGAGAGAGG
CAATATCCGCCATGATCACTCACTGCAAGGAGACAAAGCCTCGCAAGTTCACCGAGACCA
TCGAACTCCAGATTGGTCTTAAGAACTACGACCCACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGTT
CAGTCAAGTTGCCTCACATCCCAAGGCCTAAGATGAAGATTTGCATGCTCGGTGATGCCC
AGCACGTTGAAGAGGCTGAGAAGATTGGATTAGAGTCTATGGATGTGGAAGCACCTAAGA
AGCTGAACAAGAACAAAAAGCTTGTTAAGAAGCTAGCAAAGAAGTTCCATGCTTTCCTTG
CTTCTGAATCCGTTATCAAACAGATTCCTCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGCAG
GAAAGTTCCCGACTCTTGTTAGCCACCAAGAGTCTTTGGAAGCCAAAGTGAACGAGACAA
AGGCAACAGTGAAGTTCCAGCTCAAGAAGGTTCTTTGCATGGGTGTCGCTGTTGGGAACC
TTGACATGGAGGAGAAGCAGATCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTCGTCT
CACTATTGAAGAAGAACTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACAATGGGTC
CACCTAACCGTGTGTTCTAAGATTATTATTATCTCAAAGTTTCTCTTAAGTTATCATCAG
AGGCTGAGAGTAGATTTGATTTTCACTTCTGTCGTCAGCC
CT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2CC06TF 746 0 0
GGATCTC
AGGAAGTAAGCCAAAATGAGTAAGCTCCAGAGTGAAGCCGTGAGAGAGGCAATATCCGCC
ATGATCACTCACTGCAAGGAGACAAAGCCTCGCAAGCTCACCGAGACCATCGAACTCCAG
ATTGGTCTTAAGAACTACGACCCACAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGTTCAGTCAAGTTG
CCTCACATCCCAAGGCCTAAGATGAAGATTTGCATGCTCGGTGATGCCCAGCACGTTGAA
GAGGCTGAGAAGATTGGATTAGAGTCTATGGATGTGGAAGCACTTAAGAAGCTGAACAAG
AACAAAAAGCTTGTTAAGAAGCTAGCAAAGAAGTTCCATGCTTTCCTTGCTTCTAAATCC
GTTATCAAACAGATTCCTCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGCAGGAAAGTTCCCG
ACTCTTGTTAGCCACCAAGAGTCTTTGGAAGCCAAAGTGAACGAGACAAAGGCAACAGTG
AAGTTCCAGCTCAAGAAGGTTCTTTGCATGGGTGTCGCTGTTGGGAACCTTGACATGGAG
GAGAAGCAGATCTTTCAGAATGTCCAGATGAGCGTCAACTTCCTCGTCTCACTATTGAAG
AAGAACTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACAATGGGTCCACCTAACCGT
GTGTTCTAAGATTATTATTATCTCAAAGTTTCTCTTAAGTTATCATCAGAG*CTGAGAGT
AGATTTGATTTTCACTTCT

QA 8 746 8 746
DS 

RD RR2GL92TF 824 0 0
GGATCTC
AGGAAGTAAGCCAAAATGAGTAAGCTCCAGAGTGAAGCCGAGAGAGAGGCAATATCCGCC
ATGATCACTCACTGCAAGGAGACAAAGCCTCGCAAGTTCACCGAGACCATCGAACTCCAG
ATTGGTCTTAAGAACTACGACCCACAAAAGGACAAGTGTTTCAGCGGTTCAGTCAAGTTG
CCTCACATCCCAAGGCCTAAGATGAAGATTTGCATGCTCGGTGATGCCCAGCACGTTGAA
GAGGCTGAGAAGATTGGATTAGAGTCTATGGATGTGGAAGCACTTAAGAAGCTGAACAAG
AACAAAAAGCTTGTTAAGAAGCTAGCAAAGAAGTTCCATGCTTTCCTTGCTTCTGAATCC
GTTATCAAACAGATTCCTCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGCAGGAAAGTTCCCG
ACTCTTGTTAGCCACCAAGAGTCTTTGGAAGCCAAAGTGAACGAGACAAAGGCAACAGTG
AAGTTCCAGCTCAAGAAGGTTCTTTGCATGGGTGTCGCTGTTGGGAACCTTGACATGGAG
GAGAAGCAGATCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTCGTCTCACTATTGAAG
AAGAACTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACAATGGGTCCACCTAACCGT
GTGTTCTAAGATTATTATTATCTCAAAGTTTCTCTTAAGTTATCATCAGAG*CTGAGAGT
AGATTTGATTTTCACTTCTGTCGTCAGCCTTCTTC*TCTTGGAT*ACTTC*AGA*TCCTT
ACTTTTGTAGGATCCA*GATTT*CTTAAAAGACAGTT

QA 8 824 8 824
DS 

RD RR2ES86JQ 777 0 0
ATATCCGCCATGATCACTCACTGCAAGGAGACAAAGCCTCGCAAGTTCACCGAGACCATC
GAACTCCAGATTGGTCTTAAGAACTACGACCCTCAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGTTCC
GTCAAGTTGCCTCACATTCCTAGGCCTCAGATGAAGATTTGCATACTCGGTGATGCCCAG
CACGTTGAAGAGGCTGAGAAGATTGGATTGGAGTCTATGGACGTGGAAGCACTTAAGAAG
CTGAACAAGAACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTAGCAAAGAAGTTCCATGCTTTCCTTGCT
TCTGAATCCGTTATCAAACAGATTCCTCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGCAGGA
AAGTTCCCGACTCTTGTTAGCCACCAAGAGTCTTTGGAAGCCAAAGTGAACGAGACAAAG
GCAACAGTGAAGTTCCAGCTCAAGAAGGTTCTTTGCATGGGTGTCGCTGTTGGGAACCTT
GACATGGAGGAGAAGCAGATCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTCGTCTCG
CTATTGAAGAAGAACTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACAATGGGTCCA
CCTAACCGTGTGTTCTAAGATTATTATTATCTCAAAGTTTCTCTTAAGTTATCATCAGAG
GCTGAGAGTAGATTTGATTTTCACTTCTGTCGTCAGCCTTCTTCCTCTTGGATTACTTCC
AGAATCCTTACTTTTGTAGGATCAA*GATTTTCTTAAAAGACAGTTTTGTTTC
TATT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2BC80TF 597 0 0
CCAGCACGTTGAAGAGGCTGAGAAGATTGGATTAGAGTCTATGGATGTGGAAGCACTTAA
GAAGCTGAACAAGAACAAAAAGCTTGTTAAGAAGCTAGCAAAGAAGTTCCATGCTTTCCT
TGCTTCTGAATCCGTTATCAAACAGATTCCTCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGC
AGGAAAGTTCCCGACTCTTGTTAGCCACCAAGAGTCTTTGGAAGCCAAAGTGAACGAGAC
AAAGGCAACAGTGAAGTTCCAGCTCAAGAAGGTTCTTTGCATGGGTGTCGCTGTTGGGAA
CCTTGACATGGAGGAGAAGCAGATCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTCGT
CTCACTATTGAAGAAGAACTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACAATGGG
TCCACCTAACCGTGTGTTCTAAGATTATTATTATCTCAAAGTTTCTCTTAAGTTATCATC
AGAGGCTGAGAGTAGATTTGATTTTCACTTCTGTCGTCAGCCTTCTTCCTCTTGGATTAC
TTCCAGAATCCTTACTTTTGTAGGATCCAAGATTTTCTTAAA*GACAGTTTTGTTTC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2GL92JQ 474 0 0
TCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGCAGGAAAGTTCCCGACTCTTGTTAGCCACCAAGA
GTCTTTGGAAGCCAAAGTGAACGAGACAAAGGCAACAGTGAAGTTCCAGCTCAAGAAGGT
TCTTTGCATGGGTGTCGCTGTTGGGAACCTTGACATGGAGGAGAAGCAGATCTTTCAGAA
TGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTCGTCTCACTATTGAAGAAGAACTGGCAAAACGTGAG
GTGTTTGTACTTGAAGAGCACAATGGGTCCACCTAACCGTGTGTTCTAAGATTATTATTA
TCTCAAAGTTTCTCTTAAGTTATCATCAGAGGCTGAGAGTAGATTTGATTTTCACTTCTG
TCGTCAGCCTTCTTCCTCTTGGATTACTTCCAGAATCCTTACTTTTGTAGGATCCAAGAT
TTTCTTAAAAGACAGTTTTGTTTCTATTATTATTAGTGGTTTTTTCCTAAGTT
C

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2G111JQ 524 0 0
GTCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGCAGGAAAGTTCCCGACTCTTGTTAGCCACCAAG
AGTCTTTGGAAGCCAAAGTGAACGAGACAAAGGCAACAGTGAAGTTCCAGCTCAAGAAGG
TTCTTTGCATGGGTGTCGCTGTTGGGAACCTTGACATGGAGGAGAAGCAGATCTTTCAGA
ATGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTCGTCTCACTATTGAAGAAGAACTGGCAAAACGTGA
GGTGTTTGTACTTGAAGAGCACAATGGGTCCACCTAACCGTGTGTTCTAAGATTATTATT
ATCTCAAAGTTTCTCTTAAGTTATCATCAGAGGCTGAGAGTAGATTTGATTTTCACTTCT
GTCGTCAGCCTTCTTCCTCTTGGATTACTTCCAGAATCCTTACTTTTGTAGGATCCAAGA
TTTTCTTAAAAGACAGTTTTGTTTCTATTATTATTAGTGGTTTTTTCCTAAGTTTACAAG
ATAAATATGTCAAATTATCTTATATCACAACAAAAAAGCTTTAT

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 7

CO CL838Contig1 1237 7 41 U
GACCCACAATCTCTCTCTCTCTCTCTGCTCAAATCTTCTCTCTTCTCTGATATTCAAAAT
AAAAATATACAGTGAAATCATAATGGCCGTCGATCTCATGCGTTTCCCCAAGATAGATGA
TCAAGCGGCTATCGAAGAAGCTGCATCGCAAGGCTTACAGAGCATGGATCACCTCATCCG
TGTCCTCTCTAACCGCTCCGACAAACACAACAACAACCTCGACTGCTCCGAGATAACCGA
TTACACCGTTTCCAAATTCAAAACGGTTATCTCTCTCCTTAACCGCACAGGTCACGCCCG
GTTCAGACGCGGTCCGGTTCAATCCACCCCATCTCCTCAGAAACAACAACAACAGAGTCA
AATCGTCAAAATCGCTCAAACGGAGGCTCCCATAGTTTCTCAACCGACGAGACCAACGGC
GGTTGCTGCCACACCGTCGAGGATGATAGTTCATTCGAATCATCAGCCGAGCTTAACACT
CGACTTCACTAAACCTACCATCTTCGGATCCAAGAGCTCTGAGATCGAATTCTCCAAGGA
GAACTTCAGCGTTTCTTTGAGCTCTTCGTGCATGTCGTCGGGGATAACCGGAGACGGTAG
CGTATCTAAGGGATCCTCAATCTTCCTCACGTCGGCACAGCAGCCTGTCACTTCCTCTGG
AAAGCCACCGTTGGCTGGTCATCCTTATAATAAAAAAAGATGCCTTGAGCACGAGCACTC
GCTCTCGGAGGGTTTTTCCGGCAAGATCTCCGGCTCCCTTTGCCCTTGCAAGAAACGTAG
AAAAAATCGGATGAAGAGAACCGTGAGGGTACCGGCGATAAGTTCAAAGATCGCCGATAT
TCCGCCTGACGAGTATTCATGGAGGAAGTACGGTCAAAAACCGATCAAGGGCTCACCACA
CCCACGTGGTTACTACAAGTGCAGTACGTTTAGAGGGTGTCCAGCGAGAAAACATGTGGA
ACGAGCTTTGGATGATTCAACGATGCTTATTGTGACTTATGAAGGAGAGCACCGTCATAA
CCAGTCCGCGATGCAGGAGAATGTTTCTTCTTCAGGCGTTACTGATTTGGTGTTTGCTTC
GGCATGACTTTGACTTGTATTTTTTTTTT****CTTGAGTATTAGAGGGGTTGGTTTGTA
AATCTTTTACTAAAAATATATTTTGATTAGAAACAACTAATCTGGTGAAAATGTATTTTC
TATAACATATTATCCTGGTGCAATATAAAATTAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2EL87TF U 1
AF RR2D762TF U 8
AF RR2GN48TF U 338
AF RR2GD94TF U 338
AF RR2EL87JQ C 492
AF RR2GD94JQ C 501
AF RR2GN48JQ C 823
BS 1 58 RR2EL87TF
BS 59 60 RR2D762TF
BS 61 96 RR2EL87TF
BS 97 97 RR2D762TF
BS 98 132 RR2EL87TF
BS 133 133 RR2D762TF
BS 134 156 RR2EL87TF
BS 157 157 RR2D762TF
BS 158 171 RR2EL87TF
BS 172 172 RR2D762TF
BS 173 174 RR2EL87TF
BS 175 175 RR2D762TF
BS 176 349 RR2EL87TF
BS 350 352 RR2D762TF
BS 353 366 RR2EL87TF
BS 367 367 RR2D762TF
BS 368 591 RR2EL87TF
BS 592 592 RR2D762TF
BS 593 606 RR2EL87TF
BS 607 609 RR2D762TF
BS 610 610 RR2GD94TF
BS 611 697 RR2D762TF
BS 698 698 RR2GD94TF
BS 699 736 RR2D762TF
BS 737 737 RR2GD94TF
BS 738 743 RR2D762TF
BS 744 744 RR2GD94TF
BS 745 752 RR2D762TF
BS 753 753 RR2GD94TF
BS 754 770 RR2D762TF
BS 771 1004 RR2GD94TF
BS 1005 1005 RR2EL87JQ
BS 1006 1032 RR2GD94TF
BS 1033 1109 RR2EL87JQ
BS 1110 1113 RR2GD94JQ
BS 1114 1131 RR2EL87JQ
BS 1132 1132 RR2GD94JQ
BS 1133 1184 RR2EL87JQ
BS 1185 1185 RR2GD94JQ
BS 1186 1200 RR2EL87JQ
BS 1201 1237 RR2GD94JQ

RD RR2EL87TF 606 0 0
GACCCACAATCTCTCTCTCTCTCTCTGCTCAAATCTTCTCTCTTCTCTGATATTCAAA**
AAAAATATACAGTGAAATCATAATGGCCGTCGATCTTATGCGTTTCCCCAAGATAGATGA
TCAAGCGGCTATTGAAGAAGCTGCATCGCAAGGCTTGCAGAGCATGGATCATCTGATCCG
TGTCCTCTCTAACCGCTCCGACAAACACAACAACAACCTCGACTGCTCCGAGATAACCGA
TTACACCGTTTCCAAATTCAAAACGGTTATCTCTCTCCTTAACCGCACAGGTCACGCCCG
GTTCAGACGCGGTCCGGTTCAATCCACCCCATCTCCTCAGAAACAACAA***CAGAGTCA
AATCGTTAAAATCGCTCAAACGGAGGCTCCCATAGTTTCTCAACCGACGAGACCAACGGC
GGTTGCTGCCACACCGTCGAGGATGATAGTTCATTCGAATCATCAGCCGAGCTTAACACT
CGACTTCACTAAACCTACCATCTTCGGATCCAAGAGCTCTGAGATCGAATTCTCCAAGGA
GAACTTCAGCGTTTCTTTGAGCTCTTCGTGCATGTCGTCGGGGATAACCGGCGACGGTAG
CGTATC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2D762TF 775 0 0
GGACCCACCA
TCTCTCTCTGCTCTGATCTTCTCTCTTCTCTGATATTCAAAATAAAAATATACAGTGAAA
TCATAATGGCCGTCGATCTCATGCGTTTCCCCAAGATAGATGATCAAGCGGCTATCGAAG
AAGCTGCATCGCAAGGCTTACAGAGCATGGATCACCTCATCCGTGTTCTCTCTAACCGCT
CCGACAAACACAACAACAACCTCGACTGCTCCGAGATAACCGATTACACCGTTTCCAAAT
TCAAAACGGTTATCTCTCTCCTTAACCGCACAGGTCACGCCCGGTTCAGACGCGGTCCGG
TTCACTCCACCCCATCTCCTCAGAAACAACAACAACAGAGTCAAATCGTCAAAATCGCTC
AAACGGAGGCTCCCATAGTTTCTCAACCGACGAGACCAACGGCGGTTGCTGCCACACCGT
CGAGGATGATAGTTCATTCGAATCATCAGCCGAGCTTAACACTCGACTTCACTAAACCTA
CCATCTTCGGATCCAAGAGCTCTGAGATCGAATTCTCCAAGGAGAACTTCAGCGTTTCTT
TGAGCTCTTCGTGCATGTCGTCGGGGATAACCGGAGACGGTAGCGTATCTAAAGGATCCT
CAATCTTCCTCACGTCGGCACAGCAGCCTGTCACTTCCTCTGGAAAGCCACCGTTGGCTG
GTCATCCTTATAATAAAAAA*GATGCCTTGAGCACGAGCACTCGCTCTCGGAGGGTTTT*
CCGGCA*GATCTCCG*CTCCCTTTGCCCTTGCA
GAACGTAGAAAA

QA 11 763 11 763
DS 

RD RR2GN48TF 543 0 0
G
AGAAACAACAACAACAGAGTCAAATCGTCAAAATCGCTCAAACGGAGGCTCCCATAGTTT
CTCAACCGACGAGACCAACGGCGGTTGCTGCCACACCGTCGAGGATGATAGTTCATTCGA
ATCATCAGCCGAGCTTAACACTCGACTTCACTAAACCTACCATCTTCGGATCCAAGAGCT
CTGAGATCGAATTCTCCAAGGTGAACTTCAGCGTTTCTTTGAGCTCTTCGTGCATGTCGT
CGGGGATAACCGGAGACGGTAGCGTATCTAAGGGATCCTCAATCTTCCTCACGTCGGCAC
AGCAGCCTGTCACTTCCTCTGGAAAGCCACCGTTGGCTGGTCATCCTTATAATAAAAAAA
GATGCCTTGAGCACGAGCACTCGCTCTCGGAGGGTTTTTCCGGCAAGATCTCCGGCTCCC
TTTGCCCTTGCAAGAAACGTAGAAAAAATCGGATGAAGAGAACCGTGAGGGTACCGGCGA
TAAGTTCAAAGATCGCCGATATTCCGCCTGACGAGTATTCATGGAGGAAGTACGGTCAAA
AA

QA 2 543 2 543
DS 

RD RR2GD94TF 695 0 0
G
AGAAACAACAACAACAGAGTCAAATCGTCAAAATCGCTCAAACGGAGGCTCCCATAGTTT
CTCAACCGACGAGACCAACGGCGGTTGCTGCCACACCGTCGAGGATGATAGTTCATTCGA
ATCATCAGCCGAGCTTAACACTCGACTTCACTAAACCTACCATCTTCGGATCCAAGAGCT
CTGAGATCGAATTCTCCAAGGTGAACTTCAGCGTTTCTTTGAGCTCTTCGTGCATGTCGT
CGGGGATAACCGGAGACGGTAGCGTATCTAAGGGATCCTCAATCTTCCTCACGTCGGCAC
AGCAGCCTGTCACTTCCTCTGGAAAGCCACCGTTGGCTGGTCATCCTTATAATAAAAAAA
GATGCCTTGAGCACGAGCACTCGCTCTCGGAGGGTTTTTCCGGCAAGATCTCCGGCTCCC
TTTGCCCTTGCAAGAAACGTAGAAAAAATCGGATGAAGAGAACCGTGAGGGTACCGGCGA
TAAGTTCAAAGATCGCCGATATTCCGCCTGACGAGTATTCATGGAGGAAGTACGGTCAAA
AACCGATCAAGGGCTCACCACACCCACGTGGTTACTACAAGTGCAGTACGTTTAGAGGGT
GTCCAGCGAGAAAACATGTGGAACGAGCTTTGGATGATTCAACGATGCTTATTGTGACTT
ATGAAG*AGAGCACCGTCATAACCAGTCCGCGAT

QA 2 695 2 695
DS 

RD RR2EL87JQ 711 0 0
AACCTACCATCTTCGGATCCAAGAGCTCTGAGATCGAATTCTCCAAGGAGAACTTCAGCG
TTTCTTTGAGCTCTTCGTGCATGTCGTCGGGGATAACCGGCGACGGTAGCGTATCTAAGG
GATCCTCAATCTTCCTCACGTCGGCACAGCAGCCTGTCACTTCCTCTGGAAAGCCACCGT
TGGCTGGTCATCCTTATAATAAAAAAAGATGCCTTGAGCACGAGCACTCCCTCTCGGAGG
GTTTTTCCGGCAAGATCTCTGGCTCCCCTTGCCCTTGCAAGAAACGTAGAGAAAATCGGA
TGAAGAGAACTGTGAGGGTACCGGCGATAAGTTCAAAGATCGCCGATATTCCGCCGGACG
AGTATTCATGGAGGAAGTACGGTCAAAAACCGATCAAGGGCTCACCACACCCACGTGGTT
ACTACAAGTGCAGTACGTTTAGAGGGTGTCCAGCGAGAAAACATGTGGAACGAGCTTTGG
ATGATTCAACGATGCTTATTGTGACTTATGAAGGAGAGCACCGTCATAACCAGTCCGCGA
TGCAGGAGAATGTTTCTTCTTCAGGCGTTACTGATTTGGTGTTTGCTTCGGCATGACTTT
GACTTGTATTTTTTTTTTTTTTCTTGAGTATTAGAGGGGTCGGTTTGTAAATCTTTTACT
AAAAATATATTTTGATTAGAAACAACTAATCTGTTGAAAATGTATTTTC
AT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2GD94JQ 737 0 0
TCTTCGGATCCAAGAGCTCTGAGATCGAATTCTCCAAGGTGAACTTCAGCGTTTCTTTGA
GCTCTTCGTGCATGTCGTCGGGGATAACCGGAGACGGTAGCGTATCTAAGGGATCCTCAA
TCTTCCTCACGTCGGCACAGCAGCCTGTCACTTCCTCTGGAAAGCCACCGTTGGCTGGTC
ATCCTTATAATAAAAAAAGATGCCTTGAGCACGAGCACTCGCTCTCGGAGGGTTTTTCCG
GCAAGATCTCCGGCTCCCTTTGCCCTTGCAAGAAACGTAGAAAAAATCGGATGAAGAGAA
CCGTGAGGGTACCGGCGATAAGTTCAAAGATCGCCGATATTCCGCCTGACGAGTATTCAT
GGAGGAAGTACGGTCAAAAACCGATCAAGGGCTCACCACACCCACGTGGTTACTACAAGT
GCAGTACGTTTAGAGGGTGTCCAGCGAGAAAACATGTGGAACGAGCTTTGGATGATTCAA
CGATGCTTATTGTGACTTATGAAGGAGAGCACCGTCATAACCAGTCCGCGATGCAGGAGA
ATGTTTCTTCTTCAGGCGTTACTGATTTGGTGTTTGCTTCGGCATGACTTTGACTTGTAT
TTTTTTTTT****CTTGAGTATTAGAGGGGTTGGTTTGTAAATCTTTTACTAAAAATATA
TTTTGATTAGAAACAACTAATCTGGTGAAAATGTATTTTCTATAACATATTATCCTGGTG
CAATATAAAATTAGATT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2GN48JQ 415 0 0
TTCAAAGATCGCCGATATTCCGCCTGACGAGTATTCATGGAGGAAGTACGGTCAAAAACC
GATCAAGGGCTCACCACACCCACGTGGTTACTACAAGTGCAGTACGTTTAGAGGGTGTCC
AGCGAGAAAACATGTGGAACGAGCTTTGGATGATTCAACGATGCTTATTGTGACTTATGA
AGGAGAGCACCGTCATAACCAGTCCGCGATGCAGGAGAATGTTTCTTCTTCAGGCGTTAA
TGATTTGGTGTTTGCTTCGGCATGACTTTGACTTGTATTTTTTTTTT****CTTGAGTAT
TAGAGGGGTTGGTTTGTAAATCTTTTACTAAAAATATATTTTGATTAGAAACAACTAATA
TGGTGAAAATGTATTTTCTATAACATATTATCCTGGTGCAATATAAAATTAGATT

QA 1 415 1 415
DS 



AS 1 7

CO CL839Contig1 1155 7 11 U
GGGAAACACAAAGGAAACTAGAGAAAATTAAGGTGAAGTCAGGAGCAATTAGAGGCATTT
AAGATATGCTATCTTGACTGAGAGAAATAGACGAGAACAAATACAATTGTTTATCACCAT
AACCCCTAAAGTGTCTAATCTTCTTTCAATATTTCTTTTCTTTTGAAACACTTCTTTCAA
TATTTCACTCCCTGGTTTATACATAACATAGGACAATGAAGATACCATCAATGGTATGCG
TTGTTTTCTTTATCGCCATCTTTATTACCATTGTTTCGAGTTCACCAGACCATGGAGAAG
TTGAGGACGAAACTGAGTTTAACTACGAGAAGGGAGGAGAGAAGGGGCCAGAGAAATGGG
GAACACTAAAGCCAGAATGGAAAATGTGTGGAAACGGCACGATGCAGTCACCTATTGATC
TTACGGACAATAGAGTCTTCATTGATCATAAGATTGGATCGTTACACAGCCATTATCTAC
CTTCTAATGGCACCATTAAGAACAGAGGCCATGATATCATGTTGGAATTCGAAGGAGGAA
ATGCAGGTATGGGTATAACTATCAATGG*TACTGTATATCAACTTCAACAGCTTCATTGG
CACTCTCCTTCCGAACACACGATCAACGGTAAAAGGTTTGTCCTAGAGGAACACATGGTT
CATCAGAGCAAAGATGGTCGCTTCGCCGTTGTGGCGTTCCTCTACAATTTGGGAAAACCT
GACCCTTTTCTCCTTTCGTTGGAAAGACAATTGAAGAGGATAACTGATAGACATGAATCC
GAGGAATTTATCAGTATGATTGATCCTAGAATGATCAATTTCAAATCAAGATTCTATTAC
AGATATTTAGGATCACTCACAACTCCCCCCTGTTCTGAAAATGTTACTTGGTCCATTTCC
AGAGAGACGATGACTGTAACGTTGAAACAGTTGAGCCTGCTTCGTGTGACTGTACATGAT
CAATCTAATTCGAATGCTAGACCGCTTCAACGTCAAAACCAGCGTCCAGTGAAATTTTAC
TTACCAACATGGCATATTTAACCATTATGAAGTTGTTGTTTGTTCACTCTATTTGAGCTT
TGGTTAAACCTAGTTTTCATTAGTTTTATGTACTGAGAACCAAAAGAGAACACTAATAAA
AAAAAATTTGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF59TF U 87
AF RR2DS35TF U 1
AF RR2GM04TF U 87
AF RR2DG66TF U 537
AF RR2AM19TF U 155
AF RR2A839TF U 424
AF RR2AM19JQ C 351
BS 1 395 RR2DS35TF
BS 396 396 RR2GM04TF
BS 397 635 RR2DS35TF
BS 636 743 RR2GM04TF
BS 744 850 RR2AM19TF
BS 851 851 RR2A839TF
BS 852 989 RR2AM19TF
BS 990 990 RR2A839TF
BS 991 999 RR2AM19TF
BS 1000 1137 RR2A839TF
BS 1138 1155 RR2AM19JQ

RD RR2FF59TF 197 0 0
GG
AGACGAGAACAAATACAATTGTTTATCACCATAACCCCTAAAGTTTCTAATCTTCTTTCA
ATATTTCTTTTCTTTTGAAACACTTCTTTCAATATTTCACTCCCTGGTTTATACATAACA
TAAGACAATGAAGATACCATCAATGGTATGCGTTGTTTTCTTTATCGCCATCTTTATTAC
CATTGTTTCGAGTTC

QA 3 197 3 197
DS 

RD RR2DS35TF 643 0 0
GGGAAACACAAAGGAAACTAGAGAAAATTAAGGTGAAGTCAGGAGCAATTAGAGGCATTT
AAGATATGCTATCTTGACTGAGAGAAATAGACGAGAACAAATACAATTGTTTATCACCAT
AACCCCTAAAGTGTCTAATCTTCTTTCAATATTTCTTTTCTTTTGAAACACTTCTTTCAA
TATTTCACTCCCTGGTTTATACATAACATAGGACAATGAAGATACCATCAATGGTATGCG
TTGTTTTCTTTATCGCCATCTTTATTACCATTGTTTCGAGTTCACCAGACCATGGAGAAG
TTGAGGACGAAACTGAGTTTAACTACGAGAAGGGAGGAGAGAAGGGGCCAGAGAAATGGG
GAACACTAAAGCCAGAATGGAAAATGTGTGGAAACTGCACGATGCAGTCACCTATTGATC
TTACGGACAATAGAGTCTTCATTGATCATAAGATTGGATCGTTACACAGCCATTATCTAC
CTTCTAATGGCACCATTAAGAACAGAGGCCATGATATCATGTTGGAATTCGAAGGAGGAA
ATGCAGGTATGGGTATAACTATCAATGG*TACTGTATATCAACTTCAACAGCTTCATTGG
CACTCTCCTTCCGAACACACGATCAACGGTAAAAG
TTTGTCCT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2GM04TF 657 0 0
GG
AGACGAGAACAAATACAATTGTTTATCACCATAACCCCTAAAGTGTCTAATCTTCTTTCA
ATATTTCTTTTCTTTTGAAACACTTCTTTCAATATTTCACTCCCTGGTTTATACATAACG
TAGGACAATGAAGATACCATCAATGGTATGCGTTGTTTTCTTTATCGCCATCTTTATTAC
CATTGTTTCGAGTTCACCAGACCATGGAGAAGTTGAGGACGAAACTGAGTTTAACTACGA
GAAGGGAGGAGAGAAGGGGCCAGAGAAATGGGGAACACTAAAGCCAGAATGGAAAATGTG
TGGAAACGGCACGATGCAGTCACCTATTGATCTTACGGACAATAGAGTCTTCATTGATCA
TAAGATTGGATCGTTACACAGCCATTATCTACCTTCTAATGGCACCATTAAGAACAGAGG
CCATGATATCATGTTGGAATTCGAAGGAGGAAATGCAGGTATGGGTATAACTATCAATGG
*TACTGTATATCAACTTCAACAGCTTCATTGGCACTCTCCTTCCGAACACACGATCAACG
GTAAAAGGTTTGTCCTAGAGGAACACATGGTTCATCAGAGCAAAGATGGTCGCTTCGCCG
TTGTGGCGTTCCTCTACAATTTGGGAAAACCTGACCCTTTTCTCCTTTCGTTGGA

QA 3 657 3 657
DS 

RD RR2DG66TF 321 0 0
AAATGCAGGGTATG
GGGTATAACTATCAATGGGTACTGTATATCAACTTCAACAGCTTCATTGGCACTCTCCTT
CCGAACACACGATCAACGGTAAAAGGTTTGTCCTAGAGGAACACATGGTTCATCAGAGCA
AAGATGGCCGCTTCGCCGTTGTGGCGTTCCTCTACAATTTGGGAAAACCTGACCCTTTTC
TCCTTTCGTTGGAAAGACAATTGAAGAGGATAACTGATAGACATGAATCCGAG*AATTTA
TCAGTATGAT*GATCCTAGAATGATCAATTTCAAATCAAGATTCTATTACAGATATTTAG
ATCACTC

QA 15 314 15 314
DS 

RD RR2AM19TF 845 0 0
CTTTTCTTTTGAAACACTTCTTTCAATATTTCACTCCCTGGTTTATACATAACATAGGAC
AATGAAGATACCATCAATGGTATGCGTTGTTTTCTTTATCGCCATCTTTATTACCATTGT
TTCGAGTTCACCAGACCATGGAGAAGTTGAGGACGAAACTGAGTTTAACTACGAGAAGGG
AGGAGAGAAGGGGCCAGAGAAATGGGGAACACTAAAGCCAGAATGGAAAATGTGTGGAAA
CGGCACGATGCAGTCACCTATTGATCTTACGGACAATAGAGTCTTCATTGATCATAAGAT
TGGATCGTTACACAGCCATTATCTACCTTCTAATGGCACCATTAAGAACAGAGGCCATGA
TATCATGTTGGAATTCGAAGGAGGAAATGCAGGTATGGGTATAACTATCAATGG*TACTG
TATATCAACTTCAACAGCTTCATTGGCACTCTCCTTCCGAACACACGATCAACGGTAAAA
GGTTTGTCCTAGAGGAACACATGGTTCATCAGAGCAAAGATGGTCGCTTCGCCGTTGTGG
CGTTCCTCTACAATTTGGGAAAACCTGACCCTTTTCTCCTTTCGTTGGAAAGACAATTGA
AGAGGATAACTGATAGACATGAATCCGAGGAATTTATCAGTATGATTGATCCTAGAATGA
TCAATTTCAAATCAAGATTCTATTACAGATATTTAG*ATCACTCACAACTCCCCCCTGTT
CTGAAAATGTTACTTGGTCCATTTCCAGAGAGACGATGACTGTAACGTTGAAACAGTTGA
GCCTGCTTCGTGTGACTGTACATGATCAATCTAATTCGAATGCTAGACCGCTTCA*CGTC
AAAAC

QA 1 845 1 845
DS 

RD RR2A839TF 714 0 0
G
GGACAATAGAGTCTTCATTGATCATAAGATTGGATCGTTACACAGCCATTATCTACCTTC
TAATGGCACCATTAAGAACAGAGGCCATGATATCATGTTGGAATTCGAAGGAGGAAATGC
AGGTATGGGTATAACTATCAATGG*TACTGTATATCAACTTCAACAGCTTCATTGGCACT
CTCCTTCCGAACACACGATCAACGGTAAAAGGTTTGTCCTAGAGGAACACATGGTTCATC
AGAGCAAAGATGGTCGCTTCGCCGTTGTGGCGTTCCTCTACAATTTGGGAAAACCTGACC
CTTTTCTCCTTTCGTTGGAAAGACAATTGAAGAGGATAACTGATAGACATGAATCCGAGG
AATTTATCAGTATGATTGATCCTAGAATGATCAATTTCAAATCAAGATTCTATTACAGAT
ATTTAGGATCACTCACAACTCCCCCCTGTTCTGAAAATGTTACTTGGTCCATTTCCAGAG
AGACGAGGACTGTAACGTTGAAACAGTTGAGCCTGCTTCGTGTGACTGTACATGATCAAT
CTAATTCGAATGCTAGACCGCTTCAACGTCAAAACCAGCGTCCAGTGAAATTTTACTTAC
CAACATGGCATATTTAACCATTATGAAGTTGTTGTTTGTTCACTCTATTTGAGCTTTGGT
TAAACCTAGTTTTCATTAGTTTTATGTACTGAGAACCAAAAGAGAACACTAAT

QA 2 714 2 714
DS 

RD RR2AM19JQ 805 0 0
GAGAAATGGGGAACACTAAAGCCAGAATGGAAAATGTGTGGAAACGGCACGATGCAGTCA
CCTATTGATCTTACGGACAATAGAGTCTTCATTGATCATAAGATTGGATCGTTACACAGC
CATTATCTACCTTCTAATGGCACCATTAAGAACAGAGGCCATGATATCATGTTGGAATTC
GAAGGAGGAAATGCAGGTATGGGTATAACTATCAATGG*TACTGTATATCAACTTCAACA
GCTTCATTGGCACTCTCCTTCCGAACACACGATCAACGGTAAAAGGTTTGTCCTAGAGGA
ACACATGGTTCATCAGAGCAAAGATGGTCGCTTCGCCGTTGTGGCGTTCCTCTACAATTT
GGGAAAACCTGACCCTTTTCTCCTTTCGTTGGAAAGACAATTGAAGAGGATAACTGATAG
ACATGAATCCGAGGAATTTATCAGTATGATTGATCCTAGAATGATCAATTTCAAATCAAG
ATTTTATTACAGATATTTAGGATCACTCACAACTCCCCCCTGTTCTGAAAATGTTACTTG
GTCCATTTCCAGAGAGACGATGACTGTAACGTTGAAACAGTTGAGCCTGCTTCGTGTGAC
TGTACATGATCAATTTAATTCGAATGCTAGACCGCTTCAACGTCAAAACCAGCGTCCAGT
GAAATTTTACTTACCAACATGGCATATTTAACCATTATGAAGTTGTTGTTTGTTCACTCT
ATTTGAGCTTTGGTTAAACCTAGTTTTCATTAGTTTTATGTACTGAGAACCAAAAGAGAA
CACTAATAAAAAAAAATTTGTTTTT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 6

CO CL840Contig1 842 6 17 U
GAAACGGAACCAAGAGGTGGAGGACTACTTCTCACTTACAAACAGCGATGGCGATGTCTC
TTCTGAAGCTAAGAAACTCACCTGCTTTGAGATCGGCGGCGAATGTTTCCCCGATCGGAG
TTTTATCAAGGGCTTTCTCAAAGCTCTCTGAGGGCACGGACATAACCTCGGCGGCTCCAG
GCGTTTCCCTCCAGAAAGCTCGCAGCTGGGACGAAGGCGTCTCCTCCAAATTCTCCACCA
CACCATTGACAGATATCTTCAAGGGGAAGAAAGTCGTTATCTTTGGACTTCCTGGCGCGT
ACACAGGAGTCTGCTCACAGCAGCATGTGCCAAACTACAAGAGCCACATTGATAAGTTCA
AAGCCAAAGGCATTGACTCCGTCATCTGTGTCTCTGTCAATGATCCGTATACTATAAATG
GTTGGGCAGACAAGATTGGGGCCAAAGACGCTATTGAGTTTTATGGAGATTTTGATGGGA
AATTCCATAAAAGCTTGGGGCTAGACAAGGATCTCTCTGCTGCATTGCTCGGCCCTCGGT
CTGAGAGATGGTCGGCTTATGTAGAAGACGGCAAGGTGAAGGCTGTGAACGTGGAAGAAG
CACCGTCTGACTTCAAGGTGTCAGGAGCAGAAGTCATTTTAGGACAGATCTAACAAGTGT
CTCGACAAGTTGTTCTTGTCTCTGTTGTTTCCTCTTTATAAGTTGCGAGTGAAAATAAGT
TTGATCCGAACATCACCAACGGATCACACCAAGTCATCAACTCTCCTTTTTCTTGGTTCC
TGTTTTCTTTTCAATAAATAATGTTTGTTACTCGCCAATTCTCAGCAAATGTACATCATA
AC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 0 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 20 5 35 20 35 35 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2DY57TF U 77
AF RR2FK76JQ C 20
AF RR2AI18JQ C 54
AF RR2AI18TF U 54
AF RR2BG90TF U 1
AF RR2BG90JQ C 216
BS 1 41 RR2BG90TF
BS 42 42 RR2FK76JQ
BS 43 43 RR2BG90TF
BS 44 44 RR2FK76JQ
BS 45 312 RR2BG90TF
BS 313 313 RR2AI18TF
BS 314 641 RR2BG90TF
BS 642 642 RR2AI18TF
BS 643 790 RR2BG90TF
BS 791 793 RR2AI18TF
BS 794 797 RR2BG90TF
BS 798 799 RR2AI18TF
BS 800 800 RR2BG90TF
BS 801 801 RR2AI18TF
BS 802 808 RR2BG90TF
BS 809 809 RR2BG90JQ
BS 810 842 RR2BG90TF

RD RR2DY57TF 221 0 0
CTCT
CCTGCTTTGAGATCGGCGGCGAATGTTTCCCCGATCGGAGTTTTATCAAGGGCTTTCTCA
AAGCTCTCTGAGGGCACGGACATAACCTCGGCGGCTCCAGGCGTTTCCCTCCAGAAAGCT
CGCAGCTGGGACGAAGGCGTCTCCTCCAAATTCTCCACCACACCATTGACAGATATCTTC
AAGGGGAAGAAAG*CGTCATCTTTGGACTTCCTGGCG

QA 5 221 5 221
DS 

RD RR2FK76JQ 789 0 0
GAG*ACTACTTCTCATTTTCAGACAGCGATGGCGATGTCTCTTCTGAAGCTAAGAAACTC
AC*TGCTTTGAGATCGGCGGCGAATGTTTCCCCGATCGGGGTTTTATCAAGGGCTTTCTC
AAAGCTCTCTGAGGGCACGGACATAACCTCGGCGGCTCCAGGCGTTTCCCTCCAGAAAGC
TCGCAGCTGGGACGAAGGCGTCTCCTCCAAATTCTCTACCACACCATTGGCAGATATCTT
CAAGGGGAAGAAAGTCGTCATCTTTGGACTTCCTGGGGCGTACACAGGAGTCTGCTCACA
GCAGCATGTGCCAAGCTACAAGAGCCACATTGATAAGTTCAAAGCCAAAGGCATTGACTC
CGTCATCTGCGTCTCTGTCAATGATCCCTATACTATAAATGGTTGGGCAGAGAAGATTGG
TGCCAAAGATGCTATTGAGTTTTATGGAGATTTTGATGGGAAATTCCATAAAAGCTTGGG
GCTAGACAAGGATCTCTCTGTTGCATTGCTCGGACCTCGGTCTGAGAGATGGTCTGCTTA
TGTAGAAGACGGTAAGGTTAAGGCTGTAAACGTGGAAGAAGCACCGTCTGACTTCAAGGT
GTCAGGGGCAGAAGTCATTTTAGGACAGATCTAACAAGTGTCTCGACAAGTTGTTCTTGT
CTCTGTTGTTTCCTCTTTATAAGTTGCGAGTGAAAATAAGTTTGATCCGAACATCACCAA
CGGATCACACCAAGTCATCAACTCTCCTTTTTCTTGGTTCCTGTTTTCTTTTCAATAAAA
AATG
TTTGT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2AI18JQ 759 0 0
ATGTCTCTTCTGAAGCTAAGAAACTCACCTGCTTTGAGATCGGCGGCGAATGTTTCCCCG
ATCGGAGTTTTATCAAGGGCTTTCTCAAAGCTCTCTGAGGGCACGGACATAACCTCGGCG
GCTCCAGGCGTTTCCCTCCAGAAAGCTCGCAGCTGGGACGAAGGCGTCTCCTCCAAATTC
TCCACCACACCATTGACAGATATCTTCAAGTGGAAGAAAGTCGTTATCTTTGGACTTCCT
GGCGCGTACACAGGAGTCTGCTCACAGCAGCATGTGCCAAACTACAAGAGCCACATTGAT
AAGTTCAAAGCCAAAGGCATTGACTCCGTCATCTGTGTCTCTGTCAATGATCCGTATACT
ATAAATGGTTGGGCAGACAAGATTGGGGCCAAAGACGCTATTGAGTTTTATGGAGATTTT
GATGGGAAATTCCATAAAAGCTTGGGGCTAGACAAGGATCTCTCTGCTGCATTGCTCGGC
CCTCGGTCTGAGAGATGGTCGGCTTATGTAGAAGACGGCAAGGTGAAGGCTGTGAACGTG
GAAGAAGCACCGTCTGACTTCAAGGTGTCAGGAGCAGAAGTCATTTTAGGACAGATCTAA
CAAGTGTCTCGACAAGTTGTTCTTGTCTCTGTTGTTTCCTCTTTATAAGTTGCGAGTGAA
AATAAGTTTGATCCGAACATCACCAACGGATCACACCAAGTCATCAACTCTCCTTTTTCT
TGGTTCCTGTTTTCTTTTCAATAAATAATGTTTGT
TACC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2AI18TF 750 0 0
ATGTCTCTTCTGAAGCTAAGAAACTCACCTGCTTTGAGATCGGCGGCGAATGTTTCCCCG
ATCGGAGTTTTATCAAGGGCTTTCTCAAAGCTCTCTGAGGGCACGGACATAACCTCGGCG
GCTCCAGGCGTTTCCCTCCAGAAAGCTCGCAGCTGGGACGAAGGCGTCTCCTCCAAATTC
TCCACCACACCATTGACAGATATCTTCAAGTGGAAGAAAGTCGTTATCTTTGGACTTCCT
GGCGCGTACACAGGAGTCTGCTCACAGCAGCATGTGCCAAACTACAAGAGCCACATTGAT
AAGTTCAAAGCCAAAGGCATTGACTCCGTCATCTGTGTCTCTGTCAATGATCCGTATACT
ATAAATGGTTGGGCAGACAAGATTGGGGCCAAAGACGCTATTGAGTTTTATGGAGATTTT
GATGGGAAATTCCATAAAAGCTTGGGGCTAGACAAGGATCTCTCTGCTGCATTGCTCGGC
CCTCGGTCTGAGAGATGGTCGGCTTATGTAGAAGACGGCAAGGTGAAGGCTGTGAACGTG
GAAGAAGCACCGTCTGACTTCAAGGTGTCAGGAGCAGAAGTCATTTTAGGACAGATCTAA
CAAGTGTCTCGACAAGTTGTTCTTGTCTCTGTTGTTTCCTCTTTATAAGTTGCGAGTGAA
AATAAGTTTGATCCGAACATCACCAACGGATCACACCAAGTCATCAACTCTCCTTTTTCT
TGGTTCCTGTTTTCTTTTCAATAAATAATG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2BG90TF 842 0 0
GAAACGGAACCAAGAGGTGGAGGACTACTTCTCACTTACAAGCGGCGATGGCGATGTCTC
TTCTGAAGCTAAGAAACTCACCTGCTTTGAGATCGGCGGCGAATGTTTCCCCGATCGGAG
TTTTATCAAGGGCTTTCTCAAAGCTCTCTGAGGGCACGGACATAACCTCGGCGGCTCCAG
GCGTTTCCCTCCAGAAAGCTCGCAGCTGGGACGAAGGCGTCTCCTCCAAATTCTCCACCA
CACCATTGACAGATATCTTCAAGGGGAAGAAAGTCGTTATCTTTGGACTTCCTGGCGCGT
ACACAGGAGTCTACTCACAGCAGCATGTGCCAAACTACAAGAGCCACATTGATAAGTTCA
AAGCCAAAGGCATTGACTCCGTCATCTGTGTCTCTGTCAATGATCCGTATACTATAAATG
GTTGGGCAGACAAGATTGGGGCCAAAGACGCTATTGAGTTTTATGGAGATTTTGATGGGA
AATTCCATAAAAGCTTGGGGCTAGACAAGGATCTCTCTGCTGCATTGCTCGGCCCTCGGT
CTGAGAGATGGTCGGCTTATGTAGAAGACGGCAAGGTGAAGGCTGTGAACGTGGAAGAAG
CACCGTCTGACTTCAAGGTGTCAGGAGCAGAAGTCATTTTATGACAGATCTAACAAGTGT
CTCGACAAGTTGTTCTTGTCTCTGTTGTTTCCTCTTTATAAGTTGCGAGTGAAAATAAGT
TTGATCCGAACATCACCAACGGATCACACCAAGTCATCAACTCTCCTTTTTCTTGGTTCC
TGTTTTCTTTC**ATAATAA*TGTTTGT*ACTCGCCAATTCTCAGCAAATGTACATCATA
AC

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR2BG90JQ 627 0 0
GGCGTCTCCTCCAAATTCTCCACCACACCATTGACAGATATCTTCAAGGGGAAGAAAGTC
GTTATCTTTGGACTTCCTGGCGCGTACACAGGAGTCTACTCACAGCAGCATGTGCCAAAC
TACAAGAGCCACATTGATAAGTTCAAAGCCAAAGGCATTGACTCCGTCATCTGTGTCTCT
GTCAATGATCCGTATACTATAAATGGTTGGGCAGACAAGATTGGGGCCAAAGACGCTATT
GAGTTTTATGGAGATTTTGATGGGAAATTCCATAAAAGCTTGGGGCTAGACAAGGATCTT
TCTGCTGCATTGCTCGGCCCTCGGTCTGAGAGATGGTCGGCTTATGTAGAAGACGGCAAG
GTGAAGGCTGTGAACGTGGAAGAAGCACCGTCTGACTTCAAGGTGTCAGGAGCAGAAGTC
ATTTTATGACAGATCTAACAAGTGTCTCGACAAGTTGTTCTTGTCTCTGTTGTTTCCTCT
TTATAAGTTGCGAGTGAAAATAAGTTTGATCCGAACATCACCAACGGATCACACCAAGTC
ATCAACTCTCCTTTTTCTTGGTTCCTGTTTTCTTTTCAATAAATAATGTTTGTTACTCGC
CAATTCTCAGCAAATGTACATCATAAC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 8

CO CL841Contig1 522 8 17 U
GGAGAGACGTCGCCACGAATTTCGCTTGATCTCGAAACTTCCCCAATCTTCCGTCGTCTG
CATCAGG*****AAAGGGAGAGAGAATGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGAT
CTCATACGTTGCGAACGAGCTCATTGTTAATGGTTTGTCTAACAGCCATGCGTTCCAGAG
ATTCGCTGTGAGGACTTCAAAAAGAATAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAA
GGAGAAAGTCGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACC
GTGAGAATTCAAGTGCTTGGAAGTCGGGGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGGG
GGATGTTTGCTATGTCTATATAAAAAAGAATGCTTGAATGTAATAAGCTT*GTGTGTTAA
ACACAACCACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATTT*AAAAAAAAATTCACTTGACAAG
GAGTGACTTTGGCTAATGAAAATATTTGTGAAGTCTTTGCTT


BQ
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 35 50 
35 50 35 35 50 50 5 0 0 20 20 0 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN74TF U 1
AF RR2DM57JQ C 51
AF RR2F573JQ C 1
AF RR2F573TF U 1
AF RR2ET51JQ C 1
AF RR2ET51TF U 1
AF RR2CW72TF U 1
AF RR2DM57TF U 1
BS 1 24 RR2BN74TF
BS 25 25 RR2F573TF
BS 26 52 RR2BN74TF
BS 53 53 RR2F573TF
BS 54 66 RR2BN74TF
BS 67 67 RR2F573TF
BS 68 72 RR2BN74TF
BS 73 77 RR2F573TF
BS 78 314 RR2BN74TF
BS 315 315 RR2F573TF
BS 316 405 RR2BN74TF
BS 406 406 RR2F573TF
BS 407 410 RR2BN74TF
BS 411 411 RR2F573TF
BS 412 466 RR2BN74TF
BS 467 467 RR2ET51TF
BS 468 522 RR2BN74TF

RD RR2BN74TF 522 0 0
GGAGAGACGTCGCCACGAATTTCGTTTGATCTCGAAACTTCCCCAATCTTCCATCGTCTG
CATCAGT**********GAGAGAGAATGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGAT
CTCATACGTTGCGAACGAGCTCATTGTTAATGGTTTGTCTAACAGCCATGCGTTCCAGAG
ATTCGCTGTGAGGACTTCAAAAAGAATAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAA
GGAGAAAGTCGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACC
GTGAGAATTCAAGTTCTTGGAAGTCGGGGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGGG
GGATGTTTGCTATGTCTATATAAAAAAGAATGCTTGAATGTAATACGCTTTGTGTGTTAA
ACACAACCACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATTT*AAAAAAAA*TTCACTTGACAAG
GAGTGACTTTGGCTAATGAAAATATTTGTGAAGTCTTTGCTT

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2DM57JQ 465 0 0
ATCAGGTG
AGGAA*AGG**********GAGAGATAATGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTG
ATCTCATACGTTGCGAACGAGCTCATTGTTAATGGTTTGCCTAACAGCCATGCGTTCCAG
AGATTCGCTGTGAGGACTTCAAAAAGAATAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCGGAGAGC
AAGGAGAAAGTCGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAA
CCGTGAGAATTCAAGTGCTTGGAAGTCGTGGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAG
GGGGATGTTTGCTATGTCTATATAAAAAAGAATGCTTGAATGTAATAAGCTT*GTGTGTT
AAACACAACCACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATTT*AAAAAAAAATTCACTTGACA
AGGAGTGACTTTGGCTAATGAAAATATTTGTGAAGTC

QA 9 465 9 465
DS 

RD RR2F573JQ 494 0 0
GGAGAGACGTCGCCACGAATTTCGCTTGATCTCGAAACTTCCCCAATCTTCCGTCGTCTG
CATCAGG*****AAAGGGAGAGATAATGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGAT
CTCATACGTTGCGAACGAGCTCATTGTTAATGGTTTGTCTAACAGCCATGCGTTCCAGAG
ATTCGCTGTGAGGACTTCAAAAAGAATAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAA
GGAGAAAGTCGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACC
GTGAGAATTCAAGTGCTTGGAAGTCGTGGATTACATGGGTCAAAGCTCAGATAGTGAGGG
GGATGTTTGCTATGTCTATATAAAAAAGAATGCTTGAATGTAATAAGCTT*GTGTGTTAA
ACACAACCACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATTT*AAAAAAAA*TTCACTTTACAAG
GAGTGACTTTGGCT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2F573TF 494 0 0
GGAGAGACGTCGCCACGAATTTCGCTTGATCTCGAAACTTCCCCAATCTTCCGTCGTCTG
CATCAGG*****AAAGGGAGAGATAATGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGAT
CTCATACGTTGCGAACGAGCTCATTGTTAATGGTTTGTCTAACAGCCATGCGTTCCAGAG
ATTCGCTGTGAGGACTTCAAAAAGAATAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAA
GGAGAAAGTCGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACC
GTGAGAATTCAAGTGCTTGGAAGTCGTGGATTACATGGGTCAAAGCTCAGATAGTGAGGG
GGATGTTTGCTATGTCTATATAAAAAAGAATGCTTGAATGTAATAAGCTT*GTGTGTTAA
ACACAACCACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATTT*AAAAAAAA*TTCACTTTACAAG
GAGTGACTTTGGCT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2ET51JQ 515 0 0
GGAGAGACGTCGCCACGAATTTCGCTTGATCTCGAAACTTCCCCAATCTTCCGTCGTCTG
CATCAGC*****TGAGTGAGAGAGAATGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGAT
CTCATACGTTGCGAACGAGCTCATTGTTAATGGTTTGTCTAACAGCCATGTTTTCCAGAG
ATTTGCTGTGAGGACTTCAAAAAGAATAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAA
GGAGAAAGTCGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACC
GTGAGAATTCAAGTTCTTGGAAGTCGGGGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGGG
GGATGTTTGCTATGTCTATATAAAAAAGAATGCTTGAATGTAATAAGCTT*GTGTGTTAA
ACACAACTACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATTTTAAAAAAAAATTCACTTGACAAG
GAGTGACTTTGGCTAATGAAAATATTTGTGAAGTC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2ET51TF 515 0 0
GGAGAGACGTCGCCACGAATTTCGCTTGATCTCGAAACTTCCCCAATCTTCCGTCGTCTG
CATCAGC*****TGAGTGAGAGAGAATGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGAT
CTCATACGTTGCGAACGAGCTCATTGTTAATGGTTTGTCTAACAGCCATGTTTTCCAGAG
ATTTGCTGTGAGGACTTCAAAAAGAATAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAA
GGAGAAAGTCGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACC
GTGAGAATTCAAGTTCTTGGAAGTCGGGGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGGG
GGATGTTTGCTATGTCTATATAAAAAAGAATGCTTGAATGTAATAAGCTT*GTGTGTTAA
ACACAACTACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATTTTAAAAAAAAATTCACTTGACAAG
GAGTGACTTTGGCTAATGAAAATATTTGTGAAGTC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2CW72TF 522 0 0
GGAGAGACGTCGCCACGAATTTCGCTTGATCTCGAAACTTCCCCAATCTTCCATCGTCTG
CATCAGG*****AAAGTGAGAGAGAATGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGAT
CTCATACGTTGCGAACGAGCTCATTGTTAATGGTTTGTCTAACAGCCATGCGTTCCAGAG
ATTCGCTGTGAGGACTTCAAAAAGAATAGGGAACATCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAA
GGAGAAAGTCGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACC
GTGAGAATTCAAGTTCTTGGAAGTCGGGGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGGG
GGATGTTTGCTATGTCTATATAAAAAAGAATGCTTGAATGTAATAAGCTTTGTGTGTTAA
ACACAACCACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATTT*AAAAAAAAATTCACTTGACAAG
GAGTGACTTTGGCTAATGAAAATATTTGTGAAGTC
TTTGCTT

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2DM57TF 515 0 0
GGAGAGACGTCGCCACGAATTTCGCTTGATCTCGAAACTTCCCCAATCTTCCGTCGTCTG
CATCAGGTGAGGAAAGGGAGAGATAATGGCGGGAGGAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGAT
CTCATACGTTGCGAACGAGCTCATTGTTAATGGTTTGCCTAACAGCCATGCGTTCCAGAG
ATTCGCTGTGAGGACTTCAAAAAGAATAGAGAACATCTCTAAAATGGCTGCGGAGAGCAA
GGAGAAAGTCGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCAAGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACC
GTGAGAATTCAAGTGCTTGGAAGTCGTGGATTACATGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGGG
GGATGTTTGCTATGTCTATATAAAAAAGAATGCTTGAATGTAATAAGCTT*GTGTGTTAA
ACACAACCACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATTT*AAAAAAAAATTCACTTGACAAG
GAGTGACTTTGGCTAATGAAAATATTTGTGAAGTC

QA 1 515 1 515
DS 



AS 2 7

CO CL842Contig1 960 2 2 U
GGGAAAGGTCAGACACGATATAATCTCTCTGGATTTTTTTATATTTTTTTCAGTTTCGAT
TCTGTGAAAAGTATCAATTTTCAGTGCGTTATCTCTATGTTTGTCGTTATCACTATGTTT
CTGTGATTCTTCTGTTCCATTCAATTCAAACCCTGAAGCCAAAACCAACATCCGTTCAAC
GTGTCCTGTGCGGTAATCGGTTGAGCTTGGTTTAATCTTTACCTGGAACATCGTTTGTTT
TTGACTTATCACCCTTCACAAGGTTCCTGTTGTTGTATTGGACTGTGTGGAGAACCAAAG
ATGTCTGCGGAGGAGAAGAAGAACCTTATAGAAATCTTGGAGGAATGTCACAAAGTCGAT
ATACTCAAGTACATTAACTATGTCAGTGCCCCTCAAGCCGGTGCTATAGCCACATTCTCA
GGCACTACAAGAGACATGTTCCAAGGCAAAGCAGTCTTGGAGTTAAGGTATGAAGCATAT
GTGCCAATGGCCACACGATGCCTCAGCTCCATCTGTACAGCCGCTAGATCAAACTGGGAC
ATCCACAAGATTGCTGTTGCTCACCGTCTAGGACCAGTTCCCGTCGGAGAAACCAGCGTG
TTCATCGCTGTCTCATCTGTTCACCGTGGGGATGGTTTAGATGCTTGCAAGTTCTTGATC
GACGAGCTCAAGGCAACGGTTCCGATATGGAAGAAGGAGGTGTACACTAATGGAGAGGTT
TGGAAGGAGAATAGTGAGTTTCTAGAGAAAAGAGACGGCTTGGTGAAGAAACCTGTGGTT
GGAGAACATAAAAGAAGTTGCTGTGGAAGTAAAGTTAGAGTACAAGAAGATGAAGAGCGT
AAAGACATAGCAGGAGATAACAGTTCTTGATTACTTGTAGTAAAGAGCAATGTTTAGTTT
ATCTCTCTCAATAAGCAAAATGTCTTAAAACACATTGTTGAATCTAAAGACTTTAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER24TF U 1
AF RR2ER24JQ C 307
BS 1 656 RR2ER24TF
BS 657 960 RR2ER24JQ

RD RR2ER24TF 656 0 0
GGGAAAGGTCAGACACGATATAATCTCTCTGGATTTTTTTATATTTTTTTCAGTTTCGAT
TCTGTGAAAAGTATCAATTTTCAGTGCGTTATCTCTATGTTTGTCGTTATCACTATGTTT
CTGTGATTCTTCTGTTCCATTCAATTCAAACCCTGAAGCCAAAACCAACATCCGTTCAAC
GTGTCCTGTGCGGTAATCGGTTGAGCTTGGTTTAATCTTTACCTGGAACATCGTTTGTTT
TTGACTTATCACCCTTCACAAGGTTCCTGTTGTTGTATTGGACTGTGTGGAGAACCAAAG
ATGTCTGCGGAGGAGAAGAAGAACCTTATAGAAATCTTGGAGGAATGTCACAAAGTCGAT
ATACTCAAGTACATTAACTATGTCAGTGCCCCTCAAGCCGGTGCTATAGCCACATTCTCA
GGCACTACAAGAGACATGTTCCAAGGCAAAGCAGTCTTGGAGTTAAGGTATGAAGCATAT
GTGCCAATGGCCACACGATGCCTCAGCTCCATCTGTACAGCCGCTAGATCAAACTGGGAC
ATCCACAAGATTGCTGTTGCTCACCGTCTAGGACCAGTTCCCGTCGGAGAAACCAGCGTG
TTCATCGCTGTCTCATCTGTTCACCGTGGGGATGGTTTAGATGCTTGCAAGTTCTT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2ER24JQ 654 0 0
GCGGAGGAGAAGAAGAACCTTATAGAAATCTTGGAGGAATGTCACAAAGTCGATATACTC
AAGTACATTAACTATGTCAGTGCCCCTCAAGCCGGTGCTATAGCCACATTCTCAGGCACT
ACAAGAGACATGTTCCAAGGCAAAGCAGTCTTGGAGTTAAGGTATGAAGCATATGTGCCA
ATGGCCACACGATGCCTCAGCTCCATCTGTACAGCCGCTAGATCAAACTGGGACATCCAC
AAGATTGCTGTTGCTCACCGTCTAGGACCAGTTCCCGTCGGAGAAACCAGCGTGTTCATC
GCTGTCTCATCTGTTCACCGTGGGGATGGTTTAGATGCTTGCAAGTTCTTGATCGACGAG
CTCAAGGCAACGGTTCCGATATGGAAGAAGGAGGTGTACACTAATGGAGAGGTTTGGAAG
GAGAATAGTGAGTTTCTAGAGAAAAGAGACGGCTTGGTGAAGAAACCTGTGGTTGGAGAA
CATAAAAGAAGTTGCTGTGGAAGTAAAGTTAGAGTACAAGAAGATGAAGAGCGTAAAGAC
ATAGCAGGAGATAACAGTTCTTGATTACTTGTAGTAAAGAGCAATGTTTAGTTTATCTCT
CTCAATAAGCAAAATGTCTTAAAACACATTGTTGAATCTAAAGACTTTAAATCC

QA 1 654 1 654
DS 



CO CL842Contig2 1731 5 18 U
GGATAGCGAGCTTCTTCTCTCTGGGTTTAGGGTTCCCGGTAGTGTTGCAACGACGTTGAG
CGCTTTGTACCTTTATCGCCCTCATCTGACTTAGAGATGGAGATCATGCCAAGAGAGAAT
GATAACGCTTTGTCAGCTCCTACCCCCATGGAGTTGTCGACAACTTTCCCAGGACCTGGT
CCCTACGGAAAGCAGCGGACATCGAGCTTGGAAGCACCTATCATGCTGCTAACTGGACAT
CCCAGTGCTGTCTACACCATGAAGTTCAACCCATCGGGAACTCTGATTGCATCTGGGTCA
CATGACAGAGAGATCTTTCTCTGGAGGGTTCACGGGGACTGCAAAAACTTCATGGTTCTG
AAAGGTCACAAGAACGCTATCCTCGATCTTCACTGGACCAGCGACGGCTCCATGATTGTA
TCAGCAAGTCCGGATAAAACTGTGAGGGCTTGGGATGTTGACACTGGGAAACAAGTCAAG
AAGATGGCTGAGCATTCCTCCTTTGTGAATTCCTGCTGTTCCACGCGTAGAGGACCTCCG
CTTATCGTCAGTGGATCTGATGATGGAACCGCCAAGCTTTGGGACATGCGTCAGAGAGGA
GCCATTCAGACGTTTCCAGATAAATACCAGATCACGGCGGTGAGCTTCTCTGATGCAGGT
GATAAGATTTTCACTGGCGGTGTGGACAACGATGTTAAAGTCTGGGACTTGCGAAAAGGT
GAAGCCACCATGACGCTGGAGGGACATCAGGATACGATCACGGGAATGAGCTTAAGTCCA
GACGGTTCCTACCTTCTCACCAATGGAATGGACAACAAGCTCTGCGTGTGGGACATGCGT
CCTTACGCTCCACAGAACCGGTGTGTGAAGATCTTTGAAGGGCATCAACACAACTTTGAG
AAGAACCTGCTCAAGTGTTCGTGGTCACCCGATGGTACCAAAGTCACTGCTGGTAGCGCA
GACCGTATGGTTCATATTTGGGACACAACAACTCGGCGCATTCTCTACAAGCTCCCAGGC
CATAAAGGCTCTGTCAATGAGTGTGTGTTCCACCCCACTGAGCCTATCATTGGTTCTTGC
AGCAGCGATAAAGATATCTACCTGGGAGAGATCTGAAAGTTTTAAAGCTGTGTGACACAA
TTTGCAAACTAAATTTGAATTTAAAGTCTTTAGATTCAACAATGTGTTTTAAGACATTTT
GCTTATTGAGAGAGAGATAAACTAAACATTGCTCTTTGCTACAAGTAATCAAGAATAACT
GTTATCTCCTGCTATGTCTTTACGCTCTTCATCTTCTTGTACTCTAACTTTACTTCCACA
GCAACTTCTTTTATGTTCTCCAACCACAGGTTTCTTCACCAAACTGTCTCTTTTCTCTGC
AAGCTCCATCCTCTTCTCCAGAAACTCACTATTCTCCTTCCAAACCTCTCCATTGGTGTA
CACCTCCTTCTTCCATATCGGAACCGTTGCCTTGAGCTCGTCGATCAAGAACTTGCAAGC
ATCCAAACCATCCCCACGGTGAACAGATGAAACAGCGATGAAAACGCTGGTTTCTCCAAC
GGGAACTGGTCCTAAACGGTGAGCAACAGCAATCTTGTGGATGTCCCAGTTTGATCTAGC
GGCTGTACAGATGGAGCTGAAGCATCGTGTGGCCATTGGCACATATGCTTCATACCTTAA
CTCCAAGACTGCTTTGCCTTGGAACATGTCTCTTGTAGTGCCTGAGAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO58TF U 1
AF RR2F691TF U 39
AF RR2F488JQ C 517
AF RR2F691JQ C 640
AF RR2DL46JQ U 1157
BS 1 188 RR2FO58TF
BS 189 189 RR2F691TF
BS 190 212 RR2FO58TF
BS 213 213 RR2F691TF
BS 214 278 RR2FO58TF
BS 279 279 RR2F691TF
BS 280 359 RR2FO58TF
BS 360 360 RR2F691TF
BS 361 429 RR2FO58TF
BS 430 658 RR2F691TF
BS 659 659 RR2F488JQ
BS 660 714 RR2F691TF
BS 715 929 RR2F488JQ
BS 930 930 RR2F691JQ
BS 931 1136 RR2F488JQ
BS 1137 1137 RR2F691JQ
BS 1138 1158 RR2F488JQ
BS 1159 1731 RR2DL46JQ

RD RR2FO58TF 429 0 0
GGATAGCGAGCTTCTTCTCTCTGGGTTTAGGGTTCCCGGTAGTGTTGCAACGACGTTGAG
CGCTTTGTACCTTTATCGCCCTCATCTGACTTAGAGATGGAGATCATGCCAAGAGAGAAT
GATAACGCTTTGTCAGCTCCTACCCCCATGGAGTTGTCGACAACTTTCCCAGGACCTGGT
CCCTACGGGAAGCAGCGGACATCGAGCTTGGATGCACCTATCATGCTGCTAACTGGACAT
CCCAGTGCTGTCTACACCATGAAGTTCAACCCATCGGGGACTCTGATTGCATCTGGGTCA
CATGACAGAGAGATCTTTCTCTGGAGGGTTCACGGGGACTGCAAAAACTTCATGGTTCTT
AAAGGTCACAAGAACGCTATCCTCGATCTTCACTGGACCAGCGACGGCTCCATGATTGTA
TCAGCAAGT

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR2F691TF 676 0 0
GG
AGTGTTGCAACGACGTTGAGCGCTTTGTACCTTTATCGCCCTCATCTGACTTAGAGATGG
AGATCATGCCAAGAGAGAATGATAACGCTTTGTCAGCTCCTACCCCCATGGAGTTGTCGA
CAACTTTCCCAGGACCTGGTCCCTACGGAAAGCAGCGGACATCGAGCTTGGAAGCACCTA
TCATGCTGCTAACTGGACATCCCAGTGCTGTCTACACCATGAAGTTCAACCCATCGGGAA
CTCTGATTGCATCTGGGTCACATGACAGAGAGATCTTTCTCTGGAGGGTTCACGGGGACT
GCAAAAACTTCATGGTTCTGAAAGGTCACAAGAACGCTATCCTCGATCTTCACTGGACCA
GCGACGGCTCCATGATTGTATCAGCAAGTCCGGATAAAACTGTGAGGGCTTGGGATGTTG
ACACTGGGAAACAAGTCAAGAAGATGGCTGAGCATTCCTCCTTTGTGAATTCCTGCTGTT
CCACGCGTAGAGGACCTCCGCTTATCGTCAGTGGATCTGATGATGGAACCGCCAAGCTTT
GGGACATGCGTCAGAGAGGAGCCATTCAGACGTTTCCAGATAAATACCAGATCACGGCGG
TGAGCTTCTCTGATGCAG*TGATAAGATTTTCACTGGCGGTGTGGACAACGATGTTAAAG
TCTGGGACTTGCGA

QA 3 676 3 676
DS 

RD RR2F488JQ 752 0 0
TGTTCCACGCGTAGAGGAC*TCCGCTTATCGTCAGTGGATCTGATGATGGAACCGCCAAG
CTTTGGGACATGCGTCAGATAGGAGCCATTCAGACGTTTCCAGATAAATACCAGATCACG
GCGGTGAGCTTCTCTGATGCAGGTGATAAGATTTTCACTGGCGGTGTGGACAACGATGTT
AAAGTCTGGGACTTGCGAAAAGGTGAAGCCACCATGACGCTGGAGGGACATCAGGATACG
ATCACGGGAATGAGCTTAAGTCCAGACGGTTCCTACCTTCTCACCAATGGAATGGACAAC
AAGCTCTGCGTGTGGGACATGCGTCCTTACGCTCCACAGAACCGGTGTGTGAAGATCTTT
GAAGGGCATCAACACAACTTTGAGAAGAACCTGCTCAAGTGTTCGTGGTCACCTGATGGT
ACCAAAGTCACTGCTGGTAGCGCAGACCGTATGGTTCATATTTGGGACACAACAACTCGG
CGCATTCTCTACAAGCTCCCAGGCCATAAAGGCTCTGTCAATGAGTGTGTGTTCCACCCC
ACTGAGCCTATCATTGGTTCTTGCAGCAGCGATAAAGATATCTACCTGGGAGAGATCTGA
AAGTTTTAAAGCTGTGTGACTCAATTTGCAAACTAAATTTGAATTTAAAGTCTTTAGATT
CAACAATGTGTTTTAAGACATTTTGCTTATTGAGAGAGAGATAAACTAAACATTGCTCTT
TGCTACAAGTAATCAAGAA
TAACTGTTATCTC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2F691JQ 634 0 0
GTGAGCTTCTCTGATGCAGGTGATAAGATTTTCACTGGCGGTGTGGACAACGATGTTAAA
GTCTGGGACTTGCGAAAAGGTGAAGCCACCATGACGCTGGAGGGACATCAGGATACGGTC
ACGGGAATGAGCTTAAGTCCAGACGGTTCCTACCTTCTCACCAATGGAATGGACAACAAG
CTCTGCGTGTGGGACATGCGTCCTTACGCTCCACAGAACCGGTGTGTGAAGATCTTTGAA
GGGCATCAACACAACTTTGAGAAGAGCCTGCTCAAGTGTTCGTGGTCACCCGATGGTACC
AAAGTCACTGCTGGTAGCGCAGACTGTATGGTTCATATTTGGGACACAACAACTCTGCGC
ATTCTCTACAAGCTCCCAGGCCATAAAGGCTCTGTCAATGAGTGTGTGTTCCACCCCACT
GAGCCTATCATTGGTTCTTGCAGCAGCGATAAAGATATCTACCTGGGAGAGATCTGAAAG
TTTTAAAGCTGTGTGACACAATTTGCAAACTAAATTTGAATTTAAAGTCTTTAGATTCAA
CAATGTGTTTTAAGACATTTTGCTTATTGAGAGAGAGATAAACTAAACATTGCTCTTTGC
TACAAGTAATCAAGAA
TAACTGTTATCTCCTGCG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2DL46JQ 575 0 0
GA
ATTTAAAGTCTTTAGATTCAACAATGTGTTTTAAGACATTTTGCTTATTGAGAGAGAGAT
AAACTAAACATTGCTCTTTGCTACAAGTAATCAAGAATAACTGTTATCTCCTGCTATGTC
TTTACGCTCTTCATCTTCTTGTACTCTAACTTTACTTCCACAGCAACTTCTTTTATGTTC
TCCAACCACAGGTTTCTTCACCAAACTGTCTCTTTTCTCTGCAAGCTCCATCCTCTTCTC
CAGAAACTCACTATTCTCCTTCCAAACCTCTCCATTGGTGTACACCTCCTTCTTCCATAT
CGGAACCGTTGCCTTGAGCTCGTCGATCAAGAACTTGCAAGCATCCAAACCATCCCCACG
GTGAACAGATGAAACAGCGATGAAAACGCTGGTTTCTCCAACGGGAACTGGTCCTAAACG
GTGAGCAACAGCAATCTTGTGGATGTCCCAGTTTGATCTAGCGGCTGTACAGATGGAGCT
GAAGCATCGTGTGGCCATTGGCACATATGCTTCATACCTTAACTCCAAGACTGCTTTGCC
TTGGAACATGTCTCTTGTAGTGCCTGAGAATGT

QA 3 575 3 575
DS 



AS 2 8

CO CL843Contig1 775 2 4 U
TTGATTCCGAGAAATACAGAGAGTTCCTTAAGAGTAAACTCAACTTAGCTTGTGCTGCTG
TCGCCATGAAAAGGGGAGCTTTCGTCAAACCACAAGATACCTCTGGTAGATCTGAGAATG
GTGGAGCTTATACATCCAGTGCTTCAGAACAAAGCTCTCTACCTTCCTCCAAAGCTACAC
CAGTGGTGAGCAGTGCCATAACAAGTGGTTCTGAGCTCTCTGGTGATGAAGAAGAAGCTG
ATGGTGAAACTAATATGAACCCCACCAATGTTAAGCGTGTCAAAAGGATGCTCTCTAACA
GGGAATCAGCTAGACGATCCAGGAGAAGAAAGCAAGCACACCTGAGCGAGCTTGAGACAC
AAGTTTCACAGCTGCGTGTGGAGAATTCAAACCTCACGAAATGTCTCACTGACGTAACTC
AAACATTCAATGACGCAGCTGTAGAGAACAGAGTTCTGAAAGCAAATATTGAGACACTGC
GAGCAAAAGTGAAAATGGCTGAGGAGACAGTGAAGAGACTCACAGGGTTGAACCCAATGT
ACCACACCATGCCTCAGGTTTCAACCGTCTTTAATCCTTCAGAGACGACGTCAGATTCTC
TAGACACAAACGTCCAAGTGACCCCCCCGGAGATCAGCTCAGGCAACAAAAGCAAGGCCT
TGATAGGGTGCAAAATGAACAGAACAGAGTCGATGCGTAGGGTTGCGAGTTTGGAACATC
TGTAGAAACGTATTCGCAGCGTTGGGGATCAGTAAGCTTGTGAATAAAACAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C830TF U 1
AF RR2C830JQ C 172
BS 1 503 RR2C830TF
BS 504 504 RR2C830JQ
BS 505 515 RR2C830TF
BS 516 775 RR2C830JQ

RD RR2C830TF 515 0 0
TTGATTCCGAGAAATACAGAGAGTTCCTTAAGAGTAAACTCAACTTAGCTTGTGCTGCTG
TCGCCATGAAAAGGGGAGCTTTCGTCAAACCACAAGATACCTCTGGTAGATCTGAGAATG
GTGGAGCTTATACATCCAGTGCTTCAGAACAAAGCTCTCTACCTTCCTCCAAAGCTACAC
CAGTGGTGAGCAGTGCCATAACAAGTGGTTCTGAGCTCTCTGGTGATGAAGAAGAAGCTG
ATGGTGAAACTAATATGAACCCCACCAATGTTAAGCGTGTCAAAAGGATGCTCTCTAACA
GGGAATCAGCTAGACGATCCAGGAGAAGAAAGCAAGCACACCTGAGCGAGCTTGAGACAC
AAGTTTCACAGCTGCGTGTGGAGAATTCAAACCTCACGAAATGTCTCACTGACGTAACTC
AAACATTCAATGACGCAGCTGTAGAGAACAGAGTTCTGAAAGCAAATATTGAGACACTGC
GAGCAAAAGTGAAAATGGCTGAG*AGACAGTGAAG

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2C830JQ 604 0 0
AAGCTACACCAGTGGTGAGCAGTGCCATAACAAGTGGTTCTGAGCTCTCTGGTGATGAAG
AAGAAGCTGATGGTGAAACTAATATGAACCCCACCAATGTTAAGCGTGTCAAAAGGATGC
TCTCTAACAGGGAATCAGCTAGACGATCCAGGAGAAGAAAGCAAGCACACCTGAGCGAGC
TTGAGACACAAGTTTCACAGCTGCGTGTGGAGAATTCAAACCTCACGAAATGTCTCACTG
ACGTAACTCAAACATTCAATGACGCAGCTGTAGAGAACAGAGTTCTGAAAGCAAATATTG
AGACACTGCGAGCAAAAGTGAAAATGGCTGAGGAGACAGTGAAGAGACTCACAGGGTTGA
ACCCAATGTACCACACCATGCCTCAGGTTTCAACCGTCTTTAATCCTTCAGAGACGACGT
CAGATTCTCTAGACACAAACGTCCAAGTGACCCCCCCGGAGATCAGCTCAGGCAACAAAA
GCAAGGCCTTGATAGGGTGCAAAATGAACAGAACAGAGTCGATGCGTAGGGTTGCGAGTT
TGGAACATCTGTAGAAACGTATTCGCAGCGTTGGGGATCAGTAAGCTTGTGAATAAAACA
AACT

QA 1 604 1 604
DS 



CO CL843Contig2 1196 6 5 U
GGGAAAAACTTTTGCAGAGAGAAAAAGAAGAACAAAAGTTTGAAACCAAGAAAATGTCTG
GTAACCATCTCTGGTCGGAGCTGGCCGCGAAAGAGAGAAACGGGATGAACCGTAGTGACT
CCGAGTGGGCATTGCAACGCTTCATACAAGAGTCGGAAGCTGGAGAAGCGTATGGCGTTT
CCGTCTCTGGACCTCCTTCTCCTCCTCCGAGTGTTCCTGTTGATTCCGATGAATACAGAG
AGTTTCTTAAGAGTAAACTCAACTTAGCTTGTGCTGCTGTCGCCATGAAAAGGGGAGCTT
TCATCAAACCACAAGATACCTCTGGTAGATCTGAGAATGGTGGAGCTTATACATCCAGTG
CTTCAGAACAAAGCTCTCTACCTTCCTCCAAAGCTACACCAGTGGTGAGCAGTGCCATAA
CAAGTGGTTCTGAGCTCTCTGGTGATGAAGAAGAAGCTGATGGTGAAACTAATATGAACC
CCACCAATGTTAAGCGTGTCAAAAGGACGCTCTCTAACAGGGAATCAGCTAGACGGTCCA
GAAGAAGAAAGCAAGCGCACCTGAGCGAGCTTGAGACACAAGTTTCACAGCTGCGTGTGG
AGAATTCAAACCTCATGAAGGGTCTCACTGACGTAACTCAGACATTCAATGACGCAGCTG
TAGAGAACAGAGTTCTCAAAGCCAATATTGAGACACTGCGAGCAAAAGTGAAAATGGCTG
AGGAGACAGTGAAGAGACTCACAGGCTTGAACCCAATGTTCCACACCATGCCTCAGGTTT
CAACCGTCTCTAATCCTTCAGAGACGACGTCAGATTCTCTAGACACAAGCGTCCAAGTGA
CCACACCGGAGATCAGCTCAGGCAACAAAAGCAAGACCTTGATTGGGTGCAAAATGAACA
GAACAGAGTCTATGCGTAGGGTTGCTAGTTTGGAACATCTGCAGAAACGTATTCGCAGCG
TTGGTGATCAGTAAGCTTGTGAATAAAACAAACTTGTTCTGTAACATTGCCACAAGACGA
CACATAATATGTGTCTGTAAAGATGTCTGTTTATAACCCTTGTGAATTGCTTTGTTATCT
CTACTTCTGTTCTCTTCTGTCTTACTCTCATGTTCAATTTATCTCCAACATAAGCCATAT
CTTGTAAATACGACCAAGTTAACAAAAAAATATGAAACTCATGCTTCATCCATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ65TF U 29
AF RR2EV10TF U 1
AF RR2C365TF U 12
AF RR2C365JQ C 392
AF RR2DZ65JQ C 579
AF RR2EV10JQ C 388
BS 1 477 RR2EV10TF
BS 478 675 RR2C365TF
BS 676 944 RR2EV10JQ
BS 945 945 RR2C365JQ
BS 946 1196 RR2EV10JQ

RD RR2DZ65TF 287 0 0
G
GAACAAAAGTTTGAAACCAAGAAAATGTCTGGTAACCATCTCTGGTCGGAGCTGGCCGCG
AAAGAGAGAAACGGGATGAACCGTAGTTACTCCGAGTGGGCATTGCAACGCTTCATACAA
GAGTCGGAAGCTGGAGAAGCGTATGGCGTTTCCGTCTCTGGACCTCCTTCTCCTCCTCCG
AGTGTTCCTGTTGATTCCGATGAATACAGAGAGTTTCTTAAGAGTAAACTCAACTTAGCT
TGTGCTGCTGTCGCCATGAAAAGGGGAGCTTTCATCAAACCACA
GG

QA 2 285 2 285
DS 

RD RR2EV10TF 477 0 0
GGGAAAAACTTTTGCAGAGAGAAAAAGAAGAACAAAAGTTTGAAACCAAGAAAATGTCTG
GTAACCATCTCTGGTCGGAGCTGGCCGCGAAAGAGAGAAACGGGATGAACCGTAGTGACT
CCGAGTGGGCATTGCAACGCTTCATACAAGAGTCGGAAGCTGGAGAAGCGTATGGCGTTT
CCGTCTCTGGACCTCCTTCTCCTCCTCCGAGTGTTCCTGTTGATTCCGATGAATACAGAG
AGTTTCTTAAGAGTAAACTCAACTTAGCTTGTGCTGCTGTCGCCATGAAAAGGGGAGCTT
TCATCAAACCACAAGATACCTCTGGTAGATCTGAGAATGGTGGAGCTTATACATCCAGTG
CTTCAGAACAAAGCTCTCTACCTTCCTCCAAAGCTACACCAGTGGTGAGCAGTGCCATAA
CAAGTGGTTCTGAGCTCTCTGGTGATGAAGAAGAAGCTGATGGTGAAACTAATATGA

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2C365TF 664 0 0
GG
GCAGAGAGAAGAAGAAGAACAAAAGTTTGAAACCAAGAAAATGTCTGGTAACCATCTCTG
GTCGGAGCTGGCCGCGAAAGAGAGAAACGGGATGAACCGTAGTGACTCCGAGTGGGCATT
GCAACGCTTCATACAAGAGTCGGAAGCTGGAGAAGCGTATGGCGTTTCCGTCTCTGGACC
TCCTTCTCCTCCTCCGAGTGTTCCTGTTGATTCCGATGAATACAGAGAGTTTCTTAAGAG
TAAACTCAACTTAGCTTGTGCTGCTGTCGCCATGAAAAGGGGAGCTTTCATCAAACCACA
AGATACCTCTGGTAGATCTGAGAATGGTGGAGCTTATACATCCAGTGTTTCAGAACAAAG
CTCTCTACCTTCCTCCAAAGCTACACCAGTGGTGAGCAGTGCCATAACAAGTGGTTCTGA
GCTCTCTGGTGATGAAGAAGAAGCTGATGGTGAAACTAATATGAACCCCACCAATGTTAA
GCGTGTCAAAAGGACGCTCTCTAACAGGGAATCAGCTAGACGGTCCAGAAGAAGAAAGCA
AGCGCACCTGAGCGAGCTTGAGACACAAGTTTCACAGCTGCGTGTGGAGAATTCAAACCT
CATGAAGGGTCTCACTGACGTAACTCAGACATTCAATGACGCAGCTGTAGAGAACAGAGT
TC

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR2C365JQ 735 0 0
AGCTACACCAGTGGTGAGCAGTGCCATAACAAGTGGTTCTGAGCTCTCTGGTGATGAAGA
AGAAGCTGATGGTGAAACTAATATGAACCCCACCAATGTTAAGCGTGTCAAAAGGACGCT
CTCTAACAGGGAATCAGCTAGACGGTCCAGAAGAAGAAAGCAAGCGCACCTGAGCGAGCT
TGAGACACAAGTTTCACAGCTGCGTGTGGAGAATTCAAACCTCATGAAGGGTCTCACTGA
CGTAACTCAGACATTCAATGACGCAGCTGTAGAGAACAGAGTTCTCAAAGCCAATATTGA
GACACTGCGAGCAAAAGTGAAAATGGCTGAGGAGACAGTGAAGAGACTCACAGGCTTGAA
CCCAATGTTCCACACCATGCCTCGGGTTTCAACCGTCTCTAATCCTTCAGAGACGACGTC
AGATTCTCTAGACACAAGCGTCCAAGTGACCACACCGGAGATCAGCTCAGGCAACAAAAG
CAAGACCTTGATTGGGTGCAAAATGAACAGAACAGAGTCTATGCGTAGGGTTGCTAGTTT
GGAACATCTGCAGAAACGTATTCGCAGCGTTGGTGATCAGTAAGCTTGTGAATAAAACAA
ACTTGTTCTGTAACATTGCCACAAGACGACACATAATATGTGTCTGTAAAGATGTCTGTT
TATAACCCTTGTGAATTGCTTTGTTATCTCTACTTCTGTTCTCTTCTGTCTTACTCTCAT
GTTCAATTTATCTCC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2DZ65JQ 504 0 0
CAAGTTTCACAGCTGCGTGTGGAGAATTCAAACCTCATGAAGGGTCTCACTGACGTAACT
CAGACATTCAATGACGCAGCTGTAGAGAACAGAGTTCTCAAAGCCAATATTGAGACACTG
CGAGCAAAAGTGAAAATGGCTGAGGAGACAGTGAAGAGACTCACAGGCTTGAACCCAATG
TTCCACACCATGCCTCAGGTTTCAACCGTCTCTAATCCTTCAGAGACGACGTCAGATTCT
CTAGACACAAGCGTCCAAGTGACCACACCGGAGATCAGCTCAGGCAACAAAAGCAAGACC
TTGATTGGGTGCAAAATGAACAGAACAGAGTCTATGCGTAGGGTTGCTAGTTTGGAACAT
CTGCAGAAACGTATTCGCAGCGTTGGTGATCAGTAAGCTTGTGAATAAAACAAACTTGTT
CTGTAACATTGCCACAAGACGACACATAATATGTGTCTGTAAAGATGTCTGTTTATAACC
CTTGTGAATTGCTTTGTTATCTCT

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2EV10JQ 809 0 0
CCAAAGCTACACCAGTGGTGAGCAGTGCCATAACAAGTGGTTCTGAGCTCTCTGGTGATG
AAGAAGAAGCTGATGGTGAAACTAATATGAACCCCACCAATGTTAAGCGTGTCAAAAGGA
TGCTCTCTAACAGGGAATCAGCTAGGCGGTCCAGAAGAAGAAAGCAAGCGCACCTGAGCG
AGCTTGAGACACAAGTTTCACAGCTGCGTGTGGAGAATTCAAACCTCATGAAGGGTCTCA
CTGACGTAACTCAGACATTCAATGACGCAGCTGTAGAGAACAGAGTTCTCAAAGCCAATA
TTGAGACACTGCGAGCAAAAGTGAAAATGGCTGAGGAGACAGTGAAGAGACTCACAGGCT
TGAACCCAATGTTCCACACCATGCCTCAGGTTTCAACCGTCTCTAATCCTTCAGAGACGA
CGTCAGATTCTCTAGACACAAGCGTCCAAGTGACCACACCGGAGATCAGCTCAGGCAACA
AAAGCAAGACCTTGATTGGGTGCAAAATGAACAGAACAGAGTCTATGCGTAGGGTTGCTA
GTTTGGAACATCTGCAGGAACGTATTCGCAGCGTTGGTGATCAGTAAGCTTGTGAATAAA
ACAAACTTGTTCTGTAACATTGCCACAAGACGACACATAATATGTGTCTGTAAAGATGTC
TGTTTATAACCCTTGTGAATTGCTTTGTTATCTCTACTTCTGTTCTCTTCTGTCTTACTC
TCATGTTCAATTTATCTCCAACATAAGCCATATCTTGTAAATACGACCAAGTTAACAAAA
AAATATGAAACTCATGCTTCATCCATATC

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 8

CO CL844Contig1 975 8 6 U
AGGGTTCGAAGAACTCATTCATACAACTGGAATCAAAGTCATATCTCTTTCGGCTCTTAC
AAATAAAAAGTCTACCTCACAAAAGCTGCAGAACTAACACACAAACTAGTTGATACATTG
TGCTAGAGAGCTTCATGGAGTACGCGACCTTAACCCCTCGAAGCAACTTTTTACTGTTCC
AGAAGCATTTGATTGAAATGCCATGTCCCGTGTCCTTTGCCAACTCTTCGTAGTTGGGCT
ACATACTCTGAAATTTTCTTGATTGCTTCCACCTGCTCGGTCAGAAACTCGCTCTCAATA
AAATCTGCCAAGTGGACATCTCCGTTCTTTGAAGCAACACTGTGGAGGTTTAAGAGCTTC
TCATTAACCAGTTTTTCCAGTGACAGAGCCAGCTCCATCCCGTAAAGAGCATCTCCTTTA
TCAACGTGTTCAAACTCCGAGAGAGGCACTACAATGGACTGTAACTTAACCTTCCCACCA
CGTTTGTTCTGATACTCCATCAACTTCTCAGCATGCTCTCTTTCTTCCACACTCGATTCC
TTAAAGAACTTGGCAAGACCTTTAAGCGCGACGTTATCCCTATCGAAGTAAGCATACATG
GCGTGATATACATACGAGAGATTGTACTCCACATTGATCTGCTCGTTAATAGCAGCTTCG
CACTCGTCTGAGTACTTTTGACGAGCGAGCGAGACGTGAGAGCTGGTTGGGACGAGGTCG
AGCTACTTCTTCACCTCCTCGAACGGCTGGAAAACGACGCCGCTTAGCGCGTCGTCGGCG
GTTGAGATTTTAGATGCGCGAACAGAGACTGAGAGCTTTCCCTTCGAGGAGGAATCGATT
GGAGACGAGAGGGAGGATAACAAAGGAGAAACGTCCTTGATTCCGCCGTGGAAACTCACG
AGCGAGAGAGCGGAGGAAGAAGAAGAAGAAACCGTCTTGAGAAGCATTTTGACTGACTGT
TGAGTTGAGAGATCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 20 35 15 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2AN83JQ U 173
AF RR2GG38JQB U 1
AF RR2HA39JQ U 1
AF RR2DG87JQ U 3
AF RR2DG87TF C 197
AF RR2GG38TF C 420
AF RR2HA39TF C 469
AF RR2AN83TF C 836
BS 1 600 RR2GG38JQB
BS 601 614 RR2HA39JQ
BS 615 633 RR2DG87JQ
BS 634 724 RR2DG87TF
BS 725 725 RR2GG38TF
BS 726 975 RR2DG87TF

RD RR2AN83JQ 110 0 0
ACTGTTCCAGAAGCATTTGATTGAAATGCCATGTCCCGTGTCCTTTGCCAACTCTTCGTA
ATTGGGCTACGTACTCTGAAATTTTCTTGATTGCTTCCACCTGCTCGGTC

QA 1 110 1 110
DS 

RD RR2GG38JQB 600 0 0
AGGGTTCGAAGAACTCATTCATACAACTGGAATCAAAGTCATATCTCTTTCGGCTCTTAC
AAATAAAAAGTCTACCTCACAAAAGCTGCAGAACTAACACACAAACTAGTTGATACATTG
TGCTAGAGAGCTTCATGGAGTACGCGACCTTAACCCCTCGAAGCAACTTTTTACTGTTCC
AGAAGCATTTGATTGAAATGCCATGTCCCGTGTCCTTTGCCAACTCTTCGTAGTTGGGCT
ACATACTCTGAAATTTTCTTGATTGCTTCCACCTGCTCGGTCAGAAACTCGCTCTCAATA
AAATCTGCCAAGTGGACATCTCCGTTCTTTGAAGCAACACTGTGGAGGTTTAAGAGCTTC
TCATTAACCAGTTTTTCCAGTGACAGAGCCAGCTCCATCCCGTAAAGAGCATCTCCTTTA
TCAACGTGTTCAAACTCCGAGAGAGGCACTACAATGGACTGTAACTTAACCTTCCCACCA
CGTTTGTTCTGATACTCCATCAACTTCTCAGCATGCTCTCTTTCTTCCACACTCGATTCC
TTAAAGAACTTGGCAAGACCTTTAAGCGCGACGTTATCCCTATCGAAGTAAGCATACATG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2HA39JQ 614 0 0
AG
GGTTCGAAGAACTCATTCATACAACTGGAATCAAAGTCATATCTCTTTCGGCTCTTACAA
ATAAAAAGTCTACCTCACAAAAGCTGCAGAACTAACACACAAACTAGTTGATACATTGTG
CTAGAGAGCTTCATGGAGTACGCGACCTTAACCCCTCGAAGCAACTTTTTACTGTTCCAG
AAGCATTTGATTGAAATGCCATGTCCCGTGTCCTTTGCCAACTCTTCGTAGTTGGGCTAC
ATACTCTGAAATTTTCTTGATTGCTTCCACCTGCTCGGTCAGAAACTCGCTCTCAATAAA
ATCTGCCAAGTGGACATCTCCGTTCTTTGAAGCAACACTGTGGAGGTTTAAGAGCTTCTC
ATTAACCAGTTTTTCCAGTGACAGAGCCAGCTCCATCCCGTAAAGAGCATCTCCTTTATC
AACGTGTTCAAACTCCGAGAGAGGCACTACAATGGACTGTAACTTAACCTTCCCACCACG
TTTGTTCTGATACTCCATCAACTTCTCAGCATGCTCTCTTTCTTCCACACTCGATTCCTT
AAAGAACTTGGCAAGACCTTTAAGCGCGACGTTATCCCTATCGAAGTAAGCATACATGGC
GTGATATACATA

QA 3 614 3 614
DS 

RD RR2DG87JQ 631 0 0
GGTTCGAAGAACTCATTCATACAACTGGAATCAAAGTCATATCTCTTTCGGCTCTTACAA
ATAAAAAGTCTACCTCACAAAAGCTGCAGAACTAACACACAAACTAGTTGATACATTGTG
CTAGAGAGCTTCATGGAGTACGCGACCTTAACCCCTCGAAGCAACTTTTTACTGTTCCAG
AAGCATTTGATTGAAATGCCATGTCCCGTGTCCTTTGCCAACTCTTCGTAGTTGGGCTAC
ATACTCTGAAATTTTCTTGATTGCTTCCACCTGCTCGGTCAGAAACTCGCTCTCAATAAA
ATCTGCCAAGTGGACATCTCCGTTCTTTGAAGCAACACTGTGGAGGTTTAAGAGCTTCTC
ATTAACCAGTTTTTCCAGTGACAGAGCCAGCTCCATCCCGTAAAGAGCATCTCCTTTATC
AACGTGTTCAAACTCCGAGAGAGGCACTACAATGGACTGTAACTTAACCTTCCCACCACG
TTTGTTCTGATACTCCATCAACTTCTCAGCATGCTCTCTTTCTTCCACACTCGATTCCTT
AAAGAACTTGGCAAGACCTTTAAGCGCGACGTTATCCCTATCGAAGTAAGCATACATGGC
GTGATATACATACGAGAGATTGTACTCCACA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2DG87TF 779 0 0
AATGCCATGTCCCGTGTC*TTTGCCAACTCT*CGTAGT*GGGCTACATACTCTGAAATTT
*CTTGATTGCTTCCAC*TGCTCGGTCAGAAACTCGCTCTCAATAAAATCTGCCAAGTGGA
CATCTCCGTTCTTTGAAGCAACACTGTGGAGGTTTAAGAGCTTCTCATTAACCAGTTTTT
CCAGTGACAGAGCCAGCTCCATCCCGTAAAGAGCATCTCCTTTATCAACGTGTTCAAACT
CCGAGAGAGGCACTACAATGGACTGTAACTTAACCTTCCCACCACGTTTGTTCTGATACT
CCATCAACTTCTCAGCATGCTCTCTTTCTTCCACACTCGATTCCTTAAAGAACTTGGCAA
GACCTTTAAGCGCGACGTTATCCCTATCGAAGTAAGCATACATGGCGTGATATACATACG
AGAGATTGTACTCCACATTGATCTGCTCGTTAATAGCAGCTTCGCACTCGTCTGAGTACT
TTTGACGAGCGAGCGAGACGTGAGAGCTGGTTGGGACGAGGTCGAGCTCCTTCTTCACCT
CCTCGAACGGCTGGAAAACGACGCCGCTTAGCGCGTCGTCGGCGGTTGAGATTTTAGATG
CGCGAACAGAGACTGAGAGCTTTCCCTTCGAGGAGGAATCGATTGGAGACGAGAGGGAGG
ATAACAAAGGAGAAACGTCCTTGATTCCGCCGTGGAAACTCACGAGCGAGAGAGCGGAGG
AAGAAGAAGAAGAAACCGTCTTGAGAAGCATTTTGACTGACTGTTGAGTTGAGAGATCC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2GG38TF 556 0 0
ATCAACGTGTTCAAACTCCGAGAGAGGCACTACAATGGACTGTAACTTAACCTTCCCACC
ACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACTTCTCAGCATGCTCTCTTTCTTCCACACTCGATTC
CTTAAAGAACTTGGCAAGACCTTTAAGCGCGACGTTATCCCTATCGAAGTAAGCATACAT
GGCGTGATATACATACGAGAGATTGTACTCCACATTGATCTGCTCGTTAATAGCAGCTTC
GCACTCGTCTGAGTACTTTTGACGAGCGAGCGAGACGTGAGAGCTGGTTGGGACGAGGTC
GAGCTACTTCTTCACCTCCTCGAACGGCTGGAAAACGACGCCGCTTAGCGCGTCGTCGGC
GGTTGAGATTTTAGATGCGCGAACAGAGACTGAGAGCTTTCCCTTCGAGGAGGAATCGAT
TGGAGACGAGAGGGAGGATAACAAAGGAGAAACGTCCTTGATTCCGCCGTGGAAACTCAC
GAGCGAGAGAGCGGAGGAAGAAGAAGAAGAAACCGTCTTGAGAAGCATTTTGACTGACTG
TTGAGTTGAGAGATCC

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2HA39TF 507 0 0
ACCTTCCCACCACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACTTCTCAGCATGCTCTCTTTCTTCC
ACACTCGATTCCTTAAAGAACTTGGCAAGACCTTTAAGCGCGACGTTATCCCTATCGAAG
TAAGCATACATGGCGTGATATACATACGAGAGATTGTACTCCACATTGATCTGCTCGTTA
ATAGCAGCTTCGCACTCGTCTGAGTACTTTTGACGAGCGAGCGAGACGTGAGAGCTGGTT
GGGACGAGGTCGAGCTACTTCTTCACCTCCTCGAACGGCTGGAAAACGACGCCGCTTAGC
GCGTCGTCGGCGGTTGAGATTTTAGATGCGCGAACAGAGACTGAGAGCTTTCCCTTCGAG
GAGGAATCGATTGGAGACGAGAGGGAGGATAACAAAGGAGAAACGTCCTTGATTCCGCCG
TGGAAACTCACGAGCGAGAGAGCGGAGGAAGAAGAAGAAGAAACCGTCTTGAGAAGCATT
TTGACTGACTGTTGAGTTGAGAGATCC

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2AN83TF 140 0 0
CGATTGGAGACGAGAGGGAGGATAACAAAGGAGAAACGTCCTTGATTCCGCCGTGGAAAC
TCACGAGCGAGAGAGCGGAGGAAGAAGAAGAAGAAACCGTCTTGAGAAGCATTTTGACTG
ACTGTTGAGTTGAGAGATCC

QA 1 140 1 140
DS 



AS 1 6

CO CL845Contig1 606 6 9 U
GGGTCACACATTGATTTTCTTTTCACTGCTTATCTCAACTTCTCATCATCATGGGCTTAA
AGGAAGACTTCGAGGAGCACGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACCACGAAACCATCTGACG
CTGACTTGCTCATCCTCTACGGTCTCTTCAAGCAAGCCACCGTCGGGCCAGTGGACACCA
GCCGTCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCAAGTGGGATGCTTGGAAGGCCGTTG
AAGCAAAATCGACGGATGATGCTATGAGTGACTACATCACCAAGGTGAAGCAACTTCTGG
AAGCTGAGGCTTCTGCTGCTTCAACTTGATGAATATAATATGATTCACCAAAAGCTCCAC
TGCAATAATTCCATCTAAGTTTCAATAACTTAGCATAAGACTTTGTTCTTGTTGCTTCTT
GTGTTTCTCTCGTTATGAATCTATTATGTACTTTGTGACCTTCGTCTTGATTTAAAAACA
AAATCCTATGGTTTTTTTTTCTTTTTTGACAAAGATAATTCTATGGTTTCTGAAGATTCC
TGATGCATAATTAAAACCATTATCTATGTGTGATAATATCTTGTTGATTTAAAGATGAAG
CTTCTA


BQ
10 10 10 10 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 0 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS95TF U 2
AF RR2A634JQ C 2
AF RR2A634TF U 2
AF RR2CC39JQ C 1
AF RR2CC39TF U 1
AF RR2B930TF U 1
BS 1 64 RR2B930TF
BS 65 65 RR2CS95TF
BS 66 198 RR2B930TF
BS 199 199 RR2CS95TF
BS 200 252 RR2B930TF
BS 253 253 RR2CS95TF
BS 254 434 RR2B930TF
BS 435 435 RR2CS95TF
BS 436 606 RR2B930TF

RD RR2CS95TF 532 0 0
GGA
CACACATTGATTTTGTTTTCACTGCTTATCTCAACTTCTCATCATCATGGGCTTAAAGGA
AGACTTCGAGGAGCACGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACCACGAAACCATCTGACGCTGA
CTTGCTCATCCTCTACGGTCTCTTCAAGCAAGCCACCGTCGGGCCAGTGGACACCAGCCG
TCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAACGAGCCAAGTGGGATGCTTGGAAGGCCGTTGAAGC
AAAATCGACGGATGATGCTATGAGTGATTACATCACCAAGGTGAAGCAACTTCTGGAAGC
TGAGGCTTCTGCTGCTTCAACTTGATGAATATAATATGATTCACCAAAAGCTCCACTGCA
ATAATTCCATCTAAGTTTCAATAACTTAGCATAAGACTTTGTTCTTTTTGCTTCTTGTGT
TTCTCTCGTTATGAATCTATTATGTACTTTGTGACCTTCGTCTTGATTTTAAAA*AAAAT
CCTATGGTTTTTTTT*CTTTTTTGACAAAGAAAATTCCATGGTTTCTG
G

QA 4 531 4 531
DS 

RD RR2A634JQ 499 0 0
GGA
CACACATTGATTTTGTTTTCACTGCTTATCTCAACTTCTCATCATCATGGGCTTAAAGGA
AGACTTCGAGGAGCACGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACCACGAAACCATCTGACGCTGA
CTTGCTCATCCTCTACGGTCTCTTCAAGCAAGCCACCGTCGGGCCAGTGGACACCAGCCG
TCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAACGAGCCAAGTGGGATGCTTGGAAGGCCGTTGAAGC
AAAATCGACGGATGATGCTATGAGTGACTACATCACCAAGGTGAAGCAACTTCTGGAAGC
TGAGGCTTCTGCTGCTTCAACTTGATGAATATAATATGATTCACCAAAAGCTCCACTGCA
ATAATTCCATCTAAGTTTCAATAACTTAGCATAAGACTTTGTTCTTGTTGCTTCTTGTGT
TTCTCTCGTTATGAATCTATTATGTACTTTGTGACCTTCGTCTTGATTTTAAAA*AAAAT
CCTATGGTTTTTTTT
C

QA 4 498 4 498
DS 

RD RR2A634TF 499 0 0
GGA
CACACATTGATTTTGTTTTCACTGCTTATCTCAACTTCTCATCATCATGGGCTTAAAGGA
AGACTTCGAGGAGCACGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACCACGAAACCATCTGACGCTGA
CTTGCTCATCCTCTACGGTCTCTTCAAGCAAGCCACCGTCGGGCCAGTGGACACCAGCCG
TCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAACGAGCCAAGTGGGATGCTTGGAAGGCCGTTGAAGC
AAAATCGACGGATGATGCTATGAGTGACTACATCACCAAGGTGAAGCAACTTCTGGAAGC
TGAGGCTTCTGCTGCTTCAACTTGATGAATATAATATGATTCACCAAAAGCTCCACTGCA
ATAATTCCATCTAAGTTTCAATAACTTAGCATAAGACTTTGTTCTTGTTGCTTCTTGTGT
TTCTCTCGTTATGAATCTATTATGTACTTTGTGACCTTCGTCTTGATTTTAAAA*AAAAT
CCTATGGTTTTTTTT
C

QA 4 498 4 498
DS 

RD RR2CC39JQ 565 0 0
AGGGG
ACACATTGATTTTCTTTTCACTGCTTATCTCAACTTCTCATCATCATGGGCTTAAAGGAG
GACTTCGAGGAGCACGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACCACGAAACCATCTGACGCTGAC
TTGCCCATCCTTTACGGTCTCTTCAAGCAAGCCACCGTCGGGCCAGTGGACACCAGCCGT
CCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCAAGTGGGATGCTTGGAAGGCCGTTGAAGCA
AAATCGACGGATGATGCCATGAGTGACTACATCACCAAGGTGAAGCAACTTCTGGAAGCT
GAGGCTTCTGCTGCTTCAACTTGATGAATATAATATGATTCACCAAAAGCTCCACTGCAA
TAATTCCATCTAAGTTTCAATAACTTAGCATAAGACTTTGTTCTTGTTGCTTCTTGTGTT
TCTCTCGTTATGAATCTATTATGTACTTTGTGACCTTCGTCTTGATTTAAAAACAAAATC
CTATGGTTTTTTTTTCTTTTTTGACAAAGATAATTCTATGGTTTCTGAAGATTCCTGATG
CATAATTAAAACCATTATC
G

QA 6 564 6 564
DS 

RD RR2CC39TF 565 0 0
AGGGG
ACACATTGATTTTCTTTTCACTGCTTATCTCAACTTCTCATCATCATGGGCTTAAAGGAG
GACTTCGAGGAGCACGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACCACGAAACCATCTGACGCTGAC
TTGCCCATCCTCTACGGTCTCTTCAAGCAAGCCACCGTCGGGCCAGTGGACACCAGCCGT
CCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGCCAAGTGGGATGCTTGGAAGGCCGTTGAAGCA
AAATCGACGGATGATGCCATGAGTGACTACATCACCAAGGTGAAGCAACTTCTGGAAGCT
GAGGCTTCTGCTGCTTCAACTTGATGAATATAATATGATTCACCAAAAGCTCCACTGCAA
TAATTCCATCTAAGTTTCAATAACTTAGCATAAGACTTTGTTCTTGTTGCTTCTTGTGTT
TCTCTCGTTATGAATCTATTATGTACTTTGTGACCTTCGTCTTGATTTAAAAACAAAATC
CTATGGTTTTTTTTTCTTTTTTGACAAAGATAATTCTATGGTTTCTGAAGATTCCTGATG
CATAATTAAAACCATTATC
G

QA 6 564 6 564
DS 

RD RR2B930TF 606 0 0
GGGTCACACATTGATTTTCTTTTCACTGCTTATCTCAACTTCTCATCATCATGGGCTTAA
AGGAGGACTTCGAGGAGCACGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACCACGAAACCATCTGACG
CTGACTTGCTCATCCTCTACGGTCTCTTCAAGCAAGCCACCGTCGGGCCAGTGGACACCA
GCCGTCCTGGAATGTTCAACATGAAGGAAAGAGCCAAGTGGGATGCTTGGAAGGCCGTTG
AAGCAAAATCGATGGATGATGCTATGAGTGACTACATCACCAAGGTGAAGCAACTTCTGG
AAGCTGAGGCTTCTGCTGCTTCAACTTGATGAATATAATATGATTCACCAAAAGCTCCAC
TGCAATAATTCCATCTAAGTTTCAATAACTTAGCATAAGACTTTGTTCTTGTTGCTTCTT
GTGTTTCTCTCGTTTTGAATCTATTATGTACTTTGTGACCTTCGTCTTGATTTAAAAACA
AAATCCTATGGTTTTTTTTTCTTTTTTGACAAAGATAATTCTATGGTTTCTGAAGATTCC
TGATGCATAATTAAAACCATTATCTATGTGTGATAATATCTTGTTGATTTAAAGATGAAG
CTTCTA

QA 1 606 1 606
DS 



AS 2 8

CO CL846Contig1 507 4 1 U
GAGATAAAAGAAGCGTTTCATTAAATTCAAACCGGTAAAACATTCTAAAACGAAACCCTA
AAAGCAGCTTAATAGAAATCAAACAAACACTAAAAGACCAAACGCGATTTACAAACGCCA
ATCTCACCCCCTCATCAACCGCCGAATCCATACAAAGTCCGTCCCTGCCTCTTCAACGCG
TAGACAACATCCATCGCCGTCACCGTCTTCCTACGAGCGTGCTCGGTGTAAGTAACAGCG
TCACGGATCACATTCTCGAGAAAGATCTTGAGAACACCGCGAGTCTCCTCGCAGATCAAG
CCGCTGATACGCTTGACGCCACCTCTTCTAGCTAAACGGCGAATCGCCGGCTTCGTGATC
CCCTGGATGTTGTCGCGGAGAACCTTCCTGTGCCTCTTGGCTCCTCCCTTTCCCAAACCC
TTTCCTCCCTTTCCTCGCCCAGACATTTTTTTCTCGGAAAGTTTTTTAAAATTGAGATTC
GCTTTGTGTGTGTTTTAGATGTGTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK02JQ U 298
AF RR2AK09JQ U 1
AF RR2FE51JQ U 21
AF RR2AK09TF C 1
BS 1 507 RR2AK09JQ

RD RR2BK02JQ 142 0 0
AAGCCGCTGATACGCTTGACGCCACCTCTTCTAGCTAAACGGCGAATCGCCGGCTTCGTG
ATCCCCTGGATGTTGTCGCGGAGAACCTTCCTGTGCCTCTTGGCTCCTCCCTTTCCCAAA
CCCTTTCCTCCCTTTCCTCGCC

QA 1 142 1 142
DS 

RD RR2AK09JQ 507 0 0
GAGATAAAAGAAGCGTTTCATTAAATTCAAACCGGTAAAACATTCTAAAACGAAACCCTA
AAAGCAGCTTAATAGAAATCAAACAAACACTAAAAGACCAAACGCGATTTACAAACGCCA
ATCTCACCCCCTCATCAACCGCCGAATCCATACAAAGTCCGTCCCTGCCTCTTCAACGCG
TAGACAACATCCATCGCCGTCACCGTCTTCCTACGAGCGTGCTCGGTGTAAGTAACAGCG
TCACGGATCACATTCTCGAGAAAGATCTTGAGAACACCGCGAGTCTCCTCGCAGATCAAG
CCGCTGATACGCTTGACGCCACCTCTTCTAGCTAAACGGCGAATCGCCGGCTTCGTGATC
CCCTGGATGTTGTCGCGGAGAACCTTCCTGTGCCTCTTGGCTCCTCCCTTTCCCAAACCC
TTTCCTCCCTTTCCTCGCCCAGACATTTTTTTCTCGGAAAGTTTTTTAAAATTGAGATTC
GCTTTGTGTGTGTTTTAGATGTGTCCC

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2FE51JQ 486 0 0
TTAAATTCAAACCGGTAAAACATTCTAAAACGAAACCCTAAAAGCAGCTTAATAGAAATC
AAACAAACACTAAAAGACCAAACGCGATTTACAAACGCCAATCTCATCCCCTCATCAACC
GCCGAATCCATACAAAGTCCGTCCCTGCCTCTTCAACGCGTAGACAACATCCATCGCCGT
CACCGTCTTCCTACGAGCGTGCTCGGTGTAAGTAACAGCGTCACGGATCACATTCTCGAG
AAAGATCTTGAGAACACCGCGAGTCTCCTCGTAAATCAAGCCGCTGATACGCTTGACGCC
ACCTCTTCTAGCTAAACGGCGAATCGCCGGCTTCGTGATCCCCTGGATGTTGTCGCGGAA
AACCTTCCTGTGCCTCTTGGCTCCTCCCTTTCCCAAACCCTTTCCTCCCTTTCCTCGCCC
AGACATTTTTTTCTCGGAAAGTTTTTTAAAATTGAGATTCGCTTTGTGTGT
GTTTTAGATGTGTCC

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR2AK09TF 507 0 0
GAGATAAAAGAAGCGTTTCATTAAATTCAAACCGGTAAAACATTCTAAAACGAAACCCTA
AAAGCAGCTTAATAGAAATCAAACAAACACTAAAAGACCAAACGCGATTTACAAACGCCA
ATCTCACCCCCTCATCAACCGCCGAATCCATACAAAGTCCGTCCCTGCCTCTTCAACGCG
TAGACAACATCCATCGCCGTCACCGTCTTCCTACGAGCGTGCTCGGTGTAAGTAACAGCG
TCACGGATCACATTCTCGAGAAAGATCTTGAGAACACCGCGAGTCTCCTCGCAGATCAAG
CCGCTGATACGCTTGACGCCACCTCTTCTAGCTAAACGGCGAATCGCCGGCTTCGTGATC
CCCTGGATGTTGTCGCGGAGAACCTTCCTGTGCCTCTTGGCTCCTCCCTTTCCCAAACCC
TTTCCTCCCTTTCCTCGCCCAGACATTTTTTTCTCGGAAAGTTTTTTAAAATTGAGATTC
GCTTTGTGTGT
GTTTTAGATGTGTCCC

QA 1 491 1 491
DS 



CO CL846Contig2 501 4 26 U
AGAGATAAAAGAAGCGTTTCATTAAATTCAAACCGGTGAAACATTCTAAAACGAAACCCT
AAAGCAGCTTAATAGAAATCAAAACAAACCCTAAAGACCAAACGCGATTTACAAACGCCA
ATCTCATCCCCTCAACCGCCGAATCCATACAAAGTCCGTCCCTGCCTCTTCAACGCGTAG
ACAACATCCATCGCCGTCACCGTCTTCCTACGAGCGTGCTCAGTGTAAGTAACAGCGTCA
CGGATCACATTCTCGAGAAAGACCTTGAGAACACCGCGAGTCTCCTCGTAGATCAAGCCA
CTGATACGCTTGACGCCACCTCTTCTCGCTAAACGGCGAATCGCAGGCTTCGTGATGCCC
TGGATGTTGTCGCGGAGAACCTTCCTGTGCCTCTTGGCTCCTCCCTTTCCCAAACCCTTT
CCTCCCTTTCCTCGCCCAGACATTTTCTTTTCTCCGGAAAGTTTTTTAAATTGAGATTCG
CTTTGTGTGTTTTTGATGTCC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD71JQ U 22
AF RR2CD71TF C 1
AF RR2BI04JQ U 2
AF RR2BI04TF C 2
BS 1 1 RR2CD71TF
BS 2 21 RR2BI04JQ
BS 22 36 RR2CD71JQ
BS 37 37 RR2BI04JQ
BS 38 74 RR2CD71JQ
BS 75 75 RR2BI04JQ
BS 76 87 RR2CD71JQ
BS 88 88 RR2BI04JQ
BS 89 109 RR2CD71JQ
BS 110 110 RR2BI04JQ
BS 111 131 RR2CD71JQ
BS 132 132 RR2BI04JQ
BS 133 179 RR2CD71JQ
BS 180 180 RR2BI04JQ
BS 181 262 RR2CD71JQ
BS 263 263 RR2BI04JQ
BS 264 290 RR2CD71JQ
BS 291 291 RR2BI04JQ
BS 292 317 RR2CD71JQ
BS 318 318 RR2BI04JQ
BS 319 376 RR2CD71JQ
BS 377 377 RR2BI04JQ
BS 378 438 RR2CD71JQ
BS 439 439 RR2BI04JQ
BS 440 479 RR2CD71JQ
BS 480 501 RR2BI04JQ

RD RR2CD71JQ 458 0 0
TTAAATTCAAACCGGGGAAACATTCTAAAACGAAACCCTAAAGCAGCTTAATAAAAATCA
AAACAAGCCCTAAAGACCAAACGCGATT*ACAAACGCCAATCTCATCCCCCCAACCGCCG
AATCCATACAAAGTCCGTCCCTGCCTCTTCAACGCGTAAACAACATCCATCGCCGTCACC
GTCTTCCTACGAGCGTGCTCAGTGTAAGTAACAGCGTCACGGATCACATTCTCGAGAAAG
ATCTTGAGAACACCGCGAGTCTCCTCGTAAATCAAGCCACTGATACGCTTGACGCCCCCT
CTTCTCGCTAAACGGCGAATCGCAGGCTTCGTGATGCCCTGGATGTTGTCGCGGAAAACC
TTCCTGTGCCTCTTGGCTCCTCCCTTTCCCAAACCCTTTCCTCCCTTTCCTCGCCCAAAC
ATTTTCTTTTCTCCGGAAAGTTTTTTAAATTGAGATTC

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2CD71TF 500 0 0
AGAGATAAAAGAAGCGTTTCATTAAATTCAAACCGGTGAAACATTCTAAAACGAAACCCT
AAAGCAGCTTAATAGAAATCAAAACAAGCCCTAAAGACCAAACGCGATT*ACAAACGCCA
ATCTCATCCCCTCAACCGCCGAATCCATACAAAGTCCGTCCCTGCCTCTTCAACGCGTAG
ACAACATCCATCGCCGTCACCGTCTTCCTACGAGCGTGCTCAGTGTAAGTAACAGCGTCA
CGGATCACATTCTCGAGAAAGATCTTGAGAACACCGCGAGTCTCCTCGTAGATCAAGCCA
CTGATACGCTTGACGCCACCTCTTCTCGCTAAACGGCGAATCGCAGGCTTCGTGATGCCC
TGGATGTTGTCGCGGAGAACCTTCCTGTGCCTCTTGGCTCCTCCCTTTCCCAAACCCTTT
CCTCCCTTTCCTCGCCCAGACATTTTCTTTTCTCCGGAAAGTTTTTTAAATTGAGATTCG
CTTTGTGTGT
TTTTGATGTC

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR2BI04JQ 500 0 0
GAGATAAAAGAAGCGTTTCATTAAATTCAAACCGGTGAAACATTCTAAAACGAAACCCTA
AAGCAGCTTAATAGAAATCAAAACAAACCCTAAAGACCAAACGCGATTTACAAACGCCAA
TCTCATCCCCTCAACCGCCGAATCCATACAAAGTCCGTCCCTGCCTCTTCAACGCGTAGA
CAACATCCATCGCCGTCACCGTCTTCCTACGAGCGTGCTCAGTGTAAGTAACAGCGTCAC
GGATCACATTCTCGAGAAAGACCTTGAGAACACCGCGAGTCTCCTCGTAGATCAAGCCAC
TGATACGCTTGACGCCACCTCTTCTCGCTAAACGGCGAATCGCAGGCTTCGTGATGCCCT
GGATGTTGTCGCGGAGAACCTTCCTGTGCCTCTTGGCTCCTCCCTTTCCCAAACCCTTTC
CTCCCTTTCCTCGCCCAGACATTTTCTTTTCTCCGGAAAGTTTTTTAAATTGAGATTCGC
TTTGTGTGTTTTTGATGTCC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2BI04TF 500 0 0
GAGATAAAAGAAGCGTTTCATTAAATTCAAACCGGTGAAACATTCTAAAACGAAACCCTA
AAGCAGCTTAATAGAAATCAAAACAAACCCTAAAGACCAAACGCGATTTACAAACGCCAA
TCTCATCCCCTCAACCGCCGAATCCATACAAAGTCCGTCCCTGCCTCTTCAACGCGTAGA
CAACATCCATCGCCGTCACCGTCTTCCTACGAGCGTGCTCAGTGTAAGTAACAGCGTCAC
GGATCACATTCTCGAGAAAGACCTTGAGAACACCGCGAGTCTCCTCGTAGATCAAGCCAC
TGATACGCTTGACGCCACCTCTTCTCGCTAAACGGCGAATCGCAGGCTTCGTGATGCCCT
GGATGTTGTCGCGGAGAACCTTCCTGTGCCTCTTGGCTCCTCCCTTTCCCAAACCCTTTC
CTCCCTTTCCTCGCCCAGACATTTTCTTTTCTCCGGAAAGTTTTTTAAATTGAGATTCGC
TTTGTGTGT
TTTTGATGTCC

QA 1 489 1 489
DS 



AS 1 8

CO CL847Contig1 926 8 6 U
GTAAATGAAACCCGTTATTCATGTTAACAAAACACGTATTCCAATTCAACAACCAAAGTC
AACACTGATGAAACAAACAAGCTTTGAACAATGTAGAACAAAGTACATACAAGGTAGCTT
GTTACTAGCATGAGCTAACATTCCACATGGAGTCTAATAAGGTTTACACAATCTTTAGTT
ACATATAAATTGATCAAACCGCTTCTATTATTGCCATAACCGTTGATAACTTAATAATAA
TAATACATCAAGTTGGAACTTGACGATATAGGAGTCATGGAGGTGACTTCAGTAAAACAG
GCTTAAAAGGCTATTTCATCTAACTGGCTAGGCTCCACCAGAACGTACAATGGCTTTCCC
TTTAGCTTACAATGGCCCTTGAATTTAGGCAAACCAACAACGCAGGCACATTCCACAACT
TCGGCCCCAGCACGTTCCAAGAGGTTAATGGAAGCCGAGAGTGTTCCACCAGTGGCAACT
AAATCGTCGATGACAAGAGCTCTTTCATGGGATTTAACGGCCTCCATACTCATCTCTAGA
CGATCGTTTCCATACTCTAGCTCGTATTCTTCGCTTATCACTCTCCCGGGTAATTTTCCT
GGTTTACGTAGAGGGATGAATTTAGCACCTATGGCTAATGCAATGGGAGGTCCAAATATG
AATCCTCTCGCCTCTACGCCGGCGACGAGAGAGATGTCCATGTGCTTGTAACGATCTACA
AAGATATCAACGACATGTTTGAAGGCAACTGGATCTAGCAACAGCGTCGTTATGTCTTGA
AACATGATTCCAGTCTTGGGGAAGTGAGGAATGACTCGAATGGCGTCGGAGATGGCCTGT
AGTCTTGGGTCTCCCTGCAACCCATTCTCTACTGCAAACATCTTTCTCTCTCCTTTTCAC
TCGTGCGTGTAGGTGTAGTATAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2GN12JQ U 20
AF RR2D808JQ U 26
AF RR2FC88JQ U 1
AF RR2AI62JQ U 70
AF RR2D808TF C 70
AF RR2GN12TF C 193
AF RR2AI62TF C 179
AF RR2FC88TF C 675
BS 1 201 RR2FC88JQ
BS 202 202 RR2GN12JQ
BS 203 722 RR2FC88JQ
BS 723 799 RR2AI62JQ
BS 800 888 RR2D808TF
BS 889 926 RR2AI62TF

RD RR2GN12JQ 583 0 0
CATGTTA
ACAAAACACGTATTCCAATTCAACAACCAAAGTCAACACTGATGAAACAAACAAGCTTTG
AACAATGTAAAACAAAGTACATACAAGGTAGCTTGTTACTAGCATGAGCTAACATTCCAC
ATGGAGTCTAATAAGGTTTACACAATCTTTAGTTACATATAAATTGATCAAACCGCTTCT
ATTATTGCCATAACCGTTGATAACTTAATAATAATAATACATCAAGTTGGAACTTGACGA
TATAGGAGTCATGGAGGTGACTTCAGTAAAACAGGCTTAAAAGGCTATTTCATCTAACTG
GCTAGGCTCCACCAAAACGTACAATGGCTTTCCCTTTAGCTTACAATGGCCCTTGAATTT
AGGCAAACCAACAACGCAGGCACATTCCACAACTTCGGCCCCAGCACGTTCCAAGAGGTT
AATGGAAGCCGAAAGTGTTCCACCAGTGGCAACTAAATCGTCGATGACAAGAGCTCTTTC
ATGGGGTTTAACGGCCTCCATACTCATCTCTAGACGATCGTTTCCATACTCTAGCTCGTA
TTCTTCGCTTATCACTCTCCCGGGTAATTTTCCTGG

QA 8 583 8 583
DS 

RD RR2D808JQ 693 0 0
C
ACAAAACACGTATTCCAATTCAACAACCAAAGTCAACACTGATGAAACAAACAAGCTTTG
AACAATGTAGAACAAAGTACATACAAGGTAGCTTGTTACTAGCATGAGCTAACATTCCAC
ATGGAGTCTAATAAGGTTTACACAATCTTTAGTTACATATAAATTGATCAAACCGCTTCT
ATTATTGCCATAACCGTTGATAACTTAATAATAATAATACATCAAGTTGGAACTTGACGA
TATAGGAGTCATGGAGGTGACTTCAGTAAAACAGGCTTAAAAGGCTATTTCATCTAACTG
GCTAGGCTCCACCAGAACGTACAATGGCTTTCCCTTTAGCTTACAATGGCCCTTGAATTT
AGGCAAACCAACAACGCAGGCACATTCCACAACTTCGGCCCCAGCACGTTCCAAGAGGTT
AATGGAAGCCGAGAGTGTTCCACCAGTGGCAACTAAATCGTCGATGACAAGAGCTCTTTC
ATGGGATTTAACGGCCTCCATACTCATCTCTAGACGATCGTTTCCATACTCTAGCTCGTA
TTCTTCGCTTATCACTCTCCCGGGTAATTTTCCTGGTTTACGTAGAGGGATGAATTTAGC
ACCTATGGCTAATGCAATGGGAGGTCCAAATATGAATCCTCTCGCCTCTACGCCGGCGAC
GAGAGAGATGTCCATGTGCTTGTAACGATCTA

QA 2 693 2 693
DS 

RD RR2FC88JQ 722 0 0
GTAAATGAAACCCGTTATTCATGTTAACAAAACACGTATTCCAATTCAACAACCAAAGTC
AACACTGATGAAACAAACAAGCTTTGAACAATGTAGAACAAAGTACATACAAGGTAGCTT
GTTACTAGCATGAGCTAACATTCCACATGGAGTCTAATAAGGTTTACACAATCTTTAGTT
ACATATAAATTGATCAAACCGATTCTATTATTGCCATAACCGTTGATAACTTAATAATAA
TAATACATCAAGTTGGAACTTGACGATATAGGAGTCATGGAGGTGACTTCAGTAAAACAG
GCTTAAAAGGCTATTTCATCTAACTGGCTAGGCTCCACCAGAACGTACAATGGCTTTCCC
TTTAGCTTACAATGGCCCTTGAATTTAGGCAAACCAACAACGCAGGCACATTCCACAACT
TCGGCCCCAGCACGTTCCAAGAGGTTAATGGAAGCCGAGAGTGTTCCACCAGTGGCAACT
AAATCGTCGATGACAAGAGCTCTTTCATGGGATTTAACGGCCTCCATACTCATCTCTAGA
CGATCGTTTCCATACTCTAGCTCGTATTCTTCGCTTATCACTCTCCCGGGTAATTTTCCT
GGTTTACGTAGAGGGATGAATTTAGCACCTATGGCTAATGCAATGGGAGGTCCAAATATG
AATCCTCTCGCCTCTACGCCGGCGACGAGAGAGATGTCCATGTGCTTGTAACGATCTACA
AA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2AI62JQ 730 0 0
GAAACAAACAAGCTTTGAACAATGTAGAACAAAGTACATACAAGGTAGCTTGTTACTAGC
ATGAGCTAACATTCCACATGGAGTCTAATAAGGTTTACACAATCTTTAGTTACATATAAA
TTGATCAAACCGATTCTATTATTGCCATAACCGTTGATAACTTAATAATAATAATACATC
AAGTTGGAACTTGACGATATAGGAGTCATGGAGGTGACTTCAGTAAAACAGGCTTAAAAG
GCTATTTCATCTAACTGGCTAGGCTCCACCAGAACGTACAATGGCTTTCCCTCTAGCTTA
CAATGGCCCTTGAATTTAGGCAAACCAACAACGCAGGCACATTCCACAACTTCGGCCCCA
GCACGTTCCAAGAGGTTAATGGAAGCCGAGAGTGTTCCACCAGTGGCAACTAAATCGTCG
ATGACAAGAGCTCTTTCATGGGATTTAACGGCCTCCATACTCATCTCTAGACGATCGTTT
CCATACTCTAGCTCGTATTCTTCGCTTATCACTCTCCCGGGTAATTTTCCTGGTTTACGT
AGAGGGATGAATTTAGCACCTATGGCTAATGCAATGGGAGGTCCAAATATGAATCCTCTC
GCCTCTACGCCGGCGACGAGAGAGATGTCCATGTGCTTGTAACGATCTACAAAGATATCA
ACGACATGTTTGAAGGCAACTGGATCTAGCAACAGCGTCGTTATGTCTTGAAACATGATT
CCAGTCTTGG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2D808TF 821 0 0
GAAACAAACAAGCTTTGAACAATGTAGAACAAAGTACATACAAGGTAGCTTGT*ACTAGC
ATGAGCTAACATTCCACATGGAGTCTAATAAGGTTTACACAATCTTTAGTTACATATAAA
TTGATCAAACCGCTTCTATTATTGCCATAACCGTTGATAACTTAATAATAATAATACATC
AAGTTGGAACTTGACGATATAGGAGTCATGGAGGTGACTTCAGTAAAACAGGCTTAAAAG
GCTATTTCATCTAACTGGCTAGGCTCCACCAGAACGTACAATGGCTTTCCCTTTAGCTTA
CAATGGCCCTTGAATTTAGGCAAACCAACAACGCAGGCACATTCCACAACTTCGGCCCCA
GCACGTTCCAAGAGGTTAATGGAAGCCGAGAGTGTTCCACCAGTGGCAACTAAATCGTCG
ATGACAAGAGCTCTTTCATGGGATTTAACGGCCTCCATACTCATCTCTAGACGATCGTTT
CCATACTCTAGCTCGTATTCTTCGCTTATCACTCTCCCGGGTAATTTTCCTGGTTTACGT
AGAGGGATGAATTTAGCACCTATGGCTAATGCAATGGGAGGTCCAAATATGAATCCTCTC
GCCTCTACGCCGGCGACGAGAGAGATGTCCATGTGCTTGTAACGATCTACAAAGATATCA
ACGACATGTTTGAAGGCAACTGGATCTAGCAACAGCGTCGTTATGTCTTGAAACATGATT
CCAGTCTTGGGGAAGTGAGGAATGACTCGAATGGCGTCGGAGATGGCCTGTAGTCTTGGG
TCTCCCTGCAACCCATTCTCTACTGCAAACATCTTTCTC
CC

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2GN12TF 703 0 0
ATCAAACCGCTTCTATTATTGCCATAACCGTTGATAACTTAATAATAATAATACATCAAG
TTGGAACTTGACGATATAGGAGTCATGGAGGTGACTTCAGTAAAACAGGCTTAAAAGGCT
ATTTCATCTAACTGGCTAGGCTCCACCAGAACGTACAATGGCTTTCCCTTTAGCTTACAA
TGGCCCTTGAATTTAGGCAAACCAACAACGCAGGCACATTCCACAACTTCGGCCCCAGCA
CGTTCCAAGAGGTTAATGGAAGCCGAGAGTGTTCCACCAGTGGCAACTAAATCGTCGATG
ACAAGAGCTCTTTCATGGGGTTTAACGGCCTCCATACTCATCTCTAGACGATCGTTTCCA
TACTCTAGCTCGTATTCTTCGCTTATCACTCTCCCGGGTAATTTTCCTGGTTTACGTAGA
GGGATGAATTTAGCACCTATGGCTAATGCAACGGGAGGTCCAAATATGAATCCTCTCGCC
TCTACGCCGGCGACGAGAGAGATGTCCATGTGCTTGTAACGATCTACAAAGATATCAACG
ACATGTTTGAAGGCAACTGGATCTAGCAACAGCGTCGTTATGTCTTGAAACATGATTCCA
GTCTTGGGGAAGTGAGGAATGACTCGAATGGCGTCGGAGATGGCCTGTAGTCTTGGGTCT
CCCTGCAACCCATTCTCTACTGCAAGCATCTTTCTC
TCTCTCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2AI62TF 748 0 0
TTACATATAAATTGATCAAACCGATTCTATTATTGCCATAACCGTTGATAACTTAATAAT
AATAATACATCAAGTTGGAACTTGACGATATAGGAGTCATGGAGGTGACTTCAGTAAAAC
AGGCTTAAAAGGCTATTTCATCTAACTGGCTAGGCTCCACCAGAACGTACAATGGCTTTC
CCTCTAGCTTACAATGGCCCTTGAATTTAGGCAAACCAACAACGCAGGCACATTCCACAA
CTTCGGCCCCAGCACGTTCCAAGAGGTTAATGGAAGCCGAGAGTGTTCCACCAGTGGCAA
CTAAATCGTCGATGACAAGAGCTCTTTCATGGGATTTAACGGCCTCCATACTCATCTCTA
GACGATCGTTTCCATACTCTAGCTCGTATTCTTCGCTTATCACTCTCCCGGGTAATTTTC
CTGGTTTACGTAGAGGGATGAATTTAGCACCTATGGCTAATGCAATGGGAGGTCCAAATA
TGAATCCTCTCGCCTCTACGCCGGCGACGAGAGAGATGTCCATGTGCTTGTAACGATCTA
CAAAGATATCAACGACATGTTTGAAGGCAACTGGATCTAGCAACAGCGTCGTTATGTCTT
GAAACATGATTCCAGTCTTGGGGAAGTGAGGAATGACTCGAATGGCGTCGGAGATGGCCT
GTAGTCTTGGGTCTCCCTGCAACCCATTCTCTACTGCAAACATCTTTCTCTCTCCTTTTC
ACTCGTGCGTGTAGGTGTAGTATAATCC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2FC88TF 249 0 0
CTACGCC
GCGACGAGAGAGATGTCCATGTGCTTGTAACGATCTACAAAGATATCAACGACATGTTTG
AAGGCAACTGGATCTAGCAACAGCGTCGTTATGTCTTGAAACATGATTCCAGTCTTGGGG
AAGTGAGGAATGACTCGAATGGCGTCGGAGATGGCCTGTAGTCTTGGGTCTCCCTGCAAC
CCATTCTCTACTGCAAACATCTTTCTCTCTCCTTTTCACTCGTGCGTGTAGGTGTAGTAT
CC

QA 8 247 8 247
DS 



AS 1 7

CO CL848Contig1 1264 7 18 U
GGTGTTCCATTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCAAGAGACATGGCTTTG
TGCTCGATCTTCTGCCCTCGTATCCCAGTTCGATTCAGACCTAAACCCGTTTCTCCTTTC
TTCTCAAAACCTATGTTTTCCCTCTCTTATAGGGTTTACTCTTCCCTGCAACCTACTCCC
TCTTCCAAAGATGAACTTGGAAGTGTAAGCATTGGGTTTCTGGGTATGGGAATCATGGGT
TCTCCAATGGCACAGAACCTCATCAAAGCTGGGTGTGATGTGACTGTGTGGAACCGAACT
AAGAGCAAATGTGATCCTCTTGTCGGATTAGGAGCAAAATACAAGTCTTCTCCTGAAGAA
GTGACTGCAGCTTGCGATCTCACATTTGCAATGCTAGCTGATCCTGAGAGTGCAATCGAT
GTTGCCTGTGGAAAGAATGGAGCCGTATCTGGAATTAGCTCAGGAAAAGGGTATGTTGAT
GTCTCAACCGTTGATGCTGCTTCATCGATGTTAATCAGCAAGCAAATAAAGGACACCGGA
GCACTGTTCTTGGAGGCACCAGTTTCCGGTTCCAAAAAGCCTGCCGAAGATGGTCAGTTA
ATATTCCTCACTGCAGGTGATAAGCTACTATACGAAAAAGCTGCTCCTTTCTTAGACATC
ATGGGAAAGTCAAGATTCTATTTGGGTGATGTTGGTAATGGAGCAGCAATGAAACTTGTC
GTCAACATGATCATGGGAAGTATGATGGCATCATTCGCCGAGGGAATACTCCTAAGCCAG
AAAGTAGGGCTTGATCCAAATGTACTGGTCGAAGTTGTCTCACAGGGAGCCATCAATGCG
CCAATGTACTCGCTTAAGGGTCCTTCAATGATCAAGTCAGTGTACCCTACTGCTTTCCCA
TTGAAGCACCAGCAGAAGGATATGAGACTAGCACTGGGACTAGCTGAGTCAGTTTTTCAG
TCAACTCCAATTGCGGCTGCAGCAAACGAGCTTTACAAAGTTGCCAAGTCATATGGTTTG
AGCGATGAAGATTTCTTTGCGGTTATTGAAGCACTGAAAGCTGCAAGATCTCAACAAAGC
TAAGCTTTATAAAAAGATTCGTTCTTTCATTCTCATTTCTATGTGGAAGAAAAAAAGAGA
GTTTCTTTGTTGTTGTTGTTGT***ATGTAAAGATGTCAACTTTACTGTTAAAAGCGTCA
AACACAATTCAACCTTTGATCTCCTCTGATGTTTTGACTAATAAAGTGATAAAAGAATTG
TTTG


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2DS24TF U 1
AF RR2F479TF U 2
AF RR2BW01TF U 2
AF RR2FI45TF U 41
AF RR2F479JQ C 362
AF RR2DS24JQ C 655
AF RR2BW01JQ C 523
BS 1 201 RR2DS24TF
BS 202 202 RR2BW01TF
BS 203 247 RR2DS24TF
BS 248 248 RR2BW01TF
BS 249 283 RR2DS24TF
BS 284 284 RR2BW01TF
BS 285 301 RR2DS24TF
BS 302 302 RR2BW01TF
BS 303 593 RR2DS24TF
BS 594 594 RR2BW01TF
BS 595 612 RR2DS24TF
BS 613 765 RR2BW01TF
BS 766 955 RR2F479JQ
BS 956 956 RR2BW01JQ
BS 957 1162 RR2F479JQ
BS 1163 1165 RR2BW01JQ
BS 1166 1228 RR2F479JQ
BS 1229 1264 RR2BW01JQ

RD RR2DS24TF 612 0 0
GGTGTTCCATTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCAAGAGACATGGCTTTG
TGCTCGATCTTCTGCCCTCGTATCCCAGTTCGATTCAGACCTAAACCCGTTTCTCCTTTC
TTCTCAAAACCTATGTTTTCCCTCTCTTATAGGGTTTACTCTTCCCTGCAACCTACTCCC
TCTTCCAAAGATGAACTTGGAGGTGTAAGCATTGGGTTTCTGGGTATGGGAATCATGGGT
TCTCCAACGGCACAGAACCTCATCAAAGCTGGGTGTGATGTGA*TGTGTGGAACCGAACT
AGGAGCAAATGTGATCCTCTTGTCGGATTAGGAGCAAAATACAAGTCTTCTCCTGAAGAA
GTGACTGCAGCTTGCGATCTCACATTTGCAATGCTAGCTGATCCTGAGAGTGCAATCGAT
GTTGCCTGTGGAAAGAATGGAGCCGTATCTGGAATTAGCTCAGGAAAAGGGTATGTTGAT
GTCTCAACCGTTGATGCTGCTTCATCGATGTTAATCAGCAAGCAAATAAAGGACACCGGA
GCACTGTTCTTGGAGGCACCAGTTTCCGGTTCCAAAAAGCCTGCCGAAGATGGCCAGTTA
ATATTCCTCACT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2F479TF 613 0 0
GG
GTTCCATTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCAAGAGACATGGCTTTGTGC
TCGATCTTCTGCCCTCGTATCCCAGTTCGATTCAGACCTAAACCCGTTTCTCCTTTCTTC
TCAAAACCTATGTTTTCCCTCTCTTATAGGGTTTACTCTTCCCTGCAACCTACTCCCTCT
TCCAAAGATGAACTTGGAAGTGTAAGCATTGGGTTTCTGGGTATGGGAATCATGGGTTCT
CCAATGGCACAGAACCTCATCAAAGCTGGGTGTGATGTGACTGTGTGGAACCGAACTAAG
AGCAAATGTGATCCTCTTGTCGGATTAGGAGCAAAATACAAGTCTTCTCCTGAAGAAGTG
ACTGCAGCTTGCGATCTCACATTTGCAATGCTAGCTGATCCTGAGAGTGCAATCGATGTT
GCCTGTGGAAAGAATGGAGCCGTATCTGGAATTAGCTCAGGAAAAGGGTATGTTGATGTC
TCAACCGTTGATGCTGCTTCATCGATGTTAATCAGCAAGCAAATAAAGGACACCGGAGCA
CTGTTCTTGGAGGCACCAGTTTCCGGTTCCAAAAAGCCTGCCGAAGATGGTCAGTTAATA
TTCCTCACTGC

QA 3 613 3 613
DS 

RD RR2BW01TF 771 0 0
GG
GTTCCATTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCAAGAGACATGGCTTTGTGC
TCGATCTTCTGCCCTCGTATCCCAGTTCGATTCAGACCTAAACCCGTTTCTCCTTTCTTC
TCAAAACCTATGTTTTCCCTCTCTTATAGGGTTTACTCTTCCCTGCAACCTACTCCCTCT
TCCAAAGATGAACTTGGAAGTGTAAGCATTGGGTTTCTGGGTATGGGAATCATGGGTTCT
CCAATGGCACAGAACCTCATCAAAGCTGGGTGTGATGTGACTGTGTGGAACCGAACTAAG
AGCAAATGTGATCCTCTTGTCGGATTAGGAGCAAAATACAAGTCTTCTCCTGAAGAAGTG
ACTGCAGCTTGCGATCTCACATTTGCAATGCTAGCTGATCCTGAGAGTGCAATCGATGTT
GCCTGTGGAAAGAATGGAGCCGTATCTGGAATTAGCTCAGGAAAAGGGTATGTTGATGTC
TCAACCGTTGATACTGCTTCATCGATGTTAATCAGCAAGCAAATAAAGGACACCGGAGCA
CTGTTCTTGGAGGCACCAGTTTCCGGTTCCAAAAAGCCTGCCGAAGATGGTCAGTTAATA
TTCCTCACTGCAGGTGATAAGCTACTATACGAAAAAGCTGCTCCTTTCTTAGACATCATG
GGAAAGTCAAGATTCTATTTGGGTGATGTTGGTAATGGAGCAGCAATGAAACTTGTCGTC
AACATGATCATGGGAAGTATGATGGCATCATTCGCCGAGGGA
TACTCCT

QA 3 764 3 764
DS 

RD RR2FI45TF 721 0 0
AGGG
AAGAGACATGGCTTTGTGCTCGATCTTCTGCCCTCGTATCCCAGTTCGATTCAGACCTAA
ACCCGTTTCTCCTTTCTTCTCAAAACCTATGTTTTCCCTCTCTTATAGGGTTTACTCTTC
CCTGCAACCTACTCCCTCTTCCAAAGATGAACTTGGAAGTGTAAGCATTGGGTTTCTGGG
TATGGGAATCATGGGTTCTCCAATGGCACAGAACCTCATCAAAGCTGGGTGTGATGTGAC
TGTGTGGAACCGAACTAAGAGCAAATGTGATCCTCTTGTCGGATTAGGAGCAAAATACAA
GTCTTCTCCTGAAGAAGTGACTGCAGCTTGCGATCTCACATTTGCAATGCTAGCTGATCC
TGAGAGTGCAATCGATGTTGCCTGTGGAAAGAATGGAGCCGTATCTGGAATTAGCTCTGG
AAAAGGGTATGTTGATGTCTCAACCGTTGATGCTGCTTCATCGATGTTAATCAGCAAGCA
AATAAAGGACACCGGAGCACTGTTCTTGGAGGCACCAGTTTCCGGTTCCAAAAAGCCTGC
CGAAGATGGTCAGTTAATATTCCTCACTGCAGGTGATAAGCTACTATACGAAAAAGCTGC
TCCTTTCTTAGACATCATGGGAAAGTCAAGATTCTATTTGGGTGATGTTGGTAATGGAGC
AGCAATGAAACTTGTCGTCA*CATGATCATGGGAAGTATGATGGCATCATTCGCCGA

QA 5 721 5 721
DS 

RD RR2F479JQ 867 0 0
TGACTGCAGCT*GCGATCTCACATTTGCAATGCTAGCTGATC*TGAGAGTGCAATCGATG
TTGC*TGTGGAAAGAATGGAGCCGTATCTGGAATTAGCTCAGGAAAAGGGTATGTTGATG
TCTCAACCGTTGATGCTGCTTCATCGATGTTAATCAGCAAGCAAATAAAGGACACCGGAG
CACTGTTCTTGGAGGCACCAGTTTCCGGTTCCAAAAAGCCTGCCGAAGATGGTCAGTTAA
TATTCCTCACTGCAGGTGGTAAGCTACTATACGAAAAAGCTGCTCCTTTCTTAGACATCA
TGGGAAAGTCAAGATTCTATTTGGGTGATGTTGGTAATGGAGCAGCAATGAAACTTGTCG
TCAACATGATCATGGGAAGTATGATGGCATCATTCGCCGAGGGAATACTCCTAAGCCAGA
AAGTAGGGCTTGATCCAAATGTACTGGTCGAAGTTGTCTCACAGGGAGCCATCAATGCGC
CAATGTACTCGCTTAAGGGTCCTTCAATGATCAAGTCAGTGTACCCTACTGCTTTCCCAT
TGAAGCACCAGCAGAAGGATATGAGACTAGCACTGGGACTAGCTGAGTCAGTTTCTCAGT
CAACTCCAATTGCGGCTGCAGCAAACGAGCTTTACAAAGTTGCCAAGTCATATGGTTTGA
GCGATGAAGATTTCTTTGCGGTTATTGAAGCACTGAAAGCTGCAAGATCTCAACAAAGCT
AAGCTTTATAAAAAGATTCGTTCTTTCATTCTCATTTCTATGTGGAAGAAAAAAAGAGAG
TTTCTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTATGTAAAGATGTCAACTTTACTGTTAAAAGCGTCAA
ACACAATTCAACCTTTGATCTCCTCTG

QA 1 867 1 867
DS 

RD RR2DS24JQ 560 0 0
GACATCATGGGAAAGTCAAGATTCTATTTGGGTGATGTTGGTAATGGAGCAGCAATGAAA
CCTGTCGTCAACATGATCATGGGAAGTATGATGGCATCATTCGCCGAGGGAATACTCCTA
AGCCAGAAAGTAGGGCTTGATCCAAATGTACTGGTCGAAGTTTTCTCACAGGGAGCCATC
AATGCGCCAATGTACTCGCTTAAGGGTCCTTCAATGATCAAGTCAGTGTACCCTACTGCT
TTCCCATTGAAGCACCAGCAGAAGGATATGAGACTAGCACTGGGACTAGCTGAGTCAGTT
TTTCAGTCAACTCCAATTGCGGCTGCAGCAAACGAGCTTTACAAAGTTGCCAAGTCATAT
GGTTTGAGCGATGAAGATTTCTCTGCGGTTATTGAAGCACTGAAAGCTGCAAGATCTCAA
CAAAGCTAAGCTTTATAAAAAGATTCGTTCTTTCATTCTCATTTCTATGTGGAAGAAAAA
AAGAGAGTTTCTTTGTTGTTGTTGTTGT***ATGTAAAGATGTCAACTTTACTGTTAAAA
GCGTCAAACACAATTCAACC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2BW01JQ 742 0 0
CAAATAAAGGACACCGGAGCACTGTTCTTGGAGGCACCAGTTTCCGGTTCCAAAAAGCCT
GCCGAAGATGGTCAGTTAATATTCCTCACTGCAGGTGATAAGCTACTATACGAAAAAGCT
GCTCCTTTCTTAGACATCATGGGAAAGTCAAGATTCTATTTGGGTGATGTTGGTAATGGA
GCAGCAATGAAACTTGTCGTCAACATGATCATGGGAAGTATGATGGCATCATTCGCCGAG
GGAATACTCCTAAGCCAGAAAGTAGGGCTTGATCCAAATGTACTGGTCGAAGTTGTCTCA
CAGGGAGCCATCAATGCGCCAATGTACTCGCTTAAGGGTCCTTCAATGATCAAGTCAGTG
TACCCTACTGCTTTCCCTTTGAAGCACCAGCAGAAGGATATGAGACTAGCACTGGGACTA
GCTGAGTCAGTTTTTCAGTCAACTCCAATTGCGGCTGCAGCAAACGAGCTTTACAAAGTT
GCCAAGTCATATGGTTTGAGCGATGAAGATTTCTTTGCGGTTATTGAAGCACTGAAAGCT
GCAAGATCTCAACA**GCTAAGCTTTATAAAAAGATTCGTTCTTTCATTCTCATTTCTAT
GTGGAAGAAAAAAAGAGAGTTTCTTTGTTGTTGTTGTTGT***ATGTAAAGATGTCAACT
TTACTGTTAAAAGCGTCAAACACAATTCAACCTTTGATCTCCTCTGATGTTTTGACTAAT
AAAGTGATAAAAGAATTGTTTG

QA 1 742 1 742
DS 



AS 2 7

CO CL849Contig1 693 3 6 U
GGGACCCATCAAGTCCCCAATTCCCAACACTGTCACAAAA*GAGAATCTCGAACGATGAA
GCTCAACGTCGTCGTATCACTCCTCCTCCTCCTAGTCTCAACCGCAACATGTTGTCCGCC
TTCAGACCACCGCGCACTCCTAGCTTTCCGAGCAGCACTCCACGAGCCATACCTCGGCAT
TTTCAACTCATGGACTGGCCAAGACTGCTGCCACAACTGGTACGGCGTCAGCTGCGACTC
GCTCACTCACCGAGTCGCCGACATTAACCTCCGCGGCGAGTCAGAAGACCCCATCTTCGA
GCGAGCTCACCGAACCGGCTACATGACGGGACACATCTCTCCGGCAATCTGCGACCTCAC
GCGTCTCTCCGCCATCACAATCGCCGACTGGAAAGGTATCTCCGGCGAGATCCCCACCTG
CATCACGCGCCTCCCTTTCCTCCGCACGCTCGACCTCATCGGAAACCAAATCTCCGGCCC
GATACCAAACGACATCGGTAGATTACACCGGTTAGCTGTTTTAAACGTTGCCGATAACCG
GATTTCCGGTTCAATTCCAAAATCGTTAACCAGCCTCTCTAGCTTAATGCACTTGGACCT
CCGTAACAACTTAATATCCGGTTTACTCCCTTCAGACTTCGGCCGGTTAACGATGCTTAG
CCGCGCGCTACTAAGCGGTAACCGGATAACCGG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX91TF U 2
AF RR2ES50TF U 1
AF RR2DK95TF U 2
BS 1 117 RR2ES50TF
BS 118 118 RR2DX91TF
BS 119 345 RR2ES50TF
BS 346 346 RR2DK95TF
BS 347 649 RR2ES50TF
BS 650 693 RR2DK95TF

RD RR2DX91TF 277 0 0
GGACCCATCAAGTCCCCAATTCCCAACACTGTCACAAAA*GAGAATCTCGAACGATGAAG
CTCAACGTCGTCGTATCACTCCTCCTCCTCCTAGTCTCAACCGCAACATGTTGTCCGCCT
TCAGACCGCCGCGCACTCCTATCTTTCCGAGCAGCACTCCACGAGCCATACCTCGGCATT
TTCAACTCATGGACTGGCCAAGACTGCTGCCACAACTGGTACGGCGTCAGCTGCGACTCC
ATCACTCACCGAGTCGCCGGCATTAACCTCCGCGGCG

QA 1 277 1 277
DS 

RD RR2ES50TF 649 0 0
GGGACCCATCAAGTCCCCAATTCCCAACACTGTCACAAAA*GAGAATCTCGAACGATGAA
GCTCAACGTCGTCGTATCACTCCTCCTCCTCCTAGTCTCAACCGCAACATGTTGTCCCCC
TTCAGACCACCGCGCACTCCTAGCTTTCCGAGCAGCACTCCACGAGCCATACCTCGGCAT
TTTCAACTCATGGACTGGCCAAGACTGCTGCCACAACTGGTACGGCGTCAGCTGCGACTC
GCTCACTCACCGAGTCGCCGACATTAACCTCCGCGGCGAGTCAGAAGACCCCATCTTCGA
GCGAGCTCACCGAACCGGCTACATGACGGGACACATCTCTCCGGCTATCTGCGACCTCAC
GCGTCTCTCCGCCATCACAATCGCCGACTGGAAAGGTATCTCCGGCGAGATCCCCACCTG
CATCACGCGCCTCCCTTTCCTCCGCACGCTCGACCTCATCGGAAACCAAATCTCCGGCCC
GATACCAAACGACATCGGTAGATTACACCGGTTAGCTGTTTTAAACGTTGCCGATAACCG
GATTTCCGGTTCAATTCCAAAATCGTTAACCAGCCTCTCTAGCTTAATGCACTTGGACCT
CCGTAACAACTTAATATCCGGTTTACTCCCTTCAGACTTCGGCCGGTTA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2DK95TF 692 0 0
GGACCCATCAAGTCCCCAATTCCCAACACTGTCACAAAAAGAGAATCTCGAACGATGAAG
CTCAACGTCGTCGTATCACTCCTCCTCCTCCTAGCCTCAACCGCAACATGTTGTCCGCCT
TCAGACCACCACGCACTCCTAGCTTTCCTAGCAGCACTCCACGAGCCATACCTCGGCATT
TTCAAATCATGGACCGGCCAAGACTGCTGCCACAACTGGTACGGCGTCAGCTGCGACTCG
CTCACTCACCGAGTCGCCGACATTAACCTCCGCGGCGAGTCAGAGGACCCCATCTTCGAG
CGAGCTCACCGAACCGGCTACATGACGGGACACATCTCTCCGGCAATCTGCGACCTCACG
CGTCTCTCCGCCATCACAATCGCCGACTGGAAAGGTATCTCCGGCGAGATCCCCACCTGC
ATCACGCGTCTCCCTTTCCTCCGCACGCTCGACCTCATCGGAAACCAAATCTCCGGCCCG
ATACCAAACGACATCGGTAGATTACACCGGTTAGCTGTTTTAAACGTTGCTGATAACCGG
ATTTCCGGTTCAATTCCAAAATCGTTAACCAGCCTCTCTAGCTTAATGCATTTGGACCTC
CGTAACAACTTAATATCCGGTTTACTCCCTTCAGACTTCGGCCGGTTAACGATGCTTAGC
CGCGCGCTACTAAGCGGTAACCGGATAACCGG

QA 1 692 1 692
DS 



CO CL849Contig2 721 4 15 U
AATAATTAATCATAAAGTACCAAACGTAGCACACATTTATGTTTTTCAATACATAACCAT
AAAATATAGTAAGGTCTAATAAAAGAAAATTACATAAAACTCAGTTTTTTAAACAAGCCC
TCAAAGGTTTGCCGCAAAGACAGTCGTTATACATAAACGACGCCGCTTCAAGGTGACTGA
ACGGTGACCCCCCCGGAATCCTACCGCAGAGGTGGTTATGGCTAAGATCCAAATGACCAA
TAAACGACGCACCGGAGATCGATCTCGGTATAGGTCCCTTGAGATTGCTATAAGACAAAT
CAAGCACAGTGAAGTAAGACCTTGGTCCGAACCCTTCCGGTATCTTCCCTTGCAACAAGT
TCCTGCTCAAGTTCAAGTTCATCACCGATGACGTCATCAGAGTTTGAGGAATCTCACCGG
AGAATTTGTTCCCGTCGAGGTTAAGCGTCGCGAGAACCGCCATACGGCCTAGAGACGGTG
GGATCGGGCCGTATAGTTGGTTACCTGAGAGATCCACGTCAGCTAACCGATAAATCTTGG
TTAGTGATTCGGGAATTCGACCGGTTATCCGGTTACCGCTTAGTAACGCCCGGCTAAGCA
TCGTTAACCGGCCGAAGTCTGAAGGGAGTAAACCGGATATTAAGTTGTTACGGAGGTCCA
AGTGCATTAAGCTAGAGAGGCTGGTTAACGATTTTGGAATTGAACCGGAAATCCGGTTAT
C


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2HB80JQ U 1
AF RR2HB80TF C 1
AF RR2DK95JQ U 42
AF RR2ES50JQ U 57
BS 1 334 RR2HB80JQ
BS 335 375 RR2DK95JQ
BS 376 376 RR2ES50JQ
BS 377 406 RR2DK95JQ
BS 407 407 RR2ES50JQ
BS 408 415 RR2DK95JQ
BS 416 416 RR2ES50JQ
BS 417 430 RR2DK95JQ
BS 431 431 RR2ES50JQ
BS 432 585 RR2DK95JQ
BS 586 586 RR2ES50JQ
BS 587 589 RR2DK95JQ
BS 590 590 RR2ES50JQ
BS 591 618 RR2DK95JQ
BS 619 721 RR2ES50JQ

RD RR2HB80JQ 335 0 0
AATAATTAATCATAAAGTACCAAACGTAGCACACATTTATGTTTTTCAATACATAACCAT
AAAATATAGTAAGGTCTAATAAAAGAAAATTACATAAAACTCAGTTTTTTAAACAAGCCC
TCAAAGGTTTGCCGCAAAGACAGTCGTTATACATAAACGACGCCGCTTCAAGGTGACTGA
ACGGTGACCCCCCCGGAATCCTACCGCAGAGGTGGTTATGGCTAAGATCCAAATGACCAA
TAAACGACGCACCGGAGATCGATCTCGGTATAGGTCCCTTGAGATTGCTATAAGACAAAT
CAAGCACAGTGAAGTAAGACCTTGGTCCGAACCC
C

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR2HB80TF 335 0 0
AATAATTAATCATAAAGTACCAAACGTAGCACACATTTATGTTTTTCAATACATAACCAT
AAAATATAGTAAGGTCTAATAAAAGAAAATTACATAAAACTCAGTTTTTTAAACAAGCCC
TCAAAGGTTTGCCGCAAAGACAGTCGTTATACATAAACGACGCCGCTTCAAGGTGACTGA
ACGGTGACCCCCCCGGAATCCTACCGCAGAGGTGGTTATGGCTAAGATCCAAATGACCAA
TAAACGACGCACCGGAGATCGATCTCGGTATAGGTCCCTTGAGATTGCTATAAGACAAAT
CAAGCACAGTGAAGTAAGACCTTGGTCCGAACCC
C

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR2DK95JQ 577 0 0
TTTTTCA
ATACATAATCATAAAATATAGTAAGGTCTAATAAAAGAAAATTACATAAAACTCAGTTTT
TTAAACAAGCCCTCAAAGGTTTGCCGCAAAGACAGTCGTTATACATAAACGACGCCGCTT
CAAGGTGACTGAACGGCGACCCCACCGGAATCCTACCGCAGAGATGGTTATGGCTAAGAT
CCAAATGACCAATAAACGACGCACCGGAGATCGATCTCGGTATTGGTCCCTTGAGATTGT
TATAAGACAAATCAAGCACAGTGAAGTAAGACCTTGGTCCGAACCCTTCCGGTATCTTCC
CTTGCAACAAGTTCCTGCTCAAGTTCAGGTTCATCACCGATGACGTCATCAGAGTTTGTG
GAATCTCCCCGGAGAATTTGTTTCCGTCGAGGTTAAGCGTCGCGAGAACCGCCATACGGC
CTAGAGACGGTGGGATCGGGCCGTATAGTTGGTTACCTGAGAGATCCACGTCAGCTAACC
GATAAATCTTGGTTAGTGATTCGGGAATTCGACCGGTTATCCGGTTACCGCTTAGTAGCG
CGCGGCTAAGCATCGTTAACCGGCCGAAGT

QA 8 577 8 577
DS 

RD RR2ES50JQ 665 0 0
C
CATAAAATATAGAAAGGTCTAATAAAAGAAAATTACATAAAACTCAGTTTTTTAAACAAG
CCCTCAAAGGTTTGCCGCAAAGACAGTCGTTATACATAAACGACGCCGCTTCAAGGTGAC
TGAACGGTGACCCCACCGGAATCCTACCGCAGAGATGGTTATGGCTAAGATCCAAATGAC
CAATAAACGACGCACCGGAGATCGATCTCGGTATTGGTCCCTTGAGATTGTTATAAGACA
AATCAAGCACAGTGAAGTAAGACCTTGGTCCGAACCCTTCCGGTATCTTCCCTTGCAACA
GGTTCCTGCTCAAGTTCAAGTTCATCACCGATGACGTCATCAGAGTTTGAGGTATCTCAC
CGGAGAATTTGTTCCCGTCGAGGTTAAGCGTCGCGAGAACCGCCATACGGCCTAGAGACG
GTGGGATTGGGCCGTATAGTTGGTTACCTGAGAGATCCACGTCAGCTAACCGATAAATCT
TGGTTAGTGATTCGGGAATTCGACCGGTTATCCGGTTACCGCTTAGTAACGCCCGGCTAA
GCATTGTTAACCGGCCGAAGTCTGAAGGGAGTAAACCGGATATTAAGTTGTTACGGAGGT
CCAAGTGCATTAAGCTAGAGAGGCTGGTTAACGATTTTGGAATTGAACCGGAAATCCGGT
TATC

QA 2 665 2 665
DS 



AS 2 8

CO CL850Contig1 703 4 3 U
AGATGCAAAAAGAAAACTTAAGAAAGCATAACATATAAAAATCTTATTAGGTCGACAAAT
GAAATATATAATTACTACAAAAACATCAATAATGCAAAACATAACAGCTATACTCAACAG
TAGCATCGCCGTTCTTGAGATTAATCCACTTTGTCCGAGCCTCAGCGTAGCCTCTAGCAA
ATCGGAAAAGGCCACTTCCTCCGACAATAGGCATTTCTCTGACCTCCGACATCGCGGTGT
TCCGACCAAGAATCGTGATGGTGCTTCCGTTGTACTTCCCTGTCTTAAAAGCAAAGTTCA
TCGCCATTAGAAAACCCAATTCCTTTTGGGCTGCTCCGGCGTAAAAGCCTTGGGCCTGAC
CCAACAGAGTTGAGTTCATCGGAACTTTCGCCGTCAAGGCGTTGTCGATCATGGAGATGG
CTCCGAAGTAGGAATTGTTTGTAACTGGTGGTTGAATCATGATGGAGGTTGGGTTTGGAC
CACTCAAGATGTCGTGCCAATAGACTTTGAAATGGGCTAGCTTCTCTTTCTTGTGGAGAC
CGAGAAGCTTCCGATCTATGGTTCTGGCAAAATTTTCTCCCTCGTCTCCGGTGGAAGAAA
CGATGGCGAGGAGGACGATTTGGACGGCTATGAAGAAAATGAGCTTAGCCATGAGTTTTT
CTTTGGTTTTTGTGGAGTTGGTTTGTTGATATAAGTGGTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2DE51JQ U 1
AF RR2DE51TF C 1
AF RR2CD57JQ U 44
AF RR2CD57TF C 44
BS 1 516 RR2DE51JQ
BS 517 517 RR2CD57JQ
BS 518 703 RR2DE51JQ

RD RR2DE51JQ 703 0 0
AGATGCAAAAAGAAAACTTAAGAAAGCATAACATATAAAAATCTTATTAGGTCGACAAAT
GAAATATATAATTACTACAAAAACATCAATAATGCAAAACATAACAGCTATACTCAACAG
TAGCATCGCCGTTCTTGAGATTAATCCACTTTGTCCGAGCCTCAGCGTAGCCTCTAGCAA
ATCGGAAAAGGCCACTTCCTCCGACAATAGGCATTTCTCTGACCTCCGACATCGCGGTGT
TCCGACCAAGAATCGTGATGGTGCTTCCGTTGTACTTCCCTGTCTTAAAAGCAAAGTTCA
TCGCCATTAGAAAACCCAATTCCTTTTGGGCTGCTCCGGCGTAAAAGCCTTGGGCCTGAC
CCAACAGAGTTGAGTTCATCGGAACTTTCGCCGTCAAGGCGTTGTCGATCATGGAGATGG
CTCCGAAGTAGGAATTGTTTGTAACTGGTGGTTGAATCATGATGGAGGTTGGGTTTGGAC
CACTCAAGATGTCGTGCCAATAGACTTTGAAATGGGTTAGCTTCTCTTTCTTGTGGAGAC
CGAGAAGCTTCCGATCTATGGTTCTGGCAAAATTTTCTCCCTCGTCTCCGGTGGAAGAAA
CGATGGCGAGGAGGACGATTTGGACGGCTATGAAGAAAATGAGCTTAGCCATGAGTTTTT
CTTTGGTTTTTGTGGAGTTGGTTTGTTGATATAAGTGGTGCCC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2DE51TF 703 0 0
AGATG
CAAAAAGAAAACTTAAGAAAGCATAACATATAAAAATCTTATTAGGTCGACAAATGAAAT
ATATAATTACTACAAAAACATCAATAATGCAAAACATAACAGCTATACTCAACAGTAGCA
TCGCCGTTCTTGAGATTAATCCACTTTGTCCGAGCCTCAGCGTAGCCTCTAGCAAATCGG
AAAAGGCCACTTCCTCCGACAATAGGCATTTCTCTGACCTCCGACATCGCGGTGTTCCGA
CCAAGAATCGTGATGGTGCTTCCGTTGTACTTCCCTGTCTTAAAAGCAAAGTTCATCGCC
ATTAGAAAACCCAATTCCTTTTGGGCTGCTCCGGCGTAAAAGCCTTGGGCCTGACCCAAC
AGAGTTGAGTTCATCGGAACTTTCGCCGTCAAGGCGTTGTCGATCATGGAGATGGCTCCG
AAGTAGGAATTGTTTGTAACTGGTGGTTGAATCATGATGGAGGTTGGGTTTGGACCACTC
AAGATGTCGTGCCAATAGACTTTGAAATGGGTTAGCTTCTCTTTCTTGTGGAGACCGAGA
AGCTTCCGATCTATGGTTCTGGCAAAATTTTCTCCCTCGTCTCCGGTGGAAGAAACGATG
GCGAGGAGGACGATTTGGACGGCTATGAAGAAAATGAGCTTAGCCATGAGTTTTTCTTTG
GTTTTTGTGGAGTTGGTTTGTTGATATAAGTGGTGCCC

QA 6 703 6 703
DS 

RD RR2CD57JQ 660 0 0
TTATTAGGTCGCCAAATGAAATATATAATTACTACAAAAACATCAATAATGCAAAACATA
ACAGCTATACTCAACAGTAGCATCGCCGTTCTTGAGATTAATCCACTTTGTCCGAGCCTC
AGCGTAGCCTCTAGCAAATCGGAAAAGGCCACTTCCTCCGACAATAGGCATTTCTCTGAC
CTCCGACATCGCGGTGTTCCGACCAAGAATCGTGATGGTGCTTCCGTTGTACTTCCCTGT
CTTAAAAGCAAAGTTCATCGCCATTAGAAAACCCAATTCCTTTTGGGCTGCTCCGGCGTA
AAAGCCTTGGGCCTGACCCAACAGAGTTGAGTTCATCGGAACTTTCGCCGTCAAGGCGTT
GTCGATCATGGAGATGGCTCCGAAGTAGGAATTGTTTGTAACTGGTGGTTGAATCATGAT
GGAGGTTGGGTTTGGACCACTCAAGATGTCGTGCCAATAGACTTTGAAATGGGCTAGCTT
CTCTTTCTTGTGGAGACCGAGAAGCTTCCGATCTATGGTTCTGGCAAAATTTTCTCCCTC
GTCTCCGGTGGAAGAAACGATGGCGAGGAGGACGATTTGGACGGCTATGAAGAAAATGAG
CTTAGCCATGAGTTTTTCTTTGGTTTTTGTGGAGTTGGTTTGTTGATATAAGTGGTGCCC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2CD57TF 660 0 0
TTATTAGGTCGCCAAATGAAATATATAATTACTACAAAAACATCAATAATGCAAAACATA
ACAGCTATACTCAACAGTAGCATCGCCGTTCTTGAGATTAATCCACTTTGTCCGAGCCTC
AGCGTAGCCTCTAGCAAATCGGAAAAGGCCACTTCCTCCGACAATAGGCATTTCTCTGAC
CTCCGACATCGCGGTGTTCCGACCAAGAATCGTGATGGTGCTTCCGTTGTACTTCCCTGT
CTTAAAAGCAAAGTTCATCGCCATTAGAAAACCCAATTCCTTTTGGGCTGCTCCGGCGTA
AAAGCCTTGGGCCTGACCCAACAGAGTTGAGTTCATCGGAACTTTCGCCGTCAAGGCGTT
GTCGATCATGGAGATGGCTCCGAAGTAGGAATTGTTTGTAACTGGTGGTTGAATCATGAT
GGAGGTTGGGTTTGGACCACTCAAGATGTCGTGCCAATAGACTTTGAAATGGGCTAGCTT
CTCTTTCTTGTGGAGACCGAGAAGCTTCCGATCTATGGTTCTGGCAAAATTTTCTCCCTC
GTCTCCGGTGGAAGAAACGATGGCGAGGAGGACGATTTGGACGGCTATGAAGAAAATGAG
CTTAGCCATGAGTTTTTCTTTGGTTTTTGTGGAGTTGGTTTGTTGATATAAGTGGTGCCC

QA 1 660 1 660
DS 



CO CL850Contig2 767 4 2 U
GGACACCACTTATATCATCAACAAACCAACTCCACAGAAATCAAAGAAAAACTCATGGCT
AAGCTCATTTTCTTCTTAGCCGTCCAATTCGTTCTCCTCGCCATCGTTTCTTCCACCGGA
GACGACGGAGAAAACTTTGCCAGAACCATAGATCGGAAGCTTCTCGGTCTCCACAAGAAA
GAGAAGCTAACCCATTTCAAAGTCTATTGGCACGACATCTTAAGTGGTCCAAACCCAACC
TCCATCATGATTCAACCACCAGTTACAAACAATTCCTACTTCGGAGCCATCTCCATGATC
GACAACGCCTTGACGGCGAAAGTTCCGATGAACTCAACTCTGTTGGGACAGGCTCAAGGC
TTTTACGCCGGAGCAGCCCAAAAGGAATTGGGTTTTCTAATGGCGATGAACTTTGCTTTT
AAGACAGGGAAGTACAACGGAAGCACCATCACGATTCTTGGTCGGAACACCGCGATGTCG
GAGGTCAGAGAAATGCCTATTGTCGGAGGAAGTGGGCTTTTCCGATTTGCTAGAGGCTAC
GCTGAGGCTCGGACAAAGTGGATTAATCTCAAGAACGGCGATGCTACTGTTGAGTATAGC
TGTTATATTTTGCATTATTGATGTTTTTTTGTAGTAATTATATATTTCATCTGGCGACCT
AATAAGTTTTTTATATGTTATGCTTTCTTAAGTTTTCTTTTTGCATTTTGGTTTATGGTG
TGTCTGGTGGAATTGTGGTAGTAGTTTTGTGGGTTAATAATATTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FH25TF U 303
AF RR2GP06TF U 1
AF RR2GP06JQ C 141
AF RR2FH25JQ C 189
BS 1 691 RR2GP06TF
BS 692 767 RR2GP06JQ

RD RR2FH25TF 198 0 0
CAACGCCTTGACGGCGAAAGTTCCGATGAACTCAACTCTGTTGGGACAGGCTCAAGGCTT
TTACGCCGGAGCAGCCCAAAAGGAATTGGGTTTTCTAATGGCGATGAACTTTGCTTTTAA
GACAGGGAAGTACAACGGAAGCACCATCACGATTCTTGGTCGGAACACCGCGATGTCGGA
GGTCAGAGAAATGCCTAT

QA 1 198 1 198
DS 

RD RR2GP06TF 691 0 0
GGACACCACTTATATCATCAACAAACCAACTCCACAGAAATCAAAGAAAAACTCATGGCT
AAGCTCATTTTCTTCTTAGCCGTCCAATTCGTTCTCCTCGCCATCGTTTCTTCCACCGGA
GACGACGGAGAAAACTTTGCCAGAACCATAGATCGGAAGCTTCTCGGTCTCCACAAGAAA
GAGAAGCTAACCCATTTCAAAGTCTATTGGCACGACATCTTAAGTGGTCCAAACCCAACC
TCCATCATGATTCAACCACCAGTTACAAACAATTCCTACTTCGGAGCCATCTCCATGATC
GACAACGCCTTGACGGCGAAAGTTCCGATGAACTCAACTCTGTTGGGACAGGCTCAAGGC
TTTTACGCCGGAGCAGCCCAAAAGGAATTGGGTTTTCTAATGGCGATGAACTTTGCTTTT
AAGACAGGGAAGTACAACGGAAGCACCATCACGATTCTTGGTCGGAACACCGCGATGTCG
GAGGTCAGAGAAATGCCTATTGTCGGAGGAAGTGGGCTTTTCCGATTTGCTAGAGGCTAC
GCTGAGGCTCGGACAAAGTGGATTAATCTCAAGAACGGCGATGCTACTGTTGAGTATAGC
TGTTATATTTTGCATTATTGATGTTTTTTTGTAGTAATTATATATTTCATCTGGCGACCT
AATAAGTTTTTTATATGTTATGCTTTCTTAA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2GP06JQ 627 0 0
CAGAACCATAGATCGGAAGCTTCTCGGTCTCCACAAGAAAGAGAAGCTAACCCATTTCAA
AGTCTATTGGCACGACATCTTAAGTGGTCCAAACCCAACCTCCATCATGATTCAACCACC
AGTTACAAACAATTCCTACTTCGGAGCCATCTCCATGATCGACAACGCCTTGACGGCGAA
AGTTCCGATGAACTCAACTCTGTTGGGACAGGCTCAAGGCTTTTACGCCGGAGCAGCCCA
AAAGGAATTGGGTTTTCTAATGGCGATGAACTTTGCTTTTAAGACAGGGAAGTACAACGG
AAGCACCATCACGATTCTTGGTCGGAACACCGCGATGTCGGAGGTCAGAGAAATGCCTAT
TGTCGGAGGAAGTGGGCTTTTCCGATTTGCTAGAGGCTACGCTGAGGCTCGGACAAAGTG
GATTAATCTCAAGAACGGCGATGCTACTGTTGAGTATAGCTGTTATATTTTGCATTATTG
ATGTTTTTTTGTAGTAATTATATATTTCATCTGGCGACCTAATAAGTTTTTTATATGTTA
TGCTTTCTTAAGTTTTCTTTTTGCATTTTGGTTTATGGTGTGTCTGGTGGAATTGTGGTA
GTAGTTTTGTGGGTTAATAATATTTAT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2FH25JQ 579 0 0
AACCCATTTCAAAGTCTATTGGCACGACATCTTAAGTGGTCCAAACCCAACCTCCATCAT
GATTCAACCACCAGTTACAAACAATTCCTACTTCGGAGCCATCTCCATGATCGACAACGC
CTTGACGGCGAAAGTTCCGATGAACTCAACTCTGTTGGGACAGGCTCAAGGCTTTTACGC
CGGAGCAGCCCAAAAGGAATTGGGTTTTCTAATGGCGATGAACTTTGCTTTTAAGACAGG
GAAGTACAACGGAAGCACCATCACGATTCTTGGTCGGAACACCGCGATGTCGGAGGTCAG
AGAAATGCCTATTGTCGGAGGAAGTGGGCTTTTCCGATTTGCTAGAGGCTACGCTGAGGC
TCGGACAAAGTGGATTAATCTCAAGAACGGCGATGCTACTGTTGAGTATAGCTGTTATGT
TTTGCATTATTGATGTTTTTTTGTAGTAATTATATATTTCATCTGGCGACCTAATAAGTT
TTTTATATGTTATGCTTTCTTAAGTTTTCTTTTTGTATTTTGGTTTATGGTGTGTCTGGT
GGAATTGTGGTAGTAGTTTTGTGGGTTAATAATATTTAT

QA 1 579 1 579
DS 



AS 2 8

CO CL851Contig1 634 2 2 U
GCAGGGATAACTGGCTTGTGGCAGCCAAGCGTTCATAGCGACGTTGCTTTTTGATCCGTC
TATCTCGCCGTCGTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAG
AGGCTTAGGATTAACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGCACAAGAAGAGTCACCAAGGCAAT
GAGTGGAAGAAGCCTTTTGCTGGATCTTCTCACGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATT
GGTATTGAGGCCAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATC
AAGAACGGTAAAAAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAA
GAAAATGACGAAGTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATT
CCCGGAGTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCACTCTTGACCCTTTTCAAG
GAGAAGAAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGAGACTACTACTGCTTCTAATGGATTTTGATATT
TGAAACACTCCTCTGTTCTACTTATAATCTGTCTGGATCCAGTTGACTCTTTTAAGTATT
CTCTCCTCCTGCACTAAAGCTTCCCATTTTCTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D056JQ C 1
AF RR2D056TF U 1
BS 1 618 RR2D056TF
BS 619 634 RR2D056JQ

RD RR2D056JQ 634 0 0
GCAGGGATAACTGGCTTGTGGCAGCCAAGCGTTCATAGCGACGTTGCTTTTTGATCCGTC
TATCTCGCCGTCGTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAG
AGGCTTAGGATTAACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGCACAAGAAGAGTCACCAAGGCAAT
GAGTGGAAGAAGCCTTTTGCTGGATCTTCTCACGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATT
GGTATTGAGGCCAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATC
AAGAACGGTAAAAAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAA
GAAAATGACGAAGTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATT
CCCGGAGTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCACTCTTGACCCTTTTCAAG
GAGAAGAAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGAGACTACTACTGCTTCTAATGGATTTTGATATT
TGAAACACTCCTCTGTTCTACTTATAATCTGTCTGGATCCAGTTGACTCTTTTAAGTATT
CTCTCCTCCTGCACTAAAGCTTCCCATTTTCTCT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2D056TF 634 0 0
GCAGGGATAACTGGCTTGTGGCAGCCAAGCGTTCATAGCGACGTTGCTTTTTGATCCGTC
TATCTCGCCGTCGTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAG
AGGCTTAGGATTAACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGCACAAGAAGAGTCACCAAGGCAAT
GAGTGGAAGAAGCCTTTTGCTGGATCTTCTCACGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATT
GGTATTGAGGCCAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATC
AAGAACGGTAAAAAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAA
GAAAATGACGAAGTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATT
CCCGGAGTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCACTCTTGACCCTTTTCAAG
GAGAAGAAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGAGACTACTACTGCTTCTAATGGATTTTGATATT
TGAAACACTCCTCTGTTCTACTTATAATCTGTCTGGATCCAGTTGACTCTTTTAAGTATT
CTCTCCTCCTGCACTAAA
GCTTCCCATTTTCTCT

QA 1 618 1 618
DS 



CO CL851Contig2 747 6 15 U
TTTTTTTTCAACTGAGAATATTACAGTTATATAAGATTTGTGAAAATTAAAGATTTAACA
TTTCAAACAAGGTTTCAATAGGATTAGATATGACACATTGAGAGTGGTAAAAGAAAAGAG
AAAATGAGGAAAATTTAGTGCAGGAGAAGAGAATACGCAAAAGAGTCAACTGGATCCAAA
CAGATTATAAGTAGAACAGAGGAGTGTTTCAAATATCAAAATCCATTAGAAGCAGTAGTA
GTCTCTAAGACCTAGGCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAAAGAGCCAAGAGTGAGACACCAG
AGACCTTCACCACCTTGAACCTGACTCCGGGAATATCTCCGACGGCATGACCTTTACGCC
CGAACCCAGCAATCAACACTTCGTCATTTTCTTCAATGTAGTTCAAGCAACCATCATTGG
GGACGAAAGCAGCAATCTTTTTACCGTTCTTGATCAACTGAACTCTAGCACATTTACGAA
TGGCAGAGTTAGGCTGCTTGGCCTCAATACCAATTTTCTCAAGGACGATACCCTTAGCGT
GAGAAGATCCAGCAAAAGGCTTCTTCCACTCATTGCCTTGGTGACTCTTCTTGTACTGCT
TGTCAGCCCACCTCTGGTTGATCCTAAGCCTCTTCAGCTTGCGCCCAGCTCCCATACCAC
GTGTCTTACCCATGTTGACGACGGCGAGATAGACGGAACAGAGATGCTGCTGCAACTGCG
AAAAGGCTCGACCTTTGAGTTCGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2GT91JQB U 9
AF RR2E676JQ U 148
AF RR2AY70JQ U 59
AF RR2GT91TF C 1
AF RR2AY70TFB C 42
AF RR2E676TF C 269
BS 1 8 RR2GT91TF
BS 9 95 RR2GT91JQB
BS 96 96 RR2AY70JQ
BS 97 228 RR2GT91JQB
BS 229 229 RR2E676JQ
BS 230 391 RR2GT91JQB
BS 392 392 RR2E676JQ
BS 393 526 RR2GT91JQB
BS 527 527 RR2E676JQ
BS 528 663 RR2GT91JQB
BS 664 684 RR2E676JQ
BS 685 685 RR2AY70JQ
BS 686 699 RR2E676JQ
BS 700 742 RR2GT91TF
BS 743 747 RR2E676TF

RD RR2GT91JQB 655 0 0
CAACTGAGAATATTACAGTTATATAAGATTTGTGAAAATTAAAGATTTAACATTTCAAAC
AAGGTTTCAATAGGATTAGATATGACATATTGAGAGTGGTAAAAGAAAAGAGAAAATGAG
GAAAATTTAGTGCAGGAGAAGAGAATACGCAAAAGAGTCAACTGGATCCAAACAGATTAT
AAGTAGAACAGAGGAGTGTTTCAAATATCAAAATCCATTAAAAGCAGTAGTAGTCTCTAA
GACCTAGGCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAAAGAGCCAAGAGTGAGACACCAGAGACCTTC
ACCACCTTGAACCTGACTCCGGGAATATCTCCGACGGCATGACCTTTACGCCCGAACCCA
GCAATCAACACTTCGTCATTTTCCTCAATGTAGTTCAAGCAACCATCATTGGGGACGAAA
GCAGCAATCTTTTTACCGTTCTTGATCAACTGAACTCTAGCACATTTACGAATGGCAGAG
TTAGGCTGCTTGGCCTCAATACCAATTTTCTCAAGGACAATACCCTTAGCGTGAGAAGAT
CCAGCAAAAGGCTTCTTCCACTCATTGCCTTGGTGACTCTTCTTGTACTGCTTGTCAGCC
CACCTCTGGTTGATCCTAAGCCTCTTCAGCTTGCGCCCAGCTCCCATACCACGTG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2E676JQ 552 0 0
CTAATAA
ACGCAAAAGAGTCAACTGGATCCAAACAGATTATAAGTAGAACAGAGGAGTGTTTCAAAT
ATCAAAATCCATTAGAAGCAGTAGTAGTCTCTAAGACCTAGGCTTCTCCTTCTTCTCCTT
GAAAAGAGCCAAGAGTGAGACACCAGAGACCTTCACCACCTTGAACCTGACTCCGGGAAT
ATCTCCGACGGCATGACCTTTACGCCCGAACCCAGCAATCAACACTTCGTCATTTTCTTC
AATGTAGTTCAAGCAACCATCATTGGGGACGAAAGCAGCAATCTTTTTACCGTTCTTGAT
CAACTGAACTCTAGCACATTTACGAATGGCAGAGTTAGGCTGCTTGGCCTCAATACCAAT
TTTCTCAAGGACGATACCCTTAGCGTGAGAAGATCCAGCAAAAGGCTTCTTCCACTCATT
GCCTTGGTGACTCTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGGTTGATCCTAAGCCTCTT
CAGCTTGCGCCCAGCTCCCATACCACGTGTCTTACCCATGTTGACGACGGTGAGATAGAC
GGAAC

QA 8 552 8 552
DS 

RD RR2AY70JQ 629 0 0
CATTTCAAACAAGGTTTCAATAGGATTAGATATGACACATTGAGAGTGGTAAAAGAAAAG
AGAAAATGAGGAAAATTTAGTGCAGGAGAAGAGAATACGCAAAAGAGTCAACTGGATCCA
AACAGATTATAAGTAGAACAGAGGAGTGTTTCAAATATCAAAATCCATTAAAAGCAGTAG
TAGTCTCTAAGACCTAGGCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAAAGAGCCAAGAGTGAGACACC
AGAGACCTTCACCACCTTGAACCTGACTCCGGGAATATCTCCGACGGCATGACCTTTACG
CCCGAACCCAGCAATCAACACTTCGTCATTTTCTTCAATGTAGTTCAAGCAACCATCATT
GGGGACGAAAGCAGCAATCTTTTTACCGTTCTTGATCAACTGAACTCTAGCACATTTACG
AATGGCAGAATTAGGCTGCTTGGCCTCAATACCAATTTTCTCAAGGACGATACCCTTAGC
GTGAGAAGATCCAGCAAAAGGCTTCTTCCACTCATTGCCTTGGTGACTCTTCTTGTACTG
CTTGTCAGCCCACCTCTGGTTGATCCTAAGCCTCTTCAGCTTGCGCCCAGCTCCCATACC
ACGTGTCTTACCCATGTTGACGACGGCGA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2GT91TF 747 0 0
TTTTTTTTCAACTGAGAATATTACAGTTATATAAGATTTGTGAAAATTAAAGATTTAACA
TTTCAAACAAGGTTTCAATAGGATTAGATATGACATATTGAGAGTGGTAAAAGAAAAGAG
AAAATGAGGAAAATTTAGTGCAGGAGAAGAGAATACGCAAAAGAGTCAACTGGATCCAAA
CAGATTATAAGTAGAACAGAGGAGTGTTTCAAATATCAAAATCCATTAGAAGCAGTAGTA
GTCTCTAAGACCTAGGCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAAAGAGCCAAGAGTGAGACACCAG
AGACCTTCACCACCTTGAACCTGACTCCGGGAATATCTCCGACGGCATGACCTTTACGCC
CGAACCCAGCAATCAACACTTCGTCATTTTCTTCAATGTAGTTCAAGCAACCATCATTGG
GGACGAAAGCAGCAATCTTTTTACCGTTCTTGATCAACTGAACTCTAGCACATTTACGAA
TGGCAGAGTTAGGCTGCTTGGCCTCAATACCAATTTTCTCAAGGACGATACCCTTAGCGT
GAGAAGATCCAGCAAAAGGCTTCTTCCACTCATTGCCTTGGTGACTCTTCTTGTACTGCT
TGTCAGCCCACCTCTGGTTGATCCTAAGCCTCTTCAGCTTGCGCCCAGCTCCCATACCAC
GTGTCTTACCCATGTTGACGACGGCGAGATAGACGGAACAGAGATGCTGCTGCAACTGCG
AAAAGGCTCGACCTTTGAGTTC
GTTCC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2AY70TFB 703 0 0
GAAAATTAAAGATTTAACATTTCAAACAAGGTTTCAATAGGATTAGATATGACACATTGA
GAGTGGTAAAAGAAAAGAGAAAATGAGGAAAATTTAGTGCAGGAGAAGAGAATACGCAAA
AGAGTCAACTGGATCCAAACAGATTATAAGTAGAACAGAGGAGTGTTTCAAATATCAAAA
TCCATTAGAAGCAGTAGTAGTCTCTAAGACCTAGGCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAAAGA
GCCAAGAGTGAGACACCAGAGACCTTCACCACCTTGAACCTGACTCCGGGAATATCTCCG
ACGGCATGACCTTTACGCCCGAACCCAGCAATCAACACTTCGTCATTTTCTTCAATGTAG
TTCAAGCAACCATCATTGGGGACGAAAGCAGCAATCTTTTTACCGTTCTTGATCAACTGA
ACTCTAGCACATTTACGAATGGCAGAGTTAGGCTGCTTGGCCTCAATACCAATTTTCTCA
AGGACGATACCCTTAGCGTGAGAAGATCCAGCAAAAGGCTTCTTCCACTCATTGCCTTGG
TGACTCTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGGTTGATCCTAAGCCTCTTCAGCTTG
CGCCCAGCTCCCATACCACGTGTCTTACCCATGTTGACGACGGCGAGATAGACGGAACAG
AGATGCTGCTGCAACTGCGAAAAGGCTAGACCTTTGAGTTC
CC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2E676TF 479 0 0
CTCCTTGAAAAGAGCCAAGAGTGAGACACCAGAGACCTTCACCACCTTGAACCTGACTCC
GGGAATATCTCCGACGGCATGACCTTTACGCCCGAACCCAGCAATCAACACTTCGTCATT
TTCTTCAATGTAGTTCAAGCAACCATCATTGGGGACGAAAGCAGCAATCTTTTTACCGTT
CTTGATCAACTGAACTCTAGCACATTTACGAATGGCAGAGTTAGGCTGCTTGGCCTCAAT
ACCAATTTTCTCAAGGACGATACCCTTAGCGTGAGAAGATCCAGCAAAAGGCTTCTTCCA
CTCATTGCCTTGGTGACTCTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGGTTGATCCTAAG
CCTCTTCAGCTTGCGCCCAGCTCCCATACCACGTGTCTTACCCATGTTGACGACGGTGAG
ATAGACGGAACAGAGATGCTGCTGCAACTGCGAAAAGGCTCGACCTTTGAGTTCGTTCC

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 7

CO CL852Contig1 1662 7 30 U
GGACCATTCCCACTCAAATCACAATTTGATCACCACCAACACACTGCCAACCAAACACAA
AAAGACATGTCTCCTCTTGTTTTCTTTCTCTTCACCATCCTTGTCTTTTCAAGTTCATCT
TGCTCCGCGACTCGGTTCCAGCATCAGCATAGGTACATGCAGAGGAAAATAACGCTAGAC
TTGCCAAGCAAGATTGGCATCAACTACGGTAGACAAGGAAACAACCTTCCATCTCCATAC
CAATCCATCAACTTCATCAAATCTATCAAAGCTGGTCATGTCAAGCTCTACGACGCGGAT
CCAGAGAGTCTAACACTCCTCTCTCAAACTAATCTTTACGTCACCATAACCGTTCCAAAC
CACCTAATCACTTTCCTCAGCACCAACCAAACCACAGCTGAAGATTGGGTCCAAACCAAC
ATCATCCCTTACTACCCACAAACCCATATCCGGTTT*GTCCTT*GTCGGAAACGGAATCC
TCTCCGTCGAAGACAGAATGAACATAACAGCAAACGTCGTCCC*GGCCATGCGCAAAATA
GTGACTTCTCTAAGAGCACATGGCATTCACAACATCAAAGTCGGGACAGCTTTAGATATG
GATTCTCTCCGATCAACGTTTCCGCCGTCGAACTCAACTTTCCGGGAAGACATCGCCGAA
TCGTTGATGTTTCCGTTGCTGAAGTTTCTCAACGGAACGAACTCTTACTTCTTTATCAAC
CTTCATCCTTACTTGCGTTGGTCAAGAAACCCTATGAACACGAGTTTGGATTATGCTCTG
TTTCAAGGAAACTCAACTTATACCGATCCTCAAACCGGTTTGGTTTACCGTAATCTTCTA
GACCAAATGTTGGATTCGGTTATCTTCGCCATGACCAAACTCGGTTACCCACACATTCGC
GTCGCAATCTCCGAAACCGGATGGCCTAACTCGGGGGACATCGACGAAACCGGCGCCAAC
ATACTCAACGCAGCGACGTATAACCGGAATTTGATCAAGAAGATGACCGCAATTCCACCA
ATCGGTACACCAGCTAGACCCGGTTTAGCTATACCGACATTTGTTTTCTCCTTGTTCGAC
GAAAACCATAAATCCGGTTCGGGAACACAGAGACATTATGGAGTCCTGCATCCGAACGGG
ACACCGATCTACGAAATTGATTTCACGGGTTCAAAACCCTTAACCGGATTCAACCCATTG
CCTAAACCGACGAACAATGTTCCATACAAGGGTATAGTGTGGTGCGTACCGGTGGAAGGA
GCTAGCGAGGCTCAGCTTGAGGAAGCTTTGAGAATGGCTTGTGGCCGAAGCAACACGACG
TGTGCGGCTTTGGCTCCGGGAAGAGAATGTTACGAGCCGGTCACTGTTTATTGGCATGCA
AGCTATGCGGTTAGCTCGTACTGGGCTGAGTTTCGTACCGATAACGTTAGATGTTACTTC
AATGGACTGGCTCGAATGACCACGGTCAACCCTGGACACGATCGCTGCAAGTTTCCAGGC
GTTACTCTTTGAGAAAAAGAAGACTGAAAGAGATTGAAGAATGATTAAGGCTGCCTTATT
ATTCGTATTTATCCAATGTTGTTTCTCATATACATTTTCTGCCTTTTATATTGTTTCGCA
ATGTCGAGAAAAAAAAATCAAATAATTATAAATTTTAAAAAA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C966TF U 35
AF RR2EV52TF U 1
AF RR2G916TF U 1
AF RR2C031TF U 402
AF RR2C966JQ C 1172
AF RR2C031JQ C 906
AF RR2EV52JQ C 910
BS 1 69 RR2EV52TF
BS 70 70 RR2G916TF
BS 71 73 RR2EV52TF
BS 74 74 RR2G916TF
BS 75 77 RR2EV52TF
BS 78 78 RR2G916TF
BS 79 86 RR2EV52TF
BS 87 87 RR2G916TF
BS 88 92 RR2EV52TF
BS 93 93 RR2G916TF
BS 94 326 RR2EV52TF
BS 327 327 RR2G916TF
BS 328 329 RR2EV52TF
BS 330 330 RR2G916TF
BS 331 373 RR2EV52TF
BS 374 374 RR2G916TF
BS 375 542 RR2EV52TF
BS 543 543 RR2G916TF
BS 544 578 RR2EV52TF
BS 579 579 RR2G916TF
BS 580 782 RR2EV52TF
BS 783 1084 RR2C031TF
BS 1085 1085 RR2C031JQ
BS 1086 1094 RR2C031TF
BS 1095 1110 RR2C031JQ
BS 1111 1111 RR2EV52JQ
BS 1112 1148 RR2C031JQ
BS 1149 1149 RR2EV52JQ
BS 1150 1656 RR2C031JQ
BS 1657 1662 RR2EV52JQ

RD RR2C966TF 572 0 0
ACCAACACACTGCCAACCAAACACAAAAAGACATGTCTCCTCTTGTTTTCTTTCTCTTCA
CCATCCTTGTCTTTTCAAGTTCATCTTGCTCCGCGACTCGGTTCCAGCATCAGCATAGGT
ACATGCAGAGGAAAATAACGCTAGACTTGCCAAGCAAGATTGGCATCAACTACGGTAGAC
AAGGAAACAACCTTCCATCTCCATACCAATCCATCAACTTCATCAAATCTATCGA*GCTG
GTCATGTCAAGCTCTACGACGCGGATCCAGAGAGTCTAACACTCCTCTCTCAAACTAATC
TTTACGTCACCATAACCGTTCCAAACCACCTAATCACTTTCCTCAGCACCAACCAAACCA
CAGCTGAAGATTGGGTCCAAACCAACATCATCCCCTACTACCCACAAACCCATATCCGGT
TTTGTCCTTTGTCGGAAACGGAATCCTCTCCGTCGAAGACAGAATGAACATAACAGCAAA
CGTCGTCCCCGGCCATGCGCAAAATAGTGACTTCTCTAAGAGCACATGGCATTCACAACA
TCAAAGTCGGGACAGCTTTAGATATGGATTCT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2EV52TF 786 0 0
GGACCATTCCCACTCAAATCACAATTTGATCACCACCAACACACTGCCAACCAAACACAA
AAAGACATGCCTCTTCTCGTTTTCTTCCTCTTAACCATCCTTGTCTTTTCAAGTTCATCT
TGCTCCGCGACTCGGTTCCAGCATCAGCATAGGTACATGCAGAGGAAAATAACGCTAGAC
TTGCCAAGCAAGATTGGCATCAACTACGGTAGACAAGGAAACAACCTTCCATCTCCATAC
CAATCCATCAACTTCATCAAATCTATCAAAGCTGGTCATGTCAAGCTCTACGACGCGGAT
CCAGAGAGTCTAACACTCCTCTCTCAGACCAATCTTTACGTCACCATAACCGTTCCAAAC
CACCTAATCACTTCCCTCAGCACCAACCAAACCACAGCTGAAGATTGGGTCCAAACCAAC
ATCATCCCTTACTACCCACAAACCCATATCCGGTTT*GTCCTT*GTCGGAAACGGAATCC
TCTCCGTCGAAGACAGAATGAACATAACAGCAAACGTCGTCCC*GGCCATGCGCAAAATA
GTTACTTCTCTAAGAGCACATGGCATTCACAACATCAA*GTCGGGACAGCTTTAGATATG
GATTCTCTCCGATCAACGTTTCCGCCGTCGAACTCAACTTTCCGGGAAGACATCGCCGAA
TCGTTGATGTTTCCGTTGCTGAAGTTTCTCAACGGAACGAACTCTTACTTCTTTATCAAC
CTTCATCCTTACTTGCGTTGGTCAAGAAACCCTATGAACACGAGTTTGGATTATGCTCTG
TT
TCAA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2G916TF 782 0 0
GG
ACCATTCCCACTCAAATCACAATTTGATCACCACCAACACACTGCCAACCAAACACAAAA
AGACATGTCTCCTCTTGTTTTCTTTCTCTTCACCATCCTTGTCTTTTCAAGTTCATCTTG
CTCCGCGACTCGGTTCCAGCATCAGCATAGGTACATGCAGAGGAAAATAACGCTAGACTT
GCCAAGCAAGATTGGCATCAACTACGGTAGACAAGGAAACAACCTTCCATCTCCATACCA
ATCCATCAACTTCATCAAATCTATCAAAGCTGGTCATGTCAAGCTCTACGACGCGGATCC
AGAGAGTCTAACACTCCTCTCTCAAACTAATCTTTACGTCACCATAACCGTTCCAAACCA
CCTAATCACTTTCCTCAGCACCAACCAAACCACAGCTGAAGATTGGGTCCAAACCAACAT
CATCCCTTACTACCCACAAACCCATATCCGGTTT*GTCCTT*GTA**AAACGGAATCCTC
TCCGTCGAAGACAGAATGAACATAACAGCAAACGTCGTCCC*GGCCATGCGCAAAATAGT
GACTTCTCTAAGAGCACATGGCATTCACAACATCAAAGTCGGGACAGCTTTAGATATGGA
TTCTCTCCGATCAACGTTTCCGCCGTCGAACTCAACTTTCCGGGAAGACATCGCCGAATC
GTTGATGTTTCCGTTGCTGAAGTTTCTCA*CGGAACGAACTCTTACTTCTTTATCAACCT
TCATCCTTACTTGCGT*GGTCAAGAAACCCTATGAACACGAGTTTGGATTATGCTCTGTT

QA 3 782 3 782
DS 

RD RR2C031TF 693 0 0
G
GATTGGGTCCAAACCAACATCATCCCTTACTACCCACAAACCCATATCCGGTTT*GTCCT
T*GTCGGAAACGGAATCCTCTCCGTCGAAGACAGAATGAACATAACGGCAAACGTCGTCC
C*GGCCATGCGCAAAATAGTGACTTCTCTAAGAGCACATGGCATTCACAACATCAAAGTC
GGGACAGCTTTAGATATGGATTCTCTCCGATCAACGTTTCCGCCGTCGAACTCAACCTTC
CGGGAAGACATCGCCGAATCGTTGATGTTTCCGTTGCTGAAGTTTCTCAACGGAACGAAC
TCTTACTTCTTTATCAACCTTCATCCTTACTTGCGTTGGTCAAGAAACCCTATGAACACG
AGTTTGGATTATGCTCTGTTTCAAGGAAACTCAACTTATACCGATCCTCAAACCGGTTTG
GTTTACCGTAATCTTCTAGACCAAATGTTGGATTCGGTTATCTTCGCCATGACCAAACTC
GGTTACCCACACATTCGCGTCGCAATCTCCGAAACCGGATGGCCTAACTCGGGGGACATC
GACGAAACCGGCGCCAACATACTCAACGCAGCGACGTATAACCGGAATTTGATCAAGAAG
ATGACCGCAATTCCACCAATCGGTACACCAGCTAGACCCGGTTTAGCTATACCGACATTT
GTTTTCTCCTTGTTCGACGAAA*CCATAAATC

QA 2 693 2 693
DS 

RD RR2C966JQ 347 0 0
CAAAACCCTTAACCGGATTCAACCCATTGCCTAAACCGACGAACAATGTTCCATACAAGG
GTATAGTGTGGTGTGTACCGGTGGAAGGAGCTAGCGAGGCTCAGCTTGAGGAAGCTTTGA
GAATGGCTTGTGGCCGAAGCAACACGACGTGTGCGGCTTTGGCTCCGGGAAGAGAATGTT
ACGAGCCGGTCACTGTTTATTGGCATGCAAGCTATGCGGTTAGCTCGTACTGGGCTGAGT
TTCGTACCGATAACGTTAGATGTTACTTCAATGGACTGGCTCGAATGACCACGGTTAACC
CAGGACACGATCGCTGCAAGTTTCCAGGCGTTACTCTTTGAGAAAAA

QA 1 347 1 347
DS 

RD RR2C031JQ 751 0 0
CATC
TCCGAAACCGGATGGCCTAACTCGGGGGACATCGACGAAACCGGCGCCAACATACTCAAC
GCAGCGACGTATAACCGGAATTTGATCAAGAAGATGACCGCAATTCCACCAATCGGTACA
CCAGCTAGACCCGGTTTAGCTATACCGACATTTGTTTTCTCCTTGTTCGACGAAAACCAT
AAATCCGGTTCGGGAACACAGGGACATTATGGAGTCCTGCATCCGAACGGGACACCGATT
TACGAAATTGATTTCACGGGTTCAAAACCCTTAACCGGATTCAACCCATTGCCTAAACCG
ACGAACAATGTTCCATACAAGGGTATAGTGTGGTGCGTACCGGTGGAAGGAGCTAGCGAG
GCTCAGCTTGAGGAAGCTTTGAGAATGGCTTGTGGCCGAAGCAACACGACGTGTGCGGCT
TTGGCTCCGGGAAGAGAATGTTACGAGCCGGTCACTGTTTATTGGCATGCAAGCTATGCG
GTTAGCTCGTACTGGGCTGAGTTTCGTACCGATAACGTTAGATGTTACTTCAATGGACTG
GCTCGAATGACCACGGTCAACCCTGGACACGATCGCTGCAAGTTTCCAGGCGTTACTCTT
TGAGAAAAAGAAGACTGAAAGAGATTGAAGAATGATTAAGGCTGCCTTATTATTCGTATT
TATCCAATGTTGTTTCTCATATACATTTTCTGCCTTTTATATTGTTTCGCAATGTCGAGA
AAAAAAAATCAAATAATTATAAATTTT

QA 5 751 5 751
DS 

RD RR2EV52JQ 753 0 0
TCCGAAACCGGATGGCCTAACTCGGGGGACATCGACGAAACCGGCGCCAACATACTCAAC
GCAGCGACGTATAACCGGAATTTGATCAAGAAGATGACCGCAATTCCACCAATCGGTACA
CCAGCTAGACCCGGTTTAGCTATACCGACATTTGTTTTCTCCTTGTTCGACGAAAACCAT
AAATCCGGTTCGGGAACACAGAGACATTATGGAGTCCTGCATCCGAACGGGACACCGATC
TACGAAATTGATTTCACGGGTTCAAAACCCTTAACCGGATTCAACCCATTGCCTAAACCG
ACGAACAATGTTCCATACAAGGGTATAGTGTGGTGCGTACCGGTGGAAGGAGCTAGCGAG
GCTCAGCTTGAGGAAGCTTTGAGAATGGCTTGTGGCCGAAGCAACACGACGTGTGCGGCT
TTGGCTCCGGGAAGAGAATGTTACGAGCCGGTCACTGTTTATTGGCATGCAAGCTATGCG
GTTAGCTCGTACTGGGCTGAGTTTCGTACCGATAACGTTAGATGTTACTTCAATGGACTG
GCTCGAATGACCACGGTCAACCCTGGACACGATCGCTGCAAGTTTCCAGGCGTTACTCTT
TGAGAAAAAGAAGACTGAAAGAGATTGAAGAATGATTAAGGCTGCCTTATTATTCGTATT
TATCCAATGTTGTTTCTCATATACATTTTCTGCCTTTTATATTGTTTCGCAATGTCGAGA
AAAAAAAATCAAATAATTATAAATTTTAAAAAA

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 7

CO CL853Contig1 1273 7 22 U
GGAACAGACAAAGAAGAAGAGAAGAAGATATAGAATGGCACCCACAGGCGAAGCGTCGAC
CGTAAACAACAAGCAAGTCATATTTAGAGACTACGTCACCGGCTTCCCCAAGGAATCAGA
CCTCGTCTTCAACGATGCCACCGTGGATCTAAGTGTTCCGGCTGGATCTAACAAGGTTTT
GGTGAAGAATCTCTACTTGTCTTGTGATCCTTACATGCGCATTCGCATGGGCAAGCCTGA
TCCCTCCGCTGCAGCCCTCGCTCTACCCTACACCCCTGGCCAGCAAATCTATGGGTATGG
AGTGTCAAAAGTGGTAGATTCAGGGCACCCTGATTACACAAAGGGAGACCTGCTTTGGGG
TATTGTTGGATGGGAGGAGTACAGTGTTATTACTCCAACTACTTACTCACATTTTAAGAT
CCTACACACTGATGTTCCCTTGTCCTACTACACTGGACTTCTCGGTATGGCTGGGATGAC
TGCCTATTCAGGGTTTTATGAAATCTGCTCTCCTAAGAAAGGAGAGACTGTCTTCGTGTC
AGCTGCATCTGGTGCTGTTGGTCAGCTAGTGGGACAGCTCGCAAAGATCATGGGATGTTA
TGTCGTTGGAAGTGCCGGCAGTAATGAAAAGGTTGATCTTCTCAAGAATAAGTTCGGGTT
TGATGAAGCTTTCAATTACAAAGAAGAGAAAGACCTTGACGCTGCCCTGAAGAGGTGTTT
CCCGGAAGGCATAGACATATACTTTGAGAACGTAGGAGGCAAGATGCTAGACGCAGTGCT
CCTAAACATGAACCTAAAAGGCTGTATCGCGGTATGCGGAATGATCTCACAGTACAACCT
GGAGGAGCAGGAAGGTGTACGCAACCTAGCGACCGTCATTTACAAGCGGGTTAAGCTTCA
AGGCTTTGTGGTCTCTGATCTCTATGACAAATACTCCAAGTTTCTTGAGTTTGTGCTTCC
CTATATTAGAGAA*GGGAAGATCACTTACGTTGAGGATGTAGCCCAAGGACTGGAGCAGG
GGCCTTCTGCTTTGATTGGACTCTTCCATGGTAAGAACGTCGGCAAACAGCTCATTGTGG
TGTCTCGTGAGTGATGATTGAGAGACGTTTTGAGTTTGGTTATCAGCTGGAGATGAGTTA
ATTACGCTTTAGTTGTTTTGTAAGTTTAAGTTTCGCCTTAAGTACTTCACTTTCGTTATG
TAATAAATAAACCCTTTTGTTTGTTGTATTAATGTATTAGCCTATATTGAACTTGAAACT
TTTGTTGTATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF44TF U 1
AF RR2F109TF U 5
AF RR2AF87TF U 4
AF RR2B590TF U 228
AF RR2B590JQ C 449
AF RR2AF87JQ C 517
AF RR2F109JQ C 648
BS 1 72 RR2AF44TF
BS 73 73 RR2AF87TF
BS 74 456 RR2AF44TF
BS 457 457 RR2AF87TF
BS 458 483 RR2AF44TF
BS 484 484 RR2AF87TF
BS 485 507 RR2AF44TF
BS 508 508 RR2AF87TF
BS 509 567 RR2AF44TF
BS 568 568 RR2AF87TF
BS 569 588 RR2AF44TF
BS 589 589 RR2AF87TF
BS 590 628 RR2AF44TF
BS 629 724 RR2AF87TF
BS 725 973 RR2B590TF
BS 974 974 RR2B590JQ
BS 975 1008 RR2B590TF
BS 1009 1009 RR2B590JQ
BS 1010 1033 RR2B590TF
BS 1034 1253 RR2B590JQ
BS 1254 1266 RR2AF87JQ
BS 1267 1273 RR2F109JQ

RD RR2AF44TF 628 0 0
GGAACAGACAAAGAAGAAGAGAAGAAGATATAGAATGGCACCCACAGGCGAAGCGTCGAC
CGTAAACAACAAACAAGTCATATTTAGAGACTACGTCACCGGCTTCCCCAAGGAATCAGA
CCTCGTCTTCAACGATGCCACCGTGGATCTAAGTGTTCCGGCTGGATCTAACAAGGTTTT
GGTGAAGAATCTCTACTTGTCTTGTGATCCTTACATGCGCATTCGCATGGGCAAGCCTGA
TCCCTCCGCTGCAGCCCTCGCTCTACCCTACACCCCTGGCCAGCAAATCTATGGGTATGG
AGTGTCAAAAGTGGTAGATTCAGGGCACCCTGATTACACAAAGGGAGACCTGCTTTGGGG
TATTGTTGGATGGGAGGAGTACAGTGTTATTACTCCAACTACTTACTCACATTTTAAGAT
CCTACACACTGATGTTCCCTTGTCCTACTACACTGGTCTTCTCGGTATGGCTGGGATGAC
TGCTTATTCAGGGTTTTATGAAATCTGTTCTCCTAAGAAAGGAGAGACTGTCTTCGTGTC
AGCTGCATCTGGTGCTGTTGGTCAGCTCGTGGGACAGCTCGCAAAGATTATGGGATGTTA
TGTCGTTGGAAGTGCCGGCAGTAATGAA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2F109TF 697 0 0
GG
GACAAAGAAGAAGAGAAGAAGATATAGAATGGCGCCCACAGGCGAAGCGTCGACCGTAAA
CAACAAGCAAGTCATATTTAGAGACTACGTCACCGGCTTCCCCAAGGAATCAGACCTCGT
CTTCAACGATGCCACCGTGGATCTAAGTGTTCCGGCTGGATCTAACAAGGTTTTGGTGAA
GAATCTCTACTTGTCTTGTGATCCTTACATGCGCATTCGCATGGGCAAGCCTGATCCCTC
CGCTGCAGCCCTCGCTCTACCCTACACCCCTGGCCAGCAAATCTATGGGTATGGAGTGTC
AAAAGTGGTAGATTCAGGGCACCCTGATTACACAAAGGGAGACCTGCTTTGGGGTATTGT
TGGATGGGAGGAGTACAGTGTTATTACTCCAACTACTTACTCACATTTTAAGATCCTACA
CACTGATGTTCCCTTGTCCTACTACACTGGACTTCTCGGTATGGCTGGGATGACTGCCTA
TTCAGGGTTTTATGAAATCTGCTCTCCTAAGAAAGGAGAGACTGTCTTCGTGTCAGCTGC
ATCTGGTGCTGTTGGTCAGCTAGTGGGACAGCTCGCAAAGATCCTGGGATGTTATGTCGT
TGGAAGTGCCGGCAGTAATGAAAAGGTTGATCTTCTCAAGAATAAGTTCGGGTTTGATGA
AGCTTTCAATTACAAAGAAGAGAAAGACCTTGACG

QA 3 697 3 697
DS 

RD RR2AF87TF 721 0 0
GGA
GACAAAGAAGAAGAGAAGAAGATATAGAATGGCACCCACAGGCGAAGCGTCGACCGTAAA
CAACAAGCAAGTCATATTTAGAGACTACGTCACCGGCTTCCCCAAGGAATCAGACCTCGT
CTTCAACGATGCCACCGTGGATCTAAGTGTTCCGGCTGGATCTAACAAGGTTTTGGTGAA
GAATCTCTACTTGTCTTGTGATCCTTACATGCGCATTCGCATGGGCAAGCCTGATCCCTC
CGCTGCAGCCCTCGCTCTACCCTACACCCCTGGCCAGCAAATCTATGGGTATGGAGTGTC
AAAAGTGGTAGATTCAGGGCACCCTGATTACACAAAGGGAGACCTGCTTTGGGGTATTGT
TGGATGGGAGGAGTACAGTGTTATTACTCCAACTACTTACTCACATTTTAAGATCCTACA
CACTGATGTTCCCTTGTCCTACTACACTGGACTTCTCGGTATGGCTGGGATGACTGCCTA
TTCAGGGTTTTATGAAATCTGCTCTCCTAAGAAAGGAGAGACTGTCTTCGTGTCAGCTGC
ATCTGGTGCTGTTGGTCAGCTAGTGGGACAGCTCGCAAAGATCATGGGATGTTATGTCGT
TGGAAGTGCCGGCAGTAATGAAAAGGTTGATCTTCTCAAGAATAAGTTCGGGTTTGATGA
AGCTTTCAATTACAAAGAAGAGAAAGACCTTGACGCTGCCCTGAAGAGGTGTTTCCCG

QA 4 721 4 721
DS 

RD RR2B590TF 806 0 0
G
GGGCAAGTCTGATCCCTCCGCTGCAGCCCTCGCTCTACCCTACACCCCTGGCCAGCAAAT
CTATGGGTATGGAGTGTCAAAAGTGGTAGATTCAGGGCACCCTGATTACACAAAGGGAGA
CCTGCTTTGGGGTATTGTTGGATGGGAGGAGTACAGTGTTATTACTCCAACTGCTTACTC
ACATTTTAAGATCCTACACACTGATGTTCCCTTGTCCTACTACACTGGACTTCTCGGTAT
GGCTGGGATGACTGCCTATTCAGGGTTTTATGAAATCTGCTCTCCTAAGAAAGGAGAGAC
TGTCCTCGTGTCAGCTGCATCTGGTGCTGTTGGTCAGCTAGTGGGACAGCTCGCAAAGAT
CATGGGATGTTATGTCGTTGGAAGTGCCGGCAGTAATGAAAAGGTTGATCTTCTCAAGAA
TAAGTTCGGGTTTGATGAAGCTTTCAATTACAAAGAAGAGAAAGACCTTGACGCTGCCCT
GAAGAGGTGTTTCCCGGAAGGCATAGACATATACTTTGAGAACGTAGGAGGCAAGATGCT
AGACGCAGTGCTCCTAAACATGAACCTAAAAGGCTGTATCGCGGTATGCGGAATGATCTC
ACAGTACAACCTGGAGGAGCAGGAAGGTGTACGCAACCTAGCGACCGTCATTTACAAGCG
GGTTAAGCTTCAAGGCTTTGTGGTCTCTGATCTCTATGACAAATACTCCAAGTTTCTTGA
GTTTGTGCTTCCCTATATTAGAGAAAGGGAAGATCACTTACGTTGAGGATGTAGCCCAAG
*ACTGGAGCAGGGGCCTTCTGCTTT

QA 2 806 2 806
DS 

RD RR2B590JQ 807 0 0
TACACTGGACTTCTCGGTATGGCTGGGATGACTGCCTATTCAGGGTTTTATGAAATCTGC
TCTCCTAAGAAAGGAGAGACTGTCCTCGTGTCAGCTGCATCTGGTGCTGTTGGTCAGCTA
GTGGGACAGCTCGCAAAGATCATGGGATGTTATGTCGTTGGAAGTGCCGGCAGTAATGAA
AAGGTTGATCTTCTCAAGAATAAGTTCGGGTTTGATGAAGCTTTCAATTACAAAGAAGAG
AAAGACCTTGACGCTGCCCTGAAGAGGTGTTTCCCGGAAGGCATAGACATATACTTTGAG
AACGTAGGAGGCAAGATGCTAGACGCAGTGCTCCTAAACATGAACCTAAAAGGCTGTATC
GCGGTATGCGGAATGATCTCACAGTACAACCTGGAGGAGCAGGAAGGTGTACGCAACCTA
GCGACCGTCATTTACAAGCGGGTTAAGCTTCAAGGCTTTGTGGTCTCTGATCTCTATGAC
AAATACTCCAAGTTTCTTGAGTTTGTGCTTCCCTATATTAGAGAA*GGGAAGATCACTTA
CGTTGAGGATGTAGCCCAAGGACTGGAGCAGGGGCCTTTTGCTTTGATTGGACTCTTCCA
TGGTAAGAACGTCGGCAAACAGCTCATTGTGGTGTCTCGTGAGTGATGATTGAGAGACGT
TTTGAGTTTGGTTATCAGCTGGAGATGAGTTAATTACGCTTTAGTTGTTTTGTAAGTTTA
AGTTTCGCCTTAAGTACTTCACTTTCGTTATGTAATAAATAAACCCTTTTGTTTGTTGTA
TTAATGTATTAGCCTATATTGAACT
CG

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2AF87JQ 757 0 0
GAAAGGAGAGACTGTCTTCGTGTCAGCTGCATCTGGTGCTGTTGGTCAGCTAGTGGGACA
GCTCGCAAAGATCATGGGATGTTATGTCGTTGGAAGTGCCGGCAGTAATGAAAAGGTTGA
TCTTCTCAAGAATAAGTTCGGGTTTGATGAAGCTTTCAATTACAAAGAAGAGAAAGACCT
TGACGCTGCCCTGAAGAGGTGTTTCCCGGAAGGCATAGACATATACTTTGAGAACGTAGG
AGGCAAGATGCTAGACGCAGTGCTCCTAAACATGAACCTAAAAGGCCGTATCGCGGTATG
CGGAATGATCTCACAGTACAACCTGGAGGAGCAGGAAGGTGTACGCAACCTAGCGACCGT
CATTTACAAGCGGGTTAAGCTTCAAGGCTTTGTGGTCTCTGATTTTTATGACAAATACTC
CAAGTTTCTTGAGTTTGTGCTTCCCTATATTAGAGAA*GGGAAGATCACTTACGTTGAGG
ATGTAGCCCAAGGACTGGAGCAGGGGCCTTCTGCTTTGATTGGACTCTTCCATGGTAAGA
ACGTCGGCAAACAGCTCATTGTGGTGTCTCGTGAGTGATGATTGAGAGACGTTTTGAGTT
TGGTTATCAGCTGGAGATGAGTTAATTACGCTTTAGTTGTTTTGTAAGTTTAAGTTTCGC
CTTAAGTACTTCACTTTCGTTATGTAATAAATAAACCCTTTTGTTTGTTGTATTAATGTA
TTAGCCTATATTGAACTTGAAACTTTTGTT
GTAAAAC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2F109JQ 626 0 0
ATAAGTTCGGGTTTGATGAAGCTTTCAATTACAAAGAAGAGAAAGACCTTGACGCTGCCC
TGAAGAGGCGTTTCCCGGAAGGCATAGACATATACTTTGAGAACGTAGGAGGCAAGATGC
TAGACGCAGTGCTCCTAAACATGAACCTAAAAGGCCGTATCGCGGTATGCGGAATGATCT
CACAGTACAACCTGGAGGAGCAGGAAGGTGTACGCAACCTAGCGACCGTCATTTACAAGG
GGGTTAAGCTTCAAGGCTTTGTGGTCTCTGATTTCTATGACAAATACTCCAAGTTTCTTG
AGTTTGTGCTTCCCTATATTAGAGAA*GGGAAGATCACTTACGTTGAGGATGTAGCCCAA
GGACTGGAGCAGGGGCCTTCTGCTTTGATTGGACTCTTCCATGGTAAGAACGTCGGCAAA
CAGCTCATTGTGGTGTCTCGTGAGTGATGATTGAGAGACGTTTTGAGTTTGGTTATCAGC
TGGAGATGAGTTAATTACGCTTTAGTTGTTTTGTAAGTTTAAGTTTCGCCTTAAGTACTT
CACTTTCGTTATGTAATAAATAAACCCTTTTGTTTGTTGTATTAATGTATTAGCCTATAT
TGAACTTGAAACTTTTGTTGTATTGG

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 6

CO CL854Contig1 1002 6 12 U
GGAGATCGAACTTTCTCTGGTTCCGTCTGCAGAAAGGTTACTTCTTTGAGTATCATCGTG
TCCAAGCGAAGAAGAAAGATCCAGTTTTGATATTTTGGAGTTCCATCAATGGCTTCGTCG
CTAGCTCGCAGGTCGTTCAATGCTCTCCGTTCCCGACATCTCGTTTCTTCAGGGCAAGCT
TTACAGGGATCTCATCTCGGTGGGCTACAGTCCCGTGCTATATCTTATGGCACCAATAAA
GATGATCAAGAAGCTGAGCAACTTGCTAAGGAGATCTCCAAGGACTGGAGTACTGTCTTT
GAGCGGAGCATGAACACCCTATTTCTCACTGAAATGGTCCGGGGTTTGTCGCTGACTCTC
AAGTACTTCTTTGATCCAAAAGTTACAATCAATTATCCTTTTGAAAAGGGTCCATTGAGC
CCTCGCTTCCGTGGTGAGCACGCTCTTCGAAGGTATCCAACTGGGGAAGAACGCTGCATT
GCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACCATAGAGGCAGAGGAG
AGGGAAGATGGAAGCCGCAGAACCACTAGGTATGATATAGACATGACAAAGTGCATCTAC
TGTGGTTTTTGCCAAGAAGCTTGCCCTGTTGATGCGATCGTGGAAGGACCCAACTTTGAG
TTTGCAACCGAGACTCATGAGGAACTTCTGTATGACAAAGAGAAGCTTCTTGAGAATGGA
GATCGGTGGGAGACAGAGATTGCCGAGAATCTGAAGTCGGAGAGCCTCTACCGCTGAATT
CTTTAAAGGTCTTTTGCCTAATAATTTATTCAGGGAATGTTTTGGTTTGAATAAAGATGC
TTCAGCTTTTGCAAACCGTTACTGACTTGCTGCTGCTTTGCTTTGCTTTGCTTGCAAGTA
GTCCATACTGATGTGAAAACTTGGTTTGGTTTTGTTTCTGGTTTAAATTGGACCATAAAT
ACCATACCAAACACTTTGGAATATGAAGTTACGAATACATGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD29TF U 1
AF RR2B140TF U 1
AF RR2FZ10TF U 1
AF RR2FZ10JQ C 324
AF RR2B140JQ C 115
AF RR2CD29JQ C 121
BS 1 220 RR2B140TF
BS 221 221 RR2CD29TF
BS 222 229 RR2B140TF
BS 230 230 RR2CD29TF
BS 231 503 RR2B140TF
BS 504 504 RR2CD29TF
BS 505 814 RR2B140TF
BS 815 815 RR2B140JQ
BS 816 826 RR2B140TF
BS 827 904 RR2B140JQ
BS 905 905 RR2CD29JQ
BS 906 1002 RR2B140JQ

RD RR2CD29TF 702 0 0
GGAGATCGAACTTTCTCTGGTTCCGTCTGCAGAAAGGTTACTTCTTTGAGTATCATCGTG
TCCAAGCGAAGAAGAAAGATCCAGTTTTGATATTTTGGAGTTCCATCAATGGCTTCGTCG
CTAGCTCGCAGGTCGTTCAATGCTCTCCGTTCCCGACATCTCGTTTCTTCAGGGCAAGCT
TTACAGGGATCTCATCTCGGTGGGCTACAGTCCCGTGCTATATCTTATGGCACCAATAAA
GATGATCAAGAAGCTGAGCAACTTGCTAAGGAGATCTCCAAGGACTGGAGTACTGTCTTT
GAGCGGAGCATGAACACCCTATTTCTCACTGAAATGGTCCGGGGTTTGTCGCTGACTCTC
AAGTACTTCTTTGATCCAAAAGTTACAATCAATTATCCTTTTGAAAAGGGTCCATTGAGC
CCTCGCTTCCGTGGTGAGCACGCTCTTCGAAGGTATCCAACTGGGGAAGAACGCTGCATT
GCCAGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACCATAGAGGCAGAGGAG
AGGGAAGATGGAAGCCGCAGAACCACTAGGTATGATATAGACATGACAAAGTGCATCTAC
TGTGGTTTT*GCCAAGAAGCTTGCCCTGTTGATGCGATCGTGGA*GGACCCAACTTTGAG
TTTGCAACCGAGACTCATGAGGA*CTTCTGTATGACAAAGAG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2B140TF 826 0 0
GGAGATCGAACTTTCTCTGGTTCCGTCTGCAGAAAGGTTACTTCTTTGAGTATCATCGTG
TCCAAGCGAAGAAGAAAGATCCAGTTTTGATATTTTGGAGTTCCATCAATGGCTTCGTCG
CTAGCTCGCAGGTCGTTCAATGCTCTCCGTTCCCGACATCTCGTTTCTTCAGGGCAAGCT
TTACAGGGATCTCATCTCGGTGGGCTACAGTCCCGTGCTACATCTTATGACACCAATAAA
GATGATCAAGAAGCTGAGCAACTTGCTAAGGAGATCTCCAAGGACTGGAGTACTGTCTTT
GAGCGGAGCATGAACACCCTATTTCTCACTGAAATGGTCCGGGGTTTGTCGCTGACTCTC
AAGTACTTCTTTGATCCAAAAGTTACAATCAATTATCCTTTTGAAAAGGGTCCATTGAGC
CCTCGCTTCCGTGGTGAGCACGCTCTTCGAAGGTATCCAACTGGGGAAGAACGCTGCATT
GCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACCATAGAGGCAGAGGAG
AGGGAAGATGGAAGCCGCAGAACCACTAGGTATGATATAGACATGACAAAGTGCATCTAC
TGTGGTTTTTGCCAAGAAGCTTGCCCTGTTGATGCGATCGTGGAAGGACCCAACTTTGAG
TTTGCAACCGAGACTCATGAGGAACTTCTGTATGACAAAGAGAAGCTTCTTGAGAATGGA
GATCGGTGGGAGACAGAGATTGCCGAGAATCTGAAGTCGGAGAGCCTCTACCGCTGAATT
CTTTAAAGGTCTTTTGCCTAATAATTTATTCAGG*AATGTTTTGGT

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2FZ10TF 798 0 0
GGAGATCGAACTTTCTCTGGTTCCGTCTGCAGAAAGGTTACTTCTTTGAGTATCATCGTG
TCCAAGCGAAGAAGAAAGATCCAGTTTTGATATTTTGGAGTTCCATCAATGGCTTCGTCG
CTAGCTCGCAGGTCGTTCAATGCTCTCCGTTCCCGACATCTCGTTTCTTCAGGGCAAGCT
TTACAGGGATCTCATCTCGGCGGGCTACAGTCCCGTGCTATATCTTATGGCACCAATAAA
GATGATCAAGAAGCTGAGCAACTTGCTAAGGAGATCTCCAAGGACTGGAGTACTGTCTTT
GAGCGGAGCATGAATACCCTATTTCTCACTGAAATGGTCCGGGGTTTGTCGCTGACACTC
AAGTACTTCTTTGATCCAAAAGTTACAATCAATTATCCTTTTGAAAAGGGTCCATTGAGC
CCTCGCTTCCGTGGTGAGCACGCTCTTCGAAGGTATCCAACTGGGGAAGAACGCTGCATT
GCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACCATAGAGGCAGAGGAG
AGGGAAGATGGAAGCCGCAGAACCACTAGGTATGATATAGACATGACAAAGTGCATCTAC
TGTGGTTTTTGCCAAGAAGCTTGCCCTGTTGATGCGATCGTGGAAG*ACCCAACTTTGAG
TTTGCAACCGAGACTCATGAG*AACTTCTGTATGGCAAAGAGAAGCTTCTTGAGAATGGA
GATCGGTGGGAGACAGAGATTGCCGAGAATCTGAAGTCG*AGAGCCTCTACCGCTGAATT
CTTTAAAG
TCTTTTGCTA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2FZ10JQ 609 0 0
TCTCACTGAAATGGTCCGGGGTTTGTCGCTGACACTCAAGTACTTCTTTGATCCAAAAGT
TACAATCAATTATCCTTTTGAAAAGGGTCCATTGAGCCCTCGCTTCCGTGGTGAGCACGC
TCTTCGAAGGTATCCAACTGGGGAAGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGT
ATGTCCAGCTCAAGCAATCACCATAGAGGCAGAGGAGAGGGAAGATGGAAGCCGCAGAAC
CACTAGGTATGATATAGACATGACAAAGTGCATCTACTGTGGTTTTTGCCAAGAAGCTTG
CCCTGTTGATGCGATCGTGGAAGGACCCAACTTTGAGTTTGCAACCGAGACTCATGAGGA
ACTTCTGTATGGCAAAGAGAAGCTTCTTGAGAATGGAGATCGGTGGGAGACAGAGATTGC
CGAGAATCTGAAGTCGGAGAGCCTCTACCGCTGAATTCTTTAAAGGTCTTTTGCCTAATA
ATTTATTCAGGGAATGTTTTGGTTTGAATAAAGATGCTTCAGCTTTTGCAAACCGTTACT
GACTTGCTGCTGCTTTGCTTTGCTTTGCTTGCAAGTAGTCCATACTGATGTGAAAACTT
GGTTTGGTCT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2B140JQ 888 0 0
TCGTCGCTAGCTCGCAGGTCGTTCAATGCTCTCCGTTCCCGACATCTCGTTTCTTCAGGG
CAAGCTTTACAGGGATCTCATCTCGGTGGGCTACAGTCCCGTGCTACATCTTATGACACC
AATAAAGATGATCAAGAAGCTGAGCAACTTGCTAAGGAGATCTCCAAGGACTGGAGTACT
GTCTTTGAGCGGAGCATGAACACCCTATTTCTCACTGAAATGGTCCGGGGTTTGTCGCTG
ACTCTCAAGTACTTCTTTGATCCAAAAGTTACAATCAATTATCCTTTTGAAAAGGGTCCA
TTGAGCCCTCGCTTCCGTGGTGAGCACGCTCTTCGAAGGTATCCAACTGGGGAAGAACGC
TGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTGTGTCCAGCTCAAGCAATCACCATAGAGGCA
GAGGAGAGGGAAGATGGAAGCCGCAGAACCACTAGGTATGATATAGACATGACAAAGTGC
ATCTACTGTGGTTTTTGCCAAGAAGCTTGCCCTGTTGATGCGATCGTGGAAGGACCCAAC
TTTGAGTTTGCAACCGAGACTCATGAGGAACTTCTGTATGACAAAGAGAAGCTTCTTGAG
AATGGAGATCGGTGGGAGACAGAGATTGCCGAGAATCTGAAGTCGGAGAGCCTCTACCGC
TGAATTCTTTAAAGGTCTTTTGCCTAATAATTTATTCAGGGAATGTTTTGGTTTGAATAA
AGATGCTTCAGCTTTTGCAAACCGTTACTGACTTGCTGCTGCTTTGCTTTGCTTTGCTTG
CAAGTAGTCCGTACTGATGTGAAAACTTGGTTTGGTTTTGTTTCTGGTTTAAATTGGACC
ATAAATACCATACCAAACACTTTGGAATATGAAGTTACGAATACATGG

QA 1 888 1 888
DS 

RD RR2CD29JQ 843 0 0
CGCTAGCTCGCAGTCG
TCAATGCTCTCCGTTCCCGACATCTCGTTC**TCAGGGCAAGCTTTACAGGGATCTCATC
TCGGTGGGCTACAGTCCCGTGCTATATCTTATGGCACCAATAAAGATGATCAAGAAGCTG
AGCAACTTGCTAAGGAGATCTCCAAGGACTGGAGTACTGTCTTTGAGCGGAGCATGAACA
CCCTATTTCTCACTGAAATGGTCCGGGGTTTGTCGCTGACTCTCAAGTACTTCTTTGATC
CAAAAGTTACAATCAATTATCCTTTTGAAAAGGGTCCATTGAGCCCTCGCTTCCGTGGTG
AGCACGCTCTTCGAAGGTATCCAACTGGGGAAGAACGCTGCATTGCCAGCAAACTCTGTG
AAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACCATAGAGGCAGAGGAGAGGGAAGATGGAAGCC
GCAGAACCACTAGGTATGATATAGACATGACAAAGTGCATCTACTGTGGTTTTTGCCAAG
AAGCTTGCCCTGTTGATGCGATCGTGGAAGGACCCAACTTTGAGTTTGCAACCGAGACTC
ATGAGGAACTTCTGTATGACAAAGAGAAGCTTCTTGAGAATGGAGATCGGTGGGAGACAG
AGATTGCCGAGAATCTGAAGTCGGAGAGCCTCTACCGCTGAATTCTTTAAAGGTCTTTTG
CCTAATAATTTATTCAGGGAATGTTTTGGTTTGAATAAAGATGCTTCAGCTTTTGCAAAC
CGTTACTGACTTGCTGCTGCTTTGCTTTGCTTTGCTTGCAAGTAGTCCATACTGATGTGA
AAACTT***TTGGTTTTGTTTCTGGTTTAAATTGGACCATAAATACC

QA 17 843 17 843
DS 



AS 2 8

CO CL855Contig1 934 6 50 U
GGGATTCGTTTCTTCATAGATTTGATTTCTTCTACGAACACCGATCGAAAGACAGACGAT
CCTTAAAGATGGCGACCGTAGACGAGAGTTCTTCAGCTAAGAGATGGCTTCCACTCGAAG
CTAACCCCGATGTTATGAATCAGTTTCTGTGGGGGCTTGGACTTGCCCCAGATGAAGTGG
AGTGTAATGATGTGTTTGGTCTAGATGACGAACTGCTTGAGATGGTTCCAAAGCCTGTCC
TTGCTGTTCTCTTCCTTTACCCCCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAATCGAGCAAG
ATAAAGAGATCAAGGAGAGGGTGCATAGTGATAAAGTTTACTTCATGAAACAAACTGTTG
GTAATGCTTGCGGAACCATTGGTCTTCTTCATGCTATTGGCAACATTACCTCTGAAATCA
AGCTTTCTGAGGGATCATTCTTGGATAAGTTCTTCAAAACCACTGCCAAGATGAGTCCTA
TGGAGCGTGGAAGGTTTCTTGAGAACGATAGTCAAATTGAAGATGCTCATTCGGCAGCTG
TTACAGCTGGTGAAACACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCTGTTTAGCTT
GTGTAAACGGGGAGCTCTATGAACTTGATGGAAGAAAAGCAGGACCAGTTTCACATGGTG
CTTCCTCTCCAGCTACCCTGTTGAAG*ATGCGGCGAAAGTGATAAAGAAGATTATTGAGA
AGAATCCGGACACGCTCAACTTCAATGTGATGGCCATCTCTAAGAGAACCTGATTCCCTT
CTTAAGAAGCAAACCTCACTAGTCTTGTGTTTTTAGTTTATAATGATATCCACATAGATT
GTTTATCTAGGTGGATTCTGTTTTACTGCTTTCTGAATCTTATTTTTCTTGTTTATGAAA
CTTTTTTAAGTTTATGATCACCTTTTTAAAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 10 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 
40 40 20 20 35 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G745TF U 1
AF RR2CI10TF U 2
AF RR2FH15TF U 2
AF RR2GX41TF U 6
AF RR2CI10JQ C 243
AF RR2FH15JQ C 416
BS 1 106 RR2G745TF
BS 107 107 RR2CI10TF
BS 108 193 RR2G745TF
BS 194 194 RR2CI10TF
BS 195 301 RR2G745TF
BS 302 302 RR2CI10TF
BS 303 304 RR2G745TF
BS 305 305 RR2CI10TF
BS 306 318 RR2G745TF
BS 319 319 RR2CI10TF
BS 320 325 RR2G745TF
BS 326 326 RR2CI10TF
BS 327 367 RR2G745TF
BS 368 368 RR2CI10TF
BS 369 388 RR2G745TF
BS 389 389 RR2CI10TF
BS 390 451 RR2G745TF
BS 452 452 RR2CI10TF
BS 453 474 RR2G745TF
BS 475 475 RR2CI10TF
BS 476 480 RR2G745TF
BS 481 481 RR2CI10TF
BS 482 505 RR2G745TF
BS 506 506 RR2CI10TF
BS 507 508 RR2G745TF
BS 509 509 RR2CI10TF
BS 510 532 RR2G745TF
BS 533 533 RR2CI10TF
BS 534 607 RR2G745TF
BS 608 608 RR2CI10TF
BS 609 641 RR2G745TF
BS 642 642 RR2CI10TF
BS 643 679 RR2G745TF
BS 680 680 RR2CI10TF
BS 681 698 RR2G745TF
BS 699 699 RR2CI10TF
BS 700 708 RR2G745TF
BS 709 709 RR2CI10TF
BS 710 715 RR2G745TF
BS 716 716 RR2CI10TF
BS 717 726 RR2G745TF
BS 727 727 RR2GX41TF
BS 728 728 RR2FH15TF
BS 729 729 RR2CI10JQ
BS 730 759 RR2FH15TF
BS 760 776 RR2CI10JQ
BS 777 777 RR2FH15JQ
BS 778 919 RR2CI10JQ
BS 920 920 RR2FH15JQ
BS 921 934 RR2CI10JQ

RD RR2G745TF 726 0 0
GGGATTCGTTTCTTCATAGATTTGATTTCTTCTACGAACACCGATCGAAAGACAGACGAT
CCTTAAAGATGGCGACCGTAGACGAGAGTTCTTCAGCTAAGAGATGACTTCCACTCGAAG
CTAACCCCGATGTTATGAATCAGTTTCTGTGGGGGCTTGGACTTGCCCCAGATGAAGTGG
AGTGTAATGATGTTTTTGGTCTAGATGACGAACTGCTTGAGATGGTTCCAAAGCCTGTCC
TTGCTGTTCTCTTCCTTTACCCCCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAATCGAGCAAG
ACAAGGAGATCAAGGAGAAGGTGCACAGTGATAAAGTTTACTTCATGAAACAAACTGTTG
GTAATGCCTGCGGAACCATTGGTCTTCTCCATGCTATTGGCAACATTACCTCTGAAATCA
AGCTTTCTGAGGGATCATTCTTGGATAAGTTTTTCAAAACCACTGCCAAGATGACTCCTA
AGGAGCGTGGAAGGTTTCTTGAGAATGACAGTCAAATTGAAGATGCTCATTCTGCAGCTG
TTACAGCTGGTGAAACACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCTGTTTAGCTT
GTGTAAATGGGGAGCTCTATGAACTTGATGGAAGAAAAGCACGACCAGTTTCACATGGTG
CTTCCTCTCCAGCTACCCTTTTGAAG*ATGCGGCGAAATTGATAAAGA*GATTATCGAGA
AGAATC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2CI10TF 722 0 0
GGGATTCGTTTCTTC
TAGATTTGATTTCTTCTACGAACACCGATCGAAAGACAGACGATCCTTAA*GATGGCGAC
CGTAGACGAGAGTTCTTCAGCTAAGAGATGGCTTCCACTCGAAGCTAACCCCGATGTTAT
GAATCAGTTTCTGTGGGGGCTTGGTCTTGCCCCAGATGAAGTGGAGTGTAATGATGTGTT
TGGTCTAGATGACGAACTGCTTGAGATGGTTCCAAAGCCTGTCCTTGCTGTTCTCTTCCT
TTACCCCCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAATCGAGCAAGATAAAGAGATCAAGGA
GAGGGTGCATAGTGATAGAGTTTACTTCATGAAACAAACTGTTGGTAATGCTTGCGGAAC
CATTGGTCTTCTTCATGCTATTGGCAACATTACCTCTGAAATCAAGCTTTCTGAGGGATC
ATTCTTGGATAAGTTCTTCAAAACCACTGCCAAGATGAGTCCTATGGAGCGTGGAAGGTT
TCTTGAGAACGATAGTCAAATTGAAGATGCTCATTCGGCAGCTGTTACAGCTGGTGAAAC
ACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCTGTTTAGCTTGTGTAAACGGGGAGCT
CTATGAACTTGATGGAAGAAAAGCAGGACCAGTTTCACATGGTGCTTCCTCTCCAGCTAC
CCTGTTGAAG*ATGCGGCGAAAGTGATAAAGAAGATTATTGAGAAGA

QA 16 722 16 722
DS 

RD RR2FH15TF 762 0 0
GGGATTCGTTTCTTC
TAGATTTGATTTCTTCTACGAACACCGATCGAAAGACAGACGATCCTTAA*GATGGCGAC
CGTAGACGAGAGTTCTTCAGCTAAGAGATGGCTTCCACTCGAAGCTAACCCCGATGTTAT
GAATCAGTTTCTGTGGGGGCTTGGTCTTGCCCCAGATGAAGTGGAGTGTAATGATGTGTT
TGGTCTAGATGACGAACTGCTTGAGATGGTTCCAAAGCCTGTCCTTGCTGTTCTCTTCCT
TTACCCCCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAATCGAGCAAGATAAAGAGATCAAGGA
GAGGGTGCATAGTGATAAAGTTTACTTCATGAAACAAACTGTTGGTAATGCTTGCGGAAC
CATTGGTCTTCTTCATGCTATTGGCAACATTACCTCTGAAATCAAGCTTTCTGAGGGATC
ATTCTTGGATAAGTTCTTCAAAACCACTGCCAAGATGAGTCCTATGGAGCGTGGAAGGTT
TCTTGAGAACGATAGTCAAATTGAAGATGCTCATTCGGCAGCTGTTACAGCTGGTGAAAC
ACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCTGTTTAGCTTGTGTAAACGGGGAGCT
CTATGAACTTGATGGAAGAAAAGCAGGACCAGTTTCACATGGTGCTTCCTCTCCAGCTAC
CCTGTTGAAG*ATGCGGCGAAAGTGATAAAGAAGATTATTGAGAAGATCCGG*ACACGCT
CAACTTCAATGTGATGGCCATCT
CTAA

QA 16 758 16 758
DS 

RD RR2GX41TF 733 0 0
GGGTTTCTTCA
TAGATTTGATTTCTTCTACGAACACCGATCGAAAGACAGACGATCCTTAAAGATGGCGAC
CGTAGACGAGGGTTCTTCAGCTAAGAGATGGCTTCCACTCGAAGCTAACCCCGATGTTAT
GAATCAGTTTCTGTGGGGGCTTGGACTTGCCCCAGATGAAGTGGAGTGTAATGATGTTTT
TGGTCTAGATGACGAACTGCTTGAGATGGTTCCAAAGCCTGTCCTTGCTGTTCTCTTCCT
TTACCCCCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAATCGAGCAAGACAAGGAGATCAAGGA
GAAGGTGCACAGTGATAAAGTTTACTTCATGAAACAAACTGTTGGTAATGCCTGCGGAAC
CATTGGTCTTCTCCATGCTATTGGCAACATTACCTCTGAAATCAAGCTTTCTGAGGGATC
ATTCTTGGATAAGTTTTTCAAAACCACTGCCAAGATGACTCCTATGGAGCGTGGAAGGTT
TCTTGAGAATGACAGTCAAATTGAAGATGCTCATTCTGCAGCTGTTACAGCTGGTGAAAC
ACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCTGTTTAGCTTGTGTAAATGGGGAGCT
CTATGAACTTGATGGAAGAAAAGCA*GACCAGTTTCACATGGTGCTTCCTCTCCAGCTAC
CCTGTTGAAG*ATGCGGCGAAAGTGATAAAGAAGATTATCGAGAAGAATCCG*ACACGCT
CA

QA 12 733 12 733
DS 

RD RR2CI10JQ 692 0 0
GCTGTTCTCTTCCTTTACCCCCTCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGAATCGAGCAAGAT
AAAGAGATCAAGGAGAGGGTGCATAGTGATAGAGTTTACTTCATGAAACAAACTGTTGGT
AATGCTTGCGGAACCATTGGTCTTCTTCATGCTATTGGCAACATTACCTCTGAAATCAAG
CTTTCTGAGGGATCATTCTTGGATAAGTTCTTCAAAACCACTGCCAAGATGAGTCCTATG
GAGCGTGGAAGGTTTCTTGAGAACGATAGTCAAATTGAAGATGCTCATTCGGCAGCTGTT
ACAGCTGGTGAAACACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCTGTTTAGCTTGT
GTAAACGGGGAGCTCTATGAACTTGATGGAAGAAAAGCAGGACCAGTTTCACATGGTGCT
TCCTCTCCAGCTACCCTGTTGAAGGATGCGGCGAAAGTGATAAAGAAGATTATTGAGAAG
AATCCGGACACGCTCAACTTCAATGTGATGGCCATCTCTAAGAGAACCTGATTCTCTTCT
TAAGAAGCAAACCTCACTAGTCTTGTGTTTTTAGTTTATAATGATATCCACATAGATTGT
TTATCTAGGTGGATTCTGTTTTACTGCTTTCTGAATCTTATTTTTCTTGTTTATGAAACT
TTTTTAAGTTTATGATCCCCTTTTTAAAGAGC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2FH15JQ 512 0 0
AATCAAGCTTTCTGAGGGATCATTCTTGGATAAGTTCTTCAAAACCACTGCCAAGATGAG
TCCTATGGAGCGTGGAAGGTTTCTTGAGAACGATAGTCAAATTGAAGATGCTCATTCGGC
AGCTGTTACAGCTGGTGAAACACCGGCTTCAGAAGATGTGAACACACATTTCATCTGTTT
AGCTTGTGTAAACGGGGAGCTCTATGAACTTGATGGAAGAAAAGCAGGACCAGTTTCACA
TGGTGCTTCCTCTCCAGCTACCCTGTTGAAGGATGCGGCGAAAGTGATAAAGAAGATTAT
TGAGAAGAATCCGGACACGCTCAACTTCAATGTGATGGCCATTTTTAAGAGAACCTGATT
CCCTTTTTAAGAAGCAAACCTCACTAGTCTTGTGTTTTTAGTTTATAATGATATCCACAT
AGATTGTTTATCTAGGTGGATTCTGTTTTACTGCTTTCTGAATCTTATTTTTCTTGTTTA
TGAAACTTTTTTAAGTTTATGATCACCTTTTT

QA 1 512 1 512
DS 



CO CL855Contig2 685 2 6 U
ATACGAGTTCTCTTTAAAAAGGTGATCATAAACTTAAAAAAAATTTCATAAACAAGAAAA
ATAAGATTCAAAAAGCAGTAAAACAGAATCCACCTAGATAAACAATCTATGTGGATCATC
GTTATAAACTAAAAACACAACACTAATGAGATTTGCTTCTTAGGAAGAGACTCAGGTTCT
CTTAAAGATGGCCATCACATTGAAGTTGAGCGTGTCCGGATTCTTCTCGATAATCTTCTT
TATCAATTTCGCCGCATCCTTCAAAAGGGTAGCTGGAGAGGAAGCACCATGTGAAACTGG
TCCTGCTTTTCTTCCATCAAGTTCATAGAGCTCCCCATTTACACAAGCTAAACAGATGAA
ATGTGTGTTCACATCTTCTGAAGCCGGTGTTTCACCAGCTGTAACAGCTGCAGAATGAGC
ATCTTCAATTTGACTGTCATTCTCAAGAAACCTTCCACGCTCCATAGGAGTCATCTTGGC
AGTGGTTTTGAAAAACTTATCCAAGAATGATCCCTCAGAAAGCTTGATTTCAGAGGTAAT
GTTGCCAATAGCATGGAGAAGACCAATGGTTCCGCAGGCATTACCAACAGTTTGTTTCAT
GAAGTAAACTTTATCACTGTGCACCTTCTCCTTGATCTCCTTGTCTTGCTCGATTCTCTC
TTCTTCACTCTTTTTGGTGAGGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX41JQ U 1
AF RR2G745JQ U 16
BS 1 245 RR2GX41JQ
BS 246 246 RR2G745JQ
BS 247 264 RR2GX41JQ
BS 265 265 RR2G745JQ
BS 266 556 RR2GX41JQ
BS 557 685 RR2G745JQ

RD RR2GX41JQ 556 0 0
ATACGAGTTCTCTTTAAAAAGGTGATCATAAACTTAAAAAAAATTTCATAAACAAGAAAA
ATAAGATTCAAAAAGCAGTAAAACAGAATCCACCTAGATAAACAATCTATGTGGATCATC
GTTATAAACTAAAAACACAACACTAATGAGATTTGCTTCTTAGGAAGAGACTCAGGTTCT
CTTAAAGATGGCCATCACATTGAAGTTGAGCGTGTCCGGATTCTTCTCGATAATCTTCTT
TATCACTTTCGCCGCATCCTTCAACAGGGTAGCTGGAGAGGAAGCACCATGTGAAACTGG
TCCTGCTTTTCTTCCATCAAGTTCATAGAGCTCCCCATTTACACAAGCTAAACAGATGAA
ATGTGTGTTCACATCTTCTGAAGCCGGTGTTTCACCAGCTGTAACAGCTGCAGAATGAGC
ATCTTCAATTTGACTGTCATTCTCAAGAAACCTTCCACGCTCCATAGGAGTCATCTTGGC
AGTGGTTTTGAAAAACTTATCCAAGAATGATCCCTCAGAAAGCTTGATTTCAGAGGTAAT
GTTGCCAATAGCATGG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2G745JQ 670 0 0
AAAAAGGTGATCATAAACTTAAAAAAA*TTTCATAAACAAGAAAAATAAGATTCAGAAAG
CAGTAAAACAGAATCCACCTAGATAAACAATCTATGTGGATCATCGTTATAAACTAAAAA
CACAACACTAATGAGATTTGCTTCTTAGGAAGAGACTCAGGTTCTCTTAAAGATGGCCAT
CACATTGAAGTTGAGCGTGTCCGGATTCTTCTCGATAATCTTCTTTATCAATTTCGCCGC
ATCCTTCAAAAGGGTAGCTGGAGAGGAAGCACCATGTGAAACTGGTCCTGCTTTTCTTCC
ATCAAGTTCATAGAGCTCCCCATTTACACAAGCTAAACAGATGAAATGTGTGTTCACATC
TTCTGAAGCCGGTGTTTCACCAGCTGTAACAGCTGCAGAATGAGCATCTTCAATTTGACT
GTCATTCTCAAGAAACCTTCCACGCTCCTTAGGAGTCATCTTGGCAGTGGTTTTGAAAAA
CTTATCCAAGAATGATCCCTCAGAAAGCTTGATTTCAGAGGTAATGTTGCCAATAGCATG
GAGAAGACCAATGGTTCCGCAGGCATTACCAACAGTTTGTTTCATGAAGTAAACTTTATC
ACTGTGCACCTTCTCCTTGATCTCCTTGTCTTGCTCGATTCTCTCTTCTTCACTCTTTTT
GGTGAGGGGG

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 3

CO CL856Contig1 953 3 9 U
AGAGAAGCTTTATGTTAATAATGTAAAAAAAGAGAACCGACTAAGTCGTAAACCATGAGT
GGATAATATTCTTGAACATGAGAAAACGCAAATCAGCCAGCGAACTACAGTTGTGTCTGT
TAAAAAAAAAAGAGCTAAGTAAATATTATATGGTAACTTAATGAGGCAAAATACTATTTA
GACACGAGACATGCCGAGTTTGCGTTCAAACAAGCGACGCAAAAGGTAAACTTGGAGGAC
ACTTGCACCGATCAATGCAAACGACTCGAACAAAGCTTTGTGTACTGCTCTTTTGCTCAT
GTTCTCGTTCACGATAGCTTGACGATCGGTCTGAGCCTCTAACCAGTGTTGTTCAAACTG
GATGTTGTAAAGAGCCTCCTCTAACTTTGATATTTGCTCCATCAAGGGAGTGAAATGCTC
GTCCTTTGCGTGCTGGTCGTAGTATGCAAAGTGACCAAGCTGTACATCGAAGTCAATGGT
TTCATGATAAGGAGACTTGTTAGTGAAACAGAAACGGTAAACCCCTTTCTTTTGGACAAC
AAAGTCGTGCTTAGCACTTATCTGCTCCCTGAAGTCATGAATCTGTTCCCCTGTTGGGCC
GTGTATCACAAGATCTACACCATCCTCGTTAAAATGCCATTGAGAATCAGACTTGATGAC
GACGAAAGAGACGTGAAGGGTATCGCCTTCGTAATCAGCCTTGTGGGAGAAACATTCCTC
TCTGTCTATGACGAATCTAATCCCTAACGCTGCCTGGAAGCTCCATACGAGCCCTAATAT
TAGGATCGTAGCCTTCATGCTCATCTTGCAAAATCAGACGAAAAGGAGGAGTGATAGATA
GACGGGTGGAAATACGATCTGGGTCGATGAGAGATTGATCGGAGAAGAAGACGGTTTGGA
GAGAAAAGGAGCGAGTTCTTTCAGAATCGGACACGATGGAGAGCCTGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ49JQ U 1
AF RR2FH03JQ U 80
AF RR2GZ49TF C 250
BS 1 120 RR2GZ49JQ
BS 121 123 RR2FH03JQ
BS 124 170 RR2GZ49JQ
BS 171 171 RR2FH03JQ
BS 172 238 RR2GZ49JQ
BS 239 239 RR2FH03JQ
BS 240 601 RR2GZ49JQ
BS 602 658 RR2FH03JQ
BS 659 953 RR2GZ49TF

RD RR2GZ49JQ 601 0 0
AGAGAAGCTTTATGTTAATAATGTAAAAAAAGAGAACCGACTAAGTCGTAAACCATGAGT
GGATAATATTCTTGAACATGAGAAAACGCAAATCAGCCAGCGAACTACAGTTGTGTCTGT
***AAAAAAAAGAGCTAAGTAAATATTATATGGTAACTTAATGAGGCAAAGTACTATTTA
GACACGAGACATGCCGAGTTTGCGTTCAAACAAGCGACGCAAAAGGTAAACTTGGAGGGC
ACTTGCACCGATCAATGCAAACGACTCGAACAAAGCTTTGTGTACTGCTCTTTTGCTCAT
GTTCTCGTTCACGATAGCTTGACGATCGGTCTGAGCCTCTAACCAGTGTTGTTCAAACTG
GATGTTGTAAAGAGCCTCCTCTAACTTTGATATTTGCTCCATCAAGGGAGTGAAATGCTC
GTCCTTTGCGTGCTGGTCGTAGTATGCAAAGTGACCAAGCTGTACATCGAAGTCAATGGT
TTCATGATAAGGAGACTTGTTAGTGAAACAGAAACGGTAAACCCCTTTCTTTTGGACAAC
AAAGTCGTGCTTAGCACTTATCTGCTCCCTGAAGTCATGAATCTGTTCCCCTGTTGGGCC
G

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2FH03JQ 579 0 0
GAGAAAACGCAAATCATCCAGTGAACTACAGTTGTGTCTGTTAAAAAAAAAGGAGCTAAG
TAAATATTATATGGTAACTTAATGAGGCAAAATACTATTTAGACACGAGACATGCCGAGT
TTGCGTTCAAACAAGCGACGCAGAAGGTAAACTTGGAGGACACTTGCACCGATCAATGCA
AACGACTCGAACAAAGCTTTGTGTACTGCTCTTTTGCTCATGTTCTCGTTCACGATAGCT
TGACGATCGGTCTGAGCCTCTAACCAGTGTTGCTCGAACTGGATGTTGTAAAGAGCCTCC
TCTAACTTTGATATTTGCTCCATCAAGGGAGTGAAATGCTCGTCCTTTGCGTGCTGGTCG
TAGTATGCAAAGTGACCAAGCTGTACATCGAAGTCAATGGTTTCATGATAAGGAGACTTG
TTGGTGAAACAGAAACGGTAAACCCCTTTCTTCTGGACAACAAAGTCGTGCTTGGCACTT
ATCTGCTCCCTGAAGTCATGAATCTGTTCCCCTGTTGGGCCGTGTATCACAAGATCTACA
CCATCCTCGTTAAAATGCCATTGAGAATCAGACTTGATG

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2GZ49TF 704 0 0
GATCAATGCAAACGACTCGAACAAAGCTTTGTGTACTGCTCTTTTGCTCATGTTCTCGTT
CACGATAGCTTGACGATCGGTCTGAGCCTCTAACCAGTGTTGTTCAAACTGGATGTTGTA
AAGAGCCTCCTCTAACTTTGATATTTGCTCCATCAAGGGAGTGAAATGCTCGTCCTTTGC
GTGCTGGTCGTAGTATGCAAAGTGACCAAGCTGTACATCGAAGTCAATGGTTTCATGATA
AGGAGACTTGTTAGTGAAACAGAAACGGTAAACCCCTTTCTTTTGGACAACAAAGTCGTG
CTTAGCACTTATCTGCTCCCTGAAGTCATGAATCTGTTCCCCTGTTGGGCCGTGTATCAC
AAGATCTACACCATCCTCGTTAAAATGCCATTGAGAATCAGACTTGATGACGACGAAAGA
GACGTGAAGGGTATCGCCTTCGTAATCAGCCTTGTGGGAGAAACATTCCTCTCTGTCTAT
GACGAATCTAATCCCTAACGCTGCCTGGAAGCTCCATACGAGCCCTAATATTAGGATCGT
AGCCTTCATGCTCATCTTGCAAAATCAGACGAAAAGGAGGAGTGATAGATAGACGGGTGG
AAATACGATCTGGGTCGATGAGAGATTGATCGGAGAAGAAGACGGTTTGGAGAGAAAAGG
AGCGAGTTCTTTCAGAATCGGACACGATGGAGAGCCTGTTTTCC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 2 7

CO CL857Contig1 782 4 10 U
GGTTCAAAAGGGATAAAGAAAACGTAGTCAACTTGGAGATGTACATGAGTTTTGAGATCC
ATGTTTTACCAAGGTACTGTTTTGTTGGATCTCGTGTGATCAAGACAAAGCTTTAATGAT
TTTATGGCAGAGATTCATAAGAGAAGAAAGAGAAAGAAGTCTTCATCTGTAGAGAGAGAG
AGATTGTGTGATTCAGATGATCCAGCTGCTATCATCCTTCTTCAACGTTGATTCCTCTGA
CCAAGTTTGCTCTACACGTTCCCACACCAACCCTTCACCTTCCTTTGCTGTGAACTTGAC
AGTGGTTGTGCAGCCTCTGCGTCCATCCCCACTCTGTTCCCATTTGTCAAACTTTACAAT
CCATGTCCCATGAGTGGTCTCTGTTGCCAATACTTGATCTACCCAAACCCGAAACTTCTT
TCCTTGTTTGTCTCCATGGTACTTACGCAGCTCATCAATGGTATCCACCAGAGATTTCTC
AGCACCAGATGGATGAACAAACACACCTCCAGGGTGACATGAAGCTTTGAGGCTAGCTAT
GTACGCCTCGCTGTTCTCAACCTCACCACGTCTCCACCTCTCGTAGAACAAGAAAAACTT
CACAACCTCGTGACCAGGGTTGACATTATCCACCCTGCACTCCAAGAAGTCAGAGACATC
TCTCGGAGAAAGGTTTGGACCAAGCTTGAACTCACCAACGGCTTGTATAATCCCACCCGC
ACACCTCTCCTTCGCATGGATCACCTTCGGCTTGTCTTTAGCATTCTCAGCGTGTCACTT
CC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2DK35JQ U 4
AF RR2AW08JQ U 15
AF RR2FM29JQ U 1
AF RR2DK35TF C 81
BS 1 226 RR2FM29JQ
BS 227 227 RR2DK35JQ
BS 228 322 RR2FM29JQ
BS 323 323 RR2DK35JQ
BS 324 411 RR2FM29JQ
BS 412 412 RR2DK35JQ
BS 413 604 RR2FM29JQ
BS 605 605 RR2DK35TF
BS 606 696 RR2FM29JQ
BS 697 782 RR2DK35TF

RD RR2DK35JQ 431 0 0
TT
AAAAGGGATAAAGAAAACGTAGTCAACTTGGAGATGTACATGAGTTTTGAGATCCATGTT
TTACCAAGGTACTGTTTTGTTGGATCTCGTGTGATCAAGACAAAGCTTTAATGATTTTAT
GGCAGAAATTCATAAGAGAAGAAAGAGAAAGAAGTCTTCATCTGTAGAGAGAGAGAGATT
GTGTGATTCAGATGATCCAGCTGCTATCATCCTTCTTCAACGTTGATTCCTCTGACCAAG
TTTGCTCTACACGTTCCCACACCAACCCTTCACCTTCCTTTGCTGTGAACTTGACAGTGG
TTGTGCAGCCTCTGCGTCCATCCCCACTCTGTTCCCATTTGTCAAACTTTACAATCCATG
TCCCATGAGTGGTCTCTGTTGCCAATACTTGATCTACCCAAACCCGAAACTTCTTTCCTT
GTTTGTCTC

QA 3 431 3 431
DS 

RD RR2AW08JQ 470 0 0
AAAGAAAACGTAGTCAACTTGGAGATGTACATGAGTTTTGAGATCCATGTTTTACCAAGG
TACTGTTTTGTTGGATCTCGTGTGATCAAGACAAAGCTTTAATGATTTTATGGCAGAGAT
TCATAAGAGAAGAAAGAGAAAGAAGTCTTCATCTGTAGAGAGAGAGAGATTGTGTGATTC
AGATGATCCAGCTGCTATCATCCTTCTTCAACTTTGATTCCTCTGACCAAGTTTGCTCTA
CACGTTCCCACACCAACCCTTCACCTTTCTTTGCTGTGAACTTGACAGTGGTTGTGCAGC
CTCTGCGTTCATCCCCACTCTGTTCCCATTTGTCAAACTTTACAATCCATGTCCCATGAG
TGGTCTCTGTTGCCAATACTTGATCTACCCAAACCCGAAACTTCTTTCCTTGTTTGTCTC
CATGGTACTTACGCAGCTCATCAATGGTATCCACCAGAGATTTCTCAGCA

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR2FM29JQ 696 0 0
GGTTCAAAAGGGATAAAGAAAACGTAGTCAACTTGGAGATGTACATGAGTTTTGAGATCC
ATGTTTTACCAAGGTACTGTTTTGTTGGATCTCGTGTGATCAAGACAAAGCTTTAATGAT
TTTATGGCAGAGATTCATAAGAGAAGAAAGAGAAAGAAGTCTTCATCTGTAGAGAGAGAG
AGATTGTGTGATTCAGATGATCCAGCTGCTATCATCCTTCTTCAACTTTGATTCCTCTGA
CCAAGTTTGCTCTACACGTTCCCACACCAACCCTTCACCTTCCTTTGCTGTGAACTTGAC
AGTGGTTGTGCAGCCTCTGCGTTCATCCCCACTCTGTTCCCATTTGTCAAACTTTACAAT
CCATGTCCCATGAGTGGTCTCTGTTGCCAATACTTGATCTACCCAAACCCGGAACTTCTT
TCCTTGTTTGTCTCCATGGTACTTACGCAGCTCATCAATGGTATCCACCAGAGATTTCTC
AGCACCAGATGGATGAACAAACACACCTCCAGGGTGACATGAAGCTTTGAGGCTAGCTAT
GTACGCCTCGCTGTTCTCAACCTCACCACGTCTCCACCTCTCGTAGAACAAGAAAAACTT
CACAGCCTCGTGACCAGGGTTGACATTATCCACCCTGCACTCCAAGAAGTCAGAGACATC
TCTCGGAGAAAGGTTTGGACCAAGCTTGAACTCACC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2DK35TF 702 0 0
TTTGTTGGATCTCGTGTGATCAAGACAAAGCTTTAATGATTTTATGGCAGAGATTCATAA
GAGAAGAAAGAGAAAGAAGTCTTCATCTGTAGAGAGAGAGAGATTGTGTGATTCAGATGA
TCCAGCTGCTATCATCCTTCTTCAACGTTGATTCCTCTGACCAAGTTTGCTCTACACGTT
CCCACACCAACCCTTCACCTTCCTTTGCTGTGAACTTGACAGTGGTTGTGCAGCCTCTGC
GTCCATCCCCACTCTGTTCCCATTTGTCAAACTTTACAATCCATGTCCCATGAGTGGTCT
CTGTTGCCAATACTTGATCTACCCAAACCCGAAACTTCTTTCCTTGTTTGTCTCCATGGT
ACTTACGCAGCTCATCAATGGCATCCACCAGAGATTTCTCAGCACCAGATGGATGAACAA
ACACACCTCCAGGGTGACATGAAGCTTTGAGGCTAGCTATGTACGCCTCGCTGTTCTCAA
CCTCACCACGTCTCCACCTCTCGTAGAACAAGAAAAACTTCACAACCTCGTGACCAGGGT
TGACATTATCCACCCTGCACTCCAAGAAGTCAGAGACATCTCTCGGAGAAAGGTTTGGAC
CAAGCTTGAACTCACCAACGGCTTGTATAATCCCACCCGCACACCTCTCCTTCGCATGGA
TCACCTTCGGCTTGTCTTTAGCATTCTCAGCGTGTCACTTCC

QA 1 702 1 702
DS 



CO CL857Contig2 1038 3 19 U
GGGAACACGCTTACCGCCGCGACTCTCTTCTCGTCTTCTCTACCGGAAGATCACCCACCC
TTTACAAAGAGTTAAGAAAGGAGAAGCCTTTGCTGACCCCTGACATCACCATCATGTCTG
TTGGCACTGAGATTACTTATGGTAACTCCATGGTTCCTGATCACGGTTGGGTTGATACTT
TGAACAACAAATGGGACTTGAATGTTGTCAAAGAAGAGACCAGCAACTTCTCTGAGTTAA
CTCTTCAGGCGGAAACTGAGCAGAGGCCACACAAGGTTAGCTTTTACGTTGACAAGAGTA
AGGCTCAGGATGTGACTAAGGAGCTCTCACTGCGGTTGGAGAAACGTGGGTTGGATGTGA
AAATAATCTACAGTGGAGGCATGGATCTGGATATCTTACCTCAAGGTGCTGGAAAGGGAC
AAGCGCTTGCTTATCTCCTCAAGAAGCTCAAGAGCGAAGGGAAACTCCCTGTGAACACTC
TCGCTTGCGGTGACTCCGGGAACGATGCTGAACTCTTTAGCATCCCTGACGTTTACGGCG
TCATGGTAAGCAATGCTCAGGAGGAGCTGTTGAAGTGGCACGCTGAGAATGCTAAAGACA
ACCCGAAGGTGATCCATGCGAAGGAGAGGTGTGCGGGTGGGATTATACAAGCCGTTGGTG
AGTTCAAGCTTGGTCCAAACCTTTCTCCCAGAGATGTCTCTGACTTCTTGGAGTGCAAGG
TGGATAATGTCAACCCTGGTCACGAGGTTGTGAAGTTTTTCTTGTTTGTTCATCCATCTG
GTGCTGAGAAATCTCTGGTGGATACCATTGATGAGCTGCGTAAGTACCATGGAGACAAAC
AAGGAAAGAAGTTTCGGGTTTGGGTAGATCAAGTATTGGCAACAGAGACCACTCATGGGA
CATGGATTGTAAAGTTTGACAAATGGGAACAGAGTGGGGATGAACGCAGAGGCTGCACAA
CCACTGTCAAGTTCACAGCAAAGGAAGGTGAAGGGTGGTGTGGGAACGTGTAGAGCAAAC
TTGGTCAGAGGAATCAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM29TF U 1
AF RR2EV67TF U 22
AF RR2FG38TF U 307
BS 1 163 RR2FM29TF
BS 164 164 RR2EV67TF
BS 165 221 RR2FM29TF
BS 222 222 RR2EV67TF
BS 223 223 RR2FM29TF
BS 224 224 RR2EV67TF
BS 225 259 RR2FM29TF
BS 260 260 RR2EV67TF
BS 261 537 RR2FM29TF
BS 538 538 RR2EV67TF
BS 539 556 RR2FM29TF
BS 557 634 RR2EV67TF
BS 635 635 RR2FG38TF
BS 636 697 RR2EV67TF
BS 698 698 RR2FG38TF
BS 699 719 RR2EV67TF
BS 720 720 RR2FG38TF
BS 721 742 RR2EV67TF
BS 743 1038 RR2FG38TF

RD RR2FM29TF 556 0 0
GGGAACACGCTTACCGCCGCGACTCTCTTCTCGTCTTCTCTACCGGAAGATCACCCACCC
TTTACAAAGAGTTAAGAAAGGAGAAGCCTTTGCTGACCCCTGACATCACCATCATGTCTG
TTGGCACTGAGATTACTTATGGTAACTCCATGGTTCCTGATCATGGTTGGGTTGATACTT
TGAACAACAAATGGGACTTGAATGTTGTCAAAGAAGAGACCGGGAACTTCTCTGAGTTAA
CTCTTCAGGCGGAAACTGATCAGAGGCCACACAAGGTTAGCTTTTACGTTGACAAGAGTA
AGGCTCAGGATGTGACTAAGGAGCTCTCACTGCGGTTGGAGAAACGTGGGTTGGATGTGA
AAATAATCTACAGTGGAGGCATGGATCTGGATATCTTACCTCAAGGTGCTGGAAAGGGAC
AAGCGCTTGCTTATCTCCTCAAGAAGCTCAAGAGCGAAGGGAAACTCCCTGTGAACACTC
TCGCTTGCGGTGACTCCGGGAACGATGCTGAACTCTTTAGCATCCCTGACGTTTACG*CG
TCATGGTAAGCAATGC

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2EV67TF 736 0 0
G
CTCTCTTCTCGTCTTCTCTACCGGAAGATCACCCACCCTTTACAAAGAGTTAAGAAAGGA
GAAGCCTTTGCTGACCCCTGACGTTACCATCATGTCTGTTGGCACTGAGATTACTTATGG
TAACTCCATGGTTCCTGATCACGGTTGGGTTGATACTTTGAATCACAAATGGGACTTGAA
TGTTGTCAAAGAAGAGACCAGCAACTTCTCTGAGTTAACTCTTCAGGCGGAAACTGAGCA
GAGGCCACACAAGGTTAGCTTTTACGTTGACAAGAGTAAGGCTCAGGATGTGACTAAGGA
GCTCTCACTGCGGTTGGAGAAACGTGGGTTGGATGTGAAAATAATCTACAGTGGAGGCAT
GGATCTGGATATCTTACCTCAAGGTGCTGGAAAGGGACAAGCGCTTGCTTATCTCCTCAA
GAAGCTCAAGAGCCAAGGGAAACTCCCTGTGAACACTCTCGCTTGTGGTGACTCCGGGAA
CGATGCTGAGCTCTTTAGCATCCCTGACGTTTACGGCGTCATGGTAAGCAATGCTCAGGA
GGAGCTGTTGAAGTGGCACGCTGAGAATGCTAAAGACAACCCGAAGGTGATCCATGCGAA
GGAGAGGTGTGCTGGTGGGATTATACAAGCCGTTGGTGAGTTCAAGCTTGGTCCAAACCT
TTCTCCCAGAGATGTTTCTGACTTCTTGGAGTGCAAG*TGGATAATGTCAACCCTGGTCA
TGAGTTGTGAAGTTT

QA 2 721 2 721
DS 

RD RR2FG38TF 732 0 0
G
GGATGTGACTAAGGAGCTCTCACTGCGGTTGGAGAAACGTGGGTTGGATGTGAAAATAAT
CTACAGTGGAGGCATGGATCTGGATATCTTACCTCAAGGTGCTGGAAAGGGACAAGCGCT
TGCTTATCTCCTCAAGAAGCTCAAGAGCGAAGGGAAACTCCCTGTGAACACTCTCGCTTG
CGGTGACTCCGGGAACGATGCTGAACCCTTTAGCATCCCTGACGTTTACGGCGTCATGGT
AAGCAATGCTCAGGAGGAGCTGTTGAAGTGGCACGCTGAGAATGCTAAAGACAAGCCGAA
GGTGATCCATGCGAAGGAGAGGTGTGCGGGTGGGATTATACAAGCCGTTGGTGAGTTCAA
GCTTGGTCCAAACCTTTCTCCGAGAGATGTCTCTGGCTTCTTGGAGTGCAGGGTGGATAA
TGTCAACCCTGGTCACGAGGTTGTGAAGTTTTTCTTGTTTGTTCATCCATCTGGTGCTGA
GAAATCTCTGGTGGATACCATTGATGAGCTGCGTAAGTACCATGGAGACAAACAAGGAAA
GAAGTTTCGGGTTTGGGTAGATCAAGTATTGGCAACAGAGACCACTCATGGGACATGGAT
TGTAAAGTTTGACAAATGGGAACAGAGTGGGGATGAACGCAGAGGCTGCACAACCACTGT
CAAGTTCACAGCAAAGGAAGGTGAAGGGTGGTGTGGGAACGTGTAGAGCAAACTTGGTCA
GAGGAATCAAA

QA 2 732 2 732
DS 



AS 1 6

CO CL858Contig1 1078 6 29 U
ATACACGACCAAGGGAAATACAGATTGAATAAAAGACTTGTTTCTTGCACACGCAGCGAC
ATTCTTCTCACGGTAATGAGAGAAGAGAAGGCACAAAAGAGAGAAACAATACAAAATATA
TTAATAATAACAACCACTCTCTCATAGAGGAGAGGCAGAAAGAAGGAGAGGTACACATTT
TCATTGCTTATATATCAAATCCATTCATCGTCACATTGGTGGAGGTGGGGGATCAGATTT
AGAGGTACTTAACCAGCAGCCAAATGACAAGAGCAAGACCAACGATTCCAAGCACTGACA
ATAGCATTGACATGCACGAGCAACCTCCTTTCATATTCTTGTTCATCACCGCTAGGCTCT
TCTGCACCCGCCGTAAGCGGGAGTCAGTAACATCCACGTGGTAGTCTAAGTCTTCGATAA
GCCTTGTCTGAAGAGTGAGCTCTTCATTGACAGCGAGAGCAATGTGTTTGGTACTCATGA
CTGTTTCCTCCAACTTCTCCAGCCCTTCGTCTTGTTCTCTCATAACTTGTCTTTGAAATC
CAACAATGCCTTGGTTGTCCATGCCAGAGACTCTGTTCATTGCATCATCAGGCTTTGTAT
CTGGCCCAAGCAAGCTGTCTCTATTCGCAAAGTTTGACATGTTCAAAGCAGACGCCACCT
GATTTGCCTTTGATCTCAAGTTCCCAACCATATCCTTGCGACGATTCACCTCCTTCTCTG
ACACATGTTGCTTCCCAACAAGAAGAGATTGAAGAGTGTCTAATCGAGTCCCCAAAATGG
TGATCTTTCTTCGAATAGCAGAAGCACGACGCTGAGCATCAGGCCCCGTTACACCAGACG
AGTTCCTTTCAGACATCATGCCATTAATATCCTCAGAAAGCTTTAAAGCCTCATTGTACT
CTCTCATCCATGCATCAGAAGAAGACCCCATTTTGACCCTCCTTGCACTACGACGATCAA
ACCCCTTTTTTAATTGATTTTCAAAAGACAAAATCGAGGTGCTGAATTTGCAAGGCGCTG
ACGGAATGGAATCACCACGGGGCCGTCGTCGAAAAGGAAAATTATCACGCGACCGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 35 35 35 30 30 10 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2FW76JQ U 1
AF RR2FN55JQ U 272
AF RR2A345JQ U 68
AF RR2FN55TF C 513
AF RR2EB95TF C 429
AF RR2DE36TF C 554
BS 1 103 RR2FW76JQ
BS 104 104 RR2A345JQ
BS 105 271 RR2FW76JQ
BS 272 272 RR2A345JQ
BS 273 560 RR2FW76JQ
BS 561 561 RR2A345JQ
BS 562 566 RR2FW76JQ
BS 567 568 RR2A345JQ
BS 569 569 RR2EB95TF
BS 570 649 RR2A345JQ
BS 650 650 RR2FN55TF
BS 651 664 RR2EB95TF
BS 665 665 RR2FN55TF
BS 666 745 RR2EB95TF
BS 746 746 RR2DE36TF
BS 747 793 RR2EB95TF
BS 794 794 RR2DE36TF
BS 795 865 RR2EB95TF
BS 866 866 RR2DE36TF
BS 867 892 RR2EB95TF
BS 893 893 RR2DE36TF
BS 894 1030 RR2EB95TF
BS 1031 1031 RR2DE36TF
BS 1032 1040 RR2EB95TF
BS 1041 1042 RR2DE36TF
BS 1043 1053 RR2EB95TF
BS 1054 1054 RR2DE36TF
BS 1055 1074 RR2EB95TF
BS 1075 1078 RR2DE36TF

RD RR2FW76JQ 566 0 0
ATACACGACCAAGGGAAATACAGATTGAATAAAAGACTTGTTTCTTGCACACGCAGCGAC
ATTCTTCTCACGGTAATGAGAGAAGAGAAGGCACAAAAGAGAGGAACAATACAAAATATA
TTAATAATAACAACCACTCTCTCATAGAGGAGAGGCAGAAAGAAGGAGAGGTACACATTT
TCATTGCTTATATATCAAATCCATTCATCGTCACATTGGTGGAGGTGGGGGATCAGATTT
AGAGGTACTTAACCAGCAGCCAAATGACAAGGGCAAGACCAACGATTCCAAGCACTGACA
ATAGCATTGACATGCACGAGCAACCTCCTTTCATATTCTTGTTCATCACCGCTAGGCTCT
TCTGCACCCGCCGTAAGCGGGAGTCAGTAACATCCACGTGGTAGTCTAAGTCTTCGATAA
GCCTTGTCTGAAGAGTGAGCTCTTCATTGACAGCGAGAGCAATGTGTTTGGTACTCATGA
CTGTTTCCTCCAACTTCTCCAGCCCTTCGTCTTGTTCTCTCATAACTTGTCTTTGAAATC
CAACAATGCCTTGGTTGTCCGTGCCA

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2FN55JQ 292 0 0
A
GCAAGACCAACGATTCCAAGCACTGACAATAGCATTGACATGCACGAACAACCTCCTTTC
ATATTCTTGTTCATCACCGCTAGGCTCTTCTGCACCCGCCGTAAGCGGGAGTCAGTAACA
TCCACGTGGTAGTCTAAGTCTTCGATAAGCCTTGTCTGAAGAGTGAGCTCTTCATTGACA
GCGAGAGCAATGTGTTTGGTACTCATGACTGTTTCCTCCAACTTCTCCAGCCCTTCATCT
TGTTCTCTCATAACTTGTCTTTGAAATCCAACAATGCCTTGGTTGTCCATG

QA 2 292 2 292
DS 

RD RR2A345JQ 582 0 0
TCACGGTAATGAGAGAAGAGAAGGCACAAAAGAGAGAAACAATACAAAATATATTAATAA
TAACAACCACTCTCTCATAGAGGAGAGGCAGAAAGAAGGAGAGGTACACATTTTCATTGC
TTATATATCAAATCCATTCATCGTCACATTGGTGGAGGTGGGGGATTAGATTTAGAGGTA
CTTAACCAGCAGCCAAATGACAAGAGCAAGACCAACGATTCCAAGCACTGACAATAGCAT
TGACATGCACGAGCAACCTCCTTTCATATTCTTGTTCATCACCGCTAGGCTCTTCTGCAC
CCGCCGTAAGCGGGAGTCAGTAACATCCACGTGGTAGTCTAAGTCTTCGATAAGCCTTGT
CTGAAGAGTGAGCTCTTCATTGACAGCGAGAGCAATGTGTTTGGTACTCATGACTGTTTC
CTCCAACTTCTCCAGCCCTTCGTCTTGTTCTCCCATAACTTGTCTTTGAAATCCAACAAT
GCCTTGGTTGTCCATGCCAGAAACTCTGTTCATTGCATCATCAGGCTTTGTATCTGGCCC
AAGCAAGCTGTCTCTATTCGCAAAGTTTGACATGTTCAAAGC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2FN55TF 184 0 0
TGTTCTCTCATAAGTTGTCTTTGAAATCCAACAATGCTTTGGTTGTCCATGCCAGAGACT
CTATTCATTGCATCATCAGGCTTTGTATTTGGCCCAAGCAAGCTGTCTCTATTCGCAAAG
TTTGACATGTTCAAAGCAGACGCCACCTGATTTGCCTTTGATCTCAAGTTCCCAACCATA
TCCT

QA 1 184 1 184
DS 

RD RR2EB95TF 650 0 0
TGC
AGAGTGAGCTCTTCATTGACAGCGAGAGCAATGTGTTTGGTACTCATGACTGTTTCCTCC
AACTTCTCCAGCC*TTCGTCTTGTTCTCTCATTACTTGTCTTTGAAATCCAACAATGCCT
TGGTTGTCCATGCCAGAGACTCTGTTCATTGCATCATCAGGCTTTGTATCTGGCCCAAGT
AAGCTGTCTCTATTCGCAAAGTTTGACATGTTCAAAGCCGACGCCACCTGATTCGCCTTT
GATCTCAAGTTCCCAACCATATCCTTGCGACGATTCACCTCCTTCTCTGACACATGTTGC
TTCCCAACAAGAAGGGATTGAAGAGTGTCTAATCGAGTCCCCAAAATGGTGATCTTTCTT
CGTATAGCAGAAGCACGACGCTGAGCATCAGGCCCCGTTACACCAGACGAGTTCCTTTCA
GACATCATGCCATTGATATCCTCAGAAAGCTTTAAAGCCTCGTTGTACTCTCTCATCCAT
GCATCAGAAGAAGACCCCATTTTGACCCTCCTTGCACTACGACGATCAAACCCCTTTTTT
AATTGATTTTCAAAAGACAAAATCGAGGTGCTGAATTTGCAAGGCGCTGACGGAATGGAG
TCACCACGG**CCGTCGTCGAAGAGGAAAATTATCACGCGACC
GCCC

QA 4 646 4 646
DS 

RD RR2DE36TF 525 0 0
GTTGTCCATGCCAGAGACTCTGTTCATTGCATCATCAGGCTTTGTATCTGGCCCAAGCAA
GCTGTCTCTATTCGCAAAGTTTGACATGTTCAAAGCAGACACCACCTGATTTGCCTTTGA
TCTCAAGTTCCCAACCATATCCTTGCGACGATTCACCTCCTTCTCTGACACATGTTGCTT
CCCAACAAGAAGAGATTGAAGAGTGTCTAATCGAGTCCCCAAAATGGTGATCTTTCTTCG
AATAGCTGAAGCACGACGCTGAGCATCAGGCCCCGTTACACCAGACGAGTTCCTTTCAGA
CATCATGCCATTAATATCCTCAGAGAGCTTTAAAGCCTCATTGTACTCTCTCATCCATGC
ATCAGAAGAAGACCCCATTTTGACCCTCTTTGCACTACGACGATCAAACCC*TTTTTTAA
TTGATTTTCAAAAGACAAAATCGCGGTGCTGAATTTGCAAGGCTCTGACGGGATGGAATC
ACCACGGGGCCGTCGTCGAAAAGGAAAATTATCACGCGACCGCCC

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 7

CO CL859Contig1 947 7 9 U
TTTTTCTCTCTTCTTCACATAGTACAAAGAAACAGAAAAGAAGAAAAACTCTTTAGAGAT
CAAAAGATGAACATCGCTCACACCATCTTCGGCGTTTTCGGAAATGCAACTGCTCTGTTT
CTCTTCTTGGCTCCTTCGATAACATTCAAGAGAATCATCAAGAGCAAATCGACTGAACAG
TTCTCTGGCATCCCTTACCCTATGACTCTCCTCAACTGCCTCCTCTCCGCCTGGTACGGA
CTTCCCTTTGTGTCCAAAGACAACACGCTCGTGAGCACGATCAACGGAACAGGAGCAGTG
ATCGAGACAATCTACGTGCTGATCTTCCTTATCTACGCACCAAAGAAGGAGAAAGCTAAG
ATCTTTGGCATCTTCACCGCCGTCTTGGCCGTGTTCGCGACGGTGGCTCTCGTCTCTCTC
TTTGCCCTCCATGGTAACGCTAGAAAACTCTTTTGTGGTATTGCGGCCACAGTTTTCTCC
ATCATCATGTACGCTTCTCCACTCTCAATCATGAGGTTGGTGATAAAGACGAAGAGCGTA
GAGTACATGCCCTTCTTTCTCTCACTCTTTGTATTCCTCTGTGGAACTTCTTGGTTCATC
TATGGTCTTATCGGTCGTGACCCTTTTGTTGCAATCCCAAATGGGTTTGGATGTGCTTTA
GGAACACTGCAGCTGATTCTCTACTTCATCTACTGCGGAAACAAAGGCGACAAATCTGCT
GAAAAGGATGACAAGTCACTGGAGATGAGAGGTGAGGAGAAGAAGCAACATGTCGTTAAT
GAAAAGCAGCAAGAGCAGCAAGTTTAGATCTTTCAGTGATTTGTTTGTTTTCTCTGTATT
TCGTGTTTAACTCTTCTTGATTAGAGCAGAGATTAAAAATCTATGCTGAACAAAATGTAA
GATTCTTAGTGTCTTCCTAGTGATGAAACGAGTGATTAAAGAAGACT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D891TF U 1
AF RR2AL49JQ C 367
AF RR2AL49TF U 6
AF RR2AY30TFB U 6
AF RR2BF57TF U 6
AF RR2AY30JQ C 204
AF RR2D891JQ C 215
BS 1 633 RR2D891TF
BS 634 634 RR2AL49TF
BS 635 661 RR2D891TF
BS 662 662 RR2BF57TF
BS 663 696 RR2D891TF
BS 697 697 RR2AL49TF
BS 698 705 RR2D891TF
BS 706 751 RR2AL49TF
BS 752 947 RR2AY30JQ

RD RR2D891TF 706 0 0
TTTTTCTCTCTTCTTCACATAGTACAAAGAAACAGAAAAGAAGAAAAACTCTTTAGAGAT
CAAAAGATGAACATCGCTCACACCATCTTCGGCGTTTTCGGAAATGCAACTGCTCTGTTT
CTCTTCTTGGCTCCTTCGATAACATTCAAGAGAATCATCAAGAGCAAATCGACTGAACAG
TTCTCTGGCATCCCTTACCCTATGACTCTCCTCAACTGCCTCCTCTCCGCCTGGTACGGA
CTTCCCTTTGTGTCCAAAGACAACACGCTCGTGAGCACGATCAACGGAACAGGAGCAGTG
ATCGAGACAATCTACGTGCTGATCTTCCTTATCTACGCACCAAAGAAGGAGAAAGCTAAG
ATCTTTGGCATCTTCACCGCCGTCTTGGCCGTGTTCGCGACGGTGGCTCTCGTCTCTCTC
TTTGCCCTCCATGGTAACGCTAGAAAACTCTTTTGTGGTATTGCGGCCACAGTTTTCTCC
ATCATCATGTACGCTTCTCCACTCTCAATCATGAGGTTGGTGATAAAGACGAAGAGCGTA
GAGTACATGCCCTTCTTTCTCTCACTCTTTGTATTCCTCTGTGGAACTTCTTGGTTCATC
TATGGTCTTATCGGTCGTGACCCTTTTGTTGCA*TCCCAAATGGGTTTGGATGTGCTTTA
G*AACACTGCAGCTGATTCTCTACTTCATCTACTGCTGAAACAAA
T

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2AL49JQ 320 0 0
GGCATCTTCACCGCCGTCTTGGCCGTGTTCGCGACGGTGGCTCTCGTCTCTCTCTTTGCC
CTCCATGGTAACGCTAGAAAACTCTTTTGTGGTATTGCGGCCACAGTTTTCTCCATCATC
ATGTACGCTTCTCCACTCTCAATCATGAGGTTGGTGATAAAGACGAAGAGGGTAGAGTAC
ATGCCCTTCTTTTTTTCACTCTTTGTATTCCTCTGGGGAACTTCTTGGTTCATCTATGGT
CTTATCGGTCGTGACCCTTTTGTTGCAATCCCAAATGGGTTTGGATGTGCTTTAGGAACA
CTGCAGCTGATTCTCTACTT

QA 1 320 1 320
DS 

RD RR2AL49TF 755 0 0
CTCTCTTCTTCACATAGTACAAAGAAACAGAAAAGAAGAAAAACTCTTTAGAGATCAAAA
GATGAACATCGCTCACACCATCTTCGGCGTTTTCGGAAATGCAACTGCTCTGTTTCTCTT
CTTGGCTCCTTCGA***CATTCAAGAGAATCATCAAGAGCAAATCGACTGAACAGTTCTC
TGGCATCCCTTACCCTATGACTCTCCTCAACTGCCTCCTCTCCGCCTGGTACGGGCTTCC
CTTTGTGTCCAAAGACAACACGCTCGTGAGCACGATCAAGGGAACAGGAGCAGTGATCGA
GACAATCTACGTGCTGATCTTCCTTATCTACGCACCAAAGAAGGAGAAAGCTAAGATCTT
TGGCATCTTCACCGCCGTCTTGGCCGTGTTCGCGACGGTGGCTCTCGTCTCTCTCTTTGC
CCTCCATGGTAACGCTAGAAAACTCTTTTGTGGTATTGCGGCCACAGTTTTCTCCATCAT
CATGTACGCTTCTCCACTCTCAATCATGAGGTTGGTGATAAAGACGAAGAGCGTAGAGTA
CATGCCCTTCTTTCTCTCACTCTTTGTATTCCTCTGTGGAACTTCTTGGTTCATCTATGG
TCTTATCGGTCGTGACCCTTTTGTTGCAATCCCAAATGGGTTTGGATGTGCTTTAG*AAC
ACTGCAGCTGATTCTCTACTTCATCTACTGCGGAAACAAAGGCGACAAATCTGCTGAAAA
GGATGACAAGTCACTGGAGATGAGAG
TGAGGAGAG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2AY30TFB 724 0 0
CTCTCTTCTTCACATAGTACAAAGAAACAGAAAAGAAGAAAAACTCTTTAGAGATCAAAA
GATGAACATCGCTCACACCATCTTCGGCGTTTTCGGAAATGCAACTGCTCTGTTTCTCTT
CTTGGCTCCTTCGATAACATTCAAGAGAATCATCAAGAGCAAATCGACTGAACAGTTCTC
TGGCATCCCTTACCCTATGACTCTCCTCAACTGCCTCCTCTCCGCCTGGTACGGACTTCC
CTTTGTGTCCAAAGACAACACGCTCGTGAGCACGATCAACGGAACAGGAGCAGTGATCGA
GACGATCTACGTGCTGATCTTCCTTATCTACGCACCAAAGAAGGAGAAAGCTAAGATCTT
TGGCATCTTCACCGCCGTCTTGGCCGTGTTCGCGACGGTGGCTCTCGTCTCTCTCTTTGC
CCTCCATGGTAACGCTAGAAAACTCTTTTGTGGTATTGCGGCCACAGTTTTCTCCATCAT
CATGTACGCTTCTCCACTCTCAATCATGAGGTTGGTGATAAAGACGAAGAGCGTAGAGTA
CATGCCCTTCTTTCTCTCACTCTTTGTATTCCTCTGTGGAACTTCTTGGTTCATCTATGG
TCTTATCGGTCGTGACCCTTTTGTTGCAATCCCAAATGGGTTTGGATGTGCTTTAG*AAC
ACTGCAGCTGATTCTCTACTTCATCTACTGCGGAAACAAAGGCGACAAACCTGCTGAAAA
GGAT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2BF57TF 756 0 0
CTCTCTTCTTCACATAGTACAAAGAAACAGAAAAGAAGAAAAACTCTTTAGAGATCAAAA
GATGAACATCGCTCACACCATCTTCGGCGTTTTCGGAAATGCAACTGCTCTGTTTCTCTT
CTTGGCTCCTTCGATAACATTCAAGAGAATCATCAAGAGCAAATCGACTGAACAGTTCTC
TGGCATCCCTTACCCTT**ACTCTCCTCAACTGCCTCCTCTCCGCCTGGTACGGACTTCC
CTTTGTGTCCAAAGACAACACGCTCGTGAGCACGATCAACGGAACAGGAGCAGTGATCGA
GACAATCTACGTGCTGATCTTCCTTATCTACGCACCAAAGAAGGAGAAAGCTAAGATCTT
TGGCATCTTCACCGCCGTCTTGGCCGTGTTCGCGACGGTGGCTCTC***TCTCTCTTTGC
CCTCCATGGTAACGCTAGAAAACTCTTTTGTGGTATTGCGGCCACAGTTTTCTCCATCAT
CATGTACGCTTCTCCACTCTCAATCATGAGGTTGGTGATAAAGACGAAGAGCGTAGAGTA
CATGCCCTTCTTTCTCTCACTCTTTGTATTCCTCTGTGGAACTTCTTGGTTCATCTATGG
TCTTATCGGTCGTGACCCTTTTGTTGCAATCCCAAATGGGTTTGGATGTGCTTTAGGAAC
ACTGCAGCTGATTCTCTACTTCATCTACTGCGGAAACAAAGGCGACAAATCTGCTGAAAA
GGATGACA*GTCACTGGAGATGAGAG
TGAGGAGAGA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2AY30JQ 744 0 0
GACTCTCCTCAACTGCCTCCTCTCCGCCTGGTACGGACTTCCCTTTGTGTCCAAAGACAA
CACGCTCGTGAGCACGATCAACGGAACAGGAGCAGTGATCGAGACGATCTACGTGCTGAT
CTTCCTTATCTACGCACCAAAGAAGGAGAAAGCTAAGATCTTTGGCATCTTCACCGCCGT
CTTGGCCGTGTTCGCGACGGTGGCTCTCGTCTCTCTCTTTGCCCTCCATGGTAACGCTAG
AAAACTCTTTTGTGGTATTGCGGCCACAGTTTTCTCCATCATCATGTACGCTTCTCCACT
CTCAATCATGAGGTTGGTGATAAAGACGAAGAGCGTAGAGTACATGCCCTTCTTTCTCTC
ACTCTTTGTATTCCTCTGTGGAACTTCTTGGTTCATCTATGGTCTTATCGGTCGTGACCC
TTTTGTTGCAATCCCAAATGGGTTTGGATGTGCTTTAGGAACACTGCAGCTGATTCTCTA
CTTCATCTACTGCGGAAACAAAGGCGACAAACCTGCTGAAAAGGATGACAAGTCACTGGA
GATGAGAGGTGAGGAGAAGAAGCAACATGTCGTTAATGAAAAGCAGCAAGAGCAGCAAGT
TTAGATCTTTCAGTGATTTGTTTGTTTTCTCTGTATTTCGTGTTTAACTCTTCTTGATTA
GAGCAGAGATTAAAAATCTATGCTGAACAAAATGTAAGATTCTTAGTGTCTTCCTAGTGA
TGAAACGAGTGATTAAAGAAGACT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2D891JQ 723 0 0
ACTGCCTCCTCTCCGCCTGGTACGGACTTCCCTTTGTGTCCAAAGACAACACGCTCGTGA
GCACGATCAACGGAACAGGAGCAGTGATCGAGACAATCTACGTGCTGATCTTCCTTATCT
ACGCACCAAAGAAGGAGAAAGCTAAGATCTTTGGCATCTTCACCGCCGTCTTGGCCGTGT
TCGCGACGGTGGCTCTCGTCTCTCTCTTTGCCCTCCATGGTAACGCTAGAAAACTCTTTT
GTGGTATTGCGGCCACAGTTTTCTCCATCATCATGTACGCTTCTCCACTCTCAATCATGA
GGTTGGTGATAAAGACGAAGAGCGTAGAGTACATGCCCTTCTTTCTCTCACTCTTTGTAT
TCCTCTGTGGAACTTCTTGGTTCATCTATGGTCTTATCGGTCGTGACCCTTTTGTTGCAA
TCCCAAATGGGTTTGGATGTGCTTTAGGAACACTGCAGCTGATTCTTTACTTCATCTACT
GCTGAAACAAAGGCGACAAATCTGCTGAAAAGGATGACAAGTCACTGGAGATGAGAGGTG
AGGAGAAGAAGCAACATGTTGTTAATGGAAAGCAGCAAGAGCAGCAAGTTTAGATCTTTC
AGTGATTTGTTTGTTTTCTCTGTATTTCGTGTTTAACTCTTCTTGATTAGAGCAGAGATT
AAAAATCTATGCTGAACAAAATGTAAGATTCTTAGTGTCTTCCTAGTGATGAAACGAGTG
ATT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 2 6

CO CL860Contig1 851 4 8 U
CGACGCATTAACGTTCTTCTCGCAATGATTGCAAACGTTT*GTTTCTTAGTTGCTACAAT
TCAAGAAAACAAAGGAGACGATATTATTTTTTTCAATCCTGGTTCGTAAAAGGAGGATAA
CGATATGATGAATGATGATTACAAGAATCTTATTCATTTGTAAAGCTGCTTGAATCTCCG
ACACGCCTCCAAGGTGTTCTCTCTGTGACCAAAGGCGCTAACACGAACAAACCCTTCACC
TCCTGGTCCAAACCCACTCCCTGGAGTTGTAACCACATGAGTCTTCTCCAGAATCTCAGC
AAACACATCCCACGAGCTTTGGTTTGGGAAGTGAACCCAAACGTAAGGCGCGTTCTTCCC
TCCGTATACATCATAGCCAAGAGAAGTGAACGTGTCGATGATTATGTTTGTGTTTTCTTT
GTAGAACCCAACCACCTTCTGCATCGCCTCTAGTCCTTCTGGTGTTAGGCAAGCAAGAGC
ACCGGCTTGAGAGATATTAGATGCACCGTTGAAACAAGTGCAGACGATTCGGTTGAAGTC
TTTTGCAACAGGGAAGCCGTCTGAATAGAGAAGCTGTTTGGGGATGACTGTCCAACCAAG
TCTAACTCCAGTGAAACCGGCGTATTTGCTGAAGGAAGCTGTCTCCATAGCGACCTCCTC
TGCTCCAGGGATTTCGAAAATAGAGCGTGGGTTATCATCAGACATGTACATTGCATAAGC
TGAATCATACACTATGATTGATCCATTCTTCTTTGCAAACTGTACTAACTGAGTCAGTTG
CTCCCTCGTGGCAGCAGCACCGGTAGGGTTATTTGGGGGAGCAGAAGAAGATTATGTCCG
TCCTGCCGACA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS30JQ U 1
AF RR2BS30TF C 23
AF RR2B082JQ U 1
AF RR2GK40JQ U 19
BS 1 193 RR2B082JQ
BS 194 194 RR2BS30JQ
BS 195 423 RR2B082JQ
BS 424 424 RR2BS30JQ
BS 425 477 RR2B082JQ
BS 478 478 RR2BS30JQ
BS 479 787 RR2B082JQ
BS 788 851 RR2GK40JQ

RD RR2BS30JQ 665 0 0
CGG
CGCATTAACGTTCTTCTCGCAATGATTGCAAACGTTT*GTTTCTTAGTTGCTACAATTCA
AGAAAACAAAGGAGACGATATTATTTTTTTCAATCCTGGTTCGTAAAAGGAGGATAACGA
TATGATGAATGATGATTACAAGAATCTTATTCATTTGTAAAGCTGCTTGAATCTCCGACA
CGCCTCCAAGGTGTTCTCTCTGTGACCAAAGGCGCTAACACGAACAAACCCTTCACCTCC
TGGTCCAAACCCACTCCCTGGAGTTGTAACCACATGAGTCTTCTCCAGAATCTCAGCAAA
CACATCCCACGAGCTTTGGTTTGGGAAGTGAACCCAAACGTAAGGCGCGTTCTTCCCTCC
GTATACATCATAGCCAAGAGAAGTGAACGTGTCGATGATTATGTTTGTGTTTTCTTTGTA
GAACCCAACCACCTTCTGCATCGCCTCTAGTCCTTCTGGTGTTAGGCAAGCAAGAGCACC
GGCTTGAGAGATATTAGATGCACCGTTGAAACAAGTGCAGACGATTCGGTTGAAGTCTTT
TGCAACAGGGAAGCCGTCTGAATAGAGAAGCTGTTTGGGGATGACTGTCCAACCAAGTCT
AACTCCAGTGAAACCGGCGTATTTGCTGAAGGA*GCTGTCTCCATAGCGACCTCCTCTGC
TC

QA 4 665 4 665
DS 

RD RR2BS30TF 752 0 0
CAATGATTGCAAACGTT**GTTTCTTAGT*GCTACAAT*CAAGAAAACAAAGGAGACGAT
ATTATTTTTT*CAATCCTGGTTCGTAAAAGGAGGATAACGATATGATGAATGATGATTAC
AAGAATCTTATTCATTTGTAAAGCTGCTTGAATCTCCGACACGCCTCCAAGGTGTTCTCT
CTGTGACCAAAGGCGCTAACACGAACAAACCCTTCACCTCCTGGTCCAAACCCACTCCCT
GGAGTTGTAACCACATGAGTCTTCTCCAGAATCTCAGCAAACACATCCCACGAGCTTTGG
TTTGGGAAGTGAACCCAAACGTAAGGCGCGTTCTTCCCTCCGTATACATCATAGCCAAGA
GAAGTGAACGTGTCGATGATTATGTTTGTGTTTTCTTTGTAGAACCCAACCACCTTCTGC
ATCGCCTCTAGTCCTTCTGGTGTTAGGCAAGCAAGAGCACCGGCTTGAGAGATATTAGAT
GCACCGTTGAAACAAGTGCAGACGATTCGGTTGAAGTCTTTTGCAACAGGGAAGCCGTCT
GAATAGAGAAGCTGTTTGGGGATGACTGTCCAACCAAGTCTAACTCCAGTGAAACCGGCG
TATTTGCTGAAGGAAGCTGTCTCCATAGCGACCTCCTCTGCTCCAGGGATTTCGAAAATA
GAGCGTGGGTTATCATCAGACATGTACATTGCATAAGCTGAATCATACACTATGATTGAT
CCATTCTTCTTTGCAAACTGTACTAACTGAG
C

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2B082JQ 787 0 0
CGACGCATTAACGTTCTTCTCGCAATGATTGCAAACGTTT*GTTTCTTAGTTGCTACAAT
TCAAGAAAACAAAGGAGACGATATTATTTTTTTCAATCCTGGTTCGTAAAAGGAGGATAA
CGATATGATGAATGATGATTACAAGAATCTTATTCATTTGTAAAGCTGCTTGAATCTCCG
ACACGCCTCCAAGATGTTCTCTCTGTGACCAAAGGCGCTAACACGAACAAACCCTTCACC
TCCTGGTCCAAACCCACTCCCTGGAGTTGTAACCACATGAGTCTTCTCCAGAATCTCAGC
AAACACATCCCACGAGCTTTGGTTTGGGAAGTGAACCCAAACGTAAGGCGCGTTCTTCCC
TCCGTATACATCATAGCCAAGAGAAGTGAACGTGTCGATGATTATGTTTGTGTTTTCTTT
GTAAAACCCAACCACCTTCTGCATCGCCTCTAGTCCTTCTGGTGTTAGGCAAGCAAGGGC
ACCGGCTTGAGAGATATTAGATGCACCGTTGAAACAAGTGCAGACGATTCGGTTGAAGTC
TTTTGCAACAGGGAAGCCGTCTGAATAGAGAAGCTGTTTGGGGATGACTGTCCAACCAAG
TCTAACTCCAGTGAAACCGGCGTATTTGCTGAAGGAAGCTGTCTCCATAGCGACCTCCTC
TGCTCCAGGGATTTCGAAAATAGAGCGTGGGTTATCATCAGACATGTACATTGCATAAGC
TGAATCATACACTATGATTGATCCATTCTTCTTTGCAAACTGTACTAACTGAGTCAGTTG
CTCCCTC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2GK40JQ 833 0 0
CTCG
CAATGATTGCAAACGTTTAGTTTCTTAGTTGCTACAATTCAAGAAGACAAAGGAGACGAT
ATTATTTTTTTCAATCCTGGTTCGTAAAAGGAGGATAACGATATGATGAATGATGATTAC
AAGAATCTTATTCATTTGTAAAGCCGCTTGAATCTCCGACACGCCTCCAAGATGTTCTCT
CTGTGACCAAAGGCGCTAACACGAACAAACCCTTCACCTCCTGGTCCAAACCCACTCCCT
GGAGTTGTAACCACATGAGTCTTCTCCAGAATCTCAGCAAACACATCCCACGAGCTTTGG
TTTGGGAAGTGAACCCAAACGTAAGGCGCGTTCTTCCCTCCGTATACATCATAGCCAAGA
GAAGTGAACGTGTCGATGATTATGTTTGTGTTTTCTTTGTAGAACCCAACCACCTTCTGC
ATCGCCTCTAGTCCTTCTGGTGTTAGGCAAGCAAGAGCACCGGCTTGAGAGATATTAGAT
GCACCGTTGAAACAAGTGCAGACGATTCGGTTGAAGTCTTTTGCAACAGGGAAGCCGTCT
GAATAGAGAAGCTGTTTGGGGATGACTGTCCAACCAAGTCTAACTCCAGTGAAACCGGCG
TATTTGCTGAAGGAAGCTGTCTCCATAGCGACCTCCTCTGCTCCAGGGATTTCGAAAATA
GAGCGTGGGTTATCATCAGACATGTACATTGCATAAGCTGAATCATACACTATGATTGAT
CCATTCTTCTTTGCAAACTGTACTAACTGAGTCAGTTGCTCCCTCGTGGCAGCAGCACCG
GTAGGGTTATTTGGGGGAGCAGAAGAAGATTATGTCCGTCCTGCCGACA

QA 5 833 5 833
DS 



CO CL860Contig2 504 2 1 U
GTCAAGACTTTTCACACATTTAACGTTCTTGCAAATGATTGAAACATTTGTTTCTTAGTT
GCTACAATTCAAGAAAACAAAAGAGACGACATTATTTAAATCCAAATCATGTCATTAAGG
AGGATAACGATGATGATGAATGATGACTACAAGAATCTTCTTCATTTGTAAAGCTGCTTG
AATCTCCGACACGCCTCCAAGATGTTCTCTCTGTGACCAAAGGCGCTAACACGAACAAAC
CCTTCACCTCCTGGTCCAAACCCACTCCCTAGAGTCGTAACCACATGTGTCTTCTCCAGA
ATCTCAGCAAACACATCCCACGAGCTTTGGTTTGGGAAGTGAACCCAAACGTAAGGCGCG
TTCTTTCCTCCGTATACATCATACCCGAGAGAAGTGAACGTGTCGATGATTATGTTTGTG
TTTTCTTTGTAGAACCCAACCACCTTCTGCATCGCCTCAAGTCCTTCTGGTGTAAGGCAA
GCAAGAGCACCGGCTTGAGAGATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C489JQ U 209
AF RR2D186JQ U 1
BS 1 504 RR2D186JQ

RD RR2C489JQ 150 0 0
CTCTGTGACCAAAGGCGCTAACACGAACAAACCCTTCACCTCCTGGTCCAAACCCACTCC
CTGGAGTCGTAACCACATGTGTCTTCTCCAGAATCTCAGCAAACACATCCCACGAGCTTT
GGTTTGGGAAGTGAACCCAAACGTAAGGCG

QA 1 150 1 150
DS 

RD RR2D186JQ 504 0 0
GTCAAGACTTTTCACACATTTAACGTTCTTGCAAATGATTGAAACATTTGTTTCTTAGTT
GCTACAATTCAAGAAAACAAAAGAGACGACATTATTTAAATCCAAATCATGTCATTAAGG
AGGATAACGATGATGATGAATGATGACTACAAGAATCTTCTTCATTTGTAAAGCTGCTTG
AATCTCCGACACGCCTCCAAGATGTTCTCTCTGTGACCAAAGGCGCTAACACGAACAAAC
CCTTCACCTCCTGGTCCAAACCCACTCCCTAGAGTCGTAACCACATGTGTCTTCTCCAGA
ATCTCAGCAAACACATCCCACGAGCTTTGGTTTGGGAAGTGAACCCAAACGTAAGGCGCG
TTCTTTCCTCCGTATACATCATACCCGAGAGAAGTGAACGTGTCGATGATTATGTTTGTG
TTTTCTTTGTAGAACCCAACCACCTTCTGCATCGCCTCAAGTCCTTCTGGTGTAAGGCAA
GCAAGAGCACCGGCTTGAGAGATA

QA 1 504 1 504
DS 



AS 2 8

CO CL861Contig1 631 6 7 U
GTGGGAAAAATAAATCTTATCAAAACAAAAATGAGAGGAATTCCATCCAGTAATGTTTTC
AAATGCAAAATATTTCAATACATATAACTAAACTCAAAAACACAAAAACTCTGGAGCAAT
TGTT*ATGATCTTGATTTAGATGGCTTCTGCTGCGATCCTTCCAGCGACTTGGTCAAGAT
CTCTCTGACCACTTGATGTTATCTTCCTTCCCCCCTTGGTGTCAAGGTCGACAATGTTCA
TGGTCTGAAGCTGCTGAAGAATGTGACGAGCAACACCACCACTGCTCTTGCAGAAATGAG
GTGGACGGCTTCCGTTCCTCTTGCTTCCTCCGTAGATCCTGCGGAATGCACCGACTCCAA
GTCCACCTCTCAAGTACACTTTCCTCGCCATGGACGCAGCTCTGATGTAGTACCAGTCAG
GGTCATATGGAGCAAGCTCCTTAAGTTTACCAGTCTTCACTATGTCTGTCCACGCAGGCA
GCTCAATCTTGCCGGAGCGCTTGAGATGGGCAGCGTAAGCCTTGACGAACTCGTGTGGAG
AGACATCCTTCACCGTCTTGCCTGTCATTGTTGCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTCCTTGTG
ATTCGGCGTCGGCGCTTGTGCTTTGGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ80JQ U 1
AF RR2FJ80TF C 1
AF RR2C379JQ U 19
AF RR2C379TF C 19
AF RR2BZ20JQ U 33
AF RR2BZ20TF C 33
BS 1 334 RR2FJ80JQ
BS 335 335 RR2BZ20JQ
BS 336 496 RR2FJ80JQ
BS 497 497 RR2C379JQ
BS 498 607 RR2FJ80JQ
BS 608 624 RR2C379JQ
BS 625 631 RR2BZ20JQ

RD RR2FJ80JQ 607 0 0
GTGGGAAAAATAAATCTTATCAAAACAAAAATGAGAGGAATTCCATCCAGTAATGTTTTC
AAATGCAAAATATTTCAATACATATAACTAAACTCAAAAACACAAAAACTCTGGAGCAAT
TGTT*ATGATCTTGATTTAGATGGCTTCTGCTGCGATCCTTCCAGCGACTTGGTCAAGAT
CTCTCTGACCACTTGATGTTATCTTCCTTCCCCCCTTGGTGTCAAGGTCGACAATGTTCA
TGGTCTGAAGCTGCTGAAGAATGTGACGAGCAACACCACCACTGCTCTTGCAGAAATGAG
GTGGACGGCTTCCGTTCCTCTTGCTTCCTCCGTAAATCCTGCGGAATGCACCGACTCCAA
GTCCACCTCTCAAGTACACTTTCCTCGCCATGGACGCAGCTCTGATGTAGTACCAGTCAG
GGTCATATGGAGCAAGCTCCTTAAGTTTACCAGTCTTCACTATGTCTGTCCACGCAGGCA
GCTCAATCTTGCCGGAACGCTTGAGATGGGCAGCGTAAGCCTTGACGAACTCGTGTGGAG
AGACATCCTTCACCGTCTTGCCTGTCATTGTTGCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTCCTTGTG
ATTCGGC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2FJ80TF 631 0 0
GTGGG
AAAAATAAATCTTATCAAAACAAAAATGAGAGGAATTCCATCCAGTAATGTTTTCAAATG
CAAAATATTTCAATACATATAACTAAACTCAAAAACACAAAAACTCTGGAGCAATTGTT*
ATGATCTTGATTTAGATGGCTTCTGCTGCGATCCTTCCAGCGACTTGGTCAAGATCTCTC
TGACCACTTGATGTTATCTTCCTTCCCCCCTTGGTGTCAAGGTCGACAATGTTCATGGTC
TGAAGCTGCTGAAGAATGTGACGAGCAACACCACCACTGCTCTTGCAGAAATGAGGTGGA
CGGCTTCCGTTCCTCTTGCTTCCTCCGTAGATCCTGCGGAATGCACCGACTCCAAGTCCA
CCTCTCAAGTACACTTTCCTCGCCATGGACGCAGCTCTGATGTAGTACCAGTCAGGGTCA
TATGGAGCAAGCTCCTTAAGTTTACCAGTCTTCACTATGTCTGTCCACGCAGGCAGCTCA
ATCTTGCCGGAGCGCTTGAGATGGGCAGCGTAAGCCTTGACGAACTCGTGTGGAGAGACA
TCCTTCACCGTCTTGCCTGTCATTGTTGCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTCCTTGTGATTCG
GCGTCGGCGCTTGTGCTTT
GGAGTCC

QA 6 624 6 624
DS 

RD RR2C379JQ 608 0 0
ATCAAAACAAAAATGAGAGCAATTCCATCCAGTAATGTTTTCAAATGCAAAATATTTCAA
TACATATAACTAA*CTCAAAAACACAAAAACTCTGGAGCAATTGGTGATGATCTTGATTT
AAATGGCTTCTGCTGCGATCCTTCCAGCGACTTGGTCAAGATCTCTCTGACCACTTGATG
TTATCTTCCTTCCCCCCTTGGTGTCAAGGTCGACAATGTTCATGGTCTGAAGCTGCTGAA
AAATGTGACGAGCAACACCACCACTGCTCTTGCAGTAATGTGGTGGACGGCTTCCGTTCC
TCTTGCTTACTCCGTAAATCCTGCGGAAGGCACCGACTCCAAGTCCACCTCTCAGGTACA
CTTTCCTCGCCATGGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAGTCAGGGTCATATGGAGCAAGCT
CCTTAAGTTTACCAGTCTTCACTATGTCTGTCCACGCTGGCAACTCAATCTTGCCGGAGC
GCTTGAAATGGGCAGCGTAAGCCTTGACAAACTCGTGTGGAGAGACATCCTTCACCGTCT
TGCCTGTCATTGTTGCTTCTCCTTCTTCTCCTCCTCCTTGTGATTCGGCGTCGGCGCTTG
TGCTTT
CC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2C379TF 608 0 0
ATCAAAACAAAAATGAGAGCAATTCCATCCAGTAATGTTTTCAAATGCAAAATATTTCAA
TACATATAACTAA*CTCAAAAACACAAAAACTCTGGAGCAATTGGTGATGATCTTGATTT
AGATGGCTTCTGCTGCGATCCTTCCAGCGACTTGGTCAAGATCTCTCTGACCACTTGATG
TTATCTTCCTTCCCCCCTTGGTGTCAAGGTCGACAATGTTCATGGTCTGAAGCTGCTGAA
GAATGTGACGAGCAACACCACCACTGCTCTTGCAGTAATGTGGTGGACGGCTTCCGTTCC
TCTTGCTTACTCCGTAGATCCTGCGGAAGGCACCGACTCCAAGTCCACCTCTCAGGTACA
CTTTCCTCGCCATGGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAGTCAGGGTCATATGGAGCAAGCT
CCTTAAGTTTACCAGTCTTCACTATGTCTGTCCACGCTGGCAACTCAATCTTGCCGGAGC
GCTTGAGATGGGCAGCGTAAGCCTTGACGAACTCGTGTGGAGAGACATCCTTCACCGTCT
TGCCTGTCATTGTTGCTTCTCCTTCTTCTCCTCCTCCTTGTGATTCGGCGTCGGCGCTTG
TGCTTT
CC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2BZ20JQ 599 0 0
GAGAGGAATTCCATCCAGTAATGTTTTCAAATGCAAAATATTTCAATACATATAACTAAA
CTCAAAAACACAAAAACTCTGGAGCAATTGTT*ATGATCTTGATTTAGATGGCTTCTGCT
GCGATCCTTCCAGCGACTTGGTCAAGATCTCTCTGACCACTTGATGTTATCTTCCTTCCC
CCCTTGGTGTCAAGGTCGACAATGTTCATGGTCTGAAGCTGCTGAAGAATGTGACGAGCA
ACACCACCACTGCTCTTGCAGAAATGAGGTGGACGGCTTCCGTTCCTCTTGCTTCCTCCG
TAGATCCTGCGGAATGCACCGACTCCAAGTCCACCTCTCAAGTACACTTTCCTCGCCATG
GACGCAGCTCTGATGTAGTACCAGTCAGGGTCATATGGAGCAAGCTCCTTAAGTTTACCA
GTCTTCACTATGTCTGTCCACGCAGGCAGCTCAATCTTGCCGGAGCGCTTGAGATGGGCA
GCGTAAGCCTTGACGAACTCGTGTGGAGAGACATCCTTCACCGTCTTGCCTGTCATTGTT
GCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTCCTTGTGATTCGGCGTCGGCGCTTGTGCTTTGGAGTCC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2BZ20TF 599 0 0
GAGAGGAATTCCATCCAGTAATGTTTTCAAATGCAAAATATTTCAATACATATAACTAAA
CTCAAAAACACAAAAACTCTGGAGCAATTGTT*ATGATCTTGATTTAGATGGCTTCTGCT
GCGATCCTTCCAGCGACTTGGTCAAGATCTCTCTGACCACTTGATGTTATCTTCCTTCCC
CCCTTGGTGTCAAGGTCGACAATGTTCATGGTCTGAAGCTGCTGAAGAATGTGACGAGCA
ACACCACCACTGCTCTTGCAGAAATGAGGTGGACGGCTTCCGTTCCTCTTGCTTCCTCCG
TAGATCCTGCGGAATGCACCGACTCCAAGTCCACCTCTCAAGTACACTTTCCTCGCCATG
GACGCAGCTCTGATGTAGTACCAGTCAGGGTCATATGGAGCAAGCTCCTTAAGTTTACCA
GTCTTCACTATGTCTGTCCACGCAGGCAGCTCAATCTTGCCGGAGCGCTTGAGATGGGCA
GCGTAAGCCTTGACGAACTCGTGTGGAGAGACATCCTTCACCGTCTTGCCTGTCATTGTT
GCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTCCTTGTGATTCGGCGTCGGCGCTTGTGCTTT
GGAGTCC

QA 1 592 1 592
DS 



CO CL861Contig2 310 2 2 U
GGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAGGGGGGAAGGAAGATAACATCAAGTGGTC
AGAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATCGCAGCAGAAGCCATCTAAATCAAGATCC
TCATCACAATTGCTCCAGAGTTTTTGTGTTTTGAGTTTAGTTATATGTATTGAAATATTT
GCATTTGAAAACATTATTGGATGGAATTCCTCTCATTTTTGTTTTGATAAGATTTTTTTT
TTTCACTTTTCTGCTTCTTCTTTTTTATTCTCAGCAACTTCTGGCTATATATTTTGATAT
TATCTACTAG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GS16JQB C 1
AF RR2GS16TF U 1
BS 1 1 RR2GS16JQB
BS 2 310 RR2GS16TF

RD RR2GS16JQB 310 0 0
GGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAGGGGGGAAGGAAGATAACATCAAGTGGTC
AGAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATCGCAGCAGAAGCCATCTAAATCAAGATCC
TCATCACAATTGCTCCAGAGTTTTTGTGTTTTGAGTTTAGTTATATGTATTGAAATATTT
GCATTTGAAAACATTATTGGATGGAATTCCTCTCATTTTTGTTTTGATAAGATTTTTTTT
TTTCACTTTTCTGCTTCTTCTTTTTTATTCTCAGCAACTTCTGGCTATATATTTTGATAT
TATCTACTAG

QA 1 310 1 310
DS 

RD RR2GS16TF 310 0 0
G
GACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAGGGGGGAAGGAAGATAACATCAAGTGGTCA
GAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATCGCAGCAGAAGCCATCTAAATCAAGATCCT
CATCACAATTGCTCCAGAGTTTTTGTGTTTTGAGTTTAGTTATATGTATTGAAATATTTG
CATTTGAAAACATTATTGGATGGAATTCCTCTCATTTTTGTTTTGATAAGATTTTTTTTT
TTCACTTTTCTGCTTCTTCTTTTTTATTCTCAGCAACTTCTGGCTATATATTTTGATATT
ATCTACTAG

QA 2 310 2 310
DS 



AS 2 8

CO CL862Contig1 1133 4 13 U
GGAAGATATCAAAAGAGAAAATATCAATCATTATATCTCTTAACCAAGTAGAAACAGGAG
ATCATCTCATCTCATATTATAAAAAAGTATCGATAAGCACTTCAACGCCGTTTCTCCTTC
TTCTTCTC*TCTTCATCATCATCGCAAGCAATCAAGCAACCTTCGGGCATCAAATCTCCC
AAGGTG*TTTAATCAAGAAGAATGTTTACACGGCTATTCGGGAAACCCAAGGAGGAGACT
AATACTCTCCACACATTAGGCAAGCTTAATGAGACACTTGAGATGCTGGAGAAGAAGGAA
TCTGTTCTTCTCAAGAAAGCTGCTGGAGAGGTTGAGAGAGCCAAAGAATTCTCCAAGCTC
AAGAACAAACGCGCGGCTATTCAATGTTTGAAAAGGAAGAGGTTATACGAGCAACAAGTT
GAACAGCTTGGCAATTTCCAGCTCCGTATTCATGATCAAATGATTATGTTAGAAGGTGCC
AAAGCAACAACAGAGACTGTAGATGCTTTGAGGACTGGTGCTGCTGCTATGAAAGCTATG
CAGAAAGCTACAAACATTGACGATGTTGACAAGACAATGGATGAGATCAATGAGCAAACC
GATAACATGAAACAGATCCAGGACGCATTGTCTGCTCCATTTGGCTCTGCTGCTGATTTC
GACGAGGATGAATTGGAGGCAGAACTTGACGAACTTGAAGGCTTAGAGCTAGAGGACCAA
CTTCTTCAGCAAGCAAGACCACTTCCTGAAGGAAAGCTACCTGCTCGTCCTCTACCTCAG
AAGAAACAGACTGCTGATGAAGAAGATGAACTCGCTGCACTACAGGCTGAGATGGCACTA
TAAACACACAAACAACGGGTTCTATTTTTACTGCAGCGGATGTTGGTGTTGGAAGATGGG
GTTTGAGTGTGCATTATTTAAAAAAAAAAAAACAGAAACGAAGATTGTTATGTATATTAA
AGTATCCGAGTCAAATTGATCGGATACCTTATTTTATATACAATTTGACTTATATAACTT
GTAAGCTTTTTATTTATTTTTATTTCGAATGTTTCTTCACATTTGCTTTTTACTCTTTGT
TCACGCTATCTTGTGCTAACTTCCTCTATACTTGGTTACGACTTGTTACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU29TF U 85
AF RR2BH91TF U 1
AF RR2A445TF U 64
AF RR2BH91JQ C 352
BS 1 186 RR2BH91TF
BS 187 187 RR2A445TF
BS 188 310 RR2BH91TF
BS 311 312 RR2A445TF
BS 313 344 RR2BH91TF
BS 345 345 RR2A445TF
BS 346 699 RR2BH91TF
BS 700 700 RR2A445TF
BS 701 800 RR2BH91TF
BS 801 802 RR2A445TF
BS 803 805 RR2BH91JQ
BS 806 842 RR2A445TF
BS 843 1133 RR2BH91JQ

RD RR2FU29TF 694 0 0
AAGTATCGATAAGCACTTCAACGCCGTTTCTCCTTCTTCTTCTC*TCTTCATCATCATCG
CAAGCAATCAAGCAACCTTCGGGCATCAAATCTCCCAAGGTG*TTTAATCAAGAAGAATG
TTTACACGGCTATTCGGGAAACCCAAGGAGGAGACTAATACTCTCCACACATTAGGCAAG
CTTAATGAGACACTTGAGATGCTGGAGAAGAAGGAATCTGTTCTTCTCAAGAAAGCTGCT
GGAGAGGTTGAGAGAGCCAAAGAATTCTCCAAGGTCAAGAACAAACGCGCGGCTATACAA
TGTTTGAAAAGGAAGAGGTTATACGAGCAACAAGTTGAACAGCTTGGCAACTTCCAGCTC
CGTATTCATGATCAAATGATTATGTTAGAAGGTGCCAAAGCAACAACAGAGACTGTAGAT
GCTTTGAGGACTGGTGCTGCTGCTATGAAAGCTATGCAGAAAGCTACAAACATTGACGAT
GTTGACAAGACCATGGATGAGATCAATGAGCAGACCGATAACATGAAACAGATCCAGGAC
GCATTGTCCGCTCCATTTGGCTCTGCTGCTGATTTCGATGAGGATGAATTGGAAGCAGAA
CTTGACGAACTTGA*GGCTTAGAGCTAGAGGACCAACTTCTTCAGCCAGCAAGACCACTT
CCTGAAGGAA*GCTACCTGCTCGTCCTCTACCTC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2BH91TF 800 0 0
GGAAGATATCAAAAGAGAAAATATCAATCATTATATCTCTTAACCAAGTAGAAACAGGAG
ATCATCTCATCTCATATTATAAAAAAGTATCGATAAGCACTTCAACGCCGTTTCTCCTTC
TTCTTCTC*TCTTCATCATCATCGCAAGCAATCAAGCAACCTTCGGGCATCAAATCTCCC
AAGGTGGTTTAATCAAGAAGAATGTTTACACGGCTATTCGGGAAACCCAAGGAGGAGACT
AATACTCTCCACACATTAGGCAAGCTTAATGAGACACTTGAGATGCTGGAGAAGAAGGAA
TCTGTTCTTCAGAAGAAAGCTGCTGGAGAGGTTGAGAGAGCCAAGGAATTCTCCAAGCTC
AAGAACAAACGCGCGGCTATTCAATGTTTGAAAAGGAAGAGGTTATACGAGCAACAAGTT
GAACAGCTTGGCAATTTCCAGCTCCGTATTCATGATCAAATGATTATGTTAGAAGGTGCC
AAAGCAACAACAGAGACTGTAGATGCTTTGAGGACTGGTGCTGCTGCTATGAAAGCTATG
CAGAAAGCTACAAACATTGACGATGTTGACAAGACAATGGATGAGATCAATGAGCAAACC
GATAACATGAAACAGATCCAGGACGCATTGTCTGCTCCATTTGGCTCTGCTGCTGATTTC
GACGAGGATGAATTGGAGGCAGAACTTGACGAACTTGAAAGCTTAGAGCTAGAGGACCAA
CTTCTTCAGCAAGCAAGACCACTTCCTGAAGGAAAGCTACCTGCTCGTCCTCTACCTCAG
AAGAAACAGACTGCTGATGA

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2A445TF 779 0 0
GGGATCTCATATTATTA
AAAAAAGTATTGATAAGCACTTCAACGCCGTTTCTCCTTCTTCTCCTCCTCTTCATCATC
ATCGCAAGCAATCAAGCAACCTTCGGGCATCAAATCTCCCAAGGTG*TTTAATCAAGAAG
AATGTTTACACGGCTATTCGGGAAACCCAAGGAGGAGACTAATACTCTCCACACATTAGG
CAAGCTTAATGAGACACTTGAGATGCTGGAGAAGAAGGAATCTGTTCTTCTCGAGAAAGC
TGCTGGAGAGGTTGAGAGAGCCAAAGAATTCTCCAAGGTCGAGAACAAACGCGCGGCTAT
ACAATGTTTGAAAAGGAAGAGGTTATACGAGCAACAAGTTGAACAGCTTGGCAACTTCCA
GCTCCGTATTCATGATCAAATGATTATGTTAGAAGGTGCCAAAGCAACAACAGAGACTGT
AGATGCTTTGAGGACTGGTGCTGCTGCTATGAAAGCTATGCAGAAAGCTACAAACATTGA
CGATGTTGACAAGACCATGTATGAGATCAATGAGCAGACCGATAACATGAAACAGATCCA
GGACGCATTGTCCGCTCCATTTGGCTCTGCTGCTGATTTCGATGAGGATGAATTGGAAGC
AGAACTTGACGAACTTGAAGGCTTAGAGCTAGAGGACCAACTTCTTCAGCCAGCAAGACC
ACTTCCTGAAGGAAAGCTACCTGCTCGTCCTCTACCTCAGAAGAAACAGAACGCTGATGA
AG***ATGAACTCGCTGCACTACAGGCTGAGATGGCACTATA

QA 18 779 18 779
DS 

RD RR2BH91JQ 782 0 0
TCCAAGCTCAAGAACAAACGCGCGGCTATTCAATGTTTGAAAAGGAAGAGGTTATACGAG
CAACAAGTTGAACAGCTTGGCAATTTCCAGCTCCGTATTCATGATCAAATGATTATGTTA
GAAGGTGCCAAAGCAACAACAGAGACTGTAGATGCTTTGAGGACTGGTGCTGCTGCTATG
AAAGCTATGCAGAAAGCTACAAACATTGACGATGTTGACAAGACAATGGATGAGATCAAT
GAGCAAACCGATAACATGAAACAGATCCAGGACGCATTGTCTGCTCCATTTGGCTCTGCT
GCTGATTTCGACGAGGATGAATTGGAGGCAGAACTTGACGAACTTGAAGGCTTAGAGCTA
GAGGACCAACTTTTTCAGCAAGCAAGACCACTTCCTGAAGGAAAGCTACCTGCTCGTCCT
CTACCTCAGAAGAAACAGACTGCTGATGAAGAAGATGAACTCGCTGCACTACAGGCTGAG
ATGGCACTATAAACACACAAACAACGGGTTCTATTTTTACTGCAGCGGATGTTGGTGTTG
GAAGATGGGGTTTGAGTGTGCATTATTTAAAAAAAAAAAAACAGAAACGAAGATTGTTAT
GTATATTAAAGTATCCGAGTCAAATTGATCGGATACCTTATTTTATATACAATTTGACTT
ATATAACTTGTAAGCTTTTTATTTATTTTTATTTCGAATGTTTCTTCACATTTGCTTTTT
ACTCTTTGTTCACGCTATCTTGTGCTAACTTCCTCTATACTTGGTTACGACTTGTTACCT
CC

QA 1 782 1 782
DS 



CO CL862Contig2 556 4 2 U
AAGAAAATGTGAAGAAACATTCAAAATAAAAATAAATAAAAGCTTATAAGTTATATAAGT
CAAATTGTATATAAAATAATGTATCCGATCAATTTGACTCGGATACTTTAATATACATAA
CAATCTTCGTTTCTGTATTTTTTTTTTTCAAATAATGCACACTCAAACCCCATCTTCCAA
CACCACCTTCCGCTGCAGTAAAAATAGAACCCGCTGTTTGTGTGTTTAAAGGTAACCTTA
TAGTGCCATCTCAGCCTGTAGTGCAGCGAGTTCATCTTCATCAGCGTTCTGTTTCTTCTG
AGGTAGAGGACGAGCAGGTAGCTTTCCTTCAGGAAGTGGTCTTGCTGGCTGAAGAAGTTG
GTCCTCTAGCTCTAAGCCTTCAAGTTCGTCAAGTTCTGCTTCCAATTCATCCTCATCGAA
ATCAGCAGCAGAGCCAAATGGAGCGGACAATGCGTCCTGGATCTGTTTCATGTTATCGGT
CTGCTCATTGATCTCATCCATGGTCTTGTCAACATCGTCAATGTTTGTAGCTTTCTGCAT
AGCTTTCATAGCAGCA


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP08JQ U 1
AF RR2CP08TF C 1
AF RR2A445JQ U 67
AF RR2FU29JQ U 53
BS 1 472 RR2CP08JQ
BS 473 556 RR2FU29JQ

RD RR2CP08JQ 473 0 0
AAGAAAATGTGAAGAAACATTCAAAATAAAAATAAATAAAAGCTTATAAGTTATATAAGT
CAAATTGTATATAAAATAATGTATCCGATCAATTTGACTCGGATACTTTAATATACATAA
CAATCTTCGTTTCTGTATTTTTTTTTTTCAAATAATGCACACTCAAACCCCATCTTCCAA
CACCACCTTCCGCTGCAGTAAAAATAGAACCCGCTGTTTGTGTGTTTAAAGGTAACCTTA
TAGTGCCATCTCAGCCTGTAGTGCAGCGAGTTCATCTTCATCAGCGTTCTGTTTCTTCTG
AGGTAGAGGACGAGCAGGTAGCTTTCCTTCAGGAAGTGGTCTTGCTGGCTGAAGAAGTTG
GTCCTCTAGCTCTAAGCCTTCAAGTTCGTCAAGTTCTGCTTCCAATTCATCCTCATCGAA
ATCAGCAGCAGAGCCAAATGGAGCGGACAATGCGTCCTGGATCTGTTTCATG
C

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2CP08TF 473 0 0
AAGA
AAATGTGAAGAAACATTCAAAATAAAAATAAATAAAAGCTTATAAGTTATATAAGTCAAA
TTGTATATAAAATAATGTATCCGATCAATTTGACTCGGATACTTTAATATACATAACAAT
CTTCGTTTCTGTATTTTTTTTTTTCAAATAATGCACACTCAAACCCCATCTTCCAACACC
ACCTTCCGCTGCAGTAAAAATAGAACCCGCTGTTTGTGTGTTTAAAGGTAACCTTATAGT
GCCATCTCAGCCTGTAGTGCAGCGAGTTCATCTTCATCAGCGTTCTGTTTCTTCTGAGGT
AGAGGACGAGCAGGTAGCTTTCCTTCAGGAAGTGGTCTTGCTGGCTGAAGAAGTTGGTCC
TCTAGCTCTAAGCCTTCAAGTTCGTCAAGTTCTGCTTCCAATTCATCCTCATCGAAATCA
GCAGCAGAGCCAAATGGAGCGGACAATGCGTCCTGGATCTGTTTCATG
C

QA 5 472 5 472
DS 

RD RR2A445JQ 361 0 0
GTATATAAAATAATGTATCCGATCAATTTGACTCGGATACTTTAATATACATAACAATCT
TCGTTTCTGTATTTTTTTTTTTCAAATAATGCACACTCAAACCCCATCTTCCAACACCAC
CTTCCGCTGCAGTAAAAATAGAACCCGCTGTTTGTGTGTTTAAAGGTAACCTTATAGTGC
CATCTCAGCCTGTAGTGCAGCGAGTTCATCTTCATCAGCGTTCTGTTTCTTCTGAGGTAG
AGGACGAGCAGGTAGCTTTCCTTCAGGAAGTGGTCTTGCTGGCTGAAGAAGTTGGTCCTC
TAGCTCTAAGCCTTCAAGTTCGTCAAGTTCTGCTTCCAATTCATCCTCATCGAAATCAGC
A

QA 1 361 1 361
DS 

RD RR2FU29JQ 504 0 0
ATATAAGTCAAATTGTATATAAAATAATGTATCCGATCAATTTGACTCGGATACTTTAAT
ATACATAACAATCTTCGTTTCTGTATTTTTTTTTTTCAAATAATGCACACTCAAACCCCA
TCTTCCAACACCACCTTCCGCTGCAGTAAAAATAAAACCCGCTGTTTGTGTGTTTAAAGG
TAACCTTATAGTGCCATCTCAGCCTGTAGTGCAGCGAGTTCATCTTCATCAGCGTTCTGT
TTCTTCTGAGGTAGAGGACGAGCAGGTAGCTTTCCTTCAGGAAGTGGTCTTGCTGGCTGA
AGAAGTTGGTCCTCTAGCTCTAAGCCTTCAAGTTCGTCAAGTTCTGCTTCCAATTCATCC
TCATCGAAATCAGCAGCAAAGCCAAATGGAGCGGACAATGCGTCCTGGATCTGTTTCATG
TTATCGGTCTGCTCATTGATCTCATCCATGGTCTTGTCAACATCGTCAATGTTTGTAGCT
TTCTGCATAGCTTTCATAGCAGCA

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 5

CO CL863Contig1 832 5 6 U
GGGTGAACGCCAGAGAAGCGGTCGTTGTAAAGATCTTGTGTTTTGCAACTCTTTCTGTTC
CGTTCTCCGTCGTAGCTTCTATTATAATCTCCGCAAGTTTTTTCTCCTTCGTGGGCTGAA
TAAATCTGCTTCGTATCAGAGATGGCGGCTGCTTTGCCGAGCAGGTTTCTCAACACCATT
CGTTCTACCAGATTGGCATCTGCATCATCAATCTATCAAAATGGGATGATGAGGTACTCC
ACTACAGTTCCCGGCGATTCAGACACACATGATGACTTCAAGCCTACACAGAAAGTCCCT
TCTGGTTCCACCGACTCGCTCAAGGATCTCGTTGAGAATGATGTGAAGGAAAATCCAGTT
ATGATCTACATGAAAGGAGTCCCTGAAGCTCCTCAGTGTGGGTTTAGCTCACTCGCCGTT
AGGGTTCTCCAACAGTATAATGTTCCTGTCGGTGCTAGGAACATTCTTGCAGATCCAGAG
ATCAAAGAAGCTGTGAAATCCTTCAGCCACTGGCCAACATTTCCACAGATCTTCATCAAG
GGAGAGTTTATTGGAGGCTCAGACATCATCCTCAACATGCACAAGGAAGGTGAACTGGAG
GAGAAGCTTAAAGACGTCTCTGCGAACCATAAGTCTCAGTAAGCTTCTAGAGATTTTTGA
TCCAAGTCTGAAGTTCTACCTTCACTGCTGATGTATGAAGTTTATTATTATGTTTTTCTT
TTTCTTTATTTACATATAAGAATGCATTTTGATGTAACGGTAATAATGAAAGTCTCAAGA
GAACTTGGTATGAACAAAACTTGATATTATATTATTAAAGAACCTTTATTTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2E476TF U 60
AF RR2E746TF U 3
AF RR2GP33TF U 1
AF RR2E746JQ C 127
AF RR2FZ88JQ C 302
BS 1 101 RR2GP33TF
BS 102 102 RR2E476TF
BS 103 662 RR2GP33TF
BS 663 663 RR2E746JQ
BS 664 712 RR2GP33TF
BS 713 832 RR2E746JQ

RD RR2E476TF 522 0 0
GG
GTTCTCCGTCGTAGCTTCTATTATAATCTCCGCAAGTTTTTTCTCCTTCGTGGGCTGAAT
AAATCTGCTTCGTATCAGAGATGGCGGCTGCTTTGCCGAGCAGGTTTCTCAACACCATTC
GTTCTACCAGATTGGCATCTGCATCATCAATCTATCAAAATGGGATGATGAGGTACTCCA
CTACAGTTCCCGGCGATTCAGACACACATGATGACTTCAAGCCTACACAGAAAGTCCCTT
CTGGTTCCACCGACTCGCTCAAGGATCTCGTTGAGAATGATGTGAAGGAAAATCCAGTTA
TGATCTACATGAAAGGAGTCCCTGAAGCTCCTCAGTGTGGGTTTAGCTCACTCGCCGTTA
GGGTTCTCCAACAGTATAATGTTCCTGTCGGTGCTAGGAACATTCTTGCAGATCCAGAGA
TCAAAGAAGCTGTGAAATCCTTCAGCCACTGGCCAACATTTCCACAGATCTTCATCAAGG
GAGAGTTTATTGGAGGCTCAGACATCATCCTCAACATGCA

QA 3 522 3 522
DS 

RD RR2E746TF 580 0 0
GG
GAACGCCAGAGAAGCGGTCGTTGTAAAGATCTTGTGTTTTGCAACTCTTTCTGTTCCGTT
CTCCGTCGTAGCTTCTATTATAATCTCCGCAAGTTTTTTCTCCTTCGTGGGCTGAATAAA
TCTGCTTCGTATCAGAGATGGCGGCTGCTTTGCCGAGCAGGTTTCTCAACACCATTCGTT
CTACCAGATTGGCATCTGCATCATCAATCTATCAAAATGGGATGATGAGGTACTCCACTA
CAGTTCCCGGCGATTCAGACACACATGATGACTTCAAGCCTACACAGAAAGTCCCTTCTG
GTTCCACCGACTCGCTCAAGGATCTCGTTGAGAATGATGTGAAGGAAAATCCAGTTATGA
TCTACATGAAAGGAGTCCCTGAAGCTCCTCAGTGTGGGTTTAGCTCACTCTCCGTTAGGG
TTCTCCAACAGTATAATGTTCCTGTCGGTGCTAGGAACATTCTTGCAGATCCAGAGATCA
A*GAAGCTGTGAAATCCTTCAGCCACTGGCCAACATTTCCACAGATCTTCATCAAGGGAG
AGTTTATTGGAG*CTCAGACATCATCCTCAACATGCAC

QA 3 580 3 580
DS 

RD RR2GP33TF 712 0 0
GGGTGAACGCCAGAGAAGCGGTCGTTGTAAAGATCTTGTGTTTTGCAACTCTTTCTGTTC
CGTTCTCCGTCGTAGCTTCTATTATAATCTCCGCAAGTTTTCTCTCCTTCGTGGGCTGAA
TAAATCTGCTTCGTATCAGAGATGGCGGCTGCTTTGCCGAGCAGGTTTCTCAACACCATT
CGTTCTACCAGATTGGCATCTGCATCATCAATCTATCAAAATGGGATGATGAGGTACTCC
ACTACAGTTCCCGGCGATTCAGACACACATGATGACTTCAAGCCTACACAGAAAGTCCCT
TCTGGTTCCACCGACTCGCTCAAGGATCTCGTTGAGAATGATGTGAAGGAAAATCCAGTT
ATGATCTACATGAAAGGAGTCCCTGAAGCTCCTCAGTGTGGGTTTAGCTCACTCGCCGTT
AGGGTTCTCCAACAGTATAATGTTCCTGTCGGTGCTAGGAACATTCTTGCAGATCCAGAG
ATCAAAGAAGCTGTGAAATCCTTCAGCCACTGGCCAACATTTCCACAGATCTTCATCAAG
GGAGAGTTTATTGGAGGCTCAGACATCATCCTCAACATGCACAAGGAAGGTGAACTGGAG
GAGAAGCTTAAAGACGTCTCTGCGAACCATAAGTCTCAGTAAGCTTCTAGAGATTTTTGA
TC*AAGTCTGAAGTTCTACCTTCACTGCTGATGTATGAAGTTTATTATTATG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2E746JQ 706 0 0
TGCTTCGTATCAGAGATGGCGGCTGCTTTGCCGAGCAGGTTTCTCAACACCATTCGTTCT
ACCAGATTGGCATCTGCATCATCAATCTATCAAAATGGGATGATGAGGTACTCCACTACA
GTTCCCGGCGATTCAGACACACATGATGACTTCAAGCCTACACAGAAAGTCCCTTCTGGT
TCCACCGACTCGCTCAAGGATCTCGTTGAGAATGATGTGAAGGAAAATCCAGTTATGATC
TACATGAAAGGAGTCCCTGAAGCTCCTCAGTGTGGGTTTAGCTCACTCTCCGTTAGGGTT
CTCCAACAGTATAATGTTCCTGTCGGTGCTAGGAACATTCTTGCAGATCCAGAGATCAAA
GAAGCTGTGAAATCCTTCAGCCACTGGCCAACATTTCCACAGATCTTCATCAAGGGAGAG
TTTATTGGAGGCTCAGACATCATCCTCAACATGCACAAGGAAGGTGAACTGGAGGAGAAG
CTTAAAGACGTCTCTGCGAACCATAAGTCTCAGTAAGCTTCTAGAGATTTTTGATCCAAG
TCTGAAGTTCTACCTTCACTGCTGATGTATGAAGTTTATTATTATGTTTTTCTTTTTCTT
TATTTACATATAAGAATGCATTTTGATGTAACGGTAATAATGAAAGTCTCAAGAGAACTT
GGTATGAACAAAACTTGATATTATATTATTAAAGAACCTTTATTTC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2FZ88JQ 531 0 0
CTGGTTCCACCGACTCGCTCAAGGATCTCGTTGAGAATGATGTGAAGGAAAATCCAGTTA
TGATCTACATGAAAGGAGTCCCTGAAGCTCCTCAGTGTGGGTTTAGCTCACTCGCCGTTA
GGGTTCTCCAACAGTATAATGTTCCTGTCGGTGCTAGGAACATTCTTGCAGATCCAGAGA
TCAAAGAAGCTGTGAAATCCTTCAGCCACTGGCCAACATTTCCACAGATCTTCATCAAGG
GAGAGTTTATTGGAGGCTCAGACATCATCCTCAACATGCACAAGGAAGGTGAACTGGAGG
AGAAGCTTAAAGACGTCTCTGCGAACCATAAGTCTCAGTAAGCTTCTAGAGATTTTTGAT
CCAAGTCTGAAGTTCTACCTTCACTGCTGATGTATGAAGTTTATTATTATGTTTTTCTTT
TTCTTTATTTACATATAAGAATGCATTTTGATGTAACGGTAATAATGAAAGTCTCAAGAG
AACTTGGTATGAACAAAACTTGATATTATATTATTAAAGAACCTTTATTTC

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 8

CO CL864Contig1 739 8 14 U
TTTTTTTTACTCAGACCCATAATACTTTTGGCTTATTGATAGTCACAAAGATAAAACTTA
CAGAGATATCTCATGACCAAACCATAAAACAGACACAGAAGGACAAGACTCACTGTCACC
GGCAAAACAACCGGAGAAATCAGTCATTATTATTACACATAACATAAAGGTTTATTGCAA
GACTCTTAGGGGTTTGTGTGGTTATCTATTTGCAGGTGCAAGGGTTGCACTTGCAGTCAG
ATCCGCATTTGCAGGCATCGTTCTCGGCAACGAAAGTCTCGCCGGAAGCCTCGAACTGAG
AGTTCATCGACGGAGCAACGCCGAGGACGAGAGTCTCGGTGGTGGTGGTCTCGCCGGAGA
AGCTCAAGTCTGGGTACATTTTGCAGCCTCCGCATCCAACGCACTTGCAGCCAGCTCCGC
AACCACAGTTTCCTCCACAGCAAGACATTTTCTCTTGAGAATTGCGAAAGATAGAAGATA
TTAATTTGCCTTGAAGAAGAAGCTTTTTAAAACAGTTAGCGAATCCTATGTTCTGTGAAG
GCTTTAACCAGCTTAGCAGCTACTTTATGTGACTTAGTAATGAGCATAACGCCGCTAGTG
TCACGGTCTAATCTATTCGCAAGATGAAACTCATTCAATGAAGAATCTGACAAAATTAAA
AAAAAAAAAGATTCAATTATGGAAGAGAGAGATAGATTCAGATAATTTTTCCACAAGATG
TACTCACCAAGGATGATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C688JQ U 246
AF RR2C688TF C 13
AF RR2BJ47JQ U 9
AF RR2EJ52JQ U 13
AF RR2EJ52TF C 274
AF RR2BJ47TF C 9
AF RR2GI58JQB U 9
AF RR2GI58TF C 1
BS 1 8 RR2GI58TF
BS 9 24 RR2BJ47JQ
BS 25 25 RR2EJ52JQ
BS 26 245 RR2BJ47JQ
BS 246 266 RR2C688JQ
BS 267 267 RR2BJ47JQ
BS 268 358 RR2C688JQ
BS 359 359 RR2BJ47JQ
BS 360 446 RR2C688JQ
BS 447 478 RR2BJ47JQ
BS 479 479 RR2EJ52JQ
BS 480 526 RR2BJ47JQ
BS 527 714 RR2GI58JQB
BS 715 739 RR2GI58TF

RD RR2C688JQ 201 0 0
CATTTGCAGGCATCGTTCTCGACAACGAAAGTCTCGCCGGAAGCCTCGAACTGAGAGTTC
ATCGACGGAGCAACGCCGAGGACGAGAGTCTCGGTGGTGGTGGTCTCGCCGGAAAAGCTC
AAGTCTGGGTACATTTTGCAGCCTCCGCATCCAACGCACTTGCAGCCAGCTCCGCAACCA
CAGTTTCCTCCACAGCAAGAC

QA 1 201 1 201
DS 

RD RR2C688TF 514 0 0
AGACCCATAATACTTTTGGCTTATTGATAGTCACAAAGATAAAACTTACAGAGATATCTC
ATGACCAAACCATAAAACAGACACAGAAGGACAAGACTCACTGTCACCGGCAAAACAACC
GGAGAAATCAGTCATTATTATTACACATAACATAAAGGTTTATTGCAAGACTCTTAGGGG
TTTGTGTGGCTATCTATTTGCAGGTGCAAGGGTTGCACTTGCAGTCAGATCCGCATTTGC
AGGCATCGTTCTCGACAACGAAAGTCTCGCCGGAAGCCTCGAACTGAGAGTTCATCGACG
GAGCAACGCCGAGGACGAGAGTCTCGGTGGTGGTGGTCTCGCCGGAGAAGCTCAAGTCTG
GGTACATTTTGCAGCCTCCGCATCCAACGCACTTGCAGCCAGCTCCGCAACCACAGTTTC
CTCCACAGCAAGACATTTTCTCTTGAGAATTGCGAAAGATAGAAGATATTAATTTGCCTT
GAAGAAG***CTTTTTAAAACAGTTAGCGAATCC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2BJ47JQ 518 0 0
ACTCAGACCCATAATAATTTTGGCTTATTGATAGTCACAAAGATAAAACTTACAGAGATA
TCTCATGACCAAACCATAAAACAGACACAGAAGGACAAGACTCACTGTCACCGGCAAAAC
AACCGGAGAAATCAGTCATTATTATTACACATAACATAAAGGTTTATTGCAAGACTCTTA
GGGGTTTGTGTGGTTATCTATTTGCAGGTGCAAGGGTTGCACTTGCAGTCAGATCCGCAT
TTGCAGGCATCGTTCTCGGCAACGAAAGTCTCGCCGGAAGCCTCGAACTGAGAGTTCATC
GACGGAGCAACGCCGAGGACGAGAGTCTCGGTGGTGGTGGTCTCGCCGGAGAAGCTCAAG
TCTGGGTACATTTTGCAGCCTCCGCATCCAACGCACTTGCAGCCAGCTCCGCAACCACAG
TTTCCTCCACAGCAAGACATTTTCTCTTGAGAATTGCGAAAGATAGAAGACATTAATTTG
CCTTGAAGAAGAAGCTTTTTAAAACAGTTAGCGAATCC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2EJ52JQ 514 0 0
G
GACCCATAATACTTTTGGCTTATTGATAGTCACAAAGATAAAACTTACAGAGATATCTCA
TGACCAAACCATAAAACAGACACAGAAGGACAAGACTCACTGTCACCGGCAAAACAACCG
GAGAAATCAGTCATTATTATTACACATAACATAAAGGTTTATTGCAAGACTCTTAGGGGT
TTGTGTGGTTATCTATTTGCAGGTGCAAGGGTTGCACTTGCAGTCAGATCCGCATTTGCA
GCCATCGTTCTCGGCAACGAAAGTCTCGCCGGAAGCCTCGAACTGAGAGTTCATCGACGG
AGCAACGCCGAGGACGAGAGTCTCGGTGGTGGTGGTCTCGCCGGAGAAGCTCAAGTCTGG
GTACATTTTGCAGCCTCCGCATCCAACGCACTTGCAGCCAGCTCCGCAACCACAGTTTCC
TCCACAGCAAGACATTTTCTCTTGAGAATTGCGAAAGATAGAAGATATTAATTTGCCTTG
AAGAAGAAGCTTTTTAAAACAGTTAGCGAATCC

QA 2 514 2 514
DS 

RD RR2EJ52TF 253 0 0
AAGTCTCGCCGGAAGCCTCGAACTGAGAGTTCATCGACGGAGCAACGCCGAGGACGAGAG
TCTCGGTGGTGGTGGTCTCGCCGGAGAAGCTCAAGTCTGGGTACATTTTGCAGCCTCCGC
ATCCAACGCACTTGCAGCCAGCTCCGCAACCACAGTTTCCTCCACAGCAAGACATTTTCT
CTTGAGAATTGCGAAAGATAGAAGATATTAATTTGCCTTGAAGAAGAAGCTTTTTAAAAC
AGTTAGCGAATCC

QA 1 253 1 253
DS 

RD RR2BJ47TF 518 0 0
ACTCAGACCCATAATAATTTTGGCTTATTGATAGTCACAAAGATAAAACTTACAGAGATA
TCTCATGACCAAACCATAAAACAGACACAGAAGGACAAGACTCACTGTCACCGGCAAAAC
AACCGGAGAAATCAGTCATTATTATTACACATAACATAAAGGTTTATTGCAAGACTCTTA
GGGGTTTGTGTGGTTATCTATTTGCAGGTGCAAGGGTTGCACTTGCAGTCAGATCCGCAT
TTGCAGGCATCGTTCTCGGCAACGAAAGTCTCGCCGGAAGCCTCGAACTGAGAGTTCATC
GACGGAGCAACGCCGAGGACGAGAGTCTCGGTGGTGGTGGTCTCGCCGGAGAAGCTCAAG
TCTGGGTACATTTTGCAGCCTCCGCATCCAACGCACTTGCAGCCAGCTCCGCAACCACAG
TTTCCTCCACAGCAAGACATTTTCTCTTGAGAATTGCGAAAGATAGAAGACATTAATTTG
CCTTGAAGAAGAAGCTTTTTAAAACAGTTAGCGAATCC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2GI58JQB 706 0 0
ACTCAGACCCATAATACTTTTGGCTTATTGATAGTCACAAAGATAAAACTTACAGAGATA
TCTCATGACCAAACCATAAAACAGACACAGAAGGACAAGACTCACTGTCACCGGCAAAAC
AACCGGAGAAATCAGTCATTATTATTACACATAACATAAAGGTTTATTGCAAGACTCTTA
GGGGTTTGTGTGGTTATCTATTTGCAGGTGCAAGGGTTGCACTTGCAGTCAGATCCGCAT
TTGCAGGAATCGTTCTCGGCAACGAAAGTCTCGCCGGAAGCCTCGAACTGAGAGTTCATC
GACGGAGCAACGCCGAGGACGAGAGTCTCGGTGGTGGTGGTCTCGCCGGAAAAGCTCAAG
TCTGGGTACATTTTGCAGCCTCCGCATCCAACGCACTTGCAGCCAGCTCCGCAACCACAG
TTTCCTCCACAGCAAGACATTTTCTCTTGAGAATTGCGAAAGATAGAAGATATTAATTTG
CCTTGAAGAAGAAGCTTTTTAAAACAGTTAGCGAATCTTATGTTCTGTGAAGGCTTTAAC
CAGCTTAGCAGCTACTTTATGTGACTTAGTAATGAGCATAACGCCGCTAGTGTCACGGTC
TAATCTATTCGCAAGATGAAACTCATTCAATGAAGAATCTGACAAAATTAAAAAAAAAAA
AGATTCAATTATGGAAGAGAGAGATAGATTCAGATAATTTTTCCAC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2GI58TF 739 0 0
TTTTTTTTACTCAGACCCATAATACTTTTGGCTTATTGATAGTCACAAAGATAAAACTTA
CAGAGATATCTCATGACCAAACCATAAAACAGACACAGAAGGACAAGACTCACTGTCACC
GGCAAAACAACCGGAGAAATCAGTCATTATTATTACACATAACATAAAGGTTTATTGCAA
GACTCTTAGGGGTTTGTGTGGTTATCTATTTGCAGGTGCAAGGGTTGCACTTGCAGTCAG
ATCCGCATTTGCAGGAATCGTTCTCGGCAACGAAAGTCTCGCCGGAAGCCTCGAACTGAG
AGTTCATCGACGGAGCAACGCCGAGGACGAGAGTCTCGGTGGTGGTGGTCTCGCCGGAGA
AGCTCAAGTCTGGGTACATTTTGCAGCCTCCGCATCCAACGCACTTGCAGCCAGCTCCGC
AACCACAGTTTCCTCCACAGCAAGACATTTTCTCTTGAGAATTGCGAAAGATAGAAGATA
TTAATTTGCCTTGAAGAAGAAGCTTTTTAAAACAGTTAGCGAATCTTATGTTCTGTGAAG
GCTTTAACCAGCTTAGCAGCTACTTTATGTGACTTAGTAATGAGCATAACGCCGCTAGTG
TCACGGTCTAATCTATTCGCAAGATGAAACTCATTCAATGAAGAATCTGACAAAATTAAA
AAAAAAAAAGATTCAATTATGGAAGAGAGAGATAGATTCAGATAATTTTTCCACAAGATG
TACTCACCAAGGATGATGC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 7

CO CL865Contig1 897 7 26 U
CCACTGAACCAATCTCAACAGATAAGGAAACTTCACAAGACAGAAACAGAGAGAGATGAG
CCGTTGCTGCTATCTTGGGCTCTGTGTCCCGAATGCTTTGTCCCCTCTTTCTCCAAGGCC
TCGCAGCGTCAAAGCTCCTCTCTGTATTACATCTCACACAAAACCCATCACTAACACCGA
TTCTCTTCTTCAAAATGTTGCCAAGATGAGAGCAAATCCTGGTGATATCTTTGGAGCAAA
GAAGACAATCTTTGCAGCTCAACTAGGGACAGTTCTTGCTATGATTGATCATCCGGCGTT
GGCTATAACTGGAGTCAACCACGAGCAGGAACTGGGCAGCGTTGTGCTCGACATCGGTAT
CATATCTGTTTTCTACTTCCTAGTAATGCCACCAATCATAATGAACTGGCTGAGAGTAAG
ATGGTACAGAAGGAAGTTCTTCGAGATGTATTTACAGTTCATGTTCGTCTTTATGTTCTT
CCCCGGGCTACTGTTATGGGCACCATTTCTCAACTTCAGAAAGTTCCCAAGAGATCCAAA
TATGAAGTATCCTTGGGACAAACCAAAAGACCCTTCCACTATCAAGAACGGTTACCTCAA
GTACCCATTTGCACAGCCAGAAGACTACGACTACTAAAAGTTCCTTACATATCTTGTCAC
TGTATGTACGCTGGATTCACTCAATGTGCATGCTCTCTTATTATACTCAGGCTTAAGGCT
TTATGTTCAATATAGACCCATTAGCTGAACCAGCCAAGTTATAGTCTGCTCGGACAAATG
GGTGTCACCGAAATAGACCCATTTATATTTGGAGGTGAACAACCAATGGTCGGCCTACAC
ATTTAACAATAGTGAAGCTCAAAACATAATAAACAGAAATAACTTTATTCTCATTGC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 
40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 
45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 5 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 20 35 35 35 35 20 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP56TF U 22
AF RR2FV44TF U 18
AF RR2AG58JQ C 1
AF RR2AG58TF U 1
AF RR2C416TF U 4
AF RR2EK61TF U 22
AF RR2EK61JQ C 184
BS 1 5 RR2AG58JQ
BS 6 23 RR2AG58TF
BS 24 63 RR2FP56TF
BS 64 64 RR2AG58TF
BS 65 216 RR2FP56TF
BS 217 218 RR2C416TF
BS 219 279 RR2FP56TF
BS 280 280 RR2C416TF
BS 281 303 RR2FP56TF
BS 304 304 RR2C416TF
BS 305 342 RR2FP56TF
BS 343 343 RR2C416TF
BS 344 471 RR2FP56TF
BS 472 472 RR2C416TF
BS 473 642 RR2FP56TF
BS 643 643 RR2C416TF
BS 644 665 RR2FP56TF
BS 666 666 RR2C416TF
BS 667 669 RR2FP56TF
BS 670 670 RR2C416TF
BS 671 708 RR2FP56TF
BS 709 730 RR2AG58TF
BS 731 731 RR2EK61TF
BS 732 748 RR2C416TF
BS 749 799 RR2EK61TF
BS 800 897 RR2EK61JQ

RD RR2FP56TF 687 0 0
GG
AAGGAAACTTCACAAGACAGAAACAGAGAGAGATGAGCCGCTGCTGCTATCTTGGGCTCT
GTGTCCCGAATGCTTTGTCCCCTCTTTCTCCAAGGCCTCGCAGCGTCAAAGCTCCTCTCT
GTATTACATCTCACACAAAACCCATCACTAACACCGATTCTCTTCTTCAAAATGTTGCCA
AGATGAGAGCAAAGGCTGGTGATATCTTTGGAGCAAAGAAGACAATCTTTGCAGCTCAAC
TAGGGACAGTTCTTGCCATGATTGATCATCCGGCGTTGGCAATAACTGGAGTCAACCACG
AGCAGGAACTGGGCAGCGTGGTGCTCGACATCGGTATCATATCTGTTTTCTACTTCCTAG
TAATGCCACCAATCATAATGAACTGGCTGAGAGTAAGATGGTACAGAAGGAAGTTCTTCG
AGATGTATTTACAGTTCATGTTCGTCTTCATGTTCTTCCCCGGGCTACTGTTATGGGCAC
CATTTCTCAACTTCAGAAAGTTCCCAAGAGATCCAAATATGAAGTATCCTTGGGACAAAC
CAAAAGACCCTTCCACTATCAAGAACGGTTACCTCAAGTACCCATTTGCACAGCCAGAAG
ACTACGACTACTAAAAGTTTCTTACATATCTTGTCACTGTATATACTCTGGATTCACTCA
ATGTGCATGCTCTCTTATTATACTC

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR2FV44TF 689 0 0
GG
AGATAAGGAAACTTCACAAGACAGAAACAGAGAGAGATGAGCCGTTGCTGCTATCTTGGG
CTCTGTGTCCCGAATGCTTTGTCCCCTCTTTCTCCAAGGCCTCGCAGCGTCAAAGCTCCT
TTCTGTATTACATCTCACACAAAACCCATCTCTAACACCGATTCTCTTCTTCAAAATGTT
GCCAAGATGAGAGCAAATCCTGGTGATATCTTTGGAGCAAAGAAGACAATCTTTGCAGCT
CAACTAGGGACAGTTCTTGCTATGATTGATCATCCGGCGTTGGCTATAACTGGAGTCAAC
CACGAGCAGGAACTGGGCAGCGTTGTGCTCGACATCGGTATCATATCTGTTTTCTACTTC
CTAGTAATGCCACCAATCATAATGAACTGGCTGAGAGTAAGATGGTACAGAAGGAAGTTC
TTCGAGATGTATTTACAGTTCATGTTCGTCTTTATGTTCTTCCCCGGGCTACTGTTATGG
GCACCATTTCTCAACTTCAGAAAGTTCCCAAGAGATCCAAATATGAAGTATCCTTGGGTC
AAACCAAAAGACCCTTCCACTATCAAGAACGGTTACCTCAAGTACCCATTTGCACAGCCA
GAAGACTACGACTACTAAAAGTTCCTTACATATCTTGTCACTGTATGTACGCTGGATTCA
CTCAATGTGCATGCTCTCTTATTATAC

QA 3 689 3 689
DS 

RD RR2AG58JQ 731 0 0
CCACTGAACCAATCTCAACAGATAAGGAAACTTCACAAGACAGAAACAGAGAGAGATGAG
CCGTTGCTGCTATCTTGGGCTCTGTGTCCCGAATGCTTTGTCCCCTCTTTCTCCAAGGCC
TCGCAGCGTCAAAGCTCCTCTCTGTATTACATCTCACACAAAACCCATCACTAACACCGT
TTCTCTTCTTCAAAATGTTGCCAAGATGAGAGCAGAGGCTGGTGATATCTTTGGAGCAAA
GAAGACAATCTTTGCAGCTCAACTAGGGACAGTTCTTGCCATGATTGATCATCCGTCGTT
GGCAATAACTGGAGTCAACCACGAGCAGGAACTGGGCAGCGTGGTGCTCGACATCGGTAT
CATATCTGTTTTCTACTTCCTAGTAATGCCACCAATCATAATGAACTGGCTGAGAGTAAG
ATGGTACAGAAGGAAGTTCTTCGAGATGTATTTACAGTTCATGTTCGTCTTCATGTTCTT
CCCCGGGCTACTGTTATGGGCACCATTTCTCAACTTCAGAAAGTTCCCAAGAGATCCAAA
TATGAAGTATCCTTGGGACAAACCAAAAGGCCCTTCCACTATCAAGAACGGTTACCTCAA
GTACCCATTTGCACAGCCAGAAGACTACGACTACTAAAAGTTTCTTACATATCTTGTCAC
TGTATATACTCTGGATTCACTCAATGTGCATGCTCTCTTATTATACTCAGGCTTAAGGCT
TTATGTTCAA
G

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2AG58TF 731 0 0
CCACT
GAACCAATCTCAACAGATAAGGAAACTTCACAAGACAGAAACAGAGAGAGATGAGCCGTT
GCTGCTATCTTGGGCTCTGTGTCCCGAATGCTTTGTCCCCTCTTTCTCCAAGGCCTCGCA
GCGTCAAAGCTCCTCTCTGTATTACATCTCACACAAAACCCATCACTAACACCGTTTCTC
TTCTTCAAAATGTTGCCAAGATGAGAGCAGAGGCTGGTGATATCTTTGGAGCAAAGAAGA
CAATCTTTGCAGCTCAACTAGGGACAGTTCTTGCCATGATTGATCATCCGTCGTTGGCAA
TAACTGGAGTCAACCACGAGCAGGAACTGGGCAGCGTGGTGCTCGACATCGGTATCATAT
CTGTTTTCTACTTCCTAGTAATGCCACCAATCATAATGAACTGGCTGAGAGTAAGATGGT
ACAGAAGGAAGTTCTTCGAGATGTATTTACAGTTCATGTTCGTCTTCATGTTCTTCCCCG
GGCTACTGTTATGGGCACCATTTCTCAACTTCAGAAAGTTCCCAAGAGATCCAAATATGA
AGTATCCTTGGGACAAACCAAAAGGCCCTTCCACTATCAAGAACGGTTACCTCAAGTACC
CATTTGCACAGCCAGAAGACTACGACTACTAAAAGTTTCTTACATATCTTGTCACTGTAT
ATACTCTGGATTCACTCAATGTGCATGCTCTCTTATTATACTCAGGCTTAAGGCTTTATG
TTCAA
G

QA 6 730 6 730
DS 

RD RR2C416TF 764 0 0
GA
GAACCAATCTCAACAGATAAGGAAACTTCACAAGACAGAAACAGAGAGAGATGAGCCGTT
GCTGCTATCTTGGGCTCTGTGTCCCGAATGCCTTGTCCCCTCTTTCTCCAAGGCCTCGCA
GCGTCAAAGCTCCTTTCTGTATTACATCTCACACAAAACCCATCTCTAACACCGATTCTC
TTCTTCAAAATGTTGCCAAGATGAGAGCAAATCCTGGTGATATCTTTGGAGCAAAGAAGA
CAATCTTCGCAGCTCAACTAGGGACAGTTCTTGCTATGATTGATCATCCGGCGTTGGCTA
TAACTGGAGTCAACCACGAGCAGGAACTGTGCAGCGTTGTGCTCGACATCGGTATCATAT
CTGTTTTCTACTTCCTAGTAATGCCACCAATCATAATGAACTGGCTGAGAGTAAGATGGT
ACAGAAGGAAGTTCTTCGAGATGTATTTACAGTTCATGTTCGTCTTTATGTTCTTCCCCG
GGCTACTGTTATGGGCACCATTTCTCAACTTCAGAAAGTTCCCAAGAGATCCAAATATGA
AGTATCCTTGGGACAAACCAAAAGACCCTTCCACTATCAAGAACGGTTACCTCAAGTACC
CATTTGCACAGCCAGAAGACTACGACTACTAAAAGTTCCTTACATATCTTGTCACTGTAT
GTACGCTGGATTCACTCAATGTGCATGCTCTCTTATTATACTCAG*CTTAAG*CTTTATG
TTCAT*ATAGACCCATTAGCTGA
CAGCCAGTATAGTCTGCTG

QA 3 745 3 745
DS 

RD RR2EK61TF 784 0 0
GG
AAGGAAACTTCACAAGACAGAAACAGAGAGAGATGAGCCGTTGCTGCTATCTTGGGCTCT
GTGTCCCGAATGCTTTGTCCCCTCTTTCTCCAAGGCCTCGCAGCGTCAAAGCTCCTTTCT
GTATTACATCTCACACAAAACCCATCTCTAACACCGATTCTCTTCTTCAAAATGTTGCCA
AGATGAGAGCAAATCCTGGTGATATCTTTGGAGCAAAGAAGACAATCTTTGCAGCTCAAC
TAGGGACAGTTCTTGCTATGATTGATCATCCGGCGTTGGCTATAACTGGAGTCAACCACG
AGCAGGAACTGGGCAGCGTTGTGCTCGACATCGGCATCATATCTGTTTTCTACTTCCTAG
TAATGCCACCAATCATAATGAACTGGCTGAGAGTAAGATGGTACAGAAGGAAGTTCTTCG
AGATGTATTTACAGTTCATGTCCGTCTTTATGTTCTTCCCCGGGCTACTGTTATGGGCAC
CATTTCTCAACTTCAGAAAGTTCCCAAGAGATCCAAATATGAAGTATCCTTGGGACAAAC
CAAAAGACCCTTCCACTATCAAGAACGGTCACCTCAAGTACCCATTTGCACAGCCAGAAG
ACTACGACTACTAAAAGTTCCTTACATATCTTGTCACTGTATGTACGCTGGATTCACTCA
ATGTGCATGCTCTCTTATTATACTCAGGCTTA*GGCTTTATGTTCAATATAGACCCATTA
GCTGAACCAGCCAAGTTATAGTCTGCTCGGACAAATGGGTGTCACCGAAATAGACC
ATTTAT

QA 3 778 3 778
DS 

RD RR2EK61JQ 714 0 0
TCTTCTTCAAAATGTTGCCAAGATGAGAGCAAATCCTGGTGATATCTTTGGAGCAAAGAA
GACAATCTTTGCAGCTCAACTAGGGACAGTTCTTGCTATGATTGATCATCCGGCGTTGGC
TATAACTGGAGTCAACCACGAGCAGGAACTGGGCAGCGTTGTGCTCGACATCGGCATCAT
ATCTGTTTTCTACTTCCTAGTAATGCCACCAATCATAATGAACTGGCTGAGAGTAAGATG
GTACAGAAGGAAGTTCTTCGAGATGTATTTACAGTTCATGTCCGTCTTTATGTTCTTCCC
CGGGCTACTGTTATGGGCACCATTTCTCAACTTCAGAAAGTTCCCAAGAGATCCAAATAT
GAAGTATCCTTGGGACAAACCAAAAGACCCTTCCACTATCAAGAACGGTCACCTCAAGTA
CCCATTTGCACAGCCAGAAGACTACGACTACTAAAAGTTCCTTACATATCTTGTCACTGT
ATGTACGCTGGATTCACTCAATGTGCATGCTCTCTTATTATACTCAGGCTTAAGGCTTTA
TGTTCAATATAGACCCATTAGCTGAACCAGCCAAGTTATAGTCTGCTCGGACAAATGGGT
GTCACCGAAATAGACCCATTTATATTTGGAGGTGAACAACCAATGGTCGGCCTACACATT
TAACAATAGTGAAGCTCAAAACATAATAAACAGAAATAACTTTATTCTCATTGC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 2 5

CO CL866Contig1 681 2 3 U
TAAAGATCAACGGCTGGAGGAATGTCGTCAACGGTGAGATCTACTCCATCATCTGGCAAG
TCAGATCCGAGTGGTCCTAGTATCCCTTCAGAACTCAGCGTCAGTCCACTCTCAGGTTGG
AAACGAAGCATGTCAGCACGGGCCATTGCTTCTGCTTGGGCGATTCTCTGTCTAAACGTC
TGAGCCATCTCCTCAGCCTTCTCGAAAACAAGTTTTGGGTTGCGAATCATATCACCAGGT
GTTGGCTCCAGCTTCTTGGTGGAGAGACTTACTCTTCCTCTGTCACGGTCGTGGCTCAGT
ATCATAACCTTGAGGGTGTCACCGGGCTGAAGAACAGTAGCGATATCTGAGACACGGTCA
TGACTGATCTGACTGACATGGAGAAGCCCGTTGATTCCACCAATGTCAATGAAGGCACCG
TACGGTTTCAAGCTCTGAACAACTCCTATAACCACAGATCCAATTCCAAGCTGTGCCTGG
CTGTCTGCTACAGCTTTACGGTTGCTGAGTACAAGCTTTGTTTGTTCCTCATCAACCTCC
ACAAACTTTAGAGGTATTTCTTTATAAAGAAGCTCCTCAGCTGCTGCTTTCGATGATATT
TGCGAGAATGGTACAAACCCACGAAGACCTTCCACTAGAGCCACTAATCCACCTTTGTTA
GCACCAATAACCTTAGCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN43JQ U 27
AF RR2AN43TF C 1
BS 1 26 RR2AN43TF
BS 27 471 RR2AN43JQ
BS 472 681 RR2AN43TF

RD RR2AN43JQ 445 0 0
GTCAACGGTGAGATCTACTCCATCATCTGGCAAGTCAGATCCGAGTGGTCCTAGTATCCC
TTCAGAACTCAGCGTCAGTCCACTCTCAGGTTGGAAACGAAGCATGTCAGCACGGGCCAT
TGCTTCTGCTTGGGCGATTCTCTGTCTAAACGTCTGAGCCATCTCCTCAGCCTTCTCGAA
AACAAGTTTTGGGTTGCGAATCATATCACCAGGTGTTGGCTCCAGCTTCTTGGTGGAGAG
ACTTACTCTTCCTCTGTCACGGTCGTGGCTCAGTATCATAACCTTGAGGGTGTCACCGGG
CTGAAGAACAGTAGCGATATCTGAGACACGGTCATGACTGATCTGACTGACATGGAGAAG
CCCGTTGATTCCACCAATGTCAATGAAGGCACCGTACGGTTTCAAGCTCTGAACAACTCC
TATAACCACAGATCCAATTCCAAGC

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR2AN43TF 681 0 0
TAAAGATCAACGGCTGGAGGAATGTCGTCAACGGTGAGATCTACTCCATCATCTGGCAAG
TCAGATCCGAGTGGTCCTAGTATCCCTTCAGAACTCAGCGTCAGTCCACTCTCAGGTTGG
AAACGAAGCATGTCAGCACGGGCCATTGCTTCTGCTTGGGCGATTCTCTGTCTAAACGTC
TGAGCCATCTCCTCAGCCTTCTCGAAAACAAGTTTTGGGTTGCGAATCATATCACCAGGT
GTTGGCTCCAGCTTCTTGGTGGAGAGACTTACTCTTCCTCTGTCACGGTCGTGGCTCAGT
ATCATAACCTTGAGGGTGTCACCGGGCTGAAGAACAGTAGCGATATCTGAGACACGGTCA
TGACTGATCTGACTGACATGGAGAAGCCCGTTGATTCCACCAATGTCAATGAAGGCACCG
TACGGTTTCAAGCTCTGAACAACTCCTATAACCACAGATCCAATTCCAAGCTGTGCCTGG
CTGTCTGCTACAGCTTTACGGTTGCTGAGTACAAGCTTTGTTTGTTCCTCATCAACCTCC
ACAAACTTTAGAGGTATTTCTTTATAAAGAAGCTCCTCAGCTGCTGCTTTCGATGATATT
TGCGAGAATGGTACAAACCCACGAAGACCTTCCACTAGAGCCACTAATCCACCTTTGTTA
GCACCAATAACCTTAGCCTTC

QA 1 681 1 681
DS 



CO CL866Contig2 848 3 10 U
GGCATTCACAGAATCAAGCATATGGAGGAAGCTGGTATAGTTCCTGGTATGGTGGAGGAG
TTCGTCATCATTGGTGAGAACGAGAGTGATGACAGTTTGCTGTTGAGTTTAAGGATGATT
CAGTATGAACTCGCTTGGGAACGGTGTAGGCAGCTTCAGGCTGAGGATGTTGTCGTTAAA
GCTAAGGTTATTGGTGCTAACAAAGGTGGATTGGTGGCTATGGTGGAGGGTCTTCGTGGG
TTTGTGCCATTTTCGCAGATCTCATCGAAAGCACCAGCTGAAGAGCTACTTGAGAAAGAG
ATACCTCTCAAGTTTGTGGAGGTTGATGAGGAACAGACAAAGCTTGTCCTCAGTAACCGT
AAAGCTGTAGCAGATAGCCAGGCTCAGCTTGGAATTGGACCTGTGGTCCTCGGAGTTGTT
CAGAGCTTGAAACCCTATGGTGCCTTCATTGACATTGGTGGAATCAATGGGCTTCTCCAT
GTCAGTCAGATCAGTCATGACCGTGTCTCGGATATCGCTACTGTTCTTCAGCCCGGTGAC
ACTTTGAAGGTTATGATACTGAGCCATGACCGTGACAGGGGAAGAGTAAGTCTCTCCACA
AAGAAGCTGGAGCCAACACCTGGTGATATGATTCGCAACCCAAAACTTGTTTTCGAGAAG
GCTGAGGAGATGGCTCAGACGTTCAGACAGAGAATCGCCCAAGCAGAAGCTATGGCCCGT
GCAGACATGCTTCGCTTCCAACCTGAGAGTGGACTGACGCTGAGTTCTGAAGGGATACTA
GGACCACTCAGATCTGACTTGCCAGATGATGGAGTTGATCTCACCGTCGGTGACATTCCT
CCTGCCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F603TF U 373
AF RR2CB11TF U 1
AF RR2F603JQ C 189
BS 1 281 RR2CB11TF
BS 282 282 RR2F603JQ
BS 283 399 RR2CB11TF
BS 400 400 RR2F603TF
BS 401 660 RR2CB11TF
BS 661 661 RR2F603JQ
BS 662 666 RR2CB11TF
BS 667 667 RR2F603JQ
BS 668 690 RR2CB11TF
BS 691 848 RR2F603JQ

RD RR2F603TF 159 0 0
GATAGCCAGGCTCAGCTTGGAATTGGACCTGTGGTCCTCGGAGTTGTTCAGAGCTTGAAA
CCCTATGGTGCCTTCATTGACATTGGTGGAATCAATGGGCTTCTCCATGTCAGTCAGATC
AGTCATGACCGTGTCTCGGATATCGCTACTGTTCTTCAG

QA 1 159 1 159
DS 

RD RR2CB11TF 690 0 0
GGCATTCACAGAATCAAGCATATGGAGGAAGCTGGTATAGTTCCTGGTATGGTGGAGGAG
TTCGTCATCATTGGTGAGAACGAGAGTGATGACAGTTTGCTGTTGAGTTTAAGGATGATT
CAGTATGAACTCGCTTGGGAACGGTGTAGGCAGCTTCAGGCTGAGGATGTTGTCGTTAAA
GCTAAGGTTATTGGTGCTAACAAAGGTGGATTGGTGGCTATGGTGGAGGGTCTTCGTGGG
TTTGTGCCATTTTCGCAGATCTCATCGAAAGCACCAGCTGAGGAGCTACTTGAGAAAGAG
ATACCTCTCAAGTTTGTGGAGGTTGATGAGGAACAGACAAAGCTTGTCCTCAGTAACCGT
AAAGCTGTAGCAGATAGCCAGGCTCAGCTTGGAATTGGATCTGTGGTCCTCGGAGTTGTT
CAGAGCTTGAAACCCTATGGTGCCTTCATTGACATTGGTGGAATCAATGGGCTTCTCCAT
GTCAGTCAGATCAGTCATGACCGTGTCTCGGATATCGCTACTGTTCTTCAGCCCGGTGAC
ACTTTGAAGGTTATGATACTGAGCCATGACCGTGACAGGGGAAGAGTAAGTCTCTCCACA
AAGAAGCTGGAGCCAACACCTGGTGATATGATTCGCAACCCAAAACTTGTTTTCGAGAAG
*CTGAG*AGATGGCTCAGACGTTCAGACAG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2F603JQ 660 0 0
TATTGGTGCTAACAAAGGTGGATTGGTGGCTATGGTGGAGGGTCTTCGTGGGTTTGTGCC
ATTTTCGCAGATCTCATCGAAAGCACCAGCTGAAGAGCTACTTGAGAAAGAGATACCTCT
CAAGTTTGTGGAGGTTGATGAGGAACAGACAAAGCTTGTCCTCAGTAACCGTAAAGCTGT
AGCAGATAGCCAGGCTCAGCTTGGAATTGGACCTGTGGTCCTCGGAGTTGTTCAGAGCTT
GAAACCCTATGGTGCCTTCATTGACATTGGTGGAATCAATGGGCTTCTCCATGTCAGTCA
GATCAGTCATGACCGTGTCTCGGATATCGCTACTGTTCTTCAGCCCGGTGACACTTTGAA
GGTTATGATACTGAGCCATGACCGTGACAGGGGAAGAGTAAGTCTCTCCACAAAGAAGCT
GGAGCCAACACCTGGTGATATGATTCGCAACCCAAAACTTGTTTTCGAGAAGGCTGAGGA
GATGGCTCAGACGTTCAGACAGAGAATCGCCCAAGCAGAAGCTATGGCCCGTGCAGACAT
GCTTCGCTTCCAACCTGAGAGTGGACTGACGCTGAGTTCTGAAGGGATACTAGGACCACT
CAGATCTGACTTGCCAGATGATGGAGTTGATCTCACCGTCGGTGACATTCCTCCTGCCGT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 8

CO CL867Contig1 887 8 27 U
GGACGGGGGATTCGATCCAAAGTCG***TTGAGCGATCTCCAATGGCGGAAGAAGATTTC
GTTAAAGAGGGTTATGCTGAGATCGTTGTTGTACGTCATGGAGAAACATCTTGGAATGCC
GAGAGAAAGATCCAGGGTCATTTGGATGTTGAACTAAACGATGCAGGAAGACAACAAGCA
GAAAAAGTTGCTGAGCGGTTATCAAAGGAGCCTAAGGTATCTTATGTTTACTCTTCTGAC
TTGAAGAGAGCCTTTGAGACTGCTCAGATCATTGCAGCTAAATGCGGCAAGGTTGAGGTA
CTTACTGATCCTGATTTGCGGGAGAGGCATTTAGGAGATATGCAAGGTCTTGTGTACCAA
GAAGCTTCCAAACTTCGCCCTGAAGCTTACAAGGCCTTCTCATCTAACCGCACAGACGTT
GACATTCCAGGTGGAGGAGAAAGTCTTGACAAACTCTACGACAGATGCACATCTGCATTA
CAGAGAATCGGCGACAAACATCAAGGTGAAAGAGTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGTGTG
ATCCGATCTCTCTACGAGAGAGCTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTCAAC
ACATCGGTCAATGTGTTCCGTTTATTCGACGGAGACAAATGGACAATCCAAGTTTGGGGA
GATGTGTCTCATTTGGACCAAACCGGTTTCTTGCAATCCGGTTTTGGTGGTGACAGAACC
TCCGGTTAAGATTCAATGACTCTTTCCACTGAGGTTTTCTGTAATTTAAATTTGACTCCG
TTACTTTCTTCTTTTGCAATTTGACCTCATAACTTTGAGGTTATCCCGATTTAGCCTGTA
ATTGGGAGGACTAATAAAGTAATTGCTATAAATTGAACGTGATGCAT


BQ
10 10 10 10 10 5 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 25 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 20 50 50 20 
50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 0 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H437TF U 6
AF RR2E289TF U 1
AF RR2D883TF U 6
AF RR2D548TF U 26
AF RR2D883JQ C 102
AF RR2D548JQ C 353
AF RR2H437JQB C 309
AF RR2E289JQ C 257
BS 1 5 RR2E289TF
BS 6 7 RR2D883TF
BS 8 13 RR2E289TF
BS 14 14 RR2D883TF
BS 15 22 RR2E289TF
BS 23 23 RR2D883TF
BS 24 25 RR2E289TF
BS 26 28 RR2D883TF
BS 29 58 RR2E289TF
BS 59 59 RR2D883TF
BS 60 98 RR2E289TF
BS 99 99 RR2D883TF
BS 100 326 RR2E289TF
BS 327 327 RR2D883TF
BS 328 467 RR2E289TF
BS 468 468 RR2D883TF
BS 469 506 RR2E289TF
BS 507 508 RR2D883TF
BS 509 539 RR2E289TF
BS 540 540 RR2D883TF
BS 541 542 RR2E289TF
BS 543 543 RR2D883TF
BS 544 696 RR2E289TF
BS 697 724 RR2D883TF
BS 725 725 RR2D548TF
BS 726 742 RR2D883TF
BS 743 887 RR2D883JQ

RD RR2H437TF 622 0 0
GGGGATTCGATCCAAAGTCG***TTGAGCGATCTCCAATGGCGGAAGAAGATTTCGTTAA
AGAGGGTTATGCTGAGATCGTTGTTGTACGTCATGGAGAAACATCTTGGAATGCCGAGAG
AAAGATCCAGGGTCATTTGGATGTTGAACTAAACGATGCAGGAAGACAACAAGCAGAAAA
AGTTGCTGAGCGGTTATCAAAGGAGCCTAAGGTATCTTATGTTTACTCTTCTGACTTGAA
GAGAGCCTTTGAGACTGCTCAGATCATTGCAGCTAAATGCGGCAAGGTTGAGGTACTTAC
TGATCCTGATTTGCGGGAGAGGCATTTAGGAGATATGCAAGGTCTTGTGTACCAAGAAGC
TTCCAAACTTCGCCCTGAAGCTTACAAGGCCTTCTCATCTAACCGCACAGACGTTGACAT
TCCAGGTGGAGGAGAAAGTCTTGACAAACTCTACGACAGATGCACATCTGCATTACAGAG
AATCGGCGACAAACATCAAGGTGAAAGAGTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGTGTGATCCG
ATCTCTCTACGAGAGAGCTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTCAACACATC
GGTCAATGTGTTCCGTTTATTC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2E289TF 696 0 0
GGACGCCGGATTCAATCCAAAGCCGATTTTGAGCGATCTCCAATGGCGGAAGAAGATTCC
GTTAAAGAGGGTTATGCTGAGATCGTTGTTGTACGTCACGGAGAAACATCTTGGAATGCC
GAGAGAAAGATCCAGGGTCATTTGGATGTTGAACTAAACGATGCAGGAAGACAACAAGCA
GAAAAAGTTGCTGAGCGGTTATCAAAGGAGCCTAAGGTATCTTATGTTTACTCTTCTGAC
TTGAAGAGAGCCTTTGAGACTGCTCAGATCATTGCAGCTAAATGCGGCAAGGTTGAGGTA
CTTACTGATCCTGATTTGCGGGAGAGACATTTAGGAGATATGCAAGGTCTTGTGTACCAA
GAAGCTTCCAAACTTCGCCCTGAAGCTTACAAGGCCTTCTCATCTAACCGCACAGACGTT
GACATTCCAGGTGGAGGAGAAAGTCTTGACAAACTCTACGACAGATGTACATCTGCATTA
CAGAGAATCGGCGACAAACATCAAGGACAAAGAGTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGTGTC
ATTCGATCTCTCTACGAGAGAGCTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTCAAC
ACATCGGTCAATGTGTTCCGTTTATTCGACGGAGACAAATGGACAATCCAAGTTTGGGGA
GATGTGTCTCATTTGGACCAAACCGGTTTCTTGCAA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2D883TF 737 0 0
GGGGATTCGATCCAAAGTCG***TTGAGCGATCTCCAATGGCGGAAGAAGATTTCGTTAA
AGAGGGTTATGCTGAGATCGTTGTTGTACGTCATGGAGAAACATCTTGGAATGCCGAGAG
AAAGATCCAGGGTCATTTGGATGTTGAACTAAACGATGCAGGAAGACAACAAGCAGAAAA
AGTTGCTGAGCGGTTATCAAAGGAGCCTAAGGTATCTTATGTTTACTCTTCTGACTTGAA
GAGAGCCTTTGAGACTGCTCAGATCATTGCAGCTAAATGCGGCAAGGTTGAGGTACTTAC
TGATCCTGATTTGCGGGAGAGGCATTTAGGAGATATGCAAGGTCTTGTGTACCAAGAAGC
TTCCAAACTTCGCCCTGAAGCTTACAAGGCCCTCTCATCTAACCGCACAGACGTTGACAT
TCCAGGTGGATGAGAAAGTCTTGACAAACTCTACGACAGATGCACATCTGCATTACAGAG
AATCGGCGACAAACATCAAGGTGAAAGAGTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGCGTGATCCG
ATCTCTCTACGAGAGAGCTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTCAACACATC
GGTCAATGTGTTCCGTTTATTCGACGGAGACAAATGGACAATCCAAGTTTGGGGAGATGT
GTCTCATTTGGACCAAACCGGTTTCTTGCAATCCGGTTTTGGTGGTGACAGAACCTCCG*
TTAAGATTCAATGACTC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2D548TF 711 0 0
GGG
TTGAGCGATCTCCAATGGCGGAAGAAGATTTCGTTAAAGAGGGTTATGCTGAGATCGTTG
TTGTACGTCATGGAGAAACATCTTGGAATGCCGAGAGAAAGATCCAGGGTCATTTGGATG
TTGAACTAAACGATGCAGGAAGACAACAAGCAGAAAAAGTTGCTGAGCGGTTATCAAAGG
AGCCTAAGGTATCTTATGTTTACTCTTCTGACTTGAAGAGAGCCTTTGAGACTGCTCAGA
TCATTGCAGCTAAATGCGGCAAGGTTGAGGTACTTACTGATCCTGATTTGCGGGAGAGGC
ATTTAGGAGATATGCAAGGTCTTGTGTACCAAGAAGCTTCCAAACTTCGCCCTGAAGCTT
ACAAGGCCTTCTCATCTAACCGCACAGACGTTGACATTCCAGGTGGAGGAGAAAGTCTTG
ACAAACTCTACGACAGATGCACATCTGCATTACAGAGAATCGGCGACAAACATCAAGGTG
AAAGAGTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGTGTGATCCGATCTCTCTACGAGAGAGCTCGTC
CAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTCAACACATCGGTCAATGTGTTCCGTTTATTCG
ACGGAGACAAATGGACAATCCAAGTTTGGGGAGATGTGTCTCATTTGGACCAAACCGGTT
TCTTGCAATCCGGTTTTGGTGGTGACAGAACCTCCGGTTAAGATTCAA

QA 4 711 4 711
DS 

RD RR2D883JQ 786 0 0
AA
AAACATCTTGGAATGCCGAGAGAAAGATCCAGGGTCATTTGGATGTTGAACTAAACGATG
CAGGAAGACAACAAGCAGAAAAAGTTGCTGAGCGGTTATCAAAGGAGCCTAAGGTATCTT
ATGTTTACTCTTCTGACTTGAAGAGAGCCTTTGAGACTGCTCAGATCATTGCAGCTAAAT
GCGGCAAGGTTGAGGTACTTACTGATCCTGATTTGCGGGAGAGGCATTTAGGAGATATGC
AAGGTCTTGTGTACCAAGAAGCTTCCAAACTTCGCCCTGAAGCTTACAAGGCCCTCTCAT
CTAACCGCACAGACGTTGACATTCCAGGTGGATGAGAAAGTCTTGACAAACTTTACGACA
GATGCACATCTGCATTACAGAGAATCGGCGACAAACATCAAGGTGAAAGAGTGGTGGTAG
TGACTCATGGAGGCGTGATCCGATCTCTCTACGAGAGAGCTCGTCCAAGTGCACGAAAAG
TTGAAAAGATTCTCAACACATCGGTCAATGTGTTCCGTTTATTCGACGGAGACAAATGGA
CAATCCAAGTTTGGGGAGATGTGTCTCATTTGGACCAAACCGGTTTCTTGCAATCCGGTT
TTGGTGGTGACAGAACCTCCGGTTAAGATTCAATGACTCTTTCCACTGAGGTTTTCTGTA
ATTTAAATTTGACTCCGTTACTTTCTTCTTTTGCAATTTGACCTCATAACTTTGAGGTTA
TCCCGATTTAGCCTGTAATTGGGAGGACTAATAAAGTAATTGCTATAAATTGAACGTGAT
GCAT

QA 3 786 3 786
DS 

RD RR2D548JQ 517 0 0
TGTACCAAGAAGCTTCCAAACTTCGCCCTGAAGCTTACAAGGCCTTTTCATTTAACCGCA
CAGACGTTGACATTCCAGGTGGAGGAGAAAGTCTTGACAAACTTTACGACAGATGCACAT
TTGCATTACAGAGAATCGGCGACAAACATCAAGGTGAAAGAGTGGTGGTAGTGACTCATG
GAGGTGTGATCCGATCTCTTTACGAGAGAGCTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGA
TTTTCAACACATCGGTCAATGTGTTCCGTTTATTCGACGGAGACAAATGGACAATCCAAG
TTTGGGGAGATGTGTTTCATTTGGACCAAACCGGTTTTTTGCAATCCGGTTTTGGTGGTG
ACAGAACCTCCGGTTAAGATTCAATGACTCTTTCCACTGAGGTTTTTTGTAATTTAAATT
TGACTCCGTTACTTTTTTTTTTTGCAATTTGACCTCATAACTTTGAGGTTATCCCGATTT
AGCCCGTAATTGGGAGGACTAATAAAGTAATTGCT
TT

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2H437JQB 561 0 0
TCCTGATTTGCGGGAGAGGCATTTAGGAGATATGCAAGGTCTTGTGTACCAAGAAGCTTC
CAAACTTCGCCCTGAAGCTTACAAGGCCTTTTCATCTAACCGCACAGACGTTGACATTCC
AGGTGGAGGAGAAAGTCTTGACAAACTTTACGACAGATGCACATTTGCATTACAGAGAAT
CGGCGACAAACATCAAGGTGAAAGAGTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGTGTGATCCGATC
TCTTTACGAGAGAGCTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTCAACACATCGGT
CAATGTGTTCCGTTTATTCGACGGAGACAAATGGACAATCCAAGTTTGGGGAGATGTGTT
TCATTTGGACCAAACCGGTTTCTTGCAATCCGGTTTTGGTGGTGACAGAACCTCCGGTTA
AGATTCAATGACTCTTTCCACTGAGGTTTTCTGTAATTTAAATTTGACTCCGTTACTTTT
TTCTTTTGCAATTTGACCTCATAACTTTGAGGTTATCCCGATTTAGCCTGTAATTGGGAG
GACTAATAAAGTAATTGCT
AT

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2E289JQ 613 0 0
AGACTGCTCAGATCATTGCAGCTAAATGCGGCAAGGTTGAGGTACTTACTGATCCTGATT
TGCGGGAGAGACATTTAGGAGATATGCAAGGTCTTGTGTACCAAGAAGCTTCCAAACTTC
GCCCTGAAGCTTACAAGGCCTTCTCATCTAACCGCACAGACGTTGACATTCCAGGTGGAG
GAGAAAGTCTTGACAAACTCTACGACAGATGTACATCTGCATTACAGAGAATCGGCGACA
AACATCAAGGACAAAGAGTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGTGTCATTCGATCTCTCTACG
AGAGAGCTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTCAACACATCGGTCAATGTGT
TCCGTTTATTCGACGGAGACAAATGGACAATCCAAGTTTGGGGAGATGTGTCTCATTTGG
ACCAAACCGGTTTCTTGCAATCCGGTTTTGGTGGTGACAGAACCTCTGGTTAAGATTCAG
TGACTCTTTCCACTGAGGTTTTCTGTAATTTAAATTTGACTCTGTTACTTTCTTCTTTTG
CAATTTGACCTCATAACTTTGAGGTTATCCCGATTTAGCCTGTAATTGGGAGGATTAATA
AAGTAATTGCT
AT

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 5

CO CL868Contig1 1452 5 18 U
GATCTCTGTGACCTTTGTTTGTTTCTTGTTATTCATATTAGAAATCAGTTGTGGACAATA
GGATCAGTGAACCAACCCAACCAAGAACTTGCCTCTTTAACATGAAATTACAAGGAACAA
TTAATGTTAATATTGGACAATGGATTAAATATACTGAACATGTATAGAAACAAGCATCAT
GTCAGACGGTATTGTGGGATGAAAATTCCCTGAGAAGTAACTCAACCTCTTCAACAACAC
CAAGCTTCTTAAACCACCGAGCCAACACAGCAAAAGCTTCTTTACCGACCATGATCGAGT
CTTTCTCGAGCTCAACTAAAAACCCTAACGCTTCATTCAGCTTTTCTTCCATTTCATAAG
CAGACAACACAAGAGCCACACACTTGTCAGTAGCTTTGATTCCGGCTTTTCTCATATTCT
CAAAAGCCAAACGAGCATTCTGGCTCTGACCCGAGACACTGTAAGCGTTGATGAGCAGTC
CACATAGCTTCGCATCAGGAGTGATCCCGGCGATTTGAAGAGCATCAAAAACACGCTTGG
ATCCTTGGGAATCTCCAGACATAGAGTAGGATCTCAACAAGGCCTTGTAAACCTCTCTCC
CGGCACAGATATCTAGGGAGTCCATTTCTCGGAGCAAAGCCTCTCCTTTCTCTGGAGTGC
CAGCTCTAATGTAGGCCATTATCATCGAACCGTAGGAACGATAGTCAAGTTGCTCCCCAA
GCAATTTGACATCGTTGAAAGTGTCTTCGGCCAAGCGGTGATAGCCTGCCTTGCTGTACG
ACTGAAGCATGGCAGTTAGAGTGACTTGATCAATGAGAAAGCCACGGTTTTTCATAGCAA
CAAGAGTTTTCTCAGCGTCTTGGATTTGGTTAAGCTTGCCATAGTAATGGATGATCTTGG
TATAATCACGGGGGTTGGCTTCAAAAGAATCTTCGAGCAGAGCATATTCAGCCACCTTGA
TATAAAAGGGAGAGTCAAGAGTGTTGAGGTGTTTAAGAAGGGAAAGCCAGTCAGCTCGAA
TGGGTTTCATACGCCTAACCCAAGCAGCCAACATATCATCGCAGCAAAAGCTATCCTCCT
TTTCCTCCAAGCAAATTATTATCTGCTTCATAAGCGCTTGACATCGTTTAGACATGTTAA
CAGGAATCCGACTAATTGCCTCCTCTTGTTCTTCTGTAATTTGATGATGATGATGATTCA
GATCAACCCAATTGGGGCCCTTTTCTTCCTTGTCTACAACCACCATCGTAGTAGTGCATT
TGCGACAAAAACGAAGAGGAGATTCTTGTACAAAGAAGAATGGGGTTCTTCTTCTTGTAC
TAAAGTAGAGGCTTCCACTACTAACACATGGGGAGAAGGCGGAGTTCAACACTGCATTAC
TGCTATAAAATCCCATCATTAGACCCACTCTCCCTCAGAGCCAAAGGATCATTGAAATTG
TGGCACTGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ61JQB U 189
AF RR2GO07JQ U 80
AF RR2F261JQ U 69
AF RR2GJ74JQB U 1
AF RR2GJ74TF C 756
BS 1 113 RR2GJ74JQB
BS 114 114 RR2F261JQ
BS 115 174 RR2GJ74JQB
BS 175 175 RR2F261JQ
BS 176 176 RR2GJ74JQB
BS 177 177 RR2F261JQ
BS 178 215 RR2GJ74JQB
BS 216 216 RR2F261JQ
BS 217 272 RR2GJ74JQB
BS 273 273 RR2F261JQ
BS 274 319 RR2GJ74JQB
BS 320 320 RR2GJ61JQB
BS 321 366 RR2GJ74JQB
BS 367 367 RR2F261JQ
BS 368 433 RR2GJ74JQB
BS 434 434 RR2F261JQ
BS 435 822 RR2GJ74JQB
BS 823 1452 RR2GJ74TF

RD RR2GJ61JQB 343 0 0
GTATTGTGGGATGAAAATTCCCTGAGAGGTAACTCAACCTCTTCAACAACACCAAGCTTC
TTAAACCACCGAGCCAACACAGCAGAAGCTTCTTTACCGACCATGATCGAGTCTTTCTCG
AGCTCAACTAAAAACCCTAACGCTTCATTCAGCTTTTCTTCCATTTCATAAGCAGACAGC
ACAAGAGCCACACACTTGTCAGTAGCTTTGATTCCGGCTTTTCTCATATTCTCAAAAACC
AAACGCGCATTCTGGCTCTGACCCGAGACACTGTAAGCGTTGATGAGCAGTCCACATAGC
TTCGCATCAGGAGTGATCCCGGCGATTTGAAGAGCATCAAAAA

QA 1 343 1 343
DS 

RD RR2GO07JQ 452 0 0
CA
CAAGAACTTGCCTCTTTAACATGAAATTACAAGGAACAATTAATGTTAATATTGGACAAT
GGATTAAATATACTGAACATGTATAGAAACAAGCATCATGTCAGACGGTATTGTGGGATG
AAAATTCCCTGAAAAGTAACTCTACCTCTTCAACAACACCAAGCTTCTTAAACCACCGAG
CCAACACAGCAAAAGCTTCTTTACCGACCATGATCGAGTCTTTCTCGAGCTCAACTAAAA
ACCCTAACGCTTCATTCAGCTTTTCTTCCATTTCATAAGCAGACAACACAAGAGCCACAC
ACTTGTCAGTAGCTTTGATTCCTGCTTTTCTCATATTCTCAAAAGCCAAACGAGCATTCT
GGCTCTGACCCGAGACACTGTAAGCGTTGATGAGCAGTCCGCATAGCTTCGCATCAGGAG
TGATCCCGGCGATTTGAAGAGCATCAAAAA

QA 3 452 3 452
DS 

RD RR2F261JQ 494 0 0
GAACCAACCCAACCAAGAACTTGCCTCTTTAACATGAAATTACAAGGAACAATTAATGTT
AATATTGGACAATGGATTAAATATACTGAACATGTATAGAAACAAGCATCATGTCAAACG
GTATTGGGGGATGAAAATTCCCTGAGAAGTAACTCTACCTCTTCAACAACACCAAGCTTC
TTAAACCACCGAGCCAACACAGCAAAAGCTTCTTTACCGACCATGATCGAGTCTTTCTCG
AGCTCAACTAAAAACCCTAACGCTTCATTCAGCTTTTCTTCCATTTCATAAGCAGACAAC
ACAAGAGCCACACACTTGTCAGTAGCTTTGATTCCTGCTTTTCTCATATTCTCAAAAGCC
AAACGAGCATTCTGGCTCTGACCCGAGACACTGTAAGCGTTGATGAGCAGTCCGCATAGC
TTCCCATCAGGAGTGATCCCGGCGATTTGAAGAGCATCAAAAACACGCTTGGATCCTTGG
GAATCTCCAGACAT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2GJ74JQB 822 0 0
GATCTCTGTGACCTTTGTTTGTTTCTTGTTATTCATATTAGAAATCAGTTGTGGACAATA
GGATCAGTGAACCAACCCAACCAAGAACTTGCCTCTTTAACATGAAATTACAAAGAACAA
TTAATGTTAATATTGGACAATGGATTAAATATACTGAACATGTATAGAAACAAGTACCAT
GTCAGACGGTATTGTGGGATGAAAATTCCCTGAGAGGTAACTCAACCTCTTCAACAACAC
CAAGCTTCTTAAACCACCGAGCCAACACAGCAGAAGCTTCTTTACCGACCATGATCGAGT
CTTTCTCGAGCTCAACTAAGAACCCTAACGCTTCATTCAGCTTTTCTTCCATTTCATAAG
CAGACAGCACAAGAGCCACACACTTGTCAGTAGCTTTGATTCCGGCTTTTCTCATATTCT
CAAAAGCCAAACGCGCATTCTGGCTCTGACCCGAGACACTGTAAGCGTTGATGAGCAGTC
CACATAGCTTCGCATCAGGAGTGATCCCGGCGATTTGAAGAGCATCAAAAACACGCTTGG
ATCCTTGGGAATCTCCAGACATAGAGTAGGATCTCAACAAGGCCTTGTAAACCTCTCTCC
CGGCACAGATATCTAGGGAGTCCATTTCTCGGAGCAAAGCCTCTCCTTTCTCTGGAGTGC
CAGCTCTAATGTAGGCCATTATCATCGAACCGTAGGAACGATAGTCAAGTTGCTCCCCAA
GCAATTTGACATCGTTGAAAGTGTCTTCGGCCAAGCGGTGATAGCCTGCCTTGCTGTACG
ACTGAAGCATGGCAGTTAGAGTGACTTGATCAATGAGAAAGC

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR2GJ74TF 697 0 0
AGCGGTGATAGCTG
CTTGCTGTACGACTGAAGCATGGCAGTTAGAGTGACTTGATCAATGAGAAAGCCACGGTT
TTTCATAGCAACAAGAGTTTTCTCAGCGTCTTGGATTTGGTTAAGCTTGCCATAGTAATG
GATGATCTTGGTATAATCACGGGGGTTGGCTTCAAAAGAATCTTCGAGCAGAGCATATTC
AGCCACCTTGATATAAAAGGGAGAGTCAAGAGTGTTGAGGTGTTTAAGAAGGGAAAGCCA
GTCAGCTCGAATGGGTTTCATACGCCTAACCCAAGCAGCCAACATATCATCGCAGCAAAA
GCTATCCTCCTTTTCCTCCAAGCAAATTATTATCTGCTTCATAAGCGCTTGACATCGTTT
AGACATGTTAACAGGAATCCGACTAATTGCCTCCTCTTGTTCTTCTGTAATTTGATGATG
ATGATGATTCAGATCAACCCAATTGGGGCCCTTTTCTTCCTTGTCTACAACCACCATCGT
AGTAGTGCATTTGCGACAAAAACGAAGAGGAGATTCTTGTACAAAGAAGAATGGGGTTCT
TCTTCTTGTACTAAAGTAGAGGCTTCCACTACTAACACATGGGGAGAAGGCGGAGTTCAA
CACTGCATTACTGCTATAAAATCCCATCATTAGACCCACTCTCCCTCAGAGCCAAAGGAT
CATTGAAATTGTGGCACTGACCC

QA 15 697 15 697
DS 



AS 1 8

CO CL869Contig1 672 8 5 U
GGACTCCACTTAAACCATATTTTCTTAAAACACTTCTTGAAAGGCTAGATATACGGCCAT
GGAAGTTGCTATGGACCTGGAGCTCGATGATGATGTCTTCTATGCAGACATAAGCAAACA
AATCAATCTCTTAATCACAGATGAAGATGAACAGAACCCTATCTCACTTTCTTCTCCTGT
CTCATTCCAGGGTTTGTTCAGAGAAAACTACCAAGCATCAGCAACACCGTATATGATATA
CCATGAGCAGAATTACAACCAAGTTAGAGAGAGCAAAGGGACAGGAGTGTTCATCCCAAG
ATGTTCTCAGCCAAGAAGGAAACAACATAACCATTCTCATCAGAAGAAGCAAGGGAGATT
CGGTTCCCTCATCCCCAAGCAACAGTATCCTCATCATGTTTATGACAACAACAACAACTC
CACAACTTTCAACAACAACCAAGAAAGCATCACCCTTCATCATGCAGCTTCTACTAACCA
AAGAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTCTCTTCACTTAAGTCTCAATCAAGATTCAAGA
CATGGATTTGTGTCATTAATTTCATATTATATATTGATTATTGATATTTATAGATTTTGT
GTTTGTAAAATCAGCAAATAATAAGAACGAAGGAGGAACCATCAATCTAAAGGGATTTGG
TGTGATTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F636TF U 1
AF RR2FM03TF U 5
AF RR2HB87TF U 36
AF RR2FM03JQ C 104
AF RR2HB87JQ C 176
AF RR2F636JQ C 180
AF RR2D842JQ C 418
AF RR2D842TF U 418
BS 1 587 RR2F636TF
BS 588 588 RR2FM03TF
BS 589 611 RR2F636TF
BS 612 647 RR2FM03TF
BS 648 672 RR2D842TF

RD RR2F636TF 611 0 0
GGACTCCACTTAAACCATATTTTCTTAAAACACTTCTTGAAAGGCTAGATATACGGCCAT
GGAAGTTGCTATGGACCTGGAGCTCGATGATGATGTCTTCTATGCAGACATAAGCAAACA
AATCAATCTCTTAATCACAGATGAAGATGAACAGAACCCTATCTCACTTTCTTCTCCTGT
CTCATTCCAGGGTTTGTTCAGAGAAAACTACCAAGCATCAGCAACACCGTATATGATATA
CCATGAGCAGAATTACAACCAAGTTAGAGAGAGCAAAGGGACAGGAGTGTTCATCCCAAG
ATGTTCTCAGCCAAGAAGGAAACAACATAACCATTCTCATCAGAAGAAGCAAGGGAGATT
CGGTTCCCTCATCCCCAAGCAACAGTATCCTCATCATGTTTATGACAACAACAACAACTC
CACAACTTTCAACAACAACCAAGAAAGCATCACCCTTCATCATGCAGCTTCTACTAACCA
AAGAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTCTCTTCACTTAAGTCTCAATCAAGATTCAAGA
CATGGATTTGTGTCATTAATTTCATATTATATATTGATTATTGATATGTATAGATTTTGT
GTTTGTAAAAT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2FM03TF 644 0 0
GG
CACTTAAACCATATTTTCTTAAAACACTTCTTGAAAGGCTAGATATACGGCCATGGAAGT
TGCTATGGACCTGGAGCTCGATGATGATGTCTTCTATGCAGACATAAGCAAACAAATCAA
TCTCTTAATCACAGATGAAGATGAACAGAACCCTATCTCACTTTCTTCTCCTGTCTCATT
CCAGGGTTTGTTCAGAGAAAACTACCAAGCATCAGCAACACCGTATATGATATACCATGA
GCAGAATTACAACCAAGTTAGAGAGAGCAAAGGGACAGGAGTGTTCATCCCAAGATGTTC
TCAGCCAAGAAGGAAACAACATAACCATTCTCATCAGAAGAAGCAAGGGAGATTCGGTTC
CCTCATCCCCAAGCAACAGTATCCTCATCATGTTTATGACAACAACAACAACTCCACAAC
TTTCAACAACAACCAAGAAAGCATCACCCTTCATCATGCAGCTTCTACTAACCAAAGAAG
AACCTACAGAGATGCAGCATCTCTCTTCACTTAAGTCTCAATCAAGATTCAAGACATGGA
TTTGTGTCATTAATTTCATATTATATATTGATTATTGATATTTATAGATTTTGTGTTTGT
AAAATCAGCAAATAATAAGAACGAAGGAGGAACCATCAATC
C

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR2HB87TF 586 0 0
CTTGAAAGGCTAGATATACGGCCATGGAAGTTGCTATGGACCTGGAGCTCGATGATGATG
TCTTCTATGCAGACATAAGCAAACAAATCAATCTCTTAATCACAGATGAAGATGAACAGA
ACCCTATCTCACTTTCTTCTCCTGTCTCATTCCAGGGTTTGTTCAGAGAAAACTACCAAG
CATCAGCAACACCGTATATGATATACCATGAGCAGAATTACAACCAAGTTAGAGAGAGCA
AAGGGACAGGAGTGTTCATCCCAAGATGTTCTCAGCCAAGAAGGAAACAACATAACCATT
CTCATCAGAAGAAGCAAGGGAGATTCGGTTCCCTCATCCCCAAGCAACAGTATCCTCATC
ATGTTTATGACAACAACAACAACTCCACAACTTTCAACAACAACCAAGAAAGCATCACCC
TTCATCATGCAGCTTCTACTAACCAAAGAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTCTCTTCA
CTTAAGTCTCAATCAAGATTCAAGACATGGATTTGTGTCATTAATTTCATATTATATATT
GATTATTGATATTTATAGATTTTGTGTTTGTAAAATCAGCAAATAA

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2FM03JQ 545 0 0
GCAGACATAAGCAAACAAATCAATCTCTTAATCACAGATGAAGATGAACAGAACCCTATC
TCACTTTCTTCTCCTGTCTCATTCCAGGGTTTGTTCAGAGAAAACTACCAAGCATCAGCA
ACACCGTATATGATATACCATGAGCAGAATTACAACCAAGTTAGAGAGAGCAAAGGGACA
GGAGTGTTCATCCCAAGATGTTTTCAGCCAAGAAGGAAACAACATAACCATTCTCATCAG
AAGAAGCAAGGGAGATTCGGTTCCCTCATCCCCAAGCAACAGTATCCTCATCATGTTTAT
GACAACAACAACAACTCCACAACTTTCAACAACAACCAAGAAAGCATCACCCTTCATCAT
GCAGCTTCTACTAACCAAAGAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTCTCTTCACTTAAGTC
TCAATCAAGATTCAAGACATGGATTTGTGTCATTAATTTCATATTATATATTGATTATTG
ATATTTATAGATTTTGTGTTTGTAAAATCAGCAAATAATAAGAACGAAGGAGGAACCATC
AATC
C

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2HB87JQ 479 0 0
CCTGTCTCATTCCAGGGTTTGTTCAGAGAAAACTACCAAGCATCAGCAACACCGTATATG
ATATACCATGAGCAGAATTACAACCAAGTTAGAGAGAGCAAAGGGACAGGAGTGTTCATC
CCAAGATGTTTTCAGCCAAGAAGGAAACAACATAACCATTCTCATCAGAAGAAGCAAGGG
AGATTCGGTTCCCTCATCCCCAAGCAACAGTATCCTCATCATGTTTATGACAACAACAAC
AACTCCACAACTTTCAACAACAACCAAGAAAGCATCACCCTTCATCATGCAGCTTTTACT
AACCAAAGAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTCTCTTCACTTAAGTCTCAATCAAGATT
CAAGACATGGATTTGTGTCATTAATTTCATATTATATATTGATTATTGATATTTATAGAT
TTTGTGTTTGTAAAATCAGCAAATAATAAGAACGAAGGAGGAACCATCAATCT
AAAGGG

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2F636JQ 469 0 0
TT
TCATTCCAGGGTTTGTTCAGAGAAAATTACCAAGCATCAGCAACACCGTATATGATATAC
CATGAGCAGAATTACAACCAAGTTAGAGAGAGCAAAGGGACAGGAGTGTTCTTCCCAAGA
TGTTCTCAGCCAAGAAGGAAACAACATAACCATTTTCATCAGAAGAAGCAAGGGAGATTC
GGTTCCCTCATCCCCAAGCAACAGTATCCTCATCATGTTTATGACAACAACAACAACTCC
ACAACTTTCAACAACAACCAAGAAAGCATCACCCTTCATCATGCAGCTTTTACTAACCAA
AGAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTCTTTTCACTTAAGTCTCAATCAAGATTCAAGAC
AGGGATTTGGGTCATTAATTTCATATTATATATTGATTATTGATATTTATAGATTTTGTG
TTTGTAAAATCAGCAAATAATAAGAACGAAGGAGGAACCATCAATCT

QA 3 469 3 469
DS 

RD RR2D842JQ 255 0 0
G
TCCACAACTTTCAACAACAACCAAGAAAGCATCACCCTTCATCATGCAGCTTCTACTAAC
CAAAGAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTCTCTTCACTTAAGTCTCAATCAAGATTCAA
GACATGGATTTGTGTCATTAATTTCATATTATATATTGATTATTGATATTTATAGATTTT
GTGTTTGTAAAATCAGCAAATAATAAGAACGAAGGAGGAACCATCAATCTAAAGGGATTT
GGTGTGATTTATGC

QA 2 255 2 255
DS 

RD RR2D842TF 255 0 0
G
TCCACAACTTTCAACAACAACCAAGAAAGCATCACCCTTCATCATGCAGCTTCTACTAAC
CAAAGAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTCTCTTCACTTAAGTCTCAATCAAGATTCAA
GACATGGATTTGTGTCATTAATTTCATATTATATATTGATTATTGATATTTATAGATTTT
GTGTTTGTAAAATCAGCAAATAATAAGAACGAAGGAGGAACCATCAATCTAAAGGGATTT
GGTGTGATTTATGC

QA 2 255 2 255
DS 



AS 3 8

CO CL870Contig1 1025 3 12 U
GCAGACCAAGTTCTTTATCATTCAAGGCAATATTTCATACTGAATTACATAAAAGTTGCA
ACTAGTTAGATAACTTTTCCGATAATAGATAAAATCTTAAAACATAAGGTAAACCAAAAA
CTACTTATTGTTTGTTCAAACAAGCAACTTAGGCTCTGCCCTTTCCTTTTCCCTTGCCCT
TGTTGTTAAAACCAAACTGCTTGCCAAAATTGACTTGCTTCTTGTTACCACCGGATGATT
GACCTGGGCTCTGGTTAGGACTCTTTCCACCCTTTTTAGCTGGGTGTGGTGCAGCTGTGT
GCCCGCCCTTCTTCTCTTCAGTGTTCTGAGGAGTGGGTGCTACTGCAGTTTTTGTCTTCT
TTGCTGGGACAGGTGTTTTGGAAGCAGATGCAGTGGCCCTCTTCTTGTTGCTCGGCTCCT
CAGGCTGCTTAGGGGTCTCCTCCTC***TTCTTCATCCTCCTCCTCAGAGTCATCTTCTT
CATCCTCCTCCTCAGACTCATCCTCCCCGTCAGACTCAGGCTTCACTTCAGCAGGCTTGG
CTTTTGGTTTTGAGTCAGCAGCCTTGACAACATTGGAAGCAGCAGCAGCA***TTCCCAA
CCGAAGTGACAGTTGAAGTAGCAGGAACCACTTCCTCCTCGGAATCAGAAGGGTAGTCCT
CCTCTTGATCGATGTTGGGAGACCTGTAGCCCACAAAGTGGACACTACCACTCTCCAAAG
AGTGAGAAAGCTCAAACTCCTGCTCGAAGACAGGGTCAAAGGTCATCTGAGGAATGTGGT
CTTGGGAGAGCGTTCCAATGACATGTTTCTTCCAATCAATAGTCACGTACAAGAGGCCAG
ATTCTCCCTTTTTGGCATCGATTGTTGCCTGAGAAAGGTGGATGAGATGATCTACTTGAG
GCCTCACTTTTAGTGGCATCCCAGCCTTAACTTCAACTCCCCAAAATTCCATTGTTGATC
AAGGGGGAAAAGAGAGATTCGACAGGAGAGTTTTAGGGCTGCTGCTATCTAGAGAACAAT
AAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G667JQ U 14
AF RR2A992JQ U 1
AF RR2A992TF C 314
BS 1 100 RR2A992JQ
BS 101 101 RR2G667JQ
BS 102 138 RR2A992JQ
BS 139 139 RR2G667JQ
BS 140 188 RR2A992JQ
BS 189 189 RR2G667JQ
BS 190 194 RR2A992JQ
BS 195 195 RR2G667JQ
BS 196 206 RR2A992JQ
BS 207 207 RR2G667JQ
BS 208 815 RR2A992JQ
BS 816 1025 RR2A992TF

RD RR2G667JQ 630 0 0
TTTATCATTCAAGGCAATATTTCATACTGAATTACATAAAAGTTGCAACTAGTTAGATAA
CTTTTCCGATAATAGATAAAATCTTAAAACATAAGGTAAACCAAAAACTACTTATTGTTT
GTTCAAACAAGCAACTTAGGCTCTGCCCTTTCCTTTTCCCTTGCCCTTGTTGTTAAAACC
AAACTGCTTGCCAAAATTGACTTGCTTCTTGTTACCACCGGATGATTGACCTGGGCTCTG
GTTAGGACTCTTTCCACCCTTTTTAGCTGGGTGTGGTGCAGCTGTGTGCCCGCCCTTCTT
CTCTTCAGTGTTCTGAGGAGTGGGTGCTACTGCAGTTTTTGTCTTCTTTGCTGGGACAGG
TGTTTTGGAAGCGGATGCAGTGGCCCTCTTCTTGTTGCTCGGCTACTCAGGCTGCTTAGG
GGTCTCCTCCTCCTCTTCTTCATCCTCCTCCTCAAAGTCATCTTCTTCATCCTCCTCCTC
AAACTCATCCTCCCCGTCAGACTCAGGCTTCACTTCAGCAGGCTTGGCTTTTGGTTTTGA
GTCAGCAGCCTTGACAACATTGGAAGCAGCAGCAGCAGCATTCCCAACCGAAGTGACAGT
TGAAGTAGCAGGAACCACTTCCTCCTC
CTC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2A992JQ 815 0 0
GCAGACCAAGTTCTTTATCATTCAAGGCAATATTTCATACTGAATTACATAAAAGTTGCA
ACTAGTTAGATAACTTTTCCGATAATAGATAAAATCTTAAGACATAAGGTAAACCAAAAA
CTACTTATTGTTTGTTCAGACAAGCAACTTAGGCTCTGCCCTTTCCTTTTCCCTTGCCCT
TGTTGTTAGAACCAGACTGCTTGCCAGAATTGACTTGCTTCTTGTTACCACCGGATGATT
GACCTGGGCTCTGGTTAGGACTCTTTCCACCCTTTTTAGCTGGGTGTGGTGCAGCTGTGT
GCCCGCCCTTCTTCTCTTCAGTGTTCTGAGGAGTGGGTGCTACTGCAGTTTTTGTCTTCT
TTGCTGGGACAGGTGTTTTGGAAGCAGATGCAGTGGCCCTCTTCTTGTTGCTCGGCTCCT
CAGGCTGCTTAGGGGTCTCCTCCTC***TTCTTCATCCTCCTCCTCAGAGTCATCTTCTT
CATCCTCCTCCTCAGACTCATCCTCCCCGTCAGACTCAGGCTTCACTTCAGCAGGCTTGG
CTTTTGGTTTTGAGTCAGCAGCCTTGACAACATTGGAAGCAGCAGCAGCA***TTCCCAA
CCGAAGTGACAGTTGAAGTAGCAGGAACCACTTCCTCCTCGGAATCAGAAGGGTAGTCCT
CCTCTTGATCGATGTTGGGAGACCTGTAGCCCACAAAGTGGACACTACCACTCTCCAAAG
AGTGAGAAAGCTCAAACTCCTGCTCGAAGACAGGGTCAAAGGTCATCTGAGGAATGTGGT
CTTGGGAGAGCGTTCCAATGACATGTTTCTTCCAA

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR2A992TF 712 0 0
CTCTTCAGTGTTCTGAGGAGTGGGTGCTACTGCAGTTTTTGTCTTCTTTGCTGGGACAGG
TGTTTTGGAAGCAGATGCAGTGGCCCTCTTCTTGTTGCTCGGCTCCTCAGGCTGCTTAGG
GGTCTCCTCCTC***TTCTTCATCCTCCTCCTCAGAGTCATCTTCTTCATCCTCCTCCTC
AGACTCATCCTCCCCGTCAGACTCAGGCTTCACTTCAGCAGGCTTGGCTTTTGGTTTTGA
GTCAGCAGCCTTGACAACATTGGAAGCAGCAGCAGCA***TTCCCAACCGAAGTGACAGT
TGAAGTAGCAGGAACCACTTCCTCCTCGGAATCAGAAGGGTAGTCCTCCTCTTGATCGAT
GTTGGGAGACCTGTAGCCCACAAAGTGGACACTACCACTCTCCAAAGAGTGAGAAAGCTC
AAACTCCTGCTCGAAGACAGGGTCAAAGGTCATCTGAGGAATGTGGTCTTGGGAGAGCGT
TCCAATGACATGTTTCTTCCAATCAATAGTCACGTACAAGAGGCCAGATTCTCCCTTTTT
GGCATCGATTGTTGCCTGAGAAAGGTGGATGAGATGATCTACTTGAGGCCTCACTTTTAG
TGGCATCCCAGCCTTAACTTCAACTCCCCAAAATTCCATTGTTGATCAAGGGGGAAAAGA
GAGATTCGACAGGAGAGTTTTAGGGCTGCTGCTATCTAGAGAACAATAAAAT

QA 1 712 1 712
DS 



CO CL870Contig2 992 3 11 U
GGATTTTATTCTCTCTATATAGCAGCAGCCTTAAAACTCTCCCGTCGAATCTCTCTTTTC
CCCCTTGATCAACAATGAAATTTTGGGGAGTTGAAGTTAAGGCTGGGATGCCACTAAAAG
TGAGGCCTCAAGTAGACCATCTCATCCACCTTTCTCAGGCTACGATTGATGCCAAAAAGG
GAGAATCTGGTCTCTTGTACGTGACTACTGATTGGAAGAAACATGTCATTGGAACGCTCT
CTCAAGACCACATTCCTCAGATGACCTTTGACCTTGTCTTCGAGCAGGAGTTTGAGCTTT
CTCACTCTTTGGAGAGTGGTAGTGTCCACTTTGTTGGCTACAGATCTCCCAACATCGATC
AAGAGGAGGACTACCCTTCTGATGATTCTGAGGAGGAGGCGGTTCCTGCTACTTCTACTG
TCACTTCCGTTGGGAATGCTGCTGCTGCCTCAAAACCAAAAGCCAATCCTGTCGAAGTGA
AGCCTGAGTCTGATGATGATGATGAGTCTGGCGAGGAGGATGAAGAAGATGACTCTGAGG
AGGAGGATGAAGAAGAAGAGGAGACCCCTAAGCAGCCTGAGGAGCCGAGCAACAAGAAGA
GGGCCACTGCATCTGCTTCCAAAACACCTGTCCCAGCAAAGAAGACAAAAACTGCAGTAG
CACCCACTCCTCAGAACACTGAAGAGAAGAAGAAGGGGGGGCACACAGCTGCCCCCCACC
CAGCTAAAAAGGGTGGAAAGAGCCCTAACCAGAGCCCAGGTCAATCATCCGGTGGTAACA
AGAAGCAAGTCAATTTTGGCAAGCAGTCTGGTTTTAACAACAAGGGCAAGGGAAAAGGAA
AGGGCAGAGCCTAAGTTGCTTGTTTGAACAAACAATAAGTAGTTTTTGGTTTCCCTTATG
TTTTAAGATTTTATTTATTTTTGGAAAAGTTATTTAACTAGTTGCAACTTTTATGTAATT
CAGTATGAAATATTCCCTTGAATGATAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW18TF U 1
AF RR2C430TF U 19
AF RR2CW18JQ C 625
BS 1 42 RR2CW18TF
BS 43 43 RR2C430TF
BS 44 77 RR2CW18TF
BS 78 78 RR2C430TF
BS 79 343 RR2CW18TF
BS 344 344 RR2C430TF
BS 345 517 RR2CW18TF
BS 518 518 RR2C430TF
BS 519 563 RR2CW18TF
BS 564 691 RR2C430TF
BS 692 992 RR2CW18JQ

RD RR2CW18TF 572 0 0
GGATTTTATTCTCTCTATATAGCAGCAGCCTTAAAACTCTCCTGTCGAATCTCTCTTTTC
CCCCTTGATCAACAATGGAATTTTGGGGAGTTGAAGTTAAGGCTGGGATGCCACTAAAAG
TGAGGCCTCAAGTAGACCATCTCATCCACCTTTCTCAGGCTACGATTGATGCCAAAAAGG
GAGAATCTGGTCTCTTGTACGTGACTACTGATTGGAAGAAACATGTCATTGGAACGCTCT
CTCAAGACCACATTCCTCAGATGACCTTTGACCTTGTCTTCGAGCAGGAGTTTGAGCTTT
CTCACTCTTTGGAGAGTGGTAGTGTCCACTTTGTTGGCTACAGGTCTCCCAACATCGATC
AAGAGGAGGACTACCCTTCTGATGATTCTGAGGAGGAGGCGGTTCCTGCTACTTCTACTG
TCACTTCCGTTGGGAATGCTGCTGCTGCCTCAAAACCAAAAGCCAATCCTGTCGAAGTGA
AGCCTGAGTCTGATGATGATGATGAGTCTGGCGAGGATGATGAAGAAGATGACTCTGAGG
AGGAGGATGAAGAAGAAGAGGAG
ACCCCTAAG

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2C430TF 673 0 0
TATAAGCCGAGCCCT
AAACTCTCCCGTCGAATCTCT**TTTCCTCCTTGATCAACAATGAAATTTTGGGGAGTTG
AAGTTAAGGCTGGGATGCCACTAAAAGTGAGGCCTCAAGTAGATCATCTCATCCACCTTT
CTCAGGCTACGATTGATGCCAAAAAGGGAGAATCTGGTCTCTTGTACGTGACTATTGATT
GGAAGAAACATGTCATTGGAACGCTCTCTCAAGACCACATTCCTCAGATGACCTTTGACC
TTGTCTTCGAGCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACTCTTTGGAGAGTGGTAGTGTCCACTTTG
TTGGCTACAGATCTCCCAACATCGATCAAGAGGAGGACTACCCTTCTGATGATTCTGAGG
AGGAGGCGGTTCCTGCTACTTCTACTGTCACTTCCGTTGGGAATGCTGCTGCTGCCTCAA
AACCAAAAGCCAATCCTGTCGAAGTGAAGCCTGAGTCTGATGATGATGATGAGTCTGGCG
AGGAGGATGAAGAAGATGACTCTGAGGAGGAGGATGAAGAAGAAGAGGAGACCCCTAAGC
AGCCTGAGGAGCCGAGCAACAAGAAGAGGGCCACTGCATCTGCTTCCAAAACACCTGTCC
CAGCAAAGAAGACAAAAACTGCAGTAGCACCCACTCCTCAGAACACTGAAGAGAAGAA

QA 16 673 16 673
DS 

RD RR2CW18JQ 368 0 0
CACT
TGTCCCAGCAAAGAAGACAAAAACTGCAGTAGCACCCACTCCTCAGAACACTGAAGAGAA
GAAGAAGGGGGGGCACACAGCTGCCCCCCACCCAGCTAAAAAGGGTGGAAAGAGCCCTAA
CCAGAGCCCAGGTCAATCATCCGGTGGTAACAAGAAGCAAGTCAATTTTGGCAAGCAGTC
TGGTTTTAACAACAAGGGCAAGGGAAAAGGAAAGGGCAGAGCCTAAGTTGCTTGTTTGAA
CAAACAATAAGTAGTTTTTGGTTTCCCTTATGTTTTAAGATTTTATTTATTTTTGGAAAA
GTTATTTAACTAGTTGCAACTTTTATGTAATTCAGTATGAAATATTCCCTTGAATGATAA
AAAA

QA 5 368 5 368
DS 



CO CL870Contig3 711 2 7 U
TGTTCTCTAGATAGCAGCAGCCCTAAAACTCTCCTGTCGAATCTCTCTTTTCCCCCTTGA
TCAACAATGGAATTTTGGGGAGTTGAAGTTAAGGCTGGGATGCCACTAAAAGTGAGGCCT
CAAGTAGATCATCTCATCCACCTTTCTCAGGCAACAATCGATGCCAAAAAGGGAGAATCT
GGTCTCTTGTACGTGACTATTGATTGGAAGAAACATGTCATTGGAACGCCCTCTCAAGAC
CACATTCCTCAGATGACCTTTGACCTTGTCTTCGAGCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACTCT
TTGGAGAGTGGTAGTGTCCACTTTGTGGGCTACAGGTCTCCCAACATCGATCAAGAGGAG
GACTACCCTTCTGATTCCGAGGAGGAGGAAGTGGTTCCTGCTACTTCAACTGTCACTTCG
GTTGGGAATGCTGCTGCTGCTGCTTCCAATGTTGTCAAGGCTGCTGACTCAAAACCAAAA
GCCAAGCCTGCTGAAGTGAAGCCTGAGTCTGACGGGGAGGATGAGTCTGAGGAGGAGGAT
GAAGAAGATGACTCTGAGGAGGAGGATGAAGAAGAGGAGGAGGAGACCCCTAAGCAGCCT
GAGGAGCCGAGCAACAAGAAGAGGGCCACTGCATCCGCTTCCAAAACACCTGTCCCAGCA
AAGAAGACAAAACTGCAGTAGCACCCACTCCTCAGACACTGAAGAGAAGAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2G667TF U 1
AF RR2H169TF U 1
BS 1 46 RR2G667TF
BS 47 47 RR2H169TF
BS 48 229 RR2G667TF
BS 230 230 RR2H169TF
BS 231 603 RR2G667TF
BS 604 604 RR2H169TF
BS 605 711 RR2G667TF

RD RR2G667TF 711 0 0
TGTTCTCTAGATAGCAGCAGCCCTAAAACTCTCCTGTCGAATCTCT*TTTTCCCCCTTGA
TCAACAATGGAATTTTGGGGAGTTGAAGTTAAGGCTGGGATGCCACTAAAAGTGAGGCCT
CAAGTAGATCATCTCATCCACCTTTCTCAGGCAACAATCGATGCCAAAAAGGGAGAATCT
GGTCTCTTGTACGTGACTATTGATTGGAAGAAACATGTCATTGGAACGCTCTCTCAAGAC
CACATTCCTCAGATGACCTTTGACCTTGTCTTCGAGCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACTCT
TTGGAGAGTGGTAGTGTCCACTTTGTGGGCTACAGGTCTCCCAACATCGATCAAGAGGAG
GACTACCCTTCTGATTCCGAGGAGGAGGAAGTGGTTCCTGCTACTTCAACTGTCACTTCG
GTTGGGAATGCTGCTGCTGCTGCTTCCAATGTTGTCAAGGCTGCTGACTCAAAACCAAAA
GCCAAGCCTGCTGAAGTGAAGCCTGAGTCTGACGGGGAGGATGAGTCTGAGGAGGAGGAT
GAAGAAGATGACTCTGAGGAGGAGGATGAAGAAGAGGAGGAGGAGACCCCTAAGCAGCCT
GAGTAGCCGAGCAACAAGAAGAGGGCCACTGCATCCGCTTCCAAAACACCTGTCCCAGCA
AAGAAGACAAAACTGCAGTAGCACCCACTCCTCAGACACTGAAGAGAAGAA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2H169TF 707 0 0
TGT
TCTCTAGATAGCAGCAGCCCTAAAACTCTCCTGTCGAATCTCTCTTTTCCCCCTTGATCA
ACAATGGAATTTTGGGGAGTTGAAGTTAAGGCTGGGATGCCACTAAAAGTGAGGCCTCAA
GTAGATCATCTCATCCACCTTTCTCAGGCAACAATCGATGCCAAAAAGGGAGAATCTGGT
CTCTTGTACGTGACTATTGATTGGAAGAAACATGTCATTGGAACGCCCTCTCAAGACCAC
ATTCCTCAGATGACCTTTGACCTTGTCTTCGAGCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACTCTTTG
GAGAGTGGTAGTGTCCACTTTGTGGGCTACAGGTCTCCCAACATCGATCAAGAGGAGGAC
TACCCTTCTGATTCCGAGGAGGAGGAAGTGGTTCCTGCTACTTCAACTGTCACTTCGGTT
GGGAATGCTGCTGCTGCTGCTTCCAATGTTGTCAAGGCTGCTGACTCAAAACCAAAAGCC
AAGCCTGCTGAAGTGAAGCCTGAGTCTGACGGGGAGGATGAGTCTGAGGAGGAGGGTGAA
GAAGATGACTCTGAGGAGGAGGATGAAGAAGAGGAGGAGGAGACCCCTAAGCAGCCTGAG
GAGCCGAGCAACAAGAAGAGG*CCACTGCATCTGCTTCCAAAACACCTGTCC*AGCAAAG
AAGACAAAACTGCAGTAGCACCCACTCCTCAGACACTGAAGAGA

QA 4 707 4 707
DS 



AS 1 8

CO CL871Contig1 890 8 15 U
GGAACGCTTGCACTAGGTAGTTTCTCTCTCTCTTTCCTCTCCACCTTCTCTCAAAGTTCT
CCTCAAATAAAATCCGTTTAACCGGCTCCGGCGGTTTCTTTAGCGTCGGAGTCGGGTTCA
GTTTCTTTTCAATGTTTTGGATAGATTTCATCTCGGTTTTTCCTTCTACTCAACAGGGGT
CCTTAGATCTCAATCTCTTTGAGTCCTATCTAGGGTTTGAAAGCGGTTGTTGATCTCCTT
GTTGCATGTTCGTTTGGGCTTTGATCTAATGATCCTAATCTGTCAGTAACACTTTTGGTT
GAATCCTTATTTACCGTTGTTGCATGCTGATCTCGAGTTCTCTTTGACTCGTCTTCGGTT
CGATCTTCTGCTTATTCGCCTTCGTGTGTGTGGTGGTATCCGGAGTCGTGTTCGTCGCTC
CTTGTCAATTTCTTTTGATCTGATCGAGATCTGCTCTTTGTCAAGCTTCTTGATGGCGGT
TACATGTCGTTGCTTGTCCGCCTTAATCTCATCTGGATTCATCATCAGAACTTGATTTGT
TCTATCTCTCCAGATTCTGAAGCTGTGCTTATCTTGCCTGGGCTATTCATTATAGGAGGA
CATGGTGTTGGTGGTTCTGGCTTGATTGGACTCCATCGTTTATTTCTCAAAGGTTCTCTT
GTAGATCGTATGTTTCTTGGTTTGTATTGTTTAGGATTCAACTGATTTTGTTCTGATTGT
GATTAGCATCTGTTTACGTCTTAGCTTCTGTTGTATTTCATCTTCTCTCCCATGGTTGGG
CTGTTGTTTCCGGGAATCTTCTGGTTGGTTCGTCGGACTTTCTTACCGGGATTAGTATAA
TCGCCGGTCTATGTATGTGATGTTTGTTAATCATAATGAAATTAGTGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 15 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 

AF RR2H196TF U 1
AF RR2BU36TF U 1
AF RR2FW56TF U 1
AF RR2BF60TF U 41
AF RR2FW56JQ C 111
AF RR2H196JQ C 217
AF RR2BU36JQ C 166
AF RR2BF60JQ C 186
BS 1 286 RR2BU36TF
BS 287 287 RR2FW56TF
BS 288 393 RR2BU36TF
BS 394 394 RR2FW56TF
BS 395 619 RR2BU36TF
BS 620 620 RR2FW56TF
BS 621 694 RR2BU36TF
BS 695 695 RR2FW56JQ
BS 696 708 RR2BU36TF
BS 709 709 RR2BF60TF
BS 710 723 RR2FW56TF
BS 724 724 RR2BF60TF
BS 725 734 RR2FW56TF
BS 735 788 RR2BF60TF
BS 789 890 RR2FW56JQ

RD RR2H196TF 646 0 0
GGAACGCTTGCACTAGGTAGTTTCTCTCTCTCTTTCCTCTCCACCTTCTCTCAAAGTTCT
CCTCAAATAAAATCTGTTTAACCGGCTCCGGCGGTTTCTTTAGCGTCGGAGTCGGGTTCA
GTTTCTTTTCAATGTTTTGGATAGATTTCATCTCGGTTTTTCCTTCTACTCAACAGGGGT
CCTTAGATCTCAATCTCTTTGAGTCCTATCTAGGGTTTGAAAGCGGTTGTTGATCTCCTT
GTTGCATGTTCGTTTGGGCTTTGATCTAATGATCCTAATCTGTCAGTAACACTTTTGGTT
GAATCCTTATTTACCGTTGTTGCATGCTGATCTCGAGTTCTCTTTGACTCGTCTTCGGTT
CGATCTTCTGCTTATTCGCCTTCGTGTGTGTGGTGGTATCCGGAGTCGTGTTCGTCGCTC
CTTGTCAATTTCTTTTGATCTGATCGAGATCTGCTCTTTGTCAAGCTTCTTGATGGCGGT
TACATGTCGTTGCTTGTCCGCCTTAATCTCATCTGGATTCATCATCAGAACTTGATTTGT
TCTATCTCTCCAGATTCTGAAGCTGTGCTTATCTTGCCTGGGCTATTCATTATAGGAGGA
CATGGTGTTGGTGGTTCTGGCTTGATTGGACTCCATCGTTTATTTC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2BU36TF 712 0 0
GGAACGCTTGCACTAGGTAGTTTCTCTCTCTCTTTCCTCTCCACCTTCTCTCAAAGTTCT
CCTCAAATAAAATCCGTTTAACCGGCTCCGGCGGTTTCTTTAGCGTCGGAGTCGGGTTCA
GTTTCTTTTCAATGTTTTGGATAGATTTCATCTCGGTTTTTCCTTCTACTCAACAGGGGT
CCTTAGATCTCAATCTCTTTGAGTCCTATCTAGGGTTTGAAAGCGGTTGTTGATCTCCTT
GTTGCATGTTCGTTTGGGCTTTGATCTAATGATCCTAATCTGTCAGCAACACTTTTGGTT
GAATCCTTATTTACCGTTGTTGCATGCTGATCTCGAGTTCTCTTTGACTCGTCTTCGGTT
CGATCTTCTGCTTATTCGCCTTCGTGTGTGTGGCGGTATCCGGAGTCGTGTTCGTCGCTC
CTTGTCAATTTCTTTTGATCTGATCGAGATCTGCTCTTTGTCAAGCTTCTTGATGGCGGT
TACATGTCGTTGCTTGTCCGCCTTAATCTCATCTGGATTCATCATCAGAACTTGATTTGT
TCTATCTCTCCAGATTCTGAAGCTGTGCTTATCTTGCCTGGGCTATTCATTATAGGAGGA
CATGGTGTTGGTGGTTCTGTCTTGATTGGACTCCATCGTTTATTTCTCAAAGGTTCTCTT
GTAGATCGTATGTTTCTTGGTTTGTATTGTTTAG*ATTCAACTGATTT
GTTC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2FW56TF 739 0 0
GGAACGCTTGCACTAGGTAGTTTCTCTCTCTCTTTCCTCTCCACCTTCTCTCAAAGTTCT
CCTCAAATAAAATCTGTTTAACCGGCTCCGGCGGTTTCTTTAGCGTCGGAGTCGGGTTCA
GTTTCTTTTCAATGTTTTGGATAGATTTCATCTCGGTTTTTCCTTCTACTCAACAGGGGT
CCTTAGATCTCAATCTCTTTGAGTCCTATCTAGGGTTTGAAAGCGGTTGTTGATCTCCTT
GTTGCATGTTCGTTTGGGCTTTGATCTAATGATCCTAATCTGTCAGTAACACTTTTGGTT
GAATCCTTATTTACCGTTGTTGCATGCTGATCTCGAGTTCTCTTTGACTCGTCTTCGGTT
CGATCTTCTGCTTATTCGCCTTCGTGTGTGTGGTGGTATCCGGAGTCGTGTTCGTCGCTC
CTTGTCAATTTCTTTTGATCTGATCGAGATCTGCTCTTTGTCAAGCTTCTTGATGGCGGT
TACATGTCGTTGCTTGTCCGCCTTAATCTCATCTGGATTCATCATCAGAACTTGATTTGT
TCTATCTCTCCAGATTCTGAAGCTGTGCTTATCTTGCCTGGGCTATTCATTATAGGAGGA
CATGGTGTTGGTGGTTCTGGCTTGATTGGACTCCATCGTTTATTTCTCAAAG*TTCTCTT
GTAGATCGTATGTTTCTTGGTTTGTATTGTTTAG*ATTCAACTGATTT*GTTCTGATTGT
GAT*AGCATCTGTT
ACGTC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2BF60TF 748 0 0
GA
ACCTTCTCTCAAAGTTCTCCTCAAATAAAATCCGTTTAACCGGCTCCGGCGGTTTCTTTA
GCGTCGGAGTCGGGTTCAGTTTCTTTTCAATGTTTTGGATAGATTTCATCTCGGTTTTTC
CTTCTACTCAACAGGGGTCCTTAGATCTCAATCTCTTTGAGTCCTATCTAGGGTTTGAAA
GCGGTTGTTGATCTCCTTGTTGCATGTTCGTTTGGGCTTTGATCTAATGATCCTAATCTG
TCAGTAACACTTTTGGTTGAATCCTTATTTACCGTTGTTGCATGCTGATCTCGAGTTCTC
TTTGACTCGTCTTCGGTTCGATCTTCTGCTTATTCGCCTTCGTGTGTGTGGTGGTATCCG
GAGTCGTGTTCGTCGCTCCTTGTCAATTTCTTTTGATCTGATCGAGATCTGCTCTTTGTC
AAGCTTCTTGATGGCGGTTACATGTCGTTGCTTGTCCGCCTTAATCTCATCTGGATTCAT
CATCAGAACTTGATTTGTTCTATCTCTCCAGATTCTGAAGCTGTGCTTATCTTGCCTGGG
CTATTCATTATAGGAGGACATGGTGTTGGTGGTTCTGTCTTGATTGTACTCCATCGTTTA
TTTCTCAA*GGTTCTCTTGTAGATCGTATGTTTCTTGGTTTGTATTGTTTAG*ATTCAAC
TGATTTTGTTCTGATTGTGATTAGCATCTGTTTACGTCTTAGCTTCTGTTGTATTTCATC
TTCTCTCCCATGGTTGGGCTGTTGTT

QA 3 748 3 748
DS 

RD RR2FW56JQ 780 0 0
GTCGGGTTCAGTTTCTTTTCAATGTTTTGGATAGATTTCATCTCGGTTTTTCCTTCTACT
CAACAGGGGTCCTTAGATCTCAATCTCTTTGAGTCCTATCTAGGGTTTGAAAGCGGTTGT
TGATCTCCTTGTTGCATGTTCGTTTGGGCTTTGATCTAATGATCCTAATCTGTCAGTAAC
ACTTTTGGTTGAATCCTTATTTACCGTTGTTGCATGCTGATCTCGAGTTCTCTTTGACTC
GTCTTCGGTTCGATCTTCTGCTTATTCGCCTTCGTGTGTGTGGTGGTATCCGGAGTCGTG
TTCGTCGCTCCTTGTCAATTTCTTTTGATCTGATCGAGATCTGCTCTTTGTCAAGCTTCT
TGATGGCGGTTACATGTCGTTGCTTGTCCGCCTTAATCTCATCTGGATTCATCATCAGAA
CTTGATTTGTTCTATCTCTCCAGATTCTGAAGCTGTGCTTATCTTGCCTGGGCTATTCAT
TATAGGAGGACATGGTGTTGGTGGTTCTGGCTTGATTGGACTCCATCGTTTATTTCTCAA
AGGTTCTCTTGTAGATCGTATGTTTCTTGGTTTGTATTGTTTAGGATTCAACTGATTTTG
TTCTGATTGTGATTAGCATCTGTTTACGTCTTAGCTTCTGTTGTATTTCATCTTCTCTCC
CATGGTTGGGCTGTTGTTTCCGGGAATCTTCTGGTTGGTTCGTCGGACTTTCTTACCGGG
ATTAGTATAATCGCCGGTCTATGTATGTGATGTTTGTTAATCATAATGAAATTAGTGTTT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2H196JQ 674 0 0
TTGAAAGCGGTTGTTGATCTCCTTGTTGCATGTTCGTTTGGGCTTTGATCTAATGATCCT
AATCTGTCAGTAACACTTTTGGTTGAATCCTTATTTACCGTTGTTGCATGCTGATCTCGA
GTTCTCTTTGACTCGTCTTCGGTTCGATCTTCTGCTTATTCGCCTTCGTGTGTGTGGTGG
TATCCGGAGTCGTGTTCGTCGCTCCTTGTCAATTTCTTTTGATCTGATCGAGATCTGCTC
TTTGTCAAGCTTCTTGATGGCGGTTACATGTCGTTGCTTGTCCGCCTTAATCTCATCTGG
ATTCATCATCAGAACTTGATTTGTTCTATCTCTCCAGATTCTGAAGCTGTGCTTATCTTG
CCTGGGCTATTCATTATAGGAGGACATGGTGTTGGTGGTTCTGGCTTGATTGGACTCCAT
CGTTTATTTCTCAAAGGTTCTCTTGTAGATCGTATGTTTCTTGGTTTGTATTGTTTAGGA
TTCAACTGATTTTGTTCTGATTGTGATTAGCATCTGTTTACGTCTTAGCTTCTGTTGTAT
TTCATCTTCTCTCCCATGGTTGGGCTGTTGTTTCCGGGAATCTTCTGGTTGGTTCGTCGG
ACTTTCTTACCGGGATTAGTATAATCGCCGGTCTATGTATGTGATGTTTGTTAATCATAA
TGAAATTAGTGTTT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2BU36JQ 725 0 0
CTACTCAACAGGGGTCCTTAGATCTCAATCTCTTTGAGTCCTATCTAGGGTTTGAAAGCG
GTTGTTGATCTCCTTGTTGCATGTTCGTTTGGGCTTTGATCTAATGATCCTAATCTGTCA
GCAACACTTTTGGTTGAATCCTTATTTACCGTTGTTGCATGCTGATCTCGAGTTCTCTTT
GACTCGTCTTCGGTTCGATCTTCTGCTTATTCGCCTTCGTGTGTGTGGCGGTATCCGGAG
TCGTGTTCGTCGCTCCTTGTCAATTTCTTTTGATCTGATCGAGATCTGCTCTTTGTCAAG
CTTCTTGATGGCGGTTACATGTCGTTGCTTGTCCGCCTTAATCTCATCTGGATTCATCAT
CAGAACTTGATTTGTTCTATCTCTCCAGATTCTGAAGCTGTGCTTATCTTGCCTGGGCTA
TTCATTATAGGAGGACATGGTGTTGGTGGTTCTGTCTTGATTGGACTCCATCGTTTATTT
CTCAAAGGTTCTCTTGTAGATCGTATGTTTCTTGGTTTGTATTGTTTAGGATTCAACTGA
TTTTGTTCTGATTGTGATTAGCATCTGTTTACGTCTTAGCTTCTGTTGTATTTCATCTTC
TCTCCCATGGTTGGGCTGTTGTTTCCGGGAATCTTCTGGTTGGTTCGTCGGACTTTCTTA
CCGGGATTAGTATAATCGCCGGTCTATGTATGTGATGTTTGTTAATCATAATGAAATTAG
TGTTT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2BF60JQ 705 0 0
GATCTCAATCTCTTTGAGTCCTATCTAGGGTTTGAAAGCGGTTGTTGATCTCCTTGTTGC
ATGTTCGTTTGGGCTTTGATCTAATGATCCTAATCTGTCAGTAACACTTTTGGTTGAATC
CTTATTTACCGTTGTTGCATGCTGATCTCGAGTTCTCTTTGACTCGTCTTCGGTTCGATC
TTCTGCTTATTCGCCTTCGTGTGTGTGGTGGTATCCGGAGTCGTGTTCGTCGCTCCTTGT
CAATTTCTTTTGATCTGATCGAGATCTGCTCTTTGTCAAGCTTCTTGATGGCGGTTACAT
GTCGTTGCTTGTCCGCCTTAATCTCATCTGGATTCATCATCAGAACTTGATTTGTTCTAT
CTCTCCAGATTCTGAAGCTGTGCTTATCTTGCCTGGGCTATTCATTATAGGAGGACATGG
TGTTGGTGGTTCTGTCTTGATTGTACTCCATCGTTTATTTCTCAA*GGTTCTCTTGTAGA
TCGTATGTTTCTTGGTTTGTATTGTTTAGGATTCAACTGATTTTGTTCTGATTGTGATTA
GCATCTGTTTACGTCTTAGCTTCTGTTGTATTTCATCTTCTCTCCCATGGTTGGGCTGTT
GTTTCCGGGAATCTTCTGGTTGGTTCGTCGGACTTTCTTACCGGGATTAGTATAATCGCC
GGTCTATGTATGTGATGTTTGTTAATCATAATGAAATTAGCGTTT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 2 7

CO CL872Contig1 1309 5 9 U
CTAAATCTCAAAATCTAACATTTATTCAAACCATAAGTCCAAACAACCAACAAGGATAGT
CATCATCATCAAGACACTACACTGAAAACAGGAAACACACATAACAGACAAATTGCAAAA
CAAACAACACACTACCACCCATAGCAATAATCTCAAGCCTCTCTCAAACCCACATTTTCG
TTTACTTAATCTGCTTCTGCATAAGCTGTTTCAAGATGAGCTTGCTCTGCTTCTTTAACT
TCTTTCTCAGTCTTCCTTCCTTTCTTAGACTTATAGTAAACACTCATGAACGTTCCAACA
GCTCTGTACTTCTTACGGCAATGCTCGTACAAGTCAGCATCAAACATCCTCCAGAAACTC
TTCTCGTCCAGCTCAGACACAGCGTACTGAGGCTGGAACCCATGGTTCTCAATCAGCCAC
TTCTCCAACTTACGCACAGCTTCTGCTCCATCATACTCTTCACCTCTTAGGACAGGACCT
GGTGCGTAGTAGACTCCAACGTCAGTGTACATCTGAGCATCATCTGTGTCTCCTTGTCTC
TTCTCATACTCAAACCCTGGTTCTGGATAAATCTGTTGTCTGATTGGTGTCTTGTAGAGT
TTGTGTGGGCAAAGCCAAATGGGATAAACCTCCATTTCTTGGTGAACCCATTCGAGAGCA
TCACCAACCTTGTAAAGAGGAACAAGCATGTCCTGAATCACATGCATATCATGGTAATAG
TTTCTAATAGCTTCACCTTGAGTAGCCTTGAGAAGAGACACCTTCGGAGGCATCAACCAA
CCAAAGAGGAACCTAAACCAAAACTGATCACCGAAAGGAAGAATCAGCTTCCCTTCCCAG
TACAAGCACCTCGTGTGTCTGTGATAGTACTCACGAGTCGGGATGTACTCAACAAACTGT
CCTTTCGTCAGCGCGGTCTGTGCGTGCTGGTAGAACCACGGCTTGAACCACCACCCGACG
TTGTTGATCTTGTTCCCTTTCTTCTTGGCTTCTGCTTTAGACGCGTAAGTACCAACCATC
ATCACACCTTCCGTTGGATTGTAAACCATGCCTTCGACGAAGTCAGGGATCTTGGACTCG
TCTCCATCTTTGGGAGCGAAAGAGTCCATGTACCCTTGCGCTAAGGTCTGAAGATCTCCC
TTGACCGGTATGTAAGTGAGCCTCATGTACTCCTTAACCGGTATAAGCCTGATCTCAGCA
GCCACAAGTAGTCCAAGCGTCCCTTGAGACCAAGGGATCGCATAGTAAAGATCTGAATAT
TCGTTATCTCTAGTGGCACGTACAAGCTCCCCACCAGCTAGAACAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD45JQ U 1
AF RR2DX39JQ U 6
AF RR2E814JQ U 7
AF RR2DD45TF C 537
AF RR2E814TF C 750
BS 1 199 RR2DD45JQ
BS 200 200 RR2DX39JQ
BS 201 405 RR2DD45JQ
BS 406 406 RR2DX39JQ
BS 407 660 RR2DD45JQ
BS 661 708 RR2DX39JQ
BS 709 765 RR2E814JQ
BS 766 1049 RR2DD45TF
BS 1050 1309 RR2E814TF

RD RR2DD45JQ 660 0 0
CTAAATCTCAAAATCTAACATTTATTCAAACCATAAGTCCAAACAACCAACAAGGATAGT
CATCATCATCAAGACACTACACTGAAAACAGGAAACACACATAACAGACAAATTGCAAAA
CAAACAACACACTACCACCCATAGCAATAATCTCAAGCCTCTCTCAAACCCACATTTTCG
TTTACTTAATCTGCTTCTGAATAAGCTGTTTCAAGATGAGCTTGCTCTGCTTCTTTAACT
TCTTTCTCAGTCTTCCTTCCTTTCTTAGACTTATAGTAAACACTCATGAACGTTCCAACA
GCTCTGTACTTCTTACGGCAATGCTCGTACAAGTCAGCATCAAACATCCTCCAGAAACTC
TTCTCGTCCAGCTCAGACACAGCGTACTGAGGCTGGAACCCATGGCTCTCAATCAGCCAC
TTCTCCAACTTACGCACAGCTTCTGCTCCATCATACTCTTCACCTCTTAGGACAGGACCT
GGTGCGTAGTAGACTCCAACGTCAGTGTACATCTGAGCATCATCTGTGTCTCCTTGTCTC
TTCTCATACTCAAACCCTGGTTCTGGATAAATCTGTTGTCTGATTGGTGTCTTGTAGAGT
TTGTGTGGGCAAAGCCAAATGGGATAAACCTCCATTTCTTGGTGAACCCATTCGAGAGCA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2DX39JQ 703 0 0
C
CTCAAAATCTAACATTTATTCAAACCATAAGTCCAAACAACCAACAAGGATAGTCATCAT
CATCAAGACACTACACTGAAAACAGGAAACACACATAACAGACAAATTGCAAAACAAACA
ACACACTACCACCCATAGCAATAATCTCAAGCCTCTCTCAAACCCACATTTTCGTTTACT
TAATCTGCTTCTGCATAAGCTGTTTCAAGATGAGCTTGCTCTGCTTCTTTAACTTCTTTC
TCAGTCTTCCTTCCTTTCTTAGACTTATAGTAAACACTCATGAACGTTCCAACAGCTCTG
TACTTCTTACGGCAATGCTCGTACAAGTCAGCATCAAACATCCTCCAGAAACTCTTCTCG
TCCAGCTCAGACACAGCGTACTGAGGCTGGAACCCATGGTTCTCAATCAGCCACTTCTCC
AACTTACGCACAGCTTCTGCTCCATCATACTCTTCACCTCTTAGGACAGGACCTGGTGCG
TAGTAGACTCCAACGTCAGTGTACATCTGAGCATCATCTGTGTCTCCTTGTCTCTTCTCA
TACTCAAACCCTGGTTCTGGATAAATCTGTTGTCTGATTGGTGTCTTGTAGAGTTTGTGT
GGGCAAAGCCAAATGGGATAAACCTCCATTTCTTGGTGAACCCATTCGAGAGCATCACCA
ACCTTGTAAAGAGGAACAAGCATGTCCTGAATCACATGCATA

QA 2 703 2 703
DS 

RD RR2E814JQ 759 0 0
CTCAAAATCTAACATTTATTCAAACCATAAGTCCAAACAACCAACAAGGATAGTCATCAT
CATCAAGACACTACACTGAAAACAGGAAACACACATAACAGACAAATTGCAAAACAAACA
ACACACTACCACCCATAGCAATAATCTCAAGCCTCTCTCAAACCCACATTTTCGTTTACT
TAATCTGCCTCTGCATAAGCTGTTTCAAGATGAGCTTGCTCTGCTTCTTTAACTTCTTTC
TCAGTCTTCCTTCCTTTCTTAGACTTATAGTAAACACTCATGAACGTTCCAACAGCTCTG
TACTTATTACGGCAATGCTCGTACAAGTCAGCATCAAACATCCTCCAAAAACTCTTCTCG
TCCAGCTCAAACACAGCGTACTGAGGCTGGAACCCATGGTTCTCAATCAGCCACTTCTCC
AACTTACGCACAGCTTCTGCTCCATCATACTCTTCACCTCTTAGGACAGGACCTGGTGCG
TAGTAGACTCCAACGTCAGTGTACATCTGAGCATCATCTGTGTCTCCTTGTCTCTTCTCA
TACTCAAACCCTGGTTCTGGATAAATCTGTTGTCTGATTGGTGTCTTGTAGAGTTTGTGT
GGGCAAAGCCAAATGGGATAAACCTCCATTTCTTGGTGAACCCATTCGAGAGCATCACCA
ACCTTGTAAAGAGGAACAAGCATGTCCTGAATCACATGCATATCATGGTAATAGTTTCTA
ATAGCTTCACCTTGAGTAGCCTTGAGAAGAGACACCTTC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2DD45TF 514 0 0
TCTCTTCTCATACTCAAACCCTGGTTCTGGATAAATCTGTTGTCTGATTGGTGTCTTGTA
GAGTTTGTGTGGGCAAAGCCAAATGGGATAAACCTCCATTTCTTGGTGAACCCATTCGAG
AGCATCACCAACCTTGTAAAGAGGAACAAGCATGTCCTGAATCACATGCATATCATGGTA
ATAGTTTCTAATAGCTTCACCTTGAGTAGCCTTGAGAAGAGACACCTTCGGAGGCATCAA
CCAACCAAAGAGGAACCTAAACCAAAACTGATCACCGAAAGGAAGAATCAGCTTCCCTTC
CCAGTACAAGCACCTCGTGTGTCTGTGATAGTACTCACGAGTCGGGATGTACTCAACAAA
CTGTCCTTTCGTCAGCGCGGTCTGTGCGTGCTGGTAGAACCACGGCTTGAACCACCACCC
GACGTTGTTGATCTTGTTCCCTTTCTTCTTGGCTTCTGCTTTAGACGCGTAAGTACCAAC
CATCATCACACCTTCCGTTGGATTGTAAACCAT
C

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2E814TF 560 0 0
GAG
AAGAGACACCTTCGGAGGCATCAACCAACCAAAGAGGAAC*TAAACCAAAACTGATCACT
GAAAGGAAGAATCAGCTTCCCTTCCCAGTACAAGCACCTCGTGTGTCTGTGATAGTACTC
ACGAGTCGGGATGTACTCAACAAACTGTCCTTTCGTCAGCGCGGTCTGTGCGTGCTGGTA
GAACCACGGCTTGAACCACCACCCGACGTTGTTGATCTTGTTCCCTTTCTTCTTGGCTTC
TGCTTTAGACGCGTAAGTACCAACCATCCTCACACCTTCCGTTGGATTGTAAACCATGCC
TTCGACGAAGTCAGGGATCTTGGACTCGTCTCCATCTTTGGGAGCGAAAGAGTCCATGTA
CCCTTGCGCTAAGGTCTGAAGATCTCCCTTGACCGGTATGTAAGTGAGCCTCATGTACTC
CTTAACCGGTATAAGCCTGATCTCAGCAGCCACAAGTAGTCCAAGCGTCCCTTGAGACCA
AGGGATCGCATAGTAAAGATCTGAATATTCGTTATCTCTAGTGGCACGTACAAGCTCCCC
ACCAGCTAGAACAATCC

QA 4 560 4 560
DS 



CO CL872Contig2 866 2 6 U
GATCCCGACTCGTGAGTATTACCACAGACACACGAGGTGCTTGTACTGGGAAGGGAAGCT
TATCCTTCCTTTTGGTGATCAGTTTTGGTTTAGGTTCCTCTTTGGTTGGTGATGCCTCCG
AAGGTGTCTCTTCTTAAGGCTACTCAAGGTGAAGCTATTAGAAACTATTACCATGATATG
CATGTTATTCAGGACATGCTTGTTCCTCTTTACAAGGTTGGTGATGCTCTCGAATGGGTT
CACCAAGAAATGGAGGTTTATCCCATTTGGCTTTGCCCACACAAACTCTACAAGACACCA
ATCAAACAACAGATTTATCCAGAACCAGGGTTTGAGTATGAGAAGAGACAAGGAGACACA
GATGATGCTCAGATGTACACTGACGTTGGAGTCTACTACGCACCAGGTCCTGTCCTAAGA
GGTGAAGAGTATGATGGAGCAGAAGCTGTGCGTAAGCTGGAGAAGTGGCTGATTGAGAAC
CACGGGTTCCAGCCTCAGTACGCTGTGTCTGAGCTGGACGAGAAGAGTTTCTGGAGGATG
TTTGATGCTGACTTGTATGAGCATTGCCGTAAGAAGTACAGAGCTGTTGGAACGTTCATG
AGTGTTTACTATAAGTCTAAGAAAGGAAGGAAAACTGAGAAAGAAGTTAAAGAAGCAGAG
CAAGCTCATCTTGAAACAGCTTATGCTGAGGCAGATTAAGCAGTGAAAATGTGGGTTTGA
GATTATGATTGCTATGGGTGGTAGTGTGTTGTTTCTTTTGCAATTTTTCTGTTATGTGTG
TTTCCTGTTTTCAGTGTAGTGTCTTGATGATGACTATCCTTGTTGGTTGTTTGGACTTAT
GGTTTGAATAAATGTTAGATTTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP07TF U 1
AF RR2FP07JQ C 126
BS 1 690 RR2FP07TF
BS 691 691 RR2FP07JQ
BS 692 723 RR2FP07TF
BS 724 724 RR2FP07JQ
BS 725 754 RR2FP07TF
BS 755 866 RR2FP07JQ

RD RR2FP07TF 754 0 0
GATCCCGACTCGTGAGTATTACCACAGACACACGAGGTGCTTGTACTGGGAAGGGAAGCT
TATCCTTCCTTTTGGTGATCAGTTTTGGTTTAGGTTCCTCTTTGGTTGGTGATGCCTCCG
AAGGTGTCTCTTCTTAAGGCTACTCAAGGTGAAGCTATTAGAAACTATTACCATGATATG
CATGTTATTCAGGACATGCTTGTTCCTCTTTACAAGGTTGGTGATGCTCTCGAATGGGTT
CACCAAGAAATGGAGGTTTATCCCATTTGGCTTTGCCCACACAAACTCTACAAGACACCA
ATCAAACAACAGATTTATCCAGAACCAGGGTTTGAGTATGAGAAGAGACAAGGAGACACA
GATGATGCTCAGATGTACACTGACGTTGGAGTCTACTACGCACCAGGTCCTGTCCTAAGA
GGTGAAGAGTATGATGGAGCAGAAGCTGTGCGTAAGCTGGAGAAGTGGCTGATTGAGAAC
CACGGGTTCCAGCCTCAGTACGCTGTGTCTGAGCTGGACGAGAAGAGTTTCTGGAGGATG
TTTGATGCTGACTTGTATGAGCATTGCCGTAAGAAGTACAGAGCTGTTGGAACGTTCATG
AGTGTTTACTATAAGTCTAAGAAAGGAAGGAAAACTGAGAAAGAAGTTAAAGAAGCAGAG
CAAGCTCATCTTGAAACAGCTTATGCTGAG*CAGATTAAGCAGTGAAAATGTGGGTTTGA
GAT*ATGATTGCTATGGGTGGTAGTGTGTTGTTT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2FP07JQ 741 0 0
GTCTCTTCTTAAGGCTACTCAAGGTGAAGCTATTAGAAACTATTACCATGATATGCATGT
TATTCAGGACATGCTTGTTCCTCTTTACAAGGTTGGTGATGCTCTCGAATGGGTTCACCA
AGAAATGGAGGTTTATCCCATTTGGCTTTGCCCACACAAACTTTACAAGACACCAATCAA
ACAACAGATTTATCCAGAACCAGGGTTTGAGTATGAGAAGAGACAAGGAGACACAGATGA
TGCTCAGATGTACACTGACGTTGGAGTTTACTACGCACCAGGTCCTGTCCTAAGAGGTGA
AGAGTATGATGGAGCAGAAGCTGTGCGTAAGCTGGAGAAGTGGCTGATTGAGAACCACGG
GTTCCAGCCTCAGTACGCTGTGTTTGAGCTGGACGAGAAGAGTTTTTGGAGGATGTTTGA
TGCTGACTTGTATGAGCATTGCCGTAAGAAGTACAGAGCTGTTGGAACGTTCATGAGTGT
TTACTATAAGTTTAAGAAAGGAAGGAAAACTGAGAAAGAAGTTAAAGAAGCAGAGCAAGC
TCATCTTGAAACAGCTTATGCTGAGGCAGATTAAGCAGTGAAAATGTGGGTTTGAGATTA
TGATTGCTATGGGTGGTAGTGTGTTGTTTCTTTTGCAATTTTTCTGTTATGTGTGTTTCC
TGTTTTCAGTGTAGTGTCTTGATGATGACTATCCTTGTTGGTTGTTTGGACTTATGGTTT
GAATAAATGTTAGATTTTGAG

QA 1 741 1 741
DS 



AS 3 8

CO CL873Contig1 836 2 1 U
AGGAAGATTAAGACCCTCACTTGTTTTATAACTAACACTGATTTGCTTAGTTGCAAGAGA
CATCTTATTCTATAATATTCAGAGTTTTAGACTATTTCTTACGTATTACACAAGAAAACA
AGACCACACAGTTCAACAGTTTGATACTTGTCCTCAGTCAAGGTCACGAGAAACCACGAC
AAGCTGTTTCCCAACGTTCTTACCATGAAAGAGTCCAACGAGCGCAGCAGGAGCGTTCTC
GAGCCCGTCAGCAACATCTTCCACGTACGTTATCTTCCCTTGTCGTATATAGGGAAGAAC
AAACTCCAAGAACTCCGAGTACTTGGGCAAGTAATCGATGGTGTTAAACCCTTGAATACG
TATACGTTTGTAGGTAATGAGCCAGAGGTTGTATACTGCTTCAGGAATCTGCAGATTGTA
CTGTGAGATCATACCGCATGCTGCGATGCGGCCGTGTGGTCTCATGTTTAGGATCACTGC
GTCTAGCATTTTGCCTCCCACGTTCTCAAAGTATATGTCAATGCCTACAGGGAAACACCT
TTTTAAGGCAGCGTTGAGATCTTTTTCTTCCTTGTAGTTGAATGCATCGTCGAATCCAAA
CTTGTTCTTGAGAAGATCAACCTTTTCTTTGCTTCCGGCGCTTCCAACGACATAGCAACC
CATCAGCTTAGCAAACTGTCCAACAAGCTGACCAACAGCACCAGATGCAGCTGACACAAA
CACACTCTCTCCTTTCTTTGGTGAACAGATCTCATAAAACCCAGCATATGCGGTCATACC
AGGCATACCAAGAAGACCAGTGTAGTGGGATAAGGAACATCTGTATGATGGATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ58JQ U 20
AF RR2CM93JQ U 1
BS 1 836 RR2CM93JQ

RD RR2EQ58JQ 569 0 0
CTTGTTTTATAACTAACACTGATTTGCTTAGTTGCAAGAGACATCTTATTCTATAATATT
CAGAGTTTTAGACTATTTCTTACGTATTACACAAGAAAACAAGACCACACAGTTCAACAG
TTTGATACTTGTCCTCAGTCAAGGTCACGAGAAACCACGACAAGCTGTTTCCCAACGTTC
TTACCATGAAAGAGTCCAACGAGCGCAGCAGGAGCGTTCTCGAGCCCGTCAGCAACATCT
TCCACGTACGTTATCTTCCCTTGTCGTATATAGGGAAGAACAAACTCCAAGAACTCCGAG
TACTTGGGCAAGTAATCGATGGTGTTAAACCCTTGAATACGTATACGTTTGTAGGTAATG
AGCCAGAGGTTGTATACTGCTTCAGGAATCTGCAGATTGTACTGTGAGATCATACCGCAT
GCTGCGATGCGGCCGTGTGGTCTCATGTTTAGGATCACTGCGTCTAGCATTTTGCCTCCC
ACGTTCTCAAAGTATATGTCAATGCCTACAGGGAAACACCTTTTTAAGGCAGCGTTGAGA
TCTTTTTCTTCCTTGTAGTTGAATGCATC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2CM93JQ 836 0 0
AGGAAGATTAAGACCCTCACTTGTTTTATAACTAACACTGATTTGCTTAGTTGCAAGAGA
CATCTTATTCTATAATATTCAGAGTTTTAGACTATTTCTTACGTATTACACAAGAAAACA
AGACCACACAGTTCAACAGTTTGATACTTGTCCTCAGTCAAGGTCACGAGAAACCACGAC
AAGCTGTTTCCCAACGTTCTTACCATGAAAGAGTCCAACGAGCGCAGCAGGAGCGTTCTC
GAGCCCGTCAGCAACATCTTCCACGTACGTTATCTTCCCTTGTCGTATATAGGGAAGAAC
AAACTCCAAGAACTCCGAGTACTTGGGCAAGTAATCGATGGTGTTAAACCCTTGAATACG
TATACGTTTGTAGGTAATGAGCCAGAGGTTGTATACTGCTTCAGGAATCTGCAGATTGTA
CTGTGAGATCATACCGCATGCTGCGATGCGGCCGTGTGGTCTCATGTTTAGGATCACTGC
GTCTAGCATTTTGCCTCCCACGTTCTCAAAGTATATGTCAATGCCTACAGGGAAACACCT
TTTTAAGGCAGCGTTGAGATCTTTTTCTTCCTTGTAGTTGAATGCATCGTCGAATCCAAA
CTTGTTCTTGAGAAGATCAACCTTTTCTTTGCTTCCGGCGCTTCCAACGACATAGCAACC
CATCAGCTTAGCAAACTGTCCAACAAGCTGACCAACAGCACCAGATGCAGCTGACACAAA
CACACTCTCTCCTTTCTTTGGTGAACAGATCTCATAAAACCCAGCATATGCGGTCATACC
AGGCATACCAAGAAGACCAGTGTAGTGGGATAAGGAACATCTGTATGATGGATCTT

QA 1 836 1 836
DS 



CO CL873Contig2 770 4 22 U
GGAACAAGAAAAAAAAACAAATTGGAGTAATGGAAACGATGGTAATGAGCAACAAGCAAG
TCATCTTCAGAGACTACGTTACCGGATTCCTTAGCGAATCCGACCTTTTGATCAACTCTA
CCACCGTAAATCTTAAGGTACCGGCTGGATCAATGACAGCGTTGGTGAAGAATCTCTACT
TGTCTTGCGATCCTTACATGCGCAACCGTATGAGAAAGCCTGATCCCTCTAGTCCCGCTA
CTGCTCTGTCTTTCGTTCCCGGCAAGCCTATCTCAGGGTTTGGAGTGTCTAAAGTAATGG
ATTCAGGGCACCCAGATTACAAAGAAGGTGACTTGCTCTGGGGAGCTGTTGGATGGGAAG
AGTATAGTGTTATCACTCCTATTCCCAATATTCACTTCAAGATCCAGCATACAGATGTTC
CCTTATCCCACTACACTGGTCTTCTTGGTATGCCTGGTATGACCGCATACGCTGGGTTTT
ATGAGATCTGTTCACCAAAGAAAGGAGAGACTGTGTTTGTGTCAGCTGCATCTGGTGCTG
TTGGTCAGCTTGTGGGACAGTTTGCTAAGCTGATGGGTTGCTACGTCGTTGGAAGCGCCG
GAAGCAAAGAAAAGGTTGATCTTCTCAAGAACAAGTTTGGATTCGACGATGCATTCAACT
ACAAGAAGAAAACGATCTCACGCTGCCTTAAAGAGTGTTTCCCTGTAGCATGACATATAC
TTTGAGACGTGGGAGGAAAATGCTAGACGCAGTGATCTAACATGAGACCA


BQ
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 0 0 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 5 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ58TF U 1
AF RR2CM93TF U 1
AF RR2E869TF U 0
AF RR2H181TF U 1
BS 1 10 RR2CM93TF
BS 11 11 RR2E869TF
BS 12 14 RR2CM93TF
BS 15 17 RR2E869TF
BS 18 205 RR2CM93TF
BS 206 206 RR2E869TF
BS 207 238 RR2CM93TF
BS 239 239 RR2E869TF
BS 240 406 RR2CM93TF
BS 407 407 RR2E869TF
BS 408 469 RR2CM93TF
BS 470 470 RR2E869TF
BS 471 510 RR2CM93TF
BS 511 511 RR2E869TF
BS 512 553 RR2CM93TF
BS 554 554 RR2E869TF
BS 555 583 RR2CM93TF
BS 584 584 RR2E869TF
BS 585 602 RR2CM93TF
BS 603 603 RR2E869TF
BS 604 659 RR2CM93TF
BS 660 770 RR2H181TF

RD RR2EQ58TF 595 0 0
GGAACAAGAATAAACC*CAAATTGGAGTAATGGAAACGATGGTAATGAGCAACAAGCAAG
TCATCTTCAGAGACTACGTTACCGGATTCCTTAGCGAATCCGACCTTTTGATCAACTCTA
CCACCGTAAATCTTAAGGTACCGGCTGGATCAATGACAGCGTTGGTGAAGAATCTCTACT
TGTCTTGCGATCCTTACATGCGCAACCGTATGAGAAAGCCTGATCCCTCTAGTCCCGCTA
CTGCTCTGTCTTTCGTTCCCGGCAAGCCTATCTCAGGGTTTGGAGTGTCTAAAGTAATGG
ATTCAGGGCACCCAGATTACAAAGAAGGTGACTTGCTCTGGGGAGCTGTTGGATGGGAAG
AGTATAGTGTTATCACTCCTATTCCCAATATTCACTTCAAGATCCATCATACAGATGTTC
CCTTATCCCACTACACTGGTCTTCTTGGTATGCCTGGTATGACCGCATATGCTGGGTTTT
ACGAGATCTGTTCAC*AAAGAAAGGAGAGAGTGTGTTTGTGTCAGCTGCATCTGGTGCTG
TTGGTCAGCTTGTTGGACAGTTTGCTAAGCTGATGGGTTGCTATGTCGTTGGAAG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2CM93TF 659 0 0
GGAACAAGAATAAACC*CAAATTGGAGTAATGGAAACGATGGTAATGAGCAACAAGCAAG
TCATCTTCAGAGACTACGTTACCGGATTCCTTAGCGAATCCGACCTTTTGATCAACTCTA
CCACCGTAAATCTTAAGGTACCGGCTGGATCAATGACAGCGTTGGTGAAGAATCTCTACT
TGTCTTGCGATCCTTACATGCGCAAACGTATGAGAAAGCCTGATCCCTCTAGTCCCGCCA
CTGCTCTGTCTTTCGTTCCCGGCAAGCCTATCTCAGGGTTTGGAGTGTCTAAAGTAATGG
ATTCAGGGCACCCAGATTACAAAGAAGGTGACTTGCTCTGGGGAGCTGTTGGATGGGAAG
AGTATAGTGTTATCACTCCTATTCCCAATATTCACTTCAAGATCCATCATACAGATGTTC
CCTTATCCCACTACACTGGTCTTCTTGGTATGCCTGGTATGACCGCATATGCTGGGTTTT
ATGAGATCTGTTCACCAAAGAAAGGAGAGAGTGTGTTTGTGTCAGCTGCATCTGGTGCTG
TTGGTCAGCTTGTTGGACAGTTTGCTAAGCTGATGGGTTGCTATGTCGTTGGAAGCGCCG
GA*GCAAAGAAAAGGTTGATCTTCTCAAGAACAAGTTTGGATTCGACGATGCATTCAAC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2E869TF 611 0 0
GAT
AACAAGAAAAAAAAACATCTTGGAGTTATGGAGACGATGGTAATGAGCAACAAGCAAGTC
ATCTTCAGAGACTACGTTACCGGATTCCTTAGCGAATCCGACCTTTTGATCAACTCTACC
ACCGTAAATCTTAAGGTACCGGCTGGATCAATGACAGCGTTGGTGAAGAATCTCTACTTG
TCTTGCGATCCTTACATGCGCAACCGTATGAGAAAGCCTGATCCCTCTAGTCCCGCTACT
GCTCTGTCTTTCGTTCCCGGCAAGCCTATCTCAGGGTTTGGAGTGTCTAAAGTGATGGCT
TCAGGGCACCCAGATTACAAAGAAGGTGACTTGCTTTGGGGAGCTGTTGGATGGGAGGAG
TATAGTGTTATCACTCCTATTCCCAATATTCACTTCAAGATCCAGCATACAGATGTTCCC
TTATCCCACTACGCTGGTCTTCTTGGTATGCCTGGTATTACCGCATACGCTGGGTTTTAT
GAGATCTGTTCACCAAAGAAAGGAGAGACTGTGTTTGTGTCAGCTGCATCTGGTGCTGTT
GGTCAGCTTGTGGGACAGTTTGCTAAGCTGATGGGTTGCTACGTCGTTGGAAGCACCGGA
AGCAAAGA

QA 4 611 4 611
DS 

RD RR2H181TF 770 0 0
GG
AACAAGAAAAAAAAACACCTTGGAGTTATGGAGACGATGGTAATGAGCAACAAGCAAGTC
ATCTTCAGAGACTACGTTACCGGATTCCTTAGCGAATCCGACCTTTTGATCAACTCTACC
ACCGTAAATCTTAAGGTACCGGCTGGATCAATGACAGCGTTGGTGAAGAATCTCTACTTG
TCTTGCGATCCTTACATGCGCAACCGTATGAGAAAGCCTGATCCCTCTAGTCCCGCTACT
GCTCTGTCTTTCGTTCCCGGCAAGCCTATCTCAGGGTTTGGAGTGTCTAAAGTGATGGCT
TCAGGGCACCCAGATTACAAAGAAGGTGACTTGCTTTGGGGAGCTGTTGGATGGGAGGAG
TATAGTGTTATCACTCCTATTCCCAATATTCACTTCAAGATCCAGCATACAGATGTTCCC
TTATCCCACTACACTGGTCTTCTTGGTATGCCTGGTATGACCGCATACGCTGGGTTTTAT
GAGATCTGTTCACCAAAGAAAGGAGAGACTGTGTTTGTGTCAGCTGCATCTGGTGCTGTT
GGTCAGCTTGTGGGACAGTTTGCTAAGCTGATGGGTTGCTACGTCGTTGGAAGCGCCGGA
AGCAAAGAAAAGGTTGATCTTCTCAAGAACAATTTTGGATTCGATGATGCATTCAACTAC
AAGAAGAAAACGATCTCACGCTGCCTTAAAGAGTGTTTCCCTGTAGCATGACATATACTT
TGAGACGTGGGAGGAAAATGCTAGACGCAGTGATCTAACATGAGACCA

QA 3 770 3 770
DS 



CO CL873Contig3 819 2 12 U
GGCAATTGATTTCTTTATATTGTTGAAGCAACAGAGTTTATTTTATCAATAAAGAGGAAG
ATTATGACCCTCACTTGTTTTATAACTAACACTGATTTGCTTAGTTGCAAGAGACATATC
TTATTCTGTAATATTTAGAGTTTTAGACTATTTCTTAGTAGTACACAAGAAACAAGACCA
CATAGTTCAACAGTTTGGTACTTCTCAGTCAAGGTCACGAGAAACCACGACAAGCTGTTT
CCCAACGTTCTTACCATGAAAGAGTCCAACGAGCGCAGCAGGAGCGCTCTCGAGACCGTC
AGCAACATCTTCCACGTACGTTATCTTCCCTTGTCGTATATAGGGAAGCACAAACTACAA
GAACTCCGAGTATTTGGGCAAGTAATCGATTGTGTTAAACCCTTGAATACGTATACGTTT
GTATGTAATGAGCCAGAGGTTGTATACTGCTTCAGGAACCTGCAGATTGTACTGTGAGAT
CATACCGCATGCTGCGATACGGCCGTGTGGTCTCATGTTTAGGATCACTGCGTCTAGCAT
TTTTCCTCCCACGTTCTCAAAGTATATGTCAATGCCTACAGGGAAACACCTCTTTAAGGC
AGCGTTGAGATCGTTTTCTTCCTTGTAGTTGAATGCATCATCGAATCCAAAATTGTTCTT
GAGAAGATCAACCTTTTCTTTGCTTCCGGCGCTTCCAACGACGTAGCAACCCATCAGCTT
AGCAAACTGTCCCACAAGCTGACCAACAGCACCAGATGCAGCTGACACAAACACAGTCTC
TCCTTTCTTTGGTGAACAGATCTCATAAAACCCAGCGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E869JQ U 1
AF RR2H181JQ U 45
BS 1 54 RR2E869JQ
BS 55 55 RR2H181JQ
BS 56 356 RR2E869JQ
BS 357 357 RR2H181JQ
BS 358 519 RR2E869JQ
BS 520 520 RR2H181JQ
BS 521 651 RR2E869JQ
BS 652 652 RR2H181JQ
BS 653 689 RR2E869JQ
BS 690 690 RR2H181JQ
BS 691 764 RR2E869JQ
BS 765 819 RR2H181JQ

RD RR2E869JQ 764 0 0
GGCAATTGATTTCTTTATATTGTTGAAGCAACAGAGTTTATTTTATCAATAAAGGGGAAG
ATTATGACCCTCACTTGTTTTATAACTAACACTGATTTGCTTAGTTGCAAGAGACATATC
TTATTCTGTAATATTTAGAGTTTTAGACTATTTCTTAGTAGTACACAAGAAACAAGACCA
CATAGTTCAACAGTTTGGTACTTCTCAGTCAAGGTCACGAGAAACCACGACAAGCTGTTT
CCCAACGTTCTTACCATGAAAGAGTCCAACGAGCGCAGCAGGAGCGCTCTCGAGACCGTC
AGCAACATCTTCCACGTACGTTATCTTCCCTTGTCGTATATAGGGAAGCACAAACTCCAA
GAACTCCGAGTATTTGGGCAAGTAATCGATTGTGTTAAACCCTTGAATACGTATACGTTT
GTATGTAATGAGCCAGAGGTTGTATACTGCTTCAGGAACCTGCAGATTGTACTGTGAGAT
CATACCGCATGCTGCGATACGGCCGTGTGGTCTCATGTT*AGGATCACTGCGTCTAGCAT
TTTTCCTCCCACGTTCTCAAAGTATATGTCAATGCCTACAGGGAAACACCTCTTTAAGGC
AGCGTTGAGATCGTTTTCTTCCTTGTAGTTGAATGCATCATCGAATCCAAACTTGTTCTT
GAGAAGATCAACCTTTTCTTTGCTTCCGGTGCTTCCAACGACGTAGCAACCCATCAGCTT
AGCAAACTGTCCCACAAGCTGACCAACAGCACCAGATGCAGCTG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2H181JQ 775 0 0
ATCAATAAAGAGGAAGATTATGACCCTCACTTGTTTTATAACTAACACTGATTTGCTTAG
TTGCAAGAGACATATCTTATTCTGTAATATTTAGAGTTTTAGACTATTTCTTAGTAGTAC
ACAAGAAACAAGACCACATAGTTCAACAGTTTGGTACTTCTCAGTCAAGGTCACGAGAAA
CCACGACAAGCTGTTTCCCAACGTTCTTACCATGAAAGAGTCCAACGAGCGCAGCAGGAG
CGCTCTCGAGACCGTCAGCAACATCTTCCACGTACGTTATCTTCCCTTGTCGTATATAGG
GAAGCACAAACTACAAGAACTCCGAGTATTTGGGCAAGTAATCGATTGTGTTAAACCCTT
GAATACGTATACGTTTGTATGTAATGAGCCAGAGGTTGTATACTGCTTCAGGAACCTGCA
GATTGTACTGTGAGATCATACCGCATGCTGCGATACGGCCGTGTGGTCTCATGTTTAGGA
TCACTGCGTCTAGCATTTTTCCTCCCACGTTCTCAAAGTATATGTCAATGCCTACAGGGA
AACACCTCTTTAAGGCAGCGTTGAGATCGTTTTCTTCCTTGTAGTTGAATGCATCATCGA
ATCCAAAATTGTTCTTGAGAAGATCAACCTTTTCTTTGCTTCCGGCGCTTCCAACGACGT
AGCAACCCATCAGCTTAGCAAACTGTCCCACAAGCTGACCAACAGCACCAGATGCAGCTG
ACACAAACACAGTCTCTCCTTTCTTTGGTGAACAGATCTCATAAAACCCAGCGTA

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 6

CO CL874Contig1 955 6 11 U
GGGACTCCAGCGCCGTCCATTTGCAGAAACCACCCATTTGGACGAACCATGGCCCCGAAG
AAAGGAGTCAAGGTTGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACGAACCCTCTATTCGAG
AGGAGGCCTAAGCAATTTGGTATTGGTGGAGCTCTTCCTCCCAAGAAGGATCTTACCCGC
TACATCAAATGGCCCAAGTCTATCCGTCTTCAAAGGCAGAAGAGGATCCTTAAGCAGAGG
TTGAAGGTCCCACCAGCCCTTAATCAGTTCACCAAGACCCTCGACAAGAATCTTGCAACC
AGCCTCTTCAAGATCCTTCTCAAGTATAGGCCGGAGGACAAAGCCGCCAAGAAAGAGCGC
CTTGTCAAGAAGGCTCAAGCTGAAGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCTATT
GTTGTCAAATACGGCCTTAACCATGTGACCTACCTCATAGAGCAGAACAAGGCACAGCTT
GTTGTCATTGCTCATGATGTCGACCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTCTCTGC
AGGAAGATGGAAGTCCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAGCTGTGGTT
CACCAAAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCTTGAG
TTTAGCAAAATCCTCGAAGCCATCAAGGCAAACTTCAACGACAAGTACGAAGAGTACAGG
AAGAAATGGGGAGGAGGCATAATGGGATCCAAATCACAGGCCAAGACAAAGGCCAAGGAA
AGAGTACTTGCCAAGGAGGCTGCCCAGAGGAATAACTAATAAGGATCTTTTTGAGTGTTT
AGATTCTCTTCACTTTGTTGTTCAAAAAAATATTTGTCTCTTTTTTTTTAGTTGGAAGTT
GGAACTATCGTGTATGGATATGTTTTGCACCCTCTTCAGACAGTTTTTCAAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2FO26TF U 120
AF RR2CN53TF U 5
AF RR2BG01TF U 1
AF RR2GY59TF U 1
AF RR2BG01JQ C 150
AF RR2FO26JQ C 322
BS 1 18 RR2BG01TF
BS 19 19 RR2GY59TF
BS 20 45 RR2BG01TF
BS 46 46 RR2GY59TF
BS 47 56 RR2BG01TF
BS 57 57 RR2GY59TF
BS 58 253 RR2BG01TF
BS 254 254 RR2FO26TF
BS 255 748 RR2BG01TF
BS 749 953 RR2BG01JQ
BS 954 955 RR2FO26JQ

RD RR2FO26TF 596 0 0
GAGGAGGCCTAAGCAATTTGGTATTGGTGGAGCTCTTCCTCCCAAGAAGGATCTTACCCG
CTACATCAAATGGCCCAAGTCTATCCGTCTTCAAAGGCAGAAGAGGATCCTTAAGCAGAG
GTTGAAGGTCCCACCAGCCCTTAATCAGTTCACCAAGACCCTCGACAAGAATCTTGCAAC
CAGCCTCTTCAAGATCCTTCTCAAGTATAGGCCGGAGGACAAAGCCGCCAAGAAAGAGCG
CCTTGTCAAGAAGGCTCAAGCTGAAGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCTAT
TGTTGTCAAATACGGCCTTAACCATGTGACCTACCTCATAGAGCAGAACAAGGCACAGCT
TGTTGTCATTGCTCATGATGTCGACCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTCTCTG
CAGGAAGATGGAAGTCCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAGCTGTGGT
TCACCAAAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCTTGA
GTTTAGCAAAATCCTCGAAGCCATCAAGGCAAACTTCAACGACA*GTACGAAGAGT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2CN53TF 674 0 0
GG
CCAGCGCCGTCCATTTGCAGAAACCACCCATTTGGACGAACCATGGCCCCGAAGAAAGGA
GTCAAGGTTGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACGAACCCTCTATTCGAGAGGAGG
CCTAAGCAATTTGGTATTGGTGGAGCTCTTCCTCCCAAGAAGGATCTTACCCGCTACATC
AAATGGCCTAAGTCTATCCGTCTTCAAAGGCAGAAGAGGATCCTTAAGCAGAGGTTGAAG
GTCCCACCCGCCCTTAATCAGTTCACCAAGACCCTCGACAAGAATCTTGCAACCAGCCTC
TTCAAGATCCTTCTCAAGTATAGGCCGGAGGACAAAGCCGCCAAGAAAGAGCGTCTTGTC
AAGAAGGCTCAAGCTGAAGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCTATTGTTGTC
AAATACGGCCTTAACCATGTGACCTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACAGCTTGTTGTC
ATTGCTCATGATGTAGACCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTCTCTGCAGGAAG
ATGGAAGTCCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAGCTGTGGTTCACCAA
AAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGAC*ACTATCAAGAATGAG*ACAAGCTTGAGT
CAGCAAATCCTCGAAGC

QA 3 657 3 657
DS 

RD RR2BG01TF 748 0 0
GGGACTCCAGCGCCGTCCTTTTGCAGAAACCACCCATTTGGACGA*CCATGGCCCCAAAG
AAAGGAGTCAAGGTTGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACGAACCCTCTATTCGAG
AGGAGGCCTAAGCAATTTGGTATTGGTGGAGCTCTTCCTCCCAAGAAGGATCTTACCCGC
TACATCAAATGGCCCAAGTCTATCCGTCTTCAAAGGCAGAAGAGGATCCTTAAGCAGAGG
TTGAAGGTCCCACTAGCCCTTAATCAGTTCACCAAGACCCTCGACAAGAATCTTGCAACC
AGCCTCTTCAAGATCCTTCTCAAGTATAGGCCGGAGGACAAAGCCGCCAAGAAAGAGCGC
CTTGTCAAGAAGGCTCAAGCTGAAGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCTATT
GTTGTCAAATACGGCCTTAACCATGTGACCTACCTCATAGAGCAGAACAAGGCACAGCTT
GTTGTCATTGCTCATGATGTCGACCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTCTCTGC
AGGAAGATGGAAGTCCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAGCTGTGGTT
CACCAAAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCTTGAG
TTTAGCAAAATCCTCGAAGCCATCAAGGCAAACTTCAACGACAAGTACGAAGAGTACAGG
AAGAAATGGGGAGGAGGCATAATGGGAT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2GY59TF 731 0 0
GGGACT
CCAGCGCCGTCCATTTGCAGAAACCACCCATTTGGACGAACCATGGCCCCGAAGAAAGGA
GTCAAGGTTGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACGAACCCTCTATTCGAGAGGAGG
CCTAAGCAATTTGGTATTGGTGGAGCTCTTCCTCCCAAGAAGGATCTTACCCGCTACATC
AAATGGCCTAAGTCTATCCGTCTTCAAAGGCAGAAGAGGATCCTTAAGCAGAGGTTGAAG
GTCCCACCCGCCCTTAATCAGTTCACCAAGACCCTCGACAAGAATCTTGCAACCAGCCTC
TTCAAGATCCTTCTCAAGTATAGGCCGGAGGACAAAGCCGCCAAGAAAGAGCGTCTTGTC
AAGAAGGCTCAAGCTGAAGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCTATTGTTGTC
AAATACGGCCTTAACCATGTGACCTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACAGCTTGTTGTC
ATTGCTCATGATGTAGACCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTCTCTGCAGGAAG
ATGGAAGTCCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAGCTGTGGTTCACCAA
AAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCTTGAGTTCAGC
AAAATCCTCGAAGCCATCAAAGCAAACTTCAACGACAAGTACGAAGAGTACAGGAAGAAA
TGGGG

QA 7 731 7 731
DS 

RD RR2BG01JQ 805 0 0
AGCTCTTCCTCCCAAGAAGGATCTTACCCGCTACATCAAATGGCCCAAGTCTATCCGTCT
TCAAAGGCAGAAGAGGATCCTTAAGCAGAGGTTGAAGGTCCCACTAGCCCTTAATCAGTT
CACCAAGACCCTCGACAAGAATCTTGCAACCAGCCTCTTCAAGATCCTTCTCAAGTATAG
GCCGGAGGACAAAGCCGCCAAGAAAGAGCGCCTTGTCAAGAAGGCTCAAGCTGAAGCTGA
GGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCTATTGTTGTCAAATACGGCCTTAACCATGTGAC
CTACCTCATAGAGCAGAACAAGGCACAGCTTGTTGTCATTGCTCATGATGTCGACCCCAT
CGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTCTCTGCAGGAAGATGGAAGTCCCTTACTGCATTGT
CAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAGCTGTGGTTCACCAAAAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTT
GACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCTTGAGTTTAGCAAAATCCTCGAAGCCATCAAGGC
AAACTTCAACGACAAGTACGAAGAGTACAGGAAGAAATGGGGAGGAGGCATAATGGGATC
CAAATCACAGGCCAAGACAAAGGCCAAGGAAAGAGTACTTGCCAAGGAGGCTGCCCAGAG
GAATAACTAATAAGGATCTTTTTGAGTGTTTAGATTCTCTTCACTTTGTTGTTCAAAAAA
ATATTTGTCTCTTTTTTTTTAGTTGGAAGTTGGAACTATCGTGTATGGATATGTTTTGCA
CCCTCTTCAGACAGTTTTTCAAGC
C

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2FO26JQ 634 0 0
AAGTATAGGCCGGAGGACAAAGCCGCCAAGAAAGAGCGCCTTGTCAAGAAGGCTCAAGCT
GAAGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCTATTGTTGTCAAATACGGCCTTAAC
CATGTGACCTACCTCATAGAGCAGAACAAGGCACAGCTTGTTGTCATTGCTCATGATGTC
GACCCCATCGAGTTGGTCGTCTGGTTGCCTGCTTTTTGCAGGAAGATGGAAGTCCCTTAC
TGCATTGTCAAAGGCAAATTTTGTTTTGGAGCTGTGGTTCACCAAAAGACTGCTGCTTGC
TTGTGTTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCTTGAGTTTAGCAAAATCCTTGAAGCC
ATCAAGGCAAACTTCAACGACAAGTACGAAGAGTACAGGAAGAAATGGGGAGGAGGCATA
ATGGGATCCAAATCACAGGCCAAGACAAAGGCCAAGGAAAGAGTACTTGCCAAGGAGGTT
GCCCAGAGGAATAACTAATAAGGATCTTTTTGAGTGTTTAGATTTTTTTCACTTTGTTGT
TCAAAAAAATATTTGTTTCTTTTTTTTTAGTTGGAAGTTGGAACTATCGTGTATGGATAT
GTTTTGCACCCTCTTCAGACAGTTTTTCAAGCTT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 2 7

CO CL875Contig1 787 2 22 U
GGGAGAGAGAGGCGGAGAAGAGGAAAGTGAGAAAGCTTTAAAAGCAAATCGTGAGAGACC
TCTCGAGTCTTCCCTGAGTCACTCCCCTCTCTTCTCTCGCGGCGCACTCCTTCGATTCAC
CTTATTAGGGTTTTCGCTTCGCCTGCAGATTCTTCAACACACGATGCATAAGCTGAGTAG
AAGCAACCGAGACAAACTTCAGCAGTTCGTGGCTATCACTGGAGCTAGTGAGAAGAATGC
TCTTCAGGCTCTCAAAGCCTGCGATTGGCAGCTCGAAGCAGCTTTTGATGTCCTTTACAG
CCAGCCTCAGCCAAGAAGCAATGGCGATATGAGACGCTTGGAGGAGCTCTACAATAGATA
TAAAGACCCATATTCTGATATGATTCTGGCCGAAGGTATCTCGGTTCTGTGTACTGATCT
TCAGGTGGAACCCCAAGACATTGTCACGTTGGTTCTTTCGTGGCATATGAATGCTGCCAC
AGCGTACGAATTTTCCAAGGAAGAATTTTTTGGTGGATTACAGGCATTAGGAGTAGATTC
CATTGGGAAGTTGCAGGAAAAGCTGTCCTTTATGCGTTCAGAGCTCAAAGATGAACAAAA
GTTCCATGACATATACAACTTTGCTTTTGGGTGGGCGAAAGAGAAGGGGCAGAAGTCTCT
TGCTTTAGATACAGCGATTGGGATGTGGCAGTTGCTCTTTGCAGAAGAGAGTGGCCATTG
GTGAATCACTGGTGTGATTTCTTGCAGATCGTCACAACAAGGCATATCTAAGACACATGG
GCACAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE28TF U 1
AF RR2GD22TF U 7
BS 1 105 RR2CE28TF
BS 106 106 RR2GD22TF
BS 107 123 RR2CE28TF
BS 124 124 RR2GD22TF
BS 125 172 RR2CE28TF
BS 173 173 RR2GD22TF
BS 174 189 RR2CE28TF
BS 190 190 RR2GD22TF
BS 191 192 RR2CE28TF
BS 193 193 RR2GD22TF
BS 194 252 RR2CE28TF
BS 253 253 RR2GD22TF
BS 254 261 RR2CE28TF
BS 262 262 RR2GD22TF
BS 263 413 RR2CE28TF
BS 414 414 RR2GD22TF
BS 415 420 RR2CE28TF
BS 421 421 RR2GD22TF
BS 422 495 RR2CE28TF
BS 496 496 RR2GD22TF
BS 497 643 RR2CE28TF
BS 644 787 RR2GD22TF

RD RR2CE28TF 643 0 0
GGGAGAGAGAGGCGGAGAAGAGGAAAGTGAGAAAGCTTTAAAAGCAAATCGTGAGAGACC
TCTCGAGTCTTCCCTGAGTCACTCCCCTCTCTTCTCTCGCGGCGCTCTCCTTCGATTCAC
CTTGTTAGGGTTTTCGCTTCGCCTGCAGATTCTTCAACACACGATGCATAAGTTGAGTAG
AAGCAACCGCGATAAACTTCAGCAGTTCGTGGCTATCACTGGAGCTAGTGAGAAGAATGC
TCTTCAGGCTCTTAAAGCCTGGGATTGGCAGCTCGAAGCAGCTTTTGATGTCCTTTACAG
CCAGCCTCAGCCAAGAAGCAATGGCGATATGAGACGCTTGGAGGAGCTCTACAATAGATA
TAAAGACCCATATTCTGATATGATTCTGGCCGAAGGTATCTCGGTTCTGTGTAGTGATCT
*CAGGTGGAACCCCAAGACATTGTCACGTTGGTTCTTTCGTGGCATATGAATGCTGCCAC
AGCGTACGAATTTTCTAAGGAAGAATTTTTTGGTGGATTACAGGCATTAGGAGTAGATTC
CATTGGGAAGTTGCAGGAAAAGCTGTCCTTTATGCGTTCAGAGCTCAAAGATGAACAAAA
GTTCCATGACATATACAACTTTGCTTTTGGGTGGGCGAAAGAG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2GD22TF 781 0 0
GG
GAGGCGGAGAAGAGGAAAGTGAGAAAGCTTTAAAAGCAAATCGTGAGAGACTTCTCGAGT
CTTCCCTGAGTCACTTCCCTCTCTTCTCTCGCGGCGCACTCCTTCGATTTACCTTATTAG
GGTTTTCGCTTCGCCTGCAGATTCTTCAACACACGATGCATAAGCTGAGTAGAAGCAACC
GAGACAAGCTTCAGCAGTTCGTGGCTATCACTGGAGCTAGTGAGAAGAATGCTCTTCAGG
CTCTCAAAGCCTGCGATTGGCAGCTCGAAGCAGCTTTTGATGTCTTTTACAGCCAGCCTC
AGCCAAGAAGCAATGGCGATATGAGACGCTTGGAGGAGCTCTACAATAGATATAAAGACC
CATATTCTGATATGATTCTGGCCGAAGGTATCTCGGTTCTGTGTACTGATCTTCAGGTGG
AACCCCAAGACATTGTCACGTTGGTTCTTTCGTGGCATATGAATGCTGCCACAGCGTGTG
AATTTTCCAAGGAAGAATTTTTTGGTGGATTACAGGCATTAGGAGTAGATTCCATTGGGA
AGTTGCAGGAAAAGCTGTCCTTTATGCGTTCAGAGCTTAAAGATGAACAAAAGTTCCATG
ACATATACAACTTTGCTTTTGGGTGGGCGAAAGAGAAGGGGCAGAAGTCTCTTGCTTTAG
ATACAGCGATTGGGATGTGGCAGTTGCTCTTTGCAGAAGAGAGTGGCCATTGGTGAATCA
CTGGTGTGATTTCTTGCAGATCGTCACAACAAGGCATATCTAAGACACATGGGCACAGC

QA 3 781 3 781
DS 



CO CL875Contig2 998 5 17 U
AGATGATAGAAACTGGATTAGTCTGAAAGTTGAACATCTTAGTTATTTGATCATCAAAAT
ATGAAGATGAAGATTCGGACAAGAACACACACAAGTCTATTAATAAATAATGAGCAAGGA
CCACTGT*AAAATAGAGCTGAGTACTTCTCCTCCCAATTGGCCAGTTACTTCTCAACAAC
GCTCTTGTCATACAGGTACTCAACGAACTCATCGATGAGGTAAGGCCATGCTCCTTCTGC
GTCGTAATTCGACAGTGCCGGGTCCACCGTCCTTGCAAACTCCAGGAGCTGTGCCCATGT
GTCTTTAGATATGGCCTTGTTGTGACGATCCTGCAAGAAATCACACCAGTGATTCACCAA
TGGCCACTCTCTTTCTGCAAACAGCAACTGCCACATCCCAATCGCTGTATCTAAAGCAAG
AGACTTCTGCCCCTTCTCTTTCGCCCACCCAAAAGCAAAGTTGTATATGTCATGGAACTT
TTGTTCATCTTTAAGCTCTGAACGCATAAAGGACAGCTTTTCCTGCAACTTCCCAATGGA
ATCTACTCCTAATGCCTGTAATCCACCAAAAAATTCTTCCTTGGAAAATTCACACGCTGT
GGCAGCATTCATATGCCACGAAAGAACCAACGTGACAATGTCTTGGGGTTCCACCTGAAG
ATCACTACACAGAACCGAGATACCTTCGGCCAGAATCATATCAGAATAGGGGTCTTTATA
TCTATTGTAGAGCTCCTCCAAGCGTCTCATATCGCCATTGCTTCTTGGTTGAGGCTGGCT
GTAAAAGACATCAAAAGCTGCTTCGAGCGGCCAATCGCAGGCTTTGAGAGCCTGAAGAGC
ATTCTTCTCACTAGCTCCAGTGATAGCCACGAACTGCTGAAGTTTATCGCGGTTGCTTCT
ACTCAACTTATGCATCGTGCGTTGTGCAGGCGAAGCGAAAACCCTAACAAGGTAAATCGG
ATGAGAGCGCCGCGAGAGAAGAGAGGGGAGTGACTCCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD22JQ U 1
AF RR2E833JQ U 2
AF RR2CE28JQ U 20
AF RR2B433JQ U 20
AF RR2B433TF C 238
BS 1 207 RR2GD22JQ
BS 208 208 RR2B433JQ
BS 209 255 RR2GD22JQ
BS 256 256 RR2B433JQ
BS 257 258 RR2GD22JQ
BS 259 259 RR2B433JQ
BS 260 381 RR2GD22JQ
BS 382 382 RR2B433JQ
BS 383 664 RR2GD22JQ
BS 665 665 RR2B433JQ
BS 666 708 RR2GD22JQ
BS 709 709 RR2B433JQ
BS 710 768 RR2GD22JQ
BS 769 769 RR2B433JQ
BS 770 774 RR2GD22JQ
BS 775 924 RR2B433JQ
BS 925 998 RR2B433TF

RD RR2GD22JQ 774 0 0
AGATGATAGAAACTGGATTAGTCTGAAAGTTGAACATCTTAGTTATTTGATCATCAAAAT
ATGAAGATGAAGATTCGGACAAGAACACACACAAGTCTATTAATAAATAATGAGCAAGGA
CCACTGT*AAAATAGAGCTGAGTACTTCTCCTCCCAATTGGCCAGTTACTTCTCAACAAC
GCTCTTGTCATACAGGTACTCAACGAATTCATCGATGAGGTAAGGCCATGCTCCTTCTGC
GTCGTAATTCGACAGCGCTGGGTCCACCGTCCTTGCAAACTCCAGGAGCTGTGCCCATGT
GTCTTTAGATATGGCCTTGTTGTGACGATCCTGCAAGAAATCACACCAGTGATTCACCAA
TGGCCACTCTCTTTCTGCAAAGAGCAACTGCCACATCCCAATCGCTGTATCTAAAGCAAG
AGACTTCTGCCCCTTCTCTTTCGCCCACCCAAAAGCAAAGTTGTATATGTCATGGAACTT
TTGTTCATCTTTAAGCTCTGAACGCATAAAGGACAGCTTTTCCTGCAACTTCCCAATGGA
ATCTACTCCTAATGCCTGTAATCCACCAAAAAATTCTTCCTTGGAAAATTCACACGCTGT
GGCAGCATTCATATGCCACGAAAGAACCAACGTGACAATGTCTTGGGGTTCCACCTGAAG
ATCAGTACACAGAACCGAGATACCTTCGGCCAGAATCATATCAGAATATGGGTCTTTATA
TCTATTGTAGAGCTCCTCCAAGCGTCTCATATCGCCATTGCTTCTTGGCTGAGG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2E833JQ 752 0 0
GATGATAGAAACTGGATTAGTCTGAAAGTTGAACATCTTAGTTATTTGATCATCAAAATA
TGAAGATGAAGATTCGGACAAGAACACACACAAGTCTATTAATAGATAATGAGCAAGGAC
CACTGT*AAAATAGAGCTGAGTACTTCTCCTCCCAATTGGCCAGTTACTTCTCAACAACG
CTCTTGTCATACAGGTACTCAACGAATTCATCGATGAGGTAAGGCCATGCTCCTTCTGCG
TCGTAATTCGACAGCGCTGGGTCCACCGTCCTTGCAAACTCCAGGAGCTGTGCCCATGTG
TCTTTAGATATGGCCTTGTTGTGACGATCCTGCAAGAAATCACACCAGTGATTCACCAAT
GGCCACTCTCTTTCTGCAAAGAGCAACTGCCACATCCCAATCGCTGTATCTAAAGCAAGA
GACTTCTGCCCCTTCTCTTTCGCCCACCCAAAAGCAAAGTTGTATATGTCATGGAACTTT
TGTTCATCTTTAAGCTCTGAACGCATAAAGGACAGCTTTTCCTGCAACTTCCCAATGGAA
TCTACTCCTAATGTCTGTAATCCACCAAAAAATTCTTCCTTGGAAAATTCACACGCTGTG
GCAGCATTCATATGCCACGAAAGAACCAACGTGACAATGTCTTGGGGTTCCACCTGAAGA
TCAGTACACAGAACCGAGATACCTTCGGCCAGAATCATATCAGAATATGGGTCTTTATAT
CTATTGTAGAGCTCCTCCAAGCGTCTCATATC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2CE28JQ 806 0 0
AGTCTGAAAGTTGGACATCTTAGTTATTTGATCATCAAAATATGAAGATGAAGATTCGGA
CAAGAACACACACAAGTCTATTAATAAATAATGAGCAAGGACCACTGTGAAAATAGAGCT
GAGTACTTCTCC***CAATTGGCCAGTTACTTCTCAACAA*GCTCTTGTCATACAGGTAC
TCAACGATCTCGTCGACGAGGTAGGGCCATGCTCCTTCTGCGTCGTAATTCGACAGTGCC
GGGTCCACCGTCCTTGCAAACTCCAGGAGCTGTGCCCATGTGTCTTTAGATATCGCCTTG
TTGTGACGATCCTGCAAGAAATCACACCAGTGATTCACCAATGGCCACTCTCTTTCTGCA
AAGAGCAACTGCCACATCCCAATCGCTGTATCTAAAGCAAGAGACTTCTGCCCCTTCTCT
TTCGCCCACCCAAAAGCAAAGTTGTATATGTCATGGAACTTTTGTTCATCTTTGAGCTCT
GAACGCATAAAGGACAGCTTTTCCTGCAACTTCCCAATGGAATCTACTCCTAATGCCTGT
AATCCACCAAAAAATTCTTCCTTAGAAAATTCGTACGCTGTGGCAGCATTCATATGCCAC
GAAAGAACCAACGTGACAATGTCTTGGGGTTCCACCTGA*GATCACTACACAGAACCGAG
ATACCTTCGGCCAGAATCATATCAGAATATGGGTCTTTATATCTATTGTAGAGCTCCTCC
AAGCGTCTCATATCGCCATTGCTTCTTGGCTGAGGCTGGCTGTAAAGGACATCAAAAGCT
GCTTCGAGCTGCCAATCCCAGGCTTT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2B433JQ 913 0 0
AGTCTGAAAGTTGGACATCTTAGTTATTTGATCATCAAAATGTGAAGATGAAGATTCGGA
CAAGAACACACACAAGTCTATTAATAAATAATGAGCAAGGACCATTGT*AAAATAGAGCT
GAGTACTTCTCC***CAATTGGCCAGTTACTTCTCAACAACGCTCTTGTCGTACAGGTAC
TCAACGAACTCATCGATGAGGTAAGGCCATGCTCCTTCTGCGTCGTAATTCGACAGTGCC
GGGTCCACCGTCCTTGCAAACTCCAGGAGCTGTGCCCATGTGTCTTTAGATATGGCCTTG
TTGTGACGATCCTGCAAGAAATCACACCAGTGATTCACCAATGGCCACTCTCTTTCTGCA
AACAGCAACTGCCACATCCCAATCGCTGTATCTAACGCAAGAGACTTCTGCCCCTTCTCT
TTCGCCCACCCAAAAGCAAAGTTGTATATGTCATGGAACTTTTGTTCATCTTTAAGCTCT
GAACGCATAAAGGACAGCTTTTCCTGCAACTTCCCAATGGAGTCTACTCCTAATGCCTGT
AATCCACCAAAAAATTCTTCCTTGGAAAATTCACACGCTGTGGCAGCATTCATATGCCAC
GAAAGAACCAGCGTGACAATGTCTTGGGGTTCCACCTGAAGATCACTACACAGAACCGAG
ATACCTTCGGCCAGAATCATATCAGAATAGGGGTCTTTATATCTATTGTAGAGCTCCTCC
AAGCGTCTCATATCGCCATTGCTTCTTGGTTGAGGCTGGCTGTAAAAGACATCAAAAGCT
GCTTCGAGCGGCCAATCGCAGGCTTTGAGAGCCTGAAGAGCATTCTTCTCACTAGCTCCA
GTGATAGCCACGAACTGCTGAAGTTTATCGCGGTTGCTTCTACTCAACTTATGCATCGTG
CGTTG
TGCAGCGA

QA 1 905 1 905
DS 

RD RR2B433TF 761 0 0
TGCGTCGTAATTCGACAGTGCCGGGTCCACCGTCCTTGCAAACTCCAGGAGCTGTGCCCA
TGTGTCTTTAGATATGGCCTTGTTGTGACGATCCTGCAAGAAATCACACCAGTGATTCAC
CAATGGCCACTCTCTTTCTGCAAACAGCAACTGCCACATCCCAATCGCTGTATCTAACGC
AAGAGACTTCTGCCCCTTCTCTTTCGCCCACCCAAAAGCAAAGTTGTATATGTCATGGAA
CTTTTGTTCATCTTTAAGCTCTGAACGCATAAAGGACAGCTTTTCCTGCAACTTCCCAAT
GGAGTCTACTCCTAATGCCTGTAATCCACCAAAAAATTCTTCCTTGGAAAATTCACACGC
TGTGGCAGCATTCATATGCCACGAAAGAACCAGCGTGACAATGTCTTGGGGTTCCACCTG
AAGATCACTACACAGAACCGAGATACCTTCGGCCAGAATCATATCAGAATAGGGGTCTTT
ATATCTATTGTAGAGCTCCTCCAAGCGTCTCATATCGCCATTGCTTCTTGGTTGAGGCTG
GCTGTAAAAGACATCAAAAGCTGCTTCGAGCGGCCAATCGCAGGCTTTGAGAGCCTGAAG
AGCATTCTTCTCACTAGCTCCAGTGATAGCCACGAACTGCTGAAGTTTATCGCGGTTGCT
TCTACTCAACTTATGCATCGTGCGTTGTGCAGGCGAAGCGAAAACCCTAACAAGGTAAAT
CGGATGAGAGCGCCGCGAGAGAAGAGAGGGGAGTGACTCCC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 4

CO CL876Contig1 861 4 15 U
GGGGTTGACTGGTGAGAGAGATCAGAAAAGTGATGGCTATGGCTACTTCTACTTCCACTC
AGCTATCTTCTTCGTCTTTGTTTCACTCTCAAATTACCAAAAAGCCCTTCCTTCTCCCAA
CGGCGGCGACGATCAGTGGTCTTGGTTTCTCTACACCAAGGCGAAAGTCTCTCTCTTTAT
CACAACGTTCTTCTTCTGTCTCAGCTTCGGCTGCTTCCTCCGCCGTTGACCTCAATGAAC
CGGAGAAGAAATCAACGAGAACGCTTCCGTTTCGAGTAGGTCACGGGTTCGATCTGCACC
GGCTAGAGCCAGGGTACCCTCTGATAATAGGCGGGATTGATATCCCTCACGACAGAGGCT
GCGAAGCTCACTCCGATGGCGATGTGTTGCTCCATTGTGTAGTGGATGCAATCTTGGGAG
CGTTAGGGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCTAAGTGGAAAGGAG
CTGCATCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCTGTGAGACTTATGGACGAGGCAGGGTACGAGA
TAGGAAACCTAGACGCCACATTGATTCTACAGAGACCCAAGATAAGTCCACACAAGGAGA
CTATCCGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTTGTGAACTTGAAAG
CTAAAACTCATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAAACAGAAGCATCGCAGCTCACACTG
TTATTCTCCTCATGAAGAAGTGAGTCGGTTTTTATCATATTCTTTTATGTATCAGTCTCA
TTAAAAAAATACTTTATACGTAAATGTAAACTCGGTGTAATCACCCTTTTGACTTTAGAT
AAAACCATCCATTATCAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV80TF U 1
AF RR2FA92TF U 1
AF RR2BV80JQ C 117
AF RR2FA92JQ C 223
BS 1 665 RR2BV80TF
BS 666 666 RR2FA92TF
BS 667 706 RR2BV80TF
BS 707 707 RR2FA92TF
BS 708 721 RR2BV80TF
BS 722 788 RR2FA92TF
BS 789 789 RR2BV80JQ
BS 790 803 RR2FA92TF
BS 804 804 RR2BV80JQ
BS 805 809 RR2FA92TF
BS 810 810 RR2BV80JQ
BS 811 819 RR2FA92TF
BS 820 820 RR2BV80JQ
BS 821 832 RR2FA92TF
BS 833 861 RR2BV80JQ

RD RR2BV80TF 726 0 0
GGGGTTGACTGGTGAGAGAGATCAGAAAAGTGATGGCTATGGCTACTTCTACTTCCACTC
AGCTATCTTCTTCGTCTTTGTTTCACTCTCAAATTACCAAAAAGCCCTTCCTTCTCCCAA
CGGCGGCGACGATCAGTGGTCTTGGTTTCTCTACACCAAGGCGAAAGTCTCTCTCTTTAT
CACAACGTTCTTCTTCTGTCTCAGCTTCGGCTGCTTCCTCCGCCGTTGACCTCAATGAAC
CGGAGAAGAAATCAACGAGAACGCTTCCGTTTCGAGTAGGTCACGGGTTCGATCTGCACC
GGCTAGAGCCAGGGTACCCTCTGATAATAGGCGGGATTGATATCCCTCACGACAGAGGCT
GCGAAGCTCACTCCGATGGCGATGTGTTGCTCCATTGTGTAGTGGATGCAATCTTGGGAG
CGTTAGGGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCTAAGTGGAAAGGAG
CTGCATCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCTGTGAGACTTATGGACGAGGCAGGGTACGAGA
TAGGAAACCTAGACGCCACATTGATTCTACAGAGACCCAAGATAAGTCCACACAAGGAGA
CTATCCGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTTGTGAACTTGAAAG
CTAAA*CTCATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAAACAGAAGCATTGCAGCTCACACTG
T
ATCTC

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2FA92TF 832 0 0
GGAGTT
GACTGGTGAGAGAGATCAGAAAAGTGATGGCTATGGCTACTTCTACTTCCACTCAGCTAT
CTTCTTCGTCTTTGTTTCACTCTCAAATTACCAAAAAGCCCTTCCTTCTCCCAACGGCGG
CGACGATCAGTGGTCTTGGTTTCTCTACACCAAGGCGAAAGTCTCTCTCTTTATCACAAC
GTTCTTCTTCTGTCTCAGCTTCGGCTGCTTCCTCCGCCGTTGACCTCAATGAACCGGAGA
AGAAATCAACGAGAACGCTTCCGTTTCGAGTAGGTCACGGGTTCGATCTGCACCGGCTAG
AGCCAGGGTACTCTCTGATAATAGGCGGGATTGATATCCCTCACGACAGAGGCTGCGAAG
CTCACTCCGATGGCGATGTGTTGCTCCATTGTGTGGTGGATGCAATCTTGGGAGCGTTAG
GGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCTAAGTGGAAAGGAGCTGCAT
CCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCTGTGAGACTTATGGACGAGGCAGGGTACGAGATAGGAA
ACCTAGACGCCACATTGATTCTACAGAGACCCAAGATAAGTCCACACAAGGAGACTATCC
GATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTTGTGAACTTGAAAGCTAAAA
CTCATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAA*CAGAAGCATCGCAGCTCACACTGTTATTC
TCCTCATGAAGAAGTGAGTCGGTTTTTATCATATTCTTTTATGTATCAGTCTCATTAAAA
AA*TACTTTATACGTAA*TGTAA*CTCGGTGTA*TCACCCTTTTGA

QA 7 832 7 832
DS 

RD RR2BV80JQ 745 0 0
CCAACGGCGGCGACGATCAGTGGTCTTGGTTTCTCTACACCAAGGCGAAAGTCTCTCTCT
TTATCACAACGTTCTTCTTCTGTCTCAGCTTCGGCTGCTTCCTCCGCCGTTGACCTCAAT
GAACCGGAGAAGAAATCAACGAGAACGCTTCCGTTTCGAGTAGGTCACGGGTTCGATCTG
CACCGGCTAGAGCCAGGGTACCCTCTGATAATAGGCGGGATTGATATCCCTCACGACAGA
GGCTGCGAAGCTCACTCCGATGGCGATGTGTTGCTCCATTGTGTAGTGGATGCAATCTTG
GGAGCGTTAGGGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCTAAGTGGAAA
GGAGCTGCATCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCTGTGAGACTTATGGACGAGGCAGGGTAC
GAGATAGGAAACCTAGACGCCACATTGATTCTACAGAGACCCAAGATAAGTCCACACAAG
GAGACTATCCGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTTGTGAACTTG
AAAGCTAAAACTCATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAAACAGAAGCATTGCAGCTCAC
ACTGTTATTCTCCTCATGAAGAAGTGAGTCGGTTTTTATCATATTCTTTTATGTATCAGT
CTCATTAAAAAAATACTTTATACGTAAATGTAAACTCGGTGTAATCACCCTTTTGACTTT
AGATAAAACCATCCATTATCAAATC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2FA92JQ 634 0 0
CCGTTGACCTCAATGAACCGGAGAAGAAATCAACGAGAACGCTTCCGTTTCGAGTAGGTC
ACGGGTTCGATCTGCACCGGCTAGAGCCAGGGTACTCTCTGATAATAGGCGGGATTGATA
TCCCTCACGACAGAGGCTGCGAAGCTCACTCCGATGGCGATGTGTTGCTCCATTGTGTGG
TGGATGCAATCTTGGGAGCGTTAGGGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTG
ATCCTAAGTGGAAAGGAGCTGCATCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCTGTGAGACTTATGG
ACGAGGCAGGGTACGAGATAGGAAACCTAGACGCCACATTGATTCTACAGAGACCCAAGA
TAAGTCCACACAAGGAGACTATCCGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTT
CTGTTGTGAACTTGAAAGCTAAAACTCATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAAACAGAA
GCATCGCAGCTCACACTGTTATTCTCCTCATGAAGAAGTGAGTCGGTTTTTATCATATTC
TTTTATGTATCAGTCTCATTAAAAAAATACTTTATACGTAAATGTAAACTCGGTGTAATC
ACCCTTTTGACTTTAGATAAAACCATCCATTA
CC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 2 7

CO CL877Contig1 796 5 6 U
GGACTTTCTCAGTCCTTTCTCCGCGACAGAAATGGCTGCTCAATCTTTTACTCTGGCGAA
CCTAAAGATCGATTCTTTCTACAGCCAGAAACTATCTTCTCCATCACACTTCTTCTCCCC
AAGAAATCCAGTAAAATCCCCGAACCTGACGAATCCATGGATGCGCGGTGATTCTTCTTT
CTCTCTCGATTCTCCCGCCTCCGTCTCCTCACGCAGAAAGATCCCAATCGCCGTCGTTTC
CAGCTTACCCACCGCGAATCCAGAATCTGCGGTTTCTGATGCGAAAAAGCCAAAATGGTC
ATGGAGAGGAATCAAATCATTTGCAATGGGAGAGCTGGAAGCTAGGAA*GCTCAAGTATC
CCAACACTGGTACTGAATCACTTCTCATGGGTATCTTGGTTGAAGGGACTAGTTTTACTT
CCAAGTTCTTGAGGGCGCATAAGATAACGCTTTACAAAGTCCGTGAAGAAACAATCAAGG
TACTAGGTAAAGCTGATTTGTATTCCTTCAGCCCTGAACATCCTCCTTTAACCCAAGATG
CACAAAGAGCTCTTGACTCTGCTGTCGATCAGAATCTCAAAGCAGGTGGTATTGGGGAAA
TAATGCCAGCCCATATATTGCTGGGAATCTGGAATGAAGTTGAATCTCCTGGTCACAAGA
TACTGGCAACTCTTGGTTTCACCGATGAAAA*GCTAAAGAGTTAGAGTCCTTTGCCTCTG
AATCTGGATT*CTTGATGAATAGTGTGTCTTTGTTACATTTATCATCCTCCATTTATGCC
ATCTTAATTTCATACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C862TF U 242
AF RR2C862JQ C 328
AF RR2A386TF U 1
AF RR2GK92JQ C 358
AF RR2GK92TF U 9
BS 1 148 RR2A386TF
BS 149 149 RR2GK92TF
BS 150 682 RR2A386TF
BS 683 683 RR2GK92TF
BS 684 790 RR2A386TF
BS 791 796 RR2GK92TF

RD RR2C862TF 155 0 0
AGCTTACCCACCGCGAATCCAGAATCTGCGGTTTCTGATGCGAAAAAGCCAAAATGGTCA
TGGAGAGGAATCAAATCATTTGCAATGGGAGAGCTGGAAGCTAGGAA*GCTCAAGTATCC
CAACACTGGTACTGAATCACTTCTCATGGGTATCT

QA 1 155 1 155
DS 

RD RR2C862JQ 139 0 0
GGGAGAGCTGGAAGCTAGGAAAGCTCAAGTATCCCAACACTGGTACTGAATCACTTCTCA
TGGGTATCTTGGTTGAAGGGACTAGTTTTACTTCCAAGTTCTTGAGGGCGCATAAGATAA
CGCTTTACAAAGTCCGTGA

QA 1 139 1 139
DS 

RD RR2A386TF 806 0 0
GGACTTTCTCAGTCCTTTCTCCGCGACAGAAATGGCTGCTCAATCTTTTACTCTGGCGAA
CCTAAAGATCGATTCTTTCTACAGCCAGAAACTATCTTCTCCATCACACTTCTTCTCCCC
AAGAAATCCAGTAAAATCCCCGAACCTGGCGAATCCATGGATGCGCGGTGATTCTTCTTT
CTCTCTCGATTCTCCCGCCTCCGTCTCCTCACGCAGAAAGATCCCAATCGCCGTCGTTTC
CAGCTTACCCACCGCGAATCCAGAATCTGCGGTTTCTGATGCGAAAAAGCCAAAATGGTC
ATGGAGAGGAATCAAATCATTTGCAATGGGAGAGCTGGAAGCTAGGAA*GCTCAAGTATC
CCAACACTGGTACTGAATCACTTCTCATGGGTATCTTGGTTGAAGGGACTAGTTTTACTT
CCAAGTTCTTGAGGGCGCATAAGATAACGCTTTACAAAGTCCGTGAAGAAACAATCAAGG
TACTAGGTAAAGCTGATTTGTATTCCTTCAGCCCTGAACATCCTCCTTTAACCCAAGATG
CACAAAGAGCTCTTGACTCTGCTGTCGATCAGAATCTCAAAGCAGGTGGTATTGGGGAAA
TAATGCCAGCCCATATATTGCTGGGAATCTGGAATGAAGTTGAATCTCCTGGTCACAAGA
TACTGGCAACTCTTGGTTTCACTGATGAAAA*GCTAAAGAGTTAGAGTCCTTTGCCTCTG
AATCTGGATT*CTTGATGAATAGTGTGTCTTTGTTACATTTATCATCCTCCATTTATGCC
ATCTTAATTT
CATACTAAAAGTCTCC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2GK92JQ 440 0 0
ATCCCACCACTGGTACTGAATCACTTTTCATGGGTATCTTGGTTGAAGGGACTAGTTTTA
CTTCCAAGTTCTTGAGGGCGCATAAGATAACGCTTTACAAAGTCCGTGAAGAAACAATCA
AGGTACTAGGTAAAGCTGATTTGTATTCCTTCAGCCCTGAACATCCTCCTTTAACCCAAG
ATGCACAAAGAGCTCTTGACTCTGCTGTCGATCAGAATCTCAAAGCAGGTGGTATTGGGG
AAATAATGCCAGCCCATATATTGCTGGGAATCTGGAATGAAGTTGAATCTCCTGGTCACA
AGATACTGGCAACTCTTGGTTTCACCGATGAAAAAGCTAAAGAGTTAGAGTCCTTTGCCT
CTGAATCTGGATTTCTTGATGAATAGTGTGTCTTTGTTACATTTATCATCCTCCATTTAT
GCCATCTTAATTT
TCATACT

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR2GK92TF 788 0 0
GG
AGTCCTTTCTCCGCGACAGAAATGGCTGCTCAATCTTTTACTCTGGCGAACCTAAAGATC
GATTCTTTCTACAGCCAGAAACTATCTTCTCCATCACACTTCTTCTCCCCAAGAAATCCA
GTAAAATCCCCGAACCTGACGAATCCATGGATGCGCGGTGATTCTTCTTTCTCTCTCGAT
TCTCCCGCCTCCGTCTCCTCGCGCAGAAAGATCCCAATCGCCGTCGTTTCCAGCTTACCC
ACCGCGAATCCAGAATCTGCGGTTTCTGATGCGAAAAAGCCAAAATGGTCATGGAGAGGA
ATCAAATCATTTGCAATGGGAGAGCTGGAAGCTAGGAA*GCTCAAGTATCCCAACACTGG
TACTGAATCACTTCTCATGGGTATCTTGGTTGAAGGGACTAGTTTTACTTCCAAGTTCTT
GAGGGCGCATAAGATAACGCTTTACAAAGTCCGTGAAGAAACAATCAAGGTACTAGGTAA
AGCTGATTTGTATTCCTTCAGCCCTGAACATCCTCCTTTAACCCAAGATGCACAAAGAGC
TCTTGACTCTGCTGTCGATCAGAATCTCAAAGCAGGTGGTATTGGGGAAATAATGCCAGC
CCATATATTGCTGGGAATCTGGAATGAAGTTGAATCTCCTGGTCACAAGATACTGGCAAC
TCTTGGTTTCACCGATGAAAA*GCTAAAGAGTTAGAGTCCTTTGCCTCTGAATCTGGATT
*CTTGATGAATAGTGTGTCTTTGTTACATTTATCATCCTCCATTTATGCCATCTTATTTT
CATACT

QA 3 788 3 788
DS 



CO CL877Contig2 897 2 2 U
GGGTCCTTTCTCCGCGACAGAAATGGCTGCTCAATCTTTTACTCTGGCGAACCTAAAGAT
CGATTCTTTCTACAACCAGAAACTATCTTCTCCATCACACTTCTTCTCCACAAGAAATCC
ATTAAAATCCCTGAACCTGACGAATCCATGGATACGCGGTGATTCTTCTCTCTCTCTAGA
TTCTTCCGCCTCCGTCTCGCGCAGAAAGATCCCAATCGCCGTCGTTGCCAGCTTACCCAC
CGCGTAGGTTTCTTCGATTTCGTTTAGCTCTCCCTCGTCTTAACTTATTAGCACTCGATT
TTGATTACAGGAATCCAGAATCTGCGGTTTCTGATGCGAAAAAGCCAAAATGGTCATGGA
GAGGAATCAAATCATTTGCAATGGGGGAGCTGGAAGCTAGGAAGCTCAAGTATCCCAACA
CTGGTACTGAATCACTTCTCATGGGTATCTTGGTTGAAGGGACTAGTTTTACTTCCAAGT
TCTTGAGGGCGCATAAGATAACGCTTTACAAAGTCCGTGAAGAAACAGTCAAGGTACTAG
GTAAAGCTGATTTGTATTCCTTCAGCCCTGAACATCCTCCTTTGACCCAAGATGCACAAA
GAGCTCTTGACTCTGCTGTCAGTCAGAATCTCAAAGCAGGTGGTATTGGGGAAATAATGC
CAGCCCATATATTGCTGGGGATCTGGTATGAAGTTGAATCTCCTGGGCACAAGATACTGG
CAACTCTTGGTTTCACTGATGAAAAAGCTAAAGAGTTAGAGTCCTTTGCCTCTGAATCTG
GATTTCTTGATGAATAGTGTGTCTTGTTACATTTATCATCCTCCATTTATGCCATCTTAA
TTTTCAAACTAAAGTCTCCAAATTTATGGTTGCAGTTTGCAATAATGTTACTTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM33TF U 1
AF RR2FM33JQ C 141
BS 1 635 RR2FM33TF
BS 636 897 RR2FM33JQ

RD RR2FM33TF 635 0 0
GGGTCCTTTCTCCGCGACAGAAATGGCTGCTCAATCTTTTACTCTGGCGAACCTAAAGAT
CGATTCTTTCTACAACCAGAAACTATCTTCTCCATCACACTTCTTCTCCACAAGAAATCC
ATTAAAATCCCTGAACCTGACGAATCCATGGATACGCGGTGATTCTTCTCTCTCTCTAGA
TTCTTCCGCCTCCGTCTCGCGCAGAAAGATCCCAATCGCCGTCGTTGCCAGCTTACCCAC
CGCGTAGGTTTCTTCGATTTCGTTTAGCTCTCCCTCGTCTTAACTTATTAGCACTCGATT
TTGATTACAGGAATCCAGAATCTGCGGTTTCTGATGCGAAAAAGCCAAAATGGTCATGGA
GAGGAATCAAATCATTTGCAATGGGGGAGCTGGAAGCTAGGAAGCTCAAGTATCCCAACA
CTGGTACTGAATCACTTCTCATGGGTATCTTGGTTGAAGGGACTAGTTTTACTTCCAAGT
TCTTGAGGGCGCATAAGATAACGCTTTACAAAGTCCGTGAAGAAACAGTCAAGGTACTAG
GTAAAGCTGATTTGTATTCCTTCAGCCCTGAACATCCTCCTTTGACCCAAGATGCACAAA
GAGCTCTTGACTCTGCTGTCAGTCAGAATCTCAAA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2FM33JQ 757 0 0
CGAATCCATGGATACGCGGTGATTCTTCTCTCTCTCTAGATTCTTCCGCCTCCGTCTCGC
GCAGAAAGATCCCAATCGCCGTCGTTGCCAGCTTACCCACCGCGTAGGTTTCTTCGATTT
CGTTTAGCTCTCCCTCGTCTTAACTTATTAGCACTCGATTTTGATTACAGGAATCCAGAA
TCTGCGGTTTCTGATGCGAAAAAGCCAAAATGGTCATGGAGAGGAATCAAATCATTTGCA
ATGGGGGAGCTGGAAGCTAGGAAGCTCAAGTATCCCAACACTGGTACTGAATCACTTCTC
ATGGGTATCTTGGTTGAAGGGACTAGTTTTACTTCCAAGTTCTTGAGGGCGCATAAGATA
ACGCTTTACAAAGTCCGTGAAGAAACAGTCAAGGTACTAGGTAAAGCTGATTTGTATTCC
TTCAGCCCTGAACATCCTCCTTTGACCCAAGATGCACAAAGAGCTCTTGACTCTGCTGTC
AGTCAGAATCTCAAAGCAGGTGGTATTGGGGAAATAATGCCAGCCCATATATTGCTGGGG
ATCTGGTATGAAGTTGAATCTCCTGGGCACAAGATACTGGCAACTCTTGGTTTCACTGAT
GAAAAAGCTAAAGAGTTAGAGTCCTTTGCCTCTGAATCTGGATTTCTTGATGAATAGTGT
GTCTTGTTACATTTATCATCCTCCATTTATGCCATCTTAATTTTCAAACTAAAGTCTCCA
AATTTATGGTTGCAGTTTGCAATAATGTTACTTCTCT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 8

CO CL878Contig1 575 8 7 U
GGGCACCAAACTCTAACTCAGAAGAATCAAATCGGAGAGAGGTCAGTCAATTTCGGAAGA
AAGAAAATGGGAGAGAAGAAGGAGATGGTGCCACCGGAATACGACGTGAACGCTAAGTGG
GACGCATGCATCGATCTCACGACGCGCCGTTTCGTCTACTCCTCCCTCGGCGGCGCCTTC
GCCGGTCTTCTCTTCTTCAGGAGTCCGGTTACAAGATGGGCGTCTATTGCCTTTGGTGCT
GGAATCGGTATTGGCTCTGCATACACTGATTGCTCTCGTGCCTTTGATGCACCTCCTGCC
ATTGTTGAAGCTCCCAGGAGTGCAGAGACTTCTGTATTTCAGGCGGCAGAAGAGTAGAGA
AGGATGATAAAGCAGTAAGTGAACCCATGCGAAGATCAGCAGGGTATTCAGAAAACACTC
ATATGATTTTGAATTGTTTCCTTTTTTTGGTCAAATGGACAAGTATTTTGAGGTTAATGC
CCAAATGTAAAACCTTCTCTTCTGTATTTCTTTCTTATGTTAATCTTTTTGAACAAATTA
GCCTCTTAAATGTTATATCAGCGCATTCTAGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GG43JQB C 158
AF RR2G004TF U 92
AF RR2DE74JQ C 21
AF RR2DE74TF U 21
AF RR2G004JQ C 5
AF RR2GG43TF U 5
AF RR2DL29TF U 1
AF RR2DL29JQ C 193
BS 1 13 RR2DL29TF
BS 14 14 RR2GG43TF
BS 15 42 RR2DL29TF
BS 43 43 RR2DE74TF
BS 44 58 RR2DL29TF
BS 59 59 RR2DE74TF
BS 60 575 RR2DL29TF

RD RR2GG43JQB 374 0 0
ACTCCTCCCTCGGCGGCGCCTTCGCCGGTCTTCTCTTCTTCAGGAGTCCGGTTACAAGAT
GGGCGTCTATTGCCTTTGGTGCTGGAATCGGTATTGGCTCTGCATACACTGATTGCTCTC
GTGCCTTTGATGCACCTCCTGCCATTGTTGAAGCTCCCAGGAGTGCAGAGACTTCTGTAT
TTCAGGCGGCAGAAGAGTAGAGAAGGATGATAAAGCAGTAAGTGAACCCATGCGAAGATC
AGCAGGGTATTCAGAAAACACTCATATGATTTTGAATTGTTTCCTTTTTTTGGTCAAATG
GACAAGTATTTTGAGGTTAATGCCCAAATGTAAAACCTTCTCTTCTGTATTTCTTTCTTA
TGTTAATCTTTTTG

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR2G004TF 440 0 0
CACCGGAATACGACGTGAACGCTAAGTGGGACGCATGCATCGATCTCACGACGCGCCGTT
TCGTCTACTCCTCCCTCGGCGGCGCCTTCGCCGGTCTTCTCTTCTTCAGGAGTCCGGTTA
CAAGATGGGCGTCTATTGCCTTTGGTGCTGGAATCGGTATTGGCTCTGCATACACTGATT
GCTCTCGTGCCTTTGATGCACCTCCTGCCATTGTTGAAGCTCCCAGGAGTGCAGAGACTT
CTGTATTTCAGGCGGCAGAAGAGTAGAGAAGGATGATAAAGCAGTAAGTGAACCCATGCG
AAGATCAGCAGGGTATTCAGAAAACACTCATATGATTTTGAATTGTTTCCTTTTTTTGGT
CAAATGGACAAGTATTTTGAGGTTAATGCCCAAATGTAAAACCTTCTCTTCTGTATTTCT
TTCTTATGTTAATCTTTTTG

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR2DE74JQ 516 0 0
GCG
GAATCAAGTCGGAGAGAGGTCAGTCAATTTCGGAAGAAAGAAAATGGGAGAGAAGAAGGA
GATGGTGCCACCGGAATACGACGTGAACGCTAAGTGGGACGCATGCATCGATCTCACGAC
ACGCCGTTTCGTCTACTCCTCCCTCGGCGGCGCCTTCGCCGGTCTTCTCTTCTTCAGGAG
TCCGGTTACAAGATGGGCGTCTATTGCCTTTGGTGCTGGAATCGGTATTGGCTCTGCATA
CACTGATTGCTCCCGTGCCTTTGATGCACCTCCTGCCATTGTTGAAGCTCCCAGGAGTGC
AGAGACTTCTGTATTTCAGGCGGCAGAAGAGTAGAGAAGGATGATAAAGCAGTAAGTGAA
CCCATGCGAAGATCAGCAGGGTATTCAGAAAACACTCATATGATTTTGAATTGTTTCCTT
TTTTTGGTCAAATGGACAAGTATTTTGAGGTTAATGCCCAAATGTAAAACCTTCTCTTCT
GTATTTCTTTCTTATGTTAATCTTTTTGAACA
G

QA 4 515 4 515
DS 

RD RR2DE74TF 516 0 0
GCG
GAATCAAGTCGGAGAGAGGTCAGTCAATTTCGGAAGAAAGAAAATGGGAGAGAAGAAGGA
GATGGTGCCACCGGAATACGACGTGAACGCTAAGTGGGACGCATGCATCGATCTCACGAC
ACGCCGTTTCGTCTACTCCTCCCTCGGCGGCGCCTTCGCCGGTCTTCTCTTCTTCAGGAG
TCCGGTTACAAGATGGGCGTCTATTGCCTTTGGTGCTGGAATCGGTATTGGCTCTGCATA
CACTGATTGCTCCCGTGCCTTTGATGCACCTCCTGCCATTGTTGAAGCTCCCAGGAGTGC
AGAGACTTCTGTATTTCAGGCGGCAGAAGAGTAGAGAAGGATGATAAAGCAGTAAGTGAA
CCCATGCGAAGATCAGCAGGGTATTCAGAAAACACTCATATGATTTTGAATTGTTTCCTT
TTTTTGGTCAAATGGACAAGTATTTTGAGGTTAATGCCCAAATGTAAAACCTTCTCTTCT
GTATTTCTTTCTTATGTTAATCTTTTTGAACA
G

QA 4 515 4 515
DS 

RD RR2G004JQ 527 0 0
GGG
AAACTCTAACTCAGAAGAATCAAATCGGAGAGAGGTCAGTCAATTTCGGAAGAAAGAAAA
TGGGAGAGAAGAAGGAGATGGTGCCACCGGAATACGACGTGAACGCTAAGTGGGACGCAT
GCATCGATCTCACGACGCGCCGTTTCGTCTACTCCTCCCTCGGCGGCGCCTTCGCCGGTC
TTCTCTTCTTCAGGAGTCCGGTTACAAGATGGGCGTCTATTGCCTTTGGTGCTGGAATCG
GTATTGGCTCTGCATACACTGATTGCTCTCGTGCCTTTGATGCACCTCCTGCCATTGTTG
AAGCTCCCAGGAGTGCAGAGACTTCTGTATTTCAGGCGGCAGAAGAGTAGAGAAGGATGA
TAAAGCAGTAAGTGAACCCATGCGAAGATCAGCAGGGTATTCAGAAAACACTCATATGAT
TTTGAATTGTTTCCTTTTTTTGGTCAAATGGACAAGTATTTTGAGGTTAATGCCCAAATG
TAAAACCTTCTCTTCTGTATTTCTTTCTTATGTTAATCTTTTTG

QA 4 527 4 527
DS 

RD RR2GG43TF 527 0 0
GGG
AAACTCTAACTCAGAAGAATCAAATCGGAGAGAGGTCAGTCAATTTCGGAAGAAAGAAAA
TGGGAGAGAAGAAGGAGATGGTGCCACCGGAATACGACGTGAACGCTAAGTGGGACGCAT
GCATCGATCTCACGACGCGCCGTTTCGTCTACTCCTCCCTCGGCGGCGCCTTCGCCGGTC
TTCTCTTCTTCAGGAGTCCGGGTACAAGATGGGCGTCTATTGCCTTTGGTGCTGGAATCG
GTATTGGCTCTGCATACACTGATTGCTCTCGTGCCTTTGATGCACCTCCTGCCATTGTTG
AAGCTCCCAGGAGTGCAGAGACTTCTGTATTTCAGGCGGCAGAAGAGTAGAGAAGGATGA
TAAAGCAGTAAGTGAACCCATGCGAAGATCAGCAGGGTATTCAGAAAACACTCATATGAT
TTTGAATTGTTTCCTTTTTTTGGTCAAATGGACAAGTATTTTGAGGTTAATGCCCAAATG
TAAAACCTTCTCTTCTGTATTTCTTTCTTATGTTAATCTTTTTG

QA 4 527 4 527
DS 

RD RR2DL29TF 575 0 0
GGGCACCAAACTCGAACTCAGAAGAATCAAATCGGAGAGAGGCCAGTCAATTTCGGAATA
AAGAAAATGGGAGAGAAGAAGGAGATGGTGCCACCGGAATACGACGTGAACGCTAAGTGG
GACGCATGCATCGATCTCACGACGCGCCGTTTCGTCTACTCCTCCCTCGGCGGCGCCTTC
GCCGGTCTTCTCTTCTTCAGGAGTCCGGTTACAAGATGGGCGTCTATTGCCTTTGGTGCT
GGAATCGGTATTGGCTCTGCATACACTGATTGCTCTCGTGCCTTTGATGCACCTCCTGCC
ATTGTTGAAGCTCCCAGGAGTGCAGAGACTTCTGTATTTCAGGCGGCAGAAGAGTAGAGA
AGGATGATAAAGCAGTAAGTGAACCCATGCGAAGATCAGCAGGGTATTCAGAAAACACTC
ATATGATTTTGAATTGTTTCCTTTTTTTGGTCAAATGGACAAGTATTTTGAGGTTAATGC
CCAAATGTAAAACCTTCTCTTCTGTATTTCTTTCTTATGTTAATCTTTTTGAACAAATTA
GCCTCTTAAATGTTATATCAGCGCATTCTAGTTGC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2DL29JQ 383 0 0
TTCTTCAGGAGTCCGGTTACAAGATGGGCGTCTATTGCCTTTGGTGCTGGAATCGGTATT
GGCTCTGCATACACTGATTGCTCTCGTGCCTTTGATGCACCTCCTGCCATTGTTGAAGCT
CCCAGGAGTGCAGAGACTTCTGTATTTCAGGCGGCAGAAGAGTAGAGAAGGATGATAAAG
CAGTAAGTGAACCCATGCGAAGATCAGCAGGGTATTCAGAAAACACTCATATGATTTTGA
ATTGTTTCCTTTTTTTGGTCAAATGGACAAGTATTTTGAGGTTAATGCCCAAATGTAAAA
CCTTCTCTTCTGTATTTCTTTCTTATGTTAATCTTTTTGAACAAATTAGCCTCTTAAATG
TTATATCAGCGCATTCTAGTTGC

QA 1 383 1 383
DS 



AS 1 8

CO CL879Contig1 775 8 33 U
GGAGACACACTTCTCCCCCTCTCTTCTATCCTCTCTCTCTGAACAAAAATGGAAGGGGCT
CTTCTCTCATTCTCTTCTTCCCTGTCTCCTCTCTGCCACAACCGAACCTTAACCCTATCT
CCCAAACTCTCCAAATCCCAAAACTACCCTCGTCTCCCTGTCATCAGATCCGCCGTGTCT
CGTTCCAAAAAGGAAGAAACCGTGGAGACCGTCAAGTCCCACCTCGAGAAATGCCACCTC
CTCGCCGCCATCAACTACAAAGGCCTCACCGTCAAGCAGTTCCAAGACCTCAGGAGAACT
CTCCCCGACACAACAAAGCTCGTCGTCGCCAAGAACACTTTGGTCATCAAAGCCATCGAA
GGCACCAAATGGGAAGCTCTCAAAACCTGTATGAAAGGCATGAACGCTTGGCTCTTTGTC
CAGACAGATGAGATCCCTTCCGCCATCAAACCTTACCGGAGTTTCCAAAAGGAACGCAAG
CTCGAAGACAATGACTTTGCAGGCGCCGTCTTTGAAGGTAAGTTCTACGCTCCTGACAAC
TTCAAAGCTCTGGAGACCATGCCTACTCGTGCTGAGGTCTACGCTAAGATGCTCGGAGCT
CTGCAGAGTCCGGCCATTAACCTCGTCTCTACGTTACAAGCACCAGCTATTGAGGTTATC
ATGGTGCTCAAGGCTTATGTCAAGAAGCTAGAAGATGAGAGTAATGCTGCATAACTTAGT
TTAAGTAAAGCTGTACTAATCTCAGAGAACGTAATGTACTAAGCAAAGCAAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 0 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 
50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 10 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR2GZ75JQ C 323
AF RR2GE21TF U 1
AF RR2GZ75TF U 7
AF RR2GE21JQ C 326
AF RR2BA44TF U 13
AF RR2G966TF U 14
AF RR2BA44JQ C 153
AF RR2G966JQ C 326
BS 1 42 RR2GE21TF
BS 43 43 RR2BA44TF
BS 44 55 RR2GE21TF
BS 56 56 RR2BA44TF
BS 57 71 RR2GE21TF
BS 72 72 RR2BA44TF
BS 73 105 RR2GE21TF
BS 106 106 RR2BA44TF
BS 107 138 RR2GE21TF
BS 139 139 RR2GZ75TF
BS 140 203 RR2GE21TF
BS 204 204 RR2BA44TF
BS 205 209 RR2GE21TF
BS 210 210 RR2BA44TF
BS 211 383 RR2GE21TF
BS 384 385 RR2BA44TF
BS 386 386 RR2GE21TF
BS 387 387 RR2BA44TF
BS 388 425 RR2GE21TF
BS 426 426 RR2BA44TF
BS 427 476 RR2GE21TF
BS 477 477 RR2BA44TF
BS 478 665 RR2GE21TF
BS 666 666 RR2BA44TF
BS 667 668 RR2GZ75TF
BS 669 669 RR2BA44TF
BS 670 671 RR2GZ75TF
BS 672 672 RR2BA44TF
BS 673 687 RR2GZ75TF
BS 688 688 RR2BA44TF
BS 689 715 RR2GZ75TF
BS 716 771 RR2BA44TF
BS 772 775 RR2G966TF

RD RR2GZ75JQ 260 0 0
TCGTCGCCAAGAACACTTTGGTCATCAAAGCCATCGAAGGCACCAAATGGGAAGCTCTCA
AGCCTTGTATGAAAGGCATGAACGCTTGGCTCTTTGTCCAGACCGATGAGATCCCTTCCG
CCATCAAACCTTACCGGAGTTTCCAAAAGGAACGTAAGCTCGAAGACAATGACTTTGCAG
GCGCCGTCTTTGAAGGTAAGTTCTACGCTCCTGACAACTTCAAAGCTCTGGAGACCATGC
CTACTCGTGCTGAGGT
TTAC

QA 1 256 1 256
DS 

RD RR2GE21TF 667 0 0
GGAGACACACTTCTCCCCCTCTCTTCTATCCTCTCTCTCTGAGCAAAAATGGAAGTGGCT
CTTCTCTCATTTTCTTCTTCCCTGTCTCCTCTCTGCCACAACCGAGCCTTAACCCTATCT
CCCAAACTCTCCAAATCCTAAAACTACCCTCGTCTCCCTGTCATCAGATCCGCCGTGTCT
CGTTCCAAAAAGGAAGAAACCGTCGAGACAGTCAAGTCCCACCTCGAGAAATGCCACCTC
CTCGCCGCCATCAACTACAAAGGCCTCACCGTCAAGCAGTTCCAAGACCTCAGGAGAACT
CTCCCCGACACAACAAAGCTCGTCGTCGCCAAGAACACTTTGGTCATCAAAGCCATCGAA
GGCACCAAATGGGAAGCTCTCAAGCCTTGTATGAAAGGCATGAACGCTTGGCTCTTTGTC
CAGACCGATGAGATCCCTTCCGCCATCAAACCTTACCGGAGTTTCCAAAAGGAACGTAAG
CTCGAAGACAATGACTTTGCAGGCGCCGTCTTTGAAGGTAAGTTCTACGCTCCTGACAAC
TTCAAAGCTCTGGAGACCATGCCTACTCGTGCTGAGGTCTACGCTAAGATGCTCGGAGCT
CTGCAGAGTCCGGCCATTAACCTCGTCTCTACGTTACAAGCACCAGCTATTGAGGTTATC
ATGGT
AC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2GZ75TF 709 0 0
GG
ACTTCTCCCCCTCTCTTCTATCCTCTCTCTCTGAGCAAAAATGGAAGTGGCTCTTCTCTC
ATTTTCTTCTTCCCTGTCTCCTCTCTGCCACAACCGAGCCTTAACCCTATCTCCCAAACT
CTCCAAATCCCAAAACTACCCTCGTCTCCCTGTCATCAGATCCGCCGTGTCTCGTTCCAA
AAAGGAAGAAACCGTCGAGACAGTCAAGTCCCACCTCGAGAAATGCCACCTCCTCGCCGC
CATCAACTACAAAGGCCTCACCGTCAAGCAGTTCCAAGACCTCAGGAGAACTCTCCCCGA
CACAACAAAGCTCGTCGTCGCCAAGAACACTTTGGTCATCAAAGCCATCGAAGGCACCAA
ATGGGAAGCTCTCAAGCCTTGTATGAAAGGCATGAACGCTTGGCTCTTTGTCCAGACCGA
TGAGATCCCTTCCGCCATCAAACCTTACCGGAGTTTCCAAAAGGAACGTAAGCTCGAAGA
CAATGACTTTGCAGGCGCCGTCTTTGAAGGTAAGTTCTACGCTCCTGACAACTTCAAAGC
TCTGGAGACCATGCCTACTCGTGCTGAGGTCTACGCTAAGATGCTCGGAGCTCTGCAGAG
TCCGGCCATTAACCTCGTCTCTACGTTACAAGCACCAGCTATTGAGGTTATCATGGTACT
TAAAGCTTATGTCAAGAAGTTAGAAGATGAGAGTAATGCTGCATAAC

QA 3 709 3 709
DS 

RD RR2GE21JQ 356 0 0
TCGCCAAGAACACTTTGGTCATCAAAGCCATCGAAGGCACCAAATGGGAAGCTCTCAAGC
CTTGTATGAAAGGCATGAACGCTTGGCTCTTTGTCCAGACCGATGAGATCCCTTCCGCCA
TCAAACCTTACCGGAGTTTCCAAAAGGAACGTAAGCTCGAAGACAATGACTTTGCAGGCG
CCGTCTTTGAAGGTAAGTTCTACGCTCCTGACAACTTCAAAGCTCTGGAGACCATGCCTA
CTCGTGCTGAGGTCTACGCTAAGATGCTCGGAGCTCTGCAGAGTCCGGCCATTAACCTCG
TCTCTACGTTACAAGCACCAGCTATTGAGGTTATCATGGTACTTAAGGCTTATGTC

QA 1 356 1 356
DS 

RD RR2BA44TF 759 0 0
GACACTTCTCCTCCTCTCT
TCTCTCTCTGAACAAAAATGGAAGGGGCTCTTCTCTCATTCTCTTCTTCTTTGTCTCCTC
TCTGCCACAACCGAACCTTAACCCTATCTCCCAAACTCTCCAAATCCCGAAACTACCCTC
GTCTCCCTGTCATCAGATCCGCCGTGTCTCGTTCCAAAAAGGAAGAAACCGTGGAGACCG
TCAAGTCCCACCTCGAGAAATGCCACCTCCTCGCCGCCATCAACTACAAAGGCCTCACCG
TCAAGCAGTTCCAAGACCTCAGGAGAACTCTCCCCGACACAACAAAGCTCGTCGTCGCCA
AGAACACTTTGGTCATCAAAGCCATCGAAGGCACCAAATGGGAAGCTCTCAAAACCTGTA
TGAAAGGCATGAACGCTTGGCTCTTTGTTCAGACAGATGAGATCCCTTCCGCCATCAAAC
CTTACCGGAGTTTCCAAAAGGAACGCAAGCTCGAAGACAATGACTTTGCAGGCGCTGTCT
TTGAAGGTAAGTTCTACGCTCCTGACAACTTCAAAGCTCTGGAGACCATGCCTACTCGTG
CTGAGGTCTACGCTAAGATGCTCGGAGCTCTGCAGAGTCCGGCCATTAACCTCGTCTCTA
CGTTACAAGCACCAGCTATTGAGGTTATCATGGTGCTCAAGGCTTATGTCAAGAAGCTAG
AAGATGAGAGTAATGCTGCATAACTTAGTTTAAGTAAAGCTGTACTAATCTCAGAGAACG
TAATGTACTAAGCAAAGCAA

QA 20 759 20 759
DS 

RD RR2G966TF 762 0 0
GGACTTCTCCTCCTCTCT
TCTCTCTCTGAACAAAAATGGAAGGGGCTCTTCTCTCATTCTCTTCTTCTTTGTCTCCTC
TCTGCCACAACCGAACCTTAACCCTATCTCCCAAACTCTCCAAATCCCGAAACTACCCTC
GTCTCCCTGTCATCAGATCCGCCGTGTCTCGTTCCAAAAAGGAAGAAACCGTGGAGACCG
TCAAGTCCCACCTCGAGAAATGCCACCTCCTCGCCGCCATCAACTACAAAGGCCTCACCG
TCAAGCAGTTCCAAGACCTCAGGAGAACTCTCCCCGACACAACAAAGCTCGTCGTCGCCA
AGGACACTTTGGTCATCAAAGCCATCGAAGGCACCAAATGGGAAGCTCTCAAAACCTGTA
TGAAAGGCATGAACGCTTGGCTCTTTGTTCAGACAGATGAGATCCCTTCCGCCATCAAAC
CTTACCGGAGTTTCCAAAAGGAACGCAAGCTCGAAGACAATGACTTTGCAGGCGCTGTCT
TTGAAGGTAAGTTCTACGCTCCTGACAACTTCAAAGCTCTGGAGACCATGCCTACTCGTG
CTGAGGTCTACGCTAAGATGCTCGGAGCTCTGCAGAGTCCGGCCATTAACCTCGTCTCTA
CGTTACAAGCACCAGCTATTGAG*TTATCATGGTGCTCAA*GCTTATGTCAAGAAGCTAG
AAGATGAGAGTAATGCTGCATAACTTAGTTTAAGTAA*GCTGTACTA*TCTCAGAGAACG
TA*TGTACTAAGCAAAGCAAATTC

QA 19 762 19 762
DS 

RD RR2BA44JQ 619 0 0
TCTCCCTGTCATCAGATCCGCCGTGTCTCGTTCCAAAAAGGAAGAAACCGTGGAGACCGT
CAAGTCCCACCTCGAGAAATGCCACCTCCTCGCCGCCATCAACTACAAAGGCCTCACCGT
CAAGCAGTTCCAAGACCTCAGGAGAACTCTCCCCGACACAACAAAGCTCGTCGTCGCCAA
GAACACTTTGGTCATCAAAGCCATCGAAGGCACCAAATGGGAAGCTCTCAAAACCTGTAT
GAAAGGCATGAACGCTTGGCTCTTTGTTCAGACAGATGAGATCCCTTCCGCCATCAAACC
TTACCGGAGTTTCCAAAAGGAACGCAAGCTCGAAGACAATGACTTTGCAGGCGCTGTCTT
TGAAGGTAAGTTCTACGCTCCTGACAACTTCAAAGCTCTGGAGACCATGCCTACTCGTGC
TGAGGTCTACGCTAAGATGCTCGGAGCTCTGCAGAGTCCGGCCATTAACCTCGTCTCTAC
GTTACAAGCACCAGCTATTGAGGTTATCATGGTGCTCAAGGCTTATGTCAAGAAGCTAGA
AGATGAGAGTAATGCTGCATAACTTAGTTTAAGTAAAGCTGTACTAATCTCAGAGAACGT
AATGTACTAAGCAAAGCAA

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2G966JQ 446 0 0
TCGCCAAGGACACTTTGGTCATCAAAGCCATCGAAGGCACCAAATGGGAAGCTCTCAAAA
CCTGTATGAAAGGCATGAACGCTTGGCTCTTTGTTCAGACAGATGAGATCCCTTCCGCCA
TCAAACCTTACCGGAGTTTCCAAAAGGAACGCAAGCTCGAAGACAATGACTTTGCAGGCG
CTGTCTTTGAAGGTAAGTTTTACGCTCCTGACAACTTCAAAGCTCTGGAGACCATGCCTA
CTCGTGCTGAGGTTTACGCTAAGATGCTCGGAGCTCTGCAGAGTCCGGCCATTAACCTCG
TCTTTACGTTACAAGCACCAGCTATTGAGGTTATCATGGTGCTCAAGGCTTATGTCAAGA
AGCTAGAAGATGAGAGTAATGCTGCATAACTTAGTTTAAGTAAAGCTGTACTAATCTCAG
AGAACGTAATGTACTAAGCAAAGCAA

QA 1 446 1 446
DS 



AS 1 7

CO CL880Contig1 663 7 11 U
GGGATGCGACCAAAGAAGTGGGGTTTCAGTCCTTTTTTTGCTTTCTATTATTCTCTCCCG
AATCTCTCTCAGAACTTCTTTCTTCTCTCAGATCAGAGTTTGTTTTTGGTTCCGTCTCGC
CCCGGCCGGAGAATCTGATAA**AGGGAAGATGTCTGCTTTTCAGGAAGAGGACAAGAAG
CCCGGAGACCAAGGACCATCGGCTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGCCAGGATGGAAAT
GAAGTCTTCTTTAGGATCAAGAGGGCCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGACCGCTTACTGT
GACCGTCAGTCTGTGGATTTCAACTCAATTGCTTTCTTGTTTGATGGCCGTCGTCTCCGT
GCTGAACAGACTCCTGATGAGCTTGATATGGAAGAAGGAGATGAGATCGATGCAATGCTC
CATCAAACCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTGGTCTGGGTTTAGTGGCCT
TTGATGGTGTTTCAATAAGATAAGAGCGTGTCATATATATTTATGAACAGTTTTCAATAA
GACGGTGTGATGTTATTATTGGATCATTAAATATCTAATGGGCTTTGTTTAATGAGGCGG
TAGCTTTAACTATAAAAGCTACTTTTAACCGCGTTTGGTAATTGATTAAACTTGTTCCCC
ACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 

AF RR2F549JQ C 112
AF RR2F549TF U 112
AF RR2D894JQ C 1
AF RR2D894TF U 1
AF RR2EC54TF U 103
AF RR2F818TF U 71
AF RR2F818JQ C 71
BS 1 113 RR2D894TF
BS 114 381 RR2F549TF
BS 382 382 RR2D894TF
BS 383 424 RR2F549TF
BS 425 425 RR2D894TF
BS 426 565 RR2F549TF
BS 566 596 RR2D894TF
BS 597 597 RR2EC54TF
BS 598 633 RR2D894TF
BS 634 660 RR2F818TF
BS 661 663 RR2F818JQ

RD RR2F549JQ 454 0 0
GG
GTCTCGCCCCGGCCGGAGAATCTGATAA**AGGGAAGATGTCTGCTTTTCAGGAAGAGGA
CAAGAAGCCCGGAGACCAAGGACCATCGGCTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGCCAGGA
TGGAAATGAAGTCTTCTTTAGGATCAAGAGGGCCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGACCGC
TTACTGTGACCGTCAGTCTGTGGATTTCAACTCAATTGCTTTCTTGTTTGATGGCCGTCG
TCTCCGTGCTGAACAGACTCCTGATGAGTTTGATATGGAAGAAGGAGATGAGATCGATGC
AATGCTCCATCAAACCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTGGTCTGGGTTTA
GTGGCCTTTGATGGTGTTTCAATAAGATAAGAGCGTGTCATATATATTTATGAACAGTTT
TCAATAAGACGGTGTGATGTTATTATTGGATC

QA 3 454 3 454
DS 

RD RR2F549TF 454 0 0
GG
GTCTCGCCCCGGCCGGAGAATCTGATAA**AGGGAAGATGTCTGCTTTTCAGGAAGAGGA
CAAGAAGCCCGGAGACCAAGGACCATCGGCTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGCCAGGA
TGGAAATGAAGTCTTCTTTAGGATCAAGAGGGCCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGACCGC
TTACTGTGACCGTCAGTCTGTGGATTTCAACTCAATTGCTTTCTTGTTTGATGGCCGTCG
TCTCCGTGCTGAACAGACTCCTGATGAGTTTGATATGGAAGAAGGAGATGAGATCGATGC
AATGCTCCATCCAACCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTGGTCTGGGTTTA
GTGGCCTTTGATGGTGTTTCAATAAGATAAGAGCGTGTCATATATATTTATGAACAGTTT
TCAATAAGACGGTGTGATGTTATTATTGGATC

QA 3 454 3 454
DS 

RD RR2D894JQ 633 0 0
GGGATGCGACCAAAGAAGTGGGGTTTCAGTCCTTTTTTTGCTTTCTATTATTCTCTCCCG
AATCTCTCTCAGAACTTCTTTCTTCTCTCAGATCAGAGTTTGTTTTTGGTTCCGTCTCGC
CCCGGCCGGAGAATCTGATAA**AGGGAAGATGTCTGCTTTTCAGGAAGAGGACAAGAAG
CCCGGAGACCAAGGACCATCGGCTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGCCAGGATGGAAAT
GAAGTCTTCTTTAGGATCAAGAGGGCCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGACCGCTTACTGT
GACCGTCAGTCTGTGGATTTCAACTCAATTGCTTTCTTGTTTGATGGCCGTCGTCTCCGT
GCTGAACAGACTCCTGATGAGCTTGATATGGAAGAAGGAGATGAGATCGATGCAATGCTC
CATCAAACCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTGGTCTGGGTTTAGTGGCCT
TTGATGGTGTTTCAATAAGATAGGAGCGTGTCATATATATTTATGAACAGTTTTCAATAA
GACGGTGTGATGTTATTATTGGATCATTAAATATCTAATGGGCTTTGTTTAATGAGACGG
TAGCTTTAACTATAAAAGCTACTTTTAACCGCG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2D894TF 633 0 0
GGGATGCGACCAAAGAAGTGGGGTTTCAGTCCTTTTTTTGCTTTCTATTATTCTCTCCCG
AATCTCTCTCAGAACTTCTTTCTTCTCTCAGATCAGAGTTTGTTTTTGGTTCCGTCTCGC
CCCGGCCGGAGAATCTGATAA**AGGGAAGATGTCTGCTTTTCAGGAAGAGGACAAGAAG
CCCGGAGACCAAGGACCATCGGCTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGCCAGGATGGAAAT
GAAGTCTTCTTTAGGATCAAGAGGGCCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGACCGCTTACTGT
GACCGTCAGTCTGTGGATTTCAACTCAATTGCTTTCTTGTTTGATGGCCGTCGTCTCCGT
GCTGAACAGACTCCTGATGAGCTTGATATGGAAGAAGGAGATGAGATCGATGCAATGCTC
CATCAAACCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTGGTCTGGGTTTAGTGGCCT
TTGATGGTGTTTCAATAAGATAGGAGCGTGTCATATATATTTATGAACAGTTTTCAATAA
GACGGTGTGATGTTATTATTGGATCATTAAATATCTAATGGGCTTTGTTTAATGAGACGG
TAGCTTTAACTATAAAAGCTACTTTTAACCGCG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2EC54TF 531 0 0
TTTTTGGTTCCGTCTCGCCCCGGCCGGAGAATCTGATAAAAAGGGAAGATGTCTGCTTTT
CAGGAAGAGGACAAGAAGCCCGGAGACCAAGGACCATCGGCTCACATCAATCTCAAAGTC
AAGGGCCAGGATGGAAATGAAGTCTTCTTTAGGATAAAGAGGGCCACTCAGCTGAAGAAG
CTGATGACCGCTTACTGTGACCGTCAGTCTGTGGATTTCAACTCTATTGCTTTCTTGTTC
GATGGCCGTCGTCTCCGTGCTGAACAGACTCCTGATGAGCTTGATATGGAAGAGGGAGAT
GAGATCGATGCAATGCTCCATCAAACCGGTGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTG
GTCTGGGTTTAGGGGCCTTTGATGGTGTTTCAATAAGATAAGAGCGTGTCATATATATTT
ATGAACAGTTTTCAATAAGACGGTGTGATGTTATTATTGGATCATTAA*TATCTAATGGG
CTTTGTTTAATGAGGCGGTAGCTTTAACTATAAAAGCTACTTTTAACCG
TG

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2F818TF 593 0 0
G
GAACTTCTTTCTTCTCTCAGATCAGAGTTTGTTTTTGGTTCCGTCTCGCCCCGGCCGGAG
AATCTGATAA**AGGGAAGATGTCTGCTTTTCAGGAAGAGGACAAGAAGCCCGGAGACCA
AGGACCATCGGCTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGCCAGGATGGAAATGAAGTCTTCTT
TAGGATCAAGAGGGCCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGACCGCTTACTGTGACCGTCAGTC
TGTGGATTTCAACTCAATTGCTTTCTTGTTTGATGGCCGTCGTCTCCGTGCTGAACAGAC
TCCCGATGAGCTTGATATGGAAGAAGGAGATGAGATCGATGCAATGCTCCATCAAACCGG
TGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTGGTCTGGGTTTAGTGGCCTTTGATGGTGTT
TCAATAAGATAAGAGCGTGTCATATATATTTATGAACAGTTTTCAATAAGACGGTGTGAT
GTTATTATTGGATCATTAAATATCTAATGGGCTTTGTTTAATGAGGCGGTAGCTTTAACT
ATAAAAGCTACTTTTAACCGCGTTTGGTAATTGATTAAACTTGTTCCCC
ACT

QA 2 590 2 590
DS 

RD RR2F818JQ 593 0 0
G
GAACTTCTTTCTTCTCTCAGATCAGAGTTTGTTTTTGGTTCCGTCTCGCCCCGGCCGGAG
AATCTGATAA**AGGGAAGATGTCTGCTTTTCAGGAAGAGGACAAGAAGCCCGGAGACCA
AGGACCATCGGCTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGCCAGGATGGAAATGAAGTCTTCTT
TAGGATCAAGAGGGCCACTCAGCTGAAGAAGCTGATGACCGCTTACTGTGACCGTCAGTC
TGTGGATTTCAACTCAATTGCTTTCTTGTTTGATGGCCGTCGTCTCCGTGCTGAACAGAC
TCCCGATGAGCTTGATATGGAAGAAGGAGATGAGATCGATGCAATGCTCCATCAAACCGG
TGGTGTTACTAATGCTAGTGGCATGTCTGTGGTCTGGGTTTAGTGGCCTTTGATGGTGTT
TCAATAAGATAAGAGCGTGTCATATATATTTATGAACAGTTTTCAATAAGACGGTGTGAT
GTTATTATTGGATCATTAAATATCTAATGGGCTTTGTTTAATGAGGCGGTAGCTTTAACT
ATAAAAGCTACTTTTAACCGCGTTTGGTAATTGATTAAACTTGTTCCCCACT

QA 2 593 2 593
DS 



AS 1 8

CO CL881Contig1 720 8 13 U
GGATCTCACACACAAACACTTCGTACAATATTATCAAAAGCTTTGAAGAAACATTAAGAA
GTCAAAGAAATCACACGAAATATAATATCAACTTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGCCAC
AAGTTTATCTAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGG
CGAACGCGATAAGGAAGTCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGA
CCAACATGGAAGTTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTAGAACAATTCAATCTAGAGGAAC
AGAGCGAGAAAGGAAACGTAGCTTCGATTGCGAAAAGAGAAACGGCCGTGTCGAGTCCGT
TGACATTTAGCCGAGTTGTGTCAGCTCAGCAACAGGTCGTGGCTGGTCTTAAATACTATC
TAAGGATTGAAGTGACTCAAACCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTATTGTGGTTG
TTCAACCATGGCTCCATTCTAAGAAATTGCTCGGTTTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCT
TCTAAAAGTTCCTTTTTTTTTTGAGAAAAGACTCGAGAGTTGTATGATATGAAGCTATTA
ACAATGGGTTAGTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTTTACGTTCATAAATAAAAACAAAA
GACTTGTTGGAGAACCAAAACCAGCAGCAAACTCTATAATCATTTGGAATGTTGCAGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DB84TF U 1
AF RR2EN05TF U 443
AF RR2DT07TF U 7
AF RR2AR80JQ C 2
AF RR2DT07JQ C 414
AF RR2AR80TF U 2
AF RR2CJ14TF U 3
AF RR2DB84JQ C 130
BS 1 116 RR2DB84TF
BS 117 117 RR2AR80TF
BS 118 561 RR2DB84TF
BS 562 562 RR2EN05TF
BS 563 575 RR2DB84TF
BS 576 576 RR2EN05TF
BS 577 636 RR2DB84TF
BS 637 637 RR2DT07TF
BS 638 644 RR2DB84TF
BS 645 645 RR2DT07TF
BS 646 655 RR2DB84TF
BS 656 676 RR2AR80TF
BS 677 720 RR2DB84JQ

RD RR2DB84TF 655 0 0
GGATCTCACACACAAACACTTCGTACAATATTATCAAAAGCTTTGAAGAAACATTAAGAA
GTCAAAGAAATCACACGAAATATAATATCAACTTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGTCAC
AAGTTTATCTAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGG
CGAACGCGATAAGGAAGTCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGA
CCAACATGGAAGTTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTAGAACAATTCAATCTAGAGGAAC
AGAGCGAGAAAGGAAACGTAGCTTCGATTGCGAAAAGAGAAACGGCCGTGTCGAGTCCGT
TGACATTTAGCCGAGTTGTGTCAGCTCAGCAACAGGTCGTGGCTGGTCTTAAATACTATC
TAAGGATTGAAGTGACTCAAACCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTATTGTGGTTG
TTCAACCATGGCTCCATTCTAAGAAATTGCTCGGTTTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCT
TCTAAAAGTTCCTTTTTTTTT*GAGAAAAGACTCGGGAGTTGTATGATATGAAGCTATTA
ACAATGGGTTAGTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTCTACGTTCGTAAATAAAAA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2EN05TF 192 0 0
CGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTATTGTGGTTGTTCAACCATGGCTCCATTCTAA
GAAATTGCTCGGTTTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCTTCTAAAAGTTCCTTTTTTTTTT
GAGAAAAGACTCGAGAGTTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGGGTTAGTGGCTGGTTT
TGTAATATGATG

QA 1 192 1 192
DS 

RD RR2DT07TF 649 0 0
G
ACACACAAACACTTCGTACAATATTATCAAAAGCTTTGAAGAAACATTAAGAAGTCAAAG
AAATCACACGAAATATAATATCAACTTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGTCACAAGTTTA
TCTAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAACGC
GATAAGGAAGTCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGACCAACAT
GGAAGTTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTAGAACAATTCAATCTAGAGGAACAGAGCGA
GAAAGGAAACGTAGCTTCGATTGCGAAAAGAGAAACGGCCGTGTCGAGTCCGTTGACATT
TAGCCGAGTTGTGTCAGCTCAGCAACAGGTCGTGGCTGGTCTTAAATACTATCTAAGGAT
TGAAGTGACTCAAACCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTATTGTGGTTGTTCAACC
ATGGCTCCATTCTAAGAAATTGCTCGGTTTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCTTCTAAAA
GTTCCTTTTTTTTTTGAGAAAAGACTCGAGAGTTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGG
GTTAGTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTTTACGTTCATAAATAAAAA

QA 2 649 2 649
DS 

RD RR2AR80JQ 675 0 0
GATCTC
ACACACAAACACTTCGTACAATATTATCAAAAGCTTTGAAGAAACATTAAGAAGTCAAAG
AAATCACACGAAATATAATATCAACTTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGCCACAAGTTTA
TCTAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAACGC
GATAAGGAAGTCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGACCAACAT
GGAAGTTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTAGAACAATTCAATCTAGAGGAACAGAGCGA
GAAAGGAAACGTAGCTTCGATTGCGAAAAGAGAAACGGCCGTGTCGAGTCCGTTGACATT
TAGCCGAGTTGTGTCAGCTCAGCAACAGGTCGTGGCTGGTCTTAAATACTATCTAAGGAT
TGAAGTGACTCAAACCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTATTGTGGTTGTTCAACC
ATGGCTCCATTCTAAGAAATTGCTCGGTTTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCTTCTAAAA
GTTCCTTTTTTTTTTGAGAAAAGACTCGAGAGTTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGG
GTTAGTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTTTACGTTCATAAATAAAAACAAAAGACTTGT
TGGAGAACC

QA 7 675 7 675
DS 

RD RR2DT07JQ 263 0 0
TACTATTTAAGGATTGAAGTGACTCAAACCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTTTATT
GTGGTTGTTCAACCATGGCTCCATTTTAAGAAATTGCTCGGTTTCACTCCTGTTGCTACT
CCTATTTTTTAAAAGTTCCTTTTTTTTTTGAGAAAAGACTCGAGAGTTGTATGATATGAA
GCTATTAACAATGGGTTAGTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTTTACGTTCATAAATAAA
AACAAAAGACTTGTTGGAGAACC

QA 1 263 1 263
DS 

RD RR2AR80TF 675 0 0
GATCTC
ACACACAAACACTTCGTACAATATTATCAAAAGCTTTGAAGAAACATTAAGAAGTCAAAG
AAATCACACGAAATATAATATCAACTTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGCCACAAGTTTA
TCTAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAACGC
GATAAGGAAGTCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGACCAACAT
GGAAGTTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTAGAACAATTCAATCTAGAGGAACAGAGCGA
GAAAGGAAACGTAGCTTCGATTGCGAAAAGAGAAACGGCCGTGTCGAGTCCGTTGACATT
TAGCCGAGTTGTGTCAGCTCAGCAACAGGTCGTGGCTGGTCTTAAATACTATCTAAGGAT
TGAAGTGACTCAAACCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTATTGTGGTTGTTCAACC
ATGGCTCCATTCTAAGAAATTGCTCGGTTTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCTTCTAAAA
GTTCCTTTTTTTTTTGAGAAAAGACTCGAGAGTTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGG
GTTAGTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTTTACGTTCATAAATAAAAACAAAAGACTTGT
TGGAGAACC

QA 7 675 7 675
DS 

RD RR2CJ14TF 675 0 0
TGGGG
ACACACAAACACTTCGTACAATATTATCAAAAGCTTTGAAGAAACATTAAGAAGTCAAAG
AAATCACACGAAATATAATATCAACTTAAAAGCCAAAGCAGAAGCAATGTCACAAGTTTA
TCTAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAACGC
GATAAGGAAGTCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGACCAACAT
GGAAGTTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTAGAACAATTCAATCTAGAGGAACAGAGCGA
GAAAGGAAACGTAGCTTCGATTGCGAAAAGAGAAACGGCCGTGTCGAGTCCGTTGACATT
TAGCCGAGTTGTGTCAGCTCAGCAACAGGTCGTGGCTGGTCTTAAATACTATCTAAGGAT
TGAAGTGACTCAAACCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTATTGTGGTTGTTCAACC
ATGGCTCCATTCTAAGAAATTGCTCGGTTTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCTTCTAAAA
GTTCCTTTTTTTTT*GAGAAAAGACTCGAGAGTTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGG
GTTAGTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTTTACGTTCATAAATAAAA*CAAAAGACTTGT
TGGAGAACC
A

QA 6 674 6 674
DS 

RD RR2DB84JQ 591 0 0
TAAAATTGTCATTGTTAGGCCTTTTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAACGCGA
TAAGGAAGTCCATCCTTGTCGGAGGGAAGTCGGATGTTCCGAACGTTCAGACCAACATGG
AAGTTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTAGAACAATTCAATCTAGAGGAACAGAGCGAGA
AAGGAAACGTAGCTTCGATTGCGAAAAGAGAAACGGCCGTGTCGAGTCCGTTGACATTTA
GCCGAGTTGTGTCAGCTCAGCAACAGGTCGTGGCTGGTCTTAAATACTATCTAAGGATTG
AAGTGACTCAAACCGATGGCACGAGCAGGATGTTCGACTCTATTGTGGTTGTTCAACCAT
GGCTCCATTCTAAGAAATTGCTCGGTTTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCTTCTAAAAGT
TCCTTTTTTTTT*GAGAAAAGACTCGGGAGTTGTATGATATGAAGCTATTAACAATGGGT
TAGTGGCTGGTTTTGTAATATGATGTTCTACGTTCGTAAATAAAAACAAAAGACTTGTTG
GAGAACCAAAACCAGCAGCAAACTCTATAATCATTTGGAATGTTGCAGGTC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 7

CO CL882Contig1 1044 7 16 U
GTGTATCATCCATTTTCTCTTTTTCCGGTCATTACATTACAATTCATACTATAAAACATA
CAATACACGACTAATGTAACACAACATATTATGAAAGTAATGTTATTACATCTGCATTGT
AACCACACACATGATCTTTAACAAACTGAAACTACGAGGCGTCACAAAGACCGGTCTTCT
CATCGCAGAATCCATCACGACCGAAAAGACGTTGAGGTGGTGCACTGAGTAAAGGAGACG
AAGGGGAGCCATATGCATTTCTCCTGCTATTTCCACAGCCAAGGCTCTTCCTTGTGCTCA
CTCCAGTCAATGGGTTTGTCCCGTTTGCGTATTTACACAGAGCCTGTTTTTGAAGAAGAT
CAATTACAGCGTCACTAAAGTCAGCGCCTTCGATCTTGGCACCACCGAGGTCACTACGTG
TTAGAACCGAACGAACAAGAATTGCATTTGTCAGATTTGCCTCGTTTAGCACCATCCGAT
CCATCAATGTATCACTCAAATCAGCACCTGAGAAGTTAGCTTTATATGCAACTGCTTTCT
CAAGATAGGCGCCGTTGAAGGTCGAACCACTAAAATCAGACTCTCTCATATCTGCAGAAG
TGAAGTTGGCTCTTCTGAAATTTTCGTTGGAGTGAACTGTTTTGCTGAGATCAGCAGAAC
CAAACTGAGCAGCTGATCCTATCCCAAACTCGCCACGTATATCCGCCTCGAACTTGTTAA
GATCTGCCATTGCTGGAAACCCTGAGCTCGAGACTATCACAGCCGCTGCTAATGCTCCTG
ATAAAAAACTCTTCCACGTCTTCGATTCTCCACCGGAGCAACAATCTTCCCTAGAACTTG
ATGAATCTCTTTCTGGTTTTGAACGGGAGATTAGCTGTAGACGCCTCAATGGGTATCTCG
GAAGATGGTAAAGAGACCTTGAGGAGAAGGGAGATGACGATCGTGAAGTGTCAAGTGACT
TCATGGGGAGAGGAGAGAGCGAAGAGAGAGCCATTGGTAAAGGTTTAAACTTTGCAAGAG
TTAGAAATGTACATTCAAGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E936JQ U 1
AF RR2DI25JQ U 34
AF RR2FR41JQ U 62
AF RR2EG07JQ U 74
AF RR2E936TF C 452
AF RR2EG07TF C 402
AF RR2FR41TF C 392
BS 1 55 RR2E936JQ
BS 56 56 RR2DI25JQ
BS 57 559 RR2E936JQ
BS 560 562 RR2DI25JQ
BS 563 563 RR2FR41JQ
BS 564 571 RR2DI25JQ
BS 572 572 RR2FR41JQ
BS 573 574 RR2DI25JQ
BS 575 575 RR2FR41JQ
BS 576 655 RR2DI25JQ
BS 656 788 RR2EG07JQ
BS 789 835 RR2FR41TF
BS 836 836 RR2E936TF
BS 837 862 RR2FR41TF
BS 863 863 RR2E936TF
BS 864 1044 RR2FR41TF

RD RR2E936JQ 559 0 0
GTGTATCATCCATTTTCTCTTTTTCCGGTCATTACATTACAATTCATACTATAAA*CATA
CAATACACGACTAATGTAACACAACATATTATGAAAGTAATGTTATTACATCTGCATTGT
AACCACACACATGATCTTTAACAAACTGAAACTACGAGGCGTCACAAAGACCGGTCTTCT
CATCGCAGAATCCATCACGACCGAAAAGACGTTGAGGTGGTGCACTGAGTAAAGGAGACG
AAGGGGAGCCATATGCATTTCTCCTGCTATTTCCACAGCCAAGGCTCTTCCTTGTGCTCA
CTCCAGTCAATGGGTTTGTCCCGTTTGCGTATTTACACAGAGCCTGTTTTTGAAGAAGAT
CAATTACAGCGTCACTAAAGTCAGCGCCTTCGATCTTGGCACCACCGAGGTCACTACGTG
TTAGAACCGAACGAACAAGAATTGCATTTGTCAGATTTGCCTCGTTTAGCACCATCCGAT
CCATCAATGTATCACTCAAATCAGCACCTGAGAAGTTAGCTTTATATGCAACTGCTTTCT
CAAGATAGGCGCCGTTGAA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2DI25JQ 622 0 0
CAT
TTACAATTCATACTATAAAACATACAATACACGACTAATGTAACACAACATATTATTAAA
CAAATGTTATTACATCTGCATTGTAACCACACACATGATCTT*AACAAACTGAAACTACG
AGGCGTCACAAAGACCGGTCTTCTCATCGCAGAATCCATCACGACCGAAAAGACGTTGAG
GTGGCGCACTGAGTAAAGGAGACGAAGGGGAGCCATATGCATTTCTCCTGCTATTTCCAC
AGCCAAGAGACTTCCTTGTGCTAACTCCAGTCAATGGGTTTGTCCCGTTTGCGTATTTAC
ACAGAGCCTGTTTTTGAAGAAGATCAATCACAGCGTCACTAAAGTCAGCGCCTTCGATCT
TGGCACCACCGAGGTCACTACGTGTTAGAACCGAACGTACAAGAATTGCATTTGTCAGAT
TTGCCTCGTTTAGCACCATCCGATCCATCAATGTATCACTCAAATCAGCACCTGAGAAGT
TAGCTTTGTATGCAACTGCTTTCTCAAGATAGGCGCCGTTGAAGGTTGAACCACTGAAGT
CAGACTCTCTCATATCTGCAGAAGTGAAGTTGGCTCTTCTGAAATTTTCGTTGGAGTGAA
CTGTTTTGCTGAGATCAGC

QA 4 622 4 622
DS 

RD RR2FR41JQ 587 0 0
AATACACGACTAATGTAACACAACATATTATGAAAGTAATGTTATTACATCTGCATTGTA
ACCACACACATGATCTTTAACAAACTGAAACTACGAGGCGTCACAAAGACCGGTCTTCTC
ATCGCAGAATCCATCACGACCGAGAAGACGTTGAGGGGGTGCACTGAGTAAAGGAGACGA
AGGGGAGCCATATGCATTTCTCCTGCTATTTCCACAGCCAAGGCTCTTCCTTGTGCTCAC
TCCAGTCAATGGGTTTGTCCCGTTTGCGTATTTACACAGAGCCTGTTTTTGAAGAAGATC
AATTACAGCGTCACTAAAGTCAGCGCCTTCGATCTTGGCACCACCGAGGTCACTACGTGT
TAGAACCGAACGAACAAGAATGGCATTTGTCAGATTTGCCTCGTTTAGCACCATCCGATC
CATCAATGTCTCACTCAAATCAGCACCTGAGAAGTTAGCTTTATATGCAACTGCTTTCTC
AAGATAGGCGCCGTTGAAGGTCGAACCACTAAAATCAGACTCTCTCATATCTGCAGAAGT
GAAGTTGGCTCTTCTGAAATTTTCGTTGGAGTGAACTGTTTTGCTGA

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2EG07JQ 715 0 0
ATGTAACACAACATATTATGAAAGTAATGTTATTACATCTGCATTGTAACCACACACATG
ATCTTTAACAAACTGAAACTACGAGGCGTCACAAAGACCGGTCTTCTCATCGCAGAATCC
ATCACGACCGAGAAGACGTTGAGGTGGTGCACTGAGTAAAGGAGACGAAGGGGAGCCATA
TGCATTTCTCCTGCTATTTCCACAGCCAAGGCTCTTCCTTGTGCTCACTCCAGTCAATGG
GTTTGTCCCGTTTGCGTATTTACACAGAGCCTGTTTTTGAAGAAGATCAATTACAGCGTC
ACTAAAGTCAGCGCCTTCGATCTTGGCACCACCGAGGTCACTACGTGTTAGAACCGAACG
AACAAGAATTGCATTTGTCAGATTTGCCTCGTTTAGCACCATCCGATCCATCAATGTATC
ACTCAAATCAGCACCTGAGAAGTTAGCTTTATATGCAACTGCTTTCTCAAGATAGGCGCC
GTTGAAGGTCGAACCACTAAAATCAGACTCTCTCATATCTGCAGAAGTGAAGTTGGCTCT
TCTGAAATTTTCGTTGGAGTGAACTGTTTTGCTGAGATCAGCAGAACCAAACTGAGCAGC
TGATCCTATCCCAAACTCGCCACGTATATCCGCCTCGAACTTGTTAAGATCTGCCATTGC
TGGAAACCCTGAGCTCGAGACTATCACAGCCGCTGCTAATGCTCCTGATAAAAAA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2E936TF 565 0 0
CAGATTTGCCTCGTTTAGCACCATCCGATCCATCAATGTATCACTCAAATCAGCACCTGA
GAAGTTAGCTTTATATGCAACTGCTTTCTCAAGATAGGCGCCGTTGAAGGTCGAACCACT
AAAATCAGACTCTCTCATATCTGCAGAAGTGAAGTTGGCTCTTCTGAAATTTTCGTTGGA
GTGAACTGTTTTGCTGAGATCAGCAGAACCAAACTGAGCAGCTGATCCTATCCCAAACTC
GCCACGTATATCCGCCTCGAACTTGTTAAGATCTGCCATTGCTGGAAACCCTGAGCTCGA
GACTATCACAGCCGCTGCTAATGCTCCTGATAAAAAACTCTTCCACGTCTTCGATTCTCC
ACCGGAGCAACAATCTTCCCTAGAACTTGATGAATCTCTTTCTGGTTTTGAACGGGAGAT
TAGCTGTAGACGCCTCAATGGGTATCTCGGAAGATGGTAAAGAGACCTTGAGGAGAAGGG
AGATGACGATCGTGAAGTGTCAAGTGACTTCATGGGGAGAGGAGAGAGCGAAGAGAGAGC
CATTGGTAAAGGTTTAAACTTT
TCC

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2EG07TF 615 0 0
CCACTGAGGTCACTACGTGTTAGAACCGAACGAACAAGAATTGCATTTGTCAGATTTGCC
TCGTTTAGCACCATCCGATCCATCAATGTATCACTCAAATCAGCACCTGAGAAGTTAGCT
TTATATGCAACTGCTTTCTCAAGATAGGCGCCGTTGAAGGTCGAACCACTAAAATCAGAC
TCTCTCATATCTGCAGAAGTGAAGTTGGCTCTTCTGAAATTTTCGTTGGAGTGAACTGTT
TTGCTGAGATCAGCAGAACCAAACTGAGCAGCTGATCCTATCCCAAACTCGCCACGTATA
TCCGCCTCGAACTTGTTAAGATCTGCCATTGCTGGAAACCCTGAGCTCGAGACTATCACA
GCCGCTGCTAATGCTCCTGATAAAAAACTCTTCCACGTCTTCGATTCTCCACCGGAGCAA
CAATCTTCCCTAGAACTTGATGAATCTCTTTCTGGTTTTGAACGGGAGATTAGCTGTAGA
CGCCTCAATGGGTATCTCGGAAGATGGTAAAGAGACCTTGAGGAGAAGGGAGATGACGAT
CGTGAAGTGTCAAGTGACTTCATGGGGAGAGGAGAGAGCGAAGAGAGAGCCATTGGTGAA
GGTTTAAACTTT
TCC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2FR41TF 653 0 0
CGATCTT
GCACCACCGAGGTCACTACGTGTTAGAACCGAACGAACAAGAATGGCATTTGTCAGATTT
GCCTCGTTTAGCACCATCCGATCCATCAATGTCTCACTCAAATCAGCACCTGAGAAGTTA
GCTTTATATGCAACTGCTTTCTCAAGATAGGCGCCGTTGAAGGTCGAACCACTAAAATCA
GACTCTCTCATATCTGCAGAAGTGAAGTTGGCTCTTCTGAAATTTTCGTTGGAGTGAACT
GTTTTGCTGAGATCAGCAGAACCAAACTGAGCAGCTGATCCTATCCCAAACTCGCCACGT
ATATCCGCCTCGAACTTGTTAAGATCGGCCATTGCTGGAAACCCTGAGCTCGAGACTATC
ACAGCCGCTGCTAATGCTCCTGATAAAAAACTCTTCCACGTCTTCGATTCTCCACCGGAG
CAACAATCTTCCCTAGAGCTTGATGAATCTCTTTCTGGTTTTGAGCGGGAGATTAGCTGT
AGACGCCTCAATGGGTATCTCGGAAGATGGTAAAGAGACCTTGAGGAGAAGGGAGATGAC
GATCGTGAAGTGTCAAGTGACTTCATGGGGAGAGGAGAGAGCGAAGAGAGAGCCATTGGT
AAAGGTTTAAACTTTGCAAGAGTTAGAAATGTACATTCAAGTTTCC

QA 8 653 8 653
DS 



AS 2 7

CO CL883Contig1 853 3 8 U
GGAATCACATTTCTGTAAAATTCTCCTTAGTTTCTGAAACTCCCCTTACCGGGTCTCCAA
GGGGCCAAGAAAGGACTGCTTTCTCGGCTTCGCGGAGTCTCATCATTCCCTCTCTTTTTT
AACGCTTTCTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAATGGATACCAC
GGAGCTAAAACGTGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACTAAGAA
GGAGCTAAACGATTCATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCA
GATGATCGACAAGATTGATGTGAATGGTGATGGTTGCGTCGACATTGAAGAGTTTGGAGA
GCTTTACAAGACGATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATAGGAGAAGAAGATATGAAGGA
AGCGTTCAACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACAGTGGATGAATTGAAAGA
GGTGTTGTCTTCCCTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGAT
AATACAAGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGACAAATGAT
GAAAAAGGGTCGGTTTTTTTAGCTCTTTGGGCTGATTAACTATCTTTTTTTCTTTCACTT
TTGTTTTATCTTTTTTTATTTTTACCATTTATCTCTCGCATTCTAGAAGGAAAAAATTAA
ACGATTGGTAAATGAATTGTTTAATAGTCTAATTTGCGAGAGCATATTGTAAAAATTGTA
GAACTGTTTGTTTATTAATTAATGTGATATGTTATGATTGTAATAACTAATAAACTAGGT
TCGTTTTTATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH40TF U 1
AF RR2BH33TF U 5
AF RR2BH33JQ C 137
BS 1 398 RR2AH40TF
BS 399 399 RR2BH33TF
BS 400 493 RR2AH40TF
BS 494 494 RR2BH33TF
BS 495 629 RR2AH40TF
BS 630 630 RR2BH33TF
BS 631 770 RR2AH40TF
BS 771 853 RR2BH33JQ

RD RR2AH40TF 770 0 0
GGAATCACATTTCTGTAAAATTCTCCTTAGTTTCTGAAACTCCCCTTACCGGGTCTCCAA
GGGGCCAAGAAAGGACTGCTTTCTCGGCTTCGCGGAGTCTCATCATTCCCTCTCTTTTTT
AACGCTTTCTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAATGGATACCAC
GGAGCTAAAACGTGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACTAAGAA
GGAGCTAAACGATTCATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCA
GATGATCGACAAGATTGATGTGAATGGTGATGGTTGCGTCGACATTGAAGAGTTTGGAGA
GCTTTACAAGACGATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGACAGGAGAAGAAGATATGAAGGA
AGCGTTCAACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACAGTGGATGAATTGAAAGA
GGTGTTGTCTTCCTTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGAT
AATACAAGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGACAAATGAT
GAAAAAGGGTCGGTTTTTTTAGCTCTTTGAGCTGATTAACTATCTTTTTTTCTTTCACTT
TTGTTTTATCTTTTTTTATTTTTACCATTTATCTCTCGCATTCTAGAAGGAAAAAATTAA
ACGATTGGTAAATGAATTGTTTAATAGTCTAATTTGCGAGAGCATATTGT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2BH33TF 766 0 0
GG
ACATTTCTGTAAAATTCTCCTTAGTTTCTGAAACTCCCCTTACCGGGTCTCCAAGGGGCC
AAGAAAGGACTGCTTTCTCGGCTTCGCGGAGTCTCATCATTCCCTCTCTTTTTTAACGCT
TTCTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAATGGATACCACGGAGCT
AAAACGTGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACTAAGAAGGAGCT
AAACGATTCATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCAGATGAT
CGACAAGATTGATGTGAATGGTGATGGTTGCGTCGACATTGAAGAGTTTGGAGAGCTTTA
CAAGACGATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATAGGAGAAGAAGATATGAAGGAAGCGTT
CAACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACAGTGGATGAATTGAAAGAGGTGTT
GTCTTCCCTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATAATACA
AGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAAAAA
GGGTCGGTTTTTTTAGCTCTTTGGGCTGATTAACTATCTTTTTTTCTTTCACTTTTGTTT
TATCTTTTTTTATTTTTACCATTTATCTCTCGCATTCTAGAAAGAAAAAATTAAACGATT
GGTAAATGAATTGTTTAATAGTCTAATTTGCGAGAGCATATTGT

QA 3 766 3 766
DS 

RD RR2BH33JQ 717 0 0
ACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAATGGATACCACGGAGCTAAAACGTGTG
TTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACTAAGAAGGAGCTAAACGATTCA
TTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCAGATGATCGACAAGATT
GATGTGAATGGTGATGGTTGCGTCGACATTGAAGAGTTTGGAGAGCTTTACAAGACGATA
ATGGTGGAAGACGAGGACGAGATAGGAGAAGAAGATATGAAGGAAGCGTTCAACGTTTTC
GATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACAGTGGATGAATTGAAAGAGGTGTTGTCTTCCCTG
GGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATAATACAAGTGGATGTT
GATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAAAAAGGGTCGGTTT
TTTTAGCTTTTTGGGCTGATTAACTATCTTTTTTTCTTTCACTTTTGTTTTATCTTTTTT
TATTTTTCCCATTTATCTCTCGCATTCTAGAAGGAAAAAATTAAACGATTGGTAAATGAA
TTGTTTAATAGTTTAATTTGCGAGAGCATATTGTAAAAATTGTAGAACTGTTTGTTTATT
AATTAATGTGATATGTTATGATTGTAATAACTAATAAACTAGGTTCGTTTTTATTTC

QA 1 717 1 717
DS 



CO CL883Contig2 821 4 11 U
GGAATCACATTTCTGTAAAATTCTCCTTAGTTTCTGAAACTCCCCTTACCGGGTCTCCAA
GGGGCCAAGAAAGTACTGCTTTCTCGGTTTCGCGGAGTCTCATCATTCCCTCTTTTTTAA
CGCTTTCTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAAATGGATACCACG
GAGCTAAAACGCGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGGCGGTAGGATCACTAAGAAG
GAGCTAAACGATTCATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCAG
ATGATCGACAAGATAGATGTGAATGGCGATGGTTGCGTTGACATTGAAGAGTTTGGAGAG
CTTTACAAGACGATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATTGGGGAAGAAGATATGAAGGAA
GCGTTCAACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACGGTGGATGAGTTGAAAGCG
GTGTTGTCTTCCTTGGGACTCAAGTAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATC
ATACAAGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAGGGAGTTTAGACAAATGATG
AAAAAGGGTCGGTTTTTCTAGCTCTCTTTTGAGCTGATTAACTATATTTTTTTTTCTCTT
TCACTTTTGTTTTATCTTTTTCCTTTTACCATTTATCTCTCGCATTCTAGAAGGAAAAAT
TAAACGATTGGTAAATGAATTGTTTAATAGTCTAATTTGCGAGAGCACATTGTAAAAATT
GTAGAACTGTTCGTCTATTAATTAATGGGATTTGTGATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E516TF U 1
AF RR2FO29TF U 1
AF RR2BI23TF U 5
AF RR2BI23JQ C 131
BS 1 220 RR2E516TF
BS 221 221 RR2BI23TF
BS 222 325 RR2E516TF
BS 326 326 RR2FO29TF
BS 327 504 RR2E516TF
BS 505 505 RR2BI23TF
BS 506 580 RR2E516TF
BS 581 582 RR2BI23TF
BS 583 602 RR2E516TF
BS 603 773 RR2BI23TF
BS 774 821 RR2BI23JQ

RD RR2E516TF 602 0 0
GGAATCACATTTCTGTAAAATTCTCCTTAGTTTCTGAAACTCCCCTTACCGGGTCTCCAA
GGGGCCAAGAAAGTACTGCTTTCTCGGTTTCGCGGAGTCTCATCATTCCCTCTTTTTTAA
CGCTTTCTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAAATGGATACCACG
GAGCTAAAACGCGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTAGGATCACTAAGAAG
GAGCTAAACGATTCATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCAG
ATGATCGACAAGATAGATGTGAATGACGATGGTTGCGTTGACATTGAAGAGTTTGGAGAG
CTTTACAAGACGATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATTGGGGAAGAAGATATGAAGGAA
GCGTTCAACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACGGTGGATGAGTTGAAAGCG
GTGTTGTCTTCCTTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATC
ATACAAGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAA*GAGTTTAGACAAATGATG
AA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2FO29TF 602 0 0
GGAATC
ACATTTCTGTAAAATTCTCCTTAGTTTCTGAAACTCCCCTTACCGGGTCTCCAAGGGGCC
AAGAAAGTACTGCTTTCTCGGTTTCGCGGAGTCTCATCATTCCCTCTTTTTTAACGCTTT
CTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAAATGGATACCACGGAGCTA
AAACGCGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTAGGATCACTAAGAAGGAGCTA
AACGATTCATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCAGATGATC
GACAAGATAGATGTGAATGGCGATGGTTGCGTTGACATTGAAGAGTTTGGAGAGCTTTAC
AAGACGATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATTGGGGAAGAAGATATGAAGGAAGCGTTC
AACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACGGTGGATGAGTTGAAAGCGGTGTTG
TCTTCCTTGAGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATCATACAA
GTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAAGAGTTTAGACAAATGATGAA

QA 7 602 7 602
DS 

RD RR2BI23TF 769 0 0
GG
ACATTTCTGTAAAATTCTCCTTAGTTTCTGAAACTCCCCTTACCGGGTCTCCAAGGGGCC
AAGAAAGTACTGCTTTCTCGGTTTCGCGGAGTCTCATCATTCCCTCTTTTTTAACGCTTT
CTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAAATGGATACCACGGAGCTA
AAACGCGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGGCGGTAGGATCACTAAGAAGGAGCTA
AACGATTCATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCAGATGATC
GACAAGATAGATGTGAATGGCGATGGTTGCGTTGACATTGAAGAGTTTGGAGAGCTTTAC
AAGACGATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATTGGGGAAGAAGATATGAAGGAAGCGTTC
AACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACGGTGGATGAGTTGAAAGCGGTGTTG
TCTTCCTTGGGACTCAAGTAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATCATACAA
GTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAGGGAGTTTAGACAAATGATGAAAAAG
GGTCGGTTTTTCTAGCTCTCTTTTGAGCTGATTAACTATATTTTTTTTTCTCTTTCACTT
TTGTTTTATCTTTTTCCTTTTACCATTTATCTCTCGCATTCTAGAAGGAAAAATTAAACG
ATTGGTAAATGAATTGTTTAATAGTCTAATTTGCGAGAGCACATTGT

QA 3 769 3 769
DS 

RD RR2BI23JQ 691 0 0
ATCCACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAAATGGATACCACGGAGCTAAAAC
GCGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGGCGGTAGGATCACTAAGAAGGAGCTAAACG
ATTCATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCAGATGATCGACA
AGATAGATGTGAATGGCGATGGTTGCGTTGACATTGAAGAGTTTGGAGAGCTTTACAAGA
CGATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATTGGGGAAGAAGATATGAAGGAAGCGTTCAACG
TTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACGGTGGATGAGTTGAAAGCGGTGTTGTCTT
CCTTGGGACTCAAGTAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATCATACAAGTGG
ATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAGGGAGTTTAGACAAATGATGAAAAAGGGTC
GGTTTTTCTAGCTCTCTTTTGAGCTGATTAACTATATTTTTTTTT*TCTTTCACTTTTGT
TTTATCTTTTTCCTTTTACCATTTATCTCTCGCATTCTAGAAGGAAAAATTAAACGATTG
GTAAATGAATTGTTTAATAGTCTAATTTGCGAGAGCACATTGTAAAAATTGTAGAACTGT
TCGTCTATTAATTAATGGGATTTGTGATGCC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 8

CO CL884Contig1 1634 8 6 U
TTTTTTTTTGCTCTGCAACGAATGAATTCAAGAGATAAGAGAATTAAGGATACCCACCAA
GAAGACTAATCCAATCCATAAAGATGTACCAGAAAATACAACATTTTTGTTACTCGACCA
CCCATCAGGAGACGCAAATACAACGGGTACACTAATCAGTAAGATTAATGAAGTAATAAT
TAATGCAAAAACAGCCAATTGAAAAGCAATAGTCATGTTTTTAATCCTCCAAGCTATTAA
CAATATACACCATTTAATCCTCTTACCCACTAAAAAATTTTAATAAATAAAGGGATTTTA
TCATGAATCCGTTTATTCGAGATGCCTTATTTCCAACTTCTTTTTACCACTTTTATTCTA
TTCGGACATGAAGTTAAAGGTTCTTTTTGACTTCACAAATGGGTAGACTGGATCATGTAT
CTCATTTATTTATATAGACCAATTGATAGACTTATAAAGAAAGTCACACCCTATATCTTT
TTCTACATAGTGATCGTATTAACTCATCGAGCTATGTTCTATTTGGCGAAAAAAAAGATA
AAATAGAAATTATCTTTCGGAGAGATGGCCGAGTGGTTGATGGCTCCGGTCTTGAAAACC
GGTATAGTTCATAAAAAATAACTATCGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCTTTTGTTGGA
TGAATAGATTTTTTTATTTATTGGCTTTTTTACTTCTTAGCATCATAAAAAAGGAGAATG
GCTCGGCTGGATAGTATAGCCGAGCCAGAAAAAAGGAGATTGAATTGAAAGAAAGAAAGA
AGACTTTTTACTATGACCCGATTTTTACTTTCCTATTTTAACTACTACTTTAGTTAAGAG
GAGTCATAGAAAGAACAGGTTCAAAATCACGATCAATTCCTTTTTCAAATCCTGCTGCCG
CTGCCCGAGCTCTTCCCGCGTGCCATAAATGACCCACGAATAGGAAGAATCCTAGAACAA
AATGAGAGGTAGATAACCAACTTCTCGGAGAGACGTAATTGACTGCATTGATCTCAGTAG
CTACGCCCCCTACAGAATTTAAGGAACCTAAAGGAGCATGAGTCATATATTCTGCAGAAC
GTCGTTCTTGCCAAGGTTGTATGTCTTTTTTCAACCTACTTAAGTCCAAACCATTAGGAC
CCCTTAAAGGTTCTAACCAGGGAGCACGCAAATCCCAAAAACGTATTGTTTCTCCTCCAA
AAATAACTTCTCCAGTCGGGGAACGCATTAAGTATTTACCTAAACCTGTAGGTCCTTGAG
CAGACCCCACGTTAGCTCCAAGACGTTGGTCTCTAACTAGAAAAGTAAATGCTTGAGCTT
GAGAAGCTTCTGGCCCTGTAGGTCCGTAAAACTCACTAGGGTAAGCGGTATTATTAAACC
AGACAAAACAACAAGCAATGAAACCACAAACAGATAAAGCAGCTAAACTATAAGACAAGT
AAGCCTCCCCAGACCATACAAGTGCGCGGCGAGCCCATGCAAAAGGTTTGGTTAAGATAT
GCCAGATTCCACCAAATATACAAATGGAACCTAACCATACATGCCCTCCAATTATATCTT
CCAAATCGTCCACACTAACAATCCATCCTTCTCCCCCAAAGGGAGATTTTAGTAAATAAC
CAAATATAACACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR84JQ U 10
AF RR2G222JQ U 10
AF RR2G222TF C 478
AF RR2GR84TF C 1
AF RR2GB36JQ U 389
AF RR2DX06JQ U 566
AF RR2FG70TF C 988
AF RR2GJ28JQB U 904
BS 1 9 RR2GR84TF
BS 10 362 RR2GR84JQ
BS 363 536 RR2G222JQ
BS 537 839 RR2GB36JQ
BS 840 1124 RR2DX06JQ
BS 1125 1634 RR2GJ28JQB

RD RR2GR84JQ 353 0 0
GCTCTGCAACGAATGAATTCAAGAGATAAGAGAATTAAGGATACCCACCAAGAAGACTAA
TCCAATCCATAAAGATGTACCAGAAAATACAACATTTTTGTTACTCGACCACCCATCAGG
AGACGCAAATACAACGGGTACACTAATCAGTAAGATTAATGAAGTAATAATTAATGCAAA
AACAGCCAATTGAAAAGCAATAGTCATGTTTTTAATCCTCCAAGCTATTAACAATATACA
CCATTTAATCCTCTTACCCACTAAAAAATTTTAATAAATAAAGGGATTTTATCATGAATC
CGTTTATTCGAGATGCCTTATTTCCAACTTCTTTTTACCACTTTTATTCTATT

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR2G222JQ 527 0 0
GCTCTGCAACGAATGAATTCAAGAGATAAGAGAATTAAGGATACCCACCAAGAAAACTAA
TCCAATCCATAAAGATGTACCAGAAAATACAACATTTTTGTTACTCGACCACCCATCAGG
AGACGCAAATACAACGGGTACACTAATCAGTAAGATTAATGAAGTAATAATTAATGCAAA
AACAGCCAATTGAAAAGCAATAGTCATGTTTTTAATCCTCCAAGCTATTAACAATATACA
CCATTTAATCCTCTTACCCACTAAAAAATTTTAATAAATAAAGGGATTTTATCATGAATC
CGTTTATTCGAGATGCCTTATTTCCAACTTCTTTTTACCACTTTTATTCTATTCGGACAT
GAAGTTAAAGGTTCTTTTTGACTTCACAAATGGGTAGACTGGATCATGTATCTCATTTAT
TTATATAGACCAATTGATAGACTTATAAAGAAAGTCACACCCTATATCTTTTTCTACATA
GTGATCGTATTAACTCATCGAGCTATGTTCTATTTGGCGAAAAAAAA

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2G222TF 141 0 0
TTTTTCTACATAGTGATCGTATTAACTCATCGAGCTATGTTCTATTTGGCGAAAAAAAAG
ATAAAATAGAAATTATCTTTCGGAGAGATGGCCGAGTGGTTGATGGCTCCGGTCTTGAAA
ACCGGTATAGTTCATAAAAAA

QA 1 141 1 141
DS 

RD RR2GR84TF 694 0 0
TTTTTTTTTGCTCTGCAACGAATGAATTCAAGAGATAAGAGAATTAAGGATACCCACCAA
GAAGACTAATCCAATCCATAAAGATGTACCAGAAAATACAACATTTTTGTTACTCGACCA
CCCATCAGGAGACGCAAATACAACGGGTACACTAATCAGTAAGATTAATGAAGTAATAAT
TAATGCAAAAACAGCCAATTGAAAAGCAATAGTCATGTTTTTAATCCTCCAAGCTATTAA
CAATATACACCATTTAATCCTCTTACCCACTAAAAAATTTTAATAAATAAAGGGATTTTA
TCATGAATCCGTTTATTCGAGATGCCTTATTTCCAACTTCTTTTTACCACTTTTATTCTA
TTCGGACATGAAGTTAAAGGTTCTTTTTGACTTCACAAATGGGTAGACTGGATCATGTAT
CTCATTTATTTATATAGACCAATTGATAGACTTATAAAGAAAGTCACACCCTATATCTTT
TTCTACATAGTGATCGTATTAACTCATCGAGCTATGTTCTATTTGGCGAAAAAAAAGATA
AAATAGAAATTATCTTTCGGAGAGATGGCCGAGTGGTTGATGGCTCCGGTCTTGAAAACC
GGTATAGTTCATAAAAAATAACTATCGAGGGTTCGAATCCCTCTTTCTCCTTTTGTTGGA
TGAATAGATTTTTTTATTTATTGGCTTTTTTAC
C

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2GB36JQ 451 0 0
GACTTCACAAATGGGTAGACTGGATCATGTATCTCATTTATTTATATAGACCAATTGATA
GACTTATAAAGAAAGTCACACCCTATATCTTTTTCTACATAGTGATCGTATTAACTCATC
GAGCTATGTTCTATTTGGCGAAAAAAAAGATAAAATAGAAATTATCTTTCGGAGAGATGG
CCGAGTGGTTGATGGCTCCGGTCTTGAAAACCGGTATAGTTCATAAAAAATAACTATCGA
GGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCTTTTGTTGGATGAATAGATTTTTTTATTTATTGGCTTT
TTTACTTCTTAGCATCATAAAAAAGGAGAATGGCTCGGCTGGATAGTATAGCCGAGCCAG
AAAAAAGGAGATTGAATTGAAAGAAAGAAAGAAGACTTTTTACTATGACCCGATTTTTAC
TTTCCTATTTTAACTACTACTTTAGTTAAGA

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR2DX06JQ 559 0 0
TGGCCGAGTGGTTGATGGCTCCGGTCTTGAAAACCGGTATAGTTCATAAAAAATAACTAT
CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCTTTTGTTGGATGAATAGATTTTTTTATTTATTGGC
TTTTTTACTTCTTAGCATCATAAAAAAGGAGAATGGCTCGGCTGGATAGTATAGCCGAGC
CAGAAAAAAGGAGATTGAATTGAAAGAAAGAAAGAAGACTTTTTACTATGACCCGATTTT
TACTTTCCTATTTTAACTACTACTTTAGTTAAGAGGAGTCATAGAAAGAACAGGTTCAAA
ATCACGATCAATTCCTTTTTCAAATCCTGCTGCCGCTGCCCGAGCTCTTCCCGCGTGCCA
TAAATGACCCACGAATAGGAAGAATCCTAGAACAAAATGAGAGGTAGATAACCAACTTCT
CGGAGAGACGTAATTGACTGCATTGATCTCAGTAGCTACGCCCCCTACAGAATTTAAGGA
ACCTAAAGGAGCATGAGTCATATATTCTGCAGAACGTCGTTCTTGCCAAGGTTGTATGTC
TTTTTTCAACCTACTTAAG

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2FG70TF 127 0 0
GAGAGACGTAATTGACTGCATTGATCTCAGTAGCTACGCCCCCTACAGAATTTAAGGAAC
CTAAAGGAGCATGAGTCATATATTCTGCAGAACGTCGTTCTTGCCAAGGTTGTATGTCTT
TTTTCAA

QA 1 127 1 127
DS 

RD RR2GJ28JQB 731 0 0
CCCGAGCTCTTCCCGCGTGCCATAAATGACCCACGAATAGGAAGAATCCTAGAACAAAAT
GAGAGGTAGATAACCAACTTCTCGGAGAGACGTAATTGACTGCATTGATCTCAGTAGCTA
CCCCCCCTACAGAATTTAAGGAACCTAAAGGAGCATGAGTCATATATTCTGCAGAACGTC
GTTCTTGCCAAGGTTGTATGTCTTTTTTCAACCTACTTAAGTCCAAACCATTAGGACCCC
TTAAAGGTTCTAACCAGGGAGCACGCAAATCCCAAAAACGTATTGTTTCTCCTCCAAAAA
TAACTTCTCCAGTCGGGGAACGCATTAAGTATTTACCTAAACCTGTAGGTCCTTGAGCAG
ACCCCACGTTAGCTCCAAGACGTTGGTCTCTAACTAGAAAAGTAAATGCTTGAGCTTGAG
AAGCTTCTGGCCCTGTAGGTCCGTAAAACTCACTAGGGTAAGCGGTATTATTAAACCAGA
CAAAACAACAAGCAATGAAACCACAAACAGATAAAGCAGCTAAACTATAAGACAAGTAAG
CCTCCCCAGACCATACAAGTGCGCGGCGAGCCCATGCAAAAGGTTTGGTTAAGATATGCC
AGATTCCACCAAATATACAAATGGAACCTAACCATACATGCCCTCCAATTATATCTTCCA
AATCGTCCACACTAACAATCCATCCTTCTCCCCCAAAGGGAGATTTTAGTAAATAACCAA
ATATAACACTT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 2 7

CO CL885Contig1 846 3 2 U
GGGTGAAGAGAGTTAGAGAGAAAAAAAGACATGGAAGCCATGAAGGAGACTGTGGATCAG
AGTTTGAGAGAGATGAGAGAGACGTTTGCGAGCGGGAGGACGAGGAGTGTCAAGTGGAGG
AAGACACAGCTGGAAGCTATAATCGAGATGGTTAAAGACAACGAAGACAAGATGTGCGAT
GTTCTGTTTCAAGATCTGGGCAAACACAATACTGAAGCTTTCAGAGATGAGCTTGGTTTT
GTCATGAGATCAGCTACTACTGCTTTAAACAGTCTTGATAAATGGGTTGTTCCCAGAAAG
AGCAACCTTCCTCTGTTGTTCTACCCAGCAACAGGGAAAGTGATCTCAGAACCGTATGGG
ACGGTTCTTGTTCTGTCTAGCTGGAACTTTCCTATTTCTTTGTCTTTGGACCCAATGATT
GGGGCAATATCAGCAGGAAATACCGTGCTACTCAAGGCATCTGAACTGAGCCCTAACGCA
TCTGCCTTCCTCGCCAAGACGATCCCGTCTTATCTAGACACTAAAGCCATCAAAGTTATC
GAAGGAGGACCTGATGTCGCGACTATCCTCTTGCAGCATCAATGGGATAAGATCTTCTTC
ACTGGGAGTCCAAGAATCGGAAAGATTATAATGGCTGCAGCTGCAGAGCATTTGACTCCT
GTGACATTGGAGCTTGGTGGAAAATGTCCCACCATTATTGATCACCACTCTGTTTCAAAG
GACATGAAGTCGATTGTGAAGAGGATCTCGGGAGGAAAATGGGGATCTTGCAGTGGACAA
GCTTGTATCTCCGTTGATTACGTTCTTGTTGAACAGAGTTTTGCGTCTTCTCTGATTGAA
ATGTTG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ65TF U 1
AF RR2AL85TF U 1
AF RR2BB79TF U 3
BS 1 825 RR2AL85TF
BS 826 846 RR2BB79TF

RD RR2CJ65TF 756 0 0
GGGT
GAAGAGAGTTAGAGAGAAAAAAAGACATGGAAGCCATGAAGGAGACTGTGGATCAGAGTT
TGAGAGAGATGAGAGAGACGTTTGCGAGCGGGAGGACGAGGAGTGTCAAGTGGAGGAAGA
CACAGCTGGAAGCTATAATCGAGATGGTTAAAGACAACGAAGACAAGATGTGCGATGTTC
TGTTTCAAGATCTGGGCAAACACAATACTGAAGCTTTCAGAGATGAGCTTGGTTTTGTCA
TGAGATCAGCTACTACTGCTTTAAACAGTCTTGATAAATGGGTTGTTCCCAGAAAGAGCA
ACCTTCCTCTGTTGTTCTACCCAGCAACAGGGAAAGTGATCTCAGAACCGTATGGGACGG
TTCTTGTTCTGTCTAGCTGGAACTTTCCTATTTCTTTGTCTTTGGACCCAATGATTGGGG
CAATATCAGCAGGAAATACCGTGCTACTCAAGGCATCTGAACTGAGCCCTAACGCATCTG
CCTTCCTCGCCAAGACGATCCCGTCTTATCTAGACACTAAAGCCATCAAAGTTATCGAAG
GAGGACCTGATGTCGCGACTATCCTCTTGCAGCATCAATGGGATAAGGTCTTCTTCACTG
GGAGTCCAAGAATCGGAAAGATTATAATGGCTGCAGCTGCAGAGCATTTGACTCCTGTGA
CATTGGAGCTTGGTGGAAA*TGTCCCACCATTATTGATCACCACTCTGTTTCAAAG*ACA
TGAAGTCGATTGTGA*GAGGATCTCGG
AGAAA

QA 5 751 5 751
DS 

RD RR2AL85TF 825 0 0
GGGTGAAGAGAGTTAGAGAGAAAAAAAGACATGGAAGCCATGAAGGAGACTGTGGATCAG
AGTTTGAGAGAGATGAGAGAGACGTTTGCGAGCGGGAGGACGAGGAGTGTCAAGTGGAGG
AAGACACAGCTGGAAGCTATAATCGAGATGGTTAAAGACAACGAAGACAAGATGTGCGAT
GTTCTGTTTCAAGATCTGGGCAAACACAATACTGAAGCTTTCAGAGATGAGCTTGGTTTT
GTCATGAGATCAGCTACTACTGCTTTAAACAGTCTTGATAAATGGGTTGTTCCCAGAAAG
AGCAACCTTCCTCTGTTGTTCTACCCAGCAACAGGGAAAGTGATCTCAGAACCGTATGGG
ACGGTTCTTGTTCTGTCTAGCTGGAACTTTCCTATTTCTTTGTCTTTGGACCCAATGATT
GGGGCAATATCAGCAGGAAATACCGTGCTACTCAAGGCATCTGAACTGAGCCCTAACGCA
TCTGCCTTCCTCGCCAAGACGATCCCGTCTTATCTAGACACTAAAGCCATCAAAGTTATC
GAAGGAGGACCTGATGTCGCGACTATCCTCTTGCAGCATCAATGGGATAAGATCTTCTTC
ACTGGGAGTCCAAGAATCGGAAAGATTATAATGGCTGCAGCTGCAGAGCATTTGACTCCT
GTGACATTGGAGCTTGGTGGAAAATGTCCCACCATTATTGATCACCACTCTGTTTCAAAG
GACATGAAGTCGATTGTGAAGAGGATCTCGGGAGGAAAATGGGGATCTTGCAGTGGACAA
GCTTGTATCTCCGTTGATTACGTTCTTGTTGAACAGAGTTTTGCG

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR2BB79TF 844 0 0
GG
GAAGAGAGTTAGAGAGAAAAAAAGACATGGAAGCCATGAAGGAGACTGTGGATCAGAGTT
TGAGAGAGATGAGAGAGACGTTTGCGAGCGGGAGGACGAGGAGTGTCAAGTGGAGGAAGA
CACAGCTGGAAGCTATAATCGAGATGGTTAAAGACAACGAAGACAAGATGTGCGATGTTC
TGTTTCAAGATCTGGGCAAACACAATACTGAAGCTTTCAGAGATGAGCTTGGTTTTGTCA
TGAGATCAGCTACTACTGCTTTAAACAGTCTTGATAAATGGGTTGTTCCCAGAAAGAGCA
ACCTTCCTCTGTTGTTCTACCCAGCAACAGGGAAAGTGATCTCAGAACCGTATGGGACGG
TTCTTGTTCTGTCTAGCTGGAACTTTCCTATTTCTTTGTCTTTGGACCCAATGATTGGGG
CAATATCAGCAGGAAATACCGTGCTACTCAAGGCATCTGAACTGAGCCCTAACGCATCTG
CCTTCCTCGCCAAGACGATCCCGTCTTATCTAGACACTAAAGCCATCAAAGTTATCGAAG
GAGGACCTGATGTCGCGACTATCCTCTTGCAGCATCAATGGGATAAGATCTTCTTCACTG
GGAGTCCAAGAATCGGAAAGATTATAATGGCTGCAGCTGCAGAGCATTTGACTCCTGTGA
CATTGGAGCTTGGTGGAAAATGTCCCACCATTATTGATCACCACTCTGTTTCAAAGGACA
TGAAGTCGATTGTGAAGAGGATCTCGGGAGGAAAATGGGGATCTTGCAGTGGACAAGCTT
GTATCTCCGTTGATTACGTTCTTGTTGAACAGAGTTTTGCGTCTTCTCTGATTGAAATGT
TG

QA 3 844 3 844
DS 



CO CL885Contig2 976 4 10 U
ATATGTGAAAGTTGATTATATAGAATATCTCATAGCTTGAATGACATATATTATCAAACT
TATTATGTGAAGATATGAAAATCAAACATAAGAGTGATACAAATCAATCACATAATATAT
ATTGCGTGTGTTTCTCTTCTCGCTCCCTTATTTTATTTCTTAAGACCAAGCATTAAGAGG
ACAAGCTTGAAGTAAGCTTCACGAAATGCGAGTCTAATAAAGGTGAGCTTGAAGGTGTTC
CATGGAGGGTATCGAGCTTCAAGATCCATTGCTAAACTTCCTTCCATTATTGCCTTCTCG
TGACTGAAACATTCAAATGAGTATTTCCCGTGATACCTTCCTGTTCCACTCTCTCCCACT
CCTCCAAAGGGCAACGCATCACACATATACTGGATCATGACGTCGTTGAAGGTAACACTT
CCAGAGGATGTTTCTGACAAGATTCTAGTTTTAAGTTTGTCGTCCCTGGTGAATGCATAG
ATGGCAAGTGGCTTTGGTTTTGACTTGATGAACCCTATGCTTTCTTGGATATCACGTAAT
GTGATGATTGGGAGAATTGGACCAAATATTTCTTCATTCATTATCTCAGAATCAAGAGGA
GGATTCAACAAGATCGTTGGCTCAACATACAGCTTCTCTTCATCCATGGAGCCTCCATAG
ACGATTGAAGCTTGAACACGAGGATCATTAAGAAGACGAGACAATCTCTGAAAATGTTTC
TTGGTGACAATCCTAGCTAGACATCCTGATTCTTTAGGGTTTTCTCCAAAGAAAGACTTT
ATCACCGGCTTCAACATTTCAATCAGAGAAGACGCAAAACTCTGTTCAACAAGAACGTAA
TCAACGGAGATACAAGCTTGTCCACTGCAAGATCCCCATTTTCCTCCCGAGATCCTCTTC
ACAATCGACTTCATGTCCTTTGATCCACAGTCTCCTTCATGGCTTCCATGTCTTTTTTCT
CTCTAACTCTCTTCCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ65JQ U 156
AF RR2AL85JQ U 5
AF RR2BB79JQ U 1
AF RR2BZ02TF C 345
BS 1 14 RR2BB79JQ
BS 15 15 RR2AL85JQ
BS 16 265 RR2BB79JQ
BS 266 266 RR2AL85JQ
BS 267 382 RR2BB79JQ
BS 383 383 RR2AL85JQ
BS 384 618 RR2BB79JQ
BS 619 619 RR2AL85JQ
BS 620 923 RR2BB79JQ
BS 924 976 RR2BZ02TF

RD RR2CJ65JQ 394 0 0
TTTTTTA
AGACCAAGCATTAAGAGGACAAGCTTGAAGTAAGCTTCACGAAATGCGAGTCTAATAAAG
GGGAGCTTGAAGGTGTTCCATGGAGGGTATCGAGCTTCAAGATCCATTGCTAAACTTCCT
TCCATTATTGCCTTCTCGTGACTGAAACATTCAAATGAGTATTTCCCGTGATACCTTCCT
GTTCCACTCTCTCCCACTCCTCCAAAGGGCAACGCATCACACATATACTGGATCATGACG
TCGTTGAAGGTAACACTTCCAGAGGATGTTTCTGACAAGATTCTAGTTTTAAGTTTGTCG
TCCCTGGTGAATGCATAGATGGCAAGTGGCTTTGGTTTTGACTTGATGAACCCTATGCTT
TCTTGGATATCACGTAATGTGATGATT

QA 8 394 8 394
DS 

RD RR2AL85JQ 749 0 0
GTGAAAGTTGATTATATAGAATATCTCATAGCTTGAATGACATATATTATCAAACTTATT
ATGTGAAGATATGAAAATCTAACATAAGAGTGATACAAATCAATCACATAATATATATTG
CGTGTGTTTCTCTTCTCGCTCCCTTATTTTATTTTTTAAGACCAAGCATTAAGAGGACAA
GCTTGAAGTAAGCTTCACGAAATGCGAGTCTAATAAAGGTGAGCTTGAAGGTGTTCCATG
GAGGGTATCGAGCTTCAAGATCCATTGCTAAACTTCCTTCCATTATTGCCTTCTCGTGAC
TGAAACATTCAAATGAGTATTTCCCGTGATACCTTCCTGTTCCACTCTCTCCCACTCCTC
CAAAGGGCAACGCATCACACATATACTGGATCATGACGTCGTTGAAGGTAACACTTCCAG
AGGATGTTTCTGACAAGATTCTAGTTTTAAGTTTGTCGTCCCTGGTGAATGCATAGATGG
CAAGTGGCTTTGGTTTTGACTTGATGAACCCTATGCTTTCTTGGATATCACGTAATGTGA
TGATTGGGAGAATTGGACCAAATATTTCTTCATTCATTATCTCAGAATCAAGAGGAGGAT
TCAACAAGATCGTTGGCTCAACATACAGCTTCTCTTCATCCATGGAGCCTCCATAGACGA
TTGAAGCTTGAACACGAGGATCATTAAGAAGACGAGACAATCTCTGAAAATGTTTCTTGG
TGACAATCCTAGCTAGACATCCTGATTCT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2BB79JQ 942 0 0
ATATGTGAAAGTTGCTTATATAGAATATCTCATAGCTTGAATGACATATATTATCAAACT
TATTATGTGAAGATATGAAAATCAAACATAAGAGTGATACAAATCAATCACATAATATAT
ATTGCGTGTGTTTCTCTTCTCGCTCCCTTATTTTATTTCTTAAGACCAAGCATTAAGAGG
ACAAGCTTGAAGTAAGCTTCACGAAATGCGAGTCTAATAAAGGTGAGCTTGAAGGTGTTC
CATGGAGGGTATCGAGCTTCAAGATACATTGCTAAACTTCCTTCCATTATTGCCTTCTCG
TGACTGAAACATTCAAATGAGTATTTCCCGTGATACCTTCCTGTTCCACTCTCTCCCACT
CCTCCAAAGGGCAACGCATCACGCATATACTGGATCATGACGTCGTTGAAGGTAACACTT
CCAGAGGATGTTTCTGACAAGATTCTAGTTTTAAGTTTGTCGTCCCTGGTGAATGCATAG
ATGGCAAGTGGCTTTGGTTTTGACTTGATGAACCCTATGCTTTCTTGGATATCACGTAAT
GTGATGATTGGGAGAATTGGACCAAATATTTCTTCATTCATTATCTCAGAATCAAGAGGA
GGATTCAACAAGATCGTTAGCTCAACATACAGCTTCTCTTCATCCATGGAGCCTCCATAG
ACGATTGAAGCTTGAACACGAGGATCATTAAGAAGACGAGACAATCTCTGAAAATGTTTC
TTGGTGACAATCCTAGCTAGACATCCTGATTCTTTAGGGTTTTCTCCAAAGAAAGACTTT
ATCACCGGCTTCAACATTTCAATCAGAGAAGACGCAAAACTCTGTTCAACAAGAACGTAA
TCAACGGAGATACAAGCTTGTCCACTGCAAGATCCCCATTTTCCTCCCGAGATCCTCTTC
ACAATCGACTTCATGTCCTTTGA
AACAGAGTGGTGATCAATA

QA 1 923 1 923
DS 

RD RR2BZ02TF 632 0 0
TCCACTCTCTCCCACTCCTCCAAAGGGCAACGCATCACACATATACTGGATCATGACGTC
GTTGAAGGTAACACTTCCAGAGGATGTTTCTGACAAGATTCTAGTTTTAAGTTTGTCGTC
CCTGGTGAATGCATAGATGGCAAGTGGCTTTGGTTTTGACTTGATGAACCCTATGCTTTC
TTGGATATCACGTAATGTGATGATTGGGAGAATTGGACCAAATATTTCTTCATTCATTAT
CTCAGAATCAAGAGGAGGATTCAACAAGATCGTTGACTCAACATACAGCTTCTCTTCATC
CATGGAGCCTCCATAGACGATTGAAGCTTGAACACGAGGATCATTAAGAAGACGAGACAA
TCTCTGAAAATGTTTCTTGGTGACAATCCTAGCTAGACATCCTGATTCTTTAGGGTTTTC
TCCAAAGAAAGACTTTATCACCGGCTTCAACATTTCAATCAGAGAAGACGCAAAACTCTG
TTCAACAAGAACGTAATCAACGGAGATACAAGCTTGTCCACTGCAAGATCCCCATTTTCC
TCCCGAGATCCTCTTCACAATCGACTTCATGTCCTTTGATCCACAGTCTCCTTCATGGCT
TCCATGTCTTTTTTCTCTCTAACTCTCTTCCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 7

CO CL886Contig1 1307 7 8 U
TATTAATGAAATGAAACAAAGGGATCCCACCACAGTTGTGGACAACGAGAAAGTAGTGGT
GATGATGCTAATAAGTGACAACTACTCAAAAGTTGAGTTTCATAAAATCAGAAATTGGAA
AAAGTAAATGATGATTTGAGCTAAAATAACCAAAACTGCTGTGGCTTTTTAGTTTGCTCA
AGCTTTGCCATTGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGGGTTAAGCTCATCCCAAGCTTCAATCCA
TGTGACCATGGCGTCTGCAAGCTTGTCAAAGTATGGGTCTAAGGGGCTCAGCTTCTCCTT
CACCATCTTTGAGAGTTCAATGTAACATTGTTGAACAGTTGTTGCTTCTTTAGATAGCTT
TACGTTCTGGAAGAAGGGAATGATATCC*TCCTGCCAGAAGATTCCCTCGTATTCCTTTT
TTCAGGTTCACAAATGGGTTTGCTCGCTTTGCTGTGGTAAATGTATGGCAAACCCGTCTT
CACTCCCCAAGCCCAAGTGGTCACAGATTCACCTTGATGCACCAACCAGCCCACATATCG
TCGTAGCGACCAATAGGCTGACCATCACCCATGAGACCAAAGTACATAGCTGGTCCAATC
AAATCACGGTCGAAAGCTAAGTTCATACCACACATTGGAAAAAGCGTTCCTCTCCTTAGG
CTTGACGAGTTGGGTCGGGGCATCATAATCAGGGATGTTGAGCCAGAGACCATGGGAAAC
AGCAGTGGAGACACCTTCACGTAGACTGAAAGGGTATCCACGGACGAAATCAGCTCCTTC
ACGGTAAGGATCATACAAGGTGTTGAAGAACAATGGAGTCGATGGGCAGAGAAGATTCTT
GATGTGTTGCTCAAGAGCGTTCACTGCTTTCCCTGATGGATCCTTGGCAACGAAGCAATC
GTCATCAATGGTGAAGATATACTTCTTCTTAGACACCATGTAACCAAAGCACCGACAAGC
AGAGTCCTTGAACGAAATGCAAGAAGCTTTCGGACCGAGGATTCTGTTAATGTCGTTCCT
GTTGTAAAGCTCGTAGTCGTAACCTTCAGGGACGTGGATCTTCTTCGTGGGATCTCCGTC
CTGGACGATGATCAGATGGTACGGCTGGAGAAACGGCCTCCACATCTCGAGGAAGTCGAG
GTTTCGGATTGTCGGAATCACGATGTCGAGCTCGTCTTTCAACAGCGGCGTCGGGTTCAC
CGGGATTCCCACGGTATTCGCTGGGTCAACCATGATTCAAAGGGAGGAGGCAGAGATGAG
ATATCGCGTCGGTGGATATTTTTTGCTCTCTGGTGAGTTTTCGATCC


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D229JQ U 1
AF RR2GG39JQB U 1
AF RR2GW72JQ U 1
AF RR2GG39TF C 1
AF RR2GW72TF C 1
AF RR2AK92JQ U 298
AF RR2AK92TF C 444
BS 1 49 RR2D229JQ
BS 50 50 RR2GG39JQB
BS 51 55 RR2D229JQ
BS 56 56 RR2GG39JQB
BS 57 397 RR2D229JQ
BS 398 409 RR2GG39JQB
BS 410 688 RR2AK92JQ
BS 689 1307 RR2AK92TF

RD RR2D229JQ 400 0 0
TATTAATGAAATGAAACAAAGGGATCCCACCACAGTTGTGGACAACGAGGAAGTAATGGT
GATGATGCTAATAAGTGACAACTACTCAAAAGTTGAGTTTCATAAAATCAGAAATTGGAA
AAAGTAAATGATGATTTGAGCTAAAATAACCAAAACTGCTGTGGCTTTTTAGTTTGCTCA
AGCTTTGCCATTGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGGGTTAAGCTCATCCCAAGCTTCAATCCA
TGTGACCATGGCGTCTGCAAGCTTGTCAAAGTATGGGTCTAAGGGGCTCAGCTTCTCCTT
CACCATCTTTGAGAGTTCAATGTAACATTGTTGAACAGTTGTTGCTTCTTTAGATAGCTT
TACGTTCTGGAAGAAGGGAATGATATCC*TCCTGCCA
AAA

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR2GG39JQB 409 0 0
TATTAATGAAATGAAACAAAGGGATCCCACCACAGTTGTGGACAACGAGAAAGTAGTGGT
GATGATGCTAATAAGTGACAACTACTCAAAAGTTGAGTTTCATAAAATCAGAAATTGGAA
AAAGTAAATGATGATTTGAGCTAAAATAACCAAAACTGCTGTGGCTTTTTAGTTTGCTCA
AGCTTTGCCATTGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGGGTTAAGCTCATCCCAAGCTTCAATCCA
TGTGACCATGGCGTCTGCAAGCTTGTCAAAGTATGGGTCTAAGGGGCTCAGCTTCTCCTT
CACCATCTTTGAGAGTTCAATGTAACATTGTTGAACAGTTGTTGCTTCTTTAGATAGCTT
TACGTTCTGGAAGAAGGGAATGATATCC*TCCTGCCAGAAGATTCCCTC

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR2GW72JQ 409 0 0
TATTAATGAAATGAAACAAAGGGATCCCACCACAGTTGTGGACAACGAGAAAGTAGTGGT
GATGATGCTAATAAGTGACAACTACTCAAAAGTTGAGTTTCATAAAATCAGAAATTGGAA
AAAGTAAATGATGATTTGAGCTAAAATAACCAAAACTGCTGTGGCTTTTTAGTTTGCTCA
AGCTTTGCCATTGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGGGTTAAGCTCATCCCAAGCTTCAATCCA
TGTGACCATGGCGTCTGCAAGCTTGTCAAAGTATGGGTCTAAGGGGCTCAGCTTCTCCTT
CACCATCTTTGAAAGTTCAATGTAACATTGTTGAACAGTTGTTGCTTCTTTAGATAGCTT
TACGTTCTGGAAGAAGGGAATGATATCC*TCCTGCCAGAAGATTCCCTC

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR2GG39TF 409 0 0
TATTAATGAAATGAAACAAAGGGATCCCACCACAGTTGTGGACAACGAGAAAGTAGTGGT
GATGATGCTAATAAGTGACAACTACTCAAAAGTTGAGTTTCATAAAATCAGAAATTGGAA
AAAGTAAATGATGATTTGAGCTAAAATAACCAAAACTGCTGTGGCTTTTTAGTTTGCTCA
AGCTTTGCCATTGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGGGTTAAGCTCATCCCAAGCTTCAATCCA
TGTGACCATGGCGTCTGCAAGCTTGTCAAAGTATGGGTCTAAGGGGCTCAGCTTCTCCTT
CACCATCTTTGAGAGTTCAATGTAACATTGTTGAACAGTTGTTGCTTCTTTAGATAGCTT
TACGTTCTGGAAGAAGGGAATGATATCC*TCCTGCCAGAAGATTCCCTC

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR2GW72TF 409 0 0
TATTAATGAAATGAAACAAAGGGATCCCACCACAGTTGTGGACAACGAGAAAGTAGTGGT
GATGATGCTAATAAGTGACAACTACTCAAAAGTTGAGTTTCATAAAATCAGAAATTGGAA
AAAGTAAATGATGATTTGAGCTAAAATAACCAAAACTGCTGTGGCTTTTTAGTTTGCTCA
AGCTTTGCCATTGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGGGTTAAGCTCATCCCAAGCTTCAATCCA
TGTGACCATGGCGTCTGCAAGCTTGTCAAAGTATGGGTCTAAGGGGCTCAGCTTCTCCTT
CACCATCTTTGAGAGTTCAATGTAACATTGTTGAACAGTTGTTGCTTCTTTAGATAGCTT
TACGTTCTGGAAGAAGGGAATGATATCC*TCCTGCCAGAAGATTCCCTC

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR2AK92JQ 391 0 0
CTTCACCATCTTTGAGAGTTCAATGTAACATTGTTGAACAGTTGTTGCTTCTTTAGATAG
CTTTACGTTCTGGAAGAAGGGAATGATATCCCTCCTGCCAGAAGATTCCCTTGTATTCCT
TTTTTCAGGTTCACAAATGGGTTTGCTCGCTTTGCTGTGGTAAATGTATGGCAAACCCGT
CTTCACTCCCCAAGCCCAAGTGGTCACAGATTCACCTTGATGCACCAACCAGCCCACATA
TCGTCGTAGCGACCAATAGGCTGACCATCACCCATGAGACCAAAGTACATAGCTGGTCCA
ATCAAATCACGGTCGAAAGCTAAGTTCATACCACACATTGGAAAAAGCGTTCCTCTCCTT
AGGCTTGACGAGTTGGGTCGGGGCATCATAA

QA 1 391 1 391
DS 

RD RR2AK92TF 864 0 0
TCGCTTTGCTGTG*TAAATGTATGGCAAACC*GTCTTCACTCCC*AAGCCCAAGTGGTCA
CAGAT*CACCTTGATGCACCAACCAGCCCACATATCGTCGTAGCGACCAATAGGCTGACC
ATCACCCATGAGACCAAAGTACATAGCTGGTCCAATCAAATCACGGTCGAAAGCTAAGTT
CATACCACACATTGGAAAAAGCGTTCCTCTCTTTAGGCTTGACGAGTTGGGTCGGGGCAT
CATAATCAGGGATGTTGAGCCAGAGACCATGGGAAACAGCAGTGGAGACACCTTCACGTA
GACTGAAAGGGTATCCACGGACGAAATCAGCTCCTTCACGGTAAGGATCATACAAGGTGT
TGAAGAACAATGGAGTCGATGGGCAGAGAAGATTCTTGATGTGTTGCTCAAGAGCGTTCA
CTGCTTTCCCTGATGGATCCTTGGCAACGAAGCAATCGTCATCAATGGTGAAGATATACT
TCTTCTTAGACACCATGTAACCAAAGCACCGACAAGCAGAGTCCTTGAACGAAATGCAAG
AAGCTTTCGGACCGAGGATTCTGTTAATGTCGTTCCTGTTGTAAAGCTCGTAGTCGTAAC
CTTCAGGGACGTGGATCTTCTTCGTGGGATCTCCGTCCTGGACGATGATCAGATGGTACG
GCTGGAGAAACGGCCTCCACATCTCGAGGAAGTCGAGGTTTCGGATTGTCGGAATCACGA
TGTCGAGCTCGTCTTTCAACAGCGGCGTCGGGTTCACCGGGATTCCCACGGTATTCGCTG
GGTCAACCATGATTCAAAGGGAGGAGGCAGAGATGAGATATCGCGTCGGTGGATATTTTT
TGCTCTCTGGTGAGTTTTCGATCC

QA 1 864 1 864
DS 



AS 2 6

CO CL887Contig1 461 2 2 U
GGAGAACCCAAAAATGCCTAAGCAAATCCACGAGATCAAGGACTTCCTTCTGACGGCGAG
GAGGAAGGATGCTAGGTCTGTGAAGATCAAGAGAAGCAAGGACATTGTCAAGTTCAAGGT
CAGGTGCTCTAGGTACCTCTACACGCTATGCGTCTTCGACCAAGAGAAGGCTGATAAGCT
TAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCAAGACCTTTGAAGATCTTCTTGAAGTCT
AGGGATTATGTCAATGCGACCTGCTGCTTTGAATACCTTTCGCTTTGATAATTTTGATTT
TTGTTGCCTTTTGAATTACTATTGTTCAGACTCTTTCCCATTTCTATTTCAAGACCTTGA
GTTTTATTTTGTTATTTTCTATCAACGTGGTTAGTAACATGTATTATTCAAAAGATTTTG
GCAAGAGTATGAGAGGATTTTGAGTAGAATATAAATTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G544JQ C 1
AF RR2G544TF U 1
BS 1 12 RR2G544JQ
BS 13 461 RR2G544TF

RD RR2G544JQ 461 0 0
GGAGAACCCAAAAATGCCTAAGCAAATCCACGAGATCAAGGACTTCCTTCTGACGGCGAG
GAGGAAGGATGCTAGGTCTGTGAAGATCAAGAGAAGCAAGGACATTGTCAAGTTCAAGGT
CAGGTGCTTTAGGTACCTTTACACGCTATGCGTTTTCGACCAAGAGAAGGCTGATAAGCT
TAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCAAGACCTTTGAAGATTTTCTTGAAGTTT
AGGGATTATGTCAATGCGACCTGCTGCTTTGAATACCTTTCGCTTTGATAATTTTGATTT
TTGTTGCCTTTTGAATTACTATTGTTCAGACTCTTTCCCATTTTTATTTCAAGACCTTGA
GTTTTATTTTGTTATTTTCTATCAACGTGGTTAGTAACATGTATTATTCAAAAGATTTTG
GCAAGAGTATGAGAGGATTTTGAGTAGAATATAAATTTGTT

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR2G544TF 461 0 0
GGAGAACCCAAA
AATGCCTAAGCAAATCCACGAGATCAAGGACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGC
TAGGTCTGTGAAGATCAAGAGAAGCAAGGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCTAG
GTACCTCTACACGCTATGCGTCTTCGACCAAGAGAAGGCTGATAAGCTTAAGCAGTCACT
TCCTCCAGGTTTGAGTGTTCAAGACCTTTGAAGATCTTCTTGAAGTCTAGGGATTATGTC
AATGCGACCTGCTGCTTTGAATACCTTTCGCTTTGATAATTTTGATTTTTGTTGCCTTTT
GAATTACTATTGTTCAGACTCTTTCCCATTTCTATTTCAAGACCTTGAGTTTTATTTTGT
TATTTTCTATCAACGTGGTTAGTAACATGTATTATTCAAAAGATTTTGGCAAGAGTATGA
GAGGATTTTGAGTAGAATATAAATTTGTT

QA 13 461 13 461
DS 



CO CL887Contig2 761 4 2 U
GAGGTTTAGTATGCATTAGAAATAAAGAAAAATCATGTGAATGCTTTGTTCTAAATAAAA
CATGTTACTAACCAACATGGATAGCATACAGCAAAACACAGATCCAAGTCTTGAAAACAA
AAGAGAAAAGAGTCTGAATAACAGTAACTCAAAAACTACAATCTCCGGTTCAACGCAGGT
CGGATATCTCGGACTCGACGAGAAGTTCAAAGGTCTTGAACACTCAAACCTGGAGGAAGT
GACTGCTTGAGCTTATCAGCCTTCTCTTGGTCGAAAACGCAAAGTGTGTAGAGGTACTTG
GAGCACCTGACCTTGAACTTGACAATGTCCTTGCTTCTCTTGATCTTTACAGACCTAGCA
TCCTTCCTCCTCGCCGTCAGAAGGAAGTCCTTGATCTCGTGTATTTGCTTCGGCATTGTC
GCTTCGAGTTTGGAGAAGACAGCGTCCCAAGTCAATTGAATCCAAAACCCATCAATTTCA
TTTTTGTTGCATATGCATAATTGTAGAAGAGATTTTTTTGTAATGATAATGTGACCCCCC
CTTTTTTGCTTTTTATTTCATTTTATTTTAAGGAATTAATTTCCAGTAACAAGAAAAGGA
AGAATAGTTTTGGATCAATTCAAAAGAACAACAAATAATAAAAAAATAATAATACTAAAT
CTTTGGAATGCGTGCATTGTTTTGTTGTATTCAATTCAAAGGTTTTTTCTTTCTTTAACT
AACTACAAAGATGATGGGTTTTTCACTCTATTTTCTATATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H023JQ U 1
AF RR2H023TF C 1
AF RR2DK94JQ U 22
AF RR2DK94TF C 316
BS 1 446 RR2H023JQ
BS 447 761 RR2DK94JQ

RD RR2H023JQ 450 0 0
GAGGTTTAGTATGCATTAGAAATAAAGAAAAATCATGTGAATGCTTTGTTCTAAATAAAA
CATGTTACTAACCAACATGGATAGCATACAGCAAAACACAGATCCAAGTCTTGAAAACAA
AAGAGAAAAGAGTCTGAATAACAGTAACTCAAAAACTACAATCTCCGGTTCAACGCAGGT
CGGATATCTCGGACTCGACGAGAAGTTCAAAGGTCTTGAACACTCAAACCTGGAGGAAGT
GACTGCTTGAGCTTATCAGCCTTCTCTTGGTCGAAAACGCAAAGTGTGTAGAGGTACTTG
GAGCACCTGACCTTGAACTTGACAATGTCCTTGCTTCTCTTGATCTTTACAGACCTAGCA
TCCTTCCTCCTCGCCGTCAGAAGGAAGTCCTTGATCTCGTGTATTTGCTTCGGCATTGTC
GCTTCGAGTTTGGAGAAGACAGCGTC
GGCC

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR2H023TF 450 0 0
GAGGTTTAGTATGCATTAGAAATAAAGAAAAATCATGTGAATGCTTTGTTCTAAATAAAA
CATGTTACTAACCAACATGGATAGCATACAGCAAAACACAGATCCAAGTCTTGAAAACAA
AAGAGAAAAGAGTCTGAATAACAGTAACTCAAAAACTACAATCTCCGGTTCAACGCAGGT
CGGATATCTCGGACTCGACGAGAAGTTCAAAGGTCTTGAACACTCAAACCTGGAGGAAGT
GACTGCTTGAGCTTATCAGCCTTCTCTTGGTCGAAAACGCAAAGTGTGTAGAGGTACTTG
GAGCACCTGACCTTGAACTTGACAATGTCCTTGCTTCTCTTGATCTTTACAGACCTAGCA
TCCTTCCTCCTCGCCGTCAGAAGGAAGTCCTTGATCTCGTGTATTTGCTTCGGCATTGTC
GCTTCGAGTTTGGAGAAGACAGCGTC
GGCC

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR2DK94JQ 740 0 0
G
TAAAGAAAAATCATGTGAATGCTTTGTTCTAAATAAAACATGTTACTAACCAACATGGAT
AGCATACAGCAAAACACAAATCCAAGTCTTGAAAACAAAAGAGAAAAGAGTCTGAATAAC
AGTAACTCAAAAACTACAATCTCCGGTTCAACGCAGGTCGGATATCTCGGACTCGACGAG
AAGTTCAAAGGTCTTGAACACTCAAACCTGGAGGAAGTGACTGCTTGAGCTTATCAGCCT
TCTCTTGGTCGAAAACGCAAAGTGTGTAGAGGTACTTGGAGCACCTGACCTTGAACTTGA
CAATGTCCTTGCTTCTCTTGATCTTTACAGACCTAGCATCCTTCCTCCTCGCCGTCAGAA
GGAAGTCCTTGATCTCGTGTATTTGCTTCGGCATTGTCGCTTCGAGTTTGGAGAAGACAG
CGTCCCAAGTCAATTGAATCCAAAACCCATCAATTTCATTTTTGTTGCATATGCATAATT
GTAGAAGAGATTTTTTTGTAATGATAATGTGACCCCCCCTTTTTTGCTTTTTATTTCATT
TTATTTTAAGGAATTAATTTCCAGTAACAAGAAAAGGAAGAATAGTTTTGGATCAATTCA
AAAGAACAACAAATAATAAAAAAATAATAATACTAAATCTTTGGAATGCGTGCATTGTTT
TGTTGTATTCAATTCAAAGGTTTTTTCTTTCTTTAACTAACTACAAAGATGATGGGTTTT
TCACTCTATTTTCTATATC

QA 2 740 2 740
DS 

RD RR2DK94TF 446 0 0
AACTTGACAATGTCCTTGCTTCTCTTGATCTTTACAGACCTAGCATCCTTCCTCCTCGCC
GTCAGAAGGAAGTCCTTGATCTCGTGTATTTGCTTCGGCATTGTCGCTTCGAGTTTGGAG
AAGACAGCGTCCCAAGTCAATTGAATCCAAAACCCATCAATTTCATTTTTGTTGCATATG
CATAATTGTAGAAGAGATTTTTTTGTAATGATAATGTGACCCCCCCTTTTTTGCTTTTTA
TTTCATTTTATTTTAAGGAATTAATTTCCAGTAACAAGAAAAGGAAGAATAGTTTTGGAT
CAATTCAAAAGAACAACAAATAATAAAAAAATAATAATACTAAATCTTTGGAATGCGTGC
ATTGTTTTGTTGTATTCAATTCAAAGGTTTTTTCTTTCTTTAACTAACTACAAAGATGAT
GGGTTTTTCACTCTATTTTCTATATC

QA 1 446 1 446
DS 



AS 2 8

CO CL888Contig1 815 6 20 U
GGACAAAGTATAATCGACTTCTTCAACTAAAAAAAATAATAAAAACAAGAATTAGAAGTT
TGCTACAGAAAGAGCAGAAGAAGAAAGAAGAGAAGGAGACTCAAACCCAAAAAACACTTA
TTATTGGCTTTTTCCTTTTTTCATAGGAAAGCTTTTACCTAAGACCTTATATCTAAAACA
TAATTCCTGACCTTAAATTATTAAATAAGGCCAAGCTTTGATAGTAGTGAAACCCATCCA
CAATTTACTCTTTTCCATCAGCAGCACGGAGTGAGCCTAGCTGAACCGGTGCTTGAGTCC
CAACCACCTTTGATGAACCGTAAAGCGTCACATCACTGCCTTTAGCCTTCTCTTTCTCAA
TCTGTTCCTTTATCCAGAAGTAGGTTATTCTAAGCCCCTCCTTCAATCTCATTGTTGGAG
CCCAACCAAGCTTCTCTTTGATCAGATTGTTGTCCGAGTTACGGCCACGAACACCTTCAG
GGCCTGGAATGTGGTGAATTGGAAGCTTCTTTTCCTCAAAGCTGAGAACCATCTCAGCCA
TCTCATTCATGCTCACCATCTCATCGCTTCCAATGTTCACCGGCTCACGGAAATCTGATT
TTGTCAACCTGAGTACACCTTCAACACACTCATCAATGAAGGTAAATGAACGGGTCTGAA
GCCCGTCTCCCCACATCTCAAACCCATCTGTGGAGGTCAGAGCCTTCCTGCAGAAAGCAG
CTGGAGCCTTCTCTCTTCCACCTTTCCATGTTCCAAAGGGACCGTAAATGTTGTGGAACC
TTCCAATGCGGCACTCAATGCCAAAATCTTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2BT52JQ U 94
AF RR2CC08JQ U 40
AF RR2B063JQ U 1
AF RR2B627TF C 62
AF RR2B627JQ U 63
AF RR2CC08TF C 137
BS 1 105 RR2B063JQ
BS 106 106 RR2B627JQ
BS 107 162 RR2B063JQ
BS 163 163 RR2CC08JQ
BS 164 295 RR2B063JQ
BS 296 296 RR2BT52JQ
BS 297 454 RR2B063JQ
BS 455 455 RR2CC08JQ
BS 456 474 RR2B063JQ
BS 475 475 RR2CC08JQ
BS 476 646 RR2B063JQ
BS 647 647 RR2B627JQ
BS 648 655 RR2B063JQ
BS 656 656 RR2B627JQ
BS 657 684 RR2B063JQ
BS 685 685 RR2B627JQ
BS 686 688 RR2B063JQ
BS 689 689 RR2B627JQ
BS 690 754 RR2B063JQ
BS 755 815 RR2B627JQ

RD RR2BT52JQ 357 0 0
AGGAGACTCAAATCCAAAAAACACTTATTATTGGCTTTTTCCTTTTTTCATAGGAAAGCT
TTTACCTAAAACCTTATATCTAAAACATAATTCCTGACCTTAAATTATTAAATAAGGGCA
AGCTTTGATAGTAGTGAAACCCATCCACAATTTACTCTTTTCCATCAGCAGCACGGAGTG
AGCCTAGCTGAACCGGTGCTTGAGTCCCAACCACCTTTGATGAACCGTAAAGCGTCACAT
CACTGCCTTTAGCCTTCTCTTTCTCAATCTGTTCCTTTATCCAGAAGTAGGTTATTCTAA
GCCCCTCCTTCAATCTCATTGTTGGAGCCCAACCAAGCTTCTCTTTGATCAAATTGT

QA 1 357 1 357
DS 

RD RR2CC08JQ 443 0 0
TAAAAACAAGAATTAGAAGTTTGCTACAGAAAGAGCAGAAGAAGAAAGAAGAGAAGGAGA
CTCAAATCCAAAAAACACTTATTATTGGCTTTTTCCTTTTTTCATAGGAAAGCTTTTACC
TAAGACCTTATATCTAAAACATAATTCCTGACCTTAAATTATTAAATAAGGCCAAGCTTT
GATAGTAGTGAAACCCATCCACAATTTACTCTTTTCCATCAGCAGCACGGAGTGAGCCTA
GCTGAACCGGTGCTTGAGTCCCAACCACCTTTGATGAACCGTAAAGCGTCACATCACTGC
CTTTAGCCTTCTCTTTCTCAATCTGTTCCTTTATCCAGAAGTAGGTTATTCTAAGCCCCT
CCTTCAATCTCATTGTTGGAGCCCAACCAAGCTTCTCTTTGGTCAGATTGTTGTCCGAGT
TACGGCCACGAACACCTTCAGGG

QA 1 443 1 443
DS 

RD RR2B063JQ 754 0 0
GGACAAAGTATAATCGACTTCTTCAACTAAAAAAAATAATAAAAACAAGAATTAGAAGTT
TGCTACAGAAAGAGCAGAAGAAGAAAGAAGAGAAGGAGACTCAAATCCAAAAAACACTTA
TTATTGGCTTTTTCCTTTTTTCATAGGAAAGCTTTTACCTAAAACCTTATATCTAAAACA
TAATTCCTGACCTTAAATTATTAAATAAGGCCAAGCTTTGATAGTAGTGAAACCCATCCA
CAATTTACTCTTTTCCATCAGCAGCACGGAGTGAGCCTAGCTGAACCGGTGCTTGTGTCC
CAACCACCTTTGATGAACCGTAAAGCGTCACATCACTGCCTTTAGCCTTCTCTTTCTCAA
TCTGTTCCTTTATCCAGAAGTAGGTTATTCTAAGCCCCTCCTTCAATCTCATTGTTGGAG
CCCAACCAAGCTTCTCTTTGATCAGATTGTTGTCAGAGTTACGGCCACGAACACATTCAG
GGCCTGGAATGTGGTGAATTGGAAGCTTCTTTTCCTCAAAGCTGAGAACCATCTCAGCCA
TCTCATTCATGCTCACCATCTCATCGCTTCCAATGTTCACCGGCTCACGGAAATCTGATT
TTGTCAACCTGAGTACACCTTCAACACACTCATCAATGAAGGTAAAAGAACGGGTTTGAA
GCCCGTCTCCCCACATCTCAAACCTATCCGTGGAGGTCAGAGCCTTCCTGCAGAAAGCAG
CTGGAGCCTTCTCTCTTCCACCTTTCCATGTTCC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2B627TF 754 0 0
G
CTACAGAAAGAGCAGAAGAAGAAAGAAGAGAAGGAGACTCAAACCCAAAAAACACTTATT
ATTGGCTTTTTCCTTTTTTCATAGGAAAGCTTTTACCTAAGACCTTATATCTAAAACATA
ATTCCTGACCTTAAATTATTAAATAAGGCCAAGCTTTGATAGTAG*GAAACCCATCCACA
ATTTACTCTTTTCCATCAGCAGCACGGAGTGAGCCTAGCTGAACCGGTGCTTGAGTCCCA
ACCACCTTTGATGAACCGTAAAGCGTCACATCACTGCCTTTAGCCTTCTCTTTCTCAATC
TGTTCCTTTATCCAGAAGTAGGTTATTCTAAGCCCCTCCTTCAATCTCATTGTTGGAGCC
CAACCAAGCTTCTCTTTGATCAGATTGTTGTCCGAGTTACGGCCACGAACACCTTCAGGG
CCTGGAATGTGGTGAATTGGAAGCTTCTTTTCCTCAAAGCTGAGAACCATCTCAGCCATC
TCATTCATGCTCACCATCTCATCGCTTCCAATGTTCACTGGCTCACGGAAATCTGATTTT
GTCAACCTGAGTACACCTTCAACACACTCATCAATGAAGGTAAATGAACGGGTCTGAAGC
CCGTCTCCCCACATCTCAAACCCATCTGTGGAGGTCAGAGCCTTCCTGCAGAAAGCAGCT
GGAGCCTTCTCTCTTCCACCTTTCCATGTTCCAAAGGGACCGTAAATGTTGTGGAACCTT
CCAATGCGGCACTCAATGCCAAAATCTTTGTT
C

QA 2 753 2 753
DS 

RD RR2B627JQ 753 0 0
CTACAGAAAGAGCAGAAGAAGAAAGAAGAGAAGGAGACTCAAACCCAAAAAACACTTATT
ATTGGCTTTTTCCTTTTTTCATAGGAAAGCTTTTACCTAAGACCTTATATCTAAAACATA
ATTCCTGACCTTAAATTATTAAATAAGGCCAAGCTTTGATAGTAG*GAAACCCATCCACA
ATTTACTCTTTTCCATCAGCAGCACGGAGTGAGCCTAGCTGAACCGGTGCTTGAGTCCCA
ACCACCTTTGATGAACCGTAAAGCGTCACATCACTGCCTTTAGCCTTCTCTTTCTCAATC
TGTTCCTTTATCCAGAAGTAGGTTATTCTAAGCCCCTCCTTCAATCTCATTGTTGGAGCC
CAACCAAGCTTCTCTTTGATCAGATTGTTGTCCGAGTTACGGCCACGAACACCTTCAGGG
CCTGGAATGTGGTGAATTGGAAGCTTCTTTTCCTCAAAGCTGAGAACCATCTCAGCCATC
TCATTCATGCTCACCATCTCATCGCTTCCAATGTTCACTGGCTCACGGAAATCTGATTTT
GTCAACCTGAGTACACCTTCAACACACTCATCAATGAAGGTAAATGAACGGGTCTGAAGC
CCGTCTCCCCACATCTCAAACCCATCTGTGGAGGTCAGAGCCTTCCTGCAGAAAGCAGCT
GGAGCCTTCTCTCTTCCACCTTTCCATGTTCCAAAGGGACCGTAAATGTTGTGGAACCTT
CCAATGCGGCACTCAATGCCAAAATCTTTGTTC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2CC08TF 652 0 0
TTTTTCATAGGAAAGCTTTTACCTAAGACCTTATATCTAAAACATAATTCCTGACCTTAA
ATTATTAAATAAGGCCAAGCTTTGATAGTAGTGAAACCCATCCACAATTTACTCTTTTCC
ATCAGCAGCACGGAGTGAGCCTAGCTGAACCGGTGCTTGAGTCCCAACCACCTTTGATGA
ACCGTAAAGCGTCACATCACTGCCTTTAGCCTTCTCTTTCTCAATCTGTTCCTTTATCCA
GAAGTAGGTTATTCTAAGCCCCTCCTTCAATCTCATTGTTGGAGCCCAACCAAGCTTCTC
TTTGGTCAGATTGTTGTCCGAGTTACGGCCACGAACACCTTCAGGGCCTGGAATGTGGTG
AATTGGAAGCTTCTTTTCCTCAAAGCTGAGAACCATCTCAGCCATCTCATTCATGCTCAC
CATCTCATCGCTTCCAATGTTCACCGGCTCACGGAAATCTGATTTTGTCAACCTGAGTAC
ACCTTCAACACACTCATCAATGAAGGTAAATGAACGGGTCTGAAGCCCGTCTCCCCACAT
CTCAAACCTATCTGTGGAGGTCAGAGCCTTCCTGCAGAAAGCAGCTGGAGCCTTCTCTCT
TCCACCTTTCCATGTTCCAAAGGGACCGTAAATGTTGTGGAACCTTCCAAT
C

QA 1 651 1 651
DS 



CO CL888Contig2 815 2 7 U
GGACCTCTCTCTCTCTCTGCATTATCTCTTCACATTCTCCAAGCTCTCTCTCAGAATGGC
TGCAACCAACAATGGAAGTAGTGACTATGGTGAATACACATACAAGGAGCTTGAAAGAGA
GCTCTACTGGCCTTCAGAGAAGCTGAGAATCTCCATCACCGGCGCTGGTGGGTTCATCGC
TTCCCACATTGCCCGCCGTTTGAAGCACGAGGGGCACTACGTCATTGCTTCTGACTGGAA
GAAGAATGAGCACATGACCGAGGACATGTTCTGTGACGAGTTCCACCTTGTTGACCTCAG
GGTCATGGAGAATTGCCTCAAGGTCACTGATGGCGTTGATCACGTCTTTAACTTAGCTGC
TGATATGGGTGGTATGGGTTTCATCCAGTCCAACCACTCGGTGATTATGTATAACAACAC
CATGATTAGCTTCAACATGATTGAGGCTGCTAGGATCAATGGGATCAAGAGGTTCTTCTA
TGCTTCAAGTGCATGTATCTATCCGGAGTTCAAGCAGCTGGAAACTACCAATGTGAGCCT
CAAGGAGTCAGATGCTTGGCCTGCTGAGCCTCAAGATGCTTATGGTTTGGAGAAACTTGC
AACGGAGGAACTGTGCAAGCATTACAACAAAGATTTTGGCATTGAGTGCCGCATTGGAAG
GTTCCGCAACATTTACGGTCCCTTTGGAACATGGAAAGGTGGAAGAGAGAAGGCTCCAGC
TGCTTTCTGCAGAAGGCTCTGACCTCCACGGATAGGTTTGAGATGTGGGGAGACGGGCTT
CAAACCCGTTCTTTTACCTTCATTGATGAGTGTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT52TF U 1
AF RR2B063TF U 1
BS 1 192 RR2B063TF
BS 193 193 RR2BT52TF
BS 194 354 RR2B063TF
BS 355 355 RR2BT52TF
BS 356 620 RR2B063TF
BS 621 621 RR2BT52TF
BS 622 815 RR2B063TF

RD RR2BT52TF 655 0 0
GGACCTCTCTCTCTCTCTGCATTATCTCTTCACATTCTCCAAGCTCTCTC**AGAATGGC
TGCAACCACCAATGGAAGTAGTGACTATGGTGAATACACATACAAGGAGCTTGAAAGAGA
GCTCTACTGGCCTTCAGAGAAGCTGAGGATCTCTATCACCGGCGCTGGTGGGTTCATCGC
TTCCCACATTGCCCGCCGTTTGAAGCACGAGGGGCACTACGTCATTGCTTCTGACTGGAA
GAAGAATGAGCACATGACCGAGGACATGTTCTGTGACGAGTTCCACCTTGTTGACCTCAG
GGTCATGGAGAATTGCCTCAAGGTCACTGATGGCGTTGATCACGTCTTTAACTTAGCTGC
TGATATGGGTGGTATGGGTTTCATCCAGTCCAACCACTCGGTGATTATGTATAACAACAC
CATGATTAGCTTCAACATGATTGAGGCTGCTAGGATCAATGGGATCAAGAGGTTCTTCTA
TGCTTCAAGTGCATGTATCTATCCGGAGTTCAAGCAGCTGGAAACTACCAATGTGAGCCT
CAAGGAGTCAGATGCTTGGCCTGCTGAGCCTCAAGATGCTTATGGTTTGGAGAAACTTGC
AACGGAGGAGCTGTGCAAGCATTACAACAAAGATTT*GGCATTGAGTGC
GCATTG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2B063TF 815 0 0
GGACCTCTCTCTCTCTCTGCATTATCTCTTCACATTCTCCAAGCTCTCTCTCAGAATGGC
TGCAACCAACAATGGAAGTAGTGACTATGGTGAATACACATACAAGGAGCTTGAAAGAGA
GCTCTACTGGCCTTCAGAGAAGCTGAGAATCTCCATCACCGGCGCTGGTGGGTTCATCGC
TTCCCACATTGCTCGCCGTTTGAAGCACGAGGGGCACTACGTCATTGCTTCTGACTGGAA
GAAGAATGAGCACATGACCGAGGACATGTTCTGTGACGAGTTCCACCTTGTTGACCTCAG
GGTCATGGAGAATTGCCTCAAGGTCACTGATGGCGTTGATCACGTCTTTAACTTGGCTGC
TGATATGGGTGGTATGGGTTTCATCCAGTCCAACCACTCGGTGATTATGTATAACAACAC
CATGATTAGCTTCAACATGATTGAGGCTGCTAGGATCAATGGGATCAAGAGGTTCTTCTA
TGCTTCAAGTGCATGTATCTATCCGGAGTTCAAGCAGCTGGAAACTACCAATGTGAGCCT
CAAGGAGTCAGATGCTTGGCCTGCTGAGCCTCAAGATGCTTATGGTTTGGAGAAACTTGC
AACGGAGGAACTGTGCAAGCGTTACAACAAAGATTTTGGCATTGAGTGCCGCATTGGAAG
GTTCCGCAACATTTACGGTCCCTTTGGAACATGGAAAGGTGGAAGAGAGAAGGCTCCAGC
TGCTTTCTGCAGAAGGCTCTGACCTCCACGGATAGGTTTGAGATGTGGGGAGACGGGCTT
CAAACCCGTTCTTTTACCTTCATTGATGAGTGTGT

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 8

CO CL889Contig1 1600 8 16 U
GGAAACCAAAATAAATATCTTCTGCTCAGAGAGAGAGAGAGGAACTGCGATCGATGGCTG
AGGAGGAGATGGTGGCCGATGAAGCAGTTACAGCTCCGCCTCGTAAGGTCCTCCTCATTT
CCGCCGGTGCTAGTCACTCCGTCGCTCTACTCACTGGGGATGTTGTTTGCTCATGGGGTA
GAGGAGAGGATGGACAATTAGGTCACGGAGATGCGGAGGATCGACCTTCTCCCACGCAGC
TAAGCGCCTTGGATGAACACCAAATCGTTTCCGTTACCTGTG*TGCTGACCACACCGTTG
CTTATTCTCAATCACGCTCCGAGGTCTACAGTTGGGGATGGGGTGATTTTGGGAGATTAG
GCCATGGGAACTCGAGCGACTTGTTTACTCCGCTGCCAATCAAAGCATTGCATGGTGTTC
GGATAAAGCAGATTGCTTGTGGGGATAGTCATTGTTTGGCTGTGACTATGGAAGGAGAGG
TGCAGAGCTGGGGGCGCAACCAGAATGGTCAACTTGGTCTGGGGGACACTGAAGATTCTC
TAGTTCCTCGGAAGATTCAAGCCTTTGAGGGAACACGAATCAAAATGGTTGCTGCTGGTG
CAGAACACACTGCTGCGGTTACAGAAGATGGTGATCTTTATGGATGGGGATGGGGAAGAT
ACGGAAATTTGGGATTAGGTGACCGGAATGACCGCTTGGTTCCTGAAAGGGTTACCTCTG
CTGGTGCTGAGAAGATGTCGATGGTTGCTTGTGGATGGCGGCACACGATATCAGTTTCTT
ACTCTGGAGCATTATATACTTATGGATGGAGCAAATATGGACAGCTAGGACATGGTGACT
TAGAGGATCACCTTATTCCTCACAAACTGGAAGCGCTGGGCAACAATGTTATCTCCCAGA
TTTCGGGAGGTTGGAGACATACAATGGCATTGACTTCTGATGGAAAACTATATGGATGGG
GTTGGAATAAGTTTGGGCAAGTAGGAGTGGGAGATAATATTGATCAGTGTTCTCCTGTGC
AAGTACGGTTTCCCGATGATCAGAAAGTAGTTCAAGTCTCATGTGGATGGAGACATACCT
TGGCTGTGACTGAAAGAAACAATGTGTTTGCTTGGGGAAGAGGTACAAATGGACAGCTCG
GCATTGGAGAGTCGCTTGACAGGAATTCCCCCAAGATTATAGAAGCACTCAGCGTGGATG
GTGCAAGTGGACAACAGATAGAATCTTCTAATTTCGATCCATCTTCAGGGAAAAGCTGGG
TGTCACCATCAGAGAGATATGCGGTCGTTCCGGATGAAACTGTAAATGGTTCAAAGGAAG
GCAATGGTGGCGATATCAGTGTACCACAAACTGATGCTAAGCGAGTACGAATCTGAGTTC
AGACAATCCGTAGTTTTTTTTCTGTGTTTGGTTTGGTCTTGGAGCGTTTATCAATCATCT
CTTTTGGGGTTTTAAGGTTTGTCTGTACTAGTACGTCTGTCGAGTTCGGGATTTGCTTTT
TTTTTTTTGTATTTTATAACTTCTACTCTAGAGTGTTTATTTCGCCAAGTAATCAAAGAA
GAAATAAAGAATAAAGTCTGCATTATGAAATTATAAGACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY08TF U 1
AF RR2H862TF U 1
AF RR2FG39TF U 39
AF RR2GB14TF U 670
AF RR2FG39JQ C 862
AF RR2H862JQ C 938
AF RR2GY08JQ C 941
AF RR2GB14JQ C 873
BS 1 678 RR2GY08TF
BS 679 679 RR2FG39TF
BS 680 697 RR2GY08TF
BS 698 705 RR2H862TF
BS 706 764 RR2FG39TF
BS 765 765 RR2GB14TF
BS 766 792 RR2FG39TF
BS 793 793 RR2GB14TF
BS 794 814 RR2FG39TF
BS 815 815 RR2GB14TF
BS 816 828 RR2FG39TF
BS 829 1298 RR2GB14TF
BS 1299 1299 RR2FG39JQ
BS 1300 1313 RR2GB14TF
BS 1314 1549 RR2FG39JQ
BS 1550 1600 RR2GB14JQ

RD RR2GY08TF 697 0 0
GGAAACCAAAATAAATATCTTCTGCTCAGAGAGAGAGAGAGGAACTGCGATCGATGGCTG
AGGAGGAGATGGTGGCCGATGAAGCAGTTACAGCTCCGCCTCGTAAGGTCCTCCTCATTT
CCGCCGGTGCTAGTCACTCCGTCGCTCTACTCACTGGGGATGTTGTTTGCTCATGGGGTA
GAGGAGAGGATGGACAATTAGGTCACGGAGATGCGGAGGATCGACCTTCTCCCACGCAGC
TAAGCGCCTTGGATGAACACCAAATCGTTTCCGTTACCTGTG*TGCTGACCACACCGTTG
CTTATTCTCAATCACGCTCCGAGGTCTACAGTTGGGGATGGGGTGATTTTGGGAGATTAG
GCCATGGGAACTCGAGCGACTTGTTTACTCCGCTGCCAATCAAAGCATTGCATGGTGTTC
GGATAAAGCAGATTGCTTGTGGGGATAGTCATTGTTTGGCTGTGACTATGGAAGGAGAGG
TGCAGAGCTGGGGGCGCAACCAGAATGGTCAACTTGGTCTGGGGGACACTGAAGATTCTC
TAGTTCCTCGGAAGATTCAAGCCTTTGAGGGAACACGAATCAAAATGGTTGCTGCTGGTG
CAGAACACACTGCTGCGGTTACAGAAGATGGTGATCTTTATGGATGGGGATGGGGAAGAT
ACGGAAATTTGGGATTAG*TGACCGGAATGACCGCTT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2H862TF 705 0 0
GGAAACCAAAATAAATATCTTCTGCTCAGAGAGAGAGAGAGGAACTGCGATCGATGGCTG
AGGAGGAGATGGTGGCCGATGAAGCAGTTACAGCTCCGCCTCGTAAGGTCCTCCTCATTT
CCGCCGGTGCTAGTCACTCCGTCGCTCTACTCACTGGGGATGTTGTTTGCTCATGGGGTA
GAGGAGAGGATGGACAATTAGGTCACGGAGATGCGGAGGATCGACCTTCTCCCACGCAGC
TAAGCGCCTTGGATGAACACCAAATCGTTTCCGTTACCTGTG*TGCTGACCACACCGTTG
CTTATTCTCAATCACGCTCCGAGGTCTACAGTTGGGGATGGGGTGATTTTGGGAGATTAG
GCCATGGGAACTCGAGCGACTTGTTTACTCCGCTGCCAATCAAAGCATTGCATGGTGTTC
GGATAAAGCAGATTGCTTGTGGGGATAGTCATTGTTTGGCTGTGACTATGGAAGGAGAGG
TGCAGAGCTGGGGGCGCAACCAGAATGGTCAACTTGGTCTGGGGGACACTGAAGATTCTC
TAGTTCCTCGGAAGATTCAAGCCTTTGAGGGAACACGAATCAAAATGGTTGCTGCTGGTG
CAGAACACACTGCTGCGGTTACAGAAGATGGTGATCTTTATGGATGGGGATGGGGAAGAT
ACGGAAATTTGGGATTAG*TGACCGGAATGACCGCTTGGTTCCTG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2FG39TF 790 0 0
CG
GGAACTGCGATCGATGGCTGAGGAGGAGATGGTGGCCGATGAAGCAGTTACAGCTCCGCC
TCGTAAGGTCCTCCTCATTTCCGCCGGTGCTAGTCACTCCGTCGCTCTACTCACTGGGGA
TGTTGTTTGCTCATGGGGTAGAGGAGAGGATGGACAATTAGGTCACGGAGATGCGGAGGA
TCGACCTTCTCCCACGCAGCTAAGCGCCTTGGATGAACACCAAATCGTTTCCGTTACCTG
TGGTGCTGACCACACCGTTGCTTATTCTCAATCACGCTCCGAGGTCTACAGTTGGGGATG
GGGTGATTTTGGGAGATTAGGCCATGGGAACTCGAGCGACTTGTTTACTCCGCTGCCAAT
CAAAGCATTGCATGGTGTTCGGATAAAGCAGATTGCTTGTGGGGATAGTCATTGTTTGGC
TGTGACTATGGAAGGAGAGGTGCAGAGCTGGGGGCGCAACCAGAATGGTCAACTTGGTCT
GGGGGACACTGAAGATTCTCTAGTTCCTCGGAAGATTCAAGCCTTTGAGGGAACACGAAT
CAAAATGGTTGCTGCTGGTGCAGAACACACTGCTGCGGTTACAGAAGATGGTGATCTTTA
TGGATGGGGATGGGGAAGATATGGAAATTTGGGATTAGGTGACCGGAATGACCGCTTGGT
TCCTGAAAGGGTTACCTCTGCTGGTGCTGAGAAGATGTCGATGGTTGCTTGTGGATGGCG
GCACGCGATATCAGTTTCTTACTCTGGAGCAT*ATATACTTATGGATGGAGCAA*TATGG
ACAGCTAG

QA 3 790 3 790
DS 

RD RR2GB14TF 644 0 0
G
GGGATTAGGTGACCGGAATGACCGCTTGGTTCCTGAAAGGGTTACCTCTGCTGGTGCTGA
GAAGATGTCGATGGTTGCTTGTGGATGGCGGCACACGATATCAGTTTCTTACTCTGGAGC
ATTATATACTTATGGATGGAGCAAATATGGACAGCTAGGACATGGTGACTTAGAGGATCA
CCTTATTCCTCACAAACTGGAAGCGCTGGGCAACAATGTTATCTCCCAGATTTCGGGAGG
TTGGAGACATACAATGGCATTGACTTCTGATGGAAAACTATATGGATGGGGTTGGAATAA
GTTTGGGCAAGTAGGAGTGGGAGATAATATTGATCAGTGTTCTCCTGTGCAAGTACGGTT
TCCCGATGATCAGAAAGTAGTTCAAGTCTCATGTGGATGGAGACATACCTTGGCTGTGAC
TGAAAGAAACAATGTGTTTGCTTGGGGAAGAGGTACAAATGGACAGCTCGGCATTGGAGA
GTCGCTTGACAGGAATTCCCCCAAGATTATAGAAGCACTCAGCGTGGATGGTGCAAGTGG
ACAACAGATAGAATCTTCTAATTTCGATCCATCTTCAGGGAAAAGCTGGGTGTCACCATC
AGAGAGATATGCGGTCGTTCCGGATGAAGCTGTAAATGGTTCA

QA 2 644 2 644
DS 

RD RR2FG39JQ 689 0 0
ACAAACTGGAAGCGCTGGGCAACAATGTTATCTCCCAGATTTCGGGAGGTTGGAGACATA
CAATGGCATTGACTTCTGATGGAAAACTATATGGATGGGGTTGGAATAAGTTTGGGCAAG
TAGGAGTGGGAGATAATATTGATCAGTGTTCTCCTGTGCAAGTACGGTTTCCCGATGATC
AGAAAGTAGTTCAAGTCTCATGTGGATGGAGACATACCTTGGCTGTGACTGAAAGAAACA
ATGTGTTTGCTTGGGGAAGAGGTACAAATGGACAGCTCGGCATTGGAGAGTCGCTTGGCA
GGAATTCCCCCAAGATTATAGAAGCACTCAGCGTGGATGGTGCAAGTGGACAACAGATAG
AATCTTCTAATTTCGATCCATCTTCAGGGAAAAGCTGGGTGTCACCATCAGAGAGATATG
CGGTCGCTCCGGATGAAACTGTAAATGGTTCAAAGGAAGGCAATGGTGGCGATATCAGTG
TACCACAAACTGATGCTAAGCGAGTACGAATCTGAGTTCAGACAATCCGTAGTTTTTTTT
CTGTGTTTGGTTTGGTCTTGGAGCGTTTATCAATCATCTCTTTTGGGGTTTTAAGGTTTG
TCTGTACTAGTACGTCTGTCGAGTTCGGGATTTGCTTTTTTTTTTTTGTATTTTATAACT
TCTACTCTAGAGTGTTTATTTCGCCAAG
C

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2H862JQ 617 0 0
TGATGGAAAACTATACGGATGGGGTTGGAATAAGTTTGGGCAAGTAGGAGTGGGAGATAA
TATTGATCAGTGTTCTCCTGTGCAAGTACGGTTTCCCGATGATCAGAAAGTAGTTCAAGT
TTCATGTGGATGGAGACATACCTTGGCTGTGACTGAAAGAAACAATGTGTTTGCTTGGGG
AAGAGGTACAAATGGACAGCTCGGCATTGGAGAGTCGCTTGACAGGAATTCCCCCAAGAT
TATAGAAGCACTCAGCGTGGATGGTGCAAGTGGACAACAGATAGAATCTTCTAATTTCGA
TCCATCTTCAGGGAAAAGCTGGGTGTCACCATCAGAGAGATATGCGGTCGTTCCGGATGA
AACTGTAAATGGTTCAAAGGAAGGCAATGGTGGCGATATCAGTGTACCACAAACTGATGC
TAAGCGAGTACGAATCTGAGTTCAGACAATCCGTAGTTTTTTTTCTGTGTTTGGTTTGGT
CTTGGAGCGTTTATCAATCATCTCTTTTGGGGTTTTAAGGTTTGTCTGTACTAGTACGTC
TGTCGAGTTCGGGATTTGCTTTTTTTTTTT*GTATTTTATAACTTCTACTCTAGAGTGTT
TATTTCGCCAAG
TAATC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2GY08JQ 614 0 0
TGGAAAACTATACGGATGGGGTTGGAATAAGTTTGGGCAAGTAGGAGTGGGAGATAATAT
TGATCAGTGTTCTCCTGTGCAAGTACGGTTTCCCGATGATCAGAAAGTAGTTCAAGTCTC
ATGTGGATGGAGACATACCTTGGCTGTGACTGAAAGAAACAATGTGTTTGCTTGGGGAAG
AGGTACAAATGGACAGCTCGGCATTGGAGAGTCGCTTGACAGGAATTCCCCCAAGATTAT
AGAAGCACTCAGCGTGGATGGTGCAAGTGGACAACAGATAGAATCTTCTAATTTCGATCC
ATCTTCAGGGAAAAGCTGGGTGTCACCATCAGAGAGATATGCGGTCGTTCCGGATGAAAC
TGTAAATGGTTCAAAGGAAGGCAATGGTGGCGATATCAGTGTACCACAAACTGATGCTAA
GCGAGTACGAATTTGAGTTCAGACAATCCGTAGTTTTTTTTCTGTGTTTGGTTTGGTCTT
GGAGCGTTTATCAATCATCTCTTTTGGGGTTTTAAGGTTTGTCTGTACTAGTACGTCTGT
CGAGTTCGGGATTTGCTTTTTTTTTTT*GTATTTTATAACTTCTACTCTAGAGTGTTTAT
TTCGCCAAG
TAATC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2GB14JQ 728 0 0
GCGCTGGGCAACAATGTTATCTCCCAGATTTCGGGAGGTTGGAGACATACAATGGCATTG
ACTTCTGATGGAAAACTATATGGATGGGGTTGGAATAAGTTTGGGCAAGTAGGAGTGGGA
GATAATATTGATCAGTGTTCTCCTGTGCAAGTACGGTTTCCCGATGATCAGAAAGTAGTT
CAAGTCTCATGTGGATGGAGACATACCTTGGCTGTGACTGAAAGAAACAATGTGTTTGCT
TGGGGAAGAGGTACAAATGGACAGCTCGGCATTGGAGAGTCGCTTGACAGGAATTCCCCC
AAGATTATAGAAGCACTCAGCGTGGATGGTGCAAGTGGACAACAGATAGAATCTTCTAAT
TTCGATCCATCTTCAGGGAAAAGCTGGGTGTCACCATCAGAGAGATATGCGGTCGTTCCG
GATGAAGCTGTAAATGGTTCAAAGGAAGGCAATGGTGGCGATATCAGTGTACCACAAACT
GATGCTAAGCGAGTACGAATCTGAGTTCAGACAATCCGTAGTTTTTTTTCTGTGTTTGGT
TTGGTCTTGGAGCGTTTATCAATCATCTCTTTTGGGGTTTTAAGGTTTGTCTGTACTAGT
ACGTCTGTCGAGTTCGGGATTTGCTTTTTTTTTTTTGTATTTTATAACTTCTACTCTAGA
GTGTTTATTTCGCCAAGTAATCAAAGAAGAAATAAAGAATAAAGTCTGCATTATGAAATT
ATAAGACT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 3 8

CO CL890Contig1 760 4 14 U
GGGTCGACAGCACAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCAGGAGGTAAGAGCAAGAAGACC
AAAAGGACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGG
TTTCTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTTATG
AGCAAAGTTAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAATGGCAAG
GATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATTACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATT
CCTGCTACGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGATAAA
GCTGGTGGAGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGTCAGAAC
ACGGTTCTCCTTAGGGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGGAGCACTTTGGTCCTGCT
CCTGGTGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCCAAGGGAAGGAAGTTTGAG
AAAGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGTCTCTCTCTCTGCT
GTTTCGACGGGTGTTATTTTGTTATGGTTATAGCAATTTTGCTAGTGAACTCGTGTTCGT
CTTTTCCTGTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTTCGTTCTAAACGACAGT
TGAATGGTTTGCTTAATAACATTTTAAGAATTTACTGCCA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2GA91TF U 4
AF RR2CG26TF U 1
AF RR2GA91JQ C 306
AF RR2DW26TF U 311
BS 1 164 RR2CG26TF
BS 165 165 RR2GA91TF
BS 166 307 RR2CG26TF
BS 308 308 RR2GA91TF
BS 309 356 RR2CG26TF
BS 357 357 RR2GA91TF
BS 358 423 RR2CG26TF
BS 424 424 RR2GA91TF
BS 425 462 RR2CG26TF
BS 463 463 RR2GA91TF
BS 464 565 RR2CG26TF
BS 566 566 RR2GA91TF
BS 567 721 RR2CG26TF
BS 722 760 RR2DW26TF

RD RR2GA91TF 569 0 0
GG
GACAGCACAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCAGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAG
GACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGGTTTCT
GGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTTATGAGCAA
AGTTAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAATGGCAAGGATGG
TAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATTACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATTCCTGC
TACGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGATAAAGCTGG
TGGAGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGTCAGAACACGGT
TCTCCTTAGGGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGGAGCACTTTGGTCCTGCTCCTGG
TGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCCAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGC
TAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATT

QA 3 569 3 569
DS 

RD RR2CG26TF 723 0 0
GGGTCGACAGCACAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCAGGAGGTAAGAGCAAGAAGACC
AAAAGGACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGG
TTTCTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTTATG
AGCAAAGTTAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAATGGCAAG
GATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATTACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATT
CCTGCTATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAA
GCTGGTGGAGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGTCAGAAC
ACGATTCTCCTTAGGGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCTGCT
CCTGGTGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCCAAGGGAAGGAAGTTTGAG
AAAGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCATGGATTCAAGGTCTAAGAAGTCTCTCTCTCTGCT
GTTTCGACGGGTGTTATTTTGTTATGGTTATAGCAATTTTGCTAGTGAACTCGTGTTCGT
CTTTTCCTGTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTTCGTTCTAAACGACAGT
T
GA

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2GA91JQ 454 0 0
TAC
GAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGATAAAGCTGGTGG
AGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGTCAGAACACGGTTCT
CCTTAGGGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGGAGCACTTTGGTCCTGCTCCTGGTGT
GCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCCAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCTAG
AGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGTCTCTCTCTCTGCTGTTTCGAC
GGGTGTTATTTTGTTATGGTTATAGCAATTTTGCTAGTGAACTCGTGTTCGTCTTTTCCT
GTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTTCGTTCTAAACGACAGTTGAATGGT
TTGCTTAATAACATTTTAAGAATTTACTGCC

QA 4 454 4 454
DS 

RD RR2DW26TF 450 0 0
G
GGTTACTGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAAGCTGGTGGAGA
GTGCTTAACATTCGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGTCAGAACACGGTTCTCCT
TAGGGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCTGCTCCTGGTGTGCC
GCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCCAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCTAGAGG
AAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGTCTCTCTCTCTGCTGTTTCGACGGG
TGTTATTTTGTTATGGTTATAGCAATTTTGCTAGTGAACTCGTGTTCGTCTTTTCCTGTT
CCAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTTCGTTCTAAACGACAGTTGAATGGTTTG
CTTAATAACATTTTAAGAATTTACTGCCA

QA 2 450 2 450
DS 



CO CL890Contig2 767 2 4 U
GGGTCGACAGCACAAACCATGGGTATCGATCTTATCGCAGGAGGTAAGAGCAAGAAGACC
AAAAGGACTGCTCCTAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGG
TTTTTGGTAAGGAGAACCGGCAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTCATG
AGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTGCAGTTCATGAACGGCAAG
GATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATT
CCTGCTATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAA
GCTGGTGGAGAGTGCTTAACCTTCGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCGTTGGGTCAGAAC
ACGGTTCTCCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCTGCT
CCTGGTGTGCCACACAGCCACTCCAACCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGA
AAGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGCCTCTCTCTGCTGTT
TCGACGGGTGTTATTTTGTGTTATGGTTGCTTTCAGTATAGCAGTTTTGCTAGTGAACTC
GTGTTCCTCTTTGCCTGTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTTCGTTCTAA
ACGACAGTTAAATGTTTTGCTTAATAACATTTTCAGAATTTACTGCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E976TF U 1
AF RR2E976JQ C 2
BS 1 575 RR2E976TF
BS 576 576 RR2E976JQ
BS 577 712 RR2E976TF
BS 713 767 RR2E976JQ

RD RR2E976TF 712 0 0
GGGTCGACAGCACAAACCATGGGTATCGATCTTATCGCAGGAGGTAAGAGCAAGAAGACC
AAAAGGACTGCTCCTAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGG
TTTTTGGTAAGGAGAACCGGCAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTCATG
AGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTGCAGTTCATGAACGGCAAG
GATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATT
CCTGCTATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAA
GCTGGTGGAGAGTGCTTAACCTTCGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCGTTGGGTCAGAAC
ACGGTTCTCCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCTGCT
CCTGGTGTGCCACACAGCCACTCCAACCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGA
AAGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAG*TCTAAGAAGCCTCTCTCTGCTGTT
TCGACGGGTGTTATTTTGTGTTATGGTTGCTTTCAGTATAGCAGTTTTGCTAGTGAACTC
GTGTTCCTCTTTGCCTGTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2E976JQ 766 0 0
GGTC
GACAGCACAAACCATGGGTATCGATCTTATCGCAGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAG
GACTGCTCCTAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGGTTTTT
GGTAAGGAGAACCGGCAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTCATGAGCAA
AGTCAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTGCAGTTCATGAACGGCAAGGATGG
TAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATTCCTGC
TATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAAGCTGG
TGGAGAGTGCTTAACCTTCGACCAGCTAGCTCTCGTTGCTCCGTTGGGTCAGAACACGGT
TCTCCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCTGCTCCTGG
TGTGCCACACAGCCACTCCAACCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCT
AGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGCCTCTTTCTGCTGTTTCGAC
GGGTGTTATTTTGTGTTATGGTTGCTTTCAGTATAGCAGTTTTGCTAGTGAACTCGTGTT
CCTCTTTGCCTGTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTTCGTTCTAAACGAC
AGTTAAATGTTTTGCTTAATAACATTTTCAGAATTTACTGCC

QA 5 766 5 766
DS 



CO CL890Contig3 719 2 7 U
GGGACAGCACAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCAGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAA
AGGACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACAGGTTT
TTGGTAAGGAGAACCGGCAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTCATGAGC
AAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCTAAGCTCGTAGAGTTCATGAATGGCAAGGAT
GGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGACGATTTGAGAGTGCATGAGATTCCT
GCTATGAAGGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAAGCT
GGTGGAGAGTGCTTAACCTTCGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCGTTGGGTCAGAACACG
GTTCTCCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCTGCTCCT
GGTGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAA
GCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGTCTCTTTGCTGTTTCGA
CGGGTGTTATATTTTGTGTTATGGTTGCTTTCAGTATAGCAATTTTGCTAGTGAACTCGT
GTTGTTCCTCTTTGCCTGTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTTCGTTTT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC28JQ C 1
AF RR2EC28TF U 1
BS 1 2 RR2EC28JQ
BS 3 550 RR2EC28TF
BS 551 551 RR2EC28JQ
BS 552 681 RR2EC28TF
BS 682 682 RR2EC28JQ
BS 683 713 RR2EC28TF
BS 714 719 RR2EC28JQ

RD RR2EC28JQ 719 0 0
GGGACAGCACAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCAGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAA
AGGACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACAGGTTT
TTGGTAAGGAGAACCGGCAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTCATGAGC
AAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCTAAGCTCGTAGAGTTCATGAATGGCAAGGAT
GGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGACGATTTGAGAGTGCATGAGATTCCT
GCTATGAAGGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAAGCT
GGTGGAGAGTGCTTAACCTTCGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCGTTGGGTCAGAACACG
GTTCTCCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCTGCTCCT
GGTGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAA
GCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGTCTCTTTGCTGTTTCGA
CGGGTGTTATATTTTGTGTTATGGTTGCTTTCAGTATAGCAATTTTGCTAGTGAACTCGT
GTTGTTCCTCTTTGCCTGTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTTCGTTTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2EC28TF 718 0 0
GG
GACAGCACAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCAGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAG
GACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACAGGTTTTT
GGTAAGGAGAACCGGCAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTCATGAGCAA
AGTCAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCTAAGCTCGTAGAGTTCATGAATGGCAAGGATGG
TAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGACGATTTGAGAGTGCATGAGATTCCTGC
TATGAAGGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAAGCTGG
TGGAGAGTGCTTAACCTTCGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCGTTGGGTCAGAACACGGT
TCTCCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCTGCTCCTGG
TGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGC
TAGAGGAA*GCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGTCTCTTTGCTGTTTCGACG
GGTGTTATATTTTGTGTTATGGTTGCTTTCAGTATAGCAATTTTGCTAGTGAACTCGTGT
TGTTCCTCTTTGCCTGTTC*AGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTT
CGTTT

QA 3 713 3 713
DS 



AS 2 7

CO CL891Contig1 724 4 4 U
AGCAGGAGCAAATACAAACCGGAAATTTCGGTTTTCTGAAAATAGAGTTTTAAAATCGAA
TATTACATACAGTGTTTATAATCCAGTTTTGTTGGTGAAAGCGAACACATACATACGCGT
AGAACACAAGGAAGGAACTAACTACAACGTGATGACAATAATGCGATTTAACATCTCCAG
CCTCCAAAGAGTTTAAGGAAGCTCTCTTGGTTTCGGAATTCTTTAACCCGACTTGAAGAG
CAGCAAAGCTTTTTGGTCGAGGTAAAAGTAAACGAAATGGTTTGTCTCGTGAGTTACGTA
AGAACCAAAGTTGCGACCAACAATGCAATGCCAAGTAGCACCATGTTTCTTGTCAAACTC
CTTTTTTATATTCTCAGCTATATCCTTCTCCACACTGTTATTCTCAAATGCGGCGATAGC
GATATCGATAGCCTCCTTCTGCATATCCTCTTTCATATCAGCACTCTTTATTACAGCTCG
CTTCCCCGCCGCCGCTTGAGGAACTTCAACACTAGATCTCCGATCATCGGGATTCGTCTG
CGCCGGTGCTCCTCCGTTCACACTCTTCTTTATCCTCCCCTCACTCATTCTTTTTTCTTT
CGTCGGTGATTTTTTTTTAATTCTCTTGAAATCAGATTTGCTGAAGATATAAGCAAAAAA
AAGAAAGGGAAAGACTAAAGAAGAAGAAGAAGCTGTAAAGCACGGCGATGATGAGTGTGT
GTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 

AF RR2DX70JQ U 1
AF RR2A514JQ U 12
AF RR2DX70TF C 98
AF RR2A514TF C 13
BS 1 245 RR2DX70JQ
BS 246 246 RR2A514JQ
BS 247 587 RR2DX70JQ
BS 588 724 RR2A514JQ

RD RR2DX70JQ 587 0 0
AGCAGGAGCAAATACAAACCGGAAATTTCGGTTTTCTGAAAATAGAGTTTTAAAATCGAA
TATTACATACAGTGTTTATAATCCAGTTTTGTTGGTGAAAGCGAACACATACATACGCGT
AGAACACAAGGAAGGAACTAACTACAACGTGATGACAATAATGCGATTTAACATCTCCAG
CCTCCAAAGAGTTTAAGGAAGCTCTCTTGGTTTCGGAATTCTTTAACCCGACTTGAAGAG
CAGCACAGCTTTTTGGTCGAGGTAAAAGTAAACGAAATGGTTTGTCTCGTGAGTTACGTA
AGAACCAAAGTTGCGACCAACAATGCAATGCCAAGTAGCACCATGTTTCTTGTCAAACTC
CTTTTTTATATTCTCAGCTATATCCTTCTCCACACTGTTATTCTCAAATGCGGCGATAGC
GATATCGATAGCCTCCTTCTGCATATCCTCTTTCATATCAGCACTCTTTATTACAGCTCG
CTTCCCCGCCGCCGCTTGAGGAACTTCAACACTAGATCTCCGATCATCGGGATTCGTCTG
CGCCGGTGCTCCTCCGTTCACACTCTTCTTTATCCTCCCCTCACTCA

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2A514JQ 713 0 0
C
TACAAACCGGAAATTTCGGTTTTCTGAAAATAGAGTTTTAAAATCGAATATTACATACAG
TGTTTATAATCCAGTTTTGTTGGTGAAAGCGAACACATACATACGCGTAGAACACAAGGA
AGGAACTAACTACAACGTGATGACAATAATGCGATTTAACATCTCCAGCCTCCAAAGAGT
TTAAGGAAGCTCTCTTGGTTTCGGAATTCTTTAACCCGACTTGAAGAGCAGCAAAGCTTT
TTGGTCGAGGTAAAAGTAAACGAAATGGTTTGTCTCGTGAGTTACGTAAGAACCAA*GTT
GCGACCAACAATGCAATGCCAAGTAGCACCATGTTTCTTGTCAAACTCCTTTTTTATATT
CTCAGCTATATCCTTCTCCACACTGTTATTCTCAAATGCGGCGATAGCGATATCGATAGC
CTCCTTCTGCATATCCTCTTTCATATCAGTACTCTTTATTACAGCTCGCTTCCCCGCCGC
CGCTTGAGGAACTTCAACACTAGATCTCCGATCATCGGGATTCGTCTGCGCCGGTGCTCC
TCCGTTCACACTCTTCTTTATCCTCCCCTCACTCATTCTTTTTTCTTTCGTCGGTGATTT
TTTTTTAATTCTCTTGAAATCAGATTTGCTGAAGATATAAGCAAAAAAAAGAAAGGGAAA
GACTAAAGAAGAAGAAGAAGCTGTAAAGCACGGCGATGATGAGTGTGTGTCC

QA 2 713 2 713
DS 

RD RR2DX70TF 626 0 0
AAAGCGAACACATACATACGCGTAGAACACAAGGAAGGAACTAACTACAACGTGATGACA
ATAATGCGATTTAACATCTCCAGCCTCCAAAGAGTTTAAGGAAGCTCTCTTGGTTTCGGA
ATTCTTTAACCCGACTTGAAGAGCAGCACAGCTTTTTGGTCGAGGTAAAAGTAAACGAAA
TGGTTTGTCTCGTGAGTTACGTAAGAACCAAAGTTGCGACCAACAATGCAATGCCAAGTA
GCACCATGTTTCTTGTCAAACTCCTTTTTTATATTCTCAGCTATATCCTTCTCCACACTG
TTATTCTCAAATGCGGCGATAGCGATATCGATAGCCTCCTTCTGCATATCCTCTTTCATA
TCAGCACTCTTTATTACAGCTCGCTTCCCCGCCGCCGCTTGAGGAACTTCAACACTAGAT
CTCCGATCATCGGGATTCGTCTGCGCCGGTGCTCCTCCGTTCACACTCTTCTTTATCCTC
CCCTCACTCATTCTTTTTTCTTTCGTCGGTGATTTTTTTTTAATTCTCTTGAAATCAGAT
TTGCTGAAGATATAAGCAAAAAAAAGAAAGGGAAAGACTAAAGAAGAAGAAGAAGCTGTA
AAGCACGGCGATGATGAGTGTGTGT
C

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2A514TF 712 0 0
TACAAACCGGAAATTTCGGTTTTCTGAAAATAGAGTTTTAAAATCGAATATTACATACAG
TGTTTATAATCCAGTTTTGTTGGTGAAAGCGAACACATACATACGCGTAGAACACAAGGA
AGGAACTAACTACAACGTGATGACAATAATGCGATTTAACATCTCCAGCCTCCAAAGAGT
TTAAGGAAGCTCTCTTGGTTTCGGAATTCTTTAACCCGACTTGAAGAGCAGCAAAGCTTT
TTGGTCGAGGTAAAAGTAAACGAAATGGTTTGTCTCGTGAGTTACGTAAGAACCAA*GTT
GCGACCAACAATGCAATGCCAAGTAGCACCATGTTTCTTGTCAAACTCCTTTTTTATATT
CTCAGCTATATCCTTCTCCACACTGTTATTCTCAAATGCGGCGATAGCGATATCGATAGC
CTCCTTCTGCATATCCTCTTTCATATCAGTACTCTTTATTACAGCTCGCTTCCCCGCCGC
CGCTTGAGGAACTTCAACACTAGATCTCCGATCATCGGGATTCGTCTGCGCCGGTGCTCC
TCCGTTCACACTCTTCTTTATCCTCCCCTCACTCATTCTTTTTTCTTTCGTCGGTGATTT
TTTTTTAATTCTCTTGAAATCAGATTTGCTGAAGATATAAGCAAAAAAAAGAAAGGGAAA
GACTAAAGAAGAAGAAGAAGCTGTAAAGCACGGCGATGATGAGTGTGTGT
CC

QA 1 710 1 710
DS 



CO CL891Contig2 687 3 5 U
GGACACACACACACACTCATCATCGCCGTGCTTTACAGCTTCTTCTTCTTCTCTAGTCTT
TCCCTTTTCTCCTTTGCTTATATCTTCAGCAAATCTGATTTCAAGAGAAAAAAAGAAAAT
CACCGACGAAAGAAAAAAGAATGAGTGAGGGGAGGATAAGGAAGAGTGTGAACGGAGGAG
CACCGGCGCAAACGAATCCCGATGATCGGAGATCTAGTGTCGAAGTTTCTCAATCGGTGA
CGGGGAAGCGAGCTGTAATAAAAAGTGCTGATATGAAAGAGGATATGCAGAAGGAGGCTA
TCGATATCGCTATCGCCGCATTTGAGAATAACAGTGTGGAGAAGGATATAGCTGAGAATA
TAAAAAAGGAGTTTGACAAGAAACATGGTGCTACTTGGCATTGCATTGTTGGTCGCAACT
TTGGTTCTTACGTAACTCACGAGACAAACCATTTCGTTTACTTTTACCTCGACCAAAAAG
CTGTTCTGCTCTTCAAGTCGGGTTAAGAAGTCCGAAACCAAAGAGAGCTTCCTTCACCTC
TTTGGAGTCTGAAGATGTTAAATCGCATTATTGTCATCACGTTGTAGTTAGTTCCTTGTG
TTCTACGCGTATGTATGTGTTCGCTTTCACCAACAAAACTGGATTATAAACACTGTATGT
AACATTCGATTTTAAAACTCTATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS94TF U 1
AF RR2C780TF U 2
AF RR2C912TF U 11
BS 1 160 RR2GS94TF
BS 161 161 RR2C780TF
BS 162 654 RR2GS94TF
BS 655 672 RR2C780TF
BS 673 687 RR2C912TF

RD RR2GS94TF 654 0 0
GGACACACACACACACTCATCATCGCCGTGCTTTACAGCTTCTTCTTCTTCTCTAGTCTT
TCCCTTTTCTCCTTTGCTTATATCTTCAGCAAATCTGATTTCAAGAGAAAAAAAGAAAAT
CACCGACGAAAGAAAAAAGAATGAGTGAGGGGAGGATAAGTAAGAGTGTGAACGGAGGAG
CACCGGCGCAAACGAATCCCGATGATCGGAGATCTAGTGTCGAAGTTTCTCAATCGGTGA
CGGGGAAGCGAGCTGTAATAAAAAGTGCTGATATGAAAGAGGATATGCAGAAGGAGGCTA
TCGATATCGCTATCGCCGCATTTGAGAATAACAGTGTGGAGAAGGATATAGCTGAGAATA
TAAAAAAGGAGTTTGACAAGAAACATGGTGCTACTTGGCATTGCATTGTTGGTCGCAACT
TTGGTTCTTACGTAACTCACGAGACAAACCATTTCGTTTACTTTTACCTCGACCAAAAAG
CTGTTCTGCTCTTCAAGTCGGGTTAAGAAGTCCGAAACCAAAGAGAGCTTCCTTCACCTC
TTTGGAGTCTGAAGATGTTAAATCGCATTATTGTCATCACGTTGTAGTTAGTTCCTTGTG
TTCTACGCGTATGTATGTGTTCGCTTTCACCAACAAAACTGGATTATAAACACT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2C780TF 686 0 0
GACACAC
ACACACACTCATCATCGCCGTGCTTTACAGCTTCTTCTTCTTCTCTAGTCTTTCCCTTTT
CTCCTTTGCCTATATCTTCAGCAAATCTGATTTCAAGAGAAAAAAAGAAAATCACCGACG
AAAGAAAAAAGAATGAGTGAGGGGAGGATAAGGAAGAGTGTGAACGGAGGAGCACCGGCG
CAAACGAATCCCGATGATCGGAGATCTAGTGTCGAAGTTTCTCAATCGGTGACGGGGAAG
CGAGCTGTAATAAAAAGTGCTGATATGAAAGAGGATATGCAGAAGGAGGCTATCGATATC
GCTATCGCCGCATTTGAGAATAACAGTGTGGAGAAGGATATAGCTGAGAATATAAAAAAG
GAGTTTGACAAGAAACATGGTGCTACTTGGCATTGCATTGTTGGTCGCAACTTTGGTTCT
TACGTAACTCACGAGACAAACCATTTCGTTTACTTTTACCTCGACCAAAAAGCTGTTCTG
CTCTTCAAGTCGGGTTAAGAAGTCCGAAACCAAAGAGAGCTTCCTTCACCTCTTTGGAGT
CTGAAGATGTTAAATCGCATTATTGTCATCACGTTGTAGTTAGTTCCTTGTGTTCTACGC
GTATGTATGTGTTCGCTTTCACCAACAAAACTGGATTATAAACACTGTATGTAACATTCG
ATTT
AAACTCTATTTCAGA

QA 8 671 8 671
DS 

RD RR2C912TF 677 0 0
GG
ACACTCATCATCGCCGTGCTTTACAGCTTCTTCTTCTTCTCTAGTCTTTCCCTTTTCTCC
TTTGCTTATATCTTCAGCAAATCTGATTTCAAGAGAAAAAAAGAAAATCACCGACGAAAG
AAAAAAGAATGAGTGAGGGGAGGATAAGGAAGAGTGTGAACGGAGGAGCACCGGCGCAAA
CGAATCCCGATGATCGGAGATCTAGTGTCGAAGTTTCTCAATCGGTGACGGGGAAGCGAG
CTGTAATAAAAAGTGCTGATATGAAAGAGGATATTCAGAAGGAGGCTATCGATATCGCTA
TCGCCGCATTTGAGAATAACAGTGTGGAGAAGGATATAGCTGAGAATATAAAAAAGGAGT
TTGACAAGAAACATGGTGCTACTTGGCATTGCATTGTTGGTCGCAACTTTGGTTCTTACG
TAACTCACGAGACAAACCATTTCGTTTACTTTTACCTCGACCAAAAAGCTGTTCTGCTCT
TCAAGTCGGGTTAAGAAGTCCGAAACCAAAGAGAGCTTCCTTCACCTCTTTGGAGTCTGA
AGATGTTAAATCGCATTATTGTCATCACGTTGTAGTTAGTTCCTTGTGTTCTACGCGTAT
GTATGTGTTCGCTTTCACCAACAAAACTGGATTATAAACACTGTATGTAACATTCGATTT
TAAAACTCTATTTTC

QA 3 677 3 677
DS 



AS 1 8

CO CL892Contig1 1138 8 19 U
GGACCACCAAGGACCATACAACACAACACCATTTGCAAACAACTTCTGCTTTCTCTCACT
GAGTTTTTGAAATGAGAGGGATGAAGAGTCTAACTATTTGGGCTCTCTTTGCTGCTTTAC
TCTCACAGCAGCTGTTTGCTTCCGTTACTTCCATAAGGTTCGAAGATGAGAAGACATACT
ACTCTCCTCCCTCTGGACACGGCGGTTACACTCCCACTCCTAACTGTGGAAGTCCACCTT
ACGACCCAACTCCTTCAACTCCATCTCACACTCCAACTCCTTCGACTCCATCTCACACTC
CAACCCCACACACACCAACTCACCACACGCCTCCTTGTAACTGTGGGACTCCACCACACG
ACCCTTCCACACCTTCTCACCCTTCTACACCATCACATCCTTCGACGCCTTCACACCCTT
CAACGCCTCCTTCGGGTGGATATTACTCATCTCCTCCACCAAGTACTCCAGTCGTTGTGA
CTCCACCAACACCCATTGTTGTAGGAAGCCCACCAACTCCTATCATTGACCCTGGCACTC
CTGGAACTCCTTTCGTTCCTGCTCCTTTTCCACCAATCACTGGAACATGCGATTACTGGA
GAAACCACCCTACACTCATATGGGGTCTTCTTGGCTGGTGGGGAACCGTTGGTGGAGCGT
TTGGTACAGTCAGTACTTCCAGTAGCATTCCAGGCTTTGATCCTCACATGAACCTTCTTC
AGGCACTTTCCAATACCCGCACCGATGCTATTGGAGCTCTCTACCGTGAAGGCACAGCGT
CTTGGTTAAACTCCATGGTCAGCAACAAGTTCCCTTTCACAACCCCTCAAGTCAGAGACC
ACTTTGTGGCAGGACTTTCCTCAACCAAGGCAGCAACAAAGCAGGCTCATACCTTCAAGC
TTGCTAATGAAGGTCGTCTAAAGCCTAGAAACTAGAAACAAGAGAGTTTCTCATTTATCA
CAGTCGTTTGTTGGTTTGCATTAAAACAATCTTGATTAATTATCCTATGCAGTGTGTGTG
CTCATTAGAGTTTTAGAGTGTCCTATAGCTTCTAGTAATATTTATGATGGATACTCCTTT
TATATTTG***TTGTTTTAAAATTTTCTTGATCTTAA*TAATAGTAGTACTATTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2DY01TF U 134
AF RR2DE52TF U 1
AF RR2DG92TF U 4
AF RR2EN55TF U 4
AF RR2CS78TF U 7
AF RR2DE52JQ C 406
AF RR2DG92JQ C 631
AF RR2DY01JQ C 537
BS 1 353 RR2DE52TF
BS 354 354 RR2DG92TF
BS 355 708 RR2DE52TF
BS 709 709 RR2DG92TF
BS 710 718 RR2DE52TF
BS 719 747 RR2DG92TF
BS 748 766 RR2EN55TF
BS 767 769 RR2CS78TF
BS 770 868 RR2DE52JQ
BS 869 869 RR2DG92JQ
BS 870 1018 RR2DE52JQ
BS 1019 1019 RR2DG92JQ
BS 1020 1034 RR2DE52JQ
BS 1035 1036 RR2DG92JQ
BS 1037 1088 RR2DE52JQ
BS 1089 1091 RR2DG92JQ
BS 1092 1117 RR2DE52JQ
BS 1118 1118 RR2DG92JQ
BS 1119 1138 RR2DE52JQ

RD RR2DY01TF 145 0 0
GTTTGCTTCCGTTACTTCCATAAGGTTCGAAGATGAGAAGACATACTACTCTCCTCCCTC
TGGACACGGCGGTTACACTCCCACTCCTAACTGTGGAAGTCCACCTTACTACCCAACTCC
TTCAACTCCATCTCACACTCCAACT

QA 1 145 1 145
DS 

RD RR2DE52TF 718 0 0
GGACCACCAAGGACCATACAACACAACACCATTTGCAAACAACTTCTGCTTTCTCTCACT
GAGTTTTTGAAATGAGAGGGATGAAGAGTCTAACTATTTGGGCTCTCTTTGCTGCTTTAC
TCTCACAGCAGCTGTTTGCTTCCGTTACTTCCATAAGGTTCGAAGATGAGAAGACATACT
ACTCTCCTCCCTCTGGACACGGCGGTTACACTCCCACTCCTAACTGTGGAAGTCCACCTT
ACGACCCAACTCCTTCAACTCCATCTCACACTCCAACTCCTTCGACTCCATCTCACACTC
CAACCCCACACACACCAACTCACCACACGCCTCCTTGTAACTGTGGGACTCCATCACACG
ACCCTTCCACACCTTCTCACCCTTCTACACCATCACATCCTTCGACGCCTTCACACCCTT
CAACGCCTCCTTCGGGTGGATATTACTCATCTCCTCCACCAAGTACTCCAGTCGTTGTGA
CTCCACCAACACCCATTGTTGTAGGAAGCCCACCAACTCCTATCATTGACCCTGGCACTC
CTGGAACTCCTTTCGTTCCTGCTCCTTTTCCACCAATCACTGGAACATGCGATTACTGGA
GAAACCACCCTACACTCATATGGGGTCTTCTTGGCTGGTGGGGAACCGTTGGTGGAGCGT
TTGGTACAGTCAGTACTTCCAGTAGCATTCCAGGCTTTGATCCTCACACGAACCTTCT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2DG92TF 744 0 0
GGACC
AAGGACCATACAACACAACACCATTTGCAAACAACTTCTGCTTTCTCTCACTGAGTTTTT
GAAATGAGAGGGATGAAGAGTCTAACTATTTGGGCTCTCTTTGCTGCTTTACTCTCACAG
CAGCTGTTTGCTTCCGTTACTTCCATAAGGTTCGAAGATGAGAAGACATACTACTCTCCT
CCCTCTGGACACGGCGGTTACACTCCCACTCCTAACTGTGGAAGTCCACCTTACGACCCA
ACTCCTTCAACTCCATCTCACACTCCAACTCCTTCGACTCCATCTCACACTCCAACCCCA
CACACACCAACTCACCACACGCCTCCTTGTAACTGTGGGACTCCACCTCACGACCCTTCC
ACACCTTCTCACCCTTCTACACCATCACATCCTTCGACGCCTTCACACCCTTCGACGCCT
CCTTCGGGAGGATATTACTC******TCCACCAAGTACTCCAGTCGTTGTGACTCCACCA
ACACCCATTGTTGTAGGAAGCCCACCAACTCCTATTATTGACCCTGGCACACCTGGAACT
CCTTTCGTTCCTGCTCCTTTTCCACCGATCACTGGAACATGCGATTACTGGAGAAACCAC
CCTACACTCATATGGGGTCTTCTTGGCTGGTGGGGAACCGTTGGTGGAGCGTTTGGTACA
GTCAGTACTTCCAGTAGCACTCCAGGCTTTGATCCTCACATGAACCTTCTTCAGGCACTT
TCCAATACCCGCACCGATG

QA 6 744 6 744
DS 

RD RR2EN55TF 763 0 0
GGACC
AAGGACCATACAACACAACACCATTTGCAAACAACTTCTGCTTTCTCTCACTGAGTTTTT
GAAATGAGAGGGATGAAGAGTCTAACTATTTGGGCTCTCTTTGCTGCTTTACTCTCACAG
CAGCTGTTTGCTTCCGTTACTTCCATAAGGTTCGAAGATGGGAAGACATACTACTCTCCT
CCCTCTGGACACGGCGGTTACACTCCCACTCCTAACTGTGGAAGTCCACCTTACGACCCA
ACTCCTTCAACTCCATCTCACACTCCAACTCCTTCGACTCCATCTCACACTCCAACCCCA
CACACACCAACTCACCACACGCCTCCTTGTAACTGTGGGACTCCACCTCACGACCCTTCC
ACACCTTCTCACCCTTCTACACCATCACATCCTTCGACGCCTTCACACCCTTCAACGCCT
CCTTCGGGAGGATATTACTC******TCCACCAAGTACTCCAGTCGTTGTGACTCCACCA
ACACCCATTGTTGTAGGAAGCCCACCAACTCCTATTATTGACCCTGGCACACCTGGAACT
CCTTTCGTTCCTGCTCCTTTTCCACCAATCACTGGAACATGCGATTACTGGAGAAACCAC
CCTACACTCATATGGGGTCTTCTTGGCTGGTGGGGAACCGTTGGTGGAGCGTTTGGTACA
GTCAGTACTTCCAGTAGCATTCCAGGCTTTGATCCTCACATGAACCTTCTTCAG*CACTT
TCCA*TACCCGCACCGATGCTATTGGAGCTCTCTACCG

QA 6 763 6 763
DS 

RD RR2CS78TF 763 0 0
GG
AAGGACCATACAACACAACACCATTTGCAAACAACTTCTGCTTTCTCTCACTGAGTTTTT
GAAATGAGAGGGATGAAGAGTCTAACTATTTGGGCTCTCTTTGCTGCTTTACTCTCACAG
CGGCTGTTTGCTTCCGTTACTTCCATAAGGTTCGAAGATGAGAAGACATACTACTCTCCT
CCCTCTGGACACGGCGGTTACACTCCCACTCCTAACTGTGGAAGTC*ACCTTACGACCCA
ACTCCTTCAACTCCATCTCACACTCCAACTCCTTCGACTCCATCTCACACTCCAACCCCA
CACACACCAACTCACCACACGCCTCCTTGTAACTGTGGGACTCCACCACACGACCCTTCC
ACACCTTCTCACCCTTCTACACCATCACATCCTTCGACGCCTTCACACCCTTCAACGCCT
CCTTCGGGTGGATATTACTCATCTCCTCCACCAAGTACTCCAGTCGTTGTGACTCCACCA
ACACCCATTGTTGTAGGAAGCCCACCAACTCCTATCATTGACCCTGGCACTCCTGGAACT
CCTTTCGTTCCTGCTCCTTTTCCACCAATCACTGGAACATGCGATTACTGGAGAAACCAC
CCTACACTCATATGGGGTCTTCTTGGCTGGTGGGGAACCGTTGGTGGAGCGTTTGGTACA
GTCAGTACTTCCAGTAGCATTCCAG*CTTTGATCCTCACACGAACCTTCTTCAG*CACTT
TCCAATACCCGCACCGATGCTATTGGAGCTCTCTACCGTGA

QA 3 763 3 763
DS 

RD RR2DE52JQ 733 0 0
CGCCTTCACACCCTTCAACGCCTCCTTCGGGTGGATATTACTCATCTCCTCCACCAAGTA
CTCCAGTCGTTGTGACTCCACCAACACCCATTGTTGTAGGAAGCCCACCAACTCCTATCA
TTGACCCTGGCACTCCTGGAACTCCTTTCGTTCCTGCTCCTTTTCCACCAATCACTGGAA
CATGCGATTACTGGAGAAACCACCCTACACTCATATGGGGTCTTCTTGGCTGGTGGGGAA
CCGTTGGTGGAGCGTTTGGTACAGTCAGTACTTCCAGTAGCATTCCAGGCTTTGATCCTC
ACACGAACCTTCTTCAGGCACTTTCCAATACCCGCACCGATGCTATTGGAGCTCTCTACC
GTGAAGGCACAGCGTCTTGGTTAAACTCCATGGTCAGCAACAAGTTCCCTTTCACAACCC
CTCAAGTCAGAGACCACTTTGTGGCAGGACTTTCCTCAACCAAAGCAGCAACAAAGCAGG
CTCATACCTTCAAGCTTGCTAATGAAGGTCGTCTAAAGCCTAGAAACTAGAAACAAGAGA
GTTTCTCATTTATCACAGTCGTTTGTTGGTTTGCATTAAAACAATCTTGATTAATTATCC
TATGCAGTGTGTGCGCTCATTAGAGTTTTTAAGTGTCCTATAGCTTCTAGTAATATTTAT
GATGGATACTCCTTTTATATTTGATGTTGTTTTAAAATTTTCTTGATCTTAAATAATAGT
AGTACTATTTACT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2DG92JQ 508 0 0
TTGGCTGGTGGGGAACCGTTGGTGGAGCGTTTGGTACAGTCAGTACTTCCAGTAGCACTC
CAGGCTTTGATCCTCACATGAACCTTCTTCAGGCACTTTCCAATACCCGCACCGATGCTA
TTGGAGCTCTCTACCGTGAAGGCACAGCGTCTTGGTTAAACTCCATGGTCAGCAACAAGT
TCCCTTTCACAACCCCTCAAGTCAGAGACCACTTTGTGGCAGGACTTTCCTCAACCAAGG
CAGCAACAAAGCAGGCTCATACCTTCAAGCTTGCTAATGAAGGTCGTCTAAAGCCTAGAA
ACTAGAAACAAGAGAGTTTCTCATTTATCACAGTCGTTTGTTGGTTTGCATTAAAACAAT
CTTGATTAATTATCCTATGCAGTGTGTGTGCTCATTAGAGTTTTAGAGTGTCCTATAGCT
TCTAGTAATATTTATGATGGATACTCCTTTTATATTTG***TTGTTTTAAAATTTTCTTG
ATCTTAA*TAATAGTAGTACTATTTA
TC

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2DY01JQ 602 0 0
ACA
CCTGGAACTCCTTTCGTTCCTGCTCCTTTTCCACCAATCACTGGAACATGCGATTACTGG
AGAAACCACCCTACACTCATATGGGGTCTTCTTGGCTGGTGGGGAACCGTTGGTGGAGCG
TTTGGTACAGTCAGTACTTCCAGTAGCATTCCAGGCTTTGATCCTCACATGAACCTTCTT
CAGGCACTTTCCAATACCCGCACCGATGCTATTGGAGCTCTCTACCGTGAAGGCACAGCG
TCTTGGTTAAACTCCATGGTCAGCAACAAGTTCCCTTTCACAACCCCTCAAGTCAGAGAC
CACTTTGTGGCAGGACTTTCCTCAACCAAGGCAGCAACAAAGCAGGCTCATACCTTCAAG
CTTGCTAATGAAGGTCGTCTAAAGCCTAGAAACTAGAAACAAGAGAGTTTTTCATTTATC
ACAGTCGTTTGTTGGTTTGCATTAAAACAATCTTGATTAATTATCCTATGCAGTGTGTGT
GCTCATTAGAGTTTTAGAGTGTCCTATAGCTTCTAGTAATATTTATGATGGATACTCCTT
TTATATTTG***TTGTTTTAAAATTTTCTTGATCTTAA*TAATAGTAGTACTATTTA
TT

QA 4 600 4 600
DS 



AS 2 8

CO CL893Contig1 754 4 8 U
AGGACCGTGAATCTCTCTGGAAAAAACGCAGTTTCTTTCCTACTATACTACGATGCTGGG
TGGTTTACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAACCT
ATCCTTTCATGGAGTGCGTGTGAGAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCA
CAAGCCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGTAAGTCTCACCA
AGTTCTCTGTGGCCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACT
CATTGACCTCCGTGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACTGAGGAGGCGTGT
TGGATCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGACATAGACA
TGGGATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGTAAGAG
AGTTGCTATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTGAAACCTCTCTGT
AGTAGCACCAGTCCACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGATCAAATAAGCAGACATGATTT
GCTGAGGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTTGTTCTGTAA
TACTCTCTAGCTTCTCTGGTCTCTTGGTTTTGGTTGTTATCCTTTAGAACATGGATCAAA
AAGTTAGCCCATTAACAACTTTTTCTTTGTCACC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG93TF U 1
AF RR2GC93JQ C 2
AF RR2GC93TF U 2
AF RR2CG93JQ C 42
BS 1 117 RR2CG93TF
BS 118 118 RR2GC93TF
BS 119 324 RR2CG93TF
BS 325 325 RR2GC93TF
BS 326 686 RR2CG93TF
BS 687 722 RR2GC93TF
BS 723 733 RR2GC93JQ
BS 734 754 RR2CG93JQ

RD RR2CG93TF 686 0 0
AGGACCGTGAATCTCTCTGGAAAAAACGCAGTTTCTTTCCTACTATACTACGATGCTGGG
TGGTTTACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCT
ATCCTTTCATGGAGTGCGTGTGAGAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCA
CAAGCCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGTAAGTCTCACCA
AGTTCTCTGTGGCCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACT
CATTGACCTCCGTGAAGAAGTTGGTATGCACCAACATGGTGATGAACTGAGGAGGCGTGT
TGGATCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGACATAGACA
TGGGATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGTAAGAG
AGTTGCTATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTGAAACCTCTCTGT
AGTAGCACCAGTCCACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGATCAAATAAGCAGACATGATTT
GCTGAGGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTTGTTCTGTAA
TACTCTCTAGCTTCTCTGGTCTCTTG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2GC93JQ 737 0 0
GG
ACCGTGAATCTCTCTGGAAAAAACGCAGTTTCTTTC*TACTATACTACGATGCTGGGTGG
TTTACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAACCTATC
CTTTCATGGAGTGCGTGTGAGAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAA
GCCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGTAAGTCTCACCAGGT
TCTCTGTGGCCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCAT
TGACCTCCGTGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACTGAGGAGGCGTGTTGG
ATCGGAGATACGGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGACATAGACATGG
GATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGTAAGAGAGT
TGCTATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTGAAATCTCTCTGTAGT
AGCACCAGTTTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGATCAAATAAGCAGACATGATTTGCT
GAGGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTTGTTCTGTAATAC
TCTCTAGCTTCTCTGGTCTCTTGGTTTTGGTTGTTATCCTTTAGAACATGGATCAAAAAG
TTAGCCCATT
AACAA

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR2GC93TF 721 0 0
GG
ACCGTGAATCTCTCTGGAAAAAACGCAGTTTCTTTCCTACTATACTACGATGCTGGGTGG
TTTACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAACCTATC
CTTTCATGGAGTGCGTGTGAGAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAA
GCCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGTAAGTCTCACCAGGT
TCTCTGTGGCCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCAT
TGACCTCCGTGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACTGAGGAGGCGTGTTGG
ATCGGAGATACGGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGACATAGACATGG
GATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGTAAGAGAGT
TGCTATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTGAAATCTCTCTGTAGT
AGCACCAGTCTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGATCAAATAAGCAGACATGATTTGCT
GAGGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTTGTTCTGTAATAC
TCTCTAGCTTCTCTGGTCTCTTGGTTTTGGTTGTTATCCTTTAGAACATGGATCAAAAA

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR2CG93JQ 713 0 0
ACTATACTACGATGCTGGGTGGTTTACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTC
AGTCTCTGCTTCGTAATCTATCCTTTCATGGAGTGCGTGTGAGAGGAATCCGTGTGGGAA
ACGCAGAGGTTCCAAACCACAAGCCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAG
GACGCCGTAAGTCTCACCAAGTTCTCTGTGGCCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAG
ACTTAACTGGCAAAGAACTCATTGACCTCCGTGAAGAAGTTGGTATGCACCAACATGGTG
ATGAACTGAGGAGGCGTGTTGGATCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACA
GAGGAAGTAGACATAGACATGGGATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTC
GCACCAAAAAGGGTAAGAGAGTTGCTATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGA
ACCCTTGAAACCTCTCTGTAGTAGCACCAGTCCACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGATC
AAATAAGCAGACATGATTTGCTGAGGAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGAT
TCTTGAACTTGTTCTGTAATACTCTCTAGCTTCTCTGGTCTCTTGGTTTTGGTTGTTATC
CTTTAGAACATGGATCAAAAAGTTAGCCCATTAACAACTTTTTCTTTGTCACC

QA 1 713 1 713
DS 



CO CL893Contig2 716 4 5 U
GGCACCGTGAATCTCTCTGGAAAAAACGCAGTTTCTTTCCTACTATACTACGATGCTGGG
TGGTTTACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCT
ATCCTTTCATGGAGTGCGTGTGAGAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCA
CAAGCCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGCAAGTCTCACCA
GGTTCTCTGTGGCCTCGGCATCACCAACAAACTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACT
CATTGACCTCCGTGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACTGAGGAGGCGTGT
TGGATCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAGGTAGACATAGACA
TGGGATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAG
AGTTGCTATTGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGGAACCCTTAAAACCTCTCTG
TAGTAGCACCAGTCTACGACTCTGTTTGGATGATCAAATAAGCAGACATGATTTGCTGAG
GAAGAAGAGAACTTCCAAAAGTAAGCATGAACTTGTTCTGTAATACTCTCTAGCTTTCTC
TTGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAACATGGATTAAAAGTTAGCCCATT


BQ
10 10 10 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G059TF U 1
AF RR2H050TF U 1
AF RR2H050JQ C 21
AF RR2FO77TF U 3
BS 1 406 RR2G059TF
BS 407 407 RR2H050TF
BS 408 511 RR2G059TF
BS 512 689 RR2H050TF
BS 690 716 RR2FO77TF

RD RR2G059TF 511 0 0
GGCACCGTGAATCTCTCTGGAAAAAACGCAGTTTCTTTCCTACTATACTACGATGCTGGG
TGGTTTACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCT
ATCCTTTCATGGAGTGCGTGTGAGAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCA
CAAGCCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGCAAGTCTCACCA
GGTTCTCTGTGGCCTCGGCATCACCAACAAACTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACT
CATTGACCTCCGTGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACTGAGGAGGCGTGT
TGGATCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGACATAGACA
TGGGATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAG
AGTTGCTATTGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCT

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2H050TF 690 0 0
GGC
ACCGTGAATCTCTCTGGAAAAAACGCAGTTTCTTTCCTACTATACTACGATGCTGGGTGG
TTTACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCTATC
CTTTCATGGAGTGCGTGTGAGAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAA
GCCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGCAAGTCTCACCAGGT
TCTCTGTGGCCTCGGCATCACCAACAAACTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCAT
TGACCTCCGTGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACTGAGGAGGCGTGTTGG
ATCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAGGTAGACATAGACATGG
GATGCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAGAGT
TGCTATTGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGGAACCCTTAAAACCTCTCTGTAG
TAGCACCAGTCTACGACTCTGTTTGGATGATCAAATAAGCAGACATGATTTGCTGAGGAA
GAAGAGAACTTCCAAAAGTAAGCATGAACTTGTTCTGTAATACTCTCTAGCTTTCTCTTG
TCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTT
A

QA 4 689 4 689
DS 

RD RR2H050JQ 669 0 0
AAAAAACGCAGTTTCTTTCCTACTATACTACGATGCTGGGTGGTTTACGCAGATCCGCGG
CGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCTATCCTTTCATGGAGTGCGTG
TGAGAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAAGCCCCTCAAGACCGGTC
TTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGCAAGTCTCACCAGGTTCTCTGTGGCCTCGGCA
TCACCAACAAACTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCATTGACCTCCGTGAAGAAG
TTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACTGAGGAGGCGTGTTGGATCGGAGATACAGAGAC
TGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAGGTAGACATAGACATGGGATGCCTTGCAGAGGTC
AAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAGAGTTGCTATTGCTGGAAAGA
AGAAAGCTCCTCGCAAGTAGGAACCCTTAAAACCTCTCTGTAGTAGCACCAGTCTACGAC
TCTGTTTGGATGATCAAATAAGCAGACATGATTTGCTGAGGAAGAAGAGAACTTCCAAAA
GTAAGCATGAACTTGTTCTGTAATACTCTCTAGCTTTCTCTTGTCTCTTGGTTTTGTTTG
TTATCCTTT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2FO77TF 714 0 0
GG
CCGTGAATCTCTCTGGAAAAAACGCAGTTTCTTTCCTACTATACTACGATGCTGGGTGGT
TTACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCTATCC
TTTCATGGAGTGCGTGTGAGAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAAG
CCCCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTT*ACGGAATAGGACGCCGCAAGTCTCACCAGGTT
CTCTGTGGCCTCGGCATCACCAACAAACTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCATT
GACCTCCGTGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAACTGAGGAGGCGTGTTGGA
TCGGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGACATAGACATGGG
ATGCCTTGCAGAGGTCGAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAGAGTT
GCTATTGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAAACCCTTAAAACCTCTCTGTAGT
AGCACCAGTCTACGACTCTGTTTGGATGATCAAATAAGCAGACATGATTTGCTGAGGAAG
AAGAGAACTTCCAAAAGTAAGCATGAACTTGTTCTGTAATACTCTCTAGCTTTCTCTTGT
CTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAACATGGATTAAAAGTTAGCCCATT

QA 3 714 3 714
DS 



AS 2 5

CO CL894Contig1 567 3 2 U
GGGAAGCTACAACTGAGAATCTTCTTTATTTTCTCAAGGAAAAAAAATCCAATTCCCATC
GGAAAGAAATGTCGGGTCGTGGAAAGGGAGGAAAGGGTTTGGGCAAAGGAGGAGCCAAGC
GTCACAGGAAGGTTCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAGCCTGCTATTCGGAGGT
TGGCTCGCAGGGGTGGAGTCAAGCGTATCAGTGGTCTGATCTACGAGGAGACACGTGGAG
TCCTCAAGATCTTTTTGGAGAACGTCATCCGTGACGCTGTGACATACACCGAGCACGCTA
GGAGGAAGACTGTGACGGCCATGGACGTCGTCTATGCTTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGC
TTTACGGATTCGGCGGTTAAGGGTCTTTTGAGATTTGCGTTTGCGTTTCTGGGTTAGGTG
TTGTTCTTCTGGAAATTTCTAATCAAATCGTGTTATCCAGTGTTTTCGTTTTTAATTCTG
TTTGGTTACGGTCTCTGTGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTTATATGTAATGTAATTACGCAT
TTTATCAATGAAGCTGTTCGAGTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ85TF U 1
AF RR2DQ85JQ C 252
AF RR2GV89TF U 9
BS 1 530 RR2DQ85TF
BS 531 567 RR2GV89TF

RD RR2DQ85TF 530 0 0
GGGAAGCTACAACTGAGAATCTTCTTTATTTTCTCAAGGAAAAAAAATCCAATTCCCATC
GGAAAGAAATGTCGGGTCGTGGAAAGGGAGGAAAGGGTTTGGGCAAAGGAGGAGCCAAGC
GTCACAGGAAGGTTCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAGCCTGCTATTCGGAGGT
TGGCTCGCAGGGGTGGAGTCAAGCGTATCAGTGGTCTGATCTACGAGGAGACACGTGGAG
TCCTCAAGATCTTTTTGGAGAACGTCATCCGTGACGCTGTGACATACACCGAGCACGCTA
GGAGGAAGACTGTGACGGCCATGGACGTCGTCTATGCTTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGC
TTTACGGATTCGGCGGTTAAGGGTCTTTTGAGATTTGCGTTTGCGTTTCTGGGTTAGGTG
TTGTTCTTCTGGAAATTTCTAATCAAATCGTGTTATCCAGTGTTTTCGTTTTTAATTCTG
TTTGGTTACGGTCTCTGTGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTTATATGTAATGT

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2DQ85JQ 257 0 0
TTTTTGGAGAACGTCATCCGTGACGCTGTGACATACACCGAGCACGCTAGGAGGAAGACT
GTGACGGCCATGGACGTCGTCTATGCTTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGCTTTACGGATTC
GGCGGTTAAGGGTCTTTTGAGATTTGCGTTTGCGTTTCTGGGTTAGGTGTTGTTCTTCTG
GAAATTTCTAATCAAATCGTGTTATCCAGTGTTTTCGTTTTTAATTCTGTTTGGTTACGG
TCTCTGTGTGTTGCGGT

QA 1 257 1 257
DS 

RD RR2GV89TF 559 0 0
GGAA
CTGAGAATCTTCTTTATTTTCTCAAGGAAAAAAAATCCAATTCCCATCGGAAAGAAATGT
CGGGTCGTGGAAAGGGAGGAAAGGGTTTGGGCAAAGGAGGAGCCAAGCGTCACAGGAAGG
TTCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAGCCTGCTATTCGGAGGTTGGCTCGCAGGG
GTGGAGTCAAGCGTATCAGTGGTCTGATCTACGAGGAGACACGTGGAGTCCTCAAGATCT
TTTTGGAGAACGTCATCCGTGACGCTGTGACATACACCGAGCACGCTAGGAGGAAGACTG
TGACGGCCATGGATGTCGTCTATGCTTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGCTTTACGGATTCG
GCGGTTAAGGGTCTTTTGAGATTTGCGTTTGCGTTTCTGGGTTAGGTGTTGTTCTTCTGG
AAATTTCTAATCAAATCGTGTTATCCAGTGTTTTCGTTTTTAATTCTGTTTGGTTACGGT
CTCTGTGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTTATATGTAATGTAATTACGCATTTTATCAATGAA
GCTGTTCGAGTTTAT

QA 5 559 5 559
DS 



CO CL894Contig2 567 2 2 U
GGGCTACAGCTGAGAATCTTCTTTGTTTTCTCAAGGAAAAAAAAATCCAATTCCCATCGG
AAAAAATGTCAGGTCGTGGAAAGGGAGGAAAGGGTTTGGGCAAAGGAGGAGCCAAGCGTC
ACAGGAAGGTTCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAGCCTGCTATTCGGAGGTTGG
CTCGCAGGGGTGGAGTCAAGCGTATCAGTGGTCTGATCTACGAGGAGACACGTGGAGTCC
TCAAGATCTTTTTGGAGAACGTCATCCGTGACGCCGTGACTTACACCGAGCACGCAAGGA
GGAAGACTGTGACGGCCATGGATGTCGTCTATGCGTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGCTTT
ACGGATTCGGCGGTTAAGGGTCTTTTGAGATTCGCGTTTGCGTTTCTGGGTTTCTTTTAG
GTGTTGTTCTGGAAATTTCTAATCAAATCGTGTTATCCCAGTGTTTTCGTTTTTAATTCT
GTTTGGGTACGGTCTTTGTGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTGACATGTAATGTAATTACGCA
TTTTATCAATGAAGCTGTTCGAGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2FX63TF U 1
AF RR2FX63JQ C 22
BS 1 566 RR2FX63TF
BS 567 567 RR2FX63JQ

RD RR2FX63TF 567 0 0
GGGCTACAGCTGAGAATCTTCTTTGTTTTCTCAAGGAAAAAAAAATCCAATTCCCATCGG
AAAAAATGTCAGGTCGTGGAAAGGGAGGAAAGGGTTTGGGCAAAGGAGGAGCCAAGCGTC
ACAGGAAGGTTCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAGCCTGCTATTCGGAGGTTGG
CTCGCAGGGGTGGAGTCAAGCGTATCAGTGGTCTGATCTACGAGGAGACACGTGGAGTCC
TCAAGATCTTTTTGGAGAACGTCATCCGTGACGCCGTGACTTACACCGAGCACGCAAGGA
GGAAGACTGTGACGGCCATGGATGTCGTCTATGCGTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGCTTT
ACGGATTCGGCGGTTAAGGGTCTTTTGAGATTCGCGTTTGCGTTTCTGGGTTTCTTTTAG
GTGTTGTTCTGGAAATTTCTAATCAAATCGTGTTATCCCAGTGTTTTCGTTTTTAATTCT
GTTTGGGTACGGTCTTTGTGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTGACATGTAATGTAATTACGCA
TTTTATCAATGAAGCTGTTCGAGTTT
T

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2FX63JQ 546 0 0
TTTG
TTTTCTCAAGGAAAAAAAAATCCAATTCCCATCGGAAAAAATGTCAGGTCGTGGAAAGGG
AGGAAAGGGTTTGGGCAAAGGAGGAGCCAAGCGTCACAGGAAGGTTTTGAGAGACAACAT
CCAGGGAATCACCAAGCCTGCTATTCGGAGGTTGGCTCGCAGGGGTGGAGTCAAGCGTAT
CAGTGGTTTGATTTACGAGGAGACACGTGGAGTCCTCAAGATCTTTTTGGAGAACGTCAT
CCGTGACGCCGTGACTTACACCGAGCACGCAAGGAGGAAGACTGTGACGGCCATGGATGT
CGTCTATGCGTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGCTTTACGGATTCGGCGGTTAAGGGTCTTT
TGAGATTCGCGTTTGCGTTTCTGGGTTTCTTTTAGGTGTTGTTCTGGAAATTTCTAATCA
AATCGTGTTATCCCAGTGTTTTCGTTTTTAATTCTGTTTGGGTACGGTCTTTGTGTGTTG
CGGTAGCGTTTCGTGACATGTAATGTAATTACGCATTTTATCAATGAAGCTGTTCGAGTT
TT

QA 5 546 5 546
DS 



AS 1 8

CO CL895Contig1 795 8 3 U
CTGTCTGTGAAGGAAGAAGAAAAATAAACCATTTGTTCTTTTCTTTGGCTGAGCGGCAAT
GGCAGAGGAGCAAAAGACAACTGCGGTTGACGTAGAATCACCGGCGGTTTTAGTTCCGGC
AAAAGAACCTGCTCAGGTGGAAGCTTCTAAAGACGTTGCGGAGGAGAAAGTTCATAATCC
ACCTCCTCCTGACGAGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGTTGAAAAACCCATTGAAGAGGCTAC
ACCAAAGAAAAGTTCATCTGGTTCCATGGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAA
AGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAAGCAGAGAA
CAAGGCACAAAAGAAGGTATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCCAAAAAGCAGCCAT
TGAAGCCCAACTAAGGAAGATAGAAGAAAAACTAGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGGTGA
GAAAATGAAGAACAAAGTGGCTGCGATCCACAAGCAAGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGGT
TGAAGCTAAAAGAGGAGAGGAGCTTCTTAAAGCTGAAGAAATGGCTGCCAAGTACAGAGC
CACTGGTATTGTACCCACGGCAACTTGTGGTTGTTTCTAAGTTGTTTCTCAGCTCATTTG
CTTGTGATCATTCATCTCTCTTTTTTT*TGTCTCAGTTACTCTTTCTTTGGTTGTTGTAT
TGTCTATATATTTGTGATTCTGTGTTTAATAGAAGATCAAGGTCAAAGAACTCATGAAGT
ATTCGTTATGATCGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 5 35 20 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY07TF U 97
AF RR2DO29TF U 1
AF RR2FK06TF U 1
AF RR2A479TF U 1
AF RR2F717TF U 24
AF RR2A479JQ C 37
AF RR2DO29JQ C 197
AF RR2F717JQ C 25
BS 1 743 RR2A479TF
BS 744 748 RR2F717TF
BS 749 795 RR2F717JQ

RD RR2CY07TF 316 0 0
ATCACCGGCGGTTTTAGTTCCGGCAAAAGAACCTGCTCAGGTGGAAGCTTCTAAAGACGT
TGCGGAGGAGAAAGTTCATAATCCACCTCCTCCTGACGAGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGT
TGAAAAACCCATTGAAGAGGCTACACCAAAGAAAAGTTCATCTGGTTCCATGGATAGAGA
TGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAAGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGA
GAGTGAGAAGTCAAAAGCAGAGAACAAGGCACAAAAGAAGGTATCTGATGTGCTTGCTTG
GGAGAACAGCCAAAAA

QA 1 316 1 316
DS 

RD RR2DO29TF 550 0 0
CTGTCTGTGAAGGAAGAAGAAAAATAAACCATTTGTTCTTTTCTTTGGCTGAGCGGCAAT
GGCAGAGGAGCAAAAGACAACTGCGGTTGACGTAGAATCACCGGCGGTTTTAGTTCCGGC
AAAAGAACCTGCTCAGGTGGAAGCTTCTAAAGACGTTGCGGAGGAGAAAGTTCATAATCC
ACCTCCTCCTGACGAGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGTTGAAAAACCCATTGAAGAGGCTAC
ACCAAAGAAAAGTTCATCTGGTTCCATGGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAA
AGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAAGCAGAGAA
CAAGGCACAAAAGAAGGTATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCCAAAAAGCAGCCAT
TGAAGCCCAACTAAGGAAGATAGAAGAAAAACTAGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGGTGA
GAAAATGAAGAACAAAGTGGCTGCGATCCACAAGCAAGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGGT
TGAAGCTAAA

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2FK06TF 615 0 0
CTGTCTGTGAAGGAAGAAGAAAAATAAACCATTTGTTCTTTTCTTTGGCTGAGCGGCAAT
GGCAGAGGAGCAAAAGACAACTGCGGTTGACGTAGAATCACCGGCGGTTT*AGTTCCGGC
AAAAGAACCTGCTCAGGTGGAAGCTTCTAAAGACGTTGCGGAGGAGAAAGTTCATAATCC
ACCTCCTCCTGACGAGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGTTGAAAAACCCATTGAAGAGGCTAC
ACCAAAGAAAAGTTCATCTGGTTCCATGGGTAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAA
AGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAAGCAGAGAA
CAAGGCACAAAAGAAGGTATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCCAAAAAGCAGCCAT
TGAAGCCCAACTAAGGAAGATAGAAGAAAAACTAGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGGTGA
GAAAATGAAGAACAAAGTGGCTGCGATCCACAAGCAAGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGGT
TGAAGCTAAAAGAGGAGGGGAGCTTCTTAAAGCTGAAGAAATGGCTGCCAAGTACAGAGC
CACTGGTATTGTACC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2A479TF 755 0 0
CTGTCTGTGAAGGAAGAAGAAAAATAAACCATTTGTTCTTTTCTTTGGCTGAGCGGCAAT
GGCAGAGGAGCAAAAGACAACTGCGGTTGACGTAGAATCACCGGCGGTTTTAGTTCCGGC
AAAAGAACCTGCTCAGGTGGAAGCTTCTAAAGACGTTGCGGAGGAGAAAGTTCATAATCC
ACCTCCTCCTGACGAGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGTTGAAAAACCCATTGAAGAGGCTAC
ACCAAAGAAAAGTTCATCTGGTTCCATGGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAA
AGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAAGCAGAGAA
CAAGGCACAAAAGAAGGTATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCCAAAAAGCAGCCAT
TGAAGCCCAACTAAGGAAGATAGAAGAAAAACTAGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGGTGA
GAAAATGAAGAACAAAGTGGCTGCGATCCACAAGCAAGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGGT
TGAAGCTAAAAGAGGAGAGGAGCTTCTTAAAGCTGAAGAAATGGCTGCCAAGTACAGAGC
CACTGGTATTGTACCCACGGCAACTTGTGGTTGTTTCTAAGTTGTTTCTCAGCTCATTTG
CTTGTGATCATTCATCTCTCTTTTTTT*TGTCTCAGTTACTCTTTCTTTGGTTGTTGTAT
TGTCTATATATTTGTGATTCTGT
TTAATAGAAGAT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2F717TF 730 0 0
GG
AAACCATTTGTTCTTTTCTTTGGCTGAGCGGCAATGGCAGAGGAGCAAAAGACAACTGCG
GTTGACGTAGAATCACCGGCGGTTTTAGCTCCGGCAAAAGAACCTGCTCAGGTGGAAGCT
TCTAAAGACGTTGCGGAGGAGAAAGTTCATAATCCACCTCCTCCTGACGAGTCCAAAGCT
CTTGCCGTTGTTGAAAAACCCATTGAAGAGGCTACACCAAAGAAAAGTTCATCTGGTTCC
ATGGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAAGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAA
GCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAAGCAGAGAACAAGGCACAAAAGAAGGTATCTGAT
GTGCTTGCTTGGGAGAACAGCCAAAAAGCAGCCATTGAAGCCCAACTAAGGAAGATAGAA
GAAAAACTAGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCTGCG
ATCCACAAGCAAGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAGAGGCGAGGAGCTT
CTTAAAGCTGAAGAAATGGCTGCCAAGTACAGAGCCACTGGTATTGTACCCACGGCAACT
TGTGGTTGTTTCTAAGTTGTTTCTCAGCTCATTTGCTTGT*ATCATTTATCTCTCTCTTT
TG*TGTCTCAGTTACT*TTTCTTTGTTTGT*GTCT*GT*TATATATTTGTGATTCTGTGT
TTA
TAGAG

QA 3 725 3 725
DS 

RD RR2A479JQ 737 0 0
TCTTTTCTTTGGCTGAGCGGCAATGGCAGAGGAGCAAAAGACAACTGCGGTTGACGTAGA
ATCACCGGCGGTTTTAGTTCCGGCAAAAGAACCTGCTCAGGTGGAAGCTTCTAAAGACGT
TGCGGAGGAGAAAGTTCATAATCCACCTCCTCCTGACGAGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGT
TGAAAAACCCATTGAAGAGGCTACACCAAAGAAAAGTTCATCTGGTTCCATGGATAGAGA
TGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAAGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGA
GAGTGAGAAGTCAAAAGCAGAGAACAAGGCACAAAAGAAGGTATCTGATGTGCTTGCTTG
GGAGAACAGCCAAAAAGCAGCCATTGAAGCCCAACTAAGGAAGATAGAAGAAAAACTAGA
GAAGAAGAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCTGCGATCCACAAGCA
AGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAGAGGAGAGGAGCTTCTTAAAGCTGA
AGAAATGGCTGCCAAGTACAGAGCCACTGGTATTGTACCCACGGCAACTTGTGGTTGTTT
CTAAGTTGTTTCTCAGCTCATTTGCTTGTGATCATTCATCTCTCTTTTTTT*TGTCTCAG
TTACTCTTTCTTTGGTTGTTGTATTGTCTATATATTTGTGATTCTGT**TTAATAGAAGA
TCAAGGTCAAAGAAC
CC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2DO29JQ 576 0 0
TCCAAAGCTCTTGCCGTTGTTGAAAAACCCATTGAAGAGGCTACACCAAAGAAAAGTTCA
TCTGGTTCCATGGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAAGAGAAGAAAACTTCA
TTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAAGCAGAGAACAAGGCACAAAAGAAG
GTTTTTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCCAAAAAGCAGCCATTGAAGCCCAACTAAGG
AAGATAGAAGAAAAACTAGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAA
GTGGCTGCGATCCACAAGCAAGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAGAGGA
GAGGAGCTTTTTAAAGCTGAAGAAATGGCTGCCAAGTACAGAGCCACTGGTATTGTACCC
ACGGCAACTTGTGGTTGTTTTTAAGTTGTTTTTCAGCTCATTTGCTTGTGATCATTCATC
TCTCTTTTTTT*TGTTTCAGTTACTCTTTCTTTGGTTGTTGTATTGTCTATATATTTGTG
ATTCTGT**TTAATAGAAGATCAAGGTCAAAGAAC
T

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2F717JQ 771 0 0
G
AAACCATTTGTTCTTTTCTTTGGCTGAGCGGCAATGGCAGAGGAGCAAAAGACAACTGCG
GTTGACGTAGAATCACCGGCGGTTTTAGCTCCGGCAAAAGAACCTGCTCAGGTGGAAGCT
TCTAAAGACGTTGCGGAGGAGAAAGTTCATAATCCACCTCCTCCTGACGAGTCCAAAGCT
CTTGCCGTTGTTGAAAAACCCATTGAAGAGGCTACACCAAAGAAAAGTTCATCTGGTTCC
ATGGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAAGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAA
GCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAAGCAGAGAACAAGGCACAAAAGAAGGTATCTGAT
GTGCTTGCTTGGGAGAACAGCCAAAAAGCAGCCATTGAAGCCCAACTAAGGAAGATAGAA
GAAAAACTAGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCTGCG
ATCCACAAGCAAGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAGAGGCGAGGAGCTT
CTTAAAGCTGAAGAAATGGCTGCCAAGTACAGAGCCACTGGTATTGTACCCACGGCAACT
TGTGGTTGTTTCTAAGTTGTTTCTCAGCTCATTTGCTTGT*ATCATTTATCTCTCTCTTT
TTGTGTCTCAGTTACTTTTTCTTTGTTTGTTGTCTTGTTTATATATTTGTGATTCTGTGT
TTAATAGAAGATCAAGGTCAAAGAACTCATGAAGTATTCGTTATGATCGC

QA 2 771 2 771
DS 



AS 1 8

CO CL896Contig1 654 8 10 U
GGAGAGAAGAGAGCGTGGTTCTTAAGCGTAATTATTCTCCGCCGCCTACTTGTTCAAAGA
AGAAAGAAGAGGAGAGGAGAGAGAGAAAATGGGAGGTGTATTATCATCTGTGTTAGGAGG
TGGTGGAGAAGAAGCAGTCGCAGGGAATGAATCCGAAAGTCGCGTCATGAAGTTTAGCTC
ATCGGCTCGGTGGCAGCTTCACTTCAACGAGATCAAAGAATCCTCCAAACTGCTGGTGGT
TGACTTCTCAGCATCCTGGTGTGGACCTTGTAGGATGATCGAGCCTGCCTTCATCGCCAT
GTCTGCCAAGTTCACTGATGTTGAATTCGTCAAATTGGATGTCGATGAACTTCCCGATGT
GGCTAAAGAGTTCAACGTGACGGGGATGCCAACTTTTGTGCTGGTGAAAAATGGTAAAGA
GATTGAAAGGATCGTTGGAGCAAGGAAAGATGAACTTGAGAAGAAAGTTCTCAAACACAG
GGCATAGTGAACCATTAAGTTAACACACCTTCACCAGATATAGCCATTGTGTAAAACTTA
TTACTATTAATAATTGGCTTTGTTGATCCCTCTTTCTCCCTTCTGTGTGATTGATTGAAA
CGGTTTGCTGAAAATGTTTTTTCCGACTCTGCTCTATCATAATCAAGTTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 35 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 0 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2HB24TF U 1
AF RR2HB24JQ C 38
AF RR2DT96JQ C 198
AF RR2DT96TF U 50
AF RR2EM49JQ C 46
AF RR2EM49TF U 46
AF RR2B809JQ C 54
AF RR2B809TF U 54
BS 1 172 RR2HB24TF
BS 173 173 RR2DT96TF
BS 174 288 RR2HB24TF
BS 289 289 RR2DT96TF
BS 290 505 RR2HB24TF
BS 506 506 RR2DT96TF
BS 507 598 RR2HB24TF
BS 599 623 RR2EM49TF
BS 624 625 RR2B809TF
BS 626 654 RR2EM49TF

RD RR2HB24TF 598 0 0
GGAGAGAAGAGAGCGTGGTTCTTAAGCGTAATTATTCTCCGCCGCCTACTTGTTCAAAGA
AGAAAGAAGAGGAGAGGAGAGAGAGAAAATGGGAGGTGTATTATCATCTGTGTTAGGAGG
TGGTGGAGAAGAAGCAGTCGCAGGGAATGAATCCGAAAGTCGCGTCATGAAGCTTAGCTC
ATCGGCTCGGTGGCAGCTTCACTTCAACGAGATCAAAGAATCCTCCAAACTGCTGGTGGT
TGACTTCTCAGCATCCTGGTGTGGACCTTGTAGGATGATCGAGCCTGCGTTCATCGCCAT
GTCTGCCAAGTTCACTGATGTTGAATTCGTCAAATTGGATGTCGATGAACTTCCCGATGT
GGCTAAAGAGTTCAACGTGACGGGGATGCCAACTTTTGTGCTGGTGAAAAATGGTAAAGA
GATTGAAAGGATCGTTGGAGCAAGGAAAGATGAACTTGAGAAGAAAGTTCTCAAACACAG
GGCATAGTGAACCATTAAGTTAACATACCTTCACCAGATATAGCCATTGTGTAAAACTTA
TTACTATTAATAATTGGCTTTGTTGATCCCTCTTTCTCCCTTCTGTGTGATTGATTGA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2HB24JQ 553 0 0
TCCGCCGCCTACTTGTTCAAAGAAGAAAGAAGAGGAGAGGAGAGAGAGAAAATGGGAGGT
GTATTATCATCTGTGTTAGGAGGTGGTGGAGAAGAAGCAGTCGCAGGGAATGAATCCGAA
AGTCGCGTCATGAAGCTTAGCTCATCGGCTCGGTGGCAGCTTCACTTCAACGAGATCAAA
GAATCCTCCAAACTGCTGGTGGTTGACTTCTCAGCATCCTGGTGTGGACCTTGTAGGATG
ATCGAGCCTGCGTTCATCGCCATGTCTGCCAAGTTCACTGATGTTGAATTCGTCAAATTG
GATGTCGATGAACTTCCCGATGTGGCTAAAGAGTTCAACGTGACGGGGATGCCAACTTTT
GTGCTGGTGAAAAATGGTAAAGAGATTGAAAGGATCGTTGGAGCAAGGAAAGATGAACTT
GAGAAGAAAGTTCTCAAACACAGGGCATAGTGAACCATTAAGTTAACATACCTTCACCAG
ATATAGCCATTGTGTAAAACTTATTACTATTAATAATTGGCTTTGTTGATCCCTCTTTCT
CCCTTCTGTGTGA

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2DT96JQ 368 0 0
TTCACTTCAACGAGATCAAAGAATCCTCCAAAATGCTGGTGGTTGACTTTTCAGCATCCT
GGTGTGGACCTTGTAGGATGATCGAGCCTGCCTTCATCGCCATGTTTGCCAAGTTCGCTG
ATGTTGAGTTTGTCAAATTGGATGTCGATGAACTTCCCGATGTGGGTAAAGAGTTCAACG
TGACGGGGATGCCAACTTTTGTGCTGGTGAAAAATGGTAAAGAGATTGAAAGGATCGTTG
GAGCAAGGAAAGATGAACTTGAGAAGAAAGTTTTCAAACACAGGGCATAGTGATCCATTG
AGTTAACACCCCTTCCCCAGATATAGCCATTGTGTAAAAATTATTACTATTAATAATTGG
CTTTGTTG

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR2DT96TF 516 0 0
GG
GTTCAAAGAAGAAAGAAGAGGAGAGGAGAGAGAGAAAATGGGAGGTGTATTATCATCTGT
GTTAGGAGGTGGTGGAGAAGAAGCAGTCGCAGGGAATGAATCCGAAAGTCGCGTCATGAA
GTTTAGCTCATCGGCTCGGTGGCAGCTTCACTTCAACGAGATCAAAGAATCCTCCAAACT
GCTGGTGGTTGACTTCTCAGCATCCTGGTGTGGACCTTGTAGGATGATCGAGCCTGCCTT
CATCGCCATGTCTGCCAAGTTCGCTGATGTTGAGTTCGTCAAATTGGATGTCGATGAACT
TCCCGATGTGGCTAAAGAGTTCAACGTGACGGGGATGCCAACTTTTGTGCTGGTGAAAAA
TGGTAAAGAGATTGAAAGGATCGTTGGAGCAAGGAAAGATGAACTTGAGAAGAAAGTTCT
CAAACACAGGGCATAGTGATCCATTGAGTTAACACACCTTCACCAGATATAGCCATTGTG
TAAAACTTATTACTATTAATAATTGGCTTTGTTG

QA 3 516 3 516
DS 

RD RR2EM49JQ 609 0 0
GG
ACTTGTTCAAAGAAGAAAGAAGAGGAGAGAAGAGAGAGAAAATGGGAGGTGTATTATCAT
CTGTGTTAGGAGGTGGTGGAGAAGAAGCAGTCGCAGGGAATGAATCCGAAAGTCGCGTCA
TGAAGTTTAGCTCATCGGCTCGGTGGCAGCTTCACTTCAACGAGATCAAAGAATCCTCCA
AACTGCTGGTGGTTGACTTCTCAGCATCCTGGTGTGGACCTTGTAGGATGATCGAGCCTG
CCTTCATCGCCATGTCTGCCAAGTTCGCTGATGTTGAGTTCGTCAAATTGGATGTCGATG
AACTTCCCGATGTGGCTAAAGAGTTCAAAGTGACGGGGATGCCAACTTTTGTGCTGGTGA
AAAATGGTAAAGAGATTGAAAGGATCGTTGGAGCAAGGAAAGATGAACTTGAGAAGAAAG
TTCTCAAACACAGGGCATAGTGATCCATTGAGTTAACACACCTTCACCAGATATAGCCAT
TGTGTAAAACTTATTACTATTAATAATTGGCTTTGTTGATCCCTCTTTCTCCCTTCTGTG
TGATTGATTGAAACGGTTTGCTGAAAATGTTTTTTC**ACTCTGCTCTATCATAATCAAG
TTTATGC

QA 3 609 3 609
DS 

RD RR2EM49TF 609 0 0
GG
ACTTGTTCAAAGAAGAAAGAAGAGGAGAGAAGAGAGAGAAAATGGGAGGTGTATTATCAT
CTGTGTTAGGAGGTGGTGGAGAAGAAGCAGTCGCAGGGAATGAATCCGAAAGTCGCGTCA
TGAAGTTTAGCTCATCGGCTCGGTGGCAGCTTCACTTCAACGAGATCAAAGAATCCTCCA
AACTGCTGGTGGTTGACTTCTCAGCATCCTGGTGTGGACCTTGTAGGATGATCGAGCCTG
CCTTCATCGCCATGTCTGCCAAGTTCGCTGATGTTGAGTTCGTCAAATTGGATGTCGATG
AACTTCCCGATGTGGCTAAAGAGTTCAAAGTGACGGGGATGCCAACTTTTGTGCTGGTGA
AAAATGGTAAAGAGATTGAAAGGATCGTTGGAGCAAGGAAAGATGAACTTGAGAAGAAAG
TTCTCAAACACAGGGCATAGTGATCCATTGAGTTAACACACCTTCACCAGATATAGCCAT
TGTGTAAAACTTATTACTATTAATAATTGGCTTTGTTGATCCCTCTTTCTCCCTTCTGTG
TGATTGATTGAAACGGTTTGCTGAAAATGTTTTTTC**ACTCTGCTCTATCATAATCAAG
TTTATGC

QA 3 609 3 609
DS 

RD RR2B809JQ 601 0 0
GG
AAAGAAGAAAGAAGAGGAGAG***AGAGAGAAAATGGGAGGTGTATTATCATCTGTGTTA
GGAGGTGGTGGAGAAGAAGCAGTCGCAGGGAATGAATCCGAAAGTCGCGTCATGAAGTTT
AGCTCATCGGCTCGGTGGCAGCTTCACTTCAACGAGATCAAAGAATCCTCCAAACTGCTG
GTGGTTGACTTCTCAGCATCCTGGTGTGGACCTTGTAGGATGATCGAGCCTGCGTTCATC
GCCATGTCTGCCAAGTTCACTGATGTTGAATTCGTCAAATTGGATGTCGATGAACTTCCC
GATGTGGCTAAAGAGTTCAACGTGACGGGGATGCCAACTTTTGTGCTGGTGAAAAATGGT
AAAGAGATTGAAAGGATCGTTGGAGCAAGGAAAGATGAACTTGAGAAGAAAGTTCTCAAA
CACAGGGCATAGTGAACCATTAAGTTAACATACCTTCACCAGATATAGCCATTGTGTAAA
ACTTATTACTATTAATAATTGGCTTTGTTGATCCCTCTTTCTCCCTTCTGTGTGATTGAT
TGAAACGGTTTGCTGAAAATGTTTTTTTCGACTCTGCTCTATCATAATCAAGTTTATGC

QA 3 601 3 601
DS 

RD RR2B809TF 601 0 0
GG
AAAGAAGAAAGAAGAGGAGAG***AGAGAGAAAATGGGAGGTGTATTATCATCTGTGTTA
GGAGGTGGTGGAGAAGAAGCAGTCGCAGGGAATGAATCCGAAAGTCGCGTCATGAAGTTT
AGCTCATCGGCTCGGTGGCAGCTTCACTTCAACGAGATCAAAGAATCCTCCAAACTGCTG
GTGGTTGACTTCTCAGCATCCTGGTGTGGACCTTGTAGGATGATCGAGCCTGCGTTCATC
GCCATGTCTGCCAAGTTCACTGATGTTGAATTCGTCAAATTGGATGTCGATGAACTTCCC
GATGTGGCTAAAGAGTTCAACGTGACGGGGATGCCAACTTTTGTGCTGGTGAAAAATGGT
AAAGAGATTGAAAGGATCGTTGGAGCAAGGAAAGATGAACTTGAGAAGAAAGTTCTCAAA
CACAGGGCATAGTGAACCATTAAGTTAACATACCTTCACCAGATATAGCCATTGTGTAAA
ACTTATTACTATTAATAATTGGCTTTGTTGATCCCTCTTTCTCCCTTCTGTGTGATTGAT
TGAAACGGTTTGCTGAAAATGTTTTTTTCGACTCTGCTCTATCATAATCAAGTTTATGC

QA 3 601 3 601
DS 



AS 2 7

CO CL897Contig1 1156 5 18 U
GGGAGCGAGACACTTTTACCGAACACAAAGATCAAGAGAGGAATTGTGACAAAAAAAAAA
AAAGATCAAGAGAGAGGAAAAAATGAGAGGGATCAAAAGCGGCGAGAAAACGCGCGTTTT
GGTGGTGGGAGCGACGGGTTACTTAGGGAAGAGAATCGTGAGGGCGTGTTTGGCTGAAGG
TCACGAAACTTACGTTCTGCAGCGACCAGAGATTGGTCTCGACATCGAGAAAGTCCAACT
CCTTTTCTCGTTCAAGAAACTTGGCGCTCGTCTCGTCGAAGCTTCTTTCGACGACCACCA
AAGCCTCGTATCAGCGGTGAAACTCGTAGACGTCGTTATCTCCGCCATGTCGGGCGTTCA
CTTCCGTAGCCATAACATCCTTGTCCAGCTCAAGCTCGTTGAAGCCATCAAAGAGGCTGG
TAATGTCGAGCGGTTTTTACCATCTGAGTTTGGTATGGATCCACCACGTATGGGACATGC
ATTACCACCAGGAAGAGAAACATTTGACCAAAAAATGGAAGTGCGTTATGCTATTGAAAC
TGCCGGAATACCTTACACTTACATTGTTGGCGCTTGCTTCGCGGCATATTTTGCCGGAAA
CTTATCTCAGATGGAAACTTTACTCCCTCCAAAGAAAAAAGCTAATATATATGGAGATGG
AAACATAAAAGTGGTGTTCGCCGATGAAGATGATATCGCAAAATACACCGCAAAAACACT
AGATGATCCGCGAACAGTGAACAAAACAGTTTATATCAGACCTCAG*ACAACGTTCTCAC
GCAAAATGAGTTGGTCAAGATTTGGGAAAAGCTAACCGGAAATGAATTGGAAAAAACCAA
TATTGCTGCAAAAGACTTCCTTGCTAACATTGAAAACATGGAGATTCCACATCAAGCAGG
GATAGGACACTTTTATCATATCTTCTATGAAGGATGTCTCACTGATCACGAAGTTGGAGA
AGATGAAGAAGCGTCAAGTCTCTATCCAGATGTTGTACAAGCGTATGGATGATTATTTGA
GAATGTTCCTCTGATTACAATTTGCTCAAAATCATATCTATGATAAATATGCATTTAATA
AGTTTGAAGTTCGTGTTACTCAAAGTTGAATGTACTCATTATGCAACAAATATATATATG
ATCTCTTGTTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN77JQ C 555
AF RR2AN77TF U 1
AF RR2EB17TF U 63
AF RR2G335TF U 19
AF RR2EB17JQ C 384
BS 1 193 RR2AN77TF
BS 194 194 RR2EB17TF
BS 195 427 RR2AN77TF
BS 428 428 RR2EB17TF
BS 429 447 RR2AN77TF
BS 448 448 RR2EB17TF
BS 449 514 RR2AN77TF
BS 515 515 RR2EB17TF
BS 516 526 RR2AN77TF
BS 527 527 RR2EB17TF
BS 528 715 RR2AN77TF
BS 716 716 RR2EB17TF
BS 717 729 RR2AN77TF
BS 730 730 RR2EB17TF
BS 731 789 RR2AN77TF
BS 790 790 RR2EB17TF
BS 791 834 RR2AN77TF
BS 835 1156 RR2EB17JQ

RD RR2AN77JQ 157 0 0
ACACTTACATTGTTGGCGCTTGCTTCGCGGCATATTTTGCCGGAAACTTATTTCAGATGG
AAACTTTACTCCCTCCAAAGAAAAAAGCTAATATATATGGAGATGGAAACATAAAAGTGG
TGTTCGCCGATGAAGATGATATCGCAAAATACACCGC

QA 1 157 1 157
DS 

RD RR2AN77TF 834 0 0
GGGAGCGAGACACTTTTACCGAACACAAAGATCAAGAGAGGAATTGTGACAAAAAAAAAA
AAAGATCAAGAGAGAGGAAAAAATGAGAGGGATCAAAAGCGGCGAGAAAACGCGCGTTTT
GGTGGTGGGAGCGACGGGTTACTTAGGGAAGAGAATCGTGAGGGCGTGTTTGGCTGAAGG
TCACGAAACTTACTTTCTGCAGCGACCAGAGATTGGTCTCGACATCGAGAAAGTCCAACT
CCTTTTCTCGTTCAAGAAACTTGGCGCTCGTCTCGTCGAAGCTTCTTTCGACGACCACCA
AAGCCTCGTATCAGCGGTGAAACTCGTAGACGTCGTTATCTCCGCCATGTCGGGCGTTCA
CTTCCGTAGCCATAACATCCTTGTCCAGCTCAAGCTCGTTGAAGCCATCAAAGAGGCTGG
TAATGTCAAGCGGTTTTTACCATCTGATTTTGGTATGGATCCACCACGTATGGGACATGC
ATTACCACCAGGAAGAGAAACATTTGACCAAAAACTGGAAGTGCGTCATGCTATTGAAAC
TGCCGGAATACCTTACACTTACATTGTTGGCGCTTGCTTCGCGGCATATTTTGCCGGAAA
CTTATCTCAGATGGAAACTTTACTCCCTCCAAAGAAAAAAGCTAATATATATGGAGATGG
AAACATAAAAGTGGTGTTCGCCGATGAAGATGATATCGCAAAATACACCGCAAAA*CACT
AGATGATCCACGAACAGTGAACAAAACAGTTTATATCAGACCTCAG*ACAACGTTCTCAC
GCAAAATGAATTGGTCAAGATTTGGGAAAAGCTAACCGGAAATGAATTGGAAAA

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR2EB17TF 752 0 0
GGACAAAGACCAAGAG
AAAAATGGGAGGGCTCAAAAGCGGCGAGAAAACGCGCGTTTTGGTGGTGGGAGCGACGGG
TTACTTAGGGAAGAGAATCGTGAGGGCGTGTTTGGCTGAAGGTCACGAAACTTACGTTTT
GCAGCGACCAGAGATTGGTCTCGACATCGAGAAAGTCCAACTCCTTTTCTCATTCAAGAA
ACTTGGCGCTCGTCTAGTCGAAGCTTCTTTCTCCGACCACCAAAGCCTCGTATCAGCGGT
GAAACTCGTAGACGTCGTTGTCTCCGCCATGTCGGGCGTTCACTTCCGTAGCCATAACAT
CCTTGTCCAGCTCAAGCTCGTTGAAGCCATCAAAGAGGCTGGTAATGTCGAGCGGTTTTT
ACCATCTGAGTTTGGTATGGATCCACCACGTATGGGACATGCATTACCACCAGGAAGAGA
AACATTTGACCAAAAAATGGAAGTGCGTTATGCTATTGAAACTGCCGGAATACCTTACAC
TTACATTGTTGGTGCTTACTTCGCGGCATATTTTGCCGGAAACTTATCTCAGATGGAAAC
TTTACTCCCTTCAAAGAAAAAAGCTAATGTATATGGAGATGGAAACATAAAAGTGGTGTT
CGCCGATGAAGATGATATCGCAAAATACACCGCAAAAACACTAGATGATCCGCGAACAGT
GAACAAAACAGTTTATATCAGACCTCAG*ACAACGTTCTCACGCAAAATGAGTTGGTCA*
GATTTGGGAAAAGCTA

QA 17 752 17 752
DS 

RD RR2G335TF 767 0 0
GG
GAACACAAAGATCAAGAGAGGAATTGTGACAAAAAAAAAAAAAGATCAAGAGAGAGGAAA
AAATGAGAGGGATCAAAAGCGGCGAGAAAACGCGCGTTTTGGTGGTGGGAGCGACGGGTT
ACTTAGGGAAGAGAATCGTGAGGGCGTGTTTGGCTGAAGGTCACGAAACTTACGTTCTGC
AGCGACCAGAGATTGGTCTCGACATCGAGAAAGTCCAACTCCTTTTCTCGTTCAAGAAAC
TTGGCGCTCGTCTCGTCGAAGCTTCTTTCGACGACCACCAAAGCCTCGTATCAGCGGTGA
AACTCGTAGACGTCGTTATCTCCGCCATGTCGGGCGTTCACTTCCGTAGCCATAACATCC
TTGTCCAGCTCAAGCTCGTTGAAGCCATCAAAGAGGCTGGTAATGTCAAGCGGTTTTTAC
CATCTGAGTTTGGTATGGATCCACCACGTATGGGACATGCATTACCACCAGGAAGAGAAA
CATTTGACCAAAAACTGGAAGTGCGTCATGCTATTGAAACTGCCGGAATACCTTACACTT
ACATTGTTGGCGCTTGCTTCGCGGCATATTTTGCCGGAAACTTATCTCAGATGGAAACTT
TACTCCCTCCAAGGAAAAAAGCTAATATATATGGAGATGGAAACATAAAAGTGGTGTTCG
CCGATGAAGATGATATCGCAAA*TACACCGCAAAA*CACTAGATGATCCACGAACAGTGA
ACAAAACAGTTTATATCAGACCTCAG*ACAACGTTCTCACGCAAA

QA 3 767 3 767
DS 

RD RR2EB17JQ 773 0 0
TCCAGCTCAAGCTCGTTGAAGCCATCAAAGAGGCTGGTAATGTCGAGCGGTTTTTACCAT
CTGAGTTTGGTATGGATCCACCACGTATGGGACATGCATTACCACCAGGAAGAGAAACAT
TTGACCAAAAAATGGAAGTGCGTTATGCTATTGAAACTGCCGGAATACCTTACACTTACA
TTGTTGGTGCTTACTTCGCGGCATATTTTGCCGGAAACTTATCTCAGATGGAAACTTTAC
TCCCTTCAAAGAAAAAAGCTAATGTATATGGAGATGGAAACATAAAAGTGGTGTTCGCCG
ATGAAGATGATATCGCAAAATACACCGCAAAAACACTAGATGATCCGCGAACAGTGAACA
AAACAGTTTATATCAGACCTCAGGACAACGTTCTCACGCAAAATGAGTTGGTCAAGATTT
GGGAAAAGCTAACCGGAAATGAATTGGAAAAAACCAATATTGCTGCAAAAGACTTCCTTG
CTAACATTGAAAACATGGAGATTCCACATCAAGCAGGGATAGGACACTTTTATCATATCT
TCTATGAAGGATGTCTCACTGATCACGAAGTTGGAGAAGATGAAGAAGCGTCAAGTCTCT
ATCCAGATGTTGTACAAGCGTATGGATGATTATTTGAGAATGTTCCTCTGATTACAATTT
GCTCAAAATCATATCTATGATAAATATGCATTTAATAAGTTTGAAGTTCGTGTTACTCAA
AGTTGAATGTACTCATTATGCAACAAATATATATATGATCTCTTGTTTTTATT

QA 1 773 1 773
DS 



CO CL897Contig2 1040 2 4 U
GGAGCAAATACAAAGATCAAGAGAAAAAAATGGGAGAGATCAAAAGCGGTGAGAAAACGC
GCGTTTTAGTGGTAGGAGCGACGGGTTACTTAGGGAAGAGAATCGTGAGGGCGTGTCTGG
CTGAAGGTCACGAGACTTACGTTTTGCAGCGGCCAGAGATTGGTCTCGACATCGAGAAAG
TCCAACTCCTTCTCTCTTTCAAGAAACTCGGCGCTCGTCTAGTCGAAGCTTCATTCTCCG
ACCACCAAAGCCTCGTATCAGCGGTGAAACTCGTAGACGTCGTTGTCTCCGCCATGTCGG
GCGTTCACTTCCGTAGCCATAACATCCTTATCCAGCTCAAGCTCGTTGAAGCCATCAAAG
AGGCTGGTAATGTCAAGCGGTTTTTACCATCTGAGTTTGGTATGGATCCACCACGTATGG
GACACGCATTACCACCAGGAAGAGAAACGTTTGACCAAAAAATGGAAGTGCGTCATGCTA
TTGAAGCTGTCGGAATCCCTTATACTTACGTCGTTGGCGCTTGCTTCGCGGCATATTTTG
CCGGAAACTTATCTCAGATGGAAGCTTTACTTCCTCCAAAGAAAAAAACTAATATATATG
GAGATGGAAACATAAAAGTGGTGTTCGCCGATGAAGACGATATCGCAAAATACACCGCAA
AAACACTAGACGATCCACGAACAGCGAACAAAACCGTGTATATCAGACCTCAGGACAACG
TTTTCACGCAAAATGAATTGGTTAAGATTTGGGAAAACCTAACCGGAAATGAATTAGAAA
AGAACAATATTGCTGCAAAAGACTTCCTTGCCAACATTGAACACATGGAGATTCCACACC
AAGCAGGGATAGGACATTTTTATCATATTTTTTATGAAGGATGTCTCACTGATCACGAAG
TCAGAGAAGATGAAGAAGCGTCAAGTTTATATCCGGATGTCAAGTACAAGGGTATGGATG
ATTATTTAAGAATGTACCTCTGATTACAATTTGGTCAAAATCATAGCTATGATAAATATG
CATATCATAAGTTTGAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ62TF U 1
AF RR2CQ62JQ C 493
BS 1 662 RR2CQ62TF
BS 663 663 RR2CQ62JQ
BS 664 704 RR2CQ62TF
BS 705 1040 RR2CQ62JQ

RD RR2CQ62TF 704 0 0
GGAGCAAATACAAAGATCAAGAGAAAAAAATGGGAGAGATCAAAAGCGGTGAGAAAACGC
GCGTTTTAGTGGTAGGAGCGACGGGTTACTTAGGGAAGAGAATCGTGAGGGCGTGTCTGG
CTGAAGGTCACGAGACTTACGTTTTGCAGCGGCCAGAGATTGGTCTCGACATCGAGAAAG
TCCAACTCCTTCTCTCTTTCAAGAAACTCGGCGCTCGTCTAGTCGAAGCTTCATTCTCCG
ACCACCAAAGCCTCGTATCAGCGGTGAAACTCGTAGACGTCGTTGTCTCCGCCATGTCGG
GCGTTCACTTCCGTAGCCATAACATCCTTATCCAGCTCAAGCTCGTTGAAGCCATCAAAG
AGGCTGGTAATGTCAAGCGGTTTTTACCATCTGAGTTTGGTATGGATCCACCACGTATGG
GACACGCATTACCACCAGGAAGAGAAACGTTTGACCAAAAAATGGAAGTGCGTCATGCTA
TTGAAGCTGTCGGAATCCCTTATACTTACGTCGTTGGCGCTTGCTTCGCGGCATATTTTG
CCGGAAACTTATCTCAGATGGAAGCTTTACTTCCTCCAAAGAAAAAAACTAATATATATG
GAGATGGAAACATAAAAGTGGTGTTCGCCGATGAAGACGATATCGCAAAATACACCGCAA
AA*CACTAGACGATCCACGAACAGCGAACAAAACCGTGTATATC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2CQ62JQ 548 0 0
GAATCCCTTATACTTACGTCGTTGGCGCTTGCTTCGCGGCATATTTTGCCGGAAACTTAT
TTCAGATGGAAGCTTTACTTCCTCCAAAGAAAAAAACTAATATATATGGAGATGGAAACA
TAAAAGTGGTGTTCGCCGATGAAGACGATATCGCAAAATACACCGCAAAAACACTAGACG
ATCCACGAACAGGGAACAAAACCGTGTATATCAGACCTCAGGACAACGTTTTCACGCAAA
ATGAATTGGTTAAGATTTGGGAAAACCTAACCGGAAATGAATTAGAAAAGAACAATATTG
CTGCAAAAGACTTCCTTGCCAACATTGAACACATGGAGATTCCACACCAAGCAGGGATAG
GACATTTTTATCATATTTTTTATGAAGGATGTCTCACTGATCACGAAGTCAGAGAAGATG
AAGAAGCGTCAAGTTTATATCCGGATGTCAAGTACAAGGGTATGGATGATTATTTAAGAA
TGTACCTCTGATTACAATTTGGTCAAAATCATAGCTATGATAAATATGCATATCATAAGT
TTGAATGT

QA 1 548 1 548
DS 



AS 2 8

CO CL898Contig1 746 3 3 U
GGAAGAAAAAGAAATAGCCTTTGTTGACATCTTCTCTCTGTTTAAGAGTTTCATCCTTAT
CCGTTCCATCAATTTCTCTCTCTCTCTCTTAGCTTTCAGTTTGATTTGATCTTCTTATAT
TCTTATTACATTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAGCAAAGGC
AGCAGCTTTAAGCTTGAGAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGA
GAGAAGTACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCA
AACATTGACAAGAAAAAATACCTTGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAGTTCGTGTAT
GTGATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCAGAGAAGGCTATCTTCATATTCGTAGACAAT
GTTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGAT
GGCTTCCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATC
CTCTAACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATA
TAATAAGTATCATTCTCTCAGCATAATCTTCTCATGATTTGTGATTTTTCTTCTTCTTCA
TTTGGGTTCAATAATGTAAAGTAAGACTAATTGAAATATTCTCTTCATTTGCATTATTAT
TGTCTTATAATATTATTTTAGTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ89TF U 1
AF RR2FH05TF U 27
AF RR2EJ89JQ C 105
BS 1 479 RR2EJ89TF
BS 480 691 RR2FH05TF
BS 692 746 RR2EJ89JQ

RD RR2EJ89TF 479 0 0
GGAAGAAAAAGAAATAGCCTTTGTTGACATCTTCTCTCTGTTTAAGAGTTTCATCCTTAT
CCGTTCCATCAATTTCTCTCTCTCTCTCTTAGCTTTCAGTTTGATTTGATCTTCTTATAT
TCTTATTACATTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAGCAAAGGC
AGCAGCTTTAAGCTTGAGAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGA
GAGAAGTACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCA
AACATTGACAAGAAAAAATACCTTGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAGTTCGTGTAT
GTGATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCAGAGAAGGCTATCTTCATATTCGTAGACAAT
GTTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGA

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR2FH05TF 672 0 0
GG
ATCTTCTCTCTGTTTAAGAGTTTCATCCTTATCCGTTCCATCAATTTCTCTCTCTCTCTC
TTAGCTTTCAGTTTGATTTGATCTTCTTATATTCTTATTACATTCGACTTTAGATTTGGT
GTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAGCAGCTTTAAGCTTGAGAACGATTACG
AAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGAGAGAAGTACCCTGATAGAATCCCGGTGA
TTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAACATTGACAAGAAAAAATACCTTGTGC
CATCAGACCTAACAGTAGGGCAGTTCGTGTATGTGATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTG
CAGAGAAGGCTACCTTCATATTCGTAGACAATGTTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGT
CAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATGGCTTCCTTTACATTACTTACAGTGGCG
AGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCCTCTAACCTGAGAAACGCATGTATTCTG
ATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATATAATAAGTATCATTCTCTCAGCATAATC
TTCTCATGATTTGTGATTTTTCTTCTTCTTCATTTGGGTTCAATAATGTAAAGTAAGACT
AAT
TGAAATA

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR2EJ89JQ 642 0 0
TTTGATCTTCTTATATTCTTATTACATTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGT
AAAGATGAGCAAAGGCAGCAGCTTTAAGCTTGAGAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGA
AGCTGATAGGATCAGAGAGAAGTACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGA
GAAAAGTGATATCCCAAACATTGACAAGAAAAAATACCTTGTGCCATCAGACCTAACAGT
AGGGCAGTTCGTGTATGTGATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCAGAGAAGGCTATCTT
CATATTCGTAGACAATGTTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGA
GAAGAAAGACCAAGATGGCTTCCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGC
TTCTTCATTCTGAATCCTCTAACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCT
TTCAACTTTGTGTATATAATAAGTATCATTCTCTCAGCATAATCTTCTCATGATTTGTGA
TTTTTCTTCTTCTTCATTTGGGTTCAATAATGTAAAGTAAGACTAATTGAAATATTCTCT
TCATTTGCATTATTATTGTCTTATAATATTATTTTAGTTACG

QA 1 642 1 642
DS 



CO CL898Contig2 713 5 5 U
GGACAAGAAAAAGAAATAGCCTTTGTTGACATCTTCTCTCTGTTAAAAGAGTTTCATCCT
TATCCGTTCCATCAATTTCTCTCTCTGTTAGCTTTGAGTTTGATTTGATCTTCTTGTATT
CTTATTACGTTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCA
GCAGCTTTAAGCTTGACAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGG
AGAAGTACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAA
ACATTGACAAGAAAAAA*TACCTTGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTAT
GTGATTCGAAAGAGGATCAAACTGAGTGCAGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAAT
GTTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGAT
GGCTTCCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATC
CTCTAACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATA
TAATAAGTATCGTTCTCTCAGCATAATCTTCTCAAGATTTGTGATTTTTTT*CTTCTTCA
CTTTGTGTTCAATAATGTAAAGTAAGACTAATATGAAATATTTTCTTCATTGG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR2H210JQ C 1
AF RR2GP91TF U 26
AF RR2H210TF U 1
AF RR2GZ57JQ C 12
AF RR2GZ57TF U 12
BS 1 4 RR2H210JQ
BS 5 27 RR2H210TF
BS 28 671 RR2GP91TF
BS 672 708 RR2H210TF
BS 709 713 RR2GZ57JQ

RD RR2H210JQ 708 0 0
GGACAAGAAAAAGAAATAGCCTTTGTTGACATCTTCTCTCTGTTAAAAGAGTTTCATCCT
TATCCGTTCCATCAATTTCTCTCTCTGTTAGCTTTGAGTTTGATTTGATCTTCTTGTATT
CTTATTACGTTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCA
GCAGCTTTAAGCTTGACAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGG
AGAAGTACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAA
ACATTGACAAGAAAAAAATACCTTGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTAT
GTGATTCGAAAGAGGATCAAACTGAGTGCAGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAAT
GTTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGAT
GGCTTCCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATC
CTCTAACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATA
TAATAAGTATCGTTCTCTCAGCATAATCTTCTCAAGATTTGTGATTTTTTT*CTTCTTCA
CTTTGTGTTCAATAATGTAAAGTAAGACTAATATGAAATATTTTCTTC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2GP91TF 650 0 0
GG
GACATCTTCTCTCTGTTAAAAGAGTTTCATCCTTATCCGTTCCATCAATTTCTCTCTCTG
TTAGCTTTGAGTTTGATTTGATCTTCTTGTATTCTTATTACGTTCGACTTTAGATTTGGT
GTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAGCAGCTTTAAGCTTGACAACGATTACG
AAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGAGAAGTACCCTGATAGAATCCCGGTGA
TTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAACATTGACAAGAAAAAA*TACCTTGTG
CCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATGTGATTCGAAAGAGGATCAAACTGAGT
GCAGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATGTTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATG
TCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATGGCTTCCTTTACATTACTTACAGTGGC
GAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCCTCTAACCTGAGAAACGCATGTATTCT
GATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATATAATAAGTATCGTTCTCTCAGCATAAT
CTTCTCAAGATTTGTGATTTTTTT*CTTCTTCACTTTGTGTTCA
TAAT

QA 3 646 3 646
DS 

RD RR2H210TF 708 0 0
GGAC
AAGAAAAAGAAATAGCCTTTGTTGACATCTTCTCTCTGTTAAAAGAGTTTCATCCTTATC
CGTTCCATCAATTTCTCTCTCTGTTAGCTTTGAGTTTGATTTGATCTTCTTGTATTCTTA
TTACGTTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAGCAG
CTTTAAGCTTGACAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGAGAA
GTACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAACAT
TGACAAGAAAAAAATACCTTGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATGTGA
TTCGAAAGAGGATCAAACTGAGTGCAGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATGTTC
TTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATGGCT
TCCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCCTCT
AACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATATAAT
AAGTATCGTTCTCTCAGCATAATCTTCTCAAGATTTGTGATTTTTTT*CTTCTTCACTTT
GTGTTCAATAATGTAAAGTAAGACTAATATGAAATATTTTCTTC

QA 5 708 5 708
DS 

RD RR2GZ57JQ 702 0 0
AGAAATAGCCTTTGTTGACATCTTCTCTCTGTTAAAAGAGTTTCATCCTTATCCGTTCCA
TCAATTTCTCTCTCTGTTAGCTTTGAGTTTGATTTGATCTTCTTGTATTCTTATTACGTT
CGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAGCAGCTTTAAG
CTTGACAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATGGGATCAGGGAGAAGTACCCT
GATAGAATCCCGGTGATCGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAACATTGACAAG
AAAAAA*TACCTTGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATGTGATTCGAAA
GAGGATCAAACTGAGTGCAGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATGTTCTTCCTCC
TACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATGGCTTCCTTTA
CATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCCTCTAACCTGA
GAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAGTCTTTCAACTTTGTGTATATAATAAGTATC
GTTCTCTCAGCATAATCTTCTCAAGATTTGTGATTTTTTTTCTTCTTCACTTTGTGTTCA
ATAATGTAAAGTAAGACTAATATGAAATATTTTCTTCATTGG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2GZ57TF 695 0 0
AGAAATAGCCTTTGTTGACATCTTCTCTCTGTTAAAAGAGTTTCATCCTTATCCGTTCCA
TCAATTTCTCTCTCTGTTAGCTTTGAGTTTGATTTGATCTTCTTGTATTCTTATTACGTT
CGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAGCAGCTTTAAG
CTTGACAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATGGGATCAGGGAGAAGTACCCT
GATAGAATCCCGGTGATCGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAACATTGACAAG
AAAAAA*TACCTTGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATGTGATTCGAAA
GAGGATCAAACTGAGTGCAGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATGTTCTTCCTCC
TACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATGGCTTCCTTTA
CATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCCTCTAACCTGA
GAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAGTCTTTCAACTTTGTGTATATAATAAGTATC
GTTCTCTCAGCATAATCTTCTCAAGATTTGTGATTTTTTT*CTTCTTCACTTTGTGTTCA
ATAATGTAAAGTAAGACTAATATGAAATATTTTCT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 2 8

CO CL899Contig1 756 3 12 U
GGTTTTCGATCTGAGAGAAAAAGAGAGAGAGCGTGAGAAGAAGAGGAAGAATCAAAAAGA
AGAGATGGGAGAATCGAACTCGTTTGTGGATGGATTGAAAGGATTCTGGGCGTAGAAGTT
ATCATTCCTGGAGAATTACACCAGGTTCACCAAACGTGACACGCCTCTTCCTTCTTGGTC
TTCCTCCGACGTCGATGAGTTCATTGCCTCCGATCCCGTCAATGGACCCACCCTGAAAAC
AGCTAGGGAAGCTGCGACTTTTGGTGCTACTGGAGCCGCACTTGGAGCTGTGTCCACTGC
TGCTTTTGCTTGGAAATGCTCCAGGAGTCCACATGGTACTGCACTGTCCTTCTTAGGAGG
AGGTCTTTTTGGTTGGACCTTTGGGCAAGAAGTAGCCAACCACACGATGCAACAGTATAA
GCTGGACACAATGGCTGCTCAAGTTAAGTTCATGGAATGGTGGGGGCGCAAGTCTCAAGG
AAGGTCCTGAACCCAGAAAACAGAGAGACGCTTGCTACTTTCTCGCCCAAGATTTGTCTT
GCAAAACAACATGAGATGGTGGTAGCAGTTAAACCCATTTTCAGACTCTCTTTCGAACCT
TTTCTTTATCCTCTCACTCTTGAAAACATATGTTTGTTTTCCATGTCTCAATAATTCAAC
TAGCTCCATGG*AGAATGTTGAGTAGATGAATCGAAACAAACTAAATGGTCTCATTTGGA
TTTCTATAATAAGAAGTTTATTCAGTGTTAAATACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO68TF U 114
AF RR2A191TF U 1
AF RR2GO68JQ C 169
BS 1 317 RR2A191TF
BS 318 318 RR2GO68TF
BS 319 386 RR2A191TF
BS 387 387 RR2GO68TF
BS 388 413 RR2A191TF
BS 414 414 RR2GO68TF
BS 415 464 RR2A191TF
BS 465 465 RR2GO68TF
BS 466 573 RR2A191TF
BS 574 574 RR2GO68TF
BS 575 749 RR2A191TF
BS 750 756 RR2GO68JQ

RD RR2GO68TF 596 0 0
AGAAGTTATCATTCCTGGAGAATTACACCAGGTT*ACCAAACGTGACACGCCTCTTCCTT
CTTGGTCTTCCTCCGACGTCGATGAGTTCATTGCCTCCGATCCCGTCAATGGACCCACCC
TGAAAACAGCTAGGGAAGCTGCGACTTTTGGTGCTACTGGAGCCGCACTTGGAGCTGTGT
CCACTGCTGCTTTTGCTTGGAAATGCTCCAGGAGTCCACATGGTACTGCACTGTCCTTCT
TAGGAGGAGGTCTTTTTGGTTGGACCTTTGGGCAAGAAGTAGCCAACCACACGATGCAAC
AGTATAAGCTGGACACAATGGCTGCTCAAGTTAAGTTCATGGAATGGTGGGGGCGCAAGT
CTCAAGGAAGGTCCTGAACCCAGAAAACAGAGAGACGCTTGCTACTTTCTCGCCCAAGAT
TTGTCTTGCAAAACAACATGAGATGGTGGTAGCAGTTAAACCCATTTTCAGACTCTCTTT
CGAACCTTTTCTTTATCCTCTCACTCTTGAAA*CATATGTTTGTTTTCCATGTCTCAATA
ATTCAACTAGCTCCATGGGAGAATGTTGAGTAGATGAATCGAAACAAACTAAATGG

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2A191TF 750 0 0
GGTTTTCGATCTGAGAGAAAAAGAGAGAGAGCGTGAGAAGAAGAGGAAGAATCAAAAAGA
AGAGATGGGAGAATCGAACTCGTTTGTGGATGGATTGAAAGGATTCTGGGCGTAGAAGTT
ATCATTCCTGGAGAATTACACCAGGTTCACCAAACGTGACACGCCTCTTCCTTCTTGGTC
TTCCTCCGACGTCGATGAGTTCATTGCCTCCGATCCCGTCAATGGACCCACCCTGAAAAC
AGCTAGGGAAGCTGCGACTTTTGGTGCTACTGGAGCCGCACTTGGAGCTGTGTCCACTGC
TGCTTTTGCTTGGAAATACTCCAGGAGTCCACATGGTACTGCACTGTCCTTCTTAGGAGG
AGGTCTTTTTGGTTGGACCTTTGGGCTAGAAGTAGCCAACCACACGATGCAACTGTATAA
GCTGGACACAATGGCTGCTCAAGTTAAGTTCATGGAATGGTGGGAGCGCAAGTCTCAAGG
AAGGTCCTGAACCCAGAAAACAGAGAGACGCTTGCTACTTTCTCGCCCAAGATTTGTCTT
GCAAAACAACATGAGATGGTGGTAGCAGTTAAATCCATTTTCAGACTCTCTTTCGAACCT
TTTCTTTATCCTCTCACTCTTGAAAACATATGTTTGTTTTCCATGTCTCAATAATTCAAC
TAGCTCCATGG*AGAATGTTGAGTAGATGAATCGAAACAAACTAAATGGTCTCATTTGGA
TTTCTATAATAAGAAGTTTATTCAGTGTT
A

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2GO68JQ 588 0 0
TCCTTCTTGGTCTTCCTCCGACGTCGATGAGTTCATTGCCTCCGATCCCGTCAATGGACC
CACCCTGAAAACAGCTAGGGAAGCTGCGACTTTTGGTGCTACTGGAGCCGCACTTGGAGC
TGTGTCCACTGCTGCTTTTGCTTGGAAATGCTCCAGGAGTCCACATGGTACTGCACTGTC
CTTTTTAGGAGGAGGTCTTTTTGGTTGGACCTTTGGGCAAGAAGTAGCCAACCACACGAT
GCAACAGTATAAGCTGGACACAATGGCTGCTCAAGTTAAGTTCATGGAATGGTGGGGGCG
CAAGTCTCAAGGAAGGTCCTGAACCCAGAAAACAGAGAGACGCTTGCTACTTTCTCGCCC
AAGATTTGTCTTGCAAAACAACATGAGATGGTGGTAGCAGTTAAACCCATTTTCAGACTC
TCTTTCGAACCTTTTCTTTATCCTCTCACTCTTGAAAACATATGTTTGTTTTCCATGTCT
CAATAATTCAACTAGCTCCATGG*AGAATGTTGAGTAGATGAATCGAAACAAACTAAATG
GTCTCATTTGGATTTCTATAATAAGAAGTTTATTCAGTGTTAAATACG

QA 1 588 1 588
DS 



CO CL899Contig2 744 5 17 U
GGAATCTGAGAGAAAAAGAGAGAGAGCGTGAGAAGAAGAGGAAGAATCAAAAAGAAGAGA
TGGGAGAATCGAACTCGTTTGTGGATGGATTGAAGGGATTCTGGGCGGAGAAGTTATCAT
TCCTGTAGAATTACACGAGGTTCACCAAACGTGACACGCCTCTTCCTTCTTGGTCTTCCT
CCGACGTCGATGAGTTCATTGCCTCCGATCCCGTCAATGGACCCACCCTGAAAACAGCTA
GGGAAGCTGCGACTTTTGGTGCTACTGGAGCCGCACTTGGAGCTGTGTCCACTGCTGCTT
TTGCTTGGAAATACTCCAGGAGTCCACATGGTACTGCACTGTCCTTCTTAGGAGGAGGTC
TTTTTGGTTGGACCTTTGGGCAAGAAGTAGCCAACCACACGATGCAACTGTATAAGCTGG
ACACAATGGCTGCTCAAGTTAAGTTCATGGAATGGTGGGAGCGCAAGTCTCAAGGAAGGT
CCTGAACCCAGAAAACAGAGAGACGGGTGCTACTTTCTCGGCCAAGATTTGTCTTGCAAA
ACAACATGAGATGGTGGTAGCAGTTAAATCCATTTTCAGACTCTCTTTCGAACCTTTCTT
TATCCTCGCTCTCGAAAACATGTTTGTTTTCCATGTCTCAATAATTCAACAAGCTCCATG
GAGAATGTTGAGTAGATGAATCGGAAAAAACTAAATGGTCTCATTTGGATTTTTATAATA
AGAAGTTTATTCAGTGTTAAATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN33TF U 1
AF RR2H053TF U 11
AF RR2A179TF U 12
AF RR2H053JQ C 59
AF RR2DN33JQ C 183
BS 1 125 RR2DN33TF
BS 126 126 RR2H053TF
BS 127 485 RR2DN33TF
BS 486 486 RR2H053TF
BS 487 494 RR2DN33TF
BS 495 495 RR2H053TF
BS 496 627 RR2DN33TF
BS 628 628 RR2H053TF
BS 629 689 RR2DN33TF
BS 690 690 RR2A179TF
BS 691 713 RR2DN33TF
BS 714 714 RR2A179TF
BS 715 723 RR2DN33TF
BS 724 724 RR2H053TF
BS 725 734 RR2DN33TF
BS 735 738 RR2H053TF
BS 739 744 RR2DN33JQ

RD RR2DN33TF 734 0 0
GGAATCTGAGAGAAAAAGAGAGAGAGCGTGAGAAGAAGAGGAAGAATCAAAAAGAAGAGA
TGGGAGAATCGAACTCGTTTGTGGATGGATTGAAGGGATTCTGGGCGGAGAAGTTATCAT
TCCTGGAGAATTACACGAGGTTCACCAAACGTGACACGCCTCTTCCTTCTTGGTCTTCCT
CCGACGTCGATGAGTTCATTGCCTCCGATCCCGTCAATGGACCCACCCTGAAAACAGCTA
GGGAAGCTGCGACTTTTGGTGCTACTGGAGCCGCACTTGGAGCTGTGTCCACTGCTGCTT
TTGCTTGGAAATACTCCAGGAGTCCACATGGTACTGCACTGTCCTTCTTAGGAGGAGGTC
TTTTTGGTTGGACCTTTGGGCAAGAAGTAGCCAACCACACGATGCAACTGTATAAGCTGG
ACACAATGGCTGCTCAAGTTAAGTTCATGGAATGGTGGGAGCGCAAGTCTCAAGGAAGGT
CCTGAGCCCAGAAA*CAGAGAGACGGGTGCTACTTTCTCGGCCAAGATTTGTCTTGCAAA
ACAACATGAGATGGTGGTAGCAGTTAAATCCATTTTCAGACTCTCTTTCGAACCTTTCTT
TATCCTCGCTCTCGAAAACATGTTTGTCTTCCATGTCTCAATAATTCAACAAGCTCCATG
GAGAATGTTGAGTAGATGAATCGGAAAAA*CTAAATGGTCTCATTTGGATTTT*ATAATA
AGA*GTTTATTCAG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2H053TF 728 0 0
GGA
AAAAGAGAGAGAGCGTGAGAAGAAGAGGAAGAATCAAAAAGAAGAGATGGGAGAATCGAA
CTCGTTTGTGGATGGATTGAAGGGATTCTGGGCGGAGAAGTTATCATTCCTGTAGAATTA
CACGAGGTTCACCAAACGTGACACGCCTCTTCCTTCTTGGTCTTCCTCCGACGTCGATGA
GTTCATTGCCTCCGATCCCGTCAATGGACCCACCCTGAAAACAGCTAGGGAAGCTGCGAC
TTTTGGTGCTACTGGAGCCGCACTTGGAGCTGTGTCCACTGCTGCTTTTGCTTGGAAATA
CTCCAGGAGTCCACATGGTACTGCACTGTCCTTCTTAGGAGGAGGTCTTTTTGGTTGGAC
CTTTGGGCAAGAAGTAGCCAACCACACGATGCAACTGTATAAGCTGGACACAATGGCTGC
TCAAGTTAAGTTCATGGAATGGTGGGAGCGCAAGTCTCAAGGAAGGTCCTGAACCCAGAA
AACAGAGAGACGGGTGCTACTTTCTCGGCCAAGATTTGTCTTGCAAAACAACATGAGATG
GTGGTAGCAGTTAAATCCATTTTCAGACTCTCTTTCGAACCTTTCTTTATCCTCGCTCTC
GAAAACATGTTTGTTTTCCATGTCTCAATAATTCAACAAGCTCCATGGAGAATGTTGAGT
AGATGAATCGGAAAAA*CTAAATGGTCTCATTTGGATTTT*ATAATAAGAAGTTTATTCA
GTGTT

QA 4 728 4 728
DS 

RD RR2A179TF 727 0 0
GG
AAAAGAGAGAGAGCGTGAGAAGAAGAGGAAGAATCAAAAAGAAGAGATGGGAGAATCGAA
CTCGTTTGTGGATGGATTGAAGGGATTCTGGGCGGAGAAGTTATCATTCCCGGAGAATTA
CACGAGGTTCACCAAACGTGACACGCCTCTTCCTTCTTGGTCTTCCTCCGACGTCGATGA
GTTCATTGCCTCCGATCCCGTCAATGGACCCACCCTGAAAACAGCTAGGGAAGCTGCGAC
TTTTGGTGCTACTGGAGCCGCACTTGGAGCTGTGTCCACTGCTGCTTTTGCTTGGAAATA
CTCCAGGAGTCCACATGGTACTGCACTGTCCTTCTTAGGAGGAGGTCTTTTTGGTTGGAC
CTTTGGGCAAGAAGTAGCCAACCACACGATGCAACTGTATAAGCTGGACACAATGGCTGC
TCAAGTTAAGTTCATGGAATGGTGGGAGCGCAAGTCTCAAGGAAGGTCCTGAACCCAGAA
AACAGAGAGACGGGTGCTACTTTCTCGGCCAAGATTTGTCTTGCAAAACAGCATGAGATG
GTGGTAGCAGTTAAATCCATTTTCAGACTCTCTTTCGAACCTTTCTTTATCCTCGCTCTC
GAAAACATGTTTGTTTTCCATGTCTCAATAATTCAACAAGCTCCATGGAGAATGTTGAGT
AGATGAATCGGAAAAAACTAAATGGTCTCATTTGGATTTTTATAATAAGAAGTTTATTCA
GTGTT

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR2H053JQ 680 0 0
GATGGGAGAATCGAACTCGTTTGTGGATGGATTGAAGGGATTCTGGGCGGAGAAGTTATC
ATTCCTGTAGAATTACACGAGGTTCACCAAACGTGACACGCCTCTTCCTTCTTGGTCTTC
CTCCGACGTCGATGAGTTCATTGCCTCCGATCCCGTCAATGGACCCACCCTGAAAACAGC
TAGGGAAGCTGCGACTTTTGGTGCTACTGGAGCCGCACTTGGAGCTGTGTCCACTGCTGC
TTTTGCTTGGAAATACTCCAGGAGTCCACATGGTACTGCACTGTCCTTCTTAGGAGGAGG
TCTTTTTGGTTGGACCTTTGGGCAAGAAGTAGCCAACCACACGATGCAACTGTATAAGCT
GGACACAATGGCTGCTCAAGTTAAGTTCATGGAATGGTGGGAGCGCAAGTCTCAAGGAAG
GTCCTGAACCCAGAAAACAGAGAGACGGGTGCTACTTTTTCGGCCAAGATTTGTCTTGCA
AAACAACATGAGATGGTGGTAGCAGTTAAATCCATTTTCAGACTTTCTTTCGAACCTTTC
TTTATCCTCGCTCTCGAAAACATGTTTGTTTTCCATGTCTCAATAATTCAACAAGCTCCA
TGGAGAATGTTGAGTAGATGAATCGGAAAAAACTAAATGGTCTCATTTGGATTTTTATAA
TAAGAAGTTTATTCAGTGTT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2DN33JQ 562 0 0
GACGTCGATGAGTTCATTGCCTCCGATCCCGTCAATGGACCCACCCTGAAAACAGCTAGG
GAAGCTGCGACTTTTGGTGCTACTGGAGCCGCACTTGGAGCTGTGTCCACTGCTGCTTTT
GCTTGGAAATACTCCAGGAGTCCACATGGTACTGCACTGTCCTTCTTAGGAGGAGGTCTT
TTTGGTTGGACCTTTGGGCAAGAAGTAGCCAACCACACGATGCAACTGTATAAGCTGGAC
ACAATGGCTGCTCAAGTTAAGTTCATGGAATGGTGGGAGCGCAAGTCTCAAGGAAGGTCC
TGAGCCCAGAAA*CAGAGAGACGGGTGCTACTTTCTCGGCCAAGATTTGTCTTGCAAAAC
AACATGAGATGGTGGTAGCAGTTAAATCCATTTTCAGACTCTCTTTCGAACCTTTCTTTA
TCCTCGCTCTCGAAAACATGTTTGTCTTCCATGTCTCAATAATTCAACAAGCTCCATGGA
GAATGTTGAGTAGATGAATCGGAAAAAACTAAATGGTCTCATTTGGATTTTTATAATAAG
AAGTTTATTCAGTGTTAAATCT

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 7

CO CL900Contig1 1239 7 5 U
GATAAGAAAATTGAGTCTAAACTGGAGTTAATATGTTTTCTTTAACGTACTGCATATGGA
TGTATGTATCTCAAACTAGTAAAATCAGAACAAGGTGGTCTATGTATGACCAAACACCAA
GTTACAACGAGTCCTTAACACTTTTTTCTTACTCTTGTTTTCGACAAAGGACGAGAGAAA
CTGCGAACAAGGAACTAAGAAACCGAGATCTCTTCAACGCTGCTGATTTCTTCAGTCAGC
TCATGTTGTACTTTGGGCTCCAAGTCGATGAACTGGTTCGACTTGCTTGCTAGGTGTGAG
ATACTAACTCTTCCTTGACGTTTGATGTAATCCGCAACCGCATTCATCTCTTCCATTGAT
ATGTAAATGTATTTTCCTCTATCATCCATAACCCCC*GAGAGGCGCCCAATGCTCTCCAA
CGAGGCGATCCTGTTGATGCATTCCTGAGTTCTTAGATGAAACTCTGCTGCAAGATCTTC
AAGTGGAACACATTTCTGTTTCTTAATGTATTCAACAAATTCTGAAAGCAAATCTTGATT
TCCACCTTCCACTTCCTCCGTGGTACCTTCAGCATCGACTGAGAACTCTCCTTTCCATTT
GTCAAACTCTAACGCAGCTGCCTCTTCTTCCTTGGCTTGTCGTGCTTTTTCTTCTTCTTC
CAACTTCCGCTCCTCTGCCTCACGCTCTTCGTCCTTCTTCCTCCGCATCTCTGCATACCA
GTCTTGTTTTGTACTTCTTGACTCGCGTGCAGCTTCTTCAGCCTGTCTTTGTTCTTCTCG
TTCTTGTCGCTTCTTCTCTTTCTTCTTTGAAGCTCTGGCCTGATTCCCACCGGCTTCATC
TTCATCCTCATCTTCACTCCCGCTGATGTTTTCTTGAACGTTTGATGAAGAAGAGGAGCT
AGCACCAGCTGCAGAAGCTGCAGGTCTCCGACGCATTCTACGCCCACCACCACCAGTAGC
ACGTCCCACGTTTTCACGCGCCTGAAAAAAAGTCAAATCCATTTCGCCAACAATGAAACG
AAAGTTGAGAAATTTTACCTGCGGAGGTGCTGCATCTTCCTCACGTGATCTACTTGTACT
ATCTACCCGACGTTTCCACAAGAACAAGGGTATCACCGCAGCTATGAGAATCATTGGGAC
TATCAGAGCGAACATCTCTTCCATCTCTCCTTACCTAAATTGCGTTTCTTTTCACGTTTT
CTTGTCTTCTCCTTATTCGTAGTTTAACCTAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH50JQ U 44
AF RR2A472JQ U 1
AF RR2BS22JQ U 86
AF RR2CF70JQ U 86
AF RR2CF70TF C 215
AF RR2A472TF C 311
AF RR2DH50TF C 571
BS 1 805 RR2A472JQ
BS 806 828 RR2BS22JQ
BS 829 891 RR2CF70JQ
BS 892 941 RR2CF70TF
BS 942 1239 RR2DH50TF

RD RR2DH50JQ 692 0 0
AACGTACTGCATATGGATGTATGTATCTCAAACTAGTAAAATCAGAACAAGGTGGTCTAT
GTATGACCAAACACCAAGTTACAACGAGTCCTTAACACTTTTTTCTTACTCTTGTTTTCG
ACAAAGGACGAGAGAAACTGCGAACAAGGAACTAAAAAACCGAGATCTCTTCAACGCTGC
TGATTTCTTCAGTCAGCTCATGTTGTACTTTGGGCTCCAAGTCGATGAACTGGTTCGACT
TGCTTGCTAGGTGTGAGATACTAACTCTTCCTTGACGTTTGATGTAATCCGCAACCGCAT
TCATCTCTTCCATTGATATGTAAATGTATTTTCCTCTATCATCCATAACCCCC*GAGAGG
CGCCCAATGCTCTCCAACGAGGCGATCCTGTTGATGCATTCCTGAGTTCTTAGATGAAAC
TCTGCTGCAAGATCTTCAAGTGGAACACATTTCTGTTTCTTAATGTATTCAACAAATTCT
GAAAGCAAATCTTGATTTCCACCTTCCACTTCCTCCGTGGTACCTTCAGCATCGACTGAG
AACTCTCCTTTCCATTTGTCAAACTCTAACGCAGCTGCCTCTTCTTCCTTGGCTTGTCGT
GCTTTTTCTTCTTCTTCCAACTTCCGCTCCTCTGCCTCACGCTCTTCGTCCTTCTTCCTC
CGCATCTCTGCATACCAGTCTTGTTTTGTACT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2A472JQ 805 0 0
GATAAGAAAATTGAGTCTAAACTGGAGTTAATATGTTTTCTTTAACGTACTGCATATGGA
TGTATGTATCTCAAACTAGTAAAATCAGAACAAGGTGGTCTATGTATGACCAAACACCAA
GTTACAACGAGTCCTTAACACTTTTTTCTTACTCTTGTTTTCGACAAAGGACGAGAGAAA
CTGCGAACAAGGAACTAAGAAACCGAGATCTCTTCAACGCTGCTGATTTCTTCAGTCAGC
TCATGTTGTACTTTGGGCTCCAAGTCGATGAACTGGTTCGACTTGCTTGCTAGGTGTGAG
ATACTAACTCTTCCTTGACGTTTGATGTAATCCGCAACCGCATTCATCTCTTCCATTGAT
ATGTAAATGTATTTTCCTCTATCATCCATAACCCCC*GAGAGGCGCCCAATGCTCTCCAA
CGAGGCGATCCTGTTGATGCATTCCTGAGTTCTTAGATGAAACTCTGCTGCAAGATCTTC
AAGTGGAACACATTTCTGTTTCTTAATGTATTCAACAAATTCTGAAAGCAAATCTTGATT
TCCACCTTCCACTTCCTCCGTGGTACCTTCAGCATCGACTGAGAACTCTCCTTTCCATTT
GTCAAACTCTAACGCAGCTGCCTCTTCTTCCTTGGCTTGTCGTGCTTTTTCTTCTTCTTC
CAACTTCCGCTCCTCTGCCTCACGCTCTTCGTCCTTCTTCCTCCGCATCTCTGCATACCA
GTCTTGTTTTGTACTTCTTGACTCGCGTGCAGCTTCTTCAGCCTGTCTTTGTTCTTCTCG
TTCTTGTCGCTTCTTCTCTTTCTTC

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2BS22JQ 743 0 0
CAA
AACAAGGTGGTCTATGTATGACCAAACACCAAGTTACAACGAGTCCTTAACACTTTTTTC
TTACTCTTGTTTTCGACAAAGGACGAGAGAAACTGCGAACAAGGAACTAAGAAACCGAGA
TCTCTTCAACGCTGCTGATTTCTTCAGTCAGCTCATGTTGTACTTGGGGCTCCAAGTCGA
TGAACTGGTTCGACTTGCTTGCTAGGTGTGAGATACTAACTCTTCCTTGACGTTTGATGT
AATCCGCAACCGCATTCATCTCTTCCATTGATATGTAAATGTATTTTCCTCTATCATCCA
TAACCCCC*GAGAGGCGCCCAATGCTCTCCAACGAGGCGATCCTGTTGATGCATTCCTGA
GTTCTTAGATGAAACTCTGCTGCAAGATCTTCAAGTGGAACACATTTCTGTTTCTTAATG
TATTCAACAAATTCTGAAAGCAAATCTTGATTTCCACCTTCCACTTCCTCCGTGGTACCT
TCAGCATCGACTGAGAACTCTCCTTTCCATTTGTCAAACTCTAACGCAGCTGCCTCTTCT
TCCTTGGCTTGTCGTGCTTTTTCTTCTTC***CAACTTCCGCTCCTCTGCCTCACGCTCT
TCGTCCTTCTTCCTCCGCATCTCTGCATACCAGTCTTGTTTTGTACTTCTTGACTCGCGT
GCAGCTTCTTCAGCCTGTCTTTGTTCTTCTCGTTCTTGTCGCTTCTTCTCTTTCTTCTTT
GAAGCTCTGGCCTGATTCCC

QA 4 743 4 743
DS 

RD RR2CF70JQ 806 0 0
GAG
AACAAGGTGGTCTATGTATGACCAAACACCAAGTTACAACGAGTCCTTAACACTTTTTTC
TTACTCTTGTTTTCGACAAAGGACGAGAGAAACTGCGAACAAGGAACTAAGAAACCGAGA
TCTCTTCAACGCTGCTGATTTCTTCAGTCAGCTCATGTTGTACTTTGGGCTCCAAGTCGA
TGAACTGGTTCGACTTGCTTGCTAGGTGTGAGATACTAACTCTTCCTTGACGTTTGATGT
AATCCGCAACCGCATTCATCTCTTCCATTGATATGTAAATGTATTTTCCTCTATCATCCA
TAACCCCC*GAGAGGCGCCCAATGCTCTCCAACGAGGCGATCCTGTTGATGCATTCCTGA
GTTCTTAGATGAAACTCTGCTGCAAGATCTTCAAGTGGAACACATTTCTGTTTCTTAATG
TATTCAACAAATTCTGAAAGCAAATCTTGATTTCCACCTTCCACTTCCTCCGTGGTACCT
TCAGCATCGACTGAAAACTCTCCTTTCCATTTGTCAAACTCTAACGCAGCTGCCTCTTCT
TCCTTGGCTTGTCGTGCTTTTTCTTCTTCTTCCAACTTCCGCTCCTCTGCCTCACGCTCT
TCGTCCTTCTTCCTCCGCATCTCTGCATACCAGTCTCGTTTTGTACTTCTTGACTCGCGT
GCAGCTTCTTCAGCTTGTCTTTGTTCTTCTCGTTCTTGTCGCTTCTTCTCTTTCTTCTTT
GAAGCTCTGGCCTGATTCCCACCGGCTTCATCTTCATCCTCATCTTCACTCCCGCTGATG
TTTTCTTGAACGTTTGATGAAGA

QA 4 806 4 806
DS 

RD RR2CF70TF 727 0 0
CAACGCTGCTGATTTCTTCAGTCAGCTCATGTTGTACTTTGGGCTCCAAGTCGATGAACT
GGTTCGACTTGCTTGCTAGGTGTGAGATACTAACTCTTCCTTGACGTTTGATGTAATCCG
CAACCGCATTCATCTCTTCCATTGATATGTAAATGTATTTTCCTCTATCATCCATAACCC
CCCGAGAGGCGCCCAATGCTCTCCAACGAGGCGATCCTGTTGATGCATTCCTGAGTTCTT
AGATGAAACTCTGCTGCAAGATCTTCAAGTGGAACACATTTCTGTTTCTTAATGTATTCA
ACAAATTCTGAAAGCAAATCTTGATTTCCACCTTCCACTTCCTCCGTGGTACCTTCAGCA
TCGACTGAGAACTCTCCTTTCCATTTGTCAAACTCTAACGCAGCTGCCTCTTCTTCCTTG
GCTTGTCGTGCTTTTTCTTCTTCTTCCAACTTCCGCTCCTCTGCCTCACGCTCTTCGTCC
TTCTTCCTCCGCATCTCTGCATACCAGTCTCGTTTTGTACTTCTTGACTCGCGTGCAGCT
TCTTCAGCTTGTCTTTGTTCTTCTCGTTCTTGTCGCTTCTTCTCTTTCTTCTTTGAAGCT
CTGGCCTGATTCCCACCGGCTTCATCTTCATCCTCATCTTCACTCCCGCTGATGTTTTCT
TGAACGTTTGATGAAGAAGAGGAGCTAGCACCAGCTGCAGAAGCTGCAGGTCTCCGACGC
ATTCTAC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2A472TF 635 0 0
TTCCTTGACGTTTGATGTAATCCGCAACCGCATTCATCTCTTCCATTGATATGTAAATGT
ATTTTCCTCTATCATCCATAACCCCC*GAGAGGCGCCCAATGCTCTCCAACGAGGCGATC
CTGTTGATGCATTCCTGAGTTCTTAGATGAAACTCTGCTGCAAGATCTTCAAGTGGAACA
CATTTCTGTTTCTTAATGTATTCAACAAATTCTGAAAGCAAATCTTGATTTCCACCTTCC
ACTTCCTCCGTGGTACCTTCAGCATCGACTGAGAACTCTCCTTTCCATTTGTCAAACTCT
AACGCAGCTGCCTCTTCTTCCTTGGCTTGTCGTGCTTTTTCTTCTTCTTCCAACTTCCGC
TCCTCTGCCTCACGCTCTTCGTCCTTCTTCCTCCGCATCTCTGCATACCAGTCTTGTTTT
GTACTTCTTGACTCGCGTGCAGCTTCTTCAGCCTGTCTTTGTTCTTCTCGTTCTTGTCGC
TTCTTCTCTTTCTTCTTTGAAGCTCTGGCCTGATTCACACCGGCTTCATCTTCATCCTCA
TCTTCACTCCCGCTGATGTTTTCTTGAACGTTTGATGAAGAAGAGGAGCTAGCACCAGCT
GCAGAAGCTGCAGGTCTCCGACGCATTCTAC
GCCC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2DH50TF 669 0 0
AGCATCGACTGAGAACTCTCCTTTCCATTTGTCAAACTCTAACGCAGCTGCCTCTTCTTC
CTTGGCTTGTCGTGCTTTTTCTTCTTCTTCCAACTTCCGCTCCTCTGCCTCACGCTCTTC
GTCCTTCTTCCTCCGCATCTCTGCATACCAGTCTTGTTTTGTACTTCTTGACTCGCATGC
AGCTTCTTCAGCCTGTCTTTGTTCTTCTCGTTCTTGTCGCTTCTTCTCTTTCTTCTTTGA
AGCTCTGGCCTGATTCCCACCGGCTTCATCTTCATCCTCATCTTCACTCCCGCTGATGTT
TTCTTGAACGTTTGATGAAGAAGAGGAGCTAGCACCAGCTGTAGAAGCTGCAGGTCTCCG
ACGCATTCTACGCCCACCACCACCAGTAGCACGTCCCACGTTTTCACGCGCCTGAAAAAA
AGTCAAATCCATTTCGCCAACAATGAAACGAAAGTTGAGAAATTTTACCTGCGGAGGTGC
TGCATCTTCCTCACGTGATCTACTTGTACTATCTACCCGACGTTTCCACAAGAACAAGGG
TATCACCGCAGCTATGAGAATCATTGGGACTATCAGAGCGAACATCTCTTCCATCTCTCC
TTACCTAAATTGCGTTTCTTTTCACGTTTTCTTGTCTTCTCCTTATTCGTAGTTTAACCT
AAAAAAAAA

QA 1 669 1 669
DS 



AS 2 8

CO CL901Contig1 907 6 11 U
CATCAAAGACGTTTTAAATTAAACAAAAAATACGAGAGACAAGAAACATGGGTAACGAAC
AGAGTTTACGAAATATCATATAGCAAAAAGCTAATCCAACACATAAGATCTCAAAGACAC
TAGAAACTGAAAACTCAAAACATGTCCCATGTAACACATAAGGTTTCAAGCCAACAACAA
GCTTTAAGCGGCACCCTTGCCCTTCTTCTTTTGAATTTTCTTCTGGTAGAATTCTAGCTC
CTTGCCTTCAAGAATGTATCCATCAGCACGTCCACACTGGCCGGGCCTTGAGGAGATGCA
GGCCAACAACCGTCCGCTTGCAAACTGGTCCTCAATGTGGGAATCAAGGCTGCGACCTTC
TTGGCGGCTCTCAATCTTCCTCAGCACATGGTTGCTCTTCTTCACCTCCTCAGGAGCAGC
AGCAGCTGGTGCAGCATCCTCACCATCCTCGCCTTCCTTCTTAGCGGCAGGAGCGCTCTT
CTTCTTGCGACCAACCTCAACACCATAGTGCTGCAAGTACCACTGCTTGAAAGGAGCGGC
ATCAACCTGAACAATGGCGCTCTTAACGAGTGTCTTGGTACGGACAAGCTCGTTGTTGAA
GGCGTTGTAGACAACGTCCAAGACTCTGGTCTTGCGGGTGACAGCTTCGCTTCCCCAGGA
GTAGTTACCGGTATCGAGCCTCAACGCACGCCACTTGACGTTGCCTCCACGAACACGGAT
TCTTCTGACCGTCTTGTTGCTGGAGAGCTTGGTGTTGGCTGGCTGCCTTCCCATCTCATA
CTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCCAGTGGCACGCCTCTTGTGGATTGA
GTCACGAGAAATACCCATGGTTGCAACTTAGGTTTTCTCTGTTAGACAAAATAAATGCGG
AGGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2CW87JQ U 144
AF RR2EC43JQ U 1
AF RR2C774JQ U 51
AF RR2EC43TF C 293
AF RR2C774TF C 212
AF RR2CW87TF C 599
BS 1 178 RR2EC43JQ
BS 179 179 RR2C774JQ
BS 180 406 RR2EC43JQ
BS 407 407 RR2C774JQ
BS 408 653 RR2EC43JQ
BS 654 837 RR2C774JQ
BS 838 838 RR2C774TF
BS 839 850 RR2C774JQ
BS 851 872 RR2C774TF
BS 873 873 RR2CW87TF
BS 874 907 RR2C774TF

RD RR2CW87JQ 443 0 0
GTCCCATGTAACACATAAGGTTTCAAGCCAACAACAAGCTTTAAGCGGCACCCTTGCCCT
TCTTCTTTTGAATTTTCTTCTGGTAAAATTCTAGCTCCTTGCCTTCAAGAATGTATCCAT
CAGCACGTCCACACTGGCCGGGCCTTGAGGAGATGCAGGCCAACAACCGTCCGCTTGCAA
ACTGGTCCTCAATGTGGGAATCAAGGCTGCGACCTTCTTGGCGGCTCTCAATCTTCCTCA
GCACATGGTTGCTCTTCTTCACCTCCTCAGGAGCAGCAGCAGCTGGTGCAGCATCCTCAC
CATCCTCGCCTTCCTTCTTAGCGGCAGGAGCGCTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACAC
CATAGTGCTGCAAGTACCACTGCTTGAAAGGAGCGGCATCAACCTGAACAATGGCGCTCT
TAACAAGTGTCTTGGTACGGACA

QA 1 443 1 443
DS 

RD RR2EC43JQ 653 0 0
CATCAAAGACGTTTTAAATTAAACAAAAAATACGAGAGACAAGAAACATGGGTAACGAAC
AGAGTTTACGAAATATCATATAGCAAAAAGCTAATCCAACACATAAGATCTCAAAGACAC
TAGAAACTGAAAACTCAAAACATGTCCCATGTAACACATAAGGTTTCAAGCCAACAACGA
GCTTTAAGCGGCACCCTTGCCCTTCTTCTTTTGAATTTTCTTCTGGTAGAATTCTAGCTC
CTTGCCTTCAAGAATGTATCCATCAGCACGTCCACACTGGCCGGGCCTTGAGGAGATGCA
GGCCAACAACCGTCCGCTTGCAAACTGGTCCTCAATGTGGGAATCAAGGCTGCGACCTTC
TTGGCGGCTCTCAATCTTCCTCAGCACATGGTTGCTCTTCTTCACCGCCTCAGGAGCAGC
AGCAGCTGGTGCAGCATCCTCACCATCCTCGCCTTCCTTCTTAGCGGCAGGAGCGCTCTT
CTTCTTGCGACCAACCTCAACACCATAGTGCTGCAAGTACCACTGCTTGAAAGGAGCGGC
ATCAACCTGAACAATGGCGCTCTTAACGAGTGTCTTGGTACGGACAAGCTCGTTGTTGAA
GGCGTTGTAGACAACGTCCAAGACTCTGGTCTTGCGGGTGACAGCTTCGCTTC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2C774JQ 800 0 0
GGTAACGAACAGAGTTTACGAAATATCATATAGCAAAAAGCTAATCCAACACATAAGATC
TCAGAGACACTAGAAACTGAAAACTCAAAACATGTCCCATGTAACACATAAGGTTTCAAG
CCAACAACAAGCTTTAAGCGGCACCCTTGCCCTTCTTCTTTTGAATTTTCTTCTGGTAAA
ATTCTAGCTCCTTGCCTTCAAGAATGTATCCATCAGCACGTCCACACTGGCCGGGCCTTG
AGGAGATGCAGGCCAACAACCGTCCGCTTGCAAACTGGTCCTCAATGTGGGAATCAAGGC
TGCGACCTTCTTGGCGGCTCTCAATCTTCCTCAGCACATGGTTGCTCTTCTTCACCTCCT
CAGGAGCAGCAGCAGCTGGTGCAGCATCCTCACCATCCTCGCCTTCCTTCTCAGCGGCAG
GAGCGCTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACACCATAGTGCTGCAAGTACCACTGCTTGA
AAGGAGCGGCATCAACCTGAACAATGGCGCTCTTAACGAGTGTCTTGGTACGGACAAGCT
CGTTGTTGGAGGCGTAGTAAACAACGTCCAAGACTCTGGTCTTGCGGGTGACAGCTTCGC
TTCCCCAGGAGTAGTTACCGGTATCGAGCCTCAACGCACGCCACTTGACGTTGCCTCCAC
GAACACGGATTCTTCTGACCGTCTTGTTGCTGGAGAGCTTGGTGTTGGCTGGCTGCCTTC
CCATCTCATACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCCAGTGGCACGCCTCT
TGTGGATAGAGTCACGAGAA

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2EC43TF 595 0 0
GAGATGCAGGCCAACAACCGTCCGCTTGCAAACTGGTCCTCAATGTGGGAATCAAGGCTG
CGACCTTCTTGGCGGCTCTCAATCTTCCTCAGCACATGGTTGCTCTTCTTCACCGCCTCA
GGAGCAGCAGCAGCTGGTGCAGCATCCTCACCATCCTCGCCTTCCTTCTTAGCGGCAGGA
GCGCTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACACCATAGTGCTGCAAGTACCACTGCTTGAAA
GGAGCGGCATCAACCTGAACAATGGCGCTCTTAACGAGTGTCTTGGTACGGACAAGCTCG
TTGTTGAAGGCGTTGTAGACAACGTCCAAGACTCTGGTCTTGCGGGTGACAGCTTCGCTT
CCCCAGGAGTAGTTACCGGTATCGAGCCTCAACGCACGCCACTTGACGTTGCCTCCACGA
ACACGGAT*CTTCTGACCGTCTTGTTGCTGGAGAGCTTGGTGTTGGCTGGCTGCCTTCCC
ATCTCATACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCCAGTGGCACGCCTCTTG
TGGATTGAGTCACGAGAAATACCCATGGTTGCAACTTAGGTTTTCTCTGTTAGAC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2C774TF 696 0 0
TTTGAATTTCTTCT
GTAGAATTCTAGCTC*TTGC*TTCAAGAATGTATCCATCAGCACGTCCACACTGGCCGGG
C*TTGAGGAGATGCAGGCCAACAACCGTCCGCTTGCAAACTGGTCCTCAATGTGGGAATC
AAGGCTGCGACCTTCTTGGCGGCTCTCAATCTTCCTCAGCACATGGTTGCTCTTCTTCAC
CTCCTCAGGAGCAGCAGCAGCTGGTGCAGCATCCTCACCATCCTCGCCTTCCTTCTCAGC
GGCAGGAGCGCTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACACCATAGTGCTGCAAGTACCACTG
CTTGAAAGGAGCGGCATCAACCTGAACAATGGCGCTCTTAACGAGTGTCTTGGTACGGAC
AAGCTCGTTGTTGGAGGCGTAGTAGACAACGTCCAAGACTCTGGTCTTGCGGGTGACAGC
TTCGCTTCCCCAGGAGTAGTTACCGGTATCGAGCCTCAACGCACGCCACTTGACGTTGCC
TCCACGAACACGGATTCTTCTGACCGTCTTGTTGCTGGAGAGCTTGGTGTTGGCTGGCTG
CCTTCCCATCTCATACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCCAGTGGCACG
CCTCTTGTGGATTGAGTCACGAGAAATACCCATGGTTGCAACTTAGGGTTTCTCTGTTAG
ACAAAATAAATGCGGAGGGTCC

QA 15 696 15 696
DS 

RD RR2CW87TF 306 0 0
G
AGGCGTTGTAGACAACGTCCAAGACTCTGGTCTTGCGGGTGACAGCTTCGCTTCCCCAGG
AGTAGTTACCGGTATCGAGCCTCAACGCACGCCACTTGACGTTGCCTCCACGAACACGGA
TTCTTCTGACCGTCTTGTTGCTGGAGAGCTTGGTGTTGGCTGGCTGCCTTCCCATCTCAT
ACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCCAGTGGCACGCCTCTTGTGGATTG
AGCCACGAGAAATACCCATGGTTGCAACTTAGGTTTTCTATGTTAGACAAAATAACTGCG
GAG
CC

QA 2 304 2 304
DS 



CO CL901Contig2 401 2 1 U
GGAAGATTGAGAGCCGCCAAGAAGGTCGCAGCCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTG
CAAGCGGACGGTTGTTGGCCTGCATCCCCTCAAGGCCCGGCCAATGTGGACGTGCTGATG
GATACATTCTTGAAGGCAAGGAGCTAGAATTCTACCAGAAGAAAATCCAAAAGAAGAAGG
GCAAGGGTGCCGCTTAAAGCTTGTTGCTGGCTCGAAAGCTTTATGTTTACATGGGACATG
TTTTGAGTTTTCAGTTTCTAGTGTCTCTGATATCCTATGTGTTGGATTAGCTTTTTGCTA
TATGCTATTTCGTAAACTCTGTTCTTTACCCATGTTTCTCGTCTCTCGTATTTTTTGTTT
AATTTAAAACGTCTTTGATGATTATGATAGTCTCAAGTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FY34JQ C 1
AF RR2FY34TF U 1
BS 1 401 RR2FY34TF

RD RR2FY34JQ 401 0 0
GGAAGATTGAGAGCCGCCAAGAAGGTCGCAGCCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTG
CAAGCGGACGGTTGTTGGCCTGCATCCCCTCAAGGCCCGGCCAATGTGGACGTGCTGATG
GATACATTCTTGAAGGCAAGGAGCTAGAATTCTACCAGAAGAAAATCCAAAAGAAGAAGG
GCAAGGGTGCCGCTTAAAGCTTGTTGCTGGCTCGAAAGCTTTATGTTTACATGGGACATG
TTTTGAGTTTTCAGTTTCTAGTGTCTCTGATATCCTATGTGTTGGATTAGCTTTTTGCTA
TATGCTATTTCGTAAACTCTGTTCTTTACCCATGTTTCTCGTCTCTCGTATTTTTTGTTT
AATTTAAAACGTCTTTGATGATTATGATAGTCTCAAGTTGC

QA 1 401 1 401
DS 

RD RR2FY34TF 401 0 0
GGAAGATTGAGAGCCGCCAAGAAGGTCGCAGCCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTG
CAAGCGGACGGTTGTTGGCCTGCATCCCCTCAAGGCCCGGCCAATGTGGACGTGCTGATG
GATACATTCTTGAAGGCAAGGAGCTAGAATTCTACCAGAAGAAAATCCAAAAGAAGAAGG
GCAAGGGTGCCGCTTAAAGCTTGTTGCTGGCTCGAAAGCTTTATGTTTACATGGGACATG
TTTTGAGTTTTCAGTTTCTAGTGTCTCTGATATCCTATGTGTTGGATTAGCTTTTTGCTA
TATGCTATTTCGTAAACTCTGTTCTTTACCCATGTTTCTCGTCTCTCGTATTTTTTGTTT
AATTTAAAACGTCTTTGATGATTATGATAGTCTCAAGTTGC

QA 1 401 1 401
DS 



AS 1 7

CO CL902Contig1 1216 7 16 U
AGTCACGAGTGTTCGCAAATTTGAACATGATCAACATATACATTATTTGATTAATTACGA
TTTTTTGGTTGCACACTCCAAATACGTGGAATACAATAACGAAAAATATAGAAACCTAAA
GCATGAGAGTTTCTCAACACGAGATCATAAGTCTTAACACACAGCAAGCTTA**AGAGAA
CATATAATGATATCAGTCCATTATCTATATTTCAGGACTGGTCTGCAAAGGAGCCTTGAA
GGAGCCCATCTCTGATCTGAGTAGCCACATCGCGTACAGCTCCTGGTCCATGGGGAATGA
AGACAGCAGAGGATTTGGAACTGGCGCCAATCTCCTTCATCGTGTCGAAGTACTGCGTAA
CAAGCACCATGTCCATCACATCTTTAGCAGTTGTCCCGGGAACATTCACAGAGAAACCAA
GGACGCTGTCGCGTAGCCCGTAGACAATGGCTTGCCTCTGACGGGCGATACCAAGACCAG
ACAGGTACTTGGCCTCGGCTTCACCTTCAGCTCGCTTGATCTGGAGGATTTTCTCAGCCT
CTGCCTTTTCGTTTGCAGCCAACCTCATCCTTGCAGCAGCGTTGATTTCGTTCATGGCTC
GTTTGACATGTTCGTCAGGCTCGATGTCAACGATGAGAGTTTGGACAATCTCAAAACCGT
AAGCAGACATTGCCTTCTCGAGCTCCTCTTCAACAGCTTTGGCAATTTCATTCTTCTGCT
CAAAGACATCATCCAGAATCAGCTTGGGGACACTTGCTCTGATAACATCAAAGACGTAAG
CTTGGATCTGGCTCCTAGTGTTACTAAGCTTGTAGAAAGCATCATTGGCATTGTTAGCCA
AGGCACGGTACTGAATCGATGCAACAACGTTAACAAACACATTGTCCTTAGTCTTAGTCT
CGCAACGAACATCCAACTGCTGAAGCCTGAGAGAGAGGTAACCAGCAACTTGCTGACCAA
GACACCATGGGAGAAAATGGCAACCAGGCTCTAGAACATCTTCGAACTTCCCAAACGTTT
CTTTGATAGCCACCGTCGACTGGTCCACTTGTACACAGCACAACAAGTTCCCCATCTTTC
TTCACTCTTTGAAGATGAAGAAGCGAAAGAAGAACAAAGGAGAATTTCAGGGTTCACCGA
AAGTTACCGTCTTTTGATTTTCTTCTGGGTTTGATTTTAGATGAGACGTTTTTTTGTTAA
GCTCTGTGAATCCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2FQ43JQ U 316
AF RR2F296JQ U 1
AF RR2AA55JQ U 29
AF RR2BT10JQ U 38
AF RR2BT10TF C 63
AF RR2AA55TF C 507
AF RR2F296TF C 704
BS 1 172 RR2F296JQ
BS 173 174 RR2BT10JQ
BS 175 197 RR2F296JQ
BS 198 198 RR2AA55JQ
BS 199 205 RR2F296JQ
BS 206 206 RR2AA55JQ
BS 207 309 RR2F296JQ
BS 310 310 RR2AA55JQ
BS 311 441 RR2F296JQ
BS 442 442 RR2BT10JQ
BS 443 502 RR2F296JQ
BS 503 503 RR2AA55JQ
BS 504 716 RR2F296JQ
BS 717 838 RR2AA55JQ
BS 839 1213 RR2AA55TF
BS 1214 1216 RR2F296TF

RD RR2FQ43JQ 297 0 0
TGGAACTGGCGCCAATCTCCTTCATCGTGTCGAAGTACTGCGTAACAAGCACCATGTCCA
TCACATCTTTAGCAGTTGTCCCGGGAACATTCACAGAGAAACCAAGGACGCTGTCGCGTA
GCCCGTCGACAATGGCTTGCCTCTGACGGGCGATACCAAGACCAGACAGGTACTTGGCCT
CGGCTTCACCTTCAGCTCGCTTGATCTGGAGGATTTTCTCAGCCTCTGCCTTTTCGTTTG
CAGCCAACCTCATCCTTGCAGCAGCGTTGATTTCGTTCATGGCTCGTTTGACATGTT

QA 1 297 1 297
DS 

RD RR2F296JQ 716 0 0
AGTCACGAGTGTTCGCAAATTTGAACATGATCAACATATACATTATTTGATTAATTACGA
TTTTTTGGTTGCACACTCCAAATACGTGGAATACAATAACGAAAAATATAGAAACCTAAA
GCATGAGAGTTTCTCAACACGAGATCATAAGTCTTAACACACAGCAAGCTTAGTAGAGAA
CATATAATGATATCAGTTCATTATCCATATTTCAGGACTGGTCTGCAAAGGAGCCTTGAA
GGAGCCCATCTCTGATCTGAGTAGCCACATCGCGTACAGCTCCTGGTCCATGGGGAATGA
AGACAGCAGGGGATTTGGAACTGGCGCCAATCTCCTTCATCGTGTCGAAGTACTGCGTAA
CAAGCACCATGTCCATCACATCTTTAGCAGTTGTCCCGGGAACATTCACAGAGAAACCAA
GGACGCTGTCGCGTAGCCCGTCGACAATGGCTTGCCTCTGACGGGCGATACCAAGACCAG
ACAGGTACTTGGCCTCGGCTTCGCCTTCAGCTCGCTTGATCTGGAGGATTTTCTCAGCCT
CTGCCTTTTCGTTTGCAGCCAACCTCATCCTTGCAGCAGCGTTGATTTCGTTCATGGCTC
GTTTGACATGTTCGTCAGGCTCGATGTCAACGATGAGAGTTTGGACAATCTCAAAACCGT
AAGCAGACATTGCCTTCTCGAGCTCCTCTTCAACAGCTTTGGCAATTTCATTCTTC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2AA55JQ 810 0 0
GC
TCAACATATACATTATTTGATTAATTACGATTTTTTGGTTGCACACTCCAAATACGTGGA
ATACAATAACGAAAAATATAGAAACCTAAAGCATGAGAGTTTCTCAACACGAGATCATAA
GTCTTAACACACAGCAAGCTTAGTAGAGAACATATAATGATATCAGTCCATTATCTATAT
TTCAGGACTGGTCTGCAAAGGAGCCTTGAAGGAGCCCATCTCTGATCTGAGTAGCCACAT
CGCGTACAGCTCCTGGTCCATGGGGAATGAAGACAGCAGAGGATTTGGAACTGGCGCCAA
TCTCCTTCATCGTGTCGAAGTACTGCGTAACAAGCACCATGTCCATCACATCTTTAGCAG
TTGTCCCGGGAACATTCACAGAGAAACCAAGGACGCTGTCGCGTAGCCCGTCGACAATGG
CTTGCCTCTGACGGGCGATACCAAGACCAGACAGGTACTTGGCCTCGGCTTCACCTTCAG
CTCGCTTGATCTGGAGGATTTTCTCAGCCTCTGCCTTTTCGTTTGCAGCCAACCTCATCC
TTGCAGCAGCGTTGATTTCGTTCATGGCTCGTTTGACATGTTCGTCAGGCTCGATGTCAA
CGATGAGAGTTTGGACAATCTCAAAACCGTAAGCAGACATTGCCTTCTCGAGCTCCTCTT
CAACAGCTTTGGCAATTTCATTCTTCTGCTCAAAGACATCATCCAGAATCAGCTTGGGGA
CACTTGCTCTGATAACATCAAAGACGTAAGCTTGGATCTGGCTCCTAGTGTTACTAAGCT
TGTAGAAAGCATCATTGGCATTGTTAGC

QA 3 810 3 810
DS 

RD RR2BT10JQ 770 0 0
ATACATTATTTGATTAATTACGATTTTTTGGTTGCACACTCCAAATACGTGGAATACAAT
AACGAAAAATATAGAAACCTAAAGCATGAGAGTTTCTCAACACGAGATCATAAGTCTTAA
CACACAGCAAGCTTA**AGAGAACATATAATGATATCAGTCCATTATCTATATTTCAGGA
CTGGTCTGCAAAGGAGCCTTGAAGGAGCCCATCTCTGATCTGAGTAGCCACATCGCGTAC
AGCTCCTGGTCCATGGGGAATGAAGACAGCAGAGGATTTGGAACTGGCGCCAATCTCCTT
CATCGTGTCGAAGTACTGCGTAACAAGCACCATGTCCATCACATCTTTAGCAGTTGTCCC
GGGAACATTCACAGAGAAACCAAGGACGCTGTCGCGTAGCCCGTAGACAATGGCTTGCCT
CTGACGGGCGATACCAAGACCAGACAGGTACTTGGCCTCGGCTTCACCTTCAGCTCGCTT
GATCTGGAGGATTTTCTCAGCCTCTGCCTTTTCGTTTGCAGCCAACCTCATCCTTGCAGC
AGCGTTGATTTCGTTCATGGCTCGTTTAACATGTTCGTCAGGCTCGATGTCAACGATGAG
AGTTTGGACAATCTCAAAACCGTAAGCAGACATTGCCTTCTCGAGCTCCTCTTCAACAGC
TTTGGCAATTTCATTCTTCTGCTCAAAGACATCATCCAGAATCAGCTTGGGGACACTTGC
TCTGATAACATCAAAGACGTAAGCTTGGATCTGGCTCCTAGTGTTACTA
C

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2BT10TF 745 0 0
TTTTTGG
TGCACACTCCAAATACGTGGAATACAATAACGAAAAATATAGAAAC*TAAAGCATGAGAG
TTTCTCAACACGAGATCATAAGTCTTAACACACAGCAAGCTTA**AGAGAACATATAATG
ATATCAGTCCATTATCTATATTTCAGGACTGGTCTGCAAAGGAGCCTTGAAGGAGCCCAT
CTCTGATCTGAGTAGCCACATCGCGTACAGCTCCTGGTCCATGGGGAATGAAGACAGCAG
AGGATTTGGAACTGGCGCCAATCTCCTTCATCGTGTCGAAGTACTGCGTAACAAGCACCA
TGTCCATCACATCTTTAGCAGTTGTCCCGGGAACATTCACAGAGAAACCAAGGACGCTGT
CGCGTAGCCCGTAGACAATGGCTTGCCTCTGACGGGCGATACCAAGACCAGACAGGTACT
TGGCCTCGGCTTCACCTTCAGCTCGCTTGATCTGGAGGATTTTCTCAGCCTCTGCCTTTT
CGTTTGCAGCCAACCTCATCCTTGCAGCAGCGTTGATTTCGTTCATGGCTCGTTTAACAT
GTTCGTCAGGCTCGATGTCAACGATGAGAGTTTGGACAATCTCAAAACCGTAAGCAGACA
TTGCCTTCTCGAGCTCCTCTTCAACAGCTTTGGCAATTTCATTCTTCTGCTCAAAGACAT
CATCCAGAATCAGCTTGGGGACACTTGCTCTGATAACATCAAAGACGTAAGCTTGGATCT
GGCTCCTAGTGTTACTA
C

QA 8 744 8 744
DS 

RD RR2AA55TF 707 0 0
TCAGCTCGCTTGATCTGGAGGATTTTCTCAGCCTCTGCCTTTTCGTTTGCAGCCAACCTC
ATCCTTGCAGCAGCGTTGATTTCGTTCATGGCTCGTTTGACATGTTCGTCAGGCTCGATG
TCAACGATGAGAGTTTGGACAATCTCAAAACCGTAAGCAGACATTGCCTTCTCGAGCTCC
TCTTCAACAGCTTTGGCAATTTCATTCTTCTGCTCAAAGACATCATCCAGAATCAGCTTG
GGGACACTTGCTCTGATAACATCAAAGACGTAAGCTTGGATCTGGCTCCTAGTGTTACTA
AGCTTGTAGAAAGCATCATTGGCATTGTTAGCCAAGGCACGGTACTGAATCGATGCAACA
ACGTTAACAAACACATTGTCCTTAGTCTTAGTCTCGCAACGAACATCCAACTGCTGAAGC
CTGAGAGAGAGGTAACCAGCAACTTGCTGACCAAGACACCATGGGAGAAAATGGCAACCA
GGCTCTAGAACATCTTCGAACTTCCCAAACGTTTCTTTGATAGCCACCGTCGACTGGTCC
ACTTGTACACAGCACAACAAGTTCCCCATCTTTCTTCACTCTTTGAAGATGAAGAAGCGA
AAGAAGAACAAAGGAGAATTTCAGGGTTCACCGAAAGTTACCGTCTTTTGATTTTCTTCT
GGGTTTGATTTTAGATGAGACGTTTTTTTGTTAAGCTCTGTGAATCC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2F296TF 513 0 0
AATTTCATTCTTCTGCTCAAAGACATCATCCAGAATCAGCTTGGGGACACTTGCTCTGAT
AACATCAAAGACGTAAGCTTGGATCTGGCTCCTAGTGTTACTAAGCTTGTAGAAAGCATC
ATTGGCATTGTTAGCCAAGGCACGGTACTGAATCGATGCAACAACGTTAACAAACACATT
GTCCTTAGTCTTAGTCTCGCAACGAACATCCAACTGCTGAAGCCTGAGAGAGAGGTAACC
AGCAACTTGCTGACCAAGACACCATGGGAGAAAATGGCAACCAGGCTCTAGAACATCTTC
GAACTTCCCAAACGTTTCTTTGATCGCCACCGTCGACTGGTCCACTTGTACACAGCACAA
CAAGTTCCCCATCTTTCTTCACTCTTTGAAGATGAAGAAGCGAAAGAAGAACAAAGGAGA
ATTTCAGGGTTCACCGAAAGTTACCGTCTTTTGATTTTCTTCTGGGTTTGATTTTAGATG
AGACGTTTTTTTGTTAAGCTCTGTGAATCCCCT

QA 1 513 1 513
DS 



AS 2 8

CO CL903Contig1 966 4 27 U
GCTTGAAGCATAACTCGGTCATTATAAAAGTTGATAATTCAATGATACACCACAAAAGTT
CCAAGCTTTTGGGACAAAGAAACAAATATAAACTATTACATTTAATAAATAGAGATACTT
ATAAAAGTGGTAACAAAGACGGAGAATGTAGCTCGAAAGCTCTATCATAAGATCAAAATG
TCTGGTCACTCACACCGGGGCGTAAACATTACTTCAGTGAGACGCAGTGGAGTTGGTGAC
CCAATACTGCTTCACAGCAATCAAAACCTTCTCAGGAACCAAAGGGCCATCCTCATGGTC
AACCATCTTCGAGTCCCATCTCATTCCAGAGATGATTCCCTTCACCTTCATCAATGTGTC
AACATCGTCCCTGATTATAACCGCTCCTTCTGGACGCAGAATCCTATCCATCTCCAGAAG
AATGTCTTCCGCATTGCACTTGTTCTTGTAAAGACTGAAGAGATGGTTCGCATGGATTAA
GTCATATGTTCTCGGGTATGTAGAGAAAGCCTCACACCAGTCACGGTAGATACCAATGAG
TCCTCGTTCATACACAACTCCAAGTCTATTCTTCTCAGCAATGGTGGGGACAACATTCAT
AACCCAAAGCTTCTGTGATTCCAAAGCAGCAGCAAACCCACCAAACCCAGCGTTCATGTC
CATGATGTTACGGTACCTCCCAGTATCAATCAAACTATTGATCCTCTTGTAAACCTTCAC
ATGTTTCTTCCACTGTCTGTTATCATCTTCATACGCATCAGCCGTGACGCCAGAGATCGA
GCCGCTAGAGATCCTAGGCGGCACCGCGTTGAGCCTATCAGGGAACACCTGAAGCTCTCC
TCCAGCCACTTCATCCGAGCTACTTGTCTCGGGGTAAGGTGTAATGCACGCCTCCATTTT
CTTGTACCACACGTCATCCGTGTCATCATTGGTTTTGCAGAAGTTGGCTCTAGGGTCGTC
TTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS44JQ U 146
AF RR2G874JQ U 1
AF RR2BA37JQ U 4
AF RR2BA37TF C 140
BS 1 182 RR2G874JQ
BS 183 183 RR2BA37JQ
BS 184 330 RR2G874JQ
BS 331 331 RR2BA37JQ
BS 332 459 RR2G874JQ
BS 460 460 RR2BA37JQ
BS 461 461 RR2G874JQ
BS 462 462 RR2BA37JQ
BS 463 523 RR2G874JQ
BS 524 524 RR2BA37JQ
BS 525 576 RR2G874JQ
BS 577 577 RR2BA37JQ
BS 578 655 RR2G874JQ
BS 656 656 RR2BA37JQ
BS 657 685 RR2G874JQ
BS 686 686 RR2BA37JQ
BS 687 712 RR2G874JQ
BS 713 713 RR2BA37JQ
BS 714 776 RR2G874JQ
BS 777 797 RR2BA37JQ
BS 798 798 RR2BA37TF
BS 799 878 RR2BA37JQ
BS 879 879 RR2BA37TF
BS 880 902 RR2BA37JQ
BS 903 903 RR2BA37TF
BS 904 913 RR2BA37JQ
BS 914 966 RR2BA37TF

RD RR2CS44JQ 313 0 0
ATGTAGCTCGAAAGCTCTATCATAAGATCAAAATGTCAGGTCACTCACACCGGGGCGTAA
ACATTACTTCAGTGAGACGCAGTGGAGTTGGTGACCCAATACTGCTTCACAGCAATCAAA
ACCTTCTCAGGAACCAAAGGGACATCCTCATGGTCAACCATCTTCGAGTCCCATCTCATT
CCAAAAATGATTCCCTTCACCTTCATCAATGTGTCAACATCGTCCCTGATTATAACCGCT
CCTTCTGGACGCAAAATCCTATCCATCTCCAGAAAAATGTCTTCCGCATTGCACTTGTTC
TTGTAAAGACTGA

QA 1 313 1 313
DS 

RD RR2G874JQ 793 0 0
GCTTGAAGCATAACTCGGTCATTATAAAAGTTGATAATTCAATGATACACCACAAAAGTT
CCAAGCTTTTGGGACAAAGAAACAAATATAAACTATTACATTTAATAAATAGAGATACTT
ATAAAAGTGGTAACAAAGACGGAGAATGTAGCTCGAAAGCTCTATCATAAGATCAAAATG
TCAGGTCACTCACACCGGGGCGTAAACATTACTTCAGTGAGACGCAGTGGAGTTGGTGAC
CCAATACTGCTTCACAGCAATCAAAACCTTCTCAGGAACCAAAGGGCCATCCTCATGGTC
AACCATCTTCGAGTCCCATCTCATTCCAGAAATGATTCCCTTCACCTTCATCAATGTGTC
AACATCGTCCCTGATTATAACCGCTCCTTCTGGACGCAGAATCCTATCCATCTCCAGAAG
AATGTCTTCCGCATTGCACTTGTTCTTGTAAAGACTGAAAAAATGGTTCGCATGGATTAA
GTCATATGTTCTCGGGTATGTAGAGAAAGCCTCACACCAGTCATGGTAGATACCAATGAG
TCCTCGTTCATACACAACTCCAAGTCTATTCTTCTC*GCAATGGTGGGGACAACATTCAT
AACCCAAAGCTTCTGTGATTCCAAAGCAGCAGCAAACCCACCAAACCCAGCGTTCGTGTC
CATGATGTTACGGTACCTCCCAGTACCAATCAAACTATTGATCCTCTTGTAAGCCTTCAC
ATGTTTCTTCCACTGTCTGTTATCATCTTCATACGCATCAGCCGTGACGCCAGAGA
TCGAGCCGCTAGAGATC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2BA37JQ 910 0 0
CTG
AGCATAACTCGGTCATTATAAAAGTTGATAATTCAATGATACACCACAAAAGTTCCAAGC
TTTTGGGACAAAGAAACAAATATAAACTATTACATTTAATAAATAGAGATACTTATAAAA
GTGGTAACAAAGACGGAGAATGTAGCTCGAAAGCTCTATCATAAGATCAAAATGTCTGGT
CACTCACACCGGGGCGTAAACATTACTTCAGTGAGACGCAGTGGAGTTGGTGACCCAATA
CTGCTTCACAGCAATCAAAACCTTCTCAGGAACCAAAGGGCCATCCTCATGGTCAACCAT
CTTCGAGTCCCATCTCATTCCAGAGATGATTCCCTTCACCTTCATCAATGTGTCAACATC
GTCCCTGATTATAACCGCTCCTTCTGGACGCAGAATCCTATCCATCTCCAGAAGAATGTC
TTCCGCATTGCACTTGTTCTTGTAAAGACTGAAGAGATGGTTCGCATGGATTAAGTCATA
TGTTCTCGGGTATGTAGAGAAAGCCTCACACCAGTCACGGTAGATACCAATGAGTCCTCG
TTCATACACAACTCCAAGTCTATTCTTCTCAGCAATGGTGGGGACAACATTCATAACCCA
AAGCTTCTGTGATTCCAAAGCAGCAGCAAACCCACCAAACCCAGCGTTCATGTCCATGAT
GTTACGGTACCTCCCAGTATCAATCAAACTATTGATCCTCTTGTAAACCTTCACATGTTT
CTTCCACTGTCTGTTATCATCTTCATACGCATCAGCCGTGACGCCAGAGATCGAGCCGCT
AGAGATCCTAG*CGGCACCGCGTTGAGCCTATCAGGGAACACCTGAAGCTCTCCTCCAGC
CACTTCATCCGAGCTACTTGTCTCGGGGTAAG*TGTAATGCACGCCTCCATTTTCT*GTA
CCACACG

QA 4 910 4 910
DS 

RD RR2BA37TF 827 0 0
CGGAGA
ATGTAGCTCGAAAGCTCTATCATAAGATCAAAATGTCTGGTCACTCACACCGGGGCGTAA
ACATTACTTCAGTGAGACGCAGTGGAGTTGGTGACCCAATACTGCTTCACAGCAATCAAA
ACCTTCTCAGGAACCAAAGGGCCATCCTCATGGTCAACCATCTTCGAGTCCCATCTCATT
CCAGAGATGATTCCCTTCACCTTCATCAATGTGTCAACATCGTCCCTGATTATAACCGCT
CCTTCTGGACGCAGAATCCTATCCATCTCCAGAAGAATGTCTTCCGCATTGCACTTGTTC
TTGTAAAGACTGAAGAGATGGTTCGCATGGATTAAGTCATATGTTCTCGGGTATGTAGAG
AAAGCCTCACACCAGTCACGGTAGATACCAATGAGTCCTCGTTCATACACAACTCCAAGT
CTATTCTTCTCAGCAATGGTGGGGACAACATTCATAACCCAAAGCTTCTGTGATTCCAAA
GCAGCAGCAAACCCACCAAACCCAGCGTTCATGTCCATGATGTTACGGTACCTCCCAGTA
TCAATCAAACTATTGATCCTCTTGTAAACCTTCACATGTTTCTTCCACTGTCTGTTATCA
TCTTCATACGCATCAGCCGTGACGCCAGAGATCGAGCCGCTAGAGATCCTAGGCGGCACC
GCGTTGAGCCTATCAGGGAACACCTGAAGCTCTCCTCCAGCCACTTCATCCGAGCTACTT
GTCTCGGGGTAAGGTGTAATGCACGCCTCCATTTTCTTGTACCACACGTCATCCGTGTCA
TCATTGGTTTTGCAGAAGTTGGCTCTAGGGTCGTCTTGTCC

QA 7 827 7 827
DS 



CO CL903Contig2 1494 4 5 U
CAAATATAAACTATTACATTAATAAATAGAGATTGTACTTATAAAAGTGTAACAAAGACA
GAGAATGTAGCTCGAGAGCTCTATCATAAGATCAAAATGTCAGGTCACTCACACCGGTAC
TTCAGTGAGACGCAGTGGAGTTGGTGACCCAATACTGCTTCACAGCAATCAAAACCTTCT
CAGGAACCAAAGGACCATCCTCATGATCAACCATCTTCGAGTCCCATCTCATTCCAGAGA
TGATTCCCTTCACCTTCATCAACGTGTCAACATCGTCCCGGATTATAACCGCTCCTTCTG
GACGCAGAATCCTATCCATCTCCAGTAGAATGTCTTCCGCATTGCACTTGTCCTTGTAAA
GACTGAAGAGATGGTTCGCATGGATCAAGTCATATGTTCTCGGGTATGTAGAGAAAGCCT
CACACCAGTCATGGTAGATACCAATGAGTCCTCGTTCATACACAACTCCAAGTCTATTCT
TCTCAGCAATGGTTGGAACAACATTCATAACCCAAAGCTTCTGTGATTCCAAAGCAGCAG
CAAACCCACCAAACCCTGCGTTCATGTCCATGATGTTACGGTACCTCCCAGTATCAATCA
AACTATTGATCCTCTTGTAAGCCTTCACATGTTTCTTCCACTGTCTGTTATCATCCTCAT
AAGCATCAGCCGTGACGCCAGAGACGGAACCGCTGGAGATCCTAGGCGGCACCGCGTTGA
GCCTATCAGGGAATACCTGAAGCTCTCCTCCAGCCACTTCATCCGAGCTACTCGTCTCTG
GATAAGGTGTAATGCACGCCTCCATTTTCTTGTACCACACGTCATCGGTGTCATCAGTGG
CTTTGCAGAAGTTGGCTCTTGGGTCGTCTCGTCTCGCACGGCACGCCTCGTCGTTGACTC
TCTTCTGCCAGATGGCTATCTCGCCGTGTTCGTACTTCTTCTCCCAGCAGAGAAGCTTGG
CGGCTTCCTCGATCTTTCTTTGTTCCTCTTCAAGATCCTCCCTGGGACGTTGCCATGCCT
TGTAGTTGATTTTCCAGTTGATTGGAGGACCGGATAGGATCCAGTACCCGCCGGGTCTAA
GCACACGGTCGACTTCCATCAAGTACATCCCATCATTAGCTCCCCAAGGAATCAAACACC
TTGAGCAGTGAGCCATGTCGAAAGCACGTGTTGGATACGGCAACTTAATAGTCCCAAAAA
CACCAATAACAGCTGGAACACCTCTCTCCAAAGCAAACTGAACCTGAGCCTCGTGTGAAT
CTCTCGGCGCAAAAGACATCGCACGAACGTTTCTACTCCACAAGTACGCTCCCCAACTCG
CAACCCCGCAACCAGTATCCAAAGCAGTCCTAACAGTACCATTCTCCATCGGTATCACCG
AAGCAAGCTGATCAATATACTTATCAGCCCCTTGAGGGAACTGAGTCCCGCCTCCAGGGA
ACCTAAACACCTCACCTTCGTACTGGATCCAATTCTGAATCGCCTTCTCGACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GT30JQB U 1
AF RR2GT30TF C 290
AF RR2FL21JQ U 985
AF RR2FL21TF C 985
BS 1 351 RR2GT30JQB
BS 352 352 RR2GT30TF
BS 353 661 RR2GT30JQB
BS 662 984 RR2GT30TF
BS 985 1494 RR2FL21JQ

RD RR2GT30JQB 665 0 0
CAAATATAAACTATTACATTAATAAATAGAGATTGTACTTATAAAAGTGTAACAAAGACA
GAGAATGTAGCTCGAGAGCTCTATCATAAGATCAAAATGTCAGGTCACTCACACCGGTAC
TTCAGTGAGACGCAGTGGAGTTGGTGACCCAATACTGCTTCACAGCAATCAAAACCTTCT
CAGGAACCAAAGGACCATCCTCATGATCAACCATCTTCGAGTCCCATCTCATTCCAGAGA
TGATTCCCTTCACCTTCATCAACGTGTCAACATCGTCCCGGATTATAACCGCTCCTTCTG
GACGCAGAATCCTATCCATCTCCAGTAGAATGTCTTCCGCATTGCACTTGTTCTTGTAAA
GACTGAAGAGATGGTTCGCATGGATCAAGTCATATGTTCTCGGGTATGTAGAGAAAGCCT
CACACCAGTCATGGTAGATACCAATGAGTCCTCGTTCATACACAACTCCAAGTCTATTCT
TCTCAGCAATGGTTGGAACAACATTCATAACCCAAAGCTTCTGTGATTCCAAAGCAGCAG
CAAACCCACCAAACCCTGCGTTCATGTCCATGATGTTACGGTACCTCCCAGTATCAATCA
AACTATTGATCCTCTTGTAAGCCTTCACATGTTTCTTCCACTGTCTGTTATCATCCTCAT
A
AGCA

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2GT30TF 769 0 0
TACCGCTCTTCTGACGCAG
ATCCTATCCATCTCCAGTAGA*TGTCT*CCGCATTGCACTTGTC**TGTAAAGACTGAAG
AGATGGTTCGCATGGATCAAGTCATATGTTCTCGGGTATGTAGAGAAAGCCTCACACCAG
TCATGGTAGATACCAATGAGTCCTCGTTCATACACAACTCCAAGTCTATTCTTCTCAGCA
ATGGTTGGAACAACATTCATAACCCAAAGCTTCTGTGATTCCAAAGCAGCAGCAAACCCA
CCAAACCCTGCGTTCATGTCCATGATGTTACGGTACCTCCCAGTATCAATCAAACTATTG
ATCCTCTTGTAAGCCTTCACATGTTTCTTCCACTGTCTGTTATCATCCTCATAAGCATCA
GCCGTGACGCCAGAGACGGAACCGCTGGAGATCCTAGGCGGCACCGCGTTGAGCCTATCA
GGGAATACCTGAAGCTCTCCTCCAGCCACTTCATCCGAGCTACTCGTCTCTGGATAAGGT
GTAATGCACGCCTCCATTTTCTTGTACCACACGTCATCGGTGTCATCAGTGGCTTTGCAG
AAGTTGGCTCTTGGGTCGTCTCGTCTCGCACGGCACGCCTCGTCGTTGACTCTCTTCTGC
CAGATGGCTATCTCGCCGTGTTCGTACTTCTTCTCCCAGCAGAGAAGCTTGGCGGCTTCC
TCGATCTTTCTTTGTTCCTCTTCAAGATCCTCCCTGGGACGTTGCCATGCCTTGTAGTTG
ATTTTCCAGTTGATTGGAGGACCGGATAG
C

QA 20 768 20 768
DS 

RD RR2FL21JQ 510 0 0
CCTCTTCAAGATCCTCCCTGGGACGTTGCCATGCCTTGTAGTTGATTTTCCAGTTGATTG
GAGGACCGGATAGGATCCAGTACCCGCCGGGTCTAAGCACACGGTCGACTTCCATCAAGT
ACATCCCATCATTAGCTCCCCAAGGAATCAAACACCTTGAGCAGTGAGCCATGTCGAAAG
CACGTGTTGGATACGGCAACTTAATAGTCCCAAAAACACCAATAACAGCTGGAACACCTC
TCTCCAAAGCAAACTGAACCTGAGCCTCGTGTGAATCTCTCGGCGCAAAAGACATCGCAC
GAACGTTTCTACTCCACAAGTACGCTCCCCAACTCGCAACCCCGCAACCAGTATCCAAAG
CAGTCCTAACAGTACCATTCTCCATCGGTATCACCGAAGCAAGCTGATCAATATACTTAT
CAGCCCCTTGAGGGAACTGAGTCCCGCCTCCAGGGAACCTAAACACCTCACCTTCGTACT
GGATCCAATTCTGAATCGCCTTCTCGACGC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2FL21TF 510 0 0
CCTCTTCAAGATCCTCCCTGGGACGTTGCCATGCCTTGTAGTTGATTTTCCAGTTGATTG
GAGGACCGGATAGGATCCAGTACCCGCCGGGTCTAAGCACACGGTCGACTTCCATCAAGT
ACATCCCATCATTAGCTCCCCAAGGAATCAAACACCTTGAGCAGTGAGCCATGTCGAAAG
CACGTGTTGGATACGGCAACTTAATAGTCCCAAAAACACCAATAACAGCTGGAACACCTC
TCTCCAAAGCAAACTGAACCTGAGCCTCGTGTGAATCTCTCGGCGCAAAAGACATCGCAC
GAACGTTTCTACTCCACAAGTACGCTCCCCAACTCGCAACCCCGCAACCAGTATCCAAAG
CAGTCCTAACAGTACCATTCTCCATCGGTATCACCGAAGCAAGCTGATCAATATACTTAT
CAGCCCCTTGAGGGAACTGAGTCCCGCCTCCAGGGAACCTAAACACCTCACCTTCGTACT
GGATCCAATTCTGAATCGCCTTCTCGACGC

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 8

CO CL904Contig1 624 8 6 U
GGACTCATCACTACACACTTCTCGTTTTACAAACAATCAATAGCCCCTAAAACAAAGAAA
AATGGCTGGTCTAATGAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATTGTGGCCGGTCC
AATCACAACGAACGCGGCTCTGAGCTGTGGAACCGTTAACAGTAACTTGGCAGCATGCAT
TGGCTACTTGACCCAAAATGCGCCCCTCGCCAGAGGTTGCTGCACCGGCGTTACTAATCT
GAACAACATGGCCCGTACAACCCCCGACCGTCAGCAAGCTTGTCGTTGCCTTGTGGGAGC
CGCTAACTCCTTCCCTAGTCTAAACGCTGCCCGTGCTGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGG
AGTCAATATTCCTTACAAAATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACACCGTTAGATGAGCGGC
GACCGGATGAAGAAACTCAAGCGGACGTACGAATCTAATATAATGTATGAGAGAGTACTA
AATAAAATGTTTGAATGGTTGTTTTTCTGGTGTTCTAAAATTTCATGTTTTCTCTTCTGT
TGTGTCGTTCTTTTACTTTGGTCGTATGTACTATTTTCGTAGTCCACGTACGTTATATGA
AGTTTCAGATCCAGGGTTTGCGTT


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 30 30 

AF RR2EE23JQ C 286
AF RR2AA79TF U 1
AF RR2B030TF U 1
AF RR2EE23TF U 1
AF RR2DN18JQ C 1
AF RR2DN18TF U 1
AF RR2D326JQ C 425
AF RR2D326TF U 425
BS 1 164 RR2AA79TF
BS 165 165 RR2B030TF
BS 166 564 RR2AA79TF
BS 565 565 RR2B030TF
BS 566 622 RR2AA79TF
BS 623 624 RR2DN18TF

RD RR2EE23JQ 298 0 0
TTGCCTTGTGGGAGCCGCTAACTCCTTCCCTAGTCTAAACGCTGCCCGTGCTGCTGGACT
TCCTAAGGCATGGGGAGTCAATATTCCTTACAAAATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAC
CGTTAGATGAGCGGCGCCCGGATGAAGAAACTCAAGCGGACGTACGAATCTAATATAATG
TATGAGAGAGTACTAAATAAAATGTTTGAATGGTTGTTTTTCTGGTGTTCTAAAATTTCA
TGTTTTTTCTTCTGTTGTGTCGTT*TTTTACTTTGGTCGTATGTACTATTTTCGTAGT

QA 1 298 1 298
DS 

RD RR2AA79TF 622 0 0
GGACTCATCACTACACACTTCTCGTTTTACAAACAATCAATAGCCCCTAAAACAAAGAAA
AATGGCTGGTCTAATGAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATTGTGGCCGGTCC
AATCACAACGAACGCGGCTCTGAGCTGTGGAACCGTTAACAGTATCTTGGCAGCATGCAT
TGGCTACTTGACCCAAAATGCGCCCCTCGCCAGAGGTTGCTGCACCGGCGTTACTAATCT
GAACAACATGGCCCGTACAACCCCCGACCGTCAGCAAGCTTGTCGTTGCCTTGTGGGAGC
CGCTAACTCCTTCCCTAGTCTAAACGCTGCCCGTGCTGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGG
AGTCAATATTCCTTACAAAATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACACCGTTAGATGAGCGGC
GACCGGATGAAGAAACTCAAGCGGACGTACGAATCTAATATAATGTATGAGAGAGTACTA
AATAAAATGTTTGAATGGTTGTTTTTCTGGTGTTCTAAAATTTCATGTTTTCTCTTCTGT
TGTGTCGTTCTTTTACTTTGGTCGCATGTACTATTTTCGTAGTCCACGTACGTTATATGA
AGTTTCAGATCCAGGGTTTGCG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2B030TF 622 0 0
GGACTCATCACTACACACTTCTCGTTTTACAAACAATCAATAGCCCCTAAAACAAAGAAA
AATGGCTGGTCTAATGAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATTGTGGCCGGTCC
AATCACAACGAACGCGGCTCTGAGCTGTGGAACCGTTAACAGTAACTTGGCAGCATGCAT
TGGCTACTTGACCCAAAATGCGCCCCTCGCCAGAGGTTTCTGCACCGGCGTTACTAATCT
GAACAACATGGCCCGTACAACCCCCGACCGTCAGCAAGCTTGTCGTTGCCTTGTGGGAGC
CGCTAACTCCTTCCCTAGTCTAAACGCTGCCCGTGCTGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGG
AGTCAATATTCCTTACAAAATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACACCGTTAGATGAGCGGC
GACCGGATGAAGAAACTCAAGCGGACGTACGAATCTAATATAATGTATGAGAGAGTACTA
AATAAAATGTTTGAATGGTTGTTTTTCTGGTGTTCTAAAATTTCATGTTTTCTCTTCTGT
TGTGTCGTTCTTTTACTTTGGTCGTATGTACTATTTTCGTAGTCCACGTACGTTATATGA
AGTTTCAGATCCAGGGTTTGCG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2EE23TF 615 0 0
GGACTCATCACTACACACTTCTCGTTTTACAAACAATCAATAGCCCCTAAAACAAAGAAA
AATGGCTGGTCTAATGAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATTGTGGCCGGTCC
AATCACAACGAACGCGGCTCTGAGCTGTGGAACCGTTAACAGTAACTTGGCAGCATGCAT
TGGCTACTTGACCCAAAATGCGCCCCTCGCCAGAGGTTGCTGCACCGGCGTTACTAATCT
GAACAACATGGCCCGTACAACCCCCGACCGTCAGCAAGCTTGTCGTTGCCTTGTGGGAGC
CGCTAACTCCTTCCCTAGTCTAAACGCTGCCCGTGCTGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGG
AGTCAATATTCCTTACAAAATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACACCGTTAGATGAGCGGC
GACCGGATGAAGAAACTCAAGCGGACGTACGAATCTAATATAATGTATGAGAGAGTACTA
AATAAAATGTTTGAATGGTTGTTTTTCTGGTGTTCTAAAATTTCATGTTTTCTCTTCTGT
TGTGTCGTT*TTTTACTTTGGTCGTATGTACTATTTTCGTAGTCCACGTACGTTATATGA
AGTTTCAGATCCAGG

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2DN18JQ 624 0 0
GGACTCATCACTACACACTTCTCGTTTTACAAACAATCAATAGCCCCTAAAACAAAGAAA
AATGGCTGGTCTAATGAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATTGTGGCCGGTCC
AATCACAACGAACGCGGCTCTGAGCTGTGGAACCGTTAACAGTAACTTGGCAGCATGCAT
TGGCTACTTGACCCAAAATGCGCCCCTCGCCAGAGGTTGCTGCACCGGCGTTACTAATCT
GAACAACATGGCCCGTACAACCCCCGACCGTCAGCAAGCTTGTCGTTGCCTTGTAGGA*C
CGCTAACTCCTTCCCTAGTCTAAACGCTGCCCGTGCTGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGG
AGTCAATATTCCTTACAAAATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACACCGTTAGATGAGCGGC
GACCGGATGAAGAAACTCAAGCGGACGTACGAATCTAATATAATGTATGAGAGAGTACTA
AATAAAATGTTTGAATGGTTGTTTTTCTGGTGTTCTAAAATTTCATGTTTTCTCTTCTGT
TGTGTCGTTCTTTTACTTTGGTCGTATGTACTATTTTCGTAGTCCACGTACGTTATATGA
AGTTTCAGATCCAGGGTTTGCGTT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2DN18TF 624 0 0
GGACTCATCACTACACACTTCTCGTTTTACAAACAATCAATAGCCCCTAAAACAAAGAAA
AATGGCTGGTCTAATGAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATTGTGGCCGGTCC
AATCACAACGAACGCGGCTCTGAGCTGTGGAACCGTTAACAGTAACTTGGCAGCATGCAT
TGGCTACTTGACCCAAAATGCGCCCCTCGCCAGAGGTTGCTGCACCGGCGTTACTAATCT
GAACAACATGGCCCGTACAACCCCCGACCGTCAGCAAGCTTGTCGTTGCCTTGTAGGA*C
CGCTAACTCCTTCCCTAGTCTAAACGCTGCCCGTGCTGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGG
AGTCAATATTCCTTACAAAATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACACCGTTAGATGAGCGGC
GACCGGATGAAGAAACTCAAGCGGACGTACGAATCTAATATAATGTATGAGAGAGTACTA
AATAAAATGTTTGAATGGTTGTTTTTCTGGTGTTCTAAAATTTCATGTTTTCTCTTCTGT
TGTGTCGTTCTTTTACTTTGGTCGTATGTACTATTTTCGTAGTCCACGTACGTTATATGA
AGTTTCAGATCCAGGGTTTGCGTT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2D326JQ 200 0 0
GGATGAAGAAACTCAAGCGGACGTACGAATCTAATATAATGTATGAGAGAGTACTAAATA
AAATGTTTGAATGGTTGTTTTTCTGGTGTTCTAAAATTTCATGTTTTCTCTTCTGTTGTG
TCGTTCTTTTACTTTGGTCGTATGTACTATTTTCGTAGTCCACGTACGTTATATGAAGTT
TCAGATCCAGGGTTTGCGTT

QA 1 200 1 200
DS 

RD RR2D326TF 200 0 0
GGATGAAGAAACTCAAGCGGACGTACGAATCTAATATAATGTATGAGAGAGTACTAAATA
AAATGTTTGAATGGTTGTTTTTCTGGTGTTCTAAAATTTCATGTTTTCTCTTCTGTTGTG
TCGTTCTTTTACTTTGGTCGTATGTACTATTTTCGTAGTCCACGTACGTTATATGAAGTT
TCAGATCCAGGGTTTGCGTT

QA 1 200 1 200
DS 



AS 1 7

CO CL905Contig1 1166 7 14 U
GGACCACCACACAACTCTTGAAAGCACTCTCTTGTCTCTCTCTTGCTCACATTC*ATCCA
ACTCTCCAGGTATGTCTACATCCGAGAACAAAGTTGAAATCGTTGACAGAGCTCACAAGG
AGGATGAAAAAGAAGAAGAAGAAGGTAAAGGTGGATTCCTAGACAATGTCAAAGGTTTCA
TTCACGGCATCGGCGAGAAGATACAGGGAACCGTTGGTTTCGGCAAGCCAACGGCTGACG
TCTCAGCCATCCACATCCCCAAGATCAATCTCGAGAGAGCAGACATTGTCGTAGACGTGC
TCGTCAAGAACCCCAACCCTGTTCCCATCCCTCTCATCGACATCGACTACTTGATCGACA
GTGACGGGAGGAAACTCGTCTCTGGACTGATCCCTGACGCTGGAACCATCAAGGCGCATG
GAGAAGAAACCGTCAAGATACCGTTGACTCTGATCTACGACGACATCAAGAGCACTTACA
ACGACATTAACCCCGGGATGATCATACCTTACAGGATCAAAGTTGATCTCATCGTCGACG
TGCCTGTCTTGGGGAGGCTCACGTTACCGTTGGAGAAACGTGGAGAGATCCCTATCCCGA
AGAAACCTAATGTTGACATCCAGAAGATCAAGTTCCAGAAGTTTTCTTTGGAAGAAACCG
TGGCGATACTCCACGTGAGGCTTGAGAACTTGAATGATTTT*GATTTGGGGGTTAATGAC
TTGGACTGTGAAGTGTGGTTGGCTGATGTGAGTATTGGGAGAGCTGAGATATCTGACTCT
GTGAAGCTTGATAAAAACGGAAGTGGGTTGATTAATGTGCCGATCACGTTCAAGCCAAAG
GACTTTGGGTCTGCGCTTTGGGATATGATACGTGGCAAAGGGACTGGGTACACTATTAAA
GGTAATGTGGATGTTGATACACCGTTTGGAGGTATGAAGCTTCCTATTATCAAGGAAGGT
GGTGAGACTCGTTTGAAGAAGGAAGATGATGATGATGACGATGAGGAGTAAGGAGAAGAG
ATCAAGAAGATGAGTGTGTTAAGTGATGAATCTCTGATGTTAAAAAATAAATCTAAGTTA
AATGAAAGACTTATTTGTTGTGCTTATGATGTTTGATGGATCAGACTTCTAAATAGAACT
GTTTTTGTATTGTACTCCAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI09TF U 4
AF RR2CM69TF U 4
AF RR2CJ34TF U 1
AF RR2AU51TF U 25
AF RR2AU51JQ C 323
AF RR2CJ34JQ C 326
AF RR2CM69JQ C 492
BS 1 139 RR2CJ34TF
BS 140 142 RR2CM69TF
BS 143 487 RR2CJ34TF
BS 488 488 RR2CM69TF
BS 489 633 RR2CJ34TF
BS 634 634 RR2CM69TF
BS 635 679 RR2CJ34TF
BS 680 680 RR2AU51TF
BS 681 715 RR2CJ34TF
BS 716 716 RR2AU51TF
BS 717 784 RR2CJ34TF
BS 785 832 RR2AU51TF
BS 833 1139 RR2AU51JQ
BS 1140 1166 RR2CJ34JQ

RD RR2GI09TF 610 0 0
GG
ACCACACAACTCTTGAAAGCACTCTCTTGTCTCTCTCTTGCTCACATTCCATCCAATTTT
CCAGGTATGTCTACATCCGAGAACAAAGTTGAAATCGTTGACAGAGCTCACAAGGAGGAC
GAAAAAGAAGAAGA***AGGTAAAGGTGGATTCCTAGACAATGTCAAAGGCTTCATTCAC
GGCATTGGCGAGAAGATACAGGGAACCGTTGGTTTCGGCAAGCCAACAGCTGACGTCTCA
GCCATTCACATCCCCAAGATCAATCTCGAGAGAGCAGACATTGTCGTAGACGTGCTCGTC
AAGAACCCCAACCCGGTTCCCATCCCTCTCATCGACATCGACTACTTGATCGACAGTGAC
GGGAGGAAACTCGTCTCCGGACTGATCCCTGACGCTGGAACCATCAAGGCGCATGGAGAA
GAAACCGTCAAGATACCGTTGACTCTGATCTACGATGACATCAAGAGCACTTACAACGAC
ATCAACCCCGGGATGATCATACCTTACAGGATCAAAGTCGATCTCATCGTCGACGTGCCT
GTCTTGGGGAGGCTCACGTTACCGTTGGAGAAGCGTGGAGAGATTCCCATCCCGAAGAAA
CCTGATGT

QA 3 610 3 610
DS 

RD RR2CM69TF 721 0 0
GG
ACCACACAACTCTTGAAAGCACTCTCTTGTCTCTCTCTTGCTCACATTC*ATCCAACTCT
CCAGGTATGTCTACATCCGAGAACAAAGTTGAAATCGTTGACAGAGCTCACAAGGAGGAT
GAAAAAGAAGAAGAAGAAGGTAAAGGTGGATTCCT*GACAATGTCAAAGGTTTCATTCAC
GGCATCGGCGAGAAGATACAGGGAACCGTTGGTTTCGGCAAGCCAACGGCTGACGTCTCA
GCCATCCACATCCCCAAGATCAATCTCGAGAGAGCAGACATTGTCGTAGACGTGCTCGTC
AAGAACCCCAACCCTGTTCCCATCCCTCTCATCGACATCGACCACTTGATCGACAGTGAC
GGGAGGAAACTCGTCTCTGGACTGATCCCTGACGCTGGAACCATCAAGGCGCATGGAGAA
GAAACCGTCAAGATACCGTTGACTCTGATCTACGACGACATCAAGAGCACTTACAACGAC
ATTAACCCCGGGATGATCATACCTTACAGGATCAAAGTTGATCTCATCGTCGACGTGCCT
GTCTTGGGGAGGCTCACGTTACCGTTGGAGAAACGTGGAGAGATCCCTATCCCGAAGAAA
CCTAATGTTGACATCCAGAAGATCAAGTTCCAGAAGTTTTCTTTGGAAGAAACCGTGGCG
ATACTCCACGTGAG*CTTGAGAACTTGA*TGATTT**GATTTGGGGGT
ATGACTGACTG

QA 3 710 3 710
DS 

RD RR2CJ34TF 787 0 0
GGACCACCACACAACTCTTGAAAGCACTCTCTTGTCTCTCTCTTGCTCACATTC*ATCCA
ACTCTCCAGGTATGTCTACATCCGAGAACAAAGTTGAAATCGTTGACAGAGCTCACAAGG
AGGATGAAAAAGAAGAAGA***AGGTAAAGGTGGATTCCTAGACAATGTCAAAGGTTTCA
TTCACGGCATCGGCGAGAAGATACAGGGAACCGTTGGTTTCGGCAAGCCAACGGCTGACG
TCTCAGCCATCCACATCCCCAAGATCAATCTCGAGAGAGCAGACATTGTCGTAGACGTGC
TCGTCAAGAACCCCAACCCTGTTCCCATCCCTCTCATCGACATCGACTACTTGATCGACA
GTGACGGGAGGAAACTCGTCTCTGGACTGATCCCTGACGCTGGAACCATCAAGGCGCATG
GAGAAGAAACCGTCAAGATACCGTTGACTCTGATCTACGACGACATCAAGAGCACTTACA
ACGACAT*AACCCCGGGATGATCATACCTTACAGGATCAAAGTTGATCTCATCGTCGACG
TGCCTGTCTTGGGGAGGCTCACGTTACCGTTGGAGAAACGTGGAGAGATCCCTATCCCGA
AGAAACCTAATGTTGACATCCAGAAGATCAAGTCCCAGAAGTTTTCTTTGGAAGAAACCG
TGGCGATACTCCACGTGAG*CTTGAGAACTTGAATGATTTT*GATTTGGGGGTTA*TGAC
TTGGACTGTGAAGTGTGGTTGGCTGATGTGAGTATTGGGAGAGCTGAGATATCTGACTCT
GTGA
GCT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2AU51TF 811 0 0
G
ACTCTCTTGTCTCTCTCTTGCTCACATTC*ATCCAACTCTCCAGGTATGTCTACATCCGA
GAACAAAGTTGAAATCGTTGACAGAGCTCACAAGGAGGATGAAAAAGAAGAAGAAGAAGG
TAAAGGTGGATTCCTAGACAATGTCAAAGGTTTCATTCACGGCATCGGCGAGAAGATACA
GGGAACCGTTGGTTTCGGCAAGCCAACGGCTGACGTCTCAGCCATCCACATCCCCAAGAT
CAATCTCGAGAGAGCAGACATTGTCGTAGACGTGCTCGTCAAGAACCCCAACCCTGTTCC
CATCCCTCTCATCGACATCGACTACTTGATCGACAGTGACGGGAGGAAACTCGTCTCTGG
ACTGATCCCTGACGCTGGAACCATCAAGGCGCATGGAGAAGAAACCGTCAAGATACCGTT
GACTCTGATCTACGACGACATCAAGAGCACTTACAACGACATTAACCCCGGGATGATCAT
ACCTTACAGGATCAAAGTTGATCTCATCGTCGACGTGCCTGTCTTGGGGAGGCTCACGTT
ACCGTTGGAGAAACGTGGAGAGATCCCTATCCCGAAGAAACCTAATGTTGACATCCAGAA
GATCAAGTTCCAGAAGTTTTCTTTGGAAGAAACCGTGGCGATACTCCACGTGAGGCTTGA
GAACTTGAATGATTTTTGATTTGGGGGTTAATGACTTGGACTGTGAAGTGTGGTTGGCTG
ATGTGAGTATTGGGAGAGCTGAGATATCTGACTCTGTGAAGCTTGATAAAAACGGAAGTG
GGTTGATTAATGTGCCGATCACGTTCA
GCC

QA 2 808 2 808
DS 

RD RR2AU51JQ 817 0 0
TCCCATCCCTCTCATCGACATCGACTACTTGATCGACAGTGACGGGAGGAAACTCGTCTC
TGGACTGATCCCTGACGCTGGAACCATCAAGGCGCATGGAGAAGAAACCGTCAAGATACC
GTTGACTCTGATCTACGACGACATCAAGAGCACTTACAACGACATTAACCCCGGGATGAT
CATACCTTACAGGATCAAAGTTGATCTCATCGTCGACGTGCCTGTCTTGGGGAGGCTCAC
GTTACCGTTGGAGAAACGTGGAGAGATCCCTATCCCGAAGAAACCTAATGTTGACATCCA
GAAGATCAAGTTCCAGAAGTTTTCTTTGGAAGAAACCGTGGCGATACTCCACGTGAGGCT
TGAGAACTTGAATGATTTTTGATTTGGGGGTTAATGACTTGGACTGTGAAGTGTGGTTGG
CTGATGTGAGTATTGGGAGAGCTGAGATATCTGACTCTGTGAAGCTTGATAAAAACGGAA
GTGGGTTGATTAATGTGCCGATCACGTTCAAGCCAAAGGACTTTGGGTCTGCGCTTTGGG
ATATGATACGTGGCAAAGGGACTGGGTACACTATTAAAGGTAATGTGGATGTTGATACAC
CGTTTGGAGGTATGAAGCTTCCTATTATCAAGGAAGGTGGTGAGACTCGTTTGAAGAAGG
AAGATGATGATGATGACGATGAGGAGTAAGGAGAAGAGATCAAGAAGATGAGTGTGTTAA
GTGATGAATCTCTGATGTTAAAAAATAAATCTAAGTTAAATGAAAGACTTATTTGTTGTG
CTTATGATGTTTGATGGATCAGACTTCTAAATAGAAC

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2CJ34JQ 841 0 0
CC
TCCCTCTCATCGACATCGACTACTTGATCGACAGTGACGGGAGGAAACTCGTCTCTGGAC
TGATCCCTGACGCTGGAACCATCAAGGCGCATGGAGAAGAAACCGTCAAGATACCGTTGA
CTCTGATCTACGACGACATCAAGAGCACTTACAACGACAT*AACCCCGGGATGATCATAC
CTTACAGGATCAAAGTTGATCTCATCGTCGACGTGCCTGTCTTGGGGAGGCTCACGTTAC
CGTTGGAGAAACGTGGAGAGATCCCTATCCCGAAGAAACCTAATGTTGACATCCAGAAGA
TCAAGTCCCAGAAGTTTTCTTTGGAAGAAACCGTGGCGATACTCCACGTGAGGCTTGAGA
ACTTGAATGATTTT*GATTTGGGGGTTAATGACTTGGACTGTGAAGTGTGGTTGGCTGAT
GTGAGTATTGGGAGAGCTGAGATATCTGACTCTGTGAAGCTTGATAAAGACGGAAGTGGG
TTGATTAATGTGCCGATCACGTTCAAGCCAAAGGACTTTGGGTCTGCGCTTTGGGATATG
ATACGTGGCAAAGGGGCTGGGTACACTATTAAAGGTAATGTGGATGTTGATACACCGTTT
GGAGGTATGAAGCTTCCTATTATCAAGGAAGGTGGTGAGACTCGTTTGAAGAAGGAAGAT
GATGATGATGACGATGAGGAGTAAGGAGAAGAGATCAAGAAGATGAGTGTGTTAAGTGAT
GAATCTCTGATGTTAAAAAATAAATCTAAGTTAAATGAAAGACTTATTTGTTGTGCTTAT
GATGTTTGATGGATCAGACTTCTAAATAGAACTGTTTTTGTATTGTACTCCAAAAAAAA

QA 3 841 3 841
DS 

RD RR2CM69JQ 669 0 0
CCCGGGATGATCATACCTTACAGGATCAAAGTTGATCTCATCGTCGACGTGCCTGTCTTG
GGGAGGCTCACGTTACCGTTGGAGAAACGTGGAGAGATCCCTATCCCGAAGAAACCTAAT
GTTGACATCCAGAAGATCAAGTTCCAGAAGTTTTCTTTGGAAGAAACCGTGGCGATACTC
CACGTGAGGCTTGAGAACTTGAATGATTTT*GATTTGGGGGTTAATGACTTGGACTGTTA
AGTGTGGTTGGCTGATGTGAGTATTGGGAGAGCTGAGATATCTGACTCTGTGAAGCTTGA
TAAAAACGGAAGTGGGTTGATTAATGTGCCGATCACGTTCAAGCCAAAGGACTTTGGGTT
TGCGCTTTGGGATATGATACGTGGCAAAGGGACTGGGTACACTATTAAAGGTAATGTGGA
TGTTGATACACCGTTTGGAGGTATGAAGCTTCCTATTATCAAGGAAGGTGGTGAGACTCG
TTTGAAGAAGGAAGATGATGATGATGACGATGAGGAGTAAGGAGAAGAGATCAAGAAGAT
GAGTGTGTTAAGTGATGAATCTCTGATGTTAAAAAATAAATCTAAGTTAAATGAAAGACT
TATTTGTTGTGCTTATGATGTTTGGTGGATCAGACTTCTAAATAGAACTGTTTTTGTATT
GTACTCC
TC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 8

CO CL906Contig1 1240 8 23 U
ACCGATAATAACAGTAAAATAACATTAATAATAGTGATTTTTATTCGGTCTTATTTTCTT
GACAGACATGACAAACATACATCTGTTAGAATTTGAGGTAATAAAATAATCTTACAACAA
TGATCAAATAGTAGACATACGCCTAACGCCTTCTCCTGCTCGTAACATACTAAATGGTAG
CTATAACAATAATCATCTATTGATTATATTTCAAATTACCATCGTGAGAAAAACCTCAGA
GAGGTTTAAAAAACCACCGAGAAGAAGAAGGTTT*AGGTATGAGAAGCAGCACTAGATTC
TGCCGTCGACAAATCAAGAAGCATCTTCTTGTATGGCATTGCACTCATGATCCTCTCTTT
GCGCTTCTCCAAGAACCGAGCCAGCGATGCTTTACGAGCTTGTGGAACTGAAGGAATCAT
ATTGCTAGGACCTGCATTGAATGTTTCGATCATGGTCATTCCATTAGTCGCACCAACGTG
TTTGTCTTTACTCCTAGAGAAACTATCAGCGTTAGTCGCAGAGCTTGAAGATGCAGCAGC
AGTTGCTTTATGGATTTGTTTCCCAAAGACGACTCTCTCAGTTTCTCGAAGCGGTTTCTT
CAGACTGCTCTCTCCAAATTCTCCTTTCAAACCATTCCCAGCACATAACATAATGGCTCG
AGCCTTATCAGG*TGATATGTCATTAAAGACGGTAACAGTTCCGGCATATAAAATTGTGA
GCTGAGGAGATGATCCTGAGGAAGCCACTCGTGGATCCGTGGATGAGTTAAAGGCAGGAC
GGAGAGAAGGATGATTAGTTAAAGAAACTGATCCGCCAAGTAAAAGCGGATCAGCCTTCT
GAAACGCACCACCGCCAAATTGGCGTCTGCGGTGAGTAATGGCCGCAGAAACCGGGGACC
ACTGAAAATCTGCAGAAGCCGGCATGAAACTTGAATTAGGCAAGAGCTTTGCCTTTCCCC
ATTGTTTAGCTACCTTCTTGCACCGTCCTCGGTCTCCGACACGATCATCGTCAGCCTCAC
GCTTAACGTTATTCAGATACTGCTTGTCGCTCAAACCCAGAAAATCTCTTTCCATCTCAA
ACCAAATCAAAGAATACTAACACAAGTGTTTTCTCTCTTTCTGCCCAAACATTAATTTAA
AACCAAAAAACAAGACAGAACACAAAGTAAATGGGAAACCAAAATGGAAGGTTTCAATTT
GGTAATGTTGCAGACACACTTTTGGAGAGGACTGACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM35JQ U 20
AF RR2FY62JQ U 1
AF RR2EB86JQ U 46
AF RR2DE25JQ U 21
AF RR2DE25TF C 436
AF RR2EB86TF C 419
AF RR2DM35TF C 466
AF RR2FY62TF C 588
BS 1 274 RR2FY62JQ
BS 275 275 RR2DE25JQ
BS 276 393 RR2FY62JQ
BS 394 394 RR2DE25JQ
BS 395 566 RR2FY62JQ
BS 567 567 RR2EB86JQ
BS 568 672 RR2FY62JQ
BS 673 673 RR2DE25JQ
BS 674 679 RR2FY62JQ
BS 680 680 RR2DE25JQ
BS 681 702 RR2FY62JQ
BS 703 703 RR2DE25JQ
BS 704 711 RR2FY62JQ
BS 712 785 RR2DE25JQ
BS 786 1018 RR2DE25TF
BS 1019 1019 RR2DM35TF
BS 1020 1042 RR2DE25TF
BS 1043 1046 RR2EB86TF
BS 1047 1047 RR2DM35TF
BS 1048 1152 RR2EB86TF
BS 1153 1153 RR2DM35TF
BS 1154 1233 RR2EB86TF
BS 1234 1240 RR2DM35TF

RD RR2DM35JQ 214 0 0
T
AACATTAATAATAGTGATTTTTATTCGGTCTTATTTTCTTGACAGACATGACAAACATAC
ATCTGTTAAAATTTGAGGTAATAAAATAATCTTACAACAATGATCAAATAGTAAACATAC
GCCTAACGCCTTCTCCTGCTCGTAACATACTAAATGGTAGCTATAACAATAATCATCTAT
TGATTATATTTCAAATTACCATCGTGAGAAAAA

QA 2 214 2 214
DS 

RD RR2FY62JQ 711 0 0
ACCGATAATAACAGTAAAATAACATTAATAATAGTGATTTTTATTCGGTCTTATTTTCTT
GACAGACATGACAAACATACATCTGTTAGAATTTGAGGTAATAAAATAATCTTACAACAA
TGATCAAATAGTAGACATACGCCTAACGCCTTCTCCTGCTCGTAACATACTAAATGGTAG
CTATAACAATAATCATCTATTGATTATATTTCAAATTACCATCGTGAGAAAAACCTCAGA
GAGGTTTAAAAAACCACCGAGAAGAAGAAGGTTTTAGGTATGAGAAGCAGCACTAGATTC
TGCCGTCGACAAATCAAGAAGCATCTTCTTGTATGGCATTGCACTCATGATCCTCTCTTT
GCGCTTCTCCAAGAACCGAGCCAGCGATGCTTTGCGAGCTTGTGGAACTGAAGGAATCAT
ATTGCTAGGACCTGCATTGAATGTTTCGATCATGGTCATTCCATTAGTCGCACCAACGTG
TTTGTCTTTACTCCTAGAGAAACTATCAGCGTTAGTCGCAGAGCTTGAAGATGCAGCAGC
AGTTGCTTTATGGATTTGTTTCCCAAGGACGACTCTCTCAGTTTCTCGAAGCGGTTTCTT
CAGACTGCTCTCTCCAAATTCTCCTTTCAAACCATTCCCAGCACATAACATAATGGCTCG
AGCCTTATCAGGGTGATATATCATTAAAGACGGTAACAGTTCTGGCATATA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2EB86JQ 728 0 0
CGGTCTTATTTTCTTGACAGACATGACAAACATGCATCTGTTAGAATTTGAGGCAATAAA
ATAATCTTACAACAATGATCAAATAGTAGACATACGCCTAACGCCTTCTCCTGCTCGTAA
CATACTAAATGGTAGCTATAACAATAATCATCTATTGATTATATTTCAAATTACCATCGT
GAGAAAAACCTCAGAGAGGTTTAAAAAACCACCGAGAAGAAGAAGGTTT*AGGTATGAGA
AGCAGCACTAGATTCTGCCGTCGACAAATCAAGAAGCATCTTCTTGTATGGCATTGCACT
CATGATCCTCTCTTTGCGCTTCTCCAAGAACCGAGCCAGCGATGCTT*ACGAGCTTGTGG
AACTGAAGGAATCATATTGCTAGGACCTGCATTGAATGTTTCGATCATGGTCATTCCATT
AGTCGCACCAACGTGTTTGTCTTTACTCCTAGAGAAACTATCAGCGTTAGTCGCAGAGCT
TGAAGATGCAGCAGCAGTTGCTTTATGGATTTGTTTCCCAAAGACGACTCTCTCAGTTTC
TCGAAGCGGTTTCTTCAGACTGCTCTCTCCAAATTCTCCTTTCAAACCATTCCCAGCACA
TAACATAATGGCTCGAGCCTTATCAGG*TGATATGTCATTAAAGACGGTAACAGTTCCGG
CATATAAAATTGTGAGCTGAGGAGATGATCCTGAGGAAGCCACTCGTGGATCCGTGGATG
AGTTAAAG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2DE25JQ 765 0 0
AACATTAATAATAGTGATTTTTATTCGGTCTTATTTTCTTGACAGACATGACAAACATGC
ATCTGTTAGAATTTGAGGTAATAAAATAATCTTACAACAATGATCAAATAGTAGACATAC
GCCTAACGCCTTCTCCTGCTCGTAACATACTAAATGGTAGCTATAACAATAATCATCTAT
TGATTATATTTCAAATTACCATCGTGAGAAAAACCTCTGAGAGGTTTAAAAAACCACCGA
GAAGAAGAAGGTTT*AGGTATGAGAAGCAGCACTAGATTCTGCCGTCGACAAATCAAGAA
GCATCTTCTTGTATGGCATTGCACTCATGATCCTCTCTTTGCGCTTCTCCAAGAACCGAG
CCAGTGATGCTTTACGAGCTTGTGGAACTGAAGGAATCATATTGCTAGGACCTGCATTGA
ATGTTTCGATCATGGTCATTCCATTAGTCGCACCAACGTGTTTGTCTTTACTCCTAGAGA
AACTATCAGCGTTAGTCGCAGAGCTTGAAGATGCAGCAGCAGTTGCTTTATGGATTTGTC
TCCCAATGACGACTCTCTCAGTTTCTCGAAGCGGTTTCTTCAGACTGCTCTCTCCAAATT
CTCCTTTCAAACCATTCCCAGCACATAACATAATGGCTCGAGCCTTATCAGG*TGATATG
TCATTAAAGACGGTAACAGTTCCGGCATATAAAATTGTGAGCTGAGGAGATGATCCTGAG
GAAGCCACTCGTGGATCCGTGGATGAGTTAAAGGCAGGACGGAGA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2DE25TF 612 0 0
ATTGAATGTTTCGATCATGGTCATTCCATTAGTCGCACCAACGTGTTTGTCTTTACTCCT
AGAGAAACTATCAGCGTTAGTCGCAGAGCTTGAAGATGCAGCAGCAGTTGCTTTATGGAT
TTGTCTCCCAATGACGACTCTCTCAGTTTCTCGAAGCGGTTTCTTCAGACTGCTCTCTCC
AAATTCTCCTTTCAAACCATTCCCAGCACATAACATAATGGCTCGAGCCTTATCAGG*TG
ATATGTCATTAAAGACGGTAACAGTTCCGGCATATAAAATTGTGAGCTGAGGAGATGATC
CTGAGGAAGCCACTCGTGGATCCGTGGATGAGTTAAAGGCAGGACGGAGAGAAGGATGAT
TAGTTAAAGAAACTGATCCGCCAAGTAAAAGCGGATCAGCCTTCTGAAACGCACCACCGC
CAAATTGGCGTCTGCGGTGAGTAATGGCCGCAGAAACCGGGGACCACTGAAAATCTGCAG
AAGCCGGCATGAAACTTGAATTAGGCAAGAGCTTTGCCTTTCCCCATTGTTTAGCTACCT
TCTTGCACCGTCCTCGGTCTCCGACACGATCATCGTCAGCCTCGCGCTTAACGTTATTCA
GATACTG
ATTGC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2EB86TF 817 0 0
GATCATATGCTAGACTGCA
TGAATGTTTCGATCATG*TCAT*CCATTAGTCGCACCAACGTGTT*GTCTT*ACTCCTAG
AGAAACTATCAGCGTTAGTCGCAGAGCTTGAAGATGCAGCAGCAGTTGCTTTATGGATTT
GTTTCCCAAAGACGACTCTCTCAGTTTCTCGAAGCGGTTTCTTCAGACTGCTCTCTCCAA
ATTCTCCTTTCAAACCATTCCCAGCACATAACATAATGGCTCGAGCCTTATCAGG*TGAT
ATGTCATTAAAGACGGTAACAGTTCCGGCATATAAAATTGTGAGCTGAGGAGATGATCCT
GAGGAAGCCACTCGTGGATCCGTGGATGAGTTAAAGGCAGGACGGAGAGAAGGATGATTA
GTTAAAGAAACTGATCCGCCAAGTAAAAGCGGATCAGCCTTCTGAAACGCACCACCGCCA
AATTGGCGTCTGCGGTGAGTAATGGCCGCAGAAACCGGGGACCACTGAAAATCTGCAGAA
GCCGGCATGAAACTTGAATTAGGCAAGAGCTTTGTCTTTCCCCATTGTTTAGCTACCTTC
TTGCACCGTCCTCGGTCTCCGACACGATCATCGTCAGCCTCGCGCTTAACGTCATTCAGA
TACTGCTTGCCGCTCAAACCCAGAAAATCTCTTTCCATCTCAAACCAAATCAAAGAATAC
TAACACAAGTGTTTTCTCTCTTTCTGCCCAAACATTAATTTAAAACCAAAAAACAGGACA
GAACACAAAGTAAATGGGAAACCAAAATGGAAGGTTTCAATTTGGTAATGTTGCAGACAC
ACTTTTGGAGAGGACT
CC

QA 20 815 20 815
DS 

RD RR2DM35TF 775 0 0
AGTCGCACCAACGTGTTTGTCTTTACTCCTAGAGAAACTATCAGCGTTAGTCGCAGAGCT
TGGAGATGCAGCAGCAGTTGCTTTATGGATTTGTTTCCCAAAGACGACTCTCTCAGTTTC
TCGAAGCGGTTTCTTCAGACTGCTCTCTCCAAATTCTCCTTTCAAACCATTCCCAGCACA
TAACATAATGGCTCGAGCCTTATCAGG*TGATACGTCATTAAAGACGGTAACAGTTCCGG
CATATAAAATTGTGAGCTGAGGAGATGATCCTGAGGAAGCCACTCGTGGATCCGTGGATG
AGTTAAAGGCAGGACGGAGAGAAGGATGATTAGTTAAAGGAACTGATCCGCCAAGTAAAA
GTGGATCAGCCTTCTGAAACGCACCACCGCCAAATTGGCGTCTGCGGTGAGTAATGGCCG
CAGAAACCGGGGACCACTGAAAATCTGCAGAAGCCGGCATGAAACTTGAATTAGGCAAGA
GCTTTGCCTTTCCCCATTGTTTAGCTACCTTCTTGCACCGTCCTCGGTCTCCGACACGAT
CATCGTCAGCCTCACGCTTAACGTTATTCAGATACTGCTTGTCGCTCAAACCCAGAAAAT
CTCTTTCCATCTCAAACCAAATCAAAGAATACTAACACAAGTGTTTTCTCTCTTTCTGCC
CAAACATTAATTTAAAACCAAAAAACAAGACAGAACACAAAGTAAATGGGAAACCAAAAT
GGAAGGTTTCAATTTGGTAATGTTGCAGACACACTTTTGGAGAGGACTGACTTCC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2FY62TF 648 0 0
GAAGCGGTTTCTTCAGACTGCTCTCTCCAAATTCTCCTTTCAAACCATTCCCAGCACATA
ACATAATGGCTCGAGCCTTATCAGG*TGATATATCATTAAAGACGGTAACAGTTCTGGCA
TATAAAATTGTGAGCTGAGGAGATGATCCTGAGGAAGCCACTCGTGGATCCGTGGATGAG
TTAACGGCAGGACGGAGAGAAGGATGATTAGTTAAAGGAACTGATCCGCCAAGTAAAAGT
GGATCAGCCTTCTGAAACGCACCACCGCCAAATTGGCGTCTGCGGTGAGTAATGGCCGCA
GAAACCGGGGACCACTGAAAATCTGCAGAAGCCGGCATGAAACTTGAATTAGGCAAGAGC
TTTGCCTTTCCCCATTGTTTAGCTACCTTCTTGCACCGTCCTCGGTCTCCGACACGATCA
TCGTCAGCCTCACGCTTAACGTTATTCAGATACTGCTTGTCGCTCAAACCCAGAAAATCT
CTTTCCATCTCAAACCAAATCAAAGAATACTAACACAAGTGTTTTCTCTCTTTCTGCCCA
AACATTAATTTAAAACCAAAAAACAAGACAGAACACAAAGTAAATGGGAAACCAAAATGG
AAGGTTTCAATTTGGTAATGTTGCAGACACACTTTTGGAGAGGACT
CC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 8

CO CL907Contig1 1222 8 12 U
GAGCTAATGAGTTCATTTCACTTCCATAAACATGTCTTGAAGTTTAACAAGCAAAAATGA
CATGACATCAGAGTAGCAAAAATTATTTATTGTAGAGATACGGCCAGGAAAAGTCCGCCA
TTTAAACTGTAGACGAAAACAAACAATAAAAATAGGACCACTGTAAGAAAGAAAAGATCA
AACTGGTTGGGTCTCTCTCTTATTCACCCAAAGATCTTTATTTTACAAGTCCAAAAATAT
CGCTTGATCTTTTACAGCAAATGTTTGCTGCTTCAACAAAATTTGCTGCTTACGGTGTCG
TAGCTTGGAACAGACAACACCTCTCCGAAGGAACCCATTGTCAAAGGCTTTGAAATAATC
TTGCTGGTGAAATCTGTAATGTCCTTCAACGTAAGTCCGTCTACTGTCTTCAAGAATTGC
TCGACTGGCTTCCTCTCTCCGTATGTAAGTATCTGCCTGCCAATGTCTTCTGATGCAATC
ATCCGAGATTCCAAATTCATTAGAATTGCAGATTTTGTGGCTGCCTTGGCGCGATCAAGA
TGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCCAGCAACATCTTTCAGTTCTTTAGCTGCTAATTCAATT
GCTTTTGCAGCGAACTCAGGGCTCGAGCAACCATAGATTCCAAACAATCCGGTGTTGTTA
AAGATGCTAGTGAATGCAGTGCATGACTGAACTTGCTGATATTCGTTAAGAATACGGAGA
TATAGCCATGAGTGCATTCCTTTTCCAGGGCCTCCAGCTGAAAATGAGCCGCCTCCTCCC
ATGAGCATCTGAAGAACAGTGGCGATGACTGCTTCTTTCTCGTTATTCCAGCCAGGCACC
TCAAAAGCAAGCGCAAAGTGTGTAGCCTCTCCACCAGTATGTTGGCGAAAATCTCCACCA
GTATACTGAGATTTTGGCTCCCCTTGGCGCGGTACATTAGGAAGGTCAGAAGTCAATGGC
TCAACAACATGCAAAAGTTCCTCGTGTTCAACTCCACTTGCCGCCAGTACCATACGTGCA
GCAGTGAAATTCTCAGTCATAAACTCCTCCAAGAGTTCCCCATTCAACCTATCCAAAGCA
GACTCATGAGCATACAAAGGATTTGCCAAGGCACCGGAATGACCAGCAGAGTGAACGGCC
TCCATGAGGAGACCCATAGGGTTCTTTGCAAGCTCTGCTATCTCCACCTTCATCTTACGT
AGCTCTTCATTAACTTCCCAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX36JQ U 101
AF RR2F522JQ U 1
AF RR2AD83JQ U 54
AF RR2BF61JQ U 92
AF RR2E488JQ U 24
AF RR2E488TF C 330
AF RR2DX36TF C 531
AF RR2AD83TF C 472
BS 1 441 RR2F522JQ
BS 442 442 RR2E488JQ
BS 443 696 RR2F522JQ
BS 697 763 RR2E488JQ
BS 764 764 RR2E488TF
BS 765 845 RR2E488JQ
BS 846 846 RR2E488TF
BS 847 869 RR2E488JQ
BS 870 893 RR2E488TF
BS 894 894 RR2AD83TF
BS 895 981 RR2E488TF
BS 982 1222 RR2AD83TF

RD RR2DX36JQ 460 0 0
CGGCCAGGAAAAGTCCGCCATTTAAACTGTAGAAGAAAACAAACAATAAAAATAGGACCA
CTGTAAGAAAGAAAAGATCAAACTGGTTGGGTCTCTCTCTTATTCACCCAAAGATCTTTA
TTTTACAAGTCCAAAAATATCGCTTGATCTTTTACAGCAAATGTTTGCTGCTTCAACAAA
ATTTGCTGCTTACGGTGTCGTAACTTGGAACAGACAACACCTCTCCGAAGGAACCCATTG
TCAAAGGCTTTGAAATAATCTTGCTGGTGAAATCTGTAATGTCCTTCAACGTAAGTCCGT
CTACTGTCTTCAAGAATTGCTCGACTGGCTTCCTCTCTCCGTATGTAAGTATCTGCCTGC
CAATGTCTTCTGATGCAATAACCCGAGATTCCAAATTCGTTAGAATTGCAGATTTTGTGG
CTGCCTTGGCGCGATCAAGATGCTTCTGGTTAACTTTTCC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2F522JQ 696 0 0
GAGCTAATGAGTTCATTTCACTTCCATAAACATGTCTTGAAGTTTAACAAGCAAAAATGA
CATGACATCAGAGTAGCAAAAATTATTTATTGTAGAGATACGGCCAGGAAAAGTCCGCCA
TTTAAACTGTAGACGAAAACAAACAATAAAAATAGGACCACTGTAAGAAAGAAAAGATCA
AACTGGTTGGGTCTCTCTCTTATTCACCCAAAGATCTTTATTTTACAAGTCCAAAAATAT
CGCTTGATCTTTTACAGCAAATGTTTGCTGCTTCAACAAAATTTGCTGCTTACGGTGTCG
TAGCTTGGAACAGACAACACCTCTCCGAAGGAACCCATTGTCAAAGGCTTTGAAATAATC
TTGCTGGTGAAATCTGTAATGTCCTTCAACGTAAGTCCGTCTACTGTCTTCAAGAATTGC
TCGACTGGCTTCCTCTCTCCGCATGTAAGTATCTGCCTGCCAATGTCTTCTGATGCAATC
ATCCGAGATTCCAAATTCATTAGAATTGCAGATTTTGTGGCTGCCTTGGCGCGATCAAGA
TGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCCAGCAACATCTTTCAGTTCTTTAGCTGCTAATTCAATT
GCTTTTGCAGCGAACTCAGGGCTCGAGCAACCATAGATTCCAAACAATCCGGTGTTGTTA
AAGATGCTAGTGAATGCAGTGCATGACTGAACTTGC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2AD83JQ 661 0 0
CCATA
GACATGACATCACAGTAGCAAAAATTATTTATTGTAGAGATACGGCCAGGAAAAGTCCGC
CATTTAAACTGTAGACGAAAACAAACAATAAAAATAGGACCACTGTAAGAAAGAAAAGAT
CAAACTGGCTGGGTCTCTCT**TATTGACCCAAAGATCTTTATTTTACTAGTCCAAAAAT
ATCGCTTGATCTTTTACAGCAAATGTTTGCTGCTTCAACAAAATTTGCTGCTTACGGTGT
CGTAGCTTGGAACAGACAACACCTCTCCGAAGGAACCCATTGTCAAAGGCTTTGAAATAA
TCTTGCTGGTGAAATCTGTAATGTCCTTCAACGTAAGTCCGTCTACTGTCTTCAAGAATT
GCTCGACTGGCTTCCTCTCTCCGTATGTTAGTATCTGCCTGCCAATGTCTTCTGATGCAA
TCATCCGAGATTCCAAATTCATTAAAATTGCAGATTTTGTGGCTGCCTTGGCGCGATCAA
GATGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCCAGCAACATCTTTCAGTTCTTTAGCTGCTAATTCAA
TTGCTTTTGCAGCGAACTCAGGGCTCGAGCAACCATAGATTCCAAACAATCCGGTGTTGT
TAAAGATGCTAGTGAATGCGGTGCATGACTGAACTTGCTGATATTCGTTTAGAATA

QA 6 661 6 661
DS 

RD RR2BF61JQ 629 0 0
GTAA
AGATACGGCCAGGAAAAGTCCGCCATTTAAACTGTAGACGAAAACAAACAATAAAAATAG
GACCACTGTAAGAAAGAAAAGATCAAACTGGTTGGGTCTCTCTCTTATTCACCCAAAGAT
CTTTATTTTACAAGTCCAAAAATATCGCTTGATCTTTTACAGCAAATGTTTGCTGCTTCA
ACAAAATTTGCTGCTTACGGTGTCGTGGCTTGGAACAGACAACACCTCTCCGAAGGAACC
CATTGCCAAAGGCTTTGAAATAATCTTGCTGGTGAAATCTGTAATGTCCTTCAACGTAAG
TCCGTCTACTGTCTTCAAGAATTGCTCGACTGGCTTCCTCTCTCCGTATGTAAGTATCTG
CCTGCCAATGTCTTCTGATGCAATCATCCGAGATTCCAAATTCATTAGAATTGCAGATTT
TGTGGCTGCCTTGGCGCGATCAAGATGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCCAGCAACATCTTT
CAGTTCTTTAGCTGCTAATTCAATTGCTTTTGCAGCGAACTCAGGGCTCGAGCAACCATA
GATTCCAAACAATCCGGTGTTGTTAAAGATGCTAGTGAATGCAGTGCATGACTGAACTTG
CTGATATTCGTTAAGAATACGGAGA

QA 5 629 5 629
DS 

RD RR2E488JQ 846 0 0
CCATAAACATGTCTTGAAGTTTAGCACGCAAAAATGACATGACATCAGAGTAGCAAAAAT
TATTTATTGTAGAGATACGGCCAGGAAAAGTCCGCCATTTAAACTGTAGACGAAAACAAA
CAATAAAAATAGGACCACTGTAAGAAAGAAAAGATCAAACTGGTTGGGTCTCTCTCTTAT
TCACCCAAAGATCTTTATTTTACAAGTCCAAAAATATCGCTTGATCTTTTACAGCAAATG
TTTGCTGCTTCAACAAAATTTGCTGCTTACGGTGTCGTAGCTTGGAACAGACAGCACCTC
TCCGAAGGAACCCATTGTCAAAGGCTTTGAAATAATCTTGCTGGTGAAATCTGTAATGTC
CTTCAACGTAAGTCCGTCTACTGTCTTCAAGAATTGCTCGACTGGCTTCCTCTCTCCGTA
TGTAAGTATCTGCCTGCCAATGTCTTCTGATGCAATCATCCGAGATTCCAAATTCATTAG
AATTGCAGATTTTGTGGCTGCCTTGGCGCGATCAAGATGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCC
AGCAACATCTTTCAGTTCTTTAGCTGCTAATTCAATTGCTTTTGCAGCGAACTCAGGGCT
CGAGCAACCATAGATTCCAAACAATCCGGTGTTGTTAAAGATGCTAGTGAATGCAGTGCA
TGACTGAACTTGCTGATATTCGTTAAGAATACGGAGATATAGCCATGAGTGCATTCCTTT
TCCAGGGCCTCCAGCTGAAA*TGAGCCGCCTCCTCCCATGAGCATCTGAAGAACAGTGGC
GATGACTGCTTCTTTCTCGTTATTCCAGCCAGGCACCTCAAA*GCAAGCGCAAAGTGTGT
AGCCTC

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR2E488TF 655 0 0
GGAACCCATTGTCAAAGGCTTTGAAATAATCTTGCTGGTGAAATCTGTAATGTCCTTCAA
CGTAAGTCCGTCTACTGTCTTCAAGAATTGCTCGACTGGCTTCCTCTCTCCGTATGTAAG
TATCTGCCTGCCAATGTCTTCTGATGCAATCATCCGAGATTCCAAATTCATTAGAATTGC
AGATTTTGTGGCTGCCTTGGCGCGATCAAGATGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCCAGCAAC
ATCTTTCAGTTCTTTAGCTGCTAATTCAATTGCTTTTGCAGCGAACTCAGGGCTCGAGCA
ACCATAGATTCCAAACAATCCGGTGTTGTTAAAGATGCTAGTGAATGCAGTGCATGACTG
AACTTGCTGATATTCGTTAAGAATACGGAGATATAGCCATGAGTGCATTCCTTTTCCAGG
GCCTCCAGCTGAAAATGAGCCGCCTCCTCCCATGAGCATCTGAAGAACAGTGGCGATGAC
TGCTTCTTTCTCGTTATTCCAGCCAGGCACCTCAAAAGCAAGCGCAAAGTGTGTAGCCTC
TCCACCAGTATGTTGGCGAAAATCCCCACCAGTATACTGAGATTTTGGCTCCCCTTGGCG
CGGTACATTAGGAAGGTCAGAAGTCAATGGCTCAACAACATGCAAAAGTTCC
TCC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2DX36TF 452 0 0
GCGATCAAGATGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCCAGAAACATCTTTCAGTTCTTTAGCTGC
TAATTCAATTGCTTTTGCAGCGAACTCAGGGCTCGAGCAACCATAGATTCCAAACAATCC
AGTGTTGTTAAATATGCTAGTGAATGCAGTACATGACTGAACTTGCTGATATTCGTTTAG
AATACGGAGATATAGCCATGAGTGCACTCCTTTTCCAGGACCTCCAGCTGAGAATGAGCC
GCCTCCTCCCATGAGCATCTGGAGAACAGTGGCGATGACTGCTTCTTTCTCGTTATTCCA
GCCAGGCACCTCAAAAGCAAGCGCAAAGTGTGTAGCCTCTCCACCAGTATGTTGGCGAAA
ATCTCCACCAGTATACTGAGATTTCGGCTCCCCTTGGCGCGGTATATTAGGAAGGTCAGA
AGTCAATGGCTCAACAACATGCAAAAGTTCC
C

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR2AD83TF 751 0 0
GATGCAATCATCCGAGATTCCAAATTCATTAGAATTGCAGATTTTGTGGCTGCCTTGGCG
CGATCAAGATGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCCAGCAACATCTTTCAGTTCTTTAGCTGCT
AATTCAATTGCTTTTGCAGCGAACTCAGGGCTCGAGCAACCATAGATTCCAAACAATCCG
GTGTTGTTAAAGATGCTAGTGAATGCGGTGCATGACTGAACTTGCTGATATTCGTTTAGA
ATACGGAGATATAGCCATGAGTGCATTCCTTTTCCAGGGCCTCCAGCTGAGAATGAGCCG
CCTCCTCCCATGAGCATCTGGAGAACAGTGGCGATGACTGCTTCCTTCTCGTTATTCCAG
CCAGGCACCTCAAAAGCAAGCGCAAAGTGTGTAGCCTCTCCACCAGTATGTTGGCGAAAA
TCTCCACCAGTATACTGAGATTTTGGCTCTCCTTGGCGCGGTACATTAGGAAGGTCAGAA
GTCAATGGCTCAACAACGTGCAAAAGTTCCTCGTGTTCAACTCCACTTGCCGCCAGTACC
ATACGTGCAGCAGTGAAATTCTCAGTCATAAACTCCTCCAAGAGTTCCCCATTCAACCTA
TCCAAAGCAGACTCATGAGCATACAAAGGATTTGCCAAGGCACCGGAATGACCAGCAGAG
TGAACGGCCTCCATGAGGAGACCCATAGGGTTCTTTGCAAGCTCTGCTATCTCCACCTTC
ATCTTACGTAGCTCTTCATTAACTTCCCAAT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 6

CO CL908Contig1 1256 6 3 U
GCACCCTATTCTCTGTATCATTGCTTTGTCTGTAATATTCATAGCGATAGACCCCTTTCA
CATGAGTCCTATTGGTGGTCGTGAGTTCAAGCCTGTGAAGCATGAGGTCGCTCCATACAA
GCAAGTGATGGAGAACTGGCCAAGAGACAACCTTAGTCAACTAGGTCAGCATGGGAAGCT
GGAGTTTGTGGACCAAGTCTTTGGTCCGGAGTCACTAGAGTTTGATGGTTTAGGCCGTGG
TCCGTACACAGGGTTGGCTGATGGAAGGGTGGTTAGATGGATGGGTGAAGCAGTTGGATG
GGAGACATTCTCTGTTGTAACATCAAAATGGTCAGAAGAGGTTTGATAAAGAGACAGGGA
ACTTGTACATTGCAGACGCTTACTACGGTCTGCTAGTGGTTGGTCCTGAAGGAGGGGTTG
CTACGCCTTTAGCTACCCATGTGGAAGGAAAGCCTATACTCTTTGCCAACGATCTTGACA
TCCATAGAAATGGCTCCATACTCTTTACTGACACAAGCACAAGATATGACAGAGCGAATC
ATTTCTTCATATTGCTTGAAGGAGAATCAACAGGGAGGCTTCTAAGATATGACCCACCTA
CCAAAACAACACACGTTGTGCTTGATGGTTTGGCTTTTCCCAATGGCATTCAGCTCTCTA
GAGACCAATCTTTCCTTCTCTTCACAGAAACAACCAGTTGCAGGTTAGTGAAATATTGGC
TGGAGGGTTCAAGAAAGGGTGAAGTGGAGGTTGTGGCGGATCTACCAGGATTCCCAGACA
ATGTAAGAATGAACGAGAAGGGTGAGTTTTGGGTTGCAATAGACTGTTGCAGAACACCTG
CACAAGAGGTTCTTACAAACAACCCTTGGATAAAGAGCATCTACTTTAGACTTCCCATAC
CGATGAAGCTGCTGGCTAAAGCCATGGGGATGAGAATGTACACTGTGATATCAAAATTCG
ACGAGGAAGGTAAGGTCTTGGAGGTTCTTGAGGATAGACAAGGAAAGGTGATGAAGCTTG
TAAGTGAAGTTAGGGAGGTTCAAGGGAAGCTTTGGATTGGAACAGTAGCTCATAACCATA
TTGCCTCTGTGCCTTATCCTTTGAAAATGGACTAGTGAACAACTTTGTTGTGTAGTTCTT
AGCTTGTGGAAGTGTTATCCTCTTGATTAACATCGATGAGGACAAGTATGTAACAAATAA
TGGTTTTAACTTAATCATCTCCCTGTAATTTAAACTTGAATAATTTTTTTCTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E616TF U 65
AF RR2GX12TF U 1
AF RR2FJ79JQ C 788
AF RR2DJ29TF U 506
AF RR2DJ29JQ C 603
AF RR2FJ79TF U 621
BS 1 664 RR2GX12TF
BS 665 1249 RR2DJ29TF
BS 1250 1256 RR2DJ29JQ

RD RR2E616TF 191 0 0
G
GTCCTATTGGTGGTCGTGAGTTCAAGCCTGTGAAGCATGAGGTCGCTCCATACAAGCAAG
TGATGGAGGACTGGCCAAGAGACAACCTTAGTCAACTAGGTCAGCATGGGAAGCTGGAGT
TTGTGGACCAAGTCTTTGGTCCGGAGTCACTAGAGTTTGATGGTT*AGGCCGTGGTCCG*
ACACAGGGTT

QA 2 191 2 191
DS 

RD RR2GX12TF 664 0 0
GCACCCTATTCTCTGTATCATTGCTTTGTCTGTAATATTCATAGCGATAGACCCCTTTCA
CATGAGTCCTATTGGTGGTCGTGAGTTCAAGCCTGTGAAGCATGAGGTCGCTCCATACAA
GCAAGTGATGGAGAACTGGCCAAGAGACAACCTTAGTCAACTAGGTCAGCATGGGAAGCT
GGAGTTTGTGGACCAAGTCTTTGGTCCGGAGTCACTAGAGTTTGATGGTTTAGGCCGTGG
TCCGTACACAGGGTTGGCTGATGGAAGGGTGGTTAGATGGATGGGTGAAGCAGTTGGATG
GGAGACATTCTCTGTTGTAACATCAAAATGGTCAGAAGAGGTTTGATAAAGAGACAGGGA
ACTTGTACATTGCAGACGCTTACTACGGTCTGCTAGTGGTTGGTCCTGAAGGAGGGGTTG
CTACGCCTTTAGCTACCCATGTGGAAGGAAAGCCTATACTCTTTGCCAACGATCTTGACA
TCCATAGAAATGGCTCCATACTCTTTACTGACACAAGCACAAGATATGACAGAGCGAATC
ATTTCTTCATATTGCTTGAAGGAGAATCAACAGGGAGGCTTCTAAGATATGACCCACCTA
CCAAAACAACACACGTTGTGCTTGATGGTTTGGCTTTTCCCAATGGCATTCAGCTCTCTA
GAGA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2FJ79JQ 329 0 0
AATGAACGAGAAGGGTGAGTTTTGGGTTGCAATAGACTGTTGCAGAACACCTGCACAAGA
GGTTTTTACAAACAACCCTTGGATAAAGAGCATTTACTTTAGACTTCCCATACCGATGAA
GCTGCTGGCTAAAGCCATGGGGATGAGAATGTACACTGTGATATCAAAATTTGACGAGGA
AGGTAAGGTTTTGGAGGTTTTTGAGGATAGACAAGGAAAGGTGATGAAGCTTGTAAGTGA
AGTTAGGGAGGTTCAAGGGAAGCTTTGGATTGGAACAGTAGTTCATAACCATATTGCCTT
TGTGCCTTATCCTTTGAAAATGGACTAGT

QA 1 329 1 329
DS 

RD RR2DJ29TF 750 0 0
G
ACTGACACAAGCACAAGATATGACAGAGCGAATCATTTCTTCATATTGCTTGAAGGAGAA
TCAACAGGGAGGCTTCTAAGATATGACCCACCTACCAAAACAACACACGTTGTGCTTGAT
GGTTTGGCTTTTCCCAATGGCATTCAGCTCTCTAGAGACCAATCTTTCCTTCTCTTCACA
GAAACAACCAGTTGCAGGTTAGTGAAATATTGGCTGGAGGGTTCAAGAAAGGGTGAAGTG
GAGGTTGTGGCGGATCTACCAGGATTCCCAGACAATGTAAGAATGAACGAGAAGGGTGAG
TTTTGGGTTGCAATAGACTGTTGCAGAACACCTGCACAAGAGGTTCTTACAAACAACCCT
TGGATAAAGAGCATCTACTTTAGACTTCCCATACCGATGAAGCTGCTGGCTAAAGCCATG
GGGATGAGAATGTACACTGTGATATCAAAATTCGACGAGGAAGGTAAGGTCTTGGAGGTT
CTTGAGGATAGACAAGGAAAGGTGATGAAGCTTGTAAGTGAAGTTAGGGAGGTTCAAGGG
AAGCTTTGGATTGGAACAGTAGCTCATAACCATATTGCCTCTGTGCCTTATCCTTTGAAA
ATGGACTAGTGAACAACTTTGTTGTGTAGTTCTTAGCTTGTGGAAGTGTTATCCTCTTGA
TTAACATCGATGAGGACAAGTATGTAACAAATAATGGTTTTAACTTAATCATCTCCCTGT
AATTTAAACTTGAATAATTTTTT
CTCATT

QA 2 744 2 744
DS 

RD RR2DJ29JQ 654 0 0
AAAACAACACACGTTGTGCTTGATGGTTTGGCTTTTCCCAATGGCATTCAGCTCTCTAGA
GACCAATCTTTCCTTCTCTTCACAGAAACAACCAGTTGCAGGTTAGTGAAATATTGGCTG
GAGGGTTCAAGAAAGGGTGAAGTGGAGGTTGTGGCGGATCTACCAGGATTCCCAGACAAT
GTAAGAATGAACGAGAAGGGTGAGTTTTGGGTTGCAATAGACTGTTGCAGAACACCTGCA
CAAGAGGTTCTTACAAACAACCCTTGGATAAAGAGCATCTACTTTAGACTTCCCATACCG
ATGAAGCTGCTGGCTAAAGCCATGGGGATGAGAATGTACACTGTGATATCAAAATTCGAC
GAGGAAGGTAAGGTCTTGGAGGTTCTTGAGGATAGACAAGGAAAGGTGATGAAGCTTGTA
AGTGAAGTTAGGGAGGTTCAAGGGAAGCTTTGGATTGGAACAGTAGCTCATAACCATATT
GCCTCTGTGCCTTATCCTTTGAAAATGGACTAGTGAACAACTTTGTTGTGTAGTTCTTAG
CTTGTGGAAGTGTTATCCTCTTGATTAACATCGATGAGGACAAGTATGTAACAAATAATG
GTTTTAACTTAATCATCTCCCTGTAATTTAAACTTGAATAATTTTTTTCTCATT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2FJ79TF 633 0 0
GG
TGATGGTTTGGCTTTTCCCAATGGCATTCAGCTCTCTAGAGACCAATCTTTCCTTCTCTT
CACAGAAACAACCAGTTGCAGGTTAGTGAAATATTGGCTGGAGGGTTCAAGAAAGGGTGA
AGTGGAGGTTGTGGCGGATCTACCAGGATTCCCAGACAATGTAAGAATGAACGAGAAGGG
TGAGTTTTGGGTTGCAATAGACTGTTGCAGAACACCTGCACAAGAGGTTCTTACAAACAA
CCCTTGGATAAAGAGCATCTACTTTAGACTTCCCATACCGATGAAGCTGCTGGCTAAAGC
CATGGGGATGAGAATGTACACTGTGATATCAAAATTCGACGAGGAAGGTAAGGTCTTGGA
GGTTCTTGAGGATAGACAAGGAAAGGTGATGAAGCTTGTAAGTGAAGTTAGGGAGGTTCA
AGGGAAGCTTTGGATTGGAACAGTAGCTCATAACCATATTGCCTCTGTGCCTTATCCTTT
GAAAATGGACTAGTGAACAACTTTGTTGTGTAGTTCTTAGCTTGTGGAAGTGTTATCCTC
TTGATTAACATCGATGAGGACAAGTATGTAACAAATAATGGTTTTAACTTAATCATCTCC
CTGTAATTTAAACTTGAATAATTTTTT
TCTC

QA 3 629 3 629
DS 



AS 1 6

CO CL909Contig1 896 6 11 U
GGATCACTTTTAGATCGATAAAAAGACATAAGAAAATAAAAAGAAAAAGATGGCCCAGAA
CGATACGGTGAAGCTCCTAGGTTCTTGGTCGAGCCCTTATGCCCTCAGGGCTCGAGTGGC
TCTACACTTGAAATCAGTCAAGTACGAGTACTTGGACGAACCTGATGTTCTCAACGCAAA
GAGCGAACTCCTCCTCAAGTCCAACCCCATCTTCAAGAAAGTCCCTGTTCTCATCCACGG
CGATGTTTCCATCTGCGAGTCACTCAACATCGTTCAGTACGTCGATGAAGCTTGGTCCTC
TGGTCCTTCCATCCTTCCTTCTCACCCTTACGAACGTGCCTACGCTCGCTTCTGGGCTCT
CTTCGTTGACGACAAGATCTTTGGATCGTTGGATGCGGTGGGAGGAGCAAAAGACGACGA
AGGGAGGATGGCGGCGGCGGGGAAGCTGATGGAGTGTTTGGCGATGCTTGAAGAGGCGTT
TCAGAAGAGCAGCAAAGGGTTAGGGTTCCTTGGAGGAGAGAACATTGGCTTCCTCGATAT
AGCTTGTGGGACCATCTTGGGACCGGTCTCTGTGATCGAGGCGTTTTCCGGCGTCAAGTT
TCTCCGGGAAGAAACGACACCTGGGTTGATCCAGTGGGCCGAGAAGTTTAGGGCCCATGA
AGCTGTCAAGCCTTACATGCCTACCGTGGAAGAGTTCATTGCATTCGCGAAGAAGAAGTT
TGGTGTTGAGTGATATGGTTGTTTATGCAGTTTATGCAAATATTAAATGGGATGAAATAA
TGAATGAATGAATGATGTTTTGTCGTCTTTGAGAACTTTTTTTCTTTTTATAAGTTTTCC
GTATGTGCCAAAACTTTGTCTTTGTTCTTTCATCTAATGTGATAAAATTTTATTTG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD71TF U 18
AF RR2H779TF U 1
AF RR2G720TF U 1
AF RR2GD71JQ C 439
AF RR2G720JQ C 100
AF RR2G078JQ C 166
BS 1 652 RR2G720TF
BS 653 653 RR2G720JQ
BS 654 695 RR2G720TF
BS 696 696 RR2G720JQ
BS 697 726 RR2G720TF
BS 727 727 RR2G720JQ
BS 728 759 RR2G720TF
BS 760 761 RR2G720JQ
BS 762 762 RR2G078JQ
BS 763 791 RR2G720JQ
BS 792 896 RR2G078JQ

RD RR2GD71TF 585 0 0
ATAAAAAGACATAAG
AAAATAAAAAGAAAAAGATGGCCCAGAACGATACGGTGAAGCTCCTAGGTTCTTGGTCGA
GCCCTTATGCCCTCAGGGCTCGAGTGGCTCTACACTTGAAATCAGTCAAGTACGAGTACT
TGGACGAACCTGATGTTCTCAACGCAAAGAGCGAACTCCTCCTCAAGTCCAACCCCATCT
TCAAGAAAGTCCCTGTTCTCATCCACGGCGATGTTTCCATCTGCGAGTCACTCAACATCG
TTCAGTACGTCGATGAAGCTTGGTCCTCTGGTCCTTCCATCCTTCCTTCTCACCCTTACG
AACGTGCCTACGCTCGCTTCTGGGCTCTCTTCGTTGACGACAAGATCTTTGGATCGTTGG
ATGCGGTGGGAGGAGCAAAAGACGACGAAGGGAGGATGGCGGCGGCGGGGAAGCTGATGG
AGTGTTTGGCGATGCTTGAAGAGGCGTTTCAGAAGAGCAGCAAAGGGTTAGGGTTCCTTG
GAGGAGAGAACATTGGCTTCCTCGATATAGCTTGTGGGACCATCTTGGGACCGGTCTCTG
TGATCGAGGCGTTTTCCGGCGTCAAGTTTC

QA 16 585 16 585
DS 

RD RR2H779TF 647 0 0
GGATC
ACTTTTAGATCGATAAAAAGACATAAGAAAATAAAAAGAAAAAGATGGCCCAGAACGATA
CGGTGAAGCTCCTAGGTTCTTGGTCGAGCCCTTATGCCCTCAGGGCTCGAGTGGCTCTAC
ACTTGAAATCAGTCAAGTACGAGTACTTGGACGAACCTGATGTTCTCAACGCAAAGAGCG
AACTCCTCCTCAAGTCCAACCCCATCTTCAAGAAAGTCCCGGTTCTCATCCACGGCGATG
TTTCCATCTGCGAGTCACTCAACATCGTTCAGTACGTCGATGAAGCTTGGTCCTCTGGTC
CTTCCATCCTTCCTTCTCACCCTTACGAACGTGCCTACGCTCGCTTCTGGGCTCTCTTCG
TTGACGACAAGATCTTTGGATCGTTGGATGCGGTGGGAGGAGCAAAAGACGACGAAGGGA
GGATGGCAGCGGCGGGGAAGCTGATGGAGTGTTTGGCGATGCTTGAAGAGGCGTTTCAGA
AGAGCAGCAAAGGGTTAGGGTTCTTTGGAGGAGAGAACATTGGCTTCCTCGATATAGCTT
GTGGGACCATCTTGGGACCGGTCTCTGTGATCGAGGCGTTTTCCGGCGTCAAGTTTCTCC
GGGAAGAAACGACACCTGGGTTGATCCAGTGGGCCGAGAAGT

QA 6 647 6 647
DS 

RD RR2G720TF 769 0 0
GGATCACTTTTAGATCGATAAAAAGACATAAGAAAATAAAAAGAAAAAGATGGCCCAGAA
CGATACGGTGAAGCTCCTAGGTTCTTGGTCGAGCCCTTATGCCCTCAGGGCTCGAGTGGC
TCTACACTTGAAATCAGTCAAGTACGAGTACTTGGACGAACCTGATGTTCTCAACGCAAA
GAGCGAACTCCTCCTCAAGTCCAACCCCATCTTCAAGAAAGTCCCTGTTCTCATCCACGG
CGATGTTTCCATCTGCGAGTCACTCAACATCGTTCAGTACGTCGATGAAGCTTGGTCCTC
TGGTCCTTCCATCCTTCCTTCTCACCCTTACGAACGTGCCTACGCTCGCTTCTGGGCTCT
CTTCGTTGACGACAAGATCTTTGGATCGTTGGATGCGGTGGGAGGAGCAAAAGACGACGA
AGGGAGGATGGCGGCGGCGGGGAAGCTGATGGAGTGTTTGGCGATGCTTGAAGAGGCGTT
TCAGAAGAGCAGCAAAGGGTTAGGGTTCCTTGGAGGAGAGAACATTGGCTTCCTCGATAT
AGCTTGTGGGACCATCTTGGGACCGGTCTCTGTGATCGAGGCGTTTTCCGGCGTCAAGTT
TCTCCGGGAAGAAACGACACCTGGGTTGATCCAGTGGGCCGAGAAGTTTAGG*CCCATGA
AGCTGTCAAGCCTTACATGCCTACCGTGGAAGAGT*CATTGCATTCGCGAAGAAGAAGTT
TGGTGT*GAGTGATATGGTTGTTTATGCAGTTTATGCAA
TGTTAAATGG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2GD71JQ 327 0 0
GGGGAAGCTGATGGAGTGTTTGGCGATGCTTGAAGAGGCGTTTCAGAAGAGCAGCAAAGG
GTTAGGGTTCCTTGGAGGAGAGAACATTGGCTTCCTCGATATAGCTTGTGGGACCATCTT
GGGACCGGTCTCTGTGATCGAGGCGTTTTCCGGCGTCAAGTTTCTCCGGGAAGAAACGAC
ACCTGGGTTGATCCAGTGGGCCGAGAAGTTTAGGGCCCATGAAGCTGTCAAGCCTTACAT
GCCTACCGTGGAAGAGTTCATTGCATTCGCGAAGAAGAAGTTTGGTGTTGAGTGATATGG
TTGTTTATGCAGTTTATGCAAAT
GTTA

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR2G720JQ 701 0 0
TGCCCTCAGGGCTCGAGTGGCTCTACACTTGAAATCAGTCAAGTACGAGTACTTGGACGA
ACCTGATGTTCTCAACGCAAAGAGCGAACTCCTCCTCAAGTCCAACCCCATCTTCAAGAA
AGTCCCTGTTCTCATCCACGGCGATGTTTCCATCTGCGAGTCACTCAACATCGTTCAGTA
CGTCGATGAAGCTTGGTCCTCTGGTCCTTCCATCCTTCCTTCTCACCCTTACGAACGTGC
CTACGCTCGCTTCTGGGCTCTCTTCGTTGACGACAAGATCTTTGGATCGTTGGATGCGGT
GGGAGGAGCAAAAGACGACGAAGGGAGGATGGCGGCGGCGGGGAAGCTGATGGAGTGTTT
GGCGATGCTTGAAGAGGCGTTTCAGAAGAGCAGCAAAGGGTTAGGGTTCCTTGGAGGAGA
GAACATTGGCTTCCTCGATATAGCTTGTGGGACCATCTTGGGACCGGTCTCTGTGATCGA
GGCGTTTTCCGGCGTCAAGTTTTTCCGGGAAGAAACGACACCTGGGTTGATCCAGTGGGC
CGAGAAGTTTAGGGCCCATGAAGCTGTCAAGCCTTACATGCCTACCGTGGAAGAGTTCAT
TGCATTCGCGAAGAAGAAGTTTGGTGTTGAGTGATATGGTTGTTTATGCAGTTTATGCAA
ATGTTAAATGGGATGAAATAATGAATGAATGA
TGTTTTGCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2G078JQ 731 0 0
TGTTCTCAACGCAAAGAGCGAACTCCTCCTCATGTCCAACCCCATCTTCAAGAAAGTCCC
TGTTCTCATCCACGGCGATGTTTCCATCTGCGAGTCACTCAACATCGTTCAGTACGTCGA
TGAAGCTTGGTCCTCTGGTCCTTCCATCCTTCCTTCTCACCCTTACGAACGTGCTAACGC
TCGCTTCTGGGCTCTCTTCGTTGACGACAAGATCTTTGGATCGTTGGATGCGGTGGGAGG
AGCAAAAGACGAAGAAGGGAGGATGGCGGCGGCGGGGAAGCTGATGGAGTGTTTGGCGAT
GCTTGAAGTGGCGTTTCAGAAGAGCAGTAAAGGGTTAGGGTTCTTTGGAGGAGAGAACAT
TGGCTTCCTCGACATTGCTTGTGGGACCATCTTGGGACCAGTCTCTGTGATCGAGGCGTT
TTCCGGCGTCAAGTTTCTCCGGGAAGAAACAACACCTGGGCTGATCCAATGGGCCGAGAA
GTTTAGGGCCCATGAAGCTGTCAAGCCTTACATGCCTACCGTGGAAGAGTTCATTGCATT
CGCGAAGAAGAAGTTTGGTGTCGAGTGATATGGTTGTTTATGCAGTTTATGCAAATATTA
AATGGGATGAAATAATGAATGAATGAATGATGTTTTGTCGTCTTTGAGAACTTTTTTTCT
TTTTATAAGTTTTCCGTATGTGCCAAAACTTTGTCTTTGTTCTTTCATCTAATGTGATAA
AATTTTATTTG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 2 7

CO CL910Contig1 602 3 7 U
GGCAGAACAACAATACGAAGCAAAAAATAAAATAATTATAATCCCAGAGATGTCGATGAT
GTCAGCGTCTTCGGCGTTTGTTTTGACGGCTAACGTCACGGTGACCACCGGCTCTTCGTC
TTCAAGGAACTCAGTGTCTTTCCTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCCAGACTTTTAGTCAG
AGCAGCCGACGAGGCCGCTGCGGGAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACAAGCAACTGACGT
GGCTCCGGGTGGAGCTGCTGCCACCAAACCCAAACCGCCTCCGATCGTCCCTAAGAGAGG
GTCCAAGGTTAAGATCCTAAGGAGTGAATCCTACTGGTTCAAGAACGTCGGATCAGTTGT
AGCCGTTGATCAGGATCCGAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAA
TTACGCCAACATATCGACCAACAACTACGCGTTGGACGAGGTTGAAGAAGTCAAAGCTTA
AAAATGAGAGCTGAAAAACAATTGTGTGTACTTGGTTTAATGTTTATACCATTCTATCTG
TCTGTAACTCGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTTATTTCTCGTTATCTCGAG
TC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2GA23JQ C 130
AF RR2GA23TF U 2
AF RR2EH35TF U 1
BS 1 38 RR2EH35TF
BS 39 40 RR2GA23TF
BS 41 172 RR2EH35TF
BS 173 173 RR2GA23TF
BS 174 287 RR2EH35TF
BS 288 288 RR2GA23TF
BS 289 602 RR2EH35TF

RD RR2GA23JQ 461 0 0
CTCAGTGTCTTTCCTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCCAGACTTTTAGTCAGAGCAGCCGA
CGAGGCCGCTGCGGGAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACAAGCAACTGACGTGGCTCCGGG
TGGAGCTGCTGCCACCAAACCCAAACCGCCTCCGATCGTCCCTAAGAGAGGGTCCAAGGT
TAAGATCCTAAGGAGTGAATCCTACTGGTTCAAGAACGTCGGATCAGTTGTAGCCGTTGA
TCAGGATCCGAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAATTACGCCAA
CATATCGACCAACAACTACGCGTTGGACGAGGTTGAAGAAGTCAAAGCTTAAAAATGAGA
GCTGAAAAACAATTGTGTGTACTTGGTTTAATGTTTATACCATTCTATCTGTCTGTAACT
CGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTTATTTCTCG

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR2GA23TF 589 0 0
GGA
GAACAACAATACGAAGCAAAAAATAAAATAATTATAATCCCAGAGATGTCGATGATGTCA
GCGTCTTCGGCGTTTGTTTTGACGGCTAACGTCACGGTGACCACCGGCTCTTCGTCTTCA
AGGAACTCAGTGTCTTTCCTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCCAGACTTTTAGTCAGAGCA
GCCGACGAGGCCGCTGCGGGAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACAAGCAACTGACGTGGCT
CCGGGTGGAGCTGCTGCCACCAAACCCAAACCGCCTCCGATCGTCCCTAAGAGAGGGTCC
AAGGTTAAGATCCTAAGGAGTGAATCCTACTGGTTCAAGAACGTCGGATCAGTTGTAGCC
GTTGATCAGGATCCGAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAATTAC
GCCAACATATCGACCAACAACTACGCGTTGGACGAGGTTGAAGAAGTCAAAGCTTAAAAA
TGAGAGCTGAAAAACAATTGTGTGTACTTGGTTTAATGTTTATACCATTCTATCTGTCTG
TAACTCGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTTATTTCTCG

QA 4 589 4 589
DS 

RD RR2EH35TF 602 0 0
GGCAGAACAACAATACGAAGCAAAAAATAAAATAATTA**ATCCCAGAGATGTCGATGAT
GTCAGCGTCTTCGGCGTTTGTTTTGACGGCTAACGTCACGGTGACCACCGGCTCTTCGTC
TTCAAGGAACTCAGTGTCTTTCCTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCCAGACTTGTAGTCAG
AGCAGCCGACGAGGCCGCTGCGGGAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACAAGCAACTGACGT
GGCTCCGGGTGGAGCTGCTGCCACCAAACCCAAACCGCCTCCGATCGGCCCTAAGAGAGG
GTCCAAGGTTAAGATCCTAAGGAGTGAATCCTACTGGTTCAAGAACGTCGGATCAGTTGT
AGCCGTTGATCAGGATCCGAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAA
TTACGCCAACATATCGACCAACAACTACGCGTTGGACGAGGTTGAAGAAGTCAAAGCTTA
AAAATGAGAGCTGAAAAACAATTGTGTGTACTTGGTTTAATGTTTATACCATTCTATCTG
TCTGTAACTCGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTTATTTCTCGTTATCTCGAG
TC

QA 1 602 1 602
DS 



CO CL910Contig2 605 4 4 U
GGGTCGGAACAACAATACGAAGCAAAAAAAATAAAAAATAATAATCCCAGAGATGTCGAT
GATGTCGGCGTCTTCTGCGTTTGTTTTGACGGCTAACGTCACGGCGGCCACCGGCCCTTC
GTCTTCCAGGAACTCAGTGTCTTTCTTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCTAGACTTGTAGT
CAGAGCAGCCGACGAGGCCGCTGCGGGAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACAAGCAACTGA
CGTGGCTCCGGCTGGAGTTGCTGCCACCAAACCCAAACCGCCTCCGATCGGCCCTAAGAG
AGGGTCCAAGGTCAAGATCCTAAGGAGAGAATCCTACTGGTTCAAGAATGTTGGAGCAGT
TGTGGCCGTTGATCAGGATCCGAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGT
GAATTACGCCAACATATCGACCAACAACTACGCATTGGACGAGGTTGAAGAAGTCAAAGC
TTAAAAAATGAGAGCTGAAAAACAATTGTGTGTGCTTGGTTTAATGTTTATACCATTCCA
TCTGTCTGTAACTCGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTTATTTCTCGAGTCAG
AAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 10 10 10 10 

AF RR2EJ57TF U 1
AF RR2EJ57JQ C 124
AF RR2B427TF U 195
AF RR2B427JQ C 195
BS 1 494 RR2EJ57TF
BS 495 495 RR2B427TF
BS 496 600 RR2EJ57TF
BS 601 605 RR2B427JQ

RD RR2EJ57TF 600 0 0
GGGTCGGAACAACAATACGAAGCAAAAAAAATAAAAAATAATAATCCCAGAGATGTCGAT
GATGTCGGCGTCTTCTGCGTTTGTTTTGACGGCTAACGTCACGGCGGCCACCGGCCCTTC
GTCTTCCAGGAACTCAGTGTCTTTCTTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCTAGACTTGTAGT
CAGAGCAGCCGACGAGGCCGCTGCGGGAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACAAGCAACTGA
CGTGGCTCCGGCTGGAGTTGCTGCCACCAAACCCAAACCGCCTCCGATCGGCCCTAAGAG
AGGGTCCAAGGTCAAGATCCTAAGGAGAGAATCCTACTGGTTCAAGAATGTTGGAGCAGT
TGTGGCCGTTGATCAGGATCCGAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGT
GAATTACGCCAACATATCGACCAACAACTACGCATTGGACGAGGTTGAAGAAGTCAAAGC
TTAAAAAATGAGAGTTGAAAAACAATTGTGTGTGCTTGGTTTAATGTTTATACCATTCCA
TCTGTCTGTAACTCGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTTATTTCTCGAGTCAG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2EJ57JQ 477 0 0
TTCC
AGGAACTCAGTGTCTTTCTTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCTAGACTTGTAGTCAGAGCA
GCCGACGAGGCCGCTGCGGGAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACAAGCAACTGACGTGGCT
CCGGCTGGAGTTGCTGCCACCAAACCCAAACCGCCTCCGATCGGCCCTAAGAGAGGGTCC
AAGGTCAAGATCCTAAGGAGAGAATCCTACTGGTTCAAGAATGTTGGAGCAGTTGTGGCC
GTTGATCAGGATCCGAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAATTAC
GCCAACATATCGACCAACAACTACGCATTGGACGAGGTTGAAGAAGTCAAAGCTTAAAAA
ATGAGAGTTGAAAAACAATTGTGTGTGCTTGGTTTAATGTTTATACCATTCCATCTGTCT
GTAACTCGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTTATTTCTCGAGTCAG

QA 5 477 5 477
DS 

RD RR2B427TF 411 0 0
G
GGCCGCTGCGGGAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACAAGCAACTGAC*TGGCTCCGGCTGG
AGTTGCTGCCACCAAACCCAAACCGCCTCCGATCGGCCCTAAGAGAGGGTCCAAGGTCAA
GATCCTAAGGAGAGAATCCTACTGGTTCAAGAATGTTGGAGCAGTTGTGGCCGTTGATCA
GGATCCGAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAATTACGCCAACAT
ATCGACCAACAACTACGCATTGGACGAGGTTGAAGAAGTCAAAGCTTAAAAAATGAGAGC
TGAAAAACAATTGTGTGTGCTTGGTTTAATGTTTATACCATTCCATCTGTCTGTAACTCG
ACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTTATTTCTCGAGTCAG
AAAAC

QA 2 406 2 406
DS 

RD RR2B427JQ 411 0 0
G
GGCCGCTGCGGGAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACAAGCAACTGAC*TGGCTCCGGCTGG
AGTTGCTGCCACCAAACCCAAACCGCCTCCGATCGGCCCTAAGAGAGGGTCCAAGGTCAA
GATCCTAAGGAGAGAATCCTACTGGTTCAAGAATGTTGGAGCAGTTGTGGCCGTTGATCA
GGATCCGAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAATTACGCCAACAT
ATCGACCAACAACTACGCATTGGACGAGGTTGAAGAAGTCAAAGCTTAAAAAATGAGAGC
TGAAAAACAATTGTGTGTGCTTGGTTTAATGTTTATACCATTCCATCTGTCTGTAACTCG
ACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTTATTTCTCGAGTCAGAAAAC

QA 2 411 2 411
DS 



AS 2 6

CO CL911Contig1 850 3 12 U
GGATCACTTAAACAAGCCAACTGTGACCGCAAGCAAAGAGAGAGAAAGAAAAATGGTGCT
AAAGGTGTACGGACCTCACTTTGCCTCACCGAAGCGAGCTCTGGTAACCCTTATCGAGAA
GGGCGTCGCCTTCGAGACCGTCCCCGTCGATCTCATGAAAGGAGAACACAAACAGCCTGC
TTATCTCGCCTTGCAGCCTTTCGGTACCGTCCCTGCTGTTGTCGACGGCGACTACAAAAT
CTTCGAGTCACGTGCCGTCATGAGGTACGTTGCTGAGAAGTATAGGTCACAAGGACCTGA
CCTTTTAGGGAAAACCGTGGAATAAAGAGGACAAGTTGAGCAATGGCTTGACGTGGAGGC
GACCACTTACCACCCACCGCTACTGAACCTGACACTTCACATAATGTTCGCGTCCGTCAT
GGGATTCCCATCTGATGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAAGAGAAACTCTCGGCTGTTCT
TGATGTGTACGAGGGACATCTCTCAAAGAGCAAGTACTTGGCCGGTGACTTTGTGAGCTT
GGCTGATTTGGCTCACCTCCCCTTCACTGATTACTTGGTCGGTCCGATCGGGAAGGCTTA
CATGATCAAAGATAGGAAGCACGTGAGCGCGTGGTGGAACGACATCAGCAGCCGTCCTGC
GTGGAAG*AGACTCTTGAGAAGTATTCATTCCCGGCTTAAGAACATGATGTTCTTGTTGT
TGTTGTTTGTGTACGTTTATGTGAGGTTTTAATAACTCTGCATCCTCTTAATGTTATGTT
ACCTCTCTGTTCTGTTTCCTTTTGTAACTCCAACTCTTTGTGTGGTTTCAGTGAGGCTTT
TAATTAGAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL47TF U 1
AF RR2FF41TF U 1
AF RR2DL47JQ C 181
BS 1 38 RR2DL47TF
BS 39 39 RR2FF41TF
BS 40 84 RR2DL47TF
BS 85 85 RR2FF41TF
BS 86 105 RR2DL47TF
BS 106 106 RR2FF41TF
BS 107 108 RR2DL47TF
BS 109 109 RR2FF41TF
BS 110 594 RR2DL47TF
BS 595 595 RR2FF41TF
BS 596 690 RR2DL47TF
BS 691 850 RR2DL47JQ

RD RR2DL47TF 690 0 0
GGATCACTTAAACAAGCCAACTGTGACCGCAAGCAAAGGGAGAGAAAGAAAAATGGTGCT
AAAGGTGTACGGACCTCACTTTGCTTCACCGAAGCGAGCTCTGGTTACGCTTATCGAGAA
GGGCGTCGCCTTCGAGACCGTCCCCGTCGATCTCATGAAAGGAGAACACAAACAGCCTGC
TTATCTCGCCTTGCAGCCTTTCGGTACCGTCCCTGCTGTTGTCGACGGCGACTACAAAAT
CTTCGAGTCACGTGCCGTCATGAGGTACGTTGCTGAGAAGTATAGGTCACAAGGACCTGA
CCTTTTAGGGAAAACCGTGGAATAAAGAGGACAAGTTGAGCAATGGCTTGACGTGGAGGC
GACCACTTACCACCCACCGCTACTGAACCTGACACTTCACATAATGTTCGCGTCCGTCAT
GGGATTCCCATCTGATGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAAGAGAAACTCTCGGCTGTTCT
TGATGTGTACGAGGGACATCTCTCAAAGAGCAAGTACTTGGCCGGTGACTTTGTGAGCTT
GGCTGATTTGGCTCACCTCCCCTTCACTGATTACTTGGTCGGTCCGATCGGGAAAGCTTA
CATGATCAAAGATAGGAAGCACGTGAGCGCGTGGTGGAACGACATCAGCAGCCGTCCTGC
GTGGAAG*AGACTCTTGAGAAGTATTCATT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2FF41TF 690 0 0
GGATCACTTAAACAAGCCAACTGTGACCGTAAGCAGAGAGAGAGAGAGAA***TGGTGCT
TAAGGTGTACGGACCTCACTTTGCCTCACCGAAGCGAGCTCTGGTAACCCTTATCGAGAA
GGGCGTCGCCTTCGAGACCGTCCCCGTCGATCTCATGAAAGGAGAACATAAACAGCCTGC
TTATCTCGCCTTGCAGCCTTTCGGTACCGTCCCTGCTGTTGTCGACGGCGACTACAAACT
CTTCGAGTCGCGTGCCGTCATGAGGTACGTTGCTGAGAAGTACAGGTCACAAGGACCTGA
CCTTTTAGGGAAAACCGTAGAAGAAAGAGGACAAGTTGAGCAATGGCTAGACGTGGAGGC
GACGACTTACCACCCACCGCTACTGAACCTGACACTTCACATAATGTTCGCGTCAGTCAT
GGGATTCCCATCAGATGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAAGAGAAACTCTCGGCTGTTCT
CGATGTGTACGAGGCACATCTCTCAAAGAGCAAGTTCTTGGCCGGTGACTTTGTGAGTTT
GGCTGATTTGGCTCACCTCCCGTTCACTGATTACTTGGTCGGTCCGATCGGGAAGGCTTA
CATGATCAAAGATAGGAAGCACGTGAGCGCGTGGTGGAACGACATCAGCAGCCGTCCTGC
GTGGACG*AGACTCTTGAGAAGTATTCATT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2DL47JQ 670 0 0
TTATCTCGCCTTGCAGCCTTTCGGTACCGTCCCTGCTGTTGTCGACGGCGACTACAAAAT
CTTCGAGTCACGTGCCGTCATGAGGTACGTTGCTGAGAAGTATAGGTCACAAGGACCTGA
CCTTTTAGGGAAAACCGTGGAATAAAGAGGACAAGTTGAGCAATGGCTTGACGTGGAGGC
GACCACTTACCACCCACCGCTACTGAACCTGACACTTCACATAATGTTCGCGTCCGTCAT
GGGATTCCCATCTGATGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAAGAGAAACTCTCGGCTGTTCT
TGATGTGTACGAGGGACATCTCTCAAAGAGCAAGTACTTGGCCGGTGACTTTGTGAGCTT
GGCTGATTTGGCTCACCTCCCCTTCACTGATTACTTGGTCGGTCCGATCGGGAAGGCTTA
CATGATCAAAGATAGGAAGCACGTGAGCGCGTGGTGGAACGACATCAGCAGCCGTCCTGC
GTGGAAGGAGACTCTTGAGAAGTATTCATTCCCGGCTTAAGAACATGATGTTCTTGTTGT
TGTTGTTTGTGTACGTTTATGTGAGGTTTTAATAACTCTGCATCCTCTTAATGTTATGTT
ACCTCTCTGTTCTGTTTCCTTTTGTAACTCCAACTCTTTGTGTGGTTTCAGTGAGGCTTT
TAATTAGAGC

QA 1 670 1 670
DS 



CO CL911Contig2 895 3 8 U
GGAAGCGTGATAATTAAGTTCCTCTAATTAAAAGCCTCACTGTAACCACACAAAGAGTTG
GAGTTACAAAAGGAAACAGAACAGAGAGGTAACATAACATAAGAGGAGACATACAGTTAT
TAAAACCTCATATAAACGCATACAAAAGACAACAACAATAACAAGAACATCATTGTCCTT
AAGCCGGGAATGAATACTTCTCAAGAGTCTCCTTCCACGCAGGACGGCTGCTGATGTCGT
TCCACCACGCGCTCACGTGCTTCCTATCTTTGATCATGTAAGCCTTCCCGATCGGACCGA
CCAAGTAATCAGTGAACGGGAGGTGAGCCAAATCAGCCAAACTCACAAAGTCACCGGCCA
AGAACTTGCTCTTTGAGAGATGTGCCTCGTACACATCGAGAACAGCCGAGAGTTTCTCTT
CGCTCTCCTTGATCAGCTTCTCATCTGATGGGAATCCCATGACTGACGCGAACATTATGT
GAAGTGTCAGGTTCAGTAGCGGTGGGTGGTAAGTCGTCGCCTCCACGTCTAGCCATTGCT
CAACTTGTCCTCTTTCTTCTACGGTTTTCCCTAAAAGGTCAGGTCCTTGTGACCTGTACT
TCTCAGCAACGTACCTCATGACGGCACGTGACTCGAAGATCTTGTAGTCGCCGTCGACAA
CAGTAGGGACGGTACCGAAAGGCTGCAAGGCGAGATAAGCAGGCTGTTTGTGTTCTCCTT
TCATGAGATCTACGGGGACGGTCTCAAAGGCAACGCCCTTCTCGATAAGGGTTACCAGAG
CTCGCTTCGGTGAGGCAAAGTGAGGTCCGTACACCTTAAGCACCATTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTACGGTCACAGTTGGCTTGTTTAAGTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF41JQ U 17
AF RR2E205JQ U 1
AF RR2AP33TF C 181
BS 1 225 RR2E205JQ
BS 226 226 RR2FF41JQ
BS 227 402 RR2E205JQ
BS 403 403 RR2FF41JQ
BS 404 580 RR2E205JQ
BS 581 581 RR2FF41JQ
BS 582 604 RR2E205JQ
BS 605 895 RR2AP33TF

RD RR2FF41JQ 584 0 0
AGTTC
CTCTAATTAAAAGCCTCACTGTAACCACACAAAGAGTTGGAGTTACAAAAGGAAACAGAA
CAGAGAGGTAACATAACATAAGAGGGGACATACAGTTATTAAAACCTCATATAAACGCAT
ACAAAAGACAACAACAATAACAAGAACATCATTGTCCTTAAGCCGGGAATGAATACTTCT
CAAGAGTCTCCTTCCACGCAGGACGGCTGCTGATGTCGTTCCACCACGCGCTCACGTGCT
TCCTATCTTTGATCATGTAAGCCTTCCCGATCGGACCGACCAAGTAATCAGTGAACGGGA
GGTGAGCCAAATCAGCCAAACTCACAAAGTCACCGGCCAAGAACTTGCTCTTTGAGAGAT
GTGCCTCGTACACATCGAGAACAGCCGAAAGTTTCTCTTCGCTCTCCTTGATCAGCTTCT
CATCTGATGGGAATCCCATGACTGACGCGAACATTATGTGAAGTGTCAGGTTCAGTAGCG
GTGGGTGGTAAGTCGTCCCCTCCACGTCTAGCCATTGCTCAACTTGTCCTCTTTCTTCTA
CGGTTTTCCCTAAAAGGTCAGGTCCTTGTGACCTGTACT

QA 6 584 6 584
DS 

RD RR2E205JQ 604 0 0
GGAAGCGTGATAATTAAGTTCCTCTAATTAAAAGCCTCACTGTAACCACACAAAGAGTTG
GAGTTACAAAAGGAAACAGAACAGAGAGGTAACATAACATAAGAGGAGACATACAGTTAT
TAAAACCTCATATAAACGCATACAAAAGACAACAACAATAACAAGAACATCATTGTCCTT
AAGCCGGGAATGAATACTTCTCAAGAGTCTCCTTCCACGCAGGACAGCTGCTGATGTCGT
TCCACCACGCGCTCACGTGCTTCCTATCTTTGATCATGTAAGCCTTCCCGATCGGACCGA
CCAAGTAATCAGTGAACGGGAGGTGAGCCAAATCAGCCAAACTCACAAAGTCACCGGCCA
AGAACTTGCTCTTTGAGAGATGTGCCTCGTACACATCGAGAATAGCCGAGAGTTTCTCTT
CGCTCTCCTTGATCAGCTTCTCATCTGATGGGAATCCCATGACTGACGCGAACATTATGT
GAAGTGTCAGGTTCAGTAGCGGTGGGTGGTAAGTCGTCGCCTCCACGTCTAGCCATTGCT
CAACTTGTCCTCTTTCTTCTACGGTTTTCCCTAAAAGGTCCGGTCCTTGTGACCTGTACT
TCTC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2AP33TF 715 0 0
AGCCG
GGGAATGAATACTTCTCAAGAGTCTCTTTCCACGCAGGACGGCTGCTGATGTCGTTCCAC
CACGCGCTCACGTGCTTCCTATCTTTGATCATGTAAGCCTTCCCGATCGGACCGACCAAG
TAATCAGTGAACGGGAGGTGAGCCAAATCAGCCAAACTCACAAAGTCACCGGCCAAGAAC
TTGCTCTTTGAGAGATGTGCCTCGTACACATCGAGAACAGCCGAGAGTTTCTCTTCGCTC
TCCTTGATCAGCTTCTCATCTGATGGGAATCCCATGACTGACGCGAACATTATGTGAAGT
GTCAGGTTCAGTAGCGGTGGGTGGTAAGTGGTTGCCTCCACGTCTAGCCATTGCTCAACT
TGTCCTCTTTCTTCCACGGTCTTCCCCAAAAGGTCAGGTCCTTGTGACCTGTACTTCTCA
GCAACGTACCTCATGACGGCACGTGACTCGAAGATCTTGTAGTCGCCGTCGACAACAGTA
GGGACGGTACCGAAAGGCTGCAAGGCGAGATAAGCAGGCTGTTTGTGTTCTCCTTTCATG
AGATCTACGGGGACGGTCTCAAAGGCAACGCCCTTCTCGATAAGGGTTACCAGAGCTCGC
TTCGGTGAGGCAAAGTGAGGTCCGTACACCTTAAGCACCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTGCTTACGGTCACAGTTGGCTTGTTTAAGTGATCC

QA 6 715 6 715
DS 



AS 1 8

CO CL912Contig1 760 8 8 U
GGAAACAAATCCTCTCACACAGAAACGCAAAAACACAATGACTAACGTTGCAGTAATAGC
CGCTATTCTGATTGCAGCATTGTTATCAGCTAGCGTGACAGAACAAATGGCTCCATCTCC
TTCCTCAGGACCCTCGGTTGAACCAGACTGCATGACGAATCTGTTGAACATGACGGACTG
TCTTTCGTACGTGCAGGTAGGAAACCGTGGTGGTGCGGCCAATCCAGACAAATCTTGTTG
TCCGGAGCTTGCCGGCCTTGTCGATAACTCGCCACAATGCCTCTGCTACCTACTCGGCGG
AGATATGGAGGTTCAGTATGGAATCAAGATTGATAAGGCAAAGGCTCTCAAGCTTCCCGG
AGTTTGTGGCGTCGTTACTCCAGATCCCTCACTATGTTCACTGTTTGGAATTCCAGTTGG
AGCACCGGAAGCTATGGGCAACGAGGAATCCTCCCCAGCCTTCGCTCCAACTTCAGGTGC
TGAATCACCAGAAGGCTTAGCATCGGGTCCATCGGCTTGCAGGATGAGCGATGCACGAAA
CACTGCACATTATTCTCTTTTTCTCAGTATCTTCTGCATTTCATCTATAATCCTGATTTC
CTTTTCTTTTTAGCGACTCCATTATTTGTATTGTATTTTCCTATAAAAGAAGTATTGTTG
CTTTTGGTAGGTTATTTTCCTGAATTTAATACTTTGTATTTTATGGATTATTTCATCATT
CATCTTACTAAATAAAGATTGTCATCTTAAATTAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ58TF U 1
AF RR2G711TF U 28
AF RR2GU72TF U 28
AF RR2CR31TF U 27
AF RR2CR31JQ C 154
AF RR2GU72JQB C 307
AF RR2G711JQ C 289
AF RR2DQ58JQ C 163
BS 1 132 RR2DQ58TF
BS 133 133 RR2G711TF
BS 134 473 RR2DQ58TF
BS 474 517 RR2CR31TF
BS 518 518 RR2G711TF
BS 519 670 RR2CR31TF
BS 671 671 RR2CR31JQ
BS 672 760 RR2CR31TF

RD RR2DQ58TF 473 0 0
GGAAACAAATCCTCTCACACAGAAACGCAAAAACACAATGACTAACGTTGCAGTAATAGC
CGCTATTCTGATTGCAGCATTGTTATCAGCTAGCGTGACAGAACAAATGGCTCCATCTCC
TTCCTCAGGACCTTCGGTTGAACCAGACTGCATGACGAATCTGTTGAACATGACGGACTG
TCTTTCGTACGTGCAGGTAGGAAACCGTGGTGGTGCGGCCAATCCAGACAAATCTTGTTG
TCCGGAGCTTGCCGGCCTTGTCGATAACTCGCCACAATGCCTCTGCTACCTACTCGGCGG
AGATATGGAGGTTCAGTATGGAATCAAGATTGATAAGGCAAAGGCTCTCAAGCTTCCCGG
AGTTTGTGGCGTCGTTACTCCAGATCCCTCACTATGTTCACTGTTTGGAATTCCAGTTGG
AGCACCGGAAGCTATGGGCAACGAGGAATCCTCCCCAGCCTTCGCTCCAACTT

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2G711TF 641 0 0
G
AAAAACACAATGACTAACGTTGCAGTAATAGCCGCTATTCTGATTGCAGCATTGTTATCA
GCTAGCGTGACAGAACAAATGGCTCCATCTCCTTCCTCAGGACCCTCGGTTGAACCAGAC
TGCATGACGAATCTGTTGAACATGACGGACTGTCTTTCGTACGTGCAGGTAGGAAACCGT
GGTGGTGCGGCCAATCCAGACAAATCTTGTTGTCCGGAGCTTGCCGGCCTTGTCGATAAC
TCGCCACAATGCCTCTGCTACCTACTCGGCGGAGATATGGAGGTTCAGTATGGAATCAAG
ATTGATAAGGCAAAGGCTCTCAAGCTTCCCGGAGTTTGTGGCGTCGTTACTCCAGATCCC
TCACTATGTTCACTGTTTGGAATTCCAGTTGGAGCACCGGAAGCTATGGGCAACGAGGAA
TCCTCCCCAGCCTTCGCTCCAACTTCAGGTGCTGAATCACCAGAAGGCTTAGCATCGGGT
CCATCGGCTTGCAGGATGAGCGATGCACGAAACACTGCACATTATTCTCTTTTTCTCAGT
ATCTTCTGCATTTCATCTATAATCCTGATTTCCTTTTCTTTTTAGCGACTCCATTATTTG
TATTGTATTTTCCTATAAAAGAAGTATTGTTGCTTTTGGT

QA 2 641 2 641
DS 

RD RR2GU72TF 639 0 0
G
AAAAACACAATGACTAACGTTGCAGTAATAGCCGCTATTCTGATTGCAGCATTGTTATCA
GCTAGCGTGACAGAACAAATGGCTCCATCTCCTTCCTCAGGACCCTCGGTTGAACCAGAC
TGCATGACGAATCTGTTGAACATGACGGACTGTCTTTCGTACGTGCAGGTAGGAAACCGT
GGTGGTGCGGCCAATCCAGACAAATCTTGTTGTCCGGAGCTTGCCGGCCTTGTCGATAAC
TCGCCACAATGCCTCTGCTACCTACTCGGCGGAGATATGGAGGTTCAGTATGGAATCAAG
ATTGATAAGGCAAAGGCTCTCAAGCTTCCCGGAGTTTGTGGCGTCGTTACTCCAGATCCC
TCACTATGTTCACTGTTTGGAATTCCAGTTGGAGCACCGGAAGCTATGGGCAACGAGGAA
TCCTCCCCAGCCTTCGCTCCAACTTCAGGTGCTGAATCACCAGAAGGCTTAGCATCGGGT
CCATCGGCTTGCAGGATGAGCGATGCACGAAACACTGCACATTATTCTCTTTTTCTCAGT
ATCTTCTGCATTTCATCTATAATCCTGATTTCCTTTTCTTTTTAGCGACTCCATTATTTG
TATTGTATTTTCCTATAAAAGAAGTATTGTTGCTTTTG

QA 2 639 2 639
DS 

RD RR2CR31TF 734 0 0
GG
AAAAACACAATGACTAACGTTGCAGTAATAGCCGCTATTCTGATTGCAGCATTGTTATCA
GCTAGCGTGACAGAACAAATGGCTCCATCTCCTTCCTCAGGACCTTCGGTTGAACCAGAC
TGCATGACGAATCTGTTGAACATGACGGACTGTCTTTCGTTCGTGCAGGTAGGAAACCGT
GGTGGCTCGGCCAATCCAGACAAATCTTGTTGTCCGGAGCTTGCCGGCCTTGTCGATAAC
TCGCCACAATGCCTCTGCTACCTACTCGGCGGAGATATGGAGGTTCAGTATGGAATCAAG
ATTGATAAGGCAAAGGCTCTCAAGCTTCCCGGAGTTTGTGGCGTCGTTACTCCAGATCCC
TCACTATGTTCACTGTTTGGAATTCCAGTTGGAGCACCGGAAGCTATGGGCAACGAGGAA
TCCTCCCCAGCCTTCGCTCCAACTTCAGGTGCTGAATCACCAGAAGGCTTAGCATCGGGT
CCATCGGCTAGCAGGATGAGCGATGCACGAAACACTGCACATTATTCTCTTTTTCTCAGT
ATCTTCTGCATTTCATCTATAATCCTGATTTCCTTTTCTTTTTAGCGACTCCATTATTTG
TATTGTATTTTCCTATAAAAGAAGTATTGTTGCTTTTGGTAG*TTATTTTCCTGAATTTA
ATACTTTGTATTTTATGGATTATTTCATCATTCATCTTACTAAATAAAGATTGTCATCTT
AAATTAAAAAAA

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR2CR31JQ 595 0 0
GACGAATCTGTTGAACATGACGGACTGTCTTTCGTTCGTGCAGGTAGGAAACCGTGGTGG
CTCGGCCAATCCAGACAAATCTTGTTGTCCGGAGCTTGCCGGCCTTGTCGATAACTCGCC
ACAATGCCTCTGCTACCTACTCGGCGGAGATATGGAGGTTCAGTATGGAATCAAGATTGA
TAAGGCAAAGGCTCTCAAGCTTCCCGGAGTTTGTGGCGTCGTTACTCCAGATCCCTCACT
ATGTTCACTGTTTGGAATTCCAGTTGGAGCACCGGAAGCTATGGGCAACGAGGAATCCTC
CCCAGCCTTCGCTCCAACTTCAGGTGCTGAATCACCAGAAGGCTTAGCATCGGGTCCATC
GGCTAGCAGGATGAGCGATGCACGAAACACTGCACATTATTCTCTTTTTCTCAGTATCTT
CTGCATTTCATCTATAATCCTGATTTCCTTTTCTTTTTAGCGACTCCATTATTTGTATTG
TATTTTCCTATAAAAGAAGTATTGTTGCTTTTGGTAGGTTATTTTCCTGAATTTAATACT
TTGTATTTTATGGATTATTTCATCATTCATCTTACTAAATAAAGATTGTCATCTT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2GU72JQB 442 0 0
GGAGGTTCAGTATGGAATCAAGATTGATAAGGCAAAGGCTCTCAAGCTTCCCGGAGTTTG
TGGCGTCGTTACTCCAGATCCCTCACTATGTTCACTGTTTGGAATTCCAGTTGGAGCACC
GGAAGCTATGGGCAACGAGGAATCCTCCCCAGCCTTCGCTCCAACTTCAGGTGCTGAATC
ACCAGAAGGCTTAGCATCGGGTCCATCGGCTTGCAGGATGAGCGATGCACGAAACACTGC
ACATTATTCTCTTTTTCTCAGTATCTTCTGCATTTCATCTATAATCCTGATTTCCTTTTC
TTTTTAGCGACTCCATTATTTGTATTGTATTTTCCTATAAAAGAAGTATTGTTGCTTTTG
GTAGGTTATTTTCCTGAATTTAATACTTTGTATTTTATGGATTATTTCATCATTCATCTT
ATTAAATAAAGATTGTCATCTT

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR2G711JQ 460 0 0
CCTACTCGGCGGAGATATGGAGGTTCAGTATGGAATCAAGATTGATAAGGCAAAGGCTCT
CAAGCTTCCCGGAGTTTGTGGCGTCGTTACTCCAGATCCCTCACTATGTTCACTGTTTGG
AATTCCAGTTGGAGCACCGGAAGCTATGGGCAACGAGGAATCCTCCCCAGCCTTCGCTCC
AACTTCAGGTGCTGAATCACCAGAAGGCTTAGCATCGGGTCCATCGGCTTGCAGGATGAG
CGATGCACGAAACACTGCACATTATTCTTTTTTTCTCAGTATCTTCTGCATTTCATCTAT
AATCCTGATTTCCTTTTCTTTTTAGGGACTCCATTATTTGTATTGTATTTTCCTATAAAA
GAAGTATTGTTGCTTTTGGTAGGTTATTTTCCTGAATTTAATACTTTGTATTTTATGGAT
TATTTCATCATTCATCTTATTAAATAAAGATTGTCATCTT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2DQ58JQ 586 0 0
GTTGAACATGACGGACTGTCTTTCGTACGTGCAGGTAGGAAACCGTGGTGGTGCGGCCAA
TCCAGACAAATCTTGTTGTCCGGAGCTTGCCGGCCTTGTCGATAACTCGCCACAATGCCT
TTGCTACCTACTCGGCGGAGATATGGAGGTTCAGTATGGAATCAAGATTGATAAGGCAAA
GGCTCTCAAGCTTCCCGGAGTTTGTGGGGTCGTTACTCCAGATCCCTCACTATGTTCACT
GTTTGGAATTCCAGTTGGAGCACCGGAAGCTATGGGCAACGAGGAATCCTCCCCAGCCTT
CGCTCCAACTTCAGGTGCTGAATCACCAGAAGGCTTAGCATCGGGTCCATCGGCTAGCAG
GATGAGCGATGCACGAAACACTGCACATTATTCTCTTTTTTTCAGTATTTTTTGCATTTC
ATCTATAATCCTGATTTCCTTTTCTTTTTAGCGACTCCATTATTTGTATTGTATTTTCCT
ATAAAAGAAGTATTGTTGCTTTTGGTAGGTTATTTTCCTGAATTTAATACTTTGTATTTT
ATGGATTATTTCATCATTCATCTTATTAAATAAAGATTGTCATCTT

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 7

CO CL913Contig1 917 7 17 U
GGAATAAATATTTCTAAAATTAGATTGGAGCTGGAGAGACATTTTCTCTACGAAACTCGC
GGCTTGCTCTACAGTAGATCCTTCTT***********CGAAAGGGATAGG*****TAAAG
GAAGATGGGGCTTAACTTCACGAAGCTGTTCAGCAGGCTTTTCGCCAAGAAAGAAATGAG
GATTCTGATGGTAGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACTATCTTGTACAAGCTCAAGCT
TGGCGAAATTGTCACCACCATCCCCACCATTGGATTCAATGTGGAGACTGTTGAGTACAA
GAACATCAGTTTCACTGTTTGGGATGTGGGAGGTCAGGACAAGATTCGTCCCCTGTGGAG
GCACTACTTCCAGAACACTCAAGGTCTTATATTCGTGGTTGATAGCAACGACAGGGACCG
AGTTGTGGAGGCCAGGGATGAGTTACATCGCATGTTGAACGAGGATGAACTGAGGGATGC
TGTCCTTCTTGTGTTTGCTAACAAACAAGATCTTCCCAACGCAATGAATGCTGCAGAAAT
AACCGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTTCGCCAGCGCCACTGGTACATTCAAAGCACATG
TGCCACATCTGGGGAAGGTCTTTATGAAGGCCTTGATTGGCTCTCCAACAACATCGCTAA
CAAGGCATGATCGAGCTCTGCTGGAACACGTTTTTGCAACTTGAAAGAGATACATTAGTG
ATTGCGGAGAAGAGAAATAAGAAACGAGTATTGTGTCTGATGTTGTTTCAACTGTCTGTT
GATTTCTCTGACCTTTGTCTGTGTAGCCTCTAAAACTCACCTCTACTCTTTTTACCCGTT
TAATGGATTTGTGTTTTAAGTTCTTTTTATTATTTTTACAATTTCGTTTGGGTTTCCAAA
TATTGAAGCTTGGTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2D960TF U 1
AF RR2E521TF U 16
AF RR2GL72TF U 49
AF RR2AW82TFB U 332
AF RR2E521JQ C 275
AF RR2GL72JQ C 300
AF RR2AW82JQ C 174
BS 1 86 RR2D960TF
BS 87 97 RR2E521TF
BS 98 109 RR2D960TF
BS 110 115 RR2E521TF
BS 116 223 RR2D960TF
BS 224 224 RR2E521TF
BS 225 340 RR2D960TF
BS 341 341 RR2E521TF
BS 342 432 RR2D960TF
BS 433 433 RR2E521TF
BS 434 613 RR2D960TF
BS 614 614 RR2E521TF
BS 615 652 RR2GL72TF
BS 653 841 RR2AW82TFB
BS 842 856 RR2AW82JQ
BS 857 857 RR2E521JQ
BS 858 917 RR2AW82JQ

RD RR2D960TF 613 0 0
GGAATAAATATTTCTAAAATTAGATTGGAGCTGGAGAGACATTTTCTCTACGAAACTCGC
GGCTTGCTCTACAGTAGATCCTTCTTTGGAGCTTCTTCGAAAGGGATAGAAAGGCTAAAG
GAAGATGGGGCTTAACTTCACGAAGCTGTTCAGCAGGCTTTTCGCCAAGAAAGAAATGAG
GATTCTGATGGTAGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACTATCCTGTACAAGCTCAAGCT
TGGCGAAATTGTCACCACCATCCCCACCATTGGATTCAATGTGGAGACTGTTGAGTACAA
GAACATCAGTTTCACTGTTTGGGATGTGGGAGGTCAGGACGAGATTCGTCCCCTGTGGAG
GCACTACTTCCAGAACACTCAAGGTCTTATATTCGTGGTTGATAGCAACGACAGGGACCG
AGTTGTGGAGGCTAGGGATGAGTTACATCGCATGTTGAACGAGGATGAACTGAGGGATGC
TGTCCTTCTTGTGTTTGCTAACAAACAAGATCTTCCCAACGCAATGAATGCTGCAGAAAT
AACCGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTTCGCCAGCGCCACTGGTACATTCAAAGCACATG
TGCCACATCTGGG

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2E521TF 599 0 0
GGG
ATTAGATTGGAGCTGGAGAGTCATTTTCTCTACGAAACTCGCGGCTTGCTCTACAGTAGA
TCCTTCTT***********CGAAAGGGATAGG*****TAAAGGAAGATGGGGCTTAACTT
CACGAAGCTGTTCAGCAGGCTTTTCGCCAAGAAAGAAATGAGGATTCTGATGGTAGGTCT
TGATGCTGCTGGTAAGACCACTATCTTGTACAAGCTCAAGCTTGGCGAAATTGTCACCAC
CATCCCCACCATCGGATTCAATGTGGAGACTGTTGAGTACAAGAACATCAGTTTCACTGT
TTGGGATGTGGGAGGTCAGGACAAGATTCGTCCCCTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACAC
TCAAGGTCTTATATTCGTGGTTGATAGCAACGACAGGGACCGAGTTGTGGAGGCCAGGGA
TGAGTTACATCGCATGTTGAACGAGGATGAACTGAGGGATGCTGTCCTTCTTGTGTTTGC
TAACAAACAAGATCTTCCCAACGCAATGAATGCTGCAGAAATAACCGACAAGCTTGGCCT
TCACTCTCTTCGCCAGCGCCACTGGTACATTCAAAGCACATGTGCCACATCTGGGG

QA 4 599 4 599
DS 

RD RR2GL72TF 604 0 0
G
ACGAAACTCGCGGCTTGCTCTACAGTAGATCCTTCTT***********CGAAAGGGATAG
G*****TAAAGGAAGATGGGGCTTAACTTCACGAAGCTGTTCAGCAGGCTTTTCGCCAAG
AAAGAAATGAGGATTCTGATGGTAGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACTATCTTGTAC
AAGCTCAAGCTTGGCGAAATTGTCACCACCATCCCCACCATCGGATTCAATGTGGAGACT
GTTGAGTACAAGAACATCAGTTTCACTGTTTGGGATGTGGGAGGTCAGGACAAGATTCGT
CCCCTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAAGGTCTTATATTCGTGGTTGATAGCAAC
GACAGGGACCGAGTTGTGGAGGCCAGGGATGAGTTACATCGCATGTTGAACGAGGATGAA
CTGAGGGATGCTGTCCTTCTTGTGTTTGCTAACAAACAAGATCTTCCCAACGCAATGAAT
GCTGCAGAAATAACCGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTTCGCCAGCGCCACTGGTACATT
CAAAGCACATGTGCCACATCTGGGGAAGGTCTTTATGAAGGCCTTGATTGGCTCTCCAAC
AAC

QA 2 604 2 604
DS 

RD RR2AW82TFB 510 0 0
GGTCAGGACAAGATTCGTCCCCTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAAGGTCTTATA
TTCGTGGTTGATAGCAACGACAGGGACCGAGTTGTGGAGGCTAGGGATGAGTTACATCGC
ATGTTGAACGAGGATGAACTGAGGGATGCTGTCCTTCTTGTGTTTGCTAACAAACAAGAT
CTTCCCAACGCAATGAATGCTGCAGAAATAACCGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTTCGC
CAGCGCCACTGGTACATTCAAAGCACATGTGCCACATGTGGGGAAGGTCTTTATGAAGGC
CTTGATTGGCTCTCCAACAACATCGCTAACAAGGCATGATCGAGCTCTGCTGGAACACGT
TTTTGCAACTTGAAAGAGATACATTAGTGATTGCGGAGAAGAGAAATAAGAAACGAGTAT
TGTGTCTGATGTTGTTTCAACTGTCTGTTGATTTCTCTGACCTTTGTCTGTGTAGCCTCT
AAAACTCACCTCTACTCTTTTTACCCGTTT

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2E521JQ 588 0 0
TTCAATGTGGAGACTGTTGAGTACAAGAACATCAGTTTCACTGTTTGGGATGTGGGAGGT
CAGGACAAGATTCGTCCCCTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAAGGTCTTATATTC
GTGGTTGATAGCAACGACAGGGACCGAGTTGTGGAGGCCAGGGATGAGTTACATCGCATG
TTGAACGAGGATGAACTGAGGGATGCTGTCCTTCTTGTGTTTGCTAACAAACAAGATCTT
CCCAACGCAATGAATGCTGCAGAAATAACCGACAAGCTTGGCCTTCACTCTTTTCGCCAG
CGCCACTGGTACATTCAAAGCACATGTGCCACATCTGGGGAAGGTCTTTATGAAGGCCTT
GATTGGCTCTCCAACAACATCGCTAACAAGGCATGATCGAGCTCTGCTGGAACACGTTTT
TGCAACTTGAAAGAGAT*CATTAGTGATTGCGGAGAAGAGAAATAAGAAACGAGTATTGT
GTCTGATGTTGTTTCAACTGTCTGTTGATTTCTCTGACCTTTATCTGTGTAGCCTCTAAA
ACTCACCTCTACTCTTTTTACCCGTTTAATGGATTTGTGTTTTAAGTT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2GL72JQ 563 0 0
AGAACATCAGTTTCACTGTTTGGGATGTGGGAGGTCAGGACAAGATTCGTCCCCTGTGGA
GGCACTACTTCCAGAACACTCAAGGTCTTATATTCGTGGTTGATAGCAACGACAGGGACC
GAGTTGTGGAGGCCAGGGATGAGTTACATCGCATGTTGAACGAGGATGAACTGAGGGATG
CTGTCCTTCTTGTGTTTGCTAACAAACAAGATCTTCCCAACGCAATGAATGCTGCAGAAA
TAACCGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTTCGCCAGCGCCACTGGTACATTCAAAGCACAT
GTGCCACATCTGGGGAAGGTCTTTATGAAGGCCTTGATTGGCTCTCCAACAACATCGCTA
ACAAGGCATGATCGAGCTCTGCTGGAACACGTTTTTGCAACTTGAAAGAGAT*CATTAGT
GATTGCGGAGAAGAGAAATAAGAAACGAGTATTGTGTCTGATGTTGTTTCAACTGTCTGT
TGATTTCTCTGACCTTTATCTGTGTAGCCTCTAAAACTCACCTCTACTCTTTTTACCCGT
TTAATGGATTTGTGTTTTAAGTT

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2AW82JQ 744 0 0
AAATTAGGATTCTGATGGTAGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACTATCTTGTACAAGC
TCAAGCTTGGCGAAATTGTCACCACCATCCCCACCATTGGATTCAATGTGGAGACTGTTG
AGTACAAGAACATCAGTTTCACTGTTTGGGATGTAGGAGGTCAGGACAAGATTCGTCCCC
TGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAAGGTCTTATATTCGTGGTTGATAGCAACGACA
GGGACCGAGTTGTGGAGGCTAGGGATGAGTTACATCGCATGTTGAACGAGGATGAACTGA
GGGATGCTGTCCTTCTTGTGTTTGCTAACAAACAAGATCTTCCCAACGCAATGAATGCTG
CAGAAATAACCGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTTCGCCAGCGCCACTGGTACATTCAAA
GCACATGTGCCACATCTGGGGAAGGTCTTTATGAAGGCCTTGATTGGCTCTCCAACAACA
TCGCTAACAAGGCATGATCGAGCTCTGCTGGAACACGTTTTTGCAACTTGAAAGAGATAC
ATTAGTGATTGCGGAGAAGAGAAATAAGAAACGAGTATTGTGTCTGATGTTGTTTCAACT
GTCTGTTGATTTCTCTGACCTTTGTCTGTGTAGCCTCTAAAACTCACCTCTACTCTTTTT
ACCCGTTTAATGGATTTGTGTTTCAAGTTCTTTTTATTATTTTTACAATTTCGTTTGGGT
TTCCAAATATTGAAGCTTGGTAAG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 8

CO CL914Contig1 986 8 20 U
CCATACCAAACTATTATCTTATCTTTACACTATAAACTTGTGTGGTTCAAATGTATACTA
TTTATAATTTATTAACGTCGTAAAAACATGTATTAATAGCTACAATTATTACAGTGATGT
AAGCATTAAACCAGACCAGAGAGACTTTAAACCAATGTTCAAGCAACAGTGGCTTGGGTT
GTGCAGCAGACATTGAGAACATCATCTAGAGATGGATGATCACCAGTACCTTCGTCTTTT
CGACCATACAAGAGCTTCTTGCCTCTGAAAACAAACGTACCTCCCTGTTGCAACACGCTA
CTTCTGTCTTCAGGAGTGGCTTTTATGGTGTAGTTCTTTGCAGCTTCTCGTAACTCATCA
AATCGTGAGAAGACTTTTTTACTAGCTGGGTTGAAGAAAGTACGGCCTAAACCGTAGTAT
AAACCAAGAACATCATACGCCTTGCGCTCAGGATCCGCGTAAAGACATTCCATTGGAAAA
GGTAACCGAGATGCAAGTATACGAGCCTTATCAGGAGTTCCAACACCAACAGCCACCAGT
TTAACACCGGCCGCATCAAACCGCGGCTTCGCCTCTCTCAATGCAGTAGCAAGTTCCCAA
CAGCAAACGCATCCGAAATGCCTCAAAAGCACAACAGCAGAAACTCCATCGTTCTGATCC
AAGAGATTGCTGAACTTCACGGGCTGGCCTGAAGCAGTAAAGATGGAGACATCCCCGAGT
ATCTCACCGATATCTTCTCTGTACTCAGTGACGGGATCAGCTACTCCCGTGGAAGCTGCT
CTCGCGAGAACAACACGAGGTCTAGAGATTAGGGAATTGGATTTTGATCGGGCGAAAGGA
GTAGAAACGATGGAAGATGAAAAGCTCGATGATGATCGAAACAAGGGTTTCGAGCACATA
GGAGAAACAGAGGAACGAAGAAGCTGAATGGAACTTGGAGTTCGTACAGAGAGACTCGCC
ATTGTTTGTTCAGACAAGAAACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 0 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2H593JQB U 1
AF RR2AY48TFB C 478
AF RR2AY48JQ U 42
AF RR2E959JQ U 44
AF RR2BS10JQ U 57
AF RR2BS10TF C 289
AF RR2E959TF C 447
AF RR2H593TF C 289
BS 1 188 RR2H593JQB
BS 189 189 RR2AY48JQ
BS 190 221 RR2H593JQB
BS 222 222 RR2AY48JQ
BS 223 297 RR2H593JQB
BS 298 298 RR2AY48JQ
BS 299 299 RR2H593JQB
BS 300 300 RR2AY48JQ
BS 301 521 RR2H593JQB
BS 522 522 RR2AY48JQ
BS 523 569 RR2H593JQB
BS 570 612 RR2AY48JQ
BS 613 613 RR2E959JQ
BS 614 773 RR2AY48JQ
BS 774 808 RR2BS10JQ
BS 809 829 RR2BS10TF
BS 830 830 RR2E959TF
BS 831 846 RR2BS10TF
BS 847 847 RR2E959TF
BS 848 986 RR2BS10TF

RD RR2H593JQB 569 0 0
CCATACCAAACTATTATCTTATCTTTACACTATAAACTTGTGTGGTTCAAATGTATACTA
TTTATAATTTATTAACGTCGTAAAAACATGTATTAATAGCTACAATTATTACAGTGATGT
AAGCATTAAACCAGACCAGAGAGACTTTAAACCAATGTTCAAGCAACAGTGGCTTGGGTT
GTGCAGCAAACATTGAGAACATCATCTAGAGATGGATGATCGCCAGTACCTTCGTCTTTT
CGACCATACAAGAGCTTCTTGCCTCTGAAAACAAACGTACCTCCCTGTTGCAACACGTTG
CTTCTGTCTTCAGGAGTGGCTTTTATGGTGTAGTTCTTTGCAGCTTCTCGTAACTCATCA
AATCGTGAGAAGACTTTTTTACTAGCTGGGTTGAAGAAAGTACGGCCTAAACCGTAGTAT
AAACCAAGAACATCATACGCCTTGCGCTCAGGATCCGCGTAAAGACATTCCATTGGAAAA
GGTAACCGAGATGCAAGTATACGAGCCTTATCAGGAGTTCCGACACCAACAGCCACCAGT
TTAACACCGGCCGCATCAAACCGCGGCTT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2AY48TFB 224 0 0
AAAGGTAACCGAGATGCAAGTATACGAGCCTTATCAGGCGTTCCAACACCAACAGCCACC
AGTTTAACACCGGCCGCATCAAACCGCGGTTTCGCCTCTCTCAATGCAGTAGCAAGTTCC
CAACAGCAAACGCATTCGAAATGCCTCAAAAGCACAACAGCAGAAACTCCATCGTTCTGA
TCCAAGAGATTGCTGAACTTCACGGGCTGGCCTGAAGCAGTAAA

QA 1 224 1 224
DS 

RD RR2AY48JQ 732 0 0
GT
GGTTCAAATGTATACTATTTATAATTTATTAACGTCTTAAAAACATGTATTAATAGCTAC
AATTATTACAGTGATGTAAGCATTAAACCAGACCAGAGAGACTTTAAACCAATGTTCAAG
CAACAGTGGCTTGGGTTGTGCAGCAGACATTGAGAACATCATCTAGAGATGGATGATCAC
CAGTACCTTCGTCTTTTCGACCATACAAGAGCTTCTTGCCTCTGAAAACAAACGTACCTC
CCTGTTGCAACACGCTACTTCTGTCTTCAGGAGTGGCTTTTATGGTGTAGTTCTTTGCAG
CTTCTCGTAACTCATCAAATCGTGAGAAGATTTTTTTACTAGCTGGGTTGAAGAAAGTAC
GGCCTAAACCGTAGTATAAACCAAGAACATCATACGCCTTGCGCTCAGGATCCGCGTAAA
GACATTCCATTGGAAAAGGTAACCGAGATGCAAGTATACGAGCCTTATCAGGCGTTCCAA
CACCAACAGCCACCAGTTTAACACCGGCCGCATCAAACCGCGGTTTCGCCTCTCTCAATG
CAGTAGCAAGTTCCCAACAGCAAACGCATTCGAAATGCCTCAAAAGCACAACAGCAGAAA
CTCCATCGTTCTGATCCAAGAGATTGCTGAACTTCACGGGCTGGCCTGAAGCAGTAAAGA
TGGAGACATCCCCGAGTATCTCACCGATATCTTCTCTGTACTCAGTGACGGGATCAGCTA
CTCCCGTGGA

QA 3 732 3 732
DS 

RD RR2E959JQ 710 0 0
GGTTCAAATGTATACTATTTATAATTTATTAACGTCGTAAAAACATGTATTAATAGCTAC
AATTATTACAGTGATGTAAGCATTAAACCAGACCAGAGAGACTTTAAACCAATGTTCAAG
CAACAGTGGCTTGGGTTGTGCAGCAGACATTGAGAACATCATCTAGAGATGGATGATCAC
CAGTACCTTCGCCTTTTCGACCATACAAGAGCTTCTTGCCTCTGAAAACAAACGTACCTC
CCTGTTGCAACACGCTGCTTCTGTCTTCAGGAGTGGCTTTTATGGTGTAGTTCTTTGCGG
CTTCTCGTAACTCATCAAATCGTGAGAAGACTTTTTTACTAGCTGGGTTGAAGAAAGTAC
GGCCTAAACCGTAGTATAAACCAAGAACATCATACGCCTTGCGCTCAGGATCCGCGTAAA
GACATTCCATTGGAAAAGGTAACCGAGATGCAAGTATACGAGCCTTATCAGGAGTTCCGA
CACCAACAGCCACCAGTTTAACACCGGCCGCATCAAACCGCGGCTTCGCCTCTCTCAATG
CAGTAGCAAGCTCCCAACAGCAAACGCATCCGAAATGCCTCAAAAGCACAACAGCAGAAA
CTCCATCGTTCTGATCCAAGAGATTGCTGAACTTCACGGGCTGGCCTGAAGCAGTAAAGA
TGGATACATCCCCGAGTATCTCACCGATATCTTCTCTGTACTCAGTGACG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2BS10JQ 752 0 0
C
CTATTTATAATTTATTAACGTCTTAAAAACATGTATTAATAGCTACAATTATTACAGTGA
TGTAAGCATTAAACCAGACCAGAGAGACTTTAAACCAATGTTCAAGCAACAGTGGCTTGG
GTTGTGCAGCAGACATTGAGAACATCATCTAGAGATGGATGATCACCAGTACCTTCGTCT
TTTCGACCATACAAGAGCTTCTTGCCTCTGAAAACAAACGTACCTCCCTGTTGCAACACG
CTACTTCTGTCTTCAGGAGTGGCTTTTATGGTGCAGTTCTTTGCAGCTTCTCGTAACTCA
TCAAATCGTGAGAAGATTTTTTTACTAGCTGGGTTGAAGAAAGTACGGCCTAAACCGTAG
TATAAACCAAGAACATCATACGCCTTGCGCTCAGGATCCGCGTAAAGACATTCCATTGGA
AAAGGTAACCGAGATGCAAGTATACGAGCCTTATCAGGCGTTCCAACACCAACAGCCACC
AGTTTAACACCGGCCGCATCAAACCGCGGTTTCGCCTCTCTCAATGCAGTAGCAAGTTCC
CAACAGCAAACGCATCCGAAATGCCTCAAAAGCACAACAGCAGAAACTCCATCGTTCTGA
TCCAAGAGATTGCTGAACTTCACGGGCTGGCCTGAAGCAGTAAAGATGGAGACATCCCCG
AGTATCTCACCGATATCTTCTCTGTACTCAGTGACGGGATCAGCTACTCCCGTGGAAGCT
GCTCTCGCGAGAACAACACGAGGTCTAGAGA

QA 2 752 2 752
DS 

RD RR2BS10TF 698 0 0
TGCAACACGCTACTTCTGTCTTCAGGAGTGGCTTTTATGGTGCAGTTCTTTGCAGCTTCT
CGTAACTCATCAAATCGTGAGAAGATTTTTTTACTAGCTGGGTTGAAGAAAGTACGGCCT
AAACCGTAGTATAAACCAAGAACATCATACGCCTTGCGCTCAGGATCCGCGTAAAGACAT
TCCATTGGAAAAGGTAACCGAGATGCAAGTATACGAGCCTTATCAGGCGTTCCAACACCA
ACAGCCACCAGTTTAACACCGGCCGCATCAAACCGCGGTTTCGCCTCTCTCAATGCAGTA
GCAAGTTCCCAACAGCAAACGCATCCGAAATGCCTCAAAAGCACAACAGCAGAAACTCCA
TCGTTCTGATCCAAGAGATTGCTGAACTTCACGGGCTGGCCTGAAGCAGTAAAGATGGAG
ACATCCCCGAGTATCTCACCGATATCTTCTCTGTACTCAGTGACGGGATCAGCTACTCCC
GTGGAAGCTGCTCTCGCGAGAACAACACGAGGTCTAGAGATTAGGGAATTGGATTTTGAT
CTGGCGAAAGGAGTAGAAGCGATGGAAGATGAAAAGCTCGATGATGATCGAAACAAGGGT
TTCGAGCACATAGGAGAAACAGAGGAACGAAGAAGCTGAATGGAACTTGGAGTTCGTACA
GAGAGACTCGCCATTGTTTGTTCAGACAAGAAACCTCC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2E959TF 540 0 0
CTCAGGATCCGCGTAAAGACATTCCATTGGAAAAGGTAACCGAGATGCAAGTATACGAGC
CTTATCAGGAGTTCCGACACCAACAGCCACCAGTTTAACACCGGCCGCATCAAACCGCGG
CTTCGCCTCTCTCAATGCAGTAGCAAGCTCCCAACAGCAAACGCATCCGAAATGCCTCAA
AAGCACAACAGCAGAAACTCCATCGTTCTGATCCAAGAGATTGCTGAACTTCACGGGCTG
GCCTGAAGCAGTAAAGATGGATACATCCCCGAGTATCTCACCGATATCTTCTCTGTACTC
AGTGACGGGATCAGCTACTCCCGTGGAAGCTGCTCTCGCGAGAACAACACGAGGTCTAGA
GATTAGGGAATTGGATTTTGATCGGGCGAAAGGAGTAGAAACGATGGAAGATGAAAAGCT
CGATGATGATCGAAACAAGGGTTTCGAGCACATAGGAGAAACAGAGGAACGAAGAAGCTG
AATGGAACTTGGAGTTCGTACAGAGAGACTCGCCATTGTTTGTTCAGACAAGAAACCTCC

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2H593TF 681 0 0
TGCAACACGTTGCTTCTGTCTTCAGGAGTGGCTTTTATGGTGTAGTTCTTTGCAGCTTCT
CGTAACTCATCAAATCGTGAGAAGACTTTTTTACTAGCTGGGTTGAAGAAAGTACGGCCT
AAACCGTAGTATAAACCAAGAACATCATACGCCTTGCGCTCAGGATCCGCGTAAAGACAT
TCCATTGGAAAAGGTAACCGAGATGCAAGTATACGAGCCTTATCAGGAGTTCCGACACCA
ACAGCCACCAGTTTAACACCGGCCGCATCAAACCGCGGCTTCGCCTCTCTCAATGCAGTA
GCAAGCTCCCAACAGCAAACGCATCCGAAATGCCTCAAAAGCACAACAGCAGAAACTCCA
TCGTTCTGATCCAAGAGATTGCTGAACTTCACGGGCTGGCCTGAAGCAGTAAAGATGGAT
ACATCCCCGAGTATCTCACCGATATCTTCTCTGTACTCAGTGACGGGATCAGCTACTCCC
GTGGAAGCTGCTCTCGCGAGAACAACACGAGGTCTAGAGATTAGGGAATTGGATTTTGAT
CGGGCGAAAGGAGTAGAAACGATGGAAGATGAAAAGCTCGATGATGATCGAAACAAGGGT
TTCGAGCACATAGGAGAAACAGAGGAACGAAGAAGCTGAATGGAACTTGGAGTTCGTACA
GAGAGACTCGCCATTGTTT
CC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 2 8

CO CL915Contig1 605 2 3 U
CAACCAAAAATCCAAAATGTCTCATTTCAATCTTTAAGTTTACAAGCTACCAAAAGCAAA
AACAAAATTCAAAGGTAGAATAGAGACAAGCACCAAAGCAAGTATTAAACCAAATAATAG
ATGCCAATTCTCAGTACCTGATGGGTGCAAGAACATCGAGTTGGGATCCAAGCTTCTCCT
CTGCAACCTTCTCAGCCTTAGTCCTGAGCTTGAAGAGCTGCTTCTTACGCTCGTACACAA
CCTATGATCTCTCCTTTCTTTTTGACCTCAAGCTCCTTAATGGTATCGTAATGGTTCCAG
CCAACCTCAGAAGACAGACGGCCCAACAAGCAGTACTTGTGTGGAATCATCCCACGAACG
GTACGCCAGAAGATCTTAGAGGGAGCCCTGAAATGAATGGGACCGTGAGAAGGCTTGGTG
TTCATGCGTTTCCTGAGAAACCTCATGTACTTCATCTTCTGTCGAACCAACCCGCCTGAC
AGGCAAATCTCCTCGCATCTGACGACAACGACTCTCTGTCCGTTGAGCAGCTCCTTGGCG
ATGATCGAAGCAAGACGGCCCAGCATGTGGTGCCTTGCGTCGACCAAGACGCGCTTCGCG
CCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2GE63JQ U 40
AF RR2GE63TF C 1
BS 1 39 RR2GE63TF
BS 40 295 RR2GE63JQ
BS 296 605 RR2GE63TF

RD RR2GE63JQ 256 0 0
TTACAAGCTACCAAAAGCAAAAACAAAATTCAAAGGTAGAATAGAGACAAGCACCAAAGC
AAGTATTAAACCAAATAATAGATGCCAATTCTCAGTACCTGATGGGTGCAAGAACATCGA
GTTGGGATCCAAGCTTCTCCTCTGCAACCTTCTCAGCCTTAGTCCTGAGCTTGAAGAGCT
GCTTCTTACGCTCGTACACAACCTATGATCTCTCCTTTCTTTTTGACCTCAAGCTCCTTA
ATGGTATCGTAATGGT

QA 1 256 1 256
DS 

RD RR2GE63TF 605 0 0
CAACCAAAAATCCAAAATGTCTCATTTCAATCTTTAAGTTTACAAGCTACCAAAAGCAAA
AACAAAATTCAAAGGTAGAATAGAGACAAGCACCAAAGCAAGTATTAAACCAAATAATAG
ATGCCAATTCTCAGTACCTGATGGGTGCAAGAACATCGAGTTGGGATCCAAGCTTCTCCT
CTGCAACCTTCTCAGCCTTAGTCCTGAGCTTGAAGAGCTGCTTCTTACGCTCGTACACAA
CCTATGATCTCTCCTTTCTTTT*GACCTCAAGCTCCTTAATGGTATCGTAATGGTTCCAG
CCAACCTCAGAAGACAGACGGCCCAACAAGCAGTACTTGTGTGGAATCATCCCACGAACG
GTACGCCAGAAGATCTTAGAGGGAGCCCTGAAATGAATGGGACCGTGAGAAGGCTTGGTG
TTCATGCGTTTCCTGAGAAACCTCATGTACTTCATCTTCTGTCGAACCAACCCGCCTGAC
AGGCAAATCTCCTCGCATCTGACGACAACGACTCTCTGTCCGTTGAGCAGCTCCTTGGCG
ATGATCGAAGCAAGACGGCCCAGCATGTGGTGCCTTGCGTCGACCAAGACGCGCTTCGCG
CCCCT

QA 1 605 1 605
DS 



CO CL915Contig2 817 6 15 U
GGCTTTCTTCTTCGAAGAGCAGCAGTGAGAGAGAGAACCAATCGAATCGAGAGGAAGAAA
GAAAGATGGTGTCCGGGTCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTCGTGGTCGACGCAAGGCACC
ACATGCTGGGCCGTCTTGCTTCGATCATCGCCAAGGAGCTGCTCAACGGACAGAGAGTCG
TTGTCGTCAGGTGCGAGGAGATTTGCCTGTCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGT
ACATGAGGTTTCTCAGGAAACGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCA
GGGCTCCCTCTAAGATCTTCTGGCGTACCGTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGC
GTGGAGCTGCTGCTCTTGCACGCTTGAAGGTCTTTGAAGGAGTCCCACCACCTTACGACA
AGGTCAAGAGAATGGTTATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACA
AGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTGTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTA
AGGAGCTTGAGGTCAAAAGAAAGGAGAGATCACAGGTTGTGTACGAGCGTAAGAAGCAGC
TCATCAAGCTCAGGACTAAGGCTGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAGCTTGGATCCCAACTCG
ATGTTCTTGCACCCATCAAGTACTGAGAATTGGCATCCATTATTTGGTTTAATACTTGCT
TTGGTGCTTGTCTCTATTCTACCTTTGAATTTTGTTTTTGCTTTTGGTAGCTTGTAAACT
TAAAGATTGAAATGAGACATTTTGGATTTTTGGTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 0 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 0 0 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H631TF U 12
AF RR2EI86TF U 13
AF RR2GT68TF U 1
AF RR2EI86JQ C 159
AF RR2AU94TF U 14
AF RR2GT68JQB C 131
BS 1 37 RR2GT68TF
BS 38 38 RR2H631TF
BS 39 40 RR2GT68TF
BS 41 41 RR2H631TF
BS 42 97 RR2GT68TF
BS 98 98 RR2H631TF
BS 99 403 RR2GT68TF
BS 404 404 RR2H631TF
BS 405 737 RR2GT68TF
BS 738 738 RR2AU94TF
BS 739 752 RR2GT68TF
BS 753 791 RR2AU94TF
BS 792 792 RR2GT68JQB
BS 793 807 RR2AU94TF
BS 808 817 RR2GT68JQB

RD RR2H631TF 560 0 0
GGGA
AGAGCAGCAGTGAGAGTAAGAACCAATCGAATCGAGAGGAAGAAA***AGATGGTGTCCG
GGTCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTCGTGGTCGACGCAAGGCACCACATGCTGGGCCGTC
TTGCCTCGATCATCGCCAAGGAGCTGCTCAACGGACAGAGAGTCGTTGTCGTCAGGTGCG
AGGAGATTTGCCTGTCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTATGA
GGAAACGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCTAAGA
TCTTCTGGCGTACCGTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTACTC
TTGCACGCTTGAAGGTCTTTGAAGGAGTCCCACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGG
TCATTCCTGATGCTCTCAAGGTGTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGG
GACGTCTCTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGGGGTCA
AAAGAAAGGAGAG
GTC

QA 5 557 5 557
DS 

RD RR2EI86TF 603 0 0
GAGAGCATCAGT
GTGAGAGAGAGAACCAATCGAATCGAGAGGAAGAAA***AAATGGTGTCCGGGTCAGGGA
TATGCGCGAAGCGCGTCTTGGTCGACGCAAGGCACCACATGCTGGGCCGTCTTGCTTCGA
TCATCGCCAAGGAGCTGCTCAACGGACAGAGAGTCGTTGTCGTCAGATGCGAGGAGATTT
GCCTGTCAGGTGGGTTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAACGCA
TGAACACCAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCATTTCAGGGCTCCCTCTAAGATCTTCTGGC
GTACCGTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCACGCT
TGAAGGTCTTTGAAGGAGTCCCACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTTATTCCTG
ATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTGT
CTTCTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAAGAGCTTGAGGTCAAAAGAAAGG
AGAGATCACAGATTGTGTACGAGCGTAAGAAGCAGCTCTTCAAGCTCAGGA

QA 13 603 13 603
DS 

RD RR2GT68TF 755 0 0
GGCTTTCTTCTTCGAAGAGCAGCAGTGAGAGAGAGAATCAGTCGAATCGAGAGGAAGAAA
GAAAGATGGTGTCCGGGTCAGGGATATGCGCGAAGCGGGTCGTGGTCGACGCAAGGCACC
ACATGCTGGGCCGTCTTGCTTCGATCATCGCCAAGGAGCTGCTCAACGGACAGAGAGTCG
TTGTCGTCAGGTGCGAGGAGATTTGCCTGTCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGT
ACATGAGGTTTCTCAGGAAACGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCA
GGGCTCCCTCTAAGATCTTCTGGCGTACCGTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGC
GTGGAGCTGCTGCTCTTGCACGCTTGAAGGTCTTTGAAGGAGTTCCACCACCTTACGACA
AGGTCAAGAGAATGGTTATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACA
AGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTGTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTA
AGGAGCTTGAGGTCAAAAGAAAGGAGAGATCACAGGTTGTGTACGAGCGTAAGAAGCAGC
TCATCAAGCTCAGGACTAAGGCTGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAGCTTGGATCCCAACTCG
ATGTTCTTGCACCCATCAAGTACTGAGAATTGGCATCCATTATTTGGTTTAATACTTGCT
TTGGTGCTTGTCTCTAT*CTACCTTTGAATTT
GTT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2EI86JQ 621 0 0
CTGCTCAACGGACAGAGAGTCGTTGTCGTCAGATGCGAGGAGATTTGCCTGTCAGGTGGG
TTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAACGCATGAACACCAAGCCT
TCTCACGGTCCCATTCATTTCAGGGCTCCCTCTAAGATCTTCTGGCGTACCGTTCGTGGG
ATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCACGCTTGAAGGTCTTTGAA
GGAGTCCCACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTTATTCCTGATGCTCTCAAGGTT
TTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTGTCTTCTGAGGTTGGC
TGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAAAGAAAGGAGAGATCACAGATT
GTGTACGAGCGTAAGAAGCAGCTCTTCAAGCTCAGGACTAAGGCTGAGAAGGTTGCAGAG
GAGAAGCTTGGATCCCAACTCGATGTTCTTGCACCCATCAAGTACTGAGAATTGGCATCT
ATTATTTGGTTTAATACTTGCTTTGGTGCTTGTCTCTATTCTACCTTTGAATTTTGTTTT
TGCTTTTGGTAGCTTGTAAAC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2AU94TF 794 0 0
GGAGAGCAGCA
GTGAGAGAGAGAATCAGTCGAATCGAGAGGAAGAAAGAAAGATGGTGTCCGGGTCAGGGA
TATGCGCGAAGCGGGTCGTGGTCGACGCAAGGCACCACATGCTGT*CCGTCTTGCTTCGA
TCATCGCCAAGGAGCTGCTCAACGGACAGAGAGTCGTTGTCGTCAGGTGCGAGGAGATTT
GCCTGTCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAACGCA
TGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCTAAGATCTTCTGGC
GTACCGTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGCTGCTCTTGCACGCT
TGAAGGTCTTTGAAGGAGTTCCACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTTATTCCTG
ATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTGT
CTTCTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAAAGAAAGG
AGAGATCACAGGTTGTGTACGAGCGTAAGAAGCAGCTCATCAAGCTCAGGACTAAGGCTG
AGAAGGTTGCAGAGGAGAAGCTTGGATCCCAACTCGATGTTCTTGCACCCATCAAGTACT
GAGAATTGGCATCTATTATTTGGTTTAATACTTGCTTTGGTGCTTGTCTCTATTCTACCT
TTGAATTTTGTTTTTGCTTTTGGTAGCTTGTAAACTTAAAGATTGAA*TGAGACATTTTG
GAT

QA 12 794 12 794
DS 

RD RR2GT68JQB 687 0 0
CCGTCTTGCTTCGATCATCGCCAAGGAGCTGCTCAACGGACAGAGAGTCGTTGTCGTCAG
GTGCGAGGAGATTTGCCTGTCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACATGAGGTT
TCTCAGGAAACGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTC
TAAGATCTTCTGGCGTACCGTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTGC
TGCTCTTGCACGCTTGAAGGTCTTTGAAGGAGTTCCACCACCTTACGACAAGGTCAAGAG
AATGGTTATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTT
GTTGGGCCGTCTGTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGA
GGTCAAAAGAAAGGAGAGATCACAGGTTGTGTACGAGCGTAAGAAGCAGCTCATCAAGCT
CAGGACTAAGGCTGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAGCTTGGATCCCAACTCGATGTTCTTGC
ACCCATCAAGTACTGAGAATTGGCATCCATTATTTGGTTTAATACTTGCTTTGGTGCTTG
TCTCTATTCTACCTTTGAATTTTGTTTTTGCTTTTGGTAGCTTGTAAACTTAAAGATTGA
AATGAGACATTTTGGATTTTTGGTTGG

QA 1 687 1 687
DS 



AS 2 8

CO CL916Contig1 733 2 1 U
CAAGGCGAAAATGTGTCTATTATCACTAAAGGCATACGGGTTATGAGCTCTTAAGTCTAA
ACACATCATAACTAGACTTGTATCATGCATTGTTTACTTTGATTGTCCTTCAGCAGTTCA
AACACACAAAACATTTTATTACAGACAATACGCAGCTCTTATTATCGAGTAAAGGTGATC
TAAAAACGTCTGAGTATGTGTGTTTGCGCATGTTGTAACACTTGTAACACACGGAGCCAG
GAACATAACCAGAAGAAGAACTCTCCACCGAATCCACAAGTGTTTCCTCCAACGGCCTGA
AAGTCCAACCCAACTTCTGCAGTTTCTCCGAACTCATCGTACTCCTCTCTTCCACTTCGA
CGTAGCCCTTAGGGTAGTTGTAATTAGGGTAAAGACTCTTGAGCTTCTCAACCACATCCT
TTTCTTTAGCCTTGTGGGCAGTACATATGTATCTTCCTTCAGCTTCTGGTTTCTCATAAA
CCAAAAGTAACGCTTGAGCCACATCGCACATCTACAATAAGCCGCACTTGGTTCTCCCGT
GACTCAAAACCCTCTTTAAGAAGCTTGGCAAGAGCAAGGGTACTAGCGTTCACTGTGTGC
TGCTGCAGTACAGGACCAAAGACCATGGTAGGGCAAATGCTGACGAGATCAATCCCGGTT
CGTTTTGCGAATTCGAAAGCTTCACTTTCTGCTTGTGTCTTAGACGCACAATACCAATTC
TCAGTTCTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO81JQ U 4
AF RR2AA48JQ U 1
BS 1 733 RR2AA48JQ

RD RR2FO81JQ 105 0 0
GGCT
AAAATGTGTCTATTATCACTAATGGCATACGGGTTATGAGCTCTTAAGTCTAAACACATC
ATAACTAGACTTGTATCATGCATTGTTTATTTTGATTGTCC

QA 5 105 5 105
DS 

RD RR2AA48JQ 733 0 0
CAAGGCGAAAATGTGTCTATTATCACTAAAGGCATACGGGTTATGAGCTCTTAAGTCTAA
ACACATCATAACTAGACTTGTATCATGCATTGTTTACTTTGATTGTCCTTCAGCAGTTCA
AACACACAAAACATTTTATTACAGACAATACGCAGCTCTTATTATCGAGTAAAGGTGATC
TAAAAACGTCTGAGTATGTGTGTTTGCGCATGTTGTAACACTTGTAACACACGGAGCCAG
GAACATAACCAGAAGAAGAACTCTCCACCGAATCCACAAGTGTTTCCTCCAACGGCCTGA
AAGTCCAACCCAACTTCTGCAGTTTCTCCGAACTCATCGTACTCCTCTCTTCCACTTCGA
CGTAGCCCTTAGGGTAGTTGTAATTAGGGTAAAGACTCTTGAGCTTCTCAACCACATCCT
TTTCTTTAGCCTTGTGGGCAGTACATATGTATCTTCCTTCAGCTTCTGGTTTCTCATAAA
CCAAAAGTAACGCTTGAGCCACATCGCACATCTACAATAAGCCGCACTTGGTTCTCCCGT
GACTCAAAACCCTCTTTAAGAAGCTTGGCAAGAGCAAGGGTACTAGCGTTCACTGTGTGC
TGCTGCAGTACAGGACCAAAGACCATGGTAGGGCAAATGCTGACGAGATCAATCCCGGTT
CGTTTTGCGAATTCGAAAGCTTCACTTTCTGCTTGTGTCTTAGACGCACAATACCAATTC
TCAGTTCTTTTGC

QA 1 733 1 733
DS 



CO CL916Contig2 1300 6 30 U
GGAGAAACAGTACACACCTGGCACTCGTTCAGACAAGGTAAGAAGAAGAAGAAGCATCTC
GATTCTCTCGAAGATCGAAAAAAATGTCGGTGGCGACGAAAGGAAAGGTTTGCGTTACCG
GTGCCGGAGGGTTTCTTGCTTCATGGGTCGTTGATCTCCTCCTCTCTAAGGATTACTTCG
TTCACGGCACTGTCAGAGACCCTGATAACGAAAAGTATTCTCATTTGAAGAAGCTGGAGA
AAGCCGGTGAAAATCTCAAGCTCGTCAAGGCTGATTTGCTGGACTACGCCTCTCTTCAAT
CTGCTATTGCAGGTTGCGTTGGCGTCTTCCATGTCGCAAGTCCTGTTCCATCATCTTCAG
TCCCAAATCCTGAGGTGGAAGTGATGGCACCAGCTGTGGATGGGACGTTGAATGTGCTTA
AAGCGTGCGTCGAAGCGAACGTTAAGCGTGTTGTGTACGTTTCCTCTGCAGCTGCACTTA
TGATGAACCCTAATTGGTCAAAGGATCGAGTCATAGATGAGTCGTGATGGTCTGACCTGG
AGTTTTGCAAAAGAACTGAGAATTGGTATTGTGCGTCAAAGACACAAGCAGAAAGTGAAG
CTTTCGAATTCGCAAAACGAACCGGGATTGATCTCGTCAGCATTTGCCCTACCATGGTCT
TTGGTCCTGTACTGCAGCAGCACACAGTAAACGCTAGTACCCTTGCTCTTGCCAAGCTTC
TTAAAGAGGGTTTTGAGTCACGGGAGAACCAAGTGAGACTTATTGTAGATGTGCGTGATG
TGGCTCAAGCGTTACTTTTGGCTTATGAGAAACCAGAAGCTGAAGGAAGATACATATGCA
CTGCCCACAAGGCTAAAGAAAAGGACGTGGTTGAGAAGCTCAAGAGTCTTTACCCTAATT
ACAACTACCCTAAGAGCTACGTAGAAGTGGAAGAAAGGACTACGATGAGTTCGGAGAAAC
TGCAGAAGTTGGGTTGGACTTTCAGGCCGTTGGAGGAAACACTTGTGGATTCGGTGGAGA
GCTACAGGAAAGCTAAGATTCTGGACTGAAAACTTGGAAACAAGAGCAAAAGAGAGTTCT
TCTTCTGGTTATGTTCCTGTCTCCGTGTGTTACAAGTGTTACAACATGCGCAAACACACG
TACTCAGACGTCTTTAGATCATCTTTACTCAATAATAAGAGCTGCGTATTGTCTGTAATA
AAATGTTTTGTGTGTTTTGAACTGCTGAAGGACAATCAAAATAAACAATGCATGATACAA
GTCTAGTTATGATGTGATAATAGACACATTTTAGCCTTGC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA48TF U 1
AF RR2FK14TF U 1
AF RR2FO81TF U 749
AF RR2GJ59TF U 533
AF RR2FK14JQ C 609
AF RR2GJ59JQB C 675
BS 1 39 RR2AA48TF
BS 40 40 RR2FK14TF
BS 41 77 RR2AA48TF
BS 78 78 RR2FK14TF
BS 79 95 RR2AA48TF
BS 96 96 RR2FK14TF
BS 97 124 RR2AA48TF
BS 125 125 RR2FK14TF
BS 126 160 RR2AA48TF
BS 161 161 RR2FK14TF
BS 162 250 RR2AA48TF
BS 251 251 RR2FK14TF
BS 252 328 RR2AA48TF
BS 329 329 RR2FK14TF
BS 330 427 RR2AA48TF
BS 428 428 RR2FK14TF
BS 429 499 RR2AA48TF
BS 500 500 RR2FK14TF
BS 501 523 RR2AA48TF
BS 524 524 RR2FK14TF
BS 525 577 RR2AA48TF
BS 578 578 RR2FK14TF
BS 579 688 RR2AA48TF
BS 689 689 RR2FK14TF
BS 690 755 RR2AA48TF
BS 756 1026 RR2GJ59TF
BS 1027 1027 RR2FO81TF
BS 1028 1230 RR2GJ59TF
BS 1231 1244 RR2FK14JQ
BS 1245 1300 RR2GJ59JQB

RD RR2AA48TF 764 0 0
GGAGAAACAGTACACACCTGGCACTCGTTCAGACAAGGTTAGAAGAAGAAGAAGCATCTC
GATTCTCTCGAAGATCGGAAAAAATGTCGGTGGCGGCGAAAGGAAAGGTTTGCGTTACCG
GTGCGGGAGGGTTTCTTGCTTCATGGGTCGTTGATCTCCTTCTCTCTAAGGATTACTTCG
TTCACGGCACTGTCAGAGACCCTGATAACGAAAAGTATTCTCATTTGAAGAAGCTGGAGA
AAGCCGGTGACAATCTCAAGCTCGTCAAGGCTGATTTGCTGGACTACGCCTCTCTTCAAT
CTGCTATTGCAGGTTGCGTTGGCGTCTTTCATGTCGCAAGTCCTGTTCCATCATCTTCAG
TCCCAAATCCTGAGGTGGAAGTGATGGCACCAGCTGTGGATGGGACGTTGAATGTGCTTA
AAGCGTGTGTCGAAGCGAACGTTAAGCGTGTTGTGTACGTTTCCTCTGCAGCTGCACTTA
TGATGAACCCTAATTGGTCTAAGGATCGAGTCATAGATGAGTCTTGATGGTCTGACCTGG
AGTTTTGCAAAAGAACTGAGAATTGGTATTGTGCGTCTAAGACACAAGCAGAAAGTGAAG
CTTTCGAATTCGCAAAACGAACCGGGATTGATCTCGTCAGCATTTGCCCTACCATGGTCT
TTGGTCCTGTACTGCAGCAGCACACAGTGAACGCTAGTACCCTTGCTCTTGCCAAGCTTC
TTAAAGAGGGTTTTGAGTCACGGGAGAACCAAGTG
CGGCTTATT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2FK14TF 722 0 0
AGG
GAAACAGTACACACCTGGCACTCGTTCAGACAAGGTAAGAAGAAGAAGAAGCATCTCGAT
TCTCTCGAAGATCGAAAAAAATGTCGGTGGTGACGAAAGGAAAGGTTTGCGTTACCGGTG
CCGGAGGGTTTCTTGCTTCATGGGTCGTTGATCTCCTCCTCTCTAAGGATTACTTCGTTC
ACGGCACTGTCAGAGACCCTGATAACGAAAAGTATTCTCATTTGAAGAAGCTGGAGAAAG
CCGGTGAAAATCTCAAGCTCGTCAAGGCTGATTTGCTGGACTACGGCTCTCTTCAATCTG
CTATTGCAGGTTGCGTTGGCGTCTTCCATGTCGCAAGTCCTGTTCCATCATCTTCAGTCC
CAAATCCTGAGGTGGAAGTGATGGCACCAGCTGTGGATGGGACGTTGAATGTGCTTAAGG
CGTGCGTGGAAGCGAACGTTAAGCGTGTTGTGTACGTTTCCTCTGCAGCTGCGCTTATGA
TGAACCCTAATTGGTCAAAGGATCGAGTCATAGATGAGTCGTGTTGGTCTGACCTGGAGT
TTTGCAAAAGAACTGAGAATTGGTATTGTGCGTCAAAGACACAAGCAGAAAGTGAAGCTT
TCGAATTCGCAAAACGAACCGGGATTGATCTCGTCAGCATTTGCCCTACCATGGTCTTTG
GTCCTGTACTGCAGCAGCACACAGTAAACGCTAGTACCCTTGCTCTTGCCAAGCTTCTT

QA 4 722 4 722
DS 

RD RR2FO81TF 362 0 0
GG
AAGTGAGACTTATTGTAGATGTGCGTGATGTGGCTCAAGCGTTACTTTTGGTTTATGAGA
AACCAGAAGCTGAAGGAAGGTACATATGTACTGCCCACAAGGCTAAAGAAAAGGATGTGG
TTGAGAAGCTCAAGAGTCTTTACCCTAATTACAACTACCCTAAGAGCTTCGTAGAAGTGG
AAGAAAGGACTACGATGAGTTCGGAGAAACTGCAGAAGTTGGGTTGGACTTTCAGGCCGT
TGGAGGAAACACTTGTGGATTCGGTGGAGAGCTACAGGAAAACTAAGATTCTGGACTGAA
AACTTGGAAACAAGAGCAAAGGAGAGTTCTTCTTCTGGTTATGTTCCTGGCTCCCTGTGT

QA 3 362 3 362
DS 

RD RR2GJ59TF 702 0 0
G
GACCTGGAGTTTTGCAAAAGAACTGAGAATTGGTATTGTGCGTCAAAGACACAAGCAGAA
AGTGAAGCTTTCGAATTCGCAAAACGAACCGGGATTGATCTCGTCAGCATTTGCCCTACC
GTGGTCTTTGGTCCTGTACTGCAGCAGCACACAGTAAACGCTAGTACCCTTGCTCTTGCC
AAGCTTCTTAAAGAGGGTTTTGAGTCACGGGAGAACCAAGTGAGACTTATTGTAGATGTG
CGTGATGTGGCTCAAGCGTTACTTTTGGCTTATGAGAAACCAGAAGCTGAAGGAAGATAC
ATATGCACTGCCCACAAGGCTAAAGAAAAGGACGTGGTTGAGAAGCTCAAGAGTCTTTAC
CCTAATTACAACTACCCTAAGAGCTACGTAGAAGTGGAAGAAAGGACTACGATGAGTTCG
GAGAAACTGCAGAAGTTGGGTTGGACTTTCAGGCCGTTGGAGGAAACACTTGTGGATTCG
GTGGAGAGCTACATGAAAGCTAAGATTCTGGACTGAAAACTTGGAAACAAGAGCAAAAGA
GAGTTCTTCTTCTGGTTATGTTCCTGTCTCCGTGTGTTACAAGTGTTACAACATGCGCAA
ACACACGTACTCAGACGTCTTTAGATCATCTTTACTCAATAATAAGAGCTGCGTATTGTC
TGTAATAAAATGTTTTGTGTGTTTTGAACTGCTGAAG
ACAA

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR2FK14JQ 642 0 0
TTCGCAAAACGAACCGGGATTGATCTCGTCAGCATTTGCCCTACCATGGTCTTTGGTCCT
GTACTGCAGCAGCACACAGTAAACGCTAGTACCCTTGCTCTTGCCAAGCTTCTTAAAGAG
GGTTTTGAGTCACGAGAGAACCAAGTGAGACTTATTGTAGATGTGCGTGATGTGGCTCAA
GCGTTACTTTTGGTTTATGAGAAACCAGAAGCTGAAGGAAGATACATATGCACTGCCCAC
AAGGCTAAAGAAAAGGACGTGGTTGAGAAGCTCAAGAGTCTTTACCCTAATTACAACTAC
CCTAAGAGCTACGTAGAAGTGGAAGAAAGGACTACGATGAGTTCGGAGAAACTGCAGAAG
TTGGGTTGGACTTTCAGGCCGTTGGAGGAAACACTTGTGGATTCGATGGAGAGCTACAGG
AAAGCTAAGATTCTGGACTGAAAACTTGGAAACAAGAGCAAAAGAGAGTTCTTCTTCTGG
TTATGTTCCTGTCTCCGTGTGTTACAAGTGTTACAACATGCGCAAACACACGTACTCAGA
CGTCTTTAGATCATCTTTACTCAATAATAAGAGCTGCGTATTGTCTGTAATAAAATGTTT
TGTGTGTTTTGAACTGCTGAAGGACAATCAAAATAA
CAATGC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2GJ59JQB 626 0 0
CAGCAGCACACAGTAAACGCTAGTACCCTTGCTCTTGCCAAGCTTCTTAAAGAGGGTTTT
GAGTCACGGGAGAACCAAGTGAGACTTATTGTAGATGTGCGTGATGTGGCTCAAGCGTTA
CTTTTGGCTTATGAGAAACCAGAAGCTGAAGGAAGATACATATGCACTGCCCACAAGGCT
AAAGAAAAGGACGTGGTTGAGAAGCTCAAGAGTCTTTACCCTAATTACAACTACCCTAAG
AGCTACGTAGAAGTGGAAGAAAGGACTACGATGAGTTCGGAGAAACTGCAGAAGTTGGGT
TGGACTTTCAGGCCGTTGGAGGAAACACTTGTGGATTCGGTGGAGAGCTACATGAAAGCT
AAGATTCTGGACTGAAAACTTGGAAACAAGAGCAAAAGAGAGTTCTTCTTCTGGTTATGT
TCCTGTCTCCGTGTGTTACAAGTGTTACAACATGCGCAAACACACGTATTCAGACGTCTT
TAGATCATCTTTACTCAATAATAAGAGCTGCGTATTGTCTGTAATAAAATGTTTTGTGTG
TTTTGAACTGCTGAAGGACAATCAAAATAAACAATGCATGATACAAGTCTAGTTATGATG
TGATAATAGACACATTTTAGCCTTGC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 3 8

CO CL917Contig1 1421 3 8 U
GGAGAACTTGTGATTTCCCTCTAAATCTCACCCTGTTTTTCTGCACTCTGCTACCCGGAA
TCCATGGATATCGCTTCTTCCTCTCTCTGCCGAGCTCACAATGTCGCCCCCACGCGTCAA
CCTTCTCCCCCGGTCAACTCCTGCTCCCTCGGCTCGGTCTCAGTCATCGGATTCTCTCTT
CCGCAGATCAGCTCTCCTTCTCTAGCTAAATGTAGCCGAAAACAGAGCTCTTACGGCGTC
GTAAGAGCTTGTGTTGCCGTGGAACAGAAGACACGTACTGCCATCATCAGAATTGGCACA
AGGGGAAGTCCTCTAGCACTTGCTCAAGCGTACGAGACACGAGCCAAGCTCCAGTCAAAA
CACCCTGAGCTCACTGAAGACGGAGCTATCCACATCGAGATCATTAAGACAACTGGTGAT
AAGATTCTCTCTCAGCCGCTTGCTGATATCGGTGGGAAAGGGCTTTTCACCAAAGAAATT
GACGAGGCCTTGATAAACGGTCATATCGACATAGCTGTCCATTCGATGAAGGATGTCCCG
ACTTATCCACCTGAGAAGACGGTTTTACCGTGTAACCTTGTGCGTGAAGATGTCAGAGAT
GCTTTCATTTGTCTTACTGCAGCCTCGTTAGCCGATCTTCCAGCTGGAAGCGTTGTGGGA
ACAGCTTCTCTTAGGAGAAAGTCGCAGATACTCCACAAGTATCCTTCCCTAAGCGTTGAG
GAGAACTTTAGGGGTAATGTGCAGACAAGACTATCCAAGCTTCAAGGAGGAAAAGTCCAT
GCTACTCTATTAGCACTTGCTGGTCTCAAGAGGTTGAGTATGACAGAGAATGTGGCCTCT
ATTTTATCTCTCGATGAGATGCTACCAGCTGTTGCTCAAGGAGCAATCGGAATAGCCTGC
AGAACCGATGATGATAAAATGGCAAACTACTTAGCCTCATTGAACCACGAGGAAACGAGA
CTAGCGGTTGCATGCGAGAGAGCGTTTCTTGAAACGCTGGATGGCTCATGCCGTACTCCT
ATTGCTGGATACGCGGCCAAGGACGACGAAGGCAACTGCTATTTCAGAGGATTGGTTGCA
TCCCCTGACGGTACTCGAGTTCTTGAGACCTCAAGAAAAGGTCCGTATGTGTTTGAGGAC
ATGGTGAAGATGGGAAAAGACGCTGGGCAAGAGCTGCTTTCGCGTGCTGGTCCAGGCTTC
TTTGGCAACTAAGCCATTTTGAAGAAGAGGAGGAAGAAGGGCTGTAACATGGTCAGAGCC
AAGTGAACTATTGTAACTTTTTTTGATTTTGAGAGAAATATAACCTTGTTTTATTTGATT
GTATTCTTGTATTTAGATAAAAATAAGTCTTGCAATTGTAACTTTTTCATCACACTAGGA
ATCTCGTTCCCAAGAAATTAGACTTCAGCTCTATTATCTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G484TF U 1
AF RR2AM62TF U 1
AF RR2AM62JQ C 559
BS 1 31 RR2AM62TF
BS 32 32 RR2G484TF
BS 33 674 RR2AM62TF
BS 675 675 RR2AM62JQ
BS 676 747 RR2AM62TF
BS 748 748 RR2AM62JQ
BS 749 808 RR2AM62TF
BS 809 1421 RR2AM62JQ

RD RR2G484TF 556 0 0
GG
AGAACTTGTGATTTCCCTCTAAATCTCACCCTGTTTTTCTGCACTCTGCTACCCGGAATC
CATGGATATCGCTTCTTCCTCTCTCTGCCGAGCTCACAATGTCGCCCCCACGCGTCAACC
TTCTCCCCCGGTCAACTCCTGCTCCCTCGGCTCGGTCTCAGTCATCGGATTCTCTCTTCC
GCAGATCAGCTCTCCTTCTCTAGCTAAATGTAGCCGAAAACAGAGCTCTTACGGCGTCGT
AAGAGCTTGTGTTGCCGTGGAACAGAAGACACGTACTGCCATCATCAGAATTGGCACAAG
GGGAAGTCCTCTAGCACTTGCTCAAGCGTACGAGACACGAGCCAAGCTCCAGTCAAAACA
CCCTGAGCTCACTGAAGACGGAGCTATCCACATCGAGATCATTAAGACAACTGGTGATAA
GATTCTCTCTCAGCCGCTTGCTGATATCGGTGGGAAAGGGCTTTTCACCAAAGAAATTGA
CGAGGCCTTGATAAACGGTCATATCGACATAGCTGTCCATTCGATGAAGGATGTCCCGAC
TTATCTACCTGAGA

QA 3 556 3 556
DS 

RD RR2AM62TF 809 0 0
GGAGAACTTGTGATTTCCCTCTAAATCTCACTCTGTTTTTCTGCACTCTGCTACCCGGAA
TCCATGGATATCGCTTCTTCCTCTCTCTGCCGAGCTCACAATGTCGCCCCCACGCGTCAA
CCTTCTCCCCCGGTCAACTCCTGCTCCCTCGGCTCGGTCTCAGTCATCGGATTCTCTCTT
CCGCAGATCAGCTCTCCTTCTCTAGCTAAATGTAGCCGAAAACAGAGCTCTTACGGCGTC
GTAAGAGCTTGTGTTGCCGTGGAACAGAAGACACGTACTGCCATCATCAGAATTGGCACA
AGGGGAAGTCCTCTAGCACTTGCTCAAGCGTACGAGACACGAGCCAAGCTCCAGTCAAAA
CACCCTGAGCTCACTGAAGACGGAGCTATCCACATCGAGATCATTAAGACAACTGGTGAT
AAGATTCTCTCTCAGCCGCTTGCTGATATCGGTGGGAAAGGGCTTTTCACCAAAGAAATT
GACGAGGCCTTGATAAACGGTCATATCGACATAGCTGTCCATTCGATGAAGGATGTCCCG
ACTTATCCACCTGAGAAGACGGTTTTACCGTGTAACCTTGTGCGTGAAGATGTCAGAGAT
GCTTTCATTTGTCTTACTGCAGCCTCGTTAGCCGATCTTCCAGCTGGAAGCGTTGTGGGA
ACAGCTTCTCTTAG*AGAAAGTCGCAGATACTCCACAAGTATCCTTCCCTAAGCGTTGAG
GAGAACTTTAGGGGTAATGTGCAGACA*GACTATCCAAGCTTCAAGGAGGAAAAGTCCAT
GCTACTCTATTAGCACTTGCTGGTCTCA
G

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2AM62JQ 863 0 0
ACGGTTTTACCGTGTAACTTTGTGCGTGAAGATGTCAGAGATGCTTTCATTTGTCTTACT
GCAGCCTCGTTAGCCGATCTTCCAGCTGGAAGCGTTGTGGGAACAGCTTCTCTTAGGAGA
AAGTCGCAGATACTCCACAAGTATCCTTCCCTAAGCGTTGAGGAGAACTTTAGGGGTAAT
GTGCAGACAAGACTATCCAAGCTTCAAGGAGGAAAAGTCCATGCTACTCTATTAGCACTT
GCTGGTCTCAAGAGGTTGAGTATGACAGAGAATGTGGCCTCTATTTTATCTCTCGATGAG
ATGCTACCAGCTGTTGCTCAAGGAGCAATCGGAATAGCCTGCAGAACCGATGATGATAAA
ATGGCAAACTACTTAGCCTCATTGAACCACGAGGAAACGAGACTAGCGGTTGCATGCGAG
AGAGCGTTTCTTGAAACGCTGGATGGCTCATGCCGTACTCCTATTGCTGGATACGCGGCC
AAGGACGACGAAGGCAACTGCTATTTCAGAGGATTGGTTGCATCCCCTGACGGTACTCGA
GTTCTTGAGACCTCAAGAAAAGGTCCGTATGTGTTTGAGGACATGGTGAAGATGGGAAAA
GACGCTGGGCAAGAGCTGCTTTCGCGTGCTGGTCCAGGCTTCTTTGGCAACTAAGCCATT
TTGAAGAAGAGGAGGAAGAAGGGCTGTAACATGGTCAGAGCCAAGTGAACTATTGTAACT
TTTTTTGATTTTGAGAGAAATATAACCTTGTTTTATTTGATTGTATTCTTGTATTTAGAT
AAAAATAAGTCTTGCAATTGTAACTTTTTCATCACACTAGGAATCTCGTTCCCAAGAAAT
TAGACTTCAGCTCTATTATCTCC

QA 1 863 1 863
DS 



CO CL917Contig2 1003 3 4 U
GGAGTCTAATTTTCTTGGGAACGAGATTCATAGTGTGTTGAAAAAGTTACAATTATAAGA
CTTGTTTTATCTAAATACAAGAATACAATCAAATAAAACAAAGGTTATATTTCTCTCAAA
ATCAAAAAGAAGTTACAACAGTTTCACTTGGCTCTGACCATGTTACAGCCCTTCTTCCTC
CTCTCTTCAAAATGGCTTAGTTGCCAAAGAAGCCTGGACCAGCACGCGAAAGCAGTTCTT
GACCAGCGTCTTTTCCCATCTTCACCATGTCCTCAAACACATACGGGCCTTTTCTTGAGG
TCTCAAGAACTCGAGTACCGTCAGGAGAAGCAACCAATCCTCTGAAATAGCAGTTGCCTT
CTTCGTCCTTGGCCGCGTATCCAGCAATAGGAGTACGGCATGAGCCATCCAGCGTTTCAA
GAAACGCTCTCTCGCATGCAACCGCTAGTCTCGTTTCCTCGTGGTTCAATGAGGCTAAGT
AGTTTGCCATTTTATCATCATCGGTTCTGCAGGCAATTCCGATTGCTCCTTGAGCAACAG
CTGGAAGCATCTCATCGAGAGATAAAATAGAGGCCAT*TTCTCTGTCATACTCAACCTCT
TGAGACCAGCCAGTGCTAATAGAGTAGCGTGGACTTTTCCTCCTTGAAGCTTGGACAGTC
TTGTCTGCACATTACCCCTAAAGTTCTCCTCAACCTGCAGAGCCATCATCAACAAACACA
TGTGTCAAGATGCGACAGTCCCTGCGTTGTGAAAAAAGATGTAAAAAAACTCACACTTAA
CGAAGGATACTTGTGGAGTATCTGCGACTTTCTCCTAAGAGAAGCCGTTCCCACAACGCT
TCCAGCTGGAAGATCAGCCAGCGAAGCTGCAGTCAGACAAATGAAAGCATCTCTGACATC
TTCACGCACAAGGTTACACGGCAAAACCGTCTTCTCAGGTAGGTAAGTCGGGACGTCCTT
CATCGAATGGACAGCTATGTCGATATGACCGTTTATCAAGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET57JQ U 75
AF RR2BU04JQ U 1
AF RR2BU04TF C 378
BS 1 334 RR2BU04JQ
BS 335 335 RR2ET57JQ
BS 336 753 RR2BU04JQ
BS 754 1003 RR2BU04TF

RD RR2ET57JQ 609 0 0
ATACAAGAATACAATCAAATAAAACAAAGGTTATATTTCTCTCAAAATCAAAAAGAAGTT
ACAACAGTTTCACTTGGCTCTGACCATGTTACAGCCCTTCTTCCTCCTCTCTTCAAAATG
GCTTAGTTGCCAAAGAAGCCTGGACCAGCACGCGAAAGCAGTTCTTGACCAGCGTCTTTT
CCCATCTTCACCATGTCCTCAAACACATACGGGCCTTTTCTTGAGGTCTCAAGAACTCGA
GTACCGTCAGGAGAAGCAACCAATCCTCTGAAATAGCAGTTGCCTTCTTCGTCCTTGGCC
GCGTATCCAGCAATAGGAGTACGGCATGAGCCATCCAGCGTTTCAAGAAACGCTCTCTCG
CATGCAACCGCTAGTCTCGTTTCCTCGTGGTTCAATGAGGCTAAGTAGTTTGCCATTTTA
TCATCATCGGTTCTGCAGGCTATTCCGATTGCTCCTTGAGCAACAGCTGGAAGCATCTCA
TCGAGAGATAAAATAGAGGCCACATTCTCTGTCATACTCAACCTCTTGAGACCAGCAAGT
GCTAATAGAGTAGCATGGACTTTTCCTCCTTGAAGCTTGGATAGTCTTGTCTGCACATTA
CCCCTAAAG

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2BU04JQ 753 0 0
GGAGTCTAATTTTCTTGGGAACGAGATTCATAGTGTGTTGAAAAAGTTACAATTATAAGA
CTTGTTTTATCTAAATACAAGAATACAATCAAATAAAACAAAGGTTATATTTCTCTCAAA
ATCAAAAAGAAGTTACAACAGTTTCACTTGGCTCTGACCATGTTACAGCCCTTCTTCCTC
CTCTCTTCAAAATGGCTTAGTTGCCAAAGAAGCCTGGACCAGCACGCGAAAGCAGTTCTT
GACCAGCGTCTTTTCCCATCTTCACCATGTCCTCAAACACATACGGGCCTTTTCTTGAGG
TCTCAAGAACTCGAGTACCGTCAGGAGAAGCAACTAATCCTCTGAAATAGCAGTTGCCTT
CTTCGTCCTTGGCCGCGTATCCAGCAATAGGAGTACGGCATGAGCCATCCAGCGTTTCAA
GAAACGCTCTCTCGCATGCAACCGCTAGTCTCGTTTCCTCGTGGTTCAATGAGGCTAAGT
AGTTTGCCATTTTATCATCATCGGTTCTGCAGGCAATTCCGATTGCTCCTTGAGCAACAG
CTGGAAGCATCTCATCGAGAGATAAAATAGAGGCCAT*TTCTCTGTCATACTCAACCTCT
TGAGACCAGCCAGTGCTAATAGAGTAGCGTGGACTTTTCCTCCTTGAAGCTTGGACAGTC
TTGTCTGCACATTACCCCTAAAGTTCTCCTCAACCTGCAGAGCCATCATCAACAAACACA
TGTGTCAAGATGCGACAGTCCCTGCGTTGTGAA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2BU04TF 626 0 0
TATCCAGCAATAGGAGTACGGCATGAGCCATCCAGCGTTTCAAGAAACGCTCTCTCGCAT
GCAACCGCTAGTCTCGTTTCCTCGTGGTTCAATGAGGCTAAGTAGTTTGCCATTTTATCA
TCATCGGTTCTGCAGGCAATTCCGATTGCTCCTTGAGCAACAGCTGGAAGCATCTCATCG
AGAGATAAAATAGAGGCCAT*TTCTCTGTCATACTCAACCTCTTGAGACCAGCCAGTGCT
AATAGAGTAGCGTGGACTTTTCCTCCTTGAAGCTTGGACAGTCTTGTCTGCACATTACCC
CTAAAGTTCTCCTCAACCTGCAGAGCCATCATCAACAAACACATGTGTCAAGATGCGACA
GTCCCTGCGTTGTGAAAAAAGATGTAAAAAAACTCACACTTAACGAAGGATACTTGTGGA
GTATCTGCGACTTTCTCCTAAGAGAAGCCGTTCCCACAACGCTTCCAGCTGGAAGATCAG
CCAGCGAAGCTGCAGTCAGACAAATGAAAGCATCTCTGACATCTTCACGCACAAGGTTAC
ACGGCAAAACCGTCTTCTCAGGTAGGTAAGTCGGGACGTCCTTCATCGAATGGACAGCTA
TGTCGATATGACCGTTTATCAAGGCC

QA 1 626 1 626
DS 



CO CL917Contig3 782 2 9 U
GGAGAGCTATCAATCTCCATCATTTCAGAACTTGAGCTTTCCCTCTAAATCTCACTCTGT
TTTTTTGCACTCTGCTACCCGGAATCCATGGATATCGCTTCTTCCTCTCTCTGTCGAGCT
CACAAGGTCGCTCCCACGCGTCAACCTTCCCCCCCGGTCAACTCCTGCTCCCTCGGCTCG
GTCTCAGTCATCGGATTCTCTCTTCCGCAGATCACCTCTCCTTCTCTAGCTAAATGTAGC
CGAAAACAGAGCTCTTACGGCGTCGTAAGAGCTTGTGTTGCCGTGGAACAGAAGACACGT
ACTGCCATCATCAGAATTGGCACAAGGGGAAGTCCTCTAGCACTTGCTCAAGCGTACGAG
ACACGAGCAAAGCTCCAGTCAAAACACCCTGAGCTCACTGAAGACGGAGCTATCCACATC
GAGATCATCAAAACCACCGGTGATAAGATTCTCTCTCAGCCGCTTGCTGATATCGGTGGG
AAAGGGCTTTTCACCAAAGAGATTGACGAGGCCCTGATAAACGGTCATATCGACATAGCT
GTCCATTCCATGAAAGATGTCCCGACTTATCTACCTGAGAAGACGGTTTTGCCGTGTAAC
CTTGTGCGTGAAGATGTCAGAAATGCTTTCATTTGTCTGACTGCAGCTTCGCTGGCTGAT
CTTCCAGCTGGAAGCGTTGTGGGAACAGCCTCTCTTAGGAGAAAGTCGCAGATACTCCAC
AAGTATCCTTCCTTGAGTGTTGAAGAGACTTTAGGGTATGTGCAGACAGACTATCCAAGC
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2CZ48TF U 263
AF RR2ET57TF U 1
BS 1 621 RR2ET57TF
BS 622 622 RR2CZ48TF
BS 623 689 RR2ET57TF
BS 690 690 RR2CZ48TF
BS 691 698 RR2ET57TF
BS 699 699 RR2CZ48TF
BS 700 743 RR2ET57TF
BS 744 744 RR2CZ48TF
BS 745 782 RR2ET57TF

RD RR2CZ48TF 496 0 0
G
CGTAAGAGCTTGTGTTGCCGTGGAACAGAAGACACGTACTGCCATCATCAGAATTGGCAC
AAGGGGAAGTCCTCTAGCACTTGCTCAAGCGTACGAGACACGAGCAAAGCTCCAGTCAAA
ACACCCTGAGCTCACTGAAGACGGAGCTATCCACATCGAGATCATCAAAACCACCGGTGA
TAAGATTCTCTCTCAGCCGCTTGCTGATATCGGTGGGAAAGGGCTTTTCACCAAAGAGAT
TGACGAGGCCTTGATAAACGGTCATATCGACATAGCTGTCCATTCCATGAAAGATGTCCC
GACTTATCTACCTGAGAAGACGGTTTTGCCGTGTAACCTTGTGCGTGAAGATGTCAGAAA
TGCTTTCATTTGTCTGACTGCAGCTTCGCTGGCTGATCTTCCAGCTGGAAGCGTTGTGGG
AACAGCCTCTCTTAGGAGAAAGTCGCAGATACTCCACAAGTATCCTTCCTTGAGTGTTGA
AGAGA
ACTTTAGGGG

QA 2 486 2 486
DS 

RD RR2ET57TF 782 0 0
GGAGAGCTATCAATCTCCATCATTTCAGAACTTGAGCTTTCCCTCTAAATCTCACTCTGT
TTTTTTGCACTCTGCTACCCGGAATCCATGGATATCGCTTCTTCCTCTCTCTGTCGAGCT
CACAAGGTCGCTCCCACGCGTCAACCTTCCCCCCCGGTCAACTCCTGCTCCCTCGGCTCG
GTCTCAGTCATCGGATTCTCTCTTCCGCAGATCACCTCTCCTTCTCTAGCTAAATGTAGC
CGAAAACAGAGCTCTTACGGCGTCGTAAGAGCTTGTGTTGCCGTGGAACAGAAGACACGT
ACTGCCATCATCAGAATTGGCACAAGGGGAAGTCCTCTAGCACTTGCTCAAGCGTACGAG
ACACGAGCAAAGCTCCAGTCAAAACACCCTGAGCTCACTGAAGACGGAGCTATCCACATC
GAGATCATCAAAACCACCGGTGATAAGATTCTCTCTCAGCCGCTTGCTGATATCGGTGGG
AAAGGGCTTTTCACCAAAGAGATTGACGAGGCCCTGATAAACGGTCATATCGACATAGCT
GTCCATTCCATGAAAGATGTCCCGACTTATCTACCTGAGAAGACGGTTTTGCCGTGTAAC
CTTGTGCGTGAAGATGTCAGAGATGCTTTCATTTGTCTGACTGCAGCTTCGCTGGCTGAT
CTTCCAGCTGGAAGCGTTGTGGGAACAGCTTCTCTTAG*AGAAAGTCGCAGATACTCCAC
AAGTATCCTTCCTTGAGTGTTGAGGAGACTTTAGGGTATGTGCAGACAGACTATCCAAGC
TT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 6

CO CL918Contig1 1021 6 30 U
GGCCAAAGGGTAGAGTTTCTTTATTCAAAGATGATGCAGATAATTGGTGATAAAGAAAGG
TCTACATCAAAAACTACAAATCATTTATTGGGGGCAAA*GTATGAGGAAAACTCATGTTT
CTGTCTGACTCTCTGATCAAACTAAAGTGTTTTATGCAAACTGTCTTTTTAAATTTTGGC
GGTTCATAAAATCCTCTTGGGTTGGGCTTTGTAGGCAATGCGTCTGGTCACAGTGCGCAT
TGTCACGAATTCCTCTGCAGAAGACGGATGTATCCCAACCGTGCTGTCAAATTGTGCTTT
GGTTGCTCCACACTTAAGCGCAATTGCAATCCCCTGCATGATCTCAGCTGCATCTGGACC
GCACATGGACGCTCCAATAACCTTATCAGTCTGCTCATCAACTATTAGCTTCATCAATGA
CCTTTCCTGGCGTCCAGAAATGGTGTTCTTCATAGGATTAAAGCCTGAGGTGAAAACCAG
AATATCCCCAGTCGCTTTTTCTACTGCCTCTTCTTCACTGAGACCCACCACAGCTAATGG
AGGTATGCAAAACACAGCACAGGCTACATTGCTGTAGTCTGCTTTAGTAGGTTTCTCACC
AAAAACAGTGTTCGCAAAGCAGGTGGCCTCCATTAACGCAACAGGTGTAAGGTTAATCCG
GTTTGTAGCATCTCCCACAGCCCATATGCTAGGTATATTAGTGCGTGAGTACTCATCAAC
CTTCACAGCTCCAGCCTGATCAAGTCCAACACCAACAGCTTCTAAGTTCAATCGCTTGGT
GTTAGGACTCCTGCCAGTAGCAAATAGTACAACATCCGCCATGAATTCTTCCCCGTGAGA
CGAGATTACTTTAATCCCCTCGTCTGTTTTTATCAACTGAGTCAAACTTGTTTGCGGATG
CAGATTAACACCCCTTCCTTCAAGATTTCTAGCCACTAGTGCTCTCATTTCATCATCAAA
GCCCCTTAGTGGAAGTTCCTTCCTGAAGAATAAATCCACTGTACCACCCATTCCACGCCA
C


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 10 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 10 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 
40 40 10 25 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 15 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2G547JQ U 1
AF RR2DT11JQ U 55
AF RR2E070JQ U 2
AF RR2G765TF C 35
AF RR2GU67TF C 209
AF RR2E070TF C 201
BS 1 71 RR2G547JQ
BS 72 73 RR2E070JQ
BS 74 98 RR2G547JQ
BS 99 99 RR2DT11JQ
BS 100 110 RR2G547JQ
BS 111 111 RR2DT11JQ
BS 112 159 RR2G547JQ
BS 160 160 RR2E070JQ
BS 161 179 RR2G547JQ
BS 180 180 RR2E070JQ
BS 181 190 RR2G547JQ
BS 191 191 RR2E070JQ
BS 192 291 RR2G547JQ
BS 292 292 RR2E070JQ
BS 293 369 RR2G547JQ
BS 370 370 RR2E070JQ
BS 371 453 RR2G547JQ
BS 454 454 RR2E070JQ
BS 455 476 RR2G547JQ
BS 477 585 RR2E070JQ
BS 586 660 RR2G765TF
BS 661 787 RR2E070TF
BS 788 788 RR2GU67TF
BS 789 871 RR2E070TF
BS 872 872 RR2GU67TF
BS 873 894 RR2E070TF
BS 895 895 RR2GU67TF
BS 896 897 RR2E070TF
BS 898 898 RR2GU67TF
BS 899 1021 RR2E070TF

RD RR2G547JQ 476 0 0
GGCCAAAGGGTAGAGTTTCTTTATTCAAAGATGATGCAGATAATTGGTGATAAAGAAAGG
TCTACATCAAA**CTACAAATCATTTATTGGGGGCAAAAGTATGAGGAAAGCTCATGTTT
CTGTCTGACTCTCTGATCAAACTAAAGTGTTTTATGCAA*CTGTCTTTTTAAATTTTGGA
GGTTCATAAACTCCTCTTGGGTTGGGCTTTGTAGGCAATGCGTCTGGTCACAGTGCGCAT
TGTCACGAATTCCTCTGCAGAAGACGGATGTATCCCAACCGTGCTGTCAAACTGTGCTTT
GGTTGCTCCACACTTAAGCGCAATTGCAATCCCCTGCATGATCTCAGCTGCATCTGGACC
GCACATGGATGCTCCAATAACCTTATCAGTCTGCTCATCAACTATTAGCTTCATCAATGA
CCTTTCCTGGCGTCCAGAAATGGTGTTCTTCATTGGATTAAAGCCTGAGGTGAAAA

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR2DT11JQ 422 0 0
TGGC
GGTCTACATCAAAAACCACAAATCATTTATTGGGGGCAAA*GTATGAAGAAAACTCATGT
TCCTGTCTGACTCTCTGATCAAACTAAAGTGTTTTATGCAAACTGTCTTTTTAAATTTTG
GCGGTTCATAAAATCCTCTTGGGTTGGGCTTTGTAGGCAATGCGTCTGGTCACAGTGCGC
ATTGTCGCGAATTCCTCTGCAAAAGACGGATGTATCCCAACCGTGCTGTCAAATTGTGCT
TTGGTTGCTCCACACTTGAGCGCAATTGCAATCCCCTGCATGATCTCAGCTGCATCTGGA
CCGCACATGGACGCTCCAATAACCTTATCAGTCTGCTCATCAACTATTAGCTTCATCAAT
GACCTTTCCTGGCGTCCAGAAATGGTGTTCTTCATAGGATTAAAGCCTGAGGTGAAAA

QA 5 422 5 422
DS 

RD RR2E070JQ 584 0 0
GCCAAAGGGTAGAGTTTCTTTATTCAAATATGATGCAGATAATTGGTGATAAAGAAAGGT
CTACATCAAAAACTACAAACCATTTATTGGGGGCAAAAGTATGAGGAAA*CTCATGTTTC
TGTCTGACTCTCTGATCAAACTAAAGTGTTTTATGCAAACTGTCTTTTTAAATTTTGGCG
GTTCATAAAATCCTCTTGGGTTGGGATTTGTAGGCAATGCGTCTGGTCACAGTGCGCATT
GTCACGAATTCCTCTGCAGAAGACGGATGTATCCCAACCGTGCTGTCAAATTGTGCTTTG
GTTGCTCCACACTTAAGCGCAATTGCAATCCCCTGCATGATCTCAGCTGCATCTGGACCG
CACATGGACGCTCCAATAACCTTATCAGTCTGCTCATCAACTATTAGCTTCATCAATGAC
CTTTCCTGGCGTCCAGAAATGGTGTTCTTCATAGGATTAAAGCCTGAGGTGAAAACCAGA
ATATCCCCAGTCGCTTTTTCTACTGCCTCTTCTTCACTGAGACCCACCACAGCTAATGGA
GGTATGCAAAACACAGCACAGGCTACATTGCTGTAGTCTGCTTT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2G765TF 627 0 0
TCAAAGATGATGCA
GATAAAGAAAGGTCTACATCAAAAAATACAAATCATTTATTGGGGGCAAA*GTATGAGGA
TAACTCATGTTTCTGTCTGACACTCTGATCAAACTAAAGTGTTCTATGCAAACTGTCTTT
TTAAATTTTGGCGGTTCATAAAATCCTCTTGGGTTGGGCTTTGTAGGCAATGCGTCTGGT
CACAGTGCGCATTGTTACGAATTCCTCTGCAGAAGACGGATGTATCCCAACCGTGCTGTC
AAATTGTGCTTTGGCTGCTCCACACTTGAGCGCAATTGCAATCCCCTGCATGATCTCAGC
TGCATCTGGACCGCACATGGACGCTCCAATTACCTTATCAATCTGCTCATCAACTATTAG
CTTCATCAATGACCTTTCCTGGCGTCCAGAAATGGTGTTCTTCATAGGATTAAAGCCTGA
GGTGAAAACCAGAATATCTCCAGTCGCTTTTTCTACTGCCTCTTCTTCACTGAGACCCAC
CACAGCTAATGGAGGTATGCAAAACACAGCACAGGCTACATTGCTGTAGTCTGCTTTAGT
AGGTTTCTCACCAAAAACAGTGTTCGCAAAGCAGGTGGCCTCCATTAACGCAACAGGTGT
AAGGTTAATCCG
C

QA 15 626 15 626
DS 

RD RR2GU67TF 813 0 0
CTTGTA
GCAATGCGTCTG*TCACAGTGCGCAT*GT*ACGAAT*CCTCTGCAGA*GACGGATGTATC
CCAACCGTGCTGTCAAA*TGTGCTTTGG*TGCTCCACACTTGAGCGCAATTGCAATCCCC
TGCATGATCTCAGCTGCATCTGGACCGCACATGGACGCTCCAATTACTTTATCAGTCTGC
TCATCAACTATTAGCTTCATCAATGACCTTTCCTGGCGTCCAGAAATGGTGTTCTTCATA
GGATTAAAGCCTGAGGTGAAAACCAGAATATCTCCAGTCGCTTTTTCTACTGCCTCTTCT
TCACTGAGACCCACCACAGCTAATGGAGGTATGCAAAACACAGCACAGGCTACATTGCTG
TAGTCTGCTTTAGTAGGTTTCTCACCAAAAACAGTGTTCGCTAAGCAGGTGGCCTCCATT
AACGCAACAGGTGTAAGGTTAATCCGGTTTGTAGCATCTCCCACAGCCCATATGCTAGGT
ATATTAGTGCGTGAGTACTCATCAACCTTCACAGCTCCAGCCTGATCAAGTTCAACACCA
ACAGCTTCTAAGTTCAATCGCTTGGTGTTAGGACTCCTGCCAGTAGCAAATAGTACAACA
TCCGCCATGAATTCTTCTCCGTGAGACGAGATTACTTTGATCCCCTCGTCTGTTTTTATC
AACTGAGTCAAACTTGTTTGCGGATGCAGATTAACACCCCTTCCTTCAAGATTTCTAGCC
ACTAGTGCTCTCATTTCATCATCAAAGCCCCTTAGTGGAAGTTCCTTCCTGAAGAATAAA
TCCACTGTACCACCCATTCCACGCC
CC

QA 7 811 7 811
DS 

RD RR2E070TF 821 0 0
GGTTGGGA
TTGTAGGCAATGCGTCTG*TCACAGTGCGCAT*GTCACGAAT*CCTCTGCAGAAGACGGA
TGTATCCCAACCGTGCTGTCAAATTGTGCTTTGG*TGCTCCACACTTAAGCGCAATTGCA
ATCCC*TGCATGATCTCAGCTGCATCTGGACCGCACATGGACGCTCCAATAACTTTATCA
GTCTGCTCATCAACTATTAGCTTCATCAATGACCTTTCCTGGCGTCCAGAAATGGTGTTC
TTCATAGGATTAAAGCCTGAGGTGAAAACCAGAATATCCCCAGTCGCTTTTTCTACTGCC
TCTTCTTCACTGAGACCCACCACAGCTAATGGAGGTATGCAAAACACAGCACAGGCTACA
TTGCTGTAGTCTGCTTTAGTAGGTTTCTCACCAAAAACAGTGTTCGCAAAGCAGGTGGCC
TCCATTAACGCAACAGGTGTAAGGTTAATCCGGTTTGTAGCATCTCCCACAGCCCATATG
CTAGGTATATTAGTGCGTGAGTACTCATCAACCTTCACAGCTCCAGCCTGATCAAGTCCA
ACACCAACAGCTTCTAAGTTCAATCGCTTGGTGTTAGGATTCCTGCCAGTAGCAAATAGT
ACAACATCCGCCATGAATTCTTCCCCGTGAGACGAGATTACTTTAATCCCCTCGTCTGTT
TTTGTCAACTGAGTCAAACTTGTTTGGGGGTGCAGATTAACACCCCTTCCTTCAAGATTT
CTAGCCACTAGTGCTCTCATTTCATCATCAAAGCCCCTTAGTGGAAGTTCCTTCCTGAAG
AATAAATCCACTGTACCACCCATTCCACGCCAC

QA 9 821 9 821
DS 



AS 1 8

CO CL919Contig1 682 8 3 U
GGATCACAAGCAACTTCAACACAAAAGCAACTCTCTCTCTCTCTGATAAAAGTCCAAGAA
CACAAAACAAGTCAGCTACTACAATGTCAATCTCAAAAGTCTCTCTCTGCCTGATCTTTC
TCACTTTCCTCACTTCCCCACTTGTGCTCTGCTCTCGCAGCCCAAAAATGGCAGTAACAG
CATCAGCCGCAATAGAGAAGAAGCTACAGAAAACACATGTTCATCCTCCGGTATTACCTG
TTCCTGAATCCACCGAGGTTGATTCATCACCCTCCATGGCCAAGATTGATGATGAACCTG
CAACAAACTCTGTGATATCCGGTTTCTTCAGGTCTAAGTTCCCATTCCAAGGCTGGCCTT
TCCACAAGTATGGCTCTTTCCCTATGGCTAAGCCTGCAAGTCCTTCTGTTCCTACTACAA
CACCGGCTACTGGAGCAGCTGAGGAAGAGGAATCTGAGAAGGTGCCTTCTTCACCAAGCA
AAGGAAACAGAGATGGTGGCAACGCATGATGAAATGAATAACAAGAAAATGTACTAATTA
CTAAAACCGTATTGTGTTTAACGACAGTTGAATCTTTATCCACTAGTTTTACATAAATGT
ATCGAATAAAAATGTATCATGTACTATAAATGCTATGTGACATTTTACATGGATAATGAA
ATGAATACAATCTATCTTATCT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 35 35 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2AG88TF U 1
AF RR2AG88JQ C 45
AF RR2CI82JQ C 45
AF RR2GW81TF U 1
AF RR2CI82TF U 2
AF RR2GW81JQ C 467
AF RR2B237TF U 1
AF RR2B288TF U 347
BS 1 652 RR2AG88TF
BS 653 677 RR2B237TF
BS 678 682 RR2B288TF

RD RR2AG88TF 652 0 0
GGATCACAAGCAACTTCAACACAAAAGCAACTCTCTCTCTCTCTGATAAAAGTCCAAGAA
CACAAAACAAGTCAGCTACTACAATGTCAATCTCAAAAGTCTCTCTCTGCCTGATCTTTC
TCACTTTCCTCACTTCCCCACTTGTGCTCTGCTCTCGCAGCCCAAAAATGGCAGTAACAG
CATCAGCCGCAATAGAGAAGAAGCTACAGAAAACACATGTTCATCCTCCGGTATTACCTG
TTCCTGAATCCACCGAGGTTGATTCATCACCCTCCATGGCCAAGATTGATGATGAACCTG
CAACAAACTCTGTGATATCCGGTTTCTTCAGGTCTAAGTTCCCATTCCAAGGCTGGCCTT
TCCACAAGTATGGCTCTTTCCCTATGGCTAAGCCTGCAAGTCCTTCTGTTCCTACTACAA
CACCGGCTACTGGAGCAGCTGAGGAAGAGGAATCTGAGAAGGTGCCTTCTTCACCAAGCA
AAGGAAACAGAGATGGTGGCAACGCATGATGAAATGAATAACAAGAAAATGTACTAATTA
CTAAAACCGTATTGTGTTTAACGACAGTTGAATCTTTATCCACTAGTTTTACATAAATGT
ATCGAATAAAAATGTATCATGTACTATAAATGCTATGTGACATTTTACATGG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2AG88JQ 600 0 0
GATAAAAGTCCAAGAACACAAAACAAGTCAGCTACTACAATGTCAATCTCAAAAGTCTCT
CTCTGCCTGATCTTTCTCACTTTCCTCACTTCCCCACTTGTGCTCTGCTCTCGCAGCCCA
AAAATGGCAGTAACAGCATCAGCCGCAATAGAGAAGAAGCTACAGAAAACACATGTTCAT
CCTCCGGTATTACCTGTTCCTGAATCCACCGAGGTTGATTCATCACCCTCCATGGCCAAG
ATTGATGATGAACCTGCAACAAACTCTGTGATATCCGGTTTCTTCAGGTCTAAGTTCCCA
TTCCAAGGCTGGCCTTTCCACAAGTATGGCTCTTTCCCTATGGCTAAGCCTGCAAGTCCT
TCTGTTCCTACTACAACACCGGCTACTGGAGCAGCTGAGGAAGAGGAATCTGAGAAGGTG
CCTTCTTCACCAAGCAAAGGAAACAGAGATGGTGGCAACGCATGATGAAATGAATAACAA
GAAAATGTACTAATTACTAAAACCGTATTGTGTTTAACGACAGTTGAATCTTTATCCACT
AGTTTTACATAAATGTATCGAATAAAAATGTATCATGTACTATAAATGCTATGTGACATT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2CI82JQ 604 0 0
GATAAAAGTCCAAGAACACAAAACAAGTCAGCTACTACAATGTCAATCTCAAAAGTCTCT
TTCTGCCTGATCTTTCTCACTTTCCTCACTTCCCCACTTGTGCTCTGCTCTCGCAGCCCA
AAAATGGCAGTAACAGCATCAGCCGCAATAGAGAAGAAGCTACAGAAAACACATGTTCAT
CCTCCGGTATTACCTGTTCCTGAATCCACCGAGGTTGATTCATCACCCTCCATGGCCAAG
ATTGATGATGAACCTGCAACAAACTCTGTGATATCCGGTTTCTTCAGGTCTAAGTTCCCA
TTCCAAGGCTGGCCTTTCCACAAGTATGGCTCTTTCCCTATGGCTAAGCCTGCAAGTCCT
TCTGTTCCTACTACAACACCGGCTACTGGAGCAGCTGAGGAAGAGGAATCTGAGAAGGTG
CCTTCTTCACCAAGCAAAGGAAACAGAGATGGTGGCAACGCATGATGAAATGAATAACAA
GAAAATGTACTAATTACTAAAACCGTATTGTGTTTAACGACAGTTGAATCTTTATCCACT
AGTTTTACATAAATGTATCGAATAAAAATGTATCATGTACTATAAATGCTATGTGACATT
TTAC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2GW81TF 650 0 0
G
GATCACAAGCAACTTCAACACAAAAGCAACTCTCTCTCTCTCTGATAAAAGTCCAAGAAC
ACAAAACAAGTCAGCTACTACAATGTCAATCTCAAAAGTCTCTCTCTGCCTGATCTTTCT
CACTTTCCTCACTTCCCCACTTGTGCTCTGCTCTCGCAGCCCAAAAATGGCAGTAACAGC
ATCAGCCGCAATAGAGAAGAAGCTACAGAAAACACATGTTCATCCTCCGGTATTACCTGT
TCCTGAATCCACCGAGGT*GATTCATCACCCTCCATGGCCAAGATTGATGATGAACCTGC
AACAAACTCTGTGATATCCGGTTTCTTCAGGTCTAAGTTTCCATTCCAAGGCTGGCCTTT
CCACAAGTATGGCTCTTTCCCTATGGCTAAGCCTGCAAGTCCTTCTGTTCCTACTACAAC
ACCGGCTACTGGAGCAGCTGAGGAAGAGGAATCTGAGAAGGTGCCTTCTTCACCAAGCAA
AGGAAACAGAGATGGTGGCAACGCATGATGAAATGAATAACAAGAAAATGTACTAATTAC
TAAAACCGTATTGTGTTTAACGACAGTTGAATCTTTATCCACTAGTTTTACATAAATGTA
TCGAATAAAAATGTATCATGTACTATAAATGCTATGTGACATTTTACAT

QA 2 650 2 650
DS 

RD RR2CI82TF 647 0 0
GATCACAAGCAACTTCAACACAAAAGCAACTCTCTCTCTCTCTGATAAAAGTCCAAGAAC
ACAAAACAAGTCAGCTACTACAATGTCAATCTCAAAAGTCTCTCTCTGCCTGATCTTTCT
CACTTTCCTCACTTCCCCACTTGTGCTCTGCTCTCGCAGCCCAAAAATGGCAGTAACAGC
ATCAGCCGCAATAGAGAAGAAGCTACAGAAAACACATGTTCATCCTCCGGTATTACCTGT
TCCTGAATCCACCGAGGTTGATTCATCACCCTCCATGGCCAAGATTGATGATGAACCTGC
AACAAACTCTGTGATATCCGGTTTCTTCAGGTCTAAGTTCCCATTCCAAGGCTGGCCTTT
CCACAAGTATGGCTCTTTCCCTATGGCTAAGCCTGCAAGTCCTTCTGTTCCTACTACAAC
ACCGGCTACTGGAGCAGCTGAGGAAGAGGAATCTGAGAAGGTGCCTTCTTCACCAAGCAA
AGGAAACAGAGATGGTGGCAACGCATGATGAAATGAATAACAAGAAAATGTACTAATTAC
TAAAACCGTATTGTGTTTAACGACAGTTGAATCTTTATCCACTAGTTTTACATAAATGTA
TCGAATAAAAATGTATCATGTACTATAAATGCTATGTGACATTTTAC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2GW81JQ 188 0 0
TTT
TTCACCAAGCAAAGGAAACAGAGATGGGGGCAACGCATGATGAAATGAATAACAAGAAAA
TGTACTAATTACTAAAACCGTATTGTGTTTAACGACAGTTGAATTTTTATCCACTAGTTT
TACATAAATGTATCGAATAAAAATGTATCATGTACTATAAATGCTATGTGACATTTTACA
TGG
AT

QA 4 186 4 186
DS 

RD RR2B237TF 677 0 0
G
GATCACAAGCAACTTCAACACAAAAGCAACTCTCTCTCTCTCTGATAAAAGTCCAAGAAC
ACAAAACAAGTCAGCTACTACAATGTCAATCTCAAAAGTCTCTCTCTGCCTGATCTTTCT
CACTTTCCTCACTTCCCCACTTGTGCTCTGCTCTCGCAGCCCAAAAATGGCAGTAACAGC
ATCAGCCGCAATAGAGAAGAAGCTACAGAAAACACATGTTCATCCTCCGGTATTACCTGT
TCCTGAATCCACCGAGGTTGATTCATCACCCTCCATGGCCAAGATTGATGATGAACCTGC
AACAAACTCTGTGATATCCGGTTTCTTCAGGTCTAAGTTCCCATTCCAAGGCTGGCCTTT
CCACAAGTATGGCTCTTTCCCTATGGCTAAGCCTGCAAGTCCTTCTGTTCCTACTACAAC
ACCGGCTACTGGAGCAGCTGAGGAAGAGGAATCTGAGATGGTGCCTTCTTCACCAAGCAA
AGGAAACAGAGATGGTGGCAACGCATGATGAAATGAATAACAAGAAAATGTACTAATTAC
TAAAACCGTATTGTGTTTAACGACAGTTGAATCTTTATCCACTAGTTTTACATAAATGTA
TCGAATAAAAATGTATCATGTACTATAAATGCTATGTGACATTTTACATGGATAATGAAA
TGAATACAATCTATCT

QA 2 677 2 677
DS 

RD RR2B288TF 336 0 0
GG
AAGGCTGGCCTTTCCACAAGTATGGCTCTTTCCCTATGGCTAAGCCTGCAAGTCCTTCTG
TTCCTACTACAACACCGGCTACTGGAGCAGCTGAGGAAGAGGAATCTGAGAAGGTGCCTT
CTTCACCAAGCAAAGGAAACAGAGATGGTGGCAACGCATGATGAAATGAATAACAAGAAA
ATGTACTAATTACTAAAACCGTATTGTGTTTAACGACAGTTGAATCTTTATCCACTAGTT
TTACATAAATGTATCGAATAAAAATGTATCATGTACTATAAATGCTATGTGACATTTTAC
ATGGATAATGAAATGAATACAATCTATCTTATCT

QA 3 336 3 336
DS 



AS 1 7

CO CL920Contig1 1415 7 49 U
GGGTTTCCCAACTTCTCTCCACAGAAACACTTGTTCTCTACCATGGCCAAACCGGTGTCT
ATTGAAGTGTATAATCCCAATGGGAAGTACAGAGTCGTCAGCACGAAACCTATGCCTGGT
ACTCGCTGGATCAACCTCTTGGTCGACCAAGGTTGTCGCGTCGAGATATGCCATTTGAAG
AAGACAATCTTGTCTGTAGAAGACATCATTGATCTGATTGGAAACAGGTGTGATGGAGTC
ATCGGCCAGTTGACGGAAGATTGGGGAGAGACACTGTTTTCAGCTCTGAGCAAAGCCGGA
GGGAAAGCTTTCAGCAACATGGCCGTAGGTTACAACAACGTCGATGTTGAAGCCGCCAAT
AAGTATGGTATCGCCGTTGGTAACACTCCTGGAGTGTTGACCGAGACGACCGCTGAACTA
GCTGCTTCTCTTTCTCTTGCTGCTGCAAGAAGGATCGTTGAAGCTGATGGTTTCATGAGA
GGTGGCTTGTACGAGGGTTGGCTTCCTCATCTGTTTGTGGGGAATTTACTAAAAGGACAG
ACCGTGGGGGTTATTGGAGCTGGACGTATTGGGTCTGCCTACGCTAGAATGATGGTTGAA
GGGTTCAAGATGAATTTGATCTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAGAAATTC
GTGACAGCTTATGGACAATTCTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGACATGGAAACGA
GCTTCTTCCATGGAGGAGGTTCTGCGTGAGGCTGATCTGATAAGTCTTCACCCTGTGTTG
GACAAAACCACTTACCATCTTGTCAATAAGGAGAGGCTTGCCATGATGAAAAAGGAAGCA
ATTCTTGTGAACTGCAGTAGAGGTCCTGTGATCGATGAGGCAGCTCTTGTCAATCATCTA
AGAGAGAACCCAATGTTCCGAGTTGGTCTTGATGTGTTTGAGGAAGAGCCATTCATGAAG
CCAGGGCTTGCTGATATGAAGAATGCTATTGTTGTTCCTCACATTGCTTCTGCTTCCAAG
TGGACTCGTGAAGGAATGGCTACGCTTGCAGCTCTCAACGTCGTCGGAAGGATCAAAGGA
TATCCTATTTGGAGTGACCCGAACCGGGTCGACCCGTTCTTGAACGAAAATGCTTCACCG
CCTAATGCCAGCCCAAGCATTGTCAACTCAAAAGCCTTAGGATTGCCTGTGTCGAAGCTG
TGAGTTAAAAGAGTATTATGAAGAAGGGGAAATATGGAAGAATCATTTTAGTAAAATATC
TGATGGTCTCAAGTTGTGTTCATGTAATGTATTGCAAAACAACCATGTTGGATCATAAAT
AACTCTTTTTTTAAGTGTTGTTGAGTAATTTTACTCTTCCTGCTCTTCATATCACGTTTT
ATTTTGGATTTTACATTCATAACCCCTTGCTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 10 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C533TF U 1
AF RR2GJ77TF U 19
AF RR2GG74TF U 41
AF RR2FU19TF U 252
AF RR2FK80JQ C 548
AF RR2FU19JQ C 708
AF RR2GJ77JQB C 1067
BS 1 27 RR2C533TF
BS 28 28 RR2GJ77TF
BS 29 39 RR2C533TF
BS 40 40 RR2GJ77TF
BS 41 83 RR2C533TF
BS 84 84 RR2GJ77TF
BS 85 96 RR2C533TF
BS 97 97 RR2GJ77TF
BS 98 161 RR2C533TF
BS 162 162 RR2GJ77TF
BS 163 182 RR2C533TF
BS 183 183 RR2GJ77TF
BS 184 213 RR2C533TF
BS 214 214 RR2GJ77TF
BS 215 245 RR2C533TF
BS 246 246 RR2GJ77TF
BS 247 296 RR2C533TF
BS 297 297 RR2GJ77TF
BS 298 299 RR2C533TF
BS 300 300 RR2GJ77TF
BS 301 311 RR2C533TF
BS 312 524 RR2GJ77TF
BS 525 525 RR2GG74TF
BS 526 738 RR2GJ77TF
BS 739 739 RR2FU19TF
BS 740 750 RR2GJ77TF
BS 751 751 RR2FU19TF
BS 752 786 RR2GJ77TF
BS 787 788 RR2FU19TF
BS 789 795 RR2GJ77TF
BS 796 796 RR2GG74TF
BS 797 800 RR2GJ77TF
BS 801 801 RR2GG74TF
BS 802 805 RR2GJ77TF
BS 806 806 RR2FU19TF
BS 807 810 RR2GJ77TF
BS 811 811 RR2FU19TF
BS 812 818 RR2GJ77TF
BS 819 944 RR2FU19TF
BS 945 945 RR2FK80JQ
BS 946 982 RR2FU19TF
BS 983 983 RR2FK80JQ
BS 984 995 RR2FU19TF
BS 996 996 RR2FK80JQ
BS 997 1028 RR2FU19TF
BS 1029 1306 RR2FK80JQ
BS 1307 1307 RR2FU19JQ
BS 1308 1374 RR2FK80JQ
BS 1375 1415 RR2GJ77JQB

RD RR2C533TF 311 0 0
GGGTTTCCCAACTTCTCTCCACAGAAAGACTTGTTCTCTGCCATGGCCAAACCGGTGTCT
ATTGAAGTGTATAATCCCAATGGAAAGTACAGAGTCATCAGCACGAAACCTATGCCTGGT
ACTCGCTGGATCAACCTCTTGGTCGACCAAGGTTGTCGCGTAGAGATATGCCATTTGAAG
AAAACAATCTTGTCTGTAGAAGACATCATTGATTTGATTGGAAACAGGTGTGATGGAGTC
ATCGGTCAGTTGACGGAAGATTGGGGAGAGACACTGTTTTCAGCTCTGAGCAAAGCTGGT
GGGAAAGCTTT

QA 1 311 1 311
DS 

RD RR2GJ77TF 816 0 0
GG
ACAGAAACACTTGTTCTCTACCATGGCCAAACCGGTGTCTATTGAAGTGTATAATCCCAA
TGGGAAGTACAGAGTCGTCAGCACGAAACCTATGCCTGGTACTCGCTGGATCAACCTCTT
GGCCGACCAAGGTTGTCGCGTCGAGATATGCCATTTGAAGAAGACAATCTTGTCTGTAGA
AGACATCATTGATCTGATTGGAAACAGGTGTGATGGAGTCATCGGCCAGTTGACGGAAGA
TTGGGGAGAGACACTGTTTTCAGCTCTGAGCAAAGCCGGAGGGAAAGCTTTCAGCAACAT
GGCCGTAGGTTACAACAACGTCGATGTTGAAGCCGCCAATAAGTATGGTATCGCCGTTGG
TAACACTCCTGGAGTGTTGACCGAGACGACCGCTGAACTAGCTGCTTCTCTTTCTCTTGC
TGCTGCAAGAAGGATCGTTGAAGCTGATGGTTTCATGAGAGGTGGCTTGTACGAGGGTTG
GCTTCCTCATCTGTTTGTGGGGAACTTACTAAAAGGACAGACCGTGGGGGTTATTGGAGC
TGGACGTATTGGGTCTGCCTACGCTAGAATGATGGTTGAAGGGTTCAAGATGAATTTGAT
CTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAGAAATTCGTGACAGCTTATGGACAATT
CTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGACATGGAAACGAGCTTCTTCCATGGAGGAG*T
TCTGCGTGAG*CTGATCTGATAAGTCTTCACCCTGTGTTGGACAAA**CACTTAC*ATCT
*GTCA*TAAG*AGAGGCT
TGCCATGATGAAAAGG

QA 3 800 3 800
DS 

RD RR2GG74TF 794 0 0
GG
ATGGCCAAACCGGTGTCTATTGAAGTGTATAATCCCAATGGGAAGTACAGAGTCGTCAGC
ACGAAACCTATGCCTGGTACTCGCTGGATCAACCTCTTGGTCGACCAAGGTTGTCGCGTC
GAGATATGCCATTTGAAGAAGACAATCTTGTCTGTAGAAGACATCATTGATCTGATTGGA
AACAGGTGTGATGGAGTCATCGGCCAGTTGACGGAAGATTGGGGAGAGACACTGTTTTCA
GCTCTGAGCAAAGCCGGAGGGAAAGCTTTCAGCAACATGGCCGTAGGTTACAACAACGTC
GATGTTGAAGCCGCCAATAAGTATGGTATCGCCGCTGGTAACACACCTGGAGTGTTGACC
GAGACGACCGCTGAACTAGCTGCTTCTCTTTCTCTTGCTGCTGCAAGAAGGATCGTTGAA
GCTGATGGTTTCATGAGAGGTGGCTTGTACGAGGGTTGGCTTCATCATCTGTTTGTGGGG
AATTTACTAAAAGGACAGACCGTGGGGGTTATTGGAGCTGGACGTATTGGGTCTGCCTAC
GCTAGAATGATGGTTGAAGGGTTCAAGATGAATTTGATCTACTTTGATCTTTACCAATCC
ACTCGTCTTGAGAAATTCGTGACAGCTTATGGACAATTCTTGAAAGCAAATGGG*AACAA
CCTGTGACATGGAAACGAGCTTCTTCCATGGAG*AG*TTCTGCGTGAG*CTGATCTGATA
AGTCTTCACC*TGTGT*GGACAAA**CACTTACCATCTTGTCA*TAAG*AGAGGCT
GCATGATGAAAAGGAG

QA 3 778 3 778
DS 

RD RR2FU19TF 777 0 0
GACGGAAGATTGGGGAGAGACACTGTTTTCAGCTCTGAGCAAAGCCGGAGGGAAAGCTTT
CAGCAACATGGCCGTAGGTTACAACAACGTCGATGTTGAAGCCGCCAATAAGTATGGTAT
CGCCTTTGGTAACACTCCTGGAGTGTTGACCGAGACGACCGCTGAACTAGCTGCTTCTCT
TTCTCTTGCTGCTGCAAGAAGGATCGTTTAAGCTGATGGTTTCATGAGAGGTGGCTTGTA
CGAGGGTTGGCTTCCTCATCTGTTTGTGGGGAATTTACTAAAAGGACAGACCGTGGGGGT
TATTGGAGCTGGACGTATTGGGTCTGCCTACGCTAGAATGATGGTTGAAGGGTTCAAGAT
GAATTTGATCTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAGAAATTCGTGACAGCTTA
TGGACAATTCTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGACATGGAAACGAGCTTCTTCCAT
GGAGGAGGTTCTGCGTGAGGCTGATCTGATAAGTCTTCACCCTGTGTTGGACAAAACCAC
TTACCATCTTGTCAATAAGGAGAGGCTTGCCATGATGAAAAAGGAAGCAATTCTTGTGAA
CTGCAGTAGAGGTCCTGTGATCGATGAGGCAGCTCTTGTCAATCATCTAAGAGAGAACCC
AATGTTCCGAGTTGGTCTTGATGTGTTTGAGGA*GAGCCATTCATGAAGCCAGGGCTTGC
TGATATGAAGA*TGCTATTGTTGT*CCTCACATTGCTTCTGCTTCCAAGTGGACTCG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2FK80JQ 827 0 0
GGGGTT
TTGGAGCTGGACGTATTGGGTCTGC*TACGCTAGAATGATGGTTGAAGGGTTCAAGATGA
ATTTGATCTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAGAAATTCGTGACAGCTTATG
GACAATTCTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGACATGGAAACGAGCTTCTTCCATGG
AGGAGGTTCTGCGTGAGGCTGATCTGATAAGTCTTCACCCTGTGTTGGACAAAACCACTT
ACCATCTTGTCAATAAGGAGAGGCTTGCCATGATGAAAAAGGAAGCAATTCTTGTGAACT
GCAGTAGAGGTCCTGTGATTGATGAGGCAGCTCTTGTCAATCATCTAAGAGAGAACCCAA
TGTTCCGAGTTGGTCTTGATGTGTTTGAGGAAGAGCCATTCATGAAGCCAGGGCTTGCTG
ATATGAAGAATGCTATTGTTGTTCCTCACATTGCTTCTGCTTCCAAGTGGACTCGTGAAG
GAATGGCTACGCTTGCAGCTCTCAACGTCGTCGGAAGGATCAAAGGATATCCTATTTGGA
GTGACCCGAACCGGGTCGACCCGTTCTTGAACGAAAATGCTTCACCGCCTAATGCCAGCC
CAAGCATTGTCAACTCAAAAGCCTTAGGATTGCCTGTGTCGAAGCTGTGAGTTAAAAGAG
TATTATGAAGAAGGGGAAATATGGAAGAATCATTTTAGTAAAATATCTGATGGTCTCAAG
TTGTGTTCATGTAATGTATTGCAAAACAACCATATTGGATCATAAATAACTCTTTTTTTA
AGTGTTGTTGAGTAATTTTACTCTTCCTGCTCTTCATATCA

QA 7 827 7 827
DS 

RD RR2FU19JQ 645 0 0
GACATGGAAACGAGCTTCTTCCATGGAGGAGGTTCTGCGTGAGGCTGATCTGATAAGTCT
TCACCCTGTGTTGGACAAAACCACTTACCATCTTGTCAATAAGGAGAGGCTTGCCATGAT
GAAAAAGGAAGCAATTCTTGTGAACTGCAGTAGAGGTCCTGTGATCGATGAGGCAGCTCT
TGTCAATCATTTAAGAGAGAACCCAATGTTCCGAGTTGGTCTTGATGTGTTTGAGGAAGA
GCCATTCATGAAGCCAGGGCTTGCTGATATGAAGAATGCTATTGTTGTTCCTCACATTGC
TTCTGCTTCCAAGTGGACTCGTGAAGGAATGGCTACGCTTGCAGCTCTCAACGTCGTCGG
AAGGATCAAAGGATATCCTATTTGGAGTGACCCGAACCGGGTCGACCCGTTCTTGAACGA
AAATGCTTCACCGCCTAATGCCAGCCCAAGCATTGTCAACTCAAAAGCCTTAGGATTGCC
TGTGTCGAAGCTGTGAGTTAAAAGAGTATTATGAAGAAGGGGAAATATGGAAGAATCATT
TTAGTAAAATATCTGATGGTCTCAAGTTGTGTTCATGTAATGTATTGCAAAACAACCATG
TTGGATCATAAATAACTCTTTTTTTAAGTGTTGTTGAGTAATTTT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2GJ77JQB 349 0 0
GAAGGATCAAAGGATATCCTATTTGGAGTGACCCGAACCGGGTTGACCCGTTTTTGAACG
AAAATGCTTCCCCGCCTAATACCAGCCCAAGCATTGTCAACTCAAAAGCCTTAGGATTGC
CTGTGTTGAAGCTGTGAGTTAAAAGAGTTTTATGAAGAAGGGGAAATATGGAAGAATCAT
TTTAGTAAAATATTTGATGGTTTCAAGTTGTGTTCATGTAATGTATTGCAAAACAACCAT
GTTGGATCATAAATAACTTTTTTTTTAAGTGTTGTTGAGTAATTTTACTTTTCCTGCTTT
TCATATCACGTTTTATTTTGGATTTTACATTCATAACCCCTTGCTATAC

QA 1 349 1 349
DS 



AS 2 6

CO CL921Contig1 795 3 12 U
GGACAAAAAAAAAAAAGAGTTCGTAAACATTGTCTGAAGGTATATCAACGAGACAAGAGA
CGAAGAAGCTCGCTCTCTCTAAAAAAAAAACCTAAATTCTGTGAGAGATCGATCAAATCG
GATAGCACGCAATAATGGCCAATAGTAATCTTCCACGAAGGATCATCAAGGAAACTCAAC
GTCTGCTTAGTGAACCTGCTCCTGGGATAAGTGCGTCTCCATCAGAGGAAAATATGCGCT
ACTTCAATGTTATGATTCTTGGTCCTACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGCGTTTTCAAGT
TGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATATCCGATGGCAGCTCCCAAGGTTAGGCTTCTCACCA
AGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTTGGAAGAATCTGCCTTGACATACTGAAAGACA
AGTGGAGTCCTGCTCTACAAATAAGGACCGTGCTCTTGAGTATTCAAGCTCTTCTAAGTG
CACCGAACCCAGATGATCCCCTCTCTGAGAACATAGCTAAGCACTGGAAAAGCAATGAAG
CAGAAGCTGTGGAGACAGCTAAGGAGTGGACTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATATA
GAGTGCAAAAAGGAGAAAGTTCCTTGTCATTTTAAATAACAATCTATATGGTGAAACACT
CTCGTCTCAAGGTTTTATCTAGAATCCTTTTTTTTTCTAAAACAGGAAAGAAAAAGATCT
GTACTCTATGAATATGTATAACTTGGGTGGGTATTTAAGACTCGTTTGCCCATATTTGCA
AACTAACTTATGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA24JQ C 81
AF RR2CL08TF U 1
AF RR2AA24TF U 30
BS 1 111 RR2CL08TF
BS 112 112 RR2AA24TF
BS 113 289 RR2CL08TF
BS 290 290 RR2AA24TF
BS 291 350 RR2CL08TF
BS 351 351 RR2AA24TF
BS 352 563 RR2CL08TF
BS 564 564 RR2AA24TF
BS 565 671 RR2CL08TF
BS 672 672 RR2AA24TF
BS 673 692 RR2CL08TF
BS 693 795 RR2AA24TF

RD RR2AA24JQ 523 0 0
AAAAAAAAAACCTAAATTCTGTGAGAGATCGATCAAATCGGATAGCACGCAATAATGGCC
AATAGTAATCTTCCACGAAGGATCATCAAGGAAACTCAACGTCTGCTTAGTGAACCTGCT
CCTGGGATAAGTGCGTCTCCATCAGAGGAAAATATGCGCTACTTCAATGTTATGATTCTT
GGTCCTACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGCGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAA
GAATATCCGATGGCAGCTCCCAAGGTTAGGCTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATT
GACAAGCTTGGAAGAATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCTCTACAA
ATAAGGACCGTGCTCTTGAGTATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCGAACCCAGATGTTCCC
CTCTCTGAGAACATAGCTAAGCACTGGAAAAGCAATGAAGCAGAAGCTGTGGAGACAGCT
AAGGAGTGGATTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATATAGAG

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2CL08TF 700 0 0
GGACAAAAAAAAAAAAGAGTTCGTAAACATTGTCTGAAGGTATATCAACGAGACAAGAGA
CGAAGAAGCTCGCTCTCTCTAAAAAAAAAACCTAAATTCTGTGAGAGATCGGTCAAATCG
GATAGCACGCAATAATGGCCAATAGTAATCTTCCACGAAGGATCATCAAGGAAACTCAAC
GTCTGCTTAGTGAACCTGCTCCTGGGATAAGTGCGTCTCCATCAGAGGAAAATATGCGCT
ACTTCAATGTTATGATTCTTGGTCCTACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGGGTTTTCAAGT
TGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATATCCGATGGCAGCTCCCAAGGTTAGGTTTCTCACCA
AGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTTGGAAGAATCTGCCTTGACATACTGAAAGACA
AGTGGAGTCCTGCTCTACAAATAAGGACCGTGCTCTTGAGTATTCAAGCTCTTCTAAGTG
CACCGAACCCAGATGATCCCCTCTCTGAGAACATAGCTAAGCACTGGAAAAGCAATGAAG
CAGAAGCTGTGGAGACAGCTAAGTAGTGGACTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATATA
GAGTGCAAAAAGGAGAAAGTTCCTTGTCATTTTAAATAACAATCTATATGGTGAAACACT
CTCGTCTCAAG*TTTTATCTAGAATCCTTTTT
TTTTCTAA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2AA24TF 766 0 0
GG
GTCTGAAGGTATATCAACGAGACAAGAGACGAAGAAGCTCGCTCTCTCTAAAAAAAAAAC
CTAAATTCTGTGAGAGATCGATCAAATCGGATAGCACGCAATAATGGCCAATAGTAATCT
TCCACGAAGGATCATCAAGGAAACTCAACGTCTGCTTAGTGAACCTGCTCCTGGGATAAG
TGCGTCTCCATCAGAGGAAAATATGCGCTACTTCAATGTTATGATTCTTGGTCCTACCCA
GTCTCCTTATGAAGGAGGCGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATATCCGAT
GGCAGCTCCCAAGGTTAGGCTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTTGG
AAGAATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCTCTACAAATAAGGACCGT
GCTCTTGAGTATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCGAACCCAGATGATCCCCTCTCTGAGAA
CATAGCTAAGCACTGGAAAAGCAATGAAGCAGAAGCTGTGGAGACAGCTAAGGAGTGGAC
TCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATATAGAGTGCAAAAAGGAGAAAGTTCCTTGTCATT
TTAAATAACAATCTATATGGTGAAACACTCTCGTCTCAAGGTTTTATCTAGAATCCTTTT
TTTTTCTAAAACAGGAAAGAAAAAGATCTGTACTCTATGAATATGTATAACTTGGGTGGG
TATTTAAGACTCGTTTGCCCATATTTGCAAACTAACTTATGAGC

QA 3 766 3 766
DS 



CO CL921Contig2 784 3 3 U
GGAGCGTTTGACCAACGCGTACGAAAAGATTTGAAGGGCATCTCGGAAAAAAGCCTTTTA
TTTTATTTTACAAAAAGAGTTCGTAAACATTGTCGGAAATTTTATATCGACGAGACGAGA
GACGAAGAAGCTTCTTTAGCTAGAAAAAAAAAAA*GAAAACCTAAATTCTCTGAGAGATC
GATCAAATCGGATAGCACGCAATAATGGCCAATAGTAATCTTCCACGGAGGATCATCAAG
GAAACTCAACGTCTGCTTAGTGAACCTGCTCCTGGGATAAGTGCGTCTCCGTCGGAGGAA
AATATGCGCTACTTCAATGTTATGATTCTTGGTCCTACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGC
GTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATATCCGATGGCAGCTCCCAAGGTTAGA
TTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTTGGAAGAATCTGCCTTGACATA
CTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCTCTACAAATAAGGACCGTGCTCTTGAGTATTCAAGCT
CTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCCCTCTCTGAGAACATAGCTAAGCACTGGAAA
AGCAATGAAGCAGAAGCTGTGGAGACAGCTAAGGAGTGGACTCGTCTATATGCAAGTGGC
GCTTGATATAGAGTGCAAAAAGGAGAAAGTTCCCTGTCATTTTAAATAACAATCTATATG
GTGAAACACTCTCGTCTCAAGTTTTATCTAGAATCCTTTTTCTTTTCTAAAACAGAAAGA
AAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2E473TF U 1
AF RR2CK89TF U 83
AF RR2C638TF U 94
BS 1 610 RR2E473TF
BS 611 738 RR2CK89TF
BS 739 784 RR2C638TF

RD RR2E473TF 610 0 0
GGAGCGTTTGACCAACGCGTACGAAAAGATTTGAAGGGCATCTCGGAAAAAAGCCTTTTA
TTTTATTTTACAAAAAGAGTTCGTAAACATTGTCGGAAATTTTATATCGACGAGACGAGA
GACGAAGAAGCTTCTTTAGCTAGAAAAAAAAAAA*GAAAACCTAAATTCTCTGAGAGATC
GATCAAATCGGATAGCACGCAATAATGGCCAATAGTAATCTTCCACGGAGGATCATCAAG
GAAACTCAACGTCTGCTTAGTGAACCTGCTCCTGGGATAAGTGCGTCTCCGTCGGAGGAA
AATATGCGCTACTTCAATGTTATGATTCTTGGTCCTACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGC
GTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATATCCGATGGCAGCTCCCAAGGTTAGA
TTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTTGGAAGAATCTGCCTTGACATA
CTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCTCTACAAATAAGGACCGTGCTCTTGAGTATTCAAGCT
CTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCCCTCTCTGAGAACATAGCTAAGCACTGGAAA
AGCAATGAAG

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2CK89TF 656 0 0
GG
AAACATTGTCGGAAATTTTATATCGACGAGACGAGAGACGAAGAAGCTTCTTTAGCTAGA
AAAAAAAAAAAGAAAACCTAAATTCTCTGAGAGATCGATCAAATCGGATAGCACGCAATA
ATGGCCAATAGTAATCTTCCACGGAGGATCATCAAGGAAACTCAACGTCTGCTTAGTGAA
CCTGCTCCTGGGATAAGTGCGTCTCCGTCGGAGGAAAATATGCGCTACTTCAATGTTATG
ATTCTTGGTCCTACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGCGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTG
CCTGAAGAATATCCGATGGCAGCTCCCAAGGTTAGATTTCTCACCAAGATATACCATCCT
AACATTGACAAGCTTGGAAGAATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCT
CTACAAATAAGGACCGTGCTCTTGAGTATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGAT
GATCCCCTCTCTGAGAACATAGCTAAGCACTGGAAAAGCAATGAAGCAGAAGCTGTGGAG
ACAGCTAAGGAGTGGACTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATATAGAGTGCAAAAAGGA
GAAAGTTCCCTGTCATTTTAAATAACAATCTATATGGTGAAACACTCTCGTCTC

QA 3 656 3 656
DS 

RD RR2C638TF 691 0 0
CGGAAATTTTATATCGACGAGACGAGAGACGAAGAAGCTTCTTTAGCTAGAAAAAAAAAA
**GAAAACCTAAATTCTCTGAGAGATCGATCAAATCGGATAGCACGCAATAATGGCCAAT
AGTAATCTTCCACGGAGGATCATCAAGGAAACTCAACGTCTGCTTAGTGAACCTGCTCCT
GGGATAAGTGCGTCTCCGTCGGAGGAAAATATGCGCTACTTCAATGTTATGATTCTTGGT
CCTACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGCGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAA
TATCCGATGGCAGCTCCCAAGGTTAGATTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGAC
AAGCTTGGAAGAATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCTCTACAAATA
AGGACCGTGCTCTTGAGTATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCCCTC
TCTGAGAACATAGCTAAGCACTGGAAAAGCAATGAAGCAGAAGCTGTGGAGACAGCTAAG
GAGTGGATTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATATAGAGTGCAAAA*GGAGAAAGTTCC
CTGTCATTTTAAATAACAATCTATATGGTGAAACACTCTCGTCTCAAGTTTTATCTAGAA
TCCTTTTTCTTTTCTAAAACAGAAAGAAAAA

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 7

CO CL922Contig1 571 7 22 U
GGGCCTTCGAGATCTTCACGAAAGGAGCAGAAATGGCGGTCCCGTTGCTAACGAAGAAGG
TGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAATTCATCAGACCCCAGAGTGATCGCAGAATCACCGTCA
AGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGATTCCAGGGTGAGGAGGAAGTTCAAAGGTG
TGACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCGTCACTATCTCCCCA
ACGGATTCAAGAAGTTTGTTGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTACTCATGATGCACA
ACAGGACTTACTGTGCAGAGATTGCTCACAATGTGTCAACAAAGAAGAGGAAAGCCATTG
TGGAGAGAGCTTCCCAGCTTGACATCGTCGTTACCAACAGGCTTGCTAGGTTGCGTAGCC
AGGAAGACGAGTGATGAACGAAAGCCCTTTGTTTCTTTTATCTGTCTTTATTGGCAATTT
CTGAGTTGATCATAACTTCTTTTTGCGGATTAAAATGTTGACTGAATGTTTTTATGGTTT
CTGGTTTTAATACATGACCAATTCACAATCT


BQ
30 30 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 10 10 10 

AF RR2E822TF U 1
AF RR2DM68JQ C 1
AF RR2DM68TF U 1
AF RR2GD43TF U 1
AF RR2AO44JQ C -2
AF RR2GD43JQ C 201
AF RR2AO44TF U -2
BS 1 184 RR2E822TF
BS 185 185 RR2GD43TF
BS 186 307 RR2E822TF
BS 308 308 RR2DM68TF
BS 309 334 RR2E822TF
BS 335 335 RR2GD43TF
BS 336 337 RR2E822TF
BS 338 338 RR2DM68TF
BS 339 355 RR2E822TF
BS 356 356 RR2DM68TF
BS 357 439 RR2E822TF
BS 440 440 RR2DM68TF
BS 441 442 RR2E822TF
BS 443 443 RR2DM68TF
BS 444 466 RR2E822TF
BS 467 467 RR2DM68TF
BS 468 482 RR2E822TF
BS 483 483 RR2DM68TF
BS 484 498 RR2E822TF
BS 499 566 RR2DM68TF
BS 567 568 RR2GD43TF
BS 569 571 RR2AO44JQ

RD RR2E822TF 510 0 0
GGGCCTTCGAGATCTTCACGAAAGGAGCAGAAATGGCGGTCCCGTTGCTAACGAAGAAGG
TGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAATTCATCAGACCCCAGAGTGATCGCAGAATCACCGTCA
AGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGATTCCAGGGTGAGGAGGAAGTTCAAAGGTG
TGACTTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCGTCACTATCTCCCCA
ACGGATTCAAGAAGTTTGTTGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTACTCATGATGCACA
ACAGGACCTACTGTGCAGAGATTGCTCACAATGTATCGACAAAGAAGAGGAAAGCGATTG
TGGAGAGAGCTTCCCAGCTTGACATCGTCGTTACCAACAGGCTTGCTAGGTTGCGTAGCC
AGGAAGACGAGTGATGAACCAACGCCCTTTGTTTCTTTTATCTGTCGTTATTGGCAATTT
CTCAGTTGATCATAACTT
AATTTTTGCGGA

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2DM68JQ 566 0 0
GGGCCTTTGAGATCTTCACGAAAGGAGCAGAAATGGCGGTCCCGTTGCTAACGAAGAAGG
TGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAATTCATCAGACCCCAGAGTGATCGCAGAATCACCGTCA
AGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAAGGTATTGATTCCAGGGTGAGAAGGAAGTTCAAAGGTG
TGACTTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCGTCACTATCTCCCCA
ACGGATTCAAGAAGTTTGTTGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTACTCATGATGCACA
ACAGGACTTACTGTGCAGAGATTGCTCACAATGTATCAACAAAGAAGAGGAAAGCCATTG
TGGAGAGAGCTTCCCAGCTTGACATCGTCGTTACCAACAGGCTTGCTAGGTTGCGTAGCC
AGGAAGACGAGTGATGAACGAAAGCCCTTTGTTTCTTTTATCTGTCTTTATTGGCAATTT
CTGAGTTGATCATAACTTCTTTTTGCGGATTAAAATGTTGACTGAATGTTTTTATGGTTT
CTGGTTTTAATACATGACCAATTCAC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2DM68TF 566 0 0
GGGCCTTTGAGATCTTCACGAAAGGAGCAGAAATGGCGGTCCCGTTGCTAACGAAGAAGG
TGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAATTCATCAGACCCCAGAGTGATCGCAGAATCACCGTCA
AGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAAGGTATTGATTCCAGGGTGAGAAGGAAGTTCAAAGGTG
TGACTTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCGTCACTATCTCCCCA
ACGGATTCAAGAAGTTTGTTGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTACTCATGATGCACA
ACAGGACTTACTGTGCAGAGATTGCTCACAATGTATCAACAAAGAAGAGGAAAGCCATTG
TGGAGAGAGCTTCCCAGCTTGACATCGTCGTTACCAACAGGCTTGCTAGGTTGCGTAGCC
AGGAAGACGAGTGATGAACGAAAGCCCTTTGTTTCTTTTATCTGTCTTTATTGGCAATTT
CTGAGTTGATCATAACTTCTTTTTGCGGATTAAAATGTTGACTGAATGTTTTTATGGTTT
CTGGTTTTAATACATGACCAATTCAC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2GD43TF 570 0 0
GGGCCTTCGAGATCTTCACGAAAGGAGCAGAAATGGCGGTCCCGTTGCTAACGAAGAAGG
TGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAATTCATCAGACCCCAGAGTGATCGCAGAATCACCGTCA
AGGAAAGCTGGAGGAGGCCGAAGGGTATTGATTCCAGGGTGAGGAGGAAGTTCAAAGGTG
TGACCTTGATGCCCAATGTTGGCTACGGATCTGACAAGAAGACCCGTCACTATCTCCCCA
ACGGATTCAAGAAGTTTGTTGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTACTCATGATGCACA
ACAGGACTTACTGTGCAGAGATTGCTCACAATGTGTCAACAAAGAAGAGGAAAGCCATTG
TGGAGAGAGCTTCCCAGCTTGACATCGTCGTTACCAACAGGCTTGCTAGGTTGCGTAGTC
AGGAAGACGAGTGATGAACGAAAGCCCTTTGTTTCTTTTATCTGTCTCTATTGGCAATTT
CTGAGTTGATCATAACTTCTTTTTGCGGATTAAAATGTTGACTGAATGTTTTTATGGTTT
CTGGTTTTAATACATGACCAATTCACAA
GC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2AO44JQ 574 0 0
GGAAC
GCCTTCGAGATCTTCACGAAAGGAGCAGAAATGGCGGTCCCGTTGCTAACGAAGAAGGTG
TTGAAGAAGAGGTCCGCCAAATTCATCAGACCCCAGAGTGATCGCAGAATCACCGTCAAG
GAAAGCTGGAGGAGGCCGAAGGGTATTGATTCCAGGGTGAGGAGGAAGTTCAAAGGTGTG
ACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCGTCACTATCTCCCCAAC
GGATTCAAGAAGTTTGTTGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTACTCATGATGCACAAC
AGGACTTACTGTGCAGAGATTGCTCACAATGTGTCAACAAAGAAGAGGAAAGCCATTGTG
GAGAGAGCTTCCCAGCTTGACATCGTCGTTACCAACAGGCTTGCTAGGGTGCGTAGCCAG
GAAGACGAGTGATGAACGAAAGCCCTTTGTTTCTTTTATCTGTCTTTATTGGCAATTTCT
GAGTTGATCATAACTTCTTTTTGCGGATTAAAATGTTGACTGAATGTTTTTATGGTTTCT
GGTTTTAATACATGACCAATTCACAATCT

QA 6 574 6 574
DS 

RD RR2GD43JQ 370 0 0
GGC
TACGGATCTGACAAGAAGACCCGTCACTATCTCCCCAACGGATTCAAGAAGTTTGTTGTT
CACAACTCTGCTGATCTTGAGTTACTCATGATGCACAACAGGACTTACTGTGCAGAGATT
GCTCACAATGTGTCAACAAAGAAGAGGAAAGCCATTGTGGAGAGAGCTTCCCAGCTTGAC
ATCGTCGTTACCAACAGGCTTGTTAGGTTGCGTAGTCAGGAAGACGAGTGATGAACGAAA
GCCCTTTGTTTCTTTTATCTGTCTCTATTGGCAATTTCTGAGTTGATCATAACTTCTTTT
TGCGGATTAAAATGTTGACTGAATGTTTTTATGGTTTCTGGTTTTAATACATGACCAATT
CACAA
GC

QA 4 368 4 368
DS 

RD RR2AO44TF 574 0 0
GGAAC
GCCTTCGAGATCTTCACGAAAGGAGCAGAAATGGCGGTCCCGTTGCTAACGAAGAAGGTG
TTGAAGAAGAGGTCCGCCAAATTCATCAGACCCCAGAGTGATCGCAGAATCACCGTCAAG
GAAAGCTGGAGGAGGCCGAAGGGTATTGATTCCAGGGTGAGGAGGAAGTTCAAAGGTGTG
ACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACCCGTCACTATCTCCCCAAC
GGATTCAAGAAGTTTGTTGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTACTCATGATGCACAAC
AGGACTTACTGTGCAGAGATTGCTCACAATGTGTCAACAAAGAAGAGGAAAGCCATTGTG
GAGAGAGCTTCCCAGCTTGACATCGTCGTTACCAACAGGCTTGCTAGGGTGCGTAGCCAG
GAAGACGAGTGATGAACGAAAGCCCTTTGTTTCTTTTATCTGTCTTTATTGGCAATTTCT
GAGTTGATCATAACTTCTTTTTGCGGATTAAAATGTTGACTGAATGTTTTTATGGTTTCT
GGTTTTAATACATGACCAATTCACAA
TCT

QA 6 571 6 571
DS 



AS 1 8

CO CL923Contig1 1512 8 26 U
GGAGACAAAATCAAACCTATTTGGACTTTCCTTGTCTTAATCCTCAAAATTTCTTAAAGA
TTTATAGGAAAAACCTCAAAGATTACGGATTAGTTCTATAATCTTATCAAAATCCTTATT
AAAAAGTCGAATTTCTTGCCCTAAACTTTACATCTTCACATTGAAAGATGCAAAATGGGA
AAACCACCTTGTTGTGAAAAGACTGGAGTGAAGAAAGGGCCATGGACACCAGAGGAAGAC
ATCATCTTAGTTTCTTACATCCAAGAACACGGTCCTGGAAACTGGAGATCTGTCCCCACT
AACACAGGTCTGAGGAGATGTAGCAAGAGCTGCAGATTGAGATGGACTAATTATCTTCGA
CCCGGTATCAAACGTGGTAATTTCACTGATCATGAAGAAAAGATGATTGTTCATCTCCAA
GCCCTTTTAGGCAACAGATGGGCAGCCATTGCATCATACCTTCCAGAAAGGACAGACAAT
GATATAAAGAACTATTGGAACACTCACTTGAAGAAGAAGCTCAAGAAGATCAATGAATCT
GG*TGAAGAAGA*TAATGATGTCTTCTCTTCATCAAACACTATTTCACAAAAGCAACATC
AAAGCTCAAACAAAGGTCAATGGG*AGAGAAGACTTCAGACTGATATCAACATGGCAAAG
CAAGCTCTTTCTGAGGCTTT*GTCTTTAGACAAAAAGCCATCATCAACACTTTCTCCATC
ATCATCATCACCAGTAATAATACCACAAAACATCACTAGCTTCTCATCAGTTTTACTTGA
AAGTTGTCATGATCCATCCTCTTTTTCTTCCTCTACCTCAACAATTACCACCACTACTAA
TCTATACCCATCAGGCGTATATGCGTCAAGTGCTGAGAACATCGCTCGGTTGCTTCAAGA
TTTCATGAAAGACACACCAAAACCACTAACTTTGACATCCTCATCACCGGTTTCAGAGAC
CGGACCACTTGCTTCAGCAGCTTCCGAAGAAGGTGGAGAAGGCTTTGAACAATCGTTCTT
TAGCTTCAATTCCATGGAAGAAACTCAAAATCTGACTCATGAGACAAACTTCTTCCATGA
CCAAGAGAGCAAACCGGCAATAACAATGGACCATGATTTTGGTTTGATTTCACAGGGATC
TCTATCTTTGTTGGAGAAATGGCTATTTGACGAAAACATGGTCGGTATGTCGTTAGAAGG
ACAAGAAGCGATTTTCTAGAACTAAATCAGGTGGATTATTTTCTAAAATCGAGGGCTTAA
TTAGTTAAGAGTTATAACAAGTAATATAGAGTTATAACCTATAATATATGTGCTTATTAT
TGCATTAGGGTTTTAGAGTCTTTAGTAGCTTTTTAGCTCTACAATACTCTTTTTCCCTTT
TGGTGATGTAATCTATTTTTCTTATAATTTGTATGTTTCGGAAAGGGTGTATCATCTTTA
TTTAAGTATGTGTAATGTGTTTGTACTCTGTGTCTCATCTGGCCATATGAGTTATATACA
AATGTCTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2A931TF U 1
AF RR2G104TF U 476
AF RR2G087TF U 476
AF RR2BX05TF U 592
AF RR2G087JQ C 1147
AF RR2G104JQ C 1147
AF RR2A931JQ C 643
AF RR2BX05JQ C 840
BS 1 530 RR2A931TF
BS 531 531 RR2G087TF
BS 532 542 RR2A931TF
BS 543 543 RR2G087TF
BS 544 552 RR2A931TF
BS 553 553 RR2G087TF
BS 554 577 RR2A931TF
BS 578 578 RR2G087TF
BS 579 624 RR2A931TF
BS 625 625 RR2G087TF
BS 626 680 RR2A931TF
BS 681 681 RR2G087TF
BS 682 773 RR2A931TF
BS 774 1199 RR2G087TF
BS 1200 1200 RR2BX05TF
BS 1201 1214 RR2G087TF
BS 1215 1215 RR2BX05TF
BS 1216 1230 RR2G087TF
BS 1231 1231 RR2BX05TF
BS 1232 1247 RR2G087TF
BS 1248 1292 RR2BX05TF
BS 1293 1293 RR2A931JQ
BS 1294 1317 RR2BX05TF
BS 1318 1373 RR2A931JQ
BS 1374 1374 RR2BX05JQ
BS 1375 1512 RR2A931JQ

RD RR2A931TF 773 0 0
GGAGACAAAATCAAACCTATTTGGACTTTCCTTGTCTTAATCCTCAAAATTTCTTAAAGA
TTTATAGGAAAAACCTCAAAGATTACGGATTAGTTCTATAATCTTATCAAAATCCTTATT
AAAAAGTCGAATTTCTTGCCCTAAACTTTACATCTTCACATTGAAAGATGCAAAATGGGA
AAACCACCTTGTTGTGAAAAGACTGGAGTGAAGAAAGGGCCATGGACACCAGAGGAAGAC
ATCATCTTAGTTTCTTACATCCAAGAACACGGTCCTGGAAACTGGAGATCTGTCCCCACT
AACACAGGTCTGAGGAGATGTAGCAAGAGCTGCAGATTGAGATGGACTAATTATCTTCGA
CCCGGTATCAAACGTGGTAATTTCACTGATCATGAAGAAAAGATGATTGTTCATCTCCAA
GCCCTTTTAGGCAACAGATGGGCAGCCATTGCATCATACCTTCCAGAAAGGACAGACAAT
GATATAAAGAACTATTGGAACACTCACTTGAAGAAGAAGCTCAAGAAGATGAATGAATCT
GGGTGAAGAAGAATAATGATGTCTTCTCTTCATCAAAGACTATTTCACAAAAGCAACATC
AAAGCTCAAACAAAGGTCAATGGGGAGAGAAGACTTCAGACTGATATCAACATGGCAAAG
CAAGCTCTTTCTGAGGCTTTTGTCTTTAGACAAAAAGCCATCATCAACACTTTCTCCATC
ATCATCATCACCAGTAATAATACCACAAAACATCACTAGCTTCTCATCAGTTT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2G104TF 523 0 0
G
CAATGATATAAAGAACTATTGGAACACTCACTTGAAGAAGAAGCTCAAGAAGATCAATGA
ATCTGG*TGAAGAAGA*TAATGATGTCTTCTCTTCATCAAACACTATTTCACAAAAGCAA
CATCAAAGCTCAAACAAAGGTCAATGGG*AGAGAAGACTTCAGACTGATATCAACATGGC
AAAGCAAGCTCTTTCTGAGGCTTT*GTCTTTAGACAAAAAGCCATCATCAACACTTTCTC
CATCATCATCATCACCAGTAATAATACCACAAAACATCACTAGCTTCTCATCAGTTTTAC
TTGAAAGTTGTCATGATCCATCCTCTTTTTCTTCCTCTACCTCAACAATTACCACCACTA
CTAATCTATACCCATCAGGCGTATATGCGTCAAGTGCTGAGAACATCGCTCGGTTGCTTC
AAGATTTCATGAAAGACACACCAAAACCACTAACTTTGACATCCTCATCACCGGTTTCAG
AGACCGGACCACTTGCTTCAGCAGCTTCCGAAGAAGGTGGAG

QA 2 523 2 523
DS 

RD RR2G087TF 773 0 0
G
CAATGATATAAAGAACTATTGGAACACTCACTTGAAGAAGAAGCTCAAGAAGATCAATGA
ATCTGG*TGAAGAAGA*TAATGATGTCTTCTCTTCATCAAACACTATTTCACAAAAGCAA
CATCAAAGCTCAAACAAAGGTCAATGGG*AGAGAAGACTTCAGACTGATATCAACATGGC
AAAGCAAGCTCTTTCTGAGGCTTT*GTCTTTAGACAAAAAGCCATCATCAACACTTTCTC
CATCATCATCATCACCAGTAATAATACCACAAAACATCACTAGCTTCTCATCAGTTTTAC
TTGAAAGTTGTCATGATCCATCCTCTTTTTCTTCCTCTACCTCAACAATTACCACCACTA
CTAATCTATACCCATCAGGCGTATATGCGTCAAGTGCTGAGAACATCGCTCGGTTGCTTC
AAGATTTCATGAAAGACACACCAAAACCACTAACTTTGACATCCTCATCACCGGTTTCAG
AGACCGGACCACTTGCTTCAGCAGCTTCCGAAGAAGGTGGAGAAGGCTTTGAACAATCGT
TCTTTAGCTTCAATTCCATGGAAGAAACTCAAAATCTGACTCATGAGACAAACTTCTTCC
ATGACCAAGAGAGCAAACCGGCAATAACAATGGACCATGATTTTGGTTTGATTTCACAGG
GATCTCTATCTTTGTTGGAGAAATGGCTATTTGACGAAAACATGGTCGGTATGTCGTTAG
AAG*ACAAGAAGCGATTT*CTAGAACTAAATCAG*TGGATTATTTTCTAAA
T

QA 2 772 2 772
DS 

RD RR2BX05TF 732 0 0
G
GCAACATCAAAGCTCAAACAAAGGTCAATGGG*AGAGAAGACTTCAGACTGATATCAACA
TGGCAAAGCAAGCTCTTTTTGAGGCTTT*GTCTTTAGACAAAAAGCCATCATCAACACTT
TCTCCATCATCATCATCACCAGTAATAATACCACAAAACATCACTAGCTTCTCATCAGTT
TTACTTGAAAGTTGTCATGATCCATCCTCTTTTTCTTCCTCTACCTCAACAATTACCACC
ACTACTAATCTATACCCATCAGGCGTATATGCGTCAAGTGCTGAGAACATCGCTCGGTTG
CTTCAAGATTTCATGAAAGACACACCAAAACCACTAACTTTGACATCCTCATCACCGGTT
TCAGAGACCGGACCACTTGCTTCAGCAGCTTCCGAAGAAGGTGGAGAAGGCTTTGAACAA
TCGTTCTTTAGCTTCAATTCCATGGAAGAAACTCAAAATCTGACTCATGAGACAAACTTC
TTCCATGACCAAGAGAGCAAACCGGCAATAACAATGGACCATGATTTTGGTTTGATTTCA
CAGGGATCTCTATCTTTGTTGGAGAAATGGCTATTTGACGAAAACATGGTCGGTATGTCG
TTAGAAGGACAAGAAGCGATTTTCTAGAACTAAATCAGGTGGATTATTTTCTAAAATCGA
GGGCTTAATTAGTTAAGAGTTATAACAAGTAATATAGAGT*ATAACCTATAATATATGTG
CTTAT
ATTGCA

QA 2 726 2 726
DS 

RD RR2G087JQ 280 0 0
TTTGTTGGAGAAATGGCTATTTGACGAAAACATGGTCGGTATGTCGTTAGAAGGACAAGA
AGCGATTTTTTAGAACTAAATCAGGTGGATTATTTTTTAAAATCGAGGGCTTAATTAGTT
AAGAGTTATAACAAGTAATATAGAGTTATAACCTATAATATATGTGCTTATTATTGCATT
AGGGTTTTAGAGTCTTTAGTAGCTTTTTAGCTTTACAATACTCTTTTTCCCTTTTGGTGA
TGTAATTTATTTTTTTTATAATTTGTATGTTTCGGAAAGG

QA 1 280 1 280
DS 

RD RR2G104JQ 280 0 0
TTTGTTGGAGAAATGGCTATTTGACGAAAACATGGTCGGTATGTCGTTAGAAGGACAAGA
AGCGATTTTTTAGAACTAAATCAGGTGGATTATTTTTTAAAATCGAGGGCTTAATTAGTT
AAGAGTTATAACAAGTAATATAGAGTTATAACCTATAATATATGTGCTTATTATTGCATT
AGGGTTTTAGAGTCTTTAGTAGCTTTTTAGCTTTACAATACTTTTTTTCCCTTTTGGGGA
TGTAATTTATTTTTTTTATAATTTGTATGTTTCGGAAAGG

QA 1 280 1 280
DS 

RD RR2A931JQ 870 0 0
GATATCAACATGGCAAAGCAAGCTCTTTCTGAGGCTTT*GTCTTTAGACAAAAAGCCATC
ATCAACACTTTCTCCATCATCATCATCACCAGTAATAATACCACAAAACATCACTAGCTT
CTCATCAGTTTTACTTGAAAGTTGTCATGATCCATCCTCTTTTTCTTCCTCTACCTCAAC
AATTACCACCACTACTAATCTATACCCATCAGGCGTATATGCGTCAAGTGCTGAGAACAT
CGCTCGGTTGCTTCAAGATTTCATGAAAGACACACCAAAACCACTAACTTTGACATCCTC
ATCACCGGTTTCAGAGACCGGACCACTTGCTTCAGCAGCTTCCGAAGAAGGTGGAGAAGG
CTTTGAACAATCTTTCTTTAGCTTCAATTCCATGGAAGAAACTAAAAATCTGACTCATGA
AACAAACTTCTTCCATGACCAAAAGAGCAAACCGGCAATAACAATGGACCATGATTTTGG
TTTGATTTCACAGGGATCTCTATCTTTGTTGGAGAAATGGCTATTTGACGAAAACATGGT
CGGTATGTCGTTAGAAGGACAAGAAGTGATTTTCTAGAACTAAATCAGGTGGATTATTTT
CTAAAATCGAGGGCTTAATTAGTTAAGAGTTATAACAAGTAATATAGAGTTATAACCTAT
AATATATGTGCTTATTATTGCATTAGGGTTTTAGAGTCTTTAGTAGCTTTTTAGCTCTAC
AATACTCTTTTCCCCTTTTGGTGATGTAATCTATTTTTCTTATAATTTGTATGTTTCGGA
AAGGGTGTATCATCTTTATTTAAGTATGTGTAATGTGTTTGTACTCTGTGTCTCATCTGG
CCATATGAGTTATATACAAATGTCTTTTTC

QA 1 870 1 870
DS 

RD RR2BX05JQ 673 0 0
ATCTATACCCATCAGGCGTATATGCGTCAAGTGCTGAGAACATCGCTCGGTTGCTTCAAG
ATTTCATGAAAGACACACCAAAACCACTAACTTTGACATCCTCATCACCGGTTTCAGAGA
CCGGACCACTTGCTTCAGCAGCTTCCGAAGAAGGTGGAGAAGGCTTTGAACAATCGTTCT
TTAGCTTCAATTCCATGGAAGAAACTCAAAATTTGACTCATGAGACAAACTTCTTCCATG
ACCAAGAGAGCAAACCGGCAATAACAATGGACCATGATTTTGGTTTGATTTCACAGGGAT
CTCTATCTTTGTTGGAGAAATGGCTATTTGACGAAAACATGGTCGGTATGTCGTTAGAAG
GACAAGAAGCGATTTTCTAGAACTAAATCAGGTGGATTATTTTCTAAAATCGAGGGCTTA
ATTAGTTAAGAGTTATAACAAGTAATATAGAGTTATAACCTATAATATATGTGCTTATTA
TTGCATTAGGGTTTTAGAGTCTTTAGTAGCCTTTTAGCTCTACAATACTCTTTTTCCCTT
TTGGTGATGTAATCTATTTTTCTTATAATTTGTATGTTTCGGAAAGGGTGTATCATCTTT
ATTTAAGTATGTGTAATGTGTTTGTACTCTGTGTCTCATCTGGCCATATGAGTTATATAC
AAATGTCTTTTTC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 6

CO CL924Contig1 967 6 22 U
AGGGGATTGACGAAGGAAAAGAGAATAATCCCTTTTCCGCGTTTCCTGACCAAAAGTTCC
ATAACTGAGATTTGTTCCAACTCC*GATCGTAGGTTTCGCTGATTCGAGTTCGCGTCAAA
ATCCTATTCAAAGTTTCGAGATTTCGATCATGATGAATTCCATCTTCGGAAAGCGGAAAA
CTCCTGCAGAACTACTGCGGGAAAACAAGAGGATGCTTGATAAGTCAATCAGAGACATTG
AGAGGGAGAGACAAGGCCTTCAAACACAAGAGAAAAAACTTATTACCGAGATTAAAAAGA
CCGCAAAGCAGGGCCAGATGGGAGCTGTGAAAGTAATGGCAAAGGACCTTATCAGAACAC
GGCACCAGATTGAGAAGTTTTACAAGCTTAAATCCCAACTCCAAGGTGTTTCTCTCAGGA
TCCAGACTTTAAAATCAACACAAGCAATGGGAGAGGCAATGAAAGGTGTGACTAAAGCAA
TGGGTCAAATGAACAGGCAGATGAATCTGCCTTCTCTGCAGAAAATCATGCAAGAGTTTG
AGAGGCAGAACGAGAAAATGGAGATGGTCTCTGAGGTGATGGGAGATGCTATTGATGATG
CCTTGGAAGGAGATGAGGAAGAGGAAGAGACTGAAGATCTTGTTAGCCAAGTCCTTGACG
AGATCGGTATCGATATCAACCAAGAGCTGGTGAATGCTCCATCTGGTGCGGTGGCAGCAC
CAGCAGGAAAGAACAAGGTTGTGCAAGCTGAGGCGGCAGGAGCTGAGGACGGTGGGGGAA
TAGATAGTGATCTTCAGGCAAGGTTAGACAACCTTCGAAAAATGTGAGGCTTTCCCGGTT
TCTGTATAATATTGTTGAACTGTTACCCGATTATTACTTTTAAACTCCAAAGGAATATGT
GGCAAGATATGGTTACGTTTTGAGGGTGGGTTTGTAATAATTTCATAATTTGAGCCCCTG
AATTTAC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2G288TF U 1
AF RR2EJ36TF U 3
AF RR2H291TF U 59
AF RR2DF88TF U 490
AF RR2DF88JQ C 190
AF RR2EJ36JQ C 410
BS 1 208 RR2G288TF
BS 209 209 RR2EJ36TF
BS 210 316 RR2G288TF
BS 317 317 RR2EJ36TF
BS 318 335 RR2G288TF
BS 336 336 RR2EJ36TF
BS 337 349 RR2G288TF
BS 350 350 RR2H291TF
BS 351 445 RR2G288TF
BS 446 446 RR2EJ36TF
BS 447 575 RR2G288TF
BS 576 576 RR2EJ36TF
BS 577 609 RR2G288TF
BS 610 752 RR2EJ36TF
BS 753 805 RR2DF88JQ
BS 806 806 RR2EJ36JQ
BS 807 848 RR2DF88JQ
BS 849 849 RR2EJ36JQ
BS 850 858 RR2DF88JQ
BS 859 860 RR2EJ36JQ
BS 861 891 RR2DF88JQ
BS 892 967 RR2EJ36JQ

RD RR2G288TF 612 0 0
AGGGGATTGACGAAGGAAAAGAGAATAATCCCTTTTCCGCGTTTCCTGACCAAAAGTTCC
ATAACTGAGATTTGTTCCAACTCC*GATCGTAGGTTTCGCTGATTCGAGTTCGCGTCAAA
ATCCTATTCAAAGTTTCGAGATTTCGATCATGATGAATTCCATCTTCGGAAAGCGGAAAA
CTCCTGCAGAACTACTGCGGGAAAACAATAGGATGCTTGATAAGTCAATCAGAGACATTG
AGAGGGAGAGACAAGGCCTTCAAACACAAGAGAAAAAACTTATTACCGAGATTAAAAAGA
CCGCAAAGCAGGGCCAAATGGGAGCTGTGAAAGTATTGGCAAAGGACCTCATCAGAACAC
GGCACCAGATTGAGAAGTTTTACAAGCTTAAATCCCAACTCCAAGGTGTTTCTCTCAGGA
TCCAGACTTTAAAATCAACACAAGCGATGGGAGAGGCAATGAAAGGTGTGACTAAAGCAA
TGGGTCAAATGAACAGGCAGATGAATCTGCCTTCTCTGCAGAAAATCATGCAAGAGTTTG
AGAGGCAGAACGAGAAAATGGAGATGGTCTCTGAG*TGATGGGAGATGCTATTGATGATG
CCTTGGAAG
AGA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2EJ36TF 752 0 0
GGGATTGACGAAGGAAAAGAGAATAATCCCTTT*CCGCGTTTCCTGACCAAAAGTTTCAT
AACTGAGATTTGTTCCAACTCCCGATCGTAGGTTTCGCTGATTCGAGTTCGCGTCAAAAT
CCTATTCAAAGTTTCGAGATTTCGATCATGATGAATTCCATCTTCGGAAAGCGGAAAACT
CCTGCAGAACTACTGCGGGAAAACAAGAGGATGCTTGATAAGTCAATCAGAGACATTGAG
AGGGAGAGGCAAGGCCTTCAAACACAAGAGAAGAAACTTATTACCGAGATTAAGAAGACC
GCAAAGCAGGGCCAGATGGGAGCTGTGAAAGTAATGGCAAAGGACCTCATCAGAACACGG
CACCAGATTGAGAAGTTTTACAAGCTTAAATCCCAGCTCCAAGGTGTTTCTCTCAGGATC
CAGACTTTAAAATCAACACAAGCAATGGGAGAGGCAATGAAAGGTGTGACTAAAGCAATG
GGTCAAATGAACAGGCAGATGAATCTGCCTTCTCTGCAGAAAATCATGCAAGAGTTTGAG
AGGCAGAACGAGAAAATGGAGATGGTCTCTGAGGTGATGGGAGGTGCTATTGATGATGCC
TTGGAAGGAGATGAGGAAGAGGAAGAGACTGAAGATCTTGTTAGCCAAGTCCTTGACGAG
ATCGGTATCGATATCAACCAAGAGCTGGTGAATGCTCCATCTGGTGCGGTGGCAGCACCA
GCAGGAAAGAACAAGGTTGTGCAAGCTGAG
CG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2H291TF 692 0 0
GG
ATAACTGAGATTTGTTCCAACTCC*GATCGTAGGTTTCGCTGATTCGAGTTCGCGTCAAA
ATCCTATTCAAAGTTTCGAAATTTCGATCATGATGAATTCCATCTTCGGAAAGCGGAAAA
CTCCTGCAGAACTACTGCGGGAAAACAAGAGGATGCTTGATAAGTCAATCAGAGACATTG
AGAGGGAGAGACAAGGCCTTCAAACACAAGAGAAAAAACTTATTACCGAGATTAAAAAGA
CCGCAAAGCAGGGCCAAATGGGAGCTGTGAAAGTAATGGCAAAGGACCTTATCAGAACAC
GGCACCAGATTGAGAAGTTTTATAAGCTCAAATCCCAACTCCAAGGTGTTTCTCTCAGGA
TTCAGACTTTAAAATCAACACAAGCAATGGGAGAGGCAATGAAAGGTGTGACTAAAGCAA
TGGGTCAAATGAACAGGCAGATGAATCTGCCTTCTCTGCAGAAAATCATGCAAGAGTTTG
AGAGGCAGAACGAGAAAATGGAGATGGTCTCTGAGGTGATGGGAGATGCTATTGATGCTG
CCTTGTAAGGAGATGAGGAAGAGGAAGAGACTGAAGATCTTGTTAGCCAAGTCCTTGACG
AGATCGGTATCGATATCAACCAAGAGCTGGTGAATGCTCCATCTGGTGCGGTGGCAGCAC
CAGCAGCAAAGAACAAG*TTGTGCAAGCTG

QA 3 692 3 692
DS 

RD RR2DF88TF 233 0 0
TGAACAGGCAGATGAATCTGCCTTCTCTGCAGAAAATCATGCAAGAGTTTGAGAGGCAGA
ACGAGAAAATGGAGATGGTCTCCGAGGTGATGGGTGATGCTATTGATGATGCCTTGGAAG
GAGACGAGGAAGAGGAAGAGACTGAAGATCTTGTTAGCCAAGTTCTTGATGAGATCGGTA
TCGATATCAACCAAGAGCTTGTGAATGCTCCATCTGGTGCGGTGGCAGCACCA

QA 1 233 1 233
DS 

RD RR2DF88JQ 721 0 0
AACTACTGCGGGAAAACAAGAGGATGCTCGATAAGTCAATCAGAGACATTGAGAGGGAGA
GACAAGGCCTTCAAACACAAGAGAAAAAACTTATTACCGAGATTAAAAAGACCGCAAAGC
AGGGCCAGATGGGAGCTGTGAAAGTGATGGCAAAGGACCTTATCAGAACACGACATCAGA
TTGAGAAGTTTTACAAGCTTAAATCCCAACTCCAAGGAGTTTCTCTCAGGATCCAGACTT
TAAAATCAACACAAGCAATGGGTGAGGCAATGAAAGGTGTGACTAAAGCAATGGGGCAAA
TGAACAGGCAGATGAATCTGCCTTCTCTGCAGAAAATCATGCAAGAGTTTGAGAGGCAGA
ACGAGAAAATGGAGATGGTCTCCGAGGTGATGGGTGATGCTATTGATGATGCCTTGGAAG
GAGACGAGGAAGAGGAAGAGACTGAAGATCTTGTTAGCCAAGTTCTTGATGAGATCGGTA
TCGATATCAACCAAGAGCTTGTGAATGCTCCATCTGGTGCGGTGGCAGCACCAGCAGGAA
AGAACAAGGTGGTGCAAGCTGAGGCGGCAGGAGCTGAGGACGGTGGGGGAATAGATAGTG
ATCTTCAGGCAAGGTTGGACAACCTTCGAAAAATGTGAGGCTTTCCCGGTTTCTGTATAT
TATTGTTGACTTGTTACCCGATTATTACTTTTAAACTCCAAA
AGGAATATGTTTGAAACCA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2EJ36JQ 558 0 0
TTCTCTCAGGATCCAGACTTTAAAATCAACACAAGCAATGGGAGAGGCAATGAAAGGTGT
GACTAAAGCAATGGGTCAAATGAACAGGCAGATGAATCTGCCTTCTCTGCAGAAAATCAT
GCAAGAGTTTGAGAGGCAGAACGAGAAAATGGAGATGGTTTCTGAGGTGATGGGAGGTGC
TATTGATGATGCCTTGGAAGGAGATGAGGAAGAGGAAGAGACTGAAGATCTTGTTAGCCA
AGTCCTTGACGAGATCGGTATCGATATCAACCAAGAGCTGGTGAATGCTCCATCTGGTGC
GGTGGCAGCACCAGCAGGAAAGAACAAGGTTGTGCAAGCTGAGGCGGCAGGAGCTGAGGA
CGGTGGGGGAATAGATAGTGATCTTCAGGCAAGGTTAGACAACCTTCGGAAAATGTGAGG
CTTTCCCGGTTTCTGTATAATATTGTTTGACTGTTACCCGATTATTACTTTTAAACTCCA
AAGGAATATGTGGCAAGATATGGTTACGTTTTGAGGGTGGGTTTGTAATAATTTCATAAT
TTGAGCCCCTGAATTTAC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 8

CO CL925Contig1 658 8 47 U
AGAAGGAAACATTATTCTTTATTTAGATATATAACAAGTAGAAGGGATAAACAATCTAAG
GATCGATGACCTTCTACGTCACATAGAAAACCAGGAAATAGAACAAGAGTCTAGCATTTT
GTCACATACACGACAATTATTGAAAACAAGGAGAACAACAACACATACAATACATAGATT
GTGGATATGCTTCTTAGGCAGTGTCAACTGCATTAGCTGAGCCCTTGGTGCAGAAATCAG
AACATGCGTTGGTGCATTGTGCAACCGCACCATTCACAATTTCACTTGCAGCCAAGTCCT
GGAGAGTGGCTAAGTCACTGCACACAGAGGATGCACAACCCAGCTTGCAGTATCCACTCA
CAGTATTACCAGAGTTTCCGAAATGGCCATATGGATATCCTGAAGGACATATCGTCTCAG
GAACGATTATGCATCCATTAAGTTGTGCACAAGTCGCCGTCGCTTTAGTACGATTACATA
CATAAAATGCTAATCTGGCTTCCTTGCTCGGGCAACAAACCTTCGCTTCGACTTGATTAT
GGGCCATGACAAAAATCATTATGAGCACACTTAAAATCACAGTTTTGCCTTCCATCTTAA
CACTGATTACTTGTATGGTCACAAAATGTATTTAGAGATTACAAACTTGTATTGATCC


BQ
10 10 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 25 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 0 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 

AF RR2EB71JQ U 23
AF RR2C329JQ U 3
AF RR2C329TF C 3
AF RR2EB71TF C 1
AF RR2BR64JQ U 3
AF RR2BR64TF C 3
AF RR2AX66JQ U 2
AF RR2AX66TFB C 2
BS 1 2 RR2EB71TF
BS 3 22 RR2BR64JQ
BS 23 40 RR2EB71JQ
BS 41 41 RR2BR64JQ
BS 42 58 RR2EB71JQ
BS 59 59 RR2BR64JQ
BS 60 85 RR2EB71JQ
BS 86 86 RR2BR64JQ
BS 87 100 RR2EB71JQ
BS 101 101 RR2BR64JQ
BS 102 111 RR2EB71JQ
BS 112 112 RR2BR64JQ
BS 113 127 RR2EB71JQ
BS 128 128 RR2BR64JQ
BS 129 192 RR2EB71JQ
BS 193 193 RR2BR64JQ
BS 194 220 RR2EB71JQ
BS 221 221 RR2BR64JQ
BS 222 232 RR2EB71JQ
BS 233 233 RR2BR64JQ
BS 234 239 RR2EB71JQ
BS 240 240 RR2BR64JQ
BS 241 246 RR2EB71JQ
BS 247 247 RR2BR64JQ
BS 248 303 RR2EB71JQ
BS 304 304 RR2BR64JQ
BS 305 313 RR2EB71JQ
BS 314 314 RR2BR64JQ
BS 315 356 RR2EB71JQ
BS 357 357 RR2BR64JQ
BS 358 358 RR2EB71JQ
BS 359 359 RR2BR64JQ
BS 360 371 RR2EB71JQ
BS 372 372 RR2BR64JQ
BS 373 373 RR2EB71JQ
BS 374 374 RR2BR64JQ
BS 375 428 RR2EB71JQ
BS 429 429 RR2BR64JQ
BS 430 455 RR2EB71JQ
BS 456 456 RR2BR64JQ
BS 457 461 RR2EB71JQ
BS 462 462 RR2BR64JQ
BS 463 470 RR2EB71JQ
BS 471 513 RR2BR64JQ
BS 514 514 RR2C329JQ
BS 515 653 RR2BR64JQ
BS 654 658 RR2AX66JQ

RD RR2EB71JQ 448 0 0
TTAGATATATAACAAGTAAAAGGGATAAACAATCTAGGGATCGATGACCTTCTACGTCAC
ATAAAAAACCAGGAAATAAAACAAGAGTCCAGCATTTTGTCACATGCACGACAATTATTG
AAAACAAGGAGAACAACAACACATACAATACATAGATTGTGGATATGCTTTTTAGGCAGT
GTCAACTGCATTAGCTGAACCCTTGGTGCAAAAATCAAAACATGAGTTGGTGCATTGTGC
AACCGCACCATTCACAATTTCACTTGCAGCCAAGTCCTGGAAAGTGGCTAAATCACTGCA
CACAGAGGATGCACAACCCAGCTTGCAGTATCCATTGACAGTATTACCAAAATTTCCGAA
ATGGCCATATGGATATCCTGAAGGACATATCGTCTCAGGAACGATTTTGCATCCATTAAG
TTGTGCACAAGTCCCCGTCCCTTTAGTA

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR2C329JQ 598 0 0
AAGGAAACATTATTCTTTATTTAGATATATAACAAGTAGAAGGGATAAACAATCTAAGGA
TCGATGACCTTCTACGTCACATAGAAAACCAGGAAATAGAACAAGAGTCTAGCATTTTGT
CACATACACGACAATTATTGAAAACAAGGAGAACAACAACACATACAATACATAGATTGT
GGATATGCTTCTTAGGCAGTGTCAACTGCATTAGCTGAGCCCTTGGTGCAAAAATCAAAA
CATGCGTTGGTGCATTGTGCAACCGCACCATTCACAATTTCACTTGCAGCGAAGTCCTGG
AGAGTGGCTAAGTCACTGCACACAGAGGATGCACAACCCAGCTTGCAGTATCCACTCACA
GTATTACCAGAGTTTCCGAAATGGCCATATGGATATCCTGAAGGACATATCGTCTCAGGA
ACGATTATGCATCCATTAAGTTGTGCACAAGTCGCCGTCGCTTTAGTACGATTACATACA
TAAAATGCTAATCTGGCTTCCTTGCTCGGGCAACAAACCTTCGCTTCGACTTGATTATGG
GCCATGACAAAAATCATTATGAGCACACTTAAAATCACAGTTTTGCCTTCCATCTTA
C

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2C329TF 569 0 0
AAGGAAACATTATTCTTTATTTAGATATATAACAAGTAGAAGGGATAAACAATCTAAGGA
TCGATGACCTTCTACGTCACATAGAAAACCAGGAAATAGAACAAGAGTCTAGCATTTTGT
CACATACACGACAATTATTGAAAACAAGGAGAACAACAACACATACAATACATAGATTGT
GGATATGCTTCTTAGGCAGTGTCAACTGCATTAGCTGAGCCCTTGGTGCAGAAATCAGAA
CATGCGTTGGTGCATTGTGCAACCGCACCATTCACAATTTCACTTGCAGCGAAGTCCTGG
AGAGTGGCTAAGTCACTGCACACAGAGGATGCACAACCCAGCTTGCAGTATCCACTCACA
GTATTACCAGAGTTTCCGAAATGGCCATATGGATATCCTGAAGGACATATCGTCTCAGGA
ACGATTATGCATCCATTAAGTTGTGCACAAGTCGCCGTCGCTTTAGTACGATTACATACA
TAAAATGCTAATCTGGCTTCCTTGCTCGGGCAACAAACCTTCGCTTCGACTTGATTATGG
GCCATGACAAAA*TCATTATGAGCACACT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2EB71TF 658 0 0
AGAAGGAAACATTATTCTTTATTTAGATATATAACAAGTAGAAGGGATAAACAATCTAGG
GATCGATGACCTTCTACGTCACATAGAAAACCAGGAAATAGAACAAGAGTCCAGCATTTT
GTCACATGCACGACAATTATTGAAAACAAGGAGAACAACAACACATACAATACATAGATT
GTGGATATGCTTTTTAGGCAGTGTCAACTGCATTAGCTGAGCCCTTGGTGCAGAAATCAG
AACATGAGTTGGTGCATTGTGCAACCGCACCATTCACAATTTCACTTGCAGCCAAGTCCT
GGAGAGTGGCTAAGTCACTGCACACAGAGGATGCACAACCCAGCTTGCAGTATCCATTGA
CAGTATTACCAGAGTTTCCGAAATGGCCATATGGATATCCTGAAGGACATATCGTCTCAG
GAACGATTTTGCATCCATTAAGTTGTGCACAAGTCGCCGTCGCTTTAGTACGATTACATA
CATAAAATGCTAATCTGGCTTCCTTGCTCGGGCAACAAACCTTCGCTTCGACTTGATTAT
GGGCCATGACAAAAATCATTATGAGCACACTTAAAATCACAGTTTTGCCTTCCATCTTAA
CACTGATTACTTGTATGGTCACAAAATGTATTTAGAGATTACAAACTTGTATT
GATCC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2BR64JQ 653 0 0
AAGGAAACATTATTCTTTATTTAGATATATAACAAGTAGAAGGGATAAACAATCTAAGGA
TCGATGACCTTCTACGTCACATAGAAAACCAGGAAATAGAACAAGAGTCTAGCATTTTGT
CACATACACGACAATTATTGAAAACAAGGAGAACAACAACACATACAATACATAGATTGT
GGATATGCTTCTTAGGCAGTGTCAACTGCATTAGCTGAGCCCTTGGTGCAGAAATCAGAA
CATGCGTTGGTGCATTGTGCAACCGCACCATCCACAATTTCACTTGCAGCGAAGTCCTGG
AGAGTGGCTAAGTCACTGCACACAGAGGATACACAACCCAGCTTGCAGTATCCACTCACA
GTATTACCAGAGTTTCCGAAATGGCCATATGGATATCCTGAAGGACATATCGTCTCAGGA
ACGATTATGCATCCATTAAGTTGTGCACAAGTCGCCGTCGCTTTAGTACGATTACATACA
TAAAATGCTAATCTGGCTTCCTTGCTCGGGCGACAAACCTTCGCTTCGACTTGATTATGG
GCCATGACAAAAATCATTATGAGCACACTTAAAATCACAGTTTTGCCTTCCATCTTAACA
CTGATTACTTGTATGGTCACAAAATGTATTTAGAGATTACAAACTTGTATT
CC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2BR64TF 653 0 0
AAGGAAACATTATTCTTTATTTAGATATATAACAAGTAGAAGGGATAAACAATCTAAGGA
TCGATGACCTTCTACGTCACATAGAAAACCAGGAAATAGAACAAGAGTCTAGCATTTTGT
CACATACACGACAATTATTGAAAACAAGGAGAACAACAACACATACAATACATAGATTGT
GGATATGCTTCTTAGGCAGTGTCAACTGCATTAGCTGAGCCCTTGGTGCAGAAATCAGAA
CATGCGTTGGTGCATTGTGCAACCGCACCATCCACAATTTCACTTGCAGCGAAGTCCTGG
AGAGTGGCTAAGTCACTGCACACAGAGGATACACAACCCAGCTTGCAGTATCCACTCACA
GTATTACCAGAGTTTCCGAAATGGCCATATGGATATCCTGAAGGACATATCGTCTCAGGA
ACGATTATGCATCCATTAAGTTGTGCACAAGTCGCCGTCGCTTTAGTACGATTACATACA
TAAAATGCTAATCTGGCTTCCTTGCTCGGGCGACAAACCTTCGCTTCGACTTGATTATGG
GCCATGACAAAAATCATTATGAGCACACTTAAAATCACAGTTTTGCCTTCCATCTTAACA
CTGATTACTTGTATGGTCACAAAATGTATTTAGAGATTACAAACTTGTATT
CC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2AX66JQ 657 0 0
GG
AGGAAACATTATTCTTTATTTAGATATATAACAAGTAGAAGGGATAAACAATCTAGGGAT
CGATGACCTTCTACGTCACATAGAAAACCAGGAAATAGAACAAGAGTCTAGCATTTTGTC
ACATGCACGACAATTATTGAAAACAAGGAGAACAACAACACATACAATACATAGATTGTG
GATATGCTTTTTAGGCAGTGTCAACT*CATTAGCTGAGCCCTTGGTGCAGAAATCAGAAC
ATGCGTTGGTGCATTGTGCAACCGCACCATTCACAATTTCACTTGCAGCCAAGTCCTGGA
GAGTGGCTAAGTCACTGCACACAGAGGATGCACAACCCAGCTTGCAGTATCCATTGACAG
TATTACCAGAGTTTCCGAAATGGCCATATGGATATCCTGAAGGACATATCGTCTCAGGAA
CGATTTTGCATCCATTAAGTTGTGCACAAGTCGCCGTCGCTTTAGTACGATTACATACAT
AAAATGCTAATCTGGCTTCCTTGCTCGGGCAACAAACCTTCGCTTCGACTTGATTATGGG
CCATGACAAAAATCATTATGAGCGCACTTAAAATCACAGTTTTGCCTTCCATCTTAACAC
TGATTACTTGTATGGTCACAAAATGTATTTAGAGATTACAAACTTGTATTGATCC

QA 3 657 3 657
DS 

RD RR2AX66TFB 657 0 0
GG
AGGAAACATTATTCTTTATTTAGATATATAACAAGTAGAAGGGATAAACAATCTAGGGAT
CGATGACCTTCTACGTCACATAGAAAACCAGGAAATAGAACAAGAGTCTAGCATTTTGTC
ACATGCACGACAATTATTGAAAACAAGGAGAACAACAACACATACAATACATAGATTGTG
GATATGCTTTTTAGGCAGTGTCAACT*CATTAGCTGAGCCCTTGGTGCAGAAATCAGAAC
ATGCGTTGGTGCATTGTGCAACCGCACCATTCACAATTTCACTTGCAGCCAAGTCCTGGA
GAGTGGCTAAGTCACTGCACACAGAGGATGCACAACCCAGCTTGCAGTATCCATTGACAG
TATTACCAGAGTTTCCGAAATGGCCATATGGATATCCTGAAGGACATATCGTCTCAGGAA
CGATTTTGCATCCATTAAGTTGTGCACAAGTCGCCGTCGCTTTAGTACGATTACATACAT
AAAATGCTAATCTGGCTTCCTTGCTCGGGCAACAAACCTTCGCTTCGACTTGATTATGGG
CCATGACAAAAATCATTATGAGCGCACTTAAAATCACAGTTTTCCCTTCCATCTTAACAC
TGATTACTTGTATGGTCACAAAATGTATTTAGAGATTACAAACTTGTATT
GATCC

QA 3 652 3 652
DS 



AS 1 5

CO CL926Contig1 961 5 10 U
GGGAAAACAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCATATACAAAACAAAAAAAAACACCCTAG
CCAAAGTTGGAGAAGAAAGAAGAAAATGGAGCAGTCTTATGTGTATGCTTACCCACCAGG
CACGGCTCCACCGCCTCCACAAGGCGGTGGCATCGCCGGAGTGATAGTGGATCCAAGGTT
CTGTGCTCCGTATCCCGTGGATCTGGCGATCGTGCGGAAGATGATGACGTTGACTGATGG
TAACTTCGTTATAACGGACGTTAACGGGAACTTGCTGTTCAAGGTGAAGGAGCCAGTGTT
TGGTCTTCATGACAAGAGGGTTTTATTGGATGGTTCTGGATCTCCTGTCTTGACTTTGAG
AGAGAAGATGGTGAGCTTGCACGACAGGTGGCAAGTATTTAGAGGAGGGAGTACGGAGCA
GCGTGATCTGCTGTACACGGTTAAGAGATCGTCGATGCTTCAGTTTAAGACCAAACTCGA
TGTGTTTTTGAGTCACAATAAGGATGAGAAGAGATGTGATTTTAGGGTCAAAGGGAGCTG
GTTCGAGCGCTCTTGTGTCGTCTATGCCGGCGAATCTGACGCCATCGTTGCCCAAATGCA
CAAGAAGCACACGGTGCAGAGCGTGTTCTTGGGAAAAGACAATTTCTCGGTGACTGTTTA
TCCAAACGTGGACTATGCCTTCATTGCCTCTCTCGTCGTCATTCTCGATGATGTTAACCG
AGAAGACCGTGCCGCAGGCAGCAGCTGATCAGATCAGACGTGCGTGTGTGTGTTGTGTGT
GTGTGAGAGAGAGAGAGCTTGCTCGCTCGCTTGCTCACGTATTAGTTATGCTTTTGGCTT
TGTATTGTACCTATATTCTCTAAACTTTGCACTTTGGAAGGTGGACTTGTTCTTTGTGTG
ATCTTTCCAGTTGTAAAATAATACAAATGTATGTATTGTTAGCCATCACTTACTTTATTA
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2EC21TF U 1
AF RR2FY95TF U 340
AF RR2F003JQ C 282
AF RR2F003TF U 309
AF RR2EC21JQ C 209
BS 1 737 RR2EC21TF
BS 738 738 RR2FY95TF
BS 739 773 RR2EC21TF
BS 774 774 RR2FY95TF
BS 775 783 RR2EC21TF
BS 784 805 RR2FY95TF
BS 806 806 RR2F003TF
BS 807 936 RR2FY95TF
BS 937 944 RR2F003TF
BS 945 961 RR2EC21JQ

RD RR2EC21TF 783 0 0
GGGAAAACAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCATATACAAAACAAAAAAAAACACCCTAG
CCAAAGTTGGAGAAGAAAGAAGAAAATGGAGCAGTCTTATGTGTATGCTTACCCACCAGG
CACGGCTCCACCGCCTCCACAAGGCGGTGGCATCGCCGGAGTGATAGTGGATCCAAGGTT
CTGTGCTCCGTATCCCGTGGATCTGGCGATCGTGCGGAAGATGATGACGTTGACTGATGG
TAACTTCGTTATAACGGACGTTAACGGGAACTTGCTGTTCAAGGTGAAGGAGCCAGTGTT
TGGTCTTCATGACAAGAGGGTTTTATTGGATGGTTCTGGATCTCCTGTCTTGACTTTGAG
AGAGAAGATGGTGAGCTTGCACGACAGGTGGCAAGTATTTAGAGGAGGGAGTACGGAGCA
GCGTGATCTGCTGTACACGGTTAAGAGATCGTCGATGCTTCAGTTTAAGACCAAACTCGA
TGTGTTTTTGAGTCACAATAAGGATGAGAAGAGATGTGATTTTAGGGTCAAAGGGAGCTG
GTTCGAGCGCTCTTGTGTCGTCTATGCCGGCGAATCTGACGCCATCGTTGCCCAAATGCA
CAAGAAGCACACGGTGCAGAGCGTGTTCTTGGGAAAAGACAATTTCTCGGTGACTGTTTA
TCCAAACGTGGACTATGCCTTCATTGCCTCTCTCGTCGTCATTCTCGATGATGTTAACCG
AGAAGACCGTGCCGCAG*CAGCAGCTGATCAGATCAGACGTGCGTGTGTGTGT*GTGTGT
GTG

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2FY95TF 599 0 0
GG
CTCCTGTCTTGACTTTGAGAGAGAAGATGGTGAGCTTGCACGACAGGTGGCAAGTATTTA
GAGGAGGGAGTACGGAGCAGCGTGATCTGCTGTACACGGTTAAGAGATCGTCGATGCTTC
AGTTTAAGACCAAACTCGATGTGTTTTTGAGTCACAATAAGGATGAGAAGAGATGTGATT
TTAGGGTCAAAGGGAGCTGGTTCGAGCGCTCTTGTGTCGTCTATGCCGGCGAATCTGACG
CCATCGTTGCCCAAATGCACAAGAAGCACACGGTGCAGAGCGTGTTCTTGGGAAAAGACA
ATTTCTCGGTGACTGTTTATCCAAACGTGGACTATGCCTTCATTGCCTCTCTCGTCGTCA
TTCTCGATGATGTTAACCGAGAAGACCGTGCCGCAGGCAGCAGCTGATCAGATCAGACGT
GCGTGTGTGTGTTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGCTTGCTCGTTCGCTTGCTCACGTA
TTAGTTATGCTTTTGGCTTTGTATTGTACCTATATTCTCTAAACTTTGCACTTTGGAAGG
TGGACTTGTTCTTTGTGTGATCTTTCCAGTTGTAAAATAATACAAATGTATGTAT
CG

QA 3 597 3 597
DS 

RD RR2F003JQ 666 0 0
G
GGTGAAGGAGCCAGTGTTTGGTCTTCATGACAAGAGGGTTTTATTGGATGGTTCTGGATC
TCCTGTCTTGACTTTGAGAGAGAAGATGGTGAGCTTGCACGACAGGTGGCAAGTATTTAG
AGGAGGGAGTACGGAGCAGCGTGATCTGCTGTACACGGTTAAGAGATCGTCGATGCTTCA
GTTTAAGACCAAACTCGACGTGTTTTTGAGTCACAATAAGGATGAGAAGAGATGTGATTT
TAGGGTCAAAGGGAGCTGGTTCGAGCGCTCTTGTGTCGTCTATGCCGGCGAATCTGACGC
CATCGTTGCCCAAATGCACAAGAAGCACACGGTGCAGAGCGTGTTCTTGGGAAAAGACAA
TTTCTCGGTGACTGTTTATCCAAACGTGGACTATGCCTTCATTGCCTCTCTCGTCGTCAT
TCTCGATGATGTTAACCGAGAAGACCGTGCCGCAGGCAGCAGCTGATCAGATCAGACGTG
CGTGTGTGTGTTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAG**CTTGCTCGCTCGCTTGCTCACGTAT
TAGTTATGCTTTTGGCTTTGTATTGTACCTATATTCTCTAAACTTTGCACTTTGGAAGGT
GGACTTGTTCTTTGTGTGATCTTTCCAGTTGTAAAATAATACAAATGTATGTATTGTTAG
CC
GTC

QA 2 663 2 663
DS 

RD RR2F003TF 639 0 0
ATGACAAGAGGGTTTTATTGGATGGTTCTGGATCTCCTGTCTTGACTTTGAGAGAGAAGA
TGGTGAGCTTGCACGACAGGTGGCAAGTATTTAGAGGAGGGAGTACGGAGCAGCGTGATC
TGCTGTACACGGTTAAGAGATCGTCGATGCTTCAGTTTAAGACCAAACTCGACGTGTTTT
TGAGTCACAATAAGGATGAGAAGAGATGTGATTTTAGGGTCAAAGGGAGCTGGTTCGAGC
GCTCTTGTGTCGTCTATGCCGGCGAATCTGACGCCATCGTTGCCCAAATGCACAAGAAGC
ACACGGTGCAGAGCGTGTTCTTGGGAAAAGACAATTTCTCGGTGACTGTTTATCCAAACG
TGGACTATGCCTTCATTGCCTCTCTCGTCGTCATTCTCGATGATGTTAACCGAGAAGACC
GTGCCGCAGGCAGCAGCTGATCAGATCAGACGTGCGTGTGTGTGTTGTGTGTGTGTGAGA
GAGAGAG**CTTGCTCGCTCGCTTGCTCACGTATTAGTTATGCTTTTGGCTTTGTATTGT
ACCTATATTCTCTAAACTTTGCACTTTGGAAGGTGGACTTGTTCTTTGTGTGATCTTTCC
AGTTGTAAAATAATACAAATGTATGTATTGTTAGCC
GTC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2EC21JQ 753 0 0
ATCGTGCG
GAAGATGATGACGTTGACTGATGGTAACTTCGTTATAACGGACGTTAACGGGAACTTGCT
GTTCAAGGTGAAGGAGCCAGTGTTTGGTCTTCATGACAAGAGGGTTTTATTGGATGGTTC
TGGATCTCCTGTCTTGACTTTGAGAGAGAAGATGGTGAGCTTGCACGACAGGTGGCAAGT
ATTTAGAGGAGGGAGTACGGAGCAGCGTGATCTGCTGTACACGGTTAAGAGATCGTCGAT
GCTTCAGTTTAAGACCAAACTCGATGTGTTTTTGAGTCACAATAAGGATGAGAAGAGATG
TGATTTTAGGGTCAAAGGGAGCTGGTTCGAGCGCTCTTGTGTCGTCTATGCCGGCGAATC
TGACGCCATCGTTGCCCAAATGCACAAGAAGCACACGGTGCAGAGCGTGTTCTTGGGAAA
AGACAATTTCTCGGTGACTGTTTATCCAAACGTGGACTATGCCTTCATTGCCTCTCTCGT
CGTCATTCTCGATGATGTTAACCGAGAAGACCGTGCCGCAGGCAGCAGCTGATCAGATCA
GACGTGCGTGTGTGTGTTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGCTTGCTCGTTCGCTTGCTC
ACGTATTAGTTATGCTTTTGGCTTTGTATTGTACCTATATTCTCTAAACTTTGCACTTTG
GAAGGTGGACTTGTTCTTTGTGTGATCTTTCCAGTTGTAAAATAATACAAATGTATGTAT
CGTTAGCCATCACTTACTTTATTAC

QA 9 753 9 753
DS 



AS 1 7

CO CL927Contig1 1008 7 14 U
GGGTAGTTAAGACTACCTCTTTTTAGGTTTTTCATTGATTTAAATAGAGTACAAGAAGCA
AATAACGTGAAGGGAAAGTGGAGTCATCATCTCCTTACAAAATGGGAATGCAACACAAAG
TGGGAACTAATCTCCTAAAGACTAGGTCTCTTATTTGAATAAGTAAATAGCAAGAAATAA
AGAAGCCACGTGTCGTCATTGCTTCTTGATATCCTATCAATACTCCCATCCTAAAAATGA
ACCTTGTCCTCAAGGTTCAAGCCATGAAAACTCTTCTTAAGAACGGTCGGTCAATCGCAC
ACTCCGGTTTTAGTCACAAAACGTTGCTGTTTTGGGGAGCCGCCATTGCTAAGATGGTTG
GAGTGTCTTGCATTAGTTTCATGTTTGCTGTAAGACCACGGAGAGTACGTCACGAGAAAT
CAGAAGTTTTAACGGAGCTAAACGTCAGACTTTGAAGCTTAACCCTTATTGAACTTCTTC
CTCTTTTTTTTTTTTCTTTTTCTAAGCTATGGATAACAAAACAAAAACGAAAGAAGATGA
CTGAAACCTTTTTTATTTAGAAACTTTGATGATTTTTTTTTTTTTTTTT*GGAAAACTGA
AAAACAATGGAAGAATTACAGATTTTAATCCATACAAAAGAAAGGATGTTGAACTTGATC
AACAAACCCGAAAAGAAGAAAATGATGAAAAGAAAAAATAGCTGGATAAATCTCGATGAC
CGTTGATTCTGAAGAATGGCCGTTCGTCGAGGATTCTTGATAACCGTTGATTCATGAAGA
ATACCGATAACAAGGAAGATGAAAAATATAGAGTTTTTGATACCACAAAGTGGTCCGGAT
CAAAAACAAAACATGCTCTGATACCACTGATAGGTCCCTTGCCAAGAGATATCAATGTTG
ATCTAGGAACATGTGATTTGATACCAATTAAGGTCCCTCTTCAAATCAAAGAGAATTTGT
TCAAGAACAAACTAAGAACACACTTTTCTTTTGGGTAGTTAAGACTCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ38TF C 20
AF RR2FC02JQ U 1
AF RR2F740JQ U 5
AF RR2DE40JQ U 47
AF RR2DE40TF C 338
AF RR2G968JQ U 502
AF RR2G968TF C 502
BS 1 441 RR2FC02JQ
BS 442 442 RR2F740JQ
BS 443 490 RR2FC02JQ
BS 491 493 RR2F740JQ
BS 494 494 RR2FC02JQ
BS 495 495 RR2DE40JQ
BS 496 589 RR2FC02JQ
BS 590 590 RR2F740JQ
BS 591 604 RR2FC02JQ
BS 605 802 RR2DE40JQ
BS 803 887 RR2G968JQ
BS 888 888 RR2DE40TF
BS 889 996 RR2G968JQ
BS 997 1008 RR2DE40TF

RD RR2FQ38TF 581 0 0
TTTTTAGGTTTTTCACTGATTTAAATAGAGTACAAGAAGCAAATAACGTGAAGGGAAAGT
GGAGTCATCATCTCCTTACAAAATGGGAATGCAACACAAAGTGGGAACTAATCTCCTAAA
GACTAGGTCTCTTATTTGAATAAGTAAATAGCAAGAAATAAAGAAGCCACGTGTCGTCAT
TGCTTCTTGATATCCTATCAATACTCCCATCCTAAAAATGAACCTTGTCCTCAAGGTTCA
AGCCATGAAAACTCTTCTTAAGAACGGTCGGTCAATCGCACACTCCGGTTTTAGTCACAA
AACGTTGCTGTTTTGGGGAGCCGCCATTGCTAAGATGGTTGGAGTGTCTTGCATTAGTTT
CATGTTTGCTGTAAGACCACGGAGAGTACGTCACGAGAAATCAGAAGTTTTAACGGAGCT
AAACGTCAGACTTTGAAACTTAACCCTTATTGAACTTCTTCCTCTTTTTTTTTTTTCTTT
TTCTAAGCTATGGATAACAAAACAAAAACGAAAGAAGATGACTGAAACCTTTTTTATTTA
GAAACTTTGATGATTTTTTTTTTTTTT
GGAAAACTGAAAAA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2FC02JQ 604 0 0
GGGTAGTTAAGACTACCTCTTTTTAGGTTTTTCATTGATTTAAATAGAGTACAAGAAGCA
AATAACGTGAAGGGAAAGTGGAGTCATCATCTCCTTACAAAATGGGAATGCAACACAAAG
TGGGAACTAATCTCCTAAAGACTAGGTCTCTTATTTGAATAAGTAAATAGCAAGAAATAA
AGAAGCCACGTGTCGTCATTGCTTCTTGATATCCTATCAATACTCCCATCCTAAAAATGA
ACCTTGTCCTCAAGGTTCAAGCCATGAAAACTCTTCTTAAGAACGGTCGGTCAATCGCAC
ACTCCGGTTTTAGTCACAAAACGTTGCTGTTTTGGGGAGCCGCCATTGCTAAGATGGTTG
GAGTGTCTTGCATTAGTTTCATGTTTGCTGTAAGACCACGGAGAGTACGTCACGAGAAAT
CAGAAGTTTTAACGGAGCTAAGCGTCAGACTTTGAAGCTTAACCCTTATTGAACTTCTTC
CTCTTTTTTT***T*CTTTTTCTAAGCTATGGATAACAAAACAAAAACGAAAGAAGATGA
CTGAAACCTTTTTTATTTAGAAACTTTGATGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAAAACTGA
AAAA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2F740JQ 600 0 0
G
GTTAAGACTACCTCTTTTTAGGTCTTTCATTGATTTAAATAGAGTACAAGAAGCAAATAA
CGTGAAGGGAAAGTGGAGTCATCATCTCCTTACAAAATGGGAATGCAACACAAAGTGGGA
ACTAATCTCCTAAAGACTAGGTCTCTTATTTGAATAAGTAAATAGCAAGAAATAAAGAAG
CCACGTGTCGTCATTGCTTCTTGATATCCTATCAATACTCCCATCCTAAAAATGAACCTT
GTCCTCAAGGTTCAAGCCATGAAAACTCTTCTTAAGAACGGTCGGTCAATCGCACACTCC
GGTTTTAGTCACAAAACGTTGCTGTTTTGGGGAGCCGCCATTGCTAAGATGGTTGGAGTG
TCTTGCATTAGTTTCATGTTTGCTGTAAGACCACGGAGAGTACGTCACGAGAAATCAGAA
GTTTTAACGGAGCTAAACGTCAGACTTTGAAGCTTAACCCTTATTGAACTTCTTCCTCTT
TTTTTTTTT*CTTTTTCTAAGCTATGGATAACAAAACAAAAACGAAAGAAGATGACTGAA
ACCTTTTTTATTTAGAAACTTTGATGATTTTTTTTTTTTTTTTT*GGAAAACTGAAAAA

QA 2 600 2 600
DS 

RD RR2DE40JQ 756 0 0
GAGTACAAGAAGCAAATAACGTGAAGGGAAAGTGGAGTCATCATCTCCTTACAAAATGGG
AATGCAACACAAAGTGGGAACTAATCTCCTAAAGACTAGGTCTCTTATTTGAATAAGTAA
ATAGCAAGAAATAAAGAAGCCACGTGTCGTCATTGCTTCTTGATATCCTATCAATACTCC
CATCCTAAAAATGAACCTTGTCCTCAAGGTTCAAGCCATGAAAACTCCTCTTAAGAACGG
TCGGTCAATCGCACACTCCGGTTTTAGTCACAAAACGTTGCTGTTTTGGGGAGCCGCCAT
TGCTAAGATGGTTGGAGTGTCTTGCATTAGTTTCATGTTTGCTGTAAGACCACGGAGAGT
ACGTCACGAGAAATCAGAAGTTTTAACGGAGCTAAACGTCAGACTTTGAAGCTTAACCCT
TATTGAACTTCTTCCTCTTTTTTTTTTTTCTTTTTCTAAGCTATGGATAACAAAACAAAA
ACGAAAGAAGATGGCTGAAACCTTTTTTATTTAGAAACTTTGATGATTTTTTTTTTTTCT
TTT*GGAAAACTGAAAAACAATGGAAGAATTACAGATTTTAATCCATACAAAAGAAAGGA
TGTTGAACTTGATCAACAAACCCGAAAAGAAGAAAATGATGAAAAGAAAAAATAGCTGGA
TAAATCTCGATGACCGTTGATTCTGAAGAATGGCCGTTCGTCGAGGATTCTTGATAACCG
TTGATTCATGAAGAATACCGATAACAAGGAAGATGA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2DE40TF 671 0 0
AGCCGCCATTGCTAAGATGGTTGGAGTGTCTTGCATTAGTTTCATGTTTGCTGTAAGACC
ACGGAGAGTACGTCACGAGAAATCAGAAGTTTTAACGGAGCTAAACGTCAGACTTTGAAG
CTTAACCCTTATTGAACTTCTTCCTCTTTTTTTTTTTTCTTTTTCTAAGCTATGGATAAC
AAAACAAAAACGAAAGAAGATGGCTGAAACCTTTTTTATTTAGAAACTTTGATGATTTTT
TTTTTTTCTTTT*GGAAAACTGAAAAACAATGGAAGAATTACAGATTTTAATCCATACAA
AAGAAAGGATGTTGAACTTGATCAACAAACCCGAAAAGAAGAAAATGATGAAAAGAAAAA
ATAGCTGGATAAATCTCGATGACCGTTGATTCTGAAGAATGGCCGTTCGTCGAGGATTCT
TGATAACCGTTGATTCATGAAGAATACCGATAACAAGGAAGATGAAAAATATAGAGTTTT
TGATACCACAAAGCGGTCCGGATCAAAAACAAAACGTGCCCTGATACCACTGATAGGTCC
CTTGCCAAGAGATATCAATGTTGATCTAGGAACATGTGATTTGATACCAATTAAGGTCCC
TCTTCAAATCAAAGAGAATTTGTTCAAGAACAAACTAAGAACACACTTTTCTTTTGGGTA
GTTAAGACTCT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2G968JQ 497 0 0
CG
AAGCTATGGATAACAAAACAAAAACGAAAGAAGATGACTGAAACCTTTTTTATTTAAAAA
CTTTGATGATTTTTTTTTTTTTTTT**GGAAAACTGAAAAACAATGGAAAAATTACAGAT
TTTAATCCATACAAAAAAAAGGATGTTGAACTTGATCAACAAACCCGAAAAAAAGGAAAT
GATGAAAAAAAAAAATAGCTGGATAAATCTCGATGACCGTTGATTCTGAAAAATGGCCGT
TCGTCGAGGATTCTTGATAACCGTTGATTCATGAAAAATACCGATAACAAGGAAAATGAA
AAATATAGAGTTTTTGATACCACAAAGTGGTCCGGATCAAAAACAAAACATGCTCTGATA
CCACTGATAGGTCCCTTGCCAAGAAATATCAATGTTGATCTAGGAACATGTGATTTGATA
CCAATTAAGGTCCCTCTTCAAATCAAAGAGAATTTGTTCAAGAACAAACTAAGAACACAC
TTTTCTTTTGGGT
CC

QA 3 495 3 495
DS 

RD RR2G968TF 497 0 0
CG
AAGCTATGGATAACAAAACAAAAACGAAAGAAGATGACTGAAACCTTTTTTATTTAGAAA
CTTTGATGATTTTTTTTTTTTTTTT**GGAAAACTGAAAAACAATGGAAGAATTACAGAT
TTTAATCCATACAAAAGAAAGGATGTTGAACTTGATCAACAAACCCGAAAAGAAGGAAAT
GATGAAAAGAAAAAATAGCTGGATAAATCTCGATGACCGTTGATTCTGAAGAATGGCCGT
TCGTCGAGGATTCTTGATAACCGTTGATTCATGAAGAATACCGATAACAAGGAAGATGAA
AAATATAGAGTTTTTGATACCACAAAGTGGTCCGGATCAAAAACAAAACATGCTCTGATA
CCACTGATAGGTCCCTTGCCAAGAGATATCAATGTTGATCTAGGAACATGTGATTTGATA
CCAATTAAGGTCCCTCTTCAAATCAAAGAGAATTTGTTCAAGAACAAACTAAGAACACAC
TTTTCTTTTGGGT
CC

QA 3 495 3 495
DS 



AS 1 5

CO CL928Contig1 693 5 6 U
ACTTAGGAGAGCATTATTTCATAAAAAAAAAGTGAACAGCATCCATTACAAGACCGTAAG
TAAATGCACGAGGTTATGGTTACAAAGCCCTTAAGATATCTAGATTCCATTGAGTGTGAC
CACAACTTTGCGTGCTGTTGGGGCATCACGGTGTTCACACAGCCATACTCCCTGCCAGGT
TCCCAAGCCAAGTTTTCCTTTTGTAATTGGGATTGTGAGCTGACATCCAAACATCGAAGA
TTTGATATGAGCTGGCATGTCATCTGGACCTTCCATGGTATGCCTCCAAGGAGCTGACCT
CCCCTCAGGAACAATGGTGTTCAAGAAAGTCTCAGTATCAGCCTGAACATCTGGATCATA
ATTCTCATTGATTGTAAGAGAAGCACTTGTGTGTTGTAAGAAGACATGAGCAAGACCACA
GTTGAAACCCGACAGATCTTGTCTAATTTCCTTCAGAATCATAGGAGTGATGAGATGACA
TCCACGGCGTTGAGGTGGAAGAGTGATGGTTTTCTGAGCCCACTTTGGACCACCAGATGG
ACTCGCCATGGAACCTCGATCGGTTGCTGGATTCGCTGGAGTGAAGACCGATCTGACACG
TAGAGTAGGAGGAACAACACCAGAGAAGAAGATCGTCGAGCTCTGCATAGCTTTTGTTGT
TGGTGTTTCTCTCTTAAGCCCAAATAACAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AW69TFB C 9
AF RR2GE60JQ U 3
AF RR2DH70JQ U 1
AF RR2AQ57JQ U 4
AF RR2AQ57TF C 59
BS 1 30 RR2DH70JQ
BS 31 31 RR2GE60JQ
BS 32 387 RR2DH70JQ
BS 388 388 RR2GE60JQ
BS 389 612 RR2DH70JQ
BS 613 693 RR2AQ57JQ

RD RR2AW69TFB 399 0 0
GAGCATTATTTCATAAAAAAAAAGTGAACAGCATCCATTACAAGACCGTAAGTAAATGCA
CGAGGTTATGGTTACAAAGCCCTTAAGATATCTAGATTCCATTGAGTGTGACCACAACTT
TGCGTGCTGTTGGGGCATCACGGTGTTCACACAGCCATACTCCCTGCCAGGTTCCCAAGC
CAAGTTTTCCTTTTGTAATTGGGATTGTGAGCTGACATCCAAACATCGAAGATTTGATAT
GAGCTGGCATGTCATCTGGACCTTCCATGGTATGCCTCCAAGGAGCTGACCTCCCCTCAG
GAACAATGGTGTTCAAGAAAGTCTCAGTATCAGCCTGAACATCTGGATCATAATTCTCAT
TGATTGTAAGAGAAGCACTTGTGTGTTGTAAGAAGACAT

QA 1 399 1 399
DS 

RD RR2GE60JQ 532 0 0
CTG
GGAGAGCATTATTTCATAAAAAAAAAGTGAACAGCATCCATTACAAGACCGTAAGTAAAT
GCACGAGGTTATGGTTACAAAGCCCTTAAAATATCTAGATTCCATTGAGTGTGACCACAA
CTTTGCGTGCTGTTGGGGCATCACGGTGTTCACACAGCCATACTCCCTGCCAGGTTCCCA
AGCCAAGTTTTCCTTTTGTAATTGGGATTGTGAGCTGACATCCAAACATCGAAAATTTGA
TATGAGCTGGCATGTCATCTGGACCTTCCATGGTATGCCTCCAAGGAGCTGACCTCCCCT
CAGGAACAATGGTGTTCAAGAAAGTCTCAGTATCAGCCTGAACATCTGGATCATAATTCT
CATTGATTGTAAGAGAAGCACTTGTGTGTTGTAAGAAGACATGAGCAAGACCACAGTTGA
AACCCGACAGATCTTGTCTAATTTCCTTCAGAATCATAGGAGTGATGAGATGACATCCAC
GGCGTTGAGGTGGAAGAGTGATGGTTTTCTGAGCCCACTTTGGACCACC

QA 4 532 4 532
DS 

RD RR2DH70JQ 612 0 0
ACTTAGGAGAGCATTATTTCATAAAAAAAA*GTGAACAGCATCCATTACAAGACCGTAAG
TAAATGCACGAGGTTATGGTTACAAAGCCCTTAAGATATCTAGATTCCATTGAGTGTGAC
CACAACTTTGCGTGCTGTTGGGGCATCACGGTGTTCACACAGCCATACTCCCTGCCAGGT
TCCCAAGCCAAGTTTTCCTTTTGTAATTGGGATTGTGAGCTGACATCCAAACATCGAAGA
TTTGATATGAGCTGGCATGTCATCTGGACCTTCCATGGTATGCCTCCAAGGAGCTGACCT
CCCCTCAGGAACAATGGTGTTCAAGAAAGTCTCAGTATCAGCCTGAACATCTGGATCATA
ATTCTCATTGATTGTAAGAGAAGCACTCGTGTGTTGTAAGAAGACATGAGCAAGACCACA
GTTGAAACCCGACAGATCTTGTCTAATTTCCTTCAGAATCATAGGAGTGATGAGATGACA
TCCACGGCGTTGAGGTGGAAGAGTGATGGTTTTCTGAGCCCACTTTGGACCACCAGATGG
ACTCGCCATGGAACCTCGATCGGTTGCTGGATTCGCTGGAGTGAAGACCGATCTGACACG
TAGAGTAGGAGG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2AQ57JQ 690 0 0
CA
GGAGAACATTATTTCATAAAAAAAA*GTGAACAGCATCCATTACAAGACCGTAAGTAAAT
GCACGAGGTTATGGTTACAAAGCCCTTAAGATATCTAGATTCCATTGAGTGTGACCACAA
CTTTGCGTGCTGTTGGGGCATCACGGTGTTCACACAGCCATACTCCCTGCCAGGTTCCCA
GGCCAAGTTTTCCTTTTGTAATTGGGATTGTGAGCTGACATCCAAACATCGAAGATTTGA
TATGAGCTGGCATGTCATCTGGACCTTCCATGGTATGCCTCCAAGGAGCTGACCTCCCCT
CAGGAACAATGGTGTTCAAGAAAGTCTCAGTATCAGCCTGAACATCTGGATCATAATTCT
CATTGATTGTAAGAGAAGCACTTGTGTGTTGTAAGAAGACATGAGCAAGACCACAGTTGA
AACCCGACAGATCTTGTCTAATTTCCTTCAGAATCATAGGAGTGATGAGATGACATCCAC
GGCGTTGAGGTGGAAGAGTGATGGTTTTCTGAGCCCACTTTGGACCACCAGATGGACTCG
CCATGGAACCTCGATCGGTTGCTGGATTCGCTGGAGTGAAGACCGATCTGACACGTAGAG
TAGGAGGAACAACACCAGAGAAGAAGATCGTCGAGCTCTGCATAGCTTTTGTTGTTGGTG
TTTCTCTCTTAAGCCCAAATAACAGTCC

QA 3 690 3 690
DS 

RD RR2AQ57TF 635 0 0
AGTAAATGCACGAGGTTATGGTTACAAAGCCCTTAAGATATCTAGATTCCATTGAGTGTG
ACCACAACTTTGCGTGCTGTTGGGGCATCACGGTGTTCACACAGCCATACTCCCTGCCAG
GTTCCCAGGCCAAGTTTTCCTTTTGTAATTGGGATTGTGAGCTGACATCCAAACATCGAA
GATTTGATATGAGCTGGCATGTCATCTGGACCTTCCATGGTATGCCTCCAAGGAGCTGAC
CTCCCCTCAGGAACAATGGTGTTCAAGAAAGTCTCAGTATCAGCCTGAACATCTGGATCA
TAATTCTCATTGATTGTAAGAGAAGCACTTGTGTGTTGTAAGAAGACATGAGCAAGACCA
CAGTTGAAACCCGACAGATCTTGTCTAATTTCCTTCAGAATCATAGGAGTGATGAGATGA
CATCCACGGCGTTGAGGTGGAAGAGTGATGGTTTTCTGAGCCCACTTTGGACCACCAGAT
GGACTCGCCATGGAACCTCGATCGGTTGCTGGATTCGCTGGAGTGAAGACCGATCTGACA
CGTAGAGTAGGAGGAACAACACCAGAGAAGAAGATCGTCGAGCTCTGCATAGCTTTTGTT
GTTGGTGTTTCTCTCTTAAGCCCAAATAACAGTCC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 2 8

CO CL929Contig1 722 5 3 U
CATAATGCCACTTTTTATTTATAACAAAAACACACACACGTGATAACATTTTATTTAGAG
TTTCAACAGTCAGGCCGCTAAGTTCGTGCCTGAACTAGAGAGAAACTATAATGCTCGAAA
CTAGACGAGCTACATAGATGCACTCGCATAGACGTCATTCTCATGGACTACCGATAAATC
ATCCTCCACTGGTTCTTTCCAAAACTCAAACATATTTGTATTAACAGCATAGGTAATAAG
TTCACGAATGTTCATGGGTTGGATAACGTTTGGGTCGGCTCCAAATAGAAGATGAGCGAA
TGATTCTTGTGCCTTCTCTGAGTTGTGACGTCCATCGAAGTAGAGGTAAGACCTTTGATA
CTCGCATAGCTTCGAGTGCACGTTGGGTAAACCGCAACCATACGCGTTGTGCGTCCCAGT
ACCGCAACACGATACACTCGTAACGGAGTAACGGAAATTCATGTTTCTCTGTGTCCTGCG
AAGAATGACATTGTAGAAATCGAAAACGGTGAACTGGAAACCCAATTTGGATGTCGCTAG
ATCATTCAGCATCGGTCCGATTTTAGCGTTGTGTAGTTTAGCCAAATCGTTGAATTTCTC
GTAACACTCGTTACCAGTGTTAAAGTCCTGTCTCACGATAGGTAAGCAACCTAGTGGCGC
TAACATATATACAACGAACTTACTAGCTCCCAATGAATACAACATCTCAATATTGTACTT
TA


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2CS79JQ U 1
AF RR2CM05TF C 1
AF RR2CM05JQ U 12
AF RR2CE75TF C 30
AF RR2BT71JQ U 1
BS 1 475 RR2BT71JQ
BS 476 476 RR2CS79JQ
BS 477 722 RR2BT71JQ

RD RR2CS79JQ 618 0 0
CATG
ATGCCACTTTTTATTTATAACAAAAACACACACACGTGATAACATTTTATTTAGAGTTTC
AACAGTCAGGCCGCTAAGTTCGTGCCTGAACTAGAGAGAAACTATAATGCTCGAAACTAG
ACGAGCTACATAGATGCACTCGCATAGACGTCATTCTCATGGACTACCGATAAATCATCC
TCCACTGGTTCTTTCCAAAACTCAAACATATTTGTATTAACAGCATAGGTAATAAGTTCA
CGAATGTTCATGGGTTGGATAACGTTTGGGTCGGCTCCAAATAGAAGATGAGCGAATGAT
TCTTGTGCCTTCTCTGAGTTGTGACGTCCATCGAAGTAGAGGTAAGACCTTTGATACTCG
CATAGCTTCGAGTGCACGTTGGGTAAACCGCAACCATACGCGTTGTGCGTCCCAGTACCG
CAACACGATACACTCGTAACGGAGTAACGGAAATTCATGTTTCTCTGTGTCCTGCGAAGA
ATGACATTGTAGAAATCGAAAACGGTGAACTGGAAACCCAATTTGGATGTCGCTAGATCA
TTCAGCATCGGTCCGATTTTAGCGTTGTGTAGTTTAGCCAAATCGTTGAATTTCTCGTAA
CACTCGTTACCAGT

QA 5 618 5 618
DS 

RD RR2CM05TF 641 0 0
CATA
ATGCCACTTTTTATTTATAACAAAAACACACACACGTGATAACATTTTATTTAGAGTTTC
AACAGTCAGGCCGCTAAGTTCGTGCCTGAACTA*AGAGAAACTATAATGCTCGAAACTAG
ACGAGCTACATAGATGCACTCGCATAGACGTCATTCTCATGGACTACCGATAAATCATCC
TCCACTGGTTCTTTCCAAAACTCAAACATATTTGTATTAACAGCATAGGTAATAAGTTCA
CGAATGTTCATGGGTTGGATAACGTTTGGGTCGGCTCCAAATAGAAGATGAGCGAATGAT
TCTTGTGCCTTCTCTGAGTTGTGACGTCCATCGAAGTAGAGGTAAGACCTTTGATACTCG
CATAGCTTCGAGTGCACGTTGGGTAAACCGCAACCATACGCGTTGTGCGTCCCAGTACCG
CAACACGATACACTCGTAACGGAGTAACGGAAATTCATGTTTCTCTGTGTCCTGCGAAGA
ATGACATTGTAGAAATCGAAAACGGTGAACTGGAAACCCAATTTGGATGTCGCTAGATCA
TTCAGCATCGGTCCGATTTTAGCGTTGTGTAGTTTAGCCAAATCGTTGAATTTCTCGTAA
CACTCGTTACCAGTGTTAAAGTCCTGTCTCACGAT
CC

QA 5 639 5 639
DS 

RD RR2CM05JQ 630 0 0
TTTTTATTTATAACAAAAACACACACACGTGATAACATTTTATTTAGAGTTTCAACAGTC
AGGCCGCTAAGTTCGTGCCTGAACTA*AGAGAAACTATAATGCTCGAAACTAGACGAGCT
ACATAGATGCACTCGCATAGACGTCATTCTCATGGACTACCGATAAATCATCCTCCACTG
GTTCTTTCCAAAACTCAAACATATTTGTATTAACAGCATAGGTAATAAGTTCACGAATGT
TCATGGGTTGGATAACGTTTGGGTCGGCTCCAAATAGAAGATGAGCGAATGATTCTTGTG
CCTTCTCTGAGTTGTGACGTCCATCGAAGTAGAGGTAAGACCTTTGATACTCGCATAGCT
TCGAGTGCACGTTGGGTAAACCGCAACCATACGCGTTGTGCGTCCCAGTACCGCAACACG
ATACACTCGTAACGGAGTAACGGAAATTCATGTTTCTCTGTGTCCTGCGAAGAATGACAT
TGTAGAAATCGAAAACGGTGAACTGGAAACCCAATTTGGATGTCGCTAGATCATTCAGCA
TCGGTCCGATTTTAGCGTTGTGTAGTTTAGCCAAATCGTTGAATTTCTCGTAACACTCGT
TACCAGTGTTAAAGTCCTGTCTCACGAT
AC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2CE75TF 666 0 0
ACACACACACGTGATAACATTTTATTTAGAGTTTCAACAGTCAGGCCGATAAGTTCGTGC
CTGAACCAGAGAGAAACTATAATGCTCGAAACTAGACGAGCTACATAGATGCACTCGCAT
AGACGTCATTCTCATGGACTACCGATAAATCATCCTCCACTGGTTCTTTCCAAAACTCAA
ACATATTTGTATTAACAGCATAGGTAATAAGTTCACGAATGTTCATGGGTTGGATAACGT
TTGGGTCGGCTCCAAATAGAAGATGAGCGAATGATTCTTGTGCCTTCTCTGAGTTGTGAC
GTCCATCGAAGTAGAGGTAAGACCTTTGATACTCGCATAGCTTCGAGTGCACGTTGGGTA
AACCGCAACCATACGCGTTGTGCGTCCCAGTACCGCAACACGATACACTCGTAACGGAGT
AACGGAAATTCATGTTTCTCTGTGTCCTGCGAAGAATGACATTGTAGAAATCGAAAACGG
TGAACTGGAAACCCAATTTGGATGTCGCTAGATCATTCAGCATCGGTCCGATTTTAGCGT
TGTGTAGTTTAGCCAAATCGTTGAATTTCTCGTAACACTCGTTACCAGTGTTAAAGTCCT
GTCTCACGATAGGTAAGCAACCTAGTGGCGCTAACATATATACAACGAACTTACTAGCTC
CCAAT
C

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2BT71JQ 722 0 0
CATAATGCCACTTTTTATTTATAACAAAAACACACACACGTGATAACATTTTATTTAGAG
TTTCAACAGTCAGGCCGCTAAGTTCGTGCCTGAACTAGAGAGAAACTATAATGCTCGAAA
CTAGACGAGCTACATAGATGCACTCGCATAGACGTCATTCTCATGGACTACCGATAAATC
ATCCTCCACTGGTTCTTTCCAAAACTCAAACATATTTGTATTAACAGCATAGGTAATAAG
TTCACGAATGTTCATGGGTTGGATAACGTTTGGGTCGGCTCCAAATAGAAGATGAGCGAA
TGATTCTTGTGCCTTCTCTGAGTTGTGACGTCCATCGAAGTAGAGGTAAGACCTTTGATA
CTCGCATAGCTTCGAGTGCACGTTGGGTAAACCGCAACCATACGCGTTGTGCGTCCCAGT
ACCGCAACACGATACACTCGTAACGGAGTAACGGAAATTCATGTTTCTCTGTGTCTTGCG
AAGAATGACATTGTAGAAATCGAAAACGGTGAACTGGAAACCCAATTTGGATGTCGCTAG
ATCATTCAGCATCGGTCCGATTTTAGCGTTGTGTAGTTTAGCCAAATCGTTGAATTTCTC
GTAACACTCGTTACCAGTGTTAAAGTCCTGTCTCACGATAGGTAAGCAACCTAGTGGCGC
TAACATATATACAACGAACTTACTAGCTCCCAATGAATACAACATCTCAATATTGTACTT
TA

QA 1 722 1 722
DS 



CO CL929Contig2 736 3 2 U
GGATCAAACATTCCTATCTTATTATTATTATCATCTCGTCCATATAAATGGCAACCAACT
TCAGTTTAGCGAGTGTTCTAGGGGTACTTTTTGTATTCACACTGTTCCACAACCCTATCA
TCGTCGCCGGACAAAATATTCCGGCGGTGGCATTGTTCACATTCGGAGATTCCAACTTTG
ACGCAGGAAATAGAAAGTTCATCACAACTGGTACACTTCCTCAAAACTTCTGGCCTTACG
GTAAATCTCGAGATGACCCCAACGGCAAGTTATCGGATGGCAAAATCGTCCCGGACTTTA
TTGCAAAATTCATGGGAATTTCACACGATTTACCGCCGGCGCTTAAACCCGGCGTCGATG
TCTCACGAGGAGCTAGCTTTGCCGTAGACGCCGCTACTATACTTGGGGCTCCCAAAGACT
CTTTGAATCTGAATCAACAAGTGAGGAAATTCGATCAGATGATATCAAACTGGAACGAGA
GTTACATTCAGAAATCATTGTTTATGATATCTATTGGTATGGAAGATTACTTAAACTTCA
CCAAAAGCAATCCTACAGCCGATGGTTCTGCTCAAGAAGCTTTTGTCACTTCAGTCATTA
GCAGACTAAAGTACAATATTGAGATGTTGTATTCATTGGGAGCTAGTAAGTTCGTTGTAT
ATATGTTAGCGCCACTAGTTGCTTACCTATCGTGAGACAGACTTTACACTGGTACGAGTG
TTACGAGAAATTCAAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA28TF U 35
AF RR2CS79TF U 1
AF RR2BT71TF U 5
BS 1 678 RR2CS79TF
BS 679 736 RR2BT71TF

RD RR2CA28TF 417 0 0
CTCGTCCATATAAATGGCAACCAACTTCAGTTTAGCGAGTGTTCTAGGGGTACTTTTTGT
ATTCACACTGTTCCACAACCCTATCATCGTCGCCGGACAAAATATTCCGGCGGTGGCATT
GTTCACATTCGGAGATTCCAACTTTGACGCAGGAAATAGAAAGTTCATCACAACTGGTAC
ACTTCCTCAAAACTTCCGGCCTTACGGTAAATCTCGAGATGACCCCAACGGCAAGTTATC
GGATGGCAAAATCGTCCCGGACTTTATTGCAAAATTCATGGGAATTTCACACGATTTACC
GCCGGCGCTTAAACCCGGCGTCGATGTCTCACGAGGAGCTAGCTTTGCCGTAGACGCCGC
TACTATACTTGGGGCTCCCAAAGACTCTTTGAATCTGAATCAACAAGTGAGGAAATT

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR2CS79TF 682 0 0
GGATCAAACATTCCTATCTTATTATTATTATCATCTCGTCCATATAAATGGCAACCAACT
TCAGTTTAGCGAGTGTTCTAGGGGTACTTTTTGTATTCACACTGTTCCACAACCCTATCA
TCGTCGCCGGACAAAATATTCCGGCGGTGGCATTGTTCACATTCGGAGATTCCAACTTTG
ACGCAGGAAATAGAAAGTTCATCACAACTGGTACACTTCCTCAAAACTTCTGGCCTTACG
GTAAATCTCGAGATGACCCCAACGGCAAGTTATCGGATGGCAAAATCGTCCCGGACTTTA
TTGCAAAATTCATGGGAATTTCACACGATTTACCGCCGGCGCTTAAACCCGGCGTCGATG
TCTCACGAGGAGCTAGCTTTGCCGTAGACGCCGCTACTATACTTGGGGCTCCCAAAGACT
CTTTGAATCTGAATCAACAAGTGAGGAAATTCGATCAGATGATATCAAACTGGAACGAGA
GTTACATTCAGAAATCATTGTTTATGATATCTATTGGTATGGAAGATTACTTAAACTTCA
CCAAAAGCAATCCTACAGCCGATGGTTCTGCTCAAGAAGCTTTTGTCACTTCAGTCATTA
GCAGACTAAAGTACAATATTGAGATGTTGTATTCATTGGGAGCTAGTAAGTTCGTTGTAT
ATATGTTAGCGCCACTAG
TTGC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2BT71TF 732 0 0
G
AAACATTCCTATCTTATTATTATTATCATCTCGTCCATATAAATGGCAACCAACTTCAGT
TTAGCGAGTGTTCTAGGGGTACTTTTTGTATTCACACTGTTCCACAACCCTATCATCGTC
GCCGGACAAAATATTCCGGCGGTGGCATTGTTCACATTCGGAGATTCCAACTTTGACGCA
GGAAATAGAAAGTTCATCACAACTGGTACACTTCCTCAAAACTTCTGGCCTTACGGTAAA
TCTCGAGATGACCCCAACGGCAAGTTATCGGATGGCAAAATCGTCCCGGACTTTATTGCA
AAATTCATGGGAATTTCACACGATTTACCGCCGGCGCTTAAACCCGGCGTCGATGTCTCA
CGAGGAGCTAGCTTTGCCGTAGACGCCGCTACTATACTTGGGGCTCCCAAAGACTCTTTG
AATCTGAATCAACAAGTGAGGAAATTCGATCAGATGATATCAAACTGGAACGAGAGTTAC
ATTCAGAAATCATTGTTTATGATATCTATTGGTATGGAAGATTACTTAAACTTCACCAAA
AGCAATCCTACAGCCGATGGTTCTGCTCAAGAAGCTTTTGTCACTTCAGTCATTAGCAGA
CTAAAGTACAATATTGAGATGTTGTATTCATTGGGAGCTAGTAAGTTCGTTGTATATATG
TTAGCGCCACTAGTTGCTTACCTATCGTGAGACAGACTTTACACTGGTACGAGTGTTACG
AGAAATTCAAC

QA 2 732 2 732
DS 



AS 1 7

CO CL930Contig1 1176 7 18 U
GGGTCTAGCTTTAAGATACCTCAAACCACAAGATATAAAATATTCGGATCTTCATTTGCT
CTTGCTCTGATCAAATAAGTGTATCATTTGCGGACCAAAATTACCGATAAATGGGTATAT
TTCCGGGGTTTGGTGCCTGGATCAACCTGAACAGCCAACAACCTCCGAAGGCCGAGTCCA
AGAAATCTAAGAATGTAAAATCGAAGCCAGGGTCAGAGATAAATACCAATGCGGAGAGCG
AAGAAACGAAGAGGCAATTAAAGATGTGGAGAGCTGAAGAGAAGAAATGGCCATGGCTGC
GAGATTATGCTCCTACCGTGAAGGTGTCCAAATCGAGTGCAGGTGAAACCCATTTGAAGA
TGGACTTTTCAATAGGATTGCCTCCTGAGACAGTCTTCGATATTATAACTAGTCACGACA
ACCAAACATATTCTTACTTCAAACAAATGAAAAGGCGCAAAATCCTGTCAGTCAAATCAA
GCAAG*GTTCTTAGGGATAATGGAAGAGATGAGAAAGTCGTGGTAGTAAAAAAATCTGCG
CCATGGAAGTTTCTTCGGTGGAATGGGAAAATGCCATTAGATCTAGTATTCAATGAGAAC
CGAAAAGATCTCATCACATTATTTAGGATTCCGAGAGAGGATGTAATGAACATGGAATTG
TTTATGGG*TCAGTTGCAAATAAAGCCATGGTACATAGATAGTGATAAATATTGCACGGC
TAGGGTACCAAAAA**ATCCAAAAGAATACCGAAAATGTTCAGGCGGAAAAGGACTAATT
GCGTCGAAATTGAAGTTGG*ACCTGGTTTATAGGCCCATGG*AACCTCTTGATAAGCCGC
CGTTTTCTTGGTACATCCGTCGGGTCATCATCAAAAGCACTAAAAGGTTAGTGGAAGATC
TTCAGATTCGAGGCGCCGTTCTCCGAAGTGTTTGAGACTCTTCACTTCCGGTCTTGGCGC
ATTATATCATGTTGCAAGAAAATAAATAAACGCAAACACTAAACATTAGTATAACTGATC
ACTTTATCTAGATACGAGCGTTGGAGTAGTAATTGTCAAAACCTTTAGTCAATGAACAGC
AACCACACAAAATAAACTCAGTTGTTTACTTTATAGAAAACCTTAAACGTTGTCGTCTCC
CCATATTTTTCTAATATAACCCATGATCTCTTTTCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GH31TF U 3
AF RR2AE53TF U 1
AF RR2BB34TF U 255
AF RR2BY46TF U 65
AF RR2B918TF U 67
AF RR2AE53JQ C 389
AF RR2BB34JQ C 389
BS 1 687 RR2AE53TF
BS 688 688 RR2BB34TF
BS 689 729 RR2AE53TF
BS 730 737 RR2BY46TF
BS 738 799 RR2B918TF
BS 800 800 RR2AE53JQ
BS 801 821 RR2B918TF
BS 822 822 RR2AE53JQ
BS 823 875 RR2B918TF
BS 876 876 RR2AE53JQ
BS 877 886 RR2B918TF
BS 887 920 RR2AE53JQ
BS 921 921 RR2BB34JQ
BS 922 1069 RR2AE53JQ
BS 1070 1070 RR2BB34JQ
BS 1071 1167 RR2AE53JQ
BS 1168 1168 RR2BB34JQ
BS 1169 1176 RR2AE53JQ

RD RR2GH31TF 444 0 0
GG
CTAGCTTTAAGATACCTCAAACCACAAGATATAAAATATT*GGATCTTCATTTGCTCTTG
CTCTGATCAAATAAGTGTATCATTTGCGGACCAAAATTACCGATAAATGGGTATATTTCC
GGGGTTTGGTGCCTGGATCAACCTGAACAGCCAACAACCTCCGAAGGCCGAGTCCAAGAA
ATCTAAGAATGTAAAATCGAAGCCAGGGTCAGAGATAAATACCAATGCGGAGAGCGAAGA
AACGAAGAGGCAATTAAAGATGTGGAGAGCTGAAGAGAAGAAATGGCCATGGCTGCGAGA
TTATGCTCCTCCCGTGAAGGTG*CCAAATCGAGTGCAGGTGAA*CCCATTTGAAGATGGA
CTTTTCA*TAGGATTGCCTCCTGAGACAGTCTTCGATATTATAACTAGTCACGACAACCA
AACATATTCTTACTTCAA
CAAA

QA 3 440 3 440
DS 

RD RR2AE53TF 729 0 0
GGGTCTAGCTTTAAGATACCTCAAACCACAAGATATAAAATATTCGGATCTTCATTTGCT
CTTGCTCTGATCAAATAAGTGTATCATTTGCGGACCAAAATTACCGATAAATGGGTATAT
TTCCGGGGTTTGGTGCCTGGATCAACCTGAACAGCCAACAACCTCCGAAGGCCGAGTCCA
AGAAATCTAAGAATGTAAAATCGAAGCCAGGGTCAGAGATAAATACCAATGCGGAGAGCG
AAGAAACGAAGAGGCAATTAAAGATGTGGAGAGCTGAAGAGAAGAAATGGCCATGGCTGC
GAGATTATGCTCCTACCGTGAAGGTGTCCAAATCGAGTGCAGGTGAAACCCATTTGAAGA
TGGACTTTTCAATAGGATTGCCTCCTGAGACAGTCTTCGATATTATAACTAGTCACGACA
ACCAAACATATTCTTACTTCAAACAAATGAAAAGGCGCAAAATCCTGTCAGTCAAATCAA
GCAAG*GTTCTTAGGGATAATGGAAGAGATGAGAAAGTCGTGGTAGTAAAAAAATCTGCG
CCATGGAAGTTTCTTCGGTGGAATGGGAAAATGCCATTAGATCTAGTATTCAATGAGAAC
CGAAAAGATCTCATCACATTATTTAGGATTCCGAGAGAGGATGTAATGAACATGGAATTG
TTTATGGG*TCAGTTGCAAATAAAGCCGTGGTACATAGATAGTGATAAATATTGCACGGC
TAGGGTACC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2BB34TF 475 0 0
CAATTAAAGATGTGGAGAGCTGAAGAGAAGAAATGGCCATGGCTGCGAGATTATGCTCCT
ACCGTGAAGGTGTCCAAATCGAGTGCAGGTGAAACCCATTTGAAGATGGACTTTTCAATA
GGATTGCCTCCTGAGACAGTCTTCGATATTATAACTAGTCACGACAACCAAACATATTCT
TACTTCAAACAAATGAAAAGGCGCAAAATCCTGTCAGTCAAATCAAGCAAG*GTTCTTAG
GGATAATGGAAGAGATGAGAAAGTCGTGGTAGTAAAAAAGTCTGCGCCATGGAGGTTTCT
TCGGTGGAATGGGAAAATGCCATTAGATCTAGTATTCAATGAGAACCGAAAAGATCTCAT
CACATTATTTAGGATTCCGAGAGAGGATGTAATGAACATGGAATTGTTTATGGG*TCAGT
TGCAAATAAAGCCATGGTACATAGATAGTGATAAATATTGCACGGCTAGGGTACC

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2BY46TF 673 0 0
GGCT
GATCAAATAAGTGTATCATTTGCGGACCAAAATTACCAATAAATGGGTATATTTCCGGGG
TTTGGTGCCTGGATCAACCTGAACAGCCAACAACCTCCGAAGGCCGAGTCCAAGAAATCT
AAGAATGTAAAATCAAAGCCAGGGTCAGAGATAAATACCAATGCGGAGAGCGAAGAAACG
AAGAGGCAATTAAAGATGTGGAGAGCTGAAGAGAAGAAATGGCCATGGCTGCGAGATTAT
GCTCCTACCGTGAAGGTGTCCAAATCGAGTGCAGGTGAAACCCATTTGAAGATGGACTTT
TCAATAGGATTGCCTCCTGAGACAGTCTTCGATATTATAACTAGTCACGACAACCAAACA
TATTCTTACTTCAAACAAATGAAAAGGCGCAAAATCCTGTCAGTCAAATCAAGCAAG*GT
TCTTAGGGATAATGGAAGGGATGAGAAAGTCGTGGTAGTAAAAAAATCTGCGCCATGGAA
GTTTCTTCGGTGGAATGGCAAAATGCCATTAGATCTAGTATTCAATGAGAACCGAAAAGA
TCTCATTACATTATTTAGGATTCCGAGAGAGGATGTAATGAACATGGAATTGTTTATGGG
*TCAGTTGCAAATAAAGCCATGGTACATAGATAGTGATAAATATTGCACGGCTAGGGTAC
CAAAAA**A

QA 5 673 5 673
DS 

RD RR2B918TF 823 0 0
GG
GATCAAATAAGTGTATCATTTGCGGACCAAAATTACCGATAAATGGGTATATTTCCGGGG
TTTGGTGCCTGGATCAACCTGAACAGCCAACAACCTCCGAAGGCCGAGTCCAAGAAATCT
AAGAACGTAAAATCGAAGCCAGGGTCAGAGATAAATACCAATGCGGAGAGCGAAGAAACG
AAGAGGCAATTAAAGATGTGGAGAGCTGAAGAGAAGAAATGGCCATGGCTGCGAGATTAT
GCTCCTACCGTGAAGGTGTCCAAATCGAGTGCAGGTGGAACCCATTTGAAGATGGACTTT
TCAATAGGATTGCCTCCTGAGACAGTCTTCGATATTATAACTAGTCACGACAACCAAACA
TATTCTTACTTCAAACAAATGAAAAGGCTCAAAATCCTGTCAGTCAAATCAAGCAAGAGT
TCTTAGGGATAATGGAAGAGATGAGAAAGTCGTGGTAGTAAAAAAATCTGCGCCATGGAA
GTTTCTTCGGTGGAATGGGAAAATGCCATTAGATCTAGTATTCAATGAGAACCGAAAAGA
TCTCATCACATTATTTAGGATTCCGAGAGAGGATGTAATGAACATGGAATTGTTTATGGG
GTCAGTTGCAAATAAAGCCATGGTACATAGA*AGTGATAAATATTGCACGGCTAGGGTAC
CAAAAA**ATCCAAAAGAATACCGAAAATGTTCAGGCGGAAAAGGACTAATTGCGTCGAA
ATTGAAGTTGGGACCTGGTTTATAGGCCCATGGGAACCTCTTGATAAGCCGCCGTTTTCT
TGGTACATCCGTCGGGTCATCATCAAA*GCACTAAAAG
TTA

QA 3 820 3 820
DS 

RD RR2AE53JQ 788 0 0
GACAGTCTTCGATATTATAACTAGTCACGACAACCAAACATATTCTTACTTCAAACAAAT
GAAAAGGCGCAAAATCCTGTCAGTCAAATCAAGCAAG*GTTCTTAGGGATAATGGAAGAG
ATGAGAAAGTCGTGGTAGTAAAAAAATCTGCGCCATGGAAGTTTCTTCGGTGGAATGGGA
AAATGCCATTAGATCTAGTATTCAATGAGAACCGAAAAGATCTCATCACATTATTTAGGA
TTCCGAGAGAGGATGTAATGAACATGGAATTGTTTATGGG*TCAGTTGCAAATAAAGCCG
TGGTACATAGATAGTGATAAATATTGCACGGCTAGGGTACCAAAAA**ATCCAAAAGAAT
ACCGAAAATGTTCAGGCGGAAAAGGACTAATTGCGTCGAAATTGAAGTTGG*ACCTGGTT
TATAGGCCCATGG*AACCTCTTGATAAGCCGCCGTTTTCTTGGTACATCCGTCGGGTCAT
CATCAAAAGCACTAAAAGGTTAGTGGAAGATCTTCAGATTCGAGGCGCCGTTTTCCGAAG
TGTTTGAGACTCTTCACTTCCGGTCTTGGCGCATTATATCATGTTGCAAGAAAATAAATA
AACGCAAACACTAAACATTAGTATAACTGATCACTTTATCTAGATACGAGCGTTGGAGTA
GTAATTGTCAAAACCTTTAGTTAATGAACAGCAACCACACAAAATAAACTCAGTTGTTTA
CTTTATAGAAAACCTTAAACGTTGTCGTCTCCCCATATTTTTCTAATATAACCCATGATT
TCTTTTCC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2BB34JQ 788 0 0
GACAGTCTTCGATATTATAACTAGTCACGACAACCAAACATATTCTTACTTCAAACAAAT
GAAAAGGCGCAAAATCCTGTCAGTCAAATCAAGCAAG*GTTCTTAGGGATAATGGAAGAG
ATGAGAAAGTCGTGGTAGTAAAAAAGTCTGCGCCATGGAGGTTTCTTCGGTGGAATGGGA
AAATGCCATTAGATCTAGTATTCAATGAGAACCGAAAAGATCTCATCACATTATTTAGGA
TTCCGAGAGAGGATGTAATGAACATGGAATTGTTTATGGG*TCAGTTGCAAATAAAGCCA
TGGTACATAGATAGTGATAAATATTGCACGGCTAGGGTACCAAAAAAAATCCAAAAGAAT
ACCGAAAATGTTCAGGCGGAAAAGGACTAATTGCGTCGAAATTGAAGTTGG*ACCTGGTT
TATAGGCCCATGG*AACCTCTTGATAAGCCGCCGTTTTCTTGGTACATCCGTCGGGTCAT
CATCAAAAGCACTAAAAGGTTAGTGGAAGATCTTCAGATTCGAGGCGCCGTTCTCCGAAG
TGTTTGAGACTCTTCACTTCCGGTCTTGGCGCATTATATCATGTTGCAAGAAAATAAATA
AACGCAAACACTAAACATTAGTATAACTGATCACTTTATCTAGATACGAGCGTTGGAGTA
GTAATTGTCAAAACCTTTAGTCAATGAACAGCAACCACACAAAATAAACTCAGTTGTTTA
CTTTATAGAAAACCTTAAACGTTGTTGTCTCCCCATATTTTTCTAATATAACCCATGATC
TCTTTTCC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 2 8

CO CL931Contig1 686 2 2 U
GGGATCAAAAGCTCACATTGAGAGAGAGAAGTAGACAAGTCTCTCACATAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAACCCACCGGAGAAAAAAAAAGAGAAGAAGATGTCGTGGCAATCGTACGTTGA
TGACCACCTCATGTGCGACGTCGAAGGCAGCCAGCTCACCGCCGCCGCTATTCTCGGCCA
AGACGGCAGCGTCTGGGCTCAGAGCGCCAATTTCCCTCAGTTGAAGAGTGAAGAAATCAA
AGGAATCACAAAGGACTTCGAGGAGCCTGGGCATCTTGCACCAACCGGACTTTTTCTGGG
TGGAGCCAAGTACATGGTTATTCAAGGTGAGCCAGGAGCTGTGATCCGAGGCAAGAAGGG
ACCTGGAGGAGTTACTATCAAGAAGACGAATCAAGCATTGGTCATTGGCATCTACGAGGA
GCCCATGACTGGTGGTCAATGCAACTTGGTTGTGGAGAGGCTTGGTGATTATCTCATCGA
GTCTGATCTCTAAATTTTTCAGTTTCAAAAGTCTCTTCTTTCTTTTTAACTAAAGAAATG
TTCTTTTATCATTGTGATTGAATCGTAATGCTATCAAAACGCAAATCAAATTTGAGGTTT
GGAACCAATATCTTGTTGTTGGTCTTTGTTATTACCGGGTTTGTGTGTCTTATGTAATGG
CATTTTGATCATCTCTTCATCCCTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA52TF U 1
AF RR2DA52JQ C 1
BS 1 655 RR2DA52TF
BS 656 686 RR2DA52JQ

RD RR2DA52TF 655 0 0
GGGATCAAAAGCTCACATTGAGAGAGAGAAGTAGACAAGTCTCTCACATAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAACCCACCGGAGAAAAAAAAAGAGAAGAAGATGTCGTGGCAATCGTACGTTGA
TGACCACCTCATGTGCGACGTCGAAGGCAGCCAGCTCACCGCCGCCGCTATTCTCGGCCA
AGACGGCAGCGTCTGGGCTCAGAGCGCCAATTTCCCTCAGTTGAAGAGTGAAGAAATCAA
AGGAATCACAAAGGACTTCGAGGAGCCTGGGCATCTTGCACCAACCGGACTTTTTCTGGG
TGGAGCCAAGTACATGGTTATTCAAGGTGAGCCAGGAGCTGTGATCCGAGGCAAGAAGGG
ACCTGGAGGAGTTACTATCAAGAAGACGAATCAAGCATTGGTCATTGGCATCTACGAGGA
GCCCATGACTGGTGGTCAATGCAACTTGGTTGTGGAGAGGCTTGGTGATTATCTCATCGA
GTCTGATCTCTAAATTTTTCAGTTTCAAAAGTCTCTTCTTTCTTTTTAACTAAAGAAATG
TTCTTTTATCATTGTGATTGAATCGTAATGCTATCAAAACGCAAATCAAATTTGAGGTTT
GGAACCAATATCTTGTTGTTGGTCTTTGTTATTACCGGGTTTGTGTGTCTTATGT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2DA52JQ 686 0 0
GGGATCAAAAGCTCACATTGAGAGAGAGAAGTAGACAAGTCTCTCACATAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAACCCACCGGAGAAAAAAAAAGAGAAGAAGATGTCGTGGCAATCGTACGTTGA
TGACCACCTCATGTGCGACGTCGAAGGCAGCCAGCTCACCGCCGCCGCTATTCTCGGCCA
AGACGGCAGCGTCTGGGCTCAGAGCGCCAATTTCCCTCAGTTGAAGAGTGAAGAAATCAA
AGGAATCACAAAGGACTTCGAGGAGCCTGGGCATCTTGCACCAACCGGACTTTTTCTGGG
TGGAGCCAAGTACATGGTTATTCAAGGTGAGCCAGGAGCTGTGATCCGAGGCAAGAAGGG
ACCTGGAGGAGTTACTATCAAGAAGACGAATCAAGCATTGGTCATTGGCATCTACGAGGA
GCCCATGACTGGTGGTCAATGCAACTTGGTTGTGGAGAGGCTTGGTGATTATCTCATCGA
GTCTGATCTCTAAATTTTTCAGTTTCAAAAGTCTCTTCTTTCTTTTTAACTAAAGAAATG
TTCTTTTATCATTGTGATTGAATCGTAATGCTATCAAAACGCAAATCAAATTTGAGGTTT
GGAACCAATATCTTGTTGTTGGTCTTTGTTATTACCGGGTTTGTGTGTCTTATGTAATGG
CATTTTGATCATCTCTTCATCCCTTC

QA 1 686 1 686
DS 



CO CL931Contig2 748 6 10 U
TCTCACATAAAAAAAAAAAAAAAAACCACCGGAGAAAAAAAAAGAGAAGAAGATGTCGTG
GCAATCGTACGTTGATGACCACCTCATGTGCGACGTCGAAGGCAGCCAGCTCACCGCCGC
CGCTATTCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTGGGCTCAGAGCGCCAATTTCCCTCAGTTGAA
GAGTGAAGAAATCAAAGGAATCACAAAGGACTTCGAGGAGCCTGGGCATCTTGCACCAAC
CGGACTCTTTCTGGGTGGAGCCAAGTACATGGTTATTCAAGGTGAGCCAGGAGCTGTGAT
CCGAGGCAAGAAGGGACCTGGAGGAGTTACTATCAAGAAGACGAATCAAGCATTGGTCAT
TGGCATCTACGAGGAGCCCATGACTGGTGGTCAATGCAACTTGGTTGTGGAGAGGCTTGG
TGATTACCTCATCGAGTCTGATCTCTAAATTTTTCAGTTTCAAAAGTCTCTTCTTTCTCT
TTTAACTAAAAAAAAATGTCCTTTTCTCATTGTGATTGAATCGTAATGCTATCAAAACGC
AAATCAATTTGAAGATTTGGAACCAATATCTTGTTGTTGGTCTTTGTTATTACCGGGTTT
GTGTGTCTTATGTAATGGCATTTTGATCATCTTTTTATCCCTCCATATGCATTGTGTTTT
TTTTTTAGATTTTTATATCTCCATAGTTTTATTTTCTTTGAATTGATCTGTGGTTGGTTT
ACGTTTTATGGTTTTGAACATATTCGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW89JQ C 1
AF RR2GW89TF U 51
AF RR2DJ37TF U 48
AF RR2DS09JQ C 125
AF RR2DJ37JQ C 155
AF RR2EX14TF U 456
BS 1 52 RR2GW89JQ
BS 53 175 RR2GW89TF
BS 176 178 RR2DJ37TF
BS 179 328 RR2GW89TF
BS 329 329 RR2DJ37TF
BS 330 495 RR2GW89TF
BS 496 496 RR2DJ37TF
BS 497 631 RR2GW89TF
BS 632 660 RR2DJ37TF
BS 661 748 RR2EX14TF

RD RR2GW89JQ 631 0 0
TCTCACATAAAAAAAAAAAAAAAAACCACCGGAGAAAAAAAAAGAGAAGAAGATGTCGTG
GCAATCGTACGTTGATGACCACCTCATGTGCGACGTCGAAGGCAGCCAGCTCACCGCCGC
CGCTATTTTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTGGGCTCAGAGCGCCAATTTCCCTCAG**AAA
GAGTGAAGAAATCAAAGGAATCACAAAGGACTTCGAGGAGCCTGGGCATCTTGCACCAAC
CGGACTCTTTCTGGGTGGAGCCAAGTACATGGTTATTCAAGGTGAGCCAGGAGCTGTGAT
CCGAGGCAAGAAGGGACCTGGAGGAGTTGCTATCAAGAAGACGAATCAAGCATTGGTCAT
TGGCATCTACGAGGAGCCCATGACTGGTGGTCAATGCAACTTGGTTGTGGAGAGGCTTGG
TGATTACCTCATCGAGTCTGATCTCTAAATTTTTCAGTTTCAAAAGTCTCTTCTTTCTCT
TTTAACTAAAAAAAA*TGTCCTTTTCTCATTGTGATTGAATCGTAATGCTATCAAAACGC
AAATCAATTTGAAGATTTGGAACCAATATCTTGTTGTTGGTCTTTGTTATTACCGGGTTT
GTGTGTCTTATGTAATGGCATTTTGATCATC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2GW89TF 581 0 0
AA
ATGTCGTGGCAATCGTACGTTGATGACCACCTCATGTGCGACGTCGAAGGCAGCCAGCTC
ACCGCCGCCGCTATTCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTGGGCTCAGAGCGCCAATTTCCCT
CAG**AAAGAGTGAAGAAATCAAAGGAATCACAAAGGACTTCGAGGAGCCTGGGCATCTT
GCACCAACCGGACTCTTTCTGGGTGGAGCCAAGTACATGGTTATTCAAGGTGAGCCAGGA
GCTGTGATCCGAGGCAAGAAGGGACCTGGAGGAGTTGCTATCAAGAAGACGAATCAAGCA
TTGGTCATTGGCATCTACGAGGAGCCCATGACTGGTGGTCAATGCAACTTGGTTGTGGAG
AGGCTTGGTGATTACCTCATCGAGTCTGATCTCTAAATTTTTCAGTTTCAAAAGTCTCTT
CTTTCTCTTTTAACTAAAAAAAA*TGTCCTTTTCTCATTGTGATTGAATCGTAATGCTAT
CAAAACGCAAATCAATTTGAAGATTTGGAACCAATATCTTGTTGTTGGTCTTTGTTATTA
CCGGGTTTGTGTGTCTTATGTAATGGCATTTTGATCATC

QA 3 581 3 581
DS 

RD RR2DJ37TF 613 0 0
AAAAA
ATGTCGTGGCAATCGTACGTTGATGACCACCTCATGTGCGACGTCAAAGGCAGCCAGCTC
ACCGCCGCCGCTATTCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTGGGCTCAAAGCGCCAATTTCCCT
CAGTTGAAGAGTGAAGAAATCAAAGGAATCACAAAGGACTTCGAGGAGCCTGGGCATCTT
GCACCAACCGGACTCTTTCTGGGTGGAGCCAAGTACATGGTTATTCAAGGTGAGCCAGGA
GCTGTGATCCGAGGCAAGAAGGGACCTGGAGGAGTTACTATCAAGAAGACGAATCAAGCA
TTGGTCATTGGCATCTACAAGGAGCCCATGACTGGTGGTCAATGCAACTTGGTTGTGGAG
AGGCTTGGTGATTACCTCATCGAGTCTGATCTCTAAATTTTTCAGTTTCAAAAGTCTCTT
CTTTCTCTTTTAACTAAAAAAAAATGTCCTTTTCTCATTGTGATTGAATCGTAATGCTAT
CAAAACGCAAATCAATTTGAAGATTTGGAACCAATATCTTGTTGTTGGTCTTTGTTATTA
CCGGGTTTGTGTGTCTTATGTAATGGCATTTTGATCATCTTTTTATCCCTCCATATGCAT
TGTGTTTT

QA 6 613 6 613
DS 

RD RR2DS09JQ 507 0 0
ATTCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTGGGCTCAGAGCGCCAATTTCCCTCAGTTGAAGAGT
GAAGAAATCAAAGGAATCACAAAGGACTTCGAGGAGCCTGGGCATCTTGCACCAACCGGA
CTCTTTCTGGGTGGAGCCAAGTACATGGTTATTCAAGGTGAGCCAGGAGCTGTGATCCGA
GGCAAGAAGGGACCTGGAGGAGTTACTATCAAGAAGACGAATCAAGCATTGGTCATTGGC
ATCTACGAGGAGCCCATGACTGGTGGTCAATGCAACTTGGTTGTGGAGAGGCTTGGTGAT
TACCTCATCGAGTCTGATCTCTAAATTTTTCAGTTTCAAAAGTTTCTGCTTTCTCTTTTA
ACTAAAAAAAAATGTCCTTTTCTCATTGTGATTGAATCGTAATGCTATCAAAACGCAAAT
CAATTTGAAGATTTGGAACCAATATCTTGTTGTTGGTCTTTGTTATTACCGGGTTTGTGT
GTCTTATGTAATGGCATTTTGATCATC

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2DJ37JQ 546 0 0
CAGAGCGCCAATTTCCCTCAGTTGAAGAGTGAAGAAATCAAAGGAATCACAAAGGACTTC
GAGGAGCCTGGGCATCTTGCACCAACCGGACTCTTTCTGGGTGGAGCCAAGTACATGGTT
ATTCAAGGTGAGCCAGGAGCTGTGATCCGAGGCAAGAAGGGACCTGGAGGAGTTACTATC
AAGAAGACGAATCAAGCATTGGTCATTGGCATTTACGAGGAGCCCATGACTGGTGGTCAA
TGCAACTTGGTTGTGGAGAGGCTTGGTGATTACCTCATCGAGTCTGATCTCTAAATTTTT
CAGTTTCAAAAGTCTCTTCTTTCTCTTTTAACTAAAAAAAAATGTCCTTTTCTCATTGTG
ATTGAATCGTAATGCTATCAAAACGCAAATCAATTTGAAGATTTGGAACCAATATCTTGT
TGTTGGTCTTTGTTATTACCGGGTTTGTGTGTCTTATGTAATGGCATTTTGATCATCTTT
TTATCCCTCCATATGCATTGTGTTTTTTTTT*AGATTTTTATATCTCCATAGTTTTATTT
TCTTTG

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2EX14TF 293 0 0
G
GTTTCAAAAGTCTCTTCTTTCTCTTTTAACTAAAAAAAAATGTCCTTTTCTCATTGTGAT
TGAATCGTAATGCTATCAAAACGCAAATCAATTTGAAGATTTGGAACCAATATCTTGTTG
TTGGTCTTTGTTATTACCGGGTTTGTGTGTCTTATGTAATGGCATTTTGATCATCTTTTT
ATCCCTCCATATGCATTGTGTTTTTTTTTTAGATTTTTATATCTCCATAGTTTTATTTTC
TTTGAATTGATCTGTGGTTGGTTTACGTTTTATGGTTTTGAACATATTCGTG

QA 2 293 2 293
DS 



AS 2 8

CO CL932Contig1 836 6 46 U
GGACACTCAATTCTTTCACTTTCTATCTAGCTTTCTTACAAGAAACACCAATGGCAAAAC
TAAACCAAACTCTCTTTCTAATTCTCTCAATCTTCTTCTTCTTCTCGCCGGCGCTCACTG
CCGCCACCGCAGCCTCACGGGCTGGAGCCTCCAACAAAGCCGTGAACTTCATCCAATCTT
CTTGCAAAACCACCACATACCCAGCCGTGTGCTTCCACTCCCTCTCAGCCTACGCAAACG
CTATACAAACAAGCCCTAAACGCTTAGCCGAGACCGCTCTAGCCGTTACCCTGAGCCGAG
CCCAATCCACCAAACTCTTCGTCTCGCGTCTGACGCGTTTCAAGGGCCTTAAGAAGCGCG
AGGTCGAAGCCATCAAGGACTGCGTTGAGGAGATCAACGATACCATTGACCGTTTGACCA
AGTCGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGGAGTGCCAAAAATCAAGATCAGTTTGCGTTCC
ACATGAGTAATGCTCAGACTTGGACTAGTGCGGCTTTGACAGATGAGAACACTTGCTCCG
ATGGTTTCTCGGGTCGGGTCATGGATGGAAGGATCAAGAACTCGGTTCGAGCTAGAATTG
TTAACGTGGGTCACGAAACCAGCAACGCCTTGTCCTTGATTAATGCATTTGCTAAAAAGT
ATTAATTTAAAACTAGTTTTAAGAAATATTTTGTGGCATCTCATATATAAATAATATATA
TAATGATCTTCGTAA*TGTAATATATATATGTCGAGTTGGTTAGATTTTTTTTTTCTTAT
GTGGTTTGTACTATTGTTCATTTGTATTTTGAGATATAAAGTTTAAGAAGTTGAGG


BQ
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 15 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 25 25 15 40 40 40 15 25 40 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 0 0 0 0 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH19TF U 1
AF RR2GB55TF U -1
AF RR2FR81TF U 1
AF RR2GW55TF U 1
AF RR2BU63TF U 1
AF RR2FR81JQ C 94
BS 1 14 RR2BU63TF
BS 15 15 RR2GB55TF
BS 16 82 RR2BU63TF
BS 83 83 RR2GB55TF
BS 84 93 RR2BU63TF
BS 94 94 RR2GB55TF
BS 95 241 RR2BU63TF
BS 242 242 RR2GB55TF
BS 243 280 RR2BU63TF
BS 281 281 RR2GB55TF
BS 282 379 RR2BU63TF
BS 380 380 RR2GB55TF
BS 381 385 RR2BU63TF
BS 386 386 RR2GB55TF
BS 387 466 RR2BU63TF
BS 467 467 RR2GB55TF
BS 468 472 RR2BU63TF
BS 473 473 RR2GB55TF
BS 474 541 RR2BU63TF
BS 542 542 RR2GH19TF
BS 543 619 RR2BU63TF
BS 620 620 RR2GB55TF
BS 621 629 RR2BU63TF
BS 630 630 RR2GB55TF
BS 631 631 RR2BU63TF
BS 632 632 RR2GH19TF
BS 633 657 RR2BU63TF
BS 658 658 RR2GB55TF
BS 659 710 RR2BU63TF
BS 711 711 RR2GB55TF
BS 712 725 RR2BU63TF
BS 726 726 RR2GB55TF
BS 727 729 RR2BU63TF
BS 730 730 RR2GB55TF
BS 731 740 RR2BU63TF
BS 741 741 RR2FR81TF
BS 742 751 RR2BU63TF
BS 752 752 RR2GB55TF
BS 753 761 RR2BU63TF
BS 762 762 RR2GB55TF
BS 763 771 RR2BU63TF
BS 772 775 RR2FR81JQ
BS 776 778 RR2BU63TF
BS 779 779 RR2FR81JQ
BS 780 797 RR2BU63TF
BS 798 836 RR2FR81JQ

RD RR2GH19TF 771 0 0
GGACACTCAATTCTCTCACTTTCTATCTAGCTTTCTTACAAGAAACACCAATGGCAAAAC
TAAACCAAACTCTCTTTCTAATCCTCTCAATCTCCTTCTTCTTCTCGCCGGCGCTCACTG
CCGCCACCGCAGCCTCACGGGCTGGAGCCTCCAACAAAGCCGTGAACTTCATCCAATCTT
CTTGCAAAACCACCACATACCCAGCCGTGTGCTTCCACTCCCTCTCAGCCTACGCAAACG
CCATACAAACAAGCCCTAAACGCTTAGCCGAGACCGCTCTGGCCGTTACCCTGAGCCGAG
CCCAATCCACCAAACTCTTCGTCTCGCGTCTGACGCGTTTCAAGGGCCTTAAGAAGCGCG
AGGTCGAAGCCATCAAGGATTGCGTGGAG*AGATCAACGATACCATTGACCGTTTGACCA
AGTCGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGGAGTGCCAAAAATCAAGAACAGTTCGCGTTCC
ACATGAGTAATGCTCAGACTTGGACTAGTGCGGCTTTGACAGATGAGAACACTTGCTCCG
ATGGTTTCTCGGGTCGGGTCATGGATGGAAG*ATCGAGAACTCGGTTCGAGCTAGAATTG
TTAACGTGGGTCACGAAACTAGCAACGCCCTGTCCTTGATTAATGCATTTGCTAAAA*GT
ATTAATTTAAAACTAGTTTTA*GAAATATTTTGTGGCATCTCATATATAA*TA*TATATA
TAT**GTCTC*GTAA*TGTA*TATATATATGC
GAGTGTAGATTTTTTTCTG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2GB55TF 781 0 0
GGAC
ACACTCAATTCTTTCACTTTCTATCTAGCTTTCTTACAAGAAACACCAATGGCAAAACTA
AACCAAACTCTCTTTCTAATTCTCTCAATCTTCTTCTTCTTCTCGCCGGCGCTCACTGCC
GCCACCGCAGCCTCACGGGCTGGAGCCTCCAACAAAGCCGTGAACTTCATCCAATCTTCT
TGCAAAACCACCACATACCCAGCCGTGTGCTTCCACTCCCTCTCAGCCTACGCAAACGCT
ATACAAACAAGCCCTAAACGCTTAGCCGAGACCGCTCTAGCCGTTACCCTGAGCCGAGCC
CAATCCACCAAACTCTTCGTCTCGCGTCTGACGCGTTTCAAGGGCCTTAAGAAGCGCGAG
GTCGAAGCCATCAAGGACTGCGTTGAGGAGATCAACGATACCATTGACCGTTTGACCAAG
TCGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGGAGTGCCAAAAATCAAGATCAGTTTGCGTTCCAC
ATGAGTAATGCTCAGACTTGGACTAGTGCGGCTTTGACAGATGAGAACACTTGCTCCGAT
GGTTTCTCGGGTCGGGTCATGGATGGAAGGATCAAGAACTCGGTTCGAGCTAGAATTGTT
AACGTGGGTCACGAAACCAGCAACGCCTTGTCCTTGATTAATGCATTTGCTAAAAAGTAT
TAATTTAAAACTAGTTTTAAGAAATATTTTGTGGCATCTCATATATAAATAATATATATA
ATGATCTTCGTAA*TGTA*TATATATATGTCGAGTTGGTTAGATTTTTT
TTTTTTAT

QA 5 773 5 773
DS 

RD RR2FR81TF 769 0 0
GGACACTCAATTCTTTCACTTTCTATCTAGCTTTCTTACAAGAAACACCAATGGCAAAAC
TAAACCAAACTCTCTTTCTAATTCTCTCAATCTTCTTCTTCTTCTCGCCGGCGCTCACTG
CCGCCACCGCAGCCTCACGGGCTGGAGCCTCCAACAAAGCCGTGAACTTCATCCAAT*TT
CTTGCAAAACCACCACATACCCAGCCGTGTGCTTCCACTCCCTCTCAGCCTACGCAAACG
CTATACAAACAAGCCCTAAACGCTTAGCCGAGACCGCTCTAGCCGTTACCCTGAGCCGAG
CCCAATCCACCAAACTCTTCGTCTCGCGTCTGACGCGTTTCAAGGGCCTTAAGAAGCGCG
AGGTCGAAGCCATCAAGGACTGCGTTGAGGAGATCAACGATACCATTGACCGTTTGACCA
AGTCGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGAAGTGCCAAAAATCAAGATCAGTTTGCGTTCC
ACATGAGTAATGCTCAGACTTGGACTAGTGCGGCTTTGACAGATGAGAACACTTGCTCCG
ATGGTTTCTCGGGTCGGGTCATGGATGGAAGGATCAAGAACTCGGTTCGAGCTAGAATTG
TTAACGTGGGTCACGAAACCAGCAACGCCTTGTCCTTGATTAATGCATTTGCTAAAAAGT
ATTAATTTAAAACTAGTTTTAAGAAATATTTTGTGGCATCTCATATATAAATAATATATA
TAATGATCTTCGTAA*TGTAATATATATATGTCGAGTTGGTTAGATTTT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2GW55TF 732 0 0
GGACACTCAATTCTTTCACTTTCTATCTAGCTTTCTTACAAGAAACACCAATGGCAAAAC
TAAACCAAACTCTCTTTCTAATTCTCTCAATCTTCTTCTTCTTCTCGCCGGCGCTCACTG
CCGCCACCGCAGCCTCACGGGCTGGAGCCTCCAACAAAGCCGTGAACTTCATCCAATCTT
CTTGCAAAACCACCACATACCCAGCCGTGTGCTTCCACTCCCTCTCAGCCTACGCAAACG
CTATACAAACAAGCCCTAAACGCTTAGCCGAGACCGCTCTAGCCGTTACCCTGAGCCGAG
CCCAATCCACCAAACTCTTCGTCTCGCGTCTGACGCGTTTCAAGGGCCTTAAGAAGCGCG
AGGTCGAAGCCATCAAGGACTGCGTTGAGGAGATCAACGATACCATTGACCGTTTGACCA
AGTCGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGGAGTGCCAAAAATCAAGATCAGTTTGCGTTCC
ACATGAGTAATGCTCAGACTTGGACTAGTGCGGCTTTGACAGATGAGAACACTTGCTCCG
ATGGTTTCTCGGGTCGGGTCATGGATGGAAGGATCAAGAACTCGGTTCGAGCTAGAATTG
TTAACGTGGGTCACGAAACCAGCAACGCCTTGTCCTTGATTAATGCATTTGCTAAAAAGT
ATTAATTTAAAACTAGTTTTAAGAAATATTTTGTGGCATCTCATATATAAATAATATATA
TAATGATCTTCG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2BU63TF 797 0 0
GGACACTCAATTCTCTCACTTTCTATCTAGCTTTCTTACAAGAAACACCAATGGCAAAAC
TAAACCAAACTCTCTTTCTAATCCTCTCAATCTCCTTCTTCTTCTCGCCGGCGCTCACTG
CCGCCACCGCAGCCTCACGGGCTGGAGCCTCCAACAAAGCCGTGAACTTCATCCAATCTT
CTTGCAAAACCACCACATACCCAGCCGTGTGCTTCCACTCCCTCTCAGCCTACGCAAACG
CCATACAAACAAGCCCTAAACGCTTAGCCGAGACCGCTCTGGCCGTTACCCTGAGCCGAG
CCCAATCCACCAAACTCTTCGTCTCGCGTCTGACGCGTTTCAAGGGCCTTAAGAAGCGCG
AGGTCGAAGCCATCAAGGATTGCGTGGAGGAGATCAACGATACCATTGACCGTTTGACCA
AGTCGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGGAGTGCCAAAAATCAAGAACAGTTCGCGTTCC
ACATGAGTAATGCTCAGACTTGGACTAGTGCGGCTTTGACAGATGAGAACACTTGCTCCG
ACGGTTTCTCGGGTCGGGTCATGGATGGAAGGATCAAGAACTCGGTTCGAGCTAGAATTG
TTAACGTGGGTCACGAAACTAGCAACGCCCT*TCCTTGATTAATGCATTTGCTAAAA*GT
ATTAATTTAAAACTAGTTTTAAGAAATATTTTGTGGCATCTCATATATAA*TAATATATA
TAATGGTCTCCGTAA*TGTA*TATATATATGCCGAGTTGGT*AGATTTTTT****CTTGT
GTGGTTTGTACTATTGT

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2FR81JQ 743 0 0
TCTTCTTCTTCTCGCCGGCGCTCACTGCCGCCACCGCAGCCTCACGGGCTGGAGCCTCCA
ACAAAGCCGTGAACTTCATCCAAT*TTCTTGCAAAACCACCACATACCCAGCCGTGTGCT
TCCACTCCCTCTCAGCCTACGCAAACGCTATACAAACAAGCCCTAAACGCTTAGCCGAGA
CCGCTCTAGCCGTTACCCTGAGCCGAGCCCAATCCACCAAACTCTTCGTCTCGCGTCTGA
CGCGTTTCAAGGGCCTTAAGAAGCGCGAGGTCGAAGCCATCAAGGACTGCGTTGAGGAGA
TCAACGATACCATTGACCGTTTGACCAAGTCGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGAAGTG
CCAAAAATCAAGATCAGTTTGCGTTCCACATGAGTAATGCTCAGACTTGGACTAGTGCGG
CTTTGACAGATGAGAACACTTGCTCCGATGGTTTCTCGGGTCGGGTCATGGATGGAAGGA
TCAAGAACTCGGTTCGAGCTAGAATTGTTAACGTGGGTCACGAAACCAGCAACGCCTTGT
CCTTGATTAATGCATTTGCTAAAAAGTATTAATTTAAAACTAGTTTTAAGAAATATTTTG
TGGCATCTCATATATAAATAATATATATAATGATCTTCGTAAATGTAATATATATATGTC
GAGTTGGTTAGATTTTTTTTTTCTTATGTGGTTTGTACTATTGTTCATTTGTATTTTGAG
ATATAAAGTTTAAGAAGTTGAGG

QA 1 743 1 743
DS 



CO CL932Contig2 829 2 18 U
GGGACACTCAATTCTTTCACTTTCTATCTAGTTTTCTTACAAGAAACACCAATGGCAAAA
CTAAACCAAACTCTCTTTCTAATTCTCTCAATCTTCTTCTTCTCGCCGGCGCTCACTGCC
GCCACCGCAGCCTCACGGGCTGGAGCCTCCAACAAAGCCGTGAACTTCATCCAATCTTCT
TGCAAAACCACCACATACCCAGCCGTGTGCTTCCACTCCCTCTCAGCCTACGCAAACGCC
ATACAAACAAGCCCTAAACGCTTAGCCGAGACCGCTCTAGCCGTTACCCTGAGCCGAGCC
CAATCCACCAAACTCTTCGTCTCGCGTCTGACGCGTTTCAAGGGCCTTAAGAAGCGCGAG
GTCGAAGCCATCAAGGACTGCGTGGAGGAGATCAACGATACCATTGACCGTTTGACCAAG
TCGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGGAGTGCCAAAAATCAAGAACAGTTCGCGTTCCAC
ATGAGTAATGCTCAGACTTGGACTAGTGCGGCTTTGACAGATGAGAACACTTGCTCCGAC
GGTTTCTCGGGTCGGGTCATGGATGGAAGGATCAAGAACTCGGTTCGAGCTAGAATTGTT
AACGTGGGTCACGAAACCAGCAACGCCCTGTCCTTGATTAATGCATTTGCTAAAAAGTAT
TAATTTAAAACTAGTTTTAAGAAATATTTTGTGGCATCTCATATATAAATAATATATATA
ATGGTCTCCGTAAATGTAATATATATATGCCGAGTTGGTTAGATTTTTTTCTTGTGTGGT
TTGTACTATTGTCCATTTGTATTTTGAGATATAAAAGTTTAAGAAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER55TF U 1
AF RR2BU63JQ C 202
BS 1 239 RR2ER55TF
BS 240 240 RR2BU63JQ
BS 241 263 RR2ER55TF
BS 264 264 RR2BU63JQ
BS 265 351 RR2ER55TF
BS 352 352 RR2BU63JQ
BS 353 383 RR2ER55TF
BS 384 384 RR2BU63JQ
BS 385 464 RR2ER55TF
BS 465 465 RR2BU63JQ
BS 466 470 RR2ER55TF
BS 471 471 RR2BU63JQ
BS 472 539 RR2ER55TF
BS 540 540 RR2BU63JQ
BS 541 627 RR2ER55TF
BS 628 628 RR2BU63JQ
BS 629 646 RR2ER55TF
BS 647 829 RR2BU63JQ

RD RR2ER55TF 646 0 0
GGGACACTCAATTCTTTCACTTTCTATCTAGTTTTCTTACAAGAAACACCAATGGCAAAA
CTAAACCAAACTCTCTTTCTAATTCTCTCAATCTTCTTCTTCTCGCCGGCGCTCACTGCC
GCCACCGCAGCCTCACGGGCTGGAGCCTCCAACAAAGCCGTGAACTTCATCCAATCTTCT
TGCAAAACCACCACATACCCAGCCGTGTGCTTCCACTCCCTCTCAGCCTACGCAAACGCT
ATACAAACAAGCCCTAAACGCTTGGCCGAGACCGCTCTAGCCGTTACCCTGAGCCGAGCC
CAATCCACCAAACTCTTCGTCTCGCGTCTGACGCGTTTCAAGGGCCTTAAGGAGCGCGAG
GTCGAAGCCATCAAGGACTGCGTTGAGGAGATCAACGATACCATTGACCGTTTGACCAAG
TCGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGGAGTGCCAAAAATCAAGATCAGTTTGCGTTCCAC
ATGAGTAATGCTCAGACTTGGACTAGTGCGGCTTTGACAGATGAGAACACTTGCTCCGAT
GGTTTCTCGGGTCGGGTCATGGATGGAAGGATCAAGAACTCGGTTCGAGCTAGAATTGTT
AACGTGGGTCACGAAACCAGCAACGCCTTGTCCTTGATTAATGCAT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2BU63JQ 628 0 0
GCCGTGTGCTTCCACTCCCTCTCAGCCTACGCAAACGCCATACAAACAAGCCCTAAACGC
TTAGCCGAGACCGCTCTGGCCGTTACCCTGAGCCGAGCCCAATCCACCAAACTTTTCGTC
TCGCGTTTGACGCGTTTCAAGGGCCTTAAGAAGCGCGAGGTCGAAGCCATCAAGGATTGC
GTGGAGGAGATCAACGATACCATTGACCGTTTGACCAAGTCGGTCCAAGAGATGAAGCTA
TGTGGGAGTGCCAAAAATCAAGAACAGTTCGCGTTCCACATGAGTAATGCTCAGACTTGG
ACTAGTGCGGCTTTGACAGATGAGAACACTTGCTCCGACGGTTTCTCGGGTCGGGTCATG
GATGGAAGGATCAAGAACTCGGTTCGAGCTAGAATTGTTAACGTGGGTCACGAAACTAGC
AACGCCCT*TCCTTGATTAATGCATTTGCTAAAAAGTATTAATTTAAAACTAGTTTTAAG
AAATATTTTGTGGCATCTCATATATAAATAATATATATAATGGTCTCCGTAAATGTAATA
TATATATGCCGAGTTGGTTAGATTTTTTTCTTGTGTGGTTTGTACTATTGTCCATTTGTA
TTTTGAGATATAAAAGTTTAAGAAGTTG

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 8

CO CL933Contig1 1059 8 22 U
TTTTTGTCTCATCTCCTTCACCTTCTCCTCCTATCTCTCTCTCTCTCCCTCAAATCTTTT
CAGGCATAACTAAATCGAATCATAAGCACTCCAAAGTATAACTAAAAATTCCTGATCTAT
TAACTGACAATAGATTCTTGGGCTCTTCTTTATTTCGACAGATTCTAATCCGTTATAGTT
GTTTCAAACGACACGGTGAAACCTTTGTTTTTATATAATATCAGACTCCTACTTCTTCAT
CTGTGAAACTTTTAAGCTAAAAA*TGGGTGTTGAAAAAATGGTGTGTTTGGTTTCTCGCA
CTGGTCGTCAGTTTCAGAGATACAACAAAGGTCGTCGCCAAGTCGTCGGATGTATTCCGT
ACAGATTCAAGTTATCAAGCGATGGTAAAATTAGTGACGAGGTAGAAGTTCTTGTTATCT
CTTCTCAAAAAGGTCACGCCATGATGTTCCCTAAGGGTGGTTGGGAGCTTGATGAATCTG
TAGAAGAAGCTGCATCAAGAGAGTCTCTTGAAGAAGCTGGAGTTCTTGGCAACGTAGAGC
ATCAGTTGGGAAAATGGGACTTTTTGAGCAAAAGCAGAGGAACATACTATGAAGGACTGA
TGTTCCCTTTGCTTGTAACAGAACAACTTGAGCTTTGGCCTGAGCAACAT*CTAGGCAAA
GAATCTGGATGAACGTAGTTGACGCTAGAGAAGCCTGTAGAGATTGGTGGATGAAAGAAG
CATTAGATGTTTTGGTTGCGAGACTCTCGTCACCAATGATTCAACCAAAGGAAGAGAAGA
CTCTTTCCATCTCTATTGAAACAATGTGCTGATGACTGCTGATTGTGATGGGAGTTTTTG
GACTAGTGGGTCTCTGTACATACAAATAGATGGGTTTCAGTTAGTATTGAGACTGCTGAA
GATCAAAACAAATGCAGAGCCCGAAAACAAAAATTATGAGTAGATTTTTAGGTTTAATTT
GGAGCAAAAAATTATCATGTGATTTAACAAGTCTTGTATGTCGTGTTTATAATGTTTCTG
CAAGATTTGATTAAAGGGACGATGAAGTGTTACGAACAT


BQ
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 20 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2DX83TF U 1
AF RR2E805TF U 1
AF RR2A648TF U 6
AF RR2F905TF U 1
AF RR2D081TF U 1
AF RR2D081JQ C 238
AF RR2F905JQ C 421
AF RR2A648JQ C 292
BS 1 333 RR2D081TF
BS 334 334 RR2E805TF
BS 335 593 RR2D081TF
BS 594 594 RR2A648TF
BS 595 605 RR2D081TF
BS 606 606 RR2A648TF
BS 607 617 RR2D081TF
BS 618 618 RR2A648TF
BS 619 649 RR2D081TF
BS 650 650 RR2A648TF
BS 651 655 RR2D081TF
BS 656 656 RR2D081JQ
BS 657 694 RR2D081TF
BS 695 695 RR2D081JQ
BS 696 704 RR2D081TF
BS 705 705 RR2D081JQ
BS 706 715 RR2D081TF
BS 716 716 RR2D081JQ
BS 717 728 RR2D081TF
BS 729 874 RR2D081JQ
BS 875 875 RR2F905JQ
BS 876 1059 RR2D081JQ

RD RR2DX83TF 263 0 0
TTTTTGTCTCATCTCCTTCACCTTCTCCTCCTATCTCTCTCTCTCTCCCTCAAATCTTTT
CAGGCATAACTAAATCGAATCATAAGCACTCCAAAGTATAACTAAAAATTCCTGATCTAT
TAACTGACAATAGATTCTTGGGCTCTTCTTTATTTCGACAGATTCTAATCCGTTATAGTT
GTTTCAAACGACACGGCGAAACCTTTGTTTTTATATAATATCAGACTCCTACTTCTTCAT
CTGTGAAACTTTTAAGCTAAAAA

QA 1 263 1 263
DS 

RD RR2E805TF 480 0 0
TTTTTGTCTCATCTCCTTCACCTTCTCCTCCTATCTCTCTCTCTC**CCTCAAATCTTTT
CAGGCATAACTAAATCGAATCATAAGCACTTCAAAGTATAACTAAAACTTCCTGATCTAT
TAACTGACAATAGATTCTTGGGCTCTTCTTTGTTTCGACATATTCTAATCCGTTATAGTT
GTTTCAAACGACACGGTGAAACCTTTGTTTTTATATAATATCAGACTCCTACTTCTTCAT
CTGTGAAACTTTTAAGCTAAAAAATGGGTGTTGAAAAAATGGTGTGTTTGGTTTCTCGCA
CTGGTCGTCAGTTTCAGAGATACAATAAAGGTCGTCGCCAAGTCGTCGGATGTATTCCGT
ACAGATTCAAGTTATCAAGCGATGGTAAAATTAGTGACGAGGTAGAAGTTCTTGTTATCT
CTTCTCAAAAAGGTCACGCCATGATGTTCCCTAAGGGTGGTTGGGAGCTTGATGAATCTG

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2A648TF 647 0 0
GTCTCATCTCCTTCACCTTCTCCTCCTATCTCTCTCTCTCTCCCTCAAATCTTTTCAGGC
ATAACTAAATCGAATCATAAGCACTCCAAAGTATAACTAAAAATTCCTGATCTATTAACT
GACAATAGATTCTTGGGCTCTTCTTTATTTCGACAGATTCTAATCCGTTATAGTTGTTTC
AAACGACACGGTGAAACCTTTGTTTTTATATAATATCAGACTCCTACTTCTTCATCTGTG
AAACTTTTAAGCTAAAAA*TGGGTGTTGAAAAAATGGTGTGTTTGGTTTCTCGCACTGGT
CGTCAGTTTCAGAGATACAACAAAGGTCGTCGCCAAGTCGTCGGATGTATTCCGTACAGA
TTCAAGTTATCAAGCGATGGTAAAATTAGTGACGAGGTAGAAGTTCTTGTTATCTCTTCT
CAAAAAGGTCACGCCATGATGTTCCCTAAGGGTGGTTGGGAGCTTGATGAATCTGTAGAA
GAAGCTGCATCAAGAGAGTCTCTTGAAGAAGCTGGAGTTCTTGGCAACGTAGAGCATCAG
TTGGGAAAATGGGACTTTTTGAGCAAAAGCAGAGGAACATACTATGAAGGACTGATGTTC
CCTTTGCTTGTAACAGAACAACTTGAGCTTTGGCCTGAGCAACAT*G

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2F905TF 660 0 0
TTTTTGTCTCATCTCCTTCACCTTCTCCTCCTATCTCTCTCTCTCTCCCTCAAATCTTTT
CAGGCATAACTAAATCGAATCATAAGCACTCCAAAGTATAACTAAAAATTCCTGATCTAT
TAACTGACAATAGATTCTTGGGCTCTTCTTTATTTCGACAGATTCTAATCCGTTATAGTT
GTTTCAAACGACACGGTGAAACCTTTGTTTTTATATAATATCAGACTCCTACTTCTTCAT
CTGTGAAACTTTTAAGCTAAAAA*TGGGTGTTGAAAAAATGGTGTGTTTGGTTTCTCGCA
CTGGTCGTCAGTTTCAGAGATACAACAAAGGTCGTCGCCAAGTCGTCGGATGTATTCCGT
ACAGATTCAAGTTATCAAGCGATGGTAAAATTAGTGACGAGGTAGAAGTTCTTGTTATCT
CTTCTCAAAAAGGTCACGCCATGATGTTCCCTAAGGGTGGTTGGGAGCTCGATGAATCTG
TAGAAGAAGCTGCATCAAGAGAGTCTCTTGAAGAAGCTGGAGTTCTTGGCAACGTAGAGC
ATCAGTTGGGAAAATGGGACTTTTTGAGCAAAAGCAGAGGAACATACTATGAAGGACTGA
TGTTCCCTTTGCTTGTAACAGAACAACTTGAGCTTTGGCCTGAGCAACA
TGCTAGCAAAG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2D081TF 728 0 0
TTTTTGTCTCATCTCCTTCACCTTCTCCTCCTATCTCTCTCTCTCTCCCTCAAATCTTTT
CAGGCATAACTAAATCGAATCATAAGCACTCCAAAGTATAACTAAAAATTCCTGATCTAT
TAACTGACAATAGATTCTTGGGCTCTTCTTTATTTCGACAGATTCTAATCCGTTATAGTT
GTTTCAAACGACACGGTGAAACCTTTGTTTTTATATAATATCAGACTCCTACTTCTTCAT
CTGTGAAACTTTTAAGCTAAAAA*TGGGTGTTGAAAAAATGGTGTGTTTGGTTTCTCGCA
CTGGTCGTCAGTTTCAGAGATACAACAAAGGTCTTCGCCAAGTCGTCGGATGTATTCCGT
ACAGATTCAAGTTATCAAGCGATGGTAAAATTAGTGACGAGGTAGAAGTTCTTGTTATCT
CTTCTCAAAAAGGTCACGCCATGATGTTCCCTAAGGGTGGTTGGGAGCTTGATGAATCTG
TAGAAGAAGCTGCATCAAGAGAGTCTCTTGAAGAAGCTGGAGTTCTTGGCAACGTAGAGC
ATCAGTTGGGAAAATGGGACTTTTTGAGCAAAAGCAGAGGAACATACTATGAAAGACTGA
TGTTCTCTTTGCTTGTAGCAGAACAACTTGAGCTTTGGCCTGAGCAACAC*CTAG*CAAA
GAATCTGGATGAACGTAGTTGACGCTAGAGAAGC*TGTAGAGAT*GGTGGATGAA*GAAG
CATTAGAT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2D081JQ 822 0 0
CATCTGTGAAACTTT*AAGCTAAAA**TGGGTGTTGAAAAA*TGGTGTGTTTGGTTTCTC
GCACTGGTCGTCAGTTTCAGAGATACAACAAAGGTCTTCGCCAAGTCGTCGGATGTATTC
CGTACAGATTCAAGTTATCAAGCGATGGTAAAATTAGTGACGAGGTAGAAGTTCTTGTTA
TCTCTTCTCAAAAAGGTCACGCCATGATGTTCCCTAAGGGTGGTTGGGAGCTTGATGAAT
CTGTAGAAGAAGCTGCATCAAGAGAGTCTCTTGAAGAAGCTGGAGTTCTTGGCAACGTAG
AGCATCAGTTGGGAAAATGGGACTTTTTGAGCAAAAGCAGAGGAACATACTATGAAGGAC
TGATGTTCCCTTTGCTTGTAGCAGAACAACTTGAGCTTTGGCCTGAGCAACAC*CTAGGC
AAAGAATCTGGATGAACGTAGTTGACGCTAGAGAAGCCTGTAGAGATTGGTGGATGAAAG
AAGCATTAGATGTTTTGGTTGCGAGACTCTCGTCACCAATGATTCAACCAAAGGAAGAGA
AGACTCTTTCCATCTCTATTGAAACAATGTGCTGATGACTGCTGATTGTGATGGGAGTTT
TTGGACTAGTGGGTCTCTGTACATACAAATAGATGGGCTTCAGTTAGTATTGAGACTGCT
GAAGATCAAAACAAATGCAGAGCCCGAAAACAAAAATTATGAGTAGATTTTTAGGTTTAA
TTTGGAGCAAAAAATTATCATGTGATTTAACAAGTCTTGTATGTCGTGTTTATAATGTTT
CTGCAAGATTTGATTAAAGGGACGATGAAGTGTTACGAACAT

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR2F905JQ 639 0 0
CTTCTCAAAAAGGTCACGCCATGATGTTCCCTAAGGGTGGTTGGGAGCTCGATGAATCTG
TAGAAGAAGCTGCATCAAGAGAGTCTCTTGAAGAAGCTGGAGTTCTTGGCAACGTAGAGC
ATCAGTTGGGAAAATGGGACTTTTTGAGCAAAAGCAGAGGAACATACTATGAAGGACTGA
TGTTCCCTTTGCTTGTAACAGAACAACTTGAGCTTTGGCCTGAGCAACATGCTAGGCAAA
GAATCTGGATGAACGTAGTTGACGCTAGAGAAGCCTGTAGAGATTGGTGGATGAAAGAAG
CATTAGATGTTTTGGTTGCGAGACTCTCGTCACCAATGATTCAACCAAAGGAAGAGAAGA
CTCTTTCCATCTCTATTGAAACAATGTGCTGATGACTGCTGATTGTGATGGGAGTTTTTG
GACTAGTGGGTCTCTGTACATACAAATAGATGGGTTTCAGTTAGTATTGAGACTGCTGAA
GATCAAAACAAATGCAGAGCCCGAAAACAAAAATTATGAGTAGATTTTTAGGTTTAATTT
GGAGCAAAAAATTATCATGTGATTTAACAAGTCTTGTATGTCGTGTTTATAATGTTTCTG
CAAGATTTGATTAAAGGGACGATGAAGTGTTACGAAC
CC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2A648JQ 741 0 0
TTTCTCGCACTGGTCGTCAGTTTCAGAGATACAACAAAGGTCGTCGCCAAGTCGTCGGAT
GTATTCCGTACAGATTCAAGTTATCAAGCGATGGTAAAATTAGTGACGAGGTAGAAGTTC
TTGTTATCTCTTCTCAAAAAGGTCACGCCATGATGTTCCCTAAGGGTGGTTGGGAGCTTG
ATGAATCTGTAGAAGAAGCTGCATCAAGAGAGTCTCTTGAAGAAGCTGGAGTTCTTGGCA
ACGTAGAGCATCAGTTGGGAAAATGGGACTTTTTGAGCAAAAGCAGAGGAACATACTATG
AAGGACTGATGTTCCCTTTGCTTGTAACAGAACAACTTGAGCTTTGGCCTGAGCAACATG
CTAGGCAAAGAATCTGGATGAACGTAGTTGACGCTAGAGAAGCCTGTAGAGATTGGTGGA
TGAAAGAAGCATTAGATGTTTTGGTTGCGAGACTCTCGTCACCAATGATTCAACCAAAGG
AAGAGAAGACTCTTTCCATCTCTATTGAAACAATGTGCTGATGACTGCTGATTGTGATGG
GAGTTTTTGGACTAGTGGGTCTCTGTACATACAAATAGATGGGTTTCAGTTAGTATTGAG
ACTGCTGAAGATCAAAACAAATGCAGAGCCCGAAAACAAAAATTATGAGTAGATTTTTAG
GTTTAGTTTGGAGCAAAAAATTATCATGTGATTTAACAAGTCTTGTATGTCGTGTTTATA
ATGTTTCTGCAAGATTTGATT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 8

CO CL934Contig1 947 8 16 U
GGAAGAAGAAAATTATTCAAAATCCTTTTTATAGGAATCACTCGCTTCTGTATGTAACAT
ACAGAGCGGTTACATTCTATCTGTATCGTCTTACAGAGTTATTACATGCATACGTCGGTC
TTTATCTAGACACTCCTGGCCTATACCGATCTTAGTTTTATATACAAAAAAAATATCTGA
TAGTTTAGCTACTAATTAAAATAAGTATTTTGGCATTACTGGATGGTCATACTTGCTGAT
TGTCCGCGTATTAATGCAGCTTCTCAATTGGTCTTGAGCCTACCCATACTGTTCTCCTGC
TGAGAAGAAGCAGCGGTCTCCTGCTGAGAAGAAGCAGTCTGTTTCTGAGAAGTAGCAGCG
GTATGTTTCTGAGAAGAAGCAGCGGTCTGTTTCTGAGAAGAAGCAGCGTTCTGTTGCTGA
GAGGAACCAGCGTTCTGTTGCTGAGAGGATGTAGATGAAGATGAGCTAGAAGAAGCAGCA
GTCTCAACAAACTGGGTCGTGACTTTTTCAATCTTTGACATGGTCTGCTTAATCTGTGAC
TCTTTTGTCGATGATACTTTCTGTTCACCCACGATTTTGCTGTTGATATCTTGAAATTCT
TTAATATTCTTCATCAACTCTTCTTGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTCTGAT
TTGCTAAATCTTGAACCCACGAAAGTCATGGCATCAGATAGTTTACCAGTGGTTTGTCTA
GCTGTAGAAGAATATTCTTGTGCGGATTTGGTGGAAGAAACCCTTGAGGAGGCAGTCATG
GAAGCCTTGAGCTTCTCGAAGAAAGGTTTGAGTTCTTGCTTTTGTGCAAACCTTTTCTCA
AGTCCAGATATGAATGAACTTGTTTCTTGTGAAGTCTCTTTCTCGATTTCCGTCACTGAT
GTGGTCGCTGATGAACTTGAGCTCTCGCTTTTCGATTGTTGTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM46JQ U 18
AF RR2CO13JQ U 18
AF RR2CO13TF C 18
AF RR2DM12JQ U 1
AF RR2B227JQ U 30
AF RR2EY35TF C 145
AF RR2B227TF C 291
AF RR2DM46TF C 600
BS 1 124 RR2DM12JQ
BS 125 125 RR2CO13JQ
BS 126 241 RR2DM12JQ
BS 242 242 RR2CO13JQ
BS 243 352 RR2DM12JQ
BS 353 353 RR2CO13JQ
BS 354 372 RR2DM12JQ
BS 373 373 RR2CO13JQ
BS 374 470 RR2DM12JQ
BS 471 471 RR2B227JQ
BS 472 566 RR2DM12JQ
BS 567 567 RR2B227JQ
BS 568 597 RR2DM12JQ
BS 598 818 RR2B227JQ
BS 819 860 RR2EY35TF
BS 861 947 RR2B227TF

RD RR2DM46JQ 110 0 0
CAAAATCCTTTTTATAGGAATCACTCCCTTCTGTATGTAACATACAAAGCGGTTACATTC
TATCTGTATCGTCTTACAAAGTTATTACATGCATACGTCGGTCTTTA
GCT

QA 1 107 1 107
DS 

RD RR2CO13JQ 421 0 0
CAAAATCCTTTTTATAGGAATCACTCGCTTCTGTATGTAACATACAGAGCGGTTACATTC
TATCTGTATCGTCTTACAGAGTTATTACATGCATACGTCGGTCTTTATCTAGACACTCCT
GGCCTATACCGATCTTAGTTTTATATACAAAAAAAATATCTGATAGTTTAGCTACTAATT
AAAATAAGTATTTTGGCATTACTGGATGGTCATACTTGCTGATTGTCCGCGTATTAATGC
AGCTTCTCAATTGGTCTTGAGCCTACCCATACTGTTCTCCTGCTGAGAAGAAGCAGCGGT
CTCCTGCTGAGAAGAAGCAGTCTGTTTCTGAGAAGTAGCAGCGGTATGTTTCTGAGAAGA
AGCAGCGGTCTGTTTCTGAGAAGAAGCAGCGTTCTGTTGCTGAGAGGAACCAGCGTTCTG
C

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR2CO13TF 421 0 0
CAAAATCCTTTTTATAGGAATCACTCGCTTCTGTATGTAACATACAGAGCGGTTACATTC
TATCTGTATCGTCTTACAGAGTTATTACATGCATACGTCGGTCTTTATCTAGACACTCCT
GGCCTATACCGATCTTAGTTTTATATACAAAAAAAATATCTGATAGTTTAGCTACTAATT
AAAATAAGTATTTTGGCATTACTGGATGGTCATACTTGCTGATTGTCCGCGTATTAATGC
AGCTTCTCAATTGGTCTTGAGCCTACCCATACTGTTCTCCTGCTGAGAAGAAGCAGCGGT
CTCCTGCTGAGAAGAAGCAGTCTGTTTCTGAGAAGTAGCAGCGGTATGTTTCTGAGAAGA
AGCAGCGGTCTGTTTCTGAGAAGAAGCAGCGTTCTGTTGCTGAGAGGAACCAGCGTTCTG
C

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR2DM12JQ 597 0 0
GGAAGAAGAAAATTATTCAAAATCCTTTTTATAGGAATCACTCGCTTCTGTATGTAACAT
ACAGAGCGGTTACATTCTATCTGTATCGTCTTACAGAGTTATTACATGCATACGTCGGTC
TTTAGCTAGACACTCCTGGCCTATACCGATCTTAGTTTTATATACAAAAAAAATATCTGA
TAGTTTAGCTACTAATTAAAATAAGTATTTTGGCATTACTGGATGGTCATACTTGCTGAT
TTTCCGCGTATTAATGCAGCTTCTCAATTGGTCTTGAGCCTACCCATACTGTTCTCCTGC
TGAGAAGAAGCAGCGGTCTCCTGCTGAGAAGAAGCAGTCTGTTTCTGAGAAGAAGCAGCG
GTATGTTTCTGAAAAGAAGCAGCGGTCTGTTTCTGAGAAGAAGCAGCGTTCTGTTGCTGA
GAGGAACCAGCGTTCTGTTGCTGAGAGGATGTAGATGAAGATGAGCTAGACGAAGCAGCA
GTCTCAACAAACTGGGTCGTGACTTTTTCAATCTTTGACATGGTCTGCTTAATCTGTGAC
TCTTTTGTCGATGATACTTTCTGTTCGCCCACGATTTTGCTGTTGATATCTTGAAAT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2B227JQ 789 0 0
TATAGGAATCACTCGCTTCTGTATGTAACATACAGAGCGGTTACATTCTATCTGTATCGT
CTTACAGAGTTATTACATGCATACGTCGGTCTTTATCTAGACACTCCTGGCCTATACCGA
TCTTAGTTTTATATACAAAAAAAATATCTGATAGTTTAGCTACTAATTAAAATAAGTATT
TTGGCATTACTGGATGGTCATACTTGCTGATTGTCCGCGTATTAATGCAGCTTCTCAATT
GGTCTTGAGCCTACCCATACTGTTCTCCTGCTGAGAAGAAGCAGCGGTCTCCTGCTGAGA
AGAAGCAGTCTGTTTCTGAGAAGTAGCAGCGGTATGTTTCTGAGAAGAAGCAGCGGTCTG
TTTCTGAGAAGAAGCAGCGTTCTGTTGCTGAGAGGAACCAGCGTTCTGTTGCTGAGAGGA
TGTAGATGAAGATGAGCTAGAAGAAGCAGCAGTCTCAACAAACTGGGTCGTGACTTTTTC
AATCTTTGACATGGTCTGCTTAATCTGTGACTCTTTTGTCGATGATACTTTCTGTTCACC
CACGATTTTGCTGTTGATATCTTGAAATTCTTTAATATTCTTCATCAACTCTTCTTGGGT
AGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTCTGATTTGCTAAATCTTGAACCCACGAAAGTCAT
GGCATCAGATAGTTTACCAGTGGTTTGTCTAGCTGTAGAAGAATATTCTTGTGCGGATTT
GGTGGAAGAAACCCTTGAGGAGGCAGTCATGGAAGCCTTGAGCTTCTCGAAGAAAGGTTT
GAGTTCTTG

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2EY35TF 717 0 0
ACCGATCTTAGTTTTATATACAAAAAAAATATCTGATAGTTTAGCTACTAATTAAAATAA
GTATTTTGGCATTACTGGATGGTCATACTTGCTGATTTTCCGCGTATTAATGCAGCTTCT
CAATTGGTCTTGAGCCTACCCATACTGTTCTCCTGCTGAGAAGAAGCAGCGGTCTCCTGC
TGAGAAGAAGCAGTCTGTTTCTGAGAAGAAGCAGCGGTATGTTTCTGAGAAGAAGCAGCG
GTCTGTTTCTGAGAAGAAGCAGCGTTCTGTTGCTGAGAGGAACCAGCGTTCTGTTGCTGA
GAGGATGTAGATGAAGATGAGCTAGACGAAGCAGCAGTCTCAACAAACTGGGTCGTGACT
TTTTCAATCTTTGACATGGTCTGCTTAATCTGTGACTCTTTTGTCGATGATACTTTCTGT
TCGCCCACGATTTTGCTGTTGATATCTTGAAATTCTTTAATATTCTTCATCAACTCTTCT
TGGGTAGTCTTGATGATGCTCTTCATCTCTTCTGATTTGCTAAATCTTGAACCCACAAAA
GTCATGGCATCAGATAGTTTACCGGTGGTTTGTCTAGCTGTAGAAGAATATTCTTGTGCG
GATTTGGTGGAAGAAACCCTTGAGGAGGCAGTCATGGAAGCCTTGAGCTTCTCGAAGAAG
GGTTTGAGTTCTTGCTTTTGTGCAAACCTTTTCTCAAGTCCAGATATGAATGAACT
C

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2B227TF 657 0 0
GTTCTCCTGCTGAGAAGAAGCAGCGGTCTCCTGCTGAGAAGAAGCAGTCTGTTTCTGAGA
AGTAGCAGCGGTATGTTTCTGAGAAGAAGCAGCGGTCTGTTTCTGAGAAGAAGCAGCGTT
CTGTTGCTGAGAGGAACCAGCGTTCTGTTGCTGAGAGGATGTAGATGAAGATGAGCTAGA
AGAAGCAGCAGTCTCAACAAACTGGGTCGTGACTTTTTCAATCTTTGACATGGTCTGCTT
AATCTGTGACTCTTTTGTCGATGATACTTTCTGTTCACCCACGATTTTGCTGTTGATATC
TTGAAATTCTTTAATATTCTTCATCAACTCTTCTTGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCAT
CTCTTCTGATTTGCTAAATCTTGAACCCACGAAAGTCATGGCATCAGATAGTTTACCAGT
GGTTTGTCTAGCTGTAGAAGAATATTCTTGTGCGGATTTGGTGGAAGAAACCCTTGAGGA
GGCAGTCATGGAAGCCTTGAGCTTCTCGAAGAAAGGTTTGAGTTCTTGCTTTTGTGCAAA
CCTTTTCTCAAGTCCAGATATGAATGAACTTGTTTCTTGTGAAGTCTCTTTCTCGATTTC
CGTCACTGATGTGGTCGCTGATGAACTTGAGCTCTCGCTTTTCGATTGTTGTTGATC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2DM46TF 320 0 0
TTTTTAATATCTTCTTC
ACTCTTCTTGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTCTGATT*GCTAAATCTTGAAC
CCACGAAAGTCATG*CATCAGATAGTTTACCGGTGGTTTGTCTAGCTGTAGAAGAATATT
CTTGTGCGGATTTGGTGGAAGAAACCCTTGAGGAGGCAGTCATGGAAGCCTTGAGCTTCT
CGAAGAAGGGTTTGAGTTCTTGCTTTTGTGCAAACCTTTTCTCAAGTCCAGATATGAATG
AACTTGTTTCTTGTGAAGTCTCTTTCTCGATTTCCGTCACTGATGTGGTCGCTGATGAAC
TT
C

QA 18 319 18 319
DS 



AS 2 8

CO CL935Contig1 827 5 3 U
ATCACAAAATTTTTCTTTCACTAATCATCACTTTTGGATGTTAGCATATAGAATGCTTAC
AGTCTATATGTACTTATGCATAGTTATTCTTTTGTATAGGTCGGTCAATAGATATATTGC
TAGCCTACACCGATGTTTGTTTTATTTTCAATCAAAAATAAAAATCTCTAAATTATTAGC
TATTGGTTACTAGTTTTGCCATCTTGGTGAAGTTACATCTTAGCTTCACTTCAATTTGCC
TGGGCTGTTCCTGTGGAGGATGATGTAGAAGTAGATGTTGAAGTTTCACTCTTAACAGCA
ACCTCAACGAATTGGGTTGTGACTTGTTCCCACTTGGTGATTGTCGTCTTAATCTGTGCT
TGTTGTTCTGGTGTGCATGTCATTGCTCCTCCTTTCTTGTTTTGATTTTCGGCTACAATT
TTAGCGTAAATTGCATCTAGCTCTTCCATATTCTTTATCACTTCTGCTTGGTAAGTTTCC
ATTGACTTCTTTACTTCTGCTGATTTGTTTGCAAGTCTTGAACGAATAAATTGCATGGCA
TCACCTATTTTTCCAACAGCACCTTTGATCATAGCGAACAAGCCTCCTTTTTTCTTTGGA
GAAGAAACCTTTCCTGTCATGGTACTCTTTAGTTTCTCGAAAAACTGCTTGTATTCCTCC
TTCTGCGGACTCTTCTTCTCTAGGTTCATTATGAATGTCATAACTTGTTGGGAAGTCTGA
GTCTCGACTTCTGTCACTGTCACCTCCTTGGTCTGGCTAGTACTTTGAGTTGCAGTTGAA
GTAGAAGCAGCGTTCGTGGTATCTTTGGATTCATTGTTTGTATCCTG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C771JQ U 58
AF RR2F088JQ U 1
AF RR2F088TF C 14
AF RR2BZ47JQ U 1
AF RR2EN86TF C 15
BS 1 42 RR2BZ47JQ
BS 43 43 RR2F088JQ
BS 44 827 RR2BZ47JQ

RD RR2C771JQ 622 0 0
TACAGTCTATATGTACTTATGCATAGTTATTCTTTTGTATAGGTCGGTCAATAGATATAT
TGCTAGCCTACACCGATGTTTGTTTTATTTTCAATCAAAAATAAAAATCTCTAAATTATT
AGCTATTGGTTACTAGTTTTGCCATCTTGGTGAAGTTACATCTTAGCTTCACTTCAATTT
GCCTGGGCTGTTCCTGTGGAGGATGATGTAGAAGTAGATGTTGAAGTTTCACTCTTAACA
GCAACCTCAACGAATTGGGTTGTGACTTGTTCCCACTTGGTGATTGTCGTCTTAATCTGT
GCTTGTTGTTCTGGTGTGCATGTCATTGCTCCTCCTTTCTTGTTTTGATTTTCGGCTACA
AGTTTAGCGTAAATTGCATCTAGCTCTTCCATATTCTTTATCACTTCTGCTTGGTAAGTT
TCCATTGACTTCTTTACTTCTGCTGATTTGTTTGCAAGTCTTGAACGAATAAATTGCATG
GCATCACCTATTTTTCCAACAGCACCTTTGATCATAGCGAACAAGCCTCCTTTTTTCTTT
GGAGAAGAAACCTTTCCTGTCATGGTACTCTTTAGTTTCTCGAAAAACTGCTTGTATTCC
TCCTTCTGCGGACTCTTCTTCT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2F088JQ 755 0 0
AC
CACAAAATTTTTCTTTCACTAATCATCACTTTTGGATGTTAGCATATAGAATGCTTACAG
TCTATATGTACTTATGCATAGTTATTCTTTTGTATAGGTCGGTCAATAGATATATTGCTA
GCCTACACCGATGTTTGTTTTATTTTCAATCAAAAATAAAAATCTCTAAATTATTAGCTA
TTGGTTACTAGTTTTGCCATCTTGGTGAAGTTACATCTTAGCTTCACTTCAATTTGCCTG
GGCTGTTCCTGTGGAGGATGATGTAGAAGTAGATGTTGAAGTTTCACTCTTAACAGCAAC
CTCAACGAATTGGGTTGTGACTTGTTCCCACTTGGTGATTGTCGTCTTAATCTGTGCTTG
TTGTTCTGGTGTGCATGTCATTGCTCCTCCTTTCTTGTTTTGATTTTCGGCTACAATTTT
AGCGTAAATTGCATCTAGCTCTTCCATATTCTTTATCACTTCTGCTTGGTAAGTTTCCAT
TGACTTCTTTACTTCTGCTGATTTGTTTGCAGGTCTTGAACGAATAAATTGCATGGCATC
ACCTATTTTTCCAACAGCACCTTTGATCAAAGCGAACAAGCCTCCTTTTTTCTTTGGAGA
AGAAACCTTTCCTGTCATGGTACTCTTTAGTTTCTCGAAAAACTGCTTGTATTCCTCCTT
CTGCGGACTCTTCTTCTCTAGGTTCATTATGAATGTCATAACTTGTTGGGAAGTCTGAGT
CTCGACTTCTGTCACTGTCACCTCCTTGGTCT
C

QA 3 754 3 754
DS 

RD RR2F088TF 742 0 0
TCTTTCACTAATCATCACTTT*GGATGTTAGCATATAGAATGCTTACAGTCTATATGTAC
TTATGCATAGTTATTCTTTTGTATAGGTCGGTCAATAGATATATTGCTAGCCTACACCGA
TGTTTGTTTTATTTTCAATCAAAAATAAAAATCTCTAAATTATTAGCTATTGGTTACTAG
TTTTGCCATCTTGGTGAAGTTACATCTTAGCTTCACTTCAATTTGCCTGGGCTGTTCCTG
TGGAGGATGATGTAGAAGTAGATGTTGAAGTTTCACTCTTAACAGCAACCTCAACGAATT
GGGTTGTGACTTGTTCCCACTTGGTGATTGTCGTCTTAATCTGTGCTTGTTGTTCTGGTG
TGCATGTCATTGCTCCTCCTTTCTTGTTTTGATTTTCGGCTACAATTTTAGCGTAGATTG
CATCTAGCTCTTCCATATTCTTTATCACTTCTGCTTGGTAAGTTTCCATTGACTTCTTTA
CTTCTGCTGATTTGTTTGCAGGTCTTGAACGAATAAATTGCATGGCATCACCTATTTTTC
CAACAGCACCTTTGATCAAAGCGAACAAGCCTCCTTTTTTCTTTGGAGAAGAAACCTTTC
CTGTCATGGTACTCTTTAGTTTCTCGAAAAACTGCTTGTATTCCTCCTTCTGCGGACTCT
TCTTCTCTAGGTTCATTATGAATGTCATAACTTGTTGGGAAGTCTGAGTCTCGACTTCTG
TCACTGTCACCTCCTTGGTCT
C

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2BZ47JQ 827 0 0
ATCACAAAATTTTTCTTTCACTAATCATCACTTTTGGATGTTGGCATATAGAATGCTTAC
AGTCTATATGTACTTATGCATAGTTATTCTTTTGTATAGGTCGGTCAATAGATATATTGC
TAGCCTACACCGATGTTTGTTTTATTTTCAATCAAAAATAAAAATCTCTAAATTATTAGC
TATTGGTTACTAGTTTTGCCATCTTGGTGAAGTTACATCTTAGCTTCACTTCAATTTGCC
TGGGCTGTTCCTGTGGAGGATGATGTAGAAGTAGATGTTGAAGTTTCACTCTTAACAGCA
ACCTCAACGAATTGGGTTGTGACTTGTTCCCACTTGGTGATTGTCGTCTTAATCTGTGCT
TGTTGTTCTGGTGTGCATGTCATTGCTCCTCCTTTCTTGTTTTGATTTTCGGCTACAATT
TTAGCGTAAATTGCATCTAGCTCTTCCATATTCTTTATCACTTCTGCTTGGTAAGTTTCC
ATTGACTTCTTTACTTCTGCTGATTTGTTTGCAAGTCTTGAACGAATAAATTGCATGGCA
TCACCTATTTTTCCAACAGCACCTTTGATCATAGCGAACAAGCCTCCTTTTTTCTTTGGA
GAAGAAACCTTTCCTGTCATGGTACTCTTTAGTTTCTCGAAAAACTGCTTGTATTCCTCC
TTCTGCGGACTCTTCTTCTCTAGGTTCATTATGAATGTCATAACTTGTTGGGAAGTCTGA
GTCTCGACTTCTGTCACTGTCACCTCCTTGGTCTGGCTAGTACTTTGAGTTGCAGTTGAA
GTAGAAGCAGCGTTCGTGGTATCTTTGGATTCATTGTTTGTATCCTG

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2EN86TF 786 0 0
CTTTCACTAATCATCACTTT*GGATGTTAGCATATAGAATGCTTACAGTCTATATGTACT
TATGCATAGTTATTCTTT*GTATAGGTCGGTCAATAGATATATTGCTAGC*TACACCGAT
GTTTGTTTTATTTTCAATCAAAAATAAAAATCTCTAAATTATTAGCTATTGGTTACTAGT
TTTGCCATCTTGGTGAAGTTACATCTTAGCTTCGCTTCAATTTGCCTGGGCTGTTCCTGT
GGAGGATGATGTAGAAGTAGATGTTGAAGTTTCACTCTTAACAGCAACCTCAACGAATTG
GGTTGTGACTTGTTCCCACTTGGTGATTGTCGTCTTAATCTGTGCTTGTTGTTCTGGTGT
GCATGTCATTGCTCCTCCTTTCTTGTTTTGATTTTCGGCTACAATTTTAGCGTAGATTGC
ATCTAGCTCTTCCATATTCTTTATCACTTCTGCTTGGTAAGTTTCCATTGACTTCTTTAC
TTCTGCTGATTTGTCTGCAAGTCTTGAACGAATAAATTGC**********CTATTTTTCC
AACAGCACCTTTGATCATGGCGAACAAGCCTCCTTTTTTCTTTGGAGAAGAAACCTTTCC
TGTCATGGTACTCTTTAGTTTCTCGAAAAACTGCTTGTATTCCTCCTTCTGCGGACTCTT
CTTCTCTAGGTTCATTATGAATGTCATAACTTGTTGGGAAGTCTGAGTCTCGACTTCTGT
CACTGTCACCTCCTTGGTCTGGCTAGTACTTTGAGTTGCAGTTGAAGTAGAAGCAGCGTT
CGTG
CC

QA 1 784 1 784
DS 



CO CL935Contig2 805 3 4 U
GAAAGATACCACGAACGCTGCTTCTACTTCAACTGCAACTCAAAGTACTAGCCAGACCAA
GGAGGTGACAGTGACAGAAGTCGAGACTCAGACTTCCCAACAAGTTATGACATTCATAAT
GAACCTAGAGAAGAAGAGTCCGCAGAAGGAGGAATACAAGCAATTTTTCGAGAAACTAAA
GAGTACCATGACAGGAAAGGTTTCTTCTCCAAAGAAAAAAGGAGGCTTGTTCGCTATGAT
CAAAGGTGCTGTTGGAAAAATAGGTGATGCCATGCAATTTATTCGTTCAAGACTTGCAAA
CAAATCAGCAGAAGTAAAGAAGTCAATGGAAACTTACCAAGCAGAAGTGATAAAGAATAT
GGAAGAGCTAGATGCAATCTACGCTAAAATTGTAGCCGAAAATCAAAACAAGAAAGGAGG
AGCAATGACATGCACACCAGAACAACAAGCACAGATTAAGACGACAATCACCAAGTGGGA
ACAAGTCACAACCCAATTCGTTGAGGTTGCTGTTAAGAGTGAAACTTCTACATCATCCTC
CACAGGAACAGCCCAGGCAAATTGAAGTGAAGCTAAGATGTAACTTCACCAAGATGGCAA
AACTAGTAACCAATAGCTAATAATTTAGAGATTTTTATTTTTGATTGAAAATAAAACAAA
CATCGGTGTAGGCTAGCAATATATCTATTGACCGACCTATACAAAAGAATAACTATGTAT
AAGTACATATAGACTGTAAGCATTCTATATGCTAACATCCAAAAGTGATGATTAGTGAAA
GAAAAATTTTGTGGTAATTTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL69TF U 1
AF RR2DN76TF U 115
AF RR2AG24TF U 76
BS 1 671 RR2GL69TF
BS 672 672 RR2AG24TF
BS 673 701 RR2GL69TF
BS 702 805 RR2AG24TF

RD RR2GL69TF 701 0 0
GAAAGATACCACGAACGCTGCTTCTACTTCAACTGCAACTCAAAGTACTAGCCAGACCAA
GGAGGTGACAGTGACAGAAGTCGAGACTCAGACTTCCCAACAAGTTATGACATTCATAAT
GAACCTAGAGAAGAAGAGTCCGCAGAAGGAGGAATACAAGCAATTTTTCGAGAAACTAAA
GAGTACCATGACAGGAAAGGTTTCTTCTCCAAAGAAAAAAGGAGGCTTGTTCGCTATGAT
CAAAGGTGCTGTTGGAAAAATAGGTGATGCCATGCAATTTATTCGTTCAAGACTTGCAAA
CAAATCAGCAGAAGTAAAGAAGTCAATGGAAACTTACCAAGCAGAAGTGATAAAGAATAT
GGAAGAGCTAGATGCAATCTACGCTAAAATTGTAGCCGAAAATCAAAACAAGAAAGGAGG
AGCAATGACATGCACACCAGAACAACAAGCACAGATTAAGACGACAATCACCAAGTGGGA
ACAAGTCACAACCCAATTCGTTGAGGTTGCTGTTAAGAGTGAAACTTCTACATCATCCTC
CACAGGAACAGCCCAGGCAAATTGAAGTGAAGCTAAGATGTAACTTCACCAAGATGGCAA
AACTAGTAACCAATAGCTAATAATTTAGAGATTTTTATTTTTGATTGAAAATAAAACAAA
CATCGGTGTAG*CTAGCAATATATCTATTGACCGACCTATA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2DN76TF 602 0 0
CATAATGAACCTAGAGAAGAAGAGTCCGCAGAAGGAGGAATACAAGCAATTTTTCGAGAA
ACTAAAGAGTACCATGACAGGAAAGGTTTCTTCTCCAAAGAAAAAAGGAGGCTTGTTCGC
TATGATCAAAGGTGCTGTTGGAAAAATAGGTGATGCCATGCAATTTATTCGTTCAAGACT
TGCAAACAAATCAGCAGAAGTAAAGAAGTCAATGGAAACTTACCAAGCAGAAGTGATAAA
GAATATGGAAGAGCTAGATGCAATCTACGCTAAAATTGTAGCCGAAAATCAAAACAAGAA
AGGAGGAGCAATGACATGCACACTAGAACAACAAGCACAGATTAAGACGACAATCACCAA
GTGGGAACAAGTCACAACCCAATTCGTTGAGGTTGCTGTTAAGAGTGAAACTTCTACATC
ATCCTCCACAGGAACAGCCCAGGCAAATTGAAGTGAAGCTAAGATGTAACTTCACCAAGA
TGGTAAAACTAGTAACCAATAGCTAATAATTTAGAGATTTTTATTTTTGATTGAAAATAA
AACAAACATCGGTGTAGGCTAGCAATATATCTATTGACCGACCTATACAAA*GAATAACT
AT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2AG24TF 730 0 0
G
GAAGTCGAGACTCAGACTTCCCAACAAGTTATGACATTCATAATGAACCTAGAGAAGAAG
AGTCCGCAGAAGGAGGAATACAAGCAATTTTTCGAGAAACTAAAGAGTACCATGACAGGA
AAGGTTTCTTCTCCAAAGAAAAAAGGAGGCTTGTTCGCTATGATCAAAGGTGCTGTTGGA
AAAATAGGTGATGCCATGCAATTTATTCGTTCAAGACTTGCAAACAAATCAGCAGAAGTA
AAGAAGTCAATGGAAACTTACCAAGCAGAAGTGATAAAGAATATGGAAGAGCTAGATGCA
ATCTACGCTAAAATTGTAGCCGAAAATCAAAACAAGAAAGGAGGAGCAATGACATGCACA
CCAGAACAACAAGCACAGATTAAGACGACAATCACCAAGTGGGAACAAGTCACAACCCAA
TTCGTTGAGGTTGCTGTTAAGAGTGAAACTTCTACATCATCCTCCACAGGAACAGCCCAG
GCAAATTGAAGTGAAGCTAAGATGTAACTTCACCAAGATGGCAAAACTAGCAACCAATAG
CTAATAATTTAGAGATTTTTATTTTTGATTGAAAATAAAACAAACATCGGTGTAGGCTAG
CAATATATCTATTGACCGACCTATACAAAAGAATAACTATGTATAAGTACATATAGACTG
TAAGCATTCTATATGCTAACATCCAAAAGTGATGATTAGTGAAAGAAAAATTTTGTGGTA
ATTTTTCTC

QA 2 730 2 730
DS 



AS 1 8

CO CL936Contig1 662 8 2 U
GGGGCTAGTCTTTACGGTGTGAGAGAGAGATTCAGCGGCAAAAACCTCTAGACGAAGATC
TCTTCCCTTTAGCCATGGCAACTGGTAAGACTGTGAAAGACGTATCTCCTCACGACTTCG
TGAAGGCTTACGCTTCCCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCTCATGGACAG
ACATTGTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCGTATGATCCCGATTGGTACTACA
TCAGAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTGTACCTGAGGGGAGGTCTTGGAGTTGGTGCTT
TCCGTAGAATCTATGGTGGAAGCAAGAGAAACGGAAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAA
GCAGCGGTGGCATTGCCCGTCACATCCTTCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGA
TTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGGCAAAGGGATTTGGACCAAGTTG
CTGGTCGTATTGCGGTTGAAGTTTGAAGAATCAAAATAGTAGTGTTTTGAGTTTTTTCTT
CTACTACTTTTGAAACCAATGTGTTGTTTTTAGTGTTAAATCTTTTACCAATATCATTGC
TGAGACTTGCACTCATATATCTTTCTGTTTGTGTCTTCAGACAATTAAGTCTATCTTCTT
AC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 20 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2CT05JQ C 111
AF RR2CT05TF U 3
AF RR2BI28TF U 1
AF RR2DL48TF U 12
AF RR2GX04TF U 4
AF RR2CJ60JQ C 3
AF RR2CJ60TF U 3
AF RR2BI28JQ C 127
BS 1 656 RR2BI28TF
BS 657 662 RR2BI28JQ

RD RR2CT05JQ 485 0 0
CACGACTTCGTGAAGGCTTACGCTTCCCATTTCAAGCGATTTGGCAAGATCGAGCTTCCC
TCGTGGACAGACATTGTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCATATGATCCTGAT
TGGTACTACATCCGAGCTGCATTTATGGCAAGGAAGGTGTACCTGAGGGGAGGTCTTGGA
GTTGGTGCTTTCCGTAGAATTTATGGTGGAAGCAAGAGAAACGGAAGTCGCCCACCACAT
TTTTGCAAAAGCAGCGGTGGCATTGCCCGTCACATCCTTCAGCAGTTGGAGACTATGAAC
ATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGGAGAAGAATCACTTCCGGTGGGCAAAGGGATTTG
GACCAAGTTGCTGGACGTATTGCGGTTGAAGTTTGAAGAATCAAAATAGT***GTTATGA
GTTTTTTTTTTTACTACTTTTGAAACCAATGTGTTGTTTTTAGTGTTAAATCTTTTACCA
ATATC

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2CT05TF 593 0 0
GGAGTCTTTGTGGTGTGA
GAGAGAGAGATTCAGCGGCAAAAACCTCTAGACGAAGATCTCTTCACTTTAGCCATGGCA
ACTGGTAAGACTGTGAAAGACGTCTCTCCTCACGACTTCGTGAAGGCTTACGCTTCCCAT
CTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCTCGTGGACAGACATTGTGAAGACTGGTAAG
CTGAAGGAGCTTGCCCCATATGATCCTGATTGGTACTACATCCGAGCTGCATCTATGGCA
AGGAAGGTGTACCTGAGGGGAGGTCTTGGAGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTATGGTGGA
AGCAAGAGAAACGGAAGTCGCCCACCACATTTTTGCAAAAGCAGCGGTGGCATTGCCCGT
CACATCCTTCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGGAGA
AGAATCACTTCCGGTGGGCAAAGGGATTTGGACCAAGTTGCTGGACGTATTGCGGTTGAA
GTTTGAAGAATCAAAATAGT***GTTATGAGTTTTTTCTTCTACTACTTTTGAAACCAAT
GTGTTGTTTTTAGTGTTAAATCTTTTACCAATATC

QA 19 593 19 593
DS 

RD RR2BI28TF 662 0 0
GGGGCTAGTCTTTACGGTGTGAGAGAGAGATTCAGCGGCAAAAACCTCTAGACGAAGATC
TCTTCCCTTTAGCCATGGCAACTGGTAAGACTGTGAAAGACGTATCTCCTCACGACTTCG
TGAAGGCTTACGCTTCCCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCTCATGGACAG
ACATTGTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCGTATGATCCCGATTGGTACTACA
TCAGAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTGTACCTGAGGGGAGGTCTTGGAGTTGGTGCTT
TCCGTAGAATCTATGGTGGAAGCAAGAGAAACGGAAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAA
GCAGCGGTGGCATTGCCCGTCACATCCTTCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGA
TTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGGCAAAGGGATTTGGACCAAGTTG
CTGGTCGTATTGCGGTTGAAGTTTGAAGAATCAAAATAGTAGTGTTTTGAGTTTTTTCTT
CTACTACTTTTGAAACCAATGTGTTGTTTTTAGTGTTAAATCTTTTACCAATATCATTGC
TGAGACTTGCACTCATATATCTTTCTGTTTGTGTCTTCAGACAATTAAGTCTATCT
TCTTAC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2DL48TF 602 0 0
GG
ACGGTGTGAGAGAGAGATTCAGCGGCAAAAACCTCTAGACGAAGATCTCTTCCCTTTAGC
CATGGCAACTGGTAAGACTGTGAAAGACGTATCTCCTCACGACTTCGTGAAGGCTTACGC
TTCCCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCTCATGGACAGACATTGTGAAGAC
TGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCGTATGATCCCGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATC
TATGGCAAGGAAGGTGTACCTGAGGGGAGGTCTTGGAGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTA
TGGTGGAAGCAAGAGAAACGGAAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCAT
TGCCCGTCACATCCTTCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGG
AGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGGCAAAGGGATTTGGACCAAGTTGCTGGTCGTATTGC
GGTTGAAGTTTGAAGAATCAAAATAGTAGTGTTTTGAGTTTTTTCTTCTACTACTTTTGA
AACCAATGTGTTGTTTTTAGTGTTAAATCTTTTACCAATATCATTGCTGAGACTTGCACT

QA 3 602 3 602
DS 

RD RR2GX04TF 653 0 0
GG
TAGTCTTTACGGTGTGAGAGAGAGATTCAGCGGCAAAAACCTCTAGACGAAGATCTCTTC
CCTTTAGCCATGGCAACTGGTAAGACTGTGAAAGACGTATCTCCTCACGACTTCGTGAAG
GCTTACGCTTCCCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCTCATGGACAGACATT
GTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCGTATGATCCCGATTGGTACTACATCAGA
GCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTGTACCTGAGGGGAGGTCTTGGAGTTGGTGCTTTCCGT
AGAATCTATGGTGGAAGCAAGAGAAACGGAAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGC
GGTGGCATTGCCCGTCACATCCTTCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGAC
ACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGGCAAAGGGATTTGGACCAAGTTGCTGGT
CGTATTGCGGTTGAAGTTTGAAGAATCAAAATAGTAGTGTTTTGAGTTTTTTCTTCTACT
ACTTTTGAAACCAATGTGTTGTTTTTAGTGTTAAATCCTTTACCAATATCATTGCTGAGA
CTTGCACTCATATATCTTTCTGTTTGTGTCTTCAGACA*TTAAGTCTATCT

QA 3 653 3 653
DS 

RD RR2CJ60JQ 654 0 0
GGG
TAGTCTTTACGGTGTGAGAGAGAGATTCAGCGGCAAAAACCTCTAGACGAAGATCTCTTC
CCTTTAGCCATGGCAACTGGTAAGACTGTGAAAGACGTATCTCCTCACGACTTCGTGAAG
GCTTATGCTTCCCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCTCATGGACAGACATT
GTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCGTATGATCCCGATTGGTACTACATCAGA
GCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTGTACCTGAGGGGAGGTCTTGGAGTTGGTGCTTTCCGT
AGAATCTATGGTGGAAGCAAGAGAAACGGAAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGC
GGTGGCATTGCCCGTCACATCCTTCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGAC
ACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGGCAAAGGGATTTGGACCAAGTTGCTGGT
CGTATTGCGGTTGAAGTTTGAAGAATCAAAATAGTAGTGTTTTGAGTTTTTTCTTCTACT
ACTTTTGAAACCAATGTGTTGTTTTTAGTGTTAAATCTTTTACCAATATCATTGCTGAGA
CTTGCACTCATATATCTTTCTGTTTGTGTCTTCAGACAATTAAGTCTATCT

QA 4 654 4 654
DS 

RD RR2CJ60TF 654 0 0
GGG
TAGTCTTTACGGTGTGAGAGAGAGATTCAGCGGCAAAAACCTCTAGACGAAGATCTCTTC
CCTTTAGCCATGGCAACTGGTAAGACTGTGAAAGACGTATCTCCTCACGACTTCGTGAAG
GCTTATGCTTCCCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCTCATGGACAGACATT
GTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCGTATGATCCCGATTGGTACTACATCAGA
GCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTGTACCTGAGGGGAGGTCTTGGAGTTGGTGCTTTCCGT
AGAATCTATGGTGGAAGCAAGAGAAACGGAAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGC
GGTGGCATTGCCCGTCACATCCTTCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGAC
ACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGGCAAAGGGATTTGGACCAAGTTGCTGGT
CGTATTGCGGTTGAAGTTTGAAGAATCAAAATAGTAGTGTTTTGAGTTTTTTCTTCTACT
ACTTTTGAAACCAATGTGTTGTTTTTAGTGTTAAATCTTTTACCAATATCATTGCTGAGA
CTTGCACTCATATATCTTTCTGTTTGTGTCTTCAGACAATTAAGTCTATCT

QA 4 654 4 654
DS 

RD RR2BI28JQ 536 0 0
CTTACGCTTCCCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCTCATGGACAGACATTG
TGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCGTATGATCCCGATTGGTACTACATCAGAG
CTGCATCTATGGCAAGGAAGGTGTACCTGAGGGGAGGTCTTGGAGTTGGTGCTTTCCGTA
GAATCTATGGTGGAAGCAAGAGAAACGGAAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCG
GTGGCATTGCCCGTCACATCCTTCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACA
CCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGGCAAAGGGATTTGGACCAAGTTGCTGGTC
GTATTGCGGTTGAAGTTTGAAGAATCAAAATAGTAGTGTTTTGAGTTTTTTCTTCTACTA
CTTTTGAAACCAATGTGTTGTTTTTAGTGTTAAATCTTTTACCAATATCATTGCTGAGAC
TTGCACTCATATATCTTTCTGTTTGTGTCTTCAGACAATTAAGTCTATCTTCTTAC

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 6

CO CL937Contig1 1192 6 13 U
GTGTTTTATCTTCTTCTTCTACTTCTTGGACGAAGCAGTGAAAGGATTGATTCTCTGTCA
ATTTTTTCTCAATTATATCTACGTTGGAGACAGAAGAGAAGAGAAGTTCAACAGTGATTG
GGAGAGATAGATAGATGAGTTCGTCTCTACCTATGAGGCTCCTTCTTCTGCCTCTTACAC
CTTCTTTGATTTCTCCTCCTCCGGATTCTTCTCATAAGCCTCTCCGATCGCAAAACCCTA
ATTTCATTCTCCGCTCCTCTTCTTCTACTACTCCTTCATCGCCGCAGCTTTTCCCCCGGC
GATCCAGATCCTCTTCTCCCTGTGTTTCCATGTGTTTTCCCCAACACAAGGAAGATCAAG
CCAACACAGATACTTGGAGGAATGAAGAAGATGATCACATTACATGTGGGCTTGAATCAG
ATGAAGATTCCGGCGGCCTCCGGATTCCTACTCAGGCTCAGGCCATTGTTGAAGGATCTG
GTTCAGTTGCTGTCTCTGAGCTCAAACCTTCCCCTGATGTTGATTACATTCAAGAGCTAT
TGGCGATACAGCAACAAGGGCCTAGAACAATTGGCTTCTTTGGGACCAGGAACATGGGTT
TCATGCATCAAGAGCTCATCGAGATACTTAGCTACGCCATGGTTATTACTAAAAACCATA
TATATA**CTTCAGGTGCATCTGGAACTAACGCAGCTGTTATCAGAGGTGCGTTGAGAGC
AGAGAGGCCAGAGCTTCTTACAGTTATTTTGCCTCAAAGTTTGAAAAAACAACCTCCCGA
GAGCCAAGAACTCTTGTCCAAAGTACAAAACGTGGTAGAAAAGCCACACAATGACCATTT
GCCATTACTAGAAGCAAGCAGACTATGCAATATGGACATCATATCACAAGTACAGCAAGT
AATCTGCTTCACGTTTCATGACAGTAAGCTTCTCATGGAGACATGTCAAGAAGCTAAAAA
TCTCCGCAAGATCGTCACTCTCTTCTACCTCGATTGATTCCCCACTTATCTTATCTTCTC
CCGGGAACACAAGAGGATGGATACAAGTCTCTTTGTAAATTGTGAATCTCTCCCCCATCC
ACAACATATTCTTTTGTCTAAATTTTTGAAAAACCCCATCGTTGTGATTTATAGGATGAA
TTCTCTACTATTTGTAACGTTACATTTGTTATAAAATCTATCTTCTCATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM13TF U 1
AF RR2AO74TF U 27
AF RR2ES37TF U 75
AF RR2AO74JQ C 324
AF RR2DM13JQ C 518
AF RR2ES37JQ C 1014
BS 1 553 RR2DM13TF
BS 554 650 RR2AO74TF
BS 651 674 RR2ES37TF
BS 675 675 RR2AO74JQ
BS 676 705 RR2ES37TF
BS 706 706 RR2AO74JQ
BS 707 735 RR2ES37TF
BS 736 1036 RR2AO74JQ
BS 1037 1037 RR2DM13JQ
BS 1038 1124 RR2AO74JQ
BS 1125 1125 RR2DM13JQ
BS 1126 1185 RR2AO74JQ
BS 1186 1192 RR2DM13JQ

RD RR2DM13TF 553 0 0
GTGTTTTATCTTCTTCTTCTACTTCTTGGACGAAGCAGTGAAAGGATTGATTCTCTGTCA
ATTTTTTCTCAATTATATCTACGTTGGAGACAGAAGAGAAGAGAAGTTCAACAGTGATTG
GGAGAGATAGATAGATGAGTTCGTCTCTACCTATGAGGCTCCTTCTTCTGCCTCTTACAC
CTTCTTTGATTTCTCCTCCTCCGGATTCTTCTCATAAGCCTCTCCGATCGCAAAACCCTA
ATTTCATTCTCCGCTCCTCTTCTTCTACTACTCCTTCATCGCCGCAGCTTTTCCCCCGGC
GATCCAGATCCTCTTCTCCCTGTGTTTCCATGTGTTTTCCCCAACACAAGGAAGATCAAG
CCAACACAGATACTTGGAGGAATGAAGAAGATGATCACATTACATGTGGGCTTGAATCAG
ATGAAGATTCCGGCGGCCTCCGGATTCCTACTCAGGCTCAGGCCATTGTTGAAGGATCTG
GTTCAGTTGCTGTCTCTGAGCTCAAACCTTCCCCTGATGTTGATTACATTCAAGAGCTAT
TGGCGATACAGCA

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2AO74TF 624 0 0
G
GGACGAAGCAGTGAAAGGATTGATTCTCTGTCAATTTTTTCTCAATTATATCTACGTTGG
AGACAGAAGAGAAGAGAAGTTCAACAGTGATTGGGAGAGATAGATAGATGAGTTCGTCTC
TACCTATGAGGCTCCTTCTTCTGCCTCTTACACCTTCTTTGATTTCTCCTCCTCCGGATT
CTTCTCATAAGCCTCTCCGATCGCAAAACCCTAATTTCATTCTCCGCTCCTCTTCTTCTA
CTACTCCTTCATCGCCGCAGCTTTTCCCCCGGCGATCCAGATCCTCTTCTCCCTGTGTTT
CCATGTGTTTTCCCCAACACAAGGAAGATCAAGCCAACACAGATACTTGGAGGAATGAAG
AAGATGATCACATTACATGTGGGCTTGAATCAGATGAAGATTCCGGCGGCCTCCGGATTC
CTACTCAGGCTCAGGCCATTGTTGAAGGATCTGGTTCAGTTGCTGTCTCTGAGCTCAAAC
CTTCCCCTGATGTTGATTACATTCAAGAGCTATTGGCGATACAGCAACAAGGGCCTAGAA
CAATTGGCTTCTTTGGGACCAGGAACATGGGTTTCATGCATCAAGAGCTCATCGAGATAC
TTAGCTACGCCATGGTTATTACT

QA 2 624 2 624
DS 

RD RR2ES37TF 661 0 0
ATATCTACGTTGGAGACAGAAGAGAAGAGAAGTTCAACAGTGATTGGGAGAGATAGATAG
ATGAGTTCGTCTCTACCTATGAGGCTCCTTCTTCTGCCTCTTACACCTTCTTTGATTTCT
CCTCCTCCGGATTCTTCTCATAAGCCTCTCCGATCGCAAAACCCTAATTTCATTCTCCGC
TCCTCTTCTTCTACTACTCCTTCATCGCCGCAGCTTTTCCCCCGGCGATCCAGATCCTCT
TCTCCCTGTGTTTCCATGTGTTTTCCCCAACACAAGGAAGATCAAGCCAACACAGATACT
TGGAGGAATGAAGAAGATGATCACATTACATGTGGGCTTGAATCAGATGAAGATTCCGGC
GGCCTCCGGATTCCTACTCAGGCTCAGGCCATTGTTGAGGGATCTGGTTCAGTTGCTGTC
TCTGAGCTCAAACCTTCCCCTGATGTTGATTACATTCAAGAGCTATTGGCGATACAGCAA
CAAGGGCCTAGAACAATTGGCTTCTTTGGGACCAGGAACATGGGTTTCATGCATCAAGAG
CTCATCGAGATACTTAGCTACGCCATGGTTATTACTAAAAACCATATATATA**CTTCAG
*TGCATCTGGAACTAACGCAGCTGTTATCAG*GGTGCGTTGAGAGCAGAGAGGCCAGAGC
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2AO74JQ 865 0 0
GTTTCCATGTGTTTTCCCCAACACAAGGAAGATCAAGCCAACACAGATACTTGGAGGAAT
GAAGAAGATGATCACATTACATGTGGGCTTGAATCAGATGAAGATTCCGGCGGCCTCCGG
ATTCCTACTCAGGCTCAGGCCATTGTTGAAGGATCTGGTTCAGTTGCTGTCTCTGAGCTC
AAACCTTCCCCTGATGTTGATTACATTCAAGAGCTATTGGCGATACAGCAACAAGGGCCT
AGAACAATTGGCTTCTTTGGGACCAGGAACATGGGTTTCATGCATCAAGAGCTCATCGAG
ATACTTAGCTACGCCATGGTTATTACTAAAAACCATATATATA**CTTCAGGTGCATCTG
GAACTAACGCAGCTGTTATCAGAGGTGCGTTGAGAGCAGAGAGGCCAGAGCTTCTTACAG
TTATTTTGCCTCAAAGTTTGAAAAAACAACCTCCCGAGAGCCAAGAACTCTTGTCCAAAG
TACAAAACGTGGTAGAAAAGCCACACAATGACCATTTGCCATTACTAGAAGCAAGCAGAC
TATGCAATATGGACATCATATCACAAGTACAGCAAGTAATCTGCTTCACGTTTCATGACA
GTAAGCTTCTCATGGAGACATGTCAAGAAGCTAAAAATCTCCGCAAGATCGTCACTCTCT
TCTACCTCGATTGATTCCCCACTTATCTTATCTTCTCCCGGGAACACAAGAGGGTGGATA
CAAGTCTCTTTGTAAATTGTGAATCTCTCCCCCATCCACAACATATTCTTTTGTCTAAAT
TTTTGAAAAACCCCATCGTTGCGATTTATAGGATGAATTCTCTACTATTTGTAACGTTAC
ATTTGTTATAAAATCTATCTTC
CCT

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR2DM13JQ 675 0 0
TGTTGATTACATTCAAGAGCTATTGGCGATACAGCAACAAGGGCCTAGAACAATTGGCTT
CTTTGGGACCAGGAACATGGGTTTCATGCATCAAGAGCTCATCGAGATACTTAGCTGCGC
CATGGTTATTACTAAAAACCATATATATATACTTCAGGTGCATCTGGAACTAACGCAGCT
GTTATCAGAGGTGCGTTGAGAGCAGAGAGGCCAGAGCTT**TACAGTTATTTTGCCTCAA
AGTTTGAAAAAACAACCTCCCGAGAGCCAAGAACTCTTGTCCAAAGTACAAAACGTGGTA
GAAAAGCCACACAATGACCATTTGCCATTACTAGAAGCAAGCAGACTATGCAATATGGAC
ATCATATCACAAGTACAGCAAGTAATCTGCTTCGCGTTTCATGACAGTAAGCTTCTCATG
GAGACATGTCAAGAAGCTAAAAATCTCCGCAAGATCGTCACTCTCTTCTACCTCGATTGA
TTCCCCACTTATCTTATCTTCTCCCGGGAACACAGGAGGATGGATACAAGTCTCTTTGTA
AATTGTGAATCTCTCCCCCATCCACAACATATTCTTTTGTCTAAATTTTTGAAAAACCCC
ATCGTTGTGATTTATAGGATGAATTCTCTACTATTTGTAACGTTACATTTGTTATAAAAT
CTATCTTCTCATCCC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2ES37JQ 131 0 0
TCTTTTCCCGGGAACACAAGAGGATGGATACAAGTCTCTTTGTAAATTGTGAATCTCTCC
CCCATCCACAACATATTTTTTTGTTTAAATTTTTGAAAAACCCCATCGTTGTGATTTATA
GGATGAATTCT

QA 1 131 1 131
DS 



AS 3 7

CO CL938Contig1 714 2 5 U
GGAAAACATTACATTATTAAGCCTTTCTTGCATGTTTATGTAAACAACAAAATGTCACAT
AACGCTTGTAACAGCAGCAACAAACAGAACAGACATGCTAGTAGTGTTGTTGTTGTCAAA
ATAAATCAAATAAAACATGCAAACATTATATTCTACATTGATATATTATGTTCTTTGTAC
ATTGAGATAGGCCGCGTTGATGTGTCACTCTAGCCGGTGACAAAGTAATCCATCTTCTCT
GGAGGTAAGTTCAAGACCGATTGCTCAACCTCTTCGAAAGGAACGAAGACGAAGGGAGTC
ATACCCCTCTTGTGCGAGACGGCAGGTATATCGGGATTGTGAGTTTCATCGTCTCTCCAA
TTCTCAACTACCCCAAGAATGTCCTCTTCCGTGCTACTTCCTTCCTCATCGTTCACACCA
CTCGTCACTAGTGACAGCAAATCCATCCTGTTATTCGCTCCTATCGCCGTTCCTCTTAAC
CTTAAACGGATCCTTAAGACAGTTGGGCGTGTCCCTGGATACAGAACAGCTGCTTCAATC
TTGTCATCTGACATAGACAATGTATAAGTGCCTCTGTATAGACCATCTGCTTTAGAAGAC
GTAAAGTTCATGTATTTGGCTACATCCTTCAATTTCTGTGAAGAGTTCTTGTAAAGGAAT
CTGCCAGAAGGGTAGAATCTTATGTAGCGGAAGTAACATACAATGTGAACTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT65JQ U 1
AF RR2D764JQ U 19
BS 1 50 RR2BT65JQ
BS 51 51 RR2D764JQ
BS 52 600 RR2BT65JQ
BS 601 601 RR2D764JQ
BS 602 714 RR2BT65JQ

RD RR2BT65JQ 714 0 0
GGAAAACATTACATTATTAAGCCTTTCTTGCATGTTTATGTAAACAACAAGATGTCACAT
AACGCTTGTAACAGCAGCAACAAACAGAACAGACATGCTAGTAGTGTTGTTGTTGTCAAA
ATAAATCAAATAAAACATGCAAACATTATATTCTACATTGATATATTATGTTCTTTGTAC
ATTGAGATAGGCCGCGTTGATGTGTCACTCTAGCCGGTGACAAAGTAATCCATCTTCTCT
GGAGGTAAGTTCAAGACCGATTGCTCAACCTCTTCGAAAGGAACGAAGACGAAGGGAGTC
ATACCCCTCTTGTGCGAGACGGCAGGTATATCGGGATTGTGAGTTTCATCGTCTCTCCAA
TTCTCAACTACCCCAAGAATGTCCTCTTCCGTGCTACTTCCTTCCTCATCGTTCACACCA
CTCGTCACTAGTGACAGCAAATCCATCCTGTTATTCGCTCCTATCGCCGTTCCTCTTAAC
CTTAAACGGATCCTTAAGACAGTTGGGCGTGTCCCTGGATACAGAACAGCTGCTTCAATC
TTGTCATCTGACATAGACAATGTATAAGTGCCTCTGTATAGACCATCTGCTTTAGAAGAC
TTAAAGTTCATGTATTTGGCTACATCCTTCAATTTCTGTGAAGAGTTCTTGTAAAGGAAT
CTGCCAGAAGGGTAGAATCTTATGTAGCGGAAGTAACATACAATGTGAACTGGG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2D764JQ 646 0 0
AAGC
CTTTCTTGCATGTTTATGTAAACAACAAAATGTCACATAACGCTTGTAACAGCAGCAACA
AACAGAACAGACATGCTAGTAGTGTTGTTGTTGTCAAAATAAATCAAATAAAACATGCAA
ACATTATATTCTACATTGATATATTATGTTCTTTGTACATTGAGATAGGCCGCGTTGATG
TGTCACTCTAGCCGGTGACAAAGTAATCCATCTTCTCTGGAGGTAAGTTCAAGACCGATT
GCTCAACCTCTTCGAAAGGAACGAAGACGAAGGGAGTCATACCCCTCTTGTGCGAGACGG
CAGGTATATCGGGATTGTGAGTTTCATCGTCTCTCCAATTCTCAACTACCCCAAGAATGT
CCTCTTCCGTGCTACTTCCTTCCTCATCGTTCACACCACTCGTCACTAGTGACAGCAAAT
CCATCCTGTTATTCGCTCCTATCGCCGTTCCTCTTAACCTTAAACGGATCCTTAAGACAG
TTGGGCGTGTCCCTGGATACAGAACAGCTGCTTCAATCTTGTCATCTGACATAGACAATG
TATAAGTGCCTCTGTATAGACCATCTGCTTTAGAAGACGTAAAGTTCATGTATTTGGCTA
CATCCTTCAATTTCTGTGAAGAGTTCTTGTAAAGGAATCTGC

QA 5 646 5 646
DS 



CO CL938Contig2 931 3 7 U
GGAATGTGAGCTTGGAGACGACACGGAAAAAAATAAAAATAGTCTCTGGTCTTAATCTTA
TCGTCCTGTTTAATTTCTCCGGTAACAGAGGCGCGCGCGGCCACAAAACCGCTCTCGATT
CATCGGAACATCTCAATTCTCTATCAATTTCCCATGACTTCAGATGCTCTCAACATACCA
TCTGAGCTTGAATCTGCGTTACGGCTCAGGACTGTTCAATACTTTATTACAAAGAGACCT
TGGCTTGATCTCTATGGAGTCCATGTACGGCCCGTTGCACCATTCGGAAGCACAAGCAGT
AAACCACAATTTGATCCTGCTTTGATTCATCGTTCCTTGCCCGATGAGCTTCTTTTTGAG
GTATTTGCTCGGATGTTGCCTTATGACTTAGGAAGAGCAGCTTGTGTCTGCAGAAAGTGG
AGGTACACAGTTCGAAACCCTGTGTTCTGGCGTAACGCGTGCTTGAAAGCTTGGCAGACT
GCTGGGGTTATCGAAAACTATAGGATCTTGCAGTCTAAATACGATGGATCGTGGAGGAAA
ATGTGGCTTCTTAGATCCAGAGTTCGTACTGATGGTATTTATGTGAGTAGGAACACTTAC
ATTCGAGCTGGAATTGCGGAGTGGAAGATTACAAACCCAGTTCACATTGTATGTTACTTC
CGCTACATAAGATTCTACCCTTCTGGCAGATTCCTTTACAAGAACTCTTCACAGAAATTG
AAGGATGTAGCCAAATACATGAACTTTAAGTCTTCTAAAACAGATGGTCTTTACAGAGGC
ACTTATACATTGTCTATGTCAGATGACAGATTGAAGCAGCTGTTCTGTATCCAGGGACGC
GCCTACTGTCTTAAGATCCGTTTAGGTTAGAGGACGGCGATAGGAGCGATACAGGATGGA
TTGCTGTCACTAGTGACAAGTGGTGTGACGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT65TF U 1
AF RR2D764TF U 61
AF RR2E486TF U 127
BS 1 509 RR2BT65TF
BS 510 510 RR2D764TF
BS 511 687 RR2BT65TF
BS 688 700 RR2D764TF
BS 701 701 RR2E486TF
BS 702 712 RR2D764TF
BS 713 931 RR2E486TF

RD RR2BT65TF 687 0 0
GGAATGTGAGCTTGGAGACGACACGGAAAAAAATAAAAATAGTCTCTGGTCTTAATCTTA
TCGTCCTGTTTAATTTCTCCGGTAACAGAGGCGCGCGCGGCCACAAAACCGCTCTCGATT
CATCGGAACATCTCAATTCTCTATCAATTTCCCATGACTTCAGATGCTCTCAACATACCA
TCTGAGCTTGAATCTGCGTTACGGCTCAGGACTGTTCAATACTTTATTACAAAGAGACCT
TGGCTTGATCTCTATGGAGTCCATGTACGGCCCGTTGCACCATTCGGAAGCACAAGCAGT
AAACCACAATTTGATCCTGCTTTGATTCATCGTTCCTTGCCCGATGAGCTTCTTTTTGAG
GTATTTGCTCGGATGTTGCCTTATGACTTAGGAAGAGCAGCTTGTGTCTGCAGAAAGTGG
AGGTACACAGTTCGAAACCCTGTGTTCTGGCGTAACGCGTGCTTGAAAGCTTGGCAGACT
GCTGGGGTTATCGAAAACTATAGGATCTTACAGTCTAAATACGATGGATCGTGGAGGAAA
ATGTGGCTTCTTAGATCCAGAGTTCGTACTGATGGTATTTATGTGAGTAGGAACACTTAC
ATTCGAGCTGGAATTGCGGAGTGGAAGATTACAAACCCAGTTCACATTGTATGTTACTTC
CGCTACATAAGATTCTACCCTTCTGGC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2D764TF 652 0 0
GG
GTCCTGTTTAATTTCTCCGGTAACAGAGGCGCTCGCGGCCACAAAACCGCTCTCGATTCA
TCGGAACATCTCAATTCTCTATCAATTTCCCATGACTTCAGATGCTCTCAACATACCATC
TGAGCTTGAATCTGCGTTACGGCTCAGGACTGTTCAATACTTTATTACAAAGAGACCTTG
GCTTGATCTCTATGGAGTCCATGTACGGCCCGTTGCACCATTCGGAAGCACAAGCAGTAA
ACCACAATTTGATCCTGCTTTGATTCATCGTTCCTTGCCCGATGAGCTTCTTTTTGAGGT
ATTTGCTCGGATGTTGCCTTATGACTTAGGAAGAGCAGCTTGTGTCTGCAGAAAGTGGAG
GTACACAGTTCGAAACCCTGTGTTCTGGCGTAACGCGTGCTTGAAAGCTTGGCAGACTGC
TGGGGTTATCGAAAACTATAGGATCTTGCAGTCTAAATACGATGGATCGTGGAGGAAAAT
GTGGCTTCTTAGATCCAGAGTTCGTACTGATGGTATTTATGTGAGTAGGAACACTTACAT
TCGAGCTGGAATTGCGGAGTGGAAGATTACAAACCCAGTTCACATTGTATGTTACTTCCG
CTACATAAGATTCTACCCTTCTGGCAGATTCCTTTACA*GAACTCTTCAC

QA 3 652 3 652
DS 

RD RR2E486TF 805 0 0
GGAACCC
CAATTCTCTATCAATTTCCCATGACTTCAGATGCTCTCAACATACCATCTGAGCTTGAAT
CTG*GTTACGGCTCAGGACTGTTCAATACTTTATTACAAAGAGACCTTGGCTTGATCTCT
ATGGAGTCCATGTACGGCCCGTTGCACCATTCGGAAGCACAAGCAGTAAACCACAATTTG
ATCCTGCTTTGATTCATCGTTCCTTGCCTGATGAGCTTCTTTTCGAGGTATTTGCTCGGA
TGTTGCCTTATGACTTAGGAAGAGCAGCTTGTGTCTGCAGAAAGTGGAGGTACACAGTTC
GAAACCCTGTCTTCTGGCGTAACGCGTGCTTGAAAGCTTGGCAGACTGCTGGGGTTATCG
AAAACTATAGGATCTTGCAGTCTAAATACGATGGATCGTGGAGGAAAATGTGGCTTCTTA
GATCTAGAGTTCGTACTGATGGTATTTATGTGAGTAGGAACACTTACATTCGAGCTGGAA
TTGCTGAGTGGAAGATTACAAATCCAGTTCACATTGTATGTTACTTCCGCTACATAAGAT
TCTACCCTTCTGGCAGATTTCTTTACAAGAACTCTTCACAGAAATTGAAGGATGTAGCCA
AATACATGAACTTTAAGTCTTCTAAAACAGATGGTCTTTACAGAGGCACTTATACATTGT
CTATGTCAGATGACAGATTGAAGCAGCTGTTCTGTATCCAGGGACGCGCCTACTGTCTTA
AGATCCGTTTAGGTTAGAGGACGGCGATAGGAGCGATACAGGATGGATTGCTGTCACTAG
TGACAAGTGGTGTGACGA

QA 8 805 8 805
DS 



CO CL938Contig3 785 2 3 U
CCATTATTAAGGCTTTCTTGCATGTTTATGTAAACAACAAAATGTCACATAGCGCTTGTA
ACAGCAGCAACAAACAGACATGCTAGTATTGTTGTTGTCATATAATAAATCAAATAAAAC
ATGCAAACATTATATTCCACATTTTGATATATTATGTTCTTTGTACATTGAGATAGGGCG
TTGACGTGTCACACTCTAGCCGGTGACAAAGTAATCCATCTTCTCTGGAGGTAAGTTCAA
GACCGATTGCTCAACCTCTTCAAAAGGAACGAAGACGAAGGGAGTCATACCCCTCTTGTG
TGAGACGGCAGGTATATCAGGGTTGTGAGTTTCATCGTCTCTCCAATTCTCAACTACCCC
AAGAATGTCCTCCTCTGTGCTACTTCCTTCCTCATCGTTCACACCACTTGTCACTAGTGA
CAGCAAATCCATCCTGTTATTCGCTCCTATCGCCGTTCCTCTTAACCTTAAACGGATCCT
TAAGACAGTAGGGCGCGTCCCTGGATACAGAACAGCTGCTTCAATCTTGTCATCTGACAT
AGACAATGTATAAGTGCCTCTGTAAAGACCATCTGTTTTAGAAGACTTAAAGTTCATGTA
TTTGGCTACATCCTTCAATTTCTGTGAAGAGTTCTTGTAAAGAAATCTGCCAGAAGGGTA
GAATCTTATGTAGCGGAAGTAACATACAATGTGAACTGGATTTGTAATCTTCCACTCAGC
AATTCCAGCTCGAATGTAAGTGTTCCTACTCACATAAATACCATCAGTACGAACTCTAGA
TCTAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 

AF RR2E486JQ U 1
AF RR2H192JQ U 1
BS 1 184 RR2E486JQ
BS 185 185 RR2H192JQ
BS 186 785 RR2E486JQ

RD RR2E486JQ 785 0 0
CCATTATTAAGGCTTTCTTGCATGTTTATGTAAACAACAAAATGTCACATAGCGCTTGTA
ACAGCAGCAACAAACAGACATGCTAGTATTGTTGTTGTCATATAATAAATCAAATAAAAC
ATGCAAACATTATATTCCACATTTTGATATATTATGTTCTTTGTACATTGAGATAGGGCG
TTGATGTGTCACACTCTAGCCGGTGACAAAGTAATCCATCTTCTCTGGAGGTAAGTTCAA
GACCGATTGCTCAACCTCTTCAAAAGGAACGAAGACGAAGGGAGTCATACCCCTCTTGTG
TGAGACGGCAGGTATATCAGGGTTGTGAGTTTCATCGTCTCTCCAATTCTCAACTACCCC
AAGAATGTCCTCCTCTGTGCTACTTCCTTCCTCATCGTTCACACCACTTGTCACTAGTGA
CAGCAAATCCATCCTGTTATTCGCTCCTATCGCCGTTCCTCTTAACCTTAAACGGATCCT
TAAGACAGTAGGGCGCGTCCCTGGATACAGAACAGCTGCTTCAATCTTGTCATCTGACAT
AGACAATGTATAAGTGCCTCTGTAAAGACCATCTGTTTTAGAAGACTTAAAGTTCATGTA
TTTGGCTACATCCTTCAATTTCTGTGAAGAGTTCTTGTAAAGAAATCTGCCAGAAGGGTA
GAATCTTATGTAGCGGAAGTAACATACAATGTGAACTGGATTTGTAATCTTCCACTCAGC
AATTCCAGCTCGAATGTAAGTGTTCCTACTCACATAAATACCATCAGTACGAACTCTAGA
TCTAA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2H192JQ 785 0 0
A
CATTATTAAGGCTTTCTTGCATGTTTATGTAAACAACAAAATGTCACATAGCGCTTGTAA
CAGCAGCAACAAACAGACATGCTAGTATTGTTGTTGTCATATAATAAATCAAATAAAACA
TGCAAACGTTATATTCCACATTTTGATATATTATGTTCTTTGTACATTGAGATAGGGCGT
TGACGTGTCACACTCTAGCCGGTGACAAAGTAATCCATCTTCTCTGGAGGTGAGTTCAAG
ACCGATTGCTCAACCTCTTCAAAAGGAACGAAGACGAAGGGAGTCATACCCCTCTTGTGT
GAGACGGCAGGTATATCAGGGTTGTGAGTTTCATCGTCTCTCCAATTCTCAACTACCCCA
AGAATGTCCTCCTCTGTGCTACTTCCTTCCTCATCGTTCACACCACTTGTCACTAGTGAC
AGCAAATCCATCCTGTTATTCGCTCCTATCGCCGTTCCTCTTAACCTTAAACGGATCCTT
AAGACAGTAGGGCGCGTCTCTGGATACAGAACAGCTGCTTCAATCTTGTCATCTGACATA
GACAATGTATAAGTGCCTCTGTAAAGACCATCTGTTTTAGAAGACTTAAAGTTCATGTAT
TTGGCTACATCCTTCAATTTCTGTGAAGAGTTCTTGTAAAGAAATCTGCCAGAAGGGTAG
AATCTTATGTAGCGGAAGTAACATACAATGTGAACTGGATTTGTAATCTTCCACTCAGCA
ATTCCAGCTCGAATGTAAGTGTTCCTACTCACATAAATACCATCAGTACGAACTCTAGAT
CTAA

QA 2 785 2 785
DS 



AS 2 6

CO CL939Contig1 675 2 2 U
GGGCCGCATCTCCGTTTCTCTATTCGGATCTCTGACCCACCACCACTACTTCTCTTCCTT
CATCTAATAAGAGGCTTCTTCTTCTTCGTCTCCAATAGATTCAGGGAAAAGATCTTTCTT
TTACTACCCAATCTTATTTATTTTCGCCGCCATGAGTTCTGTTACCGCGATCGTGGATGA
GCAGCAAGTGGTCGAAGCTATTCAGGATTTGACTCTTCAAGCTCAGGGCAAAGAGAAGAT
CCACGAGCTCAATTTCGGAAACCATGGCGGCTGTTGTGCAATATGCTTGAGTGAAATTCC
TCTTCAAGAGACTGCTATGGTCAAAGGCTGTGAACATACTTACTGTGTGACATGCATACT
TCGTTGGGCGAGTTGCAAAGAGAGTCCTACATGCCCGCAATGTAAGCATCCATTTGATTT
TCTCAGTGTCCACCGGACTCTTGATGGCAGCATTGAAGATTTTTTGTTTGAGGAGAGTGT
GTGCCTTCTCCTGAGAGCCTCCTGGTTTATACCGTTGGATGTGATGGTGGAACAGGCGTC
ACACAGCTATGGCTATCATGATGATTTCGACACTCCCTGTGACTACGAGGATGAAGATGA
TGACCTTGACGAGTTTTATCTGCACGGGTCAGTCTTCGCATAGAAACCGGAGATGGGGCG
ACATGGTTTTGTCAG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G985TF U 1
AF RR2GY92TF U 1
BS 1 565 RR2G985TF
BS 566 675 RR2GY92TF

RD RR2G985TF 565 0 0
GGGCCGCATCTCCGTTTCTCTATTCGGATCTCTGACCCACCACCACTACTTCTCTTCCTT
CATCTAATAAGAGGCTTCTTCTTCTTCGTCTCCAATAGATTCAGGGAAAAGATCTTTCTT
TTACTACCCAATCTTATTTATTTTCGCCGCCATGAGTTCTGTTACCGCGATCGTGGATGA
GCAGCAAGTGGTCGAAGCTATTCAGGATTTGACTCTTCAAGCTCAGGGCAAAGAGAAGAT
CCACGAGCTCAATTTCGGAAACCATGGCGGCTGTTGTGCAATATGCTTGAGTGAAATTCC
TCTTCAAGAGACTGCTATGGTCAAAGGCTGTGAACATACTTACTGTGTGACATGCATACT
TCGTTGGGCGAGTTGCAAAGAGAGTCCTACATGCCCGCAATGTAAGCATCCATTTGATTT
TCTCAGTGTCCACCGGACTCTTGATGGCAGCATTGAAGATTTTTTGTTTGAGGAGAGTGT
GTGCCTTCTCCTGAGAGCCTCCTGGTTTATACCGTTGGATGTGATGGTGGAACAGGCGTC
ACACAGCTATGGCTATCATGATGAT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2GY92TF 675 0 0
G
GGCCGCATCTCCGTTTCTCTATTCGGATCTCTGACCCACCACCACTACTTCTCTTCCTTC
ATCTAATAAGAGGCTTCTTCTTCTTCGTCTCCAATAGATTCAGGGAAAAGATCTTTCTTT
TACTACCCAATCTTATTTATTTTCGCCGCCATGAGTTCTGTTACCGCGATCGTGGATGAG
CAGCAAGTGGTCGAAGCTATTCAGGATTTGACTCTTCAAGCTCAGGGCAAAGAGAAGATC
CACGAGCTCAATTTCGGAAACCATGGCGGCTGTTGTGCAATATGCTTGAGTGAAATTCCT
CTTCAAGAGACTGCTATGGTCAAAGGCTGTGAACATACTTACTGTGTGACATGCATACTT
CGTTGGGCGAGTTGCAAAGAGAGTCCTACATGCCCGCAATGTAAGCATCCATTTGATTTT
CTCAGTGTCCACCGGACTCTTGATGGCAGCATTGAAGATTTTTTGTTTGAGGAGAGTGTG
TGCCTTCTCCTGAGAGCCTCCTGGTTTATACCGTTGGATGTGATGGTGGAACAGGCGTCA
CACAGCTATGGCTATCATGATGATTTCGACACTCCCTGTGACTACGAGGATGAAGATGAT
GACCTTGACGAGTTTTATCTGCACGGGTCAGTCTTCGCATAGAAACCGGAGATGGGGCGA
CATGGTTTTGTCAG

QA 2 675 2 675
DS 



CO CL939Contig2 1092 4 2 U
GGCCGCATCTCCGTTTCTCCATTCGGATCTCTGACCCACCACCACTACTCCCCACCTTCC
TCAGATAAGAGGCTTCTTCTTCTTCACCAATAGATTCAGGGAAAAAATCTCTCTTTCACT
ACCCAATCTTATTTATTTTCGCCGCCATGAGTTCTGTTACCGCGATCGTGGATGAGCAGC
AAGTGGTCGAAGCTATTCAGGATTTGACTCTTCAAGCTCAGGGCAAAGAGAAGATCTACG
AGCTCAATTTCGGAAACCATGGCGGCTGTTGTGCAATGTGCTTGAGTGAAATTCCTCTTC
AAGAGACTGCTATGGTCAAAGGCTGTGAACATACTTACTGTGTGACATGTATACTTCGTT
GGGCGAGTTGCAAAGATAGTCCTACATGCCCGCAATGTAAGCATCCGTTTGACTTCCTCA
GTGTCCACCGGACTCTTGATGGCAGCATTGAAGATTTTTTGTTTGAGGAGAGTGTGTGCC
TTCTCCTGAGAGCCTCCTGGTTTATACCGTTGGATGTGATGGTGGAACAGGCGTCACACA
GCTATGGCTATCATGATGATTTCGACATTCCTTGCGACTACGAGGACGAAGATGATGACC
TTGACGAGTTTTATCTGCGTGGGTCAGGTCTTCGCATAGGAAACCGTAGATGGGGTGACA
ATGGTTTTGTCAGATCCGGGCGTCAAGAAGCCAGGCCAGTCAAGAAACACAGTTGTTCTG
GTTCTAGTTCTAGTTCCAGTTCCAGTTCGGGCTCATCTTCATGTGAGCCTAAGGATAAGC
AGGTGAAGACTACAAACACAACGGGAAGGCGTGCAAAGAGGGCGATGAAGCGGGAAGCTG
CTAACAAAGCAGCTGAAGTAGCTTCAGCAGCAAAGCACGAAGCTCATTTGGTTAGGCTGG
GAAGGAAGTGAGTGAGTGTGGATGCTCCTCTCTGTAAGTAAAACCGCGCTATTAAAAAAG
CTCCCACCCACTTCATTCCTTAGTTTCATCATCTGTACAGCAGCTACCTTTTAATGTTGT
GGTAAAATCCCAATCACAGTTGTTTGGGGTTTGGAGAAACAACCAGAAGTTGTGACCTTT
GTTATCTTATAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GM83TF U 1
AF RR2GQ22TF U 1
AF RR2GM83JQ C 620
AF RR2GQ22JQ C 684
BS 1 713 RR2GM83TF
BS 714 1092 RR2GM83JQ

RD RR2GM83TF 713 0 0
GGCCGCATCTCCGTTTCTCCATTCGGATCTCTGACCCACCACCACTACTCCCCACCTTCC
TCAGATAAGAGGCTTCTTCTTCTTCACCAATAGATTCAGGGAAAAAATCTCTCTTTCACT
ACCCAATCTTATTTATTTTCGCCGCCATGAGTTCTGTTACCGCGATCGTGGATGAGCAGC
AAGTGGTCGAAGCTATTCAGGATTTGACTCTTCAAGCTCAGGGCAAAGAGAAGATCTACG
AGCTCAATTTCGGAAACCATGGCGGCTGTTGTGCAATGTGCTTGAGTGAAATTCCTCTTC
AAGAGACTGCTATGGTCAAAGGCTGTGAACATACTTACTGTGTGACATGTATACTTCGTT
GGGCGAGTTGCAAAGATAGTCCTACATGCCCGCAATGTAAGCATCCGTTTGACTTCCTCA
GTGTCCACCGGACTCTTGATGGCAGCATTGAAGATTTTTTGTTTGAGGAGAGTGTGTGCC
TTCTCCTGAGAGCCTCCTGGTTTATACCGTTGGATGTGATGGTGGAACAGGCGTCACACA
GCTATGGCTATCATGATGATTTCGACATTCCTTGCGACTACGAGGACGAAGATGATGACC
TTGACGAGTTTTATCTGCGTGGGTCAGGTCTTCGCATAGGAAACCGTAGATGGGGTGACA
ATGGTTTTGTCAGATCCGGGCGTCAAGAAGCCAGGCCAGTCAAGAAACACAGT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2GQ22TF 686 0 0
GGCCGCATCTCCGTTTCTCCATTCGGATCTCTGACCCACCACCACTACTCCCCACCTTCC
TCAGATAAGAGGCTTCTTCTTCTTCACCAATAGATTCAGGGAAAAAATCTCTCTTTCACT
ACCCAATCTTATTTATTTTCGCCGCCATGAGTTCTGTTACCGCGATCGTGGATGAGCAGC
AAGTGGTCGAAGCTATTCAGGATTTGACTCTTCAAGCTCAGGGCAAAGAGAAGATCTACG
AGCTCAATTTCGGAAACCATGGCGGCTGTTGTGCAATGTGCTTGAGTGAAATTCCTCTTC
AAGAGACTGCTATGGTCAAAGGCTGTGAACATACTTACTGTGTGACATGTATACTTCGTT
GGGCGAGTTGCAAAGATAGTCCTACATGCCCGCAATGTAAGCATCCGTTTGACTTCCTCA
GTGTCCACCGGACTCTTGATGGCAGCATTGAAGATTTTTTGTTTGAGGAGAGTGTGTGCC
TTCTCCTGAGAGCCTCCTGGTTTATACCGTTGGATGTGATGGTGGAACAGGCGTCACACA
GCTATGGCTATCATGATGATTTCGACATTCCTTGCGACTACGAG*ACGAAGATGATGACC
TTGACGAGTTT*ATCTGCGTGGGTCAG*TCTTCGCATAG*AAACCGTAGATGGGGTGACA
ATGGTTTTGTCAGATCCGG
CGTCAGA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2GM83JQ 473 0 0
T
GGGTCAGGTCTTCGCATAGGAAACCGTAGATGGGGTGACAATGGTTTTGTCAGATCCGGG
CGTCAAGAAGCCAGGCCAGTCAAGAAACACAGTTGTTCTGGTTCTAGTTCTAGTTCCAGT
TCCAGTTCGGGCTCATCTTCATGTGAGCCTAAGGATAAGCAGGTGAAGACTACAAACACA
ACGGGAAGGCGTGCAAAGAGGGCGATGAAGCGGGAAGCTGCTAACAAAGCAGCTGAAGTA
GCTTCAGCAGCAAAGCACGAAGCTCATTTGGTTAGGCTGGGAAGGAAGTGAGTGAGTGTG
GATGCTCCTCTCTGTAAGTAAAACCGCGCTATTAAAAAAGCTCCCACCCACTTCATTCCT
TAGTTTCATCATCTGTACAGCAGCTACCTTTTAATGTTGTGGTAAAATCCCAATCACAGT
TGTTTGGGGTTTGGAGAAACAACCAGAAGTTGTGACCTTTGTTATCTTATAC

QA 2 473 2 473
DS 

RD RR2GQ22JQ 409 0 0
CAAGAAGCCAGGCCAGTCAAGAAACACAGTTGTTCTGGTTCTAGTTCTAGTTCCAGTTCC
AGTTCGGGCTCATCTTCATGTGAGCCTAAGGATAAGCAGGTGAAGACTACAAACACAACG
GGAAGGCGTGCAAAGAGGGCGATGAAGCGGGAAGCTGCTAACAAAGCAGCTGAAGTAGCT
TCAGCAGCAAAGCACGAAGCTCATTTGGTTAGGCTGGGAAGGAAGTGAGTGAGTGTGGAT
GCTCCTTTCTGTAAGTAAAACCGCGCTATTAAAAAAGCTCCCACCCACTTCATTCCTTAG
TTTCATCATCTGTACAGCAGCTACCTTTTAATGTTGTGGTAAAATCCCAATCACAGTTGT
TTGGGGTTTGGAGAAACAACCAGAAGTTGTGACCTTTGTTATCTTATAC

QA 1 409 1 409
DS 



AS 2 8

CO CL940Contig1 1018 3 5 U
GTGTTTAATCGGGAATCTCCAATACTTGAAAATACTTAGGTGATATGACAATTGGATACA
TACATAGTTCAAATATGAGCTAGACATCATATCTCAAAATGAAATATCTTCACATCATAT
CTCAATATGAAATATCTTCATTTACAACCATTTTTAATTGGTAAAATAAATGTCCACACA
AGCAAAACAAAGCAAAGATATGCAAAACACAGAAGTCCATAACTCAATGTTGACTGACCA
GAAGGCCCCCTTTAAGGGAAGTGTATTCCATTACATATAACTAAGCACAACAAGATGAAC
TCACTGCCCTATCCATGGCCCTATCTGGTAGAACCATTCCTGTTGGGTTTTCTGTTGGTT
GTACTCTCGGTAACCTTCTTGCAATTTCATAGAATATCTCCTTGACATTAGCTGCGGTTT
TGGCTGAAGTTTCCATGAAGAAAAGACCGTTCTCCTGAGCATGTGTTTGTGCCTCCTCTG
CGGAAACCTTCCTTGCATCTAATAAATCAGATTTGTTTCCAGCAAGGGCCATCACCATAT
TAGCGTTACCTTGTGCCTGAAGTTCCTGAACCCATTTCTTTGCCCTCTCAAACGAGGCTT
GGTTTGTAACGTCAAAGACAATGATAGCAGCAGCAGCACCCCTGTAGTACATAGGAGCCA
AACTATGGTACCGTTCCTGACCTGCTGTATCCCATATCTCAAACTTTACAGTCGCGTCGT
TGACAGCTAGTGTTTGTGAGAAAAAAGCTGCACCAATGGTTGATTCCTGAAACTCAACAA
ACTGATCTTTAACAAACCGTAACACAAGGCTCGATTTCCCAGCGCCAACATCTCCAAGCA
ACACAAATTTGGCGTTGATTGTCTTGTTTGCAGCGGTGGTAGCCATGATTGAGCTCAAGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGCTCGTGGATGGAGGAAATGAGATTGAAGATCAAAAGACAGAGA
GAACCCAAAAAGACGCGTCGTCGGCAACAACCACCCAATTTTCTGTATCCCTTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD59JQ U 1
AF RR2GF03JQ U 94
AF RR2AD59TF C 378
BS 1 245 RR2AD59JQ
BS 246 246 RR2GF03JQ
BS 247 804 RR2AD59JQ
BS 805 821 RR2GF03JQ
BS 822 1018 RR2AD59TF

RD RR2AD59JQ 804 0 0
GTGTTTAATCGGGAATCTCCAATACTTGAAAATACTTAGGTGATATGACAATTGGATACA
TACATAGTTCAAATATGAGCTAGACATCATATCTCAAAATGAAATATCTTCACATCATAT
CTCAATATGAAATATCTTCATTTACAACCATTTTTAATTGGTAAAATAAATGTCCACACA
AGCAAAACAAAGCAAAGATATGCAAAACACAGAAGTCCATAACTCAATGTTGACTGACCA
GAAGGTCCCCTTTAAGGGAAGTGTATTCCATTACATATAACTAAGCACAACAAGATGAAC
TCACTGCCCTATCCATGGCCCTATCTGGTAGAACCATTCCTGTTGGGTTTTCTGTTGGTT
GTACTCTCGGTAACCTTCTTGCAATTTCATAGAATATCTCCTTGACATTAGCTGCGGTTT
TGGCTGAAGTTTCCATGAAGAAAAGACCGTTCTCCTGAGCATGTGTTTGTGCCTCCTCTG
CGGAAACCTTCCTTGCATCTAATAAATCAGATTTGTTTCCAGCAAGGGCCATCACCATAT
TAGCGTTACCTTGTGCCTGAAGTTCCTGAACCCATTTCTTTGCCCTCTCAAACGAGGCTT
GGTTTGTAACGTCAAAGACAATGATAGCAGCAGCAGCACCCCTGTAGTACATAGGAGCCA
AACTATGGTACCGTTCCTGACCTGCTGTATCCCATATCTCAAACTTTACAGTCGCGTCGT
TGACAGCTAGTGTTTGTGAGAAAAAAGCTGCACCAATGGTTGATTCCTGAAACTCAACAA
ACTGATCTTTAACAAACCGTAACA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2GF03JQ 728 0 0
GGTTCAAATATGAGCTAG
ACATCATATCTCAATATGAAATATCTTCATTTACAACCCTTTTTAATTGGTAAAATAAAT
GTCCACACAAGCAAAACAAAGCAAAGATATGCAAAACACAGAAGTCCATAACTCAATGTT
GACTGACCAGAAGGCCCCCTTTAAGGGAAGTGTATTCCATTACATATAACTAAGCACAAC
AAGATGAACTCACTGCCCTATCCATGGCCCTATCTGGTAGAACCATTCCTGTTGGGTTTT
CTGTTGGTTGTACTCTCGGTAACCTTCTTGCAATTTCATAGAACATCTCCTTGACATTAG
CTGCGGTTTTTGCTGAAGTTTCCATGAAGAAAAGACCGTTCTCCTGAGCATATGTTTGTG
CCTCCTCTGCGGAAACCTTCCTTGCATCTAATAAATCAGATTTGTTTCCAGCAAGGGCCA
TCACCATATTAGCGTTACCTTGTGCCTGAAGTTCCTGAACCCATTTCTTTGCCCTCTCAA
ACGAGGCTTGGTTTGTAACGTCAAAGACAATGATAGCAGCAGCAGCACCCCTGTAGTACA
TAGGAGCCAAACTATGGTACCGTTCCTGACCTGCTGTATCCCATATCTCAAACTTTACAG
TCGCATCGTTGACAGCTAGTGTTTGTGAGAAAAACGCTGCACCGATGGTTGATTCCTGAA
ACTCAACAAACTGATCTTTAACAAACCGTAACACAAGGCTCGATTTCCCA

QA 19 728 19 728
DS 

RD RR2AD59TF 641 0 0
CTTGCAATTTCATAGAATATCTCCTTGACATTAGCTGCGGTTTTGGCTGAAGTTTCCATG
AAGAAAAGACCGTTCTCCTGAGCATGTGTTTGTGCCTCCTCTGCGGAAACCTTCCTTGCA
TCTAATAAATCAGATTTGTTTCCAGCAAGGGCCATCACCATATTAGCGTTACCTTGTGCC
TGAAGTTCCTGAACCCATTTCTTTGCCCTCTCAAACGAGGCTTGGTTTGTAACGTCAAAG
ACAATGATAGCAGCAGCAGCACCCCTGTAGTACATAGGAGCCAAACTATGGTACCGTTCC
TGACCTGCTGTATCCCATATCTCAAACTTTACAGTCGCGTCGTTGACAGCTAGTGTTTGT
GAGAAAAAAGCTGCACCAATGGTTGATTCCTGAAACTCAACAAACTGATCTTTAACAAAC
CGTAACACAAGGCTCGATTTCCCAGCGCCAACATCTCCAAGCAACACAAATTTGGCGTTG
ATTGTCTTGTTTGCAGCGGTGGTAGCCATGATTGAGCTCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
CTCGTGGATGGAGGAAATGAGATTGAAGATCAAAAGACAGAGAGAACCCAAAAAGACGCG
TCGTCGGCAACAACCACCCAATTTTCTGTATCCCTTTCCCC

QA 1 641 1 641
DS 



CO CL940Contig2 892 5 21 U
GGTCCTGGAAAGAGATACAGAAAATTGGGTGGTTGTTGCCGACGACGCGTCTTTTTGGGT
TCTCTCTGTCTTTTGGTCTTCAATCTCATTTCCTCCATCCACGAGCTCTCTCTCTCTCTC
TTGAGCTCAATCATGGCTACCACCGCTGCAAACAAGACCATTAACGCCAAATTGGTGTTA
CTTGGAGATGTTGGCGCTGGGAAATCGAGTCTTGTGTTACGCTTTGTTAAAGATCAGTTT
GTCGAGTTCCAGGAATCAACCATCGGTGCAGCTTTTTTCTCACAAACACTAGCTGTCAAC
GATGCGACTGTAAAGTTTGAGATATGGGATACAGCAGGTCAGGAACGGTACCATAGTTTG
GCTCCTATGTACTACAGGGGTGCTGCTGCTGCTATCATTGTCTTTGACGTTACAAACCAA
GCCTCGTTTGAGAGGGCAAAGAAATGGGTTCAGGAACTTCAGGCACAAGGTAACGCTAAT
ATGGTGATGGCCCTTGCTGGAAACAAATCTGATTTATTAGATGCAAGGAAGGTTTCCGCA
GAGGAGGCACAAACATATGCTCAGGAGAACGGTCTTTTCTTCATGGAAACTTCAGCAAAA
ACCGCAGCTAATGTCAAGGAGATATTCTATGAAATTGCAAGAAGGTTACCGAGAGTACAA
CCAACAGAAAACCCAACAGGAATGGTTCTGCCAGATAGGGCCATGGATAGGGCAGTGAGT
TCATCTTGTTGTGCTTAGTTATATGTAATGGAATACACTTCCCTTAGAGGGGACCTTCTG
GTCAGTCAACATTGAGTTATGGTATTCTGTGTTTTGCATGTCTTTGCTTTGTTTTGCTTG
TGTGAACATTTATTTTACCAATTAAAAAGGGATGTAAATGAAGATATTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F312TF U 3
AF RR2AZ80TFB U 1
AF RR2F312JQ C 54
AF RR2GF03TF U 121
AF RR2AZ80JQ C 96
BS 1 75 RR2AZ80TFB
BS 76 76 RR2F312TF
BS 77 132 RR2AZ80TFB
BS 133 133 RR2F312TF
BS 134 644 RR2AZ80TFB
BS 645 645 RR2GF03TF
BS 646 671 RR2AZ80TFB
BS 672 689 RR2GF03TF
BS 690 690 RR2F312JQ
BS 691 766 RR2GF03TF
BS 767 767 RR2F312JQ
BS 768 772 RR2GF03TF
BS 773 773 RR2F312JQ
BS 774 802 RR2GF03TF
BS 803 804 RR2F312JQ
BS 805 819 RR2GF03TF
BS 820 820 RR2F312JQ
BS 821 844 RR2GF03TF
BS 845 845 RR2F312JQ
BS 846 858 RR2GF03TF
BS 859 892 RR2F312JQ

RD RR2F312TF 638 0 0
GGCT
GGAAAGAGATACAGAAAATTGGGTGGTTGTTGCCGACGACGCGTCTTTTTGGGTTCTCTC
TGTCTTTTGGTCTTCAATCTCATTTCCTCCATCCACGAGCTCTCTCTCTCTCTCTTGAGC
TCAATCATGGCTACCACCGCTGCAAACAAGACCATTAACGCCAAATTGGTGTTACTTGGA
GATGTTGGCGCTGGGAAATCGAGTCTTGTGTTACGCTTTGTTAAAGATCAGTTTGTCGAG
TTCCAGGAATCAACCATCGGTGCAGCTTTTTTCTCACAAACACTAGCTGTCAACGATGCG
ACTGTAAAGTTTGAGATATGGGATACAGCAGGTCAGGAACGGTACCATAGTTTGGCTCCT
ATGTACTACAGGGGTGCTGCTGCTGCTATCATTGTCTTTGACGTTACAAACCAAGCCTCG
TTTGAGAGGGCAAAGAAATGGGTTCAGGAACTTCAGGCACAAGGTAACGCTAATATGGTG
ATGGCCCTTGCTGGAAACAAATCTGATTTATTAGATGCAAGGAAGGTTTCCGCAGAGGAG
GCACAAACATATGCTCAGGAGAACGGTCTTTTCTTCATGGAAACTTCAGCAAAAACCGCA
GCTAATGTCAAGGAGATATTCTATGAAATTGCAA

QA 5 638 5 638
DS 

RD RR2AZ80TFB 671 0 0
GGTCCTGGAAAGAGATACAGAAAATTGGGTGGTTGTTGCCGACGACGCGTCTTTTTGGGT
TCTCTCTGTCTTTTGATCTTCAATCTCATTTCCTCCATCCACGAGCTCTCTCTCTCTCTC
TTGAGCTCAATCGTGGCTACCACCGCTGCAAACAAGACCATTAACGCCAAATTGGTGTTA
CTTGGAGATGTTGGCGCTGGGAAATCGAGTCTTGTGTTACGCTTTGTTAAAGATCAGTTT
GTCGAGTTCCAGGAATCAACCATCGGTGCAGCTTTTTTCTCACAAACACTAGCTGTCAAC
GATGCGACTGTAAAGTTTGAGATATGGGATACAGCAGGTCAGGAACGGTACCATAGTTTG
GCTCCTATGTACTACAGGGGTGCTGCTGCTGCTATCATTGTCTTTGACGTTACAAACCAA
GCCTCGTTTGAGAGGGCAAAGAAATGGGTTCAGGAACTTCAGGCACAAGGTAACGCTAAT
ATGGTGATGGCCCTTGCTGGAAACAAATCTGATTTATTAGATGCAAGGAAGGTTTCCGCA
GAGGAGGCACAAACATATGCTCAGGAGAACGGTCTTTTCTTCATGGAAACTTCAGCAAAA
ACCGCAGCTAATGTCAAGGAGATATTCTATGAAATTGCAAGAAGTTTACCGAGAGTACAA
CCAACAGAAAA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2F312JQ 839 0 0
TTTTGGG
TCTCTCTGTCTTTTGGTCTTCAATCTCATT*CCTCCATCCACGAGCTCTCTCTCTCTCTC
TTGAGCTCAATCATGGCTACCACCGCTGCAAACAAGACCATTAACGCCAAATTGGTGTTA
CTTGGAGATGTTGGCGCTGGGAAATCGAGTCTTGTGTTACGCTTTGTTAAAGATCAGTTT
GTCGAGTTCCAGGAATCAACCATCGGTGCAGCTTTTTTCTCACAAACACTAGCTGTCAAC
GATGCGACTGTAAAGTTTGAGATATGGGATACAGCAGGTCAGGAACGGTACCATAGTTTG
GCTCCTATGTACTACAGGGGTGCTGCTGCTGCTATCATTGTCTTTGACGTTACAAACCAA
GCCTCGTTTGAGAGGGCAAAGAAATGGGTTCAGGAACTTCAGGCACAAGGTAACGCTAAT
ATGGTGATGGCCCTTGCTGGAAACAAATCTGATTTATTAGATGCAAGGAAGGTTTCCGCA
GAGGAGGCACAAACATATGCTCAGGAGAACGGTCTTTTCTTCATGGAAACTTCAGCAAAA
ACCGCAGCTAATGTCAAGGAGATATTCTATGAAATTGCAAGAAGGTTACCGAGAGTACAA
CCAACAGAAAACCCAACAGGAATGGTTCTGCCAGATAGGGCCATGGATAGGGCAGTGAGT
TCATCTTGTTGTGCTTAGTTATATGTAATGGAATACACTTCCCTTAGAGGGGACCTTCTG
GTCAGTCAACATTGAGTTATGGTATTCTGTGTTTTGCATGTCTTTGCTTTGTTTTGCTTG
TGTGAACATTTATTTTACCAATTAAAAAGGGATGTAAATGAAGATATTTCAT

QA 8 839 8 839
DS 

RD RR2GF03TF 757 0 0
GG
GAGCTCAATCATGGCTACCACCGCTGCAAACAAGACCATTAACGCCAAATTGGTGTTGCT
TGGAGATGTTGGCGCTGGGAAATCGAGCCTTGTGTTACGGTTTGTTAAAGATCAGTTTGT
TGAGTTTCAGGAATCAACCATCGGTGCAGCGTTTTTCTCACAAACACTAGCTGTCAACGA
TGCGACTGTAAAGTTTGAGATATGGGATACAGCAGGTCAGGAACGGTACCATAGTTTGGC
TCCTATGTACTACAGGGGTGCTGCTGCTGCTATCATTGTCTTTGACGTTACAAACCAAGC
CTCGTTTGAGAGGGCAAAGAAATGGGTTCAGGAACTTCAGGCACAAGGTAACGCTAATAT
GGTGATGGCCCTTGCTGGAAACAAATCTGATTTATTAGATGCAAGGAAGGTTTCCGCAGA
GGAGGCACAAACATATGCTCAGGAGAACGGTCTTTTCTTCATGGAAACTTCAGCAAAAAC
CGCAGCTAATGTCAAGGAGATGTTCTATGAAATTGCAAGAAGGTTACCGAGAGTACAACC
AACAGAAAACCCAACAGGAATGGTTCTACCAGATAGGGCCATGGATAGGGCAGTGAGTTC
ATCTTGTTGTGCTTAGTTATATGTAATGGAATACACTTCCCTTAAAGGGGGCCTTCTGGT
CAGTCAACATTGAGTTATGGACTTCTGTGTTTTGCATATCTTTGCTTTGTTTTGCTTGTG
TGGACATTTATTTTAC
AATTAAAAGGGTGTAATGA

QA 3 738 3 738
DS 

RD RR2AZ80JQ 768 0 0
CATCCACGAGCTCTCTCTCTCTCTCTTGAGCTCAATCGTGGCTACCACCGCTGCAAACAA
GACCATTAACGCCAAATTGGTGTTACTTGGAGATGTTGGCGCTGGGAAATCGAGTCTTGT
GTTACGCTTTGTTAAAGATCAGTTTGTCGAGTTCCAGGAATCAACCATCGGTGCAGCTTT
TTTCTCACAAACACTAGCTGTCAACGATGCGACTGTAAAGTTTGAGATATGGGATACAGC
AGGTCAGGAACGGTACCATAGTTTGGCTCCTATGTACTACAGGGGTGCTGCTGCTGCTAT
CATTGTCTTTGACGTTACAAACCAAGCCTCGTTTGAGAGGGCAAAGAAATGGGTTCAGGA
ACTTCAGGCACAAGGTAACGCTAATATGGTGATGGCCCTTGCTGGAAACAAATCTGATTT
ATTAGATGCAAGGAAGGTTTCCGCAGAGGAGGCACAAACATATGCTCAGGAGAACGGTCT
TTTCTTCATGGAAACTTCAGCAAAAACCGCAGCTAATGTCAAGGAGATATTCTATGAAAT
TGCAAGAAGTTTACCGAGAGTACAACCAACAGAAAACCCAACAGGAATGGTTCTGCCAGA
TAGGGCCATGGATAGGGCAGTGAGTTCATCTTGTTGTGCTTAGTTATATGTAATGGAATA
CACTTCCCTTAGAGGGGACCTTCTGGTCAGTCAACATTGAGTTATGGTATTCTGTGTTTT
GCATGTCTTTGCTTTGTTTTGCTTGTGTGAACATTTATTTTACCAATT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 8

CO CL941Contig1 659 8 10 U
GGAGGTATCGCCGACGAGTTAACTGGTAACAAATATCTCACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATCGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAA
AAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGCTGAG
AAACACTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATTATC
TCTGGACCAGTCGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCT
ATCGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGCGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGAA
GCTGCGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGTCTTCATTCTTGGATC
TACGAATGATTCTATCTCGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTTTTTTCTTTGGTTATG
GAACTCAAAACATGTTTCTTCTGCATTTGTTGCTTCCTTCTTTCATGGTAATCTATGAAG
ACCTATCTTGCATCTTTGTCTTGAAGTTTTGAATCTGAGTTTACCATTTCTGTCTTACG


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 0 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BL71JQ C 1
AF RR2E188JQ C 1
AF RR2E188TF U 1
AF RR2CN13JQ C 19
AF RR2CN13TF U 293
AF RR2D677JQ C 1
AF RR2BL71TF U 1
AF RR2D677TF U 1
BS 1 15 RR2E188TF
BS 16 16 RR2BL71TF
BS 17 488 RR2E188TF
BS 489 489 RR2CN13TF
BS 490 526 RR2E188TF
BS 527 529 RR2BL71TF
BS 530 556 RR2E188TF
BS 557 557 RR2CN13TF
BS 558 615 RR2E188TF
BS 616 659 RR2BL71TF

RD RR2BL71JQ 659 0 0
GGAGGTATCGCCGACGAGTTAACTGGTAACAAATATCTCACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATCGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAA
AAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGATCGTCCTTTCGCTGAG
AAACACTACCAAGACTTGGCTGCCAAGCCATTTTTCAACGGCCTTGTTGATTACATTATT
TTTGGACCAGTCGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTTTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCT
ATCGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGCGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGAA
GCTGCGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGTCTTCATTCTTGGATC
TACGAATGATTCTATCTCGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTTTTTTCTTTGGTTATG
GAACTCAAAACATGTTTCTTCTGCATTTGTTGCTTCCTTCTTTCATGGTAATCTATGAAG
ACCTATCTTGCATCTTTGTCTTGAAGTTTTGAATCTGAGTTTACCATTTCTGTCTTACG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2E188JQ 615 0 0
GGAGGTATCGCCGACAAGTTAACTGGTAACAAATATCTCACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATCGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAA
AAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGCTGAG
AAACACTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATTATC
TCTGGACCAGTCGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCT
ATCGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGCGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGAA
GCTGCGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGTCTTCATTCTTGGATC
TACGAATGGTTCTATCTCGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTTT***CTTTGGTTATG
GAACTCAAAACATGTTCCTTCTGCATTTGTTGCTTCCTTCTTTCATGGTAATCTATGAAG
ACCTATCTTGCATCT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2E188TF 615 0 0
GGAGGTATCGCCGACAAGTTAACTGGTAACAAATATCTCACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATCGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAA
AAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGCTGAG
AAACACTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATTATC
TCTGGACCAGTCGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCT
ATCGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGCGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGAA
GCTGCGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGTCTTCATTCTTGGATC
TACGAATGGTTCTATCTCGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTTT***CTTTGGTTATG
GAACTCAAAACATGTTCCTTCTGCATTTGTTGCTTCCTTCTTTCATGGTAATCTATGAAG
ACCTATCTTGCATCT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2CN13JQ 593 0 0
TTAACTGGTAACAAATATCTCACAATGGAGCAAACTTTCATCATGATCAAGCCCGACGGC
GTCCAGAGGGGCCTGATCGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAAAAGAAGGGTTTCACTTTG
AAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGGTGAGAAACACTACCAAGACTTG
TCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATTATTTCTGGACCAGTCGTTGCT
ATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAGATCATTGGAGCGACCAAC
CCCGCTGCTTTTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCTATCGACATTGGCAGGAAC
GTGATCCATGGGAGCGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGGAGCTGCGTTGTGGTTCCCT
GACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGTCTTCATTCTTGGATCTACGAATGATTCTATCTC
GTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTTT***CTTTGGTTATGGAACTCAAAACATGTTTC
TTCTGCATTTGTTGCTTCCTTCTTTCATGGTAATCTATGAAGACCTATCTTGC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2CN13TF 319 0 0
GAAGGAAGATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGG
ATTATGCTATCGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGCGACTCGGTGGAGAGTGCTA
ACAAGGGAGCTGCGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGTCTTCATT
CTTGGATCTACGAATGATTCTATCTCGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTTT***CTT
TGGTTATGGAACTCAAAACATGTTTCTTCTGCATTTGTTGCTTCCTTCTTTCATGGTAAT
CTATGAAGACCTATCTTGC

QA 1 319 1 319
DS 

RD RR2D677JQ 614 0 0
GGAGGTATCGCCGACGAGTTAACTGGTAACAAATATCTCACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATCGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAA
AAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGCTGAG
AAACACTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTTTTCAACGGCCTTGTTGATTACATTATT
TCTGGACCAGTCGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTTTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCT
ATCGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGCGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGAA
GCTGCGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGTCTTCATTCTTGGATC
TACGAATGATTCTATCTCGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTTTTTTCTTTGGTTATG
GAACTCAAAACATGTTTCTTCTGCATTTGTTGCTTCCTTCTTTCATGGTAATCTATGAAG
ACCTATCTTGCATC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2BL71TF 659 0 0
GGAGGTATCGCCGACGAGTTAACTGGTAACAAATATCTCACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATCGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAA
AAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGATCGTCCTTTCGCTGAG
AAACACTACCAAGACTTGGCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATTATC
TCTGGACCAGTCGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCT
ATCGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGCGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGAA
GCTGCGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGTCTTCATTCTTGGATC
TACGAATGATTCTATCTCGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTTTTTTCTTTGGTTATG
GAACTCAAAACATGTTTCTTCTGCATTTGTTGCTTCCTTCTTTCATGGTAATCTATGAAG
ACCTATCTTGCATCTTTGTCTTGAAGTTTTGAATCTGAGTTTACCATTTCTGTCTTACG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2D677TF 614 0 0
GGAGGTATCGCCGACGAGTTAACTGGTAACAAATATCTCACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGCCTGATCGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAA
AAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGCTGAG
AAACACTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGCCTTGTTGATTACATTATC
TCTGGACCAGTCGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACAGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCT
ATCGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGCGACTCGGTGGAGAGTGCTAACAAGGAA
GCTGCGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGTCTTCATTCTTGGATC
TACGAATGATTCTATCTCGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTTTTTTCTTTGGTTATG
GAACTCAAAACATGTTTCTTCTGCATTTGTTGCTTCCTTCTTTCATGGTAATCTATGAAG
ACCTATCTTGCATC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 5

CO CL942Contig1 1125 5 7 U
GGGCTTTGGCTGGTCAGAAGGATGAGGGCCTTTTCTCCGCCAACGCTGCTGCTTTGGCTT
CAAGGAGGTCTTCCCCAAGAGTCACCAACGAGGGTGTTCAGAAGGCCGCTGCTGCTTTGA
AGGGCTCAGACCACCGTCGTGCAACTAATGTTAGCGCTAGGTTAGATGCTCAGCAGAAGA
AGCTTAACCTCCCAATCCTGCCAACCACCACCATTGGATCCTTCCCCCAGACTGTAGAGC
TCAGGAGAGTTCGCAGAGAATACAAGGCTAAGAAGGTTTCCGAGGAGGACTATGTTAAGG
CCATGAAGGAAGAGATCAAGAAAGTTGTTGACCTCCAAGAGGAACTTGACATTGATGTTC
TCGTTCACGGAGAGCCAGAGAGAAACGACATGGTTGAGTACTTTGGGGAGCAGTTGTCTG
GTTTTGCCTTCACCGCAAACGGATGGGTCCAATCTTATGGATCTCGTTGTGTGAAGCCAC
CAGTTATCTACGGTGATGTGAGCCGTCCCAAGGCAATGACCGTCTTCTGGTCCGCAATGG
CTCAGAGCATGACCTCTCGCCCAATGAAGGGTATGCTTACCGGCCCTGTCACCATTCTTA
ACTGGTCCTTCGTCAGAAACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGG
CCATCAAGGACGAAGTTGAGGATCTTGAGAAAGGTGGAATTAATGTCATTCAGATCGATG
AGGCTGCACTCAGAGAAGGATTACCACTCAGGAAATCCGAACATGCTTTCTACTTGGACT
GGGCTGTTCACTCCTTCAGAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACACCACCCAGATCCACA
CTCACATGTGCTACTCTCACTTCAATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGATGCTG
ATGTGATCACCATCGAGAACTCCCGATCTGATGAGAAGCTTCTCTCTGTCTTCCGTGAGG
GAGTGAAGTACGGTGCTGGAATTGGTCCAGGTGTCTACGACATCCACTCTCCGAGAATAC
CATCTTCTGAGGAAATCGCGGACAGAGTGAACAAGATGCTTGCTGTCCTAGAGCAGAACA
TCCTTTGGGTGAACCCTGACTGTGGTCTCAAGACCCGTAAGTACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CN33TF U 1
AF RR2CZ84TF U 393
AF RR2H650TF U 332
AF RR2A824TF U 360
AF RR2GN47TF U 404
BS 1 671 RR2CN33TF
BS 672 1028 RR2H650TF
BS 1029 1033 RR2A824TF
BS 1034 1034 RR2GN47TF
BS 1035 1075 RR2A824TF
BS 1076 1076 RR2GN47TF
BS 1077 1125 RR2A824TF

RD RR2CN33TF 671 0 0
GGGCTTTGGCTGGTCAGAAGGATGAGGGCCTTTTCTCCGCCAACGCTGCTGCTTTGGCTT
CAAGGAGGTCTTCCCCAAGAGTCACCAACGAGGGTGTTCAGAAGGCCGCTGCTGCTTTGA
AGGGCTCAGACCACCGTCGTGCAACTAATGTTAGCGCTAGGTTAGATGCTCAGCAGAAGA
AGCTTAACCTCCCAATCCTGCCAACCACCACCATTGGATCCTTCCCCCAGACTGTAGAGC
TCAGGAGAGTTCGCAGAGAATACAAGGCTAAGAAGGTTTCCGAGGAGGACTATGTTAAGG
CCATGAAGGAAGAGATCAAGAAAGTTGTTGACCTCCAAGAGGAACTTGACATTGATGTTC
TCGTTCACGGAGAGCCAGAGAGAAACGACATGGTTGAGTACTTTGGGGAGCAGTTGTCTG
GTTTTGCCTTCACCGCAAACGGATGGGTCCAATCTTATGGATCTCGTTGTGTGAAGCCAC
CAGTTATCTACGGTGATGTGAGCCGTCCCAAGGCAATGACCGTCTTCTGGTCCGCAATGG
CTCAGAGCATGACCTCTCGCCCAATGAAGGGTATGCTTACCGGCCCTGTCACCATTCTTA
ACTGGTCCTTCGTCAGAAACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGG
CCATCAAGGAC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2CZ84TF 317 0 0
GTTGAGTACTTTGGGGAGCAGTTGTCTGGTTTTGCCTTCACCGCAAACGGATGGGTTCAA
TCTTATGGATCTTGCTGTGTGAAACCACCAGTTATCTACGGTGATGTGAGCCGTCCTAAG
GCAATGACCGTCTTCTGGTCCGCAATGGCTCAGAGCATGACCTCTCGCCCAATGAAGGGT
ATGCTTACCGGCCCTGTCACCATTCTT***TGGTCCTTCGTCAGAAACGACCAGCCCAGG
CACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAAGACGAAGTCGAGGATCTTGAGAAA
GGTGGAATTAATGTCAT

QA 1 317 1 317
DS 

RD RR2H650TF 697 0 0
G
CTCCAAGAGGAACTTGACATTGATGTTCTCGTTCACGGAGAGCCAGAGAGAAACGACATG
GTTGAGTACTTTGGGGAGCAGTTGTCTGGTTTTGCCTTCACCGCAAACGGATGGGTCCAA
TCTTATGGATCTCGTTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTACGGTGATGTGAGCCGTCCCAAG
GCAATGACCGTCTTCTGGTCCGCAATGGCTCAGAGCATGACCTCTCGCCCAATGAAGGGT
ATGCTTACCGGCCCTGTCACCATTCTTAACTGGTCCTTCGTCAGAAACGACCAGCCCAGG
CACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAGGACGAAGTTGAGGATCTTGAGAAA
GGTGGAATTAATGTCATTCAGATCGATGAGGCTGCACTCAGAGAAGGATTACCACTCAGG
AAATCCGAACATGCTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCCTTCAGAATCACCAACTGT
GGCGTCCAAGACACCACCCAGATCCACACTCACATGTGCTACTCTCACTTCAATGACATC
ATACACTCCATCATCGACATGGATGCTGATGTGATCACCATCGAGAACTCCCGATCTGAT
GAGAAGCTTCTCTCTGTCTTCCGTGAGGGAGTGAAGTACGGTGCTGGAATTGGTCCAGGT
GTCTACGACATCCACTCTCCGAGAATACCATCTTCT

QA 2 697 2 697
DS 

RD RR2A824TF 766 0 0
CTCGTTCACGGAGAGCCAGAGAGAAACGACATGGTTGAGTACTTTGGGGAGCAGTTGTCT
GGTTTTGCCTTCACTGCAAACGGATGGGTCCAATCTTATGGATCTCGTTGTGTGAAGCCA
CCAGTTATCTACGGTGATGTGAGCCGTCCCAAGGCAATGACCGTCTTCTGGTCCGCAATG
GCTCAGAGCATGACTTCTCGCCCAATGAAGGGTATGCTTACCGGCCCTGTCACCATTCTT
AACTGGTCCTTCGTCAGAAACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTG
GCCATCAAGGACGAAGTTGAGGATCTTGAGAAAGGTGGAATTAATGTCATTCAGATCGAT
GAGGCTGCACTCAGAGAAGGATTACCACTCAGGAAATCCGAGCACGCTTTCTACTTGGAC
TGGGCTGTTCACTCCTTCAGAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACACCACCCAGATCCAC
ACTCACATGTGCTACTCTCACTTCAATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGATGCT
GATGTGATCACCATCGAGAACTCCCGATCTGATGAGAAGCTTCTCTCTGTGTTCCGTGAG
GGAGTGAAGTACGGTGCTGGAATTGGTCCAGTTGTCTACGACATCCACTCTCCAAGAATA
CCATCTTCTGAGGAGATCGCGGACAGAGTGAACAAGATGCTTGCTGTCCTAGAGCA*AAC
ATCCTTTGGGTGAACCCTGACTGTGGTCTCAAGACCCGTAAGTACA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2GN47TF 687 0 0
G
GGGGAGCAGTTGTCTGGTTTTGCCCTCACCGCAAACGGATGGGTCCAATCTTATGGATCT
CGTTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTACGGTGATGTGAGCCGTCCCAAGGCAATGACCGTC
TTCTGGTCCGCAATGGCTCAGAGCATGACCTCTCGCCCAATGAAGGGTATGCTTACCGGC
CCTGTCACCATTCTTAACTGGTCCTTCGTCAGAAACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGT
TACCAGATCGCTTTGGCCATCAAGGACGAAGTTGAGGATCTTGAGAAAGGTGGAATTAAT
GTCATTCAGATCGATGAGGCTGCACTCAGAGAAGGATTACCACTCAGGAAATCCGAACAT
TCTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCCTTCAGAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGAC
ACCACCCAGATCCACACTCACATGTGCTACTCTCACTTCAATGACATCATACACTCCATC
ATCGACATGGATGCTGATGTGATCACCATCGAGAACTCCCGATCTGATGAGAAGCTTCTC
TCTGTCTTCCGTGAGGGAGTGAAGTACGGTGCTGGAATTGGTCCAGGTGTCTACGACATC
CACTCTCCGAGAATACCATCTTCTGAGGAAATCGCGGACAGAGTGAACAAGATGCTTGCT
GTCCTAGAGCAGAACATCCTTTGGGT

QA 2 687 2 687
DS 



AS 1 4

CO CL943Contig1 1067 4 5 U
TTTTTGGAGAAGAGTGAAGGAGATAGAGCATTCCAGAGGATGAAGTATAGATGAATGCAC
GATAAAACCCTTATTCGTCTCTCTACCTGCAGCGAAAGTTACGGTTGTTTAGTTGGTTAT
GATGATGAGTGGATGCGGCACGTTAACTTCACATGTTCTGACAAGCTCTTGGGGGTTCAA
GCCATCTTCATACAGAGCTACAACAACAGCAGGACAGTCTCAACGTTGTCTTGCTCCAAA
TTCATTGTCTGTCATAAAGAACTCTTTGGGCTCACCTTTACCATTTAATGGGCTTCAACT
TAGTGTACAAAGAGGTGTGCCTTTGTCATATCTCTCAGCCTCGTCTTCTCGCCTTCTCAG
TGGGGAACAAGGTAGTCTGTTTGGTGCGTTACCTGTGTTACCCGTCCGCAGGAAAACCCT
TTTGTCCCCAAGAGCATCAAAAGATGTACCTTCCAGCTTCCGGTTTCCTCCAATGACCAA
AAAGCCACAATGGTGGTGGAGAACTTTAGCATGCCTACCTTACCTGATGCCGCTGCACGA
AACCTGGATGTACGCAGAAACCGCTTACCATCTCCACCCTTTCCTAGAAGATTTCGAGTT
CTTGACCTACCCGTTTCTAAGCGCCTTGGGGAAGTTACCGGGCTGGTTCCTAATGGCTTA
CTTCTTTGTAACTTACCTTGGGGTAGTGAGAAGAAAAGAATGGCCTCACTTCTTCAGGTT
CCATGTGGTGATGGGTATGCTGCTTGAAATCGCTCTTCAGGTGGTGGGAACTGTTAGCAA
GTGGATGCCTCTTGGACTCTATTGGGGTAAGTTTGGGATGCATTTCTGGACTGCTGTTGC
GTTTGCGTATCTGTTTACCGTCCTTGAGAGCATAAGGTGTGCACTCGCGGGCATGTACGC
GGACATCCCATTTGTCTGTGATGCTGCGTATATCCAGATTCCATACGACTAATAAGAAGC
TATTGCATTTGAGATCGTTGTTGCTCTTCATTTCTAAAAACTGTTTGTTAGGCCTTTGTA
TCTGTAAAAACTATGTCTCTGTCTCTTGTTAAGTGACTTTTTTTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GD32TF U 1
AF RR2H547TF U 1
AF RR2H547JQB C 462
AF RR2GD32JQ C 557
BS 1 330 RR2GD32TF
BS 331 696 RR2H547TF
BS 697 697 RR2H547JQB
BS 698 713 RR2H547TF
BS 714 1067 RR2H547JQB

RD RR2GD32TF 337 0 0
TTTTTGGAGAAGAGTGAAGGAGATAGAGCATTCCAGAGGATGAAGTATAGATGAATGCAC
GATAAAACCCTTATTCGTCTCTCTACCTGCAGCGAAAGTTACGGTTGTTTAGTTGGTTAT
GATGATGAGTGGATGCGGCACGTTAACTTCACATGTTCTGACAAGCTCTTGGGGGTTCAA
GCCATCTTCATACAGAGCTACAACAACAGCAGGACAGTCTCAACGTTGTCTTGCTCCAAA
TTCATTGTCTGTCATAAAGAACTCTTTGGGCTCACCTTTACCATTTAATGGGCTTCAACT
TAGTGTACAAAGAGGTGTGCCTTTGTCATA
TCTCTCA

QA 1 330 1 330
DS 

RD RR2H547TF 713 0 0
TTTTTGGAGAAGAGTGAAGGAGATAGAGCATTCCAGAGGATGAAGTATAGATGAATGCAC
GATAAAACCCTTATTCGTCTCTCTACCTGCAGCGAAAGTTACGGTTGTTTAGTTGGTTAT
GATGATGAGTGGATGCGGCACGTTAACTTCACATGTTCTGACAAGCTCTTGGGGGTTCAA
GCCATCTTCATACAGAGCTACAACAACAGCAGGACAGTCTCAACGTTGTCTTGCTCCAAA
TTCATTGTCTGTCATAAAGAACTCTTTGGGCTCACCTTTACCATTTAATGGGCTTCAACT
TAGTGTACAAAGAGGTGTGCCTTTGTCATATCTCTCAGCCTCGTCTTCTCGCCTTCTCAG
TGGGGAACAAGGTAGTCTGTTTGGTGCGTTACCTGTGTTACCCGTCCGCAGGAAAACCCT
TTTGTCCCCAAGAGCATCAAAAGATGTACCTTCCAGCTTCCGGTTTCCTCCAATGACCAA
AAAGCCACAATGGTGGTGGAGAACTTTAGCATGCCTACCTTACCTGATGCCGCTGCACGA
AACCTGGATGTACGCAGAAACCGCTTACCATCTCCACCCTTTCCTAGAAGATTTCGAGTT
CTTGACCTACCCGTTTCTAAGCGCCTTGGGGAAGTTACCGGGCTGGTTCCTAATGGCTTA
CTTCTTTGTAACTTACCTTGGGGTAGTGAGAAGAAA*GAATGGCCTCACTTCT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2H547JQB 606 0 0
GGTTTCCTCCAATGACCAAAAAGCCACAATGGTGGTGGAGAACTTTAGCATGCCTACCTT
ACCTGATGCCGCTGCACGAAACCTGGATGTACGCAGAAACCGCTTACCATCTCCACCCTT
TCCTAGAAGATTTCGAGTTCTTGACCTACCCGTTTCTAAGCGCCTTGGGGAAGTTACCGG
GCTGGTTCCTAATGGCTTACTTCTTTGTAACTTACCTTGGGGTAGTGAGAAGAAAAGAAT
GGCCTCACTTCTTCAGGTTCCATGTGGTGATGGGTATGCTGCTTGAAATCGCTCTTCAGG
TGGTGGGAACTGTTAGCAAGTGGATGCCTCTTGGACTCTATTGGGGTAAGTTTGGGATGC
ATTTCTGGACTGCTGTTGCGTTTGCGTATCTGTTTACCGTCCTTGAGAGCATAAGGTGTG
CACTCGCGGGCATGTACGCGGACATCCCATTTGTCTGTGATGCTGCGTATATCCAGATTC
CATACGACTAATAAGAAGCTATTGCATTTGAGATCGTTGTTGCTCTTCATTTCTAAAAAC
TGTTTGTTAGGCCTTTGTATCTGTAAAAACTATGTCTCTGTCTCTTGTTAAGTGACTTTT
TTTTTT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2GD32JQ 511 0 0
GAAACCGCTTACCATCTCCACCCTTTCCTAGAAGATTTCGAGTTCTTGACCTACCCGTTT
CTAAGCGCCTTGGGGAAGTTACCGGGCTGGTTCCTAATGGCTTACTTCTTTGTAACTTAC
CTTGGGGTAGTGAGAAGAAAAGAATGGCCTCACTTCTTCAGGTTCCATGTGGTGATGGGT
ATGCTGCTTGAAATCGCTCTTCAGGTGGTGGGAACTGTTAGCAAGTGGATGCCTCTTGGA
CTCTATTGGGGTAAGTTTGGGATGCATTTCTGGACTGCTGTTGCGTTTGCGTATCTGTTT
ACCGTCCTTGAGAGCATAAGGTGTGCACTCGCGGGCATGTACGCGGACATCCCATTTGTC
TGTGATGCTGCGTATATCCAGATTCCATACGACTAATAAGAAGCTATTGCATTTGAGATC
GTTGTTGCTCTTCATTTCTAAAAACTGTTTGTTAGGCCTTTGTATCTGTAAAAACTATGT
CTCTGTCTCTTGTTAAGTGACTTTTTTTTTT

QA 1 511 1 511
DS 



AS 1 4

CO CL944Contig1 1442 4 18 U
GGATCCACCAACTCCTTCTTATCTCCAGCCACTACATCTGCTTCGATCATCACTCAATTG
TTTTTCTATCAACTATGGCAACGAAGAGAAGTGTAGGAACATTGAAGGAAGCGGATCTGA
AGGGAAAGAGCGTGTTCGTGAGGGTGGATCTCAATGTTCCTTTGGACGATAACTCTAACA
TCACTGATGACACCAGGATTCGTGCAGCCGTTCCCACCATCAAGTACTTGATGGGTAACG
GACCTAGAGTTGTTCTCTGCAGTCACTTGGGTCGCCCAAAAGGTGTTACCCCTAAATTCA
GCTTAAAGCCTCTAGTGCCGAGGTTGTCTGAGCTTCTTGGTGTTGAGGTTGTGATGGCAA
ACGACTCTATTGGTGAGGAAGTCCAGAAACTAGTTGCAGGACTACCTGAAGGTGGTGTTC
TTCTCTTGGAGAATGTGAGGTTCTACAAGGAAGAAGAGAAGAACGACCCTGATTTTGCAA
AGAAGCTTGCTGCTCTTGCTGATGTCTACGTCAACGATGCTTTCGGAACTGCTCATAGAG
CTCATGCTTCCACCGAGGGAGTTGCCAAATACTTGAAGCCTTCGGTCGCTGGTTTCCTCA
TGCAGAAGGAACTTGATTACCTTGTCGGAGCTGTGGCAAATCCCAAGAAGCCTTTTGCTG
CCATCGTTGGAGGTTCGAAAGTCTCCACGAAGATTGGTGTCATCGAGTCACTCTTGAACA
CCGTTGACATCCTCCTGCTCGGTGGTGGTATGATTTATACTTTCTACAAGGCGCAAGGTC
ACGCGGTTGGATCTTCTCTTTTGGAAGAGGACAAGCTTGACTTGGCCAGGTCGCTCATGG
AGAAGGCTAAATCCAAAGGTGTCTCTCTTTTGCTCCCAACCGATGTGGTTATTGCTGACA
AGTTCGCTCCTGATGCTAACAGCAAGACAGTGGCAGACACGGCAATCCCAGATGGCTGGA
TGGGACTAGATATTGGTCCAGACTCAATCAAGACATTCAGCGAAGCTCTGGACACAACCA
AGACCATCATCTGGAATGGTCCCATGGGTGTTTTTGAATTTGAAAAGTTTGCAGCTGGAA
CTGAGGCCGTAGCAAAGCAGCTTGCGGAGCTGAGCGGAAAGGGAGTGACCACAATCATAG
GAGGAGGTGACTCGGTGGCTGCAGTTGAGAAGGTTGGTTTGGCTGACAAGATGAGTCACA
TCTCTACGGGAGGAGGTGCAAGTTTGGAGCTTCTAGAGGGAAAGCCACTTCCAGGAGTCC
TCGCCCTCGACGACGCTTGAGAATCTTTCAAGCCTCCTCTATCTTGCGTTTATTATACAT
ATGTAACAAGTCATCTGGTTTTCTTATGACCATTGTTATTGTCAGCTTGAGAGTTCTGAC
TGCGTACTGAGTGTTTCTTTAGTTTGGAACCTTTTTAATAATGAAGAGAAACTCTGATTA
GT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2D536TF U 1
AF RR2BC77TF U 5
AF RR2BC77JQ C 611
AF RR2D536JQ C 866
BS 1 116 RR2D536TF
BS 117 117 RR2BC77TF
BS 118 205 RR2D536TF
BS 206 206 RR2BC77TF
BS 207 208 RR2D536TF
BS 209 209 RR2BC77TF
BS 210 313 RR2D536TF
BS 314 314 RR2BC77TF
BS 315 381 RR2D536TF
BS 382 770 RR2BC77TF
BS 771 771 RR2BC77JQ
BS 772 804 RR2BC77TF
BS 805 1099 RR2BC77JQ
BS 1100 1100 RR2D536JQ
BS 1101 1292 RR2BC77JQ
BS 1293 1293 RR2D536JQ
BS 1294 1427 RR2BC77JQ
BS 1428 1442 RR2D536JQ

RD RR2D536TF 381 0 0
GGATCCACCAACTCCTTCTTATCTCCAGCCACTACATCTGCTTCGATCATCACTCAATTG
TTTTTCTATCAACTATGGCAACGAAGAGAAGTGTAGGAACATTGAAGGAAGCGGATTTGA
AGGGAAAGAGCGTGTTCGTGAGGGTGGATCTCAATGTTCCTTTGGACGATAACTCTAACA
TCACTGATGACACCAGGATTCGTGCCGCTGTTCCCACCATCAAGTACTTGATGGGTAACG
GACCTAGAGTTGTTCTCTGCAGTCACTTGGGTCGCCCAAAAGGTGTTACCCCTAAATTCA
GCTTAAAGCCTCTTGTGCCGAGGTTGTCTGAGCTTCTTGGTGTTGAGGTTGTGATGGCAA
ACGACTCTATTGGTGAGGAAG

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR2BC77TF 801 0 0
GG
ACCAACTCCTTCTTATCTCCAGCCACTACATCTGCTTCGATCATCACTCAATTGTTTTTC
TATCAACTATGGCAACGAAGAGAAGTGTAGGAACATTGAAGGAAGCGGATCTTAAGGGAA
AGAGCGTGTTCGTGAGGGTTGATCTCAATGTTCCTTTGGACGATAACTCTAACATCACTG
ATGACACCAGGATTCGTGCAGCCGTTCCCACCATCAAGTACTTGATGGGTAACGGATCTA
GAGTTGTTCTCTGCAGTCACTTGGGTCGCCCAAAAGGTGTTACCCCTAAATTCAGCTTAA
AGCCTCTAGTGCCGAGGTTGTCTGAGCTTCTTGGTGTTGAGGTTGTGATGGCAAACGACT
CTATTGGTGAGGAAGTCCAGAAACTAGTTGCAGGACTACCTGAAGGTGGTGTTCTTCTCT
TGGAGAATGTGAGGTTCTACAAGGAAGAAGAGAAGAACGACCCTGATTTTGCAAAGAAGC
TTGCTGCTCTTGCTGATGTCTACGTCAACGATGCTTTCGGAACTGCTCATAGAGCTCATG
CTTCCACCGAGGGAGTTGCCAAATACTTGAAGCCTTCGGTCGCTGGTTTCCTCATGCAGA
AGGAACTTGATTACCTTGTCGGAGCTGTGGCAAATCCCAAGAAGCCTTTTGCTGCCATCG
TTGGAGGTTCGAAAGTCTCCACGAAGATTGGTGTCATCGAGTCACTCTTGAACACCGTTG
ACATCCTCCTGCTCGGTGGTGGTATGATTTATACTTTCTACAAG*CGCAAGGTCACGCGG
TTGGATCTTCTCTTTTGG
G

QA 3 800 3 800
DS 

RD RR2BC77JQ 819 0 0
ACTTGATTACCTTGTCGGAGCTGTGGCAAATCCCAAGAAGCCTTTTGCTGCCATCGTTGG
AGGTTCGAAGGTCTCCACGAAGATTGGTGTCATCGAGTCACTCTTGAACACCGTTGACAT
CCTCCTGCTCGGTGGTGGTATGATTTATACTTTCTACAAGGCGCAAGGTCACGCGGTTGG
ATCTTCTCTTTTGGAAGAGGACAAGCTTGACTTGGCCAGGTCGCTCATGGAGAAGGCTAA
ATCCAAAGGTGTCTCTCTTTTGCTCCCAACCGATGTGGTTATTGCTGACAAGTTCGCTCC
TGATGCTAACAGCAAGACAGTGGCAGACACGGCAATCCCAGATGGCTGGATGGGACTAGA
TATTGGTCCAGACTCAATCAAGACATTCAGCGAAGCTCTGGACACAACCAAGACCATCAT
CTGGAATGGTCCCATGGGTGTTTTTGAATTTGAAAAGTTTGCAGCTGGAACTGAGGCCGT
AGCAAAGCATCTTGCGGAGCTGAGCGGAAAGGGAGTGACCACAATCATAGGAGGAGGTGA
CTCGGTGGCTGCAGTTGAGAAGGTTGGTTTGGCTGACAAGATGAGTCACATCTCTACGGG
AGGAGGTGCAAGTTTGGAGCTTCTAGAGGGAAAGCCACTTCCAGGAGTCCTCGCCCTCGA
CGACGCTTGAGAATCTTTCAAGTCTCCTCTATCTTGCGTTTATTATACATATGTAACAAG
TCATCTGGTTTTCTTATGACCATTGTTATTGTCAGCTTGAGAGTTCTGACTGCGTACTGA
GTGTTTCTTTAGTTTGGAACCTTTTTAATAATGAAGA
TG

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2D536JQ 577 0 0
TCTTTTGCTCCCAACCGATGTGGTTATTGCTGACAAGTTCGCTCCTGATGCTAACAGCAA
GATAGTGGCAGCCACGGCAATCCCAGATGGTTGGATGGGACTAGATATTGGTCCAGACTC
AATCAAGACATTCAGCGAAGCTCTGGACACAACCAAGACCATCATCTGGAATGGTCCCAT
GGGTGTTTTTGAATTTGAAAAGTTTGCAGCTGGAACTGAGGCCGTAGCAAAGCAGCTTGC
GGGGCTGAGCGGAAAGGGAGTGACCACAATCATAGGAGGAGGTGACTCGGTGGCTGCAGT
TGAGAAGGTTGGTTTGGCTGACAAGATGAGTCACATCTCTACGGGAGGAGGTGCAAGTTT
GGAGCTTCTAGAGGGAAAGCCACTTCCAGGAGTCCTCGCCCTCGACGACGCTTGAGAATC
TTTCAAGCCTCCTCTATCTTGCGTTTATTATACGT**GTAACAAGTCATCTGGTTTTCTT
ATGGCCATTGTTATTGTCAGCTTGAGAGTTCTGACTGCGTACTGAGTGTTTCTTTAGTTT
GGAACCTTTTTAATAATGAAGAGAAACTCTGATTAGT

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 6

CO CL945Contig1 1400 6 48 U
GCACTTTGAAACCAAATTTCTTCTTAGAACTTTCATTATGAAACATAACGTACTGAGAAT
ACCTAAACAAGAACACATGCATATTCTTTATCTAATAAAATAAGCTATATAGGCACACCA
TAGTACAGAAAGAAACATAGGTTACGCTATTTTAACATTTTAACACAAAAGAAAAGTCTA
ATTTAATACATACAAAGTGCATAATTTATTGGATCAAAAATATGGGAAGTTAAGCCCTGT
AGACAAGCCCTAATAATAATATTACTCTCCTCTCCATCCTCCGTTCTCCAGACACACACA
CATAAAAATCTACAGGAAGTCAGAGAATGTGTCGTTCATGAGAAAATTGGCCATGATGCG
ATGAGTCTTCTGTGTTGGATGAAATGAGTCCCAAAACACATACTTGTCTGCGTTTGAACA
TGTGAATGGGTTATTCCTTTGGCAACTATATCCCATCTCGAACATCCCCGTCGCACAGCA
AGCCGCTGCGGCCACCTCGAACCCAAAAGAGGAAGGGTTCTTGATGATTCGCATAAATGG
TTCATAGGGATTTGAAAAAACAAGGATGGAACCAGAAAGCTCTTTGCTCAGCTTCTCAAC
AAGCCTCTCAAGCTTGCCGTTGAACTGGACCGCAATGTCGTTAAAGCGTCCAACGCACTC
ACCTCCCGTGCCAATGTTGGTGGCTCTCTCTAAAGGCATACATCCCATTGGAGGCAATCC
ACCTAGTGAAATCTTCCTAGCTCCAAGTCCGTGTAGCTTCTTCACAAAGTCTTTGGCGAT
TCCAGCTAGAAAATCTTGG*TAAAGATCGACCGAGTATTGAGAAGAACGTCCGGGAAAGG
CAAAGTAGTTCTCCAGGAAGTCGTTGGTCCCTACGCTTATGAGGTACAGAGAGTTGGCTA
TGGTTTCTGTGGCTTGGTCCTTTCCTTGGTATGCTTCCAGTTTTGTTTGGTATTCTTTGT
AGTATTCAAGTTGTTTCCACAGTGGTAGAACCGACAGTACATCAGAAGTGGCGTTGCCGC
AGCCGGTGGCAGCAGAAGCAAAAGTAACACCTGTTGCAAAATCTGAAATGTTGTACGAAG
GATCCAAGTATGCCGGAATTATTGGTTTGAGCCCTATGGCTTCCGACATAAAGTCAGTCG
CAATCTTTCCGTTACAAAACCTCCCAGTCGGTTTCCCACCAACAAAGTCCCGTCCATATG
GCTCAAAGTTGCTTCTTACCACTGTTGGGATGTAGTTGTTGTTACCCGCATCAACGGTTG
AGTCGCCAAACACGACGATGGCGGGTATTTTACCGGCAAAAGTTACTGCTAGAGAAGCAG
TTATTATGAAGAAGAGAAGTGTGAAAAGACTTTTGATGTTTCCCATAGTGAAATTTGTGT
CTTGTGATTTTGATTGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 5 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 0 25 0 0 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2EJ20JQ U 120
AF RR2D783JQ U 1
AF RR2GM90JQ U 90
AF RR2FU59JQ U 126
AF RR2FU59TF C 649
AF RR2EJ20TF C 726
BS 1 131 RR2D783JQ
BS 132 132 RR2GM90JQ
BS 133 134 RR2D783JQ
BS 135 135 RR2GM90JQ
BS 136 144 RR2D783JQ
BS 145 145 RR2GM90JQ
BS 146 158 RR2D783JQ
BS 159 159 RR2GM90JQ
BS 160 171 RR2D783JQ
BS 172 172 RR2GM90JQ
BS 173 306 RR2D783JQ
BS 307 310 RR2EJ20JQ
BS 311 318 RR2D783JQ
BS 319 319 RR2GM90JQ
BS 320 356 RR2D783JQ
BS 357 357 RR2GM90JQ
BS 358 361 RR2D783JQ
BS 362 362 RR2GM90JQ
BS 363 566 RR2D783JQ
BS 567 567 RR2GM90JQ
BS 568 581 RR2D783JQ
BS 582 582 RR2GM90JQ
BS 583 613 RR2D783JQ
BS 614 614 RR2GM90JQ
BS 615 658 RR2D783JQ
BS 659 659 RR2GM90JQ
BS 660 660 RR2D783JQ
BS 661 661 RR2GM90JQ
BS 662 699 RR2D783JQ
BS 700 700 RR2GM90JQ
BS 701 741 RR2D783JQ
BS 742 742 RR2GM90JQ
BS 743 798 RR2D783JQ
BS 799 799 RR2GM90JQ
BS 800 800 RR2FU59JQ
BS 801 814 RR2GM90JQ
BS 815 891 RR2FU59TF
BS 892 893 RR2EJ20TF
BS 894 919 RR2FU59TF
BS 920 920 RR2EJ20TF
BS 921 1016 RR2FU59TF
BS 1017 1017 RR2EJ20TF
BS 1018 1135 RR2FU59TF
BS 1136 1136 RR2EJ20TF
BS 1137 1217 RR2FU59TF
BS 1218 1218 RR2EJ20TF
BS 1219 1397 RR2FU59TF
BS 1398 1400 RR2EJ20TF

RD RR2EJ20JQ 618 0 0
ATAGTACA
GAAAGAAACATAGGTTACGCTATTTTAACATTTTAACACAAAAGAAAAGTCTAATTTAAT
ACATACAAAGCGCATAATTTATTGGATCAAAAATATGGGAAGTTAAGCCCTGTAGACAAG
CCCTAATAATAATATTACTCTCCTCTCCATCCTCCGTTCTCCAGACACACACACATATAA
ATCTACAGGAAGTCAGAGAATGTGTCGTTCATGAGAAAATTGGCCATGATGCGATGAGTC
TTCTGTGTTGGATGAAATGAGTCCCAAAACACATACTTGTCTGCGTTTGAACATGTGAAT
GGGTTATTCCTTTGGCAACTATATCCCATCTCGAACATCCCCGTCGCACAGCAAGCCGCT
GCGGCCACCTCGAACCCAAAAGAGGAAGGGTTCTTGATGATTCGCATAAATGGTTCATAG
GGATTTGAAAAAACAAGGATGGAACCAGAAAGCTCTTTGCTCAGCTTCTCAACAAGCCTC
TCAAGCTTGCCGTTGAACTGGACCGCAATGTCGTTAAAGCGTCCAACGCACTCACCTCCC
GTGCCAATGTTGGTGGCTCTCTCTAAAGGCATACATCCCATTGGAGGCAATCCACCTAGT
GAAATCTTCC

QA 9 618 9 618
DS 

RD RR2D783JQ 798 0 0
GCACTTTGAAACCAAATTTCTTCTTAGAACTTTCATTATGAAACATAACGTACTGAGAAT
ACCTAAACAAGAACACATGCATATTCTTTATCTAATAAAATAAGCTATATAGGCACACCA
TAGTACAGAAATAAGCATAGGTTATGCTATTTTAACATCTTAACACAAAAGCAAAGTCTA
ATTTAATACATACAAAGTGCATAATTTATTGGATCAAAAATATGGGAAGTTAAGCCCTGT
AGACAAGCCCTAATAATAATATTACTCTCCTCTCCATCCTCCGTTCTCCAGACACACACA
CATAAATCATTACAGGAACTCAGAGAATGTGTCGTTCATGAGAAAATTGGCCATGAGGCG
ACGAGTCTTCTGTGTTGGATGAAATGAGTCCCAAAACACATACTTGTCTGCGTTTGAACA
TGTGAATGGGTTATTCCTTTGGCAACTATATCCCATCTCGAACATCCCCGTCGCACAGCA
AGCCGCTGCGGCCACCTCGAACCCAAAAGAGGAAGGGTTCTTGATGATTCGCATAAATGG
TTCATAGGGATTTGAAAAAACAAGGACGGAACCAGAAAGCTATTTGCTCAGCTTCTCAAC
AAGCCTCTCAAGCCTGCCGTTGAACTGGACCGCAATGTCGTTAAAGCGTCCAACGCACCC
CCCTCCCGTGCCAATGTTGGTGGCTCTCTCTAAAGGCATGCATCCCATTGGAGGCAATCC
ACCTAGTGAAATCTTCCTAGCGCCAAGTCCGTGTAGCTTCTTCACAAAGTCTTTGGCGAT
TCCAGCTAGAAAATCTTG

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2GM90JQ 725 0 0
G
TCTAATAAAATAAGCTATATAGGCACACGATAGTACAGAAAGAAACATAGGTTACGCTAT
TTTAACATTTTAACACGAAAGAAAAGTCTAATTTAATACATACAAAGTGCATAATTTATT
GGATCAAAAATATGGGAAGTTAAGCCCTGTAGACAAGCCCTAATAATAATATTACTCTCC
TCTCCATCCTCCGTTCTCCAGACACACACATATAAATC**TACAGGAAGTCAGAGAATGT
GTCGTTCATGAGAAAATTGGCCATGATGCGATGAGTCTTCTGTGTTGGATGAAATGAGTC
CCAAAACACATACTTGTCTGCGTTTGAACATGTGAATGGGTTATTCCTTTGGCAACTATA
TCCCATCTCGAACATCCCCGTCGCACAGCAAGCCGCTGCGGCCACCTCGAACCCAAAAGA
GGAAGGGTTCTTGATGATTCGCATAAATGGTTCATAGGGATTTGAAAAAACAAGGATGGA
ACCAGAAAGCTCTTTGCTCAGCTTCTCAACAAGCCTCTCAAGCTTGCCGTTGAACTGGAC
CGCAATGTCGTTAAAGCGTCCAACGCACTCACCTCCCGTGCCAATGTTGGTGGCTCTCTC
TAAAGGCATACATCCCACTGGAGGCAATCCACCTAGTGAAATCTTCCTAGCTCCAAGTCC
GTGTAGCTTCTTCACAAAGTCTTTGGCGATTCCAGCTAGAAAATCTTGGGTAAAGATCGA
CCGA

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR2FU59JQ 681 0 0
CGGAAAGAAA
CATAGGTTACGCTATTTTAACATTTTAACACAAAAGAAAAGTCTAATTTAATACATACAA
AGTGCGTAATTTATTGGATCAAAAATATGGGAAGTTAAGCCCTGTAGACAAGCCCTAATA
ATAATATTACTCTCCTCTCCATCCTCCGTTCTCCAGACACACACACATATAAATCTACAG
GAAGTCAGAGAATGTGTCGTTCATGAGAAAATTGGCCATGATGCGATGAGTCTTCTGTGT
TGGATGAAATGAGTCCCAAAACACATACTTGTCTGCGTTTGAACATGTGAATGGGTTATT
CCTTTGGCAACTATATCCCATCTCGAACATCCCCGTCGCACAGCAAGCCGCTGCGGCCAC
CTCGAACCCAAAAGAGGAAGGGTTCTTGATGATTCGCATAAATGGTTCATAGGGATTTGA
AAAAACAAGGATGGAACCAGAAAGCTCTTTGCTCAGCTTCTCAACAAGCCTCTCAAGCTT
GCCGTTGAACTGGACCGCAATGTCGTTAAAGCGTCCAACGCACTCACCTCCCGTGCCAAT
GTTGGTGGCTCTCTCTAAAGGCATACATCCCATTGGAGGCAATCCACCTAGTGAAATCTT
CCTAGCTCCAAGTCCGTGTAGCTTCTTCACAAAGTCTTTGGCGATTCCAGCTAGAAAATC
TTGG*TAAAGA

QA 11 681 11 681
DS 

RD RR2FU59TF 751 0 0
TCCAACGCACTCACCTCCCGTGCCAATGTTGGTGGCTCTCTCTAAAGGCATACATCCCAT
TGGAGGCAATCCACCTAGTGAAATCTTCCTAGCTCCAAGTCCGTGTAGCTTCTTCACAAA
GTCTTTGGCGATTCCAGCTAGAAAATCTTGG*TAAAGATCGACCGAGTATTGAGAAGAAC
GTCCGGGAAAGGCAAAGTAGTTCTCCAGGAAGTCGTTGGTCCCTACGCTTATGAGGTACA
GAG**TTGGCTATGGTTTCTGTGGCTTGGTCTTTTCCTTGGTATGCTTCCAGTTTTGTTT
GGTATTCTTTGTAGTATTCAAGTTGTTTCCACAGTGGTAGAACCGACAGTACATCAGAAG
TGGCGTTGTCGCAGCCGGTGGCAGCAGAAGCAAAAGTAACACCTGTTGCAAAATCTGAAA
TGTTGTACGAAGGATCCAAGTATGCCGGAATTATTGGTTTGAGCCCTATGGCTTCCGACA
TAAAGTCGGTCGCAATCTTTCCGTTACAAAACCTCCCAGTCGGTTTCCCACCAACAAAGT
CCCGTCCATATGGCTCAAAGTTGCTTCTTGCCACTGTTGGGATGTAGTTGTTGTTACCCG
CATCAACGGTTGAGTCGCCAAACACGACGATGGCGGGTATTTTACCGGCAAAAGTTACTG
CTAGAGAAGCAGTTATTATGAAGAAGAGAAGTGTGAAAAGACTTTTGATGTTTCCCATAG
TGAAATTTGTGTCTTGTGATTTTGATTGT
CC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2EJ20TF 675 0 0
AGTG
AATCTTCCTAGCTCCAAGTCCGTGTAGCTTCTTCACAAAGTCTTTGGCGATTCCAGCTAG
AAAATCTTGG*TAAAGATCGACCGAGTATTGAGAAGAACGTCCGGGAAAGGCAAAGTAGT
TCTCCAGGAAGTCGTTGGTCCCTACGCTTATGAGGTACAGAGAGTTGGCTATGGTTTCTG
TGGCTTGGTCCTTTCCTTGGTATGCTTCCAGTTTTGTTTGGTATTCTTTGTAGTATTCAA
GTTGTTTCCACAGTGGTAGAACCGACAGTACATCAGAAGTGGCGTTGCCGTAGCCGGTGG
CAGCAGAAGCAAAAGTAACACCTGTTGCAAAATCTGAAATGTTGTACGAAGGATCCAAGT
ATGCCGGAATTATTGGTTTGAGCCCTATGGCTTCCGACATAAAGTCAGTCGCAATCTTTC
CGTTACAAAACCTCCCAGTCGGTTTCCCACCAACAAAGTCCCGTCCATATGGCTCAAAGT
TGCTTCTTACCACTGTTGGGATGTAGTTGTTGTTACCCGCATCAACGGTTGAGTCGCCAA
ACACGACGATGGCGGGTATTTTACCGGCAAAAGTTACTGCTAGAGAAGCAGTTATTATGA
AGAAGAGAAGTGTGAAAAGACTTTTGATGTTTCCCATAGTGAAATTTGTGTCTTGTGATT
TTGATTGTGCC

QA 5 675 5 675
DS 



AS 2 5

CO CL946Contig1 960 3 4 U
CAAATTATAACACCAACTCATAGAGGGAAAAAAGTATACATAATAGTTATATCCGAATAT
TAACAAGACGCATGGATCTTGGTATAGGCTTTCATTTCATCTTTACACAACATATGTTGA
ATCCCTCTCCCTAGGCTAATAATAACCCCTTAAGAGGTGCTACTCGTTGCCGGAACAGAA
GACGGCTCCTCTGGCTGAGCCTCACTGGCTGTAGTTTCGGGAAGTGAAGTTTCTTCCTGA
GCCACCACCGGTGGAGCTTCAGTAAGGGCAGGTGAAGACGCTTGAACAACTTGTGAAGGC
TTGA*CTTGTTAATGTAGTAGCTAAAAGAGGGTCCACTGTAATCCACTGGTTTAGGTCGA
GCCGGGGCATCTTTTCCGACTTGGAGGAGTATAGCGGACGCAGCAGCGATTGCGATAAGG
GCAAGGCCTCCAACGATTGCTGCTGTGTTCTCAGCCCCATCAGACGAAGATCCTGCAGTA
CCTGAGCTTATGGCACTCTCTGCAACATATACTGCAGGCTCAATAAAGTAAACATTAGTC
TGACCGGCAGTATCTTTCTCAACATAACCAGTTCAACCACGCTTCCGAGGTGGAAACGTT
CCCACCACTTTCGTCTTCTCTCCAGCCAACCATTCCATACTCACTGTCCCAACCTCTTTG
TCGGGAGCACATTCCTCGTCATTACAATCAGGATCATCGGGAGAAGCTCTAACGACGGAT
ACGAAAAGCTTCCGTCCAACCGACCTGGCGCTGAGGAATCTGCCAAGAGGCTTAGGAGAT
GCCAAAACGCAGCCGGTTGGGGATAGCAATACATTGGAAGCGCAAGACATCATGGTTGGA
CAAGATTCGAGGAGATTTCAGGTTTGATAAAAATAAAGAAAATTTGATAAAGAAGATAAT
ATGTGAGGATGAAAAGAGTAAAGAGACGAAGATGACGATGTGTTTTTGTGGTGGTGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL87JQ U 22
AF RR2AI55JQ U 1
AF RR2AI55TF C 196
BS 1 67 RR2AI55JQ
BS 68 68 RR2GL87JQ
BS 69 717 RR2AI55JQ
BS 718 960 RR2AI55TF

RD RR2GL87JQ 303 0 0
G
GAGGGAAAAAAGTATACATAATAGTTATATCCGAATATTAACAAGACGCATGGATCTTGG
TATAGGCTTTCATTTCATCTTTACACAACATATGTTGAATCCCTCTCCCTAGGCTAATAA
TAACCCCTTAAGAGGTGCTACTCGTTGCCGGAACAGAAGACGGCTCCTCTGGCTGAGCCT
CACTGGCTGTAGTTTCGGGAAGTGAAGTTTCTTCCTGAGCCACCACCGGTGGAGCTTCAG
TAAGGGCAGGTGAAGACGCTTGAACAACTTGTGAAGGCTTGAACTTGTTAATGTAGTAGC
TA

QA 2 303 2 303
DS 

RD RR2AI55JQ 717 0 0
CAAATTATAACACCAACTCATAGAGGGAAAAAAGTATACATAATAGTTATATCCGAATAT
TAACAAGGCGCATGGATCTTGGTATAGGCTTTCATTTCATCTTTACACAACATATGTTGA
ATCCCTCTCCCTAGGCTAATAATAACCCCTTAAGAGGTGCTACTCGTTGCCGGAACAGAA
GACGGCTCCTCTGGCTGAGCCTCACTGGCTGTAGTTTCGGGAAGTGAAGTTTCTTCCTGA
GCCACCACCGGTGGAGCTTCAGTAAGGGCAGGTGAAGACGCTTGAACAACTTGTGAAGGC
TTGA*CTTGTTAATGTAGTAGCTAAAAGAGGGTCCACTGTAATCCACTGGTTTAGGTCGA
GCCGGGGCATCTTTTCCGACTTGGAGGAGTATAGCGGACGCAGCAGCGATTGCGATAAGG
GCAAGGCCTCCAACGATTGCTGCTGTGTTCTCAGCCCCATCAGACGAAGATCCTGCAGTA
CCTGAGCTTATGGCACTCTCTGCAACATATACTGCAGGCTCAATAAAGTAAACATTAGTC
TGACCGGCAGTATCTTTCTCAACATAACCAGTTCAACCACGCTTCCGAGGTGGAAACGTT
CCCACCACTTTCGTCTTCTCTCCAGCCAACCATTCCATACTCACTGTCCCAACCTCTTTG
TCGGGAGCACATTCCTCGTCATTACAATCAGGATCATCGGGAGAAGCTCTAACGACG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2AI55TF 765 0 0
CTGAG
CTCACTGGCTGTAGTTTCGGGAAGTGAAGTTTCTTCGTGAGCCACCACCGGTGGAGCTTC
AGTAAGGGCAGGTGAAGACGCTTGAACAACTTGTGAAGGCTTGA*CTTGTTAATGTAGTA
GCTAAGAGAGGGTCCACTGTAATCCACTGGTTTAGGTCGAGCCGGGGCATCTTTTCCGAC
TTGGAGGAGTATAGCGGACGCAGCAGCGATTGCGATAAGGGCAAGGCCTCCAACGATTGC
TGCTGTGTTCTCAGCCCCATCAGACGAAGATCCTGCAGTACCTGAGCTTATGGCACTCTC
TGCAACATATACTGCAGGCTCAATAGAGTAAACATTAGTCTGACCGGCAGTATCTTTCTC
AACATAACCAGTTCAACCACGCTTCCGAGGTGGAAACGTTCCCACCACTTTCGTCTTCTC
TCCAGCCAACCATTCCATACTCACTGTCCCAACCTCTTTGTCGGGAGCACATTCCTCGTC
ATTACAATCAGGATCATCGGGAGAAGCTCTAACGACGGATACGAAAAGCTTCCGTCCAAC
CGACCTGGCGCTGAGGAATCTGCCAAGAGGCTTAGGAGATGCCAAAACGCAGCCGGTTGG
GGATAGCAATACATTGGAAGCGCAAGACATCATGGTTGGACAAGATTCGAGGAGATTTCA
GGTTTGATAAAAATAAAGAAAATTTGATAAAGAAGATAATATGTGAGGATGAAAAGAGTA
AAGAGACGAAGATGACGATGTGTTTTTGTGGTGGTGTCCC

QA 6 765 6 765
DS 



CO CL946Contig2 748 2 4 U
GCGAGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTATGGAATGGTTGGCTGGAG
AGAAGACGAAAGTGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGACTGGCTATGTTG
AGAAAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAGTGTATGTTGCAG
AGAGTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATCTTCGTCTGATGGGGCTGAGAACACAGCAG
CAATCGTAGGAGGCCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCTGCGTCCTCTATACTCCTCCAAG
TCGGCAAAGATGCCCCGGCTCGACCTAAACCAGTGGATTACAGTGGACCGTCTCTTAGCT
ACTACATCAACAAGTTCAAGCCTTCACAAGATGTTCGAGCCTCTTCACCCGCCCTCACCG
AAGCTCCACCGGTGGCTCAGGAAGAAACTTCATTGCCCGAAACTACGGCCAGTGAGGCTC
AGCCAGAGGAGGCGTCTTCTGTTCCGGCAACAAGTAGTACCTCTTAAGGGGTTCTTATTA
GCCTAGGGAGAGGGATTCAACATATGTTGTGTAAAGATGAAATGAAAGCCTATACCAAGA
TTCATGCGTCTTGTTAATATTCGGATATAACTATTATGTATACTTTTTTCCCTCTATGAG
TTGGTGTTATAATTTGAAAAAAATATCAAATCTTATTCACTTATCTTCAAGTGAGTGGCA
AATAAAAGAAGAAGGAAGAGTTCAACTG


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ34TF U 1
AF RR2FZ34JQ C 4
BS 1 682 RR2FZ34TF
BS 683 683 RR2FZ34JQ
BS 684 723 RR2FZ34TF
BS 724 748 RR2FZ34JQ

RD RR2FZ34TF 723 0 0
GCGAGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTATGGAATGGTTGGCTGGAG
AGAAGACGAAAGTGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGACTGGCTATGTTG
AGAAAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAGTGTATGTTGCAG
AGAGTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATCTTCGTCTGATGGGGCTGAGAACACAGCAG
CAATCGTAGGAGGCCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCTGCGTCCTCTATACTCCTCCAAG
TCGGCAAAGATGCCCCGGCTCGACCTAAACCAGTGGATTACAGTGGACCGTCTCTTAGCT
ACTACATCAACAAGTTCAAGCCTTCACAAGATGTTCGAGCCTCTTCACCCGCCCTCACCG
AAGCTCCACCGGTGGCTCAGGAAGAAACTTCATTGCCCGAAACTACGGCCAGTGAGGCTC
AGCCAGAGGAGGCGTCTTCTGTTCCGGCAACAAGTAGTACCTCTTAAGGGGTTCTTATTA
GCCTAGGGAGAGGGATTCAACATATGTTGTGTAAAGATGAAATGAAAGCCTATACCAAGA
TTCATGCGTCTTGTTAATATTCGGATATAACTATTATGTATACTTTTTTCCCTCTATGAG
TTGGTGTTATAATTTGAAAAAA*TATCAAATCTTATTCACTTATCTTCAAGTGAGTGGCA
AAT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2FZ34JQ 745 0 0
AGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTATGGAATGGTTGGCTGGAGAGA
AGACGAAAGTGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGACTGGCTATGTTGAGA
AAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAGTGTATGTTGCAGAGA
GTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATCTTCGTCTGATGGGGCTGAGAACACAGCAGCAA
TCGTAGGAGGCCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCTGCGTCCTCTATACTCCTCCAAGTCG
GCAAAGATGCCCCGGCTCGACCTAAACCAGTGGATTACAGTGGACCGTCTCTTAGCTACT
ACATCAACAAGTTCAAGCCTTCACAAGATGTTCGAGCCTCTTCACCCGCCCTCACCGAAG
CTCCACCGGTGGCTCAGGAAGAAACTTCATTGCCCGAAACTACGGCCAGTGAGGCTCAGC
CAGAGGAGGCGTTTTCTGTTCCGGCAACAAGTAGTACCTCTTAAGGGGTTCTTATTAGCC
TAGGGAGAGGGATTCAACATATGTTGTGTAAAGATGAAATGAAAGCCTATACCAAGATTC
ATGCGTCTTGTTAATATTCGGATATAACTATTATGTATACTTTTTTCCCTCTATGAGTTG
GTGTTATAATTTGAAAAAAATATCAAATCTTATTCACTTATCTTCAAGTGAGTGGCAAAT
AAAAGAAGAAGGAAGAGTTCAACTG

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 4

CO CL947Contig1 888 4 21 U
GGGTTCTCTCTCTCTGTCTCCGATCTATCACAAAGGAGAGAATAGTAGCTCTCAGGAAGT
GCCAAAATGAGTAAGCTCCAGAGTGAAGCCGTGAGAGAGGCGATATCGTCAATCATCACT
CACTGCAGGGAGACAAAGCCTCGCAAGTTCACCGAGACAATCGAGCTCCAGATTGGTCTT
AAGAACTATGACCCTCAAAAGGACAAGAGGTTTAGCGGTTCCGTTAAGTTGCCTCACATT
CCTAGGCCTAAGATGAAGATTTGCATGCTCGGTGACGCCCAGCACGTTGAAGAGGCTGAG
AAGATTGGGTTAGAGTCTATGGATGTGGAAGCACTTAAGAAGCTGAACAAGAACAAGAAG
CTTGTTAAGAAGCTAGCCAAAAAGTTCCATGCTTTCCTTGCTTCTGAATCTGTTATTAAG
CAGATTCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGCAGGAAAGTTTCCAACTCTTGTC
AGCCACCAAGAGTCTTTGGAATCCAAAGTGAATGAGACCAAGGCAACAGTGAAGTTCCAG
CTCAAGAAGGTTCTTTGCATGGGTGTCGCTGTTGGCAATCTCGGCATGGAAGAGAAGCAG
ATCTTCCAGAATGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTTGTTTCCCTCTTGAAGAAAAACTGG
CAAAATGTGAGGTGCTTGTACTTGAAGAGCACAATGAGTCCACCCACCCGTGTTTTCTAA
GATTTTTACTTCTCAAAGTTTTAATCTTTTAAGGTATCATTAAACTGAGAAGAAATTTGA
TTTTCTTTTATGTCATGAGCTTTCTTGGATTACTTGAAAAACTCTTACTCTGTAGGATTG
ATCAAGATTTTGTTGAAAGACATTTTTATTTCTACTTTGTTATTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ96TF U 8
AF RR2G150TF U 1
AF RR2FQ96JQ C 40
AF RR2G150JQ C 471
BS 1 127 RR2G150TF
BS 128 128 RR2FQ96TF
BS 129 152 RR2G150TF
BS 153 153 RR2FQ96TF
BS 154 655 RR2G150TF
BS 656 656 RR2FQ96JQ
BS 657 671 RR2G150TF
BS 672 672 RR2FQ96JQ
BS 673 700 RR2G150TF
BS 701 701 RR2FQ96JQ
BS 702 726 RR2G150TF
BS 727 727 RR2FQ96JQ
BS 728 741 RR2G150TF
BS 742 742 RR2FQ96JQ
BS 743 753 RR2G150TF
BS 754 754 RR2FQ96JQ
BS 755 763 RR2G150TF
BS 764 764 RR2FQ96JQ
BS 765 806 RR2G150TF
BS 807 880 RR2FQ96JQ
BS 881 888 RR2G150JQ

RD RR2FQ96TF 537 0 0
GG
CTCTCTGTCTCCGATCTATCACAAAGGAGAGAATAGTAGCTCTCAGGAAGTGCCAAAATG
AGTAAGCTCCAGAGTGAAGCCGTGAGAGAGGCGATATCGTCAATCATCACTCACTGCAGG
GAGACAAAGCCTCGCAAGTTCACCGAGACAATCGAGCTCCAGATTGGTCTTAAGAACTAT
GACCCTCAAAAGGACAAGAGGTTTAGCGGTTCCGTTAAGTTGCCTCACATTCCTAGGCCT
AAGATGAAGATTTGCATGCTCGGTGACGCCCAGCACGTTGAAGAGGCTGAGAAGATTGGG
TTAGAGTCTATGGATGTGGAAGCACTTAAGAAGCTGAACAAGAACAAGAAGCTTGTTAAG
AAGCTAGCCAAAAAGTTCCATGCTTTCCTTGCTTCTGAATCTGTTATTAAGCAGATTCCC
CGTCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGCAGGAAAGTTTCCAACTCTTGTCAGCCACCAA
GAGTCTTTGGAATCCAAAGTGAATGAGACCAAAGCAACAGTGAAGTTCCAGCTCA

QA 3 537 3 537
DS 

RD RR2G150TF 806 0 0
GGGTTCTCTCTCTCTGTCTCCGATCTATCACAAAGGAGAGAATAGTAGCTCTCAGGAAGT
GCCAAAATGAGTAAGCTCCAGAGTGAAGCCGTGAGAGAGGCGATATCGTCAATCATCACT
CACTGCAAGGAGACAAAGCCTCGCAAGTTCACTGAGACAATCGAGCTCCAGATTGGTCTT
AAGAACTATGACCCTCAAAAGGACAAGAGGTTTAGCGGTTCCGTTAAGTTGCCTCACATT
CCTAGGCCTAAGATGAAGATTTGCATGCTCGGTGACGCCCAGCACGTTGAAGAGGCTGAG
AAGATTGGGTTAGAGTCTATGGATGTGGAAGCACTTAAGAAGCTGAACAAGAACAAGAAG
CTTGTTAAGAAGCTAGCCAAAAAGTTCCATGCTTTCCTTGCTTCTGAATCTGTTATTAAG
CAGATTCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGCAGGAAAGTTTCCAACTCTTGTC
AGCCACCAAGAGTCTTTGGAATCCAAAGTGAATGAGACCAAGGCAACAGTGAAGTTCCAG
CTCAAGAAGGTTCTTTGCATGGGTGTCGCTGTTGGCAATCTCGGCATGGAAGAGAAGCAG
ATCTTCCAGAATGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTTGTTTCCCTCTTGAAGAAAA*CTGG
CAAAATGTGAG*TGCTTGTACTTGAAGAGCACAATGAGTC*ACCCACCCGTGTTTTCTAA
GATTTT*ACTTCTCAAAGTTT*AATCTTTTAAG*TATCATTAA*CTGAGAAGAAATTTGA
TTTTCTTTTATGTCATGAGCTTTCTT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2FQ96JQ 841 0 0
GAATAGTAGCTCTCAGGAAGTGCCAAAATGAGTAAGCTCCAGAGTGAAGCCGTGAGAGAG
GCGATATCGTCAATCATCACTCACTGCAGGGAGACAAAGCCTCGCAAGTTCACCGAGACA
ATCGAGCTCCAGATTGGTCTTAAGAACTATGACCCTCAAAAGGACAAGAGGTTTAGCGGT
TCCGTTAAGTTGCCTCACATTCCTAGGCCTAAGATGAAGATTTGCATGCTCGGTGACGCC
CAGCACGTTGAAGAGGCTGAGAAGATTGGGTTAGAGTCTATGGATGTGGAAGCACTTAAG
AAGCTGAACAAGAACAAGAAGCTTGTTAAGAAGCTAGCCAAAAAGTTCCATGCTTTCCTT
GCTTCTGAATCTGTTATTAAGCAGATTCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTCAACAAGGCA
GGAAAGTTTCCAACTCTTGTCAGCCACCAAGAGTCTTTGGAATCCAAAGTGAATGAGACC
AAGGCAACAGTGAAGTTCCAGCTCAAGAAGGTTCTTTGCATGGGTGTCGCTGTTGGCAAT
CTCGGCATGGAAGAGAAGCAGATCTTCCAGAATGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTTGTT
TCCCTCTTGAAGAAAAACTGGCAAAATGTGAGGTGCTTGTACTTGAAGAGCACAATGAGT
CCACCCACCCGTGTTTTCTAAGATTTTTACTTCTCAAAGTTTTAATCTTTTAAGGTATCA
TTAAACTGAGAAGAAATTTGATTTTCTTTTACGTCATGAGCTTTCTTGGATTACTTGAAA
AACTCTTACTCTGTAGGATTGATCAAGATTTTGTTGAAAGACATTTTTATTTCTACTTTG
T

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR2G150JQ 418 0 0
AACTCTTGTCAGCCACCAAGAGTCTTTGGAATCCAAAGTGAATGAGACCAAGGCAACAGT
GAAGTTCCAGCTCAAGAAGGTTCTTTGCATGGGTGTCGCTGTTGGCAATCTCGGCATGGA
AGAGAAGCAGATCTTCCAGAATGTTCAGATGAGCGTCAACTTCCTTGTTTCCCTCTTGAA
GAAAAACTGGCAAAATGTGAGGTGCTTGTACTTGAAGAGCACAATGAGTCCACCCACCCG
TGTTTTCTAAGATTTTTACTTCTCAAAGTTTTAATCTTTTAAGGTATCATTAAACTGAGA
AGAAATTTGATTTTCTTTTATGTCATGAGCTTTCTTGGATTACTTGAAAAACTCTTACTC
TGTAGGATTGATCAAGATTTTGTTGAAAGACATTTTTATTTCTACTTTGTTATTGCTC

QA 1 418 1 418
DS 



AS 2 8

CO CL948Contig1 1303 5 5 U
GACACTTCAAAAGCGTCGACATAAAGTTAGGCCAAACCCCCAGAAACCCAAAAAAAGAGT
CATAAGAAAAAAAAGAGTTAGAGAGAGAGATGAAGAGTTTCCCGATTATCAATCTCGAGA
AGCTTAATGGAGAAGAGAGAGGACTCACGATGGAGAAGATCAAAGACGCTTGTGAAAACT
GGGGATTCTTTGAGTGTGTGAACCATGGGATTCCACACGAGCTACTTGACAGAGTAGAGA
AGATGACCAAGGAACACTACAAGAAATGTATGGAAGACAGATTCAAGGAGTCTATTAAGA
ACAGAGGACTCGACTCTGTTCGGTCTGAAGTCAATGACGTTGACTGGGAGTCAACTTTCT
TCCTTAAGCACCTTCCCCTCTCCAATATCTCCAATGTCCCTGAT*CTCGACGACGATTAC
AGGACGTTGATGAAAGAGTTCGCGGGAAAGATAGAGAAGTTGTCGGAGGAGCTACTGGAT
CTGCTTTGCGAGAATCTCGGATTGGAGAAGGGCTATCTCAAAAATGTGTTTTACGGGTCG
AAAAGCCCGACTTTTGGAACCAAAGTGAGCAACTATCCACCTTGTCCTAAACCGGATTTA
ATCAAGGGGCTCCGAGCACATACCGACGCAGGCGGCATCATCCTCCTCTTCCAGGACGAT
AAAGTCAGTGGACTTCAGCTCCTTAAGGACGGCGAGTGGGTCGATGTTCCTCCGGTTAAG
CATTCTATCGTCGTTAATCTCGGTGATCAGCTTGAGGTGATAACCAATGGGAAGTACAAG
AGCGTGGAGCATAGAGTGATGGCTCAGACGGACGGAGAAGGAAGAATGTCCATTGCATCA
TTCTACAATCCTGGACGCGACTCTGTTATTTTCCCGGCGCCGGAGTTGATCGGAAAAGAA
TCGGAGAAGAAGGATAACTATCCAAAATTCGTGTTCGAGGATTACATGAAACTTTACTCT
GCTGTCAAGTTTCAAGCCAAAGAACCTAGGTTTGAAGCCATGAAAGCTATGGAGACAACT
GTGTCCAACAATGTTGGACCATTGGCCACTGCCTAAATGAATGGCATTATAAATTCATAG
TACATTGTTTTCATATAATTTCTTTATATTCGAATAATTTTTATGTGGTATATTGTATGT
CTTTTTTCATCAAAGTAGAATATATTTCCATACTTTTTCATCAAAGTAGAATTTTATGTG
GTATATTATATGTCTATTAAAACGTTATTTATATATTAATGGAAAAATAATATTTGTTGT
ATGTATAATTATTGATTTATTATAAAATGAAGAGAATTGTTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C831TF U 202
AF RR2FW49TF U 1
AF RR2BL22TF U 1
AF RR2C831JQ C 378
AF RR2BL22JQ C 577
BS 1 27 RR2BL22TF
BS 28 28 RR2FW49TF
BS 29 685 RR2BL22TF
BS 686 970 RR2C831JQ
BS 971 1303 RR2BL22JQ

RD RR2C831TF 236 0 0
ACCATGGGATTC*ACACGAGCTACTTGACAGAGTAGAGAAGATGACCAAGGAACACTACA
AGAAATGTATGGAAGACAGATTCAAGGAGTCTATTAAGAACAGAGGACTCGACTCTGTTC
GGTCTGAAGTCAATGACGTTGACTGGGAGTCAACTTTCTTCCTTAAGCACCTTCCCCTCT
CCAATATCTCCAATGTCCCTGATTCTCGACGACGATTACAGGACGTTGATGAAAGA

QA 1 236 1 236
DS 

RD RR2FW49TF 600 0 0
GACACTTCAAAAGCGTCGACATAAAGTTAGGCCAAACCCCCAGAAACCCAAAAA**GAGT
CATAAGAAAAAAAAGAGTTAGAGAGAGA**TGAAGAGTTTCCCGATTATCAATCTCGAGA
AGCTTAATGGAGAAGAGAGAGGACTCCCGATGGAGAAGATCAAAGACGCTTGTGAAAACT
GGGGATTCTTTGAGTGTGTGAACCATGGGATTCCACACGAGCTACTTGACAGAGTAGAGA
AGATGACCAAGGAACACTACAAGAAATGTATGGAAGATAGATTCAAGGAGTCCATTAAGA
ACAGAGGACTCGACTCTGTTCGATCTGAAGTCAATGACGTTGACTGGGAGTCAACTTTCT
TCCTTAAGCACCTTCCCCTCTCCAATATCTCCAATGTCCCTGAT*CTCGACGACGATTAC
AGGACGTTGATGAAAGAGTTCGCCGGAAAGATAGAGAAGTTGTCGGAGGAGCTACTGGAT
CTGCTTTGCGAGAATCTCGGATTGGAGAAGGGCTATCTGAAGAAGGTGTTTTACGGGTCG
AAAAGCCCAACTTTTGGAACCAAAGTGAGCAACTATCCACCTTGTCCTAAACCGGATTTA

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2BL22TF 685 0 0
GACACTTCAAAAGCGTCGACATAAAGT*AGGCCAAACCCCCAGAAACCCAAAAAAAGAGT
CATAAGAAAAAAAAGAGTTAGAGAGAGAGATGAAGAGTTTCCCGATTATCAATCTCGAGA
AGCTTAATGGAGAAGAGAGAGGACTCACGATGGAGAAGATCAAAGACGCTTGTGAAAACT
GGGGATTCTTTGAGTGTGTGAACCATGGGATTCCACACGAGCTACTTGACAGAGTAGAGA
AGATGACCAAGGAACACTACAAGAAATGTATGGAAGACAGATTCAAGGAGTCTATTAAGA
ACAGAGGACTCGACTCTGTTCGGTCTGAAGTCAATGACGTTGACTGGGAGTCAACTTTCT
TCCTTAAGCACCTTCCCCTCTCCAATATCTCCAATGTCCCTGAT*CTCGACGACGATTAC
AGGACGTTGATGAAAGAGTTCGCGGGAAAGATAGAGAAGTTGTCGGAGGAGCTACTGGAT
CTGCTTTGCGAGAATCTCGGATTGGAGAAGGGCTATCTCAAAAATGTGTTTTACGGGTCG
AAAAGCCCGACTTTTGGAACCAAAGTGAGCAACTATCCACCTTGTCCTAAACCGGATTTA
ATCAAGGGGCTCCGAGCACATACCGACGCAGGCGGCATCATCCTCCTCTTCCAGGACGAT
AAAGTCAGTGGACTTCAGCTCCTTA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2C831JQ 593 0 0
CTTCT
CAATATCTCCAATGTCC*TGAT*CTCGACGACGATTACAGGACGTTGATGAAAGAGTTCG
CGGGAAGGATAGAGAAGTTGTCGGAGGAGCTACTGGATCTGCTTTGCGAGAATCTCGGAT
TGGAGAAGGGCTATCTCAAAAATGTGTTTTACGGGTCGAAAAGCCCGACTTTTGGAACCA
AAGTGAGCAACTATCCACCTTGTCCTAAACCGGATTTAATCAAGGGGCTCCGAGCACATA
CCGACGCAGGCGGCATCATCCTCCTCTTCCAGGACGATAAAGTCAGTGGACTTCAGCTCC
TTAAGGACGGCGAGTGGGTCGATGTTCCTCCGGTTAAGCATTCTATCGTCGTTAATCTCG
GTGATCAGCTTGAGGTGATAACCAATGGGAAGTACAAGAGCGTGGAGCATAGAGTGATGG
CTCAGACGGACGGAGAAGGAAGAATGTCCATTGCATCATTCTACAATCCTGGACGCGACT
CTGTTATTTTCCCGGCGCCGGAGTTGATCGGAAAAGAATCGGAGAAGAAGGATAACTATC
CAAAATTCGTGTTCGAGGATTACATGAAACTTTACTCTGCTGTCAAGT

QA 6 593 6 593
DS 

RD RR2BL22JQ 727 0 0
CCACCTTGTCCTAAACCGGATTTAATCAAGGGGCTCCGAGCACATACCGACGCAGGCGGC
ATCATCCTCCTCTTCCAGGACGATAAAGTCAGTGGACTTCAGCTCCTTAAGGACGGCGAG
TGGGTCGATGTTCCTCCGGTTAAGCATTCTATCGTCGTTAATCTCGGTGATCAGCTTGAG
GTGATAACCAATGGGAAGTACAAGAGCGTGGAGCATAGAGTGATGGCTCAGACGGACGGA
GAAGGAAGAATGTCCATTGCATCATTCTACAATCCTGGATGCGACTCTGTTATTTTCCCG
GCGCCGGAGTTGATCGGAAAAGAATCGGAGAAGAAGGATAACTATCCAAAATTCGTGTTC
GAGGATTACATGAAACTTTACTCTGCTGTCAAGTTTCAAGCCAAAGAACCTAGGTTTGAA
GCCATGAAAGCTATGGAGACAACTGTGTCCAACAATGTTGGACCATTGGCCACTGCCTAA
ATGAATGGCATTATAAATTCATAGTACATTGTTTTCATATAATTTCTTTATATTCGAATA
ATTTTTATGTGGTATATTGTATGTCTTTTTTCATCAAAGTAGAATATATTTCCATACTTT
TTCATCAAAGTAGAATTTTATGTGGTATATTATATGTCTATTAAAACGTTATTTATATAT
TAATGGAAAAATAATATTTGTTGTATGTATAATTATTGATTTATTATAAAATGAAGAGAA
TTGTTAC

QA 1 727 1 727
DS 



CO CL948Contig2 719 3 1 U
AACAAATATAAATTTTCCATTAATACATAAATAACGTTTTATCAAATACAACAACATATA
CCACATAAAAGTTATTCGGATATGAAGACTATATATTACAATGCATTCATTTAGGCAGTT
GCCAATGGTCCAACATTGTTGGACACAGTTGTCTCCATAGCTTTCATGGCTTCAAACCTA
GGTTCTTTGGCTTGAAACTTGACAGCAGAGTAAGGTTTCATGTAATCCTCGAACACGAAT
TTTGGATAGTTATCCTTCTTCTCCGAATCTTTTCCGATCAACTCCGGCGCCGGAAAAATA
ACAGAGTCGCTTCCAGGATTGTAGAATGACGCAATGGACATTCTTCCTTCTCCGTCCGTC
TGAGATATCACTCTATGCTCCACGCTCTTGTACTTCCCATTGGTTATCACCTCAAGCTGA
TCACCGAGATTAACGACGATAGAATGCTTAACCGGAGGAACATCCACCCACTCGCCGTCC
TTAAGGAGCTGAAGTCCACTGACTTCATCGTCCTGGAAGAGGAGGATTATGCCGCCTGCG
TCGGTATGTGCGCGGAGCCCCTTGATTAAATCCGGTTTAGGACAAGGTGGATAGTTGCTC
ACTTTGGTTCCAAAAGTTGGGCTTTTCGACCCGTAAAACACCTTCTTCAGATAGCCCTTC
TCCAATCCGAGATTCTCGTAAAGCAGATCCAGTAGCTCCTCCGACAACTTCTCTATCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2FW49JQ U 13
AF RR2CK60JQ U 1
AF RR2CK60TF C 1
BS 1 719 RR2CK60JQ

RD RR2FW49JQ 598 0 0
T
TTTCCATTAATACATAAATAACGTTTTATCAAATACAACAACATATACCACATAAAAGTT
ATTCGGATATGAAGACTATATATTACAATGCATTCATTTAGGCAGTTGCCAATGGTCCAA
CATTGTTGGACACAGTTGTCTCCATAGCTTTCATGGCTTCAAACCTAGGTTCTTTGGCTT
GAAACTTGACAGCAGAGTAAAGTTTCATGTAATCCTCGAACACGAATTCTGGATAGTTAT
CCTTCTTCTCCGAATCTTTTCCGATCAACTCCGGCGCCGGAAAAATAACAGAGTCGCTTC
CAGGATTGTAGAATGACGCAATGGACATTCTTCCTTCTCCGTCCGTCTGAGATATCACTC
TATGCTCCACGCTCTTGTACTTCCCATTGGTTATCACCTCAAGCTGATCACCGAGATTAA
CGACGATAGAATGCTTAACCGGAGGAACATCCACCCACTCGCCGTCCTTAAGGAGCTGAA
GTCCACTGACTTTATCGTCCTGGAAGAGGAGGATTATGCCGCCTGCGTCGGTATGTGCGC
GGAGCCCCTTGATTAAATCCGGTTTAGGACAAGGTGGATAGTTGCTCACTTTGGTTC

QA 2 598 2 598
DS 

RD RR2CK60JQ 719 0 0
AACAAATATAAATTTTCCATTAATACATAAATAACGTTTTATCAAATACAACAACATATA
CCACATAAAAGTTATTCGGATATGAAGACTATATATTACAATGCATTCATTTAGGCAGTT
GCCAATGGTCCAACATTGTTGGACACAGTTGTCTCCATAGCTTTCATGGCTTCAAACCTA
GGTTCTTTGGCTTGAAACTTGACAGCAGAGTAAGGTTTCATGTAATCCTCGAACACGAAT
TTTGGATAGTTATCCTTCTTCTCCGAATCTTTTCCGATCAACTCCGGCGCCGGAAAAATA
ACAGAGTCGCTTCCAGGATTGTAGAATGACGCAATGGACATTCTTCCTTCTCCGTCCGTC
TGAGATATCACTCTATGCTCCACGCTCTTGTACTTCCCATTGGTTATCACCTCAAGCTGA
TCACCGAGATTAACGACGATAGAATGCTTAACCGGAGGAACATCCACCCACTCGCCGTCC
TTAAGGAGCTGAAGTCCACTGACTTCATCGTCCTGGAAGAGGAGGATTATGCCGCCTGCG
TCGGTATGTGCGCGGAGCCCCTTGATTAAATCCGGTTTAGGACAAGGTGGATAGTTGCTC
ACTTTGGTTCCAAAAGTTGGGCTTTTCGACCCGTAAAACACCTTCTTCAGATAGCCCTTC
TCCAATCCGAGATTCTCGTAAAGCAGATCCAGTAGCTCCTCCGACAACTTCTCTATCTC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2CK60TF 719 0 0
AACAAATATAAATTT*CCATTAATACATAAATAACGTTTTATCAAATACAACAACATATA
CCACATAAAAGTTATTCGGATATGAAGACTATATATTACAATGCATTCATTTAGGCAGTT
GCCAATGGTCCAACATTGTTGGACACAGTTGTCTCCATAGCTTTCATGGCTTCAAACCTA
GGTTCTTTGGCTTGAAACTTGACAGCAGAGTAAGGTTTCATGTAATCCTCGAACACGAAT
TTTGGATAGTTATCCTTCTTCTCCGAATCTTTTCCGATCAACTCCGGCGCCGGAAAAATA
ACAGAGTCGCTTCCAGGATTGTAGAATGACGCAATGGACATTCTTCCTTCTCCGTCCGTC
TGAGATATCACTCTATGCTCCACGCTCTTGTACTTCCCATTGGTTATCACCTCAAGCTGA
TCACCGAGATTAACGACGATAGAATGCTTAACCGGAGGAACATCCACCCACTCGCCGTCC
TTAAGGAGCTGAAGTCCACTGACTTCATCGTCCTGGAAGAGGAGGATTATGCCGCCTGCG
TCGGTATGTGCGCGGAGCCCCTTGATTAAATCCGGTTTAGGACAAGGTGGATAGTTGCTC
ACTTTGGTTCCAAAAGTTGGGCTTTTCGACCCGTAAAACACCTTCTTCAGATAGCCCTTC
TCCAATCCGAGATTCTCGTAAAGCAGATCCAGTAGCTCCTCCGACAACTTCTCTATCT
C

QA 1 718 1 718
DS 



AS 2 8

CO CL949Contig1 691 2 5 U
GGACAGCTCTCTTCTCTTCTCATTCTTCATCACAACTTCTTCAAAGAGAGACAATCATGG
GTAAAGGTCCAGGACTCTACACCGAGATCGGCAAAAAGGCCAGAGATCTTTTGTACAAGG
ACTACCAAGGAGACCAGAAGCTCAGCATCACCACTTACTCTTCAACCGGTGTTGCAATCA
CAACAACTGGAACAAACAAGGGAGATTTGTTTGTGGGTGATGTACTTACCCAAATCAAGA
ACAAGAACTTAACTGCTGATATCAAAGTTGCCTCTGATTCTTCTATCCTTACCACTGTCA
CCTATGATGAGGCTACCCCTGGATTAAAGGCTATCCTTAGCGCCAAGGTGCCTGATCAGA
AATCTGCCAAGGTTGAGCTCCAGTATCTGCATCCCCACGCAGGTATCTGCACCAGTGTTG
GACTGACAGCTAGCCCCGTTGCCAACACGAATGGCGTCCGAAGTCGTTCATCACCATCTC
TGGAGAGGTTGACTCTAAGGCCATCGAGAAGAGTGCTAAAGTTGGATTTGCTCTCGCTCT
CAAGCCTTGAGTGAAAGAACATGTCTTTCTAATCTTTTGGAACTAATCTCTGTCTGGTTT
TTTCTTTTCCCTTTAAAAATTGTTCATTTGTTTTCTTTTACAAAATAAGAATAAGAAAAA
TACTATGAAAGGATCGTCTTTGAAGATGAAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW53TF U 1
AF RR2CW53JQ C 1
BS 1 2 RR2CW53JQ
BS 3 618 RR2CW53TF
BS 619 619 RR2CW53JQ
BS 620 654 RR2CW53TF
BS 655 691 RR2CW53JQ

RD RR2CW53TF 654 0 0
GG
ACAGCTCTCTTCTCTTCTCATTCTTCATCACAACTTCTTCAAAGAGAGACAATCATGGGT
AAAGGTCCAGGACTCTACACCGAGATCGGCAAAAAGGCCAGAGATCTTTTGTACAAGGAC
TACCAAGGAGACCAGAAGCTCAGCATCACCACTTACTCTTCAACCGGTGTTGCAATCACA
ACAACTGGAACAAACAAGGGAGATTTGTTTGTGGGTGATGTACTTACCCAAATCAAGAAC
AAGAACTTAACTGCTGATATCAAAGTTGCCTCTGATTCTTCTATCCTTACCACTGTCACC
TATGATGAGGCTACCCCTGGATTAAAGGCTATCCTTAGCGCCAAGGTGCCTGATCAGAAA
TCTGCCAAGGTTGAGCTCCAGTATCTGCATCCCCACGCAGGTATCTGCACCAGTGTTGGA
CTGACAGCTAGCCCCGTTGCCAACACGAATGGCGTCCGAAGTCGTTCATCACCATCTCTG
GAGAGGTTGACTCTAAGGCCATCGAGAAGAGTGCTAAAGTTGGATTTGCTCTCGCTCTCA
AGCCTTGAGTGAAAGAACATGTCTTTCTAATCTTTTGGAACTAATCTCTGTCTGGTTTTT
TCTTTTCCCTTTAAAA*TTGTTCATTTGTTTTCTTTTACAAAATAAGAATAA

QA 3 654 3 654
DS 

RD RR2CW53JQ 691 0 0
GGACAGCTCTCTTCTCTTCTCATTCTTCATCACAACTTCTTCAAAGAGAGACAATCATGG
GTAAAGGTCCAGGACTCTACACCGAGATCGGCAAAAAGGCCAGAGATCTTTTGTACAAGG
ACTACCAAGGAGACCAGAAGCTCAGCATCACCACTTACTCTTCAACCGGTGTTGCAATCA
CAACAACTGGAACAAACAAGGGAGATTTGTTTGTGGGTGATGTACTTACCCAAATCAAGA
ACAAGAACTTAACTGCTGATATCAAAGTTGCCTCTGATTCTTCTATCCTTACCACTGTCA
CCTATGATGAGGCTACCCCTGGATTAAAGGCTATCCTTAGCGCCAAGGTGCCTGATCAGA
AATCTGCCAAGGTTGAGCTCCAGTATTTGCATCCCCACGCAGGTATTTGCACCAGTGTTG
GACTGACAGCTAGCCCCGTTGCCAACACGAATGGCGTCCGAAGTCGTTCATCACCATCTC
TGGAGAGGTTGACTCTAAGGCCATCGAGAAGAGTGCTAAAGTTGGATTTGCTCTCGCTCT
CAAGCCTTGAGTGAAAGAACATGTCTTTTTAATCTTTTGGAACTAATCTCTGTCTGGTTT
TTTCTTTTCCCTTTAAAAATTGTTCATTTGTTTTCTTTTACAAAATAAGAATAAGAAAAA
TACTATGAAAGGATCGTCTTTGAAGATGAAC

QA 1 691 1 691
DS 



CO CL949Contig2 1071 6 7 U
GGGATATATACACACATTTTACCCAAGGAAGAAAAAAAGCCATTACAGCTCTCTTCTCTT
CTCATTCTTCATCACAACTTCTTCAAAGAGAGACAATCATGGGTAAAGGTCCAGGACTCT
ACACCGAGATCGGCAAAAAGGCCAGAGATCTTTTGTACAAGGACTACCAAGGAGACCAGA
AGCTCAGCATCACCACTTACTCTTCAACCGGTGTTGCAATCACAACAACTGGAACAAACA
AGGGAGATTTGTTTGTGGGTGATGTACTTACCCAAATCAAGAACAAGAACTTAACTGCTG
ATATCAAAGTTGCCTCTGATTCTTCTATCCTTACCACTGTCACCTATGATGAGGCTACCC
CTGGATTAAAGGCTATCCTTAGCGCCAAGGTGCCTGATCAGAAATCTGCCAAGGTTGAGC
TCCAGTATCTGCATCCCCACGCAGGTATCTGCACCAGTGTTGGACTGACAGCTAGCCCCG
TTGTCAACTTCTCCGGTGTGATTGGAACCAGTGTGTTGGCTCTTGGTACCGATGTGTCCT
TTGACACGGAATCTGGCAACTTTAAACATTTCAATGCTGGTGTGAGCTTCACCAAGGATG
ATTTGATTGCTTCTCTTACTCTGAATGACAAAGGTGAGAAATTGAATGCATCGTACTACC
ACATTGTGAACCCATTGAAGAACACAGTGGTTGGAGCCGAGGTTACCCACAGCTTGAAGA
GCCAAGTGAACACGATAACCGTGGGTGCTCAGCACGCTCTTGACCCATTGACCACGGTTA
AGACACGCGTGAACAATGCTGGTATAGCCAACGCGCTGATCCAACACGAATGGCGTCCGA
AGTCGTTCATCACCATCTCTGGAGAGGTTGACTCTAAGGCCATCGAGAAGAGTGCTAAAG
TTGGATTTGCTCTCGCTCTCAAGCCTTGAGTGAAAGAACATGTCTTTCTAATCTTTTGGA
ACTAATCTCTGTCTGGTTTTTTCTTTTCCCTTTAAAAATTGTTCATTTGTTTTCTTTTAC
AAAATAAGAATAAGAAAAATACTATGAAAGGATCGTCTTTGAAGATGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F287TF U 1
AF RR2EC50TF U 35
AF RR2A052TF U 48
AF RR2A052JQ C 451
AF RR2F287JQ C 236
AF RR2EC50JQ C 398
BS 1 440 RR2F287TF
BS 441 703 RR2EC50TF
BS 704 704 RR2A052TF
BS 705 771 RR2EC50TF
BS 772 772 RR2A052TF
BS 773 1046 RR2F287JQ
BS 1047 1071 RR2EC50JQ

RD RR2F287TF 440 0 0
GGGATATATACACACATTTTACCCAAGGAAGAAAAAAAGCCATTACAGCTCTCTTCTCTT
CTCATTCTTCATCACAACTTCTTCAAAGAGAGACAATCATGGGTAAAGGTCCAGGACTCT
ACACCGAGATCGGCAAAAAGGCCAGAGATCTTTTGTACAAGGACTACCAAGGAGACCAGA
AGCTCAGCATCACCACTTACTCTTCAACCGGTGTTGCAATCACAACAACTGGAACAAACA
AGGGAGATTTGTTTGTGGGTGATGTACTTACCCAAATCAAGAACAAGAACTTAACTGCTG
ATATCAAAGTTGCCTCTGATTCTTCTATCCTTACCACTGTCACCTATGATGAGGCTACCC
CTGGATTAAAGGCTATCCTTAGCGCCAAGGTGCCTGATCAGAAATCTGCCAAGGTTGAGC
TCCAGTATCTGCATCCCCAC

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR2EC50TF 737 0 0
GG
AAGCCATTACAGCTCTCTTCTCTTCTCATTCTTCATCACAACTTCTTCAAAGAGAGACAA
TCATGGGTAAAGGTCCAGGACTCTACACCGAGATCGGCAAAAAGGCCAGAGATCTTTTGT
ACAAGGACTACCAAGGAGACCAGAAGCTCAGCATCACCACTTACTCTTCAACCGGTGTTG
CAATCACAACAACTGGAACAAACAAGGGAGATTTGTTTGTGGGTGATGTACTTACCCAAA
TCAAGAACAAGAACTTAACTGCTGATATCAAAGTTGCCTCTGATTCTTCTATCCTTACCA
CTGTCACCTATGATGAGGCTACCCCTGGATTAAAGGCTATCCTTAGCGCCAAGGTGCCTG
ATCAGAAATCTGCCAAGGTTGAGCTCCAGTATCTGCATCCCCACGCAGGTATCTGCACCA
GTGTTGGACTGACAGCTAGCCCCGTTGTCAACTTCTCCGGTGTGATTGGAACCAGTGTGT
TGGCTCTTGGTACCGATGTGTCCTTTGACACGGAATCTGGCAACTTTAAACATTTCAATG
CTGGTGTGAGCTTCACCAAGGATGATTTGATTGCTTCTCTTACTCTGAATGACAAAGGTG
AGAAATTGAATGCATCGTACTACCACATTGTGAACCCATTGAAGAACACAGTGGTTGGAG
CCGAGGT*ACCCACAGCTTGAAGAGCCAAGTGAACACGATAACCGTGGGTGCTCAGCACG
CTCTTGACCCATTGA

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR2A052TF 725 0 0
GGACAGC
TCTCTTCTC*TTCTTCATCACAACTTCGTCAAAGAGA**CAATCATGGGTAAAGGTCCAG
GACTCTACACCGAGATCGGCAAAAAGGCCAAAGATCTTTTGTACAAGGACTACCAAGGAG
ACCAGAAGCTCAGTATCACCACTTACTCTTCAACCGGTGTTGCAATCACAACAACTGGAA
CAAACAAGGGAGATTTGTTTGTGGGTGATGTACTTACCCAAATCAAGAACAAGAACTTAA
CTGCTGATATCAAAGTTACCTCTGATTCTTCTATCCTTACCACGGTCACCTATGATGAGG
CTACCCCTGGATTGAAGGCAATCGTTAGCGCCAAGGTGCCTGATCAGAAATCTGCCAAGG
TTGAGCTCCAGTATCTGCATCCCCATGCGGGTATCTGCACCAGCGTTGGGTTGACAGCTA
GCCCCGTTGTCAACTTCTCCGGTGTGATTGGAACCAGTGTGTTGGCTCTTGGTACCGATG
TGTCCTTTGACACGGAATCTGGCAACTTTAAACATTTCAATGCTGGTGTGAGCTTCACCA
AGGATGATTTGATTGCTTCTCTTACTCTGAACGACAAAGGTGAGAGATTGAATGCATCGT
ACTACCACATTGTGAACCCATTGAAGAACACAGTGGTTGGAGCCGAGGTTAGCCACAGCT
TGAAGAGCCAAGTGAACACGATAACCGTGGGTGCTCAGCACGCTCTGGACCCATTGAC

QA 8 725 8 725
DS 

RD RR2A052JQ 467 0 0
GCACCAGCGTTGGGTTGACAGCTAGCCCCGTTGTCAACTTCTCCGGTGTGATTGGAACCA
GTGTGTTGGCTCTTGGTACCGATGTGTCCTTTGACACGGAATCTGGCAACTTTAAACATT
TCAATGCTGGTGTGAGCTTCACCAAGGATGATTTGATTGCTTCTCTTACTCTGAACGACA
AAGGTGAGAGATTGAATGCATCGTACTACCACATTGTGAACCCATTGAAGAACACAGTGG
TTGGAGCCGAGGTTAGCCACAGCTTGAAGAGCCAAGTGAACACGATAACCGTGGGTGCTC
AGCACGCTCTGGACCCATTGACCACGGTTAAGACACGCGTGAACAATGCTGGTATAGCCA
ACGCGCTGATCCAACACGAGTGGCGTCCGAAGTCGTTCATCACCATCTCTGGAGAGGTTG
ACTCTAAGGCCATCGAGAAGAGTGCTAAGGTTGGGTTTGCTCTCGCT

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2F287JQ 811 0 0
AAACAAGGGAGATTTGTTTGTGGGTGATGTACTTACCCAAATCAAGAACAAGAACTTAAC
TGCTGATATCAAAGTTGCCTCTGATTCTTCTATCCTTACCACTGTCACCTATGATGAGGC
TACCCCTGGATTAAAGGCTATCCTTAGCGCCAAGGTGCCTGATCAGAAATCTGCCAAGGT
TGAGCTCCAGTATCTGCATCCCCACGCAGGTATCTGCACCAGTGTTGGACTGACAGCTAG
CCCCGTTGTCAACTTCTCCGGTGTGATTGGAACCAGTGTGTTGGCTCTTGGTACCGATGT
GTCCTTTGACACGGAATCTGGCAACTTTAAACATTTCAATGCTGGTGTGAGCTTCACCAA
GGATGATTTGATTGCTTCTCTTACTCTGAATGACAAAGGTGAGAAATTGAATGCGTCGTA
CTACCACATTGTGAACCCATTGAAGAACACAGTGGTTGGAGCCGAGGTTACCCACAGCTT
GAAGAGCCAAGTGAACACGATAACCGTGGGTGCTCAGCACGCTCTTGACCCATTGACCAC
GGTTAAGACACGCGTGAACAATGCTGGTATAGCCAACGCGCTGATCCAACACGAATGGCG
TCCGAAGTCGTTCATCACCATCTCTGGAGAGGTTGACTCTAAGGCCATCGAGAAGAGTGC
TAAAGTTGGATTTGCTCTCGCTCTCAAGCCTTGAGTGAAAGAACATGTCTTTCTAATCTT
TTGGAACTAATCTCTGTCTGGTTTTTTCTTTTCCCTTTAAAAATTGTTCATTTGTTTTCT
TTTACAAAATAAGAATAAGAAAAATACTATG

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2EC50JQ 674 0 0
TCAGAAATCTGCCAAGGTTGAGCTCCAGTATCTGCATCCCCACGCAGGTATCTGCACCAG
TGTTGGACTGACAGCTAGCCCCGTTGTCAACTTCTCCGGTGTGATTGGAACCAGTGTGTT
GGCTCTTGGTACCGATGTGTCCTTTGACACGGAATCTGGCAACTTTAAACATTTCAATGC
TGGTGTGAGCTTCACCAAGGATGATTTGATTGCTTCTCTTACTCTGAATGACAAAGGTGA
GAAATTGAATGCATCGTACTACCACATTGTGAACCCATTGAAGAACACAGTGGTTGGAGC
CGAGGTTACCCACAGCTTGAAGAGCCAAGTGAACACGATAACCGTGGGTGCTCAGCACGC
TCTTGACCCATTGACCACGGTTAAGACACGCGTGAACAATGCTGGTATAGCCAACGCGCT
GATCCAACACGAATGGCGTCCGAAGTCGTTCATCACCATCTCTGGAGAGGTTGACTCTAA
GGCCATCGAGAAGAGTGCTAAAGTTGGATTTGCTCTCGCTCTCAAGCCTTGAGTGAAAGA
ACATGTCTTTCTAATCTTTTGGAACTAATCTCTGTCTGGTTTTTTCTTTTCCCTTTAAAA
ATTGTTCATTTGTTTTCTTTTACAAAATAAGAATAAGAAAAATACTATGAAAGGATCGTC
TTTGAAGATGAATC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 2 7

CO CL950Contig1 972 5 16 U
GGAGCTCCTAACATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCACTCTCTCTCACCTCCTCTCACCAAA
CCCACTTCAAATCCCTCTTCTATCGTCAGACCCATCTCTTCCCAGTCCACCAAGTTCACT
AAACCAGAATCTCTAGTTCTCCAAAACTTGTCAACCAATGCCAAACAGGCTTGTGCAGTT
GGGAGGAGAAACATGTTGATGAGTGGCTTGCTCATGTCTGGTTTAATGGTTTCAGAAGCC
AATCTTCCAACATCAGCATTTGCTTTGACTCCTGTGTTCAGAGAGTACATTGATACATTT
GATGGATACTCTTTCAAGTACCCTCAAAACTGGATCCAAGTCAGAGGAGCAGGGGCTGAC
ATATTCTTTAGAGACCCTATTGTCCTCGACGAGAACCTCTCTGTCGAGTTTTCCTCGCCT
TCTTCCTCGAAATACAAGTCTCTTGAGGACTTGGGCTCACCTGAAGAAGCAGGAAAGAGA
GTACTTAGACAGTACTTGACTGAGTTTATGTCCACTAGACTCGGTGTCAAGCGCGAGTCA
AACATCCTAACAACTTCCTCCAGAGTAGCAGATGACGGTAAACTCTACTACCAAGTTGAG
GTGAACATAAAGTCATACGCAAACAACAACGAGCTGGCTGTGATGCCGCAAGATAGAGTG
GCTCGTTTGGAATGGGACAGGCGTTACCTCGCGGTTCTAGGAGTTGAGAACAATAGACTC
TACTCATTGAGACTCCATACACCTGAGAAAGTTTTCCAGGAAGAAGAAAAAGATCTGAGA
AGAGTTATGGATTCGTTCAGAGTTGAGAAGATTTAGAGAGAGATATGTAGCAATTGGTTT
AGAAAAAATCTTGTTGCTACTTGCTGGTTATGTTCCTCCTCTCCTTCTATTTTTTTTTGT
AATCTTAAAGCATAAGACAAGCTAAGCTAAACGCTTTTTTTTACATGATTTAAAGCTTTC
AGATTCGTTTAT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 10 35 35 10 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2FO68TF U 11
AF RR2GE76TF U 2
AF RR2A489TF U 1
AF RR2A489JQ C 246
AF RR2CE11JQ C 247
BS 1 20 RR2A489TF
BS 21 21 RR2FO68TF
BS 22 34 RR2A489TF
BS 35 35 RR2FO68TF
BS 36 81 RR2A489TF
BS 82 82 RR2FO68TF
BS 83 84 RR2A489TF
BS 85 85 RR2FO68TF
BS 86 161 RR2A489TF
BS 162 162 RR2FO68TF
BS 163 170 RR2A489TF
BS 171 171 RR2FO68TF
BS 172 486 RR2A489TF
BS 487 487 RR2FO68TF
BS 488 753 RR2A489TF
BS 754 972 RR2A489JQ

RD RR2FO68TF 686 0 0
GG
ATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCACTCTCTCTCACCTCCTCTCACCAAACCCACTTCAAAT
CCCTCTTCTATCGTCAGACCCATCTCTTCCCAGTCCACCAAGTTCACTAAACCAGAATCT
CTAGTTCTCCAAAACTTGTCAACCAATGCCAAACAGGCTTGTGCAGTTGGGAGGAGAAAC
ATGTTGATGAGTGGCTTGCTCATGTCTGGTTTAATGGTTTCAGAAGCCAATCTTCCAACA
TCAGCAATTGCTTTGACGCCTGTGTTCAGAGAGTACATTGATACATTTGATGGATACTCT
TTCAAGTACCCTCAAAACTGGATCCAAGTCAGAGGATCAGGGGCTGACATATTCTTTAGA
GACCCTATTGTCCTCGACGATAACCTCGCTGTCGAGTTTTCCTCGCCTTCTTCCTCGAAA
TACAAGTCTCTTGAGGACTTGGGTTCACCTGAAGAAGCAGGAAAGAAAGTACTTAGACAG
TACTTGACTGAGTTTATGTCCACTAGACTCGGTGTCAAGCGCGAGTCTAACATCCTAACA
ACTTCCTCCAGAGTTGCGGAAGACGGTAAACTCTACTACCAAGTTGAGGTGAACATAAAG
TCATACGCAAACAACAACGAGCTGGCTGTGATGCCGCAAGATAGAGCGGCTCGTTTGGAA
TGGGACAG*CGTTACCTCGCGGTT

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR2GE76TF 675 0 0
GAGCTCCTAACATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCACTCTCTCTCACCTCCTCTCACCAAAC
CCACTTCAAATCCCTCTTCTATCGTCAGACCCATCTCTTCCCAGTCCACCAAGTTCACTA
AAC*AGAATCTCTAGTTCTCCAAAACTTGTCAACCAATGCCAAACAGGCTTGTGCAGTTG
GGAGGAGAAACATGTTGATGAGTGGCTTGCTCATGTCTGGTTTAATGGTTTCAGAAGCCA
ATCTTCCAACATCAGCAATTGCTTTGACGCCTGTGTTCAGAGAGTACATTGATACATTTG
ATGGATACTCTTTCAAGTACCCTCAAAACTGGATCCAAGTCAGAGGAGCAGGGGCTGACA
TATTCTTTAGAGACCCTATTGTCCTCGACGAGAACCTCGCTGTCGAGTTTTCCTCGCCTT
CTTCCTCGAAATACAAGTCTCTTGAGGACTTGGGTTCACCTGAAGAAGCAGGAAAGAAAG
TACTTAGACAGTACTTGACTGAGTTTATGTCCACTAGACTCGGTGTCAAGCGCGAGTCTA
ACATCCTAACAACTTCCTCCAGAGTTGCGGAAGACGGTAAACTCTACTACCAAGTTGAGG
TGAACATAAAGTCATACGCAAACAACAACGAGCTGGCTGTGATGCCGCAAGATAGAGTGG
CTCGTTTGGAATGGG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2A489TF 753 0 0
GGAGCTCCTAACATGGAGACTCTTCTCTCTCCTCGCTCTCTCTCACCTCCTCTCACCAAA
CCCACTTCAAATCCCTCTTCTTTCTTCAGACCCATCTCTTCCCAGTCCACCAAGTTCACT
AAACCAGAATCTCTAGTTCTCCAAAACTTGTCAACCAATGCTAAACAGGCATGTGCAGTT
GGGAGGAGAAACATGTTGATGAGTGGCTTGCTCATGTCTGGTTTAATGGTTTCAGAAGCC
AATCTTCCAACATCAGCATTTGCTTTGACTCCTGTGTTCAGAGAGTACATTGATACATTT
GATGGATACTCTTTCAAGTACCCTCAAAACTGGATCCAAGTCAGAGGAGCAGGGGCTGAC
ATATTCTTTAGAGACCCTATTGTCCTCGACGAGAACCTCTCTGTCGAGTTTTCCTCGCCT
TCTTCCTCGAAATACAAGTCTCTTGAGGACTTGGGCTCACCTGAAGAAGCAGGAAAGAGA
GTACTTGGACAGTACTTGACTGAGTTTATGTCCACTAGACTCGGTGTCAAGCGCGAGTCA
AACATCCTAACAACTTCCTCCAGAGTAGCAGATGACGGTAAACTCTACTACCAAGTTGAG
GTGAACATAAAGTCATACGCAAACAACAACGAGCTGGCTGTGATGCCGCAAGATAGAGTG
GCTCGTTTGGAATGGGACAGGCGTTACCTCGCGGTTCTAGGAGTTGAGAACAATAGACTC
TACTCATTGAGACTCCATACACCTGAGAAAGTT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2A489JQ 727 0 0
TCCAACATCAGCATTTGCTTTGACTCCTGTGTTCAGAGAGTACATTGATACATTTGATGG
ATACTCTTTCAAGTACCCTCAAAACTGGATCCAAGTCAGAGGAGCAGGGGCTGACATATT
CTTTAGAGACCCTATTGTCCTCGACGAGAACCTCTCTGTCGAGTTTTCCTCGCCTTCTTC
CTCGAAATACAAGTCTCTTGAGGACTTGGGCTCACCTGAAGAAGCAGGAAAGAGAGTACT
TGGACAGTACTTGACTGAGTTTATGTCCACTAGACTCGGTGTCAAGCGCGAGTCAAACAT
CCTAACAACTTCCTCCAGAGTAGCAGATGACGGTAAACTCTACTACCAAGTTGAGGTGAA
CATAAAGTCATACGCAAACAACAACGAGCTGGCTGTGATGCCGCAAGATAGAGTGGCTCG
TTTGGAATGGGACAGGCGTTACCTCGCGGTTCTAGGAGTTGAGAACAATAGACTCTACTC
ATTGAGACTCCATACACCTGAGAAAGTTTTCCAGGAAGAAGAAAAAGATCTGAGAAGAGT
TATGGATTCGTTCAGAGTTGAGAAGATTTAGAGAGAGATATGTAGCAATTGGTTTAGAAA
AAATCTTGTTGCTACTTGCTGGTTATGTTCCTCCTCTCCTTCTATTTTTTTTTGTAATCT
TAAAGCATAAGACAAGCTAAGCTAAACGCTTTTTTTTACATGATTTAAAGCTTTCAGATT
CGTTTAT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2CE11JQ 724 0 0
CCAACATCAGCATTTGCTTTGACTCCTGTGTTCAGAGAGTACATTGATACATTTGATGGA
TACTCTTTCAAGTACCCTCAAAACTGGATCCAAGTCAGAGGAGCAGGGGCTGACATATTC
TTTAGAGACCCTATTGTCCTCGACGAGAACCTCTCTGTCGAGTTTTCCTCGCCTTCTTCC
TCGAAATACAAGTCTCTTGAGGACTTGGGCTCACCTGAAGAAGCAGGAAAGAGAGTACTT
AGACAGTACTTGACTGAGTTTATGTCCACTAGGCTCGGTGTCTAGCGCGAGTCAAACATC
CTAACAACTTCCTCCAGAGTAGCAGATGACAGTAACCTCTACTACCAAGTTGAGGTGAAC
ATAAAGTCATACGCAAACAACAACGAGCTGGCTGTGATGCCGCAATATAGAGTGGCTCGT
TTGGAATGGGACAGGCGTTACCTCGCGGTTCTAGGAGTTGAGAACAATAGACTCTACTCA
TTGAGACTCCAAACACCTGAGAAAGTTTTCCAGGAAGAAGAAAAAGATCTGAGAAGAGTT
ATGGATTCGTTCAGAGTTGAGAAGATTTAGAGAGAGATATGTAGCAATTGGTTTAGAAAA
AATCTTGTTGCTGCTTGCTGGTTATGTTCCTCCTCTCCTTCTATTTTTTTTTGTAATCTT
AAAGCATAAGACAAGCTAAGCTAAACGCTTTTTTT*ACATGATTTAAAGCTTTCAGATTC
G
TCT

QA 1 721 1 721
DS 



CO CL950Contig2 1113 2 4 U
GGCGAATCTCAAAGCTTTAAATCATGTAAAAAAGGAGTTTAGCTTAGCTTGTCTTATGCT
TTAAGATTACAAAAAAAAGATAGAACGAGAGGAGGAACATAACCAGCAACAAGATTTTTT
CTAAACCAATGGCTACATATCTCTCTCTAAATCTTCTCGACTCTGAACGAATCCATAACT
CTTCTCAGATCTTTTTCTTCTTCCTGGAAAACTTTCTCAGGTGTTTGGAGTCTCAATGAG
TAGAGTCTATTGTTCTCAACTCCTAAAACCGCGAGGTAACGCCTGTCCCATTCCAAACGA
GCCACTCTATCTTGCGGCATCACAGCCAGCTCGTTGTTGTTTGCGTATGACTTTATGTTC
ACCTCAACTTGGTAGTAGAGTTAACCGTCTTCCGCAACTCTGGAGGAAGTTGTTAGGATG
TTAGACTCGCGCTTGACACCGAGTCTAGTGGACATAAACTCAGTCAAGTACTGTCTAAGT
ACTTTCTTTCCTGCTTCTTCAGGTGAACCCAAGTCCTCAAGAGACTTGTATTTCGAGGAA
GAAGGCGAGGAAAACTCGACAGCGAGGTTCTCGTCGAGGACAATAGGGTCTCTAAAGAAT
ATGTCAGCCCCTGTTCCTCTGACTCGGATCCAGTTTTGAGGGTACTTGAAAGAGTATCCA
TAAAATGTATCAATGTACTCTCTGAACACAGGCGTCAAAGCAATTGCTGATGTTGGAAGA
TTGGCTTCTGAAACCATTAAACCAGACATGAGCAAGCCACTCATCAACATGTTTCTCCTC
CCAACCGCACAAGCCTTAAGAAACGGTGTCAATATAAACAATCATCAAACACTAAGATTA
TATGAAAAAAAAAGTCATTAGTTCTGAACAGTACCCATTTTGTCAAGAAGAGACACATAT
GGTAAAACCTAAAAGCAGAGGATTGAACCAAAGTGATGAAATATACCTGTTTGGCATTGG
TTGACAAGTTTTGGAGAACTAGAGATTCTGGTTTAGTGAACTTGGTGGACTGGGAAGAGA
TGGGTCTGACGATAGAAGAGGGATTTGAAGTGGGTTTGGTGAGAGGAGGTGAGAGAGAGT
GAGGAGAGAGAAGGGTCTCCATGTTAGGAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE76JQ U 1
AF RR2DP32TF C 343
BS 1 382 RR2GE76JQ
BS 383 383 RR2DP32TF
BS 384 548 RR2GE76JQ
BS 549 1113 RR2DP32TF

RD RR2GE76JQ 548 0 0
GGCGAATCTCAAAGCTTTAAATCATGTAAAAAAGGAGTTTAGCTTAGCTTGTCTTATGCT
TTAAGATTACAAAAAAAAGATAGAACGAGAGGAGGAACATAACCAGCAACAAGATTTTTT
CTAAACCAATGGCTACATATCTCTCTCTAAATCTTCTCGACTCTGAACGAATCCATAACT
CTTCTCAGATCTTTTTCTTCTTCCTGGAAAACTTTCTCAGGTGTTTGGAGTCTCAATGAG
TAGAGTCTATTGTTCTCAACTCCTAAAACCGCGAGGTAACGCCTGTCCCATTCCAAACGA
GCCACTCTATCTTGCGGCATCACAGCCAGCTCGTTGTTGTTTGCGTATGACTTTATGTTC
ACCTCAACTTGGTAGTAGAGTTTACCGTCTTCCGCAACTCTGGAGGAAGTTGTTAGGATG
TTAGACTCGCGCTTGACACCGAGTCTAGTGGACATAAACTCAGTCAAGTACTGTCTAAGT
ACTTTCTTTCCTGCTTCTTCAGGTGAACCCAAGTCCTCAAGAGACTTGTATTTCGAGGAA
GAAGGCGA

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2DP32TF 771 0 0
CAATTTAGAATTTGGCTTT
CCTCAACTTGGTAGTAGAGTTA**CGTCT*CCGCAACTCTGGAGGAAGTTGTTAGGATGT
TAGACTCGCGCTTGACACCGAGTCTAGTGGACATAAACTCAGTCAAGTACTGTCTAAGTA
CTTTCTTTC*TGCTTCTTCAGGTGAACCCAAGTCCTCAAGAGACTTGTATTTCGAGGAAG
AAGGCGAGGAAAACTCGACAGCGAGGTTCTCGTCGAGGACAATAGGGTCTCTAAAGAATA
TGTCAGCCCCTGTTCCTCTGACTCGGATCCAGTTTTGAGGGTACTTGAAAGAGTATCCAT
AAAATGTATCAATGTACTCTCTGAACACAGGCGTCAAAGCAATTGCTGATGTTGGAAGAT
TGGCTTCTGAAACCATTAAACCAGACATGAGCAAGCCACTCATCAACATGTTTCTCCTCC
CAACCGCACAAGCCTTAAGAAACGGTGTCAATATAAACAATCATCAAACACTAAGATTAT
ATGAAAAAAAAAGTCATTAGTTCTGAACAGTACCCATTTTGTCAAGAAGAGACACATATG
GTAAAACCTAAAAGCAGAGGATTGAACCAAAGTGATGAAATATACCTGTTTGGCATTGGT
TGACAAGTTTTGGAGAACTAGAGATTCTGGTTTAGTGAACTTGGTGGACTGGGAAGAGAT
GGGTCTGACGATAGAAGAGGGATTTGAAGTGGGTTTGGTGAGAGGAGGTGAGAGAGAGTG
AGGAGAGAGAAGGGTCTCCATGTTAGGAGCTC

QA 20 771 20 771
DS 



AS 2 7

CO CL951Contig1 547 2 2 U
GGAGGGGATTGATAGAGCTTTATCTTCACCGTTGGCTTCACTCGACGGAGGTTCAGAATC
ACCAGAGACTGTGAGGATGAGGATAATTTCAATGGCGTCCACCACCACCATCCGACCTTC
CCTGGGCTGCTTCTCTGCATCTCCTCGCTTCCCCTTCGTCTCCTCCCGGAATCTCTCTCG
CCCCACCCTCTCTTCTTTCTCCCATGTTAATCAGTCAAAGCCTTTGACTGTGAGAAGAGG
CGTAAGGTGCTTAGGAGTAGCTGAATCAGGAAACGCGGCTCAAGCAGTTACGGAAGAGGA
TCTTCTCAAGTGGGTCAAAAATGATAACAGAAGAATGCTTCATGTCGTTTACCGTGTTGG
CGATTTGGACCGGACTATTAAATTCTATACGGAATGTCTTGGGATGAAGCTTCTACGCAA
GCGTGATATTCCGGAAGAGAAGTATACTAATGCTTTCCTTGGTTATGGTCCTGAAGATTC
ACACTTCGTCATTGAGCTCACTTATAATTATGGAGTTGACAAGTATGACATTGGGGCAGG
TTTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD73TF U 1
AF RR2FA60TF U 10
BS 1 535 RR2DD73TF
BS 536 547 RR2FA60TF

RD RR2DD73TF 535 0 0
GGAGGGGATTGATAGAGCTTTATCTTCACCGTTGGCTTCACTCGACGGAGGTTCAGAATC
ACCAGAGACTGTGAGGATGAGGATAATTTCAATGGCGTCCACCACCACCATCCGACCTTC
CCTGGGCTGCTTCTCTGCATCTCCTCGCTTCCCCTTCGTCTCCTCCCGGAATCTCTCTCG
CCCCACCCTCTCTTCTTTCTCCCATGTTAATCAGTCAAAGCCTTTGACTGTGAGAAGAGG
CGTAAGGTGCTTAGGAGTAGCTGAATCAGGAAACGCGGCTCAAGCAGTTACGGAAGAGGA
TCTTCTCAAGTGGGTCAAAAATGATAACAGAAGAATGCTTCATGTCGTTTACCGTGTTGG
CGATTTGGACCGGACTATTAAATTCTATACGGAATGTCTTGGGATGAAGCTTCTACGCAA
GCGTGATATTCCGGAAGAGAAGTATACTAATGCTTTCCTTGGTTATGGTCCTGAAGATTC
ACACTTCGTCATTGAGCTCACTTATAATTATGGAGTTGACAAGTATGACATTGGG

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2FA60TF 538 0 0
G
GATAGAGCTTTATCTTCACCGTTGGCTTCACTCGACGGAGGTTCAGAATCACCAGAGACT
GTGATGATGAGGATAATTTCAATGGCGTCCACCACCACCATCCGACCTTCCCTGGGCTGC
TTCTCTGCATCTCCTCGCTTCCCCTTCGTCTCCTCCCGGAATCTCTCTCGCCCCACCCTC
TCTTCTTTCTCCCATGTTAATCAGTCAAAGCCTTTGACTGTGAGAAGAGGCGTAAGGTGC
TTAGGAGTAGCTGAATCAGGAAACGCGGCTCAAGCAGTTACGGAAGAGGATCTTCTCAAG
TGGGTCAAAAATGATAACAGAAGAATGCTTCATGTCGTTTACCGTGTTGGCGATTTGGAC
CGGACTATTAAATTCTATACGGAATGTCTTGGGATGAAGCTTCTACGCAAGCGTGATATT
CCGGAAGAGAAGTATACTAATGCTTTCCTTGGTTATGGTCCTGAAGATTCACACTTCGTC
ATTGAGCTCACTTATAATTATGGAGTTGACAAGTATGACATTGGGGCAGGTTTTGGT

QA 2 538 2 538
DS 



CO CL951Contig2 876 5 38 U
GGTTCTTATCGATCATTCATTTATCATTTTATTTCAACGGCAATAATGGTTCAAGTAAAA
CTGATATACAAGACGCAACATGGGACAATTCTGTAGAATAACTACACTGAACTCTGAAAA
ACAAATCATTCACTTTGAACAAACTAGATACTCACACTGAGAGATAAGATATACGAAACC
CCAGCTGATGTAAAAACGAAAAACCCATTCTCCTGTTTCCTTCATAGCTATGAAACTAGC
CATTTTGGTGGCCTCCTTTCTCATCTCACTCCAGTTCTTTGAGAAAGTCAACGTTGTCCA
CAAACACCGACTTCCAACCATCAGGATCCAAACACGCGGTGATCTTCGTGCTTATACCTG
GTAAGGGACCAGGTTCCCTCGTGATTTTCCCACCAAAGAGTTTTACAGCCTCTGCGGTTT
TGTACACGTCATCCGTCCCTATTGCAATCTGAGCATAAGCATTTCCTTTATCATATTCAG
TGACACCATAGTTATATGTCAGCTCCAGGACTGCAGTTTTATCTTCTGGACCATATCCCA
TCATAGCTATCGTGTACTTGTACTCTGGGTTGTCTCTTGTGCGCAGAAGCTCCATTCCAA
AAGCCTTCTCATAGAATTTGATGGACTTGTCGAGATCACCAACACGGAGCATAACTTGAC
AAAGAGGTTCAGGTGTAGGACCTCTCTCCAAGAGTTCAAATTTGTAACCATCAGGATCTT
CAATGAAAGCGATTACAGTTTTGCCACCTTTGACAGCACCAGGCTCCCTTGTTACTTTCC
CTCCCTTGGCTTTTATCAGTTCTACAGTTTTCGCCACGTCGTCGACAGCAATACCAAAGT
GACCAAAACCAGCCCCAATGTCATACTTGTCAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CN12JQ U 48
AF RR2CN12TF C 48
AF RR2FA60JQ U 1
AF RR2DD73JQ U 5
AF RR2AN53JQ U 3
BS 1 85 RR2FA60JQ
BS 86 86 RR2AN53JQ
BS 87 89 RR2FA60JQ
BS 90 90 RR2AN53JQ
BS 91 113 RR2FA60JQ
BS 114 114 RR2AN53JQ
BS 115 146 RR2FA60JQ
BS 147 147 RR2AN53JQ
BS 148 153 RR2FA60JQ
BS 154 154 RR2AN53JQ
BS 155 166 RR2FA60JQ
BS 167 167 RR2AN53JQ
BS 168 175 RR2FA60JQ
BS 176 176 RR2AN53JQ
BS 177 202 RR2FA60JQ
BS 203 203 RR2AN53JQ
BS 204 208 RR2FA60JQ
BS 209 209 RR2AN53JQ
BS 210 262 RR2FA60JQ
BS 263 263 RR2AN53JQ
BS 264 264 RR2FA60JQ
BS 265 265 RR2AN53JQ
BS 266 322 RR2FA60JQ
BS 323 323 RR2AN53JQ
BS 324 397 RR2FA60JQ
BS 398 398 RR2AN53JQ
BS 399 487 RR2FA60JQ
BS 488 520 RR2AN53JQ
BS 521 521 RR2DD73JQ
BS 522 550 RR2AN53JQ
BS 551 551 RR2DD73JQ
BS 552 685 RR2AN53JQ
BS 686 686 RR2DD73JQ
BS 687 697 RR2AN53JQ
BS 698 698 RR2DD73JQ
BS 699 727 RR2AN53JQ
BS 728 728 RR2DD73JQ
BS 729 876 RR2AN53JQ

RD RR2CN12JQ 385 0 0
GGTTCAAGTAAAACTGATATACAAGACGCAACATGGGACAATTCTGTAGAATAACTACAC
TGAACTCTGAAAAACAAATCATTCACTTTGAACAAACTAAATACTCCCACTGAGAGATAA
AATATACGAAACCCCAGCTGATGTAAAAACAAAAAACCCATTCTCCTGTTTCCTTCATAG
CTATGAAACTAGCCATTTTGGGGGCCTCCTTTCTCATCTCACTCCAGTTCTTTGAAAAAG
TCAACGTTGTCCACAAACACCGACTTCCAACCATCAGGATCCAAACACGCGGTGATCTTC
GTGCTTATACCTGGTAAGGGACCAGGTTCCCTCGTGATTTTCCCACCAAAAAGTTTTACA
GCCTCTGCGGTTTTGTACACGTCA
C

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR2CN12TF 385 0 0
GGTTCAAGTAAAACTGATATACAAGACGCAACATGGGACAATTCTGTAGAATAACTACAC
TGAACTCTGAAAAACAAATCATTCACTTTGAACAAACTAGATACTCACACTGAGAGATAA
GATATACGAAACCCCAGCTGATGTAAAAACGAAAAACCCATTCTCCTGTTTCCTTCATAG
CTATGAAACTAGCCATTTTGGTGGCCTCCTTTCTCATCTCACTCCAGTTCTTTGAGAAAG
TCAACGTTGTCCACAAACACCGACTTCCAACCATCAGGATCCAAACACGCGGTGATCTTC
GTGCTTATACCTGGTAAGGGACCAGGTTCCCTCGTGATTTTCCCACCAAAGAGTTTTACA
GCCTCTGCGGTTTTGTACACGTCA
C

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR2FA60JQ 487 0 0
GGTTCTTATCGATCATTCATTTATCATTTTATTTCAACGGCAATAATGGTTCAAGTAAAA
CTGATATACAAGACGCAACATGGGATAATCCTGTAGAATAACTACACTGAACTTTGAAAA
ACAAATCATTCACTTTGAACAAACTAAATACTCCCACTGAGAGATA*GATATACGGAACC
CCAGCTGATGTAAAAACGAAAATCCCATCCTCCTGTTTCCTTCATAGCTATGAAACTAGC
CATTTTGGTGGCCTCCTTTCTCCTATCACTCCAGTTCTTTGAGAAAGTCAACGTTGTCCA
CAAACACCGACTTCCAACCATCGGGATCCAAACACGCGGTGATCTTCGTGCTTATACCTG
GTAAGGGACCAGGTTCCCTCGTGATTTTCCCACCAAAAAGTTTTACAGCCTCTGCGGTTT
TGTACACGTCATCCGTCCCTATTGCAATCTGAGCATAAGCATTTCCTTTATCATATTCAG
TGACACC

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR2DD73JQ 792 0 0
CC
TATCGATCATTCATTTATCATTTTATTTCAACGGCAATAATGGTTCAAGTAAAACTGATA
TACAAGACGCAACATGGGATAATCCTGTAGAATAACTACACTGAACTTTGAAAAACAAAT
CATTCACTTTGAACAAACTAGATACTCACACTGAGAGATA*GATATACGAAACCCCAGCT
GATGTAAAAACGAAAATCCCATCCTCCTGTTTCCTTCATAGCTATGAAACTAGCCATTTT
GGTGGCCTCCTTTCTCCTATCACTCCAGTTCTTTGAGAAAGTCAACGTTGTCCACAAACA
CCGACTTCCAACCATCGGGATCCAAACACGCGGTGATCTTCGTGCTTATACCTGGTAAGG
GACCAGGTTCCCTCGTGATTTTCCCACCAAAGAGTTTTACAGCCTCTGCGGTTTTGTACA
CGTCATCCGTCCCTATTGCAATCTGAGCATAAGCATTTCCTTTATCATATTCAGTGACAC
CATAGTTATATGTCAGCTCCAGGACTGCAGTTTTATCTTCTGGACCATATCCCATCATGG
CTATCGTGTACTTGTACTCTGGGTTGTCTCTTGTGCGCAGAAGCTCCATTCCAAAAGCCT
TCTCATAGAATTTGATGGACTTGTCGAGATCACCAACACGGAGCATAACTTGACAAAGAG
GTTCAGGTGTAGGACCTCTCTCCAAGAGTTCAAATTTGTAACCATCAGGATCTTCAATGA
AAGCGATTACAGTTTTGCCACCTTTGACAGCACCAGGCTCCCTTGTTACTTTCCCTCCCT
TGGCTTTTAT

QA 3 792 3 792
DS 

RD RR2AN53JQ 874 0 0
TTCT
TATCTATCATTCATTTATCATCTTATTTCAACGGCAATAATGGTTCAAGTAAAACTGATA
TACAAGACGCAACATGGGACAATTCTGTAGAATAACTACACTGAACTCTGAAAAACAAAT
CATTCACTTTGAACAAACTAGATACTCACACTGAGAGATAAGATATACGAAACCCCAGCT
GATGTAAAAACGAAAAACCCATTCTCCTGTTTCCTTCATAGCTATGAAACTAGCCATTTT
GGTGGCCTCCTTTCTCATCTCACTCCAGTTCTTTGAGAAAGTCAACGTTGTCCACAAACA
CCGACTTCCAACCATCAGGATCCAAACACGCGGTGATCTTCGTGCTTATACCTGGTAAGG
GACCAGGTTCCCTCGTGATTTTCCCACCAAAGAGTTTTACAGCCTCTGCGGTTTTGTACA
CGTCATCCGTCCCTATTGCAATCTGAGCATAAGCATTTCCTTTATCATATTCAGTGACAC
CATAGTTATATGTCAGCTCCAGGACTGCAGTTTTGTCTTCTGGACCATATCCCATCATAG
CTATTGTGTACTTGTACTCTGGGTTGTCTCTTGTGCGCAGAAGCTCCATTCCAAAAGCCT
TCTCATAGAATTTGATGGACTTGTCGAGATCACCAACACGGAGCATAACTTGACAAAGAG
GTTCAGGTGTAGGACCTCTTTCCAAGAGTTCGAATTTGTAACCATCAGGATCTTCAATGA
AGGCGATTACAGTTTTGCCACCTTTGACAGCACCAGGCTCCCTTGTTACTTTCCCTCCCT
TGGCTTTTATCAGTTCTACAGTTTTCGCCACGTCGTCGACAGCAATACCAAAGTGACCAA
AACCAGCCCCAATGTCATACTTGTCAACTC

QA 5 874 5 874
DS 



AS 1 7

CO CL952Contig1 849 7 20 U
GATCATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTCGAAAAACAAAATTCTCTCTCGCTCGTGATGG
GATTGCTCGATCTGGAGAAGCACTTCGCCTTCTACGGCGCATACCACAGCAACCCAATCA
ACATCGCGATCCACATCATCTTCGTATGGCCCATCGTCTTCACAGCCTTGCTTCTCCTCT
ACCCAGCTTCCCCGATTTACGACCTTTCTCAATTAGGGTTTCCTCAGTCGATGACCCTCG
ACGGCGTTCTGAGGTTAGACGTCGGGTTTGCCGTCACGGTGGCTTATGCTCTGTTCTACA
TCTGTTTGGATAAGAAATCCGGGTTCGTCGCGGCTCTCATGTGTTTCGCTTGCTGGGTCG
GGTCCAGTGTCCTCGCTGATCGGTTAGGACCTTCTCTTGCCGTAAAGGTTGGGTTAGCAT
CTCAGCTGTTATGTTGGACCGGGCAGTTTCTTGGCCATGGATTGTTCGAGAAACGAGCAC
CTGCGCTTTTAGACAATCTAGCCCAAGCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTTG
AGATTCTTCAAATGGTTTTCGGGTACGAGCCATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGTGAATG
CCAAGGTAGAAAGTAGCATAAAGGAATGGAGAGAAAAGAAGCAGACGAAGAATAATAAGC
TCACATAAGCTTTGGATTAATATAACTGAAGAACCTAAAACCCATTGTCATGTTTATTAC
ATTAAAACCCCACGTAATAATAAGACCACCATTGATTGATGGGTTTGTGTATAACTATGT
TTCAATATAGTTGACAAAAAAAACTGCGTTTCAATTCAATATGTTGAACGGAACTTCAAA
GTTGAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ28JQ C 447
AF RR2E860TF U 280
AF RR2H292TF U 51
AF RR2GI64TF U 51
AF RR2BB54TF U 1
AF RR2EJ76JQ C 252
AF RR2BB54JQ C 295
BS 1 196 RR2BB54TF
BS 197 197 RR2GI64TF
BS 198 227 RR2BB54TF
BS 228 228 RR2GI64TF
BS 229 268 RR2BB54TF
BS 269 269 RR2GI64TF
BS 270 292 RR2BB54TF
BS 293 293 RR2GI64TF
BS 294 358 RR2BB54TF
BS 359 359 RR2GI64TF
BS 360 429 RR2BB54TF
BS 430 430 RR2GI64TF
BS 431 575 RR2BB54TF
BS 576 576 RR2GI64TF
BS 577 645 RR2BB54TF
BS 646 646 RR2GI64TF
BS 647 697 RR2BB54TF
BS 698 698 RR2GI64TF
BS 699 794 RR2BB54TF
BS 795 849 RR2BB54JQ

RD RR2EJ28JQ 141 0 0
TTTT
TTGGCCATGGATTGTTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTTTTAGACAATTTAGCCCAAGCTT
TTTTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTTGAGATTCTTCAAATGGTTTTCGGGTACGAGC
CATATCCAGGTTTTCAA

QA 5 141 5 141
DS 

RD RR2E860TF 284 0 0
G
GGCTTATGCTCTGTTCTACATCTGTTTGGATAAGAAATCCGGGTTCGTTGCGGCTCTCAT
GTGTTTCGCTTGCTGGGTTGGGTCCAGTGTCCTCGCTGTTCGGTTAGGACCTTCTCTTGC
CGTAAAGGTTGGGTTAGCATCTCAGCTGTTATGTTGGACTGGTCAGTTTCTTGGCCATGG
ATTGTTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTTTTAGACGATCTAGCCCAAGCTTTTCTCATGGC
TCCTTTCTTTGTGTTGCTTGAGATTCTTCAAATGGTTTTCGGG

QA 2 284 2 284
DS 

RD RR2H292TF 550 0 0
GGAAA
GATGGGATTGCTCGATCTGGAGAAGCACTTCGCCTTCTACGGCGCATACCACAGCAACCC
AATCAACATCGCGATCCACATCATCTTCGTATGGCCCATCGTCTTCACAGCCTTGCTTCT
CCTCTACCCAGCTTCCCCGATTTACGACCTTTCTCAATTAGGGTTTCCTCAGTCGATGAC
CCTCGACGGCGTTCTGAGGTTAGACGTCGGGTTTGCCGTCACGGTGGCTTATGCTCTGTT
CTACATCTGTTTGGATAAGAAATCCGGGTTCGTCGCGGCTCTCATGTGTTTCGCTTGCTG
GGTCGGGTCCAGTGTCCTCGCTGATCGGTTAGGACCTTCTCTTGCCGTAAAGGTTGGGTT
AGCATCTCAGCTGTTATGTTGGACCGGGCAGTTTCTTGGCCATGGATTGTTCGAGAAACG
AGCACCTGCGCTTTTAGACAATCTAGCCCAAGCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTT
GCTTGAGATTCTTCAAATGGTTTTCGGGTACGAGCCATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGT
GAATG

QA 6 550 6 550
DS 

RD RR2GI64TF 685 0 0
GGAAA
GATGGGATTGCTCGATCTGGAGAAGCACTTCGCCTTCTACGGCGCATACCACAGCAACCC
AATCAACATCGCGATCCACATCATCTTCGTATGGCCCATCGTCTTCACAGCCTTGCTTCT
CCTCTACCCAGCTTCCCCGATTTACGACCTTTCTCAATTAGGGTTTCCTCAGTCGATGAC
CCTCGACGGCGTTCTGAGGTTAGACGTCGGGTTTGCCGTCACGGTGGCTTATGCTCTGTT
CTACATCTGTTTGGATAAGAAATCCGGGTTCGTCGCGGCTCTCATGTGTTTCGCTTGCTG
GGTCGGGTCCAGTGTCCTCGCTGATCGGTTAGGACCTTCTCTTGCCGTAAAGGTTGGGTT
AGCATCTCAGCTGTTATGTTGGACCGGGCAGTTTCTTGGCCATGGATTGTTCGAGAAACG
AGCACCTGCGCTTTTAGACAATCTAGCCCAAGCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTT
GCTTGAGATTCTTCAAATGGTTTTCGGGTACGAGCCATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGT
GAATGCCAAGGTAGAAAGTAGCATAAAGGAGTGGAGAGAAAAGAAGCAGACGAAGAATAA
TAAGCTCACATAAGCTTTGGATTAATATAACTGAAGAACCTAAAACCCATTGTCATGTTT
ATTACATTAAAACCCCACGT

QA 6 685 6 685
DS 

RD RR2BB54TF 794 0 0
GATCATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTCGAAAAACAAAATTCTCTCTCGCTCGTGATGG
GATTGCTCGATCTGGAGAAGCACTTCGCCTTCTACGGCGCATACCACAGCAACCCAATCA
ACATCGCGATCCACATCATCTTCGTATGGCCCATCGTCTTCACAGCCTTGCTTCTCCTCT
ACCCAGCTTCCCCGATCTACGACCTTTCTCAATTAGGGTTTCCTCAGCCGATGACCCTCG
ACGGCGTTCTGAGGTTAGACGTCGGGTTCGCCGTCACGGTGGCTTATGCTCTCTTCTACA
TCTGTTTGGATAAGAAATCCGGGTTCGTCGCGGCTCTCATGTGTTTCGCTTGCTGGGTTG
GGTCCAGTGTCCTCGCTGATCGGTTAGGACCTTCTCTTGCCGTAAAGGTTGGGTTAGCAT
CTCAGCTGTCATGTTGGACCGGGCAGTTTCTTGGCCATGGATTGTTCGAGAAACGAGCAC
CTGCGCTTTTAGACAATCTAGCCCAAGCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTTG
AGATTCTTCAAATGGTTTTCGGGTACGAGCCATATTCAGGTTTTCAAGCTCGTGTGAATG
CCAAGGTAGAAAGTAGCATAAAGGAATGGAGAGAAAAGAAGCAGATGAAGAATAATAAGC
TCACATAAGCTTTGGATTAATATAACTGAAGAACCTATAACCCATTGTCATGTTTATTAC
ATTAAAACCCCACGTAATAATAAGACCACCATTGATTGATGGGTTTGTGTATAACTATGT
TTCAATATAGTTGA

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2EJ76JQ 544 0 0
AGGTTAGACGTCGGGTTTGCCGTCACGGTGGCTTATGCTCTGTTCTACATCTGTTTGGAT
AAGAAATCCGGGTTCGTCGCGGCTTTCATGTGTTTCGCTTGCTGGGTCGGGTCCAGTGTC
CTCGCTGATCGGTTAGGACCTTCTCTTGCCGTAAAGGTTGGGTTAGCATTTCAGCTGTTA
TGTTGGACCGGGCAGTTTTTTGGCCATGGATTGTTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTTTTA
GACAATCTAGCCCAAGCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTTGAGATTCTTCAA
ATGGTTTTCGGGTACGAGCCATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGTGAATGCCAAGGTAGAA
AGTAGCATAAAGGAATGGAGAGAAAAGAAGCAGACGAAGAATAATAAGCTCACATAAGCT
TTGGATTAATATAACTGAAGAACCTAAAACCCATTGTCATGTTTATTACATTAAAACCCC
ACGTAATAATAAGACCACCATTGATTGATGGGTTTGTGTATAACTATGTTTCAATATAGT
TGA
C

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2BB54JQ 555 0 0
TCTACATCTGTTTGGATAAGAAATCCGGGTTCGTCGCGGCTCTCATGTGTTTCGCTTGCT
GGGTTGGGTCCAGTGTCCTCGCTGATCGGTTAGGACCTTCTCTTGCCGTAAAGGTTGGGT
TAGCATTTCAGCTGTCATGTTGGACCGGGCAGTTTTTTGGCCATGGATTGTTCGAGAAAC
GAGCACCTGCGCTTTTAGACAATCTAGCCCAAGCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGT
TGCTTGAGATTCTTCAAATGGTTTTCGGGTACGAGCCATATTCAGGTTTTCAAGCTCGTG
TGAATGCCAAGGTAGAAAGTAGCATAAAGGAATGGAGAGAAAAGAAGCAGATGAAGAATA
ATAAGCTCACATAAGCTTTGGATTAATATAACTGAAGAACCTATAACCCATTGTCATGTT
TATTACATTAAAACCCCACGTAATAATAAGACCACCATTGATTGATGGGTTTGTGTATAA
CTATGTTTCAATATAGTTGACAAAAAAAACTGCGTTTCAATTCAATATGTTGAACGGAAC
TTCAAAGTTGAACAC

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 7

CO CL953Contig1 812 7 7 U
GGGATCTCATCTCTTTCTCTCTTGAAATCTCCACGACTCCGTCTTCTTCTCTTCTCCTCT
CTTTTTGCCGTCCATTTGAAGTTCGGTTGAAGTTATTGTTTTCTTCCAATTGCAATTGCT
CTTTCTCAAACTTTTCTGAGCTGATTATTGCTTCTCGCCGATTTGATTCTCGCCGTTGTG
CCTTATTTTCGGAATCATCGAAGCAATCTTCAATTTCTCTTTCGATTTTGTAGGAGGAAG
AGCTCGGCAAAGCAATCATCTTGTTTTTTTCCTATATTTCAACAACACTTTCAACCAACA
CTTTTTGGGTCTTGTTGTTGTTGTTCTGTTCTCTCTGTTTTTGTTTTCGTTGCTTCTCTT
TTCTCTTCTCTTTAGATCTTTAAAGACTTTGTTGGGTTTTGTAGGATGTTTGGATCCAGA
GAATTTTAAGGAGTTCAAACTTGTTAAGAAGCAGCAACTTAGTGTGTTTGACCATTGGAG
AACATATCAGTTACAGTTTGCTCAGTTTCGTTGAAGCTGTATTATCAAATGGATGATGGT
GGGCATCGTGACAATGGTTGGCATAAAGCATCTCAGGGCAAGCAGTGGATGATGCAGCAA
CAGCAGCAACAACACCAACCATCGATGAAACAAGTGATGTCGATCATAACAGCACAACTG
TCGTTATATGCTACTTGGTTTGTCTTGCAATTAATAAGAGTGAACCAACTTTTAGGAGAG
TTTATTTCAGATGAACTTGTTCTCATCATCCGTGTTAGATACAGAAAAATCCTTGAATTG
AGTTGTTGCTTGTTGGTAACTAATATTACTAC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BL76TF U 1
AF RR2G863TF U 65
AF RR2G253TF U 2
AF RR2GF82TF U 2
AF RR2BL76JQ C 116
AF RR2G863JQ C 343
AF RR2H564JQB C 221
BS 1 574 RR2BL76TF
BS 575 680 RR2G253TF
BS 681 681 RR2GF82TF
BS 682 689 RR2G253TF
BS 690 690 RR2BL76JQ
BS 691 707 RR2G253TF
BS 708 812 RR2BL76JQ

RD RR2BL76TF 574 0 0
GGGATCTCATCTCTTTCTCTCTTGAAATCTCCACGACTCCGTCTTCTTCTCTTCTCCTCT
CTTTTTGCCGTCCATTTGAAGTTCGGTTGAAGTTATTGTTTTCTTCCAATTGCAATTGCT
CTTTCTCAAACTTTTCTGAGCTGATTATTGCTTCTCGCCGATTTGATTCTCGCCGTTGTG
CCTTATTTTCGGAATCATCGAAGCAATCTTCAATTTCTCTTTCGATTTTGTAGGAGGAAG
AGCTCGGCAAAGCAATCATCTTGTTTTTTTCCTATATTTCAACAACACTTTCAACCAACA
CTTTTTGGGTCTTGTTGTTGTTGTTCTGTTCTCTCTGTTTTTGTTTTCGTTGCTTCTCTT
TTCTCTTCTCTTTAGATCTTTAAAGACTTTGTTGGGTTTTGTAGGATGTTTGGATCCAGA
GAATTTTAAGGAGTTCAAACTTGTTAAGAAGCAGCAACTTAGTGTGTTTGACCATTGGAG
AACATATCAGTTACAGTTTGCTCAGTTTCGTTGAAGCTGTATTATCAAATGGATGATGGT
GGGCATCGTGACAATGGTTGGCATAAAGCATCTC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2G863TF 509 0 0
GG
GCCGTCCATTTGAAGTTCGGTTGAAGTTATTGTTTTCTTCCAATTGCAATTGCTCTTTCT
CAAACTTTTCTGAGCTGATTATTGCTTCTCGCCGATTTGATTCTCGCCGTTGTGCCTTAT
TTTCGGAATCATCGAAGCAATCTTCAATTTCTCTTTCGATTTTGTAGGAGGAAGAGCTCG
GCAAAGCAATCATCTTGTTTTTTTCCTATATTTCAACAACACTTTCAACCAACACTTTTT
GGGTCTTGTTGTTGTTGTTCTGTTCTCTCTGTTTTTGTTTTCGTTGCTTCTCTTTTCTCT
TCTCTTTAGATCTTTAAAGACTTTGTTGGGTTTTGTAGGATGTTTGGATCCAGAGAATTT
TAAGGAGTTCAAACTTGTTAAGAAGCAGCAACTTAGTGTGTTTGACCATTGGAGAACATA
TCAGTTACAGTTTGCTCAGTTTCGTTGAAGCTGTATTATCAAATGGATGATGGTGGGCAT
CGTGACAATGGTTGGCATAAAGCATCT

QA 3 509 3 509
DS 

RD RR2G253TF 716 0 0
GGATCTCATCTCTTTCTCTCTTGAAATCTCCACGACTCCGTCTTCTTCTCTTCTCCTCTC
TTTTTGCCGTCCATTTGAAGTTCGGTTGAAGTTATTGTTTTCTTCCAATTGCAATTGCTC
TTTCTCAAACTTTTCTGAGCTGATTATTGCTTCTCGCCGATTTGATTCTCGCCGTTGTGC
CTTATTTTCGGAATCATCGAAGCAATCTTCAATTTCTCTTTCGATTTTGTAGGAGGAAGA
GCTCGGCAAAGCAATCATCTTGTTTTTTTCCTATATTTCAACAACACTTTCAACCAACAC
TTTTTGGGTCTTGTTGTTGTTGTTCTGTTCTCTCTGTTTTTGTTTTCGTTGCTTCTCTTT
TCTCTTCTCTTTAGATCTTTAAAGACTTTGTTGGGTTTTGTAGGATGTTTGGATCCAGAG
AATTTTAAGGAGTTCAAACTTGTTAAGAAGCAGCAACTTAGTGTGTTTGACCATTGGAGA
ACATATCAGTTACAGTTTGCTCAGTTTCGTTGAAGCTGTATTATCAAATGGATGATGGTG
GGCATCGTGACAATGGTTGGCATAAAGCATCTCAGGGCAAGCAGTGGATGATGCAGCAAC
AGCAGCAACAACACCAACCATCGATGAAACAAGTGATGTCGATCATAACAGCACAACTGT
CGTTATATGCTACTTGGTT*GTCTTGCA*TTAATAAGAGTGAACCA
CTTTTAGAGA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2GF82TF 700 0 0
GGATCTCATCTCTTTCTCTCTTGAAATCTCCACGACTCCGTCTTCTTCTCTTCTCCTCTC
TTTTTGCCGTCCATTTGAAGTTCGGTTGAAGTTATTGTTTTCTTCCAATTGCAATTGCTC
TTTCTCAAACTTTTCTGAGCTGATTATTGCTTCTCGCCGATTTGATTCTCGCCGTTGTGC
CTTATTTTCGGAATCATCGAAGCAATCTTCAATTTCTCTTTCGATTTTGTAGGAGGAAGA
GCTCGGCAAAGCAATCATCTTGTTTTTTTCCTATATTTCAACAACACTTTCAACCAACAC
TTTTTGGGTCTTGTTGTTGTTGTTCTGTTCTCTCTGTTTTTGTTTTCGTTGCTTCTCTTT
TCTCTTCTCTTTAGATCTTTAAAGACTTTGTTGGGTTTTGTAGGATGTTTGGATCCAGAG
AATTTTAAGGAGTTCAAACTTGTTAAGAAGCAGCAACTTAGTGTGTTTGACCATTGGAGA
ACATATCAGTTACAGTTTGCTCAGTTTCGTTGAAGCTGTATTATCAAATGGATGATGGTG
GGCATCGTGACAATGGTTGGCATAAAGCATCTCAGGGCAAGCAGTGGATGATGCAGCAAC
AGCAGCAACAACACCAACCATCGATGAAACAAGTGATGTCGATCATAACAGCACAACTGT
CGTTATATGCTACTTGGTTTGTCTTGCA*TTAATAAGAGT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2BL76JQ 697 0 0
TTGCTCTTTCTCAAACTTTTCTGAGCTGATTATTGCTTCTCGCCGATTTGATTCTCGCCG
TTGTGCCTTATTTTCGGAATCATCGAAGCAATCTTCAATTTCTCTTTCGATTTTGTAGGA
GGAAGAGCTCGGCAAAGCAATCATCTTGTTTTTTTCCTATATTTCAACAACACTTTCAAC
CAACACTTTTTGGGTCTGGTTGTTGTTGTTCTGTTCTCTCTGTTTTTGTTTTCGTTGCTT
CTCTTTTCTCTTCTCTTTAGATCTTTAAAGACTTTGTTGGGTTTTGTAGGATGTTTGGAT
CCAGAGAATTTTAAGGAGTTCAAACTTGTTAAGAAGCAGCAACTTAGTGTGTTTGACCAT
TGGAGAACATATCAGTTACAGTTTGCTCAGTTTCGTTGAAGCTGTATTATCAAATGGATG
ATGGTGGGCATCGTGACAATGGTTGGCATAAAGCATCTCAGGGCAAGCAGTGGATGATGC
AGCAACAGCAGCAACAACACCAACCATCGATGAAACAAGTGATGTCGATCATAACAGCAC
AACTGTCGTTATATGCTACTTGGTTTGTCTTGCAATTAATAAGAGTGAACCAACTTTTAG
GAGAGTTTATTTCAGATGAACTTGTTCTCATCATCCGTGTTAGATACAGAAAAATCCTTG
AATTGAGTTGTTGCTTGTTGGTAACTAATATTACTAC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2G863JQ 470 0 0
GTTTTCGTTGCTTCTCTTTTCTCTTCTCTTTAGATCTTTAAAGACTTTGTTGGGTTTTGT
AGGATGTTTGGATCCAGAGAATTTTAAGGAGTTCAAACTTGTTAAGAAGCAGCAACTTAG
TGTGTTTGACCATTGGAGAACATATCAGTTACAGTTTGCTCAGTTTCGTTGAAGCTGTAT
TATCAAATGGATGATGGTGGGCATCGTGACAATGGTTGGCATAAAGCATCTCAGGGCAAG
CAGTGGATGATGCAGCAACAGCAGCAACAACACCAACCATCGATGAAACAAGTGATGTCG
ATCATAACAGCACAACTGTCGTTATATGCTACTTGGTTTGTCTTGCAATTAATAAGAGTG
AACCAACTTTTAGGAGAGTTTATTTCAGATGAACTTGTTCTCATCATCCGTGTTAGATAC
AGAAAAATCCTTGAATTGAGTTGTTGCTTGTTGGTAACTAATATTACTAC

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR2H564JQB 592 0 0
TTCGATTTTGTAGGAGGAAGAGCTCGGCAAAGCAATCATCTTGTTTTTTTCCTATATTTC
AACAACACTTTCAACCAACACTTTTTGGGTCTTGTTGTTGTTGTTCTGTTCTCTCTGTTT
TTGTTTTCGTTGCTTCTCTTTTTTCTTCTCTTTAGATCTTTAAAGACTTTGTTGGGTTTT
GTAGGATGTTTGGATCCAGAGAATTTTAAGGAGTTCAAACTTGTTAAGAAGCAGCAACTT
AGTGTGTTTGACCATTGGAGAACATATCAGTTACAGTTTGCTCAGTTTCGTTGAAGCTGT
ATTATCAAATGGATGATGGTGGGCATCGTGACAATGGTTGGCATAAAGCATCTCAGGGCA
AGCAGTGGATGATGCAGCAACAGCAGCAACAACCCCAACCATCGATGAAACAAGTGATGT
CGATCATAACAGCACAACTGTCGTTATATGCTACTTGGTTTGTCTTGCAATTAATAAGAG
TGAACCAACTTTTAGGAGAGTTTATTTCAGATGAACTTGTTCTCATCATCCGTGTTAGAT
ACAGAAAAATCCTTGAATTGAGTTGTTGCTTGTTGGTAACTAATATTACTAC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 7

CO CL954Contig1 1164 7 12 U
ACGAACAAACTCAAACACAAATATCTTATAATAAAGATTCGGACAGAAAATAAGAAAGTG
TATAATAACTAATAAGCTATCAACATAGCTTTACTCAACTTAACAAAACTAAAGATATGA
CATTGCATCCACGCATCATCTTCCTTATTTTTCCATAGAAGAATGTCTACACATAGCTTA
CATATAGCATTATTAGCCTAGATCAGGGACAATGAAGTGCTCTTCATCATCATCATCATC
TCTAAACTCCAACCTCGGCTTCTTGTATGAAGCATTCGACTTCATGGTGGGTCTGTATGA
ATGAACATGACCTAAATGCGAAACAGAAAGCTCCGGAACTTCAACTGCAGGAAGACTCTC
CTGATTAGTCTGATCAGTACCGAAGAAACCCATGTCTGAAAACCACTCTAACTCACCAAG
ATCAAGCTGTCCTTTCTTCTCGGTACACTCAGGATCAGAGAAGTGAAAGAAATCGTCAAC
CGCCCACGGAAGAGGAGTGGCAGAAGAAGGTTGTTGCTGGTTTAGGGTTTTAGCTGGAAT
CTCCTTAGCTTTCTGTTGCTTCTTGGAAGGCTCAGATTGATTCTTGCTGCAACTACTTGA
GTTCAGTGCCACTTTGATCCCAGTGGCTAAGAACCTCTGGTGATTTGCAGATCTAGAGTT
AGCTACATGGATGGATTCATCACAGTCCCTGCAAAGCAGAGCTCTATCCTCAACACAGAA
AATGAAAGCTGACTTCTCTTGGCAGATATCGCAACGAGGGAACTTGGTGGCAAGAGCATT
GAGATGAAGGCGTCGGTGCTTGCTTGCGAGTTTGTTAGCAGCGTGAATCTCCACGTCGCA
TCTAGGACACAAAGCTGCTTCGTCGGCACAACATATCACCGTTGCCGGAGCTTTCTCACA
CACATCACACTGTATCTTCATCTTTCTTTGTTCTCTAAATCACAGTTCTTGATTATTGAT
*CTTGGTTTTAAATCAAGAAGACATATGCATGAATCTGACTTTGTTTGCTTAGCAGAAAA
TGTAGGTGAAGGTGGAAAGGATCTTGGAGAAGAAGTAACAAAGAATAGGAGCGATGATGC
AATAAAGAAATGATTTGACAAGTTGTTGGGGAACAATCAATCAGTGGTGAATGAGAAGAA
GATAAGAGATCTTTATGAATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD58JQ U 6
AF RR2CA01JQ U 1
AF RR2AF89JQ U 8
AF RR2BR28JQ U 116
AF RR2AF89TF C 340
AF RR2DD58TF C 406
AF RR2CA01TF C 383
BS 1 125 RR2CA01JQ
BS 126 126 RR2DD58JQ
BS 127 343 RR2CA01JQ
BS 344 344 RR2AF89JQ
BS 345 394 RR2CA01JQ
BS 395 395 RR2DD58JQ
BS 396 502 RR2CA01JQ
BS 503 503 RR2AF89JQ
BS 504 763 RR2CA01JQ
BS 764 855 RR2AF89JQ
BS 856 1027 RR2AF89TF
BS 1028 1164 RR2CA01TF

RD RR2DD58JQ 452 0 0
CCAA
CTCAAACACAAATATATTATAATAAAGATTCGGACAGAAAATAAGAAAGTGTGTAATAAC
TAATAAGCTATCAACATAGCTTTACTCAACTTAACAAAACTAAAGATATGACATTGCATC
CACGCATAATCTTCCTTATTTTTCCATAGAGGAATGTCTACACATAGCTTACATATAGCA
TT*TTAGCCTAAATCAGGGACAATGAAGTGCTCTTCATCATCATCATCATCTCTGAACTC
CAACCTCGGCTTCTTGTATGAAGCATTCGACTTCATGGTGGGTCTGTATGAATGAACATG
ACCTAAATGCGAAACAGAAAGCTCCGGAACTTCAGCTGCAGGAAGACTCTCCTGATTAGT
CTGATCAGTACAGAAGAAACCCATGTCTGAAAACCACTCTAACTCACCAAGATCAAGCTG
TCCTTTCTTCTCGGTACACTCAGGATC
G

QA 5 451 5 451
DS 

RD RR2CA01JQ 763 0 0
ACGAACAAACTCAAACACAAATATCTTATAATAAAGATTCGGACAGAAAATAAGAAAGTG
TATAATAACTAATAAGCTATCAACATAGCTTTACTCAACTTAACAAAACTAAAGATATGA
CATTGTATCCACGCATCATCTTCCTTATTTTTCCATAGAAGAATGTCTACACATAGCTTA
CATATAGCATTATTAGCCTAGATCAGGGACAATGAAGTGCTCTTCATCATCATCATCATC
TCTAAACTCCAACCTCGGCTTCTTGTATGAAGCATTCGACTTCATGGTGGGTCTGTATGA
ATGAACATGACCTAAATGCGAAACAGAAAGCTCCGGAACTTCAGCTGCAGGAAGACTCTC
CTGATTAGTCTGATCAGTACCGAAGAAACCCATGCCTGAAAACCACTCTAACTCACCAAG
ATCAAGCTGTCCTTTCTTCTCGGTACACTCAGGATCAGAGAAGTGAAAGAAATCGTCAAC
CGCCCACGGAAGAGGAGTGGCAAAAGAAGGTTGTTGCTGGTTTAGGGTTTTAGCTGGAAT
CTCCTTAGCTTTCTGTTGCTTCTTGGAAGGCTCAGATTGATTCTTGCTGCAACTACTTGA
GTTCAGTGCCACTTTGATCCCAGTGGCTAAGAACCTCTGGTGATTTGCAGATCTAGAGTT
AGCTACATGGATGGATTCATCACAGTCCCTGCAAAGCAGAGCTCTATCCTCAACACAGAA
AATGAAAGCTGACTTCTCTTGGCAGATATCGCAACGAGGGAAC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2AF89JQ 848 0 0
AG
CTCAAACACAAATATCTTATAATAAAGATTCGGACAGAAAATAAGAAAGTGTATAATAAC
TAATAAGCTATCAACATAGCTTTACTCAACTTAACAAAACTAAAGATATGATATTGTATC
CACGCATCATCTTCCTTATTTTTCCATAGAAGAATGTCTACACATAGCTTACATATAGCA
TTATTAGCCTAGATCAGGGACAATGAAGTGCTCTTCATCATCATCATCATCTCTAAACTC
CAACCTCGGCTTCTTGTATGAAGCATTCGACTTCATGGTGGGTCTGTATGAATGAACATG
ACCTAAATGCGAAACAGAAAGCTCCGGAACTTCAACTGCAGGAAGACTCTCCTGATTAGT
CTGATCAGTACCGAAGAAACCCATGTCTGAAAACCACTCTAACTCACCAAGATCAAGCTG
TCCTTTCTTCTCGGTACACTCAGGATCAGAGAAGTGAAAGAAATCGTCAACCGCCCACGG
AAGAGGAGTGGCAGAAGAAGGTTGTTGCTGGTTTAGGGTTTTAGCTGGAATCTCCTTAGC
TTTCTGTTGCTTCTTGGAAGGCTCAGATTGATTCTTGCTGCAACTACTTGAGTTCAGTGC
CACTTTGATCCCAGTGGCTAAGAACCTCTGGTGATTTGCAGATCTAGAGTTAGCTACATG
GATGGATTCATCACAGTCCCTGCAAAGCAGAGCTCTATCCTCAACACAGAAAATGAAAGC
TGACTTCTCTTGGCAGATACCGCAACGAGGGAACTTGGTGGCAAGAGCATTGAGATGAAG
GCGTCGGTGCTTGCTTGCGAGTTTGTTAGCAGCGTGAATCTCCACGTCGCATCTAGGACA
CAAAGC

QA 3 848 3 848
DS 

RD RR2BR28JQ 729 0 0
TATGACATTGCATCCACACATCATCTTCCTTATTTTTCCATAGAGAAATGTCTACACATA
GCTTACATATAGCATTATTAGCCTAGATCAGGGACAATGAAGTGCTCTTCATCATCATCA
TCATCTCTGAACTCCAACCTCGGCTTCTTGTATGAAGCATTCGACTTCATGGTGGGTCTG
TATGAATGAACATGACCTAAATGCGAAACAGAAAGCTCCGGAACTTCAGCTGCAGGAAGA
CTCTCCTGATTAGTCTGATCAGTACCGAAGAAACCCATGTCTGAAAACCATTCTAACTCA
CCAAGATCAAGCTGTTCTTTCTTCTCGGTACACTCAGGATCAGAGAAGTGAAAGAAATCG
TCAACCGCCCACGGAAGAGGAGTAGCAGAAGAAGGTTGTTGCTGGTTTAGGGTTTTAGCT
GGAATCTCCTTAGCTTTCTGTTGCTTCTTGGAAGGCTCAGATTGATTCTTGCTGCAACTA
GTTGAGTTCAGAGCCACTTTGATCCCAGTGGCTAAAAACCTCTGGTGATTTGCAGATCTA
GAGTTAGCTACATGGATGGATTCATCACAGTCCCTGCAAAGCAGAGCTCTATCCTCAACA
CAGAAAATGAAAGCTGACTTCTCTCGGCAAACATCGCAACGAGGGAACTTGGTGGCAAGA
GCATTGAGATGAAGGCGTCGGTGCTTGCTTGCGAGTTTGTTAGCAGCGTGAATCTCCACG
TCGCATCT
T

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2AF89TF 690 0 0
TTCAACTGCAGGAAGACTCTC*TGATTAGTCTGATCAGTACCGAAGAAACCCATGTCTGA
AAACCACTCTAACTCACCAAGATCAAGCTGTCCTTTCTTCTCGGTACACTCAGGATCAGA
GAAGTGAAAGAAATCGTCAACCGCCCACGGAAGAGGAGTGGCAGAAGAAGGTTGTTGCTG
GTTTAGGGTTTTAGCTGGAATCTCCTTAGCTTTCTGTTGCTTCTTGGAAGGCTCAGATTG
ATTCTTGCTGCAACTACTTGAGTTCAGTGCCACTTTGATCCCAGTGGCTAAGAACCTCTG
GTGATTTGCAGATCTAGAGTTAGCTACATGGATGGATTCATCACAGTCCCTGCAAAGCAG
AGCTCTATCCTCAACACAGAAAATGAAAGCTGACTTCTCTTGGCAGATACCGCAACGAGG
GAACTTGGTGGCAAGAGCATTGAGATGAAGGCGTCGGTGCTTGCTTGCGAGTTTGTTAGC
AGCGTGAATCTCCACGTCGCATCTAGGACACAAAGCTGCTTCGTCGGCACAACATATCAC
CGTTGCCGGAGCTTTCTCACACACATCACACTGTATCTTCATCTTTCTTTGTTCTCTAAA
TCACAGTTCTTGATTATTGAT*CTTGGTTTTAAATCAAGAAGACATATGCATGAATCTGA
CTTTGTTTGCTTAGCAGAAAATGTAGGT
CC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2DD58TF 653 0 0
CACTCTACTCACC
AGATCAAGCTGTC**TTCTTCTCGGTACACTCAGGATCGGAGAAGTGAAAGAAATCGTCA
ACCGCCCACGGAAGAGGAGTGGCAGAAGAAGGTTGTTGCTGGTTTGGGGTTTTAGCTGGA
ATCTCTTTAGCTTTCTGTTGCTTCTTGGAAGGCTCAGATTGATTCTTGCTGCAACTAGTT
GAGTTCAGAGCCACTTTGATCCCAGTGGCTAGGAACCTCTGGTGATTTGCAGATCTAGAG
TTAGCTACATGGATGGATTCATCAAAGTCCCTGCAAAGCAGAGCTCTATCCTCAACACAG
AAAATGAAAGCTGACTTCTCTTGGCAGATATCGCAACGAGGGAACTTGGTGGCAAGAGCA
TTGAGATGAAGGCGTCGGTGCTTGCTTGCGAGTTTGTTAGCAGCGTGAATCTCCACGTCG
CATCTAGGACACAAAGCTGCTTCGTCGGCACAACATATCACAGTCGCCGGAGCTTTCTCA
CACACATCACACCGTATCTTCATCTTTCTTTGTTCTCTAAATCACAGTTCTTGATTATTG
ATTCTTGGTTTTAAATCAAGAAGACATATGCATGAATCTGACTTTGTTTGCTCAGCAGAA
GATGTAGGTGAAGGTGGAAAGGATCTTGGAGAAGAAGT
CC

QA 14 651 14 651
DS 

RD RR2CA01TF 782 0 0
AAGAAACCCATGCCTGAAAACCACTCTAACTCACCAAGATCAAGCTGTCCTTTCTTCTCG
GTACACTCAGGATCAGAGAAGTGAAAGAAATCGTCAACCGCCCACGGAAGAGGAGTGGCA
GAAGAAGGTTGTTGCTGGTTTAGGGTTTTAGCTGGAATCTCCTTAGCTTTCTGTTGCTTC
TTGGAAGGCTCAGATTGATTCTTGCTGCAACTACTTGAGTTCAGTGCCACTTTGATCCCA
GTGGCTAAGAACCTCTGGTGATTTGCAGATCTAGAGTTAGCTACATGGATGGATTCATCA
CAGTCCCTGCAAAGCAGAGCTCTATCCTCAACACAGAAAATGAAAGCTGACTTCTCTTGG
CAGATATCGCAACGAGGGAACTTGGTGACAAGAGCATTGAGATGAAGGCGTCGGTGCTTG
CTTGCGAGTTTGTTAGCAGCGTGAATCTCCACGTCGCATCTAGGACACAAAGCTGCTTCG
TCGGCACAACATATCACCGTTGCCGGAGCTTTCTCACACACATCACACTGTATCTTCATC
TTTCTTTGTTCTCTAAATCACAGTTCTTGATTATTGAT*CTTGGTTTTAAATCAAGAAGA
CATATGCATGAATCTGACTTTGTTTGCTTAGCAGAAAATGTAGGTGAAGGTGGAAAGGAT
CTTGGAGAAGAAGTAACAAAGAATAGGAGCGATGATGCAATAAAGAAATGATTTGACAAG
TTGTTGGGGAACAATCAATCAGTGGTGAATGAGAAGAAGATAAGAGATCTTTATGAATCT
CC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 6

CO CL955Contig1 1263 6 25 U
GGCGAAAAGTGAGAGAGGAGTAGTGAAGAGGAAGTAGAAGTAGAGTAGAATCGAGGAGGG
TGATTGCGATCTGGTAATTGATCCTGATACTTTTCTCTAACTTACTATCCATGGCGACGT
TGCGTCCTTCTTTTGAGCTCGCCAAAGGCATCAATGGCCTCGACAAAATCATCCTCCGCG
AGTCTCGCAACCGCTCCGCCGAGGTATACTTGTATGGTGGACATGTGACTTCTTGGAAGA
ATGAGAATGGAGAAGAGTTACTTCACCTCAGTAGCAAGGCTATATTCAAGCCTCCAAAAC
CAATCCGTGGAGGGATCCCACTATGCTTTCCACAATTCAGTAACTTTGGTACACTGGAAT
CACATGGATTCGCTAGAAACAGGATCTGGGAAGTCGATGCTAGCCCGCCTCCTCTGCCAA
CAAATTCTTCTTCTAATGCTTTCGTTGACCTCATCCTAAGACCGACTGAAGACGATCTGA
AGGCATGGCCTCACAATTTTGAGTTCCGGATGAGGGTAGCCTTGGGATCTGAAGGAGAAT
TGACACTGACCTCTCGTATCAGAAACACCAGCTCTGATGGGAAGCCGTTTACATTCACAT
TTGCTTATCACACCTATTTCTCTGTCTCGGACATCAGTGAAGTAAGGGTTGAA*GGATTG
GAGACGCTTGATTATCTAGACAACTTAAAGAACAGAGAACGTTTTACGGAACAAGGCGAT
GCTATAACTTTTGAATCCGAAACTGACAAGATTTACCTGAGCACTCCTACGAAGATTGCT
ATTTTGGACCATGAGAAGAAGAGGACTTTCGTTGTTCGCAAAGACGGGCTTGCTGATGCT
GTGGTGTGGAATCCTTGGGATAAGAGGTCAAAGACGATATCAGACTTGGGAGATGAAGAC
TATAAGCAAATGCTTTGTGTTGAAGCTGCAGCTATCGAAAGGCCAATCACATTGAAACCA
GGTGAAGAATGGAAAGGAAGACTCGAGCTCTCTGCGGTTCCTTCTAGTTACTCCAGTGGA
CAGCTTGACCCCAAGAAAGTCCTCGAGTGATGCTCTCCTCTCTTTCTCTTACAGTACTAT
GAAGAAATGAGTGAAGGGAGGCGTGAAGATGTTCATCGGATTATTATACTATAGAAAGAA
ACTGAGTTCTAATAAATAAAGAAATCTCGATTTGTGGATCAAAGACAAGAGACTTGCACT
CGTTAAAATTGTGGTTTCATTATATGTTATGGTACACTTGACCACCATTCAGTACTTGTG
TCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2FI36TF U 1
AF RR2AS51TF U 9
AF RR2BH86TF U 85
AF RR2AS51JQ C 425
AF RR2FI36JQ C 630
AF RR2F790JQ C 527
BS 1 66 RR2FI36TF
BS 67 67 RR2AS51TF
BS 68 385 RR2FI36TF
BS 386 386 RR2AS51TF
BS 387 651 RR2FI36TF
BS 652 653 RR2AS51TF
BS 654 654 RR2BH86TF
BS 655 715 RR2AS51TF
BS 716 716 RR2BH86TF
BS 717 718 RR2AS51TF
BS 719 720 RR2BH86TF
BS 721 741 RR2AS51TF
BS 742 742 RR2BH86TF
BS 743 772 RR2AS51TF
BS 773 791 RR2BH86TF
BS 792 792 RR2AS51JQ
BS 793 813 RR2BH86TF
BS 814 814 RR2AS51JQ
BS 815 862 RR2BH86TF
BS 863 962 RR2AS51JQ
BS 963 963 RR2F790JQ
BS 964 1114 RR2AS51JQ
BS 1115 1115 RR2F790JQ
BS 1116 1245 RR2AS51JQ
BS 1246 1263 RR2F790JQ

RD RR2FI36TF 651 0 0
GGCGAAAAGTGAGAGAGGAGTAGTGAAGAGGAAGTAGAAGTAGAGTAGAATCGAGGAGGG
TGATTGTGATCTGGTAATTGATCCTGATACTTTTCTCTAACTTACTATCCATGGCGACGT
TGCGTCCTTCTTTTGAGCTCGCCAAAGGCATCAATGGCCTCGACAAAATCATCCTCCGCG
AGTCTCGCAACCGCTCCGCCGAGGTATACTTGTATGGTGGACATGTGACTTCTTGGAAGA
ATGAGAATGGAGAAGAGTTACTTCACCTCAGTAGCAAGGCTATATTCAAGCCTCCAAAAC
CAATCCGTGGAGGGATCCCACTATGCTTTCCACAATTCAGTAACTTTGGTACACTGGAAT
CACATGGATTCGCTAGAAACAGGAT*TGGGAAGTCGATGCTAGCCCGCCTCCTCTGCCAA
CAAATTCTTCTTCTAATGCTTTCGTTGACCTCATCCTAAGACCGACTGAAGACGATCTGA
AGGCATGGCCTCACAATTTTGAGTTCCGGATGAGGGTAGCCTTGGGATCTGAAGGAGAAT
TGACACTGACCTCTCGTATCAGAAACACCAGCTCTGATGGGAAGCCGTTTACATTCACAT
TTGCTTATCACACCTATTTCTCTGTCTCGGACATCAGTGAAGTAAGGGTTG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2AS51TF 769 0 0
GGGAGAGAG
GAGTAGTGAAGAGGAAGTAGAAGTAGAGTAGAATCGAGGAGGGTGATTGCGATCTGGTAA
TTGATCCTGATACTTTTCTCTAACTTACTATCCATGGCGACGTTGCGTCCTTCTTTTGAG
CTCGCCAAAGGCATCAATGGCCTCGACAAAATCATCCTCCGCGAGTCTCGCAACCGCTCC
GCCGAGGTATACTTGTATGGTGGACATGTGACTTCTTGGAAGAATGAGAATGGAGAAGAG
TTACTTCACCTCAGTAGCAAGGCTATATTCAAGCCTCCAAAACCAATCCGTGGAGGGATC
CCACTATGCTTTCCACAATTCAGTAACTTTGGTACACTGGAATCACATGGATTCGCTAGA
AACAGGATCTGGGAAGTCGATGCTAGCCCGCCTCCTCTGCCAACAAATTCTTCTTCTAAT
GCTTTCGTTGACCTCATCCTAAGACCGACTGAAGACGATCTGAAGGCATGGCCTCACAAT
TTTGAGTTCCGGATGAGGGTAGCCTTGGGATCTGAAGGAGAATTGACACTGACCTCTCGT
ATCAGAAACACCAGCTCTGATGGGAAGCCGTTTACATTCACATTTGCTTATCACACCTAT
TTCTCTGTCTCGGACATCAGTGAAGTAAGGGTTGAAAGGATTGGAGACGCTTGATTATCT
AGACAACTTAAAGAACAGAGAACGTTTTACGGAACAAG*CG**GCTATAACTTTTGAATC
CGAA*CTGACAAGATTTACCTGAGCACTCCTACGA
GATTG

QA 10 764 10 764
DS 

RD RR2BH86TF 778 0 0
G
GATACTTTTCTCTTACTTACTATCCATGGCGACGGAGCGTCCTTCTTTTGAGCTTGCCAA
AGGCATCAATGGCCTCGACAAAATCGTCCTCCGCGAGTCTCGCAACCGTTCCGCCGAGGT
ATACTTGTATGGTGGACATGTGACTTCTTGGAAGAATGAGAATGGAGAAGAGTTGCTACA
CCTCAGTAGCAAGGCTATATTCAAGCCTCCAAAACCAATCCGTGGAGGGATCCCACTATG
CTTTCCACAATTCAGTAACTTTGGTACACTGGAATCACATGGATTCGCTAGAAACAGGAT
CTGGGAAGTCGATGCTAGCCCGCCTCCTCTGCCAACAAATTCTTCTTCTAATGCTTTCGT
TGACCTCATCCTAAGACCGACTGAAGACGATCTGAAGGCATGGCCTCACAATTTTGAGTT
CCGGATGAGGGTAGCCTTGGGATCTGAAGGAGAATTGACACTGACCTCTCGTATCAGAAA
CACCAGCTCTGATGGGAAGCCGTTTACATTCACATTTGCTTATCACACCTATTTCTCTGT
CTCGGACATCAGTGAAGTAAGGGTTGAA*GGATTGGAGACGCTTGATTATCTAGACAACT
TAAAGAACAGGGAACGTTTTACGGAACAAGGCGATGCTATAACTTTTGAATCCGAAACTG
ACAAGATTTACCTGAGCACTCCTACGAAGATTGCTATTTTGGACCACGAGAAGAAGAGGA
CTTTCGTTATTCGCAAAGACGGGCTTGCTGATGCTGTGGTGTGGAATCCTTGGGATA

QA 2 778 2 778
DS 

RD RR2AS51JQ 821 0 0
TTCTTCTTCTAATGCTTTCGTTGACCTCATCCTAAGACCGACTGAAGACGATCTGAAGGC
ATGGCCTCACAATTTTGAGTTCCGGATGAGGGTAGCCTTGGGATCTGAAGGAGAATTGAC
ACTGACCTCTCGTATCAGAAACACCAGCTCTGATGGGAAGCCGTTTACATTCACATTTGC
TTATCACACCTATTTCTCTGTCTCGGACATCAGTGAAGTAAGGGTTGAA*GGATTGGAGA
CGCTTGATTATCTAGACAACTTAAAGAACAGAGAACGTTTTACGGAACAAGGCG**GCTA
TAACTTTTGAATCCGAAACTGACAAGATTTACCTGAGCACTCCTACGAAGATTGCTATTT
TGGACCATGAGAAAAAGAGGACTTTCGTTGTTCGCAAAGACGGGCTTGCTGATGCTGTGG
TGTGGAATCCTTGGGATAAGAGGTCAAAGACGATATCAGACTTGGGAGATGAAGACTATA
AGCAAATGCTTTGTGTTGAAGCTGCAGCTATCGAAAGGCCAATCACATTGAAACCAGG*G
AAGAATGGAAAGGAAGACTCGAGCTCTCTGCGGTTCCTTCTAGTTACTCCAGTGGACAGC
TTGACCCCAAGAAAGTCCTCGAGTGATGCTCTCCTCTCTTTCTCTTACAGTACTATGAAG
AAATGAGTGAAGGGAGGCGTGAAGATGTTCGTCGGATTATTATACTATAGAAAGAAACTG
AGTTCTAATAAATAAAGAAATCTCGATTTGTGGATCAAAGACAAGAGACTTGCACTCGTT
AAAATTGTGGTTTCATTATATGTTATGGTACACTTGACCAC

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR2FI36JQ 617 0 0
GACATCAGTGAAGTAAGGGTTGAA*GGATTGGAGACGCTTGATTATCTAGACAACTTAAA
GAACAGAGAACGTTTTACGGAACAAGGCGATGCTATAACTTTTGAATCCGAAACTGACAA
GATTTACCTGAGCACTCCTACGAAGATTGCTATTTTGGACCATGAGAAAAAGAGGACTTT
CGTTGTTCGCAAAGACGGGCTTGCTGATGCTGTGGTGTGGAATCCTTGGGATAAGAGGTC
AAAGACGATATCAGACTTGGGAGATGAAGACTATAAGCAAATGCTTTGTGTTGAAGCTGC
AGCTATCGAAAGGCCAATCACATTGAAACCAGGTGAAGAATGGAAAGGAAGACTCGAGCT
TTCTGCGGTTCCTTCTAGTTACTCCAGTGGACAGCTTGACCCCAAGAAAGTCCTCGAGTG
ATGCTCTCCTCTCTTTTTCTTACAGTACTATGAAGAAATGAGTGAAGGGAGGCGTGAAGA
TGTTCATCGGATTATTATACTATAGAAAGAAACTGAGTTCTAATAAATAAAGAAATCTCG
ATTTGTGGATCAAAGACAAGAGACTTGCACTCGTTAAAATTGTGGTTTCATTATATGTTA
TGGTACACTTGACCAC
C

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2F790JQ 737 0 0
ATCTGAAGGAGAATTGACACTGACCACTCGTATCAGAAACACCAGCTCTGATGGGAAGCC
GTTTACATTCACATTTGCTTATCACACCTATTTCTCTGTCTCGGACATCAGTGAAGTAAG
GGTTGAA*GGATTGGAGACGCTTGATTATCTAGACAACTTAAAGAACAGAGAACGTTTTA
CGGAACAAGGCGATGCTATAACTTTTGAATCCGAAGTTGACAAGATTTACCTGAGCACGC
CTACGAAGATTGCTATTTTGGACCATGAGAAGAAGAGGACTTTCGTTGTTCGCAAAGACG
GGCTTGCTGATGCTGTGGTGTGGAATCCTTGGGATAAGAGGTCAAAGACGATATCAGACT
TGGGAGATGAAGACTATAAGCATATGCTTTGTGTTGAAGCTGCAGCTATCGAGAGGCCAA
TCACATTGAAACCAGGTGAAGAATGGAAAGGAAGACTCGAGCTCTCTGCGGTTCCTTCTA
GTTACTCCAGTGGACAGCTTGACCCCAAGAAAGTCCTCGAGTGATTCTCTCCTCTCTTTC
TCTTACAGTACTATGAAGAAATGAGTGAAGGGAGGCGTGAAGATGTTCATCGGATTATTA
TACTATAGAAAGAAACTGAGTTCGAATAAATAAAGAAATCTCGATTTGTGGATCAAAGAC
AAGAGACTTGCACTCGTTAAAATTGTGGTTTCATTATATGTTATGGTACACTTGACCACC
ATTCAGTACTTGTGTCT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 8

CO CL956Contig1 652 8 25 U
TTTTTTTTTAGAAAATTTTGTTCTTTATTAAATCTCAAACTTATCAAGGAGAGTTTAGCA
AAATGGAAATTTTCTCAGATCCCAAATACTCTGTTTCCGTTTCAGGGAAAAACTTGAAGA
*AAAAAAATTTGATTCAGATTACACAATCTTGTTCAAGTTATTGTTCCTCTCTTTCAAGG
ATAGTAGCCGGTGAAGGTGAATCCTCTTCCGGCGATTTCGCCTGCGCAGTACCAGGCAAA
GCATTCGAGACCAAACAATGCAGCAATTCCTGCATCTTCTACCTTCAGATCGGTTCTGTT
CTTCCACAAGTTCTTTGCATAGTCTACTTCCTTCCAGAAAGTTTCATAGCGTTTGGGAAT
GCTAGCAAGACGGGTGTAGAGCAGCTGCTTAGACAACTCTTGGCACTTCTCCACAGTGGC
AGGTTCCTGGATGTAGTGCTTGTTCTTCTCAAGCAACTGCCTGTAATAGGAAGTCCCATG
CTTGGCCACAAACTTTGAAGCCTCACACGCCTTTGACTGAACTTGTACCAACTTCGATGC
CATCTTCAGAAACCAAATCCGTTGGGATAGAGAGATGCGGCACCGGTGAGGAAGATGAGA
GAGTTTTTGACTGGAGATTCGTGCCACTAAAATATCGTGCGACTTTCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 
0 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C911JQ U 31
AF RR2FS25JQ U 30
AF RR2FS25TF C 30
AF RR2FJ93TF C 1
AF RR2C645JQ U 75
AF RR2C911TF C 352
AF RR2C645TF C 5
AF RR2FJ93JQ U 30
BS 1 29 RR2FJ93TF
BS 30 30 RR2FJ93JQ
BS 31 74 RR2C911JQ
BS 75 79 RR2C645JQ
BS 80 80 RR2C911JQ
BS 81 120 RR2C645JQ
BS 121 121 RR2FJ93JQ
BS 122 128 RR2C645JQ
BS 129 129 RR2FJ93JQ
BS 130 180 RR2C645JQ
BS 181 181 RR2FJ93JQ
BS 182 258 RR2C645JQ
BS 259 259 RR2FJ93JQ
BS 260 318 RR2C645JQ
BS 319 319 RR2FJ93JQ
BS 320 378 RR2C645JQ
BS 379 379 RR2FJ93JQ
BS 380 435 RR2C645JQ
BS 436 436 RR2FJ93JQ
BS 437 468 RR2C645JQ
BS 469 469 RR2FJ93JQ
BS 470 610 RR2C645JQ
BS 611 611 RR2FJ93JQ
BS 612 640 RR2C645JQ
BS 641 652 RR2FJ93JQ

RD RR2C911JQ 222 0 0
AATCTCAAACTTATCAAGGAGAGTTTAGCAAAATGGAAATTTTCTCAGATCCCAAATACT
CTGTTTCCGTTTCAGGGAAAAACTTGAAGATAAAAAAAATTGATTCGGATTACACAATCT
TGTTCAAGTTATTGTTCCTCTCTTTCAAGGGTAGTAGCCGGTGAAGGTGAATCCTCTTCC
GGCGATTTCGCCTGCGCAGTACCAGGCAAAGCATTCTAGACC

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR2FS25JQ 572 0 0
AAATCTCAAACTTATCAAGGAGCGTTTAGCAAAATGGAAATTTTCTCAGATCCCAAATAC
TCTGTTTCCGTTTCAGGGAAAAACTTGAAGA*AAAAAAATTTGATTCAGATTACACAATC
TTGTTCAAGTTATTGTTCCTCTCTTTCAAGGATAGTAGCCGGTGAAGGTGAATCCTCTTC
CGGCGATTTCGCCTGCGCAGTACCAGGCAAAGCATTCGAGACCAAACAATGCAGCAATTC
CTGCATCTTCTACCTTCAGATCGGTTCTGTTCTTCCACAAGTTCTTTGCATAGTCTACTT
CCTTCCAGAAAGTTTCATAGCGTTTGGGAATGCTAGCAAGACGGGTGTAGAGCAGCTGCT
TAGACAACTCTTGGCACTTCTCCACAGTGGCAGGTTCCTGGATGTAGTGCTTGTTCTTCT
CAAGCAACTGCCTGTAATAGGAAGTCCCATGCTTGGCCACAAACTTTGAAGCCTCACACG
CCTTTGACTGAACTTGTACCAACTTCGATGCCATCTTCAGAAACCAAATCCGTTGGGATA
GAGAGATGCGGCACCGGTGAGGAAGATGAG
CC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2FS25TF 572 0 0
AAATCTCAAACTTATCAAGGAGCGTTTAGCAAAATGGAAATTTTCTCAGATCCCAAATAC
TCTGTTTCCGTTTCAGGGAAAAACTTGAAGA*AAAAAAATTTGATTCAGATTACACAATC
TTGTTCAAGTTATTGTTCCTCTCTTTCAAGGATAGTAGCCGGTGAAGGTGAATCCTCTTC
CGGCGATTTCGCCTGCGCAGTACCAGGCAAAGCATTCGAGACCAAACAATGCAGCAATTC
CTGCATCTTCTACCTTCAGATCGGTTCTGTTCTTCCACAAGTTCTTTGCATAGTCTACTT
CCTTCCAGAAAGTTTCATAGCGTTTGGGAATGCTAGCAAGACGGGTGTAGAGCAGCTGCT
TAGACAACTCTTGGCACTTCTCCACAGTGGCAGGTTCCTGGATGTAGTGCTTGTTCTTCT
CAAGCAACTGCCTGTAATAGGAAGTCCCATGCTTGGCCACAAACTTTGAAGCCTCACACG
CCTTTGACTGAACTTGTACCAACTTCGATGCCATCTTCAGAAACCAAATCCGTTGGGATA
GAGAGATGCGGCACCGGTGAGGAAGATGAG
CC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2FJ93TF 652 0 0
TTTTTTTTTAGAAAATTTTGTTCTTTATTAAATCCCAAACTTATCAAGGAGAGTTTAGCA
AAATGGAAATTTTCTCAGATCCCAAATACTCTGTTTCCGTTTCAGGGAAAAACTTGAAGA
*AAAAAAATTTGATTCAGATTACACAATCTTGTTCAAGTTATTGTTCCTCTCTTTCAAGG
ATAGTAGCCGGTGAAGGTGAATCCTCTTCCGGCGATTTCGCCTGCGCAGTACCAGGCAGA
GCATTCGAGACCAAACAATGCAGCAATTCCTGCATCTTCTACCTTCAGATCGGTTCTGTT
CTTCCACAAGTTCTTTGCATAGTCTACTTCCTTCCAGAAAGTTTCATAGCGTTTGGGAAT
GCTAGCAAGACGGGTGTAGAGCAGCTGCTTAGACAACTCTTGGCACTTCTCCACAGTGGC
AGGTTCCTGGATGTAGTGCTTGTTCTTCTCAAGCAACTGCCTGTAATAGGAGGTCCCATG
CTTGGCCACAAACTTTGAAGCCTCACACGCCTTTGACTGAACTTGTACCAACTTCGATGC
CATCTTCAGAAACCAAATCCGTTGGGATAGAGAGATGCGGCACCGGTGAGGAAGATGAGA
G**TTTTTGACTGGAGATTCGTGCCACTAAAATATCGTGCGACTTTCTCTCC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2C645JQ 568 0 0
TCAGAACCCAAATACTCTGTTTCCGTTTCAGGGAAAAACTTGAAGATAAAAAAAATTGAT
TCAGATTACACAATCTTGTTCAAGTTATTGTTCCTCTCTTTCAAGGGTAGTAGCCGGTGA
AGGTGAATCCTCTTCCGGCGATTTCGCCTGCGCAGTACCAGGCAAAGCATTCGAGACCAA
ACAAAGCAGCAATTCCTGCATCTTCTACCTTCAGATCGGTTCTGTTCTTCCACAAGTTCT
TTGCGTAGTCTACTTCCTTCCAGAAAGTTTCATAGCGTTTGGGAATGCTAGCAAGACGGG
TGTAAAGCAGCTGCTTAGACAACTCTTGGCACTTCTCCACAGTGGCAGGTTCCTGGATGT
AATGCTTGTTCTTCTCAAGCAACTGCCTGTAATAAGAAGTCCCATGCTTGGCCACAAACT
TTGAAGCCTCACACGCCTTTGACTGAACTTGTACCAACTTCGATGCCATCTTCAGAAACC
AAATCCGTTGGGATAGAGAGATGCGGCACCGGTGAGGAAGATGAGAGAGTTTTTGATTGG
AGATTCGTGCCACTAAAATATCGTGC
CC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2C911TF 269 0 0
TTTGGGAATGCTAGCAAGACGGGTGTAAAGCAGCTGCTTAGACAACTCTTGGCACTTCTC
CACAGTGGCAGGTTCCTGGATGTAATGCTTGTTCTTCTCAAGCAACTGCCTGTAATAAGA
AGTCCCATGCTTGGCCACAAACTTTGAAGCCTCACACGCCTTTGACTGAACTTGTACCAA
CTTCGATGCCATCTTCAGAAACCAAATCCGTTGGGATAGAGAGATGCGGCACCGGTGAGG
AAGATGAGAG
AGTTTTTGATTGGAGACCC

QA 1 250 1 250
DS 

RD RR2C645TF 638 0 0
CCTC
TAGAAAATTTTGTTCTTTATTAA*TCTCAAACTTATCAAGGAGAGTTTAGCAAAATGGAA
ATTTTCTCAGATCCCAAATACTCTGTTTCCGTTTCAGGGAAAAACTTGAAGATAAAAAAA
ATTGATTCAGATTACACAATCTTGTTCAAGTTATTGTTCCTCTCTTTCAAGGGTAGTAGC
CGGTGAAGGTGAATCCTCTTCCGGCGATTTCGCCTGCGCAGTACCAGGCAAAGCATTCGA
GACCAAACAAAGCAGCAATTCCTGCATCTTCTACCTTCAGATCGGTTCTGTTCTTCCACA
AGTTCTTTGCGTAGTCTACTTCCTTCCAGAAAGTTTCATAGCGTTTGGGAATGCTAGCAA
GACGGGTGTAAAGCAGCTGCTTAGACAACTCTTGGCACTTCTCCACAGTGGCAGGTTCCT
GGATGTAATGCTTGTTCTTCTCAAGCAACTGCCTGTAATAAGAAGTCCCATGCTTGGCCA
CAAACTTTGAAGCCTCACACGCCTTTGACTGAACTTGTACCAACTTCGATGCCATCTTCA
GAAACCAAATCCGTTGGGATAGAGAGATGCGGCACCGGTGAGGAAGATGAGAGAGTTTTT
GATTGGAGATTCGTGCCACTAAAATATCGTGC
CC

QA 5 636 5 636
DS 

RD RR2FJ93JQ 623 0 0
AAATCCCAAACTTATCAAGGAGAGTTTAGCAAAATGGAAATTTTCTCAGATCCCAAATAC
TCTGTTTCCGTTTCAGGGAAAAACTTGAAGA*AAAAAAATTTGATTCAGATTACACAATC
TTGTTCAAGTTATTGTTCCTCTCTTTCAAGGATAGTAGCCGGTGAAGGTGAATCCTCTTC
CGGCGATTTCGCCTGCGCAGTACCAGGCAGAGCATTCGAGACCAAACAATGCAGCAATTC
CTGCATCTTCTACCTTCAGATCGGTTCTGTTCTTCCACAAGTTCTTTGCATAGTCTACTT
CCTTCCAGAAAGTTTCATAGCGTTTGGGAATGCTAGCAAGACGGGTGTAGAGCAGCTGCT
TAGACAACTCTTGGCACTTCTCCACAGTGGCAGGTTCCTGGATGTAGTGCTTGTTCTTCT
CAAGCAACTGCCTGTAATAGGAGGTCCCATGCTTGGCCACAAACTTTGAAGCCTCACACG
CCTTTGACTGAACTTGTACCAACTTCGATGCCATCTTCAGAAACCAAATCCGTTGGGATA
GAGAGATGCGGCACCGGTGAGGAAGATGAGAG**TTTTTGACTGGAGATTCGTGCCACTA
AAATATCGTGCGACTTTCTCTCC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 8

CO CL957Contig1 1355 8 22 U
GCCTGTGTTAGTGTACATGTCTAAAGTGGATGGAAAGTTCAACTTCAGTCCTATTAGCGT
CAACTTCTTGACGGAAATCGCAAAGGTTATGTTTGCGCTTGTCATGCTTCTGATCCAGGC
CAGGCACCAAAAAGTTGGAGAGAAGCCTCTACTATCCTTATCCACATTTGTCCAGGCAGC
TCGGAACAATGTGCTTCTCGCTGTTCCAGCGGGATTGTATGCCATTAATAACTATCTTAA
GTTCACAATGCAGTTATATTTCAATCCTGCTACTGTGAAGATGCTTAGCAATCTAAAGGT
TCTGGTAATTGCTGTGCTACTGAAGATGATAATGAAGCGACGGTTTTCCATCATACAGTG
GGAAGCACTTGCTCTGTTGCTGATAGGGATTAGTGTAAACCAGCTGCGTTCTCTTCCTGA
AGGTGCTACTACTATGGCTGTTCCAGTTGCTATGGGTGCATACATCTGTACCTTTATCTT
TGTTACTGTCCCATCCTTTGCATCTGTCTACAACGAGTATGCTCTAAAGAGCCAGTATGA
CACCAGCATTTATCTCCAGAACTTATTCCTCTATGGTTACGGTGCAATATTCAACTTCCT
TGGAATACTAGCAACTGTTATATACAAAGGTCCTGGCAGTTTTGACATCCTACAAGGACA
TTCTAGAGCTACCATGTTTCTGATACTGAACAACGCAGCACAAGGGATTCTATCCTCCTT
TTTCTTCAAATATGCAGATACAATCTTGAAGAAGTATTCATCTACGGTTGCCACAATATT
TACTGGCATAGCATCTGCAGCTCTCTTTGGACATGTGTTAACCATGAATTTTCTTCTGGG
GATTTCTATAGTTTTCATTTCAATGCATCAGTTCTTTTCACCGCTTGCAAAAGTGAAAGA
CGAGCAACAAAACGGAAACATAGAAATAGTTAATGCAAAGGATGGTCATAGGGCTAAAGA
CTCATTCATCAACATGGCAGCAGGAGCAAATGAAGAGGCTAGTCACCGTGTTGAATCAGA
CGACAGAGAGCCGCTTCTTCCAAGATAAACAAAACTCTCTCAGTGAGATCATAAGCACCT
AGTTCGGTTGTTAGATTTCTGTTCACACAGTCCTTGTCTCAGGGGCGGATCTATTAACAA
GTTAGGGGGGTCAGCTGACCCCACTAGATTTTTTTTATTTCTTTCTCTACATAAAAGTTC
AGGGTCCGACTGGGGATAGGGCTGTTGAGGCTTTGTGGTTGTATAAAGCCATGAAATCCA
AAAAATTACCAATCAATTTTATGGGGTTTTAGAAATTTGTAAAGCCTTAAAACCATTTAA
AAACTGTCTTTTTGTTCATTTTTTTTTCAACAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 30 45 45 45 45 45 45 45 
15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY82TF U 1
AF RR2G572TF U 571
AF RR2CQ67TF U 532
AF RR2B122TF U 574
AF RR2GY82JQ C 528
AF RR2CQ67JQ C 620
AF RR2B122JQ C 574
AF RR2G572JQ C 765
BS 1 593 RR2GY82TF
BS 594 594 RR2G572TF
BS 595 629 RR2GY82TF
BS 630 630 RR2G572TF
BS 631 699 RR2GY82TF
BS 700 700 RR2CQ67TF
BS 701 747 RR2G572TF
BS 748 748 RR2CQ67TF
BS 749 753 RR2G572TF
BS 754 754 RR2CQ67TF
BS 755 790 RR2G572TF
BS 791 791 RR2CQ67TF
BS 792 801 RR2G572TF
BS 802 802 RR2CQ67TF
BS 803 831 RR2G572TF
BS 832 832 RR2CQ67TF
BS 833 919 RR2G572TF
BS 920 1128 RR2CQ67TF
BS 1129 1135 RR2B122TF
BS 1136 1318 RR2GY82JQ
BS 1319 1337 RR2B122JQ
BS 1338 1355 RR2G572JQ

RD RR2GY82TF 699 0 0
GCCTGTGTTAGTGTACATGTCTAAAGTGGATGGAAAGTTCAACTTCAGTCCTATTAGCGT
CAACTTCTTGACGGAAATCGCAAAGGTTATGTTTGCGCTTGTCATGCTTCTGATCCAGGC
CAGGCACCAAAAAGTTGGAGAGAAGCCTCTACTATCCTTATCCACATTTGTCCAGGCAGC
TCGGAACAATGTGCTTCTCGCTGTTCCAGCGGGATTGTATGCCATTAATAACTATCTTAA
GTTCACAATGCAGTTATATTTCAATCCTGCTACTGTGAAGATGCTTAGCAATCTAAAGGT
TCTGGTAATTGCTGTGCTACTGAAGATGATAATGAAGCGACGGTTTTCCATCATACAGTG
GGAAGCACTTGCTCTGTTGCTGATAGGGATTAGTGTAAACCAGCTGCGTTCTCTTCCTGA
AGGTGCTACTACTATGGCTGTTCCAGTTGCTATGGGTGCATACATCTGTACCTTTATCTT
TGTTACTGTCCCATCCTTTGCATCTGTCTACAACGAGTATGCTCTAAAGAGCCAGTATGA
CACCAGCATTTATCTCCAGAACTTATTCCTCTATGGTTACGGTGCAATATTCAGCTTCCT
TGGAATACTAGCAACTGTTATATACAAAG*TCCTGGCAGTTTTGACATCCTACAAGGACA
TTCTAGAGCTACCATGTTTCTGATACTGAACAACGCAGC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2G572TF 349 0 0
G
TATGGTTATGGTGCAATATTCAATTTCCTTGGAATACTAGCAACTGTTATATACAAAGGT
CCTGGCAGTTTTGACATCCTACAAGGACATTCTAGAGCTACCATGTTTCTGATACTGAAC
AACGCAGCTCAAGGGATTCTATCCTCCTTTTTCTTCAAATATGCAGATACAATCTTAAAG
AAATATTCATCTACGGTTGCCACAATATTTACTGGCATAACATCTGCAGCACTCTTTGGA
CATGTGTTAACCATGAATTTCCTTCTGGGGATTTCTATAGTTTTCATTTCAATGCATCAG
TTCTTTTCACCGCTTGCAAAAGTGAAAGACGAGCAACAAAACGGAAAC

QA 2 349 2 349
DS 

RD RR2CQ67TF 602 0 0
G
CAGTATGACACCAGCATTTATCTCCAGAACTTATTCCTCTATGGTTACGGTGCAATATTC
AACTCCCTTGGAATACTAGCAACTGTTATATACAAAGGTCCTGGCAGTTTTGACATCCTA
CAAGGACATTCTAGAGCTACCATGTTTCTGATACTGAACAACGCAGCACAAGGGATTCTA
TCCTCCTTTTTCTTCGAATATGCAGATACAATCTTGAAGAAGTATTCATCTACGGTTGCC
ACAATATTTACTGGCATAGCATCTGCAGCTCTCTTTGGACATGTGTTAACCATGAATTTT
CTTCTGGGGATTTCTATAGTTTTCATTTCAATGCATCAGTTCTTTTCACCGCTTGCAAAA
GTGAAAGACGAGCAACAAAACGGAAACATAGAAATAGTTAATGCAAAGGATGGTCATAGG
GCTAAAGACTCATTCATCAACATGGCAGCAGGAGCAAATGAAGAGGCTAGTCACCGTGTT
GAATCAGACGACAGAGAGCCGCTTCTTCCAAGATAAACAAAACTCTCTCAGTGAGATCAT
AAGCACCTAGTTCGGTTGTTAGATTTCTGTTCACACAGTCCTTGTCTCAGGGGCGG
TCTAT

QA 2 597 2 597
DS 

RD RR2B122TF 562 0 0
G
GGTTACGGTGCAATATTCAACTTCCTTGGAATACTAGCAACTGTTATATACAAAGGTCCT
GGCAGTTTTGACATCCTACAAGGACATTCTAGAGCTACCATGTTTCTGATACTGAACAAC
GCAGCACAAGGGATTCTATCCTCCTTTTTCTTCAAATATGCAGATACAATCTTGAAGAAG
TATTCATCTACGGTTGCCACAATATTTACTGGCATAGCATCTGCAGCTCTCTTTGGACAT
GTGTTAACCATGAATTTTCTTCTGGGAATTTCTATAGTTTTCATTTCAATGCATCAGTTC
TTTTCACCGCTTGCAAAAGTGAAAGACGAGCAACAAAACGGAAACATAGAAATAGTTAAT
GCAAAGGATGGTCATAGGGCTAAAGACTCATTCATCAACATGGCAGCAGGAGCAAATGAA
GAGGCTAGTCACCGTGTTGAATCAGACGACAGAGAGCCGCTTCTTCCAAGATAAACAAAA
CTCTCTCAGTGAGATCATAAGCACCTAGTTCGGTTGTTAGATTTCTGTTCACACAGTCCT
TGTCTCAGGGGCGGATCTATT

QA 2 562 2 562
DS 

RD RR2GY82JQ 791 0 0
AGAGC
CAGTATGACACCAGCATTTATCTCCAGAACTTATTCCTCTATGGTTACGGTGCAATATTC
AGCTTCCTTGGAATACTAGCAACTGTTATATACAAAGGTCCTGGCAGTTTTGACATCCTA
CAAGGACATTCTAGAGCTACCATGTTTCTGATACTGAACAACGCAGCACAAGGGATTCTA
TCCTCCTTTTTCTTCAAATATGCAGATACAATCTTGAAGAAGTATTCATCTACGGTTGCC
ACAATATTTACTG*CATAGCATCTGCAGCTCTCTTTGGACATGTGTTAACCATGAATTTT
CTTCTGGGGATTTCTATAGTTTTCATTTCAATGCATCAGTTCTTTTCACCGCTTGCAAAA
GTGAAAGACGAGCAACAAAACGGAAACATAGAAATAGTTAATGCAAAGGATGGTCATAGG
GCTAAAGACTCATTCATCAACATGGCAGCAGGAGCAAATGAAGAGGCTAGTCACCGTGTT
GAATCAGACGACAGAGAGCCGCTTCTTCCAAGATAAACAAAACTCTCTCAGTGAGATCAT
AAGCACCTAGTTCGGTTGTTAGATTTCTGTTCACACAGTCCTTGTCTCAGGGGCGGATCT
ATTAACAAGTTAGGGGGGTCAGCTGACCCCACTAGATTTTTTTTATTTCTTTCTCTACAT
AAAAGTTCAGGGTCCGACTGGGGATAGGGCTGTTGAGGCTTTGTGGTTGTATAAAGCCAT
GAAATCCAAAAAATTACCAATCAATTTTATGGGGTTTTAGAAATTTGTAAAGCCTTAAAA
CCATTT

QA 6 791 6 791
DS 

RD RR2CQ67JQ 689 0 0
ATATACAAAGGTCCTGGCAGTTTTGACATCCTACAAGGACATTCTAGAGCTACCATGTTT
CTGATACTGAACAACGCAGCACAAGGGATTCTATCCTCCTTTTTCTTCGAATATGCAGAT
ACAATCTTGAAGAAGTATTCATCTACGGTTGCCACAATATTTACTGGCATAGCATCTGCA
GCTCTCTTTGGACATGTGTTAACCATGAATTTTTTTCTGGGGATTTCTATAGTTTTCATT
TCAATGCATCAGTTCTTTTCACCGCTTGCAAAAGTGAAAGACGAGCAACAAAACGGAAAC
ATAGAAATAGTTAATGCAAAGGATGGTCATAGGGCTAAAGACTCATTCATCAACATGGCA
GCAGGAGCAAATGAAGAGGCTAGTCACCGTGTTGAATCAGACGACAGAGAGCCGCTTCTT
CCAAGATAAACAAAACTCTCTCAGTGAGATCATAAGCACCTAGTTCGGTTGTTAGATTTC
TGTTCACACAGTCCTTGTCTCAGGGGCGGATCTATTAACAAGTTAGGGGGGTCAGCTGAC
CCCACTAGATTTTTTTTATTTCTTTCTCTACATAAAAGTTCAGGGTCCGACTGGGGATAG
GGCTGTTGAGGCTTTGTGGTTGTATAAAGCCATGAAATCCAAAAAATTACCAATCAATTT
TATGGGGTTTTAGAAATTTGTAAAGCCTT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2B122JQ 765 0 0
G
GGTTACGGTGCAATATTCAACTTCCTTGGAATACTAGCAACTGTTATATACAAAGGTCCT
GGCAGTTTTGACATCCTACAAGGACATTCTAGAGCTACCATGTTTCTGATACTGAACAAC
GCAGCACAAGGGATTCTATCCTCCTTTTTCTTCAAATATGCAGATACAATCTTGAAGAAG
TATTCATCTACGGTTGCCACAATATTTACTGGCATAGCATCTGCAGCTCTCTTTGGACAT
GTGTTAACCATGAATTTTCTTCTGGGAATTTCTATAGTTTTCATTTCAATGCATCAGTTC
TTTTCACCGCTTGCAAAAGTGAAAGACGAGCAACAAAACGGAAACATAGAAATAGTTAAT
GCAAAGGATGGTCATAGGGCTAAAGACTCATTCATCAACATGGCAGCAGGAGCAAATGAA
GAGGCTAGTCACCGTGTTGAATCAGACGACAGAGAGCCGCTTCTTCCAAGATAAACAAAA
CTCTCTCAGTGAGATCATAAGCACCTAGTTCGGTTGTTAGATTTCTGTTCACACAGTCCT
TGTCTCAGGGGCGGATCTATTAACAAGTTAGGGGGGTCAGCTGACCCCCCTAGATTTTTT
TTATTTCTTTCTCTACATAAAAGTTCAGGATCCGACTGGGGATAGGGCTGTTGAGGCTTT
GTGGTTGTATAAAGCCATGAAATCCAAAAAATTACCAATCAATTTTATGGGGTTTTAGAA
ATTTGTAAAGCCTTAAAACCATTTAAAAACTGTCTTTTTGTTC
G

QA 2 764 2 764
DS 

RD RR2G572JQ 591 0 0
CGGTTGCCACAATATTTACTGGCATAGCATCTGCAGCACTCTTTGGACATGTGTTAACCA
TGAATTTCCTTCTGGGGATTTCTATAGTTTTCATTTCAATGCATCAGTTCTTTTCACCGC
TTGCAAAAGTGAAAGACGAGCAACAAAACGGAAACATAGAAATAGTTAATGCAAAGGATG
GTCATAGGGCTAAAGACTCATTCATCAACATGGCAGCAGGAGCAAATGAAGAGGCTAGTC
ACCGTGTTGAATCAGACGACAGAGGGCCGCTTCTTCCAAGATAAACAAAACTCTCTCAGC
GAGATCATAAGCACCTAGTTCGGTTGTCAGATTTCTGTTCACACAGTCCTTGTCTCAGGG
GCGGATCTATTAACAAGTTAGGGGGGTCAGCTGACCCCACTAGATTTTTTTTATTTCTTT
CTCTACATAAAAGTTCAGGGTCCGATTGGGGATAGGGCTGTTGAGGCTTTGTGGTTGTAT
AAAGCCATAAAATCCAAAAAATTACCAATCAATTTTATGGGGTTTTAGAAATTTGTAAAG
CCTTAAAACCATTTAAAAACTGTCTTTTTGTTCATTTTTTTTTCAACAGCC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 2 8

CO CL958Contig1 642 4 6 U
TCTTTCATTTCATTTCATTTCTTCTGCAACACATAGCGATGGCGGCGAGAAATGCTCTGC
TTCGATACCTTAGAGTCAACGTCAATCCATCACTACTAAACCCTACAACAGTCGGCGCTA
GAGAAGCAGCACTGCCTTTCGCCGTCCTCCTTCGACGTTTCTCGGAGGAAGTAAGAGGAT
CGTTTCTAGACAAATCTGATGTCACAGATCGCGTTATCTCTGTCGTCAAAAACTTCCAAA
GAGTCGATCCCTCAAAGGTTACACCAAAAGCCCATTTCCATAACGATCTAGGGCTAGACA
GTTTGGACAGTGTGGAAGTTGTGATGGCATTGGAGGAAGAATTCAAATTTGAGATCCCTG
ATAATGAGGCTGACAAGATCCAGTCCGTCGATCAAGCGGTTGATTTTATCGCTTCTCATC
CTCAGGCCACTTAAAAAGGGAAACAAATTCTTCAGTGCTATGGCATCATGCCTTCTGTGC
CCAATAAGAAGTTCAGAAACAAACATATTTTTTTCGGCTCTACTTTTGTTTTCATAAGGT
ATTAGATGTGTTCTTTGCTTGAGTTTACGAGGTCTTTCCTGAAACTTT*GTTGTTCTTGA
CAATCTTTTGATGAATAATGCATCTGAGACTCGTTGCATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR2AB32JQ C 24
AF RR2DI31TF U 1
AF RR2DI31JQ C 11
AF RR2AB32TF U 24
BS 1 119 RR2DI31TF
BS 120 120 RR2AB32TF
BS 121 293 RR2DI31TF
BS 294 294 RR2AB32TF
BS 295 637 RR2DI31TF
BS 638 642 RR2AB32TF

RD RR2AB32JQ 339 0 0
GG
GCAACACATAGCGATGGCGGCGAGAAATGCTCTGCTTCGATACCTTAGAGTCAACGTCAA
TCCATCACTACTAAACCCTACAACAGTCGGCGCTAGAGAAGCAGCACTGCCTTTCGCCGT
CCTCCTTCGACGTTTCTCGGAGGAAGTAAGAGGATCGTTTCTAGACAAATCTGATGTCAC
AGATCGCGTTATCTCTGTCGTCAAAAACTTCCAAAGAGTCGATCCCTCAAAGGTTACACC
AAAAGCCCATTTCCATAACGATCTAGGGCTAGACAGTTTGGACAGTGTGGAAGTTGTGAT
GGCATTGGAGGAAGAATTCAAATTTGAGATCCCTGAT

QA 3 339 3 339
DS 

RD RR2DI31TF 637 0 0
TCTTTCATTTCATTTCATTTCTTCTGCAACACATAGCGATGGCGGCGAGAAATGCTCTGC
TTCGATACCTTAGAGTCAACGTCAATCCATCACTACTAAACCCTACAACAGTCGGCGCTG
GAGAAGCAGCACTGCCTTTCGCCGTCCTCCTTCGACGTTTCTCGGAGGAAGTAAGAGGAT
CGTTTCTAGACAAATCTGATGTCACAGATCGCGTTATCTCTGTCGTCAAAAACTTCCAAA
GAGTCGATCCCTCAAAGGTTACACCAAAAGCCCATTTCCATAACGATCTAGGGTTAGACA
GTTTGGACAGTGTGGAAGTTGTGATGGCATTGGAGGAAGAATTCAAATTTGAGATCCCTG
ATAATGAGGCTGACAAGATCCAGTCCGTCGATCAAGCGGTTGATTTTATCGCTTCTCATC
CTCAGGCCACTTAAAAAGGGAAACAAATTCTTCAGTGCTATGGCATCATGCCTTCTGTGC
CCAATAAGAAGTTCAGAAACAAACATATTTTTTTCGGCTCTACTTTTGTTTTCATAAGGT
ATTAGATGTGTTCTTTGCTTGAGTTTACGAGGTCTTTCCTGAAACTTT*GTTGTTCTTGA
CAATCTTTTGATGAATAATGCATCTGAGACTCGTTGC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2DI31JQ 627 0 0
CATTTCATTTCTTCTGCAACACATAGCGATGGCGGCGAGAAATGCTCTGCTTCGATACCT
TAGAGTCAACGTCAATCCATCACTACTAAACCCTACAACAGTCGGCGCTGGAGAAGCAGC
ACTGCCTTTCGCCGTCCTCCTTCGACGTTTCTCGGAGGAAGTAAGAGGATCGTTTCTAGA
CAAATCTGATGTCACAGATCGCGTTATCTCTGTCGTCAAAAACTTCCAAAGAGTCGATCC
CTCAAAGGTTACACCAAAAGCCCATTTCCATAACGATCTAGGGTTAGACAGTTTGGACAG
TGTGGAAGTTGTGATGGCATTGGAGGAAGAATTCAAATTTGAGATCCCTGATAATGAGGC
TGACAAGATCCAGTCCGTCGATCAAGCGGTTGATTTTATCGCTTCTCATCCTCAGGCCAC
TTAAAAAGGGAAACAAATTCTTCAGTGCTATGGCATCATGCCTTCTGTGCCCAATAAGAA
GTTCAGAAACAAACATATTTTTTTCGGCTCTACTTTTGTTTTCATAAGGTATTAGATGTG
TTCTTTGCTTGAGTTTACGAGGTCTTTCCTGAAACTTT*GTTGTTCTTGACAATCTTTTG
ATGAATAATGCATCTGAGACTCGTTGC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2AB32TF 619 0 0
GG
GCAACACATAGCGATGGCGGCGAGAAAAGCTCTGCTTCGATACCTTAGAGTCAACGTCAA
TCCATCACTACTAAACCCTACAACAGTCGGCGCTAGAGAAGCAGCACTGCCTTTCGCCGT
CCTCCTTCGACGTTTCTCGGAGGAAGTAAGAGGATCGTTTCTAGACAAATCTGATGTCAC
AGATCGCGTTATCTCTGTCGTCAAAAACTTCCAAAGAGTCGATCCCTCAAAGGTTACACC
AAAAGCCCATTTCCATAACGATCTAGGGCTAGACAGTTTGGACAGTGTGGAAGTTGTGAT
GGCATTGGAGGAAGAATTCAAATTTGAGATCCCTGATAATGAGGCTGACAAGATCCAGTC
CGTCGATCAAGCGGTTGATTTTATCGCTTCTCATCCTCAGGCCACTTAAAAAGGGAAACA
AATTCTTCAGTGTTATGGCATCATGCCTTCTGTGCCCAATAAGAAGTTCAGAAACAAACA
TATTTTTTTCGGCCCTACTTTTGTTTTCATAAG*TATTAGATGTGTTCTTTGCTTGAGTT
TACGAGGTCCTTCCTGAAACTTTTGTTGTTCTTGACAATCTTTTGATGAATAATGCATCT
GAGACTCGTTGCATTTG

QA 3 619 3 619
DS 



CO CL958Contig2 661 4 24 U
TTTTTTTTTGCAACGAGTCTCAGATGCATTATTCATCAAAAGATTGTCAAGAACAACAAA
GTTTCAGGAAAGACCTCGTAAACCCAAGCAAAGAACACATCTAAAACCATATGAAAACAA
AAGTAGAGCCGAAAAAAATATGTTTGTTTCTGAACTTCTTATTGGGCACAGAAGGCATGA
TGCCATAACACTGAAGAATTTGTTTCCCTTTTTAAGTGGCCTGAGGATGAGAAGCGATAA
AATCAACCGCTTGATCGACGGACTGGATCTTGTCAGCCTCATTATCAGGGATCTCAAATT
TGAATCCTTCCTCCAATGCCATCACAACTTCCACACTGTCCAAACTGTCTAACCCTAGAT
CGTTATGGAAATGGGCTTTTGGTGTAACCTTTGAGGGATCGACTCTTTGGAAGTTTTTGA
CGACAGAGATAACGCGATCCGTGACATCAGATTTGTCTAGAAACGATCCTCTAACTTCCT
CCGAGAAACGACGAAGAAGGACGGAGAAAGGCAGTGCTGCTTCTCTAGCGCCGATTGTTG
TGGGGTTTAGTAGTGATGGATTGACGTTGACTCTGAGGTAACGAAGCAGAGCATTTCTCG
CCGCCATCGCTATGTGTTGCAGAAGAAATGAAATGAAAGACAACCCTAGAATTAGAATCC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RR2GD12JQ U 2
AF RR2F706JQ U 10
AF RR2F706TF C 1
AF RR2GD12TF C 55
BS 1 8 RR2F706TF
BS 9 138 RR2GD12JQ
BS 139 139 RR2F706JQ
BS 140 183 RR2GD12JQ
BS 184 184 RR2F706JQ
BS 185 305 RR2GD12JQ
BS 306 306 RR2F706JQ
BS 307 364 RR2GD12JQ
BS 365 365 RR2F706JQ
BS 366 385 RR2GD12JQ
BS 386 386 RR2F706JQ
BS 387 424 RR2GD12JQ
BS 425 425 RR2F706JQ
BS 426 439 RR2GD12JQ
BS 440 440 RR2F706JQ
BS 441 490 RR2GD12JQ
BS 491 491 RR2F706JQ
BS 492 496 RR2GD12JQ
BS 497 497 RR2F706JQ
BS 498 504 RR2GD12JQ
BS 505 505 RR2F706JQ
BS 506 521 RR2GD12JQ
BS 522 597 RR2F706JQ
BS 598 661 RR2F706TF

RD RR2GD12JQ 520 0 0
CCTCAAA
TGCAACGAGTCTCAGATGCATTATTCATCAAAAGATTGTCAAGAACAACAAAGTTTCAGG
AAAGACCTCGTAAACCCAAGCAAAGAACACATCTAAAACCATATGAAAACAAAAGTAGAG
CCGAAAAAAA*ATGTTTGTTTCTGAACTTCTTATTGGGCACAGAAGGCATGATGC*ATAA
CACTGAAGAATTTGTTTCCCTTTTTAAGTGGCCTGAGGATGAGAAGCGATAAAATCAACC
GCTTGATCGACGGACTGGATCTTGTCAGCCTCATTATCAGGGATCTCAAATTTGAATTCT
TCCTCCAATGCCATCACAACTTCCACACTGTCCAAACTGTCTAACCCTAGATCGTTGTGG
AAATGGGCTTTTGGTGTTACCTTTGAGGGATCGACTCTTTGGAAGTTTTTGACGACGGAG
ATAACGCGATCTGTGACATCAGATTTGTCTAGAAACGATCCTCTAACTTCCTCCGAGAAA
CGTCGAAGGAGGACGGCGAAAGGCAGTGCTGCT

QA 8 520 8 520
DS 

RD RR2F706JQ 588 0 0
GCAACGAGTCTCAGATGCATTATTCATCAAAAGATTGTCAAGAACAACAAAGTTTCAGGA
AAGACCTCGTAAACTCAAGCAAAGAACACATCTAATACCTTATGAAAACAAAAGTAGAGC
CGAAAAAAATATGTTTGTTTCTGAACTTCTTATTGGGCACAGAAGGCATGATGCCATAAC
ACTGAAGAATTTGTTTCCCTTTTTAAGTGGCCTGAGGATGAGAAGCGATAAAATCAACCG
CTTGATCGACGGACTGGATCTTGTCAGCCTCATTATCAGGGATCTCAAATTTGAATCCTT
CCTCCAATGCCATCACAACTTCCACACTGTCCAAACTGTCTAACCCTAGATCGTTATGGA
AATGGGCTTTTGGTGTAACCTTTGAGGGATCGACTCTTTGGAAGTTTTTGACGACAGAGA
TAACGCGATCCGTGACATCAGATTTGTCTAGAAACGATCCTCTAACTTCCTCCGAGAAAC
GACGAATAAGGACGGAGAAAGGCAGTGCTGCTTCTCTAGCGCCGATTGTTGTGGGGTTTA
GTAGTGATGGATTGACGTTGACTCTGAGGTAACGAAGCAGAGCATTTC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2F706TF 661 0 0
TTTTTTTTTGCAACGAGTCTCAGATGCATTATTCATCAAAAGATTGTCAAGAACAACAAA
GTTTCAGGAAAGACCTCGTAAACTCAAGCAAAGAACACATCTAATACCTTATGAAAACAA
AAGTAGAGCCGAAAAAAATATGTTTGTTTCTGAACTTCTTATTGGGCACAGAAGGCATGA
TGCCATAACACTGAAGAATTTGTTTCCCTTTTTAAGTGGCCTGAGGATGAGAAGCGATAA
AATCAACCGCTTGATCGACGGACTGGATCTTGTCAGCCTCATTATCAGGGATCTCAAATT
TGAATCCTTCCTCCAATGCCATCACAACTTCCACACTGTCCAAACTGTCTAACCCTAGAT
CGTTATGGAAATGGGCTTTTGGTGTAACCTTTGAGGGATCGACTCTTTGGAAGTTTTTGA
CGACAGAGATAACGCGATCCGTGACATCAGATTTGTCTAGAAACGATCCTCTAACTTCCT
CCGAGAAACGACGAATAAGGACGGAGAAAGGCAGTGCTGCTTCTCTAGCGCCGATTGTTG
TGGGGTTTAGTAGTGATGGATTGACGTTGACTCTGAGGTAACGAAGCAGAGCATTTCTCG
CCGCCATCGCTATGTGTTGCAGAAGAAATGAAATGAAAGACAACCCTAGAATTAGAATCC
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2GD12TF 607 0 0
AACAAAGTTTCAGGAAAGACCTCGTAAACCCAAGCAAAGAACACATCTAAAACCATATGA
AAACAAAAGTAGAGCCGAAAAAAA*ATGTTTGTTTCTGAACTTCTTATTGGGCACAGAAG
GCATGATGC*ATAACACTGAAGAATTTGTTTCCCTTTTTAAGTGGCCTGAGGATGAGAAG
CGATAAAATCAACCGCTTGATCGACGGACTGGATCTTGTCAGCCTCATTATCAGGGATCT
CAAATTTGAATTCTTCCTCCAATGCCATCACAACTTCCACACTGTCCAAACTGTCTAACC
CTAGATCGTTGTGGAAATGGGCTTTTGGTGTTACCTTTGAGGGATCGACTCTTTGGAAGT
TTTTGACGACGGAGATAACGCGATCTGTGACATCAGATTTGTCTAGAAACGATCCTCTAA
CTTCCTCCGAGAAACGTCGAAGGAGGACGGCGAAAGGCAGTGCTGCTTCTCTAGCGCCGA
TTGTTGTGGGGTTTAGTAGTGATGGATTGACGTTGACTCTAAGGTATCGAAGCAGAGCAT
TTCTCGCCGCCATCGCTATGTGTTGCAGAAGAAATGAAATGAAAGACAACCCTAGAATTA
GAATCCC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 8

CO CL959Contig1 1187 8 21 U
GGAGAACCAAACACTTCAGCTTTGGCTCTAATCTGTTCGCTATCTTATATATCGTAGATG
TTACTTTATGCTGTCTAAAGTGAATTGAGATAGAGAAAAAGAGAAAGAGAGTAGTAACAT
GGATGCTTGTTTTCTTACCTCAAGATCAATCTCTGGTGTCAAAGAGCTTGTCCCGTTCAT
CAAACCTAGAATCTTTTCTTGCCCCAAGAGAAGTTCCTGCCAGTTCCTCACCAGGAAGTT
TGCTTCTCCGTTCTCTGTAAATTGTTCACTTTCGGATTCATGGAAGCCACTGGACGATGA
TTGTGTCAACAATTCAACATCAGATGCTGACTGGAGAGAGTTCAGGGCAAGGCTGGTGGC
TGGAGAGCAAGCTGCAACCTCTGAGAAGGACTCGTCCTCGTGGTCTAACCCTGACATGGT
GGTTGACTATCCGTCATCATCATCGTCCTCACTGATCACAGTTGGAAACAAATGGGCACA
CAAGATCCACGAGCCAGAGCCAGGGTGTCTCCTAATCGCTACAGAGAAGCTAGATGGAGT
CCACATCTTCGAGAAGACAGTGATCCTCATCCTGTCTGTTGGACCTTCAGGTCCTATAGG
AGTCATACTCAACCGTCCATCGCTTATGTCTATCAAGGAGACTAAATCAACGGTCTTAGA
CGTGGCGGGAACGTTTTCAGACAAGAGGCTCTTCTTTGGTGGGCCTTTGGAAGAAGGGTT
GTTCCTGGTGAGTCCGAGGAGTGGCGGGGACAACGAGGTAGCGAAGAGCGGAGTGTTCAG
ACAAGTGATGAAAGGATTGTACTATGGGACGAGAGAGAGTGTGGGATTGGCTGCAGAGAT
GGTGAAGAGGAAGTTGGTGGGAAGAATTGAGCTAAGATTCTTTGATGGGTATTGCGGTTG
GGAAAAGGAGCAGTTGAAAGCAGAGATCTTGGGAGGGTACTGGACTGTGGCTGCTTGTAG
CTCGAGTGTTGTTGAGCTTGGTTCTGCTGTTCAGAGTCATGGTCTTTGGGATGAGGTTCT
TGGACTCATTGGTCCTCAAACTGGCTCTGTTATCTAAACTCTAGCTTCTGTAATGGTTTG
TGTTTTTACTAATGGTTTGTATCAATGAGTCATGACTATTGTGTATGTTTTATTGATGTA
TGTATGTATTAAGGGTTCATCACTAATTTAATGAGTATGAATGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 40 40 40 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS65TF U 1
AF RR2GK04TF U 58
AF RR2FJ92TF U 75
AF RR2FO17TF U 75
AF RR2D147JQ C 820
AF RR2AR11JQ C 536
AF RR2AR11TF U 536
AF RR2FJ92JQ C 539
BS 1 668 RR2CS65TF
BS 669 669 RR2GK04TF
BS 670 683 RR2CS65TF
BS 684 684 RR2GK04TF
BS 685 687 RR2CS65TF
BS 688 688 RR2GK04TF
BS 689 704 RR2CS65TF
BS 705 712 RR2GK04TF
BS 713 717 RR2FO17TF
BS 718 718 RR2AR11TF
BS 719 783 RR2FO17TF
BS 784 784 RR2AR11TF
BS 785 797 RR2FO17TF
BS 798 798 RR2AR11TF
BS 799 827 RR2FO17TF
BS 828 828 RR2AR11TF
BS 829 851 RR2FO17TF
BS 852 852 RR2AR11TF
BS 853 863 RR2FO17TF
BS 864 1163 RR2AR11TF
BS 1164 1187 RR2FJ92JQ

RD RR2CS65TF 709 0 0
GGAGAACCAAACACTTCAGCTTTGGCTCTAATCTGTTCGCTATCTTATATATCGTAGATG
TTACTTTATGCTGTCTAAAGTGAATTGAGATAGAGAAAAAGAGAAAGAGAGTAGTAACAT
GGATGCTTGTTTTCTTACCTCAAGATCAATCTCTGGTGTCAAAGAGCTTGTCCCGTTCAT
CAAACCTAGAATCTTTTCTTGCCCCAAGAGAAGTTCCTGCCAGTTCCTCACCAGGAAGTT
TGCTTCTCCGTTCTCTGTAAATTGTTCACTTTCGGATTCATGGAAGCCACTGGACGATGA
TTGTGTCAACAATTCAACATCAGATGCTGACTGGAGAGAGTTCAGGGCAAGGCTGGTGGC
TGGAGAGCAAGCTGCAACCTCTGAGAAGGACTCGTCCTCGTGGTCTAACCCTGACATGGT
GGTTGACTATCCGTCATCATCATCGTCCTCACTGATCACAGTTGGAAACAAATGGGCACA
CAAGATCCACGAGCCAGAGCCAGGGTGTCTCCTAATCGCTACAGAGAAGCTAGATGGAGT
CCACATCTTCGAGAAGACAGTGATCCTCATCCTGTCTGTTGGACCTTCAGGTCCTATAGG
AGTCATACTCAACCGTCCATCGCTTATGTCTATCAAGGAGACTAAATCAACGGTCTTAGA
CGTGGCGGTAACGTTTTCAGACA*GAG*CTCTTCTTTGGTGGGC
TTTGG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2GK04TF 655 0 0
GG
GTTACTTTATGCTGTCTAAAGTGAATTGAGATAGAGAAAAAGAGAAAGAGAGTAGTAACA
TGGATGCTTGTTTTCTTACCTCAAGATCAATCTCTGGTGTCAAAGAGCTTGTCCCGTTCA
TCAAACCTAGAATCTTTTCTTGCCCCAAGAGAAGTTCCTGCCAGTTCCTCACCAGGAAGT
TTGCTTCTCCGTTCTCTGTAAATTGTTCACTTTCGGATTCATGGAAGCCACTGGACGATG
ATTGTGTCAACAATTCAACATCAGATGCTGACTGGAGAGAGTTCAGGGCAAGGCTGGTGG
CTGGAGAGCAAGCTGCAACCTCTGAGAAGGACTCGTCCTCGTGGTCTAACCCTGACATGG
TGGTTGACTATCCGTCATCATCATCGTCCTCACTGATCACAGTTGGAAACAAATGGGCAC
ACAAGATCCACGAGCCAGAGCCAGGGTGTCTCCTAATCGCTACAGAGAAGCTAGATGGAG
TCCACATCTTCGAGAAGACAGTGATCCTCATCCTGTCTGTTGGACCTTCAGGTCCTATAG
GAGTCATACTCAACCGTCCATCGCTTATGTCTATCAAGGAGACTAAATCAATGGTCTTAG
ACGTGGCGGGAACGTTTTCAGACAAGAGGCTCTTCTTTGGTGGGCCTTTGGAA

QA 3 655 3 655
DS 

RD RR2FJ92TF 638 0 0
GG
AAAGTGAATTGAGATAGAGAAAAAGAGAAAGAGAGTAGTAACATGGATGCTTGTTTTCTT
ACCTCAAGATCAATCTCTGGTGTCAAAGAGCTTGTCCCGTTCATCAAACCTAGAATCTTT
TCTTGCCCCAAGAGAAGTTCCTGCCAGTTCCTCACCAGGAAGTTTGCTTCTCCGTTCTCT
GTAAATTGTTCACTTTCGGATTCATGGAAGCCACTGGACGATGATTGTGTCAACAATTCA
ACATCAGATGCTGACTGGAGAGAGTTCAGGGCAAGGCTGGTGGCTGGAGAGCAAGCTGCA
ACCTCTGAGAAGGACTCGTCCTCGTGGTCTAACCCTGACATGGTGGTTGACTATCCGTCA
TCATCATCGTCCTCACTGATCACAGTTGGAAACAAATGGGCACACAAGATCCACGAGCCA
GAGCCAGGGTGTCTCCTAATCGCTACAGAGAAGCTCGATGGAGTCCACATCTTCGAGAAG
ACAGTGATCCTCATCCTGTCTGTTGGACCTTCAGGTCCTATAGGAGTCATACTCAACCGT
CCATCGCTTATGTCTATCAAGGAGACTAAATCAACGGTCTTAGACGTGGCGGGAACGTTT
TCAGACAAGAGGCTCTTCTTTGGTGGGCCTTTGGAA

QA 3 638 3 638
DS 

RD RR2FO17TF 804 0 0
GG
AAAGTGAATTGAGATAGAGAAAAAGAGAAAGAGAGTAGTAACATGGATGCTTGTTTTCTT
ACCTCAAGATCAATCTCTGGTGTCAAAGAGCTTGTCCCGTTCATCAAACCTAGAATCTTT
TCTTGCCCCAAGAGAAGTTCCTGCCAGTTCCTCACCAGGAAGTTTGCTTCTCCGTTCTCT
GTAAATTGTTCACTTTCGGATTCATGGAAGCCACTGGACGATGATTGTGTCAACAATTCA
ACATCAGATGCTGACTGGAGAGAGTTCAGGGCAAGGCTGGTGGCTGGAGAGCAAGCTGCA
ACCTCTGAGAAGGACTCGTCCTCGTGGTCTAACCCTGACATGGTGGTTGACTATCCGTCA
TCATCATCGTCCTCGCTGATCACAGTTGGAAACAAATGGGCACACAAGATCCACGAGCCA
GAGCCAGGGTGTCTCCTAATCGCTACAGAGAAGCTAGATGGAGTCCACATCTTCGAGAAG
ACAGTGATCCTCATCCTGTCTGTTGGACCTTCAGGTCCTATAGGAGTCATACTCAACCGT
CCATCGCTTATGTCTATCAAGGAGACTAAATCAGCGGTCTTAGACGTGGCGGGAACGTTT
TCAGACAAGACGCTCTTCTTTGGTGGGCCTTTGGAAGAAGG*TTGTTCCTGGTGAGTCCG
AGGAGTGGCGGGGACAACGAGGTAGCGAAGAGCGGAGTGTTCAGACA*GTGATGAAAGGA
T*GTACTATGGGACGAGAGAGAGTGTGGGAT*GGCTGCAGAGATGGTGAAGAGGA*GTTG
GTGGGAA
AAGTGAGCTAGATTC

QA 3 789 3 789
DS 

RD RR2D147JQ 125 0 0
TGTGGGATTGGCTGCAGAGATGGTGAAGGGGAAGTTGGTGGGAAGAAGTGAGCTAAGATT
CTCCGATGGGTATTGCGGTTGGGAAAAGGACCAGTTGAAAGCAGAGATCTTGGGAGGGTA
CTGGA

QA 1 125 1 125
DS 

RD RR2AR11JQ 629 0 0
GGAGTCCACATCTTCGAGAAGACAGTGATCCTCATCCTGTCTGTTGGACCTTCAGGTCCT
ATAGGAGTCATACTCAACCGTCCATCGCTTATGTCTATCAAGGAGACTAAATCAACGGTC
TTAGACGTGGCGGGAACGTTTTCAGACAAGAGGCTCTTCTTTGGTGGGCCTTTGGAAGAA
GGGTTGTTCCTGGTGAGTCCGAGGAGTGGCGGGGACAACGAGGTAGCGAAGAGCGGAGTG
TTCAGACAAGTGATGAAAGGATTGTACTATGGGACGAGAGAGAGTGTGGGATTGGCTGCA
GAGATGGTGAAGAGGAAGTTGGTGGGAAGAATTGAGCTAAGATTCTTTGATGGGTATTGC
GGTTGGGAAAAGGAGCAGTTGAAAGCAGAGATCTTGGGAGGGTACTGGACTGTGGCTGCT
TGTAGCTCGAGTGTTGTTGAGCTTGGTTCTGCTGTTCAGAGTCATGGTCTTTGGGATGAG
GTTCTTGGACTCATTGGTCCTCAAACTGGCTCTGTTATCTAAACTCTAGCTTCTGTAATG
GTTTGTGTTTTTACTAATGGTTTGTATCAATGAGTCATGACTATTGTGTATGTTTTATTG
ATGTATGTATGTATTAAGGGTTCATCAC
C

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2AR11TF 629 0 0
GGAGTCCACATCTTCGAGAAGACAGTGATCCTCATCCTGTCTGTTGGACCTTCAGGTCCT
ATAGGAGTCATACTCAACCGTCCATCGCTTATGTCTATCAAGGAGACTAAATCAACGGTC
TTAGACGTGGCGGGAACGTTTTCAGACAAGAGGCTCTTCTTTGGTGGGCCTTTGGAAGAA
GGGTTGTTCCTGGTGAGTCCGAGGAGTGGCGGGGACAACGAGGTAGCGAAGAGCGGAGTG
TTCAGACAAGTGATGAAAGGATTGTACTATGGGACGAGAGAGAGTGTGGGATTGGCTGCA
GAGATGGTGAAGAGGAAGTTGGTGGGAAGAATTGAGCTAAGATTCTTTGATGGGTATTGC
GGTTGGGAAAAGGAGCAGTTGAAAGCAGAGATCTTGGGAGGGTACTGGACTGTGGCTGCT
TGTAGCTCGAGTGTTGTTGAGCTTGGTTCTGCTGTTCAGAGTCATGGTCTTTGGGATGAG
GTTCTTGGACTCATTGGTCCTCAAACTGGCTCTGTTATCTAAACTCTAGCTTCTGTAATG
GTTTGTGTTTTTACTAATGGTTTGTATCAATGAGTCATGACTATTGTGTATGTTTTATTG
ATGTATGTATGTATTAAGGGTTCATCAC
C

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2FJ92JQ 649 0 0
GTCCACATCTTCGAGAAGACAGTGATCCTCATCCTGTCTGTTGGACCTTCAGGTCCTATA
GGAGTCATACTCAACCGTCCATCGCTTATGTCTATCAAGGAGACTAAATCAACGGTCTTA
GACGTGGCGGGAACGTTTTCAGACAAGAGGCTCTTCTTTGGTGGGCCTTTGGAAGAAGGG
TTGTTCCTGGTGAGTCCGAGGAGTGGCGGGGACAACGAGGTAGCGAAGAGCGGAGTGTTC
AGACAAGTGATGAAAGGATTGTACTATGGGACGAGAGAGAGTGTGGGATTGGCTGCAGAG
ATGGTGAAGAGGAAGTTGGTGGGAAGAAGTGAGCTAAGATTCTTTGATGGGTATTGCGGT
TGGGAAAAGGAGCAGTTGAAAGCAGAGATCTTGGGAGGGTACTGGACTGTGGCTGCTTGT
AGCTCGAGTGTTGTTGAGCTTGGTTCTGCTGTTCAGAGTCATGGTCTTTGGGATGAGGTT
CTTGGACTCATTAGTCCTCAAACTGGCTCTGTTATCTAAACTCTAGCTTCTGTAATGGTT
TGTGTTTTTACTAATGGTTTGTATCAATGAGTCATGACTATTGTATATGTTTTATTGATG
TATGTATGTATTAAGGATTCATCACTAATTTAATGAGTATGAATGTTTC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 3

CO CL960Contig1 1420 3 3 U
GGGCGTTTGCCACCACAACGTTGTCTCCTCTTCTGGTTTTACTCATTGCTCTTTGATTGG
TCTCGCCTCCGTCTCTAATCCTCTTCTACAATTTACTTCCATGTTGCACGCTGCTTGTGT
CTGAATAATCTATTGTGTTTTTTTTCTCTCTCTATCTCTCTTAAGGGGTTTAAGTTTTTA
TCTAATGGCTTCCAGTCCAGACAAGAATCTGTCTCCTTCAGATGAGAAAACCGGTACTAA
ACCGGAATCAACAGCAGCCTCCTCTGGGAATTCACCTTCTTCAGCTAACAACCCTCCTCC
TGGCCTCAATTTCAATGCTTTTGATTTCTCCAACATGGCTGGTATCCTCAACGATCCAAG
CATCAGAGAATTGGCTGAGCAGATTGCTAAAGATCCTGCCTTTACCCAAATGACTGAGCA
GTTTCAGAGATCTATCCCAAACGCAGCTCAGGGAGGTGGAGGAGAAGGAGGTTTCCCTAA
CATCGATCCACAACAGTATATGAGCACAATGCAGCAGGTTATGCACAACCCCGAGTTTCT
GACTATGGCTGATCGTCTTGGTAAAGCCATAGTTCAGGATCCACAAATGTCTCCGTTTTT
GGATGCGTTCTCGAATCCTGAAACGGCAGAGCAGTTTACTGAGCGTATGGCGAGGATGAA
AGAGGATCCGGAGTTGAAACCTATACTTGATGAGATTGATGCTGGTGGTCCTTCTGCTAT
GATGAAGTACTGGAATGATAAAGATGTGCTGAAAAAGCTTGGTGAAGCAATGGGTATGCC
TATTCCTGGCTTTCCAGACCAGACTGCTTCAGCTGAACCCGAGGTAGCAGCAGGGGAAGA
AGGTGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTTTATTGTTCATCAAACTGCCAGTCTTGG
TAATGTTGAGGGTTTGAAAAATGCTTTGGCATCTGGTGGTAACAAAGATGAAGAAGATTT
TGAAGGAAGGACAGCTTTGCATTTTGCTTGTGGATATGGCGAGTTGAAATGTGCTCAAGT
TTTTATCGACGCTGGAGCAAGTGTGAACGCACTTGACAGAAACAAGAACACACCACTCCA
TTACGCTTCTGGTTACGGGAGGAAAGAATGCGTTAGCCTTTTCCTAGAGAATGGTGCTGC
AGTGACTTTGCAAAACCAAGACGAGAAGACACCCACTGACGTAGCCAAGCTCAACAACCA
AGTCGAGGTGGTGAAGCTGCTCGAGAAGGACGCTTTCCTTTGAGCTTAGGGTTAAAAACA
AAAGCTCTTTGTGCCAAAAAAAAACAAAAAAAAACAAAAGCTTTAAGATCAATGTTGTCT
GAAAACCAATTCACAGACTTTTGTATACTTGTTCTTTTTTCTGATTTAATCGTGTTTAAT
TTTAATTACTCTTTTGATAAAAAAAAAAGTTAATTACTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY06TF U 1
AF RR2BN23TF U 138
AF RR2GY06JQ C 626
BS 1 705 RR2GY06TF
BS 706 821 RR2BN23TF
BS 822 1420 RR2GY06JQ

RD RR2GY06TF 705 0 0
GGGCGTTTGCCACCACAACGTTGTCTCCTCTTCTGGTTTTACTCATTGCTCTTTGATTGG
TCTCGCCTCCGTCTCTAATCCTCTTCTACAATTTACTTCCATGTTGCACGCTGCTTGTGT
CTGAATAATCTATTGTGTTTTTTTTCTCTCTCTATCTCTCTTAAGGGGTTTAAGTTTTTA
TCTAATGGCTTCCAGTCCAGACAAGAATCTGTCTCCTTCAGATGAGAAAACCGGTACTAA
ACCGGAATCAACAGCAGCCTCCTCTGGGAATTCACCTTCTTCAGCTAACAACCCTCCTCC
TGGCCTCAATTTCAATGCTTTTGATTTCTCCAACATGGCTGGTATCCTCAACGATCCAAG
CATCAGAGAATTGGCTGAGCAGATTGCTAAAGATCCTGCCTTTACCCAAATGACTGAGCA
GTTTCAGAGATCTATCCCAAACGCAGCTCAGGGAGGTGGAGGAGAAGGAGGTTTCCCTAA
CATCGATCCACAACAGTATATGAGCACAATGCAGCAGGTTATGCACAACCCCGAGTTTCT
GACTATGGCTGATCGTCTTGGTAAAGCCATAGTTCAGGATCCACAAATGTCTCCGTTTTT
GGATGCGTTCTCGAATCCTGAAACGGCAGAGCAGTTTACTGAGCGTATGGCGAGGATGAA
AGAGGATCCGGAGTTGAAACCTATACTTGATGAGATTGATGCTGG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2BN23TF 684 0 0
TTTTTTTTCTCTCTCTATCTCTCTTAAGGGGTTTAAGTTTTTATCTAATGGCTTCCAGTC
CAGACAAGAATCTGTCTCCTTCAGATGAGAAAACCGGTACTAAACCGGAATCAACAGCAG
CCTCCTCTGGGAATTCACCTTCTTCAGCTAACAACCCTCCTCCTGGCCTCAATTTCAATG
CTTTTGATTTCTCCAACATGGCTGGTATCCTCAACGATCCAAGCATCAGAGAATTGGCTG
AGCAGATTGCTAAAGATCCTGCCTTTACCCAAATGGCTGAGCAGTTTCAGAGATCTATCC
CAAACGCAGCTCAGGGAGGTGGAGGAGAAGGAGGTTTCCCTAACATCGATCCACAACAGT
ATATGAGCACAATGCAGCAGGTTATGCACAACCCCGAGTTTCTGACTATGGCTGATCGTC
TTGGTAAAGCCATAGTTCAGGATCCACAAATGTCTCCGTTTTTGGATGCGTTCTCGAATC
CTGGAACGGCAGAGCAGTTTACTGAGCGTATGTCGAGGATGAAAGAGGATCCGGAGTTGA
AACCTATACTTGATGAGATTGATGCTGGTGGTCCTTCTGCTATGATGAAGTACTGGAATG
ATAAAGATGTGCTGAAAAAGCTTGGTGAAGCAATGGGTATGCCTATTCCTGGCTTTCCAG
ACCAGACTGCTTCAGCTGAACCCG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2GY06JQ 795 0 0
GCAGAGCAGTTTACTGAGCGTATGGCGAGGATGAAAGAGGATCCGGAGTTGAAACCTATA
CTTGATGAGATTGATGCTGGTGGTCCTTCTGCTATGATGAAGTACTGGAATGATAAAGAT
GTGCTGAAAAAGCTTG***AAGCAATGGGTATGCCTATTCCTGGCTTTCCAGACCAGACT
GCTTCAGCTGAACCCGAGGTAGCAGCAGGGGAAGAAGGTGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGAGTTTATTGTTCATCAAACTGCCAGTCTTGGTAATGTTGAGGGTTTGAAAAATGCT
TTGGCATCTGGTGGTAACAAAGATGAAGAAGATTTTGAAGGAAGGACAGCTTTGCATTTT
GCTTGTGGATATGGCGAGTTGAAATGTGCTCAAGTTTTTATCGACGCTGGAGCAAGTGTG
AACGCACTTGACAGAAACAAGAACACACCACTCCATTACGCTTCTGGTTACGGGAGGAAA
GAATGCGTTAGCCTTTTCCTAGAGAATGGTGCTGCAGTGACTTTGCAAAACCAAGACGAG
AAGACACCCACTGACGTAGCCAAGCTCAACAACCAAGTCGAGGTGGTGAAGCTGCTCGAG
AAGGACGCTTTCCTTTGAGCTTAGGGTTAAAAACAAAAGCTCTTTGTGCCAAAAAAAAAC
AAAAAAAAACAAAAGCTTTAAGATCAATGTTGTCTGAAAACCAATTCACAGACTTTTGTA
TACTTGTTCTTTTTTCTGATTTAATCGTGTTTAATTTTAATTACTCTTTTGATAAAAAAA
AAAGTTAATTACTCG

QA 1 795 1 795
DS 



AS 2 8

CO CL961Contig1 788 3 12 U
TAAAACATTTTCAAACTATTGTTTATCATTCTCATCAATGTTGCACATATACAGGTGTAA
ATATCGCAATCTTGGGAGATTTTATGAAACTTACTAAAGGTGTGAATCCATGACTTGGAA
ACAGTTTAGCTACGCCAATTAGATGATAACTCAAGATCCACATCTTCTTCCCACCAAGTT
GCTGCCTTGTAGCCCCTGCGCAAAAACTCAAGTGAGCTCCCTTTCTCTTCTTGTAGTCCT
AGAACCTGTAAAAGCTCTTCCTTCGTTTCACCCAGGGTGAAACGAGTGGGGCTTTCTGCA
ACACATGCAAATGAACCATCAGATTGCTTAAGCATCACCTGCCACGGCCCAGGATATTGC
CGAAAAAGTGCTCCGTTGTAGTTCAATACATATGGTGCCACTGCCACTGTCTTTGAATAC
TCTCTGATACGGATATAAAAGACGGGAACAAACTGAGAAAGAAACCGGTAGTGCAGATCT
TTAGGGGGAAAGCCAAGTAGCCCTAGGTCAGCACGTAAGGTATCTAGCTCAAGATTAAAG
AGAAGAGCCGGGGTTGAGGTGGCAAAGTTTTCCACAAACTGCTCTATAACAAAGAGTTCT
TTAGTGCTGCAATTGATAAACATATAAAGGGTCGGTGGCTCCTTGGGCTCCCAACTACCT
TCGTTTTCATCTTCAAAATCAAAGTCCAAGGTACTCCTTATAGCCCTGAAGAAATTGGTG
ACAGAAGTGCCAGGTATATCGTCTAGAGAACGGATACTTATACCATCAATCGAATCAAAC
GCGGCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV86JQ U 1
AF RR2GS27JQB U 12
AF RR2BQ35JQ U 12
BS 1 166 RR2AV86JQ
BS 167 167 RR2BQ35JQ
BS 168 191 RR2AV86JQ
BS 192 192 RR2BQ35JQ
BS 193 202 RR2AV86JQ
BS 203 203 RR2BQ35JQ
BS 204 517 RR2AV86JQ
BS 518 591 RR2BQ35JQ
BS 592 592 RR2GS27JQB
BS 593 689 RR2BQ35JQ
BS 690 690 RR2GS27JQB
BS 691 788 RR2BQ35JQ

RD RR2AV86JQ 517 0 0
TAAAACATTTTCAAACTATTGTTTATCATTCTCATCAATGTTGCACATATACAGGTGTAA
ATATCGCAATCTTGGGAGATTTTATGAAACTTACTAAAGGTGTGAATCCATGACTTGGAA
ACAGTTTAGCTACGCCAATTAGATGATAACTCAAGATCCACATCTTATTCCCACCAAGTT
GCTGCCTTGTAACCCCTGCGCAGAAACTCAAGTGAGCTCCCTTTCTCTTCTTGTAGTCCT
AGAACCTGTAAAAGCTCTTCCTTCGTTTCACCCAGGGTGAAACGAGTGGGGCTTTCTGCA
ACACATGCAAATGAACCATCAGATTGCTTAAGCATCACCTGCCACGGCCCAGGATATTGC
CGAAAAAGTGCTCCGTTGTAGTTCAATACATATGGTGCCACTGCCACTGTCTTTGAATAC
TCTCTGATACGGATATAAAAGACGGGAACAAACTGAGAAAGAAACCGGTAGTGCAGATCT
TTAGGGGGAAAGCCAAGTAGCCCTAGGTCAGCACGTA

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2GS27JQB 704 0 0
CAAACTATTGTTTATCATTCTCATCAATGTTGCACATATACAGGTGTAAATATCGCAATC
TTGGGAGATTTTGTGAAACTTACTAAAGGTGTGAATCCATGACTTGGCCACAATTTAGCT
ACGCCAATTAGATGATAACTCAAGATCCACATCTTCTTCCCACCAAGTTGCTGCCTTGTA
GCCCCTGCGCAAAAACTCAAGTGAGCTCCCTTTCTCTTCTTGTAGTCCGAGAACTTGTAA
AAGCTCTTCCTTCGTTTCACCCAGGGTGAAACGAGTGGGGCTTTCTGCAACACATGCAAA
TGAACCATCAGATTGCTTAAGCATCACCTGCCACGGTCCAGGATATTGCCGAAAAAGTGC
TCCGTTGTAGTTCAACACATATGGTGCCACTGCCACTGTCTTTGAATACTCTCTGATACG
GATATAAAAGACGGGAACAAACTGAGAAAGAAACCGGTAGTGCAGATCTTTAGGGGGAAA
GCCAAGTAGCCCTAGGTCAGCACGTAAGGTATCTAGCTCAAGATTAAAGAGAAGAGCCGG
GGTTGAGGTGGCAAAGTTTTCCACAAACTGCTCTATAACAAAGAGTTCTTTAGTGCTGCA
ATTGATAAACATATAAAGGGTCGGTGGCTCCTTGGGCTCCCAACTACCTTCGTTTTCATC
TTCAAAATCAAAGTCCAAGGTACTCCTTATAGCCCTGAAGAAAT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2BQ35JQ 777 0 0
CAAACTATTGTTTATCATTCTCATCAATGTTGCACATATACAGGTGTAAATATCGCAATC
TTGGGAGATTTTATGAAACTTACTAAAGGTGTGAATCCATGACTTGGAAACAGTTTAGCT
ACGCCAATTAGATGATAACTCAAGATCCACATCTTCTTCCCACCAAGTTGCTGCCTTGTA
GCCCCTGCGCAAAAACTCAAGTGAGCTCCCTTTCTCTTCTTGTAGTCCTAGAACCTGTAA
AAGCTCTTCCTTCGTTTCACCCAGGGTGAAACGAGTGGGGCTTTCTGCAACACATGCAAA
TGAACCATCAGATTGCTTAAGCATCACCTGCCACGGCCCAGGATATTGCCGAAAAAGTGC
TCCGTTGTAGTTCAATACATATGGTGCCACTGCCACTGTCTTTGAATACTCTCTGATACG
GATATAAAAGACGGGAACAAACTGAGAAAGAAACCGGTAGTGCAGATCTTTAGGGGGAAA
GCCAAGTAGCCCTAGGTCAGCACGTAAGGTATCTAGCTCAAGATTAAAGAGAAGAGCCGG
GGTTGAGGTGGCAAAGTTTTCCACAAACTGCTCTATAACAGAGAGTTCTTTAGTGCTGCA
ATTGATAAACATATAAAGGGTCGGTGGCTCCTTGGGCTCCCAACTACCTTCGTTTTCATC
TTCAAAATCAAAGTCCAATGTACTCCTTATAGCCCTGAAGAAATTGGTGACAGAAGTGCC
AGGTATATCGTCTAGAGAACGGATACTTATACCATCAATCGAATCAAACGCGGCTTT

QA 1 777 1 777
DS 



CO CL961Contig2 1005 5 13 U
GGAAACCACAGAGAGAGAGAGAGCAAAAAGAAAATGGCGATGGCGATGTTACCGGCGCTC
TTCTCTTCTCCCTCGATTCTCACCAGAAGAATCAGATGCGGAGCCACCGCGAAAAGTGGC
GGCGCACTCTCATCTACATCTCCCGAATCCGACCCTAGGAGAGGCGTCTCCGTTTATAAA
CCAAAGTCGTACGAGGTTCTGGTCTCTGACGCCGCGAACTCTCTCGCCTTCGCCCTCCAG
GAATCCAAATCTCGTCTGGAAATCGATTTCCCGCCTTTGCCCAGTAGCATTTCCTCATAC
AAGGGTTCTTCAGACGATTTCATTGATGCCAACATTCAACTCGCCTTGTCTGTCGTCCGG
AAGCTTCAGGAGAAAGTAGAGACTAGAGCTTGCATTGTTTTTCCTGATAAGCCTGAGAAA
CGCAGAGCTTCCCAACTCTTCAAAGCCGCGTTTGATTCGATTGATGGTATAAGCATACGT
TCTCTAGACGATATACCTGGCACTTCTGTCACCAATTTCTTCAGGGCTATAAGGAGTACA
TTGGACTTTGATTTTGAAGATGAAAACGAAGGTAGTTGGGAGCCCAAGGAGCCACCGACC
CTTTATATGTTTATCAATTGCAGCACTAAAGAACTCTCTGTTATAGAGCAGTTTGTGGAA
AACTTT*GCCACCTCAACCCCGGCTCTTCTCTTTAATCTTGAGCTAGATACCTTACGTGC
TGACCTAGGGCTACTTGGCTTTCCCCCTAAAGATCTGCACTACCGGTTTCTTTTCTCAGT
TTGTTCCCGTCTTTTATATCCGTATCAGAGAGTATTCAAAGACAGTGGCAGTGGCACCAT
ATGTATTGAACTACAACGGAGCACTTTTTCGGCAATATCCTGGGCCGTGGCAGGTGATGC
TTAAGCAATCTGATGGTTCATTTGCATGTGTTGCAGAAAGCCCCCCGTTTCACCCTGGGT
GAAACGAAGGAAGAGCTTTTACAGGTTCTCGGACTACAAGAAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 0 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV86TF U 71
AF RR2BQ35TF U 1
AF RR2GS27TF U 9
AF RR2B132TF U 44
AF RR2AG47TF U 336
BS 1 279 RR2BQ35TF
BS 280 280 RR2GS27TF
BS 281 473 RR2BQ35TF
BS 474 474 RR2GS27TF
BS 475 476 RR2BQ35TF
BS 477 477 RR2GS27TF
BS 478 661 RR2BQ35TF
BS 662 662 RR2GS27TF
BS 663 678 RR2BQ35TF
BS 679 819 RR2B132TF
BS 820 820 RR2AG47TF
BS 821 864 RR2B132TF
BS 865 1005 RR2AG47TF

RD RR2AV86TF 110 0 0
CCTCGATTCTCACCAGAAGAATCAGATGCGGAGCCACCGCAAAAAGTGGCGGCGCACTCT
CATCTACGTCTCCCGAATCCGACCCTAGGAGAGGCGTCTCCGTTTATAAA

QA 1 110 1 110
DS 

RD RR2BQ35TF 678 0 0
GGAAACCACAGAGAGAGAGAGAGCAAAAAGAAAATGGCGATGGCGATGTTACCGGCGCTC
TTCTCTTCTCCCTCGATTCTCACCAGAAGAATCAGATGCGGAGCCACCGCGAAAAGTGGC
GGCGCACTCTCATCTACATCTCCCGAATCCGACCCTAGGAGAGGCGTCTCCGTTTATAAA
CCAAAGTCGTACGAGGTTCTGGTCTCTGACGCCGCGAACTCTCTCGCCTTCGCCCTCCAG
GAATCCAAATCTCGTCTGGAAATCGATTTCCCGCCTTTGTCCAGTAGCATTTCCTCATAC
AAGGGTTCTTCAGACGATTTCATTGATGCCAACATTCAACTCGCCTTGTCTGTCGTCCGG
AAGCTTCAGGAGAAAGTAGAGACTAGAGCTTGCATTGTTTTTCCTGATAAGCCTGAGAAA
CGCAGAGCTTCCCAACTCTTCAAAGCCGCGTTTGATTCGATTGATGGTATAAGTATCCGT
TCTCTAGACGATATACCTGGCACTTCTGTCACCAATTTCTTCAGGGCTATAAGGAGTACA
TTGGACTTTGATTTTGAAGATGAAAACGAAGGTAGTTGGGAGCCCAAGGAGCCACCGACC
CTTTATATGTTTATCAATTGCAGCACTAAAGAACTCTCTGTTATAGAGCAGTTTGTGGAA
A*CTTT*GCCACCTCAAC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2GS27TF 670 0 0
GG
GAGAGAGAGAGAGCAAAAAGAAAATGGCGATGGCGATGTTACCGGCGCTCTTCTCTTCTC
CCTCGATTCTCACCAGAAGAATCAGATGCGGAGCCACCGCGAAAAGTGGCGGCGCACTCT
CATCTGCCTCTCCCGACTCCGACCCTAGGAGAGGCGTCTCCGTTTATAAACCAAAGTCGT
ACGAGGTTCTAGTCTCCGACGCCGCGAACTCTCTCGCCTTCGCCCTCCAGGAATCCAAAT
CTCGTTTAGAAATCGATTTCCCGCCTTTGCCCAGTAGCATTTCCTCATACAAGGGTTCTT
CAGACGATTTCATTGATGCCAACATTCAACTCGCCTTGTCTGTTGTCCGGAAGCTTCAGG
AGAAAGTAGAGACTAGAGCTTGTATTGTTTTTCCTGATAAGCCTGAGAAACGCAGAGCTT
CCCAACTCTTCAAAGCCGCGTTTGATTCGATTGATGGTATAAGCATACGTTCTCTAGACG
ATATACCTGGCACTTCTGTCACCAATTTCTTCAGGGCTATAAGGAGTACCTTGGACTTTG
ATTTTGAAGATGAAAACGAAGGTAGTTGGGAGCCCAAAGAGCCACCGACCCTTTATATGT
TTATCAATTGCAGCACTAAAGAACTCTTTGTTATAGAGCAGTTTGTGGAAAACTTT*GCC
ACCTCAAC

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR2B132TF 821 0 0
CGATGTTACCGGCGCTCTTCTCTTCTCCCTCGATTCTCACCAGAAGAATCAGATGCGGAG
CCACCGCGAAAAGTGGCGGCGCACTCTCATCTACATCTCCCGAATCCGACCCTAGGAGAG
GCGTCTCCGTTTATAAACCAAAGTCGTACGAGGTTCTGGTCTCTGACGCCGCGAACTCTC
TCGCCTTCGCCCTCCAGGAATCCAAATCTCGTCTGGAAATCGATTTCCCGCCTTTGCCCA
GTAGCATTTCCTCATACAAGGGTTCTTCAGACGATTTCATTGATGCCAACATTCAACTCG
CCTTGTCTGTCGTCCGGAAGCTTCAGGAGAAAGTAGAGACTAGAGCTTGCATTGTTTTTC
CTGATAAGCCTGAGAAACGCAGAGCTTCCCAACTCTTCAAAGCCGCGTTTGATTCGATTG
ATGGTATAAGTATCCGTTCTCTAGACGATATACCTGGCACTTCTGTCACCAATTTCTTCA
GGGCTATAAGGAGTACATTGGACTTTGATTTTGAA**TGAAAACGAAGGTAGTTGGGAGC
CCAAGAAGCCACCGACCCTTTATATGTTTATCAATTGCAGCACTAAAGAACTCTCTGTTA
TAGAGCAGTTTGTGGAAAACTTTTGCCACCTCAACCCCGGCTCTTCTCTTTAATCTTGAG
CTAGATACCTTACGTGCTGACCTAGGGCTACTTGGCTTTCCCCCTAAAGATCTGCACTAC
CGGTTTCTTTTCTCAGTTTGTTCCCGTCTTTTATATCCGTATCAGAGAGTATTCAA*GAC
AGTGGCAGTGGCACCATATGTATTGAACTACAACGGAGCAC

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR2AG47TF 670 0 0
G
CAACTCGCCTTGTCTGTTGTCCGGAAGCTTCAGGAGAAAGTAGAGACTAGAGCTTGCATT
GTTTTTCCTGATAAGCCTGAGAAACGCAGAGCTTCCCAACTCTTCAAAGCCGCGTTTGAT
TCGATTGATGGTATAAGCATACGTTCTCTAGACGATACACCTGGCACTTCTGTCACCAAT
TTCTTCAGGGCTATAAGGAGTACCTTGGACTTTGATTTTGAAGATGAAAACGAAGGTAGT
TGGGAGCCCAAGGAGCCACCGACCCTTTATATGTTTATCAATTGCAGCACTAAAGAACTC
TCTGTTATAGAGCAGTTTGTGGAAAACTTT*GCCACCTCAACCCCGGCTCTTCTCTTTAA
TCTTGAGCTAGATACCTTACGTGCTGACCTAGGGCTACTTGGCTTTCCCCCTAAAGATCT
GCACTACCGGTTTCTTT*CTCAGTTTGTTCCCGTCTTTTATATCCGTATCAGAGAGTATT
CAAAGACAGTGGCAGTGGCACCATATGTGTTGAACTACAACGGAGCACTTTTTCGGCAAT
ATCCTGGGCCGTGGCAGGTGATGCTTAAGCAATCTGATGGTTCATTTGCATGTGTTGCAG
AAAGCCCCCCGTTTCACCCTGGGTGAAACGAAGGAAGAGCTTTTACAGGTTCTCGGACTA
CAAGAAGAG

QA 2 670 2 670
DS 



AS 3 8

CO CL962Contig1 713 2 4 U
GGACTGTAAAACGGCGGCAGATTCCATTCTCAGTCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTT
CGAGATCGAACAATGTCTCTGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTC
AACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGTTTGCCCTCACCTCCATCAAGGGTATT
GGCAGGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCT
GGAGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAACCCAAAACAG
TACAAGATCCCAGACGGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCT
CAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGTCTCAAGAAA
ATCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGTCAACACACC
AAGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTGTGTCTCTAAGAAACGTTAAGCAATGTTGG
TAGCTGCAGCTGGATTGAATCTTTGATAAGGACCATGTTTTAAAGTTAATTTGAACAATT
TTGCAAAACCTTATTATGTCGTTTATCCTTCACTGCTGTTCTGTTACATTATAAGATAAT
ATTTTGTTACTTGGTCTTTTTCAATTATCTAGTTTCATTTTTGGTTTTGGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E778TF U 1
AF RR2E778JQ C 514
BS 1 680 RR2E778TF
BS 681 681 RR2E778JQ
BS 682 701 RR2E778TF
BS 702 713 RR2E778JQ

RD RR2E778TF 704 0 0
GGACTGTAAAACGGCGGCAGATTCCATTCTCAGTCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTT
CGAGATCGAACAATGTCTCTGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTC
AACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGTTTGCCCTCACCTCCATCAAGGGTATT
GGCAGGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCT
GGAGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAACCCAAAACAG
TACAAGATCCCAGACGGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCT
CAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGTCTCAAGAAA
ATCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGTCAACACACC
AAGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTGTGTCTCTAAGAAACGTTAAGCAATGTTGG
TAGCTGCAGCTGGATTGAATCTTTGATAAGGACCATGTTTTAAAGTTAATTTGAACAATT
TTGCAAAACCTTATTATGTCGTTTATCCTTCACTGCTGTTCTGTTACATTATAAGATAAT
ATTTTGTTACTTGGTCTTTT*CAATTATCTAGTTTCATTTT
GGT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2E778JQ 200 0 0
TTTT
TAAGAAACGTTAAGCAATGTTGGTAGCTGCAGCTGGATTGAATTTTTGATAAGGACCATG
TTTTAAAGTTAATTTGAACAATTTTGCAAAACCTTATTATGTCGTTTATCCTTCACTGCT
GTTTTGTTACATTATAAGATAATATTTTGTTACTTGGTTTTTTTCAATTATTTAGTTTCA
TTTTTGGTTTTGGCCT

QA 5 200 5 200
DS 



CO CL962Contig2 683 4 9 U
GGACTGTAAAACGGCGGCAGATTCTGTACTCAGTCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTT
CCAGATCGAACAATGTCTATGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTC
AACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGTTTGCCCTTACCTCCATCAAGGGTATT
GGCAGGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCT
GGAGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACCATTGTTGCCAACCCAAAACAG
TACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCT
CAAGTCGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGTCTCAAGAAA
ATCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGTCAACACACC
AAGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGCCTATGTT
GGTTGCTGCAGCTGGATTGAATCTTCGATAAGGACCATGTTTTTAAGTTAATTTGAACAA
TTTTGCAAAACCCTATTATGTCGTTTATCCTCACTGCTGTTTTGTTACATTATAAGATAA
TATTTTGTTACTGGGTCTATTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET47TF U 1
AF RR2HA23TF U 1
AF RR2HA23JQ C 32
AF RR2ET47JQ C 69
BS 1 78 RR2ET47TF
BS 79 79 RR2HA23TF
BS 80 298 RR2ET47TF
BS 299 299 RR2HA23TF
BS 300 432 RR2ET47TF
BS 433 433 RR2HA23TF
BS 434 654 RR2ET47TF
BS 655 655 RR2HA23TF
BS 656 683 RR2ET47JQ

RD RR2ET47TF 659 0 0
GGACTGTAAAACGGCGGCAGATTCTGTACTCAGTCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTT
CCAGATCGAACAATGTCTCTGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTC
AACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGTTTGCCCTTACCTCCATCAAGGGTATT
GGCAGGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCT
GGAGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACCATTGTTGCCAACCCAAAACGG
TACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCT
CAAGTCGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGTCTCAAGAAA
ATCAGGAACCACTGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGTCAACACACC
AAGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGCCTATGTT
GGTTGCTGCAGCTGGATTGAATCTTCGATAAGGACCATGTTTTTAAGTTAATTTGAACAA
TTTTGCAAAACCCTATTATGTCGTTTATCCTCACTGCTGTTTTGTTACATTATA
GATAA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2HA23TF 655 0 0
GGACTGTAAAACGGCGGCAGATTCTGTACTCAGTCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTT
CCAGATCGAACAATGTCTATGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTC
AACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGTTTGCCCTTACCTCCATCAAGGGTATT
GGCAGGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCTACATGAACAAGAGGGCT
GGAGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACCATTGTTGCCAACCCAAAACAG
TACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCT
CAAGTCGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGTCTCAAGAAA
ATCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGTCAACACACC
AAGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGCCTATGTT
GGTTGCTGCAGCTGGATTGAATCTTCGATAAGGACCATGTTTTTAAGTTAATTTGAACAA
TTTTGCAAAACCCTATTATGTCGTTTATCCTCACTGCTGTTTTGTTACATTATAA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2HA23JQ 624 0 0
AGTCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTTCCAGATCGAACAATGTCTATGGTTGCAAACG
AGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTCAACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCA
TGTTTGCCCTTACCTCCATCAAGGGTATTGGCAGGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGA
AAGCCGATGTCTACATGAACAAGAGGGCTGGAGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACC
TCATGACCATTGTTGCCAACCCAAAACAGTACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACAGAC
AGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCTCAAGTCGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGC
TCAGGGATGATCTTGAACGTCTCAAGAAAATCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACT
GGGGTCTCCGTGTCCGTGGTCAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTG
GTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGCCTATGTTGGTTGCTGCAGCTGGATTGAATCTTCGATAA
GGACCATGTTTTTAAGTTAATTTGAACAATTTTGCAAAACCCTATTATGTCGTTTATCCT
CACTGCTGTTTTGTTACATTATAA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2ET47JQ 615 0 0
AACAATGTCTCTGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTCAACACTAA
CGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGTTTGCCCTTACCTCCATCAAGGGTATTGGCAGGCG
TTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCTGGAGAGTT
GTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACCATTGTTGCCAACCCAAAACGGTACAAGAT
CCCAGACTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCTCAAGTCGT
CTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGTCTCAAGAAAATCAGGAA
CCACTGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGTCAACACACCAAGACAAC
TGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGCCTATGTTGGTTGCTG
CAGCTGGATTGAATCTTCGATAAGGACCATGTTTTTAAGTTAATTTGAACAATTTTGCAA
AACCCTATTATGTCGTTTATCCTCACTGCTGTTTTGTTACATTATAGGATAATATTTTGT
TACTGGGTCTATTCC

QA 1 615 1 615
DS 



CO CL962Contig3 680 2 2 U
GGACTGTAAAACGGCGGCAGATTCTGTACTCAGTCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTT
CCAGATCGAACAATGTCTCTGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTC
AACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGTTTGCCCTTACCTCCATCAAGGGTATT
GACAGGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCT
GGTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAACCCAAAACAG
TACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCT
CAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAGCGTCTCAAGAAA
ATCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTACGTGTCCGTGGTCAACACACC
AAGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGCCAATGTT
GGTTGCTGCAGCTGGATTTAATCTTTGTTAAGGACCGTTTAAGTTAATTTGAACAATTTT
GCAAAACCCTATTATGTTGTTTATTTGTCCTTCACTACTGTTTTGTTACATTATAAGATA
ATATTTTGTTACTGCGTCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ61JQ C 1
AF RR2FQ61TF U 1
BS 1 673 RR2FQ61TF
BS 674 680 RR2FQ61JQ

RD RR2FQ61JQ 680 0 0
GGACTGTAAAACGGCGGCAGATTCTGTACTCAGTCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTT
CCAGATCGAACAATGTCTCTGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTC
AACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGTTTGCCCTTACCTCCATCAAGGGTATT
GACAGGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCT
GGTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAACCCAAAACAG
TACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCT
CAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAGCGTCTCAAGAAA
ATCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTTTACGTGTCCGTGGTCAACACACC
AAGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTGGTGTCTTTAAGAAGCGTTAAGCCAATGTT
GGTTGCTGCAGCTGGATTTAATCTTTGTTAAGGACCGTTTAAGTTAATTTGAACAATTTT
GCAAAACCCTATTATGTTGTTTATTTGTCCTTCACTACTGTTTTGTTACATTATAAGATA
ATATTTTGTTACTGCGTCTT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2FQ61TF 680 0 0
GGACTGTAAAACGGCGGCAGATTCTGTACTCAGTCCTCTCCCTCAGGCAGCTCTTCTCTT
CCAGATCGAACAATGTCTCTGGTTGCAAACGAGGAGTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTC
AACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGTTTGCCCTTACCTCCATCAAGGGTATT
GACAGGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCT
GGTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAACCCAAAACAG
TACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCT
CAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAGCGTCTCAAGAAA
ATCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTACGTGTCCGTGGTCAACACACC
AAGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGCCAATGTT
GGTTGCTGCAGCTGGATTTAATCTTTGTTAAGGACCGTTTAAGTTAATTTGAACAATTTT
GCAAAACCCTATTATGTTGTTTATTTGTCCTTCACTACTGTTTTGTTACATTATAAGATA
ATATTTTGTTACT
GCGTCTT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 8

CO CL963Contig1 1756 8 24 U
GGGTATCATCCTCAAACCAACAGTCAGCACTCACTCACCACCATGAGACACCTCTTTGCA
CCTCCGTGGCCTCTCTTTCTACTCACCCTCATCCTCCTCTCTTTTTTTAGTTCCGGCGAA
TCCTCACCGTTCGGAGAGAAAAGTAAACTCGACACCGGCGGTCTAAGTATACAGAGTTTT
CCAAAGGACTTTTTGTTCGGAACTGCCACCTCAGCTTATCAGGCCGAAGGTGAAACTCAT
CAAGATGGTCGTGGCCCAAGCATTTGGGACGCCTTCGTCAAGATTCCTGGGACTATCGCC
AAAAATGCCACTGCTGAGATAACAGTGGATCAGTATCACCGTTACAAGGAAGATGTGGAT
TTAATGAAGAATCTGAACTTCGATGCTTATAGATTTTCCATTTCATGGTCCAGAATATTC
CCTGAGGGAACCGGTAAAATCAACTGGAAAGGAGTTGCTTATTACAACAGATTGATCGAT
TACTTGGTCCAAAAAGGGATTACACCGTATGCAAATCTGTACCACTATGATCTTCCATTG
GCTTTGGAAAAGAAGTATCAAGGCTTGCTTGGTAGACAAGTTGTGAATGATTTTGCGGAT
TATGCTGAGTTTTGTTTCAATCTATTTGGAGATAGAGTGAAAAACTGGATGACGTTTAAT
GAACCGCGTGTGGTAGCTGCTCTAGGTTATGATAATGGTATATTCGCACCGGGTAGATGC
TCTAAAGCATATGGAAACTGCACACAAGGGAACTCAGCTACTGAGCCATACATTGTTTCC
CATCACCTTATCTTGGCTCACGCAGCAGCGGCCCAAAGATACCGCAAATATTACCAGGAG
AAACAGAAGGGAAGAATAGGGATACTTCTAGATTTCGTTTGGTACGAGCCGCTTACTAGA
AGCAAAGCAGATAATCTTGCAGCTCAAAGGACAAGAGACTTCCATATCGGATGGTTCATT
CACCCAATAGTATACGGAGAGTATCCACAGACAATGCAGAACATTGTGAAAGAGAGGCTT
CCAAAATTTACAGAGGAAGAAGTGAAAA*TGGTGAAAGGTTCCATAGATTTCGTGGGAAT
AAACCAATACACAACTTATTTCATGTCAGATACTCATAACTCTACCATACCTAAGGAATT
GGGTTATCAACAAGATTGGAATGCTACTTTCGGATTTGCGAAGTTGGGGAAGCCGATCGG
TCCAAGGGCGTACTCGTATTGGTTATACAACGTACCATGGGGAATGTACAAAGCGTTGAT
GTACATGAAGGAACGTTATGGCAACCCAACTATGATTCTCTCTGAAAATGGCATGGATGA
TCCAGGCAACGTTACCCTAGCTCAAGGACTACACGACACAACGAGAATCAAGTACTATAA
AGATTACTTAACTCAACTTAAGAAAGCTGTGGATGATGGAGCCAATGTGAAGGGATATTT
CGCGTGGTCATTGCTTGATAATTTCGAATGGTTGTCAGGATATACCTCAAGGTTCGGGAT
CGTCTATGTTGATTACAAGACCTTGAAGCGGTACCCCAAGATGTCTGCACAATGGTTTAG
GCAACTTCTTAAACGAAACAAGAAATGATATCAAATGCGTCCATGAATGCATTTAGTTTG
TAAGGTTTGGAATTGATCTTTTGAAGAGTTTATGGGTCGGTTTGGTCAGTTTGTTGTCTA
CTCTAAGGAGTGAATTGTACCTTGAACTATCTCCTTTGACATTTCAGCGCAAATAATAAA
GGTTTCAATTAGCAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 15 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F763TF U 1
AF RR2AD28TF U 495
AF RR2B575JQ C 1321
AF RR2E145TF U 813
AF RR2B575TF U 1066
AF RR2F763JQ C 1011
AF RR2E145JQ C 1504
AF RR2AD28JQ C 1127
BS 1 629 RR2F763TF
BS 630 1146 RR2AD28TF
BS 1147 1147 RR2E145TF
BS 1148 1266 RR2AD28TF
BS 1267 1477 RR2E145TF
BS 1478 1478 RR2B575TF
BS 1479 1509 RR2E145TF
BS 1510 1510 RR2B575TF
BS 1511 1560 RR2E145TF
BS 1561 1563 RR2B575TF
BS 1564 1577 RR2E145TF
BS 1578 1580 RR2B575TF
BS 1581 1594 RR2E145TF
BS 1595 1595 RR2B575TF
BS 1596 1601 RR2E145TF
BS 1602 1602 RR2B575TF
BS 1603 1606 RR2E145TF
BS 1607 1607 RR2B575TF
BS 1608 1624 RR2E145TF
BS 1625 1718 RR2B575TF
BS 1719 1719 RR2F763JQ
BS 1720 1733 RR2B575TF
BS 1734 1744 RR2F763JQ
BS 1745 1756 RR2AD28JQ

RD RR2F763TF 629 0 0
GGGTATCATCCTCAAACCAACAGTCAGCACTCACTCACCACCATGAGACACCTCTTTGCA
CCTCCGTGGCCTCTCTTTCTACTCACCCTCATCCTCCTCTCTTTTTTTAGTTCCGGCGAA
TCCTCACCGTTCGGAGAGAAAAGTAAACTCGACACCGGCGGTCTAAGTATACAGAGTTTT
CCAAAGGACTTTTTGTTCGGAACTGCCACCTCAGCTTATCAGGCCGAAGGTGAAACTCAT
CAAGATGGTCGTGGCCCAAGCATTTGGGACGCCTTCGTCAAGATTCCTGGGACTATCGCC
AAAAATGCCACTGCTGAGATAACAGTGGATCAGTATCACCGTTACAAGGAAGATGTGGAT
TTAATGAAGAATCTGAACTTCGATGCTTATAGATTTTCCATTTCATGGTCCAGAATATTC
CCTGAGGGAACCGGTAAAATCAACTGGAAAGGAGTTGCTTATTACAACAGATTGATCGAT
TACTTGGTCCAAAAAGGGATTACACCGTATGCAAATCTGTACCACTATGATCTTCCATTG
GCTTTGGAAAAGAAGTATCAAGGCTTGCTTGGTAGACAAGTTGTGAATGATTTTGCGGAT
TATGCTGAGTTTTGTTTCAATCTATTTGG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2AD28TF 772 0 0
G
GGGATTACACCGTATGCAAATCTGTACCACTATGATCTTCCATTGGCTTTGGAAAAGAAG
TATCAAGGCTTGCTTGGTAGACAAGTTGTGAATGATTTTGCGGATTATGCTGAGTTTTGT
TTCAATCTATTTGGAGATAGAGTGAAAAACTGGATGACGTTTAATGAACCGCGTGTGGTA
GCTGCTCTAGGTTATGATAATGGTATATTCGCACCGGGTAGATGCTCTAAAGCATATGGA
AACTGCACACAAGGGAACTCAGCTACTGAGCCATACATTGTTTCCCATCACCTTATCTTG
GCTCACGCAGCAGCGGCCCAAAGATACCGCAAATATTACCAGGAGAAACAGAAGGGAAGA
ATAGGGATACTTCTAGATTTCGTTTGGTACGAGCCGCTTACTAGAAGCAAAGCAGATAAT
CTTGCAGCTCAAAGGACAAGAGACTTCCATATCGGATGGTTCATTCACCCAATAGTATAC
GGAGAGTATCCACAGACAATGCAGAACATTGTGAAAGAGAGGCTTCCAAAATTTACAGAG
GAAGAAGTGAAAA*TGGTGAAAGGTTCCATAGATTTCGTGGGAATAAACCAATACACAAC
TTATTTCATGTCAGATACTCATAACTCTACCATACCTAAGGAATTGGGTTACCAACAAGA
TTGGAATGCTACTTTCGGATTTGCGAAGTTGGGGAAGCCGATCGGTCCAAGGGCGTACTC
GTATTGGTTATACAACGTACCATGGGGAATGTACAAAGCGTTGATGTACAT

QA 2 772 2 772
DS 

RD RR2B575JQ 221 0 0
TCCAGGCAACGTTACCCTAGCTCAAGGACTACACGACACAACGAGAATCAAGTACTATAA
AGATTACTTAACTCAACTTAAGAAAGCTGTGGATGATGGAGCCAATGTGAAGGGATATTT
CGCGTGGTCATTGCTTGATAATTTAGAATGGTTGTCAGGATATACCTCAAGGTTCGGGAT
GGTTTATGTTGATTACAAGACCTGGAAGCGGTACCCCAAGA

QA 1 221 1 221
DS 

RD RR2E145TF 828 0 0
G
CAAAGATACCGCAAATATTACCAGGAGAAACAGAAGGGAAGAATAGGGATACTTCTAGAT
TTCGTTTGGTACGAGCCGCTTACTAGAAGCAAAGCAGATAATCTTGCAGCTCAAAGGGCA
AGAGACTTCCATATCGGATGGTTCATTCACCCAATAGTATACGGAGAGTATCCACAGACA
ATGCAGAACATTGTGAAAGAGAGGCTTCCAAAATTTACAGAGGAAGAAGTGAAAAATAGT
GAAAGGTTCCATAGATTTCGTGGGAATAAACCAATATACAACTTATTTCATGTCGGATAC
TCATAACTCCACCATACCTAAGGAATTGGGTTATCAACAAGATTGGAATGCTACTTTCGG
GTTTGCAAAGTTGGGGAAGCCGATCGGTCCAAGGGCGTACTCGTATTGGTTATATAACGT
ACCATGGGGAATGTACAAAGCGTTGATGTACATGAAGGAACGTTATGGCAACCCAACTAT
GATTCTCTCTGAAAATGGCATGGATGATCCAGGCAACGTTACCCTAGCTCAAGGACTACA
CGACACAACGAGAATCAAGTACTATAAAGATTACTTAACTCAACTTAAGAAAGCTGTGGA
TGATGGAGCCAATGTGAAGGGATATTTCGCGTGGTCATTGCTTGATAATTTCGAATGGTT
GTCACGATATACCTCAAGGTTCGGGATCGTCTATGTCGATTACAAGACCTTGAAGCGGTA
CCCCAAGATGTCTGCACAATGGTTTAG**CACTTCTTAAACGAAC**AGAAATGATATCA
A*TGCGTC*ATGA*TGCATTTAGTTTGTAAG
TTGGATGATCTTTGAA

QA 2 812 2 812
DS 

RD RR2B575TF 668 0 0
G
GATTTCGTGGGAATAAACCAATATACAACTTATTTCATGTCGGATACTCATAACTCCACC
ATACCTAAGGAATTGGGTTATCAACAAGATTGGAATGCTACTTTCGGGTTTGCAAAGTTG
GGGAAGCCGATCGGTCCAAGGGCGTACTCTTATTGGTTATATAACGCACCATGGGGAATG
TACAAAGCGTTGATGTACATGAAGGAACGTTATGGCAACCCAACTATGATTCTCTCTGAA
AATGGCATGGATGATCCAGGCAACGTTACCCTAGCTCAAGGACTACACGACACAACGAGA
ATCAAGTACTATAAAGATTACTTAACTCAACTTAAGAAAGCTGTGGATGATGGAGCCAAT
GTGAAGGGATATTTCGCGTGGTCATTGCTTGATAATTTCGAATGGTTGTCAGGATATACC
TCAAGGTTCGGGATCGTCTATGTTGATTACAAGACCTTGAAGCGGTACCCCAAGATGTCT
GCACAATGGTTTAGGCAACTTCTTAAACGAAACAAGAAATGATATCAAATGCGTCCATGA
ATGCATTTAGTTTGTAAGGTTTGGAATTGATCTTTTGAAGAGTTTATGGGTCGGTTTGGT
CAGTTTGTTGTCTACTCTAAGGAGTGAATTGTACCTTGAACTATCTCCTTTGTCATTTCA
GCGCAAA

QA 2 668 2 668
DS 

RD RR2F763JQ 743 0 0
AGAGCGGCTTCCAAAATTTACAGAGGAAGAAGTGAAAA*TGGTGAAAGGTTCCATAGATT
TCGTGGGAATAAACCAATACACAACTTATTTCATGTCAGATACTCATAACTCTACCATAC
CTAAGGAATTGGGTTATCAACAAGATTGGAATGCTACTTTCGGATTTGCGAAGTTGGGGA
AGCCGATCGGTCCAAGGGCGTACTCGTATTGGTTATACAACGTACCATGGGGAATGTACA
AAGCGTTGATGTACATGAAGGAACGTTATGGCAACCCAACTATGATTCTCTCTGAAAATG
GCATGGATGATCCAGGCAACGTTACCCTAGCTCAAGGACTACACGACACAACGAGAATCA
AGTACTATAAAGATTACTTAACTCAACTTAAGAAAGCTGTGGATGATGGAGCCAATGTGA
AGGGATATTTCGCGTGGTCATTGCTTGATAATTTCGAATGGTTGTCAGGATATACCTCAA
GGTTCGGGATCGTCTATGTTGATTACAAGACCTTGAAGCGGTACCCCAAGATGTCTGCAC
AATGGTTTAGGCAACTTCTTAAACGAAACAAGAAATGATATCAAATGCGTCCATGAATGC
ATTTAGTTTGTAAGGTTTGGAATTGATCTTTTGAAGAGTTTATGGGTCGGTTTGGTCAGT
TTGTTGTCTACTCTAAGGAGTGAATTGTACCTTGAACTATCTCCTTTGACATTTCAGCGC
AAATAATAAAGGTT
TCAATTAGC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2E145JQ 249 0 0
CTATGTCGATTACAAGACCTTGAAGCGGTACCCCAAGATGTCTGCACAATGGTTTAGGCA
ACTTCTTAAACGAAACAAGAAATGATATCAAATGCGTCCATGAATGCATTTAGTTTGTAA
GGTTTGGAATTGATCTTTTGAAGAGTTTATGGGTCGGTTTGGTCAGTTTGTTGTCTACTC
TAAGGAGTGAATTGTACCTTGAACTATCTCCTTTGACATTTCAGCGCAAATAATAAAGGT
T
CAATTAGC

QA 1 241 1 241
DS 

RD RR2AD28JQ 630 0 0
ATACCTAAGGAATTGGGTTACCAACAAGATTGGAATGCTACTTTCGGATTTGCGAAGTTG
GGGAAGCCGATCGGTCCAAGGGCGTACTCGTATTGGTTATACAACGTACCATGGGGAATG
TACAAAGCGTTGATGTACATGAAGGAACGTTATGGCAACCCAACTATGATTCTCTCTGAA
AATGGCATGGATGATCCAGGCAACGTTACCCTAGCTCAAGGACTACACGACACAACGAGA
ATCAAGTACTATAAAGATTACTTAACTCAACTTAAGAAAGCTGTGGATGATGGAGCCAAT
GTGAAGGGATATTTCGCGTGGTCATTGCTTGATAATTTCGAATGGTTGTCAGGATATACC
TCAAGGTTCGGGATCGTTTATGTTGATTACAAGACCTTGAAGCGGTACCCCAAGATGTCT
GCACAATGGTTTAGGCAACTTCTTAAACGAAACAAGAAATGATATCAAATGCGTCCATGA
ATGCATTTAGTTTGTAAGGTTTGGAATTGATCTTTTGAAGAGTTTATGGGTCGGTTTGGT
CAGTTTGTTGTCTACTCTAAGGAGTGAATTGTACCTTGAACTATCTCCTTTGACATTTCA
GCGCAAATAATAAAGGTTTCAATTAGCAAT

QA 1 630 1 630
DS 



AS 2 8

CO CL964Contig1 982 5 6 U
TCTACTTTCCAGTACAAAATCATCTGACAACAAACGTACTGATATCACAACCGATGAACA
CAAAATGGTTAATGCAA*GCAAA*CCATGAGTGTATTGTTGGTCAACTAGTTTTGGAAAG
AAAAAGAGTAAGAGCCAGTGTTGGGATCTTTAACCGCCTTGAAATTGTCTACACTCATCC
CAAATTTGCCCAATATCGTGTTTCCCATCTCCTTCAACTTTGCTATGGCTTCTTCTTTCA
TCTTTTCTTGCTTCGCAGCCGCCAATGGTTCCAAACGCCGAATTCCTTTTCTAGCCTGAT
CATTTGAAGGGTCCAGTTCTAATATCTTCTTCAAGTCAGTGAGGGCTTCTTCAAAATGTT
CAAGCTTCTCATGAGCTTCTGCACGACGGACCAAAGCTTTAGTATAGCTCGGATTCAGCT
CTATCGCTTTTGTGCTTTCCTTGATTGCTTCTGCATATTTGCCCAATTTGAGATAACATA
TAGCTCTGTTTGAATGGCAGATAGATCGAAGCTCCAAAGATTCAGGGAACTCCTTAGCAA
ACTGTAAAGCAAGCTCATACTTTGACAATGCATCTTCGTATAAGCCATTTCCAAACAATT
TGTTTCCTTCCATTTTAGCTTCATTTGCATCCTCCAAAGCTTTCTCCT***GATTTGATT
CAACATCGGTAATGGCATCCACCTGATCTTCCTTCTTCTCAGGTTTATCCGACGGTTGAT
TCTCTACCGCGTCTTGTTTCCTATCACCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCGTTATCGCTAA
CTCCACGTTCGCTGGCAGTTTCGAACCCGTCGGAATCATCTCCGCCGACTATTTTCGCCT
CCGCTGTTTTGGGCGGCGACGAGGAAGATCGCGATGGATATGGTTCTTCTATGACGGAGA
TTTCATCGTCGCTTTCGCTTTCGATCAACACCATTTTCAACTCAGTGACTTGGGATTGTT
TCCAAAAGATTCAACGATGGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS56JQB U 1
AF RR2GJ36JQB U 1
AF RR2CE25JQ U 1
AF RR2GJ36TF C 395
AF RR2CE25TF C 302
BS 1 147 RR2CE25JQ
BS 148 148 RR2GJ36JQB
BS 149 403 RR2CE25JQ
BS 404 404 RR2GJ36JQB
BS 405 698 RR2CE25JQ
BS 699 982 RR2CE25TF

RD RR2GS56JQB 561 0 0
TCTACTTTCCAGTACAAAATCATCTGACAACAAACGTACTGATATCACCACCGATGAACA
CAAAATGGTTGATGCAATGCAAAACCATGAGTGTATTGTTGGTCAACTAGTTTTGGAAAG
AAAAAGAGTAAGAGCCAGTGTTGGGATCTTTTACAGCCTTGAAATTGTCTACACTCATCC
CAAATTTTCCCAATATCGTGTTTCCCATCTCCTTCAACTTTGCTATGGCTTCTTCTTTCA
TCTTTTCTTGCTTCGCAGCCGCCAATGGTTCCAAACGCCGAATTCCTTTTCTAGCCTGAT
CATTTGAAGAGTCCAGTTCTAATATCTTCTTCAAGTCAGTGAGGGCTTCTTCAAAGTGAT
CAAGCTTTTCATGAGCTTCTGCACGACGAACCAAAGCTTTAGTATAGCTCGGATTCAGCT
CTATCGCTTTTGTGCTTTCCTTGATTGCTTCTGCATATTTACCCAATTTGAGGTAACATA
TCGCTCTGTTTGAATGGCAGATAGATCGAAGCTCCAAAGATTCAGGGAACTCCTGAGCAA
ACTGTAAAGCAAGCTCATACT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2GJ36JQB 614 0 0
TCTACTTTCCAGTACAAAATCATCTGACAACAAACGTACTGATATCACAACCGGTGAACA
CAAAATGGTTAATGCAA*GCAAA*CCATGAGTGTATTGTTGGTCAACTAGTTTTGGAAAG
AAAAAGAGTAAGAGCCAGTGTTGGGATCTTTAACCGCCTTGAAATTGTCTACACTCATCC
CAAATTTGCCCAATATCGTGTTTCCCATCTCCTTCAACTTTGCTATGGCTTCTTCTTTCA
TCTTTTCTTGCTTCGCAGCCGCCAATGGTTCCAAACGCCGAATTCCTTTTCTAGCCTGAT
CATTTGAAGGGTCCAGTTCTAATATCTTCTTCAAGTCAGTGAGGGCTTCTTCAAAATGTT
CAAGCTTCTCATGAGCTTCTGCACGACGGACCAAAGCTTTAGTATAGCTCGGATTCAGCT
CTATCGCTTTTGTGCTTTCCTTGATTGCTTCTGCATATTTGCCCAATTTGAGATAACATA
TAGCTCTGTTTGAATGGCAGATAGATCGAAGCTCCAAAGATTCAGGGAACTCCTTAGCAA
ACTGTAAAGCAAGCTCATACTTTGACAATGCATCTTCGTATAAGCCATTTCCAAACAATT
TGTTTCCTTCCATT

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2CE25JQ 698 0 0
TCTACTTTCCAGTACAAAATCATCTGACAACAAACGTACTGATATCACAACCGATGAACA
CAAAATGGTTAATGCAA*GCAAA*CCATGAGTGTATTGTTGGTCAACTAGTTTTGGAAAG
AAAAAGAGTAAGAGCCAGTGTTGGGATATTTAACCGCCTTGAAATTGTCTACACTCATCC
CAAATTTGCCCAATATCGTGTTTCCCATCTCCTTCAACTTTGCTATGGCTTCTTCTTTCA
TCTTTTCTTGCTTCGCAGCCGCCAATGGTTCCAAACGCCGAATTCCTTTTCTAGCCTGAT
CATTTGAAGGGTCCAGTTCTAATATCTTCTTCAAGTCAGTGAGGGCTTCTTCAAAATGTT
CAAGCTTCTCATGAGCTTCTGCACGACGGACCAAAGCTTTAGTGTAGCTCGGATTCAGCT
CTATCGCTTTTGTGCTTTCCTTGATTGCTTCTGCATATTTGCCCAATTTGAGATAACATA
TAGCTCTGTTTGAATGGCAGATAGATCGAAGCTCCAAAGATTCAGGGAACTCCTTAGCAA
ACTGTAAAGCAAGCTCATACTTTGACAATGCATCTTCGTATAAGCCATTTCCAAACAATT
TGTTTCCTTCCATTTTAGCTTCATTTGCATCCTCCAAAGCTTTCTCCT***GATTTGATT
CAACATCGGTAATGGCATCCACCTGATCTTCCTTCTTC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2GJ36TF 571 0 0
AGCTTTAGTATAGCTCGGATTCAGCTCTATCGCTTTTGTGCTTTCCTTGATTGCTTCTGC
ATATTTGCCCAATTTGAGATAACATATAGCTCTGTTTGAATGGCAGATAGATCGAAGCTC
CAAAGATTCAGGGAACTCCTTAGCAAACTGTAAAGCAAGCTCATACTTTGACAATGCATC
TTCGTATAAGCCATTTCCAAACAATTTGTTTCCTTCCATTTTAGCTTCATTTGCATCCTC
CAAAGCTTTCTCCTTCTGATTTGATTCAACATCGGTAATGGCATCCACCTGATCTTCCTT
CTTCTCAGGTTTATCCGACGGTTGATTCTCTACCGCGTCTTGTTTCCTATCACCTTCTTC
CTCTTCTTCTTCTTCGTTATCGCTAACTCCACGTTCGCTGGCAGTTTCGAACCCGTCGGA
ATCATCTCCGCCGACTATTTTCGCCTCCGCTGTTTTGGGCGGCGACGAGGAAGATCGCGA
TGGATTTGGTTCTTCTATGACGGAGATTTCATCGTCGCTTTCGCTTTCGATCAACACCAT
TTTCAACTCAGTGACTTGGGATT
GTTTCCCC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2CE25TF 681 0 0
ATTTGAAGGGTCCAGTTCTAATATCTTCTTCAAGTCAGTGAGGGCTTCTTCAAAATGTTC
AAGCTTCTCATGAGCTTCTGCACGACGGACCAAAGCTTTAGTGTAGCTCGGATTCAGCTC
TATCGCTTTTGTGCTTTCCTTGATTGCTTCTGCATATTTGCCCAATTTGAGATAACATAT
AGCTCTGTTTGAATGGCAGATAGATCGAAGCTCCAAAGATTCAGGGAACTCCTTAGCAAA
CTGTAAAGCAAGCTCATACTTTGACAATGCATCTTCGTATAAGCCATTTCCAAACAATTT
GTTTCCTTCCATTTTAGCTTCATTTGCATCCTCCAAAGCTTTCTCCT***GATTTGATTC
AACATCGGTAATGGCATCCACCTGATCTTCCTTCTTCTCAGGTTTATCCGACGGTTGATT
CTCTACCGCGTCTTGTTTCCTATCACCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCGTTATCGCTAAC
TCCACGTTCGCTGGCAGTTTCGAACCCGTCGGAATCATCTCCGCCGACTATTTTCGCCTC
CGCTGTTTTGGGCGGCGACGAGGAAGATCGCGATGGATATGGTTCTTCTATGACGGAGAT
TTCATCGTCGCTTTCGCTTTCGATCAACACCATTTTCAACTCAGTGACTTGGGATTGTTT
CCAAAAGATTCAACGATGGTC

QA 1 681 1 681
DS 



CO CL964Contig2 674 3 13 U
GGCTTTTGGAAACAATCCCAAGTCACTGAGTTGAAAATGGTGTTGATCGAAAGCGAAAGC
GACGATGAAATCTCCATTAAAGAAGAACCAAATCCATCGCGATCTTCCTCGTCGCCGTCC
AAAACAGCGGAGGCGAAAATAGTCGGCGGAGACGATTCCGACGGGTTCGAAACTGCCAGC
GAACGTGGAGTTAGCGATAACGAAGAAGAAGAAAAGGAAGAAGGTGATAGGAAACAAGAC
GCGGTAGAGAATGAGGATAAACCTGAGAAGAATGAAGATCAGGTGGAGGCTATTACCGAT
GTTGAATCAAATCAGAAGGAGAAAGCTTTGGAGGATGCAAACGAAGCTAAAATGGAAGGA
AACAAATTGTTTGGAAATGGCTTATACGAAGATGCATTGTCAAAGTATGAGCTTGCTTTA
CAGTTTGCTCAGGAGTTCCCTGAATCTTTGGAGCTTCGATCTATCTGCCATTCAAACAGA
GCGATATGTTACCTCAAATTGGGCAAATATGCAGAAGCAATCAAGGAAAGCACAAAAGCG
ATAGAGCTGAATCCGAGCTATACTAAAGCTTTGGTTCGTCGTGCAGAAGCTCATGAAAAG
CTTGATCACTTTGAAGAAGCCCTCACTGACTTGAAGAAGATATTAGAACTGGACCCTTCA
AATGATCAGCTAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS56TF U 1
AF RR2DU30TF U 13
AF RR2CG21TF U 12
BS 1 67 RR2GS56TF
BS 68 68 RR2DU30TF
BS 69 126 RR2GS56TF
BS 127 127 RR2DU30TF
BS 128 280 RR2GS56TF
BS 281 281 RR2DU30TF
BS 282 503 RR2GS56TF
BS 504 504 RR2DU30TF
BS 505 637 RR2GS56TF
BS 638 638 RR2DU30TF
BS 639 654 RR2GS56TF
BS 655 655 RR2DU30TF
BS 656 674 RR2GS56TF

RD RR2GS56TF 674 0 0
GGCTTTTGGAAACAATCCCAAGTCACTGAGTTGAAAATGGTGTTGATCGAAAGCGAAAGC
GACGATGGAATCTCCATTAAAGAAGAACCAAATCCATCGCGATCTTCCTCGTCGCCGTCC
AAAACATCGGAGGCGAAAATAGTCGGCGGAGACGATTCCGACGGGTTCGAAACTGCCAGC
GAACGTGGAGTTAGCGATAACGAAGAAGAAGAAAAGGAAGAAGGTGATAGGAAACAAGAC
GCGGTAGAGAATGAGGATAAACCTGAGAAGAATGAAGATCGGGTGGAGGCTATTACCGAT
GTTGAATCAAATCAGAAGGAGAAAGCTTTGGAGGATGCAAACGAAGCTAAAATGGAAGGA
AACAAATTGTTTGGAAATGGCTTATACGAAGATGCATTGTCAAAGTATGAGCTTGCTTTA
CAGTTTGCTCAGGAGTTCCCTGAATCTTTGGAGCTTCGATCTATCTGCCATTCAAACAGA
GCGATATGTTACCTCAAATTGGGTAAATATGCAGAAGCAATCAAGGAAAGCACAAAAGCG
ATAGAGCTGAATCCGAGCTATACTAAAGCTTTGGTTCGTCGTGCAGAAGCTCATGAAAAG
CTTGATCACTTTGAAGAAGCCCTCACTGACTTGAAGA*GATATTAGAACTGGACTCTTCA
AATGATCAGCTAGA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2DU30TF 655 0 0
GG
ATCCCAAGTCACTGAGTTGAAAATGGTGTTGATCGAAAGCGAAAGCGACGATGAAATCTC
CATTAAAGAAGAACCAAATCCATCGCGATCTTCCTCGTCGCCGTCCAAAACAGCGGAGGC
GAAAATAGTCGGCGGAGACGATTCCGACGGGTTCGAAACTGCCAGCGAACGTGGAGTTAG
CGATAACGAAGAAGAAGAAAAGGAAGAAGGTGATAGGAAACAAGACGCGGTAGAGAATGA
GGATAAACCTGAGAAGAATGAAGATCAGGTGGAGGCTATTACCGATGTTGAATCAAATCA
GAAGGAGAAAGCTTTGGAGGATGCAAACGAAGCTAAAATGGAAGGAAACAAATTGTTTGG
AAATGGCTTATACGAAGATGCATTGTCAAAGTATGAGCTTGCTTTACAGTTTGCTCAGGA
GTTCCCTGAATCTTTGGAGCTTCGATCTATCTGCCATTCAAACAGAGCGATATGTTACCT
CAAATTGGGCAAATATGCAGAAGCAATCAAGGAAAGCACAAAAGCGATAGAGCTGAATCC
GAGCTATACTAAAGCTTTGGTTCGTCGTGCAGAAGCTCATGAAAAGCCTGATCACTTTGA
AGAAGCCCTCACTGACTTGAAGAAGATATTAGAACTGGACCCTTCAAATGATC

QA 3 655 3 655
DS 

RD RR2CG21TF 652 0 0
GG
AATCCCAAGTCACTGAGTTGAAAATGGTGTTGATCGAAAGCGAAAGCGACGATGAAATCT
CCATTAAAGAAGAACCAAATCCATCGCGATCTTCCTCGTCGCCGTCCAAAACAGCGGAGG
CGAAAATAGTCGGCGGAGACGATTCCGACTGGTTCGAAACTGCCAGCGAACGTGGAGTTA
GTGATAACGAAGAAGAAGAAAAGGAAGAAGGTGATAGGAAACAAGACGCGGTAGAGAATG
AGGATAAACCTGAGAAGAATGAAGATCAGGTGGAGGCTATTACCGATGTTGAATCAAATC
AGAAGGAGAAAGCTTTGGAGGATGCAAACGAAGCTAAAATGGAAGGAAACAAATTGTTTG
GAAATGGCTTATACGAAGATGCATTGTCAAAGTATGAGCTTGCTTTACAGTTTGCTCAGG
AGTTCCCTGAATCTTTGGAGCTTCGATCTATCTGCCATTCAAACAGAGCGATATGTTACC
TCAAATTGGGCAAATATGCAGAAGCAATCAAGGAAAGCACAAAAGCGATAGAGCTGAATC
CGAGCTATACTAAAGCTTTGGTTCGTCGTGCAGAAGCTCATGAAAAGCTTGATCACTTTG
AAGAAGCCCTCACTGACTTGAAGAAGATATTAGAACTGGACCCTTCAAAT

QA 3 652 3 652
DS 



AS 1 6

CO CL965Contig1 835 6 8 U
GGAGCTTTCCAAAGTCCAAAAGCACAGTTTCTACCAGAAACCAACTTTGCATCTTGCAAT
TGACCCAAAAATGGAGAATCTACTGGGTCTTCTGAGAATTCATGTGAAGAGAGGTGTGAA
TCTCGCCATTAGAGATACCTCAAGCAGCGATCCTTACATCGTCTTTCGCTCAGGAAAACA
GAAGCTTAAAACCCGTGTAATCAAACATAGTATAAACCCGGAATGGAACGACGATTTAAC
TCTTTCTGTTACAGATCCAAACCTCACTGTTAAACTTACGGTTTACGACAAGGACTTGTT
CTCGGCGGATGATAAGATGGGAGAAGCAGAGTTTGGCATTGCTCCATATCTTGAAGCCAT
TAAACTACGCCATAAGCTTGAAGGAGGACTTCCCAACGGAACCATAATCATGAAGGTACA
ACCGACCAGACAAAACTGTCTGTCTGAAGAGAGCCATATTGTGTTGAGCCAAGGGAAGCT
TGTGCAGAATATGTTCCTTAGACTCCAGCACGTGGAGTGTGGAGAGGTCGAGCTACAGCT
CGAGTGGATCGAGGTTCCCGGTTCAAAGGGTATTTAAGGCCATCGACCCCATCCTTAGTC
CCTTGTGCATGCATACATGGTTAAGAAATTAGAACTAAGGCGTTGTTCAAAACTGGTCAG
TGAAAGGATCTCAAACTGGTCATGTAGTAAACTCTTTTGCGTTTTTCTGTTCTTATTTGA
GTTCAAACCGTGCAAGTCCATGAGGAATGTGGGCGTCTTAAAACAAGAATGTGTAAAAAT
AATGCATTGGTTTACTTTGTAATAAATCAAATTATATTTATATTAATTGTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2CI30TF U 2
AF RR2DL39TF U 1
AF RR2DL39JQ C 171
AF RR2CI30JQ C 74
AF RR2EH23TF U 364
AF RR2F954JQ C 271
BS 1 498 RR2DL39TF
BS 499 499 RR2EH23TF
BS 500 551 RR2DL39TF
BS 552 552 RR2EH23TF
BS 553 585 RR2DL39TF
BS 586 586 RR2EH23TF
BS 587 633 RR2DL39TF
BS 634 835 RR2EH23TF

RD RR2CI30TF 308 0 0
GGAGCTTTCC
AAGTCCAAAAGCACAGTTTCTACCAGAAACCAACTTTGCATCTTGCAATTGACCCAAAAA
TGGAGAATCTACTGGGTCTTCTGAGAATTCATGTGAAGAGAGGTGTGAATCTCGCCATTA
GAGATACCTCAAGCAGCGATCCTTACATCGTCTTTCGCTCAGGAAAACAGAAGCTTAAAA
CCCGTGTAATCAAACATAGTATAAACCCGGAATGGAACGACGATTTAACTCTTTCTGT*A
CAGATCCAAACCTCACTGT*AAACTTACGGTTTACGACAAGGACTTGT*CTCGGCGGA

QA 11 308 11 308
DS 

RD RR2DL39TF 633 0 0
GGAGCTTTCCAAAGTCCAAAAGCACAGTTTCTACCAGAAACCAACTTTGCATCTTGCAAT
TGACCCAAAAATGGAGAATCTACTGGGTCTTCTGAGAATTCATGTGAAGAGAGGTGTGAA
TCTCGCCATTAGAGATACCTCAAGCAGCGATCCTTACATCGTCTTTCGCTCAGGAAAACA
GAAGCTTAAAACCCGTGTAATCAAACATAGTATAAACCCGGAATGGAACGACGATTTAAC
TCTTTCTGTTACAGATCCAAACCTCACTGTTAAACTTACGGTTTACGACAAGGACTTGTT
CTCGGCGGATGATAAGATGGGAGAAGCAGAGTTTGGCATTGCTCCATATCTTGAAGCCAT
TAAACTACGCCATAAGCTTGAAGGAGGACTTCCCAACGGAACCATAATCATGAAGGTACA
ACCGACCAGACAAAACTGTCTGTCTGAAGAGAGCCATATTGTGTTGAGCCAAGGGAAGCT
TGTGCAGAATATGTTCCTCAGACTCCAGCACGTGGAGTGTGGAGAGGTCGAGCTACAGCT
CGAGTGGATCG*GGTTCCCGGTTCAAAGGGTATTTAAGGCCATCGGCCCCATCCTTAGTC
CCTTGTGCATGCATACATGGTTAAGAAATTAGA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2DL39JQ 589 0 0
CAGGAAAACAGAAGCTTAAAACCCGTGTAATCAAACATAGTATAAACCCGGAATGGAACG
ACGATTTAACTCTTTCTGTTACAGATCCAAACCTCACTGTTAAACTTACGGTTTACGACA
AGGACTTGTTCTCGGCGGATGATAAGATGGGAGAAGCAGAGTTTGGCATTGCTCCATATC
TTGAAGCCATTAAACTACGCCATAAGCTTGAAGGAGGACTTCCCAACGGAACCATAATCA
TGAAGGTACAACCGACCAGACAAAACTGTCTGTCTGAAGAGAGCCATATTGTGTTGAGCC
AAGGGAAGCTTGTGCAGAATATGTTCCTCAGACTCCAGCACGTGGAGTGTGGAGAGGTCG
AGCTACAGCTCGAGTGGATCG*GGTTCCCGGTTCAAAGGGTATTTAAGGCCATCGGCCCC
ATCCTTAGTCCCTTGTGCATGCATACATGGTTAAGAAATTAGAACTAAGGCGTTGTTCAA
AACTGGTCAGTGAAAGGGTCTCAAACTGGTCATGTAGTAAACTCTTTTGCGTTTTTCTGT
TCTTATTTGAGTTCAAAGCGTGCAAGTCCATGAGGAATGTGGGCGTCTT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2CI30JQ 762 0 0
GAGAATCTACTGGGTCTTCTGAGAATTCATGTGAAGAGAGGTGTGAATCTCGCCATTAGA
GATACCTCAAGCAGCGATCCTTACATCGTCTTTCGCTCAGGAAAACAGAAGCTTAAAACC
CGTGTAATCAAACATAGTATAAACCCGGAATGGAACGACGATTTAACTCTTTCTGTTACA
GATCCAAACCTCACTGTTAAACTTACGGTTTACGACAAGGACTTGTTCTCGGCGGATGAT
AAGATGGGAGAAGCAGAGTTTGGCATTGCTCCATATCTTGAAGCCATTAAACTACGCCAT
AAGCTTGAAGGAGGACTTCCCAACGGAACCATAATCATGAAGGTACAACCGACCAGACAA
AACTGTCTGTCTGAAGAGAGCCATATTGTGTTGAGCCAAGGGAAGCTTGTGCAGAATATG
TTCCTTAGACTCCAGCACGTGGAGTGTGGAGAGGTCGAGCTACAGCTCGAGTGGATCGAG
GTTCCCGGTTCAAAGGGTATTTAAGGCCATCGACCCCATCCTTAGTCCCTTGTGCATGCA
TACATGGTTAAGAAATTAGAACTAAGGCGTTGTTCAAAACTGGTCAGTGAAAGGATCTCA
AACTGGTCATGTAGTAAACTCTTTTGCGTTTTTCTGTTCTTATTTGAGTTCAAACCGTGC
AAGTCCATGAGGAATGTGGGCGTCTTAAAACAAGAATGTGTAAAAATAATGCATTGGTTT
ACTTTGTAATAAATCAAATTATATTTATATTAATTGTGTTTT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2EH23TF 472 0 0
G
CTACGCCATAAGCTTGAAGGAGGACTTCCCAACGGAACCATAATCATGAAGGTACAACCG
ACCAGACAAAACTGTCTGTCTGAAGAGAGCCATATTGTGTTGAGCCAAGGGAAGCTTGTG
CAGAATATGTTCCTTAGACTCCAGCACGTGGAGTGTGGAGAGGTCGAGCTACAGCTCGAG
TGGATCGAGGTTCCCGGTTCAAAGGGTATTTAAGGCCATCGACCCCATCCTTAGTCCCTT
GTGCATGCATACATGGTTAAGAAATTAGAACTAAGGCGTTGTTCAAAACTGGTCAGTGAA
AGGATCTCAAACTGGTCATGTAGTAAACTCTTTTGCGTTTTTCTGTTCTTATTTGAGTTC
AAACCGTGCAAGTCCATGAGGAATGTGGGCGTCTTAAAACAAGAATGTGTAAAAATAATG
CATTGGTTTACTTTGTAATAAATCAAATTATATTTATATTAATTGTGTTTT

QA 2 472 2 472
DS 

RD RR2F954JQ 565 0 0
TAAACTTACGGTTTACGACAAGGACTTGTTCTCGGCGGATGATAAGATGGGAGAAGCAGA
GTTTGGCATTGCTCCATATCTTGAAGCCATTAAACTACGCCATAAGCTTGAAGGAGGACT
TCCCAACGGAACCATAATCATGAAGGTACAACCGACCAGACAAAACTGTCTGTTTGAAGA
GAGCCATATTGTGTTGAGCCAAGGGAAGCTTGTGCAGAATATGTTCCTTAGACTCCAGCA
CGTGGAGTGTGGAGAGGTCGAGCTACAGCTCGAGTGGATCGAGGTTCCCGGTTCAAAGGG
TATTTAAGGCCATCGACCCCATCCTTAGTCCCTTGTGCATGCATACATGGTTAAGAAATT
AGAACTAAGGCGTTGTTCAAAACTGGTCAGTGAAAGGATCTCAAACTGGTCATGTAGTAA
ACTCTTTTGCGTTTTTCTGTTTTTATTTGAGTTCAAACCGTGCAAGTCCATGAGGAATGT
GGGCGTCTTAAAACAAGAATGTGTAAAAATAATGCATTGGTTTACTTTGTAATAAATCAA
ATTATATTTATATTAATTGTGTTTT

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 6

CO CL966Contig1 794 6 6 U
GGATTCCTCAACACGTCTCTAATCTCTTCTAAGAAGATCCGCGTGATGGGATTGCTCGAT
CTGGAGAAGCACTTCGCCTTCTACGGTGCTTACCACAGCAATCCGATCAACATCATAATC
CACATCATCTTCGTATGGCCGATCGTCTTCACCGCCTTGCTCCTCCTCCACTCCTCGACC
CCAATTTTCGATCTCTCTCAATCTCTGACCCTCGACGGCGTTCTTCGGCTAAACGTCGGG
TTTATCCTTACGGTTGTTTATGCTCTCTTCTACATCTCTTTGGATAGGAAAGCTGGGTTT
GTAGCGGCTCTCATGTGTTTCTCTTGCTGGCTCGGTTCCAGCTTTCTCGCTGCTCGTTTA
GGCCCTTCTCTAGCCCTCAAGGTTGGGATAGCGTCTCAGCTGTTATGTTGGACCGGGCAG
TTTCTTGGCCATGGACTCTTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTATTAGACAATCTGCTCCAA
GCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTCGAGGTTCTTCAGTCGGTTTTCGGGTAT
GAACCATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGTGAATGCCAAGGTAGAAAGTGACATTAAGGAA
TGGAGAGCAAAGAAGCAGATTAAAAAGAATAAGCTCACATAAGCTTTGGATTAATATAAC
TGAACAACTTAAACCCATTGATTGTAATGTTTCCACATTGAAAACCTATATAATAAAAAT
ATAAGACCCACCACCATGGATTGATGGATTTGTGTGTATATGTGTGTAACTATGTTTCTA
GTGAAAGTTACTTT


BQ
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2EO90TF U -4
AF RR2CI59TF U 1
AF RR2CI59JQ C 1
AF RR2AI25TF U 1
AF RR2AI25JQ C 94
AF RR2EO90JQ C 170
BS 1 284 RR2AI25TF
BS 285 285 RR2EO90TF
BS 286 559 RR2AI25TF
BS 560 560 RR2EO90TF
BS 561 786 RR2AI25TF
BS 787 794 RR2AI25JQ

RD RR2EO90TF 631 0 0
GGTCCTC
ATTCCTCAACACGTCTCTAATCTCTTCTAAGAAGATCCGCGTGATGGGATTGCTCGATCT
GGAGAAGCACTTCGCCTTCTACGGTGCTTACCACAGCAATCCGATCAACATCATAATCCA
CATCATCTTCGTATGGCCGATCGTCTTCACCGCCTTGCTCCTCCTCCACTCCTCGACCCC
AATTTTCGATCTCTCTCAATCTCTGACCCTCGACGGCGTTCTTCGGCTAAACGTCGGGTT
TATCCTTACGGTTGTTTATGCTCTCTTCTACATCTCTTTGGATAGGAAAGCTGGGTTTGT
AGCGGCTCTCATGTGTTTCTCTTGCTGGCTCGGTTCCAGCTTTCTCGCTGCTCGTTTAGG
CCCTTCTCTAGCCCTCAAGGTTGGGATAGCGTCTCAGCTGTTATGTTG*ACCGGGCAGTT
TCTTGGCCATGGACTCTTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTATTAGACAATCTGCTCCAAGC
TTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTCGAGGTTCTTCAGTCGGGTTTCGGGTATGA
ACCATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGTGAATGCCAAGGTAGAAAGTGACATTAAGGAATG
GAGAGCAAAGAAGCAGATTAAAAA

QA 8 631 8 631
DS 

RD RR2CI59TF 716 0 0
GGATTCCTCAACACGTCTCTAATCTCTTCTAAGAAGATCCGCGTGATGGGATTGCTCGAT
CTGGAGAAGCACTTCGCCTTCTACGGTGCTTACCACAGCAATCCGATCAACATCATAATC
CACATCATCTTCGTATGGCCGATCGTCTTCATCGCCTTGCTCCTCCTCCACTCCTCGACC
CCAATTTTCGATCTCTCTCAATCTCTGACCCTCGACGGCGTTCTTCGGCTAAACGTCGGG
TTTATCCTTACGGTTGTTTATGCTCTCTTCTACATCTCTTTGGATAGGAAAGCTGGGTTT
GTAGCCGCTCTCATGTGTTTCTCTTGCTGGCTCGGTTCCAGCTTTCTCGCTGCTCAGTTA
GGGCCTTCTCTATCCCTCAAGGTTGGGATAGCGTCTCAGCTGTTATGTTGGACCAGGCAG
TTTCTTGGCCATGGACTCTTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTATTAGACAATCTGCTCCAA
GCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTCGAGGTTCTTCAGTCGGTTTTCGGGTAT
GAACCATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGTGAATGCCAAGGTAGAGAGTGACATTAAGGAA
TGGAGAGCAAAGAAGCAGATTAAAAAGAATAAGCTCACATAAGCTTTGGATTAATATAAC
TGAACAACTTAAACCCATTGATTGTAATGTTTCCACATTGAAAACCTATGTAA
AAA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2CI59JQ 755 0 0
GGATTCCTCAACACGTCTCTAATCTCTTCTAAGAAGATCCGCGTGATGGGATTGCTCGAT
CTGGAGAAGCACTTCGCCTTCTACGGTGCTTACCACAGCAATCCGATCAACATCATAATC
CACATCATCTTCGTATGGCCGATCGTCTTCATCGCCTTGCTCCTCCTCCACTCCTCGACC
CCAATTTTCGATCTCTCTCAATCTCTGACCCTCGACGGCGTTCTTCGGCTAAACGTCGGG
TTTATCCTTACGGTTGTTTATGCTCTCTTCTACATCTCTTTGGATAGGAAAGCTGGGTTT
GTAGCCGCTCTCATGTGTTTCTCTTGCTGGCTCGGTTCCAGCTTTCTCGCTGCTCAGTTA
GGGCCTTCTCTATCCCTCAAGGTTGGGATAGCGTCTCAGCTGTTATGTTGGACCAGGCAG
TTTCTTGGCCATGGACTCTTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTATTAGACAATCTGCTCCAA
GCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTCGAGGTTCTTCAGTCGGTTTTCGGGTAT
GAACCATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGTGAATGCCAAGGTAGAGAGTGACATTAAGGAA
TGGAGAGCAAAGAAGCAGATTAAAAAGAATAAGCTCACATAAGCTTTGGATTAATATAAC
TGAACAACTTAAACCCATTGATTGTAATGTTTCCACATTGAAAACCTATGTAATAAAAAT
ATAAGACC*ACCACCATGGATAGGTGGATTTGTGT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2AI25TF 786 0 0
GGATTCCTCAACACGTCTCTAATCTCTTCTAAGAAGATCCGCGTGATGGGATTGCTCGAT
CTGGAGAAGCACTTCGCCTTCTACGGTGCTTACCACAGCAATCCGATCAACATCATAATC
CACATCATCTTCGTATGGCCGATCGTCTTCACCGCCTTGCTCCTCCTCCACTCCTCGACC
CCAATTTTCGATCTCTCTCAATCTCTGACCCTCGACGGCGTTCTTCGGCTAAACGTCGGG
TTTATCCTTACGGTTGTTTATGCTCTCTTCTACATCTCTTTGGACAGGAAAGCTGGGTTT
GTAGCGGCTCTCATGTGTTTCTCTTGCTGGCTCGGTTCCAGCTTTCTCGCTGCTCGTTTA
GGCCCTTCTCTAGCCCTCAAGGTTGGGATAGCGTCTCAGCTGTTATGTTGGACCGGGCAG
TTTCTTGGCCATGGACTCTTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTATTAGACAATCTGCTCCAA
GCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTCGAGGTTCTTCAGTCGGTTTTCGGGTAT
GAACCATATCCAGGTTTTCGAGCTCGTGTGAATGCCAAGGTAGAAAGTGACATTAAGGAA
TGGAGAGCAAAGAAGCAGATTAAAAAGAATAAGCTCACATAAGCTTTGGATTAATATAAC
TGAACAACTTAAACCCATTGATTGTAATGTTTCCACATTGAAAACCTATATAATAAAAAT
ATAAGACCCACCACCATGGATTGATGGATTTGTGTGTATATGTGTGTAACTATGTTTCTA
GTGAAA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2AI25JQ 701 0 0
CACAGCAATCCGATCAACATCATAATCCACATCATCTTCGTATGGCCGATCGTCTTCACC
GCCTTGCTCCTCCTCCACTCCTCGACCCCAATTTTCGATCTCTCTCAATCTCTGACCCTC
GACGGCGTTCTTCGGCTAAACGTCGGGTTTATCCTTACGGTTGTTTATGCTCTCTTCTAC
ATCTCTTTGGACAGGAAAGCTGGGTTTGTAGCGGCTCTCATGTGTTTCTCTTGCTGGCTC
GGTTCCAGCTTTCTCGCTGCTCGTTTAGGCCCTTCTCTAGCCCTCAAGGTTGGGATAGCG
TCTCAGCTGTTATGTTGGACCGGGCAGTTTCTTGGCCATGGACTCTTCGAGAAACGAGCA
CCTGCGCTATTAGACAATCTGCTCCAAGCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTC
GAGGTTCTTCAGTCGGTTTTCGGGTATGAACCATATCCAGGTTTTCGAGCTCGTGTGAAT
GCCAAGGTAGAAAGTGACATTAAGGAATGGAGAGCAAAGAAGCAGATTAAAAAGAATAAG
CTCACATAAGCTTTGGATTAATATAACTGAACAACTTAAACCCATTGATTGTAATGTTTC
CACATTGAAAACCTATATAATAAAAATATAAGACCCACCACCATGGATTGATGGATTTGT
GTGTATATGTGTGTAACTATGTTTCTAGTGAAAGTTACTTT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2EO90JQ 625 0 0
ACTCCTCGACCCCAATTTTCGATCTCTCTCAATCTCTGACCCTCGACGGCGTTCTTCGGC
TAAACGTCGGGTTTATCCTTACGGTTGTTTATGCTCTCTTCTACATCTCTTTGGATAGGA
AAGCTGGGTTTGTAGCGGCTCTCATGTGTTTCTCTTGCTGGCTCGGTTCCAGCTTTCTCG
CTGCTCGTTTAGGCCCTTCTCTAGCCCTCAAGGTTGGGATAGCGTTTCAGCTGTTATGTT
G*ACCGGGCAGTTTCTTGGCCATGGACTCTTCGAGAAACGAGCCCCTGCGCTATTAGACA
ATCTGCTCCAAGCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTCGAGGTTCTTCAGTCGG
GTTTCGGGTATGAACCATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGTGAATGCCAAGGTAGAAAGTG
ACATTAAGGAATGGAGAGCAAAGAAGCAGATTAAAAAGAATAAGCTCACATAAGCTTTGG
ATTAATATAACTGAACAACTTAAACCCATTGATTGTAATGTTTCCACATTGAAAACCTAT
ATAATAAAAATATAAGACCCACCACCATGGATTGATGGATTTGTGTGTATATGTGTGTAA
CTATGTTTCTAGTGAAAGTTA
TTTT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 8

CO CL967Contig1 950 8 12 U
GGATATCAAACATAAAAGTCAGCAAAACAAAGGCATATTCCTCTTCTCTTCATAAGCCTT
AATTTCTAAATATTCAGATTCAAAGATCTCCATGGCTATCCACAAGATCTTCTTCGCTTC
ACTTCTAATCTGCTTACTTTTCCAAATTAGTCATGGTGCTACCAAAGAAAGGCTCTTCTC
TGACCTGGAGAAAGGTGCACTTGAGGTCACCGCTACACCC*AGCCGAGAAGGCGTTTTGG
ATGCCGGAATTGACAAGTTGAGCATTACATGGAAGCTAAGCTCGACAGCTACAAAAGAGG
CTGAATTTACGACCATCAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTAAGCCAAGTTGACCGAC
CATGGCGAAAGACCCAAAATGAGCTCTTCAAGGACAAAACCTGCCCACACAAGATCATTA
CCAGGCCCTATGATAAATCCCCTCAATCATTCGAATATACCCTAGAACGCGACATCCCAA
CGGGAACCTACTTCGTTCGCGCCTACGCAGTTGATGCCAAAGGCCAGGAAGTTGCTTTTG
GACAGAGCACGGACGCGGCAAAGTCAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATCAGTGGTC
GCCACAAGTCCTTGGATATTGCCTCCGTCTGCTTCAGCGTGTTTTCCGTCCTGGCTCTTC
TCGTCTTCTTTGTGAACGAGAAGAGGAAAGCCAAGATAGAGCAGAGCAAATGAGTTGTTT
ACTTTGCGTAATTGGGAAGTTGAGCAAAACCCTGTTGACTTTGAATTTATCTTTTTCTTT
TATCCGCTGCTTTTGTTTTGATGCTTACCTCTTCTTCCTTTAAACTTCTAATAATTTCAA
GATCAATGTGGTTAATAGGAACATGTGTGGTGTTTGATAATATACTTTGTATTTGCGAAA
TTGCAAGGAGATGAAACAATAAATGTTTGACGTGTGAGCCTGAAACTTTG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI34TF U 1
AF RR2E536TF U 3
AF RR2F802TF U 3
AF RR2CD34TF U 20
AF RR2CH34TF U 50
AF RR2DI34JQ C 144
AF RR2CH34JQ C 191
AF RR2CD34JQ C 225
BS 1 522 RR2DI34TF
BS 523 523 RR2E536TF
BS 524 650 RR2DI34TF
BS 651 685 RR2CD34TF
BS 686 749 RR2CH34TF
BS 750 790 RR2DI34JQ
BS 791 791 RR2CH34JQ
BS 792 846 RR2DI34JQ
BS 847 847 RR2CH34JQ
BS 848 897 RR2DI34JQ
BS 898 937 RR2CH34JQ
BS 938 950 RR2CD34JQ

RD RR2DI34TF 650 0 0
GGATATCAAACATAAAAGTCAGCAAAACAAAGGCATATTCCTCTTCTCTTCATAAGCCTT
AATTTCTAAATATTCAGATTCAAAGATCTCCATGGCTATCCACAAGATCTTCTTCGCTTC
ACTTCTAATCTGCTTACTTTTCCAAATTAGTCATGGTGCTACCAAAGAAAGGCTCTTCTC
TGACCTGGAGAAAGGTGCACTTGAGGTCACCGCTACACCC*AGCCGAGAAGGCGTTTTGG
ATGCCGGAATTGACAAGTTGAGCATTACATGGAAGCTAAGCTCGACAGCTACAAAAGAGG
CTGAATTTACGACCATCAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTAAGCCAAGTTGACCGAC
CATGGCGAAAGACCCAAAATGAGCTCTTCAAGGACAAAACCTGCCCACACAAGATCATTA
CCAGGCCCTATGATAAATCCCCTCAATCATTCGAATATACCCTAGAACGCGACATCCCAA
CGGGAACCTACTTCGTTCGCGCCTACGCAGTTGATGCCAAAG*CCAGGAAGTTGCTTTTG
GACAGAGCACGGACGCGGCAAAGTCAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATCAGTGGTC
GCCACAAGTCCTTGGATATTGCCTCCGTCTGCTTCAGCGTGTTTTCCGTC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2E536TF 648 0 0
GG
ATCAAACATAAAAGTCAGCAAAACAAAGGCATATTCCTCTTCTCTTCATAAGCCTTAATT
TCTAAATATTCAGATTCAAAGATCTCCATGGCTATCCACAAGATCTTCTTCGCTTCACTT
CTAATCTGCTTACTTTTCCAAATTAGTCATGGTGCTACCAAAGAAAGGCTCTTCTCTGAC
CTGGAGAAAGGTGCACTTGAGGTCACCGCTACACCC*AGCCGAGAAGGCGTTTTGGATGC
CGGAATTGACAAGTTGAGCATTACATGGAAGCTAAGCTCGACAGCTACAAAAGAGGCTGA
ATTTACGACCATCAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTAAGCCAAGTTGACCGACCATG
GCGAAAGACCCAAAATGAGCTCTTCAAGGACAAAACCTGCCCACACAAGATCATTACCAG
GCCCTATGATAAATCCCCTCAATCATTCGAATATACCCTAGAACGCGACATCCCAACGGG
GACCTACTTCGTTCGCGCCTACGCAGTTGATGCCAAAGGCCAGGAAGTTGCTTTTGGACA
GAGCACGGACGCGGCAAAGTCAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATCAGTGGTCGCCA
CAAGTCCTTGGATATTGCCTCCGTCTGCTTCAGCGTGTTTTCCGTC

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR2F802TF 628 0 0
GG
ATCAAACATAAAAGTCAGCAAAACAAAGGCATATTCCTCTTCTCTTCATAAGCCTTAATT
TCTAAATATTCAGATTCAAAGATCTCCATGGCTATCCACAAGATCTTCTTCGCTTCACTT
CTAATCTGCTTACTTTTCCAAATTAGTCATGGTGCTACCAAAGAAAGGCTCTTCTCTGAC
CTGGAGAAAGGTGCACTTGAGGTCACCGCTACACCC*AGCCGAGAAGGCGTTTTGGATGC
CGGAATTGACAAGTTGAGCATTACATGGAAGCTAAGCTCGACAGCTACAAAAGAGGCTGA
ATTTACGACCATCAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTAAGCCAAGTTGACCGACCATG
GCGAAAGACCCAAAATGAGCTCTTCAAGGACAAAACCTGCCCACATAAGATCATTACCAG
GCCCTATGATAAACCCCCTCAATCATTCGAATATACCCTAGAACGCGACATCCCAACGGG
AACCTACTTCGTTCGCGCCTACGCAGTTGATGCCAAAGGCCAGGAAGTTGCTTTTGGACA
GAGCACGGACGCGGCAAAGTCAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATCAGTGGTCGCCA
CAAGTCCTTGGATATTGCCTCCGTCT

QA 3 628 3 628
DS 

RD RR2CD34TF 666 0 0
CAGCAAAACAAAGGCATATTCCTCTTCTCTTCATAAGCCTTAATTTCTAAATATTCAGAT
TCAAAGATCTCCATGGCTATCCACAAGATCTTCTTCGCTTCACTTCTAATCTGCTTACTT
TTCCAAATTAGTCATGGTGCTACCAAAGAAAGGCTCTTCTCTGACCTGGAGAAAGGTGCA
CTTGAGGTCACCGCTACACCC*AGCCGAGAAGGCGTTTTGGATGCCGGAATTGACAAGTT
GAGCATTACATGGAAGCTAAGCTCGACAGCTACAAAAGAGGCTGAATTTACGACCATCAA
AGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTAAGCCAAGTTGACCGACCATGGCGAAAGACCCAAAA
TGAGCTCTTCAAGGACAAAACCTGCCCACACAAGATCATTACCAGGCCCTATGATAAATC
CCCTCAATCATTCGAATATACCCTAGAACGCGACATCCCAACGGGGACCTACTTCGTTCG
CGCCTACGCAGTTGATGCCAAAGGCCAGGAAGTTGCTTTTGGACAGAGCACGGACGCGGC
AAAGTCAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATCAGTGGTCGCCACAAGTCCTTGGATAT
TGCCTCCGTCTGCTTCAGCGTGTTTTCCGTCCTGGCTCTTCTCGTCTTCTTTGTGAACGA
GAAGAG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2CH34TF 700 0 0
GG
ATAAGCCTTAATTTCTAAATATTCAGATTCAAAGATCTCCATGGCTATCCACAAGATCTT
CTTCGCTTCACTTCTAATCTGCTTACTTTTCCAAATTAGTCATGGTGCTACCAAAGAAAG
GCTCTTCTCTGACCTGGAGAAAGGTGCACTTGAGGTCACCGCTACACCC*AGCCGAGAAG
GCGTTTTGGATGCCGGAATTGACAAGTTGAGCATTACATGGAAGCTAAGCTCGACAGCTA
CAAAAGAGGCTGAATTTACGACCATCAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTAAGCCAAG
TTGACCGACCATGGCGAAAGACCCAAAATGAGCTCTTCAAGGACAAAACCTGCCCACACA
AGATCATTACCAGGCCCTATGATAAATCCCCTCAATCATTCGAATATACCCTA**ACGCG
ACATCCCAACGGGAACCTACTTCGTTCGCGCCTACGCAGTTGATGCCAAAGGCCAGGAAG
TTGCTTTTGGACAGAGCACGGACGCGGCAAAGTCAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTA
TCAGTGGTCGCCACAAGTCCTTGGATATTGCCTCCGTCTGCTTCAGCGTGTTTTCCGTCC
TGGCTCTTCTCGTCTTCTTTGTGAACGAGAAGAGGAAAGCCAAGATAGAGCAGAGCAAAT
GAGTTGTTTACTTTGCGTAATTGGGAAGTTGAGCAAAA

QA 3 700 3 700
DS 

RD RR2DI34JQ 754 0 0
AAATTAGTCATGGTGCTACCAAAGAAAGGCTCTTCTCTGACCTGGAGAAAGGTGCACTTG
AGGTCACCGCTACACCC*AGCCGAGAAGGCGTTTTGGATGCCGGAATTGACAAGTTGAGC
ATTACATGGAAGCTAAGCTCGACAGCTACAAAAGAGGCTGAATTTACGACCATCAAAGTA
AAGCTATGCTACGCTCCGGTAAGCCAAGTTGACCGACCATGGCGAAAGACCCAAAATGAG
CTCTTCAAGGACAAAACCTGCCCACACAAGATCATTACCAGGCCCTATGATAAATCCCCT
CAATCATTCGAATATACCCTAGAACGCGACATCCCAACGGGAACCTACTTCGTTCGCGCC
TACGCAGTTGATGCCAAAGGCCAGGAAGTTGCTTTTGGACAGAGCACGGACGCGGCAAAG
TCAACCAATCTTTTCAGCGTTCAGGCTATCAGTGGTCGCCACAAGTCCTTGGATATTGCC
TCCGTCTGCTTCAGCGTGTTTTCCGTCCTGGCTCTTCTCGTTTTCTTTGTGAACGAGAAG
AGGAAAGCCAAGATAGAGCAGAGCAAATGAGTTGTTTACTTTGCGTAATTGGGAAGTTGA
GCAAAACCCTGTTGACTTTGAATTTATCTTTTTCTTTTATCCGCTGCCTTTGTTTTGATG
CTTACCTCTTCTTCCTTTAAACTTCTAATAATTTCAAGATCAAAGTGGTTAATAGGAACA
TGTGTGGTGTTTGATAATATACTTTGTATTTGCG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2CH34JQ 747 0 0
AAAGGTGCACTTGAGGTCACCGCTACACCCCAGCCGAGAAGGCGTTTTGGATGCCGGAAT
TGACAAGTTGAGCATTACATGGAAGCTAAGCTCGACAGCTACAAAAGAGGCTGAATTTAC
GACCATCAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTAAGCCAAGTTGACCGACCATGGCGAAA
GACCCAAAATGAGCTCTTCAAGGACAAAACCTGCCCACACAAGATCATTACCAGGCCCTA
TGATAAATCCCCTCAATCATTCGAATATACCCTA**ACGCGACATCCCAACGGGAACCTA
CTTCGTTCGCGCCTACGCAGTTGATGCCAAAGGCCAGGAAGTTGCTTTTGGACAGAGCAC
GGACGCGGCAAAGTCAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATCAGTGGTCGCCACAAGTC
CTTGGATATTGCCTCCGTTTGCTTCAGCGTGTTTTCCGTCCTGGCTCTTCTCGTTTTCTT
TGTGAACGAGAAGAGGAAAGCCAAGATAGAGCAGAGCAAATGAGTTGTTTACTTTGCGTA
ATTGGGAAGTTGAGCAAAACCCTGTTGACTTTGAATTTATCTTTTTCTTTTATCCGCTGC
TTTTGTTTTGATGCTTACCTCTTCTTCCTTTAAACTTCTAATAATTTCAAGATCAATGTG
GTTAATAGGAACATGTGTGGTGTTTGATAATATACTTTGTGTTTGCGAAATTGCAAGGAG
ATGAAACAATAAATGTTTGACGTGTGA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2CD34JQ 726 0 0
CGAGAAGGCGTTTTGGATGCCGGAATTGACAAGTTGAGCATTACATGGAAGCTAAGCTCG
ACAGCTACAAAAGAGGCTGAATTTACGACCATCAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTA
AGCCAAGTTGACCGACCATGGCGAAAGACCCAAAATGAGCTCTTCAAGGACAAAACCTGC
CCACACAAGATCATTACCAGGCCCTATGATAAATCCCCTCAATCATTCGAATATACCCTA
GAACGCGACATCCCAACGGGGACCTACTTCGTTCGCGCCTACGCAGTTGATGCCAAAGGC
CAGGAAGTTGCTTTTGGACAGAGCACGGACGCGGCAAAGTCAACCAATCTCTTCAGCGTT
CAGGCTATCAGTGGTCGCCACAAGTCCTTGGATATTGCCTCCGTCTGCTTCAGCGTGTTT
TCCGTCCTGGCTCTTCTCGTCTTCTTTGTGAACGAGAAGAGGAAAGCCAAGATAGAGCAG
AGCAAATGAGTTGTTTACTTTGCGTAATTGGGAAGTTGAGCAAAACCCTGTTGACTTTGA
ATTTATCTTTTTCTTTTATCCGCTGCTTTTGTTTTGATGCTTACCTCTTCTTCCTTTAAA
CTTCTAATAATTTCAAGATCAATGTGGTTAATAGGAACATGTGTGGTGTTTGATAATATA
CTTTGTATTTGCGAAATTGCAAGGAGATGAAACAATAAATGTTTGACGTGTGAGCCTGAA
ACTTTG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 8

CO CL968Contig1 1386 8 21 U
AATTGCAAACCAGTGATTTTTTCCTTCTTAGAAAACAGTGAACATACAACTTTGACACTT
CGATGTGTAACTATTATTTTTATCTATATAACTTTAATATAACAATTTGCATTCTCATGA
GCAGAAACATACAATTATGCTTATAATACGTAGCTTAAAAACATATATACCAATTAACAA
AACCTTTGTCCTCCTCAATGAAAATACTATTATTAGCATCGCCCTTAAAGACGATCATGC
ATGTTTGTTTGCTTATACGTTGAGATTGTTGAAGTGGTCGCACCTACGTCTGACTTCTCC
TTCTCCATCGCCCTTAACGCCGACCGTACCCATTTTCTCCATCGCACGCGCGAAATCCTC
AAAGAATGCTTTCTCGTTGGTTGCGTAAAGCTCAACGAACGGTTTCGTGCTATTGTCTTT
AATAAAAAGGTGGTCGGAAGCTAACAACCCTAGTCCCCGCTTTAGGTTCTTGAAGTACAT
GTTGTCGAATTTTCCCGGAGTCATCACGTCGTTAAACGCCGCGATTGTGTCATCCACTGT
GTGGTTTTTGCATAGTTCTTTAAGAGCGGTTGCGAATCGCGGATTGATTTCTGGATCGGC
TTTTGATCCGTAGAGACGGTCACTAAACTCTTTGCAGTGAGAAAATCTGATCGTGTGAGC
TCCACTTAATGCTACCATCTCACGCAGACTAAACCCATTTTTCATGAACATCCCGTGGAT
GTCATGGATCGTCTGGTTAGGCATGGGGACGTTTCCTCGGACTTTATGGGCTTTAGATTC
GAGTCCATCCTTACGACCAAGCTTTACGTCGAAGTAAGGTCCTCCTACCATCGTGACTAG
GTCACGCGTAGCCTGCGCTAAAATATCAGCACATGACACCACGCCGGGACAAGACAACTC
TAGAGCTGTCTTGATGCGGTTGACAATGTCGAAAGCATCTCCTGGAAGGGAGTCGTTGAG
ATCATCGTCACGTTCCGCTTTGTTAAACGAGTTGGTGGCTATCAAAACCGATGCATCACA
ACCCTCAAGAAAACAATCATGGAAAAAGAGACGGAGCGTCCCTGCCGCGGTTGTTGGTTG
TTGAGCTTGCTTCGCTGTAACGGCCTCACGCACGATTTTGTTGAAATCAGGGCATGTTTT
TTGGTAGTAGTCCGTTCTCAAGATAGCTACATCAGCCGATACGGCTGGTGAAACAATAAC
GAGACAAATGAGGAGAACGAAGCCTAAGAGACGCATATTTGATGTCCGCAAGAAGAAATG
GGAGTTCAAGTTGAGAGAGAGGTCTACGAGGTAGACTTCTCTACGATCGATCTTGGTCGA
AAGCAATGAGAAATGAAGAAGAAAAGAAAGGCTTTACGACTATTTCATGGCTTAAGAGGT
TATCCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 

AF RR2GL11JQ U 1
AF RR2CY44JQ U 129
AF RR2EP77JQ U 5
AF RR2A122JQ U 82
AF RR2GL11TF C 735
AF RR2CY44TF C 678
AF RR2EP77TF C 573
AF RR2A122TF C 703
BS 1 387 RR2GL11JQ
BS 388 388 RR2EP77JQ
BS 389 425 RR2GL11JQ
BS 426 426 RR2A122JQ
BS 427 557 RR2GL11JQ
BS 558 558 RR2EP77JQ
BS 559 592 RR2GL11JQ
BS 593 593 RR2EP77JQ
BS 594 647 RR2GL11JQ
BS 648 648 RR2EP77JQ
BS 649 654 RR2GL11JQ
BS 655 714 RR2EP77JQ
BS 715 715 RR2A122JQ
BS 716 728 RR2EP77JQ
BS 729 729 RR2A122JQ
BS 730 855 RR2EP77JQ
BS 856 856 RR2EP77TF
BS 857 865 RR2EP77JQ
BS 866 1083 RR2EP77TF
BS 1084 1084 RR2A122TF
BS 1085 1386 RR2EP77TF

RD RR2GL11JQ 654 0 0
AATTGCAAACCAGTGATTTTTTCCTTCTTAGAAAACAGTGAACATACAACTTTGACACTT
CGATGTGTAACTATTATTTTTATCTATATAACTTTAATATAACAATTTGCATTCTCATGA
GCAGAAACATACAATTATGCTTATAATACGTAGCTTAAAAACATATATACCAATTAACAA
AACCTTTGTCCTCCTCAATGAAAATACTATTATTAGCATCGCCCTTAAAGACGATCATGC
ATGTTTGTTTGCTTATACGTTGAGATTGTTGAAGTGGTCGCACCTACGTCTGACTTCTCC
TTCTCCATCGCCCTTAACGCCGACCGTACCCATTTTCTCCATCGCACGCGCGAAATCCTC
AAAGAATGCTTTCTCGTTGGTTGCGTACAGCTCAACGAACGGTTTCGTGCTATTGTCTTT
AATAAGAAGGTGGTCGGAAGCTAACAACCCTAGTCCCCGCTTTAGGTTCTTGAAGTACAT
GTTGTCGAATTTTCCCGGAGTCATCACGTCGTTAAACGCCGCGATTGTGTCATCCACTGT
GTGGTTTTTGCATAGTTTTTTAAGAGCGGTTGCGAATCGCGGATTGATTTCTTGATCGGC
TTTTGATCCGTAGAGACGGTCACTAAACTCTTTGCAGTGAGAAAATCCGATCGT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2CY44JQ 486 0 0
ATACAATTATGCTTATAATACGTAGCTTAAAAACATATATACCAATTAACAAAACCTTTG
TCCTCCTCAATGAAAATACTATTATTAGCATCGCCCTTAAAGACGAACATGCATGTTTGT
TTGCTTATACGTTGAGATTGTTGAAGTGGTCGCACCTACGTCTGACTTCTCCTTCTCCAT
CGCCCTTAACGCCGACCGTACCCATTTTCTCCATCGCACACGCGAAATCCTCAAAAAATG
CTTTCTCGTTGGTTGCGTAAAGCTCAACGAACGGTTTCGTGCTATTGTCTTTAATAAAAA
GGGGGTCGGAAGCTAACAACCCTAGTCCCCGCTTTAGGTTCTTGAAGTACATGTTGTCGA
ATTTTCCCGGAGTCATCACGTCGTTAAACGCCGCGATTGTGTCATCCACTGTGTGGTTTT
TGCATAGTTCTTTAAGAGCGGTTGCGAATCGCGGATTGATTTCTGGATCGGCTTTTGATC
CGTA
AA

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2EP77JQ 861 0 0
GCAAACCAGTGATTTTTTCCTTCTTAGAAGACAGTGAACATACAACTTTGACACTTCGAT
GTGTAACTATTATTTTTATCTATATAACTCTAATATAACAATTTGCATTCTCATGAGCAG
AAACATACAATTATGCTTATAATACGTAGCTTAAAAACATATATACCAATTAACAAAACC
TTTGTCCTCCTCAATGAAAATACTATTATTAGCATCGCCCTTAAAGACGATCATGCATGT
TTGTTTGCTTATACGTTGAGATTGTTGAAGTGGTCGCACCTACGTCTGACTTCTCCTTCT
CCATCGCCCTTAACGCCGGCCGTACCCATTTTCTCCATCGCACGCACGAAATCCTCAAAG
AATGCTTTCTCGTTGGTTGCGTAAAGCTCAACGAACGGTTTCGTGCTATTGTCTTTAATA
AGAAGGTGGTCGGAAGCTAACAACCCTAGTCCCCGCTTTAGGTTCTTGAAGTACATGTTG
TCGAATTTTCCCGGAGTCATCACGTCGTTAAACGCCGCGATTGTGTCATCCACTGCGTGG
TTTTTGCATGGTTCTTTAAGAGCGGTTGCGAATCGCGGATTGATTTCTGGATCGGCTTTT
GATCCGTAGAGACGGTCACTAAACTCTTTGCAGTGAGAAAATCTGATCGTGTGAGCTCCA
CTTAATGCTACCATCTCACGCAGACTAAACCCATTTTTCATGAACATCCCATGGATGTCA
TGGACCGTCTGGTTAGGCATGGGGACGTTTCCTCGGACTTTATGGGCTTTAGATTCGAGT
CCATCCTTACGACCAAGCTTTACGTCGAAGTAAGGTCCTCCTACCATCGTGACTAGGTCA
CGCGTAGCCTGGGCTAAAATA

QA 1 861 1 861
DS 

RD RR2A122JQ 766 0 0
ATCTATATAACTTTAATATAACAATTTGCATTCTCATGAGCAGAAACATACAATTATGCT
TATAATACGTAGCTTAAAAACATATATACCAATTAACAAAACCTTTGTCCTCCTCAATGA
AAATACTATTATTAGCATCGCCCTTAAAGACGATCATGCATGTTTGTTTGCTTATACGTT
GAGATTGTTGAAGTGGTCGCACCTACGTCTGACTTCTCCTTCTCCATCGCCCTTAACGCC
GACCGTACCCATTTTCTCCATCGCACGCGCGAAATCCTCAAAGAATGCTTTCTCGTTGGT
TGCGTACAGCTCAACGAACGGTTTCGTGCTATTGTCTTTAATAAAAAGGTGGTCGGAAGC
TAACAACCCTAGTCCCCGCTTTAGGTTCTTGAAGTACATGTTGTCGAATTTTCCCGGAGT
CATCACGTCGTTAAACGCCGCGATTGTGTCATCCACTGTGTGGTTTTTGCATAGTTTTTT
AAGAGCGGTTGCGAATCGCGGATTGATTTCTTGATCGGCTTTTGATCCGTAGAGACGGTC
ACTAAACTCTTTGCAGTGAGAAAATCCGATCGTGCGAGCTCCACTTAATGCTACCATCTC
ACGTAGACTAAACCCGTTTTTCATGAACATTCCGTGGATGTCATGGATCGTCTGGTTAGG
CATTGGGACGTTTCCTCGGACTTTATGGGCTTTAGATTCGAGTCCATCCTTACGACCAAG
CTTTACGTCGAAGTAAGGTCCTCCTACCATCGTGACTAGGTCACGC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2GL11TF 641 0 0
GGTTAGGCATTGGGACGTTTCCTCGGACTTTATGGGCTTTAGATTCGAGTCCATCCTTAC
GACCAAGCTTTACGTCGAAGTAAGGTCCTCCTACCATCGTGACTAGGTCACGCGTAGCCT
GCGCTAAAATATCAGCACATGACACCACGCCGGGACAAGACAACTCTAGAGCTGTCTTGA
TGCGGTTGACAATGTCGAAAGCATCTCCTGGAAGGGAGTCGTTGAGATCATCGTCACGTT
CCGCTTTGTTAAACGAGTTGGTGGCTATCAAAACCGATGCATCACAACCCTCAAGAAAAC
AATCATGGAAAAAGAGACGGAGCGTCCCTGCCGCGGTTGTTGGTTGTTGAGCTTGCTTCG
CTGTAACGGCTTCACGCACGATTTTGTTGAAATCAGGGCATGTTTTTTGGTAGTAGTCCG
TTCTCAAGATAGCTACATCAGCCGATACGGCTGGTGAAACAATAACGAGACAAATGAGGA
GAACGAAGCCTAAGAGACGCATATTTGATGTCCGCAAGAAGAAATGGGAGTTCAAGTTGA
GAGAGAGGTCTACGAGGTAGACTTCTCTACGGTCGATCTTGGTCGAAAGCAATGAGAAAT
GAAGAAGAAAAGAAAGGCTTTACGACTATTTCATGGCTT
CC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2CY44TF 676 0 0
TCTCACGTAGACTAA*CCCACTTTTCATGAACATCCCGCGGATGTCATGGA*CGTCTGGT
TAGGCATGGGGACGTTTCCTCGGACTTTATGGGCTTTAGATTCGAGTCCATCCTTACGAC
CAAGCTTTACGTCGAAGTAAGGTCCTCCTACCATCGTGACTAGGTCACGCGTAGCCTGCG
CTAAAATATCAGCACATGACACCACGCCGGGACAAGACAACTCTAGAGCTGTCTTGATGC
GGCTGACAATGTCGAAAGCATCTCCTGGAAGGGAGTCGTTGAGATCATCGTCACGTTCCG
CTTTGTTAAACGAGTTGGTGGCTATCAAAACCGATGCATCACAACCCTCAAGAAAACAAT
CATGGAAAAAGAGACGGAGCGTCCCTGCCGCGGTTGTTGGTTGTTGAGCTTGCTTCGCTG
TAACGGCCTCACGCACGATTTTGTTGAAATCAGGGCATGTTTTTTGGTAGTAGTCCGTTC
TCAAGATAGCTACATCAGCCGATACGGCTGGTGAAACAATAACGAGACAAATGAGGAGAA
CGAAGCCTAAGAGACGCATATTTGATGTCCGCAAGAAGAAATGGGAGTTCAAGTTGAGAG
AGAGGTCTACGAGGTAGACTTCTCTACGATCGATCTTGGTCGAAAGCAATGAGAAATGAA
GAAGAAAAGAAAGGCT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2EP77TF 814 0 0
GCG
ATCGCGGATTGATTTCT*GATCGGCTTTTGATCCGTAGAGACGGTCACTAAACTCTT*GC
AGTGAGAAAATCTGATCGTGTGAGCTCCACTTAATGCTACCATCTCACGCAGACTAAACC
CATTTTTCATGAACATCCCATGGATGTCATGGA*CGTCTGGTTAGGCATGGGGACGTTTC
CTCGGACTTTATGGGCTTTAGATTCGAGTCCATCCTTACGACCAAGCTTTACGTCGAAGT
AAGGTCCTCCTACCATCGTGACTAGGTCACGCGTAGCCTGCGCTAAAATATCAGCACATG
ACACCACGCCGGGACAAGACAACTCTAGAGCTGTCTTGATGCGGTTGACAATGTCGAAAG
CATCTCCTGGAAGGGAGTCGTTGAGATCATCGTCACGTTCCGCTTTGTTAAACGAGTTGG
TGGCTATCAAAACCGATGCATCACAACCCTCAAGAAAACAATCATGGAAAAAGAGACGGA
GCGTCCCTGCCGCGGTTGTTGGTTGTTGGGCTTGCTTCGCTGTAACGGCCTCACGCACGA
TTTTGTTGAAATCAGGGCATGTTTTTTGGTAGTAGTCCGTTCTCAAGATAGCTACATCAG
CCGATACGGCTGGTGAAACAATAACGAGACAAATGAGGAGAACGAAGCCTAAGAGACGCA
TATTTGATGTCCGCAAGAAGAAATGGGAGTTCAAGTTGAGAGAGAGGTCTACGAGGTAGA
CTTCTCTACGATCGATCTTGGTCGAAAGCAATGAGAAATGAAGAAGAAAAGAAAGGCTTT
ACGACTATTTCATGGCTTAAGAGGTTATCCC

QA 4 814 4 814
DS 

RD RR2A122TF 681 0 0
CATGAACATTCCGTGGATGTCATGGATCGTCTGGTTAGGCATTGGGACGTTTCCTCGGAC
TTTATGGGCTTTAGATTCGAGTCCATCCTTACGACCAAGCTTTACGTCGAAGTAAGGTCC
TCCTACCATCGTGACTAGGTCACGCGTAGCCTGCGCTAAAATATCAGCACATGACACCAC
GCCGGGACAAGACAACTCTAGAGCTGTCTTGATGCGGTTGACAATGTCGAAAGCATCTCC
TGGAAGGGAGTCGTTGAGATCATCGTCACGTTCCGCTTTGTTAAACAGGTTGGTGGCTAT
CAAAACCGATGCATCACAACCCTCAAGAAAACAATCATGGAAAAAGAGACGGAGCGTCCC
TGCCGCGGTTGTTGGTTATTGAGCTTGCTTCGCTGTAACGGCTTCACGCACGATTTTGTT
GAAATCAGGGCATGTTTTTTGGTAGTAGTCCGTTCTCAAGATAGCTACATCAGCCGATAC
GGCTGGTGAAACAATAACGAGACAAATGAGGAGAACGAAGCCTAAGAGACGCATATTTGA
TGTCCGCAAGAAGAAATGGGAGTTCAAGTTGAGAGAGAGGTCTACGAGGTAGACTTCTCT
ACGGTCGATCTTGGTCGAAAGCAATGAGAAATGAAGAAGAAAAGAAAGGCTTTACGACTA
TTTCATGGCTTAAGAGGTT
CC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 2 7

CO CL969Contig1 1250 5 9 U
GAGAGATGGAGATGGAAGAAATCGAAGCAGTCCTCGAGAAAATCTGGGATCTGCACGACA
AGCTCAGCGACGAGATCCACTTGATTTCCCGCTCTCACTTCCTCAAATCCGTTAAACCAC
CTCCTAGATCGGAGAAGAAGAGCCACTCCGCCGAAGAGAAGCCACAGCAGGGATACGTCT
TCATCAAGGGCTTCCCCGTTAACGACAACAACGACGCAGCGATTCAAGAGGCCAAGAGTC
TTAACGCGATTCGAACCGCGCTTGAGAACCTCGAAGACCAACTCGAGTTCTTCCATACTA
TACACACACAGCAACGAACAGAGAGAGATGTAGCGGTTTCCCGGCTTGAACAGAGCAGGA
TGTTACTAGCAAAGAGATTGGCTGAACACCACGGGAAGAGCTACGGAGTTCTAGATGAAG
CTCTTGCCTTCGTTGGCAGCATTAAAACCGCTACACATCAAGTTTACAACTCTTCTCCAA
ACCCAGCC*GGGGCTAACTCTACTCCAAAGTCATCGAACTTTGTAGTCAACGCCTTTGCG
TGGACTTTCGGGTTTGCCAAAAGAGCACTTGGATTCAACCATGTGAGAGGCGTACTAGGA
AACGCTGCTATATTCGCTATAAGCATGGTCGCTATGCTACATCTTCAGCAAGTGGCTTCT
TCTAGTGAACATCATCGTCTAGGAGGGAAGAAAGAAGAGAGATACCAACTGAGGAAAACA
TACAGAGGAGAGATGTCTTCATCTGACATAAGCTTGGACCACTTGGACGTGATGATGGCT
CGTGGTTAAAGAGTAGAGACCAGATTTCCAACTTGTCTACACGTGATACTCACACCTGCA
GCAATGGGAATATAAGACAAAAAAATGTGAAAAACAAGAGAGAAGAGATAGTTCCTTTCT
TCTCGATATAATGAGCGAAAGGATAAGAACTTGGAGGCGAAGTATTGGAATTTTCTGAGC
TGTGCTAATGATTCTTTTTCTTTCAGATGCAAATATTTTTCCTTTCTCGTTTTCTTAATT
TCAATTACTGTGTTTTAAGTTTTGCTGGTAGTTAGCTTGCGTGTTTGATTTTGTTTGATT
ACAAGTGTGGTAGGTTTTTTTGTAATCACAAGTTTCTGAGTCAAGATCTCTTGGGTTGCT
CTGTGTATGTCTCCTCTGTGGTGAGTAAATTCTCTTGTTAAGGCATAGTGATGATTGACG
AACTTATTGGGCCGCTTGTAAGTTGTAAGTTTAAACTCTATTCCAGAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR71TF U 1
AF RR2B689TF U 1
AF RR2FZ46TF U 1
AF RR2DR71JQ C 296
AF RR2B689JQ C 390
BS 1 503 RR2B689TF
BS 504 504 RR2DR71TF
BS 505 594 RR2B689TF
BS 595 1076 RR2DR71JQ
BS 1077 1077 RR2B689JQ
BS 1078 1100 RR2DR71JQ
BS 1101 1101 RR2B689JQ
BS 1102 1139 RR2DR71JQ
BS 1140 1250 RR2B689JQ

RD RR2DR71TF 528 0 0
GAGAGATGGAGATGGAAGAAATCGAAGCAGTCCTCGAGAAAATCTGGGATCTGCACGACA
AGCTCAGCGACGAGATCCACTTGATTTCCCGCTCTCACTTCCTCAAATCCGTTAAACCAC
CTCCTAGATCGGAGAAGAAGAGCCACTCCGCCGAAGAGAAGCCACAGCAGGGATACGTCT
TCATCAAGGGCTTCCCCGTTAACGACAACAACGACGCAGCGATTCAAGAGGCCAAGAGTC
TTAACGCGATTCGAACCGCGCTTGAGAACCTCGAAGACCAACTCGAGTTCTTCCATACTA
TACACACACAGCAACGAACAGAGAGAGATGTAGCGGTTTCCCGGCTTGAACAGAGCAGGA
TGTTACTAGCAAAGAGATTGGCTGAACACCACGGGAAGAGCTACGGAGTTCTAGATGAAG
CTCTTGCCTTCGTTGGCAGCATTAAAACCGCTACACATCAAGTTTACAACTCTTCTCCAA
ACCCAGCC*GGGGCTAACTCTACTCCAAAGTCATCGAACTTTGTAGTC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2B689TF 594 0 0
GAGAGATGGAGATGGAAGAAATCGAAGCAGTCCTCGAGAAAATCTGGGATCTGCACGACA
AGCTCAGCGACGAGATCCACTTGATTTCCCGCTCTCACTTCCTCAAATCCGTTAAACCAC
CTCCTAGATCGGAGAAGAAGAGCCACTCCGCCGAAGAGAAGCCACAGCAGGGATACGTCT
TCATCAAGGGCTTCCCCGTTAACGACAACAACGACGCAGCGATTCAAGAGGCCAAGAGTC
TTAACGCGATTCGAACCGCGCTTGAGAACCTCGAAGACCAACTCGAGTTCTTCCATACTA
TACACACACAGCAACGAACAGAGAGAGATGTAGCGGTTTCCCGGCTTGAACAGAGCAGGA
TGTTACTAGCAAAGAGATTGGCTGAACACCACGGGAAGAGCTACGGAGTTCTAGATGAAG
CTCTTGCCTTCGTTGGCAGCATTAAAACCGCTACACATCAAGTTTACAACTCTTCTCCAA
ACCCAGCC*GGGGCTAACTCTACCCCAAAGTCATCGAACTTTGTAGTCAACGCCTTTGCG
TGGACTTTCGGGTTTGCCAAAAGAGCACTTGGATTCAACCATGTGAGAGGCGTA

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2FZ46TF 593 0 0
GAGAGATGGAGATGGAAGAAATCGAAGCAGTCCTCGAGAAAATCTGGGATCTGCACGACA
AGCTCAGCGACGAGATCCACTTGATTTCCCGCTCTCACTTCCTCAAATCCGTTAAACCAC
CTCCTAGATCGGAGAAGAAGAGCCACTCCGCCGAAGAGAAGCCACAGCAGGGATACGTCT
TCATCAAGGGCTTCCCCGTTAACGACAACAACGACGCAGCGATTCAAGAGGCCAAGAGTC
TTAACGCGATTCGAACCGCGCTTGAGAACCTCGAAGACCAACTCGAGTTCTTCCATACTA
TACACACACAGCAACGAACAGAGAGAGATGTAGCGGTTTCCCGGCTTGAACAGAGCAGGA
TGTTACTAGCAAAGAGATTGGCTGAACACCACGGGAAGAGCTACGGAGTTCTAGATGAAG
CTCTTGCCTTCGTTGGCAGCATTAAAACCGCTACACATCAAGTTTACAACTCTTCTCCAA
ACCCAGCCCGGGGCTAACTCTACTCCAAAGTCATCGAACTTTGTAGTCAACGCCTTTGCG
TGGACTTTCGG*TTTGCCAAA*GAGCACTTGGATTCAACCATGTGAGAG
CGTA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2DR71JQ 846 0 0
TACTATACACACACAGCAACGAACAGAGAGAGATGTAGCGGTTTCCCGGCTTGAACAGAG
CAGGATGTTACTAGCAAAGAGATTGGCTGAACACCACGGGAAGAGCTACGGAGTTCTAGA
TGAAGCTCTTGCCTTCGTTGGCAGCATTAAAACCGCTACACATCAAGTTTACAACTCTTC
TCCAAACCCAGCC*GGGGCTAACTCTACTCCAAAGTCATCGAACTTTGTAGTCAACGCCT
TTGCGTGGACTTTCGGGTTTGCCAAAAGAGCACTTGGATTCAACCATGTGAGAGGCGTAC
TAGGAAACGCTGCTATATTCGCTATAAGCATGGTCGCTATGCTACATCTTCAGCAAGTGG
CTTCTTCTAGTGAACATCATCGTCTAGGAGGGAAGAAAGAAGAGAGATACCAACTGAGGA
AAACATACAGAGGAGAGATGTCTTCATCTGACATAAGCTTGGACCACTTGGACGTGATGA
TGGCTCGTGGTTAAAGAGTAGAGACCAGATTTCCAACTTGTCTACACGTGATACTCACAC
CTGCAGCAATGGGAATATAAGACAAAAAAATGTGAAAAACAAGAGAGAAGAGATAGTTCC
TTTCTTCTCGATATAATGAGCGAAAGGATAAGAACTTGGAGGCGAAGTATTGGAATTTTC
TGAGCTGTGCTAATGATTCTTTTTCTTTCAGATGCAAATATTTTTCCTTTCTCGTTTTCT
TAATTTCAATTACTGTGTTTTAAGTTTTGCTGGTAGTTAGCTTGCGTGTTTGATTTTGTT
TTATTACAAGTGTGGTAGGTTTTTT*GTAATCACAAGTTTCTGAGTCAAGATCTCTTGGG
TTGC
CC

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR2B689JQ 861 0 0
CACGGGAAGAGCTACGGAGTTCTAGATGAAGCTCTTGCCTTCGTTGGCAGCATTAAAACC
GCTACACATCAAGTTTACAACTCTTCTCCAAACCCAGCC*GGGGCTAACTCTACCCCAAA
GTCATCGAACTTTGTAGTCAACGCCTTTGCGTGGACTTTCGGGTTTGCCAAAAGAGCACT
TGGATTCAACCATGTGAGAGGCGTACTAGGAAACGCTGCTATATTCGCTATAAGCATGGT
CGCTATGCTACATCTTCAGCAAGTGGCTTCTTCTAGTGAACATCATCGTCTAGGAGGGAA
GAAAGAAGAGAGATACCAACTGAGGAAAACATACAGAGGAGAGATGTCTTCATCTGACAT
AAGCTTGGACCACTTGGACGTGGTGATGGCTCGTGGTTAAAGAGTAGAGACCAGATTTCC
AACTTGTCTACACGTGATACTCACACCTGCAGCAATGGGAATATAAGACAAAAAAATGTG
AAAAACAAGAGAGAAGAGATAGTTCCTTTCTTCTCGATATAATGAGCGAAAGGATAAGAA
CTTGGAGGCGAAGTATTGGAATTTTCTGAGCTGTGCTAATGATTCTTTTTCTTTCAGATG
CAAATATTTTTCCTTTCTCGTTTTCTTAATTTCAATTACTGTGTTTTAAGTTTTGCTGGT
AGTTAGCTTGCGTGTTTGATTTTGTTTGATTACAAGTGTGGTAGGTTTTTTTGTAATCAC
AAGTTTCTGAGTCAAGATCTCTTGGGTTGCTCTGTGTATGTCTCCTCTGTGGTGAGTAAA
TTCTCTTGTTAAGGCATAGTGATGATTGACGAACTTATTGGGCCGCTTGTAAGTTGTAAG
TTTAAACTCTATTCCAGAACC

QA 1 861 1 861
DS 



CO CL969Contig2 1235 2 2 U
GAGAGATGGAGATGGAAGAAATCGAAGCAGTCCTCGAGAAAATCTGGGATCTGCACGACA
AGCTCAGCGACGAGATTCACTTGATTTCCCGCTCTCACTTCCTCAAATCCGTCAAACCAC
CTCCTAGATCGGAGGAGAAGAAGAAGAGCCACTCCGCCGAAGAGAAGCCACAGCGGGGAT
ACGTCTTCATCAAGGGCTTCCCCGTTAACGATAACAACGATTCAGCGATTCAAGAGGCCA
AGAGTCTTAACGCGATTCGAACCGCCCTTGAGCACCTCGAAGACCAGCTCGAGTTCTTCC
ATACTATACACACACAGCAACGAACAGAGAGAGATGTAGCGGTTTCCCGGCTTGAACAGA
GCAGGATGTTACTAGCAAAGAGATTGGCTGAACACCACGGGAAGAGCTACGGAGTTCTAG
ATGAAGCTCTTGCCTTCGTTGGCAGCATTAAAACCGCTACACATCAAGTTTACAACTCTT
CTCCAAACCCAGCCGGGGCTAACTCTACTTCTTCTGATGGACCAAAGTCATCGAACTTTG
TAGTCAACGCCGTTGCGTGGACTTTCGGGTTTGCCAAAAGAGCACTTGGATTCAACCATG
TGAGAGGCGTACTAGGAAACGCTGCTATATTCGCTATAAGCATGGTCGCTATGCTCCATC
TTCAACAAGTGGCTTCTAGTGAACATCATCATCGTCTAGGAGGGAAGAAAGAAGAGAGGT
ACCAAATGAGGAAAACATACAGAAGAGAGATGTCTTCATCTGACATAAGCTTGGACCACT
TGGACGTGATGATGGCTCGTGGTTAAAAGAGTAGAGACCGGATTTCCAACTTGTCTTACA
CGTGATACTCACACTTGCAGAGCAATGGGAATATAAGACAAAAAAAAATGTGAAAAACAA
GAAGAGAAGAGATAGTTCCTTTCTTCTCGATATAATGAGCGAAAGGATAAGAACTTGAAG
GCGAAGTATTGGAATTTTTTGAGCTGAGCTAATCATTCTTTTTCTTTCATCAGATGCAAA
TAATTTTCCTTTCTTCTCGTTTTTTTAATTTCAATTACTGTGTTTTAAGTTTTGCTTGTA
GTTAGCTTTGCGTGTTTGATTTTGTTTGATTACAAGTTTGGTAGGTTTTTCTGTAATCAC
AAGTTTTTGAGTCAAGATCTCTTGGGTTGCTCTGTGTATAGACCTCTGTGGTGGGTAAAT
TCTCTTGTTAAGGCATAGTGACGATTGACGAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT07TF U 1
AF RR2ES10JQ C 559
BS 1 612 RR2FT07TF
BS 613 1235 RR2ES10JQ

RD RR2FT07TF 612 0 0
GAGAGATGGAGATGGAAGAAATCGAAGCAGTCCTCGAGAAAATCTGGGATCTGCACGACA
AGCTCAGCGACGAGATTCACTTGATTTCCCGCTCTCACTTCCTCAAATCCGTCAAACCAC
CTCCTAGATCGGAGGAGAAGAAGAAGAGCCACTCCGCCGAAGAGAAGCCACAGCGGGGAT
ACGTCTTCATCAAGGGCTTCCCCGTTAACGATAACAACGATTCAGCGATTCAAGAGGCCA
AGAGTCTTAACGCGATTCGAACCGCCCTTGAGCACCTCGAAGACCAGCTCGAGTTCTTCC
ATACTATACACACACAGCAACGAACAGAGAGAGATGTAGCGGTTTCCCGGCTTGAACAGA
GCAGGATGTTACTAGCAAAGAGATTGGCTGAACACCACGGGAAGAGCTACGGAGTTCTAG
ATGAAGCTCTTGCCTTCGTTGGCAGCATTAAAACCGCTACACATCAAGTTTACAACTCTT
CTCCAAACCCAGCCGGGGCTAACTCTACTTCTTCTGATGGACCAAAGTCATCGAACTTTG
TAGTCAACGCCGTTGCGTGGACTTTCGGGTTTGCCAAAAGAGCACTTGGATTCAACCATG
TGAGAGGCGTAC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2ES10JQ 677 0 0
GGACTTTCGGGTTTGCCAAAAGAGCACTTGGATTCAACCATGTGAGAGGCGTTCTAGGAA
ACGCTGCTATATTCGCTATAAGCATGGTCGCTATGCTCCATCTTCAACAAGTGGCTTCTA
GTGAACATCATCATCGTCTAGGAGGGAAGAAAGAAGAGAGGTACCAAATGAGGAAAACAT
ACAGAAGAGAGATGTCTTCATCTGACATAAGCTTGGACCACTTGGACGTGATGATGGCTC
GTGGTTAAAAGAGTAGAGACCGGATTTCCAACTTGTCTTACACGTGATACTCACACTTGC
AGAGCAATGGGAATATAAGACAAAAAAAAATGTGAAAAACAAGAAGAGAAGAGATAGTTC
CTTTCTTCTCGATATAATGAGCGAAAGGATAAGAACTTGAAGGCGAAGTATTGGAATTTT
TTGAGCTGAGCTAATCATTCTTTTTCTTTCATCAGATGCAAATAATTTTCCTTTCTTCTC
GTTTTTTTAATTTCAATTACTGTGTTTTAAGTTTTGCTTGTAGTTAGCTTTGCGTGTTTG
ATTTTGTTTGATTACAAGTTTGGTAGGTTTTTCTGTAATCACAAGTTTTTGAGTCAAGAT
CTCTTGGGTTGCTCTGTGTATAGACCTCTGTGGTGGGTAAATTCTCTTGTTAAGGCATAG
TGACGATTGACGAACTT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 4

CO CL970Contig1 1291 4 14 U
GGAACTTTGGCTGCTGTAATTGCAGCCTCTTTCAAACTCTGTTTCATGAATCAATCGATC
TATTTTAGTTCTTGGTGACAACTCTAAGTTTATCTCTTCCTTTTATGTTTCTTGCACAAT
AAAGCTTTATAAGCTATTTCATTTTCTATCTTTCAATAAAGCTCTTATGAGCTCAATCTT
TCTAGTTTCATAACATTCACATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTATTATTCCT
CTTTCAGAGCTTCTACTAAACTTGTCAAGTCAGCTTCCTTATCAGTTTTGGTAGAGTTTC
TTTCCTGAACTCGAAATCCAAAGAAAGGTTGAGACTTTCTTGCGTTTTCCAGCCCTCTTT
CTTCACAGACGGTTCATGGGGTTATTCTGTTCATCTTCAAGCCTTAGTTTGCTCTGTCTG
AGCAAATCCAGTCCTGTTTTCTTGAAGTCTTTTCGGCAGTGACCAAGATAGAGAAGAAGC
TCGCCTGGTAAAACAAAGTTGGTGTTTTGGGGAAGCTGGCCACGCTGTCTGAAGAGGATA
ATGACTTTTCAAACAGAACTAGTAGTTTCTCCAAGTCACGTGTCATGTTTCTTCTCACGG
TAATATCTCTGTTCTTTCATGTGAGGATGAAAATAGATAGCTTCAGAACTGGAAACATAT
CGCTGGCTAGGTAGTTGCAATAGGATAGTGTTGGGTTTGAGAATAATGGCAGCAAGTTTC
TGTTTTGATGAGTGCACACAAGATGTTTGGTTAAATGTCCAAGAGAAAAAAAAAATCAGA
CTGTGAAAGTGAAGAGCTTTTGGTGGCAGATGGATAGGAAATAGAGAGTTGAGGTTTAGG
CTCTTGTAGGATGATTTTTCTTTGGCCGTGAGATAGCTTAGTCCAGTTAGGAGGATTAAA
AAAAAAAATCCCCAACTTGTTGTGAGACAAATAGGTCAAAAGAACCTGAAGATGTTCTCA
CACTTATGTCTATTCTCCAAGCTGAATATTCATCTACCTACTTCCTATAGACCTTCAACT
CGCCATGTCTCCTTCAAAACCATCTTCATGTGCATTCGAACTCAGCAGCTTCGTGTTCAC
CCGCTGCTTAGCTTGCGGGGGAGTATTAAAGCCCACACCAAGGCCCATCTTATGATCCAA
TATGAAGTGTTTGGTAACCATGTAACTAGGGTTATAGACTCATATATATATGTCGTTATC
TGTTCTTAAGATGTAACTTTGGCTGCTGTAATTGCAGCCTCTTTCAAACTCTGTTTCATG
AATCAATCGATCTATTTTAGTTCTTGGTGGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F436TF U 1
AF RR2FF90TF U 1
AF RR2F227TF U 1
AF RR2F436JQ C 490
BS 1 57 RR2F227TF
BS 58 58 RR2F436TF
BS 59 327 RR2F227TF
BS 328 328 RR2F436TF
BS 329 579 RR2F227TF
BS 580 580 RR2F436TF
BS 581 632 RR2F227TF
BS 633 633 RR2F436TF
BS 634 679 RR2F227TF
BS 680 680 RR2F436JQ
BS 681 683 RR2F227TF
BS 684 684 RR2F436JQ
BS 685 742 RR2F227TF
BS 743 1291 RR2F436JQ

RD RR2F436TF 642 0 0
G
GAACTTTGGCTGCTGTAATTGCAGCCTCTTTCAAACTCTGTTTCATGAATCAATCGATCT
ATTTTAGTTCTTGGTGACAACTCTAAGTTTATCTCTTCCTTTTATGTTTCTTGCACAATA
AAGCTTTATAAGCTATTTCATTTTCTATCTTTCAATAAAGCTCTTATGAGCTCAATCTTT
CTAGTTTCATAACATTCACATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTATTATTCCTC
TTTCAGAGCTTCTACTAAACTTGTCAAGTCAGCTTCCTTATCAGTTTTGGTAGAGTTTCT
TTCCTGAACTCGAAATCCAAAGAAAGGTTGAGACTTTCTTGCGTTTTCCAGCCCTCTTTC
TTCACAGACGGTTCATGGGGTTATTCTGTTCATCTTCAAGCCTTAGTTTGCTCTGTCTGA
GCAAATCCAGTCCTGTTTTCTTGAAGTCTTTTCGGCAGTGACCAAGATAGAGAAGAAGCT
CGCCTGGTAAA*CAAAGTTGGTGTTTTGGGGAAGCTGGCCACGCTGTCTGAAGAGGATAA
TGACTTTTCAAACAGAACTAGTAGTTTCTCCAAGTCACGTGTCATGTTTCTTCTCACGGT
AATATCTCTGTTCTTTCATGTGAGGATGAAAATAGATAGCT

QA 2 642 2 642
DS 

RD RR2FF90TF 677 0 0
G
GAACTTTGGCTGCTGTAATTGCAGCCTCTTTCAAACTCTGTTTCATGAATCAATCGATCT
ATTTTAGTTCTTGGTGACAACTCTAAGTTTATCTCTTCCTTTTATGTTTCTTGCACAATA
AAGCTTTATAAGCTATTTCATTTTCTATCTTTCAATAAAGCTCTTATGAGCTCAATCTTT
CTAGTTTCATAACATTCACATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTATTATTCCTC
TTTCAGAGCTTCTACTAAACTTGTCAAGTCAGCTTCCTTATCAGTTTTGGTAGAGTTTCT
TTCCTGAACTCGAAATCCAAAGAAAGGTTGAGACTTTCTTGCGTTTTCCAGCCCTCTTTC
TTCACAGACGGTTCATGGGGTTATTCTGTTCATCTTCAAGCCTTAGTTTGCTCTGTCTGA
GCAAATCCAGTCCTGTTTTCTTGAAGTCTTTTCGGCAGTGACCAAGATAGAGAAGAAGCT
CGCCTGGTAAAACAAAGTTGGTGTTTTGGGGAAGCTGGCCACGCTGTCTGAAGAGGATAA
TGACTTTTCAAACAGAACTAGTAGTTTCTCCAAGTCACATGTCATGTTTCTTCTCACGGT
AATATCTCTGTTCTTTCATGTGAGGATGAAAATAGATAGCTTCAGAACTGGAAACATATC
GCTGGCTAG
TAGTTGC

QA 2 670 2 670
DS 

RD RR2F227TF 742 0 0
GGAACTTTGGCTGCTGTAATTGCAGCCTCTTTCAAACTCTGTTTCATGAATCAATCGGTC
TATTTTAGTTCTTGGTGACAACTCTAAGTTTATCTCTTCCTTTTATGTTTCTTGCACAAT
AAAGCTTTATAAGCTATTTCATTTTCTATCTTTCAATAAAGCTCTTATGAGCTCAATCTT
TCTAGTTTCATAACATTCACATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTATTATTCCT
CTTTCAGAGCTTCTACTAAACTTGTCAAGTCAGCTTCCTTATCAGTTTTGGTAGAGTTTC
TTTCCTGAACTCGAAATCCAAAGAAAGTTTGAGACTTTCTTGCGTTTTCCAGCCCTCTTT
CTTCACAGACGGTTCATGGGGTTATTCTGTTCATCTTCAAGCCTTAGTTTGCTCTGTCTG
AGCAAATCCAGTCCTGTTTTCTTGAAGTCTTTTCGGCAGTGACCAAGATAGAGAAGAAGC
TCGCCTGGTAAAACAAAGTTGGTGTTTTGGGGAAGCTGGCCACGCTGTCTGAAGAGGATA
ATGACTTTTCAAACAGAACTAGTAGTTTCTCCAAGTCACATGTCATGTTTCTTCTCACGG
TAATATCTCTGTTCTTTCATGTGAGGATGAAA*TAGATAGCTTCAGAACTGGAAACATAT
CGCTGGCTAGGTAGTTGCA*TAG*ATAGTGTTGGGTTTGAGAATAATGGCAGCAAGTTTC
TGTTTTGATGAGTGCACACAAG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2F436JQ 802 0 0
T
AAACAAAGTTGGTGTTTTGGGGAAGCTGGCCACGCTGTCTGAAGAGGATAATGACTTTTC
AAACAGAACTAGTAGTTTCTCCAAGTCACGTGTCATGTTTCTTCTCACGGTAATATCTCT
GTTCTTTCATGTGAGGATGAAAATAGATAGCTTCAGAACTGGAAACATATCGCTGGCTAG
GTAGTTGCAATAGGATAGTGTTGGGTTTGAGAATAATGGCAGCAAGTTTCTGTTTTGATG
AGTGCACACAAGATGTTTGGTTAAATGTCCAAGAGAAAAAAAAAATCAGACTGTGAAAGT
GAAGAGCTTTTGGTGGCAGATGGATAGGAAATAGAGAGTTGAGGTTTAGGCTCTTGTAGG
ATGATTTTTCTTTGGCCGTGAGATAGCTTAGTCCAGTTAGGAGGATTAAAAAAAAAAATC
CCCAACTTGTTGTGAGACAAATAGGTCAAAAGAACCTGAAGATGTTCTCACACTTATGTC
TATTCTCCAAGCTGAATATTCATCTACCTACTTCCTATAGACCTTCAACTCGCCATGTCT
CCTTCAAAACCATCTTCATGTGCATTCGAACTCAGCAGCTTCGTGTTCACCCGCTGCTTA
GCTTGCGGGGGAGTATTAAAGCCCACACCAAGGCCCATCTTATGATCCAATATGAAGTGT
TTGGTAACCATGTAACTAGGGTTATAGACTCATATATATATGTCGTTATCTGTTCTTAAG
ATGTAACTTTGGCTGCTGTAATTGCAGCCTCTTTCAAACTCTGTTTCATGAATCAATCGA
TCTATTTTAGTTCTTGGTGGC

QA 2 802 2 802
DS 



AS 1 7

CO CL971Contig1 1063 7 12 U
GTAAACAGACTGAGAATTGCGACAATTACTGGAGAAACAGGAGATGCAAACATCAGGAGA
AAGCAAATTTATTGGGACGAAAATACTAAAAACACCAGAAGAGACAGACTTTGGCTGTAC
AAAGAAGCAAAAGACAAAAGGAGAGATACAACTACACAACACATCATCACCAACCATTGA
TAGCTTTAAATTAAAGCTCATTGAACAGCTTCTTGTTTTTTTCTACATCATTATTATTAT
TTCTTTTTGCTGTTAAGAGCTCTCATTCTCAATCTGCAAGAACTGTTGCTCCTTCCACCT
TGAAAGTGGCTCCCCAAATTTCTTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAGTGATCTTATTCTTAG
GGTTCTCAAAGCTCCTAAGCCCACCTAACGCAGTTGAGTAAAAGCATCCTTGAGGGAAAG
AAGCAAGAGATTTTCCACAAGCCCCTTTTAGCAACTCAAGATCATCAGCAAATGCCACAT
ATCCATCAGCTGTTATCCCCCAATACAATGGAACCTTACCAACTTGGTCAGAGGCTACAA
ACAGAGTGGAGGTTGATTTATCAAAGACCACAAAGGAGAAATCGCCACTTAGGTGTGACA
CAACGTGGTTAGCCGGGTAAGGAGCTCTGTCACGGAGAGTCTTGTAAGCCTCGATGACCA
AGAGAACCTCGTTTGCATTCTTAGCAAGCCCATATTGCTGCTTCAAGCTTCCTAGGTTGT
CAAGGGAGCCTTGGAACAAACAGAATATCTCATCCTTAGCCCCAAATGACCTTGGCCGGA
GAGGACTCTCTTTGTGGTGGGTATACGCAAGCTGCACATAGTCGCCGACTTGTACGGACA
CAGCGGATGGGTTTTTCTCGACGAACTTGTTAACTAGAGCCGACCCGGTTGTCTTTGGAG
AAGGAGTCCGACTGCCGGCCGCAACCAGCTCTTCCGGTAGCGATACTATGGCTCCGCTGA
AAATCCCCAACATCTTCTACCTCCACCGACGATAATAACGTAACTACTTGCTGAATCTTT
GAGTTCTCTCTCTGTTTGAGATAATATGGGACAATGGACATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH70JQ U 54
AF RR2CX71JQ U 1
AF RR2BM08JQ U 54
AF RR2AM74JQ U 74
AF RR2AM74TF C 380
AF RR2AH70TF C 389
AF RR2CX71TF C 419
BS 1 81 RR2CX71JQ
BS 82 82 RR2AH70JQ
BS 83 711 RR2CX71JQ
BS 712 832 RR2AM74JQ
BS 833 851 RR2AM74TF
BS 852 852 RR2AH70TF
BS 853 877 RR2AM74TF
BS 878 878 RR2AH70TF
BS 879 1034 RR2AM74TF
BS 1035 1035 RR2AH70TF
BS 1036 1055 RR2AM74TF
BS 1056 1063 RR2AH70TF

RD RR2AH70JQ 524 0 0
CAAAAA
AAAGCAAATTTATTGGGACAAAAATACTAAAAACACCAAAAAAAACAGACTTTGGCTGTA
CAAAGAAGCAAAAGACAAAAGGAGAGATACAACTACCCAACACATCATCACCAACCATTG
ATAGCTTTAAATTAAAGCTCATTGAACAGCTTCTTGTTTTTTTCTACATCATTATTATTA
TTTCTTTTTGCTGTTAAAAGCTCTCATTCTCAATCTGCAAAAACTGTTGCTCCTTCCACC
TTGAAAGTGGTTCCCCAAATTTCTTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAGTGATCTTATTCTTA
GGGTTCTCAAAGCTCCTAAGCCCACCTAACGCAGTTGAGTAAAAGCATCCTTGAGGGAAA
AAAGCAAGAAATTTTCCACAAGCCCCTTTTAGCAACTCAAGATCATCAGCAAATGCCACA
TATCCATCAGCTGTTATCCCCCAATACAATGGAACCTTACCAACTTGGTCAGAGGCTACA
AACAGAGTGGAGGTTGATTTATCAAAGACCACAAAGGA

QA 7 524 7 524
DS 

RD RR2CX71JQ 711 0 0
GTAAACAGACTGAGAATTGCGACAATTACTGGAGAAACAGGAGATGCAAACATCAGGAGA
AAGCAAATTTATTGGGACGAAGATACTAAAAACACCAGAAGAGACAGACTTTGGCTGTAC
AAAGAAGCAAAAGACAAAAGGAGAGATACAACTACACAACACATCATCACCAACCATTGA
TAGCTTTAAATTAAAGCTCATTGAACAGCTTCTTGTTTTTTTCTACATCATTATTATTAT
TTCTTTTTGCTGTTAAGAGCTCTCATTCTCAATCTGCAAGAACTGTTGCTCCTTCCACCT
TGAAAGTGGCTCCCCAAATTTCTTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAGTGATCTTATTCTTAG
GGTTCTCAAAGCTCCTAAGCCCACCTAACGCAGTTGAGTAAAAGCATCCTTGAGGGAAAG
AAGCAAGAGATTTTCCACAAGCCCCTTTTAGCAACTCAAGATCATCAGCAAATGCCACAT
ATCCATCAGCTGTTATCCCCCAATACAATGGAACCTTACCAACTTGGTCAGAGGCTACAA
ACAGAGTGGAGGTTGATTTATCAAAGACCACAAAGGAGAAATCGCCACTTAGGTGTGACA
CAACGTGGTTAGCCGGGTAAGGAGCTCTGTCACGGAGAGTCTTGTAAGCCTCGATGACCA
AGAGAACCTCGTTTGCATTCTTAGCAAGCCCATATTGCTGCTTCAAGCTTC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2BM08JQ 608 0 0
CAAGAG
AAAGCAAATTTATTGGGACGAAAATACTAAAAACACCAGAAGAGACAGACTTTGGCTGTA
CAAAGAAGCAAAAGACAAAAGGAGAGATACAACTACACAACACATCATCACCAACCATTG
ATAGCTTTAAATTAAAGCTCATTGAACAGCTTCTTGTTTTTTTCTACATCATTATTATTA
TTTCTTTTTGCTGTTAAGAGCTCTCATTCTCAATCTGCAAGAACTGTTGCTCCTTCCACC
TTGAAAGTGGCTCCCCAAATTTCTTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAGTGATCTTATTCTTA
GGGTTCTCAAAGCTCCTAAGCCCACCTAACGCAGTTGAGTAAAAGCATCCTTGAGGGAAA
GAAGCAAGAGATTTTCCACAAGCCCCTTTTAGCAACTCAAGATCATCAGCAAATGCCACA
CATCCATCAGCTGTTATCCCCCAATACAATGGAACCTTACCAACTTGGTCAGAGGCTACA
AACAGAGTGGAGGTTGATTTATCAAAGACCACAAAGGAAAAATCGCCACTTAGGTGTGAC
ACAACGTGGTTAGCCGGGTAAGGAGCTCTGTCACGGAGAGTCTTGTAAGCCTCGATGACC
AA

QA 7 608 7 608
DS 

RD RR2AM74JQ 759 0 0
GGGACGAAG
ATACTAAAAACACCAGAAGAGACAGACTTTGGCTGTACAAAGAAGCAAAAGACAAAAGGA
GAGATACAACTACACAACACATCATCACCAACCATTGATAGCTTTAAATTAAAGCTCATT
GAACAGCTTCTTGTTTTTTTCTACATCATTATTATTATTTCTTTTTGCTGTTAAGAGCTC
TCATCCTCAATCTGCAAGAACTGTTGCTCCTTCCACCTTGAAAGTGGCTCCCCAAATTTC
TTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAGTGATCTTATTCTTAGGGTTCTCAAAGCCCCTAAGCCC
ACCTAACGCAGTTGAGTAAAAGCATCCTTGAGGGAAAGAAGCAAGAGATTTTCCACAAGC
CCCTTTTAGCAACTCAAGATCATCAGCAAATGCCACATATCCATCAGCTGTTATCCCCCA
ATACAATGGAACCTTACCAACTTGGTCAGAGGCTACAAACAGAGTGGAGGTTGATTTATC
AAAGACCACAAAGGAGAAATCGCCACTTAGGTGTGACACAACGTGGTTAGCCGGGTAAGG
AGCTCTGTCACGGAGAGTCTTGTAAACCTCGATGACCAAGAGAACCTCGTTTGCATTCTT
AGCAAGCCCATATTGCTGCTTCAAGCTTCCTAGGTTGTCAAGGGAGCCTTGGAACAAACA
GAATATCTCATCCTTAGCCCCAAATGACCTTGGCCGGAGAGGACTCTCTTTGTGGTGGGT
ATACGCAAGCTGCACATAGTCGCCGACTTG

QA 10 759 10 759
DS 

RD RR2AM74TF 678 0 0
GCCCA
CTAACGCAGTTGAGTAAAAGCATCTTTGAGGGAAAGAAGCAAGAGATTTTCCACAAGCCC
CTTTTAGCAACTCAAGATCATCAGCAAATGCCACATATCCATCAGCTGTTATCCCCCAAT
ACAATGGAACCTTACCAACTTGGTCAGAGGCTACAAACAGAGTGGAGGTTGATTTATCAA
AGACCACAAAGGAGAAATCGCCACTTAGGTGTGACACAACGTGGTTAGCCGGGTAAGGAG
CTCTGTCACGGAGAGTCTTGTAAACCTCGATGACCAAGAGAACCTCGTTTGCATTCTTAG
CAAGCCCATATTGCTGCTTCAAGCTTCCTAGGTTGTCAAGGGAGCCTTGGAACAAACAGA
ATATCTCATCCTTAGCCCCAAATGACCTTGGCCGGAGAGGACTCTCTTTGTGGTGGGTAT
ACGCAAGCTGCACATAGTCGCCGACTTGTACGGACACAGCGGATGGGCTTTTCTCGACGA
ACTTGTTAACTAGGGCCGACCCGGTTGTCTTTGGAGAAGGAGTCCGACTGCCGGCCGCAA
CCAGCTCTTCCGGTAGCGATACTATGGCTCCGCTGAAAATCCCCAACATCTTCTACCTCC
ACCGACGATAATAACGTAACTACTTGCTGAATCTTTGAGTTCTCTCTCTGCTTGAGATAA
TATGGGACAAT
CC

QA 6 676 6 676
DS 

RD RR2AH70TF 675 0 0
CGCAGTTGAGTAAAAGCATCCTTGAGGGAAAGAAGCAAGAGATTTTCCACAAGCCCCTTT
TAGCAACTCAAGATCATCAGCAAATGCCACATATCCATCAGCTGTTATCCCCCAATACAA
TGGAACCTTACCAACTTGGTCAGAGGCTACAAACAGAGTGGAGGTTGATTTATCAAAGAC
CACAAAGGAGAAATCGCCACTTAGGTGTGACACAACGTGGTTAGCCGGGTAAGGAGCTCT
GTCACGGAGAGTCTTGTAAGCCTCGATGACCAAGAGAACCTCGTTTGCATTCTTAGCAAG
CCCATATTGCTGCTTCAAGCTTCCTAGGTTGTCAAGGGAGCCTTGAAACAAACAGAATAT
CTCATCCTTAGCCCCAAATGACCTTGGCCGGAGAGGACTCTCTTTGTGGTGGGTATACGC
AAGCTGCACATAGTCGCCGACTTGTACGGACACAGCGGATGGGTTTTTCTCGATGAACTT
GTTAACTAGAGCCGACCCGGTTGTCTTTGGAGAAGGAGTCCGACTGCCGGCCGCAACCAG
CTCTTCCGGTAGCGATACTATGGCTCCGCTGAAAATCCCCAACATCTTCTACCTCCACCG
ACGATAATAACGTAACTACTTGCTGAATCTTTGAGTTCTCTCTCTGTTTGAGATAATATG
GGGCAATGGACATCC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2CX71TF 645 0 0
AGAAGCAAGAGATTTTCCACAAGCCC*TTTTAGCAACTCAAGATCATCAGCAAATGCCAC
ATATCCATCAGCTGTTATCCCCCAATACAATGGAACCTTACCAACTTGGTCAGAGGCTAC
AAACAGAGTGGAGGTTGATTTATCAAAGACCACAAAGGAGAAATCGCCACTTAGGTGTGA
CACAACGTGGTTAGCCGGGTAAGGAGCTCTGTCACGGAGAGTCTTGTAAGCCTCGATGAC
CAAGAGAACCTCGTTTGCATTCTTAGCAAGCCCATATTGCTGCTTCAAGCTTCCTAGGTT
GTCAAGGGAGCCTTGGAACAAACAGAATATCTCATCCTTAGCCCCAAATGACCTTGGCCG
GAGAGGACTCTCTTTGTGGTGGGTATACGCAAGCTGCACATAGTCGCCGACTTGTACGGA
CACAGCGGATGGGTTTTTCTCGACGAACTTGTTAACTAGAGCCGACCCGGTTGTCTTTGG
AGAAGGAGTCCGACTGCCGGCCGCAACCAGCTCTTCCGGTAGCGATACTATGGCTCCGCT
GAAAATCCCCAACATCTTCTACCTCCACCGACGATAATAACGTAACTACTTGCTGAATCT
TTGAGTTCTCTCTCTGTTTGAGATAATATGGGACAAT
GGACATCC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 5

CO CL972Contig1 595 5 1 U
GGACAGCAAGAGAAGCAAAGAAACAAAAACAAAAATGTGGGCTTCGTCTACAGCAAATGC
TCTCAAGCTTTCTTCTTCTGTCTCCAAGTCTCAGCTATCTCCATATTTCTCCATCTCTAG
ATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAGGGATTAAAGTATGCGAATTCACATGAGTGGGTTAAACA
TGAAGGCTCTGTTGCCACCATTGGCATCACTGACCATGCTCAGGACCATTTAGGTGAAGT
GGTGTTTGTGGAACTACCAGAGGAAAATGGTTCAGTGAGCAAAGAGAAAAGCTTTGGAGC
TGTGGAGAGTGTGAAGGCGACAAGTGAGATCTTATCTCCTATCTCAGGTGAAGTCATTGA
GGTTAACAAGAAGCTCACAGAAGCACCAGGCTTGATTAACTCAAGCCCCTATGAAGATGG
ATGGATGATAAAAGTGAAGCAAAGCAACCCATCTGAGTTAGAATCTTTAATGGGTTCAAA
GGAATACACCAAGTTCTGCGAGGAAGAAGATGCCGCTCACTAGGAGGGTTTCTCTCTACT
TGTATGTTCTGTCCTTATTAAAAGAAAACTAATAAAAGTATATCAGTTCGCATGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2F022TF U 48
AF RR2GN21TF U 1
AF RR2A714TF U 1
AF RR2GN41TF U 1
AF RR2A714JQ C 382
BS 1 595 RR2A714TF

RD RR2F022TF 211 0 0
CTACAGCAAATGCTCTCAAGCTTTCTTCTTCTGTCTCCAAGTCTCAGCTATCTCCATATT
TCTCCATCTCTAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAGGGATTAAAGTATGCGAATTCACATG
AGTGGGTTAAACATGAAGGCTCTGTTGCCACCATTGGCATCACTGACCATGCTCAGGACC
ATTTAGGTGAAGTGGTGTTTGTGGAACTACC

QA 1 211 1 211
DS 

RD RR2GN21TF 518 0 0
GGACAGCAAGAGAAGCAAAGAAACAAAAACAAAAATGTGGGCTTCGTCTACAGCAAATGC
TCTCAAGCTTTCTTCTTCTGTCTCCAAGTCTCAGCTATCTCCATATTTCTCCATCTCTAG
ATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAGGGATTAAAGTATGCGAATTCACATGAGTGGGTTAAACA
TGAAGGCTCTGTTGCCACCATTGGCATCACTGACCATGCTCAGGACCATTTAGGTGAAGT
GGTGTTTGTGGAACTACCAGAGGAAAATGGTTCAGTGAGCAAAGAGAAAAGCTTTGGAGC
TGTGGAGAGTGTGAAGGCGACAAGTGAGATCTTATCTCCTATCTCAGGTGAAGTCATTGA
GGTTAACAAGAAGCTCACAGAAGCACCAGGCTTGATTAACTCAAGCCCCTATGAAGATGG
ATGGATGATAAAAGTGAAGCAAAGCAACCCATCTGAGTTAGAATCTTTAATGGGTTCAAA
GGAATACACCAAGTTCTGCGAGGAAGAAGATGCCGCTC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2A714TF 595 0 0
GGACAGCAAGAGAAGCAAAGAAACAAAAACAAAAATGTGGGCTTCGTCTACAGCAAATGC
TCTCAAGCTTTCTTCTTCTGTCTCCAAGTCTCAGCTATCTCCATATTTCTCCATCTCTAG
ATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAGGGATTAAAGTATGCGAATTCACATGAGTGGGTTAAACA
TGAAGGCTCTGTTGCCACCATTGGCATCACTGACCATGCTCAGGACCATTTAGGTGAAGT
GGTGTTTGTGGAACTACCAGAGGAAAATGGTTCAGTGAGCAAAGAGAAAAGCTTTGGAGC
TGTGGAGAGTGTGAAGGCGACAAGTGAGATCTTATCTCCTATCTCAGGTGAAGTCATTGA
GGTTAACAAGAAGCTCACAGAAGCACCAGGCTTGATTAACTCAAGCCCCTATGAAGATGG
ATGGATGATAAAAGTGAAGCAAAGCAACCCATCTGAGTTAGAATCTTTAATGGGTTCAAA
GGAATACACCAAGTTCTGCGAGGAAGAAGATGCCGCTCACTAGGAGGGTTTCTCTCTACT
TGTATGTTCTGTCCTTATTAAAAGAAAACTAATAAAAGTATATCAGTTCGCATGC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2GN41TF 595 0 0
GGACAGCAAGAGAAGCAAAGAAACAAAAACAAAAATGTGGGCTTCGTCTACAGCAAATGC
TCTCAAGCTTTCTTCTTCTGTCTCCAAGTCTCAGCTATCTCCATATTTCACCATCTCTAG
ATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAGGGATTAAAGTATGCGAATTCACATGAGTGGGTTAAACA
TGAAGGCTCTGTTGCCACCATTGGCATCACTGACCATGCTCAGGACCATTTAGGTGAAGT
GGTGTTTGTGGAACTACCAGAGGAAAATGGTTCAGTGAGCAAAGAGAAAAGCTTTGGAGC
TGTGGAGAGTGTGAAGGCGACAAGTGAGATCTTATCTCCTATCTCAGGTGAAGTCATTGA
GGTTAACAAGAAGCTCACAGAAGCACCAGGCTTGATTAACTCAAGCCCCTATGAAGATGG
ATGGATGATAAAAGTGAAGCAAAGCAACCCATCTGAGTTAGAATCTTTAATGGGTTCAAA
GGAATACACCAAGTTCTGCGAGGAAGAAGATGCCGCTCACTAGGAGGGTTTCTCTCTACT
TGTATGTTCTGTCCTTATTAAAAGAAAACTAATAAAAGTATATCAGTTCGCATGC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2A714JQ 214 0 0
AGCACCAGGCTTGATTAACTCAAGCCCCTATGAAGATGGATGGATGATAAAAGTGAAGCA
AAGCAACCCATCTGAGTTAGAATCTTTAATGGGTTCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGA
GGAAGAAGATGCCGCTCACTAGGAGGGTTTCTCTCTACTTGTATGTTCTGTCCTTATTAA
AAGAAAACTAATAAAAGTATATCAGTTCGCATGC

QA 1 214 1 214
DS 



AS 2 8

CO CL973Contig1 943 5 9 U
ATGATTTGAACCAAATGTGGGTGAATCTATTAACTCATCTCATTACATGACAAGTGATAT
CACAAATACGAGAATGATCAAGAAGTTCAAGTATACGCCCATAAATTGCACATACAATGC
CGCCAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAACAAAGGACCAAGCCCTTCGCACTCAGT
AGCAAGAAAAAAGTATTGGATCTGTCTTCTCGAGGATCACTCCCTCAGCCATGTAGCAAG
AGCTGAATCCCACTCGCATAGCTCGCCTTCTTTGAACCACAAAGCAATCTCACGCTTCCC
GTTTTCAGGACTATCACTACCATGCACAATGTTCCTTCCGGTTTGTACAGCAAGATCTCC
TCTTATGGTACCAGGTTCAGCTTGAAGGGGGTCTGTTTTCCCAATCAGCTTCCTGGCTGA
AGCAACCACACCAACACCTTCCCAAGCCATACACACAACAGGGCCAGAAGTGATGTACTC
AATCAGGCTAGGAAAGAATGACTTAGCACTAAGATCCTTATAATGTTCCTCGGCCAAATC
TTTAGGACACTGGAACATCTTAAGTCCAATCAGTTTAAAACCCTTCTTCTCAAAACGAGA
GATGATTTCTCCAACAAGGCCTCGTTGGATGCCGTCTGGTTTGACCATAATGTAAGTCTC
CTCAACTTGCTCCATAGAAGCGACGAGGTGAGGGAGGAAGATTCCCGAATCGGCGGAGCT
CGAAGCAGCGTAGAGACGGCGGCGGGAAGGAGAAACGCGTGAGAATAGACGGAACTGAGG
ACGAAACGCGGCCAGCTCGGTCCGCGAGCTAACGGTGGTTGGAGAGAGGTTTGAAATGCA
AGTTGCCGAATTTACTCTCGGCGACGGCGAGGCGACACAGAGAGGAGTCCATTGACCAAC
CGCAGCCATACCAACAACCATTGTGTGTGTGTGTGTGTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 10 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2BK26JQ U 230
AF RR2DJ93JQ U 1
AF RR2H915JQ U 18
AF RR2DJ93TF C 272
AF RR2GZ83TF C 273
BS 1 237 RR2DJ93JQ
BS 238 238 RR2H915JQ
BS 239 239 RR2DJ93JQ
BS 240 240 RR2H915JQ
BS 241 604 RR2DJ93JQ
BS 605 605 RR2H915JQ
BS 606 679 RR2DJ93JQ
BS 680 681 RR2H915JQ
BS 682 943 RR2DJ93TF

RD RR2BK26JQ 258 0 0
CATGTAGCAAGAGCTGAATCCCACTCCCATAGCTCGCCTTCTTTGAACCACAAAGCAATC
TCACCCTTTCCGTTTTCAGGACTATCACTACCGTGCACAATGTTCCTTCCGGTTTGTACA
GCAAGATCTCCTCTTATGGTACCGGGTTCAGCTTGAAAAGGGTCTGTTTTCCCAATCAGC
TTCCTGGCTGAAGCAACCACACCAACACCTTCCCAAGCCATACACACAACAGGGCCTGAA
GTGATGTACTCAATCAGG

QA 1 258 1 258
DS 

RD RR2DJ93JQ 679 0 0
ATGATTTGAACCAAATGTGGGTGAATCTATTAACTCATCTCATTACATGACAAGTGATAT
CACAAATACGAGAATGATCAAGAAGTTCAAGTATACGCCCATAAATTGCACATACAATGC
CGCCAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAACAAAGGACCAAGCCCTTCGCACTCAGT
AGCAAGAAAAAAGTATTGGATCTGTCTTCTCGAGGATCACTCCCTCAGCCATGTAGCTAA
AGCTGAATCCCACTCGCATAGCTCGCCTTCTTTGAACCACAAAGCAATCTCACGCTTCCC
GTTTTCAGGACTATCACTACCATGCACAATGTTCCTTCCGGTTTGTACAGCAAGATCTCC
TCTTATGGTACCAGGTTCAGCTTGAAGGGGGTCTGTTTTCCCAATCAGCTTCCTGGCTGA
AGCAACCACACCAACACCTTCCCAAGCCATACACACAACAGGGCCAGAAGTGATGTACTC
AATCAGGCTAGGAAAGAATGACTTAGCACTAAGATCCTTATAATGTTCCTCGGCCAAATC
TTTAGGACACTGGAACATCTTAAGTCCAATCAGTTTAAAACCCTTCTTCTCAAAACGAGA
GATGGTTTCTCCAACAAGGCCTCGTTGGATGCCGTCTGGTTTGACCATAATGTAAGTCTC
CTCAACTTGCTCCATAGAA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2H915JQ 664 0 0
A
GGGTGAATCTATTAACTCATCTCATTACATGACAAGTGATATCACAAATACGAGAATGAT
CAAGAAGTTCAAGTATATGCCCATAAATTGCACATACAATGCCGCCAAAATTAAAAAAAA
AAAAAAAAAA****ACAAAGGACCAAGCCCTTCGCACTCAGTAGCAAGAAAAAAGTATTG
GATCTGTCTTCTCGAGGATCACTCCCTCAGCCATGTAGCAAGAGCTGAATCCCACTCGCA
TAGCTCGCCTTCTTTGAACCACAAAGCAATCTCACGCTTTCCGTTTTCAGGACTATCACT
ACCGTGCACAATGTTCCTTCCGGTTTGTACAGCAAGATCTCCTCTTATGGTACCGGGTTC
AGCTTGAAAAGGGTCTGTTTTCCCAATCAGCTTCCTGGCTGAAGCAACCACACCAACACC
TTCCCAAGCCATACACACAACAGGGCCTGAAGTGATGTACTCAATCAGGCTAGGAAAGAA
TGACTTGGCACTAAGATCCTTATAATGTTCCTCGGCCAATTCTTTTGGACACTGGAACAT
CTTAAGTCCAATCAGTTTAAACCCCTTCTTCTCAAAACGAGAGATGATTTCTCCAACAAG
GCCTCGTTGGATGCCGTCTGGTTTGACCATAATGTAAGTCTCCTCAACTTGCTCCACAGA
AGC

QA 2 664 2 664
DS 

RD RR2DJ93TF 672 0 0
TTGAACCACAAAGCAATCTCACGCTTCCCGTTTTCAGGACTATCACTACCATGCACAATG
TTCCTTCCGGTTTGTACAGCAAGATCTCCTCTTATGGTACCAGGTTCAGCTTGAAGGGGG
TCTGTTTTCCCAATCAGCTTCCTGGCTGAAGCAACCACACCAACACCTTCCCAAGCCATA
CACACAACAGGGCCAGAAGTGATGTACTCAATCAGGCTAGGAAAGAATGACTTAGCACTA
AGATCCTTATAATGTTCCTCGGCCAAATCTTTAGGACACTGGAACATCTTAAGTCCAATC
AGTTTAAAACCCTTCTTCTCAAAACGAGAGATGGTTTCTCCAACAAGGCCTCGTTGGATG
CCGTCTGGTTTGACCATAATGTAAGTCTCCTCAACTTGCTCCATAGAAGCGACGAGGTGA
GGGAGGAAGATTCCCGAATCGGCGGAGCTCGAAGCAGCGTAGAGACGGCGGCGGGAAGGA
GAAACGCGTGAGAATAGACGGAACTGAGGACGAAACGCGGCCAGCTCGGTCCGCGAGCTA
ACGGTGGTTGGAGAGAGGTTTGAAATGCAAGTTGCCGAATTTACTCTCGGCGACGGCGAG
GCGACACAGAGAGGAGTCCATTGACCAACCGCAGCCATACCAACAACCATTGTGTGTGTG
TGTGTGTTCTCC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2GZ83TF 671 0 0
TGAACCACAAAGCAATCTCACGCTTCCCGTTTTCAGGACTATCACTACCATGCACAATGT
TCCTTCCGGTCTGTACAGCAAGATCTCCTCTTATGGTACCAGGTTCAGCTTGAAGGGGGT
CTGTTTTCCCAATCAGCTTCCTGGCTGAAGCGACCACACCAACACCTTCCCAAGCCATAC
ACACAACAGGGTCAGAAGTGATGTACTCAATCAGGCTAGGAAAGAATGACTTAGCACTAA
GATCCTTATAATGTTCCTCGGCCAAACCTTTAGGACACTGGAACATCTTAAGTCCAATCA
GTTTAAAACCCTTCTTCTCAAAACGAGAGATGATTTCTCCAACAAGGCCTCGTTGGATGC
CGTCTGGTTTGACCATAATGTAAGTCTCCTCAACTTGCTCCATAGAAGCGACGAGGTGAG
GGAGGAAGATTCCCGAATCGGCGGAGCTCGAAGCGGCGTAGAGACGGCGGCGGGAAGGAG
AAACGCGTGAGAATAGACGGAACTGAGGACGAAACGCGGCCAGCTCGGTCCGCGAGCTAA
CGGTGGTTGGAGAGAGGTTTGAAATGCAAGTTGCCGAATTTACTCTCGGCGACGGCGAGG
CGACACAGAGAGGAGTCCATTGACCAACCGCAGCCATACCAACAACCATTGTGTGTGTGT
GTGTGT
TCTCC

QA 1 666 1 666
DS 



CO CL973Contig2 953 3 7 U
GGAGAACACACACACACACACACACAATGGTTGTTGGTATGGCTGCGGTTGGTCAATGGA
CTCCTCTCTGTGTCGCCTCGCCGTCGCCGAGATTAAAGTCGACAACTTTCAGTTCAAACC
TTTCTCCAACCACCGTTAGCTCGCGGTCTGAGCTGGCTGCGTTTCGTCCTCAGTTCCGTC
TATTCTCTCGCGTTTCTCCTTCCCGCCGCCGTCTCTACGCTTCGAGCTCCGCCGATTCTG
GAATCTTCCTCCCTCACCTCGTCGCTTCTATGGAGCAAGTTGAGGAGACTTACATTATGG
TCAAACCAGACGGCATCCAACGAGGCCTTGTTGGAGAAATCATCTCTCGTTTTGAGAAGA
AGGGGTTTAAACTGATTGGACTTAAGATGTTCCAGTGTCCAAAAGAATTGGCCGAGGAAC
ATTATAAGGATCTTAGTGCCAAGTCATTCTTTCCTAGCCTGATTGAGTACATCACTTCAG
GCCCTGCTGTGTGTATGGCTTGGGAAGGTGTTGGTGTGGTTGCTTCAGCCAGGAAGCTGA
TTGGGAAAACAGACCCTCTTCAAGCTGAACCCGGTACCATAAGAGGAGATCTTGCTGTAC
AAACCGGAAGGAACATTGTGCACGGTAGTGATAGTCCTGAAAACGGAAAGCGTGAGATTG
CTTTGTGGTTCAAAGAAGGCGAGCTATGCGATTGGGATTCAGCTCTTGCTACATGGCTGA
GGGAGTGATCCTCGAGAAGACAGATCCAATACTTTTTTCTTGCTACTGAGTGCGAAGGGC
TTGGTCCTTTGTTTTCTTTTTTTTTTTAATTTTGGCGGCATTGTATGTGCAATTTATGGG
CGTATACTTGAACTTCTTGATCATTCTCGTATTTGTGATATCACTTGTCATGTAATGAGA
TGAGTTAATAGATTCACCCCCATTTGGTTCAAATCATATTTTCTCCAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H915TF U 1
AF RR2BK26TF U 5
AF RR2F685JQ C 383
BS 1 269 RR2H915TF
BS 270 270 RR2BK26TF
BS 271 313 RR2H915TF
BS 314 486 RR2BK26TF
BS 487 487 RR2F685JQ
BS 488 641 RR2BK26TF
BS 642 953 RR2F685JQ

RD RR2H915TF 313 0 0
GGAGAACACACACACACACACACACAATGGTTGTTGGTATGGCTGCGGTTGGTCAATGGA
CTCCTCTCTGTGTCGCCTCGCCGTCGCCGAGATTAAAGTCGACAACTTTCAGTTCAAACC
TTTCTCCAACCACCGTTAGCTCGCGGTCTGAGCTGGCTGCGTTTCGTCCTCAGTTCCGTC
TATTCTCTCGCGTTTCTCCTTCCCGCCGCCGTCTCTACGCTTCGAGCTCCGCCGATTCTG
GAATCTTCCTCCCTCACCTCGTCGCTTCTGTGGAGCAAGTTGAGGAGACTTACATTATGG
TCAAACCAGACGG

QA 1 313 1 313
DS 

RD RR2BK26TF 637 0 0
GGAGA
ACACACACACACACACAATGGTTGTTGGTATGGCTGCGGTTGGTCAATGGACTCCTCTCT
GTGTCGCCTCGCCGTCGCCGAGATTAAAGTCGACAACTTTCAGTTCAAGCCTTTCTCCAA
CCACCGTTAGCTCGCGGTCTGAGCTGGCTGCGTTTCGTCCTCAGTTCCGTCTATTCTCTC
GCGTTTCTCCTTCCCGCCGCCGTCTCTACGCTTCGAGCTCCGCCGATTCTGGAATCTTCC
TCCCTCACCTCGTCGCTTCTATGGAGCAAGTTGAGGAGACTTACATTATGGTCAAACCAG
ACGGCATCCAACGAGGCCTTGTTGGAGAAATCATCTCTCGTTTTGAGAAGAAGGGGTTTA
AACTGATTGGACTTAAGATGTTCCAGTGTCCAAAAGAATTGGCCGAGGAACATTATAAGG
ATCTTAGTGCCAAGTCATTCTTTCCTAGCCTGATTGAGTACATCACTTCAGGCCCTGTTG
TGTGTATGGCTTGGGAAGGTGTTGGTGTGGTTGCTTCAGCCAGGAAGCTGATTGGGAAAA
CAGACCCTCTTCAAGCTGAACCCGGTACCATAAGAGGAGATCTTGCTGTACAAACCGGAA
GGAACATTGTGCACGGTAGTGATAGTCCTGAA

QA 6 637 6 637
DS 

RD RR2F685JQ 571 0 0
TAAGATGTTCCAGTGTCCAAAAGAATTGGCCGAGGAACATTATAAGGATCTTAGTGCCAA
GTCATTCTTTCCTAGCCTGATTGAGTACATCACTTCAGGCCCTGCTGTGTGTATGGCTTG
GGAAGGTGTTGGTGTGGTTGCTTCAGCCAGGAAGCTGATTGGGAAAACAGACCCTCTTCA
AGCTGAACCCGGTACCATAAGAGGAGATCTTGCTGTACAAACCGGAAGGAACATTGTGCA
CGGTAGTGATAGTCCTGAAAACGGAAAGCGTGAGATTGCTTTGTGGTTCAAAGAAGGCGA
GCTATGCGATTGGGATTCAGCTCTTGCTACATGGCTGAGGGAGTGATCCTCGAGAAGACA
GATCCAATACTTTTTTCTTGCTACTGAGTGCGAAGGGCTTGGTCCTTTGTTTTCTTTTTT
TTTTTAATTTTGGCGGCATTGTATGTGCAATTTATGGGCGTATACTTGAACTTCTTGATC
ATTCTCGTATTTGTGATATCACTTGTCATGTAATGAGATGAGTTAATAGATTCACCCCCA
TTTGGTTCAAATCATATTTTCTCCAAAAAAA

QA 1 571 1 571
DS 



AS 2 7

CO CL974Contig1 792 2 7 U
GGCTTCTTAACCTCTTCTCTCTCGTTTTGCAGATTTTATCATCTTTGTTTCTCTCAGATT
CCACAAAAACATTTATTTTTTTTTGCGTTGGAATCTGTGAGGAACAGAGGATAAGGTATC
ATGGGTTCCATCTCTTTATCCAATTCTCTGCCCATAACGCGACTTCCTCTACTTACATCA
CTTAATCAATCCCTTCTTCCCACTTCTTCATCCTTGTCACTTCCTCCTCTCTCCAACCGT
CGTCGCTCCAATTTTTCACAGAGAATTGCCGCATCTGCCGTCTTCTCAGCTCCTGCCGGC
GTCAATGACTCCCTTCCTGCAAGAAACGAGGGCTACACCGTTGGTGATTTCATGACAGGG
AGACAGCATCTCCATGTTGTTAAGCCTTCAACCTCGGTAGATGATGCATTGGAACTTCTG
GTTGAGAAGAAAGTCACTGGATTGCCTGTAATTGATAACGATTGGAACCTGGTTGGTGTT
GTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTGGATTCCATTTCTGGCCGCTGCCAAAATGAAACC
AGCTTGTTCCCTAACGTCGACAGTACCTGGAAAACGTTCAATGAACTCCAGAAACTGATA
AGTAAGACACATGGACAAGTGGTTGGGGACTTGATGACGCCTTCCCCTCTGGTTGTCCGT
GGTTCAACCAACTTAGAAGATGCAGCCAGGTTGCTTCTGGAAACAAAGTTCCGAAGATTA
CCAGTCGTGGATTCAGATGGAAACTGATTGGGATCCTTACAAGGGGAACGTAGTAAGGCT
GCACTGCAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ03TF U 29
AF RR2FS29TF U 1
BS 1 83 RR2FS29TF
BS 84 84 RR2FJ03TF
BS 85 373 RR2FS29TF
BS 374 374 RR2FJ03TF
BS 375 635 RR2FS29TF
BS 636 636 RR2FJ03TF
BS 637 792 RR2FS29TF

RD RR2FJ03TF 657 0 0
GGAGATT
TTATCATCTTTGTTTCTCTCAGATTCCACAAAAACATTTATTTTTTTTTGCGTTGGAATC
TGTGAGGAACAGAGGATAAGGTATCATGGGTTCCATCTCTTTATCCAATTCTCTGCCCAT
AACGCGACTTCCTCTACTTACATCACTTAATCAATCCCTTCTTCCCACTTCTTCATCCTT
GTCACTTCCTCCTCTCTCCAACCGTCGTCGCTCCAATTTTTCACAGAGAATTGCCGCATC
TGCCGTCTTCTCAGCTCCTGCCGGCGTCAATGACTCCCTTCCTGCAAGAAACGAGGGCTA
CACCGTTGGTGATTTCATGACAGGGAGACAGCATCTCCATGTTGTTAAGCCTTCAACCTC
GGTAGATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCACTGGATTGCCTGTAATTGA
TGACGATTGGAACCTGGTTGGTGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTGGATTCCAT
TTCTGGCCGCTGCCAAAATGAAACCAGCTTGTTCCCTAACGTCGACAGTACCTGGAAAAC
GTTCAATGAACTCCAGAAACTGATAAGTAAGACACATGGACAAGTGGTTGGGGACTTGAT
GACGCCTTCCCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCA*CCAACTTAGAAGATGCAG

QA 8 657 8 657
DS 

RD RR2FS29TF 792 0 0
GGCTTCTTAACCTCTTCTCTCTCGTTTTGCAGATTTTATCATCTTTGTTTCTCTCAGATT
CCACAAAAACATTTATTTTTTTT*GCGTTGGAATCTGTGAGGAACAGAGGATAAGGTATC
ATGGGTTCCATCTCTTTATCCAATTCTCTGCCCATAACGCGACTTCCTCTACTTACATCA
CTTAATCAATCCCTTCTTCCCACTTCTTCATCCTTGTCACTTCCTCCTCTCTCCAACCGT
CGTCGCTCCAATTTTTCACAGAGAATTGCCGCATCTGCCGTCTTCTCAGCTCCTGCCGGC
GTCAATGACTCCCTTCCTGCAAGAAACGAGGGCTACACCGTTGGTGATTTCATGACAGGG
AGACAGCATCTCCTTGTTGTTAAGCCTTCAACCTCGGTAGATGATGCATTGGAACTTCTG
GTTGAGAAGAAAGTCACTGGATTGCCTGTAATTGATAACGATTGGAACCTGGTTGGTGTT
GTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTGGATTCCATTTCTGGCCGCTGCCAAAATGAAACC
AGCTTGTTCCCTAACGTCGACAGTACCTGGAAAACGTTCAATGAACTCCAGAAACTGATA
AGTAAGACACATGGACAAGTGGTTGGGGACTTGATTACGCCTTCCCCTCTGGTTGTCCGT
GGTTCAACCAACTTAGAAGATGCAGCCAGGTTGCTTCTGGAAACAAAGTTCCGAAGATTA
CCAGTCGTGGATTCAGATGGAAACTGATTGGGATCCTTACAAGGGGAACGTAGTAAGGCT
GCACTGCAGATC

QA 1 792 1 792
DS 



CO CL974Contig2 993 5 13 U
GGCAGATATTATCATCTTTGTTTCTCTCAGATTCCACAAAAAGATTTATTTTTGCGTCGG
AATCTGTGAGGAACAGAGGATAAGGTATCATGGGTTCCATCTCTTTATCCAATTCTCTGC
CCATAACGCGACTTCCTCTAATTACATCACTCAATCAATCCCTTCTTCCCACTTCTCCAT
CCTTCTCACTTCCTCCTCTCTCCAACCGTCGTCGCTCTAGTTTTTCGCAGAGAATCGCCG
CCTCTGCAGTCTTCTCTGCTCCTGCCGGCGTCAGTGACTCCCTTCCGGCAAGAAATGAGG
GATACACAGTGGGTGATTTCATGACAGGGAGACAGCATCTCCATGTTGTTAAGCCCTCAA
CCTCGGTCGATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTTACTGGATTGCCTGTAA
TTGATGACGATTGGAACCTGGTTGGTGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTGGATT
CCATTTCTGGCCGCTGCCAAAATGAAACGAACTTGTTCCCTAACGTTGACAGTACCTGGA
AAACGTTCAATGAACTCCAGAAACTGATAAGTAAGACACATGGACAAGTGGTTGGGGACT
TGATGACGCCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCGACCAACTTAGAAGATGCAGCCAGGT
TGCTTCTGGAAACAAAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTGGATTCAGATGGAAAACTGATTG
GAATCCTTACAAGGGGGAACGTAGTAAGGGCTGCACTGCAGATCAAGCGTGAAACAGAGA
ACTGTGAAACATAGCTAGGTAATCCCCTTTCAATCTGCCATAGTTAAATAGCAAAATCTG
TTGCAAATCTGTTCATGGAAGTATATACATATAATGTAAACCCAAACTGGGAATTCAAGA
CGTTATTGTGTAGGGCAAAGTGTATTCTCTAATCTTATTACCACCACCAAACACAAACGA
GCAAACAGAACTTGATCTACTGTTTCACATGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN87TF U 6
AF RR2G990TF U 1
AF RR2GC45TF U 49
AF RR2GC45JQ C 361
AF RR2G990JQ C 287
BS 1 669 RR2G990TF
BS 670 712 RR2GC45TF
BS 713 713 RR2G990JQ
BS 714 736 RR2GC45TF
BS 737 737 RR2G990JQ
BS 738 788 RR2GC45TF
BS 789 789 RR2G990JQ
BS 790 801 RR2GC45TF
BS 802 804 RR2G990JQ
BS 805 812 RR2GC45TF
BS 813 813 RR2G990JQ
BS 814 827 RR2GC45TF
BS 828 993 RR2G990JQ

RD RR2BN87TF 635 0 0
GGA
TTATCATCTTTGTTTCTCTCAGATTCCACAAAAAGATTTATTTTTGCGTCGGAATCTGTG
AGGAACAGAGGATAAGGTATCATGGGTTCCATCTCTTTATCCAATTCTCTGCCCATAACG
CGACTTCCTCTAATTACATCACTCAATCAATCCCTTCTTCCCACTTCTCCATCCTTCTCA
CTTCCTCCTCTCTCCAACCGTCGTCGCTCTAGTTTTTCGCAGAGAATCGCCGCCTCTGCA
GTCTTCTCTGCTCCTGCCGGCGTCAGTGACTCCCTTCCGGCAAGAAATGAGGGATACACA
GTGGGTGATTTCATGACAGGGAGACAGCATCTCCATGTTGCTAAGCCCTCAACCTCGGTC
GATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTTACTGGATTGCCTGTAATTGATGAC
GATTGGAACCTGGTTGGTGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTGGATTCCATTTCT
GGCCGCTGCCAAAATGAAACGAACTTGTTCCCTAACGTTGACAGTACCTGGAAAACGTTC
AATGAACTCCAGAAACTGATAAGTAAGACACATGGACAAGTGGTTGGGGACTTGATGACG
CCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCGACCAA

QA 4 635 4 635
DS 

RD RR2G990TF 669 0 0
GGCAGATATTATCATCTTTGTTTCTCTCAGATTCCACAAAAAGATTTATTTTTGCGTCGG
AATCTGTGAGGAACAGAGGATAAGGTATCATGGGTTCCATCTCTTTATCCAATTCTCTGC
CCATAACGCGACTTCCTCTAATTACATCACTCAATCAATCCCTTCTTCCCACTTCTCCAT
CCTTCTCACTTCCTCCTCTCTCCAACCGTCGTCGCTCTAGTTTTTCGCAGAGAATCGCCG
CCTCTGCAGTCTTCTCTGCTCCTGCCGGCGTCAGTGACTCCCTTCCGGCAAGAAATGAGG
GATACACAGTGGGTGATTTCATGACAGGGAGACAGCATCTCCATGTTGTTAAGCCCTCAA
CCTCGGTCGATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTTACTGGATTGCCTGTAA
TTGATGACGATTGGAACCTGGTTGGTGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTGGATT
CCATTTCTGGCCGCTGCCAAAATGAAACGAACTTGTTCCCTAACGTTGACAGTACCTGGA
AAACGTTCAATGAACTCCAGAAACTGATAAGTAAGACACATGGACAAGTGGTTGGGGACT
TGATGACGCCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCGACCAACTTAGAAGATGCAGCCAGGT
TGCTTCTGG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2GC45TF 786 0 0
TTTTTGCGTCGGAATCTGTGAGGAACAGAGGATAAGGTATCATGGGTTCCATCTCTTTAT
CCAATTCTCTGCCCATAACGCGACTTCCTCTAATTACATCACTCAATCAATCCCTTCTTC
CCACTTCTCCATCCTTCTCACTTCCTCCTCTCTCCAACCGTCGTCGCTCTAGTTTTTCGC
AGAGAATCGCCGCCTCTGCAGTCTTCTCTGCTCCTGCCGGCGTCAGTGACTCCCTTCCGG
CAAGAAATGAGGGATACACAGTGGGTGATTTCATGACAGGGAGACAGCATCTCCATGTTG
TTAAGCCCTCAACCTCGGTCGATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTTACTG
GATTGCTTGTAATTGATGACGATTGGAACCTGGTTGGTGTTGTTTCTGATTACGACTTGC
TTGCACTGGATTCCATTTCTGGCCGCTGCCAAAATGAAACGAACTTGTTCCCTAACGTTG
ACAGTACCTGGAAAACGTTCAATGAACTCCAGAAACTGATAAGTAAGACACATGGACAAG
TGGTTGGGGACTTGATGACGCCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTCCGACCAACTTAGAAG
ATGCAGCCAGGTTGCTTCTGGAAACAAAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTGGATTCAGATG
GAAA*CTGATTGGAATCCTTACAAGGGG*AACGTAGTAAGGGCTGCACTGCAGATCAAGC
GTGAAACAGAGAACTGTGAA*CATAGCTAGGTAT**CCCTTTCA*TCTGCCATAGTTAA
TAGCAAA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2GC45JQ 588 0 0
CCTCGGTCGATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTTACTGGATTGCTTGTAA
TTGATGACGATTGGAACCTGGTTGGTGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTGGATT
CCATTTCTGGCCGCTGCCAAAATGAAACGAACTTGTTCCCTAACGTTGACAGTACCTGGA
AAACGTTCAATGAACTCCAGAAACTGATAAGTAAGACACATGGACAAGTGGTTGGGGACT
TGATGACGCCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTCCGACCAACTTAGAAGATGCAGCCAGGT
TGCTTCTGGAAACAAAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTGGATTCAGATGGAAAACTGATTG
GAATCCTTACAAGGGGGAACGTAGTAAGGGCTGCACTGCAGATCAAGCGTGAAACAGAGA
ACTGTGAAACATAGCTAGGTAATCCCCTTTCAATCTGCCATAGTTAAATAGCAAAATCTG
TTGCAAATCTGTTCATGGAAGTATATACATATAATGTAAACCCAAACTGGGAATTCAAGA
CGTTATTGTGTAGGGCAAAGTGTATTCTCTA
ATCTTATTACCACCACC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2G990JQ 707 0 0
GGCAAGAAATGAGGGATACACAGTGGGTGATTTCATGACAGGGAGACAGCATCTCCATGT
TGTTAAGCCCTCAACCTCGGTCGATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTTAC
TGGATTGCCTGTAATTGATGACGATTGGAACCTGGTTGGTGTTGTTTCTGATTACGACTT
GCTTGCACTGGATTCCATTTCTGGCCGCTGCCAAAATGAAACGAACTTGTTCCCTAACGT
TGACAGTACCTGGAAAACGTTCAATGAACTCCAGAAACTGATAAGTAAGACACATGGACA
AGTGGTTGGGGACTTGATGACGCCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCGACCAACTTAGA
AGATGCAGCCAGGTTGCTTCTGGAAACAAAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTGGATTCAGA
TGGAAAACTGATTGGAATCCTTACAAGGGGGAACGTAGTAAGGGCTGCACTGCAGATCAA
GCGTGAAGCAGAGAACTGTGAAACATAGCTAGATAATCCCCTTTCAATCTGCCATAGTTA
AATAGCAAAATCTGTTGCAAATCTGTTCATGGAAGTATATACATATAATGTAAACCCAAA
CTGGGAATTCAAGACGTTATTGTGTAGGGCAAAGTGTATTCTCTAATCTTATTACCACCA
CCAAACACAAACGAGCAAACAGAACTTGATCTACTGTTTCACATGAG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 5

CO CL975Contig1 839 5 13 U
CGTATGTAGTATCACAACCATATGTATTACATTACACGAGATTAAACGTTACAAGTTGTA
ACTTACAACCCAACCATTGTAAAAAAAAAAACACAACCATTGTAAATACTTTAGTAGCTG
CGGGCTGTTACGACTTTTTCTCACAGCCACTTCAACTGCACTCATTCACTTTCCCTCACA
ATTAAAACACCAACCCCCCAAAAAAACTAATTAAAAACACACACAAAAACAAAAGTCATA
GATACCAATCCCCCCTTGATTTTCTCTCCTTAGTATAGAATTTTGCAAAAAAGAAGCGAA
ATTAGCGGAGAGTTTTCTTTTGTCTCGACCACTTAAAGATAGAGTTTCTTGAAAATCGGT
TAGACCCTGAAATTCTTGCCGACATAGGTTTGACCAAACTGCCAGTTAGAAGGAACTATG
TTCCATGAAGTCGAGGTTCTACGATCACTGCCTGTGACTCGGAAAGAAAGTGACTGACCA
ACCAAGACAGCGTTAGATTGCCAGTTCTGACCCCAGTTTCTGCTCAAACTCATCCAACCA
GTTCGCGAACCTTTCACGCTCGTCCTCACGATGTCTCCTGCTCCCGCCACGTTAGTGATC
AGAACCAAGTTGAAGTAACGGTGACCGTTGATTGTGAACCTTATCCCTCCTCTCTTTCTA
CAAGGCACCCTGCGGTATGAAACTGGGACAATGCCGGCACGATATTGAGCGATCTTGAGG
AAGACAGGCATGGCTAGATCAAAGTGGGCTCTTGGCGGGTTGCACCATCCTCCGTTATCA
CTGGCCTGAGCAAAGTTTGGTGGGCAGAAATTGGTTGCGGTAATGAGTATCGATGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH93JQB U 8
AF RR2GH93TF C 1
AF RR2GA28JQ U 1
AF RR2EO04JQ U 6
AF RR2GA28TF C 198
BS 1 89 RR2GA28JQ
BS 90 91 RR2GH93JQB
BS 92 216 RR2GA28JQ
BS 217 217 RR2GH93JQB
BS 218 309 RR2GA28JQ
BS 310 310 RR2EO04JQ
BS 311 490 RR2GA28JQ
BS 491 491 RR2GH93JQB
BS 492 661 RR2GA28JQ
BS 662 662 RR2EO04JQ
BS 663 808 RR2GA28JQ
BS 809 816 RR2EO04JQ
BS 817 839 RR2GA28TF

RD RR2GH93JQB 591 0 0
AGTATCACAACCATATGTATTACATTACACGAGATTAAACGTTACAAGTTGTAACTTACA
ACCCAACCATTGTAAAAAAAAAAACACAACCATTGTAAATACTTTAGTAGCTGCGGGCTG
TTACGACTTTTTCTCACAGCCACTTCAACTGCACTCATTCACTTTCCCTCACAATTAAAA
CACCAACCCCCCAAAAAAACTAATTAAAAACACACACAAAAACAAAAGTCATAAATACCA
ATCCCCCCTTGATTTTCTCTCCTTAGTATAAAATTTTGCAAAAAAAAAGCGAAATTAGCG
GAAAGTTTTCTTTTGTCTCGACCACTTAAAGATAGAGTTTCTTGAAAATCGGTTAAACCC
TGAAATTCTTGCCGACATAGGTTTGACCAAACTGCCAGTTAAAAGGAACTATGTTCCATG
AAGTCGAGGTTCTACGATCACTGCCTGTGACTCGGAAAGAAAGTGACTGACCAACCAAAA
CAGCGTTAAATTGCCAGTTCTGACCCCAGTTTCTGCTCAAACTCATCCAACCAGTTCGCG
AACCTTTCACGCTCGTCCTCACGATGTCTCCTGCTCCCGCCACGTTAGTGA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2GH93TF 704 0 0
TTTTTTT
AGTATCACAACCATATGTATTACATTACACGAGATTAAACGTTACAAGTTGTAACTTACA
ACCCAACCATTGTAAAAAAAAAAACACAACCATTGTAAATACTTTAGTAGCTGCGGGCTG
TTACGACTTTTTCTCACAGCCACTTCAACTGCACTCATTCACTTTCCCTCACAATTAAAA
CACCAACCCCCCAAAAAAACTAATTAAAAACACACACAAAAACAAAAGTCATAGATACCA
ATCCCCCCTTGATTTTCTCTCCTTAGTATAGAATTTTGCAAAAAAGAAGCGAAATTAGCG
GAGAGTTTTCTTTTGTCTCGACCACTTAAAGATAGAGTTTCTTGAAAATCGGTTAGACCC
TGAAATTCTTGCCGACATAGGTTTGACCAAACTGCCAGTTAGAAGGAACTATGTTCCATG
AAGTCGAGGTTCTACGATCACTGCCTGTGACTCGGAAAGAAAGTGACTGACCAACCAAGA
CAGCGTTAGATTGCCAGTTCTGACCCCAGTTTCTGCTCAAACTCATCCAACCAGTTCGCG
AACCTTTCACGCTCGTCCTCACGATGTCTCCTGCTCCCGCCACGTTAGTGATCAGAACCA
AGTTGAAGTAACGGTGACCGTTGATTGTGAACCTTATCCCTCCTCTCTTTCTACAAGGCA
CCCTGCGGAATGAAACTGGGACAATGCCGGCACGAT
C

QA 8 703 8 703
DS 

RD RR2GA28JQ 808 0 0
CGTATGTAGTATCACAACCATATGTATTACATTACACGAGATTAAACGTTACAAGTTGTA
ACTTACAACCCAACCATTGTAAAAAAAAA**CACAACCATTGTAAATACTTTAGTAGCTG
CGGGCTGTTACGACTTTTTCTCACAGCCACTTCAACTGCACTCATTCACTTTCCCTCACA
ATTAAAACACCAACCCCCCAAAAAAACTAATTAAAAGCACACACAAAAACAAAAGTCATA
GATACCAATCCCCCCTTGATTTTCTCTCCTTAGTATAGAATTTTGCAAAAAAGAAGCGAA
ATTAGCGGAAAGTTTTCTTTTGTCTCGACCACTTAAAGATAGAGTTTCTTGAAAATCGGT
TAGACCCTGAAATTCTTGCCGACATAGGTTTGACCAAACTGCCAGTTAGAAGGAACTATG
TTCCATGAAGTCGAGGTTCTACGATCACTGCCTGTGACTCGGAAAGAAAGTGACTGACCA
ACCAAGACAGTGTTAGATTGCCAGTTCTGACCCCAGTTTCTGCTCAAACTCATCCAACCA
GTTCGCGAACCTTTCACGCTCGTCCTCACGATGTCTCCTGCTCCCGCCACGTTAGTGATC
AGAACCAAGTTGAAGTAACGGTGACCGTTGATTGTGAACCTTATCCCTCCTCTCTTTCTA
CCAGGCACCCTGCGGTATGAAACTGGGACAATGCCGGCACGATATTGAGCGATCTTGAGG
AAGACAGGCATGGCTAGATCAAAGTGGGCTCTTGGCGGGTTGCACCATCCTCCGTTATCA
CTGGCCTGAGCAAAGTTTGGTGGGCAGA

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2EO04JQ 811 0 0
GT
AGTATCACAACCATATGTATTACATTACACGAGATTAAACGTTACAAGTTGTAACTTACA
ACCCAACCATTGTAAAAAAAAA**CACAACCATTGTAAATACTTTAGTAGCTGCGGGCTG
TTACGACTTTTTCTCACAGCCACTTCAACTGCACTCATTCACTTTCCCTCACAATTAAAA
CACCAACCCCCCAAAAAAACTAATTAAAAACACACACAAAAACAAAAGTCATAGATACCA
ATCCCCCCTTGATTTTCTCTCCTTAGTATAGAATTTTGCAAAAAAGAAGCGAAATTAGCG
GAGAGTTTTCTTTTGTCTCGACCACTTAAAGATAGAGTTTCTTGAAAATCGGTTAGACCC
TGAAATTCTTGCCGACATAGGTTTGACCAAACTGCCAGTTAGAAGGAACTATGTTCCATG
AAGTCGAGGTTCTACGATCACTGCCTGTGACTCGGAAAGAAAGTGACTGACCAACCAAGA
CAGCGTTAGATTGCCAGTTCTGACCCCAGTTTCTGCTCAAACTCATCCAACCAGTACGCG
AACCTTTCACGCTCGTCCTCACGATGTCTCCTGCTCCCGCCACGTTAGTGATCAGAACCA
AGTTGAAGTAACGGTGACCGTTGATTGTGAACCTTATCCCTCCTCTCTTTCTACAAGGCA
CCCTGCGGTATGAAACTGGGACAATGCCGGCACGATATTGAGCGATCTTGAGGAAGACAG
GCATGGCTAGATCAAAGTGGGCTCTTGGCGGGTTGCACCATCCTCCGTTATCACTGGCCT
GAGCAAAGTTTGGTGGGCAGAAATTGGTT

QA 3 811 3 811
DS 

RD RR2GA28TF 642 0 0
CCC
AAAAAACTAATTAAAAGCACACACAAAAACAAAAGTCATAGATACCAATCCCCCCTTGAT
TTTCTCTCCTTAGTATAGAATTTTGCAAAAAAGAAGCGAAATTAGCGGAGAGTTTTCTTT
TGTCTCGACCACTTAAAGATAGAGTTTCTTGAAAATCGGTTAGACCCTGAAATTCTTGCC
GACATAGGTTTGACCAAACTGCCAGTTAGAAGGAACTATGTTCCATGAAGTCGAGGTTCT
ACGATCACTGCCTGTGACTCGGAAAGAAAGTGACTGACCAACCAAGACAGTGTTAGATTG
CCAGTTCTGACCCCAGTTTCTGCTCAAACTCATCCAACCAGTTCGCGAACCTTTCACGCT
CGTCCTCACGATGTCTCCTGCTCCCGCCACGTTAGTGATCAGAACCAAGTTGAAGTAACG
GTGACCGTTGATTGTGAACCTTATCCCTCCTCTCTTTCTACCAGGCACCCTGCGGTATGA
AACTGGGACAATGCCGGCACGATATTGAGCGATCTTGAGGAAGACAGGCATGGCTAGATC
AAAGTGGGCTCTTGGCGGGTTGCACCATCCTCCGTTATCACTGGCCTGAGCAAAGTTTGG
TGGGCAGAAATTGGTTGCGGTAATGAGTATCGATGGGCC

QA 4 642 4 642
DS 



AS 1 6

CO CL976Contig1 1303 6 9 U
GGAAGGGATCGCATTATATGGCGAACTACTACTATGCATAGGATAGGATGATAGGAACAT
CACAAACACCATGAATCTCTATTCTTTTTAGTACATAACATGATGAGCCACTGTACACAC
ATGCACGTGTCTCTCTACTCTTGGTACATAACGTTATGAGACATCGTATAACCGGCCTCT
CTCACCTAAGGCTCAAAACCGGCCATGCACCAGGGGATGGCAGAGCAGGGCGGATCACTG
GGACCCTTCTTACCTCTGTGAATGCTTCATTGAGTCGAGCTGCCTGACTCATCACCCTCG
AGACCTTCTTCTCGTCGATTGCAACTTTGAGATGGAACCTTTGAGCTTTCTTTTTCATAT
GATAGAGTCTGCGTCCCAAGAGAACAAAACCCATCAGAGCTGCAGCCATGGAGAGAGACC
AAACAGGACCAATCCTAAGTGCATAGTACTTGACAAGAACAAACGGCATCTTCCACCACA
CAGTCTCTCTACTTTTACTCACATCACCAGACCTCACAGCCACCACATCCCCTCCTCCAC
TTCCCTCAACTGCTTCCCTATCAGAAACAATCTCCTCTTCACCACTCACATTCCCAGAAT
CCAGTTCGTCCCCCTCTGACTCAGGCAAACACTTGCTTGCATCCTCAATATGTTCTTCAA
CACCAGCTTGGAGATGGTCAGTCTCGGACAAACACTTGCTTGCATCCTCGACATGTTCTT
CAACACCAGCTTGGCTCTCAACTTGAAAACCTTCTGTTTCGGACAAACACTTGCTTGCAT
CCTCGATATGTTCTTCAACACAAGCTTGGCTCTCGACTTGGAGTTTGTCCGTTTCCGACA
AACACTTGCTTGCATCCTCGACATGTTCTTCAACACCAGCTTGGCTCTCAACTTGAAGAT
CCTCCGTTTCCGACAAACACTTGCTTGCATCCTCGACATGTTCCTCAACACCAGCTTGGA
TCTCGACTTGGAGATTGTCTGTTTCGGACATGCCCTCACCATCGAGAAACCCTAATTCGT
TTCCGACACCAGCATCATCACCCGGTTGATAAACATCCAACTGATCGAAACCCAAACCCA
CTGGATTCGGATACTCCGACCCGTAATCGACCCGAGAAGAATCACCAGAACCTAAGCTTT
GATCGGCGGAGAAATGATCAGAGACAATCATACCGTCATCGATTACAATTGATTCCATCT
CCGATGTGATTGAATCGGCGTCGGAGCCGTGAACGAGCCCCCAATCAAGCATCTCCTCTC
CTTCCATGGGTGATTGATTGATAATCGAAGAAAAGTTTAGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2H585JQB U 1
AF RR2H585TF C 1
AF RR2CG77JQ U 166
AF RR2AP54JQ U 50
AF RR2AP54TF C 532
AF RR2CG77TF C 646
BS 1 224 RR2H585JQB
BS 225 225 RR2AP54JQ
BS 226 513 RR2H585JQB
BS 514 859 RR2AP54JQ
BS 860 1187 RR2AP54TF
BS 1188 1188 RR2CG77TF
BS 1189 1238 RR2AP54TF
BS 1239 1239 RR2CG77TF
BS 1240 1303 RR2AP54TF

RD RR2H585JQB 514 0 0
GGAAGGGATCGCATTATATGGCGAACTACTACTATGCATAGGATAGGATGATAGGAACAT
CACAAACACCATGAATCTCTATTCTTTTTAGTACATAACATGATGAGCCACTGTACACAC
ATGCACGTGTCTCTCTACTCTTGGTACATAACGTTATGAGACATCGTATAACCGGCCTCT
CTCACCTAAGGCTCAAAACCGGCCATGCACCAGGGGATGGCAGAACAGGGCGGATCACTG
GGACCCTTCTTACCTCTGTGAATGCTTCATTGAGTCGAGCTGCCTGACTCATCACCCTCG
AGACCTTCTTCTCGTCGATTGCAACTTTGAGATGGAACCTTTGAGCTTTCTTTTTCATAT
GATAGAGTCTGCGTCCCAAGAGAACAAAACCCATCAGAGCTGCAGCCATGGAGAGAGACC
AAACAGGACCAATCCTAAGTGCATAGTACTTGACAAGAACAAACGGCATCTTCCACCACA
CAGTCTCTCTACTTTTACTCACATCACCAGACC
C

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2H585TF 514 0 0
GGAAGGGATCGCATTATATGGCGAACTACTACTATGCATAGGATAGGATGATAGGAACAT
CACAAACACCATGAATCTCTATTCTTTTTAGTACATAACATGATGAGCCACTGTACACAC
ATGCACGTGTCTCTCTACTCTTGGTACATAACGTTATGAGACATCGTATAACCGGCCTCT
CTCACCTAAGGCTCAAAACCGGCCATGCACCAGGGGATGGCAGAGCAGGGCGGATCACTG
GGACCCTTCTTACCTCTGTGAATGCTTCATTGAGTCGAGCTGCCTGACTCATCACCCTCG
AGACCTTCTTCTCGTCGATTGCAACTTTGAGATGGAACCTTTGAGCTTTCTTTTTCATAT
GATAGAGTCTGCGTCCCAAGAGAACAAAACCCATCAGAGCTGCAGCCATGGAGAGAGACC
AAACAGGACCAATCCTAAGTGCATAGTACTTGACAAGAACAAACGGCATCTTCCACCACA
CAGTCTCTCTACTTTTACTCACATCACCAGACC
C

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2CG77JQ 598 0 0
GTATAACCGGCTTCTCTCACCTAAGGCTCAAAACCGGCCATGCACCAGGGGATGGCAGAA
CAGGGCGGATCACTGGGACCCTTCTTACCTCTGTGAATGCTTCATTGAGTCGAGCTGCCT
GACTCATCACCCTCGAGACCTTCTTCTCGTCGATTGCAACTTTGAGATGGAACCTTTGAG
CTTTCTTTTTCATATGATAGAGTCTGCGTCCCAAGAGAACAAAACCCATCAGAGCTGCAG
CCATGGAGAGAGACCAAACAGGACCAATCCTAAGTGCATAGTACTTGACAAGAACAAACG
GCATCTTCCACCACACAGTCTCTCTACTTTTACTCTCATCACCAGACCTCACAGCCACCA
CATCCCCTCCTCCACTTCCCTCAACTGCTTCCCTATCAAAAACAATCTCCTCTTCACCAC
TCACATTCCCAGAATCCAGTTCGTCCCCCTCTGACTCAGGCAAACACTTGCTTGCATCCT
CAATATGTTCTTCAACACCAGCTTGGAGATGGTCAGTTTCGGACAAACACTTGCTTGCAT
CCTCGACATGTTCTTCAACACCAGCTTGGTTCTCAACTTGAAAACCTTCTGTTTCGGA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2AP54JQ 810 0 0
GATAGGAACATCACAAACACCATGAATCTCTATTCTTTTTAGTACATAACATGATGAGCC
ACTGTACACACATGCACGTGTCTCTCTACTCTTGGTACATAACGTTATGAGACATTGTAT
AACCGGCTTCTCTCACCTAAGGCTCAAAACCGGCCATGCACCAGGGGATGGCAGAGCAGG
GCGGATCACTGGGACCCTTCTTACCTCTGTGAATGCTTCATTGAGTCGAGCTGCCTGACT
CATCACCCTCGAGACCTTCTTCTCGTCGATTGCAACTTTGAGATGGAACCTTTGAGCTTT
CTTTTTCATATGATAGAGTCTGCGTCCCAAGAGAACAAAACCCATCAGAGCTGCAGCCAT
GGAGAGAGACCAAACCGGACCAATCCTAAGTGCATAGTACTTGACAAGAACAAACGGCAT
CTTCCACCACACAGTCTCTCTACTTTTACTCTCATCACCAGACCTCACAGCCACCACATC
CCCTCCTCCACTTCCCTCAACTGCTTCCCTATCAGAAACAATCTCCTCTTCACCACTCAC
ATTCCCAGAATCCAGTTCGTCCCCCTCTGACTCAGGCAAACACTTGCTTGCATCCTCAAT
ATGTTCTTCAACACCAGCTTGGAGATGGTCAGTCTCGGACAAACACTTGCTTGCATCCTC
GACATGTTCTTCAACACCAGCTTGGCTCTCAACTTGAAAACCTTCTGTTTCGGACAAACA
CTTGCTTGCATCCTCGATATGTTCTTCAACACAAGCTTGGCTCTCGACTTGGAGTTTGTC
CGTTTCCGACAAACACTTGCTTGCATCCTC

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR2AP54TF 772 0 0
CCCTCCTCACTT
CCTCAACTGCTTCCCTATCAGAAACAATCTCCTCTTCACCACTCACATTCCCAGAATCCA
GTTCGTCCCCCTCTGACTCAGGCAAACACTTGCTTGCATCCTCAATATGTTCTTCAACAC
CAGCTTGGAGATGGTCAGTCTCGGACAAACACTTGCTTGCATCCTCGACATGTTCTTCAA
CACCAGCTTGGCTCTCAACTTGAAAACCTTCTGTTTCGGACAAACACTTGCTTGCATCCT
CGATATGTTCTTCAACACAAGCTTGGCTCTCGACTTGGAGTTTGTCCGTTTCCGACAAAC
ACTTGCTTGCATCCTCGACATGTTCTTCAACACCAGCTTGGCTCTCAACTTGAAGATCCT
CCGTTTCCGACAAACACTTGCTTGCATCCTCGACATGTTCCTCAACACCAGCTTGGATCT
CGACTTGGAGATTGTCTGTTTCGGACATGCCCTCACCATCGAGAAACCCTAATTCGTTTC
CGACACCAGCATCATCACCCGGTTGATAAACATCCAACTGATCGAAACCCAAACCCACTG
GATTCGGATACTCCGACCCGTAATCGACCCGAGAAGAATCACCAGAACCTAAGCTTTGAT
CGGCGGAGAAATGATCAGAGACAATCATACCGTCATCGATTACACTTGATTCCATCTCCG
ATGTGATTGAATCGGCGTCGGAGCCGTGAACGAGCTCCCAATCAAGCATCTCCTCTCCTT
CCATGGGTGATTGATTGATAATCGAAGAAAAGTTTAGATT

QA 13 772 13 772
DS 

RD RR2CG77TF 658 0 0
CAATATGTTCTTCAACACCAGCTGGGAGATGGTCAGTTTCGGACAAACACTTGCTTGCAT
CCTCGACATGTTCTTCAACACCAGCTTGGTTCTCAACTTGAAAACCTTCTGTTTCGGACA
AACACTTGCTTGCATCCTCGATATGTTCTTCAACACAAGCCTGGCTCTCGACTTGGAGTT
TGTCCGTTTCCGACAAACACTTGCTTGCATCCTCGACATGTTCTTCAACACCAGCTTGGC
TCTCAACTTGAAGATCCTCCGTTTCCGACAAACACTTGCTTGCATCCTCGACATGTTCCT
CAACACCAGCTTGGATCTCGACTTGGAGATTGTCTGTTTCGGACATGCCCTCACCATCGA
GAAACCCTAATTCGTTTCCGACACCAGCATCATCACCCGGTTGATAAACATCCAACTGAT
CGAAACCCAAACCCACTGGATTCGGATACTCCGACCCGTAATCGACCCGAGAAGAATCAC
CAGAACCTAAGCTTTGATCGGCGGAGAAATGATCAGAGACAATCATACCGTCATCGGTTA
CAATTGATTCCATCTCCGATGTGATTGAATCGGCGTCGGAGCCGTGAACGAGCCCCCAAT
CAAGCATCTCCTCTCCTTCCATGGGTGATTGATTGATAATCGAAGAAAAGTTTAGATT

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 7

CO CL977Contig1 890 7 21 U
GGGACTTCATAAAGAAAGAAAAAAATATCACCA*AAAAAATGTCAGAAGAAAAA*GTGGT
CGTGTTGAACTTCTGGCCAAGCATGTTCGGAGCAAGAGTGATCATGGCGTTAGAGGAAAA
AGAGATCAAATTCGAGTACAAGGAAGAAGATGTATTTGGTGACAAGACCGATTTATTGCT
CCAATCCAACCCGGTTCACAAGAAAATTCCGGTACTCATCCACAACGGTAAACCGGTATG
CGAGTCCAATATCATACTCGAATATATCGACGAGGTCTGGAATAACGACAAGACTCTTCG
TCTACTACCTTCTGATCCTTTTGAGAAGGCAAAGTGTAGATTTTGGGCTGATTTAATTGA
TAAAAAGGTTTTTGACGCAGGAAGAAGAACATGGACGAAGAAAGGCAAAGAACAAGAAGA
AGCAAAACGAGAGTTTATAGAGACATTGAAAGTATTAGAAACAGAGCTTGGGGAAAAGGT
TTACTTCGGAGGAAACGAAACTGTTTCAGTGGTCGACTTGGTCCTCATCTCTTATTACCC
TTGGTTCCACACGTGGGAGACAATAGGTGAATTTAGCCTGGAGGACCATATTCCCAAGCT
AATGGATTGGGTCCGTAGATGTTTAGCCCGACCAGCTATCTCAAAATCTCTACCCGACCG
GCTTAAGATCCTTGGTCGAGTGTCTCAGATCATAAAGGTCCATGAGTTCTTCTATGGTTA
TTGATACATCAATATTTCTAGCTTTAAATTAAAATAATGATGTGAATCATAACGAATGAG
TGTGGTGGACCGATTTTTCATTCGTGGTGCTCGTATGAAAAATAATGTGTTTTTTGTTGC
TAAGTTTGAAAAGAAAAATGTTATGTTTGCTATTTTAATTGAAATAAGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 5 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 15 0 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2CX64TF U 166
AF RR2FY30TF U 1
AF RR2AG20TF U 1
AF RR2ET41TF U 1
AF RR2AG20JQ C 39
AF RR2ET41JQ C 135
AF RR2FY30JQ C 316
BS 1 30 RR2AG20TF
BS 31 32 RR2ET41TF
BS 33 33 RR2AG20TF
BS 34 34 RR2ET41TF
BS 35 283 RR2AG20TF
BS 284 284 RR2ET41TF
BS 285 335 RR2AG20TF
BS 336 336 RR2ET41TF
BS 337 488 RR2AG20TF
BS 489 489 RR2ET41TF
BS 490 552 RR2AG20TF
BS 553 553 RR2ET41TF
BS 554 590 RR2AG20TF
BS 591 591 RR2ET41TF
BS 592 726 RR2AG20TF
BS 727 727 RR2ET41TF
BS 728 775 RR2AG20TF
BS 776 776 RR2ET41TF
BS 777 819 RR2AG20TF
BS 820 870 RR2AG20JQ
BS 871 890 RR2ET41JQ

RD RR2CX64TF 165 0 0
GACCGATTTATTGCTCCAATCCAACCCGGTTCACAAGAAAATTCCGGTACTCATCCACAA
CGGTAAACCGGTATGCGAGTCCAATATCATACTCGAATATATCGACGAGGTCTGGAATAA
CGACAAGACTCTTC*TCTACTACCTTCTGATCCTTTTGAGAAGGC

QA 1 165 1 165
DS 

RD RR2FY30TF 772 0 0
GGGACTTCATAAAGAAAGAAAAAAATATCACCA**AAAAATGTCAGAAGAAAAA*GTGGT
CGTGTTGAACTTCTGGCCAAGCATGTTCGGAGCAAGAGTGATCATGGCGTTAGAGGAAAA
AGAGATCAAATTCGAGTACAAGGAAGAAGATGTATTTGGTGACAAGACCGATTTATTGCT
CCAATCCAACCCGGTTCACAAGAAAATTCCGGTACTCATCCACAACGGTAAACCGGTATG
CGAGTCCAATATCATACTCGAATATATCGACGAGGTCTGGAATAACGACAAGACTCTTCG
TCTACTACCTTCTGATCCTTTTGAGAAGGCAAAGTGTAGATTTTGGGCTGATTTAATTGA
TAAAAAGGTTTTTGACGCAGGAAGAAGAACATGGACGAAGAAAGGCAAAGAACAAGAAGA
AGCAAAACGAGAGTTTATAGAGACATTGAAAGTATTAGAAACAGAGCTTGGGGAAAAGGT
TTACTTCGGAGGAAACGAAACTGTTTCAGTGGTCGACTTGGTCCTCATCTCTTATTACCC
TTGGTTCCACACGTGGGAGACAATAGGTGAATTTAGCCTGGAGGACCATATTCCCAAGCT
AATGGATTGGGTCCGTAGATGTTTAGCCCGACCAGCTATCTCAAAATCTCTACCCGACCG
GCTTAAGATCCTTGGTCGAGTGTCTCAGATCATAAAGGTCCATGAGT*CTTCTATGGTTA
TTGATACATCAATATTTCTAGCTTTAAT***AAATAATGATGTGA*TCATAA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2AG20TF 819 0 0
GGGACTTCATAAAGAAAGAAAAAAATATCAGAACAAAAAATGTCAGAAGAAAAA*GTGGT
CGTGTTGAACTTCTGGCCAAGCATGTTCGGAGCAAGAGTGATCATGGCGTTAGAGGAAAA
AGAGATCAAATTCGAGTACAAGGAAGAAGATGTATTTGGTGACAAGACCGATTTATTGCT
CCAATCCAACCCGGTTCACAAGAAAATTCCGGTACTCATCCACAACGGTAAACCGGTATG
CGAGTCCAATATCATACTCGAATATATCGACGAGGTCTGGAATGACGACAAGACTCTTCG
TCTACTACCTTCTGATCCTTTTGAGAAGGCAAAGTATAGATTTTGGGCTGATTTAATTGA
TAAAAAGGTTTTTGACGCAGGAAGAAGAACATGGACGAAGAAAGGCAAAGAACAAGAAGA
AGCAAAACGAGAGTTTATAGAGACATTGAAAGTATTAGAAACAGAGCTTGGGGAAAAGGT
TTACTTCGTAGGAAACGAAACTGTTTCAGTGGTCGACTTGGTCCTCATCTCTTATTACCC
TTGGTTCCACACTTGGGAGACAATAGGTGAATTTAGCCTGGAGGACCATACTCCCAAGCT
AATGGATTGGGTCCGTAGATGTTTAGCCCGACCAGCTATCTCAAAATCTCTACCCGACCG
GCTTAAGATCCTTGGTCGAGTGTCTCAGATCATAAAGGTCCATGAGTTCTTCTATGGTTA
TTGATATATCAATATTTCTAGCTTTAAATTAAAATAATGATGTGAATCATAACGAGTGAG
TGTGGTGGACCGATTTTTCATTCGTGGTGCTCGTATGAA

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2ET41TF 782 0 0
GGGACTTCATAAAGAAAGAAAAAAATATCACCA*AAAAAATGTCAGAAGAAAAA*GTGGT
CGTGTTGAACTTCTGGCCAAGCATGTTCGGAGCAAGAGTGATCATGGCGTTAGAGGAAAA
AGAGATCAAATTCGAGTACAAGGAAGAAGATGTATTTGGTGACAAGACCGATTTATTGCT
CCAATCCAACCCGGTTCACAAGAAAATTCCGGCACTCATCCACAACGGTAAACCGGTATG
CGAGTCCAATATCATACTCGAATATATCGACGAGGTCTGGAATAACGACAAGACTCTTCG
TCTACTACCTTCTGATCCTTTTGAGAAGGCAAAGTGTAGATTTTGGGCTGATTTAATTGA
TAAAAAGGTTTTTGACGCAGGAAGAAGAACATGGACGAAGAAAGGCAAAGAACAAGAAGA
AGCAAAACGAGAGTTTATAGAGACATTGAAAGTATTAGAAGCAGAGCTTGGGGAAAAGGT
TTACTTCGGAGGAAACGAAACTGTTTCAGTGGTCGACTTGGTCCTCATCTCTTATTACCC
TTGGTTCCACACGTGGGAGACAATAGGTGAATTTAGCCTGGAGGACCATATTCCCAAGCT
AATGGATTGGGTCCGTAGATGTTTAGCCCGACCAGCTATCTCAAAATCTCTACCCGACCG
GCTTAAGATCCTTGGTCGAGTGTCTCAGATCATAAAGGTCCATGAGTTCTTCTATGGTTA
TTGATACATCAATATTTCTAGCTTTAAT***AAATAATGATGTGA*TCATAACGAATGAG
TG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2AG20JQ 832 0 0
AATGTCAGAAGAAAAAAGTGGTCGTGTTGAACTTCTGGCCAAGCATGTTCGGAGCAAGAG
TGATCATGGCGTTAGAGGAAAAAGAGATCAAATTCGAGTACAAGGAAGAAGATGTATTTG
GTGACAAGACCGATTTATTGCTCCAATCCAACCCGGTTCACAAGAAAATTCCGGTACTCA
TCCACAACGGTAAACCGGTATGCGAGTCCAATATCATACTCGAATATATCGACGAGGTCT
GGAATGACGACAAGACTCTTCGTCTACTACCTTCTGATCCTTTTGAGAAGGCAAAGTATA
GATTTTGGGCTGATTTAATTGATAAAAAGGTTTTTGACGCAGGAAGAAGAACATGGACGA
AGAAAGGCAAAGAACAAGAAGAAGCAAAACGAGAGTTTATAGAGACATTGAAAGTATTAG
AAACAGAGCTTGGGGAAAAGGTTTACTTCGTAGGAAACGAAACTGTTTCAGTGGTCGACT
TGGTCCTCATCTCTTATTACCCTTGGTTCCACACTTGGGAGACAATAGGTGAATTTAGCC
TGGAGGACCATACTCCCAAGCTAATGGATTGGGTCCGTAGATGTTTAGCCCGACCAGCTA
TCTCAAAATCTCTACCCGACCGGCTTAAGATCCTTGGTCGAGTGTCTCAGATCATAAAGG
TCCATGAGTTCTTCTATGGTTATTGATATATCAATATTTCTAGCTTTAAATTAAAATAAT
GATGTGAATCATAACGAGTGAGTGTGGTGGACCGATTTTTCATTCGTGGTGCTCGTATGA
AAAATAATGTGTTTTTTGTTGCTAAGTTTGAAAAGAAAAATGTTATGTTTGC

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR2ET41JQ 756 0 0
AGTACAAGGAAGAAGATGTATTTGGTGACAAGACCGATTTATTGCTCCAATCCAACCCGG
TTCACAAGAAAATTCCGGCACTCATCCACAACGGTAAACCGGTATGCGAGTCCAATATCA
TACTCGAATATATCGACGAGGTCTGGAATAACGACAAGACTCTTCGTCTACTACCTTCTG
ATCCTTTTGAGAAGGCAAAGTGTAGATTTTGGGCTGATTTAATTGATAAAAAGGTTTTTG
ACGCAGGAAGAAGAACATGGACGAAGAAAGGCAAAGAACAAGAAGAAGCAAAACGAGAGT
TTATAGAGACATTGAAAGTATTAGAAGCAGAGCTTGGGGAAAAGGTTTACTTCGGAGGAA
ACGAAACTGTTTCAGTGGTCGACTTGGTCCTCATCTCTTATTACCCTTGGTTCCACACGT
GGGAGACAATAGGTGAATTTAGCCTGGAGGACCATATTCCCAAGCTAATGGATTGGGTCC
GTAGATGTTTAGCCCGACCAGCTATCTCAAAATCTCTACCCGACCGGCTTAAGATCCTTG
GTCGAGTGTCTCAGATCATAAAGGTCCATGAGTTCTTCTATGGTTATTGATACATCAATA
TTTCTAGCTTTTAAATAAAATAATGATGTGAATCATAACGAATGAGTGTGGTGGACCGAC
TTT*CATTCGTGGTGGTCGTATGAAAAATAATGTGTTTTTTGTTGCTAAGTTTGAAAAGA
AAAATGTTATGTTTGCTATTTTAATTGAAATAAGTT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2FY30JQ 575 0 0
TCCTTTTGAGAAGGCAAAGTGTAGATTTTGGGCTGATTTAATTGATAAAAAGGTTTTTGA
CGCAGGAAGAAGAACATGGACGAAGAAAGGCAAAGAACAAGAAGAAGCAAAACGAGAGTT
TATAGAGACATTGAAAGTATTAGAAACAGAGCTTGGGGAAAAGGTTTACTTCGGAGGAAA
CGAAACTGTTTCAGTGGTCGACTTGGTCCTCATCTTTTATTACCCTTGGTTCCACACGTG
GGAGACAATAGGTGAATTTAGCCTGGAGGACCATATTCCCAAGCTAATGGATTGGGTCCG
TAGATGTTTAGCCCGACCAGCTATCTCAAAATCTCTACCCGACCGGCTTAAGATCCTTGG
TCGAGTGTCTCAGATCATAAAGGTCCATGAGTTTTTCTATGGTTATTGATACATCAATAT
TTCTAGCTTTTAAATAAAATAATGATGTGAATCATAACGAATGAGTGTGGTGGACCGACT
TT*CATTCGTGGTGGTCGTATGAAAAATAATGTGTTTTTTGTTGTTAAGTTTGAAAAGAA
AAATGTTATGTTTGCTATTTTAATTGAAATAAGTT

QA 1 575 1 575
DS 



AS 2 6

CO CL978Contig1 875 3 4 U
GGGAGCTGATGGTTTCATGGTGAAGATGAGAGACGGTAGGCAGTTACGGTGTGTTCATAA
CAATCCTCAAGGTGGGCACTTGCCTGATTATGCTCCACACCCTGCTATTGTCTTGAAAAT
GGAAGATGGGACCGGTCTCCTCCTTCCCATTATTGTCTTGGAGATGCCTAGTGTGTTGCT
TATGGCAGCAATGACCAATGTCCAGATTGCAAGACCAACGATGTATCAGGTGGTGAAGGA
GATGGTGGACAAGATGGGTTATGAAGTTAGACTTGTTAGAGTGACCAAAAGAGTTCACGA
GGCGTATTTTGCCCAACTCTACCTTTCAAAGGTGGGTGGTAATGCATCTGACTGTATCAG
CTTTGACCTTCGCCCTTCAGATGCAATTAATATAGCTGCTAGATGCAAGGTACCTATCCA
AGTGAACAAGTACCTTGCGTATAGTGATGGAATGAGAGTCATCGAGTCAGGGAAGCTGTC
ACAACAGACACCTGCTTCCGATGGTTTATTGTTTACTGAGCCAGACAAACCAAATGGTCA
GGCTTGTCTTGATACGAAAGAGTTCAATATTCTG**CAACATGATGCAAGCCGTTAATGA
AGAGCGATATGATGAAGCAGCTGAATGGAGAGACAAGCTTGGCCAGTTTAGGGCCAAGCG
TAACCTGAGGAAATACACATAAGAGAACTCGATCAACAAGTATTGGTCTGTGTACATAAT
AAGGAGGTGGTCATTGTCGGGATCAAAGTGGAGGAAGAAGCAGAGTCTTTGGATATTTAA
GAATGCTTCTACACTTAACCCATTGTCCCAGAAACCAAAAGAAAATGTAATGTATTAAAT
ATATATATGTAGCGTGATGTGTACATATTACTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F724TF U 1
AF RR2F724JQ C 185
AF RR2DK75TF U 246
BS 1 672 RR2F724TF
BS 673 673 RR2DK75TF
BS 674 721 RR2F724TF
BS 722 875 RR2DK75TF

RD RR2F724TF 721 0 0
GGGAGCTGATGGTTTCATGGTGAAGATGAGAGACGGTAGGCAGTTACGGTGTGTTCATAA
CAATCCTCAAGGTGGGCACTTGCCTGATTATGCTCCACACCCTGCTATTGTCTTGAAAAT
GGAAGATGGGACCGGTCTCCTCCTTCCCATTATTGTCTTGGAGATGCCTAGTGTGTTGCT
TATGGCAGCAATGACCAATGTCCAGATTGCAAGACCAACGATGTATCAGGTGGTGAAGGA
GATGGTGGACAAGATGGGTTATGAAGTTAGACTTGTTAGAGTGACCAAAAGAGTTCACGA
GGCGTATTTTGCCCAACTCTACCTTTCAAAGGTGGGTGGTAATGCATCTGACTGTATCAG
CTTTGACCTTCGCCCTTCAGATGCAATTAATATAGCTGCTAGATGCAAGGTACCTATCCA
AGTGAACAAGTACCTTGCGTATAGTGATGGAATGAGAGTCATCGAGTCAGGGAAGCTGTC
ACAACAGACACCTGCTTCCGATGGTTTATTGTTTACTGAGCCAGACAAACCAAATGGTCA
GGCTTGTCTTGATACGAAAGAGTTCAATATTCTG**CAACATGATGCAAGCCGTTAATGA
AGAGCGATATGATGAAGCAGCTGAATGGAGAGACAAGCTTGGCCAGTTTAGGGCCAAGCG
TAACCTGAGGAA*TACACATAAGAGAACTCGATCAACAAGTATTGGTCTGTGTACATAAT
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2F724JQ 633 0 0
GCAGCAATGACCAATGTCCAGATTGCAAGACCAACGATGTATCAGGTGGTGAAGGAGATG
GTGGACAAGATGGGTTATGAAGTTAGACTTGTTAGAGTGACCAAAAGAGTTCACGAGGCG
TATTTTGCCCAACTCTACCTTTCAAAGGTGGGTGGTAATGCATCTGACTGTATCAGCTTT
GACCTTCGCCCTTCAGATGCAATTAATATAGCTGCTAGATGCAAGGTACCTATCCAAGTG
AACAAGTACCTTGCGTATAGTGATGGAATGAGAGTCATCGAGTCAGGGAAGCTGTCACAA
CAGACACCTGCTTCCGATGGTTTATTGTTTACTGAGCCAGACAAACCAAATGGTCAGGCT
TGTCTTGATACGAAAGAGTTCAATATTCTG**CAACATGATGCAAGCCGTTAATGAAGAG
CGATATGATGAAGCAGCTGAATGGAGAGACAAGCTTGGCCAGTTTAGGGCCAAGCGTAAC
CTGAGGAAATACACATAAGAGAACTCGATCAACAAGTATTGGTCTGTGTACATAATAAGG
AGGTGGTCATTGTCGGGATCAAAGTGGAGGAAGAAGCAGAGTCTTTGGATATTTAAGAAT
GCTTCTACACTTAACCCATTGTCCCAGAAACC
G

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2DK75TF 630 0 0
G
GGACAAGATGGGTTATGAAGTTAGACTTGTTAGAGTGACCAAAAGAGTTCACGAGGCGTA
TTTTGCCCAACTCTACCTTTCAAAGGTGGGTGGTAATGCATCTGACTGTATCAGCTTTGA
CCTTCGCCCTTCAGATGCAATTAATATAGCTGTTAGATGCAAGGTACCTATCCAAGTGAA
CAAGTACCTTGCGTATAGTGATGGAATGAGAGTCATCGAGTCAGGGAAGCTGTCACAACA
GACACCTGCTTCCGATGGTTTATTGTTTACTGAGCCAGACAAACCAAATGGTCAGGCTTG
TCTTGATACGAAAGAGTTCAATATTCTGAGCAACATGATGCAAGCCGTTAATGAAGAGCG
ATATGATGAAGTAGCTGAATGGAGAGACAAGCTTGGCCAGTTTAGGGCCAAGCGTAACCT
GAGGAAATACACATAAGAGAACTCGATCAACAAGTATTGGTCTGTGTACATAATAAGGAG
GTGGTCATTGTCGGGATCAAAGTGGAGGAAGAAGCAGAGTCTTTGGATATTTAAGAATGC
TTCTACACTTAACCCATTGTCCCAGAAACCAAAAGAAAATGTAATGTATTAAATATATAT
ATGTAGCGTGATGTGTACATATTACTTGT

QA 2 630 2 630
DS 



CO CL978Contig2 1324 3 3 U
GGGACTCCCAAGCAAAGAATCTCTCTCTATCCATCCTTCTTCTTCCTCCGTTGATCATCC
TCTTCGTCTTGTTCGGATAATCTCATCCGATCCGTGCGAATCTCTCGCTCCGTGACTGTT
CCCGCCATCTGCGATCATCTGATCCACCGATCTCCCGTGCGAAAAATTGAAGATGAGGTC
GCTTCAAGCACCAGTAGTTTGCCCCGCGATTCGTCGTCCATGCGCTCTGAAGAAACAACC
TACGCTCCTTCTCAGGAGCCAATTCTTCGGTCACCGGATCATCAACAAGTCTCAGGTCAC
TCCTCCTCGTGGCTGCAGAAACAACAGCAAGAAGATCAGCATCATCGAGTGTGTTTTCAG
CTCTCACTCTGACGGTAACGGAAGCACCGCCGAGAATTTCAACGAGAACGACGAGGAATA
CGTCAAGTCTACCATACTGGAAGCTGTTGAGGTGAAGAGTGGAGCTGATGGTTTCATGGT
GAAGATGAGAGACGGTAGGCAGTTACGGTGTGTGCACAACAATCCTCAAGGAGGGCATTT
GCCTGATTATGCTCCACACCCTGCTATTGTCTTGAAAATGGAAGATGGAACCGGTCTCCT
CCTTCCCATTATTGTCTTGGAGATGCCTAGTGTGTTGCTTATGGCAGCAATGACCAATGT
CCAGATTGCAAGACCAACCATGTATCAAGTGGTGAAAGGAGATGGTGGACAAGATGGGTT
ACGAAGTTAGACTTGTTAGAGTCACCAAAAGAGTTCACGAGGCCTATTTTGCCCAACTAT
ACCTTTCAAAGGTGGGTAATGCATCTGACTGTATCAGCTTTGACCTTCGCCCTTCAGATG
CAATTAATATAGCTGTTAGATGCAAGGTACCAATCCAAGTGAACAAGTACCTTGCGTATA
GTGATGGAATGAGAGTCATCGAGTCAGGGAAACTGTCACAGCAGACACCTGCTTCCGATG
GTTTATTGTTTACTGAGCAAGACAAACCGAATGGTCAGGCTTGCCTTGATACTAAAGAGT
TCAATATTTTGAGCAACATGATGCGAGCCGTTAACGAAGAGCGACATGATGAAGCCGCTG
AATGGAGAGACAAGCTTGGCCAGTTTAGGGCCAAGCGTAACCTGAGGAAATACACATAAG
AGGTACGAAGCATAAAAACAAGTATTGGTCTGTGTACATAATAAGAAGGTGTGGTCATTG
TCGGGATCAAAGTGGAGGAAGAAGCAGAGTCTTTGGATATTTAAGAATGCTTTTACACTT
AACCCATTGTCCCAGAAACCAAAAGAAAATGTAACATATTAAATATATATGTAGCGTGAT
GTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2H695TF U 1
AF RR2GG81TF U 282
AF RR2GG81JQB C 807
BS 1 742 RR2H695TF
BS 743 861 RR2GG81TF
BS 862 1324 RR2GG81JQB

RD RR2H695TF 742 0 0
GGGACTCCCAAGCAAAGAATCTCTCTCTATCCATCCTTCTTCTTCCTCCGTTGATCATCC
TCTTCGTCTTGTTCGGATAATCTCATCCGATCCGTGCGAATCTCTCGCTCCGTGACTGTT
CCCGCCATCTGCGATCATCTGATCCACCGATCTCCCGTGCGAAAAATTGAAGATGAGGTC
GCTTCAAGCACCAGTAGTTTGCCCCGCGATTCGTCGTCCATGCGCTCTGAAGAAACAACC
TACGCTCCTTCTCAGGAGCCAATTCTTCGGTCACCGGATCATCAACAAGTCTCAGGTCAC
TCCTCCTCGTGGCTGCAGAAACAACAGCAAGAAGATCAGCATCATCGAGTGTGTTTTCAG
CTCTCACTCTGACGGTAACGGAAGCACCGCCGAGAATTTCAACGAGAACGACGAGGAATA
CGTCAAGTCTACCATACTGGAAGCTGTTGAGGTGAAGAGTGGAGCTGATGGTTTCATGGT
GAAGATGAGAGACGGTAGGCAGTTACGGTGTGTGCACAACAATCCTCAAGGAGGGCATTT
GCCTGATTATGCTCCACACCCTGCTATTGTCTTGAAAATGGAAGATGGAACCGGTCTCCT
CCTTCCCATTATTGTCTTGGAGATGCCTAGTGTGTTGCTTATGGCAGCAATGACCAATGT
CCAGATTGCAAGACCAACCATGTATCAAGTGGTGAAAGGAGATGGTGGACAAGATGGGTT
ACGAAGTTAGACTTGTTAGAGT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2GG81TF 580 0 0
G
CAACAAGTCTCAGGTCACTCTTCCTCGTGGTTGCAGAAACAACAGCAAGAAGATCAGCAT
CATCGAGTGTGTTTTCAGCTCTCACTCTGACGGTAACGGAAGCACCGCCGAGAATTTCAA
CGAGAACGACGAGGAATACGTCAAGTCTACCATACTGGAAGCTGTTGAGGTGAAGAGTGG
AGCTGATGGTTTCATGGTGAAGATGAGAGACGGTAGGCAGTTACGGTGTGTGCACAACAA
TCCTCAAGGAGGGCATTTGCCTGATTATGCTCCACACCCTGCTATTGTCTTGAAAATGGA
AGATGGAACCGGTCTCCTCCTTCCCATTATTGTCTTGGAGATGCCTAGTGTGTTGCTTAT
GGCAGCAATGACCAATGTCCAGATTGCAAGACCAACCATGTATCAAGTGGTGAA*GGAGA
TGGTGGACAAGATGGGTTACGAAGTTAGGCTTGTTAGAGTCACCAAAAGAGTTCACGAGG
CCTATTTTGCCCAACTATACCTTTCAAAGGTGGGTAATGCATCTGACTGTATCAGCTTTG
ACCTTCGCCCTTCAGATGCAATTAATATAGCTGTTAGAT

QA 2 580 2 580
DS 

RD RR2GG81JQB 518 0 0
GACTGTATCAGCTTTGACCTTCGCCCTTCAGATGCAATTAATATAGCTGTTAGATGCAAG
GTACCAATCCAAGTGAACAAGTACCTTGCGTATAGTGATGGAATGAGAGTCATCGAGTCA
GGGAAACTGTCACAGCAGACACCTGCTTCCGATGGTTTATTGTTTACTGAGCAAGACAAA
CCGAATGGTCAGGCTTGCCTTGATACTAAAGAGTTCAATATTTTGAGCAACATGATGCGA
GCCGTTAACGAAGAGCGACATGATGAAGCCGCTGAATGGAGAGACAAGCTTGGCCAGTTT
AGGGCCAAGCGTAACCTGAGGAAATACACATAAGAGGTACGAAGCATAAAAACAAGTATT
GGTCTGTGTACATAATAAGAAGGTGTGGTCATTGTCGGGATCAAAGTGGAGGAAGAAGCA
GAGTCTTTGGATATTTAAGAATGCTTTTACACTTAACCCATTGTCCCAGAAACCAAAAGA
AAATGTAACATATTAAATATATATGTAGCGTGATGTGT

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 5

CO CL979Contig1 1228 5 25 U
AGGGTTTCAACATATATGTTGGTGGAGGTATGGGAAGAACACACAGAATGGAGTCTACCT
TTGCACGCATTGCAGAACCATTAGGCTACGTACCCAAGGAGGATATCTTGTACGCTGTGA
AGGCCATTGTTGTCACACAACGTGAACACGGGAGAAGAGATGACCGCAAATACAGTAGAA
TGAAGTATCTGCTCAGCTCCTGGGGGATTGAGAAGTTCAGAGATGTGGTTGAGCAATACT
ATGGCAAAAAGTTCGAGGCTCCCCGTGATTTGCCAGAGTGGGAGTTCAAAAGCTATTTGG
GATGGCATGAGCAGGGAGATGGTGCTTGGTTTTGTGGGCTTCATGTAGACAGTGGACGTG
TTGGTGGTAACATGAAGAAGACACTGAGAGAAGTCATTGAGAAGTACAAACTCGATGTGC
GTATCACACCTAATCAGAACATTGTGTTATGTGATATCAAGAGTGAGTGGAAGCAATCCA
TCACCACTGTGCTTGCTCAGGCTGGCCTATTGCAACCAGAGTTTGTAGACCCTCTCAACC
AAACCGCAATGGCTTGTCCGGCTTTTCCTTTGTGCCCTCTGGCTATAACTGAGGCAGAGC
GTGGGATTCCAAGCATTCTAAAGCGAGTGAGAGCAATGTTTGAGAAGGTTGGTCTTGAGT
ACGAAGAATCAGTTGTGGTGAGAGTAACTGGTTGCCCTAATGGATGTGCTAGACCATACA
TGGCTGAAGTTGGTCTAGTCGGAGATGGTCCAAACAGCTATCAGGTTTGGTTAGGAGGAA
CACCGAACCAGACACAGATAGCGAGGGCTTTCATGGACAAGGTGAAGATTCAAGACTTAG
AGAAGGTCTTTGAGCCATTGTTCTACAACTGGAAACTTGGGAGACAAGCAAAGGAATCAT
TTGGAGAATTCACAACCCGTATGGGATTTGAGAAACTCAAGGAGTTGATAAGTACATACG
AAGCATCTCCACAGTAAAAACAAGAAGGAACTTTTGTCTTTTGGAATTACACAAACAAAA
CAAGAAGGATGTATTCTCTTGTCGTGGTGTTACTCTTCGGTAACATCTGACGAATAAAGA
TTATGTACTTGTCCGTACTTTCTGTACTTTTTGTACTTGAGTTGAGAGACCACCAATAAG
CTTATAAGCATTTGGGGTATGTTTGATTGTTGTATGGACAAAATAATTATTTCCTTTTTG
GGAATGGTAATGTATTTGCTATTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN32TF U 1
AF RR2D550TF U 11
AF RR2HA12TF U 274
AF RR2D793TF U 498
AF RR2HA12JQ C 654
BS 1 112 RR2FN32TF
BS 113 113 RR2D550TF
BS 114 635 RR2FN32TF
BS 636 647 RR2D550TF
BS 648 648 RR2HA12TF
BS 649 661 RR2D550TF
BS 662 662 RR2HA12TF
BS 663 714 RR2D550TF
BS 715 715 RR2HA12TF
BS 716 727 RR2D550TF
BS 728 728 RR2HA12TF
BS 729 741 RR2D550TF
BS 742 742 RR2HA12TF
BS 743 750 RR2D550TF
BS 751 751 RR2HA12TF
BS 752 758 RR2D550TF
BS 759 759 RR2HA12TF
BS 760 764 RR2D550TF
BS 765 765 RR2HA12TF
BS 766 774 RR2D550TF
BS 775 1005 RR2HA12TF
BS 1006 1006 RR2D793TF
BS 1007 1016 RR2HA12TF
BS 1017 1182 RR2D793TF
BS 1183 1228 RR2HA12JQ

RD RR2FN32TF 642 0 0
AGGGTTTCAACATATATGTTGGTGGAGGTATGGGAAGAACACACAGAATGGAGTCTACCT
TTGCACGCATTGCAGAACCATTAGGCTACGTACCCAAGGAGGATATCTTGTATGCTGTGA
AGGCCATTGTTGTCACACAACGTGAACACGGGAGAAGAGATGACCGCAAATACAGTAGAA
TGAAGTATCTGCTCAGCTCCTGGGGGATTGAGAAGTTCAGAGATGTGGTTGAGCAATACT
ATGGCAAAAAGTTCGAGGCTCCCCGTGATTTGCCAGAGTGGGAGTTCAAAAGCTATTTGG
GATGGCATGAGCAGGGAGATGGTGCTTGGTTTTGTGGGCTTCATGTAGACAGTGGACGTG
TTGGTGGTAACATGAAGAAGACACTGAGAGAAGTCATTGAGAAGTACAAACTCGATGTGC
GTATCACACCTAATCAGAACATTGTGTTATGTGATATCAAGAGTGAGTGGAAGCAATCCA
TCACCACTGTGCTTGCTCAGGCTGGCCTATTGCAACCAGAGTTTGTAGACCCTCTCAACC
AAACCGCAATGGCTTGTCCGGCTTTTCCTTTGTGCCCTCTGGCTATAACTGAGGCAGAGC
GTGGGATTCCAAGCATTCTAAAGCGAGTGAGAGCA
TGTTTGA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2D550TF 766 0 0
G
ATATATGTTGGTGGAGGTATGGGAAGAACACACAGAATGGAGTCTACCTTTGCCCGCATT
GCAGAACCATTAGGTTACGTACCCAAGGAGGATATCTTGTACGCTGTGAAGGCCATTGTT
GTCACACAACGTGAACACGGGAGAAGAGATGACCGCAAGTACAGTAGAATGAAGTATCTG
CTCAGCTCCTGGGGGATTGAGAAGTTCAGAGATGTGGTTGAGCAATACTATGGCAAAAAG
TTCGAGGCTTCTCGTGATTTGCCAGAGTGGGAGTTCAAAAGCTATTTGGGATGGCATGAG
CAGGGAGATGGTGCTTGGTTTTGTGGGCTTCATGTAGACAGTGGACGTGTTGGTGGTAAC
ATGAAGAAGACACTGAGAGAAGTCATTGAGAAGTACAAACTTGATGTTCGTATCACACCA
AATCAGAACATTGTGTTATGTGATATCAAGAGTGAGTGGAAGCAATCCATCACCACGGTG
CTTGCTCAGGCTGGCCTATTGCAACCAGAGTTTGTAGACCCTCTCAACCAAACTGCAATG
GCTTGTCCGGCTTTTCCTTTGTGTCCTCTGGCTATAACTGAGGCAGAGCGTGGGATTCCA
AGCATTCTAAAGCGAGTGAGAGCAATGTTTGAGAAG*TTGGTCTTGAGTATGAAGAATCA
GTTGTGGTGAGAGTAACTGGTTGCCCTAATGGATGTGCTAGAC*ATACATGGCTGA*GTT
GGTCTAGTCG*AGATGGTC*AAACAGCAATCAG*TTTGGTTAG
AG

QA 2 764 2 764
DS 

RD RR2HA12TF 743 0 0
G
AGAGTGGGAGTTCAAAAGCTATTTGGGATGGCATGAGCAGGGAGATGGTGCTTGGTTTTG
TGGGCTTCATGTAGACAGTTGACGTGTTGGTGGTAACATGAAGAAGACACTGAGAGAAGT
CATTGAGAAGTACAAACTCGATGTGCGTATCACACCTAATCAGAACATTGTGTTATGTGA
TATCAAGAGTGAGTGGAAGCAATCCATCACCACTGTGCTTGCTCAGGCTGGCCTATTGCA
ACCAGAGTTTGTAGACCCTCTCAACCAAACCGCAATGGCTTGTCCGGCTTTTCCTTTGTG
CCCTCTGGCTATAACTGAGGCAGAGCGTGGGATTCCAAGCATTCTAAAGCGAGTGAGAGC
AATGTTTGAGAAGGTTGGTCTTGAGTACGAAGAATCAGTTGTGGTGAGAGTAACTGGTTG
CCCTAATGGATGTGCTAGACCATACATGGCTGAAGTTGGTCTAGTCGGAGATGGTCCAAA
CAGCTATCAGGTTTGGTTAGGAGGAACACCGAACCAGACACAGATAGCGAGGGCTTTCAT
GGACAAGGTGAAGATTCAAGACTTAGAGAAGGTCTTTGAGCCATTGTTCTACAACTGGAA
ACTTGGGAGACAAGCAAAGGAATCATTTGGAGAATTCACAACCCGTATGGGATTTGAGAA
ACTCAAGGAGTTGATAAGTACATACGAAGCATCTCCACAGTAAAAACAAGAAGGAACTTT
TGTCTTTTGGA*TTACACAAAC

QA 2 743 2 743
DS 

RD RR2D793TF 688 0 0
G
AGGCTGGCCTATTGCAACCAGAGTTTGTAGACCCTCTCAACCAAACCGCAATGGCTTGTC
CGGCTTTTCCTTTGTGCCCTCTGGCTATAACTGAGGCAGAGCGTGGGATTCCAAGCATTC
TAAAGCGAGTGAGAGCAATGTTTGAGAAGGTTGGTCTTGAGTACGAAGAATCAGTTGTGG
TGAGAGTAACTGGTTGCCCTAATGGATGTGCTAGACCATACATGGCTGAAGTTGGTCTAG
TCGGAGATGGTCCAAACAGCTATCAGGTTTGGTTAGGAGGAACACCGAACCAGACACAGA
TAGCGAGGGCTTTCATGGACAAGGTGAGGATTCAAGACTTAGAGAAGGTCTTTGAGCCAT
TGTTCTACAACTGGAAACTTGGGAGACAA***AAGGAATCATTTGGAGAATTCACAACCC
GTATGGGATTTGAGAAACTCAAGGAGTTGATAAGTACATACGAAGCATCTCCACAGTAAA
AACAAGAAGGAACTTTTGTCTTTTGGAATTACACAAACAAAACAAGAAGGATGTATTCTC
TTGTCGTGGTGTTACTCTTCGGTAACATCTGACGAATAAAGATTATGTACTTGTCCGTAC
TTTCTGTACTTTTTGTACTTGAGTTGAGAGACCACCAATAAGCTTATAAGCATTTGGGGT
ATGTTTGATTGTTGTATGGACAAA
TAA

QA 2 685 2 685
DS 

RD RR2HA12JQ 575 0 0
CTTGAGTACGAAGAATCAGTTGTGGTGAGAGTAACTGGTTGCCCTAATGGATGTGCTAGA
CCATACATGGCTGAAGTTGGTCTAGTCGGAGATGGTCCAAACAGCTATCAGGTTTGGTTA
GGAGGAACACCGAACCAGACACAGATAGCGAGGGCTTTCATGGACAAGGTGAAGATTCAA
GACTTAGAGAAGGTCTTTGAGCCATTGTTCTACAACTGGAAACTTGGGAGACAAGCAAAG
GAATCATTTGGAGAATTCACAACCCGTATGGGATTTGAGAAACTCAAGGAGTTGATAAGT
ACATACGAAGCATCTCCACAGTAAAAACAAGAAGGAACTTTTGTCTTTTGGAATTACACA
AACAAAACAAGAAGGATGTATTCTCTTGTCGTGGTGTTACTCTTCGGTAACATCTGACGA
ATAAAGATTATGTACTTGTCCGTACTTTCTGTACTTTTTGTACTTGAGTTGAGAGACCAC
CAATAAGCTTATAAGTATTTGGGGTATGTTTGATTGTTGTATGGACAAAATAATTATTTC
CTTTTTGGGAATGGTAATGTATTTGCTATTTGCCC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 2 7

CO CL980Contig1 892 5 14 U
GAAAAACTCGTGGTCTACATACACGCATATTCTGTCTTTTTGTAATGGCTTCTTCCTCTT
ACGCACCATTCTCTGCAGTCTTCAGCGGTTTCGCTGCAACCAAACCTAACCCACCTCCAA
CTTGTTCTGCTTTTCTCGTCCCTAAGCGAAGATCAAATTCTCGAAATCTGAAAAATGGTG
TTTCCTTGAAATCTTGGAATAACCATGGGTTTGAATTCAAATCAAGAAATTTGAGTGTGT
GTGCAAGAGCTACTGAAGAGAAGACTGTTCATGATTTCACTGTAAAGGACATAAGTGGGA
AGGATGTTTCCCTAGACATATTCAAAGGAAAGCCTCTGTTGATCGTTAACGTTGCTTCAA
AATGTGGTTTGACATCATCAAACTACACAGAGCTTTCACAGTTGTACGATAAATACAGGA
ACCAAGGATTTGAGATTTTGGCTTTCCCTTGCAATCAATTTGGAGGTCAAGAACCGGAAT
CAAACCCGGATATCAAGCGATTCGTGTGTACCAGATTCAAAGCTGAGTTCCCTATATTCG
ATAAGGTTGATGTGAATGGACCGAGCACAGCTCCAATCTACCAGTTCTTGAAATCAAAGT
CTGGTGGGTTCTTGGGTGATCTCATCAAGTGGAACTTTGAGAAATTCTTGGTTGACAAAA
AGGGCAACGTCGTCCAGAGATACCCTCCCACGACTTCGCCTTTACAAATTGAGAAAGACA
TCCAGAAGTTGCTTGTGGCTTAAATATT***CTACTACTGTTCATAATGTGTGTGTATAA
GAGAAATTCGTAGTGTCTCAATAACCTGTTTATTGTTGGTATACCAGAAATTCAGATAGA
CATGTATCCCTTATGTTACAGAAATGACATTATACAATCGGAAATTCAAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 5 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E211TF U 1
AF RR2EZ43TF U 37
AF RR2DN11TF U 42
AF RR2EZ43JQ C 344
AF RR2E211JQ C 355
BS 1 341 RR2E211TF
BS 342 342 RR2EZ43TF
BS 343 542 RR2E211TF
BS 543 544 RR2EZ43TF
BS 545 655 RR2E211TF
BS 656 748 RR2DN11TF
BS 749 751 RR2EZ43JQ
BS 752 759 RR2DN11TF
BS 760 760 RR2EZ43JQ
BS 761 784 RR2DN11TF
BS 785 785 RR2EZ43JQ
BS 786 808 RR2DN11TF
BS 809 875 RR2EZ43JQ
BS 876 892 RR2E211JQ

RD RR2E211TF 655 0 0
GAAAAACTCGTGGTCTACATACACGCATATTCTGTCTTTTTGTAATGGCTTCTTCCTCTT
ACGCACCATTCTCTGCAGTCTTCAGCGGTTTCGCTGCAACCAAACCTAACCCACCTCCAA
CTTGTTCTGCTTTTCTCGTCCCTAAGCGAAGATCAAATTCTCGAAATCTGAAAAATGGTG
TTTCCTTGAAATCTTGGAATAACCATGGGTTTGAATTCAAATCAAGAAATTTGAGTGTGT
GTGCAAGAGCTACTGAAGAGAAGACTGTTCATGATTTCACTGTAAAGGACATAAGTGGGA
AGGATGTTTCCCTAGACATATTCAAAGGAAAGCCTCTGTTGGTCGTTAACGTTGCTTCAA
AATGTGGTTTGACATCATCAAACTACACAGAGCTTTCACAGTTGTACGATAAATACAGGA
ACCAAGGATTTGAGATTTTGGCTTTCCCTTGCAATCAATTTGGAGGTCAAGAACCGGAAT
CAAACCCGGATATCAAGCGATTCGTGTGTACCAGATTCAAAGCTGAGTTCCCTATATTCG
AT**GGTTGATGTGAATGGACCGAGCACAGCTCCAATCTACCAGTTCTTGAAATCAAAGT
CTGGTGGGTTCTTGGGTGATCTCATCAAGTGGAACTTTGAGAAATTCTTGGTTGA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2EZ43TF 619 0 0
TTTTTGT
AATGGCTTCTTCCTCTTACGCACCATTCTCTGCAGTCTTCAGCGGTTTCGCTGCAACCAA
ACCTAACCCACCTCCAACTTGTTCTGCTTTTCTCGTCCCTAAGCGAAGATCAAATTCTCG
AAATCTGAAAAATGGTGTTTCCTTGAAATCTTGGAATAACCATGGGTTTGAATTCAAATC
AAGAAATTTGAGTGTGTGTGCAAGAGCTACTGAAGAGAAGACTGTTCATGATTTCACTGT
AAAGGACATAAGTGGGAAGGATGTTTCCCTAGACATATTCAAAGGAAAGCCTCTGTTGAT
CGTTAACGTTGCTTCAAAATGTGGTTTGACATCATCAAACTACACAGAGCTTTCACAGTT
GTACGATAAATACAGGAACCAAGGATTTGAGATTTTGGCTTTCCCTTGCAATCAATTTGG
AGGTCAAGAACCGGAATCAAACCCGGATATCAAGCGATTCGTGTGTACCAGATTCAAAGC
TGAGTTCCCTATATTCGATAAAGTTGATGTGAATGGACCGAGCACAGCTCCAATCTACCA
GTTCTTGAAATCAAAGTCTGGTGGGTTCTTGGGTGATCTCATCAAGTGGAACTTTGAGAA
ATTCTTGGTTGA

QA 8 619 8 619
DS 

RD RR2DN11TF 767 0 0
GGAAT
GGCTTCTTCCTCTTACGCACCATTCTCTGCAGTCTTCAGCGGTTTCGCTGCAACCAAACC
TAACCCACCTCCAACTTGTTCTGCTTTTCTCGTCCCTAAGCGAAGATCAAATTCTCGAAA
TCTGAAAGATGGTGTTTCCTTGAAATCTTGGAATAACCATGGGTTTCAATTCAAATCAAG
AAATTTGAGTGTGTGTGCAAGATCTACTGAAGAGAAGACTGTTCATGATTTCACTGTAAA
GGACATAAGTGGGAAGGATGTTTCCCTAGACATATTCAAAGGAAAACCTCTGTTGATCGT
TAACGTTGCTTCAAAATGTGGTTTGACATCATCAAACTACACAGAGCTTTCACAGTTGTA
CGATAAATACAGGAACCAAGGATTTGAGATTTTAGCTTTCCCTTGCAATCAATTTGGAGG
TCAAGAACCGGAATCAAACCCGGATATCAAGCGATTCGTGTGTACCAGATTCAAAGCTGA
GTTCCCTATATTCGACAAGGTTGATGTGAATGGACCGAGCACTGCTCCAATCTACCAGTT
CTTGAAATCAAAGTCTGGTGGATTCTTGGGTGATCTCATCAAGTGGAACTTTGAGAAATT
CTTGGTTGACAAAAAGGGCAACGTCGTCCAGAGATACCCTCCCACGACTTCGCCTTTACA
AATTGAGAAAGACATCCAGAAGTTGCTTGTGGCTTAAATATTAATCTACTACTATTCATA
ATGTGTGTGTATAAGAGAGATTCGTAGTGTCTCAATAACCTG

QA 6 767 6 767
DS 

RD RR2EZ43JQ 549 0 0
CGTTAACGTTGCTTCAAAATGTGGTTTGACATCATCAAACTACACAGAGCTTTCACAGTT
GTACGATAAATACAGGAACCAAGGATTTGAGATTTTGGCTTTCCCTTGCAATCAATTTGG
AGGTCAAGAACCGGAATCAAACCCGGATATCAAGCGATTCGTGTGTACCAGATTCAAAGC
TGAGTTCCCTATATTCGATAAGGTTGATGTGAATGGACCGAGCACAGCTCCAATCTACCA
GTTCTTGAAATCAAAGTCTGGTGGGTTCTTGGGTGATCTCATCAAGTGGAACTTTGAGAA
ATTCTTGGTTGACAAAAAGGGCAACGTCGTCCAGAGATACCCTCCCACGACTTCGCCTTT
ACAAATTGAGAAAGACATCCAGAAGTTGCTTGTGGCTTAAATATT***CTACTACTGTTC
ATAATGTGTGTGTATAAGAGAAATTCGTAGTGTCTCAATAACCTGTTTATTGTTGGTATA
CCAGAAATTCAGATAGACATGTATCCCTTATGTTACAGAAATGACATTATAC
AATCGGAAATTCAGACG

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2E211JQ 538 0 0
CTTCAAAATGTGGTTTGACATCATCAAACTACACAGAGCTTTCACAGTTGTACGATAAAT
ACAGGAACCAAGGATTTGAGATTTTGGCTTTCCCTTGCAATCAATTTGGAGGTCAAGAAC
CGGAATCAAACCCGGATATCAAGCGATTCGTGTGTACCAGATTCAAAGCTGAGTTCCCTA
TATTCGAT**GGTTGATGTGAATGGACCGAGCACAGCTCCAATCTACCAGTTCTTGAAAT
CAAAGTCTGGTGGGTTCTTGGGTGATCTCATCAAGTGGAACTTTGAGAAATTCTTGGTTG
ACAAAAAGGGCAACGTCGTCCAGAGATACCCTCCCTCGACTTCGCCTTTACAAATTGAGA
AAGACATCCAGAAGTTGCTTGTGGCTTAAATATT***CTACTACTGTTCATAATGTGTGT
GTATAAGAGAAATTCGTAGTGTCTCAATAACCTGTTTATTGTTGGTATACCAGAAATTCA
GATAGACATGTATCCCTTATGTTACAGAAATGACATTATACAATCGGAAATTCAAACG

QA 1 538 1 538
DS 



CO CL980Contig2 976 2 2 U
GGCTTCTTCCTCTTACGCACCATTCTCTGCAGTCTTCAGCGGTTTCGCTGCAACCAAACC
TAACCCACCTCCAACTTGTTCTGCTTTTCTCATCCCTAAGCGAAGATCAAATTCTCGAAA
TCTGAAAAATGGTGTTTCCTTGAAATCTTGGAATAACCATGGGTTTCAATTCAAATCAAG
AAATTTGAGTGTGTGTGCAAGAGCTACTGAAGAGAAGACTGTTCATGATTTCACTGTAAA
GGACATAAGTGGGAAGGATGTTTCCCTAGACATATTCAAAGGAAAACCTCTGTTGATCGT
TAACGTTGCTTCAAAATGGTGGTCAAATTATTTTCTGATAATTATGATTTTCCTGTAAAT
GTATGCTGAATTTAATATTTTAATTTCAGTGGTTTGACATCATCAAACTACACAGAGCTT
TCACAGTTGTACGATAAATACAGGAACCAAGGATTTGAGATTTTAGCTTTCCCTTGCAAT
CAATTTGGAGGTCAAGAACCGGAATCAAACCCGGATATCAAGCGATTCGTGTGTACCAGA
TTCAAAGCTGAGTTCCCTATATTCGACAAGGTTGATGTGAATGGACCGAGCACTGCTCCA
ATCTACCAGTTCTTGAAATCAAAGTCTGGTGGATTCTTGGGTGATCTCATCAAGTGGAAC
TTTGAGAAATTCTTGGTTGACAAAAAGGGCAACGTCGTCCAGAGATACCCTCCCACGACT
TCGCCTTTACAAATTGAAAAGACATCCAGAAGTTGCTTGTGGCTTAAATATTAATCTACT
ACTATTCATAATGTGTGTGTATAAGAGAGATTCGTAGTGTCTCAATAACCTGTTTACTGT
TGGTATACCAAAAATTAAGATAGACATGTATTATGTTACAGAAATGACATTATACGATTG
GAAAATCAAATGAACAATTTATGTAAACTTCGGAGACATCTGATTATGCTATTTACACAC
ATACACACATGATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB37TF U 1
AF RR2EB37JQ C 339
BS 1 683 RR2EB37TF
BS 684 976 RR2EB37JQ

RD RR2EB37TF 683 0 0
GGCTTCTTCCTCTTACGCACCATTCTCTGCAGTCTTCAGCGGTTTCGCTGCAACCAAACC
TAACCCACCTCCAACTTGTTCTGCTTTTCTCATCCCTAAGCGAAGATCAAATTCTCGAAA
TCTGAAAAATGGTGTTTCCTTGAAATCTTGGAATAACCATGGGTTTCAATTCAAATCAAG
AAATTTGAGTGTGTGTGCAAGAGCTACTGAAGAGAAGACTGTTCATGATTTCACTGTAAA
GGACATAAGTGGGAAGGATGTTTCCCTAGACATATTCAAAGGAAAACCTCTGTTGATCGT
TAACGTTGCTTCAAAATGGTGGTCAAATTATTTTCTGATAATTATGATTTTCCTGTAAAT
GTATGCTGAATTTAATATTTTAATTTCAGTGGTTTGACATCATCAAACTACACAGAGCTT
TCACAGTTGTACGATAAATACAGGAACCAAGGATTTGAGATTTTAGCTTTCCCTTGCAAT
CAATTTGGAGGTCAAGAACCGGAATCAAACCCGGATATCAAGCGATTCGTGTGTACCAGA
TTCAAAGCTGAGTTCCCTATATTCGACAAGGTTGATGTGAATGGACCGAGCACTGCTCCA
ATCTACCAGTTCTTGAAATCAAAGTCTGGTGGATTCTTGGGTGATCTCATCAAGTGGAAC
TTTGAGAAATTCTTGGTTGACAA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2EB37JQ 638 0 0
TAATTATGATTTTCCTGTAAATGTATGCTGAATTTAATATTTTAATTTCAGTGGTTTGAC
ATCATCAAACTACACAGAGCTTTCACAGTTGTACGATAAATACAGGAACCAAGGATTTGA
GATTTTAGCTTTCCCTTGCAATCAATTTGGAGGTCAAGAACCGGAATCAAACCCGGATAT
CAAGCGATTCGTGTGTACCAGATTCAAAGCTGAGTTCCCTATATTCGACAAGGTTGATGT
GAATGGACCGAGCACTGCTCCAATCTACCAGTTCTTGAAATCAAAGTCTGGTGGATTCTT
GGGTGATCTCATCAAGTGGAACTTTGAGAAATTCTTGGTTGACAAAAAGGGCAACGTCGT
CCAGAGATACCCTCCCACGACTTCGCCTTTACAAATTGAAAAGACATCCAGAAGTTGCTT
GTGGCTTAAATATTAATCTACTACTATTCATAATGTGTGTGTATAAGAGAGATTCGTAGT
GTCTCAATAACCTGTTTACTGTTGGTATACCAAAAATTAAGATAGACATGTATTATGTTA
CAGAAATGACATTATACGATTGGAAAATCAAATGAACAATTTATGTAAACTTCGGAGACA
TCTGATTATGCTATTTACACACATACACACATGATCAC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 2 6

CO CL981Contig1 769 4 7 U
GGACACATCCACACACACAAAAAAGAAATGACTCTCACCGTGAGCAGCGGTGGCAGAGTC
GCTAGGATCCACTCCATAGACCTCACCGATGCTTCTCGCACTCCCTTCTCCACCTTCAAA
CTCATAAACTTCCCTCACCCGTCAAGAACCCGTCTCCACGTGGTCTCCGCCGCCAAAAAC
AACTCCTCCCAAACCGGTCGGTTCGACAGCAAGAAGCGTCGAACCCTCGTCCCGACAACA
ACCAAGGAATAGACGGAAGAAAGCAGCAACATCGACAACACACCACCGTCTCAGAACGAA
ATCGCCGACGACGGAGATGAAGATAGGTTTGCGGTGAACACTCGCTTCAGAGGTGATCCG
AAAGACGCGCCCAAGTTCTTGCTTAAGGATCTTCCTGGGCTTGAATCTGATCCATTCGAA
GGTCCTCAGTGGGATGGTTTAGGTTTCTTCGTTCAGTACTTGTGAGCTTTCGGAATCGTT
TTCGCGTTAATCTCCGGCGCAATTGCGGCGGGGACGTATAACGAAGGTGCTACGG*ATTT
CAAGGAGACGCCGGTTTATAAGGAGGCGATGGAGTCTCGTGACCTTCTGGATGAAGCAGA
GGGTTCGAACTCGGAAGATGTTTTTGAGTCTAATCCGACAGAAGTCGCGCCTAGTTTGGA
GTAGTTTCAGTTCACTGTATTGTAAAAGCCATATTCGAAGTTGATCATGAGCTTCTTGTG
TTCATAATTTTACAGAATCAAAGCAATTATTACACAAGAGGTTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AN28JQ C 169
AF RR2A841TF U 1
AF RR2AN28TF U 9
AF RR2A841JQ C 264
BS 1 192 RR2A841TF
BS 193 193 RR2AN28TF
BS 194 249 RR2A841TF
BS 250 250 RR2AN28TF
BS 251 497 RR2A841TF
BS 498 498 RR2AN28TF
BS 499 769 RR2A841TF

RD RR2AN28JQ 466 0 0
GCCGCCAAAAACAACTCCTCCCAAACCGGTCGGTTCGACAGCAAGAAGCGTCGAACCCTC
GTCCCGACAACAACCAAGGAATAGACGGAAGAAAGCAGCAACATCGACAACACACCACCG
TCTCAGAACGAAATCGCCGACGACGGAGATGAAGATAGGTTTGCGGTGAACACTCGCTTC
AGAGGTGATCCGAAAGACGCGCCCAAGTTCTTGCTTAAGGATCTTCCTGGGCTTGAATCT
GATCCATTCGAAGGTCCTCAGTGGGATGGTTTAGGTTTCTTCGTTCAGTACTTGTGGGCT
TTCGGAATCGTTTTCGCGTTAATTTCCGGCGCAATTGCGGCGGGGACGTATAACGAAGGT
GCTACGG*ATTTCAAGGAGACGCCGGTTTATAAGGAGGCGATGGAGTCTCGTGACCTTCT
GGATGAAGCAGAGGGTTCGAACTCGGAAGATGTTTTTGAGTTTAAT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR2A841TF 769 0 0
GGACACATCCACACACACAAAAAAGAAATGACTCTCACCGTGAGCAGCGGTGGCAGAGTC
GCTAGGATCCACTCCATAGACCTCACCGATGCTTCTCGCACTCCCTTCTCCACCTTCAAA
CTCATAAACTTCCCTCACCCGTCAAGAACCCGTCTCCACGTGGTCTCCGCCGCCAAAAAC
AACTCCTCCCAAGCCGGTCGGTTCGACAGCAAGAAGCGTCGAACCCTCGTCCCGACAACA
ACCAAGGAACAGACGGAAGAAAGCAGCAACATCGACAACACACCACCGTCTCAGAACGAA
ATCGCCGACGACGGAGATGAAGATAGGTTTGCGGTGAACACTCGCTTCAGAGGTGATCCG
AAAGACGCGCCCAAGTTCTTGCTTAAGGATCTTCCTGGGCTTGAATCTGATCCATTCGAA
GGTCCTCAGTGGGATGGTTTAGGTTTCTTCGTTCAGTACTTGTGAGCTTTCGGAATCGTT
TTCGCGTTAATCTCCGGTGCAATTGCGGCGGGGACGTATAACGAAGGTGCTACGG*ATTT
CAAGGAGACGCCGGTTTATAAGGAGGCGATGGAGTCTCGTGACCTTCTGGATGAAGCAGA
GGGTTCGAACTCGGAAGATGTTTTTGAGTCTAATCCGACAGAAGTCGCGCCTAGTTTGGA
GTAGTTTCAGTTCACTGTATTGTAAAAGCCATATTCGAAGTTGATCATGAGCTTCTTGTG
TTCATAATTTTACAGAATCAAAGCAATTATTACACAAGAGGTTGTTTCC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2AN28TF 730 0 0
GG
ACACACACAAAAAAGAAATGACTCTCACCGTGAGCAGCGGTGGCAGAGTCGCTAGGATCC
ACTCCATAGACCTCACCGATGCTTCTCGCACTCCCTTCTCCACCTTCAAACTCATAAACT
TCCCTCACCCGTCAAGAACCCGTCTCCACGTGGTCTCCGCCGCCAAAAACAACTCCTCCC
AAACCGGTCGGTTCGACAGCAAGAAGCGTCGAACCCTCGTCCCGACAACAACCAAGGAAT
AGACGGAAGAAAGCAGCAACATCGACAACACACCACCGTCTCAGAACGAAATCGCCGACG
ACGGAGATGAAGATAGGTTTGCGGTGAACACTCGCTTCAGAGGTGATCCGAAAGACGCGC
CCAAGTTCTTGCTTAAGGATCTTCCTGGGCTTGAATCTGATCCATTCGAAGGTCCTCAGT
GGGATGGTTTAGGTTTCTTCGTTCAGTACTTGTGGGCTTTCGGAATCGTTTTCGCGTTAA
TCTCCGGCGCAATTGCGGCGGGGACGTATAACGAAGGTGCTACGG*ATTTCAAGGAGACG
CCGGTTTATAAGGAGGCGATGGAGTCTCGTGACCTTCTGGATGAAGCAGAGGGTTCGAAC
TCGGAAGATGTTTTTGAGTCTAATCCGACAGAAGTCGCGCCTAGTTTGGAGTAGTTTCAG
TTCACTGTATTGTAAAAGCCATATTCGAAGTTGATCATGAGCTTCTTGTGTTCATAATTT
T
ACAGAAT

QA 3 723 3 723
DS 

RD RR2A841JQ 506 0 0
CAGCAACATCGACAACACACCACCGTCTCAGAACGAAATCGCCGACGACGGAGATGAAGA
TAGGTTTGCGGTGAACACTCGCTTCAGAGGTGATCCGAAAGACGCGCCCAAGTTCTTGCT
TAAGGATCTTCCTGGGCTTGAATCTGATCCATTCGAAGGTCCTCAGTGGGATGGTTTAGG
TTTCTTCGTTCAGTACTTGTGAGCTTTCGGAATCGTTTTCGCGTTAATCTCCGGTGCAAT
TGCGGCGGGGACGTATAACGAAGGTGCTACGGGATTTCAAGGAGACGCCGGTTTATAAGG
AGGCGATGGAGTCTCGTGACCTTCTGGATGAAGCAGAGGGTTCGAACTCGGAAGATGTTT
TTGAGTCTAATCCGACAGAAGTCGCGCCTAGTTTGGAGTAGTTTCAGTTCACTGTATTGT
AAAAGCCATATTCGAAGTTGATCATGAGCTTCTTGTGTTCATAATTTTACAGAATCAAAG
CAATTATTACACAAGAGGTTGTTTCC

QA 1 506 1 506
DS 



CO CL981Contig2 639 2 3 U
TGTCGGATTAGACTCAAAAACATCTTCCGAGTTCGAACCCACTGCTTCATCTAGAAGGTC
ACGAGACTCCATCGCCTCCTTATAAACTGACGTCTCCTTGAAGTCCGTCGCACCTTCGTT
ATAAGTCCCCGCCGCAATTGCACCGGAAATTAACGCGAAAACGATTCCGAAAGCCCACAA
GTACTGAACGAAGAAACCTAAACCATCCCACTGAGGACCTTCGAATGGATCAGATTCAAG
CCCAGGAAGAACCTTAAGCAAGAACTTGGGCGCGTCTTTCGGATCACCTCTGAAGCGAGT
TTTCACCGCGAACCTATCTTCATCTCCGTCGTCGGCGATTTCGTTCTGAGACGGTGGTGT
GTTGTCGATGTTGCTGCTTTCTTCCGTCTGTTCCTTGGTTGTTGTCGGGACGAGGGTTCG
ACGTTTTTTGCTGTCGAACCGACCGGTTTGGGAGGAGTTGTTTTTGGCGGCGGAGACCAT
GTGGAGACGGGTTCTTGACGGGTAAGGGAAGTTTATGAGTTTGGAGGTGGAGAAGGGAGT
ACGAGAAGCATCGGTGAGGTCTATGGAGTGGATCCTGGCGACTCTGCCACCGCTGCTCAC
GGTGAGAGTCATTTCTTTTTTGTGTGTGTGGATGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX77JQ U 13
AF RR2CX77TF C 1
BS 1 12 RR2CX77TF
BS 13 572 RR2CX77JQ
BS 573 639 RR2CX77TF

RD RR2CX77JQ 560 0 0
CTCAAAAACATCTTCCGAGTTCGAACCCACTGCTTCATCTAGAAGGTCACGAGACTCCAT
CGCCTCCTTATAAACTGACGTCTCCTTGAAGTCCGTCGCACCTTCGTTATAAGTCCCCGC
CGCAATTGCACCGGAAATTAACGCGAAAACGATTCCGAAAGCCCACAAGTACTGAACGAA
GAAACCTAAACCATCCCACTGAGGACCTTCGAATGGATCAGATTCAAGCCCAGGAAGAAC
CTTAAGCAAGAACTTGGGCGCGTCTTTCGGATCACCTCTGAAGCGAGTTTTCACCGCGAA
CCTATCTTCATCTCCGTCGTCGGCGATTTCGTTCTGAGACGGTGGTGTGTTGTCGATGTT
GCTGCTTTCTTCCGTCTGTTCCTTGGTTGTTGTCGGGACGAGGGTTCGACGTTTTTTGCT
GTCGAACCGACCGGTTTGGGAGGAGTTGTTTTTGGCGGCGGAGACCATGTGGAGACGGGT
TCTTGACGGGTAAGGGAAGTTTATGAGTTTGGAGGTGGAGAAGGGAGTACGAGAAGCATC
GGTGAGGTCTATGGAGTGGA

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2CX77TF 639 0 0
TGTCGGATTAGACTCAAAAACATCTTCCGAGTTCGAACCCACTGCTTCATCTAGAAGGTC
ACGAGACTCCATCGCCTCCTTATAAACTGACGTCTCCTTGAAGTCCGTCGCACCTTCGTT
ATAAGTCCCCGCCGCAATTGCACCGGAGATTAACGCGAAAACGATTCCGAAAGCCCACAA
GTACTGAACGAAGAAACCTAAACCATCCCACTGAGGACCTTCGAATGGATCAGATTCAAG
CCCAGGAAGATCCTTAAGCAAGAACTTGGGCGCGTCTTTCGGATCACCTCTGAAGCGAGT
TTTCACCGCGAACCTATCTTCATCTCCGTCGTCGGCGATTTCGTTCTGAGACGGTGGTGT
GTTGTCGATGTTGCTGCTTTCTTCCGTCTGTTCCTTGGTTGTTGTCGGGACGAGGGTTCG
ACGTTTTTTGCTGTCGAACCGACCGGTTTGGGAGGAGTTGTTTTTGGCGGCGGAGACCAT
GTGGAGACGGGTTCTTGACGGGTAAGGGAAGTTTATGAGTTTGGAGGTGGAGAAGGGAGT
ACGAGAAGCATCGGTGAGGTCTATGGAGTGGATCCTGGCGACTCTGCCACCGCTGCTCAC
GGTGAGAGTCATTTCTTTTTTGTGTGTGTGGATGTGTCC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 5

CO CL982Contig1 787 5 18 U
GGAAACCAATTCTTGATTCGCTTTCGAATCGATTCGTCACGAATCCAATCCCCTGCTTTC
CTTTTCTTCTTCATTTCCAGTTTTCGATTTCAATCTCTTTCTCGTGAGAAACAAACGATG
GGAAGAGGCAAGTTCAAGGGGAAACCTACGGGCCAGCGTCGATTCTCAAGTGCAGCTGAT
ATTCTTGCTGGCACTTCCGCTGCACGTCCTCGGTCATTCAAGCAGAAAGAAGCTGAATAT
GAAGAAGATGTCGAAGAGGAGTCTGAAGAGGAATCTGAAGAGGAATCCGAAGATGAATCT
GATGTGAAGAAGAAAGGACATGAAGCTCTGATTGAAGTTGATAACCCTAACAGAGCCAAA
CCAAAGACTTTAAAAGCTAGAGACCTTGATGCTAGTAAAACCACTGAACTCTCAAGGCGT
GAAAGGGAGGAGCTAGAGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCAA
GGCAAAACCGAACAATCAAGAAAGGATTTGGATCGTCTCGCTCTGATCCGCCAACAGAGA
GAAGAAGCTGCCAAGAAGCGAGAAGAGGAAAAAGCAGCGAGAGACGCCAAGAAAGTAGAT
GCTCGCAAATGAGAGAAGTTTTCTCCCTAAAAAAATAACGTACCTGAAAAAAAGAAGAAT
ACTCATCGAGTTTTACTTTGTTCCTTTTTCGATTGGTAAACAGATCATAAAACATTTGCC
TAATACTCAGTACCGTGGGGATTCCATCTTAATACATTTGAAGTTAATAATCTTGGTCTT
TCTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D933TF U 101
AF RR2H849TF U 1
AF RR2FR72TF U 6
AF RR2H849JQ C 28
AF RR2D933JQ C 66
BS 1 200 RR2H849TF
BS 201 201 RR2FR72TF
BS 202 259 RR2H849TF
BS 260 260 RR2FR72TF
BS 261 293 RR2H849TF
BS 294 294 RR2FR72TF
BS 295 432 RR2H849TF
BS 433 433 RR2FR72TF
BS 434 491 RR2H849TF
BS 492 492 RR2FR72TF
BS 493 593 RR2H849TF
BS 594 594 RR2FR72TF
BS 595 627 RR2H849TF
BS 628 634 RR2FR72TF
BS 635 635 RR2H849JQ
BS 636 653 RR2FR72TF
BS 654 771 RR2H849JQ
BS 772 787 RR2D933JQ

RD RR2D933TF 212 0 0
CTCGAGAGAAACAAACGATGGGAAGAGGCAAGTTCAAGGGGAAACCTACGGGCCAGCGCC
GATTCTCAAGTGCAGCTGATATACTTGCTGGCACTTCCGCTGCACGTCCTCGGTCGTTCA
AGCAGAAAGAAGCTGAATATGAAGAAGATGTTGAAGAGGAGTCTGAAGAGGAATCTGAAG
AGGAATCCGAAGATGAATCTGATGTGAAGAAG

QA 1 212 1 212
DS 

RD RR2H849TF 627 0 0
GGAAACCAATTCTTGATTCGCTTTCGAATCGATTCGTCACGAATCCAATCCCCTGCTTTC
CTTTTCTTCTTCATTTCCAGTTTTCGATTTCAATCTCTTTCTCGTGAGAAACAAACGATG
GGAAGAGGCAAGTTCAAGGGGAAACCTACGGGCCAGCGTCGATTCTCAAGTGCAGCTGAT
ATTCTTGCTGGCACTTCCGCCGCACGTCCTCGGTCATTCAAGCAGAAAGAAGCTGAATAT
GAAGAAGATGTCGAAGAGGTGTCTGAAGAGGAATCTGAAGAGGAATCCGAAGAGGAATCT
GATGTGAAGAAGAAAGGACATGAAGCTCTGATTGAAGTTGATAACCCTAACAGAGCCAAA
CCAAAGACTTTAAAAGCTAGAGACCTTGATGCTAGTAAAACCACTGAACTCTCAAGGCGT
GAAAGGGAGGAGTTAGAGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCAA
GGCAAAACCGAGCAATCAAGAAAGGATTTGGATCGTCTCGCTCTGATCCGCCAACAGAGA
GAAGAAGCTGCCAAGAAGCGAGAAGAGGAAAAAGCAGCGAGAGACGCCAAGAAGGTAGAT
GCTCGCAAATGAGAGAAGTTTTCTCCC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2FR72TF 648 0 0
GG
AATTCTTTATTCGCTTTCGAATCGATTCGTCACGAATCCAATCCCCTGCTTTCCTTTTCT
TCTTC***TCCAGTTTTCGATCTCAATCTCTTTCTCGTGATAAACAAACGATGGGAAGAG
GCAAGTTCAAGGGGAAACCTACGGGGCAGCGTCGATTCTCAAGTGCAGCTGATATTCTTG
CTGGCACTTCCGCTGCACGTCCTCGGTCATTCAAGCAGAAAGAAGCTGAATACGAAGAAG
ATGTCGAAGAGGAGTCTGAAGAGGAATCTGAAGAGGAATCCGAAGATGAATCTGATGTGA
AGAAGAAAGGACATGAAGCCCTGATTGAAGTTGATAACCCTAACAGAGCCAAACCAAAGA
CTTTAAAAGCTAGAGACCTTGATGCTAGTAAAACCACTGAACTCTCAAGGCGTGAAAGGG
AAGAGCTGGAGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCAAGGCAAAA
CCGAACAATCAAGAAAGGATTTGGATCGTCTGGCTCTGATTCGCCAACAGAGAGAAGAAG
CTGCCAAGAAGCGAGAAGAGGAAAAAGCAGCTAGAGACGCCAAGAAAGTAGATGCTCGCA
AATGAGAGAAGTTTTCTCCCTAAAAAA*TAACGTACCTGAAAAAAA

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR2H849JQ 745 0 0
ATCGATTCGTCACGAATCCAATCCCCTGCTTTCCTTTTCTTCTTCATTTCCAGTTTTCGA
TTTCAATCTCTTTCTCGTGAGAAACAAACGATGGGAAGAGGCAAGTTCAAGGGGAAACCT
ACGGGCCAGCGTCGATTCTCAAGTGCAGCTGATATTCTTGCTGGCACTTCCGCCGCACGT
CCTCGGTCATTCAAGCAGAAAGAAGCTGAATATGAAGAAGATGTCGAAGAGGTGTCTGAA
GAGGAATCTGAAGAGGAATCCGAAGAGGAATCTGATGTGAAGAAGAAAGGACATGAAGCT
CTGATTGAAGTTGATAACCCTAACAGAGCCAAACCAAAGACTTTAAAAGCTAGAGACCTT
GATGCTAGTAAAACCACTGAACTCTCAAGGCGTGAAAGGGAGGAGTTAGAGAAGCAGCGA
GCTCATGAGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCAAGGCAAAACCGAGCAATCAAGAAAGGAT
TTGGATCGTCTCGCTCTGATCCGCCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAGAAGCGAGAAGAG
GAAAAAGCAGCGAGAGACGCCAAGAAGGTAGATGCTCGCAAATGAGAGAAGTTTTCTCCC
TAAAAAAATAACGTACCTGAAAAAAAGAAGAATACTCATCGAGTTTTACTTTGTTCCTTT
TTCGATTGGTAAACAGATCATAAAACATTTGCCTAATACTCAGTACCGTGGGGATTCCAT
CTTAATACATTTGAAGTTAATAAT
C

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2D933JQ 722 0 0
TCTTTTCTTC
TCCAGTTTTCAATTTCAGTCTCTTTCTCGAGAGAAACAAACGATGGGAAGAGGCAAGTTC
AAGGGGAAACCTACGGGCCAGCGCCGATTCTCAAGTGCAGCTGATATACTTGCTGGCACT
TCCGCTGCACGTCCTCGGTCGTTCAAGCAGAAAGAAGCTGAATATGAAGAAGATGTTGAA
GAGGAGTCTGAAGAGGAATCTGAAGAGGAATCCGAAGATGAATCTGATGTGAAGAAGAAA
GGACATGAAGCTCTGATTGAAGTTGATAACCCTAACAGAGCCAAACCAAAGACTTTAAAA
GCTAGAGACCTTGATGCTAGTAAAACCACTGAACTCTCAAGGCGTGAAAGGGAGGAGCTA
GAGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCAAGGCAAAACCGAACAA
TCAAGAAAGGATTTGGATCGTCTGGCTCTGATTCGCCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAG
AAGCGAGAAGAGGAAAAAGCTGCGAGAGACGCCAAGAAAGTAGATGCTCGCAAATGAGAG
AAGTTTTCTCCCTAAAAAAATAACGTACCTGAAAAAAAGAAGAATACTCATCGAGTTTTA
CTTTGTTCCTTTTTCGTTTGGTAAACAGATCATTAAACATTTGCCTAATACTCAGTACCG
TGGGGATTCCATCTTAATACATTTGAAGTTAATAATCTTGGTCTTTCTTTGT

QA 11 722 11 722
DS 



AS 1 5

CO CL983Contig1 1238 5 16 U
AATTCTGGAAACAATATTACGTCATGTCATTTCAAGGCAAACAACACTTTCAATGTATGT
*AAAAATGACAAAACCGGTATCTTGGTACTTTATTACATAACCGAACCGAGTTACGTAGT
AGTAGTGGATAAGTCTCTCTCATTCAATTGCCAAATTCTCCGCTTCACTTCTGATCGAGT
CGAACATCGGAGTCGACAAGTACCGTTCCCCGCCACTCGGGAAAACCACAACTATGAGTT
TCCCTGCGTTTTCTGGTCGTTTTGCAACCTTTATCGCAGCGGCTGCAGCAGCTCCGGATG
ATATTCCAACCAGTAATCCTTCTTTCAGGGCAAGAAGTTTGGCTGTTTCAATAGCTTCCA
CACTTGGCACTTGAATGACTTCATCAAGAACGCTGAAATCCAAATTGTCTGGGATGAGTC
CAGCTCCTATACCTTGGATCCCATGTGGACCAGGTTGCCCTCCACTGAGTACTGCACTCT
CTGCAGGTTCCACTCCAAAAACCTTAACTTCTTGATTCTTCTCCTTGAGGAACTTCCCTA
CTCCAGAGATCGTTCCACCAGTCCCAACACCCACAACCAATATATCTACTTTCTCTGCAG
AGTCTCTCCATATCTCTGGACCAGTGGCCTCGTAATGAGATTGTGGGTTTGAAGGGTTTC
TGAATTGCTCTAGTATGTGACCATCTGGAGTTTTGCTTAATAACTCTTCAGATTTGACAA
TTACTCCCATAACGCCTTTTTTAGGATCTGTGAGGTGAACCTCTGCACCTAATGCTAGAA
GAATGATTCTTCTCTCAACGCTGACTGATGCAGGCAGTGTAATCACAACTTTGTAACCTC
TAGCTGACCCAACCATTGCCATACCAATCCCGGTGTTACCAGATGTTGGCTCAATCAATA
TGCTCTTTCCGGGAGTAATCAAACCCTTGTCTTCTGCATCTTTAATCATACCATAAGCAA
TTCTGTCCTTGACACTAGAGCAAGGCTGCATCATCCCAAGCTTAGCCGCGATACGTGCAA
CACAACCATCTACAATGTTGTTAAGGTACACCATTGGAGTGTTACCTATCAGTTGAGTCA
CATCATCCTTGATCGAGTACTCCATGTTACAAGGATCTTTGAAATTCCAAGCTCGAGAGA
AAAAAAACTTCCCAGATTTGGATAATGAAGATCACAAAGAGGCTCTACACGACAGCAAGA
CAGCATAACCTTCTCAAACTAATTTCAAGATTTAGGAG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 0 0 0 0 0 0 0 15 15 
0 15 0 0 0 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM56JQ U 1
AF RR2ES12JQ U 5
AF RR2CS11JQ U 33
AF RR2CS11TF C 633
AF RR2ES12TF C 540
BS 1 632 RR2BM56JQ
BS 633 711 RR2ES12JQ
BS 712 712 RR2CS11JQ
BS 713 740 RR2ES12JQ
BS 741 775 RR2CS11JQ
BS 776 995 RR2ES12TF
BS 996 996 RR2CS11TF
BS 997 1075 RR2ES12TF
BS 1076 1076 RR2CS11TF
BS 1077 1128 RR2ES12TF
BS 1129 1130 RR2CS11TF
BS 1131 1132 RR2ES12TF
BS 1133 1139 RR2CS11TF
BS 1140 1143 RR2ES12TF
BS 1144 1145 RR2CS11TF
BS 1146 1238 RR2ES12TF

RD RR2BM56JQ 632 0 0
AATTCTGGAAACAATATTACGTCATGTCATTTCAAGGCAAACAACACTTTCAATGTATGT
*AAAAATGACAAAACCGGTATCTTGGTACTTTATTACATAACCGAACCGAGTTACGTAGT
AGTAGTGGATAAGTCTCTCTCATTCAATTGCCAAATTCTCCGCTTCACTTCTGATCGAGT
CGAACATCGGAGTCGACAAGTACCGTTCCCCGCCACTCGGGAAAACCACAACTATGAGTT
TCCCTGCGTTTTCTGGTCGTTTTGCAACCTTTATCGCAGCGGCTGCAGCAGCTCCGGATG
ATATTCCAACCAGTAATCCTTCTTTCAGGGCAAGAAGTTTGGCTGTTTCAATAGCTTCCA
CACTTGGCACTTGAATGACTTCATCAAGAACGCTGAAATCCAAATTGTCTGGGATGAGTC
CAGCTCCTATACCTTGGATCCCATGTGGACCAGGTTGCCCTCCACTGAGTACTGCACTCT
CTGCAGGTTCCACTCCAAAAACCTTAACTTCTTGATTCTTCTCCTTGAGGAACTTCCCTA
CTCCAGAGATCGTTCCACCAGTCCCAACACCCACAACCAATATATCTACTTTCTCTGCAG
AGTCTCTCCATATCTCTGGACCAGTGGCCTCG

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2ES12JQ 736 0 0
CTGGAAACAATATTACGTCATGTCATTTCAAGTCAAACAACACTTTCAATGTATGTCAAA
AATGACAAAACCGGTATCTTGGTACTTTATTACATAACCGAACCGAGTTACGTAGTAGTA
GTGGATAAGTCTCTCTCATTCAATTGCCAAATTCTCCGCTTCACTTCTGATCGAGTCGAA
CATCGGAGTCGACAAGTACCGTTCCCCGCCACTCGGGAAAACCACAACTATGAGTTTCCC
TGCGTTTTCTGGTCGTTTTGCAACCTTTATCGCAGCGGCTGCAGCAGCTCCGGATGATAT
TCCAACCAGTAATCCTTCTTTCAGGGCAAGAAGTTTGGCTGTTTCAATAGCTTCCACACT
TGTCACTTGAATGACTTCATCAAGAACGCTGAAATCCAAATTGTCTGGGATGAGTCCAGC
TCCTATACCTTGGATCCCATGTGGACCAGGTTGCCCTCCACTGAGTACTGCACTCTCTGC
AGGTTCCACTCCATAAACCTTAACTTCCTGATTCTTCTCCTTGAGGAACTTCCCTACTCC
AGAGATCGTTCCACCAGTCCCAACACCCACAACCAATATATCTACTTTCTCTGCAGAGTC
TCTCCATATCTCTGGACCAGTGGCCTCGTAATGAGATTGTGGGTTTGAAGGGTTTCTGAA
TTGCTCTAGTATGTGACCATCTGGAGTTTTGCTTAATAACTCTTCAGCTTTGACAATTAC
TCCCATAACGCCTTTT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2CS11JQ 743 0 0
CAAGGCAAACAACACTTTCAATGTATGT*AAAAATGACAAAACCGGTATCTTGGTACTTT
ATTACATAACCGAACCGAGTTACGTAGTAGTAGTGGATAAGTCTCTCTCATTCAATTGCC
AAATTCTCCGCTTCACTTCTGATCGAGTCGAACATCGGAGTCGACAAGTACCGTTCCCCG
CCACTCGGGAAAACCACAACTATGAGTTTCCCTGCGTTTTCTGGTCGTTTTGCAACCTTT
ATCGCAGCGGCTGCAGCAGCTCCGGATGATATTCCAACCAGTAATCCTTCTTTCAGGGCA
AGAAGTTTGGCTGCTTCAATAGCTTCCACACTTGGCACTTGAATGACTTCATCAAGAACG
CTGAAATCCAAATTGTCTGGGATGAGTCCAGCTCCTATACCTTGGATCCCATGTGGACCA
GGTTGCCCTCCACTGAGTACTGCACTCTCTGCAGGTTCCACTCCAAAAACCTTAACTTCT
TGATTCTTCTCCTTGAGGAACTTCCCTACTCCAGAGATCGTTCCACCAGTCCCAACACCC
ACAACCAATATATCTACTTTCTCTGCAGAGTCTCTCCATATCTCTGGACCAGTGGCCTCG
TAATGAGATTGTGGGTTTGAAGGGTTTCTGAATTGCTCTAGTATGTGACCATCTGGAGTT
TTGCTTAATAACTCTTCAGATTTGACAATTACTCCCATAACGCCTTTTTTAGGATCTGTG
AGGTGAACCTCTGCACCTAATGC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2CS11TF 517 0 0
TAATGAGATTGTGGGTTTGAAGGGTTTCTGAATTGCTCTAGTATGTGACCATCTGGAGTT
TTGCTTAATAACTCTTCAGATTTGACAATTACTCCCATAACGCCTTTTTTAGGATCTGTG
AGGTGAACCTCTGCACCTAATGCTAGAAGAATGATTCTTCTCTCAATGCTGACTGATGCA
GGCAGTGTAATCACAACTTTGTAACCTCTAGCTGCCCCAACCATTGCTATACCAATCCCG
GTGTTACCAGATGTTGGCTCAATCAATATGCTCTTTCCGGGAGTAATCAAACCCTTGTCT
TCTGCATCTTTAATCATACCATAAGCAATTCTGTCCTTGACACTAGAGCAAGGCTGCATC
ATCCCAAGCTTAGCCGCGATACGTGCAACACAACCATCTACAATGTTGTTAAGGTACACC
ATTGGAGTGTTACCTATCAGTTGAGTCACATCATCCTTGATCGAGTACTCCATGTTACAA
GGATCTTTGAAATTCCAAGCTCGAGAGAAGAAAGACT

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2ES12TF 699 0 0
ACTCCAGAGATCGTTCCACCAGTCCCAACACCCACAACCAATATATCTACTTTCTCTGCA
GAGTCTCTCCATATCTCTGGACCAGTGGCCTCGTAATGAGATTGTGGGTTTGAAGGGTTT
CTGAATTGCTCTAGTATGTGACCATCTGGAGTTTTGCTTAATAACTCTTCAGCTTTGACA
ATTACTCCCATAACGCCTTTTTTAGGATCTGTGAGGTGAACCTCTGCACCTAATGCTAGA
AGAATGATTCTTCTCTCAACGCTGACTGATGCAGGCAGTGTAATCACAACTTTGTAACCT
CTAGCTGACCCAACCATTGCCATACCAATCCCGGTGTTACCAGATGTTGGCTCAATCAAT
ATGCTCTTTCCGGGAGTAATCAAACCCTTGTCTTCTGCATCTTTAATCATACCATAAGCA
ATTCTGTCCTTGACACTAGAGCAAGGCTGCATCATCTCAAGCTTAGCCGCGATACGTGCA
ACACAACCATCTACAATGTTGTTAAGGTACACCATTGGAGTGTTACCTATCAGTTGGGTC
ACATCATCCTTGATCGAGTACTCCATGTTACAAGGATCTTTGAAATTCCT*GC*******
AAAATTAACTTCCCAGATTTGGATAATGAAGATCACAAAGAGGCTCTACACGACAGCAAG
ACAGCATAACCTTCTCAAACTAATTTCAAGATTTAGGAG

QA 1 699 1 699
DS 



AS 2 5

CO CL984Contig1 680 2 2 U
GGATTACACATCATCGTCGGTCGATGATGACAACATCTCTGCTTCTTCTCAGACATTCCT
CCTCAGCAGCTCTCTTCTTCTCTTCATCTTCTTTCGTCTTCACCAAGAACACAAACTCTT
CTCGTTCCTTCACTTCCATCAAGATGGAAAGCGGTGACGCAAACGCGTCCAAGAAGAAGG
TGTTCGTCGCTGGAGCCACGGGACAAACCGGGAAGAGGATCGTTGAACAGCTCTTATCCC
GCGGCTTCGCCGTCAAAGCAGGTGTTCGTGACGTAGACAAAGCAAAAACATCTTTCAGAC
AAGACCCTTCTCTTCACTTCGTTAAAGCAGACGTGACAGAAGGCTCAGAGAAGCTAGCAG
AAGCCATAGGCGACGACTCTCAAGCCGTGATCTGCGCTACTGGTTTCCGTCCCGGGTTCG
ATCTCTTCGCTCCTTGGAAGATCGATAACTACGGAACGGTGAACCTTGTGGATGCGTGTA
AGAAACAAAAGGTGAACAGGTTCGTTCTCGTGAGCTCGCTCTTGGTTAACGGAGCTGCGA
TGGGACAGATTTTAAACCCGGCTTACATCTTCCTCAACGTCTTTGGACTCACCCTCGTCG
CCAAGCTTCAAGCAGAGAAGTATATCAGAAGATCTGGGATTAACTATACTATAGTTAGAC
CTGGTGGTCTTAAGAACGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ71TF U 1
AF RR2CS07TF U 6
BS 1 556 RR2FZ71TF
BS 557 680 RR2CS07TF

RD RR2FZ71TF 556 0 0
GGATTACACATCATCGTCGGTCGATGATGACAACATCTCTGCTTCTTCTCAGACATTCCT
CCTCAGCAGCTCTCTTCTTCTCTTCATCTTCTTTCGTCTTCACCAAGAACACAAACTCTT
CTCGTTCCTTCACTTCCATCAAGATGGAAAGCGGTGACGCAAACGCGTCCAAGAAGAAGG
TGTTCGTCGCTGGAGCCACGGGACAAACCGGGAAGAGGATCGTTGAACAGCTCTTATCCC
GCGGCTTCGCCGTCAAAGCAGGTGTTCGTGACGTAGACAAAGCAAAAACATCTTTCAGAC
AAGACCCTTCTCTTCACTTCGTTAAAGCAGACGTGACAGAAGGCTCAGAGAAGCTAGCAG
AAGCCATAGGCGACGACTCTCAAGCCGTGATCTGCGCTACTGGTTTCCGTCCCGGGTTCG
ATCTCTTCGCTCCTTGGAAGATCGATAACTACGGAACGGTGAACCTTGTGGATGCGTGTA
AGAAACAAAAGGTGAACAGGTTCGTTCTCGTGAGCTCGCTCTTGGTTAACGGAGCTGCGA
TGGGACAGATTTTAAA

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2CS07TF 675 0 0
GGAG
ATCATCGTCGGTCGATGATGACAACATCTCTGCTTCTTCTCAGACATTCCTCCTCAGCAG
CTCTCTTCTTCTCTTCATCTTCTTTCGTCTTCACCAAGAACACAAACTCTTCTCGTTCCT
TCACTTCCATCAAGATGGAAAGCGGTGACGCAAACGCGTCCAAGAAGAAGGTGTTCGTCG
CTGGAGCCACGGGACAAACCGGGAAGAGGATCGTTGAACAGCTCTTATCCCGTGGCTTCG
CCGTCAAAGCAGGTGTTCGTGACGTAGACAAAGCAAAAACATCTTTCAGACAAGACCCTT
CTCTTCACTTCGTTAAAGCAGACGTGACAGAAGGCTCAGAGAAGCTAGCAGAAGCCATAG
GCGACGACTCTCAAGCCGTGATCTGCGCTACTGGTTTCCGTCCCGGGTTCGATCTCTTCG
CTCCTTGGAAGATCGATAACTACGGAACGGTGAACCTTGTGGATGCGTGTAAGAAACAAA
AGGTGAACAGGTTCGTTCTCGTGAGCTCGCTCTTGGTTAACGGAGCTGCGATGGGACAGA
TTTTAAACCCGGCTTACATCTTCCTCAACGTCTTTGGACTCACCCTCGTCGCCAAGCTTC
AAGCAGAGAAGTATATCAGAAGATCTGGGATTAACTATACTATAGTTAGACCTGGTGGTC
TTAAGAACGAT

QA 5 675 5 675
DS 



CO CL984Contig2 1009 3 12 U
GGACACATCATCGTCGGTCGATGATGACAACATCTCTGCTTCTTCTCAGACATTCCTCCT
GTTCAGCTCTCTTCTTCTCTTCATCTTCTTCTTTCGTCTTCACCAAGAATACTAACTCTT
CTCGTTCCTTCACTTCACTTCAAGATGGAAAGCGGTGACGCAAGTGAAGCAAACGCGTCC
AAGAAGAAGGTGTTCGTCGCCGGAGCCACGGGACAAACCGGGAAGAGGATCGTTGAACAG
CTCTTATCCCGTGGATTCGCCGTCAAAGCAGGTGTCCGTGACGTAGACAAAGCAAAAACA
TCTTTCAGACAAGACCCTTCTCTTCACTTCGTTAAAGCAGACGTGACAGAAGGCTCAGAG
AAGCTAGCAG*AAGCCATAGGCGACGACTCACAAGCCGTGATCTGCGCTACTGGTTTCCG
TCCCGGG*TTCGATCTCTTCGCTCCTTGGAAGATCGATAACTACGGAACCGTGAACCTTG
TGGACGCGTGTAAGAAACAAAAGGTGAACAGGTTCGTTCTCGTGAGCTCGATCTTGGTGA
ACGGAGCTGCGATGGG*ACAGATTTTAAACCCTGCTTACATCTTCCTCAACGTCTTTGGA
CTCACTCTCGTCGCTAAGCTTCAAGCCGAGAAGTATATCAAGAGATCTGGGATTAACTAT
ACTATAGTCAGACCTGGTGGTCTTAAGAACGATCCTCCTTCGGGGAATGTAGTCATGGAG
CCTGAGGATACTTTGTCTGGAGGGAGCATATCGAGAGACCTGGTAGCTGAAGTTGCGGTG
GAAGCTTTGCTTGAGGAGGAATCGTCTTCTTTCAAGGTTGTGGAGATTGTTGCTAGTGCT
GATGCTCCGAAACGTTCCTACAAAGATCTCTTTGCTTCTGTTAAAGGAGGACATTAACTA
AGAATCAACAATGTAATGAGCCTCATGCTCTATTAGAAAAATCCTTATTTCTCTTGCTGT
CTTTTAGTACAACAATAACAACAAACAGAGATACATAAAGCTTCGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP42TF U 357
AF RR2GV80TF U 1
AF RR2GP42JQ C 265
BS 1 269 RR2GV80TF
BS 270 270 RR2GP42JQ
BS 271 381 RR2GV80TF
BS 382 382 RR2GP42TF
BS 383 529 RR2GV80TF
BS 530 530 RR2GP42TF
BS 531 564 RR2GV80TF
BS 565 565 RR2GP42TF
BS 566 566 RR2GV80TF
BS 567 567 RR2GP42TF
BS 568 693 RR2GV80TF
BS 694 1009 RR2GP42JQ

RD RR2GP42TF 290 0 0
AGAGAAGCTAGCAGTAAGCCATAGGCGACGACTCACAAGCCGTGATCTGCGCTACTGGTT
TCCGTCCCGGGGTTCGATCTCTTCGCTCCTTGGAAGATCGATAACTACGGAACCGTGAAC
CTTGTGGACGCGTGTAAGAAACAAAAGGTGAACAGGTTCGTTCTCGTGAGCTCGATCTTG
GTGAACGGAGCTGCGATGGGGACAGATTTTAAACCCTGCTTACATCTTCCTCAACGTCTT
TGGACTCACTCTCGTCGCTA*GCTTCAAGCCGAGAAGTATATCA
AGAGAT

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2GV80TF 695 0 0
GGACACATCATCGTCGGTCGATGATGACAACATCTCTGCTTCTTCTCAGACATTCCTCCT
GTTCAGCTCTCTTCTTCTCTTCATCTTCTTCTTTCGTCTTCACCAAGAATACTAACTCTT
CTCGTTCCTTCACTTCACTTCAAGATGGAAAGCGGTGACGCAAGTGAAGCAAACGCGTCC
AAGAAGAAGGTGTTCGTCGCCGGAGCCACGGGACAAACCGGGAAGAGGATCGTTGAACAG
CTCTTATCCCGTGGATTCGCCGTCAAAGCGGGTGTCCGTGACGTAGACAAAGCAAAAACA
TCTTTCAGACAAGACCCTTCTCTTCACTTCGTTAAAGCAGACGTGACAGAAGGCTCAGAG
AAGCTAGCAG*AAGCCATAGGAGACGACTCACAAGCCGTGATCTGCGCTACTGGTTTCCG
TCCCGGG*TTCGATCTCTTCGCTCCTTGGAAGATCGATAACTACGGAACCGTGAACCTTG
TGGACGCGTGTAAGAAACAAAAGGTGAACAGGTTCGTTCTCGTGAGCTCCATCTTGGTGA
ACGGAGCTGCGATGGG*ACAGATTCTGAACCCTGCTTACATCTTCCTCAACGTCTTTGGA
CTCACTCTCGTCGCTAAGCTTCAAGCCGAGAAGTATATCAAGAGATCTGGGATTAACTAT
ACTATAGTCAGACCTGGTGGTCTTAAGAACGAT
CC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2GP42JQ 745 0 0
AAAGCAGGTGTCCGTGACGTAGACAAAGCAAAAACATCTTTCAGACAAGACCCTTCTCTT
CACTTCGTTAAAGCAGACGTGACAGAAGGCTCAGAGAAGCTAGCAG*AAGCCATAGGCGA
CGACTCACAAGCCGTGATCTGCGCTACTGGTTTCCGTCCCGGG*TTCGATCTCTTCGCTC
CTTGGAAGATCGATAACTACGGAACCGTGAACCTTGTGGACGCGTGTAAGAAACAAAAGG
TGAACAGGTTCGTTCTCGTGAGCTCGATCTTGGTGAACGGAGCTGCGATGGG*ACAGATT
TTAAACCCTGCTTACATCTTCCTCAACGTCTTTGGACTCACTCTCGTCGCTAAGCTTCAA
GCCGAGAAGTATATCAAGAGATCTGGGATTAACTATACTATAGTTAGACCTGGTGGTCTT
AAGAACGATCCTCCTTCGGGGAATGTAGTCATGGAGCCTGAGGATACTTTGTCTGGAGGG
AGCATATCGAGAGACCTGGTAGCTGAAGTTGCGGTGGAAGCTTTGCTTGAGGAGGAATCG
TCTTCTTTCAAGGTTGTGGAGATTGTTGCTAGTGCTGATGCTCCGAAACGTTCCTACAAA
GATCTCTTTGCTTCTGTTAAAGGAGGACATTAACTAAGAATCAACAATGTAATGAGCCTC
ATGCTCTATTAGAAAAATCCTTATTTCTCTTGCTGTCTTTTAGTACAACAATAACAACAA
ACAGAGATACATAAAGCTTCGAAGC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 5

CO CL985Contig1 1236 5 29 U
GGACTTACCAACGACGCGAATTGGCTGGCGGGTGCGAGTGATTAATTTCGATCCTTCCAT
AGAAAGATAAAGAGAGAGAGAAAAACTTGTAACTTTGACGATTTCGACATCTAAAGGATT
GTAATTGACCGCAAGAAAAAGATTCCTCCCTCCCTCCCTCGGCTCAAAGCAAGAATCTTT
CATTCATGACGACCAATTTCGCATTCACCGGTGTTGATGATGACTCTTCAAAGCAACTCG
TCTTGCTTGCATCTGTTTGTTCCGGCATCCTCATGTGCAAAATCGTTTATGACTTGACTG
GTTTCATAAGTCCTTTGCTCTTCAGTGCTTATGGGAAACTCGATGGCAAAGTTAGAATGG
AATGGAACAACAGGGGATTCTCAACGTTCCATGCTGTTTTTGTTTCTGTGGCATCAATCT
ATCTCCTGGTGATTTCAGATCAGTTTGATGAGAGTGTTCATGGTGATTCAGTCATCAATA
GTACAACGAGGTTGTCTGAATCTGTAATGGGGATCTCCTTAGGCTATTTCGTAGCAGACT
TAATGATGATCTTTTGGCATTTTCCTACTCTTGGTGGTGTTGAATATGTTTTCCATCACT
GCTTATCGATGTTCTCCATCATTCTTTCTGTCACAAGTGGGCAAGCGCAGTTCTACATAT
TCATGGTTCTCTTATCGGAGGCCACTACCCCGTTTGTCAACCTACGGTGGTACTTGGATG
CTAGTGGTCAAAAAGGCTCTAAGGCTTACACACTCAATGGGATTGCCCTGTTCTTGGGTT
GGCTGGTCGCGAGGATCCTTTTGTTTATCTACTTCTTTGTACACATGTACTCCCATCTCC
ATCAGGTGAAGCAAGTGTTTCCACTGGGATTTTATAGCCTTATTGCGGTAGGACCGGTCC
TGTCAACGATGAATCTTCTTTGGTTCTGGAAAATCACCAAAGGATTGATCAAAACAATCT
CCAAGGCGACGGGAAAGAAAAAACAGTGATGGTCTCTGCTTGACATGGGAAAAAAGGATT
GGGGATTGCATTGACTTTGATCTGTTCATGAAAAAAAGATCGATTGATATCATATTGTGA
CGTGTCTTTGAAGCCTTTTCGGTTTATAAGACTTGCCTTTATATGGGAATTTGTATATTC
ACAACCCTTCAGCTGTTTCTTAGGTATTCAACTTGTAAAGTTTTAAGCAGAATCAGTGTT
TAAGGTCACTCGGATTTTATTGATGCTTGTTTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP46TF U 30
AF RR2GL44TF U 1
AF RR2CF04TF U 98
AF RR2DP46JQ C 288
AF RR2CF04JQ C 432
BS 1 84 RR2GL44TF
BS 85 85 RR2DP46TF
BS 86 650 RR2GL44TF
BS 651 651 RR2CF04TF
BS 652 680 RR2GL44TF
BS 681 681 RR2CF04TF
BS 682 706 RR2GL44TF
BS 707 707 RR2CF04TF
BS 708 735 RR2GL44TF
BS 736 736 RR2DP46JQ
BS 737 743 RR2GL44TF
BS 744 744 RR2DP46JQ
BS 745 746 RR2GL44TF
BS 747 747 RR2CF04TF
BS 748 756 RR2GL44TF
BS 757 757 RR2CF04TF
BS 758 763 RR2GL44TF
BS 764 766 RR2CF04TF
BS 767 781 RR2GL44TF
BS 782 782 RR2CF04TF
BS 783 797 RR2GL44TF
BS 798 798 RR2DP46JQ
BS 799 805 RR2GL44TF
BS 806 806 RR2DP46JQ
BS 807 817 RR2GL44TF
BS 818 940 RR2DP46JQ
BS 941 941 RR2CF04JQ
BS 942 1125 RR2DP46JQ
BS 1126 1236 RR2CF04JQ

RD RR2DP46TF 701 0 0
GGGTGCGAGTGATTAATTTCGATCCTTCCATAGAAAGATAAAGAGAGAGAGAAAAACTTG
TAACTTTGACGATTTCGACATCTAAAGGATTGTAATTGACCGCAAGAAAAAGATTCCTCC
CTCCCTCCCTCGGCTCAAAGCAAGAATCTTTCATTCATGACGACCAATTTCGCATTCACC
GGTGTTGATGATGACTCTTCAAAGCAACTCGTCTTGCTTGCATCTGTTTGTTCCGGCATC
CTCATGTGCAAAATCGTTTATGACTTGACTGGTTTCATAAGTCCTTTGCTCTTCAGTGCT
TATGGGAAACTCGATGGCAAAGTTAGAATGGAATGGAACAACAGGGGATTCTCAACGTTC
CATGCTGTTTTTGTTTCTGTGGCATCAATCTATCTCCTGGTGATTTCAGATCAGTTTGAT
GAGAGTGTTCATGGTGATTCAGTCATCAATAGTACAACGAGGTTGTCTGAATCTGTAATG
GGGATCTCCTTAGGCTATTTCGTAGCAGACTTAATGATGATCTTTTGGCATTTTCCTACT
CTTGGTGGTGTTGAATATGTTTTCCATCACTGCTTATCGATGTTCTCCATCATTCTTTCT
GTCACAAGTGGGCAAGCGCAGTTCTACATATTCATGGTTCTCTTATCGGAG*CCACTACC
CCGTTTGTCAACCTACAGTGGTACTTGGATGCTAGTGGTCA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2GL44TF 819 0 0
GGACTTACCAACGACGCGAATTGGCTGGCGGGTGCGAGTGATTAATTTCGATCCTTCCAT
AGAAAGATAAAGAGAGAGAGAAAAGCTTGTAACTTTGACGATTTCGACATCTAAAGGATT
GTAATTGACCGCAAGAAAAAGATTCCTCCCTCCCTCCCTCGGCTCAAAGCAAGAATCTTT
CATTCATGACGACCAATTTCGCATTCACCGGTGTTGATGATGACTCTTCAAAGCAACTCG
TCTTGCTTGCATCTGTTTGTTCCGGCATCCTCATGTGCAAAATCGTTTATGACTTGACTG
GTTTCATAAGTCCTTTGCTCTTCAGTGCTTATGGGAAACTCGATGGCAAAGTTAGAATGG
AATGGAACAACAGGGGATTCTCAACGTTCCATGCTGTTTTTGTTTCTGTGGCATCAATCT
ATCTCCTGGTGATTTCAGATCAGTTTGATGAGAGTGTTCATGGTGATTCAGTCATCAATA
GTACAACGAGGTTGTCTGAATCTGTAATGGGGATCTCCTTAGGCTATTTCGTAGCAGACT
TAATGATGATCTTTTGGCATTTTCCTACTCTTGGTGGTGTTGAATATGTTTTCCATCACT
GCTTATCGATGTTCTCCATCATTCTTTCTGTCACAAGTGGGCAAGCGCAGCTCTACATAT
TCATGGTTCTCTTATCGGAG*CCACTACCCCGTTTGTCAACCTACG*TGGTACTTGGATG
CTAGTGGTCAAAAAG*CTCTAAG*CT*ACACACTCA*TGGGATG**CCTGTTCTTGGGTT
G*CTGGTCGCGAGGATC*TTTTGTT*ATCTACTTCTT
GT

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2CF04TF 692 0 0
GG
GATTTCGACATCTAAAGGATTGTAATTGACCGCAAGAAAAAGATTCCTCCCTCCCTC***
*GGCTCAAAGCAAGAATCTTTCATTCATGACGACCAATTTCGCATTCACCGGTGTTGATG
ATGACTCTTCAAAGCAACTCGTCTTGCTTGCATCTGTTTGTTCCGGCATCCTCATGTGCA
AAATCGTTTATGACTTGACTGGTTTCATAAGTCCTTTGCTCTTCAGTGCTTATGGGAAAC
TCGATGGCAAAGTTAGAATGGAATGGAACAACAGGGGATTCTCAACGTTCCATGCTGTTT
TCGTTTCTGTGGCATCAATCTATCTCCTGGTGATTTCAGATCAGTTTGATGAGAGTGTTC
ATGGTGATTCAGTCATCAATAGTACAACGAGGTTGTCTGAATCTGTAATGGGGATCTCCT
TAGGCTATTTCGTAGCAGACTTAATGATGATCTTTTGGCATTTTCCTACTCTTGGTGGTG
TTGAATATGTTTTCCATCACTGCTTATCGATGTTCTCCACCATTCTTTCTGTCACAAGTG
GGCAAGCGCAGTTCTACATATTCATGGTTCTCTTATCGGAGGCCACTACCCCGTTTGTCA
ACCTACGGTGGTACTTGGATGCTAGTGGTCAAAAGG*CTCTAAG*CTTACACACTCAATG
GGATTGCCCTGTTCTTGGGTTGGCTGGTCG

QA 3 692 3 692
DS 

RD RR2DP46JQ 840 0 0
TATGACTTGACTGGTTTCATAAGTCCTTTGCTCTTCAGTGCTTATGGGAAACTCGATGGC
AAAGTTAGAATGGAATGGAACAACAGGGGATTCTCAACGTTCCATGCTGTTTTTGTTTCT
GTGGCATCAATCTATCTCCTGGTGATTTCAGATCAGTTTGATGAGAGTGTTCATGGTGAT
TCAGTCATCAATAGTACAACGAGGTTGTCTGAATCTGTAATGGGGATCTCCTTAGGCTAT
TTCGTAGCAGACTTAATGATGATCTTTTGGCATTTTCCTACTCTTGGTGGTGTTGAATAT
GTTTTCCATCACTGCTTATCGATGTTCTCCATCATTCTTTCTGTCACAAGTGGGCAAGCG
CAGTTCTACATATTCATGGTTCTCTTATCGGAGGCCACTACCCCGTTTGTCAACCTACGG
TGGTACTTGGATGCTAGTGGTCAAAAAGGCTCTAAGGCTTACACACTCAATGGGATTGCC
CTGTTCTTGGGTTGGCTGGTCGCGAGGATCCTTTTGTTTATCTACTTCTTTGTACACATG
TACTCCCATCTCCATCAGGTGAAGCAAGTGTTTCCACTGGGATTTTATAGCCTTATTGCG
GTAGGACCGGTCCTGTCAACGATGAATCTTCTTTGGTTCTGGAAAATCACCAAGGGATTG
ATCAAAACAATCTCCAAGGCGACGGGAAAGAAAAAACAGTGATGGTCTCTGCTTGACATG
GGAAAAAAGGATTGGGGATTGCATTGACTTTGATCTGTTCATGAAAAAAAGATCGATTGA
TATCATATTGTGACGTGTCTTTGAAGCCTTTTCGGTTTATAAGACTTGCCTTTATATG
AG

QA 1 838 1 838
DS 

RD RR2CF04JQ 805 0 0
ATTTCAGATCAGTTTGATGAGAGTGTTCATGGTGATTCAGTCATCAATAGTACAACGAGG
TTGTCTGAATCTGTAATGGGGATCTCCTTAGGCTATTTCGTAGCAGACTTAATGATGATC
TTTTGGCATTTTCCTACTCTTGGTGGTGTTGAATATGTTTTCCATCACTGCTTATCGATG
TTCTCCACCATTCTTTCTGTCACAAGTGGGCAAGCGCAGTTCTACATATTCATGGTTCTC
TTATCGGAGGCCACTACCCCGTTTGTCAACCTACGGTGGTACTTGGATGCTAGTGGTCAA
AAAGGCTCTAAGGCTTACACACTCAATGGGATTGCCCTGTTCTTGGGTTGGCTGGTCGCG
AGGATCCTTTTGTTTATCTACTTCTTTGTACACATGTACTCCCATCTCCATCAGGTGAAG
CAAGTGTTTCCACTGGGATTTTATAGCCTTATTGCGGTAGGACCGGTCCTGTCAACGATG
AATCTTCTTTGGTTCTGGAAAATCACCAAAGGATTGATCAAAACAATCTCCAAGGCGACG
GGAAAGAAAAAACAGTGATGGTCTCTGCTTGAC*TGGGAAAAAAGGATTGGGGATTGCAT
TGACTTTGATCTGTTCATGAAAAAAAGATCGATTGATATCATATTGTGACGTGTCTTTGA
AGCCTTTTCGGTTTATAATACTTGCCTTTATATGGGAATTTGTATATTCACAACCCTTCA
GCTGTTTCTTAGGTATTCAACTTGTAAAGTTTTAAGCAGAATCAGTGTTTAAGGTCACTC
GGATTTTATTGATGCTTGTTTTACT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 7

CO CL986Contig1 952 7 14 U
CTGGGGCGATAATTCTGAAAAGACAGATTTCCTATCTTTTCTTTGATCTCGGGTGAAATA
CGATCGGGGGGGGCTAATTCAAACCCCTCAGGTAAAATAAGAACAGCTCCCACATTCAAA
GCTCCTTTTTTACCATTAGCTAGAACTTGTTTTAGCTGCATATCATAAGGAATTTTAACA
ACTGCTTCAAATACAGTATCAGGAAGTACCGCTTGTGGAACCTCAATATCCACGGGCTTA
CTAGCTAAATGGCAATTGGCACATACAATACGCCCAGTTGCCTCTCGTGGATTTTCATAA
TTCTGCTGGGCAAAAATTGGATATGCACTTGAAATGGATGCCCAAGTTATTATATATATC
ATGAGTGAGACAGATATGGAGCGAGTAATCTCTTCCCTTATCCAAGAAAAGGTATTTCTA
GTTTGCATGGTCCAATCATTTATCCCGAAAATTTCTACAATAAAGTTAGGTAGGTCGATA
ATATACTTCCCTAGCCACAATTCTGCTATTTACATTTACTGAAAAAAAAATTTTTTTTTA
TTGAAATATACAAGGAATCCCTCGTGGGTAAAAAAGAGTAAAGTAAATACGACTTTGATT
TGGTTATGATGTATAAAGTAAGAAAGAGTAGAATTGGATCAGTGAATCGTTTTTTAGTCA
TTTATTGCATGATAAATCACTACAAGTGACGGAGATACACGATTTAAATAACGAAAGATC
CAATATTTAAAAATTGTATCAAGAATGACTGGAAAGGTAGAAACTAGACCAGATAAAATT
TGTTCATAATGAGCAAACCCAAAATCTTTGTAAATATAACCAATCATTAGTTCCCAACCG
TGAGGCGAATGGAATCCGATACATAAATCAGTTAATAAAAGAATCGAAAAAGCTTTAATT
GTATCACTTAAATTATATAGGAATTCTTGAACCCAAGAATTGAGAATAAAAA


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX43JQ U 3
AF RR2BR65JQ U 126
AF RR2CI04JQ U 1
AF RR2GD58JQ U 3
AF RR2GD58TF C 177
AF RR2EX43TF C 239
AF RR2CI04TF C 284
BS 1 55 RR2CI04JQ
BS 56 56 RR2EX43JQ
BS 57 191 RR2CI04JQ
BS 192 192 RR2EX43JQ
BS 193 193 RR2CI04JQ
BS 194 195 RR2EX43JQ
BS 196 402 RR2CI04JQ
BS 403 403 RR2GD58JQ
BS 404 529 RR2CI04JQ
BS 530 530 RR2GD58JQ
BS 531 788 RR2CI04JQ
BS 789 789 RR2GD58JQ
BS 790 891 RR2GD58TF
BS 892 952 RR2CI04TF

RD RR2EX43JQ 398 0 0
GG
GGCGATAATTCTGAAAAGACAGATTTCCTATCTTTTCTTTGATCTCGGGTGAAATACGAT
CGGGGGGGGCTAATTCAAACCCCTCAGGTAAAATAAGAACAGCTCCCACATTCAAAGCTC
CTTTTTTACCATTAGCTAGAACTTGTTTTAGCTGCATATCATAAGGAATTTTAACAACTG
CTTCAAATACAGTATCAGGAAGTACCGCTTGTGGAACCTCAATATCCACGGGCTTACTAG
CTAAATGGCAATTGGCACATACAATACGCCCAGTTGCCTCTCGTGGATTTTCATAATTCT
GCTGGGCAAAAATTGGATATGCACTTGAAATGGATGCCCAAGTTATTATATATATCATGA
GTGAGACAGATATGGAGCGAGTAATCTCTTCCCTTA

QA 3 398 3 398
DS 

RD RR2BR65JQ 562 0 0
TTTTTTACCATTAGCTAGAACTTGTTTTAGCTGCATATCATAAGGAATTTTAACAACTGC
TTCAAATACAGTATCAGGAAGTACCGCTTGTGGAACCTCAATATCCACGGGCTTACTAGC
TAAATGGCAATTGGCACATACAATACGCCCAGTTGCCTCTCGTGGATTTTCATAATTCTG
CTGGGCAAAAATTGGATATGCACTTGAAATGGATGCCCAAGTTATTATATATATCATGAG
TGAGACAGATATGGAGCGAGTAATCTCTTCCCTTATCCAAGAAAAGGTATTTCTAGTTTG
CATGGTCCAATCATTTATCCCGAAAATTTCTACAATAAAGTTAGGTAGGTCGATAATATA
CTTCCCTAGCCACAATTCTGCTATTTACATTTACTGAAAAAAAA**TTTTTTTTATTGAA
ATATACAAGGAATCCCTCGTGGGTAAAAAAGAGTAAAGTAAATACGACTTTGATTTGGTT
ATGATGTATAAAGTAAGAAAGAGTAGAATTGGATCAGTGAATCGTTTTTTAGTCATTTAT
TGCATGATAAAT*ACTACAAGT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2CI04JQ 788 0 0
CTGGGGCGATAATTCTGAAAAGACAGATTTCCTATCTTTTCTTTGATCTCGGGTGGAATA
CGATCGGGGGGGGCTAATTCAAACCCCTCAGGTAAAATAAGAACAGCTCCCACATTCAAA
GCTCCTTTTTTACCATTAGCTAGAACTTGTTTTAGCTGCATATCATAAGGAATTTTAACA
ACTGCTTCAAAAA**GTATCAGGAAGTACCGCTTGTGGAACCTCAATATCCACGGGCTTA
CTAGCTAAATGGCAATTGGCACATACAATACGCCCAGTTGCCTCTCGTGGATTTTCATAA
TTCTGCTGGGCAAAAATTGGATATGCACTTGAAATGGATGCCCAAGTTATTATATATATC
ATGAGTGAGACAGATATGGAGCGAGTAATCTCTTCCCTTATCTAAGAAAAGGTATTTCTA
GTTTGCATGGTCCAATCATTTATCCCGAAAATTTCTACAATAAAGTTAGGTAGGTCGATA
ATATACTTCCCTAGCCACAATTCTGCTATTTACATTTACTGAAAAAAAAGTTTTTTTTTA
TTGAAATATACAAGGAATCCCTCGTGGGTAAAAAAGAGTAAAGTAAATACGACTTTGATT
TGGTTATGATGTATAAAGTAAGAAAGAGTAGAATTGGATCAGTGAATCGTTTTTTAGTCA
TTTATTGCATGATAAATCACTACAAGTGACGGAGATACACGATTTAAATAACGAAAGATC
CAATATTTAAAAATTGTATCAAGAATGACTGGAAAGGTAGAAACTAGACCAGATAAAATT
TGTTCATA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2GD58JQ 787 0 0
GT
GGCGATAATTCTGAAAAGACAGATTTCCTATCTTTTCTTTGATCTCGGGTGAAATACGAT
CGGGGGGGGCTAATTCAAACCCCTCAGGTAAAATAAGAACAGCTCCCACATTCAAAGCTC
CTTTTTTACCATTAGCTAGAACTTGTTTTAGCTGCATATCATAAGGAATTTTAACAACTG
CTTCAAATACAGTATCAGGAAGTACCGCTTGTGGAACCTCAATATCCACGGGCTTACTAG
CTAAATGGCAATTGGCACATACAATACGCCCAGTTGCCTCTCGTGGATTTTCATAATTCT
GCTGGGCAAAAATTGGATATGCACTTGAAATGGATGCCCAAGTTATTATATATATCATGA
GTGAGACAGATATGGAGCGAGTAATCTCTTCCCTTATCCAAGAAAGGGTATTTCTAGTTT
GCATGGTCCAATCATTTATCCCGAAAATTTCTACAATAAAGTTAGGTAGGTCGATAATAT
ACTTCCCTAGCCACAATTCTGCTATTTACATTTACTGAAAAAAAAATTTTTTTTTATTGA
AATATACAAGGAATCCCTCGTGGGTAAAAAAGAGTAAAGTAAATACGACTTTGATTTGGT
TATGATGTATAAAGTAAGAAAGAGTAGAATTGGATCAGTGAATCGTTTTTTAGTCATTTA
TTGCATGATAAATCACTACAAGTGACGGAGATACACGATTTAAATAACGAAAGATCCAAT
ATTTAAAAATTGTATCAAGAATGACTGGAAAGGTAGAAACTAGACCAGATAAAATTTGTT
CATAA

QA 3 787 3 787
DS 

RD RR2GD58TF 715 0 0
AACAACTGCTTCAAATACAGTATCAGGAAGTACCGCTTGTGGAAC*TCAATATCCACGGG
CTTACTAGCTAAATGGCAATTGGCACATACAATACGCCCAGTTGCCTCTCGTGGATTTTC
ATAATTCTGCTGGGCAAAAATTGGATATGCACTTGAAATGGATGCCCAAGTTATTATATA
TATCATGAGTGAGACAGATATGGAGCGAGTAATCTCTTCCCTTATCCAAGAAAGGGTATT
TCTAGTTTGCATGGTCCAATCATTTATCCCGAAAATTTCTACAATAAAGTTAGGTAGGTC
GATAATATACTTCCCTAGCCACAATTCTGCTATTTACATTTACTGAAAAAAAAATTTTTT
TTTATTGAAATATACAAGGAATCCCTCGTGGGTAAAAAAGAGTAAAGTAAATACGACTTT
GATTTGGTTATGATGTATAAAGTAAGAAAGAGTAGAATTGGATCAGTGAATCGTTTTTTA
GTCATTTATTGCATGATAAATCACTACAAGTGACGGAGATACACGATTTAAATAACGAAA
GATCCAATATTTAAAAATTGTATCAAGAATGACTGGAAAGGTAGAAACTAGACCAGATAA
AATTTGTTCATAATGAGCAAACCCAAAATCTTTGTAAATATAACCAATCATTAGTTCCCA
ACCGTGAGGCGAATGGAATCCGATACATAAATCAGTTAATAAAAGAATCGAAAAA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2EX43TF 653 0 0
TACTAGCTAAATGGCAATTGGCACATACAATACGCCCAGTTGCCTCTCGTGGATTTTCAT
AATTCTGCTGGGCAAAAATTGGATATGCACTTGAAATGGATGCCCAAGTTATTATATATA
TCATGAGTGAGACAGATATGGAGCGAGTAATCTCTTCCCTTATCCAAGAAAAGGTATTTC
TAGTTTGCATGGTCCAATCATTTATCCCGAAAATTTCTACAATAAAGTTAGGTAGGTCGA
TAATATACTTCCCTAGCCACAATTCTGCTATTTACATTTACTGAAAAAAAA*TTTTTTTT
TATTGAAATATACAAGGAATCCCTCGTGGGTAAAAAAGAGTAAAGTAAATACGACTTTGA
TTTGGTTATGATGTATAAAGTAAGAAAGAGTAGAATTGGATCAGTGAATCGTTTTTTAGT
CATTTATTGCATGATAAATCACTACAAGTGACGGAGATACACGATTTAAATAACGAAAGA
TCCAATATTTAAAAATTGTATCAAGAATGACTGGAAAGGTAGAAACTAGACCAGATAAAA
TTTGTTCATAATGAGCAAACCCAAAATCTTTGTAAATATAACCAATCATTAGTTCCCAAC
CGTGAGGCGAATGGAATCCGATACATAAATCAGTTAATAAAAGAATCGAAAAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2CI04TF 669 0 0
CTCGTGGATTTTCATAATTCTGCTGGGCAAAAATGGGATATGCACTTGAAATGGATGCCC
AAGTTATTATATATATCATGAGTGAGACAGATATGGAGCGAGTAATCTCTTCCCTTATCT
AAGAAAAGGTATTTCTAGTTTGCATGGTCCAATCATTTATCCCGAAAATTTCTACAATAA
AGTTAGGTAGGTCGATAATATACTTCCCTAGCCACAATTCTGCTATTTACATTTACTGAA
AAAAAAGTTTTTTTTTATTGAAATATACAAGGAATCCCTCGTGGGTAAAAAAGAGTAAAG
TAAATACGACTTTGATTTGGTTATGATGTATAAAGTAAGAAAGAGTAGAATTGGATCAGT
GAATCGTTTTTTAGTCATTTATTGCATGATAAATCACTACAAGTGACGGAGATACACGAT
TTAAATAACGAAAGATCCAATATTTAAAAATTGTATCAAGAATGACTGGAAAGGTAGAAA
CTAGACCAGATAAAATTTGTTCATAATGAGCAAACCCAAAATCTTTGTAAATATAACCAA
TCATTAGTTCCCAACCGTGAGGCGAATGGAATCCGATACATAAATCAGTTAATAAAAGAA
TCGAAAAAGCTTTAATTGTATCACTTAAATTATATAGGAATTCTTGAACCCAAGAATTGA
GAATAAAAA

QA 1 669 1 669
DS 



AS 2 7

CO CL987Contig1 871 2 12 U
GGGCGCTGTTCCAAGGGTTTCGTTGGTTACGAAGGAAGAAGAGAAGAGAAGATAAGAAAG
AGGGTGAAGAAGATGCCAGGCCCAGTCGTTAAAGAAGTTAACACTGAGGAGCAATTGATG
GATGCCATCAAAGAGCAAATAAAGCTCCAGAAGGAAAATGATGTTGTCGTTGAGGATGTA
AAAGACGGAGATGAAGACGACGATGAGGACGACGACGATGACAACGTCGATGGAGCTGGT
GAGAATGAGAGCTCCAAGCAAAGCCGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCAATGCTGAAA
CTTGGAATGAAACCCGTCACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGAGATCAAAGAATGTT
CTGTTTGTCATCTCGAAGCCTGATGTGTTCAAGAGTCCCAACTCTGACACCTATGTGATA
TTCGGCGAGGCCAAGATTGATGACATGAGCTCACAGCTACAAGCCCAAGCTGCTCAGAGG
TTCAAGATGCCTGATGTTGCGTCTATGATCCCCAGCAACGCTGATGCCTCTCAAGCAGCC
ACTGTTGCACAAGAGGAGGAAGATGATGATGATGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAAGCT
AAAGACATTGATCTTGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCGAAGGCCAAAGCCGTTAAGGCT
CTCAAGACTAATGATGGAGACATCGTTTCTGCCATTATGGAACTCACTACATAGGTTGAG
TTGCAGGGACTTCCCGTTGGTTCTCTTTTGTAGTTCACTTGCATTTCTTAACCATTTTCA
TTTGTGTTTCCCCACTTCTAAGGCTTGTTTTTCCCTTCTATGAGCCATAAACATATTTGC
TTCAAAGTCTATAATATGAGACATGTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E463TF U 1
AF RR2FC50TF U 212
BS 1 638 RR2E463TF
BS 639 639 RR2FC50TF
BS 640 642 RR2E463TF
BS 643 643 RR2FC50TF
BS 644 650 RR2E463TF
BS 651 651 RR2FC50TF
BS 652 655 RR2E463TF
BS 656 656 RR2FC50TF
BS 657 662 RR2E463TF
BS 663 663 RR2FC50TF
BS 664 702 RR2E463TF
BS 703 871 RR2FC50TF

RD RR2E463TF 702 0 0
GGGCGCTGTTCCAAGGGTTTCGTTGGTTACGAAGGAAGAAGAGAAGAGAAGATAAGAAAG
AGGGTGAAGAAGATGCCAGGCCCAGTCGTTAAAGAAGTTAACACTGAGGAGCAATTGATG
GATGCCATCAAAGAGCAAATAAAGCTCCAGAAGGAAAATGATGTTGTCGTTGAGGATGTA
AAAGACGGAGATGAAGACGACGATGAGGACGACGACGATGACAACGTCGATGGAGCTGGT
GAGAATGAGAGCTCCAAGCAAAGCCGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCAATGCTGAAA
CTTGGAATGAAACCCGTCACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGAGATCAAAGAATGTT
CTGTTTGTCATCTCGAAGCCTGATGTGTTCAAGAGTCCCAACTCTGACACCTATGTGATA
TTCGGCGAGGCCAAGATTGATGACATGAGCTCACAGCTACAAGCCCAAGCTGCTCAGAGG
TTCAAGATGCCTGATGTTGCGTCTATGATCCCCAGCAACGCTGATGCCTCTCAAGCAGCC
ACTGTTGCACAAGAGGAGGAAGATGATGATGATGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAAGCT
AAAGACATTGATCTTGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCTAAG*CCAAAGCTGTTA*GGCT
CTTAAGACTAATGATGGAGACATCGTTTCTGCCATTATGGAA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2FC50TF 660 0 0
G
CGACGATGACAACGTCGATGGAGCTGGTGAGAATGAGAGCTCCAAGCAAAGCCGAAGCGA
GAAGAAAAGCCGCAAAGCAATGCTGAAACTTGGGATGAAACCTGTCACTGATGTTAGCAG
AGTCACAATCAAGAGATCAAAGAATGTTCTGTTTGTCATCTCGAAGCCTGATGTGTTCAA
GAGTCCCAACTCTGACACCTATGTGATATTCGGCGAGGCCAAGATTGATGACATGAGCTC
ACAGCTACAAGCCCAAGCTGCTCAGAGGTTCAAGATGCCTGATGTTGCGTCTATGATCCC
CAGCAACGCTGATGCCTCTCAAGCAGCCACTGTTGCACAAGAGGAGGAAGATGATGATGA
TGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAAGCTAAGGACATTGATCTTGTGATGACTCAAGCTGG
TGTCTCGAAGGCCAAAGCCGTTAAGGCTCTCAAGACTAATGATGGAGATATCGTTTCTGC
CATTATGGAACTCACTACATAGGTTGAGTTGCAGGGACTTCCCGTTGGTTCTCTTTTGTA
GTTCACTTGCATTTCTTAACCATTTTCATTTGTGTTTCCCCACTTCTAAGGCTTGTTTTT
CCCTTCTATGAGCCATAAACATATTTGCTTCAAAGTCTATAATATGAGACATGTTATGC

QA 2 660 2 660
DS 



CO CL987Contig2 876 5 15 U
GGGCATAACATGTCTCATATTATAGACTTTGAAGCAAATATGTTTATGGCTCATAGAAGG
GAAAATAAGCCTTAGAAGTGGGGAAACACAAATGAAAAGGGTTAAGAAATGCAAGTGAAC
TACAAAAGAGGACCAACAGGGAGTCTCTGCAACTCAAAACTATGTAGTGAGTTCCATAAT
GGCAGAAACGATATCTCCATCATTAGTCTTAAGAGCCTTAACAGCTTTGGCCTTAGAGAC
ACCAGCTTGAGTCATCACAAGATCAATGTCCTTAGCCTCAACACCAGTCTCATCAACATC
ATCATCATCATCTTCCTCCTCTTGTGCAACAGTGGCTGCTTGAGAGGCATCAGCGTTGCT
GGGGATCATAGACGCAACATCAGGCATCTTGAACCTCTGAGCAGCTTAGGCTTGTAGCTG
TGAGCTCATGTCATCAATCTTGGCCTCGCCGAATATCACATAGGTGTCAGAGTTGGGACT
CTTGAACACATCAGGCTTCGAGATGACAAACAGAACATTCTTTGATCTCTTGATTGTGAC
TCTGCTAACATCAGTGACAGGCTTCATTCCAAGTTTCAGCATTGCTTCGCGGCTTTTCTT
CTCGCTTCGGCTTTGCTTGGAGCTCTCATTCTCACCAGCTCCATCGACGTTGTCATCGTC
GTCGTCCTCATCGTCGTCTTCATCTCCGTCTTTTACATCCTCAACGACAACATCATTTTC
CTTCTGGAGCTTTATTTGCTCTTTGATGGCATCCATCAATTGCTCCTCAGTGTTAACTTC
TTCAACGACTGGGCCTGGCATCTTCTTCACCCTCTTTCTTATCCTCTCTTCTCTTCTTCC
TTCGTAACCAACGAAACCCTTGGAACAGCGCAGCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E463JQ U 2
AF RR2FS47JQ U 1
AF RR2GA14JQ U 1
AF RR2GA14TF C 113
AF RR2FS47TF C 123
BS 1 230 RR2FS47JQ
BS 231 231 RR2GA14JQ
BS 232 276 RR2FS47JQ
BS 277 277 RR2GA14JQ
BS 278 309 RR2FS47JQ
BS 310 312 RR2GA14JQ
BS 313 407 RR2FS47JQ
BS 408 408 RR2GA14JQ
BS 409 471 RR2FS47JQ
BS 472 472 RR2GA14JQ
BS 473 587 RR2FS47JQ
BS 588 588 RR2GA14JQ
BS 589 716 RR2FS47JQ
BS 717 833 RR2GA14JQ
BS 834 876 RR2FS47TF

RD RR2E463JQ 214 0 0
G
GCATAACATGTCTCATATTATAGACTTTGAAGCAAATATGTTTATGGCTCATAAAAGGGA
AAATAAGCCTTAAAAGTGGGGAAACACAAATGAAAAGGGTTAAAAAATGCAAGTGAACTA
CAAAAGAGGACCAACAGGGAGTCTCTGCAACTCAAAACTATGTAGTGAGTTCCATAATGG
CAGAAACGATGTCTCCATCATTAGTCTTAA
AAA

QA 2 211 2 211
DS 

RD RR2FS47JQ 716 0 0
GGGCATAACATGTCTCATATTATAGACTTTGAAGCAAATATGTTTATGGCTCATAGAAGG
GAAAATAAGCCTTAGAAGTGGGGAAACACAAATGAAAAGGGTTAAGAAATGCAAGTGAAC
TACAAAAGAGGACCAACAGGGAGTCTCTGCAACTCAAAACTATGTAGTGAGTTCCATAAT
GGCAGAAACGATATCTCCATCATTAGTCTTAAGAGCCTTAACAGCTTTGGTCTTAGAGAC
ACCAGCTTGAGTCATCACAAGATCAATGTCCTTAGCTTCAACACCAGTCTCATCAACATC
ATCATCATC***TTCCTCCTCTTGTGCAACAGTGGCTGCTTGAGAGGCATCAGCGTTGCT
GGGGATCATAGACGCAACATCAGGCATCTTGAACCTCTGAGCAGCTTGGGCTTGTAGCTG
TGAGCTCATGTCATCAATCTTGGCCTCGCCGAATATCACATAGGTGTCAGAATTGGGACT
CTTGAACACATCAGGCTTCGAGATGACAAACAGAACATTCTTTGATCTCTTGATTGTGAC
TCTGCTAACATCAGTGACAGGCTTCATTCCAAGTTTCAGCATTGCTTTGCGGCTTTTCTT
CTCGCTTCGGCTTTGCTTGGAGCTCTCATTCTCACCAGCTCCATCGACGTTGTCATCGTC
GTCGTCCTCATCGTCGTCTTCATCTCCGTCTTTTACATCCTCAACGACAACATCAT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2GA14JQ 834 0 0
AG
GCATAACATGTCTCATATTATAGACTTTGAAGCAAATATGTTTATGGCTCATAGAAGGGA
AAATAAGCCTTAGAAGTGGGGAAACACAAATGAAAAGGGTAAAGAAATGCAAGTGAACTA
CAAAAGAGGACCAACAGGGAGTCTCTGCAACTCAAAACTATGTAGTGAGTTCCATAATGG
CAGAAACGATATCTCCATCATTAGTCTTAAGAGCCTTAACAGCTTTGGCCTTAGAGACAC
CAGCTTGAGTCATCACAAGATCAATGTCCTTAGCCTCAACACCAGTCTCATCAACATCAT
CATCATCATCTTCCTCCTCTTGTGCAACAGTGGCTGCTTGAGAGGCATCAGCGTTGCTGG
GGATCATAGACGCAACATCAGGCATCTTGAACCTCTGAGCAGCTTAGGCTTGTAGCTGTG
AGCTCATGTCATCAATCTTGGCCTCGCCGAATATCACATAGGTGTCAGAGTTGGGACTCT
TGAACACATCAGGCTTCGAGATGACAAACAGAACATTCTTTGATCTCTTGATTGTGACTC
TGCTAACATCAGTGACAGGTTTCATTCCAAGTTTCAGCATTGCTTCGCGGCTTTTCTTCT
CGCTTCGGCTTTGCTTGGAGCTCTCATTCTCACCAGCTCCATCGACGTTGTCATCGTCGT
CGTCCTCATCGTCGTCTTCATCTCCGTCTTTTACATCCTCAACGACAACATCATTTTCCT
TCTGGAGCTTTATTTGCTCTTTGATGGCATCCATCAATTGCTCCTCAGTGTTAACTTCTT
CAACGACTGGGCCTGGCATCTTCTTCACCCTCTTTCTTATCCTCTCTTCTC
C

QA 3 833 3 833
DS 

RD RR2GA14TF 723 0 0
AAGTGAACTACAAAAGAGGACCAACAGGGAGTCTCTGCAACTCAAAACTATGTAGTGAGT
TCCATAATGGCAGAAACGATATCTCCATCATTAGTCTTAAGAGCCT*AACAGCTTTGGCC
T*AGAGACACCAGCTTGAGTCATCACAAGATCAATGTCCTTAGCCTCAACACCAGTCTCA
TCAACATCATCATCATCATCTTCCTCCTCTTGTGCAACAGTGGCTGCTTGAGAGGCATCA
GCGTTGCTGGGGATCATAGACGCAACATCAGGCATCTTGAACCTCTGAGCAGCTTAGGCT
TGTAGCTGTGAGCTCATGTCATCAATCTTGGCCTCGCCGAATATCACATAGGTGTCAGAG
TTGGGACTCTTGAACACATCAGGCTTCGAGATGACAAACAGAACATTCTTTGATCTCTTG
ATTGTGACTCTGCTAACATCAGTGACAGGTTTCATTCCAAGTTTCAGCATTGCTTCGCGG
CTTTTCTTCTCGCTTCGGCTTTGCTTGGAGCTCTCATTCTCACCAGCTCCATCGACGTTG
TCATCGTCGTCGTCCTCATCGTCGTCTTCATCTCCGTCTTTTACATCCTCAACGACAACA
TCATTTTCCTTCTGGAGCTTTATTTGCTCTTTGATGGCATCCATCAATTGCTCCTCAGTG
TTAACTTCTTCAACGACTGGGCCTGGCATCTTCTTCACCCTCTTTCTTATCCTCTCTTCT
C
CC

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2FS47TF 754 0 0
CAAAAGAGGACCAACAGGGAGTCTCTGCAACTCAAAACTATGTAGTGAGTTCCATAATGG
CAGAAACGATATCTCCATCATTAGTCTTAAGAGCCTTAACAGCTTTGGTCTTAGAGACAC
CAGCTTGAGTCATCACAAGATCAATGTCCTTAGCTTCAACACCAGTCTCATCAACATCAT
CATCATC***TTCCTCCTCTTGTGCAACAGTGGCTGCTTGAGAGGCATCAGCGTTGCTGG
GGATCATAGACGCAACATCAGGCATCTTGAACCTCTGAGCAGCTTGGGCTTGTAGCTGTG
AGCTCATGTCATCAATCTTGGCCTCGCCGAATATCACATAGGTGTCAGAGTTGGGACTCT
TGAACACATCAGGCTTCGAGATGACAAACAGAACATTCTTTGATCTCTTGATTGTGACTC
TGCTAACATCAGTGACAGGCTTCATTCCAAGTTTCAGCATTGCTTTGCGGCTTTTCTTCT
CGCTTCGGCTTTGCTTGGAGCTCTCATTCTCACCAGCTCCATCGACGTTGTCATCGTCGT
CGTCCTCATCGTCGTCTTCATCTCCGTCTTTTACATCCTCAACGACAACATCATTTTCCT
TCTGGAGCTTTATTTGCTCTTTGATGGCATCCATCAATTGCTCCTCAGTGTTAACTTCTT
CAACGACTGGGCCTGGCATCTTCTTCACCCTCTTTCTTATCTTCTCTTCTCTTCTTCCTT
CGTAACCAACGAAACCCTTGGAACAGCGCAGCCC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 2 7

CO CL988Contig1 804 2 10 U
GGGAGGACCATCGAATCAAATCAACCGAAGAAGAAGACGATGAAGATCTTCCACGTTCCT
TGTCTAGAAGACAACTACTCCTATCTAATAATCGATGAGAGCACCAGAGACGCGGCGGTT
GCGGATCCAGTTGATCCAGAAAAGGTGATTGATGCAGCTGAGAAGCACAGTGCAAAGATC
AAGTTCGTTCTCACCACACATCATCACTGGGATCATGCTGGTGGAAACGAGAAGATGAAG
CAGTTGGTGCCTGGAATCAAAGTCTATGGAGGTTCTCTTGATAAGGTCAAGGGATGCACT
GATGCGGTCGACAATGGTGACACCTTGTCTTTGGGTCATGATCTCAACATCTTAGCTCTT
CACACCCCTTGTCACACCAAGGGTCACATTAGTTACTATGTCACTGGCAAAGATGGAGAA
TCTCCAGCTGTGTTCACTGGAGATACACTTTTCGTTGCTGGCTGTGGGAAGTTTTTCGAA
GGGACAGCTGAACAGATGCATCAGTCCCCGTGTGTGACTCTGGCTTCACTACCTAAACCC
ACCCAGATTTACTGCGGCCACGAGTACACTGTGAAGAACTTGGAGTTTGCTTTGACTGTG
GAACCAAACAACGAGAAAATACAGCAGAAGCTATCATGGGCCCGTCAACAGCGCCAAGCA
AATCTTCCCACAATCCCTTCAACACTAGAGGAAGAACTCGAAACAAACCCGTTTATGCGC
GTTAATAACCCTGAGATACAGGAGAAACTTGGTTGCAAATCACCGATTGATACTCTCAGA
GAAATCAGAACAAGAATGATCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DB18TF U 1
AF RR2B876TF U 56
BS 1 121 RR2DB18TF
BS 122 122 RR2B876TF
BS 123 233 RR2DB18TF
BS 234 234 RR2B876TF
BS 235 507 RR2DB18TF
BS 508 509 RR2B876TF
BS 510 692 RR2DB18TF
BS 693 693 RR2B876TF
BS 694 741 RR2DB18TF
BS 742 804 RR2B876TF

RD RR2DB18TF 744 0 0
GGGAGGACCATCGAATCAAATCAACCGAAGAAGAAGACGATGAAGATCTTCCACGTTCCT
TGTCTAGAAGACAACTACTCCTATCTAATAATCGATGAGAGCACCAGAGACGCGGCGGTT
GTGGATCCAGTTGATCCAGAAAAGGTGATTGATGCAGCTGAGAAGCACAGTGCAAAGATC
AAGTTCGTTCTCACCACACATCATCACTGGGATCATGCTGGTGGAAACGAGAATATGAAG
CAGTTGGTGCCTGGAATCAAAGTCTATGGAGGTTCTCTTGATAAGGTCAAGGGATGCACT
GATGCGGTCGACAATGGTGACACCTTGTCTTTGGGTCATGATCTCAACATCTTAGCTCTT
CACACCCCTTGTCACACCAAGGGTCACATTAGTTACTATGTCACTGGCAAAGATGGAGAA
TCTCCAGCTGTGTTCACTGGAGATACACTTTTCGTTGCTGGCTGTGGGAAGTTTTTCGAA
GGGACAGCTGAACAGATGCATCAGTCCTTGTGTGTGACTCTGGCTTCACTACCTAAACCC
ACCCAGATTTACTGCGGCCACGAGTACACTGTGAAGAACTTGGAGTTTGCTTTGACTGTG
GAACCAAACAACGAGAAAATACAGCAGAAGCTATCATGGGCCCGTCAACAGCGCCAAGCA
AATCTTCCCACAATCCCTTCAACACTAGAGGA*GAACTCGAAACAAACCCGTTTATGCGC
GTTAATAACCCTGAGATACAG
AGA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2B876TF 749 0 0
TTCCTTGTCTAGAAGACAACTACTCCTATCTAATAATCGATGAGAGCACCAGAGACGCGG
CGGTTGCGGATCCAGTTGATCCAGAAAAGGTGATTGATGCAGCTGAGAAGCACAGTGCAA
AGATCAAGTTCGTTCTCACCACACATCATCACTGGGATCATGCTGGTGGAAACGAGAAGA
TGAAGCAGTTGGTGCCTGGAATCAAAGTCTATGGAGGTTCTCTTGATAAGGTCAAGGGAT
GCACTGATGCGGTCGACAATGGTGACACCTTGTCTTTGGGTCATGATCTCAACATCTTAG
CTCTTCACACCCCTTGTCACACCAAGGGTCACATTAGTTACTATGTCACTGGCAAAGATG
GAGAATCTCCAGCTGTGTTCACTGGAGATACACTTTTCGTTGCTGGCTGTGGGAAGTTTT
TCGAAGGGACAGCTGAACAGATGCATCAGTCCCCTTGTGTGACTCTGGCTTCACTACCTA
AACCCACCCAGATTTACTGCGGCCACGAGTACACTGTGAAGAACTTGGAGTTTGCTTTGA
CTGTGGAACCAAACAACGAGAAAATACAGCAGAAGCTATCATGGGCCCGTCAACAGCGCC
AAGCAAATCTTCCCACAATCCCTTCAACACTAGAGGAAGAACTCGAAACAAACCCGTTTA
TGCGCGTTAATAACCCTGAGATACAGGAGAAACTTGGTTGCAAATCACCGATTGATACTC
TCAGAGAAATCAGAACAAGAATGATCAGT

QA 1 749 1 749
DS 



CO CL988Contig2 924 5 14 U
GGGTCAACGAAGTTTCACACA**GTATATAATAAACTTTTTCAAAGGTTCACCACAGCAC
ACGAAAAGGCATTTATGCAAGAAGCTATACGATGATTCTTAGCCCCTCCACTGATCCTTC
TTGTTCCTGATTTCTCTGAGAGTATCGATCGGTGATTTGCAACCAAGTTTCTCCTGTATC
TCAGGATTAGTAACGCGCATAAACGGGTTTGTTTCGAGTTCTTCCTCTAGCGTTGAAGGG
ATTGTGGGAAGATTTGCTTGGCGCTGTTGACGGGCCCATGATAGCTTCTGCTGTATCTTC
TCGTTGTTTGGTTCCACAGTCAAAGCAAACTCCAAGTTCTTCACGGTGTACTCGTGGCCG
CAGTAAACCTGGGTGGGTTTAGGTAGTGAAGCAAGAGTCACACACAAGGACTGATGCATC
TGTTCAGCTGTCCCTTCGAAAAACTTCCCACAGCCAGCAACGAAAAGTGTATCTCCAGTG
AACACGGCTGGAGATTCTCCATCTTTGCCAGTTACATAGTAACTAATGTGACCCTTGGTG
TGACAAGGGGTGTGAAGAGCTAAGATGTTGAGATCATGACCCAAAGACAAGGTGTCACCA
TTATCGACCGCATCAGTGCATCCCTTGACCTTATCAAGAGAGCCTCCATAGACTTTGATT
CCAGGCACCAACTGCTTCATCTTCTCGTTGCCACCCGCATGATCCCAGTGATGATGCGTG
GTGAGAACGAACTTGATCTTTGCACTGTGCTGCTCAGCCGACTGAATCACCTTCCCCGGT
TCAACTGGATCCACAACCGCCGCGTCTCCGGTGCTCTCATCGATTATCAGATAGGAGTAG
TTGTCTTCTAAACAAGGAACGTGGAAGATCTTCATCGTCTTCTTCTTCAGTTGATTCGAT
TCGATGATCGTCGTAATCCTCCCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2H810JQ U 1
AF RR2C104JQ U 2
AF RR2C811JQ U 2
AF RR2C811TF C 215
AF RR2C104TF C 307
BS 1 117 RR2H810JQ
BS 118 118 RR2C104JQ
BS 119 144 RR2H810JQ
BS 145 145 RR2C104JQ
BS 146 242 RR2H810JQ
BS 243 243 RR2C811JQ
BS 244 654 RR2H810JQ
BS 655 655 RR2C104JQ
BS 656 774 RR2H810JQ
BS 775 810 RR2C811JQ
BS 811 811 RR2C811TF
BS 812 850 RR2C811JQ
BS 851 923 RR2C811TF
BS 924 924 RR2C104TF

RD RR2H810JQ 774 0 0
GGGTCAACGAAGTTTCACACA**GTATATAATAAACTTTTTCAAAGGTTCACCACAGCAC
ACGAAAAGGCATTTATGCAAGAAGCTATACGATGATTCTTAGCCCCTCCACTGATCCATC
TTGTTCCTGATTTCTCTGAGAGTACCGATCGGTGATTTGCAACCAAGTTTCTCCTGTATC
TCAGGATTAGTAACGCGCATAAACGGGTTTGTTTCGAGTTCTTCCTCTAGCGTTGAAGGG
ATCGTGGGAAGATTTGCTTGGCGCTGTTGACGGGCCCATGATAGCTTCTGCTGTATCTTC
TCGTTGTTTGGTTCCACAGTCAAAGCAAACTCCAAGTTCTTCACGGTGTACTCGTGGCCG
CAGTAAACCTGGGTGGGTTTAGGTAGTGAAGCAAGAGTCACACACAAGGACTGATGCATC
TGTTCAGCTGTCCCTTCGAAAAACTTCCCACAGCCAGCAACGAAAAGTGTATCTCCAGTG
AACACGGCTGGAGATTCTCCATCTTTGCCAGTTACATAGTAACTAATGTGACCCTTGGTG
TGACAAGGGGTGTGAAGAGCTAAGATGTTGAGATCATGACCCAAAGACAAGGTGTCACCA
TTATCGACCGCATCAGTGCATCCCTTGACCTTATCAAGAGAGCCTCCATAGACTCTGATT
CCAGGCACCAACTGCTTCATCTTCTCGTTGCCACCCGCATGATCCCAGTGATGATGCGTG
GTGAGAACGAACTTGATCTTTGCACTGTGCTGCTCAGCCGACTGAATCACCTTC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2C104JQ 780 0 0
GGTCAACGAAGTTTCACACA**GTATATAATAAACTTTTTCAAAGGTTCACCACAGCACA
CGAAAAGGCATTTATGCAAGAAGCTATACGATGATTCTTAGCCCCTCCACTGATCCTTCT
TGTTCCTGATTTCTCTGAGAGTATCGATCGGTGATTTGCAACCAAGTTTCTCCTGTATCT
CAGGATTAGTAACGCGCATAAACGGGTTTGTTTCGAGTTCTTCCTCTAGCGTTGAAGGGA
TCGTGGGAAGATTTGCTTGGCGCTGTTGACGGGCCCATGATAGCTCCTGCTGTATCTTCT
CGTTGTTTGGTTCCACAGTCAAAGCAAACTCCAAGTTCTTCACGGTGTACTCGTGGCCGC
AGTAAACCTGGGTGGGTTTAGGTAGTGAAGCAAGAGTCACACACAAGGACTGATGCATCT
GTTCAGCTGTCCCTTCGAAAAACTTCCCACAGCCAGCAACGAAAAGTGTATCTCCAGTGA
ACACGGCTGGAGATTCTCCATCTTTGCCAGTTACATAGTGACTAATGTGACCCTTGGTGT
GACAAGGGGTGTGAAGAGCTAAGATGTTGAGATCATGACCCAAAGACAAGGTGTCACCAT
TATCGACCGCATCAGTGCATCCCTTGACCTTATCAAGAGAGCCTCCATAGACTTTGATTC
CAGGCACCAACTGCTTCATCTTCTCGTTGCCACCCGCATGATCCCAGTGATGATGCGTGG
TGAGAACGAACTTGATCTTTGCACTGTGCTGCTCAGCCGACTGAATCACCTTC
TCCGTTC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2C811JQ 850 0 0
GGTCAACGAAGTTTCACACAGAGTATATAATAAACTTTTTCAAGGGTTCACTGCAGCACA
CGAAAAGGCATTTATGCAAGAAGCTATACGATGATTCTTAGCCCCTCCACTGATCCTTCT
TGTTCCTGATTTCTCTGAGAGTATCAATCGGTGATTTGCAACCAAGTTTCTCCTGTATCT
CAGGATTAGTAACACGCATAAACGGGTTTGTTTCGAGTTCTTCCTCTAGCGTTGAAGGGA
TTGTGGGAAGATTTGCTTGGCGCTGTTGACGGGCCCATGATAGCTTCTGCTGTATCTTCT
CGTTGTTTGGTTCCGCAGTCAAAGCAAACTCCAAGTTCTTCACGGTGTACTCGTGGCCGC
AGTAAACCTGGGTCGGTTTAGGTAGTGAAGCCAGAGTCACACACAAGGACTGATGCATCT
GTTCAGCTGTCCCTTCGAAAAACTTCCCACAGCCAGCGACGAAAAGTGTATCTCCAGTGA
ACACAGCTGGACTTTCTCCATCTTTGCCAGTGACATAGTAACTAATGTGACCCTTGGTGT
GACAAGGGGTGTGAAGAGCTAATATGTTGAGATCATGACCCAAAGACAAAGTGTCACCAT
TATCGACCGCATCAGTGCATCCCTTGACTTTATCAAGAGAACCTCCATAGACTTTGATTC
CAGGCACCAACTGCTTCATCTTCTCGTTTCCACCAGCATGATCCCAGTGATGATGCGTGG
TGAGAACGAACTTGATCTTTGCACTGTGCTGCTCAGCCGACTGAATCACCTTCCCCGGTT
CAACTGGATCCACAACCGCCGCGTCTCCG*TGCTCTCATCGATTATCAGATAGGAGTAGT
TGTCTTCTA
A

QA 1 849 1 849
DS 

RD RR2C811TF 709 0 0
CGAGTTCTTCCTCTAGCGTTGAAGGGATTGTGGGAAGATTTGCTTGGCGCTGTTGACGGG
CCCATGATAGCTTCTGCTGTATCTTCTCGTTGTTTGGTTCCGCAGTCAAAGCAAACTCCA
AGTTCTTCACGGTGTACTCGTGGCCGCAGTAAACCTGGGTCGGTTTAGGTAGTGAAGCCA
GAGTCACACACAAGGACTGATGCATCTGTTCAGCTGTCCCTTCGAAAAACTTCCCACAGC
CAGCGACGAAAAGTGTATCTCCAGTGAACACAGCTGGACTTTCTCCATCTTTGCCAGTGA
CATAGTAACTAATGTGACCCTTGGTGTGACAAGGGGTGTGAAGAGCTAATATGTTGAGAT
CATGACCCAAAGACAAAGTGTCACCATTATCGACCGCATCAGTGCATCCCTTGACTTTAT
CAAGAGAACCTCCATAGACTTTGATTCCAGGCACCAACTGCTTCATCTTCTCGTTTCCAC
CAGCATGATCCCAGTGATGATGCGTGGTGAGAACGAACTTGATCTTTGCACTGTGCTGCT
CAGCCGACTGAATCACCTTCCCCGGTTCAACTGGATCCACAACCGCCGCGTCTCCGGTGC
TCTCATCGATTATCAGATAGGAGTAGTTGTCTTCTAAACAAGGAACGTGGAAGATCTTCA
TCGTCTTCTTCTTCAGTTGATTCGATTCGATGATCGTCGTAATCCTCCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2C104TF 618 0 0
TTTGGTTCCACAGTCAAAGCAAACTCCAAGTTCTTCACGGTGTACTCGTGGCCGCAGTAA
ACCTGGGTGGGTTTAGGTAGTGAAGCAAGAGTCACACACAAGGACTGATGCATCTGTTCA
GCTGTCCCTTCGAAAAACTTCCCACAGCCAGCAACGAAAAGTGTATCTCCAGTGAACACG
GCTGGAGATTCTCCATCTTTGCCAGTTACATAGTGACTAATGTGACCCTTGGTGTGACAA
GGGGTGTGAAGAGCTAAGATGTTGAGATCATGACCCAAAGACAAGGTGTCACCATTATCG
ACCGCATCAGTGCATCCCTTGACCTTATCAAGAGAGCCTCCATAGACTTTGATTCCAGGC
ACCAACTGCTTCATCTTCTCGTTGCCACCCGCATGATCCCAGTGATGATGCGTGGTGAGA
ACGAACTTGATCTTTGCACTGTGCTGCTCAGCCGACTGAATCACCTTCTCCGGTTCAACT
GGATCCACAACCGCCGCGTCTCCGGTGCTCTCATCGATTATCAGATAAGAGTAGTTGTCT
TCTAGACAAGGAACGTGGAAGATCTTCATCGTCTTCTTCTTCGGTTGATTCGATTCGATG
ATCGTCGTTATCCTCCCC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 2 6

CO CL989Contig1 699 4 14 U
AGGGGTTGTGTTCATCGCCTTAAAACAGATCTAATCGCCAAGTGAATCGTCTCTTCCGCC
G***CGAAAACAAAATGT*TGAGGCATCGCCTGCATTGAGGAAGCCAGTGTTCACCAAGG
TTAGTGAGCTGAGACCAGGAACCAATGGTCTCTCACTTAACGTGAAAGTCATCAGCACGA
AGATGGTGATGCAGAGAGGAGGAGGAGGAGGTCGTCCCAGTGGTCCTCAGTCTCGTCAGA
TGCGTATTGCTGAATGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGAATCATTATCCTTACCGCAAGAA
ACGATCAAGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGATAGTGACCCTGCGCAATGCGAAGATCG
ACATGTACACGGGCTCTATGAGGCTTGCTGTTGATAGGTGGGGG*CGCGTTGAAGTCGCC
GAGGATTCGGCGGACATCACTGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAG
CTTGTGAGCGTTGAAGCTTAATTTTGGTTTAGACACCAAAAGAAATCTCAAAAGACTCCT
TTCTCTAGTTGAAGAAGCATTAGGCCTCTCTCTCTCTGCTTTGAGTTTTGCTTATCAGAA
TTTGCAGGTTGTTTTTTTGTTGCTGGTTTGAATCTTTATGCTTGCCTCTGATGTATGTAC
CGTTCTCATTTTGAAAATCAGGTTGCCTGTTTTCTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C301TF U 6
AF RR2D227TF U 3
AF RR2D090TF U 1
AF RR2C301JQ C 6
BS 1 60 RR2D090TF
BS 61 64 RR2C301TF
BS 65 77 RR2D090TF
BS 78 79 RR2C301TF
BS 80 88 RR2D090TF
BS 89 89 RR2C301TF
BS 90 287 RR2D090TF
BS 288 288 RR2C301TF
BS 289 369 RR2D090TF
BS 370 370 RR2C301TF
BS 371 461 RR2D090TF
BS 462 463 RR2D227TF
BS 464 603 RR2D090TF
BS 604 699 RR2C301JQ

RD RR2C301TF 484 0 0
GG
GTGTTCATCGCCTTAAAACAGATCTAATCGCCAAGTGAATCGTCTCTTCCGCCG***CGA
AAACAAAATGT*TGAGGCATCGCCTGCATTGAGGAAGCCAGTGTTCACCAAGGTTAGTGA
GCTGAGACCAGGAACCAATGGTCTCTCACTTAACGTGAAAGTCATCAGCACGAAGATGGT
GATGCAGAGAGGAGGAGGAGGAGGTCGTCCCAGTGGTCCTCAGTCTCGTCAGATGCGTAT
TGCTGAATGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGAATCATTATCCTTACCGCAAGAAACGATCA
AGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGATAGTGACCCTGCGCAATGCGAAGATCGACATGTA
CACGGGCTCTATGAGGCTTGCTGTTGATAGGTGGGGGGCGCGTTGAAGTCGCCGAGGATT
CGGCGGACATCACTGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTGTGA
GC

QA 3 484 3 484
DS 

RD RR2D227TF 557 0 0
GGGTT
GTGTTCATCGCCTTAAAACAGATCTAATCGCCAAGTGAATCGTCTCTTCCGCCAAAACGA
AAACAAAATGGCTGAGGCATCACCTGCATTGAGGAAGCCAGTGTTCACCAAGGTTAGTGA
GCTGAGACCAGGAACCAATGGTCTCTCACTTAACGTGAAAGTCATCAGCACGAAGATGGT
GATGCAGAGAGGAGGAGGAGGAGGTCGTCCCAGTGGTCCTCAGTCTCGTCAGATGCGTAT
TGCTGAATGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGAATCATTATCTTTACCGCGAGAAACGATCA
AGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGATAGTGACCCTGCGCAATGCGAAGATCGACATGTA
CAAGGGCTCTATGAGGCTTGCTGTTGATAGGTGGGGG*CGCGTTGAAGTCGCCGAGGATT
CGGCGGACATCACTGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTGTGA
GCGTTGAAGCTTAATTTTGGTTTAGACACCAAAAGAAATCTCAAAAGACTCCTTTCTCTA
GTTGAAGAAGCA

QA 6 557 6 557
DS 

RD RR2D090TF 603 0 0
AGGGGTTGTGTTCATCGCCTTAAAACAGATCTAATCGCCAAGTGAATCGTCTCTTCCGCC
AAAACGAAAACAAAATGGCTGAGGCATCACCTGCATTGAGGAAGCCAGTGTTCACCAAGG
TTAGTGAGCTGAGACCAGGAACCAATGGTCTCTCACTTAACGTGAAAGTCATCAGCACGA
AGATGGTGATGCAGAGAGGAGGAGGAGGAGGTCGTCCCAGTGGTCCTCAGTCTCGTCAGA
TGCGTATTGCTGAATGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGAATCATTATCTTTACCGCAAGAA
ACGATCAAGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGATAGTGACCCTGCGCAATGCGAAGATCG
ACATGTACAAGGGCTCTATGAGGCTTGCTGTTGATAGGTGGGGG*CGCGTTGAAGTCGCC
GAGGATTCGGCGGACATCACTGTCAAGGAAGATAACAATCT**CCCTCATCGAGTATGAG
CTTGTGAGCGTTGAAGCTTAATTTTGGTTTAGACACCAAAAGAAATCTCAAAAGACTCCT
TTCTCTAGTTGAAGAAGCATTAGGCCTCTCTCTCTCTGCTTTGAGTTTTGCTTATCAGAA
TTT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2C301JQ 694 0 0
GG
GTGTTCATCGCCTTAAAACAGATCTAATCGCCAAGTGAATCGTCTCTTCCGCCG***CGA
AAACAAAATGT*TGAGGCATCGCCTGCATTGAGGAAGCCAGTGTTCACCAAGGTTAGTGA
GCTGAGACCAGGAACCAATGGTCTCTCACTTAACGTGAAAGTCATCAGCACGAAGATGGT
GATGCAGAGAGGAGGAGGAGGAGGTCGTCCCAGTGGTCCTCAGTCTCGTCAGATGCGTAT
TGCTGAATGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGAATCATTATCCTTACCGCAAGAAACGATCA
AGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGATAGTGACCCTGCGCAATGCGAAGATCGACATGTA
CACGGGCTCTATGAGGCTTGCTGTTGATAGGTGGGGG*CGCGTTGAAGTCGCCGAGGATT
CGGCGGACATCACTGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTGTGA
GCGTTGAAGCTTAATTTTGGTTTAGACACCAAAAGAAATCTCAAAAGACTCCTTTCTCTA
GTTGAAGAAGCATTAGGCCTCTCTCTCTCTGCTTTGAGTTTTGCTTATCAGAATTTGCAG
GTTGTTTTTTTGTTGCTGGTTTGAATCTTTATGCTTGCCTCTGATGTATGTACCGTTCTC
ATTTTGAAAATCAGGTTGCCTGTTTTCTTTGT

QA 3 694 3 694
DS 



CO CL989Contig2 783 2 7 U
GGGTCTCTTCCACCAAAACAAAAAACAAAATGGCTGAGGCAGCACCTGCATTGAGGAAGC
CAGTGTTCACCAAGGTTAGTGAGCTGGGACCAGGAACCAATGGTCTCTCACTTAACGTGA
AAGTTATCAGCACGAAGATGGTGATGCAGAGAGGAGGAGGAGGAGGTCGTCCCAGTGGTC
CTCAGGCTCGTCAGATGCGTATTGCTGAATGTCTTGTTGGTGACGAGACTGGAATCATTA
TCTTTACCGCAAGAAACGATCAAGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGATAGTGACCCTGC
GCAATGCGAAGATCGACATGTACAAGGGCTCTATGAGGCTTGCTGTTGATAGGTGGGGGC
GCGTTGAAGTCGCTGAGGATTCCGCAGACATCACTGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCC
TCATCGAGTATGAGCTTGTGAGCGTTGAAGCTTAATTTTGGTTTAGACACCAAAAGAAAT
CTCAAAAGACTCCTTTCTCTAGTTGAAGAAGCATTAGGCCTCTCTCTCTATCTGCTTTCA
GTTTGCTTATCAGAATTTGCAGGTTGGTTTTTTGTTGCTGGTTTGAGTCTTTATGCTAGC
CTCTCATGTATGTACCGTTCTCATTTTGAAAATCAGGTTTCCTGTTTTCTTTGTTTTTTT
TTTTTAATGTAGATTGATTCTCTTTTTATATATCATGGGGTCATTTTCTTGTTTTAGTTT
TAGTTTCCTTGTGGACGTTAAAGCAAAAAGAAAACATATATAAGTGTCTTATGTTTGGAG
TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2EL16TF U 1
AF RR2EL16JQ C 50
BS 1 636 RR2EL16TF
BS 637 637 RR2EL16JQ
BS 638 664 RR2EL16TF
BS 665 665 RR2EL16JQ
BS 666 748 RR2EL16TF
BS 749 751 RR2EL16JQ
BS 752 783 RR2EL16TF

RD RR2EL16TF 783 0 0
GGGTCTCTTCCACCAAAACAAAAAACAAAATGGCTGAGGCAGCACCTGCATTGAGGAAGC
CAGTGTTCACCAAGGTTAGTGAGCTGGGACCAGGAACCAATGGTCTCTCACTTAACGTGA
AAGTTATCAGCACGAAGATGGTGATGCAGAGAGGAGGAGGAGGAGGTCGTCCCAGTGGTC
CTCAGGCTCGTCAGATGCGTATTGCTGAATGTCTTGTTGGTGACGAGACTGGAATCATTA
TCTTTACCGCAAGAAACGATCAAGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGATAGTGACCCTGC
GCAATGCGAAGATCGACATGTACAAGGGCTCTATGAGGCTTGCTGTTGATAGGTGGGGGC
GCGTTGAAGTCGCTGAGGATTCCGCAGACATCACTGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCC
TCATCGAGTATGAGCTTGTGAGCGTTGAAGCTTAATTTTGGTTTAGACACCAAAAGAAAT
CTCAAAAGACTCCTTTCTCTAGTTGAAGAAGCATTAGGCCTCTCTCTCTATCTGCTTTCA
GTTTGCTTATCAGAATTTGCAGGTTGGTTTTTTGTTGCTGGTTTGAGTCTTTATGCTAGC
CTCTCATGTATGTACCGTTCTCATTTTGAAAATCAG*TTTCCTGTTTTCTTTGTTTTTTT
TTTT*AATGTAGATTGATTCTCTTTTTATATATCATGGGGTCATTTTCTTGTTTTAGTTT
TAGTTTCCTTGTGGACGTTAAAGCAAAAG**AAACATATATAAGTGTCTTATGTTTGGAG
TCC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2EL16JQ 734 0 0
ATTGAGGAAGCCAGTGTTCACCAAGGTTAGTGAGCTGGGACCAGGAACCAATGGTCTCTC
ACTTAACGTGAAAGTTATCAGCACGAAGATGGTGATGCAGAGAGGAGGAGGAGGAGGTCG
TCCCAGTGGTCCTCAGGCTCGTCAGATGCGTATTGCTGAATGTCTTGTTGGTGACGAGAC
TGGAATCATTATCTTTACCGCAAGAAACGATCAAGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGAT
AGTGACCCTGCGCAATGCGAAGATCGACATGTACAAGGGCTCTATGAGGCTTGCTGTTGA
TAGGTGGGGGCGCGTTGAAGTCGCTGAGGATTCCGCAGACATCACTGTCAAGGAAGATAA
CAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTGTGAGCGTTGAAGCTTAATTTTGGTTTAGACA
CCAAAAGAAATCTCAAAAGACTCCTTTCTCTAGTTGAAGAAGCATTAGGCCTCTCTCTCT
ATCTGCTTTCAGTTTGCTTATCAGAATTTGCAGGTTGGTTTTTTGTTGCTGGTTTGAGTC
TTTATGCTAGCCTCTCATGTATGTACCGTTCTCATTTTGAAAATCAGGTTTCCTGTTTTT
TTTGTTTTTTTTTTTTAATGTAGATTGATTCTCTTTTTATATATCATGGGGTCATTTTCT
TGTTTTAGTTTTAGTTTCCTTGTGGACGTTAAAGCAAAAAGAAAACATATATAAGTGTCT
TATGTTTGGAGTCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 5

CO CL990Contig1 1384 5 8 U
AGTGAAAAAATGTTTTCTAGTAATTAAACAATGCAAAAGAAACATTGTATTTTATATGAT
TTGATACAACAAACATCATATCCTGAACCATTTATTTCATGAACAAACATTGCTTGGCCA
GCCGCTACTTCTTCTCCTATAGGGGCCATGAGTTTACTCAGAACACTCCGAAGAATGTAG
CTGCAGCAAAGACTAAGAAGAGAGCTCCACCAACGTATCCCACCACTTTCTCGGAAATAT
AGTTGGCTAAAAACGCGCCGCCCATGATTGCAAGCAATGTTGCCACTAAGTGTCCAGCAA
TAGCACCACTCGCAACTCCCCATGGTGACTGTGCAGCACCAAGCGCAACAGTTGCAAGCA
TTGACCGATCTCCCCATTCAGCAAAGAAGACAAGGCTGAATGACTTCCAGAGGATTTCAA
GTGGGTTTGTCAACTTTTTAGAAGCCTTTTCTTTAACGAGTTCCTCAGCTTCAGTGTATT
CACCGAGTTCTATACCACTCTCCTCACCATTCTTGGCTTCAGCTTGTGGAAGATCCCATG
CATCCTTAATGGATTTCAATCCAAAGAACATGAGAAGCGCAATTGCAGCATATCCTCCTA
TCGGTACCGTTGTCTGGAACTGAGCAGGCACGGATTGAAAAACCTTCCCGATAACAACCG
ATAAGACAGTCACCAACGATAAAGCTCCCATTGAACCTAAAAGGACCAATGTTTTCTCGT
ATTGCATAGCCAATAAAGCAGCAATAAAAAATGTCTTGTCACCAATCTCAGAAACGAAGA
TCAGTGAGAAGGCTGCTGTGAAGCCTGATTTTGCTACTGCTGCTAGAACTGAGGATGGTC
CTCCCTTGACAAAAGTGATTAGAGAGAATACCAAACCGCAACTCAGTAGTACAAGTGCTA
TCGATAATGAGTAAGGGAATGGCCCTTGAGGTTTTAAGCTTTCTGATGAAGACTGATCAA
GAGAACTACTTTGAGATCCATCCTCCTCACTCCCAGATCCAACACCAGCATTTGATGCAT
GAACTCTAAATTTTCCGCAGAGCAAATCCGATCTTGATCTCCATCTACATCTTAAAGGAG
GAGACGCTGGTTTTCTAGAACTCTTCGGGCAAGGCAACGATTCAGACACGGATAGAAACG
GGAGTTTCCGTACTGAACATACAGATGCTGATGCTGTGGAGTTCGCACTATTGCTAAAGC
TTGTAACACTCACTGTTCTTTAACTATGGATCCACGGACGCAGAGGGTTTAGTGAATCAT
TGATTTGGTTTGATAAACAAGAAACCCAGAAAGAAAGAAAGAAAGATGGAGACTTTCTTC
GGATTCTACTCTGCAGAGAGGATGCGTTAGCGATGATGGAGATGGATAGGATTGTGCCAT
TCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2A215JQ U 255
AF RR2CR92JQ U 1
AF RR2FM51JQ U 33
AF RR2FM51TF C 701
AF RR2DD11TF C 939
BS 1 235 RR2CR92JQ
BS 236 236 RR2FM51JQ
BS 237 250 RR2CR92JQ
BS 251 251 RR2FM51JQ
BS 252 562 RR2CR92JQ
BS 563 787 RR2FM51JQ
BS 788 1363 RR2FM51TF
BS 1364 1384 RR2DD11TF

RD RR2A215JQ 219 0 0
GCGCCGCCCATGATTGCAAGCAATGTTGCCACTAAGTGTCCAGCAATAGCACCACTCGCA
ACTCCCCATGGTGACTGTGCAGCACCAAGCGCAACAGTTGCAAGCATTGACCGAACTCCC
CATTCAGCAAAGAAGACAAGGCTGAATGATTTCCAGAGGATTTCAAGTGGGTTTGTCAAC
TTTTTAGAAGCCTTTTCTTTAACGAGTTCCTCAGCTTCA

QA 1 219 1 219
DS 

RD RR2CR92JQ 562 0 0
AGTGAAAAAATGTTTTCTAGTAATTAAACAATGCAAAAGAAACATTGTATTTTATATGAT
TTGATACAACAAACATCATATCCTGAACCATTTATTTCATGAACAAACATTGCTTGGCCA
GCCGCTACTTCTTCTCCTATAGGGGCCATGAGTTTACTCAGAACACTCCGAAGAATGTAG
CTGCAGCAAAGACTAAGAAGAGAGCTCCACCAACGTATCCCACCACTTTCTCGGAGATAT
AGTTGGCTAAGAACGCGCCGCCCATGATTGCAAGCAATGTTGCCACTAAGTGTCCAGCAA
TAGCACCACTCGCAACTCCCCATGGTGACTGTGCAGCACCAAGCGCAACAGTTGCAAGCA
TTGACCGATCTCCCCATTCAGCAAAGAAGACAAGGCTGAATGACTTCCAGAGGATTTCAA
GTGGGTTTGTCAACTTTTTAGAAGCCTTTTCTTTAACGAGTTCCTCAGCTTCAGTGTATT
CACCGAGTTCTATACCACTCTCCTCACCATTCTTGGCTTCAGCTTGTGGAAGATCCCATG
CATCCTTAATGGATTTCAATCC

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2FM51JQ 755 0 0
GCAAAAGAAACATTGTATTTTATATGATTTGATACAACAAACATCATATCCTGAACCGTT
TATTTCATGAACAAACATTGCTTGGCCAGCCGCTACTTCTTCTCCTATAGGGGCCATGAG
TTTACTCAGAACACTCCGAAGAATGTAGCTGCAGCAAAGACTAAGAAGAGAGCTCCACCA
ACGTATCCCACCACTTTCTCGGAAATATAGTTGGCTAAAAACGCGCCGCCCATGATTGCA
AGCAATGTTGCCACTAAGTGTCCAGCAATAGCACCACTCGCAACTCCCCATGGTGACTGT
GCAGCACCAAGCGCAACAGTTGCAAGCATTGACCGATCTCCCCATTCAGCAAAGAAGACA
AGGCTGAATGACTTCCAGAGGATTTCAAGTGGGTTTGTCAACTTTTTAGAAGCCTTTTCT
TTAACGAGTTCCTCAGCTTCAGTGTATTCACCGAGTTCTATACCACTCTCCTCACCATTC
TTGGCTTCGGCTTGTGGAAGATCCCATGCATCCTTAATGGATTTCAATCCAAAGAACATG
AGAAGCGCAATTGCAGCATATCCTCCTATCGGTACCGTTGTCTGGAACTGAGCAGGCACG
GATTGAAAAACCTTCCCGATAACAACCGATAAGACAGTCACCAACGATAAAGCTCCCATT
GAACCTAAAAGGACCAATGTTTTCTCGTATTGCATAGCCAATAAAGCAGCAATAAAAAAT
GTCTTGTCACCAATCTCAGAAACGAAGATCAGTGA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2FM51TF 666 0 0
AAGGACCAATGTTTTCTCGTATTGCATAGCCAATAAAGCAGCAATAAAAAATGTCTTGTC
ACCAATCTCAGAAACGAAGATCAGTGAGAAGGCTGCTGTGAAGCCTGATTTTGCTACTGC
TGCTAGAACTGAGGATGGTCCTCCCTTGACAAAAGTGATTAGAGAGAATACCAAACCGCA
ACTCAGTAGTACAAGTGCTATCGATAATGAGTAAGGGAATGGCCCTTGAGGTTTTAAGCT
TTCTGATGAAGACTGATCAAGAGAACTACTTTGAGATCCATCCTCCTCACTCCCAGATCC
AACACCAGCATTTGATGCATGAACTCTAAATTTTCCGCAGAGCAAATCCGATCTTGATCT
CCATCTACATCTTAAAGGAGGAGACGCTGGTTTTCTAGAACTCTTCGGGCAAGGCAACGA
TTCAGACACGGATAGAAACGGGAGTTTCCGTACTGAACATACAGATGCTGATGCTGTGGA
GTTCGCACTATTGCTAAAGCTTGTAACACTCACTGTTCTTTAACTATGGATCCACGGACG
CAGAGGGTTTAGTGAATCATTGATTTGGTTTGATAAACAAGAAACCCAGAAAGAAAGAAA
GAAAGATGGAGACTTTCTTCGGATTCTACTCTGCAGAGAGGATGCGTTAGCGATGATGGA
GAT
CCC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2DD11TF 446 0 0
CTTTCTGATGAAGACTGATCAAGAGAACTACTTTGAGATCCATCCTCCTCACTCCCAGAT
CCAACACCAGCATTTGATGCATGAACTTTAAATTTTCCGCAGAGCAAATCCGATCTTGAT
CTCCATCTACATCTTAAAGGAGGAGACGCTGGTTTTCTAGAACTCTTCGGGCAAGGCAAC
GATTCAGACACGGATAGAAACGGGAGTTTCCGTACTGAACATACAGATGGTGATGCTGTG
GAGTTCGCACTATTGCTAAAGCTTGTAACACTCATTGTTCTTTAACTATGGATCCACGGA
CGCAGAGGGTTTAGTGAATTATTGATTTGGTTTGATAAACAAGAAACCCAGAAAGAAAGA
AAGAAAGATGGAGACTTTCTTCGGATTCTACTCTGCAGAGAGGATGCGTTAGCGATGATG
GAGATGGATAGGATTGTGCCATTCCC

QA 1 446 1 446
DS 



AS 2 7

CO CL991Contig1 1060 5 10 U
GGCTCCCAAACTCTCTCACACGCCGCAACGTAGCGAACAATCGAATCGACGAAGAAAACT
CGATCCGTTCCGTTAGATACTATGGCGACCAACGAACCCGAGCACGAGCACAGAGACGCG
GAAGAAGCTGGAGCTAACGAGGACGAGGACACCGGAGCTCAGGTCGCTCCGATCGTTAGA
CTTGAGGAAGTTGCCGTCACTACCGGCGAGGAAGACGAAGACGCCGTCCTCGATCTGAAA
TCGAAGCTGTATCGGTTCGATAGGGAGGCGAATCAGTGGAAGGAGAGAGGTGGTGGTACT
GTGAAGCTATTGAAGCATAAGAGCACTGGGAAGATTCGTCTCGTCATGAGGCAATCGAAA
ACTCTCAAGATCTGTGCTAATCACTTCGTTAAACAGGGGATGAGTGTTCAGGAACACGTT
GGAAATGAAAAGTCTTGTGTGTGGCACGCTCGTGACTTTGCTGATGGTGAACTCAAGGAT
GAGCTTTTCTGCATCCGTTTCGCTTCTATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTC
AATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATGCGTCTGACACCGCT
GGTCTTCTCGAGAAGCTGAGCGTTGAAGAGTCGAAAACAGAGGAGAAACCTGTGGAAAAG
GAGAAGACTGAAGTGGAAGCAGAGGAGAAGAAAAAAAGCGAGCCAGAGAAAGCTGATGAA
GTAAAGAAAACCGAAGAGGCTAGTCCCTCGACTTAAGTTGCATCAACTTTTAAGCTCCCA
AATCTTGGCGAGTTATTTATAGCTATATCTAGTGTTTGATGCATCTCTCTCGAGTCTACT
ATTGCCTGGGCACTATCTATCTACACATGTTTTGTCTGAGTCAGATCGCTTGGGGTCGGG
TTTTGCAGTGTCGTTTTTGGGTCTATAGTTTTTGAGTCTGAAAGTGTCGGTGGAATGATA
TGAAAGATTTATTTATAAAGTCCGTTGGATTCAGTGTTTTTTCTTATGGATCGTTTTTTA
GATGGTCTTGTTATGGGGGATAGAGATGATGTTCGTCCAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ82TF U 1
AF RR2D235TF U 1
AF RR2D235JQ C 230
AF RR2F493TF U 361
AF RR2EJ82JQ C 285
BS 1 696 RR2D235TF
BS 697 697 RR2F493TF
BS 698 755 RR2D235TF
BS 756 964 RR2F493TF
BS 965 965 RR2D235JQ
BS 966 981 RR2F493TF
BS 982 982 RR2D235JQ
BS 983 988 RR2F493TF
BS 989 1004 RR2D235JQ
BS 1005 1060 RR2EJ82JQ

RD RR2EJ82TF 558 0 0
GGCTCCCAAACTCTCTCACACGCCGCAACGTAGCGAACAATCGAATCGACGAAGAAAACT
CGATCCGTTCCGTTAGATACTATGGCGACCAACGAACCCGAGCACGAGCACAGAGACGCG
GAAGAAGCTGGAGCTAACGAGGACGAGGACACCGGAGCTCAGGTCGCTCCGATCGTTAGA
CTTGAGGAAGTTGCCGTCACTACCGGCGAGGAAGACGAAGACGCCGTCCTCGATCTGAAA
TCGAAGCTGTATCGGTTCGATAAGGAGGCGAATCAGTGGAAGGAGAGGGGTGGTGGTACT
GTGAAGCTATTGAAGCATAAGAGCACTGGGAAGATTCGTCTCGTCATGAGGCGATCGAAA
ACTCTCAAGATCTGTGCTAATCACTTCGTTAAACAGGGGATGAGTGTTCAGGAACACGTT
GGAAATGAAAAGTCTTGTGTGTGGCACGCTCGTGACTTTGCTGATGGTGAACTCAAGGAT
GAGCTTTTCTGCATCCGTTTCGCTTCTATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTC
AATGAAGTTGCTGAATCT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2D235TF 755 0 0
GGCTCCCAAACTCTCTCACACGCCGCAACGTAGCGAACAATCGAATCGACGAAGAAAACT
CGATCCGTTCCGTTAGATACTATGGCGACCAACGAACCCGAGCACGAGCACAGAGACGCG
GAAGAAGCTGGAGCTAACGAGGACGAGGACACCGGAGCTCAGGTCGCTCCGATCGTTAGA
CTTGAGGAAGTTGCCGTCACTACCGGCGAGGAAGACGAAGACGCCGTCCTCGATCTGAAA
TCGAAGCTGTATCGGTTCGATAGGGAGGCGAATCAGTGGAAGGAGAGAGGTGGTGGTACT
GTGAAGCTATTGAAGCATAAGAGCACTGGGAAGATTCGTCTCGTCATGAGGCAATCGAAA
ACTCTCAAGATCTGTGCTAATCACTTCGTTAAACAGGGGATGAGTGTTCAGGAACACGTT
GGAAATGAAAAGTCTTGTGTGTGGCACGCTCGTGACTTTGCTGATGGTGAACTCAAGGAT
GAGCTTTTCTGCATCCGTTTCGCTTCTATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTC
AATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATGCGTCTGACACCGCT
GGTCTTCTCGAGAAGCTGAGCGTTGAAGAGTCGAAAACAGAGGAGAAACCTGTGGAAAAG
GAGAAGACTGAAGTGGAAGCAGAGGAGAAGAAAAAA*GCGAGCCAGAGAAAGCTGATGAA
GTAAAGAAAACCGAAGAGGCTAGTCCCTCGACTTA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2D235JQ 776 0 0
TC
GATCTGAAATCGAAGCTGTATCGGTTCGATAGGGAGGCGAATCAGTGGAAGGAGAGAGGT
GGTGGTACTGTGAAGCTATTGAAGCATAAGAGCACTGGGAAGATTCGTCTCGTCATGAGG
CAATCGAAAACTCTCAAGATCTGTGCTAATCACTTCGTTAAACAGGGGATGAGTGTTCAG
GAACACGTTGGAAATGAAAAGTCTTGTGTGTGGCACGCTCGTGACTTTGCTGATGGTGAA
CTCAAGGATGAGCTTTTCTGCATCCGTTTCGCTTCTATTGAGAACTGCAAAGCATTTATG
CAGAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATGCGTCT
GACACCGCTGGTCTTCTCGAGAAGCTGAGCGTTGAAGAGTCGAAAACAGAGGAGAAACCT
GTGGAAAAGGAGAAGACTGAAGTGGAAGCAGAGGAGAAGAAAAAAAGCGAGCCAGAGAAA
GCTGATGAAGTAAAGAAAACCGAAGAGGCTAGTCCCTCGACTTAAGTTGCATCAACTTTT
AAGCTCCCAAATCTTGGCGAGTTATTTATAGCTATATCTAGTGTTTGATGCATCTCTCTC
GAGTCTACTATTGCCTGGGCACTATCTATCTACACATGTTTTGTCTGAGTCAGATCGCTT
GGGGTCGGGTTTTGCAGTGTCGTTTTTGGGTCTATAGTTTTTGAGTCTGAAAGTGTCGGT
GGAATGATATGAAAGATTTATTTATAAAGTCCGTTGGATTCAGTGTTTTTTCT
C

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR2F493TF 628 0 0
GT
TCTCAAGATCTGTGCTAATCACTTCGTTAAACAGGGGATGAGTGTTCAGGAACACGTTGG
AAATGAAAAGTCTTGTGTGTGGCACGCTCGTGACTTTGCTGATGGTGAACTCAAGGATGA
GCTTTTCTGCATCCGTTTCGCTTCTATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTCAA
TGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATGCGTCTGACACCGCTGG
TCTTCTCGAGAAGCTGAGCGTTGAAGAGTCGAAAACAGAGGAGAAACCTGTGGAAAAGGA
GAAGACTGAAGTGGAAGCAGAGGAGAAGAAAAAAAGCGAGCCAGAGAAAGCTGATGAAGT
AAAGAAAACCGAAGAGGCTAGTCCCTCGACTTAAGTTGCATCAACTTTTAAGCTCCCAAA
TCTTGGCGAGTTATTTATAGCTATATCTAGTGTTTGATGCATCTCTCTCGAGTCTACTAT
TGCCTGGGCACTATCTATCTACACATGTTTTGTCTGAGTCAGATCGCTTGGGGTCGGGTT
TTGCAGTGTCGTTTTTGGGTCTATAGTTTTTGAGTCTGAAAGTGTCGGTGGAATGATATG
AA*GATTTATTTATAAAGTACGTTGG

QA 3 628 3 628
DS 

RD RR2EJ82JQ 776 0 0
GAGG
GGTGGTGGTACTGTGAAGCTATTGAAGCATAAGAGCACTGGGAAGATTCGTCTCGTCATG
AGGCGATCGAAAACTCTCAAGATCTGTGCTAATCACTTCGTTAAACAGGGGATGAGTGTT
CAGGAACACGTTGGAAATGAAAAGTCTTGTGTGTGGCACGCTCGTGACTTTGCTGATGGT
GAACTCAAGGATGAGCTTTTCTGCATCCGTTTCGCTTCTATTGAGAACTGCAAAGCATTT
ATGCAGAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATGCG
TCTGACACCGCTGGTCTTCTCGAGAAGCTGAGCGTTGAAGAGTCGAAAACAGAGGAGAAA
CCTGTGGAAAAGGAGAAGACTGAAGTGGAAGCAGAGGAGAAGAAAAAAAGCGAGCCAGAG
AAAGCTGATGAAGTAAAGAAAACCGAAGAGGTTAGTCCCTCGACTTAAGTTGCATCAACT
TTTAAGCTCCCAAATCTTGGCGAGTTATTTATAGCTATATCTAGTGTTTGATGCATCTCT
CTCGAGTCTACTATTGCCTGGGCACTATCTATCTACACATGTTTTGTCTGAGTCAGATCG
CTTGGGGTCGGGTTTTGCAGTGTCGTTTTTGGGTCTATAGTTTTTGAGTCTGGAAGTGTC
GGTGGAATGATATGAAAGATTTATTTATAAAGTCCGTTGGATTCAGTGTTTTTTCTTATG
GATCGTTTTTTAGATGGTCTTGTTATGGGGGATAGAGATGATGTTCGTCCAG

QA 5 776 5 776
DS 



CO CL991Contig2 948 2 2 U
GGCTCCCAAATTCTCTCACACGCCGCAGCGTAGCGAACAATCGAATCGACGAAGAAAACT
CGATCCGTTAGATACTATGGCGACGACCAACGAGCCCGAGCACGAGCACAGAGACGCGGA
AGAAGCTGGAGCTAACGAGGACGAGGACACCGGAGCTCAGGTCGCTCCGATCGTCAGGCT
CGAGGAAGTCGCCGTCACTACCGGCGAGGAAGACGAAGACGCCGTCCTAGATCTGAAATC
GAAGCTGTATCGGTTCGATAAGGAGGCGAATCAGTGGAAGGAGAGAGGTGGTGGTACTGT
GAAGCTATTGAAGCATAAGAGCACTGGGAAGATTCGTCTCGTCATGAGGCAATCGAAAAC
TCTCAAGATCTGTGCTAATCACTTCGTTAAACAGGGGATGAGTGTTCAGGAACACGTTGG
AAATGAAAAGTCTTGTGTGTGGCACGCACGTGACTTTGCTGATGGTGAACTCAAGGATGA
GCTTTTCTGCATCCGTTTCGCTTCTATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTCAA
TGAAGTAGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATACCTCCGACACCGCTGG
TCTTCTTGAGAAGCTGACCGTGGAAGAGACGAAAACAGAGGAGAAGCCTGTGGAAAAGGA
GAAGACTGAAGTGGAAGCAGAGGAGAAGAAGAAGAAGAGCGAGCCAGAGAAAGCTGATGA
AGCAAAGAAAACCGAAGAGGCTACTCCCTCAGCTTAAGTTGCATCAACTTTTAAGCTCCC
AAATCCTGGCGAGGTATTTATAGCTATAACTAGTGTTTGGATGCATCTCTCTCTCGAGTC
TACTATTGTCTGGGCACTATCTATCTACACATGGTTTGTCTGAGTCAGATCGCTTGGGGT
CGGGTTTGCAGTGTCGTTTTGGGTCTATAGTTTTGAGTCTGAAGTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW31TF U 1
AF RR2E266TF U 137
BS 1 690 RR2GW31TF
BS 691 948 RR2E266TF

RD RR2GW31TF 691 0 0
GGCTCCCAAATTCTCTCACACGCCGCAGCGTAGCGAACAATCGAATCGACGAAGAAAACT
CGATCCGTTAGATACTATGGCGACGACCAACGAGCCCGAGCACGAGCACAGAGACGCGGA
AGAAGCTGGAGCTAACGAGGACGAGGACACCGGAGCTCAGGTCGCTCCGATCGTCAGGCT
CGAGGAAGTCGCCGTCACTACCGGCGAGGAAGACGAAGACGCCGTCCTAGATCTGAAATC
GAAGCTGTATCGGTTCGATAAGGAGGCGAATCAGTGGAAGGAGAGAGGTGGTGGTACTGT
GAAGCTATTGAAGCATAAGAGCACTGGGAAGATTCGTCTCGTCATGAGGCAATCGAAAAC
TCTCAAGATCTGTGCTAATCACTTCGTTAAACAGGGGATGAGTGTTCAGGAACACGTTGG
AAATGAAAAGTCTTGTGTGTGGCACGCACGTGACTTTGCTGATGGTGAACTCAAGGATGA
GCTTTTCTGCATCCGTTTCGCTTCTATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTCAA
TGAAGTAGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATACCTCCGACACCGCTGG
TCTTCTTGAGAAGCTGACCGTGGAAGAGACGAAAACAGAGGAGAAGCCTGTGGAAAAGGA
GAAGACTGAAGTGGAAGCAGAGGAGAAGAA
G

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2E266TF 812 0 0
GAGGACGAGGACACCGGAGCTCAGGTCGCTCCGATCGTCAGGCTCGAGGAAGTTGCCGTC
ACTACCGGCGAGGAAGACGAAGACGCCGTCCTAGATCTGAAATCGAAGCTGTATCGGTTC
GATAAGGAGGCGAATCAGTGGAAGGAGAGAGGTGGTGGTACTGTGAAGCTATTGAAGCAT
AAGAGCACTGGGAAGATTCGTCTCGTCATGAGGCAATCGAAAACTCTCAAGATCTGTGCT
AATCACTTCGTTAAACAGGGGATGAGTGTTCAGGAACACGTTGGAAATGAAAAGTCTTGT
GTGTGGCACGCACGTGACTTTGCTGATGGTGAACTTAAGGATGAGCTTTTCTGCATCCGT
TTCGCTTCTATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTCAATGAAGTAGCTGAATCT
GAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATACCTCCGACACCGCTGGTCTTCTTGAGAAGCTG
ACCGTGGAAGAGACGAAAACAGAGGAGAAGCCTGTGGAAAAGGAGAAGACTGAAGTGGAA
GCAGAGGAGAAGAAGAAGAAGAGCGAGCCAGAGAAAGCTGATGAAGCAAAGAAAACCGAA
GAGGCTACTCCCTCAGCTTAAGTTGCATCAACTTTTAAGCTCCCAAATCCTGGCGAGGTA
TTTATAGCTATAACTAGTGTTTGGATGCATCTCTCTCTCGAGTCTACTATTGTCTGGGCA
CTATCTATCTACACATGGTTTGTCTGAGTCAGATCGCTTGGGGTCGGGTTTGCAGTGTCG
TTTTGGGTCTATAGTTTTGAGTCTGAAGTGTC

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 5

CO CL992Contig1 787 5 36 U
AGAACAATGGCGTCTACAGCTAGCCATCTTGTTGTTGTTGTCACCATGTTGGTCTCAGCC
ATGGCCGTAGTAGCAGAATCCAACACGCTTCAAGATTTTTGTGTTGCTGATTTGTCCAAT
GCTGTCAAGGTCAACGGCTACACATGCAAGGACTCAACACAAGTAACACCTGAAGACTTC
TACTTCCAAGGCTTAGCCACAGCCAAAAACGCTGCAAACTCCTCCACAGGAGCCATCGTA
ACCGGAGCCACCGTGGAGAAGCTACCAGGACTCAACACTCTCGGCCTCTCCATGTCCCGC
ATTGACTACGCACCAAACGGCCTAAACCCACCCCACGTCCACCCACGTGCCTCCGAGATC
ATCTTTGTCCTAGAAGGTCAGCTCTACGTCGGCTTTGTGACAACCGCAGGGAAACTAGTA
GCTAAATACATCAACAAAGGAGACATGTTCGTTTTCCCCAAAGGACTCCTCCATTTCCAG
AAGAACATTGCTGGATCAGCTCCAGCTTCTGTCCTAGCTGCTTTCGATAGCCAGTTGCCT
GGAACACAGTCCCTTGTGGCAACTCTCTTTGGAGCTCTTCCTGACAACATTCTCGTTGAG
TCGTTCAAGATCAAACCCAAACAGGTTAAGACAATCAAGGCCAGATACCAACCGAAGAAA
TGAGGAGAGACA*TAAACAAACACAATCTTTGTCTTCCTTTTTGAGCTCTAATTGTAAAA
CATTAAGAAAAGATTTAAAGTTTGGAAACATTTTTAAAACAAAAATCAATGAAAAGAGTT
TGTTCAT


BQ
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 

AF RR2G640TF U 1
AF RR2BC10TF U 1
AF RR2CQ85TF U 1
AF RR2CQ85JQ C 3
AF RR2G640JQ C 194
BS 1 30 RR2BC10TF
BS 31 31 RR2CQ85TF
BS 32 62 RR2BC10TF
BS 63 63 RR2CQ85TF
BS 64 302 RR2BC10TF
BS 303 303 RR2CQ85TF
BS 304 464 RR2BC10TF
BS 465 465 RR2CQ85TF
BS 466 467 RR2BC10TF
BS 468 468 RR2CQ85TF
BS 469 495 RR2BC10TF
BS 496 496 RR2CQ85TF
BS 497 500 RR2BC10TF
BS 501 501 RR2CQ85TF
BS 502 512 RR2BC10TF
BS 513 513 RR2CQ85TF
BS 514 518 RR2BC10TF
BS 519 519 RR2CQ85TF
BS 520 524 RR2BC10TF
BS 525 525 RR2CQ85TF
BS 526 545 RR2BC10TF
BS 546 546 RR2CQ85TF
BS 547 586 RR2BC10TF
BS 587 587 RR2CQ85TF
BS 588 653 RR2BC10TF
BS 654 654 RR2CQ85TF
BS 655 670 RR2BC10TF
BS 671 671 RR2CQ85TF
BS 672 680 RR2BC10TF
BS 681 684 RR2CQ85TF
BS 685 735 RR2BC10TF
BS 736 736 RR2CQ85JQ
BS 737 744 RR2BC10TF
BS 745 747 RR2CQ85JQ
BS 748 748 RR2G640JQ
BS 749 787 RR2CQ85JQ

RD RR2G640TF 693 0 0
AGAACAATGGCGTCTACAGCTAGCCATCTTGTTGTTGTTGTCACCATGTTGGTCTCAGCC
ATGGCCGTAGTAGCAGAATCCAACATGCTTCAAGATTTTTGTGTTGCTGATTTGTCCAAT
GCTGTCAAGGTCAACGGCTACACATGCAAGGACTCAACACAAGTAACACCTGAAGACTTC
TACTTCCAAGGCTTAGCCACAGCCAAAAACGCTGCAAACTCCTCCACAGGAGCCATCGTA
ACCGGAGCCACCGTGGAGAAGCTACCAGGACTCAACACTCTCGGCCTCTCCATGTCCCGC
ATTGACTACGCACCAAACGGCCTAAACCCACCCCACGTCCACCCACGTGCCTCCGAGATC
ATCTTTGTCCTAGAAGGTCAGCTCTACGTCGGCTTTGTGACAACCGCAGGGAAACTAGTA
GCTAAATACATCAACAAAGGAGACATGTTCGTTTTCCCCAAAGGACTCCTCCATTTCCAG
AAGAACATTGCTGGATCAGCTCCAGCTTCTGTCCTAGCTGCTTTCGATAGCCAGTTGCCT
GGAACACAGTCCCTTGTGGCAACTCTCTTTGGAGCTCTTCCTGACAACATTCTCGTTGAG
TCGTTCAAGATCAAACCCAAACAGGTTAAGACAATCAAGGCCAGATACCAACCGAAGAAA
TGAGGAGAGACA*TAAACAAACACAATCTTTGT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2BC10TF 744 0 0
AGAACAATGGCGTCTACAGCTAGCCATCTTCTTGTTGTTGTCACCATGTTGGTCTCAGCC
ATAGCCGTAGTAGCAGAATCCAACACGCTTCAAGATTTTTGTGTTGCTGATTTGTCCAAT
GCTGTCAAGGTCAACGGCTACACATGCAAGGACTCAACACAAGTAACACCTGAAGACTTC
TACTTCCAAGGCTTAGCCACAGCCAAAAACGCTGCAAACTCCTCCACAGGAGCCATCGTA
ACCGGAGCCACCGTGGAGAAGCTACCAGGACTCAACACTCTCGGCCTCTCCATGTCCCGC
ATCGACTACGCACCAAACGGCCTAAACCCACCCCACGTCCACCCACGTGCCTCCGAGATC
ATCTTTGTCCTAGAAGGTCAGCTCTACGTCGGCTTTGTGACAACCGCAGGGAAACTAGTA
GCTAAATACATCAACAAAGGAGACATGTTCGTTTTCCCCAAAGGGCTTCTCCATTTCCAG
AAGAACATTGCTGGAGCAGCCCCAGCTTCTGTGCTAGCAGCTTTTGATAGCCAGTTGCCT
GGAACGCAGTCCCTTGTGGCAACTCTCTTTGGAGCTCTTCCTGACAGCATTCTCGTTGAG
TCGTTCAAGATCAAACCCAAACAGGTTAAGACAATCAAGGCCAGATACCAACCAAAGAAA
TGAGGAGAGA*A*TAAACAA****AATCTTTGTCTTCCTTTTTGAGCTCTAATTGTAAAA
CATTAAGAAAAGATTAAAAGTTTG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2CQ85TF 726 0 0
AGAACAATGGCGTCTACAGCTAGCCATCTTGTTGTTGTTGTCACCATGTTGGTCTCAGCC
ATGGCCGTAGTAGCAGAATCCAACACGCTTCAAGATTTTTGTGTTGCTGATTTGTCCAAT
GCTGTCAAGGTCAACGGCTACACATGCAAGGACTCAACACAAGTAACACCTGAAGACTTC
TACTTCCAAGGCTTAGCCACAGCCAAAAACGCTGCAAACTCCTCCACAGGAGCCATCGTA
ACCGGAGCCACCGTGGAGAAGCTACCAGGACTCAACACTCTCGGCCTCTCCATGTCCCGC
ATTGACTACGCACCAAACGGCCTAAACCCACCCCACGTCCACCCACGTGCCTCCGAGATC
ATCTTTGTCCTAGAAGGTCAGCTCTACGTCGGCTTTGTGACAACCGCAGGGAAACTAGTA
GCTAAATACATCAACAAAGGAGACATGTTCGTTTTCCCCAAAGGACTCCTCCATTTCCAG
AAGAACATTGCTGGATCAGCTCCAGCTTCTGTCCTAGCTGCTTTCGATAGCCAGTTGCCT
GGAACACAGTCCCTTGTGGCAACTCTCTTTGGAGCTCTTCCTGACAACATTCTCGTTGAG
TCGTTCAAGATCAAACCCAAACAGGTTAAGACAATCAAGGCCAGATACCAACCGAAGAAA
TGAGGAGAGACA*TAAACAAACACAATCTTTGTCTTCCTTTTTGAGCTCTAATTGTAAAA
CATTA
G

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2CQ85JQ 785 0 0
AAA
AATGGCGTCTACAGCTAGCCATCTTGTTGTTGTTGTCACCATGTTGGTCTCAGCCATGGC
CGTAGTAGCAGAATCCAACACGCTTCAAGATTTTTGTGTTGCTGATTTGTCCAATGCTGT
CAAGGTCAACGGCTACACATGCAAGGACTCAACACAAGTAACACCTGAAGACTTCTACTT
CCAAGGCTTAGCCACAGCCAAAAACGCTGCAAACTCCTCCACAGGAGCCATCGTAACCGG
AGCCACCGTGGAGAAGCTACCAGGACTCAACACTCTCGGCCTCTCCATGTCCCGCATTGA
CTACGCACCAAACGGCCTAAACCCACCCCACGTCCACCCACGTGCCTCCGAGATCATCTT
TGTCCTAGAAGGTCAGCTCTACGTCGGCTTTGTGACAACCGCAGGGAAACTAGTAGCTAA
ATACATCAACAAAGGAGACATGTTCGTTTTCCCCAAAGGACTCCTCCATTTCCAGAAGAA
CATTGCTGGATCAGCTCCAGCTTCTGTCCTAGCTGCTTTCGATAGCCAGTTGCCTGGAAC
ACAGTCCCTTGTGGCAACTCTCTTTGGAGCTCTTCCTGACAACATTCTCGTTGAGTCGTT
CAAGATCAAACCCAAACAGGTTAAGACAATCAAGGCCAGATACCAACCGAAGAAATGAGG
AGAGACAATAAACAAACACAATCTTTGTCTTCCTTTTTGAGCTCTAATTGTAAAACATTA
AGAAAAGATTTAAAGTTTGGAAGCATTTTTAAAACAAAAATCAATGAAAAGAGTTTGTTC
AT

QA 4 785 4 785
DS 

RD RR2G640JQ 591 0 0
TAGCCACAGCCAAAAACGCTGCAAACTCCTCCACAGGAGCCATCGTAACCGGAGCCACCG
TGGAGAAGCTACCAGGACTCAACACTCTCGGCCTCTCCATGTCCCGCATTGACTACGCAC
CAAACGGCCTAAACCCACCCCACGTCCACCCACGTGCCTCCGAGATCATCTTTGTCCTAG
AAGGTCAGCTTTACGTCGGCTTTGTGACAACCGCAGGGAAACTAGTAGCTAAATACATCA
ACAAAGGAGACATGTTCGTTTTCCCCAAAGGACTCCTCCATTTCCAGAAGAACATTGCTG
GATCAGCTCCAGCTTCTGTCCTAGCTGCTTTCGATAGCCAGTTGCCTGGAACACAGTCCC
TTGTGGCAACTCTCTTTGGAGCTCTTCCTGACAACATTCTCGTTGAGTCGTTCAAGATCA
AACCCAAACAGGTTAAGACAATCAAGGCCAGATACCAACCGAAGAAATGAGGAGAGACAA
TAAACAAACACAATCTTTGTCTTCCTTTTTGAGCTCTAATTGTAAAACATTAAGAAAAGA
TTTAAAGTTTGGAAACATTTTTAAAACAAAAATCAATGAAAAGAGTTTGTT

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 7

CO CL993Contig1 568 7 22 U
GGATCTCAGTATCTCTCTCTCAAAGCCAAATTAACATTTTAGATTTCTTCAAAGTTTCTA
AAGAGAAGATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTAGCTGCGGATCTGACTGCAAGTGCGATG
GCTGCAAAGGTTGCAAAATGTACCCAGACTTGGGCTTCTCAGGCGAGACTACCACCACCG
AGACTCTTATCCTCGGCGTTGCTCCGTCTATGAACACCCAGTACGAGGCTTCGGGCGAGA
CTTTCTTCGCCGAGAATGATGGCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCGACAATTGCA
CCTGTAAATGAACAACCTCCAAACTCTGCAGTAAACCTAATGTTATGTTATGTCTTGGTT
ATATGAAATAATGGCTCATTTCGCCGGTTGTTTGGCCGGTGCTATTACCCCTGTTGTTAT
CTACATGTTGTATCCCTGTGTGACTATGTATGGTTCCAAATAGTGTTATGGGGTTTGTAA
CTGAAGTTTCAGTCGGAACTTTTTATGGTTGTTTCTTTCTTTCTTGCTCAGTACGCAACA
ATCAAGGTCAACCAATGACTCGCTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 
45 10 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA07TF U 6
AF RR2B452TF U 9
AF RR2HA31TF U 1
AF RR2FD77JQ C 6
AF RR2FD77TF U 6
AF RR2AU03JQ C 1
AF RR2AU03TF U 1
BS 1 7 RR2AU03JQ
BS 8 26 RR2DA07TF
BS 27 27 RR2AU03TF
BS 28 59 RR2DA07TF
BS 60 60 RR2AU03TF
BS 61 61 RR2DA07TF
BS 62 62 RR2AU03TF
BS 63 66 RR2DA07TF
BS 67 67 RR2AU03TF
BS 68 151 RR2DA07TF
BS 152 152 RR2AU03TF
BS 153 215 RR2DA07TF
BS 216 216 RR2AU03TF
BS 217 232 RR2DA07TF
BS 233 233 RR2AU03TF
BS 234 304 RR2DA07TF
BS 305 305 RR2AU03TF
BS 306 435 RR2DA07TF
BS 436 436 RR2AU03TF
BS 437 519 RR2DA07TF
BS 520 541 RR2AU03TF
BS 542 568 RR2AU03JQ

RD RR2DA07TF 514 0 0
GG
AGTATCTCTCTCTCAAAGCAAAATTAACATTTTAGATTTCTTCAAAGTTTCTTA*GAGAC
GATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTAGCTGCGGATCTGACTGCAAGTGCGATGGCTGCAA
AGGTTGCAAAATGTACCCAGACTTTGGCTTCTCAGGCGAGACTACCACCACCGAGACTCT
TATCCTCGGCGTTGCTCCGTCTATGAACTCCCAGTACGAGGCTTCCGGCGAGACTTTCTT
CGCCGAGAATGATGGCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCGACAATTGCACCTGCAA
ATGAACAACCTCCAAACTCTGCAGTAAACCTAATGTTATGTTATGTCTTGGTTATATGAA
ATAATGGCTCATTTCGCCGGTTGTTTGGCCGGTGCTATTACCCCTGTTGTTATCTACATG
TTGTATCCGTGTGTGACTATGTATGGTTCCAAATAGTGTTATGGGGTTTGTAACTGAAGT
TTCAGTCGGAACTTTTTATGGTTGTTTCTTTC

QA 3 514 3 514
DS 

RD RR2B452TF 492 0 0
GG
ATCTCTCTCTCAAAGCAAAATTAACATTTTAGATTTCTTCAAAGTTTCTTA*GAGACGAT
GTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTAGCCGCGGATCTGACTGCAAGTGCGATGGCTGCAAAGG
TTGCAAAATGTACCCAGACTTTGGCTTCTCAGGCGGGACTACCACCACCGAGACTCTTAT
CCTCGGCGTTGCTCCGTCTATGAACTCCCAGTACGAGGCTTCCGGCGAGACTTTCTTCGC
CGAGAATGATGGCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCGACAATTGCACCTGCAAATG
AACAACCTCCAAACTCTGCAGTAAACCTAATGTTATGTTATGTCTTGGTTATATGAAATA
ATGGCTCATTTCGCCGGTTGTTCGGCCGGTGCTATTACCCCTGTTGTTATCTACATGTTG
TATCCGTGTGTGACTATGTATGGTTCCAAATAGTGCTATGGGGTTTGTAACTGAAGTTTC
AGTCGGAACT

QA 3 492 3 492
DS 

RD RR2HA31TF 515 0 0
GGATCTC
AGTATCTCTCTCTCAAAGCAAAATTAACATTTTAGATTTCTTCAAAGTTTCTTA*GAGAC
GATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTAGCTGCGGATCTGACTGTAAGTGCGATGGCTGCAA
AGGTTGCAAAATGTACCCAGACTTTGGCTTCTCAGGCGAGACTACCACCACCGAGACTCT
TATCCTCGGCGTTGCTCCGTCTATGAACTCCCAGTACGAGGCTTCCGGCGAGACTTTCTT
CGCCGAGAATGATGGCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCGACAATTGCACCTGCAA
ATGAACAACCTCCAAACTCTGCAGTAAACCTAATGTTATGTTATGTCTTGGTTATATGAA
ATAATGGCTCATTTCGCCGGTTGTTTGGCCGGTGCTATTACCCCTGTTGTTATCTACATG
TTGTATCCGTGTGTGACTATGTATGGTTCCAAATCGTGTTATGGGGTTTGTAACTGAAGT
TTCAGTCGGAACTTTTTATGGTTGTTTC

QA 8 515 8 515
DS 

RD RR2FD77JQ 524 0 0
GG
AGTATCTCTCTCTCAAAGCCAAATTAACATTTTAGATTTCTTCAAAGTTTCTAAAGAGAA
GATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTAGCTGCGGATCTGACTGCAAGTGCGATGGCTGCAA
AGGTTGCAAAATGTACCCAGACTTGGGCTTTTCAGGCGAGACTACCACCACCGAGACTCT
TATCCTCGGCGTTGCTCCGTCTATGAACACCCAGTACGAGGCTTCGGGCGAGACTTTTTT
CGCCGAGAATGATGGCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCGACAATTGCACCTGTAA
ATGAACAACCTCCAAACTTTGCAGTAAACCTAATGTTATGTTATGTCTTGGTTATATGAA
ATAATGGCTCATTTCGCCGGTTGTTTGGCCGGTGCTATTACCCCTGTTGTTATCTACATG
TTGTATCCCTGTGTGACTATGTATGGTTCCAAATAGTGTTATGGAGTTTGTAACTGAAGT
TTCAGTCGGAACTTTTTATGGTTGTTTCTTTCTTTCTTGC
CG

QA 3 522 3 522
DS 

RD RR2FD77TF 524 0 0
GG
AGTATCTCTCTCTCAAAGCCAAATTAACATTTTAGATTTCTTCAAAGTTTCTAAAGAGAA
GATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTAGCTGCGGATCTGACTGCAAGTGCGATGGCTGCAA
AGGTTGCAAAATGTACCCAGACTTGGGCTTCTCAGGCGAGACTACCACCACCGAGACTCT
TATCCTCGGCGTTGCTCCGTCTATGAACACCCAGTACGAGGCTTCGGGCGAGACTTTCTT
CGCCGAGAATGATGGCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCGACAATTGCACCTGTAA
ATGAACAACCTCCAAACTCTGCAGTAAACCTAATGTTATGTTATGTCTTGGTTATATGAA
ATAATGGCTCATTTCGCCGGTTGTTTGGCCGGTGCTATTACCCCTGTTGTTATCTACATG
TTGTATCCCTGTGTGACTATGTATGGTTCCAAATAGTGTTATGGAGTTTGTAACTGAAGT
TTCAGTCGGAACTTTTTATGGTTGTTTCTTTCTTTCTTGC
CG

QA 3 522 3 522
DS 

RD RR2AU03JQ 568 0 0
GGATCTCAGTATCTCTCTCTCAAAGCCAAATTAACATTTTAGATTTCTTCAAAGTTTCTA
AAGAGAAGATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTAGCTGCGGATCTGACTGCAAGTGCGATG
GCTGCAAAGGTTGCAAAATGTACCCAGACTTGGGCTTCTCAGGCGAGACTACCACCACCG
AGACTCTTATCCTCGGCGTTGCTCCGTCTATGAACACCCAGTACGAGGCTTCGGGCGAGA
CTTTTTTCGCCGAGAATGATGGCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCGACAATTGCA
CCTGTAAATGAACAACCTCCAAACTCTGCAGTAAACCTAATGTTATGTTATGTCTTGGTT
ATATGAAATAATGGCTCATTTCGCCGGTTGTTTGGCCGGTGCTATTACCCCTGTTGTTAT
CTACATGTTGTATCCCCGTGTGACTATGTATGGTTCCAAATAGTGTTATGGGGTTTGTAA
CTGAAGTTTCAGTCGGAACTTTTTATGGTTGTTTCTTTCTTTCTTGCTCAGTACGCAACA
ATCAAGGTCAACCAATGACTCGCTAATG

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2AU03TF 541 0 0
GGATCTC
AGTATCTCTCTCTCAAAGCCAAATTAACATTTTAGATTTCTTCAAAGTTTCTAAAGAGAA
GATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTAGCTGCGGATCTGACTGCAAGTGCGATGGCTGCAA
AGGTTGCAAAATGTACCCAGACTTGGGCTTCTCAGGCGAGACTACCACCACCGAGACTCT
TATCCTCGGCGTTGCTCCGTCTATGAACACCCAGTACGAGGCTTCGGGCGAGACTTTCTT
CGCCGAGAATGATGGCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCGACAATTGCACCTGTAA
ATGAACAACCTCCAAACTCTGCAGTAAACCTAATGTTATGTTATGTCTTGGTTATATGAA
ATAATGGCTCATTTCGCCGGTTGTTTGGCCGGTGCTATTACCCCTGTTGTTATCTACATG
TTGTATCCCCGTGTGACTATGTATGGTTCCAAATAGTGTTATGGGGTTTGTAACTGAAGT
TTCAGTCGGAACTTTTTATGGTTGTTTCTTTCTTTCTTGCTCAGTACGCAACAA

QA 8 541 8 541
DS 



AS 2 5

CO CL994Contig1 770 2 14 U
GGAGCAACTTCAGTTCCGTACAGAAATGGCTCTTCAGGCTGCATATTCTCTTCTTCCTTC
TACCGTCTCAATCCGTAAAGAGGGCAAGTTCAATGCTAATCTAAAGGAGACGACTTTAAC
TGGGTTTTCATTTTCAAACCATCTTAAAGCAGACAAGATCTCCAACCTCTTATCCATCAA
GGAACAGAGAAGAAAAAGTCCGCGTTTTCCCACCGTTATTCGCGCACAGACTGTCACAGC
AACGCCTCCATCTAACGAAGCCTCGCCGGAGCAAAAGAAGACACAGAGAAAAGGCACCGC
AGTGATCACCGGAGCTTCCTCTGGTCTAGGTTTAGCCACGGCGAAGGCTTTAGCAGACAC
GGGGAAATGGCACGTGATCATGGCTTGCAGGAACTTTCTCAAAGCCGAGAAAGCTGCGAA
ATCCGTAGGGATGTCCAAAGAAGACTACACGGTGATGCATCTCGATCTCGCCTCGCTCGA
AAGCGTGAGGCAGTTCGTTGATAGTTTCCGCAGAACAGAACGGCCGTTAGATGTTCTTGT
TTGCAACGCAGCGGTTTACCAGCCGACTGCTAAGGAGCCTTCTTTTACAGCCGAAGGGCT
TGAGATAAGCGTTGGAACCAATCATTTAGACATTTTCTTCTCTCGAGGTTGCTTCTTGAT
GACTTGAAACAGTCTGATTATCCATCGAAACGTATGATCATCGTAGATCTATAACAGAAA
CACAACACATTGGCTGGGATGTACCGCCAAAGCGACCTGAGACTAGAGCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB80TF U 1
AF RR2EF94TF U 2
BS 1 574 RR2EB80TF
BS 575 575 RR2EF94TF
BS 576 649 RR2EB80TF
BS 650 650 RR2EF94TF
BS 651 668 RR2EB80TF
BS 669 669 RR2EF94TF
BS 670 678 RR2EB80TF
BS 679 679 RR2EF94TF
BS 680 713 RR2EB80TF
BS 714 714 RR2EF94TF
BS 715 719 RR2EB80TF
BS 720 720 RR2EF94TF
BS 721 740 RR2EB80TF
BS 741 770 RR2EF94TF

RD RR2EB80TF 740 0 0
GGAGCAACTTCAGTTCCGTACAGAAATGGCTCTTCAGGCTGCATATTCTCTTCTTCCTTC
TACCGTCTCAATCCGTAAAGAGGGCAAGTTCAATGCTAATCTAAAGGAGACGACTTTAAC
TGGGTTTTCATTTTCAAACCATCTTAAAGCAGACAAGATCTCCAACCTCTTATCCATCAA
GGAACAGAGAAGAAAAAGTCCGCGTTTTCCCACCGTTATTCGCGCACAGACTGTCACAGC
AACGCCTCCATCTAACGAAGCCTCGCCGGAGCAAAAGAAGACACAGAGAAAAGGCACCGC
AGTGATCACCGGAGCTTCCTCTGGTCTAGGTTTAGCCACGGCGAAGGCTTTAGCAGACAC
GGGGAAATGGCACGTGATCATGGCTTGCAGGAACTTTCTCAAAGCCGAGAAAGCTGCGAA
ATCCGTAGGGATGTCCAAAGAAGACTACACGGTGATGCATCTCGATCTCGCCTCGCTCGA
AAGCGTGAGGCAGTTCGTTGATAGTTTCCGCAGAACAGAACGGCCGTTAGATGTTCTTGT
TTGCAACGCAGCGGTTTACCAGCCGACTGCTAAG*AGCCTTCTTTTACAGCCGAAGGGCT
TGAGATAAGCGTTGGAACCAATCATTTAGACATTTTCTTCTCTCGAGGT*GCTTCTTGAT
GACTTGAA*CAGTCTGAT*ATCCATCGAAACGTATGATCATCGTAGATCTATA*CAGAA*
CACAACACATTGGCTGGGAT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2EF94TF 769 0 0
GAGC
AACTTCAGTTCCGTACAGAAATGGCTCTTCAGGCTGCATATTCTCTTCTTCCTTCTACCG
TCTCAATCCGTAAAGAGGGCAAGTTCAATGCTAATCTAAAGGAGACGACTTTAACTGGGT
TTTCATTTTCAAACCATCTTAAAGCAGACAAGATCTCCAACCTCTTATCCATCAAGGAAC
AGAGAAGAAAAAGTCCGCGTTTTCCCACCGTTATTCGCGCACAGACTGTCACAGCAACGC
CTCCATCTAACGAAGCCTCGCCGGAGCAAAAGAAGACACAGAGAAAAGGCACCGCAGTGA
TCACCGGAGCTTCCTCTGGTCTAGGTTTAGCCACGGCGAAGGCTTTAGCAGACACGGGGA
AATGGCACGTGATCATGGCTTGCAGGAACTTTCTCAAAGCCGAGAAAGCTGCGAAATCCG
TAGGGATGTCCAAAGAAGACTACACGGTGATGCATCTCGATCTCGCCTCGCTCGAAAGCG
TGAGGCAGTTCGTTGATAGTTTCCGCAGAACAGAACGGCCGTTAGATGTTCTTGTTTGCA
ACGCAGCGGTTTACCAGCCGACTGCTAAGGAGCCTTCTTTTACAGCCGAAGGGTTTGAGA
TAAGCGTTGGAACCAATCATTTAGACATTTTCTTCTCTCGAGGTTGCTTCTTGATGACTT
GAAACAGTCTGATTATCCATCGAAACGTATGATCATCGTAGATCTATAACAGAAACACAA
CACATTGGCTGGGATGTACCGCCAAAGCGACCTGAGACTAGAGCT

QA 5 769 5 769
DS 



CO CL994Contig2 827 3 8 U
GGTGGGAAAAGTATTACAGATTATGAATTTAGTAAATGACTTCTATTTCCATAGGTACAC
ACATACATAATCAAAAA*ATGCATTTGCATCAAGCCAAGCCAACAAGCTTCTCGCTAACC
TCCCACAGCTTCTTTGCCTTCTCTGCATCACTTGCTTCTTTTGAAAGCTGATTCTCAAAG
GAAGACGAGTTATTATTCCAGCTCCAATACACCCCTGACTTTCCCAAACTCGGATCACTC
ACAACCTGTGCTAGTCTTTTCCCAGCTTCCTCTTCAGATACGTAACCTTTGGTGATATAC
TTCTGAAAAGGCGGAAAGAGAAGCCTGAACAGAGGTACGTGTTCTCTGAACAACCCCGTC
GTAGCGATGCAACCAGGGTAAAGAGAAGCAAATGTGACTCCAGTTTCCTCGTGGTAACGC
CTGTGAAGCTCCTGCATCGTCAGCATATTGCACACTTTGCTGTCTTTGTATGCTTTGGCT
CCATCGTACTCTCCTCCATCTATCATCGAACTGTTTTGCCCGTTCAGTCCCGATGCTAAG
CCTCTTAGGTCTCCAAGGTTCGCCTTTGGCGGTACATTCCCAGCCAATGTGTTTGTGTTT
CCTGTTATAGATCCTACGATGATCATACGTTTCGATGGATAATCAGACTGTTTCAAGTCA
TCAAGAAGCAACCTCGAGAGAAGAAAATGTCCTAAATGATTGGTTCCAACGCTTATCTCA
AACCCTTCGGCTGTAAAAGAAGGCTCCTTAGCAGTCGGCTGGTAAACCGCTGCGTTGCAA
ACAAGAACATCTAACGGCCGTTCTGTTCTGCGGAAACTATCACGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT93JQ U 16
AF RR2EQ38JQ U 1
AF RR2EB80JQ U 32
BS 1 19 RR2EQ38JQ
BS 20 20 RR2DT93JQ
BS 21 76 RR2EQ38JQ
BS 77 77 RR2DT93JQ
BS 78 217 RR2EQ38JQ
BS 218 218 RR2DT93JQ
BS 219 738 RR2EQ38JQ
BS 739 827 RR2EB80JQ

RD RR2DT93JQ 617 0 0
ACAGATTATGAATTTGGTAAATGACTTCTATTTCCATAGGTACACA**TACATAATCAAA
AAAATGCATTTGCATCAAGCCAAGCCAACAAGCTTCTCGCTAACCTCCCACAGTTTCTTT
GCCTTCTCAGCATCACTTGCTTCTTTCGAAAGCTGATTCTCAAAGGAAGACGAGTTATTA
TTCCAGCTCCAATACACCCCTGACTTTCCCAAACTCGGATCACTCACAACCTGTGCTAGT
CTTTTCCCAGCTTCCTCTTCAGATACGTAACCTTTGGTGATATACTTCTGAAAAGGCGGA
AAGAGAAGCCTGAACAGAGGTACGTGTTCTCTGAACAGTCCCGTCGTAGCGATGCAGCCA
GGGTAAAGAGAAGCAAACGTGACTCCAGTTTCCTCGTGGTAACGCCTGTGAAGCTCCTGC
ATTGTCAGCATGTTGCACACTTTGCTGTCTTTGTATGCTTTGGCTCCGTCATACTCTCCT
CCATCTATCATCGAACTGTTTTGCCCGTTCAGTCCCGATGCTAAGCCTCTTAGGTCTCCG
AGGTTCGCCTTTGGCGGTACATTCCCAGCCAAAGTGTTTGTGTTTCCTGTTATAGATCCT
ACGATGATCATACGTTT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2EQ38JQ 738 0 0
GGTGGGAAAAGTATTACAGTTTATGAATTTAGTAAATGACTTCTATTTCCATAGGTACAC
ACATACATAATCAAAA**ATGCATTTGCATCAAGCCAAGCCAACAAGCTTCTCGCTAACC
TCCCACAGCTTCTTTGCCTTCTCTGCATCACTTGCTTCTTTTGAAAGCTGATTCTCAAAG
GAAGACGAGTTATTATTCCAGCTCCAATACACCCCTGGCTTTCCCAAACTCGGATCACTC
ACAACCTGTGCTAGTCTTTTCCCAGCTTCCTCTTCAGATACGTAACCTTTGGTGATATAC
TTCTGAAAAGGCGGAAAGAGAAGCCTGAACAGAGGTACGTGTTCTCTGAACAACCCCGTC
GTAGCGATGCAACCAGGGTAAAGAGAAGCAAATGTGACTCCAGTTTCCTCGTGGTAACGC
CTGTGAAGCTCCTGCATCGTCAGCATATTGCACACTTTGCTGTCTTTGTATGCTTTGGCT
CCATCGTACTCTCCTCCATCTATCATCGAACTGTTTTGCCCGTTCAGTCCCGATGCTAAG
CCTCTTAGGTCTCCAAGGTTCGCCTTTGGCGGTACATTCCCAGCCAATGTGTTTGTGTTT
CCTGTTATAGATCCTACGATGATCATACGTTTCGATGGATAATCAGACTGTTTCAAGTCA
TCAAGAAGCAACCTCGAGAGAAGAAAATGTCCTAAATGATTGGTTCCAACGCTTATCTCA
AACCCTTCGGCTGTAAAA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2EB80JQ 796 0 0
GTAAATGACTTCTATTTCCATAGGTACACACATACATAATCAAAAA*ATGCATTTGCATC
AAGCCAAGCCAACAAGCTTCTCGCTAACCTCCCACAGCTTCTTTGCCTTCTCTGCATCAC
TTGCTTCTTTTGAAAGCTGATTCTCAAAGGAAGACGAGTTATTATTCCAGCTCCAATACA
CCCCTGACTTTCCCAAACTCGGATCACTCACAACCTGTGCTAGTCTTTTCCCAGCTTCCT
CTTCAGATACGTAACCTTTGGTGATATACTTCTGAAAAGGCGGAAAGAGAAGCCTGAACA
GAGGTACGTGTTCTCTGAACAACCCCGTCGTAGCGATGCAACCAGGGTAAAGAGAAGCAA
ATGTGACTCCAGTTTCCTCGTGGTAACGCCTGTGAAGCTCCTGCATCGTCAGCATATTGC
ACACTTTGCTGTCTTTGTATGCTTTGGCTCCATCGTACTCTCCTCCATCTATCATCGAAC
TGTTTTGCCCGTTCAGTCCCGATGCTAAGCCTCTTAGGTCTCCAAGGTTCGCCTTTGGCG
GTACATTCCCAGCCAATGTGTTTGTGTTTCCTGTTATAGATCCTACGATGATCATACGTT
TCGATGGATAATCAGACTGTTTCAAGTCATCAAGAAGCAACCTCGAGAGAAGAAAATGTC
CTAAATGATTGGTTCCAACGCTTATCTCAAGCCCTTCGGCTGTAAAAGAAGGCTCCTTAG
CAGTCGGCTGGTAAACCGCTGCGTTGCAAACAAGAACATCTAACGGCCGTTCTGTTCTGC
GGAAACTATCACGACT

QA 1 796 1 796
DS 



AS 2 7

CO CL995Contig1 922 3 9 U
GGGAGCGTCGACAAAAAAGAGAATCCGGTGGGTGAGAGAGAGAGAATTGGCGACCCTTAG
ATTCAGTCGTAATATCTCTTGCGATCATCTGTGTGTTCTTATCGAATTGATAAACTTCTG
TTGTGTGAGTTACTTTATTGAAGAAGCAATGATTGGACTGTTTAAAGTAAAGGAGAAGCA
AAGGGAACAAGCTCAGAACGCTAGCAGAGGAGGAGCTTCTGTCAAGAAGCAATCTGCCGG
TGAACTTCGTCTCCACAAAGATATATCAGAGTTGAACCTTCCAAGCTCGTGCACGATATC
ATTTCCCAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCCGATGATGG
TTTCTACCATAATGGTAAGTTTGCTTTCACCTTCCAAGTCTCTCCTGTCTATCCACATGA
AGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATTTGGAAGGAAA
CGTTTGCCTCAACATCTTGCGCGAAGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACTGTCAT
CTATGGACTCTTCCATCTTTTCACCGAACCCAACTCTGAAGATCCTTTGAACCATGAAGC
TGCGCAGGTTTTAAGGGATAACCCAAAGCTCTTTGAGACCAATGTCCGGAGAGCTATGAC
CGGTGGATATGTTGGTCAAACCTTCTTCCCGCGCTGTATCTAACAAAAAAAGCTCTGGTT
GGTCTTCTTCAAGCAAGAAAGATAAGAACCTGAAAACCACTTTATCCTCCAATGTAATTC
CTGTCTCAAAGGACACTTGTTTGTTTGCTTGCCTTTGAAAAATTACGTTCTCCCTTTCCC
TTAGAGACTGAAAGGAAATGAAAACTCAAAAATTGTGGATTTGGTTTTTCGGTTTCAGTA
TATAAGTGTGTGGTAATTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK19TF U 1
AF RR2G060TF U 51
AF RR2G060JQ C 143
BS 1 504 RR2DK19TF
BS 505 505 RR2G060TF
BS 506 567 RR2DK19TF
BS 568 710 RR2G060TF
BS 711 711 RR2G060JQ
BS 712 755 RR2G060TF
BS 756 756 RR2G060JQ
BS 757 769 RR2G060TF
BS 770 922 RR2G060JQ

RD RR2DK19TF 567 0 0
GGGAGCGTCGACAAAAAAGAGAATCCGGTGGGTGAGAGAGAGAGAATTGGCGACCCTTAG
ATTCAGTCGTAATATCTCTTGCGATCATCTGTGTGTTCTTATCGAATTGATAAACTTCTG
TTGTGTGAGTTACTTTATTGAAGAAGCAATGATTGGACTGTTTAAAGTAAAGGAGAAGCA
AAGGGAACAAGCTCAGAACGCTAGCAGAGGAGGAGCTTCTGTCAAGAAGCAATCTGCCGG
TGAACTTCGTCTCCACAAAGATATATCAGAGTTGAACCTTCCAAGCTCGTGCACGATATC
ATTTCCCAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCCGATGATGG
TTTCTACCATAATGGTAAGTTTGCTTTCACCTTCCAAGTCTCTCCTGTCTATCCACATGA
AGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATTTGGAAGGAAA
CGTTTGCCTCAACATCTTGCGCGAGGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACTGTCAT
CTATGGACTCTTCCATCTTTTCACCGA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2G060TF 719 0 0
CGACCCTTAGATTCAGTCGTAATATCTCTTGCGATCATCTGTGTGTTCTTATCGAATTGA
TAAACTTCTGTTGTGTGAGTTACTTTATTGAAGAAGCAATGATTGGACTGTTTAAAGTAA
AGGAGAAGCAAAGGGAACAAGCTCAGAACGCTAGCAGAGGAGGAGCTTCTGTCAAGAAGC
AATCTGCCGGTGAACTTCGTCTCCACAAAGATATATCAGAGTTGAACCTTCCAAGCTCGT
GCACGATATCATTTCCCAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAAC
CCGATGATGGTTTCTACCATAATGGTAAGTTTGCTTTCACCTTCCAAGTCTCTCCTGTCT
ATCCACATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATT
TGGAAGGAAACGTTTGCCTCAACATCTTGCGCGAAGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTA
ACACTGTCATCTATGGACTCTTCCATCTTTTCACCGAACCCAACTCTGAAGATCCTTTGA
ACCATGAAGCTGCGCAGGTTTTAAGGGATAACCCAAAGCTCTTTGAGACCAATGTCCGGA
GAGCTATGACCGGTGGATATGTTGGTCAAACCTTCTTCCCGCGCTGTATCTAACAAAAAA
*GCTCTGGTTGGTCTTCTTCAAGCAAGAAAGATAAGAACCTGAAA*CCACTTTATCCTC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2G060JQ 780 0 0
GAAGCAATGATTGGACTGTTTAAAGTAAAGGAGAAGCAAAGGGAACAAGCTCAGAACGCT
AGCAGAGGAGGAGCTTCTGTCAAGAAGCAATCTGCCGGTGAACTTCGTCTCCACAAAGAT
ATATCAGAGTTGAACCTTCCAAGCTCGTGCACGATATCATTTCCCAATGGCAAAGATGAT
TTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCCGATGATGGTTTCTACCATAATGGTAAGTTT
GCTTTCACCTTCCAAGTCTCTCCTGTCTATCCACATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAA
ACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATTTGGAAGGAAACGTTTGCCTCAACATCTTGCGC
GAAGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACTGTCATCTATGGACTCTTCCATCTTTTC
ACCGAACCCAACTCTGAAGATCCTTTGAACCATGAAGCTGCGCAGGTTTTAAGGGATAAC
CCAAAGCTCTTTGAGACCAATGTCCGGAGAGCTATGACCGGTGGATATGTTGGTCAAACC
TTCTTCCCGCGCTGTATCTAACAAAAAAAGCTCTGGTTGGTCTTCTTCAAGCAAGAAAGA
TAAGAACCTGAAAACCACTTTATCCTCCAATGTAATTCCTGTCTCAAAGGACACTTGTTT
GTTTGCTTGCCTTTGAAAAATTACGTTCTCCCTTTCCCTTAGAGACTGAAAGGAAATGAA
AACTCAAAAATTGTGGATTTGGTTTTTCGGTTTCAGTATATAAGTGTGTGGTAATTAATG

QA 1 780 1 780
DS 



CO CL995Contig2 936 4 4 U
GGTCGACAAAAAAAAGCTAAAAGATCCAACATTCTTCGTCGTCGTCTAGCTTCCGAAGAG
GAACGAGAATCCGGTGGGTGAGAGAGATAGAATTGGCGTCCCTTTTGATTCAGTCGTAGT
CTCTTCCGATCATCTGTGTGTTCTTATAGAATTGAGAAACTTCTGTTGTGTGAGTTACTT
TCTTGAAGAAGCAATGATTGGACTGTTTAAAGTAAAGGAGAAGCAAAGGGAACAACAAGC
TCAGAACGCTAGTAGAGGAGGAGGAGGAGGAGCTTCCGTTAAGAAGCAATCTGCTGGTGA
GCTTCGTCTTCACAAAGATATATCAGAGCTGAACCTTCCAAGCTCTTGCACGATATCATT
TCCCAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCCGATGATGGTTA
CTACCATAATGGTAAGTTTGTTTTCACCTTCCAAGTCTCTCCTGTGTATCCTCATGAAGC
TCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCAAATATCGATTTGGAAGGAAACGT
TTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACTGTCATCTA
TGGACTCTTCCATCTTTTCACCGAACCCAACTCTGAAGATCCTTTGAACCATGAAGCTGC
ACAGGTCTTAAGGGATAACCCAAAGCTCTTTGAGACCAATGTGCGGAGAGCTATGACCGG
TGGATATGTTGGTCAAACCTTCTTCCCTCGCTGTATCTAATAAAAAAGCTCTGGTTGGTC
TTCTTCGAGCATAAAGCTAAGAACCTGAAACCACTTTATCCTCCAATGTAATTCATGTCT
CAAAGGACCCTTGTTTGTTTGCTTGCCTTTGTAAAATTACGTTCTCCCTTTCCCTTAGAG
ACTGAAAGGAAATGAAAACTCAAAAATTGTGGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F023TF U 1
AF RR2A608TF U 22
AF RR2F023JQ C 243
AF RR2A608JQ C 334
BS 1 668 RR2F023TF
BS 669 820 RR2A608TF
BS 821 910 RR2F023JQ
BS 911 936 RR2A608JQ

RD RR2F023TF 668 0 0
GGTCGACAAAAAAAAGCTAAAAGATCCAACATTCTTCGTCGTCGTCTAGCTTCCGAAGAG
GAACGAGAATCCGGTGGGTGAGAGAGATAGAATTGGCGTCCCTTTTGATTCAGTCGTAGT
CTCTTCCGATCATCTGTGTGTTCTTATAGAATTGAGAAACTTCTGTTGTGTGAGTTACTT
TCTTGAAGAAGCAATGATTGGACTGTTTAAAGTAAAGGAGAAGCAAAGGGAACAACAAGC
TCAGAACGCTAGTAGAGGAGGAGGAGGAGGAGCTTCCGTTAAGAAGCAATCTGCTGGTGA
GCTTCGTCTTCACAAAGATATATCAGAGCTGAACCTTCCAAGCTCTTGCACGATATCATT
TCCCAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCCGATGATGGTTA
CTACCATAATGGTAAGTTTGTTTTCACCTTCCAAGTCTCTCCTGTGTATCCTCATGAAGC
TCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCAAATATCGATTTGGAAGGAAACGT
TTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACTGTCATCTA
TGGACTCTTCCATCTTTTCACCGAACCCAACTCTGAAGATCCTTTGAACCATGAAGCTGC
ACAGGTCT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2A608TF 799 0 0
G
GATCCAACATTCTTCGTCGTCGTCTAGCTTCCGAAGAGGAACGAGAATCCGGTGGGTGAG
AGAGATAGAATTGGCGTCCCTTTTGATTCAGTCGTAGTCTCTTCCGATCATCTGTGTGTT
CTTATAGAATTGAGAAACTTCTGTTGTGTGAGTTACTTTCTTGAAGAAGCAATGATTGGA
CTGTTTAAAGTAAAGGAGAAGCAAAGGGAACAACAAGCTCAGAACGCTAGTAGAGGAGGA
GGAGGAGGAGCTTCCGTTAAGAAGCAATCTGCTGGTGAGCTTCGTCTTCACAAAGATATA
TCAGAGCTGAACCTTCCAAGCTCTTGCACGATATCATTTCCCAATGGCAAAGATGATTTG
ATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCCGATGATGGTTACTACCATAATGGTAAGTTTGTT
TTCACCTTCCAAGTCTCTCCTGTGTATCCTCATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACC
AAGGTTTATCATCCAAATATCGATTTGGAAGGAAACGTTTGCCTCAACATCTTGCGTGAA
GACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACTGTCATCTATGGACTCTTCCATCTTTTCACC
GAACCCAACTCTGAAGATCCTTTGAACCATGAAGCTGCACAGGTCTTAAGGGATAACCCA
AAGCTCTTTGAGACCAATGTGCGGAGAGCTATGACCGGTGGATATGTTGGTCAAACCTTC
TTCCCTCGCTGTATCTAATAAAAAAGCTCTGGTTGGTCTTCTTCGAGCATAAAGCTAAGA
ACCTGAAACCACTTTATC

QA 2 799 2 799
DS 

RD RR2F023JQ 668 0 0
AGAACGCTAGTAGAGGAGGAGGAGGAGGAGCTTCCGTTAAGAAGCAATCTGCTGGTGAGC
TTCGTCTTCACAAAGATATATCAGAGCTGAACCTTCCAAGCTCTTGCACGATATCATTTC
CCAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCCGATGATGGTTACT
ACCATAATGGTAAGTTTGTTTTCACCTTCCAAGTCTCTCCTGTGTATCCTCATGAAGCTC
CTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCAAATATCGATTTGGAAGGAAACGTTT
GCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACTGTCATCTATG
GACTCTTCCATCTTTTCACCGAACCCAACTTTGAAGATCCTTTGAACCATGAAGCTGCAC
AGGTCTTAAGGGATAACCCAAAGCTCTTTGAGACCAATGTGCGGAGAGCTATGACCGGTG
GATATGTTGGTCAAACCTTCTTCCCTCGCTGTATCTAATAAAAAAGCTCTGGTTGGTCTT
CTTCGAGCATAAAGCTAAGAACCTGAAACCACTTTATCCTCCAATGTAATTCATGTCTCA
AAGGACCCTTGTTTGTTTGCTTGCCTTTGTAAAATTACGTTCTCCCTTTCCCTTAGAGAC
TGAAAGGA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2A608JQ 603 0 0
CCTTCCAAGCTCTTGCACGATATCATTTCCCAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGA
AGTCTCCATTAAACCCGATGATGGTTACTACCATAATGGTAAGTTTGTTTTCCCCTTCCA
AGTCTCTCCTGTGTATCCTCATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCA
TCCAAATATCGATTTGGAAGGAAACGTTTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACC
TGTTCTCAACATTAACACTGTCATCTATGGACTCTTCCATCTTTTCACCGAACCCAACTT
TGAAGATCCTTTGAACCATGAAGCTGCACAGGTCTTAAGGGATAACCCAAAGCTCTTTGA
GACCAATGTGCGGAGAGCTATGACCGGTGGATATGTTGGTCAAACCTTCTTCCCTCGCTG
TATCTAATAAAAAAGCTCTGGTTGGTCTTCTTCGAGCATAAAGCTAAGAACCTGAAACCA
CTTTATCCTCCAATGTAATTCATGTCTCAAAGGACCCTTGTTTGTTTGCTTGCCTTTGTA
AAATTACGTTCTCCCTTTCCCTTAGAGACTGAAAGGAAATGAAAACTCAAAAATTGTGGA
TTT

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 7

CO CL996Contig1 872 7 4 U
AAGGCACAAACTCAACTCAACTACTTGTGGAACTCTTAAACTATAGTGTCAGCAAAATCA
TGGACATGCTTTATATTCTACTTATAAGACGAAAAAATGGAAAAAAAAAAAGAGTATTTT
ATCAACCCATATAAAAAACGTCATATATTTTTGATCTCGTTTGTCCACAACACTTTGGTA
TAGAGCGGTTTTCATTATGCATCTTCTTGAGGCTGGTCATCTCCACCACCTTCAATGTTG
CTGGTGTTGAACTGAACACGAGGCTTTCCCATACTGAAATTAAGAACTCTTGCATCCATA
TTGTATTGTATCTCTCCATCAAACAACATCTTCCTTATGTAGTGTTCTACGTCTGATCCT
ATCAACCTTAGTGTATACTCTGTCAATGGTGCTCCCTCATAGTGATCGACAAGTTCTTGG
AAATAAGAATAAACCTTGTTACAGCTTTCATCTTCCCACACAAACTCTTCAGTTGGATCA
AGAATCAAAGTGAGTTTATCCAACTGCGTCTGGTCAAACTCACAAGTCTCAGGATCTATA
TAAGCAGCGTATATCCTGACGTGGCGTGTCACACTGCTTAGCCACTCACCACCAAACTCT
CTTGGCAAGCCTGTGCTCTTCACATTAGACTGTTTCTCCACTGGTCTCAATGGCGTTGGC
TGCTTATTCATCTGCTTCTCTGCTGGTTGCTCTTCTTTGATTGTCTCTATGTCTTGTTCC
TGGAGTGTGTTGTCTTGCTCAGGGTTCGTCACCACGAAAGCCTTTTGTGATGTCCTAAAT
GGTCGGATTTGAGCAGCCATGGGAGGCTGTAATAGAGATAGCTTAGGACACGCAGTGTAA
GAGAATGCTGCAGCCATTTTTTCTTGTCTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 35 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK50JQ U 101
AF RR2AB51JQ U 1
AF RR2EU93JQ U 99
AF RR2D248JQ U 148
AF RR2DK50TF C 121
AF RR2EU93TF C 122
AF RR2AB51TF C 149
BS 1 745 RR2AB51JQ
BS 746 749 RR2EU93JQ
BS 750 862 RR2DK50TF
BS 863 872 RR2AB51TF

RD RR2DK50JQ 619 0 0
AAAAAAAAAAAAAGTATTTTATCAACCCATATAAAAAACGTCATATACTTTTGATCTCGT
TTGTCCACAACACTTTGGTATAAAGCGGTTTTCATTATGCATCTTCTTGAGGCTGGTCAT
CTCCACCACCTTCAATGTTGCTGGTGTTGAACTGAACACGAGGCTTTCCCATACTGAAAT
TAAAAACTCTTGCATCCATATTGTATTGTATCTCTCCATCAAACAACATCTTCCTTATGT
AGTGTTCTACGTCTGATCCTATCAACCTTAGTGTATACTCTGTCAATGGTGCTCCCTCAT
AGTGATCGACAAGTTCTTGGAAATAAAAATAAACCTTGTTACAGCTTTCATCTTCCCACA
CAAACTCTTCAGTTGGATCAAAAATCAAAGTGAGTTTATCCAACTGCGTCTGGTCAAACT
CACAAGTCTCAGGATCTATATAAGCAGCGTATATCCTGACGTGGCGTGTCACACTGCTTA
ACCACTCACCACCAAACTCTCTTGGCAAGCCTGTGCTCTTCACATTAAACTGTTTCTCCA
CTGGTCTCAATGGCGTTGGCTGCTTATTCATCTGCTTCTCTGCTGGTTGCTCTTCTTTGA
TTGTCTCTATGTCTTGTTC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2AB51JQ 745 0 0
AAGGCACAAACTCAACTCAACTACTTGTGGAACTCTTAAACTATAGTGTCAGCAAAATCA
TGGACATGCTTTATATTCTACTTATAAGACGAAAAAATGGAAAAAAAAAAAGAGTATTTT
ATCAACCCATATAAAAAACGTCATATATTTTTGATCTCGTTTGTCCACAACACTTTGGTA
TAGAGCGGTTTTCATTATGCATCTTCTTGAGGCTGGTCATCTCCACCACCTTCAATGTTG
CTGGTGTTGAACTGAACACGAGGCTTTCCCATACTGAAATTAAGAACTCTTGCATCCATA
TTGTATTGTATCTCTCCATCAAACAACATCTTCCTTATGTAGTGTTCTACGTCTGATCCT
ATCAACCTTAGTGTATACTCTGTCAATGGTGCTCCCTCATAGTGATCGACAAGTTCTTGG
AAATAAGAATAAACCTTGTTACAGCTTTCATCTTCCCACACAAACTCTTCAGTTGGATCA
AGAATCAAAGTGAGTTTATCCAACTGCGTCTGGTCAAACTCACAAGTCTCAGGATCTATA
TAAGCAGCGTATATCCTGACGTGGCGTGTCACACTGCTTAGCCACTCACCACCAAACTCT
CTTGGCAAGCCTGTGCTCTTCACATTAGACTGTTTCTCCACTGGTCTCAATGGCGTTGGC
TGCTTATTCATCTGCTTCTCTGCTGGTTGCTCTTCTTTGATTGTCTCTATGTCTTGTTCC
TGGAGTGTGTTGTCTTGCTCAGGGT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2EU93JQ 652 0 0
GG
AAAAAAAAAAAGAGTATTTTATCAACCCATATAAAAAACGTCATATATTTTTGATCTCGT
TTGTCCACAACACTTTGGTATAGAGCTGTTTTCATTATGCATCTTCTTGAGGCTGGTCAT
CTCCACCACCTTCAATGTTGCTGGTGTTGAACTGAACACGAGGCTTTCCCATACTGAAAT
TAAGAACTCTTGCATCCATATTGTATTGTATCTCTCCATCAAACAACATCTTCCTTATGT
AATGCTCTACGTCTGATCCTATCAACCTTAGTGTATACTCTGTCAATGGTGCTCCCTCAT
AGTGATCGACAAGTTCTTGGAAATAAGAATAAACCTTGTTACAGCTTTCATCTTCCCACA
CAAACTCTTCAGTTGGATCAAGAATCAAAGTGAGTTTATCCAACTGCGTCTGGTCAAACT
CACAAGTCTCAGGATCTATATAAGCAGCGTATATCCTGACGTGGCGCGTCACACTGCTTA
GCCACTCACCACCAAACTCTCTTGGCAAGCCTGTGCTCTTCACATTAGACTGTTTCTCCA
CTGGTCTCAATGGCGTTGGCTGCTTCTTCATCTGCTTCTCTGCTGGTTGCTCTTCTTTGA
TTGTCTCTATGTCTTGTTCCTGGAGTGTGTTGTCTTGCTCAGGGTTCGT
T

QA 3 651 3 651
DS 

RD RR2D248JQ 599 0 0
T
TTTTGATCTCGTTTGTCCACAACACTTTGGTATAGAGCTGTTTTCATTATGCATCTTCTT
GAGGCTGGTCATCTCCACCACCTTCAATGTTGCTGGTGTTGAACTGAACACGAGGCTTTC
CCATACTGAAATTAAAAACTATTGCATCCATATTGTATTGTATCTCTCCATCAAACAACA
TCTTCCTTATGTAATGCTCTACGTCTGATCCTATCAACCTTAGTGTATACTCTGTCAATG
GTGCTCCCTCATAGTGATCGACAAGTTCTTGGAAATAAGAATAAACCTTGTTACAGCTTT
CATCTTCCCACACAAACTCTTCAGTTGGATCAAGAATCAAAGTGAGTTTATCCAACTGCG
TCTGGTCAAACTCACAAGTCTCAGGATCTATATAAGCAGCGTATATCCTGACGTGGCGTG
TCACACTGCTTAGCCACTCACCACCAAACTCTCTTGGCAAGCCTGTGCTATTCGCATTAA
ACTGTTTCTCCACTGGTCTCAATGGCGTTGGCTGCTTCTTCATCTGCTTCTCTGCTGGTT
GCTCTTCTTTGATTGTCTCTATGTCTTGTTCCTGGAGTGTGTTGTCTTGCTCAAGGTT

QA 2 599 2 599
DS 

RD RR2DK50TF 751 0 0
ATCAACCCATATAAAAAACGTCATATACTTT*GATCTCGTTTGTCCACAACACTTTGGTA
TAGAGCGGTTTTCATTATGCATCTTCTTGAGGCTGGTCATCTCCACCACCTTCAATGTTG
CTGGTGTTGAACTGAACACGAGGCTTTCCCATACTGAAATTAAGAACTCTTGCATCCATA
TTGTATTGTATCTCTCCATCAAACAACATCTTCCTTATGTAGTGTTCTACGTCTGATCCT
ATCAACCTTAGTGTATACTCTGTCAATGGTGCTCCCTCATAGTGATCGACAAGTTCTTGG
AAATAAGAATAAACCTTGTTACAGCTTTCATCTTCCCACACAAACTCTTCAGTTGGATCA
AGAATCAAAGTGAGTTTATCCAACTGCGTCTGGTCAAACTCACAAGTCTCAGGATCTATA
TAAGCAGCGTATATCCTGACGTGGCGTGTCACACTGCTTAGCCACTCACCACCAAACTCT
CTTGGCAAGCCTGTGCTCTTCACATTAGACTGTTTCTCCACTGGTCTCAATGGCGTTGGC
TGCTTATTCATCTGCTTCTCTGCTGGTTGCTCTTCTTTGATTGTCTCTATGTCTTGTTCC
TGTAGTGTGTTGTCTTGCTCAGGGTTCGTCACCACGAAAGCCTTTTGTGATGTCCTAAAT
GGTCGGATTTGAGCAGCCATGGGAGGCTGTAATAGAGATAGCTTAGGACACGCAGTGTAA
GAGAATGCTGCAGCCATTTTTT
CTTGTCTCC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2EU93TF 747 0 0
TCAACCCATATAAAAAACGTCATATATTTT*GATCTCGTTTGTCCACAACACTTTGGTAT
AGAGCTGTTTTCATTATGCATCTTCTTGAGGCTGGTCATCTCCACCACTTTCAATGTTGC
TGGTGTTGAACTGAACACGAGGCTTTCCCATACTGAAATTAAGAACTCTTGCATCCATAT
TGTATTGTATCTCTCCATCAAACAACATCTTCCTTATGTAATGCTCTACGTCTGATCCTA
TCAACCTTAGTGTATACTCTGTCAATGGTGCTCCCTCATAGTGATCGACAAGTTCTTGGA
AATAAGAATAAACCTTGTTACAGCTTTCATCTTCCCACACAAACTCTTCAGTTGGATCAA
GAATCAAAGTGAGTTTATCCAACTGCGTCTGGTCAAACTCACAAGTCTCAGGATCTATAT
AAGCAGCGTATATCCTGACGTGGCGCGTCACACTGCTTAGCCACTCACCACCAAACTCTC
TTGGCAAGCCTGTGCTCTTCACATTAGACTGTTTCTCCACTGGTCTCAATGGCGTTGGCT
GCTTCTTCATCTGCTTCTCTGCTGGTTGCTCTTCTTTGATTGTCTCTATGTCTTGTTCCT
GGAGTGTGTTGTCTTGCTCAGGGTTCGTTACCACGAAAGCCTTTTGTGATGTCCTATATG
ATCGGATTTGAGCAGCCATGGGAGGCTGTAATAGAGATAGCTTAGGACACGCAGTGTAAG
AGAATGCTGCAGCCATTTTTT
TCTTCC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2AB51TF 724 0 0
TTTTGATCTCGTTTGTCCACAACACTTTGGTATAGAGCGGTTTTCATTATGCATCTTCTT
GAGGCTGGTCATCTCCACCACTTTCAATGTTGCTGGTGTTGAACTGAACACGAGGCTTTC
CCATACTGAAATTAAGAACTCTTGCATCCATATTGTATTGTATCTCTCCATCAAACAACA
TCTTCCTTATGTAGTGTTCTACGTCTGATCCTATCAACCTTAGTGTATACTCTGTCAATG
GTGCTCCCTCATAGTGATCGACAAGTTCTTGGAAATAAGAATAAACCTTGTTACAGCTTT
CATCTTCCCACACAAACTCTTCAGTTGGATCAAGAATCAAAGTGAGTTTATCCAACTGCG
TCTGGTCAAACTCACAAGTCTCAGGATCTATATAAGCAGCGTATATCCTGACGTGGCGTG
TCACACTGCTTAGCCACTCACCACCAAACTCTCTTGGCAAGCCTGTGCTCTTCACATTAG
ACTGTTTCTCCACTGGTCTCAATGGCGTTGGCTGCTTATTCATCTGCTTCTCTGCTGGTT
GCTCTTCTTTGATTGTCTCTATGTCTTGTTCCTGGAGTGTGTTGTCTTGCTCAGGGTTCG
TCACCACGAAAGCCTTTTGTGATGTCCTAAATGGTCGGATTTGAGCAGCCATGGGAGGCT
GTAATAGAGATAGCTTAGGACACGCAGTGTAAGAGAATGCTGCAGCCATTTTTTCTTGTC
TGAG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 6

CO CL997Contig1 1525 6 11 U
GGAAGCACCAAACACAAACCATAATCTACCAATAAGAAGGTAGTGAAGCAGCAAAGCTCA
CACAAAAAAAAATGGCTTCTCTTCTGGGAACTTCTTCTTCAGCAATATGTGCTTCTCATT
CCCTCTCTTCGTCTTCCTCAACACCTTCGATCTCTCCCATTTGCTTCAGGCCAGGAGGGA
AACTCTGTGTAGGAAAGTTAAACACAGGAATCCAAATCAGACCAAAGAAGAACAGGTCTC
GTCACCATGTCTCCGCTATGAATGTAGCCACAGAAATCAACTCCACTGAACAAGTAGGGA
AGTTTGATTCAAAGAAGAGTGCGAGGCCTGTTTATCCATTTGCAGCTATTGTAGGACAAG
ATGAGATGAAGCTGTGTCTCTTGTTGAACGTGATTGATCCCAAAATCGGTGGTGTGATGA
TTATGGGAGACAGAGGAACCGGGAAGTCCACAACTGTCAGGTCCTTAGTCGATCTGCTAC
CCGAGATCAAGGTGGTTGCAGGTGACCCTTACAACTCTGACCCGTTAGATCCCGAGTTCA
TGGGTGTTGAGGTGAGAGAGAGGGTGGAAAGAGGCGAGCAGGTTCCTGTTGTTGCTACTA
AGATCAACATGGTTGATCTTCCGTTGGGTGCAACTGAAGACAGAGTCTGTGGAACAATCG
ATATCGAGAAGGCTTTGACAGAAGGTGTGAAAGCCTTTGAGCCTGGCTTGTTGGCTAAAG
CCAACAGAGGGATACTCTATGTTGATGAAGTCAACCTCTTGGATGATCATTTGGTTGATG
TGCTTCTTGATTCAGCTGCTTCC*GGTTGGAACACGGTTGAGAGAGAAGGGATCTCGATT
TCTCACCCGGCGAGGTTTATCTTGATTGGTTCCGGGAATCCTGAGGAAGGAGAGCTTAGG
CCACAGCTTCTTGATAGGTTTGGTATGCATGCGCAAGTAGGGACGGTTAGAGATGCTGAT
CTACGTGTCAAGATTGTTGAAGAGAGAGCTCGGTTTGATAGTAACCCACAGGATTTCCGT
GAGACTTACAAAACGGAGCAGGATAAGCTTCAAGACCAGATTTCAAATGCGAGAAGCAAT
CTTTCCTCTGTCCAGATTGACCGGGAGTTGAAGGTGAAGATCTCTAAGGTGTGTTCGGAG
CTCAATGTTGATGGGCTGAGAGGAGACATTGTGACTAACAGAGCAGCGAAAGCACTTGCA
GCTCTCAAAGGAAAAGACCGAGTGACTGCAGATGATGTTGCAACCGTTATCCCTAACTGC
TTGAGGCACCGTCTCAGGAAGGATCCATTGGAGTCTATCGATTCAGGAGTGTTGGTTTCT
GAGAAGTTCGCTGAGGTTTTCAGTTGAACAAGGAGAAAAGATTATGTTATCATTTTCTTA
ACTTTTGTAAACGATGAGAAGATCCTGAAACAAACAAACATGCAAATCTGATTCTATACT
TTCTACATTGAGTTGATTGAATGTTCAAACAAACAGTCTAATGTTTTCTGCTTTAAGTTG
ATTGGATAATAATAGCTGTTCAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT41TF U 61
AF RR2B602TF U 1
AF RR2AZ12TFB U 334
AF RR2BY54JQ C 1160
AF RR2B602JQ C 632
AF RR2B327JQ C 760
BS 1 220 RR2B602TF
BS 221 221 RR2AT41TF
BS 222 803 RR2B602TF
BS 804 804 RR2B602JQ
BS 805 824 RR2B602TF
BS 825 1091 RR2B602JQ
BS 1092 1092 RR2B327JQ
BS 1093 1468 RR2B602JQ
BS 1469 1469 RR2B327JQ
BS 1470 1479 RR2B602JQ
BS 1480 1525 RR2B327JQ

RD RR2AT41TF 644 0 0
GGAC
AAAAAAAATGGCTTCTCTTCTGGGAACTTCTTCTTCAGCAATATGTGCTTCTCATTCCCT
CTCTTCGTCTTCCTCAACACCTTCGATCTCTCCCATTTGCTTCAGGCCAGGAGGGAAACT
CTGTGTAGGAAAGTTAAACACAGGAATCCAAATCAGACCAAAGAAGAACAGGTCTCGTCA
CCATGTCTCCGCTATGAATGTAGCCACAGAAATCAACTCCACTGAACAAGTAGGGAAGTT
TGATTCAAAGAAGAGTGCGAGGCCTGTTTATCCATTTGCAGCTATTGTAGGACAAGATGA
GATGAAGCTGTGTCTCTTGTTGAACGTGATTGATCCCAAAATCGGTGGTGTGATGATTAT
GGGAGACAGAGGAACCGGGAAGTCCACAACTGTCAGGTCCTTAGTCGATCTGCTACCCGA
GATCAAGGTGGTTGCAGGTGACCCTTACAACTCTGACCCGTTAGATCCCGAGTTCATGGG
TGTTGAGGTGAGAGAGAGGGTGGAAAGAGGCGAGCAGGTTCCTGTTGTTGCTACTAAGAT
CAACATGGTTGATCTTCCGTTGGGTGCAACTGAAGACAGAGTCTGTGGAACAATCGATAT
CGAGAAAGCTTTGACAGAAGGTGTGAAAGCCTTTGAGCCT

QA 5 644 5 644
DS 

RD RR2B602TF 824 0 0
GGAAGCACCAAACACAAACCATAATCTACCAATAAGAAGGTAGTGAAGCAGCAAAGCTCA
CACAAAAAAAAATGGCTTCTCTTCTGGGAACTTCTTCTTCAGCAATATGTGCTTCTCATT
CCCTCTCTTCGTCTTCCTCAACACCTTCGATCTCTCCCATTTGCTTCAGGCCAGGAGGGA
AACTCTGTGTAGGAAAGTTAAACACAGGAATCCAAATCAGGCCAAAGAAGAACAGGTCTC
GTCACCATGTCTCCGCTATGAATGTAGCCACAGAAATCAACTCCACTGAACAAGTAGGGA
AGTTTGATTCAAAGAAGAGTGCGAGGCCTGTTTATCCATTTGCAGCTATTGTAGGACAAG
ATGAGATGAAGCTGTGTCTCTTGTTGAACGTGATTGATCCCAAAATCGGTGGTGTGATGA
TTATGGGAGACAGAGGAACCGGGAAGTCCACAACTGTCAGGTCCTTAGTCGATCTGCTAC
CCGAGATCAAGGTGGTTGCAGGTGACCCTTACAACTCTGACCCGTTAGATCCCGAGTTCA
TGGGTGTTGAGGTGAGAGAGAGGGTGGAAAGAGGCGAGCAGGTTCCTGTTGTTGCTACTA
AGATCAACATGGTTGATCTTCCGTTGGGTGCAACTGAAGACAGAGTCTGTGGAACAATCG
ATATCGAGAAGGCTTTGACAGAAGGTGTGAAAGCCTTTGAGCCTGGCTTGTTGGCTAAAG
CCAACAGAGGGATACTCTATGTTGATGAAGTCAACCTCTTGGATGATCATTTGGTTGATG
TGCTTCTTGATTCAGCTGCTTCCCGGTTGGAACACGGTTGAGAG

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2AZ12TFB 458 0 0
ATCCCTTTGCAGCTATAGTAGGACAAGATGAGATGAAGCTATGTCTCTTGTTGAACGTGA
TTGATCCCAAAATCGGTGGTGTGATGATTATGGGAGACAGAGGAACCGGGAAGTCCACAA
CTGTCAGGTCCTTAGTCGATCTGCTACCCGAGATCAAGGTGGTTGCAGGTGACCCTTACA
ACTCTGACCCGTTAGATCCTGAGTTCATGGGTGTTGAGGTAAGAGAGAGGGTGGAAAGAG
GCGAACAGGTTCCCGTTGTTGCTACTAAGATCAACATGGTTGATCTTCCGTTGGGTGCAA
CTGAAGATAGAGTTTGTGGAACAATTGATATTGAGAAGGCTTTGACAGAAGGTGTGAAAG
CCTTTGAGCCTGGCTTGTTGGCTAAAGCCAATAGAGGGATACTCTATGTTGATGAAGTCA
ACCTCTTGGATGATCATTTGGTTGATGTGCTTCTTGAT

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2BY54JQ 240 0 0
GAGGAGACATTGTGACTAACAGAGCAGCGAAAGCACTTGCAGCTCTCAAAGGAAAAGACC
GAGTGACTGCAGATGATGTTGCAACCGTTATCCCTAACTGCTTGAGGCACCGTCTCAGGA
AGGATCCATTGGAGTCTATCGATTCAGGAGTGTTGGTTTCTGAGAAGTTCGCTGAGGTTT
TCAGTTGAACAAGGAGAAAAGATTATGTTATCATTTTCTTAACTTTTGTAA
ACGATGAGA

QA 1 231 1 231
DS 

RD RR2B602JQ 853 0 0
AACTGAAGACAGAGTCTGTGGAACAATCGATATCGAGAAGGCTT*GACAGAAGGTGTGAA
AGCCTTTGAGCCTGGCTTGTTGGCTAAAGCCAACAGAGGGATACTCTATGTTGATGAAGT
CAACCTCTTGGATGATCATTTGGTTGATGTGCTTCTTGATTCAGCTGCTTCC*GGTTGGA
ACACGGTTGAGAGAGAAGGGATCTCGATTTCTCACCCGGCGAGGTTTATCTTGATTGGTT
CCGGGAATCCTGAGGAAGGAGAGCTTAGGCCACAGCTTCTTGATAGGTTTGGTATGCATG
CGCAAGTAGGGACGGTTAGAGATGCTGATCTACGTGTCAAGATTGTTGAAGAGAGAGCTC
GGTTTGATAGTAACCCACAGGATTTCCGTGAGACTTACAAAACGGAGCAGGATAAGCTTC
AAGACCAGATTTCAAATGCGAGAAGCAATCTTTCCTCTGTTCAGATTGACCGGGAGTTGA
AGGTGAAGATCTCTAAGGTGTGTTCGGAGCTCAATGTTGATGGGCTGAGAGGAGACATTG
TGACTAACAGAGCAGCGAAAGCACTTGCAGCTCTCAAAGGAAAAGACCGAGTGACTGCAG
ATGATGTTGCAACCGTTATCCCTAACTGCTTGAGGCACCGTCTCAGGAAGGATCCATTGG
AGTCTATCGATTCAGGAGTGTTGGTTTCTGAGAAGTTCGCTGAGGTTTTCAGTTGAACAA
GGAGAAAAGATTATGTTATCATTTTCTTAACTTTTGTAAACGATGAGAAGATCCTGAAAC
AAACAAACATGCAAATCTGATTCTATACTTTCTACATTGAGTTGATTGAATGTTCAAGCA
AACAGTCT
TATGC

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR2B327JQ 766 0 0
TGGATGATCATTTGGTTGATGTGCTTCTTGATTCAGCTGCTTCC*GGTTGGAACACGGTT
GAGAGAGAAGGGATCTCGATTTCTCACCCGGCGAGGTTTATCTTGATTGGTTCCGGGAAT
CCTGAGGAAGGAGAGCTTAGGCCACAGCTTCTTGATAGGTTTGGTATGCATGCGCAAGTA
GGGACGGTTAGAGATGCTGATCTACGTGTCAAGATTGTTGAAGAGAGAGCTCGGTTTGAT
AGTAACCCACAGGATTTCCGTGAGACTTACAAAACGGAGCAGGATAAGCTTCAAGACCAG
ATTTCAAATGCGAGAAGCAATCTTTCCTCTGTCCAGATTGACCGGGAGTTGAAGGTGAAG
ATCTCTAAGGTGTGTTCGGAGCTCAATGTTGATGGGCTGAGAGGAGACATTGTGACTAAC
AGAGCAGCAAAGGCACTTGCAGCTCTCAAAGGGAAAGATCGAGTGACTGCAGATGATGTT
GCTACCGTTATCCCTAACTGCTTGAGGCACCGTCTCAGGAAGGATCCATTGGAGTCTATC
GATTCAGGAGTGTTGGTTTCTGAGAAGTTCGCTGAGGTTTTCAGTTGAACAAGGAGAAAA
GATTATGTTATCATTTTCTTAACTTTTGTAAACGATGAGAAGATCCTGAAGCAAACAAAC
ATGCAAATCTGATTCTATACTTTCTACATTGAGTTGATTGAGTGTTCAAACAAACAGTCT
AATGTTTTCTGCTTTAAGTTGATTGGATAATAATAGCTGTTCAAAC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 6

CO CL998Contig1 1235 6 29 U
GGATAGACTCTGTTTGCCAAAAAAAAGCATAGACTCTCTTGACTTGCTCCAAACTTAGCA
AATGGAGGATCTTGATCCAACTTTCATCCAAGCACCAGAGCATAGATCAAACTCCAACTC
CATCCCTAACCAACCGGAAGAAATACCCGTGATCGATCTCTCACGTCTCAACGACCCTGA
AGATATCCAAAACGTGATCTCTGAGATAGGTGATGCATGTGAAACATGGGGATTTTTCCA
GGTGATCAATCATGGTGTACCTTGCGATGCGAGGAAGCGTGTGGAGGAGACGGTGAAGAT
ATTTTTCGATTTGCCTATGGAAGAGAAGATCAAAGTAAAGAGAGACGAGGTGAATCCAGC
AGGGTATCATGATGGAGAACACACGAAGAACGTTAGAGACTGGAAAGAAGTGTTTGATAT
TTATTTCAAAGATCCAATGGTTATGCCTTTTTCCACAGATCCTGAAGACGATCGTTTAAG
AGTTGTTTATAACAAGTGGCCTCAGTTTCCTTCTGATTTCAGGGAGGCATGTCAGGAATA
TGCAGGCCACGCTGAAAAACTAGCGTTCAGACTTTTAGAGCTCATCTCATTAAGCTTAGG
CTTACCAAAAGACCGTTTTCATGATTACTTCAAAGAACAAATGAGTTTTTTCAGGATCAA
TCGTTATCCACCATGTCCACGGCCTGACCTAGCTCTAGGTGTAGGCCACCACAAAGATGC
AGACGTTATAAGTCTATTGGCTCAAGACGAAGTTGGAGGGTTACAAATTAGTCGTAGATC
GGACGGTG*TTTGGTTTCCTATTAAACCTGTCCCTAATGCTCTTGTCATCAATATTGGCA
ATTGTATGGAGGGATGGACGAATGATAAGTACTGGAGTGCAGAACATAGAGTGGTGGTGA
ACTCAACAAGGGAAAGATACTCAATACCGTTCTTCTTGTTGCCTTCACATGATGAGGAAG
TGAAACCATTAGAAGAGCTTTTGAGTCCTGAAAACCCTCCAAGATACAAAGGATATAAAT
ATGGCAAGTTTTATGTCAGCAGAAACAGAAGCGATTTTAAAAAACTCGAGATCCAAAACA
TTCAGATCGATGAATTCAAAATTGTAACATAGAATTACTGGTACTATGCGTGACTTGGGT
TTTTCAAGCTATGATCTCAATGTAAGCCATTAATGTAATAATGTGTGTGAGACTGAGTCT
TTGTCAGAAACAATAAACTTGATAATGTTTAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2A641TF U 28
AF RR2A629TF U 1
AF RR2B156TF U 42
AF RR2CZ25TF U 103
AF RR2B156JQ C 453
AF RR2A641JQ C 466
BS 1 57 RR2A629TF
BS 58 58 RR2A641TF
BS 59 109 RR2A629TF
BS 110 110 RR2A641TF
BS 111 135 RR2A629TF
BS 136 136 RR2A641TF
BS 137 243 RR2A629TF
BS 244 244 RR2A641TF
BS 245 247 RR2A629TF
BS 248 248 RR2A641TF
BS 249 323 RR2A629TF
BS 324 324 RR2A641TF
BS 325 576 RR2A629TF
BS 577 577 RR2A641TF
BS 578 742 RR2A629TF
BS 743 788 RR2B156TF
BS 789 789 RR2CZ25TF
BS 790 831 RR2B156TF
BS 832 832 RR2B156JQ
BS 833 840 RR2CZ25TF
BS 841 841 RR2B156JQ
BS 842 876 RR2CZ25TF
BS 877 940 RR2B156JQ
BS 941 941 RR2A641JQ
BS 942 1063 RR2B156JQ
BS 1064 1064 RR2A641JQ
BS 1065 1128 RR2B156JQ
BS 1129 1129 RR2A641JQ
BS 1130 1235 RR2B156JQ

RD RR2A641TF 673 0 0
GGG
AGACTCTCTTGACTTGCTCCAAACTTAGCAAATGGAGGATCTTGATCCAACTTTCATCCA
AGCACCAGAGCATAGATCAAACTCCAACTCCATCCCTAACCAACCGGAAGAAATACCCGT
GATCGATCTCTCACGTCTCAACGACCCTGAAGATATCCAAAACGTTATCTCTGAGATTGG
TGATGCATGTGAAACATGGGGATTTTTCCAGGTGATCAATCATGGTGTGCCTTGCGATGC
GAGGAAGCGTGTGGAGGAGACGGTGAAGATATTTTTCGATTTGCCTATGGAAGAGAAGAT
CAAAGTAAAGAGAGACGAGGTGAATCCAGCAGGGTATCATGATGGAGAACACACGAAGAA
CGTTAGAGACTGGAAAGAAGTGTTTGATATTTATTTCAAAGATCCAATGGTTATGCCTTT
TTCCACAGATCCTGAAGACGATCGTTTAAGAGTTGTTTATAACAAGTGGCCTCAGTTTCC
TTCTGATTTCAGGGAGGCATGTCAGGAATATGCAGGCCACGCTGAAAAACTAGCGTTCAG
ACTTTTAGAGCTCATCTCATTAAGCTTAGGCTTACCAAAAGACCGTTTTCATGATTACTT
CAAAGAACAAATGAGTTTTTTCAGGATCAATCGTTATCCACCATGTCCACGGCCTGACCT
AGCTCTAGGT

QA 4 673 4 673
DS 

RD RR2A629TF 742 0 0
GGATAGACTCTGTTTGCCAAAAAAAAGCATAGACTCTCTTGACTTGCTCCAAACTTAACA
AATGGAGGATCTTGATCCAACTTTCATCCAAGCACCAGAGCATAGATCAGACTCCAACTC
CATCCCTAACCAACCTGAAGAAATACCCGTGATCGATCTCTCACGTCTCAACGACCCTGA
AGATATCCAAAACGTGATCTCTGAGATAGGTGATGCATGTGAAACATGGGGATTTTTCCA
GGTCATCGATCATGGTGTACCTTGCGATGCGAGGAAGCGTGTGGAGGAGACGGTGAAGAT
ATTTTTCGATTTGCCTATGGAAGGGAAGATCAAAGTAAAGAGAGACGAGGTGAATCCAGC
AGGGTATCATGATGGAGAACACACGAAGAACGTTAGAGACTGGAAAGAAGTGTTTGATAT
TTATTTCAAAGATCCAATGGTTATGCCTTTTTCCACAGATCCTGAAGACGATCGTTTAAG
AGTTGTTTATAACAAGTGGCCTCAGTTTCCTTCTGATTTCAGGGAGGCATGTCAGGAATA
TGCAGGCCACGCTGAAAAACTAGCGTTCAGACTTTTGGAGCTCATCTCATTAAGCTTAGG
CTTACCAAAAGACCGTTTTCATGATTACTTCAAAGAACAAATGAGTTTTTTCAGGATCAA
TCGTTATCCACCATGTCCACGGCCTGACCTAGCTCTAGGTGTAGGCCACCACAAAGATGC
AGACGTTATAAGTCTATTGGCT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2B156TF 801 0 0
ACTTGCTCCAAACTTAGCAAATGGAGGATCTTGATCCAACTTTCATCCAAGCACCAGAGC
ATAGATCAAACTCCAACTCCATCCCTAACCAACCGGAAGAAATACCCGTGATCGATCTCT
CACGTCTCAACGACCCTGAAGATATCCAAAACGTGATCTCTGAGATAGGTGATGCATGTG
AAACATGGGGATTTTTCCAGGTGATCAATCATGGTGTACCTTGCGATGCGAGGAAGCGTG
TGGAGGAGACGGTGAAGATATTTTTCGATTTGCCTATGGAAGAGAAGATCAAAGTAAAGA
GAGACGAGGTGAATCCAGCAGGGTATCATGATGGAGAACACACGAAGAACGTTAGAGACT
GGAAAGAAGTGTTTGATATTTATTTCAAAGATCCAATGGTTATGCCTTTTTCCACAGATC
CTGAAGACGATCGTTTAAGAGTTGTTTATAACAAGTGGCCTCAGTTTCCTTCTGATTTCA
GGGAGGCATGTCAGGAATATGCAGGCCACGCTGAAAAACTAGCGTTCAGACTTTTAGAGC
TCATCTCATTAAGCTTAGGCTTACCAAAAGACCGTTTTCATGATTACTTCAAAGAACAAA
TGAGTTTTTTCAGGATCAATCGTTATCCACCATGTCCACGGCCTGACCTAGCTCTAGGTG
TAGGCCACCACAAAGATGCAGACGTTATAAGTCTATTGGCTCAAGACGAAGTTGGAGGGT
TACAAATTAGTCGTAGATCGGACGGTGGTTTGGTTTCCTATTAAACCTGTCCCTAATGCT
CTTGTCATCA
TATTGGCATTT

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2CZ25TF 774 0 0
G
AGATCAAACTCCAACTCCATCCCTAACCAACCGGAAGAAATACCCGTGATCGATCTCTCA
CGTCTCAACGACCCTGAAGATATCCAAAACGTTATCTCTGAGATTGGTGATGCATGTGAA
ACATGGGGATTTTTCCAGGTGATCAATCATGGTGTGCCTTGCGATGCGAGGAAGCGTGTG
GAGGAGACGGTGAAGATATTTTTCGATTTGCCTATGGAAGAGAAGATCAAAGTAAAGAGA
GACGAGGTGAATCCAGCAGGGTATCATGATGGAGAACACACGAAGAACGTTAGAGACTGG
AAAGAAGTGTTTGATATTTATTTCAAAGATCCAATGGTTATGCCTTTTTCCACAGATCCT
GAAGACGATCGTTTAAGAGTTGTTTATAACAAGTGGCCTCAGTTTCCTTCTGATTTCAGG
GAGGCATGTCAGGAATATGCAGGCCACGCTGAAAAACTAGCGTTCAGACTTTTAGAGCTC
ATCTCATTAAGCTTAGGCTTACCAAAAGACCGTTTTCGTGATTACTTCAAAGAACAAATG
AGTTTTTTCAGGATCAATCGTTATCCACCATGTCCACGGCCTGAC*TAGCTCTAGGTGTA
GGCCACCACAAAGATGCAGACGTTATAAGTCTATTGGCTCAAGACGAAGTTGGAGGGTTA
CAAATTAGTCGTAGATCGGACGGTG*TTTGGTTTCCTATTAAACCTGTCCCTAATGCTCT
TGTCATCA*TATTGGCA*TTGTATGGAGGGATGGACGAATGATAAGTACTGGA

QA 2 774 2 774
DS 

RD RR2B156JQ 783 0 0
CCACAGATCCTGAAGACGATCGTTTAAGAGTTGTTTATAACAAGTGGCCTCAGTTTCCTT
CTGATTTCAGGGAGGCATGTCAGGAATATGCAGGCCACGCTGAAAAACTAGCGTTCAGAC
TTTTAGAGCTCATCTCATTAAGCTTAGGCTTACCAAAAGACCGTTTTCATGATTACTTCA
AAGAACAAATGAGTTTTTTCAGGATCAATCGTTATCCACCATGTCCACGGCCTGACCTAG
CTCTAGGTGTAGGCCACCACAAAGATGCAGACGTTATAAGTCTATTGGCTCAAGACGAAG
TTGGAGGGTTACAAATTAGTCGTAGATCGGACGGTG*TTTGGTTTCCTATTAAACCTGTC
CCTAATGCTCTTGTCATCAATATTGGCAATTGTATGGAGGGATGGACGAATGATAAGTAC
TGGAGTGCAGAACATAGAGTGGTGGTGAACTCAACAAGGGAAAGATACTCAATACCGTTC
TTCTTGTTTCCTTCACATGATGAGGAAGTGAAACCATTAGAAGAGCTTTTGAGTCCTGAA
AACCCTCCAAGATACAAAGGATATAAATATGGCAAGTTTTATGTCAGCAGAAACAGAAGC
GATTTTAAAAAGCTCGAGATCCAAAACATTCAGATCGATGAATTCAAAATTGTAACATAG
AATTACTGGTACTATGTGTGACTTGGGTTTTTCAAGCTATGATCTCAATGTAAGCCATTA
ATGTAATAATGTGTGTGAGACTGAGTCTTTGTCAGAAACAATAAACTTGATAATGTTTAA
TGG

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2A641JQ 770 0 0
AGACGATCGTTTAAGAGTTGTTTATAACAAGTGGCCTCAGTTTCCTTCTGATTTCAGGGA
GGCATGTCAGGAATATGCAGGCCACGCTGAAAAACTAGCGTTCAGACTTTTAGAGCTCAT
CTCATTAAGCTTAGGCTTACCAAAAGACCGTTTTCATGATTACTTCAAAGAACAAATGAG
TTTTTTCAGGATCAATCGTTATCCACCATGTCCACGGCCTGACCTAGCTCTAGGTGTAGG
CCACCACAAAGATGCAGACGTTATAAGTCTATTGGCTCAAGACGAAGTTGGAGGGTTACA
AATTAGTCGTAGATCGGACGGTG*TTTGGTTTCCTATTAAACCTGTCCCTAATGCTCTTG
TCATCAATATTGGCAATTGTATGGAGGGATGGACGAATGATAAGTACTGGAGTGCAGAAC
ATAGAGTGGTGGTGAACTCAACAAGGGAAAGATACTCAATACCGTTCTTCTTGTTGCCTT
CACATGATGTGGAAGTGAAACCATTAGAAGAGCTTTTGAGTCCTGAAAACCCTCCAAGAT
ACAAAGGATATAAATATGGCAAGTTTTATGTCAGCAGAAACAGAAGCGATTTTAAAAAAC
TCGAGATCCAAAACATTCAGATCGATGAATTCAAAATTGTAACATAGAATTACTGGTACT
ATGCGTGACTTGGGTTTTTCAAGCTATGATCTCAATGTAAGCCATTAATGTAATAATGTG
TGTGAGACTGAGTCTTTGTCAGAAACAATAAACTTGATAATGTTTAATGG

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 7

CO CL999Contig1 804 7 12 U
GAACATCAACAATGTACATTCCAACTCTCCACTAACACAATGTATATATATGGTGATGAT
GATAATGTACTCGGGAGAAAGTCATTTACAAACAAAGGAAAACGAACAAATACTCAAAAC
AAAAACCAAAACAAAACAGAGCTTTGCTTTTTGCCCGGTTTAGACAACGATCTTTCATGG
CTTTCACTAACAAAATCTCGGCAGCAGCTGCGGTTGCGACAGCGATGCTATTTTTAGCGG
TCATGATCGCTCCCCGGTGGACGGAAGCACAAACGATGCCAAAGCTGGATCCAGTGTGCG
CGTTGTTGATCACTGACACCCTCACCAAATGCTACTTAAGCGGGAATTTGACGCCATCTG
ATGACTGCTGCAGCGCTCTCAAATCGGCCACCGATAGGCAAGTAACTTGTCTCTGCGACG
ATTTCATCGCACATTCTTCTGACAACAACGTCACGCAAGCTCTGTTGGAAGTATACCACA
ACGACTGTGGCGTTGCTGACAAGTTCGCCTGCAAAGGAAACTCCAATGTAGGAGCAACGA
AGAAGATCAGTGCATCAATTGGTCTACTTGGTTTGGCTACAAGTCTGTTATTTTAATTAA
TTAAAGCTCGGGCTTATCAAATACTCCTATATTTTTTTTTATTTTTTTTT*GGAACTGGA
CTCCTGTAATTCTTCTTCTTTCTTATTTTGTTGTTTGTATTTTTTGTTTTCTTCCATAAT
CTGACAGCTCGAAAACTCATTTAGTTGGTCATTGCATTTTGTAACAAGCTTTGTTTGTAA
ATGGTTATTGTACGTCTGCTTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 0 0 0 0 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2G276TF U 73
AF RR2HB25TF U 1
AF RR2ED64TF U 72
AF RR2G276JQ C 73
AF RR2H879JQ C 319
AF RR2H879TF U 73
AF RR2HB25JQ C 154
BS 1 72 RR2HB25TF
BS 73 74 RR2ED64TF
BS 75 126 RR2HB25TF
BS 127 132 RR2G276TF
BS 133 382 RR2HB25TF
BS 383 383 RR2ED64TF
BS 384 650 RR2HB25TF
BS 651 651 RR2ED64TF
BS 652 746 RR2HB25TF
BS 747 747 RR2ED64TF
BS 748 802 RR2H879TF
BS 803 804 RR2HB25JQ

RD RR2G276TF 610 0 0
GGGAGAAAGTCATTTACAAACAAAGGAAAACGAACAAATACTCAAAACAAAAACCAAAAC
AAAACAGAGCTTTGCTTTTTGCCCGGTTTAGACAACGATCTTTCATGGCTTTCACTAACA
AAATCTCGGCAGCAGCTGCGGTTGCGACAGCGATGCTATTTTTAGCGGTCATGATCGCTC
CCCGGTGGACGGAAGCACAAACGATGCCAAAGCTGGATCCAGTGTTCGCGTTGTTGATCA
CTGACACCCTCACCAAATGCTACTTAAGCGGGAATTTGACGCCATCTGATGACTGCTGCA
GCGCTCTCAAATCGGCCACCGATAGGCAAGTAACTTGTCTCTGCGACGATTTCATCGCAC
ATTCTTCTGACAACAACGTCACGCAAGCTCTGTTGGAAGTATACCACAACGACTGTGGCG
TTGCTGACAAGTTCGCCTGCAAAGGAAACTCCAATGTAGGAGCAACGAAGAAGATCAGTG
CATCAATTGGTCTACTTGGTTTGGCTACAAGTCTGTTCTTTTAATTAATTAAAGCTCGGG
CTTATCAAATACTCCTATATTTTTTTT*ATTTTTTTT**GGAACTGGACTCCTGTAA
ATCTCTCTTTCTA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2HB25TF 746 0 0
GAACATCAACAATGTACATTCCAACTCTCCACTAACACAATGTATATATATGGTGATGAT
GATAATGTACTCTTGAGAAAGTCATTTACAAACAAAGGAAAACGAACAAATACTCAAAAC
AAAAAC******AAAACAGAGCTTTGCTTTTTGCCCGGTTTAGACAACGATCTTTCATGG
CTTTCACTAACAAAATCTCGGCAGCAGCTGCGGTTGCGACAGCGATGCTATTTTTAGCGG
TCATGATCGCTCCCCGGTGGACGGAAGCACAAACGATGCCAAAGCTGGATCCAGTGTGCG
CGTTGTTGATCACTGACACCCTCACCAAATGCTACTTAAGCGGGAATTTGACGCCATCTG
ATGACTGCTGCAGCGCTCTCAAGTCGGCCACCGATAGGCAAGTAACTTGTCTCTGCGACG
ATTTCATCGCACATTCTTCTGACAACAACGTCACGCAAGCTCTGTTGGAAGTATACCACA
ACGACTGTGGCGTTGCTGACAAGTTCGCCTGCAAAGGAAACTCCAATGTAGGAGCAACGA
AGAAGATCAGTGCATCAATTGGTCTACTTGGTTTGGCTACAAGTCTGTTATTTTAATTAA
TTAAAGCTCGGGCTTATCAAATACTCCTATATTTTTTTTTATTTTTTTTTTGGAACTGGA
CTCCTGTAATTCTTCTTCTTTCTTATTTTGTTGTTTGTATTTTTTGTTTTCTTCCATAAT
CTGACAGCTCGAAAACTCATTTAGTT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2ED64TF 676 0 0
G
GGGAGAAAGTCATTTACAAACAAA***AAACGAACAAATACTCAAAACAAAAAC******
AAAACAGAGCTTTGCTTTTTGCCCGGTTTAGACAACGATCTTTCATGGCTTTCACTAACA
AAATCTCGGCAGCAGCTGCGGTTGCGACAGCGATGCTATTTTTAGCGGTCATGATCGCTC
CCCGGTGGACGGAAGCACAAACGATGCCAAAGCTGGATCCAGTGTGCGCGTTGTTGATCA
CTGACACCCTCACCAAGTGCTACTTAAGCGGGAATTTGACGCCATCTGATGACTGCTGCA
GCGCTCTCAAATCGGCCACCGATAGGCAAGTAACTTGTCTCTGCGACGATTTCATCGCAC
ATTCTTCTGACAACAACGTCACGCAAGCTCTGTTGGAAGTATACCACAACGACTGTGGCG
TTGCTGACAAGTTCGCCTGCAAAGGAAACTCCAATGTAGGAGCAATGAAGAAGATCAGTG
CATCAATTGGTCTACTTGGTTTGGCTACAAGTCTGTTATTTTAATTAATTAAAGCTCGGG
CTTATCAAATACTCCTATATTTTTTTTTATTTTTTTT**GGAACTGGACTCCTGTAATTC
TTCTTCTTTCTTATTTTGTTGTTTGTATTTTTTGTTTTCTTCCATAATCTGACAGCTCGA
AA*CTCATTTAGTTG

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR2G276JQ 678 0 0
GGGAGAAAGTCATTTACAAACAAAGGAAAACGAACAAATACTCAAAACAAAAACCAAAAC
AAAACAGAGCTTTGCTTTTTGCCCGGTTTAGACAACGATCTTTCATGGCTTTCACTAACA
AAATCTCGGCAGCAGCTGCGGTTGCGACAGCGATGCTATTTTTAGCGGTCATGATCGCTC
CCCGGTGGACGGAAGCACAAACGATGCCAAAGCTGGATCCAGTGTTCGCGTTGTTGATCA
CTGACACCCTCACCAAATGCTACTTAAGCGGGAATTTGACGCCATCTGATGACTGCTGCA
GCGCTCTCAAATCGGCCACCGATAGGCAAGTAACTTGTTTCTGCGACGATTTCATCGCAC
ATTCTTCTGACAACAACGTCACGCAAGCTCTGTTGGAAGTATACCACAACGACTGTGGCG
TTGCTGACAAGTTCGCCTGCAAAGGAAACTCCAATGTAGGAGCAACGAAGAAGATCAGTG
CATCAATTGGTCTACTTGGTTTGGCTACAAGTCTGTTCTTTTAATTAATTAAAGCTCGGG
CTTATCAAATACTCCTATATTTTTTTT*ATTTTTTTT**GGAACTGGACTCCTGTAATTC
TTCTTCTTTCTTATTTTGTTGTTTGTATTTTTTGTTTTCTTCCATGATCTGACAGCTCGA
AAACTCATTTAGTTGG
CC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2H879JQ 443 0 0
CCCTCACCAAATGCTACTTAAGCGGGAATTTGACGCCCCCTGATGACTGCTGCAGCGCTC
TCAAATCGGCCACCGATAGGCAAGTAACTTGTCTCTGCGACGATTTCATCGCCCATTCTT
CTGACAACAACGTCACCCAAGCTCTGTTGGAAGTATACCACAACGACTGTGGCGTTGCTG
ACAAGTTCGCCTGCAAAGGAAACTCCAATGTAGGAGCAACGAAGAAGATCAGTGCATCAA
TTGGTCTACTTGGTTTGGCTACAAGTCTGTTATTTTAATTAATTAAAGCTCGGGCTTATC
AAATACTCCTATATTTTTTTTTATTTTTTTTT*GGAACTGGACTCCTGTAATTCTTCTTC
TTTCTTATTTTGTTGTTTGTATTTTTTGTTTTCTTCCATAATCTGACAGCTCGAAAACTC
ATTTAGTTGGTCATTGCATTTTG

QA 1 443 1 443
DS 

RD RR2H879TF 730 0 0
GGGAGAAAGTCATTTACAAACAAAGGAAAACGAACAAATACTCAAAACAAAAAC******
AAAACAGAGCTTTGCTTTTTGCCCGGTTTAGACAACGATCTTTCATGGCTTTCACTAACA
AAATCTCGGCAGCAGCTGCGGTTGCGACAGCGATGCTATTTTTAGCGGTCATGATCGCTC
CCCGGTGGACGGAAGCACAAACGATGCCAAATCTGGATCCAGTGTGCGCGTTGTTGATCA
CTGACACCCTCACCAAATGCTACTTAAGCGGGAATTTGACGCCACCTGATGACTGCTGCA
GCGCTCTCAAATCGGCCACCGATAGGCAAGTAACTTGTCTCTGCGACGATTTCATCGCAC
ATTCTTCTGACAACAACGTCACGCAAGCTCTGTTGGAAGTATACCACAACGACTGTGGCG
TTGCTGACAAGTTCGCCTGCAAAGGAAACTCCAATGTAGGAGCAACGAAGAAGATCAGTG
CATCAATTGGTCTACTTGGTTTGGCTACAAGTCTGTTATTTTAATTAATTAAAGCTCGGG
CTTATCAAATACTCCTATATTTTTTTTTATTTTTTTTT*GGAACTGGACTCCTGTAATTC
TTCTTCTTTCTTATTTTGTTGTTTGTATTTTTTGTTTTCTTCCATAATCTGACAGCTCGA
AA*CTCATTTAGTTGGTCATTGCATTTTGTAACAAGCTTTGTTTGTAAATGGTTATTGTA
CGTCTGCTTC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2HB25JQ 651 0 0
CCCGGTTTAGACAACGATCTTTCATGGCTTTCACTAACAAAATCTCGGCAGCAGCTGCGG
TTGCGACAGCGATGCTATTTTTAGCGGTCATGATCGCTCCCCGGTGGACGGAAGCACAAA
CGATGCCAAAGCTGGATCCAGTGTGCGCGTTGTTGATCACTGACACCCTCACCAAATGCT
ACTTAAGCGGGAATTTGACGCCATTTGATGACTGCTGCAGCGCTCTCAAGTCGGCCACCG
ATAGGCAAGTAACTTGTTTTTGCGACGATTTCATCGCACATTCTTCTGACAACAACGTCA
CGCAAGCTCTGTTGGAAGTATACCACAACGACTGTGGCGTTGCTGACAAGTTCGCCTGCA
AAGGAAACTCCAATGTAGGAGCAACGAAGAAGATCAGTGCATCAATTGGTCTACTTGGTT
TGGCTACAAGTCTGTTATTTTAATTAATTAAAGCTCGGGCTTATCAAATACTCCTATATT
TTTTTTTATTTTTTTTTTGGAACTGGACTCCTGTAATTCTTCTTCTTTCTTATTTTGTTG
TTTGTATTTTTTGTTTTCTTCCATAATCTGACAGCTCGAAAACTCATTTAGTTGGTCATT
GCATTTTGTAACAAGCTTTGTTTGTAAATGGTTATTGTACGTCTGCTTCGG

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 3

CO CL1000Contig1 833 3 7 U
TTTTTGTGAAGTTAAGAAAAGGAAATAATGTCCAAAAGGGTGGGAGCAGTAGGTGGATAC
TTGGGAAATGCATTCGACGATGGTGTTTTCGATGGTGTGAAGAAAATTGTTGTGTCAGTA
GAGGGAGGTACTTTTAATTATATATCAATGATCAAGATCGAATATGAAAAGGACGGGAAA
CTTGAATCCCGTCAACATGGAACGGTTCGTGGGGAATTAAAAGAGTTTTTGGTGGATTAT
CCGAATGAATATATCACATCTGTTGGTGGGAGCTACGATACTGTTCGATACCACGACGTA
CCGCTGATCAAATCGCTAATCTTTAAAACCAACACTGGAAGAACATCTCCAGTACTCGGT
GGTAAAACAGCATCTGGAAAACCAGCTGGGACAGAATTCACCTTGGAGGGTAAATATGGA
GAAAAACTTATTGGATTCTTTGGACGTTCTGGTCAAGCTCTTGATGCCATTGGAGCTCAC
TTTGGACCACTCGGTGGTAATAAGGGAAACACATTCGACGATGGTGTTCTCGATGGTGTG
AAAAAGTTAACCGTTGGAGCAGATGAGTTCAGTGTAACTTATATCAAGATCGAATACGAA
AAGGATGGAGAAGTTGAAGTCCGTGAACATGGGACAAATCGCGGGGAGCTAAAAGAGTTC
TCGGTGAACTATGCCGAAGACAATATTGTAGAAGTTGGTGGAACCTACAAACATATTTTC
AACTATGATACAACGCTTATCACATCTTTGTACTTCACCACCTCCAAGGGATTTACCTCT
CCGTTATTTGGTGAGGCCAAGGGAACCGAGTTCGAGCTCAAAGGTGAAAATGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ78TF U 1
AF RR2EE66TF U 1
AF RR2DO12TF U 301
BS 1 100 RR2DQ78TF
BS 101 101 RR2EE66TF
BS 102 591 RR2DQ78TF
BS 592 653 RR2EE66TF
BS 654 654 RR2DO12TF
BS 655 667 RR2EE66TF
BS 668 833 RR2DO12TF

RD RR2DQ78TF 591 0 0
TTTTTGTGAAGTTAAGAAAAGGAAATAATGTCCAAAAGGGTGGGAGCAGTAGGTGGATAC
TTGGGAAATGCATTCGACGATGGTGTTTTCGATGGTGTGAGGAAAATTGTTGTGTCAGTA
GAGGGAGGTACTTTTAATTATATATCAATGATCAAGATCGAATATGAAAAGGACGGGAAA
CTTGAATCCCGTCAACATGGAACGGTTCGTGGGGAATTAAAAGAGTTTTTGGTGGATTAT
CCGAATGAATATATCACATCTGTTGGTGGGAGCTACGATACTGTTCGATACCACGACGTA
CCGCTGATCAAATCGCTAATCTTTAAAACCAACACTGGAAGAACATCTCCAGTACTCGGT
GGTAAAACAGCATCTGGAAAACCAGCTGGGACAGAATTCACCTTGGAGGGTAAATATGGA
GAAAAACTTATTGGATTCTTTGGACGTTCTGGTCAAGCTCTTGATGCCATTGGAGCTCAC
TTTGGACCACTCGGTGGTAATAAGGGAAACACATTCGACGATGGTGTTCTCGATGGTGTG
AAAAAGTTAACCGTTGGAGCAGATGAGTTCAGTGTAACTTATATCAAGATC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2EE66TF 673 0 0
TTTTTGTGAAGTTAAGAAAAGGAAATAATTTCCAAAAGGGTGGGAGCAGTAGGTGGATAC
TTGGGAAATGCATTCGACGATGGTGTTTTCGATGGTGTGAAGAAAATTGTTGTGTCAGTA
GAGGGAGGTACTTTTAATTATATATCAATGATCAAGATCGAATATGAAAAGGACGGGAAA
CTTGAATCCCGTCAACATGGAACGGTTCGTGGGGAATTAAAAGAGTTTTTGGTGGATTAT
CCGAATGAATATATCACATCTGTTGGTGGGAGCTACTATACTGTTCGATACTACGACGTA
CCGCTGATCAAATCGCTAATCTTTAAAACCAACACTGGAAGAACATCTCCAGTACTCGGT
GGTAAAACAGCATCTGGAAAACCAGCTGGGACAGAATTCACCTTGGAGGGTAAGTATGGA
GAAAAACTTATTGGATTCTTTGGACGTTCTGGTCAAGCTCTTGATGCCATTGGAGCTCAC
TTTGGACCACTCGGTGGTAATAAGGGAAACACATTCGACGATGGTGTTCTCGATGGTGTG
AAAAAGTTAACCGTTGGAGCAGATGAGTTCAGTGTAACTTATATCAAGATCGAATACGAA
AAGGATGGAGAAGTTGAAGTCCGTGAACATGGGACAAATCGCGGGGAGCTAAA*GAGTTC
TCGGTGA
CTATGC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2DO12TF 533 0 0
G
CGCTGATCAAATCGCTAATCTTTAAAACCAACACTGGAAGAACATCTCCAGTACTCGGTG
GTAAAACAGCATCTGGAAAACCAGCTGGGACAGAATTCACCTTGGAGGGTAAATATGGAG
AAAAACTTATTGGATTCTTTGGACGTTCTGGTCAAGCTCTTGATGCCATTGGAGCTCACT
TTGGACCACTCGGTGGTAATAAGGGAAACACATTCGACGATGGTGTTCTCGATGGTGTGA
AAAAGTTAACCGTTGGAGCAGATGAGTTCAGTGTAACTTATATCAAGATCGAATACGAAA
AGGATGGAGAAGTTGAAGTCCGTGAACATGGGACAAATCGCGGGGAGCTAAAAGAGTTCT
CGGTGAACTATGCCGAAGACAATATTGTAGAAGTTGGTGGAACCTACAAACATATTTTCA
ACTATGATACAACGCTTATCACATCTTTGTACTTCACCACCTCCAAGGGATTTACCTCTC
CGTTATTTGGTGAGGCCAAGGGAACCGAGTTCGAGCTCAAAGGTGAAAATGG

QA 2 533 2 533
DS 



AS 1 7

CO CL1001Contig1 949 7 17 U
GGAAGTCAGCTTCTCTTGCGAAACTCTCTCAACTTAGGACTATTCTTTCTGTCTAATACA
AGTTTTCGAATTCTACAGCGATGGATCTTAATCTCGATGCGCCGCACTCTATGGGGACGA
CCATCATCGGCGTCACTTACAATGGAGGCGTCGTTCTCGGTGCCGACTCACGTACCAGCA
CCGGGATGTACGTGGCGAATCGGGCTTCAGACAAGATCACACAACTAACAGACAATGTCT
ACGTCTGCCGTTCTGGTTCGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTATCGGACTATGTCCGCTACT
TTCTTCACCAGCATACAATCCAGCTCGGACAGCCTGCCACAGTAAAGGTTTCTGCCAACC
TTATCAGGATGCTCGCATATAATAACAAGAACATGCTGCAAACTGGCCTCATTGTTGGTG
GCTGGGATAAGTATGAAGGCGGCAAGATCTACGGGATCCCTCTCGGTGGAACTGTAGTGG
AGCAACCGTTCGCTATTGGAGGCTCTGGCTCCAGTTACCTCTACGGGTTCTTCGATCAGG
CGTGGAAAGAAAACATGACCAAAGAAGAAGCCGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGTTTCAC
TAGCCATCGCCCGTGATGGAGCCAGTGGAGGTGTTGTACGGACGGTCATAATAAACTCAG
AGGGAGTGACAAGAAACTTCTACCCTGGGGATAAGTTGCAGCTTTGGCACGAGGAGTTGG
AGCCCCAAAACTCCTTGTTGGACATCCTGAACGCTGCTGGTCCTGAACCAATGGCCATGT
GATGCAAAACAACCGATCATTCTCTTTACTCTGTTAAACAAACGTTTTAGATGTTTGCGT
TACATTTACCGGTATCTTTACTCTAAACTATGTTTTTATTTTGGATTGACCCGATCTGTC
ACTAAAAGGATATCGTGTTTGTTTATGGTTTTAAAAATTTTAATTCCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F653TF U 1
AF RR2AV05TF U 1
AF RR2DT03TF U 97
AF RR2AL93TF U 88
AF RR2F653JQ C 98
AF RR2AV05JQ C 106
AF RR2DT03JQ C 269
BS 1 9 RR2AV05TF
BS 10 10 RR2F653TF
BS 11 196 RR2AV05TF
BS 197 197 RR2F653TF
BS 198 537 RR2AV05TF
BS 538 538 RR2AL93TF
BS 539 712 RR2AV05TF
BS 713 713 RR2AL93TF
BS 714 724 RR2AV05TF
BS 725 725 RR2AL93TF
BS 726 784 RR2AV05TF
BS 785 881 RR2AL93TF
BS 882 882 RR2F653JQ
BS 883 908 RR2AL93TF
BS 909 909 RR2F653JQ
BS 910 923 RR2AL93TF
BS 924 949 RR2AV05JQ

RD RR2F653TF 535 0 0
GGAAGTCAGCTTCTCTTGCGAAACTCTCTCAACTTAGGACTATTCTTTCTGTCTAATACA
AGTTTTCGAATTCTACAGCGATGGATCTTAATCTCGATGCGCCGCACTCTATGGGGACGA
CCATCATCGGCGTCACTTACAATGGAGGCGTCGTTCTCGGTGCCGACTCACGTACCAGCA
CCGGGATGTACGTGGCGAATCGGGCTTCAGACAAGATCACACAACTAACAGACAATGTCT
ACGTCTGCCGTTCTGGTTCGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTATCGGACTATGTCCGCTACT
TTCTTCACCAGCATACAATCCAGCTCGGACAGCCTGCCACAGTAAAGGTTTCTGCCAACC
TTATCAGGATGCT*GCATATAATAACAAGAACATGCTGCAAACTGGCCTCATTGTTGGTG
GCTGGGATAAGTATGAAGGCGGCAAGATCTACAGGATCCCTCTCGGTGGAACTGTAGTGG
AGCAACCGTTCGCTATTGGAGGCTCTGGCTCCAGTTACCTCTACGGGTTCTTCGA

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2AV05TF 784 0 0
GGAAGTCAGTTTCTCTTGCGAAACTCTCTCAACTTAGGACTATTCTTTCTGTCTAATACA
AGTTTTCGAATTCTACAGCGATGGATCTTAATCTCGATGCGCCGCACTCTATGGGGACGA
CCATCATCGGCGTCACTTACAATGGAGGCGTCGTTCTCGGTGCCGACTCACGTACCAGCA
CCGGGATGTACGTGGCAAATCGGGCTTCAGACAAGATCACACAACTAACAGACAATGTCT
ACGTCTGCCGTTCTGGTTCGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTATCGGACTATGTCCGCTACT
TTCTTCACCAGCATACAATCCAGCTCGGACAGCCTGCCACAGTAAAGGTTTCTGCCAACC
TTATCAGGATGCTCGCATATAATAACAAGAACATGCTGCAAACTGGCCTCATTGTTGGTG
GCTGGGATAAGTATGAAGGCGGCAAGATCTACGGGATCCCTCTCGGTGGAACTGTAGTGG
AGCAACCGTTCGCTATTGGAGGCTCTGGCTCCAGTTACCTCTACGGGTTCTTCGATCGGG
CGTGGAAAGAAAACATGACCAAAGAAGAAGCCGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGTTTCAC
TAGCCATCGCCCGTGATGGAGCCAGTGGAGGTGTTGTACGGACGGTCATAATAAACTCAG
AGGGAGTGACAAGAAACTTCTACCCTGGGGATAAGTTGCAGCTTTGGCACGAAGAGTTGG
AGCCTCAAAACTCCTTGTTGGACATCCTGAACGCTGCTGGTCCTGAACCAATGGCCATGT
GATG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2DT03TF 721 0 0
GG
GCGCCGCACTCTATGGGGACGACCATCATCGGCGTCACTTACAATGGAGGCGTCGTTCTC
GGTGCCGACTCACGTACCAGCACCGGGATGTACGTGGCGAATCGGGCTTCAGACAAGATC
ACACAACTAACAGACAATGTCTACGTCTGCCGTTCTGGTTCGGCTGCTGATTCTCAGGTT
GTATCGGACTATGTCCGCTACTTTCTTCACCAGCATACAATCCAGCTCGGACAGCCTGCC
ACAGTAAAGGTTTCTGCCAACCTTATCAGGATGCTCGCATATAATAACAAGAACATGCTG
CAAACTGGCCTCATTGTTGGTGGCTGGGATAAGTATGAAGGCGGCAAGATCTACGGGATC
CCTCTCGGTGGAACTGTAGTGGAGCAACCGTTCGCTATTGGAGGCTCTGGCTCCAGTTAC
CTCTACGGGTTCTTCGATCAGGCGTGGAAAGAAAACATGACCAAAGAAGAAGCCGAGCAA
CTTGTTGTGAAGGCGGTTTCACTAGCCATCGCCCGTGATGGAGCCAGTGGAGGTGTTGTA
CGGACGGTCATAATAAACTCAGAGGGAGTGACAAGAAACTTCTACCCTGGGGATAAGTTG
CAGCTTTGGCACGAGGAGTTGGAGCCCCAAAACTCCTTGTTGGACATCCTGAACGCTGCT
GGTCCTGAACCAATGACCATGTGATGCAAA*CAACCGATCATTCTCTTTACTCTGTTAA

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR2AL93TF 837 0 0
GG
AATCTCGATGCGCCGCACTCTATGGGGACGACCATCATCGGCGTCACTTACAATGGAGGC
GTCGTTCTCGGTGCCGACTCACGTACCAGCACCGGGATGTACGTGGCGAATCGGGCTTCA
GACAAGATCACACAACTAACAGACAATGTCTACGTCTGCCGTTCTGGTTCGGCTGCTGAT
TCTCAGGTTGTATCGGACTATGTCCGCTACTTTCTTCACCAGCATACAATCCAGCTCGGA
CAGCCTGCCACAGTAAAGGTTTCTGCCAACCTTATCAGGATGCTCGCATATAATAACAAG
AACATGCTGCAAACTGGCCTCATTGTTGGTGGCTGGGATAAGTATGAAGGCGGCAAGATC
TACGGGATCCCTCTCGGTGGAACTGTAGTGGAGCAACCGTTCGCTATTGGAGGCTCTGGC
TCCAGTTACCTCTACGGGTTCTTCGATCAGGCGTGGAAAGAAAACATGACCAAAGAAGAA
GCCGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGTTTCACTAGCCATCGCCCGTGATGGAGCCAGTGGA
GGTGTTGTACGGACGGTCATAATAAACTCAGAGGGAGTGACAAGAAACTTCTACCCTGGG
GATAAGTTGCAGCTTTGGCACGAGGAGTTGGAGCCCCAAAACTCCTTGTTGGACATCCTG
AACGCTGCTGGTCCTGAACCAATGGCCATGTGATGCAAAACAACCGATCATTCTCTTTAC
TCTGTTAAACAAACGTTTTAGATGTTTGCGTTACATTTACCGGTATCTTTACTCTAAACT
ATGTTTTTATTT*GGATTGACCCGATCTGTCACTAAAAG*ATATCGTGTTTGTT
A

QA 3 836 3 836
DS 

RD RR2F653JQ 831 0 0
TGCGCCGCACTCTATGGG*ACGACCATCATCGGCGTCACTTACAATGGAGGCGTCGTTCT
CGGTGCCGACTCACGTACCAGCACCGGGATGTACGTGGCGAATCGGGCTTCAGACAAGAT
CACACAACTAACAGACAATGTCTACGTCTGCCGTTCTGGTTCGGCTGCTGATTCTCAGGT
TGTATCGGACTATGTCCGCTACTTTCTTCACCAGCATACAATCCAGCTCGGACAGCCTGC
CACAGTAAAGGTTTCTGCCAACCTTATCAGGATGCT*GCATATAATAACAAGAACATGCT
GCAAACTGGCCTCATTGTTGGTGGCTGGGATAAGTATGAAGGCGGCAAGATCTACGGGAT
CCCTCTCGGTGGAACTGTAGTGGAGCAACCGTTCGCTATTGGAGGCTCTGGCTCCAGTTA
CCTCTACGGGTTCTTCGATCAGGCGTGGAAAGAAAACATGACCAAAGAAGAAGCCGAGCA
ACTTGTTGTGAAGGCGGTTTCACTAGCCATCGCCCGTGATGGAGCCAGTGGAGGTGTTGT
ACGGACGGTCATAATAAACTCAGAGGGAGTGACAAGAAACTTCTACCCTGGGGATAAGTT
GCAGCTTTGGCACGAGGAGTTGGAGCCCCAAAACTCCTTGTTGGACATCCTGAACGCTGC
TGGTCCTGAACCAATGGCCATGTGATGCAAAACAACCGATCATTCTCTTTACTCTGTTAA
ACAAACGTTTTAGATGTTTGCGTTACATTTACCGGTATCTTTACTCTAAACTATGTTTTT
ATTTTGGATTGACCCGATCTGTCACTAAAAGGATATCGTGTTTGTT
TATGG

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2AV05JQ 844 0 0
ACTCTATGGGGACGACCATCATCGGCGTCACTTACAATGGAGGCGTCGTTCTCGGTGCCG
ACTCACGTACCAGCACCGGGATGTACGTGGCAAATCGGGCTTCAGACAAGATCACACAAC
TAACAGACAATGTCTACGTCTGCCGTTCTGGTTCGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTATCGG
ACTATGTCCGCTACTTTCTTCACCAGCATACAATCCAGCTCGGACAGCCTGCCACAGTAA
AGGTTTCTGCCAACCTTATCAGGATGCTCGCATATAATAACAAGAACATGCTGCAAACTG
GCCTCATTGTTGGTGGCTGGGATAAGTATGAAGGCGGCAAGATCTACGGGATCCCTCTCG
GTGGAACTGTAGTGGAGCAACCGTTCGCTATTGGAGGCTCTGGCTCCAGTTACCTCTACG
GGTTCTTCGATCGGGCGTGGAAAGAAAACATGACCAAAGAAGAAGCCGAGCAACTTGTTG
TGAAGGCGGTTTCACTAGCCATCGCCCGTGATGGAGCCAGTGGAGGTGTTGTACGGACGG
TCATAATAAACTCAGAGGGAGTGACAAGAAACTTCTACCCTGGGGATAAGTTGCAGCTTT
GGCACGAAGAGTTGGAGCCTCAAAACTCCTTGTTGGACATCCTGAACGCTGCTGGTCCTG
AACCAATGGCCATGTGATGCAAAACAACCGATCATTCTCTTTACTCTGTTAAACAAACGT
TTTAGATGTTTGCGTTACATTTACCGGTATCTTTACTCTAAACTATGTTTTTATTTTGGA
TTGACCCGATCTGTCACTAAAAGGATATCGTGTTTGTTTATGGTTTTAAAAATTTTAATT
CCTC

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR2DT03JQ 664 0 0
TTCTCAGGTTGTATCGGACTATGTCCGCTACTTTCTTCACCAGCATACAATCCAGCTCGG
ACAGCCTGCCACAGTAAAGGTTTCTGCCAACCTTATCAGGATGCTCGCATATAATAACAA
GAACATGCTGCAAACTGGCCTCATTGTTGGTGGCTGGGATAAGTATGAAGGCGGCAAGAT
CTACGGGATCCCTCTCGGTGGAACTGTAGTGGAGCAACCGTTCGCTATTGGAGGCTCTGG
CTCCAGTTACCTCTACGGGTTCTTCGATCAGGCGTGGAAAGAAAACATGACCAAAGAAGA
AGCCGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGTTTCACTAGCCATCGCCCGTGATGGAGCCAGTGG
AGGTGTTGTACGGACGGTCATAATAAACTCAGAGGGAGTGACAAGAAACTTCTACCCTGG
GGATAAGTTGCAGCTTTGGCACGAGGAGTTGGAGCCCCAAAACTCCTTGTTGGACATCCT
GAACGCTGCTGGTCCTGAACCAATGACCATGTGATGCAAAACAACCGATCATTCTCTTTA
CTCTGTTAAACAAACGTTTTAGATGTTTGCGTTACATTTACCGGTATCTTTACTCTAAAC
TATGTTTTTATTTTGGATTGACCCGATCTGTCACTAAAAGGATATCGTGTTTGTTTATGG
TTTT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 2 6

CO CL1002Contig1 549 3 4 U
AAAGAATAAATTATTACCATCAAAGAAGTCTGATCTGATTGATAAACAACCAAATGGTAT
ATTACAACTCAGTTAAAGTGTAAAATAGAGAAGGTAAAAAAGACAGAGAATATTCATTCA
TTGCAGTTGCAGAAGCAAAGTGAAAACAATCAAAAGGAGTTTTGACACACAACATACAGA
GAATCTTCACGAAACTTTTCATTATTCTTCTTCTTCCCGTTTACGAAAGATGCAAACTTG
GCTTAACTTCACGACTAGTGATGACTAGTATGAGTGGCATCACCGCCGGTATCTTGGCCT
TTCCTAAAAGCTGCTCTTAGTTTACGTTGTTCCTCTTTGTATATCCTGTTTCTTCTTTGG
AACTCTTTGGAATGGTGAAGACACTCGAGGTAGTCTTCACGAAAAAAAAAACAATCCTTG
GGCTCTCTGCAATGAGACATACACTCGCTGAAATCCATCCAGAAATCGTAACATCTCCCT
TTGTTCCCCGTTATTCCCCACCCCGACGCCATTGATGAATGAAACTCGAGTAATAGATTA
TCTATCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF22JQ U 1
AF RR2CF22TF C 1
AF RR2FJ41JQ U 89
BS 1 510 RR2CF22JQ
BS 511 511 RR2FJ41JQ
BS 512 543 RR2CF22JQ
BS 544 549 RR2FJ41JQ

RD RR2CF22JQ 545 0 0
AAAGAATAAATTATTACCATCAAAGAAGTCTGATCTGATTGATAAACAACCAAATGGTAT
ATTACAACTCAGTTAAAGTGTAAAATAGAGAAGGTAAAAAAGACAGAGAATATTCATTCA
TTGCAGTTGCAGAAGCAAAGTGAAAACAATCAAAAGGAGTTTTGACACACAACATACAGA
GAATCTTCACGAAACTTTTCATTATTCTTCTTCTTCCCGTTTACGAAAGATGCAAACTTG
GCTTAACTTCACGACTAGTGATGACTAGTATGAGTGGCATCACCGCCGGTATCTTGGCCT
TTCCTAAAAGCTGCTCTTAGTTTACGTTGTTCCTCTTTGTATATCCTGTTTCTTCTTTGG
AACTCTTTGGAATGGTGAAGACACTCGAGGTAGTCTTCACGAAAAAAAAAACAATCCTTG
GGCTCTCTGCAATGAGACATACACTCGCTGAAATCCATCCAGAAATCGTAACATCTCCCT
TTGTTCCCCGTTATTCCCCACCCCGACGCCCTTGATGAATGAAACTCGAGTAATAGATTA
TCT
CC

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2CF22TF 545 0 0
AAAGAATAAAT
TATTACCATCAAAGAAGTCTGATCTGATTGATAAACAACCAAATGGTATATTACAACTCA
GTTAAAGTGTAAAATAGAGAAGGTAAAAAAGACAGAGAATATTCATTCATTGCAGTTGCA
GAAGCAAAGTGAAAACAATCAAAAGGAGTTTTGACACACAACATACAGAGAATCTTCACG
AAACTTTTCATTATTCTTCTTCTTCCCGTTTACGAAAGATGCAAACTTGGCTTAACTTCA
CGACTAGTGATGACTAGTATGAGTGGCATCACCGCCGGTATCTTGGCCTTTCCTAGAAGC
TGCTCTTAGTTTACGTTGTTCCTCTTTGTATATCCTGTTTCTTCTTTGGAACTCTTTGGA
ATGGTGAAGACACTCGAGGTAGTCTTCACGAAGAAGAGAACAATCCTTGGGCTCTCTGCA
ATGAGACATACACTCGCTGAAATCCATCCAGAAATCGTAACATCTCCCTTTGTTCCCCGT
TATTCCCCACCCCGACGCCATTGATGAATGAAACTCGAGTAATAGATTATCT
CC

QA 12 543 12 543
DS 

RD RR2FJ41JQ 461 0 0
AA
AAGGTAAAAAAAACAGAAAATATTCATTCATTGCAGTTGCAAAAGCAAAGTGAAAACAAT
CAAAAGGAGTTTTGACACACAACATACAAAAAATCTTCACGAAACTTTTCATTATTCTTC
TTCTTCCCGTTTACAAAAGATGCAAACTTGGCTTAACTTCCCGACTAGTGATGACTAGTA
TGAGTGGCATCCCCGCCGGTATCTTGGCCTTTCCTAAAAGCTGCTCTTAGTTTACGTTGT
TCCTCTTTGTATATCCTGTTTCTTCTTTGGAACTCTTTGGAATGGTGAAAACACTCGAGG
TAGTCTTCACAAAAAAAAAAACAATCCTTGGGCTCTCTGCAATGAAACATACACTCCCTG
AAATCCATCCAGAAATCGTAACATCTCCCTTTGTTCCCCGTTATTCCCCACCCCGACCCC
ATTGATGAATGAAACTCAAGTAATAAATTATCTATCCTT

QA 3 461 3 461
DS 



CO CL1002Contig2 740 3 3 U
TTCACCGCAAATACTAGTTTGGCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATC
CACCGTGCAATGCACGCTGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTA
CTAGCTAAAGCTTTACGTCTATCGGGTGGAGATCATGTTCACGCGGGTACAGTAGTAGGT
AAACTTGGAAGAGACAAGGGATAATCTATTACTCGAGTTTCATTCATCAATGGCGTCGGG
GTGGGGAATAACGGGGAACAAAGGGAGATGTTACGATTTCTGGATGGATTTCAGCGAGTG
TATGTCTCATTGCAGAGAGCCCAAGGATTGTTCTCTTCTTCGTGAAGACTACCTCGAGTG
TCTTCACCATTCCAAAGAGTTCCAAAGAAGAAACAGGATATACAAAGAGGAACAGCGTAA
ACCAAGAGCAGCTTCTAGGAAAGGCCAAGATACCGGCGGTGATGCCACTCATCACTAGTC
ATCACTAGTCGTGAAGTTAAGCCAAGTTTGCATCTTTCGTAAACGGGAAGAAGAAGAATA
ATGAAAAGTCTCGTGAAGATTCTCTGTATGTTGTGTGTCAAACTCCTTTTGATTGTTTTC
AATTTACTTTTGCAACTGCAATGAACGAATATTCTGTCTTTTTTACCTCCTCTATTTTAC
ATTTTAACTGAGTTGTAATATACCATTTGGTTGTTTATCAATCAGATCAGACTTCTTTGA
TGGTAATATTTTTTTACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH67TF U 1
AF RR2DH67JQ C 69
AF RR2B868TF U 201
BS 1 241 RR2DH67TF
BS 242 724 RR2B868TF
BS 725 740 RR2DH67JQ

RD RR2DH67TF 241 0 0
TTCACCGCAAATACTAGTTTGGCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATC
CACCGTGCAATGCACGCTGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTA
CTAGCTAAAGCTTTACGTCTATCGGGTGGAGATCATGTTCACGCGGGTACAGTAGTAGGT
AAACTTGGAAGAGACAAGGGATAATCTATTACTCGAGTTTCATTCATCAATGGCGTCGGG
G

QA 1 241 1 241
DS 

RD RR2DH67JQ 672 0 0
AATGCACGCTGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTACTAGCTAA
AGCTTTACGTCTATCGGGTGGAGATCATGTTCACGCGGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGG
AAGAGACAAGGGATAATCTATTACTCGAGTTTCATTCATCAATGGCGTCGGGGTGGGGAA
TAACGGGGAACAAAGGGAGATGTTACGATTTCTGGATGGATTTCAGCGAGTGTATGTCTC
ATTGCAGAGAGCCCAAGGATTGTTCTCTTCTTCGTGAAGACTACCTCGAGTGTCTTCACC
ATTCCAAAGAGTTCCAAAGAAGAAACAGGATATACAAAGAGGAACAGCGTAAACTAAGAG
CAGCTTCTAGGAAAGGCCAAGATACCGGCGGTGATGCCACTCATCACTAGTCATCACTAG
TCGTGAAGTTAAGCCAAGTTTGCATCTTTCGTAAACGGGAAGAAGAAGAATAATGAAAAG
TCTCGTGAAGATTCTCTGTATGTTGTGTGTCAAACTCCTTTTGATTGTTTTCAATTTACT
TTTGCAACTGCAATGAACGAATATTCTGTCTTTTTTACCTCCTCTATTTTACATTTTAAC
TGAGTTGTAATATACCATTTGGTTGTTTATCAATCAGATCAGACTTCTTTGATGGTAATA
TTTTTTTACTCC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2B868TF 524 0 0
GG
AATCTATTACTCGAGTTTCATTCATCAATGGCGTCGGGGTGGGGAATAACGGGGAACAAA
GGGAGATGTTACGATTTCTGGATGGATTTCAGCGAGTGTATGTCTCATTGCAGAGAGCCC
AAGGATTGTTCTCTTCTTCGTGAAGACTACCTCGAGTGTCTTCACCATTCCAAAGAGTTC
CAAAGAAGAAACAGGATATACAAAGAGGAACAGCGTAAACCAAGAGCAGCTTCTAGGAAA
GGCCAAGATACCGGCGGTGATGCCACTCATCACTAGTCATCACTAGTCGTGAAGTTAAGC
CAAGTTTGCATCTTTCGTAAACGGGAAGAAGAAGAATAATGAAAAGTCTCGTGAAGATTC
TCTGTATGTTGTGTGTCAAACTCCTTTTGATTGTTTTCAATTTACTTTTGCAACTGCAAT
GAACGAATATTCTGTCTTTTTTACCTCCTCTATTTTACATTTTAACTGAGTTGTAATATA
CCATTTGGTTGTTTATCAATCAGATCAGACTTCTTTGATGGT

QA 3 524 3 524
DS 



AS 1 7

CO CL1003Contig1 624 7 5 U
GGGAAGCGGTGCCAATCCTCACCTCAACAAGACCACAACCTATGGCTGAACCCGATTCTC
CCCCTCCTCCTCAGCTGAACTTACCTTCTTTCGTCGTCAACCTGTTCCCCTTCCTCAAAC
CTAAGTCTCCTGCTTCTTCTGCTAACGTTGCCGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGAG
AAAAGGAGACTCATAACTCGACGGTCTCTTTCCCTTACAATCCTCCCAAGAGCACTGAGC
CACTCAAGGTTGAAGCCGAGCCTAGCTCCGGGACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGC
AGGTATATGCACTTGGAGGGTTTCTTGTCCTGAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGA
GGAACGAGAAAAAGAAGTCAACGGATGATGATGATGATGATGATCAAGCTCCTCGTCCGG
AAGATGATTGATTGATGATGAAGGCTTGTCATATTTGCACCAAGACAGTGAAATCTTTTA
CCCCCATTTTGGTTCTGTATAGCAGCAAAAACACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATT
GTATCTCTACTCAAGACTATTGAGTTTCTTCTACTTCTGTAATGACTACGATTCTTCTCT
CTCAATGCAGTTTTTTTTCTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G725TF U 19
AF RR2BI21JQ C 1
AF RR2G725JQ C 144
AF RR2G858JQ C 123
AF RR2G858TF U 19
AF RR2F829TF U 6
AF RR2BI21TF U 1
BS 1 7 RR2BI21JQ
BS 8 20 RR2F829TF
BS 21 588 RR2G725TF
BS 589 617 RR2G858TF
BS 618 624 RR2BI21JQ

RD RR2G725TF 570 0 0
GG
ACCTCAACAAGACCACAACCTATGGCTGAACCCGATTCTCCCCCTCCTCCTCAGCTGAAC
TTACCTTCTTTCGTCGTCAACCTGTTCCCCTTCCTCAAACCTAAGTCTCCTGCTTCTTCT
GCTAACGTTGCCGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGAGAAAAGGAGACTCATAACTCG
ACGGTCTCTTTCCCTTACAATCCTCCCAAGAGCACTGAGCCACTCAAGGTTGAAGCCGAG
CCTAGCTCCGGGACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGCAGGTATATGCACTTGGAGGG
TTTCTTGTCCTGAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGGAACGAGAAAAAGAAGTCA
ACGGATGATGATGATGATGATGATCAAGCTCCTCGTCCGGAAGATGATTGATTGATGATG
AAGGCTTGTCATATTTGCACCAAGACAGTGAAATCTTTTACCCCCATTTTGGTTCTGTAT
AGCAGCAAAAACACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGTATCTCTACTCAAGACTAT
TGAGTTTCTTCTACTTCTGTAATGACTA

QA 3 570 3 570
DS 

RD RR2BI21JQ 624 0 0
GGGAAGCGGTGCCAATCCTCACCTCAACAAGACCACAACCTATGGCTGAACCCGATTCTC
CCCCTCCTCCTCAGCTGAACTTACCTTCTTTCGTCGTCAACCTGTTCCCCTTCCTCAAAC
CTAAGTCTCCTGCTTCTTCTGCTAACGTTGCCGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGAG
AAAAGGAGACCCAGAACTCGACGGTCTCTTTCCCTTACAATCCTCCCAAGAGCACTGAGC
CACTCAAGGTTGAAGCCGAGCCTGGCTCCGGGACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGC
AGGTATATGCACTTGGAGGGTTTCTTGTCCTGAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGA
GGAACGAGAAAAAGAAGTCAACGGATGATGATGATGATGAT***CAAGCTCCTCGTCCGG
AAGATGATTGATTGATGATGAAGGCTTGTCATATTTGCACCAAGACAGTGAAATCTTTTA
CCCCCATTTTGGTTCTGTATAGCAGCAAAAACACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATT
GTATTTCTACTCAAGACTATTGAGTTTCTTCTACTTCTGTAATGACTACGATTCTTCTCT
CTCAATGCAGTTTTTTTTCTCCTC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2G725JQ 480 0 0
AACGTTGCCGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGAGAAAAGGAGACTCATAACTCGACG
GTCTCTTTCCCTTACAATCCTCCCAAGAGCACTGAGCCACTCAAGGTTGAAGCCGAGCCT
AGCTCCGGGACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGCAGGTATATGCACTTGGAGGGTTT
CTTGTCCTGAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGGAACGAGAAAAAGAAGTCAACG
GATGATGATGATGATGATGATCAAGCTCCTCGTCCGGAAGATGATTGATTGATGATGAAG
GCTTGTCATATTTGCACCAAGACAGTGAAATCTTTTACCCCCATTTTGGTTCTGTATAGC
AGCAAAAACACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGTATCTCTACTCAAGACTATTGA
GTTTCTTCTACTTCTGTAATGACTACGATTCTTCTCTCTCAATGCAGTTTTTTT
CTCCAC

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2G858JQ 501 0 0
AAGTCTCCTGCTTCTTCTGCTAACGTTGCCGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGAGAA
AAGGAGACTCATAACTCGACGGTCTCTTTCCCTTACAATCCTCCCAAGAGCACTGAGCCA
CTCAAGGTTGAAGCCGAGCCTAGCTCCGGGACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGCAG
GTATATGCACTTGGAGGGTTTCTTGTCCTGAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGG
AACGAGAAAAAGAAGTCAACGGATGATGATGATGATGATGATCAAGCTCCTCGTCCGGAA
GATGATTGATTGATGATGAAGGCTTGTCATATTTGCACCAAGACAGTGAAATCTTTTACC
CCCATTTTGGTTCTGTATAGCAGCAAAAACACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGT
ATCTCTACTCAAGACTATTGAGTTTCTTCTACTTCTGTAATGACTACGATTCTTCTCTCT
CAATGCAGTTTTTTT
CTCCAC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR2G858TF 605 0 0
GG
ACCTCAACAAGACCACAACCTATGGCTGAACCCGATTCTCCCCCTCCTCCTCAGCTGAAC
TTACCTTCTTTCGTCGTCAACCTGTTCCCCTTCCTCAAACCTAAGTCTCCTGCTTCTTCT
GCTAACGTTGCCGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGAGAAAAGGAGACTCATAACTCG
ACGGTCTCTTTCCCTTACAATCCTCCCAAGAGCACTGAGCCACTCAAGGTTGAAGCCGAG
CCTAGCTCCGGGACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGCAGGTATATGCACTTGGAGGG
TTTCTTGTCCTGAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGGAACGAGAAAAAGAAGTCA
ACGGATGATGATGATGATGATGATCAAGCTCCTCGTCCGGAAGATGATTGATTGATGATG
AAGGCTTGTCATATTTGCACCAAGACAGTGAAATCTTTTACCCCCATTTTGGTTCTGTAT
AGCAGCAAAAACACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGTATCTCTACTCAAGACTAT
TGAGTTTCTTCTACTTCTGTAATGACTACGATTCTTCTCTCTCAATGCAGTTTTTTT
CTCCAC

QA 3 599 3 599
DS 

RD RR2F829TF 616 0 0
GG
GGTGCCAATCCTCACCTCAACAAGACCACAACCTATGGCTGAACCCGATTCTCCCCCTCC
TCCTCAGCTGAACTTACCTTCTTTCGTCGTCAACCTGTTCCCCTTCCTCAAACCTAAGTC
TCCTGCTTCTTCTGCTAACGTTGCCGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGAGAAAAGGA
GACTCAGAACTCGACGGTCTCTTTCCCTTACAATCCTCCCAAGAGCACTGAGCCACTCAA
GGTTGAAGCCGAGCCTAGCTCCGGGACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGCAGGTATA
TGCACTTGGAGGGTTTCTTGTCCTGAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGGAACGA
GAAAAAGAAGTCAACGGATGATGATGATGATGATGATCAAGCTCCTCGTCCGGAAGATGA
TTGATTGATGATGAAGGCTTGTCATATTTGCACCAAGACAGTGAAATCTTTTACCCCCAT
TTTGGTTCTGTATAGCAGCAAAAACACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGTATCTC
TACTCAAGACTATTGAGTTTCTTCTACTTCTGTAATGACTACGATTCTTCTCTCTCAATG
CAGTTTTTTT
TCTC

QA 3 612 3 612
DS 

RD RR2BI21TF 624 0 0
GGGAAGC
GGTGCCAATCCTCACCTCAACAAGACCACAACCTATGGCTGAACCCGATTCTCCCCCTCC
TCCTCAGCTGAACTTACCTTCTTTCGTCGTCAACCTGTTCCCCTTCCTCAAACCTAAGTC
TCCTGCTTCTTCTGCTAACGTTGCCGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGAGAAAAGGA
GACCCAGAACTCGACGGTCTCTTTCCCTTACAATCCTCCCAAGAGCACTGAGCCACTCAA
GGTTGAAGCCGAGCCTGGCTCCGGGACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGCAGGTATA
TGCACTTGGAGGGTTTCTTGTCCTGAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGGAACGA
GAAAAAGAAGTCAACGGATGATGATGATGATGAT***CAAGCTCCTCGTCCGGAAGATGA
TTGATTGATGATGAAGGCTTGTCATATTTGCACCAAGACAGTGAAATCTTTTACCCCCAT
TTTGGTTCTGTATAGCAGCAAAAACACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGTATTTC
TACTCAAGACTATTGAGTTTCTTCTACTTCTGTAATGACTACGATTCTTCTCTCTCAATG
CAGTTTTTTT
TCTCCTC

QA 8 617 8 617
DS 



AS 2 7

CO CL1004Contig1 705 5 16 U
GGGCATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCA
CGCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAA
TTAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATC
GATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTATGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAA
TTTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTCGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCA
CATCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCA
CCAGCAATGACAGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCT
GCAAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCT
CCTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGATTGCAACGACCAAGAGAA
GCCCCCCTCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATCACACATT
TAAATGTTTCCTTTTTAACTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGGAATGTCA
AACTCGCACTTCCCAATAACTCAAAGAGAAGAGAAAACATTGCCG


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2DM85TF U 12
AF RR2EH55TF U 1
AF RR2AU13JQ C 3
AF RR2AU13TF U 3
AF RR2DM85JQ C 74
BS 1 212 RR2EH55TF
BS 213 213 RR2DM85TF
BS 214 379 RR2EH55TF
BS 380 380 RR2DM85TF
BS 381 412 RR2EH55TF
BS 413 413 RR2AU13TF
BS 414 443 RR2EH55TF
BS 444 446 RR2AU13TF
BS 447 644 RR2EH55TF
BS 645 645 RR2AU13TF
BS 646 673 RR2EH55TF
BS 674 684 RR2AU13TF
BS 685 685 RR2AU13JQ
BS 686 696 RR2AU13TF
BS 697 704 RR2AU13JQ
BS 705 705 RR2DM85JQ

RD RR2DM85TF 375 0 0
ACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCACGCAAGGCTTT
AAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAATTAAATCCTCC
CACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATCGATGTGACCGG
AGCTCCGGGGACGCTCTATGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAATTTCCCGTTAA
TTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTCGTTTTTGTTTCTCCGGCACCGTCACATCCACATAT
TTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCACCAGCAATGAC
AGCGAGTTCGGTCTG

QA 1 375 1 375
DS 

RD RR2EH55TF 673 0 0
GGGCATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCA
CGCAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAA
TTAAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATC
GATGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTATGCTAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAA
TTTCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTCGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCA
CATCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCA
CCAGCAATGACAGTGAGTTTGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAATTTCACCT
GCAAAGGAACGCCCCGCAGATAA***TCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCT
CCTAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGATTGCAACGACCAAGAGAA
GCCCCCCTCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATCACACATT
TAAATGTTTCCTTTTTAACTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTT*ACCTATGGAATGTCA
AACTCGCACTTCC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2AU13JQ 702 0 0
GG
ATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCACGCA
AGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAATTAA
ATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATCGATG
TGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTATGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAATTTC
CCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTCGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCACATC
CACATATTTACAGCTATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCACCAG
CAATGACAGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTGCAA
AGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCTCCTA
AGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGATTGCAACGACCAAGAGAAGCCC
CCCTCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATCACACATTTAAA
TGTTTCCTTTTTAACTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGGAATGTCGAACT
CGCACTTCCCAATAACTCAAAGAGAAGAGAAAACATTGCC

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR2AU13TF 702 0 0
GG
ATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCACGCA
AGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAATTAA
ATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATCGATG
TGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTATGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAATTTC
CCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTCGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCACATC
CACATATTTACAGCTATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCACCAG
CAATGACAGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTGCAA
AGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCTCCTA
AGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGATTGCAACGACCAAGAGAAGCCC
CCCTCTATTGTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATCACACATTTAAA
TGTTTCCTTTTTAACTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGGAATGTCGAACT
CGCACTTCCCAATAACTCAA*GAGAAGAGAAA
ACATTGCC

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR2DM85JQ 632 0 0
GCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAATTAAATCCTCCCA
CTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATCGATGTGACCGGAG
CTCCGGGGACGCTCTATGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAATTTCCCGTTAATT
ACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTCGTTTTTGTTTCTCCGGCACCGTCACATCCACATATTT
ACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTTGTGGTCACCAGCAATGACAG
CGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTGCAAAGGAACGCC
CCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCTCCTAAGGAGACGA
GGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCTTGATTGCAACGACCAAGAGAAGCCCCCCTCTATT
GTAATATGAAGATGATGACACTTGAAAATGTCGAATCATCACACATTTAAATGTTTCCTT
TTTAACTTGTTGTCTCCATCTTTTTCACTTTTACCTATGGAATGTCAAACTCGCACTTCC
CAATAACTCAAAGAGAAGAGAAAACATTGCCG

QA 1 632 1 632
DS 



CO CL1004Contig2 697 2 3 U
GCATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCACG
CAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAATT
AAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATTGA
TGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTATGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAATT
TCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCACA
TCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCCCC
AGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTGC
AAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCTCC
TAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCCTGATGCAACGACCAGGAGAAGCC
GCCTTTATTGTAATATGAAGATGATGACATTTGAAAATGTCGAATCATCATACATTTAAA
TGTTTTTTTAACTTGTTGTCTCCATCTTTTTAACTTTTACCTAATGGAATGTCAAACTCG
CACTTCCCAATAACTCAGAGAAGAGAAACATTGCCGG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F121JQ C 1
AF RR2F121TF U 1
BS 1 2 RR2F121JQ
BS 3 677 RR2F121TF
BS 678 697 RR2F121JQ

RD RR2F121JQ 697 0 0
GCATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCACG
CAAGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAATT
AAATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATTGA
TGTGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTATGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAATT
TCCCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCACA
TCCACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCCCC
AGCAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTGC
AAAGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCTCC
TAAGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCCTGATGCAACGACCAGGAGAAGCC
GCCTTTATTGTAATATGAAGATGATGACATTTGAAAATGTCGAATCATCATACATTTAAA
TGTTTTTTTAACTTGTTGTCTCCATCTTTTTAACTTTTACCTAATGGAATGTCAAACTCG
CACTTCCCAATAACTCAGAGAAGAGAAACATTGCCGG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2F121TF 692 0 0
GC
ATCGCACACCTTGTATTCTCTCTTTCTCCGCCATGACCAGCTCTTCCGCTCCCTCACGCA
AGGCTTTAAGCAAGATCGCGTGCAATAGGTTGCAGAAAGAGCTTACCGAGTGGCAATTAA
ATCCTCCCACTGGATTTAGGCACAAAGTTACCGATAATCTTCAAAAATGGACAATTGATG
TGACCGGAGCTCCGGGGACGCTCTATGCGAACGAGACTTACCAGCTTCAGGTTGAATTTC
CCGTTAATTACCCTATGGAAGCCCCCCAGGTAGTTTTTGTTCCTCCGGCACCGTCACATC
CACATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTTGGATATTCTATATGACTCGTGGTCCCCAG
CAATGACTGTGAGTTCGGTCTGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCAAGTTCACCTGCAA
AGGAACGCCCCGCAGATAATGATCGTTACGTCAAGAATTGTAAGAACGGGAGGTCTCCTA
AGGAGACGAGGTGGTGGTTCCATGACGACAAGGCCTGATGCAACGACCAGGAGAAGCCGC
CTTTATTGTAATATGAAGATGATGACATTTGAAAATGTCGAATCATCATACATTTAAATG
TTTTTTTAACTTGTTGTCTCCATCTTTTTAACTTTTACCTAATGGAATGTCAAACTCGCA
CTTCCCAATAACTCA
GAGAAGAGAAACATT

QA 3 677 3 677
DS 



AS 1 5

CO CL1005Contig1 1338 5 32 U
GGACGCTTCCTCTTATTGTGCGCCCTCTCCATCTCTTCGCGTGCGGCGTCGGCGCTTTCT
CCTCCTCACCGTCGACCCTCGTCACTAACGGAAGCAGCTTCGATCCTCATCTCGATCCGT
ACCCACTCGACGAGATCTCTCTTCCCGCCACCGTGATGTCGAAAGCTCGTGTCTACACCG
ACGTGAACGTGATCCGTCCCAAAGAGTATCGGGATTACGAGTCTCTCAATGTTGAGTGGG
GGGAGCAAGATGATTACGAGGTAGTCAGGAAAGTGGGGAGAGGCAAATACAGTGAGGTTT
TTGAAGGGATTAACATGAACAGCAACGAGAAGTGCGTCATCAAGATTCTTAAGCCTGTCA
AGAAGAAGAAGATTAGAAGAGAGATTAAGATACTTCAGAATCTCTGTGGAGGCCCAAATA
TTGTGAAGCTGCTTGATGTTGTCAGAGACCAACACTCAAAGACCCCAAGCTTGATATTTG
AGTATGTTAACAGCACAGACTTTAAGGTTCTGTATCCTACTTTGACTGATTATGACATCC
GTTACTACATCTACGAGCTCTTGAAGGCTTTGGACTACTGCCACTCGCAAGGTATAACGC
ACAGAGATGTCAAGCCACACAATGTCATGACCGACCGCGAGCTGCGTAAACTTCGCCTCA
TAGATTGGGGTCTTGCTGAGTTTTATCATCCTGGAAAAGAGTATAACGTCCGTGTGGCTT
CAAGATACTTCAAGGGACCCGAACTTTTAGTGGATTTACAGGACTATGACTATTCCTTGG
ACATGTGGAGCCTTGGTTGCATGTTTGCTGGGATGATATTCCGCAAGGAACCTTTTTTCT
ATGGCCATGACAACCAGGATCAGCTTGTCAAAATTGCCAAGGTTCTTGGAACCGATGAAT
TGAATGCATATCTGAATAAGTATCAGTTAGAACTCGATGCCCAATTAGAGGCACTTGTTG
GGAGACATAGCAGGAAGCCTTGGTCTAAATTCATCAATGCTGACAACAGGCATTTGGTCT
CACCTGAGGCGATTGATTTCCTGGACAAGCTACTTCGGTATGATCGTCAAGACAGATTAA
CTGCAAAAGAAGCAATGGCTCATCCTTATTTCGCGCAAGTCAAGGCAGCAGAGAGCAGCA
GAATGAGAACTTAATAGAGGCGTCTCTAAGTATCTGAAACTGGTTGGATTGTCCTTCGAA
ATGTTGTTTTCTTTTAAGAAGTGGTGTTAATGTTTAACTCTAAAATTCTATCCGAGTATT
TTCATCTGTTTTCAAACATTTGTAGAACTTCTATTGTTTAATCTTTGATATTTCAAAGAA
AAAAAAACAAGTTTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG70TF U 1
AF RR2B812TF U 257
AF RR2GV22TF U 606
AF RR2GV22JQB C 661
AF RR2B812JQ C 521
BS 1 334 RR2GG70TF
BS 335 335 RR2B812TF
BS 336 337 RR2GG70TF
BS 338 338 RR2B812TF
BS 339 403 RR2GG70TF
BS 404 404 RR2B812TF
BS 405 475 RR2GG70TF
BS 476 476 RR2B812TF
BS 477 597 RR2GG70TF
BS 598 598 RR2B812TF
BS 599 622 RR2GG70TF
BS 623 623 RR2B812TF
BS 624 630 RR2GG70TF
BS 631 631 RR2B812TF
BS 632 636 RR2GG70TF
BS 637 637 RR2B812TF
BS 638 658 RR2GG70TF
BS 659 659 RR2B812TF
BS 660 718 RR2GG70TF
BS 719 719 RR2B812TF
BS 720 722 RR2GG70TF
BS 723 723 RR2B812TF
BS 724 732 RR2GG70TF
BS 733 733 RR2B812TF
BS 734 757 RR2GG70TF
BS 758 972 RR2B812TF
BS 973 973 RR2GV22TF
BS 974 1028 RR2B812TF
BS 1029 1029 RR2GV22TF
BS 1030 1052 RR2B812TF
BS 1053 1318 RR2GV22TF
BS 1319 1338 RR2B812JQ

RD RR2GG70TF 757 0 0
GGACGCTTCCTCTTATTGTGCGCCCTCTCCATCTCTTCGCGTGCGGCGTCGGCGCTTTCT
CCTCCTCACCGTCGACCCTCGTCACTAACGGAAGCAGCTTCGATCCTCATCTCGATCCGT
ACCCACTCGACGAGATCTCTCTTCCCGCCACCGTGATGTCGAAAGCTCGTGTCTACACCG
ACGTGAACGTGATCCGTCCCAAAGAGTATCGGGATTACGAGTCTCTCAATGTTGAGTGGG
GGGAGCAAGATGATTACGAGGTAGTCAGGAAAGTGGGGAGAGGCAAATACAGTGAGGTTT
TTGAAGGGATTAACATGAACAGCAACGAGAAGTGTGTTATCAAGATTCTTAAGCCTGTCA
AGAAGAAGAAGATTAGAAGAGAGATTAAGATACTTCAGAATCTTTGTGGAGGCCCAAATA
TTGTGAAGCTGCTTGATGTTGTCAGAGACCAACACTCAAAGACCCCAAGCTTGATTTTTG
AGTATGTTAACAGCACAGACTTTAAGGTTCTGTATCCTACTTTGACTGATTATGACATCC
GTTACTACATCTACGAGCTCTTGAAGGCTTTGGACTACTGCCACTCGCAAGGTATAATGC
ACAGAGATGTCAAGCCACACAACGTCATGATCGACCACGAGCTGCGTAAACTTCGCCTGA
TAGATTGGGGTCTTGCTGAGTTTTATCATCCTGGAAAAGAGTATAACGTCCGTGTGGCCT
CA*GATACTTCA*GGGACCCGAACTTTTAGTGGATTT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2B812TF 796 0 0
GGAGGTAGTT
AGGAAAGTGGGGAGAGGCAAATACAGTGAGGTTTTTGAAGGGATTAACATGAACAGCAAC
GAGAAGTGCGTCATCAAGATTCTTAAGCCTGTCAAGAAGAAGAAGATTAGAAGAGAGATT
AAGATACTTCAGAATCTCTGTGGAGGCCCAAATATTGTGAAGCTGCTTGATGTTGTCAGA
GACCAACACTCAAAGACCCCAAGCTTGATATTTGAGTATGTTAACAGCACAGACTTTAAG
GTTTTGTATCCTACTTTGACTGATTATGACATCCGTTACTACATCTACGAGCTCTTGAAG
GCTTTGGACTACTGCCACTCGCAAGGTATAACGCACAGAGATGTCAAGCCACACAATGTC
ATGACCGACCGCGAGCTGCGTAAACTTCGCCTCATAGATTGGGGTCTTGCTGAGTTTTAT
CATCCTGGAAAAGAGTATAACGTCCGTGTGGCTTCAAGATACTTCAAGGGACCCGAACTT
TTAGTGGATTTACAGGACTATGACTATTCCTTGGACATGTGGAGCCTTGGTTGCATGTTT
GCTGGGATGATATTCCGCAAGGAACCTTTTTTCTATGGCCATGACAACCAGGATCAGCTT
GTCAAAATTGCCAAGGTTCTTGGAACCGATGAATTGAATGCATATCTGAATAAGTATCAG
TTAGAACTCGATGCCCAATTAGAGGCACTTGTTGGGAGACATAGCACGAAGCCTTGGTCT
AAATTCATCAATGCTGACAACAGGCATTTGGTCTCACCTGAG*CGATTGATTTCCTGGAC
AAGCTA

QA 11 796 11 796
DS 

RD RR2GV22TF 714 0 0
GATGTCAAGCCACACAATGTCATGATCGACCACGAGCTGCGTAAACTTCGCCTCATAGAT
TGGGGTCTTGCTGAGTTTTATCATCCTGGAAAAGAGTATAACGTCCGTGTGGCTTCAAGA
TACTTCAAGGGACCCGAACTTTTAGTGGATTTACAGGACTATGACTATTCCTTGGACATG
TGGAGCCTTGGTTGCATGTTTGCTGGGATGATATTCCGCAAGGAACCTTTTTTCTATGGC
CATGACAACCAGGATCAGCTTGTCAAAATTGCCAAGGTTCTTGGAACCGATGAATTGAAT
GCATATCTGAATAAGTATCAGTTAGAACTCGATGCCCAATTAGAGGCACTTGTTGGGAGA
CATAGCAGGAAGCCTTGGTCTAAATTCATCAATGCTGACAACAGGCATTTGGTCTCACCT
GAGGCGATTGATTTCCTGGACAAGCTACTTCGGTATGATCGTCAAGACAGATTAACTGCA
AAAGAAGCAATGGCTCATCCTTATTTCGCGCAAGTCAAGGCAGCAGAGAGCAGCAGAATG
AGAACTTAATAGAGGCGTCTCTAAGTATCTGAAACTGGTTGGATTGTCCTTCGAAATGTT
GTTTTCTTTTAAGAAGTGGTGTTAATGTTTAACTCTAAAATTCTATCCGAGTATTTTCAT
CTGTTTTCAAACATTTGTAGAACTTCTATTGTTTAATCTTTGATATTTCAAAG
T

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2GV22JQB 626 0 0
TAGATTGGGGTCTTGCTGAGTTTTATCATCCTGGAAAAGAGTATAACGTCCGTGTGGCTT
CAAGATACTTCAAGGGACCCGAACTTTTAGTGGATTTACAGGACTATGACTATTCCTTGG
ACATGTGGAGCCTTGGTTGCATGTTTGCTGGGATGATATTCCGCAAGGAACCTTTTTTCT
ATGGCCATGACAACCAGGATCAGCTTGTCAAAATTGCCAAGGTTCTTGGAACCGATGAAT
TGAATGCATATCTGAATAAGTATCAGTTAGAACTCGATGCCCAATTAGAGGCACTTGTTG
GGAGACATAGCAGGAAGCCTTGGTCTAAATTCATCAATGCTGACAACAGGCATTTGGTCT
CACCTGAGGCGATTGATTTCCTGGACAAGCTACTTCGGTATGATCGTCAAGACAGATTAA
CTGCAAAAGAAGCAATGGCTCATCCTTATTTCGCGCAAGTCAAGGCAGCAGAGAGCAGCA
GAATGAGAACTTAATAGAGGCGTCTCTAAGTATCTGAAACTGGTTGGATTGTCCTTCGAA
ATGTTGTTTTCTTTTAAGAAGTGGTGTTAATGTTTAACTCTAAAATTCTATCCGAGTATT
TTCATCTGTTTTCAAACATTTGTAGA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2B812JQ 818 0 0
TTTGACTGATTATGACATCCGTTACTACATCTACGAGCTCTTGAAGGCTTTGGACTACTG
CCACTCGCAAGGTATAACGCACAGAGATGTCAAGCCACACAATGTCATGACCGACCGCGA
GCTGCGTAAACTTCGCCTCATAGATTGGGGTCTTGCTGAGTTTTATCATCCTGGAAAAGA
GTATAACGTCCGTGTGGCTTCAAGATACTTCAAGGGACCCGAACTTTTAGTGGATTTACA
GGACTATGACTATTCCTTGGACATGTGGAGCCTTGGTTGCATGTTTGCTGGGATGATATT
CCGCAAGGAACCTTTTTTCTATGGCCATGACAACCAGGATCAGCTTGTCAAAATTGCCAA
GGTTCTTGGAACCGATGAATTGAATGCATATCTGAATAAGTATCAGTTAGAACTCGATGC
CCAATTAGAGGCACTTGTTGGGAGACATAGCAGGAAGCCTTGGTCTAAATTCATCAATGC
TGACAACAGGCATTTGGTCTCACCTGAGGCGATTGATTTCCTGGACAAGCTACTTCGGTA
TGATCATCAAGACAGATTAACTGCAAAAGAAGCAATGGCTCATCCTTATTTCGCGCAAGT
CAAGGTAGCAGAGAGCAGCAGAATGAGAACTTAATAGAGGCGTCTCTAAGTATCTGAAAC
TGGTTGGATTGTCCTTCGAAATGTTGTTTTCTTTTAAGAAGTGGTGTTAATGTTTAACTC
TAAAATTCTATCCGAGTATTTTCATCTGTTTTCAAACATTTGTAGAACTTCTATTGTTTA
ATCTTTGATATTTCAAAGAAAAAAAAACAAGTTTGTTG

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 6

CO CL1006Contig1 1023 6 7 U
GGATATAAAAGGTATATGTGTGTTCAGCCCAAATCCCTCTGATTCTCGTGTACATAAACA
TCAGTCCCAACTAAATCATCTAGAAAAAAACCCTCTTTGAGAAAAATCATCCAAAACAAT
GTACTCTTCATTGTCTGTGTCAAAACGCCTCCTTTTGATCCAGGTCTTGGCCATACAACT
TCTCCTTATAAGCAGTGAATTGTATTTAAACACGACCAATGCGTATCTCAACTTCAAATG
CTTGGATAGTCAAGGAAAATACAAGCGGGGAAGTAGGTACGAGGAAATTTTAATATCTAA
CACCAAAAGGTTCTATGTGGACAGTAGCCTTAGAAGAGCTTTCACCCTGTTCGGATCTGA
TAAATTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGTGGAGACTCCTACGGGACCAAATGCCACGACTG
CTTTGCCACTGCCCTCGCTGCGCTTATTAGGAAATGTCCATGGTATAAGGGGAGGATAAT
ATGGTATGACCAATGTCTTCTCACGTTTTCGTCCAATCATTCTACTGGAATGATCGATTA
CGACAACATCTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTGGGAGATAAGCTCGCGTTTGCAAG
TGTATGGAATACTCTCTTGGACAATCTTACGACTTTAGCTATCAGTCGAGTTAATTACAC
TGAGCCAACAGCATTGTACTCTGTGGGGGAGACACGGTTCAAGGGTGATACAGTTTATGG
AATGGTGCAGTGTACCAAAGACATAGGACCAGAAGCTTGTGAAGAGTGTTTGGTTTTTAA
TAGGTTGCATTTTCAAGATTGCCTGAATGATAAACGAGGAGCGAGATTTGTCGGTGGAAG
CTGTACTTTTAGGTTTGAGTTTTATCCTTTTATTACCAAGCCGGTTCAAAATATTTAAAG
ACCTAAATATATATATTTTTTGTTTGACTTTTTCAATCATAAGCTTATGTAACATCAAAT
GCTACTTTTTGAAAGAATAAAACAACAGAATAATGATAGGATAAGATAATTCTCTCCTAT
CTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2F147TF U 1
AF RR2E835TF U 35
AF RR2D360TF U 46
AF RR2F147JQ C 221
AF RR2D360JQ C 333
AF RR2E835JQ C 338
BS 1 483 RR2F147TF
BS 484 484 RR2E835TF
BS 485 538 RR2F147TF
BS 539 539 RR2E835TF
BS 540 692 RR2F147TF
BS 693 699 RR2D360TF
BS 700 1023 RR2F147JQ

RD RR2F147TF 692 0 0
GGATATAAAAGGTATATGTGTGTTCAGCCCAAATCCCTCTGATTCTCGTGTACATAAACA
TCAGTCCCAACTAAATCATCTAGAAAAAAACCCTCTTTGAGAAAAATCATCCAAAACAAT
GTACTCTTCATTGTCTGTGTCAAAACGCCTCCTTTTGATCCAGGTCTTGGCCATACAACT
TCTCCTTATAAGCAGTGAATTGTATTTAAACACGACCAATGCGTATCTCAACTTCAAATG
CTTGGATAGTCAAGGAAAATACAAGCGGGGAAGTAGGTACGAGGAAATTTTAATATCTAA
CACCAAAAGGTTCTATGTGGACAGTAGCCTTAGAAGAGCTTTCACCCTGTTCGGATCTGA
TAAATTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGTGGAGACTCCTACGGGACCAAATGCCACGACTG
CTTTGCCACTGCCCTCGCTGCGCTTATTAGGAAATGTCCATGGTATAAGGGGAGGATAAT
ATGATATGACCAATGTCTTCTCACGTTTTCGTCCAATCATTCTACTGGAATGATCGAT*A
CGACAACATCTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTGGGAGATAAGCTCGCGTTTGCAAG
TGTATGGAATACTCTCTTGGACAATCTTACGACTTTAGCTATCAGTCGAGTTAATTACAC
TGAGCCAACAGCATTGTACTCTGTGGGGGAGA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2E835TF 657 0 0
GG
CTCTGATTCTCGTGTACATAAACATCAGTCCCAACTAAATCATCTAGAAAAAA*CCCTCT
TTGAGAAAAATCATCCAAAACAATGTACTCTTCATTGTCTGTGTCAAAACGCCTCCTTTT
GATCCATGTCTTGGCCATACAACTTCTCCTTATAAGCAGTGAATTGTATTTAAACACGAC
CAATGCATATCTCAACTTCAAATGCTTGGATAGTCAAGGAAAATACAAGCGGGGAAGTAG
GTACGAGGAAATTTTAATATCTAACACCAAAAGGTTCTATGTGGACAGTAGCCTTAGAAG
AGCTTTCACCCTGTTCGGCTCTGATAAATTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGTGGAGACTC
CTATGGGACCAAATGCCACGACTGCTTTGCCACTGCCCTCGCTGCGCTTATTAGGAAATG
TCCATGGTATAAGGGGAGGATAATATGGTATGACCAATGTCTTCTCACGTTTTCGTCCAA
TCATTCTACTGGAATGATCGATTACGACAACATCTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTT
GGGAGATAAGCTCGCGTTTGCAAGTGTATGGAATACTCTCTTGGACAATCTTACGACTTT
AGCTATCAGTCGAGTTAATTACACTGAGCCAACAGCATTGTACTCTGTGGGGGAG

QA 3 657 3 657
DS 

RD RR2D360TF 654 0 0
GG
GTGTACATAAACATCAGTCCCAACTAAATCATCTAGAAAAAAACCCTCTTTGAGAAAAAT
CATCCAAAACAATGTACTCTTCATTGTCTGTGTCAAAACGCCTCCTTTTGATCCAGGTCT
TGGCCATACAACTTCTCCTTATAAGCAGTGAATCGTATTTAAACACGACCAATGCGTATC
TCAACTTCAAATGCTTGGATAGTCAAGGAAAATACAAGCGGGGAAGTAGGTACGAGGAAA
TTTTAATATCTAACACCAAAAGGTTCTATGTGGACAGTAGCCTTAGAAGAGCTTTCACCC
TGTTCGGATCTGATAAATTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGTGGAGACTCCTACGGGACCA
AATGCCACGACTGCTTTGCCACTGCCCTCGCTGCGCTTATTAGGAAATGTCCATGGTATA
AGGGGAGGATAATATGGTATGACCAATGTCTTCTCACGTTTTCGTCCAATCATTCTACTG
GAATGATCGATTACGACAACATCTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTGGGAGATAAGC
TCGCGTTTGCAAGTGTATGGAATACTCTCTTGGACAATCTTACGACTTTAGCTATCAGTC
GAGTTAATTACACTGAGCCAACAGCATTGTACTCTGTGGGGGAGACACGGTT

QA 3 654 3 654
DS 

RD RR2F147JQ 803 0 0
GCG
TATCTCAACTTCAAATGCTTGGATAGTCAAGGAAAATACAAGCGGGGAAGTAGGTACGAG
GAAATTTTAATATCTAACACCAAAAGGTTCTATGTGGACAGTAGCCTTAGAAGAGCTTTC
ACCCTGTTCGGATCTGATAAATTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGTGGAGACTCCTACGGG
ACCAAATGCCACGACTGCTTTGCCACTGCCCTCGCTGCGCTTATTAGGAAATGTCCATGG
TATAAGGGGAGGATAATATGATATGACCAATGTCTTCTCACGTTTTCGTCCAATCATTCT
ACTGGAATGATCGAT*ACGACAACATCTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTGGGAGAT
AAGCTCGCGTTTGCAAGTGTATGGAATACTCTCTTGGACAATCTTACGACTTTAGCTATC
AGTCGAGTTAATTACACTGAGCCAACAGCATTGTACTCTGTGGGGGAGACACGGTTCAAG
GGTGATACAGTTTATGGAATGGTGCAGTGTACCAAAGACATAGGACCAGAAGCTTGTGAA
GAGTGTTTGGTTTTTAATAGGTTGCATTTTCAAGATTGCCTGAATGATAAACGAGGAGCG
AGATTTGTCGGTGGAAGCTGTACTTTTAGGTTTGAGTTTTATCCTTTTATTACCAAGCCG
GTTCAAAATATTTAAAGACCTAAATATATATATTTTTTGTTTGACTTTTTCAATCATAAG
CTTATGTAACATCAAATGCTACTTTTTGAAAGAATAAAACAACAGAATAATGATAGGATA
AGATAATTCTCTCCTATCTA

QA 4 803 4 803
DS 

RD RR2D360JQ 691 0 0
GAAGAGCTTTCACCCTGTTCGGATCTGATAAATTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGTGGAG
ACTCCTACGGGACCAAATGCCACGACTGCTTTGCCACTGCCCTCGCTGCGCTTATTAGGA
AATGTCCATGGTATAAGGGGAGGATAATATGGTATGACCAATGTCTTCTCACGTTTTCGT
CCAATCATTCTACTGGAATGATCGATTACGACAACATCTTTTGTATGTCCAACGCGAAGA
AGTTGGGAGATAAGCTCGCGTTTGCAAGTGTATGGAATACTCTCTTGGACAATCTTACGA
CTTTAGCTATCAGTCGAGTTAATTACACTGAGCCAACAGCATTGTACTCTGTGGGGGAGA
CACGGTTCAAGGGTGATACAGTTTATGGAATGGTGCAGTGTACCAAAGACATAGGACCAG
AAGCTTGTGAAGAGTGTTTGGTTTTTAATAGGTTGCATTTTCAAGATTGCCTGAATGATA
AACGAGGAGCGAGATTTGTCGGTGGAAGCTGTACCTTTAGGTTTGAGTTTTATCCTTTTA
TTACCAAGCCGGTTCAAAATATTTAAAGACCTAAATATATATATTTTTTGTTTGACTTTT
TCAATCATAAGCTTATGTAACATCAAATGCTACTTTTTGAAAGAATAAAACAACAGAATA
ATGATAGGATAAGATAATTCTCTCCTATCTA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2E835JQ 686 0 0
GCTTTCACCCTGTTCGGCTCTGATAAATTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGTGGAGACTCC
TATGGGACCAAATGCCACGACTGCTTTGCCACTGCCCTCGCTGCGCTTATTAGGAAATGT
CCATGGTATAAGGGGAGGATAATATGGTATGACCAATGTCTTCTCACGTTTTCGTCCAAT
CATTCTACTGGAATGATCGATTACGACAACATCTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTG
GGAGATAAGCTCGCGTTTGCAAGTGTATGGAATACTCTCTTGGACAATCTTACGACTTTA
GCTATCAGTCGAGTTAATTACACTGAGCCAACAGCATTGTACTCTGTGGGGGAGACACGG
TTCAAGGGTGATACAATTTATGGAATGGTGCAGTGTACCAAAGACATAGGACCAGAAGCT
TGTGAAGAGTGTTTGGTTTTTAATAGGTTGCATTTTCAAGATTGCCTGAATGATAAACGA
GGAGCGAGATTTGTCGGTGGAAACTGTACTTTTAGGTTTGAGTTTTATCCTTTTATTACC
AAGCCGGTTCAAAATATTTAAAGACCTAAATATATATATTTTTTGTTTGACTTTTTCAAT
CATAAGCTTATGTAACATCAAGTGCTACTTTTTGAAAGAATAAAACAACAGAATAATGAT
AGGATAAGATAATTCTCTCCTATCTA

QA 1 686 1 686
DS 



AS 2 6

CO CL1007Contig1 473 2 2 U
GGGTGGTCTTGTTTTCGTGCCAAGCGAATTCACGGTGGCTAAAGGAGAGAAGATCGTTTT
CAAGAACAACGCAGGGTACCCACACAACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGATCCCTAGTGG
CGTGGACGCGAGCAAGATCTCTATGGACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGAC
ATACGAGGTTACATTGACGGAGCCTGGCTCTTACGGTTTCTACTGTGTGCCGCACCAGGG
AGCTGGTATGGTCGGGAAACTTACCGTCAATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCAT
GAACCATAAATAATTGTCTGGAAGAGTGTCTTGAATTATAAAACAGGATTATGTAATACT
CCATTTACGTACTTGTTTAGTGGTAATAGCATTGGTTCTTCGGTACTTTTAAGCTGCTGC
CATTGATTTAGATCATTTATGTTTGTCACGTGAAAATAAAGTTTCTTTGAGAT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G680JQ C 1
AF RR2G680TF U 1
BS 1 1 RR2G680JQ
BS 2 473 RR2G680TF

RD RR2G680JQ 473 0 0
GGGTGGTCTTGTTTTCGTGCCAAGCGAATTCACGGTGGCTAAAGGAGAGAAGATCGTTTT
CAAGAACAACGCAGGGTACCCACACAACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGATCCCTAGTGG
CGTGGACGCGAGCAAGATCTCTATGGACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGAC
ATACGAGGTTACATTGACGGAGCCTGGCTCTTACGGTTTTTACTGTGTGCCGCACCAGGG
AGCTGGTATGGTCGGGAAACTTACCGTCAATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCAT
GAACCATAAATAATTGTCTGGAAGAGTGTCTTGAATTATAAAACAGGATTATGTAATACT
CCATTTACGTACTTGTTTAGTGGTAATAGCATTGGTTTTTCGGTACTTTTAAGCTGCTGC
CATTGATTTAGATCATTTATGTTTGTCACGTGAAAATAAAGTTTCTTTGAGAT

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2G680TF 473 0 0
G
GGTGGTCTTGTTTTCGTGCCAAGCGAATTCACGGTGGCTAAAGGAGAGAAGATCGTTTTC
AAGAACAACGCAGGGTACCCACACAACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGATCCCTAGTGGC
GTGGACGCGAGCAAGATCTCTATGGACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGACA
TACGAGGTTACATTGACGGAGCCTGGCTCTTACGGTTTCTACTGTGTGCCGCACCAGGGA
GCTGGTATGGTCGGGAAACTTACCGTCAATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATG
AACCATAAATAATTGTCTGGAAGAGTGTCTTGAATTATAAAACAGGATTATGTAATACTC
CATTTACGTACTTGTTTAGTGGTAATAGCATTGGTTCTTCGGTACTTTTAAGCTGCTGCC
ATTGATTTAGATCATTTATGTTTGTCACGTGAAAATAAAGTTTCTTTGAGAT

QA 2 473 2 473
DS 



CO CL1007Contig2 814 4 2 U
GGACTTCAAAGTTGTTATATAAATCTGATAAAATCATATCTTATACTCATTTCATTTCTA
GTACTAATCACATAAACTAGCAAAAAACATAACAAAATGGCGTCAGTTACATCAGCTACC
CTCGCATTCCCATGTTTCACCGGCCTCAAGCTCGCCATCAACTCCAAACCCACGATGGTG
TCCGCCGCCGCCTTCAAATCCCCTTCCACAGCGGCGCCTAAGCTCTCCGTGAAGTCGTCT
CTGAAAGATTTCGGCGTCATGGCCGTCGCAGCTGCAGCTTCCATCGCTCTGGCCGGGAAT
GCGATGGCCATTGAGATTCTCTTAGGATCTGACGATGGTGGTCTTGTTTTCGTGCCAAGC
GAATTCACGGTGGCTAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAACAACGCAGGGTACCCACAC
AACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGGTCCCTAGTGGCGTGGACGCGGGCAAGATCTCTATG
GACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGACATACGAGGTTACATTGACGGAGCCT
GGCTCTTACGGTTTCTACTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTCGGGAAACTTACC
GTCAATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAATTACTGTAATCT
GGAAGAGTGTATTGAATTATAAAACAGGATTATGTAATACTCCATTTACGTACTGGTTTA
ATGGTAACAGCATTGGTTCTTCGGTACTTTTAAGCTGCTGCCATTAATTTAGATCATTTG
TGTTTGTCACGTGAAAATAAAGTTTCTTTGAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H435TF U 1
AF RR2F604JQ C 244
AF RR2BG42TF U 47
AF RR2H435JQB C 337
BS 1 681 RR2H435TF
BS 682 814 RR2BG42TF

RD RR2H435TF 681 0 0
GGACTTCAAAGTTGTTATATAAATCTGATAAAATCATATCTTATACTCATTTCATTTCTA
GTACTAATCACATAAACTAGCAAAAAACATAACAAAATGGCGTCAGTTACATCAGCTACC
CTCGCATTCCCATGTTTCACCGGCCTCAAGCTCGCCATCAACTCCAAACCCACGATGGTG
TCCGCCGCCGCCTTCAAATCCCCTTCCACAGCGGCGCCTAAGCTCTCCGTGAAGTCGTCT
CTGAAAGATTTCGGCGTCATGGCCGTCGCAGCTGCAGCTTCCATCGCTCTGGCCGGGAAT
GCGATGGCCATTGAGATTCTCTTAGGATCTGACGATGGTGGTCTTGTTTTCGTGCCAAGC
GAATTCACGGTGGCTAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAACAACGCAGGGTACCCACAC
AACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGGTCCCTAGTGGCGTGGACGCGGGCAAGATCTCTATG
GACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGACATACGAGGTTACATTGACGGAGCCT
GGCTCTTACGGTTTCTACTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTCGGGAAACTTACC
GTCAATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAATTACTGTAATCT
GGAAGAGTGTATTGAATTATA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2F604JQ 531 0 0
AAAGATTTCGGCGTCATGGCCGTCGCAGCTGCAGCTTCCATCGCTCTGGCCGGGAATGCG
ATGGCCATTGAGATTCTCTTAGGATCTGACGATGGTGGTCTTGTTTTCGTGCCAAGCGAA
TTCACGGTGGCTAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAACAACGCAGGGTACCCACACAAC
GTGGTGTTCGACGAAGACGAGGTCCCTAGTGGCGTGGACGCGGGCAAGATCTCTATGGAC
GAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGACATACGAGGTTACATTGACGGAGCCTGGC
TCTTACGGTTTCTACTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTCGGGAAACTTACCGTC
AATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAATTACTGTAATCTGGA
AGAGTGTATTGAATTATAAAACAGGATTATGTAATACTCCATTTACGTACTGGTTTAATG
GTAACAGCATTGGTTCTTCGGTACTTTTAAGCTGCTGCCATTAATTTAGAT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2BG42TF 768 0 0
GG
ATTTCATTTCTAGTACTAATCACATAAACTAGCAAAAAACATAACAAAATGGCGTCAGTT
ACATCAGCTACCCTCGCATTCCCATGTTTCACCGGCCTCAAGCTCGCCATCAACTCCAAA
CCCACGATGGTGTCCGCCGCCGCCTTCAAATCCCCTTCCACAGCGGCGCCTAAGCTCTCC
GTGAAGTCGTCTCTGAAAGATTTCGGCGTCATGGCCGTCGCAGCTGCAGCTTCCATCGCT
CTGGCCGGGAATGCGATGGCCATTGAGATTCTCTTAGGATCTGACGATGGTGGTCTTGTT
TTCGTGCCAAGCGAATTCACGGTGGCTAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAACAACGCA
GGGTACCCACACAACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGGTCCCTAGTGGCGTGGACGCGGGC
AAGATCTCTATGGACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGACATACGAGGTTACA
TTGACGGAGCCTGGCTCTTACGGTTTCTACTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTC
GGGAAACTTACCGTCAATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAA
TTACTGTAATCTGGAAGAGTGTATTGAATTATAAAACAGGATTATGTAATACTCCATTTA
CGTACTGGTTTAATGGTAACAGCATTGGTTCTTCGGTACTTTTAAGCTGCTGCCATTAAT
TTAGATCATTTGTGTTTGTCACGTGAAAATAAAGTTTCTTTGAGAT

QA 3 768 3 768
DS 

RD RR2H435JQB 459 0 0
GGTGGTCTTGTTTTCGTGCCAAGCGAATTCACGGTGGCTAAAGGAGAGAAGATCGTGTTC
AAGAACAACGCAGGGTACCCACACAACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGGTCCCTAGTGGC
GTGGACGCGGGCAAGATCTCTATGGACGAGCAAGCTTTTCTCAATGGTGCTGGAGAGACA
TACGAGGTTACATTGACGGAGCCTGGCTCTTACGGTTTTTACTGTGTGCCGCACCAGGGA
GCTGGTATGGTCGGGAAACTTACCGTCAATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATG
AACCATAAATAATTACTGTAATCTGGAAGAGTGTATTGAATTATAAAACAGGATTATGTA
ATACTCCATTTACGTACTGGTTTAATGGTAACAGCATTGGTTTTTCGGTACTTTTAAGCT
GCTGCCATTAATTTAGATCATTTGTGTTTGTCACGTGAA

QA 1 459 1 459
DS 



AS 1 6

CO CL1008Contig1 1347 6 7 U
GGGTTCACCACAGGCTGGGTATTATAACTCGATCATCTTCTTTTTCAGCTCGATGGAAAG
AGAAAAAATGTCTCCACTCTCAGATCTCCTTAACCTCAATCTCGACACCAAGCAAATCAT
CGCTGAATACATATGGATAGGTGGGTCTGGAATGGACATTAGAAGCAAAGGCAGAACGTT
ACCAGGACCAGTAAGTGATCCATCAAAGCTTCCGAAATGGAACTACGATGGATCCAGCAC
CAATCAAGCCGCCGGAGATGACAGTGAAGTCATTCTATATCCTCAGGCCATTTTTAAAGA
CCCATTCAGGAAAGGGAATAACATTCTCGTGATGTATGATGCCTACACACCGAAAGGAGA
TCCAATCCCGACCAACAATAGGCACAAAGCCGTGAAAATCTTCGATCATCCCAATGTGAA
GGCTGAAGAGCCTTGGTTTGGGATAGAGCAAGAATACACATTACTTAAGAAAGACGTCAA
GTGGCCATTAGGTTGGCCCATTGGTGGCTTTCCTGGTCCTCAGGGACCGTACTATTGTGC
CGTGGGTGCAGACAAAGCCTTTGGTCGTGACATTGTGGATGGTCACTACAAAGCTTGCCT
TTACGCTGGCTTAAGCATAGGTGGTGCCAATGGTGAAGTCATGCCTGGACAGTGGGAGTT
TCAGATCAGCCCTACTGTTGGTATTGGTGCAGGTGATCAGTTATGGGTTGCTCGCTACAT
ACTCGAGAGGATTACTGAGATATGCGGCGTGATTGTCTCATTTGATCCCAAACCAATCGA
GGGGGATTGGAACGGAGCAGCTGCTCATACAAACTTCAGTACAAAATCAATGAGGAAAGA
AGGAGGATTAGACTTGATCAAGAAAGCAATAGGGAAGCTTGAAGTAAAGCATAAACAACA
CATTGCTGTTTATGGTGAAGGCAATGAGAGGCGTCTCACTGGGAAGCATGAAACCGCAGA
CATCAACAAGTTCTCTTGGGGAGTGGCGGATCGTGGAGCATCGGTGAGGGTGGGAAGAGA
TACGGAGGAGGAAGGGAAAGGTTATTTTGAAGATCGAAGGCCTTCGTCTAATATGGATCC
TTATCTTGTTACCTCCATGATAGCTGAAACCACCATCCTCGGCTAAGCTTTCTTTTGAAG
TTGTTGCATATGTTCTTTTGTTTCTTCATGTTTCGGTTAATTTCGGTTTGAGACTCTTTT
TTTTATTGCTAATAATTCATAGGATGGTCTTGATCCTATTGTTTGTTTATCCTGGTTCAG
CTGTTAGTCTTGAGGTAATTCACTTGGAGAGATTAGTGTTAAAGAAAATTGAATTGGGAA
AATAAGGGTTTTTAGTTTTTACTTGTT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU69TF U 1
AF RR2CS05TF U 1
AF RR2AN04JQ C 613
AF RR2AN04TF U 613
AF RR2GU69JQB C 793
AF RR2CS05JQ C 628
BS 1 337 RR2CS05TF
BS 338 338 RR2GU69TF
BS 339 597 RR2CS05TF
BS 598 598 RR2GU69TF
BS 599 688 RR2CS05TF
BS 689 1232 RR2AN04TF
BS 1233 1347 RR2CS05JQ

RD RR2GU69TF 616 0 0
GG
GTTCACCACAGGCTGGGTATTATAACTCGATCATCTTCTTTTTCAGCTCGATGGAAAGAG
AAAAAATGTCTCCACTCTCAGATCTCCTTAACCTCAATCTCGACACCAAGCAAATCATCG
CTGAATACATATGGATAGGTGGGTCTGGAATGGACATTAGAAGCAAAGGCAGAACGTTAC
CAGGACCAGTAAGTGATCCATCAAAGCTTCCGAAATGGAACTACGATGGATCCAGCACCA
ATCAAGCCGCCGGAGATGACAGTGAAGTCATTCTATATCCTCAGGCCATTTTTAAAGACC
CATTCAGGAAAGGGAATAACATTCTCGTGATGTGTGATGCCTACACACCGAAAGGAGATC
CAATCCCGACCAACAATAGGCACAAAGCCGTGAAAATCTTCGATCATCCCAATGTGAAGG
CTGAAGAGCCTTGGTTTGGGATAGAGCAAGAATACACATTACTTAAGAAAGACGTCAAGT
GGCCATTAGGTTGGCCCATTGGTGGCTTTCCTGGTCCTCAGGGACCGTACTATTGTGCGG
TGGGTGCAGACAAAGCCTTTGGTCGTGACATTGTGGATGGTCACTACAAAGCTTGCCTTT
ACGCTGGTTTAAGC

QA 3 616 3 616
DS 

RD RR2CS05TF 688 0 0
GGGTTCACCACAGGCTGGGTATTATAACTCGATCATCTTCTTTTTCAGCTCGATGGAAAG
AGAAAAAATGTCTCCACTCTCAGATCTCCTTAACCTCAATCTCGACACCAAGCAAATCAT
CGCTGAATACATATGGATAGGTGGGTCTGGAATGGACATTAGAAGCAAAGGCAGAACGTT
ACCAGGACCAGTAAGTGATCCATCAAAGCTTCCGAAATGGAACTACGATGGATCCAGCAC
CAATCAAGCCGCCGGAGATGACAGTGAAGTCATTCTATATCCTCAGGCCATTTTTAAAGA
CCCATTCAGGAAAGGGAATAACATTCTCGTGATGTATTATGCCTACACACCGAAAGGAGA
TCCAATCCCGACCAACAATAGGCACAAAGCCGTGAAAATCTTCGATCATCCCAATGTGAA
GGCTGAAGAGCCTTGGTTTGGGATAGAGCAAGAATACACATTACTTAAGAAAGACGTCAA
GTGGCCATTAGGTTGGCCCATTGGTGGCTTTCCTGGTCCTCAGGGACCGTACTATTGTGC
CGTGGGTGCAGACAAAGCCTTTGGTCGTGACATTGTGGATGGTCACTACAAAGCTTGTCT
TTACGCTGGCTTAAGCATAGGTGGTGCCAATGGTGAAGTCATGCCTGGACAGTGGGAGTT
TCAGATCAGCCCTACTGTTGGTATTGGT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2AN04JQ 620 0 0
GAGCATAG
GTGGTGCCAATGGTGAAGTCATGCCTGGACAGTGGGAGTTTCAGATCAGCCCTACTGTTG
GTATTGGTGCAGGTGATCAGTTATGGGTTGCTCGCTACATACTCGAGAGGATTACTGAGA
TATGCGGCGTGATTGTCTCATTTGATCCCAAACCAATCGAGGGGGATTGGAACGGAGCAG
CTGCTCATACAAACTTCAGTACAAAATCAATGAGGAAAGAAGGAGGATTAGACTTGATCA
AGAAAGCAATAGGGAAGCTTGAAGTAAAGCATAAACAACACATTGCTGTTTATGGTGAAG
GCAATGAGAGGCGTCTCACTGGGAAGCATGAAACCGCAGACATCAACAAGTTCTCTTGGG
GAGTGGCGGATCGTGGAGCATCGGTGAGGGTGGGAAGAGATACGGAGGAGGAAGGGAAAG
GTTATTTTGAAGATCGAAGGCCTTCGTCTAATATGGATCCTTATCTTGTTACCTCCATGA
TAGCTGAAACCACCATCCTCGGCTAAGCTTTCTTTTGAAGTTGTTGCATATGTTCTTTTG
TTTCTTCATGTTTCGGTTAATTTCGGTTTGAGACTCTTTTTTTTATTGCTAATAATTCAT
AGGATGGTCTTG

QA 9 620 9 620
DS 

RD RR2AN04TF 620 0 0
GAGCATAG
GTGGTGCCAATGGTGAAGTCATGCCTGGACAGTGGGAGTTTCAGATCAGCCCTACTGTTG
GTATTGGTGCAGGTGATCAGTTATGGGTTGCTCGCTACATACTCGAGAGGATTACTGAGA
TATGCGGCGTGATTGTCTCATTTGATCCCAAACCAATCGAGGGGGATTGGAACGGAGCAG
CTGCTCATACAAACTTCAGTACAAAATCAATGAGGAAAGAAGGAGGATTAGACTTGATCA
AGAAAGCAATAGGGAAGCTTGAAGTAAAGCATAAACAACACATTGCTGTTTATGGTGAAG
GCAATGAGAGGCGTCTCACTGGGAAGCATGAAACCGCAGACATCAACAAGTTCTCTTGGG
GAGTGGCGGATCGTGGAGCATCGGTGAGGGTGGGAAGAGATACGGAGGAGGAAGGGAAAG
GTTATTTTGAAGATCGAAGGCCTTCGTCTAATATGGATCCTTATCTTGTTACCTCCATGA
TAGCTGAAACCACCATCCTCGGCTAAGCTTTCTTTTGAAGTTGTTGCATATGTTCTTTTG
TTTCTTCATGTTTCGGTTAATTTCGGTTTGAGACTCTTTTTTTTATTGCTAATAATTCAT
AGGATGGTCTTG

QA 9 620 9 620
DS 

RD RR2GU69JQB 508 0 0
CGGAGCAGCTGCTCATACAAACTTCAGTACGAAATCAATGAGGAAAGAAGGAGGATTAGA
CTTGATCAAGAAAGCAATAGGGAAGCTTGAAGTAAAGCATAAACAACACATTGCTGCTTA
TGGTGAAGGCAATGAGAGGCGTCTCACTGGGAAGCATGAAACCGCAGACATCAACAAGTT
CTCTTGGGGAGTGGCGGATCGTGGAGCATCGGTGAGGGTGGGAAGAGATACGGAGAAGGA
AGGGAAAGGTTATTTTGAAGATCGAAGGCCTTCGTCTAATATGGATCCTTATCTTGTTAC
CTCCATGATAGCTGAAACCACCATCCTCGGCTAAGCTTTCTTTTGAAGTTGTTGCATATG
TTCTTTTGTTTCTTCATGTTTCGGTTAATTTCGGTTTGAGACTCTTTTTTTTATTGCTAA
TAATTCATAGGATGGTCTTGATCCTATTGTTTGTTTATCCTGGTTCAGCTGTTAGTCTTG
AGGTAATTCACTTGGAGAGATTAGTG
GC

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2CS05JQ 720 0 0
CAATGGTGAAGTCATGCCTGGACAGTGGGAGTTTCAGATCAGCCCTACTGTTGGTATTGG
TGCAGGTGATCAGTTATGGGTTGCTCGCTACATACTCGAGAGGATTACTGAGATATGCGG
CGTGATTGTCCCATTTGATCCCAAACCAATCGAGGGGGATTGGAACGGAGCAGCTGTTCA
TACAAACTTCAGTACAAAATCAATGAGGAAAGAAGGAGGATTAGACTTGATCAAGAAAGC
AATAGGGAAGCTTGAAGTAAAGCATAAACAACACATTGCTGCTTATGGTGAAGGCAATGA
GAGGCGTCTCACTGGGAAGCATGAAACCGCAGGCATCAACAAGTTTTCTTGGGGAGTGGC
GGATCGTGGAGCATCGGTGAGGGTGGGAAGAGATACGGAGAAGGAAGGGAAAGGTTATTT
TGAAGATCGAAGGCCTTCGTTTAATATGGATCCTTATCTTGTTACCTCCATGATAGCTGA
AACCACCATCCTCGGCTAAGCTTTCTTTTGAAGTTGTTGCATATGTTCTTTTGTTTCTTC
ATGTTTCGGTTAATTTCGGTTTGAGACTTTTTTTTTTATTGCTAATAATTCATAGGATGG
TCTTGATCCTATTGTTTGTTTATCCTGGTTCAGCTGTTAGTCTTGAGGTAATTCACTTGG
AGAGATTAGTGTTAAAGAAAATTGAATTGGGAAAATAAGGGTTTTTAGTTTTTACTTGTT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 7

CO CL1009Contig1 744 7 11 U
GGACGGTATAAAGAAAATTTAGGGTTCACATGAACCAACACCAAAACCGAGTAGCGATTC
TCTCTTCTCACTTATCGCCCGTCATGGCTTCAGAGAAAGAGGCTGCTTTAGCCGCCACTC
CTTCCGATGATTCTCCCACCATATTTGACAAGATCATCAGTAAAGAAATTCCATCCACCG
TTGTTTATGAGGATGACAAGGTCTTGGCTTTTAGGGACATAACTCCACAGGGTCCTGTTC
ACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGAGGGATGGCTTAACTGGCCTCTCTAAGGCTGAGGAAA
GGCACATTGATATCTTGGGCCGCCTTCTCTACACTGCCAAGCTTGTAGCCAAACAAGAAG
GACTAGATGAAGGTTTCAGAATTGTGATCAATGATGGTCCTCAAGGCTGTCAATCGGTGT
ATCACATTCATGTTCATCTCATTGGAGGACGCCAAATGAACTGGCCTCCTGGCTAAAAAG
ATATCATCATCTACTAGTGATTCTTGTCCTGGTTATAAGAGGAACCCTACCCTGAGTTTG
CTATTGTCTTCTTCTGTCTTTATGAATAAAAGGCTTGGGACCTAAGTTTTTATGATTGAA
ATCTAAACCTTGGTCTATAGTATGAAGAGAATATTCGACTGTTCTCTTTTGTGAAATCCT
CTTTTTTTATTGTTGACTTTGTAAAACATTTCAATGGTAAAAAAAGCTTTGAATAAATGA
GTCAATAATGGAGAATCTTGGTAT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DE91TF U 38
AF RR2DW32TF U 1
AF RR2BF39JQ C 1
AF RR2BF39TF U 1
AF RR2E702TF U 31
AF RR2DE91JQ C 38
AF RR2DW32JQ C 325
BS 1 39 RR2DW32TF
BS 40 515 RR2DE91TF
BS 516 520 RR2DW32TF
BS 521 521 RR2BF39TF
BS 522 525 RR2DW32TF
BS 526 620 RR2BF39TF
BS 621 653 RR2E702TF
BS 654 654 RR2DE91JQ
BS 655 663 RR2E702TF
BS 664 704 RR2DE91JQ
BS 705 744 RR2DW32JQ

RD RR2DE91TF 478 0 0
GG
ACCAAAACCGAGTAGCGATTCTCTCTTCTCACTTATCGCCCGTCATGGCTTCAGAGAAAG
AGGCTGCTTTAGCCGCCACTCCTTCCGATGATTCTCCCACCATATTTGACAAGATCATCA
GTAAAGAAATTCCATCCACCGTTGTTTATGAGGATGACAAGGTCTTGGCTTTTAGGGACA
TAACTCCACAGGGTCCTGTTCACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGAGGGATGGCTTAACTG
GCCTCTCTAAGGCTGAGGAAAGGCACATTGATATCTTGGGCCGCCTTCTCTACACTGCCA
AGCTTGTAGCCAAACAAGAAGGACTAGATGAAGGTTTCAGAATTGTGATCAATGATGGTC
CTCAAGGCTGTCAATCGGTGTATCACATTCATGTTCATCTCATTGGAGGACGCCAAATGA
ACTGGCCTCCTGGCTAAAAAGATATCATCATCTACTAGTGATTCTTGTCCTGGTTA

QA 3 478 3 478
DS 

RD RR2DW32TF 525 0 0
GGACGGTATAAAGAAAATTTAGGGTTCACATGAACCAACACCAAAACCGAGTAGCGATTC
TCTCTTCTCACTTATCGCCCGTCATGGCTTCAGAGAAAGAGGCTGCTTTAGCCGCCACTC
CTTCCGATGATTCTCCCACCATATTTGACAAGATCATCAGTAAAGAAATTCCATCCACCG
TTGTTTATGAGGATGACAAGGTCTTGTCTTTTAGGGACATAACTCCACAGGGTCCTGTTC
ACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGAGGGATGGCTTAACTGGCCTCTCTAAGGCTGAGGAAA
GGCACATTGATATCTTGGGCCGCCTTCTCTACACTGCCAAGCTTGTAGCCAAACAAGAAG
GACTAGATGAAGGTTTCAGAATTGTGATCAATGATGGTCCTCAAGGCTGTCAATCGGTGT
ATCACATTCATGTTCATCTCATTGGAGGACGCCAAATGAACTGGCCTCCTGGCTAAAAAG
ATATCATCATCTACTAGTGATTCTTGTCCTGGTTATAAGAAGAAC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2BF39JQ 621 0 0
GGACGGTATAAAGAAAATTTAGGGTTCACATGAACCAACACCAAAACCGAGTAGCGATTC
TCTCTTCTCACTTATCGCCCGTCATGGCTTCAGAGAAAGAGGCTGCTTTAGCCGCCACTC
CTTCCGATGATTCTCCCACCATATTTGACAAGATCATCAGTAAAGAAATTCCATCCACCG
TTGTTTATGAGGATGACAAGGTCTTGGCTTTTAGGGACATAACTCCACAGGGTCCTGTTC
ACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGAGGGATGGCTTAACTGGCCTCTCTAAGGCTGAGGAAA
GGCACATTGATATCTTGGGCCGCCTTCTCTACACTGCCAAGCTTGTAGCCAAACAAGAAG
GACTAGATGAAGGTTTCAGAATTGTGATCAATGATGGTCCTCAAGGCTGTCAATCGGTGT
ATCACATTCATGTTCATCTCATTGGAGGACGCCAAATGAACTGGCCTCCTGGCTAAAAAG
ATATCATCATCTACTAGTGATTCTTGTCCTGGTTATAAGAGGAACCCTACCCTGAGTTTG
CTATTGTCTTCTTCTGTCTTTATGAATAAAAGGCTTGGGACCTAAGTTTTTATGATTGAA
ATCTAAACCTTGGTCTATAG
C

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2BF39TF 621 0 0
GGACGGTATAAAGAAAATTTAGGGTTCACATGAACCAACACCAAAACCGAGTAGCGATTC
TCTCTTCTCACTTATCGCCCGTCATGGCTTCAGAGAAAGAGGCTGCTTTAGCCGCCACTC
CTTCCGATGATTCTCCCACCATATTTGACAAGATCATCAGTAAAGAAATTCCATCCACCG
TTGTTTATGAGGATGACAAGGTCTTGGCTTTTAGGGACATAACTCCACAGGGTCCTGTTC
ACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGAGGGATGGCTTAACTGGCCTCTCTAAGGCTGAGGAAA
GGCACATTGATATCTTGGGCCGCCTTCTCTACACTGCCAAGCTTGTAGCCAAACAAGAAG
GACTAGATGAAGGTTTCAGAATTGTGATCAATGATGGTCCTCAAGGCTGTCAATCGGTGT
ATCACATTCATGTTCATCTCATTGGAGGACGCCAAATGAACTGGCCTCCTGGCTAAAAAG
ATATCATCATCTACTAGTGATTCTTGTCCTGGTTATAAGAGGAACCCTACCCTGAGTTTG
CTATTGTCTTCTTCTGTCTTTATGAATAAAAGGCTTGGGACCTAAGTTTTTATGATTGAA
ATCTAAACCTTGGTCTATAG
C

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2E702TF 650 0 0
G
GAACCAACACCAAAACCGAGTAGCGATTCTCTCTTCTCACTTATCGCCCGTCATGGCTTC
AGAGAAAGAGGCTGCTTTAGCCGCCACTCCTTCCGATCATTCTCCCACCATATTTGACAA
GATCATCAGTAAAGACATTCCATCCACCGTTGTTTATGAGGATGACAAGGTCTTGGCTTT
TAGGGACATAACTCCCCAGGGTCCTGTTCACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGAGGGATGG
CTTAACTGGCCTCTCTAAGGCTGAGGAGAGGCACATTGATATCTTGGGCCGCCTTCTCTA
CACTGCCAAGCTTGTAGCCAAACAAGAAGGACTAGATGAAGGTTTCAGAATTGTGATCAA
TGATGGTCCTCAAGGCTGTCAATCGGTGTATCACATTCATGTTCATCTCATTGGAGGACG
CCAAATGAACTGGCCTCCTGGCTAAAAAGATATCATCATCTACTAGTGATTCTTGTCCTG
GTTATAAGAGGAACCCTACCCTGAGTTTGCTATTGTCTTCTTCTGTCTTTATGAATAAAA
GGCTTGGGACATAACTTTTTATGATTGAAATCTAAACCTTGGTCTATGGTATGAAGAGAA
TATTCGACTGTTCTCTTTTGTGGAATCCTCTT
AATTATTGTTGACTTTG

QA 2 633 2 633
DS 

RD RR2DE91JQ 673 0 0
GG
ACCAAAACCGAGTAGCGATTCTCTCTTCTCACTTATCGCCCGTCATGGCTTCAGAGAAAG
AGGCTGCTTTAGCCGCCACTCCTTCCGATGATTCTCCCACCATATTTGACAAGATCATCA
GTAAAGAAATTCCATCCACCGTTGTTTATGAGGATGACAAGGTCTTGGCTTTTAGGGACA
TAACTCCACAGGGTCCTGTTCACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGAGGGATGGCTTAACTG
GCCTCTCTAAGGCTGAGGAAAGGCACATTGATATCTTGGGCCGCCTTCTCTACACTGCCA
AGCTTGTAGCCAAACAAGAAGGACTAGATGAAGGTTTCAGAATTGTGATCAATGATGGTC
CTCAAGGCTGTCAATCGGTGTATCACATTCATGTTCATCTCATTGGAGGACGCCAAATGA
ACTGGCCTCCTGGCTAAAAAGATATCATCATCTACTAGTGATTCTTGTCCTGGTTATAAG
AGGAACCCTACCCTGAGTTTGCTATTGTCTTCTTCTGTCTTTATGAATAAAAGGCTTGGG
ACCTAAGTTTTTATGATTGAAATCTAAACCTTGGTCTATAGTATGAAGAGAATATTCGAC
TGTTCTCTTTTGTGAAATCCTCTTTTTTTATTGTTGACTTTGTAAAACATTTCAATGGTA
AAAAA
GCTTTG

QA 3 667 3 667
DS 

RD RR2DW32JQ 420 0 0
TTTTT
TACACTGCCAAGCTTGTAGCCAAACAAGAAGGACTAGATGAAGGTTTCAGAATTGTGATC
AATGATGGTCCTCAAGGCTGTCAATCGGTGTATCACATTCATGTTCATTTCATTGGAGGA
CGCCAAATGAACTGGCCTCCTGGCTAAAAAGATATCATCATTTACTAGTGATTCTTGTCC
TGGTTATAAGAGGAACCCTACCCTGAGTTTGCTATTGTTTTTTTCTGTCTTTATGAATAA
AAGGCTTGGGACCTAAGTTTTTATGATTGAAATTTAAACCTTGGTTTATAGTATGAAGAG
AATATTCGACTGTTTTTTTTTGTGAAATCCTCTTTTTTTATTGTTGACTTTGTAAAACAT
TTCAATGGTAAAAAAAGCTTTGAATAAATGAGTCAATAATGGAGAATCTTGGTAT

QA 6 420 6 420
DS 



AS 1 7

CO CL1010Contig1 525 7 7 U
GGATCCAAAAAGAAAAATACAAAACTAACATCAACAAAATAAACAAAAAA*GAAATAATG
GCAATGAAGAACATCAACAACTTCTTTGTCGCCCTCTTTGTCTCGGTTGTGTTAGTGAGC
TCAGCCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCACCAGCACCAGGTGCTTCCTCTGCCACC
GTGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGCTGCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTT
CTCTTGCAGTAAATATATATATATTGAGGAGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTTT
TGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGAT
GTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAATAA
AATAATATTGTCCTATATAAGCGCTTGTTGATCAGATTTTATAAATCTGATTAGTAACTT
TATTGCTTTGTGATTAATATCTTTATACACAAAATGGCTGCACGT


BQ
30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DB07JQ C 1
AF RR2EA89TF U 64
AF RR2H217JQ C 1
AF RR2H217TF U 1
AF RR2DB07TF U 1
AF RR2B801JQ C 2
AF RR2B801TF U 2
BS 1 50 RR2H217TF
BS 51 51 RR2DB07TF
BS 52 64 RR2H217TF
BS 65 305 RR2EA89TF
BS 306 306 RR2H217TF
BS 307 419 RR2EA89TF
BS 420 525 RR2B801TF

RD RR2DB07JQ 419 0 0
GGATCCAAAAAGAAAAATACAAAACTAACATCAACAAAATAAACAAAAAA*GAAATAATG
GCAATGAAGAACATCAACAACTTCTTTGTCGCCCTCCTTGTCTCGGTTGTGTTAGTGAGC
TCAGCCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCACCAGCACCAGGTGTTTCCTCTGCCACC
GTGGCTTTTCCGATGGTTGGCTCCATCGTTGCTGCATCATTTTCTGCCTTCTTGGCTCTT
CTCTTGCAGTAAATATATATATATTGAGGAGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTTT
TGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGAT
GTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAATA

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR2EA89TF 356 0 0
G
TGAAGAACATCAACAACTTCTTTGTCGCCCTCTTTGTCTCGGTTGTGTTAGTGAGCTCAG
CCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCACCAGCACCAGGTGCTTCCTCTGCCACCGTGG
CTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGCTGCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTTCTCT
TGCAGTAAATATATATATATTGAGGAGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTTTTGTT
ACGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGATGTAT
AATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAATA

QA 2 356 2 356
DS 

RD RR2H217JQ 419 0 0
GGATCCAAAAAGAAAAATACAAAACTAACATCAACAAAATAAACAAAAAAAGAAATAATG
GCAATGAAGAACATCAACAACTTCTTTGTCGCCCTCTTTGTCTCGATTGTGTTAGTGAGC
TCAACCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCACCAGCACCAGGTGCTTCCTCTGCCACC
GTGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGCTGCATCATTTTCCGCCTTCTTGGCTCTT
TTCTTGCAGTAAATATATATATATTGAGGAGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTTT
TGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGAT
GTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAATA

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR2H217TF 419 0 0
GGATCCAAAAAGAAAAATACAAAACTAACATCAACAAAATAAACAAAAAAAGAAATAATG
GCAATGAAGAACATCAACAACTTCTTTGTCGCCCTCTTTGTCTCGATTGTGTTAGTGAGC
TCAACCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCACCAGCACCAGGTGCTTCCTCTGCCACC
GTGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGCTGCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTT
CTCTTGCAGTAAATATATATATATTGAGGAGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTTT
TGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGAT
GTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAATA

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR2DB07TF 419 0 0
GGATCCAAAAAGAAAAATACAAAACTAACATCAACAAAATAAACAAAAAA*GAAATAATG
GCAATGAAGAACATCAACAACTTCTTTGTCGCCCTCCTTGTCTCGGTTGTGTTAGTGAGC
TCAGCCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCACCAGCACCAGGTGTTTCCTCTGCCACC
GTGGCTTTTCCGATGGTTGGCTCCATCGTTGCTGCATCATTCTCTGCCTTCTTGGCTCTT
CTCTTGCAGTAAATATATATATATTGAGGAGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTTT
TGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGAT
GTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAATA

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR2B801JQ 524 0 0
GATCCAAAAAGAAAAATACAAAACTAACATCAACAAAATAAACAAAAAA*GAAATAATGG
CAATGAAGAACATCAACAACTTCTTTGTCGCCCTCTTTGTCTCGGTTGTGTTAGTGAGCT
CAGCCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCACCTGCACCAGGTGCTTCCCCTGCCACCG
TGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGCTGCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTTC
TCTTGCAGTAAATATATATATATTGAGGAGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTTTT
GTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGATG
TATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAATAAA
ATAATATTGTCCTATATAAGCGCTTGTTGATCAGATTTTATAAATCTGATTAGTAACTTT
ATTGCTTTGTGATTAATATCTTTATACACAAAATGGCTGCACGT

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2B801TF 524 0 0
GATCCAAAAAGAAAAATACAAAACTAACATCAACAAAATAAACAAAAAA*GAAATAATGG
CAATGAAGAACATCAACAACTTCTTTGTCGCCCTCTTTGTCTCGGTTGTGTTAGTGAGCT
CAGCCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCACCTGCACCAGGTGCTTCCCCTGCCACCG
TGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGCTGCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTTC
TCTTGCAGTAAATATATATATATTGAGGAGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTTTT
GTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGATG
TATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAATAAA
ATAATATTGTCCTATATAAGCGCTTGTTGATCAGATTTTATAAATCTGATTAGTAACTTT
ATTGCTTTGTGATTAATATCTTTATACACAAAATGGCTGCACGT

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 4

CO CL1011Contig1 1277 4 6 U
GGGCTCTCCACCCAAACGCCTCCATAAACCTCGTGCTTGAGAGGATCGTCCAAATCGAAA
AAAATGGGAACCTTGGGAAGAGCAATCTACACAGTGGGTAACTGGATCCGCGGGACTGGC
CAAGCTCTTGATCGCGTCGGCTCTCTTCTTCAAGGGAGCCACCGCTTGGAAGAACACCTA
TCGAGGCATCGGACGTTGATGAGTGTGTTTGATAAATCTCCGTTGGTGGATAAGGATGCG
TTCGTGGCTCCGAGTGCCTCTGTTATTGGTGATGTTCAGATCGAGAAGAGCTCCTCTATT
TGGTATGGCTGTGTTCTTCGAGGTGATGTGAATAACATCAGTGTTGGATCCGGGACGAAT
ATCCAAGATAATTCTCTCGTACATGTTGCAAAAACCAACCTAGCTGGCAAGGAATTACCC
ACTACAATTGGGGACAACGTTACAATAGGTCATAGTGCTGTAATACATGGGTGTACTGTC
GAGGATGAGGCTTTTGTTGGCATGGGAGCCACACTACTCGATGGTGTGGTTGTTGAGAAG
CATGCCATGGTTGCTGCCGGTTCCCTTGTGAGAGAGAACACTCGAATCCCTTCCGGAGAG
GTATGGGGAGGAAACCCAGCAAAGTTCATGAGAAAGTTAACAGATGAAGAGATGGCTTAT
ATCTCAAAGTCGGCTGAGAACTACATCAACCTCGCACATATTCACGCCGCCGAGAATTCA
AAGTCATTTGAAGAGATCGAGGTTGAGAGAGCGCTTAGGAAGAAGTATGCACGCAAGGAT
GAGGATTACGATTCAATGCTTGGGATTGTCCGTGAAACTCCAGCCGAGTTGATTCTCCCC
GACAATGTCTTACCGGAGAAAACAACCACCAGGGTTCCTACTACTCATTACTGATTCACC
CGCCTCAGCTTTGTTAATTTTCTGGAAAGTCGAGAGAGATATTATCTTTTGGTTTTGCCC
TTTTTTCCTCCCGAGTAAACATGGGATTTATCATATTCTTGCTCAATAAAGCCGAACAGA
ACATGTACTGTTGCGTTATGTCACATGTCTTGGATGAACAATTTCAGGAAGAGGATTGAG
CTGCATTTTTTCTTCTCCTCACTTGTTTTTAGATGCAATGGTTAACTTATTAACCTTCAG
TTCCGAATTTCAGAGGCTTTGCTTTGAAGGTGCTTAGTGTACTGTATAGTGCAACCATTT
ATGAAAGAAATTGTGGTGTCTTTTTAAATTGTAGTTCATTCAAACTCTCTTTATTTACAT
CAAGTCATCAATTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E732TF U 1
AF RR2EK24TF U 8
AF RR2EK24JQ C 414
AF RR2E732JQ C 742
BS 1 283 RR2E732TF
BS 284 284 RR2EK24TF
BS 285 613 RR2E732TF
BS 614 756 RR2EK24TF
BS 757 1067 RR2EK24JQ
BS 1068 1277 RR2E732JQ

RD RR2E732TF 613 0 0
GGGCTCTCCACCCAAACGCCTCCATAAACCTCGTGCTTGAGAGGATCGTCCAAATCGAAA
AAAATGGGAACCTTGGGAAGAGCAATCTACACAGTGGGTAACTGGATCCGCGGGACTGGC
CAAGCTCTTGATCGCGTCGGCTCTCTTCTTCAAGGGAGCCACCGCTTGGAAGAACACCTA
TCGAGGCATCGGACGTTGATGAGTGTGTTTGATAAATCTCCGTTGGTGGATAAGGATGCG
TTCGTGGCTCCGAGTGCCTCTGTTATTGGTGATGTTCAGATCGGGAAGAGCTCCTCTATT
TGGTATGGCTGTGTTCTTCGAGGTGATGTGAATAACATCAGTGTTGGATCCGGGACGAAT
ATCCAAGATAATTCTCTCGTACATGTTGCAAAAACCAACCTAGCTGGCAAGGAATTACCC
ACTACAATTGGGGACAACGTTACAATAGGTCATAGTGCTGTAATACATGGGTGTACTGTC
GAGGATGAGGCTTTTGTTGGCATGGGAGCCACACTACTCGATGGTGTGGTTGTTGAGAAG
CATGCCATGGTTGCTGCCGGTTCCCTTGTGAGAGAGAACACTCGAATCCCTTCCGGAGAG
GTATGGGGAGGAA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2EK24TF 749 0 0
GG
ACCCAAACGCCTCCATAAACCTCGTGCTTGAGAGGATCGTCCAAATCGAAAAAAATGGGA
ACCTTGGGAAGAGCAATCTACACAGTGGGTAACTGGATCCGCGGGACTGGCCAAGCTCTT
GATCGCGTCGGCTCTCTTCTTCAAGGGAGCCACCGCTTGGAAGAACACCTATCGAGGCAT
CGGACGTTGATGAGTGTGTT*GATAAATCTCCGTTGGTGGATAAGGATGCGTTCGTGGCT
CCGAGTGCCTCTGTTATTGGTGATGTTCAGATCGAGAAGAGCTCCTCTATTTGGTATGGC
TGTGTTCTTCGAGGTGATGTGAATAACATCAGTGTTGGATCCGGGACGAATATCCAAGAT
AATTCTCTCGTACATGTTGCAAAAACCAACCTAGCTGGCAAGGAATTACCCACTACAATT
GGGGACAACGTTACAATAGGTCATAGTGCTGTAATACATGGGTGTACTGTCGAGGATGAG
GCTTTTGTTGGCATGGGAGCCACACTACTCGATGGTGTGGTTGTTGAGAAGCATGCCATG
GTTGCTGCCGGTTCCCTTGTGAGAGAGAACACTCGAATCCCTTCCGGAGAGGTATGGGGA
GGAAACCCAGCAAAGTTCATGAGAAAGTTAACAGATGAAGAGATGGCTTATATCTCAAAG
TCGGCTGAGAACTACATCAACCTCGCACATATTCACGCCGCCGAGAATTCAAAGTCATTT
GAAGAGATCGAGGTTGAGAGAGCGCTT

QA 3 749 3 749
DS 

RD RR2EK24JQ 657 0 0
AT
TACCCACTACAATTGGGGACAACGTTACAATAGGTCATAGTGCTGTAATACATGGGTGTA
CTGTCGAGGATGAGGCTTTTGTTGGCATGGGAGCCACACTACTCGATGGTGTGGTTGTTG
AGAAGCATGCCATGGTTGCTGCCGGTTCCCTTGTGAGAGAGAACACTCGAATCCCTTCCG
GAGAGGTATGGGGAGGAAACCCAGCAAAGTTCATGAGAAAGTTAACAGATGAAGAGATGG
CTTATATCTCAAAGTCGGCTGAGAACTACATCAACCTCGCACATATTCACGCCGCCGAGA
ATTCAAAGTCATTTGAAGAGATCGAGGTTGAGAGAGCGCTTAGGAAGAAGTATGCACGCA
AGGATGAGGATTACGATTCAATGCTTGGGATTGTCCGTGAAACTCCAGCCGAGTTGATTC
TCCCCGACAATGTCTTACCGGAGAAAACAACCACCAGGGTTCCTACTACTCATTACTGAT
TCACCCGCCTCAGCTTTGTTAATTTTCTGGAAAGTCGAGAGAGATATTATCTTTTGGTTT
TGCCCTTTTTTCCTCCCGAGTAAACATGGGATTTATCATATTCTTGCTCAATAAAGCCGA
ACAGAACATGTACTGTTGCGTTATGTCACATGTCTTGGATGAACAATTTCAG
AAA

QA 3 654 3 654
DS 

RD RR2E732JQ 536 0 0
GTTGAGAGAGCGCTTAGGAAGAAGTATGCACGCAAGGATGAGGATTACGATTCAATGCTT
GGGATTGTCCGTGAAACTCCAGCCGAGTTGATTCTCCCCGACAATGTCTTACCGGAGAAA
ACAACCACCAGGGTTCCTACTACTCATTACTGATTCACCCGCCTCAGCTTTGTTAATTTT
CTGGAAAGTCGAGAGAGATATTATCTTTTGGTTTTGCCCTTTTTTCCTCCCGAGTAAACA
TGGGATTTATCATATTCTTGCTCAATAAAGCCGAACAGAACATGTACTGTTGCGTTATGT
CACATGTCTTGGATGAACAATTTCAGGAAGAGGATTGAGCTGCATTTTTTCTTCTCCTCA
CTTGTTTTTAGATGCAATGGTTAACTTATTAACCTTCAGTTCCGAATTTCAGAGGCTTTG
CTTTGAAGGTGCTTAGTGTACTGTATAGTGCAACCATTTATGAAAGAAATTGTGGTGTCT
TTTTAAATTGTAGTTCATTCAAACTCTCTTTATTTACATCAAGTCATCAATTACAT

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 3

CO CL1012Contig1 716 3 2 U
GGGTAAATAGTAAAAAACCATAATAGAATTCAGACAGCAAAAGACAGAGATAGTAAAAAC
CATAATAGAATTCAGAAAGCAAGAGACGGATAGTTGCAAGAAAATACAAACTAAAGACTC
GTCACAAGAATGTTACGAGCCCCTTCACGCAAACATAAAAAGGATAGCAGAAAAGCCAAA
CACAATATCCATGTTTCCAACACACTGTTCTTAGTACTCCTCACCTTCGTCATCCTCATC
GTCACCACCTTCAGCACCAACCTCTTCATAATCCTTCTCCAACGCTGCAAGATCCTCACG
AGCCTCAGAGAACTCTCCCTCCTCCATACCCTCACCGACATACCAGTGAACGAAAGCACG
TTTTGCGTACATGAGATCGAACTTGTGATCAATCCTGGAGAAGACCTCAGCGACACTTGT
GGAGTTGGAGATCATACAAACTGCTCTCTGCACTTTCGCAAGATCACCTCCTGGAACAAC
AGTTGGTGGCTGGTAGTTGATACCGCACTTGAATCCAGTAGGACACCAGTCGACAAACTG
GATGGTACGCTTGGTCTTGATGGTGCCAACAGCTGCGTTCACGTCTTTAGGGACGACATC
ACCACGGTACATCAAACAGCAAGCCATGTATTTCCCGTGACGTGGGTCACACTTGGCCAT
CATGGAAGCTGGCTCAAAGGCGCTGTTTGCGATCTCAGCAACTGAGAGCTGCTCGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ11JQ U 1
AF RR2GQ11TF C 1
AF RR2F750JQ U 18
BS 1 458 RR2GQ11JQ
BS 459 716 RR2F750JQ

RD RR2GQ11JQ 460 0 0
GGGTAAATAGTAAAAAACCATAATAGAATTCAGACAGCAAAAGACAGAGATAGTAAAAAC
CATAATAGAATTCAGAAAGCAAGAGACGGATAGTTGCAAGAAAATACAAACTAAAGACTC
GTCACAAGAATGTTACGAGCCCCTTCACGCAAACATAAAAAGGATAGCAGAAAAGCCAAA
CACAATATCCATGTTTCCAACACACTGTTCTTAGTACTCCTCACCTTCGTCATCCTCATC
GTCACCACCTTCAGCACCAACCTCTTCATAATCCTTCTCCAACGCTGCAAGATCCTCACG
AGCCTCAGAGAACTCTCCCTCCTCCATACCCTCACCGACATACCAGTGAACGAAAGCACG
TTTTGCGTACATGAGATCGAACTTGTGATCAATCCTGGAGAAGACCTCAGCGACACTTGT
GGAGTTGGAGATCATACAAACTGCTCTCTGCACTTTCG
CA

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2GQ11TF 458 0 0
GGGTAAATAGTAAAAAACCATAATAGAATTCAGACAGCAAAAGACAGAGATAGTAAAAAC
CATAATAGAATTCAGAAAGCAAGAGACGGATAGTTGCAAGAAAATACAAACTAAAGACTC
GTCACAAGAATGTTACGAGCCCCTTCACGCAAACATAAAAAGGATAGCAGAAAAGCCAAA
CACAATATCCATGTTTCCAACACACTGTTCTTAGTACTCCTCACCTTCGTCATCCTCATC
GTCACCACCTTCAGCACCAACCTCTTCATAATCCTTCTCCAACGCTGCAAGATCCTCACG
AGCCTCAGAGAACTCTCCCTCCTCCATACCCTCACCGACATACCAGTGAACGAAAGCACG
TTTTGCGTACATGAGATCGAACTTGTGATCAATCCTGGAGAAGACCTCAGCGACACTTGT
GGAGTTGGAGATCATACAAACTGCTCTCTGCACTTTCG

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2F750JQ 699 0 0
CCATAATAGAATTCAGACAGCAAAAGACAGAGATAGTAAAAACCATAATAGAATTCAGAA
AGCAAGAGACGGATAGTTGCAAGAAAATACAAACTAAAGACTCGTCACAAGAATGTTACG
AGCCCCTTCACGCAAACATAAAAAGGATAGCAGAAAAGCCAAACACAATATCCATGTTTC
CAACACACTGTTCTTAGTACTCCTCACCTTCGTCATCCTCATCGTCACCACCTTCAGCAT
CAACCTCTTCGTAATCCTTCTCCAACGCTGCAAGATCCTCACGAGCCTCAGAGAACTCTC
CCTCCTCCATACCCTCACCGACATACCAGTGAACGAAAGCACGTTTTGCGTACATGAGAT
CGAACTTGTGATCAATCCTGGAGAAGACCTCAGCGACACTTGTGGAGTTGGAGATCATAC
AAACTGCTCTCTGCACTTTCGCAAGATCACCTCCTGGAACAACAGTTGGTGGCTGGTAGT
TGATACCGCACTTGAATCCAGTAGGACACCAGTCGACAAACTGGATGGTACGCTTGGTCT
TGATGGTGCCAACAGCTGCGTTCACGTCTTTAGGGACGACATCACCACGGTACATCAAAC
AGCAAGCCATGTATTTCCCGTGACGTGGGTCACACTTGGCCATCATGGAAGCTGGCTCAA
AGGCGCTGTTTGCGATCTCAGCAACTGAGAGCTGCTCGT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 6

CO CL1013Contig1 1144 6 14 U
GGCCCACTAGCTCAACCCCTACACCCACAACACCTACGACACCCTCTACACCCACTAGTT
CAACTCCTACACCCACTACACCCACAACACCTACAACACCCTCTACACCCACTAGTTCAA
CTCCTACACCCACAACACCCTCTACACCGACTAGTTCAACCCCTACACCCACAACACCCA
GCACACCCAGTACACCCACAACACCTACTAGCTCAACTCCTTCTGCTGGTTCTACGACCA
CACAATCAGCTACCTCATCAACCGCATCAAAACAAGTCGAGACTCAAACATCCCAAGAAG
TAATGTCCTTCATATCAGAACTCGAGAAGAAGTATGCAGGAAAGGCAGAACTCAACACCT
TCTTCCAGAAACTCAAGTCTTCCATGTCTGCCACATCAAAGATCTCTACCACCGACGAAA
AAACCTTCGAAACTGGGGTGAAAACTGCTGCTGGAACACTAAATGAAGCGGCAGAATCTG
TTACTGAAAAATTAGGCACAGCAGAGACCAAGCAGAAGATAGAATCTTCCCAACAACAGT
TGATGCAGACATTCGAAGAGCTAAAAGAAGTCAACAGTAAAATAGTGAGTGAGAGTAAAG
GCCAGACAGTGTCCTCCACACAACAGTCACAACTTAAGCAGACGCTCACTAAATGGGAAC
AAGTCACCACCCAGTTTGTGGAGACTGCTGCTTCTTCTAGTTCAGCTTCAGCTTCATCTT
CCACTCAGTCTCAGAAATCTCTGCAGTCTCAACAGTCCCATCAGTCCCAACAGTCTCAGC
AGTCTCTGCAGTCAGTGCAGACACAGCAGGGCAGTACCCTGAAGGCTCAGACTCAGACCA
ATTGAGATACACTAATGCGCAGCAAATCATCAAGAGAGACAAACTAGTACCGCCAAATAT
GGTAATTAGTAGCTAAGTAGATGTTTTTTGTTTGGTTTTCAATAAAACTAAGATCGGTGT
AGGCAATAGATGTCTACCTTTAGACCGACGTATGCAAATAATAACTTTGTAAGCAATAAA
GATAGACTGTATGCTCGCTTTTTATGTTTTACATAGAGAAGTAAGCAAGACCCATTAAAG
GGATTTTGAATAATTTTCTTCTTGTTTCTATATTAAATTAAATAAAAAATTATTCTTTAT
GATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2FX35TF U 1
AF RR2EY04TF U 313
AF RR2FX35JQ C 418
AF RR2GH72TF U 453
AF RR2D487JQ C 720
AF RR2D487TF U 720
BS 1 600 RR2FX35TF
BS 601 601 RR2EY04TF
BS 602 695 RR2FX35TF
BS 696 696 RR2EY04TF
BS 697 751 RR2FX35TF
BS 752 752 RR2EY04TF
BS 753 769 RR2FX35TF
BS 770 770 RR2EY04TF
BS 771 789 RR2FX35TF
BS 790 1042 RR2EY04TF
BS 1043 1043 RR2GH72TF
BS 1044 1072 RR2EY04TF
BS 1073 1076 RR2GH72TF
BS 1077 1144 RR2D487TF

RD RR2FX35TF 789 0 0
GGCCCACTAGCTCAACCCCTACACCCACAACACCTACGACACCCTCTACACCCACTAGTT
CAACTCCTACACCCACTACACCCACAACACCTACAACACCCTCTACACCCACTAGTTCAA
CTCCTACACCCACAACACCCTCTACACCGACTAGTTCAACCCCTACACCCACAACACCCA
GCACACCCAGTACACCCACAACACCTACTAGCTCAACTCCTTCTGCTGGTTCTACGACCA
CACAATCAGCTACCTCATCAACCGCATCAAAACAAGTCGAGACTCAAACATCCCAAGAAG
TAATGTCCTTCATATCAGAACTCGAGAAGAAGTATGCAGGAAAGGCAGAACTCAACACCT
TCTTCCAGAAACTCAAGTCTTCCATGTCTGCCACATCAAAGATCTCTACCACCGACGAAA
AAACCTTCGAAACTGGGGTGAAAACTGCTGCTGGAACACTAAATGAAGCGGCAGAATCTG
TTACTGAAAAATTAGGCACAGCAGAGACCAAGCAGAAGATAGAATCTTCCCAACAACAGT
TGATGCAGACATTCGAAGAGCTAAAAGAAGTCAACAGTAAAATAGTGAGTGAGAGTAAAG
*CCAGACAGTGTCCTCCACACAACAGTCACAACTTAAGCAGACGCTCACTAAATGGGAAC
AAGTCACCACCCAGTTTGTGGAGACTGCTGCTTCT*CTAGTTCAGCTTCAGCTTCATCTT
CCACTCAGTCTCAGAAATCTCTGCAGTCTCA*CAGTCCCATCAGTCCCA*CAGTCTCAGC
AGTCTCTGC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2EY04TF 763 0 0
G
ATCAGAACTCGAGAAGAAGTATGCAGGAAAGGCAGAACTCAACACCTTCTTCCAGAAACT
CAAGTCTTCCATGTCTGCCACATCAAAGATCTCTACCACCGACGAAAAAACCTTCGAAAC
TGGGGTGAAAACTGCTGCTGGAACACTAAATGAAGCGGCAGAATCTGTTACTGAAAAATT
AGGCACAGCAGAGACCAAGCAGAAGATAGAATCTTCCCAACAACAGTTGATGCAGACATT
CGAAGAGCTAAAAGAAGTCAACAGTAAAATAGTGAGTGAGAGTAAAGGCCAGACAGTGTC
CTCCACACAACAGTCACAACTTAAGCAGACGCTCACTAAATGGGAACAAGTCACCACCCA
GTTTGTGGAGACTGCTGCTTCTTCTAGTTCAGCTTCAGCTTCATCTTCCACTCAGTCTCA
GAAATCTCTGCAGTCTCAACAGTCCCATCAGTCCCAACAGTCTCAGCAGTCTCTGCAGTC
AGTGCAGACACAGCAGGGCAGTACCCTGAAGGCTCAGACTCAGACCAATTGAGATACACT
AATGCGCAGCAAATCATCAAGAGAGACAAACTAGTACCGCCAAATATGGTAATTAGTAGC
TAAGTAGATGTTTTTTGTTTGGTTTTCAATAAAACTAAGATCGGTGTAGGCAATAGATGT
CTACCTTTAGACCGACGTATGCAAATAATAACTTTGTAAGCAATAAAGATAGACTGTATG
CTCGCTTTT*ATGTTTTACATAGAGAAGTAAGCAAGACC
ATT

QA 2 760 2 760
DS 

RD RR2FX35JQ 656 0 0
AAAAAACCTTCGAAACTGGGGTGAAAACTGCTGCTGGAACACTAAATGAAGCGGCAGAAT
CTGTTACTGAAAAATTAGGCACAGCAGAGACCAAGCAGAAGATAGAATCTTCCCAACAAC
AGTTGATGCAGACATTCGAAGAGCTAAAAGAAGTCAACAGTAAAATAGTGAGTGAGAGTA
AAGGCCAGACAGTGTCCTCCACACAACAGTCACAACTTAAGCAGACGCTCACTAAATGGG
AACAAGTCACCACCCAGTTTGTGGAGACTGCTGCTTCTTCTAGTTCAGCTTCAGCTTCAT
CTTCCACTCAGTTTCAGAAATTTTTGCAGTCTCAACAGTCCCATCAGTCCCAACAGTTTC
AGCAGTCTCTGCAGTCAGTGCAGACACAGCAGGGCAGTACCCTGAAGGCTCAGACTCAGA
CCAATTGAGATACACTAATGCGCAGCAAATCATCAAGAGAGACAAACTAGTACCGCCAAA
TATGGTAATTAGTAGCTAAGTAGATGTTTTTTGTTTGGTTTTCAATAAAACTAAGATCGG
TGTAGGCAATAGATGTCTACCTTTAGACCGACGTATGCAAATAATAACTTTGTAAGCAAT
AAAGATAGACTGTATGCTCGCTTTTTATGTTTTACATAGAGAAGTAAGCAAGACCC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2GH72TF 624 0 0
GGAACACTAAATGAAGCGGCAGAATCTGTTACTGAAAAATTAGGCACAGCAGAGACCAAG
CAGAAGATAGAATCTTCCCAACAACAGTTGATGCAGACATTCGAAGAGCTAAAAGAAGTC
AACAGTAAAATAGTGAGTGAGAGTAAAGGCCAGACAGTGTCCTCCACACAACAGCCACAA
CTTAAGCAGACGCTCACTAAATGGGAACAAGTCACCACCCAGTTTGTGGAGACTGCTGCT
TCTTCTAGTTCAGCTTCAGCTTCATCTTCCACTCAGTCTCAGAAATCTCTGCAGTCTCAA
CAGTCCCATCAGTCCCAACAGTCTCAGCAGTCTCTGCAGTCAGTGCAGACACAGCAGGGC
AGTACCCTGAAGGCTCAGACTCAGACCAATTGAGATACACTAATGCGCAGCAAATCATCA
AGAGAGACAAACTAGTACCGCCAAATATGGTAATTAGTAGCTAAGTAGATGTTTTTTGTT
TGGTTTTCAATAAAACTAAGATCGGTGTAGGCAATAGATGTCTACCTTTAGACCGACGTA
TGCAAATAATAACTTTGTAAGCAATAAAGATAGACTGTATGCTCGCTTTTTATGTTTTAC
ATAGAGAAGTAAGCAAGACCCATT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2D487JQ 425 0 0
G
CCACTCAGTTTCAGAAATCTCTGCAGTCTCAACAGTCCCATCAGTCCCAACAGTCTCAGC
AGTCTCTGCAGTCAGTGCAGACACAGCAGGGCAGTACCCTGAAGGCTCAGACTCAGACCA
ATTGAGATACACTAATGCGCAGCAAATCATCAAGAGAGACAAACTAGTACCGCCAAATAT
GGTAATTAGTAGCTAAGTAGATGTTTTTTGTTTGGTTTTCAATAAAACTAAGATCGGTGT
AGGCAATAGATGTCTACCTTTAGACCGACGTATGCAAATAATAACTTTGTAAGCAATAAA
GATAGACTGTATGCTCGCTTTTTATGTTTTACATAGAGAAGTAAGCAAGACCCATTAAAG
GGATTTTGAATAATTTTCTTCTTGTTTCTATATTAAATTAAATAAAAAATTATTCTTTAT
GATC

QA 2 425 2 425
DS 

RD RR2D487TF 425 0 0
G
CCACTCAGTCTCAGAAATCTCTGCAGTCTCAACAGTCCCATCAGTCCCAACAGTCTCAGC
AGTCTCTGCAGTCAGTGCAGACACAGCAGGGCAGTACCCTGAAGGCTCAGACTCAGACCA
ATTGAGATACACTAATGCGCAGCAAATCATCAAGAGAGACAAACTAGTACCGCCAAATAT
GGTAATTAGTAGCTAAGTAGATGTTTTTTGTTTGGTTTTCAATAAAACTAAGATCGGTGT
AGGCAATAGATGTCTACCTTTAGACCGACGTATGCAAATAATAACTTTGTAAGCAATAAA
GATAGACTGTATGCTCGCTTTTTATGTTTTACATAGAGAAGTAAGCAAGACCCATTAAAG
GGATTTTGAATAATTTTCTTCTTGTTTCTATATTAAATTAAATAAAAAATTATTCTTTAT
GATC

QA 2 425 2 425
DS 



AS 1 4

CO CL1014Contig1 1683 4 19 U
GAATTTGATCGTTTGTTTCTTCGCCTTTCTCGTCCTTAGCTTTTTCTTCCCTCCTTAAAT
ACCTACCTATACAGACAAATTTACTCTGTTATCATCGAAAATTTTCTATTTTCTATTTTT
TTCTTCGTTTTATTCCTCCTCCATATAACACAATCTTATCCCCATTGTTATCAAGAAAAC
AAGGCGGGGAAAAAAACAAAAGCAATGGTTATGGCTATGGATCGGATCGCTTTTACCTCA
TCCCCATTCGCTTATCAACGTTCTTCTCATCATCATGGCTACAGATCTTCTAGAGTTTTC
ATGTCTTCTACCATCCGTCCAGCCTCAACAGAGGTCACTAATGGAAGGAAACCGCATCTC
CCTCCTCGTGAGGTCCATCTTCAAGTGAAATACTCAATGCCACCACAAAAGCTGGAGATC
TTCAAGTCCTTAGAAGGATGGGCCAACGACAACCTGCTGCCTTACCTAAAACCCGTCGAG
AAATCATGGCAGCCAACTGATTTCCTCCCTGAACCTGAGTCAGAAGGGTTCTATGACCAA
GTCAAGGAGCTGAGAGAGAGGTGCAAAGAGCTTTCTGATGACTACTTTGTAGTGCTTGTT
GGGGATATGATCACAGAGGAAGCACTCCCAACTTACCAGACAATGATTAATACATTGGAT
GGGGTTAGAGATGAGACGGGAGCAAGTCCTACTCCTTGGGCTGTGTGGACAAGGGCATGG
ACTGCTGAAGAGAATAGGCACGGTGATCCTCTCAACAAGTATCTTTACCTCTCTGGAAGA
GTAGACATGAGGCAGATTGAAAAGACCATTCAATATCTGATTGGTTCTGGAATGGATCCA
AAGACTGAGAACAACCCTTACTTGGGTTTCATCTACACTTCATTTCAAGAAAGAGCTACA
TTCATCTCTCATGGAAACACTGCTGGACTAGCAAAGAAGCTTGGGGACTCCAAACTAGCG
CAGATTTGCGGCACCATCGCTGCCGATGAGAAGCGTCACGAGACTGCTTACACCAAGATT
GTAGAGAAGCTTTTCGAGATCGATCCTGACACCACTGTCGTAGGCTTTGCTGACATGATG
AGGAAAAAGATAGCCATGCCTGCTCATTTGATGTACGATGGCTCTGATGACAATCTGTTT
GAGCACTTCTCCTCCGTGGCGCAGAGGCTTGGTGTCTACACTGCTAGGGACTATGCTGAT
ATACTGGAGTTTCTTGTGAGGCGGTGGAACGTGGAGAACTTGGCAGGTCTCTCTGGTGAT
GGACACAAGGCCCAGGACTATCTCTGTAAATTGCCAGCTAGGATCCGCAAACTCGAAGAG
AGGGCTCAAGGGAGAGGCAAAGACGTTGCAAGAGACATACCTTTCAGCTGGATATTCGGC
CGAGAGATCAGGGCTTAAAAAGAAGTAGTATGATGCACAATCTCCTCACCATCACAATGA
TAAGGAAGGTTCTCTGTATTGGAACATATGCTAGATAAAGTATGTGTGTTTTTAGCCTTG
TTTTGTTGGGATGATCACTATTGCTATTTTATTTATTTGTTTCAGTTTCTCTCCATTTGT
TCTAGTATTGTATCCACTTCTCTCTCTCCCACTTCCAACAATTTGTAATTTAAAAAAATT
GGGTTTGCATTGTGTTTTCTTAGAGATTGTTAACAAGTTTTTTGATTATAAAAAAATTTG
ATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2EU07TF U 1
AF RR2CJ29TF U 295
AF RR2GM37TF U 477
AF RR2EU07JQ C 947
BS 1 326 RR2EU07TF
BS 327 327 RR2CJ29TF
BS 328 392 RR2EU07TF
BS 393 393 RR2CJ29TF
BS 394 476 RR2EU07TF
BS 477 477 RR2CJ29TF
BS 478 533 RR2EU07TF
BS 534 534 RR2CJ29TF
BS 535 710 RR2EU07TF
BS 711 711 RR2GM37TF
BS 712 719 RR2EU07TF
BS 720 950 RR2GM37TF
BS 951 951 RR2EU07JQ
BS 952 983 RR2GM37TF
BS 984 984 RR2EU07JQ
BS 985 1034 RR2GM37TF
BS 1035 1035 RR2EU07JQ
BS 1036 1059 RR2GM37TF
BS 1060 1683 RR2EU07JQ

RD RR2EU07TF 719 0 0
GAATTTGATCGTTTGTTTCTTCGCCTTTCTCGTCCTTAGCTTTTTCTTCCCTCCTTAAAT
ACCTACCTATACAGACAAATTTACTCTGTTATCATCGAAAATTTTCTATTTTCTATTTTT
TTCTTCGTTTTATTCCTCCTCCATATAACACAATCTTATCCCCATTGTTATCAAGAAAAC
AAGGCGGGGAAAAAAACAAAAGCAATGGTTATGGCTATGGATCGGATCGCTTTTACCTCA
TCCCCATTCGCTTATCAACGTTCTTCTCATCATCATGGCTACAGATCTTCTAGAGTTTTC
ATGTCTTCTACCATCCGTCCAGCCTCTACAGAGGTCACTAATGGAAGGAAACCGCATCTC
CCTCCTCGTGAGGTCCATCTTCAAGTGAAATATTCAATGCCACCACAAAAGCTGGAGATC
TTCAAGTCCTTAGAAGGATGGGCCAACGACAACCTGCTGCCTTACCTAAAACCCGTTGAG
AAATCATGGCAGCCAACTGATTTCCTCCCTGAACCTGAGTCAGAAGGGTTCTACGACCAA
GTCAAGGAGCTGAGAGAGAGGTGCAAAGAGCTTTCTGATGACTACTTTGTAGTGCTTGTT
GGGGATATGATCACAGAGGAAGCACTCCCAACTTACCAGACAATGATTAATACATTGGAT
GGGGTTAGAGATGAGACGGGAGCAAGTCCTACTCCTTGGGCTGTGTGGACGAGGGCATG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2CJ29TF 413 0 0
GTTTTCATGTCTTCTACCATCCGTCCAGCCTCAACAGAGGTCACTAATGGAAGGAAACCG
CATCTCCCTCCTCGTGAGGTCCATCTTCAAGTGAAATACTCAATGCCACCACAAAAGCTG
GAGATCTTCAAGTCCTTAGAAGGATGGGCTGACGACAACCTGCTGCCTTACCTAAAACCC
GTCGAGAAATCATGGCAGCCAACTGATTTCCTCCCTGAACCTGAGTCAGAAGGGTTCTAT
GACCAAGTCAAGGAGCTGAGAGAGAGGTGCAAAGAGCTTTCTGATGACTACTTTGTAGTG
CTTGTTGGGGATATGATCACAGAGGAAGCACTCCCAACTTACCAGACCATGATTAATACA
TTGGATGGGGTTAGAGATGAGACCGGAGCAAGTCCTACTCCTTGGGCTGTGTG

QA 1 413 1 413
DS 

RD RR2GM37TF 583 0 0
G
GAGAAATCATGGCAACCAACTGATTTCCTCCCTGAACCTGAGTCAGAAGGGTTCTATGAC
CAAGTCAAGGAGCTGAGAGAGAGGTGCAAAGAGCTTTCTGATGACTACTTTGTAGTGCTT
GTTGGCGATATGATCACAGAGGAAGCGCTTCCAACTTATCAGACAATGATTAATACATTG
GATGGGGTTAGAGATGAGACGGGAGCAAGTCCTACTCCTTGGGCTGTGTGGACAAGGGCA
TGGACTGCTGAAGAGAATAGGCACGGTGATCCTCTCAACAAGTATCTTTACCTCTCTGGA
AGAGTAGACATGAGGCAGATTGAAAAGACCATTCAATATCTGATTGGTTCTGGAATGGAT
CCAAAGACTGAGAACAACCCTTACTTGGGTTTCATCTACACTTCATTTCAAGAAAGAGCT
ACATTCATCTCTCATGGAAACACTGCTGGACTAGCAAAGAAGCTTGGGGACTCGAAACTA
GCGCAGATTTGCGGCACCATCGCTGCTGATGAGAAGCGTCACGAGACTGCTTACACCAAG
ATTGTAGAGAAGCTTTTTGAGATCGATCCTGACACCACTGTC

QA 2 583 2 583
DS 

RD RR2EU07JQ 737 0 0
ACTCCAAACTAGCGCAGATTTGCGGCACCATCGCTGCCGATGAGAAGCGTCACGAGACTG
CTTACACCAAGATTGTAGAGAAGCTTTTCGAGATCGATCCTGACACCACTGTCGTAGGCT
TTGCTGACATGATGAGGAAAAAGATAGCCATGCCTGCTCATTTGATGTACGATGGCTCTG
ATGACAATCTGTTTGAGCACTTCTCCTCCGTGGCGCAGAGGCTTGGTGTCTACACTGCTA
GGGACTATGCTGATATACTGGAGTTTCTTGTGAGGCGGTGGAACGTGGAGAACTTGGCAG
GTCTCTCTGGTGATGGACACAAGGCCCAGGACTATCTCTGTAAATTGCCAGCTAGGATCC
GCAAACTCGAAGAGAGGGCTCAAGGGAGAGGCAAAGACGTTGCAAGAGACATACCTTTCA
GCTGGATATTCGGCCGAGAGATCAGGGCTTAAAAAGAAGTAGTATGATGCACAATCTCCT
CACCATCACAATGATAAGGAAGGTTCTCTGTATTGGAACATATGCTAGATAAAGTATGTG
TGTTTTTAGCCTTGTTTTGTTGGGATGATCACTATTGCTATTTTATTTATTTGTTTCAGT
TTCTCTCCATTTGTTCTAGTATTGTATCCACTTCTCTCTCTCCCACTTCCAACAATTTGT
AATTTAAAAAAATTGGGTTTGCATTGTGTTTTCTTAGAGATTGTTAACAAGTTTTTTGAT
TATAAAAAAATTTGATT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 3

CO CL1015Contig1 818 3 4 U
CATTAACAAGGATTAAACTGGTTCAAAGTGTTAAAACAAAGTACTTCAAATTTGTTAACT
GGTTATAAGAATCAACTACCAAAGGAGTGTGACTGGTCCAAAGTGTTTGATGCACTCATA
CAAAATAAGGATTCAGAATTAAGAGAGGGCATATGATTATTATTCAAGTTAATATACATA
AAATATCTCTGGCAGTGACTTGTTCAAGAAGTGTCTCTTTAAGCATTGGTATCATCAGCT
CAAGCTTGGCCACAGCGAGCTAAGTCTTGTTGCCAGCTTTGCACTCTTATAGTCTTCCCG
CAGTTGTATAAACCTTTGTGCGTCTTTGCGGATGCTTGGACTACCCTCGAACAAAGTCGC
CAGACTTTCTGGAGCAACGATGAATACATTCGCCATTATTCCCAGAAGCTCAAATTTCTC
CTCCACAGATGGAACACTGAATCTCTTAACAAAATCTCCATACTCGTTTATGTCACGCTT
CAGCCGCAGTCCTCCACTGGGATTAAAAGTGAACTTCTGCCAGTGAGTTAGTAGTAGTTT
ATCTAGCCTGTTTCCCAGTTCGGTCAGGAAGGCTTGCTTATTAAGACCTTCCAATGCAGT
GAAGGCTGACTCAAGTACCCGGGAGAGATAAGCCACGACTCTTATGCAGGCATTTGTTGG
GCGGTGATCAGGAGAAAATCCATCATCAGGTGATCTATAATCCGTAGCCAGCTGCTCAGC
TGAAAGCAGTCTTTCAACCTCAGATATCACAGTTTCAATGCACTGTTGGAGTCCCTTGTA
AGCAGCAACCTCTGCTTTGGACAGAGCAGTTGACATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H240JQ U 1
AF RR2H240TF C 66
AF RR2H244JQ U 43
BS 1 135 RR2H240JQ
BS 136 136 RR2H244JQ
BS 137 685 RR2H240JQ
BS 686 818 RR2H244JQ

RD RR2H240JQ 685 0 0
CATTAACAAGGATTAAACTGGTTCAAAGTGTTAAAACAAAGTACTTCAAATTTGTTAACT
GGTTATAAGAATCAACTACCAAAGGAGTGTGACTGGTCCAAAGTGTTTGATGCACTCATA
CAAAATAAGGATTCAAAATTAAGAGAGGGCATATGATTATTATTCAAGTTAATATACATA
AAATATCTCTGGCAGTGACTTGTTCAAGAAGTGTCTCTTTAAGCATTGGTATCATCAGCT
CAAGCTTGGCCACAGCGAGCTAAGTCTTGTTGCCAGCTTTGCACTCTTATAGTCTTCCCG
CAGTTGTATAAACCTTTGTGCGTCTTTGCGGATGCTTGGACTACCCTCGAACAAAGTCGC
CAGACTTTCTGGAGCAACGATGAATACATTCGCCATTATTCCCAGAAGCTCAAATTTCTC
CTCCACAGATGGAACACTGAATCTCTTAACAAAATCTCCATACTCGTTTATGTCACGCTT
CAGCCGCAGTCCTCCACTGGGATTAAAAGTGAACTTCTGCCAGTGAGTTAGTAGTAGTTT
ATCTAGCCTGTTTCCCAGTTCGGTCAGGAAGGCTTGCTTATTAAGACCTTCCAATGCAGT
GAAGGCTGACTCAAGTACCCGGGAGAGATAAGCCACGACTCTTATGCAGGCATTTGTTGG
GCGGTGATCAGGAGAAAATCCATCA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2H240TF 642 0 0
TAAGAATCAACTACCAAAGGAGTGTGACTG*TCCAAAGTGTTTGATGCACTCATACAAAA
TAAGGATTCAGAATTAAGAGAGGGCATATGATTATTATTCAAGTTAATATACATAAAATA
TCTCTGGCAGTGACTTGTTCAAGAAGTGTCTCTTTAAGCATTGGTATCATCAGCTCAAGC
TTGGCCACAGCGAGCTAAGTCTTGTTGCCAGCTTTGCACTCTTATAGTCTTCCCGCAGTT
GTATAAACCTTTGTGCGTCTTTGCGGATGCTTGGACTACCCTCGAACAAAGTCGCCAGAC
TTTCTGGAGCAACGATGAATACATTCGCCATTATTCCCAGAAGCTCAAATTTCTCCTCCA
CAGATGGAACACTGAATCTCTTAACAAAATCTCCATACTCGTTTATGTCACGCTTCAGCC
GCAGTCCTCCACTGGGATTAAAAGTGAACTTCTGCCAGTGAGTTAGTAGTAGTTTATCTA
GCCTGTTTCCCAGTTCGGTCAGGAAGGCTTGCTTATTAAGACCTTCCAATGCAGTGAAGG
CTGACTCAAGTACCCGGGAGAGATAAGCCACGACTCTTATGCAGGCATTTGTTGGGCGGT
GATCAGGAGAAAATCCATCATCAGGTGATCTATAATCCGTAG

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2H244JQ 776 0 0
ACTTCAAATTTGTTAACTGGTTATAAGAATCAACTACCAAAGGAGTGTGACTGGTTCAAA
GTGTTTGATGCACTCATACAAAATAAGGATTCAGAATTAAGAGAGGGCATATGATTATTA
TTCAAGTTAATATACATAAAATATCTCTGGCAGTGACTTGTTCAAGAAGTGTCTCTTTAA
GCATTGGTATCATCAGCTCAAGCTTGGCCACAGCGAGCTAAGTCTTGTTGCCAGCTTTGC
ACTCTTATAGTCTTCCCGCAGTTGTATAAACCTTTGTGCGTCTTTGCGGATGCTTGGACT
ACCCTCGAACAAAGTCGCCAGACTTTCTGGAGCAACGATGAATACATTCGCCATTATTCC
CAGAAGCTCAAATTTCTCCTCCACGGATGGAACACTGAATCTCTTAACAAAATCTCCATA
CTCGTTTATGTCACGCTTCAGCCGCAGTCCTCCACTGGGATTAAAAGTGAACTTCTGCCA
GTGAGTTAGTAGTAGTTTATCTAGCCTGTTTCCCAGTTCGGTCAGGAAGGCTTGCTTATT
AAGACCTTCCAATGCAGTGAAGGCTGACTCAAGTACCCGGGAGAGATAAGCCACGACTCT
TATGCAGGCATTTGTTGGGCGGTGATCAGGAGAAAATCCATCATCAGGTGATCTATAATC
CGTAGCCAGCTGCTCAGCTGAAAGCAGTCTTTCAACCTCAGATATCACAGTTTCAATGCA
CTGTTGGAGTCCCTTGTAAGCAGCAACCTCTGCTTTGGACAGAGCAGTTGACATTT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 2 7

CO CL1016Contig1 673 5 4 U
CCTCATCCTATCCGCTGCAGCCGTCAATCGTCTCTGAGAGAACACAACAAATTCTTTTTC
GGAAGTTAAAAGCATTTAAAGACACAACATGTCAGGTGATGAGGCTGCTGCTCCCGTTGT
TGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCCATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACTGCATT
GGAGTTGACTCTAAGGAAAGCTCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTCCATGAGAG
CGCTAAGCTTATCGAGAAGCGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGATTGCAACCA
GCCTGACTACGTCAAGCTTGTTAAGGCTCTCTGCGCCGATCACAGCATCAACTTGCTTAC
TGTTCCAAGTGCCAAGACCCTCGGCGAGTGGGCTGGTCTCTGCAAGATTGACTCTGAGGG
TAATGCCAGGAAGGTTGTTGGTTGCTCATGCCTTGTGGTCAAGGACTACGGTGAGGATAC
AACTGCCCTCAATATCGTCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTAAGAAGCATTCTC
CGATGTTTTTCCATCTCAATGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATATTTTAGCAGA
CACCTATCTGAGATTTGTTTGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATCTATATTCTACTCT
TCCAAAAGCCCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 5 20 5 5 20 20 5 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 5 35 35 0 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH87TF U 1
AF RR2BH87JQ C 60
AF RR2ER33JQ C 91
AF RR2ER33TF U 12
AF RR2BJ19TF U 15
BS 1 605 RR2BH87TF
BS 606 606 RR2ER33TF
BS 607 648 RR2BH87TF
BS 649 673 RR2BJ19TF

RD RR2BH87TF 648 0 0
CCTCATCCTATCCGCTGCAGCCGTCAATCGTCTCTGAGAGAACACAACAAATTCTTTTTC
GGAAGTTAAAAGCATTTAAAGACACAACATGTCAGGTGATGAGGCTGCTGCTCCCGTTGT
TGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCCATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACTGCATT
GGAGTTGACTCTAAGGAAAGCTCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTCCATGAGAG
CGCTAAGCTTATCGAGAAGCGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGATTGCAACCA
GCCTGACTACGTCAAGCTTGTTAAGGCTCTCTGCGCCGATCACAGCATCAACTTGCTTAC
TGTTCCAAGTGCCAAGACCCTCGGCGAGTGGGCTGGTCTCTGCAAGATTGACTCTGAGGG
TAATGCCAGGAAGGTTGTTGGTTGCTCATGCCTTGTGGTCAAGGACTACGGTGAGGATAC
AACTGCCCTCAATATCGTCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTAAGAAGCATTCTC
CGATGTTTTTCCATCTCAATGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATATTTTAGCAGA
CACCTCTCTGAGATTTGTTTGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATCT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2BH87JQ 575 0 0
CGGAAGTTAAAAGCATTTAAAGACACAACATGTCAGGTGATGAGGCTGCTGCTCCCGTTG
TTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCCATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACTGCAT
TGGAGTTGACTTTAAGGAAAGCTCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTCCATGAGA
GCGCTAAGCTTATCGAGAAGCGTGTTGTTCAGCTTTGTGTTTTGGCTGAAGATTGCAACC
AGCCTGACTACGTCAAGCTTGTTAAGGCTTTTTGCGCCGATCACAGCATCAACTTGCTTA
CTGTTCCAAGTGCCAAGACCCTCGGGGAGTGGGCTGGTTTTTGCAAGATTGACTTTGAGG
GTAATGCCAGGAAGGTTGTTGGTTGCTCATGCCTTGTGGTCAAGGACTACGGGGAGGATA
CAACTGCCCTCAATATCGTCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTAAGAAGCATTTT
CCGATGTTTTTCCATCTCAATGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATATTTTAGCAG
ACACCTTTTTGAGATTTGTTTGGAACATGATCAAG

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2ER33JQ 558 0 0
GTCAGGTGATGAGGCTGCTGCTCCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCCAT
CCCAGAGGACATGGACTTGTTGACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGGAAAGCTCGTGCTCA
TGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTCCATGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTTGCTCA
GCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTGACTACGTCAAGCTTGCTAAGGCTCT
CTGCGCTGATCACAGCATCAACTTACTTACTGTTCCAAGCGCCAAGACCCTCGGCGAGTG
GGCTGGCCTCTGCAAGATTGACTCAGAGGGTAATGCCAGGAAGGCTGTTGGTTGCTCATG
CCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCCCTCAATATCGTCAAGAAGCACAT
TGAATCTAACTAAGTTTAAGAAGCATTCTCCAATGTTTTTCCATCTCAATGCTGTTTTAT
CTTGGTTTTGATACTTGATATTTTAGCAGACGACTATCTGAGATTTATTTGGAACATGAT
CAAGTTTTGCTGTTATCT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2ER33TF 616 0 0
GGGCT
GCAGCCGTCAATCGTCTCTGAGAGAACAACAAAGTTTTTTTTTCGGAAGTTAAAAGCATT
TAAAGACACAACATGTCAGGTGATGAGGCTGCTGCTCCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCT
GAGCCAGCGGCCATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGG
AAAGCTCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTCCATGAGAGCGCTAAGCTTATTGAG
AAGCGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTGACTACGTCAAG
CTTGCTAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAGCATCAACTTACTTACTGTTCCAAGCGCCAAG
ACCCTCGGCGAGTGGGCTGGCCTCTGCAAGATTGACTCAGAGGGTAATGCCAGGAAGGCT
GTTGGTTGCTCATGCCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCCCTCAATATC
GTCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTAAGAAGCATTCTCCAATGTTTTTCCATCT
CAATGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATATTTTAGCAGACGACTATCTGAGATTT
ATTTGGAACAT

QA 6 616 6 616
DS 

RD RR2BJ19TF 659 0 0
GG
GCAGCCGTCAATCGTCTCTGAGAGAACACAACAAATTCTTTTTCGGAAGTTAAAAGCATT
TAAAGACACAACATGTCAGGTGATGAGGCTGCTGCTCCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCT
GAGCCAGCGGCCATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGG
AAAGCTCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTCCATGAGAGCGCTAAGCTTATCGAG
AAGCGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGATTGCAACCAGCCTGACTACGTCAAG
CTTGTTAAGGCTCTCTGCGCCGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCCAAG
ACCCTCGGCGAGTGGGCTGGTCTCTGCAAGATTGACTCTGAGGGTAATGCCAGGAAGGTT
GTTGGTTGCTCATGCCTTGTGGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCCCTCAATATC
GTCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTAAGAAGCATTCTCCGATGTTTTTCCATCT
CAATGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATATTTTAGCAGACACCTCTCTGAGATTT
GTTTGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATCTATATTCTACTCTTCCAAAAGCCCAA

QA 3 659 3 659
DS 



CO CL1016Contig2 677 2 1 U
GGGCAGCCGTCATCGTCTCTGAGAGAACAACAAAGTTTTTTTCGGAAGTTAAAAGCATTT
AAAGACACGACATGTCGGGTGATGAGGCTGCTGCTCCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTG
AGCCAGCGGCAATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGGA
AAGCTCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTCCATGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGA
AGCGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTGACTACGTCAAGC
TCGTTAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGCGCCAAGA
CCCTCGGCGAGTGGGCTGGTCTCTGCAAGATTGACTCTGAGGGTAATGCCAGGAAGGTTG
TTGGCTGCTCATGCCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCCCTCAATATCG
TCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTTAAGAAGCATTCTCCAATGTTTTTCCATAT
CAATGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATTTTAGCAGACAGCTCTCCGAGATTTGT
TTGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATCTATATTCTACTCTTCCAAAGCCCAATTTAGT
TGATGTTTTCCTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H323TF U 1
AF RR2H323JQ C 316
BS 1 677 RR2H323TF

RD RR2H323TF 677 0 0
GGGCAGCCGTCATCGTCTCTGAGAGAACAACAAAGTTTTTTTCGGAAGTTAAAAGCATTT
AAAGACACGACATGTCGGGTGATGAGGCTGCTGCTCCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTG
AGCCAGCGGCAATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGGA
AAGCTCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTCCATGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGA
AGCGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTGACTACGTCAAGC
TCGTTAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGCGCCAAGA
CCCTCGGCGAGTGGGCTGGTCTCTGCAAGATTGACTCTGAGGGTAATGCCAGGAAGGTTG
TTGGCTGCTCATGCCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCCCTCAATATCG
TCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTTAAGAAGCATTCTCCAATGTTTTTCCATAT
CAATGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATTTTAGCAGACAGCTCTCCGAGATTTGT
TTGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATCTATATTCTACTCTTCCAAAGCCCAATTTAGT
TGATGTTTTCCTTCCCC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2H323JQ 362 0 0
GCGCTGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGCGCCAAGACCCTCGGCGAGTGGG
CTGGTCTCTGCAAGATTGACTCTGAGGGTAATGCCAGGAAGGTTGTTGGCTGCTCATGCC
TTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCCCTCAATATCGTCAAGAAGCACATTG
AATCTAACTAAGTTTTAAGAAGCATTCTCCAATGTTTTTCCATATCAATGCTGTTTTATC
TTGGTTTTGATACTTGATTTTAGCAGACAGCTCTCCGAGATTTGTTTGGAACATGATCAA
GTTTTGCTGTTATCTATATTCTACTCTTCCAAAGCCCAATTTAGTTGATGTTTTCCTTCC
CC

QA 1 362 1 362
DS 



AS 1 6

CO CL1017Contig1 546 6 5 U
GGAGATTATTCCCCATTTCTTTCTGAAAAATTAGGGTTTGCGTATTCTCATCTTTCTTCT
TCTCTTTCCTTCGCCGCGTGTAATCGAATCAGACACAGAGAGAGAGATGGGTGGAGGAAA
CGCGCAGAAATCGAAGATGGCTCGTGAGAAGAATCTCGAGAAGGCAAGGCAGGCTGGAAA
AGGAAGCCAGTTGGAAGCGAACAAGAAAGCTATGTCCCTTCAGTGCAAGGTTTGTATGCA
AACATTCATCTGCACTACATCGGAAGTGAAATGCAGGGAGCACGCTGAGGCCAAGCATCC
TAAAGCTGATGTTGTCGCTTGCTTCCCACATCTCAAGAAGTGATGAAACTATCATCTCTC
GCAAAGAAAAGGATTCCAATGTAAATGTATGGGTCCTTCTTCTACTATGTTTGTATTATC
AAAGTCTTTTAAGTGTCTTGTGTCAACAAGATAATGGTTCTGTTTCTCTTTTTGCTTAAG
ACCTTTTCAACAATAAGTCTCTTGCTATTATAATTATATATGCGATGAAACTTTCAATAT
TGTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 15 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 0 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2C439JQ C 187
AF RR2FF45JQ C 60
AF RR2C439TF U 13
AF RR2D214TF U 239
AF RR2FF45TF U 1
AF RR2F902TF U 1
BS 1 482 RR2F902TF
BS 483 483 RR2FF45TF
BS 484 501 RR2F902TF
BS 502 502 RR2C439TF
BS 503 546 RR2F902TF

RD RR2C439JQ 209 0 0
CCAGTTGGAAGCGAACAAGAAAGCTATGTCCCTTCAGTGCAAGGTTTGTATGCAAACATT
CATCTGCACTACATCGGAAGTGAAATGCAGGGAGCACGCTGAGGCCAAGCATCCTAAAGC
TGATGTTGTCGCTTGCTTCCCACATCTCAAGAAGTGATGAAACTATCATCTCTCGCAAAG
AAAAGGATTCCAATGTAAATGTATGGGTC

QA 1 209 1 209
DS 

RD RR2FF45JQ 476 0 0
TTCTCTTTCCTTCGCCGCGTGTAATCGAATCAGACACAGAGAGAGAGATGGGTGGAGGAA
ACGCGCAGAAATCGAAGATGGCTCGTGAGAAGAATCTCGAGAAGGCAAGGCAGGCTGGAA
AAGGAAGCCAGTTGGAAGCGAACAAGAAAGCTATGTCCCTTCAGTGCAAGGTTTGTATGC
AAACATTCATTTGCACTACATCGGAAGTGAAATGCAGGGAGCACGCTGAGGCCAAGCATC
CTAAAGCTGATGTTGTCGCTTGCTTCCCACATCTCAAGAAGTGATGAAACTATCATCTCT
CGCAAAGAAAAGGATTCCAATGTAAATGTATGGGTCCTTTTTTTACTATGTTTGTATTAT
CAAAGTCTTTTAAGTGTCTTGTGTCAACAAGATAATGGTTCTGTTTCTCTTTTTGCTTAA
GACCTTTTCAACAATAAGTCTCTTGCTATTATAATTATATATGCGATGAAACTTTC

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR2C439TF 523 0 0
CCATTTCTTTCTGAAAAATTAGGGTTTGCGTATT*TCATCTTTCTTCTTCTCTTTCCTTC
GCCGCGTGTAATCGAATCAGACACAGAGAGAGAGATGGGTGGAGGAAACGCGCAGAAATC
GAAGATGGCTCGTGAGAAGAATCTCGAGAAGGCAAGGCAGGCTGGAAAAGGAAGCCAGTT
GGAAGCGAACAAGAAAGCTATGTCCCTTCAGTGCAAGGTTTGTATGCAAACATTCATCTG
CACTACATCGGAAGTGAAATGCAGGGAGCACGCTGAGGCCAAGCATCCTAAAGCTGATGT
TGTCGCTTGCTTCCCACATCTCAAGAAGTGATGAAACTATCATCTCTCGCAAAGAAAAGG
ATTCCAATGTAAATGTATGGGTCCTTCTTCTACTATGTTTGTATTATCAAAGTCTTTTAA
GTGTCTTGTGTCAACAAGATAATGGTTCTGTTTCTCTTTTTGCTTAAGACTTTTTCAACA
ATAAGTCTCTTGCTATTATAATTATATATGCGATGAAACTTTC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2D214TF 250 0 0
GG
AACATTCATCTGCACTACATCGGAAGTGAAATGCAGGGAGCACGCTGAGGCCAAGCATCC
TAAAGCTGATGTTGTCACTTGCTTCCCACATCTCAAGAAGTGATGAAACTATCATCTCTC
GCAAAGAAAAGGATTCCAATGTAAATGTATGGGTCCTTCTTCTACTATGTTTGTATTATC
AAAGTCTTTTAAGTGTCTTGTGTCAACAAGATAATGGTTCTGTTTCTCTTTTTGCTTAAG
ACTTTTTC

QA 3 250 3 250
DS 

RD RR2FF45TF 535 0 0
GGAGATTATTCCCCATTTCTTTCTGAAAAATTAGGGTTTGCGTATTCTCATCTTTCTTCT
TCTCTTTCCTTCGCCGCGTGTAATCGAATCAGACACAGAGAGAGAGATGGGTGGAGGAAA
CGCGCAGAAATCGAAGATGGCTCGTGAGAAGAATCTCGAGAAGGCAAGGCAGGCTGGAAA
AGGAAGCCAGTTGGAAGCGAACAAGAAAGCTATGTCCCTTCAGTGCAAGGTTTGTATGCA
AACATTCATCTGCACTACATCGGAAGTGAAATGCAGGGAGCACGCTGAGGCCAAGCATCC
TAAAGCTGATGTTGTCGCTTGCTTCCCACATCTCAAGAAGTGATGAAACTATCATCTCTC
GCAAAGAAAAGGATTCCAATGTAAATGTATGGGTCCTTCTTCTACTATGTTTGTATTATC
AAAGTCTTTTAAGTGTCTTGTGTCAACAAGATAATGGTTCTGTTTCTCTTTTTGCTTAAG
ACCTTTTCAACAATAAGTCTCTTGCTATTATAATTATATATGCGATGAAACTTTC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2F902TF 546 0 0
GGAGATTATTCCCCATTTCTTTCTGAAAAATTAGGGTTTGCGTATTCTCATCTTTCTTCT
TCTCTTTCCTTCGCCGCGTGTAATCGAATCAGACACAGAGAGAGAGATGGGTGGAGGAAA
CGCGCAGAAATCGAAGATGGCTCGTGAGAAGAATCTCGAGAAGGCAAGGCAGGCTGGAAA
AGGAAGCCAGTTGGAAGCGAACAAGAAAGCTATGTCCCTTCAGTGCAAGGTTTGTATGCA
AACATTCATCTGCACTACATCGGAAGTGAAATGCAGGGAGCACGCTGAGGCCAAGCATCC
TAAAGCTGATGTTGTCGCTTGCTTCCCACATCTCAAGAAGTGATGAAACTATCATCTCTC
GCAAAGAAAAGGATTCCAATGTAAATGTATGGGTCCTTCTTCTACTATGTTTGTATTATC
AAAGTCTTTTAAGTGTCTTGTGTCAACAAGATAATGGTTCTGTTTCTCTTTTTGCTTAAG
ACTTTTTCAACAATAAGTCTCCTGCTATTATAATTATATATGCGATGAAACTTTCAATAT
TGTTTT

QA 1 546 1 546
DS 



AS 3 6

CO CL1018Contig1 477 2 3 U
GGAAGATGTCGTTGGTGTGGCTAGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGGATGC
TCTGTATTATGGGAAACTCTCAGTACTACATCCACAAAGCTTACCATGGCCGTCCGAAGC
ACATCGGGCACGATGAATGGGATGTTGCTATGGAGAGGCGCGACAAGAAAGTCGTCGAGA
AAGCCTCAGCTCCTTCTTCGTAATCCGATCAGGGGCTTCAGGTGAACAACTTGTTGTCAC
AAATAAAGTTTATTCCAGAAGAAGAAGCTGGAGAGTCCAATACTTTTATTCCCGTTTGAT
TTTTCTTGTGAGACAAGTTCCGATAAAGCTTTGAAGTTTAAAAACCTTTTTTTCTTTCTG
CTTCCAAAATTCAGAGTTCAGACTTAATGACATTTGGTTTATAACTTGTCTCCATTTATT
TGTGCATGGCATTTGGTATACAAACACTTCTTGCTGTGTGAATGAATAATAATCTTG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2AD26JQ C 1
AF RR2AD26TF U 1
BS 1 1 RR2AD26JQ
BS 2 473 RR2AD26TF
BS 474 477 RR2AD26JQ

RD RR2AD26JQ 477 0 0
GGAAGATGTCGTTGGTGTGGCTAGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGGATGC
TCTGTATTATGGGAAACTCTCAGTACTACATCCACAAAGCTTACCATGGCCGTCCGAAGC
ACATCGGGCACGATGAATGGGATGTTGCTATGGAGAGGCGCGACAAGAAAGTCGTCGAGA
AAGCCTCAGCTCCTTTTTCGTAATCCGATCAGGGGCTTCAGGTGAACAACTTGTTGTCAC
AAATAAAGTTTATTCCAGAAGAAGAAGCTGGAGAGTCCAATACTTTTATTCCCGTTTGAT
TTTTCTTGTGAGACAAGTTCCGATAAAGCTTTGAAGTTTAAAAACCTTTTTTTCTTTCTG
CTTCCAAAATTCAGAGTTCAGACTTAATGACATTTGGTTTATAACTTGTCTCCATTTATT
TGTGCATGGCATTTGGTATACAAACACTTCTTGCTGTGTGAATGAATAATAATCTTG

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2AD26TF 477 0 0
G
GAAGATGTCGTTGGTGTGGCTAGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGGATGCT
CTGTATTATGGGAAACTCTCAGTACTACATCCACAAAGCTTACCATGGCCGTCCGAAGCA
CATCGGGCACGATGAATGGGATGTTGCTATGGAGAGGCGCGACAAGAAAGTCGTCGAGAA
AGCCTCAGCTCCTTCTTCGTAATCCGATCAGGGGCTTCAGGTGAACAACTTGTTGTCACA
AATAAAGTTTATTCCAGAAGAAGAAGCTGGAGAGTCCAATACTTTTATTCCCGTTTGATT
TTTCTTGTGAGACAAGTTCCGATAAAGCTTTGAAGTTTAAAAACCTTTTTTTCTTTCTGC
TTCCAAAATTCAGAGTTCAGACTTAATGACATTTGGTTTATAACTTGTCTCCATTTATTT
GTGCATGGCATTTGGTATACAAACACTTCTTGCTGTGTGAATGAATAATAAT
CTTG

QA 2 473 2 473
DS 



CO CL1018Contig2 441 2 1 U
AAGATGTCGTTGGTGTGGCTAGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGGATGCTC
TGCATCATGGGGAACTCTCAGTACTACGTCCACAAAGCTTATCATGGCCGCCCGAAGCAC
ATAGGGCACGATGAATGGGATGTTGTTGGAGAGACGCGACAAGAAAGTCGTCGAGAAAGC
CGCATCTCCTTCCTCATGATCTCCCTCAGGAGGTTACTTGTGCTCACGTAATAAAAAAGG
GTATTCCAGAAGAAGAAGAAGCTGAAGAGTTTCATACTGTTATTCCCGTTTATTTCTCTT
TTTTTTTCCTGCTTTCAGAATTCAGACCGTAATGGCATTTGGTTATAACATTATCTCTGT
TTGTGATTATACATGCTTTTAAGTTGTATGATAATACACTGAAACTTGCAACTCTTCTAG
TGTGAATGAATAATTATCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AN34TF U 1
AF RR2AX23TFB U 235
BS 1 441 RR2AN34TF

RD RR2AN34TF 441 0 0
AAGATGTCGTTGGTGTGGCTAGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGGATGCTC
TGCATCATGGGGAACTCTCAGTACTACGTCCACAAAGCTTATCATGGCCGCCCGAAGCAC
ATAGGGCACGATGAATGGGATGTTGTTGGAGAGACGCGACAAGAAAGTCGTCGAGAAAGC
CGCATCTCCTTCCTCATGATCTCCCTCAGGAGGTTACTTGTGCTCACGTAATAAAAAAGG
GTATTCCAGAAGAAGAAGAAGCTGAAGAGTTTCATACTGTTATTCCCGTTTATTTCTCTT
TTTTTTTCCTGCTTTCAGAATTCAGACCGTAATGGCATTTGGTTATAACATTATCTCTGT
TTGTGATTATACATGCTTTTAAGTTGTATGATAATACACTGAAACTTGCAACTCTTCTAG
TGTGAATGAATAATTATCTTG

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR2AX23TFB 207 0 0
AAAAGGGTATTCCAGAAGAAGAAGAAGCTGAAGAGTTTCATACTGTTATTCCCGTTTATT
TCTCTTTTTTTTTCCTGCTTTCAGAATTCAGACCGTAATGGCATTTGGTTATAACATTAT
CTCTGTTTGTGATTATACATGCTTTTAAGTTGTATGATAATACACTGAAACTTGCAACTC
TTCTAGTGTGAATGAATAATTATCTTG

QA 1 207 1 207
DS 



CO CL1018Contig3 533 2 2 U
GGAGAAACAGAGAAGGAGAATCAGGAAGGAAGGAAGGAAGAAGAAGATGTCGTTGGTGTG
GCTAGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGAATGCTCTGTATTATGGGAAACTC
TCAGTACTACATCCACAAAGCTTATCATGGCCGTCCGAAGCACATCGGGCACGATGAATG
GGATGTTGCTATGGAGAGACGCGACAAGAAAGTCATCGAGAAAGCCTCAGCTCCTTCGTC
CTGATCCAATCAGGTGAACAACTTGTGGTCACAAATAAAGTTTATTCCAGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGCTGGAGAGTCTAGTAGTGTTTTTTCCCGTTTGATTTTTCTTGGAGACAAGGT
CGGATAAAGCTTTCAAGCTTAAAAACCTTTTTTTTTTCTGCTTCCAAAATTCAGAGTTCA
AACCTTAATGACATTTGGTTTATAACTTGTCTCCATTTATTTTCATGACATTTGGTATAC
AATACACTTCTTGCTGTGTGAATGAATAATAATATTGAAAAAATGGCTCATCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP82TF U 1
AF RR2GP82JQ C 1
BS 1 129 RR2GP82TF
BS 130 533 RR2GP82JQ

RD RR2GP82TF 129 0 0
GGAGAAACAGAGAAGGAGAATCAGGAAGGAAGGAAGGAAGAAGAAGATGTCGTTGGTGTG
GCTAGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGAATGCTCTGTATTATGGGAAACTC
TCAGTACTA

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR2GP82JQ 533 0 0
GGAGAAACAGAGAAGGAGAATCAGGAAGGAAGGAAGGAAGAAGAAGATGTCGTTGGTGTG
GCTAGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGAATGCTCTGTATTATGGGAAACTC
TCAGTACTACATCCACAAAGCTTATCATGGCCGTCCGAAGCACATCGGGCACGATGAATG
GGATGTTGCTATGGAGAGACGCGACAAGAAAGTCATCGAGAAAGCCTCAGCTCCTTCGTC
CTGATCCAATCAGGTGAACAACTTGTGGTCACAAATAAAGTTTATTCCAGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGCTGGAGAGTCTAGTAGTGTTTTTTCCCGTTTGATTTTTCTTGGAGACAAGGT
CGGATAAAGCTTTCAAGCTTAAAAACCTTTTTTTTTTCTGCTTCCAAAATTCAGAGTTCA
AACCTTAATGACATTTGGTTTATAACTTGTCTCCATTTATTTTCATGACATTTGGTATAC
AATACACTTCTTGCTGTGTGAATGAATAATAATATTGAAAAAATGGCTCATCT

QA 1 533 1 533
DS 



AS 3 6

CO CL1019Contig1 786 2 9 U
GGATAAAATCCGAAGGCTTGAACTCAATTTGACAAAAGTGACGTTTGAGTTGGACACACA
CAACAACTCTTGGACCTTTGAAACAAAGCCTCTTTGTAAATTACCAAAGGGAAAATGATC
ATAAACAAAGACTAAACAAACATAAAAGAGAGGACAAAGACAGATTCACATTTGATATTC
AGCAATCGGTATTGGTTTCCTCATCGTCGACCGCAGCAGATGCAAGAACAAGCTGAGGGG
TAGGAAGTGTGTAAGTGTAGTTCTCGCGTCTGGCCTTCTTCTTCTCCCTTTGCACTCTAA
AAGCTTCCCTCTTTCTTGCTCTGTAACTGTTGGGATTCTCTGGCACAACTTCCCTTGGGT
ACACACTAATCTTCTTCCTGGCAGGACCAAACTTCTCGAACTTGACTAATCCATCGATTA
AAGAGAAGATGGTATGATCTTTACCAATCCCAACGTTCTTTCCAGCATGGAACTTAGTGC
CACGTTGACGAACGATGATGGCCCCTGGTTTAGCGACTTGGTCACCGTAAATCTTGACGC
CCAGTCTTTGACCAGGAGAATCACGACCGTTCTTAGTACTCCCAGCTCCTTTCTTGTGCG
CGGATTCAATCGTCAATGGAATCGGAGCTTGGAGTTTTTCCAAAGGGAGAGTCACAGTGA
AGGAGGTTTTAGGGTTTAGAATCAAATCGCCTCTGAGGAAGGACGAGGTTGAAGAGAGGG
ATAAGCCTTTGAATGCTCCGATTAGATTCAAACTCATCGATGTTGCAATCGCCATTGCTA
CGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2A981JQ U 94
AF RR2CL61JQ U 1
BS 1 103 RR2CL61JQ
BS 104 104 RR2A981JQ
BS 105 150 RR2CL61JQ
BS 151 151 RR2A981JQ
BS 152 380 RR2CL61JQ
BS 381 381 RR2A981JQ
BS 382 541 RR2CL61JQ
BS 542 542 RR2A981JQ
BS 543 786 RR2CL61JQ

RD RR2A981JQ 554 0 0
TTGTAAATTACCAAAGGGAAAATGATCATAAACAAAGACTAA*CAAACATAAAAGAGAGG
ACAAAGACAGATTCACATTTGATATTCAGCAATCGGTATTGGTTTCCTCATCGTCGACCG
CAGCAGATGCAAGAACAAGCTGAGGGGTAGGAAGTGTGTAAGTGTAGTTCTCGCGTCTGG
CCTTCTTCTTCTCCCTTTGCACTCTAAAAGCTTCCCTCTTTCTTGCTCTGTAACTGTTGG
GATTCTCTGGCACAACTTCTCTTGGGTACACACTAATCTTCTTCCTGGCAGGACCAAACT
TCTCGAACTTGACTAATCCATCGATTAAAGAGAAGATGGTATGGTCTTTACCAATCCCAA
CGTTCTTTCCAGCATGGAACTTAGTGCCACGTTGACGAACGATGATGGCCCCTGGTTTAG
CGACTTGGTCACCGTAAATCTTGACGCCCAGTCTTTGTCCCGGAGAATCACGACCGTTCT
TAGTACTCCCAGCTCCTTTCTTGTGCGCGGATTCAATCGTCAATGGAATCGGAGCTTGGA
GTTTTTCCAAAGGG

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2CL61JQ 786 0 0
GGATAAAATCCGAAGGCTTGAACTCAATTTGACAAAAGTGACGTTTGAGTTGGACACACA
CAACAACTCTTGGACCTTTGAAACAAAGCCTCTTTGTAAATTAGCAAAGGGAAAATGATC
ATAAACAAAGACTAAACAAACATAAAAGAGGGGACAAAGACAGATTCACATTTGATATTC
AGCAATCGGTATTGGTTTCCTCATCGTCGACCGCAGCAGATGCAAGAACAAGCTGAGGGG
TAGGAAGTGTGTAAGTGTAGTTCTCGCGTCTGGCCTTCTTCTTCTCCCTTTGCACTCTAA
AAGCTTCCCTCTTTCTTGCTCTGTAACTGTTGGGATTCTCTGGCACAACTTCCCTTGGGT
ACACACTAATCTTCTTCCTGTCAGGACCAAACTTCTCGAACTTGACTAATCCATCGATTA
AAGAGAAGATGGTATGATCTTTACCAATCCCAACGTTCTTTCCAGCATGGAACTTAGTGC
CACGTTGACGAACGATGATGGCCCCTGGTTTAGCGACTTGGTCACCGTAAATCTTGACGC
CGAGTCTTTGACCAGGAGAATCACGACCGTTCTTAGTACTCCCAGCTCCTTTCTTGTGCG
CGGATTCAATCGTCAATGGAATCGGAGCTTGGAGTTTTTCCAAAGGGAGAGTCACAGTGA
AGGAGGTTTTAGGGTTTAGAATCAAATCGCCTCTGAGGAAGGACGAGGTTGAAGAGAGGG
ATAAGCCTTTGAATGCTCCGATTAGATTCAAACTCATCGATGTTGCAATCGCCATTGCTA
CGAGAG

QA 1 786 1 786
DS 



CO CL1019Contig2 814 2 2 U
GGGATCCTCACAAGAAAGAGAAAAAGAAACCCTAACCTCTCGTAGCAATGGCGATTGCAA
CATCGATGAGTTTGAATCTAATTGGAGCATTCAAAGGCTTATCCCTCTCCTCAACCTCAT
CGTTCCTCAGAGGCGATTTGATTCTAAACCCTAAAACCTCCTTCACTGTGACTCTCCCTT
TGGAAAAACTCCAAGCTCCGATTCCATTGACGATTGAATCCGCGCACAAGAAAGGAGCTG
GTAGTACTAAGAACGGTCGTGATTCTCCGGGACAAAGACTCGGCGTCAAGATTTACGGTG
ACCAAGTCGCTAAACCAGGGGCCATCATCGTTCGTCAACGTGGCACTAAGTTCCATGCTG
GAAAGAACGTTGGGATTGGTAAAGATCATACCATCTTCTCTTTAATCGATGGATTAGTCA
AGTTCGAGAAGTTTGGTCCTGACAGGAAGAAGATTAGTGTGTACCCAAGAGAAGTTGTGC
CAGAGAATCCCAACAGTTACAGAGCAAGAAAGAGGGAAGCTTTTAGAGTGCAAAGGGAGA
AGAAGAAGGCCAGACGCGAGAACTACACTTACACACTTCCCACCCCTCAGCTTGTGCTTG
CATCTGCTGCGATCGATGAGGAGGAAACCAATCCCGATTGCTGAGATTCATATGTGAAGC
TTTCTTTGTCCTCTCGTTATGTTTAGTCTTTGTTTATGATCATTTTCCCTTTGCTAATTT
ACAAAGAGGCTTTGTTTCAAAGGTCCAATAGTTGTTGTATGTGTCCAACTCAAAACCTCG
CTTTTGTCGAATTGAGTTCAAGCCTTCGGATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU68TF U 1
AF RR2CU68JQ C 149
BS 1 729 RR2CU68TF
BS 730 814 RR2CU68JQ

RD RR2CU68TF 737 0 0
GGGATCCTCACAAGAAAGAGAAAAAGAAACCCTAACCTCTCGTAGCAATGGCGATTGCAA
CATCGATGAGTTTGAATCTAATTGGAGCATTCAAAGGCTTATCCCTCTCCTCAACCTCAT
CGTTCCTCAGAGGCGATTTGATTCTAAACCCTAAAACCTCCTTCACTGTGACTCTCCCTT
TGGAAAAACTCCAAGCTCCGATTCCATTGACGATTGAATCCGCGCACAAGAAAGGAGCTG
GTAGTACTAAGAACGGTCGTGATTCTCCGGGACAAAGACTCGGCGTCAAGATTTACGGTG
ACCAAGTCGCTAAACCAGGGGCCATCATCGTTCGTCAACGTGGCACTAAGTTCCATGCTG
GAAAGAACGTTGGGATTGGTAAAGATCATACCATCTTCTCTTTAATCGATGGATTAGTCA
AGTTCGAGAAGTTTGGTCCTGACAGGAAGAAGATTAGTGTGTACCCAAGAGAAGTTGTGC
CAGAGAATCCCAACAGTTACAGAGCAAGAAAGAGGGAAGCTTTTAGAGTGCAAAGGGAGA
AGAAGAAGGCCAGACGCGAGAACTACACTTACACACTTCCCACCCCTCAGCTTGTGCTTG
CATCTGCTGCGATCGATGAGGAGGAAACCAATCCCGATTGCTGAGATTCATATGTGAAGC
TTTCTTTGTCCTCTCGTTATGTTTAGTCTTTGTTTATGATCATTTTCCCTTTGCTAATTT
ACAAAGAGG
TTTGTTTC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2CU68JQ 666 0 0
CCCTAAAACCTCCTTCACTGTGACTCTCCCTTTGGAAAAACTCCAAGCTCCGATTCCATT
GACGATTGAATCCGCGCACAAGAAAGGAGCTGGTAGTACTAAGAACGGTCGTGATTCTCC
GGGACAAAGACTCGGCGTCAAGATTTACGGTGACCAAGTCGCTAAACCAGGGGCCATCAT
CGTTTGTCAACGTGGCACTAAGTTCCATGCTGGAAAGAACGTTGGGATTGGTAAAGATCA
TACCATTTTTTCTTTAATCGATGGATTAGTCAAGTTCGAGAAGTTTGGTCCTGACAGGAA
GAAGATTAGTGTGTACCCAAGAGAAGTTGTGCCAGAGAATCCCAACAGTTACAGAGCAAG
AAAGAGGGAAGCTTTTAGAGTGCAAAGGGAGAAGAAGAAGGCCAGACGCGAGAACTACAC
TTACACACTTCCCACCCCTCAGCTTGTGCTTGCATTTGCTGCGATCGATGAGGAGGAAAC
CAATCCCGATTGCTGAGATTCATATGTGAAGCTTTCTTTGTCCTCTCGTTATGTTTAGTC
TTTGTTTATGATCATTTTCCCTTTGCTAATTTACAAAGAGGCTTTGTTTCAAAGGTCCAA
TAGTTGTTGTATGTGTCCAACTCAAAACCTCGCTTTTGTCGAATTGAGTTCAAGCCTTCG
GATTTT

QA 1 666 1 666
DS 



CO CL1019Contig3 726 2 3 U
TTAAAACAAAGCCTCTTTGTAAATTAGCAAAGGGAAAATGATCTTAAACAAAGACTAAAC
AAACGTAAAGAGAGGACAAAGACGGATTCACATTTGATATTCAGCAATCAGTATTGGTTT
CCTCATCATCGACCGCAGCAAATGCAAGCACAAGCTGAGGGGTAGGAAGTGTGTAAGTGT
AGTTCTCGCGTCTGGCCTTCTTCTTCTCCCTTTGCACTCTAAAAGCTTCCCTCTTTCTTG
CTCTGTAACTGTTGGGATTCTCTGGCACAACTTCTCTTGGGTACACACTAATCTTCTTCC
TGTCAGGACCAAACTTCTCGAACTTGACAAGTCCATCGATTAAAGAGAAGATGGTATGAT
CTTTACCAATCCCAACGTTCTTTCCAGCATGGAACTTAGTGCCACGTTGACGAACGATGA
TAGCGCCGGGTTTAGCGACTTGGTCACCGTAAATCTTGACGCCGAGTCTTTGTCCCGGAG
AATCACGACCGTTCTTAGTACTTCCAGCTCCTTTCTTGTGCGCCGATTCAATCGTCAGTG
GAATTGGAGCTTGGAGTTTTTCCAAAGGGAGAGTCACAACAGTGAAGGGGGTTTTAGGGT
TTAGAATCAAATCGCCTCTGAGGAACGATGAGGTTGAGGAGAGGGATAAGCCTTTGAATG
CTCCAATTGGATTCAAACTCATCGATGTTGCAATCGCCATTGCTACGAGAGGTTAGGGTT
TTTTTT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU13JQ U 3
AF RR2FU13TF C 1
BS 1 3 RR2FU13TF
BS 4 694 RR2FU13JQ
BS 695 726 RR2FU13TF

RD RR2FU13JQ 692 0 0
A
AAACAAAGCCTCTTTGTAAATTAGCAAAGGGAAAATGATCTTAAACAAAGACTAAACAAA
CGTAAAGAGAGGACAAAGACGGATTCACATTTGATATTCAGCAATCAGTATTGGTTTCCT
CATCATCGACCGCAGCAAATGCAAGCACAAGCTGAGGGGTAGGAAGTGTGTAAGTGTAGT
TCTCGCGTCTGGCCTTCTTCTTCTCCCTTTGCACTCTAAAAGCTTCCCTCTTTCTTGCTC
TGTAACTGTTGGGATTCTCTGGCACAACTTCTCTTGGGTACACACTAATCTTCTTCCTGT
CAGGACCAAACTTCTCGAACTTGACAAGTCCATCGATTAAAGAGAAGATGGTATGATCTT
TACCAATCCCAACGTTCTTTCCAGCATGGAACTTAGTGCCACGTTGACGAACGATGATAG
CGCCGGGTTTAGCGACTTGGTCACCGTAAATCTTGACGCCGAGTCTTTGTCCCGGAGAAT
CACGACCGTTCTTAGTACTTCCAGCTCCTTTCTTGTGCGCCGATTCAATCGTCAGTGGAA
TTGGAGCTTGGAGTTTTTCCAAAGGGAGAGTCACAACAGTGAAGGGGGTTTTAGGGTTTA
GAATCAAATCGCCTCTGAGGAACGATGAGGTTGAGGAGAGGGATAAGCCTTTGAATGCTC
CAATTGGATTCAAACTCATCGATGTTGCAAT

QA 2 692 2 692
DS 

RD RR2FU13TF 726 0 0
TTAAAACAAAGCCTCTTTGTAAATTAGCAAAGGGAAAATGATCTTAAACAAAGACTAAAC
AAACGTAAAGAGAGGACAAAGACGGATTCACATTTGATATTCAGCAATCAGTATTGGTTT
CCTCATCATCGACCGCAGCAGATGCAAGCACAAGCTGAGGGGTAGGAAGTGTGTAAGTGT
AGTTCTCGCGTCTGGCCTTCTTCTTCTCCCTTTGCACTCTAAAAGCTTCCCTCTTTCTTG
CTCTGTAACTGTTGGGATTCTCTGGCACAACTTCTCTTGGGTACACACTAATCTTCTTCC
TGTCAGGACCAAACTTCTCGAACTTGACAAGTCCATCGATTAAAGAGAAGATGGTATGAT
CTTTACCAATCCCAACGTTCTTTCCAGCATGGAACTTAGTGCCACGTTGACGAACGATGA
TAGCGCCGGGTTTAGCGACTTGGTCACCGTAAATCTTGACGCCGAGTCTTTGTCCCGGAG
AATCACGACCGTTCTTAGTACTTCCAGCTCCTTTCTTGTGCGCCGATTCAATCGTCAGTG
GAATTGGAGCTTGGAGTTTTTCCAAAGGGAGAGTCACAACAGTGAAGGGGGTTTTAGGGT
TTAGAATCAAATCGCCTCTGAGGAACGATGAGGTTGAGGAGAGGGATAAGCCTTTGAATG
CTCCAATTGGATTCAAACTCATCGATGTTGCAATCGCCATTGCTACGAGAGGTTAGGGTT
TTTTTT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 5

CO CL1020Contig1 946 5 16 U
TTTTTTTATCTCTTATTTCTCCATTCTCCTCATCTCCTCCCCCGCATCACCGTCGTGCTC
TCCCTCACGTCGGTAAGCTTACGTGATCCCTCGACTTCTAGGAGATGATGAGCATTGTTT
CAAGTCACCATCATTGTCAACCATCGTTTACACACGAACAACGATGCGGTATAGGGGCAC
TTTCTAATAAGGTTTCTTACTCCTGTCCCTGTTTCTCTGGAAGATTGGCTTTCTCTCATA
GCCTCTGCTTGAAGAGTTCTTGTAAGGAGCAAACTGGTAGTAGGAGAAGGTTTTCAAGAA
TTTGCAGTGTTGTGGATGACGGCATGAATCCAGATAGTTCGGATGACGAGGAAAAGGAAT
CACTCGATGATAAATCTAAAAGGGAAGCCAATGATATGAATCGGGCAAACCTTGAAAGAA
TGGTTGGGTCGGATGATTCTGCATTTAACGGCTTAGATCTTGCAACCCTCATCAGGCAGA
AGTATGGAAGATCTTATGATGTTCAGCTCATCAAGAAGGAGTTCATGGGGAGGAATCTTC
TTGCAATGAATGTCATGTGGAAGTACAGAGAACAGAGGTCTTTTCCTCTAACCGAAGAAG
AATACATATTAAGACTTGACGATGTAGCCAACATGTTGAAATGCTGGGGAGCGGTCTCGC
ATATCCGTAACAGCCTAGCAAAGTCCAAAGAGCGACCCAGGATAGGGAAGGCTGTTAGCA
TTTTCATAGACATGGATTCAACAGGTGGACGAGCAAACGAATGGATTTACAAGTAGCAAA
ACCGACCGGTTTACAAATCTAAACCAAAGAAAGCAAAAAAAAA*CCTTTTGTATCTAAAA
ATATAGTCATCAGATTCATTTTCAAAGCTCTTCTATGATAGTTATTTGCAGTTTGTGTTA
CATTTGATGTCTGAAATCATGTATTACATGTGTGTATAGTTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP84TF U 1
AF RR2B620TF U 24
AF RR2B620JQ C 70
AF RR2CP84JQ C 213
AF RR2GB35TF U 396
BS 1 130 RR2CP84TF
BS 131 131 RR2B620TF
BS 132 341 RR2CP84TF
BS 342 342 RR2B620TF
BS 343 416 RR2CP84TF
BS 417 417 RR2B620TF
BS 418 681 RR2CP84TF
BS 682 682 RR2B620TF
BS 683 701 RR2CP84TF
BS 702 740 RR2B620TF
BS 741 823 RR2GB35TF
BS 824 824 RR2B620JQ
BS 825 868 RR2GB35TF
BS 869 869 RR2B620JQ
BS 870 912 RR2GB35TF
BS 913 946 RR2B620JQ

RD RR2CP84TF 701 0 0
TTTTTTTATCTCTTATTTCTCCATTCTCCTCATCTCCTCCCCCGCATCACCGTCGTGCTC
TCCCTCACGTCGGTAAGCTTACGTGATCCCTCGACTTCTAGGAGATGATGAGCATTGTTT
CAAGTCACCACCATTGTCAACCATCGTTTACACACGAACAACGATGCGGTATAGGGGCAC
TTTCTAATAAGGTTTCTTACTCCTGTCCCTGTTTCTCTGGAAGATTGGCTTTCTCTCATA
GCCTCTGCTTGAAGAGTTCTTGTAAGGAGCAAACTGGTAGTAGGAGAAGGTTTTCAAGAA
TTTGCAGTGTTGTGGATGACGGCATGAATCCAGATAGTTCGTATGACGAGGAAAAGGAAT
CACTCGATGATAAATCTAAAAGGGAAGCCAATGATATGAATCGGGCAAACCTTGAAGGAA
TGGTTGGGTCGGATGATTCTGCATTTAACGGCTTAGATCTTGCAACCCTCATCAGGCAGA
AGTATGGAAGATCTTATGATGTTCAGCTCATCAAGAAGGAGTTCATGGGGAGGAATCTTC
TTGCAATGAATGTCATGTGGAAGTACAGAGAACAGAGGTCTTTTCCTCTAACCGAAGAAG
AATACATATTAAGACTTGACGATGTAGCCAACATGTTGAAATGCTGGGGAGCGGTCTCGC
ATATCCGTAACAGCCTAGCAA*GTCCAAAGAGCGACCCAGG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2B620TF 717 0 0
TTCTCCTCATCTCCTCCCCCGCATCACCGTCGTGCTCTCCCTCACGTCGGTAAGCTTACG
TGATCCCTCGACTTCTAGGAGATGATGAGCATTGTTTCAAGTCACCATCATTGTCAACCA
TCGTTTACACACGAACAACGATGCGGTATAGGGGCACTTTCTAATAAGGTTTCTTACTCC
TGTCCCTGTTTCTCTGGAAGATTGGCTTTCTCTCATAGCCTCTGCTTGAAGAGTTCTTGT
AAGGAGCAAACTGGTAGTAGGAGAAGGTTTTCAAGAATTTGCAGTGTTGTGGATGACGGC
ATGAATCCAGATAGTTCGGATGACGAGGAAAAGGAATCACTCGATGATAAATCTAAAAGG
GAAGCCAATGATATGAATCGGGCAAACCTTGAAAGAATGGTTGGGTCGGATGATTCTGCA
TTTAACGGCTTAGATCTTGCAACCCTCATCAGGCAGAAGTATGGAAGATCTTATGATGTT
CAGCTCATCAAGAAGGAGTTCATGGGGAGGAATCTTCTTGCAATGAATGTCATGTGGAAG
TACAGAGAACAGAGGTCTTTTCCTCTAACCGAAGAAGAATACATATTAGGACTTGACGAT
GTAGCCAACATGTTGAAATGCTGGGGAGCGGTCTCGCATATCCGTAACAGCCTAGCAAAG
TCCAAAGAGCGACCCAGGATAGGGAAGGCTGTTAGCATTTTCATAGACATGGATTCA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2B620JQ 877 0 0
TCGGTAAGCTTACGTGATCCCTCGACTTCTAGGAGATGATGAGCATTGTTTCAAGTCACC
ATCATTGTCAACCATCGTTTACACACGAACAACGATGCGGTATAGGGGCACTTTCTAATA
AGGTTTCTTACTCCTGTCCCTGTTTCTCTGGAAGATTGGCTTTCTCTCATAGCCTCTGCT
TGAAGAGTTCTTGTAAGGAGCAAACTGGTAGTAGGAGAAGGTTTTCAAGAATTTGCAGTG
TTGTGGATGACGGCATGAATCCAGATAGTTCGGATGACGAGGAAAAGGAATCACTCGATG
ATAAATCTAAAAGGGAAGCCAATGATATGAATCGGGCAAACCTTGAAAGAATGGTTGGGT
CGGATGATTCTGCATTTAACGGCTTAGATCTTGCAACCCTCATCAGGCAGAAGTATGGAA
GATCTTATGATGTTCAGCTCATCAAGAAGGAGTTCATGGGGAGGAATCTTCTTGCAATGA
ATGTCATGTGGAAGTACAGAGAACAGAGGTCTTTTCCTCTAACCGAAGAAGAATACATAT
TAGGACTTGACGATGTAGCCAACATGTTGAAATGCTGGGGAGCGGTCTCGCATATCCGTA
ACAGCCTAGCAAAGTCCAAAGAGCGACCCAGGATAGGGAAGGCTGTTAGCATTTTCATAG
ACATGGATTCAACAGGTGGACGAGCAAACGAATGGATTTACAAGTAGCAAAACCGACCGG
TTTACAAATCTAAACCAAAGAAAGCAAAAAAA***CCTTTTGTATCTAAAAATATAGTCA
TCAGATTCATTTTCAAAGCTCTTCTATGATAGTTATTTGCAGTTTGTGTTACATTTGATG
TCTGAAATCATGTATTACATGTGTGTATAGTTTAAGC

QA 1 877 1 877
DS 

RD RR2CP84JQ 723 0 0
TTCTCTGGAAGATTGGCTTTCTCTCATAGCCTCTGCTTGAAGAGTTCTTGTAAGGAGCAA
ACTGGTAGTAGGAGAAGGTTTTCAAGAATTTGCAGTGTTGTGGATGACGGCATGAATCCA
GATAGTTCGTATGACGAGGAAAAGGAATCACTCGATGATAAATCTAAAAGGGAAGCCAAT
GATATGAATCGGGCAAACCTTGAAGGAATGGTTGGGTCGGATGATTCTGCATTTAACGGC
TTAGATCTTGCAACCCTCATCAGGCAGAAGTATGGAAGATCTTATGATGTTCAGCTCATC
AAGAAGGAGTTCATGGGGAGGAATCTTCTTGCAATGAATGTCATGTGGAAGTACAGAGAA
CAGAGGTCTTTTCCTCTAACCGAAGAAGAATACATATTAAGACTTGACGATGTAGCCAAC
ATGTTGAAATGCTGGGGAGCGGTCTCGCATATCCGTAACAGCCTAGCAAAGTCCAAAGAG
CGACCCAGGATAGGGAAGGCTGTTAGCATTTTCATAGACATGGATTCAACAGGTGGACGA
GCAAACGAATGGATTTACAAGTAGCAAAACCGACCGGTTTACAAATCTAAACCAAAGAAA
GCAAAAAAAAA*CCTTTTGTATCTAAAAATATAGTCATCAGATTCATTTTCAAAGCTCTT
CTATGATAGTTATTTGCAGTTTGTGTTACATTTGATGTCTGAAATCATGTATTACATGTG
TG
C

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2GB35TF 528 0 0
G
TGAATCGGGCAAACCTTGAAAGAATGGTTGGGTCGGATGATTCTGCATTTAACGGCTTAG
ATCTTGCAACCCTCATCAGGCAGAAGTATGGAAGATCTTATGATGTTCAGCTCATCAAGA
AGGAGTTCATGGGGAGGAATCTTCTTGCAATGAATGTCATGTGGAAGTACAGAGAACAGA
GGTCTTTTCCTCTAACCGAAGAAGAATACATATTAAGACTTGACGATGTAGCCAACATGT
TGAAATGCTGGGGAGCGGTCTCGCATATCCGTAACAGCCTAGCAAAGTCCAAAGAGCGAC
CCAGGATAGGGAAGGCTGTTAGCATTTTCATAGACATGGATTCAACAGGTGGACGAGCAA
ACGAATGGATTTACAAGTAGCAAAACCGACCGGTTTACAAATCTAAACCAAAGAAAGCAA
AAAAAAAACCTTTTGTATCTAAAAATATAGTCATCAGATTCATTTTCAAAGCCCTTCTAT
GATAGTTATTTGCAGTTTGTGTTACATTTGATGTCT
GAATCATGTAT

QA 2 517 2 517
DS 



AS 2 6

CO CL1021Contig1 491 2 4 U
GTATAGAGCTGTCTGCTTATTTGCATATAAAAAGAGTTTAAAGGCAAAACAAGAAAATAA
CACACAAGTTTCAAGATTGAAATGAGGTCACTCTCTTTCACTCAAACTCCATTGGTAACA
ATCTTAAAGTCAAAAGAAGGAAAATGTTGCAGAGTACACAATTTCTTGCATTCCTCACCA
TTATTAACCTCAAACTTGATATCGAAACGTTTAAAAATCTCAAACTCCAGGTGTGTCAGA
ACGTAGAATTGGTTTCTCAGGCTTTCCGCAAGCCCATTTGGAGAGCGAGAAATGAACCTT
CTCGCGACTAAGGGCTTCAGCTTTGAAAGGCTCTTTGAGACAGTTCCTCACGAAATTCGC
ACAAATGTTTGAGTAGGTGATGTAAGTCATCCCCGCCGCTCTCCAAAACGGAACCGCCGC
CGTCGATGCCATCTCCGATCTTCTTTTCTCCTTTTTTCTTCGCTCCGAAATTCACAACAA
TGGAGAGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AH87TF C 1
AF RR2AH87JQ U 241
BS 1 246 RR2AH87TF
BS 247 330 RR2AH87JQ
BS 331 331 RR2AH87TF
BS 332 491 RR2AH87JQ

RD RR2AH87TF 491 0 0
GTATAGAGCTGTCTGCTTATTTGCATATAAAAAGAGTTTAAAGGCAAAACAAGAAAATAA
CACACAAGTTTCAAGATTGAAATGAGGTCACTCTCTTTCACTCAAACTCCATTGGTAACA
ATCTTAAAGTCAAAAGAAGGAAAATGTTGCAGAGTACACAATTTCTTGCATTCCTCACCA
TTATTAACCTCAAACTTGATATCGAAACGTTTAAAAATCTCAAACTCCAGGTGTGTCAGA
ACGTAGAATTGGTTTCTCAGGCTTTCCGCAAGCCCATTTGGAGAGCGAGAAATGAACCTT
CTCGCGACTAAGGGCTTCAGCTTTGAAAGGCTCTTTGAGACAGTTCCTCACGAGATTCGC
ACAAATGTTTGAGTAGGTGATGTAAGTCATCCCCGCCGCTCTCCAGAACGGAACCGCCGC
CGTCGATGCCATCTCCGATCTTCTTTTCTCCTTTTTTCTTCGCTCCGAAATTCACAACAA
TGGAGAGATTC

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2AH87JQ 251 0 0
ACGTAA
AATTGGTTTCTCAGGCTTTCCGCAAGCCCATTTGGAGAGCGAGAAATGAACCTTCTCGCG
ACTAAGGGCTTCAGCTTTGAAAGGGTCTTTGAGACAGTTCCTCACGAAATTCGCACAAAT
GTTTGAGTAGGTGATGTAAGTCATCCCCGCCGCTCTCCAAAACGGAACCGCCGCCGTCGA
TGCCATCTCCGATCTTCTTTTCTCCTTTTTTCTTCGCTCCGAAATTCACAACAATGGAGA
GATTC

QA 7 251 7 251
DS 



CO CL1021Contig2 460 4 2 U
GAAGATCGGAGATGGCATCGACGGCGGCGGTTCCGTTCTGGGGAGCGGCGGGGATGACTT
ACATCACCTACTCGAACATTTGTGCGAATCTCGTGAGGAACTGTCTGAAGGAGCCTTTCA
AAGCTGAAGCCCTTAGTCGCGAGAAGGTTCATTTCTCGCTTTCCAAATGGGCTGGCGGAA
AGCCTGAGAAACCAATTCTGCGTTCTGACACACCGGGAGTTTGAGATTTTTTAACGTTTC
GATATCAAGTTTGAGGTTAATAATGGTGAGGAATGCAAGAAATTGTGTGCAACATTTTCC
TTCTTTTGTTTAAGATTGTTAACAATGGAGTTTGAGTGAGAGAGAGTTACCTCATTCCAA
TCTTGAAACTTGTGTGTTATTTTCTTGTTTTGCCTTTAAACTCTTTTATATGCAAATAAG
CAGACAGCTCTCTATACATGTGAGTAAAGAAGTATAAAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AU72JQ C 1
AF RR2AU72TF U 1
AF RR2AB84JQ C 53
AF RR2AB84TF U 53
BS 1 362 RR2AU72TF
BS 363 460 RR2AB84TF

RD RR2AU72JQ 363 0 0
GAAGATCGGAGATGGCATCGACGGCGGCGGTTCCGTTCTGGGGAGCGGCGGGGATGACTT
ACATCACCTACTCGAACATTTGTGCGAATCTCGTGAGGAACTGTCTGAAGGAGCCTTTCA
AAGCTGAAGCCCTTAGTCGCGAGAAGGTTCATTTCTCGCTTTCCAAATGGGCTGGCGGAA
AGCCTGAGAAACCAATTCTGCGTTCTGACACACCGGGAGTTTGAGATTTTTTAACGTTTC
GATATCAAGTTTGAGGTTAATAATGGTGAGGAATGCAAGAAATTGTGTGCAACATTTTCC
TTCTTTTGTTTAAGATTGTTAACAATGGAGTTTGAGTGAGAGAGAGTTACCTCATTCCAA
TC
C

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR2AU72TF 363 0 0
GAAGATCGGAGATGGCATCGACGGCGGCGGTTCCGTTCTGGGGAGCGGCGGGGATGACTT
ACATCACCTACTCGAACATTTGTGCGAATCTCGTGAGGAACTGTCTGAAGGAGCCTTTCA
AAGCTGAAGCCCTTAGTCGCGAGAAGGTTCATTTCTCGCTTTCCAAATGGGCTGGCGGAA
AGCCTGAGAAACCAATTCTGCGTTCTGACACACCGGGAGTTTGAGATTTTTTAACGTTTC
GATATCAAGTTTGAGGTTAATAATGGTGAGGAATGCAAGAAATTGTGTGCAACATTTTCC
TTCTTTTGTTTAAGATTGTTAACAATGGAGTTTGAGTGAGAGAGAGTTACCTCATTCCAA
TC
C

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR2AB84JQ 382 0 0
GATGACTTACATCACCTACTCGAACATTTGTGCGAATCTCGTGAGGAACTGTCTGAAGGA
GCCTTTCAAAGCTGAAGCCCTTAGTCGCGAGAAGGTTCATTTCTCGCTTTCCAAATGGGC
TGGCGGAAAGCCTGAGAAACCAATTCTGCGTTCTGACACACCGGGAGTTTGAGATTTTTT
AACGTTTCGATATCAAGTTTGAGGTTAATAATGGTGAGGAATGCAAGAAATTGTGTGCAA
CATTTTCCTTCTTTTGTTTAAGATTGTTAACAATGGAGTTTGAGTGAGAGAGAGTTACCT
CATTCCAATCTTGAAACTTGTGTGTTATTTTCTTGTTTTGCCTTTAAACTCTTTTATATG
CAAATAAGCAGACAGCTCT
CTA

QA 1 379 1 379
DS 

RD RR2AB84TF 408 0 0
GATGACTTACATCACCTACTCGAACATTTGTGCGAATCTCGTGAGGAACTGTCTGAAGGA
GCCTTTCAAAGCTGAAGCCCTTAGTCGCGAGAAGGTTCATTTCTCGCTTTCCAAATGGGC
TGGCGGAAAGCCTGAGAAACCAATTCTGCGTTCTGACACACCGGGAGTTTGAGATTTTTT
AACGTTTCGATATCAAGTTTGAGGTTAATAATGGTGAGGAATGCAAGAAATTGTGTGCAA
CATTTTCCTTCTTTTGTTTAAGATTGTTAACAATGGAGTTTGAGTGAGAGAGAGTTACCT
CATTCCAATCTTGAAACTTGTGTGTTATTTTCTTGTTTTGCCTTTAAACTCTTTTATATG
CAAATAAGCAGACAGCTCTCTATACATGTGAGTAAAGAAGTATAAAGC

QA 1 408 1 408
DS 



AS 1 7

CO CL1022Contig1 723 7 4 U
GGATAGCATCAGTTCTTCCCTTTTGTTCTCTCTCATTCTCACATCTCCTCCTCTCCTTCA
TATATTCTCCATCTTCTGCTAGTTAAGGAAGACAAGAATGGTGGATCTTCAAAGAAAAGT
GTGTTGCATGTGTGGTGATGTGGGTTTCTTCGACAAGCTCTTTCACTGCAGCAAGTGCCT
TAATCGCTTCCAACACTCGTACTGTAGTAGCTATTATAAAGAGCAAGGTGATCCAATTAA
GATCTGCGATTGGTGTCAATATGAAGCGAAGAGTCGAACAGGAGCAAAGCACGGTGTTAG
CGGTGGATCGTCTAAGAGATCGTACCGGTCGGAATATTCTTCAGCCAACCAGATCAAACA
ACAAGAGATTAACCAGATTTCTGCAAGTAGTAGTATACCTCCGGTAGCCGAGAAGGGTAA
AACTGGTGTACCTTCTCCTAGAACGGCCACTCGCAGGTACAAGCTTCTCAAGGATGTCAT
GTGTTAGTAATGTTTTTTTTTCAAATAACCAAGAGTTGAGAGAGTTATAGCTATAGTGTT
TATTAGGATCTGAGATGAGATAATAAGACGCATGAATGTAAGATACAATTAGGGATGTTT
TGTAGATGTTGCCATGTGTGAGAAGCAATGTAACGTACCTGCGGAGTTATGTATGTTAAG
*ATATATGATGATGTTAGTGAGTGTTTCAA*TAAATTTTAAGTATCTTTGGGTTGATGCT
TGT


BQ
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2EZ36TF U 1
AF RR2EZ36JQ C 314
AF RR2BN54JQ C 1
AF RR2BN54TF U 1
AF RR2EJ70TF U 1
AF RR2EJ70JQ C 4
AF RR2CQ37TF U 1
BS 1 587 RR2BN54TF
BS 588 588 RR2EJ70TF
BS 589 711 RR2BN54TF
BS 712 723 RR2CQ37TF

RD RR2EZ36TF 526 0 0
GGATAGCATCAGTTCTTCCCTTTTGTTCTCTCTCATTCTCACATCTCCTCCTCTCCTTCA
TATATTCTCCATCTTCTGCTAGTTAAGGAAGACAAGAATGGTGGATCTTCAAAGAAAAGT
GTGTTGCATGTGTGGTGATGTGGGTTTCTTCGACAAGCTCTTTCACTGCAGCAAGTGCCT
TAATCGCTTCCAACACTCGTACTGTAGTAGCTATTATAAAGAGCAAGGTGATCCAATTAA
GATCTGCGATTGGTGTCAATATGAAGCGAAGAGTCGAACAGGAGCAAAGCACGGTGTTAG
CGGTGGATCGTCTAAGAGATCGTACCGGTCGGAATATTCTTCAGCCAACCAGATCAAACA
ACAAGAGATTAACCAGATTTCTGCAAGTAGTAGTATACCTCCGGTAGCCGAGAAGGGTAA
AACTGGTGTACCTTCTCCTAGAACGGCCACTCGCAGGTACAAGCTTCTCAAGGATGTCAT
GTGTTAGTAATGTTTTTTTTTCAAATAACCAAGAGTTGAGAGAGTT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2EZ36JQ 348 0 0
AAGAGATCGTACCGGTCGGAATATTCTTCAGCCAACCAGATCAAACAACAAGAGATTAAC
CAGATTTCTGCAAGTAGTAGTATACCTCCGGTAGCCGAGAAGGGTAAAACTGGTGTACCT
TCTCCTAGAACGGCCACTCGCAGGTACAAGCTTCTCAAGGATGTCATGTGTTAGTAATGT
TTTTTTTTCAAATAACCAAGAGTTGAGAGAGTTATAGCTATAGTGTTTATTAGGATCTGA
GATGAGATAATAAGACGCATGAATGTAAGATACAATTAGGGATGTTTTGTAGATGTTGCC
ATGTGTGAGAAGCAATGTAGCGTACCTGCGGAGTTATGTATGTTAAG
G

QA 1 347 1 347
DS 

RD RR2BN54JQ 714 0 0
GGATAGCATCAGTTCTTCCCTTTTGTTCTCTCTCATTCTCACATCTCCTCCTCTCCTTCA
TATATTCTCCATCTTCTGCTAGTTAAGGAAGACAAGAATGGTGGATCTTCAAAGAAAAGT
GTGTTGCATGTGTGGTGATGTGGGTTTCTTCGACAAGCTCTTTCACTGCAGCAAGTGCCT
TAATCGCTTCCAACACTCGTACTGTAGTAGCTATTATAAAGAGCAAGGTGATCCAATTAA
GATTTGCGATTGGTGTCAATATGAAGCGAAGAGTCGAACAGGAGCAAAGCACGGTGTTAG
CGGTGGATCGTCTAAGAGATCGTACCGGTCGGAATATTCTTCAGCCAACCAGATCAAACA
ACAAGAGATTAACCAGATTTCTGCAAGTAGTAGTATACCTCCGGTAGCCGAGAAGGGTAA
AACTGGTGTACCTTCTCCTAGAACGGCCACTCGCAGGTACAAGCTTCTCAAGGATGTCAT
GTGTTAGTAATGTTTTTTTTTCAAATAACCAAGAGTTGAGAGAGTTATAGCTATAGTGTT
TATTAGGATCTGAGATGAGATAATAAGACGCATGAATGTAAGATACAGTTAGGGATGTTT
TGTAGATGTTGCCATGTGTGAGAAGCAATGTAACGTACCTGCGGAGTTATGTATGTTAAG
GATATATGATGATGTTAGTGAGTGTTTCAAATAAATTTTAAGTATCTTTGG
GTT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2BN54TF 711 0 0
GGATAGCATCAGTTCTTCCCTTTTGTTCTCTCTCATTCTCACATCTCCTCCTCTCCTTCA
TATATTCTCCATCTTCTGCTAGTTAAGGAAGACAAGAATGGTGGATCTTCAAAGAAAAGT
GTGTTGCATGTGTGGTGATGTGGGTTTCTTCGACAAGCTCTTTCACTGCAGCAAGTGCCT
TAATCGCTTCCAACACTCGTACTGTAGTAGCTATTATAAAGAGCAAGGTGATCCAATTAA
GATCTGCGATTGGTGTCAATATGAAGCGAAGAGTCGAACAGGAGCAAAGCACGGTGTTAG
CGGTGGATCGTCTAAGAGATCGTACCGGTCGGAATATTCTTCAGCCAACCAGATCAAACA
ACAAGAGATTAACCAGATTTCTGCAAGTAGTAGTATACCTCCGGTAGCCGAGAAGGGTAA
AACTGGTGTACCTTCTCCTAGAACGGCCACTCGCAGGTACAAGCTTCTCAAGGATGTCAT
GTGTTAGTAATGTTTTTTTTTCAAATAACCAAGAGTTGAGAGAGTTATAGCTATAGTGTT
TATTAGGATCTGAGATGAGATAATAAGACGCATGAATGTAAGATACAGTTAGGGATGTTT
TGTAGATGTTGCCATGTGTGAGAAGCAATGTAACGTACCTGCGGAGTTATGTATGTTAAG
*ATATATGATGATGTTAGTGAGTGTTTCAA*TAAATTTTAAGTATCTTTGG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2EJ70TF 692 0 0
GGATAGCATCAGTTCTTCCCTTTTGTTCTCTCTCATTCTCACATCTCCTCCTCTCCTTCA
TATATTCTCCATCTTCTGCTAGTTAAGGAAGACAAGAATGGTGGATCTTCAAAGAAAAGT
GTGTTGCATGTGTGGTGATGTGGGTTTCTTCGACAAGCTCTTTCACTGCAGCAAGTGCCT
TAATCGCTTCCAACACTCGTACTGTAGTAGCTATTATAAAGAGCAAGGTGATCCAATTAA
GATCTGCGATTGGTGTCAATATGAAGCGAAGAGTCGAACAGGAGCAAAGCACGGTGTTAG
CGGCGGATCGTCTAAGAGATCGTACCGGTCGGAATATTCTTCAGCCAACCAGATCAAACA
ACAAGAGATCAACCAGATCTCTGCAAGTAGTAGTATACCTCCGGTAGCCGAGAAGGGTAA
AACTGGTGTACCTTCTCCTAGAACGGCCACTCGCAGGTACAAGCTTCTCAAGGATGTCAT
GTGTTAGTAATGTTTTTTTTTCAAATAACCAAGAGTTGAGAGAGTTATAGCTATAGTGTT
TATTAGGATCTGAGATGAGATAATAAGACGCATGAATGTAAGATACAATTAGGGATGTTT
TGTAGATGTTGCCATGTGTGAGAAGCAATGTAACGTACCTGCGGAGTTATGTATGTTAAG
*ATATATGATGATGTTAGTGAGTGTTTCAA
AT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2EJ70JQ 677 0 0
TAGCATCAGTTCTTCCCTTTTGTTCTCTCTCATTCTCACATCTCCTCCTCTCCTTCATAT
ATTCTCCATCTTCTGCTAGTTAAGGAAGACAAGAATGGTGGATCTTCAAAGAAAAGTGTG
TTGCATGTGTGGTGATGTGGGTTTCTTCGACAAGCTCTTTCACTGCAGCAAGTGCCTTAA
TCGCTTCCAACACTCGTACTGTAGTAGCTATTATAAAGAGCAAGGTGATCCAATTAAGAT
CTGCGATTGGTGTCAATATGAAGCGAAGAGTCGAACAGGAGCAAAGCACGGTGTTAGCGG
CGGATCGTCTAAGAGATCGTACCGGTCGGAATATTCTTCAGCCAACCAGATCAAACAACA
AGAGATCAACCAGATCTCTGCAAGTAGTAGTATACCTCCGGTAGCCGAGAAGGGTAAAAC
TGGTGTACCTTCTCCTAGAACGGCCACTCGCAGGTACAAGCTTCTCAAGGATGTCATGTG
TTAGTAATGTTTTTTTTTCAAATAACCAAGAGTTGAGAGAGTTATAGCTATAGTGTTTAT
TAGGATCTGAGATGAGATAATAAGACGCATGAATGTAAGATACAATTAGGGATGTTTTGT
AGATGTTGCCATGTGTGAGAAGCAATGTAACGTACCTGCGGAGTTATGTATGTTAAGGAT
ATATGATGATGTTAGTG

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2CQ37TF 723 0 0
GGATAGCATCAGTTCTTCCCTTTTGTTCTCTCTCATTCTCACATCTCCTCCTCTCCTTCA
TATATTCTCCATCTTCTGCTAGTTAAGGAAGACAAGAATGGTGGATCTTCAAAGAAAAGT
G*GTTGCATGTGTGGTGATGTGGGTTTCTTCGACAAGCTCTTTCACTGCAGCAAGTGCCT
TAATCGCTTCCAACACTCGTACTGTAGTAGCTATTATAAAGAGCAAGGTGATCCAATTAA
GATCTGCGATTGGTGTCAATATGAAGCGAAT**TCGAACAGGAGCAAAGCACGGTGTTAG
CGGTGGATCGTCTAATAGATCGTACCGGTCGGAATATTCTTCAGCCAACCAGATCAAACA
ACAAGAGATTAACCAGATTTCTGCAAGTAGTAGTATACCTCCGGTAGCCGAGAAGGGTAA
AACTGGTGTACCTTCTCCTAGAACGGCCACTCGCAGGTACAAGCTTCTCAAGGATGTCAT
GTGTTAGTAATGTTTTTTTTTCAAATAACCAAGAGTTGAGAGAGTTATAGCTATAGTGTT
TATTAGGATCTGAGATGAGATAATAAGACGCATGAATGTAAGATACAATTAGGGATGTTT
TGTAGATGTTGCCATGTGTGAGAAGCAATGTAACGTACCTGCGGAGTTATGTATGTTAAG
*ATATATGATGATGTTAGTGAGTGTTTCAA*TAAATTTTAAGTATCTTTGGGTTGATGCT
TGT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 7

CO CL1023Contig1 442 7 8 U
GGGGTGTCGTGACTTTGGATCCATCGTCTACGCGAAGCAGTCATCAGAGAGAGAGAGA**
TGAGGTTGTTCGATCCATGGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCTT
TTCTCACCGGATTCGCCGTAACAGGCGTCCTCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTG
AGGAAGACGCCAAGAACTCCAAGTTCGTCCAACAACACAGGCGGTGATCGACTGATGTGA
AATCTACTTCGAAGAGTCCTTCTGGCTTTCAAGCTTATTCTAATAAACATAAAAAGAGAG
TTTCCTACATACTTGTTTTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTCTGTCTTTTCACAA
CTCTCTAAACAGTGCAAGTTTGAAATGGATTGATTCCAATCTTTTCCCCCCATATGTTTG
AAATGGATTTTTGATTTCTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG65JQ C 1
AF RR2BG65TF U 1
AF RR2AS41JQ C 17
AF RR2AS41TF U 17
AF RR2GK67JQ C 17
AF RR2GK67TF U 17
AF RR2CI21TF U 17
BS 1 16 RR2BG65TF
BS 17 18 RR2AS41TF
BS 19 58 RR2BG65TF
BS 59 60 RR2AS41TF
BS 61 287 RR2BG65TF
BS 288 288 RR2AS41TF
BS 289 411 RR2BG65TF
BS 412 442 RR2CI21TF

RD RR2BG65JQ 411 0 0
GGGGTGTCGTGACTTTCCATCCATCGTTTACGGGAAGCAGTCATCAGAGAGAGAGAGAGA
TGAGGTTGTTCGATCCATGGCCAGTGTTTTTCAAGAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCTT
TTCTCACCGGATTCGCCGTAACAGGCGTCCTCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTG
AGGAAGACGCCAAGAACTCCAAGTTCGTCCAACAACACAGGCGGTGATCGACTGATGTGA
AATCTACTTCGAAGAGTCCTTCTGGCTTTCAAGCTTATTTTAATAAATATAAAAAGAGAG
TTTCCTACATACTTGTTTTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTCTGTCTTTTCACAA
CTCTCTAAACAGTGCAAGTTTGAAATGGATTGATTCCAATCTTTTCCCCCC

QA 1 411 1 411
DS 

RD RR2BG65TF 411 0 0
GGGGTGTCGTGACTTTCCATCCATCGTCTACGCGAAGCAGTCATCAGAGAGAGAGAGAGA
TGAGGTTGTTCGATCCATGGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCTT
TTCTCACCGGATTCGCCGTAACAGGCGTCCTCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTG
AGGAAGACGCCAAGAACTCCAAGTTCGTCCAACAACACAGGCGGTGATCGACTGATGTGA
AATCTACTTCGAAGAGTCCTTCTGGCTTTCAAGCTTATTCTAATAAATATAAAAAGAGAG
TTTCCTACATACTTGTTTTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTCTGTCTTTTCACAA
CTCTCTAAACAGTGCAAGTTTGAAATGGATTGATTCCAATCTTTTCCCCCC

QA 1 411 1 411
DS 

RD RR2AS41JQ 396 0 0
GGATCCATCGTTTACGCGAAGCAGTCATCAGAGAGAGGGAGA**TGAGGTTGTTCGGTCC
ATGGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCGTTTCTCACCGGATTCGC
CGTAACAGGCGTCCTCATCACCAAACTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGAA
CTCCAAGTTCGTCCAACAACACAGGCGGTGATCGACTGATGTGAAATCTACTTCGAAGAG
TGCTTCTGGCTTTCAAGCTTATTCTAATAAACATAAAAAGAGAGTTTCCTACATACTTGT
TTTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTCTGTCTTTTCACAACTCTCTAAACAGTGCA
AGTTTGAAATGGATTGATTCCAATCTTTT
TTCCCCC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2AS41TF 396 0 0
GGATCCATCGTCTACGCGAAGCAGTCATCAGAGAGAGGGAGA**TGAGGTTGTTCGGTCC
ATGGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCGTTTCTCACCGGATTCGC
CGTAACAGGCGTCCTCATCACCAAACTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGAA
CTCCAAGTTCGTCCAACAACACAGGCGGTGATCGACTGATGTGAAATCTACTTCGAAGAG
TGCTTCTGGCTTTCAAGCTTATTCTAATAAACATAAAAAGAGAGTTTCCTACATACTTGT
TTTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTCTGTCTTTTCACAACTCTCTAAACAGTGCA
AGTTTGAAATGGATTGATTCCAATCTTTT
TTCCCCC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2GK67JQ 403 0 0
GGATCCATCGTTTACGCGAAGCAGTCATCAGAGAGAGAGA****TGAGGTTGTTCGATCC
ATGGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCTTTTCTCACCGGATTCGT
CGTAACAGGCGTCCTCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGAA
CTCCAAGTTCGTCCAACAACACAGGCGGTGATCGACTGATGTGAAATCTACTTCGAAGAG
TCCTTCTGGCTTTCAAGCTTATTCTAATAAACATAAAAAGAGAGTTTCCTACATACTTGT
TTTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTCTGTCTTTTCACAACTCTCTAAACAGTGCA
AGTTTGAAATGGATTGATTCCAATCTTTT
CCCCCCATATGTTT

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2GK67TF 403 0 0
GGATCCATCGTCTACGCGAAGCAGTCATCAGAGAGAGAGA****TGAGGTTGTTCGATCC
ATGGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCTTTTCTCACCGGATTCGT
CGTAACAGGCGTCCTCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGAA
CTCCAAGTTCGTCCAACAACACAGGCGGTGATCGACTGATGTGAAATCTACTTCGAAGAG
TCCTTCTGGCTTTCAAGCTTATTCTAATAAACATAAAAAGAGAGTTTCCTACATACTTGT
TTTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTCTGTCTTTTCACAACTCTCTAAACAGTGCA
AGTTTGAAATGGATTGATTCCAATCTTTT
CCCCCCATATGTTT

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2CI21TF 426 0 0
GGATCCATCGTCTACGCGAAGCAGTCATCAGAGAGAGAGAGA**TGAGGTTGTTCGATCC
ATGGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCTTTTCTCACCGGATTCGC
CGTAACAGGCGTCCTCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGAA
CTCCAAGTTCGTCCAACAACACAGGCGGTGATCGACTGATGTGAAATCTACTTCGAAGAG
TCCTTCTGGCTTTCAAGCTTATTCTAATAAACATAAAAAGAGAGTTTCCTACATACTTGT
TTTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTCTGTCTTTTCACAACTCTCTAAACAGTGCA
AGTTTGAAATGGATTGATTCCAATCTTTTCCCCCCATATGTTTGAAATGGATTTTTGATT
TCTCTC

QA 1 426 1 426
DS 



AS 1 6

CO CL1024Contig1 808 6 24 U
CTGTAAACAGTGGAATATAATTTTATTTAATTCAAATAACACTGCGTATAATACAATGGG
TTCAAGAAGTAGCCCTATTTGAGCACACAACACATCGGTGAGACGATTCCACGCAAACTC
TCAATGCAAAACTCATTTCACTTAATCACACCCTAACGTATTTATCATATCGTACGTCTT
TATCTATAATCATACGACCGCTACGGCGGCCGGACGGCCCATTCCGGCGGATACATTTTC
AAATATACCATAATTCAACATAGAAACTCTCTGTTTAGCTTTGGCAATCATATCACTCTC
CCCAGACTCCGTCTCAGTCTCAGCAACTAGCTTCATTGATTTTCTCTCGCAGGTGCCGAG
CCATTTGGCTTGCATGTACTTTTGTTTTCTCCAAGGTCCCATGTGCATTTTCTTGTCTTT
CATGCACTTTTTCGCCGCCGTGCACAATATTTTTATCAGTGTTCTTAGCCTCTCTGTTTT
CCCGACGTACACTTCCGGTAATATTCCAACGAGTCGCTTGTACTCATCACTACCCCTCGC
CATCTCGAACTCAGCCCTGAAAGATAGCTCGATCACCACACGCATCTCGACTTTCTTCGG
TCCCGATTGGTCCACGATTTCCAAATATTCATGCTCACCTGCAAGGATCTCATGATTACT
TCTCCACTTGGATTTACAGCTGACGCAATCGTATCCGGCCTCTCGGAGAAGGCGAGACAC
TTCGCCGCGTAGACAGCTACGGCAACTGCCGGACACGGGTTTTCGGCAGACACATTTCGT
ACCCTTTGATCTCACTTCTTTCAAGGCC


BQ
10 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY57JQ U 3
AF RR2EY57TF C 3
AF RR2B748JQ U 109
AF RR2H394JQ U 1
AF RR2H394TF C 1
AF RR2B748TF C 5
BS 1 32 RR2H394JQ
BS 33 33 RR2EY57JQ
BS 34 38 RR2H394JQ
BS 39 39 RR2EY57JQ
BS 40 151 RR2H394JQ
BS 152 152 RR2EY57JQ
BS 153 243 RR2H394JQ
BS 244 244 RR2EY57JQ
BS 245 282 RR2H394JQ
BS 283 283 RR2EY57JQ
BS 284 305 RR2H394JQ
BS 306 306 RR2EY57JQ
BS 307 327 RR2H394JQ
BS 328 328 RR2EY57JQ
BS 329 353 RR2H394JQ
BS 354 354 RR2EY57JQ
BS 355 381 RR2H394JQ
BS 382 382 RR2EY57JQ
BS 383 396 RR2H394JQ
BS 397 397 RR2EY57JQ
BS 398 483 RR2H394JQ
BS 484 484 RR2B748JQ
BS 485 700 RR2H394JQ
BS 701 808 RR2B748TF

RD RR2EY57JQ 467 0 0
GTAAACAGTGGAATATAATTTTATTTAATTCAAATAACACTGCGTATAATACAATGGGTT
CAAGAAGTAGCCCTATTTGAGCACACAACACATCGGTGAGACGATTCCACGCAAACTCTC
AATGCAAAACTCATTTCACTTAATCACACCCTAACGTATTTATCATATCGTACGTCTTTA
TCTATAATCATACGACCGCTACGGCGGCCGGACGGCCCATTCCGGCGGATACATTTTCAA
ATATACCATAATTCAACATAGAAACTCTCTGTTTAGCTTTGGCAATCATATCACTCTCCC
CAGACTCCGTCTCAGTCTCAGCAACTAGCTTCATTGATTTTCTCTCGCAGGTGCCGAGCC
ATTTGGCTTGCATGTACTTTTGTTTTCTCCAAGGTCCCATGTGCATTTTCTTGTCTTTCA
TGCACTTTTTCGCCGCCGTGCACAATATTTTTATCAGTGTTCTTAGC

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2EY57TF 467 0 0
GTAAACAGTGGAATATAATTTTATTTAATTCAAATAACACTGCGTATAATACAATGGGTT
CAAGAAGTAGCCCTATTTGAGCACACAACACATCGGTGAGACGATTCCACGCAAACTCTC
AATGCAAAACTCATTTCACTTAATCACACCCTAACGTATTTATCATATCGTACGTCTTTA
TCTATAATCATACGACCGCTACGGCGGCCGGACGGCCCATTCCGGCGGATACATTTTCAA
ATATACCATAATTCAACATAGAAACTCTCTGTTTAGCTTTGGCAATCATATCACTCTCCC
CAGACTCCGTCTCAGTCTCAGCAACTAGCTTCATTGATTTTCTCTCGCAGGTGCCGAGCC
ATTTGGCTTGCATGTACTTTTGTTTTCTCCAAGGTCCCATGTGCATTTTCTTGTCTTTCA
TGCACTTTTTCGCCGCCGTGCACAATATTTTTATCAGTGTTCTTAGC

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2B748JQ 504 0 0
CCACGCAAACTCTCAATGCAAAACTCATTTCACTTAATCACACCCTAACGTATTTATCAT
ATCGTACGTCTTTATCTATAATCATACGACCGCTACGGCGGCCGGACGGCCCATTCCGGC
GGATACATTTTCAAATATACCATAATTCAACATAGAAACTCTCTGTTTAGCTTTGGCAAT
CATATCACTCTCCCCAGACTCCGTCTCAGTCTCAGCAACTAGCTTCATTGATTTTCTCTC
GCAGGTGCCGAGCCATTTGGCTTGCATGTACTTTTGTTTTCTCCAAGGTCCCATGTGCAT
TTTCTTGTCTTTCATGCACTTTTTCTCCGCCGTGCACAATATTTTTATCAATGTTCTTAG
CCTCTCTGTTTTCCCGACGTACACTTCCGGTAATATTCCAACGAGTCGCTTGTACTCATC
ACTACCCCTCGCCATCTCGAACTCAGCCCTGAAAGATAGCTCGATCACCACACGCATCTC
GACTTTCTTCGGTCCCGATTGGTC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2H394JQ 701 0 0
CTGTAAACAGTGGAATATAATTTTATTTAATTAAAATA*CACTGCGTATAATACAATGGG
TTCAAGAAGTAGCCCTATTTGAGCACACAACACATCGGTGAGACGATTCCACGCAAACTC
TCAATGCAAAACTCATTTCACTTAATCACACTCTAACGTATTTATCATATCGTACGTCTT
TATCTATAATCATACGACCGCTACGGCGGCCGGACGGCCCATTCCGGCGGATACATTTTC
AAAAATACCATAATTCAACATAGAAACTCTCTGTTTAGCTTTAGCAATCATATCACTCTC
CCCAGTCTCCGTCTCAGTCTCAGCAACCAGCTTCATTGATTTTCTCTCGCAGGCGCCGAG
CCATTTGGCTTGCATGTACTTGTGTTTTCTCCAAGGACCCATGTGCATTTTCTTGTCTTT
CATGCACTTTTTCGCCGCCGTGCACAATATTTTTATCAGTGTTCTTAGCCTCTCTGTTTT
CCC*ACGTACACTTCCGGTAATATTCCAACGAGTCGCTTGTACTCATCACTACCCCTCGC
CATCTCGAACTCAGCCCTGAAAGATAGCTCGATCACCACACGCATCTCGACTTTCTTCGG
TCCCGATTGGTCCACGATTTCCAAATATTCATGCTCACCTGCAAGGATCTCATGATTACT
TCTCCACTTGGATTTACAGCTGACGCAATCGTATCCGGCC
C

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2H394TF 701 0 0
CT
GTAAACAGTGGAATATAATTTTATTTAATTAAAATA*CACTGCGTATAATACAATGGGTT
CAAGAAGTAGCCCTATTTGAGCACACAACACATCGGTGAGACGATTCCACGCAAACTCTC
AATGCAAAACTCATTTCACTTAATCACACTCTAACGTATTTATCATATCGTACGTCTTTA
TCTATAATCATACGACCGCTACGGCGGCCGGACGGCCCATTCCGGCGGATACATTTTCAA
AAATACCATAATTCAACATAGAAACTCTCTGTTTAGCTTTAGCAATCATATCACTCTCCC
CAGTCTCCGTCTCAGTCTCAGCAACCAGCTTCATTGATTTTCTCTCGCAGGCGCCGAGCC
ATTTGGCTTGCATGTACTTGTGTTTTCTCCAAGGACCCATGTGCATTTTCTTGTCTTTCA
TGCACTTTTTCGCCGCCGTGCACAATATTTTTATCAGTGTTCTTAGCCTCTCTGTTTTCC
C*ACGTACACTTCCGGTAATATTCCAACGAGTCGCTTGTACTCATCACTACCCCTCGCCA
TCTCGAACTCAGCCCTGAAAGATAGCTCGATCACCACACGCATCTCGACTTTCTTCGGTC
CCGATTGGTCCACGATTTCCAAATATTCATGCTCACCTGCAAGGATCTCATGATTACTTC
TCCACTTGGATTTACAGCTGACGCAATCGTATCCGGCC
C

QA 3 700 3 700
DS 

RD RR2B748TF 804 0 0
AAACAGTGGAATATAATTTTATTTAATTCAAATAACACTGCGTATAATACAATGGGTTCA
AGAAGTAGCCCTATTTGAGCACACAACACATCGGTGAGACGATTCCACGCAAACTCTCAA
TGCAAAACTCATTTCACTTAATCACACCCTAACGTATTTATCATATCGTACGTCTTTATC
TATAATCATACGACCGCTACGGCGGCCGGACGGCCCATTCCGGCGGATACATTTTCAAAT
ATACCATAATTCAACATAGAAACTCTCTGTTTAGCTTTGGCAATCATATCACTCTCCCCA
GACTCCGTCTCAGTCTCAGCAACTAGCTTCATTGATTTTCTCTCGCAGGTGCCGAGCCAT
TTGGCTTGCATGTACTTTTGTTTTCTCCAAGGTCCCATGTGCATTTTCTTGTCTTTCATG
CACTTTTTCGCCGCCGTGCACAATATTTTTATCAGTGTTCTTAGCCTCTCTGTTTTCCCG
ACGTACACTTCCGGTAATATTCCAACGAGTCGCTTGTACTCATCACTACCCCTCGCCATC
TCGAACTCAGCCCTGAAAGATAGCTCGATCACCACACGCATCTCGACTTTCTTCGGTCCC
GATTGGTCCACGATTTCCAAATATTCATGCTCACCTGCAAGGATCTCATGATTACTTCTC
CACTTGGATTTACAGCTGACGCAATCGTATCCGGCCTCTCGGAGAAGGCGAGACACTTCG
CCGCGTAGACAGCTACGGCAACTGCCGGACACGGGTTTTCGGCAGACACATTTCGTACCC
TTTGATCTCACTTCTTTCAAGGCC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 2 6

CO CL1025Contig1 1126 4 5 U
GGACGTGAGCATTTGGTATATACTATCAAACTAGAGATTTCCGGTGAAATCCAATTTCAA
CAAAACAGGACCAATGTCGATTCCATCCTCTTGTTTTCCGGTGACATATGGCAATCTCGG
CCGTCCAACTGCGTCGTTTCGTTCTGGTCGATTCCCGGAGGAGCGAATTGCAGGAAATGG
GGCCTGGGTTCGCGAAAGAGGAAGAGTATACGCGAAATCAGAGGCGAAAGCTGATGAAGA
AGAAACTCCGTCTAGTGAAAGCACTACGAGCGGCAGCTTCTTGTCTCTTCTCTGTCCCTT
GCTTAAACTCTTCTCTGGTGGTGACCCTTCTCAGCAACGGAATCATGCTCTTGAGGTCGC
GACTTCTTCTTTAGCATCTATTGCAAGACTTCCATGGGGATCTCGAGTAGCATCCATGAG
TAGTAAAGATGTTTCTTCTACTCCACCTTTGCGATTGCAGCTTTTTGAATTTGAGGCATG
TCCCTTTTGCCGGAGGGTACGCGAAGCTATGACTGAGCTAGACCTCTCTGTAGAAGTTTA
TCCTTGTCCCAAAGGATCTGTAAGACACAGGGAAATGGTTAGAAGATCCGGTGGAAAAGA
GATGTTTCCCTTCCTCATTGACCCCAATACTGATACTTCAATGTACGAGAGTGGTGACAT
CGTTAAGTACCTATATAATCAATATGGTAATGGAAGAGGCCCTTCCACAGGACTTCTGGA
AAGCACCTTGTTCACAGGATGGATGCCAACACTTCTCCGAGCTGGTAGAGGCATGTCATT
ATGGGACAAGGCTTCATCAGATTCACCACCTGAAATGCTCCAGCTCTTCTCTTACGAAAA
CAACTCGTATGCACGGTTGGTGCGTGAAGCACTGTGTGAGTTAGAGCTCCCTTATGTATT
ACACAACATTGGAGAAGGGTCCACACGGATGAGATCACTTCTAAATGTTTCGGGATCCGA
TAAGGTACCATTCTTGGTTGATCCAAACACTGGTGTCCAGTTAGGTGATTACCAGAAGAT
TCTGTCTTACCTCTTCAAGACTTATTCTTCAGCAGCATCTGTATAGTTCATAATCTGACA
TATACACCATTATCCTCAACTTGACAACAGCAAGGATCATGATGCA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H034TF U 1
AF RR2A658TF U 1
AF RR2BD24TF U 1
AF RR2HA25TF U 547
BS 1 782 RR2A658TF
BS 783 790 RR2BD24TF
BS 791 791 RR2HA25TF
BS 792 842 RR2BD24TF
BS 843 1126 RR2HA25TF

RD RR2H034TF 704 0 0
GGACGTGAGCATTTGGTATATACTATCAAACTAGAGATTTCCGGTGAAATCCAATTTCAA
CAAAACAGGACCAATGTCGATTCCATCCTCTTGTTTTCCGGTGACATATGGCAATCTCGG
CCGTCCAACTGCGTCGTTTCGTTCTGGTCGATTCCCGGAGGAGCGAATTGCAGGAAATGG
GGTCTGGGTTCGCGAAAGAGGAAGAGTATACGCGAAATCAGAGGCGAAAGCTGATGAAGA
AGAAACTCCGTCTATTGAAAGCACTACGAGCGGCAGCTTCTTGTCTCTTCTCTGTCCCAT
GCTTAAACTCTTCTCTGGTGGTGACCCTTCTCAGCAACGGAATCATGCTCTTGAGGTCGC
GACTTCTTCTTTAGCATCTATTGCAAGACTTCCATGGGGATCTCGAGTAGCATCCATGAG
TAGTAAAGATGTTTCTTCTACTCCACCTTTGCGATTGCAGCTTTTTGAAGTTGAGGCATG
TCCCTTTTGCCGGAGGGTACGCGAAGCCATGACTGAGCTAGACCTCTCTGTAGAAGTTTA
TCCTTGTCCTAAAGGATCTGTAAGACACAGGGAAATGGTTAGAAGGTCCGGTGGAAAAGA
GATGTTTCCCTTCCTCATTGACCCCAATACTGATACTTCA*TGTACGAGAGTGGTGACAT
CGTTAAGTACCTATATAATCAATATGGTAATGGAAGAG
CCCTTC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2A658TF 782 0 0
GGACGTGAGCATTTGGTATATACTATCAAACTAGAGATTTCCGGTGAAATCCAATTTCAA
CAAAACAGGACCAATGTCGATTCCATCCTCTTGTTTTCCGGTGACATATGGCAATCTCGG
CCGTCCAACTGCGTCGTTTCGTTCTGGTCGATTCCCGGAGGAGCGAATTGCAGGAAATGG
GGCCTGGGTTCGCGAAAGAGGAAGAGTATACGCGAAATCAGAGGCGAAAGCTGATGAAGA
AGAAACTCCGTCTAGTGAAAGCACTACGAGCGGCAGCTTCTTGTCTCTTCTCTGTCCCTT
GCTTAAACTCTTCTCTGGTGGTGACCCTTCTCAGCAACGGAATCATGCTCTTGAGGTCGC
GACTTCTTCTTTAGCATCTATTGCAAGACTTCCATGGGGATCTCGAGTAGCATCCATGAG
TAGTAAAGATGTTTCTTCTACTCCACCTTTGCGATTGCAGCTTTTTGAATTTGAGGCATG
TCCCTTTTGCCGGAGGGTACGCGAAGCTATGACTGAGCTAGACCTCTCTGTAGAAGTTTA
TCCTTGTCCCAAAGGATCTGTAAGACACAGGGAAATGGTTAGAAGATCCGGTGGAAAAGA
GATGTTTCCCTTCCTCATTGACCCCAATACTGATACTTCAATGTACGAGAGTGGTGACAT
CGTTAAGTACCTATATAATCAATATGGTAATGGAAGAGGCCCTTCCACAGGACTTCTGGA
AAGCACCTTGTTCACAGGATGGATGCCAACACTTCTCCGAGCTGGTAGAGGCATGTCATT
AT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2BD24TF 850 0 0
GGACGTGAGCATTTGGTATATACTATCAAACTAGAGATTTCCGGTGAAATCCAATTTCAA
CAAAACAGGACCAATGTCGATTCCATCCTCTTGTTTTCCGGTGACATATGGCAATCTCGG
CCGTCCAACTGCGTCGTTTCGTTCTGGTCGATTCCCGGAGGAGCGAATTGCAGGAAATGG
GGCCTGGGTTCGCGAAAGAGGAAGAGTATACGCGAAATCAGAGGCGAAAGCTGATGAAGA
AGAAACTCCGTCTAGTGAAAGCACTACGAGCGGCAGCTTCTTGTCTCTTCTCTGTCCCTT
GCTTAAACTCTTCTCTGGTGGTGACCCTTCTCAGCAACGGAATCATGCTCTTGAGGTCGC
GACTTCTTCTTTAGCATCTATTGCAAGACTTCCATGGGGATCTCGAGTAGCATCCATGAG
TAGTAAAGATGTTTCTTCTACTCCACCTTTGCGATTGCAGCTTTTTGAATTTGAGGCATG
TCCCTTTTGCCGGAGGGTACGCGAAGCTATGACTGAGCTAGACCTCTCTGTAGAAGTTTA
TCCTTGTCCCAAAGGATCTGTAAGACACAGGGAAATGGTTAGAAGATCCGGTGGAAAAGA
GATGTTTCCCTTCCTCATTGACCCCAATACTGATACTTCAATGTACGAGAGTGGTGACAT
CGTTAAGTACCTATATAATCAATATGGTAATGGAAGAGGCCCTTCCACAGGACTTCTGGA
AAGCACCTTGTTCACAGGATGGATGCCAACACTTCTCCGAGCTGGTAGAGGCATGTCATT
ATGGGACAAG*CTTCATCAGATTCACCACCTGAAATGCTCCAGCTCTTCTCTTACGAAAA
CA
CTCGTATG

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR2HA25TF 580 0 0
GCCT
AAAGGATCTGTAAGACACAGGGAAATGGTTAGAAGATCCGGTGGAAAAGAGATGTTTCCC
TTCCTCATTGACCCCAATACTGATACTTCAATGTACGAGAGTGGTGACATCGTTAAGTAC
CTATATAATCAATATGGTAATGGAAGAGGCCCTTCCACAGGACTTCTGGAAAGCACCTTG
TTCACAGGATGGATGCCAACACTTCTCCGAGCTGGTAGAGGCATGTCATTATGGGACAAG
GCTTCATCAGATTCACCACCTGAAATGCTCCAGCTCTTCTCTTACGAAAACAACTCGTAT
GCACGGTTGGTGCGTGAAGCACTGTGTGAGTTAGAGCTCCCTTATGTATTACACAACATT
GGAGAAGGGTCCACACGGATGAGATCACTTCTAAATGTTTCGGGATCCGATAAGGTACCA
TTCTTGGTTGATCCAAACACTGGTGTCCAGTTAGGTGATTACCAGAAGATTCTGTCTTAC
CTCTTCAAGACTTATTCTTCAGCAGCATCTGTATAGTTCATAATCTGACATATACACCAT
TATCCTCAACTTGACAACAGCAAGGATCATGATGCA

QA 5 580 5 580
DS 



CO CL1025Contig2 592 2 3 U
ACGGTTTAATTCTAGGTATATAATTTTTTTTTCTGAAGAAGTTCTAGGTATATAATATCC
TAATCCATTTGCCCAAAAAAAAAAAAAAAATCCTAATCCTAGTGAGGCTTTTTGATAGTC
ATTATTGAGGAGGCTTTTGTTATCAAACTGATGCTTGAAAAAAAAAAATCTGATCACCAA
ACACAAAACAAAACCGGTGTTTAGTCTTGATATACAATATTTACCACTATTGGTACTATT
ATATATATTATCAAAAATACTTAAATAAAAAAAGGACCTCTCTGTAACCATGCATCATGA
TCCTTGCTGTTGTCAAGTTGAGGATAATGGTGTATATGTCAAATTATGAACTATACAAAT
GCTGCTGAAAAATAAGTCTTGAAAAGGTAAAACAAAATCTTCTGGTAATCACCTAACTGG
ACACCAGTGTTTGGATCAACCAAAAATGGTACCTTATCGGATCCCGAAACATTTAAAAGT
GATCTCATCCGTGTGGACCCTTCTCCAATGTTGTGTAATACATAAGGGAGCTCTAACTCA
CACAGTGCTTCACGCACCAACCGTGCATACAAGTTGTTTTCGTAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H034JQ U 1
AF RR2HA25JQ U 161
BS 1 375 RR2H034JQ
BS 376 376 RR2HA25JQ
BS 377 592 RR2H034JQ

RD RR2H034JQ 592 0 0
ACGGTTTAATTCTAGGTATATAATTTTTTTTTCTGAAGAAGTTCTAGGTATATAATATCC
TAATCCATTTGCCCAAAAAAAAAAAAAAAATCCTAATCCTAGTGAGGCTTTTTGATAGTC
ATTATTGAGGAGGCTTTTGTTATCAAACTGATGCTTGAAAAAAAAAAATCTGATCACCAA
ACACAAAACAAAACCGGTGTTTAGTCTTGATATACAATATTTACCACTATTGGTACTATT
ATATATATTATCAAAAATACTTAAATAAAAAAAGGACCTCTCTGTAACCATGCATCATGA
TCCTTGCTGTTGTCAAGTTGAGGATAATGGTGTATATGTCAAATTATGAACTATACAAAT
GCTGCTGAAAAATAATTCTTGAAAAGGTAAAACAAAATCTTCTGGTAATCACCTAACTGG
ACACCAGTGTTTGGATCAACCAAAAATGGTACCTTATCGGATCCCGAAACATTTAAAAGT
GATCTCATCCGTGTGGACCCTTCTCCAATGTTGTGTAATACATAAGGGAGCTCTAACTCA
CACAGTGCTTCACGCACCAACCGTGCATACAAGTTGTTTTCGTAAAAAAAAA

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2HA25JQ 429 0 0
GAGAAG
AATCTGATCACCAAACACAAAACAAGACCGGTGTTTAGTCTTGATATACAATATTTACCA
CTATTGGTACTATTATATATATTATCAAAGATACTTAAATAAAAAAAGGACCTCTCTGTA
ACCATGCATCATGATCCTTGCTGTTGTCAAGTTGAGGATAATGGTGTATATGTCAGATTA
TGAACTATACAGATGCTGCTGAAGAATAAGTCTTGAAGAGGTAAGACAGAATCTTCTGGT
AATCACCTAACTGGACACCAGTGTTTGGATCAACCAAGAATGGTACCTTATCGGATCCCG
AAACATTTAGAAGTGATCTCATCCGTGTGGACCCTTCTCCAATGTTGTGTAATACATAAG
GGAGCTCTAACTCACACAGTGCTTCACGCACCAACCGTGCATACGAGTTGTTTTCGTAA
GAGA

QA 7 425 7 425
DS 



AS 1 7

CO CL1026Contig1 1344 7 17 U
GGATCTCATCGAACAAAAAACAAAAAAAAATTATCGGCGACGATCCGGTAAGCGTCGAAA
CTAAATTCGCCGGCGGAGATCGTTCTGGTACCGGAGAGATTACGAATCTTTTTGATTTCC
CACACCAAAAGCCCTAGAAAATGGCTGTTCATAAGGCATCGATTACTATTATTGCCCTAA
TCTGGACTTTCATTACAGTCGCTTCGTCTGCTCCTTTCATAGTTCTACATGGAATTGGGG
ATAAATGCAGTAATTCAGGAGTGAAACATTTCACAGAGCTATTAAGTGATTGGTCTTCTT
CTCAAGGCTATTGCTTGGAGATTGGGAGTGGCTCATGGGACTCATGGACCATGCCTCTTC
TTGATCAGACGGCTGTTGTTTGTGAGAAGGTGAAAAGTATGCCTGAGCTGAGTGATGGTT
ACAGCATCGTGGGGCTTTCTCAGGGTAACATGATTGGTCGAGCTCTCATTGAGTTCTGCG
ATGATGCACCACCTGTTAAGAGTTTTGTATCGATAGGGGGACCTCATGCTGGCACTGCAT
CCATTCCTTTCTGTGGTGTTACCTGGATTTGTATCATGTTGGACAGTATGATCAAAACAG
AGATCTATAGCGACTATATGCAGGAACATTTGGCTCCTAGCGGTTTTCTCAAAATCCCTA
CTGACATTGCTGGTTACATGGAAGG*TTGTAGGTTTCTCCCAAAGCTAAACAACGAGCTT
CCAGTTAAAAACTCGACTTATAAAGAGAGGTTCTCAAGCTTGGAGAATCTTGTACTTATT
ATGTTTGACCATGACACGATACTGATACCTAAAGAGACCTCATGGTTTGGATATTATCCT
GATGGGTCTTTTAAGACCATTCTTCCACCACAAGAGACCAAGCTCTATACCGAGGACTGG
ATCGGTTTGAGAGCTCTAGACGAAGCTGGAAAGGTCAAATTCGTTAACGTCTCTGGAAAC
CATCTTCAGATATTTCATGAAGACATGAAGAAGCATATAGTGCCATACCTTTTTGACAAA
TCATCATCATC***TATAATAACAACGGCAGTTTTTCAGCTTCCTAGTGTAGGAAACTCC
GTTTTGAACCTGATCGGTCCAGAGGTGGATCAGCTTCAGCTTGTGCTGCGTCATGTCTCA
ACCTGATTGTGTTGTTGTTTGTATTCTTACTAAACATACTCGTCACTCTGCGTGAATCCG
ATTGTGTTGTTGTTATTATTACAGAAAATCTCAGGAGATAAAATAAACATACTAAGTCCA
CAGATGTATTATATCACAACATCTGGATCAAATCATATTACATCAATAATACAAGTAATA
AAGCAATGGGGGAGTTTGTCCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI14TF U 445
AF RR2B432TF U 1
AF RR2EU02TF U 1
AF RR2AQ34TF U 6
AF RR2BI14JQ C 560
AF RR2AQ34JQ C 498
AF RR2EU02JQ C 755
BS 1 147 RR2B432TF
BS 148 148 RR2EU02TF
BS 149 208 RR2B432TF
BS 209 209 RR2EU02TF
BS 210 216 RR2B432TF
BS 217 217 RR2EU02TF
BS 218 812 RR2B432TF
BS 813 813 RR2AQ34TF
BS 814 840 RR2B432TF
BS 841 973 RR2AQ34JQ
BS 974 974 RR2BI14JQ
BS 975 1012 RR2AQ34JQ
BS 1013 1013 RR2BI14JQ
BS 1014 1299 RR2AQ34JQ
BS 1300 1300 RR2EU02JQ
BS 1301 1324 RR2AQ34JQ
BS 1325 1344 RR2EU02JQ

RD RR2BI14TF 233 0 0
GTAACATGATCGGTCGAGCTCTCATTGAGTTCTGCGATGATGCACCACCTGTTAAGAGTT
TTGTATCGATAGGGGGACCTCATGCTGGCACTGCATCCATTCCTTTCTGTGGTGTTACCC
GGATTTGTATCATGTTGGACAGTATGATCAAAACAGAGATCTATAGCGACTATATGCAGG
AACATTTGGCTCCTAGCGGTTTTCTCAAAATCCCTACTGACATTGCTGGTTAC

QA 1 233 1 233
DS 

RD RR2B432TF 840 0 0
GGATCTCATCGAACAAAAAACAAAAAAAAATTATCGGCGACGATCCGGTAAGCGTCGAAA
CTAAATTCGCCGGCGGAGATCGTTCTGGTACCGGAGAGATTACGAATCTTTTTGATTTCC
CACACCAAAAGCCCTAGAAAATGGCTGGTCATAAGGCATCGATTACTATTATTGCCCTAA
TCTGGACTTTCATTACAGTCGCTTCGTCCGCTCCTT*CATAGTTCTACATGGAATTGGGG
ATAAATGCAGTAATTCAGGAGTGAAACATTTCACAGAGCTATTAAGTGATTGGTCTTCTT
CTCAAGGCTATTGCTTGGAGATTGGGAGTGGCTCATGGGACTCATGGACCATGCCTCTTC
TTGATCAGACGGCTGTTGTTTGTGAGAAGGTGAAAAGTATGCCTGAGCTGAGTGATGGTT
ACAGCATCGTGGGGCTTTCTCAGGGTAACATGATTGGTCGAGCTCTCATTGAGTTCTGCG
ATGATGCACCACCTGTTAAGAGTTTTGTATCGATAGGGGGACCTCATGCTGGCACTGCAT
CCATTCCTTTCTGTGGTGTTACCTGGATTTGTATCATGTTGGACAGTATGATCAAAACAG
AGATCTATAGCGACTATATGCAGGAACATTTGGCTCCTAGCGGTTTTCTCAAAATCCCTA
CTGACATTGCTGGTTACATGGAAGG*TTGTAGGTTTCTCCCAAAGCTAAACAACGAGCTT
CCAGTTAAAAACTCGACTTATAAAGAGAGGTTCTCAAGCTTGGAGAATCTTGTACTTATT
ATGTTTGACCATGACACGATACTGATACCTAA*GAGACCTCATGGTTTGGATATTATCCT

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2EU02TF 786 0 0
GGATCTC
ATCGAACAAAAAACAAAAAAAAAT*ATCGGCGACGATCCGGTAAGCGTCGAAACTAAATT
CGCCGGCGGAGATCGTTCTGGTACCGGAGAGATTACGAATCTTTTTGATTTCCCACACCA
AAAGCCCTAGAAAATGGCTGTTCATAAGGCATCGATTACTATTATTGCCCTAATCTGGAC
TTTCATTACAGTCGCTTCGTCTGCTCCTTTCATAGTTCTACATGGAATTGGGGATAAATG
CAGTAATTCAGGAGTGAAACATTTCACAGAGCTATTAAGTGATTGGTCTTCTTCTCAAGG
CTATTGCTTGGAGATTGGGAGCGGCTCATGGGACTCATGGACCATGCCTCTTCTTGATCA
GACGGCTGTTGTTTGTGAGAAGGTGAAAAGTATGCCTGAGCTGAGTGATGGTTACAGCAT
CGTGGGGCTTTCTCAGGGTAACATGATTGGTCGAGCTCTCATTGAGTTCTGCGATGATGC
ACCACCTGTTAAGAGTTTTGTATCGATAGGGGGACCTCATGCTGGCACTGCATCCATTCC
TTTCTGTGGTGTTACCTGGATTTGTATCATGTTGGACAGTATGATCAAAACAGAGATCTA
TAGCGACTATATGCAGGAACATTTGGCTCCTAGCGGTTTTCTCAAAATCCCTACTGACAT
TGCTGGTTACATGGAAAG*TTGTAG*TTTCTCCCAAAGCTAAACAACGAGCTTCCAGTTA
AAA*CTCGACTTATAAAGAGAGGT*CTCAAGCTTGGAGA*TCTTGTACTTATTATGTTT

QA 8 786 8 786
DS 

RD RR2AQ34TF 823 0 0
GG
ATCGAACAAAAAACAAAAAAAA*TTATCGGCGACGATCCGGTAAGCGTCGAAACTAAATT
CGCCGGCGGAGATCGTTCTGGTACCGGAGAGATTACGAATCTTTTTGATTTCCCACACCA
AAAGCCCTAGAAAATGGCTGTTCATAAGGCATCGATTACTATTATTGCCCTAATCTGGAC
TTTCATTACAGTCGCTTCGTCTGCTCCTTTCATAGTTCTACATGGAATTGGGGATAAATG
CAGTAATTCAGGAGTGAAACATTTCACAGAGCTATTAAGTGATTGGTCTTCTTCTCAAGG
CTATTGCTTGGAGATTGGGAGTGGCTCATGGGACTCATGGACCATGCCTCTTCTTGATCA
GACGGCTGTTGTGTGTGAGAAGGTGAAAAGTATGCCTGAGCTGAGTGATGGTTACAGCAT
CGTGGGGCTTTCTCAGGGTAACATGATTGGTCGAGCTCTCATTGAGTTCTGCGATGATGC
ACCACCTGTTAAGAGTTTTGTATCGATAGGGGGACCTCATGCTGGCACTGCATCCATTCC
TTTCTGTGGTGTTACCTGGATTTGTATCATGTTGGACAGTATGATCAAAACAGAGATCTA
TAGCGACTATATGCAGGAACATTTGGCTCCTAGCGGTTTTCTCAAAATCCCTACTGACAT
TGCTGGTTACATGGAAAGGTTGTAG*TTTCTCCCAAAGCTAAACAACGAGCTTCCAGTTA
AAA*CTCGACTTATAAAGAGAGGTTCTCAAGCTTGGAGAATCTTGTACTTATTATGTTTG
ACCATGACACGATACTGATACCTAAAGAGACCTCATGGTTT

QA 3 823 3 823
DS 

RD RR2BI14JQ 562 0 0
TACCCGGATTTGTATCATGTTGGACAGTATGATCAAAACAGAGATCTATAGCGACTATAT
GCAGGAACATTTGGCTCCTAGCGGTTTTCTCAAAATCCCTACTGACATTGCTGGTTACAT
GGAAGG*TTGTAGGTTTCTCCCAAAGCTAAACAACGAGCTTCCAGTTAAAGACTCGACTT
ATAAAGAGGGGTTCTCAAGCTTGGAGAATCTTGTACTTATTATGTTTGACCATGACACGA
TACTGATACCTAAAGAGACCTCATGGTTTGGATATTATCCTGATGGGTCTTTTAAGACCA
TTCTTCCACCACAAGAGACCAAGCTCTATACCGAGGACTGGATCGGTTTGAGAGCTCTAG
ACGAAGCTGGAAAGGTCAAATTCGTTAACGTCTCTGGAAACCATCTTCAGATATTTCATG
AAGACATGAAGAAGCATATAGTGCCATACCTCTTTGACAAATCATCATCATC***TATAA
TAACAACGGCAGTTTTTCAGCTTCCTAGTGTAGGAAACTCCGTTTTGAACCTGATCGGTC
CAGAGGTGGATCAGCTTCAGCT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2AQ34JQ 827 0 0
AAGAGTTTTGTATCGATAGGGGGACCTCATGCTGGCACTGCATCCATTCCTTTCTGTGGT
GTTACCTGGATTTGTATCATGTTGGACAGTATGATCAAAACAGAGATCTATAGCGACTAT
ATGCAGGAACATTTGGCTCCTAGCGGTTTTCTCAAAATCCCTACTGACATTGCTGGTTAC
ATGGAAGG*TTGTAGGTTTCTCCCAAAGCTAAACAACGAGCTTCCAGTTAAAAACTCGAC
TTATAAAGAGAGGTTCTCAAGCTTGGAGAATCTTGTACTTATTATGTTTGACCATGACAC
GATACTGATACCTAAAGAGACCTCATGGTTTGGATATTATCCTGATGGGTCTTTTAAGAC
CATTCTTCCACCACAAGAGACCAAGCTCTATACCGAGGACTGGATCGGTTTGAGAGCTCT
AGACGAAGCTGGAAAGGTCAAATTCGTTAACGTCTCTGGAAACCATCTTCAGATATCTCA
TGAAGACATGAAGAAGCATATAGTGCCATACCTTTCTGACAAATCATCATCATC***TAT
AATAACAACGGCAGTTTTTCAGCTTCCTAGTGTAGGAAACTCCGTTTTGAACCTGATCGG
TCCAGAGGTGGATCAGCTTCAGCTTGTGCTGCGTCATGTCTCAACCTGATTGTGTTGTTG
TTTGTATTCTTACTAAACATACTCGTCACTCTGCGTGAATCCGATTGTGTTGTTGTTATT
ATTACAGAAAATCTCAGGAGATAAAATAAACATACTAAGTCCACAGATGTATTATATCAC
AACATCTGGATCAAATCATATT*CATCAATAATACAAGTAATAAAGC

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2EU02JQ 590 0 0
CAAGCTTGGAGAATCTTGTACTTATTATGTTTGACCATGACACGATACTGATACCTAAAG
AGACCTCATGGTTTGGATATTATCCTGATGGGTCTTTTAAGACCATTCTTCCACCACAAG
AGACCAAGCTTTATACCGAGGACTGGATCGGTTTGAGAGCTCTAGACGAAACTGGAAAGG
TCAAATTCGTTGACGTTTCTGGAAACCATTTTCAGATATTTCATGAAGACATGAAGAAGC
ATATAGTGCCATACCTTTTTGACAAATCATCATCATCATCTATAATAACAACGGCAGTTT
TTCAGCTTCCTAGTGTAAGAAACTCCGTTTTGAACCTGATCGGTCCGGAGGTGGATCAGC
TTCAGCTTGTGCTGCGTCATGTCTCAACCTGATTGTGTTGTTGTTTGTATTCTTACTAAA
CATACTCGTCATTTTGCGTGAATCCGATTGTGTTGTTGTTATTATTACAGAAAATCTCAG
GAGATAAAATAAACATACTAAGTCCACAGATGTATTATATCACAACATTTGGATCAAATC
ATATTACATCAATAATACAAGTAATGAAGCAATGGGGGAGTTTGTCCCCT

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 7

CO CL1027Contig1 1169 7 13 U
GGGCACCGAGCCAGCCGTAAGGACTCTGTTCTCTCTCGCTAGAGCCAAACCCTAGACACA
TCCACCAATCCACCGAGAGCAGAGATGCTGCGAGTAGCAGGGAGAAAGCTTTTCTCTGTT
TCGCAGAGATCTGCCAATGCGACCTCCTTCGTCCTCTCCCGAGACCATACCCTCTACGAT
GGCGGCGGCGACTCCTCCCTCCCCTCTGCAGATCTTTCACGTTTCGATTCTTACCACCGT
AGTAGCCTTGTCAGAGGTTTCTCTTCTCAAGTCCTTACTCAAGGAGGAAACGAGATAGGT
TTTGGTTCGGAACCAGCCACCGTGGAGGCGGTCAAGACACCTAACTCAAAGATTGTCTAC
GACGACCATAACCATGAGCGTTACCCACCTGGTGACCCTAGCAAGCGTGCGTTCGCTTAC
TTCGTCTTATCAGGCGGGAGGTTTGTGTACGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTTGTTCTGAAG
CTCATTGTCAGCATGTCAGCAAGTAAAGACGTCCTTGCACTTGCATCCCTCGAGGTTGAC
CTCGGGAGCATCGAACCGGGAACCACTGTGACGGTGAAGTGGCGTGGGAAGCCCGTCTTC
ATCAGGAGAAGAACAGAGGATGATATCAAGCTGGCTAATAGCGTGGATCTTGGATCTCTG
AGGGATCCGCAGGAAGACTCGGTCAGGGTCAAGAACCCGGAGTGGTTAGTGGTTGTTGGA
GTCTGCACTCACCTGGGGTGCATTCCTTTACCGAATGCTGGTGATTACGGTGGTTGGTTT
TGTCCGTGTCACGGTTCGCATTATGACATCTCTGGAAGGATTAGGAAAGGTCCTGCACCG
TATAACCTGGAGGTACCAACCTACAGCTTCTTAGAAGAGAATAAGTTACTCATTGGTTGA
TGATGACGAATAAAAGCAAGACAACAGACTGTCTCTGTGTCTCAAAGATTCTCATCTGTT
TTATTTTTATTTTTAAAATACTCTGGCAATTTAGAGCAAGATTGTCTTGGTTTTTGCTGA
ATAATAAAAACTTGTTTACATTTATGGAACGTATACTGGAGCTCTGTTTTTTCCATCCTT
GGTGAAAGAGTCTGTTCATAATCTGTTTTTATTGTACAAGACAGATCCGTTGGTATCTGT
TAAATTCTATGTACAACAAGGAGTTCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 5 25 25 25 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX01TF U 321
AF RR2H858TF U 1
AF RR2AP55TF U 26
AF RR2DI95TF U 346
AF RR2AP55JQ C 251
AF RR2DX01JQ C 477
AF RR2H858JQ C 457
BS 1 107 RR2H858TF
BS 108 108 RR2AP55TF
BS 109 603 RR2H858TF
BS 604 610 RR2AP55TF
BS 611 611 RR2DI95TF
BS 612 671 RR2AP55TF
BS 672 672 RR2DI95TF
BS 673 766 RR2AP55TF
BS 767 885 RR2DI95TF
BS 886 886 RR2AP55JQ
BS 887 904 RR2DI95TF
BS 905 1043 RR2AP55JQ
BS 1044 1169 RR2H858JQ

RD RR2DX01TF 148 0 0
CGTGGAGGCGGTCAAGACACCTAACTCAAAGATTGTCTACGACGACCATAACCATGAGCG
TTACCCACCTGGTGACCCTAGCAAGCGTGCGTTCGCTTACTTCGTCTTATCAGGCGGGAG
GTTTGTGTACGCCTCTGTTCTCCGCCTT

QA 1 148 1 148
DS 

RD RR2H858TF 603 0 0
GGGCACCGAGCCAGCCGTAAGGACTCTGTTCTCTCTCGCTAGAGCCAAACCCTAGACACA
TCCACCAATCCACCGAGAGCAGAGATGCTGCGAGTAGCAGGGAGAAATCTTTTCTCTGTT
TCGCAGAGATCTGCCAATGCGACCTCCTTCGTCCTCTCCCGAGACCATACCCTCTACGAT
GGCGGCGGCGACTCCTCCCTCCCCTCTGCAGATCTTTCACGTTTCGATTCTTACCACCGT
AGTAGCCTTGTCAGAGGTTTCTCTTCTCAAGTCCTTACTCAAGGAGGAAACGAGATAGGT
TTTGGTTCGGAACCAGCCACCGTGGAGGCGGTCAAGACACCTAACTCAAAGATTGTCTAC
GACGACCATAACCATGAGCGTTACCCACCTGGTGACCCTAGCAAGCGTGCGTTCGCTTAC
TTCGTCTTATCAGGCGGGAGGTTTGTGTACGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTTGTTCTGAAG
CTCATTGTCAGCATGTCAGCAAGTAAAGACGTCCTTGCACTTGCATCCCTCGAGGTTGAC
CTCGGGAGCATCGAACCGGGAACCACTGTGACGGTGAAGTGGCGTGGGAAGCCCGTCTTC
ATC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2AP55TF 741 0 0
GG
GTTCTCTCTCGCTAGAGCCAAACCCTAGACACATCCACCAATCCACCGAGAGCAGAGATG
CTGCGAGTAGCAGGGAGAAAGCTTTTCTCTGTTTCGCAGAGATCTGCCAATGCGACCTCC
TTCGTCCTCTCCCGAGACCATACCCTCTACGATGGCGGCGGCGACTCCTCTCTCCCCTCT
GCAGATCTTTCACGTTTCGATTCTTACCACCGTAGTAGCCTTGTCAGAGGTTTCTCTTCT
CAAGTCCTTACTCAAGGAGGAAACGAGATAGGTTTTGGTTCGGAACCAGCCACCGTGGAG
GCGGTCAAGACACCTAACTCAAAGATTGTCTACGACGACCATAACCATGAGCGTTACCCA
CCTGGTGACCCTAGCAAGCGTGCGTTCGCTTACTTCGTCTTATCAGGCGGGAGGTTTGTG
TACGCC*CTGTTCTCCGCCTTCTTGTTCCGAAGCTCATTGTCAGCATGTCAGCAAGTAAA
GACGTCCTTGCACTTGCATCCCTCGAGGTTGACCTCGGGAGCATCGAACCGGGAACCACT
GTGACGGTGAAGTGGCGTGGGAAGCCCGTCTTCATCAGGAGAATAACAGAGGATGATATC
AAGCTGGCTAATAGCGTGGATCTTGGATCTCTGAGGGATCCGCACGAAGACTCGGTCAGG
GTCAAGAACCCGGAGTGGTTAGTGGTTGTTGGAGTCTGCACTCACCTGGGGTGCATTCCT
TTACCGAATGCTGGTGATT

QA 3 741 3 741
DS 

RD RR2DI95TF 559 0 0
G
CAAAGATTGTCTACGACGACCATAACCATGAGCGTTACCCACCTGGTGACCCTAGCAAGC
GTGCGTTCGCTTACTTCGTCTTATCAGGCGGGAGGTTTGTGTACGCCTCTGTTCTCCGCC
TTCTTGTTCTT***CTCATTGTCAGCATGTCAGCAAGTAAAGACGTCCTTGCACTTGCAT
CCCTCGAGGTTGACCTCGGGAGCATCGAACCGGGAACCACTGTGACGGTGAAGTGGCGTG
GGAAGCCCGTCTTCATCAGGAGAAGAACAGAGGATGATATCAAGCTGGCTAATAGCGTGG
ATCTTGGATCTCTGAGGGATCCGCAGGAAGACTCGGTCAGGGTCAAGAACCCGGAGTGGT
TAGTGGTTGTTGGAGTCTGCACTCACCTGGGGTGCATTCCTTTACCGAATGCTGGTGATT
ACGGTGGTTGGTTTTGTCCGTGTCACGGTTCGCATTATGACATCTCTGGAAGGATTAGGA
AAGGTCCTGCACCGTATAACCTGGAGGTACCAACCTACAGCTTCTTAGAAGAGAATAAGC
TACTCATTGGTTGATGAT

QA 2 559 2 559
DS 

RD RR2AP55JQ 793 0 0
TCAGAGGTTTCTCTTCTCAAGTCCTTACTCAAGGAGGAAACGAGATAGGTTTTGGTTCGG
AACCAGCCACCGTGGAGGCGGTCAAGACACCTAACTCAAAGATTGTCTACGACGACCATA
ACCATGAGCGTTACCCACCTGGTGACCCTAGCAAGCGTGCGTTCGCTTACTTCGTCTTAT
CAGGCGGGAGGTTTGTGTACGCC*CTGTTCTCCGCCTTCTTGTTCCGAAGCTCATTGTCA
GCATGTCAGCAAGTAAAGACGTCCTTGCACTTGCATCCCTCGAGGTTGACCTCGGGAGCA
TCGAACCGGGAACCACTGTGACGGTGAAGTGGCGTGGGAAGCCCGTCTTCATCAGGAGAA
TAACAGAGGATGATATCAAGCTGGCTAATAGCGTGGATCTTGGATCTCTGAGGGATCCGC
AGGAAGACTCGGTCAGGGTCAAGAACCCGGAGTGGTTAGTGGTTGTTGGAGTCTGCACTC
ACCTGGGGTGCATTCCTTTACCGAATGCTGGTGATTACGGTGGTTGGTTTTGTCCGTGTC
ACGGTTCGCATTATTACATCTCTGGAAGGATTAGGAAAGGTCCTGCACCGTATAACCTGG
AGGTACCAACCTACAGCTTCTTAGAAGAGAATAAGTTACTCATTGGTTGATGATGACGAA
TAAAAGCAAGACAACAGACTGTCTCTGTGTCTCAAAGATTCTCATCTGTTTTATTTTTAT
TTTTAAAATACTCTGGCAATTTAGAGCAAGATTGTCTTGGTTTTTGCTGAATAATAAAAA
CTTGTTTACATTT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2DX01JQ 598 0 0
GAAGCTCATTGTCAGCATGTCAGCAAGTAAAGACGTCCTTGCACTTGCATCCCTCGAGGT
TGACCTCGGGAGCATCGAACCGGGAACCACTGTGACGGTGAAGTGGCGTGGGAAGCCCGT
CTTCATCAGGAGAAGAACAGAGGATGATATCAAGCTGGCTAATAGCGTGGATCTTGGATC
TCTGAGGGATCCGCAGGAAGACTCGGTCAGGGTCAAGAACCCGGAGTGGTTAGTGGTTGT
TGGAGTCTGCACTCACCTGGGGTGCATTCCTTTACCGAATGCTGGTGATTACGGTGGTTG
GTTTTGTCCGTGTCACGGTTCGCATTATGACATCTCTGGAAGGATTAGGAAAGGTCCTGC
ACCGTATAACCTGGAGGTACCAACCTACAGCTTCTTAGAAGAGAATAAGTTACTCATTGG
TTGATGATGACGAATAAAAGCAAGACAACAGACTGTCTCTGTGTCTCAAAGATTCTCATC
TGTTTTATTTTTATTTTTAAAATACTCTGGCAATTTAGAGCAAGATTGTCTTGGTTTTTG
CTGAATAATAAAAACTTGTTTACATTTATGGAACGTATACTGGAGCTCTGTTTTTTCC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2H858JQ 713 0 0
GTTCTCCGCCTTCTTGTTCTGAAGCTCATTGTCAGCATGTCAGCAAGTAAAGACGTCCTT
GCACTTGCATCCCTCGAGGTTGACCTCGGGAGCATCGAACCGGGAACCACTGTGACGGTG
AAGTGGCGTGGGAAGCCCGTCTTCATCAGGAGAAGAACAGAGGATGATATCAAGCTGGCT
AATAGCGTGGATCTTGGATCTCTGAGGGATCCGCAGGAAGACTCGGTCAGGGTCAAGAAC
CCGGAGTGGTTAGTGGTTGTTGGAGTCTGCACTCACCTGGGGTGCATTCCTTTACCGAAT
GCTGGTGATTACGGTGGTTGGTTTTGTCCGTGTCACGGTTCGCATTATGACATTTCTGGA
AGGATTAGGAAAGGTCCTGCACCGTATAACCTGGAGGTACCAACCTACAGCTTCTTAGAA
GAGAATAAGTTACTCATTGGTTGATGATGACGAATAAAAGCAAGACAACAGACTGTCTCT
GTGTCTCAAAGATTTTCATCTGTTTTATTTTTATTTTTAAAATACTCTGGCAATTTAGAG
CAAGATTGTCTTGGTTTTTGCTGAATAATAAAAACTTGTTTACATTTATGGAACGTATAC
TGGAGCTCTGTTTTTTCCATCCTTGGTGAAAGAGTCTGTTCATAATCTGTTTTTATTGTA
CAAGACAGATCCGTTGGTATCTGTTAAATTCTATGTACAACAAGGAGTTCCAC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 5

CO CL1028Contig1 1019 5 18 U
GGGGAGATAGATAAAAAAAACATAGGGATCGCTTCACCGTTCGCTCCTCACTGTTCTTTC
GTCTTCTCCGGCGATTGTTTCCCTTTCCTCTCGAATTCTCGTCTCCGTTAAGGCTTCCAC
AAGTTAACATCAGAAAGTTAATGCACTAAGTATTGGGGGAAAGAGATGAGCTTTACTCAG
GCTAATTGTTTTAGACCATCCTACCACTCTCCTGTGACGACGAGGATATCTAAAGCTAAT
GGTGTCTCCACCAGTGTACCTATTAGAGCTACGGCTTCAGTTTCTACTCAGTTTTCGCCT
CTGTTAAGTCACAGGCGTAGTGGGAAATGGAAGCAGAGTTCTGCTGTTTGCTTATTTGGT
GGTGGCAAGGATAAGTCCAATGGTGGTGACGAGATATCACCATGGAAAGCAATAGAGAAA
GCTATGGGGAAGAAGTCAGTAGAAGATATGCTGCGGGAGCAGATTCAAAAGAAAGACTTT
TATGATACTGAAAGCGGCGGCGGCAACGTTCCTCCACGTGGAGGAGGAGGCGGTGGTGGT
AACGGTGGAGAGCGTCCTGAAGGGTCAGGAGGAGAAGAAGACGGTGGTGTCGCTGGGATT
GCTGAAGAGACTCTGCAAGTGGTTTTAGCCACCTTAGGCTTCATCTTTTTGTACACTTAC
ATTATCAATGGGG*AGGAGTTGATCAAGCTCGCAAGAGATTACTTTAGGTTTCTTTCGGG
AAAGCCTAAGACTGTTCGGTTGACACGAGCCTTGGATGGTTGGAATAGATTCATGGCGAC
GATGTCGAAGCCCAAAGAGTATGATGAGTACTGGCTAGAGAAGGCGATCATCAACACGCC
TACCTGGTACGACAGTCCCGAGAAGTACAAGCAAGTCCTCAAGGCCTATGTCGACTCAAA
GACTGATGAACAGTTCGATTAAACCCATTGTCAGTTTCACTTTTGTTTACTCAGTACCTG
TTCACAATCGCAATTGAGGTTTTCTTTGGTTTATCGTAAGGCTTTTTTAATAAACGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2H686TF U 1
AF RR2EC02TF U 41
AF RR2CL69TF U 48
AF RR2CL69JQ C 206
AF RR2H686JQB C 406
BS 1 190 RR2H686TF
BS 191 191 RR2EC02TF
BS 192 342 RR2H686TF
BS 343 343 RR2EC02TF
BS 344 465 RR2H686TF
BS 466 568 RR2EC02TF
BS 569 569 RR2CL69TF
BS 570 634 RR2EC02TF
BS 635 673 RR2CL69TF
BS 674 674 RR2CL69JQ
BS 675 708 RR2CL69TF
BS 709 709 RR2CL69JQ
BS 710 740 RR2CL69TF
BS 741 741 RR2CL69JQ
BS 742 788 RR2CL69TF
BS 789 789 RR2CL69JQ
BS 790 818 RR2CL69TF
BS 819 1019 RR2CL69JQ

RD RR2H686TF 465 0 0
GGGGAGATAGATAAAAAAAACATAGGGATCGCTTCACCGTTCGCTCCTCACTGTTCTTTC
GTCTTCTCCGGCGATTGTTTCCCTTTCCTCTCGAATTCTCGTCTCCGTTAAGGCTTCCAC
AAGTTAACATCAGAAAGTTAATGCACTAAGTATTGGGGGAAAGAGATGAGCTTTACTCAG
GCTAATTGTTCTAGACCATCCTACCACTCTCCTGTGACGACGAGGATATCTAAAGCTAAT
GGTGTCTCCACCAGTGTACCTATTAGAGCTACGGCTTCAGTTTCTACTCAGTTTTCGCCT
CTGTTAAGTCACAGGCGTAGTGGGAAATGGAAGCAGAGTTCTACTGTTTGCTTATTTGGT
GGTGGCAAGGATAAGTCCAATGGTGGTGACGAGATATCACCATGGAAAGCAATAGAGAAA
GCTATGGGGAAGAAGTCAGTAGAAGATATGCTGCGGGAGCAGATT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2EC02TF 594 0 0
GGGCTCCTC
ACTGTTCTTTCGTCTTCTCCGGCGATTGTTTCCCTTTCCTCTCGAATTCTCGTCTCCGTT
AAGGCTTCCACAAGTTAACATCAGAAAGTTAATGCACTAAGTATTGGGGGAAAGAGATGA
GCTTTACTCAGGCTAATTGTTTTAGACCATCCTACCACTCTCCTGTGACGACGAGGATAT
CTAAAGCTAATGGTGTCTCCACCAGTGTACCTATTAGAGCTACAGCTTCAGTTTCTACTC
AGTTTTCGCCTCTGTTAAGTCACAGGCGTAGTGGGAAATGGAAGCAGAGTTCTGCTGTTT
GCTTATTTGGTGGTGGCAAGGATAAGTCCAATGGTGGTGACGAGATATCACCATGGAAAG
CAATAGAGAAAGCTATGGGGAAGAAGTCAGTAGAAGATATGCTGCGGGAGCAGATTCAAA
AGAAAGACTTTTATGATACTGAAAGCGGCGGCGGCAACGTTCCTCCACGTGGAGGAGGAG
GCGGTGGTGGTAACGGTGGAGAGCGTCCTGAAGGGTCAGTAGGAGAAGAAGACGGTGGTG
TCGCTGGGATTGCTGAAGAGACTCTGCAAGTGGTTTTAGCCACCT

QA 10 594 10 594
DS 

RD RR2CL69TF 771 0 0
GG
ACTGTTCTTTCGTCTTCTCCGGCGATTGTTTCCCTTTCCTCTCGAATTCTCGTCTCCGTT
AAGGCTTCCACAATTTAATATCAGAAAGTTAATGCACTAAGTATTGGGGGAAAGAGATGA
GCTTTACTCAGGCTAGTTGTTTTAGACCATCCTACCACTCTCCTGTGACGACGAGGATAT
CTAAAGCTAATGGTGTCTCCACCAGTGTACCTATTAGAGCTACGGCTTCAGTTTCTACTC
AGTTTTCGCCTCTGTTAAGTCACAGGCGTAGTGGGAAATGGAAGCAGAGTTCTGCTGTTT
GCTTATTTGGTGGTGGCAAGGATAAGTCCAATGGTGGTGACGAGATATCACCATGGAAAG
CAATAGAGAAAGCTATGGGGAAGAAGTCAGTAGAAGATATGCTGCGGGAGCAGATTCAAA
AGAAAGACTTTTATGATACTGAAAGCGGCGGCGGCAATGTTCCTCCACGTGGAGGAGGAG
GCGGTGGTGGTAACGGTGGAGAGCGTCCTGAAGGGTCAGGAGGAGAAGAAGACGGTGGTG
TCGCTGGGATTGCTGAAGAGACTCTGCAAGTGGTTTTAGCCACCTTAGGCTTCATCTTTT
TGTACACTTACATTATCAATGGGGGAGGAGTTGATCAAGCTCGCAAGAGATTACTTTAG*
TTTCTTTCGGGAAAGCCTAAGACTGTTCGGT*GACACGAGCCTTGGATGGTTGGAATAGA
TTCATGGCGACGATGTCGA*GCCCAAAGAGTATGATGAGTACTGGCTAG

QA 3 771 3 771
DS 

RD RR2CL69JQ 814 0 0
CACTCT
CTGTGACGACGAG*ATATCTAA*GCTAATGGTGTCTCCACCAGTGTACCTATTAGAGCTA
CGGCTTCAGTTTCTACTCAGTTTTCGCCTCTGTTAAGTCACAGGCGTAGTGGGAAATGGA
AGCAGAGTTCTGCTGTTTGCTTATTTGGTGGTGGCAAGGATAAGTCCAATGGTGGTGACG
AGATATCACCATGGAAAGCAATAGAGAAAGCTATGGGGAAGAAGTCAGTAGAAGATATGC
TGCGGGAGCAGATTCAAAAGAAAGACTTTTATGATACTGAAAGCGGCGGCGGCAATGTTC
CTCCACGTGGAGGAGGAGGCGGTGGTGGTAACGGTGGAGAGCGTCCTGAAGGGTCAGGAG
GAGAAGAAGACGGTGGTGTCGCTGGGATTGCTGAAGAGACTCTGCAAGTGGTTTTAGCCA
CCTTAGGCTTCATCTTTTTGTACACTTACATTATCAATGGGG*AGGAGTTGATCAAGCTC
GCAAGAGATTACTTTAGGTTTCTTTCGGGAAAGCCTAAGACTGTTCGGTTGACACGAGCC
TTGGATGGTTGGAATAGATTCATGGCGACGATGTCGAAGCCCAAAGAGTATGATGAGTAC
TGGCTAGAGAAGGCGATCATCAACACGCCTACCTGGTACGACAGTCCCGAGAAGTACAAG
CAAGTCCTCAAGGCCTATGTCGACTCAAAGACTGATGAACAGTTCGATTAAACCCATTGT
CAGTTTCACTTTTGTTTACTCAGTACCTGTTCACAATCGCAATTGAGGTTTTCTTTGGTT
TATCGTAAGGCTTTTTTAATAAACGATT

QA 7 814 7 814
DS 

RD RR2H686JQB 611 0 0
AAAGCAATAGAGAAAGCTATGGGGAAGAAGTCAGTAGAAGATATGCTGCGGGAGCAGATT
CAAAAGAAAGACTTTTATGATACTGAAAGCGGCGGCGGCAACGTTCCTCCACGTGGAGGA
GGAGGCGGTGGTGGTAACGGTGGAGAGCGTCCTGAAGGGTCAGGAGGAGAAGAAGACGGT
GGTGTCGCTGGGATTGCTGAAGAGACTCTGCAAGTGGTTTTAGCCACCTTAGGCTTCATC
TTTTTGTACACTTACATTATCAATGGGG*AGGAGTTGATCAAGCTCGCAAGAGATTACTT
TAGGTTTCTTTCGGGAAAGCCTAAGACTGTTCGGTTGACACGAGCCTTGGATGGTTGGAA
TAGATTCATGGCGACGATGTCGAAGCCCAAAGAGTATGATGAGTACTGGCTAGAGAAGGC
GATCATCAACACGCCTACCTGGTACGACAGTCCCGAGAAGTACAAGCAAGTCCTCAAGGC
TTATGTCGACTCAAAGACTGATGAACAGTTCGATTAAACCCATTGTCAGTTTCACTTTTG
TTTACTCAGTACCTGTTCACAATCGCAATTGAGGTTTTCTTTGGTTTATCGTAAGGCTTT
TTTAATAAACG

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 5

CO CL1029Contig1 1035 5 16 U
AAAAATAGAGGAACATATAAATTTCATTATTTTAATTCAACTTTTGAGGAGAATCACACA
GAAAAAACACAAGTAATGAAGATTACGCAAAGTTTTCAAGCAAATGTTATCTTGGCAAAA
ATAAAAACTGAGCTCTCAACACAGGAAAAGATAAACATGTCCTCTGCTTTTTCACCAAAC
ATATGTTCTATATGAAAAGCCTCTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTCAGCTTAGGG
TCAGGTTTCATCGATTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAGACTTCATCAGGGTTT
TCTTGAACATACTGAAATGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACGCTTCGGCCAATA
CCGAGGTTGTTGATGGTGGAATGTTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCT
CTCAATGCAATGCCCTGATCAGGGATGAGAACTCCAAACGATTTTGAAATGGATTTGGTG
ATATCCGAGACGAGTGGGTAGTTCAGATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGG
ACCCACGCAAGATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAACACTTCCGTGTTTAGC
TTCTCAAATTCTTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTGGGGCAGACAAAAGTG
AAGTCCAATGGGTAGAAAAACAGAATCACATACTTTTTACCAATGTACTCTGAGAGCTTC
ACCTTGATGAACTCTTGATCAAAAACAGCCTCTGCCTCAAAATCAGGCGCCTTATTACCG
ACCAGTGGCAAATCATCGGCCTGGGCCTTGATGGCGAAGCTACGGCGAGAGGAAGAGCGG
CTGCAGGTGAGGGGAACGAGGCGGGAGAAACCGGAGCAAAGAGAGGACGGTGATGATGCA
GAGGAAGAGGGAAGAGTTCGGAGGAAAGAGGCGGCGGGAGAGAAGAGAGAAGGATTGGAG
GGGAGAACCCTAGCGGAAGAGATAAGGGTGGTGGATGAAGCTAAGGACGCCATGGACTGA
AAGTACTCCGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2CD86JQ U 34
AF RR2FH29JQ U 59
AF RR2CW13JQ U 1
AF RR2CD86TF C 247
AF RR2CW13TF C 402
BS 1 63 RR2CW13JQ
BS 64 64 RR2CD86JQ
BS 65 314 RR2CW13JQ
BS 315 315 RR2CD86JQ
BS 316 382 RR2CW13JQ
BS 383 383 RR2CD86JQ
BS 384 490 RR2CW13JQ
BS 491 491 RR2CD86JQ
BS 492 547 RR2CW13JQ
BS 548 548 RR2CD86JQ
BS 549 766 RR2CW13JQ
BS 767 767 RR2CD86TF
BS 768 824 RR2CW13JQ
BS 825 825 RR2CD86TF
BS 826 846 RR2CW13JQ
BS 847 1035 RR2CD86TF

RD RR2CD86JQ 540 0 0
AATTCAACTTTTGAGGAGAATCACACAGAAAAAACACAAGTAATGAAAATTACCCAAAGT
TTTCAAGCAAATGTTATCTTGGCAAAAATAAAAACTGAGCTCTCAACACAGGAAAAAATA
AACATGTCCTCTGCTTTTTCACCAAACATATGTTCTATATGAAAAGCCTCTTAAATAGCT
GAAAAATACTCTTTGCTCAGCTTAGGGTCAGGTTTCATCGATTTCTCCCCAGGCTTCCAT
CCCGCGGGGCAAACTTCATCAGGGTTTTCTTGAACATACTGAAATGCCTGGAGGGTTCTC
ATTGTCTCATCAACGCTTCGGCCAATACCGAGGTTGTTGATGGTGGAATGTTGGATGACT
CCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCAATGCAATGCCCTGATCAGGGATGAAAACT
CCAAACGATTTTGAAATGGATTTGGTGATATCCGAAACGAGTGGGTAGTTCAAATCACCG
AGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGGACCCACGCAAGATGCGAGAACACACTGTCGACT

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2FH29JQ 681 0 0
CAAAAA
AAACACAAGTAATGAAGATTACGCAAAGTTTTCAAGCAAATGTTATCGTGGCAAAAATAA
AAACTGAGCTCTCAACACAGGAAAAGATAAACATGTCCTCTGCTTTTTCACCAAACATAT
GTTCTATATGAAAAGCCTCTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTCAGCTTAGGGTCAG
GTTTCATCGATTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAGACTTCATCAGGGTTTTCTT
GAACATACTGTAATGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACGCTTCGGCCAATACCGA
GGTTGTTGATGGTGGAATGTTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCA
ATGCAATGCCCTGATCAGGGATGAGAACTCCAAACGATTTTGAAATGGATTTGGTGATAT
CCGAGACGAGTGGGTAGTTCAGATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGGACCC
ACGCAAGATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAACACTTCCGTGTTTAGCTTCT
CAAATTCTTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCCCTGTGGGGCAGACAAAAGTGAAGT
CCAATGGGTAGAAAAACAGAATCACATACTTTTTACCAATGTACTCTGAGAGCTTCACCT
TGATGAACTCTTGAT

QA 7 681 7 681
DS 

RD RR2CW13JQ 854 0 0
AAAAATAGAGGAACATATAAATTTCATTATTTTAATTCAACTTTTGAGGAGAATCACACA
GAAGAAACACAAGTAATGAAGATTACGCAAAGTTTTCAAGCAAATGTTATCTTGGCAAAA
ATAAAAACTGAGCTCTCAACACAGGAAAAGATAAACATGTCCTCTGCTTTTTCACCAAAC
ATATGTTCTATATGAAAAGCCTCTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTCAGCTTAGGG
TCAGGTTTCATCGATTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAGACTTCATCAGGGTTT
TCTTGAACATACTGTAATGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACGCTTCGGCCAATA
CCGAGGTTGTTGATGGTGGAATATTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCT
CTCAATGCAATGCCCTGATCAGGGATGAGAACTCCAAACGATTTTGAAATGGATTTGGTG
ATATCCGAGAAGAGTGGGTAGTTCAGATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGG
ACCCACGAAAGATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAACACTTCCGTGTTTAGC
TTCTCAAATTCTTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTGGGGCAGACAAAAGTG
AAGTCCAATGGGTAGAAAAACAGAATCACATACTTTTTACCAATGTACTCTGAGAGCTTC
ACCTTGATGAACTCTTGATCAAAAACAGCCTCTGCCTCAAAATCAG*CGCCTTATTACCG
ACCAGTGGCAAATCATCGGCCTGGGCCTTGATGGCGAAGCTACG*CGAGAGGAAGAGCGG
CTGCAG
TGAGGGAA

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR2CD86TF 789 0 0
TTCATCGATTTCTCCCCAGGCT*CCATCCCGCGGGGCAGACTTCATCAGGGTTT*CTTGA
ACATACTGAAATGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACGCTTCGGCCAATACCGAGG
TTGTTGATGGTGGAATGTTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCAAT
GCAATGCCCTGATCAGGGATGAGAACTCCAAACGATTTTGAAATGGATTTGGTGATATCC
GAGACGAGTGGGTAGTTCAGATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGGACCCAC
GCAAGATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAACACTTCCGTGTTTAGCTTCTCA
AATTCTTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTGGGGCAGACAAAAGTGAAGTCC
AATGGGTAGAAAAACAGAATCACATACTTTTTACCAATGTACTCTGAGAGCTTCACCTTG
ATGAACTCTTGATCAAAAACAGCCTCTGCCTCAAAATCAGGCGCCTTATTACCGACCAGT
GGCAAATCATCGGCCTGGGCCTTGATGGCGAAGCTACGGCGAGAGGAAGAGCGGCTGCAG
GTGAGGGGAACGAGGCGGGAGAAACCGGAGCAAAGAGAGGACGGTGATGATGCAGAGGAA
GAGGGAAGAGTTCGGAGGAAAGAGGCGGCGGGAGAGAAGAGAGAAGGATTGGAGGGGAGA
ACCCTAGCGGAAGAGATAAGGGTGGTGGATGAAGCTAAGGACGCCATGGACTGAAAGTAC
TCCGTGTCC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2CW13TF 634 0 0
GTCGATGATGAAAAGCCCTCTCAATGCAATGCCCTGATCAGGGATGAGAACTCCAAACGA
TTTTGAAATGGATTTGGTGATATCCGAGAAGAGTGGGTAGTTCAGATCACCGAGCCCTCC
TGACTTTCTGTCTGTTTGGACCCACGAAAGATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACC
TAACACTTCCGTGTTTAGCTTCTCAAATTCTTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTC
TGTGGGGCAGACAAAAGTGAAGTCCAATGGGTAGAAAAACAGAATCACATACTTTTTACC
AATGTACTCTGAGAGCTTCACCTTGATGAACTCTTGATCAAAAACAGCCTCTGCCTCAAA
ATCAGGCGCCTTATTACCGACCAGTGGCAAATCATCGGCCTGGGCCTTGATGGCGAAGCT
ACGGCGAGAGGAAGAGCGGCTGCAGGTGAGGGGAACGAGGCGGGAGAAACCGGAGCAAAG
AGAGGACGGTGATGATGCAGAGGAAGAGGGAAGAGTTCGGAGGAAAGAGGCGGCGGGAGA
GAAGAGAGAAGGATTGGAGGGGAGAACCCTAGCGGAAGAGATAAGGGTGGTGGATGAAGC
TAAGGACGCCATGGACTGAAAGTACTCCGT
GTCC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 2 6

CO CL1030Contig1 724 4 4 U
GAAACAACTCGTCTTTTATTCAATCCAAAGAGAGATTCTTAATATCCACCTGATTCGAAA
ACATTTAAAGTAAAACAGACTTTCAAACACACTTAGAATTCCACCTAAGCCTCACACAAA
ACAGAGCAAACTTGGAAGGGTTAAGATGCCATTGCACCAATGTTGTTCTTATTCATATCA
CAAAGAGAGAGAGAAGAAAAAAAGGAAATGACTTTATCCTTGCTCAGAAGAAAAGAAACA
CGATGACATCTTTGATAACGATGATCTGGAACAAGCCCAGAGAGATGACCATAAGATTCC
TAGTCATCTCCTGGTGAACATAATCCGCCAAAACTTCTTCCATCCCTGCGTTAATGTGAA
ACAGAACAGGGATCTTCCGTACGAGAGATGCGTTACTGTAACCTCGAGACGATGGGGGAC
GAGCGAATTTGGCGGCGAGATCGGATTGCCCAAGAGAAGAAACCGAACGGTCGGCGGCGG
CGAGATTCCCGGAGATAGGTTTCTGGGTTAGTAGGGAAAATGGGATCGAGGAGATTTCTC
TTCCGATT*GGGTTCCTCGCGGCGGCGGATGCAGCAGCGCACGGGGAGGAGATGTTACTC
ATCGAGAAAGGTAACGCCTTTGAGAGAGATAGGTTGTGGGTTTGTCGGTGGAGACCGAGG
ATAGAGCGGCGGAGAGACATAGCGGCGTAGGAGAGATTCCCAGTTCTACTGTTCTTGAAA
TTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2E411JQ U 1
AF RR2C440TF C 106
AF RR2E411TF C 170
AF RR2C440JQ U 536
BS 1 628 RR2E411JQ
BS 629 629 RR2C440JQ
BS 630 633 RR2E411JQ
BS 634 724 RR2C440JQ

RD RR2E411JQ 633 0 0
GAAACAACTCGTCTTTTATTCAATCCAAAGAGAGATTCTTAATATCCACCTGATTCGAAA
ACATTTAAAGTAAAACAGACTTTCAAACACACTTAGAATTCCACCTAAGCCTCACACAAA
ACAGAGCAAACTTGGAAGGGTTAAGATGCCATTGCACCAATGTTGTTCTTATTCATATCA
CAAAGAGAGAGAGAAGAAAAAAAGGAAATGACTTTATCCTTGCTCAGAAGAAAAGAAACA
CGATGACATCTTTGATAACGATGATCTGGAACAAGCCCAGAGAGATGACCATAAGATTCC
TAGTCATCTCCTGGTGAACATAATCCGCCAAAACTTCTTCCATCCCTGCGTTAATGTGAA
ACAGAACAGGGATCTTCCGTACGAGAGATGCGTTACTGTAACCTCGAGACGATGGGGGAC
GAGCGAATTTGGCGGCGAGATCGGATTGCCCAAGAGAAGAAACCGAACGGTCGGCGGCGG
CGAGATTCCCGGAGATAGGTTTCTGGGTTAGTAGGGAAAATGGGATCGAGGAGATTTCTC
TTCCGATT*GGGTTCCTCGCGGCGGCGGATGCAGCAGCGCACGGGGAGGAGATGTTACTC
ATCGAGAAAGGTAACGCCTTTGAGAGAGGTAGG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2C440TF 610 0 0
CTAAGCTCACACA
AAACAGAGCAAACTTGGAAGGGTTAAGATGCCATTGCACCAATGTTGTTCTTATTCATAT
CACAAAGAGAGAGAGAAGAAAAAAAGGAAATGACTTTATCCTTGCTCAGAAGAAAAGAAA
CACGATGACATCTTTGATAACGATGATCTGGAACAAGCCCAGAGAGATGACCATAAGATT
CCTAGTCATCTCCTGGTGAACATAATCCGCCAAAACTTCTTCCATCCCTGCGTTAATGTG
AAACAGAACAGGGATCTTCCGTACGAGAGATGCGTTACTGTAACCTCGAGACGATGGGAG
ACGAGCGAATTTGGCGGCGAGATCGGATTGCCCAAGAGAAGAAACCGAACGGTCGGCGGC
GGCGAGATTCCCGGAGATAGGTTTCTGGGTTAGTAGGGAAAATGGGATCGAGGAGATTTC
TCTTCCGATT*GGGTTCCTCGCGGCGGCGGATGCAGCAGCGCACGGGGAGGAGATGTTAC
TCATCGAGAAAGGTAACGCCTTTGAGAGAGATAGGTTGTGGGTTTGTCGGTGGAGACCGA
GGATAGAGCGGCGGAGAGACATAGCGGCGTAGGAGAGATTCCCAGTTCTACTGTTCT

QA 14 610 14 610
DS 

RD RR2E411TF 533 0 0
TATTCATATCACAAAGAGAGAGAGAAGAAAAAAAGGAAATGACTTTATCCTTGCTCAGAA
GAAAAGAAACACGATGACATCTTTGATAACGATGATCTGGAACAAGCCCAGAGAGATGAC
CATAAGATTCCTAGTCATCTCCTGGTGAACATAATCCGCCAAAACTTCTTCCATCCCTGC
GTTAATGTGAAACAGAACAGGGATCTTCCGTACGAGAGATGCGTTACTGTAACCTCGAGA
CGATGGGGGACGAGCGAATTTGGCGGCGAGATCGGATTGCCCAAGAGAAGAAACCGAACG
GTCGGCGGCGGCGAGATTCCCGGAGATAGGTTTCTGGGTTAGTAGGGAAAATGGGATCGA
GGAGATTTCTCTTCCGATT*GGGTTCCTCGCGGCGGCGGATGCAGCAGCGCACGGGGAGG
AGATGTTACTCATCGAGAAAGGTAACGCCTTTGAGAGAGGTAGGTTGTGGGTTTGTCGGT
GGAGACCGAGGATAGAGCGGCGGAGAGACATCGCGGCGTAGGAGAGATTCCC
C

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2C440JQ 189 0 0
TTCTCTTCCGATTTGGGTTCCTCGCGGCGGCGGATGCAGCAGCGCACGGGGAGGAGATGT
TACTCATCGAGAAAGGTAACGCCTTTGAGAGAGATAGGTTGTGGGTTTGTCGGTGGAGAC
CGAGGATAGAGCGGCGGAGAGACATAGCGGCGTAGGAGAGATTCCCAGTTCTACTGTTCT
TGAAATTCC

QA 1 189 1 189
DS 



CO CL1030Contig2 598 2 2 U
GATCGGATCCAATTTCAAGAACAGTAGAACTGGGAATCTCTCCTACGCCGCGATGTCTCT
CCGCCGCTCCATCCTCGGTCTCCACCGCCAAACCCACAACCTATCTCTCTCAAAGGCGTT
ACCTTTCTCGATGAGTAACAACATCTCCTCCCCGTGCGCTGCATCCGCCGCCGCGAGGAA
CCCAATCGGAAGACAAATCTCCTCGATCCCATTTTCCCTACTAACCCAGAAACCTAACTC
TGGGAATCTCGCCGCCGCCGATCGTTCGGTTTATTCTCTTGGGCAATCCGATCTCGCCGC
CAAATTCGCTCGTCTCCCATCGTCTCGAGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTACGGAAGAT
ACCTGTTCTGTTTCACATTAACGCAGGGATGGAAGAAGTTTTGGCGGATTATGTTCACCA
GGAGATGACCAGGAATCTTATGGTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATCGTTATCAA
AGATGTCATCGTGTTTCTTTTCTTCTGAGCAAGGATAAAGTCCTTTCCTTTTTTTTTCTC
TCTCTCTCTTTATGATATGAATAAGAACAACATTGGTGCAATGGCATCTTAACCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2EY53TF U 1
AF RR2EY53JQ C 281
BS 1 594 RR2EY53TF
BS 595 598 RR2EY53JQ

RD RR2EY53TF 598 0 0
GATCGGATCCAATTTCAAGAACAGTAGAACTGGGAATCTCTCCTACGCCGCGATGTCTCT
CCGCCGCTCCATCCTCGGTCTCCACCGCCAAACCCACAACCTATCTCTCTCAAAGGCGTT
ACCTTTCTCGATGAGTAACAACATCTCCTCCCCGTGCGCTGCATCCGCCGCCGCGAGGAA
CCCAATCGGAAGACAAATCTCCTCGATCCCATTTTCCCTACTAACCCAGAAACCTAACTC
TGGGAATCTCGCCGCCGCCGATCGTTCGGTTTATTCTCTTGGGCAATCCGATCTCGCCGC
CAAATTCGCTCGTCTCCCATCGTCTCGAGGTTACAGTAACGCATCTCTCGTACGGAAGAT
ACCTGTTCTGTTTCACATTAACGCAGGGATGGAAGAAGTTTTGGCGGATTATGTTCACCA
GGAGATGACCAGGAATCTTATGGTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATCGTTATCAA
AGATGTCATCGTGTTTCTTTTCTTCTGAGCAAGGATAAAGTCCTTTCCTTTTTTTTTCTC
TCTCTCTCTTTATGATATGAATAAGAACAACATTGGTGCAATGGCATCTTAACC
TTCC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2EY53JQ 318 0 0
GGGCAATCCGATCTCGCCGCCAAATTCGCTCGTCTCCCATCGTCTCGAGGTTACAGTAAC
GCATCTCTCGTACGGAAGATACCTGTTCTGTTTCACATTAACGCAGGGATGGAAGAAGTT
TTGGCGGATTATGTTCACCAGGAGATGACCAGGAATCTTATGGTGATCTCTCTGGGCTTG
TTCCAGATCATCGTTATCAAAGATGTCATCGTGTTTCTTTTCTTCTGAGCAAGGATAAAG
TCCTTTCCTTTTTTTTTCTCTCTCTCTCTTTATGATATGAATAAGAACAACATTGGTGCA
ATGGCATCTTAACCTTCC

QA 1 318 1 318
DS 



AS 1 6

CO CL1031Contig1 1021 6 14 U
GGAAGACAGAAGTTACTTCCTTCTACCTCCTGAAATCACGAAAACGCTAAGATGGCCGCA
ACTCCCACCGCCGCCGCTGCTTCGTCCATCATGGGTACTCGGGTGGTTCCCAATATCCAC
TCCGGTTCGGGTAGAATCACTGCCCGGTTTGGGTTCGGGAAGAAGAAGGCGGCTCCCAAA
AAGACCAAGTCTACCGTGACTTCCGACAGGCCTCTCTGGTACCCAGGCGCCAAATCTCCC
GAGTGGCTTGACGGCTCCCTTGTTGGAGATTACGGGTTTGATCCCTTCGGTTTAGGCAAA
CCGGCCGAGTATCTCCAGTTCGATATAGATTCGCTAGACCAGAATCTGGCTAAGAACTTA
GCCGGAGACGTGATCGGAACACGCACGGAAGAGGCTGCCCCCAAATCGACGCCGTTTCAG
CCGTGCAGTGAGGTCTTCGGAATCCAGAGGTTCAGAGAATGCGAGCTGATCCACGGACGG
TGGGCCATGCTCGCCACTCTCGGCGCTCTCTCCGTCGAATGGCTCACCGGCGTCACTTGG
CAAGACGCCGGAAAGGTGGAGCTTGTGGATGGATCGTCCTACTTGGGGCAGCCACTACCC
TTTTCCATCTCGACGTTGATATGGATCGAGGTGTTGGTGATCGGCTACATTGAGTTCCAG
CGCAACGCCGAGCTTGACTCTGAGAAGCGTTTGTACCCTGGAGGCAAATTCTTCGACCCG
CTTGGTTTAGCGTCTGACCCTGAGAAGATGGCTCAGCTTCAGTTAGCTGAGATCAAGCAC
GCACGTCTTGCCATGGTCGCCTTCTTGGGCTTCGCTGTTCAAGCCGCTGCGACTGGTAAA
GGTCCACTCAACAATTGGGCTACTCACCTCAGTGATCCGCTTCACACCACCATCATCGAT
ACCTTCTCCTCTTAGAAATCATTTCCTCCTTTTGTCATCATCATCTCTGTCTTATAATGT
AACTTTGTTCTAGTATAAACAGAGCTGCTATGAGACCGAATCGCGTTTTGCCGTTTAAAG
G


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 

AF RR2DR02TF U 1
AF RR2B734TF U 2
AF RR2DV21TF U 123
AF RR2DV21JQ C 361
AF RR2D988TF U 681
AF RR2D988JQ C 681
BS 1 424 RR2DR02TF
BS 425 425 RR2DV21TF
BS 426 470 RR2DR02TF
BS 471 471 RR2DV21TF
BS 472 485 RR2DR02TF
BS 486 593 RR2B734TF
BS 594 594 RR2DV21TF
BS 595 599 RR2B734TF
BS 600 600 RR2DV21TF
BS 601 602 RR2B734TF
BS 603 603 RR2DV21TF
BS 604 838 RR2B734TF
BS 839 1016 RR2D988TF
BS 1017 1021 RR2D988JQ

RD RR2DR02TF 485 0 0
GGAAGACAGAAGTTACTTCCTTCTACCTCCTGAAATCACGAAAACGCTAAGATGGCCGCA
ACTCCCACCGCCGCCGCTGCTTCGTCCATCATGGGTACTCGGGTGGTTCCCAATATCCAC
TCCGGTTCGGGTAGAATCACTGCCCGGTTTGGGTTCGGGAAGAAGAAGGCGGCTCCCAAA
AAGACCAAGTCTACCGTGACTTCCGACAGGCCTCTCTGGTACCCAGGCGCCAAATCTCCC
GAGTGGCTTGACGGCTCCCTTGTTGGAGATTACGGGTTTGATCCCTTCGGTTTAGGCAAA
CCGGCCGAGTATCTCCAGTTCGATATAGATTCGCTAGACCAGAATCTGGCTAAGAACTTA
GCCGGAGACGTGATCGGAACACGCACGGAAGAGGCTGCCCCCAAATCGACGCCGTTTCAG
CCGTACAGTGAGGTCTTCGGAATCCAGAGGTTCAGAGAATGCGAGCTGATTCACGGACGG
TGGGC

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2B734TF 837 0 0
GG
AGACAGAAGTTACTTCCTTCTACCTCCTGAAATCACGAAAACGCTAAGATGGCCGCAACT
CCCACCGCCGCCGCTGCTTCGTCCATCATGGGTACTCGGGTGGTTCCCAATATCCACTCC
GGTTCGGGTAGAATCACTGCCCGGTTTGGGTTCGGGAAGAAGAAGGCGGCTCCCAAAAAG
ACCAAGTCTACCGTGACTTCCGACAGGCCTCTCTGGTACCCAGGCGCCAAATCTCCCGAG
TGGCTTGACGGCTCCCTTGTTGGAGATTACGGGTTTGATCCCTTCGGTTTAGGCAAACCG
GCCGAGTATCTCCAGTTCGATATAGATTCGCTAGACCAGAATCTGGCTAAGAACTTAGCC
GGAGACGTGATCGGAACACGCACGGAAGAGGCTGCCCCCAAATCGACGCCGTTTCAGCCG
TACAGTGAGGTCTTCGGAATCCAGAGGTTCAGAGAATGCGAGCTGATTCACGGACGGTGG
GCCATGCTCGCCACTCTCGGCGCTCTCTCCGTCGAATGGCTCACCGGCGTCACTTGGCAA
GACGCCGGAAAGGTGGAGCTTGTGGATGGATCGTCCTACTTGGGGCAGCCGCTACCATTC
TCCATCTCGACGTTGATATGGATCGAGGTGTTGGTGATCGGCTACATTGAGTTCCAGCGC
AACGCCGAGCTTGACTCTGAGAAGCGTTTGTACCCTGGAGGCAAATTCTTCGACCCGCTT
GGTTTAGCGTCTGACCCTGAGAAGATGGCTCAGCTTCAGTTAGCTGAGATCAAGCACGCA
CGTCTTGCCATGGTCGCCTTCTTGGGCTTCGCTGTTCAAGCCGCTGCGACTGGTA

QA 3 837 3 837
DS 

RD RR2DV21TF 715 0 0
G
GGTTCGGGTAGAATCACTGCCCGGTTTGGGTTCGGGAAGAAGAAGGCGGCTCCCAAAAAG
ACCAAGTCTACCGTGACTTCCGACAGGCCTCTCTGGTACCTAGGCGCCAAATCTCCCGAG
TGGCTTGACGGCTCCCTTGTTGGAGATTACGGGTTTGATCCCTTCGGTTTAGGCAAACCG
GCCGAGTATCTCCAGTTCGATATAGATTCGCTAGACCAGAATCTGGCTAAGAACTTAGCC
GGAGACGTGATCGGAACACGCACGGAAGAGGCTGCCCCCAAATCGACGCCGTTTCAGCCG
TGCAGTGAGGTCTTCGGAATCCAGAGGTTCAGAGAATGCGAGCTGATCCACGGACGGTGG
GCCATGCTCGCCACTCTCGGCGCTCTCTCCGTCGAATGGCTCACCGGCGTCACTTGGCAA
GACGCCGGAAAGGTGGAGCTTGTGGATGGATCGTCCTACTTGGGGCAGCCACTACCCTTT
TCCATCTCGACGTTGATATGGATCGAGGTGTTGGTGATCGGCTACATTGAGTTCCAGCGC
AACGCCGAGCTTGACTCTGAGAAGCGTCTGTACCCTGGAGGCAAATTCTTCGACCCGCTT
GGTTTAGCGTCTGATCCTGAGAAGATGGCTCAGCTTCAGTTAGCTGAGATCAAGCACGCA
CGTCTTGCCATGGTCGCCTTCTTGGGCTTCGCTGTTCAAGCCGCTGCCACTGGT

QA 2 715 2 715
DS 

RD RR2DV21JQ 656 0 0
GCCGGAGACGTGATCGGAACACGCACGGAAGAGGCTGCCCCCAAATCGACGCCGTTTCAG
CCGTGCAGTGAGGTCTTCGGAATCCAGAGGTTCAGAGAATGCGAGCTGATCCACGGACGG
TGGGCCATGCTCGCCACTCTCGGCGCTCTCTCCGTCGAATGGCTCACCGGCGTCACTTGG
CAAGACGCCGGAAAGGTGGAGCTTGTGGATGGATCGTCCTACTTGGGGCAGCCACTACCC
TTTTCCATCTCGACGTTGATATGGATCGAGGTGTTGGTGATCGGCTACATTGAGTTCCAG
CGCAACGCCGAGCTTGACTCTGAGAAGCGTCTGTACCCTGGAGGCAAATTCTTCGACCCG
CTTGGTTTAGCGTCTGATCCTGAGAAGATGGCTCAGCTTCAGTTAGCTGAGATCAAGCAC
GCACGTCTTGCCATGGTCGCCTTCTTGGGCTTCGCTGTTCAAGCCGCTGCCACTGGTAAA
GGTCCACTCAACAATTGGGCTACTCACCTCAGTGATCCGCTTCACACCACCATCATCGAT
ACCTTCTCCTCTTAGAAATCATTTCCTCCTTTTGTCATCATCATCTCTGTCGTATAATTT
AACTTTGTTCTAGTATAAACAGAGCTGCTATGAGACTGAATCGCGTTTTGCCGTTT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2D988TF 341 0 0
G
GAGAAGCGTTTGTACCCTGGAGGCAAATTCTTCGACCCGCTTGGTTTAGCGTCTGACCCT
GAGAAGATGGCTCAGCTTCAGTTAGCTGAGATCAAGCACGCACGTCTTGCCATGGTCGCC
TTCTTGGGCTTCGCTGTTCAAGCCGCTGCGACTGGTAAAGGTCCACTCAACAATTGGGCT
ACTCACCTCAGTGATCCGCTTCACACCACCATCATCGATACCTTCTCCTCTTAGAAATCA
TTTCCTCCTTTTGTCATCATCATCTCTGTCTTATAATGTAACTTTGTTCTAGTATAAACA
GAGCTGCTATGAGACCGAATCGCGTTTTGCCGTTT
AAAGG

QA 2 336 2 336
DS 

RD RR2D988JQ 341 0 0
G
GAGAAGCGTTTGTACCCTGGAGGCAAATTCTTCGACCCGCTTGGTTTAGCGTCTGACCCT
GAGAAGATGGCTCAGCTTCAGTTAGCTGAGATCAAGCACGCACGTCTTGCCATGGTCGCC
TTCTTGGGCTTCGCTGTTCAAGCCGCTGCGACTGGTAAAGGTCCACTCAACAATTGGGCT
ACTCACCTCAGTGATCCGCTTCACACCACCATCATCGATACCTTCTCCTCTTAGAAATCA
TTTCCTCCTTTTGTCATCATCATCTCTGTCTTATAATGTAACTTTGTTCTAGTATAAACA
GAGCTGCTATGAGACCGAATCGCGTTTTGCCGTTTAAAGG

QA 2 341 2 341
DS 



AS 1 7

CO CL1032Contig1 894 7 7 U
GGATTAATGTAGTATTGATGATTAAGACTTTTAGCAATCAGACATAACTTATGTTTAATA
CATAATTTGAAAATAGAACTAAAACTCCAGCCGCATATGTCAGCCATTACATTGCTACAT
ATAAATAAGGGTATCGCTAGTTTTAAAACCGGCGAATTTATTTCAAGACAATAATACTGG
AAAGAGAAGAAGAATGTGTATAAAGCAAACTCATCAGAGCCTTGCGGTACGAAGCTGCTG
CTTGATCAGGGGTCGAATGTATTCCTGGTACCCATCAGGAACCACCGAGTCGTTCAATGG
GTCCTTCCATGCCTCCTCATAAAGCTTCGGGTATACATTACCATCATAACGCCCCAGCAC
CGAGTTCAAGTAATGGTCAGTGTAGTTGAAGGCGTCCACAAGCGCAACCGCATTAGGGCG
GACCTGAGAGTATAAGGAACGGAGCTGGTCATTGGCTAGAGAGGCTTGTTTAGGAGTGAT
GGAGTTGGTTGAGAGGAAATCTCCGAGGTGTTTATGGAGGATATGGAGAGCGTAAATGTA
ACACAGATTGTTCAGCTGCTTCTTCACTCCTTTGCCTCCTATGTCTTGCTCTAGCTTAGC
TATGAACTTGGAAACAACAATCAATTGGCAATGAGCGACTGCAGCCTCAACCAGCTCAGC
CAATAGCTCTGAAAATCCTTCTTCTTGATTCTCAAACTTGCTGAGATTTTTGGCACAAGC
AACAGCCATTCTCAGAGCCCTTGCTTCAAAAGCTTCCAGTACCGCAGCAGGGTTTAACCA
ATCCTCAGCTTTTTGAACACCAGAACGACATTGCAAAAGATGTTGTGCACGAGCCATATA
AGCAGTTGTGCCAACAGGAGCCTTTCCAGATCCCAGCTGGGACACTGTCTTTCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E422JQ U 1
AF RR2AH86JQ U 1
AF RR2AH86TF C 1
AF RR2DT77JQ U 39
AF RR2AT60JQ U 1
AF RR2B189JQ U 51
AF RR2E422TF C 581
BS 1 570 RR2AH86JQ
BS 571 764 RR2AT60JQ
BS 765 765 RR2E422TF
BS 766 804 RR2B189JQ
BS 805 805 RR2E422TF
BS 806 840 RR2B189JQ
BS 841 894 RR2E422TF

RD RR2E422JQ 194 0 0
GGATTAATGTAGTATTGATGATTAAGACTTTTAGCAATCAGACATAACTTATGTTTAATA
CATAATTTGAAAATAGTACTAAAACTCCAGCCGCATATGTCAGCCATTACATTGCTACAT
ATAAATAAGGGTATCGCTAGTTTTAAAACCGGCGAATTTATTTCAAGACAATAATACTGG
AAAGAGAA
AAAAAA

QA 1 188 1 188
DS 

RD RR2AH86JQ 571 0 0
GGATTAATGTAGTATTGATGATTAAGACTTTTAGCAATCAGACATAACTTATGTTTAATA
CATAATTTGAAAATAGAACTAAAACTCCAGCCGCATATGTCAGCCATTACATTGCTACAT
ATAAATAAGGGTATCGCTAGTTTTAAAACCGGCGAATTTATTTCAAGACAATAATACTGG
AAAGAGAAGAAGAATGTGTATAAAGCAAACTCATCAGAGCCTTGCGGTACGAAGCTGCTG
CTTGATCAGGGGTCGAATGTATTCCTGGTACCCATCAGGAACCACCGAGTCGTTCAATGG
GTCCTTCCATGCCTCCTCATAAAGCTTCGGGTATACATTACCATCATAACGCCCCAGCAC
CGAGTTCAAGTAATGGTCAGTGTAGTTGAAGGCGTCCACAAGCGCAACCGCATTAGGGCG
GACCTGAGAGTATAAGGAACGGAGCTGGTCATTGGCTAGAGAGGCTTGTTTAGGAGTGAT
GGAGTTGGTTGAGAGGAAATCTCCGAGGTGTTTATGGAGGATATGGAGAGCGTAAATGTA
ACACAGATTGTTCAGCTGCTTCTTCACTCC
C

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2AH86TF 571 0 0
GGATTAATGTAGTATTGATGATTAAGACTTTTAGCAATCAGACATAACTTATGTTTAATA
CATAATTTGAAAATAGAACTAAAACTCCAGCCGCATATGTCAGCCATTACATTGCTACAT
ATAAATAAGGGTATCGCTAGTTTTAAAACCGGCGAATTTATTTCAAGACAATAATACTGG
AAAGAGAAGAAGAATGTGTATAAAGCAAACTCATCAGAGCCTTGCGGTACGAAGCTGCTG
CTTGATCAGGGGTCGAATGTATTCCTGGTACCCATCAGGAACCACCGAGTCGTTCAATGG
GTCCTTCCATGCCTCCTCATAAAGCTTCGGGTATACATTACCATCATAACGCCCCAGCAC
CGAGTTCAAGTAATGGTCAGTGTAGTTGAAGGCGTCCACAAGCGCAACCGCATTAGGGCG
GACCTGAGAGTATAAGGAACGGAGCTGGTCATTGGCTAGAGAGGCTTGTTTAGGAGTGAT
GGAGTTGGTTGAGAGGAAATCTCCGAGGTGTTTATGGAGGATATGGAGAGCGTAAATGTA
ACACAGATTGTTCAGCTGCTTCTTCACTCC
C

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2DT77JQ 596 0 0
GG
GACATAACTTATGTTTAATACATAATTTGAAAATAGAACTAAAACTCCAGCCGCATATGT
CAGCCATTACATTGCTACATATAAATAAGGGTATCGCTAGTTTTAAAACCGGCGAATTTA
TTTCAAGACAATAATACTGGAAAGAGAAGAAGAATGTGTATAAAGCAAACTCATCAGAGC
CTTGCGGTACGAAGCTGCTGCTTGATCAGGGGTCGAATGTATTCCTGGTACCCATCAGGA
ACCACCGAGTCGTTCAATGGGTCCTTCCATGCCTCCTCATAAAGCTTCGGGTATACATTA
CCATCATAACGCCCCAGCACCGAGTTCAAGTAATGGTCAGTGTAGTTGAAGGCGTCCACA
AGCGCAACCGCATTAGGGCGGACCTGAGAGTATAAGGAACGGAGCCGGTCATTGGCTAGA
GAGGCTTGTTTAGGAGTGATGGAGTTGGTTGAGAGGAAATCTCCGAGGTGTTTATGGAGG
ATATGGAGAGCGTAAATGTAACACAGATTGTTCAGCTGCTTCTTCACTCCTTTGCCTCCT
ACGTCTTGCTCTAGCTTAGCTATGAACTTGGAAACAACAATCAATTGGCAATGA

QA 3 596 3 596
DS 

RD RR2AT60JQ 766 0 0
GGATTAATGTAGTATTGATGATTAAGGCTTTTAGCAATCAGACATAACTTATGTTTAATA
CATAATTTGAAAATAGTACTAAAACTCCAGCCGCATATGTCAGCCATTACATTGCTACAT
ATAAATAAGGGTATCGCTAGTTTTAAAACCGGCGAATTTATTTCAAGACAATAATACTGG
AAAGAGAAGAAGAATGTGTATAAAGCAAACTCATCAGAGCCTTGCGGTACGAAGCTGCTG
CTTGATCAGGGGTCGAATGTATTCCTGGTACCCATCAGGAACCACCGAGTCGTTCAATGG
GTCCTTCCATGCCTCCTCATAAAGCTTCGGGTATACATTACCATCATAACGCCCCAGCAC
CGAGTCCAAGTAATGGTCAGTGTAGTTGAAGGCGTCCACAAGCGCAACCGCATTAGGGCG
GACCTGAGAATATAAGGAACGGAGCTGGTCATTGGCCAGAGAGGCTTGTTTAGGAGTGAT
GGAGTTGGTTGAGAGGAAATCTCCGAGGTGTTTATGGAGGATATGGAGAGCGTAAATGTA
ACACAGATTGTTCAGCCGCTTCTTCACTCCTTTGCCTCCTATGTCTTGCTCTAGCTTAGC
TATGAACTTGGAAACAACAATCAATTGGCAATGAGCGACTGCAGCCTCAACCAGCTCAGC
CAATAGCTCTGAAAATCCTTCTTCTTGATTCTCAAACTTGCTGAGATTTTTGGCACAAGC
AACAGCCATTCTCAGAGCCCTTGCTTCAAAAGCTTCCAGTACCG
CA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2B189JQ 790 0 0
ATGTTTAATACATAATTTGAAAATAGTACTAAA*CTCCAGCCGCATATGTCAGCCATTAC
ATTGCTACATATAAATAAGGGTATCGCTAGTTTTAAAACCGGCGAATTTATTTCAAGACA
ATAATACTGGAAAGAGAAAAAAAATGTGTATAAAGCAAACTCATCAAAGCCTTGCGGTAC
GAAGCTGCTGCTTGATCAGGGGTCGAATGTATTCCTGGTACCTATCGGGAACCACCGAGT
CGTTCAATGGGTCCTTCCATGCCTCCTCATAAAGCTTCGGGTATACATTACCATCATAAC
GCCCCAGCACCGAGTTCAAGTAATGGTCAGTGTAGTTGAAGGCGTCCACAAGCGCAACCG
CATTAGGGCGGACCTGAAAATATAAGGAACGGAGCTGGTCATTGGCCAAAGAGGCTTGTT
TAGGAGTGATGGAGTTGGTTGAGAGGAAATCTCCGAGGTGTTTATGGAGGATATGGAGAG
CGTAAATGTAACGCAGATTGTTCAGCTGCTTCTTCACTCCTTTGCCTCCTATGTCTTGCT
CTAGCTTAGCTATGAACTTGGAAACAACAATCAATTGGCAATGAGCGACTGCAGCCTCAA
CCAGCTCAGCCAATAGCTCTGAAAATCCTTCTTCTTGATTCTCAAACTTGCTGAGATTTT
TGGCACAAGCAACAGCCATTCTCAGAGCCCTTGCTTCAAAAACTTCCAGTACCG*AGCAG
GGTTTAACCAATCCTCAGCTTTTTGAACACCAGAGCGACATTGCAAAAGATGTTGTGCAC
GAGCCATATA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2E422TF 314 0 0
AT
GTCTTGCTCTAGCTTAGCTATGAACTTGGAAACAACAATCAATTGGCAATGAGCGACTGC
AGCCTCAACCAGCTCAGCCAATAGCTCTGAAAATCCTTCTTCTTGATTCTCAAACTTGCT
GAGATTTTTGGCACAAGCAACAGCCATTCTCAGAGCCCTTGCTTCAAAAGCTTCCAGTAC
CGCAGCAGGGTTTAACCAATCCTCAGCTTTTTGAACACCAGAACGACATTGCAAAAGATG
TTGTGCCCGAGCCATATAAGCAGTTGTGCCAACAGGAGCCTTTCCAGATCCCAGCTGGGA
CACTGTCTTTCC

QA 3 314 3 314
DS 



AS 3 7

CO CL1033Contig1 555 2 1 U
TTTTTCTCTGTAATTCGCTCGCCGGCATAAAAGTGGAGGCAAGGAGGAGGAAGAAGACAT
AGTAGCATCAGGATTGAAAATGAAGGGATGCCAAGGAGAGAGTTAGATTGTATGTTCGCG
GAACAGTCCTCGGCTACAAGAGGTCGAAGTCGAACCAATACCCCAACACTTCTCTGATCC
AGATTGAAGGAGTCAACACTACAGAGGAGGTGACGTGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTT
ACATCTACAAGGCGAGGACAAAGAAGAATGGTTCCCACTACCGTTGCATCTGGGGCAAAG
TCGCTAGGCCTCATGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAGTTCACTTCAAACCTACCAC
CAAAGTCAATGGGAGCTAGAGTCAGAGTGTTCATGTACCCCAGCAACATATGAGGAGGGT
AGATTCAGGACCTGGGATTCATTTCGCAAGTATAAGAAGGAAGCTCCTCCCATCATCATT
TCTCAAAAGCTATAGTTTATCCTTTTATTCACATTTTGTCTTAAATTCTCTGTCGGTTTT
GTTTATCTCTAGACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CQ64JQ C 1
AF RR2CQ64TF U 1
BS 1 555 RR2CQ64TF

RD RR2CQ64JQ 555 0 0
TTTTTCTCTGTAATTCGCTCGCCGGCATAAAAGTGGAGGCAAGGAGGAGGAAGAAGACAT
AGTAGCATCAGGATTGAAAATGAAGGGATGCCAAGGAGAGAGTTAGATTGTATGTTCGCG
GAACAGTCCTCGGCTACAAGAGGTCGAAGTCGAACCAATACCCCAACACTTCTCTGATCC
AGATTGAAGGAGTCAACACTACAGAGGAGGTGACGTGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTT
ACATCTACAAGGCGAGGACAAAGAAGAATGGTTCCCACTACCGTTGCATCTGGGGCAAAG
TCGCTAGGCCTCATGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAGTTCACTTCAAACCTACCAC
CAAAGTCAATGGGAGCTAGAGTCAGAGTGTTCATGTACCCCAGCAACATATGAGGAGGGT
AGATTCAGGACCTGGGATTCATTTCGCAAGTATAAGAAGGAAGCTCCTCCCATCATCATT
TCTCAAAAGCTATAGTTTATCCTTTTATTCACATTTTGTCTTAAATTCTCTGTCGGTTTT
GTTTATCTCTAGACG

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2CQ64TF 555 0 0
TTTTTCTCTGTAATTCGCTCGCCGGCATAAAAGTGGAGGCAAGGAGGAGGAAGAAGACAT
AGTAGCATCAGGATTGAAAATGAAGGGATGCCAAGGAGAGAGTTAGATTGTATGTTCGCG
GAACAGTCCTCGGCTACAAGAGGTCGAAGTCGAACCAATACCCCAACACTTCTCTGATCC
AGATTGAAGGAGTCAACACTACAGAGGAGGTGACGTGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTT
ACATCTACAAGGCGAGGACAAAGAAGAATGGTTCCCACTACCGTTGCATCTGGGGCAAAG
TCGCTAGGCCTCATGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAGTTCACTTCAAACCTACCAC
CAAAGTCAATGGGAGCTAGAGTCAGAGTGTTCATGTACCCCAGCAACATATGAGGAGGGT
AGATTCAGGACCTGGGATTCATTTCGCAAGTATAAGAAGGAAGCTCCTCCCATCATCATT
TCTCAAAAGCTATAGTTTATCCTTTTATTCACATTTTGTCTTAAATTCTCTGTCGGTTTT
GTTTATCTCTAGACG

QA 1 555 1 555
DS 



CO CL1033Contig2 641 3 1 U
CGATTTGACTACTTTAATTTCGATTGAATCTTAGTAGAGAAAAAATAGGATAATTCTTTT
TTCTGCTCGAATTCCATCAAAAATAATGTTTTAATTCGTCTAGAGATGAACAGAGAGTTT
AAGACAAAATGAGAATAAAAAGATAAACTATAGCTTTTGAAAAATGATAAAGGGAGCTTC
CTTCTGATACTTGTGAAATGAATCCCAGGTCCTGAATCTACCCTCCTCATATGTTGCTAG
GGTACATGAACACTCTGACTCTAGCTCCCATTGACTTTGGTGGTAGGTTTGAAGTGAACT
TGGCACGGACAACACCGCTGTTACCATGAGGCCTAGCGACTTTGCCCCATATGCAACGGT
AGTGGGAACCGTTCTTCTTTGTCTTCGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGT
ACCACGTCACCTCCTCGGTAGTGTTGACTCCTTCAATCTGGATCAGAGAAGTGTTGGGGT
ATTGGTTCGACTTCGACCTCTTGTAGCCGAGGACTGCTCCGCGAACATACAATCTAACTC
TCTCTCCTTGGCGTCCCTTCATTTTCAATCCTGATGATACTATGTCTTCTTCCTCCTCCT
TGCCTCCACTTTTATGCCGGCAAGCGAATTACAGAGAAAAA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H775JQB U 47
AF RR2D672JQ U 1
AF RR2D672TF C 2
BS 1 641 RR2D672JQ

RD RR2H775JQB 458 0 0
AGGATAATTCTTTTTTCTGCTCGAATTCCATCAAAAATAATGTTTTAATTCGTCTAGAGA
TGAACAGAAAGTTTAAAACAAAATGAGAATAAAAAGATAAACTATAGCTTTTGAAAAATG
ATAAAGGGAGCCTCCTTCTGATACTTGTGAAATGAATCCCAGGTCCTGAATCTACCCTCC
TCATATGTTGCTAGGGTACATGAACACTCTGACTCTAGCTCCCATTGACTTTGGTGGTAG
GTTTGAAGTGAACTTGGCACGGACAACACCGCTGTTACCATGAGGCCTAGCGACTTTGCC
CCATATGCAACGGTAGTGGGAACCGTTCTTCTTTGTCTTCCCCTTGTAAATGTAAGCCAT
CCTCTTTCCCTTGTACCACGTCACCTCCTCGGTAGTGTTGACTCCTTCAATCTGGATCAA
AAAAGTGTTGGGGTATTGGTTCGACTTCGACCTCTTGT

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2D672JQ 641 0 0
CGATTTGACTACTTTAATTTCGATTGAATCTTAGTAGAGAAAAAATAGGATAATTCTTTT
TTCTGCTCGAATTCCATCAAAAATAATGTTTTAATTCGTCTAGAGATGAACAGAGAGTTT
AAGACAAAATGAGAATAAAAAGATAAACTATAGCTTTTGAAAAATGATAAAGGGAGCTTC
CTTCTGATACTTGTGAAATGAATCCCAGGTCCTGAATCTACCCTCCTCATATGTTGCTAG
GGTACATGAACACTCTGACTCTAGCTCCCATTGACTTTGGTGGTAGGTTTGAAGTGAACT
TGGCACGGACAACACCGCTGTTACCATGAGGCCTAGCGACTTTGCCCCATATGCAACGGT
AGTGGGAACCGTTCTTCTTTGTCTTCGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGT
ACCACGTCACCTCCTCGGTAGTGTTGACTCCTTCAATCTGGATCAGAGAAGTGTTGGGGT
ATTGGTTCGACTTCGACCTCTTGTAGCCGAGGACTGCTCCGCGAACATACAATCTAACTC
TCTCTCCTTGGCGTCCCTTCATTTTCAATCCTGATGATACTATGTCTTCTTCCTCCTCCT
TGCCTCCACTTTTATGCCGGCAAGCGAATTACAGAGAAAAA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2D672TF 640 0 0
GATTTGACTACTTTAATTTCGATTGAATCTTAGTAGAGAAAAAATAGGATAATTCTTTTT
TCTGCTCGAATTCCATCAAAAATAATGTTTTAATTCGTCTAGAGATGAACAGAGAGTTTA
AGACAAAATGAGAATAAAAAGATAAACTATAGCTTTTGAAAAATGATAAAGGGAGCTTCC
TTCTGATACTTGTGAAATGAATCCCAGGTCCTGAATCTACCCTCCTCATATGTTGCTAGG
GTACATGAACACTCTGACTCTAGCTCCCATTGACTTTGGTGGTAGGTTTGAAGTGAACTT
GGCACGGACAACACCGCTGTTACCATGAGGCCTAGCGACTTTGCCCCATATGCAACGGTA
GTGGGAACCGTTCTTCTTTGTCTTCGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGTA
CCACGTCACCTCCTCGGTAGTGTTGACTCCTTCAATCTGGATCAGAGAAGTGTTGGGGTA
TTGGTTCGACTTCGACCTCTTGTAGCCGAGGACTGCTCCGCGAACATACAATCTAACTCT
CTCTCCTTGGCGTCCCTTCATTTTCAATCCTGATGATACTATGTCTTCTTCCTCCTCCTT
GCCTCCACTTTTATGCCGGCAAGCGAATTACAGAGAAAAA

QA 1 640 1 640
DS 



CO CL1033Contig3 595 2 3 U
TTCTTTTCTGCTCGAATTCCATCAAAAATAATGTTTTAATTCGTCTAGAGATGAACAACA
GACAGAAAGTTTAAAACAAAATGTGAATAAAAGGATAAACTATAGCTTTTGAAAAAATGA
TGAAGGGAGCTTCCTTCTGATACTTGTGAAATGAATCCCAGGTCCTGAATCTACCCTCCT
CATATGTTGCTGGGGTACATGAACACTCTGACTCTAGCTCCCATTGACTTTGGTGGTAGG
TTTGAAGTGAACTTGGCACGGACAACACCGCTGTTACCATGAGGCCTAACGACTTTGCCC
CAAATGCAACGGTAGTGGGAACCATTCTTCTTTGTCTTCCCCTTGTAAATGTAAGCCATC
CTCTTTCCCTTGTACCACGTCACCTCCTCTGTAGTGTTGACTCCTTCAATCTGGATCAAA
AAAGTGTTGGGGTATTGGTTCGACTTCCACCTCTTGTAGCCGAGGACTGTTCCGCGAACA
TACAATCTAACTCTCTCTCCTTGGCGTCCCTTCATTTTCAATCCTGATGCTACTATGTCT
TCTTCCTCCTCCCTGCCTCCACTTTTTATGCCGGCGAGCGAATTACAGAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G071JQ U 47
AF RR2G071TF C 1
BS 1 61 RR2G071TF
BS 62 461 RR2G071JQ
BS 462 595 RR2G071TF

RD RR2G071JQ 415 0 0
AGAGATGAACAACAG
ACAGAAAGTTTAAAACAAAATGTGAATAAAAGGATAAACTATAGCTTTTGAAAAAATGAT
GAAGGGAGCTTCCTTCTGATACTTGTGAAATGAATCCCAGGTCCTGAATCTACCCTCCTC
ATATGTTGCTGGGGTACATGAACACTCTGACTCTAGCTCCCATTGACTTTGGTGGTAGGT
TTGAAGTGAACTTGGCACGGACAACACCGCTGTTACCATGAGGCCTAACGACTTTGCCCC
AAATGCAACGGTAGTGGGAACCATTCTTCTTTGTCTTCCCCTTGTAAATGTAAGCCATCC
TCTTTCCCTTGTACCACGTCACCTCCTCTGTAGTGTTGACTCCTTCAATCTGGATCAAAA
AAGTGTTGGGGTATTGGTTCGACTTCCACCTCTTGTAGCC

QA 16 415 16 415
DS 

RD RR2G071TF 595 0 0
TTCTTTTCTGCTCGAATTCCATCAAAAATAATGTTTTAATTCGTCTAGAGATGAACAACA
GACAGAGAGTTTAAGACAAAATGTGAATAAAAGGATAAACTATAGCTTTTGAAAAAATGA
TGAAGGGAGCTTCCTTCTGATACTTGTGAAATGAATCCCAGGTCCTGAATCTACCCTCCT
CATATGTTGCTGGGGTACATGAACACTCTGACTCTAGCTCCCATTGACTTTGGTGGTAGG
TTTGAAGTGAACTTGGCACGGACAACACCGCTGTTACCATGAGGCCTAGCGACTTTGCCC
CAGATGCAACGGTAGTGGGAACCATTCTTCTTTGTCTTCGCCTTGTAGATGTAAGCCATC
CTCTTTCCCTTGTACCACGTCACCTCCTCTGTAGTGTTGACTCCTTCAATCTGGATCAGA
GAAGTGTTGGGGTATTGGTTCGACTTCGACCTCTTGTAGCCGAGGACTGTTCCGCGAACA
TACAATCTAACTCTCTCTCCTTGGCGTCCCTTCATTTTCAATCCTGATGCTACTATGTCT
TCTTCCTCCTCCCTGCCTCCACTTTTTATGCCGGCGAGCGAATTACAGAGAAAAA

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 7

CO CL1034Contig1 969 7 26 U
GGACGTGTTGAACCAATTCCTTCTCTGTTCTTGATCTCGAGGTGAAAATGGCTAGCGACG
AAGTGAAGGTGATCGGCGCATGGGCGAGTCCTTTTGTGATGAGGCCGAGGATTGCTCTAA
ACCTCAAGTCTGTTCCCTACGAGTTCCTCCAGGAGACATTTGGATCTAAGAGCGAGTTGC
TTCTTAAATCAAACCCGGTTCACAAGAAGATTCCCGTTCTGATTCATGCTGTCAAACCGA
TTTGTGAGTCTAACATCATCGTTGAGTATGTTGATGAGACTTGG*AGCGCATCTGGACCG
TCCATGCTACCTTCTAATCCCTATGACCGAGCCATCTCTCGGTTCTGGGCTGCCTACATT
GACGAAAAGTGGTTTCCCTCTCTAAAAA*GTATCCTACAAGCTGAGGGAGAAGAAGAGAA
GAAAGCTGTGCTAGCTCAAGTGGAAGAAGGGACCGCACTTCTTGAGAAGGCCTTCATCGA
TTGCAGCAAAGGAAAACCATTCTTCAACGGTGAACACGTCGGTTACCTCGACATTGCATT
CGGGTCCTTCCTTGGTTGGTTGAGAGTCACCGAGTTGGCAGCTGGTCATAAAGTTCTTGA
TGAGGCCAAGACTCCTTCTCTATCCAAATGGGCTGAGCAATTTTGTAACGATCCTGCTGT
GAAACCTGTCATGCCCGACACTGCAACTCTGGCTGAATTCGCTAAGAATATCTTTGCCAA
GCCCGCAGCCTAAGTTGATGGTTGTGGTCCTTGTGGATTTGTGGGTTGAGTTCTTGCAAG
AATAAAATGAGAGTGATAGTACTTATTTATTTATGTTTTAATTTTATTTTGCTGTGTTGC
TAAGTGTATTTGGGATATTAAGTTTGTATCAGGCTTGGTGGAATGAAGTAATTTTATATA
TGTAGATTGAGAAGTAAGAAAATGATATCTAATAAAATCCAGCACTGGAAATTGAGAATA
TTTGATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 10 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN48TF U 5
AF RR2F674TF U 1
AF RR2BN63TF U 12
AF RR2EL08TF U 78
AF RR2EL08JQ C 324
AF RR2BN63JQ C 241
AF RR2F674JQ C 221
BS 1 46 RR2F674TF
BS 47 47 RR2FN48TF
BS 48 157 RR2F674TF
BS 158 158 RR2BN63TF
BS 159 163 RR2F674TF
BS 164 164 RR2BN63TF
BS 165 336 RR2F674TF
BS 337 337 RR2BN63TF
BS 338 416 RR2F674TF
BS 417 417 RR2BN63TF
BS 418 456 RR2F674TF
BS 457 457 RR2BN63TF
BS 458 462 RR2F674TF
BS 463 463 RR2BN63TF
BS 464 518 RR2F674TF
BS 519 519 RR2BN63TF
BS 520 545 RR2F674TF
BS 546 546 RR2BN63TF
BS 547 600 RR2F674TF
BS 601 639 RR2BN63TF
BS 640 640 RR2EL08TF
BS 641 716 RR2BN63TF
BS 717 778 RR2EL08TF
BS 779 790 RR2F674JQ
BS 791 791 RR2EL08JQ
BS 792 969 RR2F674JQ

RD RR2FN48TF 325 0 0
GGGTTGA
ACCAATTCCTTCTCTGTTCTTGATCTCGAGGTGAAAATGGCTAGCGACGAAGTGAAGGTG
ATCGGCGCATGGGCGAGTCCTTTTGTGATGAGGCCGAGGATTGCTCTAAACCTCAAGTCT
GTTCCCTACGAGTTCCTCCAGGAGACGTTTGGTTCTAAGAGCGAGTTGCTTCTTAAATCA
AACCCGGTTCACAAGAAGATTCCCGTTCTGATTCATGCTGACAAACCGATTTGTGAGTCT
AACATCATCGTTGAGTATGTTGATGAGACTTGGGAGCGCATCTGGACCGTCCATGCTACC
TTCTAATCCCTATGACCG

QA 8 325 8 325
DS 

RD RR2F674TF 600 0 0
GGACGTGTTGAACCAATTCCTTCTCTGTTCTTGATCTCGAGGTGAAGATGGCTAGCGACG
AAGTGAAGGTGATCGGCGCATGGGCGAGTCCTTTTGTGATGAGGCCGAGGATTGCTCTAA
ACCTCAAGTCTGTTCCCTACGAGTTCCTCCAGGAGACGTTTGGTTCTAAGAGCGAGTTGC
TTCTTAAATCAAACCCGGTTCACAAGAAGATTCCCGTTCTGATTCATGCTGTCAAACCGA
TTTGTGAGTCTAACATCATCGTTGAGTATGTTGATGAGACTTGG*AGCGCATCTGGACCG
TCCATGCTACCTTCTAATCCCTATGACCGAGCCATCGCTCGGTTCTGGGCTGCCTACATT
GACGAAAAGTGGTTTCCCTCTCTAAAAA*GTATCCTACAAGCTGAGGGAGAAGAAGCGAA
GAAAGCTGTGCTAGCTCAAGTGGAAGAAGGGACCGCGCTTCTCGAGAAGGCCTTCATCGA
TTGCAGCAAAGGAAAACCATTCTTCAACGGTGAACACGACGGTTACCTCGACATTGCATT
CGGGTGCTTCCTTGGTTGGTTGAGAGTCACCGAGTTGGCAGCTGGTCATAAAGTTCTTGA

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2BN63TF 705 0 0
ACCAATTCCTTCTCTGTTCTTGATCTTGAGGTGAAAATGGCTAGCGACGAAGTGAAGGTG
ATCGGCGCATGGGCGAGTCCTTTTGTGATGAGGCCGAGGATTGCTCTGAACCTCAAGTCT
GTTCCCTACGAGTTCCTCCAGGAGACATTTGGATCTAAGAGCGAGTTGCTTCTTAAATCA
AATCCTGTTCACAAGAAGATTCCCGTTCTGATTCATGCTGGCAAACCAGTTTGTGAGTCT
AACATCATCGTTGAGTATGTTGATGAGACTTGG*AGCGCATCTGGACCGTCCATGCTACC
TTCTAATCCTTATGACCGAGCCATCTCTCGGTTCTGGACTGCCTACATTGACGAAAAGTG
GTTTCCCTCTCTAAAAAAGTATCCTACAAGCTGAGGGAGAAGAAGAGAAGAAAGCTGTGC
TAGCTCAAGTGGAAGAAGGGACCGCACTTCTTGAGAAGGCCTTCAT*GATTGCAGCAAAG
GAAAACCATTCTTCAACGGTGAACACGTCGGTTACCTCGACATTGCATTCGGGTCCTTCC
TTGGTTGGTTGAGAGTCACCGAGTTGGCAGCTGGTCATAAAGTTCTTGATGAGGCCAAGA
CTCCTTCTCTATCCAAATGGGCTGAGCA*TTTTGTAACGATCCTGCTGTGAAACCTGTCA
TGCCCGACACTGCAACTCTGGCTGAATTCGCTAAGAATATCTTTG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2EL08TF 705 0 0
GCATGGGCGAGTCCTTTTGTGATGAGGCCGAGGATTGCTCTGAACCTCAAGTCTGTTCCC
TACGAGTTCCTCCAGGAGACATTTGGATCTAAGAGCGAGTTGCTTCTTAAATCAAATCCT
GTTCACAAGAAGATTCCCGTTCTGATTCATGCTGGCAAACCAGTTTGTGAGTCTAACATC
ATCGTTGAGTATGTTGATGAGACTTGG*AGCGCATCTGGACCGTCCATGCTACCTTCTAA
TCCTTATGACCGAGCCATCTCTCGGTTCTGGGCTGCCTACATTGACGAAAAGTGGTTTCC
CTCTCTAAAAA*GTATCCTACAAGCTGAGGGAGAATAAGAGAAGAAAGCTGTGCTAGCTC
AAGTGGAAGAAGGGACCGCACTTCTTGAGAAGGCCTTCATCGATTGCAGCAAAGGAAAAC
CATTCTTCAACGGTGAACACGTCGGTTACCTCGACATTGCATTCGGGTCCTTCCTTGGTT
GGTTGAGAGTCACCGAGTTGGCAGCTGGTCATAAAGTTCTTGATGAGGCCAAGACTCCTT
CTCTATCCAAATGGTCTGAGCAATTTTGTAACGATCCTGCTGTGAAACCTGTCATGCCCG
ACACTGCAACTCTGGCTGAATTCGCTAAGAATATCTTTGCCAAGCCCGCAGCCTAAGTTG
ATGGTTGTGGTCCTTGTGGATTTGTGGGTTGAGTTCTTGCA
GATA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2EL08JQ 633 0 0
TGACCGAGCCATCTCTCGGTTCTGGGCTGCCTACATTGACGAAAAGTGGTTTCCCTCTCT
AAAAA*GTATCCTACAAGCTGAGGGAGAATAAGAGAAGAAAGCTGTGCTAGCTCAAGTGG
AAGAAGGGACCGCACTTCTTGAGAAGGCCTTCATCGATTGCAGCAAAGGAAAACCATTCT
TCAACGGTGAACACGTCGGTTACCTCGACATTGCATTCGGGTCCTTCCTTGGTTGGTTGA
GAGTCACCGAGTTGGCAGCTGGTCATAAAGTTCTTGATGAGGCCAAGACTCCTTCTCTAT
CCAAATGGTCTGAGCAATTTTGTAACGATCCTGCTGTGAAACCTGTCATGCCCGACACTG
CAACTCTGGCTGAATTCGCTAAGAATATCTTTGCCAAGCCCGCAGCCTAAGTTGATGGTT
GTGGTCCTTGTGGATTTGTGGGTTGAGTTCTTGCAAGAATAAAATGAGAGTGATAGTACT
TATTTATTTATGTTTTAATTTTATTTTGCTGTGTTGCTAAGTGTATTTGGGATATTAAGT
TTGTATCAGGCTTGGTGGAATGAAGTAATTTTATATATGTAGATTGAGAAGTAAGAAAAT
GATATCTAATAAAATCCAGCACTGGAAATTGAG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2BN63JQ 702 0 0
TTTGTGAGTCTAACATCATCGTTGAGTATGTTGATGAGACTTGG*AGCGCATCTGGACCG
TCCATGCTACCTTCTAATCCTTATGACCGAGCCATCTCTCGGTTCTGGACTGCCTACATT
GACGAAAAGTGGTTTCCCTCTCTAAAAAAGTATCCTACAAGCTGAGGGAGAAGAAGAGAA
GAAAGCTGTGCTAGCTCAAGTGGAAGAAGGGACCGCACTTCTTGAGAAGGCCTTCAT*GA
TTGCAGCAAAGGAAAACCATTCTTCAACGGTGAACACGTCGGTTACCTCGACATTGCATT
CGGGTCCTTCCTTGGTTGGTTGAGAGTCACCGAGTTGGCAGCTGGTCATAAAGTTCTTGA
TGAGGCCAAGACTCCTTCTCTATCCAAATGGGCTGAGCAATTTTGTAACGATCCTGCTGT
GAAACCTGTCATGCCCGACACTGCAACTCTGGCTGAATTCGCTAAGAATATCTTTGCCAA
GCCCGCAGCCTAAGTTGATGGTTGTGGTCCTTGTGGATTTGTGGGTTGAGTTCTTGCAAG
AATAAAATGAGAGTGATAGTACTTATTTATTTATGTTTTAATTTTATTTTGCTGTGTTGC
TAAGTGTATTTGGGATATTAAGTTTGTATCAGGCTTGGTGGAATGAAGTAATTTTATATA
TGTAGATTGAGAAGTAAGAAAATGATATCTAATAAAATCCAG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2F674JQ 749 0 0
GATTCATGCTGTCAAACCGATTTGTGAGTCTAACATCATCGTTGAGTATGTTGATGAGAC
TTGG*AGCGCATCTGGACCGTCCATGCTACCTTCTAATCCCTATGACCGAGCCATCGCTC
GGTTCTGGGCTGCCTACATTGACGAAAAGTGGTTTCCCTCTCTAAAAA*GTATCCTACAA
GCTGAGGGAGAAGAAGCGAAGAAAGCTGTGCTAGCTCAAGTGGAAGAAGGGACCGCGCTT
CTCGAGAAGGCCTTCATCGATTGCAGCAAAGGAAAACCATTCTTCAACGGTGAACACGAC
GGTTACCTCGACATTGCATTCGGGTGCTTCCTTGGTTGGTTGAGAGTCACCGAGTTGGCA
GCTGGTCATAAAGTTCTTGATGAGGCCAAGACTCCTTCTCTATCCAAATGGGCTGAGCAA
TTTTGTAACGATCCTGCTGTGAAACCTGTCATGCCCGACACTGCAACTCTGGCTGAATTC
GCTAAGAAGATCTTTGCCAAGCCCGCGGCCTAAGCTGATGGTTGTGGTCCTTGTGAATTT
GTGGGTTGAGTTCTTGCAAGAATAAAATGATAGTGATAGTACTTATTTATTTATGTTTTA
ATTTTATTTTGCTGTGTTGCTAAGTGTATTTGGGATATTAAGTTTGTATCAGGCTTGGTG
GAATGAAGTAATTTTATATATGTAGATTGAGAAGTAAGAAAATGATATCTAATAAAATCC
AGCACTGGAAATTGAGAATATTTGATATG

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 5

CO CL1035Contig1 1148 5 19 U
GGAACAGAAAGAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGAAAAAGACCAAACAGGAAAAGTAAGAAT
GTCAGACGCAGAACAAGAAGAAGAAACGTCAAGTGCTGCTGTTAGAGGTTCGTTAAGTTT
CGATCTTCCCGAGGAAGTCCTTCAAGTCCTACCATCCGATCCATTCGAGCAGCTGGATGT
GGCCCGCAAAATCACATCCATTGCTCTCTCGACACGTGTCTCTGCTCTCGAATCAGAGTC
GTCCGATCTTCGTGAGCTTCTCGCCGAGAAAGACAATCAAATCGCCGAGCTCCAATCACA
CGTGGAGTCTCTCGACGCGTCTCTCTCCGACGCGTTGCAAAAGCTTTCTCTCGCCGAAGA
TGAAAAGGAGAATCTGGTCAGAGAGAACTCATCGTTGTCGAGTACTGTCAGGAGACTCCA
GAGAGATGTCTCTAAGCTTGAGGGTTTCAGGAAGACGCTTATGATGTCTCTTCAAGACGA
CGACCAAAATGCAGGAACAACACAAATTATTGCTAAGCCAACACCAAACGATGAAGATTC
TCCATTTCAACCTTCAAGATATTCATCAATCCAGTCTCAAGCTTCTGAAGCTGTTGAACC
AGCTCCAGTGGACAACGAAAGCGAAGCTCCTAAACCGAGTTTATCAAACAGTCTTCCATT
AGTATCTCAGACTGCTACGCCTCGGCTTACTCCTCCTGGTTCTCCACCAGCATTATCTGC
TTCTAGTACCCCTAAA*CGACTTCAAGACCTATCTCCCCTCGTCGCCATTCTGTGTCCTT
CTCTACTACTAGAGGCATGTTTGATGATACTAGATCTTCTATCTCGATCTCAGAGCCTGG
ATCCCACACCGGACGAACTCGGGTTGATGGAAAAGAGTTCTTCCGACAAGTCAGGAGCCG
GTTATCTTACGAGCAGTTTGGTGCATTCCTTGGAAATGTGAAGGATCTTAATGCTCACAA
GCAAACAAAAGATGAAACGCTTAGGAAAGCTGAAGAGATATTCGGAAGCGACAACAGAGA
TCTCTATGTCATATTCGAGGGCTTGATCACTCGCAACGCTCACTGAGAGTTTGCATTCTT
GTGTTACACGTTAAGAAGTTATATACTCGGAACTCTTCAGACTCAAATTTCTTTTGTTTT
CTTGGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D027TF U 40
AF RR2CO06TF U 1
AF RR2FQ65TF U 28
AF RR2F854JQ C 825
AF RR2CO06JQ C 632
BS 1 39 RR2CO06TF
BS 40 40 RR2FQ65TF
BS 41 53 RR2CO06TF
BS 54 54 RR2FQ65TF
BS 55 390 RR2CO06TF
BS 391 393 RR2FQ65TF
BS 394 713 RR2CO06TF
BS 714 714 RR2FQ65TF
BS 715 731 RR2CO06TF
BS 732 732 RR2FQ65TF
BS 733 742 RR2CO06TF
BS 743 745 RR2FQ65TF
BS 746 746 RR2CO06JQ
BS 747 792 RR2FQ65TF
BS 793 849 RR2CO06JQ
BS 850 850 RR2F854JQ
BS 851 1038 RR2CO06JQ
BS 1039 1039 RR2F854JQ
BS 1040 1148 RR2CO06JQ

RD RR2D027TF 456 0 0
GGAAAC
AGGAAAAGTAAGAATGTCAGACGTAGAACAAGAAGGAGAAACGTCAAGTGCTG***TTAG
AGGTTCGTTAAGTTTCGATCTTCCCGAGGAAGTCCTTCAAGTCTTACCGTCCGATCCATT
CGAGCAGCTGGATGTGGCCCGCAAAATCACATCCATTGCTCTCTCGACACGTGTCTCTGC
TCTCGAATCAGAGTCGTCCGATCTCCGTGAGCTTCTCGCCGAGAAAGACAATCAAATCGC
CGAGCTCCAATCACACGCGGAGTCTCTCGACGCGTCTCTCTCCGACGCGTTGCAAAAGCT
TTCTCTCGCCGAAGATGAAAAGGAGAATCTGGTGAGAGAGAACTCTTCGTTGTCGAGTAC
TGTCAGGAGACTCCAGAGAGATGTCTCTAAGCTTGAGGGTTTCAGGAAGACGCTTATGAT
GTCTCTTCAAGACGACGACCAAAATGC
GGG

QA 7 453 7 453
DS 

RD RR2CO06TF 760 0 0
GGAACAGAAAGAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGAAAAAGATCAAACAGGAAAAGAAAGAAT
GTCAGACGCAGAACAAGAAGAAGAAACGTCAAGTGCTGCTGTTAGAGGTTCGTTAAGTTT
CGATCTTCCCGAGGAAGTCCTTCAAGTCCTACCATCCGATCCATTCGAGCAGCTGGATGT
GGCCCGCAAAATCACATCCATTGCTCTCTCGACACGTGTCTCTGCTCTCGAATCAGAGTC
GTCCGATCTTCGTGAGCTTCTCGCCGAGAAAGACAATCAAATCGCCGAGCTCCAATCACA
CGTGGAGTCTCTCGACGCGTCTCTCTCCGACGCGTTGCAAAAGCTTTCTCTCGCCGAAGA
TGAAAAGGAGAATCTGGTCAGAGAGAACTC***GTTGTCGAGTACTGTCAGGAGACTCCA
GAGAGATGTCTCTAAGCTTGAGGGTTTCAGGAAGACGCTTATGATGTCTCTTCAAGACGA
CGACCAAAATGCAGGAACAACACAAATTATTGCTAAGCCAACACCAAACGATGAAGATTC
TCCATTTCAACCTTCAAGATATTCATCAATCCAGTCTCAAGCTTCTGAAGCTGTTGAACC
AGCTCCAGTGGACAACGAAAGCGAAGCTCCTAAACCGAGTTTATCAAACAGTCTTCCATT
AGTATCTCAGACTGCTACGCCTCGGCTTACTCCTCCTGGTTCTCCACCAGCAT*ATCTGC
TTCTAGTACCC*TAAA*CGACT
CAGACTATCTCCCTCGTC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2FQ65TF 765 0 0
GGAAGA
AAAAGACCAAACAGGAAAAGTAAGAATGTCAGACGCAGAACAAGAAGAAGAAACGTCAAG
TGCTGCTGTTAGAGGTTCGTTAAGTTTCGATCTTCCCGAGGAAGTCCTTCAAGTCCTACC
ATCCGATCCATTCGAGCAGCTGGATGTGGCCCGCAAAATCACATCCATTGCTCTCTCGAC
ACGTGTCTCTGCTCTCGAATCAGAGTCGTCCGATCTTCGTGAGCTTCTCGCCGAGAAAGA
CAATCAAATCGCCGAGCTCCAATCACACGTGGAGTCTCTCGACGCGTCTCTCTCCGACGC
GTTGCAAAAGCTTTCTCTCGCCGAAGATGAAAAGGAGAATCTGGTCAGAGAGAACTCATC
GTTGTCGAGTACTGTCAGGAGACTCCAGAGAGATGTCTCTAAGCTTGAGGGTTTCAGGAA
GACGCTTATGATGTCTCTTCAAGACGACGACCAAAATGCAGGAACAACACAAATTATTGC
TAAGCCAACACCAAACGATGAAGATTCTCCATTTCAACCTTCAAGATATTCATCAATCCA
GTCTCAAGCTTCTGAAGCTGTTGAACCAGCTCCAGTGGACAACGAAAGCGAAGCTCCTAA
ACCGAGTTTATCAAACAGTCTTCCATTAGTATCTCAGACTGCTACGCCTCGGCTTACTCC
TCCTGGTTCTCCACCAGCATTATCTGCTTCTAGTACCCCTAAA*CGACTTCA*GACCTAT
CTCCCCTCGTCGCCATTCTGTGTCCTTCTCTACTACTAG

QA 7 765 7 765
DS 

RD RR2F854JQ 265 0 0
CG
ATCTCAGAGCCTGGATCCCACACCGGACGAACTCGGGTTGATGGAAAAGAGTTCTTCCGA
CAAGTCAGGAGCCGGTTATCTTACGAGCAGTTTGGTGCATTCCTTGGAAATGTGAAGGAT
CTTAATGCTCACAAGCAAACAAAAGATGAAACGCTTAGGAAAGCTGAAGAGATATTCGGA
AGCGACAACAGAGATCTTTATGTCATATTCGAGGGCTTGATCACTCGCAGCGCTCACTGA
GAGTTTGCATTCTTGTGTTACAC

QA 3 265 3 265
DS 

RD RR2CO06JQ 517 0 0
AAACCGAGTTTATCAAACAGTCTTCCATTAGTATCTCAGACTGCTACGCCTCGGCTTACT
CCTCCTGGTTCTCCACCAGCATTATCTGCTTCTAGTACCCCTAAAACGACTTCAAGACCT
ATCTCCCCTCGTCGCCATTCTGTGTCCTTCTCTACTACTAGAGGCATGTTTGATGATACT
AGATCTTCTATCTCGATCTCAGAGCCTGGATCCCACACTGGACGAACTCGGGTTGATGGA
AAAGAGTTCTTCCGACAAGTCAGGAGCCGGTTATCTTACGAGCAGTTTGGTGCATTCCTT
GGAAATGTGAAGGATCTTAATGCTCACAAGCAAACAAAAGATGAAACGCTTAGGAAAGCT
GAAGAGATATTCGGAAGCGACAACAGAGATCTCTATGTCATATTCGATGGCTTGATCACT
CGCAACGCTCACTGAGAGTTTGCATTCTTGTGTTACACGTTAAGAAGTTATATACTCGGA
ACTCTTCAGACTCAAATTTCTTTTGTTTTCTTGGCTC

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 6

CO CL1036Contig1 1243 6 18 U
GGAAAGAAAATCTATTTGATCAAATAATGTCTAGAAGATTTCTTGAACTTTACAATGTAT
CATGCTTTGGCCAAAAGCTATAAATCTACTTTTCTTGATTAAGTAAACATTTATATGGCG
AGGTTGGCTTTCCTCGGTACAGAGTCTTGGCTTTTAGGGTTTTGAAGAACAAATGTACAT
AAAAAAACCCTTAATTTGAAAGGCAAAATGCCATCGCTTTTCTAGTCGAAAGGGTCAAAT
CGTGGGTCGTGCTCACTAGCTGTGACCATCCCAGTACATAGACAAGTCGGACACATCACC
TTTCCTGCGCCGGAACAGTTTAGACACCTTTCTGTTGTCGGAGCTTGCAGAAGCCTGCTT
GAAGCTCTTGTCCGTTTTATTGGATAAACGCTTAAGCACACACCACTTGCAGAACATTTA
GCGCATGGCAAGTATCCAGTCCCAAGGCAGTACTTGCACCTCTTCTTCTCTTGTTGTTTA
ACATTGTTCACTTCAATTAACATCAATGTCGAAAATGACACCAACGGCTCCCCCAGAAAA
TGATGCCACAATGGGATCTACTTGGCTTAATTGCAAGGGGAGATGCAAGCTCCTTATGAA
ATCCTCGTACGAGGTCCCTCCTAATCCTACCTTCAGCTCCAGCTTAGGTGCAATGAGACC
ACCAAAGAAAATTATTCCAGAGATCAAAGCAACGCTGGTCAAGTAGAGTTGTTTCAGAGT
CTTTGGTGTCACGTTAGGGAGAAAAGGAATGGAAAAAGGGATCTCAGGCATCTCTGTTGC
CTCGAGAAGAGTCTCCCCCTCGTTGATGGATTTAACACTCTTGATCCGTTGCTGAACGCG
TAACCTCCTGACTTCCTCCATGAGGAGAAAGATCTTGTTGCGTCTGCTCCTTATGTTGTC
TTGAATCTCCTGAAGCTGCATCTGCACAAAGTCCTGAACCGTCTCTGATCCCTCGATGAT
ACAGAAGTTATTTGGAACAGAGTCGCCGGCGGGAGGAGGTCCGTTGTTGCTGGCGGCTGA
GCAGGAGAGGGTAGAGCGAGATGAGCCATGTGAGAGTAGACGAGGGGTGGGTTTGAGATG
AGATGAAGGGAACAAGAGTAGGGATCTAGATGTAGAGGTAAGAGGAATACGAGGAGGAGG
AGAAGAGAAGGTCGTCGTCATCATCTTCTCGGGCTATGCTTTCGTTGTCAAGACGTTTCT
GGATAACTAACCAAAGCTACCACACTTTTCGGCCGATACCCGA


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG29JQ U 1
AF RR2FA26JQ U 1
AF RR2GJ57JQB U 1
AF RR2H870JQ U 1
AF RR2DG29TF C 626
AF RR2GJ57TF C 635
BS 1 331 RR2DG29JQ
BS 332 332 RR2FA26JQ
BS 333 362 RR2DG29JQ
BS 363 363 RR2FA26JQ
BS 364 385 RR2DG29JQ
BS 386 386 RR2GJ57JQB
BS 387 514 RR2DG29JQ
BS 515 515 RR2GJ57JQB
BS 516 647 RR2DG29JQ
BS 648 648 RR2H870JQ
BS 649 669 RR2DG29JQ
BS 670 670 RR2GJ57JQB
BS 671 693 RR2DG29JQ
BS 694 698 RR2GJ57JQB
BS 699 741 RR2H870JQ
BS 742 1099 RR2DG29TF
BS 1100 1100 RR2GJ57TF
BS 1101 1243 RR2DG29TF

RD RR2DG29JQ 693 0 0
GGAAAGAAAATCTATTTGATCAAATAATGTCTAGAAGATTTCTTGAACTTTACAATGTAT
CATGCTTTGGCCAAAAGCTATAAATCTACTTTTCTTGATTAAGTAAACATTTATATGGCG
AGGTTGGCTTTCCTCGGTACAGAGTCTTGGCTTTTAGGGTTTTGAAGAACAAATGTACAT
AAAAAAACCCTTAATTTGAAAGGCAAAATGCCATCGCTTTTCTAGTCGAAAGGGTCAAAT
CGTGGGTCGTGCTCACTAGCTGTGACCATCCCAGTACATAGACAAGTCGGACACATCACC
TTTCCTGCGCCGGAACAGTTTAGACACCTTT*TGTTGTCGGAGCTTGCAGAAGCCTGCTT
GAGGCTCTTGTCCGTTTTATTGGATCAACGCTTAAGCACACACCACTTGCAGAACATTTA
GCGCATGGCAAGTATCCAGTCCCAAGGCAGTACTTGCACCTCTTCTTCTCTTGTTGTTTA
ACATTGTTCACTTCAATTAACATCAATGTCGAAA*TGACACCAACGGCTCCCCCAGAAAA
TGATGCCACAATGGGATCTACTTGGCTTAATTGCAAGGGGAGATGCAAGCTCCTTATGAA
ATCCTCGTACGAGGTCCCTCCTAATCCTACCTTCAGCTCCAGCTTAG*TGCAATGAGACC
ACCAAAGAAGATTATTCCAGAGATCAAAGCAAC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2FA26JQ 682 0 0
GA
AAAGAAAATCTATTTGATCAAATAATGTCTAGAAGATTTCTTGAACTTTACAATGTATCA
TGCTTTGGCCAAAAGCTATAAATCTACTTTTCTTGATTAAGTAAACATTTATATGGCGAG
GTTGGCTTTCCTCGGTACAGAGTCTTGGCTTTTAGGGTTTTGAAGAACAAATGTACATAA
AAAAACCCTTAATTTGAAAGGCAAAATGCCATCGCTTTTCTAGTCGAAAGGGTCAAATCG
TGGGTCGTGCTCACTAGCTGTGACCATCCCAGTACATAGACAAGTCGGACACATCACCTT
TCCTGCGCCGGAACAGTTTAGACACCTTTCTGTTGTCGGAGCTTGCAGAAGCCTGCTTGA
AGCTCTTGTCCGTTTTATTGGATCAACGCTTAAGCACACACCACTTGCAGAACATTTAGC
GCATGGCAAGTATCCAGTCCCAAGGCAGTACCTGCACCTCTTCTTCTCTTGTTGTTTAAC
ATTGTTCACTTCAATTAACATCAATGTCGAAA*TGACACCAACGGCTCCCCCAGAAAATG
ATGCCACAATGGGATCTACTTGGCTTAATTGCAAGGGGAGATGCAAGCTCCTTATGAAAT
CCTCGTACGAGGTCCCTCCTAATCCTACCTTCAGCTCCAGCTTAG*TGCAATGAGACCAC
CAAAGAA
GATGATCCCAGAT

QA 3 669 3 669
DS 

RD RR2GJ57JQB 698 0 0
GG
AAAGAAAATCTATTTGATCAAATAATGTCTAGAAGATTTCTTGAACTTTACAATGTATCA
TGCTTTGGCCAAAAGCTATAAATCTACTTTTCTTGATTAAGTAAACATTTATATGGCGAG
GTTGGCTTTCCTCGGTACAGAGTCTTGGCTTTTAGGGTTTTGAAGAACAAATGTACATAA
AAAAACCCTTAATTTGAAAGGCAAAATGCCATCGCTTTTCTAGTCGAAAGGGTCAAATCG
TGGGTCGTGCTCACTAGCTGTGACCATCCCAGTACATAGACAAGTCGGACACATCACCTT
TCCTGCGCCGGAACAGTTTAAACACCTTTCTGTTGTCGGAGCTTGCAGAAGCCTGCTTGA
AGCTCTTGTCCGTTTTATTGGATAAACGCTTAAGCACACACCACTTGCAGAACATTTAGC
GCATGGCAAGTATCCAGTCCCAAGGCAGTACTTGCAC*TCTTCTTCTCTTGTTGTTTAAC
ATTGTTCACTTCAATTAACATCAATGTCGAAAATGACACCAACGGCTCCCCCAGAAAATG
ATGCCACAATGGGATCTACTTGGCTTAATTGCAAGGGGAGATGCAAGCTCCTTATGAAAT
CCTCGTACGAGGTCCCTCCTAATCCTACCTTCAGCTCCAGCTTAG*TGCAATGAGACCAC
CAAAGAAAATTATTCCAGAGATCAAAGCAACGCTGG

QA 3 698 3 698
DS 

RD RR2H870JQ 741 0 0
GG
AAAGAAAATCTATTTGATCAAATAATGTCTAGAAGATTTCTTGAACTTTACAATGTATCA
TGCTTTGGCCAAAAGCTATAAATCTACTTTTCTTGATTAAGTAAACATTTATATGGCGAG
GTTGGCTTTCCTCGGTACAGAGTCTTGGCTTTTAGGGTTTTGAAGAACAAATGTACATAA
AAAAACCCTTAATTTGAAAGGCAAAATGCCATCGCTTTTCTAGTCGAAAGGGTCAAATCG
TGGGTCGTGCTCACTAGCTGTGACCATCCCAGTACATAGACAAGTCGGACACATCACCTT
TCCTGCGCCGGAACAGTTTAGACACCTTTCTGTTGTCGGAGCTTGCAGAAGCCTGCTTGA
AGCTCTTGTCCGTTTTATTGGATAAACGCTTAAGCACACACCACTTGCAGAACATTTAGC
GCATGGCAAGTATCCAGTCCCAAGGCAGTACTTGCAC*TCTTCTTCTCTTGTTGTTTAAC
ATTGTTCACTTCAATTAACATCAATGTCGAAAATGACACCAACGGCTCCCCCAGAAAATG
ATGCCACAATGGGATCTACTTGGCTTAATTGCAAGGGGAGATGCAAGCTCCTTATGAAAT
CCTCGTACGAGGTCCCTCCTAATCCTACCTTCAGCTCCAGCTTAGGTGCAATGAGACCAC
CAAAGAAAATTATTCCAGAGATCAAAGCAACGCTGGTCAAGTAGAGTTGTTTCAGAGTCT
TTGGTGTCACGTTAGGGAG

QA 3 741 3 741
DS 

RD RR2DG29TF 618 0 0
TCCTA
CTTCAGCTCCAGCTTAGGTGCAATGAGACCACCAAAGAAGATTATTCCAGAGATCAAAGC
AACGCTGGTCAAGTAGAGTTGTTTCAGAGTCTTTGGTGTCACGTTAGGGAGAAAAGGAAT
GGAAAAAGGGATCTCAGGCATCTCTGTTGCCTCGAGAAGAGTCTCCCCCTCGTTGATGGA
TTTAACACTCTTGATCCGTTGCTGAACGCGTAACCTCCTGACTTCCTCCATGAGGAGAAA
GATCTTGTTGCGTCTGCTCCTTATGTTGTCTTGAATCTCCTGAAGCTGCATCTGCACAAA
GTCCTGAACCGTCTCTGATCCCTCGATGATACAGAAGTTATTTGGAACAGAGTCGCCGGC
GGGAGGAGGTCCGTTGTTGCTGGCGGCTGAGCAGGAGAGGGTAGAGCGAGATGAGCCATG
TGAGAGTAGACGAGGGGTGGGTTTGAGATGAGATGAAGGGAACAAGAGTGGGGATCTAGA
TGTAGAGGTAAGAGGAATACGAGGAGGAGGAGAAGAGAAGGTCGTCGTCATCATCTTCTC
GGGCTATGCTTTCGTTGTCAAGACGTTTCTGGATAACTAACCAAAGCTACCACACTTTTC
GGCCGATACCCGA

QA 6 618 6 618
DS 

RD RR2GJ57TF 586 0 0
AGCTCCAGCTTAGGTGCAATGAGACCACCAAAGAAAATTATTCCAGAGATCAAAGCAACG
CTGGTCAAGTAGAGTTGTTTCAGAGTCTTTGGTGTCACGTTAGGGAGAAAAGGAATGGAA
GAAGGGATCTCAGGCATCTCTGTTGCCTCGAGAAGAGTCTCCTCCTCGTTGATGGATTTA
ACACTCTTGATCCGTTGCTGAACGCGTAACCTCCTGACTTCCTCCATGAGGAGAAAGATC
TTGTTGCGTCTGCTCCTTATGTTGTCTTGAATCTCCTGAAGCTGCATCTGCACAAAGTCC
TGAACCGTCTCTGATCCCTCGATGATACAGAAGTTATTTGGAACAGAGTCGCCGGCGGGA
GGAGGTCCGTTGTTGCTGGCGGCTGAGCAGGAGAGGGTAGAGCGAGATGAGCCATGTGAG
AGTAGACGAGGGGTGGGTTTGAGATGAGATGAAGGGAACAAGAGTAGGGATCTAGATGTC
GAGGTAAGAGGAATACGAGGAGGAGGAGAGGAGAAGGTCGTCGTCATCATCTTCTCGGGC
TATGCTTTCGTTGTCAAGACGTTTCTGGATAACTAACCAAAGCT
CC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 2 7

CO CL1037Contig1 790 3 3 U
GGTTCCATAAACCTCTAAAGCTCTTTCTTTCAGATTCCTCTCTATCCATTTGATAGACTC
GCCACAAAAAAAATCAGTTTCTCTCTCTCTAAGCAAAGAAAAACCGAAGGAACTCCATTC
TCACAAGAATGGGGAAGCTTAAGCAATGTTGGTCGAGTGTGCTAGTGTTGGCAATAGTGG
TGATCGGAACAGGAGCCGTTCCCATCACTTATCTACAAAGCGCCGTAGCTAAAGGAGCCG
TGTGTTTGGATGGGAGTGCACCAGCCTACCATTTCGACAAAGGGTTTGGCTCGGGAGTTA
ACAACTGGATTGTTCACATGGAGGGAGGAGGATGGTGTACCGATGTGGCTTCATGTATTA
AGCGTAAGGGTACAATGAAGGGTTCGTCCAAATTCATGAACAAAGACTTTGGTTTCTCCG
GTATCTTGGGTGGCAAGCAAAACACTAACCCAGATTTTTACAATTGGAATAGAATCAAAG
TACGTTATTGTGACGGATCATCTTTCACCGGCAATGTAGAAGCTGTTAATCCGGCGAATA
AGCTGTTCTTCCGCGGTGCACGAGTTTGGCGTGCGGTGATCGATGATCTCATGGCTAAAG
GAATGAAAAACGCTCAAAATGCGATACTCTCGGGTTGTTCAGCCGGAGCATTGGCGGCAA
TTCTACATTGTGACACTTTCCGCGCCATACTTCCCCGGACAGCTAGAGTCAAATGTGTTT
CGGACGCCGGTACTTCATCCACGGTAAGATATCTCAGAGATCATACATACATCTTACTAC
AGTAAAGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H949TF U 139
AF RR2CV96TF U 42
AF RR2CP13TF U 1
BS 1 72 RR2CP13TF
BS 73 73 RR2CV96TF
BS 74 790 RR2CP13TF

RD RR2H949TF 134 0 0
TTAAGCAATGTTGGTCGAGTGTGCTAGTGTTGGCAATAGTGGTGATCGGAACAGGAGCCG
TTCCCATCACTTATCTACAAAGCGCCGTACCTAAAGGAGCCGTGTGTTTGGATGGGAGTG
CACCACCCTACCAT

QA 1 134 1 134
DS 

RD RR2CV96TF 612 0 0
GG
ATCCATTTGATAGACTCGCCACAAAAAAAATCAGTTTCTCTCTCTCTAAGCAAAGAAAAA
CTGAAGGAACTCCATTCTCACAAGAATGGGGAAGCTTAAGCAATGTTGGTCGAGTGTGCT
AGTGTTGGCAATAGTGGTGATCGGAACAGGAGCCGTTCCCATCACTTATCTACAAAGCGC
CGTAGCTAAAGGAGCCGTGTGTTTGGATGGGAGTGCACCAGCCTACCATTTCGACAAAGG
GTTTGGTTCGGGAGTTAACAACTGGATTGTTCACATGGAGGGAGGAGGATGGTGTACCGA
TGTGGCTTCATGTATTAAGCGTAAGGGTACAATGAAGGGTTCGTCCAAATTCATGAACAA
AGACTTTGGTTTCTCCGGTATCTTGGGTGGCAAGCAAAACACTAACCCAGATTTTTACAA
TTGGAATAGAATCAAAGTACGTTATTGTGACGGATCATCTTTCACCGGCAATGTAGAAGC
TGTTAATC*GGCGAATAAGCTGTTCTTCCGCGGTGCACGAGTTTGGCGTGCGGTGATCGA
TGATCTCATGGCTAAAGGAATGAAAAACGCTCAAAATGCGATACTCTCGGGTTGTTCCGC
CGGAGCATTG

QA 3 612 3 612
DS 

RD RR2CP13TF 790 0 0
GGTTCCATAAACCTCTAAAGCTCTTTCTTTCAGATTCCTCTCTATCCATTTGATAGACTC
GCCACAAAAAAA*TCAGTTTCTCTCTCTCTAAGCAAAGAAAAACCGAAGGAACTCCATTC
TCACAAGAATGGGGAAGCTTAAGCAATGTTGGTCGAGTGTGCTAGTGTTGGCAATAGTGG
TGATCGGAACAGGAGCCGTTCCCATCACTTATCTACAAAGCGCCGTAGCTAAAGGAGCCG
TGTGTTTGGATGGGAGTGCACCAGCCTACCATTTCGACAAAGGGTTTGGCTCGGGAGTTA
ACAACTGGATTGTTCACATGGAGGGAGGAGGATGGTGTACCGATGTGGCTTCATGTATTA
AGCGTAAGGGTACAATGAAGGGTTCGTCCAAATTCATGAACAAAGACTTTGGTTTCTCCG
GTATCTTGGGTGGCAAGCAAAACACTAACCCAGATTTTTACAATTGGAATAGAATCAAAG
TACGTTATTGTGACGGATCATCTTTCACCGGCAATGTAGAAGCTGTTAATCCGGCGAATA
AGCTGTTCTTCCGCGGTGCACGAGTTTGGCGTGCGGTGATCGATGATCTCATGGCTAAAG
GAATGAAAAACGCTCAAAATGCGATACTCTCGGGTTGTTCAGCCGGAGCATTGGCGGCAA
TTCTACATTGTGACACTTTCCGCGCCATACTTCCCCGGACAGCTAGAGTCAAATGTGTTT
CGGACGCCGGTACTTCATCCACGGTAAGATATCTCAGAGATCATACATACATCTTACTAC
AGTAAAGTGT

QA 1 790 1 790
DS 



CO CL1037Contig2 850 4 10 U
GGTCTTAATAAACTCTTTTTATTCATCTCAGCAATTAATAATTTATCCGAATATCCGAGT
GATTTTTATTTGAAATTTTAAAAATTACATTTTT*CAATAATATAATATAAGATTTATTC
GTCGGTAGAGATAGCAGGACAAGTAGGGTTGCAAATCGGCGACGGACAGTCTATCTTCTG
GAATGCACTCCGGCCGTAAAACCAGTTTCCTACCGCTACGGAAATTTTCGTGTTGGCGAC
TTGGGGACCTTTGGCGCCGGACCAAGAGGCGGCGCTTCCACCTTGGCAATGAGCGTGACA
CGAGTCCAAGAACAATCCTCTCGACGGAGTACTGTGGACCGGAGACAATGCTCGCATCAT
CTCATCTCTAAACCCTTGGACGGTTTTGAGCTGAGCGGCCGAACATTTCTTGAGATCGAG
CTTGCAGTTCGCCCACTCTTTCCGCTTATCTACTCCCGTCGGAGCCAAAACGTTCTTGAT
CTGCCAGGAGTCGAATGCAGCGTTAATGACAAAGAGCGGTGTTCGCATGGAAGGGACGAC
GTATTGCGGGAAGAAACAGAGTTCGGGTTTCATTTTTGAGGTACATGAAAGAGGAAGACT
CTTTGCAGATCCGTGGAGTGCAACAACTTTACTGTAGTAAGATTGTATGTATGATCCTCC
TGAGATATCTTTACCGTGGATGAAGTAACCGGCGTCCGAAACACATTTGACTCTAGCTGT
CCGGGGAAGTATGGCGCGGAAAGTGTCACAATGTAGAATTGCCGCCAATGCTCCGGCTGA
ACAACCCGAGAGTATCGCATTTTGAGCGTTTTTCATTCCTTTAGCCATGAGATCATCGAT
CACCGCACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 15 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV96JQ U 1
AF RR2CB85TF C 41
AF RR2H949JQ U 7
AF RR2CP13JQ U 52
BS 1 210 RR2CV96JQ
BS 211 211 RR2CP13JQ
BS 212 219 RR2CV96JQ
BS 220 220 RR2CP13JQ
BS 221 231 RR2CV96JQ
BS 232 232 RR2CP13JQ
BS 233 324 RR2CV96JQ
BS 325 325 RR2CP13JQ
BS 326 710 RR2CV96JQ
BS 711 850 RR2CP13JQ

RD RR2CV96JQ 710 0 0
GGTCTTAATAAACTCTTTTTATTCATCTCAGCAATTAATAATTTATCCGAATATCCGAGT
GATTTTTATTTGAAATTTTAAAAATTACATTTTT*CAATAATATAATATAAGATTTATTC
GTCGGTAGAGATAGCAGGACAAGTAGGGTTGCAAATCGGCGACGGACAGTCTATCTTCTG
GAATGCACTCCGGCCGTAAAACCAGTTTCCCACCGCTACCGAAATTTTCGTATTGGCGAC
TTGGGGACCTTTGGCGCCGGACCAAGAGGCGGCGCTTCCACCTTGGCAATGAGCGTGACA
CGAGTCCAAGAACAATCCTCTCGATGGAGTACTGTGGACCGGAGACAATGCTCGCATCAT
CTCATCTCTAAACCCTTGGACGGTTTTGAGCTGAGCGGCCGAACATTTCTTGAGATCGAG
CTTGCAGTTCGCCCACTCTTTCCGCTTATCTACTCCCGTCGGAGCCAAAACGTTCTTGAT
CTGCCAGGAGTCGAATGCAGCGTTAATGACAAAGAGCGGTGTTCGCATGGAAGGGACGAC
GTATTGCGGGAAGAAACAGAGTTCGGGTTTCATTTTTGAGGTACATGAAAGAGGAAGACT
CTTTGCAGATCCGTGGAGTGCAACAACTTTACTGTAGTAAGATTGTATGTATGATCCTCC
TGAGATATCTTTACCGTGGATGAAGTAACCGGCGTCCGAAACACATTTGA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2CB85TF 642 0 0
ATTTATCCGAATATCCGAGTGATTTTTATTTGAAATTTTAAAAATTACATTTT**CAATA
ATATAATATAAGATTTATTCGTCGGTAGAGATAGCAGGACAAGTAGGGTTGCAAATCGGC
GACGGACAGTCTATCTTCTGGAATGCCCTCCGCCCGTAAAACCAGTTTCCTACCGCTACG
GAAATTTTCGTGTTGGCGACTTGGGGACCTTTGGCGCCGGACCAAGAGGCGGCGCTTCCA
CCTTGGCAATGAGCGTGACACGAGTCCAAGAACAATCCTCTCGACGGAGTACTGTGGACC
GGAGACAATGCTCGCATCATCTCATCTCTAAACCCTTGGACGGTTTTGAGCTGAGCGGCC
GAACATTTCTTGAGATCGAGCTTGCAGTTCGCCCACTCTTTGCGCTTATCTACTCCCGTC
GGAGCCAAAACGTTCTTGATCTGCCAGGAGTCGAATGCAGCGTTAATGACAAAGAGCGGT
GTTCGCATGGAAGGGACGACGTATTGCGGGAAGAAACAGAGTTCGGGTTTCATTTTTGAG
GTACATGAAAGAGGAAGACTCTTTGCAGATCCGTGGAGTGCAACAACTTTACTGTAGTAA
GATTGTATGTATGATCCTCCTGAGATATCTTTACCGTGGAT
C

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2H949JQ 710 0 0
AATAAACTCTTTTTATTCATCTCAGCAATTAATAATTTATCCGAATATCCGAGTGATTTT
TATTCGAAATTTTAAAAATTACATTTTT*CAATAATATAATATAAGATTTATTCGTCGGT
AGAGATAGCAGGACAAGTAGGGTTGCAAATCGGCGACGGACAGTCTATCTTCTGGAATGC
ACTCCGGCCGTAAAACCAGTTTCCGACCGCTACCGAAATTTTCGTATTGGCGACTTGGGG
ACCTTTGGCGCCGGACCAAGAGGCGGCGCTTCCACCTTGGCAATGAGCGTGACACGAGTC
CAAGAACAATCCTCTCGATGGAGTACTGTGGACCGGAGACAATGCTCGCATCATCTCATC
TCTAAACCCTTGGACGGTTTTGAGCTGAGCGGCCGAACATTTCTTGAGATCGGGCTTGCA
GTTCGCCCACTCTTTCCGCTTATCTACTCCCGTCGGAGCCAAAACGTTCTTGATCTGCCA
GGAGTCGAATGCAGCGTTAATGACAAAGAGCGGTGTTCGCATGGAAGGGACGACGTATTG
CGGGAAGAAACAGAGTTCGGGTTTCATTTTTGAGGTACATGAAAGAGGAAGACTCTTTGC
AGATCCGTGGAGTGCAACAAATTTACTGTAGTAAGATTGTATGTATGATCCTCCTGAGAT
ATCTTTACCGTGGATGAAGTAACCGGCGTCCGAAACACATTTGA
CTCTAG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2CP13JQ 799 0 0
ATCCGAGAGAT
TTTTTATTTGGAATTTTTAAAATTACATTTTTTCAATAATACA***TAAAATTTATTCGT
CGGTAGAGATGGCAAGACAAGTAGGGTTGCAAATCGGCGACGGACAGTCTATCTTCTGGA
ATGCACTCCGGCCGTAAAACCAGTTTCCTACCGCTACGGAAATTTTCGTGTTGGCGACTT
GGGGACCTTTGGCGCCGGACCAAGAGGCGGCGCTTCCACCTTGGCAATGAGCGTGACACG
TGTCCAAGAACAATCCTCTCGACGGAGTACTGTGGACTGGAGACAATGCTCGCATCATCT
CATCTCTAAACCCTTGGACGGTTTTGGGCTGAGCGGCCGAACATTTCTTGAGATCGAGCT
TGCAGTTCGCCCACTCTTTCCGCTTATCTACTCCGGTCGGAGCCAAAACGTTCTTGATCT
GCCAGGAGTCGAATGCAGCGTTAATGACAAAGAGCGGTGTTCGCATGGAAGGGACGACGT
ATTGCGGGAAGAAACAGAGTTCGGGTTTCATTTTTGAGGTACATGAAAGAGGAAGACTCT
TTGCAGATCCGTGGAGTGCAACAACTTTACTGTAGTAAGATTGTATGTATGATCCTCCTG
AGATATCTTTACCGTGGATGAAGTAACCGGCGTCCGAAACACATTTGACTCTAGCTGTCC
GGGGAAGTATGGCGCGGAAAGTGTCACAATGTAGAATTGCCGCCAATGCTCCGGCTGAAC
AACCCGAGAGTATCGCATTTTGAGCGTTTTTCATTCCTTTAGCCATGAGATCATCGATCA
CCGCACGC

QA 12 799 12 799
DS 



AS 1 7

CO CL1038Contig1 1322 7 20 U
GGACTCCAAAGAACATTCTTAAAGTTGCTAAAAGAGAGAGACGTCAATGGCTGAAAAGCA
GAGGATCTGTGTTACTGGTTCAGGAGGATATATTGCTTCATGGCTCGTCAAGTCTCTTCT
CTCCCATGGCTACACTGTGCATGGAACCGTTCGAGATCCTTGTGATCCGAAGAACGACCA
TTTGAAGAAACTGGATAATGCTTCAAAGAATCTGAAACTTTTCCAAGCAGATTTGTTTGA
CTATGAAGGTCTTTCTTCAGCTATTTCTGGTTGTTATGGTGTTTTCCATATTGCTGGTCC
TGTGCCTTTTGAAGATGTTCCTCTCACAGAGGAACAACTGATTAAACCAGCTCTCACTGG
CACCAAAAACATTCTAGAAGCATGTACAGAAGCTAAAGTGAAGAAAGTTGTGGTTGTATC
ATCACTTGCGGCGGTTGTTTACAACCCAAAGTGGCCAAGAGATGTTGATGTGGACGAGAG
CTGCTGGTCAGACACTCAATACCTTTACTCACGTGAGGGTTATTGGTCGTATTACTTTCT
TGCCAAAACATTAATGGAACGTGAAGCTATAGAGTGGAGCAGGACAAGCTTGGCTGATGT
TGTTACGGTCTGTCCCTCGGTCGTGATAGGCCCTAGGCTTCAGTCCACGCTTAACTCTAG
TAGCTTGGGACTTCTAAACTTTATAAAAGGAGGTGTGATATCTTTGTTGAGTGACCAACT
CTATCTTGTGGATGTGCGTGATGTTGCTGATGCGCTTTTGTTGGTGTATGAAAATCAAGA
AGCAAAAGGAAGATACATATGCAATTCTCATTCACTTCACAACAATGATCTTATGAAGAA
GCTGATGAATATGTATCCTAAACGCAACTTTCCTAAAAGTTTCAGTGAGAGAAAGGAGAA
GCAAGTGAATGGGAATGTACTTCGAATAAGTTCAGAGAAGTTGGAGAAACTTGGGTGGAA
GTTTAGGTCACTAGAAGAAACTATTGATGACTCTGTTGTGAGCTTTGAAGCTACTGGTGA
TCTTCCAAAGCAGTAATAACTCATAGTGAAAGGAAGAGAGGCTTCTTCCTCTTCCTTCTC
TTCTTCATTTGTTAAGTTACTTGAGCCTTTCCTGTTAAGTTATTTGGTGTTGCTGTTTTA
ATGTCTGTATTTTCTTTTCCTGCAAGTTTTCTTTTGTTCTGTGTTGGGGTTGTGTGTGTT
TGTAATGTGTGCTCAATAAGTTGCTAATGCAACGTGTAAACTCTTGAAAATAGTATGAAA
CTAGGTGATACCCGCCCCTTGCGCGGAGTAAAAGAACTAAATAAAGATTAAATTTTTAAC
CC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 15 15 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2DG12TF U 1
AF RR2CF80TF U 2
AF RR2BU85TF U 1
AF RR2FK23TF U 1
AF RR2CF80JQ C 350
AF RR2FK23JQ C 493
AF RR2BU85JQ C 620
BS 1 79 RR2BU85TF
BS 80 80 RR2DG12TF
BS 81 112 RR2BU85TF
BS 113 113 RR2DG12TF
BS 114 146 RR2BU85TF
BS 147 147 RR2DG12TF
BS 148 558 RR2BU85TF
BS 559 559 RR2DG12TF
BS 560 582 RR2BU85TF
BS 583 583 RR2DG12TF
BS 584 636 RR2BU85TF
BS 637 637 RR2FK23TF
BS 638 689 RR2BU85TF
BS 690 692 RR2FK23TF
BS 693 715 RR2BU85TF
BS 716 716 RR2CF80JQ
BS 717 742 RR2BU85TF
BS 743 747 RR2FK23TF
BS 748 1157 RR2CF80JQ
BS 1158 1322 RR2BU85JQ

RD RR2DG12TF 686 0 0
GC
ACTCCAAAGAACATTCTTAAAGTTGCTAAAAGAGAGAGACGTCAATGGCTGAAAAGCAGA
GGATCTGTGTTACTGGTTCAGGAGGATATATTGCTTCATGGCTCTTCAAGTCTCTTCTCT
CCCATGGCTACACTGTGCATGGAACCGTTCGAGATCCTTGTGATCCGAAGTTCGACCATT
TGAAGAAACTGGATAATGCTTCAAAGAATCTGAAACTTTTCCAAGCAGATTTGTTTGACT
GTGAAGGTCTTTCTTCAGCTATTTCTGGTTGTTATGGTGTTTTCCATATTGCTGGTCCTG
TGCCTTTTGAAGATGTTCCTCTCACAGAGGAACAACTGATTAAACCAGCTCTCACTGGCA
CCAAAAACATTCTAGGAGCATGTACAGAAGCTAAAGTGAAGAAAGTTGTGGTTGTATCAT
CACTTGCGGCGGTTGTTTACAACCCAAAGTGGCCAAGAGATGTTGATGTGGACGAGAGCT
GCTGGTCAGACACTCAATACCTTTACTCACGTGAGGGTTATTGGTCGTATTACTTTCTTG
CCAAAACATTAATGGAACGTGAAGCTATAGAGTGGAGCAGGACAAGCTTGGCTGATGTTG
TTACGGTCTGTCCCTCGGTCGTGATAG*CCCTAG*CTTCAGTCCACGCTTAACTCTAGTA
GCTTGGGACTTCTAAACTTTATAA

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR2CF80TF 710 0 0
G
ACTCCAAAGAACATTCTTAAAGTTGCTAAAAGAGAGAGACGTCAATGGCTGAAAAGCAGA
GGATCTGTGTTACTGGTTCAGGAGGATATATTGCTTCATGGCTCGTCAAGTCTCTTCTCT
CCCATGGCTACACTGTGCATGGAACCGTTCGAGATCCTTGTGATCCGAAGAACGACCATT
TGAAGAAACTGGATAATGCTTCAAAGAATCTGAAACTTTTCCAAGCAGATTTGTTTGACT
ATGAAGGTCTTTCTTCAGCTATTTCTGGTTGTTATGGTGTTTTCCATATTGCTGGTCCTG
TGCCTTT*GAAGATGTTCCTCTCACAGAGGAACAACTGATTAAACCAGCTCTCACTGGCA
CCAAAAACATTCTAGAAGCATGTACAGAAGCTAAAGTGAAGAAAGTTGTGGTTGTATCAT
CACTTGCGGCGGTTGTTTACAACCCAAAGTGGCCAAGAGATGTTGATGTGGACGAGAGCT
GCTGGTCAGACACTCAATACCTTTACTCACGTGAGGGTTATTGGTCGTATTACCTTCTTG
CCAAAACATTAATGGAACGTGAAGCTATAGAGTGGAGCAGGACAAGCTTGGCTGATGTTG
TTACGGTCTGTCCCTCGGTCGTGATAGGCCCTAGGCTTCAGTCCACGCTTAACTCTAGTA
GCTTGGGACTTCTAAACTTTATAAAAGA*GGTGTGATATCTTTGTTGAG

QA 2 710 2 710
DS 

RD RR2BU85TF 742 0 0
GGACTCCAAAGAACATTCTTAAAGTTGCTAAAAGAGAGAGACGTCAATGGCTGAAAAGCA
GAGGATCTGTGTTACTGGTCCAGGAGGATATATTGCTTCATGGCTCGTCAAGCCTCTTCT
CTCCCATGGCTACACTGTGCATGGAATCGTTCGAGATCCTTGTGATCCGAAGAACGACCA
TTTGAAGAAACTGGATAATGCTTCAAAGAATCTGAAACTTTTCCAAGCAGATTTGTTTGA
CTATGAAGGTCTTTCTTCAGCTATTTCTGGTTGTTATGGTGTTTTCCATATTGCTGGTCC
TGTGCCTTTTGAAGATGTTCCTCTCACAGAGGAACAACTGATTAAACCAGCTCTCACTGG
CACCAAAAACATTCTAGAAGCATGTACAGAAGCTAAAGTGAAGAAAGTTGTGGTTGTATC
ATCACTTGCGGCGGTTGTTTACAACCCAAAGTGGCCAAGAGATGTTGATGTGGACGAGAG
CTGCTGGTCAGACACTCAATACCTTTACTCACGTGAGGGTTATTGGTCGTATTACTTTCT
TGCCAAAACATTAATGGAGCGTGAAGCTATAGAGTGGAGCAGAACAAGCTTGGCTGATGT
TGTTACGGTCTGTCCCTCGGTCGTGATAGGCCCTAG*CTTCAGTCCACGCTTAACTCTAG
TAGCTTGGGACTTCTAAACTTTATAAAAGA**GTGTGATATCTTTGTTGAGTGAC*AACT
CTATCTTGTGGATGTGCGTGAT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2FK23TF 747 0 0
GG
ACTCCAAAGAACATTCTTAAAGCTGCTAAAAGAGAGAGACGTCAATGGCTGAAAAACAGA
GGATCTGTGTTACTGGTTCAGGAGGATATATTGCTTCATGGCTCGTCAAGTCTCTTCTCT
CCCATGGCTACACTGTGCATGGAACCGTTCGAGATCCTTGTGATCCGAAGAACGACCATT
TGAAGAAACTGGATAATGCTTCAAAGAATCTGAAACTTTTCCAAGCAGATTTGTTTGACT
ATGAAGGTCTTTCTTCAGCTATTTCTGGTTGTTATGGTGTTTTCCATATTGCTGGTCCTG
TGCCTTTTGAAGATGTTCCTCTCACAGAGGAACAACTGATTAAACCAGCTCTCACTGGCA
CCAAAAACATTCTAGAAGCATGTACTGAAGCTAAAGTGAAGAAAGTTGTGGTTGTATCAT
CACTTGCGGCGGTTGTTTACAACCCAAAGTGGCCAAGAGATGTTGATGTGGACGAGAGCT
GCTGGTCAGACACTCAATACCTTTACTCACGTGAGGGTTATTGGTCGTATTACTTTCTTG
TCAAAACATTAATGGAACGTGAAGCTATAGAGTGGAGCAGGACAAGCTTGGCTGATGTTG
TTACGGTCTGTCCCTCGGTCGTGATAGGCCCTAGGCTTCAGTCCACGCTTAACTCTAGTA
GCTTGGGACTTCTAAACTTTATAAAAGGAGGTGTGATATCTTTGTTGAGTGAC*AACTCT
ATCTTGTGGATGTGCGTGATGTTGC

QA 3 747 3 747
DS 

RD RR2CF80JQ 814 0 0
GCTCTCACTG*CACCAAAAACATTCTAGAAGCATGTACAGAAGCTAAAGTGAAGAAAGTT
GTGGTTGTATCATCACTTGCGGCGGTTGTTTACAACCCAAAGTGGCCAAGAGATGTTGAT
GTGGACGAGAGCTGCTGGTCAGACACTCAATACCTTTACTCACGTGAGGGTTATTGGTCG
TATTACCTTCTTGCCAAAACATTAATGGAACGTGAAGCTATAGAGTGGAGCAGGACAAGC
TTGGCTGATGTTGTTACGGTCTGTCCCTCGGTCGTGATAGGCCCTAGGCTTCAGTCCACG
CTTAACTCTAGTAGCTTGGGACTTCTAAACTTTATAAAAGGAGGTGTGATATCTTTGTTG
AGTGACCAACTCTATCTTGTGGATGTGCGTGATGTTGCTGATGCGCTTTTGTTGGTGTAT
GAAAATCAAGAAGCAAAAGGAAGATACATATGCAATTCTCATTCACTTCACAACAATGAT
CTTATGAAGAAGCTGATGAATATGTATCCTAAACGCAACTTTCCTAAAAGTTTCAGTGAG
AGAAAGGAGAAGCAAGTGAATGGGAATGTACTTCGAATAAGTTCAGAGAAGTTGGAGAAA
CTTGGGTGGAAGTTTAGGTCACTAGAAGAAACTATTGATGACTCTGTTGTGAGCTTTGAA
GCTACTGGTGATCTTCCAAAGCAGTAATAACTCATAGTGAAAGGAAGAGAGGCTTCTTCC
TCTTCCTTCTCTTCTTCATTTGTTAAGTTACTTGAGCCTTTCCTGTTAAGTTATTTGGTG
TTGCTGTTTTAATGTCTGTATTTTCTTT
TCCTGC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2FK23JQ 665 0 0
CACTCAATACCTTTACTCACGTGAGGGTTATTGGTCGTATTACTTTCTTGTCAAAACATT
AATGGAACGTGAAGCTATAGAGTGGAGCAGGACAAGCTTGGCTGATGTTGTTACGGTCTG
TCCCTCGGTCGTGATAGGCCCTAGGCTTCAGTCCACGCTTAACTCTAGTAGCTTGGGACT
TCTAAACTTTATAAAAGGAGGTGTGATATCTTTGTTGAGTGACCAACTCTATCTTGTGGA
TGTGCGTGATGTTGCTGATGCGCTTTTGTTGGTGTATGAAAATCAAGAAGCAAAAGGAAG
ATACATATGCAATTCTCATTCACTTCACAACAATGATCTTATGAAGAAGCTGATGAATAT
GTATCCTAAACGCAACTTTCCTAAAAGTTTCAGTGAGAGAAAGGAGAAGCAAGTGAATGG
GAATGTACTTCGAATAAGTTCAGAGAAGTTGGAGAAACTTGGGTGGAAGTTTAGGTCACT
AGAAGAAACTATTGATGACTCTGTTGTGAGCTTTGAAGCTACTGGTGATCTTCCAAAGCA
GTAATAACTCATAGTGAAAGGAAGAGAGGCTTCTTCCTCTTCCTTCTCTTCTTCATTTGT
TAAGTTACTTGAGCCTTTCCTGTTAAGTTATTTGGTGTTGCTGTTTTAATGTCTGTATTT
TCTTT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2BU85JQ 703 0 0
GTCGTGATAGGCCCTAGGCTTCAGTCCACGCTTAACTCTAGTAGCTTGGGACTTCTAAAC
TTTATAAAAGGAGGTGTGATATCTTTGTTGAGTGACCAACTCTATCTTGTGGATGTGCGT
GATGTTGCTGATGCGCTTTTGTTGGTGTATGAAAATCAAGAAGCAAAAGGAAGATACATA
TGCAATTCTCATTCACTTCACAACAATGATCTTATGAAGAAGCTGATGAATATGTATCCT
AAACGCAACTTTCCTAAAAGTTTCAGTGAGAGAAAGGAGAAGCAAGTGAATGGGAATGTA
CTTCGAATAAGTTCAGAGAAGTTGGAGAAACTTGGGTGGAAGTTTAGGTCACTAGAAGAA
ACTATTGATGACTCTGTTGTGAGCTTTGAAGCTACTGGTGATCTTCCAAAGCAGTAATAA
CTCATAGTGAAAGGAAGAGAGGCTTCTTCCTCTTCCTTCTCTTCTTCATTTGTTAAGTTA
CTTGACCCTTTCCTGTTAAGTTATTTGGTGTTGCTGTTTTAATGTCTGTATTTTCTTTTC
CTGCAAGTTTTCTTTTGTTCTGTGTTGGGGTTGTGTGTGTTTGTAATGTGTGCTCAATAA
GTTGCTAATGCAACGTGTAAACTCTTGAAAATAGTATGAAACTAGGTGATACCCGCCCCT
TGCGCGGAGTAAAAGAACTAAATAAAGATTAAATTTTTAACCC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 6

CO CL1039Contig1 1090 6 7 U
GCGGACAACCCGAGTGGAAGTTTTACGGACAGCCCGAGTGGTACAACCACTGACAGTCCG
AGTGGAAGTCCCACGGATATCCCGAGTGGAAGTTTTACGGACAGTACTGGTATAACCACT
GACAGTCCGAGTGGAAGTCCCACGGACAGCCCAAGTGAAAGTCCCACAGATAGTCCTTCT
GACTCAAAATCTGCTAGTGATGAAAACTCTGCCAAAGAAAGCGGAAGTGATAACGAAGCT
GCTGCTTCCAATACCAACAGCCAAAGCTTATCCACAACATCAGCGAAAGAAGTCGAAATT
CAAACATCCAAAGAAGCAAGGTCGTTCATTCATGCCTTAGAGAAGAAGTACGCAGGAACA
GTAGAACTCGATACGTTCTTCGAGAAACTCAAGACTTCCATGTCTGCTTCCACAAAGATA
TCTAACACTGACGAAAAACGTTTCGTTTCTAAAATGAATTCTGCTGTTAGTTCTGTGTCC
GAAGCCGCATCTACTGTTACTTCAAAGTTAGCCAAATCACCAGAGGCGAAGAGCCGCATG
AAATCTTCCAAAGAACAATTGATGAAGACTTTCAAAGAACTAGAAGACCTTAACAGTAAA
ATAGTGAGCGAAAATAAAGGCAAAACAGTGTCGTCCACACAACACTCAGAGCTTAAACAG
GCACTCAGTAGATGGGAACAAGTCACCACCCAGTTTGTGGAGAATCTTACCTCTTCGAGT
TCTTCATCTTCATCTTCAT******CTTCCTCTTCCTCTCAGTCTCAGAAATCTCAACAG
TCTAAACAATCTCATGAGTCTCAACAGTCTCAGCAGGGCAGTACCATGAAGACTCAGACC
AATTGATGCGACTCAAATCATCAAGAAAGACAAACTAGTACAGCCATATATGATAATTAG
TAACCAACTAGAGGTTTTTGTTTCTTTCAATAAGACTAATTAGATCGGTGTAGGCAAGCA
ATATCTACCTATAGACCGACGTATGCAAATAATGTATACTGTATGCGCTCTCTCTGTGCT
TTACAAAGAGAAGTAAGCGAGACACAAAAGGGATTTTGAATAGTTTTTTTTTTGTGTTCC
TACCCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 

AF RR2B186TF U 1
AF RR2E450TF U 338
AF RR2C908TF U 284
AF RR2C908JQ C 284
AF RR2ET22TF U 443
AF RR2ET22JQ C 764
BS 1 374 RR2B186TF
BS 375 375 RR2C908TF
BS 376 656 RR2B186TF
BS 657 786 RR2C908TF
BS 787 787 RR2ET22TF
BS 788 936 RR2C908TF
BS 937 1090 RR2ET22TF

RD RR2B186TF 656 0 0
GCGGACAACCCGAGTGGAAGTTTTACGGACAGCCCGAGTGGTACAACCACTGACAGTCCG
AGTGGAAGTCCCACGGATATCCCGAGTGGAAGTTTTACGGACAGTACTGGTATAACCACT
GACAGTCCGAGTGGAAGTCCCACGGACAGCCCAAGTGAAAGTCCCACAGATAGTCCTTCT
GACTCAAAATCTGCTAGTGATGAAAACTCTGCCAAAGAAAGCGGAAGTGATAACGAAGCT
GCTGCTTCCAATACCAACAGCCAAAGCTTATCCACAACATCAGCGAAAGAAGTCGAAATT
CAAACATCCAAAGAAGCAAGGTCGTTCATTCATGCCTTAGAGAAGAAGTACGCAGGAACA
GTAGAACTCGATACCTTCTTCGAGAAACTCAAGACTTCCATGTCTGCTTCCACAAAGATA
TCTAACACTGACGAAAAACGTTTCGTTTCTAAAATGAATTCTGCTGTTAGTTCTGTGTCC
GAAGCCGCATCTACTGTTACTTCAAAGTTAGCCAAATCACCAGAGGCGAAGAGCCGCATG
AAATCTTCCAAAGAACAATTGATGAAGACTTTCAAAGAACTAGAAGACCTTAACAGTAAA
ATAGTGAGCGAAAATAAAGGCAAAACAGTGTCGTCCACACAACACTCAGAGCTTAA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2E450TF 385 0 0
G
AGAGAAGAAGTACGCAGGAACAGTAGAACTCGATACGTTCTTCGAGAAACTCAAGACTTC
CATGTCTGCTTCCACAAAGATATCTAACACTGACGAAAAACGTTTCGTTTCTAAAATGAA
TTCTGCTGTTAGTTCTGTGTCCGAAGCCGCATCTACTGTTACTTCAAAGTTAGCCAAATC
ACCAGAGGCGAAGAGCCACATGAAATCTTCCAAAGAACAATTGATGAAGACTTTCAAAGA
ACTAGAAGACCTTAACAGTAAAATAGTGAGCGAAAATAAAGGCAAAACAGTGTCGTCCAC
ACAACACTCAGAGCTTAAACAGGCACTCAGTAAATGGGAACAAGTCACCACCCAGTTTGT
GGAGAATCTTACCTCTTCGAGT
CT

QA 2 383 2 383
DS 

RD RR2C908TF 653 0 0
GA
AAAGAAGTCGAAATTCAAACATCCAAAGAAGCAAGGTCGTTCATTCATGCCTTAGAGAAG
AAGTACGCAGGAACAGTAGAACTCGATACGTTCTTCGAGAAACTCAAGACTTCCATGTCT
GCTTCCACAAAGATATCTAACACTGACGAAAAACGTTTCGTTTCTAAAATGAATTCTGCT
GTTAGTTCTGTGTCCGAAGCCGCATCTACTGTTACTTCAAAGTTAGCCAAATCACCAGAG
GCGAAGAGCCGCATGAAATCTTCCGAAGAACAATTGATGAAGACTTTCAAAGAACTAGAA
GACCTTAACAGTAAAATAGTGAGCGAAAATAAAGGCAAAACAGTGTCGTCCACACAACAC
TCAGAGCTTAAACAGGCACTCAGTAGATGGGAACAAGTCACCACCCAGTTTGTGGAGAAT
CTTACCTCTTCGAGTTCTTCATCTTCATCTTCAT******CTTCCTCTTCCTCTCAGTCT
CAGAAATCTCAACAGTCTAAAGAATCTCATGAGTCTCAACAGTCTCAGCAGGGCAGTACC
ATGAAGACTCAGACCAATTGATGCGACTCAAATCATCAAGAAAGACAAACTAGTACAGCC
ATATATGATAATTAGTAACCAACTAGAGGTTTTTGTTTCTTTCAATAAGAC

QA 3 653 3 653
DS 

RD RR2C908JQ 746 0 0
GA
AAAGAAGTCGAAATTCAAACATCCAAAGAAGCAAGGTCGTTCATTCATGCCT*AGAGAAG
AAGTACGCAGGAACAGTAGAACTCGATACGTTCTTCGAGAAACTCAAGACTTCCATGTCT
GCTTCCACAAAGATATCTAACACTGACGAAAAACGTTTCGTTTCTAAAATGAATTCTGCT
GTTAGTTCTGTGTCCGAAGCCGCATCTACTGTTACTTCAAAGTTAGCCAAATCACCAGAG
GGGAAGAGCCGCATGAAATCTTCCGAAGAACAATTGATGAAGACTTTCAAAGAACTAGAA
GACCTTAACAGTAAAATAGTGAGCGAAAATAAAGGCAAAACAGTGTCGTCCACACAACAC
TCAGAGCTTAAACAGGCACTCAGTAGATGGGAACAAGTCACCACCCAGTTTGTGGAGAAT
CTTACCTCTTCGAGTTCTTCATCTTCATCTTCAT******CTTCCTCTTCCTCTCAGTCT
CAGAAATCTCAACAGTCTAAAGAATCTCATGAGTCTCAACAGTCTCAGCAGGGCAGTACC
ATGAAGACTCAGACCAATTGATGCGACTCAAATCATCAAGAAAGACAAACTAGTACAGCC
ATATATGATAATTAGTAACCAACTAGAGGTTTTTGTTTCTTTCAATAAGACTAATTAGAT
CGGTGTAGGCAAGCAATATCTACCTATAGACCGACGTATGCAAATAATGTATACTGTATG
CGCTCTCTCTGTGCTTTACAAAGA

QA 3 746 3 746
DS 

RD RR2ET22TF 648 0 0
G
CGTTTCTAAAATGAATTCTGCTGTTAGTTCTGTGTCCGAAGCCGCATCTACTGTTACTTC
AAAGTTAGCCAAATCACCAGGGGCGAAGAGCCGCATGAAATCTTCCAAAGAACATTTGAT
GAAGACTTTCAAAGAACTAGAAGACCTTAACAGTAAAATAGTGAGCGAAAATAAAGGCAA
AACAGTGTCGTCCACACAACACTCAGAGCTTAAACAGGCACTCAGTAAATGGGAACAAGT
CACCACCCAGTTCGTGGAGAATCTTACCTCTTCGAGTTCTTCATCTTCATCTTCATCTTC
ATCTTCCTCTTCCTCTCAGTCTAAGAAATCTGAACAGTCTAAACAATCTCATGAGTCTCA
ACAGTCTCAGCAGGGCAGTACCATGAAGACTCAGACCAATTGATGCGACTCAAATCATCA
AGAAAGACAAACTAGTACAGCCATATATGATAATTAGTAACCAACTAGAGGTTTTTGTTT
CTTTCAATAAGACTAATTAGATCGGTGTAGGCAAGCAATATCTACCTATAGACCGACGTA
TGCAAATAATGTATACTGTATGCGCTCTCTCTGTGCTTTACAAAGAGAAGTAAGCGAGAC
ACAAAAGGGATTTTGAATAGTTTTTTTTTTGTGTTCCTACCCAAAAA

QA 2 648 2 648
DS 

RD RR2ET22JQ 322 0 0
CTA
AGAAATCTGAACAGTTTAAACAATTTCATGAGTCTCAACAGTCTCAGCAGGGCAGTACCA
GGAAGACTCAGACCAATTGATGCGACTCAAATCATCAAGAAAGACAAATTAGTACAGCCA
TATATGATAATTAGTAACCAACTAGAGGTTTTTGTTTCTTTCAATAAGACTAATTAGATC
GGTGTAGGCAAGCAATATCTACCTATAGACCGAGGTATGCAAATAATGTATACTGTATGC
GCTCTCTCTGTGCTTTACAAAGAGAAGTAAGCGAGACACAAAAGGGATTTTGAATAGTTT
TTTTTTTGTGTTCCTACCC

QA 4 322 4 322
DS 



AS 1 7

CO CL1040Contig1 1399 7 22 U
GGGAGTTTTCTTTCTATCAATCGGTTGTTTCCATGCTCAGGTTTCAATCGATCTTCAAGT
TTCTATCTTTCTAAGTGATCGATTAGGGTTTGGAAAGCTGTTTGGTTCTTGATTGCAGCT
GTCTCACAGATTCTTGGTTTGATAATCGTTGTTGTAGATCGTTAGAGAGATTTTAAATTA
GGGTTGTCTTGATTCCTGTAATCATGGCGGATGCTGTGTCTTTGGTTGGTTCGATTGTGA
GGATCTCTGTCAAGAACGAAGCGAGAACAGTTCGATTCCCGGTGAAAGCGGTTGTGTTCG
ATACGAGAAACAAGAAGCCAATGTCAGTGTTCCCAATCAAGGCTCTTGCTATGGAGCTGA
CGAAAGAGATGCCGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGACCCAAGGACTTGGAACTATCTTGATT
CCGGTTCGGTTGATAAATGGCCTCCTCCTGAGAACAAAGCCGACAAGCCTTCCTTGCACA
ACCCTTTGCTAAGGCAAGAGCGTATGGGTTGCGGTTGGCTAGGTGCGATATTCGAGTGGG
AAGGTGTTTTGATCGAAGACAATCCTGGCCTTGAGGGGCAGTCGTGGCTTACTTTAGCTC
AGGAGGAAGGCAAGTCTCCTCCTCCGGCTTCTTTACTCAGACGCATCGAAGGGATGAAGA
ACGAGCAAGCTATCTCTGAGGTTCTGTGTTGGTCGAGAGACCCTGGACAAGTTAGGAGAA
TGGCTTCGCGTAAAGAGGAGATCTTTAAGGCTTTAGATGGAGGAGTGTATAGACTGAGAG
ACGGGTCACAGGAGTTTGTGAATGTTTTGATGAATAACAAGATCCCCATGGCTTTGGTTT
CGACCCGTCCTCGTGAGACGCTAGAGAACGCTGTTGGTTCGATTGGGATAAGGAAGTTCT
TCAGTGTGATAGTTGCGTCTGAAGATGTTCACAGAGGTAAACCGGATCCGGAGATGTTTG
TTTACGCAGCGCAGCTTCTTGATTTCATACCGGAACGTTGCATTGTGTTTGGAAACTCGA
ACCAGACCATTGAGGCTGCTCATGATGGGAAGATGAAGTGTGTTGCTGTGGCTAGTAAGC
ATCCGATGTATGAGCTTGGAGCGGCGGATCTGGTTGTGAGAAGGTTGGATGAGTTATCCG
TTATTGATTTGAAGAAGCTTGCGGCTGTTGAACTGACGGAGTTCGAACCGGAATTGGAGA
TGGAGAAGGAAGATGAGCGTGAGCTGCCTTCATCTAATGTAGCAGTTGATGACTTCTTCT
GATGGAAGTGATCTTCTGTAATGTTTGTACAGTTTTATGGACTTGGATTCTTCCTCATGT
AATTCGTATTCACAAAATGTTATAGTTTGTGTATAATTGGAACAGGTTACATGGAAAAAA
TATATAAATGTACACTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO88TF U 1
AF RR2CU47TF U 82
AF RR2CO88JQ C 821
AF RR2CU47JQ C 633
AF RR2F126TF U 748
AF RR2D135TF U 807
AF RR2D135JQ C 807
BS 1 602 RR2CO88TF
BS 603 603 RR2CU47TF
BS 604 630 RR2CO88TF
BS 631 631 RR2CU47TF
BS 632 680 RR2CO88TF
BS 681 681 RR2CU47TF
BS 682 698 RR2CO88TF
BS 699 715 RR2CU47TF
BS 716 716 RR2CU47JQ
BS 717 749 RR2CU47TF
BS 750 750 RR2F126TF
BS 751 784 RR2CU47TF
BS 785 785 RR2F126TF
BS 786 791 RR2CU47TF
BS 792 792 RR2F126TF
BS 793 807 RR2CU47TF
BS 808 1075 RR2F126TF
BS 1076 1076 RR2D135TF
BS 1077 1351 RR2F126TF
BS 1352 1361 RR2D135TF
BS 1362 1373 RR2CU47JQ
BS 1374 1399 RR2D135JQ

RD RR2CO88TF 698 0 0
GGGAGTTTTCTTTCTATCAATCGGTTGTTTCCATGCTCAGGTTTCAATCGATCTTCAAGT
TTCTATCTTTCTAAGTGATCGATTAGGGTTTGGAAAGCTGTTTGGTTCTTGATTGCAGCT
GTCTCACAGATTCTTGGTTTGATAATCGTTGTTGTAGATCGTTAGAGAGATTTTAAATTA
GGGTTGTCTTGATTCCTGTAATCATGGCGGATGCTGTGTCTTTGGTTGGTTCGATTGTGA
GGATCTCTGTCAAGAACGAAGCGAGAACAGTTCGATTCCCGGTGAAAGCGGTTGTGTTCG
ATACGAGAAACAAGAAGCCAATGTCAGTGTTCCCAATCAAGGCTCTTGCTATGGAGCTGA
CGAAAGAGATGCCGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGACCCAAGGACTTGGAACTATCTTGATT
CCGGTTCGGTTGATAAATGGCCTCCTCCTGAGAACAAAGCCGACAAGCCTTCCTTGCACA
ACCCTTTGCTAAGGCAAGAGCGTATGGGTTGCGGTTGGCTAGGTGCGATATTCGAGTGGG
AAGGTGTTTTGATCGAAGACAATCCTGGCCTTGAGGGGCAGTCGTGGCTTACTTTAGCTC
AG*AGGAAGGCAAGTCTCCTCCTCCGGCTT*TTTACTCAGACGCATCGAAGGGATGAAGA
ACGAGCAAGCTATCTCTGAG*TTCTGTGTTGGTCGAGA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2CU47TF 726 0 0
ATTAGGGTTTGGAAAGCTGTTTGGTTCTTGATTGCAGCTGTCTCACAGATTCTTGGTTTG
ATAATCGTTGTTGTAGATCGTTAGAGAGATTTTAAATTAGGGTTGTCTTGATTCCTGTAA
TCATGGCGGATGCTGTGTCTTTGGTTGGTTCGATTGTGAGGATCTCTGTCAAGAACGAAG
CGAGAACAGTTCGATTCCCGGTGAAAGCGGTTGTGTTCGATACGAGAAACAAGAAGCCAA
TGTCAGTGTTCCCAATCAAGGCTCTTGCTATGGAGCTGACGAAAGAGATGCCGAAGAAGA
AGAAGAAGAAAGACCCAAGGACTTGGAACTATCTTGATTCCGGTTCGGTTGATAAATGGC
CTCCTCCTGAGAACAAAGCCGACAAGCCTTCCTTGCACAACCCTTTGCTAAGGCAAGAGC
GTATGGGTTGCGGTTGGTTAGGTGCGATATTCGAGTGGGAAGGTGTTTTGATCGAAGACA
ATCCTGGCCTTGAGGGGCAGTCGTGGCTTACTTTAGCTCAGGAGGAAGGCAAGTCTCCTC
CTCCGGCTTCTTTACTCAGACGCATCGAAGGGATGAAGAACGAGCAAGCTATCTCTGAGG
TTCTGTGTTGGTCGAGAGACCCTGGACAAGTTAG*AGAATGGCTTCGCGTAAAGAGGAGA
TCTTTAAG*CTTTAGATGGAGGAGTGTATAGACTGAGAGACGG*TCACAG*AGTTTGTGA
ATGTTT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2CO88JQ 427 0 0
GATCCCCATGGCTT*GGTTTCGACCCGTCCTCGTGAGACGCTAGAGAACGCTGTTGGTTC
GATTGGGATAAGGAAGTTCTTCAGTGTGATAGTTGCGTCTGAAGATGTTCACAGAGGTAA
ACCGGATCCGGAGATGTTTGTTTACGCAGCGCAGCTTCTTGATTTCATACCGGAACGTTG
CATTGTGTTTGGAAACTCGAACCAGACCATTGAGGCTGCTCATGATGGGAAGATGAAGTG
TGTTGCTGTGGCTAGTAAGCATCCGATGTATGAGCTTGGAGCGGCGGATCTGGTTGTGAG
AAGGTTGGATGAGTTATCCGTTATTGATTTGAAGAAGCTTGCGGCTGTTGAACTGACGGA
GTTCGAACCGGAATTGGAGATGGAGAAGGAAGATGAGCGTGAGCTGCCTTCATCTAATGT
AGCAGTT

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR2CU47JQ 741 0 0
TTACTCAGACGCATCGAAGGGATGAAGAACGAGCAAGCTATCTCTGAGGTTCTGTGTTGG
TCGAGAGACCCTGGACAAGTTAGGAGAATGGCTTCGCGTAAAGAGGAGATCTTTAAGGCT
TTAGATGGAGGAGTGTATAGACTGAGAGACGGGTCACAGGAGTTTGTGAATGTTTTGATG
AATAACAAGATCCCCATGGCTTTGGTTTCGACCCGTCCTCGTGAGACGCTAGAGAACGCT
GTTGGTTCGATTGGGATAAGGAAGTTCTTCAGTGTGATAGTTGCGTCTGAAGATGTTCAC
AGAGGTAAACCGGATCCGGAGATGTTTGTTTACGCAGCGCAGCTTCTTGATTTCATACCG
GAACGTTGCATTGTGTTTGGAAACTCGAACCAGACCATTGTGGCTGCTCATGATGGGAAG
ATGAAGTGTGTTGCTGTGGCTAGTAAGCATCCGATGTATGAGCTTGGAGCGGCGGATCTG
GTTGTGAGAAGGTTGGATGAGTTATCCGTTATTGATTTGAAGAAGCTTGCGGCTGTTGAA
CTGACGGAGTTCGAACCGGAATTGGAGATGGAGAAGGAAGATGAGCGTGAGCTGCCTTCA
TCTAATGTAGCAGTTGATGACTTCTTCTGATGGAAGTGATCTTCTGTAATGTTTGTACAG
TTTTATGGACTTGGATTCTTCCTCATGTAATTCGTATTCACAAAATGTTATAGTTTGTGT
ATAATTGGAACAGGTTACATG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2F126TF 604 0 0
G
GGCTTTAGATGGAGGAGTGTATAGACTGAGAGACGGGTCACAGGAGTTTGTGAACGTTTT
GATGAATAACAAGATCCCCATGGCTTTGGTTTCGACCCGTCCTCGTGAGACGCTAGAGAA
CGCTGTTGGTTCGATTGGGATAAGGAAGTTCTTCAGTGTGATAGTTGCGTCTGAAGATGT
TCACAGAGGTAAACCGGATCCGGAGATGTTTGTTTACGCAGCGCAGCTTCTTGATTTCAT
ACCGGAACGTTGCATTGTGTTTGGAAACTCGAACCAGACCATTGAGGCTGCTCATGATGG
GAAGATGAAGTGTGTTGCTGTGGCTAGAAAGCATCCGATGTATGAGCTTGGAGCGGCGGA
TCTGGTTGTGAGAAGGTTGGATGAGTTATCCGTTATTGATTTGAAGAAGCTTGCGGCTGT
TGAACTGACGGAGTTCGAACCGGAATTGGAGATGGAGAAGGAAGATGAGCGTGAGCTGCC
TTCATCTAATGTAGCAGTTGATGACTTCTTCTGATGGAAGTGATCTTCTGTAATGTTTGT
ACAGTTTTATGGACTTGGATTCTTCCTCATGTAATTCGTATTCACAAAATGTTATAGTTT
GTG

QA 2 604 2 604
DS 

RD RR2D135TF 555 0 0
G
TGATGAATAACAAGATCCCCATGGCTTTGGTTTCGACCCGTCCTCGTGAGACGCTAGAGA
ACGCTGTTGGTTCGATTGGGGTAAGGAAGTTCTTCAGTGTGATAGTTGCGTCTGAAGATG
TTCACAGAGGTAAACCGGATCCGGAGATGTTTGTTTACGTAGCGCAGCTTCTTGATTTCA
TACCGGAACGTTGCATTGTGTTTGGAAACTCGAACCAGACCATTGAGGCTGCTCATGATG
GGAAGATGAAGTGTGTTGCTGTGGCTAGTAAGCATCCGATGTATGAGCTTGGAGCGGCGG
ATCTGGTTGTGAGAAGGTTGGATGAGTTATCCGTTATTGATTTGAAGAAGCTTGCGGCTG
TTGAACTGACGGAGTTCGAACCGGAATTGGAGATGGAGAAGGAAGATGAGCGTGAGCTGC
CTTCATCTAATGTAGCAGTTGATGACTTCTTCTGATGGAAGTGATCTTCTGTAATGTTTG
TACAGTTTTATGGACTTGGATTCTTCCTCATGTAATTCGTATTCACAAAATGTTATAGTT
TGTGTATAATTGGA

QA 2 555 2 555
DS 

RD RR2D135JQ 593 0 0
G
TGATGAATAACAAGATCCCCATGGCTTTGGTTTCGACCCGTCCTCGTGAGACGCTAGAGA
ACGCTGTTGGTTCGATTGGGGTAAGGAAGTTCTTCAGTGTGATAGTTGCGTCTGAAGATG
TTCACAGAGGTAAACCGGATCCGGAGATGTTTGTTTACGTAGCGCAGCTTCTTGATTTCA
TACCGGAACGTTGCATTGTGTTTGGAAACTCGAACCAGACCATTGAGGCTGCTCATGATG
GGAAGATGAAGTGTGTTGCTGTGGCTAGTAAGCATCCGATGTATGAGCTTGGAGCGGCGG
ATCTGGTTGTGAGAAGGTTGGATGAGTTATCCGTTATTGATTTGAAGAAGCTTGCGGCTG
TTGAACTGACGGAGTTCGAACCGGAATTGGAGATGGAGAAGGAAGATGAGCGTGAGCTGC
CTTCATCTAATGTAGCAGTTGATGACTTCTTTTGATGGAAGTGATCTTCTGTAATGTTTG
TACAGTTTTATGGACTTGGATTCTTCCTCATGTAATTCGTATTCACAAAATGTTATAGTT
TGTGTATAATTGGAACAGGTTACATGGAAAAAATATATAAATGTACACTCGT

QA 2 593 2 593
DS 



AS 1 7

CO CL1041Contig1 618 7 8 U
GGAACGAAAAAGAAACGCGAATAGGCTTTGTTCTAACTCTCCACACTGCAACATGACTTT
CAAGCGCAGGAACGGTGGAAGGAACAAGCACAACCGTGGTCATGTGAACCCCATCAGGTG
TTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCCAAGGATAAGGCGATCAAGAGGTTCATCGTCAGGAA
CATCGTCGAACAGGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCCAGTGTCTACGATGGTTACAC
TCTCCCGAAGTTGTATGCCAAGACGCAGTACTGTGTCTCATGTGCTATCCACTCTCACGT
CGTGAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGTAGGGTTCGTACCCCACCTCCACGTTTTGTCAG
ACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCCGGACAACCTGGTCAGGCCGCTCGCCCTGCTGGTGG
TGCCCCTGCTGCTGCTGCTCGTGCTTAAAGACTGCAAGAAGCTGGCAACTCAAAAATCTT
TATGTTCTAGTATCAGTCTCAGGGTTGGCTAGAATTTTTGAAGATGTTTTCTGCATTTGG
TTAAAAGATAATTTCGTCATGTGGACCTTTGAATACTGTGAGACTATTTATCAGTTTGTT
TTGACATTTGGCGTTTCT


BQ
30 30 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL15JQ C 1
AF RR2BV44JQ C 419
AF RR2BP88JQ C 1
AF RR2BP88TF U 1
AF RR2BV44TF U -2
AF RR2AL15TF U 1
AF RR2DK36TF U 10
BS 1 37 RR2BP88TF
BS 38 38 RR2BV44TF
BS 39 50 RR2BP88TF
BS 51 52 RR2BV44TF
BS 53 65 RR2BP88TF
BS 66 66 RR2BV44TF
BS 67 605 RR2BP88TF
BS 606 618 RR2DK36TF

RD RR2AL15JQ 605 0 0
GGAACGAAAAAGAAACGCGAATAGGCTTTGTTCTAACTCTCCACACTGCAACATGACTTT
CAAGCGCAGGAACGGTGGAAGGAACAAGCACAACCGTGGTCATGTGAACCCCATCAGGTG
TTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCCAAGGATAAGGCGATCAAGAGGTTCATCGTCAGGAA
CATCGTTGAACAAACTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCCAGTGTGTACGATGGTTACAC
TCTCCCGAAGTTGTATGCCAAGACGCAGTACTGTGTCTCATGTGCTATCCACTCTCACGT
CGTGAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGTAGGGTTCGTACCCCACCTCCACGTTTTGTCAG
ACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCCGGACAACCTGGTCAGGCCGCTCGCCCTGCTGGTGG
TGCCCCTGCTGCTGCTGCTCGTGCTTAAAGACTGCAAGAAGCTGGCAACTCAAAAATCTT
TATGTTCTAGTATCAGTCTCAGGGTTGGCTAGAATTTTTGAAGATGTTTTCTGCATTTGG
TTAAAAGATAATTTCGTCATGTGGACCTTTGAATACTGTGAGACTATTTATCAGTTTGTT
TTGAC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2BV44JQ 187 0 0
GGTGCCCCTGCTGCTGCTGCTCGTGCTTAAAGACTGCAAGAAGCTGGCAACTCAAAAATC
TTTATGTTCTAGTATCAGTCTCAGGGTTGGCTAGAATTTTTGAAGATGTTTTCTGCATTT
GGTTAAAAGATAATTTCGTCATGTGGACCTTTGAATACTGTGAGACTATTTATCAGTTTG
TTTTGAC

QA 1 187 1 187
DS 

RD RR2BP88JQ 605 0 0
GGAACGAAAAAGAAACGCGAATAGGCTTTGTTCTAACCCTCCACACTGCAT*ATGACTTT
CAAGC*CAGGAACGGTGGAAGGAACAAGCACAACCGTGGTCATGTGAACCCCATCAGGTG
TTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCCAAGGATAAGGCGATCAAGAGGTTCATCGTCAGGAA
CATCGTCGAACAGGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCCAGTGTCTACGATGGTTACAC
TCTCCCGAAGTTGTATGCCAAGACGCAGTACTGTGTCTCATGTGCTATCCACTCTCACGT
CGTGAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGTAGGGTTCGTACCCCACCTCCACGTTTTGTCAG
ACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCCGGACAACCTGGTCAGGCCGCTCGCCCTGCTGGTGG
TGCCCCTGCTGCTGCTGCTCGTGCTTAAAGACTGCAAGAAGCTGGCAACTCAAAAATCTT
TATGTTCTAGTATCAGTCTCAGGGTTGGCTAGAATTTTTGAAGATGTTTTCTGCATTTGG
TTAAAAGATAATTTCGTCATGTGGACCTTTGAATACTGTGAGACTATTTATCAGTTTGTT
TTGAC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2BP88TF 605 0 0
GGAACGAAAAAGAAACGCGAATAGGCTTTGTTCTAACCCTCCACACTGCAT*ATGACTTT
CAAGC*CAGGAACGGTGGAAGGAACAAGCACAACCGTGGTCATGTGAACCCCATCAGGTG
TTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCCAAGGATAAGGCGATCAAGAGGTTCATCGTCAGGAA
CATCGTCGAACAGGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCCAGTGTCTACGATGGTTACAC
TCTCCCGAAGTTGTATGCCAAGACGCAGTACTGTGTCTCATGTGCTATCCACTCTCACGT
CGTGAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGTAGGGTTCGTACCCCACCTCCACGTTTTGTCAG
ACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCCGGACAACCTGGTCAGGCCGCTCGCCCTGCTGGTGG
TGCCCCTGCTGCTGCTGCTCGTGCTTAAAGACTGCAAGAAGCTGGCAACTCAAAAATCTT
TATGTTCTAGTATCAGTCTCAGGGTTGGCTAGAATTTTTGAAGATGTTTTCTGCATTTGG
TTAAAAGATAATTTCGTCATGTGGACCTTTGAATACTGTGAGACTATTTATCAGTTTGTT
TTGAC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2BV44TF 608 0 0
GGGGC
AACGAAAAAGAAACGCGAATAGGCTTTGTTCTAACTCTCCACACTGCAACATGACTTTCA
AGCGCAGGAACGGTGGAAGGAACAAGCACAACCGTGGTCATGTGAACCCCATCAGGTGTT
CCAACTGCGGGAAATGCTGTCCCAAGGATAAGGCGATCAAGAGGTTCATCGTCAGGAACA
TCGTCGAACAGGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCCAGTGTCT*CGATGGTTACACTC
TCCCGAAGTTGTATGCCAAGACGCAGTACTGTGTCTCATGTGCTATCCACTCTCACGTCG
TGAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGTAGGGTTCGTACCCCACCTCCACGTTTTGTCAGAC
GCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCCGGACAACCTGGTCAGGCCGCTCGCCCTGCTGGTGGTG
CCCCTGCTGCTGCTGCTCGTGCTTAAAGACTGCAAGAAGCTGGCAACTCAAAAATCTTTA
TGTTCTAGTATCAGTCTCAGGGTTGGCTAGAATTTTTGAAGATGTTTTCTGCATTTGGTT
AAAAGATAATTTCGTCATGTGGACCTTTGAATACTGTGAGACTATTTATCAGTTTGTTTT
GAC

QA 6 608 6 608
DS 

RD RR2AL15TF 605 0 0
GGAACGAAAAAGAAACGCGAATAGGCTTTGTTCTAACTCTCCACACTGCAACATGACTTT
CAAGCGCAGGAACGGTGGAAGGAACAAGCACAACCGTGGTCATGTGAACCCCATCAGGTG
TTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCCAAGGATAAGGCGATCAAGAGGTTCATCGTCAGGAA
CATCGTTGAACAAACTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCCAGTGTGTACGATGGTTACAC
TCTCCCGAAGTTGTATGCCAAGACGCAGTACTGTGTCTCATGTGCTATCCACTCTCACGT
CGTGAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGTAGGGTTCGTACCCCACCTCCACGTTTTGTCAG
ACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCCGGACAACCTGGTCAGGCCGCTCGCCCTGCTGGTGG
TGCCCCTGCTGCTGCTGCTCGTGCTTAAAGACTGCAAGAAGCTGGCAACTCAAAAATCTT
TATGTTCTAGTATCAGTCTCAGGGTTGGCTAGAATTTTTGAAGATGTTTTCTGCATTTGG
TTAAAAGATAATTTCGTCATGTGGACCTTTGAATACTGTGAGACTATTTATCAGTTTGTT
TTGAC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2DK36TF 609 0 0
AAGAAACGCGAATAGGCTTTGTTCTAACTCTCCACACTGCAACATGACTTTCAAGCGCAG
GAACGGTGGAAGGAACAAGCACAACCGTGGTCATGTGAACCCCATCAGGTGTTCCAACTG
CGGGAAATGCTGTCCCAAGGATAAGGCGATCAAGAGGTTCATCGTCAGGAACATCGTCGA
ACAGGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCCAGTGTCTACGATGGTTACACTCTCCCGAA
GTTGTATGCCAAGACGCAGTACTGTGTCTTATGTGCTATCCACTCTCACGTCGTGAGAGT
CCGTTCCCGCACCAACCGTAGGGTTCGTCCCCCACCTCCACGTTTTGTCAGACGCAAGGA
GGATGCTCCCAAGCCCGGACAACCTGGTCAGGCCGCTCGCCCTGCTGGTGGTGCCCCTGC
TGCTGCT***CGTGCTTAAAGACTGCAAGAAGCTGGCAACTCAAAAATCTTTATGTTCTA
GTATCAGTCTCAGGGTTGGCTAGAATTTTTGAAGATGTTTTCTGCATTTGGTTAAAAGAT
AATTTCGTCATGTGGACCTTTGAATACTGTGAGACTATTTATCAGTTTGTTTTGACATTT
GGCGTTTCT

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 6

CO CL1042Contig1 1416 6 31 U
GTCCATTATCTTTCGCGAGCCTCGAAGAAAGCCAAAAAACAAATCTAAAGAGCTTCTCTT
CTTCTCCTCCTAGGGTTTCGACTCGACGGCCGGCAAGGTTTTCAACCTCTCGCGAAAGGG
GAAAGATGAGGCCAGTGTTCTGCGGGAACTTTGAGTATGATGCTCGTGGAGGTGATCTTG
AGAGGCTTTTCAGAAGATACGGCAAGGTCGACAGGGTTGATATGAAAGCTGGGTTTGCTT
TTGTCTATATGGAAAACGAGAGGGATGCTGAGGATGCGATCCGAGCGCTCGATCGCTATG
AGTATGGCCGTAAGGGACGCAGACTCCGTGTTGAGTGGACCAAGAACGAGCGTGGAGCTC
CTGTGAAATCAGGTGGTTCAAGGAGATCATCAAGCTTGCGACCTTCCAAGACTCTCTTTG
TGATCAACTTCGATGCAGAGAGCACTAGGACTCGTGACTTGGAGAGGCATTTTGAGCCGT
ATGGGAAAATCGTTAACGTTAGGATCAGAAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAGTTGC
AAGATGACGCCACCAGAGCATTGGAAGCTACAAACTCGAGTAAGCTGATGGACAAGGTGA
TCTCAGTGGAGTATGCAATGAAGGATGATGATGCTAGAGGAAACGGATACAGTCCCGAGA
GGCGTCGTGATAGGTCTCCCGATAGGAGAAGGCGATCACCTAGTCCTTACAGAAGAGAAA
GAGGCAGTCCTGACTATGGACGAGGTGCTAGTCCTGTCGGACACAGAAAGGAGAGGACTA
GCCCTGACTACGGCAGAGGAAGGCGCAGCCCGAGTCCTTACAGGAGAGCCAGGGTTAGCC
CTGACTACAAGAGGGATGACCGCAGGAGGGAGAGGGTAGCTAGCCCTGATTACAAGAGAG
ATGACCGTAGGAGGGAGAAGGAGGCTAGCCCAGAGAACGGAGCTGTGAGGGACCGTAGTC
CAAGAAACGGACGTGGTGAAAGCAGGAGCCCTCCTCCGTATGAGAAGAGGAGAGAGAGGG
AGAGGTCAAGATCGAAGTCTAGCCCTGAGAATGGTCAAGTTGAAAGCCCTGGACCGATAA
TGGAAGAAGAAGAAGCTGGAAGAGGATATGATGGTGCAGAAAGCCCGATACGCGAGAGCC
ACTCTCGTTCGCCTCCAGCAGAAGAATGATCGGACTTGTCCGTGTATGACCGAGCAGATG
ATTGTCTCTCTCGCGAAGTAGCTGTTGTGTGAAGTCTTTGCTATGATGTTATGTTTAGTT
ACTAGTGTGCTCTTTTGAGTCTTTGTTCAAGTGCTTTTGCAAACTTCATTTACATTTTGT
TG**GACTCATTCGAATTCGATTATTGTAGTACTGGTTAAAACTGCACTTTACTTCGGAT
CACGATTTCTCTCAGTAATGGTTTTATAAGCGCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 0 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU66TF U 1
AF RR2C071TF U 819
AF RR2A395TF U 501
AF RR2DE10TF U 691
AF RR2BU66JQ C 596
AF RR2C071JQ C 610
BS 1 565 RR2BU66TF
BS 566 566 RR2A395TF
BS 567 592 RR2BU66TF
BS 593 593 RR2A395TF
BS 594 653 RR2BU66TF
BS 654 710 RR2A395TF
BS 711 711 RR2DE10TF
BS 712 755 RR2A395TF
BS 756 756 RR2DE10TF
BS 757 757 RR2A395TF
BS 758 758 RR2DE10TF
BS 759 822 RR2A395TF
BS 823 823 RR2DE10TF
BS 824 841 RR2A395TF
BS 842 842 RR2DE10TF
BS 843 988 RR2A395TF
BS 989 989 RR2DE10TF
BS 990 1000 RR2A395TF
BS 1001 1001 RR2DE10TF
BS 1002 1012 RR2A395TF
BS 1013 1013 RR2C071TF
BS 1014 1060 RR2A395TF
BS 1061 1061 RR2DE10TF
BS 1062 1078 RR2A395TF
BS 1079 1079 RR2DE10TF
BS 1080 1302 RR2A395TF
BS 1303 1303 RR2DE10TF
BS 1304 1361 RR2A395TF
BS 1362 1372 RR2DE10TF
BS 1373 1390 RR2BU66JQ
BS 1391 1416 RR2C071JQ

RD RR2BU66TF 653 0 0
GTCCATTATCTTTCGCGAGCCTCGAAGAAAGCCAAAAAACAAATCTAAAGAGCTTCTCTT
CTTCTCCTCCTAGGGTTTCGACTCGACGGCCGGCAAGGTTTTCAACCTCTCGCGAAAGGG
GAAAGATGAGGCCAGTGTTCTGCGGGAACTTTGAGTATGATGCTCGTGGAGGTGATCTTG
AGAGGCTTTTCAGAAGATACGGCAAGGTCGACAGGGTTGATATGAAAGCTGGGTTTGCTT
TTGTCTATATGGAAAACGAGAGGGATGCTGAGGATGCGATCCGAGCGCTCGATCGCTATG
AGTATGGCCGTAAGGGACGCAGACTCCGTGTTGAGTGGACCAAGAACGAGCGTGGAGCTC
CTGTGAAATCAGGTGGTTCAAGGAGATCATCAAGCTTGCGACCTTCCAAGACTCTCTTTG
TGATCAACTTCGATGCAGAGAGCACTAGGACTCGTGACTTGGAGAGGCATTTTGAGCCGT
ATGGGAAAATCGTTAACGTTAGGATCAGAAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAGTTGC
AAGATGACGCCACCAGAGCATTGGATGCTACAAACTCGAGTAAGCTGATGGATAAGGTGA
TCTCAGTGGAGTATGCAATGAAGGATGATGATGCTAGAGGAAACGGATACAGT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2C071TF 391 0 0
TACAGGAGAGCCAGGGTTAGCCCTGACTACAAGAGGGACGATCGCAGGAGGGAGAGGGTG
ACTAGCCCTGATTACAAGAGAGATGACCGTAGGAGGGAGAAGGAGGCTAGCCCAGAGAAT
GGAGCTGTGAGGGAACGAAGTCCAAGAAACGGACGTGGTGAAAGCAGGAGCCCTCCTCCG
TATGAGAAGAGGAGAGAGAGGGAGAGGTCAAGGTCGAAATCTAGCCCTGAGAATGGTCAA
GTTGAAAGCCCTGGACCGATAATGGAAGAAGAAGAAGCTGGAAGAGGATATGATGGTGCA
GAAAGCCCGATACGCGAGAGCCACTCTCGCTCGCCTCCAGCAGAAGA*TGATGGGACTTG
TCCGTGTATGACCAAGCAGATGAT
GTCTCTC

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR2A395TF 869 0 0
G
GGATCAGAAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAGTTGCAAGATGACGCCACCAGAGCAT
TGGAAGCTACAAACTCGAGTAAGCTGATGGACAAGGTGATCTCAGTGGAGTATGCAATGA
AGGATGATGATGCTAGAGGAAACGGATACAGTCCCGAGAGGCGTCGTGATAGGTCTCCCG
ATAGGAGAAGGCGATCACCTAGTCCTTACCGAAGAGAAAGAGGCAGTCCTGACTATGGAC
GAGGTGCTAGTCCTCTTGGACACAGAAAGGAGAGGACTAGCCCTGACTACGGCAGAGGAA
GGCGCAGCCCGAGTCCTTACAAGAGAGCCAGGGTTAGCCCGGACTACAAGAGGGATGACC
GCAGGAGGGAGAGGGTAGCTAGCCCTGATTACAAGAGAGATGACCGTAGGAGGGAGAAGG
AGGCTAGCCCAGAGAACGGAGCTGTGAGGGACCGTAGTCCAAGAAACGGACGTGGTGAAA
GCAGGAGTCCTCCTCCGTACGAGAAGAGGAGGGAGAGGGAGAGGTCAAGATCGAAGTCTA
GCCCTGAGAATGGTCAAGTCGAAAGCCCTGGACCGATCATGGAAGAAGAAGAAGCTGGAA
GAGGATATGATGGTGCAGAAAGCCCGATACGCGAGAGCCACTCTCGTTCGCCTCCAGCAG
AAGAATGATCGGACTTGTCCGTGTATGACCGAGCAGATGATTGTCTCTCTCGCGAAGTAG
CTGTTGTGTGAAGTCTTTGCTATGATGTTATGTTTAGTTACTAGTGTGCTCTTTTGAGTC
TTTGTTCAAGTGCTTTTGCAA*CTTCATTTACATTTTGTTG**GACTCATTCGAATTCGA
TTATTGTAGTACTGGTTAAA
CTGCACTT

QA 2 861 2 861
DS 

RD RR2DE10TF 682 0 0
GGCGATCACCTAGTCCTTACAGAAGAGAAAGAGGCAGTCCTGACTATGGCCGAGGTGCTA
GTCCTGTCGGACACAGGAAGGAGAGGACTAGCCCTGACTACGGCAGAGGAAGGCGCAGCC
CGAGTCCTTACAGGAGAGCCAGGGTTAGCCCTGACTACAAGAGGGATGACCGCAGGAGGG
AGAGGTTAGCTAGCCCTGATTACAAGAGAGATGACCGTAGGAGGGAGAAGGAGGCTAGTC
CAGAGAACGGAGCTGTGAGGGACCGTAGTCCAAGAAACGGACGTGGTGAAAGCAGGAGCC
CTCCTCCGTATGAGAAGAGG***GAGAGGGAGAGGTCAAGATCTAAGTCTAGCCCTGAGA
ATGGTCAAGTTGAAAGCCCTGGACCGATAATGGAAGAAGAAGAAGCTGGAAGAGGATATG
ATGGTGCAGAAAGCCCGATACGCGAGAGCCACTCTCGTTCGCCTCCAGCAGAAGAATGAT
CGGACTTGTCCGTGTATGACCGAGCAGATGATTGTCTCTCTCGCGAAGTAGCTGTTGTGT
GAAGTCTTTGCTATGATGTTATGTTTAGTTACTAGTGTGCTCTTTTGAGTCTTTGTTCAA
GTGCTTTTGCAAACTTCATTTACATTTTGTTG**GACTCATTCGAATTCGATTATTGTAG
TACTGGTTAAAACTGCACTTTA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2BU66JQ 798 0 0
GGTGATCTCAGTGGAGTATGCAATGAAGGATGATGATGCTAGAGGAAACGGATACAGTCC
CGAGAGGCGTCGTGATAGGTCTCCTGATAGGAGAAGGCGATCACCTAGTCCTTACAGAAG
AGAAAGAGGCAGTCCTGACTATGGCCGAGGTGCTAGTCCTGTCGGACACAGGAAGGAGAG
GACTAGCCCTGACTACGGCAGAGGAAGGCGCAGCCCGAGTCCTTACAGGAGAGCCAGGGT
TAGCCCTGACTACAAGAGGGATGACCGCAGGAGGGAGAGGTTAGCTAGCCCTGATTACAA
GAGAGATGACCGTAGGAGGGAGAAGGAGGCTAGTCCAGAGAACGGAGCTGTGAGGGACCG
TAGTCCAAGAAACGGACGTGGTGAAAGCAGGAGCCCTCCTCCGTATGAGAAGAGG***GA
GAGGGAGAGGTCAAGATCGAAGTCTAGCCCTGAGAATGGTCAAGTTGAAAGCCCTGGACC
GATAATGGAAGAAGAAGAAGCTGGAAGAGGATATGATGGTGCAGAAAGCCCGATACGCGA
GAGCCACTCTCGTTCGCCTCCAGCAGAAGAATGATCGGACTTGTCCGTGTATGACCGAGC
AGATGATTGTCTCTCTCGCGAAGTAGCTGTTGTGTGAAGTCTTTGCTATGATGTTATGTT
TAGTTACTAGTGTGCTCTTTTGAGTCTTTGTTCAAGTGCTTTTGCAAACTTCATTTACAT
TTTGTTG**GACTCATTCGAATTCGATTATTGTAGTACTGGTTAAAACTGCACTTTACTT
CGGATCACGATTTCT
CTC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2C071JQ 807 0 0
AGTATGCAATGAAGGATGATGATGCGAGAGGAAACGGATACAGTCCCGAGAGGCGTCGTG
ATAGATCTCCCGATAGGAGAAGGCGGTCACCTAGTCCTTACAGAAGAGAAAGAGGCAGTC
CTGACTATGGACGAGGTGCTAGTCCTGTCGGACACCGAAAGGAGAGGACTAGCCCTGACT
ACGGCAGAGGAAGGCGCAGCCCGAGTCCTTACAGGAGAGCCAGGGTTAGCCCTGACTACA
AGAGGGACGATCGCAGGAGGGAGAGGGTGACTAGCCCTGATTACAAGAGAGATGACCGTA
GGAGGGAGAAGGAGGCTAGCCCAGAGAATGGAGCTGTGAGGGAACGAAGTCCAAGAAACG
GACGTGGTGAAAGCAGGAGCCCTCCTCCGTATGAGAAGAGGAGAGAGAGGGAGAGGTCAA
GGTCGAAATCTAGCCCTGAGAATGGTCAAGTTGAAAGCCCTGGACCGATAATGGAAGAAG
AAGAAGCTGGAAGAGGATATGATGGTGCAGAAAGCCCGATACGCGAGAGCCACTCTCGCT
CGCCTCCAGCAGAAGAATGATGGGACTTGTCCGTGTATGACCAAGCAGATGAT*GTCTCT
CTCGCGAAGTAGCTGTTGTGTGAAGTCTTTGCTATGATGTTATGTTTAGTTACTAGTGTG
CTCTTTCGAGTCTTTGTTCAAGTGCTTTTGCAAACTTCATTTACATTTTGTTTCCAACAC
ATTCGAATTCGATTTTTGTAGTACTGATTAAAACTGCACTTTACTTCGGATCACGATTTC
TCTCAGTAATGGTTTTATAAGCGCTAG

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 6

CO CL1043Contig1 773 6 3 U
GGCCATCATCTTCCTTCACAAAACAAACCAAGAGAAAAGATAAATCATCAAGAAAAGGTT
TGACTTTTCTTTGTGATCGACGAAGATGGCGGATGCTTTCACCGATGAGCAGATCCAAGA
GTTTTACGAAGCCTTCTGTCTCATCGACAAAGACTCCGATGGGTTCATCACAAAGGAGAA
ACTAACGAAGGTGATGAAGTCGATGGGGAAGAATCCAAACGAGGAACAACTTCAAGAGAT
GATGAGCCATGTCGATATCTTTGGCAACGGAGGCATCACCTTTGATGATTTCTTGTATAT
AATGGCTCAAAACACCTCTCAGGAAGCGGGATCGGATGAGTTGATAGAAGTGTTTAGAGT
GTTCGACAGAGACGGAGACGGTGTCATATCTGCACTTGAGTTGGGAGAAGGAATGAAAGA
CATGGGGATGAAGATAACGGCGGAAGAGGCGGAGCATATGGTGCGAGAAGCCGATCTTGA
TGGCGATGGTGTTCTCTCTTTCCACGAGTTCTCCAAAATGATGATCGCTGCCTCTTATTA
GTATTTATATATCCCTATAAAGTAAAAGCTATGATATAAGGGGGTTTGTTTGTATGATGC
TCTGTTTTTTTTTTT*GGAGTTTGCAATTTCTAATGAAGCTTCAAATGATAAAAAAGTGG
GTTTGTTTAAGCACGTATCAACTACTTTTCCATATGTTAAACTTAAAACAGATCGAATCG
TATGTCACAGTATTTTCCCAACATATAATAAAAGTCTCGGTCCCATATCAATC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G935TF U 1
AF RR2G177JQ C 142
AF RR2G177TF U 3
AF RR2G935JQ C 134
AF RR2BE05TF U 3
AF RR2BE05JQ C 33
BS 1 702 RR2G935TF
BS 703 767 RR2BE05TF
BS 768 773 RR2BE05JQ

RD RR2G935TF 703 0 0
GGCCATCATCTTCCTTCACAAAACAAACCAAGAGAAAAGATAAATCATCAAGAAAAGGTT
TGACTTTTCTTTGTGATCGACGAAGATGGCGGATGCTTTCACCGATGAGCAGATCCAAGA
GTTTTACGAAGCCTTCTGTCTCATCGACAAAGACTCCGATGGGTTCATCACAAAGGAGAA
ACTAACGAAGGTGATGAAGTCGATGGGGAAGAATCCAAACGAGGAACAACTTCAAGAGAT
GATGAGCCATGTCGATATCTTTGGCAACGGAGGCATCACCTTTGATGATTTCTTGTATAT
AATGGCTCAAAACACCTCTCAGGAAGCGGGATCGGATGAGTTGATAGAAGTGTTTAGAGT
GTTCGACAGAGACGGAGACGGTGTCATATCTGCACTTGAGTTGGGAGAAGGAATGAAAGA
CATGGGGATGAAGATAACGGCGGAAGAGGCGGAGCATATGGTGCGAGAAGCCGATCTTGA
TGGCGATGGTGTTCTCTCTTTCCACGAGTTCTCCAAAATGATGATCGCTGCCTCTTATTA
GTATTTATATATCCCTATAAAGTAAAAGCTATGATATAAGGGGGTTTGTTTGTATGATGC
TCTGTTTTTTTTTTT*GGAGTTTGCAATTTCTAATGAAGCTTCAAATGATAAAAAAGTGG
GTTTGTTTAAGCACGTATCAACTACTTTTCCATATGTTAAAC
C

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2G177JQ 527 0 0
CATCGACAAAGACTCCGATGGGTTCATCACAAAGGAGAAACTAACGAAGGTGATGAAGTC
GATGGGGAAGAATCCAAACGAGGAACAACTTCAAGAGATGATGAGCCATGTCGATATTTT
TGGCAACGGAGGCATCACCTTTGATGATTTCTTGTATATAATGGCTCAAAACACCTCTCA
GGAAGCGGGATCGGATGAGTTGATAGAAGTGTTTAGAGTGTTCGACAGAGACGGAGACGG
TGTCATATCTGCACTTGAGTTGGGAGAAGGAATGAAAGACATGGGGATGAAGATAACGGC
GGAAGAGGCGGAGCATATGGTGCGAGAAGCCGATCTTGATGGCGATGGTGTTCTCTCTTT
CCACGAGTTCTCCAAAATGATGATCGCTGCCTCTTATTAGTATTTATATATCCCTATAAA
GTAAAAGCTATGATATAAGGGGGTTTGTTTGTATGATGCTCTGTTTTTTTTTTT*GGAGT
TTGCAATTTCTAATGAAGCTTCAAATGATAAAAAAGTGGGTTTGT
CT

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2G177TF 666 0 0
GG
ATCATCTTCCTTCACAAAACAAACCAAGAGAAAAGATAAATCATCAAGAAAAGGTTTGAC
TTTTCTTTGTGATCGACGAAGATGGCGGATGCTTTCACCGATGAGCAGATCCAAGAGTTT
TACGAAGCCTTCTGTCTCATCGACAAAGACTCCGATGGGTTCATCACAAAGGAGAAACTA
ACGAAGGTGATGAAGTCGATGGGGAAGAATCCAAACGAGGAACAACTTCAAGAGATGATG
AGCCATGTCGATATCTTTGGCAACGGAGGCATCACCTTTGATGATTTCTTGTATATAATG
GCTCAAAACACCTCTCAGGAAGCGGGATCGGATGAGTTGATAGAAGTGTTTAGAGTGTTC
GACAGAGACGGAGACGGTGTCATATCTGCACTTGAGTTGGGAGAAGGAATGAAAGACATG
GGGATGAAGATAACGGCGGAAGAGGCGGAGCATATGGTGCGAGAAGCCGATCTTGATGGC
GATGGTGTTCTCTCTTTCCACGAGTTCTCCAAAATGATGATCGCTGCCTCTTATTAGTAT
TTATATATCCCTATAAAGTAAAAGCTATGATATAAGGGGGTTTGTTTGTATGATGCTCTG
TTTTTTTTTTT*GGAGTTTGCAATTTCTAATGAAGCTTCAA*TGATAAAAAAGTGGGTTT
GT
CT

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR2G935JQ 570 0 0
TTCTGTTTCATCGACAAAGACTCCGATGGGTTCATCACAAAGGAGAAACTAACGAAGGTG
ATGAAGTCGATGGGGAAGAATCCAAACGAGGAACAACTTCAAGAGATGATGAGCCATGTC
GATATCTTTGGCAACGGAGGCATCACCTTTGATGATTTCTTGTATATAATGGCTCAAAAC
ACCTCTCAGGAAGCGGGATCGGATGAGTTGATAGAAGTGTTTAGAGTGTTCGACAGAGAC
GGAGACGGTGTCATATCTGCACTTGAGTTGGGAGAAGGAATGAAAGACATGGGGATGAAG
ATAACGGCGGAAGAGGCGGAGCATATGGTGCGAGAAGCCGATCTTGATGGCGATGGTGTT
CTCTCTTTCCACGAGTTCTCCAAAATGATGATCGCTGCCTCTTATTAGTATTTATATATC
CCTATAAAGTAAAAGCTATGATATAAGGGGGTTTGTTTGTATGATGCTCTGTTTTTTTTT
TT*GGAGTTTGCAATTTCTAATGAAGCTTCAAATGATAAAAAAGTGGGTTTGTTTAAGCA
CGTATCAACTACTTTTCCATATGTTAAAC
C

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2BE05TF 771 0 0
GG
ATCATCTTCCTTCACAAAACAAACCAAGAGAAAAGATAAATCATCAAGAAAAGGTTTGAC
TTTTCTTTGTGATCGACGAAGATGGCGGATGCTTTCACCGATGAGCAGATCCAAGAGTTT
TACGAAGCCTTCTGTCTCATCGACAAAGACTCCGATGGGTTCATCACAAAGGAGAAACTA
ACGAAGGTGATGAAGTCGATGGGGAAGAATCCAAACGAGGAACAACTTCAAGAGATGATG
AGCCATGTCGATATCTTTGGCAACGGAGGCATCACCTTTGATGATTTCTTGTATATAATG
GCTCAAAACACCTCTCAGGAAGCGGGATCGGATGAGTTGATAGAAGTGTTTAGAGTGTTC
GACAGAGACGGAGACGGTGTCATATCTGCACTTGAGTTGGGAGAAGGAATGAAAGACATG
GGGATGAAGATAACGGCGGAAGAGGCGGATCATATGGTGCGAGAAGCCGATCTTGATGGC
GATGGTGTTCTCTCATTCCACGAGTTCTCCAAAATGATGATCGCTGCCTCTTATTAGTAT
TTATATATCCCTATAAAGTAAGAGCTATGATATAAGGGGGTTTGTTTGTATGATGCTCTG
TTTTTTTTTTTTGGAGTTTGCAATTTCTAATGAAGCTTCAAATGATAAAAAAGTGGGTTT
GTTTAAGCACGTATCAACTACTTTTCCATATGTTAAACTTAAAACAGATCGAATCGTATG
TCACAGTATTTTCCCAACATATAATAAAAGTCTCGGTCCCATA
TCAATC

QA 3 765 3 765
DS 

RD RR2BE05JQ 741 0 0
AGAAAAGATAAATCATCAAGAAAAGGTTTGACTTTTCTTTGTGATCGACGAAGATGGCGG
ATGCTTTCACCGATGAGCAGATCCAAGAGTTTTACGAAGCCTTCTGTCTCATCGACAAAG
ACTCCGATGGGTTCATCACAAAGGAGAAACTAACGAAGGTGATGAAGTCGATGGGGAAGA
ATCCAAACGAGGAACAACTTCAAGAGATGATGAGCCATGTCGATATCTTTGGCAACGGAG
GCATCACCTTTGATGATTTCTTGTATATAATGGCTCAAAACACCTCTCAGGAAGCGGGAT
CGGATGAGTTGATAGAAGTGTTTAGAGTGTTCGACAGAGACGGAGACGGTGTCATATCTG
CACTTGAGTTGGGAGAAGGAATGAAAGACATGGGGATGAAGATAACGGCGGAAGAGGCGG
ATCATATGGTGCGAGAAGCCGATCTTGATGGCGATGGTGTTCTCTCATTCCACGAGTTCT
CCAAAATGATGATCGCTGCCTCTTATTAGTATTTATATATCCCTATAAAGTAAGAGCTAT
GATATAAGGGGGTTTGTTTGTATGATGCTCTGTTTTTTTTTTTTGGAGTTTGCAATTTCT
AATGAAGCTTCAAATGATAAAAAAGTGGGTTTGTTTAAGCACGTATCAACTACTTTTCCA
TATGTTAAACTTAAAACAGATCGAATCGTATGTCACAGTATTTTCCCAACATATAATAAA
AGTCTCGGTCCCATATCAATC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 4

CO CL1044Contig1 745 4 14 U
TATATAAAGTAGATAGATTTTGAGGGAGAACGGGGACATTGGTTTTGGCGGAATTAGGGT
TTGACATGGCTTCATCGAGTAGAGTAGATTACGAAATCATCACCGATCCGTTCGATCCAC
GATGTGTGGTTGCATGCTTTAAGAACCTCTTTGGAGAACTGACCGAGAAGGATAAGCTTC
TGCGGAAGAGGATGCGAGGGAAAGAGGACAATAGGAGTCCAAAGGACACCCCACAGGAGG
AACGCGATCTCGTCAACGAACAGATCAGGAAGTCACAGGGATTTGACGTGGATTTTTCCA
AGTTCCGATGCCTTTTTGATTTCTACGCTGCTTTCCATGTCGATGAAAGACATTCAAACG
TAATAAGAGAAACCGATAGGCAGTTTTTCAGAAGATTGGCTAAGGAAGCCATTGCGGATT
ACAACACTAGAGAGGGGACCAGGTTTGAATTTGTTGAGGTCGAGAAAGCAAATGTGTATA
GTAATAGTGGATTCATTTACTTCATCACCTTTGTAGCCAAAGATCCTTGCGACCAGACAA
AAGTGTTTCAAGCTAAAGTCATCAATGTTTTCTGTAGAGAGATTGTGCACAGCTTCTGCA
GGCTTAAACCAGGTCAACAAGTAGAAAGCGATGAAGATTCTAAGAGAGTTGTGAAAAAAC
CTAGGAATAATACAAGATCGAACAAGCGTGCGGATGTCACTACTAATGTGTCTCAAAATG
ATGCAACAACCATTGTCAGAGATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G984TF U 34
AF RR2BY73TF U 1
AF RR2DE50TF U 20
AF RR2G172TF U 34
BS 1 242 RR2BY73TF
BS 243 243 RR2DE50TF
BS 244 541 RR2BY73TF
BS 542 542 RR2DE50TF
BS 543 556 RR2BY73TF
BS 557 557 RR2DE50TF
BS 558 583 RR2BY73TF
BS 584 584 RR2DE50TF
BS 585 601 RR2BY73TF
BS 602 602 RR2G172TF
BS 603 634 RR2DE50TF
BS 635 635 RR2G172TF
BS 636 658 RR2DE50TF
BS 659 745 RR2G172TF

RD RR2G984TF 520 0 0
GGACATTGGTTTTGGCGGAATTAGGGTTTGACATGGCTTCATCGAGTAGAGTAGATTACG
AAATCATCACCGATCCGTTCGATCCACGATGTGTGGTTGCATGCTTTAAGAACCTCTTTG
GAGAACTGACCGAGAAGGATAAGCTTCTGCGGAAGAGGATGCGAGGGAAAGAGGACAATA
GTAGTCCAAAGGACATCCCACAGGAGGAACGCGATCTCGTCAACGAACAGATCAGGAAGT
CACAGGGATTTGACGTGGATTTTTCCAAGTTCCGATGCCTTTTTGATTTCTACGCTGCTT
TCCATGTCGATGAAAGACATTCAAACGTAATAAGAGAAACCGATAGGCAGTTTTTCAGAA
GATTGGCTAAGGAAGCCATTGCGGATTACAACACTAGAGAGGGGACCAGGTTTGAATTTG
TTGAGGTCGAGAAAGCAAATGTGTATAGTAATAGTGGATTCATTTACTTCATCACCTTTG
TAGCCAAAGATCCTTGCGACCAGACAAAAGTGTTTCAAGC

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2BY73TF 602 0 0
TATATAAAGTAGATAGATTTTGAGGGAGAACGGGGACATTGGTTTTGGCGGAATTAGGGT
TTGACATGGCTTCATCGAGTAGAGTAGATTACGAAATCATCACCGATCCGTTCGATCCAC
GATGTGTGGTTGCATGCTTTAAGAACCTCTTTGGAGAACTGACCGAGAAGGATAAGCTTC
TGCGGAAGAGGATGCGAGGGAAAGAGGACAATAGGAGTCCAAAGGACACCCCACAGGAGG
AATGCGATCTCGTCAACGAACAGATCAGGAAGTCACAGGGATTTGACGTGGATTTTTCCA
AGTTCCGATGCCTTTTTGATTTCTACGCTGCTTTCCATGTCGATGAAAGACATTCAAACG
TAATAAGAGAAACCGATAGGCAGTTTTTCAGAAGATTGGCTAAGGAAGCCATTGCGGATT
ACAACACTAGAGAGGGGACCAGGTTTGAATTTGTTGAGGTCGAGAAAGCAAATGTGTATA
GTAATAGTGGATTCATTTACTTCATCACCTTTGTAGCCAAAGATCCTTGCGACCAGACAA
A*GTGTTTCAAGCTAA*GTCATCAATGTTTTCTGTAGAGAGAT*GTGCACAGCTTCTGCA
G
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2DE50TF 639 0 0
GG
GAGGGAGAACGGGGACATTGGTTTTGGCGGAATTAGGGTTTGACATGGCTTCATCGAGTA
GAGTAGATTACGAAATCATCACCGATCCGTTCGATCCACGATGTGTGGTTGCATGCTTTA
AGAACCTCTTTGGAGAACTGACCGAGAAGGATAAGCTTCTGCGGAAGAGGATGCGAGGGA
AAGAGGACAATAGGAGTCCAAAGGACACCCCACAGGAGGAACGCGATCTCGTCAACGAAC
AGATCAGGAAGTCACAGGGATTTGACGTGGATTTTTCCAAGTTCCGATGCCTTTTTGATT
TCTACGCTGCTTTCCATGTCGATGAAAGACATTCAAACGTAATAAGAGAAACCGATAGGC
AGTTTTTCAGAAGATTGGCTAAGGAAGCCATTGCGGATTACAACACTAGAGAGGGGACCA
GGTTTGAATTTGTTGAGGTCGAGAAAGCAAATGTGTATAGTAATAGTGGATTCATTTACT
TCATCACCTTTGTAGCCAAAGATCCTTGCGACCAGACAAAAGTGTTTCAAGCTAAAGTCA
TCAATGTTTTCTGTAGAGAGATTGTGCACAGCTTCTGCAG*CTTAAACCAGGTCAACAAG
TAGAAAGCGATGA*GATTCTAAGAGAGTTGTGAAAAA

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR2G172TF 712 0 0
GGACATTGGTTTTGGCGGAATTAGGGTTTGACATGGCTTCATCGAGTAGAGTAGATTACG
AAATCATCACCGATCCGTTCGATCCACGATGTGTGGTTGCATGCTTTAAGAACCTCTTTG
GAGAACTGACCGAGAAGGATAAGCTTCTGCGGAAGAGGATGCGAGGGAAAGAGGACAATA
GTAGTCCAAAGGACATCCCACAGGAGGAACGCGATCTCGTCAACGAACAGATCAGGAAGT
CACAGGGATTTGACGTGGATTTTTCCAAGTTCCGATGCCTTTTTGATTTCTACGCTGCTT
TCCATGTCGATGAAAGACATTCAAACGTAATAAGAGAAACCGATAGGCAGTTTTTCAGAA
GATTGGCTAAGGAAGCCATTGCGGATTACAACACTAGAGAGGGGACCAGGTTTGAATTTG
TTGAGGTCGAGAAAGCAAATGTGTATAGTAATAGTGGATTCATTTACTTCATCACCTTTG
TAGCCAAAGATCCTTGCGACCAGACAAAAGTGTTTCAAGCTAAGGTCATCAATGTTTTCT
GTAGAGAGATTGTGCACAGCTTCTGCAGGCTTAAACCAGGTCAACAAGTAGAAAGCGATG
AAGATTCTAAGAGAGTTGTGAAAAAACCTAGGAATAATACAAGATCGAACAAGCGTGCGG
ATGTCACTACTAATGTGTCTCAAAATGATGCAACAACCATTGTCAGAGATAT

QA 1 712 1 712
DS 



AS 2 6

CO CL1045Contig1 1322 4 11 U
GCGTCAAATCAAATCAGTTTTATTTAAAGTAAACAATCATAGAAATATGCCTTCACATCT
TTAATAAGACACACATAAAAGACATGATACATACACAAACATAAGATAACAGAGAAAC*A
CCAACATAGAGTTTCACATACTGTATAATGACTCAAACTTCATCCTTTTTCTCGGATACC
AAATCCTTTTTCTCGGATACCAAATCCTTTTTCTCAGCTACCAACTCCTCTTGGTCGTTC
TTAAACAGCTTATGCGCAATATGCTGACCAAACGTCCTTGGAGGAAACTTAGCCGGAGAC
TCAACACTCACCATCTCCGGCAACGGCTCAAGAACAATCTTATCCTTTGGTGGCTCACAG
AACACAGCCCAAGAAACCCTAACCTTCTCCTTATTCACCAACCCACGGTGAAGTATACTC
TTAAACTTCCCGTTACTAAGAATCTCCAACGTGTCTCCAATATGCATGACAATCGAATCA
GGAACGCATTTTGCAACGACCCATTTACCCTCGTAGAACAGCTGCAAACCAGGAACCATG
TTGTGTAGAATGAAGGTCAAAGCGCTTACGTCGGTGTGAGCTTTCCACGCCAAGTGCTAG
CTCAGGCTGAGGGCATTTCGGGTAATAGTTTATCTTCATCTGGAGGAGAAGCTCTTCTAA
GCCACCAACTTCTTTCTCAAGACGGTCAGGCTCTAAGCCTAGACCGAGAGAGAGAGCCTT
GAAGACTTTTGTTGCTAGCAAACGAAGACACTTGGCGTACTCGCTCGTCGCTTCAATGTA
ATCAGTTGGTGTCTTAGGCCAAAGTGATAGATCTCTCTTGTCTTCAGGGTAAACAAGATG
GAAGAAGTAATCTTCCCACTCAAGTTGTCCACTCGCGTTGTTAGCTAACTTACTTCCATA
CCCTTGAATCTTTCCCTTTGCTTGATCGTTTGCGTACTTCTCCTTCTCTTCAACGGGCAA
ACCGAAGAACTTTTCTCCTGACTTCTTCACACGCTCCATTAGATCAACAGGTATACCGTG
GTTGATCAGATACATCACTCCCCAGTCCATAGCCGCCTTTTTGAGCTCCTCTACGCATTT
CTCACGGATCGTTTGGTCTTCTGACTCTATGTCTTTGAGATCTATGGTGGGGACTTGTGG
ACCGTCTTCTTTCTTCTCTTCTTGGAACACGTCGTTGATGCTCTCGAGCTCTTCTTTTGG
ACGGATGTATTCTTTTGGGATCGATTCGATTCCGCTCTTTGCTAAGCTCTCGACTCTTTC
AACGGCAACCATCTTCTTGTTTGTACTTCTTGTAATGTCTTTGTCTTCTCGGTTTGTTGC
CC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2DV53JQ U 1
AF RR2AE18JQ U 2
AF RR2EB14JQ U 1
AF RR2AE18TF C 455
BS 1 350 RR2DV53JQ
BS 351 351 RR2AE18JQ
BS 352 477 RR2DV53JQ
BS 478 583 RR2EB14JQ
BS 584 584 RR2AE18TF
BS 585 659 RR2EB14JQ
BS 660 660 RR2AE18TF
BS 661 708 RR2EB14JQ
BS 709 709 RR2AE18TF
BS 710 773 RR2EB14JQ
BS 774 1322 RR2AE18TF

RD RR2DV53JQ 477 0 0
GCGTCAAATCAAATCAGTTTTATTTAAAGTAAACAATCATAGAAATATGCCTTCACATCT
TTAATAAGACACACATAAAAGACATGATACATACACAAACATAAGATAACAGAGAAAC*A
CCAACATAGAGTTTCACATACTGTATAATGACTCAAACTTCATCCTTTTTCTCGGATACC
AAATCCTTTTTCTCGGATACCAAATCCTTTTTCTCAGCTACCAACTCCTCTTGGTCGTTC
TTAAACAGCTTATGCGCAATATGCTGACCAAACGTCCTTGGAGGAAACTTAGCCGGAGAC
TCAACACTCACCATCTCCGGCAACGGCTCAAGAACAATCTTATCCTTTGGCGGCTCACAG
AACACAGCCCAAGAAACCCTAACCTTCTCCTTATTCACCAACCCACGGTGAAGTATACTC
TTAAACTTCCCGTTACTAAGAATCTCCAACGTGTCTCCAATATGCATGACAATCGAA

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2AE18JQ 463 0 0
G
GTCAAATCAAATCAGTTTTATTTAAAGTAAACAATCATAGAAATATGCCTTCACATCTTT
AATAAGACACACATAAAAGACATGATACATACACAAACATAAGATAACAGAGAAACCACC
AACATAGAGTTTCACATACTGTATAATGACTCAAACTTCATCCTTTTTCTCGGATACCAA
ATCCTTTTTCTCGGATACCAAATCCTTTTTCTCAGGTACCAACTCCTCTTGGTCGTTCTT
AAACAGCTTATGCGCAATATGCTGAGCAAACGTCCTTGGAGGAAACTTAGCCGGAGACTC
AACACTCACCATCTCCGGCAACGGCTCAAGAACAATCTTATCCTTTGGTGGCTCACAGAA
CACAGCCCAAGAAACCCTAACCTTCTCCTTATTCACCAGTCCACGGTGAAGTATACTCTT
GAACTTCCCGTTGCTAAGAATCTCCAACGTGTCTCCAATATG

QA 2 463 2 463
DS 

RD RR2EB14JQ 773 0 0
GC
GTCAAATCAAATCAGTTTTATTTAAAGTAAACAATCATAGAAATATGCCTTCACATCTTT
AATAAGACACACATAAAAGACATGATACATACACAAACATAAGATAACAGAGAAAC*ACC
AACATAGAGTTTCACATTCTGTATAATGACTCAAACTTCATCCTTTTTCTCGGATACCAA
ATCCTTTTTCTCGGATACCAAATCCTTTTTCTCAGCTACCAACTCCTCTTGGTCGTTCTT
AAACAGCTTATGCGCAATATGCTGACCAAACGTCCTTGGAGGAAACTTAGCCGGAGACTC
AACACTCACCATCTCCGGCAACGGCTCAAGAACAATCTTATCCTTTGGTGGCTCACAGAA
CACAGCCCAAGAAACCCTAACCTTCTCCTTATTCACCAACCCACGGTGAAGTATACTCTT
AAACTTCCCGTTACTAAGAATCTCCAACGTGTCTCCAATATGCATGACAATCGAATCAGG
AACGCATTTTGCAACGACCCATTTACCCTCGTAGAACAGCTGCAAACCAGGAACCATGTT
GTGTAGAATGAAGGTCAAAGCGCTTACGTCGGTGTGAGCTT*CCACGCCAAGTGCTAGCT
CAGGCTGAGGGCATTTCGGGTAATAGTTTATCTTCATCTGGAGGAGAAGCTCTTCTAGGC
CACCAACTTCTTTCTCAAGACGGTCAGGCTCTAAGCCTAGACCGAGCGAGAGAGCCTTGA
AGACTTTTGTTGCTAGCAAACGAAGACACTTGGCGTACTCGCTCGTCGCTT

QA 3 773 3 773
DS 

RD RR2AE18TF 868 0 0
CTCCAATATGCATGACGATCGAATCAGGA*CGCATTTTGCAATGACCCATTTACCCTCGT
AGAACAGCTGCAAACCAGGAACCATGTTGTGTAGAATGAAGGTCAAAGCGCTTACGTCGG
TGTGAGCTTTCCACGCCAAGTGCTAGCTCAGGCTGAGGGCATTTCGGGTAATAGTTTATC
TTCATCTGGAGGAGAAGCTCTTCTAAGCCGCCAACTTCTTTCTCAAGACGGTCCGGCTCT
AAGCCTAGACCGATAGAGAGAGCCTTGAAGACTTTTGTTGCTAGCAAACGAAGACACTTG
GCGTACTCGCTCGTCGCTTCAATGTAATCAGTTGGTGTCTTAGGCCAAAGTGATAGATCT
CTCTTGTCTTCAGGGTAAACAAGATGGAAGAAGTAATCTTCCCACTCAAGTTGTCCACTC
GCGTTGTTAGCTAACTTACTTCCATACCCTTGAATCTTTCCCTTTGCTTGATCGTTTGCG
TACTTCTCCTTCTCTTCAACGGGCAAACCGAAGAACTTTTCTCCTGACTTCTTCACACGC
TCCATTAGATCAACAGGTATACCGTGGTTGATCAGATACATCACTCCCCAGTCCATAGCC
GCCTTTTTGAGCTCCTCTACGCATTTCTCACGGATCGTTTGGTCTTCTGACTCTATGTCT
TTGAGATCTATGGTGGGGACTTGTGGACCGTCTTCTTTCTTCTCTTCTTGGAACACGTCG
TTGATGCTCTCGAGCTCTTCTTTTGGACGGATGTATTCTTTTGGGATCGATTCGATTCCG
CTCTTTGCTAAGCTCTCGACTCTTTCAACGGCAACCATCTTCTTGTTTGTACTTCTTGTA
ATGTCTTTGTCTTCTCGGTTTGTTGCCC

QA 1 868 1 868
DS 



CO CL1045Contig2 831 2 4 U
GGGCAACAAACCGAGAAGACAAAGACATTGCAAGAAGCACAAACAAGAAGATGGTTGCAG
TTGAAAGAGTTGAGAGCTTAGCAAAGAGCGGAATCGAAACGATCCCAAAAGAATACATTC
GTCCCAAAGAAGAACTGGAGAGCATCAACGACGTGTTCCAAGAAGAGAAGAAAGAAGACG
GTCCACAAGTCCCCACCATCGATCTCCAAGACATAGAGTCAGAAGACCAAACGATCCGTG
AGAAATGCGTAGAGGAGCTCAAAAAGGCGGCTATGGACTGGGGAGTGATGCATCTGATCA
ACCACGGTATACCTGTTGATCTAATGGAGCGTGTGAAGAAGTCAGGAGAAGAGTTCTTCG
GTTTGCCCGTTGAAGATAAGGAGAAGTACACAAACGATCAAGCCAAGGGAAAGATTCAAG
GGTATGGAAGTAAGTTAGCTAACAACGCGAGTGGACAGCTTGAGTGGGAAGATTACTTCT
TCCATCTTGTTTACCCTGAAGACAAGAGAGATCTATCACTTTGGCCTAAGACACCAACTG
ATTACATTGAAGCGACGAGCGAGTACGCCAAGTGTCTTCGTTTGCTAGCAACAAAAGTCT
TCAAGGCTCTCTCGCTCGGTCTAGGCTTAGAGCCTGACCGTCTTGAGAAAGAAGTTGGTG
GCCTAGAAGAGCTTCTCCTCCAGATGAAGATAAACTATTACCCGAAATGCCCTCAGCCTG
AGCTAGCACTTGGCGTGAAGCTCACACCGACGTAAGCGCTTTGACCTTCATCTACACACA
TGGTTCCTGGTTTGCAGCTGTTCTACGAGGGTAAATGGGTCGTTGCAAATG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV53TF U 1
AF RR2EB14TF U 3
BS 1 389 RR2DV53TF
BS 390 390 RR2EB14TF
BS 391 597 RR2DV53TF
BS 598 831 RR2EB14TF

RD RR2DV53TF 600 0 0
GGGCAACAAACCGAGAAGACAAAGACATTGCAAGAAGCACAAACAAGAAGATGGTTGCAG
TTGAAAGAGTTGAGAGCTTAGCAAAGAGCGGAATCGAAACGATCCCAAAAGAATACATTC
GTCCCAAAGAAGAACTGGAGAGCATCAACGACGTGTTCCAAGAAGAGAAGAAAGAAGACG
GTCCACAAGTCCCCACCATCGATCTCCAAGACATAGAGTCAGAAGACCAAACGATCCGTG
AGAAATGCGTAGAGGAGCTCAAAAAGGCGGCTATGGACTGGGGAGTGATGCATCTGATCA
ACCACGGTATACCTGTTGATCTAATGGAGCGTGTGAAGAAGTCAGGAGAAGAGTTCTTCG
GTTTGCCCGTTGAAGATAAGGAGAAGTACGCAAACGATCAAGCCAAGGGAAAGATTCAAG
GGTATGGAAGTAAGTTAGCTAACAACGCGAGTGGACAGCTTGAGTGGGAAGATTACTTCT
TCCATCTTGTTTACCCTGAAGACAAGAGAGATCTATCACTTTGGCCTAAGACACCAACTG
ATTACATTGAAGCGACGAGCGAGTACGCCAAGTGTCTTCGTTTGCTAGCAACAAAAG
CCT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2EB14TF 829 0 0
GG
AACAAACCGAGAAGACAAAGACATTGCAAGAAGCACAAACAAGAAGATGGTTGCAGTTGA
AAGAGTTGAGAGCTTAGCAAAGAGCGGAATCGAAACGATCCCAAAAGAATACATTCGTCC
CAAAGAAGAACTGGAGAGCATCAACGACGTGTTCCAAGAAGAGAAGAAAGAAGACGGTCC
ACAAGTCCCCACCATCGATCTCCAAGACATAGAGTCAGAAGACCAAACGATCCGTGAGAA
ATGCGTAGAGGAGCTCAAAAAGGCGGCTATGGACTGGGGAGTGATGCATCTGATCAACCA
CGGTATACCTGTTGATCTAATGGAGCGTGTGAAGAAGTCAGGAGAAGAGTTCTTCGGTTT
GCCCGTTGAAGATAAGGAGAAGTACACAAACGATCAAGCCAAGGGAAAGATTCAAGGGTA
TGGAAGTAAGTTAGCTAACAACGCGAGTGGACAGCTTGAGTGGGAAGATTACTTCTTCCA
TCTTGTTTACCCTGAAGACAAGAGAGATCTATCACTTTGGCCTAAGACACCAACTGATTA
CATTGAAGCGACGAGCGAGTACGCCAAGTGTCTTCGTTTGCTAGCAACAAAAGTCTTCAA
GGCTCTCTCGCTCGGTCTAGGCTTAGAGCCTGACCGTCTTGAGAAAGAAGTTGGTGGCCT
AGAAGAGCTTCTCCTCCAGATGAAGATAAACTATTACCCGAAATGCCCTCAGCCTGAGCT
AGCACTTGGCGTGAAGCTCACACCGACGTAAGCGCTTTGACCTTCATCTACACACATGGT
TCCTGGTTTGCAGCTGTTCTACGAGGGTAAATGGGTCGTTGCAAATG

QA 3 829 3 829
DS 



AS 2 6

CO CL1046Contig1 1547 4 11 U
AAAAGATATATACTAGTTATTATATACACAAATTCATAAGTTCATAACAGAAAATAACCA
AAAGATATCACACTATGATTCTGGTTTTTAACCACAATTCGAATGGAAATAACAATATTA
GACAGTCAGAAATTGTATGGGAGATAGCAGTTTAGTAGGAATGCAAGAATCCAAATAACC
GTGACGAATTTAATTTTGTAATAAAATAAAAAAATAAAAAGGAATTTTCTATGCACATTA
AGTTTTGATTACTGTATATGGAAATCAAATATTGTGTGGTAGACGGAGGGGAAAGTGGTG
TTGGCTAATGTAATCCATCCCCTGGAGCTGCGGCTCGAGCGTTCAACAAAGGTTGCAGAG
CTTTCACAACAATACTCATATTCGGTCTAAAATCTGCTTCATACTGCACGCACAACGCGG
CAACCGCCGCTAGCTTAGCAACAGCTTTTGGAGGGTAATCGCCACCAAGTCTTGCATCGA
CGCACTGTTTGACCTTGTCTTCGCTCAATTTAGGTGTTGCCCATGTGACTAGACTTTGCT
GGCCTCTGGGCAATCTATGATCAACAGGTTTTCGACCTGTAAGGAGTTCGAGTAAGACAA
CCCCGAAGCTGTACACATCACTTTTGGCATTTAACTGACCGGTCATCGCATATTCAGGGG
CATGGTAACCGAAAGTTCCAAGAACACGGGTTGAATGAAGGCGAGCAGCCATATCAGGAG
CTTGATTAGAGAGATCAAAGTCAGCAATCTTGGCAACATCATCTTCAAAGAGCAGGACAT
TGCTCGATTTGATGTCACGGTGGATGATGTGAGGATTTGCTTTTTCATGCAAATACTCAA
GCCCTCTTGCGGCTCCAACTGCAATTTTCACCCGTTGATACCACGACAAGACAGGACCTG
GCTGAGCTCCTTTCACGCCTTTTCTCCCATGAAGAATGTCATGAAGAGATCCATTCTTGG
CGAACTCATAGGCAAGTATCCTCGAGTTGCCGTCGACACAGTAGCCAAGCAGCTGAACAA
AGTTATCATGCTTCAGCCTCGACACCATGGAAACCTGAGCAAGGAACTCATTGTCAGGCT
GTTTGTTAGAATCAAGCTTTTTAATGGCTGCAGGCTGCTGGTTAGTTAGCACCCCGTAAT
AAACTCTTCCGTAAGAGCCTTCACCGATGAGAGAACTCGATCCAAAATCCTCAGTTGCTC
CTTGAGTTCAGTGACAGGGATAGTAGGTACTTCAATAGGCTGAACCTTCACAGCTGGAGC
GCCCTTTTGTGCAGCTTCAGAGGCATGGTGTCTCCCATCATTTCCTCCAAAGTGTTTAGC
TGGATTGTGGCCGCCGTAATCAGCAGCAGCTTTATGCATATCATCTTCCGCGCAACACCC
GAAGCAACTCATTTCTCTTTTCTTTCTTTCTATTTATTCAAATCTCTCGAAGAAAATGAT
CTGAGAGTAGTAGTAGTAGAGGGAGTAAGAGAGGCTTCTTCTTCTCTGGGAGATCTGAAA
GAGAGTTTTGCGTTTTTTGGTAACAGTGACGATCTTTGAGCGTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ74JQ U 1
AF RR2EV86JQ U 181
AF RR2GL70JQ U 168
AF RR2GL70TF C 822
BS 1 475 RR2BQ74JQ
BS 476 476 RR2GL70JQ
BS 477 653 RR2BQ74JQ
BS 654 667 RR2GL70JQ
BS 668 668 RR2EV86JQ
BS 669 754 RR2GL70JQ
BS 755 755 RR2EV86JQ
BS 756 784 RR2GL70JQ
BS 785 785 RR2EV86JQ
BS 786 924 RR2GL70JQ
BS 925 1547 RR2GL70TF

RD RR2BQ74JQ 653 0 0
AAAAGATATATACTAGTTATTATATACACAAATTCATAAGTTCATAACAGAAAATAACCA
AAAGATATCACACTATGATTCTGGTTTTTAACCACAATTCGAATGGAAATAACAATATTA
GACAGTCAGAAATTGTATGGGAGATAGCAGTTTAGTAGGAATGCAAGAATCCAAATAACC
GTGACGAATTTAATTTTGTAATAAAATAAAAAAATAAAAAGGAATTTTCTATGCACATTA
AGTTTTGATTACTGTATATGGAAATCAAATATTGTGTGGTAGACGGAGGGGAAAGTGGTG
TTGGCTAATGTAATCCATCCCCTGGAGCTGCGGCTCGAGCGTTCAACAAAGGTTGCAGAG
CTTTCACAACAATACTCATATTCGGTCTAAAATCTGCTTCATACTGCACGCACAACGCGG
CAACCGCCGCTAGCTTAGCAACAGCTTTTGGAGGGTAATCGCCACCAAGTCTTGCGTCGA
CGCACTGTTTGACCTTGTCTTCGCTCAATTTAGGTGTTGCCCATGTGACTAGACTTTGCT
GGCCTCTGGGCAATCTATGATCAACAGGTTTTCGACCTGTAAGGAGTTCGAGTAAGACAA
CCCCGAAGCTGTACACATCACTTTTGGCATTTAACTGACCGGTCATCGCATAT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2EV86JQ 672 0 0
GTGACGAATTTAATTTTGTAATAAAATAAAAAAATAAAAAGGAATTTTCTATGCACATTA
AGTTTTGATTACTGTATATGGAAATCAAATATTGTGTGGTAGACGGAGGGGAAAGTGGTG
TTGGCTAATGTAATCCATCCCCTGGAGCTGCGGCTCGAGCGTTCAACAAAGGTTGCAGAG
CTTTCACAACAATACTCATATTCGGTCTAAAATCTGCTTCATACTGCACGCACAACGCGG
CAACCGCCGCTAGCTTAGCAACAGCTTTTGGAGGGTAATCGCCACCAAGTCTTGCATCGA
CGCACTGTTTGACCTTGTCTTCGCTCAATTTAGGTGTTGCCCATGTGACTAGACTTTGCT
GGCATCTGGGCAATCTATGATCAACAGGTTTTCGACCTGTAAGGAGTTCGAGTAAGACAA
CCCCGAAGCTGTACACATCACTTTTGGCATTTAACTGACCGGTCATCGCATATTCAGGGG
CATGGTAACCGAAAGTTCCAAGAACACGGGTTGAATGAAGGCGAGCAGCCATATCAGGAG
CTTGATTAGAGAGATCAAAGTCAGCAATCTTGGCAACATCATCTTCAAAGAGTAGGACAT
TGCTCGATTTGATGTCACGGTGGATGATGTGAGGATTTGCTTTTTCATGCAAATACTCAA
GCCCTCTTGCGG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2GL70JQ 757 0 0
AATCCAAATAACCGTGACGGATTTAATTTTGTAATAAAATAAAAAA*TAAAAAGGAATTT
TCTATGCACATTAAGTTTTGATTACTGTATATGGAAATCAAATATTGTGTGGTAGACGGA
GGGGAAAGTGGTGTTGGCTAATGTAATCCATCCCCTGGAGCTGCGGCTCGAGCGCTCAAC
AAAGGTTGCAAAGCTTTCACAACAATACTCATATTCGGTCTAAAATCTGCTTCATACTGC
ACGCACAACGCTGCAACCGCCGCTAGCTTAGCAACAGCTTTTGGAGGGTAATCGCCACCA
AGTCTTGCATCGACGCACTGTTTGACCTTGTCTTCGCTCAATTTAGGTGTTGCCCATGTG
ACTAGACTTTGCTGGCCTCTGGGCAATCTATGATCAACAGGTTTTCGACCTGTAAGGAGT
TCGAGCAAGACAACCCCGAAGCTGTACACATCACTTTTGGCATTTAACTGACCGGTCATC
GCATATTCAGGGGCATGGTAGCCGAAAGTTCCAAGAACACGGGTTGAATGAAGGCGAGCA
GCCATATCAGGAGCTTGATTAGAGAGATCAAAGTCAGCAATCTTGGCGACATCATCTTCA
AAGAGCAGGACATTGCTTGATTTGATGTCACGGTGGATGATGTGAGGATTTGCTTTTTCA
TGCAAATACTCAAGCCCTCTTGCGGCTCCAACTGCAATTTTCACCCGTTGATACCACGAC
AAGACAGGACCTGGCTGAGCTCCTTTCACGCCTTTTC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2GL70TF 726 0 0
TTTTCATGCAAATACTCAAGCCCTCTTGCGGCTCCAACTGCAATTTTCACCCGTTGATAC
CACGACAAGACAGGACCTGGCTGAGCTCCTTTCACGCCTTTTCTCCCATGAAGAATGTCA
TGAAGAGATCCATTCTTGGCGAACTCATAGGCAAGTATCCTCGAGTTGCCGTCGACACAG
TAGCCAAGCAGCTGAACAAAGTTATCATGCTTCAGCCTCGACACCATGGAAACCTGAGCA
AGGAACTCATTGTCAGGCTGTTTGTTAGAATCAAGCTTTTTAATGGCTGCAGGCTGCTGG
TTAGTTAGCACCCCGTAATAAACTCTTCCGTAAGAGCCTTCACCGATGAGAGAACTCGAT
CCAAAATCCTCAGTTGCTCCTTGAGTTCAGTGACAGGGATAGTAGGTACTTCAATAGGCT
GAACCTTCACAGCTGGAGCGCCCTTTTGTGCAGCTTCAGAGGCATGGTGTCTCCCATCAT
TTCCTCCAAAGTGTTTAGCTGGATTGTGGCCGCCGTAATCAGCAGCAGCTTTATGCATAT
CATCTTCCGCGCAACACCCGAAGCAACTCATTTCTCTTTTCTTTCTTTCTATTTATTCAA
ATCTCTCGAAGAAAATGATCTGAGAGTAGTAGTAGTAGAGGGAGTAAGAGAGGCTTCTTC
TTCTCTGGGAGATCTGAAAGAGAGTTTTGCGTTTTTTGGTAACAGTGACGATCTTTGAGC
GTACCC

QA 1 726 1 726
DS 



CO CL1046Contig2 703 2 1 U
GGTACGCTCAAAGATCGTCACTGTTACCAAAAAACGCAAACTCTCTTTCAGATCTCCCAG
AGAAGAAGAAGCCTCTCTCACTCCCTCTACTACTACTTCTCTCCGATCATCTTCTTCGAG
AGAGATTTGAATAAATAGAAAAGAAAAGAGAAATGAGTTGCTTCGGGTGTTGCGCGGAAG
ATGATATGCATAAAGCTGCAGCTGATTACGGTGGCCACAATCCAGCTAAACACTTTGGAG
GAAATGATGGGAGGCACCATGCCTCTGAAGCTGCACAAAAGGGCGCTCCAGCTGTGAAGG
TGCAGCCTATTGAAGTACCTACTATCCCCGTCGCTGAACTCAAGGAAGCAACTGAGGATT
TTGGATCGAGTTCTCTCATCGGTGAAGGCTCTTACGGAAGAGTTTATTACGGGGTGTTAA
CTAACCAGCAGCCTGCTGCCATTAAAAAGCTTGATTCTAACAAACAGCCTGACAATGAGT
TCCTTGCCCAGGTTTCCATGGTGTCGAGGCTGAAGCATGATAACTTTGTTCAGCTGCTTG
GCTACTGTGTTGACGGCAACTCGAGGATACTTGCCTATGAGTTCGCCAAGAATGGATCTC
TTCATGACATTCTTCATGGGAGAAAAGGCGTGAAAGAGCTCAGCCAGGTCCTGTCCTGTC
GTGGTATCACGGGTGAAATTGCAGTTGGAGCCGCAAGAGGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV86TF U 21
AF RR2BQ74TF U 1
BS 1 703 RR2BQ74TF

RD RR2EV86TF 590 0 0
GG
GTTACCAAAAAACGCAAACTCTCTTTCAGATCTCCCAGAGAAGAAGAAGCCTCTCTCACT
CCCTCTACTACTACTTCTCTCCGATCATCTTCTTCGAGAGAGATTTGAATAAATAGAAAA
GAAAAGAGAAATGAGTTGCTTCGGGTGTTGCGCGGAAGATGATATGCATAAAGCTGCAGC
TGATTACGGTGGCCACAATCCAGCTAAACACTTTGGAGGAAATGATGGGAGGCACCATGC
CTCTGAAGCTGCACAAAAGGGCGCTCCAGCTGTGAAGGTGCAGCCTATTGAAGTACCTAC
TATCCCCGTCGCTGAACTCAAGGAAGCAACTGAGGATTTTGGATCGAGTTCTCTCATCGG
TGAAGGCTCTTACGGAAGAGTTTATTACGGGGTGTTAACTAACCAGCAGCCTGCTGCCAT
TAAAAAGCTTGATTCTAACGAACAGCCTGACAATGAGTTCCTTGCCCAGGTTTCCATGGT
GTCGAGGCTGAAGCATGATAACTTTGTTCAGCTGCTTGGCTACTGTGTTGACGGCAACTC
GAGGATACTTGCCTATGAGTTCGCCAAGAATGGATCTCTTCATGACAT

QA 3 590 3 590
DS 

RD RR2BQ74TF 703 0 0
GGTACGCTCAAAGATCGTCACTGTTACCAAAAAACGCAAACTCTCTTTCAGATCTCCCAG
AGAAGAAGAAGCCTCTCTCACTCCCTCTACTACTACTTCTCTCCGATCATCTTCTTCGAG
AGAGATTTGAATAAATAGAAAAGAAAAGAGAAATGAGTTGCTTCGGGTGTTGCGCGGAAG
ATGATATGCATAAAGCTGCAGCTGATTACGGTGGCCACAATCCAGCTAAACACTTTGGAG
GAAATGATGGGAGGCACCATGCCTCTGAAGCTGCACAAAAGGGCGCTCCAGCTGTGAAGG
TGCAGCCTATTGAAGTACCTACTATCCCCGTCGCTGAACTCAAGGAAGCAACTGAGGATT
TTGGATCGAGTTCTCTCATCGGTGAAGGCTCTTACGGAAGAGTTTATTACGGGGTGTTAA
CTAACCAGCAGCCTGCTGCCATTAAAAAGCTTGATTCTAACAAACAGCCTGACAATGAGT
TCCTTGCCCAGGTTTCCATGGTGTCGAGGCTGAAGCATGATAACTTTGTTCAGCTGCTTG
GCTACTGTGTTGACGGCAACTCGAGGATACTTGCCTATGAGTTCGCCAAGAATGGATCTC
TTCATGACATTCTTCATGGGAGAAAAGGCGTGAAAGAGCTCAGCCAGGTCCTGTCCTGTC
GTGGTATCACGGGTGAAATTGCAGTTGGAGCCGCAAGAGGGCT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL1047Contig1 762 2 7 U
GTGTTTACCGTAGAGACTCTATTGACTCTACTCATTATCCGGTTTTCCATCAGATGGAAG
GCTTTTGTGTCTTTTCTCCTGAGGACTGGAAGGAGTCTGGCAAGGATTCCACGTTATATG
CAGCTGAGGATTTGAAGAAATGTCTTGAGGGTTTGGCACGTCACTTGTTTGGTGGTGTGG
AGATGAGATGGGTTGATACATACTTTCCATTTACCGAACCATCTTTCGAGCTTGAGATAT
ATTTTAAGGAAGACTGGTTGGAAGTTTTGGGCTGTGGGGTGACAGAGCAACGAATTTTGA
AGCAGAGTGGATTAGAAAACAATGTTGCTTGGGCCTTTGGACTTGGATTGGAGCGACTTG
CTATGGTTTTGTTTGACATCCCTGATATTAGACTCTTCTGGTCTGATGATGAACGGTTTA
CGTCCCAGTTTAAAAAAGGAGAGCTTGGAGTCAAGTTCAAGCCATTCTCAAAGTATCCAC
CTTGTTACAAGGACATCAGTTTCTGGATCAGTGAATCATTCACAGAGAATAACTTTTGTG
AAGTTGTGAGAGGAATCGCTGGGGATCTTGTTGAAGAGGTGAAGTTAATCGACAGTTTCA
CCAATAAGAAAGGGATGACGAGTCACTGTTACAGAATTGTTTTCCGTTCCATGGAGCGCT
CTCTTACAGACGAGGAGGTCAATGATCTGCAGAGTAAGTGCGTGATGAGTGCAAGAAAGC
TAAATGTTGATTAAGTAGAGTTTGCTGGAGAGATGATGATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ14TF U 219
AF RR2DA67TF U 1
BS 1 283 RR2DA67TF
BS 284 284 RR2DZ14TF
BS 285 375 RR2DA67TF
BS 376 376 RR2DZ14TF
BS 377 421 RR2DA67TF
BS 422 422 RR2DZ14TF
BS 423 762 RR2DA67TF

RD RR2DZ14TF 281 0 0
G
CATCTTTCGAGCTTGAGATATATTTTAAGGAAGACTGGTTGGAAGTTTTGGGCTGTGGGG
TGATAGAGCAACGAATTTTGAAGCAGAGTGGATTAGAAAACAATGTTGCTTGGGCCTTTG
GACTTGGATTGGAGCGACTTGCTATGGTTTTGTTTGACATCCCTGATATTAGACTTTTCT
GGTCTGATGATGAACGGTTTACGTCCCAGTTTAAAAAAGGAGAGCTTGGAGTCAAGTTCA
AGCCATTCTCAAAGTATCCGCCTTGTTACAAGGACATCAG

QA 2 281 2 281
DS 

RD RR2DA67TF 762 0 0
GTGTTTACCGTAGAGACTCTATTGACTCTACTCATTATCCGGTTTTCCATCAGATGGAAG
GCTTTTGTGTCTTTTCTCCTGAGGACTGGAAGGAGTCTGGCAAGGATTCCACGTTATATG
CAGCTGAGGATTTGAAGAAATGTCTTGAGGGTTTGGCACGTCACTTGTTTGGTGGTGTGG
AGATGAGATGGGTTGATACATACTTTCCATTTACCGAACCATCTTTCGAGCTTGAGATAT
ATTTTAAGGAAGACTGGTTGGAAGTTTTGGGCTGTGGGGTGACGGAGCAACGAATTTTGA
AGCAGAGTGGATTAGAAAACAATGTTGCTTGGGCCTTTGGACTTGGATTGGAGCGACTTG
CTATGGTTTTGTTTGGCATCCCTGATATTAGACTCTTCTGGTCTGATGATGAACGGTTTA
CTTCCCAGTTTAAAAAAGGAGAGCTTGGAGTCAAGTTCAAGCCATTCTCAAAGTATCCAC
CTTGTTACAAGGACATCAGTTTCTGGATCAGTGAATCATTCACAGAGAATAACTTTTGTG
AAGTTGTGAGAGGAATCGCTGGGGATCTTGTTGAAGAGGTGAAGTTAATCGACAGTTTCA
CCAATAAGAAAGGGATGACGAGTCACTGTTACAGAATTGTTTTCCGTTCCATGGAGCGCT
CTCTTACAGACGAGGAGGTCAATGATCTGCAGAGTAAGTGCGTGATGAGTGCAAGAAAGC
TAAATGTTGATTAAGTAGAGTTTGCTGGAGAGATGATGATGA

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 6

CO CL1048Contig1 889 6 5 U
GGGAAATCTCCGTCTCTCCTCTCTCTCTCTCACTCGATCGGCAATGGCTGCCCCCAACTC
CATTTTCACCGCCGCTCCGTCTCGAAACCTTGTACCTATATCTCTTCACCAGTCATCATT
GTCTTCAGCGTTGAGTCCCCGGGTCGCCAGATCGAACTCCGTCGCGTTTCGTCCCAAACC
CCGATCCAGCTCGCTCGTCTTCTGCTCCACCGATGATTCAAAAGTCTCGTCCGCAGAGAA
AGAGATCCCAATTGAACTCAGGTACGAGGCTTATCCGACAGTGATGGACATTAACCAGAT
ACGAGACATTTTGCCTCACAGGTTCCCGTTTCTGTTAGTGGATAGAGTGATAGAGTACAC
AGCTGGCGAATCTGCGGTAGCTATAAAGAACGTGACCATTAATGACAATTTCTTTCCTGG
CCATTTCCCTGAGAGGCCCATTATGCCTGGTGTCCTCATGGTTGAGGCGATGGCTCAGGT
GGGAGGTATAGTGATGCTGAATCCAGAAGTGGGGGGATCTAAAACCAACTTCTTCTTTGC
TGGAGTCGACAAAGTCAGGTTCAGGAAGCCTGTGATTGCTGGTGACACTCTGGTGATGAG
GATGACGCTTGTGAAGCTGCAGAAGCGGTTTGGGATAGCCAAAATGGAA*GGGAAAGCAT
ACGTAGGGAACACTCTGGTGTGCGAA*GGAGAGTTCTTGATGGCTATGGGAAAAGAAGAG
GAGTGATCATCTTCTCGTTGCCTTTTGCTTTTTTTTTTTTCTCCTTACCCCTTGTGGGTA
CGAGTTATTTATCACACATTCGAGTCTTATATCCATCTCCAGTTTCTGTTGTTTTGTTAC
GAATGCTGTTTGACCATTTTAAAAGATAATAATGAATTGGAATTATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH46TF U 8
AF RR2GH46JQB C 376
AF RR2AM90JQ C 374
AF RR2AD32TF U 1
AF RR2AM90TF U 8
AF RR2AD32JQ C 374
BS 1 649 RR2AD32TF
BS 650 650 RR2AD32JQ
BS 651 800 RR2AD32TF
BS 801 805 RR2AM90TF
BS 806 889 RR2AD32JQ

RD RR2GH46TF 641 0 0
GGGTCTCTCCT
CTCTCTCTCTCTCACTCGATCGGCAATGGCTGCCCCCAACTCCATTTTCACCGCCGCTCC
GTCTCGAAACCTTGTACCTATATCTCTTCACCAGTCATCATTGTCTTCAGCGTTGAGTCC
CCGGGTCGCCAGATCGAACTCCGTCGCGTTTCGTCCCAAACCCCGATCCAGCTCGCTCGT
CTTCTGCTCCACCGATGATTCAAAAGTCTCGTCCGCAGAGAAAGAGATCCCAATTGAACT
CAGGTACGAGGCTTATCCGACAGTGATGGACATTAACCAGATACGAGACATTTTGCCTCA
CAGGTTCCCGTTTCTGTTAGTGGATAGAGTGATAGAGTACACAGCTGGCGAATCTGCGGT
AGCTATAAAGAACGTGACCATTAATGACAATTTCTTTCCTGGCCATTTCCCTGAGAGGCC
CATTATGCCTGGTGTCCTCATGGTTGAGGCGATGGCTCAGGTGGGAGGTATAGTGATGCT
GAATCCAGAAGTGGGGGGATCTAAAACCAACTTCTTCTTTGCTGGAGTCGACAAAGTCAG
GTTCAGGAAGCCTGTGATTGCTGGTGACACTCTGGTGATGAGGATGACGCTTGTGAAGCT
GCAGAAGCGGTTTGGGATAGCCAAAATGGA

QA 12 641 12 641
DS 

RD RR2GH46JQB 306 0 0
GGTAGCTATAAAGAACGTGACCATTAATGACAATTTCTTTCCTGGCCATTTCCCTGAGAG
GCCCATTATGCCTGGTGTCCTCATGGTTGAGGCGATGGCTCAGGTGGGAGGTATAGTGAT
GCTGAATCCAGAAGTGGGGGGATTTAAAACCAACTTTTTTTTTGCTGGAGTCGACAAAGT
CAGGTTCAGGAAGCCTGTGATTGCTGGTGACACTCTGGTGATGAGGATGACGCTTGTGAA
GCTGCAGAAGCGGTTTGGGATAGCCAAAATGGAA*GGGAAAGCATACGTAGGGAACA
TTTTGGTGT

QA 1 297 1 297
DS 

RD RR2AM90JQ 348 0 0
GCGGTAGCTATAAAGAACGTGACCATTAATGACAATTTCTTTCCTGGCCATTTCCCTGAG
AGGCCCATTATGCCTGGTGTCCTCATGGTTGAGGCGATGGCTCAGGTGGGAGGTATAGTG
ATGCTGAATCCAGAAGTGGGGGGATCTAAAACCAACTTCTTCTTTGCTGGAGTCGACAAA
GTCAGGTTCAGGAAGCCTGTGATTGCTGGTGACACTCTGGTGATGAGGATGACGCTTGTG
AAGCTGCAGAAGCGGTTTGGGATAGCCAAAATGGAA*GGGAAAGCATACGTAGGGAACAC
TCTGGTGTGCGAA*GGAGAGTTCTTGATGGCTATGGGAAAAGAAGAGG

QA 1 348 1 348
DS 

RD RR2AD32TF 802 0 0
GGGAAATCTCCGTCTCTCCTCTCTCTCTCTCACTCGATCGGCAATGGCTGCCCCCAACTC
CATTTTCACCGCCGCTCCGTCTCGAAACCTTGTACCTATATCTCTTCACCAGTCATCATT
GTCTTCAGCGTTGAGTCCCCGGGTCGCCAGATCGAACTCCGTCGCGTTTCGTCCCAAACC
CCGATCCAGCTCGCTCGTCTTCTGCTCCACCGATGATTCAAAAGTCTCGTCCGCAGAGAA
AGAGATCCCAATTGAACTCAGGTACGAGGCTTATCCGACAGTGATGGACATTAACCAGAT
ACGAGACATTTTGCCTCACAGGTTCCCGTTTCTGTTAGTGGATAGAGTGATAGAGTACAC
AGCTGGCGAATCTGCGGTAGCTATAAAGAACGTGACCATTAATGACAATTTCTTTCCTGG
CCATTTCCCTGAGAGGCCCATTATGCCTGGTGTCCTCATGGTTGAGGCGATGGCTCAGGT
GGGAGGTATAGTGATGCTGAATCCAGAAGTGGGGGGATCTAAAACCAACTTCTTCTTTGC
TGGAGTCGACAAAGTCAGGTTCAGGAAGCCTGTGATTGCTGGTGACACTCTGGTGATGAG
GATGACGCTTGTGAAGCTGCAGAAGCGGTTTGGGATAGCCAAAATGGAAAGGGAAAGCAT
ACGTAGGGAACACTCTGGTGTGCGAA*GGAGAGTTCTTGATGGCTATGGGAAAAGAAGAG
GAGTGATCATCTTCTCGTTGCCTTTTGCTTTTTTTTTTTTCTCCTTACCCCTTGTGGGTA
CGAGTTATTTATCACACATT
CG

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2AM90TF 811 0 0
GGGTCTCTCCT
CTCTCTCTCTCTCACTCGATCGGCAATGTCTGCCCCCAACTCCATTTTCACCGCCGCTCC
GTCTCGAAACCTTGTACCTATATCTCTTCACCAGTCATCATTGTCTTCAGCGTTGAGTCC
CCGGGTCGCCAGATCGAACTCCGTCG**TTTCGTCCCAAACCCCGATCCAGCTCGCTCGT
CTTCTGCTCCACCGATGATTCAAAAGTCTCGTCCGCAGAGAAAGAGATCCCAATTGAACT
CAGGTACGAGGCTTATCCGACAGTGATGGACATTAACCAGATACGAGACATTTTGCCTCA
CAGGTTCCCGTTTCTGTTAGTGGATAGAGTGATAGAGTACACAGCTGGCGAATCTGCGGT
AGCTATAAAGAACGTGACCATTAATGACAATTTCTTTCCTGGCCATTTCCCTGAGAGGCC
CATTATGCCTGGTGTCCTCATGGTTGAGGCGATGGCTCAGGTGGGAGGTATAGTGATGCT
GAATCCAGAAGTGGGGGGATCTAAAACCAACTTCTTCTTTGCTGGAGTCGACAAAGTCAG
GTTCAGGAAGCCTGTGATTGCTGGTGACACTCTGGTGATGAGGATGACGCTTGTGAAGCT
GCAGAAGCGGTTTGGGATAGCCAAAATGGAAAGGGAAAGCATACGTAGGGAACACTCTGG
TGTGCGAAAGGAGAGTTCTTGATGGCTATGGGAAAAGAAGAGGAGTGATCATCTTCTCGT
TGCCTTTTGCTTTTTTTT****CTCCTTACCCCTTGTGGGTACGAGTTATTTATCACACA
TTCGAGT
CTATATCTATCTC

QA 12 798 12 798
DS 

RD RR2AD32JQ 516 0 0
GCGGTAGCTATAAAGAACGTGACCATTAATGACAATTTCTTTCCTGGCCATTTCCCTGAG
AGGCCCATTATGCCTGGTGTCCTCATGGTTGAGGCGATGGCTCAGGTGGGAGGTATAGTG
ATGCTGAATCCAGAAGTGGGGGGATCTAAAACCAACTTTTTCTTTGCTGGAGTCGACAAA
GTCAGGTTCAGGAAGCCTGTGATTGCTGGTGACACTCTGGTGATGAGGATGACGCTTGTG
AAGCTGCAGAAGCGGTTTGGGATAGCCAAAATGGAA*GGGAAAGCATACGTAGGGAACAC
TCTGGTGTGCGAA*GGAGAGTTCTTGATGGCTATGGGAAAAGAAGAGGAGTGATCATCTT
CTCGTTGCCTTTTGCTTTTTTTTTTTTCTCCTTACCCCTTGTGGGTACGAGTTATTTATC
ACACATTCGAGTCTTATATCCATCTCCAGTTTCTGTTGTTTTGTTACGAATGCTGTTTGA
CCATTTTAAAAGATAATAATGAATTGGAATTATCAC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 2 7

CO CL1049Contig1 747 3 11 U
GGACTGCCACAGCTCCCACCCAGAGAAAGAGCAGCATCCCAAAACCCCCTTAGCATTTCG
TCTCTCGTCATCCATTGTCCAACATCATGTCAAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGG
AAACTGTCACTCTCGGACCCGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTTTTCGGTGTTGTTCACA
TCTTTGCATCTTTCAATGACACTTTCATTCACGTGACTGATCTCTCGGGAAGAGAAACTC
TCGTTCGTATCACAGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACCGTGATGAGTCCTCTCCTTATG
CTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCCA
TGCACGTGAAGCTCCGTGCCACCGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGTGCCC
AGTCTGCTCTTAGAGCCCCTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTGA
CTCCAATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGTAGAGGAAGAAGACTTTGAT
TTCCCCATGAGAGCCTACTCGTCATTGTTCTGTTGTTGTGCTCTTTGACTCTGGTTGTTT
ATTGGGTACACACTTGGAATTTAGTTCTGTCTCGTTACAATTTATCTTTTCATGTTACTT
CGGAAACATTATTAAGTGGTGTCTTTCTTCAACGTTGTAACTTTTGCATTTGGAGTTGTG
AGAATGAGAAGAGTAACAGTGTGACTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB93TF U 1
AF RR2FH73TF U 1
AF RR2FH73JQ C 118
BS 1 167 RR2CB93TF
BS 168 168 RR2FH73TF
BS 169 328 RR2CB93TF
BS 329 329 RR2FH73TF
BS 330 382 RR2CB93TF
BS 383 383 RR2FH73TF
BS 384 438 RR2CB93TF
BS 439 439 RR2FH73TF
BS 440 519 RR2CB93TF
BS 520 741 RR2FH73TF
BS 742 747 RR2FH73JQ

RD RR2CB93TF 519 0 0
GGACTGCCACAGCTCCCACCCAGAGAAAGAGCAGCATCCCAAAACCCCCTTAGCATTTCG
TCTCTCGTCATCCATTGTCCAACATCATGTCAAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGG
AAACTGTCACTCTCGGACCCGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTTTTCTGTGTTGTTCACA
TCTTTGCATCTTTCAATGACACTTTCATTCACGTGACTGATCTCTCGGGAAGAGAAACTC
TCGTTCGTATCACAGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACCGTGATGAGTCCTCTCCTTATG
CTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTTGCCCAAAGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCCA
TGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGTGCCC
AGTCTGCTCTTAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTGA
CTCCAATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGAC

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2FH73TF 747 0 0
GGACTGCCACAGCTCCCACCCAGAGAAAGAGCAGCATCCCAAAACCCCCTTAGCATTTCG
TCTCTCGTCATCCATTGTCCAACATCATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGG
AAACTGTCACTCTCGGACCCGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTTTTCGGTGTTGTTCACA
TCTTTGCATCTTTCAATGACACTTTCATTCACGTGACTGATCTCTCGGGAAGAGAAACTC
TCGTTCGTATCACAGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACCGTGATGAGTCCTCTCCTTATG
CTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCCA
TGCACGTGAAGCTCCGTGCCACCGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGTGCCC
AGTCTGCTCTTAGAGCCCCTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTGA
CTCCAATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGTAGAGGAAGAAGACTTTGAT
TTCCCCATGAGAGCCTACTCGTCATTGTTCTGTTGTTGTGCTCTTTGACTCTGGTTGTTT
ATTGGGTACACACTTGGAATTTAGTTCTGTCTCGTTACAATTTATCTTTTCATGTTACTT
CGGAAACATTATTAAGTGGTGTCTTTCTTCAACGTTGTAACTTTTGCATTTGGAGTTGTG
AGAATGAGAAGAGTAACAGTG
TGACTA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2FH73JQ 630 0 0
AG
GAAACTGTCACTCTCGGACCCGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTTTTCGGTGTTGTTCAC
ATCTTTGCATCTTTCAATGACACTTTCATTCACGTGACTGATCTCTCGGGAAGAGAAACT
CTCGTTCGTATCACAGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACCGTGATGAGTCCTCTCCTTAT
GCTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCC
ATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACCGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGTGCC
CAGTCTGCTCTTAGAGCCCCTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTG
ACTCCAATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGTAGAGGAAGAAGACTTTGA
TTTCCCCATGAGAGCCTACTCGTCATTGTTCTGTTGTTGTGCTCTTTGACTCTGGTTGTT
TATTGGGTACACACTTGGAATTTAGTTCTGTCTCGTTACAATTTATCTTTTCATGTTACT
TCGGAAACATTATTAAGTGGTGTCTTTCTTCAACGTTGTAACTTTTGCATTTGGAGTTGT
GAGAATGAGAAGAGTAACAGTGTGACTA

QA 3 630 3 630
DS 



CO CL1049Contig2 746 4 8 U
GGGTCACTGCCACAGCTCAGAGCAGCATCCCAAAACCCCCTAGCATTTCGTCTCTCGCCA
TCCATCGCCCAGCATCATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAAGAAACAGTCAC
TCTCGGACCTGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTTTTTGGTGTTGTCCACATCTTTGCATC
TTTCAATGACACTTTCATTCATGTGACTGATCTTTCTGGAAGAGAAACTCTCGTTCGTAT
CACAGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACCGTGATGAGTCATCTCCTTATGCCGCTATGCT
TGCTGCTCAAGATGTCGCTCAAAGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCAATGCACGTGAA
GCTCCGTGCCACCGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGTGCCCAGTCTGCTCT
CAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTGACTCCAATTCC
CACCGACAGTACACGTAGAAAGGG*TGGACGTAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCCCATG
AGAGCCTACTCGTCATTGTTCAGTTGTCCCCTTTTGACAATGGTTGTTTATTGGGTACAC
ACTTGG*AGTTTAGTTCTGTCTCGTTACATTTTATCTTTTCATGCTACTTCGGAAACATT
ATAAGCTGTGTCTTTCTTCAATGTTGTAACTTTTGCATTTGGAGTTTTGAGAA*TGAGAA
GAGTAACAGTGACTATATGTTCCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FR47TF U 1
AF RR2FR47JQ C 23
AF RR2DI53JQ C 112
AF RR2DI53TF U 113
BS 1 165 RR2FR47TF
BS 166 166 RR2DI53TF
BS 167 321 RR2FR47TF
BS 322 322 RR2DI53TF
BS 323 696 RR2FR47TF
BS 697 697 RR2DI53TF
BS 698 710 RR2FR47TF
BS 711 746 RR2DI53TF

RD RR2FR47TF 710 0 0
GGGTCACTGCCACAGCTCAGAGCAGCATCCCAAAACCCCCTAGCATTTCGTCTCTCGCCA
TCCATCGCCCAGCATCATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAAGAAACAGTCAC
TCTCGGACCTGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTTTTTGGTGTTGTTCACATCTTTGCATC
TTTCAATGACACTTTCATTCATGTGACTGATCTTTCTGGAAGAGAAACTCTCGTTCGTAT
CACAGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACCGTGATGAGTCATCTCCTTATGCCGCTATGCT
TGCTGCTCAAGATGTCGCTCAGAGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCAATGCACGTGAA
GCTCCGTGCCACCGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGTGCCCAGTCTGCTCT
CAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTGACTCCAATTCC
CACCGACAGTACACGTAGAAAGGG*TGGACGTAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCCCATG
AGAGCCTACTCGTCATTGTTCAGTTGTCCCCTTTTGACAATGGTTGTTTATTGGGTACAC
ACTTGG*AGTTTAGTTCTGTCTCGTTACATTTTATCTTTTCATGCTACTTCGGAAACATT
ATAAGCTGTGTCTTTCTTCAATGTTGTAACTTTTGCGTTTGGAGTTTTGA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2FR47JQ 712 0 0
CAGCATCCCAAAACCCCCTAGCATTTCGTCTCTCGCCATCCATCGCCCAGCATCATGTCG
AGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAAGAAACAGTCACTCTCGGACCTGCTGTTCGTGAC
GGAGAGCAAGTTTTTGGTGTTGTTCACATCTTTGCATCTTTCAATGACACTTTCATTCAT
GTGACTGATCTTTCTGGAAGAGAAACTCTCGTTCGTATCACAGGTGGGATGAAGGTCAAG
GCTGACCGTGATGAGTCATCTCCTTATGCCGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTCGCTCAG
AGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCAATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACCGGAGGAAAC
AAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGTGCCCAGTCTGCTTTCAGAGCCCTTGCTCGTTTTGGC
ATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTGACTCCAATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAG
GG*TGGACGTAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCCCATGAGAGCCTACTCGTCATTGTTCA
GTTGTCCCCTTTTGACAATGGTTGTTTATTGGGTACACACTTGG*AGTTTAGTTCTGTCT
CGTTACATTTTATCTTTTCATGCTACTTCGGAAACATTATAAGCTGTGTCTTTCTTCAAT
GTTGTAACTTTTGCGTTTGGAGTTTTGAGAAATCAGAAGAGTAACAGTG
ACT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2DI53JQ 635 0 0
A
ACAGTCACTCTCGGACCTGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTTTTTGGTGTTGTCCACATC
TTTGCATCTTTCAATGACACTTTCATTCATGTGACTGATCTTTCTGGAAGAGAAACTCTC
GTTCGTATCACAGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACCGTGATGAGTCTTCTCCTTATGCT
GCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCCATG
CACGTGAAGCTCCGTGCCACCGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGTGCCCAG
TCTGCTTTTAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTGACT
CCAATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGG*TGGACGTAGAGGAAGAAGACTTTGATT
TCCCCATGAGAGCCTACTCGTCCTTGTTCAGTTGTCCCCTTTTGACTCTGGTTGTTTATT
GGGTACACACTTGG*AGTTTAGTTCTGTTTCGTTACATTTTATCTTTTCATGCTACTTCG
GAAACATTATAAGCTGTGTCTTTCTTCAATGTTGTAACTTTTGCATTTGGAGTTTTGAGA
A*TGAGAAGAGTAACAGTGACTATATGTTCCCTC

QA 2 635 2 635
DS 

RD RR2DI53TF 634 0 0
ACAGTCACTCTCGGACCTGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTTTTTGGTGTTGTCCACATC
TTTGCATCTTTCAATGACACTTTCATTCATGTGACTGATCTTTCTGGAAGAGAAACTCTC
GTTCGTATCACAGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACCGTGATGAGTCTTCTCCTTATGCT
GCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCCATG
CACGTGAAGCTCCGTGCCACCGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGTGCCCAG
TCTGCTCTTAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTGACT
CCAATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGGTGGACGTAGAGGAAGAAGACTTTGATT
TCCCCATGAGAGCCTACTCGTCCTTGTTCAGTTGTCCCCTTTTGACTCTGGTTGTTTATT
GGGTACACACTTGGGAGTTTAGTTCTGTTTCGTTACATTTTATCTTTTCATGCTACTTCG
GAAACATTATAAGCTGTGTCTTTCTTCAATGTTGTAACTTTTGCATTTGGAGTTTTGAGA
A*TGAGAAGAGTAACAGTGACTATATGTTCCCTC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 2 6

CO CL1050Contig1 594 3 10 U
CTCAGGCAAGAACATCGATTAATTTATAGAACCAACAGAAGTACATCACAAGAGCATTTA
ACCAATCAACCTAAAGCAATCTCTCATATTCGAACCACTTTTGAACACATAACCCGGTCG
TTTACCACTAAACCAAGTGGTTCCACTCTGTTATTATTAGTTTGAGCAGCATCCACCTTT
CTTCACAGCAGAAACATCTTTACCAAGATCGATCTTGTCTCCTTTCGACGGAACATTAGC
GGATTCGCTCGCAGCTTCCATTGCCTTTCTGCTCACAACGCAGTGAATCTGAGTGAGGAC
TTCCGCGAAAGCGTTCTCAACATTGGTAGAGTCGAGAGCCGAGGTTTCCATGAAGTAAAG
AGACTCTTTCTCAGCGAATGACTTGGCATCGTCTGTCCGAACAGCCACGAGGTGGCGGAG
ATCAGATTTGTTCCCCACGAGCATCACTACGATGTTTGGATCGGTGTGGTTTCTGAGCTC
TTTGAGCCACGTCTCCACGTTTTCGAATGTGGAGTGTCGCGTTACATCGTAGACGAAAAG
CGCTCCCACGGCTCCTCGGTAGTATGCGCTTGTGATGGCTCGGTACCTTTCTTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2A411JQ U 1
AF RR2B406JQ U 1
AF RR2B406TF C 1
BS 1 117 RR2A411JQ
BS 118 118 RR2B406JQ
BS 119 358 RR2A411JQ
BS 359 359 RR2B406JQ
BS 360 364 RR2A411JQ
BS 365 365 RR2B406JQ
BS 366 397 RR2A411JQ
BS 398 398 RR2B406JQ
BS 399 535 RR2A411JQ
BS 536 594 RR2B406JQ

RD RR2A411JQ 535 0 0
CTCAGGCAAGAACATCGATTAATTTATAGAACCAACAGAAGTACATCACAAGAGCATTTA
ACCAATCAACCTAAAGCAATCTCTCATATTCGAACCACTTTTGAACACATAACCCGGGCG
TTTACCACTAAACCAAGTGGTTCCACTCTGTTATTATTAGTTTGAGCAGCATCCACCTTT
CTTCACAGCAGAAACATCTTTACCAAGATCGATCTTGTCTCCTTTCGACGGAACATTAGC
GGATTCGCTCGCAGCTTCCATTGCCTTTCTGCTCACAACGCAGTGAATCTGAGTGAGGAC
TTCCGCGAAAGCGTTCTCAACATTGGTAGAGTCGAGAGCCGAGGTTTCCATGAAGTAAGG
AGACCCTTTCTCAGCGAATGACTTGGCATCGTCTGTCTGAACAGCCACGAGGTGGCGGAG
ATCAGATTTGTTCCCCACGAGCATCACTACGATGTTTGGATCGGTGTGGTTTCTGAGCTC
TTTGAGCCACGTCTCCACGTTTTCGAATGTGGAGTGTCGCGTTACATCGTAGACG

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2B406JQ 594 0 0
CTCAGGCAAGAACATCGATTAATTTATAGAACCAACAGAAGTACATCACAAGAGCATTTA
ACCAATCAACCTAAAGCAATCTCTCATATTCGAACCACTTTTGAACACATAACCCGGTCG
TTTACCACTAAACCAAGTGGTTCCACTCTGTTATTATTAGTTTGAGCAGCATCCACCTTT
CTTCACAGCAAAAACATCTTTACCAAGATCGATCTTGTCTCCTTTCGACGGAACATTAGC
GGATTCGCTCGCAGCTTCCATTGCCTTTCTGCTCACAACGCAGTGAATCTGAGTGAGGAC
TTCCGCGAAAGCGTTCTCAACATTGGTAGAGTCGAGAGCCGAGGTTTCCATGAAGTAAAG
AGACTCTTTCTCAGCGAATGACTTGGCATCGTCTGTCCGAACAGCCACGAGGTGGCGGAA
ATCAAATTTGTTCCCCACGAGCATCACTACGATGTTTGGATCGGTGTGGTTTCTGAGCTC
TTTGAGCCACGTCTCCACGTTTTCGAATGTGGAGTGTCGCGTTACATCGTAAACGAAAAG
CGCTCCCACGGCTCCTCGGTAGTATGCGCTTGTGATGGCTCGGTACCTTTCTTC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2B406TF 594 0 0
CTCAGGCAAGAACATCGATTAATTTATAGAACCAACAGAAGTACATCACAAGAGCATTTA
ACCAATCAACCTAAAGCAATCTCTCATATTCGAACCACTTTTGAACACATAACCCGGTCG
TTTACCACTAAACCAAGTGGTTCCACTCTGTTATTATTAGTTTGAGCAGCATCCACCTTT
CTTCACAGCAGAAACATCTTTACCAAGATCGATCTTGTCTCCTTTCGACGGAACATTAGC
GGATTCGCTCGCAGCTTCCATTGCCTTTCTGCTCACAACGCAGTGAATCTGAGTGAGGAC
TTCCGCGAAAGCGTTCTCAACATTGGTAGAGTCGAGAGCCGAGGTTTCCATGAAGTAAAG
AGACTCTTTCTCAGCGAATGACTTGGCATCGTCTGTCCGAACAGCCACGAGGTGGCGGAG
ATCAGATTTGTTCCCCACGAGCATCACTACGATGTTTGGATCGGTGTGGTTTCTGAGCTC
TTTGAGCCACGTCTCCACGTTTTCGAATGTGGAGTGTCGCGTTACATCGTAGACGAGAAG
CGCTCCCACGGCTCCTCGGTAGTATGCGCTTGTGATGGCTCGGTACCTTTCTT
C

QA 1 593 1 593
DS 



CO CL1050Contig2 1053 3 11 U
AAAATGACAATTGTTTTTTAAAAAGTTTCACGGAGGGAGCAGTATCTTTAATATCTTTCT
TAGATAAGGTAGTTCTGGGAAATTGAAAAAACATCAAAATTCAAAATCATTTTCTCAGGC
AAGAACATCGATTAATTTATAGAACCAACAGAAATACACCACAAGAGCATTTAACCAATC
AACCTAAAGCAATCTCTCATATTCGAACCACTTTTGAACACATAACCCGGTCGTTTACCA
CTAAACCAAGTGGTTCCACTCTGTTATTACTAGTTTGAGCAGCATCCACCTTTCTTCACA
GCAGAAACATCTTTACCAAGATCGATCTTGTCTCCTTTCGACGGAACATTAGCGGATTCG
CTCGCAGCTTCCATGGCCTTTCTGCTCACAACGCAGTGAATCTGAGTGAGGACTTCCGCG
AAAGCGTTCTCAACATTGGTAGAGTCGAGAGCCGAGGTTTCCATGAAGTAAAGAGACTCT
TTCTCAGCGAATGGCTTGGCATCGTCTGTCTGAACAGCGACGAGGTGGCGGAGATCAGAT
TTGTTCCCCACGAGCATGACTACGATGTTTGGATCGGTGTGGTTTCTTAGCTCTTTGAGC
CACGTCTCCACGTTTTCGAATGTGGAGTGTCGGGTTACATCGTAGACGAGAAGCGCTCCC
ACGGCTCCTCGGTAGTATGCGCTAGTGATGGCTCGGCACCTTTCTTGACCAGCAGTATCC
CAAATCTGGGCTTTGATGACCTTATCGTCAACATTCAAGCTCCTAGTCGCGAACTCGACT
CCGATGGTTGATTTGGACTCGAGGCTGAACTCGTTCTTGGTGAATCGTGAAAGCAGATTG
GACTTCCCAACACCAGAGTCACCGATGAGAACAACCTTGAAAAGGTAATCGTATTCATCG
TCTGCTTTGTAACCCGCCATTGAGAGAGAGAGAGAGATCAAAATGTTTTTTGTGCTTTTT
TAGAAAAAAAAAAGGTGAAAAACCCTAACGAGATTTACGCCAGGATTTTGTTCTCTAGAT
CTTTTCGACTTGTACACAGACAGAGGAACGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB54JQ U 1
AF RR2ES17JQ U 117
AF RR2FB54TF C 290
BS 1 221 RR2FB54JQ
BS 222 222 RR2ES17JQ
BS 223 235 RR2FB54JQ
BS 236 236 RR2ES17JQ
BS 237 750 RR2FB54JQ
BS 751 751 RR2ES17JQ
BS 752 772 RR2FB54JQ
BS 773 882 RR2ES17JQ
BS 883 883 RR2FB54TF
BS 884 937 RR2ES17JQ
BS 938 1053 RR2FB54TF

RD RR2FB54JQ 780 0 0
AAAATGACAATTGTTTTTTAAAAAGTTTCACGGAGGGAGCAGTATCTTTAATATCTTTCT
TAGATAAGGTAGTTCTGGGAAATTGAAAAAACATCAAAATTCAAAATCATTTTCTCAGGC
AAGAACATCGATTAATTTATAGAACCAACAGAAATACACCACAAGAGCATTTAACCAATC
AACCTAAAGCAATCTCTCATATTCGAACCACTTTTGAACACGTAACCCGGTCGTT*ACCA
CTAAACCAAGTGGTTCCACTCTGTTATTACTAGTTTGAGCAGCATCCACCTTTCTTCACA
GCAGAAACATCTTTACCAAGATCGATCTTGTCTCCTTTCGACGGAACATTAGCGGATTCG
CTCGCAGCTTCCATGGCCTTTCTGCTCACAACGCAGTGAATCTGAGTGAGGACTTCCGCG
AAAGCGTTCTCAACATTGGTAGAGTCGAGAGCCGAGGTTTCCATGAAGTAAAGAGACTCT
TTCTCAGCGAATGGCTTGGCATCGTCTGTCTGAACAGCGACGAGGTGGCGGAGATCAGAT
TTGTTCCCCACGAGCATGACTACGATGTTTGGATCGGTGTGGTTTCTTAGCTCTTTGAGC
CACGTCTCCACGTTTTCGAATGTGGAGTGTCGGGTTACATCGTAGACGAGAAGCGCTCCC
ACGGCTCCTCGGTAGTATGCGCTAGTGATGGCTCGGCACCTTTCTTGACCAGCAGTATCC
CAAATCTGGGCTTTGATGACCTTATCGTCA*CATTCAAGCTCCTAGTCGCGA
CTCGACTT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2ES17JQ 824 0 0
G
GGCAAGAACATCGATTAATTTATAGAACCAACAGAAATACATCACAAGAGCATTTAACCA
ATCAACCTAAAGCAATCTCTCATATTCGAACCACTTTTGAACACATAACCCGGTTGTTTA
CCACTAAACCAAGTGGTTCCACTCTGTTATTATTAGTTTGAGCAGCATCCACCTTTCTTC
ACAGCAGAAACATCTTTACCAAGATCGATCTTGTCTCCTTTGGACGGAACATTAGCGGAT
TCACTCGCAGCTTCCATTGCCTTTCTGCTCACAACGCAGTGAATCTGAGTGAGGACTTCC
GCGAAAGCGTTCTCAACATTGGTAGAGTCGAGAGCCGAAGTTTCCATGAAGTAAAGAGAC
TCTTTCTCAGCGAATGACTTGGCATCGTCTGTCTGAACAGCCACGAGGTGGCGGAGATCA
GATTTGTTCCCCACGAGCATCACTACGATGTTTGGATCGGTGTGGTTTCTGAGCTCTTTG
AGCCACGTCTCCACGTTTTCAAACGTGGAGTGTCGCGTTACGTCGTAGACGGGAAGCGCT
CCCACGGCTCCTCGGTAGTATGCGCTAGTGATGGCTCGGTACCTTTCTTGACCAGCAGTA
TCCCAAATCTGGGCTTTGATGACTTTATCGTCAACATTCAAGCTCCTAGTCGCGAACTCG
ACTCCGATGGTTGATTTGGACTCGAGGCTGAACTCGTTCTTGGTGAATCGTGAAAGCAGA
TTGGACTTCCCAACACCAGAGTCACCGATGAGAACAACCTTGAAA*GGTAATCGTATTCA
TCGTCTGCTTTGTAACCCGCCATTGAGAGAGAGAGAGAGA
GAG

QA 2 821 2 821
DS 

RD RR2FB54TF 764 0 0
CTTTTC
TCACAGCAGAAACATCTTTACCAAGATCGATCTTGTCTCCTT*CGACGGAACATTAGCGG
AT*CGCTCGCAGCTTCCATGGCCTTTCTGCTCACAACGCAGTGAATCTGAGTGAGGACTT
CCGCGAAAGCGTTCTCAACATTGGTAGAGTCGAGAGCCGAGGTTTCCATGAAGTAAAGAG
ACTCTTTCTCAGCGAATGGCTTGGCATCGTCTGTCTGAACAGCGACGAGGTGGCGGAGAT
CAGATTTGTTCCCCACGAGCATGACTACGATGTTTGGATCGGTGTGGTTTCTTAGCTCTT
TGAGCCACGTCTCCACGTTTTCGAATGTGGAGTGTCGGGTTACATCGTAGACGAGAAGCG
CTCCCACGGCTCCTCGGTAGTATGCGCTAGTGATGGCTCGGCACCTTTCTTGACCAGCAG
TATCCCAAATCTGGGCTTTGATGACCTTATCGTCAACATTCAAGCTCCTAGTCGCGAACT
CGACTCCGATGGTTGATTTGGACTCGAGGCTGAACTCGTTTTTTGTGAATCGTGAAAGCA
GATTGGACTTTCCAACACCAGAGTCACCGATGAGAACAACCTTGAAAAGGTAATCGTATT
CATCGTCTGCTTTGTAACCCGCCATTGAGAGAGAGAGAGAGATCAAAATGTTTTTTGTGC
TTTTTTAGAAAAAAAAAAGGTGAAAAACCCTAACGAGATTTACGCCAGGATTTTGTTCTC
TAGATCTTTTCGACTTGTACACAGACAGAGGAACGCCC

QA 7 764 7 764
DS 



AS 1 7

CO CL1051Contig1 520 7 10 U
GGGTACAAATAGAAACACTTCATTTATTTCCTAAAATTTTAACCCACTATCAATCCATTT
CTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTCTACTCTTATTCACCTTATTAATTGCCTTCATC
ATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATGCGCAGAAAAAGGAAGAAAAACTATGTCCTTCT
CCAATCAAGTTAGGCCGTTTTTGTCTTCCAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAAGAAA
TTCCCAACTCCTCGTATTGGTTTTGGTAGTGGTTTTTGTGCAGATTTAGAGAAGGGAATT
TGTAACTGTGCTGTTCCTTGTGGTTCACGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACCTAA
ATTCTATATTACCGTTTTAACTATAAATGTCTAAATATTTTTAGTGTCATTAAAATAAAG
TATTATGATATTTGTATCGGATCTTTGGTTTATTTATAATAAATAACAATATGAATGTTA
AATAATTGCAATCTTTATTAATAAAATTGGACTTTTTATA


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BP34JQ C 1
AF RR2BP34TF U 1
AF RR2CS61JQ C 1
AF RR2CS61TF U 1
AF RR2F682JQ C 1
AF RR2EU64TF U 159
AF RR2F682TF U 47
BS 1 103 RR2BP34TF
BS 104 104 RR2CS61TF
BS 105 162 RR2BP34TF
BS 163 163 RR2CS61TF
BS 164 403 RR2BP34TF
BS 404 404 RR2CS61TF
BS 405 451 RR2BP34TF
BS 452 481 RR2CS61TF
BS 482 504 RR2EU64TF
BS 505 520 RR2F682TF

RD RR2BP34JQ 451 0 0
GGGTACAAATAGAAACACTTCATTTATTTCCTAAAATTTTAACCCACTATCAATCCATTT
CTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTCTACTCTTATTCACCTCATTAATTGCCTTCATC
ATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATGCGCAGAAAAAGGAAAAAAAACTATGTCCTTCT
CCAATCAAGTTAGGCCGTTTTTGTCTTCCAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAAGAAA
TTCCCAACTCCTCGTATTGGTTTTGGTAGTGGTTTTTGTGCAGATTTAGAGAAGGGAATT
TGTAACTGTGCTGTTCCTTGTGGTTCACGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACCTAA
ATTCTATATTACCGTTTTAACTATAAATGTCTAAATATTTTTATTGTCATTAAAATAAAG
TATTATGATATTTGTATCGGATCTTTGGTTT

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR2BP34TF 451 0 0
GGGTACAAATAGAAACACTTCATTTATTTCCTAAAATTTTAACCCACTATCAATCCATTT
CTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTCTACTCTTATTCACCTCATTAATTGCCTTCATC
ATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATGCGCAGAAAAAGGAAAAAAAACTATGTCCTTCT
CCAATCAAGTTAGGCCGTTTTTGTCTTCCAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAAGAAA
TTCCCAACTCCTCGTATTGGTTTTGGTAGTGGTTTTTGTGCAGATTTAGAGAAGGGAATT
TGTAACTGTGCTGTTCCTTGTGGTTCACGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACCTAA
ATTCTATATTACCGTTTTAACTATAAATGTCTAAATATTTTTATTGTCATTAAAATAAAG
TATTATGATATTTGTATCGGATCTTTGGTTT

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR2CS61JQ 483 0 0
GGGTACAAATAGAAACACTTCATTTATTTCCCAAAATTTTAACCCACTATCAATCCATTT
CTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTCTACTCTTATTCACCTTATTAATTGCCTTCATC
ATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATGCGCAGAAAAAGGAGGAAAAACTATGTCCTTCT
CCAATCAAGTTAGGCCGTTTTTGTCTTCCAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAAGAAA
TTCCCAACTCCTCGTATTGGTTTTGGTAGTGGTTTTTGTGCAGATTTAGAGAAGGGAATT
TGTAACTGTGCTGTTCCTTGTGGTTCACGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACCTAA
ATTCTATATTACCGTTTTAACTA*AAATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAG
TATTATGATATTTGTATCGGATCTTTGGTTTATTTATAATAAATAACAATATGAATGTTA
A
GT

QA 1 481 1 481
DS 

RD RR2CS61TF 483 0 0
GGGTACAAATAGAAACACTTCATTTATTTCCCAAAATTTTAACCCACTATCAATCCATTT
CTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTCTACTCTTATTCACCTTATTAATTGCCTTCATC
ATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATGCGCAGAAAAAGGAGGAAAAACTATGTCCTTCT
CCAATCAAGTTAGGCCGTTTTTGTCTTCCAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAAGAAA
TTCCCAACTCCTCGTATTGGTTTTGGTAGTGGTTTTTGTGCAGATTTAGAGAAGGGAATT
TGTAACTGTGCTGTTCCTTGTGGTTCACGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACCTAA
ATTCTATATTACCGTTTTAACTA*AAATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAG
TATTATGATATTTGTATCGGATCTTTGGTTTATTTATAATAAATAACAATATGAATGTTA
A
GT

QA 1 481 1 481
DS 

RD RR2F682JQ 520 0 0
GGGTACAAATAGAAACACTTCATTTATTTCCTAAATTTTTAACCCACTATCAATCCATTT
CTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTCTACTCTTATTCACCTTATTAATTGCCTTCATC
ATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATGCGCAGAAAAAGGAAGAAAAACTATGTCCTTCT
CCAATCAAGTTAGGCCGTTTTTGTCTTCCAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAAGAAA
TTCCCAACTCCTCGTATTAGTTTGGGTAGTGGTTTTTGTGCAGATTTAGAGAAGGGAATT
TGTAACTGTGCTGTTCCTTGTGGTTCACGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACCTAA
ATTCTATATTACCGTTTTAACTATAAATGTCTAAATATTTTTAGTGTCATTAAAATAAAG
TATTATGATATTTGTATCGGATCTTTGGTTTATTTATAATAAATAACAATATGAATGTTA
AATAATTGCAATCTTTATTAATAAAATTGGACTTTTTATA

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2EU64TF 346 0 0
GGAAGAAAAACTATGTCCTTCTCCAATCAAGTTAGGCCGTTTTTGTCTTCCAGCACTATG
TCGAAGTGAGTGTAAGAAGAAATTCCCAACTCCTCGTATTGGTTTGGGTAGTGGTTTTTG
TGCAGATTTAGAGAAGGGAATTTGTAACTGTGCTGTTCCTTGTGGTTCACGCTAAATGTT
GTGAATATAATACACAACCTAAATTCTATATTACCGTTTTAACTATAAATGTCTAAATAT
TTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTATGATATTTGTATCGGATCTTTGGTTTATTTATA
ATAAATAACAATATGAATGTTAAATAATTGCAATCTTTATTAATAA

QA 1 346 1 346
DS 

RD RR2F682TF 474 0 0
CTATCAATCCATTTCTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTCTACTCTTATTCACCTTAT
TAATTGCCTTCATCATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATGCGCAGAAAAAGGAAGAAA
AACTATGTCCTTCTCCAATCAAGTTAGGCCGTTTTTGTCTTCCAGCACTATGTCGAAGTG
AGTGTAAGAAGAAATTCCCAACTCCTCGTATTAGTTTGGGTAGTGGTTTTTGTGCAGATT
TAGAGAAGGGAATTTGTAACTGTGCTGTTCCTTGTGGTTCACGCTAAATGTTGTGAATAT
AATACACAACCTAAATTCTATATTACCGTTTTAACTATAAATGTCTAAATATTTTTAGTG
TCATTAAAATAAAGTATTATGATATTTGTATCGGATCTTTGGTTTATTTATAATAAATAA
CAATATGAATGTTAAATAATTGCAATCTTTATTAATAAAATTGGACTTTTTATA

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 3

CO CL1052Contig1 1086 3 6 U
ACAGATGTTAAAACTGTTCGTAATAATATCGTAGATGCTCTTAATCAAATGGGCTTCTGG
GGGAATATGTTCTTCTATGTGAATTCTAAGCAACTCAAGTCCAACGAAATAGAGTTGTTC
AAAGCCGAAAATATTCTCTACATACCCGAGGGCACAGATGTTTACCGCGATAAACTGGCT
GATGTGCATGATGTGGATACGAGTTTTTATTTGATTGTCTCAACAGGATCTACTCCAGCA
CAACATAGAAATATTGCACTATTCGTCAAACCAAATAGTGATCCAGATAGTGAGTTACAA
AGGGTTCTCAACTGTTTGAAATCGAGGGGTCACAATGTTCTCCTAGTAGAGCTGCCACCT
GATGAAGAGTGTCTCCTTAGTGTTGACTCTCTAGTTAAATATTCCCGACTTTTGGGTGGA
GGAAAGCCTAGACACAAAAAAGAGTTAACTGATGATGATCTGCGGCCTGTGTATGGCTGG
GAATTAAGAGACGAGGATGATGAGTTCGATGATAGCAATTTCTCCAACAAGAAGATGTTA
GATTTCTCCGAGCGTATCAGACACCTCAAAGGGATCAACAGGACAGTTATCTTCTGGGAC
ACTGTGGATTGCCCATTCCCTCCTTCGCTCTCTCCTGATCAAATCTTCGACAAGATCAAA
ACAGCTCTTTGGGAAAGAGGTTATGGTGATTATATTACAATCTCGGCGTATGATCACAGG
AAATGGTCTCCGGATATGTGTCTGGGTGACCCTTACTACATGGAGTGGTTTCGATTAATG
CAGTGGAGAAAATACTATCTTGTCTTGCTAGTTCCGGGTGAGATCAGCAACATATCAGAA
AGCCCTGATGAATGGCCAGGTTATCTGCTTGATAGTCCTCCCGAAACATCAGAAGAACCT
CTTCCCAAAAAGCCTAAACTGGATGCTACCTAAGTAGAGACCTGCCCAGGGCTGATGATA
CTGGTTATTTTGATGTTGGATCTTGCTTGCTTATGTTAACGATCTTGTTTGCTTCACAAG
ACCTTTTGTTTAGCCAGATATTTATGTCAAAAACTCTTTGTTTTGTTTGGGTTTACGCTT
TTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK02TF U 119
AF RR2B745TF U 1
AF RR2FK02JQ C 382
BS 1 336 RR2B745TF
BS 337 337 RR2FK02TF
BS 338 703 RR2B745TF
BS 704 704 RR2FK02JQ
BS 705 716 RR2B745TF
BS 717 1086 RR2FK02JQ

RD RR2FK02TF 292 0 0
G
CAAAGCCGAAAATATTCTCTACATACCCGAGGGCACAGATGTTTACCGCGATAAACTGGC
TGATGTGCATGATGTGGATACGAGTTTTTATTTGATTGTCTCAACAGGATCTACTCCAGC
ACAACATAGAAATATTGCACTATTCGTCAAACCAAATAGTGATCCAGATAGTGAGTTACA
AAGGGT*CTCAACTGTTTGAAATCGGGGGGTCACAATGTTCTCCTAGTAGAGCTGCCACC
TGATGAAGAGTGTCTCCTTA*TGT*GACTCTCTA*TTAAATATTCCCGACT

QA 2 292 2 292
DS 

RD RR2B745TF 716 0 0
ACAGATGTTAAAACTGTTCGTAATAATATCGTAGATGCTCTTAATCAAATGGGCTTCTGG
GGGAATATGTTCTTCTATGTGAATTCTAAGCAACTCAAGTCCAACGAAATAGAGTTGTTC
AAAGCCGAAAATATTCTCTACATACCCGAGGGCACAGATGTTTACCGCGATAAACTGGCT
GATGTGCATGATGTGGATACGAGTTTTTATTTGATTGTCTCAACAGGATCTACTCCAGCA
CAACATAGAAATATTGCACTATTCGTCAAACCAAATAGTGATCCAGATAGTGAGTTACAA
AGGGTTCTCAACTGTTTGAAATCGAGGGGTCACAAT*TTCTCCTAGTAGAGCTGCCACCT
GATGAAGAGTGTCTCCTTAGTGTTGACTCTCTAGTTAAATATTCCCGACTTTTGGGTGGA
GGAAAGCCTAGACACAAAAAAGAGTTAACTGATGATGATCTGCGGCCTGTGTATGGCTGG
GAATTAAGAGACGAGGATGATGAGTTCGATGATAGCAATTTCTCCAACAAGAAGATGTTA
GATTTCTCCGAGCGTATCAGACACCTCAAAGGGATCAACAGGACAGTTATCTTCTGGGAC
ACTGTGGATTGCCCATTCCCTCCTTCGCTCTCTCCTGATCAAATCTTCGACAAGATCAAA
ACAGCTCTTTGGGAAAGAGGTTATGGTGATTATATTACAATCTGGGCGTATGATCA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2FK02JQ 705 0 0
GTTGACTCTCTAGTTAAATATTCCCGACTTTTGGGTGGAGGAAAGCCTAGACACAAAAAA
GAGTTAACTGATGATGATCTGCGGCCTGTGTATGGCTGGGAATTAAGAGACGAGGATGAT
GAGTTCGATGATAGCAATTTCTCCAACAAGAAGATGTTAGATTTCTCCGATCGTATCAGA
CACCTCAAAGGGATCAACAGGACAGTTATCTTCTGGGACACTGTGGATTGCCCATTCCCT
CCTTCGCTCTCTCCTGATCAAATCTTCGACAAGATCAAAACAGCTCTTTGGGAAAGAGGT
TATGGTGATTATATTACAATCTCTGCGTATGATCACAGGAAATGGTCTCCGGATATGTGT
CTGGGTGACCCTTACTACATGGAGTGGTTTCGATTAATGCAGTGGAGAAAATACTATCTT
GTCTTGCTAGTTCCGGGTGAGATCAGCAACATATCAGAAAGCCCTGATGAATGGCCAGGT
TATCTGCTTGATAGTCCTCCCGAAACATCAGAAGAACCTCTTCCCAAAAAGCCTAAACTG
GATGCTACCTAAGTAGAGACCTGCCCAGGGCTGATGATACTGGTTATTTTGATGTTGGAT
CTTGCTTGCTTATGTTAACGATCTTGTTTGCTTCACAAGACCTTTTGTTTAGCCAGATAT
TTATGTCAAAAACTCTTTGTTTTGTTTGGGTTTACGCTTTTGTTT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 2 7

CO CL1053Contig1 549 3 2 U
GGGAAACCGATAGATAACGATTCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGTTAAATCAAACGT
AAATTTCAAGCAATGGCATCGATGACAATGACAGCAACGTTCCTCCCAGCCGTCGCTAAG
CTTCCGTCACCCACCGCAGGAAGAAGGATGTCCATTGTCAGAGCCTCGACGAGCGAGAAC
ACACCCAGCTTAGAAGTCAAGGCCAAGGAGGAACAAAGCAGCACCACAATGAGGAGGGAT
CTCATGTTCACGGCTGCAGCTTCTGCCGTTTGTGCCTTGGCTAAGGTAGCCATGGCGGAC
GAGGAGGAGCCCAAGCGAGGGACAGAGGCGGCTAAGAAGAAATACGCTCAAGTCTGTGTC
ACAATGCCTACGGCCAAGGTCTGCCGCTACTGATTCAGCCATCCACCTTTAATGTCCTTA
TCTCTATCTATTTCTATGGTTCAGTATCTCAAATTTGGTATGTAATCATATATTTGGATC
AAAATCTTATAATCTTCAACTAGACTTCCTTTCCATTATAATGAAAACTTAAAAGAAGCA
TTGCATAGC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E808TF U 2
AF RR2BW53JQ C 1
AF RR2BW53TF U 1
BS 1 1 RR2BW53JQ
BS 2 549 RR2BW53TF

RD RR2E808TF 503 0 0
GGAAACCGATAGATAACGATTCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGTTAAATCAAACGTA
AATTTCAAGCAATGGCATCGATGACAATGACAGCAACGTTCCTCCCAGCCGTCGCTAAGC
TTCCGTCACCCACCGCAGGAAGAAGGATGTCCATTGTCAGAGCCTCGACGAGCGAGAACA
CACCCAGCTTAGAAGTCAAGTCCAAGGAGGAACAAAGCAGCACCACAATGAGGAGGGATC
TCATGTTCACGGCTGCAGCTTCTGCCGTTTGTGCCTTGGCTAAGGTAGCCATGGCGGACG
AGGAGGAGCCCAAGCGAGGGACAGAGGCGGCTAAGAAGAAATACGCTCAAGTCTGTGTCA
CAATGCCTACGGCCAAGGTCTGCCGCTACTGATTCAGCCATCCACCTTTAATGTCCTTAT
CTCTATCTATTTCTATGGTTCAGTATCTCAAATTTGGTATGTAATCATATATTTGGATCA
AAATCTTATAATCTTCAACTAGA

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2BW53JQ 549 0 0
GGGAAACCGATAGATAACGATTCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGTTAAATCAAACGT
AAATTTCAAGCAATGGCATCGATGACAATGACAGCAACGTTCCTCCCAGCCGTCGTTAAG
CTTCCGTCACCCACCGCAGGAAGAAGGATGTCCATTGTCAGAGCCTCGACGAGCGAGAAC
ACACCCAGCTTAGAAGTCAAGGCCAAGGAGGAACAAAGCAGCACCACAATGAGGAGGGAT
CTCATGTTCACGGCTGCAGCTTCTGCCGTTTGTGCCTTGGCTAAGGTAGCCATGGCGGAC
GAGGAGGAGCCCAAGCGAGGGACAGAGGCGGCTAAGAAGAAATACGCTCAAGTCTGTGTC
ACAATGCCTACGGCCAAGGTCTGCCGCTACTGATTCAGCCATCCACCTTTAATGTCCTTA
TCTCTATCTATTTCTATGGTTCAGTATCTCAAATTTGGTATGTAATCATATATTTGGATC
AAAATCTTATAATCTTCAACTAGACTTCCTTTCCATTATAATGAAAACTTAAAAGAAGCA
TTGCATAGC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2BW53TF 549 0 0
G
GGAAACCGATAGATAACGATTCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGTTAAATCAAACGTA
AATTTCAAGCAATGGCATCGATGACAATGACAGCAACGTTCCTCCCAGCCGTCGCTAAGC
TTCCGTCACCCACCGCAGGAAGAAGGATGTCCATTGTCAGAGCCTCGACGAGCGAGAACA
CACCCAGCTTAGAAGTCAAGGCCAAGGAGGAACAAAGCAGCACCACAATGAGGAGGGATC
TCATGTTCACGGCTGCAGCTTCTGCCGTTTGTGCCTTGGCTAAGGTAGCCATGGCGGACG
AGGAGGAGCCCAAGCGAGGGACAGAGGCGGCTAAGAAGAAATACGCTCAAGTCTGTGTCA
CAATGCCTACGGCCAAGGTCTGCCGCTACTGATTCAGCCATCCACCTTTAATGTCCTTAT
CTCTATCTATTTCTATGGTTCAGTATCTCAAATTTGGTATGTAATCATATATTTGGATCA
AAATCTTATAATCTTCAACTAGACTTCCTTTCCATTATAATGAAAACTTAAAAGAAGCAT
TGCATAGC

QA 2 549 2 549
DS 



CO CL1053Contig2 553 4 8 U
GGACATTCAACCATCTCACAAGCTCTAACGATACAGAGAGAGAGAGAGGGTCAAATCAAA
CGTAGATTTCAAGCAATGGCATCGATGACAATGACAGCAACGTTCCTCCCAGCCGTCGCT
AAGCTTCCGTCACCCACCGCAGGAAGAAGGATGTCCATGGTCAGAGCCTCAACGAGCGAG
AACACAACCACCTTAGAAGTCAAGCCCAAGGAAGAACAGAGAAGCACCACAATGAGGAGG
GATATAATGTTCACGGCTGCAGCTTCTGCCGTTTGTGCCTTGGCTAAGGTAGCCATGGCG
GATGAGGAGGAGCCCAAGCGAGGGACAGAAGCGGCTAAGAAGAAATACGCTCAAGTTTGT
GTGACAATGCCTACGGCCAAGGTCTGCCGCTACTGATTCAGCCATCCACCTTTAATGTCC
TTATCTCTATCTATTTCTATGGTTCAGTATCTCAAATTTGGTATGTAATCATATATTTGG
ATCAAAATCTTATAATCTTCAACTAGACTTCCTTTCCATTATAATGAAAACTTAAAAGAA
GCATTGCATAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2EO52JQ C 20
AF RR2EO52TF U 20
AF RR2DO90JQ C 1
AF RR2DO90TF U 1
BS 1 32 RR2DO90TF
BS 33 33 RR2EO52TF
BS 34 34 RR2DO90TF
BS 35 320 RR2EO52TF
BS 321 321 RR2DO90TF
BS 322 504 RR2EO52TF
BS 505 552 RR2DO90TF
BS 553 553 RR2DO90JQ

RD RR2EO52JQ 486 0 0
GGGCTAACGATTC
AGAGAGAGAGAGAGAGGGTCAAATCAAACGTAGATTTCAAGCAATGGCATCGATGACAAT
GACAGCAACGTTCCTCCCAGCCGTCGCTAAGCTTCCGTCACCCACCGCAGGAAGAAGGAT
GTCCATGGTCAGAGCCTCAACGAGCGAGAACACAACCACCTTAGAAGTCAAGCCCAAGGA
AGAACAGAGAAGCACCACAATGAGGAGGGATATAATGTTCACGGCTGCAGCTTCTGCCGT
TTGTGCCTTGGCTAAGGTAGCCATGGCGGATGAGGAGGAGCCCAAGCGTGGGACAGAAGC
GGCTAAGAAGAAATACGCTCAAGTTTGTGTGACAATGCCTACGGCCAAGGTCTGCCGCTA
CTGATTCAGCCATCCACCTTTAATGTCCTTATCTCTATCTATTTCTATGGTTCAGTATCT
CAAATTTGGTATGTAATCATATATTTGGATCAAAATCTTATAATCTTCAACT
G

QA 14 485 14 485
DS 

RD RR2EO52TF 486 0 0
GGGCTAACGATTC
AGAGAGAGAGAGAGAGGGTCAAATCAAACGTAGATTTCAAGCAATGGCATCGATGACAAT
GACAGCAACGTTCCTCCCAGCCGTCGCTAAGCTTCCGTCACCCACCGCAGGAAGAAGGAT
GTCCATGGTCAGAGCCTCAACGAGCGAGAACACAACCACCTTAGAAGTCAAGCCCAAGGA
AGAACAGAGAAGCACCACAATGAGGAGGGATATAATGTTCACGGCTGCAGCTTCTGCCGT
TTGTGCCTTGGCTAAGGTAGCCATGGCGGATGAGGAGGAGCCCAAGCGTGGGACAGAAGC
GGCTAAGAAGAAATACGCTCAAGTTTGTGTGACAATGCCTACGGCCAAGGTCTGCCGCTA
CTGATTCAGCCATCCACCTTTAATGTCCTTATCTCTATCTATTTCTATGGTTCAGTATCT
CAAATTTGGTATGTAATCATATATTTGGATCAAAATCTTATAATCTTCAACT
G

QA 14 485 14 485
DS 

RD RR2DO90JQ 553 0 0
GGACATTCAACCATCTCACAAGCTCTAACGATTCAGAGAGAGAGAGAGGGTCAAATCAAA
CGTAGATTTCAAGCAATGGCATCGATGACAATGACAGCAACGTTCCTCCCAGCCGTCGCT
AAGCTTCCGTCACCCACCGCAGGAAGAAGGATGTCCATGGTCAGAGCCTCAACGAGCGAG
AACACAACCACCTTAGAAGTCAAGCCCAAGGAAGAACAGAGAAGCACCACAATGAGGAGG
GATATAATGTTCACGGCTGCAGCTTCTGCCGTTTGTGCCTTGGCTAAGGTAGCCATGGCG
GATGAGGAGGAGCCCAAGCGAGGGACAGAAGCGGCTAAGAAGAAATACGCTCAAGTTTGT
GTGACAATGCCTACGGCCAAGGTCTGCCGCTACTGATTCAGCCATCCACCTTTAATGTCC
TTATCTCTATCTATTTCTATGGTTCAGTATCTCAAATTTGGTATGTAATCATATATTTGG
ATCAAAATCTTATAATCTTCAACTAGACTTCCTTTCCATTATAATGAAAACTTAAAAGAA
GCATTGCATAGCC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2DO90TF 553 0 0
GGACATTCAACCATCTCACAAGCTCTAACGATTCAGAGAGAGAGAGAGGGTCAAATCAAA
CGTAGATTTCAAGCAATGGCATCGATGACAATGACAGCAACGTTCCTCCCAGCCGTCGCT
AAGCTTCCGTCACCCACCGCAGGAAGAAGGATGTCCATGGTCAGAGCCTCAACGAGCGAG
AACACAACCACCTTAGAAGTCAAGCCCAAGGAAGAACAGAGAAGCACCACAATGAGGAGG
GATATAATGTTCACGGCTGCAGCTTCTGCCGTTTGTGCCTTGGCTAAGGTAGCCATGGCG
GATGAGGAGGAGCCCAAGCGAGGGACAGAAGCGGCTAAGAAGAAATACGCTCAAGTTTGT
GTGACAATGCCTACGGCCAAGGTCTGCCGCTACTGATTCAGCCATCCACCTTTAATGTCC
TTATCTCTATCTATTTCTATGGTTCAGTATCTCAAATTTGGTATGTAATCATATATTTGG
ATCAAAATCTTATAATCTTCAACTAGACTTCCTTTCCATTATAATGAAAACTTAAAAGAA
GCATTGCATAGC
C

QA 1 552 1 552
DS 



AS 2 7

CO CL1054Contig1 855 5 4 U
GGGAGGCACTTTCTTCGCCGGTAACAAAAAAAGGATAATCAAATAAACTAATCATCATCA
TCATCATCATCAACCCTTCCGTCTTCAAATGTCTTCTCGCCGGAGAGTTCTTCTTAAGGT
TATCATCCTCGGCGATAGCGGGGTTGGGAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAACCG
CAAGTTTAGTAATCAGTACAAAGCCACGATTGGAGCTGATTTCTTGACTAAAGAGGTTCA
AATCGATGACCGCATCTTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCTGGACAAGAAAGGTTCCA
AAGCTTGGGAGTTGCGTTCTACAGAGGAGCTGACTGTTGTGTTCTTGTGTACGATGTCAA
TGTTATGAAATCTTTTGAGAATCTTAATAACTGGAGGGAAGAGTTCTTGATTCAAGCTGG
TCCATCAGATCCTGACAACTTCCCCTTTGTCGTCTTGGGGAACAAGACCGACGTTGATGG
TGGCAAAAGCCGAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCCTGGTGTGCGTCAAAAGGAAA
CATTCCTTACTTTGAGACATCTGCCAAAGAAGGATTCAATGTAGACGCAGCTTTCGAGTG
CATCACCAAAAATGCTTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACCTACCCGACACGAT
TGATGTTGCTGGAGGTCAGCAACACAGATCAACAGGGTGTGAATGCTAAACCAAGCAAAA
AGGTTTCTTTCAGTTCATTTGAATTATTACAGATTCTAACGAACTATTAGCTCATTTTCT
TTTGGGTTCCATACAATATTTTCAATCATGTAGTGCCACAAAATATCATTTATGGATGCA
TTCGAGGTTCTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 5 5 5 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN64TF U 5
AF RR2ES93TF U 39
AF RR2CS52TF U 1
AF RR2CS52JQ C 455
AF RR2ES93JQ C 145
BS 1 526 RR2CS52TF
BS 527 527 RR2EN64TF
BS 528 674 RR2CS52TF
BS 675 855 RR2ES93JQ

RD RR2EN64TF 608 0 0
GGG
ACTTTCTTCGCCGGTAACAAAAAAAGGATAATCAAATAAACTAATCATCATCATCA****
*****ACCCTTCCGTCTTCAAATGTCTTCTCGCCGGAGAGTTCTTCTTAAGGTTATCATC
CTCGGCGATAGCGGGGTTGGGAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAATCGCAAGTTT
AGTAATCAGTACAAAGCCACGATTGGAGCTGATTTCTTGACTAAAGAGGTTCAAATTGAT
GACCGCATCTTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCGGGACAAGAAAGGTTCCAAAGCTTG
GGAGTAGCTTTCTACAGAGGAGCTGACTGTTGTGTTCTTGTGTACGATGTCAATGTTATG
AAATCCTTTGAGAATCTTAATAACTGGAGGGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTGGTCCATCA
GATCCTGACAACTTCCCGTTTGTCGTCTTGGGGAACAAGACCGATGTTGATGGTGGCAAA
AGCCGAGTCGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCCTGGTGTGCGTCAAAAGGAAACATTCCT
TACTTTGAGACATCTGCCAAAGAAGGATTCAATGTAGACGCAGCTTTCGAGTGCATCACC
AAAAA

QA 4 608 4 608
DS 

RD RR2ES93TF 574 0 0
GG
AAATAAACTAATCATCATCATCATCATCATCAACCCTTCCGTCTTCAAATGTCTTCTCGC
CGGAGAGTTCTTCTTAAGGTTATCATCCTCGGCGATAGCGGGGTTGGGAAGACATCGTTG
ATGAATCAGTTTGTGAACCGCAAGTTTAGTAATCAGTACAAAGCCACGATTGGAGCTGAT
TTCTTGACTAAAGAGGTTCAAATCGATGACCGCATCTTCACTTTACAGATTTGGGATACT
GCTGGACAAGAAAGGTTCCAAAGCTTGGGAGTTGCGTTCTACAGAGGAGCTGACTGTTGT
GTTCTTGTGTACGATGTCAATGTTATGAAATCTTTTGAGAATCTTAATAACTGGAGGGAA
GAGTTCTTGATTCAAGCTGGTCCATCAGATCCTGACAACTTCCCCTTTGTCGTCTTGGGG
AACAAGACCGACGTTGATGGTGGCAAAAGCCGAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCC
TGGTGTGCGTCAAAAGGAAACATTCCTTACTTTGAGACATCTGCCAAAGAAGGATTCAAT
GTAGACGCAGCTTTCGAGTGCATCACCAAAAA

QA 3 574 3 574
DS 

RD RR2CS52TF 687 0 0
GGGAGGCACTTTCTTCGCCGGTAACAAAAAAAGGATAATCAAATAAACTAATCATCATCA
TCATCATCATCAACCCTTCCGTCTTCAAATGTCTTCTCGCCGGAGAGTTCTTCTTAAGGT
TATCATCCTCGGCGATAGCGGGGTTGGGAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAACCG
CAAGTTTAGTAATCAGTACAAAGCCACGATTGGAGCTGATTTCTTGACTAAAGAGGTTCA
AATCGATGACCGCATCTTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCTGGACAAGAAAGGTTCCA
AAGCTTGGGAGTTGCGTTCTACAGAGGAGCTGACTGTTGTGTTCTTGTGTACGATGTCAA
TGTTATGAAATCTTTTGAGAATCTTAATAACTGGAGGGAAGAGTTCTTGATTCAAGCTGG
TCCATCAGATCCTGACAACTTCCCCTTTGTCGTCTTGGGGAACAAGACCGACGTTGATGG
TGGCAAAAGCCGAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCCTGGTGTTCGTCAAAAGGAAA
CATTCCTTACTTTGAGACATCTGCCAAAGAAGGATTCAATGTAGACGCAGCTTTCGAGTG
CATCACCAAAAATGCTTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACCTACCCGACACGAT
TGATGTTGCTGGAG
TCAGCACACAGAT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2CS52JQ 387 0 0
TTGGGGAACAAGACCGACGTTGATGGTGGCAAAAGCCGAGTGGTTTTTGAGAAGAAAGCA
AAGGCCTGGTGTTTGTCAAAAGGAAACATTCCTTACTTTGAGACATTTGCCAAAGAAGGA
TTCAATGTAGACGCAGCTTTCGAGTGCATCCCCAAAAATGCTTTCAAGAATGAACCTGAA
GAAGAACCGTACCTACCCGACACGATTGATGTTGCTGGAGGTCAGCAACACAGATCAACA
GGGTGTGAATGTTAAACCAAGCAAAAAGGTTTTTTTCAGTTCATTTGAATTATTACAGAT
TTTAACGAACTATTAGCTCATTTTTTTTTGGGTTCCATACAATATTTTCAATCATGTAGT
GCCACAAAATATCATTTATGGAT
GCAT

QA 1 383 1 383
DS 

RD RR2ES93JQ 711 0 0
GGTGG
AGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAACCGCAAGTTTAGTAATCAGTACAAAGCCACGA
TTGGAGCTGATTTCTTGACTAAAGAGGTTCAAATCGATGACCGCATCTTCACTTTACAGA
TTTGGGATACTGCTGGACAAGAAAGGTTCCAAAGCTTGGGAGTTGCGTTCTACAGAGGAG
CTGACTGTTGTGTTCTTGTGTACGATGTCAATGTTATGAAATCTTTTGAGAATCTTAATA
ACTGGAGGGAAGAGTTCTTGATTCAAGCTGGTCCATCAGATCCTGACAACTTCCCCTTTG
TCGTCTTGGGGAACAAGACCGACGTTGATGGTGGCAAAAGCCGAGTGGTTTCTGAGAAGA
AAGCAAAGGCCTGGTGTGCGTCAAAAGGAAACATTCCTTACTTTGAGACATCTGCCAAAG
AAGGATTCAATGTAGACGCAGCTTTCGAGTGCATCACCAAAAATGCTTTCAAGAATGAAC
CTGAAGAAGAACCGTACCTACCCGACACGATTGATGTTGCTGGAGGTCAGCAACACAGAT
CAACAGGGTGTGAATGCTAAACCAAGCAAAAAGGTTTCTTTCAGTTCATTTGAATTATTA
CAGATTCTAACGAACTATTAGCTCATTTTCTTTTGGGTTCCATACAATATTTTCAATCAT
GTAGTGCCACAAAATATCATTTATGGATGCATTCGAGGTTCTAAGG

QA 6 711 6 711
DS 



CO CL1054Contig2 785 2 4 U
GGAAGGTTATCATCCTCGGCGATAGCGGGGTTGGGAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTG
TGAATCGCAAGTTTAGTAATCAGTACAAAGCCACGATTGGAGCTGATTTCTTGACTAAAG
AGGTTCAAATTGATGACCGCATCTTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCGGGACAAGAAA
GGTTCCAAAGCTTGGGAGTAGCTTTCTACAGAGGAGCTGACTGTTGTGTTCTTGTGTACG
ATGTCAATGTTATGAAATCCTTTGAGAATCTTAATAACTGGAGGGAAGAGTTCTTGATTC
AGGCTGGTCCATCAGATCCTGACAACTTCCCGTTTGTCGTCTTGGGGAACAAGACCGATG
TTGATGGTGGCAAAAGCCGAGTCGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCCTGGTGTGCGTCAA
AAGGAAACATTCCTTACTTTGAGACATCTGCCAAAGAAGGATTCAATGTAGACGCAGCTT
TCGAGTGCATCACCAAAAATGCTTTCAAGAACGAACCTGAAGAAGAACCGTACCTACCCG
ACACGATTGATGTTGCTGGAGGTCAGCAACGCAGATCAACAGGGTGTGAATGCTAATCAA
GCAAACGGTTTCTTTCAGTTCATTTTGAATTATTACAGATTCTAACGAACTATTAGCTCG
TTTTCTTTTGGGTTCCATACAATGTTTTCGATCATGTAGTGCCACAAAATATCATTTATG
GATTCATTCGAGATTCTAAGCTTTGTTTTCCTTACTCTTTTGAAGTTCTACGATTGTGTG
ATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2H848TF U 1
AF RR2EN64JQ C 34
BS 1 378 RR2H848TF
BS 379 379 RR2EN64JQ
BS 380 740 RR2H848TF
BS 741 785 RR2EN64JQ

RD RR2H848TF 746 0 0
GGAAGGTTATCATCCTCGGCGATAGCGGGGTTGGGAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTG
TGAATCGCAAGTTTAGTAATCAGTACAAAGCCACGATTGGAGCTGATTTCTTGACTAAAG
AGGTTCAAATTGATGACCGCATCTTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCGGGACAAGAAA
GGTTCCAAAGCTTGGGAGTAGCTTTCTACAGAGGAGCTGACTGTTGTGTTCTTGTGTACG
ATGTCAATGTTATGAAATCCTTTGAGAATCTTAATAACTGGAGGGAAGAGTTCTTGATTC
AGGCTGGTCCATCAGATCCTGACAACTTCCCGTTTGTCGTCTTGGGGAACAAGACCGATG
TTGATGGTGGCAAAAGCCTAGTCGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCCTGGTGTGCGTCAA
AAGGAAACATTCCTTACTTTGAGACATCTGCCAAAGAAGGATTCAATGTAGACGCAGCTT
TCGAGTGCATCACCAAAAATGCTTTCAAGAACGAACCTGAAGAAGAACCGTACCTACCCG
ACACGATTGATGTTGCTGGAGGTCAGCAACGCAGATCAACAGGGTGTGAATGCTAATCAA
GCAAACGGTTTCTTTCAGTTCATTTTGAATTATTACAGATTCTAACGAACTATTAGCTCG
TTTTCTTTTGGGTTCCATACAATGTTTTCGATCATGTAGTGCCACAAAATATCATTTATG
GATTCATTCGAGATTCTAAG
CTTTGT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2EN64JQ 752 0 0
GGAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAATCGCAAGTTTAGTAATCAGTACAAAGCCA
CGATTGGAGCTGATTTCTTGACTAAAGAGGTTCAAATTGATGACCGCATCTTCACTTTAC
AGATTTGGGATACTGCGGGACAAGAAAGGTTCCAAAGCTTGGGAGTAGCTTTCTACAGAG
GAGCTGACTGTTGTGTTCTTGTGTACGATGTCAATGTTATGAAATCCTTTGAGAATCTTA
ATAACTGGAGGGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTGGTCCATCAGATCCTGACAACTTCCCGT
TTGTCGTCTTGGGGAACAAGACCGATGTTGATGGTGGCAAAAGCCGAGTCGTTTCTGAGA
AGAAAGCAAAGGCCTGGTGTGCGTCAAAAGGAAACATTCCTTACTTTGAGACATCTGCCA
AAGAAGGATTCAATGTAGACGCAGCTTTCGAGTGCATCACCAAAAATGCTTTCAAGAACG
AACCTGAAGAAGAACCGTACCTACCCGACACGATTGATGTTGCTGGAGGTCAGCAACGCA
GATCAACAGGGTGTGAATGCTAATCAAGCAAACGGTTTCTTTCAGTTCATTTTGAATTAT
TACAGATTCTAACGAACTATTAGCTCGTTTTCTTTTGGGTTCCATACAATGTTTTCGATC
ATGTAGTGCCACAAAATATCATTTATGGATTCATTCGAGATTCTAAGCTTTGTTTTCCTT
ACTCTTTTGAAGTTCTACGATTGTGTGATGTC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 2 7

CO CL1055Contig1 769 2 2 U
CCTTCTTACAGGCTTTAGATTTAAGGTGAACATGTTTTATTTTTGGTTATGTTACTGAAA
CCGATTTGGTGAATCGTAAAAAGGATTTAAAAAATATAAATAAAAGAAAGACTAATGTTC
CTCTCGGATCTAAAGTTTTTTCCTGGCTAGAGAAGAGAGAACAAAAGAAGGTGTTTTTGT
GGCTTTCTTGGAGATTGTAGCTTTTGGGCTATAAACCCTTTTGTAGCTTTGATCTATTAT
TCCTCCGGTGCTCTTACATGCCTTTCTTCTTGCTTTATTACTTGTATTTTTAAAACCTCT
CTTCATAAGATCTTCAAGACTTTTAACATTTGCTAGTGATGTGAATGATTGAGATTTTCC
TTCATAAAACTTTGACAATCCCCTCTTGATTGGGAGGTGTAACATGAGGTCAGAGAGATC
TTCAAGAGGTCCATTTGAAAAAGATGAGGAAGCATCATCATCCTCCTCTGTTAAATCAAA
TGAACACATGGAAGATAATGAACAAGATGACAAATCTTTTTCTTCCCCGGAGAATGTTTC
AGCTTCTAACATTGATCTTGAAACTCCTTCAACAAGGTCTTCTTCTTCTTCTGTCCTACT
TGAATCTTGATAGATCATTTTGCCCATGTGCTTTATATTCAGATTCATCTTCCAACAGAA
ATCAAGAAAAACGAATTCTTGAAACAGGATAAGAAACAGAACAAGAGAGTTCTTATGTCA
AGATGTGTGTTGTTGTTCTACAATTGGGAACACAGAAACATGAGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A135TF C 1
AF RR2A135JQ U 142
BS 1 141 RR2A135TF
BS 142 769 RR2A135JQ

RD RR2A135TF 769 0 0
CCTTCTTACAGGCTTTAGATTTAAGGTGAACATGTTTTATTTTTGGTTATGTTACTGAAA
CCGATTTGGTGAATCGTAAAAAGGATTTAAAAAATATAAATAAAAGAAAGACTAATGTTC
CTCTCGGATCTAAAGTTTTTTCCTGGCTAGAGAAGAGAGAACAAAAGAAGGTGTTTTTGT
GGCTTTCTTGGAGATTGTAGCTTTTGGGCTATAAACCCTTTTGTAGCTTTGATCTATTAT
TCCTCCGGTGCTCTTACATGCCTTTCTTCTTGCTTTATTACTTGTATTTTTAAAACCTCT
CTTCATAAGATCTTCAAGACTTTTAACATTTGCTAGTGATGTGAATGATTGAGATTTTCC
TTCATAAAACTTTGACAATCCCCTCTTGATTGGGAGGTGTAACATGAGGTCAGAGAGATC
TTCAAGAGGTCCATTTGAAAAAGATGAGGAAGCATCATCATCCTCCTCTGTTAAATCAGA
TGAACACATGGAAGATAATGAACAAGATGACAAATCTTTTTCTTCCCCGGAGAATGTTTC
AGCTTCTAACATTGATCTTGAAACTCCTTCAACAAGGTCTTCTTCTTCTTCTGTCCTACT
TGAATCTTGATAGATCATTTTGCCCATGTGCTTTATATTCAGATTCATCTTCCAACAGAA
ATCAAGAAAAACGAATTCTTGAAACAGGATAAGAAACAGAACAAGAGAGTTCTTATGTCA
AGATGTGTGTTGTTGTTCTACAATTGGGAACACAGAAACAT
GAGTTCCC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2A135JQ 628 0 0
CCTGGCTAGAGAAGAGAGAACAAAAGAAGGTGTTTTTGTGGCTTTCTTGGAGATTGTAGC
TTTTGGGCTATAAACCCTTTTGTAGCTTTGATCTATTATTCCTCCGGTGCTCTTACATGC
CTTTCTTCTTGCTTTATTACTTGTATTTTTAAAACCTCTCTTCATAAGATCTTCAAGACT
TTTAACATTTGCTAGTGATGTGAATGATTGAGATTTTCCTTCATAAAACTTTGACAATCC
CCTCTTGATTGGGAGGTGTAACATGAGGTCAGAGAGATCTTCAAGAGGTCCATTTGAAAA
AGATGAGGAAGCATCATCATCCTCCTCTGTTAAATCAAATGAACACATGGAAGATAATGA
ACAAGATGACAAATCTTTTTCTTCCCCGGAGAATGTTTCAGCTTCTAACATTGATCTTGA
AACTCCTTCAACAAGGTCTTCTTCTTCTTCTGTCCTACTTGAATCTTGATAGATCATTTT
GCCCATGTGCTTTATATTCAGATTCATCTTCCAACAGAAATCAAGAAAAACGAATTCTTG
AAACAGGATAAGAAACAGAACAAGAGAGTTCTTATGTCAAGATGTGTGTTGTTGTTCTAC
AATTGGGAACACAGAAACATGAGTTCCC

QA 1 628 1 628
DS 



CO CL1055Contig2 822 5 8 U
GGCCGAAAAAGGGATGTACAAATATTTAACTTTTCTACACGTTTAAGACACTGGAATATC
TTTCTTACAGGCTTAAGATTTAAGGTGAACATGTTTTATTTTTGGTTATGTTACTGAAAC
CGATTTGGTGAATCGTAAAAAGGATTTTAAATAAAAAATAAAAGAAAAACTAATGTTCCT
CTCGGATCTAAAGTTTTTTCCTGGCTAGAGAAGAGAGAACAAAAGAAGGTGTTTTTGTGG
CTTTCTTGGAGATTGTAGCTTTTGGGCTATAAACCCTTTTGTAACTTTGATCTATTATTC
CTCCGGTGCTCTTACATGCCTTTCTTCTTGCTTTATTACTTGTATTTTTAAAACCTCTCT
TCATAAGATCTTCAAGACTTTTAACATTTGCTAGTGATGTGAATGATTGAGATTTTCCTT
CATAAAACTTTGACAATCCCCTCTTGATTGGGAGGTGTAACATGAGGTCAGAGAGATCTC
CAAGAGGTCCATTTGAAAAAGATGAAGAAGCATCATCATCCTCCTCTGTTAAATCAGATG
AACACATGGAAGATAATGAACAAGATGACAAATCTTCTTCTTCCCCGGAGAATGTTTCAG
CTTCTAACATCGATCTTGAAACTCCTTCAACAAGGTCTTCTTCTTCTTCTGTCCTACTTG
AATCTTGATAGATCATTTTGCCCATGTGCTTTATATGCAGATTCATCTTTCAACAGAAAT
CAAAGAAAAACGAATTCTTGAAACAGGATAAGAAACAGAGCAAGAGAGTTCTTATGTCAA
GATGTGTGTTGTTGTTCTACAATTGGGAACACAGAAACATCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2ET76JQ U 1
AF RR2F277JQ U 2
AF RR2F277TF C 37
AF RR2ET76TF C 70
AF RR2C070JQ U 83
BS 1 334 RR2ET76JQ
BS 335 335 RR2F277JQ
BS 336 618 RR2ET76JQ
BS 619 619 RR2F277JQ
BS 620 697 RR2ET76JQ
BS 698 747 RR2F277JQ
BS 748 748 RR2C070JQ
BS 749 822 RR2F277JQ

RD RR2ET76JQ 697 0 0
GGCCGAAAAAGGGATGTACAAATATTTAACTTTTCTACACGTTTAAGACACTGGAATATC
TTTCTTACAGGCTTAAGATTTAAGGTGAACATGTTTTATTTTTGGTTATGTTACTGAAAC
CGATTTGGTGAATCGTAAAAAGGATTTTAAATAAAAAATAAAAGAAAAACTAATGTTCCT
CTCGGATCTAAAGTTTTTTCCTGGCTAGAGAAGAGAGAACAAAAGAAGGTGTTTTTGTGG
CTTTCTTGGAGATTGTAGCTTTTGGGCTATAAACCCTTTTGTAACTTTGATCTATTATTC
CTCCGGTGCTCTTACATGCCTTTCTTCTTGCTTTGTTACTTGTATTTTTAAAACCTCTCT
TCATAAGATCTTCAAGACTTTTAACATTTGCTAGTGATGTGAATGATTGAGATTTTCCTT
CATAAAACTTTGACAATCCCCTCTTGATTGGGAGGTGTAACATGAGGTCAGAGAGATCTC
CAAGAGGTCCATTTGAAAAAGATGAAGAAGCATCATCATCCTCCTCTGTTAAATCAGATG
AACACATGGAAGATAATGAACAAGATGACAAATCTTCTTCTTCCCCGGAGAATGTTTCAG
CTTCTAACATCGATCTTGGAACTCCTTCAACAAGGTCTTCTTCTTCTTCTGTCCTACTTG
AATCTTGATAGATCATTTTGCCCATGTGCTTTATATG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2F277JQ 821 0 0
GCCGAAAAAGGGATGTACAAATATTTAACTTTTCTACACGTTTAAGACACTGGAATATCT
TTCTTACAGGCTTAAGATTTAAGGTGAACATGTTTTATTTTTGGTTATGTTACTGAAACC
GATTTGGCGAATCGTAAAAAGGATTTTAAATAAAAAATAAAAGAAAAACTAATGTTCCTC
TCGGATCTAAAGTTTTTTCCTGGCTAGAGAAGAGAGAACAAAAGAAGGTGTTTTTGTGGC
TTTCTTGGAGATTGTAGCTTTTGGGCTATAAACCCTTTTGTAACTTTGATCTATTATTCC
TCCGGTGCTCTTACATGCCTTTCTTCTTGCTTTATTACTTGTATTTTTAAAACCTCTCTT
CATAAGATCTTCAAGACTTTTAACATTTGCTAGTGATGTGAATGATTGAGATTTTCCTTC
ATAAAACTTTGACAATCCCCTCTTGATTGGGAGGTGTAACATGAGGTCAGAGAGATCTCC
AAGAGGTCCATTTGAAAAAGATGAAGAAGCATCATCATCCTCCTCTGTTAAATCAGATGA
ACACATGGAAGATAATGAACAAGATGACAAATCTTCTTCTTCCCCGGAGAATGTTTCAGC
TTCTAACATCGATCTTGAAACTCCTTCAACAAGGTCTTCTTCTTCTTCTGTCCTACTTGA
ATCTTGATAGATCATTTTGCCCATGCGCCTTATATGCAGATTCATCTTTCAACAGAAATC
AAAGAAAAACGAATTCTTGAAACAGGGTAAGAAACAGAGCAAGAGAGTTCTTATGTCAAG
ATGTGTGTTGTTGTTCTACAATTGGGAACACAGAAACATCC

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR2F277TF 786 0 0
CA
ACGTTTAAGACACTGAAATATCTTTCTTACAGGCTTAAGATTTAAGGTGAACATGTTTTA
TTTTTGGTTATGTTACTGAAACCGATTTGGCGAATCGTAAAAAGGATTTTAAATAAAAAA
TAAAAGAAAAACTAATGTTCCTCTCGGATCTAAAGTTTTTTCCTGGCTAGAGAAGAGAGA
ACAAAAGAAGGTGTTTTTGTGGCTTTCTTGGAGATTGTAGCTTTTGGGCTATAAACCCTT
TTGTAACTTTGATCTATTATTCCTCCGGTGCTCTTACATGCCTTTCTTCTTGCTTTATTA
CTTGTATTTTTAAAACCTCTCTTCATAAGATCTTCAAGACTTTTAACATTTGCTAGTGAT
GTGAATGATTGAGATTTTCCTTCATAAAACTTTGACAATCCCCTCTTGATTGGGAGGTGT
AACATGAGGTCAGAGAGATCTCCAAGAGGTCCATTTGAAAAAGATGAAGAAGCATCATCA
TCCTCCTCTGTTAAATCAGATGAACACATGGAAGATAATGAACAAGATGACAAATCTTCT
TCTTCCCCGGAGAATGTTTCAGCTTCTAACATCGATCTTGAAACTCCTTCAACAAGGTCT
TCTTCTTCTTCTGTCCTACTTGAATCTTGATAGATCATTTTGCCCATGCGCCTTATATGC
AGATTCATCTTTCAACAGAAATCAAAGAAAAACGAATTCTTGAAACAGGGTAAGAAACAG
AGCAAGAGAGTTCTTATGTCAAGATGTGTGTTGTTGTTCTACAATTGGGAACACAGAAAC
ATCC

QA 3 786 3 786
DS 

RD RR2ET76TF 753 0 0
GGCTTAAGATTTAAGGTGAACATGTTTTATTTT*GGTTATGTTACTGAAACCGATTTGGT
GAATCGTAAAAAGGATTTTAAATAAAAA*TAAAAGAAAAACTAATGTTCCTCTCGGATCT
AAAGTTTTTTCCTGGCTAGAGAAGAGAGAACAAAAGAAGGTGTTTTTGTGGCTTTCTTGG
AGATTGTAGCTTTTGGGCTATAAACCCTTTTGTAACTTTGATCTATTATTCCTCCGGTGC
TCTTACATGCCTTTCTTCTTGCTTTGTTACTTGTATTTTTAAAACCTCTCTTCATAAGAT
CTTCAAGACTTTTAACATTTGCTAGTGATGTGAATGATTGAGATTTTCCTTCATAAAACT
TTGACAATCCCCTCTTGATTGGGAGGTGTAACATGAGGTCAGAGAGATCTCCAAGAGGTC
CATTTGAAAAAGATGAAGAAGCATCATCATCCTCCTCTGTTAAATCAGATGAACACATGG
AAGATAATGAACAAGATGACAAATCTTCTTCTTCCCCGGAGAATGTTTCAGCTTCTAACA
TCGATCTTGGAACTCCTTCAACAAGGTCTTCTTCTTCTTCTGTCCTACTTGAATCTTGAT
AGATCATTTTGCCCATGTGCTTTATATGCAGATTCATCTTTCAACAGAAATCAAAGAAAA
ACGAATTCTTGAAACAGGATAAGAAACAGAGCAAGAGAGTTCTTATGTCAAGATGTGTGT
TGTTGTTCTACAATTGGGAACACAGAAACATCC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2C070JQ 740 0 0
G
GGTGAACATGTTTTATTTTTGGTTATGTTACTGGAACCGATTTGGTGAATCGTAAAAAGG
ATTTTAAATAAAAAATAAAAGAAAAACTAATGTTCCTCTCGGATCTAAAGTTTTTTCCTG
GCTAGAGAAGAGAGAACAAAAGAAGGTGTTTTTGTGGCTTTCTTGGAGATTGTAGCTTTT
GGGCTATAAACCCTTTTGTAACTTTGATCTATTATTCCTCCGGTGCTCTTACATGCCTTT
CTTCTTGCTTTATTACTTGTATTTTTAAAACCTCTCTTCATAAGATCTTCAAGACTTTTA
ACATTTGCTAGTGATGTGAATGGTTGAGATTTTCCTTCATAAAACTTTGACAATCCCCTC
TTGATTGGGAGGTGTAACATGAGGTCAGAGAGATCTCCAAGAGGTCCATTTGAAAAAGAT
GAAGAAGCATCATCATCCTCCTCTGTTAAATCAGATGAACACATGGAAGATAATGAACAA
GGTGACAAATCTTCTTCTTCCCCGGAGAATGTTTCAGCTTCTAACATCGATCTTGAAACT
CCTTCAACAAGGTCTTCTTCTTCTTCTGTCCTACTTGAACCTTGATAGATCATTTTGCCC
ATGTGCTTTATATGCAGATTCATCTTTCAACAGAAATCAAAGAAAAACGAATTCTTGAAA
CAGGATAAGAAACAGAGCAAGAGAGTTCTTATGTCAAGATGTGTGTTGTTGTTCTACAAT
TGGGAACACAGAAACATCC

QA 2 740 2 740
DS 



AS 1 4

CO CL1056Contig1 1269 4 4 U
CAAAACGTGAATATTCGTTATCCTGCTGGAAATTACAGGGATGTTTATTATGAAAAAACA
TCTTGGAAAAAGTCAGGTGGTCTCAACAAGAAGCCAGCAAAAATAAATTGGTTTCGGTAA
CCCTTAGGTACTCCTTTATGGTGGATAGATATATCAAAAGCCAAGTTTAACGCAAAACAA
GGATGATGTGCTTTGCTTATTTAGCGGCTTCAAGTGCAGAAGCTCCAGAGATAATCTCGA
TAAGCTCTGTTGTGATAGAAGCTTGACGAGTCCTGTTGTAAGTGAGGGTGAGACGGTCAA
GCATTTCTCCTGCGTTTCTGCTTGAGCTGTCCATTGCTGACATCCTTGCTCCCATCTCAC
TACACGCATTCTCCAGCACCGCGTTGAACATCACACAAGAGAACTGGAACTCGGCCAGGT
TCTGCAGAATTTCTCCCTTTGTTTCACCACCTTCGATCTCGTATGAGTCGAGCTCACCGA
GTTTTCCTCCGACTTCAGATTCCTTTTCAATAATCTCAGGAGACAAAACAGTGGCCACAG
TTGGTAGAAATGCGACAACGGAATGGAACTTGTTGTAGACAATTCGCAAAGCATCAAATT
CAACGTTTTTCAGTATGTCATCAGCTAGCACCGAGACCTGAGCATAATTGAGTGGATTCT
TGTTCAGCTCTGTTACAGTGAGGGAGATGTCGTTCTTTGAGTCACGAAACATTATAGCTT
TTGCTTTCTCTCCAACAATGACAAACTTCACATCCTTTTCAGGACCAGCATTCAACTTGT
AGAGAGCCCTGCTGACTTTAACAACAGTGGAGTTAATTCCACCACAGAGACCCTTGTCAG
AAGAGAGGGTGACCACCACACTCTTCTTTACGTCAATACTGGGATTATCTCCAAGAAGAG
CAGTAAATGGCTGCCAAAGACCACGAGAGTTCTCGGCTCGTCCTTGAACAGCTCTAAGCT
TAGAAGCAGCAACCATCTTCATGGCCTTTGTGATCTTCTGGATGTTCTTTACACTCTTCA
TACGGTTACGCACCACTTGAGTAGAGATAGATCGAACTCCAAAAGGTCCCTCCTCCCGGT
CAGAAGAGAGAGGAGACGGGGTGGTGGCAGCGATTGGACGAGCGGCGATTGAAGGGAGGA
GACGCCTCCCTTCGCGACGGAAAACAGCCATTGCCATTTGATCGGAGATTGATTGATCGA
TGATAGACGAAACCCTAGCTTGCTCAGATCCGACTATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCG
ACTCGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E202JQ U 16
AF RR2F714JQ U 1
AF RR2E202TF C 641
AF RR2BI48TF C 536
BS 1 661 RR2F714JQ
BS 662 1197 RR2BI48TF
BS 1198 1198 RR2E202TF
BS 1199 1269 RR2BI48TF

RD RR2E202JQ 582 0 0
CGTTATC
CTGCTGGAAATTACAGGGATGTTTATTATGAAAAAACATCTTGGCAAAAGTCAGGTGGTC
TCAACAAGAAGCCAGCAAAAATAAATTGGTTTCGGTAACCCTTAGGTACTCCTTTATGGT
GGATAGATATATCAAAAGCCAAGTTTAACGCAAAACAAGGATGATGTGCTTTGCTTATTT
AGCGGCTTCAAGTGCAGAAGCTCCAGAGATAATCTCGATAAGCTCTGTTGTGATAGAAGC
TTGACGAGTCCTGTTGTAAGTGAGGGTGAGACGGTCAAGCATTTCTCCTGCGTTTCTGCT
TGAGCTGTCCATTGCTGACATCCTTGCTCCCATCTCACTACACGCATTCTCCAGCACCGC
GTTGAACATCACACAAGAGAACTGGAACTCGGCCAGGTTCTGCAGAATTTCTCCCTTTGT
TTCACCACCTTCGATCTCGTATGAGTCGAGCTCACCGAGTTTTCCTCCGACTTCAGATTC
CTTTTCAATAATCTCAGGAGACAAAACAGTGGCCACAGTTGGTAGAAATGCGACAACGGA
ATGGAACTTGTTGTAGACAATTCGCAAAGCATCAA

QA 8 582 8 582
DS 

RD RR2F714JQ 670 0 0
CAAAACGTGAATATTCGTTATCCTGCTGGAAATTACAGGGATGTTTATTATGAAAAAACA
TCTTGGAAAAAGTCAGGTGGTCTCAACAAGAAGCCAGCAAAAATAAATTGGTTTCGGTAA
CCCTTAGGTACTCCTTTATGGTGGATAGATATATCAAAAGCCAAGTTTAACGCAAAACAA
GGATGATGTGCTTTGCTTATTTAGCGGCTTCAAGTGCAGAAGCTCCAGAGATAATCTCGA
TAAGCTCTGTTGTGATAGAAGCTTGACGAGTCCTGTTGTAAGTGAGGGTGAGACGGTCAA
GCATTTCTCCTGCGTTTCTGCTTGAGCTGTCCATTGCTGACATCCTTGCTCCCATCTCAC
TACACGCATTCTCCAGCACCGCGTTGAACATCACACAAGAGAACTGGAACTCGGCCAGGT
TCTGCAGAATTTCTCCCTTTGTTTCACCACCTTCGATCTCGTATGAGTCGAGCTCACCGA
GTTTTCCTCCGACTTCAGATTCCTTTTCAATAATCTCAGGAGACAAAACAGTGGCCACAG
TTGGTAGAAATGCGACAACGGAATGGAACTTGTTGTAGACAATTCGCAAAGCATCAAATT
CAACGTTTTTCAGTATGTCATCAGCTAGCACCGAGACCTGAGCATAATTGAGTGGATTCT
T
CTTCTTCTT

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2E202TF 623 0 0
AGCATAATTGAGTGGATTCTTGTTCAGCTCTGTTACAGTGAGGGAGATGTCGTTCTTTGA
GTCACGAAACATTATAGCTTTTGCTTTCTCTCCAACAATGACAAACTTCACGTCCTTTTC
AGGACCAGCATTCAACTTGTAGAGAGCCCTGCTGACTTTAACAACAGTGGAGTTAATTCC
ACCACAGAGACCCTTGTCAGAAGAGAGGGTGACCACCACACTCTTCTTTACGTCAATACT
GGGATTATCTCCAAGAAGAGCAGTAAATGGCTGCCAAAGACCACGGGAGTTCTCGGCTCG
TCCTTGAACAGCTCTAAGCTTAGAAGCGGCAACCATCTTCATGGCCTTTGTGATCTTCTG
GATGTTCTTTACACTCTTCATACGGTTACGCACCACTTGAGTAGAGATAGATCGAACTCC
AAAAGGTCCCTCCTCCCGGTCAGAAGAGAGAGGAGACGGGGTGGTGGCAGCGATTGGACG
AGCGGCGATTGAAGGGAGGAGACGCCTCCCTTCGCGACGGAAAACAGCCATTGCCATTTG
ATCGGAGATTGATTGATCGATGATAGACGAAACCCTAGCTTGCTCAGATCCGACTATTCT
TCTTCTTCTTCTTCT
CGACTCCC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2BI48TF 734 0 0
CACAGTTGGTAGAAATGCGACAACGGAATGGAACTTGTTGTAGACAATTCGCAAAGCATC
AAATTCAACGTTTTTCAGTATGTCATCAGCTAGCACCGAGACCTGAGCATAATTGAGTGG
ATTCTTGTTCAGCTCTGTTACAGTGAGGGAGATGTCGTTCTTTGAGTCACGAAACATTAT
AGCTTTTGCTTTCTCTCCAACAATGACAAACTTCACATCCTTTTCAGGACCAGCATTCAA
CTTGTAGAGAGCCCTGCTGACTTTAACAACAGTGGAGTTAATTCCACCACAGAGACCCTT
GTCAGAAGAGAGGGTGACCACCACACTCTTCTTTACGTCAATACTGGGATTATCTCCAAG
AAGAGCAGTAAATGGCTGCCAAAGACCACGAGAGTTCTCGGCTCGTCCTTGAACAGCTCT
AAGCTTAGAAGCAGCAACCATCTTCATGGCCTTTGTGATCTTCTGGATGTTCTTTACACT
CTTCATACGGTTACGCACCACTTGAGTAGAGATAGATCGAACTCCAAAAGGTCCCTCCTC
CCGGTCAGAAGAGAGAGGAGACGGGGTGGTGGCAGCGATTGGACGAGCGGCGATTGAAGG
GAGGAGACGCCTCCCTTCGCGACGGAAAACAGCCATTGCCATTTGATCGGAGATTGATTG
ATTGATGATAGACGAAACCCTAGCTTGCTCAGATCCGACTATTCTTCTTCTTCTTCTTCT
TCTCGACTCGACCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 6

CO CL1057Contig1 1245 6 34 U
GGGCTCTCTCCCTCCCTTTGCAGAAACAAAACTTGTTCTCGCTAAGAGCTCCGACAATGG
CTGTCTGCGCAACTCACAGCTCCGGTCTCATGATAGCATACGCCGCATCCAAGGACCTCA
CAATCCCGTCTCTTTTCTCATTTGCCAACCCAAGACCAAACAACTTGAGCGTCGCACTCT
GTCCCCCTCTTGTTCTCCTTGGGGCTAGAAGAGGCTCGAACCGATCCTTCCCGGTAGTTG
TATCAGCCGTCGCAGCAGAGGCAGATGTCGACACGGAGGAGGACGCGGAGCAGAATGAAG
CCACCTCCACCGCCACAGCCGTCCTTGATCCGCCGAAGCCTAAGAAAGGAAAAGCCGCTT
TGCTTCTAAAGAGAGATAGAACAAGGTCTAAGAGGTTTCTGGAAATTCAAAAGCTAAGGG
AAACCAAAAAGGAGTACGACGTCAAGACTGCTGTATCTTTGCTCAAGCAAACCGCTAACA
CAAGGTTTGTGGAGTCGGTTGAAGCCCATTTCCGTCTCAACATCGATCCAAAGTACAACG
ATCAGCAGCTGCGAGCAACGGTGAGCCTTCCTAAAGGAACAGGACAAACTGTTAAAGTGG
CTGTTCTTGCACAAGGTGAGAAGGTGGGTGAAGCAAAAAATGCAGGGGCAGATATTGTGG
GCAGTGATGATTTGATCGAACAGATAAAAGGAGGGTTCATGGAGTTCGATAAGTTAATTG
CATCCCCGGATATGATGGTCAAGGTTGCTGGCCTTGGAAAGATTCTTGGTCCTCGAGGAC
TCATGCCAAATCCCAAGGCTGGTACCGTCACAGCTAACATTCCACAGGCTATAGAGGAGT
TCAAGAAGGGCAAAGTAGAATTCAGAGCAGACAAAACTGGGATTGTTCACATTCCCTTCG
GGAAAGTTAATTTCACAGAGGAAGACCTGCTCGTAAACTTCCTAGCAGCAGTGAAATCGG
TGGAGACAAACAAGCCAAAGGGAGCAAAAGGAGTGTACTGGAAAAGCGCACACATATGCT
CGTCAATGGGGCCATCCATCAAGTTGAACATAA*GGGAGATGATAGACTTCAAGCCATAA
ATAAATAAACCCACATTTGAGTGAATGAGGAGGAAGGTGTATGTTTTTGAGAGTGTAGGC
GAACACCAAAGATGTAGTATGTTAGTTATCTCTTGTATACCTCCTCACTGGTTGTATCAC
CTTTAACTCTGATAGCTATTTGATGTATTGATTATTACTGTTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C238TF U 1
AF RR2H428TF U 113
AF RR2D621TF U 286
AF RR2A284TF U 337
AF RR2H428JQB C 502
AF RR2A284JQ C 769
BS 1 122 RR2C238TF
BS 123 123 RR2H428TF
BS 124 151 RR2C238TF
BS 152 152 RR2H428TF
BS 153 194 RR2C238TF
BS 195 195 RR2H428TF
BS 196 204 RR2C238TF
BS 205 205 RR2H428TF
BS 206 241 RR2C238TF
BS 242 242 RR2H428TF
BS 243 243 RR2C238TF
BS 244 244 RR2H428TF
BS 245 457 RR2C238TF
BS 458 458 RR2H428TF
BS 459 627 RR2C238TF
BS 628 628 RR2H428TF
BS 629 639 RR2C238TF
BS 640 640 RR2H428TF
BS 641 647 RR2C238TF
BS 648 648 RR2H428TF
BS 649 694 RR2C238TF
BS 695 695 RR2H428TF
BS 696 713 RR2C238TF
BS 714 714 RR2H428TF
BS 715 743 RR2C238TF
BS 744 797 RR2H428TF
BS 798 798 RR2D621TF
BS 799 827 RR2H428TF
BS 828 973 RR2D621TF
BS 974 1053 RR2A284TF
BS 1054 1054 RR2H428JQB
BS 1055 1105 RR2A284TF
BS 1106 1239 RR2H428JQB
BS 1240 1245 RR2A284JQ

RD RR2C238TF 751 0 0
GGGCTCTCTCCCTCCCTTTGCAGAAACAAAACTTGTTCTCGCTAAGAGCTCCGACAATGG
CTGTCTGCGCAACTCACAGCTCCGGTCTCATGATAGCATACGCCGCATCCAAGGACCTCA
CAGTCCCGTCTCTTTTCTCATTTGCCAACCCTAGACCAAACAACTTGAGCGTCGCACTCT
GTCCCCCTCTTGTTGTCCTTGGGGGTAGAAGAGGCTCGAACCGATCCTTCCCGGTAGTTG
TCTTAGCCGTCGCAGCAGAGGCAGATGTCGACACGGAGGAGGACGCGGAGCAGAATGAAG
CCACCTCCACCGCCACAGCCGTCCTTGATCCGCCGAAGCCTAAGAAAGGAAAAGCCGCTT
TGCTTCTAAAGAGAGATAGAACAAGGTCTAAGAGGTTTCTGGAAATTCAAAAGCTAAGGG
AAACCAAAAAGGAGTACGACGTCAAGACTGCTGTATCCTTGCTCAAGCAAACCGCTAACA
CAAGGTTTGTGGAGTCGGTTGAAGCCCATTTCCGTCTCAACATCGATCCAAAGTACAACG
ATCAGCAGCTGCGAGCAACGGTGAGCCTTCCTAAAGGAACAGGACAAACTGTTAAAGTGG
CTGTTCTTGCACAAGGTGAGAAGGTGGATGAAGCAAAAA*TGCAGGG*CAGATATTGTGG
GCAGTGATGATTTGATCGAACAGATAAAAGGAGG*TTCATGGAGTTCGATAAGCTAATTG
CATCCCCGGATATGATGGTCAAG
TTGCTGGC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2H428TF 727 0 0
GGACCTTACAATCCCGTCTCTTTTCTCATTTGCCAACCCAAGACCCAACAACTTGAGCGT
CGCACTCTGTCCCCCTCTTGTTCTCCTTGGGGCTAGAAGAGGCTCGAACCGATCCTTCCC
GGTAGTTGTATCAGCCGTCGCAGCAGAGGCTGATGTCGACACGGAGGAGGACGCGGAGCA
GAATGAAGCCACCTCCACCGCCACAGCCGTCCTTGATCCGCCGAAGCCTAAGAAAGGAAA
AGCCGCTTTGCTTCTAAAGAGAGATAGAACAAGGTCTAAGAGGTTTCTGGAAATTCAAAA
ACTAAGGGAAACCAAAAAGGAGTACGACGTCAAGACTGCTGTATCTTTGCTCAAGCAA*C
CGCTAACACAAGGTTTGTGGAGTCGGTTGAAGCCCATTTCCGTCTCAACATCGATCCAAA
GTACAACGATCAGCAGCTGCGAGCAACGGTGAGCCTTCCTAAAGGAACAGGACAAACTGT
TAAAGTGGCTGT*CTTGCACAAGGTGAGAAGGTGGGTGAAGCAAAAAATGCAGGGGCAGA
TATTGTGGGCAGTGATGATTTGATCGAACAGATAAAAGGAGGGTTCATGGAGTTCGATAA
GTTAATTGCATCCCCGGATATGATGGTCAAAGTTGCTGGCCTTGGAAAGATTCTTGGTCC
TCGAGGACTCATGCCAAATCCCAAG*CTGGTACCGTCACAGCTAACATTCCACAG
CTATAGAGAGTT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2D621TF 688 0 0
G
GGAGCAGAATGAAGCCACCTCCACCGCCACAGCCGTCCTTGATCCGCCGAAGCCTAAGAA
AGGAAAAGCCGCTTTGCTTCTAAAGAGAGATAGAACAAGGTCTAAGAGGTTTCTGGAAAT
TCAAAAGCTAAGGGAAACCAAAAAGGAGTACGACGTCAAGACTGCTGTATCTTTGCTCAA
GCAAACCGCTAACACAAGGTTTGTGGAGTCGGTTGAAGCCCATTTCCGTCTCAACATCGA
TCCAAAGTACAACGATCAGCAGCTGCGAGCAACGGTGAGCCTTCCTAAGGGAACAGGACA
AACTGTTAAAGTGGCTGTTCTTGCACAAGGTGAGAAGGTGGTTGAAGCAAAAAATGCAGG
GGCAGATATTGTGGGCAGTGATGATTTGATCGAACAGATAAAAGGAGGGTTCATGGAGTT
CGATAAGTTAATTGCATCCCCGGATATGATGGTCAAGGTTGCTGGCCTTGGAAAGATTCT
TGGTCCTCGAGGACTCATGCCAAATCCCAAGGCTGGTACCGTCACAGCTAACATTCCACA
GGCTATAGAGGAGTTCAAGAAGGGCAAAGTAGAATTCAGAGCAGACAAAACTGGGATTGT
TCACATTCCCTTCGGGAAAGTTAATTTCACAGAGGAAGACCTGCTCGTAAACTTCCTAGC
AGCAGTGAAATCGGTGGAGACAAACAA

QA 2 688 2 688
DS 

RD RR2A284TF 769 0 0
G
GCCTAAGAAAGGAAAAGCCGCTTTGCTTCTAAAGAGAGATAGAACAAGGTCTAAGAGGTT
TCTGGAAATTCAAAAGCTAAGGGAAACCAAAAAGGAGTACGACGTCAAGACTGCTGTATC
TTTGCTCAAGCAAACCGCTAACACAAGGTTTGTGGAGTCGGTTGAAGCCCATTTCCGTCT
CAACATCGATCCAAAGTACAACGATCAGCAGCTGCGAGCAACGGTGAGCCTTCCTAAAGG
AACAGGACAAACTGTTAAAGTGGCTGTTCTTGCACAAGGTGAGAAGGTGGATGAAGCAAA
AAATGCAGGGGCAGATATTGTGGGCAGTGATGATTTGATCGAACAGATAAAAGGAGGGTT
CATGGAGTTCGATAAGTTAATTGCATCCCCGGATATGATGGTCAAGGTTGCTGGCCTTGG
AAAGATTCTTGGTCCTCGAGGACTCATGCCAAATCCCAAGGCTGGTACCGTCACAGCTAA
CATTCCACAGGCTATAGAGGAGTTCAAGAAGGGCAAAGTAGAATTCAGAGCAGACAAAAC
TGGGATTGTTCACATTCCCTTCGGGAAAGTTAATTTCACAGAGGAAGACCTGCTCGTAAA
CTTCCTAGCAGCAGTGAAATCGGTGGAGACAAACAAGCCAAAGGGAGCAAAAGGAGTGTA
CTGGAAAAGCGCACACATATGCTCGTCAATGGGGCCATCCATCAAGTTGAACATAAAGGG
AGATGATAGACTTCAAGCCATAAATAAATAAACCCACATTTGAGTGAA

QA 2 769 2 769
DS 

RD RR2H428JQB 738 0 0
AAGCCCATTTCCGTCTCAACATCGATCCAAAGTACAACGATCAGCAGCTGCGAGCAACGG
TGAGCCTTCCTAAAGGAACAGGACAAACTGTTAAAGTGGCTGT*CTTGCACAAGGTGAGA
AGGTGGGTGAAGCAAAAAATGCAGGGGCAGATATTGTGGGCAGTGATGATTTGATCGAAC
AGATAAAAGGAGGGTTCATGGAGTTCGATAAGTTAATTGCATCCCCGGATATGATGGTCA
AGGTTGCTGGCCTTGGAAAGATTCTTGGTCCTCGAGGACTCATGCCAAATCCCAAGGCTG
GTACCGTCACAGCTAACATTCCACAGGCTATAGAGGAGTTCAAGAAGGGCAAAGTAGAAT
TCAGAGCAGACAAAACTGGGATTGTTCACATTCCCTTCGGGAAAGTTAATTTCACAGAGG
AAGACCTGCTCGTAAACTTCCTAGCAGCAGTGAAATCGGTGGAGACAAACAAGCCAAAGG
GAGCAAAAGGAGTGTACTGGAAAAGCGCACACATATGCTCGTCAATGGGGCCATCCATCA
AGTTGAACATAA*GGGAGATGATAGACTTCAAGCCATAAATAAATAAACCCACATTTGAG
TGAATGAGGAGGAAGGTGTATGTTTTTGAGAGTGTAGGCGAACACCAAAGATGTAGTATG
TTAGTTATCTCTTGTATACCTCCTCACTGGTTGTATCACCTTTAACTCTGATAGCTATTT
GATGTATTGATTATTACT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2A284JQ 477 0 0
GTCCTCGAGGACTCATGCCAAATCCCAAGGCTGGTACCGTCACAGCTAACATTCCACAGG
CTATAGAGGAGTTCAAGAAGGGCAAAGTAGAATTCAGAGCAGACAAAACTGGGATTGTTC
ACATTCCCTTCGGGAAAGTTAATTTCACAGAGGAAGACCTGCTCGTAAACTTCCTAGCAG
CAGTGAAATCGGTGGAGACAAACAAGCCAAAGGGAGCAAAAGGAGTGTACTGGAAAAGCG
CACACATATGCTCGTCAATGGGGCCATCCATCAAGTTGAACATAA*GGGAGATGATAGAC
TTCAAGCCATAAATAAATAAACCCACATTTGAGTGAATGAGGAGGAAGGTGTATGTTTTT
GAGAGTGTAGGCGAACACCAAAGATGTAGTATGTTAGTTATCTCTTGTATACCTCCTCAC
TGGTTGTATCACCTTTAACTTTGATAGCTATTTGATGTATTGATTATTACTGTTAAG

QA 1 477 1 477
DS 



AS 1 6

CO CL1058Contig1 886 6 9 U
GGCCAAACTCAAAAGCATGGAACGACTTCGTCAGCTCATCATCTTCTTCTTCTTCGTCCT
CGTGACCGTTCTTGAACATGCTTCATCTGCTCGGATTCATACAATCATCTCTAAGCCCGA
CAGACATGATATTGCGGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATTTGGGGTGTCCT
CAGCACATTGTCCATTGAGCATGATGGAGCACTTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGA
TGGTCTGCTCGGGAAAGGCAAGGGTATACCATATTTTTACTTGACAATGCTTGATCCAAC
CACAAGAAACGCATTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGG
AACTTGCAAGAGAGATCCTATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTT
GTTGCAACTGAATGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAAAAGAGCTCTATTCACTAA
GCATCCAGAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACTGGATAT
CATCAATATATCCCTGACCAATTGGTATGGTGGAGCTAAATCCATCACCGTAGATGAATA
TCTTCGTTACAAGGAGACCAAAGTCGCTTCCTTCTTATGAAAATCACAGCTGGAAATGAG
CAAAAGGTGAAGAATAAGCACATCATGAAACTTGTATATTGGTAACACAATAAAAATGTA
TTCAGCTCTTCTGTAAATAACTGTTGTTAATAGCCTTTCGATTACATCTATGTGGACATG
ATGAATATAGAACTATTCATAAATTCCCACAATCCAAATTCAAATGTACAATATAAAAAT
ATATATATTGCTATGAATAAAATTGACAAGTGTGCATAGCTTCTTG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT82TF U 1
AF RR2GY72TF U 1
AF RR2F093TF U 2
AF RR2GY72JQ C 66
AF RR2GT82JQB C 218
AF RR2F093JQ C 78
BS 1 609 RR2GT82TF
BS 610 666 RR2GY72TF
BS 667 667 RR2F093TF
BS 668 689 RR2GY72TF
BS 690 756 RR2F093TF
BS 757 765 RR2GY72JQ
BS 766 767 RR2F093JQ
BS 768 768 RR2GT82JQB
BS 769 886 RR2F093JQ

RD RR2GT82TF 609 0 0
GGCCAAACTCAAAAGCATGGAACGACTTCGTCAGCTCATCATCTTCTTCTTCTTCGTCCT
CGTGACCGTTCTTGAACATGCTTCATCTGCTCGGATTCATACAATCATCTCTAAGCCCGA
CAGACATGATATTGCGGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATTTGGGGTGTCCT
CAGCACATTGTCCATTGAGCATGATGGAGCACTTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGA
TGGTCTGCTCGGGAAAGGCAAGGGTATACCATATTTTTACTTGACAATGCTTGATCCAAC
CACAAGAAACGCATTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGG
AACTTGCAAGAGAGATCCTATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTT
GTTGCAACTGAATGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAAAAGAGCTCTATTCACTAA
GCATCCAGAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACTGGATAT
CATCAATATATCCCTGACCAATTGGTATGGTGGAGCTAAATCCATCACCGTAGATGAATA
TCTTCGTTA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2GY72TF 689 0 0
GGCC
AAACTCAAAAGCATGGAACGACTTCGTCAGCTCATCATCTTCTTCTTCTTCGTCCTCGTG
ACCGTTCTTGAACATGCTTCATCTGCTCGGATTCATACAATCATCTCTAAGCCCGACAGA
CATGATATTGCGGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATTTGGGGTGTCCTCAGC
ACATTGTCCATTGAGCATGATGGAGCACTTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGATGGT
CTGCTCGGGAAAGGCAAGGGTATACCATATTTTTACTTGACAATGCTTGATCCAACCACA
AGAAACGCATTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGGAACT
TGCAAGAGAGATCCTATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTTGTTG
CAACTGAATGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAAAAGAGCTCTATTCACTAAGCAT
CCAGAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACTGGATATCATC
AATATATCCCTGACCAATTGGTATGGTGGAGCTAAATCCATCACCGTAGATGAATATCTT
CGTTACAAGGAGACCAAAGTCGCTTCCTTCTTATGAAAATCACAGCTGGAAATGAGCAAA
AG*TGAAGAATAAGCACATCATGAA

QA 5 689 5 689
DS 

RD RR2F093TF 755 0 0
GGA
AAACTCAAAAGCATGGAACGACTTCGTCAGCTCATCATCTTCTTCTTCTTCGTCCTCGTG
ACCGTTCTTGAACATGCTTCATCTGCTCGGATTCATACAATCATCTCTAAGCCCGACAGA
CATGATATTGCAGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATTTGGGGTGTCCTCAGC
ACATTGTCCATTGAGCATGATGAAGCACCTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGATGGT
CTGCCCGGGAAAGGCAAGGGTATACCATATTTTTACTTGACAATGCTTGATCCAACCACA
AGAAACGCATTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGGAACT
TGCAAGAGAGATCCTATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTTGTTG
CAACTGAATGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGTCAAAAAAGCTCTATTCACTAAGCAT
CCAGAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACTGGATATCATC
AATATATTCCTGATCAATTGGTATGGTGGAGCTAAATCCATCACCGTAGATGAATATCTT
CGTTACAAGGAGACCAAAGTCGCTTCCTTCTTATGAAAATCACAGCTGGAAATGAGCAAA
AGGTGAAGAATAAGCACATCATGAAACTTGTATATTGGTAACACAATAAAAATGTATTCA
GCTCTTCTGTAAATAACTGTTGTTAATAGCCT

QA 4 755 4 755
DS 

RD RR2GY72JQ 700 0 0
CCGTTCTTGAACATGCTTCATCTGCTCGGATTCATACAATCATCTCTAAGCCCGACAGAC
ATGATATTGCGGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATTTGGGGTGTCCTCAGCA
CATTGTCCATTGAGCATGATGGAGCACTTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGATGGTC
TGCTCGGGAAAGGCAAGGGTATACCATATTTTTACTTGACAATGCTTGATCCAACCACAA
GAAACGCATTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGGAACTT
GCAAGAGAGATCCTATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTTGTTGC
AACTGAATGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAAAAGAGCTCTATTCACTAAGCATC
CAGAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACTGGATATCATCA
ATATATCCCTGACCAATTGGTATGGTGGAGCTAAATCCATCACCGTAGATGAATATCTTC
GTTACAAGGAGACCAAAGTCGCTTCCTTCTTATGAAAATCACAGCTGGAAATGAGCAAAA
GGTGAAGAATAAGCACATCATGAAACTTGTATATTGGTAACACAATAAAAATGTATTCAG
CTCTTCTGTAAATGACTGTTGTTAATAGCCTTTCGATTAC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2GT82JQB 593 0 0
GGGAATGTTGTGTCATATAGTGATGGTCTGCTCGGGAAAGGCAAGGGTATACCATATTTT
TACTTGACAATGCTTGATCCAACCACAAGAAACGCATTAAAAGACTCGAGGGCTTCATTC
GCAATCAGTGAATCTCCCATTGGAACTTGCAAGAGAGATCCTATGGACCCTACTTGCTCT
AAACTAACCCTCACCGGAAAGTTGTTGCAACTGAATGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTA
GCCAAAAGAGCTCTATTCACTAAGCATCCAGAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAG
TTCAGTGTCTTCAAACTGGATATCATCAATATATCCCTGACCAATTGGTATGGTGGAGCT
AAATCCATCACCGTAGATGAATATCTTCGTTACAAGGAGACCAAAGTCGCTTCCTTCTTA
TGAAAATCACAGCTGGAAATGAGCAAAAGGTGAAGAATAAGCACATCATGAAACTTGTAT
ATTGGTAACACAATAAAAATGTATTCAGCTCTTCTGTAAATGACTGTTGTTAATAGCCTT
TCGATTACATCTATGTGGACATGATGAATATAGAACTATTCATAAATTCCC
CC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2F093JQ 809 0 0
ATGCTTCATCTGCTCGGATTCATACAATCATCTCTAAGCCCGACAGACATGATATTGCAG
CAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATTTGGGGTGTCCTCAGCACATTGTCCATTG
AGCATGATGAAGCACCTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGATGGTCTGCCCGGGAAAG
GCAAGGGTATACCATATTTTTACTTGACAATGCTTGATCCAACCACAAGAAACGCATTAA
AAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGGAACTTGCAAGAGAGATC
CTATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTTGTTGCAACTGAATGAAG
GATCTGAGGAAGAGAACGTAGTCAAAAAAGCTCTATTCACTAAGCATCCAGAGATGATGG
ATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACTGGATATCATCAATATATTCCTGA
TCAATTGGTATGGTGGAGCTAAATCCATCACCGTAGATGAATATTTTCGTTACAAGGAGA
CCAAAGTCGCTTCCTTCTTATGAAAATCACAGCTGGAAATGAGCAAAAGGTGAAGAATAA
GCACATCATGAAACTTGTATATTGGTAACACAATAAAAATGTATTCAGCTCTTCTGTAAA
TAACTGTTGTTAATAGCCTTTCGATTACATTTATGTGGACATGATGAATATAGAACTATT
CATAAATTCCCACAATCCAAATTCAAATGTACAATATAAAAATATATATATTGCTATGAA
TAAAATTGACAAGTGTGCATAGCTTCTTG

QA 1 809 1 809
DS 



AS 2 6

CO CL1059Contig1 497 3 7 U
GAAAAATATCCTTATTTATAGTTCAAAAAGGCAATAACATGCATGAATAACGTAACAACA
CATTCTGTAAAAACATTTCGTGTTCACATGCGTTGTTTCTCAACCCAATCAAGCCTACAA
AATCATGTGTTTCATCGGATATATGAATTCAAAACCGTATTTCTTTCATCATTTGCTGCT
GTCTGTGAAGTCAGCGTCAATCACATCATCACCATCTTTCCCCGTTGAATCTGCTGATGA
AGCATCTCCGCCTCCAGGGGAAGGACCTGCACCTGCTGCTCCTGCTCCAGGCTGGTTGTA
CATCGACTGACCAATCTGCATCACTTCTTGGTTAAGAGCAGCCATCGTGTCCTTGATCTC
TTGGGTAGTTCCACTTGCAATCTTGTCTTTCAGCTCTTGTAGCTTGGCCTCCACCTTCTC
TTTCACTTCACCTGGAATCTTCTCTCCCAGTTCTTTGAGTTGCTTCTCTGTCTGGTACAC
CACTGAATCCGCCTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H936JQ U 30
AF RR2H936TF C 30
AF RR2GG15JQB U 1
BS 1 93 RR2GG15JQB
BS 94 94 RR2H936JQ
BS 95 206 RR2GG15JQB
BS 207 207 RR2H936JQ
BS 208 247 RR2GG15JQB
BS 248 248 RR2H936JQ
BS 249 497 RR2GG15JQB

RD RR2H936JQ 446 0 0
GGCAATAACATGCATGAATAACGTAACAACACATTCTGTAAAAACATTTCGTGTTCACAT
GCGTTGTTTCTCAACCCAATCAAGCCTACAAAATCATGTGTTTCATCGGATATATGAATT
CAAAACCGTATTTCTTTCATCATTTGCTGCTGTCTGTGAAGTCAGCGTCAATCACATCAT
CACCATCTTTCCCCGTTGAATCTGCTGATGAAGCATCTCCGCCTCCAGGGGAAGGACCTG
CACCTGCTGCTCCTGCTCCAGGCTGGTTGTACATCGACTGACCAATCTGCATCACTTCTT
GGTTAAGAGCAGCCATCGTGTCCTTGATCTCTTGGGTAGTTCCACTTGCAATCTTGTCTT
TCAGCTCTTGTAGCTTGGCCTCCACCTTCTCTTTCACTTCACCTGGAATCTTCTCTCCCA
GTTCTTTGAGTTGCTTCTCTGTCTG
C

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR2H936TF 446 0 0
GGCAATAACATGCATGAATAACGTAACAACACATTCTGTAAAAACATTTCGTGTTCACAT
GCGTTGTTTCTCAACCCAATCAAGCCTACAAAATCATGTGTTTCATCGGATATATGAATT
CAAAACCGTATTTCTTTCATCATTTGCTGCTGTCTGTGAAGTCAGCGTCAATCACATCAT
CACCATCTTTCCCCGTTGAATCTGCTGATGAAGCATCTCCGCCTCCAGGGGAAGGACCTG
CACCTGCTGCTCCTGCTCCAGGCTGGTTGTACATCGACTGACCAATCTGCATCACTTCTT
GGTTAAGAGCAGCCATCGTGTCCTTGATCTCTTGGGTAGTTCCACTTGCAATCTTGTCTT
TCAGCTCTTGTAGCTTGGCCTCCACCTTCTCTTTCACTTCACCTGGAATCTTCTCTCCCA
GTTCTTTGAGTTGCTTCTCTGTCTG
C

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR2GG15JQB 497 0 0
GAAAAATATCCTTATTTATAGTTCAAAAAGGCAATAACATGCATGAATAACGTAACAACA
CATTCTGTAAAAACATTTCGTGTTCACATGCGTCGTTTCTCAACCCAATCAAGCCTACAA
AATCATGTGTTTCATCGGATATATGAATTCAAAACCGTATTTCTTTCATCATTTGCTGCT
GTCTGTGAAGTCAGCGTCAATCACATTATCACCATCTTTCCCCGTTGAATCTGCTGATGA
AGCATCTTCGCCTCCAGGGGAAGGACCTGCACCTGCTGCTCCTGCTCCAGGCTGGTTGTA
CATCGACTGACCAATCTGCATCACTTCTTGGTTAAGAGCAGCCATCGTGTCCTTGATCTC
TTGGGTAGTTCCACTTGCAATCTTGTCTTTCAGCTCTTGTAGCTTGGCCTCCACCTTCTC
TTTCACTTCACCTGGAATCTTCTCTCCCAGTTCTTTGAGTTGCTTCTCTGTCTGGTACAC
CACTGAATCCGCCTGGT

QA 1 497 1 497
DS 



CO CL1059Contig2 791 3 2 U
GATTGTCCTTCTTGATGTGACACCCCTATCCATTGGTTTGGAAACACTTGGCGGTGTTAT
GACCAAGATTATTCCACGGAACTCAACTCTGCCTACTTCTAAGTCAGAAGTCTTCTCGAC
GGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGATTAATGTGTTGCAGGGTGAGAGGGAGTTTGT
CCGGGACAACAAGTCTCTTGGCAGCTTCCGTCTAGATGGCATCCCACCAGCACCACGTGG
AGTTCCACAGATCGAAGTCAAATTTGACATCGATGCCAATGGTATTCTATCCGTCAGTGC
TAGTGACAAAGGCACTGGAAAGAAACAAGACATCACCATTACTGGTGCCAGTACATTGCC
TAAAGACGAGGTAGAGCAGATGGTCCAAGAAGCAGAAAGGTTTGCAAAGGACGACAAGGA
GAAGAGAGACGCAATTGACACGAAGAACCAGGCGGATTCAGTGGTGTACCAGACAGAGAA
GCAACTCAAAGAACTGGGAGAGAAGATTCCAGGTGAAGTGAAAGAGAAGGTGGAGGCCAA
GCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATTGCAGGTCCTTCCCCTGGAGGCGAAGATGCTTCATC
AGCAGATTCAACGGGGAAAGATGGTGATGATGTGATTGACGCTGACTTCACAGACAGCAG
CAAATGATGAAAGAAATACGGTTTTGAATTCATATATCCGATGAAACACATGATTTTTTA
GGCTTGATTGGGTTGAGAAACAACGCATGTGAACACGAAATGTTTTTACAGAATGTGTTG
TTACGTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH25TF U 1
AF RR2GG15TF U 289
AF RR2GH25JQB C 97
BS 1 525 RR2GH25TF
BS 526 791 RR2GH25JQB

RD RR2GH25TF 525 0 0
GATTGTCCTTCTTGATGTGACACCCCTATCCATTGGTTTGGAAACACTTGGCGGTGTTAT
GACCAAGATTATTCCACGGAACTCAACTCTGCCTACTTCTAAGTCAGAAGTCTTCTCGAC
GGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGATTAATGTGTTGCAGGGTGAGAGGGAGTTTGT
CCGGGACAACAAGTCTCTTGGCAGCTTCCGTCTAGATGGCATCCCACCAGCACCACGTGG
AGTTCCACAGATCGAAGTCAAATTTGACATCGATGCCAATGGTATTCTATCCGTCAGTGC
TAGTGACAAAGGCACTGGAAAGAAACAAGACATCACCATTACTGGTGCCAGTACATTGCC
TAAAGACGAGGTAGAGCAGATGGTCCAAGAAGCAGAAAGGTTTGCAAAGGACGACAAGGA
GAAGAGAGACGCAATTGACACGAAGAACCAGGCGGATTCAGTGGTGTACCAGACAGAGAA
GCAACTCAAAGAACTGGGAGAGAAGATTCCAGGTGAAGTGAAAGA

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2GG15TF 230 0 0
GG
CCGTCAGTGCTAGTGACAAAGGCACTGGAAAGAAACAAGACATCACCATTACTGGTGCCA
GTACATTGCCTAAAGACGAGGTAGAGCAAATGGTCCAAGAAACAGAAAGGTTTGCAAAGG
ACGACAAGGAGAAGAGAGACGTAATTGACACGAAGAACCAGGCGGATTCAGTGGTGTACC
AGACAGAGAAGCAACTCAAAGAACTGGGAGAGAAGATTCCAGGTGAAG

QA 3 230 3 230
DS 

RD RR2GH25JQB 695 0 0
TTCTAAGTCAGAAGTCTTCTCGACGGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGATTAATGT
GTTGCAGGGTGAGAGGGAGTTTGTCCGGGACAACAAGTCTCTTGGCAGCTTCCGTCTAGA
TGGCATCCCACCAGCACCACGTGGAGTTCCACAGATCGAAGTCAAATTTGACATCGATGC
CAATGGTATTCTATCCGTCAGTGCTAGTGACAAAGGCACTGGAAAGAAACAAGACATCAC
CATTACTGGTGCCAGTACATTGCCTAAAGACGAGGTAGAGCAGATGGTCCAAGAAGCAGA
AAGGTTTGCAAAGGACGACAAGGAGAAGAGAGACGCAATTGACACGAAGAACCAGGCGGA
TTCAGTGGTGTACCAGACAGAGAAGCAACTCAAAGAACTGGGAGAGAAGATTCCAGGTGA
AGTGAAAGAGAAGGTGGAGGCCAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATTGCAGGTCCTTC
CCCTGGAGGCGAAGATGCTTCATCAGCAGATTCAACGGGGAAAGATGGTGATGATGTGAT
TGACGCTGACTTCACAGACAGCAGCAAATGATGAAAGAAATACGGTTTTGAATTCATATA
TCCGATGAAACACATGATTTTTTAGGCTTGATTGGGTTGAGAAACAACGCATGTGAACAC
GAAATGTTTTTACAGAATGTGTTGTTACGTTATCC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 3 7

CO CL1060Contig1 1378 3 7 U
AAAAGAACTTTATATCTGATGCATGGTGGGATTGTATACATTACTTTGTCAGTATCAAAA
CGCAGCAAATGCTTTACATAGAAGGACTGAAACAACAACAAAAAAAAACGAATCTCTCAG
TTCACCTTTTCTTCATCCGACATATCGAAGCAACACTCAATCGTTTCCAAGCACAAACCC
TTTCTTGTCATCCACAAATTTGACCGCGTACAGATTAGCTGCGATATTGTCAGCAGCTTT
GTCACGGTTCCATGACTTGCCTCCGTTTCTTGTTCTCAGTAGAATCCCACTCCCTCCTGC
TGCCCATGCTTCTTCCTCTGAGCGATAACCAACATCTAGAATGCCAAACCCACGGCTTTG
TACTGGAACTTCGTCAAAGTCCTCTGAAATACCAGTGCCTTTGCTAAGATAAAGTCCTCC
TCCTCGAACAAGAAGCTAAAGACCACCATCAGCTCTCCATCCCATGTTCTGAATTCTTCT
CGCAACTGCTCTATTGTGTGGTTGCCAGTAAGGCTGCCCAGGCTCCCATGTCAAAAAGAA
ATTACCACGGCTCGAAACAGCAACATATCTTCCATCTGGTGAACGATTAACAGCACTGAA
GGTTCCCGTGTAGTAACTAGCACCACTGATTCCACTGGAGACTGTCCTATTCAAAGTAGC
TGAAACGGTTTCCTGAATAGCAGCTTTCCAGTTATATCCCTTGTTAGAAGTAACATAGAT
AGCACCTTCATCGGTAACCATCTCTGCGCTCTTTTCTCCAGTCGCCTCTATAAACACCAT
ATCACCAGGAAGCTGAGAGCTGAGGGGGATTCGATCCCAATTCTCTCCGGCATCAGCAGT
GTACAACAAGATAGCAGGCTTGCCAATGATCCGCCCTTCCTTGCCTTTGAAGCTGATCGA
ATTGAACCTGTAATTGAAATCCTCTTCTTCAGCTGAAGGGATTGATCGTGGGGCCCATGT
GTTTCCACCGTCTTTGGTCTCCAACAGAGTCTGCCTCGTCCCCAGTAGAAACCCGTGGCT
AGGTTCGTCGGGGACGAAAGCAATGTCGAGAAGAACGACGCCGGGATCGATTGGGAGGAA
GACTCTTTCCCATTCGGATAACTGTTCATCGGCTTTAGCTGGTCCGGCGACGGAGGAAAG
GGAGAGTGATACTGCCGCCGATTGGTAGAGAAGGTCCCGCCGAGTGAGAGAGAGTGAAGA
AGATGAAGATGAAGACGGTGGAGGAGGAGGAGAAGCGGAGGCTTTAGGGATGAGGCGGTG
AGTGATTCGTTGGGGGAGACGGAAGCGTGGAGATACAGAGGGCTTAGAGAGAAGATAACC
GTCGCAGAGTCGGAGAGACGCCATTGAAGTGTAACCTCTCTCTCTTCTCCCGCCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX72JQ U 1
AF RR2FR73JQ U 1
AF RR2FR73TF C 677
BS 1 42 RR2DX72JQ
BS 43 43 RR2FR73JQ
BS 44 158 RR2DX72JQ
BS 159 159 RR2FR73JQ
BS 160 426 RR2DX72JQ
BS 427 768 RR2FR73JQ
BS 769 1378 RR2FR73TF

RD RR2DX72JQ 428 0 0
AAAAGAACTTTATATCTGATGCATGGTGGGATTGTATACATTGCTTTGTCAGTATCAAAA
CGCAGCAAATGCTTTACATAGAAGGACTGAAACAACAACAAAAAAAAACGAATCTCTCAG
TTCACCTTTTCTTCATCCGACATATCGAAGCAACACTCCATCGTTTCCAAGCACAAACCC
TTTCTTGTCATCCACAAATTTGACCGCGTACAGATTAGCTGCGATATTGTCAGCAGCTTT
GTCACGGTTCCATGACTTGCCTCCGTTTCTTGTTCTCAGTAGAATCCCACTCCCTCCTGC
TGCCCATGCTTCTTCCTCTGAGCGATAACCAACATCTAGAATGCCAAACCCACGGCTTTG
TACTGGAACTTCGTCAAAGTCCTCTGAAATACCAGTGCCTTTGCTAAGATAAAGTCCTCC
TCCTCG
AA

QA 1 426 1 426
DS 

RD RR2FR73JQ 768 0 0
AAAAGAACTTTATATCTG
ATGCATGGTGGGATTGTATACATTACTTTGTCAGTATCAAAACGCAGTAAATGCTTTACA
TAGAAGGACTGAAACAACAACAAAAAAAAACGAATCTCTCAGTTCACCTTTTCTTCATCC
GACATATCGAAGCAACACTCAATCGTTTCCAAGCACAAACCCTTTCTTGTCATCCACAAA
TTTGACCGCGTACAGATTAGCTGCGATATTGTCAGCAGCTTTGTCACGGTTCCATGACTT
GCCTCCGTTTCTTGTTCTCAGTAGAATCCCACTCCCTCCTGCTGCCCATGCTTCTTCCTC
TGAGCGATAACCAACATCTAGAATGCCAAACCCACGGCTTTGTACTGGAACTTCGTCAAA
GTCCTCTGAAATACCAGTGCCTTTGCTAAGATAAAGTCCTCCTCCTCGAACAAGAAGCTA
AAGACCACCATCAGCTCTCCATCCCATGTTCTGAATTCTTCTCGCAACTGCTCTATTGTG
TGGTTGCCAGTAAGGCTGCCCAGGCTCCCATGTCAAAAAGAAATTACCACGGCTCGAAAC
AGCAACATATCTTCCATCTGGTGAACGATTAACAGCACTGAAGGTTCCCGTGTAGTAACT
AGCACCACTGATTCCACTGGAGACTGTCCTATTCAAAGTAGCTGAAACGGTTTCCTGAAT
AGCAGCTTTCCAGTTATATCCCTTGTTAGAAGTAACATAGATAGCACCTTCATCGGTAAC
CATCTCTGCGCTCTTTTCTCCAGTCGCCTC

QA 19 768 19 768
DS 

RD RR2FR73TF 702 0 0
ATAGCAGCTTTCCAGTTATATCCCTTGTTAGAAGTAACATAGATAGCAC*TTCATCGGTA
ACCATCTCTGCGCTCTTTTCTCCAGTCGCCTCTATAAACACCATATCACCAGGAAGCTGA
GAGCTGAGGGGGATTCGATCCCAATTCTCTCCGGCATCAGCAGTGTACAACAAGATAGCA
GGCTTGCCAATGATCCGCCCTTCCTTGCCTTTGAAGCTGATCGAATTGAACCTGTAATTG
AAATCCTCTTCTTCAGCTGAAGGGATTGATCGTGGGGCCCATGTGTTTCCACCGTCTTTG
GTCTCCAACAGAGTCTGCCTCGTCCCCAGTAGAAACCCGTGGCTAGGTTCGTCGGGGACG
AAAGCAATGTCGAGAAGAACGACGCCGGGATCGATTGGGAGGAAGACTCTTTCCCATTCG
GATAACTGTTCATCGGCTTTAGCTGGTCCGGCGACGGAGGAAAGGGAGAGTGATACTGCC
GCCGATTGGTAGAGAAGGTCCCGCCGAGTGAGAGAGAGTGAAGAAGATGAAGATGAAGAC
GGTGGAGGAGGAGGAGAAGCGGAGGCTTTAGGGATGAGGCGGTGAGTGATTCGTTGGGGG
AGACGGAAGCGTGGAGATACAGAGGGCTTAGAGAGAAGATAACCGTCGCAGAGTCGGAGA
GACGCCATTGAAGTGTAACCTCTCTCTCTTCTCCCGCCACCC

QA 1 702 1 702
DS 



CO CL1060Contig2 741 2 9 U
CTGACAAGGGATATAACTGGAAAGCTGCTATTCAGGAAACAGTGTCAGCTACTTTGAATA
GGACAGTCTCCAGTGGAATCAGTGGTGCTAGTTACTACACGGGAACCTTCAGTGCTGTTA
ATCGTTCACCAGATGGAAGATATGTTGCTGTTTCCAGCCGTGGTAACTTCTTTTTGACAT
GGGAGCCTGGGCAGCCTTACTGGCAACCACACAATAGAGCAGTTGCTAGAAGAATTCAGA
ACATGGGATGGAGAACTGATGGTGGTCTTTGGCTTCTTGTCCGAGGAGGAGGACTTTATC
TTAGCAAAGGCACTGGGATTTCAGAGGACTTTGACGAAGTTCCAGTACAAAGCCGTGGGT
TTGGCATTCTAGATGTTGGTTATCGCTCGGAGGAAGAAGCATGGGCAGCAGGAGGCAGTG
GGATTCTACTGAGAACAAGAAACGGAGGCAAGTCATGGAACCGTGACAAAGCTGCTGACA
ACATCGCAGCTAATCTGTACGCGGTCAAATTTGTGGATGACAAGAAAGGGTTTGTGCTTG
GAAACGATGGAGTGTTGCTTCGATATGTGGGATGAAGAGAAGGTGAATTGAGAGATTCGT
TTTTTTGTTTTGTTTCAGCCTTTCTTTGTAAAGCGTTTACTGCGTCTTGATACTGCATTA
CAAAGTATTGTATACATTCCCACCATGCATGAGGTATGTAAATTTAAAGTTCTTATAAAA
TCTACTAGCCCGTTTATGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL42TF U 49
AF RR2FJ89JQ C 1
BS 1 49 RR2FJ89JQ
BS 50 346 RR2DL42TF
BS 347 347 RR2FJ89JQ
BS 348 361 RR2DL42TF
BS 362 362 RR2FJ89JQ
BS 363 618 RR2DL42TF
BS 619 619 RR2FJ89JQ
BS 620 689 RR2DL42TF
BS 690 741 RR2FJ89JQ

RD RR2DL42TF 641 0 0
G
TACTTTGAATAGGACAGTCTCCAGTGGAATCAGTGGTGCTAGTTACTACACGGGAACCTT
CAGTGCTGTTAATCGTTCACCAGATGGAAGATATGTTGCTGTTTCCAGCCGTGGTAACTT
CTTTTTGACATGGGAGCCTGGGCAGCCTTACTGGCAACCACACAATAGAGCAGTTGCTAG
AAGAATTCAGAACATGGGATGGAGAACTGATGGTGGTCTTTGGCTTCTTGTCCGAGGAGG
AGGACTTTATCTTAGCAAAGGCACTGGGATTTCAGAGGACTTTGACGAAGTTCCAGTGCA
AAGCCGTGGGTT*GGCATTCTAGATGTTGGTTATCGCTCGGAGGAAGAAGCATGGGCAGC
AGGAGGCAGTGGGATTCTACTGAGAACAAGAAACGGAGGCAAGTCATGGAACCGTGACAA
AGCTGCTGACAACATCGCAGCTAATCTGTACGCGGTCAAATTTGTGGATGACAAGAAAGG
GTTTGTGCTTGGAAACGATGGAGTGTTGCTTCGATATGTGGGATGAAGAGAAGGTGAATT
GAGAGATTCGTTTTTTTGTTTTGTTTCAGTCTTTCTTTGTAAAGCGTTTACTGCGTCTTG
ATACTGCATTACAAAGTATTGTATACATTCCCACCATGCA

QA 2 641 2 641
DS 

RD RR2FJ89JQ 741 0 0
CTGACAAGGGATATAACTGGAAAGCTGCTATTCAGGAAACAGTGTCAGCTACTTTGAATA
GGACAGTCTCCAGTGGAATCAGTGGTGCTAGTTACTACACGGGAACCTTCAGTGCTGTTA
ATCGTTCACCAGATGGAAGATATGTTGCTGTTTCCAGCCGTGGTAACTTCTTTTTGACAT
GGGAGCCTGGGCAGCCTTACTGGCAACCACACAATAGAGCAGTTGCTAGAAGAATTCAGA
ACATGGGATGGAGAGCTGATGGTGGTCTTTGGCTTCTTGTCCGAGGAGGAGGACTTTATC
TTAGCAAAGGCACTGGGATTTCAGAGGACTTTGACGAAGTTCCAGTACAAAGCCGTGGGT
TTGGCATTCTAGATGTTGGTTATCGCTCGGAGGAAGAAGCATGGGCAGCAGGAGGCAGTG
GGATTTTACTGAGAACAAGAAACGGAGGCAAGTCATGGAACCGTGACAAAGCTGCTGACA
ACATCGCAGCTAATCTGTACGCGGTCAAATTTGTGGATGACAAGAAAGGGTTTGTGCTTG
GAAACGATGGAGTGTTGCTTCGATATGTGGGATGAAGAGAAGGTGAATTGAGAGATTCGT
TTTTT*GTTTTGTTTCAGCCTTTCTTTGTAAAGCGTTTACTGCGTCTTGATACTGCATTA
CAAAGTATTGTATACATTCCCACCATGCATGAGGTATGTAAATTTAAAGTTCTTATAAAA
TCTACTAGCCCGTTTATGTTC

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL1060Contig3 741 2 7 U
GGATGTGGCGGGAGAAGAGAGAGGTCACACTTCAATGGCGTCTCTCCAACTCTGCGACGG
TTATCTTCTCTCTAAGCCTTCTGTATCTCCACGCTTCCGTCTCCCTCAACGAATCTCTCA
CCGCCTCATCCCCAAAGCCTCCGCTTCCCCTCCTCCTCCACCATCTTCATCTTCATCTTC
TTCATTGTCTCTCACTCGTCGGGACCTTCTCTACCAATCGGCGGCAGTATCACTCTCCCT
TTCCTCCATCGTCGGACCAGCTAAAGCCGATGAACAGTTATCCGAATGGGAAAGAGTCTT
CCTCCCAATCGATCCCGGCGTCGTTCTTCTCGACATTGCTTTCGTCCCCGACGAGCCTAG
CCGCGGGTTTCTACTGGGGACGAGGCAGACTCTGTTAGAGACCAAAGACGGTGGAAACAC
GTGGGCCCCACGATCAATCCCTTCAGCTGAAGAAGAGGATTTCAATTACAGGTTCAATTC
GATCAGCTTCAAAGGCAAAGAAGGGTGGATCATTGGCAAGCCTGCTATCTTGTTGTACAC
TGCCGATGCCGGAGAGAATTGGGATCGAATCCCCCTTAGCTCTCAACTTCCTGGTGATAT
GGTGTTTATAGAGGCGACTGGAGAAAAGAGTGCTGAGATGGTTACAGATGAAGGTGCTAT
CTATGTTACTTCTAACAAGGGATATAACTGGAAAGCTGCTATTCAGAAACAGTGTCAGCT
ACTTTGAATAGACAGTCTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ89TF U 1
AF RR2EN76TF U 32
BS 1 653 RR2FJ89TF
BS 654 654 RR2EN76TF
BS 655 673 RR2FJ89TF
BS 674 674 RR2EN76TF
BS 675 708 RR2FJ89TF
BS 709 709 RR2EN76TF
BS 710 741 RR2FJ89TF

RD RR2FJ89TF 741 0 0
GGATGTGGCGGGAGAAGAGAGAGGTCACACTTCAATGGCGTCTCTCCAACTCTGCGACGG
TTATCTTCTCTCTAAGCCTTCTGTATCTCCACGCTTCCGTCTCCCTCAACGAATCTCTCA
CCGCCTCATCCCCAAAGCCTCCGCTTCCCCTCCTCCTCCACCATCTTCATCTTCATCTTC
TTCATTGTCTCTCACTCGTCGGGACCTTCTCTACCAATCGGCGGCAGTATCACTCTCCCT
TTCCTCCATCGTCGGACCAGCTAAAGCCGATGAACAGTTATCCGAATGGGAAAGAGTCTT
CCTCCCAATCGATCCCGGCGTCGTTCTTCTCGACATTGCTTTCGTCCCCGACGAGCCTAG
CCGCGGGTTTCTACTGGGGACGAGGCAGACTCTGTTAGAGACCAAAGACGGTGGAAACAC
GTGGGCCCCACGATCAATCCCTTCAGCTGAAGAAGAGGATTTCAATTACAGGTTCAATTC
GATCAGCTTCAAAGGCAAAGAAGGGTGGATCATTGGCAAGCCTGCTATCTTGTTGTACAC
TGCCGATGCCGGAGAGAATTGGGATCGAATCCCCCTTAGCTCTCAACTTCCTGGTGATAT
GGTGTTTATAGAGGCGACTGGAGAAAAGAGTGCTGAGATGGTTACAGATGAAG*TGCTAT
CTATGTTACTTCTGACAAGGGATATAACTGGAAAGCTGCTATTCAGAA*CAGTGTCAGCT
ACTTTGAATAGACAGTCTCAG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2EN76TF 697 0 0
GG
AATGGCGTCTCTCCAACTCTGCGACGGTTATCTTCTCTCTAGGCCTTCTGTATCTCCACG
CTTCCGTCTCCCTCAACGAATCTCTCACCGCCTCATCCCCAAAGCCTCCGCTTCCCCTCC
TCCTCCACCATCTTCATCTTCATCTTCTTCATTGTCTCTCACTCGTCGGGACCTTCTCTA
CCAATCGGCGGCAGTATCACTCTCCCTTTCCTCCATCGTCGGACCAGCTAAAGCCGATGA
ACAGTTATCCGAATGGGAAATAGTCTTCCTCCCAATCGATCCCGGCGTCGTTCTTCTCGA
CATTGCTTTCGTCCCCGACGAGCCTAGCCGCGGGTTTCTACTGGGGACGAGGCAGACTCT
GTTAGAGACCAAAGACGGTGGAAACACGTGGGCCCCACGATCAATCCCTTCAGCTGAAGA
AGAGGATTTCAATTACAGGTTCAATTCGATCAGCTTCAAAGGCAAAGAAGGGTGGATCAT
TGGCAAGCCTGCTATCTTGTTGTACACTGCCGATGCCGGAGAGAATTGGGATCGAATCCC
CCTTAGCTCTCAACTTCCTGGTGATATGGTGTTTATAGAGGCGACTGGAGAAAAGAGTGC
TGAGATGGTTACAGATGAAGGTGCTATCTATGTTACTTCTAACAAGGGATATAACTGGAA
AGCTGCTATTCAGAAACAGTGTCAGCTACTTTGAA

QA 3 697 3 697
DS 



AS 2 6

CO CL1061Contig1 637 2 1 U
AACTCAAAAGACTACGATCATCTTCAAGAGAGTCTCGAACAGCTTTCGTTTCCAAAGTAA
CCAAGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAGA
AGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACATCCACGTCAGGATCCAGCAGAG
GAATGGGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGAAGAAAGCGTACAGCTACGAGAA
GATTCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTCTGCTGCAACGGCAACGTGGTGCAGGACAAGGA
GCTAGGCAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAGGTGTCTCACTTCTTGGT
TCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTCTAAAACCCGATTCG
AATTGGATCGTATGATATATTTCTTTCTATTTTTATATATATGCGAATAATTGGACTTGG
TGTGTGTGATCACTAGGAAGGTTTCATTATTTTTCGTTTTGATTGTTGTTTGTTGGTGTG
GGACATTTGACTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTTCGATTGTTGTATTTTACATGTCT
TCGTTTAAGTTATTTGCTCAAGAAATAATTGTTTATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AU52JQ C 1
AF RR2AU52TF U 1
BS 1 637 RR2AU52TF

RD RR2AU52JQ 637 0 0
AACTCAAAAGACTACGATCATCTTCAAGAGAGTCTCGAACAGCTTTCGTTTCCAAAGTAA
CCAAGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAGA
AGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACATCCACGTCAGGATCCAGCAGAG
GAATGGGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGAAGAAAGCGTACAGCTACGAGAA
GATTCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTTTGCTGCAACGGCAACGTGGTGCAGGACAAGGA
GCTAGGCAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAGGTGTCTCACTTCTTGGT
TCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTCTAAAACCCGATTCG
AATTGGATCGTATGATATATTTCTTTCTATTTTTATATATATGCGAATAATTGGACTTGG
TGTGTGTGATCACTAGGAAGGTTTCATTATTTTTCGTTTTGATTGTTGTTTGTTGGTGTG
GGACATTTGACTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTTCGATTGTTGTATTTTACATGTCT
TCGTTTAAGTTATTTGCTCAAGAAATAATTGTTTATG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2AU52TF 637 0 0
AACTCAAAAGACTACGATCATCTTCAAGAGAGTCTCGAACAGCTTTCGTTTCCAAAGTAA
CCAAGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAGA
AGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACATCCACGTCAGGATCCAGCAGAG
GAATGGGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGAAGAAAGCGTACAGCTACGAGAA
GATTCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTCTGCTGCAACGGCAACGTGGTGCAGGACAAGGA
GCTAGGCAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAGGTGTCTCACTTCTTGGT
TCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTCTAAAACCCGATTCG
AATTGGATCGTATGATATATTTCTTTCTATTTTTATATATATGCGAATAATTGGACTTGG
TGTGTGTGATCACTAGGAAGGTTTCATTATTTTTCGTTTTGATTGTTGTTTGTTGGTGTG
GGACATTTGACTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTTCGATTGTTGTATTTTACATGTCT
TCGTTTAAGTTATTTGCTCAAGAAATAATTGTTTATG

QA 1 637 1 637
DS 



CO CL1061Contig2 656 4 15 U
AACTCAAAAGACTCCGATCATCTTCAAGAGAGAATAGAACAGCTTTCGTTTCCAAAGTAA
ACCAAGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTCCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAG
AAGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACCAAAGAGTACATCCACGTCCGGATCCAGCAGA
GGAATGGGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGAAGAAAGCGTACAGCTACGAGA
AGATTCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTCTGCTGCAACGGGAACGTGGTGCAGGACAAGG
AGCTAGGCAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAGGTGTCTCACTTCTTGG
TTCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTTTAAGACCCTCGAT
TCGAATTGGATCGTGTGATATCTTTCTTTCTATTTACATATATATGCGAATAATTGGACG
TGGTGTGTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTTT**TCGTTTTGATTGTTGTTTGTTGGT
GTGGG*ACATTTGACTTGTGGAATGAAGATAAACCACCTTTCGATTGTTGTATTTTACAT
GTCTTCGTTTAAGTTATTTGCTCAAGAAAGAATTGTTTATGAATATCACGATTTAA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C532JQ C 1
AF RR2CT42TF U 1
AF RR2EN66TF U 1
AF RR2FM30TF U 16
BS 1 441 RR2CT42TF
BS 442 442 RR2EN66TF
BS 443 456 RR2CT42TF
BS 457 457 RR2EN66TF
BS 458 485 RR2CT42TF
BS 486 486 RR2EN66TF
BS 487 512 RR2CT42TF
BS 513 514 RR2EN66TF
BS 515 545 RR2CT42TF
BS 546 546 RR2EN66TF
BS 547 566 RR2CT42TF
BS 567 567 RR2EN66TF
BS 568 575 RR2CT42TF
BS 576 591 RR2EN66TF
BS 592 656 RR2FM30TF

RD RR2C532JQ 392 0 0
AACTCAAAAGACTCCGATCATCTTCAAGAGAGAATAGAACAGCTTTCGTTTCCAAAGTAA
ACCAAGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTCCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAG
AAGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACCAAAGAGTACATCCACGTCCGGATCCAGCAGA
GAAATGGGAAAAAGAGCTTGACAACTGTTCAGGGTCTGAAGAAAGCGTACAGCTACGAGA
AGATTCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTTTGCTGCAACGGGAACGTGGTGCAGGACAAGG
AGCTAGGCAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAGGTGTCTCACTTCTTGG
TTCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATC

QA 1 392 1 392
DS 

RD RR2CT42TF 586 0 0
AACTCAAAAGACTCCGATCATCTTCAAGAGAGAATAGAACAGCTTTCGTTTCCAAAGTAA
ACCAAGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTCCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAG
AAGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACCAAAGAGTACATCCACGTCCGGATCCAGCAGA
GGAATGGGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGAAGAAAGCGTACAGCTACGAGA
AGATTCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTCTGCTGCAACGGGAACGTGGTGCAGGACAAGG
AGCTAGGCAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAGGTGTCTCACTTCTTGG
TTCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTTTAAGACCCTCGAT
TCGAATTGGATCGTGTGATATATTTCTTTCTATTTATATATATATGCGAATAATTGGACG
TGGTGCGTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTT****TCGTTTTGATTGTTGTTTGTTGGT
GTGGGGACATTTGACTTGTGGAATGATGATAAACC
TTTCGATTGTT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2EN66TF 591 0 0
AACTCAAAAGACTTCGATCATCTTCAAGAGAGAATAGAACAGCTTTCGTTTCCGAAGTAA
*CCAAGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAG
AAGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACATCCACGTCCGGATCCAGCAGA
GGAATGGGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAAGGTCTTAAGAAAGCGTACAGCTACGAGA
AGATTCTCAAGGATCTTAAGAAAGACTTCTGCTGCAACGGCAACGTGGTGCAGGACAAGG
AGCTAGGCAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAAGTGTCTCACTTCTTGG
TTCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTTTAAGACCCTCGAT
TCGAATTGGATCGTGTGATATCTTTCTTTCTATTTACATATATATGCGAATAATTGGACG
TGGTGTGTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTTTTTTCGTTTTGATTGTTGTTTGTTGGT
GTGGG*ACATTTGACTTGTGGAATGAAGATAAACCACCTTTCGATTGTTGT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2FM30TF 641 0 0
GATCATCTTCAAGAGAGAATAGAACAGCTTTCGTTTCCGAAGTAA*CCAAGTTTACATGG
TTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAGAAGCTCAAGAATCAG
ATGCACCAGGGACAAAAGAGTACATCCACGTCCGGATCCAGCAGAGGAATGGGAAAAAGA
GCTTGACGACTGTTCAAGGTCTTAAGAAAGCGTACAGCTACGAGAAGATTCTCAAGGATC
TTAAGAAAGACTTCTGCTGCAACGGCAACGTGGTGCAGGACAAGGAGCTAGGCAAGATCA
TTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAAGTGTCTCACTTCTTGGTTCAGACTGGGATTG
CTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTTTAAGACCCTCGATTCGAATTGGATCGTG
TGATATCTTTCTTTCTATTTACATATATATGCGAATAATTGGACGTGGTGTGTGTGATCA
CTAGGAAGGTTTTTTTTTT**TCGTTTTGATTGTTGTTTGTTGGTGTGGG*ACATTTGAC
TTGTGGAATGAAGATAAACCACCTTTCGATTGTTGTATTTTACATGTCTTCGTTTAAGTT
ATTTGCTCAAGAAAGAATTGTTTATGAATATCACGATTTAA

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 6

CO CL1062Contig1 937 6 9 U
GTAGGTAACAACTCTGATAACTTTTGGAACGAAGTTTACATTACAACAAAGTTCAATAAC
ACACGTTTCTTCTCTGTAGTGAATTGCATTGACCGATGCAGAACGGGAAAAAACAAATGG
GCGAGGCAGAAAACAGACATGGAAGTGTATATAAAATGTATTATTGGCGCCTCCTAAAGA
CGAACAATGAACCTCTAGAGCCTAATCCCAACCTAAGTTTCTCATCAACGTATGTGATCC
TAAGCTTCACTTCACTTTCAAACCCATATTTAAACTCCAGAGAACCAAATTTCAGTTCCG
GAGGCTCGAATATCACCTGAACCCACTCACTGTCCAACACTTTCAGCTTCCCTGTCAAGG
AGACGTCTCCGTCAAGAAAACCCAAAGCAGTAAAGGAAACTCTGTTCCTGACGATATCAG
GAGAATCAATGCCTTGGGTCATCTCATTGGTTCTGAAGAAGAGACGGCCTATCACGCTTC
TGTAGCCTCCACCTGGAGATGTCGGTACAGAACAGTACACCACATCCCAATCTCCGAAGA
TGAGAGGGCATTTGACAGGCTCGCTCACACAGTACTTTTGAAGCTCTCCAGCCACTTGTG
CCACCTCCTTGTGTTGCTCCGGGCTAAGCGTCACACCTCCATCACTGTTCGCAACCTTAG
AGAGGAGAGATGAAATGAGATCATCGGGTCCGGTACGGAGCTCAACGTTGGGCACTGAAA
CGGAGCTCACGACGAGTCTCCTGCTCCGTGGATTGGCCTTATACGGGATGGAGAGTTGAA
GTACCGGGAGGCTCGAGCGCTTCGAGGAACGGATCTGAGTCCGTGGTTCGGAGAAGGATG
ATGCGATTGTAAAGGAAGAAGCAGCCGTAGCCATTGTTGCTCTAGAGATAGAGAGAAGCA
GATAATGGAATGTGGAAGAGACAAGGTGGAGAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A995JQ U 24
AF RR2E715JQ U 1
AF RR2D307JQ U 26
AF RR2A995TF C 431
AF RR2D307TF C 217
AF RR2E715TF C 238
BS 1 130 RR2E715JQ
BS 131 131 RR2A995JQ
BS 132 411 RR2E715JQ
BS 412 454 RR2D307JQ
BS 455 594 RR2D307TF
BS 595 595 RR2A995TF
BS 596 771 RR2D307TF
BS 772 772 RR2E715TF
BS 773 937 RR2D307TF

RD RR2A995JQ 336 0 0
TT
GGAACGAAGTTTACATTACAACAAAGTTCAATAACACACGTTTCTTCTCTGTAGTGAATT
GCATTGACCGATGCAGAACGGGAAAAAACAAATGGGCGAGGCAGAAAACAGACATGGAAG
TGTATATAAAATGTATTATTGGAGCCTCCTAAAGACGAACAATGAACCTCTAGAGCCTAA
TCCCAACCTAAGTTTCTCATCAACGTATGTGATCCTAAGCTTCACTTCACTTTCAAACCC
ATATTTAAACTCCAGAAAACCAAATTTCAGTTCCGGAGGCTCGAATATCACCTGAACCCA
CTCACTGTCCAACACTTTCAGCTTCCCTGTCAAG

QA 3 336 3 336
DS 

RD RR2E715JQ 411 0 0
GTAGGTAACAACTCTGATAACTTTTGGAACGAAGTTTACATTACAACAAAGTTCAATAAC
ACACGTTTCTTCTCTGTAGTGAATTGCATTGACCGATGCAGAACGGGAAAAAACAAATGG
GCGAGGCAGAGAACAGACATGGAAGTGTATATAAAATGTATTATTGGCGCCTCCTAAAGA
CGAACAATGAACCTCTAGAGCCTAATCCCAACCTAAGTTTCTCATCAACGTATGTGATCC
TAAGCTTCACTTCACTTTCAAACCCATATTTAAACTCCAGAGAACCAAATTTCAGTTCCG
GAGGCTCGAATATCACCTGAACCCACTCACTGTCCAACACTTTCAGCTTCCCTGTCAAGG
AGACGTCTCCGTCAAGAAAACCCAAAGCAGTAAAGGAAACTCTGTTCCTGA

QA 1 411 1 411
DS 

RD RR2D307JQ 435 0 0
GGAACGAAGTTTACATTACAACAAAGTTCAATAACACACGTTTCTTCTCTGTAGTGAATT
GCATTGACCGATGCAGAACGGGAAAAAACGAATGGGCGAGGCAGAAAACAGACATGGAAG
TGTATATAAAATGTATTATTGGCGCCTCCTAAAGACGAACAATGAACCTCTAGAGCCTAA
TCCCAACCTAAGTTTCTCATCAACGTATGTGATCCTAAGCTTCACTTCACTTTCAAACCC
ATATTTAAACTCCAGAAAACCAAATTTCAGTTCCGGAGGCTCGAATATCACCTGAACCCA
CTCACTGTCCAACACTTTCAGCTTCCCTGTCAAGGAGACGTCTCCGTCAAGAAAACCCAA
AGCAGTAAAGGAAACTCTGTTCCTGACGATATCAGGAGAATCAATGCCTTGGGTCATCTC
ATTGGTTCT
GAAAAA

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR2A995TF 281 0 0
GCCTTGGATCATCTCATTGGTTCTGAAGAAGAGACGGCCTATCACGCTTCTGTAGCCTCC
ACCTGGAGATGTCGGTACAGAACAGTACACCACATCCCAATCTCCGAAGATGAGAGGGCA
TTTGACAGGCTCGCTCACACAGTACTTTTGAAGCTCTCCAGCCACTTGTGCCACCTCTTT
GTGTTGCTCCGGGGTAAGCGTCACACCTCCATCACTGTTCGCAACCTTAGAGAGGAGAGA
TGAAATGAGATCATCGGGTCCGGTACGGAGCTCAACGTTGG

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR2D307TF 721 0 0
GTTTCTCATCAACGTATGTGATC*TAAGCTTCACTTCACTTTCAAACCCATATTTAAACT
CCAGAGAACCAAATTTCAGTTCGGGAGGCTCGAATATCACC*GAACCCACTCACTGTCCA
ACACTTTCAGCTTCCCTGTCAAGGAGACGTCTCCGTCAAGAAAACCCAAAGCAGTAAAGG
AAACTCTGTTCCTGACGATATCAGGAGAATCAATGCCTTGGGTCATCTCATTGGTTCTGA
AGAAGAGACGGCCTATCACGCTTCTGTAGCCTCCACCTGGAGATGTCGGTACAGAACAGT
ACACCACATCCCAATCTCCGAAGATGAGAGGGCATTTGACAGGCTCGCTCACACAGTACT
TTTGAAGCTCTCCAGCCAATTGTGCCACCTCCTTGTGTTGCTCCGGGCTAAGCGTCACAC
CTCCATCACTGTTCGCAACCTTAGAGAGGAGAGATGAAATGAGATCATCGGGTCCGGTAC
GGAGCTCAACGTTGGGCACTGAAACGGAGCTCACGACGAGTCTCCTGCTCCGTGGATTGG
CCTTATACGGGATGGGGAGTTGAAGTACCGGGAGGCTCGAGCGCTTCGAGGAACGGATCT
GAGTCCGTGGTTCGGAGAAGGATGATGCGATTGTAAAGGAAGAAGCAGCCGTAGCCATTG
TTGCTCTAGAGATAGAGAGAAGCAGATAATGGAATGTGGAAGAGACAAGGTGGAGAATCC
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2E715TF 668 0 0
TCA
TAAGCTTCACTTCACTTTCAAACCCATATTTAAACTCCAGAGAACCAAATTTCAGTTCCG
GAGGCTCGAATATCACCTGAACCCACTCACTGTCCAACACTTTCAGCTTCCCTGTCAAGG
AGACGTCTCCGTCAAGAAAACCCAAAGCAGTAAAGGAAACTCTGTTCCTGACGATATCAG
GAGAATCAATGCCTTGGATCATCTCATTGGTTCTGAAGAAGAGACGGCCTATCACGCTTC
TATAGCCTCCACCTGGAGATGTCGGTACAGAACAGTACACCACATCCCAATCTCCGAAGA
TGAGAGGGCATTTGACAGGCTCGCTCACACAATACTTTTGAAGCTCTCCAGCCACTTGTG
CAACCTCCTTGTGTTGCTCCGGGCTAAGCGTCACACCTCCATCACTGTTCGCAACCTTAG
AGAGGAGAGATGAAATGAGATCATCGGGTCCGGTACGGAGCTCAACGTTGGGCGCTGAAA
CGGAGCTCACGACGAGTCTCCTGCTCCGTGGATTGGCCTTATACGGGATGGAGAGTTGAA
GTACCGGGAGGCTCGAGCGCTTCGAGGAACGGATCTGAGTCCGTGGTTCGGAGAAGGATG
ATGCGATTGTAAGGGAAGAAGCAGCCGTAGCCATTGTTGCTCTAGAGATAGAGAGAAGCA
GAT
CC

QA 4 666 4 666
DS 



AS 1 7

CO CL1063Contig1 1176 7 13 U
CTGAAAAATGTGTTGTAGATTAAGAGCATCTAAAAAACACTTTATTTTAAGGTTTGCAAA
ACTTTATATTTGAATTAAGATTATAAATCTACAAATAGATTTGATCATGAACTTTTCAAT
GAAGCATAACTTTTCTCTCTCTTCCAAAAGCTCCCTCTTCTCTCTAGTCTAAACTCCGAC
TGATTCAGATTCCGGTCGACGACGTTGGCTCTTCCAGCCACGGCGTCGGTCCGGCCTTAT
CCTAAGTCTTTAATTTTTCTGTAGTTTGTGTAGATTTGTGGTTTTTGGCTTGGTTACTTC
AAAAAACAGAGGTAGATCTAGGGTTTCAGATCCAAATTGATGAACAGATTTTCAGTGGTC
GCGGATCTCTTCCATCTTGGCCTTGCCGTGGTGGTTTCTGGATCGTGTGGTCTCAGATTT
TAGTGTCTCCATCATCAGCGTAGAAAGGGCTCCTTCACCTTGGTTGAAGGTACTTCCTTT
TCTCAGATTGTTGGCTTAGTTCGTCTCGGGTTTGTTGGCGCTTCTCGTTTGTGTGCTTCT
GTTGGTGATTTATTCTTGCTTGGAGAGTTTGCTTTTCCTTGGTTTGCTTGCATCGGAATA
GATCCCTGGGTAAGCTCTTGCTAGTTCCCATGTGGTTATGGAGTCTCCGGCTCATTCCAA
AGGAAAAGGGGGCTTTCGCTCCTTCTCGCTTCTCGCCGTGGGTGTTCGAATGGTAAAGTT
GTTTCTTCGTCTCCCTTGGATGGTTCATTGCGTTCGAACTCGTGGCTCGTGGTATGCTCC
AGAGCAGTAGAAGGAGTTCATGTTGGCGGCCATCTTCAATAATTCGGCTTCAGTTGCTAT
GCTTCTCTTCACCTCTCCATGTTCTTGAAGAAATCACTGATAGGGTATCTTATATTGTTT
TGTGATCTTATCTCTGTTGCTTGTTGTTCTCTTAGTAGCCAGTAGGATTATGTCTCTATG
GTCTGTTTTGTTTAGTCTCTAGGGAATGGTTGTTCTTTGTTCCGCTAGCTTTTGTCTCCA
GAGGTGTTGTGTTGTACCTGCTGGCTTGAAGTATCCCAAAAATGTATCCCACCCCTGTAT
AAATTATTGCAATGTTCTTGCAATGTTAATGAAGTTCTTAGTGTGAAAAAAAAAGATTTG
ATCGTGAACTGCTTGCCGTCAATTTGATAAATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU40TF U 120
AF RR2BW87JQ U 1
AF RR2FZ70TF U 119
AF RR2FM49TF U 424
AF RR2FZ70JQ C 312
AF RR2GU40JQB C 467
AF RR2BW87TF C 456
BS 1 187 RR2BW87JQ
BS 188 188 RR2FZ70TF
BS 189 442 RR2BW87JQ
BS 443 443 RR2FZ70TF
BS 444 485 RR2BW87JQ
BS 486 486 RR2FZ70TF
BS 487 723 RR2BW87JQ
BS 724 789 RR2FZ70TF
BS 790 941 RR2FM49TF
BS 942 1082 RR2FZ70JQ
BS 1083 1116 RR2BW87TF
BS 1117 1117 RR2GU40JQB
BS 1118 1176 RR2BW87TF

RD RR2GU40TF 376 0 0
G
GAAGCATAACTTTTCTCTCTCTTCCAAAAGCTCCCTCTTCTCTCTAGTCTAAACTCCGAC
TGATTCAGATTCCGGTCGACGACGTTGGCTCTTCCAGCCACGGCGTCGGTCCGGCCTTAT
CCTAAGTCTTTAATTTTTCTGTAGTTTGTGTAGATTTGTGGTTTTTGGCTTGGTTACTTC
AAAAAACAGAGGTAGATCTAGGGTTTCAGATCCAAATTGATGAGCAGATTTTCAGTGGTC
GCGGATCTCTTCCATCTTGGCCTTGCCGTGGTGGTTTCTGGATCGTGTGGTCTCAGATTT
TAGTGTCTCCATCATCAGCGTAGAAAGGGCTCCTTCACCTTGGTTGAAGGTACTTCCTTT
TCTCAGATTGTTGGC

QA 2 376 2 376
DS 

RD RR2BW87JQ 723 0 0
CTGAAAAATGTGTTGTAGATTAAGAGCATCTAAAAAACACTTTATTTTAAGGTTTGCAAA
ACTTTATATTTGAATTAAGATTATAAATCTACAAATAGATTTGATCATGAACTTTTCAAT
GAAGCATAACTTTTCTCTCTCTTCCAAAAGCTCCCTCTTCTCTCTAGTCTAAACTCCGAC
TGATTCAAATTCCGGTCGACGACGTTGGCTCTTCCAGCCACGGCGTCGGTCCGGCCTTAT
CCTAAGTCTTTAATTTTTCTGTAGTTTGTGTAGATTTGTGGTTTTTGGCTTGGTTACTTC
AAAAAACAGAGGTAGATCTAGGGTTTCAGATCCAAATTGATGAACAGATTTTCAGTGGTC
GCGGATCTCTTCCATCTTGGCCTTGCCGTGGTGGTTTCTGGATCGTGTGGTCTCAGATTT
TAGTGTCTCCATCATCAGCGTAAAAAGGGCTCCTTCACCTTGGTTGAAGGTACTTCCTTT
TCTCAAATTGTTGGCTTAGTTCGTCTCGGGTTTGTTGGCGCTTCTCGTTTGTGTGCTTCT
GTTGGTGATTTATTCTTGCTTGGAGAGTTTGCTTTTCCTTGGTTTGCTTGCATCGGAATA
GATCCCTGGGTAAGCTCTTGCTAGTTCCCATGTGGTTATGGAGTCTCCGGCTCATTCCAA
AGGAAAAGGGGGCTTTCGCTCCTTCTCGCTTCTCGCCGTGGGTGTTCGAATGGTAAAGTT
GTT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2FZ70TF 671 0 0
GG
GAAGCATAACTTTTCTCTCTCTTCCAAAAGCTCCCTCTTCTCTCTAGTCTAAACTCCGAC
TGATTCAGATTCCGGTCGACGACGTTGGCTCTTCCAGCCACGGCGTCGGTCCGGCCTTAT
CCTAAGTCTTTAATTTTTCTGTAGTTTGTGTAGATTTGTGGTTTTTGGCTTGGTTACTTC
AAAAAACAGAGGTAGATCTAGGGTTTCAGATCCAAATTGATGAACAGATTTTCAGTGGTC
GCGGATCTCTTCCATCTTGGCCTTGCCGTGGTGGTTTCTGGATCGTGTGGTCTCAGATTT
TAGTGTCTCCATCATCAGCGTAGAAAGGGCTCCTTCACCTTGGTTGAAGGTACTTCCTTT
TCTCAGATTGTTGGCTTAGTTCGTCTCGGGTTTGTTGGCGCTTCTCGTTTGTGTGCTTCT
GTTGGTGATTTATTCTTGCTTGGAGAGTTTGCTTTTCCTTGGTTTGCTTGCATCGGAATA
GATCCCTGGGTAAGCTCTTGCTAGTTCCCATGTGGTTATGGAGTCTCCGGCTCATTCCAA
AGGAAAAGGGGGCTTTCGCTCCTTCTCGCTTCTCGCCGTGGGTGTTCGAATGGTAAAGTT
GTTTCTTCGTCTCCCTTGGATGGTTCATTGCGTTCGAACTCGTGGCTCGTGGTATGCTCC
AGAGCAGTA

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR2FM49TF 518 0 0
G
GTCTCCATCATCAGCGTAGAAAGGGCTCCTTCACCTTGGTTGAAGGTACTTCCTTTTCTC
AGATTGTTGGCTTAGTTCGTCTCGGGTTTGTTGGCGCTTCTCGTTTGTGTGCTTCTGTTG
GTGATTTATTCTTGCTTGGAGAGTTTGCTTTTCCTTGGTTTGCTTGCATCGGAATAGATC
CCTGGGTAAGCTCTCGCTAGTTCCCATGTGGTTATGGAGTCTCCGGCTCATTCCAAAGGA
AAAGGGGGCTTTCGCTCCTTCTCGCTTCTCGCCGTGGGTGTTCGAATGGTAAAGTTGTTT
CTTCGTCTCCCTTGGATGGTTCATTGCGTTCGAACTCGTGGCTCGTGGTATGCTCCAGAG
CAGTAGAAGGAGTTCATGTTGGCGGCCATCTTCAATAATTCGGCTTCAGTTGCTATGCTT
CTCTTCACCTCTCCATGTTCTTGAAGAAATCACTGATAGGGTATCTTATATTGTTTTGTG
ATCTTATCTCTGTTGCTTGTTGTTCTCTTAGTAGCCA

QA 2 518 2 518
DS 

RD RR2FZ70JQ 774 0 0
GTAGATCTAGGGTTTCAGATCCAAATTGATGAACAGATTTTCAGTGGTCGCGGATCTCTT
CCATCTTGGCCTTGCCGTGGTGGTTTCTGGATCGTGTGGTCTCAGATTTTAGTGTCTCCA
TCATCAGCGTAGAAAGGGCTCCTTCACCTTGGTTGAAGGTACTTCCTTTTCTCAGATTGT
TGGCTTAGTTCGTCTCGGGTTTGTTGGCGCTTCTCGTTTGTGTGCTTCTGTTGGTGATTT
ATTCTTGCTTGGAGAGTTTGCTTTTCCTTGGTTTGCTTGCATCGGAATAGATCCCTGGGT
AAGCTCTTGCTAGTTCCCATGTGGTTATGGAGTCTCCGGCTCATTCCAAAGGAAAAGGGG
GCTTTCGCTCCTTCTCGCTTCTCGCCGTGGGTGTTCGAATGGTAAAGTTGTTTCTTCGTC
TCCCTTGGATGGTTCATTGCGTTCGAACTCGTGGCTCGTGGTATGCTCCAGAGCAGTAGA
AGGAGTTCATGTTGGCGGCCATCTTCAATAATTCGGCTTCAGTTGCTATGCTTCTCTTCA
CCTCTCCATGTTCTTGAAGAAGTCACTGATAGGGTATCTTATATTGTTTTGTGATCTTAT
CTCTGTTGCTTGTTGTTCTCTTAGTAGCCAGTAGGATTATGTCTCTATGGTCTGTTTTGT
TTAGTCTCTAGGGAATGGTTGTTCTTTGTTCCGCTAGCTTTTGTCTCCAGAGGTGTTGTG
TTGTACCTGCTGGCTTGAAGTATCCCAAAAATGTATCCCACCCCTGTATAA
GTT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2GU40JQB 658 0 0
AAGGTACTTCCTTTTCTCAGATTGTTGGCTTAGTTCGTCTCGGGGTTGTTGGCGCTTCTC
GTTTGTGTGCTTCTGTTAGTGATTTATTCTTGCTTGGAGAGTTTGCTTTTCCTTGGTTTG
CTTGCATCGGAATAGATCCCTGGGTAAGCTCTTGCTAGTTCCCATGTGGTTATGGAGTCT
CCGGCTCATTCCAAAGGAAAAGGGGGCTTTCGCTCCTTCTCGCTTCTCGCCGTGGGTGTT
CGAATGGTAAAGTTGTTTCTTCGTCTCCCTTGGATGGTTCATTGCGTTCGAACTCGTGGC
TCTTGGTATGCTCCAGAGCAGTAGAAGGAGTTCATGTTGGCGGCCATCTTCAATAATTCG
GCTTCAGTTGCTATGCTTCTCTTCACCTCTCCATGTTCTTGAAGAAATCACTGATAGGGT
ATCTTATATTGTTTTGTGATCTTATCTCTGTTGCTTGTTGTTCTCTTAGTAGCCAGTAGG
ATTATGTCTCTATGGTCTGTTTTGTTTAGTCTCTAGGGAATGGTTGTTCTTTGTTCCGCT
AGCTTTTGTCTCCAGAGGTGTTGTGTTGTACCTGCTGGCTTGAAGTATCCCAAAAATGTA
TCCCCCCCCTGTATAAGTTATTGCAATGTTCTTGCAATGTTAATGAAGTTCTTAGTGT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2BW87TF 721 0 0
TCA
CTTGGTTGAAGGTACTTC*TTTTCTCAGATTGTTGGCTTAGTTCGTCTCGGGTTTGTTGG
CGCTTCTCGTTTGTGTGCTTCTGTTGGTGATTTATTCTTGCTTGGAGAGTTTGCTTTTCC
TTGGTTTGCTTGCATCGGAATAGATCCCTGGGTAAGCTCTTGCTAGTTCCCATGTGGTTA
TGGAGTCTCCGGCTCATTCCAAAGGAAAAGGGGGCTTTCGCTCCTTCTCGCTTCTCGCCG
TGGGTGTTCGAATGGTAAAGTTGTTTCTTCGTCTCCCTTGGATGGTTCATTGCGTTCGAA
CTCGTGGCTCGTGGTATGCTCCAGAGCAGTAGAAGGAGTTCATGTTGGCGGCCATCTTCA
ATAATTCGGCTTCAGTTGCTATGCTTCTCTTCACCTCTCCATGTTCTTGAAGAAATCACT
GATAGGGTATCTTATATTGTTTTGTGATCTTATCTCTGTTGCTTGTTGTTCTCTTAGTAG
CCAGTAGGATTATGTCTCTATGGTCTGTTTTGTTTAGTCTCTAGGGAATGGTTGTTCTTT
GTTCCGCTAGCTTTTGTCTCCAGAGGTGTTGTGTTGTACCTGTTGGCTTGAAGTATCCCA
AAAATGTATCCCACCCCTGTATAAATTATTGCAATGTTCTTGCAATGTTAATGAAGTTTT
TAGTGTGAAAAAAAAAGATTTGATCGTGAACTGCTTGCCGTCAATTTGATAAATCTCC

QA 4 721 4 721
DS 



AS 2 6

CO CL1064Contig1 844 2 12 U
GGTGTTTCAAATTTCAGTTCCCAATATCATTTCTTTCCACAAGTAAAAAAAGATTCTTGT
TGATAATCTTATCTCTCTCTCTCAAAGAATCTCATACCCCTCTCCCTCCCTCGAATCTTC
TTCTAGCGTTTAATCTACGTCTCATCATCATTTCCCCATGGCGATCAAGAAGATGAACAG
TTTGATCCCAACCTGCTCTTCCCCGGATGATCTGAAACGCGTTCTCCAGACGCTAGGCTC
GACCTGGGGAGACGTGGTCGAAGATCTCGAGAGTCTTGAGGTTGTTCCGTTGAAAGGAGC
CATGACCAACGAGGTTTACCAGATCAACTGGCCTACCTTAAACGGAGGAGAAGACGCTCT
TCACCGCAGAGTTCTTGTTCGGATCTACGAAGACGGCGTTGACCTTTTCTTCAACAGAGA
CGACGAGATCAAAACCTTCGAGTGTATGTCTCATCACGGTTATGGACCTAAGCTTCTTGG
CCGCTTCTCCGATGGTCGTCTCGAAGAGTTCATCCACGCAAGAACTCTTTCTGCAGGTGA
TCTCCGTGTACCAGAAACATCTGATTTAATCGCGGCGAAACTAAGAGAGTTTCACAAGCT
AGACATGCCTGGTCCAAAGAACGTACTCATTTGGGAGAGACTCAGGACTTGGCTTAAGGA
AGCTAAGAACCTGTGTTCGCCGACAGAGATCGATGAGTTTCGTTTGGAAGATATGGAAGC
TGAAATCAACTTGTCGGAAGAGAGGCTGACTCGGGACGATCAGGAGATTGGTTTCTGTCA
CATGATCTTCAGTATGGTAACGTCATGATCGATGAGGAACAACGCTATTACATTATAGAC
TATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2BM68TF U 1
AF RR2FI16TF U 71
BS 1 140 RR2BM68TF
BS 141 141 RR2FI16TF
BS 142 225 RR2BM68TF
BS 226 226 RR2FI16TF
BS 227 456 RR2BM68TF
BS 457 457 RR2FI16TF
BS 458 465 RR2BM68TF
BS 466 466 RR2FI16TF
BS 467 519 RR2BM68TF
BS 520 520 RR2FI16TF
BS 521 628 RR2BM68TF
BS 629 844 RR2FI16TF

RD RR2BM68TF 637 0 0
GGTGTTTCAAATTTCAGTTCCCAATATCATTTCTTTCCACAAGTAAAAAAAGATTCTTGT
TGATAATCTTATCTCTCTCTCTCAAAGAATCTCATACCCCTCTCCCTCCCTCGAATCTTC
TTCTAGCGTTTAATCTACGTTTCATCATCATTTCCCCATGGCGATCAAGAAGATGAACAG
TTTGATCCCAACCTGCTCTTCCCCGGATGATCTGAAACGCGTTCTTCAGACGCTAGGCTC
GACCTGGGGAGACGTGGTCGAAGATCTCGAGAGTCTTGAGGTTGTTCCGTTGAAAGGAGC
CATGACCAACGAGGTTTACCAGATCAACTGGCCTACCTTAAACGGAGGAGAAGACGCTCT
TCACCGCAGAGTTCTTGTTCGGATCTACGAAGACGGCGTTGACCTTTTCTTCAACAGAGA
CGACGAGATCAAAACCTTCGAGTGTATGTCTCATCATGGTTATGGTCCTAAGCTTCTTGG
CCGCTTCTCCGATGGTCGTCTCGAAGAGTTCATCCACGCTAGAACTCTTTCTGCAGGTGA
TCTCCGTGTACCAGAAACATCTGATTTAATCGCGGCGAAACTAAGAGAGTTTCACAAGCT
AGACATGCCTGGTCCAAAGAACGTACTC
CTCTGGGAA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2FI16TF 774 0 0
GGA
TCTCTCTCTCAAAGAATCTCATACCCC*CTCCCTCCCTCGAATCTTCTTCTAGCGTTTAA
TCTACGTCTCATCATCATTTCCCCATGGCGATCAAGAAGATGAACAGTTTGATCCCTACC
TGCTCTTCCCCGGATGATCTGAAACGCGTTCTCCAGACGCTAGGTTCTACCTGGGGAGAC
GTGGTCGAAGATCTCGAGAGTCTTGAGGTTGTTCCGTTGAAAGGAGCCATGACCAACGAG
GTTTACCAGATCAACTGGCCTACCTTAAACGGAGGAGAAGATGCTCTTCACCGCAGGGTT
CTTGTTCGGATCTACGGAGACGGCGTTGACCTTTTCTTCAACAGAGACGACGAGATCAAA
ACCTTCGAGTGTATGTCTCATCACGGTTATGGACCTAAGCTTCTTGGCCGCTTCTCCGAT
GGTCGTCTCGAAGAGTTCATCCACGCAAGAACTCTTTCTGCAGGTGATCTCCGTGTATCC
GAAACATCTGATTTAATCGCGGCGAAACTAAGAGAGTTTCACAAGCTAGATATGCCTGGT
CCAAAGAACGTACTCATTTGGGAGAGACTCAGGACTTGGCTTAAGGAAGCTAAGAACCTG
TGTTCGCCGACAGAGATCGATGAGTTTCGTTTGGAAGATATGGAAGCTGAAATCAACTTG
TCGGAAGAGAGGCTGACTCGGGACGATCAGGAGATTGGTTTCTGTCACATGATCTTCAGT
ATGGTAACGTCATGATCGATGAGGAACAACGCTATTACATTATAGACTATG

QA 4 774 4 774
DS 



CO CL1064Contig2 1220 4 4 U
GGGAACAGTTTGATCCCAACCTGCTCTTCCCCGGATGATCTGAAACGCGTTCTTCAGACG
CTAGGCTCGACCTGGGGAGACGTGGTCGAAGATCTCGAGAGTCTTGAGGTTGTTCCGTTG
AAAGGAGCCATGACCAACGAGGTTTACCAGATCAACTGGCCTACCTTAAACGGAGGAGAA
GACGCTCCTCACCGCAGAGTTCTTGTTCGGATCTACGGAGACGGCGTTGACCTTTTCTTC
AACAGAGACGACGAGATCAAAACCTTCGAGTGTATGTCTCATCATGGTTATGGTCCTAAG
CTTCTTGGCCGCTTCTCCGATGGTCGTCTCGAAGAGTTCATCCACGCTAGAACTCTTTCT
GCAGGTGATCTCCGTGTACCAGAAACATCTGATTTAATCGCGGCGAAACTAAGAGAGTTT
CACAAGCTAGACATGCCTGGTCCAAAGAACGTACTCCTCTGGGAAAGGCTCAGGACTTGG
CTCAAGGAAGCTAAGAACCTGTGTTCGCCGACAGAGATCGGTGAGTTTCGTTTGGAAGCT
ATGGACGGTGAAATCAACTTGTTGGAAGAGAGGCTGACTCGGGAGGATCAAGAGATTGGG
TTCTGTCACAATGATCTTCAGTATGGTAACGTTATGATCGATGAGGAAACCAACGCTATT
ACCATCATAGACTATGAGTATTCGAGTTTCAACCCTGTTGCTTATGACATTGCTAACCAC
TTCTGTGAAATGGCTGCTAATTACCATTCAGACACTCCTCATGTTCTGGATTACACTCTA
TATCCAGGAGAAGAAGAACGTAGAAGGTTCATTAGCACATACCTTGGCTCTACAGGGAAT
GCACCAAGCCAAGAAGAAAAGGATAGGTTAATGACTGATGCAGAGAGATACACTTTGGCA
AATCATATCTTTTGGGGCTTATGGGGAATCATCTCGGGGCATGTGAACACGATTGAGTTT
GATTACAAGGAATATGCAAGGCAGAGATTTGAACAGTACTGGCTTAGAAAACAAATGCTC
CTAGATTGAGGATGAAGAAGATTCACATTGAAGAAAACTTGAATTTCTAAAAGTTTCTGC
AATTAGATAAAAGGAAAGGAGAATATTTAGGTGAATATTATGCTGTTGTTGTTACTTTCA
CCAGTTTGTATGTTTTCCTCCATTGTATATAGAGGTTTGTAAACTTTCAAAGCAATGGAC
ATGACTTTTGTTAAATAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ64TF U 1
AF RR2EG08TF U 400
AF RR2BM68JQ C 507
AF RR2EG08JQ C 556
BS 1 641 RR2GJ64TF
BS 642 1062 RR2EG08TF
BS 1063 1149 RR2BM68JQ
BS 1150 1220 RR2EG08JQ

RD RR2GJ64TF 641 0 0
GGGAACAGTTTGATCCCAACCTGCTCTTCCCCGGATGATCTGAAACGCGTTCTTCAGACG
CTAGGCTCGACCTGGGGAGACGTGGTCGAAGATCTCGAGAGTCTTGAGGTTGTTCCGTTG
AAAGGAGCCATGACCAACGAGGTTTACCAGATCAACTGGCCTACCTTAAACGGAGGAGAA
GACGCTCCTCACCGCAGAGTTCTTGTTCGGATCTACGGAGACGGCGTTGACCTTTTCTTC
AACAGAGACGACGAGATCAAAACCTTCGAGTGTATGTCTCATCATGGTTATGGTCCTAAG
CTTCTTGGCCGCTTCTCCGATGGTCGTCTCGAAGAGTTCATCCACGCTAGAACTCTTTCT
GCAGGTGATCTCCGTGTACCAGAAACATCTGATTTAATCGCGGCGAAACTAAGAGAGTTT
CACAAGCTAGACATGCCTGGTCCAAAGAACGTACTCCTCTGGGAAAGGCTCAGGACTTGG
CTCAAGGAAGCTAAGAACCTGTGTTCGCCGACAGAGATCGGTGAGTTTCGTTTGGAAGCT
ATGGACGGTGAAATCAACTTGTTGGAAGAGAGGCTGACTCGGGAGGATCAAGAGATTGGG
TTCTGTCACAATGATCTTCAGTATGGTAACGTTATGATCGA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2EG08TF 669 0 0
GT
GGCGAAACTAAGAGAGTTTCGCAAGCTAGACATGCCTGGTCCAAAGAACGTACTCCTCTG
GGAAAGGCTCAGGACTTGGCTCAAGGAAGCTAAGAACCTGTGTTCGCCGACAGAGATCGG
TGAGTTTCGTTTGGAAGCTATGGACGGTGAAATCAACTTGTTGGAAGAGAGGCTGACTCG
GGAGGATCAAGAGATTGGGTTCTGTCACAATGATCTTCAGTATGGTAACGTTATGATCGA
TGAGGAAACCAACGCTATTACCATCATAGACTATGAGTATTCGAGTTTCAACCCTGTTGC
TTATGACATTGCTAACCACTTCTGTGAAATGGCTGCTAATTACCATTCAGACACTCCTCA
TGTTCTGGATTACACTCTATATCCAGGAGAAGAAGAACGTAGAAGGTTCATTAGCACATA
CCTTGGCTCTACAGGGAATGCACCAAGCCAAGAAGAAAAGGATAGGTTAATGACTGATGC
AGAGAGATACACTTTGGCAAATCATATCTTTTGGGGCTTATGGGGAATCATCTCGGGGCA
TGTGAACACGATTGAGTTTGATTACAAGGAATATGCAAGGCAGAGATTTGAACAGTACTG
GCTTAGAAAACAAATGCTCCTAGATTGAGGATGAAGAAGATTCACATTGAAGAAAACTTG
A
TTTCTA

QA 3 663 3 663
DS 

RD RR2BM68JQ 643 0 0
GCCGACAGAGATCGGTGAGTTTCGTTTGGAAGCTATGGACGGTGAAATCAACTTGTTGGA
TGAGAGGCTGACTCGGGAGGATCAAGAGATTGGGTTCTGTCACAATGATCTTCAGTATGG
TAACGTTATGATCGATGAGGAAACCAACGCTATTACCATCATAGACTATGAGTATTCGAG
TTTCAACCCTGTTGCTTATGACATTGCTAACCACTTCTGTGAAATGGCTGCTAATTACCA
TTCAGACACTCCTCATGTTCTGGATTACACTCTATATCCAGGAGAAGAAGAACGGAGAAG
GTTCATTAGCACATACCTTGGCTCTACAGGGAATGCACCAAGCCAAGAAGAAAAGGATAG
GTTAATGACTGATGCAGAGAGATACACTTTGGCAAATCATATCTTTTGGGGCTTATGGGG
AATCATCTCGGGGCATGTGAACACGATTGAGTTTGATTACAAGGAATATGCA*GGCAGAG
ATTTGAACAGTACTGGCTTAGAAAACAAATGCTCCTAGATTGAGGATGAAGAAGATTCAC
ATTGAAGAAAACTTGAATTTCTAAAAGTTTCTGCAATTAGATAAAAGGAAAGGAGAATAT
TTAGGTGAATATTATGCTGTTGTTGTTACTTTCACCAGTTTGT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2EG08JQ 665 0 0
AACTTGTTGGAAGAGAGGCTGACTCGGGAGGATCAAGAGATTGGGTTCTGTCACAATGAT
CTTCAGTATGGTAACGTTATGATCGATGAGGAAACCAACGCTATTACCATCATAGACTAT
GAGTATTCGAGTTTCAACCCTGTTGCTTATGACATTGCTAACCACTTCTGTGAAATGGCT
GCTAATTACCATTCAGACACTCCTCATGTTTTGGATTACACTCTATATCCAGGAGAAGAA
GAACGTAGAAGGTTCATTAGCACATACCTTGGCTCTACAGGGAATGCACCAAGCCAAGAA
GAAAAGGATAGGTTAATGACTGATGCAGAGAGATACACTTTGGCAAATCATATCTTTTGG
GGCTTATGGGGAATCATCTCGGGGCATGTGAACACGATTGAGTTTGATTACAAGGAATAT
GCAAGGCAGAGATTTGAACAGTACTGGCTTAGAAAACAAATGCTCCTAGATTGAGGATGA
AGAAGATTCACATTGAAGAAAACTTGAATTTTTAAAAGTTTTTGCAATTAGATAAAAGGA
AAGGAGAATATTTAGGTGAATATTATGCTGTTGTTGTTACTTTCACCAGTTTGTATGTTT
TCCTCCATTGTATATAGAGGTTTGTAAACTTTCAAAGCAATGGACATGACTTTTGTTAAA
TAACG

QA 1 665 1 665
DS 



AS 2 7

CO CL1065Contig1 847 4 13 U
GGGTCCCAAAGGTCAACTGAGAAAAAGAGCATCGGTGAGAAGAGATTCGAGATTCGCTAA
TAATCTTTGGAGGGGTGACCTGAGATTCACGACACAAACACAATCATAATCATGTGGAGA
AGAATCGTCTCCTCTGGTCTCAAAACCCTAGCTTCCGATGTCGCCGCCGCTTCTCCTCGC
CGATCTATAGCCT**GCCGTGAGACCCATTGGCTTCCACCCATCCGCCAATCCCGCTTCT
TCTTCCCTTATCACTCGTCATTTCAGCTCCGAATCAGTTGAGACCGTTGTTGCGAAGAAG
AAGGTGGAGGATGTTATGCCCATCGCAACTGGTCAGGAAAAGGAGGAGCTTGAAGCTGAA
CTT*AGGGGAGGAGGCTGCTGGACATTGACTTCCCTGAAGGCCCTTTTGGAACCAAGGAA
TCTCCTGCTATCGTGAAGTCTTACTATGACAAGCGTATTGTGGGATGCCCTGGTGGTGAA
GGCGAGGATGAGCACGACGTTGTTTGGTTCTGGCTGGAGAAAGGAAAGTCTTTTGAATGC
CCGGTTTGCACTCAGTACTTTGAGCTGGAAGTGGTTGGTCCAGGTGGGCCTCCTGATGGT
CACGGTGATGAACACGATGAGCACCACCACTGATTCCGGCTTCTCTCTTGCGGCTGAGTT
TTACTTTTTGTTTTTAGTATTTTTTGACTGGAATAAAAA*CATATTGCTGCTGGTGAAAC
ACAGTTGAAATTGTTTTTGATCCCTTGGGAACAGCACTTCGTTATCGGAAATGCCAAAAC
TCTCACGACCGTTGTTTTACTTTTGTAAGAATTCTTGAATCAGAATCATTCTTGCCTTTT
GCATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2FF12TF U 6
AF RR2BT92TF U 1
AF RR2BK04TF U 92
AF RR2BK04JQ C 92
BS 1 192 RR2BT92TF
BS 193 195 RR2BK04TF
BS 196 335 RR2BT92TF
BS 336 336 RR2BK04TF
BS 337 363 RR2BT92TF
BS 364 364 RR2BK04TF
BS 365 503 RR2BT92TF
BS 504 504 RR2BK04TF
BS 505 718 RR2BT92TF
BS 719 719 RR2BK04TF
BS 720 750 RR2BT92TF
BS 751 778 RR2BK04TF
BS 779 847 RR2BK04JQ

RD RR2FF12TF 689 0 0
GG
AAAGGTCAACTGAGAAAAAGAGCATCGGTGAGAAGAGATTCGAGATTCGCTAATAATCTT
TGGAGGGGTGACCTGAGATTCACGACACAAACACAATCATAATCATGTGGAGAAGAATCG
TCTCTTCTGGTCTCAAAACCCTAGCTTCCGATGTCGCCGCCGCTTCTCCTCGCCGATCTA
TAGCCACCGCCGTGAGACCCATTGGCTTCCACCTATCCGCCAATCCCGCTTCTTCTTCCC
TTATCACTCGTCATTTCAGCTCCGAATCAGTTGAGACCGTTGTTGCGAAGAAGAAGGTGG
AGGATGTTATGCCCATCGCAACTGGTCATGAAAAGGAGGAGCTTGAAGCTGAACTTGAGG
GGAGGAGGCTGCTGGACATTGACTTCCCTGAAGGCCCTTTTGGAACCAAGGAATCTCCTG
CTATCGTGAAGTCTTACTATGACAAGCGTATTGTGGGATGCCCTGGTGGTGAAGGCGAGG
ATGAGCACGACGTTGTGTGGTTCTGGCTGGAGAAAGGAAAGTCTTTTGAATGCCCGGTTT
GCACTCAGTACTTTGAGCTGGAAGTGGTTGGTCCAGGTGGGCCTCCTGATGGTCACGGTG
ATGAACACGATGAGCACCACCACTGATTCCGGCTTCTCTCTTGCGGCTGAGTTTTACTTT
TTGTTTT*AGTATTTTTTGACTGGAAT

QA 3 689 3 689
DS 

RD RR2BT92TF 757 0 0
GGGTCCCAAAGGTCAACTGAGAAAAAGAGCATCGGTGAGAAGAGATTCGAGATTCGCTAA
TAATCTTTGGAGGGGTGACCTGAGATTCACGACACAAACACAATCATAATCATGTGGAGA
AGAATCGTCTCCTCTGGTCTCAAAACCCTAGCTTCCGATGTCGCCGCCGCTTCTCCTCGC
CGATCTATAGCCACCGCCGTGAGACCCATTGGCTTCCACCCATCCGCCAATCCCGCTTCT
TCTTCCCTTATCACTCGTCATTTCAGCTCCGAATCAGTTGAGACCGTTGTTGCGAAGAAG
AAGGTGGAGGATGTTATGCCCATCGCAACTGGTCATGAAAAGGAGGAGCTTGAAGCTGAA
CTTGAGGGGAGGAGGCTGCTGGACATTGACTTCCCTGAAGGCCCTTTTGGAACCAAGGAA
TCTCCTGCTATCGTGAAGTCTTACTATGACAAGCGTATTGTGGGATGCCCTGGTGGTGAA
GGCGAGGATGAGCACGACGTTGTGTGGTTCTGGCTGGAGAAAGGAAAGTCTTTTGAATGC
CCGGTTTGCACTCAGTACTTTGAGCTGGAAGTGGTTGGTCCAGGTGGGCCTCCTGATGGT
CACGGTGATGAACACGATGAGCACCACCACTGATTCCGGCTTCTCTCTTGCGGCTGAGTT
TTACTTTTTGTTTTTAGTATTTTTTGACTGGAATAAAAA*CATATTGCTGCTGGTGAA*C
ACAGTTGAAATTGTTTTTGATCCCTTGGGA
CAGCACT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2BK04TF 695 0 0
AG
ACAAACACAATCATAATCATGTGGAGAAGAATCGTCTCCTCTGGTCTCAAAACCCTAGCT
TCCGATGTCGCCGCCGCTTCTCCTCGCCGATCTATAGCCT**GCCGTGAGACCCATTGGC
TTCCACCCATCCGCCAATCCCGCTTCTTCTTCCCTTATCACTCGTCATTTCAGCTCCGAA
TCAGTTGAGACCGTTGTTGCGAAGAAGAAGGTGGAGGATGTTATGCCCATCGCAACTGGT
CAGGAAAAGGAGGAGCTTGAAGCTGAACTT*AGGGGAGGAGGCTGCTGGACATTGACTTC
CCTGAAGGCCCTTTTGGAACCAAGGAATCTCCTGCTATCGTGAAGTCTTACTATGACAAG
CGTATTGTGGGATGCCCTGGTGGTGAAGGCGAGGATGAGCACGACGTTGTTTGGTTCTGG
CTGGAGAAAGGAAAGTCTTTTGAATGCCCGGTTTGCACTCAGTACTTTGAGCTGGAAGTG
GTTGGTCCAGGTGGGCCTCCTGATGGTCACGGTGATGAACACGATGAGCACCACCACTGA
TTCCGGCTTCTCTCTTGCGGCTGAGTTTTACTTTTTGTTTTTAGTATTTTTTGACTGGAA
TAAAAA*CATATTGCTGCTGGTGAAACACAGTTGAAATTGTTTTTGATCCCTTGGGAACA
GCACTTCGTTATCGGAAATGCCAAA
CTCTCACG

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR2BK04JQ 756 0 0
AG
ACAAACACAATCATAATCATGTGGAGAAGAATCGTCTCCTCTGGTCTCAAAACCCTAGCT
TCCGATGTCGCCGCCGCTTCTCCTCGCCGATCTATAGCCT**GCCGTGAGACCCATTGGC
TTCCACCCATCCGCCAATCCCGCTTCTTCTTCCCTTATCACTCGTCATTTCAGCTCCGAA
TCAGTTGAGACCGTTGTTGCGAAGAAGAAGGTGGAGGATGTTATGCCCATCGCAACTGGT
CAGGAAAAGGAGGAGCTTGAAGCTGAACTT*AGGGGAGGAGGCTGCTGGACATTGACTTC
CCTGAAGGCCCTTTTGGAACCAAGGAATCTCCTGCTATCGTGAAGTCTTACTATGACAAG
CGTATTGTGGGATGCCCTGGTGGTGAAGGCGAGGATGAGCACGACGTTGTTTGGTTCTGG
CTGGAGAAAGGAAAGTCTTTTGAATGCCCGGTTTGCACTCAGTACTTTGAGCTGGAAGTG
GTTGGTCCAGGTGGGCCTCCTGATGGTCACGGTGATGAACACGATGAGCACCACCACTGA
TTCCGGCTTCTCTCTTGCGGCTGAGTTTTACTTTTTGTTTTTAGTATTTTTTGACTGGAA
TAAAAAACATATTGCTGCTGGTGAAACACAGTTGAAATTGTTTTTGATCCCTTGGGAACA
GCACTTCGTTATCGGAAATGCCAAAACTCTCACGACCGTTGTTTTACTTTTGTAAGAATT
CTTGAATCAGAATCATTCTTGCCTTTTGCATATT

QA 3 756 3 756
DS 



CO CL1065Contig2 759 3 8 U
GGACGACACAAAACAATCATAATCATGTGGAGAAGAATCGCCTCCTCTGGTCTCAAAACC
CAAGCTTCCGATGTCGCCGTCGCTTCTCCTCGCCGATCTATAGCCACCACCGTGAGGCCC
CTTGGCTTCTACCGATCAGCCAATCCCGCTTCTTCTTCCCTTATCCCTCGCCATTTCAGC
TCCGAATCAGTTGATACAATAGC***GAAGAAGAAGGTGGAGGATGTTATGCCCATCGCA
ACAGGTCATGAAAAGGAGGAGCTTGAAGCTGAACTTGAGGGGAGGAGGCTGCTCGACATT
GACTTCCCTGAAGGTCCTTTTGGAACTAAGGAATCTCCGGCTATCGTGAAGTCTTACTAT
GACAAGCGTATTGTGGGATGCCCTGGTGGTGAAGGCGAGGATGAGCACGACGTTGTGTGG
TTCTGGCTGGAGAAAGGAAAGTCTTTTGAATGCCCGGTTTGCACTCAATACTTTGAGCTG
GAAGTGGTTGGTCCAGGTGGGCCTCCTGATGGTCACGGTGATGAAGACGATGAGCACCAC
CACTGATTCCGGCTTCTCCCTTGCGGC*GAGTTTTACTTTT*GTTTTTAGTATTTTTTGA
CTGGAATAAAAAACATATTGCTGCTGGTGAAACACAGTTGAAATTGTTTTTGATCCCTTG
GGAACAGCACTTCGTTATCGGAAATGCCAAAACTCTCACGACCGTTGTTTTACTTTTGTA
AGAATTCTTGAATCAGAATCATTCTTGCCTTTTGCATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 10 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 10 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2E038TF U 1
AF RR2E038JQ C 82
AF RR2E394TF U 104
BS 1 691 RR2E038TF
BS 692 692 RR2E394TF
BS 693 710 RR2E038TF
BS 711 711 RR2E394TF
BS 712 722 RR2E038TF
BS 723 723 RR2E394TF
BS 724 740 RR2E038TF
BS 741 759 RR2E394TF

RD RR2E038TF 740 0 0
GGACGACACAAAACAATCATAATCATGTGGAGAAGAATCGCCTCCTCTGGTCTCAAAACC
CAAGCTTCCGATGTCGCCGTCGCTTCTCCTCGCCGATCTATAGCCACCACCGTGAGGCCC
CTTGGCTTCTACCGATCAGCCAATCCCGCTTCTTCTTCCCTTATCCCTCGCCATTTCAGC
TCCGAATCAGTTGATACAATAGC***GAAGAAGAAGGTGGAGGATGTTATGCCCATCGCA
ACAGGTCATGAAAAGGAGGAGCTTGAAGCTGAACTTGAGGGGAGGAGGCTGCTCGACATT
GACTTCCCTGAAGGTCCTTTTGGAACTAAGGAATCTCCGGCTATCGTGAAGTCTTACTAT
GACAAGCGTATTGTGGGATGCCCTGGTGGTGAAGGCGAGGATGAGCACGACGTTGTGTGG
TTCTGGCTGGAGAAAGGAAAGTCTTTTGAATGCCCGGTTTGCACTCAATACTTTGAGCTG
GAAGTGGTTGGTCCAGGTGGGCCTCCTGATGGTCACGGTGATGAAGACGATGAGCACCAC
CACTGATTCCGGCTTCTCCCTTGCGGC*GAGTTTTACTTTT*GTTTTTAGTATTTTTTGA
CTGGAATAAAAAACATATTGCTGCTGGTGAAACACAGTTGAAATTGTTTTTGATCCCTTG
GGAACAGCACTTCGTTATCGGAAATGCCAAA*CTCTCACGACCGTTGTTT*ACTTTTGTA
AG*ATTCTTGAATCAGAATC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2E038JQ 674 0 0
GCTTCTCCTCGCCGATCTATAGCCACCACCGTGAGGCCCCTTGGCTTCTACCGATCAGCC
AATCCCGCTTCTTCTTCCCTTATCCCTCGCCATTTCAGCTCCGAATCAGTTGATACAATA
GC***GAAGAAGAAGGTGGAGGATGTTATGCCCATCGCAACAGGTCATGAAAAGGAGGAG
CTTGAAGCTGAACTTGAGGGGAGGAGGCTGCTCGACATTGACTTCCCTGAAGGTCCTTTT
GGAACTAAGGAATCTCCGGCTATCGTGAAGTCTTACTATGACAAGCGTATTGTGGGATGC
CCTGGTGGTGAAGGCGAGGATGAGCACGACGTTGTGTGGTTCTGGCTGGAGAAAGGAAAG
TCTTTTGAATGCCCGGTTTGCACTCAATACTTTGAGCTGGAAGTGGTTGGTCCAGGTGGG
CCTCCTGATGGTCACGGTGATGAAGACGATGAGCACCACCACTGATTCCGGCTTCTCCCT
TGCGGC*GAGTTTTACTTTT*GTTTTTAGTATTTTTTGACTGGAATAAAAAACATATTGC
TGCTGGTGAAACACAGTTGAAATTGTTTTTGATCCCTTGGGAACAGCACTTCGTTATCGG
AAATGCCAAAACTCTCACGACCGTTGTTTTACTTTTGTAAGGATTCTTGAATCAGAATCA
TTCTTGCCTTTTGC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2E394TF 656 0 0
GCACCACCGC
GAGACCCGTTGGCTTCTACCGATCAGCCAATCCCGCTTCTTCTTCCCTTATCCCTCGCCA
TTTCAGCTCCGTATCAGTTGAGACCGTTGTTGGGAAGAAGAAGGTGGAGGATGTTATGCC
CATCGCAACTGGTCATGAAAAGGAGGAACTTGAAGCTGAACTTGAGGGGAAGAGGCTGCT
CGACATTGACTTCCCTGAAGGTCCTTTTGGAACTAAGGAATCTCCTGCTATCGTGAAGTC
TTACTATGACAAGCGTATTGTGGGATGCCCTGGTGGTGAAGGCGAGGATGAGCACGACGT
TATGTGGTTCTGGCTGGAGAAAGGAAAGTCTTTTGAATGCCCAGTTTGCACTCAGTACTT
TGAGCTGGAAGTGGTTGGTCCAGGTGGGCCTCCTGATGGTCACGGTGATGAAGACGATGA
GCACCACCACTGATTCCGGCTTCTCCCTTGCGGCTGAGTTTTACTTTTTGTTTTTAGTAT
TTTTTGACTGGAATAAAAAACATATTGCTGCTGGTGAAACACAGTTGAAATTGTTTTTGA
TCCCTTGGGAACAGCACTTCGTTATCGGAAATGCCAAAACTCTCACGACCGTTGTTTTAC
TTTTGTAAGAATTCTTGAATCAGAATCATTCTTGCCTTTTGCATAT

QA 11 656 11 656
DS 



AS 2 5

CO CL1066Contig1 874 2 2 U
GGGCGTTGGTGTTCCCTTAGCTCAGAATCAGATCCGCTTGCTTCGTCGAGGTGACGCAGA
GAAAGCTCTCCTTCATTGTTATTCAGCTTCCGTTTTTCAAAAGAATCACAATGGACGGTG
GTGACATGGCGACGCCTGTACAAAAGAAGGCACACGAGGCATGGAGGGTTTACAAGTACT
ACCTCGACAAGACTACACCTCACTCAACCTACAGGTGGATTGGCACGCTCGTTGTCTTTC
TCATCTCCTACGGTCTCGGCATCTACCTCCTCAACCTCCTCATCGGCTTCTTGTCCCCTC
TCGTTGATCCTGAGCTCTACGCGTCCTCTGATGGTGGTGGTGCTTCTCTCCCTACTCGTG
GCTCTGATGAGTTCAAGCCTTTTATCCGCCGACTCCCTGAGTTTAAGTTCTGGTACTCCA
TGACTAAGGCATTCTGCATTGCCTTTCTCATGACGTTCTTCTCGGTTTTTGATGTTCCCG
TCTTCTGGCCTATACTGCTTTGCTACTGGATTGTTCTCTTTGTCCTCACCATGAGACGCC
AAATCTCCCACATGATCAAGCACAAGTACATTCCTTTCAGCATCGGTAAACAGAAATATA
GCGGTAGGAGATCTGCTGCTAGCAGTGGCGGCTCTCGTGCTGATTGATTGATCCAGAAGA
ACGAAAAAGGGGGATGGGGGTTCAAACCATTTTGGAGTGTTTTTGTAGTGTGATGAATTG
AATCAGACTCCTATCAGCTTTACCTATTGGCAACAAGGGTGTGATTAGTTTAATCTGTCA
TATGTTGCAAGAAAAATGTTCTTTTGTTAGTTCCCCTTTAATCCTAAGTACTTCTGTAAA
TATGATTTACGTTTATTTCGAAACACATTCATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI79TF U 1
AF RR2BI79JQ C 53
BS 1 791 RR2BI79TF
BS 792 874 RR2BI79JQ

RD RR2BI79TF 791 0 0
GGGCGTTGGTGTTCCCTTAGCTCAGAATCAGATCCGCTTGCTTCGTCGAGGTGACGCAGA
GAAAGCTCTCCTTCATTGTTATTCAGCTTCCGTTTTTCAAAAGAATCACAATGGACGGTG
GTGACATGGCGACGCCTGTACAAAAGAAGGCACACGAGGCATGGAGGGTTTACAAGTACT
ACCTCGACAAGACTACACCTCACTCAACCTACAGGTGGATTGGCACGCTCGTTGTCTTTC
TCATCTCCTACGGTCTCGGCATCTACCTCCTCAACCTCCTCATCGGCTTCTTGTCCCCTC
TCGTTGATCCTGAGCTCTACGCGTCCTCTGATGGTGGTGGTGCTTCTCTCCCTACTCGTG
GCTCTGATGAGTTCAAGCCTTTTATCCGCCGACTCCCTGAGTTTAAGTTCTGGTACTCCA
TGACTAAGGCATTCTGCATTGCCTTTCTCATGACGTTCTTCTCGGTTTTTGATGTTCCCG
TCTTCTGGCCTATACTGCTTTGCTACTGGATTGTTCTCTTTGTCCTCACCATGAGACGCC
AAATCTCCCACATGATCAAGCACAAGTACATTCCTTTCAGCATCGGTAAACAGAAATATA
GCGGTAGGAGATCTGCTGCTAGCAGTGGCGGCTCTCGTGCTGATTGATTGATCCAGAAGA
ACGAAAAAGGGGGATGGGGGTTCAAACCATTTTGGAGTGTTTTTGTAGTGTGATGAATTG
AATCAGACTCCTATCAGCTTTACCTATTGGCAACAAGGGTGTGATTAGTTTAATCTGTCA
TATGTTGCAAG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2BI79JQ 822 0 0
GACGCAGAGAAAGCTCTCCTTCATTGTTATTCAGCTTCCGTTTTTCAAAAGAATCACAAT
GGACGGTGGTGACATGGCGACGCCTGTACAAAAGAAGGCACACGAGGCATGGAGGGTTTA
CAAGTACTACCTCGACAAGACTACACCTCACTCAACCTACAGGTGGATTGGCACGCTCGT
TGTCTTTCTCATCTCCTACGGTCTCGGCATCTACCTCCTCAACCTCCTCATCGGCTTCTT
GTCCCCTCTCGTTGATCCTGAGCTCTACGCGTCCTCTGATGGTGGTGGTGCTTCTCTCCC
TACTCGTGGCTCTGATGAGTTCAAGCCTTTTATCCGCCGACTCCCTGAGTTTAAGTTCTG
GTACTCCATGACTAAGGCATTCTGCATTGCCTTTCTCATGACGTTCTTCTCGGTTTTTGA
TGTTCCCGTCTTCTGGCCTATACTGCTTTGCTACTGGATTGTTCTCTTTGTCCTCACCAT
GAGACGCCAAATCTCCCACATGATCAAGCACAAGTACATTCCTTTCAGCATCGGTAAACA
GAAATATAGCGGTAGGAGATCTGCTGCTAGCAGTGGCGGCTCTCGTGCTGATTGATTGAT
CCAGAAGAACGAAAAAGGGGGATGGGGGTTCAAACCATTTTGGAGTGTTTTTGTAGTGTG
ATGAATTGAATCAGACTCCTATCAGCTTTACCTATTGGCAACAAGGGTGTGATTAGTTTA
ATCTGTCATATGTTGCAAGAAAAATGTTCTTTTGTTAGTTCCCCTTTAATCCTAAGTACT
TCTGTAAATATGATTTACGTTTATTTCGAAACACATTCATTC

QA 1 822 1 822
DS 



CO CL1066Contig2 1022 3 2 U
AGGGGCTACGAGCAAAACTAAAAATAAAAGAAAAGAAAAAGGAATTCGTGTGAGAGATAT
TCTTCTTCGCATTGGTGTGTCCCTTAGCTCAGAATCAGATCCGCTTACTTCGTCGAGGTG
ACGCAGAGAAAGCTCTCCTTCATTGTTATTCAGCTTCCGTTTTTTTTCAAAAGAATCACA
ATGGACGGAGGAAGCGTTGGTGGTGACATGGCCACGCCTGTACAAAAGAAGGCACACGAG
GCATGGAGGGTTTACAAATACTACCTCGACAAGACCACACCTCACTCAACCTACAGGTGG
ATTGGAACGCTCGTCGTCTTTCTCATCTACTGCTTGAGGGTTTTCTCCATCCACGGTTTC
TACATCATCTCCTACGGTCTCGGCATCTACCTCCTCAACCTCCTCATCGGCTTCTTGTCC
CCTCTCGTTGATCCTGAGCTCGACGCTGCCTCTGATGGTGGTGGTGCCTCTCTCCCTACT
CGTGGCTCTGATGAGTTCAAGCCTTTTATCCGCCGACTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTAC
TCCATGACAAAGGCATTCTGCATTGCCTTTCTCATGACGTTCTTCTCCGTCTTTGATGTT
CCCGTCTTCTGGCCTATACTGCTTTACTACTGGATTGTTCTCTTTGTCCTCACCATGAGA
CGCCAAATCTCCCACATGATCAAGCACAAGTACATTCCTTTCAGCATCGGTAAACAGAAA
TATAGCGGTCGGAGATCTGCTGCTAGCAGTGGCGGCTCTCGTGCTGATTGATTGATCCAG
AAGAACGAAAACAAAAGGGAGATGGGGTTCAAGCCAATTTGGAGTGTTTTTGTAGTGTGA
TGAATTGAATCAAATTCCCTATCAGCTACCTATTGGCAACAAGGGTGTGATTAGTTTAAT
CTGTTATATGTTGCAAGAAAAATGTTCTTTGTTAGTTTCCGTTTAATCCTAAGTACTTCT
GTAAATATTGATTTACTTTTATTTCGAAACACATTCATTCCTTTGTTTATCTTCTCAAAA
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2E158TF U 72
AF RR2GD68TF U 1
AF RR2GD68JQ C 222
BS 1 709 RR2GD68TF
BS 710 1022 RR2GD68JQ

RD RR2E158TF 193 0 0
GGGGTGTG
TCCCTTAGCTCAGAATCAGATCCGCTTACTTCGTCGAGGTGACGCATAGAAAGCTCTCCT
TCATTGTTATTCAGCTTCCGTTTTTTTTCAAAAGAATCACAATGGGCGGAGGAAGCGTTG
GTGGTGACATGGCCACGCCTGTACAAGAGAAGGCACACGAGGCATGGAGGGTTTACAAAT
ACTAC

QA 9 193 9 193
DS 

RD RR2GD68TF 712 0 0
AGGGGCTACGAGCAAAACTAAAAATAAAAGAAAAGAAAAAGGAATTCGTGTGAGAGATAT
TCTTCTTCGCATTGGTGTGTCCCTTAGCTCAGAATCAGATCCGCTTACTTCGTCGAGGTG
ACGCAGAGAAAGCTCTCCTTCATTGTTATTCAGCTTCCGTTTTTTTTCAAAAGAATCACA
ATGGACGGAGGAAGCGTTGGTGGTGACATGGCCACGCCTGTACAAAAGAAGGCACACGAG
GCATGGAGGGTTTACAAATACTACCTCGACAAGACCACACCTCACTCAACCTACAGGTGG
ATTGGAACGCTCGTCGTCTTTCTCATCTACTGCTTGAGGGTTTTCTCCATCCACGGTTTC
TACATCATCTCCTACGGTCTCGGCATCTACCTCCTCAACCTCCTCATCGGCTTCTTGTCC
CCTCTCGTTGATCCTGAGCTCGACGCTGCCTCTGATGGTGGTGGTGCCTCTCTCCCTACT
CGTGGCTCTGATGAGTTCAAGCCTTTTATCCGCCGACTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTAC
TCCATGACAAAGGCATTCTGCATTGCCTTTCTCATGACGTTCTTCTCCGTCTTTGATGTT
CCCGTCTTCTGGCCTATACTGCTTTACTACTGGATTGTTCTCTTTGTCCTCACCATGAGA
CGCCAAATCTCCCACATGATCAAGCACAAGTACATTCCTTTCAGCATCG
TAA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2GD68JQ 801 0 0
ACAAAAGAAGGCACACGAGGCATGGAGGGTTTACAAATACTACCTCGACAAGACCACAC*
TCACTCAACCTACAGGTGGATTGGAACGCTCGTCGTCTTTCTCATCTACTGCTTGAGGGT
TTTCTCCATCCACGGTTTCTACATCATCTCCTACGGTCTCGGCATCTACCTCCTCAACCT
CCTCATCGGCTTCTTGTCCCCTCTCGTTGATCCTGAGCTCGACGCTGCCTCTGATGGTGG
TGGTGCCTCTCTCCCTACTCGTGGCTCTGATGAGTTCAAGCCTTTTATCCGCCGACTCCC
TGAGTTCAAGTTCTGGTACTCCATGACAAAGGCATTCTGCATTGCCTTTCTCATGACGTT
CTTCTCCGTCTTTGATGTTCCCGTCTTCTGGCCTATACTGCTTTACTACTGGATTGTTCT
CTTTGTCCTCACCATGAGACGCCAAATCTCCCACATGATCAAGCACAAGTACATTCCTTT
CAGCATCGGTAAACAGAAATATAGCGGTCGGAGATCTGCTGCTAGCAGTGGCGGCTCTCG
TGCTGATTGATTGATCCAGAAGAACGAAAACAAAAGGGAGATGGGGTTCAAGCCAATTTG
GAGTGTTTTTGTAGTGTGATGAATTGAATCAAATTCCCTATCAGCTACCTATTGGCAACA
AGGGTGTGATTAGTTTAATCTGTTATATGTTGCAAGAAAAATGTTCTTTGTTAGTTTCCG
TTTAATCCTAAGTACTTCTGTAAATATTGATTTACTTTTATTTCGAAACACATTCATTCC
TTTGTTTATCTTCTCAAAAAG

QA 1 801 1 801
DS 



AS 3 6

CO CL1067Contig1 805 2 9 U
GGGCAAACAGAAAAATCGTGTCTGCCTTTCTCTCATTTAAACAATAGTCTTTTTTCAGTT
TTGTTTTATTTTGTTTTGGGGCGTGTTTCACCTTAACCATCGTCAGCTTCAACCGCCGGA
GCCGCCGTAAGAAAGGCTCTTCATCGGCCATAACATATTTTAGTGGTCTATAAAGCTGTC
GCCTTTCTTGCCTTTTCATACGGACTAGGAAATGGTTAAAAGGCATGGAGAGTTTTGATT
TACTAGAGAGGGGATCATGTCGCAGTGCGTAGACGGTTTTAGGCATGTATGCAACTCTTT
GTTGCGGTGTTTTGATATTGATATAGGCAAATCTTCTGGAGGCCCTGGAGACCCTGAACT
ACTTGCCAGAGACACTGTTTTTGACGTGAGTGAAATAGAAGCTCTCTATGAGCTGTTTAA
AAAAATCAGCAGTGCGGTGATTGATGATGGGCTAATAAACAAGGAAGAGTTTCAACTGGC
CCTATTTAAGACAAATAAAAAAGAAAGCTTGTTTGCAGACCGGGTGTTCGATTTGTTCGA
CACAAAGCATAATGGAATACTGGGGTTTGAGGAGTTTGCTCGTGCTCTCTCCGTTTTTCA
TCCAGATGCTCCTATTGATAACAAGATTGACTTTTCGTTTCAGCTGTATGATCTTAAGCA
GCAAGGTTTCATCGAGAGGCAGGAGGTGAAGCAAATGGTGGTGGCTACACTTGCTGAGTC
AGGCATGAACCTGTCAGACGAAGTCATAGAGAGTATAATCGACAAGACATTTGAGGAAGC
TGATACAAACATGATGGGAGGATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B175TF U 71
AF RR2AJ38TF U 1
BS 1 131 RR2AJ38TF
BS 132 132 RR2B175TF
BS 133 161 RR2AJ38TF
BS 162 162 RR2B175TF
BS 163 250 RR2AJ38TF
BS 251 253 RR2B175TF
BS 254 492 RR2AJ38TF
BS 493 493 RR2B175TF
BS 494 805 RR2AJ38TF

RD RR2B175TF 619 0 0
GG
GTTTTGGGGCGTGTTTCACCTTAACCATCGTCAGCTTCAACCGCCGGAGCTGCCGTAAGA
AAGGCTCTTCATCGGCCATAACATATTTTAGTGGTCTATAAAGC*GTCGCCTTTCTTGCC
TTTTCATACGGATTAGGAAATGGTTAAAAGGCATGGAGAGTTTTGATTTACTAGAGAGGG
GATCATGTCGCAGTGCGTAGACGGTTTTAGGCATGTATGCAACTCTTTGTTGCGGTGTTT
TGATATTGATATAGGCAAATCTTCTGGAGGCCCTGGAGACCCTGAACTCCTTGCCAGAGA
CACTGTTTTTGGCGTGAGTGAAATAGAGGCTCTCTATGAGCTGTTTAAAAAAATCAGCAG
TGCTGTGATTGATGATGGGCTAATAAACAAGGAAGAGTTTCAACTGGCCTTATTTAAGAC
AAATAAGAAAGAGAGCTTGTTTGCAGACCGGGTGTTCGATTTGTTCGACACAAAGCATAA
TGGAATACTGGGGTTTGAGGAGTTTGCTCGTGCTCTCTCCGTTTTTCATCCAGATGCTCC
TATTGATAACAAGATTGACTTTTCGTTTCAGCTGTATGATCTTAAGCAGCAAGGTTTCAT
CGAGAGGCAGGAGGTGA

QA 3 619 3 619
DS 

RD RR2AJ38TF 805 0 0
GGGCAAACAGAAAAATCGTGTCTGCCTTTCTCTCATTTAAACAATAGTCTTTTTTCAGTT
TTGTTTTATTTTGTTTTGGGGCGTGTTTCACCTTAACCATCGTCAGCTTCAACCGCCGGA
GCCGCCGTAAGGAAGGCTCTTCATCGGCCATAACATATTTTTGTGGTCTATAAAGCTGTC
GCCTTTCTTGCCTTTTCATACGGACTAGGAAATGGTTAAAAGGCATGGAGAGTTTTGATT
TACTAGAGAG***ATCATGTCGCAGTGCGTAGACGGTTTTAGGCATGTATGCAACTCTTT
GTTGCGGTGTTTTGATATTGATATAGGCAAATCTTCTGGAGGCCCTGGAGACCCTGAACT
ACTTGCCAGAGACACTGTTTTTGACGTGAGTGAAATAGAAGCTCTCTATGAGCTGTTTAA
AAAAATCAGCAGTGCGGTGATTGATGATGGGCTAATAAACAAGGAAGAGTTTCAACTGGC
CCTATTTAAGACGAATAAAAAAGAAAGCTTGTTTGCAGACCGGGTGTTCGATTTGTTCGA
CACAAAGCATAATGGAATACTGGGGTTTGAGGAGTTTGCTCGTGCTCTCTCCGTTTTTCA
TCCAGATGCTCCTATTGATAACAAGATTGACTTTTCGTTTCAGCTGTATGATCTTAAGCA
GCAAGGTTTCATCGAGAGGCAGGAGGTGAAGCAAATGGTGGTGGCTACACTTGCTGAGTC
AGGCATGAACCTGTCAGACGAAGTCATAGAGAGTATAATCGACAAGACATTTGAGGAAGC
TGATACAAACATGATGGGAGGATCG

QA 1 805 1 805
DS 



CO CL1067Contig2 789 2 5 U
GTTAACTCTAAAAAGACTACCAGTAAATTCATATAGAGAATATAAACAAAGCCAGCAGGA
TACAGAAAAAAAAAGAATACAACTTGAAAGTTTTCTCTTTCTGTTTTTCAGAGAAGAAAC
AACAAACTCTTGGAACTGGATTTCAGACTGAAACAAAATAAACATGATACACTCAGAAAC
ACACAAACACACAACTGCCAAAGTTGTCTGATGCTCTAGTAAATGCTTTTTTTCTCAGGT
ATCTTCCACCTGTGAATGAAACACAAAGCTCGGAAACGTAGTCGTGATATCCTTGAGATA
CTGAAGAGTCATGTTTTTCAGAAGGGAAGGATGCCTAAGAACAAGGATCCTCCACTCATC
CCTATCGATCCTCCCGCCATGTTTTGTATCAGCTTCCTCAAATGTCTTGTCGATTATACT
CTCTATGACTTCGTCTGATAGGTTCATGCCTGACTCAGCAAGAGTAGCCACCACCATTTG
CTTCACCTCCTGCCTCTCGATGAAACCTTGCTGCTTAAGATCATACAGCTGAAACGAAAA
GTCAATCTTGTTATCAATAGGAGCATCTGGATGAAAAACGGAGAGAGCACGAGCAAACTC
CTCAAACCCCAGTATTCCATTATGCTTTGTGTCGAACAAATCGAACACCCGGTCTGCAAA
CAAGCTCTCTTTCTTATTTGTCTTAAATAAGGCCAGTTGAAACTCTTCCTTGTTTATTAG
CCCATCATCAATCACAGCACAGCTGATTTTTTTAAACAGCTCATAGAGAGCCTCTATTTC
ACTCACGCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2B175JQ U 1
AF RR2AZ93JQ U 5
BS 1 376 RR2B175JQ
BS 377 377 RR2AZ93JQ
BS 378 740 RR2B175JQ
BS 741 741 RR2AZ93JQ
BS 742 789 RR2B175JQ

RD RR2B175JQ 789 0 0
GTTAACTCTAAAAAGACTACCAGTAAATTCATATAGAGAATATAAACAAAGCCAGCAGGA
TACAGAAAAAAAAAGAATACAACTTGAAAGTTTTCTCTTTCTGTTTTTCAGAGAAGAAAC
AACAAACTCTTGGAACTGGATTTCAGACTGAAACAAAATAAACATGATACACTCAGAAAC
ACACAAACACACAACTGCCAAAGTTGTCTGATGCTCTAGTAAATGCTTTTTTTCTCAGGT
ATCTTCCACCTGTGAATGAAACACAAAGCTCGGAAACGTAGTCGTGATATCCTTGAGATA
CTGAAGAGTCATGTTTTTCAGAAGGGAAGGATGCCTAAGAACAAGGATCCTCCACTCATC
CCTATCGATCCTCCCGTCATGTTTTGTATCAGCTTCCTCAAATGTCTTGTCGATTATACT
CTCTATGACTTCGTCTGATAGGTTCATGCCTGACTCAGCAAGAGTAGCCACCACCATTTG
CTTCACCTCCTGCCTCTCGATGAAACCTTGCTGCTTAAGATCATACAGCTGAAACGAAAA
GTCAATCTTGTTATCAATAGGAGCATCTGGATGAAAAACGGAGAGAGCACGAGCAAACTC
CTCAAACCCCAGTATTCCATTATGCTTTGTGTCGAACAAATCGAACACCCGGTCTGCAAA
CAAGCTCTCTTTCTTATTTGTCTTAAATAAGGCCAGTTGAAACTCTTCCTTGTTTATTAG
CCCATCATCAATCACAGCACTGCTGATTTTTTTAAACAGCTCATAGAGAGCCTCTATTTC
ACTCACGCC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2AZ93JQ 785 0 0
ACTCTAAAAAGACTACCAGTAAATTCATATAGAGAATATAAACAAAGCCAGCAGGATACA
GAAAAAAAAAGAATACAACTTGAAAGTTTTCTCTTTCTGTTTTTCAGAGAAGAAACAACA
AACTCTTGGAACTGGATTTCAGACTGAAACAAAATAAACATGATACACTCAGAAACACAC
AAACACACAACTGCCAAAGTTGTCTGATGCTCTAGTAAATGCTTTTTTTCTCAGGTATCT
TCCACCTGTGAATGAAACACAAAGCTCGGAAACGTAGTCGTGATATCCTTGGGATACTGA
AGAGTCATGTTTTTCAGAAGGGAAGGATGCCTAAGAACAAGGATCCTCCACTCATCCCTA
TCGATCCTCCCGCCATGTTTTGTATCAGCTTCCTCAAATGTCTTGTCGATTATACTCTCT
ATGACTTCGTCTGATAGGTTCATGCCTGACTCAGCAAGAGTAGCCACCACCATTTGCTTC
ACCTCCTGCCTCTCGATGAAGCCTTGCTGCTTAAGATCATACAGCTGAAACGAAAAGTCA
ATCTTGTTATCAATAGGAGCATCTGGATGAAAAACGGAGAGAGCACGAGCAAACTCCTCA
AACCCCAGTATTCCATTATGCTTTGTGTCGAACAAATCGAACACCCGGTCTGCAAACAAG
CTCTCTTTCTTATTTGTCTTAAATAAGGCCAGTTGAAACTCTTCCTTGTTTATTAGCCCA
TCATCAATCACAGCACAGCTGATTTTTTTAAACAGCTCATAGAGAGCCTCTATTTCACTC
ACGCC

QA 1 785 1 785
DS 



CO CL1067Contig3 1132 2 2 U
GGGAAACAGAAAAATCGTGTCTGCCTTTCTCTCATTTAAACAATAGTCTTTTTTTTCAGT
TTTGTTTTGTTTTGTTTTGGGGCGTGTTTCACCTTAACCATCGTCAGCTTCAACCGCCGG
AGCCGCCGTAAGGAAGGCTCTTCATCGGCCATAACATATTTTTGTGGTCTATATTATAAA
GCGTCGCCTTTCTTGCCTTTTCATACGGACTAGTAGGAAATGGTTAAAAGGCATGGAGAG
TTTTGATTTACTAGACAGGAAATATCATGTCGCAGTGCGTAGACGGTTTTAGGCATGTAT
GCAACTCTTTGTTGCGGTGTTTTGATATTGATATAGGCAAATCTTCTGGAGGCCCTGGAG
ACCCTGAACTACTTGCCAGAGACACTGTTTTTGGCGTGAGTGAAATAGAAGCTCTCTATG
AGCTGTTTAAAAAAATCAGCAGTGCTGTGATTGATGATGGGCTAATAAACAAGGAAGAGT
TTCAGCTGGCCTTATTCAAGACAAATAAAAAAGAGAGCTTATTTGCAGACCGGGTGTTCG
ATTTGTTCGACACAAAGCATAATGGAATACTGGGGTTTGAGGAGTTTGCTCGTGCTCTCT
CCGTTTTTCATCCAGATGCTCCTATTGATAACAAGATTGACTTTTCGTTTCAGCTGTATG
ATCTTAAGCAGCAAGGTTTCATCGAGAGGCAGGAGGTGAAGCAAATGGTGGTGGCTACTC
TTGCTGAGTCAGGCATGAACCTATCAGACGAAGTCATAGAGAGTATAATCGACAAGACAT
TTGAGGAAGCTGATACAAAACATGACGGGAGGATCGATAGGGAAGAGTGGAGGATCCTTG
TTTTTAGGCATCCTTCCCTTTTGAAAAACATGACTCTTCAGTATCTCAAGGATATCACGA
CTACGTTTCCGAGCTTTGTGTTTCATTCACAGGTGGAAGATACCTGAGAAAAGCATTTTC
TAGAGTCAGACAACTTTGGCAGTTGTGTTTTGTGTGTTTCTGAGTGTATCCTGTTTATTT
TGTTTCAGTCTGAAATCCAGTTCCAAGAGTTTGTTGTTTCTTTTCTGAAAAACAGAAAGA
GAAAACTTTCTAGTTGTATTCTCTTTTTTTTTTCTGTATCCTGCTGGTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS70TF U 1
AF RR2BS70JQ C 402
BS 1 645 RR2BS70TF
BS 646 1132 RR2BS70JQ

RD RR2BS70TF 645 0 0
GGGAAACAGAAAAATCGTGTCTGCCTTTCTCTCATTTAAACAATAGTCTTTTTTTTCAGT
TTTGTTTTGTTTTGTTTTGGGGCGTGTTTCACCTTAACCATCGTCAGCTTCAACCGCCGG
AGCCGCCGTAAGGAAGGCTCTTCATCGGCCATAACATATTTTTGTGGTCTATATTATAAA
GCGTCGCCTTTCTTGCCTTTTCATACGGACTAGTAGGAAATGGTTAAAAGGCATGGAGAG
TTTTGATTTACTAGACAGGAAATATCATGTCGCAGTGCGTAGACGGTTTTAGGCATGTAT
GCAACTCTTTGTTGCGGTGTTTTGATATTGATATAGGCAAATCTTCTGGAGGCCCTGGAG
ACCCTGAACTACTTGCCAGAGACACTGTTTTTGGCGTGAGTGAAATAGAAGCTCTCTATG
AGCTGTTTAAAAAAATCAGCAGTGCTGTGATTGATGATGGGCTAATAAACAAGGAAGAGT
TTCAGCTGGCCTTATTCAAGACAAATAAAAAAGAGAGCTTATTTGCAGACCGGGTGTTCG
ATTTGTTCGACACAAAGCATAATGGAATACTGGGGTTTGAGGAGTTTGCTCGTGCTCTCT
CCGTTTTTCATCCAGATGCTCCTATTGATAACAAGATTGACTTTT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2BS70JQ 731 0 0
GAAATAGAAGCTCTCTATGAGCTGTTTAAAAAAATCAGCAGTGCTGTGATTGATGATGGG
CTAATAAACAAGGAAGAGTTTCAGCTGGCCTTATTCAAGACAAATAAAAAAGAGAGCTTA
TTTGCAGACCGGGTGTTCGATTTGTTCGACACAAAGCATAATGGAATACTGGGGTTTGAG
GAGTTTGCTCGTGCTCTCTCCGTTTTTCATCCAGATGCTCCTATTGATAACAAGATTGAC
TTTTCGTTTCAGCTGTATGATCTTAAGCAGCAAGGTTTCATCGAGAGGCAGGAGGTGAAG
CAAATGGTGGTGGCTACTCTTGCTGAGTCAGGCATGAACCTATCAGACGAAGTCATAGAG
AGTATAATCGACAAGACATTTGAGGAAGCTGATACAAAACATGACGGGAGGATCGATAGG
GAAGAGTGGAGGATCCTTGTTTTTAGGCATCCTTCCCTTTTGAAAAACATGACTCTTCAG
TATCTCAAGGATATCACGACTACGTTTCCGAGCTTTGTGTTTCATTCACAGGTGGAAGAT
ACCTGAGAAAAGCATTTTCTAGAGTCAGACAACTTTGGCAGTTGTGTTTTGTGTGTTTCT
GAGTGTATCCTGTTTATTTTGTTTCAGTCTGAAATCCAGTTCCAAGAGTTTGTTGTTTCT
TTTCTGAAAAACAGAAAGAGAAAACTTTCTAGTTGTATTCTCTTTTTTTTTTCTGTATCC
TGCTGGTTTTG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 2 6

CO CL1068Contig1 1238 2 6 U
GGATCTTAGCTCTTTTAACTAACCCCCCGCTTCTTTGGACTTCTCTAGCTAGCTCGCTGC
CTTGTTCTTCCAATGGAGTCTTCTGCAGCTCTCGGATCTCTCCCTCAGACTTTTGGTTCC
CCCATAAATGTTCACTCGCTTTCTGGTAACTGGTCTGCCTCTGGTAATTCTTGTGCGCCA
CGGTGGAGTTTGTTCAACAGGAACACCAAGTACACGTTTGTTTTACGTGCAGAGTCCTCT
AAATCTTCCACAACAACAACCAAAACTGATGGTGACATTATATTATCTTTCACCTTTCAT
CTTGGAATAGAGCCAGAAAAATATACAAAGACGTTACTACTGGAACATGTTTTCCTTTCT
AATAGCGTTTGTTTATCTTCTTTATTTATGTTTGCAGAATCATGTGATGCTTCAACGGGG
AAGGGTACTGTTCGACGCACAACGTTCCCGAAAGAAGTGGAGGCACTGGTTCACGAGATG
TGTGATGAGACTGAGGTTGCTGTGCTCAAACTCAAGGTTGGAGATTTCGAGATGAACTTA
AAGCGGAAGATTGGACAGACCGCAACTCCCATTCCTGTGCCTGATATTTCTCCATCAGTA
GCTCCTCCGATTCCTTCTGAGCCCATGAACAAATCAGTTTCTGCTGCTGCTGCTGCTAGC
CCATCCAAAAGCAAAACCTGCCTCTGAAAAAGTGTCTCCATTTATTAATGCTGCATACCG
AAAATCATCAAAGTTGACTGCTTTGGATGCATCTGGATCCAACAACTATGTCCTAGTCAC
ATCACCTTCAGTGGGCAAGTTTCAGAGAAGCAGAACTGTAAAGGGAAAGAAACAAGGTCC
TAGCTGCAAAGAGGGTGATGCAATAAAGGAAGGCCAAGTGATTGGATACGTACATCAGTT
GGGAAAGGAACTTCCAGTAACGTCTGATGTAGCTGGTGAAGTTCTCAAGCTTCTTTCAGA
TGATGGAGACTCTATAGGGTATGGGGAGCCTCTGGTTGCGGTCTTGCCATCGTTCCATGA
TATCAACATCCAGTGATGATGTCAGCGCAGTTCCACAATAAATTAATAGCATCTTCATCT
GGAGACTGTACTCTTCTTCATCTTTCCCTTTTATGGAGTTTGAGAATCTATTTTGATCTT
CATCTTTGATCACATGATTTGTGTGGAGATTTAATTCCTGAACATTTGACACGCAGCTAT
ATTGTTTTTGTCACTCTTTTGGAGTTTTGGTTCGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN23TF U 1
AF RR2EN01JQ C 653
BS 1 669 RR2EN23TF
BS 670 670 RR2EN01JQ
BS 671 736 RR2EN23TF
BS 737 737 RR2EN01JQ
BS 738 764 RR2EN23TF
BS 765 1238 RR2EN01JQ

RD RR2EN23TF 764 0 0
GGATCTTAGCTCTTTTAACTAACCCCCCGCTTCTTTGGACTTCTCTAGCTAGCTCGCTGC
CTTGTTCTTCCAATGGAGTCTTCTGCAGCTCTCGGATCTCTCCCTCAGACTTTTGGTTCC
CCCATAAATGTTCACTCGCTTTCTGGTAACTGGTCTGCCTCTGGTAATTCTTGTGCGCCA
CGGTGGAGTTTGTTCAACAGGAACACCAAGTACACGTTTGTTTTACGTGCAGAGTCCTCT
AAATCTTCCACAACAACAACCAAAACTGATGGTGACATTATATTATCTTTCACCTTTCAT
CTTGGAATAGAGCCAGAAAAATATACAAAGACGTTACTACTGGAACATGTTTTCCTTTCT
AATAGCGTTTGTTTATCTTCTTTATTTATGTTTGCAGAATCATGTGATGCTTCAACGGGG
AAGGGTACTGTTCGACGCACAACGTTCCCGAAAGAAGTGGAGGCACTGGTTCACGAGATG
TGTGATGAGACTGAGGTTGCTGTGCTCAAACTCAAGGTTGGAGATTTCGAGATGAACTTA
AAGCGGAAGATTGGACAGACCGCAACTCCCATTCCTGTGCCTGATATTTCTCCATCAGTA
GCTCCTCCGATTCCTTCTGAGCCCATGAACAAATCAGTTTCTGCTGCTGCTGCTGCTAGC
CCATCCAAA*GCAAAACCTGCCTCTGAAAAAGTGTCTCCATTTATTAATGCTGCATACCG
AAAATCATCAAAGTTGGCTGCTTTGGATGCATCTGGATCCAACA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2EN01JQ 586 0 0
CTGCTAGCCCATCCAAAAGCAAAACCTGCCTCTGAAAAAGTGTCTCCATTTATTAATGCT
GCATACCGAAAATCATCAAAGTTGACTGCTTTGGATGCATCTGGATCCAACAACTATGTC
CTAGTCACATCACCTTCAGTGGGCAAGTTTCAGAGAAGCAGAACTGTAAAGGGAAAGAAA
CAAGGTCCTAGCTGCAAAGAGGGTGATGCAATAAAGGAAGGCCAAGTGATTGGATACGTA
CATCAGTTGGGAAAGGAACTTCCAGTAACGTCTGATGTAGCTGGTGAAGTTCTCAAGCTT
CTTTCAGATGATGGAGACTCTATAGGGTATGGGGAGCCTCTGGTTGCGGTCTTGCCATCG
TTCCATGATATCAACATCCAGTGATGATGTCAGCGCAGTTCCACAATAAATTAATAGCAT
CTTCATCTGGAGACTGTACTCTTCTTCATCTTTCCCTTTTATGGAGTTTGAGAATCTATT
TTGATCTTCATCTTTGATCACATGATTTGTGTGGAGATTTAATTCCTGAACATTTGACAC
GCAGCTATATTGTTTTTGTCACTCTTTTGGAGTTTTGGTTCGTCTT

QA 1 586 1 586
DS 



CO CL1068Contig2 1124 4 6 U
GGATCTTAGCTCTTTTAACTAACCATCCCCCGCTTCTTTGGACTCTCTAGCTAGCTCGCT
ACCTTGTTCTTCCAATGGAGTCTTCTGCAGCTCTCGGATCTCTCCGTCACACTTTTGGTT
CCTCCATAAATGTTCACTCGCTTTCTGGTAACTGGTCTGCCTCTGCCAATTCTTGTGCCC
CACGGTGGAGTTTGTGCAACAGGAACACCAAGTACACGCTTGTGTTGCGCGCAGAGTCCT
CTAAATCCTCCACAACTACCAAAACTGACGAATCATGTGATGCTTCAACGGGGAAGAGTA
CTGTTCGACGCACAACGTTCCCAAAAGAAGTGGAGGCACTGGTTCACGAGATGTGTGATG
AGACTGAGGTTGCTGTGCTCAAACTTAAGGTTGGAGATTTCGAGATGAACTTAAAGCGGA
AGATTGGACAGACCGCAACTCCCACTCCCGTGCCTGATATTTCTCCATCAGTAGCTCCTC
CGATTCCTTCCGAACCCATGAACAAATCAGTTTCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTAGCCCAT
CCAAAGCAAAACCTGCCTCTGAAAAAGTGTCTCCATTTATTAATGCTGCATATCGAAAAT
CATCAAAGTTGGCTGCTTTGGATGCATCTGGATCTAACAACTATGTCCTAGTCACCTCTC
CCTCAGTGGGCAAGTTTCAGAGAAGCAGAACTGTAAAAGGAAAGAAACGAGGTCCTAGCT
GTAAAGAGGGTGATGCAATAAAGGAAGGGCAAGTGATTGGATACGTACATCAGTTGGGAA
AAGAACTTCCAGTGACGTCTGATGTAGCTGGTGAAGTTCTCAAGCTTCTTTCAGATGATG
GAGACTCTATAGGGTATGGGGAGCCTCTGGTTGCGGTCTTGCCATCGTTCCATGATATCA
ACATCCAGTGATGATGTCAGCCCAGTTCCAGAATAAATTAGTAGCATCTTCATCTGGAGA
CTGTACTCTTCTTCATCTTTCCTTTTATGGAGTTTGAGATTCTATTTTGATCTTCATCTT
GATCACATGATTTGTGTGGAGATTTAATTCCTGAACATGTGACACGGAGCTATATTGTTT
TTGTCACTCTTTGGATTTTTGGCTCGTCTTAATATGGGATCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2EO08TF U 1
AF RR2BF14TF U 31
AF RR2BF14JQ C 265
AF RR2EO08JQ C 476
BS 1 695 RR2EO08TF
BS 696 699 RR2BF14TF
BS 700 700 RR2BF14JQ
BS 701 739 RR2BF14TF
BS 740 1121 RR2BF14JQ
BS 1122 1124 RR2EO08JQ

RD RR2EO08TF 695 0 0
GGATCTTAGCTCTTTTAACTAACCATCCCCCGCTTCTTTGGACTCTCTAGCTAGCTCGCT
ACCTTGTTCTTCCAATGGAGTCTTCTGCAGCTCTCGGATCTCTCCGTCACACTTTTGGTT
CCTCCATAAATGTTCACTCGCTTTCTGGTAACTGGTCTGCCTCTGCCAATTCTTGTGCCC
CACGGTGGAGTTTGTGCAACAGGAACACCAAGTACACGCTTGTGTTGCGCGCAGAGTCCT
CTAAATCCTCCACAACTACCAAAACTGACGAATCATGTGATGCTTCAACGGGGAAGAGTA
CTGTTCGACGCACAACGTTCCCAAAAGAAGTGGAGGCACTGGTTCACGAGATGTGTGATG
AGACTGAGGTTGCTGTGCTCAAACTTAAGGTTGGAGATTTCGAGATGAACTTAAAGCGGA
AGATTGGACAGACCGCAACTCCCACTCCCGTGCCTGATATTTCTCCATCAGTAGCTCCTC
CGATTCCTTCCGAACCCATGAACAAATCAGTTTCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTAGCCCAT
CCAAAGCAAAACCTGCCTCTGAAAAAGTGTCTCCATTTATTAATGCTGCATATCGAAAAT
CATCAAAGTTGGCTGCTTTGGATGCATCTGGATCTAACAACTATGTCCTAGTCACCTCTC
CCTCAGTGGGCAAGTTTCAGAGAAGCAGAACTGTA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2BF14TF 709 0 0
CGCTTCTTTGGACTCTCTAGCTAGCTCGCTACCTTGTTCTTCCAATGGAGTCTTCTGCAG
CTCTCGGATCTCTCCGTCACACTTTTGGTTCCTCCATAAATGTTCACTCGCTTTCTGGTA
ACTGGTCTGCCTCTGCCAATTCTTGTGCCCCACGGTGGAGTTTGTGCAACAGGAACACCA
AGTACACGCTTGTGTTGCGTGCAGAGTCCTCTAAATCCTCCACAACTACCAAAACTGACG
AATCATGTGATGCTTCAACGGGGAAGAGTACTGTTCGACGCACAACGTTCCCAAAAGAAG
TGGAGGCACTGGTTCACGAGATGTGTGATGAGACTGAGGTTGCTGTGCTCAAACTTAAGG
TTGGAGATTTCGAGATGAACTTAAAGCGGAAGATTGGACAGACCGCAACTCCCACTCCCG
TGCCTGATATTTCTCCATCAGTAGCTCCTCCGATTCCTTCTGAACCCATGAACAAATCAG
TTTCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTAGCCCATCCAAAGCAAAACCTGCCTCTGAAAAAGTGT
CTCCATTTATTAATGCTGCATATCGAAAATCATCAAAGTTGGCTGCTTTGGATGCATCTG
GATCTAACAACTATGTCCTAGTCACCTCTCCCTCAGTGGGCAAGTTTCATAGAAGCAGAA
CTGTAAAAG*AAAGAAACGAGGTCCTAGCTGTAAAGAGGGTGATGCAAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2BF14JQ 857 0 0
CTGACGAATCATGTGATGCTTCAACGGGGAAGAGTACTGTTCGACGCACAACGTTCCCAA
AAGAAGTGGAGGCACTGGTTCACGAGATGTGTGATGAGACTGAGGTTGCTGTGCTCAAAC
TTAAGGTTGGAGATTTCGAGATGAACTTAAAGCGGAAGATTGGACAGACCGCAACTCCCA
CTCCCGTGCCTGATATTTCTCCATCAGTAGCTCCTCCGATTCCTTCTGAACCCATGAACA
AATCAGTTTCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTAGCCCATCCAAAGCAAAACCTGCCTCTGAAA
AAGTGTCTCCATTTATTAATGCTGCATATCGAAAATCATCAAAGTTGGCTGCTTTGGATG
CATCTGGATCTAACAACTATGTCCTAGTCACCTCTCCCTCAGTGGGCAAGTTTCATAGAA
GCAGAACTGTAAAAGGAAAGAAACGAGGTCCTAGCTGTAAAGAGGGTGATGCAATAAAGG
AAGGGCAAGTGATTGGATACGTACATCAGTTGGGAAAAGAACTTCCAGTGACGTCTGATG
TAGCTGGTGAAGTTCTCAAGCTTCTTTCAGATGATGGAGACTCTATAGGGTATGGGGAGC
CTCTGGTTGCGGTCTTGCCATCGTTCCATGATATCAACATCCAGTGATGATGTCAGCCCA
GTTCCAGAATAAATTAGTAGCATCTTCATCTGGAGACTGTACTCTTCTTCATCTTTCCTT
TTATGGAGTTTGAGATTCTATTTTGATCTTCATCTTGATCACATGATTTGTGTGGAGATT
TAATTCCTGAACATGTGACACGGAGCTATATTGTTTTTGTCACTCTTTGGATTTTTGGCT
CGTCTTAATATGGGATC

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR2EO08JQ 649 0 0
TCCTCCGATTCCTTCCGAACCCATGAACAAATCAGTTTCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTAG
CCCATCCAAAGCAAAACCTGCCTCTGAAAAAGTGTCTCCATTTATTAATGCTGCATATCG
AAAATCATCAAAGTTGGCTGCTTTGGATGCATCTGGATCTACCAACTATGTCCTAGTCAC
CTCTCCCTCAGTGGGCAAGTTTCAGAGAAGCAGAACTGTAAAAGGAAAGAAACAAGGTCC
TAGCTGTAAAGAGGGTGATGCAATAAAGGAAGGGCAAGTGATTGGATACGTACATCAGTT
GGGAAAAGAACTTCCAGTGACGTCTGATGTAGCTGGTGAAGTTCTCAAGCTTCTTTCAGA
TGATGGAGACTCTATAGGGTATGGGGAGCCTCTGGTTGCGGTCTTGCCATCGTTCCATGA
TATCAACATCCAGTGATGATGTCAGCCCAGTTCCAGAATAAATTAGTAGCATTTTCATCT
GGAGACTGTACTCTTCTTCATCTTTCCTTTTATGGAGTTTGAGATTCTATTTTGATCTTC
ATCTTGATCACATGATTTGTGTGGAGATTTAATTCCTGAACATGTGACACGGAGCTATAT
TGTTTTTGTCACTCTTTGGATTTTTGGCTCGTCTTAATATGGGATCATC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 2 5

CO CL1069Contig1 836 2 2 U
GGAATCAATAAACGCCATCGGAACAGCGTCGTCGTTTTTTTTTTCCAAATAGAGAGAGAG
AACACAAGAAAAAAAGGGATGGCCCAACAGCAACAATCGTTGATCTACAGTTTCGTGGCA
CGAGGGACGGTGATCCTCGTGGAGTTCACGGATTTCAAGGGAAATTTCACATCGATCGCT
GCACAGTGCCTCCAAAAGCTTCCTTCTTCCAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGATGGT
CATACCTTCAATTACTTGGTTGAAAATGGATTCAACAAGAGATATGGTGGTGGCAAGGCT
GCTACTGCTCAACCCAACTCCTTGAATAAGGAATTTGGGTCGAAACTGAAAGAGCACATG
CAGTATTGTATGGATCATCCTGACGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTTAAAGCTCAAGTT
TCTGAAGTTAAAGGTGTCATGATGGAAAACATTGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAA
ATCGAACTTTTGGTGGACAAAACCGAAAACCTTCGCTCACAGGCGCAAGATTTCAGAACA
CAAGGAACTCAAATGAGAAGAAAGATGTGGTTTCAGAACATGAAGATAAAACTCATTGTT
CTTGCAATCATCATCGCTTTGATCCTCATCATCGTCCTCTCAGTCTGCGGTGGCTTCAAC
TGCGGCAAATAAGTCTGGGAACATCTCTGATTTCCGAGAACATCATCCCCATTCAGTTTG
TTGTGCTTTTTTCTTTTCTTTTTGGTTTAAAATTTCTCATGGCTATGTTTCTCTTGCTTA
GATTTGCACTTGTTGAAATTGGTTTTGTATAGGTCATATATATATGTATGAAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A484TF U 1
AF RR2A484JQ C 89
BS 1 730 RR2A484TF
BS 731 836 RR2A484JQ

RD RR2A484TF 730 0 0
GGAATCAATAAACGCCATCGGAACAGCGTCGTCGTTTTTTTTTTCCAAATAGAGAGAGAG
AACACAAGAAAAAAAGGGATGGCCCAACAGCAACAATCGTTGATCTACAGTTTCGTGGCA
CGAGGGACGGTGATCCTCGTGGAGTTCACGGATTTCAAGGGAAATTTCACATCGATCGCT
GCACAGTGCCTCCAAAAGCTTCCTTCTTCCAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGATGGT
CATACCTTCAATTACTTGGTTGAAAATGGATTCAACAAGAGATATGGTGGTGGCAAGGCT
GCTACTGCTCAACCCAACTCCTTGAATAAGGAATTTGGGTCGAAACTGAAAGAGCACATG
CAGTATTGTATGGATCATCCTGACGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTTAAAGCTCAAGTT
TCTGAAGTTAAAGGTGTCATGATGGAAAACATTGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAA
ATCGAACTTTTGGTGGACAAAACCGAAAACCTTCGCTCACAGGCGCAAGATTTCAGAACA
CAAGGAACTCAAATGAGAAGAAAGATGTGGTTTCAGAACATGAAGATAAAACTCATTGTT
CTTGCAATCATCATCGCTTTGATCCTCATCATCGTCCTCTCAGTCTGCGGTGGCTTCAAC
TGCGGCAAATAAGTCTGGGAACATCTCTGATTTCCGAGAACATCATCCCCATTCAGTTTG
TTGTGCTTTT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2A484JQ 748 0 0
AGCAACAATCGTTGATCTACAGTTTCGTGGCACGAGGGACGGTGATCCTCGTGGAGTTCA
CGGATTTCAAGGGAAATTTCACATCGATCGCTGCACAGTGCCTCCAAAAGCTTCCTTCTT
CCAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGATGGTCATACCTTCAATTACTTGGTTGAAAATG
GATTCAACAAGAGATATGGTGGTGGCAAGGCTGCTACTGCTCAACCCAACTCCTTGAATA
AGGAATTTGGGTCGAAACTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGACGAGA
TTAGCAAGCTTGCTAAGGTTAAAGCTCAAGTTTCTGAAGTTAAAGGTGTCATGATGGAAA
ACATTGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATCGAACTTTTGGTGGACAAAACCGAAA
ACCTTCGCTCACAGGCGCAAGATTTCAGAACACAAGGAACTCAAATGAGAAGAAAGATGT
GGTTTCAGAACATGAAGATAAAACTCATTGTTCTTGCAATCATCATCGCTTTGATCCTCA
TCATCGTCCTCTCAGTCTGCGGTGGCTTCAACTGCGGCAAATAAGTCTGGGAACATCTCT
GATTTCCGAGAACATCATCCCCATTCAGTTTGTTGTGCTTTTTTCTTTTCTTTTTGGTTT
AAAATTTCTCATGGCTATGTTTCTCTTGCTTAGATTTGCACTTGTTGAAATTGGTTTTGT
ATAGGTCATATATATATGTATGAAACTG

QA 1 748 1 748
DS 



CO CL1069Contig2 1051 3 14 U
GTTTCAGCGTTAAGTCTTTTCTAGATCTTCTCTACCTTCCTTCACGCCGTTATAATAACA
AAACTCTCTGATCAGTCAATAAAATCCATCGGAACAGCGTTGTTGTTTTTTTTGTTCCCA
GTAGAGAGAGAGAGAGAACACAGGAAAAAAAAAGGAATGGCGCAACAGCAACAATCGTTG
ATCTACAGTTTCGTGGCTCGCGGGACGGTGATCCTGGTGGAGTTCACGGATTTCAAGGGA
AATTTCACATCGATCGCTGCACAGTGTCTCCAAAAGCTTCCTTCTTCCAACAACAAGTTC
ACCTACAACTGCGATGGTCATACCTTCAATTACTTGGTTGAAAATGGATTCACTTATTGT
GTTGTTGCAGTTGATTCTGCTGGGAGGCAAATTCCTATGGCTTTCTTGGAGCGAGTTAAG
GAGGATTTCAACAAGAGATATGGTGGTGGCAAGGCTGCTACTGCTCAACCCAACTCCTTG
AATAAGGAATTTGGGTCGAAACTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGAT
GAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTTAAAGCTCAAGTTTCTGAAGTTAAAGGTGTCATGATG
GAAAACATTGAGAAGGTCCTTGACCGTGGTGAGAAAATCGAACTTTTGGTGGACAAAACC
GAAAACCTTCGCTCACAGGCGCAAGATTTCAGAACACAAGGAACACAAATGAGAAGAAAG
ATGTGGTTTCAGAACATGAAGATAAAGCTCATTGTTCTTGCAATCATCATCTCCTTGATC
CTCATCATCGTCCTCTCAGTCTGCGGTGGCTTCAACTGCGGCAAATAAGTCTGGAACATC
TCTGATTTCCGAGAACATCATCCTCATTCAGTTTGTTGTGCTTTTTTTCTTTTTGGTTTA
AAATTTCTCATGGCTATGTTTCTCTTGCTTAGATTTGCACTTGTTGAAATTGGTTTTGTA
TAGGTCATATATATATGTATGAAACTGATTCTTGCAAACCATTTACTTGGACCTAATTTG
AACGCTTGTGTTTGCTTTGGTCTTTCTATTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ45TF U 1
AF RR2GL78TF U 1
AF RR2CZ45JQ C 307
BS 1 8 RR2CZ45TF
BS 9 9 RR2GL78TF
BS 10 112 RR2CZ45TF
BS 113 113 RR2GL78TF
BS 114 152 RR2CZ45TF
BS 153 153 RR2GL78TF
BS 154 156 RR2CZ45TF
BS 157 157 RR2GL78TF
BS 158 604 RR2CZ45TF
BS 605 605 RR2CZ45JQ
BS 606 615 RR2CZ45TF
BS 616 616 RR2CZ45JQ
BS 617 657 RR2CZ45TF
BS 658 1051 RR2CZ45JQ

RD RR2CZ45TF 659 0 0
GTTTCAGCTTTAAGTCTTTTCTAGATCTTCTCTACCTTCCTTCACGCCGTTATAATAACA
AAACTCTCTGATCAGTCAATAAAATCCATCGGAACAGCGTTGTTGTTTTTTT*GTTCCCA
GTAGAGAGAGAGAGAGAACACAGGAAAAAAAAGGGA*TGGCGCAACAGCAACAATCGTTG
ATCTACAGTTTCGTGGCTCGCGGGACGGTGATCCTGGTGGAGTTCACGGATTTCAAGGGA
AATTTCACATCGATCGCTGCACAGTGTCTCCAAAAGCTTCCTTCTTCCAACAACAAGTTC
ACCTACAACTGCGATGGTCATACCTTCAATTACTTGGTTGAAAATGGATTCACTTATTGT
GTTGTTGCAGTTGATTCTGCTGGGAGGCAAATTCCTATGGCTTTCTTGGAGCGAGTTAAG
GAGGATTTCAACAAGAGATATGGTGGTGGCAAGGCTGCTACTGCTCAACCCAACTCCTTG
AATAAGGAATTTGGGTCGAAACTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGAT
GAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTTAAAGCTCAAGTTTCTGAAGTTAAAGGTGTCATGATG
GAAA*CATTGAGAAG*TCCTTGACCGTGGTGAGAAAATCGAACTTTTGGTGGACAAA
CC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2GL78TF 612 0 0
GTTTCAGCGTTAAGTCTTTTCTAGATCTTCTCTACCTTCCTTCACGCCGTTATAATAACA
AAACTCTCTGATCAGTCAATAAAATCCATCGGAACAGCGTTGTTGTTTTTTTTGTTCCCA
GTAGAGAGAGAGAGAGAACACAGGAAAAAAAAAGGAATGGCGCAACAGCAACAATCGTTG
ATCTACAGTTTCGTGGCTCGCGGGACGGTGATCCTGGTGGAGTTCACGGATTTCAAGGGA
AATTTCACATCGATCGCTGCACAGTGTCTCCAAAAGCTTCCTTCTTCCAACAACAAGTTC
ACCTACAACTGCGATGGTCATACCTTCAATTACTTGGTTGAAAATGGATTCACTTATTGT
GTTGTTGCAATTGATTCTGCTGGGAGGCAAATTCCTATGGCTTTCTTGGAGCGAGTTAAG
GAGGATTTCAACAAGAGATATGGTGGTGGCAAGGCTGCTACTGCTCAACCCAACTCCTTG
AATAAGGAATTTGGGTCGAAACTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGAT
GAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTTAAGGCTCAAGTTTCTGAAGTTAAAGGTGTCATGATG
GAAA
ACATTGAG

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2CZ45JQ 745 0 0
AACTGCGATGGTCATACCTTCAATTACTTGGTTGAAAATGGATTCACTTATTGTGTTGTT
GCAGTTGATTCTGCTGGGAGGCAAATTCCTATGGCTTTCTTGGAGCGAGTTAAGGAGGAT
TTCAACAAGAGATATGGTGGTGGCAAGGCTGCTACTGCTCAACCCAACTCCTTGAATAAG
GAATTTGGGTCGAAACTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATT
AGCAAGCTTGCTAAGGTTAAAGCTCAAGTTTCTGAAGTTAAAGGTGTCATGATGGAAAAC
ATTGAGAAGGTCCTTGACCGTGGTGAGAAAATCGAACTTTTGGTGGACAAAACCGAAAAC
CTTCGCTCACAGGCGCAAGATTTCAGAACACAAGGAACACAAATGAGAAGAAAGATGTGG
TTTCAGAACATGAAGATAAAGCTCATTGTTCTTGCAATCATCATCTCCTTGATCCTCATC
ATCGTCCTCTCAGTCTGCGGTGGCTTCAACTGCGGCAAATAAGTCTGGAACATCTCTGAT
TTCCGAGAACATCATCCTCATTCAGTTTGTTGTGCTTTTTTTCTTTTTGGTTTAAAATTT
CTCATGGCTATGTTTCTCTTGCTTAGATTTGCACTTGTTGAAATTGGTTTTGTATAGGTC
ATATATATATGTATGAAACTGATTCTTGCAAACCATTTACTTGGACCTAATTTGAACGCT
TGTGTTTGCTTTGGTCTTTCTATTA

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 7

CO CL1070Contig1 572 7 9 U
GGACATCACTACTAAATCAAACAAAGAAAAGCAAGAAGATGTGGGATGAAACGGTTGCTG
GACCAAAGCCGGAGCATGGCCTTGGACGTCTCCGCAATAAGATCACCGCTCAACCCATAG
ACATCAAAGGTGTGGGAGAAGGGAGCAGCAGTAAGACTACCCCGGCGGCAGGGAGTCCTG
GAACTCCGACGACGCCAGGGTCAGCACGTAAGGAGAACGTGTGGAGGAGTGTGTTTCATC
CAGGAAGCAACATAGCCACCAAAGGAATGGGGACTAACCTCTTTGATAAGCCTTCTCACC
CCAACTCTCCCACCGTATACGACTGGCTGTACAGCGACGATACCAGGAGCAAGCACCGTT
AAAGCGAGAGGATCTAGTGACATGCCGGTGATGTAAAAATGTGTTTTTCTTGTTTTTTTT
TTTGTTGTATTCGCAACTTTTTCTTCTTTCTTTCTTGTTGTTTACCGTTCGATCTCTAGT
TTCTGTGATGGTTTTTAACGGTGACGATGCGTCCTCTTGTCTCTTGTAAGGTTTCTACTG
TTTGGTAAATGATATATTTTACTTTAGCTTCG


BQ
30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A848JQ C 2
AF RR2E303TF U 1
AF RR2E303JQ C 233
AF RR2G734JQ C 1
AF RR2G734TF U 1
AF RR2GO43TF U 1
AF RR2A848TF U 2
BS 1 268 RR2E303TF
BS 269 269 RR2G734TF
BS 270 363 RR2E303TF
BS 364 364 RR2G734TF
BS 365 422 RR2E303TF
BS 423 423 RR2G734TF
BS 424 526 RR2E303TF
BS 527 565 RR2G734TF
BS 566 572 RR2G734JQ

RD RR2A848JQ 367 0 0
GACATCACTACTAAATCAAACAAAGAAAAGCAAGAAGATGTGGGATGAAACGGTTGCTGG
ACCAAAGCCGGAGCATGGCCTTGGACGTCTCCGCAATAAGATCACCGCTCAACCCATAGA
CATCAAAGGTGTGGGAGAAGGGAGCATCAGTAAGACTACCCCGGCGGCAGGGAGTCCTGG
AACTCCGACGACGCCAGGGTCAGCACGTAAGGAGAACGTGTGGAGGAGTGTGTTTCATCC
AGGAAGCAACATAGCCACCAAAGGAATGGGGACTAACCTCTTTGATAAGCCTTCTCACCC
CAACTCTCCCACCGTATACGACTGGCTGTACAGCGACGATACCAGGAGCAAGCACCGTTA
AAGCGAG

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR2E303TF 526 0 0
GGACATCACTACTAAATCAAACAAAGAAAAGCAAGAAGATGTGGGATGAAACGGTTGCTG
GACCAAAGCCGGAGCATGGCCTTGGACGTCTCCGCAATAAGATCACCGCTCAACCCATAG
ACATCAAAGGTGTGGGAGAAGGGAGCAGCAGTAAGACTACCCCGGCGGCAGGGAGTCCTG
GAACTCCGACGACGCCAGGGTCAGCACGTAAGGAGAACGTGTGGAGGAGTGTGTTTCATC
CAGGAAGCAACATAGCCACCAAAGGAATAGGGACTAACCTCTTTGATAAGCCTTCTCACC
CCAACTCTCCCACCGTATACGACTGGCTGTACAGCGACGATACCAGGAGCAAGCACCGTT
AAAACGAGAGGATCTAGTGACATGCCGGTGATGTAAAAATGTGTTTTTCTTGTTTTTTTT
TT*GTTGTATTCGCAACTTTTTCTTCTTTCTTTCTTGTTGTTTACCGTTCGATCTCTAGT
TTCTGTGATGGTTTTTAACGGTGACGATGCGTCCTCTTGTCTCTTG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2E303JQ 296 0 0
GTTTCATCCAGGAAGCAACATAGCCACCAAAGGAATAGGGACTAACCTCTTTGATAAGCC
TTCTCACCCCAACTCTCCCACCGTATACGACTGGCTGTACAGCGACGATACCAGGAGCAA
GCACCGTTAAAACGAGAGGATCTAGTGACATGCCGGTGATGTAAAAATGTGTTTTTCTTG
TTTTTTTTTT*GTTGTATTCGCAACTTTTTCTTCTTTCTTTCTTGTTGTTTACCGTTCGA
TCTCTAGTTTCTGTGATGGTTTTTAACGGTGACGATGCGTCCTCTTGTCTCTTGTA

QA 1 296 1 296
DS 

RD RR2G734JQ 572 0 0
GGACATCACTACTAAATCGAACAAAGAAAAGCAAGAAGATGTGGGATGAAACGGTTGCTG
GACCAAAGCCGGAGCATGGCCTTGGACGTCTCCGCAATAAGATCACCGCTCAACCCATAG
ACATCAAAGGTGGGGGAGAAGGGAGCAGCAGTAAGACTACCCCGGCGGCAGGGAGTCCTG
GAACTCCGACGACGCCAGGGTCAGCACGTAAGGAGAACGTGTGGAGGAGTGTGTTTCATC
CAGGAAGCAACATAGCCACCAAAGGAATGGGGACTAACCTCTTTGATAAGCCTTCTCACC
CCAACTCTCCCCCCGTATACGACTGGCTGTACAGCGACGATACCAGGAGCAAGCACCGTT
AAAGCGAGAGGATCTAGTGACATGCCGGTGATGTAAAAATGTGTTTTTTTTGTTTTTTTT
TTTGTTGTATTCGCAACTTTTTTTTCTTTCTTTCTTGTTGTTTACCGTTCGATCTCTAGT
TTCTGTGATGGTTTTTAACGGTGACGATGCGTCCTCTTGTCTCTTGTAAGGTTTTTACTG
TTTGGTAAATGATATATTTTACTTTAGCTTCG

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2G734TF 572 0 0
GGACATCACTACTAAATCGAACAAAGAAAAGCAAGAAGATGTGGGATGAAACGGTTGCTG
GACCAAAGCCGGAGCATGGCCTTGGACGTCTCCGCAATAAGATCACCGCTCAACCCATAG
ACATCAAAGGTGGGGGAGAAGGGAGCAGCAGTAAGACTACCCCGGCGGCAGGGAGTCCTG
GAACTCCGACGACGCCAGGGTCAGCACGTAAGGAGAACGTGTGGAGGAGTGTGTTTCATC
CAGGAAGCAACATAGCCACCAAAGGAATGGGGACTAACCTCTTTGATAAGCCTTCTCACC
CCAACTCTCCCACCGTATACGACTGGCTGTACAGCGACGATACCAGGAGCAAGCACCGTT
AAAGCGAGAGGATCTAGTGACATGCCGGTGATGTAAAAATGTGTTTTTCTTGTTTTTTTT
TTTGTTGTATTCGCAACTTTTTCTTCTTTCTTTCTTGTTGTTTACCGTTCGATCTCTAGT
TTCTGTGATGGTTTTTAACGGTGACGATGCGTCCTCTTGTCTCTTGTAAGGTTTCTACTG
TTTGGTAAATGATATATTTTACTTT
AGCTTCG

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2GO43TF 571 0 0
GGACATCACTACTAAATCAAACAAAGAAAAGCAAGAAGATGTGGGATGAAACGGTTGCTG
GACCAAAGCCGGAGCATGGCCTTGGACGTCTCCGCAATAAGATCACCGCTCAACCCATAG
ACATCAAAGGTGTGGGAGAAGGGAGCAGCAGTAAGACTACCCCGGCGGCAGGGAGTCCTG
GAACTCCGACGACGCCAGGGTCAGCACGTAAGGAGAACGTGTGGAGGAGTGTGTTTCATC
CAGGAAGCAACATAGCCACCAAAGGAATGGGGACTAACCTCTTTGATAAGCCTTCTCACC
CCAACTCTCCCACCGTATACGACTGGCTGTACAGCGACGATACCAGGAGCAAGCACCGTT
AAAGCGAGAGGATCTAGTGACATGCCGGTGATGTAAAAATGTGTTTTTCTTGTTTTTTTT
TT*GTTGTATTCGCAACTTTTTCTTCTTTCTTTCTTGTTGTTTACCGTTCGATCTCTAGT
TTCTGTGATGGTTTTTAACGGTGACGATGCGTCCTCTTGTCTCTTGTAAGGTTTCTACTG
TTTGGTAAATGATATATTTTACTTT
TAGCTT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2A848TF 569 0 0
GACATCACTACTAAATCAAACAAAGAAAAGCAAGAAGATGTGGGATGAAACGGTTGCTGG
ACCAAAGCCGGAGCATGGCCTTGGACGTCTCCGCAATAAGATCACCGCTCAACCCATAGA
CATCAAAGGTGTGGGAGAAGGGAGCATCAGTAAGACTACCCCGGCGGCAGGGAGTCCTGG
AACTCCGACGACGCCAGGGTCAGCACGTAAGGAGAACGTGTGGAGGAGTGTGTTTCATCC
AGGAAGCAACATAGCCACCAAAGGAATGGGGACTAACCTCTTTGATAAGCCTTCTCACCC
CAACTCTCCCACCGTATACGACTGGCTGTACAGCGACGATACCAGGAGCAAGCACCGTTA
AAGCGAGAGGATCTAGTGACATGCCGGTGATGTAAAAATGTGTTTTTCTTGTTTTTTTTT
TTGTTGTATTCGCAACTTTTTCTTCTTTCTTTCTTGTTGTTTACCGTTCGATCTCTAGTT
TCTGTGATGGTTTTTAACGGTGACGATGCGTCCTCTTGTCTCTTGTAAGGTTTCTACTGT
TTGGTAAATGATATATTTTACTTT
TAGCC

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 7

CO CL1071Contig1 889 7 10 U
TTTTTGTTTGTGTGTGTGAGAAAGAGATATGAACGACGCAGATGTGTCAAAGCAAATACA
ACAGATGGTCCGGTTCATCCGGCAAGAGGCTGACGAGAAAGCTAACGAGATCTCAATCTC
AGCTGAGGAGGAATTCAACATAGAGAAACTTCAGCTTCTTGAGAATGCCAAGCGTAAGCT
CCGTCAAGATTATGACCGCAAGCTCAAGCAGGTCGATATCCGCAAGCGCATCGACTACTC
GACGCAGCTGAATGCAAGTAGGATTAAGTACCTTCAAGCACAAGATGACGTTGTCACCTC
CATGAAAGACTCTGCGGCTAAGGATCTCCTTCGTGTCTCCAACGACAAGAACGCGTACAA
GAAGCTTCTCAAGGCTCTCATCGTTGAGAGTTTGCTGCGGCTGAAAGAGCCATCAGTGCT
GCTGAGATGCAGAGAGATGGACAAGAGGGTTGTTGAATCCATCATTGACGATGCTAAGAA
ACAGTATTCAGACAAAGCCAAAGTTGGGTCTCCTAAGATCACAATCGACGAAAGAGTGTT
CCTCCCTCCACCTCCTAACCCTAAGCTCCCTGACTCCCATGACGCTCACTGCTCGGGTGG
GGTGGTGCTGGCTTCTCAAGATGGAAAGATTGTCTGCGAGAACACTTTAGACGCACGTCT
AGACGTTGCCTTCAGACAGAAGCTTCCCCAGATCCGGACACGCCTCGTTGGAGCTCCTGA
AATCTCAAGAGCATGATACTACCAAACAAGGCTTGCTTAAGCCCCTTAATAAGTGACATT
CAAAAGGATCATCACTTCTTTTTTTAATATGTCTAGTTATTTTCATCTTGACGAAGAGAA
TAAACTTCTAATAATGCCATTTTCATGTCAACTTCTAGAAATTTTATTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DZ95TF U 1
AF RR2EJ87TF U 1
AF RR2GQ45TF U 1
AF RR2FQ05TF U 1
AF RR2EJ87JQ C 320
AF RR2DZ95JQ C 385
AF RR2GQ45JQ C 635
BS 1 19 RR2DZ95TF
BS 20 20 RR2EJ87TF
BS 21 120 RR2DZ95TF
BS 121 121 RR2FQ05TF
BS 122 240 RR2DZ95TF
BS 241 241 RR2EJ87TF
BS 242 281 RR2DZ95TF
BS 282 609 RR2EJ87TF
BS 610 743 RR2FQ05TF
BS 744 889 RR2EJ87JQ

RD RR2DZ95TF 287 0 0
TTTTTGTTTGTGTGTGTGACAAAGAGATATGAACGACGCAGATGTGTCAAAGCAAATACA
ACAGATGGTCCGGTTCATCCGGCAAGAGGCTGACGAGAAAGCTAACGAGATCTCAATCTC
TGCTGAGGAGGAATTCAACATAGAGAAACTTCAGCTTCTTGAGAATGCCAAGCGTAAGCT
CCGTCAAGATTATGACCGCAAGCTCAAGCAGGTCGATATCCGCAAGCGCATCGACTACTC
TACGCAGCTGAATGCAAGTAGGATTAAGTACCTTCAAGCAC
TAGAGG

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR2EJ87TF 609 0 0
TTTTTGTTTGTGTGTGTGAGAAAGAGATATGAACGACGCAGATGTGTCAAAGCAAATACA
ATAGATGGCCCGGTTCATCCGGCAAGAGGCTGACGAGAAAGCTAACGAGATCTCAATCTC
TGCTGAGGAGGAATTCAACATAGAGAAACCTCAGCTTCTTGAGAATGCCAAGCGTAAGCT
CCGTCAAGATTATGACCGCAAGCTCAAGCAGGTCGATATCCGCAAGCGCATCGACTACTC
GACGCAGCTGAATGCAAGTAGGATTAAGTACCTTCAAGCACAAGATGACGTTGTCACCTC
CATGAAAGACTCTGCGGCTAAGGATCTCCTTCGTGTCTCCAACGACAAGAACGCGTACAA
GAAGCTTCTCAAGGCTCTCATCGTTGAGAGTTTGCTGCGGCTGAAAGAGCCATCAGTGCT
GCTGAGATGCAGAGAGATGGACAAGAGGGTTGTTGAATCCATCATTGACGATGCTAAGAA
ACAGTATTCAGACAAAGCCAAAGTTGGGTCTCCTAAGATCACAATCGACGAAAGAGTGTT
CCTCCCTCCACCTCCTAACCCTAAGCTCCCTGACTCCCATGACGCTCACTGCTCGGGTGG
GGTGGTGCT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2GQ45TF 690 0 0
TTTTTGTTTGTGTGTGTGAGAAAGAGATATGAACGACGCAGATGTGTCAAAGCAGATACA
ACAGATGGTCCGGTTCATCCGGCAAGAGGCTGACGAGAAAGCTAACGAGATCTCAATCTC
AGCTGAGGAGGAATTCAACATAGAGAAACTTCAGCTTCTTGAGAATGCCAAGCGTAAGCT
CCGTCAAGATTATGACCGCAAGCTCAAGCAGGTCGATATCCGCAAGCGCATCGACTACTC
GACGCAGCTGAATGCAAGTAGGATTAAGTACCTTCAAGCACAAGATGACGTTGTCACCTC
CATGAAAGACTCTGCGGCTAAGGATCTCCTTCGTGTCTCCAACGACAAGAACGCGTACAA
GAAGCTTCTCAAGGCTCTCATCGTTGAGAGTTTGCTGCGGCTGAAAGAGCCGTCAGTGCT
GCTGAGATGCAGAGAGATGGACAAGAGGGTTGTTGAATCCATCATTGACGATGCTAAGAA
ACAGTATTCAGACAAAGCCAAAGTTGGGTCTCCTAAGATCACAATCGACGAAAAAGTGTT
CCTCCCTCCACCTCCTAACCCTAAGCTCCCTGACTCCCATGACCCTCACTGCTCGGGCGG
GGTGGTGCTGGCTTCTCAAGATGGAAAGATTGTCTGCGAGAACACTTTAGACGCACGTCT
AGACGTTGCCTTCAGACAGAAGCTTCCCCA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2FQ05TF 743 0 0
TTTTTGTTTGTGTGTGTGAGAAAGAGATATGAACGACGCAGATGTGTCAAAGCAGATACA
ACAGATGGTCCGGTTCATCCGGCAAGAGGCTGACGAGAAAGCTAACGAGATCTCAATCTC
AGCTGAGGAGGAATTCAACATAGAGAAACTTCAGCTTCTTGAGAATGCCAAGCGTAAGCT
CCGTCAAGATTATGACCGCAAGCTCAAGCAGGTCGATATCCGCAAGCGCATCGACTACTC
GACGCAGCTGAATGCAGGTAGGATTAAGTACCTTCAAGCACAAGATGACGTTGTCACCTC
CATGAAAGACTCTGCGGCTAAGGATCTCCTTCGTGTCTCCAACGACAAGAACGCGTACAA
GAAGCTTCTCAAGGCTCTCATCGTTGAGAGTTTGCTGCGGCTGAAAGAGCCGTCAGTGCT
GCTGAGATGCAGAGAGATGGACAAGAGGGTTGTTGAATCCATCATTGACGATGCTAAGAA
ACAGTATTCAGACAAAGCCAAAGTTGGGTCTCCTAAGATCACAATCGA**AAAAAGTGTT
CCTCCCTCCACCTCCTAACCCTAAGCTCCCTGACTCCCATGACCCTCACTGCTCGGGCGG
GGTGGTGCTGGCTTCTCAAGATGGAAAGATTGTCTGCGAGAACACTTTAGACGCACGTCT
AGACGTTGCCTTCAGACAGAAGCTTCCCCAGATCCGGACACGCCTCGTTGGAGCTCCTGA
AATCTCAAGAGCATGATACTACC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2EJ87JQ 570 0 0
AAGGATCTCCTTCGTGTCTCCAACGACAAGAACGCGTACAAGAAGCTTCTCAAGGCTCTC
ATCGTTGAGAGTTTGCTGCGGCTGAAAGAGCCATCAGTGCTGCTGAGATGCAGAGAGATG
GACAAGAGGGTTGTTGAATCCATCATTGACGATGCTAAGAAACAGTATTCAGACAAAGCC
AAAGTTGGGTCTCCTAAGATCACAATCGACGAAAGAGTGTTCCTCCCTCCACCTCCTAAC
CCTAAGCTCCCTGACTCCCATGACGCTCACTGCTCGGGTGGGGTGGTGCTGGCTTCTCAA
GATGGAAAGATTGTCTGCGAGAACACTTTAGACGCACGTCTAGACGTTGCCTTCAGACAG
AAGCTTCCCCAGATCCGGACACGCCTCGTTGGAGCTCCTGAAATCTCAAGAGCAAGATAC
TACCAAACAAGGCTTGCTTAAGCCCCTTAATAAGTGACATTCAAAAGGATCATCACTTCT
TTTTTTAATATGTCTAGTTATTTTCATCTTGACGAAGAGAATAAACTTCTAATAATGCCA
TTTTCATGTCAACTTCTAGAAATTTTATTT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2DZ95JQ 505 0 0
TGAGAGTTTGCTGCGGCTGAAAGAGCCATCAGTGCTGCTGAGATGCAGAGAGATGGACAA
GAGGGTTGTTGAATCCATCATTGACGATGCTAAGAAACAGTATTCAGACAAAGCCAAAGT
TGGGTCTCCTAAGATCACAATCGACGAAAGAGTGTTCCTCCCTCCACCTCCTAACCCTAA
GCTCCCTGACTCCCATGACGCTCACTGCTCGGGTGGGGTGGTGCTGGCTTCTCAAGATGG
AAAGATTGTTTGCGAGAACACTTTAGACGCACGTTTAGACGTTGCCTTCAGACAGAAGCT
TCCCCAGATCCGGACACGCCTCGTTGGAGCTCCTGAAATCTCAAGAGCATGATACTACCA
AACAAGGCTTGCTTAAGCCCCTTAATAAGTGACATTCAAAAGGATCATCACTTCTTTTTT
TAATATGTCTAGTTATTTTCATCTTGACGAAGAGAATAAACTTCTAATAATGCCATTTTC
ATGTCAACTTCTAGAAATTTTATTT

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR2GQ45JQ 241 0 0
TGG
GAGAACACTTTAGACGCACGTTTAGACGTTGCCTTCAGACAGAAGCTTCCCCAGATCCGG
ACACGCCTCGTTGGAGCTCCTGAAATTTCAAGAGCATGATACTACCAAACAAGGCTTGCT
TAAGCCCCTTAATAAGTGACATTCAAAAGGATCATCACTTCTTTTTTTAATATGTCTAGT
TATTTTCATCTTGACGAAGAGAATAAACTTTTAATAATGCCATTTTCATGTCAACTTC

QA 4 241 4 241
DS 



AS 1 5

CO CL1072Contig1 1203 5 13 U
GGGTCCAAGCCCATTATCATCGTCAATGGCTAAAGCCAGCACCACTCTGTTTGCTGTCAC
CTCCTCTGTTTCGACTCGTTTCTCTCTTCTCCCTCCTTCTAAATCTCTTAAACTCTCAGC
TCCAAGCGCGAGACTCGCCGTGCCAATGGCTGCTATGGCCGCCACTGCTAAAAAGGTGGC
TCCTGCTGTGATCGTGGGTGGCGGGAGAGTCGGAAAAGCGTTGCAGGAAATGGGTAGTGG
CAATGATGTATTGGTGAAGAGAGGAGAACCCGTTCCGGTTGATTTCGAAGGACCCATTTT
GGTTTGTACTAAAAATGATGATCTCGATGCTGTTCTTCAAGCTACTCCTCAGTCTAGATG
GAAAGATTTGGTGTTTTTCCAAAATGGAATGATGGAGCCGTGGTTCGAGAGCAAAGGTTT
GGGTGATGCAGACCAAGTGTTGGCTTATTTTGCTGTGTCAAAGCTCGGTGAGCCTCCTGT
GGATGGGATAACTGACACTAATCCAGAAGGTTTAACTGCTGCTTATGGCAAATGGGCTTC
GGATGTAGCTGCAAGACTGCAATCTGGTGGCCTCTCTTGCAAGGTACTTGACAAAGAAGC
TTTTCAGAAGCAAATGCTGGAGAAACTCATATGGATTTGTGCGTTTATGCTTGTTGGAGC
TCGTCATCCAGGTGCTAGCGTGGGAACGGTGGAGAAAGAATACAGAGATGAAGTGGCGAG
ACTCATCCAAGAACTTGCAGCAGCTGCTGCTGCAGAAAAAGGACTAACCTTTGAAGACAA
CATGGTGGAGAGACTGTGTGCTTATTCCAGAGCCGTTGCTCATTTCCCAACCGCTGTTAA
AGAATTTAAATGGAGGAATGGTTGGTTTTATTCGCTATCAGAGAAGGCGATTGCAGAAGG
GAAACCTGATCCTTGTCCACTCCACACCGAATGGCTGAGAGAGCTAAAAGTGATATAGAG
CCTTGACGGTACGTGGCACACTTTAGTAGATAGTGGCAGATCATTGATCTGAAACTAGTT
TGAGCTTTGTACACGTGTATGAGAAGCCAAGTAAAACGTTTGATTTTGTAAAAGTTGTCC
AGACTTTTATTTGTGAAAAGTCTCTGTGTATTCAACGATCAAACATCTGGTTATTGTCCC
ATCCGTTAGAAAATTTGAAGTTTTTTTTCTTCATAATTTGCGTATAAGATTGAATAAAGA
AGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2D152TF U 1
AF RR2FI18TF U 5
AF RR2CE14TF U 47
AF RR2D152JQ C 359
AF RR2FI18JQ C 1019
BS 1 314 RR2D152TF
BS 315 315 RR2FI18TF
BS 316 351 RR2D152TF
BS 352 352 RR2FI18TF
BS 353 365 RR2D152TF
BS 366 607 RR2FI18TF
BS 608 608 RR2CE14TF
BS 609 667 RR2FI18TF
BS 668 684 RR2CE14TF
BS 685 685 RR2D152JQ
BS 686 754 RR2CE14TF
BS 755 1140 RR2D152JQ
BS 1141 1203 RR2FI18JQ

RD RR2D152TF 368 0 0
GGGTCCAAGCCCATTATCATCGTCAATGGCTAAAGCCAGCACCACTCTGTTTGCTGTCAC
CTCCTCTGTTTCGACTCGTTTCTCTCTTCTCCCTCCTTCTAAATCTCTTAAACTCTCAGC
TCCAAGCGCGAGACTCGCCGTGCCAATGGCTGCTATGGCCGCCACTGCTAAAAAGGTGGC
TCCTGCTGTGATCGTGGGTGGCGGGAGAGTCGGAAAAGCGTTGCAGGAAATGGGTAGTGG
CAATGATGTATTGGTGAAGAGAGGAGAACCCGTTCCGGTTGATTTCGAAGGACCCATTTT
GGTTTGTACTAAAA*TGATGATCTCGATGCTGTTCTTCAAGCTACTCCTCA*TCTAGATG
GAAAG
TTT

QA 1 365 1 365
DS 

RD RR2FI18TF 663 0 0
GGAAGCCCATT
ATCATCGTCAATGGCTAAAGCCAGCACCACTCTGTTTGCTGTCACCTCCTCTGTTTCGAC
TCGTTTCTCTCTTCTCCCTCCTTCTAAATCTCTTAAACTCTCAGCTCCAAGCGCGAGACT
CGCCGTGCCAATGGCTGCTATGTCCGCCACTGCTAAAAAGGTGGCTCCTGCTGTGATCGT
GGGTGGCGGGAGAGTCGGAAAAGCGTTGCAGGAAATGGGTAGTGGCAATGATGTATTGGT
GAAGAGAGGAGAACCCGTTCCGGTTGATTTCGAAGGACCCATTTTGGTTTGTACTAAAAA
TGATGATCTCGATGCTGTTCTTCAAGCTACTCCTCAGTCTAGATGGAAAGATTTGGTGTT
TTTCCAAAATGGAATGATGGAGCCGTGGTTCGAGAGCAAAGGTTTGGGTGATGCAGACCA
AGTGTTGGCTTATTTTGCTGTGTCAAAGCTCGGTGAGCCTCCTGTGGATGGGATAACTGA
CACTAATCCAGAAGGTTTAACTGCTGCTTATGGCAAATGGGCTTCGGATGTAGCTGCAAG
ACTGCAATCTGGTGGCCTCTCTTGCAAGGTACTTGACAAAGAAGCTTTTCAGTAGCAAAT
GCTGGAGAAACTCATATGGATTTGTGCGTTTATGCTTGTTGGAGCTCGTCAT

QA 12 663 12 663
DS 

RD RR2CE14TF 708 0 0
GG
GTTTGCTGTCACCTCCTCTGTTTCGACTCGTTTCTCTCTTCTCCCTCCTTCTAAATCTCT
TAAACTCTCAGCTCCAAGCGCGAGACTCGCCGTGCCAATGGCTGCTATGGCCGCCACTGC
TAAAAAGGTGGCTCCTGCTGTGATCGTGGGTGGGGGAAGAGTCGGAAGGGCGTTGCAGGA
AATGGGTAGTGGCGATGATTTGTTGGTGAAGAGAGGAGAACCAGTCCCGGTTGATTTCGA
AGGACCCATTTTGGTTTGTACTAGAAACGATGATCTCGATGCTGTTCTTGAATCTACTCC
TCAGTCTAGATGGAAAGATTTGGTGTTTTTCCAAAATGGAATGATGGAGCCGTGGTTCGA
GAGCAAAGGTTTGGGCGATGCAGACCAAGTGTTGGCGTATTTTGCTGTGTCAAAGCTCGG
TGAGCCTCCTGTGGATGGGATAACTGACACTAACCCGGAAGGTTTAACTGCTGCTTATGG
CAAATGGGCTTCGGATGTAGCTGCAAGACTGCAATCTGGTGGCCTCTCTTGCAAGGTACT
TGACAAAGAAGCTTTTCAGAAGCAAATGCTGGAGAAACTCATTTGGATTTGTGCGTTTAT
GCTTGTTGGAGCTCGTCATCCAGGTGCTAGCGTGGGCACGGTGGAGAAAGAATACAGAGA
TGAAGTGGCGAGACTCATCCAAGAACTTGCAGCAGCTGCTGCTGCA

QA 3 708 3 708
DS 

RD RR2D152JQ 785 0 0
AT
GAAAGATTTGGTGTTTT*CCAAAATGGAATGATGGAGCCGTGGTTCGAGAGCAAAGGTTT
GGGTGATGCAGACCAAGTGTTGGCTTATTTTGCTGTGTCAAAGCTCGGTGAGCCTCCTGT
GGATGGGATAACTGACACTAATCCAGAAGGTTTAACTGCTGCTTATGGCAAATGGGCTTC
GGATGTAGCTGCAAGACTGCAATCTGGTGGCCTCTCTTGCAAGGTACTTGACAAAGAAGC
TTTTCAGAAGCAAATGCTGGAGAAACTCATATGGATTTGTGCGTTTATGCTTGTTGGAGC
TCGTCATCCAGGTGCTAGTGTGGGAATGGTGGAGAAAGAATACAGAGATGAAGTGGCGAG
ACTCATCCAAGAACTTGCAGCAGCTGCTGCTGCAGAAAAAGGACTAACCTTTGAAGACAA
CATGGTGGAGAGACTGTGTGCTTATTCCAGAGCCGTTGCTCATTTCCCAACCGCTGTTAA
AGAATTTAAATGGAGGAATGGTTGGTTTTATTCGCTATCAGAGAAGGCGATTGCAGAAGG
GAAACCTGATCCTTGTCCACTCCACACCGAATGGCTGAGAGAGCTAAAAGTGATATAGAG
CCTTGACGGTACGTGGCACACTTTAGTAGATAGTGGCAGATCATTGATCTGAAACTAGTT
TGAGCTTTGTACACGTGTATGAGAAGCCAAGTAAAACGTTTGATTTTGTAAAAGTTGTCC
AGACTTTTATTTGTGAAAAGTCTCTGTGTATTCAACGATCAAACATCTGGTTATTGTCCC
ATC

QA 3 782 3 782
DS 

RD RR2FI18JQ 185 0 0
TTTGAGCTTTGTACACGTGTATGAGAAGCCAAGTAAAACGTTTGATTTTGTAAAAGTTGT
CCAGACTTTTATTTGTGAAAAGTCTTTGTGTATTCAACGATCAAACATCTGGTTATTGTC
CCATCCGTTAGAAAATTTGAAGTTTTTTTTCTTCATAATTTGCGTATAAGATTGAATAAA
GAAGT

QA 1 185 1 185
DS 



AS 2 7

CO CL1073Contig1 615 2 2 U
GGCAGAGAAGTTTAAGAGACATCCTTACAGCTTTGTGTGGGTGGCGGCTGTTACGTAGCC
GGATTTGGAGAAGAAAGTCAACGTGGGAGGATACGGTTATCCAGCAATGGTAGCCATGAA
CGTGAAGAAAGCAGTGTATGCTCCTCTTAAAAGCGCATTTGAGCTTCAACACCTCTTAGA
ATTTGTGAAGGATGCTGGGGCAGGTGGAAAAGGAAACGTGCCTATGAATGGAACACCGGA
GATCGTCGAGGCAAAAGCGTGGGACGGTAAAGACGGGGAAGTGATCGAGGAAGATGAGTT
CTCACTCGAAGAACTCATGGGAGGTGATGATAATAATGTTGATGTAGGTACCAAGGATGA
GTTGTGAAGAATCCAGGGTTTGACCTGATTTCTCTACTTTTGGATTTCGAACCGTTGAAT
GTTTAGTTTCTCACTCTTTTATATTTGCCAAAAAGAAAGTAAGATAAGAGACAGGAACTA
TCCATATGTAGAACTTCCCAAAACATATTAGACATTATCAGAGAATCTTTGGTGGAAGTG
AGCATTATTAGAGTACATCGCCCTTCACTTTTGTTTTAGTGGCTTTGTCTTCCTAATAAA
GTATACCCACTCTTC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GF78JQ C 1
AF RR2GF78TF U 1
BS 1 1 RR2GF78JQ
BS 2 615 RR2GF78TF

RD RR2GF78JQ 615 0 0
GGCAGAGAAGTTTAAGAGACATCCTTACAGCTTTGTGTGGGTGGCGGCTGTTACGTAGCC
GGATTTGGAGAAGAAAGTCAACGTGGGAGGATACGGTTATCCAGCAATGGTAGCCATGAA
CGTGAAGAAAGCAGTGTATGCTCCTCTTAAAAGCGCATTTGAGCTTCAACACCTCTTAGA
ATTTGTGAAGGATGCTGGGGCAGGTGGAAAAGGAAACGTGCCTATGAATGGAACACCGGA
GATCGTCGAGGCAAAAGCGTGGGACGGTAAAGACGGGGAAGTGATCGAGGAAGATGAGTT
CTCACTCGAAGAACTCATGGGAGGTGATGATAATAATGTTGATGTAGGTACCAAGGATGA
GTTGTGAAGAATCCAGGGTTTGACCTGATTTCTCTACTTTTGGATTTCGAACCGTTGAAT
GTTTAGTTTCTCACTCTTTTATATTTGCCAAAAAGAAAGTAAGATAAGAGACAGGAACTA
TCCATATGTAGAACTTCCCAAAACATATTAGACATTATCAGAGAATCTTTGGTGGAAGTG
AGCATTATTAGAGTACATCGCCCTTCACTTTTGTTTTAGTGGCTTTGTCTTCCTAATAAA
GTATACCCACTCTTC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2GF78TF 615 0 0
G
GCAGAGAAGTTTAAGAGACATCCTTACAGCTTTGTGTGGGTGGCGGCTGTTACGTAGCCG
GATTTGGAGAAGAAAGTCAACGTGGGAGGATACGGTTATCCAGCAATGGTAGCCATGAAC
GTGAAGAAAGCAGTGTATGCTCCTCTTAAAAGCGCATTTGAGCTTCAACACCTCTTAGAA
TTTGTGAAGGATGCTGGGGCAGGTGGAAAAGGAAACGTGCCTATGAATGGAACACCGGAG
ATCGTCGAGGCAAAAGCGTGGGACGGTAAAGACGGGGAAGTGATCGAGGAAGATGAGTTC
TCACTCGAAGAACTCATGGGAGGTGATGATAATAATGTTGATGTAGGTACCAAGGATGAG
TTGTGAAGAATCCAGGGTTTGACCTGATTTCTCTACTTTTGGATTTCGAACCGTTGAATG
TTTAGTTTCTCACTCTTTTATATTTGCCAAAAAGAAAGTAAGATAAGAGACAGGAACTAT
CCATATGTAGAACTTCCCAAAACATATTAGACATTATCAGAGAATCTTTGGTGGAAGTGA
GCATTATTAGAGTACATCGCCCTTCACTTTTGTTTTAGTGGCTTTGTCTTCCTAATAAAG
TATACCCACTCTTC

QA 2 615 2 615
DS 



CO CL1073Contig2 788 5 18 U
GAAGGGGCGATGTACTCTAATGTCACTTCCACCAAAGATTCTCTGATAATATGTTTGGGA
AGTTCTACATATGGATAGTTCCGGTCTCTTATCTTACTTTCTTTTTGGCAAAATATAAAA
GAGTGAGAAACATTCAACGGTTCGAAATCCAAAAGTAGAGAAATCAGGTCAAACCCTGGA
TTCTTCACAACTCATCCTTGGTACCTACGTTATCATCACCTCCCATGAGTTCTTCGAGTG
AGAATTCATCTTCCTCAATCACTTCCCCGTCTTTACCGTCCCACGCTTTTGTCTCAACGA
TCTCCGGTGTTCCATTCATAGGCACGTTTCCTTTTCCACCTGCCCCAGCATCCTTCACAA
ATTCTAAGAGGTGTTGAAGCTCAAATGCGCTTTTAAGAGGAGCATACACTGCTTTCTTCA
CGTTCATGGCTACCATTGCTGGATAACCGTATCCTCCCACGTTGACTTTCTTCTCCAAAT
CCGGTTGCGTAACAGCCGCCACCCACACAAAGCTGTAAGGATGTCTCTTAAACTTCTCTG
CAACGGATAACAACATGTCTAGATACTTGTTCCTTCCTTCAGCTTTGGAGTCGAGAATGT
CAGGTAGGAAAGAGACAAAGCAAATAGCAGCAGAACCACACTTCTTTTCCATGACATCCG
GTCCGGTTAGTTCAGTTACTTCAACAGGCCCAGCACTAGATTCCACAAGTTCTGTAGCAA
AAGATTCTATAGCTGACGCAGATCTAGCACCATCATAAGCATATGGGCTGCTTTTGTCTA
CACCAAAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY75JQ U 29
AF RR2GP09JQ U 1
AF RR2GU78JQB U 1
AF RR2EY75TF C 29
AF RR2CV18JQ U 34
BS 1 76 RR2GP09JQ
BS 77 77 RR2EY75JQ
BS 78 82 RR2GP09JQ
BS 83 83 RR2EY75JQ
BS 84 208 RR2GP09JQ
BS 209 209 RR2EY75JQ
BS 210 221 RR2GP09JQ
BS 222 222 RR2EY75JQ
BS 223 256 RR2GP09JQ
BS 257 257 RR2EY75JQ
BS 258 295 RR2GP09JQ
BS 296 296 RR2EY75JQ
BS 297 338 RR2GP09JQ
BS 339 339 RR2EY75JQ
BS 340 467 RR2GP09JQ
BS 468 468 RR2CV18JQ
BS 469 614 RR2GP09JQ
BS 615 788 RR2CV18JQ

RD RR2EY75JQ 372 0 0
CCACCAAAGATTCTCTGATAATATGTTTGGGAAGTTCTACATATGGATAGTTCCGGTCTC
TTATCTTACTTTCTTTTTGGCAAAATATAAAAGAGTGAGAAACATTCAACGGTTCGAAAT
CCAAAAGTAGAGAAATCAGGTCAAACCCTGGATTCTTCACAACTCATCCTTGGTACCTAC
GTTATCATCACCTCCCATGAGTTCTTCGAGTGAGAATTCATCTTCCTCAATCACTTCCCC
GTCTTTACCGTCCCACGCTTTTGTCTCAACGATCTCCGGTGTTCCATTCATAGGCACGTT
TCCTTTTCCACCTGCCCCAGCATCCTTCACAAATTCTAAGAGGTGTTGAAGCTCAAATGC
GCTTTTAAGAGG

QA 1 372 1 372
DS 

RD RR2GP09JQ 614 0 0
GAAGGGGCGATGTACTCTAATGTCACTTCCACCAAAGATTCTCTGATAATATGTTTGGGA
AGTTCTACATATGGATGGTTCCTGTCTCTTATCTTACTTTCTTTTTGGCAAAATATAAAA
GAGTGAGAAACATTCAACGGTTCGAAATCCAAAAGTAGAGAAATCAGGTCAAACCCTGGA
TTCTTCACAACTCATCCTTGGTACCTACATTATCATCACCTACCATGAGTTCTTCGAGTG
AGAATTCATCTTCCTCGATCACTTCCCCGTCTTTACCGTCCCACGCTTTTGTCTCGACGA
TCTCCGGTGTTCCATTCATAGGCACGTTTCCTTTTCCATCTGCCCCAGCATCCTTCACAA
ATTCTAAGAGGTGTTGAAGCTCAAATGCGCTTTTAAGAGGAGCATACACTGCTTTCTTCA
CGTTCATGGCTACCATTGCTGGATAACCGTATCCTCCCACGTTGACTCTCTTCTCCAAAT
CCGGTTGCGTAACAGCCGCCACCCACACAAAGCTGTAAGGATGTCTCTTAAACTTCTCTG
CAACGGATAACAACATGTCTAGATACTTGTTCCTTCCTTCAGCTTTGGAGTCGAGAATGT
CAGGTAGGAAAGAG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2GU78JQB 614 0 0
GAAGGGGCGATGTACTCTAATGTCACTTCCACCAAAGATTCTCTGATAATATGTTTGGGA
AGTTCTACATATGGATGGTTCCTGTCTCTTATCTTACTTTCTTTTTGGCAAAATATAAAA
GAGTGAGAAACATTCAACGGTTCGAAATCCAAAAGTAGAGAAATCAGGTCAAACCCTGGA
TTCTTCACAACTCATCCTTGGTACCTACATTATCATCACCTACCATGAGTTCTTCGAGTG
AGAATTCATCTTCCTCGATCACTTCCCCGTCTTTACCGTCCCACGCTTTTGTCTCGACGA
TCTCCGGTGTTCCATTCATAGGCACGTTTCCTTTTCCATCTGCCCCAGCATCCTTCACAA
ATTCTAAGAGGTGTTGAAGCTCAAATGCGCTTTTAAGAGGAGCATACACTGCTTTCTTCA
CGTTCATGGCTACCATTGCTGGATAACCGTATCCTCCCACGTTGACTCTCTTCTCCAAAT
CCGGTTGCGTAACAGCCGCCACCCACACAAAGCTGTAAGGATGTCTCTTAAACTTCTCTG
CAACGGATAACAACATGTCTAGATACTTGTTCCTTCCTTCAGCTTTGGAGTCGAGAATGT
CAGGTAGGAAAGAG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2EY75TF 655 0 0
CCACCAAAGATTCTCTGATAATATGTTTGGGAAGTTCTACATATGGATAGTTCCGGTCTC
TTATCTTACTTTCTTTTTGGCAAAATATAAAAGAGTGAGAAACATTCAACGGTTCGAAAT
CCAAAAGTAGAGAAATCAGGTCAAACCCTGGATTCTTCACAACTCATCCTTGGTACCTAC
GTTATCATCACCTCCCATGAGTTCTTCGAGTGAGAATTCATCTTCCTCAATCACTTCCCC
GTCTTTACCGTCCCACGCTTTTGTCTCAACGATCTCCGGTGTTCCATTCATAGGCACGTT
TCCTTTTCCACCTGCCCCAGCATCCTTCACAAATTCTAAGAGGTGTTGAAGCTCAAATGC
GCTTTTAAGAGGAGCATACACTGCTTTCTTCACGTTCATGGCTACCATTGCTGGATAACC
GTATCCTCCCACGTTGACTTTCTTCTCCAAATCCGGTTGCGTAACAGCCGCCACCCACAT
AAAGCTGTAAGGATGTCTCTTAAACTTCTCTGCAACGGATAACAACATGTCTAGATACTT
GTTCCTTCCTTCAGCTTTGGAGTCGAGAATGTCAGGTAGGAAAGAGACAAAGCAAATAGC
AGCAGAACCACACTTCTTTTCCATGACATCCGGTCCGGTTAGTTCAGTTACTTC
C

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2CV18JQ 755 0 0
AAAGATTCTCTGATAATATGTTTGGGAAGTTCTACATATGGATAGTTCCGGTCTCTTATC
TTACTTTCTTTTTGGCAAAATATAAAAGAGTGAGAAACATTCAACGGTTCGAAATCCAAA
AGTAGAGAAATCAGGTCAAACCCTGGATTCTTCACAACTCATCCTTGGTACCTACGTTAT
CATCACCTCCCATGAGTTCTTCGAGTGAGAATTCATCTTCCTCAATCACTTCCCCGTCTT
TACCGTCCCACGCTTTTGTCTCAACGATCTCCGGTGTTCCATTCATCGGCACGTTTCCTT
TTCCACCTGCCCCAGCATCCTTCACAAATTCTAAGAGGTGTTGAAGCTCAAATGCGCTTT
TAAGAGGAGCATACACTGCTTTCTTAACGTTCATGGCTACCATTGCTGGATAACCGTATC
CTCCCACGTTGACTTTCTTCTCCAAATCCGGTTGCGTAACAGCCGCCACCCACACAAAGC
TGTAAGGATGTCTCTTAAACTTCTCTGCAACGGATAACAACATGTCTAGATACTTGTTCC
TTCCTTCAGCTTTGGAGTCGAGAATGTCAGGTAGGAAAGAGACAAAGCAAATAGCAGCAG
AACCACACTTCTTTTCCATGACATCCGGTCCGGTTAGTTCAGTTACTTCAACAGGCCCAG
CACTAGATTCCACAAGTTCTGTAGCAAAAGATTCTATAGCTGACGCAGATCTAGCACCAT
CATAAGCATATGGGCTGCTTTTGTCTACACCAAAT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 4

CO CL1074Contig1 761 4 4 U
GGGAAGCTAGTTTTGTGGAGTATCATCTCTTCTTGTCTGATTCTTCAGAAACACACTGTT
CCGTTATCCTTCTTACAACAACTACATAAGCAAAAAGCAACCTTGTTTTCAAGATGGAGA
AGAAACTGATAATGTTATTGTTTGTTCTTCTGCAACTTCTGTTAGTAGTAAACTCTCTTT
CTCCCAAACATTCACCAGCCAAGCCAAAGGCAGAAGTGACTGTAATGGGTTTTGTTTACT
GCGATGTCTGCTCCAACAACACTTTCTCCACACACAGTTACTTCATGTCCGGCGTGGAGG
TGAGAATAGTCTGCAGATTCAAATCAGCTTCCTCGAGAACAAACGAGATGGTAACATTCT
CTGCAAACAGAACCACTAACGAGTTCGGACTCTACAAGGTAGCCATAACTTCTCTAGATT
GCGCTGACGTGGACAGTCTCGCGAGTTCTTGTCAAGCGAGTTTGGTCGGGAGAAGAAGCC
CTTCGGATCTTTCTTGCAACGTGCCTGGTTATAGAACCACCACGGATCAAGTCGTGTTTA
AGTCTAAACGGTCTAATCTCTGTATCTATGGTTTCAATGCTTTGAACTTCAGACCCTTCA
AGAGAGATCTTGCCTTGTGTAGCAAGAAGTAGAGTTTCAAAACAGAACTATCTTTCACTG
TTGTTGTCTATGTTGCTTCCACTCAGAGATATTGTCTAGTAGCAGGAAGAAGATATCGTT
TTTATTTAATCAATATCTGAAAATGCGTTTCTGTTTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GS53TF U 1
AF RR2GS53JQB C 104
AF RR2GD48TF U 133
AF RR2GD48JQ C 247
BS 1 317 RR2GS53TF
BS 318 318 RR2GD48TF
BS 319 620 RR2GS53TF
BS 621 761 RR2GD48TF

RD RR2GS53TF 620 0 0
GGGAAGCTAGTTTTGTGGAGTATCATCTCTTCTTGTCTGATTCTTCAGAAACACACTGTT
CCGTTATCCTTCTTACAACAACTACATAAGCAAAAAGCAACCTTGTTTTCAAGATGGAGA
AGAAACTGATAATGTTATTGTTTGTTCTTCTGCAACTTCTGTTAGTAGTAAACTCTCTTT
CTCCCAAACATTCACCAGCCAAGCCAAAGGCAGAAGTGACTGTAATGGGTTTTGTTTACT
GCGATGTCTGCTCCAACAACACTTTCTCCACACACAGTTACTTCATGTCCGGCGTGGAGG
TGAGAATAGTCTGCAGAATCAAATCAGCTTCCTCGAGAACAAACGAGATGGTAACATTCT
CTGCAAACAGAACCACTAACGAGTTCGGACTCTACAAGGTAGCCATAACTTCTCTAGATT
GCGCTGACGTGGACAGTCTCGCGAGTTCTTGTCAAGCGAGTTTGGTCGGGAGAAGAAGCC
CTTCGGATCTTTCTTGCAACGTGCCTGGTTATAGAACCACCACGGATCAAGTCGTGTTTA
AGTCTAAACGGTCTAATCTCTGTATCTATGGTTTCAATGCTTTGAACTTCAGACCCTTCA
AGAGAGATCTTGCCTTGTGT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2GS53JQB 628 0 0
TGTTTTCAAGATGGAGAAGAAACTGATAATGTTATTGTTTGTTCTTCTGCAACTTCTGTT
AGTAGTAAACTCTCTTTCTCCCAAACATTCACCAGCCAAGCCAAAGGCAGAAGTGACTGT
AATGGGTTTTGTTTACTGCGATGTCTGCTCCAACAACACTTTCTCCACACACAGTTACTT
CATGTCCGGCGTGGAGGTGAGAATAGTCTGCAGATTCAAATCAGCTTCCTCGAGAACAAA
CGAGATGGTAACATTCTCTGCAAACAGAACCACTAACGAGTTCGGACTCTACAAGGTAGC
CATAACTTCTCTAGATTGCGCTGACGTGGACAGTCTCGCGAGTTCTTGTCAAGCGAGTTT
GGTCGGGAGAAGAAGCCCTTCGGATCTTTCTTGCAACGTGCCTGGTTATAGAACCACCAC
GGATCAAGTCGTGTTTAAGTCTAAACGGTCTAATCTCTGTATCTATGGTTTCAATGCTTT
GAACTTCAGACCCTTCAAGAGAGATCTTGCCTTGTGTAGCAAGAAGTAGAGTTTCAAAAC
AGAACTATCTTTCACTGTTGTTGTCTATGTTGCTTCCACTCAGAGATATTGTCTAGTAGC
AGGAAGAAGATATCGTTTTTATTTAATC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2GD48TF 629 0 0
G
GTTATTGTTTGTTCTTCTGCAACTTCTGTTAGTAGTAAACTCTCTTTCTCCCAAACATTC
ACCAGCCAAGCCAAAGGCAGAAGTGACTGTAATGGGTTTTGTTTACTGCGATGTCTGCTC
CAACAACACTTTCTCCACACACAGTTACTTCATGTCCGGCGTGGAGGTGAGAATAGTCTG
CAGATTCAAATCAGCTTCCTCGAGAACAAACGAGATGGTAACATTCTCTGCAAACAGAAC
CACTAACGAGTTCGGACTCTACAAGGTAGCCATAACTTCTCTAGATTGCGCTGACGTGGA
CAGTCTCGCGAGTTCTTGTCAAGCGAGTTTGGTCGGGAGAAGAAGCCCTTCGGATCTTTC
TTGCAACGTGCCTGGTTATAGAACCACCACGGATCAAGTCGTGTTTAAGTCTAAACGGTC
TAATCTCTGTATCTATGGTTTCAATGCTTTGAACTTCAGACCCTTCAAGAGAGATCTTGC
CTTGTGTAGCAAGAAGTAGAGTTTCAAAACAGAACTATCTTTCACTGTTGTTGTCTATGT
TGCTTCCACTCAGAGATATTGTCTAGTAGCAGGAAGAAGATATCGTTTTTATTTAATCAA
TATCTGAAAATGCGTTTCTGTTTAAACC

QA 2 629 2 629
DS 

RD RR2GD48JQ 515 0 0
TCTGCTCCAACAACACTTTCTCCACACACAGTTACTTCATGTCCGGCGTGGAGGTGAGAA
TAGTCTGCAGATTCAAATCAGCTTCCTCGAGAACAAACGAGATGGTAACATTCTCTGCAA
ACAGAACCACTAACGAGTTCGGACTCTACAAGGTAGCCATAACTTCTCTAGATTGCGCTG
ACGTGGACAGTCTCGCGAGTTCTTGTCAAGCGAGTTTGGTCGGGAGAAGAAGCCCTTCGG
ATCTTTCTTGCAACGTGCCTGGTTATAGAACCACCACGGATCAAGTCGTGTTTAAGTCTA
AACGGTCTAATCTCTGTATCTATGGTTTCAATGCTTTGAACTTCAGACCCTTCAAGAGAG
ATCTTGCCTTGTGTAGCAAGAAGTAGAGTTTCAAAACAGAACTATCTTTCACTGTTGTTG
TCTATGTTGCTTCCACTCAGAGATATTGTCTAGTAGCAGGAAGAAGATATCGTTTTTATT
TAATCAATATCTGAAAATGCGTTTCTGTTTAAACC

QA 1 515 1 515
DS 



AS 2 5

CO CL1075Contig1 1068 2 6 U
GTTCTCCTAAGCATTGGTTGAGCTACCTGCTCCTCTTCCATGTGTTCCTCAACTTGTTGC
TCCTCAGCTGGTGTATTTGCATTTCCATCCTGATCATGAACCTGATCACTGTGTGGTGAT
GTTTCTTGATTCCCCCCTTCAGGATTAGGATGGGAATCCTCACTTGCCGGAGTAACCTCT
TCACTCACAGCTACTGGAGGTTGATTTCCAGCTCCAGTACTCCCATTTTCAGAACCACCA
GCTCCATCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGAGAAAATAATCAAATGG
CGGAAGATCTGGTACTAGACACGGCGATCAGAGACTGGGTTCTGATCCCTCTCTCCGTAG
TGATGGTTCTAATCGGTGTTCTCCGCTACTTCGTCTCCAAGCTCATGCGTTCGTCTCCCA
CTCCCGACGCAAAGATCCTCAAAGAAGGGCAAGTTGTAATCAGGGCTCGGAACCTGAAGG
CCGGCGCCAATTTCATCCCGCTAAAGTCCTTCCGAGCTCGGAGATTCTACTTCAGCAACG
AGGAAAATGGATTGCTACATGTTCCCAAGGACCAAGCTCAAAACCCACAAGCTCAGATGT
TTTCTGATCCCAACATGGCCATGGATATGATGAAGAAAAATCTTTCTATGATTATTCCAC
AGACACTCACTTATGCATGGGTCAACTTCTTCTTCTCTGGGTTTGTGGCAGCCAAAATAC
CATTTCCACTGACTCAGAGGTTCAGGTCTATGCTACAGAACGGGATTGACTTGAGCACTG
TTGATGTTAGCTATGTCAGCAGCCGTTCATGGTACTTCTTGAACTTGTTCGGATTAAGAG
GCTTGTTTAGTCTCATTCTTGGAGATGAAAATGCTATTGATGATACACAACGAATGATGC
AAATGGGTGGTGGGATTTGGTTTTGATGCATCAAAGAGCTTGGGCGCTGAGAAAGATGGT
CTCGACATTATTCAACATGAATGGGCTTTACCCGGTTTCGAGCACCTCGCAGAGTCCGTT
TTGAGAAAACTCGTGCAGTAGAGAGAGGACATTTGTACCCCTGATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ26TF U 1
AF RR2B707TF U 294
BS 1 639 RR2BZ26TF
BS 640 640 RR2B707TF
BS 641 716 RR2BZ26TF
BS 717 717 RR2B707TF
BS 718 736 RR2BZ26TF
BS 737 1068 RR2B707TF

RD RR2BZ26TF 740 0 0
GTTCTCCTAAGCATTGGTTGAGCTACCTGCTCCTCTTCCATGTGTTCCTCAACTTGTTGC
TCCTCAGCTGGTGTATTTGCATTTCCATCCTGATCATGAACCTGATCACTGTGTGGTGAT
GTTTCTTGATTCCCCCCTTCAGGATTAGGATGGGAATCCTCACTTGCCGGAGTAACCTCT
TCACTCACAGCTACTGGAGGTTGATTTCCAGCTCCAGTACTCCCATTTTCAGAACCACCA
GCTCCATCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGAGAAAATAATCAAATGG
CGGAAGATCTGGTACTAGACACGGCGATCAGAGACTGGGTTCTGATCCCTCTCTCCGTAG
TGATGGTTCTAATCGGTGTTCTCCGCTACTTCGTCTCCAAGCTCATGCGTTCGTCTCCCA
CTCCCGACGCAAAGATCCTCAAAGAAGGGCAAGTTGTAATCAGGGCTCGGAACCTGAAGG
CCGGCGCCAATTTCATCCCGCTAAAGTCCTTCCGAGCTCGGAGATTCTACTTCAGCAACG
AGGAAAATGGATTGCTACATGTTCCCAAGGACCAAGCTCAAAACCCACAAGCTCAGATGT
TTTCTGATCCCAACATGGCCATGGATATGATGAAGAAAA*TCTTTCTATGATTATTCCAC
AGACACTCACTTATGCATGGGTCAACTTCTTCTTCTCTGGGTTTGTGGCAGCCAAA*TAC
CATTTCCACTGACTCA
AAGG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2B707TF 775 0 0
CAAATGGCGGAAGATCTGGTACTAGACACGGCGATCAGAGACTGGGTTCTGATCCCTCTC
TCCGTAGTGATGGTTCTAATCGGTGTTCTCCGCTACTTCGTCTCCAAGCTCATGCGTTCG
TCTCCCACTCCCGACGCAAAGATCCTCAAAGAAGGGCAAGTTGTAATCAGGGCTCGGAAC
CTGAAGGCCGGCGCCAATTTCATCCCGCTAAAGTCCTTCCGAGCTCGGAGATTCTACTTC
AGCAACGAGGAAAATGGATTGCTACATGTTCCCAAGGACCAAGCTCAAAACCCACAAGCT
CAGATGTTTTCTGATCCCAACATGGCCATGGATATGATGAAGAAAAATCTTTCTATGATT
ATTCCACAGACACTCACTTATGCATGGGTCAACTTCTTCTTCTCTGGGTTTGTGGCAGCC
AAAATACCATTTCCACTGACTCAGAGGTTCAGGTCTATGCTACAGAACGGGATTGACTTG
AGCACTGTTGATGTTAGCTATGTCAGCAGCCGTTCATGGTACTTCTTGAACTTGTTCGGA
TTAAGAGGCTTGTTTAGTCTCATTCTTGGAGATGAAAATGCTATTGATGATACACAACGA
ATGATGCAAATGGGTGGTGGGATTTGGTTTTGATGCATCAAAGAGCTTGGGCGCTGAGAA
AGATGGTCTCGACATTATTCAACATGAATGGGCTTTACCCGGTTTCGAGCACCTCGCAGA
GTCCGTTTTGAGAAAACTCGTGCAGTAGAGAGAGGACATTTGTACCCCTGATTTT

QA 1 775 1 775
DS 



CO CL1075Contig2 959 3 9 U
GGATTCTCCGATCGAAAACTCAGAGAATAATCAAATGGCGGAAGATCTGGTTCTAGACAC
GGCGATCAGAGACTGGGTTCTGATCCCTCTCTCCGTGGTGATGGTTCTAATCGGTGTTCT
CCGCTACTTCGTCTCCAAGCTCATGCGATCTTCTCCAACTCCCGACGCGAAGATCGTCAA
AGAAGGGCAAGTTGTAATTAGGGCTAGGAATCTGAAGCCCGGCGCCAATTTCATCCCGCC
CAAGTCCTTCCGAGCTCGGAGATTCTACTTCAGCAACGAGGAAAATGGATTGCTACATGT
TCCCAAGGACCAAGCTCAAAACCCACAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCCAACATGGCCAT
GGATATGATGAAGAAAAATCTTTCTATGATTATTCCACAGACACTCACTTATGCATGGGT
CAACTTCTTCTTCTCTGGGTTTGTTGCAGCCAAAATACCGTTTCCACTGACTCAGAGGTT
CAGGTCTATGCTACAGAACGGGATTGACTTGAGCACTGTTGATGTTAGCTATGTCAGCAG
CCGTTCATGGTACTTCTTGAACTTGTTCGGACTAAGAGGCTTATTTAGTCTCATTCTTGG
AGATGAAAATGCTATTGATGATACACAACGAATGATGCAAATGGGTGGTGGATTTGGTTT
TGATGCATCAAAGAGCTTAGGCGCTGAGAAAGATGGTCTCGACATTATTCAACATGAATG
GGCTTTACCCGGATTCGAGCACCGCGCAGAGTCCGTTTTGAGAAAACTCGTGCAGTAGAG
AGACGACATTTGTACTCTGATTTTTGATTTTGTATGATTTGGTTGAAGTCTGTCTGTAGC
ATTATTACAGCATTACTTTGTTTTAGCTGATCTGGTTATGCTGGTGCTTGTGATCTGATG
CTTATTATCTTATAAAACTTCTCAGAGTTTGTTTGTCAAGCAAGATTTACTATACTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF47TF U 1
AF RR2FP22TF U 8
AF RR2DF47JQ C 346
BS 1 217 RR2DF47TF
BS 218 218 RR2FP22TF
BS 219 667 RR2DF47TF
BS 668 680 RR2FP22TF
BS 681 681 RR2DF47JQ
BS 682 734 RR2FP22TF
BS 735 735 RR2DF47JQ
BS 736 795 RR2FP22TF
BS 796 959 RR2DF47JQ

RD RR2DF47TF 667 0 0
GGATTCTCCGATCGAAAACTCAGAGAATAATCAAATGGCGGAAGATCTGGTTCTAGACAC
GGCGATCAGAGACTGGGTTCTGATCCCTCTCTCCGTGGTGATGGTTCTAATCGGTGTTCT
CCGCTACTTCGTCTCCAAGCTCATGCGATCTTCTCCAACTCCCGACGCGAAGATCGTCAA
AGAAGGGCAAGTTGTAATTAGGGCTAGGAATCTGAAGGCCGGCGCCAATTTCATCCCGCC
CAAGTCCTTCCGAGCTCGGAGATTCTACTTCAGCAACGAGGAAAATGGATTGCTACATGT
TCCCAAGGACCAAGCTCAAAACCCACAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCCAACATGGCCAT
GGATATGATGAAGAAAAATCTTTCTATGATTATTCCACAGACACTCACTTATGCATGGGT
CAACTTCTTCTTCTCTGGGTTTGTTGCAGCCAAAATACCGTTTCCACTGACTCAGAGGTT
CAGGTCTATGCTACAGAACGGGATTGACTTGAGCACTGTTGATGTTAGCTATGTCAGCAG
CCGTTCATGGTACTTCTTGAACTTGTTCGGACTAAGAGGCTTATTTAGTCTCATTCTTGG
AGATGAAAATGCTATTGATGATACACAACGAATGATGCAAATGGGTGGTGGATTTGGTTT
TGATGCA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2FP22TF 805 0 0
GGGATCGAAAACTCAGAG
AATAATCAAATGGCGGAAGATCTGGTTCTAGACACGGCGATCAGAGACTGGGTTCTGATC
CCTCTCTCCGTGGTGATGGTTCTAATCGGTGTTCTCCGCTACTTCGTCTCCAAGCTCATG
CGATCTTCTCCAACTCCCGACGCGAAGATCGTCAAAGAAGGGCAAGTTGTAATTAGGGCT
AGGAATCTGAAGCCCGGCGCCAATTTCATCCCGCCCAAGTCCTTCCGAGCTCGGAGATTC
TACTTCAGCAACGAGTAAAATGGATTGCTACATGTTCCCAAGGACCAAGCTCAAAACCCA
CAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCCAACATGGCCATGGATATGATGAAGAAAAATCTTTCT
ATGATTATTCCACAGACACTCACTTATGCATGGGTCAACTTCTTCTTCTCTGGGTTTGTT
GCAGCCAAAATACCGTTTCCACTGACTCAGAGGTTCAGGTCTATGCTACAGAACGGGATT
TACTTGAGCACTGTTGATGTTAGCTATGTCAGCAGCCGTTCATGGTACTTCTTGAACTTG
TTCGGACTAAGAGGCTTATTTAGTCTCATTCTTGGAGATGAAA*TGCTATTGATGATACA
CAACGAATGATGCAAATGGGTGGTGGATTTGGTTTTGATGCATCAAAGAGCTTAG*CGCT
GAGAAAGATGGTCTCGACATTATTCAACATGAATGGGCTTTACCCGGAT*CGAGCACCGC
GCAGAGTCCGTTTTGAGAAAACTCGTGCAGTAGAGAGACGACATTTGTAC
TCTGATTTTGATTTTGT

QA 19 788 19 788
DS 

RD RR2DF47JQ 614 0 0
TCCCAACATGGCCATGGATATGATGAAGAAAAATCTTTCTATGATTATTCCACAGACACT
CACTTATGCATGGGTCAACTTCTTCTTCTCTGGGTTTGTTGCAGCCAAAATACCGTTTCC
ACTGACTCAGAGGTTCAGGTCTATGCTACAGAACGGGATTGACTTGAGCACTGTTGATGT
TAGCTATGTCAGCAGCCGTTCATGGTACTTCTTGAACTTGTTCGGACTAAGAGGCTTATT
TAGTCTCATTCTTGGAGATGAAAATGCTATTGATGATACACAACGAATGATGCAAATGGG
TGGTGGATTTGGTTTTGATGCATCAAAGAGCTTAGGCGCTGAGAAGGATGGTCTCGACAT
TATTCAACATGAATGGGCTTTACCCGGATTCGAGCACCGCGCAGAGTCCGTTTTGAGAAA
ACTCGTGCAGTAGAGAGACGACATTTGTACTCTGATTTTTGATTTTGTATGATTTGGTTG
AAGTCTGTCTGTAGCATTATTACAGCATTACTTTGTTTTAGCTGATCTGGTTATGCTGGT
GCTTGTGATCTGATGCTTATTATCTTATAAAACTTCTCAGAGTTTGTTTGTCAAGCAAGA
TTTACTATACTCCC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 0 0

AS 1 7

CO CL1077Contig1 480 7 8 U
GGATATTCGGATAGACAAACTCAACGACTCATTTTCAATTGTCTTATCAAAATGTGGATC
AACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGTGTGCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACG
GTTCCTTCGCAACCTCCAGCTACACAGGGCCCATCAGATTGTTTGTCATCGCTGGAAGAT
ATTCCCGACTGCATCCCAGAGATATTGAGATCGATAATAAGTGGACAAATCGGGAGTATT
GGACATTCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGGTATCAGTACCGAATGTGCCGCTCATGTGTTT
GTCTTCGCTCCCTTCTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCACTGTTCCCGACAACATTAGTGC
CAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTTATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACT
AATGTGATAACAAACTTTGCTATGTTTCGCTTAATAAAAGAATATCTCTCCATATTATAG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 10 10 10 10 

AF RR2G238TF U 201
AF RR2E524JQ C 1
AF RR2H087JQ C 24
AF RR2H087TF U 24
AF RR2E524TF U 1
AF RR2GL86JQ C 1
AF RR2GL86TF U 1
BS 1 25 RR2E524TF
BS 26 167 RR2H087TF
BS 168 170 RR2E524TF
BS 171 270 RR2H087TF
BS 271 271 RR2E524TF
BS 272 474 RR2H087TF
BS 475 476 RR2E524TF
BS 477 480 RR2E524JQ

RD RR2G238TF 130 0 0
GATATTGAGATCGATAATAAGTGGACAAATCGGGAGTATTGGACATTCTTGCTGCCATGC
CTTTTTGGGTATCAGTACCGAATGTGCCGCTCATGTGTTTGTCTTCGCTCCCTTCTTCCC
TCCGACTCTA

QA 1 130 1 130
DS 

RD RR2E524JQ 480 0 0
GGATATTCGGATAGACAAACTCAACGACTCATTTTCAATTGTCTTATCAAAATGTGGATC
AACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGTGTGCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACG
GTTCCTTCGCAACCTCCAGCTACACAGGGCCCATCAGATTGTTTGTCATCGCTGGAAGAT
ATTCCCGACTGCATCCCAGAGATATTGAGATCGATAATAAGTGGACAAATCGGGAGTATT
GGACATTCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGGTATCAGTACCGAATGTGCCGCTCATGTGTTT
GTCTTCGCTCCCTTCTTCCCTCCGACTTTAAGGGATCACTGTTCCCGACAACATTAGTGC
CAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTTATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACT
AATGTGATAACAAACTTTGCTATGTTTCGCTTAATAAAAGAATATCTCTCCATATTATAG

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2H087JQ 453 0 0
GG
GACTCATTTTCAATTGTCTTATCAAAATGTGGATCAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAG
TTGTGTGCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACGGTTCCTTCGCAACCTCCAGCTACAC
AGGGCCCATCAGATTGTTTGTC***GCTGGAAGATATTCCCGACTGCATCCCAGAGATAT
TGAGATCGATAATAAGTGGACAAATCGGGAGTATTGGACATTCTTGCTGCCATGCCTTTT
TGGGTCTCAGTACCGAATGTGCCGCTCATGTGTTTGTCTTCGCTCCCTTCTTCCCTCCGA
CTCTAAGGGATCACTGTTCCCGACAACATTAGTGCCAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTT
ATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACTAATGTGATAACAAACTTTGCTATGT
TTCGCTTAATAAAAGAATATCTCTCCATA
CC

QA 3 451 3 451
DS 

RD RR2H087TF 453 0 0
GG
GACTCATTTTCAATTGTCTTATCAAAATGTGGATCAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAG
TTGTGTGCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACGGTTCCTTCGCAACCTCCAGCTACAC
AGGGCCCATCAGATTGTTTGTC***GCTGGAAGATATTCCCGACTGCATCCCAGAGATAT
TGAGATCGATAATAAGTGGACAAATCGGGAGTATTGGACATTCTTGCTGCCATGCCTTTT
TGGGTCTCAGTACCGAATGTGCCGCTCATGTGTTTGTCTTCGCTCCCTTCTTCCCTCCGA
CTCTAAGGGATCACTGTTCCCGACAACATTAGTGCCAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTT
ATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACTAATGTGATAACAAACTTTGCTATGT
TTCGCTTAATAAAAGAATATCTCTCCATA
CC

QA 3 451 3 451
DS 

RD RR2E524TF 480 0 0
GGATATTCGGATAGACAAACTCAACGACTCATTTTCAATTGTCTTATCAAAATGTGGATC
AACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGTGTGCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACG
GTTCCTTCGCAACCTCCAGCTACACAGGGCCCATCAGATTGTTTGTCATCGCTGGAAGAT
ATTCCCGACTGCATCCCAGAGATATTGAGATCGATAATAAGTGGACAAATCGGGAGTATT
GGACATTCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGGTATCAGTACCGAATGTGCCGCTCATGTGTTT
GTCTTCGCTCCCTTCTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCACTGTTCCCGACAACATTAGTGC
CAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTTATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACT
AATGTGATAACAAACTTTGCTATGTTTCGCTTAATAAAAGAATATCTCTCCATATT
ATAG

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR2GL86JQ 476 0 0
GGATATTCGGATAGACAAACTCAACGACTCATTTTCAATTGTCTTATCAAAATGTGGATC
AACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGTGTGCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACG
GTTCCTTCGCAACCTCCAGCTACACAGGGCCCATCAGATTGTTTGTCATCGTTGGAAGAT
ATTCCCGACTGCATCCCAGAGATATTGAGATCGATAATAAGTGGACAAATCGGGAGTATT
GGACATTCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGGTATCAGTACCGAATGTGCCGCTCATGTGTTT
GTCTTCGCTCCCTTCTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCACTGTTCCCGACAACATTAGTGC
CAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTTATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACT
AATGTGATAACAAACTTTGCTATGTTTCGCTTAATAAAAGAATATCTCTCCATATT

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR2GL86TF 476 0 0
GGATATTCGGATAGACAAACTCAACGACTCATTTTCAATTGTCTTATCAAAATGTGGATC
AACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGTGTGCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACG
GTTCCTTCGCAACCTCCAGCTACACAGGGCCCATCAGATTGTTTGTCATCGTTGGAAGAT
ATTCCCGACTGCATCCCAGAGATATTGAGATCGATAATAAGTGGACAAATCGGGAGTATT
GGACATTCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGGTATCAGTACCGAATGTGCCGCTCATGTGTTT
GTCTTCGCTCCCTTCTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCACTGTTCCCGACAACATTAGTGC
CAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTTATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACT
AATGTGATAACAAACTTTGCTATGTTTCGCTTAATAAAAGAATATCTCTCCATATT

QA 1 476 1 476
DS 



AS 2 4

CO CL1078Contig1 593 2 1 U
AAACCTTTTGATTCAACGGAACTTTGAAAACCTATTAGTAATCATACAATAAGAAGAAGC
AACACATAACTTTTATCCCTTTGACGTTGAGATAGATTACCACCGAATGTAATGTTCTTT
GGGAATGAATGAAATCTTTTAACCCTCCCATCCATCATGCGCCGCTTGCGTAAAGACGGG
TCCATTCTTTAGCTGTTTCCACAGCTTCTGCCTCATTACTCTTCCAATGCTTAGCGATGT
TCTCAAACAATGGATCATCAGGGTTTGGTGCACTCAAAAAAGCTTGAATACTCAAGAGCA
CTGTTCGTATTTGTAGAGCAGGGCTCCATTTGTCTTTCAGAATGTCAAGACAGATTCTTC
CAAGCTTATCAATGTTAGGATGGTAAATCTTGGTGAGAAACCTAACCTTGGGGGCTGACA
TAGGGTAATCTTCAGGTAAAAAGAGCTCCAACTTGAAAACTCCTCCTTCATAAGGTGATT
GAGAAGGACCAAGAACCATGACGTTGAAGTATCGCATGTTATCCTCAGATGGAGATGCAC
TTATCCCTGGAGCAGGTTCACTGAGCAGGCGTTGAGTTTCCTTGATAATTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG45JQ U 344
AF RR2A781JQ U 1
BS 1 593 RR2A781JQ

RD RR2BG45JQ 164 0 0
G
TCAAGACAGATTCTTCCAAGCTTATCAATGTTAGGATGGTAAATCTTGGTGAGAAACCTA
ACCTTGGGGGCTGACATAGGGTAATCTTCAGGTAAAAAGAGCTCCAACTTGAAAACTCCT
CCTTCATAAGGTGATTGAGAAGGACCAAGAACCATGACGTTGA

QA 2 164 2 164
DS 

RD RR2A781JQ 593 0 0
AAACCTTTTGATTCAACGGAACTTTGAAAACCTATTAGTAATCATACAATAAGAAGAAGC
AACACATAACTTTTATCCCTTTGACGTTGAGATAGATTACCACCGAATGTAATGTTCTTT
GGGAATGAATGAAATCTTTTAACCCTCCCATCCATCATGCGCCGCTTGCGTAAAGACGGG
TCCATTCTTTAGCTGTTTCCACAGCTTCTGCCTCATTACTCTTCCAATGCTTAGCGATGT
TCTCAAACAATGGATCATCAGGGTTTGGTGCACTCAAAAAAGCTTGAATACTCAAGAGCA
CTGTTCGTATTTGTAGAGCAGGGCTCCATTTGTCTTTCAGAATGTCAAGACAGATTCTTC
CAAGCTTATCAATGTTAGGATGGTAAATCTTGGTGAGAAACCTAACCTTGGGGGCTGACA
TAGGGTAATCTTCAGGTAAAAAGAGCTCCAACTTGAAAACTCCTCCTTCATAAGGTGATT
GAGAAGGACCAAGAACCATGACGTTGAAGTATCGCATGTTATCCTCAGATGGAGATGCAC
TTATCCCTGGAGCAGGTTCACTGAGCAGGCGTTGAGTTTCCTTGATAATTCTT

QA 1 593 1 593
DS 



CO CL1078Contig2 657 2 2 U
GCGTTTGGAAATGCAACTAGTAAATGTCTTGAACATATAAGTTAATGATACAATCATTCA
GAGAGATTACAACTTCGTAATGAGGGGGAAGAACCAGCAAAGGATAAGATTTAACCAAAT
GTAATGTTATTTGATGGATGAGCGAGAGACACTGCATCATTCGCCACTTGCGTAAAGACG
AGTCCATTCCTTAGCTGTCTCCACAGCTTCTGCCTCGTCACTCTTCCAATGCTTAGCGAT
GTTCTCGGACAAGGGATCATCAGGGTTTGGTGCACTCAGCAGAACTTGGATACTTAAAAG
CACAGTTCGTATTTGTAGAGCAGGGCTCCATTTGTCTTTCAGAATATCAAGACAAATTCT
TCCAAGCTTATCAATATTAGGATGGTATATCTTGGTGAGAAACCTAACCTTGGGAGCTGA
CATAGGGTATTCTTCAGGTAAAAAGAGCTCCAACTTGAAAACTCCTCCTTCATAAGGTGA
TTGAGAAGGACCAAGAACCATAACGTTGAAGTAACGCATGTTCTCCTCAGATGGAGACGC
ACTTATACCAGGAGCAGGTTCACTGAGCAGACGTTGAGTTTCCTTGATGATTCTTCGGGG
AAGGTTACTGTTGGCCGTTATCGCTCGCTGCTAAGCTCGATCGATCGATCGATAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G409JQ U 1
AF RR2EJ81JQ U 19
BS 1 475 RR2G409JQ
BS 476 657 RR2EJ81JQ

RD RR2G409JQ 475 0 0
GCGTTTGGAAATGCAACTAGTAAATGTCTTGAACATATAAGTTAATGATACAATCATTCA
GAGAGATTACAACTTCGTAATGAGGGGGAAGAACCAGCAAAGGATAAGATTTAACCAAAT
GTAATGTTATTTGATGGATGAGCGAGAGACACTGCATCATTCGCCACTTGCGTAAAGACG
AGTCCATTCCTTAGCTGTCTCCACAGCTTCTGCCTCGTCACTCTTCCAATGCTTAGCGAT
GTTCTCGGACAAGGGATCATCAGGGTTTGGTGCACTCAGCAGAACTTGGATACTTAAAAG
CACAGTTCGTATTTGTAGAGCAGGGCTCCATTTGTCTTTCAGAATATCAAGACAAATTCT
TCCAAGCTTATCAATATTAGGATGGTATATCTTGGTGAGAAACCTAACCTTGGGAGCTGA
CATAGGGTATTCTTCAGGTAAAAAGAGCTCCAACTTGAAAACTCCTCCTTCATAA

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2EJ81JQ 639 0 0
G
GTAAATGTCTTGAACATATAAGTTAATGATACAATCATTCAGAGAGATTACAACTTCGTA
ATGAGGGGGAAGAACCAGCAAAGGATAAGATTTAACCAAATGTAATGTTATTTGATGGAT
GAGCGAGAGACACTGCATCATTCGCCACTTGCGTAAAGACGAGTCCATTCCTTAGCTGTC
TCCACAGCTTCTGCCTCGTTACTCTTCCAATGCTTAGCGATGTTCTCGGACAAGGGATCA
TCAGGGTTTGGTGCACTCAGCAGAGCTTGGATACTTAAAAGCACAGTTCGTATTTGTAGA
GCAGGGCTCCATTTGTCTTTCAGAATATCAAGACAAATTCTTCCAAGCTTATCAATATTA
GGATGGTATATCTTGGTGAGAAACCTAACCTTGGGAGCTGACATAGGGTATTCTTCAGGT
AAAAAGAGCTCCAACTTGAAAACTCCTCCTTCATAAGGTGATTGAGAAGGACCAAGAACC
ATAACGTTGAAGTAACGCATGTTCTCCTCAGATGGAGACGCACTTATACCAGGAGCAGGT
TCACTGAGCAGACGTTGAGTTTCCTTGATGATTCTTCGGGGAAGGTTACTGTTGGCCGTT
ATCGCTCGCTGCTAAGCTCGATCGATCGATCGATAAGA

QA 2 639 2 639
DS 



AS 2 7

CO CL1079Contig1 631 3 5 U
GGATTGCTCTCTCAAGAAACAAGAAAAGGAAAATGATGTCATCAATGGCACTCCACTCAT
CTGCTTCCCTCTGCTCCTCTTTCATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCATCAAAGCTTCTC
CCTCGTTCCTTAACCAATCCACCAAACCCATCTCTCTAAACCGGAGAACCGTGGCTCTTA
CAGCTCCAGAGACCCTCACATCTGAACCAGTCACCGGAAATCTTGATACTTCCGACACTC
CACAGCCAAAACAGGTGGTGAATCAACAAGATGAGAAGGCAAGAGTGGTTCTCAAGTTTG
TGTGGATGGAGAAGAACATAGGATTAGGATTGGACCAGCATGTTCCTGGACATGGCACAA
TCCCACTGAGTCCTTACTTCTTCTGGCCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTA
CTCTTGAAGCCAAGCCATGGATCTCTCAGAAGAAGATGATTATTCTCCTTAATCAAGCTA
CTGACATCATCAATCTCTGGCAACAAAGTGGCGGCAACTTAACTTCCCAATAATCTCTCC
TCTTTTTATTTATTTTATTTTGCAATTCAAGAACTCAAACTCATTTTTCCATTGTCTATT
GATATTTTGCTATTCAGAGTTACTTGTTACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB36TF U 1
AF RR2CR38JQ C 22
AF RR2CR38TF U 22
BS 1 217 RR2EB36TF
BS 218 218 RR2CR38TF
BS 219 378 RR2EB36TF
BS 379 379 RR2CR38TF
BS 380 631 RR2EB36TF

RD RR2EB36TF 631 0 0
GGATTGCTCTCTCAAGAAACAAGAAAAGGAAAATGATGTCATCAATGGCACTCCACTCAT
CTGCTTCCCTCTGCTCCTCTTTCATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCATCAAAGCTTCTC
CCTCGTTCCTTAACCAATCCACCAAACCCATCTCTCTAAACCGGAGAACCGTGGCTCTTA
CAGCTCCAGAGACCCTCACATCTGAACCAGTCACCGGCAATCTTGATACTTCCGACACTC
CACAGCCAAAACAGGTGGTGAATCAACAAGATGAGAAGGCAAGAGTGGTTCTCAAGTTTG
TGTGGATGGAGAAGAACATAGGATTAGGATTGGACCAGCATGTTCCTGGACATGGCACAA
TCCCACTGAGTCCTTACTCCTTCTGGCCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTA
CTCTTGAAGCCAAGCCATGGATCTCTCAGAAGAAGATGATTATTCTCCTTAATCAAGCTA
CTGACATCATCAATCTCTGGCAACAAAGTGGCGGCAACTTAACTTCCCAATAATCTCTCC
TCTTTTTATTTATTTTATTTTGCAATTCAAGAACTCAAACTCATTTTTCCATTGTCTATT
GATATTTTGCTATTCAGAGTTACTTGTTACA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2CR38JQ 594 0 0
G
GAAAAGGAAAATGATGTCATCAATGGCACTCCACTCATCTGCTTCCCTCTGCTCCTCTTT
CATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCATCAAAGCTTCTCCCTCGTTCCTTAACCAATCCAC
CAAACCCATCTCTCTAAACCGGAGAACCGTGGCTCTTACAGCTCCAGAGACCCTCACATC
TGAACCAGTCACCGGAAATCTTGATACTTCCGACACTCCACAGCCAAAACAGGTGGTGAA
TCAACAAGATGAGAAGGCAAGAGTGGTTCTCAAGTTTGTGTGGATGGAGAAGAACATAGG
ATTAGGATTGGACCAGCATGTTCCTGGACATGGCACAATCCCACTGAGTCCTTACTTCTT
CTGGCCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTACTCTTGAAGCCAAGCCATGGAT
CTCTCAGAAGAAGATGATTATTCTCCTTAATCAAGCTACTGACATCATCAATCTCTGGCA
ACAAAGTGGCGGCAACTTAACTTCCCAATAATCTCTCCTCTTTTTATTTATTTTATTTTG
CAATTCAAGAACTCAAACTCATTTTTCCATTGTCTATTGATATTTTGCTATTC

QA 2 594 2 594
DS 

RD RR2CR38TF 594 0 0
G
GAAAAGGAAAATGATGTCATCAATGGCACTCCACTCATCTGCTTCCCTCTGCTCCTCTTT
CATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCATCAAAGCTTCTCCCTCGTTCCTTAACCAATCCAC
CAAACCCATCTCTCTAAACCGGAGAACCGTGGCTCTTACAGCTCCAGAGACCCTCACATC
TGAACCAGTCACCGGAAATCTTGATACTTCCGACACTCCACAGCCAAAACAGGTGGTGAA
TCAACAAGATGAGAAGGCAAGAGTGGTTCTCAAGTTTGTGTGGATGGAGAAGAACATAGG
ATTAGGATTGGACCAGCATGTTCCTGGACATGGCACAATCCCACTGAGTCCTTACTTCTT
CTGGCCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTACTCTTGAAGCCAAGCCATGGAT
CTCTCAGAAGAAGATGATTATTCTCCTTAATCAAGCTACTGACATCATCAATCTCTGGCA
ACAAAGTGGCGGCAACTTAACTTCCCAATAATCTCTCCTCTTTTTATTTATTTTATTTTG
CAATTCAAGAACTCAAACTCATTTTTCCATTGTCTATTGATATTTTGCTATTC

QA 2 594 2 594
DS 



CO CL1079Contig2 721 4 2 U
GGACCATATCTTCTTTCTTATCCATTTGTCATAAAATCTCCATTAGCTCTCTCAAGAAAC
AAGAAAAAGAAAATGATGTCATCAATGGCACTTCACTCATCTGCTTCCCTCTGCTCTTCT
TTCATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCATCAAAGCTTCTCCCTCGTTCCTTAACCAGTCT
ACTAAACCCATCTCTCTAAACCGGAAAACCGTGGTGGCTCTTGCAGCTCCAGAGACCCTC
ACATCTGAACCAGTCACCGGCATTGATACTTCCGACACTCCACAGCCAAAACAGGTGAAG
AATCAACAAGATGAGAAGGCAAGAGTGGTTCTCAAGTTTGTGTGGATGGAGAAGAACATA
GGATTAGGATTGGACCAGCATGTTCCTGGACATGGCACAATCCCACTGAGTCCTTACTTC
TTCTGGCCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTACTCTTGAAGCCAAGCCATGG
ATCTCTCAGAAGAAGATGATTATTCTCCTTAATCAAGCTACTGACATCATCAATCTCTGG
CAACAAAGTGGCGGCAACTTAACTTCCCAATAATCTTCTCTCTTTTTTTTTCTTTTTTTG
CAATTCAAGAACTCAACTCATTTTTCCTCCATTGTCTTATTGATATTTTGCTATTCAGAG
TTATTTGTTACCACCATATCTAAACAATACCTCCTCCATAATATTGAAACTTATCAAGGG
C


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2AX33TFB U 41
AF RR2H728JQB C 1
AF RR2H728TF U 1
AF RR2AX33JQ C 600
BS 1 661 RR2H728TF
BS 662 721 RR2AX33JQ

RD RR2AX33TFB 278 0 0
GGGGT
GCTCTCTCAAGAAACAAGAAAAAGAAAATGATGTCATCAATGGGACTTCACTCATCTGCT
TCCCTCTGCTCTTCTTTCATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCATCAAAGCTTCTCCCTCG
TTCCTTAACCAGTCCACTAAACCCATCTCTCTAAACCGGAAAACCGTGGTGGCTCTTGCA
GCTCCAGGGACCCTCACATCTGAACCAGTCACCGGCATTGATACTTCCGACACTCCACAG
CCAAAACAGGTGAAGAATCAACAAGATGAGAAG

QA 6 278 6 278
DS 

RD RR2H728JQB 662 0 0
GGACCATATCTTCTTTCTTATCCATTTGTCATAAAATCTCCATT*GCTCTCTCAAGAAAC
AAGAAAAAGAAAATGATGTCATCAATGGCACTTCACTCATCTGCTTCCCTCTGCTCTTCT
TTCATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCATCAAAGCTTCTCCCTCGTTCCTTAACCAGTCT
ACTAAACCCATCTCTCTAAACCGGAAAACCGTGGTGGCTCTTGCAGCTCCAGAGACCCTC
ACATTTGAACCAGTCACCGGCATTGATACTTCCGACACTCCACAGCCAAAACAGGTGAAG
AATCAACAAGATGAGAAGGCAAGAGTGGTTCTCAAGTTTGTGTGGATGGAGAAGAACATA
GGATTAGGATTGGACCAGCATGTTCCTGGACATGGCACAATCCCACTGAGTCCTTACTTC
TTCTGGCCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTACTCTTGAAGCCAAGCCATGG
ATCTCTCAGAAGAAGATGATTATTCTCCTTAATCAAGCTACTGACATCATCAATCTCTGG
CAACAAAGTGGCGGCAACTTAACTTCCCAATAATCTTCTCTCTTTTTTTTTCTTTTTTTG
CAATTCAAGAACTCAACTCATTTTTCCTCCATTGTCTTATTGATATTTTGCTATTCAGAG
T
G

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2H728TF 663 0 0
GGACCATATCTTCTTTCTTATCCATTTGTCATAAAATCTCCATTAGCTCTCTCAAGAAAC
AAGAAAAAGAAAATGATGTCATCAATGGCACTTCACTCATCTGCTTCCCTCTGCTCTTCT
TTCATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCATCAAAGCTTCTCCCTCGTTCCTTAACCAGTCT
ACTAAACCCATCTCTCTAAACCGGAAAACCGTGGTGGCTCTTGCAGCTCCAGAGACCCTC
ACATCTGAACCAGTCACCGGCATTGATACTTCCGACACTCCACAGCCAAAACAGGTGAAG
AATCAACAAGATGAGAAGGCAAGAGTGGTTCTCAAGTTTGTGTGGATGGAGAAGAACATA
GGATTAGGATTGGACCAGCATGTTCCTGGACATGGCACAATCCCACTGAGTCCTTACTTC
TTCTGGCCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTCAAGACTACTCTTGAAGCCAAGCCATGG
ATCTCTCAGAAGAAGATGATTATTCTCCTTAATCAAGCTACTGACATCATCAATCTCTGG
CAACAAAGTGGCGGCAACTTAACTTCCCAATAATCTTCTCTCTTTTTTTTTCTTTTTTTG
CAATTCAAGAACTCAACTCATTTTTCCTCCATTGTCTTATTGATATTTTGCTATTCAGAG
T
GA

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2AX33JQ 122 0 0
GCAATTCAAGAACTCAACTCATTTTTCCTCCATTGTCTTATTGATATTTTGCTATTCAGA
GTTATTTGTTACCACCATATCTAAACAATACCTCCTCCATAATATTGAAACTTATCAAGG
GC

QA 1 122 1 122
DS 



AS 1 4

CO CL1080Contig1 1037 4 11 U
CACGTCTCTCAAAATCCATTCATTTCTGGTTCTTCTCGATTAGATTCGTTTTCTTTCTCC
GTTTCATCACAATGAATGGCTTCTCCGATATTAACTCTTCTGTGAGCAAACCTTCGCTCT
CACATCTTACTCCTTTAGAAGCCATTCTCTTTGATGTTGATGGAACTCTCTGTGATTCTG
ATCCATTCCACCTTATCGCCTTCCAACAACTTCTCCAACAGATTGGTTTTAACAACGGTG
TCCTAATCGACGAGAAGTTCTATATTGAGAACATTGCTGGAAAACACAACTCTGAGGTTG
CTCTATCTCTCTTCCCTGATGACGTTGCTAGAGGGTTAACATTCTGTGATAAAAAAGAAG
CTCTTTACCGCAAACTTGTAGCAGAGAAGATAAAGCCACTTGACGGGCTTATAAAACTAA
CCAAATGGATAGAGGAACGTGGACTGAAACGAGCTGCTGTCACAAACGCTCCAAAAGAAA
ACGCAGAGCTCATGATATCAAAACTTGGTCTGACTGACTTCTTCCAGGCGGTGATTCTTG
GGTCCGAATGTGAGTACCCCAAGCCGCACCCGGGGCCTTACTTGAAGGCTCTCGAAGTGC
TTAACGTGTCGAAGGAGCATACGTTAGTGTTCGAGGACTCTGTCCCTGGGATAAAAGCTG
GAGTTGCTGCTGGAATGCCTGTGGTTGGACTGACTACGGGTAATCCAGCGAGCATGCTTA
TGCAAGCAAAACCGGCTTTTCTGATCGAGAACTATGCGGATCCAAAACTGTGGGCTGTGT
TGGAAGAGCTTGATAACAAGGGGAGTTCCCAAAAGTCTTGAGGAGTGAAGAGCTTGTCGT
TGTCTCATTTGTGTGGCTCATAGAGACTAAACAAGTATTAGCAGCCTCTGACATTTACCT
TTTTTTT*ATCTTTGTTGAATATTCTTGTGGGAATTTATGACAATGGGAGCTTTCAAATA
ATTGAAGATGGATGATCAGAAGGGTTATATAATATCTCTATAGCATCTCCAAAAGATACT
CTATGATTTCAAATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ25TF U 1
AF RR2AZ21TFB U 295
AF RR2AZ21JQ C 309
AF RR2BJ25JQ C 246
BS 1 350 RR2BJ25TF
BS 351 351 RR2AZ21TFB
BS 352 644 RR2BJ25TF
BS 645 645 RR2AZ21TFB
BS 646 724 RR2BJ25TF
BS 725 725 RR2AZ21TFB
BS 726 766 RR2BJ25TF
BS 767 767 RR2AZ21TFB
BS 768 784 RR2BJ25TF
BS 785 976 RR2AZ21TFB
BS 977 1037 RR2BJ25JQ

RD RR2BJ25TF 784 0 0
CACGTCTCTCAAAATCCATTCATTTCTGGTTCTTCTCGATTAGATTCGTTTTCTTTCTCC
GTTTCATCACAATGAATGGCTTCTCCGATATTAACTCTTCTGTGAGCAAACCTTCGCTCT
CACATCTTACTCCTTTAGAAGCCATTCTCTTTGATGTTGATGGAACTCTCTGTGATTCTG
ATCCATTCCACCTTATCGCCTTCCAACAACTTCTCCAACAGATTGGTTTTAACAACGGTG
TCCTAATCGACGAGAAGTTCTATATTGAGAACATTGCTGGAAAACACAACTCTGAGGTTG
CTCTATCTCTCTTCCCTGATGACGTTGCTAGAGGGTTAACATTCTGTGATGAAAAAGAAG
CTCTTTACCGCAAACTTGTAGCAGAGAAGATAAAGCCACTTGACGGGCTTATAAAACTAA
CCAAATGGATAGAGGAACGTGGACTGAAACGAGCTGCTGTCACAAACGCTCCAAAAGAAA
ACGCAGAGCTCATGATATCAAAACTTGGTCTGACTGACTTCTTCCAGGCGGTGATTCTTG
GGTCCGAATGTGAGTACCCCAAGCCGCACCCGGGGCCTTACTTGAAGGCTCTCGAAGTGC
TTAACGTGTCGAAGGAGCATACGTTAGTGTTCGAGGACTCTGTCTCTGGGATAAAAGCTG
GAGTTGCTGCTGGAATGCCTGTGGTTGGACTGACTACGGGTAATCCAGCGAGCATGCTTA
TGCAGGCAAAACCGGCTTTTCTGATCGAGAACTATGCGGATCCAAA*CTGTGGGCTGTGT
TGGA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2AZ21TFB 682 0 0
G
GGTTGCTCTATCTCTCTTCCCTGATGACGTTGCTAGAGGGTTAACATTCTGTGATAAAAA
AGAAGCTCTTTACCGCAAACTTGTAGCAGAGAAGATAAAGCCACTTGACGGGCTTATAAA
ACTAACCAAATGGATAGAGGAACGTGGACTGAAACGAGCTGCTGTCACAAACGCTCCAAA
AGAAAACGCAGAGCTCATGATATCAAAACTTGGTCTGACTGACTTCTTCCAGGCGGTGAT
TCTTGGGTCTGAATGTGAGTACCCCAAGCCGCACCCGGGGCCTTACTTGAAGGCTCTCGA
AGTGCTTAACGTGTCGA*GGAGCATACGTTAGTGTTCGAGGACTCTGTCCCTGGGATAAA
AGCTGGAGTTGCTGCTGGAATGCCTGTGGTTGGACTGACTACGGGTAATCCAGCGAGCAT
GCTTATGCAAGCAAAACCGGCTTTTCTGATCGAGAACTATGCGGATCCAAAACTGTGGGC
TGTGTTGGAAGAGCTTGATAACAAGGGGAGTTCCCAAAAGTCTTGAGGAGTGAAGAGCTT
GTCGTTGTCTCATTTGTGTGGCTCATAGAGACTAAACAAGTATTAGCAGCCTCTGACATT
TACCTTTTTTTT*ATCTTTGTTGAATATTCTTGTGGGAATTTATGACAATGGGAGCTTTC
AAATAATTGAAGATGGATGAT

QA 2 682 2 682
DS 

RD RR2AZ21JQ 682 0 0
CTCTTCCCTGATGACGTTGCTAGAGGGTTAACATTCTGTGATAAAAAAGAAGCTCTTTAC
CGCAAACTTGTAGCAGAGAAGATAAAGCCACTTGACGGGCTTATAAAACTAACCAAATGG
ATAGAGGAACGTGGACTGAAACGAGCTGCTGTCACAAACGCTCCAAAAGAAAACGCAGAG
CTCATGATATCAAAACTTGGTCTGACTGACTTCTTCCAGGCGGTGATTCTTGGGTCTGAA
TGTGAGTACCCCAAGCCGCACCCGGGGCCTTACTTGAAGGCTCTCGAAGTGCTTAACGTG
TCGA*GGAGCATACGTTAGTGTTCGAGGACTCTGTCCCTGGGATAAAAGCTGGAGTTGCT
GCTGGAATGCCTGTGGTTGGACTGACTACGGGTAATCCAGCGAGCATGCTTATGCAAGCA
AAACCGGCTTTTCTGATCGAGAACTATGCGGATCCAAAACTGTGGGCTGTGTTGGAAGAG
CTTGATAACAAGGGGAGTTCCCAAAAGTCTTGAGGAGTGAAGAGCTTGTCGTTGTCTCAT
TTGTGTGGCTCATAGAGACTAAACAAGTATTAGCAGCCTCTGACATTTACCTTTTTTTT*
ATCTTTGTTGAATATTCTTGTGGGAATTTATGACAATGGGAGCTTTCAAATAATTGAAGA
TGGATGATCAGAAGGGTTATA
C

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2BJ25JQ 792 0 0
ATCGACGAGAAGTTCTATATTGAGAACATTGCTGGAAAACACAACTCTGAGGTTGCTCTA
TCTCTCTTCCCTGATGACGTTGCTAGAGGGTTAACATTCTGTGATGAAAAAGAAGCTCTT
TACCGCAAACTTGTAGCAGAGAAGATAAAGCCACTTGACGGGCTTATAAAACTAACCAAA
TGGATAGAGGAACGTGGACTGAAACGAGCTGCTGTCACAAACGCTCCAAAAGAAAACGCA
GAGCTCATGATATCAAAACTTGGTCTGACTGACTTCTTCCAGGCGGTGATTCTTGGGTCC
GAATGTGAGTACCCCAAGCCGCACCCGGGGCCTTACTTGAAGGCTCTCGAAGTGCTTAAC
GTGTCGAAGGAGCATACGTTAGTGTTCGAGGACTCTGTCTCTGGGATAAAAGCTGGAGTT
GCTGCTGGAATGCCTGTGGTTGGACTGACTACGGGTAATCCAGCGAGCATGCTTATGCAG
GCAAAACCGGCTTTTCTGATCGAGAACTATGCGGATCCAAAACTGTGGGCTGTGTTGGAA
GAGCTTGATAACAAGGGGAGTTCCCAAAAGTCTTGAGGAGTGAAGAGCTTGTCGTTGTCT
CATTTGTGTGGCTCATAG**ACTAAACAAGTATTAGCAGCCTCTGACATTTACCTTTTTT
TTTATCTTTGTTGAATATTCTTGTGGGAATTTATGACAATGGGAGCTTTCAAATAATTGA
AGATGGATGATCAGAAGGGTTATATAATATCTCTATAGCATCTCCAAAAGATACTCTATG
ATTTCAAATATG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 4

CO CL1081Contig1 1116 4 22 U
GGCGGATATTTGATGTATACATATGACAAATTTTACATTAACAACAGTGATGAATAAAAA
AACTAACTTTTTGTAAAACTCCCATCAAATTTGTCATGTATTAATTCCATCTGTCTCAGT
TCATTGATTACAAAGAGTTAAAAAGAATGAAGAGAAGTGGTTGTTCTTGTGCCTTCTCTA
GCCAATCTTCCTCATGCAAAGCTTCAGTTTCTAAGCTTTGGACCGGTAACTAGCAGCATT
CCTTCTCGCGCAGCACCCAACAAAGTACACCATTGACAAGATAAGGAACAGAACCACGTT
GAACATTGCAACAAGTCTCCACTCGGTTTTT*ATGTACTGAGCTACTCCAGCTTTGCAAG
AATCACAGTTGTAGCACTTGACGGTCCTCGAATTCTTGTAAAGCTTACAATCTTTGTTAG
AACTTATTGAATGAAAGCTCAAGTCATAGTAAGAACCATTCACCGCAGGATAACCACACT
CAGATGGTGGTCGACAGCATCCAGCTTCTATTGGGGTTAACTCTGCAGATTTCAACTGTT
TGATGGTCTTGTATTTCTTTGAGAGCTTCCTGCATTGCTCGGATTTAACAAGGCAGCTCT
TGAGTCTTTTCCAGTGATTGGTGTTGTTAAGCTGTTTTAGAAACCATGAGCTGTAATCAT
TCAGCTTATACTCCTTGTACCTTAAACCAGGGTTGGTATGCCCTGACCCGTTGTTTGTAA
CAATGAACGCTAATACGTAAAGACAAGAATGGCGATCAAAACGATCAGGAGCACAACAAG
ATAAATCCAAAGAAGCGCCACGCTTCTCTTGCAGGCGCCAAGAAACCCGATTATGGATAT
GAAGAAGATGAAACCACCGAGAGCTAAGACAGGAAACGTAAGAGACCTTCTGCATCCATC
ATTGTGTGTACTCATCCACACCCCAAATATTATCACTGCCACAGCCAATAGCATAGTAAG
AAGATTGACCCATCTGATAACGAAGGTGCTTGTGCCCATACCCATTTATCTCTTCAAGCT
TCCTGCTTCTATAAAAGGAAACTTCTCCAAAGAAAAAAGAAAGATGCAAACTTTGGTTCC
AGGGTCTTGCAAGCAAGAAAACAAAGGGGTGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN55JQ U 173
AF RR2DD33JQ U 1
AF RR2BJ39JQ U 81
AF RR2BJ39TF C 245
BS 1 233 RR2DD33JQ
BS 234 234 RR2AN55JQ
BS 235 281 RR2DD33JQ
BS 282 282 RR2BJ39JQ
BS 283 330 RR2DD33JQ
BS 331 331 RR2AN55JQ
BS 332 332 RR2BJ39JQ
BS 333 427 RR2DD33JQ
BS 428 428 RR2BJ39JQ
BS 429 458 RR2DD33JQ
BS 459 459 RR2BJ39JQ
BS 460 511 RR2DD33JQ
BS 512 512 RR2BJ39JQ
BS 513 551 RR2DD33JQ
BS 552 552 RR2BJ39JQ
BS 553 592 RR2DD33JQ
BS 593 593 RR2BJ39JQ
BS 594 619 RR2DD33JQ
BS 620 620 RR2BJ39JQ
BS 621 736 RR2DD33JQ
BS 737 922 RR2BJ39JQ
BS 923 1116 RR2BJ39TF

RD RR2AN55JQ 178 0 0
CTTCTCTAGCCAATCTTCCTCATGCAAAGCTTCAGTTTCTAAGCTTTGGACCGGTAACTA
GCAGCATTCCTTCTCGCGCAGCACCCAACAAAGTACACCATTGACAAGACAAGGAACAGA
ACAACGTTGAACATTGCAACAAGTCTCCACTCGGTTTTTCATGTACTGAGCTACTCCA

QA 1 178 1 178
DS 

RD RR2DD33JQ 744 0 0
GGCGGATATTTGATGTATACATATGACAAATTTTACATTAACAACAGTGATGAATAAAAA
AACTAACTTTTTGTAAAACTCCCATCAAATTTGTCATGTATTAATTCCATCTGTCTCAGT
TCATTGATTACAAAGAGTTAAAAAGAATGAAGAGAAGTGGTTGTTCTTGTGCCTTCTCTA
GCCAATCTTCCTCATGCAAAGCTTCAGTTTCTAAGCTTTGGACCGGTAACTAGAAGCATT
CCTTCTCGCGCAGCACCCAACAAAGTACACCATTGACAAGACAAGGAACAGAACCACGTT
GAACATTGCAACAAGTCTCCACTCGGTTTT*CATGTACTGAGCTACTCCAGCTTTGCAAG
AATCACAGTTGTAGCACTTGACGGTCCTCGAATTCTTGTAAAGCTTACAATCTTTGTTAG
AACTTATGGAATGAAAGCTCAAGTCATAGTAAGAACCACTCACCGCAGGATAACCACACT
CAGATGGTGGTCGACAGCATCCAGCTTCTATCGGGGTTAACTCTGCAGATTTCAACTGTT
TGATGGTCTTGAATTTCTTTGAGAGCTTCCTGCATTGCTCGGATTTAACAAGACAGCTCT
TGAGTCTTTTCCAGTGATTCGTGTTGTTAAGCTGTTTTAGAAACCATGAGCTGTAATCAT
TCAGCTTATACTCCTTGTACCTTAAACCAGGGTTGGTATGCCCTGACCCGTTGTTTGTAA
CAATGAACGCTAATAC
TGTAAAGA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2BJ39JQ 842 0 0
CCCATCAAATTTGTCATGTATTAATTCCATCTGTCTCAGTTCATTGATTACAAAGAGTTA
AAAAGAATGAAGAGAAGTGGTTGTTCTTGTGCCTTCTCTAGCCAATCTTCCTCATGCAAA
CCTTCAGTTTCTAAGCTTTGGACCGGTAACTAGCAGCATTCCTTCTCGCGCAGCACCCAA
CAAAGTACACCATTGACAAGATAAGGAACAGAACCACGTTGAACATTGCAACAAGTCTCC
ACTCGGTTTTT*ATGTACTGAGCTACTCCAGCTTTGCAAGAATCACAGTTGTAGCACTTG
ACGGTCCTCGAATTCTTGTAAAGCTTACAATCTTTGTTAGAACTTATTGAATGAAAGCTC
AAGTCATAGTAAGAACCATTCACCGCAGGATAACCACACTCAGATGGTGGTCGACAGCAT
CCAGCTTCTATTGGGGTTAACTCTGCAGATTTCAACTGTTTGATGGTCTTGTATTTCTTT
GAGAGCTTCCTGCATTGCTCGGATTTAACAAGGCAGCTCTTGAGTCTTTTCCAGTGATTG
GTGTTGTTAAGCTGTTTTAGAAACCATGAGCTGTAATCATTCAGCTTATACTCCTTGTAC
CTTAAACCAGGGTTGGTATGCCCTGACCCGTTGTTTGTAACAATGAACGCTAATACGTAA
AGACAAGAATGGCGATCAAAACGATCAGGAGCACAACAAGATAAATCCAAAGAAGCGCCA
CGCTTCTCTTGCAGGCGCCAAGAAACCCGATTATGGATATGAAGAAGATGAAACCACCGA
GAGCTAAGACAGGAAACGTAAGAGACCTTCTGCATCCATCATTGTGTGTACTCATCCACA
CC

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR2BJ39TF 872 0 0
CTCGCGCAGCACCCAACAAAGTACACCATTGACAAGATAAGGAACAGAACCACGTTGAAC
ATTGCAACAAGTCTCCACTCGGTTTTT*ATGTACTGAGCTACTCCAGCTTTGCAAGAATC
ACAGTTGTAGCACTTGACGGTCCTCGAATTCTTGTAAAGCTTACAATCTTTGTTAGAACT
TATTGAATGAAAGCTCAAGTCATAGTAAGAACCATTCACCGCAGGATAACCACACTCAGA
TGGTGGTCGACAGCATCCAGCTTCTATTGGGGTTAACTCTGCAGATTTCAACTGTTTGAT
GGTCTTGTATTTCTTTGAGAGCTTCCTGCATTGCTCGGATTTAACAAGGCAGCTCTTGAG
TCTTTTCCAGTGATTGGTGTTGTTAAGCTGTTTTAGAAACCATGAGCTGTAATCATTCAG
CTTATACTCCTTGTACCTTAAACCAGGGTTGGTATGCCCTGACCCGTTGTTTGTAACAAT
GAACGCTAATACGTAAAGACAAGAATGGCGATCAAAACGATCAGGAGCACAACAAGATAA
ATCCAAAGAAGCGCCACGCTTCTCTTGCAGGCGCCAAGAAACCCGATTATGGATATGAAG
AAGATGAAACCACCGAGAGCTAAGACAGGAAACGTAAGAGACCTTCTGCATCCATCATTG
TGTGTACTCATCCACACCCCAAATATTATCACTGCCACAGCCAATAGCATAGTAAGAAGA
TTGACCCATCTGATAACGAAGGTGCTTGTGCCCATACCCATTTATCTCTTCAAGCTTCCT
GCTTCTATAAAAGGAAACTTCTCCAAAGAAAAAAGAAAGATGCAAACTTTGGTTCCAGGG
TCTTGCAAGCAAGAAAACAAAGGGGTGAGTCC

QA 1 872 1 872
DS 



AS 1 7

CO CL1082Contig1 1604 7 39 U
GGATATTATATAAATAGTACTTTACGTCGACGAAACTTAAAAAGAAAACTGGTTTATGAT
ATGGCTCCTATCATCCTAAGAAATAGTTACACCATCGTACCCTCTGAACCTACATGGGCT
GGTTGTTTTCCATTAGCCGAATGGGATCTAGTTGGTACTATAACTCACGTTCCTACCGTT
TACTTCTACAACAAGCCATCTGAATCGTTCCAGGGCAATGTAGTCGAAACCCTAAGAAAC
TCGTTGAGCCGTGCTCTTTTTCACTTCTACCCTACGGCCGGCCGTCTTAGGTGGCTCCCT
CGGGGCCGGTTAGAGCTAGATTGTAACGCCGAGGGAGTGTCATTCATGGAAGCCGAGTCC
GAGGCAAAGCTTTCAAATTTCAACGATTTCTCTCCAACGCCAGAATTTGAAAAACTTGTT
CCGCAAGTTGACTACAAACACCCTATTGAAACGATCCCTCTCTTCTTAGCTCAGGTCACC
AGATTTAAATGCGGCGGGATAAGCCTCGGCGTCAGCATTTCACACGCTGTGGTCGATGGA
CAAAGCGCGTTTCACTTCTTGTCGGAATGGGGAAGAATCGCTCGTGGGGAACCTCTTGAA
ACCATTCCAATTCTCGACCGCAAAATCCTCTGGACTGGTGAACCGCTTCCGCCGTTTGCC
TCGCCACCTCAGTGCGAACGTAAAGGGTTTGAACAGCCGCCGTTACTGATCGGAGAAACT
GACAATGTAGAAGAAAGAAAGAAGAAAACAACTGTAGAGATACTAAAACTTAGCAAAACT
CAGCTTGAAAAGCTTAGAAGCAGAGTGAATGCAAGTGAATACGCTGATCCAGCTAGAGGG
TTTACAAGGTACGAGACGGTCGCGGGACATGTGTGGAGGTGCGCTTCTAAAGCACGTGGG
CACTCCCCAGAGCAACCCACGTCTCTGGGAATCTGTGTAGATACTCGTAGTCGGGTGCAG
CCACCTCTACCACGCGGCTACTTTGGCAATGCCACTATTAATGCGGTCGCAAGAAGCACC
TCAGGTGAACTCATATCGAATGGG*TTGGGTTTCGCCGCCGAAAAAATCAGTGAAGCCAT
AAAAAGTGTGACAAACGAATACGTAATGAATGGG*ATAGAGTATCTAAAAAACCACGAGG
ATCTGAAGACGTTTCAAGATATACGTGCCTTGGGAAGCACGGAAGGTCCATTCTACGGAA
ACCCTAATCTTGGACTTGTGAGCTGGTTAACTCTACCGATGTACGGCCTTGATTTCGGGT
GGGGCAAGGAGGTCCACATGGGACCATGCACGCATGACGGAGACGGGGGCTCTCTGCTAC
TGCCTGATAAAAATGATGACGGCTCGCTGATTCTCGCCACGTGTCTACAGGTAGCTCACA
TGGAGGCCTTCAAGAAACATTTATATGAAGATATCTAGGGTTGTCTTAGTAAAAAAA***
GAAGATATCTAGGGTTCTATATATACACACAAGTATTCATATATCTATGCATTTTCATTT
CCATTTGAATAAGGATTCGAGTAGGGATTCTACTACTGTTGGTGTGATTCTTGATTTGTA
TTAACAAATTTACACATATATAATTACACTTTATATTTTTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV32TF U 1
AF RR2BW84TF U 114
AF RR2B291TF U 375
AF RR2E759TF U 614
AF RR2BW84JQ C 782
AF RR2B291JQ C 833
AF RR2E759JQ C 910
BS 1 274 RR2BV32TF
BS 275 275 RR2BW84TF
BS 276 388 RR2BV32TF
BS 389 389 RR2BW84TF
BS 390 668 RR2BV32TF
BS 669 680 RR2BW84TF
BS 681 681 RR2B291TF
BS 682 756 RR2BW84TF
BS 757 757 RR2B291TF
BS 758 790 RR2BW84TF
BS 791 791 RR2B291TF
BS 792 858 RR2BW84TF
BS 859 859 RR2B291TF
BS 860 886 RR2BW84TF
BS 887 1044 RR2B291TF
BS 1045 1045 RR2E759TF
BS 1046 1114 RR2B291TF
BS 1115 1115 RR2E759TF
BS 1116 1125 RR2B291TF
BS 1126 1184 RR2E759TF
BS 1185 1185 RR2BW84JQ
BS 1186 1258 RR2E759TF
BS 1259 1263 RR2BW84JQ
BS 1264 1264 RR2B291JQ
BS 1265 1311 RR2BW84JQ
BS 1312 1312 RR2B291JQ
BS 1313 1313 RR2BW84JQ
BS 1314 1314 RR2B291JQ
BS 1315 1376 RR2BW84JQ
BS 1377 1377 RR2B291JQ
BS 1378 1422 RR2BW84JQ
BS 1423 1423 RR2B291JQ
BS 1424 1437 RR2BW84JQ
BS 1438 1440 RR2B291JQ
BS 1441 1494 RR2BW84JQ
BS 1495 1495 RR2B291JQ
BS 1496 1581 RR2BW84JQ
BS 1582 1597 RR2B291JQ
BS 1598 1604 RR2E759JQ

RD RR2BV32TF 668 0 0
GGATATTATATAAATAGTACTTTACGTCGACGAAACTTAAAAAGAAAACTGGTTTATGAT
ATGGCTCCTATCATCCTAAGAAATAGTTACACCATCGTACCCTCTGAACCTACATGGGCT
GGTTGTTTTCCATTAGCCGAATGGGATCTAGTTGGTACTATAACTCACGTTCCTACCGTT
TACTTCTACAACAAGCCATCTGAATCGTTCCAGGGCAATGTAGTCGAAACCCTAAGAAAC
TCGTTGAGCCGTGCTCTTTTTCACTTCTACCCTATGGCCGGCCGTCTTAGGTGGCTCCCT
CGGGGCCGGTTAGAGCTAGATTGTAACGCCGAGGGAGTGTCATTCATGGAAGCCGAGTCC
GAGGCAAAGCTTTCAAATTTCAACGATT*CTCTCCAACGCCAGAATTTGAAAAACTTGTT
CCGCAAGTTGACTACAAACACCCTATTGAAACGATCCCTCTCTTCTTAGCTCAGGTCACC
AGATTTAAATGCGGCGGGATAAGCCTCGGCGTCAGCATTTCACACGCTGTGGTCGATGGA
CAAAGCGCGTTTCACTTCTTGTCGGAATGGGGAAGAATCGCTCGTGGGGAACCTCTTGAA
ACCATTCCAATTCTCGACCGCAAAATCCTCTGGACTGGTGAACCGCTTCCGCCGTTTGCC
TCGCCACC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2BW84TF 773 0 0
GG
GGGCTGGTTGTTTTCCATTAGCCGAATGGGATCTAGTTGGTACTATAACTCACGTTCCTA
CCGTTTACTTCTACAACAAGCCATCTGAATCGTTCCAGGGCAATGTAGTCGAAACCCTAA
GAAACTCGTTGAGCCGTGCTCTTTTTCACTTCTACCCTACGGCCGGCCGTCTTAGGTGGC
TCCCTCGGGGCCGGTTAGAGCTAGATTGTAACGCCGAGGGAGTGTCATTCATGGAAGCCG
AGTCCGAGGCAAAGCTTTCAGATTTCAACGATTTCTCTCCAACGCCAGAATTTGAAAAAC
TTGTTCCGCAAGTTGACTACAAACACCCTATTGAAACGATCCCTCTCTTCTTAGCTCAGG
TCACCAGATTTAAATGCGGCGGGATAAGCCTCGGCGTCAGCATTTCACACGCTGTGGTCG
ATGGACAAAGCGCGTTTCACTTCTTGTCGGAATGGGGAAGAATCGCTCGTGGGGAACCTC
TTGAAACCATTCCAATTCTCGACCGCAAAATCCTCTGGACTGGTGAACCGCTTCCGCCGT
TTGCCTCGCCACCTCAGTGCGAACGCAAAGGGTTTGAACAGCCGCCGTTACTGATCGGAG
AAACTGACAATGTAGAAGAAAGAAAGAAGAAAACAACTGTACAGATACTAAAACTTAGCA
AAACTCAGCTTGAAA*GCTTAGAAGCAGAGTGAATGCAAGTGAATACGCTGATCCAGCTA
GAGGGTTTACAAGGTACGAGACG*TCGCGGGACATGTGTGGAGGTGCGCTT

QA 3 773 3 773
DS 

RD RR2B291TF 751 0 0
GG
ATTTCAACGATTTCCCTCCAACGCCAGAATTTGAAAAACTTGTTCCGCAAGTTGACTACA
AACACCCTATTGAAACGATCCCTCTCTTCTTAGCTCAGGTCACCAGATTTAAATGCGGCG
GAATAAGCCTCGGCGTCAGCATTTCACACGCGGTGGTCGACGGACAAAGCGCGTTTCACT
TCTTGTCGGAATGGGGAAGAATCGCTCGTGGGGAACCTCTTGAAACCATTCCAATTCTCG
ACCGCAAAATCCTCTGGACTGGTGAACCGCTTCCGCCGTTTGCCTCGCCACCTCAGTGCG
AACGTAAAGGGTTTGAACAGCCGCCGTTACTGATCGGAGAAACTGACAATGTAGAAGAAA
GAAAGAAGAAAACAACTGTAGAGATACTAAAACTTAGCAAAACTCAGCTTGAAAAGCTTA
GAAGCAGAGTGAATGCAAGTGAATACGCTGATCCAGCTAGAGGGTTTACAAGGTACGAGA
CGGTCGCGGGACATGTGTGGAGGTGCGCTTCTAAAGCACGTGGGCACTCCCCAGAGCAAC
CCACGTCTCTGGGAATCTGTGTAGATACTCGTAGTCGGGTGCAGCCACCTCTACCACGCG
GCTACTTTGGCAATGCCACTATTAATGCGGTCGCAAGAAGCACCTCAGGTGAACTCATAT
CGAATGGGGTTGGGTTTCGCCGCCGAAAAAATCAGTGAAGCCATAAAAAGTGTGACAAAC
GAATACGTAATGAATGGGGATAGAGTATC

QA 3 751 3 751
DS 

RD RR2E759TF 647 0 0
G
CGACCGCAAAATCCTCTGGACTGGTGAACCGCTTCCGCCGTTTGCCTCGCCACCTCAGTG
CGAACGTAAAGGGTTTGAACAGCCGCCGTTACTGATCGGAGAAACTGACAATGTAGAAGA
AAGAAAGAAGAAAACAACTGTAGAGATACTAAAACTTAGCAAAACTCAGCTTGAAAAGCT
TAGAAGCAGAGTGAATGCAAGTGAATACGCTGATCCAGCTAGAGGGTTTACAAGGTACGA
GACGGTCGCGGGACATGTGTGGAGGTGCGCTTCTAAAGC**GTGGGCACTCCCCAGAGCA
ACCCACGTCTCTGGGAATCTGTGTAGATACTCGTAGTTGGGTGCAGCCACCTCTACCACG
CGGCTACTTTGGCAATGCCGCTATTAATGCGGTCGCAAGAAGCACCTCAGGTGAACTCAT
ATCGAATGGG*TTGGGTTTCGCCGCCGAAAAAATCAGTGAATCCATAAAAAGTGTGACAA
ACGAATACGTAATGAATGGG*ATAGAGTATCTAAAAAACCACGAGGATCTGAAGACGTTT
CAAGATATACGTGCCTTGGGAAGCACGGAAAGTCCATTCTACGGAAACCCTAATCTTGGA
CTTGTGAGCTGGTTAACTCTACCGATGTACGGCCTTGATTTCGG
TG

QA 2 645 2 645
DS 

RD RR2BW84JQ 800 0 0
AGCTTGA
AAAGCTTAGAAGCAGAGTGAATGCAAGTGAATACGCTGATCCAGCTAGAGGGTTTACAAG
GTACGAGACGGTCGCGGGACATGTGTGGAGGTGCGCTTCTAAAGCACGTGGGCACTCCCC
AGAGCAACCCACGTCTCTGGGAATCTGTGTAGATACTCGTAGTCGGGTGCAGCCACCTCT
ACCACGCGGCTACTTTGGCAATGCCACTATTAATGCGGTCTCAAGAAGCACCTCAGGTGA
ACTCATATCGAATGGG*TTGGGTTTCGCCGCCGAAAAAATCAGTGAAGCCATAAAAAGTG
TGACAAACGAATACGTAATGAATGGG*ATAGAGTATTTAAAAAACCACGAGGATCTGAAG
ACGTTTCAAGATATACATGCCTTGGGAAGCACGGAAGGTCCATTTTACGGAAACCCTAAT
CTTGGACTTGTGAGCTGGTTAACTCTACCGATGTACGGCCTTGATTTCGGGTGGG*CAAG
GAGGTCCACATGGGACCATGCACGCATGACGGAGACGGGGGCTTTTTGCTACTGCCTGAT
AAAAATGATGACGGCTCGCTGATTCTCGCCACGTGTCTACAGGTAGCTTACATGGAGGCC
TTCAAGAAACATTTATATGAAGATATCTAGGGTTCTCTTAGTAAAAAAAAAAGAAGATAT
CTAGGGTTCTATATATACACACAAGTATTCATATATCTATGCATTT*CATTTCCATTTGA
ATAAGGATTCGAGTAGGGATTCTACTACTGTTGGTGTGATTCTTGATTTGTATTAACAAA
TTTACACATATAT

QA 8 800 8 800
DS 

RD RR2B291JQ 765 0 0
CTAGAGGGTTTACAAGGTACGAGACGGTCGCGGGACATGTGTGGAGGTGCGCTTCTAAAG
CACGTGGGCACTCCCCAGAGCAACCCACGTCTCTGGGAATCTGTGTAGATACTCGTAGTC
GGGTGCAGCCACCTCTACCACGCGGCTACTTTGGCAATGCCACTATTAATGCGGTCGCAA
GAAGCACCTCAGGTGAACTCATATCGAATGGG*TTGGGTTTCGCCGCCGAAAAAATCAGT
GAAGCCATAAAAAGTGTGACAAACGAATACGTAATGAATGGG*ATAGAGTATCTAAAAAA
CCACGAGGATCTGAAGACGTTTCAAGATATACATGCCTTGGGAAGCACGGAAGGTCCATT
TTACGGAAACCCTAATCTTGGACTTGTGAGCTGGTTAACTCTATCGATGTACGGCCTTGA
TTTCGGGTGGGGCAAGGAGGTCCACATGGGACCATGCACGCATGACGGAGACGGGGGCTC
TCTGCTACTGCCTGATAAAAATGATGACGGCTCGCTGATTCTCGCCACGTGTCTACAGGT
AGCTCACATGGAGGCCTTCAAGAAACATTTATATGAAGATATCTAGGGTTGTCTTAGTAA
AAAAA***GAAGATATCTAGGGTTCTATATATACACACAAGTATTCATATATCTATGCAT
TTTCATTTCCATTTGAATAAGGATTCGAGTAGGGATTCTACTACTGTTGGTGTGATTCTT
GATTTGTATTAACAAATTTACACATATATAATTACACTTTATATT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2E759JQ 695 0 0
GAGCAACCCACGTCTCTGGGAATCTGTGTAGATACTCGTAGTTGGGTGCAGCCACCTCTA
CCACGCGGCTACTTTGGCAATGCCGCTATTAATGCGGTCGCAAGAAGCACCTCAGGTGAA
CTCATATCGAATGGG*TTGGGTTTCGCCGCCGAAAAAATCAGTGAATCCATAAAAAGTGT
GACAAACGAATACGTAATGAATGGG*ATAGAGTATCTAAAAAACCACGAGGATCTGAAGA
CGTTTCAAGATATACGTGCCTTGGGAAGCACGGAAGGTCCATTCTACGGAAACCCTAATC
TTGGACTTGTGAGCTGGTTAACTCTACCGATGTACGGCCTTGATTTCGGGTGGGGCAAGG
AGGTCCACATGGGACCATGCACGCATGACGGAGACGGGGGCTCTCTGCTACTGCCTGATA
AAAATGATGACGGCTCGCTGATTCTCGCCACGTGTCTACAGGTAGCTCACATGGAGGCCT
TCAAGAAACATTTATATGAAGATATCTAGGGTTGTCTTAGTAAAAAAA***GAAGATATC
TAGGGTTCTATATATACACACAAGTATTCATATATCTATGCATTTTCATTTCCATTTGAA
TAAGGATTCGAGTAGGGGTTCTACTACTGTTGGTGTGATTCTTGATTTGTATTAACAAAT
TTACACATATATAATTACACTTTATATTTTTGCTT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 2 6

CO CL1083Contig1 798 4 5 U
GGGTAGCTCTTCCTCTCGTATCTTCTTCGCCCAGACAAGAAGCCGCCTTTATCCGAAGAG
TTTTTAGGGTTTCCATTTCTTTCCCTTGTCGTACAATCAAAATCTTCGAAACCCTAATAT
TAAGAGCAGGCTTCAGATATCCTTGTCTGTTTGTTCCCTCGGGTTCATGTCTGATCTTGA
AGTTCAAGTCCCCACTGCCTTTGATCCGTTTGCTGATGCAAATGCTGAGGACGCTGGAGC
TGGAGCTGGAACAAAGGAATACGTGCACATACGTGTTCAGCAGCGTAATGGTAGAAAAAG
CCTGACCACTGTCCAGGGCCTTAAGAAAGAGTACAGCTATACCAAGATCCTTAAAGACCT
CAAGAAAGAGTTCTGCTGCAATGGCACTGTCGTCCAGGACTCTGAACTAGGACAGGTTAT
TCAGCTACAAGGAGATCAGAGGAAGAACGTCTCTACCTTCCTTGTTCAGGCTGGTCTGGT
AAAGAAGGATAACATCAAGATCCATGGTTTTTGAGCATATTCTACGTACTTGGTTGTTAG
TTCATCCTTGTGCAACCAACTTGAATTTGCGTAATCAATCAACCAGCCCTTCTCAAAGGC
AGTATAAACAATCACTTATGTATGATTAATAATGTTTTATATATATTGTCAGAAAACAAA
AAAAAAAAAAATTAATGTTTTGTTTATGAGCGAATGTAACACAAATGTATGTATTAAAAA
AAAAACACAAATGTATGAACTTTTGATTTGCGATTGTACCGTGAGATTATCAATAAAACT
TTTGTGAATTGAGTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ56TF U 1
AF RR2B150TF U 26
AF RR2B150JQ C 243
AF RR2DJ56JQ C 456
BS 1 43 RR2DJ56TF
BS 44 44 RR2B150TF
BS 45 652 RR2DJ56TF
BS 653 786 RR2B150TF
BS 787 798 RR2DJ56JQ

RD RR2DJ56TF 652 0 0
GGGTAGCTCTTCCTCTCGTATCTTCTTCGCCCAGACAAGAAGCTGCCTTTATCCGAAGAG
TTTTTAGGGTTTCCATTTCTTTCCCTTGTCGTACAATCAAAATCTTCGAAACCCTAATAT
TAAGAGCAGGCTTCAGATATCCTTGTCTGTTTGTTCCCTCGGGTTCATGTCTGATCTTGA
AGTTCAAGTCCCCACTGCCTTTGATCCGTTTGCTGATGCAAATGCTGAGGACGCTGGAGC
TGGAGCTGGAACAAAGGAATACGTGCACATACGTGTTCAGCAGCGTAATGGTAGAAAAAG
CCTGACCACTGTCCAGGGCCTTAAGAAAGAGTACAGCTATACCAAGATCCTTAAAGACCT
CAAGAAAGAGTTCTGCTGCAATGGCACTGTCGTCCAGGACTCTGAACTAGGACAGGTTAT
TCAGCTACAAGGAGATCAGAGGAAGAACGTCTCTACCTTCCTTGTTCAGGCTGGTCTGGT
AAAGAAGGATAACATCAAGATCCATGGTTTTTGAGCATATTCTACGTACTTGGTTGTTAG
TTCATCCTTGTGCAACCAACTTGAATTTGCGTAATCAATCAACCAGCCCTTCTCAAAGGC
AGTATAAACAATCACTTATGTATGATTAATAATGTTTTATATATATTGTCAG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2B150TF 761 0 0
GGA
GCCCAGACAAGAAGCCGCCTTTATCCGAAGAGTTTTTAGGGTTTCCATTTCTTTCCCTTG
TCGTACAATCAAAATCTTCGAAACCCTAATATTAAGAGCAGGCTTCAGATATCCTTGTCT
GTTTGTTCCCTCGGGTTCATGTCTGATCTTGAAGTTCAAGTCCCCACTGCCTTTGATCCG
TTTGCTGATGCAAATGCTGAGGACGCTGGAGCTGGAGCTGGAACAAAGGAATACGTGCAC
ATACGTGTTCAGCAGCGTAATGGTAGAAAAAGCCTGACCACTGTCCAGGGCCTTAAGAAA
GAGTACAGCTATACCAAGATCCTTAAAGACCTCAAGAAAGAGTTCTGCTGCAATGGCACT
GTCGTCCAGGACTCTGAACTAGGACAGGTTATTCAGCTACAAGGAGATCAGAGGAAGAAC
GTCTCTACCTTCCTTGTTCAGGCTGGTCTGGTAAAGAAGGATAACATCAAGATCCATGGT
TTTTGAGCATATTCTACGTACTTGGTTGTTAGTTCATCCTTGTGCAACCAACTTGAATTT
GCGTAATCAATCAACCAGCCCTTCTCAAAGGCAGTATAAACAATCACTTATGTATGATTA
ATAATGTTTTATATATATTGTCAGAAAACAAAAAAAAAAAAAATTAATGTTTTGTTTATG
AGCGAATGTAACACAAATGTATGTATTAAAAAAAAAACACAAATGTATGAACTTTTGATT
TGCGATTGTACCGTGAGATTATCAATAAAACTTTTGTG

QA 4 761 4 761
DS 

RD RR2B150JQ 544 0 0
GAGCTGGAACAAAGGAATACGTGCACATACGTGTTCAGCAGCGTAATGGTAGAAAAAGCC
TGACCACTGTCCAGGGCCTTAAGAAAGAGTACAGCTATACCAAGATCCTTAAAGACCTCA
AGAAAGAGTTTTGCTGCAATGGCACTGTCGTCCAGGACTTTGAACTAGGACAGGTTATTC
AGCTACAAGGAGATCAGAGGAAGAACGTTTTTACCTTCCTTGTTCAGGCTGGTTTGGTAA
AGAAGGATAACATCAAGATCCATGGTTTTTGAGCATATTTTACGTACTTGGTTGTTAGTT
CATCCTTGTGCAACCAACTTGAATTTGGGTAATCAATCAACCAGCCCTTTTCAAAGGCAG
TATAAACAATCACTTATGTATGATTAATAATGTTTTATATATATTGTCAGAAAACAAAAA
AAAAAAAAATTAATGTTTTGTTTATGAGGGAATGTAACACAAATGTATGTATTAAAAAAA
AAACACAAATGTATGAACTTTTGATTTGCGATTGTACCGTGAGATTATCAATAAAACTTT
TGTG

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2DJ56JQ 343 0 0
CCTTCCTTGTTCAGGCTGGTCTGGTAAAGAAGGATAACATCAAGATCCATGGTTTTTGAG
CATATTCTACGTACTTGGTTGTTAGTTCATCCTTGTGCAACCAACTTGAATTTGCGTAAT
CAATCAACCAGCCCTTTTCAAAGGCAGTATAAACAATCACTTATGTATGATTAATAATGT
TTTATATATATTGTCAGAAAACAAAAAAAAAAAAA*TTAATGTTTTGTTTATGAGCGAAT
GTAACACAAATGTATGTATTAAAAAAAAA*CACAAATGTATGAACTTTTGATTTGCGATT
GTACCGTGAGATTATCAATAAAACTTTTGTGAATTGAGTGACC

QA 1 343 1 343
DS 



CO CL1083Contig2 589 2 1 U
TTTTTAGGGTTTCCATTTCTTTCCCTTTTCGTACAACCAAATCTTCGAAACCCTAATATT
AAGACCAGGCTTCAGCAAATCCTTGTCTGTTTGTTCCCTCAGGTTCATGTCTGATCTTGA
AGTTCAAGTCCCCACTGCCTTTGATCCGTTTGCTGATGCAAATGCTGAGGACGCTGGAGC
TGGAACAAAGGAATACGTGCACATACGTGTTCAGCAGCGTAATGGTAGAAAAAGCCTGAC
CACTGTCCAGGGCCTTAAGAAAGAGTACAGCTATACCAAGATCCTTAAAGACCTCAAGAA
AGAGTTCTGCTGCAATGGCACTGTCGTCCAGGACTCTGAACTAGGACAGGTTATTCAGCT
ACAAGGTGATCAGAGGAAGAACGTCTCTACTTTCCTTGTTCAGGCTGGTCTGGTAAAGAA
GGATAACATCAAGATCCATGGTTTTTGAGCAAATTCTACATACTTGGTTGTCGTTAGTTC
ATCTCTCTGCAACCAACTTGAATTTGCGTAATCAATCAATCAGCCCTTCTCAAAGGCAGT
ATAAACAATCACTTATGTATGATTAATAATGTTTTATATATATTGTCAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H355JQ C 1
AF RR2H355TF U 1
BS 1 589 RR2H355TF

RD RR2H355JQ 589 0 0
TTTTTAGGGTTTCCATTTCTTTCCCTTTTCGTACAACCAAATCTTCGAAACCCTAATATT
AAGACCAGGCTTCAGCAAATCCTTGTCTGTTTGTTCCCTCAGGTTCATGTCTGATCTTGA
AGTTCAAGTCCCCACTGCCTTTGATCCGTTTGCTGATGCAAATGCTGAGGACGCTGGAGC
TGGAACAAAGGAATACGTGCACATACGTGTTCAGCAGCGTAATGGTAGAAAAAGCCTGAC
CACTGTCCAGGGCCTTAAGAAAGAGTACAGCTATACCAAGATCCTTAAAGACCTCAAGAA
AGAGTTCTGCTGCAATGGCACTGTCGTCCAGGACTCTGAACTAGGACAGGTTATTCAGCT
ACAAGGTGATCAGAGGAAGAACGTCTCTACTTTCCTTGTTCAGGCTGGTCTGGTAAAGAA
GGATAACATCAAGATCCATGGTTTTTGAGCAAATTCTACATACTTGGTTGTCGTTAGTTC
ATCTCTCTGCAACCAACTTGAATTTGCGTAATCAATCAATCAGCCCTTCTCAAAGGCAGT
ATAAACAATCACTTATGTATGATTAATAATGTTTTATATATATTGTCAG

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2H355TF 589 0 0
TTTTTAGGGTTTCCATTTCTTTCCCTTTTCGTACAACCAAATCTTCGAAACCCTAATATT
AAGACCAGGCTTCAGCAAATCCTTGTCTGTTTGTTCCCTCAGGTTCATGTCTGATCTTGA
AGTTCAAGTCCCCACTGCCTTTGATCCGTTTGCTGATGCAAATGCTGAGGACGCTGGAGC
TGGAACAAAGGAATACGTGCACATACGTGTTCAGCAGCGTAATGGTAGAAAAAGCCTGAC
CACTGTCCAGGGCCTTAAGAAAGAGTACAGCTATACCAAGATCCTTAAAGACCTCAAGAA
AGAGTTCTGCTGCAATGGCACTGTCGTCCAGGACTCTGAACTAGGACAGGTTATTCAGCT
ACAAGGTGATCAGAGGAAGAACGTCTCTACTTTCCTTGTTCAGGCTGGTCTGGTAAAGAA
GGATAACATCAAGATCCATGGTTTTTGAGCAAATTCTACATACTTGGTTGTCGTTAGTTC
ATCTCTCTGCAACCAACTTGAATTTGCGTAATCAATCAATCAGCCCTTCTCAAAGGCAGT
ATAAACAATCACTTATGTATGATTAATAATGTTTTATATATATTGTCAG

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 7

CO CL1084Contig1 798 7 15 U
GGGATAGCCATTTCGCAACCACGCTAAAACGTAATGTTGTCTGCTCTCCGATCTCGCTGC
TCTTCTCTCCCTTCTCTTCTCAAATCGCAACCATCACCTTCACTTCTAGATCAGTCATGG
AAGCTACTAGGTCTCTCCGCTTCGAATCCTCTTTCGTTCTCTTCTTCTTCCACCGCCGGC
GCCGCCCGTGATGTCTCAGAGGTTCTGTCCGTTCCCGAAGTGGAGAAGATACTCTCCGAC
GTTAAAGCAGACAACGTGATTGTGATTCCGACGCATAATCAGTCATGCTGGGCCGACGTC
ACGATCATCGCCACGGGAAGATCCGATTGGCACCTGAAGAACATCGCTCAGGCTCTCGTC
TACAGGGCAAAGCAGAAGCAGAGAGGAGAGAAACATGTAATGCTTCCTTGTGTTCAAGGC
TACGATACCAAGTGGATTGTCATTGACTACGGGAAGTTTGTGGTACATGCACTTGATGAG
AAGGCCAGGGTTTACTTCAATTTGGAGAGTCTTTGGACTGGTGAACCTGCTTCAGCTAAC
GATAACTCAGATAAGGATTTACAGAACGCTTTTGTTAAGGTCCGACCAATTAACAACTCC
AAAAAGAAGAATCCGGCTAAACTGAGCTCTTAATCCAGAAAAAAAGCCACTGTTCGATTG
ACAAACAGTTTGTAATAAACATATTCTCATTAAGGATATACTCCTAGATGGGTATGGGTT
GAGGATGTGTTTTTTTCTTCTAAATTCTATAAAATATTTGATGGAGAAAACATGGCGGAA
TACAAACTGTTGGAAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F096JQ C 315
AF RR2F143TF U 1
AF RR2BW42TF U 8
AF RR2AG39TF U 15
AF RR2BW42JQ C 139
AF RR2AG39JQ C 75
AF RR2BD77TF U 196
BS 1 479 RR2F143TF
BS 480 480 RR2BW42TF
BS 481 637 RR2F143TF
BS 638 639 RR2BW42TF
BS 640 693 RR2AG39TF
BS 694 694 RR2BD77TF
BS 695 706 RR2AG39TF
BS 707 710 RR2BD77TF
BS 711 712 RR2AG39JQ
BS 713 769 RR2BD77TF
BS 770 770 RR2AG39JQ
BS 771 775 RR2BD77TF
BS 776 776 RR2AG39JQ
BS 777 785 RR2BD77TF
BS 786 798 RR2AG39JQ

RD RR2F096JQ 193 0 0
GGGAAGATCCGATTGGCACCTGAAGAACATCGCTCAGGCTCTCGTCTACAGGGCAAAGCA
GAAGCAGAGAGGAGAGAAACATGTAATGCTTCCATGTGTTCAAGGCTACGATACCAAGTG
GATTGTCATTGATTACGGGAAGTTTGTGGTACATGCACTTGATGAGAAGGCCAGGGTTTA
CTTCAATTTGGAG

QA 1 193 1 193
DS 

RD RR2F143TF 637 0 0
GGGATAGCCATTTCGCAACCACGCTAAAACGTAATGTTGTCTGCTCTCCGATCTCGCTGC
TCTTCTCTCCCTTCTCTTCTCAAATCGCAACCATCACCTTCACTTCTAGATCAGTCATGG
AAGCTACTAGGTCTCTCCGCTTCGAATCCTCTTTCGTTCTCTTCTTCTTCCACCGCCGGC
GCCGCCCGTGATGTCTCAGAGGTTCTGTCCGTTCCCGAAGTGGAGAAGATACTCTCCGAC
GTTAAAGCAGACAACGTGATTGTGATTCCGACGCATAATCAGTCATGCTGGGCCGACGTC
ACGATCATCGCCACGGGAAGATCCGATTGGCACCTGAAGAACATCGCTCAGGCTCTCGTC
TACAGGGCAAAGCAGAAGCAGAGAGGAGAGAAACATGTAATGCTTCCTTGTGTTCAAGGC
TACGATACCAAGTGGATTGTCATTGACTACGGGAAGTTTGTGGTACATGCACTTGATGAT
AAGGCCAGGGTTTACTTCAATTTGGAGAGTCTTTGGACTGGTGAACCTGCTTCAGCTAAC
GATAACTCAGATAAGGATTTACAGAACGCTTTTGTTAAGGTCCGACCAATTAACAACTCC
AAAAAGAAGAATCCGGCTAAACTGAGCTCTTAATCCA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2BW42TF 632 0 0
GGATTTCGC
AACCACGCTAAAACGTAATGTTGTCTGCTCTCCGATCTCGCTGCTCTTCTCTCCCTTCTC
TTCTCAAATCGCAACCATCACCTTCACTTCTAGATCAGTCATGGAAGCTACTAGGTCTCT
CCGCTTCGAATCCTCTTTCGTTCTCTTCTTCTTCCACCGCCGGCGCCGCCCGTGATGTCT
CAGAGGTTCTGTCCGTTCCCGAAGTGGAGAAGATACTCTCCGACGTTAAAGCAGACGACG
TGATTGTGATTCCGACGCATAATCAGTCATGCTGGGCCGACGTCACGATCATCGCCACGG
GAAGATCCGATTGGCACCTGAAGAACATCGCTCAGGCTCTCGTCTACAGGGCAAAGCAGA
AGCAGAGAGGAGAGAAACATGTAATGCTTCCTTGTGTTCAAGGCTACGATACCAAGTGGA
TTGTCATTGACTACGGGAAGTTTGTGGTACATGCACTTGATGAGAAGGCCAGGGTTTACT
TCAATTTGGAGAGTCTTTGGACTGGTGAACCTGCTTCAGCTAACGATAACTCAGATAAGG
ATTTACAGAACGCTTTTGTTAAGGTCCGACCAATTAACAACTCCAAAAAGAAGAATCCGG
CTAAACTGAGCTCTTAATCCAGA

QA 10 632 10 632
DS 

RD RR2AG39TF 692 0 0
GG
AACCACACTAAAACGTAATGTTGTCTGCCCTCCGATCTCGCTGCTCTTCTCTCCCTTCTC
TTCTCAAATCGCAACCATCACCTTCACTTCTAGATCAGTCATGGAAGCTACTAGGTCTCT
CCGCTTCGAATCCTCTTTCGTTCTCTTCTTCTTCCACCGCCGGCGCCGCCCGTGATGTCT
CAGAGGTTCTGTCCGTTCCCGAAGCGGAGAAGATACTCTCCGACGTTAAAGCAGACAACG
TGATTGTGATTCCGACGCATAATCAGTCATGCTGGGCCGACGTCACGATCATCGCCACGG
GAAGATCCGATTGGCACCTGAAGAACATCGCTCAGGCTCTCGTCTACAGGGCAAAGCAGA
AGCAGAGAGGAGAGAAACATGTAATGCTTCCTTGTGTTCAAGGCTACGATACCAAGTGGA
TTGTCATTGACTACGGGAAGTTTGTGGTACATGCACTTGATGAGAAGGCCAGGGTTTACT
TCAATTTGGAGAGTCTTTGGACTGGTGAACCTGCTTCAGCTAACGATAACTCAGATAAGG
ATTTACAGAGCGCTTTTGTTAAG*TCCGACCAATTAACAACTCCAAAAAGAAGAATCCCG
CTAAACTGAGCTCTTAATCCAGAAAAAAAGCCACTGTTCGATTGACAAACAGTTTGTAAT
AAACATATTCTCATTAAAGATATACTCCTA

QA 3 692 3 692
DS 

RD RR2BW42JQ 621 0 0
GCTTCGAATCCTCTTTCGTTCTCTTCTTCTTCCACCGCCGGCGCCGCCCGTGATGTCTCA
GAGGTTCTGTCCGTTCCCGAAGTGGAGAAGATACTCTCCGACGTTAAAGCAGACGACGTG
ATTGTGATTCCGACGCATAATCAGTCATGCTGGGCCGACGTCACGATCATCGCCACGGGA
AGATCCGATTGGCACCTGAAGAACATCGCTCAGGCTCTCGTCTACAGGGCAAAGCAGAAG
CAGAGAGGAGAGAAACATGTAATGCTTCCTTGTGTTCAAGGCTACGATACCAAGTGGATT
GTCATTGACTACGGGAAGTTTGTGGTACATGCACTTGATGAGAAGGCCAGGGTTTACTTC
AATTTGGAGAGTCTTTGGACTGGTGAACCTGCTTCAGCTAACGATAACTCAGATAAGGAT
TTACAGAACGCTTTTGTTAAGGTCCGACCAATTAACAACTCCAAAAAGAAGAATCCGGCT
AAACTGAGCTCTTAATCCAGAAAAAAAGCCACTGTTCGATTGACAAACAGTTTGTAATAA
ACATGTTCTCATTAAGGATATACTCCTAGATGGGTATGGGTTGAGGATGTGTTTTTTTCT
TCTAAATTCTATAAAATATTT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2AG39JQ 724 0 0
TCTTCTCAAATCGCAACCATCACCTTCACTTCTAGATCAGTCATGGAAGCTACTAGGTCT
CTCCGCTTCGAATCCTCTTTCGTTCTCTTCTTCTTCCACCGCCGGCGCCGCCCGTGATGT
CTCAGAGGTTCTGTCCGTTCCCGAAGCGGAGAAGATACTCTCCGACGTTAAAGCAGACAA
CGTGATTGTGATTCCGACGCATAATCAGTCATGCTGGGCCGACGTCACGATCATCGCCAC
GGGAAGATCCGATTGGCACCTGAAGAACATCGCTCAGGCTCTCGTCTACAGGGCAAAGCA
GAAGCAGAGAGGAGAGAAACATGTAATGCTTCCTTGTGTTCAAGGCTACGATACCAAGTG
GATTGTCATTGACTACGGGAAGTTTGTGGTACATGCACTTGATGAGAAGGCCAGGGTTTA
CTTCAATTTGGAGAGTCTTTGGACTGGTGAACCTGCTTCAGCTAACGATAACTCAGATAA
GGATTTACAGAGCGCTTTTGTTAAGGTCCGACCAATTAACAACTCCAAAAAGAAGAATCC
GGCTAAACTGAGCTCTTAATCCAGAAAAAAAGCCACTGTTCGATTGACAAACAGTTTGTA
ATAAACATATTCTCATTAAGGATATACTCCTAGATGGGTATGGGTTGAGGATGTGCTTTT
TTCTTCTAAATTCTATAAAATATTTGATGGAGAAAACATGGCGGAATACAAACTGTTGGA
AAGT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2BD77TF 597 0 0
G
CAGAGGTTCTGTCCGTTCCCGAAGTGGAGAAGATACTCTCCGACGTTAAAGCAGACAACG
TGATTGTGATTCCGACGCATAATCAGTCATGCTGGGCCGACGTCACGATCATCGCCACGG
GAAGATCCGATTGGCACCTGAAGAACATCGCTCAGGCTCTCGTCTACAGGGCAAAGCAGA
AGCAGAGAGGAGAGAAACATGTAATGCTTCCTTGTGTTCAAGGCTACGATACCAAGTGGA
TTGTCATTGACTACGGGAAGTTTGTGGTACATGCACTTGATGAGAAGGCCAGGGTTTACT
TCAATTTGGAGAGTCTTTGGACTGGTGAACCTGCTTCAGCTAACGATAACTCAGATAAGG
ATTTACAGAACGCTTTTGTTAAGGTCCGACCAATTAACAACTCCAAAAAGAAGAATCCGG
CTAAACTGAGCTCTTAATCCAGAAAAAAAGCCACTGTTCGATTGACAAACAGTTTGTAAT
AAACATATTCTCATTAAGGATATACTCCTAGATG**TATGGGTTGAGGATGTGTTTTTTT
CTTCTAAATTCTATAAAATATTTGATGGAGAAA*CATGGTGGAATACAA
CTGTTGG

QA 2 590 2 590
DS 



AS 1 7

CO CL1085Contig1 508 7 7 U
GGAGACACACAATCACAAGGCAGCTCAAGAAACACCAAGAAACAATGTCAAAAGCCTCAA
AGGCTTCTTATCTCAGTTTACTCCTCGCTGTCGTCTTCTTCCTCGGTTCTCAACCTGCAT
TCTCACTTCGTGCCCCAAAACCGCAATCAGAACCAACATCACCCCAAACCATAATGGATG
ATTCGTCTTCAATGGGAAAGATCGACCATGCAAAATCCATGATTGCTGGATTCTTCAGCC
ACAAGTTTCCATTAAAGGGTTGGCCTTTCCCCAAGTACCCGCCTTTCACAATGGTTAACC
CTAACATTCCAACAAACCCATCTGGAGCTCAAAGGGGACCAGAGAAGCTACCCTTTTCCC
CACGCAAAGGCAAGAAAGATGCAGGAAACGCTTGAAGATTGAAGTTTACTTGTGTTTGAA
AACATTTATATCATTTTACATTGCATCAAAATAAAAATTGTTATCTTTAACAACTGAATG
CCAAAAAGAAAGAAGATATTTATCTATC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR2CF62JQ C 1
AF RR2DQ02TF U 152
AF RR2CF62TF U 1
AF RR2DO84JQ C 1
AF RR2DO84TF U 1
AF RR2GZ34JQ C 9
AF RR2GZ34TF U 9
BS 1 151 RR2CF62TF
BS 152 453 RR2DQ02TF
BS 454 458 RR2CF62TF
BS 459 459 RR2DO84TF
BS 460 465 RR2CF62TF
BS 466 504 RR2DO84TF
BS 505 508 RR2GZ34JQ

RD RR2CF62JQ 468 0 0
GGAGACACACAATCACAAGGCAGCTCAAGAAACACCAAGAAACAATGTCAAAAGCCTCAA
AGGCTTCTTATCTCAGTTTACTCCTCGCTGTCGTCTTCTTCCTCGGTTCTCAACCTGCAT
TCTCACTTCGTGCCCCAAAACCGCAATCAGAACCAACATCACCCCAAACCATAATGGATG
ATTCGTCTTCAATGGGAAAGATCGACCATGCAAAATCCATGATTGCTGGATTCTTCAGCC
ACAAGTTTCCATTAAAGGGTTGGCCTTTCCCCAAGTACCCGCCTTTCACAATGGTTAACC
CTAACATTCCAACAAACCCATCTGGAGCTCAAAGGGGACCAGAGAAGCTACCCTTTTCCC
CACGCAAAGGCAAGAAAGATGCAGGAAACGCTTGAAGATTGAAGTTTACTTGTGTTTGAA
AACATTTATATCATTTTACATTGCATCAAAATAAAAATCGTTATC
CTT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2DQ02TF 302 0 0
ACCAACATCACCCCAAACCATAATGGATGATTCGTCTTCAATGGGAAAGATCGACCATGC
AAAATCCATGATTGCTGGATTCTTCAGCCACAAGTTTCCATTAAAGGGTTGGCCTTTCCC
CAAGTACCCGCCTTTCACAATGGTTAACCCTAACATTCCAACAAACCCATCTGGAGCTCA
AAGGGGACCAGAGAAGCTACCCTTTTCCCCACGCAAAGGCAAGAAAGATGCAGGAAACGC
TTGAAGATTGAAGTTTACTTGTGTTTGAAAACATTTATATCATTTTACATTGCATCAAAA
TA

QA 1 302 1 302
DS 

RD RR2CF62TF 468 0 0
GGAGACACACAATCACAAGGCAGCTCAAGAAACACCAAGAAACAATGTCAAAAGCCTCAA
AGGCTTCTTATCTCAGTTTACTCCTCGCTGTCGTCTTCTTCCTCGGTTCTCAACCTGCAT
TCTCACTTCGTGCCCCAAAACCGCAATCAGAACCAACATCACCCCAAACCATAATGGATG
ATTCGTCTTCAATGGGAAAGATCGACCATGCAAAATCCATGATTGCTGGATTCTTCAGCC
ACAAGTTTCCATTAAAGGGTTGGCCTTTCCCCAAGTACCCGCCTTTCACAATGGTTAACC
CTAACATTCCAACAAACCCATCTGGAGCTCAAAGGGGACCAGAGAAGCTACCCTTTTCCC
CACGCAAAGGCAAGAAAGATGCAGGAAACGCTTGAAGATTGAAGTTTACTTGTGTTTGAA
AACATTTATATCATTTTACATTGCATCAAAATAAAAATCGTTATC
CTT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2DO84JQ 505 0 0
GGAGACACACAATCACAAGGCAGCTCAAGAAACACCAAGAAACAATGTCAAAAGCCTCAA
AGGCTTCTTATCTCAGTTTACTCCTCGCTGTCGTCTTCTTCCTCGGTTCTCAACCTGCAT
TCTCACTTCGTGCCCCAAAACCGCAATCAGAACCAACATCACCCCAAACCATAATGGATG
ATTCGTCTTCAATGGGAAAGATCGACCATGCAAAATCCATGATTGCTGGATTCTTCAGCC
ACAAGTTTCCATTAAAGGGTTGGCCTTTCCCCAAGTACCCGCCTTTCACAATGGTTAACC
CTAACATTCCAACAAACCCATCTTGAGCTCAAAGGGGACCAGAGAAGCTACCCTTTTCCC
CACGCAAAGGCAAGAAAGATGCAGGAAACGCTTGAAGATTGAAGTTTACTTGTGTTTGAA
AACATTTATATCATTTTACATTGCATCAAAATAAAAATTGTTATCTTTAACAACTGAATG
CCAAAAAGAAAGAAGATATTTATC
C

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2DO84TF 505 0 0
GGAGACACACAATCACAAGGCAGCTCAAGAAACACCAAGAAACAATGTCAAAAGCCTCAA
AGGCTTCTTATCTCAGTTTACTCCTCGCTGTCGTCTTCTTCCTCGGTTCTCAACCTGCAT
TCTCACTTCGTGCCCCAAAACCGCAATCAGAACCAACATCACCCCAAACCATAATGGATG
ATTCGTCTTCAATGGGAAAGATCGACCATGCAAAATCCATGATTGCTGGATTCTTCAGCC
ACAAGTTTCCATTAAAGGGTTGGCCTTTCCCCAAGTACCCGCCTTTCACAATGGTTAACC
CTAACATTCCAACAAACCCATCTTGAGCTCAAAGGGGACCAGAGAAGCTACCCTTTTCCC
CACGCAAAGGCAAGAAAGATGCAGGAAACGCTTGAAGATTGAAGTTTACTTGTGTTTGAA
AACATTTATATCATTTTACATTGCATCAAAATAAAAATTGTTATCTTTAACAACTGAATG
CCAAAAAGAAAGAAGATATTTATC
C

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2GZ34JQ 500 0 0
G
CAATCACAAGGCAGCTCAAGAAACACCAAGAAACAATGTCAAAAGCCTCAAAGGCTTCTT
ATCTCAGTTTACTCCTCGCTGTCGTCTTCTTCCTCGGTTCTCAACCTGCATTCTCACTTC
GTGCCCCAAAACCGCAATCAGAACCAACATCACCCCAAACCATAATGGATGATTCGTCTT
CAATGGGAAAGATCGACCATGCAAAATCCATGATTGCTGGATTCTTCAGCCACAAGTTTC
CATTAAAGGGTTGGCCTTTCCCCAAGTACCCGCCTTTCACAATGGTTAACCCTAACATTC
CAACAAACCCATCTGGAGCTCAAAGGGGACCAGAGAAGCTACCCTTTTCCCCACGCAAAG
GCAAGAAAGATGCAGGAAACGCTTGAAGATTGAAGTTTACTTGTGTTTGAAAACATTTAT
ATCATTTTACATTGCATCAAAATAAAAATTGTTATCTTTAACAACTGAATGCCAAAAAGA
AAGAAGATATTTATCTATC

QA 2 500 2 500
DS 

RD RR2GZ34TF 500 0 0
G
CAATCACAAGGCAGCTCAAGAAACACCAAGAAACAATGTCAAAAGCCTCAAAGGCTTCTT
ATCTCAGTTTACTCCTCGCTGTCGTCTTCTTCCTCGGTTCTCAACCTGCATTCTCACTTC
GTGCCCCAAAACCGCAATCAGAACCAACATCACCCCAAACCATAATGGATGATTCGTCTT
CAATGGGAAAGATCGACCATGCAAAATCCATGATTGCTGGATTCTTCAGCCACAAGTTTC
CATTAAAGGGTTGGCCTTTCCCCAAGTACCCGCCTTTCACAATGGTTAACCCTAACATTC
CAACAAACCCATCTGGAGCTCAAAGGGGACCAGAGAAGCTACCCTTTTCCCCACGCAAAG
GCAAGAAAGATGCAGGAAACGCTTGAAGATTGAAGTTTACTTGTGTTTGAAAACATTTAT
ATCATTTTACATTGCATCAAAATAAAAATTGTTATCTTTAACAACTGAATGCCAAAAAGA
AAGAAGATATTTATC
TATC

QA 2 496 2 496
DS 



AS 2 6

CO CL1086Contig1 828 4 7 U
GAAGATGATGAAGACTATAAACCTCCTCCCCAGGAAACAGCCCGAAGTCTCTGAGGAGGA
GGAAGGCGAGCTCCTGGGTCTGAAACGCAAATCCCCTTTCGCAGAAAGAGAACAAGAGCC
TTCCCCCAAGAAACCTCGACTGGGTAAAAACCCGAAAAGAGAAAACGTGTTTGCTGTGCT
GTGCTCGACGTTGAGCCATGCAGTGCTTGCAAAGAAAAGTCAAGGCACCGCTGGATCTGC
AGCCCGGTCTATTGTAACCAAGGAACCTGGGGAATCGAGAAGTAGTGAAGAGAATAATAG
CAGCAGTTCGGATGATGAGAAGAATCATAAGGATGATGGAGTTTCTAGTTCAGAACAGGG
AACATCAGACAATGGAAAGAAGCTAAATGGGGAAGAATCAGTGGTAGTTGCTCCAAAATC
ATCACCTGAAATGGCCGTAAATGGATCCTGAGGTTATAACACTCTGGACTTGTAGTTTGG
CTGTGGACGGAAGGCACTCATGGGTGGCTTATAAAAGAACACTTCAAAGTTTAAAGACTG
AGGAGGAGACATGAGAATCTGCAATCAACAACCAATAGAAGAAGAAATGTATAGAGAGCG
CCAGTTTGAGAGGGTAACAGGTTTCTTCTTCCATTGTGTTTGCAGCCGGTTTTATTTATA
TATTCATCTTTTGGAAAAGAAAAAAAAACTTAGAAGTCTCTGGTCTTGTCAAAATTGCAT
ATTGTAAGAAACATCATATGGTCTATCAGCAACTAACTCTGTTTTTTCTTCTAAATTCAA
GTTCCTAGTGGTTTCGTGGATATTCCACTCTCTTCGCTGTATTTTGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DU83TF U 55
AF RR2DU83JQ C 356
AF RR2AP62JQ C 1
AF RR2AP62TF U 1
BS 1 30 RR2AP62TF
BS 31 31 RR2AP62JQ
BS 32 54 RR2AP62TF
BS 55 467 RR2DU83TF
BS 468 468 RR2AP62TF
BS 469 576 RR2DU83TF
BS 577 828 RR2AP62TF

RD RR2DU83TF 522 0 0
GGAGGAGGAAGGCGAGCTCCTGGGTCTGAAACGCAAATCCCCTTTCGCAGAAAGAGAACA
AGAGCCTTCCCCCAAGAAACCTCGACTGGGTAAAAACCCGAAAAGAGAAAACGTGTTTGC
TGTGCTGTGCTCGACGTTGAGCCATGCAGTGCTTGCAAAGAAAAGTCAAGGCACCGCTGG
ATCTGCAGCCCGGTCTATTGTAACCAAGGAACCTGGGGAATCGAGAAGTAGTGAAGAGAA
TAATAGCAGCAGTTCGGATGATGAGAAGAATCATAAGGATGATGGAGTTTCTAGTTCAGA
ACAGGGAACATCAGACAATGGAAAGAAGCTAAATGGGGAAGAATCAGTGGTAGTTGCTCC
AAAATCATCACCTGAAATGGCCGTAAATGGATCCTGAGGTTATAACACTCTGGGCTTGTA
GTTTGGCTGTGGACGGAAGGCACTCATGGGTGGCTTATAAAAGAACACTTCAAAGTTTAA
AGACTGAGGAGGAGACATGAGAATCTGCAATCAACAACCAAT

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2DU83JQ 408 0 0
CAGGGAACATCAGACAATGGAAAGAAGCTAAATGGGGAAGAATCAGTGGTAGTTGCTCCA
AAATCATCACCTGAAATGGCCGTAAATGGATCCTGAGGTTATAACACTCTGGGCTTGTAG
TTTGGCTGTGGACGGAAGGCACTCATGGGTGGCTTATAAAAGAACACTTCAAAGTTTAAA
GACTGAGGAGGAGACATGAGAATCTGCAATCAACAACCAATAGAAGAAGAAATGTATAGA
GAGCGCCAGTTTGAGAGGGTAACAGGTTTCTTCTTCCATTGTGTTTGCAGCCGGTTTTAT
TTATATATTCATCTTTTGGAAAAGAAAAAAAAACTTAGAAGTCTCTGGTCTTGTCAAAAT
TGCATATTGTAAGAAACATCATATGGTCTATCAGCAACTAACTCTGTT

QA 1 408 1 408
DS 

RD RR2AP62JQ 828 0 0
GAAGATGATGAAGACTATAAACCTCCTCCCCAGGAAACAGCCCGAAGTCTCTGAGGAGGA
GGAAGGCGAGCTCCTGGGTCTGAAACGCAAATCCCCTTTCGCAGAAAGAGAACAAGAGCC
TTCCCCCAAGAAACCTCGACTGGGTAAAAACCCGAAAAGAGAAAACGTGTTTGCTGTGCT
GTGCTCGACGTTGAGCCATGCAGTGCTTGCAAAGAAAAGTCAAGGCACCGCTGGATCTGC
AGCCCGGTCTATTGTAACCAAGGAACCTGGGGAATCGAGAAGTAGTGAAGAGAATAATAG
CAGCAGTTCGGATGATGAGAAGAATCATAAGGATGATGGAGTTTCTAGTTCAGAACAGGG
AACATCAGACAATGGAAAGAAGCTAAATGGGGAAGAATCAGTGGTAGTTGCTCCAAAATC
ATCACCTGAAATGGCTGTAAATGGATCCTGAGGTTATAACACTCTGGACTTGTAGTTTGG
CTGTGGACGGAAGGCACTCATGGGTGGCTTATAAAAGAACACTTCAAAGTTTAAAGACTG
AGGAGGAGACATGAGAATCTGCAATCAACAACCAATAGAAGAAGAAATGTATAGAGAGCG
CCAGTTTGAGAGGGTAACAGGTTTCTTCTTCCATTGTGTTTGCAGCCGGTTTTATTTATA
TATTCATCTTTTGGAAAAGAAAAAAAAACTTAGAAGTCTCTGGTCTTGTCAAAATTGCAT
ATTGTAAGAAACATCATATGGTCTATCAGCAACTAACTCTGTTTTTTCTTCTAAATTCAA
GTTCCTAGTGGTTTCGTGGATATTCCACTCTCTTCGCTGTATTTTGAC

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2AP62TF 828 0 0
GAAGATGATGAAGACTATAAACCTCCTCCC*AGGAAACAGCCCGAAGTCTCTGAGGAGGA
GGAAGGCGAGCTCCTGGGTCTGAAACGCAAATCCCCTTTCGCAGAAAGAGAACAAGAGCC
TTCCCCCAAGAAACCTCGACTGGGTAAAAACCCGAAAAGAGAAAACGTGTTTGCTGTGCT
GTGCTCGACGTTGAGCCATGCAGTGCTTGCAAAGAAAAGTCAAGGCACCGCTGGATCTGC
AGCCCGGTCTATTGTAACCAAGGAACCTGGGGAATCGAGAAGTAGTGAAGAGAATAATAG
CAGCAGTTCGGATGATGAGAAGAATCATAAGGATGATGGAGTTTCTAGTTCAGAACAGGG
AACATCAGACAATGGAAAGAAGCTAAATGGGGAAGAATCAGTGGTAGTTGCTCCAAAATC
ATCACCTGAAATGGCTGTAAATGGATCCTGAGGTTATAACACTCTGGACTTGTAGTTTGG
CTGTGGACGGAAGGCACTCATGGGTGGCTTATAAAAGAACACTTCAAAGTTTAAAGACTG
AGGAGGAGACATGAGAATCTGCAATCAACAACCAATAGAAGAAGAAATGTATAGAGAGCG
CCAGTTTGAGAGGGTAACAGGTTTCTTCTTCCATTGTGTTTGCAGCCGGTTTTATTTATA
TATTCATCTTTTGGAAAAGAAAAAAAAACTTAGAAGTCTCTGGTCTTGTCAAAATTGCAT
ATTGTAAGAAACATCATATGGTCTATCAGCAACTAACTCTGTTTTTTCTTCTAAATTCAA
GTTCCTAGTGGTTTCGTGGATATTCCACTCTCTTCGCTGTATTTTGAC

QA 1 828 1 828
DS 



CO CL1086Contig2 1079 2 8 U
GGGTCGCGTTTCGAAGGTTGGGGGAAGGCCTTCGCAGATATAAAAAAAAAGCTAAAGAGA
AGAGAGAGAGAGAGAGAATGTCAATGTTCGTTTGATTGATTCCTCTCGTATAGTAAATTA
GGGTTTCCTATTTGATTTCATCCCCTTTCGAGCTCTCAATCTCCCGACGCCCTTCCTCCT
CTTGCTCCAAAACCCTAACTTTTGCTTTCGCTCACTCTATTCGCTTTTGCTCGGGATCGA
TTTGGGGTGTTTGGACGTGGGAGGGAATCAGTGATGGGGGCCCCGGATAAGCCACAATCT
AATTCCAATTCGATGCAGAGAGTGAAGGTGTATCATTTGAATGAAGGCGAGCTCCTTGGG
CTGAAACGCAAATCCCCTTTCCCAGAAAGAGAACAAGAGCCTTCCCCCAAGAAACCTCGA
CTGGGTAAAAACCCGAAAAGAGAAAACGTGTTTGCTGTGCTGTGTTCGACGTTGAGCCAT
GCAGTGCTCGCAAAGAAAAGTCAGGGCAGCACTGGATCTGCAGCCCGGTCTATTGTAACC
AAGGAACCTGAGGAATCTAGAAGTAGTGAAGAGAATAATAGCAGCAGTTCGGATGATGAG
AAGAATCATAAGGATGATGGAGTTTCTAGTTCAGAACAGGGAACATCAGACAATGGAAAG
AAGCTAAATGGGGAAGAATCAGTGGTAGTTGCTCCAAAATCATCACCTGAAATGGCTGTA
AATGGATCCTGAGGTTATAACACTCTGGACTTGTAGTTTGGCTGTGGACGGAAGGCACTC
ATGGGTGGCTTATAAAAGAACCCTTCAAAGTTAAAGACTGAGGAGGAGGAGACATGAGAA
TCTGCAATCAACAACCAATAGAAGAAGAAATGTATAGAGAGCGCCAGTTTGAGAGGGTAA
CAGGTTTCTTCTTCCATTGTGTTTGCAGCCGGTTTTATTTATATATTCATCTTTTGGAAA
AGAAAAAAACTTAGAAGTCTCTGGTCTTGTCAAAATTGCATATTGTAAGAAACATCATAT
GGTCTATCAGCAACTAACTCTGTTTTTTCTTCTAAATTCAAGTTCCTAGTGGTTTCGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL62TF U 1
AF RR2GL62JQ C 262
BS 1 698 RR2GL62TF
BS 699 699 RR2GL62JQ
BS 700 721 RR2GL62TF
BS 722 722 RR2GL62JQ
BS 723 733 RR2GL62TF
BS 734 734 RR2GL62JQ
BS 735 753 RR2GL62TF
BS 754 1079 RR2GL62JQ

RD RR2GL62TF 753 0 0
GGGTCGCGTTTCGAAGGTTGGGGGAAGGCCTTCGCAGATATAAAAAAAAAGCTAAAGAGA
AGAGAGAGAGAGAGAGAATGTCAATGTTCGTTTGATTGATTCCTCTCGTATAGTAAATTA
GGGTTTCCTATTTGATTTCATCCCCTTTCGAGCTCTCAATCTCCCGACGCCCTTCCTCCT
CTTGCTCCAAAACCCTAACTTTTGCTTTCGCTCACTCTATTCGCTTTTGCTCGGGATCGA
TTTGGGGTGTTTGGACGTGGGAGGGAATCAGTGATGGGGGCCCCGGATAAGCCACAATCT
AATTCCAATTCGATGCAGAGAGTGAAGGTGTATCATTTGAATGAAGGCGAGCTCCTTGGG
CTGAAACGCAAATCCCCTTTCCCAGAAAGAGAACAAGAGCCTTCCCCCAAGAAACCTCGA
CTGGGTAAAAACCCGAAAAGAGAAAACGTGTTTGCTGTGCTGTGTTCGACGTTGAGCCAT
GCAGTGCTCGCAAAGAAAAGTCAGGGCAGCACTGGATCTGCAGCCCGGTCTATTGTAACC
AAGGAACCTGAGGAATCTAGAAGTAGTGAAGAGAATAATAGCAGCAGTTCGGATGATGAG
AAGAATCATAAGGATGATGGAGTTTCTAGTTCAGAACAGGGAACATCAGACAATGGAAAG
AAGCTAAATGGGGAAGAATCAGTGGTAGTTGCTCCAAA*TCATCACCTGAAATGGCTGTA
A*TGGATCCTGAG*TTATAACACTCTGGACTTG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2GL62JQ 818 0 0
AGGGAATCAGTGATGGGGGCCCCGGATAAGCCACAATCTAATTCCAATTCGATGCAGAGA
GTGAAGGTGTATCATTTGAATGAAGGCGAGCTCCTTGGGCTGAAACGCAAATCCCCTTTC
CCAGAAAGAGAACAAGAGCCTTCCCCCAAGAAACCTCGACTGGGTAAAAACCCGAAAAGA
GAAAACGTGTTTGCTGTGCTGTGTTCGACGTTGAGCCATGCAGTGCTCGCAAAGAAAAGT
CAGGGCAGCACTGGATCTGCAGCCCGGTCTATTGTAACCAAGGAACCTGAGGAATCTAGA
AGTAGTGAAGAGAATAATAGCAGCAGTTCGGATGATGAGAAGAATCATAAGGATGATGGA
GTTTCTAGTTCAGAACAGGGAACATCAGACAATGGAAAGAAGCTAAATGGGGAAGAATCA
GTGGTAGTTGCTCCAAAATCATCACCTGAAATGGCTGTAAATGGATCCTGAGGTTATAAC
ACTCTGGACTTGTAGTTTGGCTGTGGACGGAAGGCACTCATGGGTGGCTTATAAAAGAAC
CCTTCAAAGTTAAAGACTGAGGAGGAGGAGACATGAGAATCTGCAATCAACAACCAATAG
AAGAAGAAATGTATAGAGAGCGCCAGTTTGAGAGGGTAACAGGTTTCTTCTTCCATTGTG
TTTGCAGCCGGTTTTATTTATATATTCATCTTTTGGAAAAGAAAAAAACTTAGAAGTCTC
TGGTCTTGTCAAAATTGCATATTGTAAGAAACATCATATGGTCTATCAGCAACTAACTCT
GTTTTTTCTTCTAAATTCAAGTTCCTAGTGGTTTCGGG

QA 1 818 1 818
DS 



AS 3 7

CO CL1087Contig1 1149 2 2 U
GTAGCACCGATGATGTTATTGAAATGGTGAAAGCTATCTCTTCTAAGGTTGTTCAGCAAC
CGAGTGACAAAGCTTCACTTCGTTTGAAGATCCTCTTCAATCTCTATAACCTTCTGGACC
ACCCGTATGCTCGTTTCCAAGTGTACATGAAAGCTCTTACACTGGCTGTTGAAGGGAAGG
TTGCTGAGTACATAGTTCCTTCTTTTAAGAAGATTGACAACTTCTTGAAAGAGTGGAGCA
TTGACACTAAAGATCAGAGACAACTTTTCCTTGCTATTGCTAATGTGCTGAGAGAAAACA
AAAGCTTGGTGAAAGAATCTCTTAACTTCTCGACGAAGTATCTAGCGACTTTCTCCACTG
AGGATGCTCTGGATGAAGCTAAGGAGGAGGCTGTTCGTGCAGTTATTGAGTTTGTCAAGG
CTTCCAGCATCTTCCAGTGTGATTTGTTGGACTTGCCAGCCGTAGCACAGTTAGAGAAGG
ATGCTAAGTATGCACCTGTTTACCAGCTACTTAAGATCTTTCTAACTCAGAGGCTGAATG
CTTACTTAGAGTTCCAAGCTGCAAATGCTGAATGTCTGCAAAGCTATGGACTTGTCGATG
AAGATTGTGTGACGAAGATGAGATTGTTGCCACTAGTGGACTTAGCGTCAGATGAATCTG
GCAAAATACCTTACGTCTCAATTAAAGACACTCTACAGGTAAAGGAAGAGGAGGTTGAAC
TGTGGATCGTGAAGGCAATAACTGCGAAGCTGATCGATTGTAAGATGGATCAGATGAACC
AAGTTGTCATTGTCAGCCGCTGTTCCGAGCGTGAATTTGGGTCAAAGCAATGGCAATCAC
TACGAACTAAGCTCGCGACTTGGCGGGATAACATTGGAAACGTCATAAGTACAATCGAGG
TAAACAAGGTAACCGAGGAAGGTTTTCAGGCATCATCATTTGCTGCAGCAATTCAAGGGG
TCCGTTGAAAAGCTATCTAGATTCATCTCCAGAAAAGCTCTCCAATTCATTACCAACGTT
AAAAGATCTCTTGTCTTCCTTAAAAGCTTTCCTCTTTGTTTTCTTGCTTGCTGAGTTTTT
CAATTTTTGAATCTTTTTTTTGTCCCTGAAACAATGCGCAGACTTTTGCTATACATTATT
TTTGGCCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A592TF U 1
AF RR2A592JQ C 388
BS 1 731 RR2A592TF
BS 732 1149 RR2A592JQ

RD RR2A592TF 731 0 0
GTAGCACCGATGATGTTATTGAAATGGTGAAAGCTATCTCTTCTAAGGTTGTTCAGCAAC
CGAGTGACAAAGCTTCACTTCGTTTGAAGATCCTCTTCAATCTCTATAACCTTCTGGACC
ACCCGTATGCTCGTTTCCAAGTGTACATGAAAGCTCTTACACTGGCTGTTGAAGGGAAGG
TTGCTGAGTACATAGTTCCTTCTTTTAAGAAGATTGACAACTTCTTGAAAGAGTGGAGCA
TTGACACTAAAGATCAGAGACAACTTTTCCTTGCTATTGCTAATGTGCTGAGAGAAAACA
AAAGCTTGGTGAAAGAATCTCTTAACTTCTCGACGAAGTATCTAGCGACTTTCTCCACTG
AGGATGCTCTGGATGAAGCTAAGGAGGAGGCTGTTCGTGCAGTTATTGAGTTTGTCAAGG
CTTCCAGCATCTTCCAGTGTGATTTGTTGGACTTGCCAGCCGTAGCACAGTTAGAGAAGG
ATGCTAAGTATGCACCTGTTTACCAGCTACTTAAGATCTTTCTAACTCAGAGGCTGAATG
CTTACTTAGAGTTCCAAGCTGCAAATGCTGAATGTCTGCAAAGCTATGGACTTGTCGATG
AAGATTGTGTGACGAAGATGAGATTGTTGCCACTAGTGGACTTAGCGTCAGATGAATCTG
GCAAAATACCTTACGTCTCAATTAAAGACACTCTACAGGTAAAGGAAGAGGAGGTTGAAC
TGTGGATCGTG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2A592JQ 762 0 0
AGGCTGTTCGTGCAGTTATTGAGTTTGTCAAGGCTTCCAGCATCTTCCAGTGTGATTTGT
TGGACTTGCCAGCCGTAGCACAGTTAGAGAAGGATGCTAAGTATGCACCTGTTTACCAGC
TACTTAAGATCTTTCTAACTCAGAGGCTGAATGCTTACTTAGAGTTCCAAGCTGCAAATG
CTGAATGTCTGCAAAGCTATGGACTTGTCGATGAAGATTGTGTGACGAAGATGAGATTGT
TGCCACTAGTGGACTTAGCGTCAGATGAATCTGGCAAAATACCTTACGTCTCAATTAAAG
ACACTCTACAGGTAAAGGAAGAGGAGGTTGAACTGTGGATCGTGAAGGCAATAACTGCGA
AGCTGATCGATTGTAAGATGGATCAGATGAACCAAGTTGTCATTGTCAGCCGCTGTTCCG
AGCGTGAATTTGGGTCAAAGCAATGGCAATCACTACGAACTAAGCTCGCGACTTGGCGGG
ATAACATTGGAAACGTCATAAGTACAATCGAGGTAAACAAGGTAACCGAGGAAGGTTTTC
AGGCATCATCATTTGCTGCAGCAATTCAAGGGGTCCGTTGAAAAGCTATCTAGATTCATC
TCCAGAAAAGCTCTCCAATTCATTACCAACGTTAAAAGATCTCTTGTCTTCCTTAAAAGC
TTTCCTCTTTGTTTTCTTGCTTGCTGAGTTTTTCAATTTTTGAATCTTTTTTTTGTCCCT
GAAACAATGCGCAGACTTTTGCTATACATTATTTTTGGCCTG

QA 1 762 1 762
DS 



CO CL1087Contig2 819 3 3 U
GGCTCCTCCGTCTCGTCTCTCTCTGCTCGGCTGCTGGAATAAGTTTTATAGTTTCGTGGC
TTT**GTTTCACAGCGCCGCCGAGAGAAGAGGGCAGAGCTAAGAAGCTATGACGACGATT
GTTCCCACTTCCGAAGAAGATCCGTTTCTCGCCGTCGTTCGATTCACTTCCCAGCTCGCC
TGGGCTGATGCTGGTCCCGAGGCTGCAGAGCCAGAGATCACCAGGCTATGTAGGGAGGCT
GAGGAGTCTATTGTAGCAGGAAAGTGGTTGGAGTTAGCTTCGTTAATGGTTACTTCAGCT
GAATTGGTATCTTCCAAGATCTCTGAGAAAGATCTTGAGTGTACCTACACCATCATTTGC
AGCCTTGTCAAGAATGCCAATAGCACCGATGATGTTCTTGAAATGGTGAAAGCTATCTCT
TCTAAGGTTGTTCAGCAACCGAGTGACAAAGCTTCACTTCGTTTGAAGATCCTCTTCAAT
CTCTATAACCTTCTGGACCACCCGTATGCTCGTTTCCAAGTGTACATGAAAGCTCTTACA
CTGGCTGTTGAAGGGAAGGTTGCTGAGTACATAGTTCCTTCTTTTAAGAAGATTGACAAC
TTCTTGAAAGAGTGGAGCATTGACACTAAAGATCAGAGACAACTTTTCCTTGCTATTGCT
AATGTGCTGAGAGAAAACAAAAGCTTGGTGAAAGAATCTCTTAACTTCTCGACGAAGTAT
CTAGCGACTTTCTCCTCTGAGATGCTCTGGATGAAGCTAAGGAGAGCTGTTCGTGCAGTT
ATTGAGTTTGTTAAGCTTCCAGCATTTCCAGTGTGATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE91TF U 1
AF RR2AS89TF U 1
AF RR2DA18TF U 1
BS 1 761 RR2AS89TF
BS 762 762 RR2DA18TF
BS 763 819 RR2AS89TF

RD RR2EE91TF 684 0 0
GGCTCCTCCGTCTCGTCTCTCTCTGCTCGGCTGCTGGAAGAAGTT**ATAGTTTCGTGGG
TTTTGTTTTCACAGCGCCGCCGAGAGAAGAGAGCAGAGCTAAGAAGCTATGACGACGATT
GTTCCCACTTCCGAAGAAGATCCGTTTCTCGCCGTCGTCCGATTCACTTCCCAGCTCGCC
TGGGCTGATGCTGGTCCCGAGGCTGCAGAGCCAGAGATCAGCAGGCTATGTAGGGAGGCT
GAGGAGTCTATTGTAGCAGGAAAGTGGTTGGAGTTAGCTTCGCTAATGGTCACTTCTGCT
GAATTGGTATCTTCCAAGATCTCTGAGAAAGATCTTGAGTGTACCTACACCATCATTTGC
AGCCTTGTCAAGAATGCGAATAGCACCGATGATGTTCTTGAAATGGTGAAAGCTATCTCT
TCTAAGGTTGTTCAGCAACCGAGTGACAAAGCTTCACTTCGTTTGAAGATCCTTTTCAAT
CTCTATAACCTTCTGGACCACCCGTATGCTCGTTTCCAAGTCTACATGAAAGCTCTTACA
CTGGCTGTTGAAGGGAAGGTTGCTGAGTACGTAGTTCCTTCTTTTAAGAAGATTGATAAC
TTCTTGAAAGAGTGGAACATTGACACTAAAGATCAGAGGCAGCTTTTCCTTGCTATTGCT
AATGTGCTGAGAGAAA
CAAAAGCT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2AS89TF 819 0 0
GGCTCCTCCGTCTCGTCTCTCTCTGCTCGGCTGCTGGAATAAGTTTTATAGTTTCGTGGC
TTT**GTTTCACAGCGCCGCCGAGAGAAGAGGGCAGAGCTAAGAAGCTATGACGACGATT
GTTCCCACTTCCGAAGAAGATCCGTTTCTCGCCGTCGTTCGATTCACTTCCCAGCTCGCC
TGGGCTGATGCTGGTCCCGAGGCTGCAGAGCCAGAGATCACCAGGCTATGTAGGGAGGCT
GAGGAGTCTATTGTAGCAGGAAAGTGGTTGGAGTTAGCTTCGTTAATGGTTACTTCAGCT
GAATTGGTATCTTCCAAGATCTCTGAGAAAGATCTTGAGTGTACCTACACCATCATTTGC
AGCCTTGTCAAGAATGCCAATAGCACCGATGATGTTCTTGAAATGGTGAAAGCTATCTCT
TCTAAGGTTGTTCAGCAACCGAGTGACAAAGCTTCACTTCGTTTGAAGATCCTCTTCAAT
CTCTATAACCTTCTGGACCACCCGTATGCTCGTTTCCAAGTGTACATGAAAGCTCTTACA
CTGGCTGTTGAAGGGAAGGTTGCTGAGTACATAGTTCCTTCTTTTAAGAAGATTGACAAC
TTCTTGAAAGAGTGGAGCATTGACACTAAAGATCAGAGACAACTTTTCCTTGCTATTGCT
AATGTGCTGAGAGAAAACAAAAGCTTGGTGAAAGAATCTCTTAACTTCTCGACGAAGTAT
CTAGCGACTTTCTCCTCTGAGATGCTCTGGATGAAGCTAAG*AGAGCTGTTCGTGCAGTT
ATTGAGTTTGTTAAGCTTCCAGCATTTCCAGTGTGATTG

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2DA18TF 781 0 0
GGCTCCTCCGTCTCGTCTCTCTCTGCTCGGCTGCTGGAATAAGTTTTATAGTTTCGTGGC
TTT**GTTTCACAGCGCCGCCGAGAGAAGAGGGCAGAGCTAAGAAGCTATGACGACGATT
GTTCCCACTTCCGAAGAAGATCCGTTTCTCGCCGTCGTTCGATTCACTTCCCAGCTCGCC
TGGGCTGATGCTGGTCCCGAGGCTGCAGAGCCAGAGATCACCAGGCTATGTAGGGAGGCT
GAGGAGTCTATTGTAGCAGGAAAGTGGTTGTAGTTAGCTTCGTTAATGGTTACTTCAGCT
GAATTGGTATCTTCCAAGATCTCTGAGAAAGATCTTGAGTGTACCTACACTATCATTTGC
AGCCTTGTCAAGAATGCCAATAGCACCGATGATGTTCTTGAAATGGTGAAAGCTATCTCT
TCTAAGGTTGTTCAGCAACCGAGTGACAAAGCTTCACTTCGTTTGAAGATCCTCTTCAAT
CTCTATAACCTTCTGGACCACCCGTATGCTCGTTTCCAAGTGTACATGAAAGCTCTTACA
CTGGCTGTTGAAGGGAAGGTTGCTGAGTACATAGTTCCTTCTTTTAAGAAGATTGACAAC
TTCTTGAAAGAGTGGAGCATTGACACTAAAGATCAGAGACAACTTTTCCTTGCTATTGCT
AATGTGCTGAGAGAAAACAAAAGCTTGGTGAAAGAATCTCTTAACTTCTCGACGAAGTAT
CTAGCGACTTTCTCCTCTGAGATGCTCTGGATGAAGCTAAGGAGAGCTGTTCGTGCAGTT
A

QA 1 781 1 781
DS 



CO CL1087Contig3 798 2 15 U
ATCAATCTAGCTATTCAGGTGGAAAATAATGTGTCTTCTCAAAACAAGAAACGGTATTAG
GCCAAAAATAATGTATAGCAAAAGTCTCCGCATTGTTTCAGGGACAAAAAAAAATTCAAA
AATTGAAAAACTCAGCGAGCAAGTAAACAGAGAGAACAAGCTTTTAAGGAAGACAAGAGA
TCTTTAACGTTGGTTATGAATTTGAGAGCTTTTCTGGAAATAAATCTAAATAGCTTTTCA
ACGGACCCCTTGTATTGCTTGAGCAAATGATGATGCCTGAAAACCTTCCTCGGTTACCTT
GTTTGCCTCGATTGTACTTATGACGTTTCCAATGTTATCCCGCCAAGTCGCGAGCTTAGT
TCGTAGTGATTGCCATTGCTTTGACCCAAATTCACGCTCGGAACAGCGGCTGACAATGAC
AACTTGGTTCATCTGATCCATCTTACAATCGATCAGCTTCCCAGTTATTGCCTTCACGAT
CCACAGTTCAACCACCTCTTCCTTTACCTGTAGAGTGTCTTTAATTGAAACGTAAGGTAT
TTTGCCAAATTCATCTGACGCTAAGTCCACTAGTGACAACAATCTCATCTTCGTTACACA
ATCTTCATCGACAAGTCCATAGCTTTGCAGACATTCAGCATTTGCAGCTTGGAACTCCAA
GTAAGCATTCAGCCTCTGAGTAAGAAAGATCTTGAGTAGCTGGTAAACAGGTGCATACTT
AGCATCCTTCTCTAACTGTGCTACGGCTGGCAAGTCCAACAAATCACACTGGAAATGCTG
GAAGCCTTACAACTCATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS89JQ U 176
AF RR2DA18JQ U 1
BS 1 218 RR2DA18JQ
BS 219 219 RR2AS89JQ
BS 220 228 RR2DA18JQ
BS 229 229 RR2AS89JQ
BS 230 265 RR2DA18JQ
BS 266 266 RR2AS89JQ
BS 267 280 RR2DA18JQ
BS 281 281 RR2AS89JQ
BS 282 460 RR2DA18JQ
BS 461 461 RR2AS89JQ
BS 462 528 RR2DA18JQ
BS 529 529 RR2AS89JQ
BS 530 547 RR2DA18JQ
BS 548 548 RR2AS89JQ
BS 549 798 RR2DA18JQ

RD RR2AS89JQ 494 0 0
AGAGATA
TTTAACGTTGGTTATGAATTTGAGAGCTTTTCTGGAAATAAATCTAAATAGCTTTTCAAC
GGACCCCTTGTATTGCTTGAGCAAATGATGATGCCTGAAAACCTTCCTCGGTTACCTTGT
TTGCCTCGATTGTACTTATGACGTTTCCAATGTTATCCCGCCAAGTCGCGAGCTTAGTTC
GTAGTGATTGCCATTGCTTTGACCCAAATTCACGCTCGGAACAGCGGCTGACAATGACAA
CTTGGTTCATCTGATCCATCTTATAATCGATCAGCTTCCCAGTTATTGCCTTCACGATCC
ACAGTTCAACCTCCTCTTCCTTTACCTGTAGAGTGTCTTTAATTGAAACGTAAGGTATTT
TGCCAAATTCATCTGACGCTAAGTCCACTAGTGACAACAATCTCATCTTCGTTACACAAT
CTTCATCGACAAGTCCATAGCTTTGCAGACATTCAGCATTTGCAGCTTGGAACTCCAAGT
AAGCATT

QA 8 494 8 494
DS 

RD RR2DA18JQ 798 0 0
ATCAATCTAGCTATTCAGGTGGAAAATAATGTGTCTTCTCAAAACAAGAAACGGTATTAG
GCCAAAAATAATGTATAGCAAAAGTCTCCGCATTGTTTCAGGGACAAAAAAAAATTCAAA
AATTGAAAAACTCAGCGAGCAAGTAAACAGAGAGAACAAGCTTTTAAGGAAGACAAGAGA
TCTTTAACGTTGGTTATGAATTTGAGAGCTTTTCTGGAGATAAATCTAGATAGCTTTTCA
ACGGACCCCTTGTATTGCTTGAGCAGATGATGATGCCTGAGAACCTTCCTCGGTTACCTT
GTTTGCCTCGATTGTACTTATGACGTTTCCAATGTTATCCCGCCAAGTCGCGAGCTTAGT
TCGTAGTGATTGCCATTGCTTTGACCCAAATTCACGCTCGGAACAGCGGCTGACAATGAC
AACTTGGTTCATCTGATCCATCTTACAATCGATCAGCTTCGCAGTTATTGCCTTCACGAT
CCACAGTTCAACCACCTCTTCCTTTACCTGTAGAGTGTCTTTAATTGAGACGTAAGGTAT
TTTGCCAGATTCATCTGACGCTAAGTCCACTAGTGACAACAATCTCATCTTCGTTACACA
ATCTTCATCGACAAGTCCATAGCTTTGCAGACATTCAGCATTTGCAGCTTGGAACTCCAA
GTAAGCATTCAGCCTCTGAGTAAGAAAGATCTTGAGTAGCTGGTAAACAGGTGCATACTT
AGCATCCTTCTCTAACTGTGCTACGGCTGGCAAGTCCAACAAATCACACTGGAAATGCTG
GAAGCCTTACAACTCATA

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 7

CO CL1088Contig1 824 7 8 U
ATGAACCAACAAATTGAAAGTAACCAGTTAGAAATAAAGAATACAATAATAAGTAATAAG
TCAAAAATTATCCAATTATTTGGATTTGAATGTCATTTATTAGAATAAATTTATTAGTTA
GGGCTATACGGATTCGAACCGTAAACCTGCTCGGTAAAAGAGCTCGAACTTATTATTATC
AAAATGATTCGAACTCTTTCAAAGACCCAACATGCATTTTTTTTTTGCATTGGGCTCTTT
CATTAACTGATAGAAAGATCAGTTAGTCTACCATATTTTTTCTTAAAAAAAAA*GATAAG
AAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTTTAATTCTATAATTCTAATACAATACAG
AAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTGGGTTCTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTGG
TCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAACATCCTGATTAAAAAATCAAATATGAA
ACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAAGATCACTTTTGAGTTCCTTATACTCAT
TCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCACCCTATCAATATCTCAAATCAATGATGGG
TTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACTTTAATAGGACCTAATGTCAGGCTATTGTT
CTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAAGTCATGGAGTAAGACATCGATTTATTAATAAGATCAAT
CAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTGAAAAACTTTGGCGCACGTGTAAACGAGG
TGCTCTACCTAACTGAGCCATAGCCCTTGTGTTTATGATCCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 10 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 20 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS67JQ U 282
AF RR2F269JQ U 154
AF RR2AK71JQ U 154
AF RR2AK71TF C 154
AF RR2F269TF C 154
AF RR2AB55JQ U 1
AF RR2AB55TF C 120
BS 1 293 RR2AB55JQ
BS 294 294 RR2F269JQ
BS 295 299 RR2AB55JQ
BS 300 300 RR2AK71JQ
BS 301 424 RR2AB55JQ
BS 425 425 RR2AK71JQ
BS 426 799 RR2AB55JQ
BS 800 824 RR2AB55TF

RD RR2AS67JQ 140 0 0
CTTAAAAAAAAAA*ATAAAAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTTTAATTCTA
TAATTCTAATACAATACAAAAAAACTACCAAAGTGTTTCAAAAAAGGGTTGGGTTCTCTT
GACGTAGGTTTGCTTTTGGT

QA 1 140 1 140
DS 

RD RR2F269JQ 401 0 0
GTAAAAGAGCTCGAACTTATTATTATCAAAATGATTCGAACTCTTTCAAAGACCCAACAT
GCATTTTTTTTT*GCATTGGGCTCTTTCATTAACTGATAAAAAGATCAGTTAGTCTACCA
TATTTTTTCTTAAAAAAAAA*GATAAAAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTT
TAATTCTATAATTCTAATACAATACAGAAAAACTACCAAAGTGTTTCAAAAAAGGGTTGG
GTTCTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTGGTCTAAATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAA
CATCCTGATTAAAAAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAA
GATCACTTTTGAGTTACTTATACTCATTCTGCCTAGCATTA

QA 1 401 1 401
DS 

RD RR2AK71JQ 599 0 0
GTAAAAGAGCTCGAACTTATTATTATCAAAATGATTCGAACTCTTTCAAAGACCCAACAT
GCATTTTTTTTTTGCATTGGGCTCTTTCATTAACTGATAGAAAGATCAGTTAGTCTACCA
TATTTTTTCTTAAAAAAAAA*GATAAGAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTT
TAATTCTATAATTCTAATACAATACAGAAGA*CTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTGG
GTTCTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAA
CATCCTGATTAAAAAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAA
GATCACTTTTGAGTTCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCACC
CTATCAATATCTCAAATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACTTT
AATAGGACCTAATGTCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAAATCATGGAGTA
AGACATCGATTTATTAATAAGATCAATCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2AK71TF 599 0 0
GTAAAAGAGCTCGAACTTATTATTATCAAAATGATTCGAACTCTTTCAAAGACCCAACAT
GCATTTTTTTTTTGCATTGGGCTCTTTCATTAACTGATAGAAAGATCAGTTAGTCTACCA
TATTTTTTCTTAAAAAAAAA*GATAAGAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTT
TAATTCTATAATTCTAATACAATACAGAAGA*CTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTGG
GTTCTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAA
CATCCTGATTAAAAAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAA
GATCACTTTTGAGTTCCTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCACC
CTATCAATATCTCAAATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACTTT
AATAGGACCTAATGTCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAAATCATGGAGTA
AGACATCGATTTATTAATAAGATCAATCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2F269TF 604 0 0
GTAAAAGAGCTCGAACTTATTATTATCAAAATGATTCGAACTCTTTCAAAGACCCAACAT
GCATTTTTTTTT*GCATTGGGCTCTTTCATTAACTGATAGAAAGATCAGTTAGTCTACCA
TATTTTTTCTTAAAAAAAAA*GATAAGAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTT
TAATTCTATAATTCTAATACAATACAGAAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTGG
GTTCTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTGGTCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAA
CATCCTGATTAAAAAATCAAATATGAAACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAA
GATCACTTTTGAGTTACTTATACTCATTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCACC
CTATCAATATCTCAAATCAATGATGGGTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACTTT
AATAGGACCTAATGTCAGGCTATTGTTCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAAGTCATGGAGTA
AGACATCGATTTATTAATAAGATCAATCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTG
AAAAA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2AB55JQ 799 0 0
ATGAACCAACAAATTGAAAGTAACCAGTTAGAAATAAAGAATACAATAATAAGTAATAAG
TCAAAAATTATCCAATTATTTGGATTTGAATGTCATTTATTAGAATAAATTTATTAGTTA
GGGCTATACGGATTCGAACCGTAAACCTGCTCGGTAAAAGAGCTCGAACTTATTATTATC
AAAATGATTCGAACTCTTTCAAAGACCCAACATGCATTTTTTTTTTGCATTGGGCTCTTT
CATTAACTGATAGAAAGATCAGTTAGTCTACCATATTTTTTCTTAAAAAAAAAAGATAAA
AAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTTTAATTCTATAATTCTAATACAATACAG
AAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTGGGTTCTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTGG
TCTAAATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAACATCCTGATTAAAAAATCAAATATGAA
ACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAAGATCACTTTTGAGTTCCTTATACTCAT
TCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCACCCTATCAATATCTCAAATCAATGATGGG
TTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACTTTAATAGGACCTAATGTCAGGCTATTGTT
CTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAAGTCATGGAGTAAGACATCGATTTATTAATAAGATCAAT
CAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTGAAAAACTTTGGCGCACGTGTAAACGAGG
TGCTCTACCTAACTGAGCC

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2AB55TF 705 0 0
AGGGCTATACGGATTCGAACCGTAGACCTGCTCGGTAAAAGAGCTCGAACTTATTATTAT
CAAAATGATTCGAACTCTTTCAAAGACCCAACATGCATTTTTTTTTTGCATTGGGCTCTT
TCATTAACTGATAGAAAGATCAGTTAGTCTACCATATTTTTTCTTAAAAAAAAAAGATAA
GAAATGGTTCCAAGTACTCTGATTGATTATTTTTTAATTCTATAATTCTAATACAATACA
GAAGAACTACCAAAGTGTTTCAAAGAAGGGTTGGGTTCTCTTGACGTAGGTTTGCTTTTG
GTCTAGATCAACTTAAGTTAAATATAGTCTCTAACATCCTGATTAAAAAATCAAATATGA
AACTTGCTACACCTTAAGGTTCATAGGACGAAAAGATCACTTTTGAGTTCCTTATACTCA
TTCTGCCTAGCATTAAGTAGACTGGGTATTCACCCTATCAATATCTCAAATCAATGATGG
GTTCTATTAATTCCCTACCTAAATGGGGTACTTTAATAGGACCTAATGTCAGGCTATTGT
TCTCCTCTTTTTCCTAAAAAAAAGTCATGGAGTAAGACATCGATTTATTAATAAGATCAA
TCAATTGGTTTGATTGCGTGATGGACTCCTCTGAAAAACTTTGGCGCACGTGTAAACGAG
GTGCTCTACCTAACTGAGCCATAGCCCTTGTGTTTATGATCCATC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 7

CO CL1089Contig1 738 7 9 U
GGCATAAACCAAACAAAAAAAGAGAGCCAAAGCTTTAAAACAAGAAAGAAATGGCAACGT
CGGGAACATACGTGACGGAGGTTCCTTTAAAAGGGACGGCGGAGAAACACTACAAGAGGT
GGAAGAGTGAGAACCATCTCTTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAACGTCACCG
TTCACGAAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATG
GAAAGCAGGAGGTATACAAGGAGAAGAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGG
CTAGAGGAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAAT
TTATTCCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCA
ACGATGAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTATATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTTGCTGACA
TGGAGGAGCACGTCCACAAAGCTTAATCACCATCACCATCACAATCACCATCACAATCCC
CATCACCATCACCATCAAGTCATCACTATCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATAT
AATTATTAATGAATAAGTGTGGTCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATAAAATCGTTTGG
TTCTTGTAAGATGGTCTAAGTATCGAGTTCTGTAATGATCCTTCAGTTAATTTTAAATTT
CCCATATAGTATACACAC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL45TF U 4
AF RR2EL34TF U 2
AF RR2GW77TF U 1
AF RR2F327TF U 2
AF RR2F327JQ C 62
AF RR2EL34JQ C 189
AF RR2FL45JQ C 528
BS 1 172 RR2GW77TF
BS 173 173 RR2F327TF
BS 174 481 RR2GW77TF
BS 482 482 RR2EL34TF
BS 483 664 RR2GW77TF
BS 665 694 RR2F327TF
BS 695 695 RR2F327JQ
BS 696 730 RR2F327TF
BS 731 738 RR2FL45JQ

RD RR2FL45TF 581 0 0
GG
AAACCAAACAAAAAAAGAGAGCCAAAGCTTTAAAACAAGAAAGAAATGGCAACGTCGGGA
ACATACGTGACGGAGGTTCCTTTAAAAGGGACGGCGGAGAAACACTACAAGAGGTGGAAG
AGTGAGAACCATCTCTTCCCTGATACCATCGTCCACCACATTCAGAATGTCACCGTTCAC
GAAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAAG
CAGGAGGTATACAAGGAGAAGAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGCTAGA
GGAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTTATT
CCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACCATGATCTGGGAGAAGCGCAACGAT
GAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTATATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTTGCTGACATGGAG
GAGCACGTCCACAAAGCTTAATCACCATCACCATCACAATCACCATCACAATCCCCATCA
CCATCACCATCAAGTCATCACTATCTCAATTTACTTATT

QA 3 581 3 581
DS 

RD RR2EL34TF 639 0 0
GGAT
AAACCAAACAAAAAAAGAGAGCCAAAGCTTTAAAACAAGAAAGAAATGGCAACGTCGGGA
ACATACGTGACGGAGGTTCCTTTAAAAGGGACGGCGGAGAAACACTACAAGAGGTGGAAT
AGTGAGAACCATCTCTTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGTCACCGTTCAC
GAAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAAG
CAGGAGGTATACAAGGAGAAGAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGCTAGA
GGAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTTATT
CCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCAACGAT
GAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTATATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTTGCTGACATGGAG
GAGCACGTCCACAAAGCTTAATCACCATCACCATCACAATCACCATCACAATCCCCATCA
CCATCACCATCAAGTCATCACTATCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTA
TTAATGAATAAGTGTGGTCTTGTACGTGGAGTTCC

QA 5 639 5 639
DS 

RD RR2GW77TF 664 0 0
GGCATAAACCAAACAAAAAAAGAGAGCCAAAGCTTTAAAACAAGAAAGAAATGGCAACGT
CGGGAACATACGTGACGGAGGTTCCTTTAAAAGGGACGGCGGAGAAACACTACAAGAGGT
GGAAGAGTGAGAACCATCTCTTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGTCACCG
TTCACGAAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATG
GAAAGCAGGAGGTATACAAGGAGAAGAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGG
CTAGAGGAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAAT
TTATTCCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCA
ACGATGAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTATATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTTGCTGACA
TTGAGGAGCACGTCCACAAAGCTTAATCACCATCACCATCACAATCACCATCACAATCCC
CATCACCATCACCATCAAGTCATCACTATCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATAT
AATTATTAATGAATAAGTGTGGTCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATAAAATCGTTTGG
TTCT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2F327TF 733 0 0
GGAT
AAACCAAACAAAAAAAGAGGGCCAAAGCTTTAAAACAAGAAAGAAATGGCAACGTCGGGA
ACATACGTGACGGAGGTTCCTTTAAAAGGGACGGCGGAGAAACACTACAAGAGGTGGAAG
AGTGAGAACCATCTCTTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAACGTCACCGTTCAC
GAAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAAG
CAGGAGGTATACAAGGAGAAGAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGCTAGA
GGAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTTATT
CCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCAACGAT
GAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTATATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTTGCTGACATGGAG
GAGCACGTCCACAAAGCTTAATCACCATCACCATCACAATCACCATCACAATCCCCATCA
CCATCACCATCAAGTCATCACTATCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTA
TTAATGAATAAGTGTGGTCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATAAAATCGTTTGGTTCTT
GTAAGATGGTCTAAGTATCGAGTTCTGTA*TGATCCTTCAGTTAATTTTAAATTTCCCAT
ATAGT
ATAC

QA 5 729 5 729
DS 

RD RR2F327JQ 673 0 0
GGGAACATACGTGACGGAGGTTCCTTTAAAAGGGACGGCGGAGAAACACTACAAGAGGTG
GAAGAGTGAGAACCATCTCTTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAACGTCACCGT
TCACGAAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGG
AAAGCAGGAGGTATACAAGGAGAAGAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGC
TAGAGGAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATT
TATTCCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCAA
CGATGAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTATATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTTGCTGACAT
GGAGGAGCACGTCCACAAAGCTTAATCACCATCACCATCACAATCACCATCACAATCCCC
ATCACCATCACCATCAAGTCATCACTATCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATA
ATTATTAATGAATAAGTGTGGTCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATAAAATCGTTTGGT
TCTTGTAAGATGGTCTAAGTATCGAGTTCTGTAATGATCCTTCAGTTAATTTTAAATTTC
CCATATAGT
ATAC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2EL34JQ 542 0 0
GGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAAGCAG
GAGGTATACAAGGAGAAGAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGCTAGAGGA
ATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTTATTCCC
AGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATTTGGGAGAAGCGCAACGATGAA
GTCCCCGAACCAAGCAGCTATATGAAACTTGTCAAGAGCATGGTTGCTGACATGGAGGAG
CACGTCCACAAAGCTTAATCACCATCACCATCACAATCACCATCACAATCCCCATCACCA
TCACCATCAAGTCATCACTATCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTATTA
ATGAATAAGTGTGGTCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATAAAATCGTTTGGTTCTTGTA
AGATGGTCTAAGTATCGAGTTCTGTAATGATCCTTCAGTTAATTTTAAATTTCCCATATA
GT

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2FL45JQ 211 0 0
CCATCACAATCCCCATCACCATCACCATCAAGTCATCACTATCTCAATTTACTTATTAAG
GTGTTTTCAATATAATTATTAATGAATAAGTGTGGTCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTA
TAAAATCGTTTGGTTCTTGTAAGATGGTCTAAGTATCGAGTTCTGTAATGATCCTTCAGT
TAATTTTAAATTTCCCATATAGTATACACAC

QA 1 211 1 211
DS 



AS 2 6

CO CL1090Contig1 808 2 2 U
GGGAATACCAACGGTTTCATATCTGAGTCAGTGTTTCTGATTAGTCAGCGACCAAGTTAA
AGAGTATCTTCGGAGCCCAGGAAATGTTAGGAAGCTCTTTAGCTTCACCTTTGGCTACGG
TGGGTTCTGTCAAATGCTTTCGACACTCTGCAGGTGATTTTGTAACATGCAGCAATGTTT
TACCATTGAGACTGAACTCGTCTTATCATGGTCTGGTTGGAGAAGTAAGAACACCTCGTG
TGTCACGAAACAAGTGGATAGTGCTCTGTTCAACAACACAAGTGGAAACCTCTGGTGATG
AGCCAAAGACATGGGAAGAATGCAAAGAAGCTTTGTCTTGTTTTGATTTCAGCGTAGAGG
AGCAAGACAAGATACTAGGAAAAGCGTTTGGTCATATCCACTCGCCGTACTGGACAGAAG
AACGAGTGAAAGAGAATCCAAAGGTGGAAACTTTGAATCATGTAGTCGAGTTCCTTAGAA
GTCTCGGTTTGTCTGACGAAGATCTTCACAAAGTGCTGAAGAAGTTCCCGGAAGTACTCG
GTTGCAGCCTAGAAGAAGAGATGAAACCCAACATTGGGATCTTGGAAAGTCAATGGGGGA
TTACGGGTAAGTCGCTGCGAAGTCTGTTGCTTCGGAATCCCAAAGTGTTGGGGTACAATG
TGGATTGTAAAGGAGATTGTATTGCTCAGTGCACTCGGTGTTGGGTTCGGTTTTAGTCTT
TCACTAGTTCGTTTGTTCCTCAAGGAGAAGAGTTGGTTTGTATCTAGTCTACAGCTACTG
AAATAAACAAGCACTAGAACACCCGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS76TF U 1
AF RR2BS76JQ C 76
BS 1 693 RR2BS76TF
BS 694 808 RR2BS76JQ

RD RR2BS76TF 693 0 0
GGGAATACCAACGGTTTCATATCTGAGTCAGTGTTTCTGATTAGTCAGCGACCAAGTTAA
AGAGTATCTTCGGAGCCCAGGAAATGTTAGGAAGCTCTTTAGCTTCACCTTTGGCTACGG
TGGGTTCTGTCAAATGCTTTCGACACTCTGCAGGTGATTTTGTAACATGCAGCAATGTTT
TACCATTGAGACTGAACTCGTCTTATCATGGTCTGGTTGGAGAAGTAAGAACACCTCGTG
TGTCACGAAACAAGTGGATAGTGCTCTGTTCAACAACACAAGTGGAAACCTCTGGTGATG
AGCCAAAGACATGGGAAGAATGCAAAGAAGCTTTGTCTTGTTTTGATTTCAGCGTAGAGG
AGCAAGACAAGATACTAGGAAAAGCGTTTGGTCATATCCACTCGCCGTACTGGACAGAAG
AACGAGTGAAAGAGAATCCAAAGGTGGAAACTTTGAATCATGTAGTCGAGTTCCTTAGAA
GTCTCGGTTTGTCTGACGAAGATCTTCACAAAGTGCTGAAGAAGTTCCCGGAAGTACTCG
GTTGCAGCCTAGAAGAAGAGATGAAACCCAACATTGGGATCTTGGAAAGTCAATGGGGGA
TTACGGGTAAGTCGCTGCGAAGTCTGTTGCTTCGGAATCCCAAAGTGTTGGGGTACAATG
TGGATTGTAAAGGAGATTGTATTGCTCAGTGCA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2BS76JQ 733 0 0
CC
CAGGAAATGTTAGGAAGCTCTTTAGCTTCACCTTTGGCTACGGTGGGTTCTGTCAAATGC
TTTCGACACTCTGCAGGTGATTTTGTAACATGCAGCAATGTTTTACCATTGAGACTGAAC
TCGTCTTATCATGGTCTGGTTGGAGAAGTAAGAACACCTCGTGTGTCACGAAACAAGTGG
ATAGTGCTCTGTTCAACAACACAAGTGGAAACCTCTGGTGATGAGCCAAAGACATGGGAA
GAATGCAAAGAAGCTTTGTCTTGTTTTGATTTCAGCGTAGAGGAGCAAGACAAGATACTA
GGAAAAGCGTTTGGTCATATCCACTCGCCGTACTGGACAGAAGAACGAGTGAAAGAGAAT
CCAAAGGTGGAAACTTTGAATCATGTAGTCGAGTTCCTTAGAAGTCTCGGTTTGTCTGAC
GAAGATCTTCACAAAGTGCTGAAGAAGTTCCCGGAAGTACTCGGTTGCAGCCTAGAAGAA
GAGATGAAACCCAACATTGGGATCTTGGAAAGTCAATGGGGGATTACGGGTAAGTCGCTG
CGAAGTCTGTTGCTTCGGAATCCCAAAGTGTTGGGGTACAATGTGGATTGTAAAGGAGAT
TGTATTGCTCAGTGCACTCGGTGTTGGGTTCGGTTTTAGTCTTTCACTAGTTCGTTTGTT
CCTCAAGGAGAAGAGTTGGTTTGTATCTAGTCTACAGCTACTGAAATAAACAAGCACTAG
AACACCCGCAC

QA 3 733 3 733
DS 



CO CL1090Contig2 1039 4 7 U
GGAGAGCGTAAAGACGCAATTTCAGAAAGCGACCTTTCTTTTCTCTCAACAACAATGGTT
GGTTCTTCCTTCTTCTCTCACATATACACCTAACCTTCTCAATACCAACGGTTTCATATC
TGACTCAGTGTTTGCTTCTGGTTCGCCAGCGACCAAGTTAAGAGTATCTTCGCAGTTCAG
GAAATGTTAGGAAGCTCTTTAGCTTCACCTTTGGCTACAGTGGGTTCTGTCAAATGTTTT
CGACACTCTGCAGGTGATTTTGTAACATACAGTAATGTTTTACCACTGGGACTGAACTCG
TCGTATCACAGTGTGGTGGGAGGAGTAAGAACATCTCGTGTTCCGCGAAACAAGTGGATA
GTGCTCTGTTCAACAACACAAATGGAAACCTCTGGTGATGAGCCAAAGACATGGGAAGAA
TGCAAAGAAGCTTTGTCTTGTTTTGATTTCAGCGCAGAGGAGCAAGACAAGATACTAGGA
AAAGCGTTTGGTCATATCCATTCGCCTTACTGGACAGAAGAACGAGTGAAAGAGAATCCA
AAGGTGGAAACTTTGAATCATGTAGTCGAGTTCCTTAGAAGTCTCGGTTTGTCTGACGAA
GATCTTCACAAAGTGCTGAAGAAGTTCCCGGAAGTACTCGGTTGCAGCCTAGAAGAAGAG
ATGAAACCCAACATTGGGATCTTGGAAAGTCAATGGGGGATTACGGGTAAGTCGCTGCGA
AGTCTGTTGCTTCGGAATCCCAAAGTGTTGGGGTACAATGTGGATTGTAAAGGAGATTGT
ATTGCTCAGTGCACTCGGTGTTGGGTTCGGTTTTAGTCTTTCACTAGTTCGTTTGTTCCT
CAAGGAGAAGAGTTGGTTTGTATCTAGTCAACAGCTACTGAAATAAACAAGCACTAGAAC
ACCCGCTCATTTTATAAATATATAACTAAATGTTTTAAATATGTGATTTATATTTAGTAT
TATATATTGCACAACTTTTGTAATTTTATTGTTTCAATTTTTTTATTAACCGTTATTAAT
ATATAATGAATTGTTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F350TF U 1
AF RR2A366TF U 189
AF RR2GB95JQ C 616
AF RR2F350JQ C 213
BS 1 727 RR2F350TF
BS 728 768 RR2A366TF
BS 769 869 RR2F350JQ
BS 870 870 RR2GB95JQ
BS 871 889 RR2F350JQ
BS 890 890 RR2GB95JQ
BS 891 1039 RR2F350JQ

RD RR2F350TF 727 0 0
GGAGAGCGTAAAGACGCAATTTCAGAAAGCGACCTTTCTTTTCTCTCAACAACAATGGTT
GGTTCTTCCTTCTTCTCTCACATATACACCTAACCTTCTCAATACCAACGGTTTCATATC
TGACTCAGTGTTTGCTTCTGGTTCGCCAGCGACCAAGTTAAGAGTATCTTCGCAGTTCAG
GAAATGTTAGGAAGCTCTTTAGCTTCACCTTTGGCTACAGTGGGTTCTGTCAAATGTTTT
CGACACTCTGCAGGTGATTTTGTAACATACAGTAATGTTTTACCACTGGGACTGAACTCG
TCGTATCACAGTGTGGTGGGAGGAGTAAGAACATCTCGTGTTCCGCGAAACAAGTGGATA
GTGCTCTGTTCAACAACACAAATGGAAACCTCTGGTGATGAGCCAAAGACATGGGAAGAA
TGCAAAGAAGCTTTGTCTTGTTTTGATTTCAGCGCAGAGGAGCAAGACAAGATACTAGGA
AAAGCGTTTGGTCATATCCATTCGCCTTACTGGACAGAAGAACGAGTGAAAGAGAATCCA
AAGGTGGAAACTTTGAATCATGTAGTCGAGTTCCTTAGAAGTCTCGGTTTGTCTGACGAA
GATCTTCACAAAGTGCTGAAGAAGTTCCCGGAAGTACTCGGTTGCAGCCTAGAAGAAGAG
ATGAAACCCAACATTGGGATCTTGGAAAGTCAATGGGGGATTACGGGTAAGTCGCTGCGA
AGTCTGT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2A366TF 580 0 0
AGGAAGCTCTTTAGCTTCACCTTTGGCTACAGTGGGTTCTGTCAAATGTTTTCGACACTC
TGCAGGTGATTTTGTAACATACAGTAATGTTTTACCACTGGGACTGAACTCGTCGTATCA
CAGTGTGGTGGGAGGAGTAAGAACATCTCGTGTTCCGCGAAACAAGTGGATAGTGCTCTG
TTCAACAACACAAATGGAAACCTCTGGTGATGAGCCAAAGACATGGGAAGAATGCAAAGA
AGCTCTGTCTTGTTTTGATTTCAGCGCAGAGGAGCAAGACAAGATACTAGGAAAAGCGTT
TGGTCATATTCACTCGCCTTACTGGACAGAAGAACGAGTGAAAGAGAATCCGAAGGTGGA
AACTTTGAATCATGTGGTCGAGTTCCTTAGAAGTCTCGGTTTGTCTGACGAAGATCTTCA
CAAAGTGCTGAAGAAGTTCCCGGAAGTACTCGGTTGCAGCCTAGAAGAAGAGATGAGACC
CAACATTGGGATCTTGGAAAGTCAATGGGGGATAACGGGTAAGTCGCTGCGAAGTCTGTT
GCTTCGGAATCCCAAAGTGTTGGGGTACAATGTGGATTGT

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2GB95JQ 367 0 0
CTGAAGAAGTTCCCGGAAGTACTCGGTTGCAGCCTAGAAGAAGAGATGAAACCCAACATT
GGGATCTTGGAAAGTCAATGGGG*ATTACGGGTAAGTCGCTGCGAAGTCTGTTGCCTCGG
AATCCCAAAGTGTTGGGGTACAATGTGGATTGTAAAGGAGATTGTATTGCTCAGTGCACT
CGGTGTTGGGTTCGGTTTTAGTCTTTCACTAGTTCGTTTGTTCCTCAAGGAGAAGAGTTG
GTTTGTATCTAGTCAACAGCTACTGAAATAAACAAGCACTAGAACACCCGCTCATTTTAT
A**TATATAACTAAATGTTTTAAATATGTGATTTATATTTAGTATTATATATTGCATAAC
TTT
GTGG

QA 1 363 1 363
DS 

RD RR2F350JQ 827 0 0
GGCTACAGTGGGTTCTGTCAAATGTTTTCGACACTCTGCAGGTGATTTTGTAACATACAG
TAATGTTTTACCACTGGGACTGAACTCGTCGTATCACAGTGTGGTGGGAGGAGTAAGAAC
ATCTCGTGTTCCGCGAAACAAGTGGATAGTGCTCTGTTCAACAACACAAATGGAAACCTC
TGGTGATGAGCCAAAGACATGGGAAGAATGCAAAGAAGCTTTGTCTTGTTTTGATTTCAG
CGCAGAGGAGCAAGACAAGATACTAGGAAAAGCGTTTGGTCATATCCATTCGCCTTACTG
GACAGAAGAACGAGTGAAAGAGAATCCAAAGGTGGAAACTTTGAATCATGTAGTCGAGTT
CCTTAGAAGTCTCGGTTTGTCTGACGAAGATCTTCACAAAGTGCTGAAGAAGTTCCCGGA
AGTACTCGGTTGCAGCCTAGAAGAAGAGATGAAACCCAACATTGGGATCTTGGAAAGTCA
ATGGGGGATTACGGGTAAGTCGCTGCGAAGTCTGTTGCTTCGGAATCCCAAAGTGCTGGG
GTACAATGTGGATTGTAAAGGAGATTGTATTGCTCAGTGCACTCGGTGTTGGGTTCGGTT
TTAGTCTTTCACTAGTTCGTTTGTTCCTCAAGGAGAAGAGTTGGTTTGTATCTAGTCTAC
AGCTACTGAAATAAACATGCACTAGAACACCCGCTCATTTTATAAATATATAACTAAATG
TTTTAAATATGTGATTTATATTTAGTATTATATATTGCACAACTTTTGTAATTTTATTGT
TTCAATTTTTTTATTAACCGTTATTAATATATAATGAATTGTTATGT

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 7

CO CL1091Contig1 710 7 7 U
GGAATTCATTCAAAAGCCAAAAGAACAAAAACAAAAAA*GAAAGATCAGAGATGGCGACG
TCAGGAACATATGTGACGGAGGTTCCTTTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACTACAAGAGG
TGGAAGAATGAAAACCATCTCTTCCCCGACGCCATTGGCCACCTCATTCAAGGTGTCAAC
GTCCACGATGGTGAATGGGACTCTCATGGATCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGAT
GGGAAACAAGAGGTGTTCAAGGAGAGGAGAGAGAATGACGATGAGAATATGGCGGTAACG
CTCAAAGGGCTCGAAGGTCACGTAATGGAGCAGCTTAAAGTGTATGACGTCACCTTTCAG
TTCATTCAAAAGTCGCCTAGTGATATAGTCTGCAAGGTCACTATGATATGGGAGAAGCGA
ACCGATGACTCGCCTGAACCCATCAACTACATGAAGTTCGCCAAGAGCCTCGCTGCGGAC
ATGGATCACCACGTTATCAAATCCTAAGTCCGTTTCAAACCATCATCACCAGATCCCCCA
CCGTTATATATGGCTGCCTTTGTGTGTGTGTGCGCGCGCGCCCCTTCGTATTATGTTATA
ATAAATGGGGCTCTTGTATGGTTCATCAATTTCAATATATTGTTGTTTGTGTATTTTGAT
ATGCTTTGATGTTGTTAATTACGTGTGATAAATCTCGAGGTTTCATATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL84TF U 1
AF RR2A367JQ C 211
AF RR2GN24TF U 6
AF RR2A809TF U 1
AF RR2CL84JQ C 575
AF RR2CX82TF U 1
AF RR2GN24JQ C 207
BS 1 460 RR2A809TF
BS 461 461 RR2GN24TF
BS 462 473 RR2A809TF
BS 474 474 RR2CX82TF
BS 475 498 RR2A809TF
BS 499 499 RR2CX82TF
BS 500 710 RR2A809TF

RD RR2CL84TF 108 0 0
GGAATTC
ATTCAAAAGCCAAAAGAACAAAAACAAAAAAAGAAAGATCATAGATGGCGACGTCAGGAA
CATATGTGACGGAGGTTCCTTTGAAAGGATCGGCGGAGAAA

QA 8 108 8 108
DS 

RD RR2A367JQ 108 0 0
TCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAAACAAGAGGTGTTCAAGGAGAGGAGA
GAGAATGACGATGAGAATATGGCGGTAACGCTCAAAGGGCTGGAAGGT

QA 1 108 1 108
DS 

RD RR2GN24TF 625 0 0
GG
ATTCAAAAGCCAAAAGAACAAAAACAAAAAA*GAAAGATCAGAGATGGCGACGTCAGGAA
CATATGTGACGGAGGTTCCTTTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACCACAAGAGGTGGAAGA
ATGAAAACCATCTCTTCCCCGACGCCATTGGCCACCTCATTCAAGGTGTCAACGTCCACG
ATGGTGAATGGGACTCTCATGGATCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAAAC
AAGAGGTGTTCAAGGAGAGGAGAGAGAATGACGATGAGAATATGGCGGTAACGCTCAAAG
GGCTCGAAGGTCACGTAATGGAGCAGCTTAAAGTGTATGACGTCACCTTTCAGTTCATTC
AAAAGTCGCCTAGTGATATAGTCTGCAAGGTCACTATGATATGGGAGAAGCGAACCGATG
ACTCGCCTGAACCCATCAACTACATGAAGTTCGCCAAGAGCCTCGCTGCGGACATGGATC
ACCACGTTATCAAATCCTAAGTCCGTTTCAAACCATCATCACCAGATCCCCCACCGTTAT
ATATGGCTGCCTTTGTGTGTGTGTGCGCGCGCGCCCCTTCGTATTATGTTATAATAAATG
GGGCTCTTGTATGGTTCATCAAT

QA 3 625 3 625
DS 

RD RR2A809TF 710 0 0
GGAATTCATTCAAAAGCCAAAAGAACAAAAACAAAAAA*GAAAGATCAGAGATGGCGACG
TCAGGAACATATGTGACGGAGGTTCCTTTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACTACAAGAGG
TGGAAGAATGAAAACCATCTCTTCCCCGACGCCATTGGCCACCTCATTCAAGGTGTCAAC
GTCCACGATGGTGAATGGGACTCTCATGGATCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGAT
GGGAAACAAGAGGTGTTCAAGGAGAGGAGAGAGAATGACGATGAGAATATGGCGGTAACG
CTCAAAGGGCTCGAAGGTCACGTAATGGAGCAGCTTAAAGTGTATGACGTCACCTTTCAG
TTCATTCAAAAGTCGCCTAGTGATATAGTCTGCAAGGTCACTATGATATGGGAGAAGCGA
ACCGATGACTCGCCTGAACCCATCAACTACATGAAGTTCGTCAAGAGCCTCGCCGCGGAC
ATGGATCACCACGTTATCGAATCCTAAGTCCGTTTCAAACCATCATCACCAGATCCCCCA
CCGTTATATATGGCTGCCTTTGTGTGTGTGTGCGCGCGCGCCCCTTCGTATTATGTTATA
ATAAATGGGGCTCTTGTATGGTTCATCAATTTCAATATATTGTTGTTTGTGTATTTTGAT
ATGCTTTGATGTTGTTAATTACGTGTGATAAATCTCGAGGTTTCATATAT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2CL84JQ 101 0 0
G
GCGCGCGCCTACGTATTATGTTATAATAAAAGGGGCTCTTGTATGGTTCATCAATTTCAA
TATATTGTTGTTTGTGTATTTTGATATGCTTTGATGTTGT

QA 2 101 2 101
DS 

RD RR2CX82TF 680 0 0
GGAATTC
ATTCAAAAGCCAAAAGAACAAAAACAAAAAA*GAAAGATCAGAGATGGCGACGTCAGGAA
CATATGTGACGGAGGTTCCTTTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACTACAAGAGGTGGAAGA
ATGAAAACCATCTCTTCCCCGACGCCATTGGCCACCTCATTCAAGGTGTCAACGTCCACG
ATGGTGAATGGGACTCTCATGGATCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAAAC
AAGAGGTGTTCAAGGAGAGGAGAGAGAATGACGATGAGAATATGGCGGTAACGCTCAAAG
GGCTCGAAGGTCACGTAATGGAGCAGCTTAAAGTGTATGACGTCACCTTTCAGTTCATTC
AAAAGTCGCCTAGCGATATAGTCTGCAAGGTCACTATGATATGGGAGAAGCGAACCGATG
ACTCGCCTGAACCCATCAACTACATGAAGTTCGTCAAGAGCCTCGCTGCGGACATGGATC
ACCACGTTATCAAATCCTAAGTCCGTTTCAAACCATCATCACCAGATCCCCCACCGTTAT
ATATGGCTGCCTTTGTGTGTGTGTGCGCGCGCGCCCCTTCGTATTATGTTATAATAAATG
GGGCTCTTGTATGGTTCATCAATTTCAATATATTGTTGTTTGTGTATTTTGATATGCTTT
GATGTTGT
TAATT

QA 8 675 8 675
DS 

RD RR2GN24JQ 470 0 0
TGGATCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGGAAACAAGAGGTGTTCAAGGAGAG
GAGAGAGAATGACGATGAGAATATGGCGGTAACGCTCAAAGGGCTCGAAGGTCACGTAAT
GGAGCAGCTTAAAGTGTATGACGTCACCTTTCAGTTCATTCAAAAGTCGCCTAGTGATAT
AGTCTGCAAGGTCACTATGATATGGGAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAACCCATCAA
CTACATGAAGTTCGCCAAGAGCCTCGCTGCGGACATGGATCACCACGTTATCAAATCCTA
AGTCCGTTTCAAACCATCATCACCAGATCCCCCACCGTTATATATGGCTGCCTTTGTGTG
TGTGTGCGCGCGCGCCCCTTCGTATTATGTTATAATAAATGGGGCTCTTGTATGGTTCAT
CAATTTCAATATATTGTTGTTTGTGTATTTTGATATGCTTTGATGTTGT
T

QA 1 469 1 469
DS 



AS 2 7

CO CL1092Contig1 643 5 11 U
GGACTCTTTCGTGTCGGAAGAAACAATAAGAAACAACAGAAAAGAAAAGAAAAAGCTCTA
CAGATGGCGATGATGTCAGCATCTTCGGTGTTTCTTTTGCCGGCCAACGTCACGGTGGCC
GCTGGATCTTCGTCGTCCAGAAACTCCGTGTCTTTCTTACCGATGAGAAACGCCGGTTCT
AGGCTCGTAGTCAGAGCAGCCGATGACGCGGCTCCAGAACCAGCTGCGCCAGAAGGTGCT
CCGGCAGCTGTAGCGGCGCCAGCTGCAGCTCCTGCCGCGAAACCCAAGCCGCCTCCTATT
GGCCCTAAGAGAGGGACCAAGGTCAAGATTCTAAGGAAAGAATCCTACTGGTTCAAGAGC
ACTGGATCGGTTGTGGCCGTTGATCAGGACCCGAAGACCCGGTACCCTGTTGTGGTCAGG
TTTGCGAAAGTGAATTACGCAAACATATCGACCAACAACTATGCATTGGACGAGATTGAA
GAAGTTAAAGCTTAAGAATGAGAGAGACCTAAA*AAGAAGCGTTGTGTATTTGGTTTAAT
CTTCATATCGGTCTTATCTGTTTGTAGCTTGACCAGAATCGTTATGTACCAAAATATTTT
ACCATTATTTCTCTCAACTTCTAAAATTTTATATCTTAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD01TF U 1
AF RR2EU30JQ C 14
AF RR2FJ59TF U 18
AF RR2EU30TF U 14
AF RR2FT19TF U 35
BS 1 495 RR2DD01TF
BS 496 496 RR2EU30TF
BS 497 512 RR2FJ59TF
BS 513 514 RR2EU30TF
BS 515 520 RR2FJ59TF
BS 521 521 RR2EU30TF
BS 522 547 RR2FJ59TF
BS 548 548 RR2EU30TF
BS 549 601 RR2FJ59TF
BS 602 621 RR2EU30TF
BS 622 643 RR2FT19TF

RD RR2DD01TF 495 0 0
GGACTCTTTCGTGTCGGAAGAAACAATAAGAAACAACAGAAAAGAAAAGAAAAAGCTCTA
CAGATGGCGATGATGTCAGCATCTTCGGTGTTTCTTTTGCCGGCCAACGTCACGGTGGCC
GCTGGATCTTCGTCGTCCAGAAACTCCGTGTCTTTCTTACCGATGAGAAACGCCGGTTCT
AGGCTCGTAGTCAGAGCAGCCGATGACGCGGCTCCAGAACCAGCTGCGCCAGAAGGTGCT
CCGGCAGCTGTAGCGGCGCCAGCTGCAGCTCCTGCCGCGAAACCCAAGCCGCCTCCTATT
GGCCCTAAGAGAGGGACCAAGGTCAAGATTCTAAGGAAAGAATCCTACTGGTTCAAGAGC
ACTGGATCGGTTGTGGCCGTTGATCAGGACCCGAAGACCCGGTACCCTGTTGTGGTCAGG
TTTGCGAAAGTGAATTACGCAAACATATCGACCAACAACTATGCATTGGACGAGATTGAA
GAAGTTAAAGCTTAA

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR2EU30JQ 609 0 0
GG
GGAAGAAACAATAAGAAACAACAGAAAAGAAAAGAAAAAGCTCTACAGATGGCGATGATG
TCAGCATCTTCGGTGTTTCTTTTGCCGGCCAACGTCACGGTGGCCGCTGGATCTTCGTCG
TCCAGAAACTCCGTGTCTTTCTTACCGATGAGAAACGCCGGTTCTAGGCTCGTAGTCAGA
GCAGCCGATGACGCGGCTCCAGAACCAGCTGCGCCAGAAGGTGCTCCGGCAGCTGTAGCG
GCGCCAGCTGCAGCTCCTGCCGCGAAACCCAAGCCGCCTCCTATTGGCCCTAAGAGAGGG
ACCAAGGTCAAGATTCTAAGGAAAGAATCCTACTGGTTCAAGAGCACTGGATCGGTTGTG
GCCGTTGATCAGGACCCGAAGACCCGGTACCCTGTTGTGGTCAGGTTTGCGAAAGTGAAT
TACGCAAACATATCGACCAACAACTATGCATTGGACGAGATTGAAGAAGTTAAAGCTTAA
GAATGAGAGAGACCTAAA*AAGAAGCGTTGTGTATTTGGTTTAATCTTCATATCGGTCTT
ATCTGTTTGTAGCTTGACCAGAATCGTTATGTACCAAAATATTTTACCATTATTTCTCTC
AACTTC
T

QA 3 608 3 608
DS 

RD RR2FJ59TF 590 0 0
GG
GAAACAATAAGAAACAACAGAAAAGAAAAGAAAAAGCTCTACAGATGGCGATGATGTCAG
CATCTTCGGTGTTTCTTTTGCCGGCCAACGTCACAGTGGCCGCTGGATCTTCGTCGTCCA
GAAACTCCGTGTCTTTCTTACCGATGAGAAACGCCGGTTCTAGGCTCGTAGTCAGAGCAG
CCGATGACGCGGCTCCAGAACCAGCTGCGCCAGAAGGTGCTCCGGCAGCTGTAGCGGCGC
CAGCTGCTGCTCCTGCCGCGAAACCCAAGCCGCCTCCTATTGGCCCTAAGAGAGGGACCA
AGGTCAAGATTCTAAGGAAAGAATCCTACTGGTTCAAGAGCACTGGATCGGTTGTGGCCG
TTGATCAGGACCCGAAGACCCGGTACCCTGTTGTGGTCAGGTTTGCGAAAGTGAATTACG
CAAACATATCGACCAACAACTATGCATTGGACGAGATTGAAGAAGTTAAAGCTTAAAAAT
GAGAGAGACCTAAGGAAGAAGTGTTGTGTATTTGGTTTAATCTTCATACCGGTCTTATCT
GTTTGTAGCTTGACCAGAATCGTTATGTACCAAAATATTTTA
ACCATT

QA 3 584 3 584
DS 

RD RR2EU30TF 609 0 0
GG
GGAAGAAACAATAAGAAACAACAGAAAAGAAAAGAAAAAGCTCTACAGATGGCGATGATG
TCAGCATCTTCGGTGTTTCTTTTGCCGGCCAACGTCACGGTGGCCGCTGGATCTTCGTCG
TCCAGAAACTCCGTGTCTTTCTTACCGATGAGAAACGCCGGTTCTAGGCTCGTAGTCAGA
GCAGCCGATGACGCGGCTCCAGAACCAGCTGCGCCAGAAGGTGCTCCGGCAGCTGTAGCG
GCGCCAGCTGCAGCTCCTGCCGCGAAACCCAAGCCGCCTCCTATTGGCCCTAAGAGAGGG
ACCAAGGTCAAGATTCTAAGGAAAGAATCCTACTGGTTCAAGAGCACTGGATCGGTTGTG
GCCGTTGATCAGGACCCGAAGACCCGGTACCCTGTTGTGGTCAGGTTTGCGAAAGTGAAT
TACGCAAACATATCGACCAACAACTATGCATTGGACGAGATTGAAGAAGTTAAAGCTTAA
GAATGAGAGAGACCTAAA*AAGAAGCGTTGTGTATTTGGTTTAATCTTCATATCGGTCTT
ATCTGTTTGTAGCTTGACCAGAATCGTTATGTACCAAAATATTTTACCATTATTTCTCTC
AACTTC
T

QA 3 608 3 608
DS 

RD RR2FT19TF 609 0 0
AGCAACAGAAAAGAA
AAAAAACTCTACAGATGGCGATGATGTCAGCATCTTCGGTGTTTCTTTTGCCGGCCAACG
TCACAGTGGCCGCTGGATCTTCGTCGTCCAGAAACTCCGTGTCTTTCTTACCGATGAGAA
ACGCCGGTTCTAGGCTCGTAGTCAGAGCAGCCGATGACGCGGCTCCAGAACCAGCTGCGC
CAGAAGGTGCTCCGGCAGCTGTAGCGGCTCCAGCTGCAGCTCCTGCTGCGAAACCCAAGC
CGCCTCCTATTGGCCCTAAGAGAGGGACCAAGGTCAAGATTCTAAGGAAAGAATCTTACT
GGTTCAAGAGCACTGGATCGGTTGTGGCCGTTGATCAGGACCTGAAGACCCGGTACCCTG
TTGTGGTCAGGTTTGCGAAAGTGAATTACGCAAACATATCGACCAACAACTATGCATTGG
ACGAGATTGAAGAAGTTAAAGCTTAAAAATGAGAGAGACCTAAA*AAGAAGTGTTGTGTA
TTTGGTTTAATCTTCATACCGGTCTTATCTGTTTGTAGCTTGACCAGAATCGTTATGTAC
CAAAATATTTTACCATTATTTCTCTCAACTTCTAAAATTTTATATCTTAAAAAA

QA 16 609 16 609
DS 



CO CL1092Contig2 651 2 2 U
GGAGCCTTTCCAACATATTACGAATCAAGAACTCACTCTTTCGTGTCGGAAGAAACAGTA
AGAAGCAACAGAAAAGAAAAAAAACTCTACAGATGGCGATGATGTCAGCATCTTCGGTGT
TTCTTTTGCCGGCCAACGTCACAGTGGCCGCTGGATCTTCGTCGTCCAGAAACTCCGTGT
CTTTCTTACCGATGAGAAACGCCGGTTCTAGGCTCGTAGTCAGAGCAGCCGATGAGGCGG
CTCCAGAACCAGCTGCGCCAGAAGGTGCTCCGGCAGCTGTAGCGGCGCCAGCTGCAGCTC
CTGCCGCGAAACCCAAGCCGCCTCCTATTGGCCCTAAGAGAGGGACCGAGGTCAAGATTC
TAAGGAAAGAATCTTACTGGTTCAAGAGCACTGGATCGGTTGTGGCCGTTGATCAGGACC
CGAAGACCCGGTACCCTGTTGTGGTCAGGTTTGCGAAAGTGAACTACGCAAACATATCGA
CCAACAACTATGCATTGGACGAGATTGAAGAAGTTAAAGCTTAAAAATGAGAGAGACCTA
AAAAAGAAGTGTTGTGTATTTGGTTTAATCTTCATACCGGTCTTATCTGTCTGTAGCTTG
ACCAGAATCGTTATGTACCAAAATATTTTACCATTATTTCTCTCAACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY22TF U 1
AF RR2DY22JQ C 53
BS 1 616 RR2DY22TF
BS 617 651 RR2DY22JQ

RD RR2DY22TF 616 0 0
GGAGCCTTTCCAACATATTACGAATCAAGAACTCACTCTTTCGTGTCGGAAGAAACAGTA
AGAAGCAACAGAAAAGAAAAAAAACTCTACAGATGGCGATGATGTCAGCATCTTCGGTGT
TTCTTTTGCCGGCCAACGTCACAGTGGCCGCTGGATCTTCGTCGTCCAGAAACTCCGTGT
CTTTCTTACCGATGAGAAACGCCGGTTCTAGGCTCGTAGTCAGAGCAGCCGATGAGGCGG
CTCCAGAACCAGCTGCGCCAGAAGGTGCTCCGGCAGCTGTAGCGGCGCCAGCTGCAGCTC
CTGCCGCGAAACCCAAGCCGCCTCCTATTGGCCCTAAGAGAGGGACCGAGGTCAAGATTC
TAAGGAAAGAATCTTACTGGTTCAAGAGCACTGGATCGGTTGTGGCCGTTGATCAGGACC
CGAAGACCCGGTACCCTGTTGTGGTCAGGTTTGCGAAAGTGAACTACGCAAACATATCGA
CCAACAACTATGCATTGGACGAGATTGAAGAAGTTAAAGCTTAAAAATGAGAGAGACCTA
AAAAAGAAGTGTTGTGTATTTGGTTTAATCTTCATACCGGTCTTATCTGTCTGTAGCTTG
ACCAGAATCGTTATGT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2DY22JQ 599 0 0
AAACAGTAAGAAGCAACAGAAAAGAAAAAAAACTCTACAGATGGCGATGATGTCAGCATC
TTCGGTGTTTCTTTTGCCGGCCAACGTCACAGTGGCCGCTGGATCTTCGTCGTCCAGAAA
CTCCGTGTCTTTCTTACCGATGAGAAACGCCGGTTCTAGGCTCGTAGTCAGAGCAGCCGA
TGAGGCGGCTCCAGAACCAGCTGCGCCAGAAGGTGCTCCGGCAGCTGTAGCGGCGCCAGC
TGCAGCTCCTGCCGCGAAACCCAAGCCGCCTCCTATTGGCCCTAAGAGAGGGACCGAGGT
CAAGATTCTAAGGAAAGAATCTTACTGGTTCAAGAGCACTGGATCGGTTGTGGCCGTTGA
TCAGGACCCGAAGACCCGGTACCCTGTTGTGGTCAGGTTTGCGAAAGTGAACTACGCAAA
CATATCGACCAACAACTATGCATTGGACGAGATTGAAGAAGTTAAAGCTTAAAAATGAGA
GAGACCTAAAAAAGAAGTGTTGTGTATTTGGTTTAATCTTCATACCGGTCTTATCTGTCT
GTAGCTTGACCAGAATCGTTATGTACCAAAATATTTTACCATTATTTCTCTCAACTTCC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 2 7

CO CL1093Contig1 742 2 2 U
GGGTTGTCTTGTCGATCTGTCTAGAATAATATCAAAATTGCATCTAACTCCTTTCCCCTT
TCTCCCCCAATTGACATCTTTCTAGGGTTTCGTATTTCGCTGCTTCTCGAGGAATCAATC
TTGTGCAATAACAGCAATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAGCCTGCTACAACGAAGCG
AATGGACAAGCTTGACACTGTCTTTAGCTGTCCCTTTTGCAATCACGGCTCTAGTGTCGA
ATGCCAAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATTGCCACTTGTAGGATCTGTGAAGAAAG
CTTTAGCACTACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATCTATAGCGAGTGGATTGA
TGAGTGTGAGAGGGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAAGAAGAGGGAGTGGAGGA
AGAAGAGGTATATGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGATGATGTTGAAGATGAACG
TGTGTCTACTAAAAGGAAGTTTAACTACCGGGACGATTGATCTGTATCGAAAACCATGCA
AGTAGTCCTCTTTAGACATTGCCCGTATGTTGTAATATCTACTGATACTCGTTGTTATCT
ATCAACCTTCGTTTCCTTTTGGTTTTCCATTTACTGAAACAGTAATCTCAAATCAAGAAG
ATAGATGGAGGTTAGCCAAGTTTAGAACCGTCAATAGCAAGAAATAATATTCAGGGGGTT
TGAGATTATTTAAACCTTTCCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV04TF U 1
AF RR2EV04JQ C 1
BS 1 704 RR2EV04TF
BS 705 742 RR2EV04JQ

RD RR2EV04TF 710 0 0
GGGTTGTCTTGTCGATCTGTCTAGAATAATATCAAAATTGCATCTAACTCCTTTCCCCTT
TCTCCCCCAATTGACATCTTTCTAGGGTTTCGTATTTCGCTGCTTCTCGAGGAATCAATC
TTGTGCAATAACAGCAATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAGCCTGCTACAACGAAGCG
AATGGACAAGCTTGACACTGTCTTTAGCTGTCCCTTTTGCAATCACGGCTCTAGTGTCGA
ATGCCAAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATTGCCACTTGTAGGATCTGTGAAGAAAG
CTTTAGCACTACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATCTATAGCGAGTGGATTGA
TGAGTGTGAGAGGGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAAGAAGAGGGAGTGGAGGA
AGAAGAGGTATATGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGATGATGTTGAAGATGAACG
TGTGTCTACTAAAAGGAAGTTTAACTACCGGGACGATTGATCTGTATCGAAAACCATGCA
AGTAGTCCTCTTTAGACATTGCCCGTATGTTGTAATATCTACTGATACTCGTTGTTATCT
ATCAACCTTCGTTTCCTTTTGGTTTTCCATTTACTGAAACAGTAATCTCAAATCAAGAAG
ATAGATGGAGGTTAGCCAAGTTTAGAACCGTCAATAGCAAGAAA
TAATAT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2EV04JQ 742 0 0
GGGTTGTCTTGTCGATCTGTCTAGAATAATATCAAAATTGCATCTAACTCCTTTCCCCTT
TCTCCCCCAATTGACATCTTTCTAGGGTTTCGTATTTCGCTGCTTCTCGAGGAATCAATC
TTGTGCAATAACAGCAATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAGCCTGCTACAACGAAGCG
AATGGACAAGCTTGACACTGTCTTTAGCTGTCCCTTTTGCAATCACGGCTCTAGTGTCGA
ATGCCAAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATTGCCACTTGTAGGATCTGTGAAGAAAG
CTTTAGCACTACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATCTATAGCGAGTGGATTGA
TGAGTGTGAGAGGGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAAGAAGAGGGAGTGGAGGA
AGAAGAGGTATATGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGATGATGTTGAAGATGAACG
TGTGTCTACTAAAAGGAAGTTTAACTACCGGGACGATTGATCTGTATCGAAAACCATGCA
AGTAGTCCTCTTTAGACATTGCCCGTATGTTGTAATATCTACTGATACTCGTTGTTATCT
ATCAACCTTCGTTTCCTTTTG*TTTTCCATTTACTGAAACAGTAATCTCAAATCAAGAAG
ATAGATGGAGGTTAGCCAAGTTTAGAACCGTCAATAGCAAGAAATAATATTCAGGGGGTT
TGAGATTATTTAAACCTTTCCG

QA 1 742 1 742
DS 



CO CL1093Contig2 736 5 8 U
GGGTTGTCTTGTCGATCTGTCTAGAATAATATCAAAATTGCATCCAACTCCATTCCCCTT
TCTCCCCCAATTGACATCTTTCTAGGGTTTCGTATTTCGCTGCTCCTCGAGGAATCGATC
TTGTGCAATAATAACAGGTGGTTAAGCAATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAGCCTGC
TACAACGAAGCGAATGGACAAGCTTGACACTGTCTTTAGCTGTCCCTTTTGCAATCACGG
CTCTAGTGTCGAATGCCAAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATTGCCACTTGTAGGAT
CTGCGAAGAAAGCTTTAGCACTACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATCTATAG
CGAGTGGATTGATGAGTGCGAGAGGGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAAGAAGA
GGGAGTGGAGGAAGAAGAGGTATATGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGATGATGT
TGAGGATGAACGTGTGTCTACTAAAAGGAAGTTTAACTACCGGGACGATTGATCTGTATC
GAAAACCATGCAAGTCCTCTTTAGACATTGCCCGTATGTTGTAATATCTACTGATACTCG
TTGTTATCTATCACCTTGGTTTTCCTTTTGTTTTCCATTTACTGAAACAGTAATCTCAGA
TCAAGAAGATAGATGCGGTTAGTCAAGTTTAGAACCGTCAAGAGCAAGAAACATAATAAT
CAGGGGGTTTGAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GR69JQ C 364
AF RR2GR69TF U 1
AF RR2CA37TF U 60
AF RR2AP67JQ C 54
AF RR2AP67TF U 54
BS 1 169 RR2GR69TF
BS 170 170 RR2CA37TF
BS 171 303 RR2GR69TF
BS 304 304 RR2AP67TF
BS 305 625 RR2GR69TF
BS 626 726 RR2AP67TF
BS 727 727 RR2AP67JQ
BS 728 736 RR2AP67TF

RD RR2GR69JQ 136 0 0
GG
GGATTGATGAGTGGGAGAGGGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAAGAAGAGGGAG
TGGAGGAAGAAGAGGTTTTTGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGATGATGTTGAGG
ATGAACGTGTGT
TT

QA 3 134 3 134
DS 

RD RR2GR69TF 625 0 0
GGGTTGTCTTGTCGATCTGTCTAGAATAATATCAAAATTGCATCCAACTCCATTCCCCTT
TCTCCCCCAATTGACATCTTTCTAGGGTTTCGTATTTCGCTGCTCCTCGAGGAATCGATC
TTGTGCAATAATAACAGGTGGTTAAGCAATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGACAAAGCCTGC
TACAACGAAGCGAATGGACAAGCTTGACACTGTCTTTAGCTGTCCCTTTTGCAATCACGG
CTCTAGTGTCGAATGCCAAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATTGCCACTTGTAGGAT
CTGTGAAGAAAGCTTTAGCACTACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATCTATAG
CGAGTGGATTGATGAGTGCGAGAGGGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAAGAAGA
GGGAGTGGAGGAAGAAGAGGTATATGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGATGATGT
TGAGGATGAACGTGTGTCTACTAAAAGGAAGTTTAACTACCGGGACGATTGATCTGTATC
GAAAACCATGCAAGTCCTCTTTAGACATTGCCCGTATGTTGTAATATCTACTGATACTCG
TTGTTATCTATCACCTTGGTTTTCC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2CA37TF 567 0 0
GG
CTCCCCCAATTGACATCTTTCTAGGGTTTCGTATTTCGCTGCTCCTCGAGGAATCGATCT
TGTGCAATAATAACAGGTGGTTAAGCAATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAGCCTGCT
ACAACGAAGCGAATGGACAAGCTTGACACTGTCTTTAGCTGTCCCTTTTGCAATCACGGC
TCTAGTGTCGAATGCCAAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATTGCCACTTGTAGGATC
TGTGAAGAAAGCTTTAGCACTACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATCTATAGC
GAGTGGATTGATGAGTGCGAGAGGGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAAGAAGAG
GGAGTGGAGGAAGAAGAGGTATATGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGATGATGTT
GAGGATGAACGTGTGTCTACTAAAAGGAAGTTTAACTACCGGGACGATTGATCTGTATCG
AAAACCATGCAAGTCCTCTTTAGACATTGCCCGTATGTTGTAATATCTACTGATACTCGT
TGTTATCTATCACCTTGGTTTTCC
T

QA 3 566 3 566
DS 

RD RR2AP67JQ 683 0 0
GG
CCCTTTCTCCCCCAATTGACATCTTTCTAGGGTTTCGTATTTCGCTGCTCCTCGAGGAAT
CGATCTTGTGCAATAATAACAGGTGGTTAAGCAATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAG
CCTGCTACAACGAAGCGAATGGACAAGCTTGACACTGTCTTTAGCTGTCCCTTTTGCAAT
CACGGCTCTAGTGTCGAATGCCAAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATTGCCACTTGT
AGGATCTGCGAAGAAAGCTTTAGCACTACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATC
TATAGCGAGTGGATTGATGAGTGCGAGAGGGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAA
GAAGAGGGAGTGGAGCAAGAAGAGGTATATGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAT
GATGTTGAGGATGAACGTGTGTCTACTAAAAGGAAGTTTAACTACCGGGACGATTGATCT
GTATCGAAAACCATGCAAGTCCTCTTTAGACATTGCCCGTATGTTGTAATATCTACTGAT
ACTCGTTGTTATCTATCACCTTGGTTTTCCTTTTGTTTTCCATTTACTGAAACAGTAATC
TCAGATCAAGAAGATAGATGCGGTTAGTCAAGTTTAGAACCGTCAAGAGCAAGAAACATA
ATAATCAGGGGGTTTGAGATT

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2AP67TF 683 0 0
GG
CCCTTTCTCCCCCAATTGACATCTTTCTAGGGTTTCGTATTTCGCTGCTCCTCGAGGAAT
CGATCTTGTGCAATAATAACAGGTGGTTAAGCAATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAG
CCTGCTACAACGAAGCGAATGGACAAGCTTGACACTGTCTTTAGCTGTCCCTTTTGCAAT
CACGGCTCTAGTGTCGAATGCCAAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATTGCCACTTGT
AGGATCTGCGAAGAAAGCTTTAGCACTACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATC
TATAGCGAGTGGATTGATGAGTGCGAGAGGGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAA
GAAGAGGGAGTGGAGCAAGAAGAGGTATATGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAT
GATGTTGAGGATGAACGTGTGTCTACTAAAAGGAAGTTTAACTACCGGGACGATTGATCT
GTATCGAAAACCATGCAAGTCCTCTTTAGACATTGCCCGTATGTTGTAATATCTACTGAT
ACTCGTTGTTATCTATCACCTTGGTTTTCCTTTTGTTTTCCATTTACTGAAACAGTAATC
TCAGATCAAGAAGATAGATGCGGTTAGTCAAGTTTAGAACCGTCAAGAGCAAGAAACATA
ATAATCAGGGG*TTTGAGATT

QA 3 683 3 683
DS 



AS 2 7

CO CL1094Contig1 724 2 7 U
CGACCAAAAAAAAAGATTAGCCACTGACTATATCAGTACTTATTTATGTATCAGTTTATT
CTCTCACAAAATAAACATACTATATTCTCAGAAAGTAAAAATATACTTTTGAGATTACTG
CCTCAAAGTTCTTTATATGTTTAGTGTCCTAAATATATAATATTCTATTTTTCGTTTTTT
GGAGGAAATATAGCTTCTTTAGCCTGTGCTGCTTTATCTCCAACGTACTTAGCGGTTTTC
TTGCGCATGTCAGTCGCCGAATCTTTGGCTTCATCAGCTTTTTCAAAAATGAAATCTTTA
GCTTTTTCAGTCATTAAAACAGTTTCTTCCTTGGTCTCTTTGCCTTTATCCGTCACAAAC
TCCGAAAATTTCTTAGCAGTTTCAGCTACCGTGTCCATCGCTTCACCAGCTTTCTCAACA
ATATAGTTTCTTGCGCTCTCCATATGATCTTTAACTTCTTGTCCTTTCTGAGCAGTCACG
TGCCCCACTTCGCTCCCCATGTCCTTCACGAACTCGCCAGCTTTCTGTGAGGCATCATCT
AGCCATTTGGGGTCGTTCTTTGACTTTCCATCACCTTTCACGGCGGCTAGGACCCATGAC
TTCTTGCGCTGAGGTGTAATGGTCGCATACTTCCGGCCAACACTCATTGATCCACCGCTT
ACGCCGTCGCTTTTCTTACTTCCGTTGATCAATAACGAAGAGCCAACCCCACTAAGCATG
GCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2GD70JQ U 18
AF RR2AW12JQ U 1
BS 1 366 RR2AW12JQ
BS 367 368 RR2GD70JQ
BS 369 403 RR2AW12JQ
BS 404 404 RR2GD70JQ
BS 405 626 RR2AW12JQ
BS 627 627 RR2GD70JQ
BS 628 724 RR2AW12JQ

RD RR2GD70JQ 674 0 0
CG
GCCACTGACTATATCAGTACTTATTTATGTATCAGTTTATTCTCTCACAAAATAAACATA
CTATATTCTCAGAAAGTAAAAATATACTTTTGAGATTACTGCCTCAAAGTTCTTTATATG
TTTAGTGTCCTAAATATATAATATTCTATTTTTCGTTTTTTGGAGGAAATATAGCTTCTT
TAGCCTGTGCTGCTTTATCTCCAACGTACTTAGCGGTTTTCTTGCGCATGTCAGTCGCCG
AATCTTTGGCTTCATCAGCTTTTTCAACAATGAAATCTTTAGCTTTTTCAGTCATTAAAA
CAGTTTCTTCCTTGGTCTCTTTGCCTTTATCCGTCACAAACTCCGAAAATTTCTTAGCAG
TTTCAGCTACCGTGTCCATCGCTTCACCAGCTTTCTCAACAATATAGTTTCTTGCGCTCT
CCATATGATCTTTAACTTCTTGTCCTTTCTGAGCAGTCACGTGCCCCACTTCGCTCCCCA
TGTCCTTCACGAACTCGCCAGCTTTCTGTGAGGCATCATCTAGCCATTTGGGGTCGTTCT
TTGACTTTCCATCACCTTTCACGGCGGCTAGGACCCATGACTTCTTGCGCTGAGGTGTAA
TGGTCGCATACTTCCGGCCAACACTCATTGATCCACCGCTTACGCCGTCGCTTTTCTTGC
TTCCGTTGATCA

QA 3 674 3 674
DS 

RD RR2AW12JQ 724 0 0
CGACCAAAAAAAAAGATTAGCCACTGACTATATCAGTACTTATTTATGTATCAGTTTATT
CTCTCACAAAATAAACATACTATATTCTCAGAAAGTAAAAATATACTTTTGAGATTACTG
CCTCAAAGTTCTTTATATGTTTAGTGTCCTAAATATATAATATTCTATTTTTCGTTTTTT
GGAGGAAATATAGCTTCTTTAGCCTGTGCTGCTTTATCTCCAACGTACTTAGCGGTTTTC
TTGCGCATGTCAGTCGCCGAATCTTTGGCTTCATCAGCTTTTTCAAAAATGAAATCTTTA
GCTTTTTCAGTCATTAAAACAGTTTCTTCCTTGGTCTCTTTGCCTTTATCCGTCACAAAC
TCCGAAGCTTTCTTAGCAGTTTCAGCTACCGTGTCCATCGCTTTACCAGCTTTCTCAACA
ATATAGTTTCTTGCGCTCTCCATATGATCTTTAACTTCTTGTCCTTTCTGAGCAGTCACG
TGCCCCACTTCGCTCCCCATGTCCTTCACGAACTCGCCAGCTTTCTGTGAGGCATCATCT
AGCCATTTGGGGTCGTTCTTTGACTTTCCATCACCTTTCACGGCGGCTAGGACCCATGAC
TTCTTGCGCTGAGGTGTAATGGTCGCGTACTTCCGGCCAACACTCATTGATCCACCGCTT
ACGCCGTCGCTTTTCTTACTTCCGTTGATCAATAACGAAGAGCCAACCCCACTAAGCATG
GCTC

QA 1 724 1 724
DS 



CO CL1094Contig2 881 5 10 U
GGGAATTTAACTCCTCACTTTAGATTCTTCTACCCTCAAAACACACAATTTCCACCTCTT
AAGAGAAAAAAGGTAAGAAATTCTCATGTCGATGTCTATTTCTGGAGCTATGCTTAGTGG
GGTGGGCTCTTCGTTATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACAGCGTAAGCAGTGGATC
AATGAGTGTTGGCCGGAAGAATGCGACCATTACACCTCAGCGCAAGAAGTCATGGGTCCT
AGCCGCCGTGAAAGGTGATGGAAAATCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCTC
ACAGAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCA
GAAAGGACAAGAAGTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGC
TGGTGAGGCGATGGACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGA
TAAAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCAT
TGTTGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAA
GTACGTTGGAGATAAAGCAGTACAGGCTAAAGAAGCTATATCTCCTCCAAAAA*CGAAGA
ATAGAATATTGTAATTTATAGGACACTAAACATACAAAGAACTTTGAGGCAGTAATCTCA
AAAGTATATTTTCTACTTTGTGAGAATATAGTATGTTTATTTTGTGAGAGAATAAACTGA
AACATAAATAAGTACTGATATAGTCAGTGGCTAATCTTATCATTCAAATTAAGTGCTAAT
CTTTAGCTTACAAACTATGATATTGTACAATGGTTTCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD70TF U 3
AF RR2CD37TF U 1
AF RR2G122TF U 239
AF RR2CD37JQ C 60
AF RR2G122JQ C 109
BS 1 328 RR2CD37TF
BS 329 329 RR2GD70TF
BS 330 398 RR2CD37TF
BS 399 399 RR2GD70TF
BS 400 694 RR2CD37TF
BS 695 695 RR2G122TF
BS 696 720 RR2CD37TF
BS 721 770 RR2G122TF
BS 771 797 RR2CD37JQ
BS 798 881 RR2G122JQ

RD RR2GD70TF 619 0 0
GGAACTCCTCA
CTCACTTTAGATTCTTCTACTCTCAAAACACACAATTTCCACCTCTTAAGAGAACAAAGG
TAAGAGATCCTCATGTCGATGTCTATTTCTGGAGCCATGCTTAGTGGGGTTGGCTCTTCG
TTATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTGGATCAATGAGTGTTGGC
CGGAAGTATGCGACCATTACACCTCAGCGCAAGAAGTCATGGGTCCTAGCCGCCGTGAAA
GGTGATGGAAAGTCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCTCACAGAAAGCTGGC
GAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGAAAGGACAAGAA
GTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGCTGGTGAAGCGATG
GACACGGTAGCTGAAACTGCTAAGAAATCTTCGGAGTTTGTGACGGATAAAGGCAAAGAG
ACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCATTGTTGAAAAAGCT
GATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTACGTTGGAGAT
AAAGCAG
C

QA 12 618 12 618
DS 

RD RR2CD37TF 720 0 0
GGGAATTTAACTCCTCACTTTAGATTCTTCTACCCTCAAAACACACAATTTCCACCTCTT
AAGAGAAAAAAGGTAAGAAATTCTCATGTCGATGTCTATTTCTGGAGCTATGCTTAGTGG
GGTGGGCTCTTCGTTATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACAGCGTAAGCAGTGGATC
AATGAGTGTTGGCCGGAAGAATGCGACCATTACACCTCAGCGCAAGAAGTCATGGGTCCT
AGCCGCCGTGAAAGGTGATGGAAAATCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCTC
ACAGAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACGTGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCA
GAAAGGACAAGAAGTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAATAAACTATATTGTTGAGAAAGC
TGGTGAGGCGATGGACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGA
TAAAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCAT
TGTTGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAA
GTACGTTGGAGATAAAGCAGTACAGGCTAAAGAAGCTATATCTCCTCCAAAAA*CGAAGA
ATAGAATATTGTAATTTATAGGACACTAAACATATAAAGAACTTTGAGGCAGTAATCTCA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2G122TF 532 0 0
CTAGCCGCCGTGAAAGGTGATGGAAAATCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCC
TCACAGAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCT
CAGAAAGGACAAGAAGTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAA
GCTGGTGAGGCGATGGACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACG
GATAAAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTC
ATTGTTGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCT
AAGTACGTTGGAGATAAAGCAGTACAGGCTAAAGAAGCTATATCTCCTCCAAAAA*CGAA
GAATAGAATATTGTAATTTATAGGACACTGAACATACAAAGAACTTTGAG*CAGTAATCT
CAAAAGTATATTTTCTACTTTGTGAGAATATAGTATGTTTATTTTGTGAGAG

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2CD37JQ 739 0 0
TAAGAGAAAAAAGGTAAGAAATTCTCATGTCGATGTCTATTTCTGGAGCTATGCTTAGTG
GGGTGGGCTCTTCGTTATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACAGCGTAAGCAGTGGAT
CAATGAGTGTTGGCCGGAAGAATGCGACCATTACACCTCAGCGCAAGAAGTCATGGGTCC
TAGCCGCCGTGAAAGGTGATGGAAAATCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCT
CACAGAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACGTGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTC
AGAAAGGACAAGAAGTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAATAAACTATATTGTTGAGAAAG
CTGGTGAGGCGATGGACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGG
ATAAAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCA
TTGTTGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTA
AGTACGTTGGAGATAAAGCAGTACAGGCTAAAGAAGCTATATCTCCTCCAAAAAACGAAG
AATAGAATATTGTAATTTATAGGACACTAAACATATAAAGAACTTTGAGGCAGTAATCTC
AAAAGTATATTTTCTACTTTGTGAGAATATAGTATGTTTATTTTGTGAGAGAATAAACTG
AAACATAAATAAGTACTG
G

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2G122JQ 773 0 0
T
ATGCTTAGTGGGGTGGGCTCTTCGTTATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACAGCGTA
AGCAGTGGATCAATGAGTGTTGGCCGGAAGAACGCGACCATTACACCTCAGCGCAAGAAG
TCATGGGTCCTAGCCGCCGTGAAAGGTGATGGAAAATCAAAGAACGACCCCAAATGGCTA
GATGATGCCTCACAGAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCAC
GTGACTGCTCAGAAAGGACAAGAAGTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATT
GTTGAGAAAGCTGGTGAGGCGATGGACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAG
TTTGTGACGGATAAAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCT
AAAGATTTCATTGTTGAAAAAGCTGGTGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAG
AAAACCGCTAAGTACGTTGGAGATAAAGCAGTACAGGCTAAAGAAGCTATATCTCCTCCA
AAAA*CGAAGAATAGAATATTGTAATTTATAGGACACTGAACATACAAAGAACTTTGAGG
CAGTAATCTCAAAAGTATATTTTCTACTTTGTGAGAATATAGTATGTTTATTTTGTGAGA
GAATAAACTGAAACATAAATAAGTACTGATATAGTCAGTGGCTAATCTTATCATTCAAAT
TAAGTGCTAATCTTTAGCTTACAAACTATGATATTGTACAATGGTTTCAATC

QA 2 773 2 773
DS 



AS 2 7

CO CL1095Contig1 641 2 2 U
CTTATACGATCTTTAGAAAACTACTTTTTATCAAACTCTCTAAAACAAGAGTAAACTTCA
ACCAAAACTAGATAAGATCTGTCACAAAAAAAAAGAACGGAGACAAATTGTACTGAACAG
CAAAGAGCAGCAGAAAACAAAACAACCAGAAACAAGAAGGCACGAGTATAGTAGCTCTTC
TAGTCTTCTTCCTCGCCCTCGTTCTCAGCAATGTTGAAGTACCTCAACTCATAGAGGTTA
CGGTCCTTGTTGGCCGCAATCACTCTGAGCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTAC
TTCTTCGTCAAGTACTTGAGGTACCTCTTGGAGAATTGGCCATCAGAGGTGACAGTGATC
TTGTTCTTCTCACGGGTGATAGTGACAGAATCACCAAGCGCACCAGCTTTCCCACCTACT
TTGATCCTCTCCTGAAGAAACTTCTCGAGGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACA
GGCTTCGAGCAATCAATGGAGAAGGACACTCCCTTCTTCTTTCCCTTGGCAACTGCTGCA
CCTCCACGACTCATTTTCACAACCTTTTCCTTGAAGACGAGCGGCGTCTTTTAGCTCTTG
AACGAGAGAGGAGGAGGAGACGAGAAACAAAATGTGGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CA89TF C 1
AF RR2CA89JQ U 25
BS 1 24 RR2CA89TF
BS 25 641 RR2CA89JQ

RD RR2CA89TF 641 0 0
CTTATACGATCTTTAGAAAACTACTTTTTATCAAACTCTCTAAAACAAGAGTAAACTTCA
ACCAAAACTAGATAAGATCTGTCACAAAAAAAAAGAACGGAGACAAATTGTACTGAACAG
CAAAGAGCAGCAGAAAACAAAACAACCAGAAACAAGAAGGCACGAGTATAGTAGCTCTTC
TAGTCTTCTTCCTCGCCCTCGTTCTCAGCAATGTTGAAGTACCTCAACTCATAGAGGTTA
CGGTCCTTGTTGGCCGCAATCACTCTGAGCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTAC
TTCTTCGTCAAGTACTTGAGGTACCTCTTGGAGAATTGGCCATCAGAGGTGACAGTGATC
TTGTTCTTCTCACGGGTGATAGTGACAGAATCACCAAGCGCACCAGCTTTCCCACCTACT
TTGATCCTCTCCTGAAGAAACTTCTCGAGGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACA
GGCTTCGAGCAATCAATGGAGAAGGACACTCCCTTCTTCTTTCCCTTGGCAACTGCTGCA
CCTCCACGACTCATTTTCACAACCTTTTCCTTGAAGACGAGCGGCGTCTTTTAGCTCTTG
AACGAGAGAGGAGGAGGAGACGAGAAACAAAATGTGGCTCC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2CA89JQ 617 0 0
TTTTTATCAAACTCTCTAAAACAAGAGTAAACTTCAACCAAAACTAGATAAGATCTGTCA
CAAAAAAAAAGAACGGAGACAAATTGTACTGAACAGCAAAGAGCAGCAGAAAACAAAACA
ACCAGAAACAAGAAGGCACGAGTATAGTAGCTCTTCTAGTCTTCTTCCTCGCCCTCGTTC
TCAGCAATGTTGAAGTACCTCAACTCATAGAGGTTACGGTCCTTGTTGGCCGCAATCACT
CTGAGCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTACTTCTTCGTCAAGTACTTGAGGTAC
CTCTTGGAGAATTGGCCATCAGAGGTGACAGTGATCTTGTTCTTCTCACGGGTGATAGTG
ACAGAATCACCAAGCGCACCAGCTTTCCCACCTACTTTGATCCTCTCCTGAAGAAACTTC
TCGAGGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACAGGCTTCGAGCAATCAATGGAGAAG
GACACTCCCTTCTTCTTTCCCTTGGCAACTGCTGCACCTCCACGACTCATTTTCACAACC
TTTTCCTTGAAGACGAGCGGCGTCTTTTAGCTCTTGAACGAGAGAGGAGGAGGAGACGAG
AAACAAAATGTGGCTCC

QA 1 617 1 617
DS 



CO CL1095Contig2 621 5 11 U
GGAGCCACATTTGTTTCGCATCTCCTCTCTCTCTCGTTCAAAAGCTAAAAGACGCCGCTC
GTCTTCAAGAAAAA*GGTTGAGAAAA*TGAGTCGTGGAGCTGCAGCAGTTGCCAAGGGGA
AGAAGAAGGGAGTGTCCTTCTCCATTGATTGCTCAAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGG
AGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCTGGTG
CGCTTGGTGATTCTGTCACAATCACCCGTGATAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATG
GCCAATTCTCCAAGAGGTACCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATG
TGAGGGATTGGCTGAGAGTGATTGCGGCCAACAAGGACCGTAACCTCTATGAGTTGAGGT
ACTTCAACATTGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTACTATACTCGTA
CCTTCTTGTTTCTGGTTATTTTGTTTTCTGCTGCTCTTTGCTGTTCAGTACAATTTGTCT
CCGTTCTTTTTTTTT*GTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTT
TTAGAGAGTTTGATAAAAAAA


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 

AF RR2FI13JQ C 1
AF RR2EQ33JQ C 3
AF RR2EQ33TF U 3
AF RR2FI13TF U 1
AF RR2G648TF U 84
BS 1 3 RR2FI13JQ
BS 4 41 RR2EQ33TF
BS 42 42 RR2FI13TF
BS 43 290 RR2EQ33TF
BS 291 291 RR2FI13TF
BS 292 555 RR2EQ33TF
BS 556 556 RR2FI13TF
BS 557 582 RR2EQ33TF
BS 583 583 RR2FI13TF
BS 584 619 RR2EQ33TF
BS 620 621 RR2FI13TF

RD RR2FI13JQ 631 0 0
GGAGCCACATTTGTTTCGCATCTCCTCTCTCTCTCGTTCAAAAGCTAAAAGACGCCGCTC
GTCTTCAAGAAAAA*GGTTGAGAAAA*TGAGTCGTGGAGCTGCAGCAGTTGCCAAGGGGA
AGAAGAAGGGAGTGTCCTTCTCCATTGATTGCTCAAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGG
AGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCTGGTG
CGCTTGGTGATTCTGTCACAATCACCCGTGATAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATG
GCCAATTCTCCAAGAGGTACCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATG
TGAGGGATTGGCTGAGAGTGATTGCGGCCAACAAGGACCGTAACCTCTATGAGTTGAGGT
ACTTCAACATTGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTACTATACTCGTA
CCTTCTTGTTTCTGGTTATTTTGTTTTCTGCTGCTCTTTGCTGTTCAGTACAATTTGTCT
CCGTTCTTTTTTTTT*GTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTT
TTAGAGAGTTTGATAAAAA
AATATTTTTCCG

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2EQ33JQ 628 0 0
G
GCCACATTTGTTTCGCATCTCCTCTCTCTCTCGTTCAAGAGCTAAAAGACGCCGCTCGTC
TTCAAGAAAAAAGGTTGAGAAAAATGAGTCGTGGAGCTGCAGCAGTTGCCAAGGGGAAGA
AGAAGGGAGTGTCCTTCTCCATTGATTGCTCAAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGGAGA
TTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCTGGTGCGC
TTGGTGATTCTGTCACAATCACCCGTGATAAGAACAAGATCACTGTCGCTTCTGATGGCC
AATTCTCCAAGAGGTACCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGA
GGGATTGGCTGAGAGTGATTGCGGCCAACAAGGACCGTAACCTCTATGAGTTGAGGTACT
TCAACATTGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTACTATACTCGTACCT
TCTTGTTTCTGGTTATTTTGTTTTCTGCTGCTCTTTGCTGTTCAGTACAATTTGTCTCCG
TTCTTTTTTTTTTGTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTT*AAGTTATAACTCTTGTTTTA
GAGAGTTTGATAAAAA
AATATTTTTCC

QA 2 617 2 617
DS 

RD RR2EQ33TF 628 0 0
G
GCCACATTTGTTTCGCATCTCCTCTCTCTCTCGTTCAAGAGCTAAAAGACGCCGCTCGTC
TTCAAGAAAAA*GGTTGAGAAAA*TGAGTCGTGGAGCTGCAGCAGTTGCCAAGGGGAAGA
AGAAGGGAGTGTCCTTCTCCATTGATTGCTCAAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGGAGA
TTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCTGGTGCGC
TTGGTGATTCTGTCACAATCACCCGTGATAAGAACAAGATCACTGTCGCTTCTGATGGCC
AATTCTCCAAGAGGTACCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGA
GGGATTGGCTGAGAGTGATTGCGGCCAACAAGGACCGTAACCTCTATGAGTTGAGGTACT
TCAACATTGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTACTATACTCGTACCT
TCTTGTTTCTGGTTATTTTGTTTTCTGCTGCTCTTTGCTGTTCAGTACAATTTGTCTCCG
TTCTTTTTTTTTTGTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTT*AAGTTATAACTCTTGTTTTA
GAGAGTTTGATAAAAA
AATATTTTTCC

QA 2 617 2 617
DS 

RD RR2FI13TF 621 0 0
GGA
GCCACATTTGTTTCGCATCTCCTCTCTCTCTCGTTCAAAAGCTAAAAGACGCCGCTCGTC
TTCAAGAAAAA*GGTTGAGAAAA*TGAGTCGTGGAGCTGCAGCAGTTGCCAAGGGGAAGA
AGAAGGGAGTGTCCTTCTCCATTGATTGCTCAAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGGAGA
TTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCTGGTGCGC
TTGGTGATTCTGTCACAATCACCCGTGATAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCC
AATTCTCCAAGAGGTACCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGA
GGGATTGGCTGAGAGTGATTGCGGCCAACAAGGACCGTAACCTCTATGAGTTGAGGTACT
TCAACATTGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTACTATACTCGTACCT
TCTTGTTTCTGGTTATTTTGTTTTCTGCTGCTCTTTGCTGTTCAGTACAATTTGTCTCCG
TTCTTTTTTTTT*GTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTTTTA
GAGAGTTTGATAAAAAAA

QA 4 621 4 621
DS 

RD RR2G648TF 538 0 0
AAAATGAGTCGTGGAGCTGCAGCAGTTGCCAAGGGGAAGAAGAAGGGAGTGTCCTTCTCC
ATTGATTGCTCAAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTC
CTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCTGGTGCGCTTGGTGATTCTGTCACAATC
ACCCGTGATAAGAACAAGATCACTGTCACTTCCGATGGCCAATTCTCCAAGAGGTACCTC
AAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGAGGGATTGGCTGAGAGTGATT
GCGGCCAACAAGGACCGTAACCTCTATGAGTTGAGGTACTTCAACATTGCTGAGAACGAG
GGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTACTATACTCGTACCTTCTTGTTTCTGGTTATTTTG
TTTTCTGCTGCTCTTTGCTGTTCAGTACAATTTGTCTCCGTTCTTTTTTTTT*GTGACAT
ATCTTATCTAGTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTTTTAGAGAGTTTGATAAAAAAA

QA 1 538 1 538
DS 



AS 2 7

CO CL1096Contig1 974 2 6 U
GGGAATAAATTTTCTCCGGCCGGCGGGTTTGGGGAGCAGATCATCATCAGCTTCTCTAGT
CTCTCTGGTCAGTTTTTCTTTTCTTCGTGTCGATTAGGCTTTTGTTAGCTAACGGAACGT
GGAAGCTCAATTATATTCACTGCTGTTTGTTGATTTTCATGTAGATTTGTTCTGATCTAG
GGTTTATGTAACTAATCCAAATTGTTATCGTTTTCTATTAGGGTGAGTCAATCGGAATCG
GGGATGTTTGTTTATATTTCAAATCAGATCTCTCACTTTTTTGCCCCTTTGATTGCATTG
TGATTAATATTTTGTTCTCTCAGCGATCCGAAAGAGAGAAGAAGAAGTTTTTCAGTGTTT
GAGGATCTGCAAATAGTATCCATCCAAGGTTTTCAAACTATGGTTTTATTACAGTTGGAC
CCGTTCCTCAATGAACTGACGAGTATGTTCGAGAAAAGCAAAGAGAAGGGTTCTGTGTGG
GTTACTTTGAAAAGATCATCTTTGAAGTCTAAGCTGCAGAAGAGGAAACTCAGCTCTGCT
GGAGAATCCATCGAGTACAGATGTCTTATTCGAGCTACTGATGCTAAGAAAACCATTTCT
ACTTCGGTTGGGGCTAAGGATCACCAGAGATTTCAAGCATCATATGCCACCATTCTTAAG
GCTCACATGACTGCTTTGAAGAAGAGGGAGAGGAAAGACCGTAAGAAATCCACAGAGGCA
GAGAAGAAGGAAGGCACCTCAACCACCACTAAACCCAAGAAACTTTGATGGTCTTCTCTT
AATGATTTGCATTTTGTTGCCTAGAAATTGAATTTTGAAAAAGATATCAGAGATTTTGAT
TCGTCATTATATAGATTTTTGGCTTGCGTTTCTTCTTTGAATAAACAATGATAAATATCT
GATAAACTAAACACGAACATCGACTAAATATCAAAGAACTGAAAACTGAACCTATAATAA
AAAGATTAACTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F201TF U 1
AF RR2F201JQ C 219
BS 1 660 RR2F201TF
BS 661 661 RR2F201JQ
BS 662 710 RR2F201TF
BS 711 711 RR2F201JQ
BS 712 727 RR2F201TF
BS 728 974 RR2F201JQ

RD RR2F201TF 727 0 0
GGGAATAAATTTTCTCCGGCCGGCGGGTTTGGGGAGCAGATCATCATCAGCTTCTCTAGT
CTCTCTGGTCAGTTTTTCTTTTCTTCGTGTCGATTAGGCTTTTGTTAGCTAACGGAACGT
GGAAGCTCAATTATATTCACTGCTGTTTGTTGATTTTCATGTAGATTTGTTCTGATCTAG
GGTTTATGTAACTAATCCAAATTGTTATCGTTTTCTATTAGGGTGAGTCAATCGGAATCG
GGGATGTTTGTTTATATTTCAAATCAGATCTCTCACTTTTTTGCCCCTTTGATTGCATTG
TGATTAATATTTTGTTCTCTCAGCGATCCGAAAGAGAGAAGAAGAAGTTTTTCAGTGTTT
GAGGATCTGCAAATAGTATCCATCCAAGGTTTTCAAACTATGGTTTTATTACAGTTGGAC
CCGTTCCTCAATGAACTGACGAGTATGTTCGAGAAAAGCAAAGAGAAGGGTTCTGTGTGG
GTTACTTTGAAAAGATCATCTTTGAAGTCTAAGCTGCAGAAGAGGAAACTCAGCTCTGCT
GGAGAATCCATCGAGTACAGATGTCTTATTCGAGCTACTGATGCTAAGAAAACCATTTCT
ACTTCGGTTGGGGCTAAGGATCACCAGAGATTTCAAGCATCATATGCCACCATTCTTAAG
*CTCACATGACTGCTTTGAAGAAGAGGGAGAGGAAAGACCGTAAGAAATC*ACAGAGGCA
GAGAAGA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2F201JQ 756 0 0
TAGGGTGAGTCAATCGGAATCGGGGATGTTTGTTTATATTTCAAATCAGATCTCTCACTT
TTTTGCCCCTTTGATTGCATTGTGATTAATATTTTGTTCTCTCAGCGATCCGAAAGAGAG
AAGAAGAAGTTTTTCAGTGTTTGAGGATCTGCAAATAGTATCCATCCAAGGTTTTCAAAC
TATGGTTTTATTACAGTTGGACCCGTTCCTCAATGAACTGACGAGTATGTTCGAGAAAAG
CAAAGAGAAGGGTTCTGTGTGGGTTACTTTGAAAAGATCATCTTTGAAGTCTAAGCTGCA
GAAGAGGAAACTCAGCTCTGCTGGAGAATCCATCGAGTACAGATGTCTTATTCGAGCTAC
TGATGCTAAGAAAACCATTTCTACTTCGGTTGGGGCTAAGGATCACCAGAGATTTCAAGC
ATCATATGCCACCATTCTTAAGGCTCACATGACTGCTTTGAAGAAGAGGGAGAGGAAAGA
CCGTAAGAAATCCACAGAGGCAGAGAAGAAGGAAGGCACCTCAACCACCACTAAACCCAA
GAAACTTTGATGGTCTTCTCTTAATGATTTGCATTTTGTTGCCTAGAAATTGAATTTTGA
AAAAGATATCAGAGATTTTGATTCGTCATTATATAGATTTTTGGCTTGCGTTTCTTCTTT
GAATAAACAATGATAAATATCTGATAAACTAAACACGAACATCGACTAAATATCAAAGAA
CTGAAAACTGAACCTATAATAAAAAGATTAACTGCG

QA 1 756 1 756
DS 



CO CL1096Contig2 617 5 10 U
GGTGACCGAATAAATTTTCTCCGGCCGGCGGGTTTGGGGAGCAGATCATCATCAGCTTCT
CTAGTCTCTCTGCGATCCGAAAGAGAGAAGAAGAAGTTTTTCAGTGTTTGAGGATCTGCA
AATAGTATCCATCCAAGGTTTTCAAACTATGGTTTTATTACAGTTGGACCCGTTCCTCAA
TGAACTGACGAGCATGTTCGAGAAAAGCAAAGAGAAGGGTTCTGTGTGGGTTACTTTGAA
AAGATCATCTTTGAAGTCTAAGCTGCAGAAGAGGAAACTCAGCTCTGCTGGAGAATCCAT
CGAGTACAGATGTCTTATTCGAGCTACTGATGCTAAGAAAACCATTTCTACTTCGGTTGG
GGCTAAGGATCACCAGAGATTTCAAGCATCATATGCCACCATTCTTAAGGCTCACATGAC
TGCTTTGAAGAAGAGGGAGAGGAAAGACCGTAAGAAATCCACAGAGGCAGAGAAGAAGGA
AGGCACCTCAACCACCACTAAACCCAAGAAACTTTGATGGTCTTCTCTTAATGATTTGCA
TTTTGTTGCCTAGAAATTGAATTTTGAAAAAGATATCAGAGATTTTGATTCGTCATTATA
TAGATTTTTGGCTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR2G816JQ C 97
AF RR2G816TF U 3
AF RR2G902TF U 1
AF RR2EJ67TF U 3
AF RR2G902JQ C 97
BS 1 53 RR2G902TF
BS 54 54 RR2EJ67TF
BS 55 83 RR2G902TF
BS 84 84 RR2EJ67TF
BS 85 206 RR2G902TF
BS 207 207 RR2EJ67TF
BS 208 479 RR2G902TF
BS 480 480 RR2EJ67TF
BS 481 612 RR2G902TF
BS 613 617 RR2EJ67TF

RD RR2G816JQ 501 0 0
TTTTTCAGTGTTTGAGGATCTGCAAATAGTATCCATCCAAGGTTTTCAAACTATGGTTTT
ATTACAGTTGGACCCGTTCCTCAATGAACTGACGAGCATGTTCGAGAAAAGCAAAGAGAA
GGGTTCTGTGTGGGTTACTTTGAAAAGATCATCTTTGAAGTTTAAGCTGCAGAAGAGGAA
ACTCAGCTTTGCTGGAGAATCCATCGAGTACAGATGTTTTATTCGAGCTACTGATGCTAA
GAAAACCATTCCTACTTCGGTTGGGGCTAAGGATCACCAGAGATTTCAAGCATCATATGC
CACCATTTTTAAGGCTCACATGACTGCTTTGAAGAAGAGGGAGAGGAAAGACCGTAAGAA
ATCCACAGAGGCAGAGAAGAAGGAAGGCACCTCAACCACCACTAAACCCAAGAAACTTTG
ATGGTCTTCTCTTAATGATTTGCATTTTGTTGCCTAGAAATTGAATTTTGAAAAAGATAT
CAGAGATTTTGATTCGTCATT

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR2G816TF 595 0 0
GGA
CCGAATAAATTTTCTCCGGCCGGCGGGTTTGGGGAGCAGATCATCATCAGCTTCTCTAGT
CTCTCTGCGATCCGAAAGAGAGAAGAAGAAGTTTTTCAGTGTTTGAGGATCTGCAAATAG
TATCCATCCAAGGTTTTCAAACTATGGTTTTATTACAGTTGGACCCGTTCCTCAATGAAC
TGACGAGCATGTTCGAGAAAAGCAAAGAGAAGGGTTCTGTGTGGGTTACTTTGAAAAGAT
CATCTTTGAAGTCTAAGCTGCAGAAGAGGAAACTCAGCTCTGCTGGAGAATCCATCGAGT
ACAGATGTCTTATTCGAGCTACTGATGCTAAGAAAACCATTCCTACTTCGGTTGGGGCTA
AGGATCACCAGAGATTTCAAGCATCATATGCCACCATTCTTAAGGCTCACATGACTGCTT
TGAAGAAGAGGGAGAGGAAAGACCGTAAGAAATCCACAGAGGCAGAGAAGAAGGAAGGCA
CCTCAACCACCACTAAACCCAAGAAACTTTGATGGTCTTCTCTTAATGATTTGCATTTTG
TTGCCTAGAAATTGAATTTTGAAAAAGATATCAGAGATTTTGATTCGTCATT

QA 4 595 4 595
DS 

RD RR2G902TF 613 0 0
GGTGACCGAATAAATTTTCTCCGGCCGGCGGGTTTGGGGAGCAGATCATCATCGGCTTCT
CTAGTCTCTCTGCGATCCGAAAGGGAGAAGAAGAAGTTTTTCAGTGTTTGAGGATCTGCA
AATAGTATCCATCCAAGGTTTTCAAACTATGGTTTTATTACAGTTGGACCCGTTCCTCAA
TGAACTGACGAGCATGTTCGAGAAAATCAAAGAGAAGGGTTCTGTGTGGGTTACTTTGAA
AAGATCATCTTTGAAGTCTAAGCTGCAGAAGAGGAAACTCAGCTCTGCTGGAGAATCCAT
CGAGTACAGATGTCTTATTCGAGCTACTGATGCTAAGAAAACCATTTCTACTTCGGTTGG
GGCTAAGGATCACCAGAGATTTCAAGCATCATATGCCACCATTCTTAAGGCTCACATGAC
TGCTTTGAAGAAGAGGGAGAGGAAAGACCGTAAGAAATCCACAGAGGCAGAGAAGAAGGG
AGGCACCTCAACCACCACTAAACCCAAGAAACTTTGATGGTCTTCTCTTAATGATTTGCA
TTTTGTTGCCTAGAAATTGAATTTTGAAAAAGATATCAGAGATTTTGATTCGTCATTATA
TAGATTTTTGGC
C

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2EJ67TF 615 0 0
GGT
CCGAATAAATTTTCTCCGGCCGGCGGGTTTGGGGAGCAGATCATCATCAGCTTCTCTAGT
CTCTCTGCGATCCGAAAAAGAGAAGAAGAAGTTTTTCAGTGTTTGAGGATCTGCAAATAG
TATCCATCCAAGGTTTTCAAACTATGGTTTTATTACAGTTGGACCCGTTCCTCAATGAAC
TGACGAGCATGTTCGAGAAAAGCAAAGAGAAGGGTTCTGTGTGGGTTACTTTGAAAAGAT
CATCTTTGAAGTCTAAGCTGCAGAAGAGGAAACTCAGCTCTGCTGGAGAATCCATCGAGT
ACAGATGTCTTATTCGAGCTACTGATGCTAAGAAAACCATTTCTACTTCGGTTGGGGCTA
AGGATCACCAGAGATTTCAAGCATCATATGCCACCATCCTTAAGGCTCACATGACTGCTT
TGAAGAAGAGGGAGAGGAAAGACCGTAAGAAATTCACAGAGGCAGAGAAGAAGGAAGGCA
CCTCAACCACCACTAAACCCAAGAAACTTTGATGGTCTTCTCTTAATGATTTGCATTTTG
TTGCCTAGAAATTGAATTTTGAAAAAGATATCAGAGATTTTGATTCGTCATTATATAGAT
TTTTGGCTTGCG

QA 4 615 4 615
DS 

RD RR2G902JQ 517 0 0
TTTTTCAGTGTTTGAGGATCTGCAAATAGTATCCATCCAAGGTTTTCAAACTATGGTTTT
ATTACAGTTGGACCCGTTCCTCAATGAACTGACGAGCATGTTCGAGAAAATCAAAGAGAA
GGGTTCTGTGTGGGTTACTTTGAAAAGATCATCTTTGAAGTTTAAGCTGCAGAAGAGGAA
ATTCAGTTCTGCTGGAGAATCCATCGAGTACAGATGTTTTATTCGAGCTACTGATGCTAA
GAAAACCATTTTTACTTCGGTTGGGGCTAAGGATCACCAGAGATTTCAAGCATCATATGC
CACCATTCTTAAGGCTCACATGACTGCTTTGAAGAAGAGGGAGAGGAAAGACCGTAAGAA
ATCCACAGAGGCAGAGAAGAAGGAAGGCACCTCAACCACCACTAAACCCAAGAAACTTTG
ATGGTCTTCTCTTAATGATTTGCATTTTGTTGCCTAGAAATTGAATTTTGAAAAAGATAT
CAGAGATTTTGATTCGTCATTATATAGATTTTTGGC
C

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 6

CO CL1097Contig1 1354 6 7 U
GATGGTAGGATGGAGAAAGGAGTAAGCAAAGCAGGTGTGCAGTTTTACCACGACCTAATT
GATGAGCTCCTCAAAAATGAAATAACACCGTTAGTAACCGTTTTTCACTGGGACACTCCT
CAAGACTTGGAAGATGAATACGGTGGCTTCTTAAGCGACCGTATAATAAAGGATTATACG
GAGTACGCAAACTTCACATTCCAAGAGTACGGACACAAAGTGAAGCATTGGATCACATTT
AACGAGCCATGGGTGTTCAGTCGAGCTGGCTATGACATCGGGAAAACAGCACCTGGACGT
TGTTCTAAATACATCAAAGAGCACGGAGAGTTGTGTCACATGCCGATAAGTGTAAAGGTG
GTAAAATTGGGATTGCTCATACTCCGGCTTGGTTTGACCAGTGCGACCTCACGGATGACC
CGCACCAGCACTCGGAAGAAGAACACGAAACTCCTGCAACTAATTTGATTGACTTCGTCA
TGGGATGGCATTTGAATCCGACCACGTATGGAGATTATCCACAATCGATGAAAGATCATG
TCGGAGATCGACTACCAGAATTTACCGAAGCACAGAAGAACAAGTTGAAAAATTCCGCTG
ATTTCGTAGGAATCAATTACTATAATTCACTATTTGCATTGCACGGCGAAGAGCCAGATC
CTTCGAAACCTAGTTGGGAGAGTGATTCTCTCATTGACTATGAACCTAGGTATGTGGATA
AATTCAATGCATTTACAATTAAGCCTGATGTTGCCAGAGTTGAAGTCTACGCAAATGGTT
TGAGAAGACTTCTGAACTACATAAAGGATAAATATGGCAATCCGGAAGTCATTATCACCG
GGAATGGATACGGAGAAGATCTAGGTGAGCAAGACAGAAGTCTTGTACTGGCGCTCTCAG
ATGACCACAGAACATACTACATTCAGAAGCATCTCTTGAGCTTGCACCAAGCAATTTGCG
ATGATAAAGTAAACGTTACAGGGTATTTTCTTTGGTCATTGATGGATAATTTTGAATGGC
AAGAGGGCTACAGCGCGAGATTTGGACTATACTACGTCGATTACAATAATAATTTGACAC
GCCATGAAAAATTATCAGCCCAGTGGTACTCGAGTTTTCTCCAAGATGGACTGAAAGAGT
TCGAGTATGATCAGCACGATGAGCAACACGAGCACGATGAGTTGTAGTGCGAATGCTCTA
CTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACTACAATCAACCAATGTATTTCTTTTAACAT
TTTAGACCAAAAAAGAACTAATGTATTTCCATATTCCAGAAAAATAATCAGATTTATCGA
TATAAAAACAAGTGAAGTTTGGATTTGTTTACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR71TF U 1
AF RR2HB65TF U 569
AF RR2FR71JQ C 601
AF RR2HB65JQ C 632
AF RR2EQ68TF U 920
AF RR2B292TF U 833
BS 1 767 RR2FR71TF
BS 768 1199 RR2HB65TF
BS 1200 1200 RR2B292TF
BS 1201 1267 RR2HB65TF
BS 1268 1268 RR2B292TF
BS 1269 1304 RR2HB65TF
BS 1305 1354 RR2B292TF

RD RR2FR71TF 767 0 0
GATGGTAGGATGGAGAAAGGAGTAAGCAAAGCAGGTGTGCAGTTTTACCACGACCTAATT
GATGAGCTCCTCAAAAATGAAATAACACCGTTAGTAACCGTTTTTCACTGGGACACTCCT
CAAGACTTGGAAGATGAATACGGTGGCTTCTTAAGCGACCGTATAATAAAGGATTATACG
GAGTACGCAAACTTCACATTCCAAGAGTACGGACACAAAGTGAAGCATTGGATCACATTT
AACGAGCCATGGGTGTTCAGTCGAGCTGGCTATGACATCGGGAAAACAGCACCTGGACGT
TGTTCTAAATACATCAAAGAGCACGGAGAGTTGTGTCACATGCCGATAAGTGTAAAGGTG
GTAAAATTGGGATTGCTCATACTCCGGCTTGGTTTGACCAGTGCGACCTCACGGATGACC
CGCACCAGCACTCGGAAGAAGAACACGAAACTCCTGCAACTAATTTGATTGACTTCGTCA
TGGGATGGCATTTGAATCCGACCACGTATGGAGATTATCCACAATCGATGAAAGATCATG
TCGGAGATCGACTACCAGAATTTACCGAAGCACAGAAGAACAAGTTGAAAAATTCCGCTG
ATTTCGTAGGAATCAATTACTATAATTCACTATTTGCATTGCACGGCGAAGAGCCAGATC
CTTCGAAACCTAGTTGGGAGAGTGATTCTCTCATTGACTATGAACCTAGGTATGTGGATA
AATTCAATGCATTTACAATTAAGCCTGATGTTGCCAGAGTTGAAGTC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2HB65TF 736 0 0
G
GCACAGAAGAACAAGTTGAAAAATTCCGCTGATTTCGTAGGAATCAATTACTATAATTCA
CTATTTGCATTGCACGGCGAAGAGCCAGATCCTTCGAAACCTAGTTGGGAGAGTGATTCT
CTCATTGACTATGAACCTAGGTATGTGGATAAATTCAATGCATTTACAATTAAGCCTGAT
GTTGCCAGAGTTGAAGTCTACGCAAATGGTTTGAGAAGACTTCTGAACTACATAAAGGAT
AAATATGGCAATCCGGAAGTCATTATCACCGGGAATGGATACGGAGAAGATCTAGGTGAG
CAAGACAGAAGTCTTGTACTGGCGCTCTCAGATGACCACAGAACATACTACATTCAGAAG
CATCTCTTGAGCTTGCACCAAGCAATTTGCGATGATAAAGTAAACGTTACAGGGTATTTT
CTTTGGTCATTGATGGATAATTTTGAATGGCAAGAGGGCTACAGCGCGAGATTTGGACTA
TACTACGTCGATTACAATAATAATTTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCCCAGTGGTAC
TCGAGTTTTCTCCAAGATGGACTGAAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGATGAGCAACAC
GAGCACGATGAGTTGTAGTGCGAATGCTCTGCTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAA
CTACAATCAACCAATGTATTTCTTTTAACATTTTAGAC*AAAAAAGAACTAATGTATTTC
CATATTCCAGAAAAA

QA 2 736 2 736
DS 

RD RR2FR71JQ 723 0 0
ATTTCGTAGGAATCAATTACTATAATTCACTATTTGCATTGCACGGCGAAGAGCCAGATC
CTTCGAAACCTAGTTGGGAGAGTGATTCTCTCATTGACTATGAACCTAGGTATGTGGATA
AATTCAATGCATTTACAATTAAGCCTGATGTTGCCAGAGTTGAAGTCTACGCAAATGGTT
TGAGAAGACTTCTGAACTACATAAAGGATAAATATGGCAATCCGGAAGTCATTATCACCG
GGAATGGATACGGAGAAGATTTAGGTGAGCAAGACAGAAGTCTTGTACTGACGCTTTCAG
ATGACCACAGAACATACTACATTCAGAAGCATTTCTTGAGCTTGCACCAAGCAATTTGCG
ATGATAAAGTAAACGTTACAGGGTATTTTCTTTGGTCATTGATGGATAATTTTGAATGGC
AAGAGGGCTACAGCGCGAGATTTGGACTATACTACGTCGATTACAATAATAATTTGACAC
GCCATGAAAAATTATCAGCCCAGTGGTACTCGAGTTTTTTCCAAGATGGACTGAAAGAGT
TCGAGTATGATCAGCACGATGAGCAACACGAGCACGATGAGTTGTAGTGCGAATGCTTTA
CTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACTACAATCAACCAATGTATTTCTTTTAACAT
TTTAGACCAAAAAAGAACTAATGTATTTCCATATTCCAGAAAAATAATCAGATTTATCG
ATAT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2HB65JQ 688 0 0
ATTTGCATTGCACGGCGAAGAGCCAGATCCTTCGAAACCTAGTTGGGAGAGTGATTCTCT
CATTGACTATGAACCTAGGTATGTGGATAAATTCAATGCATTTACAATTAAGCCTGATGT
TGCCAGAGTTGAAGTCTACGCAAATGGTTTGAGAAGACTTTTGAACTACATAAAGGATAA
ATATGGCAATCCGGAAGTCATTATCACCGGGAATGGATACGGAGAAGATTTAGGTGAGCA
AGACAGAAGTTTTGTACTGGCGCTTTCAGATGACCACAGAACATACTACATTCAGAAGCA
TTTCTTGAGCTTGCACCAAGCAATTTGCGATGATAAAGTAAACGTTACAGGGTATTTTCT
TTGGTCATTGATGGATAATTTTGAATGGCAAGAGGGCTACAGCGCGAGATTTGGACTATA
CTACGTCGATTACAATAATAATTTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCCCAGTGGTACTC
GAGTTTTTTCCAAGATGGACTGAAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGATGAGCAACACGA
GCACGATGAGTTGTAGTGCGAATGCTTTGCTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACT
ACAATCAACCAATGTATTTCTTTTAACATTTTAGACCAAAAAAGAAATAATGTATTTCCA
TATTCCAGAAAAATAATCAGATTTATCG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2EQ68TF 404 0 0
G
ATTCAGAAGCATCTCTTGAGCTTGCACCAAGCAATTTGCGATGATAAAGTAAACGTTACA
GGGTATTTTCTTTGGTCATTGATGGATAATTTTGAATGGCAAGAGGGCTACAGCGCGAGA
TTTGGACTATACTACGTCGATTACAATAATAATTTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCC
CAGTGGTACTCGAGTTTTCTCCAAGATGGACTGAAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGAT
GAGCAACACGAGCACGATGAGTTGTAGTGCGAATGCTCTACTACAGACTTTGATATTTTG
AGTCATAAACTACAATCAACCAATGTATTTCTTTTAACATTTTAGACCAAAAAAGAACTA
ATGTATTTCCATATTCCAGAAAAATAATCAGATTTATCG
ATAT

QA 2 400 2 400
DS 

RD RR2B292TF 522 0 0
TATCACCGGGAATGGATACGGAGAAGATCTAGGTGAGCAAGACAGAAGTCTTGTACTGGC
GCTCTCAGATGACCACAGAACATACTACATTCAGAAGCATCTCTTGAGCTTGCACCAAGC
AATTTGCGATGATAAAGTAAACGTTACAGGGTATTTTCTTTGGTCATTGATGGATAATTT
TGAATGGCAAGAGGGCTACAGCGCGAGATTTGGACTATACTACGTCGATTACAATAATAA
TTTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCCCAGTGGTACTCGAGTTTTCTCCAAGATGGACT
GAAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGATGAGCAACACGAGCACGATGAGTTGTAGTGCGA
ATGCTCTACTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACTACAATCAACCAATGTATTTCT
TTTAACATTTTAGACCAAAAAAGAACTAATGTATTTCCATATTCCAGAAAAATAATCAGA
TTTATCGATATAAAAACAAGTGAAGTTTGGATTTGTTTACCG

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 7

CO CL1098Contig1 1460 7 17 U
GGAACGAGAAGAAAATAGCAACTAGAAAACCAATAATTCAATCATCTTTTT*ATACATAA
TTGAGTAGAAATGAAGTTGAAACTAAGAGAGAGAGACAAAGAAACATAGAAAACCGTAAA
CTCTAGAAATAACAAATGAAAAGCAAAAGAACAGTTAAGAAGGGTTTAAGAAAGTATCAA
CCTTAACGTTGGAAGCGGCAGACAAGAACTTCATGCAGATAGGAGGCTTAACACCAGCTA
AAGCAAGTACAGAGCTTGGTAACGTCCATATCCCTT*CACCACATATCAAACCAGAAGCA
ACAGCTGAAGAGTACGCATCTGCTTTTGGTCTATTCAGCTTCCTCCATAAGAACAGAATC
AGACTTCCCACGCACATATCGATCGTGAAGTAACCACCGATGTAAAACGGTATAGCCATA
GCCATCGGGAGAGGGATGAACCGAGACCAGTTAGGCCCCACGGCGTCCCTCACACCGTTC
ACAAACACTGCTGCTGCAAAGAATATGTAACAGAGCATGAGGCAA*TTGTGGGGCAGAGC
AGAGAATCCTTCTACCCCGAGTATCGACATGTTTCTGTAGACTAAAGCGTAAGGTGCGGG
ATACGCGGTTCCGGTTTGACCGAAGTCAGGGAAGGCCTTGTAGAATAGCCAGAAGACGCA
AGGAGAGATGACGCAGCCCATCGCTGTACCAATCGCTTGGCTCAAGAACATTGATCTCGG
CGAAGCTAATGTCATGTAACCGGTTTTGAAATCTTGCATGAGATCAGAAGCGGTGGAGAC
AATGTTCATCATGACACCACAAGCCGCGAGTCCTGCCAAGACACCTCCGTTGGCTGCACC
AGCCCAAGCTCCGATGGTGAAAATGGCGAGTTTTCCGTAGGTAGAAGCTAAGGACCAGTC
GGTGAGCCCGCAACCGTAGGCGTTACAGAAGGCTAGGACAGGAGCGATTATGTACATGGT
CAAGATGTGGTACCATCTGAGCTGAGGGAAGATGTGTGGAACTGTGATGATTGAGATTAT
GGCCATGACTACGTAGCCGGTTACAGCAATCCATGATGGGATTCTGTCTTTGAGGAAAAG
CTCTGTTCTTCGTTTGTCGTCGTAGGAAATGGTTACTGTGTTTGATGGTGACCGGTCGTT
TACGGGAAGAGCATCTCTGTTCTTGAATTGCTTGTATAGACCGACGATAGTGCGGCCTAG
GACTTTGATGAAGTTGTAGAGACCATCACCGAGGATCATAGCAATGGCTATAAACACCTT
GTAGCCTTGAAGGCCGTGGAGACTAGTTGAACTAAGATCAGCAGAGTACCATTTGCCTTT
TTGGGCACCTACGAGAGGCCACATAACACCCCATGATAGTATTGATCCAACCAGAAGCGA
CACATTGATTAGATATGGACATATCATTCCAACACCAACATATGTAGCTGAGAAATCAAA
ATAGAACTTGTTTTCGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT46JQ U 1
AF RR2DZ22JQ U 17
AF RR2CT46TF C 248
AF RR2AE01JQ U 17
AF RR2GZ07JQ U 14
AF RR2GZ07TF C 641
AF RR2DZ22TF C 868
BS 1 192 RR2CT46JQ
BS 193 193 RR2GZ07JQ
BS 194 524 RR2CT46JQ
BS 525 525 RR2AE01JQ
BS 526 536 RR2GZ07JQ
BS 537 537 RR2AE01JQ
BS 538 555 RR2GZ07JQ
BS 556 556 RR2AE01JQ
BS 557 585 RR2GZ07JQ
BS 586 586 RR2AE01JQ
BS 587 597 RR2GZ07JQ
BS 598 598 RR2AE01JQ
BS 599 630 RR2GZ07JQ
BS 631 631 RR2AE01JQ
BS 632 832 RR2GZ07JQ
BS 833 1293 RR2GZ07TF
BS 1294 1460 RR2DZ22TF

RD RR2CT46JQ 525 0 0
GGAACGAGAAGAAAATAGCAACTAGAAAACCAATAATTCAATCATCTTTTT*ATACATAA
TTGAGTAGAAATGAAGTTGAAACTAAGAGAGAGAGACAAAGAAACATAGAAAACCGTAAA
CTCTAGAAATAACAAATGAAAAGCAAAAGAACAGTTAAGAAGGGTTTAAGAAAGTATCAA
CCTTAACGTTGGTAGCGGCAGACAAGAACTTCATGCAGATAGGAGGCTTAACACCAGCTA
AAGCAAGTACAGAGCTTGGTAACGTCCATATCCCTT*CACCACATATCAAACCAGAAGCA
ACAGCTGAAGAGTACGCATCTGCTTTTGGTCTATTCAGCTTCCTCCATAAGAACAGAATC
AGACTTCCCACGCACATATCGATCGTGAAGTAACCACCGATGTAAAACGGTATAGCCATA
GCCATCGGGAGAGGGATGAACCGAGACCAGTTAGGCCCCACGGCGTCCCTCACACCGTTC
ACAAACACTGCTGCTGCAAAGAATATGTAACAGAGCATGAGGCA
A

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2DZ22JQ 630 0 0
AGCAACTAGAAAACCAATAATTCAATCATCTTTTT*ATACATAATTGAGTAGAAATGAAG
TTGAAACTAAGAGAGATAGACAAAGAAACATAGAAAACCGTAAACTCTAGAAATAACAAA
TGAAAAGCAAAAGAGCAGTTAAGAAGGGTTTAAGAAAGTATCAACCTTAACGTTGGAAGC
GGCAGACAAGAACTTCATGCAGATAGGAGGCTTAACACCAGCTAAAGCAAGTACAGAGCT
TGGTAACGTCCATATCCCTT*CGCCACATATCAAACCAGAAGCAACAGCTGACGAGTAAG
CATCTGCTTTTGGTCTATTCAGCTTCCTCCATAAGAACAGAATCAGACTTCCCACGCACA
TATCGATCGTGAAGTAACCTCCGATGTAAAACGGTATAGCCATAGCCATCGGGAGAGGGA
TGAACCGAGACCAGTTAGGCCCCACGGCGTCCCTCACACCGTTCACAAACACTGCTGCTG
CGAAGAATATGTAACAGAGCATGAGGCAG*TTGTGGGGCAAAGCAGAGAATCCTTCTACT
CCGAGTATCGACATGTTTCTGTAGACTAAGGCGTGAGGTGCAGGATACGCGGTTCCGGTT
TGACCGAAGTCAGGAAAGGCCTTGTAGAAT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2CT46TF 465 0 0
TACAGAGCTTGGTAACGTCCATATCCCTTTCACCACATATCAAACCAGAAGCAACAGCTG
AAGAGTACGCATCTGCTTTTGGTCTATTCAGCTTCCTCCATAAGAACAGAATCAGACTTC
CCACGCACATATCGATCGTGAAGTAACCACCGATGTAAAACGGTATAGCCATAGCCATCG
GGAGAGGGATGAACCGAGACCAGTTAGGCCCCACGGCGTCCCTCACACCGTTCACAAACA
CTGCTGCTGCAAAGAATATGTAACAGAGCATGAGGCAAATTGTGGGGCAGAGCAGAGAAT
CCTTCTACCCCGAGTATCGACATGTTTCTGTAGACTAAAGCGTAAGGTGCGGGATACGCG
GTTCCGGTTTGACCGAAGTCAGGGAAGGCCTTGTAGAATAGCCAGAAGACGCAAGGAGAT
ATGACGCAGCCCATCGCTGTACCAATCGCTTGGCTCAAGAACATT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2AE01JQ 671 0 0
AGCAACTAGAAAACCAATAATTCAATCATCTTTTTTATACATAATTGAGTAGAAATGAAG
TTGAAACTAAGAGAGAGAGACAAAGAAACATAGAAAACCGTAAACTCTAGAAATAACAAA
TGAAAAGCAAAAGAACAGTTAAGAAGGGTTTAAGAAAGTATCAACCTTAACGTTGGTAGC
GGCAGACAAGAACTTCATGCAGATAGGAGGCTTAACACCAGCTAAAGCAAGTACAGAGCT
TGGTAACGTCCATATCCCTT*CACCACATATCAAACCAGAAGCAACAGCTGAAGAGTACG
CATCTGCTTTTGGTCTATTCAGCTTCCTCCATAAAAACAGAATCAGACTTCCCACGCACA
TATCGATCGTGAAGTAACCACCGATGTAAAACGGTATAGCCATAGCCATCGGGAGAGGGA
TGAACCGAGACCAGTTAGGCCCCACGG*GTCCCTCACACCGTTCACAAACACTGCTGCTG
CAAAGAATATGTAACAGAGCATGAGGCAA*TTGTGGGGCAGAGCAGAAAATCCTTCTACC
CCGAGTATCGACATGTTTCTGTAGACTAAAGCGTAAGGTGCGGGATACGCGGTTCCGGTT
TGACCGAAGTCAGGGAAGGCCTTGTAGAATAGCCAGAAGACGCAAGGAGATATGACGCAG
CCCATCGCTG
C

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2GZ07JQ 819 0 0
AAT
AGCAACTAGAAAACCAATAATTCAATCATCTTTTT*ATACATAATTGAGTAGAAATGAAG
TTGAAACTAAGAGAGATAGACAAAGAAACATAGAAAACCGTAAACTCTAGAAATAACAAA
TGAAAAGCAAAAGAACAGTTAAGAAGGGTTTAAGAAAGTATCAACCTTAACGTTGGAAGC
GGCAGACAAGAACTTCATGCAGATAGGAGGCTTAACACCAGCTAAAGCAAGTACAGAGCT
TGGTAACGTCCATATCCCTT*CACCACATATCAAACCAGAAGCAACAGCTGACGAGTAAG
CATCTGCTTTTGGTCTATTCAGCTTCCTCCATAAGAACAGAATCAGACTTCCCACGCACA
TATCGATCGTGAAGTAACCTCCGATGTAAAACGGTATAGCCATAGCCATCGGGAGAGGGA
TGAACCGAGACCAGTTAGGCCCCACGGCGTCCCTCACACCGTTCACAAACACTGCTGCTG
CGAAGAATATGTAACAGAGCATGAGGCAG*TTGTGGGGCAAAGCAGAGAATCCTTCTACT
CCGAGTATCGACATGTTTCTGTAGACTAAGGCGTAAGGTGCAGGATACGCGGTTCCGGTT
TGACCGAAGTCAGGAAAGGCCTTGTAGAATAGCCAGAAGACGCAAGGAGAGATGACGCAG
CCCATCGCTGTACCAATCGCTTGGCTCAAGAACATTGATCTCGGCGAAGCTAATGTCATG
TAACCGGTTTTGAAATCTTGCATGAGATCAGAAGCGGTGGAGACAATGTTCATCATGACA
CCACAAGCCGCGAGTCCTGCCAAGACACCTCCGTTG

QA 4 819 4 819
DS 

RD RR2GZ07TF 654 0 0
TAGAATAGCCAGAAGACGCAAGGAGAGATGACGCAGCCCATCGCTGTACCAATCGCTTGG
CTCAAGAACATTGATCTCGGCGAAGCTAATGTCATGTAACCGGTTTTGAAATCTTGCATG
AGATCAGAAGCGGTGGAGACAATGTTCATCATGACACCACAAGCCGCGAGTCCTGCCAAG
ACACCTCCGTTGGCTGCACCAGCCCAAGCTCCGATGGTGAAAATGGCGAGTTTTCCGTAG
GTAGAAGCTAAGGACCAGTCGGTGAGCCCGCAACCGTAGGCGTTACAGAAGGCTAGGACA
GGAGCGATTATGTACATGGTCAAGATGTGGTACCATCTGAGCTGAGGGAAGATGTGTGGA
ACTGTGATGATTGAGATTATGGCCATGACTACGTAGCCGGTTACAGCAATCCATGATGGG
ATTCTGTCTTTGAGGAAAAGCTCTGTTCTTCGTTTGTCGTCGTAGGAAATGGTTACTGTG
TTTGATGGTGACCGGTCGTTTACGGGAAGAGCATCTCTGTTCTTGAATTGCTTGTATAGA
CCGACGATAGTGCGGCCTAGGACTTTGATGAAGTTGTAGAGACCATCACCGAGGATCATA
GCAATGGCTATAAACACCTTGTAGCCTTGAAGGCCGTGGAGACTAGTTGAACT
C

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2DZ22TF 593 0 0
GAGTTTTCCGTAGGTAGAAGCTAAGGACCAGTCGGTGAGCCCGCAACCGTAGGCGTTACA
GAAGGCTAGGACAGGAGCGATTATGTACATGGTCAAGATGTGGTACCATCTGAGCTGAGG
GAAGATGTGTGGAACTGTGATGATTGAGATTATGGCCATGACTACGTAGCCGGTTACAGC
AATCCATGATGGGATTCTGTCTTTGAGGAAAAGCTCTGTTCTTCGTTTGTCGTCGTAGGA
AATGGTTACTGTGTTTGATGGTGACCGGTCGTTTACGGGAAGAGCATCTCTGTTCTTGAA
TTGCTTGTATAGACCGACGATAGTGCGGCCTAGGACTTTGATGAAGTTGTAGAGACCATC
ACCGAGGATCATAGCAATGGCTATAAACACCTTGTAGCCTTGAAGGCCGTGGAGACTAGT
TGAACTAAGATCAGCAGAGTACCATTTGCCTTTTTGGGCACCTACGAGAGGCCACATAAC
ACCCCATGATAGTATTGATCCAACCAGAAGCGACACATTGATTAGATATGGACATATCAT
TCCAACACCAACATATGTAGCTGAGAAATCAAAATAGAACTTGTTTTCGTACC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 7

CO CL1099Contig1 1308 7 8 U
GATGACATAAAGAAGCCTGATCATAAAGTAAAGCCTGGTTACAAAGAGAAGCTTAATGAT
GGTGACAAAGAGAAGATTGATGACATAGAGAAGCCTGATCATGAAGTAAAGCCTGATTAC
AAAGAGAAGCTTAATGATGGTGACAAAGAGAAGATTGATGACAAGCCTGATCACAAAGTA
AAGCCTGGTTACAAAGAGAAGCTTGATGATGGTGACAAAGAGAAGATTGATGACATAGAG
AAGCCTGATCACACAGTTAAGCCTATGGGATATGGCTATGGCGTTGGTTATGGAAGTGGA
GGCAGCGGCTTCGGAGTAGGGATAGGCTCTAGTGGTGGCAGTGGCTTTGGAGAAGGGATT
GGCTCTAGTGGAGGAAGTGGCTTTGGAGAAGGGATAGGCTCTAGTGGAGGTAGTGGCTTT
GGAGAAGGAATAGGCTCTAGTGGAGGAAGTGGCTTTGGGGAAGGGATTGGGTCAAGTGGT
GGTTCAGGTGTTGGCATTGGAGAAGGAAGAGGATCGGGGTATGGCCAACCTAACTGCGGT
CCTGTCACAGGAGCCCCAGGTAGCGGATACGGTGAAGGCATTGGACGAGGTAGTGGTTCA
GGGGAAGGGATTGGTATAGGTATAGGAGGAAGTGGCTCTACTGGTGG*TGTAGTTGTCCC
TCCCATAAATGTACCAGGCACAACAATCCCTCCCATAACAGTACCAGGGACCCATATTCC
CGGTTTTGTGATTCCAGGAGTGACGGTTCCTGGTTATGGTAGTGGTGGATGCCAAACCGG
TGGGTGCACCCCAAGCGTGCCATACTACCATCCACCTATTTACCAGCCACCAGAGTGTCC
ACATTGTCCTCCTTACGTTGCAGGACAAGACAAACACATGGTAGATAAAGAAACCATGAC
GGAAGCTCTTGCACCCATGTCAAGCGAGATGCACGCCTAAGCTATTTAGTGACCATGGAA
ACAGAGAGTCTAAGAAAGTCACTCATAATGAGATTAAAGTATGTTTTGGTTTAAAAGCTA
CACGTTAAGTTGAATAATCCAACTTTACCCAAATAAAGTTCTGAATAAGTGAAATGTGGA
GAAGAAATAGTATTATCATGTAAAGAAGCAGGCAACTGGAACTGTATTTTGCATTTTCAT
GGATGTATCTTTGACAATGAGTTTTTAATAGGCCCCAAGCTTGTATTATAGTGTGTTATT
TTCTGTAAAATTTAAATAAATAGTAATTATGGTGGTGGATTTAATAGATGGATGAACTGA
GCATATGATTATTAAAAATGGTTAAAATTAAATATAATTCAATTAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AP59TF U 1
AF RR2DI86TF U 423
AF RR2AP59JQ C 385
AF RR2DI86JQ C 654
AF RR2EW52TF U 787
AF RR2BG88JQ C 916
AF RR2BG88TF U 916
BS 1 647 RR2AP59TF
BS 648 648 RR2DI86TF
BS 649 741 RR2AP59TF
BS 742 1107 RR2DI86TF
BS 1108 1236 RR2EW52TF
BS 1237 1237 RR2BG88TF
BS 1238 1242 RR2EW52TF
BS 1243 1308 RR2BG88TF

RD RR2AP59TF 741 0 0
GATGACATAAAGAAGCCTGATCATAAAGTAAAGCCTGGTTACAAAGAGAAGCTTAATGAT
GGTGACAAAGAGAAGATTGATGACATAGAGAAGCCTGATCATGAAGTAAAGCCTGATTAC
AAAGAGAAGCTTAATGATGGTGACAAAGAGAAGATTGATGACAAGCCTGATCACAAAGTA
AAGCCTGGTTACAAAGAGAAGCTTGATGATGGTGACAAAGAGAAGATTGATGACATAGAG
AAGCCTGATCACACAGTTAAGCCTATGGGATATGGCTATGGCGTTGGTTATGGAAGTGGA
GGCAGCGGCTTCGGAGTAGGGATAGGCTCTAGTGGTGGCAGTGGCTTTGGAGAAGGGATT
GGCTCTAGTGGAGGAAGTGGCTTTGGAGAAGGGATAGGCTCTAGTGGAGGTAGTGGCTTT
GGAGAAGGAATAGGCTCTAGTGGAGGAAGTGGCTTTGGGGAAGGGATTGGGTCAAGTGGT
GGTTCAGGTGTTGGCATTGGAGAAGGAAGAGGATCGGGGTATGGCCAACCTAACTGCGGT
CCTGTCACAGGAGCCCCAGGTAGCGGATACGGTGAAGGCATTGGACGAGGTAGTGGTTCA
GGGGAAGGGATTGGTATAGGTATAGGAGGAAGTGGCTCTACTGGTGGGTGTAGTTGTCCC
TCCCATAAATGTACCAGGCACAACAATCCCTCCCATAACAGTACCAGGGACCCATATTCC
CGGTTTTGTGATTCCAGGAGT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2DI86TF 685 0 0
G
GAAGGAATAGGCTCTAGTGGAGGAAGTGGCTTTGGGGAAGGGATTGGGTCAAGTGGTGGT
TCAGGTGTTGGCATTGGAGAAGGAAGAGGATCAGGGTATGGCCAACCTAACTGCGGTCCT
GTCACAGGAGCCCCAGGTAGCGGATACGGTGAAGGCATTGGACGAGGTAGTGGTTCAGGG
GAAGGGATTGGTATAGGTATAGGAGGAAGTGGCTCTACTGGTGG*TGTAGTTGTCCCTCC
CATAAATGTACCAGGCACAACAATCCCTCCCATAACAGTACCAGGGACCCATATTCCCGG
TTTTGTGATTCCAGGAGTGACGGTTCCTGGTTATGGTAGTGGTGGATGCCAAACCGGTGG
GTGCACCCCAAGCGTGCCATACTACCATCCACCTATTTACCAGCCACCAGAGTGTCCACA
TTGTCCTCCTTACGTTGCAGGACAAGACAAACACATGGTAGATAAAGAAACCATGACGGA
AGCTCTTGCACCCATGTCAAGCGAGATGCACGCCTAAGCTATTTAGTGACCATGGAAACA
GAGAGTCTAAGAAAGTCACTCATAATGAGATTAAAGTATGTTTTGGTTTAAAAGCTACAC
GTTAAGTTGAATAATCCAACTTTACCCAAATAAAGTTCTGAATAAGTGAAATGTGGAGAA
GAAATAGTATTATCATGTAAAGAA

QA 2 685 2 685
DS 

RD RR2AP59JQ 782 0 0
GGAGAAGGGATAGGCTCTAGTGGAGGTAGTGGCTTTGGAGAAGGAATAGGCTCTAGTGGA
GGAAGTGGCTTTGGGGAAGGGATTGGGTCAAGTGGTGGTTCAGGTGTTGGCATTGGAGAA
GGAAGAGGATCGGGGTATGGCCAACCTAACTGCGGTCCTGTCACAGGAGCCCCAGGTAGC
GGATACGGTGAAGGCATTGGACGAGGTAGTGGTTCAGGGGAAGGGATTGGTATAGGTATA
GGAGGAAGTGGCTCTACTGGTGG*TGTAGTTGTCCCTCCCATAAATGTACCAGGCACAAC
AATCCCTCCCATAACAGTACCAGGGACCCATATTCCCGGTTTTGTGATTCCAGGAGTGAC
GGTTCCTGGTTATGGTGGTGGTGGATGCCAAACCGGTGGGTGCACCCCAAGCGTGCCATA
CTACCATCCACCTATTTACCAGCCACCAGAGTGTCCACATTGTCCTCCTTACGTTGCAGG
ACAAGACAAACACATGGTAGATAAAGAAACCATGACGGAAGCTCTTGCACCCATGTCAAG
CGAGATGCACGCCTAAGCTATTTAGTGACCATGGAAACAGAGAGTTTAAGAAAGTCACTC
ATAATGAGATTAAAGTATGTTTTGGTTTAAAAGCTACACGTTAAGTTGAATAATCCAACT
TTACCCAAATAAAGTTCTGAATAAGTGAAATGTGGAGAAGAAATAGTATTATCATGTAAA
GAAGCAGGCAACTGGAACTGTATTTTGCATTTTCATGGATGTATCTTTGACAATGAGTTT
TT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2DI86JQ 589 0 0
TTGTCCCTCCCATAAATGTACCAGGCACAACAATCCCTCCCATAACAGTACCAGGGACCC
ATATTCCCGGTTTTGTGATTCCAGGAGTGACGGTTCCTGGTTATGGTAGTGGTGGATGCC
AAACCGGTGGGTGCACCCCAAGCGTGCCATACTACCATCCACCTATTTACCAGCCACCAG
AGTGTCCACATTGTCCTCCTTACGTTGCAGGACAAGACAAACACATGGTAGATAAAGAAA
CCATGACGGAAGCTCTTGCACCCATGTCAAGCGAGATGCACGCCTAAGCTATTTAGTGAC
CATGGAAACAGAGAGTCTAAGAAAGTCACTCATAATGAGATTAAAGTATGTTTTGGTTTA
AAAGCTACACGTTAAGTTGAATAATCCAACTTTACCCAAATAAAGTTCTGAATAAGTGAA
ATGTGGAGAAGAAATAGTATTATCATGTAAAGAAGCAGGCAACTGGAACTGTATTTTGCA
TTTTCATGGATGTATCTTTGACAATGAGTTTTTAATAGGCCCCAAGCTTGTATTATAGTG
TGTTATTTTCTGTAAAATTTAAATAAATAGTAATTATGGTGGTGGATTT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2EW52TF 457 0 0
CACCCCAAGCGTGCCATACTACCATCCACCTATTTACCAGCCACCAGAGTGTCCACATTG
TCCTCCTTACGTTGCAGGACAAGACAAACACATGGTAGATAAAGAAACCATGACGGAAGC
TCTTGCACCCATGTCAAGCGAGATGCACGCCTAAGCTATTTAGTGACCATGGAAACAGAG
AGTCTAAGAAAGTCACTCATAATGAGATTAAAGTATGTTTTGGTTTAAAAGCTACACATT
AAGTTGAATAATCCAACTTTACCCAAATAAAGTTCTGAATAAGTGAAATGTGGAGAAGAA
ATAGTATTATCATGTAAAGAAGCAGGCAACTGGAACTGTATTTTGCATTTTCATGGATGT
ATCTTTGACAATGAGTTTTTAATAGGCCCCAAGCTTGTATTATAGTGTGTTATTTTCTGT
AAAATTTAAATAAATAGTAATTATGGTGGTTGATTT
C

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR2BG88JQ 393 0 0
G
ATGTCAAGCGAGATGCACGCCTCAGCTATTTAGTGACCATGGAAACAGAGAGTTTAAGAA
AGTCACTCATAATGAGATTAAAGTATGTTTTGGTTTAAAAGTTACACGTTAAGTTGAATA
ATCCAACTTTACCCAAATAAAGTTCTGAATAAGTGAAATGTGGAGAAGAAATAGTATTAT
CATGTAAAGAAGCAGGCAACTGGAACTGTATTTTGCATTTTCATGGATGTATCTTTGACA
ATGAGTTTTTAATAGGCCCCAAGCTTGTATTATAGTGTGTTATTTTCTGTAAAATTTAAA
TAAATAGTAATTATGGTGGTGGATTTAATAGATGGATGAACTGAGCATATGATTATTAAA
AATGGTTAAAATTAAATATAATTCAATTAAAG

QA 2 393 2 393
DS 

RD RR2BG88TF 393 0 0
G
ATGTCAAGCGAGATGCACGCCTCAGCTATTTAGTGACCATGGAAACAGAGAGTCTAAGAA
AGTCACTCATAATGAGATTAAAGTATGTTTTGGTTTAAAAGTTACACGTTAAGTTGAATA
ATCCAACTTTACCCAAATAAAGTTCTGAATAAGTGAAATGTGGAGAAGAAATAGTATTAT
CATGTAAAGAAGCAGGCAACTGGAACTGTATTTTGCATTTTCATGGATGTATCTTTGACA
ATGAGTTTTTAATAGGCCCCAAGCTTGTATTATAGTGTGTTATTTTCTGTAAAATTTAAA
TAAATAGTAATTATGGTGGTGGATTTAATAGATGGATGAACTGAGCATATGATTATTAAA
AATGGTTAAAATTAAATATAATTCAATTAAAG

QA 2 393 2 393
DS 



AS 2 7

CO CL1100Contig1 646 3 5 U
GGAAGGTTTTCAGCTTCTTTAACACCTCTCCAGATATCGAGTGGGAAGAATCATCTTGAG
CCATGTCTCCAGCTAAAGTTGATACCACGAAGAAGGCTGACCCCAAGGCCAAGGCCTTGA
AGGCTGCGAAAGCAGTTAAGTCTGGCCAAGCCTTCAAGAAGTAGGACAAGAAGATCAGGA
CTAAGGTTACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCTAGAGATCCCAAGTACCCAA
GAATCAGCGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGATCACTATGGTATCCTCAAGTACCCACTCA
CCACCGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACCCTTGTCTTCATTGTTGACA
TTCGTGCTGACAAGAAGAAGATTAAGGATGCTGTTAAAAAGATGTATGACATTCAGACCA
AGAAGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
CTGACTACGATGCTTTAGATGTTGCTAACAAGATTGGCATCATCTAAGTTCGTCTACCTC
TCTTATTATAAAAAGGACTTGTGGTTTTGTCTCTAGTGGTCAAAACTTTGTTTTACAATA
CATTCGTGTTGCAGTTAATTGTTGAATTCAAATTCTATGTTTTTGG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D232TF U 1
AF RR2EQ91JQ C 1
AF RR2EQ91TF U 1
BS 1 161 RR2D232TF
BS 162 162 RR2EQ91TF
BS 163 481 RR2D232TF
BS 482 482 RR2EQ91TF
BS 483 646 RR2D232TF

RD RR2D232TF 646 0 0
GGAAGGTTTTCAGCTTCTTTAACACCTCTCCAGATATCGAGTGGGAAGAATCATCTTGAG
CCATGTCTCCAGCTAAAGTTGATACCACGAAGAAGGCTGACCCCAAGGCCAAGGCCTTGA
AGGCTGCGAAAGCAGTTAAGTCTGGCCAAGCCTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGA
CTAAGGTTACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCTAGAGATCCCAAGTACCCAA
GAATCAGCGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGATCACTATGGTATCCTCAAGTACCCACTCA
CCACCGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACCCTTGTCTTCATTGTTGACA
TTCGTGCTGACAAGAAGAAGATTAAGGATGCTGTTAAAAAGATGTATGACATTCAGACCA
AGAAGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
CAGACTACGATGCTTTAGATGTTGCTAACAAGATTGGCATCATCTAAGTTCGTCTACCTC
TCTTATTATAAAAAGGACTTGTGGTTTTGTCTCTAGTGGTCAAAACTTTGTTTTACAATA
CATTCGTGTTGCAGTTAATTGTTGAATTCAAATTCTATGTTTTTGG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2EQ91JQ 634 0 0
GGAAGGTTTTCAGCTTCTTTAACACCTCTCCAGATATCGAGTGGGAAGAATCATCTTGAG
CCATGTCTCCAGCTAAAGTTGATACCACGAAGAAGGCTGACCCCAAGGCCAAGGCCTTGA
AGGCTGCGAAAGCAGTTAAGTCTGGCCAAGCCTTCAAGAAGTAGGACAAGAAGATCAGGA
CTAAGGTTACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCTAGAGATCCCAAGTACCCAA
GAATCAGCGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGATCACTATGGTATCCTCAAGTACCCACTCA
CCACCGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACCCTTGTCTTCATTGTTGACA
TTCGTGCTGACAAGAAGAAGATTAAGGATGCTGTTAAAAAGATGTATGACATTCAGACCA
AGAAGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
CTGACTACGATGCTTTAGATGTTGCTAACAAGATTGGCATCATCTAAGTTCGTCTACCTC
TCTTATTATAAAAAGGACTTGTGGTTTTGTCTCTAGTGGTCAAAACTTTGTTTTACAATA
CATTCGTGTTGCAGTTAATTGTTGAATTCAAATT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2EQ91TF 634 0 0
GGAAGGTTTTCAGCTTCTTTAACACCTCTCCAGATATCGAGTGGGAAGAATCATCTTGAG
CCATGTCTCCAGCTAAAGTTGATACCACGAAGAAGGCTGACCCCAAGGCCAAGGCCTTGA
AGGCTGCGAAAGCAGTTAAGTCTGGCCAAGCCTTCAAGAAGTAGGACAAGAAGATCAGGA
CTAAGGTTACCTTCCACAGGCCAAAGACTTTGACCAAGGCTAGAGATCCCAAGTACCCAA
GAATCAGCGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGATCACTATGGTATCCTCAAGTACCCACTCA
CCACCGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACCCTTGTCTTCATTGTTGACA
TTCGTGCTGACAAGAAGAAGATTAAGGATGCTGTTAAAAAGATGTATGACATTCAGACCA
AGAAGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
CTGACTACGATGCTTTAGATGTTGCTAACAAGATTGGCATCATCTAAGTTCGTCTACCTC
TCTTATTATAAAAAGGACTTGTGGTTTTGTCTCTAGTGGTCAAAACTTTGTTTTACAATA
CATTCGTGTTGCAGTTAATTGTTGAATTCAAATT

QA 1 634 1 634
DS 



CO CL1100Contig2 686 4 14 U
GGTTTATAAAGAGTGGTATATGATAAGATTGTTGAGAAGCCAAAAAACATAGAATTTGAA
TTCAACAATTAACTGCAACACGAATGTATTGTAAAACAAAGTTTTGACCACTAGAGACAA
AACCACAAGTCCTTTTTATAATAGGAGAGGTAGACGAACTTAGATGATGCCAATCTTGTT
AGCAACATCTAAAGCATCGTAGTCTGGTGTAAGCCTAACGTAAGCCTTCTTCGTTCCATC
AGGCCTGATGAAAGTGTTGACCTTCTTGGTCTGAATGTCATACATCTTTTTAACAGCATC
CTTAATCTCCTTCTTGTCGGCACGAATGTCAACAATGAAGACAAGAGTGTTGTTGTCTTC
AATCTCCTTCATTGCAGACTCGGTGGTGAGTGGGTACTTAAGGATACCATAGTGATCCAA
CTTGTTCCTTGGAGTAGCGCTGATTCTTGGGTACTTGGGATCTCTAGCCTTGGTCAAAGT
CTTTGGCCTGTGGAAGGTAACCTTAGTCCTGATCTTCTTGTCCTTCTTCTTGAAGGCTTG
GCCAGACTTAACTGCCTTCGCAGCCTTCAAGGCCCTGGCCTTAGGATCAGCCTTCTTCGT
GGTATCAACTTTAGCAGGAGACATAGCTCAAGATGATTATTCCCACTTGATATCTGGAGA
GGTGTTAAAGAAGCTGAAAACCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 

AF RR2DE17JQ U 1
AF RR2DE17TF C 1
AF RR2CX88TF C 4
AF RR2CX88JQ U 94
BS 1 121 RR2DE17JQ
BS 122 122 RR2CX88JQ
BS 123 161 RR2DE17JQ
BS 162 162 RR2CX88JQ
BS 163 251 RR2DE17JQ
BS 252 252 RR2CX88JQ
BS 253 308 RR2DE17JQ
BS 309 309 RR2CX88JQ
BS 310 574 RR2DE17JQ
BS 575 575 RR2CX88JQ
BS 576 615 RR2DE17JQ
BS 616 616 RR2CX88JQ
BS 617 622 RR2DE17JQ
BS 623 686 RR2CX88JQ

RD RR2DE17JQ 622 0 0
GGTTTATAAAGAGTGGTATATGATAAGATTGTTGAGAAGCCAAAAAACATAGAATTTGAA
TTCAACAATTAACTGCAACACGAATGTATTGTAAAACAAAGTTTTGACCACTAGAGACAA
A*CCACAAGTCCTTTTTATAATAGGAGAGGTAGACGAACTTGGATGATGCCAATCTTGTT
AGCAACATCTAAAGCATCGTAGTCTGGTGTAAGCCTAACGTAAGCCTTCTTCGTTCCATC
AGGCCTGATGAGAGTGTTGACCTTCTTGGTCTGAATGTCATACATCTTTTTAACAGCATC
CTTAATCTTCTTCTTGTCGGCACGAATGTCAACAATGAAGACAAGAGTGTTGTTGTCTTC
AATCTCCTTCATTGCAGACTCGGTGGTGAGTGGGTACTTAAGGATACCATAGTGATCCAA
CTTGTTCCTTGGAGTAGCGCTGATTCTTGGGTACTTGGGATCTCTAGCCTTGGTCAAAGT
CTTTGGCCTGTGGAAGGTAACCTTAGTCCTGATCTTCTTGTCCTTCTTCTTGAAGGCTTG
GCCAGACTTAACTGCCTTCGCAGCCTTCAAGGCCTTGGCCTTAGGATCAGCCTTCTTCGT
GGTATCAACTTTAGCTGGAGAC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2DE17TF 686 0 0
GGTTTATA
AAGAGTGGTATATGATAAGATTGTTGAGAAGCCAAAAAACATAGAATTTGAATTCAACAA
TTAACTGCAACACGAATGTATTGTAAAACAAAGTTTTGACCACTAGAGACAAA*CCACAA
GTCCTTTTTATAATAGGAGAGGTAGACGAACTTGGATGATGCCAATCTTGTTAGCAACAT
CTAAAGCATCGTAGTCTGGTGTAAGCCTAACGTAAGCCTTCTTCGTTCCATCAGGCCTGA
TGAGAGTGTTGACCTTCTTGGTCTGAATGTCATACATCTTTTTAACAGCATCCTTAATCT
TCTTCTTGTCGGCACGAATGTCAACAATGAAGACAAGAGTGTTGTTGTCTTCAATCTCCT
TCATTGCAGACTCGGTGGTGAGTGGGTACTTAAGGATACCATAGTGATCCAACTTGTTCC
TTGGAGTAGCGCTGATTCTTGGGTACTTGGGATCTCTAGCCTTGGTCAAAGTCTTTGGCC
TGTGGAAGGTAACCTTAGTCCTGATCTTCTTGTCCTTCTTCTTGAAGGCTTGGCCAGACT
TAACTGCCTTCGCAGCCTTCAAGGCCTTGGCCTTAGGATCAGCCTTCTTCGTGGTATCAA
CTTTAGCTGGAGACATAGCTCAAGATGATTATTCCCACTTGATATCTGGAGAGGTGTTAA
AGAAGCTGAAAGCCTTCC

QA 9 686 9 686
DS 

RD RR2CX88TF 683 0 0
TTTTT
AAGAGTGGTATATGATAAGATTGTTGAGAAGCCAAAAAACATAGAATTTGAATTCAACAA
TTAACTGCAACACGAATGTATTGTAAAACAAAGTTTTGACCACTAGAGACAAAACCACAA
GTCCTTTTTATAATAGGAGAGGTAGACGAACTTAGATGATGCCAATCTTGTTAGCAACAT
CTAAAGCATCGTAGTCTGGTGTAAGCCTAACGTAAGCCTTCTTCGTTCCATCAGGCCTGA
TGAAAGTGTTGACCTTCTTGGTCTGAATGTCATACATCTTTTTAACAGCATCCTTAATCT
CCTTCTTGTCGGCACGAATGTCAACAATGAAGACAAGAGTGTTGTTGTCTTCAATCTTCT
TCATTGCAGACTCGGTGGTGAGTGGGTACTTAAGGATACCATAGTGTTCCAACTTGTTCC
TTGGAGTAGCGCTGATTCTTGGGTACTTGGGATCTCTAGCCTTGGTCAAAGTCTTTGGCC
TGTGGAAGGTAACCTTAGTCCTGGTCTTCTTGTCCTTCTTCTTGAAGGCTTGGCCAGACT
TAACTGCCTTCGCAGCCTTCAAGGCCCTGGCCTTAGGATCAGCCTTCTTCGTGGTATCAA
CTTTAGCAGGAGACATAGCTCAAGATGATTATTCCCACTTGATATCTGGAGAGGTGTTAA
AGAAGCTGAAAACCTTCC

QA 6 683 6 683
DS 

RD RR2CX88JQ 593 0 0
AAACAAAGTTTTGACCACTAGAGACAAAACCACAAGTCCTTTTTATAATAGGAGAGGTAG
ACGAACTTAGATGATGCCAATCTTGTTAGCAACATCTAAAGCATCGTAGTCTGGTGTAAG
CCTAACGTAAGCCTTCTTCGTTCCATCAGGCCTGATGAAAGTGTTGACCTTCTTGGTCTG
AATGTCATACATCTTTTTAACAGCATCCTTAATCTCCTTCTTGTCGGCACGAATGTCAAC
AATGAAGACAAGAGTGTTGTTGTCTTCAATCTTCTTCATTGCAGACTCGGTGGTGAGTGG
GTACTTAAGGATACCATAGTGATCCAACTTGTTCCTTGGAGTAGCGCTGATTCTTGGGTA
CTTGGGATCTCTAGCCTTGGTCAAAGTCTTTGGCCTGTGGAAGGTAACCTTAGTCCTGAT
CTTCTTGTCCTTCTTCTTGAAGGCTTGGCCAGACTTAACTGCCTTCGCAGCCTTCAAGGC
CCTGGCCTTAGGATCAGCCTTCTTCGTGGTATCAACTTTAGCAGGAGACATAGCTCAAGA
TGATTATTCCCACTTGATATCTGGAGAGGTGTTAAAGAAGCTGAAAACCTTCC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 7

CO CL1101Contig1 729 7 12 U
GGAATCCTAGAACTTAAAAAAAAGAATATATTGCAACAGTACTGTATCCTCTCGTTTCCT
CCATTGTCACCACTAATCGAATAAGATATCAATGGCTGAAGCATTCACAAGTTTCACCTT
CACAAACCTTCATATTCCTTCTTCCTCAAGTTATTCGCCTAAGCAGATTTCAGGGCCAAA
TCATGGATGCTGGCTCTCTATGAAAAAGAATGAGAAGAGGCCGGAAAAGAATCTGATGAG
AGGAAGCTTGTGTGTGAGAAAGGCTCTGCCACATGATATGCCACTAATGGCTGTGATGGT
TCAACAAATAGAGGGGATGCGTGATATCATTACAGAGAAACACGTGTGGCATCTAAGTGA
TAAAGCCATCAAGAATGTCTATTTGTTCTATATCATGTTCACTTGTTGGGGATGTCTGTA
CTTCGGTTCCGCAAAAGATCCATTCTATGATTCGGAGGAGTACCGTGGAGATGGAGGTGA
TGGAACTGGATACTGGGTCTATGAAACTCAAGAAGACATAGAAGAGAAGGCAAGAGCAGA
GCTATGGCGTGAAGAGCTTATCGAAGAAATTGAACAGAAAGTTGGTGGTTTAAGAGAGCT
CGAAGAAGCTGTTAATAAGTAGACAACTAACATGTGAATCATACACAAATTATACATATG
TAAAATATTGTTTTCTGATAATGGTCATAAACCACTCTTCATTTATATAATACTATATGT
TAACTGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 15 45 15 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN72TF U 61
AF RR2GG04TF U 1
AF RR2FN72JQ C 199
AF RR2ED51TF U 27
AF RR2CT15TF U 70
AF RR2ED51JQ C 36
AF RR2AI01TF U 61
BS 1 135 RR2GG04TF
BS 136 136 RR2ED51TF
BS 137 188 RR2GG04TF
BS 189 189 RR2ED51TF
BS 190 312 RR2GG04TF
BS 313 313 RR2ED51TF
BS 314 318 RR2GG04TF
BS 319 319 RR2ED51TF
BS 320 586 RR2GG04TF
BS 587 642 RR2ED51TF
BS 643 722 RR2AI01TF
BS 723 729 RR2ED51JQ

RD RR2FN72TF 476 0 0
GG
ATTGTCACCACTAATCGAATAAGATATCAATGGCTGAAGCATTCACAAGTTTCACCTTCA
CAAACCTTCATATCCCTTCTTCCTCAAGTTATTCGCCTAAGCAGATTTCAGGGCCAAATC
ATGGATGCTGGCTCTCTATGAAAAAGAATGAGAAGAGGCCGGAAAAGAATCTGATGAGAG
GAAGCTTGTGTGTGAGAAAGGCTCTGCCACATGATATGCCACTAATGGCTGTGATGGTTC
AACAAATAGAGGGGATGCGTGATATCATTACAGAGAAACACGTGTGGCATCTAAGTGATA
AAGCCATCAAGAATGTCTATTTGTTCTATATCATGTTCACTTGTTGGGGATGTCTGTACT
TCGGTTCCGCAAAAGATCCATTCTATGATTCGGAGGAGTACCGTGGAGATGGAGGTGATG
GAACTGGATACTGGGTCTATGAAACTCAAGAAGACATAGAAGAGAAGGCAAGAG

QA 3 476 3 476
DS 

RD RR2GG04TF 586 0 0
GGAATCCTAGAACTTAAAAAAAAGAATATATTGCAACAGTACTGTATCCTCTCGTTTCCT
CCATTGTCACCACTAATCGAATAAGATATCAATGGCTGAAGCATTCACAAGTTTCACCTT
CACAAACCTTCATATCCCTTCTTCCTCAAGTTATTCGCCTAAGCAGATTTCAGGGCCAAA
TCATGGATTCTGGCTCTCTATGAAAAAGAATGAGAAGAGGCCGGAAAAGAATCTGATGAG
AGGAAGCTTGTGTGTGAGAAAGGCTCTGCCACATGATATGCCACTAATGGCTGTGATGGT
TCAACAAATAGAAGGGATACGTGATATCATTACAGAGAAACACGTGTGGCATCTAAGTGA
TAAAGCCATCAAGAATGTCTATTTGTTCTATATCATGTTCACTTGTTGGGGATGTCTGTA
CTTCGGTTCCGCAAAAGATCCATTCTATGATTCGGAGGAGTACCGTGGAGATGGAGGTGA
TGGAACTGGATACTGGGTCTATGAAACTCAAGAAGACATAGAAGAGAAGGCAAGAGCAGA
GCTATGGCGTGAAGAGCTTATCGAAGAAATTGAACAGAAAGTTGGT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2FN72JQ 348 0 0
TATGAAAAAGAATGAGAAGAGGCCGGAAAAGAATTTGATGAGAGGAAGCTTGTGTGTGAG
AAAGGTTTTGCCACATGATATGCCACTAATGGCTGTGATGGTTCAACAAATAGAGGGGAT
GCGTGATATCATTACAGAGAAACACGTGTGGCATTTAAGTGATAAAGCCATCAAGAATGT
TTATTTGTTTTATATCATGTTCACTTGTTGGGGATGTTTGTACTTCGGTTCCGCAAAAAA
TCCATTTTATGATTCGGAGGAGTACCGTGGAGATGGAGGTGATGGAACTGGATACTGGGT
TTATGAAACTCAAGAAGACATAGAAGAGAAGGCAAGAGCAGAGTTATG

QA 1 348 1 348
DS 

RD RR2ED51TF 616 0 0
GGG
ATTGCAACAGTACTGTATCCTCTCGTTTCCTCCATTGTCACCACTAATCGAATAAGATAT
CAATGGCTGAAGCATTCACAAGTTTCACCTTCACAAACCTTCATATTCCTTCTTCCTCAA
GTTATTCGCCTAAGCAGATTTCAGGGCCAAATCATGGATGCTGGCTCTCTATGAAAAAGA
ATGAGAAGAGGCCGGAAAAAAGTCTGATGAGAGGAAGCTTGTGTGTGAGAAAGGCTCTGC
CACATGATATGCCACTAATGGCTGTGATGGTTCAACAAATAGAGGGGATGCGTGATATCA
TTACAGAGAAACACGTGTGGCATCTAAGTGATAAAGCCATCAAGAATGTCTATTTGTTCT
ATATCATGTTCACTTGTTGGGGATGTCTGTACTTCGGTTCCGCAAAAGATCCATTCTATG
ATTCGGAGGAGTACCATGGAGATGGAGGTGATGGAACTGGATACTGGGTCTATGAAACTC
AAGAAGACATAGAAGAGAAGGCAAGAGCAGAGCTATGGCGTGAAGAGCTTATCGAAGAAA
TTGAACAGAAAGTTGGTGGTTTAAGAGAGCTCGAAGAAGCTGTTAATAAGTAGACAACTA
ACATGTGAATCAT

QA 4 616 4 616
DS 

RD RR2CT15TF 634 0 0
GG
ACTAATCGAATAAGATATCAATGGCTGAAGCATTCACAAGTTTCACCTTCACAAACCTTC
ATATTCCTTCTTCCTCAAGTTATTCGCCTAAGCAGATTTCAGGGCCAAATCATGGATGCT
GGCTCTCTATGAAAAAGAATGAGAAGAGGTCGGAAAAGAATCTGATGAGAGGAAGCTTGT
GTGTGAGAAAGGCTCTGCCACATGATATGCCACTAATGGCTGTGATGGTTCAACAAATAG
AGGGGATGCGTGATATCATTACAGAGAAACACGTGTGGCATCTAAGTGATAAAGCCGTCA
AGAATGTCTATTTGTTCTATATCATGTTCACTTGTTGGGGATGTCTGTACTTCGGTTCCG
CAAAAGATCCATTCTATGATTCGGAGGAGTACCGTGGAGATGGAGGTGATGGAACTGGAT
ACTGGGTCTATGAAACTCAAGAAGACATAGAAGAGAAGGCAAGAGCAGAGCTATGGCGTG
AAGAGCTTATCGAAGAAATTGAACAGAAAGTTGGTGGTTTAAGAGAGCTCGAAGAAGCTG
TTAATAAGTAGACAACTAACATGTGAATCATACACAAATTATACATATGTAAAATATTGT
TTTCTGATAATGGTCATAAACCACTCTTCATT

QA 3 634 3 634
DS 

RD RR2ED51JQ 694 0 0
ACAGTACTGTATCCTCTCGTTTCCTCCATTGTCACCACTAATCGAATAAGATATCAATGG
CTGAAGCATTCACAAGTTTCACCTTCACAAACCTTCATATTCCTTCTTCCTCAAGTTATT
CGCCTAAGCAGATTTCAGGGCCAAATCATGGATGCTGGCTCTCTATGAAAAAGAATGAGA
AGAGGCCGGAAAAAAGTCTGATGAGAGGAAGCTTGTGTGTGAGAAAGGCTCTGCCACATG
ATATGCCACTAATGGCTGTGATGGTTCAACAAATAGAGGGGATGCGTGATATCATTACAG
AGAAACACGTGTGGCATCTAAGTGATAAAGCCATCAAGAATGTCTATTTGTTCTATATCA
TGTTCACTTGTTGGGGATGTCTGTACTTCGGTTCCGCAAAAGATCCATTCTATGATTCGG
AGGAGTACCATGGAGATGGAGGTGATGGAACTGGATACTGGGTCTATGAAACTCAAGAAG
ACATAGAAGAGAAGGCAAGAGCAGAGCTATGGCGTGAAGAGCTTATCGAAGAAATTGAAC
AGAAAGTTGGTGGTTTAAGAGAGCTCGAAGAAGCTGTTAATAAGTAGACAACTAACATGT
GAATCATACACAAATTATACATATGTAAAATATTGTTTTCTGATAATGGTTATAAACCAC
TCTTCATTTATATAATACTATATGTTAACTGTAG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2AI01TF 664 0 0
GG
ATTGTCACCACTAATCGAATAAGATATCAATGGCTGAAGCATTCACAAGTTTCACCTTCA
CAAACCTTCATATCCCTTCTTCCTCAAGTTATTCGCCTAAGCAGATTTCAGGGCCAAATC
ATGGATGCTGGCTCTCTATGAAAAAGAATGAGAAGAGGCCGGAAAAGAATCTGATGAGAG
GAAGCTTGTGTGTGAGAAAGGCTCTGCCACATGATATGCCACTAATGGCTGTGATGGTTC
AACAAATAGAGGGGATGCGTGATATCATTACAGAGAAACACGTGTGGCATCTAAGTGATA
AAGCCATCAAGAATGTCTATTTGTTCTATATCATGTTCACTTGTTGGGGATGTCCGTACT
TCGGTTCCGCAAAAGATCCATTCTATGATTCGGAGGAGTACCGTGGAGATGGAGGTGATG
GAACTGGATACTGGGTCTATGAAACTCAAGAAGACATAGAAGAGAAGGCAAGAGCAGAGC
TATGGCGTGAAGAGCTTATCGAAGAAATTGAACAGAAAGTTGGTGGTTTAAGAGAGCTCG
AAGAAGCTGTTAATAAGTAGACAACTAACATGTGAATCATACACAAATTATACATATGTA
AAATATTGTTTTCTGATAATGGTCATAAACCACTCTTCATTTATATAATACTATATGTTA
TC

QA 3 662 3 662
DS 



AS 2 6

CO CL1102Contig1 1261 3 5 U
TCTCACACGTAGTAGATCAACGAGAAACAAAAAAAAGAAAAGAAAAATGGCGAATCAATC
AGCACCTGGAATCGCCATTCTCGGAGCTGGGATCTTCGTCAAGACGCAGTACATTCCTCG
CTTGGCTGAGATCTCCGATCTCCTCATCCTCAAAGCCATTTGGAGCCGTTCCGAGGAATC
TGCGAAAGGAGCCGTGGAGGTAGCACGAAAGCATTTTCCTGGAGTGGAGTGCAAATGGGG
AGATGAAGGATTGAATGAGATCATTCAAGATAGTTCCATACTTGGTGTTGCTGTTGTCAT
TGCTGGCCAAACCCAGGTTGAAATGTCATTAAAGATGCTCAAGGCAGGAAAGCACGTCCT
TCAAGAGAAGCCAGCTGCTGCTTCAATCGGTGAGATTGAAACTGCAATGACAAGCTATAA
GAATATTTCTGCTGATTCCCCATGCCGTCCAATCTGGGCTGTGGCTGAAAATTATCGTTT
TGAACCAGCTTTTGTTGAGTTGAAGAAACTGGTGGAAGAAATTGGGGATATGATGAACGT
CCAACTTATTATTGAGGGATCAATGAACAGTTCGAATCCTTACTTCTCAAGCTCCTGGAG
ACGAAATTTGGACGGTGGTTTCATCTTGGATATGGGTGTGCATTACATTGCAGGGTTAAG
AATGCTTGTTGGATGTGAGGTAACAACAGTCTCAGCCACCCCTTCCCATGTTGATAAGAC
TTTGCCTGCACCAGACAATATAACGTCAAACTTTCAGCTAGAGAACGGATGCTTGGAGTT
TTTGTTATGGTTGTGTCTTCAAGGTCTCCCAAGATATTATGGAGAGTAGTTGGATTGAAG
GGCACAGTTCAACTTGAGCGCGGAGTCCAAGATGGCCGACACGGCTACATGGCCACAGTT
TACGGGGAAGGAGGGACGTCTAGGACAATCTTTTACCCGTTCAGTGGAGTGACTGAAGAG
CTAAAAGCGTTCTTCAGTGACATTTCAGGGACTTCAAAGGAGCAAGAGCCTCGTCTATCA
TACGTGGAAGGTGCTCGAGACGTTGCTGTTCTTGAGGCAATGCTTGAATCCGGTGCAAGA
AACGGAGCTGTTATTCCCGTTAAGAAGTTCTAGCTTTGAAGCTCTGACAAGTATTGTGAA
AACATCAAGAACCACCAAAGAAGCATTGTCTGAATAAAATTTCATGGGGATCCAAACCGA
AACTCTTTTGTAACCAACCCTTTATTATCCCGATCATTATTAAGGTGTGCACTTTTGTTT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BR59TF U 1
AF RR2EU81TF U 557
AF RR2EU81JQ C 585
BS 1 588 RR2BR59TF
BS 589 589 RR2EU81TF
BS 590 656 RR2BR59TF
BS 657 1244 RR2EU81TF
BS 1245 1261 RR2EU81JQ

RD RR2BR59TF 660 0 0
TCTCACACGTAGTAGATCAACGAGAAACAAAAAAAAGAAAAGAAAAATGGCGAATCAATC
AGCACCTGGAATCGCCATTCTCGGAGCTGGGATCTTCGTCAAGACGCAGTACATTCCTCG
CTTGGCTGAGATCTCCGATCTCCTCATCCTCAAAGCCATTTGGAGCCGTTCCGAGGAATC
TGCGAAAGGAGCCGTGGAGGTAGCACGAAAGCATTTTCCTGGAGTGGAGTGCAAATGGGG
AGATGAAGGATTGAATGAGATCATTCAAGATAGTTCCATACTTGGTGTTGCTGTTGTCAT
TGCTGGCCAAACCCAGGTTGAAATGTCATTAAAGATGCTCAAGGCAGGAAAGCACGTCCT
TCAAGAGAAGCCAGCTGCTGCTTCAATCGGTGAGATTGAAACTGCAATGACAAGCTATAA
GAATATTTCTGCTGATTCCCCATGCCGTCCAATCTGGGCTGTGGCTGAAAATTATCGTTT
TGAACCAGCTTTTGTTGAGTTGAAGAAACTGGTGGAAGAAATTGGGGATATGATGAACGT
CCAACTTATTATTGAGGGATCAATGAACAGTTCGAATCCTTACTTCTCTAGCTCCTGGAG
ACGAAATTTGGACGGTGGTTTCATCTTGGATATGGGTGTGCATTACATTGCAGGGT
AAGA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2EU81TF 704 0 0
GGATCAATGAACAGTTCGAATCCTTACTTCTCAAGCTCCTGGAGACGAAATTTGGACGGT
GGTTTCATCTTGGATATGGGTGTGCATTACATTGCAGGGTTAAGAATGCTTGTTGGATGT
GAGGTAACAACAGTCTCAGCCACCCCTTCCCATGTTGATAAGACTTTGCCTGCACCAGAC
AATATAACGTCAAACTTTCAGCTAGAGAACGGATGCTTGGAGTTTTTGTTATGGTTGTGT
CTTCAAGGTCTCCCAAGATATTATGGAGAGTAGTTGGATTGAAGGGCACAGTTCAACTTG
AGCGCGGAGTCCAAGATGGCCGACACGGCTACATGGCCACAGTTTACGGGGAAGGAGGGA
CGTCTAGGACAATCTTTTACCCGTTCAGTGGAGTGACTGAAGAGCTAAAAGCGTTCTTCA
GTGACATTTCAGGGACTTCAAAGGAGCAAGAGCCTCGTCTATCATACGTGGAAGGTGCTC
GAGACGTTGCTGTTCTTGAGGCAATGCTTGAATCCGGTGCAAGAAACGGAGCTGTTATTC
CCGTTAAGAAGTTCTAGCTTTGAAGCTCTGACAAGTATTGTGAAAACATCAAGAACCACC
AAAGAAGCATTGTCTGAATAAAATTTCATGGGGATCCAAACCGAAACTCTTTTGTAACCA
ACCCTTTATTATCCCGATCATTATTAAG
TGTGCACTTTTGTTTT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2EU81JQ 677 0 0
TCTCAAGCTCCTGGAGACGAAATTTGGACGGTGGTTTCATCTTGGATATGGGTGTGCATT
ACATTGCAGGGTTAAGAATGCTTGTTGGATGTGAGGTAACAACAGTCTCAGCCACCCCTT
CCCATGTTGATAAGACTTTGCCTGCACCAGACAATATAACGTCAAACTTTCAGCTAGAGA
ACGGATGCTTGGAGTTTTTGTTATGGTTGTGTCTTCAAGGTCTCCCAAGATATTATGGAG
AGTAGTTGGATTGAAGGGCACAGTTCAACTTGAGCGCGGAGTCCAAGATGGCCGACACGG
CTACATGGCCACAGTTTACGGGGAAGGAGGGACGTCTAGGACAATCTTTTACCCGTTCAG
TGGAGTGACTGAAGAGCTAAAAGCGTTCTTCAGTGACATTTCAGGGACTTCAAAGGAGCA
AGAGCCTCGTCTATCATACGTGGAAGGTGCTCGAGACGTTGCTGTTCTTGAGGCAATGCT
TGAATCCGGTGCAAGAAACGGAGCTGTTATTCCCGTTAAGAAGTTCTAGCTTTGAAGCTC
TGACAAGTATTGTGAAAACATCAAGAACCACCAAAGAAGCATTGTCTGAATAAAATTTCA
TGGGGATCCAAACCGAAACTCTTTTGTAACCAACCCTTTATTATCCCGATCATTATTAAG
GTGTGCACTTTTGTTTT

QA 1 677 1 677
DS 



CO CL1102Contig2 1021 3 4 U
GAATTCCCATGAATATTTATTTCACAATGCATCGTGTAGTTATTTAATGAGCTTTAGGAC
ATAAAACTAAAGTACATACCTTAACAATGATCGGGATAACAAAGGGTTGGTTACAAAAGA
GTTTCGGTTTGAATCCCCATGAAATTTTATTCAGACAATGCTTTGGTGGTTCTTGATGTC
TTCACAATACTTGTCAGAGCTTCAAAGCTAGAACTTCTTAACGGGAATAACAGCTCCGTT
TCTTGCACCGGATTCAAGCATTGCCTCAAGAACAGCAACGTCCCGAGCACCTTCCACGTA
TGATAGACGAGGCTCTTGCTCCTTTGAAGTCCCTGAAATGTCGCTGAAGAACGCTTTTAG
CTCTTCAGTCACTCCACTGAACGGGTAAAAGATGGTCCTTGACGTCCCTCCTTCCCCGTA
AACTGTGGCCATGTAGCCGTGTCGGCCATCTTGGACTCCACGCTCAAGTTGAACTGTGCC
CTTTAATCCAACTACTCTCCATAATATCTTTGGAGACCTTGAAGACACAACCATAACAAA
AACTCCAGAGCATCCGTTCTCTAGCTGAAAGTTTGATGTTATATTGTCTGGTGCAGGCAA
AGTCTTATCAACATGGGAAGTGGTGGCTGAGACTGTTGTTAACTCACATCCAACAAGCAT
TCTTAACCCTGCAATGTAATGCCTTGAGCATTTTCAGTGACATTTCAACCTGGGTTTGGC
CAGCAATGACAACAGTAACACCAAGAATGGAACTATCTTGAATGATCTCATTAAGACCTT
CATCTCCCCATTTGCACTCCACTCCGGGAAAATGCTTCCGTGCTACCTCAACGGCTCCTT
TCGCAGATTCCTCAGTTCGGCTCCAAATGGCTTTGAGGTTGAGGAGATCGGAGATCTCAG
CCAAGCGAGGAATGTACTGCGTCTTGACGAAGATCCCAGCTCCGAGAATGGCGATTCCAG
GTGCTGATTCATTCGCCATTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTCTCGTTGATCTACTAAGTGTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2E522JQ U 38
AF RR2FN76JQ U 1
AF RR2FN76TF C 336
BS 1 203 RR2FN76JQ
BS 204 204 RR2E522JQ
BS 205 801 RR2FN76JQ
BS 802 1021 RR2FN76TF

RD RR2E522JQ 658 0 0
C
GTTATTTAATGAGCTTTAGGACATAAAACTAAAGTACATACCTTAACAATGATCGGGATA
ACAAAGGGTTGGTTACAAAAGAGTTTCGGTTTGAATCCCCATGAAATTTTATTCAGACAA
TGCTTTGGTGGTTCTTGATGTCTTCACAATACTTGTCAGAGCTTCAAAGCTAGAACTTCT
TAACGGGAATAACAGCTCCGTTTCTTGCACCGGATTCAAGCATTGCCTCAAGAACAGCAA
CGTCCCGAGCACCTTCCACGTATGATAGACGAGGCTCTTGCTCCTTTGAAGTCCCTGAAA
TGTCGCTGAAGAACGCTTTTAGCTCTTCAGTCACTCCACTGAACGGGTAAAAGATGGTCC
TCGACGTCCCTCCTTCCCCGTAAACTGTGGCCATGTAGCCGTGTCGGCCATCTTGGACTC
CACGCTCAAGTTGAACTGTGCCCTTTAATCCAACTACTCTCCATAATATCTTTGGAGACC
TTGAAGACACAACCATAACAAAAACTCCAGAGCATCCGTTCTCTAGCTGAAAGTTTGATG
TTATATTGTCTGGTGCAGGTAAAGTCTTATCAACATGGGAAGTGGTGGCTGAGACTGATG
CTACCTCACATCCAACTAGCATTCTTAACCCTGCAATGTAATGC
ACACCCATATCCA

QA 2 645 2 645
DS 

RD RR2FN76JQ 801 0 0
GAATTCCCATGAATATTTATTTCACAATGCATCGTGTAGTTATTTAATGAGCTTTAGGAC
ATAAAACTAAAGTACATACCTTAACAATGATCGGGATAACAAAGGGTTGGTTACAAAAGA
GTTTCGGTTTGAATCCCCATGAAATTTTATTCAGACAATGCTTTGGTGGTTCTTGATGTC
TTCACAATACTTGTCAGAGCTTCGAAGCTAGAACTTCTTAACGGGAATAACAGCTCCGTT
TCTTGCACCGGATTCAAGCATTGCCTCAAGAACAGCAACGTCCCGAGCACCTTCCACGTA
TGATAGACGAGGCTCTTGCTCCTTTGAAGTCCCTGAAATGTCGCTGAAGAACGCTTTTAG
CTCTTCAGTCACTCCACTGAACGGGTAAAAGATGGTCCTTGACGTCCCTCCTTCCCCGTA
AACTGTGGCCATGTAGCCGTGTCGGCCATCTTGGACTCCACGCTCAAGTTGAACTGTGCC
CTTTAATCCAACTACTCTCCATAATATCTTTGGAGACCTTGAAGACACAACCATAACAAA
AACTCCAGAGCATCCGTTCTCTAGCTGAAAGTTTGATGTTATATTGTCTGGTGCAGGCAA
AGTCTTATCAACATGGGAAGTGGTGGCTGAGACTGTTGTTAACTCACATCCAACAAGCAT
TCTTAACCCTGCAATGTAATGCCTTGAGCATTTTCAGTGACATTTCAACCTGGGTTTGGC
CAGCAATGACAACAGTAACACCAAGAATGGAACTATCTTGAATGATCTCATTAAGACCTT
CATCTCCCCATTTGCACTCCA

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2FN76TF 686 0 0
AAATGTCGCTGAAGAACGCTTTTAGCTCTTCAGTCACTCCACTGAACGGGTAAAAGATGG
TCCTTGACGTCCCTCCTTCCCCGTAAACTGTGGCCATGTAGCCGTGTCGGCCATCTTGGA
CTCCACGCTCAAGTTGAACTGTGCCCTTTAATCCAACTACTCTCCATAATATCTTTGGAG
ACCTTGAAGACACAACCATAACAAAAACTCCAGAGCATCCGTTCTCTAGCTGAAAGTTTG
ATGTTATATTGTCTGGTGCAGGCAAAGTCTTATCAACATGGGAAGTGGTGGCTGAGACTG
TTGTTAACTCACATCCAACAAGCATTCTTAACCCTGCAATGTAATGCCTTGAGCATTTTC
AGTGACATTTCAACCTGGGTTTGGCCAGCAATGACAACAGTAACACCAAGAATGGAACTA
TCTTGAATGATCTCATTAAGACCTTCATCTCCCCATTTGCACTCCACTCCGGGAAAATGC
TTCCGTGCTACCTCAACGGCTCCTTTCGCAGATTCCTCAGTTCGGCTCCAAATGGCTTTG
AGGTTGAGGAGATCGGAGATCTCAGCCAAGCGAGGAATGTACTGCGTCTTGACGAAGATC
CCAGCTCCGAGAATGGCGATTCCAGGTGCTGATTCATTCGCCATTTTTCTTTTCTTTTTT
TTTTCTCGTTGATCTACTAAGTGTCC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 6

CO CL1103Contig1 1202 6 15 U
GGATTGCGATTCACTCTTCCCCCCATCATCTTTCAGTCAGGAGATATCTGACGGATTTGA
ACGGCCACGATGGAACCGCTTGGTGGTAACAAAGGACAAGGATTCAACGATGTTGGTTTT
GAAGGTGTGAAGAAAATAACTGTGGGAGCCGATGATGTAAACATAACTTATATCAAGATC
GAATACGTAAAGAACGGAAAAGTCGAGACCCGTGAGCATGGAGCGGCTCGTGGCGAACTA
AAAGAGTTTTCAGTGGATTATCCGAAAGATAGTATCACTGCCGTTGGTGGAACCTACAAG
CATATTTTCTCTTATGATACAACGCTTATCACATCGCTGTACTTCACAACCTCTAAAGGA
TTTACCTCTCCTTTATTCGGTGAGATGAAGGGAACCGAATTCGAGTTCAAAGGTGAAAGT
GGAGAAAAGCTTATTGGATTCCATGGACGTAGCAGTAATGCTATCGATGCCATCGGAGCT
TATTTCGGCTCTAACTCCGGAGTTGATGGCTCAAACAGTGGAAGCGGATCTAGTACTCAA
AAACTTGACGCTCAAGGTGGCAACGGAGGCAATGAATGGGATGATGGAGGTGATCACGAC
GGTGTGACAAAGATACATATCGCAGTTGGTAGAGGTATTGAGCAAATCAGGTTTGATTAT
CTCAAGAACGGACAGACAAAGGAAGGACCCGCCCATGGTGTGAAGGGTGGCAGATCTTCC
ATTAGAACGTTTGAGATAAGTCATCCCAACGAGTATTTACTTTCTGCGAAGGGTTGGTCT
GATTCATCCAACAAGATTGTGGGAATTAAATTCATAACCAACACAAAGACTTCAGAATGT
TATGGATTTGAAAAAGTTCCTGGGAGAAGAGGGTACAGATATTTCACTTGAAGTGAAAGA
CAAGAAGATCGTCGGTTTTCATGGCCTCGCTGACTCGCAACTCAATTTTCTGGGAGCTTA
TTTCGCTTCAATCACCAGCTGAAATCATTGTTATATCCGTTTTTGATTTCCCTATGAATA
AGGTTACATCAGAGCCATACTTGTGTGGATTTCCGTATGGACTCTAATAATAATACGTTT
TATGTTGTTTCTCAAAAAAAAAAAGACTATGTTTCATGTTTTCTTTGTTTGAGTGTGATG
TTTGTGTTTGAGTTCGATGTTTGTGTTGTCACTTGTGGATTTTCATAAAGGATGTCTATG
TT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2CL07TF U 1
AF RR2C574TF U 4
AF RR2CC36TF U 4
AF RR2C835TF U 2
AF RR2AH72TF U 143
AF RR2C574JQ C 442
BS 1 35 RR2CL07TF
BS 36 36 RR2C574TF
BS 37 65 RR2CL07TF
BS 66 66 RR2C574TF
BS 67 502 RR2CL07TF
BS 503 503 RR2C574TF
BS 504 508 RR2CL07TF
BS 509 509 RR2C574TF
BS 510 563 RR2CL07TF
BS 564 564 RR2C574TF
BS 565 647 RR2CL07TF
BS 648 872 RR2AH72TF
BS 873 873 RR2C574JQ
BS 874 909 RR2AH72TF
BS 910 1202 RR2C574JQ

RD RR2CL07TF 652 0 0
GGATTGCGATTCACTCTTCCCCCCATCATCTTTCA*TCAGGAGATATCTGACGGATTTGA
ACGGCTACGATGGAACCGCTTGGTGGTAACAAAGGACAAGGATTCAACGATGTTGGTTTT
GAAGGTGTGAAGAAAATAACTGTGGGAGCCGATGATGTAAACATAACTTATATCAAGATC
GAATACGTAAAGAACGGAAAAGTCGAGACCCGTGAGCATGGAGCGGCTCGTGGCGAACTA
AAAGAGTTTTCAGTGGATTATCCGAAAGATAGTATCACTGCCGTTGGTGGAACCTACAAG
CATATTTTCTCTTATGATACAACGCTTATCACATCGCTGTACTTCACAACCTCTAAAGGA
TTTACCTCTCCTTTATTCGGTGAGATGAAGGGAACCGAATTCGAGTTCAAAGGTGAAAGT
GGAGAAAAGCTTATTGGATTCCATGGACGTAGCAGTAATGCTATCGATGCCATCGGAGCT
TATTTCGGCTCTAACTCCGGAGGTGATGACTCAAACAGTGGAAGCGGATCTAGTACTCAA
AAACTTGACGCTCAAGGTGGCAAGGGAGGCAATGAATGGGATGATGGAGGTGATCACGAC
GGTGTGACAAAGATACATATCGCAGTTGGTAGAGGTATTGAGCAAAT
TACGT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2C574TF 644 0 0
GG
GCGATTCATTCTTCCCCCCATCATCTTTCAGTCAGGAGATATCTGACGGATTTGAACGGC
CACGATGGAACCGCTTGGTGGTAACAAAGGACAAGGATTCAACGATGTTGGTTTTGAAGG
TGTGAAGAAAATAACTGTGGGAGCCGATGATGTAAACATAACTTATATCAAGATCGAATA
CGTAAAGAACGGAAAAGTCGAGATCCGTGAGCATGGAGCGGCTCGTGGCGAACTAAAAGA
GTTTTCAGTGGATTATCCGAAAGATAGTATCACTGCCGTTGGTGGAACCTACAAGCATAT
TTACTCTTATGATACAACGCTTATCACATCGCTGTACTTCACAACCTCTAAAGGATTTAC
CTCTCCTTTATTCGGTGAGATGAAGGGAACCGAATTCGAGTTCAAAGGTGAAAGTGGAGA
AAAGCTTATTGGATTCCATGGACGTAGCAGTAATGCTATCGATGCCATCGGAGCTTATTT
CGGCTCTAACTCCGGAGTTGATGGCTCAAACAGTGGAAGCGGATCTAGTACTCAAAAACT
TGACGCTCAAGGTGGCAACGGAGGCAATGAATGGGATGATGGAGGTGATCACGACGGTGT
GACAAAGATACATATCGCAGTTGGTAGAGGTATTGAGCAAAT

QA 3 644 3 644
DS 

RD RR2CC36TF 644 0 0
GG
GCGATTCACTCTTCCCCCCATCATCTTTCAGTCAGGAGATATCTGACGGATTTGAACGGC
TACGATGGAACCGCTTGGTGGTAACAAAGGACAAGGATTCAACGATGTTGGTTTTGAAGG
TGTGAAGAAAATAACTGTGGGAGCCGATGATGTAAACATAACTTATATCAAGATCGAATA
CGTAAAGAACGGAAAAGTCGAGACCCGTGAGCATGGAGCGGCTCGTGGCGAACTAAAAGA
GTTTTCAGTGGATTATCCGAAAGATAGTATCACTGCCGTTGGTGGAACCTACAAGCATAT
TTTCTCTTATGATACAACGCTTATCACATCGCTGTACTTCACAACCTCTAAAGGATTTAC
CTCTCCTTTATTCGGTGAGATGAAGGGAACCGAATTCGAGTTCAAAGGTGAAAGTGGAGA
AAAGCTTATTGGATTCCATGGACGTAGCAGTAATGCTATCGATGCCATCGGAGCTTATTT
CGGCTCTAACTCCGGAGGTGATGACTCAAACAGTGGAAGCGGATCTAGTACTCAAAAACT
TGACGCTCAAGGTGGCAAGGGAGGCAATGAATGGGATGATGGAGGTGATCACGACGGTGT
GACAAAGATACATATCGCAGTTGGTAGAGGTATTGAGCAAAT

QA 3 644 3 644
DS 

RD RR2C835TF 645 0 0
GATT
GCGATTCACTCTTCCCCCCATCATCTTTCAGTCAGGAGATATCTGACGGATTTGAACGGC
CACGATGGAACCGCTTGGTGGTAACAAAGGACAAGGATTCAACGATGTTGGTTTTGAAGG
TGTGAAGAAAATAACTGTGGGAGCCGATGATGTAAACATAACTTATATCAAGATCGAATA
CGTAAAGAACGGAAAAGTCGAGACCCGTGAGCATGGAGCGGCTCGTGGCGAACTAAAAGA
GTTTTCAGTGGATTATCCGAAAGATAGTATCACTGCCGTTGGTGGAACCTACAAGCATAT
TTTCTCTTATGATACAACGCTTATCACATCGCTGTACTTCACAACCTCTAAAGGATTTAC
CTCTCCTTTATTCGGTGAGATGAAGGGAACCGAATTCGAGTTCAAAGGTGAAAGTGGAGA
AAAGCTTATTGGATTCCATGGACGTAGCAGTAATGCTATCGATGCCATCGGAGCTTATTT
CGGCTCTAACTCCGGAGGTGATGACTCAAACAGTGGAAGCGGATCTAGTACTCAAAAACT
TGACGCTCAAGGTGGCAAGGGAGGCAATGAATGGGATGATGGAGGTGATCACGACGGTGT
GACAAAGATACATATCGCAGTTGGTAGAGGTATTGAGCAAA

QA 5 645 5 645
DS 

RD RR2AH72TF 768 0 0
G
GGGAGCCGATGATGTAAACATAACTTATATCAAGATCGAATACGTAAAGAACGGAAAAGT
CGAGATCCGTGAGCATGGAGCGGCTCGTGGCGAACTAAAAGAGTTTTCAGTGGATTATCC
GAAAGATAGTATCACTGCCGTTGGTGTAACCTACAAGCATATTTACTCTTATGATACAAC
GCTTATCACATCGCTGTACTTCACAACCTCTAAAGGATTTACCTCTCCTTTATTCGGTGA
GATGAAGGGAACCGAATTCGAGTTCAAAGGTGAAAGTGGAGAAAAGCTTATTGGATTCCA
TGGACGTAGCAGTAATGCTATCGATGCCATCGGAGCTTATTTCGGCTCTAACTCCGGAGT
TGATGGCTCAAACAGTGGAAGCGGATCTAGTACTCAAAAACTCGACGCTCAAGGTGGCAA
CGGAGGCAATGAATGGGATGATGGAGGTGATCACGACGGTGTGACAAAGATACATATCGC
AGTTGGTAGAGGTATTGAGCAAATCAGGTTTGATTATCTCAAGAACGGACAGACAAAGGA
AGGACCCGCCCATGGTGTGAAGGGTGGCAGATCTTCCATTAGAACGTTTGAGATAAGTCA
TCCCAACGAGTATTTACTTTCTGCGAAGGGTTGGTCTGATTCATCCAACAAGATTGTGGG
AATTAAATTCATAACCAACACAAAGACTTCAGAATGTTATGGATTTGAAAAAGTTCCTGG
GAGAAGAGG*TACAGATATTTCACTTGAAGTGAAAGACAAGAAGAT
C

QA 2 767 2 767
DS 

RD RR2C574JQ 761 0 0
CATGGACGTAGCAGTAATGCTATCGATGCCATCGGAGCTTATTTCGGCTCTAACTCCGGA
GTTGATGGCTCAAACAGTGGAAGCGGATCTAGTACTCAAAAACTTGACGCTCAAGGTGGC
AACGGAGGCAATGAATGGGATGATGGAGGTGATCACGACGGTGTGACAAAGATACATATC
GCAGTTGGTAGAGGTATTGAGCAAATCAGGTTTGATTATCTCAAGAACGGACAGACAAAG
GAAGGACCCGCCCATGGTGTGAAGGGTGGCAGATTTTCCATTAGAACGTTTGAGATAAGT
CATCCCAACGAGTATTTACTTTTTGCGAAGGGTTGGTTTGATTCATCCAACAAGATTGTG
GGAATTAAATTCATAACCAACACAAAGACTTCAGAATGTTATGGATTTGAAAAAGTTCCT
GG*AGAAGAGGGTACAGATATTTCACTTGAAGTGAAAGACAAGAAGATCGTCGGTTTTCA
TGGCCTCGCTGACTCGCAACTCAATTTTCTGGGAGCTTATTTCGCTTCAATCACCAGCTG
AAATCATTGTTATATCCGTTTTTGATTTCCCTATGAATAAGGTTACATCAGAGCCATACT
TGTGTGGATTTCCGTATGGACTCTAATAATAATACGTTTTATGTTGTTTCTCAAAAAAAA
AAAGACTATGTTTCATGTTTTCTTTGTTTGAGTGTGATGTTTGTGTTTGAGTTCGATGTT
TGTGTTGTCACTTGTGGATTTTCATAAAGGATGTCTATGTT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 5

CO CL1104Contig1 875 5 32 U
GGAACACATTTCTAGGAGACAGATAAAGATAAAAC*AAGTAATGGCGGAGAAAGAAGAAG
TGAAGCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTT*CAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAA
CTCAAAGGCATACCGTACGCTTACGTTGAAGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTT
CTTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATT
CTCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTC
CCTGAAGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAG
ATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTG
GCGGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTC
TTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGT
TTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATTGGATTGAAAGTGATTACGGAGGAGAAGTTCCCAGAG
TATAGCAGATGGGTGAAGAACATGGAGAAAGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCA
AGAGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGACG
AAAGTCATATTTGGTTCTGTGTTTTAATGTTTTTATTGTTACTGTCATGTTTGAACTTTG
AACCTTGTTATCTGTTAT*GTTTTTCAAAAAGCTTATCTTTTTTCTTCTAATAAACAAAT
TCATCTTATAAAAGTACGAGTGATTTAAGTTGTGT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB91TF U 5
AF RR2D638TF U 1
AF RR2A184TF U 1
AF RR2BD81JQ C 4
AF RR2HB91JQ C 263
BS 1 20 RR2A184TF
BS 21 21 RR2HB91TF
BS 22 27 RR2A184TF
BS 28 28 RR2HB91TF
BS 29 34 RR2A184TF
BS 35 36 RR2HB91TF
BS 37 139 RR2A184TF
BS 140 140 RR2HB91TF
BS 141 219 RR2A184TF
BS 220 220 RR2D638TF
BS 221 275 RR2A184TF
BS 276 276 RR2HB91TF
BS 277 443 RR2A184TF
BS 444 445 RR2HB91TF
BS 446 528 RR2A184TF
BS 529 529 RR2HB91TF
BS 530 717 RR2A184TF
BS 718 718 RR2BD81JQ
BS 719 740 RR2A184TF
BS 741 741 RR2BD81JQ
BS 742 744 RR2A184TF
BS 745 745 RR2BD81JQ
BS 746 754 RR2A184TF
BS 755 757 RR2BD81JQ
BS 758 796 RR2A184TF
BS 797 797 RR2BD81JQ
BS 798 798 RR2A184TF
BS 799 799 RR2BD81JQ
BS 800 803 RR2A184TF
BS 804 804 RR2BD81JQ
BS 805 809 RR2A184TF
BS 810 875 RR2BD81JQ

RD RR2HB91TF 630 0 0
G
ACATTTCTAGGAGACAGATAAAGATAAAAC*AAGTAATGGCGGAGAAAGAAGAAGTGAAG
CTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTA*CAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAACTCAA
AGGCATACCGTACGCTTACGTTGAAGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTTCTTAC
ACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATTCTCGA
GTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTCCCTGA
AGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAGATTAT
CACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTGGCGGA
GCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTCTTCGG
CGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGTTTGGA
GAGAGGTTGGGAAGGAATTGGATTGAAAGTGATTACGGAGGAGAAGTTCCCAGAGTATAG
CAGATGGGTGAAGA*CATGGAGAAAGTTG

QA 2 630 2 630
DS 

RD RR2D638TF 748 0 0
GGAAC
ACATTTCTAGGAGACGGATAAAAATAAAATTAAGTAATGGCGGAGAAAGAAGAAGTGAAG
CTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTT*CAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAACTCAA
AGGCATACCGTACGATTACGTTGAAGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTTCTTGC
ACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATTCTCGA
GTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGACACTTGGAAACAGAATCCAATTCTCCCTGA
AGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAGATTAT
CACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTGGCGGA
GCAGACAAGAGAACTGATGGTGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGTAAAGATTTCTTCGG
CGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGGTTCCGTTTTGTTTGGA
GAGAGGTTGGGAAGGAATTGGATTGAAAGTGATTACGGAGGAGAAGTTCCCAGAGTATAG
CAGATGGGTGAAGAACATGGAGAAAGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCAAGAGA
GAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAA*GAATCAGATCCGCTTAGTCGAAAGT
CATATTTGGTTCTGT
ATTTCATG

QA 6 740 6 740
DS 

RD RR2A184TF 824 0 0
GGAACACATTTCTAGGAGACGGATAAAAATAAAATTAAGTAATGGCGGAGAAAGAAGAAG
TGAAGCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTT*CAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAA
CTCAAAGGCATACCGTACGATTACGTTGAAGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTT
CTTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTATCCACAATGGCAAAACCATT
CTCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGACACTTGGAAACAGAATCCAATTCTC
CCTGAAGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAG
ATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTG
GCGGAGCAGACAAGAGAACTGATGGTGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTC
TTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGGTTCCGTTTTGT
TTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATTGGATTGAAAGTGATTACGGAGGAGAAGTTCCCAGAG
TATAGCAGATGGGTGAAGAACATGGAGAAAGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCA
AGAGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGTCG
AAAGTCATATTTGGTTCTGTATTTCAATGTTTTTTAAGTTACTGTCATGTTTGAACTTTG
AACCTTGTTATCTGTTGTTGTTTCTCAAA
GCTTATCTTTTTCTC

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2BD81JQ 872 0 0
GG
ACATTTCTAGGAGACAGATAAAGATAAAAC*AAGTAATGGCGGAGAAAGAAGAAGTGAAG
CTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTACAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAACTCAA
AGGCATACCGTACGCTTACGTTGAAGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTTCTTGC
ACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATTCTCGA
GTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTCCCTGA
AGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAGATTAT
CACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTGGCGGA
GCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTCTTCGG
CGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGTTTGGA
GAGAGGTTGGGAAGGAATTGGATTGAAAGTGATTACGGAGGAGAAGTTCCCAGAGTATAG
CAGATGGGTGAAGAACATGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCAAGAGA
GAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGACGAAAGT
CATATTTGGTTCTGTGTTTTAATGTTTTTATTGTTACTGTCATGTTTGAACTTTGAACCT
TGTTATCTGTTAT*GTTTTTCAAAAAGCTTATCTTTTTTCTTCTAATAAACAAATTCATC
TTATAAAAGTACGAGTGATTTAAGTTGTGT

QA 3 872 3 872
DS 

RD RR2HB91JQ 585 0 0
AATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTCCCTGAAGATCCTTACGAGAGAT
CCAAGGCTCGATTTTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAGATTATCACTGCGGGTTTTGTAT
CAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTGGCGGAGCAGACAAGAGAACTGA
TTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTTTTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGT
TCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGTTTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAA
TTGGATTGAAAGTGATTACGGAGGAGAAGTTCCCAGAGTATAGCAGATGGGTGAAGAACA
TGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCAAGAGAGAAACATGTTGAACACA
TGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGACGAAAGTCATATTTGGTTTTGTGT
TTTAATGTTTTTATTGTTACTGTCATGTTTGAACTTTGAACCTTGTTATCTGTTAT*GTT
TTTCAAAAAGCTTATCTTTTTTCTTTTAATAAACAAATTCATCTT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 7

CO CL1105Contig1 779 7 22 U
GGCTAACGGAAAAGTTCCGAGTATTAAAGCCAATTTTGATCGCGTCGTCTCCTTCGCTAG
CTCAAGGCGGAAACACACAAAGAAACCCTAGATCCCCGTCGTCCTTTTGTTCGAAATCAT
GTCGAGGAGAAAGACAAGAGAGCCAAAGGAAGAGACAGTGACACTTGGTCCAGCTGTTCG
TGACGGAGAGCAAGTCTTTGGTGTTGTCCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACACTTTCAT
CCATGTCACTGATCTGTCTGGAAGAGAAACACTTGTTCGTATCACTGGTGGGATGAAGGT
GAAAGCCGACAGAGATGAGTCCTCACCTTATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTCGC
TCAGCGTTGCAAGGAACTTGGAATCACAGCCATGCATGTGAAGCTTCGTGCCACAGGTGG
TAACAAGACAAAGACCCCTGGTCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGCCCGTTC
TGGCATGAAAATTGGTCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCAACCGACAGTACCCGCAG
AAAGGGTGGAAGAAGGGGAAGGAGGCTCTGAGTTCTTTCTGGCCTCAGCCGGTGGATCAC
TCTATATGGGTGGGGCTCATCTTTATATTTAGCACTCTCTATGTGTTGTTTTGTTTAGTA
GATTGAAAGAGAGATCTTGGTTATTATATGCGTTGTTGTTTTCTCAAATCTTTACACATT
TATGTTCCTGTTACATGACCATCAAATATTCAAAAGATTTGGTTGAAGTATTTCTCGCA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2AF54TF U 183
AF RR2E644TF U 75
AF RR2A977JQ C 1
AF RR2DV03TF U 55
AF RR2A977TF U 1
AF RR2BP87TF U 57
AF RR2BP87JQ C 463
BS 1 58 RR2A977TF
BS 59 74 RR2DV03TF
BS 75 182 RR2E644TF
BS 183 187 RR2AF54TF
BS 188 188 RR2E644TF
BS 189 276 RR2AF54TF
BS 277 277 RR2E644TF
BS 278 363 RR2AF54TF
BS 364 364 RR2E644TF
BS 365 427 RR2AF54TF
BS 428 536 RR2E644TF
BS 537 537 RR2DV03TF
BS 538 545 RR2E644TF
BS 546 546 RR2DV03TF
BS 547 571 RR2E644TF
BS 572 572 RR2DV03TF
BS 573 587 RR2E644TF
BS 588 588 RR2DV03TF
BS 589 614 RR2E644TF
BS 615 754 RR2DV03TF
BS 755 755 RR2A977JQ
BS 756 779 RR2BP87TF

RD RR2AF54TF 245 0 0
ACGGAAAGCAAGTCTTTGGTGTTGTCCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACACTTTCATCC
ATGTCACTGATCTGTCTGGAAGAGAAACACTTGTCCGTATCACTGGTGGGATGAAGGTGA
AAGCCGACAGAGATGAGTCCTCACCTTATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTCGCTC
AACGTTGCAAGGAACTTGGAATCACAGCCATGCATGTGAAGCTTCGTGCCACAGGTGGTA
ACAAG

QA 1 245 1 245
DS 

RD RR2E644TF 548 0 0
ACACAAAGAAACCCTAGATCCCCGTCGTCCTTTTGTTCGAAATCATGTCGAGGAGAAAGA
CAAGAGAGCCAAAGGAAGAGACAGTGACACTTGGTCCAGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAG
TCTTTGGTGTTGTCCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACACTTTCATCCATGTCACTGATC
TGTCTGGAAGAGAAACACTTGTTCGTATCACTGGTGGGATGAAGGTGAAAGCCGGCAGAG
ATGAGTCCTCACCTTATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTCGCTCAGCGTTGCAAGG
AACTTGGAATCACAGCCATGCATGTGAAGCTTCGTGCCACAGGTGGTAACAAGACAAAGA
CCCCTGGTCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGCCCGTTCTGGCATGAAAATTG
GTCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCAACCGACAGTACCCACAGAAAGG*TGGAAGAA
GGGGAAGGAGGCTCTGA*TTCTTTCTGGCCTCA*CCGGTGGATCACTCTATATGGGTGGG
CTCATCTT

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2A977JQ 768 0 0
GGCTAACGGAAAAGTTCCGAGTATTAAAGCCAATTTTGATCGCGTCGTCTCCTTCGCTAG
CTCAAGGCGGAAACACACAAAGAAACCCTAGATCCCCGTCGTCCTTTTGTTCGAAATCAT
GTCGAGGAGAAAGACAAGAGAGCCAAAGGAAGAGACAGTGACACTTGGTCCAGCTGTTCG
TGACGGAGAGCAAGTCTTTGGTGTTGTCCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACACTTTCAT
CCATGTCACTGATCTGTCTGGAAGAGAAACACTTGTTCGTATCACTGGTGGGATGAAGGT
GAAAGCCGACAGAGATGAGTCCTCACCTTATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTCGC
TCAGCGTTGCAAGGAACTTGGAATCACAGCCATGCATGTGAAGCTTCGTGCCACAGGTGG
TAACAAGACAAAGACCCCTGGTCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGCCCGTTC
TGGCATGAAAATTGGTCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCAACCGACAGTACCCGCAG
AAAGGGTGGAAGAAGGGGAAGGAGGCTCTGAGTTCTTTCTGGCCTCAGCCGGTGGATCAC
TCTATATGGGTGGGGCTCATCTTTATATTTAGCACTCTCTATGTGTTGTTTTGTTTAGTA
GATTGAAAGAGAGATCTTGGTTATTATATGCGTTGTTGTTTTCTCAAATCTTTACACATT
TATGTTCCTGTTACATGACCATCAAATATTCAAAAGATTTGGTCGA
AG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2DV03TF 710 0 0
GGCT
AGCTCAAGGCGGAAACACACAAAGAAACCCTAGATCCCCGTCGTCCTTTTGTTCGAAATC
ATGTCGAGGAGAAAGACAAGAGAGCCGAAGGAAGAGACAGTGACACTTGGTCCAGCTGTT
CGTGACGGAGAGCAAGTCTTTGGTGTTGTCCACATCCTTGCTTCTTTCAACGACACTTTC
ATCCATGTCACTGATCTGTCTGGAAGAGAAACACTTGTTCGTATCACTGGTGGGATGAAG
GTGAAAGCCGACAGAGATGAGTCCTCACCTTATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTC
GCTCAGCGTTGCAAGGAACTTGGAATCACAGCCATGCGTGTGAAGCTTCGTGCCACAGGT
GGTAACAAGACAAAGACCCCTGGTCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGCCCGT
TCTGGCATGAAAATTGGTCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCAACCGACAGTACCCGC
AGAAAGGGTGGAAGAAGGGGAAGGAGGCTCTGAGTTCTTTCTGGCCTCAGCCGGTGGATC
ACTCTATATGGGTGGGGCTCATCTTTATATTTAGCACTCTCTATGTGTTGTTTTGTTTAG
TAGATTGAAAGAGAGATCTTGGTTATTATATGCGTTGTTGTTTTCTCAAATCTTTACACA
TTTATGTTCCTGTTACATGACCATCAAATATTCAAA
GATTTGGTTG

QA 5 700 5 700
DS 

RD RR2A977TF 766 0 0
GGCTAACGGAAAAGTTCCGAGTATTAAAGCCAATTTTGATCGCGTCGTCTCCTTCGCTAG
CTCAAGGCGGAAACACACAAAGAAACCCTAGATCCCCGTCGTCCTTTTGTTCGAAATCAT
GTCGAGGAGAAAGACAAGAGAGCCAAAGGAAGAGACAGTGACACTTGGTCCAGCTGTTCG
TGACGGAGAGCAAGTCTTTGGTGTTGTCCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACACTTTCAT
CCATGTCACTGATCTGTCTGGAAGAGAAACACTTGTTCGTATCACTGGTGGGATGAAGGT
GAAAGCCGACAGAGATGAGTCCTCACCTTATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTCGC
TCAGCGTTGCAAGGAACTTGGAATCACAGCCATGCATGTGAAGCTTCGTGCCACAGGTGG
TAACAAGACAAAGACCCCTGGTCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGCCCGTTC
TGGCATGAAAATTGGTCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCAACCGACAGTACCCGCAG
AAAGGGTGGAAGAAGGGGAAGGAGGCTCTGAGTTCTTTCTGGCCTCAGCCGGTGGATCAC
TCTATATGGGTGGGGCTCATCTTTATATTTAGCACTCTCTATGTGTTGTTTTGTTTAGTA
GATTGAAAGAGAGATCTTGGTTATTATATGCGTTGTTGTTTTCTCAAATCTTTACACATT
TATGTTCCTGTTACATGACCATCAAATATTCAAA
AGATTTGGTCGA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2BP87TF 723 0 0
GG
AGCTCAAGGCGGAAACACACAAAGAAACCCTAGATCCCCGTCGTCCTTTTGTTCGAAATC
ATGTCGAGGAGAAAGACAAGAGAGCCAAAGGAAGAGACAGTGACACTTGGTCCAGCTGTT
CGTGACGGAGAGCAAGTCTTTGGTGTTGTCCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACACTTTC
ATCCATGTCACTGATCTGTCTGGAAGAGAAACACTTGTTCGTATCACTGGTGGGATGAAG
GTGAAGGCCGACAGAGATGAGTCCTCACCTTATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTC
GCTCAGCGTTGCAAGGAACTTGGAATCACAGCCATGCATGTGAAGCTTCGTGCCACAGGT
GGTAACAAGACCAAGACCCCTGGTCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTAAGAGCCCTTGCCCGT
TCTGGCATGAAAATTGGTCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCAACCGACAGTACCCGC
AGAAAGGGTGGAAGAAGGGGAAGGAGGCTCTGAGTTCTTTCTGGCCTCAGCCGGTGGATC
ACTCTATATGGGTGGGGCTCATCTTTATATTTAGCACTCTCTATGTGTTGTTTTGTTTAG
TAGATTGAAAGAGAGATCTTGGTTATTATATGCGTTGTTGTTTTCTCAAATCTTTATACA
TTTATGTTCCTGTTACATGACCATCAAATATTCAAA*GATTTGGTTGAAGTATTTCTCGC
A

QA 3 723 3 723
DS 

RD RR2BP87JQ 316 0 0
A
AGAGCCCTTGCCCGTTCTGGCATGAAAATTGGTCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCA
ACCGACAGTACCCGCAGAAAGGGTGGAAGAAGGGGAAGGAGGCTTTGAGTTCTTTCTGGC
CTCAGCCGGTGGATCACTCTATATGGGTGGGGCTCATCTTTATATTTAGCACTCTCTATG
TGTTGTTTTGTTTAGTAGATTGAAAGAGAGATCTTGGTTATTATATGCGTTGTTGTTTTC
TCAAATCTTTATACATTTATGTTCCTGTTACATGACCATCAAATATTCAAAAGATTTGGT
TGAAGTATTTCTCGC

QA 2 316 2 316
DS 



AS 1 6

CO CL1106Contig1 526 6 9 U
CGCTTAAAATTTAGAAGTTGATAATTATAATTAACTTTTACAGCTTATTTTGTCATTTAT
TACATATGCAAATGAACATATTTATTGTTATCGTAATTTGAAAATAAAAATTTTGACAAC
TTATTTAATTATTACTATAAATAACATCATAATTTATTATAAATATATCTGAATTCTGTT
GTCAATAAACTAAACATTAAGATTATTTTGGACATGGGGTATAGCAGGCGCATTTGTTTC
CCGGGACACAACCAGTGGTTACTTCCTTTATTCCTGACCCTTGTATCCTCTTGTTGCACG
CAGATTGGCAAGCTGCCTTGTTCTTACAACTTTCAGGCTGTTGGTTATCTAGATATATGG
GACATATATCTTTTTT*ATTTTTATTCCCTTGCCCCATCGCTCCGGCCACTAGTACAAGA
ATGACGAGGAGAGTTAAAACATTGAATGAAAATATAAGTGATTTTTT*CATCCTTGGTAA
TATGAATGAATTGATTATGTTTTTTTATCAGAAAATTTTGTTGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 

AF RR2GI15JQB U 1
AF RR2F230JQ U 27
AF RR2F230TF C 27
AF RR2GI15TF C 1
AF RR2FT63JQ U 27
AF RR2FT63TF C 27
BS 1 45 RR2GI15JQB
BS 46 46 RR2F230JQ
BS 47 298 RR2GI15JQB
BS 299 299 RR2F230JQ
BS 300 316 RR2GI15JQB
BS 317 317 RR2F230JQ
BS 318 487 RR2GI15JQB
BS 488 488 RR2F230JQ
BS 489 526 RR2GI15JQB

RD RR2GI15JQB 526 0 0
CGCTTAAAATTTAGAAGTTGATAATTATAATTAACTTTTACAGCTCATTTTGTCATTTAT
TACATATGCAAATGAACATATTTATTGTTATCGTAATTTGAAAATAAAAATTTTGACAAC
TTATTTAATTATTACTATAAATAACATCATAATTTATTATAAATATATCTGAATTCTGTT
GTCAATAAACTAAACATTAAGATTATTTTGGACATGGGGTATAGCAGGCGCATTTGTTTC
CCGGGACACAACCAGTGGTTACTTCCTTTATTCCTGACCCTTGTATCCTCTTGTTGCATG
CAGATTGGCAAGCTGCTTTGTTCTTACAACTTTCAGGCTGTTGGTTATCTAGATATATGG
GACATATATCTTTTTT*ATTTTTATTCCCTTGCCCCATCGCTCCGGCCACTAGTACAAGA
ATGACGAGGAGAGTTAAAACATTGAATGAAAATATAAGTGATTTTTT*CATCCTTGGTAA
TATGAATAAATTGATTATGTTTTTTTATCAGAAAATTTTGTTGTCC

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2F230JQ 503 0 0
ATAATTAACTTTTGCAGCTTATTTTGTCATTTATTACATATGCAAATGAACATATTTATT
GTTATCGTAATTTGAAAATAAAAATTTTGAAAACTTATTTAATTATTACTATAAATAACA
TCATAATTTATTATAAATATATCTGAATTCTGTTGTCAATAAACTAAACATTAAGATTAT
TTTGGACATGGGGTATAGCAGGCGCATTTGTTTCCCGGGACACAACCAGTGGTTACTTCC
TTTATTCCTGACCCTTGTATCCTCTTGTTGCACGCAGATTGGCAAGCTGCCCTGTTCTTA
CAACTTTCAGGCTGTTGTTTATCTAGATATATGGGACATATATCTTTTTT*ATTTTTATT
CCCTTGCCCCATCGCTCCGGCCACTAGTACAAGAATGACGAGGAGAGTTAAAACATTGAA
TGAAAATATAAGTGATTTTTT*CATCCTTGGTGATATGAATGAATTGATTATGTTTTTTT
ATCAGAAAATTTTGTTGT
GTGTC

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2F230TF 503 0 0
ATAATTAACTTTTGCAGCTTATTTTGTCATTTATTACATATGCAAATGAACATATTTATT
GTTATCGTAATTTGAAAATAAAAATTTTGAAAACTTATTTAATTATTACTATAAATAACA
TCATAATTTATTATAAATATATCTGAATTCTGTTGTCAATAAACTAAACATTAAGATTAT
TTTGGACATGGGGTATAGCAGGCGCATTTGTTTCCCGGGACACAACCAGTGGTTACTTCC
TTTATTCCTGACCCTTGTATCCTCTTGTTGCACGCAGATTGGCAAGCTGCCCTGTTCTTA
CAACTTTCAGGCTGTTGTTTATCTAGATATATGGGACATATATCTTTTTT*ATTTTTATT
CCCTTGCCCCATCGCTCCGGCCACTAGTACAAGAATGACGAGGAGAGTTAAAACATTGAA
TGAAAATATAAGTGATTTTTT*CATCCTTGGTGATATGAATGAATTGATTATGTTTTTTT
ATCAGAAAATTTTGTTGT
GTGTC

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2GI15TF 526 0 0
CGCTTAAAATTTAGAAGTTGATAATTATAATTAACTTTTACAGCTCATTTTGTCATTTAT
TACATATGCAAATGAACATATTTATTGTTATCGTAATTTGAAAATAAAAATTTTGACAAC
TTATTTAATTATTACTATAAATAACATCATAATTTATTATAAATATATCTGAATTCTGTT
GTCAATAAACTAAACATTAAGATTATTTTGGACATGGGGTATAGCAGGCGCATTTGTTTC
CCGGGACACAACCAGTGGTTACTTCCTTTATTCCTGACCCTTGTATCCTCTTGTTGCATG
CAGATTGGCAAGCTGCTTTGTTCTTACAACTTTCAGGCTGTTGGTTATCTAGATATATGG
GACATATATCTTTTTT*ATTTTTATTCCCTTGCCCCATCGCTCCGGCCACTAGTACAAGA
ATGACGAGGAGAGTTAAAACATTGAATGAAAATATAAGTGATTTTTT*CATCCTTGGTAA
TATGAATAAATTGATTATGTTTTTTTATCAGAAAATTTTGTTGTCC

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2FT63JQ 500 0 0
ATAATTAACTTTTACAGCTTATTTTGTCATTTATTACATATGCAAATGAACATATTTATT
GTTATCGTAATTTGAAAATAAAATTTTTGACAACTTATTTAATTATTACTATAAATAACA
TCATAATTTATTATAAATATATCTGAATTCTGTTGTCAATAAACTAAACATTAAGATTAT
TTTGGACATGGGGTATAGCAGGCGCATTTGTTTCCCGGGACACAACCAGTGGTTACTTCC
TTTATTCCTGACCCTTGTATCCTCTTGTTGCACGCAGATTGACAAGCTGCCTTGTTCTTA
CAACTTTCAGGCTGTTGGTTTTCTAGATATATGGGACATGTATCTTTTTTTATTTTTATT
CCCTTGCCCCATCACTCCGGCCACTAGTACAAGAATGACGAGGAGAGTTAAAACATTGAA
TGAAAATATAAGTGATTTTTTTCATCATTGGTAATATGAATGAATTGATTATGGTTTTTT
ATCAGAAAATTTTGTTGTCC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2FT63TF 500 0 0
ATAATTAACTTTTACAGCTTATTTTGTCATTTATTACATATGCAAATGAACATATTTATT
GTTATCGTAATTTGAAAATAAAATTTTTGACAACTTATTTAATTATTACTATAAATAACA
TCATAATTTATTATAAATATATCTGAATTCTGTTGTCAATAAACTAAACATTAAGATTAT
TTTGGACATGGGGTATAGCAGGCGCATTTGTTTCCCGGGACACAACCAGTGGTTACTTCC
TTTATTCCTGACCCTTGTATCCTCTTGTTGCACGCAGATTGACAAGCTGCCTTGTTCTTA
CAACTTTCAGGCTGTTGGTTTTCTAGATATATGGGACATGTATCTTTTTTTATTTTTATT
CCCTTGCCCCATCACTCCGGCCACTAGTACAAGAATGACGAGGAGAGTTAAAACATTGAA
TGAAAATATAAGTGATTTTTTTCATCATTGGTAATATGAATGAATTGATTATGGTTTTTT
ATCAGAAAATTTTGTTGTCC

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 4

CO CL1107Contig1 930 4 14 U
GGGGAGTTTCTCCAGATTCTCGAGCTCTCTTAGGACAAAGTCTTGTTGTGTCTTTGATAT
CAAAACTTGTCCTTCTTCGCAGATTTCTTATTTGAAGCAGAAGGATGAAGAGAATATTCG
GTGCGAAGAACAACAAAGAGCCTCCTCCCTCCATCCAGGATGCCTCCGATCGGATCAATA
AAAGAGGAGAATCGGTGGAAGATAAGGTGAAGAGGCTTGATGCTGAGCTCTGCAAATACA
AAGACCAGATCAAGAGAACCCGACCTGGTCCCGCTCAGGAAGCTATCAAAGCTCGTGCTA
TGCGAGTCCTCAAGCAAAAGAAAATGTATGAAGGACAACGTGACATGCTGTACAATCAGA
CTTTCAACCTTGATCAAGTTTCTTTTGCTGCTGGAGGCCTCAAAGATGCTCAACAAACTA
TGACAGCGTTGAAATCTGCTAACAAGGAGTTGAAAGGAATGATGAAAACTGTCAAGATTC
AAGATATTGATAATTTACAAGATGAGATGATGGACTTGATGGATGTGAGCTCTGAAATTC
AAGATTCACTTGGTAGGAGCTACAATGTTCCTGATGACATTGACGAAGATGACCTCATGG
GCGAGCTTGATGCTCTTGAAGCTGACATGGGAAACGAGACTGAAGCAGACGGTGTGCCTT
CCTATCTCCAACCCGATACTGAACATGATCTCGATGAAGGACTTGACTTGCCTCCACCAC
CAACGGGGAGGACACAAACAACAGGTGCTCAACCTGGACGTGCTCAGGCTGAGGATGAAT
GGGGTTTACCTGCGGTGCCACGTGCCTCACTCCGGGGTTAAACCCACCGTTTCCACACAC
TTCTGTTTGTCTGCATTCAAAGATTCATCTCCAAGCGATTTCACTTGTGAAATTCTACTA
ACATTTTTATAAATCATTTTCTTATCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ96TF U 17
AF RR2D239TF U 1
AF RR2C978JQ C 442
AF RR2D239JQ C 302
BS 1 651 RR2D239TF
BS 652 652 RR2D239JQ
BS 653 697 RR2D239TF
BS 698 698 RR2D239JQ
BS 699 744 RR2D239TF
BS 745 745 RR2D239JQ
BS 746 767 RR2D239TF
BS 768 768 RR2D239JQ
BS 769 773 RR2D239TF
BS 774 774 RR2D239JQ
BS 775 789 RR2D239TF
BS 790 790 RR2D239JQ
BS 791 801 RR2D239TF
BS 802 930 RR2D239JQ

RD RR2GZ96TF 625 0 0
TTCTCGAGCTCTCTTAGGACAAAGTCTTGTTGTGTCTTTGATATCAAAACTTGTCCTTCT
TCGCAGATTTCTTATTTGAAGCAGAAGGATGAAGAGAATATTCGGTGCGAAGAACAACAA
AGAGCCTCCTCCCTCCATCCAGGATGCCTCCGATCGGATCAATAAAAGAGGAGAATCGGT
GGAAGATAAGGTGAAGAGGCTTGATGCTGAGCTCTGCAAATACAAAGACCAGATCAAGAG
AACCCGACCTGGTCCCGCTCAGGAAGCTATCAAAGCTCGTGCTATGCGAGTCCTCAAGCA
AAAGAAAATGTATGAAGGACAACGTGACATGCTGTACAATCAGACTTTCAACCTTGATCA
AGTTTCTTTTGCTGCTGAAGGCCTCAAAGATGCTCAACAAACTATGACAGCGTTGAAATC
TGCTAACAAGGAGTTGAAAGGAATGATGAAAACTGTCAAGATTCAAGATATTGATAATTT
ACAAGATGAGATGATGGACTTGATGGATGTGAGCTCTGAAATTCAAGATTCACTTGGTAG
GAGCTACAATGTTCCTGATGACATTGACGAAGATGACCTCATGGGCGAGCTTGATGCTCT
TGAAGCTGACATGGGAAACGAGACT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2D239TF 801 0 0
GGGGAGTTTCTCCAGATTCTCGAGCTCTCTTAGGACAAAGTCTTGTTGTGTCTTTGATAT
CAAAACTTGTCCTTCTTCGCAGATTTCTTATTTGAAGCAGAAGGATGAAGAGAATATTCG
GTGCGAAGAACAACAAAGAGCCTCCTCCCTCCATCCAGGATGCCTCCGATCGGATCAATA
AAAGAGGAGAATCGGTGGAAGATAAGGTGAAGAGGCTTGATGCTGAGCTCTGCAAATACA
AAGACCAGATCAAGAGAACCCGACCTGGTCCCGCTCAGGAAGCTATCAAAGCTCGTGCTA
TGCGAGTCCTCAAGCAAAAGAAAATGTATGAAGGACAACGTGACATGCTGTACAATCAGA
CTTTCAACCTTGATCAAGTTTCTTTTGCTGCTGGAGGCCTCAAAGATGCTCAACAAACTA
TGACAGCGTTGAAATCTGCTAACAAGGAGTTGAAAGGAATGATGAAAACTGTCAAGATTC
AAGATATTGATAATTTACAAGATGAGATGATGGACTTGATGGATGTGAGCTCTGAAATTC
AAGATTCACTTGGTAGGAGCTACAATGTTCCTGATGACATTGACGAAGATGACCTCATGG
GCGAGCTTGATGCTCTTGAAGCTGACATGGGAAACGAGACTGAAGCAGACG*TGTGCCTT
CCTATCTCCAACCCGATACTGAACATGATCTCGATGA*GGACTTGACTTGCCTCCACCAC
CAACGGGGAGGACACAAACAACAG*TGCTCAACCTGGACGTGCTCAG*CTGAG*ATGAAT
GGGGTTTAC*TGCGGTGCCAC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2C978JQ 400 0 0
ACAAGGAGTTGAAAGGAATGATGAAAACTGTCAAGATTCAAGATATTGATAATTTACAAG
ATGAGATGATGGACTTGATGGATGTGAGTTCTGAAATTCAAGATTCACTTGGTAGGAGCT
ACAATGTTCCTGATGACATTGAGGAAGATGACCTCATGGGCGAGCTTGATGTTCTTGAAG
CTGACATGGGAAACGAGACTGAAGCAGACGGTGTGCCTTCCTATTTCCAACCCGATACTG
GACCTGATCTCGATGAAGGACTTGACTTGCCTCCACCACCAACGGGGAGGACACAAACAA
CAGGTGCTCAACCTGGACGTGCTCAGGCTGAGGATGAATGGGGTTTACCTGCGGTGCCAC
GTGCCTCACTCCGGGGTTAAACCCCCCGTTTCC
CCCCACT

QA 1 393 1 393
DS 

RD RR2D239JQ 629 0 0
GCGAGTCCTCAAGCAAAAGAAAATGTATGAAGGACAACGTGACATGCTGTACAATCAGAC
TTTCAACCTTGATCAAGTTTCTTTTGCTGCTGGAGGCCTCAAAGATGCTCAACAAACTAT
GACAGCGTTGAAATCTGCTAACAAGGAGTTGAAAGGAATGATGAAAACTGTCAAGATTCA
AGATATTGATAATTTACAAGATGAGATGATGGACTTGATGGATGTGAGCTCTGAAATTCA
AGATTCACTTGGTAGGAGCTACAATGTTCCTGATGACATTGACGAAGATGACCTCATGGG
CGAGCTTGATGCTCTTGAAGCTGACATGGGAAACGAGACTGAAGCAGACGGTGTGCCTTC
CTATCTCCAACCCGATACTGAACATGATCTCGATGAAGGACTTGACTTGCCTCCACCACC
AACGGGGAGGACACAAACAACAGGTGCTCAACCTGGACGTGCTCAGGCTGAGGATGAATG
GGGTTTACCTGCGGTGCCACGTGCCTCACTCCGGGGTTAAACCCACCGTTTCCACACACT
TCTGTTTGTCTGCATTCAAAGATTCATCTCCAAGCGATTTCACTTGTGAAATTCTACTAA
CATTTTTATAAATCATTTTCTTATCATGC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 2 7

CO CL1108Contig1 708 4 2 U
GGATCACTAAATAGTCTCAAGAGTTGTTTGCTTCTCTCACTTTACCAATCTCTTTTAGTT
AATACATCTTCTTCTTCCAAAACCGATTTGATTTCTTCAATCAAATCGCAAACAGAGAAA
TTTGGCGTAGAGATTAACATTTGTAATGGCGGACCAAACCACCGATTCAACATCTCCTGC
GGCTCTTGTCTCCACACCGTCTCCTAAGAAAGAAATCTCCAATCCAGTTGATTCGAAGCT
CACTGAACTAAGCGAATCAAGGGCCGAGTTACTTAACAGGATCCAGAATCTCAAACAGGA
CTTGCAAAGTTGGAGAGGTAAGCTCGACACCCAAGTTCAAGTCTACCGTGAGGAGCTCTC
TGGGCTGAAGAAGACTCTCAATCTTGAAGTTGAGCAGCTCCGTGAGGAATTCAAAGACCT
GAAAACCACTTTGAATCAGCAGCAAGACGATGTTTCTGCTAGCCTCAAAAGCTTAGGCCT
ACAAGATAAACCTAAAGATTCAGAAGGGGAAATGGATAAGAAAAGCGAGGCGAAAGAAGA
GAAAGTGGAAGCTCGGTTGAGCGATGATGAGAATGCGAAAGAAGCAGAGCATTAGAGACC
ATGAAAATGTTTCTTTCTTTATCATCTTATGGCTACTACTACGTTTGTGATTGTACCGTT
ACTCCTTTAAATATGTTACTACTGCGGTTTAGTTAATTCTGACGATCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DL67TF U 1
AF RR2FA91TF U 1
AF RR2FA91JQ C 59
AF RR2DL67JQ C 206
BS 1 675 RR2DL67TF
BS 676 708 RR2FA91TF

RD RR2DL67TF 675 0 0
GGATCACTAAATAGTCTCAAGAGTTGTTTGCTTCTCTCACTTTACCAATCTCTTTTAGTT
AATACATCTTCTTCTTCCAAAACCGATTTGATTTCTTCAATCAAATCGCAAACAGAGAAA
TTTGGCGTAGAGATTAACATTTGTAATGGCGGACCAAACCACCGATTCAACATCTCCTGC
GGCTCTTGTCTCCACACCGTCTCCTAAGAAAGAAATCTCCAATCCAGTTGATTCGAAGCT
CACTGAACTAAGCGAATCAAGGGCCGAGTTACTTAACAGGATCCAGAATCTCAAACAGGA
CTTGCAAAGTTGGAGAGGTAAGCTCGACACCCAAGTTCAAGTCTACCGTGAGGAGCTCTC
TGGGCTGAAGAAGACTCTCAATCTTGAAGTTGAGCAGCTCCGTGAGGAATTCAAAGACCT
GAAAACCACTTTGAATCAGCAGCAAGACGATGTTTCTGCTAGCCTCAAAAGCTTAGGCCT
ACAAGATAAACCTAAAGATTCAGAAGGGGAAATGGATAAGAAAAGCGAGGCGAAAGAAGA
GAAAGTGGAAGCTCGGTTGAGCGATGATGAGAATGCGAAAGAAGCAGAGCATTAGAGACC
ATGAAAATGTTTCTTTCTTTATCATCTTATGGCTACTACTACGTTTGTGATTGTACCGTT
ACTCCTTTAAATATG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2FA91TF 708 0 0
GG
ATCACTAAATAGTCTCAAGAGTTGTTTGCTTCTCTCACTTTACCAATCTCTTTTAGTTAA
TACATCTTCTTCTTCCAAAACCGATTTGATTTCTTCAATCAAATCGCAAACAGAGAAATT
TGGCGTAGAGATTAACATTTGTAATGGCGGACCAAACCACCGATTCAACATCTCCTGCGG
CTCTTGTCTCCACACCGTCTCCTAAGAAAGAAATCTCCAATCCAGTTGATTCGAAGCTCA
CTGAACTAAGCGAATCAAGGGCCGAGTTACTTAACAGGATCCAGAATCTCAAACAGGACT
TGCAAAGTTGGAGAGGTAAGCTCGACACCCAAGTTCAAGTCTACCGTGAGGAGCTCTCTG
GGCTGAAGAAGACTCTCAATCTTGAAGTTGAGCAGCTCCGTGAGGAATTCAAAGACCTGA
AAACCACTTTGAATCAGCAGCAAGACGATGTTTCTGCTAGCCTCAAAAGCTTAGGCCTAC
AAGATAAACCTAAAGATTCAGAAGGGGAAATGGATAAGAAAAGCGAGGCGAAAGAAGAGA
AAGTGGAAGCTCGGTTGAGTGATGATGAGAATGCGAAAGAAGCAGAGCATTAGAGACCAT
GAAAATGTTTCTTTCTTTATCATCTTATGGCTACTACTACGTTTGTGATTGTACCGTTAC
TCCTTTAAATATGTTACTACTGCGGTTTAGTTAATTCTGACGATCC

QA 3 708 3 708
DS 

RD RR2FA91JQ 641 0 0
TTAATACATCTTCTTCTTCCAAAACCGATTTGATTTCTTCAATCAAATCGCAAACAGAGA
AATTTGGCGTAGAGATTAACATTTGTAATGGCGGACCAAACCACCGATTCAACATCTCCT
GCGGCTCTTGTCTCCACACCGTCTCCTAAGAAAGAAATCTCCAATCCAGTTGATTCGAAG
CTCACTGAACTAAGCGAATCAAGGGCCGAGTTACTTAACAGGATCCAGAATCTCAAACAG
GACTTGCAAAGTTGGAGAGGTAAGCTCGACACCCAAGTTCAAGTCTACCGTGAGGAGCTC
TCTGGGCTGAAGAAGACTCTCAATCTTGAAGTTGAGCAGCTCCGTGAGGAATTCAAAGAC
CTGAAAACCACTTTGAATCAGCAGCAAGACGATGTTTCTGCTAGCCTCAAAAGCTTAGGC
CTACAAGATAAACCTAAAGATTCAGAAGGGGAAATGGATAAGAAAAGCGAGGCGAAAGAA
GAGAAAGTGGAAGCTCGGTTGAGTGATGATGAGAATGCGAAAGAAGCAGAGCATTAGAGA
CCATGAAAATGTTTCTTTCTTTATCATCTTATGGCTACTACTACGTTTGTGATTGTACCG
TTACTCCTTTAAATATGTTACTACTGCGGTTTAGTTAATTC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2DL67JQ 503 0 0
AAGAAAGAAATCTCCAATCCAGTTGATTCGAAGCTCACTGAACTAAGCGAATCAAGGGCC
GAGTTACTTAACAGGATCCAGAATCTCAAACAGGACTTGCAAAGTTGGAGAGGTAAGCTC
GACACCCAAGTTCAAGTCTACCGTGAGGAGCTCTCTGGGCTGAAGAAGACTCTCAATCTT
GAAGTTGAGCAGCTCCGTGAGGAATTCAAAGACCTGAAAACCACTTTGAATCAGCAGCAA
GACGATGTTTCTGCTAGCCTCAAAAGCTTAGGCCTACAAGATAAACCTAAAGATTCAGAA
GGGGAAATGGATAAGAAAAGCGAGGCGAAAGAAGAGAAAGTGGAAGCTCGGTTGAGCGAT
GATGAGAATGCGAAAGAAGCAGAGCATTAGAGACCATGAAAATGTTTCTTTCTTTATCAT
CTTATGGCTACTACTACGTTTGTGATTGTACCGTTACTCCTTTAAATATGTTACTACTGC
GGTTTAGTTAATTCTGACGATCC

QA 1 503 1 503
DS 



CO CL1108Contig2 760 3 9 U
AGGGGCCAACGACATCACTAAATAGTCTCAAGAGTTGTTTGATTCTCTCACTTTACCAAT
CTCTTTTAGTTAATACATCTTCTTCTTCCTTCTTTCTCAACCGATTTGAATTCTTCAATC
AAATCGCAAACAGAGAAATTTGGCGTAGAGATTAACATCTGTAATGGCGGACCAAACCAC
CGATTCAACATCTCCTGCGGCTCTTGTCTCCACATCGTCTCCTAAGAAAGAAATCTCCAA
TCCAGTTGATTCGAAGCTCACTGAACTAAGCGAATCAAGGGCCGAGTTACTTAACAGGAT
CCAGAATCTCAAACAGGACTTGCAAAGTTGGAGAGGTAAGCTCGACACCCAAGTTCAAGT
CTACCGTGAGGAGCTCTCTGGGCTGAAGAAGACTCTCAATCTTGAAGTTGAGCAGCTCCG
TGAGGAATTCAAAGACCTGAAAACCACTTTGAATCAGCAGCAAGACGATGTTTCTGCTAG
CCTCAAAAGCTTAGGCCTACAAGATAACTCTAAAGATTCAGAAGGGAAAATGGATAAGGA
AAGGGAGGCGAAAGAAGAGAAAGTGGAAGCTCGGTTGAGTGAGGATGAGAATGCGAAAGA
AGCAGAGCATTAGAGACCATGGAAATGTTTCTTCTTTCTTTATCATCTTATGGCTACCTA
CTACTACGTTTGTGATTGTAACGTTACTATTTTAAATATGCTAGTATTGTGGTTTAGTAC
GATGCGAAACACAAGAACCAACTTTAGTAATGATCTCAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G952TF U 48
AF RR2G952JQ C 48
AF RR2H693TF U 1
BS 1 158 RR2H693TF
BS 159 159 RR2G952TF
BS 160 546 RR2H693TF
BS 547 547 RR2G952TF
BS 548 629 RR2H693TF
BS 630 630 RR2G952TF
BS 631 695 RR2H693TF
BS 696 696 RR2G952TF
BS 697 760 RR2H693TF

RD RR2G952TF 674 0 0
GG
ACTTTACCAATCTCTTTTAGTTAATACATCTTCTTCTTCCTTCTTTCTCAACCGATTTGA
ATTCTTCAATCAAATCGCAAACAGAGAAATTTGGCGTAGAGATTAACATCTGTAATGGCG
GACCAAACCACCGATTCAACATCTCCTGCGGCTCTTGTCTCCACATCGTCTCCTAAGAAA
GAAATCTCCAATCCAGTTGATTCGAAGCTCACTGAACTAAGCGAATCAAGGGCCGAGTTA
CTTAACAGGATCCAGAATCTCAAACAGGACTTGCAAAGTTGGAGAGGTAAGCTCGACACC
CAAGTTCAAGTCTACCGTGAGGAGCTCTCTGGGCTGAAGAAGACTCTCAATCTTGAAGTT
GAGCAGCTCCGTGAGGAATTCAAAGACCTGAAAACCACTTTGAATCAGCAGCAAGACGAT
GTTTCTGCTAGCCTCAAAAGCTTAGGCCTACAAGATAACTCTAAAGATTCAGAAGGGAAA
ATGGATAAGGAAAGGGAGGCGAAAGAAGAGAAAGTGGAAGCTCGGTTGAGTGAGGATGAG
AATGCGAAAGAAGCAGAGCATTAGAGACCATGGAAATGTTTCTTCTTTCTTTATCATCTT
ATGGCTACCTACTACTACGTTTGTGATTGTAACGTTACTATTTTAAATATGCTAGTATTG
TGG
AAAAAAAAA

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR2G952JQ 665 0 0
GG
ACTTTACCAATCTCTTTTAGTTAATACATCTTCTTCTTCCTTCTTTCTCAACCGATTTGA
ATTCTTCAATCAAATCGCAAACAGAGAAATTTGGCGTAGAGATTAACATCTGTAATGGCG
GACCAAACCACCGATTCAACATCTCCTGCGGCTCTTGTCTCCACATCGTCTCCTAAGAAA
GAAATCTCCAATCCAGTTGATTCGAAGCTCACTGAACTAAGCGAATCAAGGGCCGAGTTA
CTTAACAGGATCCAGAATCTCAAACAGGACTTGCAAAGTTGGAGAGGTAAGCTCGACACC
CAAGTTCAAGTCTACCGTGAGGAGCTCTCTGGGCTGAAGAAGACTCTCAATCTTGAAGTT
GAGCAGCTCCGTGAGGAATTCAAAGACCTGAAAACCACTTTGAATCAGCAGCAAGACGAT
GTTTTTGCTAGCCTCAAAAGCTTAGGCCTACAAGATAACTCTAAAGATTCAGAAGGGAAA
ATGGATAAGGAAAGGGAGGCGAAAGAAGAGAAAGTGGAAGCTCGGTTGAGTGAGGATGAG
AATGCGAAAGAAGCAGAGCATTAGAGACCATGGAAATGTTTCTTCTTTCTTTATCATCTT
ATGGCTACCTACTACTACGTTTGTGATTGTAACGTTACTATTTTAAATATG
CTAGTATTGTGG

QA 3 653 3 653
DS 

RD RR2H693TF 760 0 0
AGGGGCCAACGACATCACTAAATAGTCTCAAGAGTTGTTTGATTCTCTCACTTTACCAAT
CTCTTTTAGTTAATACATCTTCTTCTTCCTTCTTTCTCAACCGATTTGAATTCTTCAATC
AAATCGCAAACAGAGAAATTTGGCGTAGAGATTAACATTTGTAATGGCGGACCAAACCAC
CGATTCAACATCTCCTGCGGCTCTTGTCTCCACATCGTCTCCTAAGAAAGAAATCTCCAA
TCCAGTTGATTCGAAGCTCACTGAACTAAGCGAATCAAGGGCCGAGTTACTTAACAGGAT
CCAGAATCTCAAACAGGACTTGCAAAGTTGGAGAGGTAAGCTCGACACCCAAGTTCAAGT
CTACCGTGAGGAGCTCTCTGGGCTGAAGAAGACTCTCAATCTTGAAGTTGAGCAGCTCCG
TGAGGAATTCAAAGACCTGAAAACCACTTTGAATCAGCAGCAAGACGATGTTTCTGCTAG
CCTCAAAAGCTTAGGCCTACAAGATAACTCTAAAGATTCAGAAGGGAAAATGGATAAGGA
AAGGGAAGCGAAAGAAGAGAAAGTGGAAGCTCGGTTGAGTGAGGATGAGAATGCGAAAGA
AGCAGAGCATTAGAGACCATGGAAATGTT*CTTCTTTCTTTATCATCTTATGGCTACCTA
CTACTACGTTTGTGATTGTAACGTTACTATTTTAA*TATGCTAGTATTGTGGTTTAGTAC
GATGCGAAACACAAGAACCAACTTTAGTAATGATCTCAAA

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 6

CO CL1109Contig1 1211 6 5 U
GGAAGCTTAGATAACATAGAGAGAGTGAGTGAGTGTCAGAGAGAGAGAGAGAGAAACAGA
GATGGATCACGAAGCAGATGCGTACCGTACGGATTTGATGACGATCACGAGATTCGTGCT
GAACGAGCAATCAAAGTACCCCGAGTCTCGTGGGGATTTCACGATTTTGCTCAGCAACAT
CGTTTTGGGTTGCAAATTCGTCTGCAGTGCCGTCAACAAGGCTGGTTTGGCCAAGCTTAT
TGGACTTGCTGGGGAGACAAATATCCAGGGTGAAGAGCAAAAGAAACTGGATGTGCTCTC
TAACGATGTTTTTATCAAAGCTCTGGTTAGCAGTGGCAGAACATCTGTTCTTGTCTCGGA
AGAAGATGAGGAAGCTACGTTTGTGGAGTCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTT
TGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATTGACTGTGGTGTCTCCATTGGAACAATCTTTGG
AATTTACACAATGGACCACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGGATGTTCTGAAACCTGGGAA
TGAAATGGTTGCAGCTGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCAC
TGGAACAGGTGTCCACGGATTTACTCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCA
CCCAGACATTAAGATTCCAAATAAGGGAAACATCTACTCAGTGAATGAAGGAAACGCTCA
GAACTGGGATGGTCCAACCACAAAGTATGTAGAGAGATGCAAGTATCCCAAAGACGGTTC
TCCCGCAAAATTTTTTAGATATGTCGGAAGTATGGTAGCCGATGTTCATCGCACGCTGCT
TTACGGAGGAATCTTCTTGTACCCTGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAATTGCGTGT
CTTGTATGAAGTCTTCCCAATGGCGTTCTTGATGGAGCAAGCTGGAGGTCAGGCCTTCAC
TGGCAAGAAAAGGGCACTGGACCTTGTCCCGGAGAAGATCCATGAGCGTTTTCCGATATT
TCTTGGAAGTTATGACGATGTAGAGGAGATTAAGGCTCTGTATGCTGCGGAGGAGAAGAA
CTAAGCTTTCCATTGTAACATCGTATTTCTATACCTTCTTCTGTTGAGACAAATCATTTG
ACTCGACTCATGTATGCCAAGAAGACTGGTTGAAAAAAATAAAATAAAAATAATATATAA
CTTCTTTCGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2E957TF U 1
AF RR2D163TF U 1
AF RR2CT74TF U 7
AF RR2CT74JQ C 486
AF RR2FF91JQ C 796
AF RR2E957JQ C 640
BS 1 602 RR2D163TF
BS 603 710 RR2CT74TF
BS 711 711 RR2CT74JQ
BS 712 769 RR2CT74TF
BS 770 1211 RR2CT74JQ

RD RR2E957TF 389 0 0
GGAAGCTT
AGATAACATAGAGAGAGTGAGTG****TCAGAGAGAGAGAGAGAGAAACAGAGATGGATC
ACGAAGCAGATGCGTACCGTACGGATTTGATGACGATCACGAGATTCGTGCTGAACGAGC
AATCAAAGTACCCCGAGTCTCGTGGGGATTTCACGATTTTGCTCAGCAACATCGTTTTGG
GTTGCAAATTCGTCTGCAGTGCCGTCAACAAGGCTGGTTTGGCCAAGCTTATTGGACTTG
CTGGGGAGACAAATATCCAGGGTGAAGAGCAAAAGAAACTGGATGTGCCCTCTAACGATG
TTTTTATCAAAGCTCTGGTTAGCAGTGGCAGAACATCTGTTCTTGTCTCGGAAGAAGATG
AGGAAGCTACGTTTGTGGAGT

QA 9 389 9 389
DS 

RD RR2D163TF 602 0 0
GGAAGCTTAGATAACATAGAGAGAGTGAGTGAGTGTCAGAGAGAGAGAGAGAGAAACAGA
GATGGATCACGAAGCAGATGCGTACCGTACGGATTTGATGACGATCACGAGATTCGTGCT
GAACGAGCAATCAAAGTACCCCGAGTCTCGTGGGGATTTCACGATTTTGCTCAGCAACAT
CGTTTTGGGTTGCAAATTCGTCTGCAGTGCCGTCAACAAGGCTGGTTTGGCCAAGCTTAT
TGGACTTGCTGGGGAGACAAATATCCAGGGTGAAGAGCAAAAGAAACTGGATGTGCTCTC
TAACGATGTTTTTATCAAAGCTCTGGTTAGCAGTGGCAGAACATCTGTTCTTGTCTCGGA
AGAAGATGAGGAAGCTACGTTTGTGGAGTCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTT
TGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATTGACTGTGGTGTCTCCATTGGAACAATCTTTGG
AATTTACACAATGGACCACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGGATGTTCTGAAACCTGGGAA
TGAAATGGTTGCAGCTGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCAC
TG

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2CT74TF 763 0 0
GG
AGATAACATAGAGAGAGTGAGTGAGTGTCAGAGAGAGAGAGAGA**AACAGAGATGGATC
ACGAAGCAGATGCGTACCGTACGGATTTGATGACGATCACGAGATTCGTGCTGAACGAGC
AATCAAAGTACCCCGAGTCTCGTGGGGATTTCACGATTTTGCTCAGCAACATCGTTTTGG
GTTGCAAATTCGTCTGCAGTGCCGTCAACAAGGCTGGTTTGGCCAAGCTTATTGGACTTG
CTGGGGAGACAAATATCCAGGGTGAAGAGCAAAAGAAACTGGATGTGCTCTCTAACGATG
TTTTTATCAAAGCTCTGGTTAGCAGTGGCATAACATCTGTTCTTGTCTCGGAAGAAGATG
AGGAAGCTACGTTTGTGGAGTCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCAC
TTGATGGATCCTCAAACATTGACTGTGGTGTCTCCATTGGAACAATCTTTGGAATTTACA
CAATGGACCACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGGATGTTCTGAAACCTGGGAATGAAATGG
TTGCAGCTGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACAG
GTGTCCACGGATTTACTCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCAGACA
TTAAGATTCCAAATAAGGGAAACATCTACTCAGTGAATGAAG*AAACGCTCAGAACTGGG
ATGGTCCAACCACAAAGTATGTAGAGAGATGCAAGTATCCC

QA 3 763 3 763
DS 

RD RR2CT74JQ 726 0 0
ACACAATGGACCACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGGATGTTCTGAAACCTGGGAATGAAA
TGGTTGCAGCTGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAA
CAGGTGTCCACGGATTTACTCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCAG
ACATTAAGATTCCAAATAAGGGAAACATCTACTCAGTGAATGAAGGAAACGCTCAGAACT
GGGATGGTCCAACCACAAAGTATGTAGAGAGATGCAAGTATCCCAAAGACGGTTCTCCCG
CAAAATTTTTTAGATATGTCGGAAGTATGGTAGCCGATGTTCATCGCACGCTGCTTTACG
GAGGAATCTTCTTGTACCCTGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAATTGCGTGTCTTGT
ATGAAGTCTTCCCAATGGCGTTCTTGATGGAGCAAGCTGGAGGTCAGGCCTTCACTGGCA
AGAAAAGGGCACTGGACCTTGTCCCGGAGAAGATCCATGAGCGTTTTCCGATATTTCTTG
GAAGTTATGACGATGTAGAGGAGATTAAGGCTCTGTATGCTGCGGAGGAGAAGAACTAAG
CTTTCCATTGTAACATCGTATTTCTATACCTTCTTCTGTTGAGACAAATCATTTGACTCG
ACTCATGTATGCCAAGAAGACTGGTTGAAAAAAATAAAATAAAAATAATATATAACTTCT
TTCGAT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2FF91JQ 413 0 0
TAGATATGTCGGAAGTATGGTAGCCGATGTTCATCGCACGCTGCTTTACGGAGGAATCTT
CTTGTACCCTGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAATTGCGTGTCTTGTATGAAGTCTT
CCCAATGGCGTTCTTGATGGAGCAAGCTGGAGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGGC
ACTGGACCTTGTCCCGGAGAAGATCCATGAGCGTTTTCCGATATTTCTTGGAAGTTATGA
CGATGTAGAGGAGATTAAGGCTCTGTATGCTGCGGAGGAGAAGAACTAAGCTTTCCATTG
TAACATCGTATTTCTATACCTTCTTCTGTTGAGACAAATCATTTGACTCGACTCATGTAT
GCCAAGAAGACTGGTTGAAAAAAATAAAATAAAAATAATATATAACTTCTTTC

QA 1 413 1 413
DS 

RD RR2E957JQ 572 0 0
AGGAGAGTTCATATTAACTCACCCAGACATTAAGATTCCAAATAAGGGAAACATCTACTC
AGTGAATGAAGGAAACGCTCAGAACTGGGATGGTCCAACCACAAAGTATGTAGAGAGATG
CAAGTATCCCAAAGACGGTTTTCCCGCAAAATTTTTTAGATATGTCGGAAGTATGGTAGC
CGATGTTCATCGCACGCTGCTTTACGGAGGAATTTTCTTGTACCCTGCTGACAAGAAAAG
CCCCAATGGGAAATTGCGTGTCTTGTATGAAGTCTTCCCAATGGCGTTCTTGATGGAGCA
AGCTGGAGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGGCACTGGACCTTGTCCCGGAGAAGAT
CCATGAGCGTTTTCCGATATTTCTTGGAAGTTATGACGATGTAGAGGAGATTAAGGCTTT
GTATGCTGCGGAGGAGAAGAAATAAGCTTTCCATTGTAACATCGTATTTTTATACCTTTT
TTTGTTGAGACAAATCATTTGACTCGACTCATGTATGCCAAGAAGACTGGTTGAAAAAAA
TAAAATAAAAATAATATATAACTTCTTTC
GGT

QA 1 569 1 569
DS 



AS 2 7

CO CL1110Contig1 554 4 4 U
GGACTCACAATTCTCCCTACTTTCCTAAATACAAACACACCTATTTTTTCCATTTTGTTC
ATATCTTTCTTCTTCAGAGTCTCCCAATGGCTGGTGTTGAGGTTGAGAAAACAGTACCAA
ATACAGAAGAGAAGACGACGACCGAAGCAACAACGATTGAGACGCCTAAGGAAACCATCC
ATGCAGATGACTCAGCCACTGCGGTTGAAGTTGAGATTAAAGAAGATGAAGAAGCACCGA
AGGTAGAGAAAGAGACTGAAAAAACCGAGACAGCTCCGGGTAAAGAGGAGAAACCGGTCG
AAACTCCGGCAGCTGGGGAGGAGAAAGATGTTAAGCCGGTGGCAGAAGAGGAGAAGACTG
TTGAAGTAAAGACAGCCTAAGATGCTCGTCTTTCTCACCCATGAGAACATTTCTGTTTTG
TTTTGTTTAAATCCTATATTTTCATATAATAATAAGGTAATCCAGGGGCTATTATTGTAA
TGTTTATTTAATATATAATGATATTATGTGTTTTCCTTTTAATCTTGTCTATTATGAGAC
AATTAAGATGGTCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EW43JQ C 301
AF RR2EW43TF U 1
AF RR2BJ11JQ C 1
AF RR2BJ11TF U 1
BS 1 40 RR2EW43TF
BS 41 41 RR2BJ11TF
BS 42 520 RR2EW43TF
BS 521 554 RR2BJ11TF

RD RR2EW43JQ 220 0 0
AAAT
TCCGGCAGCTGGGGAGGAGAAAGATGTTAAGCCGGTGGCAGAAGAGGAGAAGACTGTTGA
AGTAAAGACAGCCTAAGATGTTTGTTTTTTTCACCCATGAGAACATTTTTGTTTTGTTTT
GTTTAAATCCTATATTTTCATATAATAATAAGGTAATCCAGGGGCTATTATTGTAATGTT
TATTTAATATATAATGATATTATGTGTTTTCCTTTT

QA 5 220 5 220
DS 

RD RR2EW43TF 520 0 0
GGACTCACAATTCTCCCTACTTTCCTAAATACAAACACACTTATTTTTTCCATTTTGTTC
ATATCTTTCTTCTTCAGAGTCTCCCAATGGCTGGTGTTGAGGTTGAGAAAACAGTACCAA
ATACAGAAGAGAAGACGACGACCGAAGCAACAACGATTGAGACGCCTAAGGAAACCATCC
ATGCAGATGACTCAGCCACTGCGGTTGAAGTTGAGATTAAAGAAGATGAAGAAGCACCGA
AGGTAGAGAAAGAGACTGAAAAAACCGAGACAGCTCCGGGTAAAGAGGAGAAACCGGTCG
AAACTCCGGCAGCTGGGGAGGAGAAAGATGTTAAGCCGGTGGCAGAAGAGGAGAAGACTG
TTGAAGTAAAGACAGCCTAAGATGCTCGTCTTTCTCACCCATGAGAACATTTCTGTTTTG
TTTTGTTTAAATCCTATATTTTCATATAATAATAAGGTAATCCAGGGGCTATTATTGTAA
TGTTTATTTAATATATAATGATATTATGTGTTTTCCTTTT

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2BJ11JQ 554 0 0
GGACTCACAATTCTCCCTACTTTCCTAAATACAAACACACCTATTTTTTCCATTTTGTTC
ATATCTTTCTTCTTCAGAGTCTCCCAATGGCTGGTGTTGAGGTTGAGAAAACAGTACCAA
ATACAGAAGAGAAGACGACGACCGAAGCAACAACGATTGAGACGCCTAAGGAAACCATCC
ATGCAGATGACTCAGCCACTGCGGTTGAAGTTGAGATTAAAGAAGATGAAGAAGCACCGA
AGGTAGAGAAAGAGACTGAAAAAACCGAGACAGCTCCGGGTAAAGAGGAGAAACCGGTCG
AAACTCCGGCAGCTGGGGAGGAGAAAGATGTTAAGCCGGTGGCAGAAGAGGAGAAGACTG
TTGAAGTAAAGACAGCCTAAGATGCTCGTCTTTCTCACCCATGAGAACATTTCTGTTTTG
TTTTGTTTAAATCCTATATTTTCATATAATAATAAGGTAATCCAGGGGCTATTATTGTAA
TGTTTATTTAATATATAATGATATTATGTGTTTTCCTTTTAATCTTGTCTATTATGAGAC
AATTAAGATGGTCC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2BJ11TF 554 0 0
GGACTCACAATTCTCCCTACTTTCCTAAATACAAACACACCTATTTTTTCCATTTTGTTC
ATATCTTTCTTCTTCAGAGTCTCCCAATGGCTGGTGTTGAGGTTGAGAAAACAGTACCAA
ATACAGAAGAGAAGACGACGACCGAAGCAACAACGATTGAGACGCCTAAGGAAACCATCC
ATGCAGATGACTCAGCCACTGCGGTTGAAGTTGAGATTAAAGAAGATGAAGAAGCACCGA
AGGTAGAGAAAGAGACTGAAAAAACCGAGACAGCTCCGGGTAAAGAGGAGAAACCGGTCG
AAACTCCGGCAGCTGGGGAGGAGAAAGATGTTAAGCCGGTGGCAGAAGAGGAGAAGACTG
TTGAAGTAAAGACAGCCTAAGATGCTCGTCTTTCTCACCCATGAGAACATTTCTGTTTTG
TTTTGTTTAAATCCTATATTTTCATATAATAATAAGGTAATCCAGGGGCTATTATTGTAA
TGTTTATTTAATATATAATGATATTATGTGTTTTCCTTTTAATCTTGTCTATTATGAGAC
AATTAAGATGGTCC

QA 1 554 1 554
DS 



CO CL1110Contig2 529 3 8 U
GGACTCACAATTCTCCCTACTTTCCTAAATACAAGCACACTTATTTTTTCCATTGTTCAT
ATCTTTCTTCTTCAGAGTCTCCCAATGGCTGGTGTTGAGGTTGAGAAAACAGTACCAAAT
ACAGAAGAGAAGACGACGATCGAAACAACAACGATTGAGACGCCTAAGGAAACTATCAAT
GCAGATGACTCAGCCACTGCGGTTGAAGTTGAGATTAAAGAAGATGAAGAAGCACCAAAG
GTAGAGAAAGAGACTGAAAAAACCGAGACAGCTCCGGGTAAAGAGGAGAAACCGGAGAAA
CCGGTCGAAACTCCGGCAGCTGGGGAGGAGAAAGATGTTAAGCCGGCGGCAGAAGAGGAG
AAGACTGTTGAAGTAAAGACAGCCTAAGATGCTCTCGTCTTTCTCACCCATGAGAACATT
TCTGTTTTGTTTTGTTTAAATCCTATATTTTCATATAATAATAAGATAATCCAGGGGCTA
TTATTGTAATGTTTATTTAATATATAATGATATTATGTGTTTTCCTTTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2F959JQ C 1
AF RR2BN25TF U 1
AF RR2F959TF U 1
BS 1 144 RR2BN25TF
BS 145 145 RR2F959TF
BS 146 252 RR2BN25TF
BS 253 253 RR2F959TF
BS 254 280 RR2BN25TF
BS 281 281 RR2F959TF
BS 282 528 RR2BN25TF
BS 529 529 RR2F959TF

RD RR2F959JQ 392 0 0
GGACTCACAATTCTCCCTACTTTCCTAAATACAAGCACACTTATTTTTTCCATTGTTCAT
ATCTTTTTTTTTCAGAGTCTCCCAATGGCTGGTGTTGAGGTTGAGAAAACAGTACCAAAT
ACAGAAGAGAAGACGACGATCGAAACAACAACGATTGAGACGCCTAAGGAAACTATCAAT
GCAGATGATTCAGCCACTGCGGTTGAAGTTGAGATTAAAGAAGATGAAGAAGCACCAAAG
GTAGAGAAAGAGACTGAAAAAACCGAGACAGCTCCGGGTAAAGAGGAGAAACCGGAGAAA
CCGGTCGAAACTCCGGCAGCTGGGGAGGAGAAAGATGTTAAGCCGGCGGCAGAAGAGGAG
AAGACTGTTGAAGTAAAGACAGCCTAAGATGC

QA 1 392 1 392
DS 

RD RR2BN25TF 528 0 0
GGACTCACAATTCTCCCTACTTTCCTAAATACAAGCACACTTATTTTTTCCATTGTTCAT
ATCTTTCTTCTTCAGAGTCTCCCAATGGCTGGTGTTGAGGTTGAGAAAACAGTACCAAAT
ACAGAAGAGAAGACGACGATCGAAGCAACAACGATTGAGACGCCTAAGGAAACTATCAAT
GCAGATGACTCAGCCACTGCGGTTGAAGTTGAGATTAAAGAAGATGAAGAAGCACCAAAG
GTAGAGAAAGAGGCTGAAAAAACCGAGACAGCTCCGGGTAGAGAGGAGAAACCGGAGAAA
CCGGTCGAAACTCCGGCAGCTGGGGAGGAGAAAGATGTTAAGCCGGCGGCAGAAGAGGAG
AAGACTGTTGAAGTAAAGACAGCCTAAGATGCTCTCGTCTTTCTCACCCATGAGAACATT
TCTGTTTTGTTTTGTTTAAATCCTATATTTTCATATAATAATAAGATAATCCAGGGGCTA
TTATTGTAATGTTTATTTAATATATAATGATATTATGTGTTTTCCTTT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2F959TF 529 0 0
GGACTCACAATTCTCCCTACTTTCCTAAATACAAGCACACTTATTTTTTCCATTGTTCAT
ATCTTTCTTCTTCAGAGTCTCCCAATGGCTGGTGTTGAGGTTGAGAAAACAGTACCAAAT
ACAGAAGAGAAGACGACGATCGAAACAACAACGATTGAGACGCCTAAGGAAACTATCAAT
GCAGATGACTCAGCCACTGCGGTTGAAGTTGAGATTAAAGAAGATGAAGAAGCACCAAAG
GTAGAGAAAGAGACTGAAAAAACCGAGACAGCTCCGGGTAAAGAGGAGAAACCGGAGAAA
CCGGTCGAAACTCCGGCAGCTGGGGAGGAGAAAGATGTTAAGCCGGCGGCAGAAGAGGAG
AAGACTGTTGAAGTAAAGACAGCCTAAGATGCTCTCGTCTTTCTCACCCATGAGAACATT
TCTGTTTTGTTTTGTTTAAATCCTATATTTTCATATAATAATAAGATAATCCAGGGGCTA
TTATTGTAATGTTTATTTAATATATAATGATATTATGTGTTTTCCTTTT

QA 1 529 1 529
DS 



AS 2 7

CO CL1111Contig1 671 2 5 U
GGGTCGACAGCAAAACTTCTGACAATGGAAGCAATCAGATTCTCTAACGTGTCAGCTCTT
CTTATACTGCTGCTGCTACTGTCACTGTCTCTCCGTGCGACGTCAAAAGACCAAACTGTT
TCTTGCACAATGTGTTCCTCTTGCGACAATCCATGTAACCCTGTCCCGTCTTCCTCTCCG
CCCCCTACTCCTCCGAGCTCCGGCGGCGGCGGTGGATCTTATTATTATTCTCCTCCTCCT
CCTAATCATCCGAGCTCCGGCGGCGACGGCTCTTATTATTATCCTCCTCCTTCAAGTTCA
GGTGGCGGTAAATACCCTCCTCCGTATGGAGACGGTGGACAGAGTTACTATTATCCGCCT
GCTTCTTACGGTAACTACCCGACGCCCCCTCCACCGAATCCCATCGTTCCTTATTTTCCG
TTTTACTTTCACGTTCCTCCTCCAGGAGATTCTGGATCGGATCGTTTAATGAGTTCATTT
CTCTTTGTTCTGTTCTCGTTCTTGATTTGTTTTGTGTGAATGATGAGAGGATCATGTTTT
ACTACTACTTTTACCTTTTTAACTATGCTACTACTTTTTTACTTTCTGTTGACAATTTGT
AATTAACATTATAATTACTCGTTGTCAAGAATCTAGATATGAGCAAAAAAGTATTTATAA
AACTTTTTCTT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG13TF U 1
AF RR2CG13JQ C 1
BS 1 2 RR2CG13JQ
BS 3 386 RR2CG13TF
BS 387 387 RR2CG13JQ
BS 388 648 RR2CG13TF
BS 649 671 RR2CG13JQ

RD RR2CG13TF 655 0 0
GG
GTCGACAGCAAAACTTCTGACAATGGAAGCAATCAGATTCTCTAACGTGTCAGCTCTTCT
TATACTGCTGCTGCTACTGTCACTGTCTCTCCGTGCGACGTCAAAAGACCAAACTGTTTC
TTGCACAATGTGTTCCTCTTGCGACAATCCATGTAACCCTGTCCCGTCTTCCTCTCCGCC
CCCTACTCCTCCGAGCTCCGGCGGCGGCGGTGGATCTTATTATTATTCTCCTCCTCCTCC
TAATCATCCGAGCTCCGGCGGCGACGGCTCTTATTATTATCCTCCTCCTTCAAGTTCAGG
TGGCGGTAAATACCCTCCTCCGTATGGAGACGGTGGACAGAGTTACTATTATCCGCCTGC
TTCTTACGGTAACTACCCGACGCCGCCTCCACCGAATCCCATCGTTCCTTATTTTCCGTT
TTACTTTCACGTTCCTCCTCCAGGAGATTCTGGATCGGATCGTTTAATGAGTTCATTTCT
CTTTGTTCTGTTCTCGTTCTTGATTTGTTTTGTGTGAATGATGAGAGGATCATGTTTTAC
TACTACTTTTACCTTTTTAACTATGCTACTACTTTTTTACTTTCTGTTGACAATTTGTAA
TTAACATTATAATTACTCGTTGTCAAGAATCTAGATATGAGCAAAA
AAGTATT

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR2CG13JQ 671 0 0
GGGTCGACAGCAAAACTTCTGACAATGGAAGCAATCAGATTCTCTAACGTGTCAGCTCTT
CTTATACTGCTGCTGCTACTGTCACTGTCTCTCCGTGCGACGTCAAAAGACCAAACTGTT
TCTTGCACAATGTGTTCCTCTTGCGACAATCCATGTAACCCTGTCCCGTCTTCCTCTCCG
CCCCCTACTCCTCCGAGCTCCGGCGGCGGCGGTGGATCTTATTATTATTCTCCTCCTCCT
CCTAATCATCCGAGCTCCGGCGGCGACGGCTCTTATTATTATCCTCCTCCTTCAAGTTCA
GGTGGCGGTAAATACCCTCCTCCGTATGGAGACGGTGGACAGAGTTACTATTATCCGCCT
GCTTCTTACGGTAACTACCCGACGCCCCCTCCACCGAATCCCATCGTTCCTTATTTTCCG
TTTTACTTTCACGTTCCTCCTCCAGGAGATTCTGGATCGGATCGTTTAATGAGTTCATTT
CTCTTTGTTCTGTTCTCGTTCTTGATTTGTTTTGTGTGAATGATGAGAGGATCATGTTTT
ACTACTACTTTTACCTTTTTAACTATGCTACTACTTTTTTACTTTCTGTTGACAATTTGT
AATTAACATTATAATTACTCGTTGTCAAGAATCTAGATATGAGCAAAAAAGTATTTATAA
AACTTTTTCTT

QA 1 671 1 671
DS 



CO CL1111Contig2 754 5 12 U
GGTGAATGTGCTTTGTTCTCTCTCTCTCTCTCCATCCGTTCATTTTATCTTCTCTCCTCC
TTATCACTTGATCTTTTTTCCTAATCTTTCGCTCATTTGTCGACAGCAAAACTTCTGACA
ATGGAAGCAATCAGATTCTCTAACGTGTCAGCTCTTCTTATACTGCTGCTACCGTCACTG
TCTCTCCGTGCGACGTCAAAAGACCAAACTGTTTCTTGCACAATGTGTACCTCTTGCGAC
AATCCATGTAACCCTGTCCCGTCTTCCTCTCCGCCCCCTACTCCTCCGAGCTCCGGCGGC
GGCGGTGGATCTTATTATTATTCTCCTCCTCCTCCTAATCATCCGAGCTCCGGCGGCGAC
GGCTCTTATTATTATCCTCCTCCTTCAAGTTCCGGTGGTGGTAAATACCCTCCTCCGTAT
GGAGACGGTGGACAAAGTTACTATTATCCGCCTGCTTCTTACGGTAACTACCCGACGCCG
CCTCCGCCGAATCCCATCGTTCCTTATTTTCCGTTTTACTTTCACGTTCCTCCTCCGGGA
GATTCTGGATCGGATCGTTTAATGAGTTCATTTCTCTTTGTTCTGTTCTCGTTCTTGATT
TGTTTTGGGTGAATGATGAGAAGGATCATGTTTTACTACTACTTTTACCTTTTT**AACT
ATGCTACTACTTTTTTACTTTCTGTTGACAATTTGTAATTAACATCATAATTACTCGTTG
TTAAGATCTAGATATGAGCAAAAGTAATTATGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 
35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G672TF U 1
AF RR2B732TF U 2
AF RR2FR52JQ C 456
AF RR2FR52TF U 3
AF RR2E156TF U 6
BS 1 172 RR2G672TF
BS 173 173 RR2B732TF
BS 174 434 RR2G672TF
BS 435 435 RR2B732TF
BS 436 575 RR2G672TF
BS 576 621 RR2B732TF
BS 622 622 RR2FR52TF
BS 623 654 RR2B732TF
BS 655 656 RR2FR52TF
BS 657 705 RR2B732TF
BS 706 721 RR2FR52TF
BS 722 754 RR2E156TF

RD RR2G672TF 575 0 0
GGTGAATGTGCTTTGTTCTCTCTCTCTCTCTCCATCCGTTCATTTTATCTTCTCTCCTCC
TTATCACTTGATCTTTTTTCCTAATCTTTCGCTCATTTGTCGACAGCAAAACTTCTGACA
ATGGAAGCAATCAGATTCTCTAACGTGTCAGCTCTTCTTATACTGCTGCTACTGTCACTG
TCTCTCCGTGCGACGTCAAAAGACCAAACTGTTTCTTGCACAATGTGTACCTCTTGCGAC
AATCCATGTAACCCTGTCCCGTCTTCCTCTCCGCCCCCTACTCCTCCGAGCTCCGGCGGC
GGCGGTGGATCTTATTATTATTCTCCTCCTCCTCCTAATCATCCGAGCTCCGGCGGCGAC
GGCTCTTATTATTATCCTCCTCCTTCAAGTTCCGGTGGTGGTAAATACCCTCCTCCGTAT
GGAGACGGTGGACAGAGTTACTATTATCCGCCTGCTTCTTACGGTAACTACCCGACGCCG
CCTCCGCCGAATCCCATCGTTCCTTATTTTCCGTTTTACTTTCACGTTCCTCCTCCGGGA
GATTCTGGATCGGATCGTTTAATGAGTTCATTTCT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2B732TF 706 0 0
GGGAATGTGCTTTGTTCTC
TCTCTCTCTCTCCATCCGTTCATTTTATCTTCTCTCCTCCTTATCACTTGATCTTTTTTC
CTAATCTTTCGCTCATTTGTCGACAGCAAAACTTCTGACAATGGAAGCAATCAGATTTTC
TAACGTGTCAGCTCTTCTTATACTGCTGCTACCGTCACTGTCTCTCCGTGCGACGTCAAA
AGACCAAACTGTTTCTTGCACAATGTGTACCTCTTGCGACAATCCATGTAACCCTGTCCC
GTCTTCCTCTCCGCCCCCTACTCCTCCGAGCTCCGGCGGCGGCGGTGGATCTTATTATTA
TTCTCCTCCTCCTCCTAATCATCCGAGCTCCGGCGGCGACGGCTCTTATTATTATCCTCC
TCCTTCAAGTTCCGGTGGTGGTAAATACCCTCCTCCGTATGGAGACGGTGGACAAAGTTA
CTATTATCCGCCTGCTTCTTACGGTAACTACCCAACGCCGCCTCCGCCGAATCCCATCGT
TCCTTATTTTCCGTTTTACTTTCACGTACCTCCTCCGGGAGATTCTGGATCGGATCGTTT
AAAGAGTTCATTTCTCTTTGTTCTGTTCTCGTTCTTGATTTGTTTTGGGTGAATGATGAG
A*GGATCATGTTTTACTACTACTTTTACCTTTTTTTAACTATGCTACTACTTTTTTACTT
TCTGTTGACAATTTGTAATTAACAT
CA

QA 20 704 20 704
DS 

RD RR2FR52JQ 211 0 0
TTT
TTACGGTAACTACCCGACGCCGCCTCCGCCGAATCCCATCGTTCCTTATTTTCCGTTTTA
CTTTCACGTTCCTCCTCCGGGGGATTTTGGATCGGATCGTTTAATGAGTTCATTTTTCTT
TGTTCTGTTTTCGTTCTTGATTTGTTTTGGGGGAATGATGAGAAGGATCATGTTTTACTA
CTACTTTTACCTTTTT**AACTATGCTA

QA 4 211 4 211
DS 

RD RR2FR52TF 735 0 0
GGAATGTGCTTTGTTCTC
TCTCTCTCTCTCCATCCGTTCATTTTATCTTCTCTCCTCCTTATCACTTGATCTTTTTTC
CTAATCTTTCGCTCATTTGTCGACAGCAAAACTTCTGACAATGGAAGCAATCAGATTCTC
TAACGTGTCAGCTCTTCTTATACTGCTGCTACTGTCACTGTCTCTCCGTGCGACGTCAAA
AGACCAAACTGTTTCTTGCACAATGTGTACCTCTTGCGACAATCCATGTAACCCTGTCCC
GTCTTCCTCTCCGCCCCCTACTCCTCCGAGCTCCGGCGGCGGCGGTGGATCTTATTATTA
TTCTCCTCCTCCTCCTAATCATCCGAGCTCCGGCGGCGACGGCTCTTATTATTATCCTCC
TCCTTCAAGTTCCGGTGGTGGTAAATACCCTCCTCCGTATGGAGACGGTGGACAGAGTTG
CTATTATCCGCCTGCTTCTTACGGTAACTACCCGACGCCGCCTCCGCCGAATCCCATCGT
TCCTTATTTTCCGTTTTACTTTCACGTTCCTCCTCCGGGAGATTCTGGATCGGATCGTTT
AATGAGTTCATTTCTCTTTGTTCTGTTCTCGTTCTTGATTTGTTTTGGGTGAATGATGAG
AAGGATCATGTTTTACTACTACTTTTACCTTTTT**AACTATGCTACTACTTTTTTACTT
TCTGTTGACAATTTGTAATTAACATCATAATTACTCGTTGT
TAGATCTAGATATGAG

QA 19 719 19 719
DS 

RD RR2E156TF 749 0 0
GGGAATGTGCTTTGT
TCTCTCTCTCTCCATCCGTTCATTTTATCTTCTCTCCTCCTTATCACTTGATCTTTTTTC
CTAATCTTTCGCTCATTTGTCGACAGCAAAACTTCTGACAATGGAAGCAATCAGATTTTC
TAACGTGTCAGCTCTTCTTATACCGCTGCTACCGTCACTGTCTCTCCGTGCGACGTCAAA
AGACCAAACTGTTTCTTGCACAATGTGTACCTCTTGCGACAATCCATGTAACCCTGTCCC
GTCTTCCTCTCCGCCCCCTACTCCTCCGAGCTCCGGCGGCGGCGGTGGATCTTATTATTA
TTCTCCTCCTCCTCCTAATCATCCGAGCTCCGGCGGCGACGGCTCTTATTATTATCCTCC
TCCTTCAAGTTCCGGTGGTGGTAAATGCCCTCCTCCGTATGGAGACGGTGGACAAAGTTA
CTATTATCCGCCTGCTTCTTACGGTAACTACCCAACGCCGCCTCCGCCGAATCCCATCGT
TCCTTATTTTCCGTTTTACTTTCACGTACCTCCTCCGGGAGATTCTGGATCGGATCGTTT
AAAGAGTTCATTTCTCTTTGTTCTGTTCTCGTTCTTGATTTGTTTTGGGTGAATGATGAG
A*GGATCATGTTTTACTACTACTTTTACCTTTTTTTAACTATGCTACTACTTTTTTACTT
TCTGTTGACAATTTGTAATTAACATCATAATTACTCGTTGTTAAGATCTAGATATGAGCA
AAAGTAATTATGAA

QA 16 749 16 749
DS 



AS 1 7

CO CL1112Contig1 1719 7 16 U
GGACTCACAAATCAGCCAACATCACTTCTTTCTTCTTCTTTTTCAGCGAAGTCTGTTTTT
TTCATATAGTGATAATGTACCAAACCGATATGAAATTCTGTAGTAGCTATTTTCTGGTCG
ATCCGACCAAAGCGAGTGTTCTTGATCTCCTTCTCCTTTTATTTTTCCCCAACCTGACCA
ACACAGGATTCATAGATTCTCCCCCGGACACGCTCAAAAGCGTCCGGAGAACTTTCGCAA
GTCGATGGATCATTGTGTTAGCCGTTTTGGTTCAAAAGATATTAATGCTCTTAAGAGAAC
CCTTTGCATCCGTAGGTCGTTTCCTCACCTATTGGCCTAATCTTCTTACGGCAAATGGAG
GCTTCTTCAAGTTGATACTTCATATTTTGACAGGAAAGTTGGTACAGCCTGAGGAATCGT
CGGCGACATATGTGTCATTTGTAGGATGCACAGATCGAAGAGTAGAGCTTGACAAGATAT
TAAGTGTTGGTACCATCGAGTACAAGTCGATGTTGTCAATAATGGCTTCTAAGGTCTCTT
ATGAGAACAAATCTTTCATCACTTCCGTAGTAAAGAACACTTGGAAGATGGACTTCGTGA
GTTACTACGACTTTTACAACGCATTCCAAAATAGAAACCTGACGCAAGCCTTCGTGTTCA
AGGCATCGAGTACAAATCCAAATCTTATCGTCGTTAGCTTCAGAGGAACCGAGCCTTTCG
ACGTTGATGATTGGTGCACTGATCTCGACATCTCTTGGTACGAGTTGAAAAACGTTGGCA
AAGTTCACGCAGGGTTCTCTAAAGCTCTAGGCCTCCAAAAAAACGGATGGCCCAAAGAAA
TTATACCTCTAGGACACCAATATGCGTACTACACAATTAGACAGAAGCTTAGGGACATGT
TTGCAAAAAACAAGAACCTTAAGTTTATTCTAACGGGTCACAGCCTTGGTGGCGCACTAG
CCGCTCTTTTTCCGGCAGTACTGGCGATTCACGGTGAGGATGAGTTGCTAGATAAACTAG
AGGGAGTGTACACATTTGGACAGCCACGCATAGGGGATGAGGTGTTTGGGGAGTTTATGA
AGGAAGTAGTGAGAAAGCATGGAATAGAGTATGAGAGGTTTGTTTATAACAACGATATTG
TGCCTAGGATACCCTTTGATGACAAGGTTTTATTCGCGTTCAAGCACTACGGATCTTGCA
ATTACTTCAATAGTCTCTACAAAGGAAAGGTAAGGGAAGATGCACCAAATGCAAATTACT
TCAGCTTGTTGTGGCTAATACCGAAGCTGTTAAATGGTGCGTGGGAGTTCATAAGGAGTT
TCATAATACGGTTTTGGAAAGGCAGAGACTACAAAGAAAATTGGATTATGACGTTTATTA
GGATTTTTGGAATAATATTCCCTGGTGCCTCTAATCATCTGCCATATGATTACGTCAACT
CCACACGCTTGGGAGGCTTGGCTCGACCATTTGCTGCTACTACTCCAGAGGATAAACTTG
CCCTTATTGCTTAACTCAAAGCCACTCTAAATTTGTAGTAATCGTATCTACTTTATGCGC
TCTTGTTGGGTTCAATAAATTGTACTGGAGCATTTATTCTCGTTATATGTAATAATCGCA
TCTCTACTCTATGTGCTTCCTCAATAAATTGTACTGGAGCATTTATTGTCTGTGTATGTT
TTGTGTATGTGTGACTTTTATCGTGTTATTATAATGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2BD09TF U 1
AF RR2BA91TF U 443
AF RR2AZ72TFB U 792
AF RR2GY38TF U 1066
AF RR2BD09JQ C 851
AF RR2BA91JQ C 972
AF RR2AZ72JQ C 994
BS 1 767 RR2BD09TF
BS 768 1100 RR2BA91TF
BS 1101 1101 RR2AZ72TFB
BS 1102 1168 RR2BA91TF
BS 1169 1169 RR2AZ72TFB
BS 1170 1220 RR2BA91TF
BS 1221 1378 RR2AZ72TFB
BS 1379 1381 RR2GY38TF
BS 1382 1382 RR2BD09JQ
BS 1383 1437 RR2GY38TF
BS 1438 1486 RR2BD09JQ
BS 1487 1487 RR2BA91JQ
BS 1488 1660 RR2BD09JQ
BS 1661 1686 RR2BA91JQ
BS 1687 1687 RR2AZ72JQ
BS 1688 1719 RR2BA91JQ

RD RR2BD09TF 767 0 0
GGACTCACAAATCAGCCAACATCACTTCTTTCTTCTTCTTTTTCAGCGAAGTCTGTTTTT
TTCATATAGTGATAATGTACCAAACCGATATGAAATTCTGTAGTAGCTATTTTCTGGTCG
ATCCGACCAAAGCGAGTGTTCTTGATCTCCTTCTCCTTTTATTTTTCCCCAACCTGACCA
ACACAGGATTCATAGATTCTCCCCCGGACACGCTCAAAAGCGTCCGGAGAACTTTCGCAA
GTCGATGGATCATTGTGTTAGCCGTTTTGGTTCAAAAGATATTAATGCTCTTAAGAGAAC
CCTTTGCATCCGTAGGTCGTTTCCTCACCTATTGGCCTAATCTTCTTACGGCAAATGGAG
GCTTCTTCAAGTTGATACTTCATATTTTGACAGGAAAGTTGGTACAGCCTGAGGAATCGT
CGGCGACATATGTGTCATTTGTAGGATGCACAGATCGAAGAGTAGAGCTTGACAAGATAT
TAAGTGTTGGTACCATCGAGTACAAGTCGATGTTGTCAATAATGGCTTCTAAGGTCTCTT
ATGAGAACAAATCTTTCATCACTTCCGTAGTAAAGAACACTTGGAAGATGGACTTCGTGA
GTTACTACGACTTTTACAACGCATTCCAAAATAGAAACCTGACGCAAGCCTTCGTGTTCA
AGGCATCGAGTACAAATCCAAATCTTATCGTCGTTAGCTTCAGAGGAACCGAGCCTTTCG
ACGTTGATGATTGGTGCACTGATCTCGACATCTCTTGGTACGAGTTG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2BA91TF 778 0 0
G
GGATGCACAGATCGAAGAGTAGAGCTTGACAAGATATTAAGTGTTGGTACCATCGAGTAC
AAGTCGATGTTGTCAATAATGGCTTCTAAGGTCTCTTATGAGAACAAATCTTTCATCACT
TCCGTAGTAAAGAACACTTGGAAGATGGACTTCGTGAGTTACTACGACTTTTACAACGCA
TTCCAAAATAGAAACCTGACGCAAGCCTTCGTGTTCAAGGCATCGAGTACAAATCCAAAT
CTTATCGTCGTTAGCTTCAGAGGAACCGAGCCTTTCGACGTTGATGATTGGTGCACTGAT
CTCGACATCTCTTGGTACGAGTTGAAAAACGTTGGCAAAGTTCACGCAGGGTTCTCTAAA
GCTCTAGGCCTCCAAAAAAACGGATGGCCCAAAGAAATTATACCTCTAGGACACCAATAT
GCGTACTACACAATTAGACAGAAGCTTAGGGACATGTTTGCAAAAAACAAGAACCTTAAG
TTTATTCTAACGGGTCACAGCCTTGGTGGCGCACTAGCCGCTCTTTTTCCGGCAGTACTG
GCGATTCACGGTGAGGATGAGTTGCTAGATAAACTAGAGGGAGTGTACACATTTGGACAG
CCACGCATAGGGGATGAGGTGTTTGGGGAGTTTATGAAGGAAGTAGTGAGAAAGCATAGA
ATAGAGTATGAGAGGTTTGTTTATAACAACGATATTGTGCCTAGGATACCCTTTGATGAC
AAGGTATTATTCGCGTTCAAGCACTACGGATCTTGCAATTACTTCAATAGTCTCTAC

QA 2 778 2 778
DS 

RD RR2AZ72TFB 587 0 0
GGGTTCTCTAAAGCTCTAGGCCTCCAAAAAAACGGATGGGCCAAAGAAATTATACCTCTA
GGACACCAATATGCGTACTACACAATTAGACAGAAGCTTAGGGACATGTTTGCAAAAAAC
AAGAACCTTAAGTTTATTCTAACGGGTCACAGCCTTGGTGGCGCACTAGCCGCTCTTTTT
CCGGCAGTACTGGCGATTCACGGTGAGGATGAGTTGCTAGATAAACTAGAGGGAGTGTAC
ACATTTGGACAGCCACGCATAGGGGATGAGGTGTTTGGGGAGTTTATGAAGGAAGTAGTG
AGAAAGCATGGAATAGAGTATGAGAGGTTTGTTTATAACAACGATATTGTGCCTAGGATA
CCCTTTGATGACAAGGTTTTATTCGCGTTCAAGCACTACGGATCTTGCAATT**TTCAAT
AGTCTCTACAAAGGAAAGGTAAGGGAAGATGCACCAAATGCAAATTACTTCAGCTTGTTG
TGGCTAATACCGAAGCTGTTAAATGGTGCGTGGGAGTTCATAAGGAGTTTCATAATACGG
TTTTGGAAAGGCAGAGACTACAAAGAAAATTGGATTATGACGTTTAT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2GY38TF 372 0 0
G
TGGGGAGTTTATGAAGGAAGTAGTGAGAAAGCATGGAATAGAGTATGAGAGGTTTGTTTA
TAACAACGATATTGTGCCTAGGATACCCTTTGATGACAAGGTTTTATTCGCGTTCAAGCA
CTACGGATCTTGCAATTACTTCAATAGTCTCTACAAAGGAAAGGTAAGGGAAGATGCACC
AAATGCAAATTACTTCAGCTTGTTGTGGCTAATACCGAAGCTGTTAAATGGTGCGTGGGA
GTTCATAAAGAGTTTCATAATACGGTTTTGGAAAG*CAGAGACTACAA*GAAAATTGGAT
TATGACATTTATTAG*ATTTTTGGAATAATATTCCCTGGTGCCTCTAATCATCTGCCATA
TGATTACGTCA

QA 2 372 2 372
DS 

RD RR2BD09JQ 810 0 0
AGGACACCAATATGCGTACTACACAATTAGACAGAAGCTTAGGGACATGTTTGCAAAAAA
CAAGAACCTTAAGTTTATTCTAACGGGTCACAGCCTTGGTGGCGCACTAGCCGCTCTTTT
TCCGGCAGTACTGGCGATTCACGGTGAGGATGAGTTGCTAGATAAACTAGAGGGAGTGTA
CACATTTGGACAGCCACGCATAGGGGATGAGGTGTTTGGGGAGTTTATGAAGGAAGTAGT
GAGAAAGCATGGAATAGAGTATGAGAGGTTTGTTTATAACAACGATATTGTGCCTAGGAT
ACCCTTTGATGACAAGGTTTTATTCGCGTTCAAGCACTACGGATCTTGCAATTACTTCAA
TAGTCTCTACAAAGGAAAGGTAAGGGAAGATGCACCAAATGCAAATTACTTCAGCTTGTT
GTGGCTAATACCGAAGCTGTTAAATGGTGCGTGGGAGTTCATAAGGAGTTTCATAATACG
GTTTTGGAAAGGCAGAGACTACAAAGAAAATTGGATTATGACGTTTATTAGGATTTTTGG
AATAATATTCCCTGGTGCCTCTAATCATCTGCCATATGATTACGTCAACTCCACACGCTT
GGGAGGCTTGGCTCGACCATTTGCTGCTACTACTCCGGAGGATAAACTTGCCCTTATTGC
TTAACTCAAAGCCACTCTAAATTTGTAGTAATCGTATCTACTTTATGCGCTCTTGTTGGG
TTCAATAAATTGTACTGGAGCATTTATTCTCGTTATATGTAATAATCGCATCTCTACTCT
ATGTGCTTCCTCAATAAATTGTACTGGAGC

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR2BA91JQ 748 0 0
CCGGCAGTACTGGCGATTCACGGTGAGGATGAGTTGCTAGATAAACTAGAGGGAGTGTAC
ACATTTGGACAGCCACGCATAGGGGATGAGGTGTTTGGGGAGTTTATGAAGGAAGTAGTG
AGAAAGCATAGAATAGAGTATGAGAGGTTTGTTTATAACAACGATATTGTGCCTAGGATA
CCCTTTGATGACAAGGTATTATTCGCGTTCAAGCACTACGGATCTTGCAATTACTTCAAT
AGTCTCTACAAAGGAAAGGTAAGGGAAGATGCACCAAATGCAAATTACTTCAGCTTGTTG
TGGCTAATACCGAAGCTGTTAAATGGTGCGTGGGAGTTCATAAGGAGTTTCATAATACGG
TTTTGGAAAGGCAGAGACTACAAAGAAAATTGGATTATGACGTTTATTAGGATTTTTGGA
ATAATATTCCCTGGTGCCTCTAATCATCTGCCATATGATTACGTCAACTCCACACGCTTG
GGAGGCTTGGCTCGACCATTTGCTGCTACTACTCCAGAGGATAAACTTGCCCTTATTGCT
TAACTCAAAGCCACTCTAAATTTGTAGTAATCGTATCTACTTTATGCGCTCTTGTTGGGT
TCAATAAATTGTACTGGAGCATTTATTCTCGTTATATGTAATAATCGCATCTCTACTCTA
TGTGCTTCCTCAATAAATTGTACTGGAGCATTTATTGTCTGTGTATGTTTTGTGTGTGTG
TGACTTTTATCGTGTTATTATAATGTTG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2AZ72JQ 726 0 0
GTGAGGATGAGTTGCTAGATAAACTAGAGGGAGTGTACACATTTGGACAGCCACGCATAG
GGGATGAGGTGTTTGGGGAGTTTATGAAGGAAGTAGTGAGAAAGCATGGAATAGAGTATG
AGAGGTTTGTTTATAACAACGATATTGTGCCTAGGATACCCTTTGATGACAAGGTTTTAT
TCGCGTTCAAGCACTACGGATCTTGCAATT**TTCAATAGTCTCTACAAAGGAAAGGTAA
GGGAAGATGCACCAAATGCAAATTACTTCAGCTTGTTGTGGCTAATACCGAAGCTGTTAA
ATGGTGCGTGGGAGTTCATAAGGAGTTTCATAATACGGTTTTGGAAAGGCAGAGACTACA
AAGAAAATTGGATTATGACGTTTATTAGGATTTTTGGAATAATATTCCCTGGTGCCTCTA
ATCATCTGCCATATGATTACGTCAACTCCACACGCTTGGGAGGCTTGGCTCGACCATTTG
CTGCTACTACTCCAGAGGATAAACTTGCCCTTATTGCTTAACTCAAAGCCACTCTAAATT
TGTAGTAATCGTATCTACTTTATGCGCTCTTGTTGGGTTCAATAAATTGTACTGGAGCAT
TTATTCTCGTTATATGTAATAATCGCATCTCTACTCTATGTGCTTCCTCAATAAATTGTA
CTGGAGCATTTATTGTCTGTGTATGTTTTGTGTATGTGTGACTTTTATCGTGTTATTATA
ATGTTG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 6

CO CL1113Contig1 1210 6 8 U
GCACCATCACCCACACACACAACTCAAATCAGCTTAGGAAAATGAGGTTTTCTCCTTCGT
TTTCTTGCATCATGGGAGCCCTAGTATTGAGTTGCCTTCTCCTTCAAGCATCAAACTCTA
ACGCTCAACCATTAAGTCCTGATTTCTATTCCAGAACATGCCCGCGTGTGTTCGATATCA
TTAGGAGGACCATCGTTGCTGAATTACGCTCCGATCCTCGTATTGCCGCTAGCATCCTTC
GTCTTCACTTCCATGACTGTTTTGTTAATGGTTGTGATGCATCGATCCTGCTGGACAGTT
CCACATCTTTCAGGACCGAGAAAGATGCTGCTCCAAACGCTAATTCGGCTAGAGGGTTTG
ACGTCATAGATAGAATGAAAGCCGAGATTGAGATAGCGTGCCCAAGAACAGTTTCTTGTG
CAGATGTTCTTACCATCGCTTCTCAAATATCAGTGATTTTGTCAGGAGGTCCAGGGTGGC
AGGTTCCATTGGGAAGGAGAGACAGCTTACGAGCCCTCTTCGATCTGGCTAATACAGCTC
TTCCTTCTCCATTTTTCACACTTGCTCAACTTAATGCAAGTTTTGCTGCGGTTGGTCTAA
ACCGCCCCTCCGATCTAGTCGCTCTTTCTGGTGGTCACACATTTGGAAAAGCACAATGTC
AATTTGTGACACCTCGTCTCTACAACTTCAATGGTACCAATAGACCTGACCCTAGTCTCA
*CCCAACTTACCTCACCCAACTCCGTGGATTGTGCCCTCAAAACGGAATCGGCACTGTTT
TGGTCAACTTCGACCCTGTGACTCCAGGTGGTTTCGATAATCAGTACTACACCAATCTCC
GTAATGGGAGAGGACTGATTCAGAGCGATCAAGAACTGTTTTCAACCCCACGAGCATTTA
CGATTCCACTAGTGGAGCAATACAGCAACAACAGGCTCGTGTTCTTTCAAGCATTCGCCG
AAGCAATGATTCGGATGGGAAATCTCAAACCTTTGACTGGAACTCAAGGCGAGATAAGAC
GGAATTGTAGGGTTGTGAACTCAAGGATCAGGAGTGTGGAGAATGAGGATGATGGTGTTG
TGAGTTCGATTTGATCATGCTGGGGATATGAATATGTAAGAAAATATAAAAATGAGTGGG
GAACAATATATGTATTTCGACTAAATAAATGTTCACACTAGTTATGAGATTACTATGATA
TCTGGTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN36TF U 4
AF RR2FU60TF U 4
AF RR2EP34TF U 1
AF RR2FZ37TF U 4
AF RR2FU60JQ C 748
AF RR2EP34JQ C 320
BS 1 89 RR2EP34TF
BS 90 90 RR2FN36TF
BS 91 170 RR2EP34TF
BS 171 171 RR2FN36TF
BS 172 762 RR2EP34TF
BS 763 1036 RR2EP34JQ
BS 1037 1037 RR2FU60JQ
BS 1038 1210 RR2EP34JQ

RD RR2FN36TF 687 0 0
GG
ATCACCCACACACACAACTCAAATCAGCTTAGGAAAATGAGGTTTTCTCCTTCGTTTTCT
TGCATCATGGGAGCCCTAGTATTGAGTTGCCTTCTCCTTCAAGCATCAAACTCTAACGCT
CAACCATTAAGTCCTGATTTCTATTCCAGAACATGCCCGCGTGTGTTCGATATCATTAGG
AGGACCATCGTTGCTGAATTACGCTCCGATCCTCGTATTGCCGCTAGCATCCTTCGTCTT
CACTTCCATGACTGTTTTGTTAATGGTTGTGATGCATCGATCCTGCTGGACAGTTCCACA
TCCTTCAGGACCGAGAAAGATGCTGCTCCAAACGCTAATTCGGCTAGAGGGTTTGACGTC
ATAGATAGAATGAAAGCCGAGATTGAGATAGCGTGCCCAAGAACAGTTTCTTGTGCAGAT
GTTCTTACCATCGCTTCTCAAATATCAGTGATTTTGTCAGGAGGTCCAGGGTGGCAGGTT
CCATTGGGAAGGAGAGACAGCTTACGAGCTTTCTTCGATCTGGCTAATACAGCTCTTCCT
TCTCCATTTTTCACACTTGCTCAACTTAATGCAAGTTTTGCTGCGGTTGGTCTAAACCGC
CCCTCCGATCTAGTCGCTCTTTCTGGTGGTCACACATTTGGAAAAGCACAATGTCAATTT
GTGACACCTCGTCTCTACAACTTCA

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR2FU60TF 714 0 0
GG
ATCACCCACACACGCAACTCAAATCAGCTTAGGAAAATGAGGTTTTCTCCTTCGTTTTCT
TGCATCATGGGAGCCCTAGTATTGAGTTGCCTTCTCCTTCAAGCATCAAACTCTAACGCT
CAACCATTAAGTCCTGATTTCTATTCCAGAACATGCCCGCGTGTGTTCGATATCATTAGG
AGGACCATCGTTGCTGAATTACGCTCCGATCCTCGTATTGCCGCTAGCATCCTTCGTCTT
CACTTCCATGACTGTTTTGTTAATGGTTGTGATGCATCGATCCTGCTGGACAGTTCCACA
TCTTTCAGGACCGAGAAAGATGCTGCTCCAAACGCTAATTCGGCTAGAGGGTTTGACGTC
ATAGATAGAATGAAAGCCGAGATTGAGATAGCGTGCCCAAGAACAGTTTCTTGTGCAGAT
GTTCTTACCATCGCTTCTCAAATATCAGTGATTTTGTCAGGAGGTCCAGGGTGGCAGGTT
CCATTGGGAAGGAGAGACAGCTTACGAGCTTTCTTCGATCTGGCTAATACAGCTCTTCCT
TCTCCATTTTTCACACTTGCTCAACTTAATGCAAGTTTTGCTGCGGTTGGTCTAAACCGC
CCCTCCGATCTAGTCGCTCTTTCTGGTGGTCACACATTTGGAAAAGCACAATGTCAATTT
GTGACACCTCGTCTCTACAACTTCAATGGTACCAATAGACCTGACCCTAGTC

QA 3 714 3 714
DS 

RD RR2EP34TF 766 0 0
GCACCATCACCCACACACACAACTCAAATCAGCTTAGGAAAATGAGGTTTTCTCCTTCGT
TTTCTTGCATCATGGGAGCCCTAGTATTGGGTTGCCTTCTCCTTCAAGCATCAAACTCTA
ACGCTCAACCATTAAGTCCTGATTTCTATTCCAGAACATGCCCGCGTGTGCTCGATATCA
TTAGGAGGACCATCGTTGCTGAATTACGCTCCGATCCTCGTATTGCCGCTAGCATCCTTC
GTCTTCACTTCCATGACTGTTTTGTTAATGGTTGTGATGCATCGATCCTGCTGGACAGTT
CCACATCTTTCAGGACCGAGAAAGATGCTGCTCCAAACGCTAATTCGGCTAGAGGGTTTG
ACGTCATAGATAGAATGAAAGCCGAGATTGAGATAGCGTGCCCAAGAACAGTTTCTTGTG
CAGATGTTCTTACCATCGCTTCTCAAATATCAGTGATTTTGTCAGGAGGTCCAGGGTGGC
AGGTTCCATTGGGAAGGAGAGACAGCTTACGAGCCCTCTTCGATCTGGCTAATACAGCTC
TTCCTTCTCCATTTTTCACACTTGCTCAACTTAATGCAAGTTTTGCTGCGGTTGGTCTAA
ACCGCCCCTCCGATCTAGTCGCTCTTTCTGGTGGTCACACATTTGGAAAAGCACAATGTC
AATTTGTGACACCTCGTCTCTACAACTTCAATGGTACCAATAGACCTGACCCTAGTCTCA
*CCCAACTTACCTCACCCAACTCCGTGGATTGTGCCCTCAAA
CGGA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2FZ37TF 729 0 0
GG
ATCACCCACACACACAACTCAAATCAGCTTAGGAAAATGAGGTTTTCTCCTTCGTTTTCT
TGCATCATGGGAGCCCTAGTATTGGGTTGCCTTCTCCTTCAAGCATCAAACTCTAACGCT
CAACCATTAAGTCCTGATTTCTATTCCAGAACATGCCCGCGTGTGTTCGATATCATTAGG
AGGACCATCGTTGCTGAATTACGCTCCGATCCTCGTATTGCCGCTAGCATCCTTCGTCTT
CACTTCCATGACTGTTTTTTTAATGGTTGTGATGCATCGATCCTGCTGGACAGTTCCACA
TCTTTCAGGACCGAGAAAGATGCTGCTCCAAACGCTAATTCGGCTAGAGGGTTTGACGTC
ATAGATAGAATGAAAGCCGAGATTGAGATAGCGTGCCCAAGAACAGTTTCTTGTGCAGAT
GTTCTTACCATCGCTTCTCAAATATCAGTGATTTTGTCAGGAGGTCCAGGGTGGCAGGTT
CCATTGGGAAGGAGAGACAGCTTACGAGCTTTCTTCGATCTGGCTAATACAGCTCTTCCT
TCTCCATTTTTCACACTTGCTCAACTTAATGCAAGTTTTGCTGCGGTTGGTCTAAACCGC
CCCTCCGATCTAGTCGCTCTTTCTGGTGGTCACACATTTGGAAAAGCACAATGTCAATTT
GTGACACCTCGTCTCTACAACTTCAATGGTACCA*TAGACCTGACCCTAGTCTCA*CCCA
ACTTACC

QA 3 729 3 729
DS 

RD RR2FU60JQ 320 0 0
GATTGTGCCCTCAAAACGGAATCGGCACTGTTTTGGTCAACTTCGACCCTGTGACTCCAG
GTGGTTTCGATAATCAGTACTACACCAATCTCCGTAATGGGAGAGGACTGATTCAGAGCG
ATCAAGAACTGTTTTCAACCCCACGAGCATTTACGTTTCCACTAGTGGAGCAATACAGCA
ACAACAGGCTCGTGTTCTTTCAAGCATTCGCCGAAGCAATGATTCGGATGGGAAATCTCA
AACCTTTGACTGGAACTCAAGGCGAGATAAGACGGAATTGTAGGGTTGTGAACTCAAGGA
TCAGGAGTGTGGAGAATGAG

QA 1 320 1 320
DS 

RD RR2EP34JQ 891 0 0
GAAAGATGCTGCTCCAAACGCTAATTCGGCTAGAGGGTTTGACGTCATAGATAGAATGAA
AGCCGAGATTGAGATAGCGTGCCCAAGAACAGTTTCTTGTGCAGATGTTCTTACCATCGC
TTCTCAAATATCAGTGATTTTGTCAGGAGGTCCAGGGTGGCAGGTTCCATTGGGAAGGAG
AGACAGCTTACGAGCCCTCTTCGATCTGGCTAATACAGCTCTTCCTTCTCCATTTTTCAC
ACTTGCTCAACTTAATGCAAGTTTTGCTGCGGTTGGTCTAAACCGCCCCTCCGATCTAGT
CGCTCTTTCTGGTGGTCACACATTTGGAAAAGCACAATGTCAATTTGTGACACCTCGTCT
CTACAACTTCAATGGTACCAATAGACCTGACCCTAGTCTCAACCCAACTTACCTCACCCA
ACTCCGTGGATTGTGCCCTCAAAACGGAATCGGCACTGTTTTGGTCAACTTCGACCCTGT
GACTCCAGGTGGTTTCGATAATCAGTACTACACCAATCTCCGTAATGGGAGAGGACTGAT
TCAGAGCGATCAAGAACTGTTTTCAACCCCACGAGCATTTACGATTCCACTAGTGGAGCA
ATACAGCAACAACAGGCTCGTGTTCTTTCAAGCATTCGCCGAAGCAATGATTCGGATGGG
AAATCTCAAACCTTTGACTGGAACTCAAGGCGAGATAAGACGGAATTGTAGGGTTGTTAA
CTCAAGGATCAGGAGTGTGGAGAATGAGGATGATGGTGTTGTGAGTTCGATTTGATCATG
CTGGGGATATGAATATGTAAGAAAATATAAAAATGAGTGGGGAACAATATATGTATTTCG
ACTAAATAAATGTTCACACTAGTTATGAGATTACTATGATATCTGGTCTTG

QA 1 891 1 891
DS 



AS 2 7

CO CL1114Contig1 664 3 5 U
GAGCTACAGAGAGAGAGAGAGAGATATGGCAAGTGGAATCGCTCGTGGTCGTTTGGCGGA
GGAGAGGAAGTCGTGGAGGAAGAATCATCCTCACGGATTTGTGGCGAAGCCGGAGACTGG
AGCTGATGGGTCTGTCAATCTAATGGTGTGGCATTGCACTATCCCTGGTAAAGCTGGGAC
TGATTGGGAAGGTGGATACTTTCCATTAACGATGCACTTCAGCGAGGACTATCCGAGCAA
GCCTCCTAAATGCAAATTCCCACCAGGCTTTTTCCACCCTAATGTCTATCCTTCCGGAAC
AGCCTGTCTCTCCATCCTTAACGAGGATTCCGGATGGAGACCAGCCATCACAGTGAAGCA
GATTCTTGTCGGTATTCAGGATTTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCACAGAC
TGATGGTTACCATCTCTTCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAAAGGGTTAAGCTACA
GTCCAAACAGTATCCTCCCATTGTCTAAAACCCTCATAAGAGGACAAACACTAAAACTGA
TGACAAACCTCTCTGAATCTTTTTGTGTTCTTTGTGATTGTGTTTAAATGTCAACGGGTG
ATTGAAAACTCCTCATTTTGTTGCACCTTTGAGACACTACTAGAATCTCTTTGATTTTCA
TAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2CP23JQ C 318
AF RR2ET14TF U 2
AF RR2CP23TF U 1
BS 1 224 RR2CP23TF
BS 225 225 RR2ET14TF
BS 226 302 RR2CP23TF
BS 303 303 RR2ET14TF
BS 304 664 RR2CP23TF

RD RR2CP23JQ 220 0 0
TTAACGAGGATTCCGGATGGAGACCAGCCATCACAGTGAAGCAGATTTTTGTCGGTATTC
AGGATTTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCACAGACTGATGGTTACCATTTTT
TCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAAAGGGTTAAGCTACAGTCCAAACAGTATCCTC
CCATTGTTTAAAACCCTCATAAGAGGACA
AACACTAAAAC

QA 1 209 1 209
DS 

RD RR2ET14TF 557 0 0
GGAGCTAC
AGAGAGAGAGAGAGATATGGCAAGTGGAATCGCTCGTGGTCGTTTGGCGGAGGAGAGGAA
GTCGTGGAGGAAGAATCATCCTCACGGATTTGTGGCGAAGCCGGAGACTGGAGCTGATGG
GTCTGTCAATCTAATGGTGTGGCATTGCACTATCCCTGGTAAAGCTGGGACTGATTGGGA
AGGTGGATACTTTCCATTAACGATGCACTTCAGCGAGGACTATCCGAGCAAGCCTCCTAA
ATGCAAATTCCCACCAGGCTTTTTCCACCCTAATGTCTATCCTTCCGGAACAGCCTGTCT
CTCCATCCTTAACGAGGATTCCGGATGGAGACCAGCCATCACAGTGAAGCAGATTCTTGT
CGGTATTCAGGATTTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCACAGACTGATGGTTA
CCATCTCTTCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAAAGGGTTAAGCTACAGTCCAAACA
GTATCCTCCCATTGTCTAAAACCCTCATAAGAGGACAAACACTAAAACTGATGACAAACC
TCTCTGAAT

QA 9 557 9 557
DS 

RD RR2CP23TF 664 0 0
GAGCTACAGAGAGAGAGAGAGAGATATGGCAAGTGGAATCGCTCGTGGTCGTTTGGCGGA
GGAGAGGAAGTCGTGGAGGAAGAATCATCCTCACGGATTTGTGGCGAAGCCGGAGACTGG
AGCTGATGGGTCTGTCAATCTAATGGTGTGGCATTGCACTATCCCTGGTAAAGCTGGGAC
TGATTGGGAAGGTGGATACTTTCCATTAACGATGCACTTCAGCGCGGACTATCCGAGCAA
GCCTCCTAAATGCAAATTCCCACCAGGCTTTTTCCACCCTAATGTCTATCCTTCCGGAAC
AGTCTGTCTCTCCATCCTTAACGAGGATTCCGGATGGAGACCAGCCATCACAGTGAAGCA
GATTCTTGTCGGTATTCAGGATTTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCACAGAC
TGATGGTTACCATCTCTTCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAAAGGGTTAAGCTACA
GTCCAAACAGTATCCTCCCATTGTCTAAAACCCTCATAAGAGGACAAACACTAAAACTGA
TGACAAACCTCTCTGAATCTTTTTGTGTTCTTTGTGATTGTGTTTAAATGTCAACGGGTG
ATTGAAAACTCCTCATTTTGTTGCACCTTTGAGACACTACTAGAATCTCTTTGATTTTCA
TAAA

QA 1 664 1 664
DS 



CO CL1114Contig2 737 4 2 U
GGGCAGCTACAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGATGGCAAGTGGAATCGCTCGTGGTCGTTTG
GCGGAGGAGAGGAAGTCGTGGAGGAAGAATCATCCTCATGGATTTGTGGCGAAGCCGGAG
ACTGGAGCTGATGGGTCTGTCAATCTAAAGGTGTGGCATTGCACTATCCCTGGTAAAGCT
GGGACTGATTGGGAAGGTGGATACTTTCCATTAACGATGCACTTCAGCGAGGACTATCCG
AGCAAGCCTCCTAAATGCAAATTCCCACCAGGCTTTTTCCACCCTAATGTCTATCCTTCC
GGAACAGTCTGTCTCTCCATCCTTAACGAGGATTCCGGATGGAGACCAGCCATCACAGTG
AAGCAGATTCTTGTCGGCATTCAGGATTTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCA
CAGACTGATGGTTACCATCTCTTCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAAAGGGTTAAG
CTGCAGTCCAAACAGTATCCTCCCATTGTCTAAAACCCTCAGAAGAGGACAGGACAAACA
CCAAAACTGATGACAAACACCTCTGAATCTTTTTGTGGTCTTTGTGATTGTGTTTAAATG
TCAACGGGTGATTGAAAACTCCTCATTTTGTTGCACCTTTGAGACACTACTAGAATCTCT
TTGATTTTCATAAAAGAAAACATCTCTTTTTCTCTCTGTTAACTGTTAATATTCTTGGTT
ACTGAATCAGTTGGTGT


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E657TF U 1
AF RR2FG81TF U 1
AF RR2EU35TF U 3
AF RR2DD44TF U 3
BS 1 690 RR2E657TF
BS 691 737 RR2DD44TF

RD RR2E657TF 698 0 0
GGGCAGCTACAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGATGGCAAGTGGAATCGCTCGTGGTCGTTTG
GCGGAGGAGAGGAAGTCGTGGAGGAAGAATCATCCTCATGGATTTGTGGCGAAGCCGGAG
ACTGGAGCTGATGGGTCTGTCAATCTAAAGGTGTGGCATTGCACTATCCCTGGTAAAGCT
GGGACTGATTGGGAAGGTGGATACTTTCCATTAACGATGCACTTCAGCGAGGACTATCCG
AGCAAGCCTCCTAAATGCAAATTCCCACCAGGCTTTTTCCACCCTAATGTCTATCCTTCC
GGAACAGTCTGTCTCTCCATCCTTAACGAGGATTCCGGATGGAGACCAGCCATCACAGTG
AAGCAGATTCTTGTCGGCATTCAGGATTTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCA
CAGACTGATGGTTACCATCTCTTCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAAAGGGTTAAG
CTGCAGTCCAAACAGTATCCTCCCATTGTCTAAAACCCTCAGAAGAGGACAGGACAAACA
CCAAAACTGATGACAAACACCTCTGAATCTTTTTGTGGTCTTTGTGATTGTGTTTAAATG
TCAACGGGTGATTGAAAACTCCTCATTTTGTTGCACCTTTGAGACACTACTAGAATCTCT
TTGATTTTCATAAAAGAAAACATCTCTTTT
CTCTCTGT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2FG81TF 676 0 0
GGGC
AGCTACAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGATGGCAAGTGGAATCGCTCGTGGTCGTTTGGCGG
AGGAGAGGAAGTCGTGGAGGAAGAATCATCCTCATGGATTTGTGGCGAAGCCGGAGACTG
GAGCTGATGGGTCTGTCAATCTAAAGGTGTGGCATTGCACTATCCCTGGTAAAGCTGGGA
CTGATTGGGAAGGTGGATACTTTCCATTAACGATGCACTTCAGCGAGGACTATCCGAGCA
AGCCTCCTAAATGCAAATTCCCACCAGGCTTTTTCCACCCTAATGTCTATCCTTCCGGAA
CAGTCTGTCTCTCCATCCTTAACGAGGATTCCGGATGGAGACCAGCCATCACAGTGAAGC
AGATTCTTGTCGGCATTCAGGATTTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCACAGA
CTGATGGTTACCATCTCTTCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAAAGGGTTAAGCTGC
AGTCCAAACAGTATCCTCCCATTGTCTAAAACCCTCAGAAGAGGACAGGACAAACACCAA
AACTGATGACAAACACCTCTGAATCTTTTTGTGGTCTTTGTGATTGTGTTTAAATGTCAA
CGGGTGATTGAAAACTCCTCATTTTGTTGCACCTTTGAGACACTACTAGAATCTCTTTGA
TTTTCATAAA
GA

QA 5 674 5 674
DS 

RD RR2EU35TF 690 0 0
GG
AGCTACAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGATGGCAAGTGGAATCGCTCGTGGTCGTTTGGCGG
AGGAGAGGAAGTCGTGGAGGAAGAATCATCCTCATGGATTTGTGGCGAAGCCGGAGACTG
GAGCTGATGGGTCTGTCAATCTAATGGTGTGGCATTGCACTATCCCTGGTAAAGCTGGGA
CTGATTGGGAAGGTGGATACTTTCCATTAACGATGCACTTCAGCGAGGACTATCCGAGCA
AGCCTCCTAAATGCAAATTCCCACCAGGCTTTTTCCACCCTAATGTCTATCCTTCCGGAA
CAGTCTGTCT*TCCATCCTTAACGAGGATTCCGGATGGAGACCAGCCATCACAGTGAAGC
AGATTCTTGTCGGCATTCAGGATTTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCACAGA
CTGATGGTTACCATCTCTTCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAAAGGGTTAAGCTGC
AGTCCAAACAGTATCCTCCCATTGTCTAAAACCCTCAGAAGAGGACAGGACAAACACCAA
AACTGATGACAAACACCTCTGAATCTTTTTGTGGTCTTTGTGATTGTGTTTAAATGTCAA
CGGGTGATTGAAAACTCCTCATTTTGTTGCACCTTTGAGACACTACTAGAATCTCTTTGA
TTTTCATAAAAGAAAACATCTCTTTT
TC

QA 3 688 3 688
DS 

RD RR2DD44TF 735 0 0
GG
AGCTACAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGATGGCAAGTGGAATCGCTCGTGGTCGTTTGGCGG
AGGAGAGGAAGTCGTGGAGGAAGAATCATCCTCATGGATTTGTGGCGAAGCCGGAGACTG
GAGCTGATGGGTCTGTCAATCTAATGGTGTGGCATTGCACTATCCCTGGTAAAGCTGGGA
CTGATTGGGAAGGTGGATACTTTCCATTAACGATGCACTTCAGCGAGGACTATCCGAGCA
AGCCTCCTAAATGCAAATTCCCACCAGGCTTTTTCCACCCTAATGTCTATCCTTCCGGAA
CAGTCTGTCTCTCCATCCTTAACGAGGATTCCGGATGGAGACCAGCCATCACAGTGAAGC
AGATTCTTGTCGGCATTCAGGATTTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCACAGA
CTGATGGTTACCATCTCTTCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAAAGGGTTAAGCTGC
AGTCCAAACAGTATCCTCCCATTGTCTAAAACCCTCAGAAGAGGACAGGACAAACACCAA
AACTGATGACAAACACCTCTGAATCTTTTTGTGGTCTTTGTGATTGTGTTTAAATGTCAA
CGGGTGATTGAAAACTCCTCATTTTGTTGCACCTTTGAGACACTACTAGAATCTCTTTGA
TTTTCATAAAAGAAAACATCTCTTTTTCTCTCTGTTAACTGTTAATATTCTTGGTTACTG
AATCAGTTGGTGT

QA 3 735 3 735
DS 



AS 2 6

CO CL1115Contig1 783 3 30 U
TCCAAACCGGCGAGGGCTCGTGCCTTTTCAACGGAAGTTCCGTCGACGATCGATTCGACG
TTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACATGGACCCGCCGCAGACTCCTTCCTCA
TTCATGAAGGCTCGTCCGACGACTGCTTCCTCGATTCCGACGAAGCTCACCGTCAATTTC
GTCCTCCCTTACGCATCTGAGCTTTCCGGGAAAGAGGTCGACATGGTCATCATTCCAGCG
ACAACAGGACAAATGGGTGTTTTGCCTGGACACGTTCCAACAATCGCCGAGCTGAAACCC
GGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACATAAAGAAGTACTTTGTTAGCAGTGGATTC
GCATTT*CTACACGCAAATTCCGTCGCTGACATTATCGCTGTTGAGGCCGTGCC*GCTTG
AGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACGCAGAAACTT*GCT
TCTGCAACAACAGATCTTGAGAAGGCGGAAGCACAGATTGGTGTCGAAGTTCACAGTGCT
ATGAACGCAGCTCTCTCGGGCTAAAAGAAGATGATCCCTTATTTACCCTACTACAAAGGA
TGGAATAATTTAGAAAATGATTTTTGCTTTGCTTAATTTTGTTGGACTTTGTTTTGAATA
AATGATTTTGTTGAAGGCACAAACTAACAGAGTTTCTTGTGTTCATATTCTTCTCTACTT
AGTTTGGGTTGAGAAACTAAGTTGTTTTTGTAATTTCTTTTCAGAAAAGAAATAAAATTT
CGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C989TF U 1
AF RR2BT69JQ C 133
AF RR2BT69TF U 133
BS 1 146 RR2C989TF
BS 147 147 RR2BT69TF
BS 148 149 RR2C989TF
BS 150 150 RR2BT69TF
BS 151 281 RR2C989TF
BS 282 282 RR2BT69TF
BS 283 287 RR2C989TF
BS 288 288 RR2BT69TF
BS 289 356 RR2C989TF
BS 357 357 RR2BT69TF
BS 358 366 RR2C989TF
BS 367 367 RR2BT69TF
BS 368 384 RR2C989TF
BS 385 385 RR2BT69TF
BS 386 414 RR2C989TF
BS 415 415 RR2BT69TF
BS 416 466 RR2C989TF
BS 467 467 RR2BT69TF
BS 468 476 RR2C989TF
BS 477 477 RR2BT69TF
BS 478 486 RR2C989TF
BS 487 487 RR2BT69TF
BS 488 491 RR2C989TF
BS 492 492 RR2BT69TF
BS 493 503 RR2C989TF
BS 504 504 RR2BT69TF
BS 505 506 RR2C989TF
BS 507 507 RR2BT69TF
BS 508 515 RR2C989TF
BS 516 783 RR2BT69TF

RD RR2C989TF 519 0 0
TCCAAACCGGCGAGGGCTCGTGCCTTTTCAACGGAAGTTCCGTCGACGATCGATTCGACG
TTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACATGGACCCGCCGCAGACTCCTTCCTCA
TTCATGAAGGCTCGTCCGACGACTGCGTCTTCGATTCCGACGAAGCTCACCGTCAATTTC
GTCCTCCCTTACGCATCTGAGCTTTCCGGGAAAGAGGTCGACATGGTCATCATTCCAGCG
ACAACAGGACAAATGGGTGTTTTGCCTGGACACGTTCCAACCATCGCTGAGCTGAAACCC
GGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACATAAAGAAGTACTTTGTTAGCAGTGGTTTC
GCATTTTCTACACGCAAATTCCGTGGCTGACATTATCGCTGTTGAGGCCGTGCCCGCTTG
AGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACACAGAAACTTTGCT
TCTGCATCAACGGATCTTGAGAAAGCAGAAGCACA
TATT

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2BT69JQ 651 0 0
GGTCCAT
CGACTGCTTCCTCGATTCCGACGAAGCTCACCGTCAATTTCGTCCTCCCTTACGCATCTG
AGCTTTCCGGGAAAGAGGTCGACATGGTCATCATTCCAGCGACAACAGGACAAATGGGTG
TTTTGCCTGGACACGTTCCAACAATCGCCGAGCTGAAACCCGGTATCATGTCCGTTCACG
AAGGCACTGACATAAAGAAGTACTTTGTTAGCAGTGGATTCGCATTT*CTACACGCAAAT
TCCGTCGCTGACATTATCGCTGTTGAGGCCGTGCC*GCTTGAGAACATCGACGCTAGCCA
AGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACGCAGAAACTT*GCTTCTGCAACAACAGATCTTG
AGAAGGCGGAAGCACAGATTGGTGTCGAAGTTCACAGTGCTATGAACGCAGCTCTCTCGG
GCTAAAAGAAGATGATCCCTTATTTACCCTACTACAAAGGATGGAATAATTTAGAAAATG
ATTTTTGCTTTGCTTAATTTTGTTGGACTTTGTTTTGAATAAATGATTTTGTTGAAGGCA
CAAACTAACAGAGTTTCTTGTGTTCATATTCTTCTCTACTTAGTTTGGGTTGAGAAACTA
AGTTGTTTTTGTAATTTCTTTTCAGAAAAGAAATAAAATTTCGT

QA 8 651 8 651
DS 

RD RR2BT69TF 651 0 0
GGTCCAT
CGACTGCTTCCTCGATTCCGACGAAGCTCACCGTCAATTTCGTCCTCCCTTACGCATCTG
AGCTTTCCGGGAAAGAGGTCGACATGGTCATCATTCCAGCGACAACAGGACAAATGGGTG
TTTTGCCTGGACACGTTCCAACAATCGCCGAGCTGAAACCCGGTATCATGTCCGTTCACG
AAGGCACTGACATAAAGAAGTACTTTGTTAGCAGTGGATTCGCATTT*CTACACGCAAAT
TCCGTCGCTGACATTATCGCTGTTGAGGCCGTGCC*GCTTGAGAACATCGACGCTAGCCA
AGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACGCAGAAACTT*GCTTCTGCAACAACAGATCTTG
AGAAGGCGGAAGCACAGATTGGTGTCGAAGTTCACAGTGCTATGAACGCAGCTCTCTCGG
GCTAAAAGAAGATGATCCCTTATTTACCCTACTACAAAGGATGGAATAATTTAGAAAATG
ATTTTTGCTTTGCTTAATTTTGTTGGACTTTGTTTTGAATAAATGATTTTGTTGAAGGCA
CAAACTAACAGAGTTTCTTGTGTTCATATTCTTCTCTACTTAGTTTGGGTTGAGAAACTA
AGTTGTTTTTGTAATTTCTTTTCAGAAAAGAAATAAAATTTCGT

QA 8 651 8 651
DS 



CO CL1115Contig2 518 3 1 U
AGTAAACTTTATGTTGGTTTGTGTACTCAACAAAATCATTTATTCAAAACAGAGTCCAAC
CCACATAAAACAAAGAGGAAAAGTAAGTTTCTTATTTATTCCATCCTTTGCAGTCAAGGG
ACTTTCACTAATCATTTGAAAAGCAAAATGATTTTCTTTTTTTCTTTTACTTGGAAGAAA
TAAACCTGCTCTTAGCCTGAGAGAGCTGCGTTCATAGCACTGTGAACTTCAACACCAATC
TGTGCTTCTGCTTTCTCAAGATCCGTTGATGCAGAAGCAAGTTTCTGTGTGAACTCAGCT
AAACCCTTTTGGACTTGGCTAGCGTCGATGTTCTCAAGCGGCACGGCCTCAACAGCGATA
ATGTCAGCCACGGAATTTGCGTGTAGAAATGCGAAACCACTGCTAACAAAGTACTTCTTT
ATGTCAGTGCCTTCGTGAACGGACATGATACCGGGTTTCAGCTCAGCGATGGTTGGAACG
TGTCCAGGCAAAACACCCATTTGTCCTGTTGTCGCTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2C989JQ U 24
AF RR2DB04JQ U 1
AF RR2DB04TF C 1
BS 1 518 RR2DB04JQ

RD RR2C989JQ 436 0 0
TACTCAACAAAATCATTTATTCAAAAAAGAGTCCAACCCACATAAAACAAAGAGGAAAAG
TAAGTTTCTTATTTATTCCATCCTTTGCAGTCAAGGGACTTTCACTAATCATTTGAAAAG
CAAAATGATTTTCTTTTTTTCTTTTACTTGGAAGAAATAAACCTGCTCTTAGCCTGAGAG
AGCTGCGTTCATAGCACTGTGAACTTCAACACCAATATGTGCTTCTGCTTTCTCAAGATC
CGTTGATGCAGAAGCAAGTTTCTGTGTGAACTCAGCTAAACCCTTTTGGACTTGGCTAGC
GTCGATGTTCTCAAGCGGCACGGCCTCAACAGCGATAATGTCAGCCACGGAATTTGCGTG
TAGAAATGCGAAACCACTGCTAACAAAGTACTTCTTTATGTCAGTGCCTTCGTGAACGGA
CATGATACCGGGTTTC

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR2DB04JQ 518 0 0
AGTAAACTTTATGTTGGTTTGTGTACTCAACAAAATCATTTATTCAAAACAGAGTCCAAC
CCACATAAAACAAAGAGGAAAAGTAAGTTTCTTATTTATTCCATCCTTTGCAGTCAAGGG
ACTTTCACTAATCATTTGAAAAGCAAAATGATTTTCTTTTTTTCTTTTACTTGGAAGAAA
TAAACCTGCTCTTAGCCTGAGAGAGCTGCGTTCATAGCACTGTGAACTTCAACACCAATC
TGTGCTTCTGCTTTCTCAAGATCCGTTGATGCAGAAGCAAGTTTCTGTGTGAACTCAGCT
AAACCCTTTTGGACTTGGCTAGCGTCGATGTTCTCAAGCGGCACGGCCTCAACAGCGATA
ATGTCAGCCACGGAATTTGCGTGTAGAAATGCGAAACCACTGCTAACAAAGTACTTCTTT
ATGTCAGTGCCTTCGTGAACGGACATGATACCGGGTTTCAGCTCAGCGATGGTTGGAACG
TGTCCAGGCAAAACACCCATTTGTCCTGTTGTCGCTCC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2DB04TF 518 0 0
AGTAAACTTTATGTTGGTTTGTGTACTCAACAAAATCATTTATTCAAAACAGAGTCCAAC
CCACATAAAACAAAGAGGAAAAGTAAGTTTCTTATTTATTCCATCCTTTGCAGTCAAGGG
ACTTTCACTAATCATTTGAAAAGCAAAATGATTTTCTTTTTTTCTTTTACTTGGAAGAAA
TAAACCTGCTCTTAGCCTGAGAGAGCTGCGTTCATAGCACTGTGAACTTCAACACCAATC
TGTGCTTCTGCTTTCTCAAGATCCGTTGATGCAGAAGCAAGTTTCTGTGTGAACTCAGCT
AAACCCTTTTGGACTTGGCTAGCGTCGATGTTCTCAAGCGGCACGGCCTCAACAGCGATA
ATGTCAGCCACGGAATTTGCGTGTAGAAATGCGAAACCACTGCTAACAAAGTACTTCTTT
ATGTCAGTGCCTTCGTGAACGGACATGATACCGGGTTTCAGCTCAGCGATGGTTGGAACG
TGTCCAGGCAAAACACCCATTTGTCCTGTTGTCGCT
CC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 5

CO CL1116Contig1 1190 5 9 U
GATCTTTGAGCTCTGTGGATATCATTGGGTTTGGAACTGGACCTGAATTGGAGAAGAAGC
TTAAGTATGCTGAAGATGTTTCTTACGGTGTGATTTTCGGGAGGGAGCTCATTAACTCCC
CTGCCAATGTCCTCACTCCTGCTGTGTTAGCTGAGGAAGCGGCAAAAGTGGCTTCTACGT
ACAGTGATGTGTTTACGGCGAATATCTTGAACGAGGAGCAGTGCAGGGAGTTGAAGATGG
GTTCTTATCTAGCCGTTGCTGCTGCGTCGGCTAATCCTCCTTTCTTTATTCACCTTGTGT
ATAAACCTTCGAGTGGCGGTGTTAAGACCAAGCTTGCTCTTGTTGGTAAAGGATTGACCT
TTGACAGTGGTGGCTACAACATTAAGACTGGACCTGGCTGCTCCATTGAGCTCATGAAAT
TCGACATGGGTGGTTCAGCTGCTGTTCTTGGCGCTGCGAAAGCCATTGGTGAGATTAAGC
CTCCTGGTGTTGAGGTTCATTTCATCGTTGCAGCCTGTGAGAATATGATTAGTGGAACTG
GAATGAGACCTGGAGATGTCATCACAGCCTCAAACGGAAAGACCATTGAGGTGAACAACA
CAGATGCTGAAGGTCGTTTAACACTTGCTGATGCTCTAGTGTATGCTTGTAACCAAGGCG
TTGACAAGATTGTTGACCTCGCTACGTTGACCGGAGCCTGTGTTATTGCTCTTGGAACAT
CAGTGGCAGGGATCTACACACCTAACGACGAGCTTGCAAAGGAAGTGATTGCTGCGTCAG
AGAAGAGTGGAGAGAAGCTGTGGAGGATGCCATTAGAAGAGAGCTACTGGGAGATGATGA
AGTCTGGATGTGCTGATATGGTCAACACAGGTGGGCGTGCAGGAGGTTCCATCACCGCAG
CTCTCTTCTTGAAGCAGTTTGTGAGCGAGAAGGTGCAATGGATGCATATAGACATGGCTG
GACCGGTGTGGAACGAGAAAAAGAAGTCTGGAACTGGGTTTGGTGTTGCGACGCTTGTAG
AATGGGTGCAGACGAATTCTTCTTCGTAGAGGATGAGATAAAGTGTTTCGGGTGTCGAAG
TGGTTGTTGGTTTTAATAAGGTAGTCAAAAGTTGTTGTGCTTTGGATTGTCTTTTACTTG
TTCCGAACAGTAACATTATCAGATGCTGAATAAAAGAAGTCTTTTGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC82TF U 1
AF RR2D041TF U 437
AF RR2EY60TF U 388
AF RR2AC82JQ C 312
AF RR2A554JQ C 454
BS 1 481 RR2AC82TF
BS 482 482 RR2EY60TF
BS 483 656 RR2AC82TF
BS 657 657 RR2EY60TF
BS 658 730 RR2AC82TF
BS 731 731 RR2EY60TF
BS 732 786 RR2AC82TF
BS 787 1033 RR2EY60TF
BS 1034 1190 RR2AC82JQ

RD RR2AC82TF 786 0 0
GATCTTTGAGCTCTGTGGATATCATTGGGTTTGGAACTGGACCTGAATTGGAGAAGAAGC
TTAAGTATGCTGAAGATGTTTCTTACGGTGTGATTTTCGGGAGGGAGCTCATTAACTCCC
CTGCCAATGTCCTCACTCCTGCTGTGTTAGCTGAGGAAGCGGCAAAAGTGGCTTCTACGT
ACAGTGATGTGTTTACGGCGAATATCTTGAACGAGGAGCAGTGCAGGGAGTTGAAGATGG
GTTCTTATCTAGCCGTTGCTGCTGCGTCGGCTAATCCTCCTTTCTTTATTCACCTTGTGT
ATAAACCTTCGAGTGGCGGTGTTAAGACCAAGCTTGCTCTTGTTGGTAAAGGATTGACCT
TTGACAGTGGTGGCTACAACATTAAGACTGGACCTGGCTGCTCCATTGAGCTCATGAAAT
TCGACATGGGTGGTTCAGCTGCTGTTCTTGGCGCTGCGAAAGCCATTGGTGAGATTAAGC
CGCCTGGTGTTGAGGTTCATTTCATCGTTGCAGCCTGTGAGAATATGATTAGTGGAACTG
GAATGAGACCTGGAGATGTCATCACAGCCTCAAACGGAAAGACCATTGAGGTGAACAACA
CAGATGCTGAAGGTCGTTTAACACTTGCTGATGCTCTAGTGTATGCTTGTAACCAAAGCG
TTGACAAGATTGTTGACCTCGCTACGTTGACCGGAGCCTGTGTTATTGCTCTTGGAACAT
CAGTGGCAGG*ATCTACACACCTAACGACGAGCTTGCAAAGGAAGTGATTGCTGCGTCAG
AGAAGA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2D041TF 490 0 0
G
GCTGCTGTCCTTGGTGCTGCGAAAGCCATTGGTGAGATTAAGCCTCCTGGTGTTGAGGTT
CATTTCATCGTTGCAGCCTGTGAGAATATGATTAGTGGAACTGGAATGAGACCTGGAGAT
GTCATCACAGCCTCAAACGGAAAGACCATTGAGGTGAACAACACAGATGCTGAAGGTCGT
TTAACACTTGCTGATGCTCTAGTGTATGCTTGTAACCAAGGCGTTGACAAGATTGTTGAC
CTCGCTACGTTGACCGGAGCCTGTGTTATTGCTCTTGGAACATCAGTGGCAGGGATCTAC
ACACCTAACGACGAGCTTGCAAAGGAAGTGATTGCTGCGTCAGAGAAGAGTGGAGAGAAG
CTGTGGAGGATGCCATTAGAAGAGAGCTACTGGGAGATGATGAAGTCTGGATGTGCTGAT
ATGGTCAACACAGGTGGGCGTGCAGGAGGTTCCATCACCGCAGCTCTCTTCTTGAAGCAG
TTTGTGAGC

QA 2 490 2 490
DS 

RD RR2EY60TF 646 0 0
GG
GGACCTGGCTGCTCTATTGAGCTCATGAAATTCGACATGGGTGGTTCAGCTGCTGTCCTT
GGTGCTGCGAAAGCCATTGGTGAGATTAAGCCTCCTGGTGTTGAGGTTCATTTCATCGTT
GCAGCCTGTGAGAATATGATTAGTGGAACTGGAATGAGACCTGGAGATGTCATCACAGCC
TCAAACGGAAAGACCATTGAGGTGAACAACACAGATGCTGAAGGTCGTTTAACACTTGCT
GATGCTCTAGTGTATGCTTGTAACCAAGGCGTTGACAAGATTGTTGACCTCGCTACTTTG
ACCGGAGCCTGTGTTATTGCTCTTGGAACATCAGTGGCAGGGATCTACACACCTAACGAC
GAGCTTGCAAAGGAAGTGATTGCTGCGTCAGAGAAGAGTGGAGAGAAGCTGTGGAGGATG
CCATTAGAAGAGAGCTACTGGGAGATGATGAAGTCTGGATGTGCTGATATGGTCAACACA
GGTGGGCGTGCAGGAGGTTCCATCACCGCAGCTCTCTTCTTGAAGCAGTTTGTGAGCGAG
AAGGTGCAATGGATGCATATAGACATGGCTGGACCGGTGTGGAACGAGAAAAAGAAGTCT
GGAACTGGGTTTGGTGTTGCGACGCTTGTAGAATGGGTGCAGAC

QA 3 646 3 646
DS 

RD RR2AC82JQ 879 0 0
A
GTGGCGGTGTTAAGACCAAGCTTGCTCTTGTTGGTAAAGGATTGACCTTTGACAGTGGTG
GCTACAACATTAAGACTGGACCTGGCTGCTCCATTGAGCTCATGAAATTCGACATGGGTG
GTTCAGCTGCTGTTCTTGGCGCTGCGAAAGCCATTGGTGAGATTAAGCCGCCTGGTGTTG
AGGTTCATTTCATCGTTGCAGCCTGTGAGAATATGATTAGTGGAACTGGAATGAGACCTG
GAGATGTCATCACAGCCTCAAACGGAAAGACCATTGAGGTGAACAACACAGATGCTGAAG
GTCGTTTAACACTTGCTGATGCTCTAGTGTATGCTTGTAACCAAGGCGTTGACAAGATTG
TTGACCTCGCTACGTTGACCGGAGCCTGTGTTATTGCTCTTGGAACATCAGTGGCAGGGA
TCTACACACCTAACGACGAGCTTGCAAAGGAAGTGATTGCTGCGTCAGAGAAGAGTGGAG
AGAAGCTGTGGAGGATGCCATTAGAAGAGAGCTACTGGGAGATGATGAAGTCTGGATGTG
CTGATATGGTCAACACAGGTGGGCGTGCAGGAGGTTCCATCACCGCAGCTCTCTTCTTGA
AGCAGTTTGTGAGCGAGAAGGTGCAATGAATGCATATAGACATGGCTGGACCGGTGTGGA
ACGAGAAAAAGAAGTCTGGAACTGGGTTTGGTGTTGCGACGCTTGTCGAATGGGTGCAGA
CGAATTCTTCTTCGTAGAGGATGAGATAAAGTGTTTCGGGTGTCGAAGTGGTTGTTGGTT
TTAATAAGGTAGTCAAAAGTTGTTGTGCTTTGGATTGTCTTTTACTTGTTCCGAACAGTA
ACATTATCAGATGCTGAATAAAAGAAGTCTTTTGATTT

QA 2 879 2 879
DS 

RD RR2A554JQ 728 0 0
CTGCGAAAGCCATTGGTGAGATTAAGCCTCCTGGTGTTGAGGTTCATTTCATCGTTGCAG
CCTGTGAGAATATGATTAGTGGAACTGGAATGAGACCTGGAGATGTCATCACAGCCTCAA
ACGGAAAGACCATTGAGGTGAACAACACAGATGCTGAAGGTCGTTTAACACTTGCTGATG
CTCTAGTGTATGCTTGTAACCAAGGCGTTGACAAGATTGTTGACCTCGCTACGTTGACCG
GAGCCTGTGTTATTGCTCTTGGAACATCAGTGGCAGGGATCTACACACCTAACGACGAGC
TTGCAAAGGAAGTGATTGCTGCGTCAGAGAAGAGTGGAGAGAAGCTGTGGAGGATGCCAT
TAGAAGAGAGCTACTGGGAGATGATGAAGTCTGGATGTGCTGATATGGTCAACACAGGTG
GGCGTGCAGGAGGTTCCATCACCGCAGCTCTCTTCTTGAAGCAGTTTGTGAGCGAGAAGG
TGCAATGGATGCATATAGACATGGCTGGACCGGTGTGGAACGAGAAAAAGAAGTCTGGAA
CTGGGTTTGGTGTTGCGACGCTTGTAGAATGGGTGCAGACGAATTCTTCTTCGTAGAGGA
TGAGATAAAGTGTTTCGGGTGTCGAAGTGGTTGTTGGTTTTAATAAGGTTGTCAAAAGTT
GTTGTGCTTTGGATTGTCTTTTACTTGTTCCGAACAGTAACATTATCAGATGCTGAATAA
AA
TAAGCC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 5

CO CL1117Contig1 935 5 7 U
GGACTCCAGAAAACAAAGAGAAACAAAACACTAGTTTCCACTCTCGAGAGGAAAACAAAA
AAAAA*CAGAACTTAGTAGAGATCTCATGGCGATGACTGTCTCCGGAGCTGTAATCAGCG
GGCTTGGTTCTTCGTTCCTCGCCGGAGGCAAGAAGAGTGCCGCCGCGTTGGGAAACGGCG
TAGGCGCTGGAGCTGCGAGAGTTGGCAGGAAAACTCTGATCGTCGCTGCTGCCGCTGCTC
AGCCCAAGAAATCGTGGATCCCCGCCGTTAAAGGTGGCGGCAACTTCCTTGACCCTGAAT
GGCTCGATGGCTCGCTACCCGGAGATTTCGGGTTCGACCCGTTGGGTTTAGGAAAAGACC
CGGCTTTTCTGAAATGGTACAGAGAGGCAGAGCTGATCCACGGCCGATGGGCGATGGCAG
CTGTTCTCGGGATCTTCGTTGGCCAGGCGTGGAGCGGCGTGCCGTGGTTCGAAGCCGGAG
CTGACCCACGAGCCATCGCGCCGTTCTCATTCGGATCACTTCTCGGGACGCAGCTGCTTC
TCATGGGGTGGGTGGAGAGCAAACGGTGGGTCGACTTCTTCAACCCGGACTCTCAGTCAG
TTGAGTGGGCGACGCCGTGGTCGAGGACCGCTGAGAATTTCGCAAACTACACCGGCGATC
AAGGATATCCCGGTGGGAGATTCTTTGATCCGTTGGGGCTAGCTGGGAAGTCAAGGGACG
GTGTTTACGAGCCGGACAGGGAGAAGCTGGAGCGGTTGAAGGTTGCGGAGATTAAACACT
CTAGGCTCGCTACGCCTGCAATGTTGATCTTTTACTTTGAGGCTGGTCAGGGGAAAACCC
CTCTAGGTGCCCTTGGTTTATAAGAATGATATGTTTTTTTTTTGAGTCTGTAGATATAAC
TTCTCCTCTCTAAAACTTGATGATCTCTCTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DX60TF U 8
AF RR2BE68TF U 1
AF RR2GC48TF U 6
AF RR2BE68JQ C 108
AF RR2GC48JQ C 337
BS 1 663 RR2BE68TF
BS 664 664 RR2BE68JQ
BS 665 723 RR2BE68TF
BS 724 730 RR2GC48TF
BS 731 805 RR2BE68JQ
BS 806 806 RR2GC48JQ
BS 807 935 RR2BE68JQ

RD RR2DX60TF 568 0 0
GGAAAACAAAGAGA
AACAAAACACTAGTTTCCACTCTCGAGAGGAAAACAAAAAAAAA*CAGAACTTAGTAGAG
ATCTCATGGCGATGACTGTCTCCGGAGCTGTAATCAGCGGGCTTGGTTCTTCGTTCCTCG
CCGGAGGCAAGAGGAGTGCCGCCGCGTTGGGAAACGGCGTAGGCGCTGGAGCTGCGAGAG
TTGGCAGGAAAACTCTGATCGTCGCTGCTGCCGCTGCTCAGCCCAAGAAATCGTGGATCC
CCGCCGTTAAAGGTGGCGGCAACTTCCTTGACCCTGAATGGCTCGATGGCTCGCTACCCG
GAGATTTCGGGTTCGACCCGTTGGGTTTAGGAAAAGACCCGGCTTTTCTGAAATGGTACA
GAGAGGCAGAGCTGATCCACGGCCGATGGGCGATGGCAGCTGTTCTCGGGATCTTCGTTG
GCCAGGCGTGGAGCGGCGTGCCGTGGTTCGAAGCCGGAGCTGACCCACGAGCCATCGCGC
CGTTCTCATTCGGATCACTTCTCGGGACGCAGCTGCTTCTCATGGGGTGGGTGGAGAGCA
AACGGTGGGTCGAC

QA 15 568 15 568
DS 

RD RR2BE68TF 723 0 0
GGACTCCAGAAAACAAAGAGAAACAAAACACTAGTTTCCACTCTCGAGAGGAAAACAAAA
AAAAA*CAGAACTTAGTAGAGATCTCATGGCGATGACTGTCTCCGGAGCTGTAATCAGCG
GGCTTGGTTCTTCGTTCCTCGCCGGAGGCAAGAAGAGTGCCGCCGCGTTGGGAAACGGCG
TAGGCGCTGGAGCTGCGAGAGTTGGCAGGAAAACTCTGATCGTCGCTGCTGCCGCTGCTC
AGCCCAAGAAATCGTGGATCCCCGCCGTTAAAGGTGGCGGCAACTTCCTTGACCCTGAAT
GGCTCGATGGCTCGCTACCCGGAGATTTCGGGTTCGACCCGTTGGGTTTAGGAAAAGACC
CGGCTTTTCTGAAATGGTACAGAGAGGCAGAGCTGATCCACGGCCGATGGGCGATGGCAG
CTGTTCTCGGGATCTTCGTTGGCCAGGCGTGGAGCGGCGTGCCGTGGTTCGAAGCCGGAG
CTGACCCACGAGCCATCGCGCCGTTCTCATTCGGATCACTTCTCGGGACGCAGCTGCTTC
TCATGGGGTGGGTGGAGAGCAAACGGTGGGTCGACTTCTTCAACCCGGACTCTCAGTCAG
TTGAGTGGGCGACGCCGTGGTCGAGGACCGCTGAGAATTTCGCAAACTACACCGGCGATC
AAG*ATATCCCGGTGGGAGATTCTTTGATCCGTTGGGGCTAGCTGGGAAGTCAAGGGACG
GTG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2GC48TF 725 0 0
GGA
GAAAACAAAGAGAAACAAAACACTAGTTTCCACTCTCGAGAGGAAAACAAAAAAAAAACA
GAACTTAGTAGAGATCTCATGGCGATGACTGTCTCCGGAGCTGTAATCAGCGGGCTTGGT
TCTTCGTTCCTCGCCGGAGGCAAGAGGAGTGCCGCCGCGTTGGGAAACGGCGTAGGCGCT
GGAGCTGCGAGAGTTGGCAGGAAAACTCTGATCGTCGCTGCTGCCGCTGCTCAGCCCAAG
AAATCGTGGATCCCCGCCGTTAAAGGTGGCGGCAACTTCCTTGACCCTGAATGGCTCGAT
GGCTCGCTACCCGGAGATTTCGGGTTCGACCCGTTGGGTTTAGGAAAAGACCCGGCTTTT
CTGAAATGGTACAGAGAGGCAGAGCTGATCCACGGCCGATGGGCGATGGCAGCTGTTCTC
GGGATCTTCGTTGGCCAGGCGTGGAGCGGCGTGCCGTGGTTCGAAGCCGGAGCTGACCCA
CGAGCCATCGCGCCGTTCTCATTCGGATCACTTCTCGGGACGCAGCTGCTTCTCATGGGG
TGGGTGGAGAGCAAACGGTGGGTCGACTTCTTCAACCCGGACTCTCAGTCAGTTGAGTGG
GCGACGCCGTGGTCGAGGACCGCTGAGAATTTCGCAAACTACACCGGCGATCAAG*ATAT
CCCGGTGGGAGATTCTTTGATCCGTTGGGGCTAGCTGGGAAGTCAAGGGACGGTGTTTAC
GA

QA 4 725 4 725
DS 

RD RR2BE68JQ 828 0 0
GCTGTAATCAGCGGGCTTGGTTCTTCGTTCCTCGCCGGAGGCAAGAAGAGTGCCGCCGCG
TTGGGAAACGGCGTAGGCGCTGGAGCTGCGAGAGTTGGCAGGAAAACTCTGATCGTCGCT
GCTGCCGCTGCTCAGCCCAAGAAATCGTGGATCCCCGCCGTTAAAGGTGGCGGCAACTTC
CTTGACCCTGAATGGCTCGATGGCTCGCTACCCGGAGATTTCGGGTTCGACCCGTTGGGT
TTAGGAAAAGACCCGGCTTTTCTGAAATGGTACAGAGAGGCAGAGCTGATCCACGGCCGA
TGGGCGATGGCAGCTGTTCTCGGGATCTTCGTTGGCCAGGCGTGGAGCGGCGTGCCGTGG
TTCGAAGCCGGAGCTGACCCACGAGCCATCGCGCCGTTCTCATTCGGATCACTTCTCGGG
ACGCAGCTGCTTCTCATGGGGTGGGTGGAGAGCAAACGGTGGGTCGACTTCTTCAACCCG
GACTCTCAGTCAGTTGAGTGGGCGACGCCGTGGTCGAGGACCGCTGAGAATTTCGCAAAC
TACACCGGCGATCAAGGATATCCCGGTGGGAGATTCTTTGATCCGTTGGGGCTAGCTGGG
AAGTCAAGGGACGGTGTTTACGAGCCGGACAGGGAGAAGCTGGAGCGGTTGAAGGTTGCG
GAGATTAAACACTCTAGGCTCGCTACGCCTGCAATGTTTATCTTTTACTTTGAGGCTGGT
CAGGGGAAAACCCCTCTAGGTGCCCTTGGTTTATAAGAATGATATGTTTTTTTTTTGAGT
CTGTAGATATAACTTCTCCTCTCTAAAACTTGATGATCTCTCTTCTTC

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2GC48JQ 599 0 0
ACCCGTTGGGTTTAGGAAAAGACCCGGCTTTTCTGAAATGGTACAGAGAGGCAGAGCTGA
TCCACGGCCGATGGGCGATGGCAGCTGTTCTCGGGATCTTCGTTGGCCAGGCGTGGAGCG
GCGTGCCGTGGTTCGAAGCCGGAGCTGACCCACGAGCCATCGCGCCGTTCTCATTCGGAT
CACTTCTCGGGACGCAGCTGCTTCTCATGGGGTGGGTGGAGAGCAAACGGTGGGTCGACT
TCTTCAACCCGGACTCTCAGTCAGTTGAGTGGGCGACGCCGTGGTCGAGGACCGCTGAGA
ATTTCGCAAACTACACCGGCGATCAAGGATATCCCGGTGGGAGATTCTTTGATCCGTTGG
GGCTAGCTGGGAAGTCAAGGGACGGTGTTTACGAGCCGGACAGGGAGAAGCTGGAGCGGT
TGAAGGTTGCGGAGATTAAACACTCTAGGCTCGCTATGCTTGCAATGTTGATCTTTTACT
TTGAGGCTGGTCAGGGGAAAACCCCTCTAGGTGCCCTTGGTTTATAAGAATGATATGTTT
TTTTTTTGAGTCTGTAGATATAACTTCTCCTCTCTAAAACTTGATGATCTCTCTTCTTC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 7

CO CL1118Contig1 2007 7 39 U
GGTCCCCAAATCGCGAAGATGGGAGACAAAGGAGAATTGTCTGCAACAATAAAATGGCCG
AAGATCAAAGCCAAACCCAATCTCAGTGTCTCTTATCTCAAGAATCTTGATCTCTTCACG
GTGGAGAACTGTCTAACTAGTGATGAGTCAAAGGGCTTTGTTAAAATCGCAGAGTCTCTA
GGTTTCACTCACCAAGGAAGCCGAGGCCCTGCTTATGGTGAAGCTTTTAGAGATAACCAT
CGAATCTCTGTGAACGATCCTGTTCTTGCTGACACACTATGGCAATCCGGGCTTTCTAAT
TTGTTTACTGATATCAAGATTAGGAGGAGAGTTGCTGTTGGTTTGAATCCAAACATTCGA
TTTTACAGGTATAGTGCTGGTCAGCATTTTGGTCGTCACATTGATGAAAGTGTTGATCCT
GAAGATGGGAAGCGGACCTATTACACATTGTTGATATATCTAAGCGGCAACAATAACGCA
AAATCCAAATCAAAGAGCAGTTCTTCAAGCAAGACAAATGATTCTTCTTCAGCTGAGCCT
TTATTA*GGTGGAGAAACTGTCTTTTATGGTTCAAGGAACAGTATCGTAGCTGAGGTAGC
TCCAGTGGAAGGTATGGCTCTGTTTCATATTCATG*AGACAAGTGCATGTTGCACGAAGG
AAGAAATGTTTCCAAGGGAGTCAAGTATGTGTTCCGTTCTGATG*TTGTTTTTGCATAAC
GAAACATTATTCAAATTCTATGTG*TTTTGTGTTTCACAAATGTGTTACTTTCATTCAAC
ATTTCGAGCCATCAATTAACTTTATGTTCACGACGAAGCAGAACAAAGTTACATGTAAAG
CAAACGATGCAACTCATAGCGAACTATAATACTATTAATACATTATGATATGAATTGTAA
ATGCAATCAAACTTAAAGAAATGAAAGCTCTCAATTGCATATATTTTCCGTAAACTTTTA
CTTTTTTTAATTGACGAAACGAGTGTTGGCTCTCACTTCTCCCGTCTCCTTGGCACCAAA
GTTCCCAAGTTTCACCATGGAAGTTGCAAACTCTCTGAAAAAGGCCTTTTGGTCTCGAGC
ATATGTCTCAACGATCCACTTAGTCCGGTAGTCTCCTAAAAGCGCCTGATCAGATCCAAA
CACACCTTTTCCTGATAGTATCTGCTTGTAGTAATCGTTATCGAAAACCGAGGTCGTAAA
GTCCAAGAAAGTCCCTGCGTTCTTGCCTCGGTTGTTAGATGTCGGGCATTTCTTTTTCAG
GCTTTGCGCAAATGCAAAGTTCATCGAAGGATCGATATCGTGGAACTTGCTGAAGTTATG
AAGACGGGCCTCGAAAGAAGAACAATGAGAGAATCCTATCGTGTGGCCGCCGGAGAGTGT
AACCATGTCTTTCACTGACTAGCCTCTTGCTGCAAAGCTTTGGATCAGTTGAGACACGTT
GAATGTTGGTCCTGGGAGATTGATCGTCTCGGTTGCTCGTGACATTCTCCCATCTTTTCG
CCCTCTCAGTACGCTCCAGTAAGGACCACCGGACAAGGTGACCACATCTCTAGCTGCAAT
GGCGATCACGTCCGCACAAGAAACAGTACGAGGACAAACCTCTTCAAGCTTTGTCTTGGC
ATTATCTATCACGTAAAATGATCGTACCGAAATGTTTGGTGGGCCGTCCTTCTCAGCTTG
GTTTGACTTGGTCGAATCTAGTAGAATAGACGCATCACACCCCCTGATGAAGCAGTCGTG
GAAGAACATTCTGAGGAGACGAGCAGGCACTTTGGGATCATGCAAGATAGCTTTCTTAAC
AGTTTCAAGTATGATTCTCTCGGCAGCAGGGCACGATCGGTCATAGTAATGAGCATCAAG
AGCAGCTTCTGAGGGCTTAACTATCACAAAAACTGTAAAAATTATCGCCAAAACAAGTCT
CTTGGAGAATGCCATTTTAAGTATTGTGTATTTAAGCCTCAAAAAGTACTCTTTGTGTTC
TTAGAGTTGTTTGAGGATTTGATGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C436JQ C 149
AF RR2C436TF U 11
AF RR2EN71TF U 1
AF RR2A953JQ C 25
AF RR2A953TF U 25
AF RR2DO66JQ U 714
AF RR2DO66TF C 1378
BS 1 53 RR2EN71TF
BS 54 54 RR2A953TF
BS 55 59 RR2EN71TF
BS 60 60 RR2A953TF
BS 61 134 RR2EN71TF
BS 135 135 RR2C436TF
BS 136 199 RR2EN71TF
BS 200 200 RR2C436TF
BS 201 228 RR2EN71TF
BS 229 229 RR2C436TF
BS 230 273 RR2EN71TF
BS 274 274 RR2C436TF
BS 275 418 RR2EN71TF
BS 419 419 RR2A953TF
BS 420 491 RR2EN71TF
BS 492 492 RR2A953TF
BS 493 496 RR2EN71TF
BS 497 497 RR2C436TF
BS 498 525 RR2EN71TF
BS 526 526 RR2C436TF
BS 527 543 RR2EN71TF
BS 544 544 RR2A953TF
BS 545 611 RR2EN71TF
BS 612 612 RR2A953TF
BS 613 635 RR2EN71TF
BS 636 636 RR2A953TF
BS 637 645 RR2EN71TF
BS 646 646 RR2A953TF
BS 647 669 RR2EN71TF
BS 670 670 RR2A953TF
BS 671 712 RR2EN71TF
BS 713 713 RR2A953TF
BS 714 726 RR2EN71TF
BS 727 727 RR2A953TF
BS 728 744 RR2EN71TF
BS 745 745 RR2DO66JQ
BS 746 811 RR2A953TF
BS 812 1458 RR2DO66JQ
BS 1459 2007 RR2DO66TF

RD RR2C436JQ 265 0 0
CAAAGGGCTTTGTTAAAATCGCAGAGTCTCTAGGTTTCACTCACCAAGGAAGCCGAGGCC
CTGCTTATGGTGAAGCTTTTAGAGATAACCATCGAATCTCTGTGAACGATCCTGTTCTTG
CTGACACACTATGGCAATCCGGGCTTTCTAATTTGTTTACTGATATCAAGATTAGGAGGA
GAGTTGCTGTTGGTTTGAATCCAAACATTCGATTTTACAGGTATAGTGCTGGTCAGCATT
TTGGTCGTCACATTGATGAAAGTGT

QA 1 265 1 265
DS 

RD RR2C436TF 573 0 0
GG
GCGAAGATGGGAGACAAAGGAGAATTGTCTGCAACAATAAAGTGGCCTAAGATCAAAGCC
AAACCCAATCTCAGTGTCTCTTATCTCAAGAATCTTGATCTCTTCACGGTGGAGAACTGT
CTAACTAGTGATGAGTCAAAGGGCTTTGTTAAAATCGCAGAGTCTCTAGGTTTCACTCAC
CAAGGAAGCCGAGGCCCTGCTTATGGTGAAGCTTTTAGAGATAACCATCGAATCTCTGTG
AACGATCCTGTTCTTGCTGACACACTATGGCAATCCGGGCTTTCTAATTTGTTTACTGAT
ATCAAGATTAGGAGGAGAGTTGCTGTTGGTTTGAATCCAAACATTCGATTTTACAGGTAT
AGTGCTGGTCAGCATTTTGGTCGTCACATTGATGAAAGTGTTGATCTTGAAGATGGGAAG
CGGACCTATTACACATTGTTGATATATCTAAGCGGTAACAACAACGCAAAATCCAAATCC
AAGAGCAGTTCTTCAAGCAAGACGAATGATTCTTCTTCAGCTGAGCCTTTAGTA*GGTGG
AGAAACTGTCTTTTATGGTTCAAGGAACAGT

QA 3 573 3 573
DS 

RD RR2EN71TF 751 0 0
GGTCCCCAAATCGCGAAGATGGGAGACAAAGGAGAATTGTCTGCAACAATAAAGTGGCCT
AAGATCAAAGCCAAACCCAATCTCAGTGTCTCTTATCTCAAGAATCTTGATCTCTTCACG
GTGGAGAACTGTCTCACTAGTGATGAGTCAAAGGGCTTTGTTAAAATCGCAGAGTCTCTA
GGTTTCACTCACCAAGGAACCCGAGGCCCTGCTTATGGTGAAGCTTTTGGAGATAACCAT
CGAATCTCTGTGAACGATCCTGTTCTTGCTGACTCACTATGGCAATCCGGGCTTTCTAAT
TTGTTTACTGATATCAAGATTAGGAGGAGAGTTGCTGTTGGTTTGAATCCAAACATTCGA
TTTTACAGGTATAGTGCTGGTCAGCATTTTGGTCGTCACATTGATGAAAGTGTTGATCTT
GAAGATGGGAAGCGGACCTATTACACATTGTTGATATATCTAAGCGGCAACAATAACGCA
AAATCCAAATCCAAGATCAGTTCTTCAAGCAAGACAAATGATTCTCCTTCAGCTGAGCCT
TTAGTA*GGTGGAGAAACTGTCTTTTATGGTTCAAGGAACAGTATCGTAGCTGAGGTAGC
TCCAGTGGAAG*TATGGCTCTGTTTCATATTCATGGAGACAAGTGTATGTTGCACGAAGG
AAGAAATGTCTCCAAGGGAGTCAAGTATGTGTTCCGTTCTGATG*TTGTTTT*GCATAAC
GAAACAATATTCAAATTCTATGTG
TTTGTGT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2A953JQ 789 0 0
GGA
AAAGGAGAATTGTCTGCAACAATAAAATGGCCGAAGATCAAAGCCAAACCCAATCTCAGT
GTCTCTTATCTCAAGAATCTTGATCTCTTCACGGTGGAGAACTGTCTAACTAGTGATGAG
TCAAAGGGCTTTGTTAAAATCGCAGAGTCTCTAGGTTTCACTCACCAAGGAAGCCGAGGC
CCTGCTTATGGTGAAGCTTTTAGAGATAACCATCGAATCTCTGTGAACGATCCTGTTCTT
GCTGACACACTATGGCAATCTGGGCTTTCTAATTTGTTTACTGATATTAAGATTAGGAGG
AGAGTTGCTGTTGGTTTGAATCCAAACATTCGATTTTACAGGTATAGTGCTGGTCAGCAT
TTTGGTCGTCACATTGATGAAAGTGTTGATCCTGAAGATGGGAAGCGGACCTATTACACA
TTGTTGATATATCTAAGCGGCAACAATAACGCAAAATCCAAATCAAAGAGCAGTTCTTCA
AGCAAGACAAATGATTCTTCTTCAGCTGAGCCTTTATTA*GGTGGAGAAACTGTCTTTTA
TGGTTCAAGGAACAGTATCGTAGCTGAGGTAGCTCCAGTGGAAGGTATGGCTCTGTTTCA
TATTCATG*AGACAAGTGCATGTTGCACGAAGGAAGAAATGTTTCCAAGGGAGTCAAGTA
TGTGTTCCGTTCTGATG*TTGTTTTTGCATAACGAAACATTATTCAAATTCTATGTG*TT
TTGTGTTTCACAAATGTGTTACTTTCATTCAACATTTCGAGCCATCAATTAACTTTATGT
TCAC
CC

QA 4 787 4 787
DS 

RD RR2A953TF 787 0 0
GGA
AAAGGAGAATTGTCTGCAACAATAAAATGGCCGAAGATCAAAGCCAAACCCAATCTCAGT
GTCTCTTATCTCAAGAATCTTGATCTCTTCACGGTGGAGAACTGTCTAACTAGTGATGAG
TCAAAGGGCTTTGTTAAAATCGCAGAGTCTCTAGGTTTCACTCACCAAGGAAGCCGAGGC
CCTGCTTATGGTGAAGCTTTTAGAGATAACCATCGAATCTCTGTGAACGATCCTGTTCTT
GCTGACACACTATGGCAATCTGGGCTTTCTAATTTGTTTACTGATATTAAGATTAGGAGG
AGAGTTGCTGTTGGTTTGAATCCAAACATTCGATTTTACAGGTATAGTGCTGGTCAGCAT
TTTGGTCGTCACATTGATGAAAGTGTTGATCCTGAAGATGGGAAGCGGACCTATTACACA
TTGTTGATATATCTAAGCGGCAACAATAACGCAAAATCCAAATCAAAGAGCAGTTCTTCA
AGCAAGACAAATGATTCTTCTTCAGCTGAGCCTTTATTAAGGTGGAGAAACTGTCTTTTA
TGGTTCAAGGAACAGTATCGTAGCTGAGGTAGCTCCAGTGGAAGGTATGGCTCTGTTTCA
TATTCATG*AGACAAGTGCATGTTGCACGAAGGAAGAAATGTTTCCAAGGGAGTCAAGTA
TGTGTTCCGTTCTGATGGTTGTTTTTGCATAACGAAACATTATTCAAATTCTATGTGGTT
TTGTGTTTCACAAATGTGTTACTTTCATTCAACATTTCGAGCCATCAATTAACTTTATGT
TCAC

QA 4 787 4 787
DS 

RD RR2DO66JQ 745 0 0
GT
ATAACGAAACATTATTCAAATTCTATGTG*TTTTGTGTTTCACAAATGTGTTACTTTCAT
TCAACATTTCGAACCATCAATTAACTTTATGTTCACGACGAAGCAGAACAAAGTTACATG
TAAAGCAAACGATGCAACTCATAGCGAACTATAATACTATTAATACATTATGATATGAAT
TGTAAATGCAATCAAACTTAAAGAAATGAAAGCTCTCAATTGCATATATTTTCCGTAAAC
TTTTACTTTTTTTAATTGACGAAACGAGTGTTGGCTCTCACTTCTCCCGTCTCCTTGGCA
CCAAAGTTCCCAAGTTTCACCATGGAAGTTGCAAACTCTCTGAAAAAGGCCTTTTGGTCT
CGAGCATATGTCTCAACGATCCACTTAGTCCGGTAGTCTCCTAAAAGCGCCTGATCAGAT
CCAAACACACCTTTTCCTGATAGTATCTGCTTGTAGTAATCGTTATCGAAAACCGAGGTC
GTAAAGTCCAAGAAAGTCCCTGCGTTCTTGCCTCGGTTGTTAGATGTCGGGCATTTCTTT
TTCAGGCTTTGCGCAAATGCAAAGTTCATCGAAGGATCGATATCGTGGAACTTGCTGAAG
TTATGAAGACGGGCCTCGAAAGAAGAACAATGAGAGAATCCTATCGTGTGGCCGCCGGAG
AGTGTAACCATGTCTTTCACTGACTAGCCTCTTGCTGCAAAGCTTTGGATCAGTTGAGAC
ACGTTGAATGTTGGTCCTGGGAG

QA 3 745 3 745
DS 

RD RR2DO66TF 630 0 0
TGTAACCATGTCTTTCACTGACTAGC*TCTTGCTGCAAAGCTTTGGATCAGTTGAGACAC
GTTGAATGTTGGTCCTGGGAGATTGATCGTCTCGGTTGCTCGTGACATTCTCCCATCTTT
TCGCCCTCTCAGTACGCTCCAGTAAGGACCACCGGACAAGGTGACCACATCTCTAGCTGC
AATGGCGATCACGTCCGCACAAGAAACAGTACGAGGACAAACCTCTTCAAGCTTTGTCTT
GGCATTATCTATCACGTAAAATGATCGTACCGAAATGTTTGGTGGGCCGTCCTTCTCAGC
TTGGTTTGACTTGGTCGAATCTAGTAGAATAGACGCATCACACCCCCTGATGAAGCAGTC
GTGGAAGAACATTCTGAGGAGACGAGCAGGCACTTTGGGATCATGCAAGATAGCTTTCTT
AACAGTTTCAAGTATGATTCTCTCGGCAGCAGGGCACGATCGGTCATAGTAATGAGCATC
AAGAGCAGCTTCTGAGGGCTTAACTATCACAAAAACTGTAAAAATTATCGCCAAAACAAG
TCTCTTGGAGAATGCCATTTTAAGTATTGTGTATTTAAGCCTCAAAAAGTACTCTTTGTG
TTCTTAGAGTTGTTTGAGGATTTGATGATC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 2 7

CO CL1119Contig1 720 2 3 U
TAGTTTGAAGAGCTATACATCGCCGTGCTTCTCGTCTACAATGACATAAACAAGCGATTG
CCCGGTCCTCATTTCGATCCGCCTTCTAAGGATCTTGTCCGGAGCATTATGACGGAGTGT
GATATGAACTTGGATGGAGAAATTGACCGGGAGGAGTTTGTGAAGTTTATCGAACTGCTC
ACGACTGACACGTTGGCGGTTGTGAGTCAAGGTTTGATCATATCGTTGATCGTGGCCCCC
ACCGTGGCTATTGCTACAAAGAAGGCCACGGAAGGTGTCCCAGGTGTTGGGAAAGTGGTG
CATAAGCTGCCTACTTCAGTGTATGCTTCTCTTGTGACCCTCGCAGTGGTGTGGGTGAAT
TCCTCCGAATAACTTAGTTGAGGAGTTGCAAAAGCTTTGCTACAAAATAAATGTCGTGTC
CTTTTTAGTCTTACTATTTTATTACAAGAACTTGTTCTTTTATCACGCAAATATAGAATA
ACGCAAGGGTCGAGTGAAAACAGTTTTATTATCCTTTGTATGTGTTGTGGGTCTTGGTTT
CCCTTTGTATATCCCTGTCCTCTCTTTCAAGGACCAAAGAAAAAGAAAAAAAAAATGATC
GTTTTATGGTTGGGTGGTTGGTCATTCACAAAACCTGAGTCGCTGTTTTCAGTCATGTGT
CATTACTACATGGCTCTCACTTATAAATCTTGCTAAGAATCTTAGACATGTTCTTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C121TF U 221
AF RR2C121JQ C 1
BS 1 220 RR2C121JQ
BS 221 567 RR2C121TF
BS 568 720 RR2C121JQ

RD RR2C121TF 347 0 0
TATCGTTGATCGTGGCCCCCACCGTGGCTATTGCTACAAAGAAGGCCACGGAAGGTGTCC
CAGGTGTTGGGAAAGTGGTGCATAAGCTGCCTACTTCAGTGTATGCTTCTCTTGTGACCC
TCGCAGTGGTGTGGGTGAATTCCTCCGAATAACTTAGTTGAGGAGTTGCAAAAGCTTTGC
TACAAAATAAATGTCGTGTCCTTTTTAGTCTTACTATTTTATTACAAGAACTTGTTCTTT
TATCACGCAAATATAGAATAACGCAAGGGTCGAGTGAAAACAGTTTTATTATCCTTTGTA
TGTGTTGTGGGTCTTGGTTTCCCTTTGTATATCCCTGTCCTCTCTTT

QA 1 347 1 347
DS 

RD RR2C121JQ 720 0 0
TAGTTTGAAGAGCTATACATCGCCGTGCTTCTCGTCTACAATGACATAAACAAGCGATTG
CCCGGTCCTCATTTCGATCCGCCTTCTAAGGATCTTGTCCGGAGCATTATGACGGAGTGT
GATATGAACTTGGATGGAGAAATTGACCGGGAGGAGTTTGTGAAGTTTATCGAACTGCTC
ACGACTGACACGTTGGCGGTTGTGAGTCAAGGTTTGATCATATCGTTGATCGTGGCCCCC
ACCGTGGCTATTGCTACAAAGAAGGCCACGGAAGGTGTCCCAGGTGTTGGGAAAGTGGTG
CATAAGCTGCCTACTTCAGTGTATGCTTCTCTTGTGACCCTCGCAGTGGTGTGGGTGAAT
TCCTCCGAATAACTTAGTTGAGGAGTTGCAAAAGCTTTGCTACAAAATAAATGTCGTGTC
CTTTTTAGTCTTACTATTTTATTACAAGAACTTGTTCTTTTATCACGCAAATATAGAATA
ACGCAAGGGTCGAGTGAAAACAGTTTTATTATCCTTTGTATGTGTTGTGGGTCTTGGTTT
CCCTTTGTATATCCCTGTCCTCTCTTTCAAGGACCAAAGAAAAAGAAAAAAAAAATGATC
GTTTTATGGTTGGGTGGTTGGTCATTCACAAAACCTGAGTCGCTGTTTTCAGTCATGTGT
CATTACTACATGGCTCTCACTTATAAATCTTGCTAAGAATCTTAGACATGTTCTTTATCC

QA 1 720 1 720
DS 



CO CL1119Contig2 661 5 2 U
GATAATAAAACTGTTTTCACTCAACCCTTGAGTTATTCTATATTTTGCGTGATAAAAGAA
CAAGTTCTTGTAATAAA*TAGTA*GACTAAAAAAGGACATGACATTTATTTTGTAGCAAA
GCTTTTGCAACTCCTCAACTAAGTTATTCGGAGGAATTCACCCACACCACTGCAAGGGTC
ACAAGAGAAGCATACACTGAAGTAGGCAGCTTATGCACCACTTTCCCAACTCCTGGGACA
CCTTCCGTGGCCTTCTTTGTAGCAATAGCCACGGTGGGGGCCACGATCAACGATATGATC
AAACCCTGACTCACAACCGCCAACGTGTCGGTCGAAAGCAGCTCAATAAACTTCACAAAC
TCCTCACGGTCAATTT*CTCCATCCAAGTTCATATCACACTCCGTCATAATGCTTCGGAC
AAGATCCTTAGAAGGCGGATCGAAATGAGGACCGGGCAATCGCTTGTTTATGTCATTGTA
GACGAAAAGCACGGCGATGTATAGCTCTTCAAACGAGAGATTGGCTCTTCCGGTTTCAAG
CTTGAACCGATCGAAAACCCGATCACATATCGCCTGTACCTGTTTTTGCCTCCACTGCTT
ACCTCGGAGCTTGTCGAAGACTTGTCCCATGGCGATGAGTTTCTTCTTGTCTGATGTGCC
C


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2CW20JQ U 72
AF RR2G926JQ U 1
AF RR2G926TF C 1
AF RR2GQ52JQ U 1
AF RR2CW20TF C 18
BS 1 613 RR2G926JQ
BS 614 661 RR2GQ52JQ

RD RR2CW20JQ 350 0 0
AATAAAATAGTAAGACTAAAAA*GGACACGACATTTATTTTGTAGCAAAGCTTTTGCAAC
TCCTCAACTAGGTTATTCGGAGGAATTCACCCACACCACTGCGAGGGTCACAAGAGAAGC
ATACACTGAAGTAGGCAACTTATGCACCACTTTCCCAACACCTGGGACACCTTCCGTGGC
CTTCTTTGTAGCAATAGCCACGGTGGGGGCCACGATCAACGATATGATCAAACCTTGACT
CACAACCGCCAACGTGTCAGTCGTGAGCAGTTCGATAAACTTCACAAACTCCTCCCGGTC
AATTTTCTCCATCCAAGTTCATATCACACTCCGTCATAATGCTCCGGACA

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR2G926JQ 613 0 0
GATAATAAAACTGTTTTCACTCAACCCTTGAGTTATTCTATATTTTGCGTGATAAAAGAA
CAAGTTCTTGTAATAAA*TAGTA*GACTAAAAAAGGACATGACATTTATTTTGTAGCAAA
GCTTTTGCAACTCCTCAACTAAGTTATTCGGAGGAATTCACCCACACCACTGCAAGGGTC
ACAAGAGAAGCATACACTGAAGTAGGCAGCTTATGCACCACTTTCCCAACTCCTGGGACA
CCTTCCGTGGCCTTCTTTGTAGCAATAGCCACGGTGGGGGCCACGATCAACGATATGATC
AAACCCTGACTCACAACCGCCAACGTGTCGGTCGAAAGCAGCTCAATAAACTTCACAAAC
TCCTCACGGTCAATTT*CTCCATCCAAGTTCATATCACACTCCGTCATAATGCTTCGGAC
AAGATCCTTAGAAGGCGGATCGAAATGAGGACCGGGCAATCGCTTGTTTATGTCATTGTA
GACGAAAAGCACGGCGATGTATAGCTCTTCAAACGAGAGATTGGCTCTTCCGGTTTCAAG
CTTGAACCGATCGAAAACCCGATCACATATCGCCTGTACCTGTTTTTGCCTCCACTGCTT
ACCTCGGAGCTTG

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2G926TF 661 0 0
GATAATAAAACTGTTTTCACTCAACCCTTGAGTTATTCTATATTTTGCGTGATAAAAGAA
CAAGTTCTTGTAATAAA*TAGTA*GACTAAAAAAGGACATGACATTTATTTTGTAGCAAA
GCTTTTGCAACTCCTCAACTAAGTTATTCGGAGGAATTCACCCACACCACTGCAAGGGTC
ACAAGAGAAGCATACACTGAAGTAGGCAGCTTATGCACCACTTTCCCAACTCCTGGGACA
CCTTCCGTGGCCTTCTTTGTAGCAATAGCCACGGTGGGGGCCACGATCAACGATATGATC
AAACCCTGACTCACAACCGCCAACGTGTCGGTCGAAAGCAGCTCAATAAACTTCACAAAC
TCCTCACGGTCAATTT*CTCCATCCAAGTTCATATCACACTCCGTCATAATGCTTCGGAC
AAGATCCTTAGAAGGCGGATCGAAATGAGGACCGGGCAATCGCTTGTTTATGTCATTGTA
GACGAGAAGCACGGCGATGTATAGCTCTTCAAACGAGAGATTGGCTCTTCCGGTTTCAAG
CTTGAACCGATCGAAAACCCGATCACATATCGCCTGTACCTGTTTTTGCCTCCACTGCTT
ACCTCGGAGCTTGTCGAAGACTTGTCCCATGGCGATGAGTTTCTTCTTGTCTGATGTGCC
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2GQ52JQ 661 0 0
GATAATAAAACTGTTTTCACTCAACCCTTGAGTTATTCTATATTTTGCGTGATAAAAGAA
CAAGTTCTTGTAATAAA*TAGTA*GACTAAAAAAGGACATGACATTTATTTTGTAGCAAA
GCTTTTGCAACTCCTCAACTAAGTTATTCGGAGGAATTCACCCACACCACTGCAAGGGTC
ACAAGAGAAGCATACACTGAAGTAGGCAGCTTATGCACCACTTTCCCAACTCCTGGGACA
CCTTCCGTGGCCTTCTTTGTAGCAATAGCCACGGTGGGGGCCACGATCAACGATATGATC
AAACCCTGACTCACAACCGCCAACGTGTCGGTCGAAAGCAGCTCAATAAACTTCACAAAC
TCCTCACGGTCAATTT*CTCCATCCAAGTTCATATCACACTCCGTCATAATGCTTCGGAC
AAGATCCTTAAAAGGCGGATCGAAATGAGGACCGGGCAATCGCTTGTTTATGTCATTGTA
GACGAAAAGCACGGCGATGTATAGCTCTTCAAACGAGAGATTGGCTCTTCCGGTTTCAAG
CTTGAACCGATCGAAAACCCGATCACATATCGCCTGTACCTGTTTTTGCCTCCACTGCTT
ACCTCGGAGCTTGTCGAAGACTTGTCCCATGGCGATGAGTTTCTTCTTGTCTGATGTGCC
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2CW20TF 644 0 0
CACTCGC
CCCTTGCGTTATTCTATATT**GCGTGATAAAAGAACAAGTTCTTGTAATAAAATAGTAA
GACTAAAAA*GGACACGACATTTATTTTGTAGCAAAGCTTTTGCAACTCCTCAACTAGGT
TATTCGGAGGAATTCACCCACACCACTGCGAGGGTCACAAGAGAAGCATACACTGAAGTA
GGCAACTTATGCACCACTTTCCCAACACCTGGGACACCTTCCGTGGCCTTCTTTGTAGCA
ATAGCCACGGTGGGGGCCACGATCAACGATATGATCAAACCTTGACTCACAACCGCCAAC
GTGTCAGTCGTGAGCAGTTCGATAAACTTCACAAACTCCTCCCGGTCAATTT*CTCCATC
CAAGTTCATATCACACTCCGTCATAATGCTCCGGACAAGATCCTTAGAAGGCGGATCGAA
ATGAGGACCGGGCAATCGCTTGTTTATGTCATTGTAGACGAGAAGCACGGCGATGTATAG
CTCTTCAAAACTAAGATTGGCTCTTCCGGTTTCAAGCTTGAACCGATCGAAAACCCGATC
ACATATCGCCTGTACCTGTTTTTGCCTCCACTGCTTGCCTCGGAGCTTGTCGAAGACTTG
TCCCATGGCGATGAGTTTCTTCTTGTCTGATGTGCCC

QA 8 644 8 644
DS 



AS 2 6

CO CL1120Contig1 663 4 2 U
TTTTTTTTTAATCTAATAACAATCGTGTTTATTGCGTCACAAGCCGTATATATACATCAA
TGAAAAGGAGAGACTACAAATAACAAATGGGAGGCGAGATTATAGTGAACTCTTTAACGC
ATCATAGGAGCAAACTCATCAAAGCTCAAAACTCCATCAGCATTGAGATCAAAAGCACGA
ATCATAACTCTACAATCATCAGTGCTTCTTGTCTCACCTAGCTTCTTTAACATCATCTTC
AAGCTTCTCGGAGTAATACACTCTTCACCTTCTGCTATATACATTCTAAAAGCTTCCTTT
AGCTCAGTCTTCTTCTCTTCCTCATCATCTCCTTTGATCAGCTGAGCAAACTCATCAAAA
TCCAACATCCCGTCTCCGTCTGTATCAGACAATCTAACCGCAGCTTCGGCTTCTTCATCA
GACAACTGCTCTCCTAATGTCATGAAACTCTTCTGAAGCTCATGTGGAGATATTCTACCG
TCTCTGTTTGCGTCCATGTAAGCAAAGACAGCTTCTAAGTCTCTGTTCTTGTCCTCATCA
CCATTAATGTTACCTTGTGTCTCTTCGGATGAATCTTTCCTCTTTGGTGACAGTTTCCGG
CAAAACTTCACGAAAGATGAAGATGATTGAGCTTGAGTATTCTTCATCCTGATGATAGAA
AAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2F164JQ U 15
AF RR2F164TF C 320
AF RR2CK45TF C 1
AF RR2CK45JQ U 10
BS 1 9 RR2CK45TF
BS 10 663 RR2CK45JQ

RD RR2F164JQ 404 0 0
AATAACAATCGTGTTTATTGCGTCACAAGCCGTATATATACATCAATGAAAAGGAGAGAC
TACAAATAACAAATGGGAGGCGAGATTATAGTGAACTCTTTAACGCATCATAAGAGCAAA
CTCATCGAAGCTCAAAACTCCATCAGCATTGAGATCAAAAGCACGAATCATAACTCTACA
ATCATCAGTGCTTCTTGTCTCACCTAGCTTCTTTAACATCATCTTCAAGCTTCTCGGAGT
AATACACTCTTCACCTTCTGCTATATACATTCTAAAAGCTTCCTTTAGCTCAGTCTTCTT
CTCTTCCTCATCATCTCCTTTGATCAGCTGAGCAAACTCATCAAAATCCAACATCCCGTC
TCCGTCTGTATCAAACAATCTAACCGCAGCTTCGGCTTCTTCAT

QA 1 404 1 404
DS 

RD RR2F164TF 289 0 0
CCTCATCATCTCCTTTGATCAGCTGAGCAAACTCATCAAAATCCAACATCCCGTCTCCGT
CTGTATCAGACAATCTAACCGCAGCTTCGGCTTCTTCATCAGACAACTGCTCTCCTAATG
TCATGAAACTCTTCTGAAGCTCATGTGGAGATATTCTACCGTCTCTGTTTGCGTCCATGT
AAGCAAAGACAGCTTCTAAGTCTCTGTTCTTGTCCTCATCGCCATTAATGTTACCTTGTG
TCTCTTCGGATGAATCTTTCCTCTTTGGTGACAGTTTCCGGCAAAACTT

QA 1 289 1 289
DS 

RD RR2CK45TF 663 0 0
TTTTTTTTTAATCTAATAACAATCGTGTTTAT*GCGTCACAAGCCGTATATATACATCAA
TGAAAAGGAGAGACTACAAATAACAAATGGGAGGCGAGATTATAGTGAACTCTTTAACGC
ATCATAGGAGCAAACTCATCAAAGCTCAAAACTCCATCAGCATTGAGATCAAAAGCACGA
ATCATAACTCTACAATCATCAGTGCTTCTTGTCTCACCTAGCTTCTTTAACATCATCTTC
AAGCTTCTCGGAGTAATACACTCTTCACCTTCTGCTATATACATTCTAAAAGCTTCCTTT
AGCTCAGTCTTCTTCTCTTCCTCATCATCTCCTTTGATCAGCTGAGCAAACTCATCAAAA
TCCAACATCCCGTCTCCGTCTGTATCAGACAATCTAACCGCAGCTTCGGCTTCTTCATCA
GACAACTGCTCTCCTAATGTCATGAAACTCTTCTGAAGCTCATGTGGAGATATTCTACCG
TCTCTGTTTGCGTCCATGTAAGCAAAGACAGCTTCTAAGTCTCTGTTCTTGTCCTCATCA
CCATTAATGTTACCTTGTGTCTCTTCGGATGAATCTTTCCTCTTTGGTGACAGTTTCCGG
CAAAACTTCACGAAAGATGAAGATGATTGAGCTTGAGTATTCTTCATCCTGATGATAGAA
AAA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2CK45JQ 654 0 0
AATCTAATAACAATCGTGTTTATTGCGTCACAAGCCGTATATATACATCAATGAAAAGGA
GAGACTACAAATAACAAATGGGAGGCGAGATTATAGTGAACTCTTTAACGCATCATAGGA
GCAAACTCATCAAAGCTCAAAACTCCATCAGCATTGAGATCAAAAGCACGAATCATAACT
CTACAATCATCAGTGCTTCTTGTCTCACCTAGCTTCTTTAACATCATCTTCAAGCTTCTC
GGAGTAATACACTCTTCACCTTCTGCTATATACATTCTAAAAGCTTCCTTTAGCTCAGTC
TTCTTCTCTTCCTCATCATCTCCTTTGATCAGCTGAGCAAACTCATCAAAATCCAACATC
CCGTCTCCGTCTGTATCAGACAATCTAACCGCAGCTTCGGCTTCTTCATCAGACAACTGC
TCTCCTAATGTCATGAAACTCTTCTGAAGCTCATGTGGAGATATTCTACCGTCTCTGTTT
GCGTCCATGTAAGCAAAGACAGCTTCTAAGTCTCTGTTCTTGTCCTCATCACCATTAATG
TTACCTTGTGTCTCTTCGGATGAATCTTTCCTCTTTGGTGACAGTTTCCGGCAAAACTTC
ACGAAAGATGAAGATGATTGAGCTTGAGTATTCTTCATCCTGATGATAGAAAAA

QA 1 654 1 654
DS 



CO CL1120Contig2 688 2 1 U
TTTTTCTATCATCAGGATGAAGAATACTCAAGCTCAATCATCTTCATCTTTCGTGAAGCT
TTGCCGGAAACTGTCACCAAAGAGGAAAGATTCATCCCCAGAGACGACACAACATAGCAT
TAATGGTGATGAGGACAAGAACAGAGACTTAGAGGCTGTCTTTGCTTACATGGACGCAAA
CAGAGACGGTAGAATATCTCCACATGAGCTTCAGAAGAGTTTCATGACACTAGGAGAGGA
GTTGTCTGATGAAGAAGCCGAAGCTGCGGTTAGATTGTCTGATACAGACGGAGACGGGAT
GTTGGATTTTGATGAGTTTGCTCAGTTAATCAAAGGAGATGATGAGGAAGAGAAGAAGAC
TGAGCTAAAGGAAGCTTTTAGAATGTATATAGCAGAAGGTGAAGAGTGTATTACTCCAAG
AAGCTTGAAGATGATGTTAAAGAAGCTAGGTGAGACAAGAAGCACTGATGATTGTAGAGT
TATGATTCGTGCTTTTGATCTCAATGCTGATGGAGTTTTGAGCTTTGATGAGTTTGCTCT
TATGATGCGTTAAAAGAGTTTACTATATAATCGCCTCCCATTGGTTATTTGTAGTCTCTC
CTTTTCATTGATGTATATATACAGCTTGTGACGCAATAAACACTATTGTTATTAGATTAA
AATCCATTTATAAACCTTTTTTTATACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H304JQ C 1
AF RR2H304TF U 1
BS 1 688 RR2H304TF

RD RR2H304JQ 688 0 0
TTTTTCTATCATCAGGATGAAGAATACTCAAGCTCAATCATCTTCATCTTTCGTGAAGCT
TTGCCGGAAACTGTCACCAAAGAGGAAAGATTCATCCCCAGAGACGACACAACATAGCAT
TAATGGTGATGAGGACAAGAACAGAGACTTAGAGGCTGTCTTTGCTTACATGGACGCAAA
CAGAGACGGTAGAATATCTCCACATGAGCTTCAGAAGAGTTTCATGACACTAGGAGAGGA
GTTGTCTGATGAAGAAGCCGAAGCTGCGGTTAGATTGTCTGATACAGACGGAGACGGGAT
GTTGGATTTTGATGAGTTTGCTCAGTTAATCAAAGGAGATGATGAGGAAGAGAAGAAGAC
TGAGCTAAAGGAAGCTTTTAGAATGTATATAGCAGAAGGTGAAGAGTGTATTACTCCAAG
AAGCTTGAAGATGATGTTAAAGAAGCTAGGTGAGACAAGAAGCACTGATGATTGTAGAGT
TATGATTCGTGCTTTTGATCTCAATGCTGATGGAGTTTTGAGCTTTGATGAGTTTGCTCT
TATGATGCGTTAAAAGAGTTTACTATATAATCGCCTCCCATTGGTTATTTGTAGTCTCTC
CTTTTCATTGATGTATATATACGGCTTGTGACGCAATAAACACTATTGTTATTAGATTAA
AATCCATTTATAAACCTTTTTTTATACG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2H304TF 688 0 0
TTTTTCTATCATCAGGATGAAGAATACTCAAGCTCAATCATCTTCATCTTTCGTGAAGCT
TTGCCGGAAACTGTCACCAAAGAGGAAAGATTCATCCCCAGAGACGACACAACATAGCAT
TAATGGTGATGAGGACAAGAACAGAGACTTAGAGGCTGTCTTTGCTTACATGGACGCAAA
CAGAGACGGTAGAATATCTCCACATGAGCTTCAGAAGAGTTTCATGACACTAGGAGAGGA
GTTGTCTGATGAAGAAGCCGAAGCTGCGGTTAGATTGTCTGATACAGACGGAGACGGGAT
GTTGGATTTTGATGAGTTTGCTCAGTTAATCAAAGGAGATGATGAGGAAGAGAAGAAGAC
TGAGCTAAAGGAAGCTTTTAGAATGTATATAGCAGAAGGTGAAGAGTGTATTACTCCAAG
AAGCTTGAAGATGATGTTAAAGAAGCTAGGTGAGACAAGAAGCACTGATGATTGTAGAGT
TATGATTCGTGCTTTTGATCTCAATGCTGATGGAGTTTTGAGCTTTGATGAGTTTGCTCT
TATGATGCGTTAAAAGAGTTTACTATATAATCGCCTCCCATTGGTTATTTGTAGTCTCTC
CTTTTCATTGATGTATATATACAGCTTGTGACGCAATAAACACTATTGTTATTAGATTAA
AATCCATTTATAAACCTTTTTTTATACG

QA 1 688 1 688
DS 



AS 3 7

CO CL1121Contig1 542 2 2 U
CAGAAGCGTTGAGAGAGAGAATTCAAACGCCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTTCAGA
GGATTATGACCCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGGATCC
AGATTTGGCTTTTTGAGCAGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTTGACG
AGTACATGAACCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTGAGCATCAAGAAGAACACCAGGA
AGCCACTTGGAAGGATTCTGCTCAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACGGGAA
AGTAATGTCTGTTCTCAACAAACTCTCTCGAGGATTTGTGGATCTGCGTTTCGACTATCT
CCAAAGCTTTTACTAAATGTATGTTGAGTTAAGTTCTTCAGTTAACTGATAATGCCTTCT
TCTCTTCATGATCGTGTAATATTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAGAAATTATGGAACTTG
GTTGAATCTTATGGATGGTATTGTCCTTTTAGTTTCATGTATGCTACTAACACTGTTTTT
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2A290JQ C 1
AF RR2A290TF U 1
BS 1 10 RR2A290JQ
BS 11 542 RR2A290TF

RD RR2A290JQ 542 0 0
CAGAAGCGTTGAGAGAGAGAATTCAAACGCCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTTCAGA
GGATTATGACCCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGGATCC
AGATTTGGCTTTTTGAGCAGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTTGACG
AGTACATGAACCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTGAGCATCAAGAAGAACACCAGGA
AGCCACTTGGAAGGATTCTGCTCAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACGGGAA
AGTAATGTCTGTTCTCAACAAACTCTCTCGAGGATTTGTGGATCTGCGTTTCGACTATCT
CCAAAGCTTTTACTAAATGTATGTTGAGTTAAGTTCTTCAGTTAACTGATAATGCCTTCT
TCTCTTCATGATCGTGTAATATTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAGAAATTATGGAACTTG
GTTGAATCTTATGGATGGTATTGTCCTTTTAGTTTCATGTATGCTACTAACACTGTTTTT
CC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2A290TF 542 0 0
CAGAAGCGTT
GAGAGAGAGAATTCAAACGCCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTTCAGAGGATTATGAC
CCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGGATCCAGATTTGGCT
TTTTGAGCAGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTTGACGAGTACATGAA
CCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTGAGCATCAAGAAGAACACCAGGAAGCCACTTGG
AAGGATTCTGCTCAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACGGGAAAGTAATGTCT
GTTCTCAACAAACTCTCTCGAGGATTTGTGGATCTGCGTTTCGACTATCTCCAAAGCTTT
TACTAAATGTATGTTGAGTTAAGTTCTTCAGTTAACTGATAATGCCTTCTTCTCTTCATG
ATCGTGTAATATTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAGAAATTATGGAACTTGGTTGAATCTT
ATGGATGGTATTGTCCTTTTAGTTTCATGTATGCTACTAACACTGTTTTTCC

QA 11 542 11 542
DS 



CO CL1121Contig2 541 3 1 U
CCGAAGCGTTGAGAGAGAGAGAGAATTCAAACGTCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTT
CAGAGGATTATGACCCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGG
ATCCAGATTTGGCTTTTTGAGCAGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTT
GACGAGTACATGAACCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTTAGCATCAAGAAGAACACC
AGGAAACCACTTGGAAGGATTCTACTCAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACG
GGAAAGTAATGTCTGCTCTCAACAAACTCTCTCGTGGATTAGTAGATTTGCTTTTCGACT
ATCTCCAAAGCTTTTACTAAATGTATGTTGAGTTTAGTTCTTCAATTATCTGATAATGCC
TTCTTCTCTTCATGATCGTCTAATGCTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAGAAATTATGGAA
CTTGGTTGAATCTTATGGATGGTATTGTCCCTTTTAGTTTCATGTAATCTGGCATTTTTA
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2DH14TF U 224
AF RR2GF46TF U 4
AF RR2F609TF U 1
BS 1 541 RR2F609TF

RD RR2DH14TF 288 0 0
GCATCAAGAAGAACACCAGGAAACCACTTGGAAGGATTCTACTCAAAGGAGACAACATCA
CTCTGATGATGAACACGGGAAAGTAATGTCTGCTCTCAACAAACTCTCTCGTGGATTAGT
AGATTTGCTTTTCGACTATCTCCAAAGCTTTTACTAAATGTATGTTGAGTTTAGTTCTTC
AATTATCTGATAATGCCTTCTTCTCTTCATGATCGTCTAATGCTGCAATGTAGTGACAAG
TTTGAGAAATTATGGAACTTGGTTGAATCTTATGGATGGTATTGTCC
C

QA 1 287 1 287
DS 

RD RR2GF46TF 489 0 0
GGGCGTTGAGA
GAGAGAGAGAATTCAAACGTCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTTCAGAGGATTATGAC
CCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGGATCCAGATTTGGCT
TTTTGAGCAGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTTGACGAGTACATGAA
CCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTTAGCATCAAGAAGAACACCAGGAAACCACTTGG
AAGGATTCTACTCAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACGGGAAAGTAATGTCT
GCTCTCAACAAACTCTCTCGTGGATTAGTAGATTTGCTTTTCGACTATCTCCAAAGCTTT
TACTAAATGTATGTCGAGTTTAGTTCTTCAATTATCTGATAATGCCTTCTTCTCTTCATG
ATCGTCTAATGCTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAGAAATTATGGAACTTGGTTGAATC

QA 12 489 12 489
DS 

RD RR2F609TF 541 0 0
CCGAAGCGTTGAGAGAGAGAGAGAATTCAAACGTCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTT
CAGAGGATTATGACCCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGG
ATCCAGATTTGGCTTTTTGAGCAGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTT
GACGAGTACATGAACCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTTAGCATCAAGAAGAACACC
AGGAAACCACTTGGAAGGATTCTACTCAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACG
GGAAAGTAATGTCTGCTCTCAACAAACTCTCTCGTGGATTAGTAGATTTGCTTTTCGACT
ATCTCCAAAGCTTTTACTAAATGTATGTTGAGTTTAGTTCTTCAATTATCTGATAATGCC
TTCTTCTCTTCATGATCGTCTAATGCTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAGAAATTATGGAA
CTTGGTTGAATCTTATGGATGGTATTGTCCCTTTTAGTTTCATGTAATCTGGCATTTTTA
T

QA 1 541 1 541
DS 



CO CL1121Contig3 582 2 1 U
GAGAGAGAGAGAGAGAGAATTCAAACGTCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTTCAGAGG
ATTATGACCCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGGATCCAG
ATTTGGCTTTTTGAGCAGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTTGACGAG
TATATGAACCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTTAGCATCAAGAAGAACACCAGGAAA
CCACTTGGAAGGATTCTGCTCAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACGGGAAAG
TAATGTCTGTTCTCAACACTCTCTCGAGGATTAGTGGATCTGCGTTTCGACTATCTCCAA
AGCTTTTGCTAAATATATGTTGAGTTAAGTTCTTCTTCAGTTGACTGATAATACCTTCTT
CTCTTCATGATCGTGTAATATTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAGAAATTATGGAACTTGG
TTGAATCTTATTATTAGTAACACTGTTTTTCTTTTGTTTGGAGTATTGTATTACAAAAGA
GTCGAATTGTTTCACAATTTATTAAAAATCAATATTTGCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GL73TF U 1
AF RR2GL73JQ C 46
BS 1 582 RR2GL73TF

RD RR2GL73TF 582 0 0
GAGAGAGAGAGAGAGAGAATTCAAACGTCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTTCAGAGG
ATTATGACCCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGGATCCAG
ATTTGGCTTTTTGAGCAGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTTGACGAG
TATATGAACCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTTAGCATCAAGAAGAACACCAGGAAA
CCACTTGGAAGGATTCTGCTCAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACGGGAAAG
TAATGTCTGTTCTCAACACTCTCTCGAGGATTAGTGGATCTGCGTTTCGACTATCTCCAA
AGCTTTTGCTAAATATATGTTGAGTTAAGTTCTTCTTCAGTTGACTGATAATACCTTCTT
CTCTTCATGATCGTGTAATATTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAGAAATTATGGAACTTGG
TTGAATCTTATTATTAGTAACACTGTTTTTCTTTTGTTTGGAGTATTGTATTACAAAAGA
GTCGAATTGTTTCACAATTTATTAAAAATCAATATTTGCTGC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2GL73JQ 537 0 0
ACCAAAGTTCAGAGGATTATGACCCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGT
AAAGCTAGGATCCAGATTTGGCTTTTTGAGCAGAAAGATTTCAGGATTGAAGGAAGGATT
ACTGGTTTTGACGAGTATATGAACCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTTAGCATCAAG
AAGAACACCAGGAAACCACTTGGAAGGATTCTGCTCAAAGGAGACAACATCACTCTGATG
ATGAACACGGGAAAGTAATGTCTGTTCTCAACACTCTCTCGAGGATTAGTGGATCTGCGT
TTCGACTATCTCCAAAGCTTTTGCTAAATATATGTTGAGTTAAGTTCTTCTTCAGTTGAC
TGATAATACCTTCTTCTCTTCATGATCGTGTAATATTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAGA
AATTATGGAACTTGGTTGAATCTTATTATTAGTAACACTGTTTTTCTTTTGTTTGGAGTA
TTGTATTACAAAAGAGTCGAATTGTTTCACAATTTATTAAAAATCAATATTTGCTGC

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 7

CO CL1122Contig1 690 7 6 U
GGACTCATCAGTAAATTAAGAAAGAGAGAATTTTAAGATGGCATCTTCTAAAGTATCTTG
CATGCTTGTCTCTCTCCTTCTTCTGGTTCTTGTGCTTTCCGATATGGATAAAGCCCTGGG
TGAACCAATTCAGCTCCTCAACCGCAAACTTAAAGTGACTGAACATCATGATCAATTGAC
GACAGACCGACGTCTCGCTGTTGTTTCTAAGAGTTTGCGGAATACGTTGCCGAAATGGTT
CAGAAAGGTCCAGGAATTGGCGGGCGCTGCTAAAGATAAACTCCCTCCTTCATCGCCGAA
ATATTGCAACAATAATGACTACGCATGTAAGAGGAAGTTGGAAGCCTTGATAAGAGCCTT
TAACTTGTATAAGGCAAAACAAATATCGTTGAGACAGGTGAAAATGGCCTATGACTCCTG
GCTGAAGGCAAAATCCCATCCATCGCCTTGAAGGTCTTCCAAAGGCAAAAACATATGACT
CCACAAATTTCTTTTTTTTGACAAATTCCACAAATTTCTTGATGAAAAAATATTTTCACA
AGTTGTCACCATAAATGTAATTCTGAAAATTTCTTGCAAAATAAAAGATATTATGCCACT
CGGGATGATGGTATGATGATATGGTGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTCGAACTGTTTTAT
TTTAATTTCCTTATAAATTATATATGTCCT


BQ
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D106TF U 1
AF RR2BJ70JQ C 102
AF RR2BJ70TF U 102
AF RR2CW34JQ C 1
AF RR2CW34TF U 1
AF RR2B506TF U 5
AF RR2GT22TF U 1
BS 1 320 RR2CW34TF
BS 321 322 RR2D106TF
BS 323 539 RR2CW34TF
BS 540 540 RR2D106TF
BS 541 656 RR2CW34TF
BS 657 690 RR2GT22TF

RD RR2D106TF 569 0 0
GGACTCATCAGTAAATTAAGAAAGAGAGAATTTTAAGATGGCATCTTCTAAAGTATCTTG
CATGCTTGTCTCTCTCCTTCTTCTGGTTCTTGTGCTTTCCGATATGGATAAAGCCCTGGG
TGAACCAATTCAGCTCCTCAACCGCAAACTTAAAGTGACTGAACATCATGATCAATTGAC
GACAGACCGACGTCTCGCTGTTGTTTCTAAGAGTTTGCGGAATACGTTGCCGAAATGGTT
CAGAAAGGTCCAGGAATTGGCGGGCGCTGCTAAAGATAAACTCCCCCCTTCATCGCCGAA
ATATTGCAACAATAACGACTACGCATGTAAGAGGAAGTTGGAAGCCTTGATAAGAGCCTT
TAACTTGTATAAGGCAAAACAAATATCGTTGAGACAGGTGAAAATGGCCTATGACTCCTG
GCTGAAGGCAAAACCCCATCCATCGCCTTGAAGGTCTTCCAAAGGCAAAAACATATGACT
CCACAAATTTCTTTTTTT*GACAAATTCCACAAATTTCTTGATGAAAAAATATTTTCACA
AGTTGTCACCATAAATGTAATTCTAAAAA

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2BJ70JQ 479 0 0
G
TATGGATAAAGCCCTGGGTGAACCAATTCAGCTCCTCAACCGCAAACTTAAAGTGACTGA
ACATCATGATCAATTGACGACAGACCGACGTCTCGCTGTTGTTTTTAAGAGTTTGCGGAA
TACGTTGCCGAAATGGTTCAGAAAGGTCCAGGAATTGGCGGGCGCTGTTAA*GATAAACT
CCCTCCTTCATCGCCGAAATATTGCAACAATAATGACTACGCATGTAAGAGGAAGTTGAA
AGCCTTGATAAGAGCCTTTAACTTGTATAAGGCAAAACAAATATCGTTGAGACAGGTGAA
AATGGCCTATGACTCCTGGCTGAAGGCAAAATCCCATCCATCGCCTTGAAGGTCTTCCAA
AGGCAAAAACATATGACTCCACAAATTTCTTTTTTTTGACAAATTCCACAAATTTCTTGA
TGAAAAAATATTTTCACAAGTTGTCACCATAAATGTAATTCTGAAAATTTCTTGCAAA

QA 2 479 2 479
DS 

RD RR2BJ70TF 479 0 0
G
TATGGATAAAGCCCTGGGTGAACCAATTCAGCTCCTCAACCGCAAACTTAAAGTGACTGA
ACATCATGATCAATTGACGACAGACCGACGTCTCGCTGTTGTTTCTAAGAGTTTGCGGAA
TACGTTGCCGAAATGGTTCAGAAAGGTCCAGGAATTGGCGGGCGCTGCTAA*GATAAACT
CCCTCCTTCATCGCCGAAATATTGCAACAATAATGACTACGCATGTAAGAGGAAGTTGAA
AGCCTTGATAAGAGCCTTTAACTTGTATAAGGCAAAACAAATATCGTTGAGACAGGTGAA
AATGGCCTATGACTCCTGGCTGAAGGCAAAATCCCATCCATCGCCTTGAAGGTCTTCCAA
AGGCAAAAACATATGACTCCACAAATTTCTTTTTTTTGACAAATTCCACAAATTTCTTGA
TGAAAAAATATTTTCACAAGTTGTCACCATAAATGTAATTCTGAAAATTTCTTGCAAA

QA 2 479 2 479
DS 

RD RR2CW34JQ 656 0 0
GGACTCATCAGTAAATTAAGAAAGAGAGAATTTTAAGATGGCATCTTCTAAAGTATCTTG
CATGCTTGTCTCTCTCCTTCTTCTGGTTCTTGTGCTTTCCGATATGGATAAAGCCCTGGG
TGAACCAATTCAGCTCCTCAACCGCAAACTTAAAGTGACTGAACATCATGATCAATTGAC
GACAGACCGACGTCTCGCTGTTGTTTCTAAGAGTTTGCGGAATACGTTGCCGAAATGGTT
CAGAAAGGTCCAGGAATTGGCGGGCGCTGCTAAAGATAAACTCCCTCCTTCATCGCCGAA
ATATTGCAACAATAATGACT**GCATGTAAGAGGAAGTTGGAAGCCTTGATAAGAGCCTT
TAACTTGTATAAGGCAAAACAAATATCGTTGAGACAGGTGAAAATGGCCTATGACTCCTG
GCTGAAGGCAAAATCCCATCCATCGCCTTGAAGGTCTTCCAAAGGCAAAAACATATGACT
CCACAAATTTCTTTTTTTTGACAAATTCCACAAATTTCTTGATGAAAAAATATTTTCACG
AGTTGTCACCATAAATGTAATTCTGAAAATTTCTTGCAAAATAAAAGATATTATGCCCCT
CGGGATGATGGTATGATGATATGGTGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTCGAACTGTT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2CW34TF 663 0 0
GGACTCATCAGTAAATTAAGAAAGAGAGAATTTTAAGATGGCATCTTCTAAAGTATCTTG
CATGCTTGTCTCTCTCCTTCTTCTGGTTCTTGTGCTTTCCGATATGGATAAAGCCCTGGG
TGAACCAATTCAGCTCCTCAACCGCAAACTTAAAGTGACTGAACATCATGATCAATTGAC
GACAGACCGACGTCTCGCTGTTGTTTCTAAGAGTTTGCGGAATACGTTGCCGAAATGGTT
CAGAAAGGTCCAGGAATTGGCGGGCGCTGCTAAAGATAAACTCCCTCCTTCATCGCCGAA
ATATTGCAACAATAATGACT**GCATGTAAGAGGAAGTTGGAAGCCTTGATAAGAGCCTT
TAACTTGTATAAGGCAAAACAAATATCGTTGAGACAGGTGAAAATGGCCTATGACTCCTG
GCTGAAGGCAAAATCCCATCCATCGCCTTGAAGGTCTTCCAAAGGCAAAAACATATGACT
CCACAAATTTCTTTTTTTTGACAAATTCCACAAATTTCTTGATGAAAAAATATTTTCACG
AGTTGTCACCATAAATGTAATTCTGAAAATTTCTTGCAAAATAAAAGATATTATGCCACT
CGGGATGATGGTATGATGATATGGTGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTCGAACTGTT
TTATTCC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2B506TF 633 0 0
GG
ATCAGTAAATTAAGAAAGAGAGAATTTTAAGATGGCATCTTCTAAAGTATCTTGCATGCT
TGTCTCTCTCCTTCTTCTGGTTCTTGTGCTTTC*GATATGGATAAAGCCCTGGGTGAACC
AATTCAGCTCCTCAACCGCAAACTTAAAGTGACTGAACATCATGATCAATTGACGACAGA
CCGACGTCTCGCTGTTGTTTCTAAGAGTTTGCGGAATACGTTGCCGAAATGGTTCAGAAA
GGTCCAGGAATTGGCGGGCGCTTCTAAAGATAAACTCCCTCCTTCATCGCCGAAATATTG
CAACAATAATGACTACGCATGTAAGAGGAAGTTGGAAGCCTTGATAAGAGCCTTTAACTT
GTATAAGGCAAAACAAATATCGTTGAGACAGGTGAAAATGGCCTATGACTCCTGGCTGAA
GGCAAAATCCCATCCATCGCCTTGAAGGTCTTCCAAAGGCAAAAACATATGACTCCACAA
ATTTCTTTTTTTTGACAAATTCCACAAATTTCTTGATGAAAAAATATTTTCACAAGTTGT
CACCATAAATGTAATTCTGAAAATTTCTTGCAAAATAAAAGATATTATGCCACTCGGGAT
GATGGTATGATGATATGGTGTTACAAGTT
AA

QA 3 631 3 631
DS 

RD RR2GT22TF 690 0 0
GGACTCATCAGTAAATTAAGAAAGAGAGAATTTTAAGATGGCATCTTCTAAAGTATCTTG
CATGCTTGTCTCTCTCCTTCTTCTGGTTCTTGTGCTTTCCGATATGGATAAAGCCCTGGG
TGAACCAATTCAGCTCCTCAACCGCAAACTTAAAGTGACTGAACATCATGATCAATTGAC
GACAGACCGACGTCTCGCTGTTGTTTCTAAGAGTTTGCGGAATACGTTGCCGAAATGGTT
CAGAAAGGTCCAGGAATTGGCGGGCGCTGCTAAAGATAAACTCCCTCCTTCATCGCCGAA
ATATTGCAACAATAATGACTACGCATGTAAGAGGAAGTTGGATGCCTTGATAAGAGCCTT
TAACTTGTATAAGGCAAAACAAATATCGTTGAGACAGGTGAAAATGGCCTATGACTCCTG
GCTGAAGGCAAAATCCCATCCATCGCCTTGAAGGTCTTCCAAAGGCAAAAACATATGACT
CCACAAATTTCTTTTTTTTGACAAATTCCACAAATTTCTTGATGAAAAAATATTTTCACA
AGTTGTCACCATAAATGTAACTCTGAAAATTTCTTGCAAAATAAAAGATATTATGCCACT
CGGGATGATGGTATGATGATATGGTGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTCGAACTGTTTTAT
TTTAATTTCCTTATAAATTATATATGTCCT

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 7

CO CL1123Contig1 670 7 4 U
GGATCAATACAAGTTTATACTTTTAAGTGCTCTCTCTACGTAACAGTCTAAAGATGGAAG
GCAAAACTGTGATTTTAAGTTTTCTCATAGTGAGTCTTGTCATAGCGCAAAATCAAGTCG
AAGCTAGTAATGGGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGCTGCCATACGCGAGTATCGTATATGCA
GATTAATGAAACACTCACTGTCTTGTATAACAGACAGTGGATGCATATACGTTATTGGAG
TGCCGACATGTCCTCCGAAATATCCATATGTCGCTATCAAAAATTCTGGTGATAGTGTCA
ATGAATACTGCAAGTTGGGTTGTGAATCCTCTGTGTGCGGTGCCTTAACCACTCTTCAGA
ACTCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGAACAATGCGCCAACGCGTGTGCTA
ATTTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAAGGCAGTTGAAACTGCCTAAGAAGCATATCCAAGAT
CGATCTATGTATTATATGTCTTGTTGTTGTTCTCCCTGTTTTCAATAATTGGCGTGTATG
TGAAAAAAA*TGCTAGACTCTTGTGCTATTTCCTGGTTTTCTATGTTATGTAGAAGGTCA
TCGATCTCTAGATTGTTATCCCTTCTACTTGCTATGTATCTAAATAAAGAATAATGTTTC
CTTCTCGACG


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 15 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA41TF U 8
AF RR2GW04TF U 1
AF RR2FU49TF U 4
AF RR2C410TF U 1
AF RR2E268TF U 1
AF RR2E268JQ C 42
AF RR2GA41JQ C 98
BS 1 482 RR2C410TF
BS 483 483 RR2GA41TF
BS 484 662 RR2C410TF
BS 663 670 RR2GA41JQ

RD RR2GA41TF 632 0 0
G
ACAAGTTTATACTTTTAAGTGCTCTCTCTACGTAACAGTCTAAAGATGGAAGGCAAAACT
GTGATTTTAAGTTTTCTCATAGTGAGTCTTGTCATAGCGCAAAATCAAGTCGAAGCTAGT
AATGGGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGCTGCCATACGCGAGTATCGTATATGCAGATTAATG
AAACACTCACTGTCTTGTATAACAGACAGTGGATGCATATACGTTATTGGAGTGCCGACA
TGTCCTCCGAAATATCCATACGTCGCTATCAAAAATTCTGGTGATGGTGTCAATGAATAC
TGCAAGTTGGGTTGTGAATCCTCTGTGTGCGGTGCCTTAACCACTCTTCAGAACTCCGAT
GCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGAACAATGCGCCAACGCGTGTGCTAATTTCTGC
ACCAAGGGCTCAGCTAAGGCAGTTGAAACTGCCTAAGAAGCATATCCAAGATCGATCTAT
GTATTATATGTCTTGTTGTTGTTCTCCCTGTCTTCAATAATTGGCGTGTATGTGAAAAAA
**TGCTAGACTCTTGTGCTATTTCCTGGTTTTCTATGTTATGTAGAAAGTCATCGATCTC
TAGATTGTTATCCCTTCTACTTGCTATGTAT

QA 2 632 2 632
DS 

RD RR2GW04TF 659 0 0
GGATC
AATACAAGTTTATACTTTTAAGTGCTCTCTCTACGCAACAGTCTAAAGATGGAAGGCAAA
ACTGTGATTTTAAGTTTTCTCATAGTGAGTCTTGTCATAGCGCAAAATCAAGTCGAAGCT
AGTAATGGGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGCTGCCATACGCGAGTATCGTATATGCAGATTA
ATGAAACACTCACTGTCTTGTATAACAGACAGTGGATGCATATACGTTATTGGAGTGCCG
ACATGTCCTCCGAAATATCCATATGTCGGTATCAAAAATTCTGGTGATAGTGTCAATGAA
TACTGCAAGTTGGGTTGTGAATCCTCTGTGTGCGGTGCCTTAACCACTCTTCAGAACTCC
GATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCAGTTGAACAATGCGCCAACGCGTGTGCTAATTTA
TGCACCAAGGGTTCAGCTAAGGCAGTTGAAACTGCCTAAGAAGCATATCCAAGATAGATC
TATGTATTATATGTCTTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTCCAATAATTGGCGTGTATGTGAAA
AAAAATGCTAGACTCTTGTGCTATTTCCTGGTTTTCTATGTTATGTAGAAGGTCATCGAT
CTCTAGATTGTTATCCCTTCTACTTGCTATGTATCTAAATAAAGAATAATGTTT

QA 6 659 6 659
DS 

RD RR2FU49TF 629 0 0
GG
AATACAAGTTTATACTTTTAAGTGCTCTCTCTACGTAACAGTCTAAAGATGGAAGGCAAA
ACTGTGATTTTAAGTTTTCTCATAGTGAGTCTTGTCATAGCGCAAAATCAAGTCGAAGCT
AGTAATGGGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGCTGCCATACGCGAGTATCGTATATGCAGATTA
ATGAAACACTCACTGTCTTGTATAACAGACAGTGGATGCATATACGTTATTGGAGTGCCG
ACATGTCTTCCGAAATATCCATATGTCGCTATCAAAAATTCTGGTGATAGTGTCAATGAA
TACTGCAAGTTGGGTTGTGAATCCTCTGTGTGCGGTGCCTTAACCACTCTTCAGAACTCC
GATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGAACAATGCGCCAACGCGTGTGCTAATTTC
TGCACCAAGGGCTCAGCTGAGGCAGTTGAAACTGCCTAAGAAGCATATCCAAGATCGATC
TATGTATTATATGTCTTGTTGTTGTTCTCCCTGTTTTCAATAATTGGCGTGTATGTGAAA
AAAA*TGCTAGACTCTTGTGCTATTTCCTGGTTTTCTATGTTATGTAGAAGGTCATCGAT
CTCTAGATTGTTATCCCTTCTACTTGC

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR2C410TF 662 0 0
GGATCAATACAAGTTTATACTTTTAAGTGCTCTCTCTACGTAACAGTCTAAAGATGGAAG
GCAAAACTGTGATTTTAAGTTTTCTCATAGTGAGTCTTGTCATAGCGCAAAATCAAGTCG
AAGCTAGTAATGGGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGCTGCCATACGCGAGTATCGTATATGCA
GATTAATGAAACACTCACTGTCTTGTATAACAGACAGTGGATGCATATACGTTATTGGAG
TGCCGACATGTCCTCCGAAATATCCATATGTCGCTATCAAAAATTCTGGTGATAGTGTCA
ATGAATACTGCAAGTTGGGTTGTGAATCCTCTGTGTGCGGTGCCTTAACCACTCTTCAGA
ACTCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGAACAATGCGCCAACGCGTGTGCTA
ATTTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAAGGCAGTTGAAACTGCCTAAGAAGCATATCCAAGAT
CGCTCTATGTATTATATGTCTTGTTGTTGTTCTCCCTGTTTTCAATAATTGGCGTGTATG
TGAAAAAAA*TGCTAGACTCTTGTGCTATTTCCTGGTTTTCTATGTTATGTAGAAGGTCA
TCGATCTCTAGATTGTTATCCCTTCTACTTGCTATGTATCTAAATAAAGAATAATGTTTC
CT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2E268TF 663 0 0
GGATC
AATACAAGTTTATACTTTTAAGTGCTCTCTCTACGTAACAGTCTAAAGATGGCAGGCAAA
ACTGTGATTTTAAGTTTTCTCATAGTGAGTCTTGTCATAGCGCAAAATCAAGTCGAAGCT
AGTAATGGGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGCTGCCATACGCGAGTATCGTATATGCAGATTA
ATGAAACACTCACTGTCTTGTATAACAGACAGTGGATGCATATACGTTATTGGAGTGCCG
ACATGTCTTCCGAAATATCCATATGTCGCTATCAAAAATTCTGGTGATAGTGTCAATGAA
TACTGCAAGTTGGGTTGTGAATCCTCTGTGTGCGGTGCCTTAACCACTCTTCAGAACTCC
GATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGAACAATGCGCCAACGCGTGTGCTAATTTC
TGCACCAAGGGCTCAGCTAAGGCAGTTGAAACTGCCTAAGAAGCATATCCAAGATCGATC
TATGTATTATATGTCTTGTTGTTGTTCTCCCTGTTTTCAATAATTGGCGTGTATGTGAAA
AAAA*TGCTAGACTCTTGTGCTATTTCCTGGTTTTCTATGTTATGTAGAAGGTCATCGAT
CTCTAGATTGTTATCCCTTCTACTTGCTATGTATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCT
C

QA 6 662 6 662
DS 

RD RR2E268JQ 622 0 0
AACAGTCTAAAGATGGCAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTTTTCTCATAGTGAGTCTTGTC
ATAGCGCAAAATCAAGTCGAAGCTAGTAATGGGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGCTGCCATA
CGCGAGTATCGTATATGCAGATTAATGAAACACTCACTGTCTTGTATAACAGACAGTGGA
TGCATATACGTTATTGGAGTGCCGACATGTCTTCCGAAATATCCATATGTCGCTATCAAA
AATTCTGGTGATAGTGTCAATGAATACTGCAAGTTGGGTTGTGAATCCTCTGTGTGCGGT
GCCTTAACCACTCTTCAGAACTCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGAACAA
TGCGCCAACGCGTGTGCTAATTTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAAGGCAGTTGAAACTGCC
TAAGAAGCATATCCAAGATCGATCTATGTATTATATGTCTTGTTGTTGTTCTCCCTGTTT
TCAATAATTGGCGTGTATGTGAAAAAAA*TGCTAGACTCTTGTGCTATTTCCTGGTTTTC
TATGTTATGTAGAAGGTCATCGATCTCTAGATTGTTATCCCTTCTACTTGCTATGTATCT
AAATAAAGAATAATGTTTCCT
C

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2GA41JQ 573 0 0
TGTCATAGCGCAAAATCAAGTCGAAGCTAGTAATGGGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGCTGC
CATACGCGAGTATCGTATATGCAGATTAATGAAACACTCACTGTCTTGTATAACAGACAG
TGGATGCATATACGTTATTGGAGTGCCGACATGTCCTCCGAAATATCCATACGTCGCTAT
CAAAAATTCTGGTGATGGTGTCAATGAATACTGCAAGTTGGGTTGTGAATCCTCTGTGTG
CGGTGCCTTAACCACTCTTCAGAACTCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGA
ACAATGCGCCAACGCGTGTGCTAATTTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAAGGCAGTTGAAAC
TGCCTAAGAAGCATATCCAAGATCGATCTATGTATTATATGTCTTGTTGTTGTTCTCCCT
GTCTTCAATAATTGGCGTGTATGTGAAAAAA**TGCTAGACTCTTGTGCTATTTCCTGGT
TTTCTATGTTATGTAGAAGGTCATCGATCTCTAGATTGTTATCCCTTCTACTTGCTATGT
ATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCTTCTCGACG

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 7

CO CL1124Contig1 1034 7 22 U
GAGATCTGTTGCTGATAAGGTTGGAGCTCTTTTGCTCTGTGACATGGCTCACATCAGTGG
TCTCGTTGCTGCTCAGGAAGCTGCAAACCCCTTTGAGTACTGTGACGTTGTGACAACAAC
AACCCACAAGAGTTTGAGGGGTCCAAGGGCTGGTATGATCTTCTACAGGAAGGGTCCGAA
ACCACAAAGAAGGGGCAAGCCGAGGGTGCAGCCTATGACTTTGAGGACAAAATCAACTTT
GCCGTGTTCCCTGCGCTTCAAGGTGGTCCTCACAACCACCAGATCGGTGCTTTAGCTGTT
GCGTTGAAGCAGGCTAATACTCCTGGTTTCAAGGTCTATGCGAAACAGGTGAAAGCTAAT
GCTGTTGCCCTTGCAAACTACCTGATGGGCAAGGGATACAGTATTGTAACCGGTGGAACT
GAGAACCATCTTGTTCTTTGGGATCTTCGCCCTCTTGGATTGACCGGTAACAAGGTTGAG
AAGCTTTGCGATCTGTGCGACATTACTTTGAACAAGAATGCTGTCTTTGGAGACAGCAGT
GCTCTTGCTCCTGGAGGTGTAAGAATCGGTACTCCTGCGATGACATCAAGGGGATTGG*T
GGAGAAGGACTTTGAGATGATAGGAGAGTTCTTGAGCCGATCAGTGACGCTGACATTGAA
CATCCAGAAGGAGCATGGTAAGCTGTTGAAGGACTTCAACAAGGGTTTGGTGAACAACAA
GGAGATCGAGGAGCTCAAGGCTGATGTTGAGAAGTTCGCTGCCTCCTATGAGATGCCTGG
ATTTCTCATGTCTGAGATGAAGTACCAGCACTAGAGATTTCCTCTCTCTATCAAAGAGTA
ATCTTCTGTTATCTCTCTATATAATATGCTTTTGTAGGGCCGCCTGATTGGAATTCACAA
GGCGAAGAGATAAAGAAACAAACAGTAAAAAGAAAAAGGGTTTTCTTGAGTAATTTCTTC
TTGAATGTTTTTATTTTCTCTTATTGAAATTGTTGTATTTTGTTGGCTTTTAATAATAAT
ATCAAGCGAGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 30 5 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 

AF RR2E191TF U 1
AF RR2AK04TF U 222
AF RR2E191JQ C 386
AF RR2C672TF U 415
AF RR2DA89JQ C 421
AF RR2DA89TF U 425
AF RR2AK04JQ C 497
BS 1 429 RR2E191TF
BS 430 430 RR2AK04TF
BS 431 598 RR2E191TF
BS 599 599 RR2AK04TF
BS 600 669 RR2E191TF
BS 670 670 RR2AK04TF
BS 671 691 RR2E191TF
BS 692 692 RR2AK04TF
BS 693 739 RR2E191TF
BS 740 740 RR2AK04TF
BS 741 752 RR2E191TF
BS 753 755 RR2AK04TF
BS 756 776 RR2E191TF
BS 777 777 RR2AK04TF
BS 778 800 RR2E191TF
BS 801 801 RR2AK04TF
BS 802 802 RR2C672TF
BS 803 805 RR2AK04TF
BS 806 819 RR2E191TF
BS 820 897 RR2AK04TF
BS 898 1031 RR2C672TF
BS 1032 1034 RR2DA89TF

RD RR2E191TF 822 0 0
GAGATCTGTTGCTGATAAGGTTGGAGCTCTTTTGCTCTGTGACATGGCTCACATCAGTGG
TCTCGTTGCTGCTCAGGAAGCTGCAAACCCCTTTGAGTACTGTGACGTTGTGACAACAAC
AACCCACAAGAGTTTGAGGGGTCCAAGGGCTGGTATGATCTTCTACAGGAAGGGTCCGAA
ACCACAAAGAAGGGGCAAGCCGAGGGTGCAGCCTATGACTTTGAGGACAAAATCAACTTT
GCCGTGTTCCCTGCGCTTCAAGGTGGTCCTCACAACCACCAGATCGGTGCTTTAGCTGTT
GCGTTGAAGCAGGCTAATACTCCTGGTTTCAAGGTCTATGCGAAACAGGTGAAAGCTAAT
GCTGTTGCCCTTGCAAACTACCTGATGGGCAAGGGATACAGTATTGTAACCGGTGGAACT
GAGAACCAT*TTGTTCTTTGGGATCTTCGCCCTCTTGGATTGACCGGTAACAAGGTTGAG
AAGCTTTGCGATCTGTGCGACATTACTTTGAACAAGAATGCTGTCTTTGGAGACAGCAGT
GCTCTTGCTCCTGGAGGTGTAAGAATCGGTACTCCTGCGATGACATCAAGGGGATTGGGT
GGAGAAGGACTTTGAGATGATAGGAGAGTTCTTGAGCCGATCAGTGACGCTGACATTGAA
CATCCAGAAAGAGCATGGTAAGCTGTTGAAG*ACTTCAACAAGGGTTTGGTGAACAACAA
GGAGATCGAGGAGCTCAAG*CTGATGTTGAGA**GTCGCTGCCTCCTATGAGATGC*TGG
ATTTCTCATGTCTGAGATGAGTA**CAGCACTAGAGATT
CTC

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2AK04TF 676 0 0
G
GAGGACAAAATCAACTTTGCCGTGTTCCCTGCGCTTCAAGGTGGTCCTCACAACCACCAG
ATCGGTGCTTTAGCTGTTGCGTTGAAGCAGGCTAATACTCCTGGTTTCAAGGTCTATGCG
AAACAGGTGAAAGCTAATGCTGTTGCCCTTGCAAACTACCTGATGGGCAAGGGATACAGT
ATTGTAACCGGTGGAACTGAGAACCATCTTGTTCTTTGGGATCTTCGCCCTCTTGGATTG
ACCGGTAACAAGGTTGAGAAGCTTTGCGATCTGTGCGACATTACTTTGAACAAGAATGCT
GTCTTTGGAGACAGCAGTGCTCTTGCTCCTGGAGGTGTAAGAATCGGTACTCCTACGATG
ACATCAAGGGGATTGG*TGGAGAAGGACTTTGAGATGATAGGAGAGTTCTTGAGCCGATC
AGTGACGCTGACATTGAACATCCAGAAGGAGCATGGTAAGCTGTTGAAGGACTTCAACAA
GGGTTTGGTGAACAACAAGGAGATCGAGGAGCTCAAGGCTGATGTTGAGAAGTTCGCTGC
CTCCTATGAGATGCCTGGATTTCTCATGTCTGAGATGAATTACCAGCACTAGAGATTTCC
TCTCTCTATCAAAGAGTAATCTTCTGTTATCTCTCTATATAATATGCTTTTGTAGGGCCG
CCTGATTGGAATTCA

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR2E191JQ 649 0 0
TGGGCAAGGGATACAGTATTGTAACCGGTGGAACTGAGAACCAT*TTGTTCTTTGGGATC
TTCGCCCTCTTGGATTGACCGGTAACAAGGTTGAGAAGCTTTGCGATCTGTGCGACATTA
CTTTGAACAAGAATGCTGTCTTTGGAGACAGCAGTGCTCTTGCTCCTGGAGGTGTAAGAA
TCGGTACTCCTGCGATGACATCAAGGGGATTGG*TGGAGAAGGACTTTGAGATGATAGGA
GAGTTCTTGAGCCGATCAGTGACGCTGACATTGAACATCCAGAAGGAGCATGGTAAGCTG
TTGAAGGACTTCAACAAGGGTTTGGTGAACAACAAGGAGATCGAGGAGCTCAAGGCTGAT
GTTGAGAAGTTCGCTGCCTCCTATGAGATGCCTGGATTTCTCATGTCTGAGATGAAGTAC
CAGCACTAGAGATTTCCTCTCTCTATCAAAGAGTAATCTTCTGTTATCTCTCTATATAAT
ATGCTTTTGTAGGGCCGCCTGATTGGAATTCACAAGGCGAAGAGATAAAGAAACAAACAG
TAAAAAGAAAAAGGGTTTTCTTGAGTAATTTCTTCTTGAATGTTTTTATTTTCTCTTATT
GAAATTGTTGTATTTTGTTGGCTTTTAATAATAATATCAAGCGAGTTTT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2C672TF 617 0 0
GGAACTGAGAACCATCTTGTTCTTTGGGATCTTCGCCCTCTTGGATTGACCGGTAACAAG
GTTGAGAAGCTTTGCGATCTGTGCGACATTACTTTGAACAAGAATGCTGTCTTTGGAGAC
AGCAGTGCTCTTGCTCCTGGAGGTGTAAGAATCGGTACTCCTGCGATGACATCAAGGGGA
TTGG*TGGAGAAGGACTTTGAGATGATAGGAGAGTTCTTGAGCCGATCAGTGACGCTGAC
ATTGAACATCCAGAAGGAGCATGGTAAGCTGTTGAAGGACTTCAACAAGGGTTTGGTGAA
CAACAAGGAGATCGAGGAGCTCAAGGCTGATGTTGAGAAGTTCGCTGCCTCCTATGAGAT
GCCTGGATTTCTCATGTCTGAGATGAAGTACCAGCACTAGAGATTTCCTCTCTCTATCAA
AGAGTAATCTTCTGTTATCTCTCTATATAATATGCTTTTGTAGGGCCGCCTGATTGGAAT
TCACAAGGCGAAGAGATAAAGAAACAAACAGTAAAAAGAAAAAGGGTTTTCTTGAGTAAT
TTCTTCTTGAATGTTTTTATTTTCTCTTATTGAAATTGTTGTATTTTGTTGGCTTTTAAT
AATAATATCAAGCGAGT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2DA89JQ 614 0 0
GAGA
ACCATCCTGTTCTTTGGGATCTTCGCCCTCTTGGATTGACCGGTAACAAGGTTGAGAAGC
TTTGCGATCTGTGTGACATTACTTTGAACAAGAATGCTGTCTTTGGAGACAGCAGTGCTC
TTGCTCCTGGAGGTGTAAGAATCGGTACTCCTGCGATGACATCAAGGGGATTGG*TTGAG
AAGGACTTTGAGATGATAGGAGAGTTCTTGAGCCGATCAGTGACGCTGACATTGAACATC
CAGAAGGAGCATGGTAAGCTGTTGAAGGACTTCAACAAGGGTTTGGTGAACAACAAGGAG
ATCGAGGAGCTCAAGGCTGATGTTGAGAAGTTCGCTGCCTCCTATGAGATGCCTGGATTT
TTCATGTTTGAGATGAAGTACCAGCACTAGAGATTTCCTCTCTCTATCAAAGAGTAATCT
TCTGTTATCTCTCTATATAATATGCTTTTGTAGGGCCGCCTGATTGGAATTCACAAGGGG
AAGAGATAAAGAAACAAACAGTAAAAAGAAAAAGGGTTTTCTTGAGTAATTTTTTCTTGA
ATGTTTTTATTTTTTCTTATTGAAATTGTTGTATTTTGTTGGCTTTTAATAATAATATCA
AGCGAGTTTT

QA 5 614 5 614
DS 

RD RR2DA89TF 610 0 0
ACCATCCTGTTCTTTGGGATCTTCGCCCTCTTGGATTGACCGGTAACAAGGTTGAGAAGC
TTTGCGATCTGTGTGACATTACTTTGAACAAGAATGCTGTCTTTGGAGACAGCAGTGCTC
TTGCTCCTGGAGGTGTAAGAATCGGTACTCCTGCGATGACATCAAGGGGATTGG*TTGAG
AAGGACTTTGAGATGATAGGAGAGTTCTTGAGCCGATCAGTGACGCTGACATTGAACATC
CAGAAGGAGCATGGTAAGCTGTTGAAGGACTTCAACAAGGGTTTGGTGAACAACAAGGAG
ATCGAGGAGCTCAAGGCTGATGTTGAGAAGTTCGCTGCCTCCTATGAGATGCCTGGATTT
CTCATGTCTGAGATGAAGTACCAGCACTAGAGATTTCCTCTCTCTATCAAAGAGTAATCT
TCTGTTATCTCTCTATATAATATGCTTTTGTAGGGCCGCCTGATTGGAATTCACAAGGCG
AAGAGATAAAGAAACAAACAGTAAAAAGAAAAAGGGTTTTCTTGAGTAATTTCTTCTTGA
ATGTTTTTATTTTCTCTTATTGAAATTGTTGTATTTTGTTGGCTTTTAATAATAATATCA
AGCGAGTTTT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2AK04JQ 538 0 0
GCGACATTACTTTGAACAAGAATGCTGTCTTTGGAGACAGCAGTGCTCTTGCTCCTGGAG
GTGTAAGAATCGGTACTCCTACGATGACATCAAGGGGATTGG*TGGAGAAGGACTTTGAG
ATGATAGGAGAGTTCTTGAGCCGATCAGTGACGCTGACATTGAACATCCAGAAGGAGCAT
GGTAAGCTGTTGAAGGACTTCAACAAGGGTTTGGTGAACAACAAGGAGATCGAGGAGCTC
AAGGCTGATGTTGAGAAGTTCGCTGCCTCCTATGAGATGCCTGGATTTTTCATGTTTGAG
ATGAATTACCAGCACTAGAGATTTCCTCTCTCTATCAAAGAGTAATCTTCTGTTATCTCT
CTATATAATATGCTTTTGTAGGGCCGCCTGATTGGAATTCACAAGGGGAAGAGATAAAGA
AACAAACAGTAAAAAGAAAAAGGGTTTTCTTGAGTAATTTTTTCTTGAATGTTTTTATTT
TTTTTTATTGAAATTGTTGTATTTTGTTGGCTTTTAATAATAATATCAAGCGAGTTTT

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 7

CO CL1125Contig1 1550 7 25 U
GGACCAGCCTTGGACGATCTGCATCTCTCCCCCGAAAACCTCTCTCGTTTTGTAGATCGC
CGACGAGGTTAACATACCTTTCTGATCTAATCAGTATTTCTAACGGAAAGAAAAACAATG
GCGTTTGAGAAGATCAAGGTTGCTAATCCCATCGTCGAGATGGATGGTGATGAAATGACC
CGAGTTATCTGGAAGTCCATCAAGGACAAGCTTATTACTCCTTTTGTGGAGTTGGATATC
AAGTACTTCGACCTTGGACTTCCTCACCGTGATGCTACCGATGACAAAGTTACTATTGAA
AGTGCTGAAGCCACTAAGAAGTATAATGTGGCGATCAAGTGTGCCACCATCACTCCAGAT
GAAGGCCGTGTTACGGAATTTGGCTTGAAGCAGATGTGGAGAAGTCCAAATGGTACCATC
AGGAATATTCTGAACGGAACTGTATTTAGAGAACCAATTCTCTGCAAAAATGTTCCCAAG
CTTGTCCCAGGGTGGACAAAGCCCATCTGCATTGGAAGGCATGCTTTTGGTGATCAGTAC
CGTGCCACTGATGCTGTTATCAAGGGACCAGGAAGACTGACTATGACTTTCGAGGGAAAA
GATGGAAAAACTGAAACTGAAGTGTTCACATTTACCGGTGAAGGCGGTGTTGCTATGGCC
ATGTACAACACTGATGAGTCCATCCGTGCTTTTGCTGATGCATCGATGAACACTGCTTAT
GAGAAAAAGTGGCCACTTTATCTTAGCACAAAGAACACCATTCTTAAGAAATACGATGGC
AGATTCAAAGACATCTTCCAGGAAGTGTATGAAGCCAGCTGGAAGTCAAAGTATGAAGCT
GCTGGAATATGGTATGAGCACCGTCTCATTGATGATATGGTGGCTTACGCTCTTAAGAGC
GAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGCAAAAACTATGATGGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTG
GCACAAGGATTCGGGTCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCTGCCCGGATGGGAAG
ACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGTACCGTTACCCGTCACTACAGGGTTCACCAGAAA
GGTGG*AGAGACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCATCTTTGCTTGGACTCGTGGACTTGC
ACACAGAGCTAAGCTGGATGACAACTCAAAACTCTTGGAGTTTACTGAGAAGCTCGAAGC
TGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGGAAAAATGACCAAAGATCTTGCGCCCATCATTCA
CGGCTCAAAGCTCTCGAGGGATACTTACCTCAACACGGAGGAGTTCATCGATGCAGTTGC
GGAAGAGCTCAAAACAAGACTCGGCGCTTAAGAACACATTCGACGACTTAGTCATAAGTG
TCTAATCTGGTGGGTTTGTGAGAGTTGAAGGAATAAATGAGAGAACGTTTGCGTATTGAG
AACGATTTGTTTCATCTGCTATTATATTTTCAAAACATTGTTACATGTTTTCCTTCCTTA
TGCAGATTTCAAATAATTTTTCACTGATTAGTGATTATCCTCACTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY76TF U 1
AF RR2B062TF U 335
AF RR2GI72TF U 670
AF RR2GI72JQB C 998
AF RR2FM45TF U 735
AF RR2EY76JQ C 807
AF RR2FM45JQ C 768
BS 1 407 RR2EY76TF
BS 408 408 RR2B062TF
BS 409 443 RR2EY76TF
BS 444 444 RR2B062TF
BS 445 488 RR2EY76TF
BS 489 489 RR2B062TF
BS 490 605 RR2EY76TF
BS 606 606 RR2B062TF
BS 607 654 RR2EY76TF
BS 655 655 RR2B062TF
BS 656 709 RR2EY76TF
BS 710 710 RR2B062TF
BS 711 727 RR2EY76TF
BS 728 728 RR2B062TF
BS 729 745 RR2EY76TF
BS 746 746 RR2GI72TF
BS 747 971 RR2B062TF
BS 972 972 RR2GI72TF
BS 973 1085 RR2B062TF
BS 1086 1086 RR2GI72TF
BS 1087 1167 RR2B062TF
BS 1168 1410 RR2FM45TF
BS 1411 1411 RR2FM45JQ
BS 1412 1462 RR2FM45TF
BS 1463 1550 RR2FM45JQ

RD RR2EY76TF 748 0 0
GGACCAGCCTTGGACGATCTGCATCTCTCCCCCGAAAACCTCTCTCGTTTTGTAGATCGC
CGACGAGGTTAACATACCTTTCTGATCTAATCAGTATTTCTAACGGAAAGAAAAACAATG
GCGTTTGAGAAGATCAAGGTTGCTAATCCCATCGTCGAGATGGATGGTGATGAAATGACC
CGAGTTATCTGGAAGTCCATCAAGGACAAGCTTATTACTCCTTTTGTGGAGTTGGATATC
AAGTACTTCGACCTTGGACTTCCTCACCGTGATGCTACCGATGACAAAGTTACTATTGAA
AGTGCTGAAGCCACTAAGAAGTATAATGTGGCGATCAAGTGTGCCACCATCACTCCAGAT
GAAGGCCGTGTTACGGAATTTGGCTTGAAGCAGATGTGGAGAAGTCCCAATGGTACCATC
AGGAATATTCTGAACGGAACTGTGTTTAGAGAACCAATTCTCTGCAAAAATGTTCCCAAG
CTTGTCCCTGGGTGGACAAAGCCCATCTGCATTGGAAGGCATGCTTTTGGTGATCAGTAC
CGTGCCACTGATGCTGTTATCAAGGGACCAGGAAGACTGACTATGACTTTCGAGGGAAAA
GATGGGAAAACTGAAACTGAAGTGTTCACATTTACCGGTGAAGGCGGTGTTGCTGTGGCC
ATGTACAACACTGATGAGTCCATCCGTGCTTTTGCTGATGCATCGATGA*CACTGCTTAT
GAGAAAA*GTGGCCACTTTATCTTA
GCA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2B062TF 833 0 0
GG
AAGTGTGCCACCATCACTCCAGATGAAGGCCGTGTTACGGAATTTGGCTTGAAGCAGATG
TGGAGAAGTCCAAATGGTACCATCAGGAATATTCTGAATGGAACTGTATTTAGAGAACCA
ATTCTCTGCAAAAATGTTCCTAAGCTTGTCCCAGGGTGGACAAAGCCCATCTGCATTGGA
AGGCATGCTTTTGGTGATCAGTACCGTGCCACTGATGCTGTTATCAAGGGACCTGGAAGA
CTGACTATGACTTTCGAGGGAAAAGATGGAAAAACTGAAACTGAAGTGTTCACATTTACC
GGTGAAGGTGGTGTTGCTATGGCCATGTACAACACTGATGAGTCCATCCGTGCTTTTGCG
GACGCATCGATGAACACTGCTTATGAGAAAAAGTGGCCACTTTATCTTACCACAAAGAAC
ACCATTCTTAAGAAATACGATGGCAGATTCAAAGACATCTTCCAGGAAGTGTATGAAGCC
AGCTGGAAGTCAAAGTATGAAGCTGCTGGAATATGGTATGAGCACCGTCTCATTGATGAT
ATGGTGGCTTACGCTCTTAAGAGCGAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGCAAAAACTATGAT
GGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTGGCACAAGGATTTGGGTCACTTGGATTGATGACATCT
GTTCTGGTCTGCCCGGATGGGAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGTACCGTTACC
CGTCACTACAGGGTTCACCAGAAAGGTGGGAGAGACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCAT
CTTTGCTTGGACTCGTGGACTTGCACACAGAGCTAAGCTGGATGACAACTC

QA 3 833 3 833
DS 

RD RR2GI72TF 491 0 0
G
CTGATGAGTCCATCCGTGCTTTTGCTGATGCATCGATGAACACTGCTTATGAGAAAAAGT
GGCCACTTTATCTTAGCACAAAGAACACCATTCTTAAGAAATACGATGGCAGATTCAAAA
ACATCTTCCAGGAAGTGTATGAAGCCAGCTGGAAGTCAAAGTATGAAGCTGCTGGAATAT
GGTATGAGCATCGTCTCATTGATGATATGGTGGCTTACGCTCTTAAGAGCGAGGGAGGCT
ATGTGTGGGCATGCAAAAACTATGATGGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTGGCACAAGGAT
TCGGGTCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCTGCCCGGATGGGAAGACAATTGAAG
CTGAAGCAGCCCATGGTACCGTTACCCGTCACTACAGGGTTCACCAGAAAGGTGG*AGAG
ACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCATCTTTGCTTGGACTCGTGGACTTGCACACAGAGCT
AAGCTGGATG

QA 2 491 2 491
DS 

RD RR2GI72JQB 362 0 0
TTT
TGGTCTGCCCGGATGGGAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGTACCGTTACCCGTC
ACTACAGGGTTCCCCAGAAAGGTGG*AGAGACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCATTTTT
GCTTGGACTCGTGGACTTGCCCACAGAGTTAAGCTGGATGACAACTCAAAACTTTTGGAG
TTTACTGAGAAGCTCGAAGCTGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGGAAAAATGACCAAA
GATTTTGCGCTCATCATTCACGGCTCAAAGCTCTCGAGGGATACTTACCTCAACACGGAG
GAGTTCATCGATGCAGTTGGGGAAGAGCTCAAAACAAGACTCGGCGCTTAAGAACACAT

QA 4 362 4 362
DS 

RD RR2FM45TF 729 0 0
G
CTTTATCTTAGCACAAAGAACACCATTCTTAAGAAATACGATGGCAGATTCAAAGACATC
TTCCAGGAAGTGTATGAAGCCAGCTGGAAGTCAAAGTATGAAGCTGCTGGAATATGGTAT
GAGCACCGTCTCATTGATGATATGGTGGCTTACGCTCTTAAGAGCGAGGGAGGCTATGTG
TGGGCATGCAAAAACTATGATGGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTGGCACAAGGATTCGGG
TCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCTGCCCGGATGGGAAGACAATTGAAGCTGAA
GCAGCCCATGGTACCGTTACCCGTCACTACAGGGTTCACCAGAAAGGTGG*AGAGACCAG
CACAAACAGCATAGCCTCCATCTTTGCTTGGACTCGTGGACTTGCACACAGAGCTAAGCT
GGATGACAACTCAAAACTCTTGGAGTTTACTGAGAAGCTCGAAGCTGCTTGTGTTGGTAC
AGTGGAGTCTGGAAAAATGACCAAAGATCTTGCGCCCATCATTCACGGCTCAAAGCTCTC
GAGGGATACTTACCTCAACACGGAGGAGTTCATCGATGCAGTTGCGGAAGAGCTCAAAAC
AAGACTCGGCGCTTAAGAACACATTCGACGACTTAGTCATAAGTGTCTAATCTGGTGGGT
TTGTGAGAGTTGAAG*AATAAATGAGAGAACGTTTGCGTATTGAGAACGATTTGTTTCAT
CTGCTAT
A

QA 2 728 2 728
DS 

RD RR2EY76JQ 683 0 0
GTATGAAGCCAGCTGGAAGTCAAAGTATGAAGCTGCCGGAATATGGTATGAGCACCGTCT
CATTGATGATATGGTGGCTTACGCTCTTAAGAGCGAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGCAA
AAACTATGATGGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTGACACAAGGATTCGGGTCACTTGGATT
GATGACATCTGTTCTGGTCTGCCCGGATGGGAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGG
TACCGTTACCCGTCACTACAGGGTTCACCAGAAAGGTGG*AGAGACCAGCACAAACAGCA
TAGCCTCCATCTTTGCTTGGACTCGTGGACTTGCACACAGAGCTAAGCTGGATGACAACT
CAAAACTCTTGGAGTTTACTGAGAAGCTCAAAGCTGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCTG
GAAAAATGACCAAAGATCTTGCGCTCATCATTCGCGGCTCAAAGCTCTCGAGGGATACTT
ACCTCAACACGGAGGAGTTCATCGATGCAGTTGCGGAAGAGCTCAAAACAAGACTCGGCG
CTTAAGAACACATTCGACGACTTAGTCATAAGTGTCTAATCTGGTGGGTTTGTGAGAGTT
GAAGGAATAAATGAGAGAACGTTTGCGTATTGAGAATGATTTGTTTCATCTGCTATTATA
TTTTCAAAACATTGTTACATGTT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2FM45JQ 783 0 0
GAAATACGATGGCAGATTCAAAGACATCTTCCAGGAAGTGTATGAAGCCAGCTGGAAGTC
AAAGTATGAAGCTGCTGGAATATGGTATGAGCA*CGTCTCATTGATGATATGGTGGCTTA
CGCTCTTAAGAGCGAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGCAAAAACTATGATGGTGATGTCCA
GAGCGATTTCCTGGCACAAGGATTCGGGTCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCTG
CCCGGATGGGAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGTACCGTTACCCGTCACTACAG
GGTTCACCAGAAAGGTGG*AGAGACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCATCTTTGCTTGGA
CTCGTGGACTTGCACACAGAGCTAAGCTGGATGACAACTCAAAACTCTTGGAGTTTACTG
AGAAGCTCGAAGCTGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGGAAAAATGACCAAAGATCTTG
CGCCCATCATTCACGGCTCAAAGCTCTCGAGGGATACTTACCTCAACACGGAGGAGTTCA
TCGATGCAGTTGCGGAAGAGCTCAAAACAAGACTCGGCGCTTAAGAACACATTCGACGAC
TTAGTCATAAGTGTCTAATCTGGTGGGTTTGTGAGAGTTGAAGGAATAAATGAGAGAACG
TTTGCGTATTGAGAACGATTTGTTTCATCTGCTATTATATTTTCAAAACATTGTTACATG
TTTTCCTTCCTTATGCAGATTTCAAATAATTTTTCACTGATTAGTGATTATCCTCACTTT
TTT

QA 1 783 1 783
DS 



AS 2 7

CO CL1126Contig1 555 5 4 U
GAAAGGGCTCTCTTCCTGTAAACCCGGCGATCAGCGACACTTGACGGCGTTGAGAAGATG
GTAGCGGCGAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAACAGCAGATTAGCTCTTGTG
ATGAAGAGTGGAAAGTACACGCTTGGCTACAAATCAGTTCTCAAGTCCCTTCGCAGCTCC
AAAGGTAAGTTGATTCTTATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAGATCAGAAATCGAG
TACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGCGTTCATCACTACAACGGGAACAATGTCGATTTG
GGAACTGCTTGCGGGAAGTATTTCCGGGTTTCTTGCCTCAGCATCGTTGACCCAGGTGAC
TCCGACATCATCAAGTCGCTTCCCGGAGACCAGTGATTGTTGATTTGTTATGGGTTTACC
ATGTTTTGTCTGCTTTTTTTATGGAATGTGTTCTGGAAAGACATCATGTTTGGTTTCTGA
ACTCCTTATGCTTAATTACACTTTCGTCTCTTGGATACATTTTGCATGAATGAAAGACTT
ATTTTAGGTTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 10 10 10 10 

AF RR2FO43TF U 1
AF RR2FO43JQ C 1
AF RR2GK27TF U 2
AF RR2EQ53TF U 16
AF RR2EQ53JQ C 72
BS 1 8 RR2FO43JQ
BS 9 114 RR2FO43TF
BS 115 551 RR2GK27TF
BS 552 555 RR2EQ53TF

RD RR2FO43TF 114 0 0
GAAAGGGC
TCTCTTCCTGTAAACCCGGCGATCAGCGACACTTGACGGCGTTGAGAAGATGGTAGCGGC
GAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAACAGCAGATTAGCT

QA 9 114 9 114
DS 

RD RR2FO43JQ 518 0 0
GAAAGGGCTTTCTTCCTGTAAACCCGGCGATCAGCGACACTTGACGGCGTTGAGAAGATG
GTAGCGGCGAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAACAGCAGATTAGCTCTTGTG
GTGAAGAGTGGAAAGTACACGCTTGGCTACAAATCAGTTCTCAAGTCCCTTCGCAGCTCC
AAAGGTAAGTTGATTCTTATCTCGGGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAGATCAGAAATCGAG
TACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGCGTTCATCACTACAACGGGAACAATGTCGATTTG
GGAACTGCTTGCGGGAAGTATTTCCGGGTTTCTTGCCTCAGCATCGTTGACCCAGGTGAC
TCCGACATCATCAAGTCGCTTCCCGGAGACCAGTGATTGTTGATTTGTTATGGGTTTACC
ATGTTTTGTCTGCTTTTT**ATGGAATGTGTTCTGGAAAGACATCATGTTTGGTTTTTGA
ACTCCTTATGCTTAATTACACTTTCGTCTCTTGGATAC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2GK27TF 554 0 0
CGAGGGC
TCTCTTCCTGTAAACCCGGCGATCAGCGACACTTGACGGCGTTGAGAAGATGGTAGCGGC
GAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAACAGCAGATTAGCTCTTGTGATGAAGAG
TGGAAAGTACACGCTTGGCTACAAATCAGTTCTCAAGTCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAA
GTTGATTCTTATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAGATCAGAAATCGAGTACTACGC
TATGCTTGCTAAAGTCGGCGTTCATCACTACAACGGGAACAATGTCGATTTGGGAACTGC
TTGCGGGAAGTATTTCCGGGTTTCTTGCCTCAGCATCGTTGACCCAGGTGACTCCGACAT
CATCAAGTCGCTTCCCGGAGACCAGTGATTGTTGATTTGTTATGGGTTTACCATGTTTTG
TCTGCTTTTTTTATGGAATGTGTTCTGGAAAGACATCATGTTTGGTTTCTGAACTCCTTA
TGCTTAATTACACTTTCGTCTCTTGGATACATTTTGCATGAATGAAAGACTTATTTTAGG
TTA
TTAT

QA 8 550 8 550
DS 

RD RR2EQ53TF 540 0 0
GG
GTAAACCCGGCGATCAGCGACACTTGACGGCGTTGCGAAGATGGTGGCGGCGAAGAAGAC
GAAGAAGTCCCATTAAGGAATCAACAGCAGATTAGCTCTTGTGATGAAGAGTGGAAAGTA
CACGCTTGGCTACAAATCAGTTCTCAAGTCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCT
TATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAGATCAGAAATCGAGTACTACGCTATGCTTGC
TAAAGTCGGCGTTCATCACTACAACGGGAACAATGTCGATTTGGGAACTGCTTGCGGGAA
GTATTTCCGGGTTTCTTGCCTCAGCATCGTTGACCCAGGTGACTCCGACATCATCAAGTC
GCTTCCCGGAGACCAGTGATTGTTGATTTGTTATGGGTTTACCATGTTTTGTCTGCTTTT
TTTATGTAATGTGTTCTGGAAAGACATCATGTTTGGTTTCTGAACTCCTTATGCTTAATT
ACACTTTCGTCTCTTGGATACATTTTGCATGAATGAAAGACTTATTTTAGGTTAAAAA

QA 3 540 3 540
DS 

RD RR2EQ53JQ 479 0 0
GAAGACGAAGAAGTCCCATTAAGGAATCAACAGCAGATTAGCTCTTGTGATGAAGAGTGG
AAAGTACACGCTTGGCTACAAATCAGTTCTCAAGTCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTT
GATTTTTATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAGATCAGAAATCGAGTACTACGCTAT
GCTTGCTAAAGTCGGCGTTCATCACTACAACGGGAACAATGTCGATTTGGGAACTGCTTG
CGGGAAGTATTTCCGGGTTTCTTGCCTCAGCATCGTTGACCCAGGTGACTCCGACATCAT
CAAGTCGCTTCCCGGAGACCAGTGATTGTTGATTTGTTATGGGTTTACCATGTTTTGTTT
GCTTTTTTTATGTAATGTGTTCTGGAAAGACATCATGTTTGGTTTTTGAACTCCTTATGC
TTAATTACACTTTCGTTTCTTGGATACATTTTGCATGAATGAAAGACTTATTTTAGGTT

QA 1 479 1 479
DS 



CO CL1126Contig2 554 2 3 U
ACCCCGAAAGGGCTTCTCTTCCTGTAAATCCGGCGATCAGCGACACTTGACGGCGTTGAG
AAGAAGATGGTGGCGGCGAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAACAGCAGATTA
GCTCTTGTGATGAAGAGTGGAAAGTACACCCTTGGCTACAAATCAGTTCTCAAGTCCCTT
CGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTTATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAGATCA
GAAATCGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTGGGCGTTCATCACTACAACGGGAACAAT
GTCGATTTGGGAACTGCTTGCGGGAAGTACTTCCGTGTGTCTTGCCTCAGCATCGTGGAT
CCATGTGACTCCGACATCATCAAATCGCTTCCCGGAGACCAGTGATTGTTGATTTGTTAT
GAGTTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTTTTATGGAATGTGTTCTGGAAAGACATCATGTTTG
GTTTCTGAACTCCTTATGCTTAATTACACTTTCGGGATACATTTTGCATGAATGAAAGAC
TTATTTTAGGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2FP71JQ C 1
AF RR2FP71TF U 1
BS 1 14 RR2FP71JQ
BS 15 553 RR2FP71TF
BS 554 554 RR2FP71JQ

RD RR2FP71JQ 554 0 0
ACCCCGAAAGGGCTTCTCTTCCTGTAAATCCGGCGATCAGCGACACTTGACGGCGTTGAG
AAGAAGATGGTGGCGGCGAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAACAGCAGATTA
GCTCTTGTGATGAAGAGTGGAAAGTACACCCTTGGCTACAAATCAGTTCTCAAGTCCCTT
CGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTTATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAGATCA
GAAATCGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTGGGCGTTCATCACTACAACGGGAACAAT
GTCGATTTGGGAACTGCTTGCGGGAAGTACTTCCGTGTGTCTTGCCTCAGCATCGTGGAT
CCATGTGACTCCGACATCATCAAATCGCTTCCCGGAGACCAGTGATTGTTGATTTGTTAT
GAGTTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTTTTATGGAATGTGTTCTGGAAAGACATCATGTTTG
GTTTCTGAACTCCTTATGCTTAATTACACTTTCGGGATACATTTTGCATGAATGAAAGAC
TTATTTTAGGTTAC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2FP71TF 554 0 0
ACCCCGAAAGGGCT
TCTCTTCCTGTAAATCCGGCGATCAGCGACACTTGACGGCGTTGAGAAGAAGATGGTGGC
GGCGAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAACAGCAGATTAGCTCTTGTGATGAA
GAGTGGAAAGTACACCCTTGGCTACAAATCAGTTCTCAAGTCCCTTCGCAGCTCCAAAGG
TAAGTTGATTCTTATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAGATCAGAAATCGAGTACTA
CGCTATGCTTGCTAAAGTGGGCGTTCATCACTACAACGGGAACAATGTCGATTTGGGAAC
TGCTTGCGGGAAGTACTTCCGTGTGTCTTGCCTCAGCATCGTGGATCCATGTGACTCCGA
CATCATCAAATCGCTTCCCGGAGACCAGTGATTGTTGATTTGTTATGAGTTTGCCATGTT
TTGTCTGCTTTTTTATGGAATGTGTTCTGGAAAGACATCATGTTTGGTTTCTGAACTCCT
TATGCTTAATTACACTTTCGGGATACATTTTGCATGAATGAAAGACTTATTTTAGGTTA
C

QA 15 553 15 553
DS 



AS 1 7

CO CL1127Contig1 738 7 5 U
GGGGTAACAGTTAAATTTATTTCGACTATAAATTGTCCATTGCATTTCAAATCTTATTCC
ACTTTATAATCATAAAAATAAAAATTCAGTAATTGCAATGAAGCAACCTTACAAGAGTAC
AACTATTAAAATAAAAACAAAGACAACCAAAATATAATAAATTAATAATACTAATACTTA
AACGATTTATTTTTTAGGATTCTCCAAGTAGTAGTTGCGTTTCTCTTCCTCGTCCATGAA
TGCGGTAATGTGAAAAGACTTGCCGATTCCCATAGGAGTCTTGAAGTAAATCTTCTTGCT
TTTAGGCTCCTCCATACTCATCTCCACAATCGGCACCCACAAAAACATCTGCTTACTCTT
CACGCCTGTCATCTTCTTCATACAACACTTGTCAATATAGGCGGTGACCTCAACAGCGTA
AGAAACGCGAGTGTTGGTGGCTTCAAAGAAATGTTCGTATGGAGTGTTTTGCTTCATCCA
CACGAAACCGGTGGCTCTAACTCTTCCACACTCCACGAGGTTCTTCAAAGGCATAACACC
TTTTGGAAACCCTAGCTCCTCTAGAAGCTCCACCGAGTTCTTGTAACACTCCTCCGCTCC
ATACACGATCTCAGCTCCTGCTCTCTCTCCTTCAACCACCACGACTTCCTCGCTCGCCAT
TTTGATCGCGAGAGTATAGAACTTTGCAAGAAAATTTATTTGTGTATGTTTTCTTCAAAT
AAAGATGAAATGAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 

AF RR2G054TF C 24
AF RR2G054JQ U 1
AF RR2EB50TF C 15
AF RR2E612JQ U 23
AF RR2EB50JQ U 23
AF RR2A774JQ U 68
AF RR2A774TF C 65
BS 1 299 RR2G054JQ
BS 300 300 RR2E612JQ
BS 301 655 RR2G054JQ
BS 656 734 RR2E612JQ
BS 735 738 RR2EB50JQ

RD RR2G054TF 480 0 0
GACTATAAATTGTCCATTGCATTTCAAATCTTATTCCACTTTATAATCATAAAAATAAAA
ATTCAGTAATTGCAATGAAGCAACCTTACAAGAGTACAACTATTAAAATAAAAACAAAGA
CAACCAAAATATAATAAATTAATAATACTAATACTTAAACGATTTATTTTTTAGGATTCT
CCAAGTAGTAGTTGCGTTTCTCTTCCTCGTCCATGAATGCGGTAATGTGAAAAGACTTGC
CGATTCCCATAGGAGTCTTGAAGTAAATCTTCTTGCCTTTAGGCTCCTCCATACTCATCT
CCACAATCGGCACCCACAAAAACATCTGCTTACTCTTCACGCCTGTCATCTTCTTCATAC
AACACTTGTCAATATAGGCGGTGACCTCAACAGCGTAAGAAACGCGAGTGTTGGTGGCTT
CAAAGAAATGTTCGTATGGAGTGTTTTGCTTCATCCACACGAAACCGGTGGCTCTAACTC

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2G054JQ 657 0 0
GGGGTAACAGTTAAATTTATTTCGACTATAAATTGTCCATTGCATTTCAAATCTTATTCC
ACTTTATAATCATAAAAATAAAAATTCAGTAATTGCAATGAAGCAACCTTACAAGAGTAC
AACTATTAAAATAAAAACAAAGACAACCAAAATATAATAAATTAATAATACTAATACTTA
AACGATTTATTTTTTAGGATTCTCCAAGTAGTAGTTGCGTTTCTCTTCCTCGTCCATGAA
TGCGGTAATGTGAAAAGACTTGCCGATTCCCATAGGAGTCTTGAAGTAAATCTTCTTGCC
TTTAGGCTCCTCCATACTCATCTCCACAATCGGCACCCACAAAAACATCTGCTTACTCTT
CACGCCTGTCATCTTCTTCATACAACACTTGTCAATATAGGCGGTGACCTCAACAGCGTA
AGAAACGCGAGTGTTGGTGGCTTCAAAGAAATGTTCGTATGGAGTGTTTTGCTTCATCCA
CACGAAACCGGTGGCTCTAACTCTTCCACACTCCACGAGGTTCTTCAAAGGCATAACACC
TTTTGGAAACCCTAGCTCCTCTAGAAGCTCCACCGAGTTCTTGTAACACTCCTCCGCTCC
ATACACGATCTCAGCTCCTGCTCTCTCTCCTTCAACCACCACGACTTCCTCGCTC
CC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2EB50TF 724 0 0
TTTTT
TTTCGACTATAAAT*GTCCATTGCATT*CAAATCTTATTCCACTTTATAATCATAAAA*T
AAAAATTCAGTAATTGCAATGAAGCAAC*TTACAAGAGTACAACTATTAAAATAAAAACA
AAGACAACCAAAATATAATAAATTAATAATACTAATACTTAAACGATTTATTTTTTAGGA
TTCTCCAAGTAGTAGTTGCGTTTCTCTTCCTCGTCCATGAATGCGGTAATGTGAAAAGAC
TTGCCGATTCCCATAGGAGTCTTGAAGTAAATCTTCTTGCTTTTAGGCTCCTCCATACTC
ATCTCCACAATCGGCACCCACAAAAACATCTGCTTACTCTTCACGCCTGTCATCTTCTTC
ATACAACACTTGTCAATATAGGCGGTGACCTCAACAGCGTAAGAAACGCGAGTGTTGGTG
GCTTCAAAGAAATGTTCGTATGGAGTGTTTTGCTTCATCCACACGAAACCGGTGGCTCTA
ACTCTTCCACACTCCACGAGGTTCTTCAAAGGCATAACACCTTTTGGAAACCCTAGCTCC
TCTAGAAGCTCCACCGAGTTCTTGTAACACTCCTCCGCTCCATACACGATCTCAGCTCCT
GCTCTCTCTCCTTCAACCACCACGACTTCCTCGCTCGCCATTTTGATCGCGAGAGTATAG
AACTTTGCAAGAAAATTTATTTGTGTATGTTTTCTTCAAATAAAGATGAAATGAATCC
C

QA 6 723 6 723
DS 

RD RR2E612JQ 717 0 0
CGACTATAAATTGTCCATTGCATTTCAAATCTAATTCCACTTTATAATCATAAAAATAAA
AATTCAGTAATTGCAATGAAGCAACCTTACAAGAGTACAACTATTAAAATAAAAACAAAG
ACAACCAAAATATAATAAATTAATAATACTAATACTTAAACGATTTATTTTTTAGGATTC
TCCAAGTAGTAGTTGCGTTTCTCTTCCTCGTCCATGAATGCGGTAATGTGAAAAGACTTG
CCGATTCCCATAGGAGTCTTGAAGTAAATCTTCTTGCTTTTAGGCTCCTCCATACTCATC
TCCACAATCGGCACCCACAAAAACATCTGCTTACTCTTCACGCCTGTCATCTTCTTCATA
CAACACTTGTCAATATAGGCGGTGACCTCAACAGCGTAAGAAACGCGAGTGTTGGTGGCT
TCAAAGAAATGTTCGTATGGAGTGTTTTGCTTCATCCACACGAAACCGGTGGCTCTAACT
CTTCCACACTCCACGAGGTTCTTCAAAGGCATAACACCTTTTGGAAACCCTAGCTCCTCT
AGAAGCTCCACCGAGTTCTTGTAACACTCCTCCGCTCCATACACGATCTCAGCTCCTGCT
CTCTCTCCTTCAACCACCACGACTTCCTCGCTCGCCATTTTGATCGCGAGAGTATAGAAC
TTTGCAAGAAAATTTATTTGTGTATGTTTTCTTCAAATAAAGATGAAATGAA
AATCC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2EB50JQ 716 0 0
CGACTATAAATTGTCCATTGCATTTCAAATCTTATTCCACTTTATAATCATAAAAATAAA
AATTCAGTAATTGCAATGAAGCAACCTTACAAGAGTACAACTATTAAAATAAAAACAAAG
ACAACCAAAATATAATAAATTAATAATACTAATACTTAAACGATTTATTTTTTAGGATTC
TCCAAGTAGTAGTTGCGTTTCTCTTCCTCGTCCATGAATGCGGTAATGTGAAAAGACTTG
CCGATTCCCATAGGAGTCTTGAAGTAAATCTTCTTGCTTTTAGGCTCCTCCATACTCATC
TCCACAATCGGCACCCACAAAAACATCTGCTTACTCTTCACGCCTGTCATCTTCTTCATA
CAACACTTGTCAATATAGGCGGTGACCTCAACAGCGTAAGAAACGCGAGTGTTGGTGGCT
TCAAAGAAATGTTCGTATGGAGTGTTTTGCTTCATCCACACGAAACCGGTGGCTCTAACT
CTTCCACACTCCACGAGGTTCTTCAAAGGCATAACACCTTTTGGAAACCCTAGCTCCTCT
AGAAGCTCCACCGAGTTCTTGTAACACTCCTCCGCTCCATACACGATCTCAGCTCCTGCT
CTCTCTCCTTCAACCACCACGACTTCCTCGCTCGCCATTTTGATCGCGAGAGTATAGAAC
TTTGCAAGAAAATTTATTTGTGTATGTTTTCTTCAAATAAAGATGAAATGAATCCC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2A774JQ 670 0 0
G
ATCATAAAAATAAAAATTCAGTAATTGCAATGAAGCAACCTTACAAGAGTACAACTGTTA
AAATAAAAACAAAGACAACCAAGATATAATAAATTAATAATACTAATACTTAAACGATTT
ATTTTTTAGGATTCTCCAAGTAGTAGTTGCGTTTCTCTTCCTCGTCCATGAATGCGGTAA
TGTGAAAAGACTTGCCGATTCCCATAGGAGTCTTGAAGTAAATCTTCTTGCTTTTAGGCT
CCTCCATACTCATCTCCACAATCGGCACCCACAAAAACATCTGCTTACTCTTCACGCCTG
TCATCTTCTTCATACAACACTTGTCAATATAGGCGGTGACCTCAACAGCGTAAGAAACGC
GAGTGTTGGTGGCTTCAAAGAAATGTTCGTATGGAGTGTT**GCTTCATCCACACGAAAC
CGGTGGCTCTAACTCTTCCACACTCCACGAGGTTCTTCAAAGGCATAACACCTTTTGGAA
ACCCTAGCTCCTCTAGAAGCTCCACCGAGTTCTTGTAACACTCCTCCGCTCCATACACGA
TCTCAGCTCCTGCTCTCTCTCCTTCAACCACCACGACTTCCTCGCTCGCCATTTTGATCG
CGAGAGTATAGAACTTTGCAAGAAAATTTATTTGTGTATGTTTTCTTCAAATAAAGATGA
AATGAATCC

QA 2 670 2 670
DS 

RD RR2A774TF 673 0 0
TTTG
ATCATAAAAATAAAAATTCAGTAATTGCAATGAAGCAACCTTACAAGAGTACAACTGTTA
AAATAAAAACAAAGACAACCAAGATATAATAAATTAATAATACTAATACTTAAACGATTT
ATTTTTTAGGATTCTCCAAGTAGTAGTTGCGTTTCTCTTCCTCGTCCATGAATGCGGTAA
TGTGAAAAGACTTGCCGATTCCCATAGGAGTCTTGAAGTAAATCTTCTTGCTTTTAGGCT
CCTCCATACTCATCTCCACAATCGGCACCCACAAAAACATCTGCTTACTCTTCACGCCTG
TCATCTTCTTCATACAACACTTGTCAATATAGGCGGTGACCTCAACAGCGTAAGAAACGC
GAGTGTTGGTGGCTTCAAAGAAATGTTCGTATGGAGTGTT**GCTTCATCCACACGAAAC
CGGTGGCTCTAACTCTTCCACACTCCACGAGGTTCTTCAAAGGCATAACACCTTTTGGAA
ACCCTAGCTCCTCTAGAAGCTCCACCGAGTTCTTGTAACACTCCTCCGCTCCATACACGA
TCTCAGCTCCTGCTCTCTCTCCTTCAACCACCACGACTTCCTCGCTCGCCATTTTGATCG
CGAGAGTATAGAACTTTGCAAGAAAATTTATTTGTGTATGTTTTCTTCAAATAAAGATGA
AATGAATCC

QA 5 673 5 673
DS 



AS 2 5

CO CL1128Contig1 1024 3 2 U
AAGTCTAAAACCAAAATAATACATATAAAAGGAAACAAAAGAGTTCTCTTCTTCTTTATC
CCTCAAAACTTTCACCAAGAGGTCTGTCTAATCAAATTAACAATAAAAACAACATTAAAC
AACTTAAAGCTCATCGTGAGACTCATCCTCATCTTCGGCCGCTCCTTCTCCACCAGCACC
ACCTGGCGCACCACCTGACCTCTGATAAACGGCCGTGATGATTGGGTTACAAACTGCCTC
TACTTCCTTCAACTTCTCGTCGTACTCTTCCTTCTCCGAGTTTTGGTTCTCGTCAAGCCA
CTCCAAGGCTTCTTTCGTCGCTGCCTCAATCTTCTCCTT*CTCGTCACCCTCAAGTTTGT
CTGCGAGCTTGTCCTTGTCGTTTATTTGGTTCTTCATGTTGTACACGTAAGTCTCGAGGC
TATTCCTTGCGTCGATTCTCTCCTTCACCTTCTTGTCTTCCTCTGCAAACTCCTCTGCCT
CCTTCACCATCCGGTCAATCTCTTCTTGGCTCAAACGTCCCTTCTCGTTTGTGATTGTGA
TCTTCTCTGATTTACCACTTGCCTTGTCCTCTGCCTTCACGTTCAGGATACCGTTGGCGT
CCACTTCAAAGGTAACCTCGATTTGAGGTGTTCCTCTTGGTGCTGGTGGGATTCCGGTGA
GGTCGAAGTTACCGAGCAGCCTGCAGTCCTTGGTGAGACTTCGCTCACCTTCAAAGACCT
GAATGGAGACGGTGGTCTGTTGGTCTTGGTATGTCGTGAACACCTGAGACTTCTTGGTCG
GAATAACTGTGTTTCTCGGGATAAGTTTGGTCATCACTCCTCCCACGGTCTCAATACCCA
AAGTGAGTGGTGCAACGTCAAGAAGAAGGATATCTTTGGTCTCATCACCACCTTCTCCGC
TCAGAATACCACCCTGGACAGCGGCACCGTAAGCAACGGCTTCGTCAGGGTTCACACCCT
TGTTTGGCTCTTTCCCTTCGAAGAAGTCCTTCAACAGCTGCTGAACCTTTGGGATTCTAG
TACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2BE30JQ U 1
AF RR2AQ78JQ U 1
AF RR2AQ78TF C 242
BS 1 783 RR2AQ78JQ
BS 784 1024 RR2AQ78TF

RD RR2BE30JQ 652 0 0
AAGTCTAAAACCAAAATAATACATATAAAAGGAAACAAAAGAGTTCTCTTCTTCTTTATC
CCTCAAAACTTTCACCAAGAGGTCTGTCTAATCAAATTAACAATAAAAACAACATTAAAC
AACTTAAAGCTCATCGTGAGACTCATCCTCATCTTCGGCCGCTCCTTCTCCACCAGCACC
ACCTGGCGCACCACCTGACCTCTGATAAACGGCCGTGATGATTGGGTTACAAACTGCCTC
TACTTCCTTCAACTTCTCGTCGTACTCTTCCTTCTCCGAGTTTTGGTTCTCGTCAAGCCA
CTCCAAGGCTTCTTTCGTCGCTGCCTCAATCTTCTCCTT*CTCGTCACCCTCAAGTTTGT
CTGCGAGCTTGTCCTTGTCGTTTATTTGGTTCTTCATGTTGTACACGTAAGTCTCGAGGC
TATTCCTTGCGTCGATTCTCTCCTTCACCTTCTTGTCTTCCTCTGCAAACTCCTCTGCCT
CCTTCACCATCCGGTCAATCTCTTCTTGGCACAAACGTCCCTTCTCGTTTGTGATTGTGA
TCTTCTCTGATTTACCACTTGCCTTGTCCTCTGCCTTCACGTTCAGGATACCGTTGGCGT
CCACTTCAAAGGTAACCTCGATTTGAGGTGTTCCTCTTGGTGCTGGTGGGAT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2AQ78JQ 783 0 0
AAGTCTAAAACCAAAATAATACATATAAAAGGAAACAAAAGAGTTCTCTTCTTCTTTATC
CCTCAAAACTTTCACCAAGAGGTCTGTCTAATCAAATTAACAATAAAAACAACATTAAAC
AACTTAAAGCTCATCGTGAGACTCATCCTCATCTTCGGCCGCTCCTTCTCCACCAGCACC
ACCTGGCGCACCACCTGACCTCTGATAAACGGCCGTGATGATTGGGTTACAAACTGCCTC
TACTTCCTTCAACTTCTCGTCGTACTCTTCCTTCTCCGAGTTTTGGTTCTCGTCAAGCCA
CTCCAAGGCTTCTTTCGTCGCTGCCTCAATCTTCTCCTT*CTCGTCACCCTCAAGTTTGT
CTGCGAGCTTGTCCTTGTCGTTTATTTGGTTCTTCATGTTGTACACGTAAGTCTCGAGGC
TATTCCTTGCGTCGATTCTCTCCTTCACCTTCTTGTCTTCCTCTGCAAACTCCTCTGCCT
CCTTCACCATCCGGTCAATCTCTTCTTGGCTCAAACGTCCCTTCTCGTTTGTGATTGTGA
TCTTCTCTGATTTACCACTTGCCTTGTCCTCTGCCTTCACGTTCAGGATACCGTTGGCGT
CCACTTCAAAGGTAACCTCGATTTGAGGTGTTCCTCTTGGTGCTGGTGGGATTCCGGTGA
GGTCGAAGTTACCGAGCAGCCTGCAGTCCTTGGTGAGACTTCGCTCACCTTCAAAGACCT
GAATGGAGACGGTGGTCTGTTGGTCTTGGTATGTCGTGAACACCTGAGACTTCTTGGTCG
GAA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2AQ78TF 783 0 0
TAC
TCCTTCAACTTCTCGTCGTACTCTCCTTTCTCCGAGTTTTGGTTCTCGTCAAGCCACTCC
AAGGCTTCTTTCGTCGCTGCCTCAATCTTCTCCTTTCTCGTCACCCTCAAGTTTGTCTGC
GAGCTTGTCCTTGTCGTTTATTTGGTTCTTCATGTTGTACACGTAAGTCTCGAGGCTATT
CCTTGCGTCGATTCTCTCCTTCACCTTCTTGTCTTCCTCTGCAAACTCCTCTGCCTCCTT
CACCATCCGGTCAATCTCTTCTTGGCTCAAACGTCCCTTCTCGTTTGTGATTGTGATCTT
CTCTGATTTACCACTTGCCTTGTCCTCTGCCTTCACGTTCAGGATACCGTTGGCGTCCAC
TTCAAAGGTAACCTCGATTTGAGGTGTTCCTCTTGGTGCTGGTGGGATTCCGGTGAGGTC
GAAGTTACCGAGCAGCCTGCAGTCCTTGGTGAGACTTCGCTCACCTTCAAAGACCTGAAT
GGAGACGGTGGTCTGTTGGTCTTGGTATGTCGTGAACACCTGAGACTTCTTGGTCGGAAT
AACTGTGTTTCTCGGGATAAGTTTGGTCATCACTCCTCCCACGGTCTCAATACCCAAAGT
GAGTGGTGCAACGTCAAGAAGAAGGATATCTTTGGTCTCATCACCACCTTCTCCGCTCAG
AATACCACCCTGGACAGCGGCACCGTAAGCAACGGCTTCGTCAGGGTTCACACCCTTGTT
TGGCTCTTTCCCTTCGAAGAAGTCCTTCAACAGCTGCTGAACCTTTGGGATTCTAGTACC

QA 4 783 4 783
DS 



CO CL1128Contig2 726 2 7 U
AAGTCTCACCAAGGACTGCAGGCTGCTCGGGAACTTCGACCTCACCGGAATCCCACCGGC
TCCAAGAGGAACACCTCAAATCGAGGTGACGTTTGAAGTAGACGCCAACGGTATCCTGAA
CGTGAAAGCGGAGGACAAGGCGAGTGGTAAATCAGAGAAGATCACAATCACGAACGAGAA
GGGACGTCTGAGCCAGGAAGAAATCGACCGGATGGTGAAGGAGGCAGAGGAGTTTGCAGA
GGAAGACAAGAAGGTGAAGGAGAGAATCGACGCAAGGAACAGCCTCGAGACACACGTGTA
CAACATGAAGAACCAAATAAACGACAAGGACAAGCTCGCTGACAAACTTGAGGGTGACGA
GAAGGAGAAGATTGAGGCAGCGACGAAAGAAGCGTTGGAGTGGCTTGACGAGAACCAAAA
CTCAGAGAAGGAAGAGTATGACGAGAAGTTGAAGGAGGTAGAGGCAGTGTGTAACCCAAT
CATCACTGCTGTTTACCAGAGGTCAGGTGGTGCACCAGGTGATGCGGGTGGAGAATCAGC
AACCGAGGAGGAAGATGAGTCTCATGATGAGCTCTAAGCTAAGTTGCCTTTTTTTATAGT
TAATTTGTTTTTAAACCAACCACTCGTTAGAAAATTTGAGGATAAGGAAGAATAGAACTC
TTTTTTATACATGTTTTTATTTTTGGGAAATTTTTTACAAGTGAATGAACTTCTTTTGTC
TGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2F253TF U 130
AF RR2H778JQB C 1
BS 1 130 RR2H778JQB
BS 131 291 RR2F253TF
BS 292 293 RR2H778JQB
BS 294 683 RR2F253TF
BS 684 684 RR2H778JQB
BS 685 703 RR2F253TF
BS 704 726 RR2H778JQB

RD RR2F253TF 574 0 0
G
GAGGACAAGGCGAGTGGTAAATCAGAGAAGATCACAATCACGAACGAGAAGGGACGTCTG
AGCCAGGAAGAAATCGACCGGATGGTGAAGGAGGCAGAGGAGTTTGCAGAGGAAGACAAG
AAGGTGAAGGAGAGAATCGACGCAAGGAACAGCCTCGAGACTTACGTGTACAACATGAAG
AACCAAATAAACGACAAGGACAAGCTCGCTGACAAACTTGAGGGTGACGAGAAGGAGAAG
ATTGAGGCAGCGACGAAAGAAGCGTTGGAGTGGCTTGACGAGAACCAAAACTCAGAGAAG
GAAGAGTATGACGAGAAGTTGAAGGAGGTAGAGGCAGTGTGTAACCCAATCATCACTGCT
GTTTACCAGAGGTCAGGTGGTGCACCAGGTGATGCGGGTGGAGAATCAGCAACCGAGGAG
GAAGATGAGTCTCATGATGAGCTCTAAGCTAAGTTGCCTTTTTTTATAGTTAATTTGTTT
TTAAACCAACCACTCGTTAGAAAATTTGAGGATAAGGAAGAATAGAACTCTTTTTTATAC
ATGTTTTTATTTT*GGGAAATTTTTTACAAGTG

QA 2 574 2 574
DS 

RD RR2H778JQB 726 0 0
AAGTCTCACCAAGGACTGCAGGCTGCTCGGGAACTTCGACCTCACCGGAATCCCACCGGC
TCCAAGAGGAACACCTCAAATCGAGGTGACGTTTGAAGTAGACGCCAACGGTATCCTGAA
CGTGAAAGCGGAGGACAAGGCGAGTGGTAAATCAGAGAAGATCACAATCACGAACGAGAA
GGGACGTTTGAGCCAGGAAGAGATCGACCGGATGGTGAAGGAGGCAGAGGAGTTTGCTGA
GGAAGACAAGAAGGTGAAGGAGAGAATCGACGCAAGGAACAGCCTGGAGACACACGTGTA
CAACATGAAGAACCAAATAAACGACAAGGACAAGCTCGCTGACAAACTTGAGGGTGACGA
GAAGGAGAAGATTGAGGCAGCGACGAAAGAAGCGTTGGAGTGGCTTGACGAGAACCAAAA
CTCAGAGAAGGAAGAGTATGACGAGAAGTTGAAGGAGGTAGAGGCAGTGTGTAACCCAAT
CATCACTGCTGTTTACCAGAGGTCAGGTGGTGCACCAGGTGGTGCGGGTGGAGAATCAGC
AACCGAGGAGGAAGATGAGTCTCATGATGAGCTCTAAGCTAAGTTGCCTTTTTT*ATAGT
TAATTTGTTTTTAAACCAACCACTCGTTAGAAAATTTGAGGATAAGGAAGAATAGAACTC
TTTTTTATACATGTTTTTATTTTTGGGAAATTTTTTACAAGTGAATGAACTTCTTTTGTC
TGAATC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 5

CO CL1129Contig1 663 5 2 U
AGGGGACACTCCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCAATCTCCCTCTCGAGCAGATCTCTCTCG
TGAACATCGACAATGTCGACCACTTTCAGCTCTTCTGTCTCCATGCAAGCTACTTCTCTG
GCAACATTCCAGAAGCCAGCTGCTTTGGTTTCAGGGACTAATCTCTCCTTCAACCTGCGC
CGTTCGATCCCCACTCGCTTCTCAATCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACAGTAGAGAAA
GTGTCAAAGATCGTCAAGAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAAAAGGTCGTTGCAGAA
ACCAAATTTGCTGATCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAGATAGTGATGGGTTTG
GAGGAAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACGGTGGAG
CAAGCTGCTGAGCTCATTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAATTTTAGTATTAAGAG
CGAAGTCTTTGTTGGG*TTTGTTGTTTTCATAATCTTTCTGGTCATTTTTCCTTTTTTTA
ATGTGTCATGCGACTCTGTTGGTTTAAGTAGTATCTGTATGCCATGGATATCATCTCTAT
TTGTCGACTGAAAACTTTTGGTTACACATGAAGGAATGCTTGTTTCTTTTATAAGAAAAA
AAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2E664TF U 6
AF RR2C249JQ C 1
AF RR2CC26JQ C 56
AF RR2CC26TF U 56
AF RR2C249TF U 1
BS 1 16 RR2C249JQ
BS 17 663 RR2C249TF

RD RR2E664TF 460 0 0
GGACTCCGCCAC
CTCTCTCTCTCTCTCAATCTCCCTCTCGAGCAGATCTCTCTCGTGAATATCGACAATGTC
GACCACTTTCAGCTCTTCTGTCTCCATGCAAGCTACTTCTCTGGCAACATTCCAGAAGCC
AGCTGCTTTGGTTTCAAGGACTAATCTCTCCTACAGCCTACGCCGTTCGATCCCCACTCG
CTTCTCAATCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACAGTAGAGAAAGTGTCAAAGATCGTCAA
GAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAAAAGGTCGTTGCAGAAACCAAACTTGCTGATCT
CGGAGCCGATTCTCTCGACACTGTTGAGATAGTGATGGGTTTGGAGGAAGAGTTTGGCAT
CGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACGGTGGAGCAAGCTGCTGAGCTCAT
TGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAA

QA 13 460 13 460
DS 

RD RR2C249JQ 652 0 0
AGGGGACACTCCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCAATCTCCCTCTCGAGCAGATCTCTCTCG
TGAACATCGACAATGTCGACCACTTTCAGCTCTTCTGTCTCCATGCAAGCTACTTTTCTG
GCAACATTCCAGAAGCCAGCTGCTTTGGTTTCAGGGACTAATCTCTCCTTCAACCTGCGC
CGTTCGATCCCCACTCGCTTCTCAATCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACAGTAGAGAAA
GTGTCAAAGATCGTCAAGAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAAAAGGTCGTTGCAGAA
ACCAAATTTGCTGATCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAGATAGTGATGGGTTTG
GAGGAAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACGGTGGAG
CAAGCTGCTGAGCTCATTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAATTTTAGTATTAAGAG
CGAAGTCTTTGTTGGG*TTTGTTGTTTTCATAATCTTTCTGGTCATTTTTCCTTTTTTTA
ATGTGTCATGCGACTCTGTTGGTTTAAGTAGTATCTGTATGCCATGGATATCATCTCTAT
TTGTCGACTGAAAACTTTTGGTTACACATGAAGGAATGCTTGTTTCTTTTAT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2CC26JQ 572 0 0
G
CTCGTGAACATCGACAATGTCGACCACTTTCAGTTCTTCTGTCTCCATGCAAGCTACTTT
TCTGGCAACATTCCAGAAGCCAGCTGCTTTGGTTTCAGGGACTAATCTCTCCTTCAACCT
GCGCCGTTCGATCCCCACTCGCTTCTCAATCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACAGTAGA
GAAAGTGTCAAAGATCGTCAAGAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAAAAGGTCGTTGC
AGAAACCAAATTTGCTGATCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAGATAGTGATGGG
TTTGGAGGAAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACGGT
GGAGCAAGCTGCTGAGCTCATTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAATTTTAGTATTA
AGAGCGAAGTCTTTGTTGGG*TTTGTTGTTTTCATAATCTTTCTGGTCATTTTTCCTTTT
TTTAATGTGTCATGCGACTCTGTTGGTTTAAGTAGTATCTGTATGCCATGGATATCATCT
CTATTTGTCGACTGAAAACTTTTGGTTACAC

QA 2 572 2 572
DS 

RD RR2CC26TF 572 0 0
G
CTCGTGAACATCGACAATGTCGACCACTTTCAGCTCTTCTGTCTCCATGCAAGCTACTTC
TCTGGCAACATTCCAGAAGCCAGCTGCTTTGGTTTCAGGGACTAATCTCTCCTTCAACCT
GCGCCGTTCGATCCCCACTCGCTTCTCAATCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACAGTAGA
GAAAGTGTCAAAGATCGTCAAGAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAAAAGGTCGTTGC
AGAAACCAAATTTGCTGATCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAGATAGTGATGGG
TTTGGAGGAAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACGGT
GGAGCAAGCTGCTGAGCTCATTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAATTTTAGTATTA
AGAGCGAAGTCTTTGTTGGGGTTTGTTGTTTTCATAATCTTTCTGGTCATTTTTCCTTTT
TTTAATGTGTCATGCGACTCTGTTGGTTTAAGTAGTATCTGTATGCCATGGATATCATCT
CTATTTGTCGACTGAAAACTTTTGGTTACAC

QA 2 572 2 572
DS 

RD RR2C249TF 663 0 0
AGGGGACACTCCGCCA
TCTCTCTCTCTCTCTCAATCTCCCTCTCGAGCAGATCTCTCTCGTGAACATCGACAATGT
CGACCACTTTCAGCTCTTCTGTCTCCATGCAAGCTACTTCTCTGGCAACATTCCAGAAGC
CAGCTGCTTTGGTTTCAGGGACTAATCTCTCCTTCAACCTGCGCCGTTCGATCCCCACTC
GCTTCTCAATCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACAGTAGAGAAAGTGTCAAAGATCGTCA
AGAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAAAAGGTCGTTGCAGAAACCAAATTTGCTGATC
TCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAGATAGTGATGGGTTTGGAGGAAGAGTTTGGCA
TCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACGGTGGAGCAAGCTGCTGAGCTCA
TTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAATTTTAGTATTAAGAGCGAAGTCTTTGTTGGG
*TTTGTTGTTTTCATAATCTTTCTGGTCATTTTTCCTTTTTTTAATGTGTCATGCGACTC
TGTTGGTTTAAGTAGTATCTGTATGCCATGGATATCATCTCTATTTGTCGACTGAAAACT
TTTGGTTACACATGAAGGAATGCTTGTTTCTTTTATAAGAAAAAAAA

QA 17 663 17 663
DS 



AS 1 4

CO CL1130Contig1 922 4 3 U
GGGGCATAATTTTTTTAATTATAATCATCATTCATGCAGATAAGTATTTATGCAAGGACT
AATAACAGCAGCAAATTACTCAAACGGACCAACATAGTATTACATAATTAAACTTTCTCT
TGAACGCCAGCTTTCTTCCATAAGCTTCAAGGTTCCTTGATCTTGGGTCGTGTCGGAAGC
AACTGGTAGCAAGAAATGAGGGAGGTTATGAATCCAAAAGCTCCGGTGACACGAGGAGTG
ATCTTCTCTGGATATAACCGAAGAAGACCAGCTGCTACAACAATGTCCATGGCTGATTTG
ATCAAAGCAAGACTCCTCTCGTTAGACTGTTTAAGCTTGGCACGATACTCCTCATCTTGA
AACTTGTTGCCATTCTTAAGCCCTTTCTCGATCTTCTTCATCGACGATGAGAGCCTTCCA
ATCTCACCAAGCTCAACTAAAGTTGTACAGACAGATGATCCCATCCAGCAGAAAACTGAT
ATACGTCCAAGTAACTCAGCTCGCTCTTGGTTCTTATAGATTCCTGATCTTCCAAGCCAG
ACGATTTGATCCAGGAACAAGAATGTAGACAAGAGTGCGTTCTTGGACTTTCCAAGCAAG
GCGAGAGGAAGTGGAGTCCCTTTAGGAACAGGACTGATAAGACCATGTAAATCATTAACA
AACTTGAAAAGACGGAAGACTTTCCTGGCTAAGGTAGTGGATTTATCAACGTTCTGAGCA
GTACCAGGTTGTCCACCGCTCACAAACTTTGAACCATACTGTATAGCTCTGCATAACTTA
TCCCTTGCCTCTGCTTTGTTCAGATACATAACCACTAGACCAAGCTCTGCTCTCGATACA
TCTAACGTACTAGCCATCTCCTCTCTGAAAACACACACAAAGAAGCCCTTCTTTGTGTAC
AAAGAGAACCTCTGTTTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER36JQ U 43
AF RR2FO02JQ U 1
AF RR2H164JQ U 28
AF RR2FO02TF C 133
BS 1 689 RR2FO02JQ
BS 690 724 RR2H164JQ
BS 725 922 RR2FO02TF

RD RR2ER36JQ 184 0 0
AGTATTTATGCAAGGACTAATAACAGCAGCAAATTACTCAAACGGACCAACATAGTATTA
CATAATTAAACTTTCTCTTGAACGCCAGCTTTCTTCCATAAGCTTCAAGGTTCCTTGATC
TTGGGTCGTGTCGGAAGCAACTGGTAGCAAGAAATGAGGGAGGTTATGAATCCAAAAGCT
CCGG

QA 1 184 1 184
DS 

RD RR2FO02JQ 689 0 0
GGGGCATAATTTTTTTAATTATAATCATCATTCATGCAGATAAGTATTTATGCAAGGACT
AATAACAGCAGCAAATTACTCAAACGGACCAACATAGTATTACATAATTAAACTTTCTCT
TGAACGCCAGCTTTCTTCCATAAGCTTCAAGGTTCCTTGATCTTGGGTCGTGTCGGAAGC
AACTGGTAGCAAGAAATGAGGGAGGTTATGAATCCAAAAGCTCCGGTGACACGAGGAGTG
ATCTTCTCTGGATATAACCGAAGAAGACCAGCTGCTACAACAATGTCCATGGCTGATTTG
ATCAAAGCAAGACTCCTCTCGTTAGACTGTTTAAGCTTGGCACGATACTCCTCATCTTGA
AACTTGTTGCCATTCTTAAGCCCTTTCTCGATCTTCTTCATCGACGATGAGAGCCTTCCA
ATCTCACCAAGCTCAACTAAAGTTGTACAGACAGATGATCCCATCCAGCAGAAAACTGAT
ATACGTCCAAGTAACTCAGCTCGCTCTTGGTTCTTATAGATTCCTGATCTTCCAAGCCAG
ACGATTTGATCCAGGAACAAGAATGTAGACAAGAGTGCGTTCTTGGACTTTCCAAGCAAG
GCGAGAGGAAGTGGAGTCCCTTTAGGAACAGGACTGATAAGACCATGTAAATCATTAACA
AACTTGAAAAGACGGAAGACTTTCCTGGC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2H164JQ 697 0 0
TCATTCATGCAGATAAGTATTTATACAAGGACTAATAACAGCAGCAAATTACTCAAACGG
ACCAACATAGTATTACATAATTAAACTTTCTCTTGAACGCCAGCTTTCTTCCATAAGCTT
CAAGGTTCCTTGATCTTGGGTTGTGTCGGAAGCAACTGGTAGCAAGAAATGAGGGAGGTG
ATGAATCCAAAAGCTCCGGTGACACGAGGAGTGATCTTCTCTGGATATAACCGAAGAAGA
CCAGCTGCTACAACAATGTCCATGGCTGATTTGATCAAAGCAAGACTCCTCTCGTTAGAC
TGTTTAAACTTGGCACGATACTCCTCATCTTGAAACTTGTTGCCATTCTTAAGCCCTTTC
TCGATCTTCTTCATCGACGATGAGAGCCTTCCAATCTCACCAAGCTCAACTAAAGTTGTA
CAGACAGATGATCCCATCCAGCAGAAAACTGATATACGTCCAAGTAACTCAGCTCGCTCT
TGGTTCTTATAGATTCCTGATCTTCCAAGCCAGACGATTTGATCCAGGAACAAGAATGTA
GACAAGAGTGCGTTCTTGGACTTTCCAAGCAAGGCGAGAGGAAGTGGAGTCCCTTTAGGA
ACAGGACTGATAAGACCATGTAAATCATTAACAAACTTGAAAAGACGGAAGACTTTCCTG
GCTAAGGTAGTGGATTTATCAACGTTCTGAGCAGTAC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2FO02TF 790 0 0
TTTC
TCCATAAGCTTCAAGGT*CCTTGATCTTGG*TCGTGTCGGAAGCAACTGGTAGCAAGAAA
TGAGGGAGGTTATGAATCCAAAAGCTCCGGTGACACGAGGAGTGATCTTCTCTGGATATA
ACCGAAGAAGACCAGCTGCTACAACAATGTCCATGGCTGATTTGATCAAAGCAAGACTCC
TCTCGTTAGACTGTTTAAGCTTGGCACGATACTCCTCATCTTGAAACTTGTTGCCATTCT
TAAGCCCTTTCTCGATCTTCTTCATCGACGATGAGAGCCTTCCAATCTCACCAAGCTCAA
CTAAAGTTGTACAGACAGATGATCCCATCCAGCAGAAAACTGATATACGTCCAAGTAACT
CAGCTCGCTCTTGGTTCTTATAGATTCCTGATCTTCCAAGCCAGACGATTTGATCCAGGA
ACAAGAATGTAGACAAGAGTGCGTTCTTGGACTTTCCAAGCAAGGCGAGAGGAAGTGGAG
TCCCTTTAGGAACAGGACTGATAAGACCATGTAAATCATTAACAAACTTGAAAAGACGGA
AGACTTTCCTGGCTAAGGTAGTGGATTTATCAACGTTTTGAGCAGTACCAGGTTGTCCAC
CGCTCACAAACTTTGAACCATACTGTATAGCTCTGCATAACTTATCCCTTGCCTCTGCTT
TGTTCAGATACATAACCACTAGACCAAGCTCTGCTCTCGATACATCTAACGTACTAGCCA
TCTCCTCTCTGAAAACACACACAAAGAAGCCCTTCTTTGTGTACAAAGAGAACCTCTGTT
TTGTCC

QA 5 790 5 790
DS 



AS 1 7

CO CL1131Contig1 923 7 14 U
CAATCGAAATTGCATGCCGGTTTTATTGGATACACCAGCAAAGCGTGTCTGAAGCACATA
AAAACGGCAACGTCTGGAAACACAAAAATGTGAACGGCAGCCTAGCAAAAATGAGTCTGT
GACGTTTGAAGGTTAAGAACAAAGAAGCATTATTCTTAACGAATACAAGTTTTTATCATT
ATGATAACCAGTTACTCAAGAATTCAACAACACATTTCAGAAAGCTCTGCGCAAGAAAAA
TAAAAATGTAAAACCAGGTTGTGTTTGGGCAGTTTTTTTGAAGGGTTTCAGATAAGGGGA
ACATGAAGAACTTTGATGAAACTCCAGAGAGATATCATAATTGTGGAAAAGTTCGTAGTT
TGTTCACAACATTTCTTGAGACTTTCTCACACACCGGCTAACTTTCTTCTTGAACTCGTC
TCTCTTCTCACGCCATTCTTTAGCAGCTTCAACGTTTGCAGGAGACTCATCGTTTGGACC
AGAAAGCATAGATATAATACTCAACATAATACTTTCAACAGTATGAACAGGGGTCCAGCG
CTCGCTAGCAAGCTCATAACCACTTGGATCATCACCAGGAGGATGCAGGATCGAAATGCA
AACACGACCATCAGAATAAACATTAGGATGCCACATATCTGAAGTAAACCTAACGGTTGG
TGGACTATTAGGATAATTCTGAGGGAAGCTCATTATAGCGTTAAAGAAACCTCCTTCATA
GAGAGTATCTGGAGGTCCGATGATGGTAACGTTCCACTCGAATATATTCTTCTCGTCGAC
GAGCCCCGCGGAGAATCCATCAACAGGATGCTTACACAGATCTTTCAGTTGTTTCTGAAG
GAGAAGGATAGCTTGCGAATTCGAGGCCATGGACGATGATGATGGTGATAGAGAAGATCG
AGCTTGAAACTCTAGAGATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G179JQ U 158
AF RR2AX92JQ U 113
AF RR2G179TF C 158
AF RR2AW89JQ U 1
AF RR2AW89TFB C 660
AF RR2BM07JQ U 158
AF RR2BM07TF C 169
BS 1 158 RR2AW89JQ
BS 159 159 RR2G179JQ
BS 160 307 RR2AW89JQ
BS 308 308 RR2G179JQ
BS 309 366 RR2AW89JQ
BS 367 367 RR2G179JQ
BS 368 651 RR2AW89JQ
BS 652 652 RR2G179JQ
BS 653 708 RR2AW89JQ
BS 709 709 RR2G179JQ
BS 710 801 RR2AW89JQ
BS 802 802 RR2BM07JQ
BS 803 835 RR2AW89JQ
BS 836 923 RR2BM07TF

RD RR2G179JQ 591 0 0
AACGAATACAAGTTTTTATCATTATGATAACCAGTTACTCAAGAATTCAACAACACATTT
CAGAAAGCTCTGCGCAAGAAAAATAAAAATGTAAAACCAGGTTGTGTTTGGGCAGTTTTT
TTGAAGGGTTTCAGATAAGGGGAACATGAAGAACTTTGATGAAACTCCAGAGAGATATCA
TAATTGTGGAAAAGTTCGTAGTTTGTTCACAACATTTCTTGAGACTTTCTCACACACCGG
CTAACTTTCTTCTTGAACTCGTCTCTCTTCTCACGCCATTCTTTAGCAGCTTCAACGTTT
GCAGGAGACTCATCGTTTGGACCAGAAAGCATAGATATAATACTCAACATAATACTTTCA
ACAGTATGAACAGGGGTCCAGCGCTCGCTAGCAAGCTCATAACCACTTGGATCATCACCA
GGAGGATGCAGGATCGAAATGCAAACACGACCATCAGAATAAACATTAGGATGCCACATA
TCTGAAGTAAACCTAACGGTTGGTGGACTATTAGGATAATTCTGAGGGAAGCTCATTATA
GCGTTAAAGAAACCTCCTTCATAGAGAGTATCTGGAGGTCCGATGATGGT
C

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2AX92JQ 644 0 0
GAGTCTGTGACGTTT*AAGGTTAAGAGCAAAGAAGCATTATTCTTAACGAATACAAGTTT
TTATCATTATGATAACCAGTTACTCAAGAATTCAACAACACATTTCAAAAAGCTCTGCGC
AAGAAAAATAAAAATGTAAAACCAGGTTGTGTTTGGGCAGTTTTTTTGAAGGGTTTCAAA
TAAGGGGAACATGAAGAACTTTGATGAAACTCCAGAGAGATATCATAATTGTGGAAAAGT
CCGTAGTTTGTTCACAACATTTCTTGAGACTTTCTCACACACCGGCTAACTTTCTTCTTG
AACTCGTCTCTCTTCTCACGCCATTCTTTAGCAGCTTCAACGTTTGCAGGAGACTCATCG
TTTGGACCAAAAAGCATAGATATAATACTCAACATAATACTTTCAACAGTATGAACAGGG
GTCCAGCGCTCGCTAGCAAGCTCATAACCACTTGGATCATCACCAGGAGGATGCAGGATA
GAAATGCAAACACGACCATCAGAGTAAACATTAGGATGCCACATATCTGAAGTAAACCTA
ACGGTTGGTGGACTATTAGGATAATTCTGAGGGAAGCTCATTATAGCGTTAAAGAAACCT
CCTTCATAGAGAGTATCTGGAGGTCCGATGATGGTAACGTTCCA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2G179TF 591 0 0
AACGAATACAAGTTTTTATCATTATGATAACCAGTTACTCAAGAATTCAACAACACATTT
CAGAAAGCTCTGCGCAAGAAAAATAAAAATGTAAAACCAGGTTGTGTTTGGGCAGTTTTT
TTGAAGGGTTTCAGATAAGGGGAACATGAAGAACTTTGATGAAACTCCAGAGAGATATCA
TAATTGTGGAAAAGTTCGTAGTTTGTTCACAACATTTCTTGAGACTTTCTCACACACCGG
CTAACTTTCTTCTTGAACTCGTCTCTCTTCTCACGCCATTCTTTAGCAGCTTCAACGTTT
GCAGGAGACTCATCGTTTGGACCAGAAAGCATAGATATAATACTCAACATAATACTTTCA
ACAGTATGAACAGGGGTCCAGCGCTCGCTAGCAAGCTCATAACCACTTGGATCATCACCA
GGAGGATGCAGGATCGAAATGCAAACACGACCATCAGAATAAACATTAGGATGCCACATA
TCTGAAGTAAACCTAACGGTTGGTGGACTATTAGGATAATTCTGAGGGAAGCTCATTATA
GCGTTAAAGAAACCTCCTTCATAGAGAGTATCTGGAGGTCCGATGATGGT
C

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2AW89JQ 835 0 0
CAATCGAAATTGCATGCCGGTTTTATTGGATACACCAGCAAAGCGTGTCTGAAGCACATA
AAAACGGCAACGTCTGGAAACACAAAAATGTGAACGGCAGCCTAGCAAAAATGAGTCTGT
GACGTTTGAAGGTTAAGAACAAAGAAGCATTATTCTTAGCGAATACAAGTTTTTATCATT
ATGATAACCAGTTACTCAAGAATTCAACAACACATTTCAGAAAGCTCTGCGCAAGAAAAA
TAAAAATGTAAAACCAGGTTGTGTTTGGGCAGTTTTTTTGAAGGGTTTCAGATAAGGGGA
ACATGAAAAACTTTGATGAAACTCCAGAGAGATATCATAATTGTGGAAAAGTTCGTAGTT
TGTTCATAACATTTCTTGAGACTTTCTCACACACCGGCTAACTTTCTTCTTGAACTCGTC
TCTCTTCTCACGCCATTCTTTAGCAGCTTCAACGTTTGCAGGAGACTCATCGTTTGGACC
AGAAAGCATAGATATAATACTCAACATAATACTTTCAACAGTATGAACAGGGGTCCAGCG
CTCGCTAGCAAGCTCATAACCACTTGGATCATCACCAGGAGGATGCAGGATCGAAATGCA
AACACGACCATCAGAATAAACATTAGGATGCCACATATCTGAAGTAAACCTCACGGTTGG
TGGACTATTAGGATAATTCTGAGGGAAGCTCATTATAGCGTTAAAGAATCCTCCTTCATA
GAGAGTATCTGGAGGTCCGATGATGGTAACGTTCCACTCGAATATATTCTTCTCGTCGAC
GAGCCCCGCGGAGAATCCATCGACAGGATGCTTACACAGATCTTTCAGTTGTTTC

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR2AW89TFB 140 0 0
GTGGACTATTAGGATAATTCTGAGGGAAGCTCATTATAGCGTTAAAGAATCCTCCTTCAT
AGAGAGTATCTGGAGGTCCGATGATGGTAACGTTCCACTCGAATATATTCTTCTCGTCGA
CGACCCCCGCGGAGAATCCA

QA 1 140 1 140
DS 

RD RR2BM07JQ 668 0 0
AACGAATACAAGTTTTTATCATTATGATAACCAGTTACTCAAGAATTCAACAACACATTT
CAGAAAGCTCTGCGCAAGAAAAATAAAAATGTAAAACCAGGTTGTGTTTGGGCAGTTTTT
TTGAAGGGTTTCAGATAAGGGGAACATGAAGAACTTTGATGAAACTCCAGAGAGATATCA
TAATTGTGGAAAAGTTCGTAGTTTGTTCACAACATTTCTTGAGACTTTCTCACACACCGG
CTAACTTTCTTCTTGAACTCGTCTCTCTTCTCACGCCATTCTTTAGCAGCTTCAACGTTT
GCAGGAGACTCATCGTTTGGACCAGAAAGCATAGATATAATACTCAACATAATACTTTCA
ACAGTATGAACAGGGGTCCAGCGCTCGCTAGCAAGCTCATAACCACTTGGATCATCACCA
GGAGGATGCAGGATCGAAATGCAAACACGACCATCAGAATAAACATTAGGATGCCACATA
TCTGAAGTAAACCTAACGGTTGGTGGACTATTAGGATAATTCTGAGGGAAGCTCATTATA
GCGTTAAAGAAACCTCCTTCATAGAGAGTATCTGGAGGTCCGATGATGGTAACGTTCCAC
TCGAATATATTCTTCTCGTCGACGAGCCCCGCGGAGAATCCATCAACAGGATGCTTACAC
AGATCTTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2BM07TF 755 0 0
AG
TTTTATCATTATGATAACCAGTTACTCAAGAATTCAACAACACATTTCAGAAAGCTCTGC
GCAAGAAAA*TAAAAATGTAAAACCAGGTTGTGTTTGGGCAGTTTTTT*GAAGGGTTTCA
GATAAGGGGAACATGAAGAACTTTGATGAAACTCCAGAGAGATATCATAATTGTGGAAAA
GTTCGTAGTTTGTTCACAACATTTCTTGAGACTTTCTCACACACCGGCTAACTTTCTTCT
TGAACTCGTCTCTCTTCTCACGCCATTCTTTAGCAGCTTCAACGTTTGCAGGAGACTCAT
CGTTTGGACCAGAAAGCATAGATATAATACTCAACATAATACTTTCAACAGTATGAACAG
GGGTCCAGCGCTCGCTAGCAAGCTCATAACCACTTGGATCATCACCAGGAGGATGCAGGA
TCGAAATGCAAACACGACCATCAGAATAAACATTAGGATGCCACATATCTGAAGTAAACC
TAACGGTTGGTGGACTATTAGGATAATTCTGAGGGAAGCTCATTATAGCGTTAAAGAAAC
CTCCTTCATAGAGAGTATCTGGAGGTCCGATGATGGTAACGTTCCACTCGAATATATTCT
TCTCGTCGACGAGCCCCGCGGAGAATCCATCAACAGGATGCTTACACAGATCTTTCAGTT
GTTTCTGAAGGAGAAGGATAGCTTGCGAATTCGAGGCCATGGACGATGATGATGGTGATA
GAGAAGATCGAGCTTGAAACTCTAGAGATTTCC

QA 3 755 3 755
DS 



AS 1 5

CO CL1132Contig1 667 5 2 U
GGCCATAACAGATTCCATTTCTTCCTTCATACCTTTCGAGATTTGATTTTGTTTTCATCG
GAGAAGAATGGGCGGAGACGGCAAAGTTTACACCTTGGCGGAGGTTTCTCAGCACACTAC
CGCCAAGGATTGCTGGATCGTCATCGATGGCAAGGTTTATGATGTGACAAAGTTCTTGGA
CGACCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTCAACAGGGAAAGACGCGACGGATGA
TTTTGAGGATGTTGGACACAGTTCGACTGCTAAAGCTATGCTAGATGAGTACTATGTGGG
TGATATTGACACAGCCACTGTCCCAGCCAAAACCAAGTTTGTTCCTCCTCCTCCTAAGCA
GACCGAGTCTAACCAGAACCAGAGCTCGGATTTCGTTGTTAAGATACTTCAGTTCCTTGT
TCCTCTTTTCATCTTGGGCTTGGCTCTCGGTATCCGTTCTTACACCAAGACTCCTTCTTC
TTGAGGACTCTCTATTGGGGTGGGTTCTTTGAGTGTTTTGTCCATTTTTATCTATCTGCC
TGTCTTGTAACACTTCAGATATTATATTCTTATTCAGTCAAGTGGATCTGTTTATGTTTG
AGACCTTTTTTGATTAAAGAATCAGCTACATTTGTTGTCTTATATCATATTATCATTTGC
ACAAGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS81JQ C 1
AF RR2AS81TF U 1
AF RR2BS41JQ C 36
AF RR2BS41TF U 36
AF RR2B504TF U 36
BS 1 629 RR2AS81TF
BS 630 667 RR2B504TF

RD RR2AS81JQ 629 0 0
GGCCATAACAGATTCCATTTCTTCCTTCATACCTTTCGAGATTTGATTTTGTTTTCATCG
GAGAAGAATGGGCGGAGACGGCAAAGTTTACACCTTGGCGGAGGTTTCTCAGCACACTAC
CGCCAAGGATTGCTGGATCGTCATCGATGGCAAGGTTTATGATGTGACAAAGTTCTTGGA
CGACCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTCAACAGGGAAAGACGCGACGGATGA
TTTTGAGGATGTTGGACACAGTTCGACTGCTAAAGCTATGCTAGATGAGTACTATGTGGG
TGATATTGACACAGCCACTGTCCCAGCCAAAACCAAGTTTGTTCCTCCTCCTCCTAAGCA
GACCGAGTCTAACCAGAACCAGAGCTCGGATTTCGTTGTTAAGATACTTCAGTTCCTTGT
TCCTCTTTTCATCTTGGGCTTGGCTCTCGGTATCCGTTCTTACACCAAGACTCCTTCTTC
TTGAGGACTCTCTATTGGGGTGGGTTCTTTGAGTGTTTTGTCCATTTTTATCTATCTGCC
TGTCTTGTAACACTTCAGATATTATATTCTTATTCAGTCAAGTGGATCTGTTTATGTTTG
AGACCTTTTTTGATTAAAGAATCAGCTAC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2AS81TF 629 0 0
GGCCATAACAGATTCCATTTCTTCCTTCATACCTTTCGAGATTTGATTTTGTTTTCATCG
GAGAAGAATGGGCGGAGACGGCAAAGTTTACACCTTGGCGGAGGTTTCTCAGCACACTAC
CGCCAAGGATTGCTGGATCGTCATCGATGGCAAGGTTTATGATGTGACAAAGTTCTTGGA
CGACCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTCAACAGGGAAAGACGCGACGGATGA
TTTTGAGGATGTTGGACACAGTTCGACTGCTAAAGCTATGCTAGATGAGTACTATGTGGG
TGATATTGACACAGCCACTGTCCCAGCCAAAACCAAGTTTGTTCCTCCTCCTCCTAAGCA
GACCGAGTCTAACCAGAACCAGAGCTCGGATTTCGTTGTTAAGATACTTCAGTTCCTTGT
TCCTCTTTTCATCTTGGGCTTGGCTCTCGGTATCCGTTCTTACACCAAGACTCCTTCTTC
TTGAGGACTCTCTATTGGGGTGGGTTCTTTGAGTGTTTTGTCCATTTTTATCTATCTGCC
TGTCTTGTAACACTTCAGATATTATATTCTTATTCAGTCAAGTGGATCTGTTTATGTTTG
AGACCTTTTTTGATTAAAGAATCAGCTAC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2BS41JQ 606 0 0
GG
GAGATTTGATTTTGTTTTCATCGGAGAAGAATGGGCGGAGACGGCAAAGTTTACACCTTG
GCGGAGGTTTCTCAGCACACTACCGCCAAGGATTGCTGGATCGTCATCGATGGCAAGGTT
TATGATGTGACAAAGTTCTTGGACGACCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTCA
ACAGGGAAAGACGCGACGGATGATTTTGAGGATGTTGGACACAGTTCGACTGCTAAAGCT
ATGCTAGATGAGTACTATGTGGGTGATATTGACACAGCCACTGTCCCAGCCAAAACCAAG
TTTGTTCCTCCTCCTCCTAAGCAGACCGAGTCTAACCAGAACCAGAGCTCGGATTTCGTT
GTTAAGATACTTCAGTTCCTTGTTCCTCTTTTCATCTTGGGCTTGGCTCTCGGTATCCGT
TCTTACACCAAGACTCCTTCTTCTTGAGGACTCTCTATTGGGGTGGGTTCTTTGAGTGTT
TTGTCCATTTTTATCTATCTGCCTGTCTTGTAACACTTCAGATATTATATTCTTATTCAG
TCAAGTGGATCTGTTTATGTTTGAGACCTTTTTTGATTAAAGAATCAGCTACATTTGTTG
TC
CG

QA 3 604 3 604
DS 

RD RR2BS41TF 606 0 0
GG
GAGATTTGATTTTGTTTTCATCGGAGAAGAATGGGCGGAGACGGCAAAGTTTACACCTTG
GCGGAGGTTTCTCAGCACACTACCGCCAAGGATTGCTGGATCGTCATCGATGGCAAGGTT
TATGATGTGACAAAGTTCTTGGACGACCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTCA
ACAGGGAAAGACGCGACGGATGATTTTGAGGATGTTGGACACAGTTCGACTGCTAAAGCT
ATGCTAGATGAGTACTATGTGGGTGATATTGACACAGCCACTGTCCCAGCCAAAACCAAG
TTTGTTCCTCCTCCTCCTAAGCAGACCGAGTCTAACCAGAACCAGAGCTCGGATTTCGTT
GTTAAGATACTTCAGTTCCTTGTTCCTCTTTTCATCTTGGGCTTGGCTCTCGGTATCCGT
TCTTACACCAAGACTCCTTCTTCTTGAGGACTCTCTATTGGGGTGGGTTCTTTGAGTGTT
TTGTCCATTTTTATCTATCTGCCTGTCTTGTAACACTTCAGATATTATATTCTTATTCAG
TCAAGTGGATCTGTTTATGTTTGAGACCTTTTTTGATTAAAGAATCAGCTACATTTGTTG
TC
CG

QA 3 604 3 604
DS 

RD RR2B504TF 632 0 0
GG
GAGATTTGATTTTGTTTTCATCGGAGAAGAATGGGCGGAGACGGCAAAGTTTACACCTTG
GCGGAGGTTTCTCAGCACACTACCGCCAAGGATTGCTGGATCGTCATCGATGGCAAGGTT
TATGATGTGACAAAGTTCTTGGACGACCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTCA
ACAGGGAAAGACGCGACGGATGATTTTGAGGATGTTGGACACAGTTCGACTGCTAAAGCT
ATGCTAGATGAGTACTATGTGGGTGATATTGACACAGCCACTGTCCCAGCCAAAACCAAG
TTTGTTCCTCCTCCTCCTAAGCAGACCGAGTCTAACCAGAACCAGAGCTCGGATTTCGTT
GTTAAGATACTTCAGTTCCTTGTTCCTCTTTTCATCTTGGGCTTGGCTCTCGGTATCCGT
TCTTACACCAAGACTCCTTCTTCTTGAGGACTCTCTATTGGGGTGGGTTCTTTGAGTGTT
TTGTCCATTTTTATCTATCTGCCTGTCTTGTAACACTTCAGATATTATATTCTTATTCAG
TCAAGTGGATCTGTTTATGTTTGAGACCTTTTTTGATTAAAGAATCAGCTACATTTGTTG
TCTTATATCATATTATCATTTGCACAAGTT

QA 3 632 3 632
DS 



AS 1 7

CO CL1133Contig1 707 7 5 U
GGGGCAGCAGCTTGAGAAAAGGAGGAAGAAGAGGAGCAGCAGCAGAAACACGCCACCATG
GTTCTCAAGACGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGTATC
AGATTCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTAC
TTCCATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCAC
AAGAAGGATGCAGCTCAAGAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCTTAC
TCAAGGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCT
GAAGTTCGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAG
ACCAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAAGCTGAATTTGCCTCAAAGCAACAGAAGATTCAG
GCTAAGGTCCCCAAGGCTGCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAA
CGCTGAAGAGCCCAAAGCCATTTTATCTTTACTCTTTTGTTAGTTATATGTTGAGCTCGG
AATATTCTGCCCAACGTAAACCTTTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTACTTTTTGCAACTC
GTAATCCCGGACTTGAGAATTTTGGTGCTTATCAACTTCATTTCACC


BQ
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 30 

AF RR2AQ42JQ C 1
AF RR2C321JQ C 332
AF RR2C321TF U 393
AF RR2F190JQ C 1
AF RR2GC26TF U 2
AF RR2F190TF U 1
AF RR2AQ42TF U 1
BS 1 1 RR2F190TF
BS 2 372 RR2GC26TF
BS 373 373 RR2F190TF
BS 374 392 RR2GC26TF
BS 393 707 RR2C321TF

RD RR2AQ42JQ 707 0 0
GGGGCAGCAGCTTGAGAAAAGGAGGAAGAAGAGGAGCAGCAGCAGAAACACGCCGTCATG
GTTCTCAAGACGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGTATC
AGATTCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTAC
TTCCATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCAC
AGGAAGGATGCAGCTCAAGAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCTTAC
TCAAGGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCT
GAAGTTCGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAG
ACCAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAAGCTGAATTTGCCTCAAAGCAACAGAAGATTCAG
GCTAAGGTCCCCAAGGCTGCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAA
CGCTGAAGAGCCCAAAGCCATTTTATCTTTACTCTTTTGTTAGTTATATGTTGAGCTCGG
AATATTCTGCCCAACGAAAACCTTTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTACTTTTTGCAACTC
GTAATCCCGGACTTGAGAATTTTGGTGCTTATCAACTTCATTTCACC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2C321JQ 376 0 0
G
GATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCT
CCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACCAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAAGCTGA
ATTTGCCTCAAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGGTCCCCAAGGCTGCTGCAAAGGGAGG
TCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGCTGAAGAGCCCAAAGCCATTTTATCTTTAC
TCTTTTGTTAGTTATATGTTGAGCTCGGAATATTCTGCCCAACGTAAACCTTTTGTTGTT
GCCGTTTGTCTTTTACTTTTTGCAACTCGTAATCCCGGACTTGAGAATTTTGGTGCTTAT
CAACTTCATTTCACC

QA 2 376 2 376
DS 

RD RR2C321TF 315 0 0
CCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACCAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAAGCTGA
ATTTGCCTCAAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGGTCCCCAAGGCTGCTGCAAAGGGAGG
TCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAACGCTGAAGAGCCCAAAGCCATTTTATCTTTAC
TCTTTTGTTAGTTATATGTTGAGCTCGGAATATTCTGCCCAACGTAAACCTTTTGTTGTT
GCCGTTTGTCTTTTACTTTTTGCAACTCGTAATCCCGGACTTGAGAATTTTGGTGCTTAT
CAACTTCATTTCACC

QA 1 315 1 315
DS 

RD RR2F190JQ 706 0 0
GGGGCAGCAGCTTGAGAAAAGGAGGAAGAAGAGGAGCAGCAGCAGAAACACGCCACCATG
GTTCTCAAGACGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGTATC
AGATTCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTAC
TTCCATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACGGAAAGCAGCAC
AAGAAGGATGCAGCTCAAGAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCTTAC
TCAAGGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCTT
GAAGTTTGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAG
ACCAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAAGCTGAATTTGCCTCAAAGCAACAGAAGATTCAG
GCTAAGGTCCCCAAGGCTGCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAA
CGCTGAAGAGCCCAAAGCCATTTTATCTTTACTCTTTTGTTAGTTATATGTTGAGCTCGG
AATATTCTGCCCAACGTAAACCTTTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTACTTTTTGCAACTC
GTAATCCCGGACTTGAGAATTTTGGTGCTTATCAACTTCATTTCAC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2GC26TF 703 0 0
GGGCAGCAGCTTGAGAAAAGGAGGAAGAAGAGGAGCAGCAGCAGAAACACGCCACCATGG
TTCTCAAGACGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGTATCA
GATTCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACT
TCCATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACA
AGAAGGATGCAGCTCAAGAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCTTACT
CAAGGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTG
AAGTTCGTGATACCGCAAGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGA
CCAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAAGCTGAATTTGCCTCAAAGCAACAGAAGATTCAGG
CTAAGGTCCCCAAGGCTGCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAAC
GCTGAAGAGCCCAAAGCCATTTTATCTTTACTCTTTTGTTAGTTATATGTTGAGCTCGGA
ATATTCTGCCCAACGTAAACCTTTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTACTTTTTGCAACTCG
TAATCCCGGACTTGAGAATTTTGGTGCTTATCAACTTCATTTC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2F190TF 706 0 0
GGGGCAGCAGCTTGAGAAAAGGAGGAAGAAGAGGAGCAGCAGCAGAAACACGCCACCATG
GTTCTCAAGACGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGTATC
AGATTCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTAC
TTCCATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACGGAAAGCAGCAC
AAGAAGGATGCAGCTCAAGAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCTTAC
TCAAGGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCTT
GAAGTTTGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAG
ACCAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAAGCTGAATTTGCCTCAAAGCAACAGAAGATTCAG
GCTAAGGTCCCCAAGGCTGCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAA
CGCTGAAGAGCCCAAAGCCATTTTATCTTTACTCTTTTGTTAGTTATATGTTGAGCTCGG
AATATTCTGCCCAACGTAAACCTTTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTACTTTTTGCAACTC
GTAATCCCGGACTTGAGAATTTTGGTGCTTATCAACTTCATTTCAC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2AQ42TF 707 0 0
GGGGCAGCAGCTTGAGAAAAGGAGGAAGAAGAGGAGCAGCAGCAGAAACACGCCGTCATG
GTTCTCAAGACGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGTATC
AGATTCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTAC
TTCCATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCAC
AGGAAGGATGCAGCTCAAGAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCTTAC
TCAAGGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCT
GAAGTTCGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAG
ACCAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAAGCTGAATTTGCCTCAAAGCAACAGAAGATTCAG
GCTAAGGTCCCCAAGGCTGCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGTGGTGGTGGCAAA
CGCTGAAGAGCCCAAAGCCATTTTATCTTTACTCTTTTGTTAGTTATATGTTGAGCTCGG
AATATTCTGCCCAACGAAAACCTTTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTACTTTTTGCAACTC
GTAATCCCGGACTTGAGAATTTTGGTGCTTATCAACTTCATTTCACC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 3 7

CO CL1134Contig1 1066 3 6 U
AGGGAAAAAAATAATATTCAATTGAGAAATGTTTTGATAAGTTACAAAAAAATAGAGACA
AACACCAAATGACTAACAAGATAGATATACATCATTTTGTTTATACTTTTATTCAAAGAC
AAAGAAGAATAACAGAAAGCACAAAGTTTGAGAGAGAGATAAAATACACAAAAAAACAAA
AAAGAAGATCCCACATAAGATAATCACATAACTATCTCTGGCTTCAAGATGTTGGATTTG
ATCTCCTTGTGTGGCAAAACAACCCCTCCATTGGTGTATATCTCATCCCCAACATGAACA
TCTTCCCCCAAGATCGTCATGTTCTCAATCCTAGCCCACTGCCCAACCGTTGAGTGCCAC
CCCACGATACTGCTCGAGATACACGCATGCTTCTTGATCCTTGCCCCACGCATGACCGTG
CACCGTGAAAGCCTCACCCCTGACTCAACAACGCATCCTGGACCAATGGCCACGTCAGGT
CCTATCAAACACCCTTCCCCAATCTTAGCGGTTTCATCCACCAGAACGTTCCCAACGATG
TGTGCACCAGTGGTTAGCTTGGCAGGAGACTTCTTCCTCAGAGAGTCTAAGTAGAGTCTC
AGGCCCGTTATGTAGTCCTTGGGTTGTCCAATGTCCATCCAGAATCCAGGTAGCACCATG
GCGTAGAGCCCTTGAGCTGCTGCAATCTTGGGGAAGGTCTCTTTCTCGATTGATGTTGGT
CTTAGCTCAATCTTGTCGAGAACCGATGGGTTCAGAAGGTAAATCCCAGCGTTGATCTTG
TTGCCTACAAACAGTTTTGGCTTCTCCACAAACTTCTCAACTTTTCCTGTAGCTTCATCC
ATGACAACAACTCCATACTTGGACGGTTCATCAACCTTTGTCACCATAATGGAGGCTTCT
CCACCGTGAGCTTTGTGAAACTCAATCATCTCTTTGAGAGGGTACTCACTAATCACATCA
CTGTTGAGGACAAAGAAGGGCTCTCCAGATCCATCAACCAGTTTGTCTCTAGCTAGAGCC
AGAGGACCAGCCGTACCCATAGGCTCAGTCTCTTGTGAGCAAGTGC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G962JQ U 1
AF RR2CI95JQ U 1
AF RR2CI95TF C 358
BS 1 51 RR2CI95JQ
BS 52 52 RR2G962JQ
BS 53 157 RR2CI95JQ
BS 158 159 RR2G962JQ
BS 160 743 RR2CI95JQ
BS 744 1066 RR2CI95TF

RD RR2G962JQ 375 0 0
GAAA
AAAATAATAATATTCAATTGAGAAATGTTTTGATAAGTTACAAAAAAATAGAGACAAACA
CCAAATGACTAACAAGATAGATATACATCATTTTGTTTATACTTTTATTCAAAGCCATAG
AAGAATAACAGAAA*CACAAAGTTTGAGAGAGAGATAAAATACACAAAAAA*CAAAAAAG
AA*ATCCCACATAAGATAATCACATAACTATCTCTGGCTTCAAGATGTTGGATTTGATCT
CCTTGTGTGGCAAAACAACCCCTCCATTGGTGTATATCTCATCCCCAACATGAACATCTT
CCCCCAAGATCGTCATGTTCTCAATCCTAGCCCACTGCCCAACCGTTGAGTGCCACCCTA
CGATACTGCTC

QA 5 375 5 375
DS 

RD RR2CI95JQ 743 0 0
AGGGAAAAAAATAATATTCAATTGAGAAATGTTTTGATAAGTTACAAAAAA*TAGAGACA
AACACCAAATGACTAACAAGATAGATATACATCATTTTGTTTATACTTTTATTCAAAGAC
AAAGAAGAATAACAGAAAGCACAAAGTTTGAGAGAGA**TAAAATACACAAAAAAACAAA
AAAGAAGATCCCACATAAGATAATCACATAACTATCTCTGGCTTCAAGATGTTGGATTTG
ATCTCCTTGTGTGGCAAAACAACCCCTCCATTGGTGTATATCTCATCCCCAACATGAACA
TCTTCCCCCAAGATCGTCATGTTCTCAATCCTAGCCCACTGCCCAACCGTTGAGTGCCAC
CCCACGATACTGCTCGAGATACACGCATGCTTCTTGATCCTTGCCCCACGCATGACCGTG
CACCGTGAAAGCCTCACCCCTGACTCAACAACGCATCCTGGACCAATGGCCACGTCAGGT
CCTATCAAACACCCTTCCCCAATCTTAGCGGTTTCATCCACCAGAACGTTCCCAACGATG
TGTGCACCAGTGGTTAGCTTGGCAGGAGACTTCTTCCTCAGAGAGTCTAAGTAGAGTCTC
AGGCCCGTTATGTAGTCCTTGGGTTGTCCAATGTCCATCCAGAATCCAGGTAGCACCATG
GCGTAGAGCCCTTGAGCTGCTGCAATCTTGGGGAAGGTCTCTTTCTCGATTGATGTTGGT
CTTAGCTCAATCTTGTCGAGAAC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2CI95TF 709 0 0
CACCCCACGATACTGCTCGAGATACACGCATGCTTCTTGATCCTTGCCCCACGCATGACC
GTGCACCGTGAAAGCCTCACCC*TGACTCAACAACGCATCCTGGACCAATGGCCACGTCA
GGTCCTATCAAACACCCTTCCCCAATCTTAGCGGTTTCATCCACCAGAACGTTCCCAACG
ATGTGTGCACCAGTGGTTAGCTTGGCAGGAGACTTCTTCCTCAGAGAGTCTAAGTAGAGT
CTCAGGCCCGTTATGTAGTCCTTGGGTTGTCCAATGTCCATCCAGAATCCAGGTAGCACC
ATGGCGTAGAGCCCTTGAGCTGCTGCAATCTTGGGGAAGGTCTCTTTCTCGATTGATGTT
GGTCTTAGCTCAATCTTGTCGAGAACCGATGGGTTCAGAAGGTAAATCCCAGCGTTGATC
TTGTTGCCTACAAACAGTTTTGGCTTCTCCACAAACTTCTCAACTTTTCCTGTAGCTTCA
TCCATGACAACAACTCCATACTTGGACGGTTCATCAACCTTTGTCACCATAATGGAGGCT
TCTCCACCGTGAGCTTTGTGAAACTCAATCATCTCTTTGAGAGGGTACTCACTAATCACA
TCACTGTTGAGGACAAAGAAGGGCTCTCCAGATCCATCAACCAGTTTGTCTCTAGCTAGA
GCCAGAGGACCAGCCGTACCCATAGGCTCAGTCTCTTGTGAGCAAGTGC

QA 1 709 1 709
DS 



CO CL1134Contig2 703 2 3 U
GAAAAAAAATAATATTCAATTGAGAATTGTTTTTATAAGTTACAAAAAAAATAGAGACAA
ACACCAAATGACTAACAAGATAGATATACATCATTTTTGTTTATACTTTTATTCAAAGCC
AAAGAAGAAAACAGAAAGCACAAAGTTTGAGAGAGAGAAAAAATACACAAAAAACAAAAA
AGAAGATCCCACATAGATAATCACATAACTATCTCTGGCTTCAAGATGTTGGATTTGATC
TCCTTGTGTGGCAAAACAACTCCTCCATTGGTGTATATCTCATCCCCAACATGAACATCT
TCCCCCAAGATCGTCATGTTCTCAATCCTAGCCCACTGCCCAACCGTTGAGTGCCACCCT
ACGATACTGCTCGAGATACACGCATGCTTCTTGATCCTTGCCCCACGCATGACCGTGCAC
CGTGAAAGCCTCACCCCTGACTCAACAACGCATCCTGGACCAATGGCCACCTCTGGTCCT
ATCAAACACCCTTCCCCAATCTTAGCGGTTTCATCCACCAAAAAATTCCCAACAATGTGT
GCACCAGTGGTTAGCTTGGCAGGAGATTTCTTCCTCAGAGAATCTAAGTAGAGTCTCAGG
CCCGTTATGTAGTCCTTGGGTTGTCCAATGTCCATCCAGAATCCAGGTAGCACCATGGCG
TAGAGCCCTTGAGCTGCTGCAATCTTGGGGAAGGTCTCTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK09JQ U 386
AF RR2CQ08JQ U 1
BS 1 470 RR2CQ08JQ
BS 471 471 RR2EK09JQ
BS 472 703 RR2CQ08JQ

RD RR2EK09JQ 126 0 0
GCTTCTTGATCCTTGCCCCACGCATGACCGTGCACCGTGAAAGCCTCACCCCTGACTCAA
CAACGCATCCTGGACCAATGGCCACCTTTGGTCCTATCAAACACCCTTCCCCAATCTTAG
CGGTTT

QA 1 126 1 126
DS 

RD RR2CQ08JQ 703 0 0
GAAAAAAAATAATATTCAATTGAGAATTGTTTTTATAAGTTACAAAAAAAATAGAGACAA
ACACCAAATGACTAACAAGATAGATATACATCATTTTTGTTTATACTTTTATTCAAAGCC
AAAGAAGAAAACAGAAAGCACAAAGTTTGAGAGAGAGAAAAAATACACAAAAAACAAAAA
AGAAGATCCCACATAGATAATCACATAACTATCTCTGGCTTCAAGATGTTGGATTTGATC
TCCTTGTGTGGCAAAACAACTCCTCCATTGGTGTATATCTCATCCCCAACATGAACATCT
TCCCCCAAGATCGTCATGTTCTCAATCCTAGCCCACTGCCCAACCGTTGAGTGCCACCCT
ACGATACTGCTCGAGATACACGCATGCTTCTTGATCCTTGCCCCACGCATGACCGTGCAC
CGTGAAAGCCTCACCCCTGACTCAACAACGCATCCTGGACCAATGGCCACGTCTGGTCCT
ATCAAACACCCTTCCCCAATCTTAGCGGTTTCATCCACCAAAAAATTCCCAACAATGTGT
GCACCAGTGGTTAGCTTGGCAGGAGATTTCTTCCTCAGAGAATCTAAGTAGAGTCTCAGG
CCCGTTATGTAGTCCTTGGGTTGTCCAATGTCCATCCAGAATCCAGGTAGCACCATGGCG
TAGAGCCCTTGAGCTGCTGCAATCTTGGGGAAGGTCTCTTTCT

QA 1 703 1 703
DS 



CO CL1134Contig3 739 2 13 U
GGGATTTGCCAACAAAACTCTTTCCTTTCCTCGTCATCCCAGCTCAGCCTGACCCCCAAC
TCTCTCTTTCCGATCTCAGATCTCTCGATCCCGTGAGATCTCTTCTTCCAAGGAATTGAA
AAAGTGTAGTTTGAGTCCTAGAAGATGAAGGCTCTCATTCTTGTTGGAGGGTTCGGGACT
CGCTTGAGACCATTGACTCTCAGCTTCCCAAAGCCCCTTGTTGACTTTGCCAACAAACCC
ATGATCCTTCATCAGATAGAAGCGCTCAAGCCAGTTGGAGTTGATGAAGTGGTTTTGGCC
ATCAATTACCAACCAGAGGTGATGCTTAACTTCTTGAAAGACTTTGAGGCAAAGCTCGAA
ATCAAAATCACTTGCTCACAAGAGACTGAGCCTATGGGTACGGCTGGTCCTCTGGCTCTA
GCTAGAGACAAACTGGTTGATGGATCTGGCGAGCCCTTCTTTGTCCTCAACAGTGATGTG
ATTAGTGAGTACCCTCTCAGAGAGATGATTGAGTTTCACAAAGCTCACGGTGGTGAAGCC
TCCATCATGGTGACAAAGGTTGATGAACCGTCCAAGTATGGAGTGGTTGTGAAGGATGAA
ACTACAGGAAAAGTTGAGAAGTTTGTGGAGAAGCCAAAACTGTTTGTAGGCAACAAGATC
AACGCTGGGATTTACCTTCTGAACCCATCTGTTCTCGACAAGATTGAGCTAAGACCAACC
TCAATCGAGAAGAGACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ08TF U 1
AF RR2CL36TF U 28
BS 1 230 RR2CQ08TF
BS 231 231 RR2CL36TF
BS 232 592 RR2CQ08TF
BS 593 593 RR2CL36TF
BS 594 649 RR2CQ08TF
BS 650 652 RR2CL36TF
BS 653 700 RR2CQ08TF
BS 701 701 RR2CL36TF
BS 702 711 RR2CQ08TF
BS 712 712 RR2CL36TF
BS 713 715 RR2CQ08TF
BS 716 716 RR2CL36TF
BS 717 739 RR2CQ08TF

RD RR2CQ08TF 739 0 0
GGGATTTGCCAACAAAACTCTTTCCTTTCCTCGTCATCCCAGCTCAGCCTGACCCCCAAC
TCTCTCTTTCCGATCTCAGATCTCTCGATCCCGTGAGATCTCTTCTTCCAAGGAATTGAA
AAAGTGTAGTTTGAGTCCTAGAAGATGAAGGCTCTCATTCTTGTTGGAGGGTTCGGGACT
CGCTTGAGACCATTGACTCTCAGCTTCCCAAAGCCCCTTGTTGACTTTGCTAACAAACCC
ATGATCCTTCATCAGATAGAAGCGCTCAAGCCAGTTGGAGTTGATGAAGTGGTTTTGGCC
ATCAATTACCAACCAGAGGTGATGCTTAACTTCTTGAAAGACTTTGAGGCAAAGCTCGAA
ATCAAAATCACTTGCTCACAAGAGACTGAGCCTATGGGTACGGCTGGTCCTCTGGCTCTA
GCTAGAGACAAACTGGTTGATGGATCTGGCGAGCCCTTCTTTGTCCTCAACAGTGATGTG
ATTAGTGAGTACCCTCTCAGAGAGATGATTGAGTTTCACAAAGCTCACGGTGGTGAAGCC
TCCATCATGGTGACAAAGGTTGATGAACCGTCCAAGTATGGAGTGGTTGTGATGGATGAA
ACTACAGGAAAAGTTGAGAAGTTTGTGGAGAAGCCAAAACTGTTTGTAG**CACAAGATC
AACGCTGGGATTTACCTTCTGAACCCATCTGTTCTCGACA*GATTGAGCTA*GAC*AACC
TCAATCGAGAAGAGACTTC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2CL36TF 708 0 0
GG
CTCGTCATCCCAGCTCAGCCTGATCCCCAACTCTCTCTTTCCGATCTCAGATCTCTCGAT
CCCGTGAGATCTCTTCTTCCAAGGAATTGAAAAAGTGTAGTTTGAGTCCTAGAAGATGAA
GGCTCTCATTCTTGTTGGAGGGTTCGGGACTCGCTTGAGACCATTGACTCTCAGCTTCCC
AAAGCCCCTTGTTGACTTTGCCAACAAACCCATGATCCTTCATCAGATAGAAGCGCTCAA
GGCAGTTGGAGTTGATGAAGTGGTTTTGGCCATCAATTACCAACCAGAGGTGATGCTTAA
CTTCTTGAAAGACTTTGAGGCAAAGCTCGAAATCAAAATCACTTGCTCACAAGAGACTGA
GCCTATGGGTACGGCTGGTCCTCTGGCTCTAGCTAGAGACAAACTGGTTGATGGATCTGG
CGAGCCCTTCTTTGTCCTCAACAGTGATGTGATTAGTGAGTACCCTCTCAGAGAGATGAT
TGAGTTTCACAAAGCTCACGGTGGTGAAGCCTCCATTATGGTGACAAAGGTTGATGAACC
GTCCAAGTATGGAGTGGTTGTGAAGGATGAAACTACAGGAAAAGTTGAGAAGTTTGTGGA
GAAGCCAAAACTGTTTGTAGGCAACAAGATCAACGCTGGGATTTACCTTCTGAACCCATC
TGTTCTCGACAAGATTGAGCTAAGACCAACCTCAATCGAGAA
AGAG

QA 3 704 3 704
DS 



AS 1 6

CO CL1135Contig1 937 6 7 U
GGAGGGCTTCTCCGACCAAACAATCATTTGAGAGCGAAGAAGAAGAAGAAACTTGGGAGA
TGGCGATACCGCTGGGCATGGCGACGTATCTGATGAGGATGGTTTGGTTTTCTCTGAGCG
GTTGGGTCTTCACTTGTTTGTCTATCGCCGACGAGATCGCTGGTTCTCTTAGAAACGGAG
ATATTGGTCCTTTCCATGTCGGATGAATCGATATCTTTAGCTCTCCTTCTGTTAGATATG
CGTATATGTTCTTACTCAATTTAAAGTTTCGTTTTTTTTTT*GATCCGTTGTTGTTTTCG
ATCAGAGTCTCTTTTGAGACTCTTATAATTTGATACTAGTTAATGTTAATAGATGGTTAA
GATTTAGATCAAGTTTGTGGATGTGTTATATGTCTCAGCCGCTAAGTGTGCCTAGGTGTG
ACTAGTGTTTTGCTTCCTATATGAGACTTGATGATGCTTTTTTGTGTTCTTGTGTTTATA
GAAAGTATGTCGAGGACCGTGATCATTTGTATTCAGATAATTTCTCTGGTGATATGATCA
CCATAAGCTTTAACAGCTTTTGGATGAGTTTCAAGACATAAGTGATGATGAACTCTTTTT
AAGTTCTGTAACAAAGCTTTCTTTGAGATTATGTATTTATTTATCTCAACAATATCCCTT
TTTTTTGGCTCCTTAGCTTGCTTAGTAGGTTGAACAAACACGTTTTGCACTCAGGCCTTT
TTGATTTTCAGGAAAGGGTTTATAACTGCAACCAATCTGCAGGGAACAAAAGAACTTATG
TCATCTTGATTTGATGTCAAATCTCCTCAGCCAAGAGCGGAGCAGAGCAAAGCATGGCTA
CAGAGAATAGATTCCATAGTTTTACCATTTTTTTCCAACACGGTTTTGTTTGATTCAACC
AAACCATTTTGAATCATATTCCATATATTTTATCAAT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F588JQ C 1
AF RR2F588TF U 1
AF RR2GC42JQ C 206
AF RR2GC42TF U 2
AF RR2G327TF U 28
AF RR2BU89JQ C 231
BS 1 1 RR2F588JQ
BS 2 281 RR2F588TF
BS 282 282 RR2GC42TF
BS 283 462 RR2F588TF
BS 463 577 RR2GC42TF
BS 578 599 RR2G327TF
BS 600 937 RR2BU89JQ

RD RR2F588JQ 462 0 0
GGAGGGCTTTTCCGACCAAACAATCATTTGAGAGCGAAGAAGAAGAAGAAACTTGGGAGA
TGGCGATACCGCTGGGCATGGCGACGTATTTGATGAGGATGGTTTGGTTTTCTTTGAGCG
GTTGGGTCTTCACTTGTTTGTCTATCGCCGACGAGATCGCTGGTTTTTTTAGAAACGGAG
ATATTGGTCCTTTCCATGTCGGATGAATCGATATCTTTAGCTCTCCTTCTGTTAGATATG
CGTATATGTTCTTACTCAATTTAAAGTTTCGTTTTTTTTTTTGATCCGTTGTTGTTTTCG
ATCAGAGTCTCTTTTGAGACTCTTATAATTTGATACTAGTTAATGTTAATAGATGGTTAA
GATTTAGATCAAGTTTGTGGATGTGTTATATGTCTCAGCCGCTAAGTGTGCCTAGGTGTG
ACTAGTGTTTTGCTTCCTATATGAGACTTGATGATGCTTTTT

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2F588TF 462 0 0
G
GAGGGCTTCTCCGACCAAACAATCATTTGAGAGCGAAGAAGAAGAAGAAACTTGGGAGAT
GGCGATACCGCTGGGCATGGCGACGTATCTGATGAGGATGGTTTGGTTTTCTCTGAGCGG
TTGGGTCTTCACTTGTTTGTCTATCGCCGACGAGATCGCTGGTTCTCTTAGAAACGGAGA
TATTGGTCCTTTCCATGTCGGATGAATCGATATCTTTAGCTCTCCTTCTGTTAGATATGC
GTATATGTTCTTACTCAATTTAAAGTTTCGTTTTTTTTTTTGATCCGTTGTTGTTTTCGA
TCAGAGTCTCTTTTGAGACTCTTATAATTTGATACTAGTTAATGTTAATAGATGGTTAAG
ATTTAGATCAAGTTTGTGGATGTGTTATATGTCTCAGCCGCTAAGTGTGCCTAGGTGTGA
CTAGTGTTTTGCTTCCTATATGAGACTTGATGATGCTTTTT

QA 2 462 2 462
DS 

RD RR2GC42JQ 317 0 0
AATCGATATCTTTAGCTCTCCTTTTGTTAGATATGGGTATATGTTTTTACTCAATTTAAA
GTTTCGTTTTTTTTTT*GATCCGTTGTTGTTTTCGATCAGAGTTTCTTTTGAGACTTTTA
TAATTTGATACTAGTTAATGTTAATAGATGGTTAAGATTTAGATCAAGTTTGTGGATGTG
TTATATGTTTCAGCCGCTAAGTGTGCCTAGGTGTGACTAGTGTTTTGCTTCCTATATGAG
ACTTGATGATGCTTTTTTGTGTTCTTGTGTTTATAGAAAGTATGTCGAGGACCGTGATCA
TTTGTATTCAGATAATT

QA 1 317 1 317
DS 

RD RR2GC42TF 576 0 0
GAGGGCTTCTCCGACCAAACAATCATTTGAGAGCGAAGAAGAAGAAGAAACTTGGGAGAT
GGCGATGCCGCTGGGCATGGCGACGTATCTGATGAGAATGGTTTGGTTTTCTCTGAGCGG
TTGGGTCTTCACTTGTTTGTCTATCGCCGACGAGATCGCTGGTTCTCTTAGAAACGGAGA
TATTGGCCCTTTCCATGTCGGATGAATCGATATCTTTAGCTCTCCTTCTGTTAGATATGC
GTATATGTTCTTACTCAATTTAAAGTTTCGTTTTTTTTTT*GATCCGTTGTTGTTTTCGA
TCAGAGTCTCTTTTGAGACTCTTATAATTTGATACTAGTTAATGTTAATAGATGGTTAAG
ATTTAGATCAAGTTTGTGGATGTGTTATATGTCTCAGCCGCTAAGTGTGCCTAGGTGTGA
CTAGTGTTTTGCTTCCTATATGAGACTTGATGATGCTTTTTTGTGTTCTTGTGTTTATAG
AAAGTATGTCGAGGACCGTGATCATTTGTATTCAGATAATTTCTCTGGTGATATGATCAC
CATAAGCTTTAACAGCTTTTGGATGAGTTTCAAGAC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2G327TF 572 0 0
GG
GAGAGCGAAGAAGAAGAAGAAACTTGGGAGATGGCGATGCCGCTGGGCATGGCGACGTAT
CTGATGAGAATGGTTTGGTTTTCTCTGAGCGGTTGGGTCTTCACTTGTTTGTCTATCGCC
GACGAGATCGCTGGTTCTCTTAGAAACGGAGATATTGGTCCTTTCCATGTCGGATGAATC
GATATCTTTAGCTCTCCTTCTGTTAGATATGCGTATATGTTCTTACTCAATTTAAAGTTT
CGTTTTTTTTTT*GATCCGTTGTTGTTTTCGATCAGAGTCTCTTTTGAGACTCTTATAAT
TTGATACTAGTTAATGTTAATAGATGGTTAAGATTTAGATCAAGTTTGTGGATGTGTTAT
ATGTCTCAGCCGCTAAGTGTGCCTAGGTGTGACTAGTGTTTTGCTTCCTATATGAGACTT
GATGATGCTTTTTTGTGTTCTTGTGTTTATAGAAAGTATGTCGAGGACCGTGATCATTTG
TATTCAGATAATTTCTCTGGTGATATGATCACCATAAGCTTTAACAGCTTTTGGATGAGT
TTCAAGACATAAGTGATGATGAACTCTTTT

QA 3 572 3 572
DS 

RD RR2BU89JQ 707 0 0
GTTAGATATGCGTATATGTTCTTTCTCAATTTAAAGTTTCGTTTTTTTTT**GATCCGTT
GTTGTTTTCGATCAGAGTCTCTTTTGAGACTCTTATAATTTGATACTAGTTAATGTTAAT
AGATGGTTAAGATTTAGATCAAGTTTGTGGATGTGTTATATGTCTCAGCCGCTAAGTGTG
CCTAGGTGTGACTAGTGTTTTGCTTCCTATATGAGACTTGATGATGCTTTTT*GTGTTCT
TGTGTTTATAGAAAGTATGTCGAGGACCGTGATCATTTGTATTCAGATAATTTCTCTGGT
GATATGATCACCATAAGCTTTAACAGTTTTTGGATGAGTTTCAAGACATAAGTGATGATG
AACTCTTTTTAAGTTCTGTAACAAAGCTTTCTTTGAGATTATGTATTTATTTATCTCAAC
AATATCCCTTTTTTTTGGCTCCTTAGCTTGCTTAGTAGGTTGAACAAACACGTTTTGCAC
TCAGGCCTTTTTGATTTTCAGGAAAGGGTTTATAACTGCAACCAATCTGCAGGGAACAAA
AGAACTTATGTCATCTTGATTTGATGTCAAATCTCCTCAGCCAAGAGCGGAGCAGAGCAA
AGCATGGCTACAGAGAATAGATTCCATAGTTTTACCATTTTTTTCCAACACGGTTTTGTT
TGATTCAACCAAACCATTTTGAATCATATTCCATATATTTTATCAAT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 5

CO CL1136Contig1 1317 5 14 U
GGCATTTTTGTTTGCACCTAGTTTCATTTGGAAGTGAAAGGAATACACAAACAAACTAAA
GTAAATGCAAATTAAAAAAATTCTGCTTTTATTGGAATGAAATCTAAGTAAAAAAATTCA
ATATTAAAACTTTTTTTAACAGTTTCCTTTCTTCTTCTTCTTGTCCTCTCGGCCTGAGAT
TCTCACATCGTGTTGGCTTATTCAGCAACCAAATACAAGTGGCTAAGCAAAACCAGTGCC
TAGACTTTTCTTGAAAATCTTAAACCTCCTTGACAGAAGTCCCTTCACTTCCTCCAATAA
CAGCATCATCTGGGATGTAGCGTTTCCAGAAGGGATGCTGCTTCCACACTCTTCCCATTT
CTTCAATAGGAACCCCTTTTGTCTCCGGAAACAAGAAGTAGATGAAGATCGTCATGATCA
GGACCATTCCTCCAAAGAAGTAGAAGAGACCAAACTTCATGTGACAAAGCATCGTTAAAA
AGAATTGTCCAATGAGGAAAGTGAAGAACATGTTGACAGAAACATTGACGGCTTGTCCCG
CTGGTCTGATTTCCAAAGGACAGATCTCACTTGGTACTAACCATCCTAATGGACCCCATG
ACCATGCAAACCCTGCAACGTATATGCATATGAAAGCTAGGACCCAATTTGCTGTTGCAG
GTGTCAAGGTCCCTGATCCTGTGGTACCAAAATTCATACCAATCAAAGTACCAACAATGA
TCTGGCAAATGATCATTTGAATGCCACCTTCGAGGAAGAGAATCCTTCTTCCATACATGT
CAACCGCATAGATGGAGACAAGGGTAGAGACAACGTTCACCACACCGGTGATGACCGCAG
AGATGAGCGAGGCATCATCAGCGAAACCGAGAGTTCTAAAGAGAACAGGAGCGTAGAA*C
ATGATCACATTGATACCGGTGAACTGCTGGAAGAAAGGTATCGCAGAACAGAAAGCAAGA
GCAGGTCGGTATTTAGCTTGTAGGAAAAGGTTCTTCCAAGGGTGTTCCACTTTTTTAGCA
GCCTCACAAGCATCACAAAGATCTTGAAACTCCTCGTCGACGTTGTCAGCTCCACGGATC
TTTTGTAACATCGCTCTCGCTTGTTCATACTTACCTCTCTCGAGCATTGAGTTTGGCGTG
TCTGGCAAGACAAAAGATCCTATGACCATTACAACTGCTGGAACAGCAGCTAGACCTAAA
GACACTCTCCATCCGTTCTTTGCCGTTTGAGATGTTCCATAGTTAATCAGGTTTGCAATC
AGAATCCCGATAGTTATAGCCATTTGGAATCCGATGTTGAGTGCTCCTCTGATCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO58JQ U 45
AF RR2GP36JQ U 1
AF RR2B929JQ U 77
AF RR2GP36TF C 203
AF RR2B929TF C 414
BS 1 63 RR2GP36JQ
BS 64 64 RR2GO58JQ
BS 65 74 RR2GP36JQ
BS 75 75 RR2GO58JQ
BS 76 226 RR2GP36JQ
BS 227 227 RR2GO58JQ
BS 228 242 RR2GP36JQ
BS 243 243 RR2B929JQ
BS 244 386 RR2GP36JQ
BS 387 898 RR2B929JQ
BS 899 899 RR2GP36TF
BS 900 930 RR2B929JQ
BS 931 939 RR2GP36TF
BS 940 1317 RR2B929TF

RD RR2GO58JQ 207 0 0
ACACAAACAAACTAAAGTAAATGCAAATTAAAAAAATTCTGCTTTTATTGGAATGAAATC
TAAGTAAAAAAATTCAATATTAAAACTTTTTT*AACAGTTTCCTTTCTTCTTCTTCTTGT
CCTCTCGGCCTGAAATTCTCACATCGTGTTGGCTTATTCAGCAACCAAATACAAGTGGCT
AAGCAAAACCAGTGCCTAAACTTTTC
C

QA 1 206 1 206
DS 

RD RR2GP36JQ 386 0 0
GGCATTTTTGTTTGCACCTAGTTTCATTTGGAAGTGAAAGGAATACACAAACAAACTAAA
GTAGATGCAAATTAGAAAAATTCTGCTTTTATTGGAATGAAATCTAAGTAAAAAAATTCA
ATATTAAAACTTTTTTTAACAGTTTCCTTTCTTCTTCTTCTTGTCCTCTCGGCCTGAGAT
TCTCACATCGTGTTGGCTTATTCAGCAACCAAATACAAGTGGCTAAACAAAACCAGTGCC
TAAACTTTTCTTGAAAATCTTAAACCTCCTTGACAGAAGTCCCTTCACTTCCTCCAATAA
CAGCATCATCTGGGATGTAGCGTTTCCAGAAGGGATGCTGCTTCCACACTCTTCCCATTT
CTTCAATAGGAACCCCTTTTGTCTCC

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR2B929JQ 856 0 0
AAAATTCTGCTTTTATTGGAATGAAATCTAAGTAAAAGAATTCAATATTAAAACTTTTTT
TAACAGTTTCCTTTCTTCTTCTTCTTGTCCTCTCGGCCTGAGATTCTCACATCGTGTTGG
CTTATTCAGCAACCAAATACAAGTGGCTAAGCAAAACCAGTGCCTAGACTTTTCTTGAAA
ATCTTAAACCTCCTTGACAGAAGTCCCTTCACTTCCTCCAATAACAGCATCATCTGGGAT
GTAGCGTTTCCAGAAGGGATGCTGCTTCCACACTCTTCCCATTTCTTCAATAGGAACCCC
TTTTGTCTCCGGAAACAAGAAGTAGATGAAGATCGTCATGATCAGGACCATTCCTCCAAA
GAAGTAGAAGAGACCAAACTTCATGTGACAAAGCATCGTTAAAAAGAATTGTCCAATGAG
GAAAGTGAAGAACATGTTGACAGAAACATTGACGGCTTGTCCCGCTGGTCTGATTTCCAA
AGGACAGATCTCACTTGGTACTAACCATCCTAATGGACCCCATGACCATGCAAACCCTGC
AACGTATATGCATATGAAAGCTAGGACCCAATTTGCTGTTGCAGGTGTCAAGGTCCCTGA
TCCTGTGGTACCAAAATTCATACCAATCAAAGTACCAACAATGATCTGGCAAATGATCAT
TTGAATGCCACCTTCGAGGAAGAGAATCCTTCTTCCATACATGTCAACCGCATAGATGGA
GACAAGGGTAGAGACAACGTTCACCACACCGGTGATGACCGCAGAGATGAGCGAGGCATC
ATCAGCGAAACCGAGAGTTCTAAAGAGAACAGGAGCGTAGAAACATGATCACATTGATAC
CGGTGAACTGCTGG
GA

QA 1 854 1 854
DS 

RD RR2GP36TF 738 0 0
CAGCAACCAAATACAAGTGGCTAAGCAAAACCAGTGCCTAGACTTTTCTTGAAAATCTTA
AACCTCCTTGACAGAAGTCCCTTCACTTCCTCCAATAACAGCATCATCTGGGATGTAGCG
TTTCCAGAAGGGATGCTGCTTCCACACTCTTCCCATTTCTTCAATAGGAACCCCTTTTGT
CTCCGGCAACAAGAAGTAGATGAAGATCGTCATGATCAGGACCATTCCTCCAAAGAAGTA
GAAGAGACCAAACTTCATGTGACAAAGCATCGTTAAAAAGAATTGTCCAATGAGGAAAGT
GAAGAACATGTTGACAGAAACATTGACGGCTTGTCCCGCTGGTCTGATTTCCAAAGGACA
GATCTCACTTGGTACTAACCATCCTAATGGACCCCATGACCATGCAAACCCTGCAACGTA
TATGCATATGAAAGCTAGGACCCAATTTGCTGTTGCAGGTGTCAAGGTCCCTGATCCTGT
GGTACCAAAATTCATACCAATCAAAGTACCAACAATGATCTGGCAAATGATCATTTGAAT
GACACCTTCGAGGAAGAGAATCCTTCTTCCATACCTGTCAACCGCATAGATGGAGACAAG
GGTAGAGACAACGTTCACCACACCGGTGATGACCGCAGAGATGAGCGAGGCATCATCAGC
GAAACCGAGAGTTTTAAAGAGAACAGGAGCGTAGAA*CATGATCACATTGATACCGGTGA
ACTGCTGGAAGAAAGGT
C

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2B929TF 904 0 0
CGTCATGATCAGACAT
CTCCAAAGAAGTAGAAGAGACCAAACTTCATGTGACAAAGCATCGTTAAAAAGAATTGTC
CAATGAGGAAAGTGAAGAACATGTTGACAGAAACATTGACGGCTTGTCCCGCTGGTCTGA
TTTCCAAAGGACAGATCTCACTTGGTACTAACCATC*TAATGGACCCCATGACCATGCAA
ACCCTGCAACGTATATGCATATGAAAGCTAGGACCCAATTTGCTGTTGCAGGTGTCAAGG
TCCCTGATCCTGTGGTACCAAAATTCATACCAATCAAAGTACCAACAATGATCTGGCAAA
TGATCATTTGAATGCCACCTTCGAGGAAGAGAATCCTTCTTCCATACATGTCAACCGCAT
AGATGGAGACAAGGGTAGAGACAACGTTCACCACACCGGTGATGACCGCAGAGATGAGCG
AGGCATCATCAGCGAAACCGAGAGTTCTAAAGAGAACAGGAGCGTAGAA*CATGATCACA
TTGATACCGGTGAACTGCTGGAAGAAAGGTATCGCAGAACAGAAAGCAAGAGCAGGTCGG
TATTTAGCTTGTAGGAAAAGGTTCTTCCAAGGGTGTTCCACTTTTTTAGCAGCCTCACAA
GCATCACAAAGATCTTGAAACTCCTCGTCGACGTTGTCAGCTCCACGGATCTTTTGTAAC
ATCGCTCTCGCTTGTTCATACTTACCTCTCTCGAGCATTGAGTTTGGCGTGTCTGGCAAG
ACAAAAGATCCTATGACCATTACAACTGCTGGAACAGCAGCTAGACCTAAAGACACTCTC
CATCCGTTCTTTGCCGTTTGAGATGTTCCATAGTTAATCAGGTTTGCAATCAGAATCCCG
ATAGTTATAGCCATTTGGAATCCGATGTTGAGTGCTCCTCTGATCTTC

QA 17 904 17 904
DS 



AS 3 6

CO CL1137Contig1 899 2 3 U
GGAAAGCGTTTTGTTCTCACTCTCTGCCGTCTCTCTCTCACTCTCTGCAGCTTTGACCCA
TACTCTCTGTTTCTCTCTTACAGCCATGGCCGCCTCTGTAGAAATCGACGCCGAGATTCA
GCAGCAGCTTACCAACGAGGTCAAGCTCTTCAACCGCTGGACCTATGACGACGTTTCGGT
GACAGACATCAGTCTTGTTGACTACATCGGAGTCCAGGCAGCTAAACACGCCACCTTTGT
CCCCCACACCGCCGGAAGATACTCTGTGAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGTCCCATCGT
GGAGAGGCTCACGAACTCTCTCATGATGCACGGAAGAAACAACGGGAAGAAACTGATGGC
GGTGAGAATCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCACCTCTTGACTGACGCTAACCCTAT
CCAGGTCATCATCGATGCCATTGTCAACAGGTCCACGTGAAGATGCCACGAGAATTGGAT
CTGCTGGTGTTGTGAGGAGACAGGCGGTTGATATCTCCCCTCTGAGACGTGTAAACCAAG
CGATCTTCTTGCTTACAACCGGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAACATCAAGACTATTG
CCGAGTGCCTTGCTGATGAATTGATCAACGCTGCCAAAGGGCTCCTCCAACAGCTATGCC
ATCAAGAAGAAGGATGAGATTGGAAGGGTTGCCAAGGCCAATCGTTAAGGATTTTCCTTT
TCTCCTGAGGGTTGCGATATCATCAATGAAGTTTATGTTTTCTTTACCGGTAGATTGGGT
GGAATATGTTTAAGATGTTATGCTTTGTTGTTTTATGAAACTTTTATTTCGTCAGAACTT
TGGATAGATAAATTTTGAATGCTTAAATGAAGAAAGCTAAAGAGTTTGTTTTTGTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT18TF U 13
AF RR2AT18JQ C 1
BS 1 12 RR2AT18JQ
BS 13 668 RR2AT18TF
BS 669 899 RR2AT18JQ

RD RR2AT18TF 656 0 0
GTTCTCACTCTCTGCCGTCTCTCTCTCACTCTCTGCAGCTTTGACCCATACTCTCTGTTT
CTCTCTTACAGCCATGGCCGCCTCTGTAGAAATCGACGCCGAGATTCAGCAGCAGCTTAC
CAACGAGGTCAAGCTCTTCAACCGCTGGACCTATGACGACGTTTCGGTGACAGACATCAG
TCTTGTTGACTACATCGGAGTCCAGGCAGCTAAACACGCCACCTTTGTCCCCCACACCGC
CGGAAGATACTCTGTGAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGTCCCATCGTGGAGAGGCTCAC
GAACTCTCTCATGATGCACGGAAGAAACAACGGGAAGAAACTGATGGCGGTGAGAATCAT
CAAGCACGCCATGGAGATCATCCACCTCTTGACTGACGCTAACCCTATCCAGGTCATCAT
CGATGCCATTGTCAACAGGTCCACGTGAAGATGCCACGAGAATTGGATCTGCTGGTGTTG
TGAGGAGACAGGCGGTTGATATCTCCCCTCTGAGACGTGTAAACCAAGCGATCTTCTTGC
TTACAACCGGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAACATCAAGACTATTGCCGAGTGCCTTG
CTGATGAATTGATCAACGCTGCCAAAGGGCTCCTCCAACAGCTATGCCATCAAGAA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2AT18JQ 899 0 0
GGAAAGCGTTTTGTTCTCACTCTCTGCCGTCTCTCTCTCACTCTCTGCAGCTT*GACCCA
TACTCTCTGTTTCTCTCTTACAGCCATGGCCGCCTCTGTAGAAATCGACGCCGAGATTCA
GCAGCAGCTTACCAACGAGGTCAAGCTCTTCAACCGCTGGACCTATGACGACGTTTCGGT
GACAGACATCAGTCTTGTTGACTACATCGGAGTCCAGGCAGCTAAACACGCCACCTTTGT
CCCCCACACCGCCGGAAGATACTCTGTGAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGTCCCATCGT
GGAGAGGCTCACGAACTCTCTCATGATGCACGGAAGAAACAACGGGAAGAAACTGATGGC
GGTGAGAATCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCACCTCTTGACTGACGCTAACCCTAT
CCAGGTCATCATCGATGCCATTGTCAACAGGTCCACGTGAAGATGCCACGAGAATTGGAT
CTGCTGGTGTTGTGAGGAGACAGGCGGTTGATATCTCCCCTCTGAGACGTGTAAACCAAG
CGATCTTCTTGCTTACAACCGGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAACATCAAGACTATTG
CCGAGTGCCTTGCTGATGAATTGATCAACGCTGCCAA*GGGCTCCTCCAACAGCTATGCC
ATCAAGAAGAAGGATGAGATTGGAAGGGTTGCCAAGGCCAATCGTTAAGGATTTTCCTTT
TCTCCTGAGGGTTGCGATATCATCAATGAAGTTTATGTTTTCTTTACCGGTAGATTGGGT
GGAATATGTTTAAGATGTTATGCTTTGTTGTTTTATGAAACTTTTATTTCGTCAGAACTT
TGGATAGATAAATTTTGAATGCTTAAATGAAGAAAGCTAAAGAGTTTGTTTTTGTCTTT

QA 1 899 1 899
DS 



CO CL1137Contig2 783 2 4 U
AGCAGCAGCTTACTAACGAGGTCAAGCTCTTCAACCGCTGGACCTATGACGACGTTTCGG
TGACAGACATCAGTCTTGTTGACTACATCGGAGTCCAGGCAGCTAAACACGCCACCTTTG
TCCCCCACACCGCCGGAAGATACTCTGTGAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGCGCCCCATCG
TCGAGAGGCTTACGAACTCTCTCATGATGCACGGAAGAAACAACGGAAAGAAATTGATGG
CGGTGAGAATCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCACCTCTTGACTGACGCTAACCCTA
TCCAGGTCATCATTGATGCCATTGTCAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCCACGAGAATTG
GATCTGCTGGTGTTGTGAGGAGACAACCGGTTGATATCTCCCCCCTAAGACGTGTGAACC
AAGCGATCTTCTTGCTTACCACAGGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAACATCAAGACTA
TTGCCGAGTGCCTTGCCGATGAATTGATCAACGCTGCCAAGGGCTCCTCCAACAGCTATG
CCATCAAGAAGAAGGATGAGATTGAAAGAGTTGCCAAGACCAATCGTTAAGGATTTTCCT
TGTCCTCTGAGGGTTACAATATCATCAATGAAGTTTATGTTTTCTTTACCGGTAGATTGG
GTGGAATATGTTTAAGATGTTTCGCTCTGTTGTTTTATGAAAGTTTTATTTCGTCTGGAC
TTTGAATAGATAAATTTTTGAATTCTTAAGTGAAGAAATCTAAAGAGTTTGCTTTTGTCT
TTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2CZ69JQ C 1
AF RR2CP45TF U 371
BS 1 371 RR2CZ69JQ
BS 372 496 RR2CP45TF
BS 497 497 RR2CZ69JQ
BS 498 783 RR2CP45TF

RD RR2CZ69JQ 773 0 0
AGCAGCAGCTTACTAACGAGGTCAAGCTCTTCAACCGCTGGACCTATGACGACGTTTCGG
TGACAGACATCAGTCTTGTTGACTACATCGGAGTCCAGGCAGCTAAACACGCCACCTTTG
TCCCCCACACCGCCGGAAGATACTCTGTGAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGCGCCCCATCG
TCGAGAGGCTTACGAACTCTCTCATGATGCACGGAAGAAACAACGGAAAGAAATTGATGG
CGGTGAGAATCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCACCTCTTGACTGACGCTAACCCTA
TCCAGGTCATCATTGATGCCATTGTCAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCCACGAGAATTG
GATCTGCTGGTGTTGTGAGGAGACAAGCGGTTGATATCTCCCCTCTAAGACGTGTGGACC
AAGCGATCTTCTTGCTTACCACAGGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAACATCAAGACTA
TTGCCGAGTGCCTTGCCGATGAATTGATCAACGCTGCCAAGGGCTCCTCCAACAGCTATG
CCATCAAGAAGAAGGATGAGATTGAAAGAGTTGCCAAGGCCAATCGTTAAGGATTTTCCT
TGTCCTCTGAGGGTTACAATATCATCAATGAAGTTTATGTTTTCTTTACCGGTAGATTGG
GTGGAATATGTTTAAGATGTTTCGCTCTGTTGTTTTATGAAAGTTTTATTTCGTCTGGAC
TTTGAATAGATAAATTTTTGAATTCTTAAGTGAAGAAATCTAAAGAGTTTG
CT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2CP45TF 413 0 0
G
GTTGTGAGGAGACAACCGGTTGATATCTCCCCCCTAAGACGTGTGAACCAAGCGATCTTC
TTGCTTACCACAGGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAACATCAAGACTATTGCCGAGTGC
CTTGCTGATGAATTGATCAACGCTGCCAAGGGCTCCTCCAACAGCTATGCCATCAAGAAG
AAGGATGAGATTGAAAGAGTTGCCAAGACCAATCGTTAAGGATTTTCCTTGTCCTCTGAG
GGTTACAATATCATCAATGAAGTTTATGTTTTCTTTACCGGTAGATTGGGTGGAATATGT
TTAAGATGTTTCGCTCTGTTGTTTTATGAAAGTTTTATTTCGTCTGGACTTTGAATAGAT
AAATTTTTGAATTCTTAAGTGAAGAAATCTAAAGAGTTTGCTTTTGTCTTTT

QA 2 413 2 413
DS 



CO CL1137Contig3 570 2 2 U
GGCTCACGAACTCTCTCATGATGCACGGAAGAAACAACGGAAAGAAATTGATGGCCGTGA
GAATCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCACCTCTTGACCGACGCGAACCCTATCCAGG
TCATCATCGATGCCATTGTCAACAGTAGTCCACGTGAAGATGCAACGAGAATTGGATCTG
CTGGTGTTGTGAGAAGACAAGCGGTTGATATCTCCCCTCTGAGACGTGTGAACCAAGCTA
TCTTCTTGCTTACCACCGGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAACATCAAGACTATTGCCG
AGTGCCTTGCTGATGAGTTGATCAACGCTGCCAAGGGCTCCTCCAACAGCTATGCTATCA
AGAAGAAGGATGAGATTGAAAGAGTTGCCAAGGCCAATCGTTAAGGATTTTTCTTGTCTC
CTGAGGGTCACAGTATCATCGATGAAGTTTATGTTTTCTTTATCGGTAGATTGGATGGAA
TATGTTTAAGATGTTTTGCTCTGTTTTGTGAAAGTTTTATTTCGTCTGGACTTTGGATAG
ATAAATTTTTTGAATGCCTAAATTAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF68TF U 1
AF RR2DF68JQ C 94
BS 1 550 RR2DF68TF
BS 551 570 RR2DF68JQ

RD RR2DF68TF 569 0 0
GGCTCACGAACTCTCTCATGATGCACGGAAGAAACAACGGAAAGAAATTGATGGCCGTGA
GAATCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCACCTCTTGACCGACGCGAACCCTATCCAGG
TCATCATCGATGCCATTGTCAACAGTAGTCCACGTGAAGATGCAACGAGAATTGGATCTG
CTGGTGTTGTGAGAAGACAAGCGGTTGATATCTCCCCTCTGAGACGTGTGAACCAAGCTA
TCTTCTTGCTTACCACCGGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAACATCAAGACTATTGCCG
AGTGCCTTGCTGATGAGTTGATCAACGCTGCCAAGGGCTCCTCCAACAGCTATGCTATCA
AGAAGAAGGATGAGATTGAAAGAGTTGCCAAGGCCAATCGTTAAGGATTTTTCTTGTCTC
CTGAGGGTCACAGTATCATCGATGAAGTTTATGTTTTCTTTATCGGTAGATTGGATGGAA
TATGTTTAAGATGTTTTGCTCTGTTTTGTGAAAGTTTTATTTCGTCTGGACTTTGGATAG
ATAAATTTTT
TGAATGCCTAAATTAAAAA

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2DF68JQ 477 0 0
TCTTGACCGACGCGAACCCTATCCAGGTCATCATCGATGCCATTGTCAACAGTAGTCCAC
GTGAAGATGCAACGAGAATTGGATCTGCTGGTGTTGTGAGAAGACAAGCGGTTGATATCT
CCCCTCTGAGACGTGTGAACCAAGCTATCTTCTTGCTTACCACCGGTGCTCGTGAGGCTG
CTTTCAGAAACATCAAGACTATTGCCGAGTGCCTTGCTGATGAGTTGATCAACGCTGCCA
AGGGCTCCTCCAACAGCTATGCTATCAAGAAGAAGGATGAGATTGAAAGAGTTGCCAAGG
CCAATCGTTAAGGATTTTTCTTGTCTCCTGAGGGTCACAGTATCATCGATGAAGTTTATG
TTTTCTTTATCGGTAGATTGGATGGAATATGTTTAAGATGTTTTGCTCTGTTTTGTGAAA
GTTTTATTTCGTCTGGACTTTGGATAGATAAATTTTTTGAATGCCTAAATTAAAAAA

QA 1 477 1 477
DS 



AS 2 7

CO CL1138Contig1 1126 2 2 U
GGAATCTTCACCAGACCCAACCAACCAAGCCAGATCTTGAAGAGCGAGCAAGTAACAAAA
AAAAGAAGACTTTTACTCGAAGAATGAAAGCAGAGCTAAACTTACCAGCAGGATTCCGAT
TCCATCCAACGGACGAAGAGCTTGTGAATTTCTACCTTTGCCGGAAATGCGCGTCGGAGC
AGATCTCAGCTCCGGTTATCGCCGAGATCGATCTCTACAAGTTCAATCCTTGGGAGCTTC
CAGAGAAGTCTCTGTACGGAGAGAAAGAGTGGTACTTCTTCTCGCCCCGAGACAGGAAAT
ACCCAAACGGTTCGCGTCCTAACCGGGCAGCAGGAACTGGTTATTGGAAAGCCACCGGAG
CTGATAAACCGATCGGTAAACCGAAGACGTTGGGTATAAAGAAAGCGCTCGTGTTCTACG
CTGGGAAAGCTCCTAAAGGGATTAAAACGAATTGGATTATTCACGAGTATCGTCTCGCTA
ATGTCGACAGATCAGCTTCTGTTCACAAAAAGAACAACCTACGACTTGATGATTGGGTGT
TATGTCGAATATACAACAAGAAAGGAACCATGGAGAAATACTACCCTGCGGATGAGAAAC
CGAGGACTATCACTGATCACTCATCGTCGCCTTTTGATACGTCGGTCTCGAGTTACCCGA
CACTGCAAGAGGATGATTCGAGCAGCTCGGGGGGTCGCGTGGTGTCACCGGATGCGCGGG
AGGTTCAGAGCGAGCCTAAATGGGGAGAGCTTGAGAATGCTTTTGATACTTCCATGTTTG
GTGGTGGTTCCATGGACTTGTTGCAGAGTGAAGCTGCTTTTGTCCCTCAGTTCTTGTACC
AGCCTTCTACTGATTATTTCAACTCCTGGCTGGACACGCAAGAGCAGAAACCGTTCTTGA
ATTGGAGTTTTGGTCACAGGGGTGAAAAAGGAAAAGAGAGTACAAGGTTTTTGGTCTGTG
TGGTGGTGATGTGTTAGGGAGAAGTTCTCAATCATCTTTGTTTTCTTAGGAGTGAGAAAA
AAGATTGTAGAGTGTTAATAGTTTCTTAGCATCATCAATGTTTCCCTGGTAGGCAAATTC
TTGTTATTTCATCAGAAGTTTATATGAAAAATTATACACATTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B129TF U 1
AF RR2B129JQ C 386
BS 1 777 RR2B129TF
BS 778 1126 RR2B129JQ

RD RR2B129TF 777 0 0
GGAATCTTCACCAGACCCAACCAACCAAGCCAGATCTTGAAGAGCGAGCAAGTAACAAAA
AAAAGAAGACTTTTACTCGAAGAATGAAAGCAGAGCTAAACTTACCAGCAGGATTCCGAT
TCCATCCAACGGACGAAGAGCTTGTGAATTTCTACCTTTGCCGGAAATGCGCGTCGGAGC
AGATCTCAGCTCCGGTTATCGCCGAGATCGATCTCTACAAGTTCAATCCTTGGGAGCTTC
CAGAGAAGTCTCTGTACGGAGAGAAAGAGTGGTACTTCTTCTCGCCCCGAGACAGGAAAT
ACCCAAACGGTTCGCGTCCTAACCGGGCAGCAGGAACTGGTTATTGGAAAGCCACCGGAG
CTGATAAACCGATCGGTAAACCGAAGACGTTGGGTATAAAGAAAGCGCTCGTGTTCTACG
CTGGGAAAGCTCCTAAAGGGATTAAAACGAATTGGATTATTCACGAGTATCGTCTCGCTA
ATGTCGACAGATCAGCTTCTGTTCACAAAAAGAACAACCTACGACTTGATGATTGGGTGT
TATGTCGAATATACAACAAGAAAGGAACCATGGAGAAATACTACCCTGCGGATGAGAAAC
CGAGGACTATCACTGATCACTCATCGTCGCCTTTTGATACGTCGGTCTCGAGTTACCCGA
CACTGCAAGAGGATGATTCGAGCAGCTCGGGGGGTCGCGTGGTGTCACCGGATGCGCGGG
AGGTTCAGAGCGAGCCTAAATGGGGAGAGCTTGAGAATGCTTTTGATACTTCCATGT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2B129JQ 741 0 0
GACGTTGGGTATAAAGAAAGCGCTCGTGTTCTACGCTGGGAAAGCTCCTAAAGGGATTAA
AACGAATTGGATTATTCACGAGTATCGTCTCGCTAATGTCGACAGATCAGCTTCTGTTCA
CAAAAAGAACAACCTACGACTTGATGATTGGGTGTTATGTCGAATATACAACAAGAAAGG
AACCATGGAGAAATACTACCCTGCGGATGAGAAACCGAGGACTATCACTGATCACTCATC
GTCGCCTTTTGATACGTCGGTCTCGAGTTACCCGACACTGCAAGAGGATGATTCGAGCAG
CTCGGGGGGTCGCGTGGTGTCACCGGATGCGCGGGAGGTTCAGAGCGAGCCTAAATGGGG
AGAGCTTGAGAATGCTTTTGATACTTCCATGTTTGGTGGTGGTTCCATGGACTTGTTGCA
GAGTGAAGCTGCTTTTGTCCCTCAGTTCTTGTACCAGCCTTCTACTGATTATTTCAACTC
CTGGCTGGACACGCAAGAGCAGAAACCGTTCTTGAATTGGAGTTTTGGTCACAGGGGTGA
AAAAGGAAAAGAGAGTACAAGGTTTTTGGTCTGTGTGGTGGTGATGTGTTAGGGAGAAGT
TCTCAATCATCTTTGTTTTCTTAGGAGTGAGAAAAAAGATTGTAGAGTGTTAATAGTTTC
TTAGCATCATCAATGTTTCCCTGGTAGGCAAATTCTTGTTATTTCATCAGAAGTTTATAT
GAAAAATTATACACATTCTCC

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL1138Contig2 1128 5 9 U
GAAGAATCTGTATAATTTTTCATAAAAATTTCTGATGAAATAACAAGAATTTGCCTACCA
ATGAAACATTGATGATGCTAAGAAACTATTAACACTCTACAATCTTTTTTCTCACTACTA
AGAAACAAAGATGATTGAGAACTTATCTCTAACACATCACCATAACACAGACCAAAAACA
TTTCACTCTCTTCCTTTTTCACCCTTGTGGACCAAAACTCCAATTCAAGAACGGTTTCTG
CTCTTGCGTGTCCTGCCAGGAGTTGAAATAATCAGTAGAAGGCTGGTACAAGAACTGAGG
GACAAAAGCAGCTTCACTCTGCAACAAGTCCATGGAACCACCACCAAACATGGAAGTATC
AAACGCATTCTCAAGCTCTCCCCACTTAGGCTCGCTCTGAACCTCCCGCGCATCCGGTGA
CACCACGCGACCCCCCGAGCTGCTCGAATCATCCTCTTGCAGTGTCGGGTAACTCGAGAC
CGACGTATCAAAAGGGGATGAAGCGGTCATGGCCCTCGGTTTCTCATCAGCAGGGTAGTA
TTTCTCCATGGTTCCTTTCTTGTTGTATATTCGACATAACACCCAATCATCAAGTCGTAG
GTTGTTCTTTTTGTGAACAGAAGCTGATCTGTCGACATTAGCGAGACGATACTCGTGCAT
AATCCAATTCGTTTTAATCCCTTTTGGAGCTTTCCCAGCGTAGAAGACAAGTGATTTCTT
TATACCCAACGTCTTCGGTTTACCGATCGGTTTATCAGCTCCGGTGGCTTTCCAATAACC
GGAACCTGCTGCCCGGTTAGGACGCGAACCGTTTGGGTATTTCCGGTCTCGGGGCGAGAA
GAAGTACCACTCTTTCTCTCCGTACAGAGACTTCTCAGGAAGCTCCCAAGGATTGAACTT
GTAGAGATCGATCTCGGCGATAACCGGAGCTGAGATCTGCTCCGACGCGCATTTCCGGCA
CAGGTAGAAATTCACAAGCTCTTCGTCCGTTGGATGGAATCTGAATCCTGCTGGTAAGTT
TAGCTCTGCTTTCATTCTTCGAGTAAAAGTCTTCTCTTTTTTTTTTGTTACTTGCTCGCT
CTTCAAGATCTGGCTTGGTTGGTTGGTTTGGTGAAGATTGGAATTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ11JQ U 1
AF RR2EZ62JQ U 16
AF RR2E560JQ U 105
AF RR2EZ62TF C 346
AF RR2FZ11TF C 485
BS 1 394 RR2FZ11JQ
BS 395 395 RR2EZ62JQ
BS 396 483 RR2FZ11JQ
BS 484 700 RR2EZ62JQ
BS 701 713 RR2EZ62TF
BS 714 714 RR2FZ11TF
BS 715 1065 RR2EZ62TF
BS 1066 1066 RR2FZ11TF
BS 1067 1128 RR2EZ62TF

RD RR2FZ11JQ 483 0 0
GAAGAATCTGTATAATTTTTCATAAAAATTTCTGATGAAATAACAAGAATTTGCCTACCA
ATGAAACATTGATGATGCTAAGAAACTATTAACACTCTACAATCTTTTTTCTCACTACTA
AGAAACAAAGATGATTGAGAACTTATCTCTAACACATCACCATAACACAGACCAAAAACA
TTTCACTCTCTTCCTTTTTCACCCTTGTGGACCAAAACTCCAATTCAAGAACGGTTTCTG
CTCTTGCGTGTCCTGCCAGGAGTTGAAATAATCAGTAGAAGGCTGGTACAAGAACTGAGG
GACAAAAGCAGCTTCACTCTGCAACAAGTCCATGGAACCACCACCAAACATGGAAGTATC
AAACGCATTCTCAAGCTCTCCCCACTTAGGCTCGTTCTGAACCTCCCGCGCATCCGGTGA
CACCACGCGACCCCCCGAGCTGCTCGAATCATCCTCTTGCAGTGTCGGGTAACTCGAGAC
CGA

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR2EZ62JQ 685 0 0
TTTTTCATAAAAATTTCTGATGAAATAACAAGAATTTGCCTACCAATGAAACATTGATGA
TGCTAAGAAACTATTAACACTCTACAATCTTTTTTCTCACTACTAAGAAACAAAGATGAT
TGAGAACTTATCTCTAACACATCACCATAACACAGACCAAAAACATTTCACTCTCTTCCT
TTTTCACCCTTGTGGACCAAAACTCCAATTCAAGAACGGTTTCTGCTCTTGCGTGTCCTG
CCAGGAGTTGAAATAATCAGTAGAAGGCTGGTACAAGAACTGAGGGACAAGAGCAGCTTC
ACTCTGCAACAAGTCCATGGAACCACCACCAAACATGGAAGTATCAAACGCATTCTCAAG
CTCTCCCCACTTAGGCTCGCTCTGAACCTCCCGCGCATCCGGTGACACCACGCGACCCCC
CGAGCTGCTCGAATCATCCTCTTGCAGTGTCGGGTAACTCGAGACCGACGTATCAAAAGG
GGATGAAGCGGTCATGGCCCTCGGTTTCTCATCAGCAGGGTAGTATTTCTCCATGGTTCC
TTTCTTGTTGTATATTCGACATAACACCCAATCATCAAGTCGTAGGTTGTTCTTTTTGTG
AACAGAAGCTGATCTGTCGACATTAGCGAGACGATACTCGTGCATAATCCAATTCGTTTT
AATCCCTTTTGGAGCTTTCCCAGCG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2E560JQ 595 0 0
TTTTTTCTCACTACTAAGAAACAAAGATGATTGAGAACTTATCTCTAACACATCACCATA
ACACAGACCAAAAACATTTCACTCTCTTCCTTTTTCACCCTTGTGGACCAAAACTCCAAT
TCAAGAACGGTTTCTGCTCTTGCGTGTCCTGCCAGGAGTTGAAATAATCAGTAAAAGGCT
GGTACAAGAACTGAGGGACAAAAGCAGCTTCACTCTGCAACAAGTCCATGGAACCACCAC
CAAACATGGAAGTATCAAACGCATTCTCAAGCTCTCCCCACTTAGGCTCGCTCTGAACCT
CCCGCGCATCCGGTGACACCACGCGACCCCCCGAGCTGCTCGAATCATCCTCTTGCAGTG
TCGGGTAACTCGAGACCGACGTATCAAAAGGGGATGAAGCGGTCATGGCCCTCGGTTTCT
CATCAGCAGGGTAGTATTTCTCCATGGTTCCTTTCTTGTTGTATATTCGACATAACACCC
AATCATCAAGTCGTAGGTTGTTCTTTTTGTGAACAGAAGCTGATCTGTCGACATTAGCGA
GACGATACTCGTGCATAATCCAATTCGTTTTAATCCCTTTTGGAGCTTTCCCAGC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2EZ62TF 783 0 0
AAACATGGAAGTATCAA*CGCAT*CTCAAGCTCTCCCCACTTAGGCTCGCTCTGA*CCTC
CCGCGCATCCGGTGACACCACGCGACCCCCCGAGCTGCTCGAATCATCCTCTTGCAGTGT
CGGGTAACTCGAGACCGACGTATCAAAAGGGGATGAAGCGGTCATGGCCCTCGGTTTCTC
ATCAGCAGGGTAGTATTTCTCCATGGTTCCTTTCTTGTTGTATATTCGACATAACACCCA
ATCATCAAGTCGTAGGTTGTTCTTTTTGTGAACAGAAGCTGATCTGTCGACATTAGCGAG
ACGATACTCGTGCATAATCCAATTCGTTTTAATCCCTTTTGGAGCTTTCCCAGCGTAGAA
GACAAGTGCTTTCTTTATACCCAACGTCTTCGGTTTACCGATCGGTTTATCAGCTCCGGT
GGCTTTCCAATAACCGGAACCTGCTGCCCGGTTAGGACGCGAACCGTTTGGGTATTTCCG
GTCTCGGGGCGAGAAGAAGTACCACTCTTTCTCTCCGTACAGAGACTTCTCAGGAAGCTC
CCAAGGATTGAACTTGTAGAGATCGATCTCGGCGATAACCGGAGCTGAGATCTGCTCCGA
CGCGCATTTCCGGCACAGGTAGAAATTCACAAGCTCTTCGTCCGTTGGATGGAATCTGAA
TCCTGCTGGTAAGTTTAGCTCTGCTTTCATTCTTCGAGTAAAAGTCTTCTCTTTTTTTTT
*GTTACTTGCTCGCTCTTCAAGATCTGGCTTGGTTGGTTGGTTTGGTGAAGATTGGAATT
CCC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2FZ11TF 644 0 0
GTATCAAAAGGGGATGAAGCGGTCATGGCCCTCGGTTTCTCATCAGCAGGGTAGTATTTC
TCCATGGTTCCTTTCTTGTTGTATATTCGACATAACACCCAATCATCAAGTCGTAGGTTG
TTCTTTTTGTGAACAGAAGCTGATCTGTCGACATTAGCGAGACGATACTCGTGCATAATC
CAATTCGTTTTAATCCCTTTTGGAGCTTTCCCAGCGTAGAAGACAAGTGATTTCTTTATA
CCCAACGTCTTCGGTTTACCGATCGGTTTATCAGCTCCGGTGGCTTTCCAATAACCGGAA
CCTGCTGCCCGGTTAGGACGCGAACCGTTTGGGTATTTCCGGTCTCGGGGCGAGAAGAAG
TACCACTCTTTCTCTCCGTACAGAGACTTCTCAGGAAGCTCCCAAGGATTGAACTTGTAG
AGATCGATCTCGGCGATAACCGGAGCTGAGATCTGCTCCGACGCGCATTTCCGGCACAGG
TAGAAATTCACAAGCTCTTCGTCCGTTGGATGGAATCTGAATCCTGCTGGTAAGTTTAGC
TCTGCTTTCATTCTTCGAGTAAAAGTCTTCTCTTTTTTTTTTGTTACTTGCTCGCTCTTC
AAGATCTGGCTTGGTTGGTTGGTTTGGTGAAGATT
GGAATTCCC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 6

CO CL1139Contig1 870 6 6 U
GGGAGCTCTGTTCTTCTTCTTCTGGCTCTTGGTCTGATCTCTTACAAGAAACAGCACAAA
AATGGCGTTCGCAGGAACAACACAGAAATGCATGGCCTGTGACAAAACCGTTTATCTCGT
CGACAAGCTAACCGCAGATAACCGGGTTTACCACAAAGCATGTTTCCGTTGTCACCATTG
CAAAGGAACTCTCAAGCTTAGCAACTATAACTCATTTGAGGGAGTTCTCTACTGCAGACC
ACATTTTGATCAGAACTTCAAGAGAACTGGAAGTCTTGAGAAGAGCTTCGAGGGGACACC
AAAGATCGGAAAACCGGATAGACCTTTGGAGGGAGAGAGACCAGCTGGTACCAAAGTGTC
TAATATGTTTGGTGGAACACGAGAAAAATGCGTTGGTTGTGACAAAACCGTGTATCCAAT
TGAGAAGGTGTCGGTGAATGGGACATTGTACCACAAGAGCTGCTTCAAGTGTACACATGG
TGGATGCACGATAAGTCCTTCGAATTACATAGCTCACGAGGGGAAGCTTTATTGCAAGCA
TCATCATATTCAGCTTATCAAGGAGAAAGGAAACTTGAGCCAGCTCGAAGGAGGAGATAA
TACCGCAAAGGACAAAGTGGACGCTGCTTGAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAACAGTTCAT
TTTGACCCTTGAAGAACCGATAGTGTCACCACCCTCGATCGATCCATAATATAAAAATTG
GTTTTGTTCTTCTTAAGTTTATGTTCTTTCTTTTGGGATCTTTATTGTCTCCTAGGGTGA
TCTTGTTCACTCTTCGTTGGGTTTCTTGAGATGAAACAAAGAAACAAATAAATAATGGAT
ATTGCTTATGAGAATATACGTATCACGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 0 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO34TF U 18
AF RR2GO24TF U 1
AF RR2C568TF U 41
AF RR2ET01TF U 8
AF RR2ET01JQ C 233
AF RR2FO34JQ C 112
BS 1 127 RR2GO24TF
BS 128 128 RR2FO34TF
BS 129 537 RR2GO24TF
BS 538 538 RR2FO34TF
BS 539 630 RR2GO24TF
BS 631 870 RR2FO34JQ

RD RR2FO34TF 569 0 0
GG
TTCTGACTCTTGGTCTGATCTCTTACAAGAAAGAGCACAAAAATGGCGTTCGCAGGAACA
ACACAGAAATGCATGGCCTGTGACAAAACCGTTTATCTCGTCGACAAGCTAACCGCAGAT
AACCGGGTTTACCATAAAGCCTGTTTCCGTTGTCACCATTGCAAAGGAACTCTCAAGCTT
AGCAACTATAACTCTTTTGAGGGAGTTCTCTACTGCAGACCACATTTTGATCAGAACTTC
AAGAGAACTGGAAGTCTTGAGAAGAGCTTCGAGGGGACACCAAAGATCGGAAAACCGGAT
AGACCTTTGGAGGGAGAGAGACCAGCTGGTACCAAAGTGTCTAATATGTTTGGTGGAACA
CGAGAAAAATGCGTTGGTTGTGACAAAACCGTGTATCCAATTGAGAAGGTGTCGGTGAAT
GGGACATTGTACCACAAGAGCTGCTTCAAGTGTACACATGGTGGATGCACGATAAGTCCT
TCGAATTACATAGCTCACGAGGGGAAGCTTTATTGCAAGCATCATCATATTCAGCTTATC
AAGGAGAAAGGAAGCTTGAGCCAGCTC

QA 3 569 3 569
DS 

RD RR2GO24TF 635 0 0
GGGAGCTCTGTTCTTCTTCTTCTGGCTCTTGGTCTGATCTCTTACAAGAAACAGCACAAA
AATGGCGTTCGCAGGAACAACACAGAAATGCATGGCCTGTGACAAAACCGTTTATCTCGT
CGACAAGTTAACCGCAGATAACCGGGTTTACCACAAAGCATGTTTCCGTTGTCACCATTG
CAAAGGAACTCTCAAGCTTAGCAACTATAACTCATTTGAGGGAGTTCTCTACTGCAGACC
ACATTTTGATCAGAACTTCAAGAGAACTGGAAGTCTTGAGAAGAGCTTCGAGGGGACACC
AAAGATCGGAAAACCGGATAGACCTTTGGAGGGAGAGAGACCAGCTGGTACCAAAGTGTC
TAATATGTTTGGTGGAACACGAGAAAAATGCGTTGGTTGTGACAAAACCGTGTATCCAAT
TGAGAAGGTGTCGGTGAATGGGACATTGTACCACAAGAGCTGCTTCAAGTGTACACATGG
TGGATGCACGATAAGTCCTTCGAATTACATAGCTCACGAGGGGAAGCTTTATTGCAATCA
TCATCATATTCAGCTTATCAAGGAGAAAGGAAACTTGAGCCAGCTCGAAGGAGGAGATAA
TACCGCAAAGGACAAAGTGGACGCTGCTTG
AAAAA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2C568TF 566 0 0
CTTACAAGAAACAGCACAAAAATGGCGTTCGCAGGAACAACACAGAAATGCATGGCCTGT
GACAAAACCGTTTATCTCGTCGACAAGTTAACCGCAGATAACCGGGTTTACCACAAAGCA
TGTTTCCGTTGTCACCATTGCAAAGGAACTCTCAAGCTTAGCAACTATAACTCATTTGAG
GGAGTTCTCTACTGCAGACCACATTTTGATCAGAACTTCAAGAGAACTGGAAGTCTTGAG
AAGAGCTTCGAGGGGACACCAAAGAACGGAAAACCGGATAGACCTTTGGAGGGAGAGAGA
CCAGCTGGTACCAAAGTGTCTAATATGTTTGGTGGAACACGAGAAAAATGCGTTGGTTGT
GACAAAACCGTGTATCCAATTGAGAAGGTGTCGGTGAATGGGACATTGTACCACAAGAGC
TGCTTCAAGTGTACACATGGTGGATGCACGATAAGTCCTTCGAATTACATAGCTCACGAG
GGGAAGCTTTATTGCAAGCATCATCATATTCAGCTTATCAAGGAGAAAGGAAACTTGAGC
CAGCTCGAAAGAG*AGATAATACCGC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2ET01TF 623 0 0
GG
GTTCTTCTTCTTCTGGCTCTTGGTCTGATCTCTTACAAGAAACAGCACAAAAATGGCGTT
CGCAGGAACAACACAGAAATGCATGGCCTGTGACAAAACCGTTTATCTCGTCGACAAGTT
GACCGCAGATAACTGGGTTTACCACAAAGCATGTTTCCGTTGTCACCATTGCAAAGGAAC
TCTCAAGCTTAGCAACTATAACTCATTTGAGGGAGTTCTCTACTGCAGACCACATTTTGA
TCAGAACTTCAAGAGAACTGGAAGTCTTGAGAAGAGCTTCGAGGGGACACCAAAGATCGG
AAAACCGGATAGACCTTTGGAGGGAGAGAGACCAGCTGGTACCAAAGTGTCTAATATGTT
TGGTGGAACACGAGAAAAATGCGTTGGTTGTGACAAAACCGTGTATCCAATTGAGAAGGT
GTCGGTGAATGGGACATTGTACCACAAGAGCTGCTTCAAGTGTACACATGGTGGATGCAC
GATAAGTCCTTCGAATTACATAGCTCACGAGGGGAAGCTTTATTGCAAGCATCATCATAT
TCAGCTTATCAAGGAGAAAGGAAACTTGAGCCAGCTCGAAGGAGGAGATAATACCGCAAA
GGACAAAGTGGACGCTGCTTG

QA 3 623 3 623
DS 

RD RR2ET01JQ 388 0 0
TGCAGACCACATTTTGATCAGAACTTCAAGAGAACTGGAAGTCTTGAGAAGAGCTTGGAG
GGGACACCAAAGATCGGAAAACCGGATTGACCTTTGGAGGGAGAGAGACCAGCTGGTACC
AAAGTGTCTAATATGTTTGGTGGAACACGAGAAAAATGCGTTGGTTGTGACAAAACCGTG
TATCCAATTGAGAAGGTGTCGGTGAATGGGACATTGTACCACAAGAGCTGCTTCAAGTGT
ACACATGGTGGATGCACGATAAGTCCTTTGAATTACATAGCTCACGAGGGGAAGCTTTAT
TGCAAGCATCATCATATTCAGCTTATCAAGGAGAAAGGAAACTTGAGCCAGCTCGAAGGA
GGAGATAATACCGCAAAGGACAAAGTGG

QA 1 388 1 388
DS 

RD RR2FO34JQ 759 0 0
TTATCTCGTCGACAAGCTAACCGCAGATAACCGGGTTTACCATAAAGCCTGTTTCCGTTG
TCACCATTGCAAAGGAACTCTCAAGCTTAGCAACTATAACTCTTTTGAGGGAGTTCTCTA
CTGCAGACCACATTTTGATCAGAACTTCAAGAGAACTGGAAGTCTTGAGAAGAGCTTCGA
GGGGACACCAAAGATCGGAAAACCGGATAGACCTTTGGAGGGAGAGAGACCAGCTGGTAC
CAAAGTGTTTAATATGTTTGGTGGAACACGAGAAAAATGCGTTGGTTGTGACAAAACCGT
GTATCCAATTGAGAAGGTGTCGGTGAATGGGACATTGTACCACAAGAGCTGCTTCAAGTG
TACACATGGTGGATGCACGATAAGTCCTTCGAATTACATAGCTCACGAGGGGAAGCTTTA
TTGCAAGCATCATCATATTCAGCTTATCAAGGAGAAAGGAAGCTTGAGCCAGCTCGAAGG
AGGAGATAATACCGCAAAGGACAAAGTGGACGCTGCTTGAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAA
ACAGTTCATTTTGACCCTTGAAGAACCGATAGTGTCACCACCCTCGATCGATCCATAATA
TAAAAATTGGTTTTGTTCTTCTTAAGTTTATGTTCTTTCTTTTGGGATCTTTATTGTCTC
CTAGGGTGATCTTGTTCACTCTTCGTTGGGTTTCTTGAGATGAAACAAAGAAACAAATAA
ATAATGGATATTGCTTATGAGAATATACGTATCACGTTC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 2 5

CO CL1140Contig1 1217 2 2 U
GAGAGAGAGATGGAGAACGCTTTGTCTCTGTCGCCAGCAGGTGAAATCGCGGGAAGAGTA
GCGTCTCTTTACGTCTATCCTATCAAATCATGTCGAGGGATATCTTTGTCTCAGGCTTCG
CTCACTCCCACAGGTACTTCTTAATCTCGTTAGTTTGGTTATGATGTTGATGGATTCTTG
GGGTTTAGGGTTTCGATGGGATAGAAACTGGTTGATTGTCAACTCCAAAGGAAGAGGATT
GACTCAAAGAGTGGAACCAAAGCTTTCCTTAATTGAAGTCGAAATGCCTAAACATGCGTT
TGCACATGACTGGGACCCCGACAACAACTCTAACATGTTGGTTAGAGCTCCCGGCATGGA
TGTACTTAAGGTTACACTAGCCAAACCTGAGAAAATAGCAGACGGTGTCTCAGTCTGGGA
GTGGTTTGGCTCCGCACTTGATGAAGGAGAGGAAGCCTCTAACTGGTTTTCAACTTTTGT
TGGCAAGCCTTGTCGACTTGTTCGTTTTGATTCAGCCTCTGAGACAAGACCTGTGGATCC
AAATTATGCTCCAGGTCACTTTGCCATGTTCTCAGATATGTACCCTTTCTTGCTTATATC
ACAGGGTTCTCTTGATGCCCTGAATGAGCTTCTCATAGAGCCTGTACCCATCAACCGATT
CAGACCCAAATGTGTGACAGCATCTTGGTTGATGGATGTGAACCATTTGCTGAAGACTTA
TGGACAGAGATCCTTATAGACAATTTCACCTTTCACGGTGTGAAATTATGCTCCCGTTGC
AAGGTACCGACGATAAATCAAGACATTGGAATTGGAGGTGAAGAGCCAATTGAGACGCTG
AGGAGTTTCAGGTCAGACAAATTTTTACAGCCACAGAAGAAACCACAGGGAAAGATATAC
TTTGGACAGAACATGGTTTGGAAAGATGGGTTTGGGGATGGAACAGCAAAAACAATTGGG
ATTGGAGATTCCGTTCTTGTCCTTGGAAAACACTCCTCTCCTACTGAAGCAGCAACTTGA
AAGCAAAAAGAAAAAAACAAGAAAACGTGCATTTTGTTCACGGTGTAAGTTTATCTGAGG
ACATCAAAGCTTTATCAGAGCACTTGTATATATCATTTCTATTAATCCTAAGCTACACAA
AAAGACTCTTAGGTTCCTCAATCCGCAAAACTTAAAATTCCAGCAGACAAGGCAAGTTAA
GAAACGCTTTCGTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD48TF U 1
AF RR2BD48JQ C 521
BS 1 738 RR2BD48TF
BS 739 1217 RR2BD48JQ

RD RR2BD48TF 738 0 0
GAGAGAGAGATGGAGAACGCTTTGTCTCTGTCGCCAGCAGGTGAAATCGCGGGAAGAGTA
GCGTCTCTTTACGTCTATCCTATCAAATCATGTCGAGGGATATCTTTGTCTCAGGCTTCG
CTCACTCCCACAGGTACTTCTTAATCTCGTTAGTTTGGTTATGATGTTGATGGATTCTTG
GGGTTTAGGGTTTCGATGGGATAGAAACTGGTTGATTGTCAACTCCAAAGGAAGAGGATT
GACTCAAAGAGTGGAACCAAAGCTTTCCTTAATTGAAGTCGAAATGCCTAAACATGCGTT
TGCACATGACTGGGACCCCGACAACAACTCTAACATGTTGGTTAGAGCTCCCGGCATGGA
TGTACTTAAGGTTACACTAGCCAAACCTGAGAAAATAGCAGACGGTGTCTCAGTCTGGGA
GTGGTTTGGCTCCGCACTTGATGAAGGAGAGGAAGCCTCTAACTGGTTTTCAACTTTTGT
TGGCAAGCCTTGTCGACTTGTTCGTTTTGATTCAGCCTCTGAGACAAGACCTGTGGATCC
AAATTATGCTCCAGGTCACTTTGCCATGTTCTCAGATATGTACCCTTTCTTGCTTATATC
ACAGGGTTCTCTTGATGCCCTGAATGAGCTTCTCATAGAGCCTGTACCCATCAACCGATT
CAGACCCAAATGTGTGACAGCATCTTGGTTGATGGATGTGAACCATTTGCTGAAGACTTA
TGGACAGAGATCCTTATA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2BD48JQ 697 0 0
GAGACAAGACCTGTGGATCCAAATTATGCTCCAGGTCACTTTGCCATGTTCTCAGATATG
TACCCTTTCTTGCTTATATCACAGGGTTCTCTTGATGCCCTGAATGAGCTTCTCATAGAG
CCTGTACCCATCAACCGATTCAGACCCAAATGTGTGACAGCATCTTGGTTGATGGATGTG
AACCATTTGCTGAAGACTTATGGACAGAGATCCTTATAGACAATTTCACCTTTCACGGTG
TGAAATTATGCTCCCGTTGCAAGGTACCGACGATAAATCAAGACATTGGAATTGGAGGTG
AAGAGCCAATTGAGACGCTGAGGAGTTTCAGGTCAGACAAATTTTTACAGCCACAGAAGA
AACCACAGGGAAAGATATACTTTGGACAGAACATGGTTTGGAAAGATGGGTTTGGGGATG
GAACAGCAAAAACAATTGGGATTGGAGATTCCGTTCTTGTCCTTGGAAAACACTCCTCTC
CTACTGAAGCAGCAACTTGAAAGCAAAAAGAAAAAAACAAGAAAACGTGCATTTTGTTCA
CGGTGTAAGTTTATCTGAGGACATCAAAGCTTTATCAGAGCACTTGTATATATCATTTCT
ATTAATCCTAAGCTACACAAAAAGACTCTTAGGTTCCTCAATCCGCAAAACTTAAAATTC
CAGCAGACAAGGCAAGTTAAGAAACGCTTTCGTTACC

QA 1 697 1 697
DS 



CO CL1140Contig2 836 3 4 U
GGAAAGAGAAAGAGATAGAGATAGAGAGATGGAGAACGCTATATCTCCGTCGCCGGCAGG
TGAAATCGCGGGAAGAGTAGCGTCTCTTTACGTCTATCCTATCAAATCATGTCGAGGGAT
TTCTTTGTCTCAGGCTTCGCTCACTCCCACAGGGTTTCGATGGGATAGAAACTGGTTGAT
TGTCAACTCCAAAGGAAGAGGATTGACTCAAAGAGTGGAACCGAAGCTTTCCTTAATTGA
AGTCGAAATGCCTAAACATGCGTTTGCACATGACTGGCAGCCCGACAACAACTCTAACAT
GTTGGTTAGAGCTCCTGGCATGGATGTACTTAAGGTTTCGCTAGCCAAACCTGAGAAAAC
AGCAGACGGTGTCTCAGTCTGGGAGTGGTTTGGCTCCGCACTCGATGAAGGAGAGGAAGC
CTCTAACTGGTTTTCAGATTTTGTTGGCAAGCCTTGTCGACTTGTTCGTTTTGATTCAGC
CTCTGAGACAAGACCTGTGGATCCAAATTATGCTCCAGGTCACTTTGCTATGTTCTCAGA
TATGTACCCTTTCTTGCTTATATCACAGGGTTCTCTTGATGCCCTGAATGAGCTTCTCAT
GGAGCCTGTACCCATCAACCGATTCAGACCCAACATCTTGGTTGATGGATGTGAACCATT
TGCTGAAGACTTATGGACAGAGATACTTATAGACAATTTCACCTTTCACGGTGTGAAGTT
ATGCTCCCGTTGCAAGGTACCGACGATAAATCAAGACACTGGAGTTGGAGGTGAAGAGCC
AATTGAGACGCTGAGGAGTTTCAGTTCAGACAAATTTTTACAGCCCCAGAAGAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX41TF U 9
AF RR2FR33TF U 1
AF RR2CX41JQ C 504
BS 1 710 RR2FR33TF
BS 711 711 RR2CX41JQ
BS 712 732 RR2FR33TF
BS 733 836 RR2CX41JQ

RD RR2CX41TF 215 0 0
GG
AGAGATAGAGATAGAGAGATGGAGAACGCTATATCTCCGTCGCCGGCAGGTGAAATCGCG
GGAAGAGTAGCGTCTCTTTACGTCTATCCTATCAAATCATGTCGAGGGATTTCTTTGTCT
CAGGCTTCGCTCACTCCCACAGGGTTTCGATGGGATAGAAACTGGTTGATTGTCAACTCC
AAAGGAAGAGGATTGACTCAAAGA
TGGAACCGA

QA 3 206 3 206
DS 

RD RR2FR33TF 732 0 0
GGAAAGAGAAAGAGATAGAGATAGAGAGATGGAGAACGCTATATCTCCGTCGCCGGCAGG
TGAAATCGCGGGAAGAGTAGCGTCTCTTTACGTCTATCCTATCAAATCATGTCGAGGGAT
TTCTTTGTCTCAGGCTTCGCTCACTCCCACAGGGTTTCGATGGGATAGAAACTGGTTGAT
TGTCAACTCCAAAGGAAGAGGATTGACTCAAAGAGTGGAACCGAAGCTTTCCTTAATTGA
AGTCGAAATGCCTAAACATGCGTTTGCACATGACTGGCAGCCCGACAACAACTCTAACAT
GTTGGTTAGAGCTCCTGGCATGGATGTACTTAAGGTTTCGCTAGCCAAACCTGAGAAAAC
AGCAGACGGTGTCTCAGTCTGGGAGTGGTTTGGCTCCGCACTCGATGAAGGAGAGGAAGC
CTCTAACTGGTTTTCAGATTTTGTTGGCAAGCCTTGTCGACTTGTTCGTTTTGATTCAGC
CTCTGAGACAAGACCTGTGGATCCAAATTATGCTCCAGGTCACTTTGCTATGTTCTCAGA
TATGTACCCTTTCTTGCTTATATCACAGGGTTCTCTTGATGCCCTGAATGAGCTTCTCAT
GGAGCCTGTACCCATCAACCGATTCAGACCCAACATCTTGGTTGATGGATGTGAACCATT
TGCTGAAGACTTATGGACAGAGATACTTATAGACAATTTCACCTTTCACG*TGTGAAGTT
ATGCTCCCGTTG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2CX41JQ 333 0 0
CAAATTATGCTCCAGGTCACTTTGCTATGTTTTCAGATATGTACCCTTTCTTGCTTATAT
CACAGGGTTTTCTTGATGCCCTGAATGAGCTTTTCATGGAGCCTGTACCCATCAACCGAT
TCAGACCCAACATCTTGGTTGATGGATGTGAACCATTTGCTGAAGACTTATGGACAGAGA
TACTTATAGACAATTTCACCTTTCCCGGTGTGAAGTTATGCTCCCGTTGCAAGGTACCGA
CGATAAATCAAGACACTGGAGTTGGAGGTGAAGAGCCAATTGAGACGCTGAGGAGTTTCA
GTTCAGACAAATTTTTACAGCCCCAGAAGAAAC

QA 1 333 1 333
DS 



AS 2 6

CO CL1141Contig1 620 2 1 U
GGGACTTCTTTCATTGCCGTCTTCAGAAACCCCTTAGCTTTCCGCTGCCTCCTGCGAGAT
CCTCCCATCAACTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCCTGCTCGCCGTTCTAAG
CGGAAAAGCTTGCCCAACCAGCGCCGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCTGA
GACAGAGGAGTCTCAGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGA
GCTGATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCAAGCGGTGGTGGCGTTGCCAT
GGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTACTCCTGCTGCTGAGTCCAAGAA
AGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTCGA
GTAAGGCGGTATGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTTTAACCTCTTTAAACCTAT
ATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTCAAG
AGATTTTACACAACATGATCTTATATTTGCATTTCTATTTTCTTGTTTTGAAAATCTGCC
TAATGTTAAATATGATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CQ22TF U 1
AF RR2CQ22JQ C 330
BS 1 620 RR2CQ22TF

RD RR2CQ22TF 620 0 0
GGGACTTCTTTCATTGCCGTCTTCAGAAACCCCTTAGCTTTCCGCTGCCTCCTGCGAGAT
CCTCCCATCAACTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCCTGCTCGCCGTTCTAAG
CGGAAAAGCTTGCCCAACCAGCGCCGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCTGA
GACAGAGGAGTCTCAGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGA
GCTGATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCAAGCGGTGGTGGCGTTGCCAT
GGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTACTCCTGCTGCTGAGTCCAAGAA
AGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTCGA
GTAAGGCGGTATGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTTTAACCTCTTTAAACCTAT
ATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTCAAG
AGATTTTACACAACATGATCTTATATTTGCATTTCTATTTTCTTGTTTTGAAAATCTGCC
TAATGTTAAATATGATTTCC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2CQ22JQ 291 0 0
GAGGTGCTACTCCTGCTGCTGAGTCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAAT
CCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTCGAGTAAGGCGGTATGCTTGGCCACTGGTTTT
TGCTGTCATTTTTTAACCTCTTTAAACCTATATGTTGTTGTTTTTTAGTTTGTTTTCGGT
CAGTATTTTTGACATTCCTGAAATTTTCAAGAGATTTTACACAACATGATTTTATATTTG
CATTTTTATTTTCTTGTTTTGAAAATCTGCCTAATGTTAAATATGATTTCC

QA 1 291 1 291
DS 



CO CL1141Contig2 562 4 5 U
GGCACTTCTTTCATTGCCGTCTTCAGAAACCCCTTAGGTTTCCGCTGCCTCCTGCGAGAT
CCTCCTATCAACTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCCTGCTCGCCGTTCTAAG
CGGAAAAGCTTGCCCAGCCAGTGCCGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCCGA
AACAGAGGATTCTCAGATGGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGA
GCTAATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCAAGCGGTGGTGGTGTTGCTAT
GGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGTCCAAGAA
AGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGACGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTCGA
GTAAGGCGCGTTTGCTTGGATGTTATCTGTTTTTGTAACGTTTTGGAACCTCTTTGAAAC
CTATATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCT
CAAGAGATTTTACACAAACATG


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 

AF RR2GN44JQ C 1
AF RR2GN44TF U 1
AF RR2B211TF U 2
AF RR2B211JQ C 323
BS 1 3 RR2GN44JQ
BS 4 535 RR2GN44TF
BS 536 536 RR2B211TF
BS 537 557 RR2GN44TF
BS 558 562 RR2B211TF

RD RR2GN44JQ 575 0 0
GGCACTTCTTTCATTGCCGTCTTCAGAAACCCCTTAGGTTTCCGCTGCCTCCTGCGAGAT
CCTCCTATCAACTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCCTGCTCGCCGTTCTAAG
CGGAAAAGCTTGCCCAGCCAGTGCCGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCCGA
AACAGAGGATTTTCAGATGGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGA
GCTAATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCAAGCGGTGGTGGTGTTGCTAT
GGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGTCCAAGAA
AGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGACGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTCGA
GTAAGGCGCGTTTGCTTGGATGTTATCTGTTTTTGTAACGTTTTGGAACCTCTTTGAAAC
CTATATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCT
CAAGAGATTTTACACAA
ACATGATCTTTTATTTGC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2GN44TF 575 0 0
GGC
ACTTCTTTCATTGCCGTCTTCAGAAACCCCTTAGGTTTCCGCTGCCTCCTGCGAGATCCT
CCTATCAACTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCCTGCTCGCCGTTCTAAGCGG
AAAAGCTTGCCCAGCCAGTGCCGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCCGAAAC
AGAGGATTCTCAGATGGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGAGCT
AATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCAAGCGGTGGTGGTGTTGCTATGGC
TTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGTCCAAGAAAGA
AGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGACGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTCGAGTA
AGGCGCGTTTGCTTGGATGTTATCTGTTTTTGTAACGTTTTGGAACCTCTTTGAAACCTA
TATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAA*TTCTCAA
GAGATTTTACACAA
ACATGATCTTTTATTTGC

QA 4 557 4 557
DS 

RD RR2B211TF 561 0 0
GG
ACTTCTTTCATTGCCGTCTTCAGAAACCCCTTAGGTTTCCGCTGCTTCCTGCGAGATCCT
CCCATCAACTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCCTGCTCGCCGCTCTAAGCGG
AAAAGCTTGCCCAACCAGTGCCGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCCGAAAC
AGAGGATTCTCAGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGAGCT
AATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTCGGCTTCAGTACCAAGCGGTGGTGGTGTTGCTATGGC
TTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGTCCAAGAAAGA
AGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGACGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTCGAGTA
AGGCGCGTTTTCTTGGATGTTATCTGTTTTTGTAACGTTTTGGAACCTCTTTGAAACCTA
TATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTCAA
GAGATTTTACACAAACATG

QA 3 561 3 561
DS 

RD RR2B211JQ 240 0 0
GGTGGAGGAGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGTCCAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAG
GAAGAATCCGACGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTCGAGTAAGGCGCGTTTTTTTGGATG
TTATCTGTTTTTGTAACGTTTTGGAACCTCTTTGAAACCTATATGTTGTTGTTTTCTAGT
TTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTCAAGAGATTTTACACAAACATG

QA 1 240 1 240
DS 



AS 1 7

CO CL1142Contig1 782 7 7 U
GGAAGCTAAAACGCTTAACTCCAAAACAGAAAGTCAAGTGGGTTTTGGGTTTGCCGAGCT
ACTTGTATAAATAGAGCCAAAACCGCAGTCTCTTCTTCCATCAAACATTCTTCATTAGAT
ATTTTCTCTTCTACTATTTTAAGCAAACAAAAGAATTTTTTATAGTAAAGAAATGGAAGA
AACAAAGGAGAGAAAGATCGTAGTAGCAGTGGACGAGAGCGAAGAGAGCATGGAAGCTCT
TTCATGGAGTCTTGACAATCTTTTTCCATATGGTTCCAATAATACCCTCATCCTCCTCTA
CGTCAAGCCCCCTCTTCCCGTTTATTCTTCCATTGATGCCGCAGGGTTTATAGTGACCGG
AGATCCGGTTGCAGCCTTGAAGAAATACGAAAATGAGCTTGTGGAATCAGTCATGGCTCG
ATCTCGAAACGTCTACCAAGATTTTGAGTCCGATTTTAATATAGAGAGAAAAGTTGGAAG
AGGAGATGCCAAGGAAGTAATATGTAACGCAGTTCAGAACCTTAAGGCTGATATGTTAGT
TATGGGCACACATGACTATGGCTTCTTCAAAAGGGCTTTGCTAGGCAGTGTGAGCGAGTA
TTGCGCCAAACGTGTGAAGTGTCCTGTGATTATTGTGAAGAAGAATATGCCTCAAAATAA
TTGAGCTCAAAAGTCACAAGTCTTATGATTATGTATGTTTGAGAGCAA*TTGATGCAAAT
AGTTGAATCAATATTCGTATGCAATCATGTATATTATATATATGAATTACTTTTACGTTT
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2FL10TF U 1
AF RR2GS18TF U 98
AF RR2BA81JQ C 281
AF RR2CU29JQ C 100
AF RR2CU29TF U 101
AF RR2BA81TF U 98
AF RR2GS18JQB C 107
BS 1 656 RR2FL10TF
BS 657 657 RR2GS18TF
BS 658 693 RR2FL10TF
BS 694 695 RR2GS18TF
BS 696 742 RR2FL10TF
BS 743 765 RR2GS18TF
BS 766 782 RR2GS18JQB

RD RR2FL10TF 748 0 0
GGAAGCTAAAACGCTTAACTCCAAAACAGAAAGTCAAGTGGGTTTTGGGTTTGCCGAGCT
ACTTGTATAAATAGAGCCAAAACCGCAGTCTCTTCTTCCATCAAACATTCTTCATTAGAT
ATTTTCTCTTCTACTATTTTAAGCAAACAAAAGAATTTTTTATAGTAAAGAAATGGAAGA
AACAAAGGAGAGAAAGATCGTAGTAGCAGTGGACGAGAGCGAAGAGAGCATGGAAGCTCT
TTCATGGAGTCTTGACAATCTTTTTCCATATGGTTCCAATAATACCCTCATCCTCCTCTA
CGTCAAGCCCCCTCTTCCCGTTTATTCTTCCATTGATGCCGCAGGGTTTATAGTGACCGG
AGATCCGGTTGCAGCCTTGAAGAAATACGAAAATGAGCTTGTGGAATCAGTCATGGCTCG
ATCTCGAAACGTCTACCAAGATTTTGAGTCCGATTTTAATATAGAGAGAAAAGTTGGAAG
AGGAGATGCCAAGGAAGTAATATGTAACGCAGTTCAGAACCTTAAGGCTGATATGTTAGT
TATGGGCACACATGACTATGGCTTCTTCAAAAGGGCTTTGCTAGGCAGTGTGAGCGAGTA
TTGCGCCAAACGTGTGAAGTGTCCTGTGATTATTGTGAAGAAGAATATGCCTCAAA*TAA
TTGAGCTCAAAAGTCACAAGTCTTATGATTATG**TGTTTGAGAGCAA*TTGATGCAAAT
AGTTGAATCAATATTCGTATGC
ATCATG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2GS18TF 671 0 0
GGAT
CAAACATTCTTCATTAGATATTTTCTCTTCTACTATTTTAAGCAAACAAAAGAATTTTTT
ATAGTAAAGAAATGGAAGAAACAAAGGAGAGAAAGATCGTAGTAGCAGTGGACGAGAGCG
AAGAGAGCATGGAAGCTCTTTCATGGAGTCTTGACAATCTTTTTCCATATGGTTCCAATA
ATACCCTCATCCTCCTCTACGTCAAGCCCCCTCTTCCCGTTTATTCTTCCATTGATGCCG
CAGGGTTTATAGTGACCGGAGATCCGGTTGCAGCCTTGAAGAAATACGAAAATGAGCTTG
TGGAATCAGTCATGGCTCGATCTCGAAACGTCTACCAAGATTTTGGGTCCGATTTTAATA
TAGAGAGAAAAGTTGGAAGAGGAGATGCCAAGGAAGTAATATGTAACGCAGTTCAGAACC
TTAAGGCTGATATGTTAGTTATGGGCACACATGACTATGGCTTCTTCAAAAGGGCTTTGC
TAGGCAGTGTGAGCGAGTATTGCGCCAAACGTGTGAAGTGTCCTGTGATTATTGTGAAGA
AGAATATGCCTCAAAATAATTGAGCTCAAAAGTCACAAGTCTTATGATTATGTATGTTTG
AGAGCAA*TTGATGCAA*TAGTTGAATCAATATTCGTATGCAATCATGTATATTATATAT
ATGA
TTA

QA 5 668 5 668
DS 

RD RR2BA81JQ 462 0 0
AATACCCTCATCCTCCTTTACGTCAAGCCCCCTCTTCCCGTTTATTCTTCCATTGATGCC
GCAGGGTTTATAGTGACCGGAGATCCGGTTGCAGCCTTGAAGAAATACGAAAATGAGCTT
GTGGAATCAGTCATGGCTCGATCTCGAAACGTCTACCAAGATTTTGAGTCCGATTTTAAT
ATAGAGAGAAAAGTTGGAAGAGGAGATGCCAAGGAAGTAATATGTAACGCAGTTCAGAAC
CTTAAGGCTGATATGTTAGTTATGGGCACACATGACTATGGCTTCTTCAAAAGGGCTTTG
CTAGGCAGTGTGAGCGAGTATTGCGCCAAACGTGTGAAGTGTCCTGTGATTATTGTGAAG
AAGAATATGCCTCAAAATAATTGAGCTCAAAAGCCACAAGTCTTATGATTATGTATGTTT
GAGAGCAA*TTGATGCAAATAGTTGAATCAATATTCGTATGC

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2CU29JQ 643 0 0
GG
CAAACATTCTTCATTAGATATTTTCTCTTCTACTATTTTAAGCAAACAAAAGAATTTTTT
ATAGCAAAGAAATGGAAGAAACAAAGGAGAGAAAGATCGTAGTAGCAGTGGACGAGAGCG
AAGAGAGCATGGAAGCTCTTTCATGGAGTCTTGACAATCTTTTTCCATATGGTTCCAATA
ATACCCTCATCCTCCTCTACGTCAAGCCCCCTCTTCCCGTTTATTCTTCCATTGATGCCG
CAGGGTTTATAGTGACCGGAGATCCGGTTGCAGCCTTGAAGAAATACGAAAATGAGCTTG
TGGAATCAGTCATGGCTCGATCTCGAAACGTCTACCAAGATTTTGAGTCCGATTTTAATA
TAGAGAGAAAAGTTGGAAGAGGAGATGCCAAGGAAGTAATATGTAACGCAGTTCAGAACC
TTAGGGCTGATATGTTAGTTATGGGCACACATGACTATGGCTTCTTCAAAAGGGCTTTGC
TAGGCAGTGTGAGCGAGTATTGCGCCAAACGTGTGAAGTGTCCTGTGGTTATTGTGAAGA
AGAATATGCCTCAAAATAATTGAGCTCAAAAGTCACAAGTCTTATGATTATGTATGTTTG
AGAGCAAATTGATGCAAATAGTTGAATCAATATTCGTATGC

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR2CU29TF 642 0 0
G
CAAACATTCTTCATTAGATATTTTCTCTTCTACTATTTTAAGCAAACAAAAGAATTTTTT
ATAGCAAAGAAATGGAAGAAACAAAGGAGAGAAAGATCGTAGTAGCAGTGGACGAGAGCG
AAGAGAGCATGGAAGCTCTTTCATGGAGTCTTGACAATCTTTTTCCATATGGTTCCAATA
ATACCCTCATCCTCCTCTACGTCAAGCCCCCTCTTCCCGTTTATTCTTCCATTGATGCCG
CAGGGTTTATAGTGACCGGAGATCCGGTTGCAGCCTTGAAGAAATACGAAAATGAGCTTG
TGGAATCAGTCATGGCTCGATCTCGAAACGTCTACCAAGATTTTGAGTCCGATTTTAATA
TAGAGAGAAAAGTTGGAAGAGGAGATGCCAAGGAAGTAATATGTAACGCAGTTCAGAACC
TTAGGGCTGATATGTTAGTTATGGGCACACATGACTATGGCTTCTTCAAAAGGGCTTTGC
TAGGCAGTGTGAGCGAGTATTGCGCCAAACGTGTGAAGTGTCCTGTGGTTATTGTGAAGA
AGAATATGCCTCAAAATAATTGAGCTCAAAAGTCACAAGTCTTATGATTATGTATGTTTG
AGAGCAA*TTGATGCAAATAGTTGAATCAATATTCGTATGC

QA 2 642 2 642
DS 

RD RR2BA81TF 645 0 0
GGGATC
AACATTCTTCATTAGATATTTTCTCTTCTACTATTTTAAGCAAACAAAAGAATTTTTTAT
AGTAAAGAAATGGAAGAAACAAAGGAGAGAAAGATCGTAGTAGCAGTGGACGAGAGCGAA
GAGAGCATGGAAGCTCTTTCATGGAGTCTTGACAATCTTTTTCCATATGGTTCCAATAAT
ACCCTCATCCTCCTCTACGTCAAGCCCCCTCTTCCCGTTTATTCTTCCATTGATGCCGCA
GGGTTTATAGTGACCGGAGATCCGGTTGCAGCCTTGAAGAAATACGAAAATGAGCTTGTG
GAATCAGTCATGGCTCGATCTCGAAACGTCTACCAAGATTTTGAGTCCGATTTTAATATA
GAGAGAAAAGTTGGAAGAGGAGATGCCAAGGAAGTAATATGTAACGCAGTTCAGAACCTT
AAGGCTGATATGTTAGTTATGGGCACACATGACTATGGCTTCTTCAAAAGGGCTTTGCTA
GGCAGTGTGAGCGAGTATTGCGCCAAACGTGTGAAGTGTCCTGTGATTATTGTGAAGAAG
AATATGCCTCAAAATAATTGAGCTCAAAAGCCACAAGTCTTATGATTATGTATGTTTGAG
AGCAA*TTGATGCAAATAGTTGAATCAATATTCGTATGC

QA 7 645 7 645
DS 

RD RR2GS18JQB 676 0 0
ATTCTTCATTAGATATTTTCTCTTCTACTATTTTAAGCAAACAAAAGAATTTTTTATAGT
AAAGAAATGGAAGAAACAAAGGAGAGAAAGATCGTAGTAGCAGTGGACGAGAGCGAAGAG
AGCATGGAAGCTCTTTCATGGAGTCTTGACAATCTTTTTCCATATGGTTCCAATAATACC
CTCATCCTCCTCTACGTCAAGCCCCCTCTTCCCGTTTATTCTTCCATTGATGCCGCAGGG
TTTATAGTGACCGGAGATCCGGTTGCAGCCTTGAAGAAATACGAAAATGAGCTTGTGGAA
TCAGTCATGGCTCGATCTCGAAACGTCTACCAAGATTTTGGGTCCGATTTTAATATAGAG
AGAAAAGTTGGAAGAGGAGATGCCAAGGAAGTAATATGTAACGCAGTTCAGAACCTTAAG
GCTGATATGTTAGTTATGGGCACACATGACTATGGCTTCTTCAAAAGGGCTTTGCTAGGC
AGTGTGAGCGAGTATTGCGCCAAACGTGTGAAGTGTCCTGTGATTATTGTGAAGAAGAAT
ATGCCTCAAAATAATTGAGCTCAAAAGTCACAAGTCTTATGATTATGTATGTTTGAGAGC
AA*TTGATGCAAATAGTTGAATCAATATTCGTATGCAATCATGTATATTATATATATGAA
TTACTTTTACGTTTTT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 7

CO CL1143Contig1 723 7 4 U
GGATCCAATAACAATTACTTGGACGGTCTCTTCTTCCTCAGATAAACGAGAAAAAAATCT
CTAAATGGCGTCAGTTTCTGCAAGTTTGCCTCCACCATTGCTGCTCACTCAGAGAAAACC
TAACCTCACATCAGTTCAGAAACTCCCGTTTTCTCTTATTCGAGATAGAAGAAACCCTAG
CATGGGTGTTATGGTAAAAGCTAATGGTAAAAGTTCTGAATCATCGACTGATCTTGACGT
CGTTAGTTCAATTCAGAATGTTTGGGATAAATCTGAAGATCGTTTAGGTCTTATTGGTTT
GAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCGTCACTTAACATAATCACGGCAATCGACAA
ATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTTGGTATCTTGTTCTCCACGTGGTTTAC
ATATCGATATCTCTTGTTCAAACCCGACAGAGAGGAGCTATCCCAAATTGTCAAGAAATC
AGTGGCGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTTCTCAAAAGAAGAAAAAAA*GATATA
CTTGGCCAATAAGGCAGTAAATGCATGTGGTATCCTGAGATGATTTGTGTTTGTGACATG
ATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTGCTGAACCTGTAAATACTGTATTGTGG
GTTTTAGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTTATATAAAGAATTAAGACATCA
AGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 10 10 
10 10 

AF RR2EC80TF U 1
AF RR2EC80JQ C 43
AF RR2FO09JQ C 38
AF RR2FO09TF U 38
AF RR2B970JQ C 15
AF RR2B970TF U 15
AF RR2ER01TF U 38
BS 1 533 RR2EC80TF
BS 534 534 RR2FO09TF
BS 535 719 RR2EC80TF
BS 720 723 RR2ER01TF

RD RR2EC80TF 722 0 0
GGATCCAATAACAATTACTTGGACGGTCTCTTCTTCCTCAGATAAACGAGAAAAAAATCT
CTAAATGGCGTCAGTTTCTGCAAGTTTGCCTCCACCATTGCTGCTCACTCAGAGAAAACC
TAACCTCACATCAGTTCAGAAACTCCCGTTTTCTCTTATTCGAGATAGAAGAAACCCTAG
CATGGGTGTTATGGTAAAAGCTAATGGTAAAAGTTCTGAATCATCGACTGATCTTGACGT
CGTTAGTTCAATTCAGAATGTTTGGGATAAATCTGAAGATCGTTTAGGTCTTATTGGTTT
GAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCGTCACTTAACATAATCACGGCAATCGACAA
ATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTTGGTATCTTGTTCTCCACGTGGTTTAC
ATATCGATATCTCTTGTTCAAACCCGACAGAGAGGAGCTATCCCAAATTGTCAAGAAATC
AGTGGCGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTTCTCAAAAGAAGAAAAAAAAGATATA
CTTGGCCAATAAGGCAGTAAATGCATGTGGTATCCTGAGATGATTTGTGTTTGTGACATG
ATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTGCTGAACCTGTAAATACTGTATTGTGG
GTTTTAGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTTATATAAAGAATTAAGACATC
AAA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2EC80JQ 677 0 0
TAAACGAGAAAAAAATCTCTAAATGGCGTCAGTTTCTGCAAGTTTGCCTCCACCATTGCT
GCTCACTCAGAGAAAACCTAACCTCACATCAGTTCAGAAACTCCCGTTTTCTCTTATTCG
AGATAGAAGAAACCCTAGCATGGGTGTTATGGTAAAAGCTAATGGTAAAAGTTCTGAATC
ATCGACTGATCTTGACGTCGTTAGTTCAATTCAGAATGTTTGGGATAAATCTGAAGATCG
TTTAGGTCTTATTGGTTTGAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCGTCACTTAACAT
AATCACGGCAATCGACAAATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTTGGTATCTT
GTTCTCCACGTGGTTTACATATCGATATCTCTTGTTCAAACCCGACAGAGAGGAGCTATC
CCAAATTGTCAAGAAATCAGTGGCGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTTCTCAAAA
GAAGAAAAAAA*GATATACTTGGCCAATAAGGCAGTAAATGCATGTGGTATCCTGAGATG
ATTTGTGTTTGTGACATGATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTGCTGAACCT
GTAAATACTGTATTGTGGGTTTTAGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTTATA
TAAAGAATTAAGACATC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2FO09JQ 682 0 0
GG
AGATAAACGAGAAAAAAATCTCTAAATGGCGTCAGTTTCTGCAAGTTTGCCTCCACCATT
GCTGCTCACTCAGAGAAAACCTAACCTCACATCAGTTCAGAAACTCCCGTTTTCTCTTAT
TCGAGATAGAAGAAACCCTAGCATGGGTGTTATGGTAAAAGCTAATGGTAAAAGTTCTGA
ATCATCGACTGATCTTGACGTCGTTAGTTCAATTCAGAATGTTTGGGATAAATCTGAAGA
TCGTTTAGGTCTTATTGGTTTGAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCGTCACTTAA
CATAATCACGGCAATCGACAAATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTTGGTAT
CTTGTTCTCCACGTGGTTTACATATCGATATCTCTTGTTCAAACCCGACAGAGAGGAGCT
ATCCCAAATTGTCAAGAAATCAGTGGCGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTTCTCA
AAAGAAGAAAAAAA*GATATACTTGGCCAATAAGGCAGTAAATGCATGTGGTATCCTGAG
ATGATTTGTGTTTGTGACATGATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTGCTGAA
CCTGTAAATACTGTATTGTGGGTTTTAGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTT
ATATAAAGAATTAAGACATC

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR2FO09TF 682 0 0
GG
AGATAAACGAGAAAAAAATCTCTAAATGGCGTCAGTTTCTGCAAGTTTGCCTCCACCATT
GCTGCTCACTCAGAGAAAACCTAACCTCACATCAGTTCAGAAACTCCCGTTTTCTCTTAT
TCGAGATAGAAGAAACCCTAGCATGGGTGTTATGGTAAAAGCTAATGGTAAAAGTTCTGA
ATCATCGACTGATCTTGACGTCGTTAGTTCAATTCAGAATGTTTGGGATAAATCTGAAGA
TCGTTTAGGTCTTATTGGTTTGAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCGTCACTTAA
CATAATCACGGCAATCGACAAATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTTGGTAT
CTTGTTCTCCACGTGGTTTACATATCGATATCTCTTGTTCAAACCCGACAGAGAGGAGCT
ATCCCAAATTGTCAAGAAATCAGTGGCGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTTCTCA
AAAGAAGAAAAAAA*GATATACTTGGCCAATAAGGCAGTAAATGCATGTGGTATCCTGAG
ATGATTTGTGTTTGTGACATGATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTGCTGAA
CCTGTAAATACTGTATTGTGGGTTTTAGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTT
ATATAAAGAATTAAGACATC

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR2B970JQ 705 0 0
GG
ACTTGGACGGTCTCTTCTTCCTCAGATAAACGAGAAAAAAATCTCTAAATGGCGTCAGTT
TCTGCAAGTTTGCCTCCACCATTGCTGCTCACTCAGAGAAAACCTAACCTCACATCAGTT
CAGAAACTCCCGTTTTCTCTTATTCGAGATAGAGGAAACCCTAGCATGGGTGTTATGGTA
AAAGCTAATGGTAAAAGTTCTGAATCATCGACTGATCTTGACGTCGTTAGTTCAATTCAG
AATGTTTGGGATAAATCTGAAGATCGTTTAGGTCTTATTGGTTTGAGTTTTGCTGCTATT
GTAGCTCTTTGGGCGTCACTTAACATAATCACGGCAATCGACAAATTGCCTGTTATCTCC
TCTGGGTTTGAACTAGTTGGTATCTTGTTCTCCACGTGGTTTACATATCGATATCTCTTG
TTCAAACCCGACAGAGAGGAGCTATCCCAAATTGTCAAGAAATCAGTGGCGAATATACTT
GGCCAGTAGAAAACCCTTTCTCAAAAGAAGAAAAAAA*GATATACTTGGCCAATAAGGCA
GTAAATGCATGTGGTATCCTGAGATGATTTGTGTTTGTGACATGATAGATGTTGTTATCT
CTGGTTCATGTTCATGTGCTGAACCTGTAAATACTGTATTGTGGGTTTTAGTTGCTGTTT
CTTGTGAACAAATCAATCATTTTATATAAAGAATCAAGACATC

QA 3 705 3 705
DS 

RD RR2B970TF 705 0 0
GG
ACTTGGACGGTCTCTTCTTCCTCAGATAAACGAGAAAAAAATCTCTAAATGGCGTCAGTT
TCTGCAAGTTTGCCTCCACCATTGCTGCTCACTCAGAGAAAACCTAACCTCACATCAGTT
CAGAAACTCCCGTTTTCTCTTATTCGAGATAGAGGAAACCCTAGCATGGGTGTTATGGTA
AAAGCTAATGGTAAAAGTTCTGAATCATCGACTGATCTTGACGTCGTTAGTTCAATTCAG
AATGTTTGGGATAAATCTGAAGATCGTTTAGGTCTTATTGGTTTGAGTTTTGCTGCTATT
GTAGCTCTTTGGGCGTCACTTAACATAATCACGGCAATCGACAAATTGCCTGTTATCTCC
TCTGGGTTTGAACTAGTTGGTATCTTGTTCTCCACGTGGTTTACATATCGATATCTCTTG
TTCAAACCCGACAGAGAGGAGCTATCCCAAATTGTCAAGAAATCAGTGGCGAATATACTT
GGCCAGTAGAAAACCCTTTCTCAAAAGAAGAAAAAAA*GATATACTTGGCCAATAAGGCA
GTAAATGCATGTGGTATCCTGAGATGATTTGTGTTTGTGACATGATAGATGTTGTTATCT
CTGGTTCATGTTCATGTGCTGAACCTGTAAATACTGTATTGTGGGTTTTAGTTGCTGTTT
CTTGTGAACAAATCAATCATTTTATATAAAGAATCAAGACATC

QA 3 705 3 705
DS 

RD RR2ER01TF 686 0 0
GG
AGATAAACGAGAAAAAAATCTCTAAATGGCGTCAGTTTCTGCAAGTTTGCCTCCACCATT
GCTGCTCACTCATAGAAAACCTAACCTCACATCAGTTCAGAAACTCCCGTTTTCTCTTAT
TCGAGATAGAAGAAACCCTAGCATGGGTGTTATGGTAAAAGCTAATGGTAAAAGTTCTGA
ATCATCGACTGATCTTGACGTCGTTAGTTCAATTCAGAATGTTTGGGATAAATCTGAAGA
TCGTTTAGGTCTTATTGGTTTGAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCGTCACTTAA
CATAATCACGGCAATCGACAAATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTTGGTAT
CTTGTTCTCCACGTGGTTTACATATCGATATCTCTTGTTCAAACCCGACAGAGAGGAGCT
ATCCCAAATTGTCAAGAAATCAGTGGCGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTTCTCA
AAAGAAGAAAAAAA*GATATACTTGGCCAATAAGGCAGTAAATGCATGTGGTATCCTGAG
ATGATTTGTGTTTGTGACATGATAGATGTTGTTATCCCTGGTTCATGTTCATGTGCTGAA
CCTGTAAATACTGTATTGTGGGTTTTAGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTT
ATATAAAGAATTAAGACATCAAGA

QA 3 686 3 686
DS 



AS 1 6

CO CL1144Contig1 790 6 9 U
GGAATCAGACAAAAGCCTCTCATACCTCTCTATTGGGGGATCTGAATCTTTCACTTTCTC
TGAGATTCTTTTGAAGAAAAAGATTAGAAGAGAAGAAGGAGAAGAAAAATGCCGCATGGA
ACGCTTGAAGTTGTTCTTGTCAGCGCCAAAGGTCTCGAGGATTCTGATTTTCTGAATAGC
ATGGATCCTTATGTGCTCCTCACTTGCCGGACTCAAGATCAGAAGAGCAATGTTGCATCA
GGACAAGGCACAACTCCGGAATGGAATGAGACATTTATCTTCAATGTCTCTGAAGGAACT
ACAGAATTAAAAGCCAAACTCTTTGACACAGATGTTGGCACAGAGGATGATCCCCTTGGT
GAAGCAACTATTCCATTGGAGGCGGTTTTCCTGGAAGGAGATATCCCACCAGCTGCATAC
AATGTGGTGAAGGATGAAGAGTTCAAAGGCGAGATCTGGATCGGACTATCCTTCAAACCT
TCGGAAAACCGAAGCAGAGGTTTCGAAGAAGAGTCTTATGGAGGCTGGAAAAACTCTGAA
GCTTCTTACTAAAGAGATCAAAAACACCAAATGTGTGTTACTCTTTAATTTTGTTGAGTC
TTGGGAATAAAATGTTGAAAAAGGAGTTCTGTTAAGAGAGTTTCTTCTTATTCTTATTTC
TATTATTA*TTATTGTTGTTCTGTTCTGTTTGAAATTCAAAACTCTCGAGAGTTTGATTT
GTTTGTCAAGAATTTGTTTCAGTCTTGTTTTTGGTATTTAAGAAAATATATTTTCAATTC
TAGTTTTATG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG85TF U 30
AF RR2GS12TF U 1
AF RR2B334TF U 2
AF RR2C461TF U 60
AF RR2DA27TF U 42
AF RR2GS12JQB C 202
BS 1 623 RR2GS12TF
BS 624 624 RR2B334TF
BS 625 648 RR2GS12TF
BS 649 649 RR2B334TF
BS 650 707 RR2GS12TF
BS 708 765 RR2B334TF
BS 766 766 RR2GS12JQB
BS 767 778 RR2B334TF
BS 779 790 RR2GS12JQB

RD RR2DG85TF 377 0 0
GG
ATTGGGGGATCTGAATCTTTCACTTTCTCTGAGATTCTTTTGAAGAAAAAGATTAGAAGA
GAAGAAGGAGAAGAAAAATGCCGCATGGAACGCTTGAAGTTGTTCTTGTCAGCGCCAAAG
GTCTCGAGGATTCTGATTTTCTGAATAGCATGGATCCTTATGTGCTCCTCACTTGCCGGA
CTCAAGATCAGAAGAGCAATGTTGCATCAGGACAAGGCACAACTCCGGAATGGAATGAGA
CATTTATCTTCAATGTCTCTGAAGGAACTACAGAATTAAAAGCCAAACTCTTTGACACAG
ATGTTGGCACAGAGGATGATCCCCTTGGTGAAGCAACTATTCCATTGGAGGCGGTTT*CC
TGGAAGGAGATATCC

QA 3 377 3 377
DS 

RD RR2GS12TF 707 0 0
GGAATCAGACAAAAGCCTCTCATACCTCTCTATTGGGGGATCTGAATCTTTCACTTTCTC
TGAGATTCTTTTGAAGAAAAAGATTAGAAGAGAAGAAGGAGAAGAAAAATGCCGCATGGA
ACGCTTGAAGTTGTTCTTGTCAGCGCCAAAGGTCTCGAGGATTCTGATTTTCTGAATAGC
ATGGATCCTTATGTGCTCCTCACTTGCCGGACTCAAGATCAGAAGAGCAATGTTGCATCA
GGACAAGGCACAACTCCGGAATGGAATGAGACATTTATCTTCAATGTCTCTGAAGGAACT
ACAGAATTAAAAGCCAAACTCTTTGACACAGATGTTGGCACAGAGGATGATCCCCTTGGT
GAAGCAACTATTCCATTGGAGGCGGTTTTCCTGGAAGGAGATATCCCACCAGCTGCATAC
AATGTGGTGAAGGATGAAGAGTTCAAAGGCGAGATCTGGATCGGACTATCCTTCAAACCT
TCGGAAAACCGAAGCAGAGGTTTCGAAGAAGAGTCTTATGGAGGCTGGAAAAACTCTGAA
GCTTCTTACTAAAGAGATCAAAAACACCAAATGTGTGTTACTCTTTAATTTTGTTGAGTC
TTGGGAATAAAATGTTGAAAAAG*AGTTCTGTTAAGAGAGTTTCTTCT*ATTCTTATTTC
TATTATTA*TTATTGTTGTTCTGTTCTGTTTGAAATTCAAAACTCTC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2B334TF 777 0 0
GG
ATCAGACAAAAGCCTCTCATACCTCTCTATTGGGGGATCTGAATCTTTCACTTTCTCTGA
GATTCTTTTGAAGAAAAAGATTAGAAGAGAAGAAGGAGAAGAAAAATACCGCATGGAACG
CTTGAAGTTGTTCTTGTCAGCGCCAAAGGTCTCGAGGATTCTGATTTTCTGAATAGCATG
GATCCTTATGTGCTCCTCACTTGCCGGACTCAAGATCAGAAGAGCAATGTTGCATCAGGA
CAAGGCACAACTCCGGAATGGAATGAGACATTTATCTTCAATGTCTCTGAAGGAACTACA
GAATTAAAAGCCAAACTCTTTGACACAGATGTTGGCACAGAGGATGATCCCCTTGGTGAA
GCAACTATTCCATTGGAGGCGGTTTTCCTGGAAGGAGATATCCCACCAGCTGCATACAAT
GTGGTGAAGGATGAAGAGTTCAAAGGCGAGATCTGGATCGGACTATCCTTCAAACCTTCG
GAAAACCGAAGCAGAGGTTTCGAAGAAGAGTCTTATGGAGGCTGGGAAAACTCTGAAGCT
TCTTACTAAAGAGATCAAAAACACCAAATGTGTGTTACTCTTTAATTTTGTTGAGTCTTG
GGAATAAAATGTTGAAAAAGGAGTTCTGTTAAGAGAGTTTCTTCTTATTCTTATTTCTAT
TATTAATTATTGTTGTTCTGTTCTGTTTGAAATTCAAAACTCTCGAGAGTTTGATTTGTT
TGTCAAGAATTTGTTTCAGTCTTGTTTTTGGTATTTAAGAAA*TATATTTTCAAT

QA 3 777 3 777
DS 

RD RR2C461TF 698 0 0
GG
GAGATTCTTTTGAAGAAAAAGATCAGAAGAGAAGAAGAAGAAGAAAAATGCCGCATGGAA
CGCTTGAAGTTGTTCTTGTCAGCGCCAAAGGTCTCGAGGATTCTGATTTTCTGAATAGCA
TGGATCCTTATGTGCTCCTCACTTGCCGGACTCAGGACCAGAAGAGCAATGTTGCCTCAG
GACAAGGCACAACTCCGGAATGGAATGAGACATTTATCTTCAATGTCTCTGAAGGAACTA
CAGAGTTAAAAGCCAAACTCTTTGACACAGATGTTGGCACAGAGGATGATCCCCTTGGTG
AAGCAACTATTCCATTGGAGGCGGTTTTCCTGGAAGGAGATATCCCACCAGCTGCATACA
ATGTGGTGAAGGATGAAGAGTTCAAAGGCGAGATCTGGATCGGACTATCCTTCAAACCTT
CGGAAAACCGAAGCAGGGGTTTCGAAGAAGGGTCTTATGGAGGCTGGAAAAACTCTGAAG
CTTCTTACTAAAGAGATCAAAAACACCAAATGTGTGTTACTCTTTAATTT*GTTGAGTCT
TGGGAATAAAATGTTGAAAAAGGAGTTCTGTTAAGAGAGTTTCTTCTTATTCTTATTTCT
ATTATTA*TTATTGTTGTTCTGTTCTGTTTGAAATTCAAAACTCTCGAGAGTTTGATTTG
TTTGTCAAGAATTTGTTTCAGTCTTGTTTT
GGTATT

QA 3 692 3 692
DS 

RD RR2DA27TF 686 0 0
GG
GAATCTTTCACTTTCTCTGAGATTCTTTTGAAGAAAAAGATTAGAAGAGAAGAAGGAGAA
GAAAAATGCCGCATGGAACGCTTGAAGTTGTTCTTGTCAGCGCCAAGGGTCTCGAGGATT
CTGATTTTCTGAATAGCATGGATCCTTATGTGCTCCTCACTTGCCGGACTCAAGATCAGA
AGAGCAATGTTGCATCAGGACAAGGCACAACTCCGGAATGGAATGAGACATTTATCTTCA
ATGTCTCTGAAGGAACTACAGAATTAAAAGCCAAACTCTTTGACACAGATGTTGGCACAG
AGGATGATCCCCTTGGTGAAGCAACTATTCCATTGGAGGCGGTTTTCCTGGAAGGAGATA
TCCCACCAGCTGCATACAATGTGGTGAAGGATGAAGAGTTCAAAGGCGAGATCTGGATCG
GACTATCCTTCAAACCTTCGGAAAACCGAAGCAGAGGTTTCGAAGAAGAGTCTTATGGAG
GCTGGAAAAACTCTGAAGCTTCTTACTAAAGAGATCAAAAACACCAAATGTGTGTTACTC
TTTAATTTTGTTGAGTCTTGGGAATAAAATGTTGAAAAAGGAGTTCTGTTAAGAGAGTTT
CTTCTTATTCTTATTTCTATTATTA*TTATTGTTGTTCTGTTCTGTTTGAAATTCAAAAC
TCTCGAGAGTTTGATTTGTTTGTC

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR2GS12JQB 589 0 0
ACTTGCCGGACTCAAGATCAGAAGAGCAATGTTGCATCAGGACAAGGCACAACTCCGGAA
TGGAATGAGACATTTATCTTCAATGTCTCTGAAGGAACTACAGAATTAAAAGCCAAACTC
TTTGACACAGATGTTGGCACAGAGGATGATCCCCTTGGTGAAGCAACTATTCCATTGGAG
GCGGTTTTCCTGGAAGGAGATATCCCACCAGCTGCATACAATGTGGTGAAGGATGAAGAG
TTCAAAGGCGAGATCTGGATCGGACTATCCTTCAAACCTTCGGAAAACCGAAGCAGAGGT
TTCGAAGAAGAGTCTTATGGAGGCTGGAAAAACTCTGAAGCTTCTTACTAAAGAGATCAA
AAACACCAAATGTGTGTTACTCTTTAATTTTGTTGAGTCTTGGGAATAAAATGTTGAAAA
AGGAGTTCTGTTAAGAGAGTTTCTTCTTATTCTTATTTCTATTATTA*TTATTGTTGTTC
TGTTCTGTTTGAAATTCAAAACTCTCGAGAGTTTGATTTGTTTGTCAAGAATTTGTTTCA
GTCTTGTTTTTGGTATTTAAGAAAATATATTTTCAATTCTAGTTTTATG

QA 1 589 1 589
DS 



AS 2 7

CO CL1145Contig1 591 5 5 U
GGACAAAGACAAATCTCACAAACAAACAATCTTTCTCTAAAAAGGTTAACATTTTCTCCT
CTTCAATACGGCTTCCAAAACTCTTGCCATTGTTCTCCTCTTCAACATCATCTGCTTCAC
TGCAGTTAACGCTACAGGTTGTCCCAATGCCGGAAATTTAGTCACGGTGTGTGCAGATTT
GTTGAATGGAGTGGTCAAGGTTTCTCTGCCAGCAGGAACCGAATGTTGCACACTTCTCAA
AGGCATTGTGGACGCAAATGCAGCCGTTTGTCTTTGTACCGCTGTTAAAGCTAATATCGG
AAGCCTTCTTCCCTTGTTGAACATTCCCCTAGCTGTCAGCCTTACACTCAATGCTTGTGG
TGTTCCATCGGGTATTCCATGCCTCTAAAACAATATGTTTTATATATTTCTTGAAAACTT
TTATGTGTTTTTGTTTTCAAGAAAATGAGTTATGTTATTTTAAGTTTTTTTTTTTT*CCT
TTAAGTTGTTCCACATAAGGTCTTTATAATGACCATTGAGTTTGCAAAAGTTGTAGTCAC
GTACTTCTTTGTCGTAATTTATTAATTAATAGAAAACACACACTTTATTTT


BQ
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2CJ42JQ C 1
AF RR2CJ42TF U 1
AF RR2EO75TF U 1
AF RR2BC38TF U -2
AF RR2EO75JQ C 97
BS 1 473 RR2CJ42TF
BS 474 475 RR2EO75TF
BS 476 579 RR2CJ42TF
BS 580 587 RR2EO75TF
BS 588 591 RR2EO75JQ

RD RR2CJ42JQ 579 0 0
GGACAAAGACAAATCTCACAAACAAACAATCTTTCTCTAAAAAGGTTAACATTTTTTCCT
CTTCAATACGGCTTCCAAAACTCTTGCCATTGTTTTCCTTTTCAACATCATTTGCTTCAC
TGCAGTTAACGCTACAGGTTGTCCCAATGCCGGAAATTTAGTCACGGTGTGTGCAGATTT
GTTGAATGGAGTGGTCAAGGTTTTTTTGCCAGCAGGAACCGAATGTTGCACACTTTTCAA
AGGCATTGTGGACGCAAATGCAGCCGTTTGTCTTTGTACCGCTGTTAAAGCTAATATCGG
AAGCCTTCTTCCCTTGTTGAACATTCCCCTAGCTGTCAGCCTTACACTCAATGCTTGTGG
TGTTCCATCGGGTATTCCATGCCTCTAAAACAATATGTTTTATATATTTCTTGAAAACTT
TTATGTGTTTTTGTTTTCAAGAAAATGAGTTATGTTATTTTAAGTTTTTTTTT**T*CCT
TTAAGTTGTTCCACATAAGGTCTTTATAATGACCATTGAGTTTGCAAAAGTTGTAGTCAC
GTACTTCTTTGTCGTAATTTATTAATTAATAGAAAACAC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2CJ42TF 579 0 0
GGACAAAGACAAATCTCACAAACAAACAATCTTTCTCTAAAAAGGTTAACATTTTCTCCT
CTTCAATACGGCTTCCAAAACTCTTGCCATTGTTCTCCTCTTCAACATCATCTGCTTCAC
TGCAGTTAACGCTACAGGTTGTCCCAATGCCGGAAATTTAGTCACGGTGTGTGCAGATTT
GTTGAATGGAGTGGTCAAGGTTTCTCTGCCAGCAGGAACCGAATGTTGCACACTTCTCAA
AGGCATTGTGGACGCAAATGCAGCCGTTTGTCTTTGTACCGCTGTTAAAGCTAATATCGG
AAGCCTTCTTCCCTTGTTGAACATTCCCCTAGCTGTCAGCCTTACACTCAATGCTTGTGG
TGTTCCATCGGGTATTCCATGCCTCTAAAACAATATGTTTTATATATTTCTTGAAAACTT
TTATGTGTTTTTGTTTTCAAGAAAATGAGTTATGTTATTTTAAGTTTTTTTTT**T*CCT
TTAAGTTGTTCCACATAAGGTCTTTATAATGACCATTGAGTTTGCAAAAGTTGTAGTCAC
GTACTTCTTTGTCGTAATTTATTAATTAATAGAAAACAC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2EO75TF 591 0 0
GGACAAAGACAAATCTCACAAACAAACAATCTTTCTCTAAAAAGGTTAACATTTTCTCCT
CTTCAATATGGCTTCCAAAACTCTTGCCATTGTTCTCCTCTTCAACATCATCTGCTTCAC
TGCAGTTAACGCTACAGGTTGTCCCAATGCCGGAAATTTAGTCACGGTGTGTGCAGATTT
GTTGAATGGAGTGGTCAAGGTTTCTCTGCCAGCAGGAACCGAATGTTGCACACTTCTCAA
AGGCATTGTGGACGCAAATGCAGCCGTTTGTCTTTGTACCGCTGTTAAAGCTAATATCGG
AAGCCTTCTTCCCTTGTTGAACATTCCCCTAGCTGTCAGCCTTACACTCAATGCTTGTGG
TGTTCCATCGGGTATTCCATGCCTCTAAAACAATATGTTTTATATATTTCTTGAAAACTT
TTATGTGTTTTTGTTTTCAAGAAAATGAGTTATGTTATTTTAAGTTTTTTTTTTTT*CCT
TTAAGTTGTTCCACATAAGGTCTTTATAATGACCATTGAGTTTGCAAAAGTTGTAGTCAC
GTACTTCTTTGTCGTAATTTATTAATTAATAGAAAACACACACTTTA
TTTT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2BC38TF 592 0 0
GGATC
ACAAAGACAAATCTCGCAAACAAACAATCTTTCTCTAAAAAGGTTAACATTTTCTCCTCT
TCAATATGGCTTCCAAAACTCTTGCCATTGTTCTCCTCTTCAACATCATCTGCTTCACTG
CAGTTAACGCTACAGGTTGTCCCAATGCCGGAAATTTAGTCACGGTGTGTGCAGATTTGT
TGAATGGAGTGGTCAAGGTTTCTCTGCCAGCAGGAACCGAATGTTGCACACTTCTCAAAG
GCATTGTGGACGCAAATGCAGCCGTTTGTCTTTGTACCGCTGTTAAAGCTAATATCGGAA
GCCTTCTTCCCTTGTTGAACATTCCCCTAGCTGTCAGCCTTACACTCAATGCTTGTGGTG
TTCCATCGGGTATTCCATGCCTCTAAAACAATAT**TTTATATATTTCTTGAAAACTTTT
ATGTGTTTTTGTTTTCAAGAAAATGAGTTATGTTATTTTAAGTTTTTTTTTTTTTCCTTT
AAGTTGTTCCACATAAGGTCTTTATAATGACCATTGAGTTTGCAAAAGTTGTAGTCACGT
ACTTCTTTGTCGTAATTTATTAATTAATAGAAAACACACACTTTA
TG

QA 6 590 6 590
DS 

RD RR2EO75JQ 495 0 0
CCTCTTCAACATCATTTGCTTCACTGCAGTTAACGCTACAGGTTGTCCCAATGCCGGAAA
TTTAGTCACGGTGTGTGCAGATTTGTTGAATGGAGTGGTCAAGGTTTTTTTGCCAGCAGG
AACCGAATGTTGCACACTTTTCAAAGGCATTGTGGACGCAAATGCAGCCGTTTGTTTTTG
TACCGCTGTTAAAGCTAATATCGGAAGCCTTTTTCCCTTGTTGAACATTCCCCTAGCTGT
CAGCCTTACACTCAATGCTTGTGGTGTTCCATCGGGTATTCCATGCCTTTAAAACAATAT
GTTTTATATATTTTTTGAAAACTTTTATGTGTTTTTGTTTTCAAGAAAATGAGTTATGTT
ATTTTAAGTTTTTTTTTTTT*CCTTTAAGTTGTTCCACATAAGGTCTTTATAATGACCAT
TGAGTTTGCAAAAGTTGTAGTCACGTACTTTTTTGTCGTAATTTATTAATTAATAGAAAA
CACACACTTTATTTT

QA 1 495 1 495
DS 



CO CL1145Contig2 586 2 2 U
GGACAAACACAAATCCCACAAACAAACAATCTTTCTCTAAAAAGTTAACATTTTCTCCTC
TTCAAGATGGCTTCCAAAACTCTTGTCATTGTTCTCCTCTTCAACATCATCTACTTCACT
GCAGTTAACGCTACAGGTTGTCCCAATGCCGTAAATTTAGTTACGGTGTGTGCAGATTTG
TTGAATGGAGTGGTCAAGGTTTCTCTGCCAGCAGGAACCGAATGTTGCACACTTCTCAAA
GGCATTGTGGACGCAAATGCAGCAGTTTGTCTTTGTACCGCTGTTAAAGCTAATATCGGA
AGCCTTCTTCCCTTGTTGAACATTCCCCTAGCTGTCAGCCTTACACTCAATGCTTGTGGT
GTTCCATCGGGTATTCCATGCCTCTAAAACAATATGTTTTATATATTTCTTGAAAACTTT
TATGTGTTTTTGTTTTCAAGAAAATGAGTTATGTTCTATGTTGTTTAAGTTTTTTTTTGG
TTTTTCCACATAAGGTCTTTATAATGACCATTGAGTTTGCAAAAGTTGTAGTCACGTACT
TCTTTGTCGTACTTTATCAATTAATAGAAAACACACACTTTAGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2GR81TF U 1
AF RR2GR81JQ C 98
BS 1 582 RR2GR81TF
BS 583 586 RR2GR81JQ

RD RR2GR81TF 586 0 0
GGACAAACACAAATCCCACAAACAAACAATCTTTCTCTAAAAAGTTAACATTTTCTCCTC
TTCAAGATGGCTTCCAAAACTCTTGTCATTGTTCTCCTCTTCAACATCATCTACTTCACT
GCAGTTAACGCTACAGGTTGTCCCAATGCCGTAAATTTAGTTACGGTGTGTGCAGATTTG
TTGAATGGAGTGGTCAAGGTTTCTCTGCCAGCAGGAACCGAATGTTGCACACTTCTCAAA
GGCATTGTGGACGCAAATGCAGCAGTTTGTCTTTGTACCGCTGTTAAAGCTAATATCGGA
AGCCTTCTTCCCTTGTTGAACATTCCCCTAGCTGTCAGCCTTACACTCAATGCTTGTGGT
GTTCCATCGGGTATTCCATGCCTCTAAAACAATATGTTTTATATATTTCTTGAAAACTTT
TATGTGTTTTTGTTTTCAAGAAAATGAGTTATGTTCTATGTTGTTTAAGTTTTTTTTTGG
TTTTTCCACATAAGGTCTTTATAATGACCATTGAGTTTGCAAAAGTTGTAGTCACGTACT
TCTTTGTCGTACTTTATCAATTAATAGAAAACACACACTTTA
GTCT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2GR81JQ 489 0 0
TCTTCAACATCATCTACTTCACTGCAGTTAACGCTACAGGTTGTCCCAATGCCGTAAATT
TAGTTACGGTGTGTGCAGATTTGTTGAATGGAGTGGTCAAGGTTTCTCTGCCAGCAGGAA
CCGAATGTTGCACACTTCTCAAAGGCATTGTGGACGCAAATGCAGCAGTTTGTCTTTGTA
CCGCTGTTAAAGCTAATATCGGAAGCCTTCTTCCCTTGTTGAACATTCCCCTAGCTGTCA
GCCTTACACTCAATGCTTGTGGTGTTCCATCGGGTATTCCATGCCTCTAAAACAATATGT
TTTATATATTTCTTGAAAACTTTTATGTGTTTTTGTTTTCAAGAAAATGAGTTATGTTCT
ATGTTGTTTAAGTTTTTTTTTGGTTTTTCCACATAAGGTCTTTATAATGACCATTGAGTT
TGCAAAAGTTGTAGTCACGTACTTCTTTGTCGTACTTTATCAATTAATAGAAAACACACA
CTTTAGTCT

QA 1 489 1 489
DS 



AS 1 7

CO CL1146Contig1 723 7 12 U
GAAAACAATTAAAAAAACGGAAGAGAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAATGAGCTCCT
TCACCACCAAAACTCCGCCACCTTATCTACGCCGGCCAAATCACCATCGCCGCGTAAACC
CACTATACCCTGTCATTTGCTGCGTCAGAGAATCCCAACAAGACAGCTTTACTCGCCGTA
GAACCCTGACAACGCTTATAACACTCACGGCCATCGTCCCAACGTCATCAGCATTAGCAC
AGGAGAAATGGGGGACGAGGTCATTCATAAAGGAGAAATACTTTCAGCCAGGGTTATCGC
CGGAGGACGCTGCGGCTCGTATAAAACAGACGGCTGAAGGGTTAAAAGACATGAGGGAGA
TGTTGGACCATATGTCGTGGAGGTACGTCATCTTTTACTTACGATTAAAACAGGCTTATC
TGTCTCAGGATCTGACCAACGCCATGAACATCTTGCCGGAGAGCCGCCGGAATGATTACG
TTCTAGCGGCAAACCAACTAGTAGAAAACATGAGTGAGTTGGATTTTTACGTACGGACGC
CGAAGGTTTACGAGTCGTATCTCTACTACGAGAAGACATTGAAATCGATAGACGACGTGG
TGGAGCTTCTTGCTTAATTGTATTTGTATTGTATTATATGATATGTCTCTCTTCACATGA
AATCTCTGTACTCATTACATTACGTTATGTCACGTTACACTATGTATAAACGTGAAGAAA
TTC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2CW54TF U 5
AF RR2CW54JQ C 20
AF RR2AC25TF U 335
AF RR2GF53TF U 1
AF RR2F989TF U 6
AF RR2AC38TF U 30
AF RR2AC38JQ C 30
BS 1 348 RR2GF53TF
BS 349 349 RR2CW54TF
BS 350 372 RR2GF53TF
BS 373 373 RR2CW54TF
BS 374 463 RR2GF53TF
BS 464 464 RR2AC38TF
BS 465 486 RR2GF53TF
BS 487 487 RR2F989TF
BS 488 628 RR2GF53TF
BS 629 629 RR2F989TF
BS 630 709 RR2GF53TF
BS 710 723 RR2AC38JQ

RD RR2CW54TF 424 0 0
GG
AATTAAAAAAACGGAAGAGAAAAAAAAAA*CAAAAACAAAAAAAATGAGCTCCTTCACCA
CCAAAACTCCGCCACCTTATCTACGCCGGCCAAATCACCATCGCCGCGTAAACCCACTAT
ACCCTGTCATTTGCTGCGTCAGAGAATCCCAACAAGACAGCTTTACTCGCCGTAGAACCC
TGACAACGCTTATAACACTCACGGCCATCGTCCCAACGTCATCAGCATTAGCACAGGAGA
AATGGGGGACGAGGTCATTCATAAAGGAGAAATACTTTCAGCCAGGGTTATCGCCGGAGG
ACGCTGCGGCTCGTATAAAACAGACGGCTGAAGGGTTAAAAGACATGAGGGAGATGTTGG
ACCATATGTCGTGGAGGTACGTCATCTTTTACTTACGATTAAAACAGGCTTATCTGTCTC
AG

QA 3 424 3 424
DS 

RD RR2CW54JQ 408 0 0
CGGAAGAG
AAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAATGAGCTCCTTCACCACCAAAACTCCGCCACCTTATC
TACGCCGGCCAAATCACCATCGCCGCGTAAACCCACTATACCCTGTCATTTGCTGCGTCA
GAGAATCCCAACAAGACAGCTTTACTCGCCGTAGAACCCTGACAACGCTTATAACACTCA
CGGCCATCGTCCCAACGTCATCAGCATTAGCACAGGAGAAATGGGGGACGAGGTCATTCA
TAAAGGAGAAATACTTTCAGCCAGGGTTATCGCCGGAGGACGCTGCGGCTCGTATAAAAC
AGACGGCTGAAGGGTTAAAAGACATGAGGGAGATGTTGGACCATATGTCGTGGAGGTACG
TCATCTTTTACTTACGATTAAAACAGGCTTATCTGTCTCA

QA 9 408 9 408
DS 

RD RR2AC25TF 119 0 0
TGAAGGGTTAAAAGACATGAGGGAGATGTTGGACCATATGTCGTGGAGGTACGTCATCTT
TTACTTACGATTAAAACAGGCTTATCTGTCTCAGGATCTGACCAACGCCATGAACATCT

QA 1 119 1 119
DS 

RD RR2GF53TF 718 0 0
GAAAACAATTAAAAAAACGGAAGAGAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAATGAGCTCCT
TCACCACCAAAACTCCGCCACCTTATCTACGCCGGCCAAATCACCATCGCCGCGTAAACC
CACTATACCCTGTCATTTGCTGCGTCAGAGAATCCCAACAAGACAGCTTTACTCGCCGTA
GAACCCTGACAACGCTTATAACACTCACGGCCATCGTCCCAACGTCATCAGCATTAGCAC
AGGAGAAATGGGGGACGAGGTCATTCATAAAGGAGAAATACTTTCAGCCAGGGTTATCGC
CGGAGGACGCTGCGGCTCGTATAAAACAGACGGCTGAAGGGTTAAAAGGCATGAGGGAGA
TGTTGGACCATACGTCGTGGAGGTACGTCATCTTTTACTTACGATTAAAACAGGCTTATC
TGTCTCAGGATCTGACCAACGCCATGAACATCTTGCCGGAGAGTCGCCGGAATGATTACG
TTCTAGTGGCAAACCAACTAGTAGAAAACATGAGTGAGTTGGATTTTTACGTACGGACGC
CGAAGGTTTACGAGTCGTATCTCTACTACGAGAAGACATTGAAATCGATAGACGACGTGG
TGGAGCTTCTTGCTTAATTGTATTTGTACTGTATTATATGATATGTCTCTCTTCACATGA
AATCTCTGTACTCATTACATTACGTTATGTCACGTTACACTATGTATAA
CGTGAGAAA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2F989TF 718 0 0
G
AATTAAAAAAACGGAAGAGAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAATGAGCTCCTTCACCA
CCAAAACTCCGCCACCTTATCTACGCCGGCCAAACCACCATCGCCGCGTAAACCCACTAT
ACCCTGTCATTTGCTGCGTCAGAGAATCCCAACAAGACAGCTTTACTCGCCGTAGAACCC
TGACAACGCTTATAACACTCACGGCCATCGTCCCAACGTCATCAGCATTAGCACAGGAGA
AATGGGGGACGAGGTCATTCATAAAGGAGAAATACTTTCAGCCAGGGTTATCGCCGGAGG
ACGCTGCGGCTCGTATAAAACAGACGGCTGAAGGGTTAAAAGACATGAGGGAGATGTTGG
ACCATATGTCGTGGAGGTACGTCATCTTTTACTTACGATTAAAACAGGCTTATCTGTCTC
AGGATCTGACCAACGCCATGAACATCTTGCCGGAGAGTCGCCGGAATGATTACGTTCTAG
CGGCAAACCAACTAGTAGAAAACATGAGTGTGTTGGATTTTTACGTACGGACGCCGAAGG
TTTACGAGTCGTATCTCTACTACGAGAAGACATTGAAATCGATAGACGACGTGGTGGAGC
TTCTTGCTTAATTGTATTTGTATTGTATTATATGATATGTCTCTCTTCACATGAAATCTC
TGTACTCATTACATTACGTTATGTCACGTTACACTATGTATAA
ACGTGAAGAAATTC

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR2AC38TF 694 0 0
GG
AAAAACAAAAACAAAAAAAATGAGCTCCTTCACCACCAAAACTCCGCCACCTTATCTACG
CCGGCCAAATCACCATCGCCGCGTAAACCCACTATACCCTGTCATTTGCTGCGTCAGAGA
ATCCCAACAAGACAGCTTTACTCGCCGTAGAACCCTGACAACGCTTATAACACTCACGGC
CATCGTCCCAACGTCATCAGCATTAGCACAGGAGAAATGGGGGACGAGGTCATTCATAAA
GGAGAAATACTTTCAGCCAGGGTTATCGCCGGAGGACGCTGCGGCTCGTATAAAACAGAC
GGCTGAAGGGTTAAAAGACATGAGGGAGATGTTGGACCATATGTCGTGGAGGTACGTCAT
CTTTTACTTACGATTAAAACAGGCTTATCTGTCTCAGGATCTGACCAACGCCATGAACAT
CTTGCCGGAGAGCCGCCGGAATGATTACGTTCTAGCGGCAAACCAACTAGTAGAAAACAT
GAGTGAGTTGGATTTTTACGTACGGACGCCGAAGGTTTACGAGTCGTATCTCTACTACGA
GAAGACATTGAAATCGATAGACGACGTGGTGGAGCTTCTTGCTTAATTGTATTTGTATTG
TATTATATGATATGTCTCTCTTCACATGAAATCTCTGTACTCATTACATTACGTTATGTC
ACGTTACACTATGTATAA
ACGTGAAGAAATTC

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR2AC38JQ 694 0 0
GG
AAAAACAAAAACAAAAAAAATGAGCTCCTTCACCACCAAAACTCCGCCACCTTATCTACG
CCGGCCAAATCACCATCGCCGCGTAAACCCACTATACCCTGTCATTTGCTGCGTCAGAGA
ATCCCAACAAGACAGCTTTACTCGCCGTAGAACCCTGACAACGCTTATAACACTCACGGC
CATCGTCCCAACGTCATCAGCATTAGCACAGGAGAAATGGGGGACGAGGTCATTCATAAA
GGAGAAATACTTTCAGCCAGGGTTATCGCCGGAGGACGCTGCGGCTCGTATAAAACAGAC
GGCTGAAGGGTTAAAAGACATGAGGGAGATGTTGGACCATATGTCGTGGAGGTACGTCAT
CTTTTACTTACGATTAAAACAGGCTTATCTGTCTCAGGATCTGACCAACGCCATGAACAT
CTTGCCGGAGAGCCGCCGGAATGATTACGTTCTAGCGGCAAACCAACTAGTAGAAAACAT
GAGTGAGTTGGATTTTTACGTACGGACGCCGAAGGTTTACGAGTCGTATCTCTACTACGA
GAAGACATTGAAATCGATAGACGACGTGGTGGAGCTTCTTGCTTAATTGTATTTGTATTG
TATTATATGATATGTCTCTCTTCACATGAAATCTCTGTACTCATTACATTACGTTATGTC
ACGTTACACTATGTATAAACGTGAAGAAATTC

QA 3 694 3 694
DS 



AS 1 5

CO CL1147Contig1 1024 5 14 U
GGAACCAAAGAAAGGAACGATCTTTTAGTTTTCCGACAAATCAATGGCGGCTACTGCATT
GTCCAACTCCTCTTGTCTTCTCCAACCCAAGTCCAGCTCCACCACTCGCCTAAACCCTTC
TTCTCTCGTCAAGCCCTGTCCGAATCCGACCAGAGTTTCGTTTTCGGGGAAGAGTCGTGG
ATATGTCGTAACGAGAGCTTCGATCAAAATGGCGCATTCGAACTCGACGCCTTCCACTGT
TGTGAACTCCTCGAATAAGCACAAGGGTCCCATCATCGTGATTGATAATTACGACAGCTT
CACCTACAATCTCTGTCAGTATATGGGAGAGCTAGGATGCCATTTTGAAGTTTACCGCAA
TGATGAACTTACTGTAGAGGAACTCAAAAGTAAAAATCCAAGAGGAGTGCTGATTTCTCC
TGGGCCTGGTACCCCACAAGACTCTGGGATCTCCTTACAAACTGTGTTGGAACTTGGACC
ACGTGTTCCTTTGTTTGGAGTCTGTATGGGTTTTCAGTGCATAGGAGAAGCATTTGGAGG
GAAGATTGTAAGGTCACCGTACGGTGTAATGCATGGGAAAAGCTCCATGGTTCACTATGA
TGAGAAAGGAGAAGATGGCTTGTTCTCTGGATTATCTAACCCTTTCCTTGTAGGTAGATA
TCACAGCCTCGTGATCGAAAAAGATACGTTTCCCAATGATGAACTCGAGGTTACTGCGTG
GACAGAAGATGGTTTGGTTATGGCGGCCCGACACAGGAAGTACAAGCATATACAGGGAGT
CCAGTTTCATCCGGAGAGTATTATAACAACTGAAGGCAAGACAATTGTTCGCAACTTCAT
CAAACTTGTAGAGAAAAAGGAGGCTGAGAAGTTGTGTTGACTTAGTGCTTTCCTCAATTC
GAACAAATCACATGTCTACGATTAGTGTGTCTCACTGTAATAAAAGTTTGGCAATGCAAA
ATGTTCCTTGTCATCTTTCCATTGTTTCCATCAATAAAAAAAATGACAGTCATCTGAATA
TTCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2EV89TF U 28
AF RR2GM41TF U 1
AF RR2F234TF U 6
AF RR2EV89JQ C 255
AF RR2GM41JQ C 596
BS 1 388 RR2GM41TF
BS 389 389 RR2EV89TF
BS 390 513 RR2GM41TF
BS 514 514 RR2EV89TF
BS 515 580 RR2GM41TF
BS 581 581 RR2EV89TF
BS 582 653 RR2GM41TF
BS 654 654 RR2F234TF
BS 655 693 RR2GM41TF
BS 694 694 RR2F234TF
BS 695 719 RR2GM41TF
BS 720 736 RR2F234TF
BS 737 975 RR2EV89JQ
BS 976 1024 RR2GM41JQ

RD RR2EV89TF 575 0 0
T
TTTTCCGACAAATCAATGGCGGCTACTGCATTGTCCAACTCCTCTTGTCTTCTCCAACCC
AAGTCCAGCTCCACCACTCGCCTAAACCCTTCTTCTCTCGTCAAGCCCTGTCCGAATCCG
ACCAGAGTTTCGTTTTCGGGGAAGAGTCGTGGATATGTCGTAACGAGAGCTTCGATCAAA
ATGGCGCATTCGAACTCGACGCCTTCCACTGTTGTGAACTCCTCGAATAAGCACAAGGGT
CCCATCATCGTGATTGATAATTACGACAGCTTCACCTACAATCTCTGTCAGTATATGGGA
GAGCTAGGATGCCATTTTGAAGTTTACCGCAATGATGAACTTACTGTAGAGGAACTCAAA
AGTAAAAATCCAAGAGGAGTGCTGATTTCTCCTGGGCCTGGTACCCCACAAGACTCTGGG
ATCTCCTTACAAACTGTGTTGGAACTTGGACCACGTGTTCCTTTGTTTGGAGTCTGTATG
GGTTTTCAGTGCATAGGAGAAGCATTTGGAGGGAAGATTGTAAGGTCACCGTACGGTGTA
ATGCATGGGAAAAGCTCCATGGTTCACTATGATG

QA 2 575 2 575
DS 

RD RR2GM41TF 719 0 0
GGAACCAAAGAAAGGAACGATCTTTTAGTTTTCCGACAAATCAATGGCGGCTACTGCATT
GTCCAACTCCTCTTGTCTTCTCCAACCCAAGTCCAGCTCCACCACTCGCCTAAACCCTTC
TTCTCTCGTCAAGCCCTGTCCGAATCCGACCAGAGTTTCGTTTTCGGGGAAGAGTCGTGG
ATATGTCGTAACGAGAGCTTCGATCAAAATGGCGCATTCGAACTCGACGCCTTCCACTGT
TGTGAACTCCTCGAATAAGCACAAGGGTCCCATCATCGTGATTGATAATTACGACAGCTT
CACCTACAATCTCTGTCAGTATATGGGAGAGCTAGGATGCCATTTTGAAGTTTACCGCAA
TGATGAACTTACTGTAGAGGAACTCAAAGGTAAAAATCCAAGAGGAGTGCTGATTTCTCC
TGGGCCTGGTACCCCACAAGACTCTGGGATCTCCTTACAAACTGTGTTGGAACTTGGACC
ACGTGTTCCTTTGTTTGGAGTCTGTATGGGTTTGCAGTGCATAGGAGAAGCATTTGGAGG
GAAGATTGTAAGGTCACCGTACGGTGTAATGCATGGGAAA*GCTCCATGGTTCACTATGA
TGAGAAAGGAGAAGATGGCTTGTTCTCTGGATTATCTAACCCTTTCCTTGTAG*TAGATA
TCACAGCCTCGTGATCGAAAAAGATACGTTTCC*AATGATGAACTCGAGGTTACTGCGT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2F234TF 731 0 0
CAAAGAAAGGAACGATCTTTTAGTTTTCCGACAAATCAATGGCGTCTACTGCATTGTCCA
ACTCCTCTTGTCTTCTCCAACCCAAGTCCAGCTCCACCACTCGCCTAAACCCTTCTTCTC
TCGTCAAGCCCTGTCCGAATCCGACCAGAGTTTCGTTTTCGGGGAAGAGTCGTGGATATG
TCGTAACGAGAGCTTCGATCAAAATGGCGCATTCGAACTCGACGCCTTCCACTGTTGTGA
ACTCCTCGAATAAGCACAAGGGTCCCATCATCGTGATTGATAATTACGACAGCTTCACCT
ACAATCTCTGTCAGTATATGGGAGAGCTAGGATGCCATTTTGAAGTTTACCGCAATGATG
AACTTACTGTAGAGGAACTCAAAAGTAAAAATCCAAG**GAGTGCTGATTTCTCCTGGGC
CTGGTACCCCACAAGACTCTGGGATCTCCTTACAAACTGTGTTGGAACTTGGACCACGTG
TTCCTTTGTTTGGAGTCTGTATGGGTTTGCAGTGCGTAGGAGAAGCATTTGGAGGGAAGA
TTGTAAGGTCACCGTACGGTGTAATGCATGGGAAAAGCTCCATGGTTCACTATGATGAGA
AAGGAGAAGATGGCTTGTTCTCTGGATTATCTAACCCTTTCCTTGTAGGTAGATATCACA
GCCTCGTGATCGAAAAAGATACGTTTCCCAATGATGAACTCGAGGTTACTGCGTGGACAG
AAGATGGTTTG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2EV89JQ 721 0 0
ATAAGCACAAGGGTCCCATCATCGTGATTGATAATTACGACAGCTTCACCTACAATCTCT
GTCAGTATATGGGAGAGCTAGGATGCCATTTTGAAGTTTACCGCAATGATGAACTTACTG
TAGAGGAACTCAAAAGTAAAAATCCAAGAGGAGTGCTGATTTCTCCTGGGCCTGGTACCC
CACAAGACTCTGGGATCTCCTTACAAACTGTGTTGGAACTTGGACCACGTGTTCCTTTGT
TTGGAGTCTGTATGGGTTTTCAGTGCATAGGAGAAGCATTTGGAGGGAAGATTGTAAGGT
CACCGTACGGTGTAATGCATGGGAAAAGCTCCATGGTTCACTATGATGAGAAAGGAGAAG
ATGGCTTGTTCTCTGGATTATCTAACCCTTTCCTTGTAGGTAGATATCACAGCCTCGTGA
TCGAAAAAGATACGTTTCCCAATGATGAACTCGAGGTTACTGCGTGGACAGAAGATGGTT
TGGTTATGGCGGCCCGACACAGGAAGTACAAGCATATACAGGGAGTCCAGTTTCATCCGG
AGAGTATTATAACAACTGAAGGCAAGACAATTGTTCGCAACTTCATCAAACTTGTAGAGA
AAAAGGAGGCTGAGAAGTTGTGTTGACTTAGTGCTTTCCTCAATTCGAACAAATCACATG
TCTACGATTAGTGTGTCTCACTGTAATAAAAGTTTGGCAATGCAAAATGTTCCTTGTCAT
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2GM41JQ 429 0 0
TATGATGAGAAAGGAGAAGATGGCTTGTTCTCTGGATTATCTAACCCTTTCCTTGTAGGT
AGATATCACAGCCTCGTGATCGAAAAAGATACGTTTCCCAATGATGAACTCGAGGTTACT
GCGTGGACAGAAGATGGTTTGGTTATGGCGGCCCGACACAGGAGGTACAAGCATATACAG
GGAGTCCAGTTTCATCCGGAGAGTATTATAACAACTGAAGGCAAGACAATTGTTCGCAAC
TTCATCAAACTTGTAGAGAAAAAGGAGGCTGAGAAGTTGTGTTGACTTAGTGCTTTCCTC
AATTCGAACAAATCACATGTCTACGATTAGTGTGTCTCACTGTAATAAAAGTTTGGCAAT
GCAAAATGTTCCTTGTCATCTTTCCATTGTTTCCATCAATAAAAAAAATGACAGTCATCT
GAATATTCT

QA 1 429 1 429
DS 



AS 2 6

CO CL1148Contig1 738 2 5 U
GCAACAACTTCGCTCTCACTATCTTTCTCGAGACGATCGGTGCTCTCTGTGAGGATCTCT
CCCTCGAACCAGTAGATTTCCAGGGATTTGCTGCTCTTTGTCTGCCAATGACATCAAAGC
CGGAACCAATATTGAAGTCGATGGTGCTCCTTGGCGTGTTCTGGAGTTTCTTCATGTCAA
GCCAGGAAAAGGTGCGGCCTTTGTGAGAACTAAGATCAGGAACTATGTTAATGGTAGCAC
AGTGGAGAGAACATTTCGTGCTGGAATCTCTGTCGAGGAAGCAAACGTATTCAAAGAAAC
CAAACAGTTCACATACAAAGACGGGTCTCAGTTTGTTTTCATGGATTTGAGCACATACGA
AGAAACACGTCTCAACGAATCCGATATGGGCGACAAGACGAGATGGCTGAAAGAAGGAAT
GGAATGCAGTTTGCTGTACTGGAAAGACAAGGTTATCGATTTCGAACTACCAAATACGGT
TACGCTCAAAGTGGTTGATGTTGATCCTGGTCTACGCGGTGACACTGCACAAGGTGGATC
AAAGCCGGCTACAGTGGAAACAGGGGCAGTAGTTACCGTACCACTCTTTGTTAACATTGG
CGAAGAAATTTTGGTGGATACTAGAACCGGTATGTACATGAACCGGGCGTGAACCGTGTC
TACACCTACTTAAATCGGATCCAGAATTCAATCCGATGAGCCAGTTATAATCATTTTTGT
GTATGTATATGCAAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ71TFB U 1
AF RR2AZ71JQ C 1
BS 1 6 RR2AZ71JQ
BS 7 62 RR2AZ71TFB
BS 63 63 RR2AZ71JQ
BS 64 696 RR2AZ71TFB
BS 697 738 RR2AZ71JQ

RD RR2AZ71TFB 696 0 0
GCAACA
ACTTCGCTCTCACTATCTTTCTCGAGACGATCGGTGCTCTCTGTGAGGATCTCTCC*TCG
AACCAGTAGATTTCCAGGGATTTGCTGCTCTTTGTCTGCCAATGACATCAAAGCCGGAAC
CAATATTGAAGTCGATGGTGCTCCTTGGCGTGTTCTGGAGTTTCTTCATGTCAAGCCAGG
AAAAGGTGCGGCCTTTGTGAGAACTAAGATCAGGAACTATGTTAATGGTAGCACAGTGGA
GAGAACATTTCGTGCTGGAATCTCTGTCGAGGAAGCAAACGTATTCAAAGAAACCAAACA
GTTCACATACAAAGACGGGTCTCAGTTTGTTTTCATGGATTTGAGCACATACGAAGAAAC
ACGTCTCAACGAATCCGATATGGGCGACAAGACGAGATGGCTGAAAGAAGGAATGGAATG
CAGTTTGCTGTACTGGAAAGACAAGGTTATCGATTTCGAACTACCAAATACGGTTACGCT
CAAAGTGGTTGATGTTGATCCTGGTCTACGCGGTGACACTGCACAAGGTGGATCAAAGCC
GGCTACAGTGGAAACAGGGGCAGTAGTTACCGTACCACTCTTTGTTAACATTGGCGAAGA
AATTTTGGTGGATACTAGAACCGGTATGTACATGAACCGGGCGTGAACCGTGTCTACACC
TACTTAAATCGGATCCAGAATTCAATCCGA

QA 7 696 7 696
DS 

RD RR2AZ71JQ 738 0 0
GCAACAACTTCGCTCTCACTATCTTTCTCGAGACGATCGGTGCTCTCTGTGAGGATCTCT
CCCTCGAACCAGTAGATTTCCAGGGATTTGCTGCTCTTTGTCTGCCAATGACATCAAAGC
CGGAACCAATATTGAAGTCGATGGTGCTCCTTGGCGTGTTCTGGAGTTTCTTCATGTCAA
GCCAGGAAAAGGTGCGGCCTTTGTGAGAACTAAGATCAGGAACTATGTTAATGGTAGCAC
AGTGGAGAGAACATTTCGTGCTGGAATCTCTGTCGAGGAAGCAAACGTATTCAAAGAAAC
CAAACAGTTCACATACAAAGACGGGTCTCAGTTTGTTTTCATGGATTTGAGCACATACGA
AGAAACACGTCTCAACGAATCCGATATGGGCGACAAGACGAGATGGCTGAAAGAAGGAAT
GGAATGCAGTTTGCTGTACTGGAAAGACAAGGTTATCGATTTCGAACTACCAAATACGGT
TACGCTCAAAGTGGTTGATGTTGATCCTGGTCTACGCGGTGACACTGCACAAGGTGGATC
AAAGCCGGCTACAGTGGAAACAGGGGCAGTAGTTACCGTACCACTCTTTGTTAACATTGG
CGAAGAAATTTTGGTGGATACTAGAACCGGTATGTACATGAACCGGGCGTGAACCGTGTC
TACCCCTACTTAAATCGGTTCCAGAATTCAATCCGATGAGCCAGTTATAATCATTTTTGT
GTATGTATATGCAAATAT

QA 1 738 1 738
DS 



CO CL1148Contig2 900 4 15 U
TTTTTCAGACACAGCTGCTCCCCTGCTTTTATCTTCTCGCCGGCGAAGCCAGAGAACAAA
AAAAAAATGGCGGGAAGAGCGGCTTTCTCTGTATCTTCGTCTCCTTCACTCTGCATACCT
TATTCACCTACTTCGCTCTCACTGTCTTTCTCGAACCGATCTGCACTATCTGTGCGGATT
TCTACTCGAACCAGCAGATTTTCCGGGATTTGCTGCTCTTTGTCTGCCAATGACATCAAA
GCAGGAACCAACATCGAGGTCGATGGTGCCCCTTGGCGTGTACTTGAGTTTCTACATGTC
AAACCAGGAAAAGGAGCGGCCTTTGTGAGAACTAAGATCAGGAACTATGTTAATGGTAGC
ACAGTGGAGAGAACATTTCGTGCTGGAATCTCTGTCGAGGAAGCAAATGTATTCAAAGAA
ACTAAACAGTTCACATACAAAGACGGGTCTCAGTTTGTTTTCATGGATTTGAGCACATAC
GAAGAAACACGTCTGAACGAATCCGATATGGGCGACAAGACGGGGTGGCTGAAAGAAGGA
ATGGAATGTAGTTTGCTGTACTGGAAAGACAAGGTTATCGATTTCGAACTACCAAATACG
GTTACGCTCAAAGTGGTTGATGTTGATCCTGGTCTTCGCGGTGACACTGCACAAGGTGGA
TCAAAGCCTGCAACAGTGGAAACAGGGGCAGTAGTTACCGTACCACTCTTTGTTAACATA
GGCGAAGAAATTTTGGTGGATACTAGAACCGGTATGTACATGAACCGGGCGTGAACCGTG
TCTACACCTACTTAAATCGGATCCAGAATTCAATCCGATGAGGCAATTATAATCATTTTT
GTGTATGTATATGCAAATATGCAATGTTCGAATCGAGGATGATATATGTTTTTGAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 0 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G165TF U 1
AF RR2CA48TF U 6
AF RR2CA48JQ C 135
AF RR2GT84JQB C 549
BS 1 66 RR2G165TF
BS 67 67 RR2CA48TF
BS 68 422 RR2G165TF
BS 423 423 RR2CA48TF
BS 424 522 RR2G165TF
BS 523 523 RR2CA48TF
BS 524 569 RR2G165TF
BS 570 655 RR2CA48TF
BS 656 656 RR2CA48JQ
BS 657 717 RR2CA48TF
BS 718 811 RR2CA48JQ
BS 812 812 RR2GT84JQB
BS 813 840 RR2CA48JQ
BS 841 841 RR2GT84JQB
BS 842 900 RR2CA48JQ

RD RR2G165TF 569 0 0
TTTTTCAGACACAGCTGCTCCCCTGCTTTTATCTTCTCGCCGGCGAAGCCAGAGAACAAA
AAAAAA*TGGCGGGAAGAGCGGCTTTCTCTGTATCTTCGTCTCCTTCACTCTGCATACCT
TATTCACCTACTTCGCTCTCACTGTCTTTCTCGAACCGATCTGCACTATCTGTGCGGATT
TCTACTCGAACCAGCAGATTTTCCGGGATTTGCTGCTCTTTGTCTGCCAATGACATCAAA
GCAGGAACCAACATCGAGGTCGATGGTGCCCCTTGGCGTGTACTTGAGTTTCTACATGTC
AAACCAGGAAAAGGAGCGGCCTTTGTGAGAACTAAGATCAGGAACTATGTTAATGGTAGC
ACAGTGGAGAGAACATTTCGTGCTGGAATCTCTGTCGAGGAAGCAAATGTATTCAAAGAA
ACCAAACAGTTCACATACAAAGACGGGTCTCAGTTTGTTTTCATGGATTTGAGCACATAC
GAAGAAACACGTCTGAACGAATCCGATATGGGCGACAAGACGAGGTGGCTGAAAGAAGGA
ATGGAATGTAGTTTGCTGTACTGGAAAGA

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2CA48TF 712 0 0
CAGACACAGCTGCTCCCCTGCTTTTATCTTCTCGCCGGCGAAGCCAGAGAACAAAAAAAA
AATGGCGGGAAGAGCGGCTTTCTCTGTATCTTCGTCTCCTTCACTCTGCATACCTTATTC
ACCTACTTCGCTCTCACTGTCTTTCTCGAACCGATCTGCACTATCTGTGCGGATTTCTAC
TCGAACCAGCAGATTTTCCGGGATTTGCTGCTCTTTGTCTGCCAATGACATCAAAGCAGG
AACCAACATCGAGGTCGATGGTGCCCCTTGGCGTGTACTTGAGTTTCTACATGTCAAACC
AGGAAAAGGAGCGGCCTTTGTGAGAACTAAGATCAGGAACTATGTTAATGGTAGCACAGT
GGAGAGAACATTTCGTGCTGGAATCTCTGTCGAGGAAGCAAATGTATTCAAAGAAACTAA
ACAGTTCACATACAAAGACGGGTCTCAGTTTGTTTTCATGGATTTGAGCACATACGAAGA
AACACGTCTGAACGAATCCGATATGGGCGACAAGACGGGGTGGCTGAAAGAAGGAATGGA
ATGTAGTTTGCTGTACTGGAAAGACAAGGTTATCGATTTCGAACTACCAAATACGGTTAC
GCTCAAAGTGGTTGATGTTGATCCTGGTCTTCGCGGTGACACTGCACAAG*TGGATCAAA
GCCTGCAACAGTGGAAACAGGGGCAGTAGTTACCGTACCACTCTTTGTTAAC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2CA48JQ 766 0 0
GCTCTCACTGTCTTTCTCGAACCGATCTGCACTATCTGTGCGGATTTCTACTCGAACCAG
CAGATTTTCCGGGATTTGCTGCTCTTTGTCTGCCAATGACATCAAAGCAGGAACCAACAT
CGAGGTCGATGGTGCCCCTTGGCGTGTACTTGAGTTTCTACATGTCAAACCAGGAAAAGG
AGCGGCCTTTGTGAGAACTAAGATCAGGAACTATGTTAATGGTAGCACAGTGGAGAGAAC
ATTTCGTGCTGGAATCTCTGTCGAGGAAGCAAATGTATTCAAAGAAACTAAACAGTTCAC
ATACAAAGACGGGTCTCAGTTTGTTTTCATGGATTTGAGCACATACGAAGAAACACGTCT
GAACGAATCCGATATGGGCGACAAGACGGGGTGGCTGAAAGAAGGAATGGAATGTAGTTT
GCTGTACTGGAAAGACAAGGTTATCGATTTCGAACTACCAAATACGGTTACGCTCAAAGT
GGTTGATGTTGATCCTGGTCTTCGCGGTGACACTGCACAAGGTGGATCAAAGCCTGCAAC
AGTGGAAACAGGGGCAGTAGTTACCGTACCACTCTTTGTTAACATAGGCGAAGAAATTTT
GGTGGATACTAGAACCGGTATGTACATGAACCGGGCGTGAACCGTGTCTACACCTACTTA
AATCGGATCCAGAATTCTATCCGATGAGGCAATTATAATCATTTTT*TGTATGTATATGC
AAATATGCAATGTTCGAATCGAGGATGATATATGTTTTTGAAAAAA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2GT84JQB 345 0 0
C
AGTTTGCTGTACTGGAAAGACAAGGTTATCGATTTCGAACTACCAAATACGGTTACGCTC
AAAGTGGTTGATGTTGATCCTGGTTTACGCGGTGACACTGCACAAGGTGGATCAAAGCCG
GCTACAGTGGAAACAGGGGCAGTAGTTACCGTACCACTCTTTGTTAACATTGGGGAAGAA
ATTTTGGTGGATACTAGAACCGGTATGTACATGAACCGGGCGTGAACCGTGTTTACACCT
ACTTAAATCGGATCCAGAATTCAATCCGATGAGGCAGTTATAATCATTTTTGTGTATGTA
TATGCAAATATGCAATGTTTGAATCGAGGATGATATATGTTTT
G

QA 2 344 2 344
DS 



AS 2 7

CO CL1149Contig1 830 5 7 U
AGAAACGGAAAAAAATAATCTCCTCTTTCGCGGTCGTCTTCTGCAAGCTAAGCTCCTCTT
TCGATTTCAGCAGAGAGATGTCTGCGTACGAAAATGTTATTGGTGGGAAGCTAAAGCTGA
AAGGGAAGGCTTTAGATGTGAAAGCAGGTGGAGTCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAACAGA
AGAAACACGAAGAGCAAGCTCTTAGAATTACTGAACATGAACACATAGAAGGAGAAAACG
AAGAAGCATTGGGTAAATTGATTGAAGGAGGAGAAGAAGAAGATGAGGAGGGTAGGAGTG
GAAAGGAGGATGGAAAAGTGCAACCTGATGATGATGATCTGTTAACGCCTGCAGAAAGAC
GGTACATAGAGCAGAAGCAGAAACTGGATGTGCAGAAACTAGCCAAGGAAGCTAACAAGT
CTCACCGTAACAGGATTGAGGATTTCAATCAGTATCTGGCTAACATGAGTGAGCACTACG
ATATCCCTAAAGTGGGACCTGGTTAAATCTACTTCTTCCTTGTTTCTCTCTCTGCTTATT
TTCAATTTGGCATTGTCAAACAGCTATTGTTGTTGGATCTCTCGTGTTATTCCCATAACC
TTGCTATTTTGTGGCCTCAGCTCTTTTCTATGATGGACACATTTTCGTGGAATGTTCACT
CTTCCTTCTGTATCTCTCAGTTTCCAAACTTGTTCTATTTTCCAATCACAAAACAATCTT
TTCAATAGCTGGAATAGACACGAGACACCTCACGAGAGGTTTATTTTTTTTGTACACATC
GCAGAGACTCTTCTGAGTTTTGTCTTTGAGAACTGAGGAAAATATTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL67JQ C 202
AF RR2DZ06JQ C 87
AF RR2BL67TF U 28
AF RR2DZ06TF U 29
AF RR2AP03TF U 1
BS 1 85 RR2AP03TF
BS 86 86 RR2BL67TF
BS 87 659 RR2AP03TF
BS 660 660 RR2BL67TF
BS 661 672 RR2AP03TF
BS 673 673 RR2DZ06TF
BS 674 830 RR2AP03TF

RD RR2BL67JQ 241 0 0
TTAGAATTACTGAACATGAACACATAGAAGGAGAAAACGAAGAAGCATTGGGTAAATTGA
TTGAAGGAGGAGAAGAAGAAGATGAGGAGGGTAGGAGTGGAAAGGAGGATGGAAAAGTGC
AACCTGATGATGATGATTTGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGA
AACTGGATGTGCAGAAACTAGCCAAGGAAGCTAACAAGTTTCCCCGTAACAGGATTGAGG
A

QA 1 241 1 241
DS 

RD RR2DZ06JQ 621 0 0
TACGAAAATGTTATTGGTGGGAAGCTAAAGCTGAAAGGGAAGGCTTTAGATGTGAAAGCA
GGTGGAGTCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAACAGAAGAAACACGAAGAGCAAGCTCTTAGA
ATTACTGAACATGAACACATAGAAGGAGAAAACGAAGAAGCATTGGGTAAATTGATTGAA
GGAGGAGAAGAAGAAGATGAGGAGGGTAGGAGTGGAAAGGAGGATGGAAAAGTGCAACCT
GATGATGATGATCTGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAAACTG
GATGTGCAGAAACTAGCCAAGGAAGCTAACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGAGGATTTC
AATCAGTATCTGGCTAACATGAGTGAGCACTACGATATCCCTAAAGTGGGACCTGGTTAA
ATCTACTTCTTCCTTGTTTCTCTCTCTGCTTATTTTCAATTTGGCATTGTCAAACAGCTA
TTGTTGTTGGATCTCTCGTGTTATTCCCATAACCTTGCTATTTTGTGGCCTCAGCTCTTT
TCTATGATGGACACATTTTCGTGGAATGTTCACTCTTCCTTCTGTATCTCTCAGTTTCCA
AACTTGTTCTATTTTCCAA
CC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2BL67TF 652 0 0
GGGCGGTCGTC
TTCTGCAAGCTAAGCTCCTCTTTCGATTTCAGCAGAGAGATGTCTGCGTACGAAAATGTT
ATTGGTGGGAAGCTAAAGCTGAAAGGGAAGGCTTTAGATGTGAAAGCAGGTGGAGTCAAG
AAGAAGAAGAAGAAGAAACAGAAGAAACACGAAGAGCAAGCTCTTAGAATTACTGAACAT
GAACACATAGAAGGAGAAAACGAAGAAGCATTGGGTAAATTGATTGAAGGAGGAGAAGAA
GAAGATGAGGAGGGTAGGAGTGGAAAGGAGGATGGAAAAGTGCAACCTGATGATGATGAT
CTGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAAACTGGATGTGCAGAAA
CTAGCCAAGGAAGCTAACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGAGGATTTCGATCAGTATCTG
GCTAACATGAGTGAGCACTACGATATCCCTAAAGTGGGACCTGGTTAAATCTACTTCTTC
CTTGTTTCTCTCTCTGCTTATTTTCAATTTGGCATTGTCAAACAGCTATTGTTGTTGGAT
CTCTCGTGTTATTCCCATAACCTTGCTATTTTGTGGCCTCAGCTCTTTTCTATGATGGAC
ACATTTTCGTGGAATGTTCACTCTTCCTTCTGTA
AAAAAAA

QA 12 645 12 645
DS 

RD RR2DZ06TF 667 0 0
GGCGGTCGTC
TTCTGCAAGCTAAGCTCCTCTTTCGATTTCAGCAGAGAGATGTCTGCGTACGAAAATGTT
ATTGGTGGGAAGCTAAAGCTGAAAGGGAAGGCTTTAGATGTGAAAGCAGGTGGAGTCAAG
AAGAAGAAGAAGAAGAAACAGAAGAAACACGAAGAGCAAGCTCTTAGAATTACTGAACAT
GAACACATAGAAGGAGAAAACGAAGAAGCATTGGGTAAATTGATTGAAGGAGGAGAAGAA
GAAGATGAGGAGGGTAGGAGTGGAAAGGAGGATGGAAAAGTGCAACCTGATGATGATGAT
CTGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAAACTGGATGTGCAGAAA
CTAGCCAAGGAAGCTAACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGAGGATTTCAATCAGTATCTG
GCTAACATGAGTGAGCACTACGATATCCCTAAAGTGGGACCTGGTTAAATCTACTTCTTC
CTTGTTTCTCTCTCTGCTTATTTTCAATTTGGCATTGTCAAACAGCTATTGTTGTTGGAT
CTCTCGTGTTATTCCCATAACCTTGCTATTTTGTGGCCTCAGCTCTTTTCTATGATGGAC
ACATTTTCGTGGAATGTTCACTCTTCCTTCTGTATCTCTCAGTTTCCAAACTT
GTTC

QA 11 663 11 663
DS 

RD RR2AP03TF 830 0 0
AGAAACGGAAAAAAATAATCTCCTCTTTCGCGGTCGTCTTCTGCAAGCTAAGCTCCTCTT
TCGATTTCAGCAGAGAGATGTCTGCTTACGAAAATGTTATTGGTGGGAAGCTAAAGCTGA
AAGGGAAGGCTTTAGATGTGAAAGCAGGTGGAGTCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAACAGA
AGAAACACGAAGAGCAAGCTCTTAGAATTACTGAACATGAACACATAGAAGGAGAAAACG
AAGAAGCATTGGGTAAATTGATTGAAGGAGGAGAAGAAGAAGATGAGGAGGGTAGGAGTG
GAAAGGAGGATGGAAAAGTGCAACCTGATGATGATGATCTGTTAACGCCTGCAGAAAGAC
GGTACATAGAGCAGAAGCAGAAACTGGATGTGCAGAAACTAGCCAAGGAAGCTAACAAGT
CTCACCGTAACAGGATTGAGGATTTCAATCAGTATCTGGCTAACATGAGTGAGCACTACG
ATATCCCTAAAGTGGGACCTGGTTAAATCTACTTCTTCCTTGTTTCTCTCTCTGCTTATT
TTCAATTTGGCATTGTCAAACAGCTATTGTTGTTGGATCTCTCGTGTTATTCCCATAACC
TTGCTATTTTGTGGCCTCAGCTCTTTTCTATGATGGACACATTTTCGTGGAATGTTCACC
CTTCCTTCTGTACCTCTCAGTTTCCAAACTTGTTCTATTTTCCAATCACAAAACAATCTT
TTCAATAGCTGGAATAGACACGAGACACCTCACGAGAGGTTTATTTTTTTTGTACACATC
GCAGAGACTCTTCTGAGTTTTGTCTTTGAGAACTGAGGAAAATATTTGTG

QA 1 830 1 830
DS 



CO CL1149Contig2 677 2 2 U
GGCTCGGTCGTCTTGTATTCTGCAAGCTAAGCTCCTTCGATTTCAGCAGAGAGATGTCAG
CGTACGAAAATGTTATTGGTGGGAAGCTAAAGCTGAAAGGGAAGGCTTTAGATGTGAAAG
CAGGTGGAGTCAAGAAGAAGAAGAAGAAACAGAAGAAACAGGAAGAGCAAGCTCTTAAAA
TTACTGAACATGAACACATAGAAGAAGAAAACGAAGAAGCGTTGGGTAAATTGATTGAAG
GAGGAGAAGAAGAAGAAGAGGGTAGGAGTGAAAAGGAGGATGGAAAAGTGCAACCTGATG
ATGATGATATGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAAACTGGATG
TGCAGAAACTAGCCAAGGAAGCGAACAAATCTCACCGTAACAGGATTGAGGACTTCAATC
AGTATCTGGCTAACATGAGTGAGCATTACGATATCCCTAAAGTCGGACCTGGTTAAATCT
ACTTCTTCCTTGTCTCTTTCTGCTTATTTTCAGTTTGGCATTGTCAAACAGCTACTGTTG
TTGGATCTCTCGTGTTATTCCCATAACTTTGCTATTACGTGGCCTCTGTTCTTTTCTATG
ATGGACACATTTTCGTGGAATGTTCACTCTTCCTCCTGTATCTCTCAGTTTCCAAACTTT
TTCTATTTTCCAATCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2H159TF U 1
AF RR2H159JQ C 23
BS 1 673 RR2H159TF
BS 674 677 RR2H159JQ

RD RR2H159TF 677 0 0
GGCTCGGTCGTCTTGTATTCTGCAAGCTAAGCTCCTTCGATTTCAGCAGAGAGATGTCAG
CGTACGAAAATGTTATTGGTGGGAAGCTAAAGCTGAAAGGGAAGGCTTTAGATGTGAAAG
CAGGTGGAGTCAAGAAGAAGAAGAAGAAACAGAAGAAACAGGAAGAGCAAGCTCTTAAAA
TTACTGAACATGAACACATAGAAGAAGAAAACGAAGAAGCGTTGGGTAAATTGATTGAAG
GAGGAGAAGAAGAAGAAGAGGGTAGGAGTGAAAAGGAGGATGGAAAAGTGCAACCTGATG
ATGATGATATGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAAACTGGATG
TGCAGAAACTAGCCAAGGAAGCGAACAAATCTCACCGTAACAGGATTGAGGACTTCAATC
AGTATCTGGCTAACATGAGTGAGCATTACGATATCCCTAAAGTCGGACCTGGTTAAATCT
ACTTCTTCCTTGTCTCTTTCTGCTTATTTTCAGTTTGGCATTGTCAAACAGCTACTGTTG
TTGGATCTCTCGTGTTATTCCCATAACTTTGCTATTACGTGGCCTCTGTTCTTTTCTATG
ATGGACACATTTTCGTGGAATGTTCACTCTTCCTCCTGTATCTCTCAGTTTCCAAACTTT
TTCTATTTTCCAA
TCGC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2H159JQ 655 0 0
CAAGCTAAGCTCC
TTCGATTTCAGCAGAGAGATGTCAGCGTACGAAAATGTTATTGGTGGGAAGCTAAAGCTG
AAAGGGAAGGCTTTAGATGTGAAAGCAGGTGGAGTCAAGAAGAAGAAGAAGAAACAGAAG
AAACAGGAAGAGCAAGCTCTTAAAATTACTGAACATGAACACATAGAAGAAGAAAACGAA
GAAGCGTTGGGTAAATTGATTGAAGGAGGAGAAGAAGAAGAAGAGGGTAGGAGTGAAAAG
GAGGATGGAAAAGTGCAACCTGATGATGATGATATGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTAC
ATAGAGCAGAAGCAGAAACTGGATGTGCAGAAACTAGCCAAGGAAGCGAACAAATCTCAC
CGTAACAGGATTGAGGACTTCAATCAGTATCTGGCTAACATGAGTGAGCATTACGATATC
CCTAAAGTCGGACCTGGTTAAATCTACTTCTTCCTTGTCTCTTTCTGCTTATTTTCAGTT
TGGCATTGTCAAACAGCTACTGTTGTTGGATCTCTCGTGTTATTCCCATAACTTTGCTAT
TACGTGGCCTCTGTTCTTTTCTATGATGGACACATTTTCGTGGAATGTTCACTCTTCCTC
CTGTATCTCTCAGTTTCCAAACTTTTTCTATTTTCCAATCGC

QA 14 655 14 655
DS 



AS 3 7

CO CL1150Contig1 703 3 6 U
TTTAAACATAAAACGACCACACATTGTCTTATTCCCAAAAGAAATTACATATCAATATCC
TTCACAGCTTCCCAGCACAAACAAGGTACCCTTGAGCAGGGTGAGATTCATTATTTATTA
CGTTACGAAAGAAAAAAACATAGATCATAACTTGGGAGAAACGTAGATGATAACTTCCAA
TGCATTAGAGATCAAATAGACACACTGTAGGGAACACCCATCCCGGTAACGCCTGGTTCA
GAGATAGGCTTCAAAAGCTCGTACTTAACAACACCTGCTCCAGCTCGATTCTTTAGAGAA
ACATTCACGTTCCTCTCATCTATCACTCCTTCTAGGTATTGGAGCTTTCCTTTGAAACGT
TCATATGCAGCATAGATGACAGGTTCGTGGGCCCAAGATGCTTCTGGGTTTTCCCCTAGG
TACTCTTCATCTGGTGAATGTGATGATAGAAGATCCAAAGTCACCATCACTTTGGTCGCC
TGCTTCTTCGAAGGGAATGTCTTAAGCATAGTCTTCTCTGGCTCCTCATAGAACTCTCTG
AGCTCTTCCTCTGTCGGTTCTTCCACTGGCATTTTTATCCTTGTTGTGGTTGGTCGGTTG
GGAAAGTATCCCCCATACCCGTATTGTC*AAAGTTCACAGCTGCATGGTGACCTGAAGCC
ACCCATGCAATCGTGGTCACCACTTCAATCAAGTCATCTTGTC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2DW85JQ U 50
AF RR2DS34TF C 1
AF RR2DS34JQ U 4
BS 1 4 RR2DS34TF
BS 5 49 RR2DS34JQ
BS 50 628 RR2DW85JQ
BS 629 629 RR2DS34JQ
BS 630 635 RR2DW85JQ
BS 636 703 RR2DS34JQ

RD RR2DW85JQ 586 0 0
TATCAATATCCTTCACAGCTTCCCAGCACAAACAAGGTACCCTTGAGCAGGGTGAGATTC
ATTATTTATTACGTTACGAAAGAAAAAAACATAGATCATAACTTGGGAGAAACGTAGATG
ATAACTTCCAATGCATTAGAGATCAAATAGACACACTGTAGGGAACACCCATCCCGGTAA
CGCCTGGTTCAGAGATAGGCTTCAAAAGCTCGTACTTAACAACACCTGCTCCAGCTCGAT
TCTTTAGAGAAACATTCACGTTCCTCTCATCTATCACTCCTTCTAGGTATTGGAGCTTTC
CTTTGAAACGTTCATATGCAGCATAGATGACAGGTTCGTGGGCCCAAGATGCTTCTGGGT
TTTCCCCTAGGTACTCTTCATCTGGTGAATGTGATGATAGAAGATCCAAAGTCACCATCA
CTTTGGTCGCCTGCTTCTTCGAAGGGAATGTCTTAAGCATAGTCTTCTCTGGCTCCTCAT
AGAACTCTCTGAGCTCTTCCTCTGTCGGTTCTTCCACTGGCATTTTTATCCTTGTTGTGG
TTGGTCGGTTGGGAAAGTATCCCCCATACCCGTATTGTCCAAAGTT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2DS34TF 703 0 0
TTTAAACATAAAACGACCACACATTGTCTTATTCCCAAAAGAAATTACATATCAATATCC
TTCACAGCTTCCCAGCACAAACAAGGTACCCTTGAGCAGGGTGAGATTCATTATTTATTA
CGTTACGAAAGAAAAAAACATAGATCATAACTTGGGAGAAACGTAGATGATAACTTCCAA
TGCATTAGAGATCAAATAGACACACTGTAGGGAACACCCATCCCGGTAACGCCTGGTTCA
GAGATAGGCTTCAAAAGCTCGTACTTAACAACACCTGCTCCAGCTCGATTCTTTAGAGAA
ACATTCACGTTCCTCTCATCTATCACTCCTTCTAGGTATTGGAGCTTTCCTTTGAAACGT
TCATATGCAGCATAGATGACAGGTTCGTGGGCCCAAGATGCTTCTGGGTTTTCCCCTAGG
TACTCTTCATCTGGTGAATGTGATGATAGAAGATCCAAAGTCACCATCACTTTGGTCGCC
TGCTTCTTCGAAGGGAATGTCTTAAGCATAGTCTTCTCTGGCTCCTCATAGAACTCTCTG
AGCTCTTCCTCTGTCGGTTCTTCCACTGGCATTTTTATCCTTGTTGTGGTTGGTCGGTTG
GGAAAGTATCCCCCATACCCGTATTGTC*AAAGTTCACAGCTGCATGGTGACCTGAAGCC
ACCCATGCAATCGTGGTCACCACTTCAATCAAGTCATCTTGT
C

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2DS34JQ 700 0 0
A
AACATAAAACGACCACACATTGTCTTATTCCCAAAAGAAATTACATATCAATATCCTTCA
CAGCTTCCCAGCACAAACAAGGTACCCTTGAGCAGGGTGAGATTCATTATTTATTACGTT
ACGAAAGAAAAAAACATAGATCATAACTTGGGAGAAACGTAAATGATAACTTCCAATGCA
TTAAAGATCAAATAGACACACTGTAGGGAACACCCATCCCGGTAACGCCTGGTTCAAAAA
TAGGCTTCAAAAGCTCGTACTTAACAACACCTGCTCCAGCTCGATTCTTTAGAGAAACAT
TCACGTTCCTCTCATCTATCACTCCTTCTAGGTATTGGAGCTTTCCTTTGAAACGTTCAT
ATGCAGCATAAATGACAGGTTCGTGGGCCCAAGATGCTTCTGGGTTTTCCCCTAGGTACT
CTTCATCTGGTGAATGTGATGATAGAAGATCCAAAGTCACCATCACTTTGGTCGCCTGCT
TCTTCGAAGGGAATGTCTTAAGCATAGTCTTCTCTGGCTCCTCATAGAACTCTCTGAGCT
CTTCCTCTGTCGGTTCTTCCACTGGCATTTTTATCCTTGTTGTGGTTGGTCGGTTGGGAA
AGTATCCCCCATACCCGTATTGTC*AAAGTTCACAGCTGCATGGTGACCTGAAGCCACCC
ATGCAATCGTGGTCACCACTTCAATCAAGTCATCTTGTC

QA 2 700 2 700
DS 



CO CL1150Contig2 778 2 16 U
GTGGAAGATGAGACGGCGGAACATGGGGTACGCCTGACGATACCAGATTACCCATTTGCC
AATGACGGTTTAATGCTGTGGGATGCACTAAAGGAATGGACCACAGACTATGTGAAGCAC
TATTATCCAGATGCGGAACAGGTCATGTTGGATGAGGAACTCCAAGGATGGTGGAGTGAA
GTGAGGAACATAGGGCATGGAGACAAGAAAAATGAACCATGGTGGCCTGACCTCAAAACA
CAAGATGACTTGATTGAAGTGGTGACCACGATTGCATGGGTGGCTTCAGGTCACCACGCA
GCTGTAAACTTTGGACAATACGGGTATGGGGGATACTTTCCCAACCGACCAACCACAACA
AGGATAAAAATGCCAGTGGAAGAACCGACAGAGGAAGAGCTAAGAGAGTTCTATGAGGAG
CCAGAGAAGACCATGCTTAAGACATTCCCTTCGAAGAAGCAGGCGACCAAAGTGATGGTG
ACTTTGGATCTTCTATCATCACATTCACCAGATGAAGAGTACCTAGGGGAAAACCCAGAA
GCATCTTGGGCCCACGAACCTGTCATCTATGCTGCATATGAACGTTTCAAAGGAAAGCTC
CAATACCTAGAAGGAGTGATAGATGAGAGGAACGTGAATGTTTCTCTAAAGAATCGAGCT
GGAGCAGTGTTGTTAAGTACGAGCTTTTGAAGCCTATCTCTGAACCAGCGCTACCGGGGA
TGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTATTTGATCTCTATGCATTGGAAGTTATCATCTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW85TF U 1
AF RR2H072TF U 24
BS 1 53 RR2DW85TF
BS 54 54 RR2H072TF
BS 55 89 RR2DW85TF
BS 90 90 RR2H072TF
BS 91 230 RR2DW85TF
BS 231 231 RR2H072TF
BS 232 296 RR2DW85TF
BS 297 297 RR2H072TF
BS 298 305 RR2DW85TF
BS 306 306 RR2H072TF
BS 307 401 RR2DW85TF
BS 402 402 RR2H072TF
BS 403 431 RR2DW85TF
BS 432 432 RR2H072TF
BS 433 608 RR2DW85TF
BS 609 778 RR2H072TF

RD RR2DW85TF 608 0 0
GTGGAAGATGAGACGGCGGAACATGGGGTACGCCTGACGATACCAGATTACCCGTTTGCC
AATGACGGTTTAATGCTGTGGGATGCACTTAAGGAATGGACCACAGACTATGTGAAGCAC
TATTATCCAGATGCGGAACAGGTCATGTTGGATGAGGAACTCCAAGGATGGTGGAGTGAA
GTGAGGAACATAGGGCATGGAGACAAGAAAAATGAACCATGGTGGCCTGATCTCAAAACA
CAAGATGACTTGATTGAAGTGGTGACCACGATTGCATGGGTGGCTTCAGGTCACCATGCA
GCTGTGAACTTTGGACAATACGGGTATGGGGGATACTTTCCCAACCGACCAACCACAACA
AGGATAAAAATGCCAGTGGAAGAACCGACAGAGGAAGAGCTCAGAGAGTTCTATGAGGAG
CCAGAGAAGACTATGCTTAAGACATTCCCTTCGAAGAAGCAGGCGACCAAAGTGATGGTG
ACTTTGGATCTTCTATCATCACATTCACCAGATGAAGAGTACCTAGGGGAAAACCCAGAA
GCATCTTGGGCCCACGAACCTGTCATCTATGCTGCATATGAACGTTTCAAAGGAAAGCTC
CAATACCT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2H072TF 755 0 0
G
GGGGTACGCCTGACGATACCAGATTACCCATTTGCTAATGACGGTTTAATGCTGTGGGAT
GCACTAAAGGAATGGATCACAGACTATGTGAAGCACTATTATCCAGATGCGGAACATGTC
ATGTTGGATGAGGAACTCCAAGGATGGTGGAGTGAAGTGAGGAACATAGGGCATGGAGAC
AAGAAAAATGAACCATGGTGGCCTGTCCTCAAAACACAAGATGACTTGATTGAAGTGGTG
ACCACGATTGCATGGGTGGCTTCAGGTCACCACGCTGCTGTAAACTTTGGACAGTACGGG
TATGGGGGATACTTTCCCAACCGACCAACCACAACAAGGATAAAAATGCCAGTGGAAGAA
CCGACAGAGGAAGAGCTAAGAGAGTTCTTTGAGGAGCCAGAGAAGACCATGCTTAAGACA
TTCCCTTCGAAGAAGCAGGCGACCAAAGTGATGGTGACTTTGGATCTTCTATCATCACAT
TCACCAGATGAAGAGTACCTAGGGGAAAACCCAGAAGCATCTTGGGCCCACGAACCTGTC
ATCTATGCTGCATATGAACGTTTCAAAGGCAAGCTCCAATACCTAGAAGGAGTGATAGAT
GAGAGGAACGTGAATGTTTCTCTAAAGAATCGAGCTGGAGCAGTGTTGTTAAGTACGAGC
TTTTGAAGCCTATCTCTGAACCAGCGCTACCGGGGATGGGTGTTCCCTACAGTGTGTCTA
TTTGATCTCTATGCATTGGAAGTTATCATCTACG

QA 2 755 2 755
DS 



CO CL1150Contig3 1068 2 2 U
CGATAGGTCAGGCCAACTCTGTGTAGTGGTTGCCCTGCGTCCAACAATATTTAGTCCAAT
TTAACATAAAACGACCACACATTGTCTTATTCCCAAAAGAAATAACATATCAATATCCTT
CACAGCTTCCCAGCACAAACAAGGTACCCTTGAGCAGGGTGAGATTCATTATTTATTACG
AAAGAAAAAAAACATAGATCATAACTTGGGAGAAACGTAAATGAAACGTAGATGATAACT
TCCAATGCATTAGAGATCAAATAGACACACTGTAGGGAACACCCATCCCGGTAGCGCCTG
GTTCAAAAATAGGCTTCAAAAGCTCGTACTTAACAACACCTGCTCCAGCTCGATTCTTTA
GAGAAACATTCACGTTCCTCTCATCTATCACTCCTTCTAGGTATTGGAGCTTGCCTTTGA
AACGTTCATATGCAGCATAAATGACAGGTTCGTGGGCCCAAGATGCTTCTGGGTTTTCCC
CTAGGTACTCTTCATCTGGTGAATGTGATGATAGAAGATCCAAAGTCACCATCACTTTGG
TCGCCTGCTTCTTCGAAGGGAATGTCTTAAGCATGGTCTTCTCTGGCTCCTCAAAGAACT
CTCTTAGCTCTTCCTCTGTCGGTTCTTCCACTGGCATTTTTATCCTTGTTGTGGTTGGTC
GGTTGGGAAAGTATCCCCCATACCCGTACTGTCCAAAGTTTACAGCAGCGTGGTGACCTG
AAGCCACCCATGCAATCGTGGTCACCACTTCAATCAAGTCATCTTGTGTTTTGAGGACAG
GCCACCATGGTTCATTTTTCTTGTCTCCATGCCCTATGTTCCTCACTTCACTCCACCATC
CTTGGAGTTCCTCATCCAACATGACATGTTCCGCATCTGGATAATAGTGCTTCACATAGT
CTGTGATCCATTCCTTTAGTGCATCCCACAGCATTAAACCGTCATTAGCAAATGGGTAAT
CTGGTATCGCCAGGCGTACCCCATGTGCCGCCGTCTCATCTTCCACAGCTAGACCCCTGC
TGATGAGGTATGCAGGTAAGCCTTCCGTGTCGAACCTCCATAGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H072JQ U 1
AF RR2E535TF C 549
BS 1 706 RR2H072JQ
BS 707 1068 RR2E535TF

RD RR2H072JQ 709 0 0
CGATAGGTCAGGCCAACTCTGTGTAGTGGTTGCCCTGCGTCCAACAATATTTAGTCCAAT
TTAACATAAAACGACCACACATTGTCTTATTCCCAAAAGAAATAACATATCAATATCCTT
CACAGCTTCCCAGCACAAACAAGGTACCCTTGAGCAGGGTGAGATTCATTATTTATTACG
AAAGAAAAAAAACATAGATCATAACTTGGGAGAAACGTAAATGAAACGTAGATGATAACT
TCCAATGCATTAGAGATCAAATAGACACACTGTAGGGAACACCCATCCCGGTAGCGCCTG
GTTCAAAAATAGGCTTCAAAAGCTCGTACTTAACAACACCTGCTCCAGCTCGATTCTTTA
GAGAAACATTCACGTTCCTCTCATCTATCACTCCTTCTAGGTATTGGAGCTTGCCTTTGA
AACGTTCATATGCAGCATAAATGACAGGTTCGTGGGCCCAAGATGCTTCTGGGTTTTCCC
CTAGGTACTCTTCATCTGGTGAATGTGATGATAGAAGATCCAAAGTCACCATCACTTTGG
TCGCCTGCTTCTTCGAAGGGAATGTCTTAAGCATGGTCTTCTCTGGCTCCTCAAAGAACT
CTCTTAGCTCTTCCTCTGTCGGTTCTTCCACTGGCATTTTTATCCTTGTTGTGGTTGGTC
GGTTGGGAAAGTATCCCCCATACCCGTACTGTCCAAAGTTTACAGC
AGC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2E535TF 520 0 0
TTCTTCGAAGGGAATGTCTTAAGCATGGTCTTCTCTGGCTCCTCAAAGAACTCTCTTAGC
TCTTCCTCTGTCGGTTCTTCCACTGGCATTTTTATCCTTGTTGTGGTTGGTCGGTTGGGA
AAGTATCCCCCATACCCGTACTGTCCAAAGTTTACAGCAGCGTGGTGACCTGAAGCCACC
CATGCAATCGTGGTCACCACTTCAATCAAGTCATCTTGTGTTTTGAGGACAGGCCACCAT
GGTTCATTTTTCTTGTCTCCATGCCCTATGTTCCTCACTTCACTCCACCATCCTTGGAGT
TCCTCATCCAACATGACATGTTCCGCATCTGGATAATAGTGCTTCACATAGTCTGTGATC
CATTCCTTTAGTGCATCCCACAGCATTAAACCGTCATTAGCAAATGGGTAATCTGGTATC
GCCAGGCGTACCCCATGTGCCGCCGTCTCATCTTCCACAGCTAGACCCCTGCTGATGAGG
TATGCAGGTAAGCCTTCCGTGTCGAACCTCCATAGTTTGC

QA 1 520 1 520
DS 



AS 2 7

CO CL1151Contig1 727 4 8 U
GGGCCACTCTCTTTGCTGATCAGCTCCCTCGTTTTCTCGCATCCCCTGAATCCTGAGATG
GCGTCAGAGAAGAAGCTGTCGAACCCAATGAGGGATATCAAGGTTCAGAAGCTCGTCCTT
AACATTTCTGTTGGTGAGAGTGGTGATCGTCTCACCCGTGCTTCCAAGGTGTTGGAACAG
CTCAGTGGTCAAACTCCTGTCTTCTCCAAGGCAAGGTACACTGTGAGGTCATTCGGTATT
AGGCGTAACGAAAAGATTGCGTGCTACGTCACCGTGAGAGGAGACAAGGCAATGCAGCTT
CTTGAGAGTGGTTTGAAAGTTAAGGAGTACGAGCTGTTGAGGAGGAACTTCAGTGACACT
GGCTGTTTTGGTTTCGGTATCCAGGAGCACATTGATCTTGGTATCAAGTACGATCCTTCT
ACGGGTATCTATGGAATGGACTTCTATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCA
CGTCGTCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAACATAGGGTTACAAAGGATGATGCC
ATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGTGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACT
GGTTGAAGAGTTTTGTTTTGTTTTGTCGTGTTTGGCTCTGTTTAAGTTGTTATAATTTGC
GATTCTGGATTTCTTGTTGTGGGAATCCTTTTAAGTACTCTCGAGATATGAACAATTTTT
GGAGGTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC83TF U 1
AF RR2E420TF U 1
AF RR2H113TF U 10
AF RR2E420JQ C 57
BS 1 75 RR2AC83TF
BS 76 76 RR2E420TF
BS 77 125 RR2AC83TF
BS 126 126 RR2E420TF
BS 127 170 RR2AC83TF
BS 171 171 RR2E420TF
BS 172 711 RR2AC83TF
BS 712 727 RR2E420JQ

RD RR2AC83TF 720 0 0
GGGCCACTCTCTTTGCTGATCAGCTCCCTCGTTTTCTCGCATCCCCTGAATCCTGAGATG
GCGTCAGAGAAGAAGTTGTCGAACCCAATGAGGGATATCAAGGTTCAGAAGCTCGTCCTT
AACATCTCTGTTGGTGAGAGTGGTGATCGTCTCACCCGTGCTTCCAAGGTATTGGAACAG
CTCAGTGGTCAAACTCCTGTCTTCTCCAAGGCAAGGTACACTGTGAGGTCATTCGGTATT
AGGCGTAACGAAAAGATTGCGTGCTACGTCACCGTGAGAGGAGACAAGGCAATGCAGCTT
CTTGAGAGTGGTTTGAAAGTTAAGGAGTACGAGCTGTTGAGGAGGAACTTCAGTGACACT
GGCTGTTTTGGTTTCGGTATCCAGGAGCACATTGATCTTGGTATCAAGTACGATCCTTCT
ACGGGTATCTATGGAATGGACTTCTATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCA
CGTCGTCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAACATAGGGTTACAAAGGATGATGCC
ATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGTGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACT
GGTTGAAGAGTTTTGTTTTGTTTTGTCGTGTTTGGCTCTGTTTAAGTTGTTATAATTTGC
GATTCTGGATTTCTTGTTGTGGGAATCCTTTTAAGTACTCTCGAGATATGA
ACAATTTTT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2E420TF 692 0 0
GGGCCACTCTCTTTGCTGATCAGCTCCCTCGTTTTCTCGCATCCCCTGAATCCTGAGATG
GCGTCAGAGAAGAAGCTGTCGAACCCAATGAGGGATATCAAGGTTCAGAAGCTCGTCCTT
AACATTTCTGTTGGTGAGAGTGGTGATCGTCTCACCCGTGCTTCCAAGGTGTTGGAACAG
CTCAGTGGTCAAACTCCTGTCTTCTCCAAGGCAAGGTACACTGTGAGGTCATTCGGTATT
AGGCGTAACGAAAAGATTGCGTGCTACGTCACCGTGAGAGGAGACAAGGCAATGCAGCTT
CTTGAGAGTGGTTTGAAAGTTAAGGAGTACGAGCTGTTGAGGAGGAACTTCAGTGACACT
GGCTGTTTTGGTTTCGGTATCCAGGAGCACATTGATCTTGGTATCAAGTACGATCCTTCT
ACGGGTATCTATGGAATGGACTTCTATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCA
CGTCGTCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAACATAGGGTTACAAAGGATGATGCC
ATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGTGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACT
GGTTGAAGAGTTTTGTTTTGTTTTGTCGTGTTTGGCTCTGTTTAAGTTGTTATAATTTGC
GATTCTGGATTTCTTGTTGTGGGAATCCTTTT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2H113TF 705 0 0
TT
TTTGCTGATCAGCCCCCTCGTTTTCTCGCATCCCCTGAATCCTGAGATGGCGTCAGAGAA
GGAGCTGTCGAACCCAATGAGGGATATCAAGGTTCAGAAGCTCGTCCTTAACATCTCTGT
TGGTGAGAGTGGTGATCGTCTCACCCGTGCTTCCAAGGTGTTGGAACAGCTCAGTGGTCA
AACTCCTGTCTTCTCCAAGGCAAGGTACACTGTGAGGTCATTCGGTATTAGGCGTAACGA
AAAGATTGCGTGCTACGTCACCGTGAGAGGAGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGG
TTTGAAAGTTAAGGAGTACGAGCTGTTGAGGAGGAACTTCAGTGACACTGGCTGTTTTGG
TTTCGGTATCCAGGAGCACATTGATCTTGGTATCAAGTACGATCCTTCTACGGGTATCTA
TGGAATGGACTTCTATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCACGTCGTCGTAG
GCGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAACATAGGGTTACAAAGGATGATGCCATGAAGTGGTT
CCAAGTTAAGTATGAAGGTGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACTGGTTGAAGAGT
TTTGTTTTGTTTTGTCGTGTTTGGCTCTGTTTAAGTTGTTATAATTTGCGATTCTGGATT
TCTTGTTGTGGGAATCCTTTTAAGTACTCTCGAGATATGA
CAT

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR2E420JQ 671 0 0
GATGGCGTCAGAGAAGAAGCTGTCGAACCCAATGAGGGATATCAAGGTTCAGAAGCTCGT
CCTTAACATTTCTGTTGGTGAGAGTGGTGATCGTCTCACCCGTGCTTCCAAGGTGTTGGA
ACAGCTCAGTGGTCAAACTCCTGTCTTCTCCAAGGCAAGGTACACTGTGAGGTCATTCGG
TATTAGGCGTAACGAAAAGATTGCGTGCTACGTCACCGTGAGAGGAGACAAGGCAATGCA
GCTTCTTGAGAGTGGTTTGAAAGTTAAGGAGTACGAGCTGTTGAGGAGGAACTTCAGTGA
CACTGGCTGTTTTGGTTTCGGTATCCAGGAGCACATTGATCTTGGTATCAAGTACGATCC
TTCTACGGGTATCTATGGAATGGACTTCTATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGATACCGTGT
TGCACGTCGTCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAACATAGGGTTACAAAGGATGA
TGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGTGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACAT
CACTGGTTGAAGAGTTTTGTTTTGTTTTGTCGTGTTTGGCTCTGTTTAAGTTGTTATAAT
TTGCGATTCTGGATTTCTTGTTGTGGGAATCCTTTTAAGTACTCTCGAGATATGAACAAT
TTTTGGAGGTT

QA 1 671 1 671
DS 



CO CL1151Contig2 707 3 4 U
TTTTTCTCGCATCCCTGAATCCTGAGATGGCGTCAGAGAAGAAGCTCTCGAACCCAATGA
GGGATATCAAGGTTCAGAAGCTCGTCCTTAACATCTCTGTTGGTGAGAGTGGTGATCGTC
TCACCCGTGCCTCCAAGGTGTTGGAACAGCTCAGTGGTCAAACTCCTGTCTTCTCCAAGG
CGAGGTACACTGTGAGGTCATTCGGTATTAGGCGTAACGAAAAGATTGCTTGCTACGTCA
CCGTGAGAGGAGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGTTCGAAAGTTAAGGAGCACG
AGCTGTTGAGGTGGAACTTCAGTGACACTGGCTGTTTTGGATTCGGTATCCAGGAGCACA
TTGATCTTGGTATCAAGTACGATCCTTCTACTGGTATCTATGGAATGGACTTCTACGTTG
TTCTTGAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGA
TTCAACATAGGGTTACAAAGGATGATGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGTG
TTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACCGGTTGAAGAGTTTCATTTTGTTTTGTGGTGT
TTTGGCTCTGTTTCAAGTTGTTATAATTTGCGAATCTGGATGATAAGGTTTTCTTGTTGT
GGTAGAATCCTTTTAAGTACTCTCGAGATATGAACAATTTTTGGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D701TF U 7
AF RR2FD63TF U 1
AF RR2FD63JQ C 26
BS 1 647 RR2FD63TF
BS 648 648 RR2FD63JQ
BS 649 701 RR2FD63TF
BS 702 707 RR2FD63JQ

RD RR2D701TF 575 0 0
TCGCAT
CCCTGAATCCTGAGATGGCGTCAGAGAAGAAGCTCTCGAACCCAATGAGGGATATCAAGG
TTCAGAAGCTCGTCCTTAACATCTCTGTTGGTGAGAGTGGTGATCGTCTCACCCGTGCCT
CCAAGGTGTTGGAACAGCTCAGTGGTCAAACTCCTGTTTTCTCCAAGGCGAGGTACACTG
TAAGGTCATTCGGTATTAGGCGTAACGAAAAGATTGCGTGCTACGTCACCGTGAGAGGAG
ACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGTTTGAAAGTTAAGGAGTACGAGCTGTTGAGGA
GGAACTTCAGTGACACTGGCTGTTTTGGATTCGGTATCCAGGAGCACATTGATCTTGGTA
TCAAGTACGATCCTTCTACGGGTATCTATGGAATGGACTTCTACGTTGTTCTTGAGCGTC
CTGGATACCGTGTTGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAACATAGGG
TTACAAAGGATGATGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGTGTTATCCTCAACA
AGTCTCAGAACATCACCGGTTGAAGAGTT

QA 7 575 7 575
DS 

RD RR2FD63TF 706 0 0
TTTTTCTCGCATCCCTGAATCCTGAGATGGCGTCAGAGAAGAAGCTCTCGAACCCAATGA
GGGATATCAAGGTTCAGAAGCTCGTCCTTAACATCTCTGTTGGTGAGAGTGGTGATCGTC
TCACCCGTGCCTCCAAGGTGTTGGAACAGCTCAGTGGTCAAACTCCTGTCTTCTCCAAGG
CGAGGTACACTGTGAGGTCATTCGGTATTAGGCGTAACGAAAAGATTGCTTGCTACGTCA
CCGTGAGAGGAGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGTTCGAAAGTTAAGGAGCACG
AGCTGTTGAGGTGGAACTTCAGTGACACTGGCTGTTTTGGATTCGGTATCCAGGAGCACA
TTGATCTTGGTATCAAGTACGATCCTTCTACTGGTATCTATGGAATGGACTTCTACGTTG
TTCTTGAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGA
TTCAACATAGGGTTACAAAGGATGATGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGTG
TTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACCGGTTGAAGAGTTTCATTTTGTTTTGTGGTGT
TTTGGCTCTGTTTCAAGTTGTTATAATTTGCGAATCTGGATGATAAG*TTTTCTTGTTGT
GGTAGAATCCTTTTAAGTACTCTCGAGATATGAACAATTTT
GGAGG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2FD63JQ 682 0 0
GATGGCGTCAGAGAAGAAGCTCTCGAACCCAATGAGGGATATCAAGGTTCAGAAGCTCGT
CCTTAACATCTCTGTTGGTGAGAGTGGTGATCGTCTCACCCGTGCCTCCAAGGTGTTGGA
ACAGCTCAGTGGTCAAACTCCTGTCTTCTCCAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCATTCGG
TATTAGGCGTAACGAAAAGATTGCTTGCTACGTCACCGTGAGAGGAGACAAGGCAATGCA
GCTTCTTGAGAGTGGTTCGAAAGTTAAGGAGCACGAGCTGTTGAGGTGGAACTTCAGTGA
CACTGGCTGTTTTGGATTCGGTATCCAGGAGCACATTGATCTTGGTATCAAGTACGATCC
TTCTACTGGTATCTATGGAATGGACTTTTACGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGATACCGTGT
TGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAACATAGGGTTACAAAGGATGA
TGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGTGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACAT
CACCGGTTGAAGAGTTTCATTTTGTTTTGTGGTGTTTTGGCTCTGTTTCAAGTTGTTATA
ATTTGCGAATCTGGATGATAAGGTTTTCTTGTTGTGGTAGAATCCTTTTAAGTACTCTCG
AGATATGAACAATTTTTGGAGG

QA 1 682 1 682
DS 



AS 2 5

CO CL1152Contig1 693 3 2 U
GGGCTCACGAAGTCTAATTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGCAGAGAAGTCTTTCA
CCAAGTCGTGAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGTCGTGGCAATCGTACGTTGACGAC
CACCTTATGTGCGATGTGGAAGGCAGCCAACTCACAGCCGCCGCCATCCTCGGTCATGAC
GGCAGTGTCTGGGCTCAGAGCTCCGCTTTCCCTCAGTTGAAGACTGAAGAAGTCAATGGG
ATCAACAAGGACTTCGAGGAGCCCGGGTTTCTCGCCCCGACCGGTTTATTTCTCGGTGGT
GCGAAATACATGGTTATCCAAGGTGAACCAGGAGCTGTCATCCGAGGGAAGAAGGGACCT
GGAGGTGTTACTATCAAGAAGACGAATCAAGCTTGGGTCATTGGCATCTACGAGGAGCCT
ATGACTGGAGGTCAATGCAATTTGGTTGTGGAAAGGCTCGGGGATTACCTCATCGAGTCT
GATCTCTAAAACTTTCTGTTTCAAAGTCTCTTCTTTTTTAACTAAAAAAGAATGGTCACT
ACCCCTTTTTCATTGTGATTGATTGTAGTAACGCAATCGATCTGATACTTTGGAAGCGAA
TATCTTTGTTTTGGTCTTCTTGTTCCTGGGTTTGTGTGTCTTGTAATGCCATTTGATGAT
ATTATTTTTTTCTTTCATTATGTGTTTTCTTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW80TFB U 68
AF RR2CJ67JQ C 1
AF RR2CJ67TF U 1
BS 1 664 RR2CJ67TF
BS 665 693 RR2CJ67JQ

RD RR2AW80TFB 455 0 0
GTGAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGTCGTGGCAATCGTACGTTGACGACCACCTTA
TGTGCGATGTGGAAGGGAGCCAACTCACAGCCGCCGCCATCCTCGGTCATGACGGCAGTG
TCTGGGCTCAGAGCTCCGCTTTCCCTCAGTTGAAGACTGAAGAAGTCAATGGGATCAACA
AGGACTTCGAGGAGCCCGGGTTTCTCGCCCCGACCGGTTTATTTCTCGGTGGTGCGAAAT
ACATGGTTATCCAAGGTGAACCAGGAGCTGTCATCCGAGGGAAGAAGGGACCTGGAGGTG
TTACTATCAAGAAGACGAATCAAGCTTGGGTCATTGGCATCTACGAGGAGCCTATGACTG
GAGGTCAATGCAATTTGGTTGTGGAAAGGCTCGGGGATTACCTCATCGAGTCTGATCTCT
AAAACTTTCTGTTTCAAAGTCTCTTCTTTTT
AACT

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR2CJ67JQ 693 0 0
GGGCTCACGAAGTCTAATTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGCAGAGAAGTCTTTCA
CCAAGTCGTGAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGTCGTGGCAATCGTACGTTGACGAC
CACCTTATGTGCGATGTGGAAGGCAGCCAACTCACAGCCGCCGCCATCCTCGGTCATGAC
GGCAGTGTCTGGGCTCAGAGCTCCGCTTTCCCTCAGTTGAAGACTGAAGAAGTCAATGGG
ATCAACAAGGACTTCGAGGAGCCCGGGTTTCTCGCCCCGACCGGTTTATTTCTCGGTGGT
GCGAAATACATGGTTATCCAAGGTGAACCAGGAGCTGTCATCCGAGGGAAGAAGGGACCT
GGAGGTGTTACTATCAAGAAGACGAATCAAGCTTGGGTCATTGGCATTTACGAGGAGCCT
ATGACTGGAGGTCAATGCAATTTGGTTGTGGAAAGGCTCGGGGATTACCTCATCGAGTCT
GATCTCTAAAACTTTCTGTTTCAAAGTCTCTTCTTTTTTAACTAAAAAAGAATGGTCACT
ACCCCTTTTTCATTGTGATTGATTGTAGTAACGCAATCGATCTGATACTTTGGAAGCGAA
TATCTTTGTTTTGGTCTTCTTGTTCCTGGGTTTGTGTGTCTTGTAATGCCATTTGATGAT
ATTATTTTTTTCTTTCATTATGTGTTTTCTTGG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2CJ67TF 664 0 0
GGGCTCACGAAGTCTAATTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGCAGAGAAGTCTTTCA
CCAAGTCGTGAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGTCGTGGCAATCGTACGTTGACGAC
CACCTTATGTGCGATGTGGAAGGCAGCCAACTCACAGCCGCCGCCATCCTCGGTCATGAC
GGCAGTGTCTGGGCTCAGAGCTCCGCTTTCCCTCAGTTGAAGACTGAAGAAGTCAATGGG
ATCAACAAGGACTTCGAGGAGCCCGGGTTTCTCGCCCCGACCGGTTTATTTCTCGGTGGT
GCGAAATACATGGTTATCCAAGGTGAACCAGGAGCTGTCATCCGAGGGAAGAAGGGACCT
GGAGGTGTTACTATCAAGAAGACGAATCAAGCTTGGGTCATTGGCATCTACGAGGAGCCT
ATGACTGGAGGTCAATGCAATTTGGTTGTGGAAAGGCTCGGGGATTACCTCATCGAGTCT
GATCTCTAAAACTTTCTGTTTCAAAGTCTCTTCTTTTTTAACTAAAAAAGAATGGTCACT
ACCCCTTTTTCATTGTGATTGATTGTAGTAACGCAATCGATCTGATACTTTGGAAGCGAA
TATCTTTGTTTTGGTCTTCTTGTTCCTGGGTTTGTGTGTCTTGTAATGCCATTTGATGAT
ATTA

QA 1 664 1 664
DS 



CO CL1152Contig2 685 2 1 U
AGGGGACGAAGTCTAATTGAGAGAGAGAGAGAAGCAGAGAAGTCTTTCACCAAGTCGTGA
GGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACGTCGTGGCAATCGTACGTTGACGACCACCTTATGTG
CGATGTCGAAGGCAGCCAACTCACAGCCGCCGCCATCCTCGGTCATGACGGCAGTGTCTG
GGCTCAGAGCGCCGCTTTCCCTCAGTTGAAGACTGAAGAAGTCAATGGGATCAACAAGGA
CTTCGAGGAGCCCGGGTTTCTTGCCCCGACCGGTTTATTTCTCGGTGGAGCTAAATACAT
GGTTATCCAAGGTGAACCAGGAGCTGTCATCCGAGGGAAGAAGGGACCTGGAGGTGTTAC
TATCAAGAAGACGAATCAAGCTTTGGTCATCGGTATCTACGAGGAGCCTATGACTGGAGG
TCAATGCAATTTGGTTGTGGAGAGGCTCGGAGATTACCTCATCGAGTCTGATCTCTAAAA
ATTTCTGTTTCAAAGTCTCTCTTCTTTTTAACTAAAAAGAATGGTGGTCATTACCCCTTT
TTCATTGTGATTGATTGTAGTGACGCAATCGATCTGATACTTTGGAACCGAATATATTTG
TTTTGGTCTTCTTGTTCCCGGGTTTGGGGTTTGTGTGTCTTGTAATGGCATTTGATGATA
TTATTTTTTCTTTTCATTATGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GW45TF U 1
AF RR2GW45JQ C 246
BS 1 685 RR2GW45TF

RD RR2GW45TF 685 0 0
AGGGGACGAAGTCTAATTGAGAGAGAGAGAGAAGCAGAGAAGTCTTTCACCAAGTCGTGA
GGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACGTCGTGGCAATCGTACGTTGACGACCACCTTATGTG
CGATGTCGAAGGCAGCCAACTCACAGCCGCCGCCATCCTCGGTCATGACGGCAGTGTCTG
GGCTCAGAGCGCCGCTTTCCCTCAGTTGAAGACTGAAGAAGTCAATGGGATCAACAAGGA
CTTCGAGGAGCCCGGGTTTCTTGCCCCGACCGGTTTATTTCTCGGTGGAGCTAAATACAT
GGTTATCCAAGGTGAACCAGGAGCTGTCATCCGAGGGAAGAAGGGACCTGGAGGTGTTAC
TATCAAGAAGACGAATCAAGCTTTGGTCATCGGTATCTACGAGGAGCCTATGACTGGAGG
TCAATGCAATTTGGTTGTGGAGAGGCTCGGAGATTACCTCATCGAGTCTGATCTCTAAAA
ATTTCTGTTTCAAAGTCTCTCTTCTTTTTAACTAAAAAGAATGGTGGTCATTACCCCTTT
TTCATTGTGATTGATTGTAGTGACGCAATCGATCTGATACTTTGGAACCGAATATATTTG
TTTTGGTCTTCTTGTTCCCGGGTTTGGGGTTTGTGTGTCTTGTAATGGCATTTGATGATA
TTATTTTTTCTTTTCATTATGTGTT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2GW45JQ 440 0 0
AGGAGCCCGGGTTTCTTGCCCCGACCGGTTTATTTCTCGGTGGAGCTAAATACATGGTTA
TCCAAGGTGAACCAGGAGCTGTCATCCGAGGGAAGAAGGGACCTGGAGGTGTTACTATCA
AGAAGACGAATCAAGCTTTGGTCATCGGTATTTACGAGGAGCCTATGACTGGAGGTCAAT
GCAATTTGGTTGTGGAGAGGCTCGGAGATTACCTCATCGAGTCTGATCTCTAAAAATTTC
TGTTTCAAAGTCTCTCTTCTTTTTAACTAAAAAGAATGGTGGTCATTACCCCTTTTTCAT
TGTGATTGATTGTAGTGACGCAATCGATCTGATACTTTGGAACCGAATATATTTGTTTTG
GTCTTCTTGTTCCCGGGTTTGGG*TTTGTGTGTCTTGTAATGGCATTTGATGATATTATT
TTTTCTTTTCATTATGTGTT

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 7

CO CL1153Contig1 551 7 16 U
AGGACACTTAACAATTGTTTCCTTCCAACTCTCGCTCTCTCT***ACTTTCTTCCTCTCT
CGCAAAATGAAGCTTTCTTTGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCATGTTTATGATATTC
GTCGCTTCAGGGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCAT
AAGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGACACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGGT
TTTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCCGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACACTGCTGA
TTTATCCATCTCAATCGATTCTCATAACTCGAATCTTCAATCCGCCGTCTCGTCTCTTCT
CATCGTGTTTGTTTCTTTTTTCTTCTTTTCGAAAAATTTCTCGTGTTTGTTTCTTTCTGT
CTAATATTTCTTACAGTGCCATGTTGTACTGTGTCTGTGTGTGTGTTTATTGTGTTTTCG
AATAAGTCTTTGTTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAATTCTAA*TGTTTTT
TAAAGAAAATC


BQ
10 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EG10TF U 2
AF RR2AJ79JQ C 1
AF RR2FE96JQ C 2
AF RR2GY15JQ C 1
AF RR2GY15TF U 1
AF RR2FE96TF U 2
AF RR2AJ79TF U 1
BS 1 1 RR2AJ79JQ
BS 2 42 RR2EG10TF
BS 43 45 RR2GY15TF
BS 46 130 RR2EG10TF
BS 131 131 RR2GY15TF
BS 132 176 RR2EG10TF
BS 177 177 RR2GY15TF
BS 178 229 RR2EG10TF
BS 230 230 RR2GY15TF
BS 231 356 RR2EG10TF
BS 357 357 RR2GY15TF
BS 358 361 RR2EG10TF
BS 362 461 RR2GY15TF
BS 462 462 RR2FE96TF
BS 463 541 RR2GY15TF
BS 542 551 RR2AJ79TF

RD RR2EG10TF 367 0 0
GGACACTTAACAATTGTTTCCTTCCAACTCTCGCTCTCTCTTAAACTTTCTTCCTCTCTC
GCAAAATGAAGCTTTCTTTGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCATGTTTATGATATTCG
TCGCTTCAGTGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGTCATA
AGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGACACAATTGCGCAAATGTGTGCCGCAACGAAGGTT
TTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCCGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACACTGCTGAT
TTATCCATCTCAATCGATTCTCATAACTCGAATCTTCAATCCGCCGTCTCGTCTCGTCTC
TTCTCGT

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR2AJ79JQ 551 0 0
AGGACACTTAACAATTGTTTC*TTCCAACTTTCGCTTTCTCTTAAACTTTCTTCCTCTCT
CGCAAAATGAAGCTTTCTTTGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCATGTTTATGATATTC
GTTGCTTCAGGGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCAT
AAGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGACACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGGT
TTTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCCGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACGCTGCTGA
TTTATCCATCTCAATCGATTCTCATAACTCGAATCTTCAATCCGCCGTCTCGTCTCTTCT
CATCGTGTTTGTTTCTTTTTTCTTCTTTTCGAAAATTTTCTCGTGTTTGTTTCTTTCTGT
CTAATATTTCTTACAGTGCCATGTTGTACTGTGTCTGTGTGTGTGTTTAATGTGTTTTCG
AATAAGTCTTTGTTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAATTCTAAATGTTTTT
TAAAGAAAATC

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2FE96JQ 540 0 0
GGACACTTAACAATTGTTTCCTTCCAACTCTCGCTCTCTCT***ACTTTCTTCCTCTCTC
GCAAAATGAAGCTTTCTTTGCGTTTGATTTCAGCTGTTCTCCTCATGTTTATGATATTCG
TCGCTTCAGGGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATA
AGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGACACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGGTT
TTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCCGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACACTGCTGAT
TTATCCATCTCAATCGATTCTCATAACTCGAATCTTCAATCCGCCGTCTCGTCTCTTCTC
ATCGTGTTTGTTTCTTTTTTCTTCTTTTCGAAAAATTTCTCGTGTTTGTTTCTTTCTGTC
TAATATTTCTTACAGTGCCATGTTGTACTGTGTCTGTGTGTGT**TTATTGTGTTTTCGA
ATAAGTCTTTGTTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAATTCTAA*TGTTTTTT

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2GY15JQ 541 0 0
GAC
ACACTTAACAATTGTTTCCTTCCAACTCTCGCTCTCTCT***ACTTTCTTCCTCTCTCGC
AAAATGAAGCTTTCTTTGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCATGTTTATGATATTCGTC
GCTTCAGGGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATAAG
TTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGACACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGGTTTT
CATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCCGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACACTGCTGATTT
ATCCATCTCAATCGATTCTCATAACTCGAATCTTCAATCCGCCGTCTCGTCTCTTCTCAT
CGTGTTTGTTTCTTTTTTCTTCTTTTCGAAAAATTTCTCGTGTTTGTTTCTTTCTGTCTA
ATATTTCTTACAGTGCCATGTTGTACTGTGTCTGTGTGCGTGTTTATTGTGTTTTCGAAT
AAGTCTTTGTTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAATTCTAA*TGTTTTTT

QA 4 541 4 541
DS 

RD RR2GY15TF 541 0 0
GAC
ACACTTAACAATTGTTTCCTTCCAACTCTCGCTCTCTCT***ACTTTCTTCCTCTCTCGC
AAAATGAAGCTTTCTTTGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCATGTTTATGATATTCGTC
GCTTCAGGGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATAAG
TTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGACACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGGTTTT
CATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCCGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACACTGCTGATTT
ATCCATCTCAATCGATTCTCATAACTCGAATCTTCAATCCGCCGTCTCGTCTCTTCTCAT
CGTGTTTGTTTCTTTTTTCTTCTTTTCGAAAAATTTCTCGTGTTTGTTTCTTTCTGTCTA
ATATTTCTTACAGTGCCATGTTGTACTGTGTCTGTGTGCGTGTTTATTGTGTTTTCGAAT
AAGTCTTTGTTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAATTCTAA*TGTTTTTT

QA 4 541 4 541
DS 

RD RR2FE96TF 540 0 0
GGACACTTAACAATTGTTTCCTTCCAACTCTCGCTCTCTCT***ACTTTCTTCCTCTCTC
GCAAAATGAAGCTTTCTTTGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCATGTTTATGATATTCG
TCGCTTCAGGGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATA
AGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGACACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGGTT
TTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCCGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACACTGCTGAT
TTATCCATCTCAATCGATTCTCATAACTCGAATCTTCAATCCGCCGTCTCGTCTCTTCTC
ATCGTGTTTGTTTCTTTTTTCTTCTTTTCGAAAAATTTCTCGTGTTTGTTTCTTTCTGTC
TAATATTTCTTACAGTGCCATGTTGTACTGTGTCTGTGTGTGT**TTATTGTGTTTTCGA
ATAAGTCTTTGTTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAATTCTAA*TGTTTTTT

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2AJ79TF 551 0 0
A
GGACACTTAACAATTGTTTC*TTCCAACTTTCGCTTTCTCTTAAACTTTCTTCCTCTCTC
GCAAAATGAAGCTTTCTTTGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCATGTTTATGATATTCG
TTGCTTCAGGGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATA
AGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGACACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGGTT
TTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCCGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACGCTGCTGAT
TTATCCATCTCAATCGATTCTCATAACTCGAATCTTCAATCCGCCGTCTCGTCTCTTCTC
ATCGTGTTTGTTTCTTTTTTCTTCTTTTCGAAAATTTTCTCGTGTTTGTTTCTTTCTGTC
TAATATTTCTTACAGTGCCATGTTGTACTGTGTCTGTGTGTGTGTTTAATGTGTTTTCGA
ATAAGTCTTTGTTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAATTCTAAATGTTTTTT
AAAGAAAATC

QA 2 551 2 551
DS 



AS 1 5

CO CL1154Contig1 606 5 2 U
GGACCTTTGAACTTTCTCGATTGAAATAAAATCTCAAAATTCGATCAAAGAAATGCAAAC
ATCATCATCTGTTCCTCCTGCAAGAAGAAGAAGTCTCTGTCTGATCCTCATCATAGTCTT
CTTAACGCTCCTTTCATCGATCACCATGTCTGAATCCACCGGAGAAGCATCGTCAGAAGC
TAAGGTTCACATCGTCTACACAGAGAAACCCACCGACGAGGAGCCTAAGGACTATCACCT
CCGTACCCTTTCCTCCGCTCTCGGCAGCGAGGAAGCTGCGAAGGATGCTTTGATTTACAG
TTACAAGGAAGCTGCTTCTGGTTTCTCTGCTAAGCTCACACCTGCCCAAGTCGAAGAGAT
TTCCAAGCAACCAGGTGTGATTCAAGTAGTGCCGAGCCAGACCTACCAGTTGCACAAACC
TGTTGGTGCTGGTGGTTTCAAGCTTACCTAACTTTGACTTTGTGTAGCGTGTTGTTGTTG
TGAATGTCGTGGCTTTGAGAACTGGTATCTAACTAAAATAATTGCCATGAGTTTGCTTTG
GATTCGACTTGTTCTGTGTTGTTGAGAATTGGGTTTTATAAATATATATGAGTTTAAGAT
AATCTT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2A647TF U 1
AF RR2DG19TF U 1
AF RR2DJ02JQ C 227
AF RR2DJ02TF U 72
AF RR2B124TF U 2
BS 1 584 RR2A647TF
BS 585 606 RR2B124TF

RD RR2A647TF 586 0 0
GGACCTTTGAACTTTCTCGATTGAAATAAAATCTCAAAATTCGATCAAAGAAATGCAAAC
ATCATCATCTGTTCCTCCTGCAAGAAGAAGAAGTCTCTGTCTGATCCTCATCATAGTCTT
CTTAACGCTCCTTTCATCGATCACCATGTCTGAATCCACCGGAGAAGCATCGTCAGAAGC
TAAGGTTCACATCGTCTACACAGAGAAACCCACCGACGAGGAGCCTAAGGACTATCACCT
CCGTACCCTTTCCTCCGCTCTCGGCAGCGAGGAAGCTGCGAAGGATGCTTTGATTTACAG
TTACAAGGAAGCTGCTTCTGGTTTCTCTGCTAAGCTCACACCTGCCCAAGTCGAAGAGAT
TTCCAAGCAACCAGGTGTGATTCAAGTAGTGCCGAGCCAGACCTACCAGTTGCACAAACC
TGTTGGTGCTGGTGGTTTCAAGCTTACCTAACTTTGACTTTGTGTAGCGTGTTGTTGTTG
TGAATGTCGTGGCTTTGAGAACTGGTATCTAACTAAAATAATTGCCATGAGTTTGCTTTG
GATTCGACTTGTTCTGTGTTGTTGAGAATTGGGTTTTATAAATA
AA

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2DG19TF 577 0 0
G
GACCTTTGAACTTTCTCGATTGAAATAAAATCTCAAAATTCGATCAAAGAAATGCAAACA
TCATCATCTGTTCCTCCTGCAAGAAGAAGAAGTCTCTGTCTGATCCTCATCATAGTCTTC
TTAACGCTCCTTTCATCGATCACCATGTCTGAATCCACCGGAGAAGCATCGTCAGAAGCT
AAGGTTCACATCGTCTACACAGAGAAACCCACCGACGAGGAGCCTAAGGACTATCACCTC
CGTACCCTTTCCTCCGCTCTCGGCAGCGAGGAAGCTGCGAAGGATGCTTTGATTTACAGT
TACAAGGAAGCTGCTTCTGGTTTCTCTGCTAAGCTCACACCTGCCCAAGTCGAAGAGATT
TCCAAGCAACCAGGTGTGATTCAAGTAGTGCCGAGCCAGACCTACCAGTTGCACAAACCT
GTTGGTGCTGGTGGTTTCAAGCTTACCTAACTTTGACTTTGTGTAGCGTGTTGTTGTTGT
GAATGTCGTGGCTTTGAGAACTGGTATCTAACTAAAATAATTGCCATGAGTTTGCTTTGG
ATTCGACTTGTTCTGTGTTGTTGAGAATTGGGTTTT

QA 2 577 2 577
DS 

RD RR2DJ02JQ 374 0 0
AAGGACTATCACCTCCGTACCCTTTCCTCCGCTCTCGGCAGCGAGGAAGCTGCGAAGGAT
GCTTTGATTTACAGTTACAAGGAAGCTGCTTCTGGTTTTTCTGCTAAGCTCACACCTGCC
CAAGTCGAAGAGATTTCCAAGCAACCAGGTGTGATTCAAGTAGTGCCGAGCCAGACCTAC
CAGTTGCACAAACCTGTTGGTGCTGGTGGTTTCAAGCTTACCTAACTTTGACTTTGTGTA
GCGTGTTGTTGTTGTGAATGTCGTGGCTTTGAGAACTGGTATCTAACTAAAATAATTGCC
ATGAGTTTGCTTTGGATTCGACTTGTTCTGTGTTGTTGAGAATTGGGTTTTATAAATATA
TATGAGTTTAAGA
C

QA 1 373 1 373
DS 

RD RR2DJ02TF 529 0 0
G
TCCTCCTGCAAGAAGAAGAAGTCTCTGTCTGATCCTCATCATAGTCTTCTTAACGCTCCT
TTCATCGATCACCATGTCTGAATCCACCGGAGAAGCATCGTCAGAAGCTAAGGTTCACAT
CGTCTACACAGAGAAACCCACCGACGAGGAGCCTAAGGACTATCACCTCCGTACCCTTTC
CTCCGCTCTCGGCAGCGAGGAAGCTGCGAAGGATGCTTTGATTTACAGTTACAAGGAAGC
TGCTTCTGGTTTCTCTGCTAAGCTCACACCTGCCCAAGTCGAAGAGATTTCCAAGCAACC
AGGTGTGATTCAAGTAGTGCCGAGCCAGACCTACCAGTTGCACAAACCTGTTGGTGCTGG
TGGTTTCAAGCTTACCTAACTTTGACTTTGTGTAGCGTGTTGTTGTTGTGAATGTCGTGG
CTTTGAGAACTGGTATCTAACTAAAATAATTGCCATGAGTTTGCTTTGGATTCGACTTGT
TCTGTGTTGTTGAGAATTGGGTTTTATAAATATATATGAGTTTAAGA
C

QA 2 528 2 528
DS 

RD RR2B124TF 605 0 0
GACCTTTGAACTTTCTCGATTGAAATAAAATCTCAAAATTCGATCAAAGAAATGCAAACA
TCATCATCTGTTCCTCCTGCAAGAAGAAGAAGTCTCTGTCTGATCCTCATCATAGTCTTC
TTAACGCTCCTTTCATCGATCACCATGTCTGAATCCACCGGAGAAGCATCGTCAGAAGCT
AAGGTTCACATCGTCTACACAGAGAAACCCACCGACGAGGAGCCTAAGGACTATCACCTC
CGTACCCTTTCCTCCGCTCTCGGCAGCGAGGAAGCTGCGAAGGATGCTTTGATTTACAGT
TACAAGGAAGCTGCTTCTGGTTTCTCTGCTAAGCTCACACCTGCCCAAGTCGAAGAGATT
TCCAAGCAACCAGGTGTGATTCAAGTAGTGCCGAGCCAGACCTACCAGTTGCACAAACCT
GTTGGTGCTGGTGGTTTCAAGCTTACCTAACTTTGACTTTGTGTAGCGTGTTGTTGTTGT
GAATGTCGTGGCTTTGAGAACTGGTATCTAACTAAAATAATTGCCATGAGTTTGCTTTGG
ATTCGACTTGTTCTGTGTTGTTGAGAATTGGGTTTTATAAATATATATGAGTTTAAGATA
ATCTT

QA 1 605 1 605
DS 



AS 2 7

CO CL1155Contig1 1019 5 16 U
AATAGTTAAAAACTACTAATTTATTAATTAAACAAAGAACTAATCAAGTTATGTCCATTA
GAAATGGACAAAACAAAACAAACCCTAACAGAAAACTAAATGAAAATGAAAGAAAATCCA
AAACGGAGGAGACGAGCTTAGTTCTTCTTGGCATGCTTGATGTGACAAGAGTACTGAAGG
AGAGGAGTAAAGAAATGGCTCTTGAACATCATGTGGAGATGGCCATAGCACTTCTTGTCC
ATATTCAAAACGATCTCACAACACTCCTTGTCCAAAGCCAAGTCGTTCTCTGCCCAACTG
GAAAACACCTGCGAGAAACATTTCTCTGACACCTTCGACTTATCCCCAGTCAAACACTTC
TTTAACTCACCGGACTGCGACACGAGAACAGACTGGAACGGGCTAAATGATCCTCCAAGA
CCAGGAAGGTTAGGGATGTTCGGTATACTTGGGATCTGTGGGATAGGAATGTTTGGTATC
CCTGGAATCTGTGGGATAGGGATGTTCGGTATTCCTGGGATCTGTGGGATAGGGATGTTT
GGTATCCCTGGAATCTGTGGGATTTGAGGGATGTTTGGTATCGCTGGAATCTGTGGGATG
TTTGGTATCCCTGGAATGTTTGGGAT**TGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGG
ATGTGGTAGCCGTTTCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTAATTCTCCGTCACCCG
TTACCACCATGGTAGGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATG
ATGCGTCGCCAGCACAAAGGCCATGCGATCCGTCGAGTTATCATGAATCATCAGAGCAAC
GGGCAGAGCCCGCGTCGACCTTTTATCTAATAAATGCATCCCTTCCAGAAGTCGGGGTTT
GTTGCACGTATTAGCTCTAGAATTACTACGGTTATCCGAGTAGTAGTTACCATCAAACAA
ACTATAACTGATTTAATGAGCCATTCGCAGTTTCACAGTCTGAATTCGTTCATACCTCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 10 25 25 10 25 10 10 10 10 25 10 25 25 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A521JQ U 1
AF RR2A521TF C 1
AF RR2FN51JQ U 1
AF RR2C915JQ U 69
AF RR2C915TF C 364
BS 1 599 RR2A521JQ
BS 600 626 RR2FN51JQ
BS 627 628 RR2C915JQ
BS 629 632 RR2FN51JQ
BS 633 633 RR2C915JQ
BS 634 636 RR2FN51JQ
BS 637 638 RR2C915JQ
BS 639 640 RR2FN51JQ
BS 641 641 RR2C915JQ
BS 642 642 RR2FN51JQ
BS 643 646 RR2C915JQ
BS 647 647 RR2FN51JQ
BS 648 648 RR2C915JQ
BS 649 650 RR2FN51JQ
BS 651 731 RR2C915JQ
BS 732 1019 RR2C915TF

RD RR2A521JQ 600 0 0
AATAGTTAAAAACTACTAATTTATTAATTAAACAAAGAACTAATCAAGTTATGTCCATTA
GAAATGGACAAAACAAAACAAACCCTAACAGAAAACTAAATGAAAATGAAAGAAAATCCA
AAACGGAGGAGACGAGCTTAGTTCTTCTTGGCATGCTTGATGTGACAAGAGTACTGAAGG
AGAGGAGTAAAGAAATGGCTCTTGAACATCATGTGGAGATGGCCATAGCACTTCTTGTCC
ATATTCAAAACGATCTCACAACACTCCTTGTCCAAAGCCAAGTCGTTCTCTGCCCAACTG
GAAAACACCTGCGAGAAACATTTCTCTGACACCTTCGACTTATCCCCAGTCAAACACTTC
TTTAACTCACCGGACTGCGACACGAGAACAGACTGGAACGGGCTAAATGATCCTCCAAGA
CCAGGAAGGTTAGGGATGTTCGGTATACTTGGGATCTGTGGGATAGGAATGTTTGGTATC
CCTGGAATCTGTGGGATAGGGATGTTCGGTATTCCTGGGATCTGTGGGATAGGGATGTTT
GGTATCCCTGGAATCTGTGGGATTTGAGGGATGTTTGGTATCGCTGGAATCTGTGGGAT
C

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2A521TF 600 0 0
AATAGTTAAAAACTACTAATTTATTAATTAAACAAAGAACTAATCAAGTTATGTCCATTA
GAAATGGACAAAACAAAACAAACCCTAACAGAAAACTAAATGAAAATGAAAGAAAATCCA
AAACGGAGGAGACGAGCTTAGTTCTTCTTGGCATGCTTGATGTGACAAGAGTACTGAAGG
AGAGGAGTAAAGAAATGGCTCTTGAACATCATGTGGAGATGGCCATAGCACTTCTTGTCC
ATATTCAAAACGATCTCACAACACTCCTTGTCCAAAGCCAAGTCGTTCTCTGCCCAACTG
GAAAACACCTGCGAGAAACATTTCTCTGACACCTTCGACTTATCCCCAGTCAAACACTTC
TTTAACTCACCGGACTGCGACACGAGAACAGACTGGAACGGGCTAAATGATCCTCCAAGA
CCAGGAAGGTTAGGGATGTTCGGTATACTTGGGATCTGTGGGATAGGAATGTTTGGTATC
CCTGGAATCTGTGGGATAGGGATGTTCGGTATTCCTGGGATCTGTGGGATAGGGATGTTT
GGTATCCCTGGAATCTGTGGGATTTGAGGGATGTTTGGTATCGCTGGAATCTGTGGGAT
C

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2FN51JQ 652 0 0
AATAGTTAAAAACTACTAATTTATTAATTAAACAAAGAACTAATCAAGTTATGTCCATTA
GAAATGGACAAAACAAAACAAACCCTAACAGAAAACTAAATGAAAATGAAAGAAAATCCA
AAACGGAGGAGACGAGCTTAGTTCTTCTTGGCATGCTTGATGTGACAAGAGTACTGAAGG
AGAGGTGTAAAGAAATGGCTCTTGAACATCATGTGGAGATGGCCATAGCACTTCTTGTCC
ATATTCAAAACGATCTCACAACACTCCTTGTCCAAAGCCAAGTCGTTCTCTGCCCAACTG
GAAAACACCTGCGAGAAACATTTCTCTGACACCTTCGACTTATCCCCAGTCAAACACTTC
TTTAACTCACCGGACTGCGACACGAGAACAGACTGGAACGGGCTAAATGATCCTCCAAGA
CCAGGAAGGTTAGGGATGTTCGGTATACTTGGGATCTGTGGGATAGGAATGTTTGGTATC
CCTGGAATCTGTGGGATAGGGATGTTCGGTATTCCTGGGATCTGTGGGATAGGGATGTTT
GGTATCCCTGGAATCTATGGGATTTGAGGGATGTTTGGTATCGCTGGAATCTGTGGGATG
TTTGGTATCCCTGGAATGTTTGGGATAGTGGGGAATGAGC*CAGGAGGTGAA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2C915JQ 663 0 0
CAAAACAAAACAAACCCTAACAGAAAACTAAATGAAAATGAAAGAAAATCCAAAACGGAG
GAGACGAGCTTAGTTCTTCTTGGCATGCTTGATGTGACAAGAGTACTGAAGGAGAGGTGT
AAAGAAATGGCTCTTGAACATCATGTGGAGATGGCCATAGCACTTCTTGTCCATATTCAA
AACGATCTCACAACACTCCTTGTCCAAAGCCAAGTCGTTATCTGCCCAACTGGAAAACAC
CTGCGAGAAACATTTCTCTGACACCTTCGACTTATCCCCAGTCAAACACTTCTTTAACTC
ACCGGACTGCGACACGAGAACAGACTGGAACGGGCTGAATGATCCTCCAAGACCAGGAAG
GTTAGGGATGTTCGGTATACTTGGGATCTGTGGGATAGGAATGTTTGGTATCCCTGGAAT
CTGTGGGATAGGGATGTTCGGTATTCCTGGGATCTGTGGGATAGGGATGTTTGGTATCCC
TGGAATCTGTGGGATTTGAGGGATGTTTGGTATCGCTGGAATCTGTGGGATGTTTGGTAT
CCCTGGAATGTTTGGGAT**TGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTA
GCCGTTTCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTAATTCTCCGTCACCCGTTACCACC
ATG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2C915TF 656 0 0
AACTCACCGGACTGCGACACGAGAACAGACTGGAACGGGCTGAATGATCCTCCAAGACCA
GGAAGGTTAGGGATGTTCGGTATACTTGGGATCTGTGGGATAGGAATGTTTGGTATCCCT
GGAATCTGTGGGATAGGGATGTTCGGTATTCCTGGGATCTGTGGGATAGGGATGTTTGGT
ATCCCTGGAATCTGTGGGATTTGAGGGATGTTTGGTATCGCTGGAATTTGTGGGATGTTT
GGTATCCCTGGAATGTTTGGGAT**TGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATG
TGGTAGCCGTTTCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTAATTGTCCGTCACCCGTTA
CCACCATGGTAGGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGATG
CGTCGCCAGCACAAAGGCCATGCGATCCGTCGAGTTATCATGAATCATCAGAGCAACGGG
CAGAGCCCGCGTCGACCTTTTATCTAATAAATGCATCCCTTCCAGAAGTCGGGGTTTGTT
GCACGTATTAGCTCTAGAATTACTACGGTTATCCGAGTAGTAGTTACCATCAAACAAACT
ATAACTGATTTAATGAGCCATTCGCAGTTTCACAGTCTGAATTCGTTCATACCTCC

QA 1 656 1 656
DS 



CO CL1155Contig2 784 2 14 U
TTTTTCAACTTTGAAATACTATTTGCTAGAAATACTCTCTGCTCCAAATCGCCTTAATTA
ATTAACCATGGTGAAGAGCATCATTGTCATCGTAGCTATCCTATGCCTCATATCTCTACC
AAATCCAACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCA
CAATGGAAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAA
TGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAA
CATCCCACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGGATACC
AAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGG
GATACCAAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGG
TCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAA
GAAGTGTTTGACTGGGGATAAGTCGAAAGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCAGGTGTTTTC
CAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATAT
GGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACACCTCT
CCTTCAGTACTCTTGTCACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAGCTCGTCTCCTCCGTTT
GGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 0 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2GB03TF U 1
AF RR2FN51TF U 5
BS 1 111 RR2GB03TF
BS 112 112 RR2FN51TF
BS 113 317 RR2GB03TF
BS 318 318 RR2FN51TF
BS 319 567 RR2GB03TF
BS 568 568 RR2FN51TF
BS 569 610 RR2GB03TF
BS 611 611 RR2FN51TF
BS 612 714 RR2GB03TF
BS 715 715 RR2FN51TF
BS 716 742 RR2GB03TF
BS 743 743 RR2FN51TF
BS 744 762 RR2GB03TF
BS 763 784 RR2FN51TF

RD RR2GB03TF 762 0 0
TTTTTCAACTTTGAAATACTATTTGCTAGAAATACTCTCTGCTCCAAATCGCCTTAATTA
ATTAACCATGGTGAAGAGCATCATTGTCATCGTAGCTATCCTATGCCTCATCTCTCTACC
AAATCCAACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCA
CAATGGAAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAA
TGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAA
CATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGGATACC
AAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGG
GATACCAAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGG
TCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAA
GAAGTGTTTGACTGGGGATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCAGGTGTTTTC
CAGTTGGGCA*AGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATAT
GGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACTCCTCT
CCTTCAGTACTCTTGTCACATCGAGCATGCCAAGAAGAACTA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2FN51TF 780 0 0
GG
AACTTTGAAATACTATTTGCTAGAAATACTCTCTGCTCCAAATCGCCTTAATTAATTAAC
CATGGTGAAGAGCATCATTGTCATCGTAGCTATCCTATGCCTCATATCTCTACCAAATCC
AACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCACAATGG
AAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAATGCTCC
TCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCCC
ACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCATAGATTCCAGGGATACCAAACAT
CCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGGGATACC
AAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGGTCTTGG
AGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAAGAAGTG
TTTGACTGGGGATAAGTCGAAAGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCAG*TGTTTTCCAGTTG
GGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATATGGACAA
GAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACACCTCTCCTTCA
GTACTCTTGTCACATCAAGCATGCCAG**AGA*CTAAGCTCGTCTCCTCCGTTTGGAT

QA 3 780 3 780
DS 



AS 1 7

CO CL1156Contig1 582 7 11 U
GGATCACTTCTTTTGCATTGTGCGGAAACTCTTGAGCTTTTGTCTTCATCTTCCCAAAGT
AACAAACCTCATCGAATCAGATTAGAATAACTTCACCCTCACTAAGAATGAAAATGAAAC
TCTCTGTTGTAACATTCTTCATCATCTCCCTACTCCTCTCATCTTCTTTGTTCATGCTTT
CAAAAGCCTCACCATGCGACGGAAAATGCAATGCGAGATGTTCAAAGGCAGGAAGACAAG
ATCGGTGTCTCAAGTATTGCAATATATGTTGTGAGAAGTGTAACTACTGTGTTCCCTCCG
GCACTTATGGAAACAAAGATGAATGCCCCTGTTACAGGGATATGAAAAACTCCAAAGGCC
ATCCCAAATGTCCTTGAACATGTTTTGAAGATCATCTTCAAATACATCATATCTATTATA
CACAAAAATATTACAATGGTGGTTGGCGCATGAAATAATGAGTTTGAATATGTTTGTATG
AAAAATGTGAAAGATCTTGATTATAAACGTAATGTGTTGTAAGAAACACGAAATAATGTA
CTTTTAATTAAACTATTGAAGGTAAAGGTTTTATTTATATGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR66JQ C 1
AF RR2DQ12TF U 109
AF RR2G241JQ C 72
AF RR2G241TF U 72
AF RR2CR66TF U 1
AF RR2GG56TF U 124
AF RR2GG56JQB C 135
BS 1 73 RR2CR66TF
BS 74 108 RR2G241TF
BS 109 274 RR2DQ12TF
BS 275 275 RR2G241TF
BS 276 317 RR2DQ12TF
BS 318 318 RR2G241TF
BS 319 416 RR2DQ12TF
BS 417 417 RR2G241TF
BS 418 569 RR2DQ12TF
BS 570 576 RR2CR66TF
BS 577 582 RR2GG56JQB

RD RR2CR66JQ 576 0 0
GGATCACTTCTTTTGCATTGTGCGGAAACTCTTGAGCTTTTGTCTTCATCTTCCCAAAGT
AACAAACCTCATCGAATCAGATTAGAATAACTTCACCCTCACTAAGAATGAAAATGAAAC
TCTCTGTTGTAACATTCTTCATCATCTCCCTACTCCTCTCATCTTCTTTGTTCATGCTTT
CAAAAGCCTCACCATGCGACGGAAAATGCAATGCGAGATGTTCAAAGGCAGGAAGACAAG
ATCGGTGTCTCAAGTATTGCAATATATGTTGTGAGAAGTGTAACTACTGTGTTCCCTCCG
GCACTTATGGAAACAAAGATGAATGCCCCTGTTACAGGGATATGAAAAACTCCAAAGGCC
ATCCCAAATGTCCTTGAACATGTTTTGAAGATCATCTTCAAATACATCATATCTATTATA
CACAAAAATATTACAATGGTGGTTGGCGCATGAAATAATGAGTTTGAATATGTTTGTATG
AAAAATGTGAAAGATCTTGATTATAAACGTAATGTGTTGTAAGAAACACGAAATAATGTA
CTTTTAATTAAACTATTGAAGGTAAAGGTTTTATTT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2DQ12TF 461 0 0
TGAAAATGAAACTCTCTGTTGTAACATTCTTCATCATCTCCCTACTCCTCTCATCTTCTT
TGTTCATGCTTTCAAAAGCCTCACCATGCGACGGAAAATGCAATGCGAGATGTTCAAAGG
CAGGAAGACAAGATCGGTGTCTCAAGTATTGCAATATATGTTGTGACAAGTGTAACTACT
GTGTTCCCTCCGGCACTTATGGAAACAAAAATGAATGCCCCTGTTACAGGGATATGAAAA
ACTCCAAAGGCCATCCCAAATGTCCTTGAACATGTTTTGAAGATCATCTTCAAATACATC
ATATCTAT*ATACACAAAAATATTACAATGGTGGTTGGCGCATGAAATAATGAGTTTGAA
TATGTTTGTATGAAAAATGTGAAAGATCTTGATTATAAACGTAATGTGTTGTAAGAAACA
CGAAATAATGTACTTTTAATTAAACTATTGAAGGTAAAGGT

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR2G241JQ 483 0 0
GG
GAATCAGATTAGAATAACTTCACCCTCACTAAGAATGAAAATGAAACTTTCTGTTGTAAC
ATTCTTCATCATCTCCCTACTCCTTTCATCTTCTTTGTTCATGCTTTCAAAAGCCTCACC
ATGCGACGGAAAATGCAATGCGAGATGTTCAAAGGCAGGAAGACAAGATCGGTGTCTCAA
GTATTGCAATATATGTTGTGAGAAGTGTAACTACTGTGTTCCCTCCGGCACTTATGGAAA
CAAAGATGAATGCCCCTGTTACAGGGATATGAAAAACTCCAAAGGCCATCCCAAATGTCC
TTGAACATGTTTTGAAGATCATCTTCAAATACATCATATCTATTATACACAAAAATATTA
CAATGGTGGTTGGCGCATGAAATAATGAGTTTGAATATGTTTGTATGAAAAATGTGAAAG
ATCTTGATTATAAACGTAATGTGTTGTAAGAAACACGAAATAATGTACTTTTAATTAAAC
C

QA 3 482 3 482
DS 

RD RR2G241TF 483 0 0
GG
GAATCAGATTAGAATAACTTCACCCTCACTAAGAATGAAAATGAAACTCTCTGTTGTAAC
ATTCTTCATCATCTCCCTACTCCTCTCATCTTCTTTGTTCATGCTTTCAAAAGCCTCACC
ATGCGACGGAAAATGCAATGCGAGATGTTCAAAGGCAGGAAGACAAGATCGGTGTCTCAA
GTATTGCAATATATGTTGTGAGAAGTGTAACTACTGTGTTCCCTCCGGCACTTATGGAAA
CAAAGATGAATGCCCCTGTTACAGGGATATGAAAAACTCCAAAGGCCATCCCAAATGTCC
TTGAACATGTTTTGAAGATCATCTTCAAATACATCATATCTATTATACACAAAAATATTA
CAATGGTGGTTGGCGCATGAAATAATGAGTTTGAATATGTTTGTATGAAAAATGTGAAAG
ATCTTGATTATAAACGTAATGTGTTGTAAGAAACACGAAATAATGTACTTTTAATTAAAC
C

QA 3 482 3 482
DS 

RD RR2CR66TF 576 0 0
GGATCACTTCTTTTGCATTGTGCGGAAACTCTTGAGCTTTTGTCTTCATCTTCCCAAAGT
AACAAACCTCATCGAATCAGATTAGAATAACTTCACCCTCACTAAGAATGAAAATGAAAC
TCTCTGTTGTAACATTCTTCATCATCTCCCTACTCCTCTCATCTTCTTTGTTCATGCTTT
CAAAAGCCTCACCATGCGACGGAAAATGCAATGCGAGATGTTCAAAGGCAGGAAGACAAG
ATCGGTGTCTCAAGTATTGCAATATATGTTGTGAGAAGTGTAACTACTGTGTTCCCTCCG
GCACTTATGGAAACAAAGATGAATGCCCCTGTTACAGGGATATGAAAAACTCCAAAGGCC
ATCCCAAATGTCCTTGAACATGTTTTGAAGATCATCTTCAAATACATCATATCTATTATA
CACAAAAATATTACAATGGTGGTTGGCGCATGAAATAATGAGTTTGAATATGTTTGTATG
AAAAATGTGAAAGATCTTGATTATAAACGTAATGTGTTGTAAGAAACACGAAATAATGTA
CTTTTAATTAAACTATTGAAGGTAAAGGTTTTATTT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2GG56TF 459 0 0
GG
GTTGTAACATTCTTCATCATCTCCCTACTCCTCTCATCTTCTTTGTTCATGCTTTCAAAA
GCCTCACCATGCGACGGAAAATGCAATGCGAGATGTTCAAAGGCAGGAAGACAAGATCGG
TGTCTCAAGTATTGCAATATATGTTGTGAGAAGTGTAACTACTGTGTTCCCTCCGGCACT
TATGGAAACAAAGATGAATGCCCCTGTTACAGGGATATGAAAAACTCCAAAGGCCATCCC
AAATGTCCTTGAACATGTTTTGAAGATCATCTTCAAATACATCATATCTATTATACACAA
AAATATTACAATGGTGGTTGGCGCATGAAATAATGAGTTTGAATATGTTTGTATGAAAAA
TGTGAAAGATCTTGATTATAAACGTAATGTGTTGTAAGAAACACGAAATAATGTACTTTT
AATTAAACTATTGAAGGTAAAGGTTTTATTT
ATATGC

QA 3 453 3 453
DS 

RD RR2GG56JQB 448 0 0
TTT
TTCATCATCTCCCTACTCCTTTCATCTTCTTTGTTCATGCTTTCAAAAGCCTCACCATGC
GACGGAAAATGCAATGGGAGATGTTCAAAGGCAGGAAGACAAGATCGGTGTTTCAAGTAT
TGCAATATATGTTGTGAGAAGTGTAACTACTGTGTTCCCTCCGGCACTTATGGAAACAAA
GATGAATGCCCCTGTTACAGGGATATGAAAAACTCCAAAGGCCATCCCAAATGTCCTTGA
ACATGTTTTGAAGATCATTTTCAAATACATCATATTTATTATACACAAAAATATTACAAT
GGTGGTTGGCGCATGAAATAATGAGTTTGAATATGTTTGTATGAAAAATGTGAAAGATCT
TGATTATAAACGTAATGTGTTGTAAGAAACACGAAATAATGTACTTTTAATTAAACTATT
GAAGGTAAAGGTTTTATTTATATGC

QA 4 448 4 448
DS 



AS 1 6

CO CL1157Contig1 1050 6 29 U
GGGGCTAAAGCCCTCCTTCGTCTTCTCCATCTCTCTCCAATGGAGTCACTCCTGCGCGCG
TCTTCGTCTCTAGTATCTCTCAGGCCCAGAATAGACGGCCGAGATTCGTTCATCAACTCT
CCCCGCGTGTGCCTCATACCTAGTCTCGCCCCCAGAGGATCAAAGTCTCTTCCTTTGCTC
GTCGCCGCCGCTAAGAAGAAGAAAAGCAAGAAAGACGACAGCCACAGCTTCTCCGCTAGA
CCTGACGAAGCCACCGGCCCGTTTCCTGAATCCATTCTTCTCAAAGAGAAGAAGATCGAT
GAGGAAGGTGATCTTCTTCCTGAGTTCGCTGATGATGAAGAAAAGGAGCTATACGAGTTT
CTTGACCTTCAGCTTCAGAGTGACTTGAATGAAGAAAGGATGAGACACTATGAGGTGGTT
TACTTGATTCATGAGAAACATGCAGAGGAGGTT*GAAAGCGTCAATGAGAAAGTT*CAAG
AGTT*CTTGAAGGAGAAGAAGGGGAGAGT*GTGGAGGTTT*AGTGACTGGGGGATGCGTA
GACTGGCGTATAAGATACAGAAGGCAGAGAACGCACACTATATACTGATGAACTTTGAGA
TGGAAGCCAAACACTTGAACGAGTTCAAAGGAATGTTGGATGGTGATGAGAGGGTGATCA
GGCATCTCGTGATGAAACGTGATGAGGCCATTACGGAAGACTGCCCTCCCCCTCCCGAGT
TTCACTCGGTTCGTGCAAGTATGGACGGGGATGATGACTTTTATGATGATGATGAGGAGG
AGGAAGAAGAGTTTGATGAAGAAGAGGAAGAAGGTGATGATGTAGAGTATGAAGTAGATG
ATGATGGTAATGTTGTTATGGTGGTGTATGAAGATGATGAAGAAGAACAAGGACAGGACC
AGTCAAATAAAGCCACAAGAGAAAAAAACCGAACAACAGTTAGCGTTTGATGAGGTTTAG
AGAGGTGTTTTGTAGAGATCTTCAGTGTTTTGGGACATGGAATTTGTATAAACAATATCA
CATCATTAAAAGTACTTTTCTTTTTCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E101TF U 1
AF RR2FF11TF U 7
AF RR2BF42TF U 314
AF RR2AR82TF U 7
AF RR2E101JQ C 661
AF RR2AR82JQ C 350
BS 1 177 RR2E101TF
BS 178 178 RR2AR82TF
BS 179 260 RR2E101TF
BS 261 261 RR2AR82TF
BS 262 302 RR2E101TF
BS 303 303 RR2AR82TF
BS 304 365 RR2E101TF
BS 366 366 RR2AR82TF
BS 367 404 RR2E101TF
BS 405 405 RR2AR82TF
BS 406 419 RR2E101TF
BS 420 420 RR2AR82TF
BS 421 505 RR2E101TF
BS 506 506 RR2AR82TF
BS 507 595 RR2E101TF
BS 596 596 RR2AR82TF
BS 597 607 RR2E101TF
BS 608 608 RR2AR82TF
BS 609 658 RR2E101TF
BS 659 667 RR2AR82TF
BS 668 668 RR2BF42TF
BS 669 776 RR2AR82TF
BS 777 777 RR2AR82JQ
BS 778 787 RR2AR82TF
BS 788 788 RR2AR82JQ
BS 789 799 RR2AR82TF
BS 800 898 RR2AR82JQ
BS 899 899 RR2E101JQ
BS 900 1050 RR2AR82JQ

RD RR2E101TF 658 0 0
GGGGCTAAAGCCCTCCTTCGTCTTCTCCATCTCTCTCCAATGGAGTCACTCCTGCGCGCG
TCTTCGTCTCTAGTATCTCTCAGGCCCAGAATAGACGGCCGAGATTCGTTCATCAACTCT
CCCCGCGTGTGCCTCATACCTAGTCTCGCCCCCAGAGGATCAAAGTCTCTTCCTTTGGTC
GTCGCCGCCGCTAAGAAGAAGAAAAGCAAGAAAGACGACAGCCACAGCTTCTCCGCTAGA
CCTGACGAAGCCACCGGCCCATTTCCTGAATCCATTCTTCTCAAAGAGAAGAAGATCGAT
GAAGAAGGTGATCTTCTTCCTGAGTTCGCTGATGATGAAGAAAAGGAGCTATACGAGTTT
CTTGATCTTCAGCTTCAGAGTGACTTGAATGAAGAAAGGATGAGGCACTATGAGGTGGTG
TACTTGATTCATGAGAAACATGCAGAGGAGGTT*GAAAGCGTCAATGAGAAAGTT*CAAG
AGTT*CTTGAAGGAGAAGAAGGGGAAAGT*GTGGAGGTTT*AGTGACTGGGGGATGCGTA
GACTGGCGTATAAGATACAGAAGGCAGAGAACGCACACTATATACTGATGAACTTCGAGA
TGGAAGCGAAACACTTGAACGAGTTCAAAGGAATGTTGGATGGTGATGAGAGGGTGAT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2FF11TF 702 0 0
GG
AGCCCTCCTTCGTCTTCTCCATCTCTCTCCAATGGAGTCACTCCTGCGCGCGTCTTCGTC
TCTAGTATCTCTCAGGCCCAGAATAGACGGCCGAGATTCGTTCATCAACTCTCCCCGCGT
GTGCCTCATACCTAGTCTCGCCCCCAGAGGATCAAAGTCTCTTCCTTTGCTCGTCGCCGC
CGCTAAGAAGAAGAAAAGCAAGAAAGACGACAGCCACAGCTTCTCCGCTAGACCTGACGA
AGCCACCGGCCCGTTTCCTGAATCCATTCTTCTCAAAGAGAAGAAGATTGATGAGGAAGG
TGATCTTCTTCCTGAGTTCGCTGATGATGAAGAAAAGGAGCTATACGAGTTTCTTGATCT
TCAGCTTCAGAGTGACTTGAATGAAGAAAGGATGAGGCACTATGAAGTGGTTTACTTGAT
TCATGAGAAACATGCAGAGGAGGTT*GAAAGCGTCAATGAGAAAGTT*CAAGAGTT*CTT
GAAGGAGAAGAAGGGGAAAGT*GTGGAGGTTT*AGTGACTGGGGGATGCGTAGACTGGCG
TATAAGATACAGAAGGCAGAGAACGCACACTATATACTGATGAACTTTGAGATGGAAGCG
AAACACTTGAACGAGTTCAAAGGAATGTTGGATGGTGATGAGAGGGTGATCAGGCATCTC
GTGATGAAACGTGATGAGGCCATTACAGAAGACTGC
TCTC

QA 3 698 3 698
DS 

RD RR2BF42TF 460 0 0
TTCTTCCTGAGTTCGCTGATGATGAAGAAAAGGAGCTATACGAGTTTCTTGACCTTCAGC
TTCAGAGTGACTTGAATGAAGAAAGGATGAGACACTATGAGGTGGTTTACTTGATTCATG
AGAAACATGCAGAGGAGGTTTGAAAGCGTCAATGAGAAAGTTTCAAGAGTTTCTTGAAGG
AGAAGAAGGGGAGAGTTGTGGAGGTTTTAGTGACTGGGGGATGCGTAGACTGGCGTATAA
GATACAGAAGGCAGAGAACGCACACTATATACTGATGAACTTTGAGATGGAAGCCAAACA
CTTGAACGAGTTCAAAGGAATGTTGGATGGTGATGAGAGGGTGATCAGGCATCTCGTGAT
GAAACGTGATGAGGCCATTACGGAAGACTGCCCTCCCCCTCCCGAGTTTCACTCGGTTCG
TGCA*GTATGGACGGGGATGATGACTTTTATGATGATGAT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2AR82TF 794 0 0
GA
AGCCCTCCTTCGTCTTCTCCATCTCTCTCCAATGGAGTCACTCCTTCGCGCGTCTTCGTC
TCTAGTATCTCTCAGGCCCAGAATAGACGGCCGAGATTCGTTCATCAACTCTCCCCGCGT
GTGCCTCATACCTAGTCTCGCCCCCAGAGGATCAAAGTCTCTTCCTTTGCTCGTCGCCGC
CGCTAAGAAGAAGAAAAGCAAGAAAGACGACAGCCACAGCTTCTCCGCTAGACCTGACGA
AGCCACCGGCCCGTTTCCTGAATCCATTCTTCTCAAAGAGAAGAAGATCGATGAGGAAGG
TGATCTTCTTCCTGAGTTCGCTGATGATGAAGAAAAGGAGCTATACGAGTTTCTTGACCT
TCAGCTTCAGAGTGACTTGAATGAAGAAAGGATGAGACACTATGAGGTGGTTTACTTGAT
TCATGAGAAACATGCGGAGGAGGTT*GAAAGCGTCAATGAGAAAGTT*CAAGAGTT*CTT
GAAGGAGAAGAAGGGGAGAGT*GTGGAGGTTT*AGTGACTGGGGGATGCGTAGACTGGCG
TATAAGATACAGAAGGCAGAGAACGCACACTATATACTGATGAACTTTGAGATGGAAGCC
AAACACTTGAACGAGTTCAAAGGAATGTTGGATGGTGATGAGAGGGTGATCAGGCATCTT
GTGATGAAACGTGATGAGGCCATTACGGAAGACTGCCCTCCCCCTCCCGAGTTTCACTCG
GTTCGTGCAAGTATGGACGGGGATGATGACTTTTATGATGATGATGAG*AGGAGGAAGA*
GAGTTTGATGA
T

QA 3 793 3 793
DS 

RD RR2E101JQ 269 0 0
GGCATCTCGTGATGAAACGTGATGAGGCCATTACGGAAGACTGTCCTCCCCCTCCCGAGT
TTCACTCTGTTCGTGCAAGTATGGACGGGGATGATGACTTTTATGATGATGATGAGGAGG
AGGAAGAAGAGTTTGATGAAGAAGAGGAAGAAGGTGATGATGTAGAGTATGAAGTAGATG
ATGATGGTAATGTTGTTATGGTGGTGTATGAAGATGATGAAGAAGAACAAGGACAGGACC
AGTCAAATAAAGCCACAAGAGAAAAAAA
A

QA 1 268 1 268
DS 

RD RR2AR82JQ 701 0 0
TATACGAGTTTCTTGACCTTCAGCTTCAGAGTGACTTGAATGAAGAAAGGATGAGACACT
ATGAGGTGGTTTACTTGATTCATGAGAAACATGCGGAGGAGGTT*GAAAGCGTCAATGAG
AAAGTT*CAAGAGTT*CTTGAAGGAGAAGAAGGGGAGAGT*GTGGAGGTTT*AGTGACTG
GGGGATGCGTAGACTGGCGTATAAGATACAGAAGGCAGAGAACGCACACTATATACTGAT
GAACTTTGAGATGGAAGCCAAACACTTGAACGAGTTCAAAGGAATGTTGGATGGTGATGA
GAGGGTGATCAGGCATCTTGTGATGAAACGTGATGAGGCCATTACGGAAGACTGCCCTCC
CCCTCCCGAGTTTCACTCGGTTCGTGCAAGTATGGACGGGGATGATGACTTTTATGATGA
TGATGAGGAGGAGGAAGAAGAGTTTGATGAAGAAGAGGAAGAAGGTGATGATGTAGAGTA
TGAAGTAGATGATGATGGTAATGTTGTTATGGTGGTGTATGAAGATGATGAAGAAGAACA
AGGACAGGATCAGTCAAATAAAGCCACAAGAGAAAAAAACCGAACAACAGTTAGCGTTTG
ATGAGGTTTAGAGAGGTGTTTTGTAGAGATCTTCAGTGTTTTGGGACATGGAATTTGTAT
AAACAATATCACATCATTAAAAGTACTTTTCTTTTTCATTT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 6

CO CL1158Contig1 1522 6 18 U
TTTTTTCTTTCCATTTGTTTTGACGTCTGAGTTGTTTTTTACGTCGGAAAAGAAAGAACC
TGGAGAGGAGCTGGCACCACCGCCTAACTCGCCATTGACACACCACCAAAAAAACTCTAA
TTCTTTACTTTTATTCCACAAAGATAGATACAGACACTAATAATACTTACAACATTTTGC
CTCAAAATTATCAGCTCTTACAGACGCTCTGTCTCAATCTCTTGTCCCTCTAATTCATCA
CCCTCATTTCTTTCTTCCAAGCTACTTCTCCTCTGCTTTCGTATTTGTTCCGTTAATCAA
AGTTTCGATTTATATAATACTAGATCCTGAGATTTTTGAGAGGTGTGTGTAGAGAGAGAG
AAACAGAGTAATGGCGAACAGAGATGTGGAGAGAGCTAAGAACAGAGGAGTTCATA****
**ACAACAATAACTATTTCTACGATGAAAGCTCCCGCGATACTCACTGGACTTCGTGGCT
CGTTCCACTGATCGTGGTGGCGAATCTCGCCGTCTTTATCGCCGTTATGTTTGTTAACGA
CTGTCCTAAGAAAATCACCGGACCAAACAAAGCTTGCGTCGCAAGGTTCCTCGGAAGATT
CTCGTTTCAGCCACTTAGAGAGAATCCTCTCTTCGGCCCATCTTCTTCAACATTGGAGAG
AATGGGAGCGTTGGAGTGGAGGAAAGTAGTACATGAGCATCAAGGATGGAGACTCGTCAC
TTGTATGTGGCTACACGCTGGTATCATTCATCTTCTTACCAATATGTTGAGTTTGATCTT
CATCGGTATCCGCCTTGAGCAGCAGTTTGGCTTCATAAGAGTGGGGCTTATCTACTTAGT
ATCTGGTCTCGGTGGAAGCATACTATCGTCTCTTTTCCTTCAAGAAAGTATCTCTGTTGG
TGCTTCTGGTGCTCTCTTCGGACTTCTTGGTGCTATGTTATCTGAACTTCTCACCAATTG
GACTATCTATGCCAACAAGGCGGCTGCACTTGTCACACTCTTATTCATCATAGCAATCAA
CTTAGGACTAGGCTTGCTACCTCGGGTTGACAATTTCGCTCACATTGGAGGCTTCTTAAC
AGGGTTGTGCCTCGGGTTTGTCCTCCTTGTCCGACCACAGTACGGTTGGGAAGCTTCCCG
CACCAACACTTCTTCCGGCACCAAACGCAAGCATAGCATGTACCAGTACGTGTTGTTCGT
AGTCGCAGCGGTTCTACTAGTGGTTGGTTTAACTGTTGGATTAGTGATGCTTTTCAAAGG
AGAGAATGGGAACAAGCATTGCAAATGGTGTCATCGCCTCAGCTGTTTCCCTACTTCTAA
ATGGACCTGTTAATCATCATCCCAAAGCTTCTTATATGCGTTCTTGTAACATATAATCTG
TTCGTTCCTTTTGCCTTTGACCCCTCTAGCCTTTTATAACATACATGTATATTATTACAT
TTGAATATTATCCTTACTCAACTCTCAACTGAATAAATAGTATTGTTTGATTGAAGGTAC
TTAATGTCAACTAATTTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB28TF U 1
AF RR2D290TF U 343
AF RR2HA24TF U 343
AF RR2AT53TF U 535
AF RR2AT53JQ C 651
AF RR2HA24JQ C 890
BS 1 657 RR2HB28TF
BS 658 690 RR2D290TF
BS 691 691 RR2HA24TF
BS 692 918 RR2D290TF
BS 919 919 RR2HA24TF
BS 920 1021 RR2D290TF
BS 1022 1025 RR2HA24TF
BS 1026 1026 RR2AT53TF
BS 1027 1070 RR2HA24TF
BS 1071 1071 RR2AT53TF
BS 1072 1083 RR2HA24TF
BS 1084 1084 RR2AT53TF
BS 1085 1094 RR2HA24TF
BS 1095 1257 RR2AT53TF
BS 1258 1341 RR2AT53JQ
BS 1342 1342 RR2HA24JQ
BS 1343 1463 RR2AT53JQ
BS 1464 1522 RR2HA24JQ

RD RR2HB28TF 657 0 0
TTTTTTCTTTCCATTTGTTTTGACGTCTGAGTTGTTTTTTACGTCGGAAAAGAAAGAACC
TGGAGAGGAGCTGGCACCACCGCCTAACTCGCCATTGACACACCACCAAAAAAACTCTAA
TTCTTTACTTTTATTCCACAAAGATAGATACAGACACTAATAATACTTACAACATTTTGC
CTCAAAATTATCAGCTCTTACAGACGCTCTGTCTCAATCTCTTGTCCCTCTAATTCATCA
CCCTCATTTCTTTCTTCCAAGCTACTTCTCCTCTGCTTTCGTATTTGTTCCGTTAATCAA
AGTTTCGATTTATATAATACTAGATCCTGAGATTTTTGAGAGGTGTGTGTAGAGAGAGAG
AAACAGAGTAATGGCGAACAGAGATGTGGAGAGAGCTAAGAACAGAGGAGTTCATA****
**ACAACAATAACTATTTCTACGATGAAAGCTCCCGCGATACTCACTGGACTTCGTGGCT
CGTTCCACTGATCGTGGTGGCGAATCTCGCCGTCTTTATCGCCGTTATGTTTGTTAACGA
CTGTCCTAAGAAAATCACCGGACCAAACAAAGCTTGCGTCGCAAGGTTCCTCGGAAGATT
CTCGTTTCAGCCACTTAGAGAGAATCCTCTCTTCGGCCCATCTTCTTCAACATTGGA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2D290TF 679 0 0
GGGTGTGTAGAGAGAGAG
AAACAGAGTAATGGCGAACAGAGATGTGGAGAGAGCTAAGAACAGAGGAGTTCATA****
**ACAACAATAACTATTTCTACGATGAAAGCTCCCGCGATACTCACTGGACTTCGTGGCT
CGTTCCACTGATCGTGGTGGCGAATCTCGCCGTCTTTATCGCCGTTATGTTTGTTAACGA
CTGTCCTAAGAAAATCACCGGACCAAACAAAGCTTGCGTCGCAAGGTTCCTCGGAAGATT
CTCGTTTCAGCCACTTAGAGAGAATCCTCTCTTCGGCCCATCTTCTTCAACATTGGAGAG
AATGGGAGCGTTGGAGTGGAGGAAAGTAGTGCATGAGCATCAAGGATGGAGACTCGTCAC
TTGTATGTGGCTACACGCTGGTATCATTCATCTTCTTACCAATATGTTGAGTTTGATCTT
CATCGGTATCCGCCTTGAGCAGCAGTTTGGCTTCATAAGAGTGGGGCTTATCTACTTAGT
ATCTGGTCTCGGTGGAAGCATACTATCGTCTCTTTTCCTTCAAGAAAGTATCTCTGTTGG
TGCTTCTGGTGCTCTCTTTGGACTTCTTGGTGCTATGTTATCTGAACTTCTCACCAATTG
GACTATCTATGCCAACAAGGCGGCTGCACTTGTCACACTCTTATTCATCATAGCAATCAA
C

QA 19 679 19 679
DS 

RD RR2HA24TF 752 0 0
GGGGTGTGTGAGAGAAAC
AAACAGAGTAATGGCTAACATAGATGTGGAGAGAGCTAAGAACAGAGGAGTTCATAACAG
CAACAACAATAACTATTTCTATGAAGAAAGCTCCCGCGATACTCACTGGACTTCGTGGCT
CGTTCCACTGATCGTGGTGGCGAATCTCGCCGTCTTTATCGCCGTTATGTTCGTTAACGA
CTGTCCTAAGAAAATCACCGGACCAAACAAAGCTTGCGTCGCAAGGTTCCTCGGAAGATT
CTCGTTTCAGCCACTTAGAGAGAATCCTCTCTTCGGCCCATCTTCTTCAACATTGGAGAG
AATGGGAGCGTTGGAGTGGAGGAAAGTAGTACATGAGCATCAAGGATGGAGACTCGTCAC
TTGTATGTGGCTACACGCTGGTATCATTCATCTTCTTACCAATATGTTGAGTTTGATCTT
CATCGGTATCCGCCTTGAGCAGCAGTTTGGCTTCATAAGAGTGGGGCTTATCTACTTAGT
ATCTGGTCTCGGTGGAAGCATACTATCGTCTCTTT*CCTTCAAGAAAGTATCTCTGTTGG
TGCTTCTGGTGCTCTCTTCGGACTTCTTGGTGCTATGTTATCTGAACTTCTCACCAATTG
GACTATCTATGCCAACAAAGCGGCTGCACTTGTCACACTCTTATTCATCATAGCAATCAA
CTTAG*ACTAGGCTTGCTACCTCGGGTTGACAATTTCGCTCACATTGGAG*CTTCTTAAC
AGG*TTGTGCCTCG

QA 19 752 19 752
DS 

RD RR2AT53TF 723 0 0
G
AACGACTGTCTTAAGAAAATCACCGGACCAAACAAAGCTTGCGTCGCAAGGTTCCTCGGA
AGATTCTCGTTTCAGCCACTTAGAGAGAATCCTCTCTTCGGCCCATCTTCTTCAACATTG
GAGAGAATGGGAGCGTTGGAGTGGAGGAAAGTAGTACATGAGCATCAAGGATGGAGACTC
GTCACTTGTATGTGGCTACACGCTGGTATCATTCATCTTCTTACCAATATGTTGAGTTTG
ATCTTCATCGGTATCCGCCTTGAGCAGCAGTTTGGCTTCATAAGAGTGGGGCTTATCTAC
TTAGTATCTGGTCTCGGTGGAAGCATACTATCGTCTCTTTTCCTTCAAGAAAGTATCTCT
GTTGGTGCTTCTGGTGCTCTCTTCGGACTTCTTGGTACTATGTTATCTGAACTTCTCACC
AATTGGACTATCTATGCCAACAAGGCGGCTGCACTTGTCACACTCTTATTCATCATAGCA
ATCAACTTAGGACTAGGCTTGCTACCTCGGGTTGACAATTTCGCTCACATTGGAGGCTTC
TTAACAGGGTTGTGCCTCGGGTTTGTCCTCCTTGTCCGACCACAGTACGGTTGGGAAGCT
TCCCGCACCAACACTTCTTCCGGCACCAAACGCAAGCATAGCATGTACCAGTACGTGTTG
TTCGTAGTCGCAGCGGTTCTACTAGTGGTTGGTTTAACTGTTGGATTAGTGATGCTTTTC
AA

QA 2 723 2 723
DS 

RD RR2AT53JQ 813 0 0
CATTGGAGAGAATGGGAGCGTTGGAGTGGAGGAAAGTAGTACATGAGCATCAAGGATGGA
GACTCGTCACTTGTATGTGGCTACACGCTGGTATCATTCATCTTCTTACCAATATGTTGA
GTTTGATCTTCATCGGTATCCGCCTTGAGCAGCAGTTTGGCTTCATAAGAGTGGGGCTTA
TCTACTTAGTATCTGGTCTCGGTGGAAGCATACTATCGTCTCTTTTCCTTCAAGAAAGTA
TCTCTGTTGGTGCTTCTGGTGCTCTCTTCGGACTTCTTGGTACTATGTTATCTGAACTTC
TCACCAATTGGACTATCTATGCCAACAAGGCGGCTGCACTTGTCCCACTCTTATTCATCA
TAGCAATCAACTTAGGACTAGGCTTGCTACCTCGGGTTGACAATTTCGCTCACATTGGAG
GCTTCTTAACAGGGTTGTGCCTCGGGTTTGTCCTCCTTGTCCGACCACAGTACGGTTGGG
AAGCTTCCCGCACCAACACTTCTTCCGGCACCAAACGCAAGCATAGCATGTACCAGTACG
TGTTGTTCGTAGTCGCAGCGGTTCTACTAGTGGTTGGTTTAACTGTTGGATTAGTGATGC
TTTTCAAAGGAGAGAATGGGAACAAGCATTGCAAATGGTGTCATCGCCTCAGCTGTTTCC
CTACTTCTAAATGGACCTGTTAATCATCATCTCAAAGCTTCTTATATGCGTTCTTGTAAC
ATATAATCTGTTCGTTCCTTTTGCCTTTGACCCCTCTAGCCTTTTATAACATACATGTAT
ATTATTACATTTGAATATTATCCTTACTCAACT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2HA24JQ 633 0 0
ATCTCTGTTGGTGCTTCTGGTGCTCTCTTCGGACTTCTTGGTGCTATGTTATCTGAACTT
CTCACCAATTGGACTATCTATGCCAACAAGGCGGCTGCACTTGTCACACTCTTATTCATC
ATAGCAATCAACTTAGGACTAGGCTTGCTACCTCGGGTTGACAATTTCGCTCACATTGGA
GGCTTCTTAACAGGGTTGTGCCTCGGGTTTGTCCTCCTTGTCCGACCACAGTACGGTTGG
GAAGCTTCCCGCACCAACACTTCTTCCGGCACCAAACGCAAGCATAGCATGTACCAGTAC
GTGTTGTTCGTAGTCGCAGCGGTTCTACTAGTGGTTGGTTTAACTGTTGGATTAGTGATG
CTTTTCAAAGGAGAGAATGGGAACAAGCATTGCAAATGGTGTCATCGCCTCAGCTGTTTC
CCTACTTCTAAATGGACCTGTTAATCATCATCCCAAAGCTTCTTATATGCGTTCTTGTAA
CATATAATCTGTTCGTTCCTTTTGCCTTTGACCTCTCTAGCCTTTTATAACATACATGTA
TATTATTACATTTGAATATTATCCTTACTCAACTCTCAACTGAATAAATAGTATTGTTTG
ATTGAAGGTACTTAATGTCAACTAATTTTTCAT

QA 1 633 1 633
DS 



AS 2 6

CO CL1159Contig1 629 2 10 U
CGTGGCCACAGAAACACAAAACTAATCAATAGAATCCCCACGACGACGACGATGGCTTCT
CTCGCGACTTCCATAGCCGGAGCTGGAACCTCCAAGATTCTCGTTTCATCATCTTCAAAG
AGAATTGGGTTTCCCAACTCGAGAGTCTTCTTCTTCCTTTTTGCTAGACCGATCTCTAAA
GCTGGGATCTTTCCCCGATCGGCGATACACGCTTCGAGCCAAGAGGAGACAAAGTCTTCA
CCTTTCGCATCCGTCGCATCACCACCGGGTCTATACTCTGCTCAGACTTTCGAATTGACT
CCTCAAAACGTCGACTTGGTCCTGGAAGATGTCAGGCCGTTCCTCATCTCTGATGGTGGG
AACGTCGACGTTGTCTCTGTTGAAGACGGCGCCGTTTCTCTCAAACTCCAAGGAGCATGC
AATAGCTGTCCGAGTTCTTCAACAACCATGACTATGGGAATCGAAAGGGTACTCAAAGAG
AAGTTTGGAGATGCTTTGAAAGATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGAAGTTAAGCATATA
ACCGTGGAGGCAGTGAATGCTCATCTTGATATACTGAGACCAGCGATCAAGAACTACGGA
GGAAGTGTAGAAGTTATCAGTTCAAGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM59TF U 1
AF RR2D184TF U 46
BS 1 208 RR2EM59TF
BS 209 209 RR2D184TF
BS 210 303 RR2EM59TF
BS 304 304 RR2D184TF
BS 305 391 RR2EM59TF
BS 392 392 RR2D184TF
BS 393 419 RR2EM59TF
BS 420 420 RR2D184TF
BS 421 597 RR2EM59TF
BS 598 629 RR2D184TF

RD RR2EM59TF 600 0 0
CGTGGCCACAGAAACACAAAACTAATCAATAGAATCCCCACGACGACGACGATGGCTTCT
CTCGCGACTTCCATAGCCGGAGCTGGAACCTCCAAGATTCTCGTTTCATCATCTTCAAAG
AGAATTGGGTTTCCCAACTCGAGAGTCTTCTTCTTCCTTTTTGCTAGACCGATCTCTAAA
GCTGGGATCTTTCCCCGATCGGCGATACCCGCTTCGAGCCAAGAGGAGACAAAGTCTTCA
CCTTTCGCATCCGTCGCATCACCACCGGGTCTATACTCTGCTCAGACTTTCGAATTGACT
CCTTAAAACGTCGACTTGGTCCTGGAAGATGTCAGGCCGTTCCTCATCTCTGATGGTGGG
AACGTCGACGTTGTCTCTGTTGAAGACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTCCAAGGAGCATGT
AATAGCTGTCCGAGTTCTTCAACAACCATGACTATGGGAATCGAAAGGGTACTCAAAGAG
AAGTTTGGAGATGCTTTGAAAGATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGAAGTTAAGCATATA
ACCGTGGAGGCAGTGAATGCTCATCTTGATATACTGAGACCAGCGATCAAGAACTAC
AGA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2D184TF 584 0 0
GG
GACGATGGCTTCTCTCGCGACTTCCATAGCCGGAGCTGGAACCTCCAAGATTCTCGTTTC
ATCATCTTCAAAGAGAATTGGGTTTCCCAACTCGAGAGTCTTCTTCTTCCTTTTTGCTAG
ACCGATCTCTAAAGCTGGGATCTTTCCCCGATCGGCGATACACGCTTCGAGCCAAGAGGA
GACAAAGTCTTCACCTTTCGCATCCGTCGCATCACCACCGGGTCTATACTCTGCTCAGAC
TTTCGAATTGACTCCTCAAAACGTCGACTTGGTCCTGGAAGATGTCAGGCCGTTCCTCAT
CTCTGATGGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCTGTTGAAGACGGCGCCGTTTCTCTCAAACT
CCAAGGAGCATGCAATAGCTGTCCGAGTTCTTCAACAACCATGACTATGGGAATCGAAAG
GGTACTCAAAGAGAAGTTTGGAGATGCTTTGAAAGATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGA
AGTTAAGCATATAACCGTGGAGGCAGTGAATGCTCATCTTGATATACTGAGACCAGCGAT
CAAGAACTACGGAGGAAGTGTAGAAGTTATCAGTTCAAGGGG

QA 3 584 3 584
DS 



CO CL1159Contig2 885 4 2 U
GGACGACGACGACGACGATGGCTTCTCTCGCGACTTCCATTGCCGGAGCTGGAACCTCCA
AGATTCTCGTTTCATCATCTTCAAAGAGAATTGGGTTTCCAAACTCGAGAGTCTTCTTCC
TTTCCGCTAGACCGATCTCTAAAGTTGGGATCTTTCCCCGATCGGCGATACACGCTTCGA
GCCAAGAGGAAACAAAGGCTTCACCTTTCGCATCCGTTGCGTCACCGCCGGGTCTATACT
CAGCTCAGACTTTCGATTTGACTCCTCAAAACGTCGACTTGGTCCTTGAAGATGTCAGGC
CGTTCCTCATCTCCGATGGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCTGTTGAAGACGGCGTCGTTT
CTCTCAAACTCCAAGGAGCATGTACTAGCTGTCCGAGTTCTTCAACAACCATGACGATGG
GAATCGAAAGGGTACTCAAAGAGAAGTTTGGAGATGCTTTGAAAGATATTCGACAAGTTT
TTGATGAAGAAGTTAAGCATATAACCGTGGAGGCAGTGAATGCTCATCTTGATATACTGA
GACCAGCGATCAAGAACTACGGTGGAAGTGTGGAAGTTTTATCAGTTGAAGGGGAAGACT
GTGTTGTGAAGTACGTTGGACCTGAATCGATTGGAATGGGAATTAAAGCAGCGATTAAAG
AAAAGTTCAAGGACATATCTAATGTTACCTTTACAAGCTAGAAACTGTATATGTAAAAAA
AAAAACACAAAGTTGCTCTTTGTTTGAGCTTATTTCATTTTGTAATGTCCACATCACTAG
TAGTCTCTTAGAGCTATCTTGCAAAGTTGATCAAGAACAGTGTGTAGACAAAGAAGCAAG
TTGTACCAATCCTTTCACCAGAAAATAAAAAGAACACTGTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C451TF U 153
AF RR2F134TF U 1
AF RR2F134JQ C 192
AF RR2EM59JQ C 315
BS 1 720 RR2F134TF
BS 721 885 RR2F134JQ

RD RR2C451TF 405 0 0
TTTCCCCGATCGGCGATACACGCTTCGAGCCAAGAGGAAACAAAGGCTTCACCTTTCGCA
TCCGTTGCGTCACCGCCGGGTCTATACTCAGCTCAGACTTTCGATTTGACTCCTCAAAAC
GTCGACTTGGTCCTCGAAGATGTCAGGCCGTTCCTCATCTCCGATGGTGGGAACGTCGAC
GTTGTCTCTGTTGAAGACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTCCAAGGAGCATGTACTAGCTGT
CCGAGTTCTTCAACAACCATGACGATGGGAATCGAAAGGGTACTCAAAGAGAAGTTTGGA
GATGCTTTGAAAGATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGAAGTTAAGCATATAACCGTGGAG
GCAGTGAATGCTCATCTTGATATACTGAGACCAGCGATCAAGAAC

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR2F134TF 720 0 0
GGACGACGACGACGACGATGGCTTCTCTCGCGACTTCCATTGCCGGAGCTGGAACCTCCA
AGATTCTCGTTTCATCATCTTCAAAGAGAATTGGGTTTCCAAACTCGAGAGTCTTCTTCC
TTTCCGCTAGACCGATCTCTAAAGTTGGGATCTTTCCCCGATCGGCGATACACGCTTCGA
GCCAAGAGGAAACAAAGGCTTCACCTTTCGCATCCGTTGCGTCACCGCCGGGTCTATACT
CAGCTCAGACTTTCGATTTGACTCCTCAAAACGTCGACTTGGTCCTTGAAGATGTCAGGC
CGTTCCTCATCTCCGATGGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCTGTTGAAGACGGCGTCGTTT
CTCTCAAACTCCAAGGAGCATGTACTAGCTGTCCGAGTTCTTCAACAACCATGACGATGG
GAATCGAAAGGGTACTCAAAGAGAAGTTTGGAGATGCTTTGAAAGATATTCGACAAGTTT
TTGATGAAGAAGTTAAGCATATAACCGTGGAGGCAGTGAATGCTCATCTTGATATACTGA
GACCAGCGATCAAGAACTACGGTGGAAGTGTGGAAGTTTTATCAGTTGAAGGGGAAGACT
GTGTTGTGAAGTACGTTGGACCTGAATCGATTGGAATGGGAATTAAAGCAGCGATTAAAG
AAAAGTTCAAGGACATATCTAATGTTACCTTTACAAGCTAGAAACTGTATATGTAAAAAA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2F134JQ 694 0 0
ACAAAGGCTTCACCTTTCGCATCCGTTGCGTCACCGCCGGGTCTATACTCAGCTCAGACT
TTCGATTTGACTCCTCAAAACGTCGACTTGGTCCTTGAAGATGTCAGGCCGTTCCTCATC
TCCGATGGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCTGTTGAAGACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTC
CAAGGAGCATGTACTAGCTGTCCGAGTTCTTCAACAACCATGACGATGGGAATCGAAAGG
GTACTCAAAGAGAAGTTTGGAGATGCTTTGAAAGATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGAA
GTTAAGCATATAACCGTGGAGGCAGTGAATGCTCATCTTGATATACTGAGACCAGCGATC
AAGAACTACGGTGGAAGTGTGGAAGTTTTATCAGTTGAAGGGGAAGACTGTGTTGTGAAG
TACGTTGGACCTGAATCGATTGGAATGGGAATTAAAGCAGCGATTAAAGAAAAGTTCAAG
GACATATCTAATGTTACCTTTACAAGCTAGAAACTGTATATGTAAAAAAAAAAACACAAA
GTTGCTCTTTGTTTGAGCTTATTTCATTTTGTAATGTCCACATCACTAGTAGTCTCTTAG
AGCTATCTTGCAAAGTTGATCAAGAACAGTGTGTAGACAAAGAAGCAAGTTGTACCAATC
CTTTCACCAGAAAATAAAAAGAACACTGTTTTAT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2EM59JQ 535 0 0
GATGGTGGGAACGTCGACGTTGTCTCTGTTGAAGACGGCGTCGTTTCTCTCAAACTCCAA
GGAGCATGTAATAGCTGTCCGAGTTCTTCAACAACCATGACTATGGGAATCGAAAGGGTA
CTCAAAGAGAAGTTTGGAGATGCTTTGAAAGATATTCGACAAGTTTTTGATGAAGAAGTT
AAGCATATAACCGTGGAGGCAGTGAATGCTCATCTTGATATACTGAGACCAGCGATCAAG
AACTACGGAGGAAGTGTAGAAGTTTTATCAGTTCAAGGGGAAAACTGTGTTGTGAAGTAC
GCTGGACCTGAATCGATTGGAATGGGAATTAAAGCAGCGATTAAAGAAAAGTTCAAGGAC
ATATCTAATGTTACCTTCACAAGCTAGAAACTGTATATGTAAAAAAAAA**CACAAAGTT
GCTCTTTGTTTGAGCTTATTTCATTTTGTAATGTCCACATCACTAGTAGTCTCTTTGAGC
TATCTTGCAAAGTTGATCAAGAACAGTGTGTAGACAAAGAAGCAAGTTGT
TCTCT

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 5

CO CL1160Contig1 1755 5 20 U
GGATGTTTTATTAAACTTTCTTTTAGCAAAAAACGAACGAATCAGTGTCGGCTCTCGGGT
TCCGGAAAACACACACACACAGAGAAAAAAAACATTGTACGTCGGATCCAAAACGCGCTT
TGCATAAACGCTTTACTACTTCCGTGAATCTTTCTGCTCCCGCCATTGCTCGGAACTCGC
GTCCTCGGGCAATGTGCAGAAACTGAGTCATCCTCCGAGTTAACAAACCGAAACTTGGAG
GTTCAGACTAACCCCAAGTTGGGTTTTGTGAGAAACCGCGTTTCCAAAATGTTCAACTTC
AAGCAATGGTTGGTTCTTGTGGTATGTTTGTTAGCAATCTTTAAAGCAGAAGGATTGTTT
GTCAATATTAGATTTGTTAGAAACGCCGTCGCAAGAGGGGCCGTTTGTTTGGATGGTAGT
CCACCAGCTTATCATTTACACAGAGGTTCTGGAACTGGAATCAACAGCAGGTTGATACAG
CTTGAGGGAGGAGGATGGTGTAATAATGTAACAAACTGCCTTAGTCGGATGCATACTCGA
TTAGGTTCATCCAAGAAAATGGTGGAGAATCTTGCCTTCTCAGCTATTCTTAGCAATAAG
AAACAATATAATCCTGATTTTTACAATTGGAACAGAGTGAAAGTTAGATACTGTGACGGG
TCATCATTCACAGGAGATGTGCAAGCAGTGAACCCTGCTACTAATCTTCACTTCAGAGGT
GCTCGAGTTTGGCTAGCCGTTATGCAGGAGTTGCTAGCTAAAGGCATGAGAAACGCCGAG
AACGCTGTTTTGTCTGGGTGTTCTGCTGGCGGGTTAGCTTCCCTGATGCATTGTGACAGT
TTCCGTGCTCTGTTACCGATGGGTACCAAAGTAAAATGTCTTTCAGATGCTGGTTTCTTT
CTCAATACAAGAGATGTCTCAGGAGCCCAATACATTAAATCATACTTCAAAGATGTGGTT
ACTCTACATGGATCAGCAAAGAACTTGCCGAGGTCATGCACATCAAGATTGACCCCTGCA
ATGTGTTTCTTCCCGCAATACGTAGCTCGCCAGATTAGAACTCCTGTATTCATTCTTAAT
GCCGCATACGACTCTTGGCAGATAAAGAACATTTTGGCTCCCCGTGCTGCTGATCCTTAT
GGAAAATGGCAAAGTTGTCAACTTGACATCAAGAATTGCCAACCAAACCAGCTGAAAGTT
ATGCAAGATTTCAGGTTAGAGTTCTTGAGTGCGGTGATAGGTCTAGGTAGATCTTCATCA
AGAGGGATGTTCATAGACTCTTGTTACACTCACTGCCAAACCGAGACACAAACTTCATGG
TTCTGGCAAGATTCTCCAATTCTAAACCGAACGACAATAGCAAAAGCTGTTGGAGATTGG
GTTTATGACAGAAAATTGTTTCAGAAGATAGATTGTCCTTATCCCTGTAACCCTACTTGC
CACCACAGGGTTTTCACTCCTCAAGATGCTCCTCCAATTTAAGAAATACATATAGATTTA
CTATTCTTTATAAAAAAGAAAAAAAATACTTATAAATGACTCATTTGTCATATTACAGTG
ATATATTTGTAGGGTTTAGCTATAGAAAAAGAAAAAGTGGTGATTGATTCTTGATTGTTG
AAAATACGCAAAAGGAGTAATTTTCTTCAACACATGTGTGTGCTGAAGTTGCTCTGTTTT
CTCTTCCATTCTTATTCTCATGTAAAATGCAAATTTGTTACTTGTATTCGAATAAATAAA
ATATATACTTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2F853TF U 1
AF RR2F521TF U 633
AF RR2DZ50TF U 1154
AF RR2A557JQ C 949
AF RR2F521JQ C 1020
BS 1 713 RR2F853TF
BS 714 1319 RR2F521TF
BS 1320 1334 RR2DZ50TF
BS 1335 1335 RR2A557JQ
BS 1336 1422 RR2DZ50TF
BS 1423 1424 RR2A557JQ
BS 1425 1425 RR2F521JQ
BS 1426 1526 RR2A557JQ
BS 1527 1527 RR2F521JQ
BS 1528 1621 RR2A557JQ
BS 1622 1622 RR2F521JQ
BS 1623 1631 RR2A557JQ
BS 1632 1632 RR2F521JQ
BS 1633 1649 RR2A557JQ
BS 1650 1650 RR2F521JQ
BS 1651 1740 RR2A557JQ
BS 1741 1741 RR2F521JQ
BS 1742 1746 RR2A557JQ
BS 1747 1747 RR2F521JQ
BS 1748 1755 RR2A557JQ

RD RR2F853TF 713 0 0
GGATGTTTTATTAAACTTTCTTTTAGCAAAAAACGAACGAATCAGTGTCGGCTCTCGGGT
TCCGGAAAACACACACACACAGAGAAAAAAAACATTGTACGTCGGATCCAAAACGCGCTT
TGCATAAACGCTTTACTACTTCCGTGAATCTTTCTGCTCCCGCCATTGCTCGGAACTCGC
GTCCTCGGGCAATGTGCAGAAACTGAGTCATCCTCCGAGTTAACAAACCGAAACTTGGAG
GTTCAGACTAACCCCAAGTTGGGTTTTGTGAGAAACCGCGTTTCCAAAATGTTCAACTTC
AAGCAATGGTTGGTTCTTGTGGTATGTTTGTTAGCAATCTTTAAAGCAGAAGGATTGTTT
GTCAATATTAGATTTGTTAGAAACGCCGTCGCAAGAGGGGCCGTTTGTTTGGATGGTAGT
CCACCAGCTTATCATTTACACAGAGGTTCTGGAACTGGAATCAACAGCAGGTTGATACAG
CTTGAGGGAGGAGGATGGTGTAATAATGTAACAAACTGCCTTAGTCGGATGCATACTCGA
TTAGGTTCATCCAAGAAAATGGTGGAGAATCTTGCCTTCTCAGCTATTCTTAGCAATAAG
AAACAATATAATCCTGATTTTTACAATTGGAACAGAGTGAAAGTTAGATACTGTGACGGG
TCATCATTCACAGGAGATGTGCAAGCAGTGAACCCTGCTACTAATCTTCACTT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2F521TF 693 0 0
G
AGAGTGAAAGTTAGATACTGTGACGGGTCATCATTCACAGGAGATGTGCAAGCTGTGAAC
CCTGCTACTAATCTTCACTTCAGAGGTGCTCGAGTTTGGCTAGCCGTTATGCAGGAGTTG
CTAGCTAAAGGCATGAGAAACGCCGAGAACGCTGTTTTGTCTGGGTGTTCTGCTGGCGGG
TTAGCTTCCCTGATGCATTGTGACAGTTTCCGTGCTCTGTTACCGATGGGTACCAAAGTA
AAATGTCTTTCAGATGCTGGTTTCTTTCTCAATACAAGAGATGTCTCAGGAGCCCAATAC
ATTAAATCATACTTCAAAGATGTGGTTACTCTACATGGATCAGCAAAGAACTTGCCGAGG
TCATGCACATCAAGATTGACCCCTGCAATGTGTTTCTTCCCGCAATACGTAGCTCGCCAG
ATTAGAACTCCTGTATTCATTCTTAATGCCGCATACGACTCTTGGCAGATAAAGAACATT
TTGGCTCCCCGTGCTGCTGATCCTTATGGAAAATGGCAAAGTTGTCAACTTGACATCAAG
AATTGCCAACCAAACCAGCTGAAAGTTATGCAAGATTTCAGGTTAGAGTTCTTGAGTGCG
GTGATAGGTCTAGGTAGATCTTCATCAAGAGGGATGTTCATAGACTCTTGTTACACTCAC
TGCCAAACCGAGACACAAACTTCATG
GTTCTG

QA 2 687 2 687
DS 

RD RR2DZ50TF 269 0 0
GTTGTCAACTTGACATCAAGAATTGCCAACCAAACCAGCTGAAAGTTATGCAAGATTTCA
GGTTAGAGTTCTTGAGTGCGGTGATAGGTCTAGGTAGATCTTCATCAAGAGGGATGTTCA
TAGACTCTTGTTACACTCACTGCCAAACCGAGACACAAACTTCATGGTTCTGGCAAGATT
CCCCAATTCTAAACCGAACGACAATAGCAAAAGCTGTTGGAGATTGGGTTTATGACAGAA
AATTGTTTCAGAAGATAGATTGTCCTTAT

QA 1 269 1 269
DS 

RD RR2A557JQ 807 0 0
AAAGATGTGGTTACTCTGCATGGATCAGCAAAGAACTTGCCGAGGTCATGCACATCAAGA
TTGACCCCTGCAATGTGTTTCTTTCCGCAATACGTAGCTCGCCAGATTAGAACTCCTGTT
TTCATTCTTAATGCCGCATACGACTCTTGGCAGATAAAGAACATTTTGGCTCCCCGTGCT
GCTGATCCTTATGGAAAATGGCAAAGTTGTCAACTTGACATCAAGAATTGCCAACCAAAC
CAGCTGAAAGTCATGCAAGATTTCAGGTTAGAGTTCTTGAGTGCGGTGATAGGTCTAGGT
AGATCTTCATCAAGAGGGATGTTCATAGACTCTTGTTACACTCACTGCCAAACCGAGACA
CAAACTTCATG*TTCTGGCAAGATTCTCCAATTCTAAACCGAACGACAATAGCAAAGGCT
GTTGGAGATTGGGTTTATGACAGAAAATTGTTTCAGAAGATAGATTGTCCTTATCCTTGT
AACCCTACTTGCCACCACAGGGTTTTCACTCCTCAAGATGCTCCTCCAATTTAAGAAATA
CATATAGATTTACTATTCTTTATAAAAAAGAAAAAAAA*ACTTATAAATGACTCATTTGT
CATATTACAGTGATATATTTGTAGGGTTTAGCTATAGAAAAAGAAAAAGTGGTGATTGAT
TCTTGATTGTTGAGAATACGCAAGAGGAGTAATTTTCTTCAGCACATGTGTGTGCTGAAG
TTGCTCTGTTTTCTCTTCCATTCTTATTCTCATGTAAAATGCAAATTTGTTACTTGTATT
CGAATAAATAAAGTATATCCTTTTCAT

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2F521JQ 736 0 0
AATGTGTTTCTTCCCGCAATACGTAGCTCGCCAGATTAGAACTCCTGTATTCATTCTTAA
TGCCGCATACGACTCTTGGCAGATAAAGAACATTTTGGCTCCCCGTGCTGCTGATCCTTA
TGGAAAATGGCAAAGTTGTCAACTTGACATCAAGAATTGCCAACCAAACCAGCTGAAAGT
TATGCAAGATTTCAGGTTAGAGTTCTTGAGTGCGGTGATAGGTCTAGGTAGATCTTCATC
AAGAGGGATGTTCATAGACTCTTGTTACACTCACTGCCAAACCGAGACACAAACTTCATG
GTTCTGGCAAGATTCTCCAATTCTAAACCGAACGACAATAGCAAAAGCTGTTGGAGATTG
GGTTTATGACAGAAAATTGTTTCAGAAGATAGATTGTCCTTATCCCTGTAACCCTACTTG
CCACCACAGGGTTTTCACTCCTCAAGATGCTCCTCCAATTTAAGAAATACATATAGATTT
ACTATTCTTTATAAAAAAGAAAAAAAATACTTATAAATGACTCATTTGTCATATTACAGT
GATATATTTGTAGGGTTTAGCTATAGAAAAAGAAAAAGTGGTGATTGATTCTTGATTGTT
GAAAATACGCAAAAGGAGTAATTTTCTTCAACACATGTGTGTGCTGAAGTTGCTCTGTTT
TCTCTTCCATTCTTATTCTTATGTAAAATGCAAATTTGTTACTTGTATTCGAATAAATAA
AATATATACTTTTCAT

QA 1 736 1 736
DS 



AS 2 7

CO CL1161Contig1 684 2 2 U
GGACACCAAGCTAATTTATTCTCAGTTAAACTAAAACAGATTTAAACACACAAAATAAAA
TGGCGGGCCGTGACATTTTCCAGCTGCGTTTCGTGGCTGTCGCGGTATCCGTCGCCGTAT
TGACCTTCCTCGTCTCCACTCAAGTCACAGAAGCGTCACGTGTGATGAACCTCTGCTCAC
ACACCGCGTATCCATCCCTATGCCAACCTTTGATTAAACGTATCACGAATCCAAGACGTG
CCACGCACCGAACTATTCAGGCTTTGGAAGTTAAGACAAAAGTGGCTTTAGCTGAAGCGG
CTAGGTACAAAGACGGTAACCAAGCGATCGCGACGTGTTACGCGACGTTTAGCGATGCGG
TTTATAATCTTGCGAACGCGAGGAAAAGTATAAGGAAACGTGATATTATGGGGATGAACA
CGTTTTTGACCGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACGCGA
ACCAAGTTAATACGGTTCAGAATGTAGCGGTTGACTTGAGAAAAATTAGCAGCAACTGCT
TGTCGTTGTCTACATTGGTTTAGATGATCGAGTACAAATTACCATTTTTTAATTTTTTCT
CAAAACAAACAAAAAACTAATTAATTTCGTCTAAATGAATAAGAAGGAAAATAAAATCTT
GAATAATTAAAAATGTTTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH17TF U 1
AF RR2EH17JQ C 127
BS 1 229 RR2EH17TF
BS 230 684 RR2EH17JQ

RD RR2EH17TF 230 0 0
GGACACCAAGCTAATTTATTCTCAGTTAAACTAAAACAGATTTAAACACACAAAATAAAA
TGGCGGGCCGTGACATTTTCCAGCTGCGTTTCGTGGCTGTCGCGGTATCCGTCGCCGTAT
TGACCTTCCTCGTCTCCACTCAAGTCACAGAAGCGTCACGTGTGATGAACCTCTGCTCAC
ACACCGCGTATCCATCCCTATGCCAACCTTTGATTAAACGTATCACGAA
T

QA 1 229 1 229
DS 

RD RR2EH17JQ 558 0 0
TCCTCGTCTCCACTCAAGTCACAGAAGCGTCACGTGTGATGAACCTCTGCTCACACACCG
CGTATCCATCCCTATGCCAACCTTTGATTAAACGTATCACGAATCCAAGACGTGCCACGC
ACCGAACTATTCAGGCTTTGGAAGTTAAGACAAAAGTGGCTTTAGCTGAAGCGGCTAGGT
ACAAAGACGGTAACCAAGCGATCGCGACGTGTTACGCGACGTTTAGCGATGCGGTTTATA
ATCTTGCGAACGCGAGGAAAAGTATAAGGAAACGTGATATTATGGGGATGAACACGTTTT
TGACCGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACGCGAACCAAG
TTAATACGGTTCAGAATGTAGCGGTTGACTTGAGAAAAATTAGCAGCAACTGCTTGTCGT
TGTCTACATTGGTTTAGATGATCGAGTACAAATTACCATTTTTTAATTTTTTCTCAAAAC
AAACAAAAAACTAATTAATTTCGTCTAAATGAATAAGAAGGAAAATAAAATCTTGAATAA
TTAAAAATGTTTTTTCCC

QA 1 558 1 558
DS 



CO CL1161Contig2 835 5 5 U
GGGTACACCAAGCTAATTTATTCTCAGTTAAACTAAAACAGATTAAAACACAAAATAAAA
TGGCGGGCCGTGACATCTTCCAGCTGCGTTTCGTGGCTGTCGCGGTATCCGTCGCCGTAT
TGACCTTCCTCGCCTCCAGCCAAGTCACAGAAGGGTCACGTATGTTGAACCTCTGCTCAC
ACACCGCGTATCCATCTCTATGCCAACCTTTGATTAAACGTATTACGAACCCAAGACGTG
CCACGCACCGAACCATTCAGGCTTTGGAAGCTAAGACGAAAGTGGCTTTAGCTGAAGCGG
CTAGGTACAAAGACGGTAACCAAGCGATCGCGACGTGTTACGCGACGTTTAGCGATGCGG
TTTATAATCTTGCGAACGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGACGTGATGGGGATGAACA
CGTTTTTGACCGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACGCAA
ATCAAGTTAATACGGTTCAGAATGTAGCGGTTGACCTGAGAAAAATTAGCAGCAACTGCT
TGTCGTTGTCTACATTGGTTTAGATGATCGAGTACAAATTACCATTTTTTAATTTTTTCT
CAAAACAAACAAAAAACTAATTAATTTCGTCTAAATGAATAAGAAGGAAAATAAAATCTT
GAATAATTAAAAATGTTTTTTCTTATGTTGCAACTTTTGTTTTGAGGGGGAGATATTTGC
TGGATCATCATTTGTCATGTAAAACGCCACTGGGTGTTATTAATTATACTTGGTTTCTTG
TAAATTAATTGCTGATAGAATTCTTTTTCTTATGGTAATTTAAAAATTTTCAACC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI78TF U 3
AF RR2CX65JQ C 58
AF RR2FF84TF U 1
AF RR2FF84JQ C 267
AF RR2F233TF U 676
BS 1 508 RR2FF84TF
BS 509 509 RR2GI78TF
BS 510 743 RR2FF84TF
BS 744 781 RR2F233TF
BS 782 835 RR2FF84JQ

RD RR2GI78TF 585 0 0
GG
ACACCAAGCTAATTTATTCTCAGTTAAACTAAAACAGATTAAAACACAAAATAAAATGGC
GGGCCGTGACATCTTCCAGCTGCGTTTCGTGGCTGTCGCGGTATCCGTCGCCGTATTGAC
CTTCCTCGCCTCCAGCCAAGTCACAGAAGGGTCACGTATGTTGAACCTCTGCTCACACAC
CGCGTATCCATCTCTATGCCAACCTTTGATTAAACGTATTACGAACCCAAGACGTGCCAC
GCACCGAACCATTCAGGCTTTGGAAGCTAAGACGAAAGTGGCTTTAGCTGAAGCGGCTAG
GTACAAAGACGGTAACCAAGCGATCGCGACGTGTTACGCGACGTTTAGCGATGCGGTTTA
TAATCTTGCGAACGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGACGTGATGGGGATGAACACGTT
TTTGACCGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACGCAAATCA
AGTTAATACGGTTCAGAATGTAGCGGTTGACCTGAGAAAAATTAGCAGCAACTGCTTGTC
GTTGTCTACATTGGTTTAGATGATCGAGTACAAATTACCATTT

QA 3 585 3 585
DS 

RD RR2CX65JQ 516 0 0
AAATGGCGGGCCGTGACATCTTCCAGCTGCGTTTCGTGGCTGTCGCGGTATCCGTCGCCG
TATTGACCTTCCTCGCCTCCAGCCAAGTCACAGAAGGGTCACGTATGTTGAACCTTTGCT
CACACACCGGGTATCCATCTTTATGCCAACCTTTGATTAAACGTATTACGAACCCAAGAC
GTGCCACGCACCGAACCATTCAGGCTTTGGAAGCTAAGACGAAAGTGGCTTTAGCTGAAG
CGGCTAGGTACAAAGACGGTAACCAAGCGATCGGGACGTGTTACGCGACGTTTAGCGATG
CGGTTTATAATCTTGCGAACGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGACGTGATGGGGATGA
ACACGTTTTTGACCGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACG
CAAATCAAGTTAATACGGTTCAGAATGTAGCGGTTGACCTGAGAAAAATTAGCAGCAACT
GCTTGTCGTTGTCTACATTGGTTTAGATGATCGAGT

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2FF84TF 748 0 0
GGGTACACCAAGCTAATTTATTCTCAGTTAAACTAAAACAGATTAAAACACAAAATAAAA
TGGCGGGCCGTGACATCTTCCAGCTGCGTTTCGTGGCTGTCGCGGTATCCGTCGCCGTAT
TGACCTTCCTCGCCTCCAGCCAAGTCACAGAAGGGTCACGTATGTTGAACCTCTGCTCAC
ACACCGCGTATCCATCTCTATGCCAACCTTTGATTAAACGTATTACGAACCCAAGACGTG
CCACGCACCGAACCATTCAGGCTTTGGAAGCTAAGACGAAAGTGGCTTTAGCTGAAGCGG
CTAGGTACAAAGACGGTAACCAAGCGATCGCGACGTGTTACGCGACGTTTAGCGATGCGG
TTTATAATCTTGCGAACGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGACGTGATGGGGATGAACA
CGTTTTTGACCGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACGCAA
ATCAAGTTAATACGGTTCAGAATGTAGCTGTTGACCTGAGAAAAATTAGCAGCAACTGCT
TGTCGTTGTCTACATTGGTTTAGATGATCGAGTACAAATTACCATTTTTTAATTTTTTCT
CAAAACAAACAAAAAACTAATTAATTTCGTCTAAATGAATAAGAAGGAAAATAAAATCTT
GAATAATTAAAAATGTTTTTTCTTATGTTGCAACTTTTGTTTTGAGGGGGAGATATTTGC
TGGATCATCATTTGTCATGTAAA
CGCCA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2FF84JQ 569 0 0
GAAGCTAAGACGAAAGTGGCTTTAGCTGAAGCGGCTAGGTACAAAGACGGTAACCAAGCG
ATCGCGACGTGTTACGCGACGTTTAGCGATGCGGTTTATAATCTTGCGAACGCGAGGAAG
AGTATAAGGAAACGTGACGTGATGGGGATGAACACGTTTTTGACCGCGGCTGTGTCTGAT
TACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACGCAAATCAAGTTAATACGGTTCAGAATGTA
GCTGTTGACCTGAGAAAAATTAGCAGCAACTGCTTGTCGTTGTCTACATTGGTTTAGATG
ATCGAGTACAAATTCCCATTTTTTAATTTTTTCTCAAAACAAACAAAAAACTAATTAATT
TCGTCTAAATGAATAAGAAGGAAAATAAAATCTTGAATAATTAAAAATGTTTTTTCTTAT
GTTGCAACTTTTGTTTTGAGGGGGAGATATTTGCTGGATCATCATTTGTCATGTAAAACG
CCACTGGGTGTTTTTAATTATACTTGGTTTCTTGTAAATTAATTGCTGATAGAATTCTTT
TTCTTATGGTAATTTAAAAATTTTCAACC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2F233TF 106 0 0
TTTTTTCTTATGTTGCAACTTTTGTTTTGAGGGGGAGATATTTGCTGGATCATCATTTGT
CATGTAAAACGCCACTGGGTGTTATTAATTATACTTGGTTTCTTGT

QA 1 106 1 106
DS 



AS 2 7

CO CL1162Contig1 1077 3 7 U
GATCTGGGTGAAGAATGGTAACACTGGGTATGACGAGATCCGTGCTGCCATTAAAGAAGC
TAAAGCTGTTACAGACAAGCCTACATTGATTAAGGTCACTACTACCATTGGTTATGGATC
TCCCAACAAGGCCAACTCATACAGTGTCCATGGAGCTGCACTTGGTGAGAAGGAAGTTGA
GGCTACCAGAAACAACCTCGGATGGCCATATGAGCCATTCAAGGTACCTGATGAAGTTAA
AAGCCACTGGAGCCGTCACACGCCTGATGGCAAAGCTCTTGAGTCTGACTGGAATGCATC
GTTCGCAGCGTATGAAAAGAAGTACCCAGAGGAAGCTGCAGAGTTGAAATCTATCATCAC
TGGTGAACTACCTGCTGGCTGGGAGAAGGCACTACCAACATACACACCAGAGTCTCCTGG
TGATGCCACAAGAAACTTGTCACAGCAATGTCTCAACGCCCTCGCTAAAGTTGTCCCTGG
TTTCCTCGGAGGAAGTGCTGACCTTGCATCTTCCAACATGACACTCCTGAAAGCCTTTGG
TGACTTCCAAAAGGCGACACCGGAAGAAAGAAACCTTAGGTTCGGTGTCAGAGAGCATGG
AATGGGAGCCATCTGCAACGGCATTGCACTCCACAGCCCTGGTCTTATCCCTTACTGTGC
AACTTTCTTTGTCTTCACTGACTACATGAGAGGTGCGATGAGAATCTCAGCTTTGTCTGA
AGCTGGTGTCATCTATGTGATGACTCATGACTCCATTGGTCTTGGAGAAGATGGACCAAC
CCATCAGCCTATTGAGCATATTGCTAGTTTCCGTGCTATGCCTAACACTCTTATGTTCCG
TCCTGCTGATGGAAACGAAACAGCCCGGGGCGTACAAGATCGCTGTCACCAAGCGCAAGA
CACCGTCTATCTTAGCTCTGTCTAGACAAAAGCTTCCTCAGCTTCCAGGCACATCCATCG
AAGGAGTTGAGAAGGGTGGATACACGATCTCTGACAACTCGTCAGGAAACAAACCCGATG
TGATCTTGGTTGGAACTGGATCTGAGCTAGAGATTGCTGCACAGGCTGCAGAGGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO43TF U 1
AF RR2FG94TF U 83
AF RR2E589TF U 545
BS 1 442 RR2AO43TF
BS 443 443 RR2FG94TF
BS 444 659 RR2AO43TF
BS 660 660 RR2FG94TF
BS 661 860 RR2AO43TF
BS 861 879 RR2FG94TF
BS 880 1077 RR2E589TF

RD RR2AO43TF 860 0 0
GATCTGGGTGAAGAATGGTAACACTGGGTATGACGAGATCCGTGCTGCCATTAAAGAAGC
TAAAGCTGTTACAGACAAGCCTACATTGATTAAGGTCACTACTACCATTGGTTATGGATC
TCCCAACAAGGCCAACTCATACAGTGTCCATGGAGCTGCACTTGGTGAGAAGGAAGTTGA
GGCTACCAGAAACAACCTCGGATGGCCATATGAGCCATTCAAGGTACCTGATGAAGTTAA
AAGCCACTGGAGCCGTCACACGCCTGATGGCAAAGCTCTTGAGTCTGACTGGAATGCATC
GTTCGCAGCGTATGAAAAGAAGTACCCAGAGGAAGCTGCAGAGTTGAAATCTATCATCAC
TGGTGAACTACCTGCTGGCTGGGAGAAGGCACTACCAACATACACACCAGAGTCTCCTGG
TGATGCCACAAGAAACTTGTCATAGCAATGTCTCAACGCCCTCGCTAAAGTTGTCCCTGG
TTTCCTCGGAGGAAGTGCTGACCTTGCATCTTCCAACATGACACTCCTGAAAGCCTTTGG
TGACTTCCAAAAGGCGACACCGGAAGAAAGAAACCTTAGGTTCGGTGTCAGAGAGCATGG
AATGGGAGCCATCTGCAACGGCATTGCACTCCACAGCCCTGGTCTTATCCCTTACTGTGT
AACTTTCTTTGTCTTCACTGACTACATGAGAGGTGCGATGAGAATCTCAGCTTTGTCTGA
AGCTGGTGTCATCTATGTGATGACTCATGACTCCATTGGTCTTGGAGAAGATGGACCAAC
CCATCAGCCTATTGAGCATATTGCTAGTTTCCGTGCTATGCCTAACACTCTTATGTTCCG
TCCTGCTGATGGAAACGAAA

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR2FG94TF 797 0 0
G
CATTGATTAAGGTCACTACTACCATTGGTTATGGATCTCCCAACAAGGCCAACTCATACA
GTGTCCATGGAGCTGCACTTGGTGAGAAGGAAGTTGAGGCTACCAGAAACAACCTCGGAT
GGCCATATGAGCCATTCAAGGTACCTGATGAAGTTAAAAGCCACTGGAGCCGTCACACGC
CTGATGGCAAAGCTCTTGAGTCTGACTGGAATGCATCGTTTGCAGCGTATGAAAAGAAGT
ACCCAGAGGAAGCTGCAGAGTTGAAATCTATCATCACTGGTGAACTACCTGCTGGCTGGG
AGAAGGCACTACCAACATACACACCAGAGTCTCCTGGTGATGCCACAAGAAACTTGTCAC
AGCAATGTCTCAACGCCCTCGCTAAAGTTGTTCCTGGTTTCCTCGGAGGAAGTGCTGACC
TTGCATCTTCCAACATGACACTCCTGAAAGCCTTTGGTGACTTCCAAAAGGCGACACCGG
AAGAAAGAAGCCTTAGGTTCGGTGTCAGAGAGCATGGAATGGGAGCCATCTGCAACGGCA
TTGCACTCCACAGCCCTGGTCTTATCCCTTACTGTGCAACTTTCTTTGTCTTCACTGACT
ACATGAGAGGTTCGATGAGAATCTCAGCTTTGTCTGAAGCTGGTGTCATCTATGTGATGA
CTCATGACTCCATTGGTCTTGGAGAAGATGGACCAACCCATCAGCCTATTGAGCATATTG
CTAGTTTCCGTGCTATGCCTAACACTCTTATGTTCCGTCCTGCTGATGGAAACGAAACAG
CCCGGGGCGTACAAGA

QA 2 797 2 797
DS 

RD RR2E589TF 533 0 0
G
TCCAAAAGGCGACACCGGAAGAAAGAAACCTTAGGTTCGGTGTCAGAGAGCATGGAATGG
GAGCCATCTGCAACGGCATTGCACTCCACAGCCCTGGTCTTATCCCTTACTGTGCAACTT
TCTTTGTCTTCACTGACTACATGAGAGGTGCGATGAGAATCTCAGCTTTGTCTGAAGCTG
GTGTCATCTATGTGATGACTCATGACTCCATTGGTCTTGGAGAAGATGGACCAACCCATC
AGCCTATTGAGCATATTGCTAGTTTCCGTGCTATGCCTAACACTCTTATGTTCCGTCCTG
CTGATGGAAACGAAACAGCC*GGTGCGTACAAGATCGCTGTCACCAAGCGCAAGACACCG
TCTATCTTAGCTCTGTCTAGACAAAAGCTTCCTCAGCTTCCAGGCACATCCATCGAAGGA
GTTGAGAAGGGTGGATACACGATCTCTGACAACTCGTCAGGAAACAAACCCGATGTGATC
TTGGTTGGAACTGGATCTGAGCTAGAGATTGCTGCACAGGCTGCAGAGGTGC

QA 2 533 2 533
DS 



CO CL1162Contig2 867 4 7 U
GGAAAAGTTTGCTGAAAATTCAAGCATATGATAAACAATACACAACTGATCATAAAAGAG
TTTTTACATTGTCTTCTAATATCTTCTCTTCCCAAACCCAAAACCTATGTTGACCCCGCA
TTACAAGAAACAAAGAAAGAAGAGTCTCTGCGTCTTGTTGCACTTTATTTTGAGGTAATG
AGACAATGTAGTTGAAACCCTTAAAGTCACTTAGAAGAATGACTTAGCCGCATCAACAAC
AGCTTCAACAGTGATGCCAAACTCCTTGTAGAGTAATGGAGCTGGTGCACTAGCCCCAAA
CGAATTAATACCAATGGACTTCCCTTTGCCTCCAACAATCTTCCCCCATCCGAAAGTCGA
AGCTGCTTCAATACTAACTCTAGCAGATACACCAGACGGCAAGACACTCTCCTTGTACTC
ATCTGATTGCTCATCAAACAGCTCCCAGCAGACGAAAGACACAACTCTCACGGTTTTGCC
TTCTTTCCTAAGCACCTCTGCAGCCTGTGCAGCAATCTCTAGCTCAGATCCAGTTCCAAC
CAAGATCACATCGGGTTTGTTTCCTGACGAGTTGTCAGAGATCGTGTATCCACCCTTCTC
AACTCCTTCGATGGATGTGCCTGGAAGCTGAGGAAGCTTTTGTCTAGACAGAGCTAAGAT
AGACGGTGTCTTGCGCTTGGTGACAGCGATCTTGTACGCACCGGCTGTTTCGTTTCCATC
AGCAGGACGGAACATAAGAGTGTTAGGCATAGCACGGAAACTAGCAATATGCTCAATAGG
CTGATGGGTTGGTCCATCTTCTCCAAGACCAATGGAGTCATGAGTCATCACATAGATGAC
ACCAGCTTCAGACAAAGCTGAGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E589JQ U 1
AF RR2FG94JQ U 15
AF RR2AO43JQ U 14
AF RR2DC83TF C 269
BS 1 160 RR2E589JQ
BS 161 161 RR2AO43JQ
BS 162 565 RR2E589JQ
BS 566 579 RR2AO43JQ
BS 580 580 RR2FG94JQ
BS 581 839 RR2AO43JQ
BS 840 867 RR2DC83TF

RD RR2E589JQ 565 0 0
GGAAAAGTTTGCTGAAAATTCAAGCATATGATAAACAATACACAACTGATCATAAAAGAG
TTTTTACATTGTCTTCTAATATCTTCTCTTCCCAAACCCAAAACCTATGTTGACCCCGCA
TTACAAGAAACAAAGAAAGAAGAGTCTCTGCGTCTTGTTGAACTTTATTTTGAGGTAATG
AGACAATGTAGTTGAAACCCTTAAAGTCACTTAGAAGAATGACTTAGCCGCATCAACAAC
AGCTTCAACAGTGATGCCAAACTCCTTGTAGAGTAATGGAGCTGGTGCACTAGCCCCAAA
CGAATTAATACCAATGGACTTCCCTTTGCCTCCAACAATCTTCCCCCATCCGAAAGTCGA
AGCTGCTTCAATACTAACTCTAGCAGATACACCAGACGGCAAGACACTCTCCTTGTACTC
ATCTGATTGCTCATCAAACAGCTCCCAGCAGACGAAAGACACAACTCTCACGGTTTTGCC
TTCTTTCCTAAGCACCTCTGCAGCCTGTGCAGCAATCTCTAGCTCAGATCCAGTTCCAAC
CAAGATCACATCGGGTTTGTTTCCT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2FG94JQ 704 0 0
A
AAATTCAAGCATATGATAAACAATACACAACTGATCATAAAAGAGTTTTTACATTGTCTT
CTAATATCTTCTCTTCCCAAACCCAAAACCTATGTTGACCCCGCATTACAAGAAACAAAG
AAAGAAGAGTCTCTGCGTCTTGTTGCACTTTATTTTGGGGTAATGAGACAATGTAGTTGA
AACCCTTAAAGTCACTTAGAAGAATGACTTAGCCGCATCAACAACAGCTTCAACAGTGAT
GCCAAACTCCTTGTAGAGTAATGGAGCTGGTGCACTAGCCCCAAACGAATTAATACCAAT
GGACTTCCCTTTGCCTCCAACAATCTTCCCCCATCCGAAAGTCGAAGCTGCTTCAATACT
AACTCTAGCAGATACACCAGACGGCAAGACACTCTCCTTGTACTCATCTGATTGCTCATC
AAACAGCTCCCAGCAGACGAAGGACACAACTCTCACGGTTTTGCCTTCTTTCCTAAGCAC
CTCTGCAGCCTGTGCAGCAATCTCTAGCTCAGATCCAGTTCCAACCAAGATCACATCGGG
TTTGTTTCCTGACGAGTTGTCAGAGATCGTGTATCCACCCTTCTCAACTCCTTCGATGGA
TGTGCCTGGAAGCTGAGGAAGCTTTTGTCTAGACAGAGCTAAGATAGACGGTGTCTTGCG
CTTGGTGACAGCGATCTTGTACGCACCGGCTGTTTCGTTTCCA

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR2AO43JQ 826 0 0
GG
AAATTCAAGCATATGATAAACAATACACAACTGATCATAAAAGAGTTTTTACATTGTCTT
CTAATATCTTCTCTTCCCAAACCCAAAACCTATGTTGACCCCGCATTACAAGAAACAAAG
AAAGAAGAGTCTCTGCGCCTTGTTGCACTTTATTTTGAGGTAATGAGACAATGTAGTTGA
AACCCTTAAAGTCACTTAGAAGAATGACTTAGCCGCATCAACAACAGCTTCAACAGTGAT
GCCAAACTCCTTGTAGAGTAATGGAGCTGGTGCACTAGCCCCAAACGAATTAATACCAAT
GGACTTCCCTTTGCCTCCAACAATCTTCCCCCATCCGAAAGTCGAAGCTGCTTCAATACT
AACTCTAGCAGATACACCAGACGGCAAGACACTCTCCTTGTACTCATCTGATTGCTCATC
AAACAGCTCCCAGCAGACGAAAGACACAACTCTCACGGTTTTGCCTTCTTTCCTAAGCAC
CTCAGCAGCCTGTGCAGCAATCTCTAGCTCAGATCCAGTTCCAACCAAGATCACATCGGG
TTTGTTTCCTGACGAGTTGTCAGAAATCGTGTATCCACCCTTCTCAACTCCTTCGATGGA
TGTGCCTGGAAGCTGAGGAAGCTTTTGTCTAGACAGAGCTAAGATAGACGGTGTCTTGCG
CTTGGTGACAGCGATCTTGTACGCACCGGCTGTTTCGTTTCCATCAGCAGGACGGAACAT
AAGAGTGTTAGGCATAGCACGGAAACTAGCAATATGCTCAATAGGCTGATGGGTTGGTCC
ATCTTCTCCAAGACCAATGGAGTCATGAGTCATCACATAGATGA

QA 3 826 3 826
DS 

RD RR2DC83TF 599 0 0
TAGAGCAATGGAGCTGGTGCACTAGCCCCAAACGAATTAATACCAATGGACTTCCCTTTG
CCTCCGACAATCTTCCCCCATCCGAAAGTCGAAGCTGCTTCAATACTAACTCTAGCAGAT
ACACCAGACGGCAAGACACTCTCCTTGTACTCATCTGTTTGCTCATCAAACAGCTCCCAG
CAGACGAAAGACACAACTCTCACGGTTTTGCCTTCTTTCCTAAGCACCTCCGCAGCCTGT
GCAGCAATCTCCAGCTCAGATCCAGTTCCAACCAAGATCACATCAGGTTTGTTCCCTGAC
GAGTTGTCAGAGATTGTGTACCCACCCTTCTCAACTCCTTCGATGGATGTGCCTGGAAGC
TGAGGAAGCTTTTGCCTAGACAGAGCTAAGATAGACGGTGTCTTGCGCTTGGTGACAGCA
ATCTTGTACGCACCGGCTGTTTCGTTTCCATCAGCAGGACGGAACATAAGAGTGTTTGGC
ATAGCACGGAAACTAGCAATATGCTCAATAGGCTGATGGGTTGGTCCATCTTCTCCAAGA
CCAATGGAGTCATGAGTCATCACATAGATGACACCAGCTTCAGACAAAGCTGAGATTCC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 2 6

CO CL1163Contig1 873 4 24 U
TGGGAGATTCACTCACTTGATTAAACAAATCACACGATACAAAGGAGACAACAGTAAAGT
TTCAATGTTTTCAAAGAAACCTTAATCGACACTTTCCTCTTGCCCATCTACTTACATGGA
GAAGAAGAAACCAAACAAACTAACCATTACATAAAACTTTTACCATCCCTAA**TACTAC
TACCCAAGAAGGTGGACTGTGTGTAGATAGAAACACAGGTGAATTCACGAAAAACAAGAG
AACCGGACAGGTAAGTCAGTACAGTACAGTACATCACTTGGTGTCT*TACTACTTTATGG
ACAGTTCTCGTTTTTACCAGGACCTCCATAGTAGAAGAAATGACCCCAATCATCATTGTT
TCCGGGTTGAACATCATAACAGTTGGACTGCTCAGTGAACGTTCCAAGTCCTTTAGGTGC
CTTGAG*TTGTTTGAAGAATCAACCACTTGAATGTTCCTGAAGTAACTTGCTTTGCTGAA
GCCTTCTTCAGGGAATCTACCACTGCCCATTTGCGTTGAAGTGTGGTGGCCATCTGCTTG
TGAGTTCACAACTTCCCCTCCCCATTCAATCATTGACGCACTTTCTGTTAAGTAGGAGAA
GAGAAAAGACGGCCAGTATCCTAAAACGTAGCCGTTTCCAAATTGCATCCACCAGTGTCC
TCTTTTGGATCCTTCCAGATCAGAATGCTGATGTCATACTGCGAGTTACGGTAGCCAGAG
ACCGGAGAGATACTTGCTCCCATTGCTATGTCACTGTTTATTTGAATAAAACCAGAGCAA
AGAAGATTGTAGCAGCCAGTAGCTTGATATGCATCACTAGTCAGTAAGTGAAGAGTCTTG
TGTATGTCACAGTATAGATCCGGGCTCACTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H969JQ U 8
AF RR2C245TF C 1
AF RR2C245JQ U 2
AF RR2EL62JQ U 1
BS 1 15 RR2C245TF
BS 16 44 RR2EL62JQ
BS 45 45 RR2C245JQ
BS 46 85 RR2EL62JQ
BS 86 86 RR2C245JQ
BS 87 155 RR2EL62JQ
BS 156 156 RR2C245JQ
BS 157 172 RR2EL62JQ
BS 173 174 RR2C245JQ
BS 175 228 RR2EL62JQ
BS 229 229 RR2C245JQ
BS 230 286 RR2EL62JQ
BS 287 287 RR2C245JQ
BS 288 318 RR2EL62JQ
BS 319 319 RR2C245JQ
BS 320 393 RR2EL62JQ
BS 394 394 RR2C245JQ
BS 395 426 RR2EL62JQ
BS 427 427 RR2C245JQ
BS 428 555 RR2EL62JQ
BS 556 556 RR2C245JQ
BS 557 609 RR2EL62JQ
BS 610 610 RR2C245JQ
BS 611 873 RR2EL62JQ

RD RR2H969JQ 183 0 0
TTCCCTCC
CTTGATTAAACAAATCACACGATACAAAGGAAACAACAGTAAAGTCTCAATGTTTTCAAA
AAAACCTTAATCGACACTTTCCTCTTGCCCATCTACTTACATGGAGAAAAAAAAACCAAA
CAAACTAACCATTACATAAAACTTTTACCATCCCTAA**TACTACTACCCAA
AAA

QA 9 180 9 180
DS 

RD RR2C245TF 592 0 0
TGGGAGATTCACTCACTTGATTAAACAAATCACACGATACAAAGGAGACAACAGTAAAGT
TTCAATGTTTTCAAAGAAACCTTAATCGACACTTTCCTCTTGCCCATCTACTTACATGGA
GAAGAAGAAACCAAACAAACTAACCATTACATAAAACTTTTACCATCCCTAA**TACTAC
TACCCAAGAAGGTGGACTGTGTGTAGATAGAAACACAGGTGAATTCACGAAAAACAAGAG
AACCGGACAGGTAAGTCAGTACAGTACAGTACATCACTTGGTGTCT*TACTACTTTATGG
ACAGTTCTCGTTTTTACCAGGACCTCCATAGTAGAAGAAATGACCCCAATCATCATTGTT
TCCGGGTTGAACATCATAACAGTTGGACTGCTCAGTGAACGTTCCAAGTCCTTTAGGTGC
CTTGAG*TTGTTTGAAGAATCAACCACTTGAATGTTCCTGAAGTAACTTGCTTTGCTGAA
GCCTTCTTCAGGGAATCTACCACTGCCCATTTGCGTTGAAGTGTGGTGGCCATCTGCTTG
TGAGTTCACAACTTCCCCTCCCCATTCAATCATTGACGCACTTTCTGTTA
AG

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2C245JQ 622 0 0
GGGGGATTCACTCA
CTTGATTAAACAAATCACACGATACAAAGGAGACAACAGTAAAGTTTCAATGTTTTCAAA
GAAACCTTAATCGACACTTTCCTCTTGCCCATCTACTTACATGGAGAAGAAGAAACCAAA
CAAACTAACCATTACATAAAACTTTTACCATCCCTAA**TACTACTACCCAAGAAGGTGG
ACTGTGTGTAGATAGAAACACAGGTGAATTCACGAAAAACAAGAGAACCGGACAGGTAAG
TCAGTACAGTACAGTACATCACTTGGTGTCT*TACTACTTTATGGACAGTTCTCGTTTTT
ACCAGGACCTCCATAGTAGAAGAAATGACCCCAATCATCATTGTTTCCGGGTTGAACATC
ATAACAGTTGGACTGCTCAGTGAACGTTCCAAGTCCTTTAGGTGCCTTGAG*TTGTTTGA
AGAATCAACCACTTGAATGTTCCTGAAGTAACTTGCTTTGCTGAAGCCTTCTTCAGGGAA
TCTACCACTGCCCATTTGCGTTGAAGTGTGGTGGCCATCTGCTTGTGAGTTCACAACTTC
CCCTCCCCATTCAATCATTGACGCACTTTCTGTTAAGTAGGAGAAGAGAAAAGACGGCCA
GTATCCT
C

QA 15 621 15 621
DS 

RD RR2EL62JQ 873 0 0
AGAGAGATTCACTCA
CTTGATTAAACAAATCACACGATACAAAGTAGACAACAGTAAAGTTTCAATGTTTTCAAA
GAAACCTTAAGCGACACTTTCCTCTTGCCCATCTACTTACATGGAGAAGAAGAAACCAAA
CAAACTAACCATTACATAAA*CTTTTACCATCCCTAAAATACTACTACCCAAGAAGGTGG
ACTGTGTGTAGATAGAAACACAGGTGAATTCACAAAAAACAAGAGAACCGGACAGGTAAG
TCAGTACAGTACAGTACATCACTTGGTGTCTCTACTACTTTATGGACAGTTCTCGTTTTT
ACCGGGACCTCCATAGTAGAAGAAATGACCCCAATCATCATTGTTTCCGGGTTGAACATC
ATAACAGTTGGACTGCTCTGTGAACGTTCCAAGTCCTTTAGGTGCCTTGAGGTTGTTTGA
AGAATCAACCACTTGAATGTTCCTGAAGTAACTTGCTTTGCTGAAGCCTTCTTCAGGGAA
TCTACCACTGCCCATTTGCGTTGAAGTGTGGTGGCCATCTGCTTGTGAGTTCACAACTTC
TCCTCCCCATTCAATCATTGACGCACTTTCTGTTAAGTAGGAGAAGAGAAAAGATGGCCA
GTATCCTAAAACGTAGCCGTTTCCAAATTGCATCCACCAGTGTCCTCTTTTGGATCCTTC
CAGATCAGAATGCTGATGTCATACTGCGAGTTACGGTAGCCAGAGACCGGAGAGATACTT
GCTCCCATTGCTATGTCACTGTTTATTTGAATAAAACCAGAGCAAAGAAGATTGTAGCAG
CCAGTAGCTTGATATGCATCACTAGTCAGTAAGTGAAGAGTCTTGTGTATGTCACAGTAT
AGATCCGGGCTCACTGCC

QA 16 873 16 873
DS 



CO CL1163Contig2 830 2 14 U
TTTTTTCAGTGCTTAAAAAGGAATACAATGGGAGCGGCGAAGCATCTTAGCAGGGATAAG
TTAGGTAGAGGCTTCTTAGTGTGTTTATGTCTTTAGGGTTTCTTCTCTCTATCCTGCGCC
GCAAGGTCCGGCGTATCTAAGCAGAAGTTCCAAGTCAAGAAGCATCTAAACAGGCTTAAC
AAACCTGCCGTCAAGAGCATTCAGAGCCCAGATGGTGATATCATTGACTGTGTTCCTATC
ACAAAGCAACCAGCTTTTGATCATCCTTTCCTCAAAGATCACAAGATTCAGATGAAGCCT
AACTACCATCCTGAGGGACTCTTTGATGACAACAAAGTGTCCTCTACTAAATCAAAAGAC
AAGGAACCCCATATCCCTCAGTTATGGCATCGTTATGGCAAATGCGCTGAAGGAACCATT
CCCATGAGGAGGACTAAAGAGGACGATGTCTTGAGAGCAAGTTCTGTCAAAAGATATGGC
AAGAAGAAGCATAGAACCGTCCCTTTGCCTAAATCTGCTGAACCTGACCTCATCAACCAA
AGTGGGCACCAGCATGCCATAGCTTATGTGGAAGGGGATAAGTACTATGGAGCTAAAGCG
ACTATTAATGTGTGGGAGCCCAAGATACAGCAGCAGAACGAGTTCAGCTTGTCGCAGATT
TGGCTTCTTGGTGGCTCTTTCGGACAAGATCTTAACAGCATCGAAGCTGGTTGGCAGTGA
GCCCGGATCTATACTGTGACAATAACACAAGACTCTTCACTTACTGGACTAGTGATGCAT
ATCAAGCTACTGGCTGCTACAATCTTCTTTGCTCTGGTTTATTCAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS01TF U 1
AF RR2EL62TF U 28
BS 1 54 RR2GS01TF
BS 55 55 RR2EL62TF
BS 56 150 RR2GS01TF
BS 151 151 RR2EL62TF
BS 152 291 RR2GS01TF
BS 292 292 RR2EL62TF
BS 293 341 RR2GS01TF
BS 342 342 RR2EL62TF
BS 343 512 RR2GS01TF
BS 513 513 RR2EL62TF
BS 514 545 RR2GS01TF
BS 546 546 RR2EL62TF
BS 547 573 RR2GS01TF
BS 574 830 RR2EL62TF

RD RR2GS01TF 578 0 0
TTTTTTCAGTGCTTAAAAAGGAATACAATGGGAGCGGCGAAGCATCTTAGCAGGTATAAG
TTAGGTAGAGGCTTCTTAGTGTGTTTATGTCTTTAGGGTTTCTTCTCTCTATCCTGCGCC
GCAAGGTCCGGCGTATCTAAGCAGAAGTTCGAAGTCAAGAAGCATCTAAACAGGCTTAAC
AAACCTGCCGTCAAGAGCATTCAGAGCCCAGATGGTGATATCATTGACTGTGTTCCTATC
ACAAAGCAACCAGCTTTTGATCATCCTTTCCTCAAAGATCACAAGATTCAGGTGAAGCCT
AACTACCATCCTGAGGGACTCTTTGATGACAACAAAGTGTCTTCTACTAAATCAAAAGAC
AAGGAACCCCATATCCCTCAGTTATGGCATCGTTATGGCAAATGCGCTGAAGGAACCATT
CCCATGAGGAGGACTAAAGAGGACGATGTCTTGAGAGCAAGTTCTGTCAAAAGATATGGC
AAGAAGAAGCATAGAACCGTCCCTTTGCCTAA*TCTGCTGAACCTGACCTCATCAACCAA
AGTGGTCACCAGCATGCCATAGCTTATGTGGAA
AGGGG

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2EL62TF 803 0 0
GG
GGGAGCGGCGGCGCATCTTAGCAGGGATAAGTTAGGTAGAGGTTTCTTAGTGTGTTTATG
TCTTTGGGGTTTCTTCTCTCTATCCTGCGCCGCAAGGTCCGGCGTATCTAAGCAGAAGTT
CCAAGTCAAGAAGCATCTGAACAGGCTTAACAAACCTGCCGTCAAGAGCATTCAGAGCCC
AGATGGTGATATCATTGACTGTGTTCCTATCACAAAGCAACCAGCTTTTGATCATCCTTT
CCTCAAAGATCACAAGATTCAGATGAAGCCTAACTACCATCCTGAGGGACTCTTTGATGA
CAACAAAGTGTCCTCTACTGAATCTAAAGACAAGGAACCGCATATCCCTCAGTTATGGCA
TCGTTATGGCAAATGCGCTGAAGGAACCATTCCCATGAGGAGGACTAAAGAGGACGATGT
CTTGAGAGCAAGTTCTGTCAAAAGATATGGCAAGAAGAAGCATAGAACCGTCCCTTTGCC
TAAATCTGCTGAACCTGACCTCATCAACCAAAGTGGG*ACCAGCATGCCATAGCTTATGT
GGAAGGGGATAAGTACTATGGAGCTAAAGCGACTATTAATGTGTGGGAGCCCAAGATACA
GCAGCAGAACGAGTTCAGCTTGTCGCAGATTTGGCTTCTTGGTGGCTCTTTCGGACAAGA
TCTTAACAGCATCGAAGCTGGTTGGCAGTGAGCCCGGATCTATACTGTGACAATAACACA
AGACTCTTCACTTACTGGACTAGTGATGCATATCAAGCTACTGGCTGCTACAATCTTCTT
TGCTCTGGTTTATTCAAAAAA

QA 3 803 3 803
DS 



AS 2 7

CO CL1164Contig1 760 4 16 U
CTTAATAAAAAGGGTCCTTGATTTGCTAATATAGGCTCGAACTGAGATTACAAAGTAGAA
GAAACATGATCTATTGAATACAGTGATTCCTCTTTCTTCTGGAAAATCATAATATAGCTG
TACCAATTACATAGAGGATTTCGAGAATCATGCGTTCAATGGTTTGTAGAGCTTCTCAAC
CATCTTCCTGTACTCTTTTTGATTGCTCCAAAGCTGAGCTGCTTGATTGTTCAATGGCGA
GCTGATGTTCGGTTCTCCGAGAAGGCTTTGAATCGAGAGTAATAACGTCCTCACATCGTA
AGCCGATGACCATTTATCCTGAAGAATGTCCAAGCAAATATTGCCATAGAGGTCGACATT
GGGATGGAAGCAGCAAGTCTCGAACTTAACTTTGGGAGGTTTGAAAGGATAATCGTTGGA
GAAAGCGAGGGAGAGTCTGTACTCAGTTCCTCGAAACACAGTGTCTTTGCTCCCAGTGAT
TGTTCCTTTCCAGCAGAATATATTGTCTTCCTCTGGGAACGCAGATATACCCGGATCACC
TCCCATCATTAAACCCATTAGTTCAGATTGCAGCCTTTTGAGAACGGAGTGGCTATCGAC
GGATTTAGCCGGAGGAGCAGGTTGCTTCGATCCGGTGGTTGCAGGCGTTGTCTCCGCCGG
AGTGTTTCCTTGGTGCCCATTTACCGCCGCCATCCCTCGAGAATCGGTGATTTATGAAAT
CGAAATTGTTTCCCTCGTGAAGAATTTTGATCAAAAGTAT


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A532JQ U 1
AF RR2A532TF C 1
AF RR2A418JQ U 4
AF RR2A418TF C 4
BS 1 57 RR2A532JQ
BS 58 58 RR2A418JQ
BS 59 60 RR2A532JQ
BS 61 61 RR2A418JQ
BS 62 137 RR2A532JQ
BS 138 138 RR2A418JQ
BS 139 323 RR2A532JQ
BS 324 324 RR2A418JQ
BS 325 348 RR2A532JQ
BS 349 349 RR2A418JQ
BS 350 451 RR2A532JQ
BS 452 452 RR2A418JQ
BS 453 495 RR2A532JQ
BS 496 496 RR2A418JQ
BS 497 602 RR2A532JQ
BS 603 760 RR2A418JQ

RD RR2A532JQ 603 0 0
CTTAATAAAAAGGGTCCTTGATTTGCTAATATAGGCTCGAACTGAGATTACAAAGTAAAA
AAAACATGATCTATTGAATACAGTGATTCCTCTTTCTTCTGGAAAATCATAATATAGCTG
TACCAATTACATAGAGGCTTTCGAGAATCATGCGTTCAATGGTTTGTAGAGCTTCTCAAC
CATCTTCCTGTACTCTTTTTGATTGCTCCAAAGCTGAGCTGCTTGATTGTTCAATGGCGA
GCTGATGTTCGGTTCTCCGAGAAGGCTTTGAATCGAGAGTAATAACGTCCTCACATCGTA
AGCCGATGACCATTTATCCTGAAAAATGTCCAAGCAAATATTGCCATAAAGGTCGACATT
GGGATGGAAGCAGCAAGTCTCGAACTTAACTTTGGGAGGTTTGAAAGGATAATCGTTGGA
GAAAGCGAGGGAGAGTCTGTACTCAGTTCCTTGAAACACAGTGTCTTTGCTCCCAGTGAT
TGTTCCTTTCCAGCAAAATATATTGTCTTCCTCTGGGAACGCAGATATACCCGGATCACC
TCCCATCATTAAACCCATTAGTTCAGATTGCAGCCTTTTGAGAACGGAGTGGCTATCGAC
GG
C

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2A532TF 603 0 0
CTT
AATAAAAAGGGTCCTTGATTTGCTAATATAGGCTCGAACTGAGATTACAAAGTAGAAGAA
ACATGATCTATTGAATACAGTGATTCCTCTTTCTTCTGGAAAATCATAATATAGCTGTAC
CAATTACATAGAGGCTTTCGAGAATCATGCGTTCAATGGTTTGTAGAGCTTCTCAACCAT
CTTCCTGTACTCTTTTTGATTGCTCCAAAGCTGAGCTGCTTGATTGTTCAATGGCGAGCT
GATGTTCGGTTCTCCGAGAAGGCTTTGAATCGAGAGTAATAACGTCCTCACATCGTAAGC
CGATGACCATTTATCCTGAAGAATGTCCAAGCAAATATTGCCATAGAGGTCGACATTGGG
ATGGAAGCAGCAAGTCTCGAACTTAACTTTGGGAGGTTTGAAAGGATAATCGTTGGAGAA
AGCGAGGGAGAGTCTGTACTCAGTTCCTTGAAACACAGTGTCTTTGCTCCCAGTGATTGT
TCCTTTCCAGCAGAATATATTGTCTTCCTCTGGGAACGCAGATATACCCGGATCACCTCC
CATCATTAAACCCATTAGTTCAGATTGCAGCCTTTTGAGAACGGAGTGGCTATCGACGG
C

QA 4 602 4 602
DS 

RD RR2A418JQ 757 0 0
AATAAAAAGGGTCCTTGATTTGCTAATATAGGCTCGAACTGAGATTACAAAGTAGAAGAA
ACATGATCTATTGAATGCAGTGATTCCTCTTTCTTCTGGAAAATCATAATATAGCTGTAC
CAATTACATAGAGGATTTCGAGAATCATGCGTTCAATGGTTTGTAGAGCTTCTCAACCAT
CTTCCTGTACTCTTTTTGATTGCTCCAAAGCTGAGCTGCTTGATTGTTCAATGGCGAGCT
GATGTTCGGTTCTCCGAGAAGGCTTTGAATCGAGAGTAATAACGTCCTCACATCGTAAGC
CGATGACCATTTATCCTGAAGAATGTCCAAGCAAATATTGCCATAGAGGTCGACATTGGG
ATGGAAGCAGCGAGTCTCGAACTTAACTTTGGGAGGTTTGAAAGGATAATCGTTGGAGAA
AGCGAGGGAGAGTCTGTACTCAGTTCCTCGAAACACAGTGTCTTTGCTCCCAGTGATTGT
TCCTTTCCAGCAGAATATATTGTCTTCCTCTGGGAACGCAGATATACCCGGATCACCTCC
CATCATTAAACCCATTAGTTCAGATTGCAGCCTTTTGAGAACGGAGTGGCTATCGACGGA
TTTAGCCGGAGGAGCAGGTTGCTTCGATCCGGTGGTTGCAGGCGTTGTCTCCGCCGGAGT
GTTTCCTTGGTGCCCATTTACCGCCGCCATCCCTCGAGAATCGGTGATTTATGAAATCGA
AATTGTTTCCCTCGTGAAGAATTTTGATCAAAAGTAT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2A418TF 757 0 0
AATAAAAAGGGTCCTTGATTTGCTAATATAGGCTCGAACTGAGATTACAAAGTAGAAGAA
ACATGATCTATTGAATGCAGTGATTCCTCTTTCTTCTGGAAAATCATAATATAGCTGTAC
CAATTACATAGAGGATTTCGAGAATCATGCGTTCAATGGTTTGTAGAGCTTCTCAACCAT
CTTCCTGTACTCTTTTTGATTGCTCCAAAGCTGAGCTGCTTGATTGTTCAATGGCGAGCT
GATGTTCGGTTCTCCGAGAAGGCTTTGAATCGAGAGTAATAACGTCCTCACATCGTAAGC
CGATGACCATTTATCCTGAAGAATGTCCAAGCAAATATTGCCATAGAGGTCGACATTGGG
ATGGAAGCAGCGAGTCTCGAACTTAACTTTGGGAGGTTTGAAAGGATAATCGTTGGAGAA
AGCGAGGGAGAGTCTGTACTCAGTTCCTCGAAACACAGTGTCTTTGCTCCCAGTGATTGT
TCCTTTCCAGCAGAATATATTGTCTTCCTCTGGGAACGCAGATATACCCGGATCACCTCC
CATCATTAAACCCATTAGTTCAGATTGCAGCCTTTTGAGAACGGAGTGGCTATCGACGGA
TTTAGCCGGAGGAGCAGGTTGCTTCGATCCGGTGGTTGCAGGCGTTGTCTCCGCCGGAGT
GTTTCCTTGGTGCCCATTTACCGCCGCCATCCCTCGAGAATCGGTGATTTATGAAATCGA
AATTGTTTCCCTCGTGAAGAATTTTGATCAAAAGTAT

QA 1 757 1 757
DS 



CO CL1164Contig2 714 3 3 U
GGAGTCGTACACGTTTTCATAACCCAGAACCTCTCTCTCCAGAAAGAAAAAGGAGAAGAA
GAACGCTCCTTCTCTCCTTTTTATACTTTTGATCAAATTCTTCACGAGGGAGACAATTTC
GATTTCATAAATCACCGATTATCGAGGGATGGCGGCGGTAAATGGACACCAAGGAAATAC
TCCGGCGGAGACAACGCCGGCAGCCACTGGAACGAAGCAACCTGCTCCTCCGGCTAAATC
CGTCGATAGCCAATCCGTTCTCAAAAGGTTGCAATCTGAACTAATGGGTTTAATGATGGG
AGGTGATCCGGGGATATCTGCTTTCCCAGAGGAAGACAACATATTCTGCTGGAAAGGAAC
AATCACTGGAAGCAAAGATACTGTGTTCCAAGGAACTGAGTACAGACTCTCCCTCGCTTT
CTCCAACGATTATCCTTTCAAACCTCCCAAAGTTAAGTTCGAGACTTGCTGCTTCCATCC
CAATGTCGACCTCTATGGCAATATTTGCTTGGACATTCTTCAGGATAAATGGTCATCGGC
TTACGATGTGAGGACGTTATTACTCTCGATTCAAAGCCTTCTCGGAGAACCGAACATCAG
CTCGCCATTGAACAATCAAGCAGCTCAGCTTTGGAGCAATCAAAAAGAGTACAGGAAGAT
GGTTGAGAAGCTCTACAAACCATTGAACGCATGATTCTCCAAAGCCTCTATGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E357TF U 78
AF RR2DK66TF U 82
AF RR2CU60TF U 1
BS 1 331 RR2CU60TF
BS 332 332 RR2E357TF
BS 333 714 RR2CU60TF

RD RR2E357TF 409 0 0
TTTTT
ATACTTTTGATCAAATTCTTCACGAGGGAGACAATTTCGATTTCATCAATCACCGATTAT
CGAGGGATGGCGGCGGTAAATGGACACCAAGGAAATACTCCGGCGGAGACAACGCCGGCA
GCCACTGGAACGAAGCAACCTGCTCCTCCGGCTAAATCCGTCGATAGCCATTCCGTTCTC
AAAAGGTTGCAATCTGAACTAATGGGTTTAATGATGGGAGGTGATCCGGGGATATCTGCT
TTCCCAGAGGAAGACAACATATTCTGCTGGAAAGGAACAATCACTGGAAGCAAAGATACT
GTGTTCCAAGGAACTGAGTACAGACTCTCCCTCGCTTTCTCCAACGATTATCCTTTCAAA
CCTCCCAAAGTTAAGTTCGAGACTTGCTGCTTCCATCCCAATGT

QA 6 409 6 409
DS 

RD RR2DK66TF 483 0 0
G
ATACTTTTGATCAAATTCTTCACGAGGGAGACAATTTCGATTTCATAAATCACCGATTAT
CGAGGGATGGCGGCGGTAAATGGACACCAAGGAAATACTCCGGCGGAGACAACGCCGGCA
GCCACTGGAACGAAGCAACCTGCTCCTCCGGCTAAATCCGTCGATAGCCAATCCGTTCTC
AAAAGGTTGCAATCTGAACTAATGGGTTTAATGATGGGAGGTGATCCGGGGATATCTGCT
TTCCCAGAGGAAGACAACATATTCTGCTGGAAAGGAACAATCACTGGAAGCAAAGATACT
GTGTTCCAAGGAACTGAGTACAGACTCTCCCTCGCTTTCTCCAACGATTATCCTTTCAAA
CCTCCCAAAGTTAAGTTCGAGACTTGCTGCTTCCATCCCAATGTCGACCTCTATGGCAAT
ATTTGCTTGGACATTCTTCAGGATAAATGGTCATCGGCTTACGATGTGAGGACGTTATTA
CT

QA 2 483 2 483
DS 

RD RR2CU60TF 714 0 0
GGAGTCGTACACGTTTTCATAACCCAGAACCTCTCTCTCCAGAAAGAAAAAGGAGAAGAA
GAACGCTCCTTCTCTCCTTTTTATACTTTTGATCAAATTCTTCACGAGGGAGACAATTTC
GATTTCATAAATCACCGATTATCGAGGGATGGCGGCGGTAAATGGACACCAAGGAAATAC
TCCGGCGGAGACAACGCCGGCAGCCACTGGAACGAAGCAACCTGCTCCTCCGGCTAAATC
CGTCGATAGCCAATCCGTTCTCAAAAGGTTGCAATCTGAACTAATGGGTTTAATGATGGG
AGGTGATCCGGGGATATCTGCTTTCCCAGAGTAAGACAACATATTCTGCTGGAAAGGAAC
AATCACTGGAAGCAAAGATACTGTGTTCCAAGGAACTGAGTACAGACTCTCCCTCGCTTT
CTCCAACGATTATCCTTTCAAACCTCCCAAAGTTAAGTTCGAGACTTGCTGCTTCCATCC
CAATGTCGACCTCTATGGCAATATTTGCTTGGACATTCTTCAGGATAAATGGTCATCGGC
TTACGATGTGAGGACGTTATTACTCTCGATTCAAAGCCTTCTCGGAGAACCGAACATCAG
CTCGCCATTGAACAATCAAGCAGCTCAGCTTTGGAGCAATCAAAAAGAGTACAGGAAGAT
GGTTGAGAAGCTCTACAAACCATTGAACGCATGATTCTCCAAAGCCTCTATGTA

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 6

CO CL1165Contig1 1197 6 18 U
GGAATGAGCAAATCATTTACATTTTCTGAGAAAAGTCTCTCATCAATGGCCGAGATCTCT
GGTATTACTGTTCGAACACAAACTACCATCTTAAACATCGAAGATGGTGGATCCAGTGGT
GATTCCCGGTCACCAGATTCTCCCTATCCTCTTATATCCATATCCTTCATTCAAAAGTTG
ATTGGTGAGTTCGTGGGGACATTCTCTCTGGTATTTGCGGGCTGCTCGGCAATCGTGGTA
AATGATACGTACGGTGAGAAGGTGACACTTCCTGGCATAGCTTTGGCATGGGGTCTAACC
GTAATGGTTATGACCTACTCACTTGGTCATGTATCGGGTGCACATTTCAACCCTGCTGTT
TCCATTGCGCTTGCTTCTTCTAGAAAGTTTCCTTTTAAACAGGTTCCGATGTATATTTCT
GCTCAACTTCTCGGATCAACCTTGGCGGCCGAAGCTCTCAAGCTCATGTTCCATCTGAAT
AGCGACGTTTGTAGCCTTAAAGGCGATATTTATGTTGGAACACACCCTTCAGGTTCCAAC
ATAGCGACATTCGTAGTGGAATTCATCGCTACTTTCAACTTGTTGTTTATTATCTCGGCT
GTAGCTACTGATAAAAGAGCAAACAGATCATTTGCAGGCGTTGCTATTGGTGCAACCGTA
GTACTCGACATCTTGTTCAGCGGGCCAATCTCAGGAGCATCAATGAATCCAGCAAGAAGC
TTGGCTCCTGCTTATAT*ATGGGGATGTTATAAGGATTTATGGTTATACATAGTTTCACC
GGTTATCGGAGCATTGGCAGGTGCATGGACTTATAATATATTACGGTCTACAAATAAATC
ATATGGTGAGATAATACGCCGAAATTGCAATAAAGTTTCTTCGAACGATCGTCAAGAACC
ATCTCAAGACGATTTCTGTATTTTTCGAGTGGTTGATCCGGATAACCGGAAAGTTTTCAT
ACTTTCTTCCCCCACTGACATTAACGACACATGTAATGTCACATGCAAGTTGGCGTAAAA
GAGGAAAAGACAGATGTGTTGCAACAATATTTCATATAAGTCAGATTTCTGGCCGCAAAG
TTGTATGAAAAAAAAA*CTGAATTGTTTAGAAGTAATTTCCTAAAATGTTATATGGCAAA
ATTGAACAAATGTAAACAAAAATAAAATGGGCCAAAAAATGCTTTTTCTAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H690TF U 27
AF RR2GL40TF U 1
AF RR2CO18TF U 144
AF RR2GO52JQ C 445
AF RR2CO18JQ C 535
AF RR2GL40JQ C 597
BS 1 198 RR2GL40TF
BS 199 199 RR2H690TF
BS 200 253 RR2GL40TF
BS 254 254 RR2H690TF
BS 255 694 RR2GL40TF
BS 695 695 RR2CO18TF
BS 696 714 RR2GL40TF
BS 715 737 RR2CO18TF
BS 738 738 RR2GO52JQ
BS 739 800 RR2CO18TF
BS 801 801 RR2GO52JQ
BS 802 820 RR2CO18TF
BS 821 1095 RR2GO52JQ
BS 1096 1096 RR2CO18JQ
BS 1097 1157 RR2GO52JQ
BS 1158 1175 RR2CO18JQ
BS 1176 1176 RR2GL40JQ
BS 1177 1197 RR2CO18JQ

RD RR2H690TF 607 0 0
TGAGAAAAGTCTCTCATCAATGGCCGAGATCTCTGGTATTACTGTTCGAACACAAACTAC
CATCTTAAACATCGAAGATGGTGGATCCAGTGGTGATTCCCGGTCACCAGATTCTCCCTA
TCCTCTTATATCCATATCCTTCATTCAAAAGTTGATTGGTGAGTTCGTGGGGACATTCTC
TCTGGTATTTGCGGGCTGCTCGGCAATCGTGGTAAATGATACGTACGGTGAGAAGGTGAC
ACTTCCTGGCATAGCTTTGGCATGGGGTCTAACCGTAATGGTTATGACCTACTCACTTGG
TCACGTATCGGGTGCACATTTCAACCCTGCTGCTTCCATTGCGCTTGCTTCTTCTAGAAA
GTTTCCTTTTAAACAGGTTCCGATGTATATTTCTGCTCAACTTCTCGGATCAACCTTGGC
GGCCGAAGCTCTCAAGCTCATGTTCCATCTGAATAGCGACGTTTATAGCCTTAAAGGCGA
TATTTATGTTGGAACACACCCTTCAGGTTCCAACATAGCGACATTCGTAGTGGAATTCAT
CGCTACTTTCAACTTGTTGTTTATTATCTCGGCTGTAGCTACTGATAAAAGAGCAAACAG
ATCATTT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2GL40TF 728 0 0
GGAATGAGCAAATCATTTACATTTTCTGAGAAAAGTCTCTCATCAATGGCCGAGATCTCT
GGTATTACTGTTCGAACACAAACTACCATCTTAAACATCGAAGATGGTGGATCCAGTGGT
GATTCCCGGTCACCAGATTCTCCCTATCCTCTTATATCCATATCCTTCATTCAAAAGTTG
ATTGGTGAGTTCGTGGGGGCATTCTCTCTGGTATTTGCGGGCTGCTCGGCAATCGTGGTA
AATGATACGTACGATGAGAAGGTGACACTTCCTGGCATAGCTTTGGCATGGGGTCTAACC
GTAATGGTTATGACCTACTCACTTGGTCATGTATCGGGTGCACATTTCAACCCTGCTGTT
TCCATTGCGCTTGCTTCTTCTAGAAAGTTTCCTTTTAAACAGGTTCCGATGTATATTTCT
GCTCAACTTCTCGGATCAACCTTGGCGGCCGAAGCTCTCAAGCTCATGTTCCATCTGAAT
AGCGACGTTTGTAGCCTTAAAGGCGATATTTATGTTGGAACACACCCTTCAGGTTCCAAC
ATAGCGACATTCGTAGTGGAATTCATCGCTACTTTCAACTTGTTGTTTATTATCTCGGCT
GTAGCTACTGATAAAAGAGCAAACAGATCATTTGCAGGCGTTGCTATTGGTGCAACCGTA
GTACTCGACATCTTGTTCAGCGGGCCAATCTCAG*AGCATCAATGAATCCAGCA
GAAGCTGGCTCTGC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2CO18TF 677 0 0
CTATCCTCTTATATCCATATCCTTCATTCAAAAGTTGATTGGTGAGTTCGTGGGGACATT
CTCTCTGGTATTTGCGGGCTGCTGGGCAATCGTGGTAAATGATACGTACGGTGAGAAGGT
GACACTTCCTGGCATAGCTTTGGCATGGGGTCTAACCGTAATGGTTATGACCTACTCACT
TGGTCATGTATCGGGTGCACATTTCAACCCTGCTGTTTCCATTGCGCTTGCTTCTTCCAG
AAAGTTTCCTTTTAAACAGGTTCCGATGTATATTTCTGCTCAACTTCTCGGATCAACCTT
GGCGGCCGAAGCTCTCAAGCTCATGTTCCATCTGAATAGCGACGTTTGTAGCCTTAAAGG
CGATATTTATGTTGGAACACACCCTTCAGGTTCCAACATAGCGACATTCGTAGTGGAATT
CATCGCTACTTTCAACTTGTTGCTTATTATCTCGGCTGTAGCTACTGATAAAAGAGCAAA
CAGATCATTTGCAGGCGTTGCTATTGGTGCAACCGTAGTACTCGACATCTTGTTCAGCGG
GCCAATCTCAGGAGCATCAATGAATCCAGCAAGAAGCTTGGCTCCTGCTTATATTATGGG
GATGTTATAAGGATTTATGGTTATACATAGTTTCACCGGTTATCGGAGCATTGGCAG*TG
CATGGACTTATAATATA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2GO52JQ 714 0 0
GCGGCCGAAGCTCTCAAGCTCATGTTCCATCTGAATAGCGACGTTTGTAGCCTTAAAGGC
GATATTTATGTTGGAACACACCCTTCAGGTTCCAACATAGCGACATTCGTAGTGGAATTC
ATCGCTACTTTCAACTTGTTGTTTATTATCTCGGCTGTAGCCACTGATAAAAGAGCAAAC
AGATCATTTGCAGGCGTTGCTATTGGTGCAACCGTAGTACTCGACATCTTGTTCAGCGGG
CCAATCTCAGGAGCATCAATGAATCCAGCAAGAAGCTTGGCTCCTGCTTATAT*ATGGGG
ATGTTATAAGGATTTATGGTTATACATAGTTTCACCGGTTATCGGAGCATTGGCAGGTGC
ATGGACTTATAATATATTACGGTCTACAAATAAATCATATGGTGAGATAATACGCCGAAA
TTGCAATAAAGTTTCTTCGAACGATCGTCAAGAACCATCTCAAGACGATTTCTGTATTTT
TCGAGTGGTTGATCCGGATAACCGGAAAGTTTTCATACTTTCTTCCCCCACTGACATTAA
CGACACATGTAATGTCACATGCAAGTTGGCGTAAAAGAGGAAAAGACAGATGTGTTGCAA
CAATATTTCATATAAGTCAGATTTCTGGCCGCAAAGTTGTATGAAAAAAAA**CTGAATT
GTTTAGAAGTAATTTCCTAAAATGTTATATGGCAAAATTGAACAAATGTAAAC
G

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2CO18JQ 663 0 0
TCCAACATAGCGACATTCGTAGTGGAATTCATCGCTACTTTCAACTTGTTGCTTATTATC
TCGGCTGTAGCTACTGATAAAAGAGCAAACAGATCATTTGCAGGCGTTGCTATTGGTGCA
ACCGTAGTACTCGACATCTTGTTCAGCGGGCCAATTTCAGGAGCATCAATGAATCCAGCA
AGAAGCTTGGCTCCTGCTTATAT*ATGGGGATGTTATAAGGATTTATGGTTATACATAGT
TTCACCGGTTATCGGAGCATTGGCAGGTGCATGGACTTATAATATATTACGGTCTACAAA
TAAATCATATGGTGAGATAATACGCCGAAATTGCAATAAAGTTTCTTCGAACGATCGTCA
AGAACCATCTCAAGACGATTTCTGTATTCTTCGAGTGGTTGATCCGGATAACCGGAAAGT
TTTCATACTTTCTTCCCCCACTGACATTAACGACACATGTAATGTCACATGCAAGTTGGC
GTAAAAGAGGAAAAGACAGATGTGTTGCAACAATATTTCATATAAGTCAGATTTCTGGCC
GCAAAGTTGTATGAAAAAAAAAACTGAATTGTTTAGAAGTAATTTCCTAAAATGTTATAT
GGCAAAATTGAACAAATGTAAACAAAAATAAAATGGGCCAAGAAATGCTTTTTCTAAAAA
AAA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2GL40JQ 595 0 0
GGCTGTAGCTACTGATAAAAGAGCAAACAGATCATTTGCAGGCGTTGCTATTGGTGCAAC
CGTAGTACTCGACATTTTGTTCAGCGGGCCAATTTCAGGAGCATCAATGAATCCAGCAAG
AAGCTTGGCTCCTGCTTATAT*ATGGGGATGTTATAAGGATTTATGGTTATACATAGTTT
CACCGGTTATCGGAGCATTGGCAGGTGCATGGACTTATAATATATTACGGTTTACAAATA
AATCATATGGTGAGATAATACGCCGAAATTGCAATAAAGTTTTTTCGAACGATCGGCAAG
AACCATCTCAAGACGATTTTTGTATTTTTCGAGTGGTTGATCCGGATAACCGGAAAGTTT
TCATACTTTCTTCCCCCACTGACATTAACGACACATGTAATGTCACATGCAAGTTGGCGT
AAAAGAGGAAAAGACAGATGTGTTGCAACAATATTTCATATAAGTCAGATTTCTGGCCGC
AAAGTTGTATGAAAAAAAAA*CTGAATTGTTTAGAAGTAATTTCCTAAAATGTTATATGG
CAAAATTGAACAAATGTAAACAAAAATAAAATGGGCCTAAGAATGCTTTTTCTA
G

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 7

CO CL1166Contig1 1804 7 14 U
GGACCGAAGCTTCGAACAGAGCTTCATCAATGGGCTAAAAACAGAGTGACATCATTTGTA
ATTTACGAGAGAGAAAGATGGAGTCATCTCTTTTTCTTCAATCCCACTCTTCTTTCTCGT
CGTGTCTCTTCACAGCAAAGTGTAAACCATTCCCCTCTCCTAAACCCAGACCCGTCTCCA
TCAAAGCCTCCATAGAGAAACCTAAACCGAAACCGAAACCAAAACCCAAATCCGAAACCA
CATCGTGGGTCAGTCCCGATTGGCTCACATCACTCACTCGCACCATAACCTCAGGACAAA
ACGACGATTCAGGTATACCAATCGCGAGCGCGAAGCTCGACGACGTGTCTGAGCTTCTCG
GAGGAGCTCTCTTCTTACCACTGTACAAATGGATGAACGAGTACGGACCCATCTACCGTC
TCGCTGCGGGTCCTCGTAACTTCGTGGTGGTCAGCGATCCAGCGATCGCCAAACACGTTC
TCAGAAACTATCCAAAGTACGCTAAAGGGTTAGTCGCTGAAGTCTCCGAGTTCCTTTTCG
GGTCCGGTTTTGCTATCGCTGAGGGACCTCTTTGGACGGCGAGGAGAAGAGCTGTGGTTC
CGTCTCTTCACAAGAGGTACTTGTCTGTGATTGTGGAGAGAGTGTTCTGCAGATGTGCAC
AGAGGCTTGTTGAGAAACTACAGCCTTATGCATTGGAGGGAAAAGCTGTGAACATGGAAG
ACAAGTTCTCTCAGTTAACTCTCGATGTTATCGGCATATCGCTTTTTAACTTCAACTTTG
ATTCACTCACTACTGATAGTCCTGTGATTGAAGCTGTTTACACTGCTCCCAAAGAAGCTG
AGCTTCGTTCTACTGATATTCTACCCTATTGGAAGATCGATGCATTGTGTAAGATAGTTC
CCAGACAAGTGAAAGCTGAAAAGGCTGTGACTTTGATAAGGGAAACAGTTGAAGACCTCA
TTGCTAAGTGCAAAGAGATTGTGGAAAGAGAAGGAGAAAGAATCAATGACGAAGAGTATG
TGAATGAGTCAGACCCAAGTATCTTGCGGTTCTTGCTTGCAAGCAGGGAAGAGGTGTCAA
GTGTGCAGTTACGGGATGATCTTCTCTCAATGCTTGTTGCAGGTCATGAAACAACTGGTT
CTGTCCTCACTTGGACACTTTATCTCCTAAGTAAGAACCCATCTGCATTGGCGAAAGCAC
AAGAGGAAGTAGACAGAGTTTTGGCGGGAAGAAACCCTGCTTATGAGGATATAAAGGAGT
TGAAGTACATCACTCGTTGTATTAACGAGTCTATGCGTCTCTACCCCCATCCTCCTGTCT
TGATTAGAAGAGCTCAAGTTCCAGACATCCTTCCAGGGAACTACAAGGTTAATACAGGAC
AAGACATTATGATCTCCGTCTATAACGTCCATCGTTCATCCGCGGTGTGGGAGAAAGCTG
AAGAGTTTCTGCCTGAACGTTTCGAGTTAGAAGGACCGATTCCTAACGAAACAAACACAG
ATTTCAAGTTTATACCATTTAGTGGAGGGCCTAGAAAATGTGTAGGTGATCAGTTTGCAT
TGATGGAAGCCATAGTGGCACTTGCGGTGTTTCTCCAGCGCCTAAACGTTGAGCTTGTTC
CTGATCAGACCATCAGCATGACCACTGGAGCTACCATACACACCACTAATGGATTGTATA
TGAAGGTGAGCCAAAGGTAAGCTAGAAATGTGGAAGATGAAGTTTGAATCTGTTTTCATC
TGTATTTTATGATTATTGATTTTTGTTGTTACCATCATGATTCATTGTAGTTACAACTTT
TGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2EB67TF U 1
AF RR2CO56TF U 190
AF RR2A210TF U 103
AF RR2H009TF U 634
AF RR2CO56JQ C 1396
AF RR2A210JQ C 1132
AF RR2EB67JQ C 998
BS 1 372 RR2EB67TF
BS 373 373 RR2A210TF
BS 374 392 RR2EB67TF
BS 393 393 RR2A210TF
BS 394 417 RR2EB67TF
BS 418 733 RR2A210TF
BS 734 1145 RR2H009TF
BS 1146 1146 RR2EB67JQ
BS 1147 1324 RR2H009TF
BS 1325 1325 RR2EB67JQ
BS 1326 1328 RR2H009TF
BS 1329 1329 RR2EB67JQ
BS 1330 1352 RR2H009TF
BS 1353 1804 RR2EB67JQ

RD RR2EB67TF 417 0 0
GGACCGAAGCTTCGAACAGAGCTTCATCAATGGGCTAAAAACAGAGTGACATCATTTGTA
ATTTACGAGAGAGAAAGATGGAGTCATCTCTTTTTCTTCAATCCCACTCTTCTTTCTCGT
CGTGTCTCTTCACAGCAAAGTGTAAACCATTCCCCTCTCCTAAACCCAGACCCGTCTCCA
TCAAAGCCTCCATAGAGAAACCTAAACCGAAACCGAAACCAAAACCCAAATCCGAAACCA
CATCGTGGGTCAGTCCCGATTGGCTCACATCACTCACTCGCACCATAACCTCAGGACAAA
ACGACGATTCAGGTATACCAATCGCGAGCGCGAAGCTCGACGACGTGTCTGAGCTTCTCG
GAGGAGCTCTCT*CTTACCACTGTACAAATGG*TGAACGAGTACGGACCCATCTACC

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR2CO56TF 459 0 0
CCATAGAGAAACCTAAACCGAAACCGAAACCAAAACCCAAATCCGAAACCACATCGTGGG
TCAGTCCCGATTGGCTCACATCACTCACTCGCACCATGACCTCAGGACAAAACGACGATT
CAGGTATACCAATCGCGAGCGCGAAGCTCGACGACGTGTCTGAGCTTCTCGGAGGAGCTC
TCTTCTTACCACTGTACAAATGGATGAACGAGTACGGACCCATCTACCGTCTCGCTGCGG
GTCCTCGTAACTTCGTGGTGGTCAGCGATCCAGCGATCGCCAAACACGTTCTCAGAAACT
ATCCAAAGTACGCTAA*GGGTTAGTCGCTGAAGTCTCCGAGTTCCTTTTCGGGTCCGGTT
TTGCTATCGCTGAGGGACCTCTTTGGACGGCGAGGAGAAGAGCTGTGGTTCCGTCTCTTC
ACAAGAG*TACTTGTCTGTGATTGTGGAGAGAGTGTTCT

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR2A210TF 631 0 0
CCCACTCTTCTTTCTCGTCGTGTCTCTTCACAGCAAAGTGTAAACCATTCCCCTCTCCTA
AACCCAGACCCGTCTCCATCAAAGCCTCCATAGAGAAACCTAAACCGAAACCGAAACCAA
AACCCAAATCCGAAGCCACATCGTGGGTCAGTCCCGATTGGCTCACATCACTCACTCGCA
CCATAACCTCAGGACAAAACGACGATTCAGGTATACCAATCGCGAGCGCGAAGCTCGACG
ACGTGTCTGAGCTTCTCGGAGGAGCTCTCTTCTTACCACTGTACAAATGGATGAACGAGT
ACGGACCCATCTACCGTCTCGCTGCGGGTCCTCGTAACTTCGTGGTGGTCAGCGATCCAG
CGATCGCCAAACACGTTCTCAGAAACTATCCAAAGTACGCTAAAGGGTTAGTCGCTGAAG
TCTCCGAGTTCCTTTTCGGGTCCGGTTTTGCTATCGCTGAGGGACCTCTTTGGACGGCGA
GGAGAAGAGCTGTGGTTCCGTCTCTTCACAAGAGGTACTTGTCTGTGATTGTGGAGAGAG
TGTTCTGCAGATGTGCACAGAGGCTTGTTGAGAAACTACAGCCTTATGCATTGGAGGGAA
AAGCTGTGAACATGGAAGACAAGTTCTCTCA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2H009TF 719 0 0
TGGAGAGAGTGTTCTGCAGATGTGCAGAGAGGCTTGTTGAGAAGCTACAGCCTTATGCAT
TGGAGGGAAAAGCTGTGAACATGGAAGACAAGTTCTCTCAGTTAACTCTCGATGTTATCG
GCATATCGCTTTTTAACTTCAACTTTGATTCACTCACTACTGATAGTCCTGTGATTGAAG
CTGTTTACACTGCTCCCAAAGAAGCTGAGCTTCGTTCTACTGATATTCTACCCTATTGGA
AGATCGATGCATTGTGTAAGATAGTTCCCAGACAAGTGAAAGCTGAAAAGGCTGTGACTT
TGATAAGGGAAACAGTTGAAGACCTCATTGCTAAGTGCAAAGAGATTGTGGAAAGAGAAG
GAGAAAGAATCAATGACGAAGAGTATGTGAATGAGTCAGACCCAAGTATCTTGCGGTTCT
TGCTTGCAAGCAGGGAAGAGGTGTCAAGTGTGCAGTTACGGGATGATCTTCTCTCAATGC
TTGTTGCAGGTCATGAAACAACTGGTTCTGTCTTCACTTGGACACTTTATCTCCTAAGTA
AGAACCCATCTGCATTGGCGAAAGCACAAGAGGAAGTAGACAGAGTTTTGGCGGGAAGAA
ACCCTGCTTATGAGGATATAAAGGAGTTGAAGTACATCACTCGTTGTATTAACGAGTCTA
TGCGTCTCTACCCCCATCCTCCTGTCTTGAT*AGA*GAGCTCAAGTTCCAGACATCCTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2CO56JQ 234 0 0
CCGTCTATAACGTCCATCGTTCATCCGCGGTGTGGGAGAAAGCTGAAGAGTTTCTGCCTG
AACGTTTCGAGTTAGAAGGACCGATTCCTAACGAAACAAACACAGATTTCAAGTTTATAC
CATTTAGTGGAGGGCCTAGAAAATGTGTAGGTGATCAGTTTGCATTGATGGAAGCCATAG
TGGCACTTGCGGTGTTTCTCCAGCGCCTAAACGTTGAGCTTGTTCCCGATCAGA

QA 1 234 1 234
DS 

RD RR2A210JQ 597 0 0
CAACTGGTTCTGTCCTCACTTGGACACTTTATCTCCTAAGTAAGAACCCATCTGCATTGG
CGAAAGCACAAGAGGAAGTAGACAGAGTTTTGGCGGGAAGAAACCCTGCTTATGAGGATA
TAAAGGAGTTGAAGTACATCACTCGTTGTATTAACGAGTTTATGCGTCTCTACCCCCATC
CTCCTGTCTTGATTAGAAGAGCTCAAGTTCCAGACATCCTTCCAGGGAACTACAAGGTTA
ATACAGGACAAGACATTATGATTTCCGTCTATAACGTCCATCGTTCATCCGCGGTGTGGG
AGAAAGCTGAAGAGTTTCTGCCTGAACGTTTCGAGTTAGAAGGACCGATTCCTAACGAAA
CAAACACAGATTTCAAGTTTATACCATTTAGTGGAGGGCCTAGAAAATGTGTAGGTGATC
AGTTTGCATTGATGGAAGCCATAGTGGCACTTGCGGTGTTTTTCCAGCACCTAAACGTTG
AGCTTGTTCCTGATCAGACCATCAGCATGACCACTGGAGCTACCATACACACCATTAATG
GATTGTATATGAAGGTGAGCCAAAGGTAAGCTAGAAATGTGGAAGATGAAGTTTGAA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2EB67JQ 807 0 0
AAGAATCAATGACGAAGAGTATGTGAATGAGTCAGACCCAAGTATCTTGCGGTTCTTGCT
TGCAAGCAGGGAAGAGGTGTCAAGTGTGCAGTTACGGGATGATCTTCTCTCAATGCTTGT
TGCAGGTCATGAAACAACTGGTTCTGTCCTCACTTGGACACTTTATCTCCTAAGTAAGAA
CCCATCTGCATTGGCGAAAGCACAAGAGGAAGTAGACAGAGTTTTGGCGGGAAGAAACCC
TGCTTATGAGGATATAAAGGAGTTGAAGTACACCACTCGTTGTATTAACGAGTCTATGCG
TCTCTACCCCCATCCTCCTGTCTTGATTAGAAGAGCTCAAGTTCCAGACATCCTTCCAGG
GAACTACAAGGTTAATACAGGACAAGACATTATGATCTCCGTCTATAACGTCCATCGTTC
ATCCGCGGTGTGGGAGAAAGCTGAAGAGTTTCTGCCTGAACGTTTCGAGTTAGAAGGACC
GATTCCTAACGAAACAAACACAGATTTCAAGTTTATACCATTTAGTGGAGGGCCTAGAAA
ATGTGTAGGTGATCAGTTTGCATTGATGGAAGCCATAGTGGCACTTGCGGTGTTTCTCCA
GCGCCTAAACGTTGAGCTTGTTCCTGATCAGACCATCAGCATGACCACTGGAGCTACCAT
ACACACCACTAATGGATTGTATATGAAGGTGAGCCAAAGGTAAGCTAGAAATGTGGAAGA
TGAAGTTTGAATCTGTTTTCATCTGTATTTTATGATTATTGATTTTTGTTGTTACCATCA
TGATTCATTGTAGTTACAACTTTTGCT

QA 1 807 1 807
DS 



AS 2 6

CO CL1167Contig1 746 2 7 U
AAAAGGGACGGAATTTTTTGAATAGATAAAAGTGGAAATGATAACTTTTAGTTTAAGAAA
ATGAAGAGCACTCACTTAACAGAATTACACAAATCACCAAAGAAAAATCAAAGACATAAT
CTGGGAAGGCTTTTAAAACTGACTACTTCTGCCTCTTGTAAATCTTAACCAAAAAGGATT
TGAGCACTGCTTGGATTGCTTTACTTTTGTGAGCCTCAATCACTCCAGTCAGCTTCTCGT
AGCTTCTGCTCTCATACTCCTTGAACACTCCCTCAAGGTCAAGCTCTTTGTAAAGCTCCT
TCACTTTAGCAACGTTTGACGGGTCGGGTTTACCGTAATTCTCATATAATATCTCAGTTT
GTTCTTTGCTGCAGCGTTCCAATGCCTTTACCACCAACCAGGAGCATTTGAAGTCTTCTA
TATCCGTTCCTATCTTGCCAAGTGTCTCTGGGTCAGCAAAACAATCCAAATAATCATCCT
GCACTTGGAAGTAGATCCCCATGTCAACAAGAACATTCTTCACATCAATATGGTTTTCCA
AGTTTTCGCCCGCCATAAGTAACGCACAAGCAACAGGGAGATAAAATGAGTAATAAGCAG
TTTTGTATTGGACAATACGCCGGTGGATTGGCAATGAGTACTTGGCCAAATCCTTTTCGC
CTTCAAAGGTGGTGATCAGATCAATCATCTGACCACAAGCTGTTTGCATCTCCACCTCAT
TAAAGAGATCAACGAGGTCAACATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB26JQ U 29
AF RR2C267JQ U 1
BS 1 167 RR2C267JQ
BS 168 168 RR2HB26JQ
BS 169 245 RR2C267JQ
BS 246 246 RR2HB26JQ
BS 247 337 RR2C267JQ
BS 338 338 RR2HB26JQ
BS 339 746 RR2C267JQ

RD RR2HB26JQ 439 0 0
AAAGTGGAAATGATAACTTTTAGTTTAAGAAAATGAAGAGCACTCACTTAACAGAATTAC
ACAAATCACCAAAGAAAAATCAAAGACATAATCTGGGAAGGCTTTTAAAACTGACTACTT
CTGCCTCTTGTAAATCTTAACCAAAAAGGATTTGAGCACTGCTTGGATTGCTTTACTTTT
GTGAGCCTCAATCACTCCAGTCAGCTTCTCGTAGCTTCTGCTCTCATACTCCTTGAACAC
TCCCTCAAGGTCAAGCTCTTTGTAAAGCTCCTTCACTTTAGCAACGTTTGACGGGTCGGG
TTTACCGTAATTCTCATATAATATCTCAGTTTGTTCTTTGCTGCAGCGTTCCAATGCCTT
TACCACCAACCAGGAGCATTTGAAGTCTTCTATATCCGTTCCTATCTTGCCAAGTGTCTC
TGGGTCAGCAAAACAATCC

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2C267JQ 746 0 0
AAAAGGGACGGAATTTTTTGAATAGATAAAAGTGGAAATGATAACTTTTAGTTTAAGAAA
ATGAAGAGCACTCACTTAACAGAATTACACAAATCACCAAAGAAAAATCAAAGACATAAT
CTGGGAAGGCTTTTAAAACTGACTACTTCTGCCTCTTGTAAATCTTAGCCAAAAAGGATT
TGAGCACTGCTTGGATTGCTTTACTTTTGTGAGCCTCAATCACTCCAGTCAGCTTCTCGT
AGCTTTTGCTCTCATACTCCTTGAACACTCCCTCAAGGTCAAGCTCTTTGTAAAGCTCCT
TCACTTTAGCAACGTTTGACGGGTCGGGTTTACCGTAGTTCTCATATAATATCTCAGTTT
GTTCTTTGCTGCAGCGTTCCAATGCCTTTACCACCAACCAGGAGCATTTGAAGTCTTCTA
TATCCGTTCCTATCTTGCCAAGTGTCTCTGGGTCAGCAAAACAATCCAAATAATCATCCT
GCACTTGGAAGTAGATCCCCATGTCAACAAGAACATTCTTCACATCAATATGGTTTTCCA
AGTTTTCGCCCGCCATAAGTAACGCACAAGCAACAGGGAGATAAAATGAGTAATAAGCAG
TTTTGTATTGGACAATACGCCGGTGGATTGGCAATGAGTACTTGGCCAAATCCTTTTCGC
CTTCAAAGGTGGTGATCAGATCAATCATCTGACCACAAGCTGTTTGCATCTCCACCTCAT
TAAAGAGATCAACGAGGTCAACATAG

QA 1 746 1 746
DS 



CO CL1167Contig2 1243 4 9 U
GGAATAAAGGCTCTTCTGCATTTACATCTCAGGCCACCTCCTCGTGGATCCAGTCTCTAT
CATCGTACCCAAAGTAGGCACCTTTCATCCTCCTCTTCAATGGCCGATCTCAAGTCAACC
TTCCTCAACGTCTACTCCACCCTCAAATCCGACCTCCTCCACGACCCTTCCTTCGAATTC
ACCGATGAATCACGTCTCTGGGTCGAAAAGATGTTGGATTACAATGTACCGGGAGGGAAG
CTGAATCGTGGTCTCTCTGTCGTGGACAGCTTCAAGCTTTTGAAGGAAGGTGAAGATTTG
ACCGAGGAAGAGGTTTTCCTCTCGTGTGCTCTTGGTTGGTGCATCGAATGGCTTCAAGCT
TATTTCCTTGTGCTTGATGACATTATGGATAACTCTGTCACTCGACGTGGACAACCTTGC
TGGTTCAGAGTTCCTCAGGTTGGTATGGTTGCCATCAACGATGGGATCTTACTTCGCAAT
CACATCCACAGGATCCTCAAGAAGCACTTCAGGGGAAAGCCTTACTATGTTGACCTCGTT
GATCTCTTTAATGAGGTAGAGATGCAAACAGCTTGCGGCCAGATGATTGATCTGATCACC
ACCTTCGAAGGCGAAAAGGATTTGGCCAAGTACTCATTGCCAATCCACCGGCGTATTGTC
CAATACAAAACTGCTTATTACTCATTTTATCTCCCTGTTGCTTGTGCGTTACTTATGGCT
GGCGAGAACTTGGAAAACCATATTGATGTGAAGAATGTTCTGGTTGACATGGGAATCTAC
TTCCAAGTGCAGGATGATTATCTGGATTGTTTTGCTGACCCAGAGGCACTTGGCAAGATA
GGAACGGATATAGAAGACTTCAAATGCTCCTGGTTGGTGGTAAAGGCATTGGAACGCTGC
AGCAAAGCACAAACTGAGATATTATATGAAAACTACGGTAAACCCGACCCATCAAACGTT
GCTAAAGTGAAGGAGCTTTACAAAGAGCTTGACCTTGAGGGAGTGTTCAAGGAGTATGAG
AGCAAAAGCTACGAGAAGCTGACTGGAGTGATTAGGCTCACAAAAGTAAAGCAATCCAAG
CAGTGCTCAAATCCTTCTTGGCTAAGATCTACAAGAGGCAGAAGTAGTCAGTCTTAAGCC
TTCCCAGATTATGTCTTTGATTCTTCTTTGATGATTTGTGTAATTCTGTTAAGTGCTTTC
ATTTCTTAAACTAAAAAGTTATCATTTCCACTTTTATCTATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 10 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C723TF U 1
AF RR2C267TF U 49
AF RR2E161TF U 1
AF RR2C723JQ C 540
BS 1 609 RR2C723TF
BS 610 610 RR2E161TF
BS 611 667 RR2C723TF
BS 668 751 RR2E161TF
BS 752 752 RR2C723JQ
BS 753 762 RR2E161TF
BS 763 764 RR2C723JQ
BS 765 783 RR2E161TF
BS 784 1243 RR2C723JQ

RD RR2C723TF 667 0 0
GGAATAAAGGCTCTTCTGCATTTACATCTCAGGCCACCTCCTCGTGGATCCAGTCTCTAT
CATCGTACCCAAAGTAGGCACCTTTCATCCTCCTCTTCAATGGCCGATCTCAAGTCAACC
TTCCTCAACGTCTACTCCACCCTCAAATCCGACCTCCTCCACGACCCTTCCTTCGAATTC
ACCGATGAATCACGTCTCTGGGTCGAAAAGATGTTGGATTACAATGTACCGGGAGGGAAG
CTGAATCGTGGTCTCTCTGTCGTGGACAGCTTCAAGCTTTTGAAGGAAGGTGAAGATTTG
ACCGAGGAAGAGGTTTTCCTCTCGTGTGCTCTTGGTTGGTGCATCGAATGGCTTCAAGCT
TATTTCCTTGTGCTTGATGACATTATGGATAACTCTGTCACTCGACGTGGACAACCTTGC
TGGTTCAGAGTTCCTCAGGTTGGTATGGTTGCCATCAACGATGGGATCTTACTTCGCAAT
CACATCCACAGGATCCTCAAGAAGCACTTCAGGGGAAAGCCTTACTATGTTGACCTCGTT
GATCTCTTTAATGAGGTAGAGATGCAAACAGCTTGCGGCCAGATGATTGATCTGATCACC
ACCTTCGAAAGCGAAAAGGATTTGGCCAAGTACTCATTGCCAATCCACCGGCGTATTGTC
CAATACA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2C267TF 691 0 0
GG
CAGTCTCTATCATCGTATCCAAAGTAGGCACCTTTCATCCTCCTCTTCAATGGCCGATCT
CAAGTCAACCTTCCTCAACGTCTACTCCACCCTCAAATCCGACCTCCTCCACGACCCTTC
CTTCGAATTCACCGATGAATCACGTCTCTGGGTCGAAAAGATGTTGGATTACAATGTACC
GGGAGGGAAGCTGAATCGTGGTCTCTCTGTCGTGGACAGCTTCAAGCTTTTGAAGGAAGG
TGAAGATTTGACCGAGGAAGAGGTTTTCCTCTCGTGTGCTCTTGGTTGGTGCATCGAATG
GCTTCAAGCTTATTTCCTTGTGCTTGATGACATTATGGATAACTCTGTCACTCGACGTGG
ACAGCCTTGCTGGTTCAGAGTTCCTCAGGTTGGTATGGTCGCCATCAACGATGGGATTCT
ACTTCGCAATCACATCCACAGGTTTCTCAAGAAGCACTTCAGGGGAAAGCCTTACTATGT
TGACCTCGTTGATCTCTTTAATGAGGTGGAGATGCAAACAGCTTGTGGTCAGATGATTGA
TCTGATCACCACCTTTGAAGGCGAAAAGGATTTGGCCAAGTACTCATTGCCAATCCACCG
GCGTATTGTCCAATACAAAACTGCTTATTACTCATTTTATCTCCCTGTTGCTTGTGCGTT
ACTTATGGCGGGCGAAA
CTTGGAAACCAT

QA 3 679 3 679
DS 

RD RR2E161TF 799 0 0
GGAATAAAGGCTCTTCTGCATTTACATCTCAGGCCACCTCCTCGTGGATCCAGTCTCTAT
CATCGTACCCAAAGTAGGCACCTTTCATCCTCCTCTTCAATGGCCGATCTCAAGTCAACC
TTCCTCAACGTCTACTCCACCCTCAAATCCGACCTCCTCCACGACCCTTCCTTCGAATTC
ACCGATGAATCACGTCTCTGGGTCGAAAAGATGTTGGATTACAATGTACCGGGAGGGAAG
CTGAATCGTGGTCTCTCTGTCGTGGACGGCTTCAAGCTTTTGAAGGAAGGTGAAGATTTG
ACCGAGGAAGAGGTTTTCCTCTCGTGTGCTCTTGGTTGGTGCATCGAATGGCTTCAAGCT
TATTTCCTTGTGCTTGATGACATTATGGATAACTCTGTCACTCGACGTGGACAACCTTGC
TGGATCAGAGTTCCTCAGGTTTGTATGGTTGCCATCAACGATGGGATCTTACTTCGCAAT
CACATCCACAGGATCCTCAAGAAGCACTTCAGGGGAAAGCCTTACTATGTTGACCTCGTT
GATCTCTTTAATGAGGTAGAGATGCAAACAGCTTGCGGCCAGATGATTGATCTGATCACC
ACCTTCGAAGGCGAAAAGGATTTGGCCAAGTACTCATTGCCAATCCACCGGCGTATTGTC
CAATACAAAACTGCTTATTACTCATTTTATCTCCCTGTTGCTTGTGCGTTACTTATGGCT
GGCGAGAACTTGGAAAACCATATTGATGTGA*GAATGTTCTG**TGACATGGGAATCTAC
TTC
AAGTGCAGATGATATC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2C723JQ 704 0 0
TGATCTCTTTAATGAGGTAGAGATGCAAACAGCTTGCGGCCAGATGATTGATCTGATCAC
CACCTTCGAAGGCGAAAAGGATTTGGCCAAGTACTCATTGCCAATCCACCGGCGTATTGT
CCAATACAAAACTGCTTATTACTCATTTTATCTCCCTGTTGCTTGTGCGTTACTTATGGC
TGGCGAGAACTTGGAAAACCATATTGATGTGAAGAATGTTCTTGTTGACATGGGAATCTA
CTTCCAAGTGCAGGATGATTATCTGGATTGTTTTGCTGACCCAGAGGCACTTGGCAAGAT
AGGAACGGATATAGAAGACTTCAAATGCTCCTGGTTGGTGGTAAAGGCATTGGAACGCTG
CAGCAAAGCACAAACTGAGATATTATATGAAAACTACGGTAAACCCGACCCATCAAACGT
TGCTAAAGTGAAGGAGCTTTACAAAGAGCTTGACCTTGAGGGAGTGTTCAAGGAGTATGA
GAGCAAAAGCTACGAGAAGCTGACTGGAGTGATTAGGCTCACAAAAGTAAAGCAATCCAA
GCAGTGCTCAAATCCTTCTTGGCTAAGATCTACAAGAGGCAGAAGTAGTCAGTCTTAAGC
CTTCCCAGATTATGTCTTTGATTCTTCTTTGATGATTTGTGTAATTCTGTTAAGTGCTTT
CATTTCTTAAACTAAAAAGTTATCATTTCCACTTTTATCTATCC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 7

CO CL1168Contig1 755 7 4 U
GAAGAGGATACATTACTCATTTATGAATATTTTTGAAAATTCGAACTGACTAGAAATGGA
GATTCGGAGGTAATAATAAATGATTTAAGACACAATAAAATATCCGAAAAAAGAACCAAT
CACTTTTGCTTTTTGGACAGAACAAAATTAATAAAATATTCAATAATTGCCATTTTCACA
TGATAGCACCGACGACGACAGCGCAGGCCAGCGAAGCAACGACGGTGGAAAATTGCAGCG
ACGAAGAAGAAGATTTCTGAGAGAGTGGGATAGATCCAAATGCGTTTTGGTAAGAGGGAG
CATCGGCATCGGCAGAAGACGAGGGAGACAAGGCGTCTGCTTCGGCGGAGTAAGTGCCGA
CGGAGACAATGAGCTTCTGGTACTTTAGACAGTGGCCAGGCTGTCCGCTGGTGAAGTAAA
AGGTTCCGTTTTGGGTGAGGTTGAAGAGAGAGTTGCCGTCGTTCATGTACAAGATTGGAT
CTTTGGTGTTGCAGCTCTTGAAGTTGGAAGGTGTCACTTGAATCATTGAATCTTCGCTTG
GTGGGTACAAGAACAAGAGGGAGTCGCCGATCTTGAAAGAATGAGATTTGGGCCATTTGG
TGTAGACTTTAGCATCAACCGGGATACCCCATGAGTCCAAGTTCCCAACTTTGTACTGCG
TCGAAGATACTTGCACTAACAGTATCATCACCAAAACCATTACGCTGCTCAAACTCATCA
TTCCCATCTCTCCCTCTTTCTCTTGTCCTGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 

AF RR2C459JQ U 279
AF RR2AW49JQ U 250
AF RR2EP55JQ U 1
AF RR2C459TF C 47
AF RR2EP55TF C 9
AF RR2FF87TF C 57
AF RR2FF87JQ U 65
BS 1 583 RR2EP55JQ
BS 584 584 RR2FF87JQ
BS 585 754 RR2EP55JQ
BS 755 755 RR2EP55TF

RD RR2C459JQ 167 0 0
AATGCGTTTTGGTAAGAGGGAGCATCGGCATCGGCAGAAGACGAGGGAGACAAGGCGTCT
GCTTCGGCGGAATAAGTGCCGACGGAAACAATGAGCTTCTGGTACTTTAAACAGTGGCCA
GGCTGTCCGCTGGTGAAGTAAAAGGTTCCGTTTTGGGTGAGGTTGAA

QA 1 167 1 167
DS 

RD RR2AW49JQ 241 0 0
AAA
ATTTCTGAGAGAGTGGGATGGATCCAAATGCATTTTGGTAAGAGGGAGCATCGGCATCGG
CAGAAGAGGAAGGAGACAAGGCGTCTGCTTCGGCGGAATAAGTGCCGACGGAGACAATGA
GCTTCTGGTACTTTAGACAGTGGCCAGGTTGTCCGCTGGTGAAGTAAAAGGTTCCGTTTT
GGGTGAGGTTGAAGAGAGAGTTGCCGTCGTTCATGTACAAGATTGGATCTTTGGTGTT

QA 4 241 4 241
DS 

RD RR2EP55JQ 754 0 0
GAAGAGGATACATTACTCATTTATGAATATTTTTGAAAATTCGAACTGACTAGAAATGGA
GATTCGGAGGTAATAATAAATGATTTAAGACACAATAAAATATCCGAAAAAAGAACCAAT
CACTTTTGCTTTTTGGACAGAACAAAATTAATAAAATATTCAATAATTGCCATTTTCACA
TGATAGCACCGACGACGACAGCGCAGGCCAGCGAAGCAACGACGGTGGAAAATTGCAGCG
ACGAAGAAGAAGATTTCTGAGAGAGTGGGATAGATCCAAATGCGTTTTGGTAAGAGGGAG
CATCGGCATCGGCAGAAGACGAGGGAGACAAGGCGTCTGCTTCGGCGGAGTAAGTGCCGA
CGGAGACAATGAGCTTCTGGTACTTTAGACAGTGGCCAGGCTGTCCGCTGGTGAAGTAAA
AGGTTCCGTTTTGGGTGAGGTTGAAGAGAGAGTTGCCGTCGTTCATGTACAAGATTGGAT
CTTTGGTGTTGCAGCTCTTGAAGTTGGAAGGTGTCACTTGAATCATTGAATCTTCGCTTG
GTGGGTACAAGAACAAGAGGGAGTCGCCGATCTTGAAAGAATGGGATTTGGGCCATTTGG
TGTAGACTTTAGCATCAACCGGGATACCCCATGAGTCCAAGTTCCCAACTTTGTACTGCG
TCGAAGATACTTGCACTAACAGTATCATCACCAAAACCATTACGCTGCTCAAACTCATCA
TTCCCATCTCTCCCTCTTTCTCTTGTCCTGATTC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2C459TF 710 0 0
TGACTAGAAATGGAGATTCGGAGGTAATAATAAATGATTTAAGACACAATAAAATATCCG
AAAAAAGAACCAATCACTTTTGCTTTTTGGACAGAACAAAATTAATAAAATATTCAATAA
TTGCCATTTTCACATGATAGCACCGACGACGACAGCGCAGGCCAGCGAAGCAACGACGGT
GGAAAATTGCAGCGACGAAGAAGAAGATTTCTGAGAGAGTGGGATAGATCCAAATGCGTT
TTGGTAAGAGGGAGCATCGGCATCGGCAGAAGACGAGGGAGACAAGGCGTCTGCTTCGGC
GGAGTAAGTGCCGACGGAGACAATGAGCTTCTGGTACTTTAGACAGTGGCCAGGCTGTCC
GCTGGTGAAGTAAAAGGTTCCGTTTTGGGTGAGGTTGAAGAGAGAGTTGCCGTCGTTCAT
GTACAAGATTGGATCTTTGGTGTTGCAGCTCTTGAAGTTGGAAGGTGTCACTTGAATCAT
TGAATCTTCGCTTGGTGGGTACAAGAACAAGAGGGAGTCGCCGATCTTGAAAGAATGAGA
TTTGGGCCATTTGGTGTAGACTTTAGCATCAACCGGGATACCCCATGAGTCCAAGTTCCC
AACTTTGTACTGCGTCGAAGATACTTGCACTAACAGTATCATCACCAAAACCATTACGCT
GCTCAAACTCATCATTCCCATATCTCCCTCTTTCTCTTGTCCTGATT
GCC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2EP55TF 747 0 0
TACATTACTCATTTATGAATATTTT*GAAAATTCGAACTGACTAGAAATGGAGATTCGGA
GGTAATAATAAATGATTTAAGACACAATAAAATATCCGAAAAAAGAACCAATCACTTTTG
CTTTTTGGACAGAACAAAATTAATAAAATATTCAATAATTGCCATTTTCACATGATAGCA
CCGACGACGACAGCGCAGGCCAGCGAAGCAACGACGGTGGAAAATTGCAGCGACGAAGAA
GAAGATTTCTGAGAGAGTGGGATAGATCCAAATGCGTTTTGGTAAGAGGGAGCATCGGCA
TCGGCAGAAGACGAGGGAGACAAGGCGTCTGCTTCGGCGGAGTAAGTGCCGACGGAGACA
ATGAGCTTCTGGTACTTTAGACAGTGGCCAGGCTGTCCGCTGGTGAAGTAAAAGGTTCCG
TTTTGGGTGAGGTTGAAGAGAGAGTTGCCGTCGTTCATGTACAAGATTGGATCTTTGGTG
TTGCAGCTCTTGAAGTTGGAAGGTGTCACTTGAATCATTGAATCTTCGCTTGGTGGGTAC
AAGAACAAGAGGGAGTCGCCGATCTTGAAAGAATGGGATTTGGGCCATTTGGTGTAGACT
TTAGCATCAACCGGGATACCCCATGAGTCCAAGTTCCCAACTTTGTACTGCGTCGAAGAT
ACTTGCACTAACAGTATCATCACCAAAACCATTACGCTGCTCAAACTCATCATTCCCATC
TCTCCCTCTTTCTCTTGTCCTGATTCC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2FF87TF 699 0 0
TTTTTT
TTCGGAGGTAATAATAAATGATTTAAGACACAATAAAATATCCGAAAAAAGAACCAATCA
CTTTTGCTTTTTGGACAGAACAAAATTAATAAAATATTCAATAATTGCCATTTTCACATG
ATAGCACCGACGACGACAGCGCAGGCCGGCGAAGCAACGACGGTGGAGAATCGCAGCGAC
GAAGAAGAAGATTTCTGAGAGAGTGGGATAGATCCAAATGCGTTATGGTAAGAGGGAGCA
TCGGCATCGGCAGAAGACGAAGGAGACAAGGCGTCTGCTTCGGCGGAGTAAGTGCCGACG
GAGACAATGAGCTTCTGGTACTTTTGACAGTGGCCAGGCTGTCCGCTGGTGAAGTAAAAG
GTTCCGTTTTGGGTGAGGTTGAAGAGAGAGTTGCCGTCGTTCATGTACAAGATTGGATCT
TTGGTGTTGCAGCTCTTGAAGTTGGAAGGTGTCACTTGAATCATTGAATCTTCGCTTGGT
GGATACAAGAACAAGAGGGAGTCACCGATCTTGAAAGAGTGAGATTTGGGCCATTTGGAA
TAGACTTTAGAATCAACCGGGATACCCCATGAGTCCAAGTTCCCAACTTTGTACTGCGTC
GAAGATACTTGCACTAACAGTATCATCACCAAAACCATTACGCTGCTCAAACTCATCATT
CCCATCTCTCCCTCTTTCTCTAGTCCTGATTC
C

QA 7 698 7 698
DS 

RD RR2FF87JQ 691 0 0
CGGAGGTAATAATAAATGATTTAAGACACAATAAAATATCCGAAAAAAGAACCAATCACT
TTTGCTTTTTGGACAGAACAAAATTAATAAAATATTCAATAATTGCCATTTTCACATGAT
AGCACCGACGACGACAGCGCAGGCCGGCGAAGCAACGACGGTGGAGAATCGCAGCGACGA
AGAAGAAGATTTCTGAGAGAGTGGGATAGATCCAAATGCGTTATGGTAAGAGGGAGCATC
GGCATCGGCAGAAGACGAAGGAGACAAGGCGTCTGCTTCGGCGGAGTAAGTGCCGACGGA
GACAATGAGCTTCTGGTACTTTTGACAGTGGCCAGGCTGTCCGCTGGTGAAGTAAAAGGT
TCCGTTTTGGGTGAGGTTGAAGAGAGAGTTGCCGTCGTTCATGTACAAGATTGGATCTTT
GGTGTTGCAGCTCTTGAAGTTGGAAGGTGTCACTTGAATCATTGAATCTTCGCTTGGTGG
ATACAAGAACAAGAGGGAGTCACCGATCTTGAAAGAGTGAGATTTGGGCCATTTGGAATA
GACTTTAGAATCAACCGGGATACCCCATGAGTCCAAGTTCCCAACTTTGTACTGCGTCGA
AGATACTTGCACTAACAGTATCATCACCAAAACCATTACGCTGCTCAAACTCATCATTCC
CATCTCTCCCTCTTTCTCTAGTCCTGATTC
C

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 4

CO CL1169Contig1 1286 4 8 U
CGAGCAGGGACCAAACTACTAGAATGAAAACAGAGTTACATCTTTTAATGAAAAACGTAA
GTTGACATAATTTTTGATCATTTACAGAGACGTCAGAGGATAGTATCATTTTTGTTTTTG
TTTTTGTTTCTTCTCGTTTCTCCATCAGACAAAAACTACTTACACTAGAGAGACAGACAT
ACATGTCAAGAGGGAAGAAAGAAGTAGTAAAGATGATATGTGATGAAACATTGTGAGGTA
GACTCACCAATCTCTCAGCATTCACATCTCTTTGCTAATGTTTTCTTTACTCCTCTCACA
ATCTTACCGAACCATATCAAGTTCATGACACCAAGCGCAGCTGGTACCCCAAATACCAGA
GCGTATCCGAAGATGTGCATCCTCATGACCTGGTTGTAGTGCAGATAGACATGATAAAAC
ATGTATATGAATAGAAGAATTCTAGCAACCAGCCAAGCCAAGAAGATGAAAACGCCATTG
ACAACATAAGCCATTGACTTCTTCATACCAGCTGTGTCCAGGTACCATCTCAAGTTGATC
TCTGGGGTTGTAATCTCAGAGATGAGGACCATGTATGTATACAACTGTCCTTCCCCAGAA
AACAAGGAGTAGGCAACAGCTACCCCCGAGAGCGAGTGATGGACAATATACTCAAGTCCA
CCCAAAGAAGGATATTTCCAGAAGATCATCCCAAGATCAGCAATGAAGTAACCAATGGAT
AACCCTAAACCAAGAGAGGAAAGACGTGAGCTGCGGAAGACAACAAGATCATTGTGCCAC
CTATCAGAAAAGAGATCGGACCAGAAGACAAAGTAGAGGGACATTGCGGAGATAAAGATA
GCATGAACCGTCGAGATACCACGGTTGTTCCATTCGATACGTTGAATCTTGGTGAGGATG
ATATAGGTCTTGGAATGGGAGTTGCTGATGAAGTGACAAAGATCATAGACCACTTTGCAG
AGGAACATGCCGGTGAGAATAGAAGTGTAAGGAATAAAAGGATCAGCCAAGAGATAGTTG
TTAACCAAATGCTGCGCTTGATGATGATAAGCCTTTATCGCACCAATCGTTTGCAAAGAA
GTCGACGACATTGCAGAGATTATTATTATTTTATTTATTTTGATTTTTGATTTACCGATT
CCTCATCTCATCATTCGCCACACCACCCTCGTGTAGGGGAAAATATCTCGGAGAAATGGA
CGCAAAGGAAGAGAGGATCAGCGGCGAGAAAAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAAA
GGAAGCAGCCAAGCTTTGGCTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY71JQ U 1
AF RR2G322JQ U 21
AF RR2GY64JQ U 47
AF RR2GY64TF C 594
BS 1 60 RR2DY71JQ
BS 61 61 RR2G322JQ
BS 62 316 RR2DY71JQ
BS 317 317 RR2G322JQ
BS 318 439 RR2DY71JQ
BS 440 754 RR2G322JQ
BS 755 797 RR2GY64JQ
BS 798 1286 RR2GY64TF

RD RR2DY71JQ 439 0 0
CGAGCAGGGACCAAACTACTAGAATGAAAACAGAGTTACATCTTTTAATGAAAAACGTAA
ATTGACATAATTTTTGATCATTTACAGAGACGTCAGAGGATAGTATCATTTTTGTTTTTG
TTTTTGTTTCTTCTCGTTTCTCCATCAGACAAAAACTACTTACACTAGAGAGACAGACAT
ACATGTCAAGAGGGAAGAAAGAAGTAGTAAAGATGATATGTGATGAAACATTGTGAGGTA
GACTCACCAATCTCTCAGCATTCACATCTCTTTGCTAATGTTTTCTTTACTCCTCTCACA
ATCTTACCGAACCATACCAAGTTCATGACACCAAGCGCAGCTGGTACCCCAAATACCAGA
GCGTATCCGAAGATGTGCATCCTCATGACCTGGTTGTAGTGCAGATAGACATGATAAAAC
ATGTATATGAATAGAAGAA

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2G322JQ 734 0 0
G
GAATGAAAACAGAGTTACATCTTTTAATGAAAAACGTAAGTTGACATAATTTTTGATCAT
TTACAGAGACGTCAGAGGATAGTATCATTTTTGTTTTTGTTTTTGTCTCTTCTCGTTTCT
CCATCAGACAAAAACTACTTACACTAGAGAGACAGACATACATGTCAAGAGGGAAGAAAG
AAGTAGTAAAGATGATATGTGATGAAACATTGTGAGGTAGACTCACCAATCTCTCAGCAT
TCACATCTCTTTGCTAATGTTTTCTTTACTCCTCTCACAATCTTACCGAACCATATCAAG
TTCATGACACCAAGCGCAGCTGGTACCCCAAATACCAGAGCGTATCCGAAGATGTGCATC
CTCATGACCTGGTTGTAGTGCAGATAGACATGATAAAACATGTATATGAATAGAAGAATT
CTAGCAACCAGCCAAGCCAAGAAGATGAAAACGCCATTGACAACATAAGCCATTGACTTC
TTCATACCAGCTGTGTCCAGGTACCATCTCAAGTTGATCTCTGGGGTTGTAATCTCAGAG
ATGAGGACCATGTATGTATACAACTGTCCTTCCCCAGAAAACAAGGAGTAGGCAACAGCT
ACCCCCGAGAGCGAGTGATGGACAATATACTCAAGTCCACCCAAAGAAGGATATTTCCAG
AAGATCATCCCAAGATCAGCAATGAAGTAACCAATGGATAACCCTAAACCAAGAGAGGAA
AGACGTGAGCTGC

QA 2 734 2 734
DS 

RD RR2GY64JQ 751 0 0
AATGAAAAACGTAAGTTGACATAATTTTTGATCATTTACAGAGACGTCAGAGGATAGTAT
CATTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTCTTCTCGTCTCTCCATCAGACAAAAACTACTTACACT
AGAGAGACAGACATACATGTCAAGAGGGAAGAAAGAAGCAGTAAAGATGATATGTGATGA
AACATTGTGAGGTAGACTCACCAATCTCTCAGCATTCACATCTCTTTGCTAATGTTTTCT
TTACTCCTCTCACAATCTTACCGAACCATATCAAGTTCATGACACCAAGCGCAGCTGGTA
CCCCAAATACCAGAGCGTATCCGAAGATGTGCATCCTCATGACCTGGTTGTAGTGCAGAT
AGACATGATAAAACATGTATATGAATAGAAGAATTCTAGCAACCAGCCAAGCCAAGAAGA
TGAAAACGCCATTGACAACATAAGCCATTGACTTCTTCATACCAGCTGTGTCCAGGTACC
ATCTCAAGTTGATCTCTGGGGTTGTAATCTCAGAGATGAGGACCATGTATGTATACAACT
GTCCTTCCCCAGAAAACAAGGAGTAGGCAACAGCTACCCCCGAGAGCGAGTGATGGACAA
TATACTCAAGTCCACCCAAAGAAGGATATTTCCAGAAGATCATCCCAAGATCAGCAATGA
AGTAACCAATGGATAACCCTAAACCAAGAGAGGAAAGACGTGAGCTGCGGAAGACAACAA
GATCATTGTGCCACCTATCAGAAAAGAGATC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2GY64TF 693 0 0
CCCAGAAAACAAGGAGTAGGCAACAGCTACCCCCGAGAGCGAGTGATGGACAATATACTC
AAGTCCACCCAAAGAAGGATATTTCCAGAAGATCATCCCAAGATCAGCAATGAAGTAACC
AATGGATAACCCTAAACCAAGAGAGGAAAGACGTGAGCTGCGGAAGACAACAAGATCATT
GTGCCACCTATCAGAAAAGAGATCGGACCAGAAGACAAAGTAGAGGGACATTGCGGAGAT
AAAGATAGCATGAACCGTCGAGATACCACGGTTGTTCCATTCGATACGTTGAATCTTGGT
GAGGATGATATAGGTCTTGGAATGGGAGTTGCTGATGAAGTGACAAAGATCATAGACCAC
TTTGCAGAGGAACATGCCGGTGAGAATAGAAGTGTAAGGAATAAAAGGATCAGCCAAGAG
ATAGTTGTTAACCAAATGCTGCGCTTGATGATGATAAGCCTTTATCGCACCAATCGTTTG
CAAAGAAGTCGACGACATTGCAGAGATTATTATTATTTTATTTATTTTGATTTTTGATTT
ACCGATTCCTCATCTCATCATTCGCCACACCACCCTCGTGTAGGGGAAAATATCTCGGAG
AAATGGACGCAAAGGAAGAGAGGATCAGCGGCGAGAAAAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGTG
AGAGAAAGGAAGCAGCCAAGCTTTGGCTTTTCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 4

CO CL1170Contig1 825 4 16 U
GGGAACTTCATCGTCATTCAATCAGATTCATCGGCCGGCGTCTTCTTAAAATTCAGATCA
TCGAAGATGTCTACGTTCAGTGGCGATGAGACCGCTCCTTTCTTCGGCTTCCTTGGCGCT
GCCGCAGCCCTCGTCTTCTCCTGCATGGGAGCTGCATATGGGACTGCCAAGAGTGGTGTC
GGTGTGGCATCTATGGGTGTTATGAGACCTGAGTTGGTCATGAAGTCTATTGTCCCTGTT
GTTATGGCTGGTGTCTTGGGTATCTATGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGT
ATTAACCCCAAGGCTAAATCTTACTACCTCTTCGACGGTTATGCCCATCTCTCTTCTGGT
CTCGCTTGTGGCCTTGCTGGTCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGTATTGTTGGTGATGCT
GGTGTCAGGGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGTATGATTCTTATCCTCATT
TTCGCTGAAGCTTTGGCTCTATACGGTCTCATCGTCGGCATCATCTTGTCCTCCCGAGCT
GGTCAGTCCAGAGCCGAATGAGAAGAGAATGCGCTTCTTCTTGGATTCTTTCTTTGCTTT
TTCGCTCTCGTCTTACATTATTTCTCAGGTTAGTAGGGAGTCCCCCTGTGGTTTGCTACT
TGTAGCATGTTTCTTAAAAAACCACACACTCACCAAAGTGTTTT*CGTTTTCTACCCTCG
TGTTATGTTTGTAATATTCTTCTCTTCCCAGTTAAGAGAGACACCCTCTTATTTATATAC
TTTTGTCAGTCTAATAAAATCACAGAAAACTCAATTTGATTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX72TF U 8
AF RR2GX72JQ C 334
AF RR2G109TF U 1
AF RR2G109JQ C 38
BS 1 615 RR2G109TF
BS 616 616 RR2GX72TF
BS 617 680 RR2G109TF
BS 681 681 RR2G109JQ
BS 682 716 RR2G109TF
BS 717 717 RR2G109JQ
BS 718 733 RR2G109TF
BS 734 734 RR2G109JQ
BS 735 748 RR2G109TF
BS 749 749 RR2G109JQ
BS 750 754 RR2G109TF
BS 755 755 RR2G109JQ
BS 756 770 RR2G109TF
BS 771 771 RR2G109JQ
BS 772 791 RR2G109TF
BS 792 825 RR2G109JQ

RD RR2GX72TF 619 0 0
GG
ATCGTCATTCA*TCAGATTCATCGGCCGGCGTCTTCTTAAAATTCAGATCATCGAAGATG
TCTACGTTCAGTGGCGATGAGACCGCTCCTTTCTTCGGCTTCCTTGGCGCTGCCGCAGCC
CTCGTCTTCTCCTGCATGGGAGCTGCATATGGGACTGCCAAGAGTGGTGTCGGTGTGGCA
TCTATGGGTGTTATGAGACCTGAGTTGGTCATGAAGTCTATTGTCCCTGTTGTTATGGCT
GGTGTCTTGGGTATCTATGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGTATTAACCCC
AAGGCTAAATCTTACTACCTCTTCGACGGTTATGCCCATCTCTCTTCTGGTCTCGCTTGT
GGCCTTGCTGGTCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGTATTGTTGGTGATGCTGGTGTCAGG
GCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGTATGATTCTTATCCTCATTTTCGCTGAA
GCTTTGGCTCTATACGGTCTCATCGTCGGCATCATCTTGTCCTCCCGAGCTGGTCAGTCC
AGAGCCGAATGAGAAGAGAATGCGCTTCTTCTTGGATTCTTTCTTTGCTTTTTCGCTCTC
GTCTTACATTATTTCTC

QA 3 619 3 619
DS 

RD RR2GX72JQ 427 0 0
GACGGTTATGCCCATCTCTCTTCTGGTCTCGCTTGTGGCCTTGCTGGTCTTTCTGCTGGA
ATGGCCATTGGTATTGTTGGTGATGCTGGTGTCAGGGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTT
TTCGTTGGTATGATTCTTATCCTCATTTTCGCTGAAGCTTTGGCTCTATACGGTCTCATC
GTCGGCATCATCTTGTCCTCCCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCCGAATGAGAAGAGAATGCG
CTTCTTCTTGGATTCTTTCTTTGCTTTTTCGCTCTCGTCTTACATTATTTCTCAGGTTAG
TAGGGAGTCCCCCTGTGGTTTGCTACTTGTAGCATGTTTCTTAAAAAACCACACACTCAC
CAAAGTGTTTTTCGTTTTCTACCCTCGTGTTATGTTTGTAATATTCTTCTCTTCC
CAGTTAAGAGAG

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR2G109TF 791 0 0
GGGAACTTCATCGTCATTCAATCAGATTCATCGGCCGGCGTCTTCTTAAAATTCAGATCA
TCGAAGATGTCTACGTTCAGTGGCGATGAGACCGCTCCTTTCTTCGGCTTCCTTGGCGCT
GCCGCAGCCCTCGTCTTCTCCTGCATGGGAGCTGCATATGGGACTGCCAAGAGTGGTGTC
GGTGTGGCATCTATGGGTGTTATGAGACCTGAGTTGGTCATGAAGTCTATTGTCCCTGTT
GTTATGGCTGGTGTCTTGGGTATCTATGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGT
ATTAACCCCAAGGCTAAATCTTACTACCTCTTCGACGGTTATGCCCATCTCTCTTCTGGT
CTCGCTTGTGGCCTTGCTGGTCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGTATTGTTGGTGATGCT
GGTGTCAGGGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGTATGATTCTTATCCTCATT
TTCGCTGAAGCTTTGGCTCTATACGGTCTCATCGTCGGCATCATCTTGTCCTCCCGAGCT
GGTCAGTCCAGAGCCGAATGAGAAGAGAATGCGCTTCTTCTTGGATTCTTTCTTTGCTTT
TTCGCTCTCGTCTTATATTATTTCTCAGGTTAGTAGGGAGTCCCCCTGTGGTTTGCTACT
TGTAGCATGTTTCTTAAAAA*CCACACACTCACCAAAGTGTTTT*CGTTTTCTACC*TCG
TGTTATGTTTGTA*TATTCTTCTCTTCC*AGTTA*GAGAGACACCCTCTT*TTTATATAC
TTTTGTCAGTC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2G109JQ 788 0 0
GCGTCTTCTTAAAATTCAGATCATCGAAGATGTCTACGTTCAGTGGCGATGAGACCGCTC
CTTTCTTCGGCTTCCTTGGCGCTGCCGCAGCCCTCGTCTTCTCCTGCATGGGAGCTGCAT
ATGGGACTGCCAAGAGTGGTGTCGGTGTGGCATCTATGGGTGTTATGAGACCTGAGTTGG
TCATGAAGTCTATTGTCCCTGTTGTTATGGCTGGTGTCTTGGGTATCTATGGTTTGATTA
TTGCTGTTATCATCAGTACCGGTATTAACCCCAAGGCTAAATCTTACTACCTCTTCGACG
GTTATGCCCATCTTTCTTCTGGTCTCGCTTGTGGCCTTGCTGGTCTTTCTGCTGGAATGG
CCATTGGTATTGTTGGTGATGCTGGTGTCAGGGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCG
TTGGTATGATTCTTATCCTCATTTTCGCTGAAGCTTTGGCTCTATACGGTCTCATCGTCG
GCATCATCTTGTCCTCCCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCCGAATGAGAAGAGAATGCGCTTC
TTCTTGGATTCTTTCTTTGCTTTTTCGCTCTCGTCTTATATTATTTCTCAGGTTAGTAGG
GAGTCCCCCTGTGGTTTGCTACTTGTAGCATGTTTCTTAAAAAACCACACACTCACCAAA
GTGTTTT*CGTTTTCTACCCTCGTGTTATGTTTGTAATATTCTTCTCTTCCCAGTTAAGA
GAGACACCCTCTTATTTATATACTTTTGTCAGTCTAATAAAATCACAGAAAACTCAATTT
GATTTGTC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 6

CO CL1171Contig1 849 6 11 U
GGAGAATAGAATTGAGAAAAAAAATGGCGATTCTATCAGTAAGCTCTAGTCTGGTGAGAG
CTGCTTTAGATACGAAGCCTAAGCTCCTCCGGTACAATCCCAATTCGCCGCGTAACGTCA
AGAGAAACCCTAATTCTATCTCACCTCCTTCGTCTTCGACAGTCTTAACAACAACGGGAA
GAAGCGTCTCCTCCGTTTCTGATTTGCTCAAACGTCCCGCAAGCAAAGAAGAAGAGGTTG
GTGGTGATTATGAGAAATGGTTTCCAAGTCCACCGAAAGTGGGTAAGCCTAGATCCGTCT
TCAATGCTGCCTCCCTTGCTTACATTGGTGATTCCATCTACGAGATATATGCTCGTCGCC
ATTTTCTATTCCCTCCACTTAGTATTGAAGAATACAACGACCGTGTTCGAGCAGTGGTGC
GATGTGAAGCACAATATGCTTTGCTTCAGAAGCTCCTTGATGAAGATTTCTTAACTAAAG
ATGAAAGAGAGATACTTCGGTGGGGTAAAAACGTTGGCTCGGTTAAAACAAGGTCAACTA
GGCGTGCTGGTGTTGCGGTCTATAACAAGGCCTCATCACTGGAAACACTTATTGGCTATT
TGTATCTAGCAAACGGCAAGAGATTAGAAGAAATAATGCAGAAGCTGGGATTCTCAAGTG
GTTCTTCAACAGAGATAATGGTTAAGGAGGCCAAGCACAAACTATCAGCTTTAAAATAAA
CTTTTATATGTATATATAGAACTGTATCGTTAAAAATGTTCAAAAACATTGAATCGACTT
CATCAAAAACGTTACTGAGTTTTGGTGATGTTTTGTTTTAGCTAAGTTCGAAGAGAGTGT
GTTTTGGTG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 15 15 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AD33TF U 1
AF RR2EJ96TF U 1
AF RR2BG59TF U 1
AF RR2DD03TF U 1
AF RR2DD03JQ C 153
AF RR2EJ96JQ C 252
BS 1 529 RR2AD33TF
BS 530 530 RR2BG59TF
BS 531 651 RR2AD33TF
BS 652 652 RR2BG59TF
BS 653 685 RR2AD33TF
BS 686 690 RR2BG59TF
BS 691 691 RR2DD03TF
BS 692 788 RR2BG59TF
BS 789 789 RR2DD03JQ
BS 790 806 RR2BG59TF
BS 807 849 RR2DD03JQ

RD RR2AD33TF 685 0 0
GGAGAATAGAATTGAGAAAAAAAATGGCGATTCTATCAGTAAGCTCTAGTCTGGTGAGAG
CTGCTTTAGATACGAAGCCTAAGCTCCTCCGGTACAATCCCAATTCGCCGCGTAACGTCA
AGAGAAACCCTAATTCTATCTCACCTCCTTCGTCTTCGACAGTCTTAACAACAACGGGAA
GAAGCGTCTCCTCCGTTTCTGATTTGCTCAAACGTCCCGCAAGCAAAGAAGAAGAGGTTG
GTGGTGATTATGAGAAATGGTTTCCAAGTCCACCGAAAGTGGGTAAGCCTAGATCCGTCT
TCAATGCTGCCTCCCTTGCTTACATTGGTGATTCCATCTACGAGATATATGCTCGTCGCC
ATTTTCTATTCCCTCCACTTAGTATTGAAGAATACAACGACCGTGTTCGAGCAGTGGTGC
GATGTGAAGCACAATATGCTTTGCTTCAGAAGCTCCTTGATGAAGATTTCTTAACTAAAG
ATGAAAGAGAGATACTTCGGTGGGGTAAAAACGTTGGCTCGGTTAAAACGAGGTCAACTA
GGCGTGCTGGTGTTGCGGTCTATAACAAGGCCTCATCACTGGAAACACTTATTGGCTATT
TGTATCTAGCAAACGGCAAGAGATTAGAAGAAATAATGCAGAAGCTGGGATGCTCAAGTG
GTTCTTCAACAGAGATAATGGTTAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2EJ96TF 682 0 0
GGAGAATAGAATTGAGAAAAAAAATGGCGATTCTATCAGTAAGCTCTAGTCTGGTGAGAG
CTGCTTTAGATACGAAGCCTAAGCTCCTCCGGTACAATCCCAATTCGCCGCGCAGCGTCA
AGAGAAACCCTAATTCTATCTCACCTCCTTCGTCTTCGACAGTCTTAACAACAACGGGAA
GAAGCGTCTCCTCCGTTTCTGATTTGCTCAAACGTCCCGTAAGCAAAGAAGA***GGTTG
GTGGTGATTATGAGAAATGGTTTCCAAGTCCACCGAAAGTGGGTAAGCCTAGATCCGTCT
TCAATGCTGCCTCCCTTGCTTACATTGGTGATTCCATCTACGAGATATATGCTCGTCGCC
ATTTTCTATTCCCTCCACTTAGTATTGAAGAATACAACGACCGTGTTCGAGCAGTGGTGC
GATGTGAAGCACAATATGCTTTGCTTCAGAAGCTCCTTGATGAAGATTTCTTAACTAAAG
ATGAAAGAGAGATACTTCGGTGGGGTAAAAACGTTGGCTCGGTTAAAACAAGGTCAACTA
GGCGTGCTGGTGTTGCGGTCTATAACAAGGCCTCATCACTGGAAACACTTATTGGCTATT
TGTATCTAGCAAACGGCAAGAGATTAGAAGAAATAATGCAGAAGCTGGGATTCTCAAGTG
GTTCTTCAACAGAGATAATGG
G

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2BG59TF 806 0 0
GGAGAATAGAATTGAGAAAAAAAATGGCGATTCTATCAGTAAGCTCTAGTCTGGTGAGAG
CTGCTTTAGATACGAAGCCTAAGCTCCTCCGGTACAATCCCAATTCGCCGCGTAACGTCA
AGAGAAACCCTAATTCTATCTCACCTCCTTCGTCTTCGACAGTCTTAACAACAACGGGAA
GAAGCGTCTCCTCCGTTTCTGATTTGCTCAAACGTCCCGCAAGCAAAGAAGAAGAGGTTG
GTGGTGATTATGAGAAATGGTTTCCAAGTCCACCGAAAGTGGGTAAGCCTAGATCCGTCT
TCAATGCTGCCTCCCTTGCTTACATTGGTGATTCCATCTACGAGATATATGCTCGTCGCC
ATTTTCTATTCCCTCCACTTAGTATTGAAGAATACAACGACCGTGTTCGAGCAGTGGTGC
GATGTGAAGCACAATATGCTTTGCTTCAGAAGCTCCTTGATGAAGATTTCTTAACTAAAG
ATGAAAGAGAGATACTTCGGTGGGGTAAAAACGTTGGCTCGGTTAAAACAAGGTCAACTA
GGCGTGCTGGTGTTGCGGTCTATAACAAGGCCTCATCACTGGAAACACTTATTGGCTATT
TGTATCTAGCAA*CGGCAAGAGATTAGAAGAAATAATGCAGAAGCTGGGATTCTCAAGTG
GTTCTTCAACAGAGATAATGGTTAAGGAGGTCAAGCACAAACTATCAGCTTTAAAATAAA
CTTTTATATGTATATATAGAACTGTATCGTTAAAAATGTTCAAAAACATTGAATCGACTT
CATCAAAA*CGTTACTGAGTTTTGGT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2DD03TF 796 0 0
GGAGAATAGAATTGAGAAAAAAAATGGCGATTCTATCAGTAAGCTCTAGTCTGGTGAGAG
CTGCTTTAGATACGAAGCCTAAGCTCCTCCGGTACAATCCCAATTCGCCGCGTAACGTCA
AGAGAAACCCTAATTCTATCTCACCTCCTTCGTCTTCGACAGTCTTAACAACAACGGGAA
GAAGCGTCTCCTCCGTTTCTGATTTGCTCAAACGTCCCGCAAGCAAAGAAGAAGAGGTTG
GTGGTGATTATGAGAAATGGTTTCCAAGTCCACCGAAAGTGGGTAAGCCTAGATCCGTCT
TCAATGCTGCCTCCCTTGCTTACATTGGTGATTCCATCTACGAGATATATGCTCGTCGCC
ATTTTCTATTCCCTCCACTTAGTATTGAAGAATACAACGACCGTGTTCGAGCAGTGGTGC
GATGTGAAGCACAATATGCTTTGCTTCAGAAGCTCCTTGATGAAGATTTCTTAACTAAAG
ATGAAAGAGAGATACTTCGGTGGGGTAAAAACGTTGGCTCGGTTAAAACAAGGTCAACTA
GGCGTGCTGGTGTTGCGGTCTATAACAAGGCCTCATCACTGGAAACACTTATTGGCTATT
TGTATCTAGCAAACGGCAAGAGATTAGAAGAAATAATGCAGAAGCTGGGATTCTCAAGTG
GTTCTTCAACAGAGATAATGGTTAAGA**GCCAAGCACAAACTATCAGCTTTAAAT**AA
CTTTTATATGTATATATAGAACTGTATCGTTAAAA*TGTTCAAAA*CATTGAATCGACTT
CATCAAAA
CGTTACTG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2DD03JQ 697 0 0
TCTTCGACAGTCTTAACAACAACGGGAAGAAGCGTCTCCTCCGTTTCTGATTTGCTCAAA
CGTCCCGCAAGCAAAGAAGAAGAGGTTGGTGGTGATTATGAGAAATGGTTTCCAAGTCCA
CCGAAAGTGGGTAAGCCTAGATCCGTCTTCAATGCTGCCTCCCTTGCTTACATTGGTGAT
TCCATCTACGAGATATATGCTCGTCGCCATTTTCTATTCCCTCCACTTAGTATTGAAGAA
TACAACGACCGTGTTCGAGCAGTGGTGCGATGTGAAGCACAATATGCTTTGCTTCAGAAG
CTCCTTGATGAAGATTTCTTAACTAAAGATGAAAGAGAGATACTTCGGTGGGGTAAAAAC
GTTGGCTCGGTTAAAACAAGGTCAACTAGGCGTGCTGGTGTTGCGGTCTATAACAAGGCC
TCATCACTGGAAACACTTATTGGCTATTTGTATCTAGCAAACGGCAAGAGATTAGAAGAA
ATAATGCAGAAGCTGGGATTCTCAAGTGGTTCTTCAACAGAGATAATGGTTAAGGAGGCC
AAGCACAAACTATCAGCTTTAAAATAAACTTTTATATGTATATATAGAACTGTATCGTTA
AAAATGTTCAAAAACATTGAATCGACTTCATCAAAAACGTTACTGAGTTTTGGTGATGTT
TTGTTTTAGCTAAGTTCGAAGAGAGTGTGTTTTGGTG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2EJ96JQ 598 0 0
GAGAAATGGTTTCCAAGTCCACCGAAAGTGGGTAAGCCTAGATCCGTCTTCAATGCTGCC
TCCCTTGCTTACATTGGTGATTCCATCTACGAGATATATGCTCGTCGCCATTTTCTATTC
CCTCCACTTAGTATTGAAGAATACAACGACCGTGTTCGAGCAGTGGTGCGATGTGAAGCA
CAATATGCTTTGCTTCAGAAGCTCCTTGATGAAGATTTCTTAACTAAAGATGAAAGAGAG
ATACTTCGGTGGGGTAAAAACGTTGGCTCGGTTAAAACAAGGTCAACTAGGCGTGCTGGT
GTTGCGGTCTATAACAAGGCCTCATCACTGGAAACACTTATTGGCTATTTGTATCTAGCA
AACGGCAAGAGATTAGAAGAAATAATGCAGAAGCTGGGATTCTCAAGTGGTTCTTCAACA
GAGATAATGGTTAAGGAGGCCAAGCACAAACTATCAGCTTTAAAATAAACTTTTATATGT
ATATATAGAACTGTATCGTTAAAAATGTTCAAAAACATTGAATCGACTTCATCAAAAACG
TTACTGAGTTTTGGTGATGTTTTGTTTTAGCTAAGTTCGAAGAGAGTGTGTTTTGGTG

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 7

CO CL1172Contig1 872 7 2 U
CTAAAGTGAGAAAACCTTTTCAAGACTGATCTTTCTTCCTTCTTCTCTCCAAGCGAAACC
ATGGCGCTACTCCTATGGCAAACACTGAAAGAAGCGATACATGCTTACACAGGTCTCTCC
CCAGTGGTCTTCTTCACCGCCCTCGCTCTCGCCTTCGCCATTTACCAAGTCGTCTCAGGC
TGGTTCGCTTCGCCTTTCGATGATGTTCGCCGACATCAGAGGGCTAGATCGTCAGCTGCA
GAGGAAGAACCACCGATCCCTCAGCCTGTTCAGGTCGGCGAGATCACAGAGGCGGAGCTT
AAGCAGTACGATGGCTCCGATCCTCAAAAGCCCCTTCTTATGGCCATCAAACATCAGATC
TATGATGTAACTCAAAGCAGGATGTTCTATGGACCAGGAGGACCGTATGCTTTGTTTGCA
GGGAAAGACGCAAGCCGAGCTCTTGCAAAGATGTCTTTTGAGGAGAAAGATTTGACTTGG
GATATCTCTGGTCTTGGTCCCTTTGAGCTAGAAGCTCTTCAGGACTGGGAGTACAAGTTC
AAGAGCAAGTATGCTACTGTTGGCACCGTCAAAGTGACCGGTTCAGAAGCCGAAAAAACC
CCATCTGCGTCTGAACCCGCAGAGACTGGTGAGAAAGACGCTCATGTAACCAAGCAAGAA
TCGGCCGTTGTGGATAAGAATGATGAGCCTCCTACTGAGCGTGATGTGAAGAACGAGTAG
ATTCCTTTTCAGTGATTTTTTCATAGAGACCAGGGGAAGTCTCAATGTAGAATCTCTGGT
GTTGTGGAAGTTTCAGTGATATGATTTTGTTTCATTATCTCAAAAACCAAGTTTGCTGGC
TAATAAAGCGTTTATAAACCGAGAAAATTGAG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F596TF U 1
AF RR2AG44TF U 1
AF RR2BZ66TF U 14
AF RR2BZ66JQ C 95
AF RR2AG44JQ C 56
AF RR2F596JQ C 229
AF RR2AG37TF U 690
BS 1 775 RR2AG44TF
BS 776 872 RR2AG37TF

RD RR2F596TF 672 0 0
GG
AAAGTGAGAAAACCTTTTCAAGACTGATCTTTCTTCCTTCTTCTCTCCAAGCGAAACCAT
GGCGCTACTCCTATGGCAAACACTGAAAGAAGCGATACATGCTTACACAGGTCTCTCCCC
AGTGGTCTTCTTCACCGCCCTCGCTCTCGCCTTCGCCATTTACCAAGTCGTCTCAGGCTG
GTTCGCTTCGCCTTTCGATGATGTTCGCCGACATCAGAGGGCTAGATCGTCAGCTGCAGA
GGAAGAACCACCGATCCCTCAGCCTGTTCAGGTCGGCGAGATCACAGAGGCGGAGCTTAA
GCAGTACGATGGCTCCGATCCTCAAAAGCCCCTTCTTATGGCCATCAAACATCAGATCTA
TGATGTAACTCAAAGCAGGATGTTCTATGGACCAGGAGGACCGTATGCTTTGTTTGCAGG
GAAAGACGCAAGCCGAGCTCTTGCAAAGATGTCTTTTGAGGAGAAAGATTTGACTTGGGA
TATCTCTGGTCTTGGTCCCTTTGAGCTAGAAGCTCTTCAGGACTGGGAGTACAAGTTCAA
GAGCAAGTATGCTACTGTTGGCACCGTCAAAGTGACCGGTTCAGAAGCCGAAAAAACCCC
ATCTGCGTCTGAACCCGCAGAGACTGGTGAGAAAGACGCTTATGTAACCAAGCAAGAATC
GGCCGTTGTG

QA 3 672 3 672
DS 

RD RR2AG44TF 775 0 0
CTAAAGTGAGAAAACCTTTTCAAGACTGATCTTTCTTCCTTCTTCTCTCCAAGCGAAACC
ATGGCGCTACTCCTATGGCAAACACTGAAAGAAGCGATACATGCTTACACAGGTCTCTCC
CCAGTGGTCTTCTTCACCGCCCTCGCTCTCGCCTTCGCCATTTACCAAGTCGTCTCAGGC
TGGTTCGCTTCGCCTTTCGATGATGTTCGCCGACATCAGAGGGCTAGATCGTCAGCTGCA
GAGGAAGAACCACCGATCCCTCAGCCTGTTCAGGTCGGCGAGATCACAGAGGCGGAGCTT
AAGCAGTACGATGGCTCCGATCCTCAAAAGCCCCTTCTTATGGCCATCAAACATCAGATC
TATGATGTAACTCAAAGCAGGATGTTCTATGGACCAGGAGGACCGTATGCTTTGTTTGCA
GGGAAAGACGCAAGCCGAGCTCTTGCAAAGATGTCTTTTGAGGAGAAAGATTTGACTTGG
GATATCTCTGGTCTTGGTCCCTTTGAGCTAGAAGCTCTTCAGGACTGGGAGTACAAGTTC
AAGAGCAAGTATGCTACTGTTGGCACCGTCAAAGTGACCGGTTCAGAAGCCGAAAAAACC
CCATCTGCGTCTGAACCCGCAGAGACTGGTGAGAAAGACGCTCATGTAACCAAGCAAGAA
TCGGCCGTTGTGGATAAGAATGATGAGCCTCCTACTGAGCGTGATGTGAAGAACGAGTAG
ATTCCTTTTCAGTGATTTTTTCATAGAGACCAGGGGAAGTCTCAATGTAGAATCT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2BZ66TF 749 0 0
GG
CTTTTCAAGACTGATCTTTCTTCCTTCTTCTCTCCAAGCGAAACCATGGCGCTACTCCTA
TGGCAAACACTGAAAGAAGCGATACATGCTTACACAGGTCTCTCCCCAGTGGTCTTCTTC
ACCGCCCTCGCTCTCGCCTTCGCCATTTACCAAGTCGTCTCAGGCTGGTTCGCTTCGCCT
TTCGATGATGTTCGCCGACATCAGAGGGCTAGATCGTCAGCTGCAGAGGAAGAACCACCG
ATCCCTCAGCCTGTTCAGGTCGGCGAGATCACAGAGGCGGAGCTTAAGCAGTACGATGGC
TCCGATCCTCAAAAGCCCCTTCTTATAGCCATCAAACATCAGATCTATGATGTAACTCAA
AGCAGGATGTTCTATGGACCAGGAGGACCGTATGCTTTGTTTGCAGGGAAAGACGCAAGC
CGAGCTCTTGCAAAGATGTCTTTTGAGGAGAAAGATTTGACTTGGGATATCTCTGGTCTT
GGTCCCTTTGAGCTAGAAGCTCTTCAGGACTGGGAGTACAAGTTCAAGAGCAAGTATGCT
ACTGTTGGCACCGTCAAAGTGACCGGTTCAGAAGCCGAAAAAACCCCATCTGCGTCTGAA
CCCGCAGAGACTGGTGAGAAAGACGCTCATGTAACCAAGCAAGAATCGGCCGTTGTGGAT
AAGAATGATGAGCCTCCTACTGAGCGTGATGTGAAGAACGAGTAGATTCCTTTTCAGTGA
TTTTT*CATAGAGACCAGGG
AAGTCTC

QA 3 742 3 742
DS 

RD RR2BZ66JQ 747 0 0
CGATACATGCTTACACAGGTCTCTCCCCAGTGGTCTTCTTCACCGCCCTCGCTCTCGCCT
TCGCCATTTACCAAGTCGTCTCAGGCTGGTTCGCTTCGCCTTTCGATGATGTTCGCCGAC
ATCAGAGGGCTAGATCGTCAGCTGCAGAGGAAGAACCACCGATCCCTCAGCCTGTTCAGG
TCGGCGAGATCACAGAGGCGGAGCTTAAGCAGTACGATGGCTCCGATCCTCAAAAGCCCC
TTTTTATAGCCATCAAACATCAGATCTATGATGTAACTCAAAGCAGGATGTTCTATGGAC
CAGGAGGACCGTATGCTTTGTTTGCAGGGAAAGACGCAAGCCGAGCTCTTGCAAAGATGT
CTTTTGAGGAGAAAGATTTGACTTGGGATATCTCTGGTCTTGGTCCCTTTGAGCTAGAAG
CTCTTCAGGACTGGGAGTACAAGTTCAAGAGCAAGTATGCTACTGTTGGCACCGTCAAAG
TGACCGGTTCAGAAGCCGAAAAAACCCCATCTGCGTCTGAACCCGCAGAGACTGGTGAGA
AAGACGCTCATGTAACCAAGCAAGAATCGGCCGTTGTGGATAAGAATGATGAGCCTCCTA
CTGAGCGTGATGTGAAGAACGAGTAGATTCCTTTTCAGTGATTTTTTCATAGAGACCAGG
GGAAGTCTCAATGTAGAATCTCTGGTGTTGTGGAAGTTTCAGTGATATGATTTTGTTTCA
TTATCTCAAAAACCAAGTTTGCTGGC
G

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2AG44JQ 808 0 0
AAACCATGGCGCTACTCCTATGGCAAACACTGAAAGAAGCGATACATGCTTACACAGGTC
TCTCCCCAGTGGTCTTCTTCACCGCCCTCGCTCTCGCCTTCGCCATTTACCAAGTCGTCT
CAGGCTGGTTCGCTTCGCCTTTCGATGATGTTCGCCGACATCAGAGGGCTAGATCGTCAG
CTGCAGAGGAAGAACCACCGATCCCTCAGCCTGTTCAGGTCGGCGAGATCACAGAGGCGG
AGCTTAAGCAGTACGATGGCTCCGATCCTCAAAAGCCCCTTCTTATGGCCATCAAACATC
AGATCTATGATGTAACTCAAAGCAGGATGTTCTATGGACCAGGAGGACCGTATGCTTTGT
TTGCAGGGAAAGACGCAAGCCGAGCTCTTGCAAAGATGTCTTTTGAGGAGAAAGATTTGA
CTTGGGATATCTCTGGTCTTGGTCCCTTTGAGCTAGAAGCTCTTCAGGACTGGGAGTACA
AGTTCAAGAGCAAGTATGCTACTGTTGGCACCGTCAAAGTGACCGGTTCAGAAGCCGAAA
AAACCCCATCTGCGTCTGAACCCGCAGAGACTGGTGAGAAAGACGCTCATGTAACCAAGC
AAGAATCGGCCGTTGTGGATAAGAATGATGAGCCTCCTACTGAGCGTGATGTGAAGAACG
AGTAGATTCCTTTTCAGTGATTTTTTCATAGAGACCAGGGGAAGTCTCAATGTAGAATCT
CTGGTGTTGTGGAAGTTTCAGTGATATGATTTTGTTTCATTATCTCAAAAACCAAGTTTG
CTGGCTAATAAAGCGTTTATAAACC
GAG

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2F596JQ 632 0 0
TCGTCAGCTGCAGAGGAAGAACCACCGATCCCTCAGCCTGTTCAGGTCGGCGAGATCACA
GAGGCGGAGCTTAAGCAGTACGATGGCTCCGATCCTCAAAAGCCCCTTCTTATGGCCATC
AAACATCAGATTTATGATGTAACTCAAAGCAGGATGTTCTATGGACCAGGAGGACCGTAT
GCTTTGTTTGCAGGGAAAGACGCAAGCCGAGCTCTTGCAAAGATGTCTTTTGAGGAGAAA
GATTTGACTTGGGATATCTCTGGTCTTGGTCCCTTTGAGCTAGAAGCTCTTCAGGACTGG
GAGTACAAGTTCAAGAGCAAGTATGCTACTGTTGGCACCGTCAAAGTGACCGGTTCAGAA
GCCGAAAAAACCCCATCTGCGTCTGAACCCGCAGAGACTGGTGAGAAAGACGCTTATGTA
ACCAAGCAAGAATCGGCCGTTGTGGACAAGAATGATGAGCCTCCTACTGAGCGTGATGTG
AAGAACGAGTAGATTCCTTTTCAGTGATTTTTTCATAGAGACCAGGGGAAGTCTCAATGT
AGAATCTCTGGTGTTGTGGAAGTTTCAGTGATATGATTTTGTTTCATTATCTCAAAAACC
AAGTTTGCTGGCTAATAAAGCGTTTATAAACC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2AG37TF 183 0 0
G
CCTACTGAGCGTGATGTGAAGAACGAGTAGATTCCTTTTCAGTGATTTTTTCATAGAGAC
CAGGGGAAGTCTCAATGTAGAATCTCTGGTGTTGTGGAAGTTTCAGTGATATGATTTTGT
TTCATTATCTCAAAAACCAAGTTTGCTGGCTAATAAAGCGTTTATAAACCGAGAAAATTG
AG

QA 2 183 2 183
DS 



AS 1 7

CO CL1173Contig1 993 7 17 U
GGACTTCCCCAAAAGAAAAGGGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCTTCATCAC
TCTCTTCATAGCTATCTTCACCTCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTCAAATTTAACCA
CTTCGGTAATGGCTCCGATCTCTTCTCTTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGACAC
GGACGGCACGACCCGGTCCGGTTCTCTCTCATTGACCAAAGACAAAATTCCTTTCTCTCA
TGGTCGAACCATTTTAATCAACCCAATCACCTTCAAACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGT
TTACCCTTTCAAGACCTCTTT*CACTTTCTCCATCACGCCTCACCGAACAAACCCTACTC
CTGGTCACGGTCTCGCCTTCCTCGTCGTCCCAGGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAG
GCTACCTCAGTCTCGTGAACCGAACCAGCAACGGTAATCCCAGTAACCATCTCTTTGCTG
TTGAGTTCGACGTGTTTCAGGACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAA
TCGACATTAATTCTGTCGACTCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAA
GAAACGGTTGGTTGTTCAAGGACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGG
TCGAGTACAACAACAACTTAAAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAAGA
AACCGAACCGGCCATTGATCGAGGAGAAATTCGACCTCTCTAATGTGCTGCTCGAGAAGA
TGTACGCCGGTTTTACCGGTTCAATGGGCCGTGGTGTTGAGCGTCACGAGATCTGGGACT
GGAGTTTCCAGAATTAGATAACAGGGTTCATTCGATGTGAGATCGGTTTAAATCGGTTTT
CCTTTGGTTTGCTTCTTTGTCTTGTTTTGATAGCTTCTGTTAGTGGCTCCCGCTAATAAT
TGAAGTGAATAAAAGCCCAAGTTGTCGGTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2CX89TF U 12
AF RR2EP14TF U 1
AF RR2BB08TF U 20
AF RR2FB04TF U 94
AF RR2BB08JQ C 139
AF RR2EP14JQ C 276
AF RR2CX89JQ C 163
BS 1 396 RR2EP14TF
BS 397 397 RR2CX89TF
BS 398 721 RR2EP14TF
BS 722 722 RR2BB08TF
BS 723 748 RR2EP14TF
BS 749 749 RR2BB08TF
BS 750 762 RR2EP14TF
BS 763 763 RR2BB08TF
BS 764 793 RR2EP14TF
BS 794 794 RR2BB08TF
BS 795 803 RR2EP14TF
BS 804 852 RR2BB08TF
BS 853 853 RR2BB08JQ
BS 854 865 RR2FB04TF
BS 866 866 RR2BB08JQ
BS 867 888 RR2FB04TF
BS 889 993 RR2BB08JQ

RD RR2CX89TF 638 0 0
GG
AGAAAAGGGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCTTCATCACTCTCTTCATAGCT
ATCTTCACCTCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTCAAATTTAACCACTTCGGTAATGGC
TCCGATCTCTTCTCTTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGACACGGACGGCACGACC
CGGTCCGGTTCTCTCTCATTGACCAAAGACAAAATTCCTTTCTCTCATGGTCGAACCATT
TTAATCAACCCAATCACCTTCAAACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAG
ACCTCTTT*CACTTTCTCCATCACGCCTCACCGAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCT
CGCCTTCCTCGTCGTCCCAGGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTCAGTCT
CGTGAACCGAACCAGCAACGGTAATCCCAGTAACCATCTCTTTGCTGTTGAGTTCGACGT
GTTTCAGGACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTC
TGTCGACTCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTT
GTTCAAGGACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTA

QA 3 638 3 638
DS 

RD RR2EP14TF 814 0 0
GGACTTCCCCAAAAGAAAAGGGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCTTCATCAC
TCTCTTCATAGCTATCTTCACCTCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTCAAATTTAACCA
CTTCGGTAATGGCTCCGATCTCTTCTCTTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGACAC
GGACGGCACGACCCGGTCCGGTTCTCTCTCATTGACCAAAGACAAAATTCCTTTCTCTCA
TGGTCGAACCATTTTAATCAACCCAATCACCTTCAAACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGT
TTACCCTTTCAAGACCTCTTT*CACTTTCTCCATCACGCCTCACCGAACAAACCCTACTC
CTGGTCACGGTCTCGCCTTCCTCGTCGTCCCAGGTAGCCAACATGCCGGTTCCGGTTTAG
GCTACCTCAGTCTCGTGAACCGAACCAGCAACGGTAATCCCAGTAACCATCTCTTTGCTG
TTGAGTTCGACGTGTTTCAGGACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAA
TCGACATTAATTCTGTCGACTCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAA
GAAACGGTTGGTTGTTCAAGGACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGG
TCGAGTACAACAACAACTTAAAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAAGA
A*CCGAACCGGCCATTGATCGAGGAGAA*TTCGACCTCTCTA*TGTGCTGCTCGAGAAGA
TGTACGCCGGTTT*ACCGGTTCA
TGGGCGTGGTG

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2BB08TF 850 0 0
GGGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCTTCATCACTCTCTTCATAGCTATCTTC
ACCTCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTCAAATTTAACCACTTCGGTAATGGCTCCGAT
CTCTTCTCTTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGACACGGACGGCACGACCCGGTCC
GGTTCTCTCTCATTGACCAAAGACAAAATTCCTTTCTCTCATGGTCGAACCATTTTAATC
AACCCAATCACCTTCAAACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCT
TT*CACTTTCTCCATCACGCCTCACCGAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTT
CCTCGTCGTCCCAGGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTCAGTCTCGTGAA
CCGAACCAGCAACGGTAATCCCAGTAACCATCTCTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCA
GGACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCTGTCGA
CTCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCAA
GGACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAACTT
AAAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAAGAAACCGAACCGGCCATTGAT
CGAGGAGAAATTCGACCTCTCTAATGTGCTGCTCGAGA*GATGTACGCCGGTTTTACCGG
TTCAATGGGCCGTGGTGTTGAGCGTCACGAGATCTGGGACTGGAGTTTCCAGA
TTAGATACAGGTTCATC

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2FB04TF 812 0 0
GG
ATGCTTACAGATTCAAATTTAACCACTTCGGTAATGGCTCCGATCTCTTCTCTTTCCATG
GAGACGCAGAGTATGGTCACGACACGGACGGCACGACCCGGTCCGGTTCTCTCTCATTGA
CCAAAGACAAAATTCCTTTCTCTCATGGTCGAACCATTTTAATCAACCCAATCACCTTCA
AACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCTTT*CACTTTCTCCATC
ACGCCTCACCGAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTCCTCGTCGTCCCAGGT
AACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTCAGTCTCGTGAACCGAACCAGCAACGGT
AATCCCAGTAACCATCTCTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAGGACAAGTCTTTTAAA
GACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCTGTCGACTCGGTGAAGTCGGTT
AAATCCGGTTATTGGGTTATGACAA**AACGGTTGGTTGTTCAAGGACTTGAAGCTGAGC
AGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAAC***TTAAAAGTAATCTCGGTT
ACCATCGGTCTCGCGCATTTGAAGAAACCGAACCGGCCATTGATCGAGGAGAAATTCGAC
CTCTCTAATGTGCTGCTCGAGAAGATGTACGCCGGTTT*ACCGGTTCA*TGGGCCGTGGT
GTTGAGCGTCACGAGATCTGGGACTGGAGTTTC*AGA*TTAGATAACAGG*TTCATTCGA
TGTGAGATCGGTT
AATCGTTTCCTTGGTTG

QA 3 795 3 795
DS 

RD RR2BB08JQ 855 0 0
TCTCTTCTCTTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGACACGGACGGCACGACCCGGTC
CGGTTCTCTCTCATTGACCAAAGACAAAATTCCTTTCTCTCATGGTCGAACCATTTTAAT
CAACCCAATCACTTTCAAACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTC
TTTTCACTTTCTCCATCACGCCTCACCGAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCT
TCCTCGTCGTCCCAGGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTCAGTCTCGTGA
ACCGAACCAGCAACGGTAATCCCAGTAACCATCTCTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTC
AGGACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCTGTCG
ACTCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCA
AGGACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAACT
TAAAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAAGAAACCGAACCGGCCATTGA
TCGAGGAGAAATTCGACCTCTCTAATGTGCTGCTCGAGAAGATGTACGCCGGTTTTACCG
GTTCAATGGGCCGTGGTGTTGAGCGTCACGAGATCTGGGACTGGAGTTTCCAGAATTAGA
TAACAGGGTTCATTCGATGTGAGATCGGTTTAAATCGGTTTTCCTTTGGTTTGCTTCTTT
GTCTTGTTTTGATAGCTTCTGTTAGTGGCTCCCGCTAATAATTGAAGTGAATAAAAGCCC
AAGTTGTCGGTTTTC

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR2EP14JQ 718 0 0
AACCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCTTT*CACTTTCTCCATC
ACGCCTCACCGAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTCCTCGTCGTCCCAGGT
AGCCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTCAGTCTCGTGAACCGAACCAGCAACGGT
AATCCCAGTAACCATCTCTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAGGACAAGTCTTTTAAA
GACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCTGTCGACTCGGTGAAGTCGGTT
AAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCAAGGACTTGAAGCTGAGC
AGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAACTTAAAAGTAATCTCGGTT
ACCATCGGTCTCGCGCATTTGAAGAAACCGAACCGGCCATTGATCGAGGAGAAATTCGAC
CTCTCTAATGTGCTGCTCGAGAAGATGTACGCCGGTTTTACCGGTTCAATGGGCCGTGGT
GTTGAGCGTCACGAGATCTGGGACTGGAGTTTCCAGAATTAGATAACAGGGTTCATTCGA
TGTGAGATCGGTTTAAATCGGTTTTCCTTTGGTTTGCTTCTTTGTCTTGTTTTGATAGCT
TCTGTTAGTGGCTCCCGTTAATAATTGAAGTGAATAAAAGCCCAAGTTGTCGGTT
TCC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2CX89JQ 828 0 0
CAGAGTAT
GTCACGACACGGACGGCACGACCCGGTCCGGT*CTCTCTCAT*GACCAAAGACAAAATTC
CTTTCTCTCATGGTCGAACCATTTTAATCAACCCAATCACCTTCAAACCTCCCAACAACG
CTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCTTT*CACTTTCTCCATCACGCCTCACCGAACA
AACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTCCTCGTCGTCCCAGGTAACCAACATGCCGGT
TCCGGTTTAGGCTACCTCAGTCTCGTGAACCGAACCAGCAACGGTAATCCCAGTAACCAT
CTCTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAGGACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAAC
CATGTCGGAATCGACATTAATTCTGTCGACTCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGG
GTTATGACAAGAAACGGTTGGTTGTTCAAGGACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTAC
ACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAACTTAAAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCG
CATTTGAAGAAACCGAACCGGCCATTGATCGAGGAGAAATTCGACCTCTCTAATGTGCTG
CTCGAGAAGATGTACGCCGGTTTTACCGGTTCAATGGACCGTGGTGTTGAGCGTCACGAG
ATCTGGGACTGGAGTTTCCAGAATTAGATAACAGGGTTCATTCGATGTGAGATCGGTTTA
AATCGGTTTTCCTTTGGTTTGCTTCTTTGTCTTGTTTTGATAGCTTCTGTTAGTGGCTCC
CGCTAATAATTGAAGTGAATAAAAGCCCAAGTTGTCGGTT

QA 9 828 9 828
DS 



AS 2 7

CO CL1174Contig1 809 4 13 U
GGATCTCAACAGTTACTATCATTATCTGTGTGAACCAGAGCGTGGCTTTAGACCAATCGA
CATGGTTTCCACACCATTCCACTCCATCATCTTTCTCTTCTTCGTCTTCTCCGCCGGAGT
TAAAATCTCTGTCGCTGATAAGCCGGTGACGCAGCCTGTTCCTGCGCCATGGCCGGAGCA
GTTCCACGCGTTGATGTTGATGAACAAATCTGGTTCCATTGAGATTGTTGACCTATGGTA
CGACTGGATCAATGGCCGTAACTTCAACATCATTCAGAAGCAGCTTGGCAAAGTAACCTA
CGACCTTGAATGGAACAATGGCACATCTTTCTACTATACACTTGACGCTTCCAAAACTTG
CCGCACCGTTCATTTCGAGGTTGGAATCTTGAGGCCAAACTGGCTGGATGGAGCATACTA
TTTGGGTCAACGAAATGTGAGTGGGTTTCTCTGCAACGTATGGGAGAAGGTTGACTTCTT
ATGGTACTACGAGGATGTTGTCACCAAGAGACCTGTTCAATGGATCTTCTACACAGGTAG
AGAAGCTCATGTGATGACATTTGAGGTCGGAGCTGTCCTAGAGGACGAGAAATGGCACGC
TCCAGTCTATTGTTTTCACAACGAGAAGAAGAGCAGTGAGTAATTTGATAACTTGAGACT
GTGTTTTCACTGTATGTAGACTTTTGGGGAATCTTTCAAGAAATCAAATGTTCATCAAGG
AAGCCATTTTCATCTTTTATCAAAAACTTTATTATGTAGCATATAGAGACTTGTTTTTTA
GTGGATCATAAATAAAAGCAGATGTCTTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H006TF U 1
AF RR2DE85TF U 1
AF RR2C651TF U 1
AF RR2A203TF U 1
BS 1 30 RR2A203TF
BS 31 31 RR2DE85TF
BS 32 255 RR2A203TF
BS 256 256 RR2DE85TF
BS 257 576 RR2A203TF
BS 577 577 RR2DE85TF
BS 578 597 RR2A203TF
BS 598 598 RR2DE85TF
BS 599 661 RR2A203TF
BS 662 663 RR2C651TF
BS 664 669 RR2A203TF
BS 670 670 RR2C651TF
BS 671 809 RR2A203TF

RD RR2H006TF 594 0 0
GGATCTCAACAGTTACTATCATTATCTGTGTGAACCAGAGCGTGGCTTTAGACCAATCGA
CATGGTTTCCACACCATTCCACTCCATCATCTTTCTCTTCTTCGTCTTCTCCGCCGGAGT
TAAAATCTCTGTCGCTGATAAGCCGGTGACGCAGCCTGTTCCTGCGCCATGGCCGGAGCA
GTTCCACGCGTTGATGTTGATGAACAAATCTGGTTCCATTGAGATTGTTGACCTATGGTA
CGACTGGATCAATGGCCGTAACTTCAACATCATTCAGAAGCAGCTTGGCAAAGTAACCTA
CGACCTTGAATGGAACAATGGCACATCTTTCTACTATACACTTGACGCTTCCAACACTTG
CCGCACCGTTCATTTCGAGGTTGGAATCTTGAGGCCAAACTGGCTGGATGGAGCATACTA
TTTGGGTCAACGAAATGTGAGTGGGTTTCTCTGCAACGTATGGGAGAAGGTTGACTTCTT
ATGGTACTACGAGGATGTTGTCACCAAGAGACCTGTTCAATGGATCTTCTACACAGGTAG
AGAAGCTCATGTGATGACATTTGAGGTCGGAGCTGTCCTAGAGGATGAGAAATG

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2DE85TF 612 0 0
GGATCTCAACAGTTACTATCATTATCTGTGTGAACCAGAGCGTGGCTTTAGACCAATCGA
CATGGTTTCCACACCATTCCACTCCATCATCTTTCTCTTCTTCGTCTTCTCCGCCGGAGT
TAAAATCTCTGTCGCTGATAAGCCGGTGACGCAGCCTGTTCCTGCGCCATGGCCGGAGCA
GTTCCACGCGTTGATGTTGATGAACAAATCTGGTTCCATTGAGATTGTTGACCTATGGTA
CGGCTGGATCAATGGCCGTAACTTCAACATCATTCAGAAGCAGCTTGGCAAAGTAACCTA
CGACCTTGAATGGAACAATGGCACATCTTTCTACTATACACTTGACGCTTCCAACACTTG
CCGCACCGTTCATTTCGAGGTTGGAATCTTGAGGCCAAACTGGCTGGATGGAGCATACTA
TTTGGGTCAACGAAATGTGAGTGGGTTTCTCTGCAACGTATGGGAGAAGGTTGACTTCTT
ATGGTACTACGAGGATGTTGTCACCAAGAGACCTGCTCAATGGATCTTCTACACAGGTAG
AGAAGCTCATGTGATGACATTTGAGGTCGGAGCTGTCCTAGAGGACGAGAAATGGCACGC
TCCAGTCTATTG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2C651TF 713 0 0
GGATCTCAACAGTTACTATCATTATCTGTGTGAACCAGACCGTGGCTTTAGACCAATCGA
CATGGTTTCCACACCATTCCACTCCATCATCTTTCTTTTCTTCGTCTTCTCCGCTGGAGT
TAAAATCT**GTCGCTGATAAGCCGGTGACGCAGCCTGTTCCTGCGCCATGGCCGGAGCA
GTTCCACGCGTTGATGTTGATGAACAAATCTGGTTCCATTGAGATTGTTGACCTATGGTA
CGACTGGATCAATGGCCGTAACTTCAACATCATCCAGAAGCAGCTTGGCAAAGTAACCTA
CGACCTTGAATGGAACAATGGCACATCTTTCTACTATACACTTGACGCTTCCAAAACTTG
CCGCACCGTTCATTTCGAGGTTGGAATCTTGAGGCCAAACTGGCTGGATGGAGCATACTA
TTTGGGTCAACGAAATGTGAGTGGGTTTCTCTGCAACGTATGGGAGAAGGTTGACTTCTT
ATGGTACTACGAGGATGTTGTCACCAAGAGACCTGTTCAATGGATCTTCTACACAGGTAG
AGAAGCTCATGTGATGACATTTGAGGTCGGAGCTGTTCTAGAGGACGAGAAATGGCA*GC
TCCAATCTATTGTTTTCACAACGAGAAGAAGAGCAGTGAGTA*TTTGATAACTTGAGACT
GTGTTTTCACTGTATGTAGACTTTTGGG*AATCTTTCA*GAAATCAAATGTTC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2A203TF 809 0 0
GGATCTCAACAGTTACTATCATTATCTGTGAGAACCAGAGCGTGGCTTTAGACCAATCGA
CATGGTTTCCACACCATTCCACTCCATCATCTTTCTCTTCTTCGTCTTCTCCGCCGGAGT
TAAAATCTCTGTCGCTGATAAGCCGGTGACGCAGCCTGTTCCTGCGCCATGGCCGGAGCA
GTTCCACGCGTTGATGTTGATGAACAAATCTGGTTCCATTGAGATTGTTGACCTATGGTA
CGACTGGATCAATGGTCGTAACTTCAACATCATTCAGAAGCAGCTTGGCAAAGTAACCTA
CGACCTTGAATGGAACAATGGCACATCTTTCTACTATACACTTGACGCTTCCAAAACTTG
CCGCACCGTTCATTTCGAGGTTGGAATCTTGAGGCCAAACTGGCTGGATGGAGCATACTA
TTTGGGTCAACGAAATGTGAGTGGGTTTCTCTGCAACGTATGGGAGAAGGTTGACTTCTT
ATGGTACTACGAGGATGTTGTCACCAAGAGACCTGTTCAATGGATCTTCTACACAGGTAG
AGAAGCTCATGTGATGACATTTGAGGTCGGAGCTGTTCTAGAGGACGAGAAATGGCAGGC
TCCAGTCTATTGTTTTCACAACGAGAAGAAGAGCAGTGAGTAATTTGATAACTTGAGACT
G**TTTTCATTGTATGTAGACTTTTGGGGAATCTTTCAAGAAATCAAATGTTCATCAAGG
AAGCCATTTTCATCTTTTATCAAAAACTTTATTATGTAGCATATAGAGACTTGTTTTTTA
GTGGATCATAAATAAAAGCAGATGTCTTC

QA 1 809 1 809
DS 



CO CL1174Contig2 779 3 6 U
AAGAAGACATCTGCTTTTATTTATGATCCACTAAAAACAAGTCTCTATATGCTAAGTTTT
TGATAAAAGATGAAAATGGCCTCCTTGATGAACATTTGATTTCATGAAAGATTCCCAAAA
GTCTACATACAATGAAAACACAGTCTCAACTCTCAAGTTATCAAATTACTCACTGCTCTT
CTTCTCGTTGTGAAAACAATAGACTGGAGCCTGCCATTTCTCGTCCTCTAGGACAGCTCC
GACCTCAAATGTCATCACATGAGCTTCTCTACCTGTGTAGAAGATCCATTGAACAGGTCT
CTTGGTGACAACATCCTCGTAGTACCATAAGAAGTCAACCTTCTCCCATACGTTGCAGAG
AAACCCACTCACATTTCGTTGACCCAAATAGTATGCTCCATCCAGCCAGTTTGGCCTCAA
GATTCCAACCTCGAAATGAACGGTGCGGCAAGTGTTGGAAGCGTCAAGTGTATAGTAGAA
AGATGTGCCATTGTTCCATTCAAGGTCGTAGGTTACTTTGCCAAGCTGCTTCTGAATGAT
GTTGAAGTTACGGCCATTGATCCAGTCGTACCATAGGTCAACAATCTCAATGGAACCAGA
TTTGTTCATCAACATCAACGCGTGGAACTGCTCCGGCCATGGCGCAGGAACAGGCTGCGT
CACCGGCTTATCAGCGACAGAGATTTTAACTCCGGCGGAGAAGACGAAGAAGAGAAAGAT
GATGGAGTGGAATGGTGTGGAAACCATGTCGATTGGTCTAAAGCCACGCTCTGGTTCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H006JQ U 1
AF RR2DE85JQ U 1
AF RR2AM21TF C 87
BS 1 292 RR2DE85JQ
BS 293 293 RR2H006JQ
BS 294 565 RR2DE85JQ
BS 566 566 RR2H006JQ
BS 567 771 RR2DE85JQ
BS 772 779 RR2AM21TF

RD RR2H006JQ 715 0 0
CG
GAAGACATCTGCTTTTATTTATGATCCACTAAAAACAAGTCTCTATATGCTAAGTTTTTG
ATAAAAGATGAAAATGGCCTCCTTGATGAACATTTGATTTCATGAAAGATTCCCAAAAGT
CTACATACAATGAAAACACAGTCTCAACTCTCAAGTTATCAAATTACTCACTGCTCTTCT
TCTCGTTGTGAAAACAATAGACTGGAGCCTGCCATTTCTCATCCTCTAGGACAGCTCCGA
CCTCAAATGTCATCACATGAGCTTCTCTACCTGTGTAGAAGATCCATTGAACAGGTCTCT
TGGTGACAACATCCTCGTAGTACCATAAGAAGTCAACCTTCTCCCATACGTTGCAGAGAA
ACCCACTCACATTTCGTTGACCCAAATAGTATGCTCCATCCAGCCAGTTTGGCCTCAAGA
TTCCAACCTCGAAATGAACGGTGCGGCAAGTGTTGGAAGCGTCAAGTGTATAGTAGAAAG
ATGTGCCATTGTTCCATTCAAGGTCGTAGGTTACTTTGCCAAGCTGCTTCTGAATGATGT
TGAAGTTACGGCCATTGATCCAGTCGTACCATAGGTCAACAATCTCAATGGAACCAGATT
TGTTCATCAACATCAACGCGTGGAACTGCTCCGGCCATGGCGCAGGAACAGGCTGCGTCA
CCGGCTTATCAGCGACAGAGATTTTAACTCCGGCGGAGAAGACGAAGAAGAGA

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR2DE85JQ 771 0 0
AAGAAGACATCTGCTTTTATTTATGATCCACTAAAAACAAGTCTCTATATGCTAAGTTTT
TGATAAAAGATGAAAATGGCCTCCTTGATGAACATTTGATTTCATGAAAGATTCCCAAAA
GTCTACATACAATGAAAACACAGTCTCAACTCTCAAGTTATCAAATTACTCACTGCTCTT
CTTCTCGTTGTGAAAACAATAGACTGGAGCCTGCCATTTCTCGTCCTCTAGGACAGCTCC
GACCTCAAATGTCATCACATGAGCTTCTCTACCTGTGTAGAAGATCCATTGAGCAGGTCT
CTTGGTGACAACATCCTCGTAGTACCATAAGAAGTCAACCTTCTCCCATACGTTGCAGAG
AAACCCACTCACATTTCGTTGACCCAAATAGTATGCTCCATCCAGCCAGTTTGGCCTCAA
GATTCCAACCTCGAAATGAACGGTGCGGCAAGTGTTGGAAGCGTCAAGTGTATAGTAGAA
AGATGTGCCATTGTTCCATTCAAGGTCGTAGGTTACTTTGCCAAGCTGCTTCTGAATGAT
GTTGAAGTTACGGCCATTGATCCAGCCGTACCATAGGTCAACAATCTCAATGGAACCAGA
TTTGTTCATCAACATCAACGCGTGGAACTGCTCCGGCCATGGCGCAGGAACAGGCTGCGT
CACCGGCTTATCAGCGACAGAGATTTTAACTCCGGCGGAGAAGACGAAGAAGAGAAAGAT
GATGGAGTGGAATGGTGTGGAAACCATGTCGATTGGTCTAAAGCCACGCTC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2AM21TF 693 0 0
GAT
GAACATTTGATTTCATGAAAGATTCCCAAAAGTCTACATACAATGAAAACACAGTCTCAA
CTCTCAAGTTATCAAATTACTCACTGCTCTTCTTCTCGTTGTGAAAACAATAGACTGGAG
CCCGCCATTTCTCGTCCTCTAGGACAGCTCCGGCCTCAAATGTCATCACATGAGCTTCTC
TACCTGTGTAGAAGATCCATTGAACAGGTCTCTTGGTGACAACATCCTCGTAGTACCATA
AGAAGTCAACCTTCTCCCATACGTTGCAGAGAAACCCACTCACATTTCGTTGACCCAAAT
AGTATGCTCCATCCAGCCAGTTTGGCCTCAAGATTCCAACCTCGAAATGAACGGTGCGGC
AAGTGTTGGAAGCGTCAAGTGTATAGTAGAAAGATGTGCCATTGTTCCATTCAAGGTCGT
AGGTTACTTTGCCAAGCTGCTTCTGAATGATGTTGAAGTTACGGCCATTGATCCAGTCGT
ACCATAGGTCAACAATCTCAATGGAACCAGATTTGTTCATCAACATCAACGCGTGGAACT
GCTCCGGCCATGGCGCAGGAACAGGCTGCGTCACCGGCTTATCAGCGACAGAGATTTTAA
CTCCGGCGGAGAAGACGAAGAAGAGAAAGATGATGGAGTGGAATGGTGTGGAAACCATGT
CGATTGGTCTAAAGCCACGCTCTGGTTCCC

QA 4 693 4 693
DS 



AS 3 7

CO CL1175Contig1 783 3 10 U
GGGTCTGAGAAAGAACCACTTTTGCCTCGATCTTTTTAGCGATGTCGATTCCTCAGGCAA
AGATGGAGCTTCGTCCTCTGGGAAACACAGGTCTCAAAGTTAGCTCCGTCGGCTTCGGCG
CCTCTCCTCTCGGAAGCGTCTTCGGTCCAGTCGCCGAAGTCGATGCCGTCGCCACCGTAA
GCGAGGCGTTCCGACAAGGCATTAACTTCTTCGACACTTCCCCGTATTATGGAGGAACAC
TATCGGAGAAGATGCTTGGAAAGGGACTAAAGGCACTACAAGTCCCTAGAAGCGACTACA
TTGTGGCTACCAAGTGTGGACGTTACGAAGAAGGCTTTGACTTCAGTGCCGAGAGAGTCA
CAAAGAGCATCGACGAGAGCTTGGAGAGGCTTCAGCTAGATTACGTCGACATACTTCACT
GCCACGACATTGAGTTCGGGTCTCTTGACCAGATTGTGAGTGAAACAATCCCTGCGCTGC
AGAAACTGAAACGGGAAGGGAAGACAAGGTTTATCGGTATCACCGGTCTTCCGTTGAGTA
TTTTCACTTATGTTCTTGATCGAGTGCCTCCAGGGAGTGTTGATGTGATATTGTCGTACT
GCCATTACGGTGTAAACGATTCCACGTTGCTTGATTTGTTGCCTTACTTGAAGAGCAAAG
GCGTGGGCGTGATTAGTGCTTCTCCATTGGCAATGGGTCTCCTTACGAACAAGTCCTCCT
GAGTGGCACCCTGCTTCCCTGAGCTCAGTCTGCTTGCAAGCTGCTGCTGGTCATGTAATC
AAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2DJ59TF U 33
AF RR2FH13TF U 1
AF RR2GV04TF U 33
BS 1 49 RR2FH13TF
BS 50 50 RR2DJ59TF
BS 51 526 RR2FH13TF
BS 527 527 RR2DJ59TF
BS 528 561 RR2FH13TF
BS 562 562 RR2DJ59TF
BS 563 707 RR2FH13TF
BS 708 708 RR2GV04TF
BS 709 774 RR2FH13TF
BS 775 783 RR2GV04TF

RD RR2DJ59TF 572 0 0
TTTTTAGCGATGTCGATTCCTCAGGCAAAGATGGAGCTTCGTCCTCTGGGAAACACAGGT
CTCAAAGTTAGCTCCGTCGGCTTCGGCGCCTCTCCTCTCGGAAGCGTCTTCGGTCCAGTC
GCCGAAGTCGATGCCGTCGCCACCGTAAGCGAGGCGTTCCGACAAGGCATTAACTTCTTC
GACACTTCCCCGTATTATGGAGGAACACTATCGGAGAAGATGCTTGGAAAGG*ACTAAAG
GTACTACAAGTCCCTAGAAGCGACTACATTGTGGCTACCAAGTGTGGACGTTACGAAGAA
GGCTTTGACTTCAGTGCCGAGAGAGTCACAAAGAGCATCGACGAGAGCTTGGAGAGGCTT
CAGCTAGATTACGTCGACATACTTCACTGCCACGACATTGAGTTCGGGTCTCTTGACCAG
ATTGTGAGTGAAACAATCCCTGCGCTGCAGAAACTGACACGGGAAGGGAAGACAAGGTTT
ATCGGTATCACCGGTCTTCCGTTGAGTATTTTCACTTATGTTCTTGATCGAGTGCCTCCA
GGGAGTGTTGATGTGATATTGTCGTACTGCCA

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2FH13TF 781 0 0
GGGTCTGAGAAAGAACCACTTTTGCCTCGATCTTTTTAGCGATGTCGATCCCTCAGGCAA
AGATGGAGCTTCGTCCTCTGGGAAACACAGGTCTCAAAGTTAGCTCCGTCGGCTTCGGCG
CCTCTCCTCTCGGAAGCGTCTTCGGTCCAGTCGCCGAAGTCGATGCCGTCGCCACCGTAA
GCGAGGCGTTCCGACAAGGCATTAACTTCTTCGACACTTCCCCGTATTATGGAGGAACAC
TATCGGAGAAGATGCTTGGAAAGGGACTAAAGGCACTACAAGTCCCTAGAAGCGACTACA
TTGTGGCTACCAAGTGTGGACGTTACGAAGAAGGCTTTGACTTCAGTGCCGAGAGAGTCA
CAAAGAGCATCGACGAGAGCTTGGAGAGGCTTCAGCTAGATTACGTCGACATACTTCACT
GCCACGACATTGAGTTCGGGTCTCTTGACCAGATTGTGAGTGAAACAATCCCTGCGCTGC
AGAAACTGAAACGGGAAGGGAAGACAAGGTTTATCGGTATCACCGGCCTTCCGTTGAGTA
TTTTCACTTATGTTCTTGATCTAGTGCCTCCAGGGAGTGTTGATGTGATATTGTCGTACT
GCCATTACGGTGTAAACGATTCCACGTTGCTTGATTTGTTGCCTTACTTGAAGAGCAAAG
GCGTGGGCGTGATTAGTGCTTCTCCATTGGCAATGGGTCTCCTTACGGACAAGTCCTCCT
GAGTGGCACCCTGCTTCCCTGAGCTCAGTCTGCTTGCAAGCTGCTGCTGGTCAT
TGTAATC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2GV04TF 751 0 0
TTTTTAGCGATGTCGATTCCTCAGGCAAAGATGGAGCTTCGTCCTCTGGGAAACACAGGT
CTCAAAGTTAGCTCCGTCGGCTTCGGCGCCTCTCCTCTCGGAAGCGTCTTCGGTCCAGTC
GCCGAAGTCGATGCCGTCGCCACCGTAAGCGAGGCGTTCCGACAAGGCATTAACTTCTTC
GACACTTCCCCGTATTATGGAGGAACACTATCGGAGAAGATGCTTGGAAAGGGACTAAAG
GCACTACAAGTCCCTAGAAGCGACTACATTGTGGCTACCAAGTGTGGACGTTACGAAGAA
GGCTTTGACTTCAGTGCCGAGAGAGTCACAAAGAGCATCGACGAGAGCTTGGAGAGGCTT
CAGCTAGATTACGTCGACATACTTCACTGCCACGACATTGAGTTCGGGTCTCTTGACCAG
ATTGTGAGTGAAACAATCCCTGCGCTGCAGAAACTGAAACGGGAAGGGAAGACAAGGTTT
ATCGGTATCACCGGTCTTCCGTTGAGTATTTTCACTTATGTTCTTGATCGAGTGCCTCCA
GGGAGTGTTGATGTGATATTGTCGTACTGCCATTACGGTGTAAACGATTCCACGTTGCTT
GATTTGTTGCCTTACTTGAAGAGCAAAGGCGTGGGCGTGATTAGTGCTTCTCCATTGGCA
ATGGGTCTCCTTACGAACAAGTCCTCCTGAGTGGCACCCTGCTTCCCTGAGCTCAGTCTG
CTTGCAAGCTGCTGCTGGTCATGTAATCAAA

QA 1 751 1 751
DS 



CO CL1175Contig2 1164 2 2 U
GGGTATTCTCAAGTCTCAACCATATCTATCTCCCAGTTTGCATCAGTTTCGTCTGAGAGA
ACCACTTTTGCCTCGATCTTTTTAGCCATGTCGATTCCTCAGGCCAAGATGGAGCTTCGT
CCTCTGGGAAACACAGGTCTCAAAGTTAGCTCCATCGGCTTCGGCGCCTCTCCTCTCGGA
AGCGTCTTCGGTCCAGTCTCCGAAGTCGATGCCGTCGCCACCGTAAGCGAGGCGTTCCGA
CAAGGCATCAACTTCTTCGACACTTCCCCGTATTATGGAGGAACACTATCGGAGAAGATG
CTTGGAAAGGGACTCAAGGCACTACAAGTCCCTAGAAGCGACTACATTGTGGCTACCAAG
TGTGGACGTTACCAAGAAGGCTTTGACTTCAGTGCCGAGAGAGTCACAAAGAGTATTGAC
GAGAGCTTGGAGAGGCTTCAGCTAGATTACGTCGACATTCTTCATTGCCACGACATTGAG
TTCGGGTCTCTTGACCAGATTGTGAGTGAAACAATCCCTGCGCTGCAGAAACTGAAACGG
GAAGGGAAGACAAGGTTTATTGGCATCACTGGTCTTCCGTTGGATATATTCACTTATGTT
CTTGATAGAGTGCCCCCAGGGAGTGTTGATGTGATATTATCGTACTGCCATTACGGTGTA
AACGATTCCACGTTGCTGGATTTGTTGCCTTACTTGAAGAGCAAAGGCGTGGGCGTGATA
AGTGCTTCTCCATTGGCAATGGGTCTCCTTACGGAACAAGGTCCTCCTGAGTGGCGCCCT
GCTTCCCCTGAGCTCAAGTCTGCTTGCAAAGCTGCTGCTGGTCATTGTAAATCAAAGGGT
AAGAAGATCACAAAGTTAGCACTGCAGTACAGCTTAGCAAACAAGGAGGTTTCATCGGTG
TTGGTTGGAATGAGCTCTGTCTCACAGGTGGAAGAAAATGTTGAAGCAGTTAGAGAGCTT
GAAGGTGTGGGTATGGATCAAGAAACTCTATCTGAGGTTGAAGCTATTCTTGAGCCTGTA
AAGAATCAGACATGGCCAAGTGGAATCGATCAAAAGTAAAAAGCTCTCTTCGTTGTGTTT
GTTCACATCACTTCTTCTTGGAATGCTTTGATGTGTCGGTAACAGTTTAAGTTGAGTTGA
TACGGTTAATAAAATTTCTTAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT23TF U 1
AF RR2FT23JQ C 341
BS 1 728 RR2FT23TF
BS 729 1164 RR2FT23JQ

RD RR2FT23TF 728 0 0
GGGTATTCTCAAGTCTCAACCATATCTATCTCCCAGTTTGCATCAGTTTCGTCTGAGAGA
ACCACTTTTGCCTCGATCTTTTTAGCCATGTCGATTCCTCAGGCCAAGATGGAGCTTCGT
CCTCTGGGAAACACAGGTCTCAAAGTTAGCTCCATCGGCTTCGGCGCCTCTCCTCTCGGA
AGCGTCTTCGGTCCAGTCTCCGAAGTCGATGCCGTCGCCACCGTAAGCGAGGCGTTCCGA
CAAGGCATCAACTTCTTCGACACTTCCCCGTATTATGGAGGAACACTATCGGAGAAGATG
CTTGGAAAGGGACTCAAGGCACTACAAGTCCCTAGAAGCGACTACATTGTGGCTACCAAG
TGTGGACGTTACCAAGAAGGCTTTGACTTCAGTGCCGAGAGAGTCACAAAGAGTATTGAC
GAGAGCTTGGAGAGGCTTCAGCTAGATTACGTCGACATTCTTCATTGCCACGACATTGAG
TTCGGGTCTCTTGACCAGATTGTGAGTGAAACAATCCCTGCGCTGCAGAAACTGAAACGG
GAAGGGAAGACAAGGTTTATTGGCATCACTGGTCTTCCGTTGGATATATTCACTTATGTT
CTTGATAGAGTGCCCCCAGGGAGTGTTGATGTGATATTATCGTACTGCCATTACGGTGTA
AACGATTCCACGTTGCTGGATTTGTTGCCTTACTTGAAGAGCAAAGGCGTGGGCGTGATA
AGTGCTTC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2FT23JQ 824 0 0
ACTACATTGTGGCTACCAAGTGTGGACGTTACCAAGAAGGCTTTGACTTCAGTGCCGAGA
GAGTCACAAAGAGTATTGACGAGAGCTTGGAGAGGCTTCAGCTAGATTACGTCGACATTC
TTCATTGCCACGACATTGAGTTCGGGTCTCTTGACCAGATTGTGAGTGAAACAATCCCTG
CGCTGCAGAAACTGAAACGGGAAGGGAAGACAAGGTTTATTGGCATCACTGGTCTTCCGT
TGGATATATTCACTTATGTTCTTGATAGAGTGCCCCCAGGGAGTGTTGATGTGATATTAT
CGTACTGCCATTACGGTGTAAACGATTCCACGTTGCTGGATTTGTTGCCTTACTTGAAGA
GCAAAGGCGTGGGCGTGATAAGTGCTTCTCCATTGGCAATGGGTCTCCTTACGGAACAAG
GTCCTCCTGAGTGGCGCCCTGCTTCCCCTGAGCTCAAGTCTGCTTGCAAAGCTGCTGCTG
GTCATTGTAAATCAAAGGGTAAGAAGATCACAAAGTTAGCACTGCAGTACAGCTTAGCAA
ACAAGGAGGTTTCATCGGTGTTGGTTGGAATGAGCTCTGTCTCACAGGTGGAAGAAAATG
TTGAAGCAGTTAGAGAGCTTGAAGGTGTGGGTATGGATCAAGAAACTCTATCTGAGGTTG
AAGCTATTCTTGAGCCTGTAAAGAATCAGACATGGCCAAGTGGAATCGATCAAAAGTAAA
AAGCTCTCTTCGTTGTGTTTGTTCACATCACTTCTTCTTGGAATGCTTTGATGTGTCGGT
AACAGTTTAAGTTGAGTTGATACGGTTAATAAAATTTCTTAGGT

QA 1 824 1 824
DS 



CO CL1175Contig3 685 2 2 U
GATATTACCTAAAAAATTTTATTAACCGTATCAACTCAACATAAAACTGTTACCGACACA
TCAAAGCATTCCAAGAAAAAGTAATGGGAACAAACACAACGAAAAAAGCTTTTTACTTTT
GATCGATTCCGCTTGGCCATGTCTGATTCTTTACAGGCTCAAGAATAGCTTCAACCTCAG
AGAGGGTTTCTTGATCCATACCCAAACCTTCAAGCTCTCTAACTGCTGCAACATTTTCTT
CCACCTGTGAGACAGAGCTCATTCCAACCAACACTGATGAAACCTCCTTGTTTCCTAAGC
TGTACTGCAGTGCTAACTTTGTGATCTTCTTACCCTTTGATTTACAATGACCAGCAGCAG
CTTTGCAAGCAGACTTGAGCTCAGGGGAAGCAGGGTGCCACTCAGGAGGACCTTGTTCCG
TAAGGAGACCCATTGCCAATGGAGAAGCACTAATCACGCCCACGCCTTTGCTCTTCAAGT
AAGGCAACAAATCAAGCAACGTGGAATCGTTTACACCGTAATGGCAGTACGACAATATCA
CATCAACACTCCCTGGAGGCACTAGATCAAGAACATAAGTGAAAATACTCAACGGAAGGC
CGGTGATACCGATAAACCTTGTCTTCCCTTCCCGTTTCAGTTTCTGCAGCGCAGGGATTG
TTTCACTCACAATCTGGTCAAGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV04JQB U 1
AF RR2FH13JQ U 7
BS 1 162 RR2GV04JQB
BS 163 685 RR2FH13JQ

RD RR2GV04JQB 165 0 0
GATATTACCTAAAAAATTTTATTAACCGTATCAACTCAACATAAAACTGTTACCGACACA
TCAAAGCATTCCAAGAAAAAGTAATGGGAACAAACACAACGAAAAAAGCTTTTTACTTTT
GATCGATTCCGCTTGGCCATGTCTGATTCTTTACAGGCTCAA
AAA

QA 1 162 1 162
DS 

RD RR2FH13JQ 679 0 0
G
CCTAAAAAATTTTATTAACCGTATCAACTCAACATAAAACTGTTACCGACACATCAAAGC
ATTCCAAGAAGAAGTAATGTGAACAAACACAACGAAGAGAGCTTTTTACTTTTGATCGAT
TCCGCTTGGCCATGTCTGATTCTTTACAGGCTCAAGAATAGCTTCAACCTCAGAGAGGGT
TTCTTGATCCATACCCAAACCTTCAAGCTCTCTAACTGCTGCAACATTTTCTTCCACCTG
TGAGACAGAGCTCATTCCAACCAACACTGATGAAACCTCCTTGTTTCCTAAGCTGTACTG
CAGTGCTAACTTTGTGATCTTCTTACCCTTTGATTTACAATGACCAGCAGCAGCTTTGCA
AGCAGACTTGAGCTCAGGGGAAGCAGGGTGCCACTCAGGAGGACCTTGTTCCGTAAGGAG
ACCCATTGCCAATGGAGAAGCACTAATCACGCCCACGCCTTTGCTCTTCAAGTAAGGCAA
CAAATCAAGCAACGTGGAATCGTTTACACCGTAATGGCAGTACGACAATATCACATCAAC
ACTCCCTGGAGGCACTAGATCAAGAACATAAGTGAAAATACTCAACGGAAGGCCGGTGAT
ACCGATAAACCTTGTCTTCCCTTCCCGTTTCAGTTTCTGCAGCGCAGGGATTGTTTCACT
CACAATCTGGTCAAGAGA

QA 2 679 2 679
DS 



AS 1 5

CO CL1176Contig1 1129 5 14 U
GTCAAAAAGATTTAACTTCTTCAAAGAAAATAGCATCCTCATACTCAAAATCCTCAAACG
AAATTAAAAGTGAAAACAAAAGTTTAATTGCTCAAGTCTTGCAAAAAAAGTAAAAGCTCC
TACAAGAGACATCATCAGGAGACGCTGAACTTCCCAGTGCTTTACTCTTCGTCGTCCTCA
TCATCATCATCACCTCCAGCCGCTCCGTTCAATGCCTTGACTCTCTCGATCAACTTGTTC
TTCCTCTCCTCATAGGTCAACTTCTTCAAGTTGTACCTCTTGTGTGCTTTGGGAGCAGGT
TTCACAGTCTTCTTAGGGTTGGGGTCAGCACGGATGGCAGCATGAACCTTCTTGTACAAC
TCCTCCATCTTCTCAGCATCAACTCCCTTCTTCAAGTACTGACTGAAGTGAGTCTGAAAC
TTCTCTGGCTCGTCCTCGTTCAACATCTTCATGTAGTTGGAGACGTGACCACCATAGATG
TAGTTCCTGTGGATCTCAGCATCGAGGTTCTTGTTCTCCTTGCTGAAACCAGCGAATCTC
TTGTCACTGTGGGGGATATCAAGTCCTCCGTCC*AAGGCTCCCTTGAGTGCACCGAAGAC
ACGGTTTCCTGTTGTGGTCCTGATGAGACCAACATCAAGAAGAGCACGGAATGGTCTCCT
TGACTCAGTTGGCTCAACGGAGAAGTCCTCTCCGGTTGCCTCGAGGTTGCCCTCGTACTC
TGCATCCATCTCCAACATCTTCAGAACACGGCGAGCCAAAAGAAGCCCAGTACAGTAAGC
AGCAGCGTAGTTGGTAAGACCAACAGAGAGACCATACTGAGGCAACTCATGAGCGTAAGC
AGAGGCCTTGACAATGTCACCGGCGATGCTTGCGGACACAATCTGTGCGACTATGTCCTT
GTTGGTGAACCTGACAACAAAACGGTACTTGGGAGTGTTGTACTTGTTCTTGTCCTGGTT
GATGAGACGGATCCTCGCCCTGTAGTCAGTCTTACCAGCTCTCCTTCTCCTGAACTTGAC
TTGGTACCTCTTGAAGTACGCGTTCGACTTGGATGGCTTCACAAACACCATTGTTCGAAG
CTGAGGGAAGCTTAAGGTGTGAGATGAGTGACGAGAAGACAAGAGGCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC22JQ U 1
AF RR2EE06JQ U 1
AF RR2B188JQ U 1
AF RR2EE06TF C 394
AF RR2B188TF C 482
BS 1 107 RR2B188JQ
BS 108 108 RR2EC22JQ
BS 109 344 RR2B188JQ
BS 345 345 RR2EC22JQ
BS 346 501 RR2B188JQ
BS 502 502 RR2EC22JQ
BS 503 598 RR2B188JQ
BS 599 599 RR2EC22JQ
BS 600 826 RR2B188JQ
BS 827 852 RR2EE06TF
BS 853 853 RR2B188TF
BS 854 1075 RR2EE06TF
BS 1076 1076 RR2B188TF
BS 1077 1129 RR2EE06TF

RD RR2EC22JQ 623 0 0
GTCAAAAAGATTTAACTTCTTCAAAGAAAATAGCATCCTCATACTCAAAATCCTCAAACG
AAATTAAAAGTGGAAACAAAAGTTTAAT*GCTCAAGTCTTGCAAAAAAAGTAAAAGCTCC
TACAAGAGACATCATCAGGAGACGCTGAACTTTCCAGTGCTTTACTCTTCGTCGTCCTCA
TCATAATCGTCACCTCCAGCTGCTCCGTTCAATGCCTTGACTCTCTCGATCAACTTGTTC
TTCCTCTCCTCATAGGTCAACTTCTTCAAGTTGTACCTCTTGTGTGCCTTGGGAGCAGGT
TTCACAGTCTTCTTAGGGTTGGGGTCAGCACGGATGGCAGCATGAACCTTCTTGTACAAC
TCCTCCATCTTCTCAGCATCAACTCCCTTCTTCAAGTACTGACTGAAGTGAGTCTGAAAC
TTCTCTGGCTCATCCTCGTTCAACATCTTCATGTAGTTCGAGACGTGACCACCATAGATG
TAGTTCCTGTGGATCTCAGCATCGAGGTTCTTGTTCTCCTTGCTGAAACCAGCGAATCTC
TTGTCACTGTGGGGGATATCAAGTCCTCCGTCC*AAGGCTCCCTTGAGTGCACCGAAGAC
ACGGTTTCCTGTTGTGGTCCTGA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2EE06JQ 731 0 0
GTCAAAAAGATTTAACTTCTTCAAAGAAAATAGCATCCTCATACTCAAAATCCTCAAACG
AAATTAAAAGTGAAAACAAAAGTTTAATTGCTCAAGTCTTGCAAAAAAAGTAAAAGCTCC
TACAAGAGACATCATCAGGAGACGCTGAACTTCCCAGTGCTTTACTCTTCGTCGTCCTCA
TCATCATCATCACCTCCAGCCGCTCCGTTCAATGCCTTGACTCTCTCGATCAACTTGTTC
TTCCTCTCCTCATAGGTCAACTTCTTCAAGTTGTACCTCTTGTGTGCTTTGGGAGCAGGT
TTCACAGTCTTCTTAGGGTTGGGGTCAGCACGGATGGCAGCATGAACCTTCTTGTACAAC
TCCTCCATCTTCTCAGCATCAACTCCCTTCTTCAAATACTGACTGAAGTGAGTCTGAAAC
TTCTCTGGCTCGTCCTCGTTCAACATCTTCATGTAGTTGGAGACGTGACCACCATAGATG
TAGTTCCTGTAGATCTCAGCATCGAGGTTCTTGTTCTCCTTGCTGAAACCAGCGAATCTC
TCGTCACTGTGGGGGATATCAAGTCCTCCGTCC*AAGGCTCCCTTGAGTGCACCGAAGAC
ACGGTTTCCTGTTGTGGTCCTGATGAGACCAACATCAAGAAGAGCACGGAATGGTCTCCT
TGACTCAGTTGGCTCAACGGAGAAGTCCTCTCCGGTTGCCTCGAGGTTGCCCTCGTACTC
TGCATCCATCT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2B188JQ 826 0 0
GTCAAAAAGATTTAACTTCTTCAAAGAAAATAGCATCCTCATACTCAAAATCCTCAAACG
AAATTAAAAGTGAAAACAAAAGTTTAATTGCTCAAGTCTTGCAAAAAGAGTAAAAGCTCC
TACAAGAGACATCATCAGGAGACGCTGAACTTCCCAGTGCTTTACTCTTCGTCGTCCTCA
TCATCATCATCACCTCCAGCCGCTCCGTTCAATGCCTTGACTCTCTCGATCAACTTGTTC
TTCCTCTCCTCATAGGTCAACTTCTTCAAGTTGTACCTCTTGTGTGCTTTGGGAGCAGGT
TTCACAGTCTTCTTAGGGTTGGGGTCAGCACGGATGGCAGCATGGACCTTCTTGTACAAC
TCCTCCATCTTCTCAGCATCAACTCCCTTCTTCAAGTACTGACTGAAGTGAGTCTGAAAC
TTCTCTGGCTCGTCCTCGTTCAACATCTTCATGTAGTTGGAGACGTGACCACCATAGATG
TAGTTCCTGTGGATCTCAGCACCGAGGTTCTTGTTCTCCTTGCTGAAACCAGCGAATCTC
TTGTCACTGTGGGGGATATCAAGTCCTCCGTCC*AAGGCTCCCTTGAGTGCACCGAAGGC
ACGGTTTCCTGTTGTGGTCCTGATGAGACCAACATCAAGAAGAGCACGGAATGGTCTCCT
TGACTCAGTTGGCTCAACGGAGAAGTCCTCTCCGGTTGCCTCGAGGTTGCCCTCGTACTC
TGCATCCATCTCCAACATCTTCAGAACACGGCGAGCCAAAAGAAGCCCAGTACAGTAAGC
AGCAGCGTAGTTGGTAAGACCAACAGAGAGACCATACTGAGGCAAC

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2EE06TF 736 0 0
AAA
TACTGACTGAAGTGAGTCTGAAACTTCTCTGGCTCGTCCTCGTTCAACATCTTCATGTAG
TTGGAGACGTGACCACCATAGATGTAGTTC*TGTAGATCTCAGCATCGAGGTTCTTGTTC
TCCTTGCTGAAACCAGCGAATCTCTCGTCACTGTGGGGGATATCAAGTCCTCCGTCC*AA
GGCTCCCTTGAGTGCACCGAAGACACGGTTTCCTGTTGTGGTCCTGATGAGACCAACATC
AAGAAGAGCACGGAATGGTCTCCTTGACTCAGTTGGCTCAACGGAGAAGTCCTCTCCGGT
TGCCTCGAGGTTGCCCTCGTACTCTGCATCCATCTCCAACATCTTCAGAACACGGCGAGC
CAAAAGAAGCCCAGTACAGTAAGCAGCAGCGTAGTTGGTAAGACCAACAGAGAGACCATA
CTGAGGCAACTCATGAGCGTAAGCAGAGGCCTTGACGATGTCACCGGCGATGCTTGCGGA
CACAATCTGTGCGACTATGTCCTTGTTGGTGAACCTGACAACAAAACGGTACTTGGGAGT
GTTGTACTTGTTCTTGTCCTGGTTGATGAGACGGATCCTCGCCCTGTAGTCAGTCTTACC
AGCTCTCCTTCTCCTGAACTTGACTTGGTACCTCTTGAAGTACGCGTTCGACTTGGATGG
CTTCACAAACACCATTGTTTGAAGCTGAGGGAAGCTTAAGGTGTGAGATGAGTGACGAGA
AGACAAGAGGCCC

QA 4 736 4 736
DS 

RD RR2B188TF 645 0 0
AGTTCCTGTGGATCTCAGCACCGAGGTTCTTGTTCTCCTTGCTGAAACCAGCGAATCTCT
TGTCACTGTGGGGGATATCAAGTCCTCCGTCCCAAGGCTCCCTTGAGTGCACCGAAGGCA
CGGTTTCCTGTTGTGGTCCTGATGAGACCAACATCAAGAAGAGCACGGAATGGTCTCCTT
GACTCAGTTGGCTCAACGGAGAAGTCCTCTCCGGTTGCCTCGAGGTTGCCCTCGTACTCT
GCATCCATCTCCAACATCTTCAGAACACGGCGAGCCAAAAGAAGCCCAGTACAGTAAGCA
GCAGCGTAGTTGGTAAGACCAACAGAGAGACCATACTGAGGCAACTCATGAGCGTAAGCA
GAGGCCTTGACAATGTCACCGGCGATGCTTGCGGACACAATCTGTGCGACTATGTCCTTG
TTGGTGAACCTGACAACAAAACGGTACTTGGGAGTGTTGTACTTGTTCTTGTCCTGGTTG
ATGAGACGGATCCTCGCCCTGTAGTCAGTCTTACCAGCTCTCCTTCTCCTGAACTTGACT
TGGTACCTCTTGAAGTACGCGTTCGACTTGGATGGCTTCACAAACACCATTGTTCGAAGC
TGAGGGAAGCTTAAGGTGTGAGATGAGTGACGAGAAGAC
AAGACC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 2 4

CO CL1177Contig1 781 2 13 U
CACACAATGCAAGATCTCAATTACGAAATAAAACTGTAACACAAAGAACCTCCAGATCAA
ATTCTCATGAACCACATCAAACTAAAACTGAAAGTTTTAAAACAGAGAACTAACAAGATA
GATATAGATGAAAGACACAGCACCAAGCAGCGATGAAACTGCTCGACCACAGCTTTTGTG
CTCAGGATGATTCAGCAGCGGGTTGAGTCACACCGTGCTCCACCAACAGCTTGGTGAGCG
AGTCAGGAGAGTGAACATGGTACTTAACACTCCCTGAAGGAGTCAAAAACACCTCAACAA
GCTCAAGCTTCTCAGACGTCAAACTCGTGCTGTCCATAGTCTTGCTCAAAACCTTCAACG
CAAGCTCGACCGCCTCTTCTCTGGTCGCATCCTCCTTGTAGTCCTGTTTCAAAATAAACT
GAGCAGCCTGATTGTTACCCCCAACGGCTGCAGCTTTCCAGCCACCATAGTTCCCACTCG
GGTCACTCATATACAACTGAAACCCATGGTTCTTATCCCACCCAGCAAAGAGAAACGACA
CTCCAAAAGGACGAAGACCGCCGAACTGGGTGTACCCTTGTTTGGTATCGCAGAGAGACT
GAACAAGCTGCTCAACGGGCTTGGAGGTGACTTTCTTCTCGCCGATCAAGACGACGCCGT
CTTTGGATAAGATACCGATGGCGGAACCGGCGTTTCCGATGGCTTCCATGGCGTACTCGA
CTTGGTAGAGACGGCCTTCAGGGGAGAAGATTGTGGTGCGGCTATCGTATCTCCGAGACA
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2FJ25JQ U 23
AF RR2A756JQ U 1
BS 1 40 RR2A756JQ
BS 41 41 RR2FJ25JQ
BS 42 131 RR2A756JQ
BS 132 132 RR2FJ25JQ
BS 133 156 RR2A756JQ
BS 157 157 RR2FJ25JQ
BS 158 296 RR2A756JQ
BS 297 297 RR2FJ25JQ
BS 298 411 RR2A756JQ
BS 412 412 RR2FJ25JQ
BS 413 416 RR2A756JQ
BS 417 417 RR2FJ25JQ
BS 418 781 RR2A756JQ

RD RR2FJ25JQ 567 0 0
G
CGAAATAAAACTGTAACACAAAGAACCTCCAGATCAAATTCTCATGAACCACATCAAACT
AAAACTGAAAGTTTTAAAACAGAGAACTAACAAGATAGATATAGATGAAAGACACAGCAC
CAAGCAGCGATGAAACTGCTCGACCACAGCTTTTGTGCTCAGGATGATTCAGCAGCGGGT
TGAGTCACACCGTGCTTCACCAACAGCTTGGTGAGCGAGTCAGGAGAGTGAACATGGTAC
TTAACGCTCCCTGAAGGAGTCAAAAACACCTCAACAAGCTCAAGCTTCTCAGACGTCAAA
CTCGTGCTGTCCATAGTCTTGCTCAAAACCTTCAACGCAAGCTCGACCGCCTCTTCTCTG
GTCGCATCCTCCTTGTAGTCCTGTTTCAAAATAAACTGAGCAGCCTGATTGTTACCCCCA
ACGGCTGCAGCTTTCCAGCCACCATAGTTCCCACTCGGGTCACTCATATACAACTGAAAC
CCATGGTTCTTATCCCACCCAGCAAAGAGAAACGACACTCCAAAAGGACGAAGACCGCCG
AACTGGGTGTACCCTTGTTTGGTATC

QA 2 567 2 567
DS 

RD RR2A756JQ 781 0 0
CACACAATGCAAGATCTCAATTACGAAATAAAACTGTAACTCAAAGAACCTCCAGATCAA
ATTCTCATGAACCACATCAAACTAAAACTGAAAGTTTTAAAACAGAGAACTAACAAGATA
GATATAGATGAGAGACACAGCACCAAGCAGCGATGAGACTGCTCGACCACAGCTTTTGTG
CTCAGGATGATTCAGCAGCGGGTTGAGTCACACCGTGCTCCACCAACAGCTTGGTGAGCG
AGTCAGGAGAGTGAACATGGTACTTAACACTCCCTGAAGGAGTCAAAAACACCTCAGCAA
GCTCAAGCTTCTCAGACGTCAAACTCGTGCTGTCCATAGTCTTGCTCAAAACCTTCAACG
CAAGCTCGACCGCCTCTTCTCTGGTCGCATCCTCCTTGTAGTCCTGTTTCAGAATAGACT
GAGCAGCCTGATTGTTACCCCCAACGGCTGCAGCTTTCCAGCCACCATAGTTCCCACTCG
GGTCACTCATATACAACTGAAACCCATGGTTCTTATCCCACCCAGCAAAGAGAAACGACA
CTCCAAAAGGACGAAGACCGCCGAACTGGGTGTACCCTTGTTTGGTATCGCAGAGAGACT
GAACAAGCTGCTCAACGGGCTTGGAGGTGACTTTCTTCTCGCCGATCAAGACGACGCCGT
CTTTGGATAAGATACCGATGGCGGAACCGGCGTTTCCGATGGCTTCCATGGCGTACTCGA
CTTGGTAGAGACGGCCTTCAGGGGAGAAGATTGTGGTGCGGCTATCGTATCTCCGAGACA
T

QA 1 781 1 781
DS 



CO CL1177Contig2 821 2 12 U
GGGGGGTCGACTGTCGAGAAAATTTCTCAGCCAAGAAGAGGTTCAAAATCAAAGTCCTTC
CTTTCAGCTCTTAAAACATGTCTCGGAGATACGATAGCCGCACCACAATCTTCTCCCCTG
AAGGCCGTCTCTACCAAGTCGAGTACGCCATGGAGGCCATCGGAAACGCCGGTTCCGCCA
TCGATATCTTATCCAAAGACGGCGTCGTCTTGATCGGCGAGAAGAAAGTCACCTCCAAGC
TTCTCCAAACCTCCACCTCCTCCGAGAAAATGTACAAGATCGACGACCATGTCGCCTGCG
CCGTCGCTGGTATCATGTCCGATGCAAACATACTCATCAACACGACTCGTGTCCAAGCCC
AGCGCTACACCTTCATGTACCAAGAGCCCATGCCCGTGGAGCAGCTGGTTCAGTCTCTCT
GCGATACCAAACAAGGGTACACGCAGTTCGGTGGTCTTCGTCCCTTTGGAGTGTCGTTTC
TCTTTGCAGGGTGGGATAAGAACCATGGGTTTCAGTTGTATATGAGTGACCCGAGTGGGA
ACTACGGTGGCTGGAAAGCTGCAGCCGTTGGAGCTAACAACCAGGCTGCTCAGTCTATTC
TGAAACAGGACTACAAGGAGGATGGGACCAGAGAAGAGGCGGTCGAGCTTGCGTTGAAAG
TTTTGAGCAAGACTATGGACAGCACGAGTTTGACATCTGAGAAGCTTGAGCTTGCTGAGT
GTTTTTGACTCCATCAGGAGTGTTAAGTACATGTTCACTCTCCTGACTCGCTCACAAGCT
GTGCTCAAGCACGTGTGACTCACCTGCTGCTGATCATCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV08TF U 1
AF RR2E351TF U 12
BS 1 200 RR2AV08TF
BS 201 201 RR2E351TF
BS 202 286 RR2AV08TF
BS 287 287 RR2E351TF
BS 288 344 RR2AV08TF
BS 345 345 RR2E351TF
BS 346 544 RR2AV08TF
BS 545 545 RR2E351TF
BS 546 732 RR2AV08TF
BS 733 733 RR2E351TF
BS 734 738 RR2AV08TF
BS 739 821 RR2E351TF

RD RR2AV08TF 742 0 0
GGGGGGTCGACTGTCGAGAAAATTTCTCAGCCAAGAAGAGGTTCAAAATCAAAGTCCTTC
CTTTCAGCTCTTAAAACATGTCTCGGAGATACGATAGCCGCACCACAATCTTCTCCCCTG
AAGGCCGTCTCTACCAAGTCGAGTACGCCATGGAGGCCATCGGAAACGCCGGTTCCGCCA
TCGATATCTTATCCAAAGACTGCGTCGTCTTGATCGGCGAGAAGAAAGTCACCTCCAAGC
TTCTCCAAACCTCCACCTCCTCCGAGAAAATGTACAAGATCGACGATCATGTCGCCTGCG
CCGTCGCTGGTATCATGTCCGATGCAAACATACTCATCAACACGGCTCGTGTCCAAGCCC
AGCGCTACACCTTCATGTACCAAGAGCCCATGCCCGTGGAGCAGCTGGTTCAGTCTCTCT
GCGATACCAAACAAGGGTACACGCAGTTCGGTGGTCTTCGTCCCTTTGGAGTGTCGTTTC
TCTTTGCAGGGTGGGATAAGAACCATGGGTTTCAGTTGTATATGAGTGACCCGAGTGGGA
ACTATGGTGGCTGGAAAGCTGCAGCCGTTGGAGCTAACAACCAGGCTGCTCAGTCTATTC
TGAAACAGGACTACAAGGAGGATGGGACCAGAGAAGAGGCGGTCGAGCTTGCGTTGAAAG
TTTTGAGCAAGACTATGGACAGCACGAGTTTGACATCTGAGAAGCTTGAGCTTGCTGAGT
GTTTTTGACTCCGTCAGG
AGTG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2E351TF 810 0 0
G
GTCGAGAAAATTTCTCAGCCAAGAAGAGGTTCAAAATCAAAGTCCTTCCTTTCAGCTCTT
AAAACATGTCTCGGAGATACGATGGCCGCACCACAATCTTCTCCCCTGAAGGCCGTCTCT
ACCAAGTCGAGTACGCCATGGAGGCCATCGGAAACGCCGGTTCCGCCATCGGTATCTTAT
CCAAAGACGGCGTCGTCTTGATCGGCGAGAAGAAAGTCACCTCCAAGCTTCTCCAAACCT
CCACCTCCTCCGAGAAAATGTACAAGATCGACGACCATGTCGCCTGCGCCGTCGCTGGTA
TCATGTCCGATGCAAACATACTCATCAACACGACTCGTGTCCAAGCCCAGCGCTACACCT
TCATGTACCAAGAGCCCATGCCCGTGGAGCAGCTGGTTCAGTCTCTCTGCGATACCAAAC
AAGGGTACACGCAGTTCGGTGGTCTTCGTCCCTTTGGAGTGTCGTTTCTCTTTGCAGGGT
GGGATAAGAACCATGGGTTTCAGTTGTATATGAGTGACCCGAGTGGGAACTACGGTGGTT
GGAAAGCTGCAGCCGTTGGAGCTAACAATCAGGCTGCTCAGTCTATTCTGAAACAGGACT
ACAAGGAGGATGGGACCAGAGAAGAGGCGGTCGAGCTTGCGTTGAA*GTTTTGAGCAAGA
CTATGGACAGCACGAGTTTGACTTCTGAGAAGCTTGAGCTTGCTGAGTGTTTT*GACTCC
ATCAGGAGTGTTAAGTACATGTTCACTCTCCTGACTCGCTCACAAGCTGTGCTCAAGCAC
GTGTGACTCACCTGCTGCTGATCATCTGA

QA 2 810 2 810
DS 



AS 1 6

CO CL1178Contig1 1273 6 14 U
CTAAATTTGTATTATTTATCAACACTGTCTTGTCCAAAGATTGGTTCGAATTTTGATTCA
AACATTCCAACTCATACTAGTAATAATACTCTTCTTTGGCTGCAGGAACTTAACAAAACA
AAACAGTCTCTGATAAATATTAGCGTATAATAAAACATTTAGAAATAGATTCTCATGGGA
AAAAAACACACATGTTACATTGCAAAATCGTCTCATCTGTCGTCTGATGCAGTGGGTTTT
GTGAGTTACTCAAATTCTTTTAGCTTTTTGGAAGCAGACCCTTCTTCCTTATTCTTCTTC
AGCTTACCCTCTCTTCGCTCTCTCTTCACTCCCTTGGATTTATCAGCCAATGGAATTTTT
CCAACCTCCTGCTCAGGAATATAAACCCTCCCTAACTTCCCTAGCACGTCATTTTGATCA
ACATTCTTCACCTTCTTCTTGGGCTTATCTTTAGATGATCTCATCGCTTCTTTCCTTAGG
CCTTCGTTGGGAAGACGGTTACGACGGATAACCAAGTCCATGGATGGACCAACTTCAACA
AGCTCTATCCTAGGCACGATGGTCCCTGACTTTTTTAGCTTAATAGCGCAGTGAGTAAGG
AAAACCTTAGTAGGTGATATCGCTGTGCATACGTAAGCACGGTCTAATCCAGTAAGATTT
AGATTCTCCACAACCTCGCCCCGAAAGAGATCAGTGAGGACTTCTTTAAGCTGCTTGAGC
TCAGGTACATTGCCAAAACCTTCTCCAGTAAAGCAAATAAAAGGCTTTGATCCTTCATGA
GGAGCTATCTTCTTGTCGTAGGAAAAGGAAAGCAGAGATTTAAAGTTCTCAATCCCAACT
TCTATAAGATCGTAGACATGGTGATCATACATTCTGCCCAGCACTAGATTGTCAGGTCTT
TT*CTTTGTGTGAGACCCATACACAAAGATGCTACAGTCGGTCTTGAGAGAGAAGAACTC
CAGAGAGGTTTCACCTCCACTCTCAAAGGGCCTAATGTTCTCATTCCTCCTCGAGTATTT
GATGGCGCCTCCCTTCTTCAAACGGTACAGCTCCATCAGCACAGAGCTAACTGTAGCGCT
CGTCTTTGTTCCATGAAGTATCAATGTCTTCTTCCCGTTCTCGACCAACTTAGGAGCTCG
CTTTTCGAGTACACGCTTGGCTTTGTGGGTCTTCGGAGTTCGTATTTCCATCATGACTGG
TGATTTTCCGGCAACTTCAGCAAAGCGACGGCTCCGAGGAAGAAAGAGGTTTTTCAATTA
AAATGATATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 15 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2BT26JQ U 1
AF RR2D865JQ U 73
AF RR2BH82JQ U 79
AF RR2BH82TF C 486
AF RR2BT26TF C 498
AF RR2D865TF C 498
BS 1 406 RR2BT26JQ
BS 407 407 RR2D865JQ
BS 408 455 RR2BT26JQ
BS 456 456 RR2D865JQ
BS 457 732 RR2BT26JQ
BS 733 733 RR2D865JQ
BS 734 734 RR2BH82JQ
BS 735 831 RR2D865JQ
BS 832 832 RR2BH82JQ
BS 833 875 RR2D865JQ
BS 876 902 RR2BH82JQ
BS 903 903 RR2BH82TF
BS 904 917 RR2BH82JQ
BS 918 1273 RR2BH82TF

RD RR2BT26JQ 732 0 0
CTAAATTTGTATTATTTATCAACACTGTCTTGTCCAAAGATTGGTTCGAATTTTGATTCA
AACATTCCAACTCATACTAGTAATAATACTCTTCTTTGGCTGCAGGAACTTAACAAAACA
AAACAGTCTCTGATAAATATTAGCGTATAATAAAACATTTAGAAATAGATTCTCATGGGA
AAAAAACACACATGTTACATTGCAAAATCGTCTCATCTGTCGTCTGATGCAGTGGGTTTT
GTGAGTTACTCAAATTCTTTTAGCTTTTTGGAAGCAGACCCTTCTTCCTTATTCTTCTTC
AGCTTACCCTCTCTTCGCTCTCTCTTCACTCCCTTGGATTTATCAGCCAATGGAATTTTT
CCAACCTCCTGCTCAGGAATATAAACCCTCCCTAACTTCCCTAGCATGTCATTTTGATCA
ACATTCTTCACCTTCTTCTTGGGCTTATCTTTAGACGATCTCATCGCTTCTTTCCTTAGG
CCTTCGTTGGGAAGACGGTTACGACGGATAACCAAGTCCATGGATGGACCAACTTCAACA
AGCTCTATCCTAGGCACGATGGTCCCTGACTTTTTTAGCTTAATAGCGCAGTGAGTAAGG
AAAACCTTAGTAGGTGATATCGCTGTGCATACGTAAGCACGGTCTAATCCAGTAAGATTT
AGATTCTCCACAACCTCGCCCCGAAAGAGATCAGTGAGGACTTCTTTAAGCTGCTTGAGC
TCAGGTACATTG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2D865JQ 803 0 0
CATACT
AGTAATAATACTCTTCTTTGGCTGCAGGAACTTAACAAAACAAAACAGTCTCTGATAAAT
ATTAGCGTATAATAAAACATTTAGAAATAGATTCTCATGGGAAAAAAACACACATGTTAC
ATTGCAAAATCGTCTCATCTGTCGTCTGATGCAGTGGGTTTTGTGAGTTACTCAAACTCT
TTTAGCTTTTTGGAAGCAAACCCTTCTTCCTTATTCTTCTTCAGCTTACCCTCTCTTCGC
TCTCTCTTCACTCCCTTGGATTTATCAACCAATGGAATTTTCCCAACCTCCTGCTCAGGA
ATATAAACCCTCCCTAACTTCCCTAGCACGTCATTTTGATCAACATTCTTCACCTTCTTC
TTGGGCTTATCTTTAAATGATCTCATCGCTTCTTTCCTTAGGCCTTCGTTGGGAAGACGG
TTACAACGGATAACCAAGTCCATGGATGGACCAACTTCAACAAGCTCTATCCTAGGCACG
ATGGTCCCTGACTTTTTTAGCTTAATAGCGCAGTGAGTAAGGAAAACCTTAGTAGGTGAT
ATCGCTGTGCATACGTAAGCACGGTCTAATCCAGTAAGATTTAGATTCTCCACAACCTCG
CCCCGAAAGAGATCAGTGAGGACTTCTTTAAGCTGCTTAAGCTCAGGTACATTGC*AAAA
CCTTCTCCAGTAAAGCAAATAAAAGGCTTTGATCCTTCATGAGGAGCTATCTTCTTGTCG
TAGGAAAAGGAAAGCAGAGATTTAAAGTTCTCAGTCCCAACTTCTATAAGATCGTAGACA
TGGTGATCATACATTCT

QA 7 803 7 803
DS 

RD RR2BH82JQ 839 0 0
AGTAATAATACTCTTCTTTGGCTGCAGGAACTTAACAAAACAAAACAGTCTCTGATAAAT
ATTAGCGTATAATAAAACATTTAGAAATAGATTCTCATGGGAAAAAAACACACATGTTAC
ATTGCAAAATCGTCTCATCTGTCGTCTGATGCAGTGAGTTTTGTGAGTTACTCAGATTCT
TTTAGCTTTTTGGAAGCAGACCCTTCTTCCTTATTCTTCTTCAGCTTACCCTCTCTTCGC
TCTCTCTTCACTCCCTTGGATTTATCAGCCAATGGAATTTTTCCAACCTCCTGCTCAGGA
ATATAAACCCTCCCTAACTTCCCTAGCACGTCATTTTGATCAACATTCTTCACCTTCTTC
TTGGGCTTATCTTTAGATGATCTCATCGCTTCTTTCCTTAGGCCTTCGTTGGGAAGACGG
TTACGACGGATAACCAAGTCCATGGATGGACCAACTTCAACAAGCTCTATCCTAGGCACG
ATGGTCCCTGACTTTTTTAGCTTAATAGCGCAGTGAGTAAGGAAAACCTTAGTAGGTGAT
ATCGCTGTGCATACGTAAGCACGGTCTAATCCAGTAAGATTTAGATTCTCCACAACCTCG
CCCCGAAAGAGATCAGTGAGGACTTCTTTAAGCTGCTTGAGCTCAGGTACATTGCCAAAA
CCTTCTCCAGTAAAGCAAATAAAAGGCTTTGATCCTTCATGAGGAGCTATCTTCTTGTCG
TAGGAAAAGGAAAGCAGAGATTTAAAGTTCTCAATCCCAACTTCTATAAGATCGTAGACA
TGGTGATCATACATTCTGCCCAGCACTAGATTGTCAGGTCTTTTTCTTTGTGTGAGACC

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR2BH82TF 788 0 0
GTTGGGAAGACGGTTACGACGGATAACCAAGTCCATGGATGGACCAACTTCAACAAGCTC
TATCCTAGGCACGATGGTCC*TGACTTTTTTAGCTTAATAGCGCAGTGAGTAAGGAAAAC
TTTAGTAGGTGATATCGCTGTGCATACGTAAGCACGGTCTAATCCAGTAAGATTTAGATT
CTCCACAACCTCGCCCCGAAAGAGATCAGTGAGGACTTCTTTAAGCTGCTTGAGCTCAGG
TACATTGCCAAAACCTTCTCCAGTAAAGCAAATAAAAGGCTTTGATCCTTCATGAGGAGC
TATCTTCTTGTCGTAGGAAAAGGAAAGCAGAGATTTAAAGTTCTCAATCCCAACTTCTAT
AAGATCGTAGACATGGTGATCATACATTCTGCCCAGCACTAGATTGTCAGGTCTTTT*CT
TTGTGTGAGACCCATACACAAAGATGCTACAGTCGGTCTTGAGAGAGAAGAACTCCAGAG
AGGTTTCACCTCCACTCTCAAAGGGCCTAATGTTCTCATTCCTCCTCGAGTATTTGATGG
CGCCTCCCTTCTTCAAACGGTACAGCTCCATCAGCACAGAGCTAACTGTAGCGCTCGTCT
TTGTTCCATGAAGTATCAATGTCTTCTTCCCGTTCTCGACCAACTTAGGAGCTCGCTTTT
CGAGTACACGCTTGGCTTTGTGGGTCTTCGGAGTTCGTATTTCCATCATGACTGGTGATT
TTCCGGCAACTTCAGCAAAGCGACGGCTCCGAGGAAGAAAGAGGTTTTTCAATTAAAATG
ATATATCC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2BT26TF 774 0 0
GTTACGACGGATAACCAAGTCCATG*ATG*ACCAC**TCAACAAGCTCTATCCTAG*CAC
GATG*TCCCTGACTTTTT*AGCTTA*TAGCGCAGTGAGTAAGGAAAAC*TTAGTAGGTGA
TATCGCTGTGCATACGTAAGCACGGTCTAATCCAGTAAGATTTAGATTCTCCACAACCTC
GCCCCGAAAGAGATCAGTGAGGACTTCTTTAAGCTGCTTGAGCTCAGGTACATTGTCAAA
ACCTTCTCCAGTAAAGCAAATAAAAGGCTTTGATCCTTCATGAGGAGCTATCTTCTTGTC
GTAGGAAAAGGAAAGCAGAGATTTAAAGTTCTCAATCCCAACTTCTATAAGATCGTAGAC
ATGGTGATCATACATTCTGCCCAGCACTAGATTGTCAGGTCTTTT*CTTTGTGTGAGACC
CATACACAAAGATGCTACAGTCGGTCTTGAGAGAGAAGAACTCCAGAGAGGTTTCACCTC
CACTCTCAAAGGGCCTAATGTTCTCATTCCTCCTCGAGTATTTGATGGCGCCTCCCTTCT
TCAAACGGTACAGCTCCATCAGCACAGAGCTAACTGTAGCGCTCGTCTTTGTTCCATGA*
GTATCAATGTCTTCTTCCCGTTCTCGACCAACTTAGGAGCTCGCTTTTCGAGTACACGCT
TGGCTTTGTGGGTCTTCGGAGTTCGTATTTCCATCATGACTGGTGATTTTCCGGCAACTT
CAGCAAAGCGACGGCTCCGAGGAAGAAAGAGGTTTTTCAATTAAAATGATAT
CC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2D865TF 774 0 0
GG
TACGACGGATAACCAAGTCCATGGATG*ACCAACTTCAACAAGCTCTATCCTAGGCACGA
TGGTCCCTGACTTTTT*AGCTTA*TAGCGCAGTGAGTAAGGAAAACCTTAGTAGGTGATA
TCGCTGTGCATACGTAAGCACGGTCTAATCCAGTAAGATTTAGATTCTCCACAACCTCGC
CCCGAAAGAGATCAGTGAGGACTTCTTTAAGCTGCTTAAGCTCAGGTACATTGC*AAAAC
CTTCTCCAGTAAAGCAAATAAAAGGCTTTGATCCTTCATGAGGAGCTATCTTCTTGTCGT
AGGAAAAGGAAAGCAGAGATTTAAAGTTCTCAGTCCCAACTTCTATAAGATCGTAGACAT
GGTGATCATACATTCTGCCCAGCGCTAGATTGTCAGGTCTTTT*CTTTGTGTGAGACCCA
TACACAAAGATGCTACAGTCGGTCTTGAGAGAGAAGAACTCCAGAGAGGTTTCACCTCCA
CTCTCAAAGGGCCTAATGTTCTCATTCCTCCTCGAGTATTTGATGGCGCCTCCCTTCTTC
AAACGGTACAGCTCCATCAGCACAGAGCTAACTGTAGCGCTCGTCTTTGTTCCATGAAGT
ATCAATGTCTTCTTCCCGTTCTCGACCAACTTAGGAGCTCGCTTTTCGAGTACACGCTTG
GCTTTGTGGGTCTTCGGAGTTCGTATTTCCATCATGACTGGTGATTTTCCGGCAACTTCA
GCAAAGCGACGGCTCCGAGGAAGAAAGAGGTTTTTCAATTAAAATGATAT
CC

QA 3 772 3 772
DS 



AS 1 7

CO CL1179Contig1 893 7 22 U
AGGGATACATACATCTCCTCCATCCATCACACAACAAGTAAGATAAAAAGAAACCATTTC
ACCAATGTCCAAAGACTGTGAGAAGCACGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCAGGAGAAT
ATGCGGAGTGATCATCGGCTTCATCATCATTGTCTTGATAACAATCTTCCTCGTCTGGGT
AATCCTCCAACCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCTTTCAA
CCTCACGCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACCG
AAACTCCAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACCGGAACCA
GCAAATCACTTTCCCTACGGCCATTCCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGT
TTGGTCTCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCT
CGGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGATGGGCGCGTGAG
GTGGAAGGTTGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTTT
TATCAATCTTGCGGACAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGGGAAAATATCGTTAAGTACAC
TGTGGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGATACAGCTCTGAC
GCCGTTAAGTTTGCTTTTTTTCTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACTCTTTGCTTCTGTA
TCGTTTAATTTGTCTACTTTTATCTTTATCTCGTAAACTATACCACTCATGACATTACAG
TGTCGCTAAATTATTTTAAATGAACTATAACTACATTTCACATAATTTTGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 
25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 20 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
20 45 45 45 45 45 30 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW58TF U 3
AF RR2BR77TF U 31
AF RR2D016TF U 2
AF RR2GK32TF U 293
AF RR2BF13TF U 1
AF RR2BR77JQ C 122
AF RR2DW58JQ C 255
BS 1 62 RR2BF13TF
BS 63 63 RR2DW58TF
BS 64 87 RR2BF13TF
BS 88 88 RR2DW58TF
BS 89 150 RR2BF13TF
BS 151 151 RR2DW58TF
BS 152 192 RR2BF13TF
BS 193 193 RR2DW58TF
BS 194 234 RR2BF13TF
BS 235 235 RR2DW58TF
BS 236 297 RR2BF13TF
BS 298 298 RR2DW58TF
BS 299 540 RR2BF13TF
BS 541 541 RR2DW58TF
BS 542 719 RR2BF13TF
BS 720 720 RR2D016TF
BS 721 800 RR2BF13TF
BS 801 801 RR2GK32TF
BS 802 816 RR2BF13TF
BS 817 817 RR2GK32TF
BS 818 863 RR2BF13TF
BS 864 893 RR2BR77JQ

RD RR2DW58TF 633 0 0
GGAC
ACATACATCTCCTCCATCCATCCCACAAGAAGTAAGATAAAAAGAAACCTTTTCACCAAT
GTCCAAAGACTGTGAGAAGCACGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCAGGAGAATATGCGG
AGTGATCATCGGCTTCATCATCATTGTCTTGATAACAATCTTCCTCGTCTTGGTAATCCT
CCAACCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCTTTCAACCTCAC
GCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACCGAAACTC
CAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACCGGAACCAGCAAAT
CACTTTCCCTACGGCCATTCCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGTTTGGTC
TCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCTCGGAGA
CGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGATGGGCGCGTGAGGTGGAA
GGTTGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTTTTATCAA
TCTTGCGGACAAATCTAACGGAGTTATTG

QA 5 633 5 633
DS 

RD RR2BR77TF 635 0 0
GGAAG
AAGTAAGATAAAAAGAAACCTTTTCACCAATGTCCAAAGACTGTGAGAAGCACGGAGGAG
GCGGGGGAGGAACCGCCAGGAGAATATGCGGAGTGATCATCGGCTTCTTCATCATTGTCT
TGATAACAATCTTCCTCGTCTGGGTAATCCTCCAACCGACAAAACCAAGATTCATCCTCC
AAGACGCCACCGTCTTCGCTTTCAACCTCACGCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCC
AAGTCACGCTCGTTATACGAAACCGAAACTCCAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTC
ACGTCTACGCCACTTACCGGAACCAGCAAATCACTTTCCTTACGGCCATTCCACCGAGCT
ACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGTTTGGTCTCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCG
TCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCTCGGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGG
TTATACGCGCTGATGGGCGCGTGAGGTGGAAGGTTGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATC
ATCTTCATGTTCGTTGTCATACTTTTATCAATCTTGCGGACAAATCTAACGGAGTTATTG
TCGGGGAAAATATCGTTAAGTACACTGTGG

QA 6 635 6 635
DS 

RD RR2D016TF 719 0 0
GGGAT
ACATACATCTCCTCCATCCATCACACAACAAGTAAGATAAAAAGAAACCATTTCACTAAT
GTCCAAAGACTGTGAGAAGCATGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCAGGA*AATATGCGG
AGTGATCATCGGCTTCATCATCATCGTCTTGATAACAATCTTCCTCGTCTGGGTAATCCT
CCAACCAACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCCTTCAACCTCAC
GCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAATCGAAACTC
CAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACCGGAACCAGCAAAT
CACTTTCCCTACGGCCATTCCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGTTTGGTC
TCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCTCGGAGA
CGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGATGGGCGCGTGAGATGGAA
AGTTGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTTTTATCAA
TCTTGCGGACAA*TCTAACGGAGTTATTGTCGGGGAAAATATCGTTAAGTACACTGTGGA
CTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACG*TGAA*TGGGATACAGCTCTGAC

QA 6 719 6 719
DS 

RD RR2GK32TF 536 0 0
G
GAAACCGAAACTCCAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACC
GGAACCAGCAAATCACTTTCCCTACGGCCATTCCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAG
ACAGTGTTTGGTCTCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCG
TCGCTCTCGGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGATGGGC
GCGTGAGGTGGAAGGCCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTC
ATACTTTTATCAATCTTGCGGATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGGGAAAATATCGTTA
AGTACACTGTGGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGAATACAG
CTCTGACGCCGTTAAGTTTGCTTTTTTTCTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACTCTTTGC
TTCTGTATCGTTTAATTTGTCTACTTTTATCTTTATCTCGTAAACTATACCACTC

QA 2 536 2 536
DS 

RD RR2BF13TF 875 0 0
AGGGATACATACATCTCCTCCATCCATCACACAACAAGTAAGATAAAAAGAAACCATTTC
ACTAATGTCCAAAGACTGTGAGAAGCATGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCAGGAGAAT
ATGCGGAGTGATCATCGGCTTCATCATCATCGTCTTGATAACAATCTTCCTCGTCTGGGT
AATCCTCCAACCAACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCCTTCAA
CCTCACGCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAATCG
AAACTCCAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACCGGAACCA
GCAAATCACTTTCCCTACGGCCATTCCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGT
TTGGTCTCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCT
CGGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGATGGGCGCGTGAG
ATGGAAGGTTGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTTT
TATCAATCTTGCGGACAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGGGAAAATATCGTTAAGTACAC
TGTGGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGATACAGCTCTGAT
GCCGTTAAGTTTGCTTTTTTTCTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACTCTTTGCTTCTGTA
TCGTTTAATTTGTCTACTTT*ATCTTTATCTCGTAA*CTATACCACTCATGACATTACAG
TGTCGCTAAATTATTTTAAATGA
CTATACTACATT

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR2BR77JQ 772 0 0
TGCGGAGTGATCATCGGCTTCTTCATCATTGTCTTGATAACAATCTTCCTCGTCTGGGTA
ATCCTCCAACCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCTTTCAAC
CTCACGCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACCGA
AACTCCAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACCGGAACCAG
CAAATCACTTTCCTTACGGCCATTCCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGTT
TGGTCTCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCTC
GGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGATGGGCGCGTGAGG
TGGAAGGTTGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTTTT
ATCAATCTTGCGGACAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGGGAAAATATCGTTAAGTACACT
GTGGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGATACAGCTCTGACG
CCGTTAAGTTTGTTTTTTTTCTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACTCTTTGCTTCTGTAT
CGTTTAATTTGTCTACTTTTATCTTTATCTCGTAAACTATACCACTCATGACATTACAGT
GTCGCTAAATTATTTTAAATGAACTATAACTACATTTCACATAATTTTGTGG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2DW58JQ 629 0 0
ACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACCGAAACTCCAGGATCG
GAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACCGGAACCAGCAAATCACTTTCC
CTACGGCCATTCCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGTTTGGTCTCCTATTA
TCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCTCGGAGACGAGCAGA
GTCGTGGGTTTGTTGATTTGGTTATACGCGCTGATGGGCGCGTGAGGTGGAAGGTTGGGA
CTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTTTTATCAATCTTGCGG
ACAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGGGAAAATATCGTTAAGTACACTGTGGACTACCAAT
GCAGTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGATACAGCTCTGACGCCGTTAAGTTTGT
TTTTTTTCTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACTCTTTGCCTCTGTATCGTTTAATTTGTC
TACTTTTATCTTTATCTCGTAAACTATACCACTCATGACATTACAGTGTCGCTAAATTAT
TTTAAATGAACTATAACTACATTTCACAT

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 6

CO CL1180Contig1 1278 6 20 U
GGACTCACACTAGCTTAAGTCAGTTTACTCAAAATGGCTACCTTAAACACTCGAG*CTTC
TTCTTCTACTTTTCACTCTGTCTCATACTTAGCAAGAAAGCAACGTCGCAGCTTGATGAG
CTATGGCTAGTCGGCGACGACGATGACGATCCACTCAGGGCGTTGCAGACAAGGCACGAA
AGAACAGAGGGGAAGTGTGATTACTCAGAGGGAAAATGGAGCTACGACGAAACGTATCCT
CTCTACGACTCAAACTGTCCGTACTTGAGCTCTGCGCTAAGTTGTCAGAGAAATGGAAGG
CCTGACTCTTATTACCAGAAATGGAGATGGGTCCCTAAGTCTTGCTCACTTTCAAGGTTT
GACGCATTGAAATTTCTGGGGAAAATGAGGCAAAAAAGAATAATGCTGGTAGGAGATTCA
ATAATGAGGAACCAGTGGGAATCTCTTGTCTGTTTAGTACAGTCTGTGCTTCCCACTCAT
CGTAAGAAGCTCACTTACAATGGTCCTACAATGTCTTTCCATTCTCTGGACTTTGAGACA
TCAATTGAATTCTGTTGGGCTCCTCTGCTTGTGGAACTCAAGAAAGGAAATGACCGTGAA
AGAGTGTTACATTTGGACTCAATTGAAGACAATGCTAGATACTGGCGAGGTGTTGATGTT
CTTGTGTTCGATTCTGCTCACTGGTGGACTCACTCTCAGAAACGGAGTTCGTGGGACTAT
TACAAAGATGGGAACAAGCTTTACAAAGCTATGAACCCAATGGTTGCTTATGAAAGAGGA
CTAACCACATGGGCTGAATGGGTAGAGATTAATCTTGATCCATCCAAAACTAAAGTCATT
TTTCGCACAAGCTCACCAAGAGAGAGTGGTCAAAAGTGCTATAACCAGAAACATCCATTG
CCTTCTTCTAGCGAACCACATGTTCCTCAACAATCAAGAGTTTTGAAAAAAGTGCTTACG
AGAATGAAATACAGAGTGTATTTGCACGATATCACAACAATGTCGGCGTACAGGAGAGAC
GGGCATCCATCGGTGTTTAAGAGAGCTATGGGCGAGGAAGAGAAGCACCATCGTTTCGCT
GGACCTTCGCCAGATTGTAGTCACTGGTGCTTGCCTGGTGTCCCGGATATCTGGAATGAG
ATGCTTTCTTCAACTATCTTAACCAAAGCTGCATGAGTTATGTGTCGGATTTACTCATGA
TGTTTACTTGTGTGAGTTATGTATGCAAAGGGAAGTCAGTGGTTTACTATATATAAGCAT
ACCCTTTCCAAACTAAGC


BQ
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G186TF U 1
AF RR2FL20TF U 1
AF RR2EX44TF U 35
AF RR2B841TF U 1
AF RR2G186JQ C 756
AF RR2B841JQ C 692
BS 1 47 RR2B841TF
BS 48 48 RR2G186TF
BS 49 55 RR2B841TF
BS 56 56 RR2EX44TF
BS 57 67 RR2B841TF
BS 68 68 RR2EX44TF
BS 69 120 RR2B841TF
BS 121 121 RR2EX44TF
BS 122 185 RR2B841TF
BS 186 186 RR2EX44TF
BS 187 248 RR2B841TF
BS 249 249 RR2EX44TF
BS 250 258 RR2B841TF
BS 259 259 RR2G186TF
BS 260 377 RR2B841TF
BS 378 378 RR2EX44TF
BS 379 778 RR2B841TF
BS 779 779 RR2B841JQ
BS 780 856 RR2B841TF
BS 857 1278 RR2B841JQ

RD RR2G186TF 596 0 0
GGACTCACACTAGCTTAAGTCAGTTTACTCAAAATGGCTACCTTAAACACTCGAGTCTTC
TTCTTCTTCTTTTCACTCTGTCTCATACTTAGCAAGAAAGCAACGTCGCAGCTTGATGAG
TTATGGCTAGTCGGCGACGACGATGACGATCCACTCAGGGCGTTGCAGACAAGGCACGAA
AGAACGGAGGGGAAGTGTGATTACTCAGAGGGAAAATGGAGCTACGACGAAACGTATCCT
CTCTACGATTCAAACTGTCCGTACTTGAGCTCTGCGCTAAGTTGTCAGAGAAATGGAAGG
CCTGACTCTTATTACCAGAAATGGAGATGGGTCCCTAAGTCTTGCTCACTTTCAAGGTTT
GACACATTGAAATTTCTTGGGAAAATGAGGCAAAAAAGAATAATGCTGGTAGGAGATTCA
ATAATGAGGAACCAGTGGGAATCTCTTGTCTGTTTAGTACAGTCTGTGCTTCCCACTCAT
CGTAAGAAGCTCACTTACAATGGTCCTACAATGTCTTTCCATTCTCTGGACTTTGAGACA
TCAATTGAATTCTGTTGGGCTCCTCTGCTTGTGGAACTCAAGAAAGGAAATGACCG

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2FL20TF 776 0 0
GGACCCACACTAGCTTAAGTCAGTTTACTCAAAATGGCTACCTTAAACACTCGAG***TC
TTCTTCTACTTTTCTCTCTGTCTCATACTTAGCAAGAAAGCAACGTCGCAGCTTGATGAG
CTATGGCTAGTCGGCGACGACGATGACGATCCACTTAGGGCGTTGCAGACAAGGCACGAA
AGAACAGAGGGGAGGTGTGATTACCCAGTGGGAAAATGGAGCTACGATGAAACGTATCCT
CTCTACGACTCAAACTGTCCGTACTTGAGCTCTGCGCTAAGTTGTCAGAGAAATGGAAGG
CCTGACTCTTATTACCAGAAATGGAGATGGGTCCCTAAGTCTTGCTCACTTTCAAGGTTT
GACGCATTGAAATTTCTGGGGAAAATGAGGCAAAAAAGAATAATGCTGGTAGGAGATTCA
ATAATGAGGAACCAGTGGGAATCTCTTGTCTGTTTAGTACAGTCTGTGCTTCCCACTCAT
CGTAAGAAGCTCAGTTATAATGGTCCTACAATGTCTTTCCATTCTCTGGACTTTGAGACA
TCAATTCAGTTCTGTTGGGCTCCTCTGCTTGTGGAACTCAAGAAAGGAAATGACCGTGAA
AGAGTGTTACATTTGGACTCAATTGAAGACAATGCTAGATACTGGCGAGGTGTTGATGTT
CTTGTGTTCGATTCTGCTCACTGGTGGACTCACTCACAGAAACGGAGTTCGTGGGACTAT
TACAA*GATGGGAACAAGCTTTACAAAGCTATGGACCCAATGGTTGCTTATGAAAG

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2EX44TF 761 0 0
TGGCTACCTTAAACACTCGAG***TCTTCTTCTACTTTTCTCTCTGTCTCATACTTAGCA
AGAAAGCAACGTCGCAGCTTGATGAGCTATGGCTAGTCGGCGACGACGATGACGATCCAC
TTAGGGCGTTGCAGACAAGGCACGAAAGAACAGAGGGGAAGTGTGATTACTCAGTGGGAA
AATGGAGCTACGACGAAACGTATCCTCTCTACGACTCAAACTGTCCGTACTTGAGCTCTG
CGCTAAGTTGTCAGAGAAATGGAAGGCCTGACTCTTATTACCAGAAATGGAGATGGGTCC
CTAAGTCTTGCCCACTTTCAAGGTTTGACGCATTGAAATTTCTGGGGAAAATGAGGCAAA
AAAGAATAATGCTGGTAGGAGATTCAATAATGAGGAACCAGTGGGAATCTCTTGTCTGTT
TAGTACAGTCTGTGCTTCCCACTCATCGTAAGAAGCTCAGTTATAATGGTCCTACAATGT
CTTTCCATTCTCTGGACTTTGAGACATCAATTGAGTTCTGTTGGGCTCCTCTGCTTGTGG
AACTCAAGAAAGGAAATGACCGTGAAAGAGTGTTACATTTGGACTCAATTGAAGACAATG
CTAGATACTGGCGAGGTGTTGATGTTCTTGTGTTCGATTCTGCTCACTGGTGGACTCACT
CACAGAAACGGAGTTCGTGGGACTATTACAAAGATGGGAACAAGCTTTACAAAGCTATGG
ACCCAATGGTTGCTTATGAAAGAG*ACTAACCACATGGGCT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2B841TF 865 0 0
GGACTCACACTAGCTTAAGTCAGTTTACTCAAAATGGCTACCTTAAATACTCGAGCCTTC
TTCTTCTTCTTTTCACTCTGTCTCATACTTAGCAAGAAAGCAACGTCGCAGCTTGATGAG
TTATGGCTAGTCGGCGACGACGATGACGATCCACTCAGGGCGTTGCAGACAAGGCACGAA
AGAACGGAGGGGAAGTGTGATTACTCAGAGGGAAAATGGAGCTACGACGAAACGTATCCT
CTCTACGATTCAAACTGTTCGTACTTGAGCTCTGCGCTAAGTTGTCAGAGAAATGGAAGG
CCTGACTCTTATTACCAGAAATGGAGATGGGTCCCTAAGTCTTGCTCACTTTCAAGGTTT
GACGCATTGAAATTTCTTGGGAAAATGAGGCAAAAAAGAATAATGCTGGTAGGAGATTCA
ATAATGAGGAACCAGTGGGAATCTCTTGTCTGTTTAGTACAGTCTGTGCTTCCCACTCAT
CGTAAGAAGCTCACTTACAATGGTCCTACAATGTCTTTCCATTCTCTGGACTTTGAGACA
TCAATTGAATTCTGTTGGGCTCCTCTGCTTGTGGAACTCAAGAAAGGAAATGACCGTGAA
AGAGTGTTACATTTGGACTCAATTGAAGACAATGCTAGATACTGGCGAGGTGTTGATGTT
CTTGTGTTCGATTCTGCTCACTGGTGGACTCACTCTCAGAAACGGAGTTCGTGGGACTAT
TACAAAGATGGGAACAAGCTTTACAAAGCTATGAACCCAATGGTTGCTTATGAAAGAG*A
CTAACCACATGGGCTGAATGGGTAGAGATTAATCTTGATCCATCCAAAACTAAAGTCATT
TTTCGCACAAGCTCAC
AAGAGAGAG

QA 1 856 1 856
DS 

RD RR2G186JQ 473 0 0
CCCAATGGTTGCTTATGAAAGAGGACTAACCACATGGGCTGAATGGGTAGAGATTAATCT
TGATCCATCCAAAACCAGAGTCATTTTTCGCACAAGCTCACCAAGAGAGAGTGGTCAAAA
GTGCTATAACCAGAAACATCCATTGCCTTCTTCTAGCGAACCACATGTTCCTCAACAATC
AAGAGTTTTGAAAAAAGTGCTTACGAGAATGGAATACAGAGTGTATTTGCACGATATCAC
AACAATGTCGGCGTACAGGAGAGACGGGCATCCATCGGTGTTTAAGATAGCTATGGGCGA
GGAAGAGAAGCACCATCGTTTCGCTGGACCTTCGCCAGATTGTAGTCACTGGTGCTTGCC
TGGTGTCCCGGATATCTGGAATGAGATGCTTTCTTCAATTATCTTAACCAAAGCTGCATG
AGTTATGTGTCGGATTTACTCATGATGTTTACTTGTGTGAGTTAT
GTATGCAA

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2B841JQ 587 0 0
ACTCTCAGAAACGGAGTTCGTGGGACTATTACAAAGATGGGAACAAGCTTTACAAAGCTA
TGAACCCAATGGTTGCTTATGAAAGAGGACTAACCACATGGGCTGAATGGGTAGAGATTA
ATCTTGATCCATCCAAAACTAAAGTCATTTTTCGCACAAGCTCACCAAGAGAGAGTGGTC
AAAAGTGCTATAACCAGAAACATCCATTGCCTTCTTCTAGCGAACCACATGTTCCTCAAC
AATCAAGAGTTTTGAAAAAAGTGCTTACGAGAATGAAATACAGAGTGTATTTGCACGATA
TCACAACAATGTCGGCGTACAGGAGAGACGGGCATCCATCGGTGTTTAAGAGAGCTATGG
GCGAGGAAGAGAAGCACCATCGTTTCGCTGGACCTTCGCCAGATTGTAGTCACTGGTGCT
TGCCTGGTGTCCCGGATATCTGGAATGAGATGCTTTCTTCAACTATCTTAACCAAAGCTG
CATGAGTTATGTGTCGGATTTACTCATGATGTTTACTTGTGTGAGTTATGTATGCAAAGG
GAAGTCAGTGGTTTACTATATATAAGCATACCCTTTCCAAACTAAGC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 7

CO CL1181Contig1 756 7 8 U
GGCTCCTCTCTTTCTCTCTTCCCTCGCTCTCTGTTCAGAGCCCAAACCAGAACACACACA
CTAACACGATGCTGCTTGGAAAGAGACAACGACCACCGATCAACAGAACAACGAGTCTAT
CCGAGATAAAGTTTGATCTGAACCTTCCCAGCGAATCAGAGGTACCATCAACTCAGCAGA
GTCCAAGCCAAAATACTGTGGTCGGGCCGTCCGGTTCCAACGGTCAACACGTAGCAGCAG
CCGTCGATCCACGGTTCTTAGCTATGGTCTCACCGAGAGGTAACCTGAGGAGACACTCAG
GCGAGTTTTCCGACGCTGGACATTTCTTGAGATCTTGCTCCTTATGTGAACGCTTACTTG
TTCCTGGCCGTGACATCTATATGTACAGGGGAGATACGGCCTTTTGTAGCTCAGAGTGCA
GGGAACAGCAAATGACACAAGACGAGGGGAAAGAGAAAGTTAAGCCGGCGAAAGAATCCG
CGGTGCCAGCCAGAGCCAAACCTGGCCGAGGGAGAGCTGCAGCCGCCGTGTAATCCTCCT
CCCCACCCCATATTCACATACATTATATAGTCATATGCTATGTATT**GTGTGGCTTGTT
CTGTGTTTGTATATGATTATATGATGTAATACATATTCAAAGCATTGAGCGTCAATTAAC
CTGTTGTTAATCACTCTCGTGTGTTGTGGTGCATGGAATTGTATGTCTTTTTTACGAGGG
TTTAAATTTTACAAGTTTTGATCTATTTGAAACTAC


BQ
10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH31TF U 45
AF RR2CL34TF U 1
AF RR2EQ95TF U 3
AF RR2C092TF U 2
AF RR2CL34JQ C 1
AF RR2C092JQ C 2
AF RR2EH31JQ C 447
BS 1 1 RR2CL34JQ
BS 2 227 RR2CL34TF
BS 228 228 RR2EQ95TF
BS 229 570 RR2CL34TF
BS 571 571 RR2EQ95TF
BS 572 712 RR2CL34TF
BS 713 743 RR2CL34JQ
BS 744 756 RR2C092JQ

RD RR2EH31TF 252 0 0
G
ACCAGAACACGCACACTAACACGATGCTGCTTGGAAAGAGACAACGACCACCGATCAACA
GAACAACGAGTCTATCCGAGATAAAGTTTGATCTGAACCTTCCCAGCGAATCAGAGGTAC
CATCAACTCAGCAGAGTCCAAGCCAAAATACTGTGGTCGGGCCGTCCGGTTCCAACGGTC
AACACGTAGCAGCAGCCGTCGATCCACGGTTCTTAGCTATGGTCTCACCGAGAGGTAACC
TGAGGAGACAC

QA 2 252 2 252
DS 

RD RR2CL34TF 713 0 0
G
GCTCCTCTCTTTCTCTCTTCCCTCGCTCTCTGTTCAGAGCCCAAACCAGAACACACACAC
TAACACGATGCTGCTTGGAAAGAGACAACGACCACCGATCAACAGAACAACGAGTCTATC
CGAGATAAAGTTTGATCTGAACCTTCCCAGCGAATCAGAGGTACCATCAACTCAGCAGAG
TCCAAGCCAAAATACTGTGGTCGGGCCGTCCGGTTCCAACGGTCAAAACGTAGCAGCAGC
CGTCGATCCACGGTTCTTAGCTATGGTCTCACCGAGAGGTAACCTGAGGAGACACTCAGG
CGAGTTTTCCGACGCTGGACATTTCTTGAGATCTTGCTCCTTATGTGAACGCTTACTTGT
TCCTGGCCGTGACATCTATATGTACAGGGGAGATACGGCCTTTTGTAGCTCAGAGTGCAG
GGAACAGCAAATGACACAAGACGAGGGGAAAGAGAAAGTTAAGCCGGCGAAAGAATCCGC
GGTGCCAGCCAGAGCCAAACCTGGCCGAGGGAGAGCTGCAGCCGCCGTGTAATCCTCCTC
CCCACCCCATATTCACATACATTATATAGCCATATGCTATGTATT**GTGTGGCTTGTTC
TGTGTTTGTATATGATTATATGATGTAATACATATTCAAAGCATTGAGCGTCAATTAACC
TGTTGTTAATCACTCTCGTGTGTTGTGGTGCATGGAATTGTATGTCTTTTT
A

QA 2 712 2 712
DS 

RD RR2EQ95TF 687 0 0
GG
CCTCTCTTTCTCTCTTCCCTCGCTCTCTGTTCAGAGCCCAAACCAGAACACACACACTAA
CACGATGCTGCTTGGAAAGAGACAACGACCACCGATCAACAGAACAACGAGTCTATCCGA
GATAAAGTTTGATCTGAACCTTCCCAGCGAATCAGAGGTACCATCAACTCAGCAGAGTCC
AAGCCAAAATACTGTGGTCGGGCCGTCCGGTTCCAACGGTCAACACGTAGCAGCAGCCGT
CGATCCACGGTTCTTAGCTATGGTCTCACCGAGAGGTAACCTGAGGAGACACTCAGGCGA
GTTTTCCGACGCTGGACATTTCTTGAGATCTTGCTCCTTATGTGAACGCTTACTTGTTCC
TGGCCGTGACATCTATATGTACAGGGGAGATACGGCCTTTTGTAGCTCAGAGTGCAGGGA
ACAGCAAATGACACAAGACGAGGGGAAAGAGAAAGTTAAGCCGGCGAAAGAATCCGCGGT
GCCAGCCAGAGCCAAACCTGGCCGAGGGAGAGCTGCAGCCGCCGTGTAATCCTCCTCCCC
ACCCCATATTCACATACATTATATAGTCATATGCTATGTATT**GTGTGGCTTGTTCTGT
GTTTGTATATGATTATATGATGTAATACATATTCAAAGCATTGAGCGTCAATTAACCTGT
TGTTAATCACTCTCGTGTGTTGTGG

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR2C092TF 692 0 0
GCTCCTCTCTTTCTCTCTTCCCTCGCTCTCTGTTCAGAGCCCAAACCAGAACACACACAC
TAACACGATGCTGCTTGGAAAGAGACAACGACCACCGATCAACAGAACAACGAGTCTATC
CGAGATAAAGTTTGATCTGAACCTTCCCAGCGAATCAGAGGTACCATCAACTCAGCAGAG
TCCAAGCCAAAATACGGTGGTCGGGCCGTCCGGTTCCAACGGTCAACACGTAGCAGCAGC
CGTCGATCCACGGTTCTTAGCTATGGTCTCACCGAGAGGTAACCTGAGGAGACACTCAGG
CGAGTTTTCCGACGCTGGACATTTCTTGAGATCTTGCTCCTTATGTGAACGCTTACTTGT
TCCTGGCCGTGACATCTATATGTACAGGGGAGATACGGCCTTTTGTAGCTCAGAGTGCAG
GGAACAGCAAATGACACAAGACGAGGGGAAAGAGAAAGTTAAGCCGGCGAAAGAATCCGC
GGTGCCAGCCAGAGCCAAACCTGGCCGAGGGAGAGCTGCAGCCGCCGTGTAATCCTCCTC
CCCACCCCATATTCACATACATTATATAGTCATATGCTATGTATT**GTGTGGCTTGTTC
TGTGTTTGTATATGATTATATGATGTAATACATATTCAAAGCATTGAGCGTCAATTAACC
TGTTGTTA*TCACTCTCGTGTGTTGTGGTGCA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2CL34JQ 744 0 0
GGCTCCTCTCTTTCTCTCTTCCCTCGCTCTCTGTTCAGAGCCCAAACCAGAACACACACA
CTAACACGATGCTGCTTGGAAAGAGACAACGACCACCGATCAACAGAACAACGAGTCTAT
CCGAGATAAAGTTTGATCTGAACCTTCCCAGCGAATCAGAGGTACCATCAACTCAGCAGA
GTCCAAGCCAAAATACTGTGGTCGGGCCGTCCGGTTCCAACGGTCAAAACGTAGCAGCAG
CCGTCGATCCACGGTTCTTAGCTATGGTCTCACCGAGAGGTAACCTGAGGAGACACTCAG
GCGAGTTTTCCGACGCTGGACATTTCTTGAGATCTTGCTCCTTATGTGAACGCTTACTTG
TTCCTGGCCGTGACATCTATATGTACAGGGGAGATACGGCCTTTTGTAGCTCAGAGTGCA
GGGAACAGCAAATGACACAAGACGAGGGGAAAGAGAAAGTTAAGCCGGCGAAAGAATCCG
CGGTGCCAGCCAGAGCCAAACCTGGCCGAGGGAGAGCTGCAGCCGCCGTGTAATCCTCCT
CCCCACCCCATATTCACATACATTATATAGCCATATGCTATGTATT**GTGTGGCTTGTT
CTGTGTTTGTATATGATTATATGATGTAATACATATTCAAAGCATTGAGCGTCAATTAAC
CTGTTGTTAATCACTCTCGTGTGTTGTGGTGCATGGAATTGTATGTCTTTTTTACGAGGG
TTTAAATTTTACAAGTTTTGATC
C

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2C092JQ 755 0 0
GCTCCTCTCTTTCTCTCTTCCCTCGCTCTCTGTTCAGAGCCCAAACCAGAACACACACAC
TAACACGATGCTGCTTGGAAAGAGACAACGACCACCGATCAACAGAACAACGAGTCTATC
CGAGATAAAGTTTGATCTGAACCTTCCCAGCGAATCAGAGGTACCATCAACTCAGCAGAG
TCCAAGCCAAAATACGGTGGTCGGGCCGTCCGGTTCCAACGGTCAACACGTAGCAGCAGC
CGTCGATCCACGGTTCTTAGCTATGGTCTCACCGAGAGGTAACCTGAGGAGACACTCAGG
CGAGTTTTCCGACGCTGGACATTTCTTGAGATCTTGCTCCTTATGTGAACGCTTACTTGT
TCCTGGCCGTGACATCTATATGTACAGGGGAGATACGGCCTTTTGTAGCTCAGAGTGCAG
GGAACAGCAAATGACACAAGACGAGGGGAAAGAGAAAGTTAAGCCGGCGAAAGAATCCGC
GGTGCCAGCCAGAGCCAAACCTGGCCGAGGGAGAGCTGCAGCCGCCGTGTAATCCTCCTC
CCCACCCCATATTCACATACATTATATAGTCATATGCTATGTATT**GTGTGGCTTGTTC
TGTGTTTGTATATGATTATATGATGTAATACATATTCAAAGCATTGAGCGTCAATTAACC
TGTTGTTAATCACTCTCGTGTGTTGTGGTGCATGGAATTGTATGTCTTTTTTACGAGGGT
TTAAATTTTACAAGTTTTGATCTATTTGAAACTAC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2EH31JQ 277 0 0
GGGAAAGAGAAAGTTAAGCCGGCGAAAGAATCCGCGGTGCCAGCCAGAGCCAAACCTGGC
CGAGGGAGAGCTGCAACCGCCGTGTAATCCTCCTCCCCACCCCATATTCACATACATTAT
ATAGTCATATGCTATGTATTATGTGTGGCTTGTTCTGTGTTTGTATATGATTATATGATG
TAATACATATTCAAAGCATTGAGCGTCAATTAACCTGTTGTTAATCACTCTCGTGTGTTG
TGGTGCATGGAATTGTATGTCTTTTTTACGAGGGTTT

QA 1 277 1 277
DS 



AS 1 5

CO CL1182Contig1 1035 5 16 U
CTCAAGAAAAATTGAGAGATTTTATTTATTCTTTTAAACATGTGATTCCATAATTAACAG
CCATGAACTTTATCAATTTTGTACTCTTGGCTTGTGTAATAGAAACTAAAATCATGGAAC
AACAAATATGTGCGGTTGAAGGTAACCCACAGTAATAGTATTTTTATGCCTTAAGATAAC
CCTTGTGTTCTAAGTATGCAACGACTGTTTCAGCCATTTCGATTGGAGAAGTTCCCGTTC
CCTCTTCTCCTAGAGAAATCTCGCAGTTCAATGGTGGCTCGTAAGGGTCATCAATCCCGG
TAAAACCTTTAATCTTTCCAGCACGTGCAAGCTTGTAGAGACCCTTTGGATCCCTAGCCT
CACAAACTTCAAGCGACACATTCATGAACACCTCAACAAAATCCCCCTCGGGAAGCAGAG
TTCGACAAGCGTCCCTGTCTCTTCTGTAAGGAGAAATCAAACTTGCAATGCATATGATTC
CAGCATCAGCAAAAAGCTTAGCAACTTCACCGACTCTACGAATGTTCTCAGCACGATCTT
CGACTTTAAAGCTGAGATCACGGTTTAAGCCGTGCCTTACATTATCTCCGTCGAGAATAT
AACAAAGCTTCCCCTTTTGGAACAGCTTCTGGTTCAAAGCACAAGCTAAAGTGCTCTTCC
CTGAACCACTAAGACCAGTGACCCAAATCACACATCCTTTCTGGTCAAGCAATCTCTGTC
TATCAACTTTCTCAACAGGACATTCATGCCACTTTATGTTCGTCGAGTTTCCGACCGTAG
ACAATGGTCCTTGATTTTGTCCTGTGTGACCATTGACCGATTTTAGCTCAGGGAGAGATC
CATTTTTGCTGTAAGTAGATCCTTCCATGGAAAAACAAGCACGAAGAACACCAAAAGATC
TGGAGTTAGTACTCGATGAATAGCTGTCGGATATCCCTTTGGGGGATGCGATTGAAAGGC
CTAGAAACGATTTAGCTCCAATCCTGATGAGATCCGAAATTCGAATTAGAGAGATCGAAG
AAGATGTAAAAAAAA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C210JQ U 1
AF RR2FL39JQ U 2
AF RR2GN92JQ U 14
AF RR2GN92TF C 186
AF RR2C210TF C 595
BS 1 403 RR2C210JQ
BS 404 404 RR2GN92JQ
BS 405 417 RR2C210JQ
BS 418 418 RR2GN92JQ
BS 419 448 RR2C210JQ
BS 449 449 RR2FL39JQ
BS 450 542 RR2C210JQ
BS 543 543 RR2GN92JQ
BS 544 555 RR2C210JQ
BS 556 556 RR2FL39JQ
BS 557 734 RR2C210JQ
BS 735 779 RR2GN92JQ
BS 780 873 RR2GN92TF
BS 874 874 RR2C210TF
BS 875 907 RR2GN92TF
BS 908 1035 RR2C210TF

RD RR2C210JQ 734 0 0
CTCAAGAAAAATTGAGAGATTTTATTTATTCTTTTAAACATGTGATTCCATAATTAACAG
CCATGAACTTTATCAATTTTGTACTCTTGGCTTGTGTAATAGAAACTAAAATCATGGAAC
AACAAATATGTGCGGTTGAAGGTAACCCACAGTAATAGTATTTTTATGCCTTAAGATAAC
CCTTGTGTTCTAAGTATGCAACGACTGTTTCAGCCATTTCGATTGGAGAAGTTCCCGTTC
CCTCTTCTCCTAGAGAAATCTCGCAGTTCAATGGTGGCTCGTAAGGGTCATCAATCCCGG
TAAAACCTTTAATCTTTCCAGCACGTGCAAGCTTGTAGAGACCCTTTGGATCCCTAGCCT
CACAAACTTCAAGCGACACATTCATGAACACCTCAACAAAATCTCCCTCGGGAAGCAAAG
TTCGACAAGCGTCCCTGTCTCTTCTGTAGGGAGAAATCAAACTTGCAATGCATATGATTC
CAGCATCAGCAAAAAGCTTAGCAACTTCACCGACTCTACGAATGTTCTCAGCACGATCTT
CGGCTTTAAAGCTGAAATCACGGTTTAAGCCGTGCCTTACATTATCTCCGTCGAGAATAT
AACAAAGCTTCCCCTTTTGGAACAGCTTCTGGTTCAAAGCACAAGCTAAAGTGCTCTTCC
CTGAACCACTAAGACCAGTGACCCAAATCACACATCCTTTCTGGTCAAGCAATCTCTGTC
TATCAACTTTCTCA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2FL39JQ 730 0 0
A
CAAGAAAAATTGAGAGATTTTATTTATTCTTTTAAACTTGTGATTCCATAATTAACAGCC
ATGAACTTTATCAATTTTGTACTCTTGGCTTGTGTAATAGAAACTAAAACCATGGAACAA
CAAATATGTGCTGTTGAAGGTAACCCACAGTAATAGTATTTT*ATGCCTTAAGATAACCC
TTGTGTTCTAAGTATGCAACGACTGTTTCTGCCATTTCGATTGGAGAAGTTCCCGTTCCT
TCTTCTCCTAGAGAAATCTCGCAGTTCAATGGTGGCTCGTAAGGGTCATCAATCCCGGTA
AAACCTTTAATCTTTCCAGCACGTGCAAGCTTGTAGAGACCCTTTGGATCCCTAGCCTCA
CAAACTTCAAGCGATACATTCATGAACACCTCAACAAAATCTCCCTCGGGAAGCAAAGCT
CGACAAGCGTCCCTGTCTCTTCTGTAAGGAGAAATCAAACTTGCAATGCATATGATTCCA
GCATCAGCAAAAAGCTTAGCAACTTCACCGACTCTACGAATGTTCTCAGCACGATCTTCG
GCTTTAAAGCTGAGATCACGGTTTAAGCCGTGCCTTACATTATCTCCATCGAGGATATAA
CAAAGCTTCCCCCTTTGGAACAACTTCTGGTTCAAAGCACAAGCTAAAGTGCTCTTCCCT
GAACCACTAAGACCAGTGACCCAAATGGCACATCCTTTCTGGTCAAGCAGCCTCTGTCTA
TCAACTTTC

QA 2 730 2 730
DS 

RD RR2GN92JQ 766 0 0
GAGAGATTTTATTTATTCTTTTAAACATGTGATTCCATAATTAACAGCCATGAACTTTAT
CAATTTTGTACTCTTGGCTTGTGTAATAGAAACTAAAATCATGGAACAACAAATATGTGC
GGTTGAAGGTAACCCACAGTAATAGTATTTTTATGCCTTAAGATAACCCTTGTGTTCTAA
GTATGCAACGACTGTTTCAGCCATTTCGATTGGAGAAGTTCCCGTTCCCTCTTCTCCTAG
AGAAATCTCGCAGTTCAATGGTGGCTCGTAAGGGTCATCAATCCCGGTAAAACCTTTAAT
CTTTCCAGCACGTGCAAGCTTGTAGAGACCCTTTGGATCCCTAGCCTCACAAACTTCAAG
CGACACATTCATGAACACCTCAACAAAATCCCCCTCGGGAAGCAGAGTTCGACAAGCGTC
CCTGTCTCTTCTGTAAGGAGAAATCAAACTTGCAATGCATATGATTCCAGCATCAGCAAA
AAGCTTAGCAACTTCACCGACTCTACGAATGTTCTCAGCACGATCTTCGACTTTAAAGCT
GAGATCACGGTTTAAGCCGTGCCTTACATTATCTCCGTCGAGAATATAACAAAGCTTCCC
CTTTTGGAACAGCTTCTGGTTCAAAGCACAAGCTAAAGTGCTCTTCCCTGAACCACTAAG
GCCAGTGACCCAAATCACACATCCTTTCTGGTCAAGCAATCTCTATCTATCAACTTTCTC
AACAGGACATTCATGCCACTTTATGTTCGTCGAGTTTCCGACCGTA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2GN92TF 723 0 0
TGTTCTAAGTATGCAACGACTGTTTCAGCCATTTCGATTGGAGAAGTTCCCGTTCCCTCT
TCTCCTAGAGAAATCTCGCAGTTCAATGGTGGCTCGTAAGGGTCATCAATCCCGGTAAAA
CCTTTAATCTTTCCAGCACGTGCAAGCTTGTAGAGACCCTTTGGATCCCTAGCCTCACAA
ACTTCAAGCGACACATTCATGAACACCTCAACAAAATCCCCCTCGGGAAGCAGAGTTCGA
CAAGCGTCCCTGTCTCTTCTGTAAGGAGAAATCAAACTTGCAATGCATATGATTCCAGCA
TCAGCAAAAAGCTTAGCAACTTCACCGACTCTACGAATGTTCTCAGCACGATCTTCGACT
TTAAAGCTGAGATCACGGTTTAAGCCGTGCCTTACATTATCTCCGTCGAGAATATAACAA
AGCTTCCCCTTTTGGAACAGCTTCTGGTTCAAAGCACAAGCTAAAGTGCTCTTCCCTGAA
CCACTAAGGCCAGTGACCCAAATCACACATCCTTTCTGGTCAAGCAATCTCTATCTATCA
ACTTTCTCAACAGGACATTCATGCCACTTTATGTTCGTCGAGTTTCCGACCGTAGACAAT
GGTCCTTGATTTTGTCCTGTGTGACCATTGACCGATTTTAGCTCAGGGAGAGATCCATTT
TTGCTGTAAGTAGATCCTTCCATGGAAACACAAGCACGAAGAACACCAAAAGATCTGGAG
TT
C

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2C210TF 441 0 0
GAATATAACAAAGCTTCCCCTTTTGGAACAGCTTCTGGTTCAAAGCACAAGCTAAAGTGC
TCTTCCCTGAACCACTAAGACCAGTGACCCAAATCACACATCCTTTCTGGTCAAGCAATC
TCTGTCTATCAACTTTCTCAACAGGACATTCATGCCACTTTATGTTGGTCGAGTTTCCGA
CCGTAGACAATGGTCCTTGTTTTTGTCCTGTGTGACCATTGACCGATTTTAGCTCAGGGA
GAGATCCATTTTTGCTGTAAGTAGATCCTTCCATGGAAAAACAAGCACGAAGAACACCAA
CAGATCTGGAGTTAGTACTCGATGAATAGCTGTCGGATATCCCTTTGGGGGATGCGATTG
AAAGGCCTAGAAACGATTTAGCTCCAATCCTGATGAGATCCGAAATTCGAATTAGAGAGA
TCGAAGAAGATGTAAAAAAAA

QA 1 441 1 441
DS 



AS 1 7

CO CL1183Contig1 599 7 4 U
GGAATTAAAGCTAATAGAACTAACTCTCTCACAAACTTTGAATCTTCTTTAAAAAATTTG
CTTCTTTGGATCATCAATCATGTCACAGCAAGCATTCAATGCTGGCCAAACCAAGGGCCA
AGCTCGTGAGAAGGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCAAAGCAGACTGCACAATCAGCACG
TGATAAGACTGCAGAGGTGGCACAATCAGCACATGACAAGGCTATTGATGTTACACATTC
AGCACAAAACAAGTCTGCTGATAAATCTCATCCCACTAGAGAATCCGCCCAACATGGCCA
GGAACAAACCGCTGGTTTTCTTGGCCAGACGGGAGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAAGG
TGCTTTGGATGGTGTTAAAAACAGTCTTGGCATGAATGAGAAGAAATGAGGAAATGAATA
TTCATACGTCTCAACTGTTTATTTACATATTTAAATATTATTTCTGATGTTTAGCAGTTT
CTGTTTTCTCTAAATTATCTATGTAATAACTATTTTCTTTTTGAAAGATTTTGTGATAAT
AAAAACTGAGATGTAATAATGTACTGCAACATACTATAATTTTCATTTTAAGGGAATGA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E484TF U 1
AF RR2AX55JQ C 48
AF RR2AL32TF U 15
AF RR2BJ63TF U 1
AF RR2CB02TF U 1
AF RR2FR51TF U 15
AF RR2GV79TF U 15
BS 1 473 RR2BJ63TF
BS 474 474 RR2AL32TF
BS 475 558 RR2BJ63TF
BS 559 599 RR2FR51TF

RD RR2E484TF 287 0 0
GGAATTAAAGCTAATAGAACTAACTCTCTCACAAACTTTGAATCTTCTTTAAAAAATTTG
CTTCTTTGGATCATCAATCATGTCACAGCAAGCATTCAATGCTGGCCAAACCAAGGGCCA
AGCTCGTGAGAAGGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCAAAGCAGACTGCACAATCAGCACG
TGATAAGACTGCAGAGGTGGCACAATCATCACATGACAAGGCTATTGATGTTACACATTC
AGCACAAAACAAGTCTGCTGATAAATCTCATCCCACTAGAGAATCCG

QA 1 287 1 287
DS 

RD RR2AX55JQ 385 0 0
TTTAAAAAATTTGCTTCTTTGGATCATCAATCATGTCACAGCAAGCATTCAATGCTGGCC
AAACCAAGGGCCAAGCTCGTGAGAAGGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCAAAGCAGACTG
CACAATCAGCACGTGATAAGACTGCAGAGGTGGCACAATCAGCACATGACAAGGCTATTG
ATGTTACACATTCAGCACAAAACAAGTCTGCTGATAAATCTCATCCCACTAGAGAATCCG
CCCAACATGGCCAGGAACAAACCGCTGGTTTTCTTGGCCAGACGGGAGAATCTGTGAAGA
ACATGGCTCAAGGTGCTTTGGATGGTGTTAAAAACAGTCTTGGCATGAAAGAGAAGAAAT
GAGGAAATGAATATTCATACGTCTC

QA 1 385 1 385
DS 

RD RR2AL32TF 526 0 0
TAGAACTAACTCTCTCACAGACTTTGAATCTTCTTTAAAAAATTTGCTTCTTTGGATCAT
CAATCATGTCACAGCAAGCATTCAATGCTGGCCAAACCAAGGGCCAATCTCGTGAGAAGG
CTGAGCAATGGACTGAGTCTGCAACGCAGACTGCACAATCAGCACGTGATAAGACTGCAG
AGGTGGCACAATCAGCACATGACAAGGCTATTGATGTTACACATTCAGCGCAAAACAAGT
CTGCTGATAAATCTCATTCCACTAGAGAATCCGCCCAACATGGCCAGGAACAAACCGCTG
GTTTTCTTGGCCAGACGGGAGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAAGGTGCTTTGGATGGTG
TTAAGAACAGTCTTGGCATGAATGAGAAGAAATGAGGAAATGAATATTCATACGTCTCAA
CTGTTTATTTACATATTTAAATATTATTTCTGATGTTTAGCAGTTTCTGTTTTCTCTAAA
TTATCTATGTAATAACTATTTTCTTTTTGAAAGATTTTGTGATAAT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2BJ63TF 559 0 0
GGAATTAAAGCTAATAGAACTAACTCTCTCACAAACTTTGAATCTTCTTTAAAAAATTTG
CTTCTTTGGATCATCAATCATGTCACAGCAAGCATTCAATGCTGGCCAAACCAAGGGCCA
AGCTCGTGAGAAGGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCAAAGCAGACTGCACAATCAGCACG
TGATAAGACTGCAGAGGTGGCACAATCAGCACATGACAAGGCTATTGATGTTACACATTC
AGCACAAAACAAGTCTGCTGATAAATCTCATCCCACTAGAGAATCCGCCCAACATGGCCA
GGAACAAACCGCTGGTTTTCTTGGCCAGACGGGAGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAAGG
TGCTTTGGATGGTGTTAAAAACAGTCTTGGCATGAATGAGAAGAAATGAGGAAATGAATA
TTCATACGTCTCAACTGTTTATTTACATATTTAAATATTATTTCTGATGTTTAACAGTTT
CTGTTTTCTCTAAATTATCTATGTAATAACTATTTTCTTTTTGAAAGATTTTGTGATAAT
AAAAACTGAGATGTAATA
T

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2CB02TF 545 0 0
GGAATTAAAGCTAATAGAACTAACTCTCTCACAAACTTTGAATCTTCTTTAAAAAATTTG
CTTCTTTGGATCATCAATCATGTCACAGCAAGCATTCAATGCTGGCCAAACCAAGGGCCA
AGCTCGTGAGAAGGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCAAAGCAGACTGCACAATCAGCACG
TGATAAGACTGCAGAGGTGGCACAATCAGCACATGACAAGGCTATTGATGTTACACATTC
AGCACAAAACAAGTCTGCTGATAAATCTCATCCCACTAGAGAATCCGCCCAACATGGCCA
GGAACAAACCGCTGGTTTTCTTGGCCAGACGGGAGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAAGG
TGCTTTGGATGGTGTTAAAAACAGTCTTGGCATGAATGAGAAGAAATGAGGAAATGAATA
TTCATACGTCTCAACTGTTTATTTACATATTTAAATATTATTTCTGATGTTTAGCAGTTT
CTGTTTTCTCTAAATTATCTATGTAATAACTATTTTCTTTTTGAAAGATTTTGTGATAAT
AAAAA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2FR51TF 585 0 0
TAGAACTAACTCTCTCACAGACTTTGAATCTTCTTTAAAAAATTTGCTTCTTTGGATCAT
CAATCATGTCACAGCAAGTATTCAATGCTGGCCAAACCAAGGGCCAAGCTCGTGAGAAGG
CTGAGCAATGGACTGAGTCTGCAAAGCAGACTGCACAATCAGCACGTGATAAGACTGCAG
AGGTGGCACAATCAGCACATGACAAGGCTATTGATGTTACACATTCAGCACAAAACAAGT
CTGCTGATAAATCTCATTCCACTAGAGAATCCGCCCAACATGGCCAGGAACAAACCGCTG
GTTTTCTTGGCCAGACGGGAGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAAGGTGCTTTGGATGGTG
TTAAGAACAGTCTTGGCATGAATGAGAAGAAATGAGGAAATGAATATTCATACGTCTCAA
CTGTTTATTTACATATTTAAATATTATTTCTGATGTTTAGCAGTTTCTGTTTTCTCTAAA
TTATCTATGTAATAACTATTTTCTTTTTGAAAGATTTTGCGATAATAAAAACTGAGATGT
AATAATGTACTGCAACATACTATAATTTTCATTTTAAGGGAATGA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2GV79TF 531 0 0
TAGAACTAACTCTCTCACAGACTTTGAATCTTCTTTAAAAAATTTGCTTCTTTGGATCAT
CAATCATGTCACAGCAAGCGTTCAATGCTGGCCAAACCAAGGGCCAAGCTCGTGAGAAGG
CTGAGCAATGGACTGAGTCTGCAAAGCAGACTGCACAATCAGCACGTGATAAGACTGCAG
AGGTGGCACAATCAGCACATGACAAGGCTATTGATGTTACACATTCAGCACAAAACAAGT
CTGCTGATAAATCTCATTCCACTAGAGAATCCGCCCAACATGGCCAGGAACAAACCGCTG
GTTTTCTTGGCCAGACGGGAGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAAGGTGCTTTGGATGGTG
TTAAGAACAGTCTTGGCATGAATGAGAAGAAATGAGGAAATGAATATTCATACGTCTCAA
CTGTTTATTTACATATTTAAATATTATTTCTGATGTTTAGCAGTTTCTGTTTTCTCTAAA
TTATCTATGTAATAACTATTTTCTTTTTGAAAGATTTTGTGATAATAAAAA

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 6

CO CL1184Contig1 1265 6 36 U
AATGGCAATGAATGATGAAAATGATAGTATAGTATATATCAAAAAA**ACATAGCTTATC
TTCAGGTTACACAAACTTAGATGTGAAAATTACACTTGCTGTTCCACTATACTTGCCACC
GAATGTTAAATCAGTAGACTTCAACGTTCCATTGCTCTGCTTTCTTCAACTGCTTCTTAT
AATCAAACCAATCAATACCGTCGTTAGCAGCTAATGAGACCATGATGTCATCAATTCCTT
TCTCCATGCCCTTGAGCCCACACATGTAGACAAACGTGTTGTCTTTCTTCAACAACTCCC
ATAGTTCAGGCGCGTACTGCGCCATTCTGGTCTGGATATACATTTTCTCTCCTTTATCGT
TAGTTTCTTCTCTGCTTATAGCGTAATCAACCCTGAAATTCTCAGGTGCCTTTGCTTTCA
TCTTACCAAACTCCTCTGTGTAGAGCAATGAACTAGTGGTTGGTACACCCAAGAACAGCC
ACGCTAAGCCATTAAACTTGTAGTCATCATGTTTCTCGAAGAACATCTTCCACAAGAAAG
ACCTGAAAGGAGCTATTCCTGTCCCTGTGGCAAGCATAATAACAGTGGCGTTTGGATCCT
TAGGCATAAGCATTTCTTTCCCTACAGGACCAGTGAGTTTAACCTCACTCCCTGGTTTCA
AGTCACATAAGAAGTTTGAGCAAACTCCTTTAACAACCTCTCCTGCGTCATTAGTATAAA
CAAGCCTTTTCACGCACAAAGAAACGGTTTCAGAGTTGCCAAAATCTCCAAGAGCGCTGC
TCGCAATGGAGTAAAGCCTGACCTTGTTAGGCTTCCCATTCTTGTCAACCCCATCTGCAA
TCACACCAACAGATTGTCCCTCTCTGTACGGTATTTCACCTTGATGGCTGAAAACCATGT
GCCAGGTCTCTCCAGGGGCATCATCAGCTGTGATCTTGGCGTTGAGAAGGACTTTGCCGG
TGTAAGGTTCTTTTGGTCTGTACTTGTTGGTGATCACACCTTCCTCGTTCTTCTTTGACT
CTTTCTCTACTTTCTTCACTGGAGGAGGAGTATCTGTTGTGACCTCAGCTCTTACCGAAA
CCACTCTTCTGCTTGTCACTACATTGTTGCTTTTGTAGTAAAAAGCACCCTTACCAAACC
TGACCCTTTCAGGAGCAATGGCACAGCTTGTAGCAGGAAGAGAAGAAGATTTTGAACATG
TGAGAGAGACAGCAGCATTCAGAGTAGTCGCCATTGCAGACAGAGGATATGAAATGAAAC
TGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 

AF RR2BI10JQ U 1
AF RR2H832JQ U 10
AF RR2BW69JQ U 14
AF RR2FP90JQ U 14
AF RR2BW69TF C 603
AF RR2FP90TF C 605
BS 1 160 RR2BI10JQ
BS 161 161 RR2H832JQ
BS 162 202 RR2BI10JQ
BS 203 203 RR2H832JQ
BS 204 223 RR2BI10JQ
BS 224 224 RR2H832JQ
BS 225 303 RR2BI10JQ
BS 304 305 RR2H832JQ
BS 306 310 RR2BI10JQ
BS 311 311 RR2H832JQ
BS 312 328 RR2BI10JQ
BS 329 329 RR2H832JQ
BS 330 334 RR2BI10JQ
BS 335 335 RR2H832JQ
BS 336 361 RR2BI10JQ
BS 362 362 RR2H832JQ
BS 363 400 RR2BI10JQ
BS 401 401 RR2H832JQ
BS 402 412 RR2BI10JQ
BS 413 413 RR2H832JQ
BS 414 451 RR2BI10JQ
BS 452 452 RR2H832JQ
BS 453 481 RR2BI10JQ
BS 482 482 RR2H832JQ
BS 483 710 RR2BI10JQ
BS 711 711 RR2H832JQ
BS 712 727 RR2BI10JQ
BS 728 728 RR2H832JQ
BS 729 733 RR2BI10JQ
BS 734 734 RR2H832JQ
BS 735 773 RR2BI10JQ
BS 774 784 RR2BW69JQ
BS 785 806 RR2FP90JQ
BS 807 939 RR2BW69TF
BS 940 940 RR2FP90TF
BS 941 1265 RR2BW69TF

RD RR2BI10JQ 773 0 0
AATGGCAATGAATGATGAAAATGATAGTATAGTATATATCAAAAAA**ACATAGCTTATC
TTCAGGTTACACAAACTTAGATGTGAAAATTACACTTGCTGTTCCACTATACTTGCCACC
GAATGTTAAATCAGTAGACTTCAACGTTCCATTGCTCTGCCTTCTTCAACTGCTTCTTAT
AATCAAACCAATCAATACCGTCATTAGCAGCTAATGAGACCATAATGTCATCAATTCCTT
TCTCCATGCCCTTGAGCCCACACATGTAGACAAACGTGTTGTCTTTCTTCAACAACTCCC
ATAACTCAGGTGCGTACTGCGCCATTCTTGTCTGAATATACATTTTCTCTCCTTTATCGT
TTGTTTCTTCTCTGCTTATAGCGTAATCAACCCTGAAATTTTCAGGTGCCTTAGCTTTCA
TCTTACCAAACTCCTCTGTGTAGAGCAATGAGCTAGTGGTTGGTACACCCAAGAACAGCC
AAGCTAAGCCATTAAACTTGTAGTCATCATGTTTCTCGAAGAACATCTTCCACAAGAAAG
ACCTGAAAGGAGCTATTCCTGTCCCTGTGGCAAGCATAATAACAGTGGCGTTTGGATCCT
TAGGCATAAGCATTTCTTTCCCTACAGGACCAGTGAGTTTAACCTCACTCCCTGGTTTCA
AGTCACATAAGAAGTTTGAGCAAACTCCTTTAACAACCTCTCCTGCGTCACTAGTATAAA
CAAGCCTCTTCACACACAAAGAAACGGTTTCAGAGTTGCCAAAATCTCCAAGA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2H832JQ 743 0 0
GAATGA
TGAAAATGATAGTATAGTATATATCAAAAAA**ACATAGCTTATCTTCAGGTTACACAAA
CTTAGATGTGAAAATTACACTTGCTGTTCCACTATACTTGCCACCGAATGTTAAATCAGT
AGACTTCAACGTTCCATTGCTCTGCTTTCTTCAACTGCTTCTTATAATCAAACCAATCAA
TACCGTCGTTAGCAGCTAATGAGACCATGATGTCATCAATTCCTTTCTCCATGCCCTTGA
GCCCACACATGTAGACAAACGTGTTGTCTTTCTTCAACAACTCCCATAGTTCAGGCGCGT
ACTGCGCCATTCTGGTCTGGATATACATTTTCTCTCCTTTATCGTTAGTTTCTTCTCTGC
TTATAGCGTAATCAACCCTGAAATTCTCAGGTGCCTTTGCTTTCATCTTACCAAACTCCT
CTGTGTAGAGCAATGAACTAGTGGTTGGTACACCCAAGAACAGCCACGCTAAGCCATTAA
ACTTGTAGTCATCATGTTTCTCGAAGAACATCTTCCACAAGAAAGACCTGAAAGGAGCTA
TTCCTGTCCCTGTGGCAAGCATAATAACAGTGGCGTTTGGATCCTTAGGCATAAGCATTT
CTTTCCCTACAGGACCAGTGAGTTTAACCTCACTCCCTGGTTTCAAGTCACATAAGAAGT
TTGAGCAAACTCCTTTAACAACCTCTCCTGCGTCATTAGTATAAACAAGCCTTTTCACGC
ACAAAGAAACGGTTTCA

QA 7 743 7 743
DS 

RD RR2BW69JQ 771 0 0
AG
TGAAAATGATAGTATAGTATATATCAAAAAA**ACATAGCTTATCTTCAGGTTACACAAA
CTTAGATGTGAAAATTACACTTGCTGTTCCACTATACTTGCCACCGAATGTTAAATCAGT
AGACTTCAACGTTCCATTGCTCTGCTTTCTTCAACTGCTTCTTATAATCAAACCAATCAA
TACCGTCGTTAGCAGCTAATGAGACCATGATGTCATCAATTCCTTTCTCCATGCCCTTGA
GCCCACACATGTAGACAAACGTGTTGTCTTTCTTCAACAACTCCCATAGTTCAGGCGCGT
ACTGCGCCATTCTGGTCTGGATATACATTTTCTCTCCTTTATCGTTAGTTTCTTCTCTGC
TTATAGCGTAATCAACCCTGAAATTCTCAGGTGCCTTTGCTTTCATCTTACCAAACTCCT
CTGTGTAGAGCAATGAACTAGTGGTTGGTACACCCAAGAACAGCCACGCTAAGCCATTAA
ACTTGTAGTCATCATGTTTCTCGAAGAACATCTTCCACAAGAAAGACCTGAAAGGAGCTA
TTCCTGTCCCTGTGGCAAGCATAATAACAGTGGCGTTTGGATCCTTAGGCATAAGCATTT
CTTTCCCTACAGGACCAGTGAGTTTAACCTCACTCCCTGGTTTCAAGTCACATAAGAAGT
TTGAGCAAACTCCTTTAACAACCTCTCCTGCGTCATTAGTATAAACAAGCCTTTTCACGC
ACAAAGAAACGGTTTCAGAGTTGCCAAAATCTCCAAGAGCGCTGCTCGC

QA 3 771 3 771
DS 

RD RR2FP90JQ 793 0 0
GG
TGAAAATGATAGTATAGTATATACCAAAAAAAAACATAGCTTATCTTCAGGTTGCACAAA
CTTAAACGTGAAAATTACACTTGCTGTTCCACTATACTTGCCACCGAATGTTAAATCAGT
AGACTTCAACGTTCCATTGCTCTGCTTTCTTCAACTGCTTCTTATAATCAAACCAATCAA
TACCGTCGTTAGCAGCTAATGAGACCATGATGTCATCAATTCCTTTCTCCATGCCCTTGA
GCCCACACATGTAGACAAACGTGTTGTCTTTCTTCAACAACTCCCATAGTTCAGGCGCGT
ACTGCGCCATTCTGGTCTGGATATACATTTTCTCTCCTTTATCGTTAGTTTCTTCTCTGC
TTATAGCGTAATCAACCCTGAAATTCTCAGGTGCCTTTGCTTTCATCTTACCAAACTCCT
CTGTGTAGAGCAATGAACTAGTGGTCGGTACACCCAAGAACAGCCACGCTAAGCCATTAA
ACTTGTAGTCATCATGTTTCTCGAAGAACATCTTCCACAAGAAAGACCTGAAAGGAGCTA
TTCCTGTCCCTGTGGCAAGCATAATAACAGTGGCGTTTGGATCCTTAGGCATAAGCATTT
CTTTCCCTACAGGACCAGTGAGTTTAACCTCACTCCCTGGTTTCAAGCCACATAAGAAGT
TTGAGCAAACTCCTTTAACAACCTCTCCTGCGTCATTAGTATAAACAAGCCTTTTCACGC
ACAAAGAAACGGTTTCAGAGTTGCCAAAATCTCCAAGAGCGCTGCTCGCAATGGAGTAAA
GCCTGACCTTG

QA 3 793 3 793
DS 

RD RR2BW69TF 663 0 0
GGCATAAGCATTTCTTTCCCTACAGGACCAGTGAGTTTAACCTCACTCCCTGGTTTCAAG
TCACATAAGAAGTTTGAGCAAACTCCTTTAACAACCTCTCCTGCGTCATTAGTATAAACA
AGCCTTTTCACGCACAAAGAAACGGTTTCAGAGTTGCCAAAATCTCCAAGAGCGCTGCTC
GCAATGGAGTAAAGCCTGACCTTGTTAGGCTTCCCATTCTTGTCAACCCCATCTGCAATC
ACACCAACAGATTGTCCCTCTCTGTACGGTATTTCACCTTGATGGCTGAAAACCATGTGC
CAGGTCTCTCCAGGGGCATCATCAGCTGTGATCTTGGTGTTGAGAAGGACTTTGCCGGTG
TAAGGTTCTTTTGGTCTGTACTTGTTGGTGATCACACCTTCCTCGTTCTTCTTTGACTCT
TTCTCTACTTTCTTCACTGGAGGAGGAGTATCTGTTGTGACCTCAGCTCTTACCGAAACC
ACTCTTCTGCTTGTCACTACATTGTTGCTTTTGTAGTAAAAAGCACCCTTACCAAACCTG
ACCCTTTCAGGAGCAATGGCACAGCTTGTAGCAGGAAGAGAAGAAGATTTTGAACATGTG
AGAGAGACAGCAGCATTCAGAGTAGTCGCCATTGCAGACAGAGGATATGAAATGAAACTG
TCC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2FP90TF 661 0 0
CATAAGCATTTCTTTCCCTACAGGACCAGTGAGTTTAACCTCACTCCCTGGTTTCAAGCC
ACATAAGAAGTTTGAGCAAACTCCTTTAACAACCTCTCCTGCGTCATTAGTATAAACAAG
CCTTTTCACGCACAAAGAAACGGTTTCAGAGTTGCCAAAATCTCCAAGAGCGCTGCTCGC
AATGGAGTAAAGCCTGACCTTGTTAGGCTTCCCATTCTTGTCAACCCCATCTGCAATCAC
ACCAACAGATTGTCCCTCTCTGTACGGTATTTCACCTTGATGGCTGAAAACCATGTGCCA
GGTCTCTCCAGGGGCATCATCAGCTGTGATCTTGGCGTTGAGAAGGACTTTGCCGGTGTA
AGGTTCTTTTGGTCTGTACTTGTTGGTGATCACACCTTCCTCGTTCTTCTTTGACTCTTT
CTCTACTTTCTTCACTGGAGGAGGAGTATCTGTTGTGACCTCAGCTCTTACCGAAACCAC
TCTTCTGCTTGTCACTACATTGTTGCTTTTGTAGTAAAAAGCACCCTTACCAAACCTGAC
CCTTTCAGGAGCAATGGCACAGCTTGTAGCAGGAAGAGAAGAAGATTTTGAACATGTGAG
AGAGACAGCAGCATTCAGAGTAGTCGCCATTGCAGACAGAGGATATGAAATGAAGCTGTC
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 7

CO CL1185Contig1 1044 7 6 U
GGACGAAATCGACGAGGTTGAAGAGAAAAAAAAAGAAAAAGAGATAGCAAAATGGAATGG
AAGAAATGGTACTTAGACGTGATTCTTGTGCCATTAGCTCTTGCGATGATGCTTTGTTAC
CACATCTACTTGTCCTTCATGGTTCGAACCCAGCCCTTCTCCACCGTCCTCGGCATTAAC
TCTCGCGGCCGCCGACTCTGGATTTCCGCTATGATCAAGGAGAATCAGAAGATGAACATT
TTAACTGTACAAACACTCCGTAACATAGTAATGGGAGCTACACTGATGGCTACGACCTGC
ATCCTCCTCTGCGCCGGTCTAGCCGCAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCC
CTAAACGACGCCGTTTATGGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACG
ATTCTCACAATCTTCATCTTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAAC
CAAGTCGCCATGCTCGTTAACATCCCTAACTTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTC
CTCACGTCTGAGTACGTCAGCGAGTTGTTTGACAAGGGTTTCTTTCTCAGCACGGTAGGC
AACAGGTTGTTCTACGCAGGGTTTTCTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTG
TTCTTGAGCGTTTTGTTGATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGC
AACAATAAAGAAAAACAACGTATAGTGGATTGTCCACGCGCCTTTGAGACTCCAAACGGT
GGTGGTGATGATGCATAATACAATTCCATATGTGAAATTTTGAAAAACAATATGAAAATG
ATAATATACACATTTTTCAAATGTGAAAATGGTATATCTATCATCACCTAAATAGTTAAA
CATGGTGATTTTAAGTATCACTACTTATTTTGTTATTCATAATGCATGTCTTAACAAGAA
CTGAGTTCGAGTTGTATTGTTTACTATAGTGAATCAGTATTGTAGATCGTAAATTTAAGA
AAAATAAAAAGTCCTTTTGATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E283TF U 1
AF RR2D992TF U 8
AF RR2CC11TF U 19
AF RR2H317TF U 18
AF RR2D992JQ C 298
AF RR2E283JQ C 688
AF RR2H317JQ C 301
BS 1 714 RR2E283TF
BS 715 725 RR2D992TF
BS 726 733 RR2H317TF
BS 734 735 RR2D992JQ
BS 736 750 RR2H317TF
BS 751 1044 RR2D992JQ

RD RR2E283TF 714 0 0
GGACGAAATCGACGAGGTTGAAGAGAAAAAAAAAGAAAAAGAGATAGCAAAATGGAATGG
AAGAAATGGTACTTAGACGTGATTCTTGTGCCATTAGCTCTTGCGATGATGCTTTGTTAC
CACATCTACTTGTCCTTCATGGTTCGAACCCAGCCCTTCTCCACCGTCCTCGGCATTAAC
TCTCGCGGCCGCCGACTCTGGATTTCCGCTATGATCAAGGAGAATCAGAAGATGAACATT
TTAACTGTACAAACACTCCGTAACATAGTAATGGGAGCTACACTGATGGCTACGACCTGC
ATCCTCCTCTGCGCCGGTCTAGCCGCAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCC
CTAAACGACGCCGTTTATGGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACG
ATTCTCACAATCTTCATCTTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAAC
CAAGTCGCCATGCTCGTTAACATCCCTAACTTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTC
CTCACGTCTGAGTACGTCAGCGAGTTGTTTGACAAGGGTTTCTTTCTCAGCACGGTAGGC
AACAGGTTGTTCTACGCAGGGTTTTCTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTG
TTCTTGAGCGTTTTGTTGATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2D992TF 722 0 0
GCG
GACGAGGTTGAAGAGAAAAAAAAAGAAAAAGAGATAGCAAAATGGAATGGAAGAAATGGT
ACTTAGACGTGATTCTTGTGCCATTAGCTCTTGCGATGATGCTTTGTTACCACATCTACT
TGTCCTTCATGGTTCGAACCCAGCCCTTCTCCACCGTCCTCGGCATTAACTCTCGCGGCC
GCCGACTCTGGATTTCCGCTATGATCAAGGAGAATCAGAAGATGAACATTTTAACTGTAC
AAACACTCCGTAACATAGTAATGGGAGCTACACTGATGGCTACGACCTGCATCCTCCTCT
GCGCCGGTCTAGCCGCAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCCCTAAACGACG
CCGTTTATGGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATTCTCACAA
TCTTCATCTTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAACCAAGTCGCCA
TGCTCGTTAACATCCCTAACTTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTCCTCACGTCTG
AGTACGTCAGCGAGTTGTTTGACAAGGGTTTCTTTCTCAGCACGGTAGGCAACAGGTTGT
TCTACGCAGGGTTTTCTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTGTTCTTGAGCG
TTTTGTTGATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGCAACAA
TAAA

QA 4 718 4 718
DS 

RD RR2CC11TF 707 0 0
TTGAAGA
AAAAAAAAAGAAAAAGAGATAGCAAAATGGAATGGAAGAAATGGTACTTAGACGTGATTC
TTGTGCCATTAGCTCTTTCTATGGTGCTTTGTTACCACATCTACTTGTCCTTCATGGTTC
GAACCCAGCCCTTCTCCACCGTCCTCGGCATTAACTCTCGCGGCCGCCGACTCTGGATTT
CCGCTATGATCAAGGAGAATCAGAAGATGAACATTTTAACTGTACAAACACTCCGTAACA
TAGTAATGGGAGCTACACTGATGGCTACGACCTGCATCCTCCTCTGCGCCGGTCTAGCCG
CAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCCCTAAACGACGCCGTTTATGGTGCTC
ATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATTCTCACAATCTTCATCTTTTCTT
TCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAACCAAGTCGCCATGCTCGTTAACATCC
CTAACTTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTCCTCACGTCTGAGTACGTCAGCGAGT
TGTTTGACAAGGGTTTCTTTCTCAGCACGGTAGGCAACAGGTTGTTCTACGCAGGGTTTT
CTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTGTTCTTGAGCGTTTTGTTGATGATTC
TTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGCAACAA

QA 8 707 8 707
DS 

RD RR2H317TF 748 0 0
TTGAAGAG
AAAAAAAAAGAAAAAGAGATAGCAAAATGGAATGGAAGAAATGGTACTTAGACGTGATTC
TTGTGCCATTAGCTCTTGCGATGATGCTTTGTTACCACATCTACTTGTCCTTCATGGTTC
GAACCCAGCCCTTCTCCACCGTCCTCGGCATTAACTCTCGCGGCCGCCGACTCTGGATTT
CCGCTATGATCAAGGAGAATCAGAAGATGAACATTTTAACTGTACAAACACTCCGTAACA
TAGTAATGGGAGCTACACTGATGGCTACGACCTGCATCCTCCTCTGCGCCGGTCTAGCCG
CAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCCCTAAACGACGCCGTTTATGGTGCTC
ATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATTCTCACAATCTTCATCTTTTCTT
TCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCCTAACCAAGTCGCCATGCTCGTTAACATCC
CTAACTTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTCCTCACGTCTGAGTACGTCAGCGAGT
TGTTTGACAAGGGTTTCTTTCTCAGCACGTTAGGCAACAGGTTGTTCCACGCACGGTTTT
CTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTGTTCTTGAGCGTTTTGTTGATGATTC
TTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGCA*CAATAAAGAAA**CAACGTATAG
TGGAT
GTCACGCGCTCTGAG

QA 9 733 9 733
DS 

RD RR2D992JQ 747 0 0
TGCATCCTCCTCTGCGCCGGTCTAGCCGCAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAG
CCCCTAAACGACGCCGTTTATGGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTA
ACGATTCTCACAATCTTCATCTTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTT
AACCAAGTCGCCATGCTCGTTAACATCCCTAACTTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTG
TTCCTCACGTCTGAGTACGTCAGCGAGTTGTTTGACAAGGGTTTCTTTCTCAGCACGGTA
GGCAACAGGTTGTTTTACGCAGGGTTTTCTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTC
GTGTTCTTGAGCGTTTTGTTGATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTC
GGCAACAATAAAGAAAAACAACGTATAGTGGATTGTCCACGCGCCTTTGAGACTCCAAAC
GGTGGTGGTGATGATGCATAATACAATTCCATATGTGAAATTTTGAAAAACAATATGAAA
ATGATAATATACACATTTTTCAAATGTGAAAATGGTATATCTATCATCACCTAAATAGTT
AAACATGGTGATTTTAAGTATCACTACTTATTTTGTTATTCATAATGCATGTCTTAACAA
GAACTGAGTTCGAGTTGTATTGTTTACTATAGTGAATCAGTATTGTAGATCGTAAATTTA
AGAAAAATAAAAAGTCCTTTTGATTGG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2E283JQ 351 0 0
ACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGCAACAATAAAGAAAAACAACGTATAGTG
GATTGTCCACGCGCCTTTGAGACTCCAAACGGTGGTGGTGATGATGCATAATACAATTCC
ATATGTGAAATTTTGAAAAACAATATGAAAATGATAATATACACATTTTTCAAATGTGAA
AATGGTATATCTATCATCACCTAAATAGTTAAACATGGTGATTTTAAGTATCACTACTTA
TTTTGTTATTCATAATGCATGTCTTAACAAGAACTGAGTTCGAGTTGTATTGTTTACTAT
AGTGAATCAGTATTGTAGATCGTAAATTTAAGAAAAATAAAAAGTCCTTT
G

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR2H317JQ 744 0 0
ATCCTCCTCTGCGCCGGTCTAGCCGCAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCC
CTAAACGACGCCGTTTATGGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACG
ATTCTCACAATCTTCATCTTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCCTAAC
CAAGTCGCCATGCTCGTTAACATCCCTAACTTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTC
CTCACGTCTGAGTACGTCAGCGAGTTGTTTGACAAGGGTTTCTTTCTCAGCACGTTAGGC
AACAGGTTGTTCCACGCAGGGTTTTTTTTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTG
TTCTTGAGCGTTTTGTTGATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGC
AACAATAAAGAAAAACAACGTATAGTGGATTGTCCACGCGCCTTTGAGACTCCAAACGGT
GGTGGTGATGATGCATAATACAATTCCATATGTGAAATTTTGAAAAACAATATGAAAATG
ATAATATACACATTTTTCAAATGTGAAAATGGTATATCTATCATCACCTAAATAGTTAAA
CATGGTGATTTTAAGTATCACTACTTATTTTGTTATTCATAATGCATGTCTTAACAAGAA
CTGAGTTCGGGTTGTATTGTTTACTATAGTGAATCAGTATTGTAGATCGTAAATTTAAGA
AAAATAAAAAGTCCTTT
TGATTGG

QA 1 737 1 737
DS 



AS 2 7

CO CL1186Contig1 851 4 7 U
ACAAAAGCATGTCTTGATTCTTCTAAAGGAGGTTGGTTACATATCAGAGAAACAAGAACA
CTAACAATAGGAATTGGGGTAGAGTTATGGCAATAAACAAAGATCTCTCTCTCCCTATGC
AAACAATAACCTTAAGAT*GTGGTGAAGAATAAGAAAAACAAAAACAAGGTGGGATAAAA
AAGCATCAAATCACATGTTTGGTATCTTCTTTTCTTTGCTTGCGACTTAAACAGTGTAGT
GTCCGGGAGTTTCAATGTCCAAACCCTTTAGCTTCACGACGGATTCAACATGTCCCTTGA
GTGTGTGCAGCTCCCTAAGCCTAGCGATCTCAGCTCTCTTCTTGGCTTGTTCTGCAATCT
CAGACAACTCTCTGTAACCTCCTTGCTCAGGAATGATGTTAACAGGTTCTTTTGGCTGCA
AACCGTGAAGTGTCCTCTGAGCAACTGCCCATTGAGCCTCCCTCTCTTCTTTTCCAAAAT
CTTTCTTGTTGGTTAAAGCAACCCTGTTCTCAAACAAGTTGAGCCAAGCCTTTCCACTCA
AGATGTATCTAATGGCAAACTTGAAAATGTCCTGTGGGACGTATGTTACAATACTGTATA
TCCAGATCACTCCAGCCCATCCCCATCCAATACCCTTAACCTTTGCAAACTCCCAGTTGG
CGTACACAGCAATCAAAGTAACAACCAGTTGTGCAACGACAAAAGCAACCATCAGTAACA
CTCCAGGACGTTCAACAAAGGACCAACTCCTTGATCTTGTGACAAAGATGAGAGCCTGAC
TAATGATACTAACTTGCAGATACACCGCACCCATTAGCTCATTGTTATTGTCTCTGATGG
ACCTCACACCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY10JQ U 1
AF RR2FU76JQ U 63
AF RR2ER29JQ U 1
AF RR2ER29TF C 161
BS 1 680 RR2BY10JQ
BS 681 681 RR2ER29JQ
BS 682 716 RR2BY10JQ
BS 717 717 RR2ER29JQ
BS 718 744 RR2BY10JQ
BS 745 844 RR2ER29JQ
BS 845 851 RR2ER29TF

RD RR2BY10JQ 744 0 0
ACAAAAGCATGTCTTGATTCTTCTAAAGGAGGTTGGTTACATATCAGAGAAACAAGAACA
CTAACAATAGGAATTGGGGTAGAGTTATGGCAATAAACAAAGATCTCTCTCTCCCTATGC
AAACAATAACCTTAAGAT*GTGGTGAAGAATAAGAAAAACAAAAACAAGGTGGGATAAAA
AAGCATCAAATCACATGTTTGGTATCTTCTTTTCTTTGCTTGCGACTTAAACAGTGTAGT
GTCCGGGAGTTTCAATGTCCAAACCCTTTAGCTTCACGACGGATTCAACATGTCCCTTGA
GTGTGTGCAGCTCCCTAAGCCTAGCGATCTCAGCTCTCTTCTTGGCTTGTTCTGCAATCT
CAGACAACTCTCTGTAACCTCCTTGCTCAGGAATGATGTTAACAGGTTCTTTTGGCTGCA
AACCGTGAAGTGTCCTCTGAGCAACTGCCCATTGAGCCTCCCTCTCTTCTTTTCCAAAAT
CTTTCTTGTTGGTTAAAGCAACCCTGTTCTCAAACAAGTTGAGCCAAGCCTTTCCACTCA
AGATGTATCTAATGGCAAACTTGAAAATGTCCTGTGGGACGTATGTTACAATACTGTATA
TCCAGATCACTCCAGCCCATCCCCATCCAATACCCTTAACCTTTGCAAACTCCCAGTTGG
CGTACACAGCAATCAAAGTAGCAACCAGTTGTGCAACGACAAAAGCAACCATCAGTGACA
CTCCAGGACGTTCAACAAAGGACC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2FU76JQ 750 0 0
C
ACAATAGGAATGGGGGAAGAGTTATGGCAATAAACAAAGATCTCTCTCTCCCTATACAAA
CAATAACCTTAAGATTGTGGTGAAGAATAAAAAAAACAAAAACAAGGTGGGATAAAAAAG
CATCAAATCACATGTTTGGTATCTTCTTTTCTTTGCTTGTGACTTAAACAGTGTAGTGTC
CGGGAGTTTCAATGTCCAAACCCTTTAGCTTCACGACTGATTCAACATGTCCCTTGAGTG
TGTGCAGCTCCCTAAGCCTAGCGATCTCAGCTCTCTTCTTGGCTTGTTCTGCAATCTCAA
ACAACTCTCTGTAACCTCCTTGCTCAGGAATGATGTTAACAGGTTCTTTTGGCTGCAGAC
CGTGAAGTGTTCTCTGAGCAACTGCCCATTGAGCCTCCCTCTCTTCTTTTCCAAAATCTT
TCTTGTTGGTTAAAGCAACCCTGTTCTCAAACAAGTTGAGCCAAGCCTTTCCACTCAAGA
TGTATCTAATGGCAAACTTGAAAATGTCCTGTGGGACGTATGTTACAATACTGTAAATCC
AGATCACTCCAGCCCATCCCCATCCAATACCCTTAACCTTTGCAAACTCCCAGTTGGCGT
ACACAGCAATCAAAGTAGCAACCAGTTGTGCAACGACAAAAGCAACCATCAGTAACACTC
CAGGACGTTCAACAAAGGACCAACTCCTTGATCTTGTGACAAAGATGAGAGCCTGACTAA
TAATACTAACTTGCAGATACACCGCACCC

QA 2 750 2 750
DS 

RD RR2ER29JQ 844 0 0
AT
AAAAGCATGTCTTGATTCTTCTAAAGGAGGTTGGTTACATATCAGAGAAACAAGAACACT
AACAATAGGAATTGGGGTAGAGCTATGGCAATAAACAAAGATCTCTCTCTCCCTATGCAA
ACAATAACCTTAAGAT*GTGGTGAAGAATAAGAAAAACAAAAACAAGGTGGGATAAAAAA
GCATCAAATCACATGTTTGGTATCTTCTTTTCTTTGCTTGCGACTTAAACAGTGTAGTGT
CCGGGAGTTTCAATGTCCAAACCCTTTAGCTTCACGACGGATTCAACATGTCCCTTGAGT
GTGTGCAGCTCCCTAAGCCTAGCGATCTCAGCTCTCTTCTTGGCTTGTTCTGCAATCTCA
GACAACTCTCTGTAACCTCCTTGCTCAGGAATGATGTTAACAGGTTCTTTTGGCTGCAAA
CCGTGAAGTGTCCTCTGAGCAACTGCCCATTGAGCCTCCCTCTCTTCTTTTCCAAAATCT
TTCTTGTTGGTTAAAGCAACCCTGTTCTCAAACAAGTTGAGCCAAGCCTTTCCACTCAAG
ATGTATCTAATGGCAAACTTGAAAATGTCCTGTGGGACGTATGTTACAATACTGTATATC
CAGATCACTCCAGCCCATCCCCATCCAATACCCTTAACCTTTGCAAACTCCCAGTTGGCG
TACACAGCAATCAAAGTAACAACCAGTTGTGCAACGACAAAAGCAACCATCAGTAACACT
CCAGGACGTTCAACAAAGGACCAACTCCTTGATCTTGTGACAAAGATGAGAGCCTGACTA
ATGATACTAACTTGCAGATACACCGCACCCATTAGCTCATTGTTATTGTCTCTGATGGAC
CT

QA 3 844 3 844
DS 

RD RR2ER29TF 691 0 0
C
AAAACAAGGTGGGATAAAAA*GCATCAAATCACATGTTTGGTATCTTCTTTTCTTTGCTT
GCGACTTAGACAGTGTAGTGTCCGGGAGTTTCAATGTCCAAACCCTTTAGCTTCACGACG
GATTCAACATGTCCCTTGAGTGTGTGCAGCTCCCTAAGCCTAGCGATCTCAGCTCTCTTC
TTGGCTTGTTCTGCAATCTCAGACAACTCTCTGTAACCTCCTTGCTCAGGAATGATGTTA
ACAGGTTCTTTTGGCTGCAAACCGTGAAGTGTCCTCTGAGCAACTGCCCATTGAGCCTCC
CTCTCTTCTTTTCCAAAATCTTTCTTGTTGGTTAAAGCAACCCTGTTCTCAAACAAGTTG
AGCCAAGCCTTTCCACTCAAGATGTATCTAATGGCAAACTTGAAAATGTCCTGTGGGACG
TATGTTACAATACTGTATATCCAGATCACTCCAGCCCATCCCCATCCAATACCCTTAACC
TTTGCAAACTCCCAGTTGGCGTACACAGCAATCAAAGTAACAACCAGTTGTGCAACGACA
AAAGCAACCATCAGTAACACTCCAGGACGTTCAACAAAGGACCAACTCCTTGATCTTGTG
ACAAAGATGAGAGCCTGACTAATGATACTAACTTGCAGATACACCGCACCCATTAGCTCA
TTGTTATTGTCTCTGATGGACCTCACACCC

QA 2 691 2 691
DS 



CO CL1186Contig2 1208 3 12 U
GTTTTGATCCTCCAAGACATGACAGTGCTGAAACCATCAGAAGAGCTTTGAACCTCGGTG
TTAATGTCAAGATGATCACTGGTGACCAACTTGCTATTGGTAAGGAGACTGGTCGCAGAC
TTGGAATGGGAACAAACATGTACCCATCATCTGCTCTTCTTGGAAACCACAAGGACGCAA
ACCTTGCTTCCATCCCCGTTGAGGAGCTTATCGAAAAGGCTGATGGATTTGCTGGAGTCT
TCCCAGAGCACAAGTACGAGATCGTCAAGAAGTTGCAGGAGAGGAAGCATATTGTTGGAA
TGACTGGTGATGGTGTCAACGACGCTCCTGCTTTGAAGAAGGCTGATATTGGTATCGCTG
TGGATGATGCTACCGATGCTGCTCGTGGTGCCTCAGATATCGTTCTCACTGAGCCAGGAC
TCAGCGTTATCATCAGTGCTGTCCTAACCAGCAGAGCTATTTTCCAGAGGATGAAGAACT
ACACCATCTATGCAGTCTCGATCACAATCCGTATCGTTCTTGGTTTCATGCTCATTGCTC
TCATATGGGAGTTTGACTTCTCAGCATTCATGGTTCTGATCATTGCCATTCTTAACGATG
GTACCATCATGACTATCTCAAAGGACAGAGTCAAGCCATCTCCCACACCTGATAGCTGGA
AACTTAGAGAGATTTTCGCTACTGGAGTTGTGCTTGGAACCTACCAAGCCATCATGAGTG
TTATTTTCTTCTGGCTGGCACACAAAACCGACTTTTTCTCGGACAAGTTTGGTGTGAGGT
CCATCAGAGACAACAACAATGAGCTAATGGGTGCGGTGTATCTGCAAGTTAGTATTATTA
GTCAGGCTCTCATCTTTGTCACAAGATCAAGGAGTTGGTCCTTTGTTGAACGTCCTGGAG
TGTTACTGATGGTTGCTTTTGTCGTTGCACAACTGGTTGCTACTTTGATTGCTGTGTACG
CCAACTGGGAGTTTGCAAAGGTTAAGGGTATTGGATGGGGATGGGCTGGAGTGATCTGGA
TTTACAGTATTGTAACATACGTCCCACAGGACATTTTCAAGTTTGCCATTAGATACATCT
TGAGTGGAAAGGCTTGGCTCAACTTGTTTGAGAACAGGGTTGCTTTAACCAACAAGAAAG
ATTTTGGAAAAGAGAGAGGGAGCTCAATGGGCAGTTGCTCAGAGACACTTCACGGTCTGC
AGCCAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH96TF U 80
AF RR2BY10TF U 1
AF RR2FU76TF U 478
BS 1 275 RR2BY10TF
BS 276 276 RR2DH96TF
BS 277 422 RR2BY10TF
BS 423 423 RR2DH96TF
BS 424 608 RR2BY10TF
BS 609 609 RR2DH96TF
BS 610 746 RR2BY10TF
BS 747 747 RR2FU76TF
BS 748 756 RR2BY10TF
BS 757 757 RR2FU76TF
BS 758 776 RR2BY10TF
BS 777 1208 RR2FU76TF

RD RR2DH96TF 625 0 0
G
GGTGACCAACTTGCTATTGGTAAGGAGACTGGTCGCAGACTTGGAATGGGAACAAACATG
TACCCATCATCTGCTCTTCTTGGAAACCACAAGGACGCAAACCTTGCTTCCATCCCCGTT
GAGGAGCTTATCGAAAAGGCTGATGGATTTGCTGGAGTCTTCCCAGAGCACAAGTACGAG
ATCGTCAAGAAGTTGCAGGAGAGGAAGCATATTGTTGGAATGACTGGTGATGGTGTCAAC
GACGCTCCTGCTTTGAAGAAGGCTGATATTGGTATCGCTGTGGATGATGCTACCGATGCT
GCTCGTGGTGCCTCAGATATCGTTCTCACTGAGCCAGGACTCAGCGTTATCATCAGTGCT
GTTCTAACCAGCAGAGCTATTTTCCAGAGGATGAAGAACTACACCATCTATGCAGTCTCG
ATCACAATCCGTATCGTTCTTGGTTTCATGCTCATTGCTCTCATATGGGAGTTTGACTTC
TCAGCATTCATGGTTCTGATCATTGCCATTCTTAACGATGGTACCATCATGACTATCTCA
AAGGACAGAGTCAAGCCATCTCCCACACCTGATAGCTGGAAACTTAGAGAGATTTTCGCT
ACTGGAGTTGTGCTTGGAACCTAC

QA 2 625 2 625
DS 

RD RR2BY10TF 776 0 0
GTTTTGATCCTCCAAGACATGACAGTGCTGAAACCATCAGAAGAGCTTTGAACCTCGGTG
TTAATGTCAAGATGATCACTGGTGACCAACTTGCTATTGGTAAGGAGACTGGTCGCAGAC
TTGGAATGGGAACAAACATGTACCCATCATCTGCTCTTCTTGGAAACCACAAGGACGCAA
ACCTTGCTTCCATCCCCGTTGAGGAGCTTATCGAAAAGGCTGATGGATTTGCTGGAGTCT
TCCCAGAGCACAAGTACGAGATCGTCAAGAAGTTGTAGGAGAGGAAGCATATTGTTGGAA
TGACTGGTGATGGTGTCAACGACGCTCCTGCTTTGAAGAAGGCTGATATTGGTATCGCTG
TGGATGATGCTACCGATGCTGCTCGTGGTGCCTCAGATATCGTTCTCACTGAGCCAGGAC
TCGGCGTTATCATCAGTGCTGTCCTAACCAGCAGAGCTATTTTCCAGAGGATGAAGAACT
ACACCATCTATGCAGTCTCGATCACAATCCGTATCGTTCTTGGTTTCATGCTCATTGCTC
TCATATGGGAGTTTGACTTCTCAGCATTCATGGTTCTGATCATTGCCATTCTTAACGATG
GTACCATCGTGACTATCTCAAAGGACAGAGTCAAGCCATCTCCCACACCTGATAGCTGGA
AACTTAGAGAGATTTTCGCTACTGGAGTTGTGCTTGGAACCTACCAAGCCATCATGAGTG
TTATTTTCTTCTGGCTGGCACACAAA*CCGACTTTT*CTCGGACAAGTTTGGTGTG

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2FU76TF 731 0 0
G
CTACACCATCTATGCAGTCTCGATCACAATCCGTATCGTGCTTGGTTTCATGCTCATTGC
TCTCATATGGGAGTTTGACTTCTCAGCATTCATGGTTCTGATCATTGCCATTCTTAACGA
TGGTACCATCATGACTATCTCAAAGGACGGAGTCAAGCCATCTCCCACACCTGATAGCTG
GAAACTCAGAGAGATTTTCGCTACTGGAGTTGTGCTTGGAACCTACCAAGCCATCATGAG
TGTTATTTTCTTCTGGCTGGCACACAAAACCGACTTTTTCTCGGACAAGTTTGGTGTGAG
GTCCATCAGAGACAACAACAATGAGCTAATGGGTGCGGTGTATCTGCAAGTTAGTATTAT
TAGTCAGGCTCTCATCTTTGTCACAAGATCAAGGAGTTGGTCCTTTGTTGAACGTCCTGG
AGTGTTACTGATGGTTGCTTTTGTCGTTGCACAACTGGTTGCTACTTTGATTGCTGTGTA
CGCCAACTGGGAGTTTGCAAAGGTTAAGGGTATTGGATGGGGATGGGCTGGAGTGATCTG
GATTTACAGTATTGTAACATACGTCCCACAGGACATTTTCAAGTTTGCCATTAGATACAT
CTTGAGTGGAAAGGCTTGGCTCAACTTGTTTGAGAACAGGGTTGCTTTAACCAACAAGAA
AGATTTTGGAAAAGAGAGAGGGAGCTCAATGGGCAGTTGCTCAGAGACACTTCACGGTCT
GCAGCCAAAG

QA 2 731 2 731
DS 



AS 1 5

CO CL1187Contig1 881 5 11 U
GGAAACCTCTCTCACACTATCAGAATCTGATCCTCCCACCTTTCACTGATTCTCAGTCCA
AAAGTTAAGTCAAAGAGTTGAAAATGGAAGGGACTGTGTTCACGCCGTGTTTGGAAGGAA
TGAAGAACGTCAAGTCTGAACAAGGGGAGATGCTTACTAAGCCTTTTCTAGACCTCTGCA
AGACCATCTTGCCTGTTATAGATAAGTTTGGAGCCGCTATGACTCTCGTGAAAGCTGACA
TTGGTGGCAACATATCGAGGTTGGAGAAGAACTACTTGTCTGATCCCGACAAGTACAAGT
ACTTGTACACCTTTGTTCAAGGTGAAATTGAGTCGAAGACAGCAAAAGGATCGTCTAGTT
GTACCAACGGTCTTCTCTGGTTAACCAGAGCAATGGATTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCA
ACTTGGTAGCACATCAAGACTGGCCAATGTCACAAGCTTGTGGTGAATCTTACCAAAAAA
CACTCAAGAAATGGCACGGATGGCTCGCCAGCTCTACCTTCTCTATGGCGTTAAAGCTTG
CTCCAGACAGGAAGAAGTTCATGGATGTCATATCTGGTTCTGGTGACATATACGCTGACA
TGGAAAGGTTTTGCACTGAGTTTGGTCCATTCCTTCAAGAAAATCATAAGTTTCTGGCTA
GCGTTGGTTTGGATGACTTGAAAGCTTCTTGAGCCATCATATGATTATCACCTGTATCCA
ATCTGCTTTTTTCAGAAAAAACAGTCTGTTTTAACGTTTCTCCTTTGGATTCTAAAACTT
TTTAGACTATCCAAAGAAACAGAATAATGTTCTCACTTTATATTATAAGTTTATATAAAA
AAGACCAAATACATGTTTAGACATGCATGTGTTTAATTAAC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FR96TF U 1
AF RR2FR04TF U 3
AF RR2B785JQ C 159
AF RR2ET83JQ C 197
AF RR2B785TF U 159
BS 1 44 RR2FR96TF
BS 45 46 RR2FR04TF
BS 47 574 RR2FR96TF
BS 575 611 RR2FR04TF
BS 612 612 RR2B785TF
BS 613 619 RR2FR04TF
BS 620 620 RR2B785TF
BS 621 677 RR2FR04TF
BS 678 678 RR2B785TF
BS 679 717 RR2FR04TF
BS 718 881 RR2B785TF

RD RR2FR96TF 574 0 0
GGAAACCTCTCTCACACTATCAGAATCTGATCCTCCCACCTTTCTTTGATTCTCAGTCCA
AAAGTTAAGTCAAAGAGTTGAAAATGGAAGGGACTGTGTTCACGCCGTGTTTGGAAGGAA
TGAAGAACGTCAAGTCTGAACAAGGGGAGATGCTTACTAAGCCTTTTCTAGACCTCTGCA
AGACCATCTTGCCTGTTATAGATAAGTTTGGAGCCGCTATGACTCTCGTGAAAGCTGACA
TTGGTGGCAACATATCGAGGTTGGAGAAGAACTACTTGTCTGATCCCGACAAGTACAAGT
ACTTGTACACCTTTGTTCAAGGTGAAATTGAGTCGAAGACAGCAAAAGGATCGTCTAGTT
GTACCAACGGTCTTCTCTGGTTAACCAGAGCAATGGATTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCA
ACTTGGTAGCACATCAAGACTGGCCAATGTCACAAGCTTGTGGTGAATCTTACCAAAAAA
CACTCAAGAAATGGCACGGATGGCTCGCCAGCTCTACCTTCTCTATGGCGTTAAAGCTTG
CTCCAGACAGGAAGAAGTTCATGGATGTCATATC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2FR04TF 715 0 0
GG
ACCTCTCTCACACTATCAGAATCTGATCC***CACCTTTCACTGATTCTCAGTCCAAAAG
TTAAGTCAAAGAGTTGAAAATGGAAGGGACTGTGTTCACGCCGTGTTTGGAAGGAATGAA
GAATGTCAAGTCTGAACAAGGGGAGATGCTTACTAAGCCTTTTCTAGACCTCTGCAAGAC
CATCTTGCCTGTTATAGATAAATTTGGAGCCGCTATGACTCTCGTCAAAGCTGACATTGG
TGGCAACATATCGAGGTTGGAGAAGAACTACTTGTCTGACCCCGACAAGTACAAGTACTT
GTGCACCTTTGTTCAAGGTGAAATTGAGTCGAAGACAGCAAAAGGATCGTCTAGTTGTAC
CAACGGTCTTCTCTGGTTAACCAGAGCAATGGATTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTT
GGTAGCACATCAAGACTGGCCAATGTCACAAGCTTGTGGTGAATCTTACCAAAAAACACT
CAAGAAATGGCACGGATGGCTCGCCAGCTCTACCTTCTCTATGGCCTTA**GCTTGCTCC
AGACAGGAAGAAGTTCATGGATGTCATATCTGGTTCTGGTGACATATACGCTGACATGGA
AAGGTTTCGCACTGACTTTGGTCCATTCCTTCAAGAAAATCATAAGTTTCTGGCTAGCGT
TGGTTTGGATGACCTGAAAGCTTCTTGAGCCATCATATGATTATCACCTGTAT

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR2B785JQ 723 0 0
G
AGCCTTTTCTAGACCTCTGCAAGACCATCTTGCCTGTTATAGATAAGTTTGGAGCCGCTA
TGACTCTCGTGAAAGCTGACATTGGTGGCAACATATCGAGGTTGGAGAAGAACAACTTGT
CTGATCCCGACAAGTACAAGTACTTGTACACCTTTGTTCAAGGTGAAATTGAGTCGAAGA
CAGCAAAAGGATCGTCTAGTTGTACCAACGGTCTTCTCTGGTTAACCAGAGCGATGGATT
TCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTGGTAGCACATCAAGACTGGCCAATGTCACAAGCTT
GTGGTGAATCTTACCAAAAAACACTCAAGAAATGGCACGGATGGCTCGCCAGCTCTACCT
TCTCTATGGCGTTAAAGCTTGCTCCAGACAGGAAGAAGTTCATGGATGTCATATCTGGTT
CTGGTGACATATACGCTGACATGGAAAGGTTTTGCACTGAGTTTGGTCCATTCTTTCAAG
AAAATCATAAGTTTCTGGCTATCGTTGGTTTGGATGACTTGAAAGCTTCTTGAGCCATCA
TATGATTATCACCTGTATCCAATCTGCTTTTTTCAGAAAAAACAGTCTGTTTTAACGTTT
CTCCTTTGGATTCTAAAACTTTTTAGACTATCCAAAGAAACAGAATAATGTTCTCACTTT
ATATTATAAGTTTATATAAAAAAGACCAAATACATGTTTAGACATGCATGTGTTTAATTA
AC

QA 2 723 2 723
DS 

RD RR2ET83JQ 662 0 0
TATAGATAAGTTTGGAGCCGCTATGACTCTCGTGAAAGCTGACATTGGTGGCAACATATC
GAGGTTGGAGAAGAACTACTTGTCTGATCCCGACAAGTACAAGTACTTGTACACCTTTGT
TCAAGGTGAAATTGAGTCGAAGACAGCAAAAGGATCGTCTAGTTGTACCAACGGTCTTCT
CTGGTTAACCAGAGCAATGGATTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTGGTAGTACATCA
AGACTGGCCAATGTCACAAGCTTGTGGTGAATCTTACCAAAAAACACTCAAGAAATGGCA
CGGATGGCTCGCCAGCTCTACCTTCTCTATGGCGTTAAAGCTTGCTCCAGACAGGAAGAA
GTTCATGGATGTCATATCTGGTTCTGGTGACATATACGCTGACATGGAAAGGTTTTGCAC
TGAGTTTGGTCCATTCCTTCAAGAAAATCATAAGTTTCTGGCTAGCGTTGGTTTGGATGA
CTTGAAAGCTTCTTGAGCCATCATATGATTATCACCTGTATCCAATCTGCTTTTTTCAGA
AAAAACAGTCTGTTTTAACGTTTCTCCTTTGGATTCTAAAACTTTTTAGACTATCCAAAG
AAACAGAATAATGTTCTCACTTTATATTATAAGTTTATATAAAAAAGACCAAATACATGT
TT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2B785TF 723 0 0
G
AGCCTTTTCTAGACCTCTGCAAGACCATCTTGCCTGTTATAGATAAGTTTGGAGCCGCTA
TGACTCTCGTGAAAGCTGACATTGGTGGCAACATATCGAGGTTGGAGAAGAACAACTTGT
CTGATCCCGACAAGTACAAGTACTTGTACACCTTTGTTCAAGGTGAAATTGAGTCGAAGA
CAGCAAAAGGATCGTCTAGTTGTACCAACGGTCTTCTCTGGTTAACCAGAGCGATGGATT
TCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTGGTAGCACATCAAGACTGGCCAATGTCACAAGCTT
GTGGTGAATCTTACCAAAAAACACTCAAGAAATGGCACGGATGGCTCGCCAGCTCTACCT
TCTCTATGGCGTTAAAGCTTGCTCCAGACAGGAAGAAGTTCATGGATGTCATATCTGGTT
CTGGTGACATATACGCTGACATGGAAAGGTTTTGCACTGAGTTTGGTCCATTCTTTCAAG
AAAATCATAAGTTTCTGGCTATCGTTGGTTTGGATGACTTGAAAGCTTCTTGAGCCATCA
TATGATTATCACCTGTATCCAATCTGCTTTTTTCAGAAAAAACAGTCTGTTTTAACGTTT
CTCCTTTGGATTCTAAAACTTTTTAGACTATCCAAAGAAACAGAATAATGTTCTCACTTT
ATATTATAAGTTTATATAAAAAAGACCAAATACATGTTTAGACATGCATGTGTTTAATTA
AC

QA 2 723 2 723
DS 



AS 2 6

CO CL1188Contig1 850 3 2 U
GGGTGGAAGAAAAAGGAGATTTTATCATCATCTAGAATCCCATCGTCGTCTCCCTCGTAT
CTTGCTATAGTTCCAATGGCATCTCTTCACTCCCGGGCCGCCGTTTCTGTTATCGTTACG
GGCGACGCTAAAGGAATAGCACTTAATTCGTCTTGTGCCTCTACTCTCCATCTACGATTT
AAACCCAGCGAGCTCTGTATATTCCAAAAACATCGCAGGGTCGTGCTCAAAGGGAGAGCA
ATAAAGGCGCAGTCAAAAGAAGAAGCAAGTATTCCTCCTCCGGTGGGAGATGCATTTACT
AATAGTACTATCAAGCATCTTCTCCTGCCTGTCATTGATCGGAATCCTTATCTCTCTGAA
GGCACCCGACAGGCTGCTGCTACAACAACTAGCTTAGCAAACAAGTATGGAGCTGACATC
ACAGTTGTCGTCATAGACGAAGAAAAGAGAGAATCATCTTCGGAGCACTAGACTCAAGTC
TCCAACATCCGGTGGCATCTAGCAGAAGGTGGTTTCGAGGAGTTCAAGCTCTTGGAGAGG
CTTGGAGAAGGGAAAAAGGCCACTGCGGTAATAGGAGAGGTGGCCGATGACCTGGGGACG
GAGCTGGTTGTTATGAGCATGGAAGCCATCCACTCCAAGTTCATCGACGCCAATTTACTT
GCTGAGTTCATCCCCTGCCCCGTCCTCCTCTTGCCCTTATGAATCCAAATATTTGCTCGT
CTTGTCCTTCCCAATCGTTTTTTTTTT*ATGTATTGTCTGGGGAACGCATAGCAGAGACT
AGAGAGAGTGGGTCGAAATGTGAGATGCATGTATCCATACATCTTCTGTATTTATTATGA
TGGTTCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2D094TF U 26
AF RR2BI73TF U 1
AF RR2BI73JQ C 168
BS 1 849 RR2BI73TF
BS 850 850 RR2BI73JQ

RD RR2D094TF 783 0 0
GGAATCATCATCTAGA
ATCGTCGTCTCCCTCGTATCTTGCTA**GTTCCAATGGCATCTCTTCACTCCCGGGCCGC
CGTTTCTGTTATCGTTACGGGCGACGCTAAAGGAATAGCACTTAATTCGTCTTGTGCCTC
TACTCTCCATCTACGATTTAAACCCAGCGAGCTATGTATATTCCAAAAACATCGCAGGGT
CGTGCTCAAAGGGAGAGCAATAAAGGCGCAGTCGAAAGAAGAAGCAAGTATTCCTCCTCC
GGTGGGAGATGCATTTACTAATAGTACTATCAAGCATCTTCTCTTGCCTGTCATTGATCG
GAATCCTTATCTCTCTGAAGGCACCCGACAGGCTGCTGCTACAACAACTAGCTTGGCAAA
CAAGTATGGAGCTGATATCACAGTTGTAGTCATAGACGAAGAAAAACGAGAGTCATCTTC
GGAGCACGAGACTCAAGTATCCAACATCCGGTGGTATCTAGCAGAAGGTGGTTTCGAGGA
GTTCAAGCTCTTGGAGAGGCTTGGGGAAGGGAAAAAGGCCACGGCTGTAATAGGAGAGGT
GGCGGATGAACTGGGGACAGAGCTGGTTGTTATGAGCATGGAAGCCATCCACTCCAAGTT
CATCGACGCCAATTTGCTTGCTGAGTTCATCCCCTGCCCCGTCCTCCTCTTGCCCTTATG
AATCCAAATATTTGCTCGTCTTGTCCTTCCCAATCGTTTTTTTTTTTATGTATTGTCTGG
GGAACGCATAGCAGAGACTAGAAAGAGTGAGTCGAAACGTGAGATGC

QA 17 783 17 783
DS 

RD RR2BI73TF 850 0 0
GGGTGGAAGAAAAAGGAGATTTTATCATCATCTAGAATCCCATCGTCGTCTCCCTCGTAT
CTTGCTATAGTTCCAATGGCATCTCTTCACTCCCGGGCCGCCGTTTCTGTTATCGTTACG
GGCGACGCTAAAGGAATAGCACTTAATTCGTCTTGTGCCTCTACTCTCCATCTACGATTT
AAACCCAGCGAGCTCTGTATATTCCAAAAACATCGCAGGGTCGTGCTCAAAGGGAGAGCA
ATAAAGGCGCAGTCAAAAGAAGAAGCAAGTATTCCTCCTCCGGTGGGAGATGCATTTACT
AATAGTACTATCAAGCATCTTCTCCTGCCTGTCATTGATCGGAATCCTTATCTCTCTGAA
GGCACCCGACAGGCTGCTGCTACAACAACTAGCTTAGCAAACAAGTATGGAGCTGACATC
ACAGTTGTCGTCATAGACGAAGAAAAGAGAGAATCATCTTCGGAGCACTAGACTCAAGTC
TCCAACATCCGGTGGCATCTAGCAGAAGGTGGTTTCGAGGAGTTCAAGCTCTTGGAGAGG
CTTGGAGAAGGGAAAAAGGCCACTGCGGTAATAGGAGAGGTGGCCGATGACCTGGGGACG
GAGCTGGTTGTTATGAGCATGGAAGCCATCCACTCCAAGTTCATCGACGCCAATTTACTT
GCTGAGTTCATCCCCTGCCCCGTCCTCCTCTTGCCCTTATGAATCCAAATATTTGCTCGT
CTTGTCCTTCCCAATCGTTTTTTTTTT*ATGTATTGTCTGGGGAACGCATAGCAGAGACT
AGAGAGAGTGGGTCGAAATGTGAGATGCATGTATCCATACATCTTCTGTATTTATTATGA
TGGTTCTGT
C

QA 1 849 1 849
DS 

RD RR2BI73JQ 683 0 0
CCATCTACGATTTAAACCCAGCGAGCTCTGTATATTCCAAAAACATCGCAGGGTCGTGCT
CAAAGGGAGAGCAATAAAGGCGCAGTCAAAAGAAGAAGCAAGTATTCCTCCTCCGGTGGG
AGATGCATTTACTAATAGTACTATCAAGCATCTTCTCCTGCCTGTCATTGATCGGAATCC
TTATCTCTCTGAAGGCACCCGACAGGCTGCTGCTACAACAACTAGCTTAGCAAACAAGTA
TGGAGCTGACATCACAGTTGTCGTCATAGACGAAGAAAAGAGAGAATCATTTTCGGAGCA
CTAGACTCAAGTCTCCAACATCCGGTGGCATTTAGCAGAAGGTGGTTTCGAGGAGTTCAA
GCTCTTGGAGAGGCTTGGAGAAGGGAAAAAGGCCACTGCGGTAATAGGAGAGGTGGCCGA
TGACCTGGGGACGGAGCTGGTTGTTATGAGCATGGAAGCCATCCACTCCAAGTTCATGGA
CGCCAATTTACTTGCTGAGTTCATCCCCTGCCCCGTCCTCCTCTTGCCCTTATGAATCCA
AATATTTGCTCGTCTTGTCCTTCCCAATCGTTTTTTTTTT*ATGTATTGTCTGGGGAACG
CATAGCAGAGACTAGAGAGAGTGGGTCGAAATGTGAGATGCATGTATCCATACATCTTCT
GTATTTATTATGATGGTTCTGTC

QA 1 683 1 683
DS 



CO CL1188Contig2 856 3 9 U
GGGTCTTGTGGAAGAAAAAGGAGATTTTATCATCATCTAGAATCCCATCGTCGTCTCCCT
CGTATCTTGCTATAGTTCCAATGGCATCTCTTCACTCCCGGGCCGCCGTTTCTGTTATCG
TTACGGGCGACGCTAAAGGAATAGCACTTAATTCGTCTTGTGCCTCTACTCTCCATCTAC
GATTTAAACCCAGCGAGCTCTGTATATTCCAAAAACATCGCAGGGTCGTGCTCAAAGGGA
CAGCGATAAAGGCGCAGTCGAAAGAAGAAGCAAGTCTTCCTCCTGTGGGAGATGCATTTA
ATAGTATTAAGCATCTTCTCCTGCCTGTCATTGATCGGAATCCTTATCTCTCTGAAGGCA
CCCGACAGGCTGCTGCTACAACAACTAGCTTGGCAAACAAGTATGGAGCTGATATCACAG
TTGTAGTCATAGACGAAGAAAAACGAGAGTCATCTCCGGAGCACGAGACTCAAGTATCCA
ACATCCGGTGGCATCTAGCAGAATGTGGTTTCGAGGAGTTCAAGCTCTTGGAGAGGCTTG
GGGAAGGGAAAAAGGCCACGGCTGTAATAGGAGAGGTGGCGGATGATCTGGGGACAGAGC
TGGTTGTTATGAGCATGGAAGCCATCCACTCCAAGTTCATCGACGCCAATTTACTTGCTG
AGTTCATCCCCTGCCCCGTCCTCCTCTTGCCCTTATGAATCCAAATATTTGCTCGTCTTG
TCCTTCCCAATCGTTTTTTTTTTGTTGTATTGTCTGGGGAACGCATAGCAGAGACTAGAG
AGAGTGGGTCAAAACGTGAGATGCATGTATCCAGACATCTTCTGTATTTATTATGATGGT
TCTGTGTGTGGTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA19TF U 1
AF RR2FT25TF U 33
AF RR2FT25JQ C 181
BS 1 455 RR2HA19TF
BS 456 456 RR2FT25TF
BS 457 503 RR2HA19TF
BS 504 504 RR2FT25TF
BS 505 699 RR2HA19TF
BS 700 700 RR2FT25TF
BS 701 714 RR2HA19TF
BS 715 732 RR2FT25TF
BS 733 856 RR2FT25JQ

RD RR2HA19TF 714 0 0
GGGTCTTGTGGAAGAAAAAGGAGATTTTATCATCATCTAGAATCCCATCGTCGTCTCCCT
CGTATCTTGCTATAGTTCCAATGGCATCTCTTCACTCCCGGGCCGCCGTTTCTGTTATCG
TTACGGGCGACGCTAAAGGAATAGCACTTAATTCGTCTTGTGCCTCTACTCTCCATCTAC
GATTTAAACCCAGCGAGCTCTGTATATTCCAAAAACATCGCAGGGTCGTGCTCAAAGGGA
CAGCGATAAAGGCGCAGTCGAAAGAAGAAGCAAGTCTTCCTCCTGTGGGAGATGCATTTA
ATAGTATTAAGCATCTTCTCCTGCCTGTCATTGATCGGAATCCTTATCTCTCTGAAGGCA
CCCGACAGGCTGCTGCTACAACAACTAGCTTGGCAAACAAGTATGGAGCTGATATCACAG
TTGTAGTCATAGACGAAGAAAAACGAGAGTCATCTTCGGAGCACGAGACTCAAGTATCCA
ACATCCGGTGGCATCTAGCAGAAGGTGGTTTCGAGGAGTTCAAGCTCTTGGAGAGGCTTG
GGGAAGGGAAAAAGGCCACGGCTGTAATAGGAGAGGTGGCGGATGATCTGGGGACAGAGC
TGGTTGTTATGAGCATGGAAGCCATCCACTCCAAGTTCATCGACGCCAATTTACTTGCTG
AGTTCATCCCCTGCCCCGTCCTCCTCTTGCCCTTATGAACCCAAATATTTGCTC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2FT25TF 700 0 0
GGATCTAGAATCCC
ATCGTCGTCTCCCTCGTATCTTGCTATAGTTCCAATGGCATCTCTTCACTCCCGGGCCGC
CGTTTCTGTTATCGTTACGGGCGACGCTAAAGGAATAGCACTTAATTCGTCTTGTGCCTC
TACTCTCCATCTACGATTTAAACCCAGCGAGCTCTGTATATTCCAAAAACATCGCAGGGT
CGTGCTCAAAGGGACAGCGATAAAGGCGCAGTCGAAAGAAGAAGCAAGTCTTCCTCCTGT
GGGAGATGCATTTAATAGTATTAAGCATCTTCTCCTGCCTGTCATTGATCGGAATCCTTA
TCTCTCTGAAGGCACCCGACAGGCTGCTGCTACAACAACTAGCTTGGCAAACAAGTATGG
AGCTGATATCACAGTTGTAGTCATAGACGAAGAAAAACGAGAGTCATCTCCGGAGCACGA
GACTCAAGTATCCAACATCCGGTGGCATCTAGCAGAATGTGGTTTCGAGGAGTTCAAGCT
CTTGGAGAGGCTTGGGGAAGGGAAAAAGGCCACGGCTGTAATAGGAGAGGTGGCGGATGA
TCTGGGGACAGAGCTGGTTGTTATGAGCATGGAAGCCATCCACTCCAAGTTCATCGACGC
CAATTTACTTGCTGAGTTCATCCCCTGCCCCGTCCTCCTCTTGCCCTTATGAATCCAAAT
ATTTGCTCGTCTTGTCCTTCCCAATC

QA 15 700 15 700
DS 

RD RR2FT25JQ 676 0 0
GATTTAAACCCAGCGAGCTCTGTATATTCCAAAAACATCGCAGGGTCGTGCTCAAAGGGA
CAGCGATAAAGGCGCAGTCGAAAGAAGAAGCAAGTCTTCCTCCTGTGGGAGATGCATTTA
ATAGTATTAAGCATCTTCTCCTGCCTGTCATTGATCGGAATCCTTATCTCTCTGAAGGCA
CCCGACAGGCTGCTGCTACAACAACTAGCTTGGCAAACAAGTATGGAGCTGATATCACAG
TTGTAGTCATAGACGAAGAAAAACGAGAGTCATCTCCGGAGCACGAGACTCAAGTATCCA
ACATCCGGTGGCATCTAGCAGAATGTGGTTTCGAGGAGTTCAAGCTCTTGGAGAGGCTTG
GGGAAGGGAAAAAGGCCACGGCTGTAATAGGAGAGGTGGCGGATGATCTGGGGACAGAGC
TGGTTGTTATGAGCATGGAAGCCATCCACTCCAAGTTCATCGACGCCAATTTACTTGCTG
AGTTCATCCCCTGCCCCGTCCTCCTCTTGCCCTTATGAATCCAAATATTTGCTCGTCTTG
TCCTTCCCAATCGTTTTTTTTTTGTTGTATTGTCTGGGGAACGCATAGCAGAGACTAGAG
AGAGTGGGTCAAAACGTGAGATGCATGTATCCAGACATCTTCTGTATTTATTATGATGGT
TCTGTGTGTGGTTGTT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 7

CO CL1189Contig1 862 7 20 U
AATTTCAGATCACAACAGCAAATATTCTTAACGTTAAAATCATAGATCTTACAACAATCT
TTATACAACGATAAAATGCCAGGTTTTGTCCACACGGACTTCCATCAGTGAAGAACAAAA
TGACAAACTAAAATTCGGTTTTTTAGGGGGAAAACCAAACTAAACCGGAGGGAATACAAA
AGAATCGTTTCTGAACCGGTTAAAGAATCACAAATGTGAACCGGATGACGAGCCGTCATG
GCTGCTCATATCCCAATTATGTTTCTTCTTGTGCTCGAAATTCTGAAAGCAAGTCAAAGG
CCTCATCCTCCATTGTCGTTTGTGACCCATATGATGAAGAATAGACTCAAGCCGTTTAAT
GATCTCTCTGAAA*GTAGGTCGCTTGGCCGGTTTATCTTGCCAGCATTCTTCTATCAACG
TTTTAAGTCCATGAGGGTAAAGCTTTGATGGAGCTTTGAACAATGGCCGCTCTTTGCTGG
CATAAGCTTCTGATGCTTCGCTGTCTTC*CTTTTCAGCAAAGGGCATTCTTC*CTTCTAT
CATCTCTTGAACGATCAAAGCAAAGGAGAAAACATCAGCTTTTGTGTCATATTCCTCGCT
AGTGAAAACTTCAGGAGCAATATATCTACAAGAAGTGTCAAGACATGTGAAAGGCTTCTC
TTCTTTAACAGTAACAAGCTTGCTAACTCCAAAGTCTGCAACTTTCAGATGCCCTGAATC
ATCCCTCAATATGTTTGAAGGTTCAAGATCGCGGTGGATGATCGGGTCTCCTTTGATCTC
ATGAAGATAGCTCATTCCCCTTGCAATGTCGAGGGCGTATCTAACAGCAGTAGCTGGTTT
TAGTTGTCCTTTCCTTTTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E633JQ U 1
AF RR2CR69TF C 32
AF RR2G053TF C 174
AF RR2FW27JQ U 9
AF RR2CA66JQ U 13
AF RR2G053JQ U 9
AF RR2FW27TF C 306
BS 1 82 RR2E633JQ
BS 83 83 RR2FW27JQ
BS 84 112 RR2E633JQ
BS 113 113 RR2FW27JQ
BS 114 297 RR2E633JQ
BS 298 298 RR2FW27JQ
BS 299 338 RR2E633JQ
BS 339 339 RR2FW27JQ
BS 340 499 RR2E633JQ
BS 500 500 RR2FW27JQ
BS 501 570 RR2E633JQ
BS 571 735 RR2FW27JQ
BS 736 740 RR2G053JQ
BS 741 741 RR2FW27TF
BS 742 784 RR2G053JQ
BS 785 785 RR2FW27TF
BS 786 805 RR2G053JQ
BS 806 806 RR2FW27TF
BS 807 823 RR2G053JQ
BS 824 862 RR2FW27TF

RD RR2E633JQ 570 0 0
AATTTCAGATCACAACAGCAAATATTCTTAACGTTAAAATCATAGATCTTACAACAATCT
TTATACAACGATAAAATGCCAGTTTTTGTCCACACGGACTTCCATCAGTGAAAAACAAAA
TGACAAACTAAAATTCGGTTTTTTAGGGGGAAAACCAAACTAAACCGGAGGGAATACAAA
AGAATCGTTTCTGAACCGGTTAAAGAATCACAAATGTGAACCGGATGACGAGCCGTCATG
GCTGCTCATATCCCAATTATGTTTCTTCTTGTGCTCGAAATTCTGAAAGCAAGTCAACGG
CCTCATCCTCCATTGTCGTTTGTGACCCATATGATGAAAAATAGACTCAAGCCGTTTAAT
GATCTCTCTGAAA*GTAGGTCGCTTGGCCGGTTTATCTTGCCAGCATTCTTCTATCAACG
TTTTAAGTCCATGAGGGTAAAGCTTTGATGGAGCTTTGAACAATGGCCGCTCTTTGCTGG
CATAAGCTTCTGATGCTTCACTGTCTTC*CTTTTCAGCAAAGGGCATTCTTC*CTTCTAT
CATCTCTTGAACGATCAAAGCAAAGGAGAA

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2CR69TF 586 0 0
CGTTAAAATCATAGATCTTACAACAATCTTTATACAGCGATAAAATGCCAGGTTTTGTCC
ACACGGACTTCCATCAGTGAAGAACAAAATGACAAACTAAAATTCGGTTTTTTAGGGGGA
AAACCAAACTAAACCGGAGGGAATACAAAAGAATCGTTTCTGAACCGGTTAAAGAATCAC
AAATGTGAACCGGATGACGAGCCGTCATGGCTGCTCATATCCCAATTATGTTTCTTCTTG
TGCTCGAAATTCTGAAAGCAAGTCAAAGGCCTCATCCTCCATTGTCGTTTGTGACCCATA
TGATGAAGAATAGACTCAAGCCGTTTAATGATCTCTCTGAAA*GTAGGTCGCTTGGCCGG
TTTATCTTGCCAGCATTCTTCTATCAACGTTTTAAGTCCATGAGGGTAAAGCTTTGATGG
AGCTTTGAACAATGGCCGCTCTTTGCTGGCATAAGCTTCTGATGCTTCACTGTCTTC*CT
TTTCAGCAAAGGGCATTCTTC*CTTCTATCATCTCTTGAACGATCAAAGCAAAGGAGAAA
ACATCAGCTTTTGTGTCATATTCCTCGCTAGTGAAAACTTCAGGA
C

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2G053TF 500 0 0
GATAC
AAAGAATCGTTTCTGA*CCGGTTAAAGAATCACAAATGTGAAC*GGATGACGAGC*GTCA
TGGCTGCTCATATCCCAATTATGTTTCT*CTTGTGCTCGAAATTCTGAAAGCAAGTCAAA
GGCCTCATCCTCCATTGTCGTTTGTGACCCATATGATGAAGAATAGACTCAAGCCGTTTA
ATGATCTCTCTGAAAAGTAGGTCGCTTGGCCGGTTTATCTTGCCAGCATTCTTCTATCAA
CGTTTTAAGTCCATGAGGGTAAAGCTTTGATGGAGCTTTGAACAATGGCCGCTCTTTGCT
GGCATAAGCTTCTGATGCTTCGCTGTCTTCTCTTTTCAGCAAAGGGCATTCTTCTCTTCT
ATCATCTCTTGAACGATCAAAGCAAAGGAGAAAACATCAGCTTTTGTGTCATATTCCTCG
CTAGTGAAAACTTCAGGAGCAATATATCTACAAGAAGTGTCAAGACATGTGAAAGGCTTC
TCTTCTTTAACAGTA

QA 6 500 6 500
DS 

RD RR2FW27JQ 728 0 0
ATCA
CAACAGCAAATATTCTTAACGTTAAAATCATAGATCTTACAACAATCTTTATACAACGAT
AAAATGCCAGGTTTTGTCCACACGGACTTCCATCAGTGAAGAACAAAATGACAAACTAAA
ATTCGGTTTTTTAGGGGGAAAACCAAACTAAACCGGAGGGAATACAAAAGAATCGTTTCT
GAACCGGTTAAAGAATCACAAATGTGAACCGGATGACGAGCCGTCATGGCTGCTCATATC
CCAATTATGTTTCTTCTTGTGCTCGAAATTCTGAAAGCAAGTCAAAGGCCTCATCCTCCA
TTGTCGTTTGTGACCCATATGATGAAGAATAGACTCAAGCCGTTTAATGATCTCTCTGAA
A*GTAGGTCGCTTGGCCGGTTTATCTTGCCAGCATTCTTCTATCAACGTTTTAAGTCCAT
GAGGGTAAAGCTTTGATGGAGCTTTGAACAATGGCCGCTCTTTGCTGGCATAAGCTTCTG
ATGCTTCGCTGTCTTC*CTTTTCAGCAAAGGGCATTCTTC*CTTCTATCATCTCTTGAAC
GATCAAAGCAAAGGAGAAAACATCAGCTTTTGTGTCATATTCCTCGCTAGTGAAAACTTC
AGGAGCAATATATCTACAAGAAGTGTCAAGACATGTGAAAGGCTTCTCTTCTTTAACAGT
AACAAGCTTGCTAACTCCAAAGTCTGCAACTTTCAGATGCCCTGAATCATCCCTCAATAT
GTT
T

QA 5 727 5 727
DS 

RD RR2CA66JQ 723 0 0
CAACAGCAAATATTCTTAACGTTAAAATCATAGATCTCACAACAATCTTTATACAACGAT
AAAATGCCAGTTTTTGTCCGCACGGACTTCCATCAGTGAAGAACAAAATGACAAACTAAA
ATTCGGTTTTTTAGGGGGAAAACCAAACTAAACCGGAGGGAATACAAAAGAATCGTTTCT
GAACCGGTTAAAGAATCACAAATGTGAACCGGATGACGAGCCGTCATGGCTGCTCATATC
CCAATTATGTTTCTTCTTGTGCTCGAAATTCTGAAAGCAAGTCAACGGCCTCATCCTCCA
TTGTCGTTTGTGACCCATATAATGAAGAATAGACTCAAGCCGTTTAATGATCTCTCTGAA
A*GTAGGTCGCTTGGCCGGTTTATCTTGCCAGCATTCTTCTATCAACGTTTTAAGTCCAT
GAGGGTAAAGCTTTGATGGAGCTTTGAACAATGGCCGCTCTTTGCTGGCATAAGCTTCTG
ATGCTTCACTGTCTTC*CTTTTCAGCAAAGGGCATTCTTC*CTTCTATCATCTCTTGAAC
GATCAAAGCAAAGGAGAAGACATCAGCTTTTGTGTCATATTCCTCGCTAGTGAAAACTTC
AGGAGCAATATATCTACAAGAAGTGTCAAGACATGTGAAAGGCTTGTCCTCTTTAACAGT
AACAAGCTTGCTAACTCCAAAGTCTGCAACTTTCAGATGCCCTGAATCATCCCTCAATAT
GTT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2G053JQ 820 0 0
ATCA
CAACAGCAAATATTCTTAACGTTAAAATCATAGATCTTACAACAATCTTTATACAACGAT
AAAATGCCAGGTTTTGTCCACACGGACTTCCATCAGTGAAGAACAAAATGACAAACTAAA
ATTCGGTTTTTTAGGGGGAAAACCAAACTAAACCGGAGGGAATACAAAAGAATCGTTTCT
GAACCGGTTAAAGAATCACAAATGTGAACCGGATGACGAGCCGTCATGGCTGCTCATATC
CCAATTATGTTTCTTCTTGTGCTCGAAATTCTGAAAGCAAGTCAAAGGCCTCATCCTCCA
TTGTCGTTTGTGACCCATATGATGAAGAATAGACTCAAGCCGTTTAATGATCTCTCTGAA
A*GTAGGTCGCTTGGCCGGTTTATCTTGCCAGCATTCTTCTATCAACGTTTTAAGTCCAT
GAGGGTAAAGCTTTGATGGAGCTTTGAACAATGGCCGCTCTTTGCTGGCATAAGCTTCTG
ATGCTTCGCTGTCTTC*CTTTTCAGCAAAGGGCATTCTTC*CTTCTATCATCTCTTGAAC
GATCAAAGCAAAGGAGAAAACATCAGCTTTTGTGTCATATTCCTCGCTAGTGAAAACTTC
AGGAGCAATATATCTACAAGAAGTGTCAAGACATGTGAAAGGCTTCTCTTCTTTAACAGT
AACAAGCTTGCTAACTCCAAAGTCTGCAACTTTCAGATGCCCTGAATCATCCCTCAATAT
GTTTGAAG*TTCAAGATCGCGGTGGATGATCGGGTCTCCTTTGATCTCATGA*GATAGCT
CATTCCCCTTGCA*TGTCGAGGGCGTATCTA
CAGCA

QA 5 815 5 815
DS 

RD RR2FW27TF 557 0 0
TCT
TCCATTGTCGTTTGTGACCCATATGATGAAGAATAGACTCAAGCCGTTTAATGATCTCTC
TGAAA*GTAGGTCGCTTGGCCGGTTTATCTTGCCAGCATTCTTCTATCAACGTTTTAAGT
CCATGAGGGTAAAGCTTTGATGGAGCTTTGAACAATGGCCGCTCTTTGCTGGCATAAGCT
TCTGATGCTTCGCTGTCTTC*CTTTTCAGCAAAGGGCATTCTTC*CTTCTATCATCTCTT
GAACGATCAAAGCAAAGGAGAAAACATCAGCTTTTGTGTCATATTCCTCGCTAGTGAAAA
CTTCAGGAGCAATATATCTACAAGAAGTGTCAAGACATGTGAAAGGCTTCTCTTCTTTAA
CAGTAACAAGCTTGCTAACTCCAAAGTCTGCAACTTTCAGATGCCCTGAATCATCCCTCA
ATATGTTTGAAGGTTCAAGATCGCGGTGGATGATCGGGTCTCCTTTGATCTCATGAAGAT
AGCTCATTCCCCTTGCAATGTCGAGGGCGTATCTAACAGCAGTAGCTGGTTTTAGTTGTC
CTTTCCTTTTGAGC

QA 4 557 4 557
DS 



AS 1 6

CO CL1190Contig1 1328 6 13 U
GGACACTTCACTAACATATAAAGCCTTAAAGATGACGAATCCCCACACAAACACCGTTTC
TTCTGTTTTTCTCTTGTTTTTCCTCTTTATCACGTCTGCCTCTTCACGTTCCTTCATACG
ACAATACACTGATGACTTCAACACAAATCTGCAGCAGGAGAATGGGGCAGGACCAAACCC
AAACATGGGAAAAGCGCATCACCTACATGAACGTCAAGAGATATCATCACGTGATTATAA
AGTCTCAGTTTCAAGTATGGTGAATGGTCTAAGAGATCGTCCTCCATCGTCATACTCTCT
CAAGATGGAGTCTTTCAACAAGCTCCTCAACTCACCCAACACAGAGAGATACCAGTCTCG
TCCATTTACAGTTGGTGGATACAACTGGACACTTATGGTGTACCCCAACGGTAACAAGAA
GGATAGTGGTTCAGGGTACCTTTCGCTTTACGTAGCCATAGACAACTCAACTCTCGTCGC
TGGACATCAAGATGTTTATGCAGATCTCAGGTTTTACGTCTTCAATAACAACGAGAGGAA
ATACTTTACTATCCAAGATACCAATGTATGGCGCTTCACTGTCTTCAAAAGTATGTGGGG
ATTCTCTCAAGTCCTCCCCGTTGCTACATTCAAAGACCCTAGAAACGGATACCTTTACGA
TGGAGATCATTGCGAGTTTGGTGTTGATGTGACCATTCCCACTACGTATCAAATTTCCGA
ACTTTTCTCTATTGCTGAAAAATTCTATAACCCCAAGTTCACCTATACCATTCGTGGGTT
GTCTACGCTTCTCCAAGATACTTACTACTCAGATCTCTTCTCCGTTGGAGGGAGAAATTG
GAAGATACAAGTGGATCCAAGTGGTCGTTCAACGGCACAAGGAAAAGCCTTGTCCATGTA
TCTTAACCTAGATGTGAATGAGAAGTTCAGACCCTACGAGAAGATTTATGTTCGAGCCAA
GCTTAGAGTTCTTAACCAACGTGGACTCAATAACATCGAAAGGCAACTGGATAACTGGTA
CCAGGGTCCAGCTTATGGAGGAGAATACAGCTGGGGTTACCATGAGTTTATCTCTTTCTC
TGATCTCAGAGATTCAGCAAAGGGTTTTGTTGTGAACGACGTGTTGATGGTTCAGGCTGA
ATTCGAGTACATTTCTTCAACCAAGTACTTGCCTAACTAGATTTTTTCTAGACAAGGAAG
TTGTACCTTCATGTTTTTTACTTTCTCATCAACCATTTTATAATACGACTCTGTTTTTGT
GTATCAAATAAAAGAATGTTTGTTGTTGTTTTCATAAAAATATCAAAACATCATCTTTCT
TCTTGAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 35 35 35 
20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD37TF U 36
AF RR2BS81TF U 1
AF RR2B593TF U 1
AF RR2BS81JQ C 444
AF RR2B593JQ C 516
AF RR2AD37JQ C 529
BS 1 10 RR2B593TF
BS 11 11 RR2BS81TF
BS 12 253 RR2B593TF
BS 254 254 RR2AD37TF
BS 255 820 RR2B593TF
BS 821 822 RR2BS81JQ
BS 823 823 RR2B593JQ
BS 824 964 RR2BS81JQ
BS 965 965 RR2B593JQ
BS 966 1149 RR2BS81JQ
BS 1150 1150 RR2B593JQ
BS 1151 1283 RR2BS81JQ
BS 1284 1328 RR2AD37JQ

RD RR2AD37TF 682 0 0
CGAATCCCCACACAAACACCGTTTCTTCTGTTTTTCTCTTGTTTTTCCTCTTTATCACGT
CTGCCTCTTCACGTTCCTTCATACGACAATACACTGATGACTTCAACACAAATCTGCAGC
AGGAGAATGGGGCAGGACCAAAACCAAACATGGGAAAAGCGCATCACCTACATGAACGTC
AAGAGATAGCATCACGTGATTATAAAGTCTCAGTTTCAAGTATGGTGAATGGTCTAAGAG
ATCGTCCTCCATCGTCATACTCTCTCAAAATGGAGTCTTTCAACAAGCTCCTCAACTCAC
CCAACACAGAGAGATACCAGTCTCGTCCATTTACAGTTGGTGGATACAACTGGACACTTA
TGGTGTACCCCAACGGTAACAAGAAGGATAGTGGTTCAGGGTACCTTTCGCTTTACGTAG
CCATAGACAACTCAACTCTCGTCGCTGGACATCAAGATGTTTGTGCAGATCTCAGGTTTT
ACGTCTTCAATAACAACGAGAGGAAATACTTAACTATCCAAGATACCAATGTATGGCGCT
TCACTGTCTTCAAAAGTATGTGGGGATTCTCTCAAGTCCTCCCCGTTGCTACATTCAAAG
ACCCTAGAAACGGATATCTTTACGATGGAGATCACTGCGAGTTTGGTGTTGATGTGACCA
TTCCCACTACGTATCAAATTTC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2BS81TF 760 0 0
GGACACTTCACTAACATATAAAGCCTTAAAGATGACGAATCCCCACACAAACACCGTTTC
TTCTGTTTTTCTCTTGTTTTTCCTCTTTATCACGTCTGCCTCTTCACGTTCCTTCATACG
ACAATACACTGATGACTTCAACACAAATCTGCAGCAGGAGAATGGGGCAGGACCAAACCC
AAACATGGGAAAAGCGCATCACCTACATGAACGTCAAGAGATATCATCACGTGATTATAA
AGTCTCAGTTTCAAGTATGGTGAATGGTCTAAGAGATCGTCCTTCATCGTCATACTCTCT
CAAGATGGAGTCTTTCAACAAGCTCCTCAACTCACCCGACACAGATAGATACCAGTCTCG
TCCATTTACAGTTGGTGGATACAACTGGACACTTATGGTGTACCCCAACGGTAACAAGAA
GGATAGTGGTTCAGGGTACCTTTCGCTTTACGTAGCCATAGACAACTCAACTCTCGTCGC
TGGACATCAAGATGTTTATGCAGATCTCAGGTTTTACGTCTTCAATAACAACGAGAGGAA
ATACTTTACTATCCAAGATACCAATGTATGGCGCTTCACTGTCTTCAAAAGTATGTGGGG
ATTCTCTCAAGTCCTCCCCGTTGCTACATTCAAAGACCCTAGAAACGGATACCTTTACGA
TGGAGATCATTGCGAGTTTGGTGTTGATGTGAC*ATTCCCACTACGTATCAA*TTTCCGA
C**TTTCTCTATTGCTGAAAA
TCTATAACCCCAGTCACTA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2B593TF 820 0 0
GGACACTTCATTAACATATAAAGCCTTAAAGATGACGAATCCCCACACAAACACCGTTTC
TTCTGTTTTTCTCTTGTTTTTCCTCTTTATCACGTCTGCCTCTTCACGTTCCTTCATACG
ACAATACACTGATGACTTCAACACAAATCTGCAGCAGGAGAATGGGGCAGGACCAAACCC
AAACATGGGAAAAGCGCATCACCTACATGAACGTCAAGAGATATCATCACGTGATTATAA
AGTCTCAGTTTCAGGTATGGTGAATGGTCTAAGAGATCGTCCTCCATCGTCATACTCTCT
CAAGATGGAGTCTTTCAACAAGCTCCTCAACTCACCCAACACAGAGAGATACCAGTCTCG
TCCATTTACAGTTGGTGGATACAACTGGACACTTATGGTGTACCCCAACGGTAACAAGAA
GGATAGTGGTTCAGGGTACCTTTCGCTTTACGTAGCCATAGACAACTCAACTCTCGTCGC
TGGACATCAAGATGTTTATGCAGATCTCAGGTTTTACGTCTTCAATAACAACGAGAGGAA
ATACTTTACTATCCAAGATACCAATGTATGGCGCTTCACTGTCTTCAAAAGTATGTGGGG
ATTCTCTCAAGTCCTCCCCGTTGCTACATTCAAAGACCCTAGAAACGGATACCTTTACGA
TGGAGATCATTGCGAGTTTGGTGTTGATGTGACCATTCCCACTACGTATCAAATTTCCGA
ACTTTTCTCTATTGCTGAAAAATTCTATAACCCCAAGTTCACCTATACCATTCGTGGGTT
GTCTACGCTTCTCCAAGATACTTACTACTCAGATCTCTTC

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR2BS81JQ 848 0 0
CGCTTTACGTAGCCATAGACAACTCAACTCTCGTCGCTGGACATCAAGATGTTTATGCAG
ATCTCAGGTTTTACGTCTTCAATAACAACGAGAGGAAATACTTTACTATCCAAGATACCA
ATGTATGGCGCTTCACTGTCTTCAAAAGTATGTGGGGATTCTCTCAAGTCCTCCCCGTTG
CTACATTCAAAGACCCTAGAAACGGATACCTTTACGATGGAGATCATTGCGAGTTTGGTG
TTGATGTGACCATTCCCACTACGTATCAAATTTCCGAACTTTTCTCTATTGCTGAAAAAT
TCTATAACCCCAAGTTCACCTATACCATTCGTGGGTTGTCTACGCTTCTCCAAGATACTT
ACTACTCAGATCTCTTCTCTGTTGGAGGGAGAAATTGGAAGATACAAGTGGATCCAAGTG
GTCGTTCAACGGCACAAGGAAAAGCCTTGTCCATGTATCTTAACCTAGATGTGAATGAGA
AGTTCAGACCCTACGAGAAGATTTATGTTCGAGCCAAGCTTGGAGTTCTTAACCAACGTG
GACTCAATAACATCGAAAGGCAACTGGATAACTGGTACCAGGGTCCAGCTTATGGAGGAG
AATACAGCTGGGGTTACCATGAGTTTATCTCTTTCTCTGATCTCAGAGATTCAGCAAAGG
GTTTTGTTGTGAACGACGTGTTGATGGTTCAGGCTGAATTCGAGTATATTTCTTCAACCA
AGTACTTGCCTAACTAGATTTTTTCTAGACAAGGAAGTTGTACCTTCATGTTTTTTACTT
TCTCATCAACCATTTTATAATACGACTCTGTTTTTGTGTATCAAATAAAAGAATGTTTGT
GTTGTTCT

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2B593JQ 773 0 0
ACGTCTTCAATAACAACGAGAGGAAATACTTTACTATCCAAGATACCAATGTATGGCGCT
TCACTGTCTTCAAAAGTATGTGGGGATTCTCTCAAGTCCTCCCCGTTGCTACATTCAAAG
ACCCTAGAAACGGATACCTTTACGATGGAGATCATTGCGAGTTTGGTGTTGATGTGACCA
TTCCCACTACGTATCAAATTTCCGAACTTTTCTCTATTGCTGAAAAATTCTATAACCCCA
AGTTCACCTATACCATTCGTGGGTTGTCTACGCTTCTCCAAGATACTTACTACTCAGATC
TCTTCTCCGTTGGAGGGAGAAATTGGAAGATACAAGTGGATCCAAGTGGTCGTTCAACGG
CACAAGGAAAAGCCTTGTCCATGTATCTTAACCTAGATGTGAATGAGAAGTTCAGACCCT
ACGAGAAGATTTATGTTCGAGCCAAGCTTAGAGTTCTTAACCAACGTGGACTCAATAACA
TCGAAAGGCAACTGGATAACTGGTACCAGGGTCCAGCTTATGGAGGAGAATACAGCTGGG
GTTACCATGAGTTTATCTCTTTCTCTGACCTCAGAGATTCAGCAAAGGGTTTTGTTGTGA
ACGACGTGTTGATGGTTCAGGCTGAATTCGAGTACATTTCTTCAACCAAGTACTTGCCTA
ACTAGATTTTTTCTAGACAAGGAAGTTGTACCTTCATGTTTTTTACTTTCTCATCAACCA
TTTTATAATACGACTCTGTTTTTGTGTATCAAATAAAAGAATGTTTGT
TGTCG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2AD37JQ 800 0 0
CAACGAGAGGAAATACTTAACTATCCAAGATACCAATGTATGGCGCTTCACTGTCTTCAA
AAGTATGTGGGGATTCTCTCAAGTCCTCCCCGTTGCTACATTCAAAGACCCTAGAAACGG
ATATCTTTACGATGGAGATCACTGCGAGTTTGGTGTTGATGTGACCATTCCCACTACGTA
TCAAATTTCCGAACTTTTCTCTATTGCTGATAAATTCTATAACCCCAAGTTCACCTATAC
CATTCGTGGGTTGTCTACGCTTCTCAAAGATACTTACTACTCAGATCTCTTCTCCGTTGG
AGGGAGAAATTGGAAGATACAAGTGGATCCAAGTGGTCGTTCAACGGCACAAGGAAAAGC
CTTGTCCATGTATCTTAACCTAGATGTGAATGAGAAGTTCAGACCCTACGAGAAGATTTA
TGTTCGAGCCAAGCTTAGAGTTCTTAACCAACGTGGACTCAACAACATCGAAAAGCAAGT
GGATAACTGGTACCAGGGTCAAGCTTACGGAGTAGAATACAGCTGGGGTTACCATGAGTT
TATCTCTTTCTCTGATCTCAGAGATTCAGCAAAGGGTTTTGTTGTGAACGACGTGTTGAT
GGTTCAGGCTGAATTCGAGTACATTTCTTCAACCAAGTACTTGCCTAACTAGATTTCT*C
TAGACAAGGAACTTGTACCTTCATGTTTTTTACTTTCTCATCAACCATTTTATAATACGA
CTCTGTTTTTGTGTATCAAATAAAAGAATGTTTGTTGTTGTTTTCATAAAAATATCAAAA
CATCATCTTTCTTCTTGAAC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 7

CO CL1191Contig1 945 7 13 U
GGGAGAGATAGATAGACATTGGCCGGTGGCCTCGTCACAAATGCAAAATATCTAAAAAAG
GATTCGGGAAACATTTTTTTTCTGAAAGAGAATCCAAAACCTTTCTTTCATTTCTCAAAT
TCCCAGCACAAAGCAAACCCACAAGATTCGATTCAACTAATCCCATTTTCTCAGTAAAAG
TTTCGTTTTTTGATTTTTTTCTTTCTGTTGAAACCGAAAGGGAAACACTTTCAATCTTCC
TTTTCACGTTTTTAGCGTTCTGGGTGTTTCTGTTTGATGAGGTGCGAGGAGGAGATTCTT
CCTCTGTTTGTGTCTCTGTCAGATGGAAGACAATGATAAGTCTCCTCCCCCTAAGGATTA
CTATAAGATTCTAGAAGTTGATTACGACGCAACTGAGGAACTGATCAGAGTGAATTATCG
GAAGCTTGCTTTGAAGTGGCATCCTGATAAGCACAAAGGAGATAGTGCAGCTTCAGAAAA
GTTTATAGAGATAAATGATGCTTATAACGTGCTGATGGACCCTGCTGCACGTTTTGAATA
TGATTTAACCGGTATCTATGAGATCCACAAGTATACTCTACGGGAATATCTTGCCAGATT
TAA*GGGAATGATACTCACTTGCAATGGGCTCGGTATCAGCCAATCCTCATCACCATGGA
CACATCAATTGTCTGAGACTAGCAGCAAAACAACAGACTAGCGAGGGTGTGTGTTTGTGG
TGGTGTACAAAACTGGAGTCATGGCGCGGAGCTTTGTCATGATATGCTTTAGTTAGATGT
TGTATTGTTCTGAGTCGATGTAGTATTAGAGAAGCGATTATGGTCTCTGGTTTCGGAGGG
TCATACGTTTACACAGTGTGATGGATCCAGGTCTTGTATTACTACTTACTTTCATCATTC
ATTGTTTTTCAAACTTGAGAGTGAATGATACAAATTAATGAATCG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F911TF U 1
AF RR2BX34TF U 6
AF RR2B895TF U 99
AF RR2EW55TF U 186
AF RR2B895JQ C 201
AF RR2BX34JQ C 308
AF RR2EW55JQ C 403
BS 1 358 RR2F911TF
BS 359 359 RR2BX34TF
BS 360 661 RR2F911TF
BS 662 689 RR2BX34TF
BS 690 692 RR2B895TF
BS 693 707 RR2BX34TF
BS 708 708 RR2B895TF
BS 709 767 RR2BX34TF
BS 768 906 RR2B895TF
BS 907 908 RR2EW55TF
BS 909 909 RR2B895JQ
BS 910 924 RR2EW55TF
BS 925 945 RR2EW55JQ

RD RR2F911TF 661 0 0
GGGAGAGATAGATAGACATTGGCCGGTGGCCTCGTCACAAATGCAAAATATCTAAAAAAG
GATTCGGGAAACATTTTTTTTCTGAAAGAGAATCCAAAACCTTTCTTTCATTTCTCAAAT
TCCCAGCACAAAGCAAACCCACAAGATTCGATTCAACTAATCCCATTTTCTCAGTAAAAG
TTTCGTTTTTTGATTTTTTTCTTTCTGTTGAAACCGAAAGGGAAACACTTTCAATCTTCC
TTTTCACGTTTTTAGCGTTCTGGGTGTTTCTGTTTGATGAGGTGCGAGGAGGAGATTCTT
CCTCTGTTTGTGTCTCTGTCAGATGGAAGACAATGATAAGTCTCCTCCCCCTAAGGAT*A
CTATAAGATTCTAGAAGTTGATTACGACGCAACTGAGGAACTGATCAGAGTGAATTATCG
GAAGCTTGCTTTGAAGTGGCATCCTGATAAGCACAAAGGAGATAGTGCAGCTTCAGAAAA
GTTTATAGAGATAAATGATGCTTATAACGTGCTGATGGACCCTGCTGCACGTTTTGAATA
TGATTTAACCGGTATCTATGAGATCCACAAGTATACTCTACGGGAATATCTTGCCAGATT
TAA*GGGAATGATACTCACTTGCAATGGGCTCGGTATCAGCCAATCCTCATCACCATGGA
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2BX34TF 762 0 0
AGATAGATAGACATTGGCCGGTGGCCTCGTCACAAATGCAAAATATCTAAAAAAGGATTC
GGGAAACATTTTTTTTCTGAAAGAGAATCCAAAACCTTTCTTTCATTTCTCAAATTCCCA
GCACAAAGCAAACCCACAAGATTCGATTCAACTAATCCCATTTTCTCAGTAAAAGTTTCG
TTTTTTGATTTTTTTCTTTCTGTTGAAACCGAAAGGGAAACACTTTCAATCTTCCTTTTC
ACGTTTTTAGCGTTCTGGGTGTTTCTGTTTGATGAGGTGCGAGGAGGAGATTCTTCCTCT
GTTTGTGTCTCTGTCAGATGGAAGACAATGATAAGTCTCCTCCCCCTAAGGATTACTATA
AGATTCTAGAAGTTGATTACGACGCAACTGAGGAACTGATCAGAGTGAATTATCGGAAGC
TTGCTTTGAAGTGGCATCCTGATAAGCACAAAGGAGATAGTGCAGCTTCAGAAAAGTTTA
TAGAGATAAATGATGCTTATAACGTGCTGATGGACCCTGCTGCACGTTTTGAATATGATT
TAACCGGTATCTATGAGATCCACAAGTATACTCTACGGGAATATCTTGCCAGATTTAAAG
GGAATGATACTCACTTGCAATGGGCTCGGTATCAGCCAATCCTCATCACCATGGACACAT
CAATTGTCTGAGACTAGCAGCAAA**CACAGACTAGCGAGGG*GTGTGTTTGTGGTGGTG
TACAAAACTGGAGTCATGGCGCGGAGCTTTGTCATGATATGC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2B895TF 808 0 0
GG
CTTTCTTTCATTTCTCAAATTCCCAGCACAAAGCAAACCCACAAGACTCGATTCAACTAA
TCCCTTTTTCTCAGTAAAAGTTTCGTTTTTTGATTTTTTTCTTTCTGTTGAAACCGAAAG
GGAAACACTTTCAATCTTCCTTTTCACGTTTTTAGCGTTCTGGGTGTTTCTGTTTGATGA
GGTGCGAGGAGGAGATTCTTCCTCTGTTTGTGTCTCTGTCAGATGGAAGACAATGATAAG
TCTCCTCCCCCTAAGGATTACTATAAGATTCTAGAAGTTGATTACGACGCAACTGAGGAA
CTGATCAGAGTGAATTATCGGAAGCTTGCTTTGAAGTGGCATCCTGATAAGCACAAAGGA
GATAGTGCAGCTTCAGAAAAGTTTATAGAGATAAATGATGCTTATAACGTGCTGATGGAC
CCTGCTGCACGTTTTGAATATGATTTAACCGGTATCTATGAGATCCACAAGTATACTCTA
CGGGAATATCTTGCCAGATTTAA*GGGAATGATACTCACTTGCAATGGGCTCGGTATCAG
CCAATCCTCATCACCATGGACACATCAATTGTCTGAGACTAGCAGCAAAACAACAGACTA
GCGAGGGTGTGTGTTTGTGGTGGTGTACAAAACTGGAGTCATGGCGCGGAGCTTTGTCAT
GATATGCTTTAGTTAGATGTTGTATTGTTCTGAGTCGATGTAGTATTAGAGAAGCGATTA
TGGTCTCTGGTTTCGGAGGGTCATACGTTTACACAGTGTGATGGATCCAGGTCTTGTATT
ACTACTTACTTTCATCATTCATTGTT

QA 3 808 3 808
DS 

RD RR2EW55TF 757 0 0
TTTTTTGATTTTTTTCTTTCTGTTGAAACCGAAAGGGAAACACTTTCAATCTTCCTTTTC
ACGTTTTTAGCGTTCTGGGTGTTTCTGTTTGATGAGGTGCGAGGAGGAGATTCTTCCTCT
GTTTGTGTCTCTGTCAGATGGAAGACAATGATAAGTCTCCTCCCCCTAAGGATTACTATA
AGATTCTAGAAGTTGATTACGACGCAACTGAGGAACTGATCAGAGTGAATTATCGGAAGC
TTGCTTTGAAGTGGCATCCTGATAAGCACAAAGGAGATAGTGCAGCTTCAGAAAAGTTTA
TAGAGATAAATGATGCTTATAACGTGCTGATGGACCCTGCTGCACGTTTTGAATATGATT
TAACCGGTATCTATGAGATCCACAAGTATACTCTACGGGAATATCTTGCCAGATTTAA*G
GGAATGATACTCACTTGCAATGGGCTCGGTATCAGCCAATCCTCATCACCATGGACACAT
CAATTGTCTGAGACTAGCAGCAAAACAACAGACTAGCGAGGGTGTGTGTTTGTGGTGGTG
TACAAAACTGGAGTCATGGCGCGGAGCTTTGTCATGATATGCTTTAGTTAGATGTTGTAT
TGTTCTGAGTCGATGTAGTATTAGAGAAGCGATTATGGTCTCTGGTTTCGGAGGGTCATA
CGTTTACACAGTGTGATGGATCCAGGTCTTGTATTACTACTTACTTTCATCATTCATTGT
TTT*CAAACTTGAGAGTGA
TGATACAATTAATGATCG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2B895JQ 739 0 0
CTTTCTGTTGAAACCGAAAGGGAAACACTTTCAATCTTCCTTTTCACGTTTTTAGCGTTC
TGGGTGTTTCTGTTTGATGAGGTGCGAGGAGGAGATTCTTCCTCTGTTTGTGTCTCTGTC
AGATGGAAGACAATGATAAGTCTCCTCCCCCTAAGGATTACTATAAGATTCTAGAAGTTG
ATTACGACGCAACTGAGGAACTGATCAGAGTGAATTATCGGAAGCTTGCTTTGAAGTGGC
ATCCTGATAAGCACAAAGGAGATAGTGCAGCTTCAGAAAAGTTTATAGAGATAAATGATG
CTTATAACGTGCTGATGGACCCTGCTGCACGTTTTGAATATGATTTAACCGGTATCTATG
AGATCCACAAGTATACTCTACGGGAATATCTTGCCAGATTTAA*GGGAATGATACTCACT
TGCAATGGGCTCGGTATCAGCCAATCCTCATCACCATGGACACATCAATTGTCTGAGACT
AGCAGCAAAACAACAGACTAGCGAGGGTGTGTGTTTGTGGTGGTGTACAAAACTGGAGTC
ATGGCGCGGAGCTTTGTCATGATATGCTTTAGTTAGATGTTGTATTGTTCTGAGTCGATG
TAGTATTAGAGAAGCGATTATGGTCTCTGGTTTCGGAGGGTCATACGTTTACACAGTGTG
ATGGATCCAGGTCTTGTATTACTACTTACTTTCATCATTCATTGTTTTTCAAACTTGAAA
GTGA
ATGATACAAATTAAT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2BX34JQ 604 0 0
TTGTGTCTCTGTCAGATGGAAGACAATGATAAGTCTCCTCCCCCTAAGGATTACTATAAG
ATTCTAGAAGTTGATTACGACGCAACTGAGGAACTGATCAGAGTGAATTTTCGGAAGCTT
GCTTTGAAGTGGCATCCTGATAAGCCCAAAGGAGATAGTGCAGCTTCAGAAAAGTTTATA
GAGATAAATGATGCTTATAACGTGCTGATGGACCCTGCTGCACGTTTTGAATATGATTTA
ACCGGTATCTATGAGATCCACAAGTATACTCTACGGGAATATCTTGCCAGATTTAA*GGG
AATGATACTCACTTGCAATGGGCTCGGTATCAGCCAATCCTCATCACCATGGACACATCA
ATTGTCTGAGACTAGCAGCAAAACAACAGACTAGCGAGGGTGTGTGTTTGTGGTGGTGTA
CAAAACTGGAGTCATGGCGCGGAGCTTTGTCATGATATGCTTTAGTTAGATGTTGTATTG
TTCTGAGTCGATGTAGTATTAGAGAAGCGATTATGGTCTCTGGTTTCGGAGGGTCATACG
TTTACACAGTGTGATGGATCCAGGTCTTGTATTACTACTTACTTTCATCATTCATTGTTT
T
TCC

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2EW55JQ 543 0 0
GATCAGAGTGAATTATCGGAAGCTTGCTTTGAAGTGGCATCCTGATAAGCACAAAGGAGA
TAGTGCAGCTTCAGAAAAGTTTATAGAGATAAATGATGCTTATAACGTGCTGATGGACCC
TGCTGCACGTTTTGAATATGATTTAACCGGTATCTATGAGATCCACAAGTATACTCTACG
GGAATATCTTGCCAGATTTAA*GGGAATGATACTCACTTGCAATGGGCTCGGTATCAGCC
AATCCTCATCACCATGGACACATCAATTGTTTGAGACTAGCAGCAAAACAACAGACTAGC
GAGGGTGTGTGTTTGTGGTGGTGTACAAAACTGGAGTCATGGCGCGGAGCTTTGTCATGA
TATGCTTTAGTTAGATGTTGTATTGTTCTGAGTCGATGTAGTATTAGAGAAGCGATTATG
GTCTCTGGTTTCGGAGGGTCATACGTTTACACAGTGTGATGGATCCAGGTCTTGTATTAC
TACTTACTTTCATCATTCATTGTTTTTCAAACTTGAGAGTGAATGATACAAATTAATGAA
TCG

QA 1 543 1 543
DS 



AS 2 6

CO CL1192Contig1 1107 3 2 U
GGACAATCTCTCACACTCAAAACACTTCCTTCTCCGCTTCAGCCATGGGAACCCTATCTC
TCTCATCTTCCCTCAAACCTTCCCTCGTTTCACCAAGACCCAGCTCATCTCCCTCCACCT
CTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTTCCCGAAACCCAACAAACTCCACCTCAAACCCATTTCAA
CCCCCTTAAGAACTTCTCCGTCGCCACTGAGATTCGCGAACGCTTCAATCGAGATGTCGC
AGACACACGAGTCAGCCATTCGCGGCGCGGAGTCTGACGTCATGGGTCTTCTCCTTAGGG
AACGAACCGTCTTCCTCGGCAGCAGTATCGACGATTTCGTCGCCGACGCAATCATGAGTC
AGCTCCTGCTCCTTGATGCTAAAGACCCTAACAAAGACACCAAACTCTTCATCAACTCCT
CTGGTGGTTCCCTCAGTGCAACCATGGCTATATACGATGTGGTTCAGCTTATCCGAGCTG
ATGTCTCCACGATTGCTCTCGGCATTGCTGCATCAACGGCTTCGATAATTCTCGGTGCCG
GAACTAAAGGCAAGCGCTTTGCTATGCCCAACACGAGGATAATGATGCATCAGCCTCTTG
GAGGTGCGAGTGGTCAAGCTATAGATGTTGAGATCCAAGCTAAAGAAGTTATGCATAACA
AGAACAATGTCACCAGCATTATCGCTGGGTGTACTAGCCGGTTTTTTGAGCAGGTTTTGA
AAGATATTGACAGAGACCGGTACATGTTTCCCATTGAAGCGGTTGAGTATGGTTTGATTG
ATGGGGTTATTGATGGAGACAGCATCATTCCTCTCGAGCCTGTGCCTGATAGGGTGAAAC
CGAGGGTAAACTATGAGGGGATTAGTAAATATCCGATGAAGTTCTTGACCCCAGAGATAC
CTGATGATGAGATTTATTAAAAAAGGTCAAGCCTTTTTTAGAACCAGGCATATTCCAGTG
TGAGTCGAGACGGGTAAGTTTAGCTGATGAGGTCACTCGTGAGGGGGATTGGCTTTGCAA
AATTGACGTTTTTTTTTTTTTTGCAAAATTGACGTTGTTAAAAATTCTCTTTGGATTGAG
CATAATGACTGAAAAATGTTGTAGTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP83TF U 1
AF RR2DM69TF U 1
AF RR2DM69JQ C 612
BS 1 673 RR2DM69TF
BS 674 1107 RR2DM69JQ

RD RR2DP83TF 502 0 0
GGACAATCTCTCACACTCAAAACACTTCCTTCTCCGCTTCAGCCATGGGAACCCTATCTC
TCTCATCTTCCCTCAAACCTTCCCTCGTTTCACCAAGACCCAGCTCATCTCCCTCCACCT
CTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTTCCCGAAACCCAACAAACTCCACCTCAAACCCATTTCAA
CCCCCTTAAGAACTTCTCCGTCGCCACTGAGATTCGCGAACGCTTCAATCGAGATGTCGC
AGACACACGAGTCAGCCATTCGCGGCGCGGAGTCTGACGTCATGGGTCTTCTCCTTAGGG
AACGAATCGTCTTCCTCGGCAGCAGTATCGACGATTTCGTCGCCGACGCAATCATGAGTC
AGCTCCTGCTCCTTGATGCTAAAGACCCTAACAAAGACATCAAACTCTTCATCAACTCCT
CTGGTGGTTCCCTCAGTGCAACCATGGCTATATACGATGTGGTTCAGCTTATCCGAGCTG
ATGTCTCCACGATTGCTCTCGG

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR2DM69TF 685 0 0
GGACAATCTCTCACACTCAAAACACTTCCTTCTCCGCTTCAGCCATGGGAACCCTATCTC
TCTCATCTTCCCTCAAACCTTCCCTCGTTTCACCAAGACCCAGCTCATCTCCCTCCACCT
CTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTTCCCGAAACCCAACAAACTCCACCTCAAACCCATTTCAA
CCCCCTTAAGAACTTCTCCGTCGCCACTGAGATTCGCGAACGCTTCAATCGAGATGTCGC
AGACACACGAGTCAGCCATTCGCGGCGCGGAGTCTGACGTCATGGGTCTTCTCCTTAGGG
AACGAACCGTCTTCCTCGGCAGCAGTATCGACGATTTCGTCGCCGACGCAATCATGAGTC
AGCTCCTGCTCCTTGATGCTAAAGACCCTAACAAAGACACCAAACTCTTCATCAACTCCT
CTGGTGGTTCCCTCAGTGCAACCATGGCTATATACGATGTGGTTCAGCTTATCCGAGCTG
ATGTCTCCACGATTGCTCTCGGCATTGCTGCATCAACGGCTTCGATAATTCTCGGTGCCG
GAACTAAAGGCAAGCGCTTTGCTATGCCCAACACGAGGATAATGATGCATCAGCCTCTTG
GAGGTGCGAGTGGTCAAGCTATAGATGTTGAGATCCAAGCTAAAGAAGTTATGCATAACA
AGAACAATGTCAC
AGCATATCGCTG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2DM69JQ 496 0 0
GGTCAAGCTATAGATGTTGAGATCCAAGCTAAAGAAGTTATGCATAACAAGAACAATGTC
CCCAGCATTATCGCTGGGTGTACTAGCCGGTTTTTTGAGCAGGTTTTGAAAGATATTGAC
AGAGACCGGTACATGTTTCCCATTGAAGCGGTTGAGTATGGTTTGATTGATGGGGTTATT
GATGGAGACAGCATCATTCCTCTCGAGCCTGTGCCTGATAGGGTGAAACCGAGGGTAAAC
TATGAGGGGATTAGTAAATATCCGATGAAGTTCTTGACCCCAGAGATACCTGATGATGAG
ATTTATTAAAAAAGGTCAAGCCTTTTTTAGAACCAGGCATATTCCAGTGTGAGTCGAGAC
GGGTAAGTTTAGCTGATGAGGTCACTCGTGAGGGGGATTGGCTTTGCAAAATTGACGTTT
TTTTTTTTTTTGCAAAATTGACGTTGTTAAAAATTCTCTTTGGATTGAGCATAATGACTG
AAAAATGTTGTAGTTG

QA 1 496 1 496
DS 



CO CL1192Contig2 785 3 14 U
AGCTTCCATCATTCTCGGTGCGGGAACTAAAGGCAAGCGCTTTGCTACGCCCAACACGAG
GATAATGATGCATCAGCCTCTTGGAGGTGCGAGTGGTCAAGCTATAGATGTTGAGATCCA
AGCTAAAGAAGTTATGCACAACAAGAACAATGTCACCAGCATTATCGCTGGGTGTACTAG
CCGGTCGTTTGAGCAGGTTTTGAAAGATATTGACAGGGACCGGTACATGTCTCCCATTGA
AGCGGTTGAGTATGGTTTGATTGATGGTGTTATTGATGGAGACAGCATCATTCCTCTCGA
GCCTGTGCCTGATAGGGTGAAACCGAGGGTAAAATATGAGGAGATTAGCAAAGATCCGAT
GAAGTTCCTGACTCCTGAGATACCTGATGATGAGATTTATTAAAAATGTCAAGCCTCGTC
TAGAACCAGGTGACTGATCATATGAGAGACTATAGCTACTTTCTTGTTAATGTTTGCCTC
TTCATTTGTCAAGATAGATAGCATCTTGAACCAATTAGAGTAAAAGGAACATGAGGTTAT
GATAGAAACAGTAAACTTAATTTTCTTCTCATATCCTCCAGGCATATTTCAGTGTGAGTC
GAGACGGGTAAGTTCAGCTTATGGGGTCACTCGTGACTCGTGAGTGGTGATTGGCTTTGC
AAAATCGACGTTGATATTACCTGTCTTTGTATCTCATATTTTGCCTAATCTGAAAGATAA
TTGTTGTTAAAAATTCACTCTGGTTTGAGCATAATGACTGAAAAAAATTGTAGTTGATTT
CATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2HB18TF U 1
AF RR2EK62JQ C 36
AF RR2EK62TF U 36
BS 1 45 RR2HB18TF
BS 46 46 RR2EK62TF
BS 47 47 RR2HB18TF
BS 48 48 RR2EK62TF
BS 49 93 RR2HB18TF
BS 94 94 RR2EK62TF
BS 95 123 RR2HB18TF
BS 124 124 RR2EK62TF
BS 125 174 RR2HB18TF
BS 175 732 RR2EK62TF
BS 733 733 RR2EK62JQ
BS 734 766 RR2EK62TF
BS 767 767 RR2EK62JQ
BS 768 785 RR2EK62TF

RD RR2HB18TF 174 0 0
AGCTTCCATCATTCTCGGTGCGGGAACTAAAGGCAAGCGCTTTGCGATGCCCAACACGAG
GATAATGATGCATCAGCCTCTTGGAGGTGCGAGCGGTCAAGCTATAGATGTTGAGATCCA
AGCGAAAGAAGTTATGCACAACAAGAACAATGTCACCAGCATTATCGCTGGGTG

QA 1 174 1 174
DS 

RD RR2EK62JQ 750 0 0
G
GCGCTTTGCTACGCCCAACACGAGGATAATGATGCATCAGCCTCTTGGAGGTGCGAGTGG
TCAAGCTATAGATGTTGAGATCCAAGCTAAAGAAGTTATGCACAACAAGAACAATGTCAC
CAGCATTATCGCTGGGTGTACTAGCCGGTCGTTTGAGCAGGTTTTGAAAGATATTGACAG
GGACCGGTACATGTCTCCCATTGAAGCGGTTGAGTATGGTTTGATTGATGGTGTTATTGA
TGGAGACAGCATCATTCCTCTCGAGCCTGTGCCTGATAGGGTGAAACCGAGGGTAAAATA
TGAGGAGATTAGCAAAGATCCGATGAAGTTCCTGACTCCTGAGATACCTGATGATGAGAT
TTATTAAAAATGTCAAGCCTCGTCTAGAACCAGGTGACTGATCATATGAGAGACTATAGC
TACTTTCTTGTTAATGTTTGCCTCTTCATTTGTCAAGATAGATAGCATCTTGAACCAATT
AGAGTAAAAGGAACATGAGGTTATGATAGAAACAGTAAACTTAATTTTCTTCTCATATCC
TCCAGGCATATTTCAGTGTGAGTCGAGACGGGTAAGTTCAGCTTATGGGGTCACTCGTGA
CTCGTGAGTGGTGATTGGCTTTGCAAAATCGACGTTGATATTACCTGTCTTTGTATCTCA
TATTTTGCCTAATCTGAAAGATAATTGTTGTTAAAAATTCACTCTGGTTTGAGCATAATG
ACTGAAAAAAATTGTAGTTGATTTCATTT

QA 2 750 2 750
DS 

RD RR2EK62TF 750 0 0
G
GCGCTTTGCTACGCCCAACACGAGGATAATGATGCATCAGCCTCTTGGAGGTGCGAGTGG
TCAAGCTATAGATGTTGAGATCCAAGCTAAAGAAGTTATGCACAACAAGAACAATGTCAC
CAGCATTATCGCTGGGTGTACTAGCCGGTCGTTTGAGCAGGTTTTGAAAGATATTGACAG
GGACCGGTACATGTCTCCCATTGAAGCGGTTGAGTATGGTTTGATTGATGGTGTTATTGA
TGGAGACAGCATCATTCCTCTCGAGCCTGTGCCTGATAGGGTGAAACCGAGGGTAAAATA
TGAGGAGATTAGCAAAGATCCGATGAAGTTCCTGACTCCTGAGATACCTGATGATGAGAT
TTATTAAAAATGTCAAGCCTCGTCTAGAACCAGGTGACTGATCATATGAGAGACTATAGC
TACTTTCTTGTTAATGTTTGCCTCTTCATTTGTCAAGATAGATAGCATCTTGAACCAATT
AGAGTAAAAGGAACATGAGGTTATGATAGAAACAGTAAACTTAATTTTCTTCTCATATCC
TCCAGGCATATTTCAGTGTGAGTCGAGACGGGTAAGTTCAGCTTATGGGGTCACTCGTGA
CTCGTGAGTGGTGATTGGCTTTGCAAAATCGACGTTGATATTACCTGTCTTTGTATCTCA
TATTTTGCCTAATCTGAAAGATAATTGTTGTTAAAA*TTCACTCTGGTTTGAGCATAATG
ACTGAAAAAA*TTGTAGTTGATTTCATTT

QA 2 750 2 750
DS 



AS 1 7

CO CL1193Contig1 801 7 18 U
GGGAAGAAGATAAAGCAAAAAAACAATGGCAACCATTAATTCAACGGTCACGATTCTCTC
TCCCAAATCGATCCCAAAGATCATCAACTCGAAACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGAC
CGCCGGTTTCTCTCCCAACGTGGTGAAATGTGTCAGCTCCTCCTCTTGCCGGAGATTGAA
GCTAGCGAAGCTGGTCTCTGCGGCTGGACTGTCGCAGATAGAACCAGATATCAACGAAGA
TCCCATTGGTCAGTTCGAGCTTAACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGGTATTA
CGATGGAGCTCACACTTATTACGAAGGAGAAGTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAAT
TGCAGATGATATTGCTGCTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTT
GTTTCTTCCTGCTATTGCGGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCAT
AGGTGCGGGTTTGTTTACCATAGTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCC
CCACAACTTCGAACCTCAGATTTACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAA
TGACTACAACACTATGAGCATTTGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTT
CACCGTCGAGAAGAATGATATCGCCACAAGATAAGATGTTGATTCTTACAAAAAAATGAT
GATATGATATTTGATGAAAACTGTTTATAACTGATGAATCAAACGTGTTACCATGTGTAT
AATGTATTCTTCATGTGCTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 20 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2DL21TF U 17
AF RR2CL22TF U 1
AF RR2ET58TF U 1
AF RR2B492JQ C 17
AF RR2B492TF U 17
AF RR2ET58JQ C 16
AF RR2DL21JQ C 196
BS 1 194 RR2CL22TF
BS 195 195 RR2DL21TF
BS 196 602 RR2CL22TF
BS 603 603 RR2DL21TF
BS 604 661 RR2CL22TF
BS 662 662 RR2ET58TF
BS 663 715 RR2CL22TF
BS 716 716 RR2B492TF
BS 717 739 RR2ET58TF
BS 740 740 RR2B492TF
BS 741 749 RR2ET58TF
BS 750 750 RR2B492TF
BS 751 757 RR2ET58TF
BS 758 760 RR2B492TF
BS 761 761 RR2B492JQ
BS 762 778 RR2ET58TF
BS 779 799 RR2ET58JQ
BS 800 801 RR2DL21JQ

RD RR2DL21TF 639 0 0
AAAAAAACAATGGCAACCATTAATTCAACGGTCACGATTCTCGCTCCCAAATCGATCCCA
AAGATCATCAACTCGAAACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGACCGCCGGTTTCTCTCCC
AACGTGGTGAAATGTGTCAGCTCCTCCTCTTGCCGGAGATTGAAGCTAGCGAAGCTGGTC
TCTGCGGCTGGACTGTCGCAGATAGAACCAGATATCAACGAAGATCCCATTGGTCAGTTC
GAGCTTAACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGGTATTACGATGGAGCTCACACT
TATTACGAAGGAGAAGTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAATTGCAGATGATATTGCT
GCTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTTCCTGCTATT
GCGGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCATAGGTGCGGGTTTGTTT
ACCATAGTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCCCCACAACTTCGAACCT
CAGATTTACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAATGACTACAACACTATG
AGCATTTGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2CL22TF 715 0 0
GGGAAGAAGATAAAGCAAAAAAACAATGGCAACCATTAATTCAACGGTCACGATTCTCTC
TCCCAAATCGATCCCAAAGATCATCAACTCGAAACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGAC
CGCCGGTTTCTCTCCCAACGTGGTGAAATGTGTCAGCTCCTCCTCTTGCCGGAGATTGAA
GCTAGCGAAGCTGGCCTCTGCGGCTGGACTGTCGCAGATAGAACCAGATATCAACGAAGA
TCCCATTGGTCAGTTCGAGCTTAACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGGTATTA
CGATGGAGCTCACACTTATTACGAAGGAGAAGTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAAT
TGCAGATGATATTGCTGCTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTT
GTTTCTTCCTGCTATTGCGGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCAT
AGGTGCGGGTTTGTTTACCATAGTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCC
CCACAACTTCGAACCTCAGATTTACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAA
TGGCTACAACACTATGAGCATTTGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTT
C*CCGTCGAGAAGAATGATATCGCCACAAGATAAGATGTTGATTCTTACAAAAAA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2ET58TF 778 0 0
GGGAAGAAGATAAAGCAAAAAAACAATGGCAACCATTAATTCAACGGTCACGATTCTCTC
TCCCAAATCGATCCCAAAGATCATCAACTCGAAACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGAC
CGCCGGTTTCTCTCCCAACGTGGTGAAATGTGTCAGCGCCTCCTCTTGCCGGAGATTGAA
GCTAGCGAAGCTGGTCTCTGCGGCTGGACTGTCGCAGATAGAACCAGATATCAACGAAGA
TCCCATTGGTCAGTTCGAGCTTAACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGGTATTA
CGATGGAGCTCACACTTATTACGAAGGAGAAGTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAAT
TGCAGATGATATTGCTGCTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTT
GTTTCTTCCTGCTATTGCGGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCAT
AGGTGCGGGTTTGTTTACCATAGTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCC
CCACAACTTCGAACCTCAGATTTACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAA
TGACTACA*CACTATGAGTATTTGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTT
CACCGTCGAGAG**ATGATATCGCCACA*GATA*GATGTTGATTCTTACAAAAAA*TGAT
GATATGATATTTGATGAAA*CTGTTTATA*CTGATGAT**GAACGTGTTACCATGTGT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2B492JQ 762 0 0
AAAAAAACAATGGCAACCATTAATTCAACGGTCACGATTCTCTCTCCCAAATCAATCCCA
AAGATCATCAACTCGAAACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGACCGCCGGTTTCTCTCCC
AACGCTGTGAAATGTGTGAGTTCCTCCTCTTGCCGGAGATTGAAGCTAGCGAAGCTGGTC
TCTGCGGCTGGACTGTCGCAGATAGAACCAGATATCAACGAGGATCCCATTGGTCAGTTC
GAGCTTAACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGGTATTACGATGGAGCTCACACT
TATTACGAAGGAGAAGTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAATTGCAGATGATATTACT
GCTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTTCCTGCTATT
GCGGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCATAGGTGCGGGTTTGTTT
ACCATAGTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCCCCACAACTTCGAACCT
CAGATTTACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAATGACTACAACACTATG
AGCATTTGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTTCACCGTCGAGAAGAAT
GATATCGCCACAAGATAAGATGTTGATTCTTACAAAAAAATGATGATATGATATTTGATG
AAAACTGTTTATAACTGATGAATCAAACGTGTTACCATGTGT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2B492TF 762 0 0
AAAAAAACAATGGCAACCATTAATTCAACGGTCACGATTCTCTCTCCCAAATCAATCCCA
AAGATCATCAACTCGAAACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGACCGCCGGTTTCTCTCCC
AACGCTGTGAAATGTGTGAGTTCCTCCTCTTGCCGGAGATTGAAGCTAGCGAAGCTGGTC
TCTGCGGCTGGACTGTCGCAGATAGAACCAGATATCAACGAGGATCCCATTGGTCAGTTC
GAGCTTAACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGGTATTACGATGGAGCTCACACT
TATTACGAAGGAGAAGTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAATTGCAGATGATATTACT
GCTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTTCCTGCTATT
GCGGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCATAGGTGCGGGTTTGTTT
ACCATAGTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCCCCACAACTTCGAACCT
CAGATTTACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAATGACTACAACACTATG
AGCATTTGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTTCACCGTCGAGAAGAAT
GATATCGCCACAAGATAAGATGTTGATTCTTACAAAAAAATGATGATATGATATTTGATG
AAAACTGTTTATAACTGATGAATC*AACGTGTTACCATGTGT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2ET58JQ 786 0 0
GC
AAAAAACAATGGCAACCATTAATTCAACGGTCACGATTCTCTCTCCCAAATCGATCCCAA
AGATCATCAACTCGAAACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGACCGCCGGTTTCTCTCCCA
ACGTGGTGAAATGTGTCAGCGCCTCCTCTTGCCGGAGATTGAAGCTAGCGAAGCTGGTCT
CTGCGGCTGGACTGTCGCAGATAGAACCAGATATCAACGAAGATCCCATTGGTCAGTTCG
AGCTTAACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGGTATTACGATGGAGCTCACACTT
ATTACGAAGGAGAAGTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAATTGCAGATGATATTGCTG
CTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTTCCTGCTATTG
CGGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCATAGGTGCGGGTTTGTTTA
CCATAGTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCCCCACAACTTCGAACCTC
AGATTTACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAATGACTACAACACTATGA
GTATTTGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTTCACCGTCGAGAAGAATG
ATATCGCCACAAGATAAGATGTTGATTCTTACAAAAAAATGATGATATGATATTTGATGA
AAACTGTTTATAACTGATGAATGAAACGTGTTACCATGTGTATAATGTATTCTTCATGTG
CT
CC

QA 3 784 3 784
DS 

RD RR2DL21JQ 606 0 0
CTCTGCGGCTGGACTGTCGCAGATAGAACCAGATATCAACGAAGATCCCATTGGTCAGTT
CGAGCTTAACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGGTATTACGATGGAGCTCACAC
TTATTACGAAGGAGAAGTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAATTGCAGATGATATTGC
TGCTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTTCCTGCTAT
TGCGGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCATAGGTGCGGGTTTGTT
TACCATAGTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCCCCACAACTTCGAACC
TCAGATTTACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAATGACTACAACACTAT
GAGCATTTGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTTCACCGTCGAGAAGAA
TGATATCGCCACAAGATAAGATGTTGATTCTTACAAAAAAATGATGATATGATATTTGAT
GAAAACTGTTTATAACTGATGAATGAAACGTGTTACCATGTGTATAATGTATTCTTCATG
TGCTTC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 2 7

CO CL1194Contig1 761 2 13 U
GGGTTTTCCATTATACCATTTCAATCTCTTCGGGAAAAAAGAAGAAGAAGAAGCAGGAGC
TAGCTTTTGTAAGAGAAGCAAAAGTGATAAATCTCTGAGCTTTTTATCTGATTCTTTAGA
GATGGCGGTTGCTCCGGCGAGAGCTCGTTCTGACTATGATTACCTCATCAAGCTCCTTCT
CATCGGAGACAGCGGTGTGGGGAAGAGTTGCTTGTTACTGCGTTTCTCAGATGATACTTT
CACTACAAGTTTCATTACTACCATTGGAATTGACTTCAAGATAAGAACCGTTGAGCTTGA
TGGGAAGCGTATCAAATTGCAGATATGGGACACTGCTGGTCAAGAACGTTTCAGAACTAT
CACCACAGCGTATTACAGAGGAGCGATGGGGATACTGCTTGTCTACGACGTAACCGATGA
GTCATCCTTCAACAACATTAGGAACTGGATGAAGAACATAGAGCAGCATGCCTCAGATAA
CGTCAACAAAATACTGGTCGGTAACAAAGCTGACATGGATGAGAGCAAAAGGGCTATCCC
AACAGCAAAGGGCCAAGCTTTAGCTGATGAATATGGAATCAAATTCTTTGAAACGAGTGC
AAAAACAAACCTCAATGTTGAGTCGGTTTTCCTCTCTATCGCAAAAGACATCAAACAAAG
ATTGACAGAAACTGATACAAACGCAGAGCCTCAAGGCATCAAGATCACTAAACAAGATGC
TGCTTCATCGTCTCTACTACAGCTGAGAAACAGCTTGCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E412TF U 9
AF RR2D752TF U 1
BS 1 31 RR2D752TF
BS 32 32 RR2E412TF
BS 33 39 RR2D752TF
BS 40 41 RR2E412TF
BS 42 51 RR2D752TF
BS 52 52 RR2E412TF
BS 53 56 RR2D752TF
BS 57 57 RR2E412TF
BS 58 216 RR2D752TF
BS 217 217 RR2E412TF
BS 218 228 RR2D752TF
BS 229 229 RR2E412TF
BS 230 761 RR2D752TF

RD RR2E412TF 466 0 0
GGATG
TACCATTTCAATCTCTTCGGGAAAACAGAAGAAGAAGAAGCAGGAGCTAGCTTTTGTAAG
AGAAGCAAAAGTGATAAATCTCTGAGCTTTTTATCTGATTCTTTAGAGATGGCGGTTGCT
CCGGCGAGAGCTCGTTCTGACTATGATTACCTCATCAAGCTCCTTCTCATCGGAGACAGC
GGTGTGGGGAAGAGTTGCTTGTTACTGCGTTTCTCAGATGATACTTTCACTACAAGTTTC
ATTACTACCATTGGAATTGACTTCAAGATAAGAACCGTTGAGCTTGATGGGAAGCGTATC
AAATTGCAGATATGGGACACTGCTGGTCAAGAACGTTTCAGAACTATCACCACAGCGTAT
TACAGAGGAGCGATGGGTATACTGCTTGTCTACGACGTAACCGA*GAGTCATCCTTCGAC
AACATTAGGAACTGGATGAAGAACATAGAGCAGCATGCCTC

QA 6 466 6 466
DS 

RD RR2D752TF 761 0 0
GGGTTTTCCATTATACCATTTCAATCTCTTCTGGAAAAA**AAGAAGAAGA*GCAG*AGC
TAGCTTTTGTAAGAGAAGCAAAAGTGATAAATCTCTGAGCTTTTTATCTGATTCTTTAGA
GATGGCGGTTGCTCCGGCGAGAGCTCGTTCTGACTATGATTACCTCATCAAGCTCCTTCT
CATCGGAGACAGCGGTGTGGGGAAGAGTTGCTTGTTGCTGCGTTTCTCCGATGATACTTT
CACTACAAGTTTCATTACTACCATTGGAATTGACTTCAAGATAAGAACCGTTGAGCTTGA
TGGGAAGCGTATCAAATTGCAGATATGGGACACTGCTGGTCAAGAACGTTTCAGAACTAT
CACCACAGCGTATTACAGAGGAGCGATGGGGATACTGCTTGTCTACGACGTAACCGATGA
GTCATCCTTCAACAACATTAGGAACTGGATGAAGAACATAGAGCAGCATGCCTCAGATAA
CGTCAACAAAATACTGGTCGGTAACAAAGCTGACATGGATGAGAGCAAAAGGGCTATCCC
AACAGCAAAGGGCCAAGCTTTAGCTGATGAATATGGAATCAAATTCTTTGAAACGAGTGC
AAAAACAAACCTCAATGTTGAGTCGGTTTTCCTCTCTATCGCAAAAGACATCAAACAAAG
ATTGACAGAAACTGATACAAACGCAGAGCCTCAAGGCATCAAGATCACTAAACAAGATGC
TGCTTCATCGTCTCTACTACAGCTGAGAAACAGCTTGCTGT

QA 1 761 1 761
DS 



CO CL1194Contig2 1018 5 28 U
CCACACTACAACAGTTTCATTTCATAAATTCAAAAGTCTTTAAACATTGTTTTT*GACCA
ACATTGTCTTCCATATCAGGAAGATCAATTGTACAGAATCACAAAGATAACAAATTAGAC
AAGACATACAAGATCACAACCATCAATGAGATATATCCTACTCGTCCTATGTTACACAAA
ACAAGAACGATCTCTGATTTGAGACAGTAAGAGATGAAACATCAGATGGCTAGAGAGGAC
TTAAAAGAACCAGTGCAGGCGAAAGAAGAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAACTACAG
CAAGCTGATTTCTCAGCTGTAGTAGAAGACGATGAAGCAGCATCTTGCTTAGTGATCTTG
ATGCCTTGAGGCTCTGCCTTTGTATCGGTTTCTGTCAATCTTTGTTTTATGTCTTTTGCA
ATAGAGAGGAAAACCGACTCAACATTGAGGTTTGTTTTTGCACTCGTTTCAAAGAATTTG
ATTCCATATTCATCAGCTAAAGCTTGGCCCTTTGCTGTTGGGATAGCCCTTTTGCTTTCA
TCCATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCT
ATGTTCTTCATCCAGTTCCTAATGTTGTTGAAGGATGACTCATCGGTTACGTCGTAGACA
AGCAGTATACCCATCGCTCCTCTGTAATACGCTGTGGTGATAGTTCTGAAACGTTCTTGA
CCAGCAGTGTCCCATATCTGCAATTTGATACGCTTCCCATCAAGCTCAACGGTTCTTATC
TTGAAGTCAATTCCAATGGTAGTAATGAAACTTGTAGTGAAAGTATCATCTGAGAAACGC
AGCAACAAGCAACTCTTCCCCACACCGCTGTCTCCGATGAGAAGGAGCTTGATGAGGTAA
TCATAGTCAGAACGAGCTCTCGCCGGAGCAACCGCCATCTCTAAAGAATCAGATAAAAAG
CTCAGAGATTTATCACTTTTTGCTTCTCTCTTACAAAAGCTAGCTCTGCTTCTTCCCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED16JQ U 1
AF RR2DP39JQ U 1
AF RR2D752JQ U 2
AF RR2ED16TF C 274
AF RR2DP39TF C 724
BS 1 22 RR2DP39JQ
BS 23 23 RR2ED16JQ
BS 24 240 RR2DP39JQ
BS 241 241 RR2ED16JQ
BS 242 335 RR2DP39JQ
BS 336 336 RR2ED16JQ
BS 337 347 RR2DP39JQ
BS 348 348 RR2ED16JQ
BS 349 353 RR2DP39JQ
BS 354 354 RR2ED16JQ
BS 355 407 RR2DP39JQ
BS 408 408 RR2ED16JQ
BS 409 440 RR2DP39JQ
BS 441 441 RR2ED16JQ
BS 442 536 RR2DP39JQ
BS 537 537 RR2ED16JQ
BS 538 614 RR2DP39JQ
BS 615 615 RR2ED16JQ
BS 616 736 RR2DP39JQ
BS 737 737 RR2D752JQ
BS 738 740 RR2DP39JQ
BS 741 741 RR2D752JQ
BS 742 792 RR2DP39JQ
BS 793 805 RR2D752JQ
BS 806 842 RR2ED16TF
BS 843 843 RR2DP39TF
BS 844 980 RR2ED16TF
BS 981 1018 RR2DP39TF

RD RR2ED16JQ 701 0 0
G
CACACTACGACAGTTTCATTTCATAAATTCAAAAGTCTTTAAACATTGTTTTT*GACCAA
CATTGTCTTCCGTATCAGGAAGATCAATTGTACAGAATCACAAAGATAACAAATTAGACA
AGACATACAAGATCACAACCATCAATGAGAGATATCCTACTCGTCCTATGTTACACAAAA
CAAGAACGATCTCTGATTTGAGACAGTAAGAGATGAAACATCAGATGGCTAGAGAGGACT
TAAAAGAACCAGTGCAGGCGAAAGAAGAGCGATCA***AACTCCTAAACATAACTACAGC
AAGCTGATTTCTCAGCTGTAGTAGAAGACGATGAAGCAGCATCTTGCTTAGTGATCTTGA
TGCCTTGAGGCTCTGCCTTTGTATCGGTTTCTGTCAATCTTTGTTTTATGTCTTTTGCAA
TAGAGAGGAAAACCGACTCAACATTGAGGTTTGTTTTTGCACTCGTTTCAAAGAATTTGA
TTCCATATTCATCAGCTAAAGCTTGGCCCTTTGCTGTTGGGATAGCCCTTTTGCTTTCAT
CCATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCTA
TGTTCTTCATCCAGTTCCTAATGTTGTTGAAGGATGACTCATCGGTTACGTCGTAGACAA
GCAGTATACCCATCGCTCCTCTGTAATACGCTGTGGTGAT

QA 2 701 2 701
DS 

RD RR2DP39JQ 792 0 0
CCACACTACAACAGTTTCATTTTATAAATTCAAAAGTCTTTAAACATTGTTTTT*GACCA
ACATTGTCTTCCATATCAGGAAGATCAATTGTACAGAATCACAAAGATAACAAATTAGAC
AAGACATACAAGATCACAACCATCAATGAGATATATCCTACTCGTCCTATGTTACACAAA
ACAAGAACGATCTCTGATTTGAGACAGTAAGAGATGAAACATCAGATGGCTAGAGAGGAC
ATAAAAGAACCAGTGCAGGCGAAAGAAGAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAACTACAG
CAAGCTGATTTCTCAGCTGTAGTAGAAGACGATGAGGCAGCATCTTGTTTAGTTATCTTG
ATGCCTTGAGGCTCTGCCTTTGTATCGGTTTCTGTCAATCTTTGTTTGATGTCTTTTGCA
ATAGAGAGGAAAACCGACTCGACATTGAGGTTTGTTTTTGCACTCGTTTCAAAGAATTTG
ATTCCATATTCATCAGCTAAAGCTTGGCCCTTTGCTGTTGGGATAGCCCTTTTGCTCTCA
TCCATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCT
ATGTTCTTCATCCAATTCCTAATGTTGTTGAAGGATGACTCATCGGTTACGTCGTAGACA
AGCAGTATACCCATCGCTCCTCTGTAATACGCTGTGGTGATAGTTCTGAAACGTTCTTGA
CCAGCAGTGTCCCATAACTGTAATTTGATACGCTTCCCATCAAGCTCAACGGTTCTTATC
TTGAAGTCAATT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2D752JQ 804 0 0
CACACTACAACAGTTTCATTTCATAAATTCAAAAGTCTTTAAACATTGTTTTTTGACCAA
CATTGTCTTCCATATCAGGAAGATCA*TTGTACAGAATCACAAAGATAACAAATTAGACA
AGACATACAAGATCACAACCATCAATGAGATATATCCTACTCGTCCTATGTTACACAAAA
CAAGAACGATCTCTGATTTGAGACAGTAAGAGATGAAACATCAGATGGCTAGAGAGGTCT
TAAA*GAACCAGTGCAGGCGAAAGAAGAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAACTACAGC
AAGCTGATTTCTCAGCTGTAGTAGAAGACGATGAAGCAGCATCTTGTTTAGTGATCTTGA
TGCCTTGAGGCTCTGCCTTTGTATCAGTTTCTGTCAATCTTTGTTTGATGTCTTTTGCGA
TAGAGAGGAAAACCGACTCAACATTGAGGTTTGTTTTTGCACTCGTTTCAAAGAATTTGA
TTCCATATTCATCAGCTAAAGCTTGGCCCTTTGCTGTTGGGATAGCCCTTTTGCTCTCAT
CCATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCTA
TGTTCTTCATCCAGTTCCTAATGTTGTTGAAGGATGACTCATCGGTTACGTCGTAGACAA
GCAGTATCCCCATCGCTCCTCTGTAATACGCTGTGGTGATAGTTCTGAAACGTTCTTGAC
CAGCAGTGTCCCATATCTGCAATTTGATACGCTTCCCATCAAGCTCAACGGTTCTTATCT
TGAAGTCAATTCCAATGGTAGTAA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2ED16TF 726 0 0
CG
ATCAAACTCCTAAACATAACTACAGCAAGCTGATT*CTCAGCTGTAGTAGAAGACGATGA
AGCAGCATCTTGCTTAGTGATCTTGATGCCTTGAGGCTCTGCCTTTGTATCGGTTTCTGT
CAATCTTTGTTTTATGTCTTTTGCAATAGAGAGGAAAACCGACTCAACATTGAGGTTTGT
TTTTGCACTCGTTTCAAAGAATTTGATTCCATATTCATCAGCTAAAGCTTGGCCCTTTGC
TGTTGGGATAGCCCTTTTGCTTTCATCCATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTT
GACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCTATGTTCTTCATCCAGTTCCTAATGTTGTTGAAGGA
TGACTCATCGGTTACGTCGTAGACAAGCAGTATACCCATCGCTCCTCTGTAATACGCTGT
GGTGATAGTTCTGAAACGTTCTTGACCAGCAGTGTCCCATATCTGCAATTTGATACGCTT
CCCATCAAGCTCAACGGTTCTTATCTTGAAGTCAATTCCAATGGTAGTAATGAAACTTGT
AGTGAAAGTATCATCTGAGAAACGCAGTAACAAGCAACTCTTCCCCACACCGCTGTCTCC
GATGAGAAGGAGCTTGATGAGGTAATCATAGTCAGAACGAGCTCTCGCCGGAGCAACCGC
CATCTCTAAAGAATCAGATAAAAAGCTCAGAGATTTATCACTTTT
GCTTCTCTTACAAAAGCTA

QA 3 707 3 707
DS 

RD RR2DP39TF 295 0 0
GCAGTGTCCCATA*CTGTAATTTGAT*CGCTTCCCA*CAAGCTCAACGGTTCTTATCTTG
AAGTCAATTCCAATGGTAGTAATGAAGCTTGTAGTGAAAGTATCATCTGAGAAACGCAGC
AACAAGCAACTCTTCCCCACACCGCTGTCTCCGATGAGAAGGAGCTTGATGAGGTAATCA
TAGTCAGAACGAGCTCTCGCCGGAGCAACCGCCATCTCTAAGGAATCAGATAAAAAGCTC
AGAGATTTATCACTTTTTGCTTCTCTCTTACAAAAGCTAGCTCTGCTTCTTCCCC

QA 1 295 1 295
DS 



AS 1 6

CO CL1195Contig1 871 6 5 U
GGGAGCAGCAGAGAGTAACAACCATACAAACATGACTTTGGTCGCCAATTTGCAACTCAA
CATTCTTCCGCAACGGCCGAGAAGCAGCTGCACCACCAAGCTCGTGTGTTCACTGAAAAA
CTCAACAACGACACAACAACCCTCATCATCCTCTTCTACAATCTCTCTATTACCAAAGCT
AATATCTTTTGCTCTCGCCCTATCTCTAAACTCCTCATCTGCCCCTGCTGCCTTAGCCAT
TCCTTCTCTCTCCTCTTCTCAGCCTCTCACTACTCCTTTCACCCAATCCAAGTTCAACCA
GACGGGTCTTCTCAACGGAAAAATCAGACCTTGCCCTTCCACAAACCCAGGATGTGTATC
AACGAACCCCACCTCTTCATCCTTTACATTTCCATTGACGATCCCAGAAACTGATACACA
GGATCCAATCCAGAAACTGAAGGAAGCAATAGCCAAAACCCAGAAGAATCCTAAGTTTGT
GGTTATTGAAGATAAACCAGAAGGGAGATATTTGGAGGCGGAGGTAGAAGGAGGAGGATT
TAACCAGAGCAGAGATGTGATGGAGTTTCTGGTGAAGGGAGATGTGGTTGCTTACAGGTG
TATGGCTACCAAGGTTACGTTTGTGTATCCTTTCACCACTGCTTTTGGAGACTCTAAGGG
ACAAGAGGAGAGGATGAAGAAGCTCGTTGATGAGCTTGGTTGGTTTGCTCCTACCTTTGA
CATGGAGGAGTCTTCTCTTAATGCCTTCCCTTATAACAATTAGCTGCTTCCTTCTTCTTT
TTAATTTATCATTTTACAAGTCAGATACTGAGAGAGACGGTATGAGTTTCTTTCGAGGAT
CAAAGAAAAGCTATGAATGGGGAACCTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ82TF U 18
AF RR2BP33TF U 1
AF RR2H934TF U 18
AF RR2EM66TF U 18
AF RR2A466JQ C 254
AF RR2H934JQ C 254
BS 1 586 RR2BP33TF
BS 587 587 RR2H934TF
BS 588 748 RR2BP33TF
BS 749 762 RR2EM66TF
BS 763 871 RR2H934JQ

RD RR2DJ82TF 422 0 0
GG
AACCATACAAACATGACTTTGGTCGCCAATTTGCAACTCAACATTCTTCCGCAACGGCCG
AGAAGCAGCTGCACCACCAAGCTCGTGTGTTCACTGAAAAACTCAACAACGACACAACAA
CCCTCATCATCCTCTTCTACAATCTCTCTATTACCAAAGCTAATATCTTTTGCTCTCGCC
CTATCTCTAAACTCCTCATCTGCCCCTGCTGCCTTAGCCATTCCTTCTCTCTCCTCTTCT
CAGCCTCTCACTACTCCTTTCACCCAATCCAAGTTCAACCAGACGGGTCTTCTCAACGGA
AAAATCAGACCTTGCCCTTCCACAAACCCAGGATGTGTATCAACGAACCCCACCTCTTCA
TCCTTTACATTTCCATTGACGATCCCAGAAACTGATACACAGGATCCAATCCAGAAACTG

QA 3 422 3 422
DS 

RD RR2BP33TF 748 0 0
GGGAGCAGCAGAGAGTAACAACCATACAAACATGACTTTGGTCGCCAATTTGCAACTCAA
CATTCTTCCGCAACGGCCGAGAAGCAGCTGCACCACCAAGCTCGTGTGTTCACTGAAAAA
CTCAACAACGACACAACAACCCTCATCATCCTCTTCTACAATCTCTCTATTACCAAAGCT
AATATCTTTTGCTCTCGCCCTATCTCTAAACTCCTCATCTGCCCCTGCTGCCTTAGCCAT
TCCTTCTCTCTCCTCTTCTCAGCCTCTCACTACTCCTTTCACCCAATCCAAGTTCAACCA
GACGGGTCTTCTCAACGGAAAAATCAGACCTTGCCCTTCCACAAACCCAGGATGTGTATC
AACGAACCCCACCTCTTCATCCTTTACATTTCCATTGACGATCCCAGAAACTGATACACA
GGATCCAATCCAGAAACTGAAGGAAGCAATAGCCAAAACCCAGAAGAATCCTAAGTTTGT
GGTTATTGAAGATAAACCAGAAGGGAGATATTTGGAGGCGGAGGTAGAAGGAGGAGGATT
TAACCAGAGCAGAGATGTGATGGAGTTTCTGGTGAAGGGAGATGTGATTGCTTACAGGTG
TATGGCTACCAAGGTTACGTTTGTGTATCCTTTCACCACTGCTTTTGGAGACTCTAAGGG
ACAAGAGGAGAGGATGAAGAAGCTCGTTGATGAGCTTGGTTGGTTTGCTCCTACCTTTGA
CATGGAGGAGTCTTCTCTTAATGCCTTC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2H934TF 729 0 0
GG
AACCATACAAACATGACTTTGGTCGCCAATTTGCAACTCAACATTCTTCCGCAACGGCCG
AGAAGCAGCCGCACCACCAAGCTCGTGTGTTCACTGAAAAACTCAACAACGACACAACAA
CCCTCATCATCCTCTTCTACAATCTCTCTATTACCAAAGCTAATATCTTTTGCTCTCGCC
CTATCTCTAAACTCCTCATCTGCCCCTGCTGCCTTAGCCATTCCTTCTCTCTCCTCTTCT
CAGCCTCTCACTACTCCTTTCACCCAATCCAAGTTCAACCAGACGGGTCTTCTCAACGGA
AAAATCAGACCTTGCCCTTCCACAAACCCAGGATGTGTATCAACGAACCCCACCTCTTCA
TCCTTTACATTTCCATTGACGATCCCAGAAACTGATACACAGGATCCAATCCAGAAACTG
AAGGAAGCAATAGCCAAAACCCAGAAGAATCCTAAGTTTGTGGTTATTGAAGATAAACCA
GAAGGGAGATATTTGGAGGCGGAGGTAGAAGGAGGAGGATTTAACCAGAGCAGAGATGTG
ATGGAGTTTCTGGTGAAGGGAGATGTGGTTGCTTACAGGTGTATGGCTACCAAGGTTACG
TTTGTGTATCCTTTCACCACTGCTTTTGGAGACTCTAAGGGACAAGAGGAGAGGATGAAG
AAGCTCGTTGATGAGCTTGGTTGGTTTGCTCCTACCTTTGACATGGAGGAGTCTTCTCTT
AATGCCT

QA 3 729 3 729
DS 

RD RR2EM66TF 745 0 0
GG
AACCATACAAACATGACTTTGGTCGCCAATTTGCAACTCAACATTCTTCCGCAACGGCCG
AGAAGCAGCTGCACCACCAAGCTCGTGTGTTCACTGAAAAACTCAACAACGACACAACAA
CCCTCATCATCCTCTTCTACAATCTCTCTATTACCAAAGCTAATATCTTTTGCTCTCGCC
CTATCTCTAAACTCCTCC****CCCCTGCTGCCTTAGCCATTCCTTCTCTCTCCTCTTCT
CAGCCTCTCACTACTCCTTTCACCCAATCCAAGTTCAACCAGACGGGTCTTCTCAACGGA
AAAATCAGACCTTGCCCTTCCACAAGCCCAGGATGTGTATCAACGAACCCCACCTCTTCA
TCCTTTACATTTCCATTGACGATCCCAGAAACTGATACACAGGATCCAATCCAGAAACTG
AAGGAAGCAATAGCCAAAACCCAGAAGAATCCTAAGTTTGTGGTTATTGAAGATAAACCA
GAAGGGAGATATTTGGAGGCGGAGGTAGAAGGAGGAGGATTTAACCAGAGCAGAGATGTG
ATGGAGTTTCTGGTGAAGGGAGATGTGGTTGCTTACAGGTGTATGGCTACCAAGGTTACG
TTTGTGTATCCTTTCACCACTGCTTTTGGAGACTCTAAGGGACAAGAGGAGAGGATGAAG
AAGCTCGTTGATGAGCTTGGTTGGTTTGCTCCTACCTTTGACATGGAGGAGTCTTCTCTT
AATGCCTTCCCTTATAACAATTA

QA 3 745 3 745
DS 

RD RR2A466JQ 480 0 0
TCTTCTCAGCCTCTCACTACTCCTTTCACCCAATCCAAGTTCAACCAGACCGGTCTTCTC
AATGGAAAAATCAGACCTTGCCCTTCCACAAACCCAGGATGTGTATCAACGAATCCCACC
TCTTCTTCCTTCACATTTCCATTGACGATCCCAGAAACTGATACACAGGATCCAATCCAG
AAACTGAAGGACGCAATAGCCAAAACGCAGAAGAATCCTAAGTTTGTGGTTATTGAAGAT
AAACCAGAAGGGAGATATTTGGAGGCGGAGGTAGAAGGAGGAGGATTTAACCAGAGCAGA
GATGTGATGGAGTTTCTGGTGAAGGGAGATGTGGTTGCTTACAGGTGTATGGCTACTAAG
GTTACGTTTGTGTATCCTTTCACCACTGCTTTTGGAGACTCCAAGGGACAGGAGGAGAGG
ATGAAGAAGCTCGTTGATGAGCTTGGTTGGTTTGCTCCTACCTTTGACATGGAGGAGT
TT

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2H934JQ 618 0 0
TCTTCTCAGCCTCTCACTACTCCTTTCACCCAATCCAAGTTCAACCAGACGGGTCTTCTC
AACGGAAAAATCAGACCTTGCCCTTCCACAAACCCAGGATGTGTATCAACGAACCCCACC
TCTTCATCCTTTACATTTCCATTGACGATCCCAGAAACTGATACACAGGATCCAATCCAG
AAACTGAAGGAAGCAATAGCCAAAACCCAGAAGAATCCTAAGTTTGTGGTTATTGAAGAT
AAACCAGAAGGGAGATATTTGGAGGCGGAGGTAGAAGGAGGAGGATTTAACCAGAGCAGA
GATGTGATGGAGTTTCTGGTGAAGGGAGATGTGGTTGCTTACAGGTGTATGGCTACCAAG
GTTACGTTTGTGTATCCTTTCACCACTGCTTTTGGAGACTCTAAGGGACAAGAGGAGAGG
ATGAAGAAGCTCGTTGATGAGCTTGGTTGGTTTGCTCCTACCTTTGACATGGAGGAGTCT
TCTCTTAATGCCTTCCCTTATAACAATTAGCTGCTTCCTTCTTCTTTTTAATTTATCATT
TTACAAGTCAGATACTGAGAGAGACGGTATGAGTTTCTTTCGAGGATCAAAGAAAAGCTA
TGAATGGGGAACCTTTAC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 2 7

CO CL1196Contig1 1110 4 7 U
GGAATGTAACGACTCTGTCTTGAGTCTTCATCAAAGTCATCACCAATCTTCTTTCTCTCT
CATCCATTTTTAAAAATTTTGTCCCGTCTTCTGCAACTTTCTGTGGTGCTTCTGAGATTC
ACAAAGTTTGCTGAGCTCGATTTTGGGCCAGAACTAGGCTTTGGTTATTAGCAGAATGTC
GAAGATCTGAGAAAAAAAAAGCACGAACAAAACAAGGAAGGGCTTTTTTTTTCGATCTAG
CAGCGGAGATGAGCGCGTCAAGGTTCATAAAGTGTGTAACCGTCGGTGATGGTGCTGTCG
GAAAAACATGCATGCTGATCTCTTACACCAGCAACACTTTCCCCACTGACTATGTGCCAA
CAGTTTTCGACAACTTTAGTGCTAATGTGGTTGTTGATGGAAACACCGTCAATCTTGGCT
TGTGGGACACAGCCGGTCAAGAAGACTACAACAGGTTACGACCTCTGAGTTACCGTGGCG
CTGATGTTTTCATTCTTGCTTTTTCCCTCATCAGCAAGGCTAGCTATGAGAATATCGCCA
AAAAGTGGATTCCTGAGCTCAGGCATTATGCTCCTGGTGTTCCAATTATCCTCGTTGGAA
CAAAACTTGACCTTCGAGATGACAAGCAATTCTTCATAGATCATCCTGGTGCAGTACCCA
TTACTACAAACCAGGGAGAGGAGCTGAAGAAACTGATTGGGTCTGCGGTCTACATTGAAT
GTAGTTCAAAGACACAGCAGAATGTGAAGGCAGTATTTGATGCAGCCATCAAAGTGGTGC
TTCAGCCACCAAAGCAGAGGAAGAAGAAAAAGAACAAAAACCGTTGCGCCTTCTTGTGAT
TTTTTTCTAAAAATCTCTAAAAGACTAGGTAACCAACTTAAAAGAAGAAGAAGAAGAATG
CTGATTTTCAACTATTTGATTCGTCCTCATTTTATTAAGTGACAATTCCGACAATGAGAA
GGAGAACATCTCGAGTAGCTTTTTGTATAGTTTTTGCTTAAAACAAGCTGTGTTGTTGTT
GTTGTGTCTTTTGCTCTTTCGTTTTGAGTTAACAGTGTGTTGTACTCTTGCTATGTAGTC
TAATCTTTCTATTTCAAATTATGTATTGAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF62TF U 4
AF RR2BB57TF U 1
AF RR2BB57JQ C 230
AF RR2A447TF U 316
BS 1 157 RR2BB57TF
BS 158 158 RR2EF62TF
BS 159 222 RR2BB57TF
BS 223 223 RR2EF62TF
BS 224 737 RR2BB57TF
BS 738 1088 RR2A447TF
BS 1089 1110 RR2BB57JQ

RD RR2EF62TF 541 0 0
GG
GTAACGACTCTGTCTTGAGTCTTCATCAAAGTCATCACCAATCTTCTTTCTCTCTCATCC
ATTTTTAAAAATTTTGTCCCGTCTTCTGCAACTTTCTGTGGTGCTTCTGAGATTCACAAA
GTTTGCTGAGTTCGATTTTGGGCCAGAACTAGGCTTTGGTTATTAGCAGAATGTCGAAGA
TCTGAGGAAAAAAAAGCACGAACAAAACAAGGAAGGGCTTTTTTTTTCGATCTAGCAGCG
GAGATGAGCGCGTCAAGGTTCATAAAGTGTGTAACCGTCGGTGATGGTGCTGTCGGAAAA
ACATGCATGCTGATCTCTTACACCAGCAACACTTTCCCCACTGACTATGTGCCAACAGTT
TTCGACAACTTTAGTGCTAATGTGGTTGTTGATGGGAACACCGTCAATCTTGGCTTGTGG
GACACAGCCGGTCAAGAAGACTACAACAGGTTACGACCTCTGAGTTACCGTGGCGCTGAT
GTTTTCATTCTTGCTTTTTCCCTCATCAGCAAGGCTAGCTATGAGAATATCGCCAAAAA

QA 3 541 3 541
DS 

RD RR2BB57TF 737 0 0
GGAATGTAACGACTCTGTCTTGAGTCTTCATCAAAGTCATCACCAATCTTCTTTCTCTCT
CATCCATTTTTAAAAATTTTGTCCCGTCTTCTGCAACTTTCTGTGGTGCTTCTGAGATTC
ACAAAGTTTGCTGAGCTCGATTTTGGGCCAGAACTAGTCTTTGGTTATTAGCAGAATGTC
GAAGATCTGAGAAAAAAAAAGCACGAACAAAACAAGGAAGGG*TTTTTTTTTCGATCTAG
CAGCGGAGATGAGCGCGTCAAGGTTCATAAAGTGTGTAACCGTCGGTGATGGTGCTGTCG
GAAAAACATGCATGCTGATCTCTTACACCAGCAACACTTTCCCCACTGACTATGTGCCAA
CAGTTTTCGACAACTTTAGTGCTAATGTGGTTGTTGATGGAAACACCGTCAATCTTGGCT
TGTGGGACACAGCCGGTCAAGAAGACTACAACAGGTTACGACCTCTGAGTTACCGTGGCG
CTGATGTTTTCATTCTTGCTTTTTCCCTCATCAGCAAGGCTAGCTATGAGAATATCGCCA
AAAAGTGGATTCCTGAGCTCAGGCATTATGCTCCTGGTGTTCCAATTATCCTCGTTGGAA
CAAAACTTGACCTTCGAGATGACAAGCAATTCTTCATAGATCATCCTGGTGCAGTACCCA
TTACTACAAACCAGGGAGAGGAGCTGAAGAAACTGATTGGGTCTGCGGTCTACATTGAAT
GTAGTTCAAAGACACAG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2BB57JQ 881 0 0
TTTCGATCTAGCAGCGGAGATGAGCGCGTCAAGGTTCATAAAGTGTGTAAC*GTCGGTGA
TGGTGCTGTCGGAAAAACATGCATGCTGATCTCTTACACCAGCAACACTTTCCCCACTGA
CTATGTGCCAACAGTTTTCGACAACTTTAGTGCTAATGTGGTTGTTGATGGAAACACCGT
CAATCTTGGCTTGTGGGACACAGCCGGTCAAGAAGACTACAACAGGTTACGACCTCTGAG
TTACCGTGGCGCTGATGTTTTCATTCTTGCTTTTTCCCTCATCAGCAAGGCTAGCTATGA
GAATATCGCCAAAAAGTGGATTCCTGAGCTCAGGCATTATGCTCCTGGTGTTCCAATTAT
CCTCGTTGGAACAAAACTTGACCTTCGAGATGACAAGCAATTCTTCATAGATCATCCTGG
TGCAGTACCCATTACTACAAACCAGGGAGAGGAGCTGAAGAAACTGATTGGGTCTGCGGT
CTACATTGAATGTAGTTCAAAGACACAGCAGAATGTGAAGGCAGTATTTGATGCAGCCAT
CAAAGTGGTGCTTCAGCCACCAAAGCAGAGGAAGAAGAAAAAGAACAAAAACCGTTGCGC
CTTCTTGTGATTTTTTTCTAAAAATCTCTAAAAGACTAGGTAACCAACTTAAAAGAAGAA
GAAGAAGAATGCTGATTTTCAACTATTTGATTCGTCCTCATTTTATTAAGTGACAATTCC
GACAATGAGAAGGAGAACATCTCGAGTAGCTTTTTGTATAGTTTTTGCTTAAAACAAGCT
GTGTTGTTGTTGTTGTGTCTTTTGCTCTTTCGTTTTGAGTTAACAGTGTGTTGTACTCTT
GCTATGTAGTCTAATCTTTCTATTTCAAATTATGTATTGAC

QA 1 881 1 881
DS 

RD RR2A447TF 773 0 0
G
GATCTCTTACACCAGCAACACTTTCCCTACTGACTATGTGCCAACAGTTTTCGACAACTT
TAGTGTTAATGTGGTTGTTGATGGGAACACCGTCAATCTTGGCTTGTGGGACACAGCCGG
TCAAGAAGACTACAACAGGTTACGACCTCTGAGTTACCGTGGCGCTGATGTTTTCATTCT
TGCTTTTTCCCTCATCAGCAAGGCTAGCTATGAGAATATCGCCAAAAAGTGGATTCCTGA
GCTCAGGCATTATGCTCCTGGTGTTCCAATTATCCTCGTTGGAACAAAACTTGACCTTCG
AGATGACAAGCAATTCTTCATAGATCATCCTGGTGCAGTACCCATTACTACAAACCAGGG
AGAGGAGCTGAAGAAACTGATCGGGTCTGCGGTCTACATTGAATGTAGTTCAAAGACACA
GCAGAATGTGAAGGCAGTATTTGATGCAGCCATCAAAGTGGTGCTTCAGCCACCAAAGCA
GAGGAAGAAGAAAAAGAACAAAAACCGTTGCGCCTTCTTGTGATTTTTTTCTAAAAATCT
CTAAAAGACTAGGTAACCAACTTAAAAGAAGAAGAAGAAGAATGCTGATTTTCAACTATT
TGATTCGTCCTCATTTTATTAAGTGACAATTCCGACAATGAGAAGGAGAACATCTCGAGT
AGCTTTTTGTATAGTTTTTGCTTAAAACAAGCTGTGTTGTTGTTGTTGTGTCTTTTGCTC
TTTCGTTTTGAGTTAACAGTGTGTTGTACTCTTGCTATGTAGTCTAATCTTT

QA 2 773 2 773
DS 



CO CL1196Contig2 1150 3 13 U
GGAATGTAACGACTCTGTCTTGAGTCTTCATCAAAGTCATCACCAACTTTCTTTCTCTCT
CATCCATTTTTTTAAATTTTGTCCCGTCTTCTGCAACTTTCTGTGGTGCTTCTGGGAGAT
TCACAAAGCTTGCTAGTTCGATTTTGGGCCAGAACTAGCTTTGGTTATCAGCAGAATGTC
GAAGATCTGAGGAAGAAAAGCACGAACGAACAAACAAACAAGGAAGGGGGTTTTTTTCGA
TCTAGCAGCAGAGATGAGCGCGTCAAGGTTCATAAAGTGTGTTACTGTCGGTGATGGTGC
TGTCGGAAAAACCTGCATGCTGATCTCTTACACTAGCAACACTTTCCCCACTGACTATGT
GCCAACAGTTTTCGACAACTTTAGTGCTAATGTGGTTGTTGATGGCAACACCGTCAATCT
TGGCTTGTGGGACACAGCCGGTCAAGAAGACTACAACAGGTTACGACCTCTGAGTTACCG
TGGCGCTGATGTTTTCATTCTTGCCTTCTCCCTCATCAGCAAAGCTAGCTATGAGAATAT
AGCAAAGAAGTGGATACCTGAGCTCAGGCATTATGCTCCTGGTGTTCCCACTATCCTCGT
TGGAACAAAACTTGACCTTCGAGATGACAAGCAATTCTTCATAGATCATCCTGGTGCAGT
ACCCATTACTACAAACCAGGGAGAGGACCTGAAGAAACTGATTGGGTCTGCGGTCTACAT
TGAATGTAGTTCAAAGACACAGCAGAATGTGAAGGCAGTGTGTGATGCAGCCATAAAAGT
GGTGCTTCAGCCACCAAAGCAGAGGAAGAAGAAAAAGAACAAGAACCGTTGCGCCTTCTT
GTGATTTTTTTAAAAGAAAAATCTCTAAAGACTACTAGGTAACCAACTTTAAAGAAGAAG
AAGAATGATGATTTTCAACTATTTGATTCGTCCCCATTTTATTAAGTGACAATTCCGACA
ATGAGAAGGGAGAACATTTCGAGTAACTTTTTGTATAGTTTTGCTTAAAACAAGCTGTGT
TGTTGTTGCTGTGTCTTTTGCTCTTTCGTTTGCGTTAACAGTGTGTTGTACTCTTTGCTA
TGTAGTCTAATCTTTCTATTTCAAATTATGTATTGACATATGAATCTAATTAATATTGCC
AACTTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD71TF U 1
AF RR2EI05TF U 1
AF RR2DD71JQ C 315
BS 1 49 RR2DD71TF
BS 50 50 RR2EI05TF
BS 51 72 RR2DD71TF
BS 73 73 RR2EI05TF
BS 74 563 RR2DD71TF
BS 564 590 RR2EI05TF
BS 591 591 RR2DD71JQ
BS 592 734 RR2EI05TF
BS 735 735 RR2DD71JQ
BS 736 746 RR2EI05TF
BS 747 748 RR2DD71JQ
BS 749 772 RR2EI05TF
BS 773 1150 RR2DD71JQ

RD RR2DD71TF 563 0 0
GGAATGTAACGACTCTGTCTTGAGTCTTCATCAAAGTCATCACCAACTT*CTTTCTCTCT
CATCCATTTTTT*AAATTTTGTCCCGTCTTCTGCAACTTTCTGTGGTGCTTCTGGGAGAT
TCACAAAGCTTGCTAGTTCGATTTTGGGCCAGAACTAGCTTTGGTTATCAGCAGAATGTC
GAAGATCTGAGGAAGAAAAGCACGAACGAACAAACAAACAAGGAAGGGGGTTTTTTTCGA
TCTAGCAGCAGAGATGAGCGCGTCAAGGTTCATAAAGTGTGTTACTGTCGGTGATGGTGC
TGTCGGAAAAACCTGCATGCTGATCTCTTACACTAGCAACACTTTCCCCACTGACTATGT
GCCAACAGTTTTCGACAACTTTAGTGCTAATGTGGTTGTTGATGGCAACACCGTCAATCT
TGGCTTGTGGGACACAGCCGGTCAAGAAGACTACAACAGGTTACGACCTCTGAGTTACCG
TGGCGCTGATGTTTTCATTCTTGCCTTCTCCCTCATCAGCAAAGCTAGCTATGAGAATAT
AGCAAAGAAGTGGATACCTGAGC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2EI05TF 772 0 0
GGAAT
GTAACGACTCTGTCTTGAGTCTTCATCAAAGTCATCACCAACTTTCTTTCTCTCTCATCC
ATTTTTTTAAATTTTGTCCCGTCTTCTGCAACTTTCTGTGGTGCTTCTGGGAGATTCACA
AAGCTTGCTAGTTCGATTTTGGGCCAGAACTAGCTTTGGTTATCAGCAGAATGTCGAAGA
TCTGAGGAAGAAAAGCACGAACGAACAAACAAACAAGGAAGGGGGTTTTTTTCGATCTAG
CAGCAGAGATGAGCGCGTCAAGGTTCATAAAGTGTGTTACTGTCGGTGATGGTGCTGTCG
GAAAAACCTGCATGCTGATCTCTTACACTAGCAACACTTTCCCCACTGACTATGTGCCAA
CAGTTTTCGACAACTTTAGTGCTAATGTGGTTGTTGATGGCAACACCGTCAATCTTGGCT
TGTGGGACACAGCCGGTCAAGAAGGCTACAACAGGTTACGACCTCTGAGTTACCGTGGCG
CTGATGTTTTCATTCTTGCCTTCTCCCTCATCAGCAAGGCTAGCTATGAGAATATAGCAA
AGAAGTGGATACCTGAGCTCAGGCATTATGCTCCTGGTGTTCCCATTATCCTCGTTGGAA
CAAAACTTGACCTTCGAGATGACAAGCAATTCTTCATAGATCATCCTGGTGCAGTACCCA
TTACTACAAACCAGGGAGAGGACCTGAAGAAACTGATTGGGTCTGCGGTCTACATTGAAT
GTAGTTCAA*GACACAGCAGAC*GTGAAGGCAGTGTGTGATGCAGCC

QA 6 772 6 772
DS 

RD RR2DD71JQ 836 0 0
GCATGCTGATCTCTTACACTAGCAACACTTTCCCCACTGACTATGTGCCAACAGTTTTCG
ACAACTTTAGTGCTAATGTGGTTGTTGATGGCAACACCGTCAATCTTGGCTTGTGGGACA
CAGCCGGTCAAGAAGACTACAACAGGTTACGACCTCTGAGTTACCGTGGCGCTGATGTTT
TCATTCTTGCCTTCTCCCTCATCAGCAAAGCTAGCTATGAGAATATAGCAAAGAAGTGGA
TACCTGAGCTCAGGCATTATGCTCCTGGTGTTCCCACTATCCTCGTTGGAACAAAACTTG
ACCTTCGAGATGACAAGCAATTCTTCATAGATCATCCTGGTGCAGTACCCATTACTACAA
ACCAGGGAGAGGACCTGAAGAAACTGATTGGGTCTGCGGTCTACATTGAATGTAGTTCAA
AGACACAGCAGAATGTGAAGGCAGTGTTTGATGCAGCCATAAAAGTGGTGCTTCAGCCAC
CAAAGCAGAGGAAGAAGAAAAAGAACAAGAACCGTTGCGCCTTCTTGTGATTTTTTTAAA
AGAAAAATCTCTAAAGACTACTAGGTAACCAACTTTAAAGAAGAAGAAGAATGATGATTT
TCAACTATTTGATTCGTCCCCATTTTATTAAGTGACAATTCCGACAATGAGAAGGGAGAA
CATTTCGAGTAACTTTTTGTATAGTTTTGCTTAAAACAAGCTGTGTTGTTGTTGCTGTGT
CTTTTGCTCTTTCGTTTGCGTTAACAGTGTGTTGTACTCTTTGCTATGTAGTCTAATCTT
TCTATTTCAAATTATGTATTGACATATGAATCTAATTAATATTGCCAACTTTTGTC

QA 1 836 1 836
DS 



AS 2 6

CO CL1197Contig1 683 3 10 U
GGGAACGTGGAAATCGAATCCAGGCGAATCCGAGTGAGCGAGAGAGAGGTGAAGAGGAAA
AAAGCGATGGCTTTGACGGTGGCGAAGAGTGCGTTAGAGGCGATTAGAGAAAAAGGTCTC
GGAGGTTTCCTCAGGATGATCCGTGAAGAAGGCTTCCTGAGATGCCTACCAGATGGGAAC
CTCCTGCAAACTAAAATACACAACATAGGAGCAACACTTGTTGGCGTCGACAAGTTCGGT
AACAAATACTACCAGAAGCTGGGTGATACTCAATACGGTAGACACAGATGGGTAGAGTAC
GCATCCAAGGATCGTTACAACGCATCTCAAGTACCAGCCGAATGGCACGGATGGCTTCAT
TTCATCACTGATCACACTGGAGATGAGCTGTTGAGTCAGAAACCAAAAAGGTATGGGATT
GAGCATAAGGAGAACTTCTCTGGAGAAGGTGATGCATACATTTACCATTCCAAAGGACAT
ACCTTGAACCCGGGGCAAAAGAACTGGACTAGGTACCAACCATGGGTACCCACCAAGACC
AAGTAAGAATGTGAGAGCTCTGGTTTACGCTCTTTGAGAATCTCTCTGAGTTATTGGTTG
TTTGTTTCTGTCTCTTTGAATAAAAAGCAAAATCTTTTGGATCTAAAGTTGAACAATTGG
GTTTATGGAATTGTGTAATTGAT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DX51TF U 1
AF RR2BF43JQ C 1
AF RR2BF43TF U 1
BS 1 183 RR2DX51TF
BS 184 184 RR2BF43TF
BS 185 195 RR2DX51TF
BS 196 196 RR2BF43TF
BS 197 301 RR2DX51TF
BS 302 302 RR2BF43TF
BS 303 541 RR2DX51TF
BS 542 542 RR2BF43TF
BS 543 620 RR2DX51TF
BS 621 683 RR2BF43TF

RD RR2DX51TF 620 0 0
GGGAACGTGGAAATCGAATCCAGGCGAATCCGAGTGAGCGAGAGAGAGGTGAAGAGGAAA
AAAGCGATGGCTTTGACGGTGGCGAAGAGTGCGTTAGAGGCGATTAGAGAAAAAGGTCTC
GGAGGTTTCCTCAGGATGATCCGTGAAGAAGGCTTCCTGAGATGCCTACCAGATGGGAAC
CTCTTGCAAACTAAAGTACACAACATAGGAGCAACACTTGTTGGCGTCGACAAGTTCGGT
AACAAATACTACCAGAAGCTGGGTGATACTCAATACGGTAGACACAGATGGGTAGAGTAC
GTATCCAAGGATCGTTACAACGCATCTCAAGTACCAGCCGAATGGCACGGATGGCTTCAT
TTCATCACTGATCACACTGGAGATGAGCTGTTGAGTCAGAAACCAAAAAGGTATGGGATT
GAGCATAAGGAGAACTTCTCTGGAGAAGGTGATGCATACATTTACCATTCCAAAGGACAT
ACCTTGAACCCGGGGCAAAAGAACTGGACTAGGTACCAACCATGGGTACCCACCAAGACC
AGGTAAGAATGTGAGAGCTCTGGTTTACGCTCTTTGAGAATCTCTCTGAGTTATTGGTTG
TTTGTTTCTGTCTCTTTGAA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2BF43JQ 683 0 0
GGGAACGTGGAAATCGAATCCAGGCGAATCCGAGTGAGCGAGAGAGAGGTGAAGAGGAAA
AAAGCGATGGCTTTGACGGTGGCGAAGAGTGCGTTAGAGGCGATTAGAGAAAAAGGTCTC
GGAGGTTTCCTCAGGATGATCCGTGAAGAAGGCTTCCTGAGATGCCTACCAGATGGGAAC
CTCCTGCAAACTAAAATACACAACATAGGAGCAACACTTGTTGGCGTCGACAAGTTCGGT
AACAAATACTACCAGAAGCTGGGTGATACTCAATACGGTAGACACAGATGGGTAGAGTAC
GCATCCAAGGATCGTTACAACGCATCTCAAGTACCAGCCGAATGGCACGGATGGCTTCAT
TTCATCACTGATCACACTGGAGATGAGCTGTTGAGTCAGAAACCAAAAAGGTATGGGATT
GAGCATAAGGAGAACTTCTCTGGAGAAGGTGATGCATACATTTACCATTCCAAAGGACAT
ACCTTGAACCCGGGGCAAAAGAACTGGACTAGGTACCAACCATGGGTACCCACCAAGACC
AAGTAAGAATGTGAGAGCTCTGGTTTACGCTCTTTGAGAATCTCTCTGAGTTATTGGTTG
TTTGTTTCTGTCTCTTTGAATAAAAAGCAAAATCTTTTGGATCTAAAGTTGAACAATTGG
GTTTATGGAATTGTGTAATTGAT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2BF43TF 683 0 0
GGGAACGTGGAAATCGAATCCAGGCGAATCCGAGTGAGCGAGAGAGAGGTGAAGAGGAAA
AAAGCGATGGCTTTGACGGTGGCGAAGAGTGCGTTAGAGGCGATTAGAGAAAAAGGTCTC
GGAGGTTTCCTCAGGATGATCCGTGAAGAAGGCTTCCTGAGATGCCTACCAGATGGGAAC
CTCCTGCAAACTAAAATACACAACATAGGAGCAACACTTGTTGGCGTCGACAAGTTCGGT
AACAAATACTACCAGAAGCTGGGTGATACTCAATACGGTAGACACAGATGGGTAGAGTAC
GCATCCAAGGATCGTTACAACGCATCTCAAGTACCAGCCGAATGGCACGGATGGCTTCAT
TTCATCACTGATCACACTGGAGATGAGCTGTTGAGTCAGAAACCAAAAAGGTATGGGATT
GAGCATAAGGAGAACTTCTCTGGAGAAGGTGATGCATACATTTACCATTCCAAAGGACAT
ACCTTGAACCCGGGGCAAAAGAACTGGACTAGGTACCAACCATGGGTACCCACCAAGACC
AAGTAAGAATGTGAGAGCTCTGGTTTACGCTCTTTGAGAATCTCTCTGAGTTATTGGTTG
TTTGTTTCTGTCTCTTTGAATAAAAAGCAAAATCTTTTGGATCTAAAGTTGAACAATTGG
GTTTATGGAATTGTGTAATTGAT

QA 1 683 1 683
DS 



CO CL1197Contig2 753 3 3 U
TTTTTTTATAGTCCTCCACACTCCTCTCTCTAGAGGTGAAGGAAAGCTCAAGTAACCAAA
ATGAGATGAAACATTATCAATTACACAATTCCATAAACCCAATTGTTCAACTTTAGATCC
AAAAGATTTTGCTTTTTATTCAAATAGACAGAAACAAACAACCAATAACTCAGAGAGATT
CTCAAAGAGCGTAAACCAGAGCTCTCACATTCTTACTTGGTCTTGGTGGGTACCCATGGT
TGGTACCTAGTCCAGTTCTTTTGCCCCGGGTTCAAGGTATGTCCTTTGGAATGGTAAATG
TATGCATCACCTTCTCCAGAGAAGTTCTCCTTATGCTCAATCCCATACCTTTTTGGTTTC
TGACTCAACAGCTCATCTCCAGTGTGATCAGTGATGAAATGAAGCCATCCGTGCCACTCG
GCTGGTACTTGAGATGCGTTGTAACGATCCTTGGATGCGTACTCTACCCATCTGTGTCTA
CCGTATTGAGTATCACCCAGCTTCTGGTAGTATTTGTTACCGAACTTGTCGACACCAACA
AGTGTTGCTCCTATGTTGTGTATTTTAGTTTGCAAGAGGTTCCCATCTGGTAGGCATCTC
AGGAAGCCTTCTTCACGGATCATCCTGAGGAAACCGCCGAGACCTTTCTCTCTAATCGTC
TCTAACGCACTCTTCGCCACCGTCAAAGCCATCGATTTTTTTCCTCTTCACCTCTCTCAC
TCGGATTCGCCTGGATATTCGATTTCGACGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX51JQ U 40
AF RR2DG05JQ U 8
AF RR2DG05TF C 1
BS 1 7 RR2DG05TF
BS 8 673 RR2DG05JQ
BS 674 753 RR2DG05TF

RD RR2DX51JQ 324 0 0
AGGAAAGCTCAAGTAACCAAAATGAGATGAAACATTATCAATTACACAATTCCATAAACC
CAATTGTTCAACTTTAGATCCAAAAGATTTTGCTTTTTATTCAAAGAGACAGAAACAAAC
AACCAATAACTCAGAGAGATTCTCAAAGAGCGTAAACCAGAGCTCTCACATTCTTACCTG
GTCTTGGTGGGTACCCATGGTTGGTACCTAGTCCAGTTCTTTTGCCCCGGGTTCAAGGTA
TGTCCTTTGGAATGGTAAATGTATGCATCACCTTCTCCAGAAAAGTTCTCCTTATGCTCA
ATCCCATACCTTTTTGGTTTCTGA

QA 1 324 1 324
DS 

RD RR2DG05JQ 666 0 0
ATAGTCCTCCACACTCCTCTCTCTAGAGGTGAAGGAAAGCTCAAGTAACCAAAATGAGAT
GAAACATTATCAATTACACAATTCCATAAACCCAATTGTTCAACTTTAGATCCAAAAGAT
TTTGCTTTTTATTCAAATAGACAGAAACAAACAACCAATAACTCAGAGAGATTCTCAAAG
AGCGTAAACCAGAGCTCTCACATTCTTACTTGGTCTTGGTGGGTACCCATGGTTGGTACC
TAGTCCAGTTCTTTTGCCCCGGGTTCAAGGTATGTCCTTTGGAATGGTAAATGTATGCAT
CACCTTCTCCAGAGAAGTTCTCCTTATGCTCAATCCCATACCTTTTTGGTTTCTGACTCA
ACAGCTCATCTCCAGTGTGATCAGTGATGAAATGAAGCCATCCGTGCCACTCGGCTGGTA
CTTGAGATGCGTTGTAACGATCCTTGGATGCGTACTCTACCCATCTGTGTCTACCGTATT
GAGTATCACCCAGCTTCTGGTAGTATTTGTTACCGAACTTGTCGACACCAACAAGTGTTG
CTCCTATGTTGTGTATTTTAGTTTGCAAGAGGTTCCCATCTGGTAGGCATCTCAGGAAGC
CTTCTTCACGGATCATCCTGAGGAAACCGCCGAGACCTTTCTCTCTAATCGTCTCTAACG
CACTCT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2DG05TF 753 0 0
TTTTTTTATAGTCCTCCACACTCCTCTCTCTAGAGGTGAAGGAAAGCTCAAGTAACCAAA
ATGAGATGAAACATTATCAATTACACAATTCCATAAACCCAATTGTTCAACTTTAGATCC
AAAAGATTTTGCTTTTTATTCAAATAGACAGAAACAAACAACCAATAACTCAGAGAGATT
CTCAAAGAGCGTAAACCAGAGCTCTCACATTCTTACTTGGTCTTGGTGGGTACCCATGGT
TGGTACCTAGTCCAGTTCTTTTGCCCCGGGTTCAAGGTATGTCCTTTGGAATGGTAAATG
TATGCATCACCTTCTCCAGAGAAGTTCTCCTTATGCTCAATCCCATACCTTTTTGGTTTC
TGACTCAACAGCTCATCTCCAGTGTGATCAGTGATGAAATGAAGCCATCCGTGCCACTCG
GCTGGTACTTGAGATGCGTTGTAACGATCCTTGGATGCGTACTCTACCCATCTGTGTCTA
CCGTATTGAGTATCACCCAGCTTCTGGTAGTATTTGTTACCGAACTTGTCGACACCAACA
AGTGTTGCTCCTATGTTGTGTATTTTAGTTTGCAAGAGGTTCCCATCTGGTAGGCATCTC
AGGAAGCCTTCTTCACGGATCATCCTGAGGAAACCGCCGAGACCTTTCTCTCTAATCGTC
TCTAACGCACTCTTCGCCACCGTCAAAGCCATCGATTTTTTTCCTCTTCACCTCTCTCAC
TCGGATTCGCCTGGATATTCGATTTCGACGTTC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 7

CO CL1198Contig1 1479 7 20 U
GGAGGTGAAAGTCATTGAGGTATTCTTGGAGATCGTTGGGGTCAAGAACTTACCAGACAC
TCATAAAGGAAATGTATTTATTGTGTTCAGCAAAACACAACCTGATTCTCTGTTTAACAC
TGAGCGTAACCTAACGGCTTGTGGTGAAAAGCAAGTTGCTATGTTCAAGTGTGAACCTAC
AGGAGAGCTTAGTTTCCAACTAATGTCTTCTAAATCTAAAACCTTATTAGGTTCTGCTTC
TTTGTCGCTTTCTGAGTTTCTGTGTCCAGTTACTAGACTCTCTGTTGAGAAGTGGCTGGA
GTTAACAACACCAGTTCAAAGGGGAAAGGCCATCTCTCTACGAGTTGCTGTCTCCTTCAC
TCCACCAACTCGTAGCCCCACAGTTCTACATTTGGTTCAAGCAAGACCATCACTGAAAGA
CTCTTGTTTCTTTCCTATGCTTGGAAACGTTTCTAAGAGTTTTACACGAGTTGTTGATGA
GACAGAAACAGAGTTGATCAGTCTCCATATGAGGAACCACAACAACGCAAGACAAGTGAT
TGGTGTGAAAGAGAGTGGTGAAACTCTTGTTCTAGCAACTTATGATGGGTGTGTCTGGTC
TTTGCTTGAAGCAAAATGGTCACTTAAGCAAACAAGCAGTCTTGATGGTCCTGTCTTTGA
GATTTTTGGTGTGAGAATGGTGAAAGTTTATTATGGAAGGAAGCTGGAGTATGAGACAAA
ACGTTGCGCAAAGCTAAGAAGTGAGCAAGATTTCATGACAGCTGTCGAATTCTCAAAGCA
GTATCCTTATGGTAAAGCTGTGGGGTTGCTAGACTTGAAGTTTGGTTCTTTTGAGGCTAA
TGAGAAATGGTTGGTTTTGCCTGGATTAGTATCTGCTTTCATACTCAATGATCTTCTTAA
GAAGGAAGGTTTTTGTGGAGCTGCAAAAGACATAGTGAAAGGTAATGGGATAACTGTGAA
GCTAGAAGAAGAAACAATGATGCATGTGAACATCAATGGCGGTGCTAGGTGCTTGTCCAA
GGAGCTTAACAGTGGGAACATGGTGGAAGAAGAAGGTGGTCATTGTGGTGGTTGTGGTGG
ATGTGGAGGATGTGGCGGTGGCAGTGGGTGCGGAGGAGGTGGTGGAAGATGTGGTAATAT
GATGACCAATGAAAATGTTAGCACAGGTGGCGGCTCCTGCACTGGCGGTTCCACTGGATG
CGGTGGGTGCGGTGGAGCCGGTGGAGGATGTGGTAATATGATGACCAATGAAAATGTTCC
ATCACTAGTAGCAGCAGCGGAAGCTCCCATCGACGCAGTTGCAGCTTGATTATTATTTAA
AGAAAGAAAAGCGATATTAAGTTTTATCTATGTGATGTTAACAAATGGACTAACAGTATA
TAATAAAACTAATGAGATGTGTTGTTATGTGTTTTCTTTTCTTTTAAACATTTGTAAGCT
GTAATAAAATATATATAGTTAAACGTTTTCTAACAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA94TF U 1
AF RR2EZ04TF U 42
AF RR2DN79TF U 442
AF RR2AA94JQ C 621
AF RR2EZ04JQ C 747
AF RR2DN79JQ C 764
AF RR2D811TF U 1120
BS 1 698 RR2AA94TF
BS 699 699 RR2DN79TF
BS 700 795 RR2AA94TF
BS 796 831 RR2EZ04TF
BS 832 832 RR2DN79TF
BS 833 835 RR2EZ04TF
BS 836 836 RR2DN79TF
BS 837 839 RR2EZ04TF
BS 840 840 RR2DN79TF
BS 841 857 RR2EZ04TF
BS 858 858 RR2DN79TF
BS 859 866 RR2EZ04TF
BS 867 867 RR2DN79TF
BS 868 878 RR2EZ04TF
BS 879 1055 RR2DN79TF
BS 1056 1056 RR2AA94JQ
BS 1057 1077 RR2DN79TF
BS 1078 1120 RR2AA94JQ
BS 1121 1470 RR2D811TF
BS 1471 1479 RR2DN79JQ

RD RR2AA94TF 795 0 0
GGAGGTGAAAGTCATTGAGGTATTCTTGGAGATCGTTGGGGTCAAGAACTTACCAGACAC
TCATAAAGGAAATGTATTTATTGTGTTCAGCAAAACACAACCTGATTCTCTGTTTAACAC
TGAGCGTAACCTAACGGCTTGTGGTGAAAAGCAAGTTGCTATGTTCAAGTGTGAACCTAC
AGGAGAGCTTAGTTTCCAACTAATGTCTTCTAAATCTAAAACCTTATTAGGTTCTGCTTC
TTTGTCGCTTTCTGAGTTTCTGTGTCCAGTTACTAGACTCTCTGTTGAGAAGTGGCTGGA
GTTAACAACACCAGTTCAAAGGGGAAAGGCCATCTCTCTACGAGTTGCTGTCTCCTTCAC
TCCACCAACTCGTAGCCCCACAGTTCTACATTTGGTTCAAGCAAGACCATCACTGAAAGA
CTCTTGTTTCTTTCCTATGCTTGGAAACGTTTCTAAGAGTTTTACACGAGTTGTTGATGA
GACAGAAACAGAGTTGATCAGTCTCCATATGAGGAACCACAACAACGCAAGACAAGTGAT
TGGTGTGAAAGAGAGTGGTGAAACTCTTGTTCTAGCAACTTATGATGGGTGTGTCTGGTC
TTTGCTTGAAGCAAAATGGTCACTTAAGCAAACAAGCAGTCTTGATGGTCCTGTCTTTGA
GATTTTTGGTGTGAGAATGGTGAAAGTTTATTATGGAAAGAAGCTGGAGTATGAGACAAA
ACGTTGCGCAAAGCTAAGAAGTGAGCAAGATTTCATGACAGCTGTCGAATTCTCAAAGCA
GTATCCTTATGGTAA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2EZ04TF 849 0 0
G
CAAGAACTTACCAGACACTCATAAAGGAAATGTATTTATTGTGTTCAGCAAAACACAACC
TGATTCTCTGTTTAACACTGAGCGTAACCTAACGGCTTGTGGTGAAAAGCAAGTTGCTAT
GTTCAAGTGTGAACCTACAGGAGAGCTTAGTTTCCAACTAATGTCTTCTAAATCTAAAAC
CTTATTAGGTTCTGCTTCTTTGTCGCTTTCTGAGTTTCTGTGTCCAGTTACTAGACTCTC
TGTTGAGAAGTGGCTGGAGTTAACAACACCAGTTCAAAGGGGAAAGGCCATCTCTCTACG
AGTTGCTGTCTCCTTCACTCCACCAACTCGTAGCCCCCCAGTTCTACATTTGGTTCAAGC
AAGACCATCACTGAAAGACTCTTGTTTCTTTCCTATGCTTGGAAACGTTTCTAAGAGTTT
TACACGAGTTGTTGATGAGACAGAAACAGAGTTGATCAGTCTCCATATGAGGAACCACAA
CAACGCAAGACAAGTGATTGGTGTGAAAGAGAGTGGTGAAACTCTTGTTCTAGCAACTTA
TGATGGGTGTGTCTGGTCTTTGCTTGAAGCAAAATGGTCACTTAAGCAAACAAGCAATCT
TGATGGTCCTGTCTTTGAGATTTTTGGTGTGAGAATGGTGAAAGTTTATTATGGAA*GAA
GCTGGAGTATGAGACAAA*CGTTGCGCAAAGCTAAGAAGTGAGCAAGATTTCATGACAGC
TGTCGA*TTCTCAAAGCAGTATCCTTATGGTAAAGCTGTGGGGTTGCTAGACTTGAAGTT
TGGTTCTTT*GAG*CTA*TGAGAAATGGTTGGTTT*GCCTGGAT*AGTATCTGCTT
CATACTCATGAT

QA 2 837 2 837
DS 

RD RR2DN79TF 636 0 0
G
GGAAACGTTTCTAAGAGTTTTACACGAGTTGTTGGTGAGACAGAAACAGAGTTGATCAGT
CTCCATATGAGGAACCACAACAACGCAAGACAAGTGATTGGTGTGAAAGAGAGTGGTGAA
ACTCTTGTTCTATCAACTTATGATGGGTGTGTCTGGTCTTTGCTTGAAGCAAAATGGTCA
CTTAAGCAAACAAGCAGTCTTGATGGTCCTGTCTTTGAGATTTTTGGTGTGAGAATGGTG
AAAGTTTATTATGGAAGGAAGCTGGAGTATGAGACAAAACGTTGCGCAAAGCTAAGAAGT
GAGCAAGATTTCATGACAGCTGTCGAATTCTCAAAGCAGTATCCTTATGGTAAAGCTGTG
GGGTTGCTAGACTTGAAGTTTGGTTCTTTTGAGGCTAATGAGAAATGGTTGGTTTTGCCT
GGATTAGTATCTGCTTTCATACTCAATGATCTTCTTAAGAAGGAAGGTTTTTGTGGAGCT
GCAAAAGACATAGTGAAAGGTAATGGGATAACTGTGAAGCTAGAAGAAGAAACAATGATG
CATGTGAACATCAATGGCGGTGCTAGGTGCTTGTCCAAGGAGCTTAACAGTGGGAACATG
GTGGAAGAAGAAG*TGGTCATTGTGGTGGTTGTGG

QA 2 636 2 636
DS 

RD RR2AA94JQ 854 0 0
CACTTAAGCAAACAAGCAGTCTTGATGGTCCTGTCTTTGAGATTTTTGGTGTGAGAATGG
TGAAAGTTTATTATGGAAGGAAGCTGGAGTATGAGACAAAACGTTGCGCAAAGCTAAGAA
GTGAGCAAGATTTCATGACAGCTGTCGAATTCTCAAAGCAGTATCCTTATGGTAAAGCTG
TGGGGTTGCTAGACTTGAAGTTTGGTTCTTTTGAGGCTAATGAGAAATGGTTGGTTTTGC
CTGGATTAGTATCTGCTTTCATACTCAATGATCTTCTTAAGAAGGAAGGTTTTTGTGGAG
CTGCAAAAGACATAGTGAAAGGTAATGGGATAACTGTGAAGCTAGAAGAAGAAACAATGA
TGCATGTGAACATCAATGGCGGTGCTAGGTGCTTGTCCAAGGAGCTTAACAGTGGGAACA
TGGTGGAAGAAGAAGGTGGTCATTGTGGTGGTTGTGGTGGATGTGGAGGATGTGGCGGTG
GCAGTGGGTGCGGAGGAGGTGGTGGAAGATGTGGTAATATGATGACCAATGAAAATGTTA
GCACAGGTGGCGGCTCCTGCACTGGCGGTTCCACTGGATGCGGTGGGTGCGGTGGAGCCG
GTGGAGGATGTGGTAATATGACGACCAATGAAAAT*TTCCATCACTAGTAGCAGCAGCGG
AAGCTCCCATCGACGCAGTTGCAGCTTGATTATTATTTAAAGAAAGAAAAGCGATATTAA
GTTTTATCTATGTGATGTTAACAAATGGACTAACAGTATATAATAAAACTAATGAGATGT
GTTGTTATGTGTTTTCTTTTCTTTTAAACATTTGTAAGCTGTAATAAAATATATATAGTT
AAACGTTTTC
TAAC

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR2EZ04JQ 725 0 0
AAGATTTCATGACAGCTGTCGAATTCTCAAAGCAGTATCCTTATGGTAAAGCTGTGGGGT
TGCTAGACTTGAAGTTTGGTTCTTTTGAGGCTAATGAGAAATGGTTGGTTTTGCCTGGAT
TAGTATCTGCTTTCATACTCAATGATCTTCTTAAGAAGGAAGGTTTTTGTGGAGCTGCAA
AAGACATAGTGAAAGGTAATGGGATAACCGTGAAGCTAGAAGAAGAAACAATGATGCATG
TGAACATCAATGGCGGTGCTAGGTGCTTGTCCAAGGAGCTTAACATTGGGAACATGGTGG
AAGAAGAAGGTGGTCATTGTGGTGGTTGTGGTGGATGTGGAGGATGTGGCGGTGGCAGTG
GGTGCGGAGGAGGTGGTGGAAGATGGGGTAATATGATGACCAATGAAAATGTTAGCACAG
GTGGCGGCTCCTGCACTGGCGGTTCCACTGGATGCGGTGGGTGCGGTGGAGCCGGTGGAG
GATGTGGTAATATGATGACCAATGAAAATGTTCCATCACTAGTAGCAGCAGCGGAAGCTC
CCATCGACGCAGTTGCAGCTTGATTATTATTTAAAGAAAGAAAAGCGATATTAAGTTTTA
TCTATGTGATGTTAACAAATGGACTAACAGTATATAATAAAACTAATGAGATGTGTTGTT
ATGTGTTTTCTCTTCTTTTAAACATTTGTAAGCTGTAATAAAATATATATAGTTAAACGT
TTTC
G

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2DN79JQ 716 0 0
GTCGAATTCTCAAAGCAGTATCCTTATGGTAAAGCTGTGGGGTTGCTAGACTTGAAGTTT
GGTTCTTTTGAGGCTAATGAGAAATGGTTGGTTTTGCCTGGATTAGTATCTGCTTTCATA
CTCAATGATCTTCTTAAGAAGGAAGGTTTTTGTGGAGCTGCAAAAGACATAGTGAAAGGT
AATGGGATAACTGTGAAGCTAGAAGAAGAAACAATGATGCATGTGAACATCAATGGCGGT
GCTAGGTGCTTGTCCAAGGAGCTTAACAGTGGGAACATGGTGGAAGAAGAAGGTGGTCAT
TGTGGTGGTTGTGGTGGATGTGGAGGATGTGGCGGTGGCAGTGGGTGCGGAGGAGGTGGT
GGAAGATGTGGTAATATGATGACCAATGAAAATGTTAGCACAGGTGGCGGCTCCTGCACT
GGCGGTTCCACTGGATGCGGTGGGTGCGGTGGAGCCGGTGGAGGATGTGGTAATATGATG
ACCAATGAAAATGTTCCATCACTAGTAGCAGCAGCGGAAGCTCCCATCGACGCAGTTGCA
GCTTGATTATTATTTAAAGAAAGAAAAGCGATATTAAGTTTTATCTATGTGATGTTAACA
AATGGACTAACAGTATATAATAAAACTAATGAGATGTGTTGTTATGTGTTTTCTTTTCTT
TTAAACATTTGTAAGCTGTAATAAAATATATATAGTTAAACGTTTTCTAACAATGC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2D811TF 352 0 0
G
GGTGGAAGATGTGGTAATATGATGACCAATGAAAATGTTAGCACAGGTGGCGGCTCCTGC
ACTGGCGGTTCCACTGGATGCGGTGGGTGCGGTGGAGCCGGTGGAGGATGTGGTAATATG
ATGACCAATGAAAATGTTCCATCACTAGTAGCAGCAGCGGAAGCTCCCATCGACGCAGTT
GCAGCTTGATTATTATTTAAAGAAAGAAAAGCGATATTAAGTTTTATCTATGTGATGTTA
ACAAATGGACTAACAGTATATAATAAAACTAATGAGATGTGTTGTTATGTGTTTTCTTTT
CTTTTAAACATTTGTAAGCTGTAATAAAATATATATAGTTAAACGTTTTC
T

QA 2 351 2 351
DS 



AS 2 7

CO CL1199Contig1 745 2 3 U
AAGAAAGAATGTCGAGTCGATTAGGAAGACGAGTGGTTCATCTCGCGAATCTTCCGATCA
AGCTTCTGATGCCTACGAAGCTGACGAACATCCACGAGTTCGCGCTGAAAACGATACCTT
CAGCGACGAAGATCGAGATCAAGCGAGTCCTGGAGTCACTCTACGGATTCGAGGTGGAAA
AGGTGAACACTTTGAACATGGACGGGAAGAAGAAGAAGCGCGGTGGTCTGTTGATAGCCA
AGGCGGACTACAAGAAAGCTTACGTCACGCTCAAAAACCCTTTGTCGATCTCCAAGGATC
TGTTCCCGGTGAAGTACATCGAGGAAGATAGGAAGAGTAAAGTGAAAGGATCTAGCTTTG
TCGAGGAGGAAGATGATAAGAAGAGTCACTGGCTTGATCAGAAGGAGAAGAGGGAGGTCG
GTGGCTATGGTAATGGTAAAAGTCGTCGCGGCGGTGGCGTGAAAGGTCGACTTCGCCGGC
GAGAGCTTCTGTTGCTGCTGCTTCCGGGGCTAAGTTTCCATGAGCAGCATGAGATTTGGT
GGCAAGTAAGGGTTTTTTTTGTTACTAGTCCACAGTTAGGGTTTATGACCAAACTATTAT
TTACCTGGGGGGTTGTGTTTCTTTTTAGCTGTCGGATTGTTATGCATTTTGTTTCTGTTG
CTTGCTGGTTGTTTCCGTTTTAAAAAGACGAGCTTGATCGTGAATCTGAATCTTATAAGC
TCTCAGAGTTTTTGTGTGTTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ75JQ C 1
AF RR2AZ75TFB U 16
BS 1 15 RR2AZ75JQ
BS 16 725 RR2AZ75TFB
BS 726 745 RR2AZ75JQ

RD RR2AZ75JQ 745 0 0
AAGAAAGAATGTCGAGTCGATTAGGAAGACGAGTGGTTCATCTCGCGAATCTTCCGATCA
AGCTTCTGATGCCTACGAAGCTGACGAACATCCACGAGTTCGCGCTGAAAACGATACCTT
CAGCGACGAAGATCGAGATCAAGCGAGTCCTGGAGTCACTCTACGGATTCGAGGTGGAAA
AGGTGAACACTTTGAACATGGACGGGAAGAAGAAGAAGCGCGGTGGTCTGTTGATAGCCA
AGGCGGACTACAAGAAAGCTTACGTCACGCTCAAAAACCCTTTGTCGATCTCCAAGGATC
TGTTCCCGGTGAAGTACATCGAGGAAGATAGGAAGAGTAAAGTGAAAGGATCTAGCTTTG
TCGAGGAGGAAGATGATAAGAAGAGTCACTGGCTTGATCAGAAGGAGAAGAGGGAGGTCG
GTGGCTATGGTAATGGTAAAAGTCGTCGCGGCGGTGGCGTGAAAGGTCGACTTCGCCGGC
GAGAGCTTCTGTTGCTGCTGCTTCCGGGGCTAAGTTTCCATGAGCAGCATGAGATTTGGT
GGCAAGTAAGGGTTTTTTTTGTTACTAGTCCACAGTTAGGGTTTATGACCAAACTATTAT
TTACCTGGGGG*TTGTGTTTCTTTTTAGCTGTCGGATTGTTATGCATTTTGTTTCTGTTG
CTTGCTGGTTGTTTCCGTTTTAAAAAGACGAGCTTGATCGTGAATCTGAATCTTATAAGC
TCTCAGAGTTTTTGTGTGTTTTGGC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2AZ75TFB 720 0 0
GTCGATTAGGAAGACGAGTGGTTCATCTCGCGAATCTTCCGATCAAGCTTCTGATGCCTA
CGAAGCTGACGAACATCCACGAGTTCGCGCTGAAAACGATACCTTCAGCGACGAAGATCG
AGATCAAGCGAGTCCTGGAGTCACTCTACGGATTCGAGGTGGAAAAGGTGAACACTTTGA
ACATGGACGGGAAGAAGAAGAAGCGCGGTGGTCTGTTGATAGCCAAGGCGGACTACAAGA
AAGCTTACGTCACGCTCAAAAACCCTTTGTCGATCTCCAAGGATCTGTTCCCGGTGAAGT
ACATCGAGGAAGATAGGAAGAGTAAAGTGAAAGGATCTAGCTTTGTCGAGGAGGAAGATG
ATAAGAAGAGTCACTGGCTTGATCAGAAGGAGAAGAGGGAGGTCGGTGGCTATGGTAATG
GTAAAAGTCGTCGCGGCGGTGGCGTGAAAGGTCGACTTCGCCGGCGAGAGCTTCTGTTGC
TGCTGCTTCCGGGGCTAAGTTTCCATGAGCAGCATGAGATTTGGTGGCAAGTAAGGGTTT
TTTTTGTTACTAGTCCACAGTTAGGGTTTATGACCAAACTATTATTTACCTGGGGGGTTG
TGTTTCTTTTTAGCTGTCGGATTGTTATGCATTTTGTTTCTGTTGCTTGCTGGTTGTTTC
CGTTTTAAAAAGACGAGCTTGATCGTGAATCTGAATCTTATAAGCTCTCA
GAGTTTTTGT

QA 1 710 1 710
DS 



CO CL1199Contig2 749 5 7 U
GGGAGAGAGAGAGAAGAGAAACTCTCGATCAAAAATGTCGAGTCGATTAGGAAGACGAGT
GGTTCATTTCGCGAACCTTCCGATCAAGCTTCTGATGCCTACGAAGCTGACGAACATCCA
CGAGTTCGCGCTGAAAACGATACCTTCAGCGACGAAGATCGAGATCAAGCGAGTCCTCGA
GTCACTCTACGGATTCGAGGTCGAGAAGGTGAACACTTTGAACATGGACGGGAAGAAGAA
GAAGCGAGGTGGTCTGTTGATAGCCAAGGCGGACTACAAGAAGGCATACGTGACGCTCAA
AAACCCTTTGTCGATCTCCAAGGATCTGTTCCCGGTGAAGTACATCGAGGAAGATAGGAA
GAGTAAAGTGAAAGGATCTAGCTTTGTCGAGGAGGAAGATGATAAGAAAAGTCACTGGCT
TGATCAGAAGGAGAAGAGGGAGATCGGTGGTTATGGTAATGGTAAAAGTCGTCGCGGCGG
CGGCGGTGAAAGGTCGACTTCGCCGGCGAGAGCTTCTGCTGCTGCTTCCGGTGCTAAGTT
TCCATGGAGCAGCATGAGATTTGGTGGCAAGTAAGGGTTTTTTTGTTACTAGTCCTCAGT
AGGGTTTATGACCAAACTATTATTTACCTGGGGTTTGTGTTTCTTTTTAGCTGTCGGATT
GTTATGGATTTTGTTTCTGTTGCTTGCTTGTTGTTTCCGTCTTTAAAAGACGAGCTTGAT
CGTGAATCTGAATCTTATAAGCTCTCAGA


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 10 

AF RR2DT48TF U 14
AF RR2GF76TF U 1
AF RR2GF76JQ C 167
AF RR2E892TF U 3
AF RR2E892JQ C 3
BS 1 10 RR2GF76TF
BS 11 11 RR2E892TF
BS 12 707 RR2GF76TF
BS 708 708 RR2GF76JQ
BS 709 731 RR2GF76TF
BS 732 732 RR2E892TF
BS 733 749 RR2GF76TF

RD RR2DT48TF 651 0 0
GG
GAGAAACTCTCGATCAAAAATGTCGAGTCGATTAGGAAGACGAGTGGTTCATTTCGCGAA
CCTTCCGATCAAGCTTCTGATGCCTACGAAGCTGACGAACATCCACGAGTTCGCGCTGAA
AACGATACCTTCAGCGACGAAGATCGAGATCAAGCGAGTCCTCGAGTCACTCTACGGATT
CGAGGTCGAGAAGGTGAACACTTTGAACATGGACGGGAAGAAGAAGAAGCGAGGTGGTCT
GTTGATAGCCAAGGCGGACTACAAGAAGGCATACGTGACGCTCAAAAACCCTTTGTCGAT
CTCCAAGGATCTGTTCCCGGTGAAGTACATCGAGGAAGATAGGAAGAGTAAAGTGAAAGG
ATCTAGCTTTGTCGAGGAGGAAGATGATAAGAAAAGTCACTGGCTTGATCAGAAGGAGAA
GAGGGAGATCGGTGGTTATGGTAATGGTAAAAGTCGTCGCGGCGGCGGCGGTGAAAGGTC
GACTTCGCCGGCGAGAGCTTCTGCTGCTGCTTCCGGTGCTAAGTTTCCATGGAGCAGCAT
GAGATTTGGTGGCAAGTAAGGGTTTTTTTGTTACTAGTCCTCAGTAGGGTTTATGACCAA
ACTATTATTTACCTGGGGTTTGTGTTTCTTTTTAGCTGTCGGATTGTTA

QA 3 651 3 651
DS 

RD RR2GF76TF 749 0 0
GGGAGAGAGAAAGAAGAGAAACTCTCGATCAAAAATGTCGAGTCGATTAGGAAGACGAGT
GGTTCATTTCGCGAACCTTCCGATCAAGCTTCTGATGCCTACGAAGCTGACGAACATCCA
CGAGTTCGCGCTGAAAACGATACCTTCAGCGACGAAGATCGAGATCAAGCGAGTCCTCGA
GTCACTCTACGGATTCGAGGTCGAGAAGGTGAACACTTTGAACATGGACGGGAAGAAGAA
GAAGCGAGGTGGTCTGTTGATAGCCAAGGCGGACTACAAGAAGGCATACGTGACGCTCAA
AAACCCTTTGTCGATCTCCAAGGATCTGTTCCCGGTGAAGTACATCGAGGAAGATAGGAA
GAGTAAAGTGAAAGGATCTAGCTTTGTCGAGGAGGAAGATGATAAGAAAAGTCACTGGCT
TGATCAGAAGGAGAAGAGGGAGATCGGTGGTTATGGTAATGGTAAAAGTCGTCGCGGCGG
CGGCGGTGAAAGGTCGACTTCGCCGGCGAGAGCTTCTGCTGCTGCTTCCGGTGCTAAGTT
TCCATGGAGCAGCATGAGATTTGGTGGCAAGTAAGGGTTTTTTTGTTACTAGTCCTCAGT
AGGGTTTATGACCAAACTATTATTTACCTGGGGTTTGTGTTTCTTTTTAGCTGTCGGATT
GTTATGGATTTTGTTTCTGTTGCTTGCTTGTTGTTTCCGTCTTTAAA*GACGAGCTTGAT
CGTGAATCTGA*TCTTATAAGCTCTCAGA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2GF76JQ 596 0 0
AAGCGAGTCCTCGAGTCACTCTACGGATTCGAGGTCGAGAAGGTGAACACTTTGAACATG
GACGGGAAGAAGAAGAAGCGAGGTGGTCTGTTGATAGCCAAGGCGGACTACAAGAAGGCA
TACGTGACGCTCAAAAACCCTTTGTCGATCTCCAAGGATCTGTTCCCGGTGAAGTACATC
GAGGAAGATAGGAAGAGTAAAGTGAAAGGATCTAGCTTTGTCGAGGAGGAAGATGATAAG
AAAAGTCACTGGCTTGATCAGAAGGAGAAGAGGGAGATCGGTGGTTATGGTAATGGTAAA
AGTCGTCGCGGCGGCGGCGGTGAAAGGTCGACTTCGCCGGCGAGAGCTTCTGCTGCTGCT
TCCGGTGCTAAGTTTCCATGGAGCAGCATGAGATTTGGTGGCAAGTAAGGGTTTTTTTGT
TACTAGTCCTCAGTAGGGTTTATGACCAAACTATTATTTACCTGGGGTTTGTGTTTCTTT
TTAGCTGTCGGATTGTTATGGATTTTGTTTCTGTTGCTTGCTTGTTGTTTCCGTCTTTAA
AAGACGAGCTTGATCGTGAATTTGAATCTTATAAGCTCTCA
GAGTTTTTGTGTTTT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2E892TF 753 0 0
GG
GAGAGAGAGAAGAGAAACTCTCGATCAAAAATGTCGAGTCGATTAGGAAGACGAGTGGTT
CATTTCGCGAACCTTCCGATCAAGCTTCTGATGCCTACGAAGCTGACGAACATCCACGAG
TTCGCGCTGAAAACGATACCTTCAGCGACGAAGATCGAGATCAAGCGAGTCCTCGAGTCA
CTCTACGGATTCGAGGTCGAGAAGGTGAACACTTTGAACATGGACGGGAAGAAGAAGAAG
CGAGGTGGTCTGTTGATAGCCAAGGCGGACTACAAGAAGGCATACGTGACGCTCAAAAAC
CCTTTGTCGATCTCCAAGGATCTGTTCCCGGTGAAGTACATCGAGGAAGATAGGAAGAGT
AAAGTGAAAGGATCTAGCTTTGTCGAGGAGGAAGATGATAAGAAAAGTCACTGGCTTGAT
CAGAAGGAGAAGAGGGAGATCGGTGGTTATGGTAATGGTAAAAGTCGTCGCGGCGGCGGC
GGTGAAAGGTCGACTTCGCCGGCGAGAGCTTCTGCTGCTGCTTCCGGTGCTAAGTTTCCA
TGGAGCAGCATGAGATTTGGTGGCAAGTAAGGGTTTTTTTGTTACTAGTCCTCAGTAGGG
TTTATGACCAAACTATTATTTACCTGGGGTTTGTGTTTCTTTTTAGCTGTCGGATTGTTA
TGGATTTTGTTTCTGTTGCTTGCTTGTTGTTTCCGTCTTTAAA*GACGAGCTTGATCGTG
AATCTGAATCTTATAAGCTCTCA
AAAAAAAA

QA 3 745 3 745
DS 

RD RR2E892JQ 744 0 0
GG
GAGAGAGAGAAGAGAAACTCTCGATCAAAAATGTCGAGTCGATTAGGAAGACGAGTGGTT
CATTTCGCGAACCTTCCGATCAAGCTTCTGATGCCTACGAAGCTGACGAACATCCACGAG
TTCGCGCTGAAAACGATACCTTCAGCGACGAAGATCGAGATCAAGCGAGTCCTCGAGTCA
CTCTACGGATTCGAGGTCGAGAAGGTGAACACTTTGAACATGGACGGGAAGAAGAAGAAG
CGAGGTGGTCTGTTGATAGCCAAGGCGGACTACAAGAAGGCATACGTGACGCTCAAAAAC
CCTTTGTCGATCTCCAAGGATCTGTTCCCGGTGAAGTACATCGAGGAAGATAGGAAGAGT
AAAGTGAAAGGATCTAGCTTTGTCGAGGAGGAAGATGATAAGAAAAGTCACTGGCTTGAT
CAGAAGGAGAAGAGGGAGATCGGTGGTTATGGTAATGGTAAAAGTCGTCGCGGCGGCGGC
GGTGAAAGGTCGACTTCGCCGGCGAGAGCTTCTGCTGCTGCTTCCGGTGCTAAGTTTCCA
TGGAGCAGCATGAGATTTGGTGGCAAGTAAGGGTTTTTTTGTTACTAGTCCTCAGTAGGG
TTTATGACCAAACTATTATTTACCTGGGGTTTGTGTTTCTTTTTAGCTGTCGGATTGTTA
TGGATTTTGTTTCTGTTGCTTGCTTGTTGTTTCCGTCTTTAAAAGACGAGCTTGATCGTG
AATCTGAATCTTATAAGCTCTC

QA 3 744 3 744
DS 



AS 1 6

CO CL1200Contig1 783 6 16 U
GGCCATCACTTGCGAAAGAAAACAAAAGAGGTTAAAGATGGCTCTCGAAGTCTGCGTGAA
AGCCGCTGTTGGTGCCCCTGACGCTCTTGGCGACTGCCCGTTCAGCCAAAGGGTCCTTCT
CACCCTCGAGGAGAAGAATCAGCCCTACAAAATACATCTCATTAACCTCTCCGACAAACC
TCAGTGGTTCTTAGACATTAATCCTCAAGGGAAAGTACCAGTCCTTAAGATGGACGACAA
GTGGGTGCCTGATTCTGACATCATCGTCAACATCCTCGACGACAAGTATCCTGACCCATC
TCTCAAGACCCCACCTCAGTTTGCCTCTGTTGGATCCAGCATCTTCAGCACTTTCGTGAG
TTTCATCAAGAGCAAAGACTCCAACGACGGAACCGAAAAGGCCTTGGTTGATGAGCTACA
AGCACTGGAAGATCATCTCAAGTCTCATGACGGTCCTTTCATCGCAGGGGGAAGAGTCAC
GGCGGTGGATCTTAGCTTAGTACCCAAGCTTCACTATCTCGAGGTCGCTCTTGGGCATTT
CAAAACCTGGTCTGTCCCTGGGACCTTACCCCATGTCCGTACCTACATGAAGGCTTTGTT
CTCTATTGACTCCTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATTGCTGGATGGGC
ACCCAAGGTCAACCCCTAAAAAGAACTGTAGCTCTGAAGTCTCTTCAATAAGAAAATAAA
AAAATAATGTTCTTGGAGCTGGTATTGAATCAATGAAATGAAATATTTTCTAAAATTCCA
AGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 0 
35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 10 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2A092TF U 124
AF RR2EP58TF U 60
AF RR2GG93TF U 1
AF RR2CR33JQ C 26
AF RR2E911TF U 237
AF RR2GG93JQB C 82
BS 1 418 RR2GG93TF
BS 419 419 RR2E911TF
BS 420 420 RR2EP58TF
BS 421 667 RR2GG93TF
BS 668 668 RR2E911TF
BS 669 681 RR2GG93TF
BS 682 694 RR2E911TF
BS 695 695 RR2CR33JQ
BS 696 723 RR2E911TF
BS 724 724 RR2CR33JQ
BS 725 730 RR2E911TF
BS 731 731 RR2CR33JQ
BS 732 736 RR2E911TF
BS 737 737 RR2CR33JQ
BS 738 770 RR2E911TF
BS 771 783 RR2GG93JQB

RD RR2A092TF 208 0 0
CCTCGAGGAGAAGAATCAGCCCTACAAAATACATCTCATTAACCTCTCCGACAAACCTCA
GTGGTTCTTAGACATTAATCCTCAAGGGAAAGTACCAGTCCTTAAGATGGACGACAAGTG
GGTGCCTGATTCTGACATCATCGTCAACATCCTCGACGACAAGTATCCTGACCCATCTCT
CAAGACCCCACCTCAGTTT
TGCCTCTGT

QA 1 199 1 199
DS 

RD RR2EP58TF 604 0 0
GG
GCCGCTGTTGGTGCCCCTGACGCTCTTGGCGACTGCCCGTTCAGCCAAAGGGTCCTTCTG
ACCCTCGAGGAGAAGAATCAGCCCTACAAAATACATCTCATTAACCTCTCCGACAAACCT
CAGTGGTTCTTAGACATTAATCCTCAAGGGAAAGTACCAGTCCTTAAGATGGACGACAAG
TGGGTGCCTGATTCTGACATCATCGTCAACATCCTCGACGACAAGTATCCTGACCCATCT
CTCAAGACCCCACCTCAGTTTGCCTCTGTTGGATCCAACATCTTCAGCACTTTCGTGAGT
TTCCTCAAGAGCAAAGACTCCAATGACGGAACTGAAAAGGCCTTGGTTGATGAGCTACAA
GCTCTGGAAGATCATCTCAAGTCTCATGAAGGTCCTTTCATAGCAGGGGGAAGAGTCACG
GCGGTGGATCTTAGCTTAGCACCCAAGCTTCACTATCTCGAGGTCGCTCTTGGGCATTTC
AAAACCTGGTCTGTCCCTGGGAGCTTACCATATGTCCGTACCTACATGAAGGCTTTGTTC
TCTCTTGACTCCTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCTGGATGGGC
CCC

QA 3 601 3 601
DS 

RD RR2GG93TF 683 0 0
GGCCATCACTTGCGAAAGAAAACAAAAGAGGTTAAAGATGGCTCTCGAAGTCTGCGTGAA
AGCCGCTGTTGGTGCCCCTGACGCTCTTGGCGACTGCCCGTTCAGCCAAAGGGTCCTTCT
CACCCTCGAGGAGAAGAATCAGCCCTACAAAATACATCTCATTAACCTCTCCGACAAACC
TCAGTGGTTCTTAGACATTAATCCTCAAGGGAAAGTACCAGTCCTTAAGATGGACGACAA
GTGGGTGCCTGATTCTGACATCATCGTCAACATCCTCGACGACAAGTATCCTGACCCATC
TCTCAAGACCCCACCTCAGTTTGCCTCTGTTGGATCCAGCATCTTCAGCACTTTCGTGAG
TTTCATCAAGAGCAAAGACTCCAACGACGGAACCGAAAAGGCCTTGGTTGATGAGCTA**
AGCACTGGAAGATCATCTCAAGTCTCATGACGGTCCTTTCATCGCAGGGGGAAGAGTCAC
GGCGGTGGATCTTAGCTTAGTACCCAAGCTTCACTATCTCGAGGTCGCTCTTGGGCATTT
CAAAACCTGGTCTGTCCCTGGGACCTTACCCCATGTCCGTACCTACATGAAGGCTTTGTT
CTCTATTGACTCCTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATTGCTGGATGGGC
ACCCAAG*TCAACCCCTAAAA
GA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2CR33JQ 746 0 0
AAGAGGTTAAAGATGGCTCTCGAAGTCTGCGTGAAAGCCGCTGTTGGTGCCCCTGACGCT
CTTGGCGACTGCCCGTTCAGCCAAAGGGTCCTTCTCACCCTCGAGGAGAAGAATCAGCCC
TACAAAATACATCTCATTAACCTCTCCGACAAACCTCAGTGGTTCTTAGACATTAATCCT
CAAGGGAAAGTACCAGTCCTTAAGATGGACGACAAGTGGGTGCCTGATTCTGACATCATC
GTCAACATCCTCGACGACAAGTATCCTGACCCATCTCTCAAGACCCCACCTCAGTTTGCC
TCTGTTGGATCCAGCATCTTCAGCACTTTCGTGAGTTTCATCAAGAGCAAAGACTCCAAC
GACGGAACCGAAAAGGCCTTGGTTGATGAGCTACAAGCACTGGAAGATCATCTCAAGTCT
CATGACGGTCCTTTCATCGCAGGGGGAAGAGTCACGGCGGTGGATCTTAGCTTAGTACCC
AAGCTTCACTATCTCGAGGTCGCTCTTGGGCATTTCAAAACCTGGTCTGTCCCTGGGACC
TTACCCCATGTCCGTACCTACATGAAGGCTTTGTTCTCTATTGACTCCTTTGAGAAAACA
AAGACCGAGGAGAAGTATGTGATTGCTGGATGGGCACCCAAGGTCAACCCCTAAAAAGAA
CTGTAGCTCTGAAGTCTCTTCAATAAGAAAATAAAAAAATAATGTTCTTGGAGCTGGTAT
TGAATCAATGAAATGAAATATTTTC
T

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2E911TF 534 0 0
G
CAAGTGGGTGCCTGATTCTGACATCATCGTCAACATCCTCGACGACAAGTATCCTGACCC
ATCTCTCAAGACCCCACCTCAGTTTGCCTCTGTTGGATCCAACATCTTCAGCACTTTCGT
GAGTTTCCTCAAGAGCAAAGACTCCAATGACGGAACTGAAAAGGCCTTGGTTGATGAGCT
ACGAGCTCTGGAAGATCATCTCAAGTCTCATGAAGGTCCTTTCATAGCAGGGGGAAGAGT
CACGGCGGTGGATCTTAGCTTAGCACCCAAGCTTCACTATCTCGAGGTCGCTCTTGGGCA
TTTCAAAACCTGGTCTGTCCCTGGGAGCTTACCACATGTCCGTACCTACATGAAGGCTTT
GTTCTCTCTTGACTCCTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCTGGATG
GGCCCCCAAGGTCAACCCCTAAAAAGAACTGTAGCTCCGAAGTCTCTTCAATAAGAAAAT
AAAAAA*TAATGTACTTGGGGCTGGTATTGAATCAATGAAATGAAATATTTTC

QA 2 534 2 534
DS 

RD RR2GG93JQB 702 0 0
CGCTCTTGGCGACTGCCCGTTCAGCCAAAGGGTCCTTCTCACCCTCGAGGAGAAGAATCA
GCCCTACAAAATACATCTCATTAACCTCTCCGACAAACCTCAGTGGTTCTTAGACATTAA
TCCTCAAGGGAAAGTACCAGTCCTTAAGATGGACGACAAGTGGGTGCCTGATTCTGACAT
CATCGTCAACATCCTCGACGACAAGTATCCTGACCCATCTCTCAAGACCCCACCTCAGTT
TGCCTCTGTTGGATCCAGCATCTTCAGCACTTTCGTGAGTTTCATCAAGAGCAAAGACTC
CAACGACGGAACCGAAAAGGCCTTGGTTGATGAGCTA**AGCACTGGAAGATCATCTCAA
GTCTCATGACGGTCCTTTCATCGCAGGGGGAAGAGTCACGGCGGTGGATCTTAGCTTAGT
ACCCAAGCTTCACTATCTCGAGGTCGCTCTTGGGCATTTCAAAACCTGGTCTGTCCCTGG
GACCTTACCCCATGTCCGTACCTACATGAAGGCTTTGTTCTCTATTGACTCCTTTGAGAA
AACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATTGCTGGATGGGCACCCAAGGTCAACCCCTAAAA
AGAACTGTAGCTCTGAAGTCTCTTCAATAAGAAAATAAAAAAATAATGTTCTTGGAGCTG
GTATTGAATCAATGAAATGAAATATTTTCTAAAATTCCAAGT

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 7

CO CL1201Contig1 819 7 22 U
GGATGGTGGATCCGGATAATAATTGGAGCCCCCTCTACCTGAAAAACACGACCAAAAACT
TTTCTTTGTCTTCCAATCTTTTCTCTCTATACACACAC******TCTCTCTCTAATCGTT
CCTTATCATCTTTATCTCGATTTCCGTCTACGATGAGCTCGGAGGAAGCCAAGGTCGTTG
TGCCAAGGAACTTTAGGTTGTTGGAAGAGCTAGAGAGAGGAGAGAAAGGTATCGGAGATG
GTACGGTAAGCTATGGAATGGACGACGCTGATGATATCTATATGCAATCCTGGACTGGCA
CCATTCTCGGCCCTCATAATACTGCATACGATGGGAAAATCTTCCAGCTCAAGCTCTTCT
GTGGTAAGGAATACCCAGAGAGTCCACCAAGTGTCAAGTTCCAGACCCGGATTAACATGG
CCTGCGTTAACCCTGAGACTGGAGTGGTTGAACCGAGTCTCTTTCCTATGCTCGCTAACT
GGCGCCGAGAATACACAATGGAGGACATTCTGGTTAAACTTAAAAAAGAAATGATGACTT
CACATAACCGCAAGTTAGCTCAGCCCCCGGAAGGTACCGAGGAAGCTAGGGCTGATCCAA
AGGGACCAGCTAAATGCTGTGTGATGTGAAGAGAGA**AGTTGGGGCTGTCAACAATTTG
TATTAATATAAGAGACAATGTATATAAAACATCATTTGAAGCTTTTGAAAATTGCCTACA
ACTTAATGTCATAGTGTTGTTTGAGATTATAATATATATATGCACCAATAACAGGTAATG
ACCATCCTAATAAATCTTCTCTTTTCATAGTTCATAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 30 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AQ89TF U 1
AF RR2AB69JQ C 152
AF RR2AB69TF U 70
AF RR2D948TF U 46
AF RR2AB23TF U 47
AF RR2AQ89JQ C 61
AF RR2AB23JQ C 49
BS 1 66 RR2AQ89TF
BS 67 68 RR2AB23TF
BS 69 98 RR2AQ89TF
BS 99 104 RR2AB69TF
BS 105 142 RR2AQ89TF
BS 143 143 RR2AB69TF
BS 144 325 RR2AQ89TF
BS 326 326 RR2AB69TF
BS 327 424 RR2AQ89TF
BS 425 425 RR2AB69TF
BS 426 454 RR2AQ89TF
BS 455 455 RR2AB69TF
BS 456 463 RR2AQ89TF
BS 464 464 RR2AB69TF
BS 465 588 RR2AQ89TF
BS 589 589 RR2AB69TF
BS 590 636 RR2AQ89TF
BS 637 638 RR2AB69TF
BS 639 750 RR2AQ89TF
BS 751 751 RR2AB23TF
BS 752 770 RR2AQ89TF
BS 771 819 RR2AB23TF

RD RR2AQ89TF 770 0 0
GGATGGTGGATCCGGATAATAATTGGAGCCCCCTCTACCTGAAAAACACGACCAAAAACT
TTTCTTCCTCTTCCAATCTTTTCTCTCTATACACACACACTCTCTCTCTCTCTAATCGTT
CCTTATCATCTTTATCTCGATT*CCGTCTACGATGAGCTCGGAGGAAGCCAAGGTCGTTG
TGCCAAGGAACTTTAGGTTGTTGGAAGAGCTAGAGAGAGGAGAGAAAGGTATCGGAGATG
GTACGGTAAGCTATGGAATGGACGACGCTGATGATATCTATATGCAATCCTGGACTGGCA
CCATTCTCGGCCCTCATAATACTGCGTACGATGGGAAAATCTTCCAGCTCAAGCTCTTCT
GTGGTAAGGAATACCCAGAGAGTCCACCAAGTGTCAAGTTCCAGACCCGGATTAACATGG
CCTGTGTTAACCCTGAGACTGGAGTGGTTGAACCTAGTCTCTTCCCTATGCTCGCTAACT
GGCGCCGAGAATACACAATGGAGGACATTCTGGTTAAACTTAAAAAAGAAATGATGACTT
CACATAACCGCAAGTTAGCTCAGCCCCCGGAAGGTACCGAGGAAGCTATGGCTGATCCAA
AGGGACCAGCTAAATGCTGTGTGATGTGAAGAGAGAGAAGTTGGGGCTGTCAACAATTTG
TATTAATATAAGAGACAATGTATATAAAACATCATTTGAAGCTTTTGAAAATTGCCTACA
ACTTAATGTCATAGTGTTGTTTGAGATTATTATATATATATGCACCAATA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2AB69JQ 579 0 0
GATGAGCTCGGAGGAAGCCAAGGTCGTTGTGCCAAGGAACTTTAGGTTGTTGGAAGAGCT
AGAGAGAGGAGAGAAAGGTATCGGAGATGGTACGGTAAGCTATGGAATGGACGACGCTGA
CGATATCTATATGCAATCCTGGACTGGCACTATTCTCGGCCCTCATAATACTGCATACGA
TGGGAAAATCTTCCAGCTCAAGCTCTTCTGTGGTAAGGAATACCCGGAGAGTCCACCAAG
TGTCAAGTTCCAGACCCGGGTTAACATGGCCTGCGTTAACCCTGAGACTGGAGTGGTTGA
ACCGAGTCTCTTTCCTATGCTCGCTAACTGGCGCCGAGAATACACAATGGAGGACATTTT
GGTTAAACTTAAAAAAGAAATGATGACTTCACATAACCGGAAGTTAGCTCAGCCCCCGGA
AGGTACCGAGGAAGCTAGGGCTGATCCAAAGGGACCAGCTAAATGCTGTGTGATGTGAAG
AGAGA**AGTTGGGGCTGTCAACAATTTGTATTAATATAATAGACAATGTATATAAAACA
TCATTTGAAGCTTTTGAAGATTGCCTACAACTTAATG
CC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2AB69TF 661 0 0
GGCTTCCAATC
TTCTCTCTATACACACAC******TCTCTCTCTAATCGTTCCTTATCATCTTTATCTCGA
TTTCCGTCTACGATGAGCTCGGAGGAAGCCAAGGTCGTTGTGCCAAGGAACTTTAGGTTG
TTGGAAGAGCTAGAGAGAGGAGAGAAAGGTATCGGAGATGGTACGGTAAGCTATGGAATG
GACGACGCTGACGATATCTATATGCAATCCTGGACTGGCACTATTCTCGGCCCTCATAAT
ACTGCATACGATGGGAAAATCTTCCAGCTCAAGCTCTTCTGTGGTAAGGAATACCCGGAG
AGTCCACCAAGTGTCAAGTTCCAGACCCGGGTTAACATGGCCTGCGTTAACCCTGAGACT
GGAGTGGTTGAACCGAGTCTCTTTCCTATGCTCGCTAACTGGCGCCGAGAATACACAATG
GAGGACATTCTGGTTAAACTTAAAAAAGAAATGATGACTTCACATAACCGGAAGTTAGCT
CAGCCCCCGGAAGGTACCGAGGAAGCTAGGGCTGATCCAAAGGGACCAGCTAAATGCTGT
GTGATGTGAAGAGAGA**AGTTGGGGCTGTCAACAATTTGTATTAATATAATAGACAATG
TATATAAAACATCATTTGAAGCTTTTGAAGATTGCCTACAACTTAATG
CC

QA 12 659 12 659
DS 

RD RR2D948TF 678 0 0
GGA
CGACCAAAAACTTTTCTTCCTCTTCCAATCTT**CTCTCTATACACACAC******TCTC
TCTCTAATCGTTCCTTATCATCTTTATCTCGATTTCCGTCTACGATGAGCTCGGAGGAAG
CCAAGGTCGTTGTGCCAAGGAACTTTAGGTTGTTGGAAGAGCTAGAGAGAGGAGAGAAAG
GTATCGGAGATGGTACGGTAAGCTATGGAATGGACGACGCTGATGATATCTATATGCAAT
CCTGGACTGGCACTATTCTCGGCCCTCATAATACTGCATACGATGGGAAAATCTTCCAGC
TCAAGCTCTTCTGTGGTAAGGAATACCCAGAGAGTCCACCAAGTGTCAAGTTCCAGACCC
GGATTAACATGGCCTGCGTTAACCCTGAGACTGGAGTGGTTGAACCGAGCCTCTTTCCTA
TGCTCGCTAACTGGCGCCGAGAATACACAATGGAGGACATTCTGGTTAAACTTAAAAAAG
AAATGATGACTTCACATAACCGGAAGTTAGCTCAGCCCCCGGAAGGTACCGAGGAAGCTA
GGGCTGATCCAAAGGGACCAGCTAAATGCTGTGTGATGTGAAGAGAGA**AGTTGGGGCC
GTCAACAATTTGTATTAATATAAGAGACAATGTATATAAAACATCATTTGAAGCTTTTGA
AAATTGCCTACAACT

QA 4 678 4 678
DS 

RD RR2AB23TF 773 0 0
GA
CGACCAAAAACTTTTCTTTGTCTTCCAATCTTTTCTCTCTATACACACAC******TCTC
TCTCTAATCGCTCCTTATCATCTTTATCTCGATTTCCGTCTACGATGAGCTCGGAGGAAG
CCAAGGTCGTTGTGCCAAGGAACTTTAGGTTGTTGGAAGAGCTAGAGAGAGGAGAGAAAG
GTATCGGAGATGGTACGGTAAGCTATGGAATGGACGACGCTGATGATATCTATATGCAAT
CCTGGACTGGCACCATTCTCGGCCCTCATAATACTGCATACGACGGGAAAATCTTCCAGC
TCAAGCTCTTCTGTGGTAAGGAATACCCAGAGAGTCCACCAAGTGTCAAGTTCCAGACCC
GGATTAACATGGCCTGCGTTAACCCTGAGACTGGAGTGGTTGAACCGAGTCTCTTTCCTA
TGCTCGCTAACTGGCGCCGACAATACACAATGGAGGACATTCTGGTTAAACTTAAAAAAG
AAATGATGACTTCACATAACCGCAAGTTAGCTCAACCCCCGGAAGGTACCGAGGAAGCTA
GGGCTGATCCAAAGGGACCGGCTAAATGCTGTGTGATGTGAAGAGAGA**AGTTGGGGCT
GTCAACAATTTGTATTAATATAAGAGACAATGTATATAAAACACCATTTGAAGCTTTTGA
AAATTGCCTACAACTTAATGTCATAGTGTTGTTTGAGATTATATTATATATATGCACCAA
TAACAGGTAATGACCATCCTAATAAATCTTCTCTTTTCATAGTTCATAAAG

QA 3 773 3 773
DS 

RD RR2AQ89JQ 741 0 0
TTTCTTCC
TCTTCCAATCTTTTCTCTCTATACACACACACTCTCTCTCTCTCTAATCGTTCCTTATCA
TCTTTATCTCGATT*CCGTCTACGATGAGCTCGGAGGAAGCCAAGGTCGTTGTGCCAAGG
AACTTTAGGTTGTTGGAAGAGCTAGAGAGAGGAGAGAAAGGTATCGGAGATGGTACGGTA
AGCTATGGAATGGACGACGCTGATGATATCTATATGCAATCCTGGACTGGCACCATTCTC
GGCCCTCATAATACTGCGTACGATGGGAAAATCTTCCAGCTCAAGCTTTTTTGTGGTAAG
GAATACCCAGAGAGTCCACCAAGTGTCAAGTTCCAGACCCGGATTAACATGGCCTGTGTT
AACCCTGAGACTGGAGTGGTTGAACCTAGTTTTTTCCCTATGCTCGCTAACTGGCGCCGA
GAATACACAATGGAGGACATTCTGGTTAAACTTAAAAAAGAAATGATGACTTCACATAAC
CGCAAGTTAGCTCAGCCCCCGGAAGGTACCGAGGAAGCTATGGCTGATCCAAAGGGACCA
GCTAAATGCTGTGTGATGTGAAGAGAGAGAAGTTGGGGCTGTCAACAATTTGTATTAATA
TAAGAGACAATGTATATAAAACATCATTTGAAGCTTTTGAAAATTGCCTACAACTTAATG
TCATAGTGTTGTTTGAGATTATTATATATATATGCACCAATAACAGGTAATGATCATCCT
AATAAATCTTCTC

QA 9 741 9 741
DS 

RD RR2AB23JQ 769 0 0
CGACCAAAAACTTTTCTTTGTCTTCCAATCTTTTCTCTCTATACACACAC******TCTC
TCTCTAATCGCTCCTTATCATCTTTATCTCGATTTCCGTTTACGATGAGCTCGGAGGAAG
CCAAGGTCGTTGTGCCAAGGAACTTTAGGTTGTTGGAAGAGCTAGAGAGAGGAGAGAAAG
GTATCGGAGATGGTACGGTAAGCTATGGAATGGACGACGCTGATGATATCTATATGCAAT
CCTGGACTGGCACCATTCTCGGCCCTCATAATACTGCATACGACGGGAAAATCTTCCAGC
TCAAGCTCTTCTGTGGTAAGGAATACCCAGAGAGTCCACCAAGTGTCAAGTTCCAGACCC
GGATTAACATGGCCTGCGTTAACCCTGAGACTGGAGTGGTTGAACCGAGTCTCTTTCCTA
TGCTCGCTAACTGGCGCCGACAATACACAATGGAGGACATTCTGGTTAAACTTAAAAAAG
AAATGATGACTTCACATAACCGCAAGTTAGCTCAACCCCCGGAAGGTACCGAGGAAGCTA
GGGCTGATCCAAAGGGACCGGCTAAATGCTGTGTGATGTGAAGAGAGA**AGTTGGGGCT
GTCAACAATTTGTATTAATATAAGAGACAATGTATATAAAACACCATTTGAAGCTTTTGA
AAATTGCCTACAACTTAATGTCATAGTGTTGTTTGAGATTATATTATATATATGCACCAA
TAACAGGTAATGACCATCCTAATAAATCTTCTCTTTTCATAGTTCATAA

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 6

CO CL1202Contig1 1111 6 4 U
AAACTACAAAGGTTGTATTGTATGTGACCATCATCATCAAATATATTATCATACAAATAG
GTGGGGGCTATATACAGATAACTGGCACTGGTACACACTATAAGCATACAAATGGCTCTC
AACGTCTCTCCTTTGAAGTCAGAACTTTCATGTTTGCTATATATCTCACAGTTTCGAAAA
GCAAACGTGAAAGTTTTCTTCTCAAATGATTTGCGTCAATGGTAACCATAGCCGAATGAA
ATGCCTATGGATACAGGCGACTCTGCTGTGCGTTTTAGGGTTCAAAAAACATTGTTGATA
CAATAACTGGAGGAGAATGAAGCTGAAGCAAAGATTTTCCTTCAGGATAGCCGCCTATGC
ATAGCGTGTCTCCTCGACCATGCCAGATACCATCATGGACGTTGTTTATCTCCAGTGTTT
TCGATTCCTGAGTTAATGTACAGAAGGGACACATGAGATGGTGGATGCAATCGTCAAAGA
AACTATCATCGCCTCTAATGTTGAACTTCCTTCTTATCTGCATACGGAAGAACCCCAGGT
AGGATGCAATCAAAAGGAGGAAAGCAACAGCCAGATAGAGAAAGCAATGCTTCTTGGTTA
CAGCAAAAGCTGCAACGTTGAATAGGAGACCAATGATAAGAATCATATGAACAGCACCCT
GAAGAAAGCAAGAACCAAAACCGGTCCTCGTCATGTTCTTCCCAAATCTGTAGCACGGAC
AGCAAGCGGATTCTATGCATAGATGACGGTCCTCGAGGCAATCCATAACATCCCCTTCCC
AAAGCCGTAAAACACCGCCGCCGTATTCATCATCCGCCGCATCTTCTCCATCAGAGCTTT
CTAGTTTCCTCCACTTCCCCTGAGTCTGAAGCGCCACCGTCGAGCAGAGCAGATCGAAAT
CCAACACAGATATTCCTTCCAACTCCGCTAGCATCTCCCTCTCTTCCACCGCTGCGCCGC
CGGCTTCGACTCCAATGTCGCCGATAACGGCGGCTCCACCGCTCTCTAGTTTATTCAAAT
CCGCCATTGATAAACAAAAAAAGGAGAAAACTTTAGGGTTTTTTTAGTCTCTGTTCTTCG
ATTCGATATCTTGTTGTCTGCAAAGAGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 15 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F776JQ U 1
AF RR2CB14JQ U 35
AF RR2AK90JQ U 339
AF RR2CB14TF C 370
AF RR2F776TF C 497
AF RR2AK90TF C 433
BS 1 675 RR2F776JQ
BS 676 841 RR2CB14JQ
BS 842 851 RR2AK90JQ
BS 852 1111 RR2CB14TF

RD RR2F776JQ 675 0 0
AAACTACAAAGGTTGTATTGTATGTGACCATCATCATCAAATATATTATCATACAAATAG
GTGGGGGCTATATACAGATAACTGGCACTGGTACACACTATAAGCATACAAATGGCTCTC
AACGTCTCTCCTTTGAAGTCAGAACTTTCATGTTTGCTATATATCTCACAGTTTCGAAAA
GCAAACGTGAAAGTTTTCTTCTCAAATGATTTGCGTCAATGGTAACCATAGCCGAATGAA
ATGCCTATGGATACAGGCGACTCTGCTGTGCGTTTTAGGGTTCAAAAAACATTGTTGATA
CAATAACTGGAGGAGAATGAAGCTGAAGCAAAGATTTTCCTTCAGGATAGCCGCCTATGC
ATAGCGTGTCTCCTCGACCATGCCAGATACCATCATGGACGTTGTTTATCTCCAGTGTTT
TCGATTCCTGAGTTAATGTACAGAAGGGACACATGAGATGGTGGATGCAATCGTCAAAGA
AACTATCATCGCCTCTAATGTTGAACTTCCTTCTTATCTGCATACGGAAGAACCCCAGGT
AGGATGCAATCAAAAGGAGGAAAGCAACAGCCAGATAGAGAAAGCAATGCTTCTTGGTTA
CAGCAAAAGCTGCAACGTTGAATAGGAGACCAATGATAAGAATCATATGAACAGCACCCT
GAAGAAAGCAAGAAC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2CB14JQ 807 0 0
CATCAAATATATTATCATACAAATAGGTGGGGGCTATATACAGATAACTGGCACTGGTAC
ACACTATAAGCATACAAATGGCTCTCAACGTCTCTCCTTTGAAGTCAGAATTTTCATGTT
TGCTATATATCTCACAGTTTCGAAAAGCAAACGTGAAAGTTTTCTTCTCAAATGATTTGT
GTCAATGGTAACCATAGCCGAATGAAATGCCTATGGATACATGCGACTCTGCTGTGCGTT
TTAGGGTTCAGAAGACATTGTTGATACAATAACTGGAGGAGAATGAAGCTGAAGCAAAGA
TTTTCCTTCAGGATAGCCGCCTATGCATAGCGTGTCTCCTCGACCATGCCAGATACCATC
ATGGACGTTGTTTATCTCCAGTGTTTTCGATTCCTGAGTTAATGTACAGAAGGGACACAT
GAGATGGTGGATGCAATCGTCAAAGAAACTATCATCGCCTCTAATGTTGAACTTCCTTCT
TATCTGCATACGGAAGAACCCCAGGTAGGATGCAATCAAAAGGAGGAAAGCAACAGCCAG
ATAGAGAAAGCAATGCTTCTTGGTTACAGCAAAAGCTGCAACGTTGAATAGGAGACCAAT
GATAAGAATCATATGAACAGCACCCTGAAGAAAGCAAGAACCAAAACCGGTCCTCGTCAT
GTTCTTCCCAAATCTGTAGCACGGACAGCAAGCGGATTCTATGCATAGATGACGGTCCTC
GAGGCAATCCATAACATCCCCTTCCCAAAGCCGTAAAACACCGCCGCCGTATTCATCATC
CGCCGCATCTTCTCCATCAGAGCTTTC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2AK90JQ 513 0 0
CCTTCAGGATAGCCGC
CTATGCATAGCGGGTCTCCTCGACCATGCCAGATACCATCATGGACGTTGTTTATCTCCA
GTGTTTTTGATTCCTGAGTTAATGTACAGAAGGGACACATGAGATGGTGGATGCAATCGT
CAAAGAAACTATCATCGCCTCTAATGTTGAACTTCCTTATTATCTGCATACGGAAGAACC
CCAGGTAGGATGCAATCAAAAGGAGGAAAGCAACAGCCAGATAGAGAAAGCAATGCTTCT
TGGTTACAGCAAAAGCTGCAACGTTGAATAGGAGACCAATGATAAGAATCATATGAACAG
CACCCTGAAGAAAGCAAGAACCAAAACCGGTCCTCGTCATGTTCTTCCCAAATCTGTAGC
ACGGACAGCAAGCGGATTCTATGCATAGATGACGGTCCTCGAGGCAATCCATAACATCCC
CTTCCCAAAGCCGTAAAACACCGCCGCCGTATTCATCGTCCGCCGCATCTTCTCCATCAG
AGCTTTCTAGTTTCCTC

QA 17 513 17 513
DS 

RD RR2CB14TF 742 0 0
TCT
CTCGACCATGCCAGATACCATCATGGACGTTGTTTATCTCCAGTGTTT*CGATTC*TGAG
TTAATGTACAGAAGGGACACATGAGATGGTGGATGCAATCGTCAAAGAAACTATCATCGC
CTCTAATGTTGAACTTCCTTCTTATCTGCATACGGAAGAACCCCAGGTAGGATGCAATCA
AAAGGAGGAAAGCAACAGCCAGATAGAGAAAGCAATGCTTCTTGGTTACAGCAAAAGCTG
CAACGTTGAATAGGAGACCAATGATAAGAATCATATGAACAGCACCCTGAAGAAAGCAAG
AACCAAAACCGGTCCTCGTCATGTTCTTCCCAAATCTGTAGCACGGACAGCAAGCGGATT
CTATGCATAGATGACGGTCCTCGAGGCAATCCATAACATCCCCTTCCCAAAGCCGTAAAA
CACCGCCGCCGTATTCATCATCCGCCGCATCTTCTCCATCAGAGCTTTCTAGTTTCCTCC
ACTTCCCCTGAGTCTGAAGCGCCACCGTCGAGCAGAGCAGATCGAAATCCAACACAGATA
TTCCTTCCAACTCCGCTAGCATCTCCCTCTCTTCCACCGCTGCGCCGCCGGCTTCGACTC
CAATGTCGCCGATAACGGCGGCTCCACCGCTCTCTAGTTTATTCAAATCCGCCATTGATA
AACAAAAAAAGGAGAAAACTTTAGGGTTTTTTTAGTCTCTGTTCTTCGATTCGATATCTT
GTTGTCTGCAAAGAGGATC

QA 4 742 4 742
DS 

RD RR2F776TF 593 0 0
AATGTTGAACTTCTTTCTTATCTGCATACGGAAGAACCCCAGGTAGGATGCAATCAAAAG
GAGGAAAGCAACAGCCAGATAGAGAAAGCAATGCTTCTTGGTTACAGCAAAAGCTGCAAC
GTTGAATAGGAGACCAATGATAAGAATCATATGAACAGCACCCTGAAGAAAGCAAGAACC
AAAACCGGTCCTCGTCATGTTCTTCCCAAATCTGTAGCACGGACAGCAAGCGGATTCTAT
GCATAGATGACGGTCCTTGAGGCAATCCATAACATCCCCTTCCCAAAGCCGTAAAACACC
GCCGCCGTATTCATCATCCGCCGCATCTTCTCCATCAGAGCTTTCTAGTTTCCTCCACTT
CCCCTGAGTCTGAAGCGCCACCGTCGAGCAGAGCAGATCGAAATCCAACACAGATATTCC
TTCCAACTCCGCTAGCATCTCCCTCTCTTCCACCGCTGCGCCGCCGGCTTCGACTCCAAT
GTCGCCGATAACGGCGGCTCCACCGCTCACTAGTTTATTCAAATCCGCCATTGATAAACA
AAGAAAGGAGAAAACTTTAGGGTTTTTTTAGTCTCTGTTCTTCGATTCGAT
CC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2AK90TF 661 0 0
TTAATGTACAGAAGGGACACATGAGATGGTGGATGCAATCGTCAAAGAAACTATCATCGC
CTCTAATGTTGAACTTCCTTATTATCTGCATACGGAAGAACCCCAGGTAGGATGCAATCA
AAAGGAGGAAAGCAACAGCCAGATAGAGAAAGCAATGCTTCTTGGTTACAGCAAAAGCTG
CAACGTTGAATAGGAGACCAATGATAAGAATCATATGAACAGCACCCTGAAGAAAGCAAG
AACCAAAACCGGTCCTCGTCATGTTCTTCCCAAATCTGTAGCACGGACAGCAAGCGGATT
CTATGCATAGATGACGGTCCTCGAGGCAATCCATAACATCCCCTTCCCAAAGCCGTAAAA
CACCGCCGCCGTATTCATCGTCCGCCGCATCTTCTCCATCAGAGCTTTCTAGTTTCCTCC
ACTTCCCCTGAGTCTGAAGCGCCACCGTCGAGCAGAGCAGATCGAAATCCAACACAGATA
TTCCTTCCAACTCCGCTAGCATCTCCCTCTCTTCCACCGCTGCGCCGCCGGCTTCGACTC
CAATGTCGCCGATAACGGCGGCTCCACCGCTCTCTAGTTTATTCAAATCCGCCATTGATA
AACAAAAAAAGGAGAAAACTTTAGGGTTTTTTTAGTCTCTGTTCTTCGATTCGAT
ATCTTC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 2 7

CO CL1203Contig1 926 5 10 U
GGATTTCCCTTATATTGTCGCAGCCGGAGAACTTATCATCTCCCTCTACGATCAGCGACA
AGAGGAAGAAGCAACGATGCCGGCAAAACAGAGGACGCCAAAGGTCAGCCGAAACCCTGA
TCTCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCAAGGTCGCAGATGTACCACAAGAGAGGCTTGTG
GGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCGCCACGATGCTAAACCCAAGGTTGA
TGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTAAAAAGCCTCTCTC
CAACAGGCGCAAGGCAAATCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATTACCCCTGGAACTGTTCT
GATCATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTCTTGAAGCAGCTTCCCTC
TGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCTTTGAGACGTGTTAA
CCAGTCTTACGTGATTGGCACGTCCACAAAGGTTGACATCTCTGGTGTTAGCCTCGAGAA
ATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGCTGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAGGAGA
GTTCTTCGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCACAAGGGAAGAAAGATGACCA
GAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCGGTTCCAGAGTTGAAGACTTA
CCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAACAAGGAATGAAGCCACACGAGCTTGTTTTTTAGAT
TTTCAGTAAACTTTTATTTGTGTGTTACTCTCAACGTTTGTTTTTGTCCTTGTCCACTTG
CTAGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTATGTTTTCGCATTTGGTATCTTAATGTGA
ACTTTGAAGCCATATATTTCAACGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DE73TF U 42
AF RR2GU39TF U 1
AF RR2AC70TF U 46
AF RR2AC70JQ C 123
AF RR2GU39JQB C 362
BS 1 565 RR2GU39TF
BS 566 566 RR2AC70TF
BS 567 588 RR2GU39TF
BS 589 589 RR2AC70TF
BS 590 593 RR2GU39TF
BS 594 774 RR2AC70TF
BS 775 775 RR2AC70JQ
BS 776 870 RR2AC70TF
BS 871 920 RR2AC70JQ
BS 921 926 RR2GU39JQB

RD RR2DE73TF 495 0 0
GGCTCT
ACGATCAGCGACAAGAGGGAGAAGCAACGATGCCGGCAAAACAGAGGACGCCAAAGGTCA
GCCGAAACCCTGATCTCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCAAGGTCGCAGATGTACCACA
AGAGAGGCTTGTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCGCCACGATGCTA
AACCCAAGGTTGATGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTA
AAAAGCCTCTCTCCAACAGGCGCAAGGCAAATCCGACCAAGCTCGGATCCAGCATTACCC
CTGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTCTTGA
AGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCTT
TGAGACGTGTTAACCAGTCTTACGTGATTGGCACGTCCACAAAGGTTGACATCTCTGGTG
TTAGCCTCG

QA 7 495 7 495
DS 

RD RR2GU39TF 593 0 0
GGATTTCCCTTATATTGTCGCAGCCGGAGAACTTATCATCTCCCTCTACGATCAGCGACA
AGAGGAAGAAGCAACGATGCCGGCAAAACAGAGGACGCCAAAGGTCAGCCGAAACCCTGA
TCTCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCAAGGTCGCAGATGTACCACAAGAGAGGCTTGTG
GGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCGCCACGATGCTAAACCCAAGGTTGA
TGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTAAAAAGCCTCTCTC
CAACAGGCGCAAGGCAAATCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATTACCCCTGGAACTGTTCT
GATCATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTCTTGAAGCAGCTTCCCTC
TGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCTTTGAGACGTGTTAA
CCAGTCTTACGTGATTGGCACGTCCACAAAGGTTGACATCTCTGGTGTTAGCCTCGAGAA
ATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAG*TGGCTGAGAAGAAGAACAAGAAAGGAG

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2AC70TF 837 0 0
GG
ACGATCAGCGACAAGAGGAAGAAGCAACGATGCCGGCAAAACAGAGGACGCCAAAGGTCA
GCCGAAACCCTGATCTCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCAAGGTCGCAGATGTACCACA
AGAGAGGCTTGTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCGCCACGATGCTA
AACCCAAGGTTGATGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTA
AAAAGCCTCTCTCCAACAGGCGCAAGGCAAATCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATTACCC
CTGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTCTTGA
AGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCTT
TGAGACGTGTTAACCAGTCTTACGTGATTGGCACGTCCACAAAGGTTGACATCTCTGGTG
TTAGCCTCGAGAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGTTGAGAAGAAGAACAAGA
AGGGAGAAGGAGAGTTCTTCGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCACAAGGGA
AGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCGGTTCCAG
AGTTGAAGACTTACCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAACAAGGAATGAAGCCACACGAGC
TTGTTTTCTAGATTTTCAGTAAACTTTTATTTGTGTGTTACTCTCAACGTTTGTTTTTGT
CCTTGTCCACTTGCTAGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTT
ATGTTTCGCATT

QA 3 825 3 825
DS 

RD RR2AC70JQ 798 0 0
TCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCAAGGTCGCAGATGTACCACAAGAGAGGCTTGTGGG
CTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCGCCACGATGCTAAACCCAAGGTTGATG
CTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTAAAAAGCCTCTCTCCA
ACAGGCGCAAGGCAAATCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATTACCCCTGGAACTGTTCTGA
TCATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTCTTGAAGCAGCTTCCCTCTG
GTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCTTTGAGACGTGTTAACC
AGTCTTACGTGATTGGCACGTCCACAAAGGTTGACATTTCTGGTGTTAGCCTCGAGAAAT
TCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGTTGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAGGAGAGT
TCTTCGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGA
AAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCGGTTCCAGAGTTGAAGACTTACC
TTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAACAAGGAATGAAGCCACACGAGCTTGTTTTTTAGATTT
TCAGTAAACTTTTATTTGTGTGTTACTCTCAACGTTTGTTTTTGTCCTTGTCCACTTGCT
AGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTATGTTTTCGCATTTGGTATCTTAATGTGAAC
TTTGAAGCCATATATTTC

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2GU39JQB 565 0 0
ATCATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTCTTGAAGCAGCTTCCCTCT
GGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCTTTGAGACGTGTTAAC
CAGTCTTACGTGATTGGCACGTCCACAAAGGTTGACATCTCTGGTGTTAGCCTCGAGAAA
TTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGCTGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAGGAGAG
TTTTTCGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAG
AAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCGGTTCCAGAGTTGAAGACTTAC
CTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAACAAGGAATGAAGCCACACGAGCTTGTTTTTTAGATT
TTCAGTAAACTTTTATTTGTGTGTTACTCTCAATGTTTGTTTTTGTCCTTGTCCACTTGC
TAGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTATGTTTTCGCATTTGGTATCTTAATGTGAA
CTTTGAAGCCATATATTTCAACGAG

QA 1 565 1 565
DS 



CO CL1203Contig2 599 2 1 U
AGCATCACCCCTGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTT
GTGTTTTTGAAGCAGCTTCCTTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAAT
GGTGTGCCTTTGAGGCGTGTTAACCAGTCTTACGTGATTGGCACGTCCACAAAGGTTGAC
ATCTCTGGTGTTAGCCTCGAGAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGCTGAGAAG
AAGAACAAGAAGGGAGAACGAGAGTTCTTCGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTC
CCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAG
TCGGTTCCAGAGTTGAAGACTTACCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAGCAAGGAATGAAG
CCACATGAGCTTGTTTTCTAGATTTTCAGTAAACTTTTATTTGTGTGTTACTCCCAACGT
TTGTTTTGTCCTTGTCCACTTGCTAGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTAAATTTT
CGCATTTGGTATCTGAATGTGAACTTTTGAAGCAATATATTTCAATAGATAGTAGTGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GZ26JQ C 1
AF RR2GZ26TF U 1
BS 1 599 RR2GZ26TF

RD RR2GZ26JQ 599 0 0
AGCATCACCCCTGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTT
GTGTTTTTGAAGCAGCTTCCTTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAAT
GGTGTGCCTTTGAGGCGTGTTAACCAGTCTTACGTGATTGGCACGTCCACAAAGGTTGAC
ATCTCTGGTGTTAGCCTCGAGAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGCTGAGAAG
AAGAACAAGAAGGGAGAACGAGAGTTCTTCGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTC
CCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAG
TCGGTTCCAGAGTTGAAGACTTACCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAGCAAGGAATGAAG
CCACATGAGCTTGTTTTCTAGATTTTCAGTAAACTTTTATTTGTGTGTTACTCCCAACGT
TTGTTTTGTCCTTGTCCACTTGCTAGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTAAATTTT
CGCATTTGGTATCTGAATGTGAACTTTTGAAGCAATATATTTCAATAGATAGTAGTGCC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2GZ26TF 599 0 0
AGCATCACCCCTGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTT
GTGTTTTTGAAGCAGCTTCCTTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAAT
GGTGTGCCTTTGAGGCGTGTTAACCAGTCTTACGTGATTGGCACGTCCACAAAGGTTGAC
ATCTCTGGTGTTAGCCTCGAGAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGCTGAGAAG
AAGAACAAGAAGGGAGAACGAGAGTTCTTCGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTC
CCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAG
TCGGTTCCAGAGTTGAAGACTTACCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAGCAAGGAATGAAG
CCACATGAGCTTGTTTTCTAGATTTTCAGTAAACTTTTATTTGTGTGTTACTCCCAACGT
TTGTTTTGTCCTTGTCCACTTGCTAGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTAAATTTT
CGCATTTGGTATCTGAATGTGAACTTTTGAAGCAATATATTTCAATAGATAGTAGTGCC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 6

CO CL1204Contig1 1299 6 4 U
CCTACCCAAAAAAATATTTTCCTTTTCCCCAACAACTTTACATCGTTTCAACAAAAAGAA
ACACGAACAAAATCATGGCTAACACAAACGAAAAGCCTGAATCTATAGGGACCGGTCAGA
ACAAGATACAACTAGTATATTGTAATATAAAAGATTATATTTAATATAATATTCTCTTAA
AAAATCCGTCAAGGAAGAACAAATTCTTGAATCCCAAAATATCATCACAAAGAGGCCATC
TAAGTGTCAATGTCAAGGAATCAACTTTGTTAGTTTACTTTAAAAAAGCATTAATAAAAC
TCTCGAGATTTATAATAAGGTTTAACATATTTCTCATCACTTTCGTATCTCCAACTACTT
CTCATCAGCAAGATCACTCGGAAGATCTTCTCCGGAAGGTATTTTTCCGGGATAGTTAGT
CACAGGAGGATCCGAACCGTTCATGCATTTATCCACAAGAACTACCGAACGAAGCTCACA
GTTAGCGAAATGTGAAGATATCTCGCTTTTCACGGTTGGAACACAATCGTTTCCAAATGA
GTTTAATGTATGATACAAGAACCCACTATGAGTAACAACTGCAATTTCCTTTTCTTTCCT
TGTACTCAACCAGTTCATGAATTTCACGCCTCTGGCTGCGAGATCTTTGTCCTCCTCTCT
GATCTCAGGCTTCCACAAGACATCTTCGTCAGTTTCTACCAATGAAAAATCAACCGCAGG
GAATAACTCGCGGTACTTGGTGATACTGCTTCTTCTGTCACAAGGATGAACACCCAAATG
TTCTCGGCAAGATTCAACTGCAATGAATGGTGGACGATTTAAGCTTGATATAGCAGGACG
GTCGCTGCTTCCTGCACCAGTCGTCATAAGCGGAGGTGCGTCAACGCCATCTGTGTAACC
CTCCCCTCCAAAAGTTCCAACCGCAGTTTGCAAAGTCCTGAGCAGAGGCGACACAACAAC
CAACTCAATCCTGTTAGAGATCCCACTTGCCTTAACATGCGTGCGTAAGTTATCAACCTG
TTGCCATCCGAGAGGGGTAAGATGTGCGTCAAAGAGATCCTCAGATAAATAAGCATCATG
GTTCTTCTCTCCTTCTACGTTATGAACCCCTTGAGCATGTCTTACCAGATGTATGGTTTT
GCAACGATGAAGTGGGTAAAGGCCTTGACTTGGTTTTGCCTCCATATCTTGAGAAGGAAT
AGAGTTGCAACAACGAGGAGAGAGAGTCCTAGGCGATGGAAGAGGAGAAACGGAGGAAAT
GGAAATGAAGTGGGGAAATGAAAGAGCTGAGTTCATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2E216JQ U 1
AF RR2FO59JQ U 179
AF RR2CI27JQ U 254
AF RR2FO59TF C 512
AF RR2CI27TF C 549
AF RR2BL11TF C 635
BS 1 675 RR2E216JQ
BS 676 941 RR2FO59JQ
BS 942 1033 RR2CI27JQ
BS 1034 1299 RR2FO59TF

RD RR2E216JQ 675 0 0
CCTACCCAAAAAAATATTTTCCTTTTCCCCAACAACTTTACATCGTTTCAACAAAAAGAA
ACACGAACAAAATCATGGCTAACACAAACGAAAAGCCTGAATCTATAGGGACCGGTCAGA
ACAAGATACAACTAGTATATTGTAATATAAAAGATTATATTTAATATAATATTCTCTTAA
AAAATCCGTCAAGGAAGAACAAATTCTTGAATCCCAAAATATCATCACAAAGAGGCCATC
TAAGTGTCAATGTCAAGGAATCAACTTTGTTAGTTTACTTTAAAAAAGCATTAATAAAAC
TCTCGAGATTTATAATAAGGTTTAACATATTTCTCATCACTTTCGTATCTCCAACTACTT
CTCATCAGCAAGATCACTCGGAAGATCTTCTCCGGAAGGTATTTTTCCGGGATAGTTAGT
CACAGGAGGATCCGAACCGTTCATGCATTTATCCACAAGAACTACCGAACGAAGCTCACA
GTTAGCGAAATGTGAAGATATCTCGCTTTTCACGGTTGGAACACAATCGTTTCCAAATGA
GTTTAATGTATGATACAAGAACCCACTATGAGTAACAACTGCAATTTCCTTTTCTTTCCT
TGTACTCAACCAGTTCATGAATTTCACGCCTCTGGCTGCGAGATCTTTGTCCTCCTCTCT
GATCTCAGGCTTCCA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2FO59JQ 763 0 0
AAAAAATCCGTCAAGGAAGAACAAATTCTTGAATCCCAAAATATCATCACAAAGAGGCCA
TCTAAGTGTCAATGTCAAGGAATCAACTTTGTTAGTTTACTTTAAAAAAGCATTAATAAA
ACTCTCGAGATTTATAATAAGGTTTAACATATTTCTCATCACTTTCGTATCTCCAACTAC
TTCTCATCAGCAAGATCACTCGGAAGATCTTCTCCGGAAGGTATTTTTCCGG*ATAGTTA
GTCACAGGAGGATCCGAACCGTTCATGCATTTATCCACAAGAACTACCGAACGAAGCTCA
CAGTTAGCGAAATGTGAAGATATCTCGCTTTTCACGGTTGGAACACAATCGTTTCCAAAT
GAGTTTAATGTATGATACAAGAACCCACTATGAGTAACAACTGCAATTTCCTTTTCTTTC
CTTGTACTCAACCAGTTCATGAATTTCACGCCTCTGGCTGCGAGATCTTTGTCCTCCTCT
CTGATCTCAGGCTTCCACAAGACATCTTCGTCAGTTTCTACCAATGAAAAATCAACCGCA
GGGAATAACTCGCGGTACTTGGTGATACTGCTTCTTCTGTCACAAGGATGAACACCCAAA
TGTTCTCGGCAAGATTCAACTGCAATGAATGGTGGACGATTTAAGCTTGATATAGCAGGA
CGGTCGCTGCTTCCTGCACCAGTCGTCATAAGCGGAGGTGCGTCAACGCCATCTGTGTAA
CCCTCCCCTCCAAAAGTTCCAACCGCAGTTTGCAAAGTCCTGA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2CI27JQ 780 0 0
CAAGGAATCAACTTTGTTAGTTTACTTTAAAAAAGCATTAATAAAACTCTCGAGATTTAT
AATAAGGTTTAACATATTTCTCATCACTTTCGTATCTCCAACTACTTCGCATCAGCAAGA
TCACTCGGAAGATCTTCTCCGGAAGGTATTTTTCCGGGATAGTTAGTCACAGGAGGATCC
GAACCGTTCATGCATTTATCCACAAGAACTACCGAACGAAGCTCACAGTTAGCGAAATGT
GAAGATATCTCGCTTTTCACGGTTGGAACACAATCGTTTCCAAATGAGTTTAATGTATGA
TACAAGAACCCACTATGAGTAACAACTGCAATTTCCTTTTCTTTCCTTGTACTCAACCAG
TTCATGAATTTCACGCCTCTGGCTGCGAGATCTTTGTCCTCCTCTCTGATCTCAGGCTTC
CACAAAACATCTTCGTCAGTTTCTACCAATGAAAAATCAACCGCAGGGAATAACTCGCGG
TACTTGGTGATACTGCTTCTTCTGTCACAAGGATGAACACCCAAATGTTCTCGGCAAGAT
TCAACTGCAATGAATGGTGGACGATTTAAGCTTGATATAGCAGGACGGTCGCTGCTTCCT
GCACCAGTCGTCGTAAGCGGAGGTGCGTCAACGCCATCTGTGTAACCCTCCCCTCCAAAA
GTTCCAACCGCAGTTTGCAAAATCCTGAGCAGAGGCGACACAACAACCAACTCAATCCTG
TTAGAGATCCCACTTGCCTTAACATGCGTGCGTAAGTTATCAACCTGTTGCCATCCGAGA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2FO59TF 788 0 0
TCACGGTGGAACAC
ATCGTTTCCAAATGAGTT*AATGTATGATACA*GAACCCACTATGAGTAC**ACTGCAAT
TTC*TTTTCTTTC*TTGTACTCAACCAGTTCATGAATTTCACGCCTCTGGCTGCGAGATC
TTTGTCCTCCTCTCTGATCTCAGGCTTCCACAAGACATCTTCGTCAGTTTCTACCAATGA
AAAATCAACCGCAGGGAATAACTCGCGGTACTTGGTGATACTGCTTCTTCTGTCACAAGG
ATGAACACCCAAATGTTCTCGGCAAGATTCAACTGCAATGAATGGTGGACGATTTAAGCT
TGATATAGCAGGACGGTCGCTGCTTCCTGCACCAGTCGTCATAAGCGGAGGTGCGTCAAC
GCCATCTGTGTAACCCTCCCCTCCAAAAGTTCCAACCGCAGTTTGCAAAGTCCTGAGCAG
AGGCGACACAACAACCAACTCAATCCTGTTAGAGATCCCACTTGCCTTAACATGCGTGCG
TAAGTTATCAACCTGTTGCCATCCGAGAGGGGTAAGATGTGCGTCAAAGAGATCCTCAGA
TAAATAAGCATCATGGTTCTTCTCTCCTTCTACGTTATGAACCCCTTGAGCATGTCTTAC
CAGATGTATGGTTTTGCAACGATGAAGTGGGTAAAGGCCTTGACTTGGTTTTGCCTCCAT
ATCTTGAGAAGGAATAGAGTTGCAACAACGAGGAGAGAGAGTCCTAGGCGATGGAAGAGG
AGAAACGGAGGAAATGGAAATGAAGTGGGGAAATGAAAGAGCTGAGTTCATTCC

QA 15 788 15 788
DS 

RD RR2CI27TF 725 0 0
TGTATGATACAG
ACCCACTATGAGTA*CAACTGCAATTTCCTTT*CTTTC*TTGTACTCAACCAGTTCATGA
ATTTCACGCCTCTGGCTGCGAGATCTTTGTCCTCCTCTCTGATCTCAGGCTTCCACAAGA
CATCTTCGTCAGTTTCTACCAATGAAAAATCAACCGCAGGGAATAACTCGCGGTACTTGG
TGATACTGCTTCTTCTGTCACAAGGATGAACACCCAAATGTTCTCGGCAAGATTCAACTG
CAATGAATGGTGGACGATTTAAGCTTGATATAGCAGGACGGTCGCTGCTTCCTGCACCAG
TCGTCGTAAGCGGAGGTGCGTCAACGCCATCTGTGTAACCCTCCCCTCCAAAAGTTCCAA
CCGCAGTTTGCAAAATCCTGAGCAGAGGCGACACAACAACCAACTCAATCCTGTTAGAGA
TCCCACTTGCCTTAACATGCGTGCGTAAGTTATCAACCTGTTGCCATCCGAGAGGGGTAA
GATGTGCGTCAAAGAGATCCTCAGATAAATAAGCATCATGGTTCTTCTCTCCTTCTACGT
TACGAACCCCTTGAGCATGTCTTACCAGATGTATGGTTTTGCAACGATGAAGTGGGTAAA
GGCCTTGACTTGGTTTTGCCTCCATATCTTGAGAAGGAATAGAGTTGCAACAACGAGGAG
AGAGAGTCCTAGGCGATGGAAGAGGAGAAACGGAGGAAATGGAAATGAAGT
CC

QA 13 723 13 723
DS 

RD RR2BL11TF 665 0 0
GCTGCGAGATCTTTGTCCTCCTCTCTGATCTCAGGCTTCCACAAGACATCTTCGTCAGTT
TCTACCAATGAAAAATCAACCGCAGGGAATAACTCGCGGTACTTGGTGATACTGCTTCTT
CTGTCACAAGGATGAACACCCAAATGTTCTCGGCAAGATTCAACTGCAATGAATGGTGGA
CGATTTAAGCTTGATATAGCAGGACGGTCGCTGCTTCCTGCACCAGTCGTCATAAGCGGA
GGTGCGTCAACGCCATCTGTGTAACCCTCCCCTCCAAAAGTTCCAACCGCAGTTTGCAAA
GTCCTGAGCAGAGGCGACACAACAACCAACTCAATCCTGTTAGAGATCCCACTTGCCTTA
ACATGCGTGCGTAAGTTATCAACCTGTTGCCATCCGAGAGGGGTAAGATGTGCGTCAAAG
AGATCCTCAGATAAATAAGCATCATGGTTCTTCTCTCCTTCTACGTGATGAACCCCTTGA
GCATGTCTTACCAGATGTATGGTTTTGCAACGATGAAGTGGGTAAAGGCCTTGACTTGGT
TTTGCCTCCATATCTTGAGAAGGAATAGAGTTGCAACAACGAGGAGAGAGAGTCCTAGGC
GATGGAAGAGGAGAAACGGAGGAAATGGAAATGAAGTGGGGAAATGAAAGAGCTGAGTTC
ATTCC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 6

CO CL1205Contig1 1446 6 20 U
GGGACAAGCAATCCCTAATTTGGCCTCAAAAACCCAATCCTTGGTCGTCTAGATCTTCAT
CTACTTCATCGGTTGCCAAATCGGAGATGGCGAGTTCTATGGCCTCTCCTCTTACTTCAC
AACTCAACCACGAAGCTCTATGTTCCAAGTCTGTGCTTCGCAAATCACCCTTCATGTCGG
GATCTACTAAGCTCTTCTCCTCGAACATGCCTTGCTCTACTGTTCCTCAACGCACAAGAA
GATCACACTGCTTCGCTTCTGCTAAAAACATGAGCTTTGACCACATCCCCAAGCAGTTTC
GAGGAGACAACCTCAAAGATGGAGTGATGCAAAACTTCAAGAATGTACCGCAATACTTCT
ACGGGCTTAATCCAGCTCAAATGGATATGTTCATGACCGAGGATAGCCCTGTCCGTAGGC
AAGCGGAAAAAGTTACTGAGGAAAGCATCTCGTCTAGAAGAAATTATTTAGACAATGGAG
GGACATGGAGTATGTCTGGTATGAATGTAGCAGATCCTAGAAGATATAGGATGAGTGTCC
AAATGTACAGAGGTGGAGGAGGCGGCGGTGGAGGATCTCCGAGACCAAGAACTGCTCCTC
CAGATTTGCCTTCTTTGCTCTTGGATGCTAGGATCTGCTATCTTGGCATGCCTATTGTAC
CTGCAGTTACTGAGTTACTCGTTGCACAGTTTATGTGGTTAGACTATGATAACCCAGCAA
AGCCCATCTATCTATACATAAACTCACCTGGGACTCAGAATGAGAAGATGGAGACTGTTG
GGTCAGAAACAGAGGCTTACGCCATAGCTGACACCATTTCTTATTGCAAATCAGATGTAT
ACACAATCAATTGTGGAATGGCTTTTGGTCAAGCAGCAATGCTTCTTTCTCTTGGGAAAA
AGGGTTATCGTGCCGTACAACCACATTCATCAACAAAACTATATCTGCCAAAAGTAAACA
GATCGAGTGGAGCTGCCATAGACATGTGGATAAAGGCCAAGGAACTTGATGCAAATACTG
AGTATTACATCGAGCTGTTAGCTAAGGGAACAGGTAAATCTAAAGAGCAGATCAACGAGG
ACATCAAGAGGCCGAAATATCTCCAAGCACAAGCAGCCATTGACTATGGAGTCGCAGACA
AGATAGCTGACTCTCAGGATAGTTCCTTTGAGAAACGGGATTACGATGGGTCTCTTGCCC
AGAGAGCCATGGGAAGACCTGGAGGAGGCAATCCAACAGCTTCAGCAGGACTTAGATGAT
CAGTTAATTCACACTTACAAATGTTTGAATCTCAATTTGCTTAGTCACTCTGGAATATGT
AGCTGTTACAGTCTGTAAGCAAACACGTGTAGTATTAACATACAAAAGTGTTGGCAAAAA
GGATTTTTTCTGTTTTCCAAGGAAGTTTGGTAGTCAATTTCTTAATGAAAATAAAGACCG
ATTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET65TF U 57
AF RR2CM57TF U 25
AF RR2AQ88TF U 1
AF RR2ET65JQ C 970
AF RR2HA58JQ C 634
AF RR2AQ88JQ C 614
BS 1 765 RR2AQ88TF
BS 766 766 RR2AQ88JQ
BS 767 788 RR2AQ88TF
BS 789 789 RR2AQ88JQ
BS 790 847 RR2AQ88TF
BS 848 1058 RR2AQ88JQ
BS 1059 1059 RR2ET65JQ
BS 1060 1088 RR2AQ88JQ
BS 1089 1089 RR2ET65JQ
BS 1090 1090 RR2AQ88JQ
BS 1091 1091 RR2ET65JQ
BS 1092 1132 RR2AQ88JQ
BS 1133 1133 RR2ET65JQ
BS 1134 1252 RR2AQ88JQ
BS 1253 1253 RR2ET65JQ
BS 1254 1345 RR2AQ88JQ
BS 1346 1346 RR2ET65JQ
BS 1347 1359 RR2AQ88JQ
BS 1360 1360 RR2ET65JQ
BS 1361 1446 RR2AQ88JQ

RD RR2ET65TF 665 0 0
GG
ATCTTCTTCATCGGTTGCCAAATCGGAGATGGCGACTTCTATGGTCTCTCCTCTTACTTC
ACAACTCAACCACGAAGCTCTATGTTCGAAGTCAGTGCTTCGCAACTCACCCTTCATGTC
GGGATGTACTAAGCTCTTCTCCTCGAACATGCCTTGCTCTTCTGTCCCTCAACGCACAAG
AAGATCACACTGCTTCGCTTCTGCTAAAAACATGAGCTTTGACCACATCCCCAAGCAGTT
TCGAGGAGACAATCTCAAAGATGGAGTGATGCAAAACTTCAAGAATGTACCGCAATATTT
CTACGGGCTTAATCCAGCTCAAATGGATATGTTCATGACCGAGGATAGCCCTGTCCGTAG
GCAAGCGGAAAAAGTTACTGAGGAAAGCATCTCGTCTAGAAGAAATTATTTAGACAACGG
AGGGACATGGAGTATGTCTGGTATGAACGCAGCAGATCCTAGAAGATATAGCATGAGTGT
CCAAATGTACAGAGGTGGAAGAGGAGGCGGTGGAGGATCTGCAAGACCAAGAACTGCTCC
CCCAGATTTGCCTTCTTTGCTCTTGGATGCTAGGATCTGCTACCTTGGCATGCCTATTGT
ACCTGCAGTTACTGAGTTACTCGTTGCACAGTTTATGTGGTTAGATTATGATAACCCAGC
AAA

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR2CM57TF 732 0 0
CTCAAAAACCCAATCCTTGGTCGTCTAGATCTTCATCTACTTCATCGGTTGCCAAATCGG
AGATGGCGAGTTCTATGGCCTCTCCTCTTACTTCACAACTCAACCACGAAGCTCTATGTT
CCAAGTCTGTGCTTCGCAAATCACCCTTCATGTCGGGATCTACTAAGCTCTTCTCCTCGA
ACATGCCTTGCTCTACTGTTCCTCAACGCACAAGAAGATCACACTGATTCGCTTCTGCTA
AAAACATGAGCTTTGACCACATCCCCAAGCAGTTTCGAGGAGACAACCTCAAAGATGGAG
TGATGCAAAACTTCAAGAATGTACCGCAATACTTCTACGGGCTTAATCCAGCTCAAATGG
ATATGTTCATGACCGAGGATAGCCCTGTCCGTAGGCAAGCGGAAAAAGTTACTGAGGAAA
GCATCTCGTCTAGAAGAAATTATTTAGACAATGGAGGGACATGGAGTATGTCTGGTATGA
ATGTAGCAGATCCTAGAAGATATAGGATGAGTGTCCAAATGTACAGAGGTGGAGGAGGCG
GCGGTGGAGGATCTCCGAGACCAAGAACTGCTCCTCCAGATTTGCCTTCTTTGCTCTTGG
ATGCTAGGATCTGCTATCTTGGCATGCCTATTGTACCTGCAGTTACTGAGTTACTCGTTG
CACAGTTTATGTGGTTAGACTATGATAACCCAGCAAAGCCCATCTATCTATACATAAACT
CACCTGGGACTC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2AQ88TF 847 0 0
GGGACAAGCAATCCCTAATTTGGCCTCAAAAACCCAATCCTTGGTCGTCTAGATCTTCAT
CTACTTCATCGGTTGCCAAATCGGAGATGGCGAGTTCTATGGCCTCTCCTCTTACTTCAC
AACTCAACCACGAAGCTCTATGTTCCAAGTCTGTGCTTCGCAAATCACCCTTCATGTCGG
GATCTACTAAGCTCTTCTCCTCGAACATGCCTTGCTCTACTGTTCCTCAACGCACAAGAA
GATCACACTGCTTCGCTTCTGCTAAAAACATGAGCTTTGACCACATCCCCAAGCAGTTTC
GAGGAGACAACCTCAAAGATGGAGTGATGCAAAACTTCAAGAATGTACCGCAATACTTCT
ACGGGCTTAATCCAGCTCAAATGGATATGTTCATGACCGAGGATAGCCCTGTCCGTAGGC
AAGCGGAAAAAGTTACTGAGGAAAGCATCTCGTCTAGAAGAAATTATTTAGACAATGGAG
GGACATGGAGTATGTCTGGTATGAATGTAGCAGATCCTAGAAGATATAGGATGAGTGTCC
AAATGTACAGAGGTGGAGGAGGCGGCGGTGGAGGATCTCCGAGACCAAGAACTGCTCCTC
CAGATTTGCCTTCTTTGCTCTTGGATGCTAGGATCTGCTATCTTGGCATGCCTATTGTAC
CTGCAGTTACTGAGTTACTCGTTGCACAGTTTATGTGGTTAGACTATGATAACCCAGCAA
AGCCCATCTATCTATACATAAACTCACCTGGGACTCAGAATGAGA*GATGGAGACTGTTG
GGTCAGAA*CAGAGGCTTACGCCATAGCTGACACCATTTCTTATTGCAAATCAGATGTAT
ACACAAT

QA 1 847 1 847
DS 

RD RR2ET65JQ 411 0 0
GAGCTGCCATAGACATGTGGATAAAGGCCAAGGAACTTGATGCAAATACTGAGTATTACA
TGGAGCTGTTAGCTAAGGGAACAGGTAAATCTAAAGAGCAGATCAACGAGGACATCAAGA
GGCCGAAATATCTCCAAGCACAAGCAGCCATTGACTATGGAGTCGCAGACAAGATAGCTG
ACTCTCAGGATAGTTCCTTTGAGAAACGGGATTACGATGGGTCTCTTGCCCAGAGAGCCA
TGGGAAGACCTGGAGGAGGCAATCCAACAGCTTCAGCAGGACTTAGATGATCAGTTAATT
CACACTTACAAATGTTTGAATCTCAATTTGCTTAGTCACTCTGGAATATGTAGCTGTTAC
AGTCTGTAAGCAAACACGTGTAGTATTAACATACAAAAGTGTTGGC
AAAAA

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR2HA58JQ 742 0 0
TCTGCTACCTTGGCATGCCTATTGTACCTGCAGTTACTGAGTTACTCGTTGCACAGTTTA
TGTGGTTAGATTATGATAACCCAGCAAAGCCCATCTATCTATACATAAACTCACCTGGGA
CTCAGAATGAGAAGATGGAGACTGTTGGGTCAGAAACAGAGGCTTACGCCATAGCTGACA
CCATTTCTTATTGCAAATCAGATGTATACACAATCAATTGTGGAATGGCTTTTGGTCAAG
CAGCAATGCTTCTTTCTCTTGGGAAAAAGGGTTATCGTGCCGTACAACCACATTCATCAA
CAAAACTATATCTGCCAAAAGTAAACAGATCGAGTGGAGCTGCCATAGACATGTGGATAA
AGGCCAAGGAACTTGATGCATATACTGAGTATTACATCGAGCTGTTAGCTAAGGGAACAG
GTAAATCTAAAGAGCAGATCAACGAGGACATCAAGAGGCCGAAATATCTCCAAGCACAAG
CAGCCATTGACTATGGAGTCGCAGACAAGATAGCTGACTCTCAGGATAGTTCCTTTGAGA
AACGGGATTACGATGGGTCTCTTGCCCAGAGAGCCATGGGAAGACCTGGAGGAGGCAATC
CAACAGCTTCAGCAGGACTTAGATGATCAGTTAATTCACACTTACAAATGTTTGAATCTC
AATTTGCTTAGTCACTCTGGAATATGTAGCTGTTACAGTCTGTAAGCAAACACGTGTAGT
ATTAACATACAAAAGTGTTGGC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2AQ88JQ 833 0 0
TTTGCTCTTGGATGCTAGGATCTGCTATCTTGGCATGCCTATTGTACCTGCAGTTACTGA
GTTACTCGTTGCACAGTTTATGTGGTTAGACTATGATAACCCAGCAAAGCCCATCTATCT
ATACATAAACTCACCTGGGACTCAGAATGAGAAGATGGAGACTGTTGGGTCAGAAACAGA
GGCTTACGCCATAGCTGACACCATTTCTTATTGCAAATCAGATGTATACACAATCAATTG
TGGAATGGCTTTTGGTCAAGCAGCAATGCTTCTTTCTCTTGGGAAAAAGGGTTATCGTGC
CGTACAACCACATTCATCAACAAAACTATATCTGCCAAAAGTAAACAGATCGAGTGGAGC
TGCCATAGACATGTGGATAAAGGCCAAGGAACTTGATGCAAATACTGAGTATTACATCGA
GCTGTTAGCTAAGGGAACAGGTAAAACTAAAGAGCAGATCAACGAGGACATCAAGCGACC
GAAATATCTCCAAGCACAAGCAGCCATTGACTATGGAGTAGCAGACAAGATAGCTGACTC
TCAGGATAGTTCCTTTGAGAAACGGGATTACGATGGGTCTCTTGCCCAGAGAGCCATGGG
AAGACCTGGAGGAGGCAATCCAACAGCTTCAGCAGGACTAAGATGATCAGTTAATTCACA
CTTACAAATGTTTGAATCTCAATTTGCTTAGTCACTCTGGAATATGTAGCTGTTACAGTC
TGTAAGCAAACATGTGTAGTATTAACGTACAAAAGTGTTGGCAAAAAGGATTTTTTCTGT
TTTCCAAGGAAGTTTGGTAGTCAATTTCTTAATGAAAATAAAGACCGATTCTT

QA 1 833 1 833
DS 



AS 2 6

CO CL1206Contig1 838 4 10 U
GGGAGAACGTAACGATAGTAAGGTGAAACAACCATGGCGTCGAAGATTCTCTCAGCCATA
GTCTTTGTGTTCAACCTTGTTGCCTTTGGTCTAGCCGTCGCTGCTGAACAAAGACGAAGC
ACTGCAAAGGTTGTGCAGGACACTGAGGTGCAGTACAACTATTGTGTGTATGATTCGGAC
AGAGCCACAGGGTATGGAGTTGGAGCCTTTTTGTTCTCGTTGGCTAGTCAACTTCTTATC
ATGCTCGTTAGCCGCTGCTTCTGTTGTGGCAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCGCGCGCT
CTTGCCCTCGTTCTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTAATAGCGGAGATATGTCTA
TTAGCTGGATCGGTAGAGAATGCATACCACACCAAGTACAGGACAATGTTCATGGACAAT
CCTCCTGATTGTCAAACTCTTCGTAAGGGTGTCTTCGCTGCGGGTGCCTCCTTTGTCTTC
TTCAACGCCATTGTTCCTCAGTTCTATTATTTCTTCTACTCCTCTGCTGCTGCCGCCTCC
CTCTCGCCTTACTAGGGGATTTGAACCAACAAAAATAAGTTTGTTTATTTTGTGTTATGT
GATATCATACTAATGTCATATTTTGGGCCTGTTGCTTGTTAAAGTATATGACTGCAAAAT
TACTTGAAGTTGAGGGTACGACTATGAGTTTTGTAGATGCATGTGTATGGATATTGAATT
GAAATGTTGTTCTTAAAAAGCTGATTAATGTGGTTTTATGATACCAAACAAAAAAAACTC
AGTGTGCTAGACTGCTATATGTTATATTTGTTAATTCAACACATGTTACAAGTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ58TF U 8
AF RR2D116TF U 1
AF RR2DZ58JQ C 89
AF RR2D116JQ C 2
BS 1 495 RR2D116TF
BS 496 496 RR2DZ58TF
BS 497 658 RR2D116TF
BS 659 659 RR2D116JQ
BS 660 730 RR2D116TF
BS 731 731 RR2D116JQ
BS 732 738 RR2D116TF
BS 739 739 RR2D116JQ
BS 740 758 RR2D116TF
BS 759 838 RR2D116JQ

RD RR2DZ58TF 708 0 0
G
GTAACGATAGTAAGGTGAAACAACCATGGCGTCGAAGATTCTCTCAGCCATAGTCTTTGT
GTTCAACCTTGTTGCCTTTGGTCTAGCCGTCGCTGCTGAACAAAGACGAAGCACTGCAAA
GGTTGTGCAGGACACTGAGGTGCAGTACAACTATTGTGTGTATGATTCGGACAGAGCCAC
AGGGTATGGAGTTGGAGCCTTTTTGTTCTCGTTGGCTAGTCAACTTCTTATCATGCTCGT
TAGCCGCTGCTTCTGTTGTGGCAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCGCGCGCTCTTGCCCT
CGTTCTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTAATAGCGGAGATATGTCTATTAGCTGG
ATCGGTAGAGAATGCATACCACACCAAGTACAGGACAATGTTCATGGACAATCCTCCTGA
TTGTCAAACTCTTCGTAAGGGTGTCTTCGCTGCGGGTGCCTCCTTTGTCTTCTTCAGCGC
CATTGTTCCTCAGTTCTATTATTTCTTCTACTCCTCTGCTGCTGCCGCCTCCCTCTCGCC
TTACTAGGGGATTTGAACCAGCAAAAATAAGTTTGTTTATTTTGTGTTATGTGATATCAT
ACTAATGTCATATTTTGGGCCTGTTGCTTGTTAAAGTATATGACTGCAAA*TTACTTGA*
GTTGAGG*TACGACTATGAGTTT*GTAGATGCATGTGTATG
ATATGA

QA 2 702 2 702
DS 

RD RR2D116TF 776 0 0
GGGAGAACGTAACGATAGTAAGGTGAAACAACCATGGCGTCGAAGATTCTCTCAGCCATA
GTCTTTGTGTTCAACCTTGTTGCCTTTGGTCTAGCCGTCGCTGCTGAACAAAGACGAAGC
ACTGCAAAGGTTGTGCAGGACACTGAGGTGCAGTACAACTATTGTGTGTATGATTCGGAC
AGAGCCACAGGGTATGGAGTTGGAGCCTTTTTGTTCTCGTTGGCTAGTCAACTTCTTATC
ATGCTCGTTAGCCGCTGCTTCTGTTGTGGCAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCGCGCGCT
CTTGCCCTCGTTCTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTAATAGCGGAGATATGTCTA
TTAGCTGGATCGGTAGAGAATGCATACCACACCAAGTACAGGACAATGTTCATGGACAAT
CCTCCTGATTGTCAAACTCTTCGTAAGGGTGTCTTCGCTGCGGGTGCCTCCTTTGTCTTC
TTCAACGCCATTGTTTCTCAGTTCTATTATTTCTTCTACTCCTCTGCTGCTGCCGCCTCC
CTCTCGCCTTACTAGGGGATTTGAACCAACAAAAATAAGTTTGTTTATTTTGTGTTATGT
GATATCATACTAATGTCATATTTTGGGCCTGTTGCTTGTTAAAGTATATGACTGCAAA*T
TACTTGAAGTTGAGGGTACGACTATGAGTTTTGTAGATGCATGTGTATGGATATTGAATT
GAAATGTTGT*CTTAAAA*GCTGATTAATGTGGTTTTA
TGATACCAAACAAAAAAA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2DZ58JQ 646 0 0
GTCTAGCCGTCGCTGCTGAACAAAGACGAAGCACTGCAAAGGTTGTGCAGGACACTGAGG
TGCAGTACAACTATTGTGTGTATGATTCGGACAGAGCCACAGGGTATGGAGTTGGAGCCT
TTTTGTTCTCGTTGGCTAGTCAACTTCTTATCATGCTCGTTAGCCGCTGCTTCTGTTGTG
GCAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCGCGCGCTCTTGCCCTCGTTCTCTTCATTGTCAGCT
GGATGTTCTTCTTAATAGCGGAGATATGTCTATTAGCTGGATCGGTAGAGAATGCATACC
ACACCAAGTACAGGACAATGTTCATGGACAATCCTCCTGATTGTCAAACTCTTCGTAAGG
GTGTCTTCGCTGCGGGTGCCTCCTTTGTCTTCTTCAGCGCCATTGTTCCTCAGTTCTATT
ATTTCTTCTACTCCTCTGCTGCTGCCGCCTCCCTCTCGCCTTACTAGGGGATTTGAACCA
GCAAAAATAAGTTTGTTTATTTTGTGTTATGTGATATCATACTAATGTCATATTTTGGGC
CTGTTGCTTGTTAAAGTATATGACTGCAAAATTACTTGAAGTTGAGGGTACGACTATGAG
TTTTGTAGATGCATGTGTATGGATATTGAATTGAAATGTTGT
TCTC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2D116JQ 837 0 0
GGAGAAC
GTAACGATAGTAAGGTGAAACAACCATGGCGTCGAAGAT*CTCTCAGCCATAGTCTTTGT
GTTCAAC*TTGTTGCCTTTGGTCTAGCCGTCGCTGCTGAACAAAGACGAAGCACTGCAAA
GGTTGTGCAGGACACTGAGGTGCAGTACAACTATTGTGTGTATGATTCGGACAGAGCCAC
AGGGTATGGAGTTGGAGCCTTTTTGTTCTCGTTGGCTAGTCAACTTCTTATCATGCTCGT
TAGCCGCTGCTTCTGTTGTGGCAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCGCGCGCTCTTGCCCT
CGTTCTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTAATAGCGGAGATATGTCTATTAGCTGG
ATCGGTAGAGAATGCATACCACACCAAGTACAGGACAATGTTCATGGACAATCCTCCTGA
TTGTCAAACTCTTCGTAAGGGTGTCTTCGCTGCGGGTGCCTCCTTTGTCTTCTTCAACGC
CATTGTTTCTCAGTTCTATTATTTCTTCTACTCCTCTGCTGCTGCCGCCTCCCTCTCGCC
TTACTAGGGGATTTGAACCAACAAAAATAAGTTTGTTTATTTTGTGTTATGTGATATCAT
ACTAATGTCATATTTTGGGCCTGTTGCTTGTTAAAGTATATGACTGCAAAATTACTTGAA
GTTGAGGGTACGACTATGAGTTTTGTAGATGCATGTGTATGGATATTGAATTGAAATGTT
GTTCTTAAAAAGCTGATTAATGTGGTTTTATGATACCAAACAAAAAAAACTCAGTGTGCT
AGACTGCTATATGTTATATTTGTTAATTCAACACATGTTACAAGTTTTAT

QA 8 837 8 837
DS 



CO CL1206Contig2 850 2 10 U
GGGTAACGATAGTAAGGTGAAACAACCATGGCGTCGAAGATTCTCTCAGCCATAGTCTTT
GTGTTCGACCTTGTTGCCTTTGGTCTAGCCGTCGCTGCTGAACAAAGACGAAGCACTGCA
AAGGTTGTGCAGGACACTGAGGTGCAGTACAACTATTGTGTGTATGATTCGGACAGAGCC
ACAGGGTATGGAGTTGGAGCCTTTTTGTTCTCGTTGGCTAGTCAACTTCTTATCATGCTC
GTTAGCCGCTGCTTCTGTTGTGGCAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCGCGCGCTCTTGCC
CTCGTTCTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTAATAGCGGAGATATGTCTATTAGCT
GGATCGGTAGAGAATGCATACCACACCAAGTACAGGACAATGTTCATGGACAATCCTCCT
GATTGTCAAACTCTTCGTAAGGGTGTCTTCGCTGCGGGTGCCTCCTTTGTCTTCTTCAAC
GCCATTGTTTCTCAGTTCTATTATTTCTTCTACTCCTCTGCTGCTGCCGCTCCCCTCTCG
CCTTACTAGAGGATTTGAAAAAATAAGTTTGTTTATTTCTTATGTGTTATGTAATATCAT
ACTAATGTCATATCTTGGGCCTGTTGCTTGTTAAAGTATATGACTGCAAAATTACTTGAA
GTTGAAGGTACGACTATGAGTTTTGTTAGATGGATTTGTATGGATATTGAATTGAAATGT
TGTTCTTAAAAAGCTGATGTAGTGTGGTTTTTACCAAACAAGAAAAAAAACTCAGTGTGC
TAGACTGCTATATGTTATATTTGTTAATTCAACACATGTTACAAGTTTTATAAATGCAAC
TAATAGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH27TF U 1
AF RR2FH27JQ C 38
BS 1 667 RR2FH27TF
BS 668 668 RR2FH27JQ
BS 669 716 RR2FH27TF
BS 717 717 RR2FH27JQ
BS 718 723 RR2FH27TF
BS 724 724 RR2FH27JQ
BS 725 731 RR2FH27TF
BS 732 732 RR2FH27JQ
BS 733 751 RR2FH27TF
BS 752 850 RR2FH27JQ

RD RR2FH27TF 765 0 0
GGGTAACGATAGTAAGGTGAAACAACCATGGCGTCGAAGATTCTCTCAGCCATAGTCTTT
GTGTTCGACCTTGTTGCCTTTGGTCTAGCCGTCGCTGCTGAACAAAGACGAAGCACTGCA
AAGGTTGTGCAGGACACTGAGGTGCAGTACAACTATTGTGTGTATGATTCGGACAGAGCC
ACAGGGTATGGAGTTGGAGCCTTTTTGTTCTCGTTGGCTAGTCAACTTCTTATCATGCTC
GTTAGCCGCTGCTTCTGTTGTGGCAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCGCGCGCTCTTGCC
CTCGTTCTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTAATAGCGGAGATATGTCTATTAGCT
GGATCGGTAGAGAATGCATACCACACCAAGTACAGGACAATGTTCATGGACAATCCTCCT
GATTGTCAAACTCTTCGTAAGGGTGTCTTCGCTGCGGGTGCCTCCTTTGTCTTCTTCAAC
GCCATTGTTTCTCAGTTCTATTATTTCTTCTACTCCTCTGCTGCTGCCGCTCCCCTCTCG
CCTTACTAGAGGATTTGAAAAAATAAGTTTGTTTATTTCTTATGTGTTATGTAATATCAT
ACTAATGTCATATCTTGGGCCTGTTGCTTGTTAAAGTATATGACTGCAAAATTACTTGAA
GTTGAAG*TACGACTATGAGTTTTGTTAGATGGATTTGTATGGATATTGAATTGAA*TGT
TGT*CTTAAAA*GCTGATGTAGTGTGGTTTT
ACAAACAGAAAAAA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2FH27JQ 813 0 0
GAGA
TCTCTCAGCCATAGTCTTT*TGTTCGACCTTGTTGCCTTTG*TCTAGCCGTCGCTGCTGA
ACAAAGACGAAGCACTGCAAAGGTTGTGCAGGACACTGAGGTGCAGTACAACTATTGTGT
GTATGATTCGGACAGAGCCACAGGGTATGGAGTTGGAGCCTTTTTGTTCTCGTTGGCTAG
TCAACTTCTTATCATGCTCGTTAGCCGCTGCTTCTGTTGTGGCAAGCCTCTCAAGCCTGG
TGGTTCGCGCGCTCTTGCCCTCGTTCTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTAATAGC
GGAGATATGTTTATTAGCTGGATCGGTAGAGAATGCATACCACACCAAGTACAGGACAAT
GTTCATGGACAATCCTCCTGATTGTCAAACTCTTCGTAAGGGTGTTTTCGCTGCGGGTGC
CTCCTTTGTCTTTTTCAACGCCATTGTTTCTCAGTTCTATTATTTTTTCTACTCCTCTGC
TGCTGCCGCTCCCCTCTCGCCTTACTAGAGGATTTGAAAAAATAAGTTTGTTTATTTCTT
ATGTGTTATGTAATATCATACTAATGTCATATCTTGGGCCTGTTGCTTGTTAAAGTATAT
GACTGCAAAATTACTTGAAGTTGAAGGTACGACTATGAGTTTTGTTAGATGGATTTGTAT
GGATATTGAATTGAAATGTTGTTCTTAAAAAGCTGATGTAGTGTGGTTTTTACCAAACAA
GAAAAAAAACTCAGTGTGCTAGACTGCTATATGTTATATTTGTTAATTCAACACATGTTA
CAAGTTTTATAAATGCAACTAATAGTTGT

QA 5 813 5 813
DS 



AS 1 6

CO CL1207Contig1 612 6 8 U
GGATCGTGGCCTTTAGGGTTTCTAACACTGAACCTCGAAAGACTATCGGACCTCGATAGC
CAGAGACTTGATTCACCGAAGAG*AGAGAGAGAGTGAGAGGAGAAGAGTTAGAAGCAATG
GAGGGAGGAGAAGAAGCTGGAGCGGAGATAATGGTTGATTCAAAGGACTTACAGCAACAA
AGCAAAGCTTTAGACAAGCTTACCGATCGCGTCGAGGATCGCCAGCTCGATTCTAATCGT
GTTCAATCGGCTATGGCTTCGATTGCTGCTTCTAGAGAGGCTGATCTGAATGCTAAGAGA
TTGAGGGAGAAGGAACTGGCTTCTGTTAAGATCAATGCTGCAGATGTTGAGCTCATTGTA
AACGAACTCGAGCTGGAGAAGAATGTTGTGGAGAGAACTCTAAGGGAGCACAAAGGCGAT
GCAGTTGCTGCAACTAGGGAATTGCTTTCTCGATATCCACTTTGATCGATCATTACCTGC
TTTACTTCTTGCAGTTTCTTTTGTCTGTGTAAGGTGTCCGAATATTCAACTCATGTTTGA
AGTTTCCGTACTAAACTTATGAGATATTATTGCAACAGTGGCACATGCTAAAAGCAAGAC
AATAATAAGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 30 30 40 40 40 
40 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 40 10 40 40 40 10 40 40 10 10 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DM83JQ C 1
AF RR2DM83TF U 1
AF RR2GV28JQB C 56
AF RR2GV28TF U 56
AF RR2BO18JQ C 54
AF RR2BO18TF U 54
BS 1 54 RR2DM83TF
BS 55 55 RR2BO18TF
BS 56 256 RR2DM83TF
BS 257 257 RR2GV28TF
BS 258 536 RR2DM83TF
BS 537 537 RR2GV28TF
BS 538 573 RR2DM83TF
BS 574 612 RR2BO18TF

RD RR2DM83JQ 572 0 0
GGATCGTGGCCTTTAGGGTTTCTAACACTGAACCTCGAAAGACTATCGGACCTCTATAGC
CAGAGACTTGATTCACCGAAGAG*AGAGAGAGAGTGAGAGGAGAAGAGTTAGAAGCAATG
GAGGGAGGAGAAGAAGCTGGAGCGGAGATAATGGTTGATTCAAAGGACTTACAGCAACAA
AGCAAAGCTTTAGACAAGCTTACCGATCGCGTCGAGGATCGCCAGCTCGATTCTAATCGT
GTTCAATCGGCTATGGTTTCGATTGCTGCTTCTAGAGAGGCTGATCTGAATGCTAAGAGA
TTGAGGGAGAAGGAACTGGCTTCTGTTAAGATCAATGCTGCAGATGTTGAGCTCATTGTA
AACGAACTCGAGCTGGAGAAGAATGTTGTGGAGAGAACTCTAAGGGAGCACAAAGGCGAT
GCAGTTGCTGCAACTAGGGAATTGCTTTCTCGATATCCACTTTGATCGATCATTACCTGC
TTTACTTCTTGCAGTTTCTTTTGTCTGTGTAAGGTGTCCGAATATTCAACTCATGTCTGA
AGTTTCCGTACTAAACTTATGAGATATTATTG

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2DM83TF 573 0 0
GGATCGTGGCCTTTAGGGTTTCTAACACTGAACCTCGAAAGACTATCGGACCTCTATAGC
CAGAGACTTGATTCACCGAAGAG*AGAGAGAGAGTGAGAGGAGAAGAGTTAGAAGCAATG
GAGGGAGGAGAAGAAGCTGGAGCGGAGATAATGGTTGATTCAAAGGACTTACAGCAACAA
AGCAAAGCTTTAGACAAGCTTACCGATCGCGTCGAGGATCGCCAGCTCGATTCTAATCGT
GTTCAATCGGCTATGGTTTCGATTGCTGCTTCTAGAGAGGCTGATCTGAATGCTAAGAGA
TTGAGGGAGAAGGAACTGGCTTCTGTTAAGATCAATGCTGCAGATGTTGAGCTCATTGTA
AACGAACTCGAGCTGGAGAAGAATGTTGTGGAGAGAACTCTAAGGGAGCACAAAGGCGAT
GCAGTTGCTGCAACTAGGGAATTGCTTTCTCGATATCCACTTTGATCGATCATTACCTGC
TTTACTTCTTGCAGTTTCTTTTGTCTGTGTAAGGTGTCCGAATATTCAACTCATGTCTGA
AGTTTCCGTACTAAACTTATGAGATATTATTGC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2GV28JQB 518 0 0
GG
AGCCAGAGACTTGATTCACCGAAGAG*AGAGAGAG**TGAGAGGAGAAGAGTTAGAAGCA
ATGGAGGGAGGAGAAGAAGCTGGAGCGGAGATAATGGTTGATTCAAAGGACTTACAGCAA
CAAAGCAAAGCTTTAGACAAGCTTACCGATCGCGTCGAGGATCGCCAGCTCGATTCTAAT
CGTGTTCAATCGGCTATGGCTTCGATTGCTGCTTCTAGAGAGGCTGATCTGAATGCTAAG
AGATTGAGGGAGAAGGAACTGGCTTCTGTTAAGATCAATGCTGCAGATGTTGAGCTCATT
GTAAACGAACTCGAGCTGGAGAAGAATGTTGTGGAGAGAACTCTAAGGGAGCACAAAGGC
GATGCAGTTGCTGCAACTAGGGAATTGCTTTCTCGATATCCACTTTGATCGATCATTACC
TGCTTTACTTCTTGCAGTTTCTTTTGTCTGTGTAAGGTGTCCGAATATTCAACTCATGTT
TGAAGTTTCCGTACTAAACTTATGAGATATTATTGC

QA 3 518 3 518
DS 

RD RR2GV28TF 518 0 0
GG
AGCCAGAGACTTGATTCACCGAAGAG*AGAGAGAG**TGAGAGGAGAAGAGTTAGAAGCA
ATGGAGGGAGGAGAAGAAGCTGGAGCGGAGATAATGGTTGATTCAAAGGACTTACAGCAA
CAAAGCAAAGCTTTAGACAAGCTTACCGATCGCGTCGAGGATCGCCAGCTCGATTCTAAT
CGTGTTCAATCGGCTATGGCTTCGATTGCTGCTTCTAGAGAGGCTGATCTGAATGCTAAG
AGATTGAGGGAGAAGGAACTGGCTTCTGTTAAGATCAATGCTGCAGATGTTGAGCTCATT
GTAAACGAACTCGAGCTGGAGAAGAATGTTGTGGAGAGAACTCTAAGGGAGCACAAAGGC
GATGCAGTTGCTGCAACTAGGGAATTGCTTTCTCGATATCCACTTTGATCGATCATTACC
TGCTTTACTTCTTGCAGTTTCTTTTGTCTGTGTAAGGTGTCCGAATATTCAACTCATGTT
TGAAGTTTCCGTACTAAACTTATGAGATATTATTGC

QA 3 518 3 518
DS 

RD RR2BO18JQ 559 0 0
GGATAGCCGGAGTCTTGATTCACCGAAACTCAAAGAAAGAGAGAGAGTAGAAGAGGTAGA
AGCAATGGAGGGAGCAGAAGAAGCTGGAGCGGAGATAATGGTTGATTCAAAGGACTTACA
GCAACAAAGCAAAGCTTTAGACAAGCTTACCGATCGCGTTGAGGATCGCCAGCTCGATTC
TAATCGTGTTCAATCGGCTATGGCTTCGATTGCTGCTTCTAGAGAGGCTGATCTGAATGC
TAAGAGATTGAGGGAGAAGGAACTGGCTTCTGTTAAGATCAATGCTGCAGATGTTGAGCT
CATTGTAAACGAACTCGAGCTGGAGAAGAATGTTGTGGAGAGAACTCTAAGGGAGCACAA
AGGCGATGCAGTTGCTGCAACTAGGGAATTGCTTTCTCGATATCCACTTTGATCGATCAT
TACCTGCTTTACTTCTTGCAGTTTCTTTTGTCTGTGTAAGGTGTCCGAATATTCAACTCA
TGTTTGAAGTTTCCGTACTAAACTTATGAGATATTATTGCAACAGTGGCACATGCTAAAA
GCAAGACAATAATAAGTTT

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2BO18TF 559 0 0
GGATAGCCGGAGTCTTGATTCACCGAAACTCAAAGAAAGAGAGAGAGTAGAAGAGGTAGA
AGCAATGGAGGGAGCAGAAGAAGCTGGAGCGGAGATAATGGTTGATTCAAAGGACTTACA
GCAACAAAGCAAAGCTTTAGACAAGCTTACCGATCGCGTTGAGGATCGCCAGCTCGATTC
TAATCGTGTTCAATCGGCTATGGCTTCGATTGCTGCTTCTAGAGAGGCTGATCTGAATGC
TAAGAGATTGAGGGAGAAGGAACTGGCTTCTGTTAAGATCAATGCTGCAGATGTTGAGCT
CATTGTAAACGAACTCGAGCTGGAGAAGAATGTTGTGGAGAGAACTCTAAGGGAGCACAA
AGGCGATGCAGTTGCTGCAACTAGGGAATTGCTTTCTCGATATCCACTTTGATCGATCAT
TACCTGCTTTACTTCTTGCAGTTTCTTTTGTCTGTGTAAGGTGTCCGAATATTCAACTCA
TGTTTGAAGTTTCCGTACTAAACTTATGAGATATTATTGCAACAGTGGCACATGCTAAAA
GCAAGACAATAATAAGTTT

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 5

CO CL1208Contig1 949 5 8 U
GGATCCTCCGAGCAGCAACTGAGAGAGAGTGATAACCATGGCGACGAGCTCTCATCTTCT
TCTTCCTCCTCAGGCATTGCATATGATGCCGACGCAGCCATCGAAGAAACTAGGGTTTTC
GCCGTTTCTATCATGCGCACCTTCGATGCAACCTATTCTATCGATCTCAAGGCTTTCTCT
TACTCACTCCAAATCTAGCTTCTCACTCGATACTAAGGCGAGACGAGAGGTTCTCGTTAG
AGCAGAAGGCGAAGGTGAAGGTGAAGGCGAACCAGAGGAAGCTGTTGATGCTATCGCTGC
TACGGAGGTTAATGTAGAGGATGTTGTCGAAGCTACTGAAGCAAAAGCTCCAAGAAAGCC
GAGAGTCAAGCTGGGAGACGTAATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTATCAGA
GAAAGTGAGACCTGTTCCTGAAATCAGGACTGGAGATATCGTTGAGATCAAACTGGAAGT
TCCTGAGAACAGACGGAGGTTGTCTATCTACAAAGGCATTGTGATGTCTAGACAGAACGC
TGGCATACACACTACCATTCGTATTCGCAGGATTATTGCTGGTATCGGTGTTGAAATCGT
GTTTCCATTATACTCTCCCAACATCAAAGAGATAAAAGTGGTGAGTCACAGAAAAGTGAG
AAGAGCAAGGCTTTACTACCTGAGGGACAAGCTTCCCCGTCTCTCCACTTTCAAGTGAAC
ACCACCCCACTCTGCTGTGTTTGACCCAACCAAAAGGTAGTAATCTTCCCTTGTGTTCTC
TTTTCTTGTAAGAATTGTTCTTTTCTGTTTTCTTTTGTTTAAGCTTGTAAGTCATGGCAT
GCACATTCTTCCGAGAAAGTAAAATCAAGATTAGTCGAGATTCCGTTTGGTTGAATGTAG
ACCTGGTCCTTGTTTGATAATGAAATGATATATGACCCTTTTAGGACTT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 0 15 0 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2A115TF U 2
AF RR2AC88TF U 1
AF RR2DJ51TF U 1
AF RR2CP09JQ C 157
AF RR2AC88JQ C 330
BS 1 83 RR2AC88TF
BS 84 84 RR2DJ51TF
BS 85 746 RR2AC88TF
BS 747 747 RR2CP09JQ
BS 748 756 RR2DJ51TF
BS 757 757 RR2CP09JQ
BS 758 773 RR2DJ51TF
BS 774 949 RR2CP09JQ

RD RR2A115TF 676 0 0
GGA
CCTCCGAGCAGCAACTGAGAGAGAGTGATAACCATGGCGACGAGCTCTCATCTTCTTCTT
CCTCCTCAGGCATTGCATATGATGCCGACGCAGCCATCGAAGAAACTAGGGTTTTCGCCG
TTTCTATCATGCGCACCTTCGATGCAACCTATTCTATCGATCTCAAGGCTTTCTCTTACT
CACTCCAAATCTAGCTTCTCACTCGATACTAAGGCGAGACGAGAGGTTCTCGTTAGAGCA
GAAGGCGAAGGTGAAGGTGAAGGCGAACCAGAGGAAGCTGTTGATGCTATCGCTGCTACG
GAGGTTAATGTAGAGGATGTTGTCGAAGCTACTGAAGCAAAAGCTCCAAGAAAGCCGAGA
GTCAAGCTGGGAGACGTAATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTATCAGAGAAA
GTGAGACCTGTTCCTGAAATCAGGACTGGAGATATCGTTGAGATCAAACTGGAAGTTCCT
GAGAACAGACGGAGGTTGTCTATCTACAAAGGCATTGTGATGTCTAGACAGAACGCTGGC
ATACACACTACCATTCGTATTCGCAGGATTATTGCTGGTATCGGTGTTGAAATCGTGTTT
CCATTATACTCTCCCAACATCAAAGAGATAAAAGTGGTGAGTCACAGAAAAGTGAGAAGA
GCAAGGCTTTACT

QA 4 676 4 676
DS 

RD RR2AC88TF 752 0 0
GGATCCTCCGAGCAGCAACTGAGAGAGAGTGATAACCATGGCGACGAGCTCTCATCTTCT
TCTTCCTCCTCAGGCATTGCATACGATGCCGACGCAGCCATCGAAGAAACTAGGGTTTTC
GCCGTTTCTATCATGCGCACCTTCGATGCAACCTATTCTATCGATCTCAAGGCTTTCTCT
TACTCACTCCAAATCTAGCTTCTCACTCGATACTAAGGCGAGACGAGAGGTTCTCGTTAG
AGCAGAAGGCGAAGGTGAAGGTGAAGGCGAACCAGAGGAAGCTGTTGATGCTATCGCTGC
TACGGAGGTTAATGTAGAGGATGTTGTCGAAGCTACTGAAGCAAAAGCTCCAAGAAAGCC
GAGAGTCAAGCTGGGAGACGTAATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTATCAGA
GAAAGTGAGACCTGTTCCTGAAATCAGGACTGGAGATATCGTTGAGATCAAACTGGAAGT
TCCTGAGAACAGACGGAGGTTGTCTATCTACAAAGGCATTGTGATGTCTAGACAGAACGC
TGGCATACACACTACCATTCGTATTCGCAGGATTATTGCTGGTATCGGTGTTGAAATCGT
GTTTCCATTATACTCTCCCAACATCAAAGAGATAAAAGTGGTGAGTCACAGAAAAGTGAG
AAGAGCAAGGCTTTACTACCTGAGGGACAAGCTTCCCCGTCTCTCCACTTTCAAGTGAAC
ACCACCCCACTCTGCTGTGTTTGACC
CAACCA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2DJ51TF 773 0 0
GGAT
CCTCCGAGCAGCAACTGAGAGAGAGTGATAACCATGGCGACGAGCTCTCATCTTCTTCTT
CCTCCTCAGGCATTGCATATGATGCCGACGCAGCCATCGAAGAAACTAGGGTTTTCGCCG
TTTCTATCATGCGCACCTTCGATGCAACCTATTCTATCGATCTCAAGGCTTTCTCTTACT
CACTCCAAATCTAGCTTCTCACTCGATACTAAGGCGAGACGAGAGGTTCTCGTTAGAGCA
GAAGGCGAAGGTGAAGGTGAAGGCGAACCAGAGGAAGCTGTTGATGCTATCGCTGCTACG
GAGGTTAATGTAGAGGATGTTGTCGAAGCTACTGAAGCAAAAGCTCCAAGAAAGCCGAGA
GTCAAGCTGGGAGACGTAATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTATCAGAGAAA
GTGAGACCTGTTCCTGAAATCAGGACTGGAGATATCGTTGAGATCAAACTGGAAGTTCCT
GAGAACAGACGGAGGTTGTCTATCTACAAAGGCATTGTGATGTCTAGACAGAACGCTGGC
ATACACACTACCATTCGTATTCGCAGGATTATTGCTGGTATCGGTGTTGAAATCGTGTTT
CCATTATACTCTCCCAACATCAAAGAGATAAAAGTGGTGAGTCACAGAAAAGTGAGAAGA
GCAAGGCTTTACTACCTGAGGGACAAGCTTCCCCGTCTCTCCACTTTCAAGTGAACACCA
CCCCACTCTGCTGTGTTTGACC*AACCAAAAG*TAGTAATCTTCCCTTG

QA 5 773 5 773
DS 

RD RR2CP09JQ 793 0 0
TCTATCGATCTCAAGGCTTTCTCTTACTCACTCCAAATCTAGCTTCTCACTCGATACTAA
GGCGAGACGAGAGGTTCTCGTTAGAGCAGAAGGCGAAGGTGAAGGTGAAGGCGAACCAGA
GGAAGCTGTTGATGCTATCGCTGCTACGGAGGTTAATGTAGAGGATGTTGTCGAAGCTAC
TGAAGCAAAAGCTCCAAGAAAGCCGAGAGTCAAGCTGGGAGACGTAATGGGGATACTGAA
CCAGAAAGCAATTGTGGTATCAGAGAAAGTGAGACCTGTTCCTGAAATCAGGACTGGAGA
TATCGTTGGGATCAAACTGGAAGTTCCTGAGAACAGACGGAGGTTGTCTATCTACAAAGG
CATTGTGATGTCTAGACAGAACGCTGGCATACACACTACCATTCGTATTCGCAGGATTAT
TGCTGGTATCGGTGTTGAAATCGTGTTTCCATTATACTCTCCCAACATCAAAGAGATAAA
AGTGGTGAGTCACAGAAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTACTACCTGAGGGACAAGCTTCC
CCGTCTCTCCACTTTCAAGTGAACACCACCCCACTCTGCTGTGTTTGACCCAACCAAAAG
GTAGTAATCTTCCCTTGTGTTCTCTTTTCTTGTAAGAATTGTTCTTTTCTGTTTTCTTTT
GTTTAAGCTTGTAAGTCATGGCATGCACATTCTTCCGAGAAAGTAAAATCAAGATTAGTC
GAGATTCCGTTTGGTTGAATGTAGACCTGGTCCTTGTTTGATAATGAAATGATATATGAC
CCTTTTAGGACTT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2AC88JQ 616 0 0
AAGCTACTGAAGCAAAAGCTCCAAGAAAGCCGAGAGTCAAGCTGGGAGACGTAATGGGGA
TACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTATCAGAGAAAGTGAGACCTGTTCCTGAAATCAGGA
CTGGAGATATCGTTGAGATCAAACTGGAAGTTCCTGAGAACAGACGGAGGTTGTTTATTT
ACAAAGGCATTGTGATGTTTAGACAGAACGCTGGCATACACACTACCATTTGTATTCGCA
GGATTATTGCTGGTATCGGTGTTGAAATCGTGTTTCCATTATACTCTCCCAACATCAAAG
AGATAAAAGTGGTGAGTCACAGAAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTACTACCTGAGGGACA
AGCTTCCCCGTCTTTCCACTTTCAAGTGAACACCCCCCCACTTTGCTGTGTTTGACCCAA
CCAAAAGGTAGTAATTTTCCCTTGTGTTTTTTTTTTTTGTAAGAATTGTTTTTTTTTGTT
TTTTTTTGTTTAAGCTTGTAAGTCATGGCATGCACATTTTTCCGAGAAAGTAAAATCAAG
ATTAGTCGAGATTCCGTTTGGTTGAATGTAGACCTGGTCCTTGTTTGATAATGAAATGAT
ATATGACCCTTTTAGG

QA 1 616 1 616
DS 



AS 3 6

CO CL1209Contig1 577 2 3 U
GGAAGAACAAGAACACAAACACAAAGCCAACACAAAAAAAAAAAACTCAACCAAAAAAAC
AAAGAAAGTTTTAAAAACAAATGGGGAAAGGAGGAAATTTTGTGACGGTGGCGGCTTCCG
AGGTGGAGGAGCTACGACGGAAGAACGGAGAGATGGAAAAAGCCGTGGAGGAAATGAGGA
ATCAGATGTTGCAGCTGTGGCGGCGGACGCAGGTGGCTGAGGAGGCCGAGGAGCGTCTCT
GCTCTCAGCTCGCCGAGCTCGAAGCCGAATCGCTCGACCAGGCGCGTGATTACCAATCTC
GCATCCTCTTCCTCGTGAACGAACTCTCTCGTCTCTCTTCCTCCGATTTGGCCTTGCCCT
AGATTGATAGACACATACGTACGTATGTATGTGTAAGGATAGATTATTAGACTGATATGC
ATTTATCTTAATTTACAATATTGGCTCATATCAATGCCAATCTGTAGAGTTTTTCGTTTT
TTTTCTTATTGTTTATAGATCTCAAATTTCTGTTTGGAAATTTTTAGTGTAAACAAAAAT
CCATGTTGTTATAAAAAAAAGGTAATGAAAGTCTTCG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AR88JQ C 1
AF RR2AR88TF U 1
BS 1 1 RR2AR88JQ
BS 2 575 RR2AR88TF
BS 576 577 RR2AR88JQ

RD RR2AR88JQ 577 0 0
GGAAGAACAAGAACACAAACACAAAGCCAACACAAAAAAAAAAAACTCAACCAAAAAAAC
AAAGAAAGTTTTAAAAACAAATGGGGAAAGGAGGAAATTTTGTGACGGTGGCGGCTTCCG
AGGTGGAGGAGCTACGACGGAAGAACGGAGAGATGGAAAAAGCCGTGGAGGAAATGAGGA
ATCAGATGTTGCAGCTGTGGCGGCGGACGCAGGTGGCTGAGGAGGCCGAGGAGCGTCTCT
GCTCTCAGCTCGCCGAGCTCGAAGCCGAATCGCTCGACCAGGCGCGTGATTACCAATCTC
GCATCCTCTTCCTCGTGAACGAACTCTCTCGTCTCTCTTCCTCCGATTTGGCCTTGCCCT
AGATTGATAGACACATACGTACGTATGTATGTGTAAGGATAGATTATTAGACTGATATGC
ATTTATCTTAATTTACAATATTGGCTCATATCAATGCCAATCTGTAGAGTTTTTCGTTTT
TTTTCTTATTGTTTATAGATCTCAAATTTCTGTTTGGAAATTTTTAGTGTAAACAAAAAT
CCATGTTGTTATAAAAAAAAGGTAATGAAAGTCTTCG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2AR88TF 577 0 0
G
GAAGAACAAGAACACAAACACAAAGCCAACACAAAAAAAAAAAACTCAACCAAAAAAACA
AAGAAAGTTTTAAAAACAAATGGGGAAAGGAGGAAATTTTGTGACGGTGGCGGCTTCCGA
GGTGGAGGAGCTACGACGGAAGAACGGAGAGATGGAAAAAGCCGTGGAGGAAATGAGGAA
TCAGATGTTGCAGCTGTGGCGGCGGACGCAGGTGGCTGAGGAGGCCGAGGAGCGTCTCTG
CTCTCAGCTCGCCGAGCTCGAAGCCGAATCGCTCGACCAGGCGCGTGATTACCAATCTCG
CATCCTCTTCCTCGTGAACGAACTCTCTCGTCTCTCTTCCTCCGATTTGGCCTTGCCCTA
GATTGATAGACACATACGTACGTATGTATGTGTAAGGATAGATTATTAGACTGATATGCA
TTTATCTTAATTTACAATATTGGCTCATATCAATGCCAATCTGTAGAGTTTTTCGTTTTT
TTTCTTATTGTTTATAGATCTCAAATTTCTGTTTGGAAATTTTTAGTGTAAACAAAAATC
CATGTTGTTATAAAAAAAAGGTAATGAAAGTCTT
CG

QA 2 575 2 575
DS 



CO CL1209Contig2 591 2 4 U
GGAAGAACAAGAACACAAACACAAAGCCAACACACAAAAAATAAAACTCAACCAAAAAAA
AACAAAGAAACTTTGAAAAACAAATGGGGAAAGGAGGAAATTTTGTGACGGTGACGGCTT
CTGAGGTGGAGGAGCTACGACGGAAGAACGGAGAGATGGAAAGAGCGGTGGAGGAAATGA
GGAAAGAGATGTTGCAGCTGTGGCGGCGGACGCAGGTGGCTGAGGAGGCCGAGGAGCGTC
TCTGCTCTCAGCTCGCCGAGCTCGAAGCCGAATCGCTCGACCAGGCGCGTGATTACCAAT
CTCGCATCCTCTTTCTCGTGAACGAACTATCTCGTCTCTCTTCCTCCGATTTGGCCTCGC
CCTAGATTGATAGACACATACGTATGTATGTATGTGTAAGGATAGATTCTTAGACTGATG
CATTTATCTTAATTTGCAATATTGGCTCATATCAATGCCAATCTGTAGAGTTTTTTTTTC
TTATTGTTTATAGATCTCAAATTTCTGCTTGGAAATTTTAGTGTAAACAAAAATCCATGT
TATAAAAAAAAGGAAAAGAAAGTCTTTGAAAATTAAAGCATTAAGTCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2BB33TF U 1
AF RR2BB33JQ C 490
BS 1 556 RR2BB33TF
BS 557 557 RR2BB33JQ
BS 558 589 RR2BB33TF
BS 590 591 RR2BB33JQ

RD RR2BB33TF 589 0 0
GGAAGAACAAGAACACAAACACAAAGCCAACACACAAAAAATAAAACTCAACCAAAAAAA
AACAAAGAAACTTTGAAAAACAAATGGGGAAAGGAGGAAATTTTGTGACGGTGACGGCTT
CTGAGGTGGAGGAGCTACGACGGAAGAACGGAGAGATGGAAAGAGCGGTGGAGGAAATGA
GGAAAGAGATGTTGCAGCTGTGGCGGCGGACGCAGGTGGCTGAGGAGGCCGAGGAGCGTC
TCTGCTCTCAGCTCGCCGAGCTCGAAGCCGAATCGCTCGACCAGGCGCGTGATTACCAAT
CTCGCATCCTCTTTCTCGTGAACGAACTATCTCGTCTCTCTTCCTCCGATTTGGCCTCGC
CCTAGATTGATAGACACATACGTATGTATGTATGTGTAAGGATAGATTCTTAGACTGATG
CATTTATCTTAATTTGCAATATTGGCTCATATCAATGCCAATCTGTAGAGTTTTTTTTTC
TTATTGTTTATAGATCTCAAATTTCTGCTTGGAAATTTTAGTGTAAACAAAAATCCATGT
TATAAAAAAAAGGAAATGAAAGTCTTTGAAAATTAAAGCATTAAGTCTT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2BB33JQ 102 0 0
ATAAATT
TCAAATTTTTGCTTGGAAATTTTAGTGTAAACAAAAATCCATGTTATAAAAAAAAGGAAA
AGAAAGTCTTTGAAAATTAAAGCATTAAGTCTTTG

QA 8 102 8 102
DS 



CO CL1209Contig3 555 2 3 U
GTGAAGAACAAGAACACAAACACAAAGCCAACACAAAAAAAAAAAACTCAACCAAAAAAA
ACAAAGAGACTTTGAAAAACAAATGGGAAAAGGAGGAAATTTTGTGACGGTGGCGGCTTC
CGAGGTGGAGGAGCTACGACGGAAGAACGGAGAGATGGAAAGAGCGGTGGAGGAAATGAG
GAAAGAGATGTTGCAGCTGTGGCGGCGGACGCAGGTGGCTGAGGAGGCCGAGGAGCGTCT
CTGCTCTCAGCTCGCCGAGCTCGAAGCCGAATCGCTCGACCAGGCGCGTGATTACCAATC
TCGCATCCTCTTCCTCGTGAACGAACTATCTCGTCTCTCTTCCTCCGATTTAGCCTCGCC
CTAGATTGATAGACACATATGTATGTGTAAGGATAGATTCTTAGACTGATATGCATTTAT
CTTAATTTACAATATTGGCTCATATCAATGCCAATCTGTAGAGTTTTTCGTTTTTTTTCT
TATTGTTTATAGATCTCAAATTTCTGCTTGGAAATTTTAGTGTAAACAAAAATCCATGTT
ATAAAAAAAAAGGTA


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2DI93JQ C 1
AF RR2DI93TF U 1
BS 1 2 RR2DI93JQ
BS 3 550 RR2DI93TF
BS 551 555 RR2DI93JQ

RD RR2DI93JQ 555 0 0
GTGAAGAACAAGAACACAAACACAAAGCCAACACAAAAAAAAAAAACTCAACCAAAAAAA
ACAAAGAGACTTTGAAAAACAAATGGGAAAAGGAGGAAATTTTGTGACGGTGGCGGCTTC
CGAGGTGGAGGAGCTACGACGGAAGAACGGAGAGATGGAAAGAGCGGTGGAGGAAATGAG
GAAAGAGATGTTGCAGCTGTGGCGGCGGACGCAGGTGGCTGAGGAGGCCGAGGAGCGTTT
TTGCTTTCAGCTCGCCGAGCTCGAAGCCGAATCGCTCGACCAGGCGCGTGATTACCAATC
TCGCATCCTTTTCCTCGTGAACGAACTATCTCGTCTCTCTTCCTCCGATTTAGCCTCGCC
CTAGATTGATAGACACATATGTATGTGTAAGGATAGATTTTTAGACTGATATGCATTTAT
CTTAATTTACAATATTGGCTCATATCAATGCCAATCTGTAGAGTTTTTCGTTTTTTTTCT
TATTGTTTATAGATCTCAAATTTTTGCTTGGAAATTTTAGTGTAAACAAAAATCCATGTT
ATAAAAAAAAAGGTA

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2DI93TF 555 0 0
GT
GAAGAACAAGAACACAAACACAAAGCCAACACAAAAAAAAAAAACTCAACCAAAAAAAAC
AAAGAGACTTTGAAAAACAAATGGGAAAAGGAGGAAATTTTGTGACGGTGGCGGCTTCCG
AGGTGGAGGAGCTACGACGGAAGAACGGAGAGATGGAAAGAGCGGTGGAGGAAATGAGGA
AAGAGATGTTGCAGCTGTGGCGGCGGACGCAGGTGGCTGAGGAGGCCGAGGAGCGTCTCT
GCTCTCAGCTCGCCGAGCTCGAAGCCGAATCGCTCGACCAGGCGCGTGATTACCAATCTC
GCATCCTCTTCCTCGTGAACGAACTATCTCGTCTCTCTTCCTCCGATTTAGCCTCGCCCT
AGATTGATAGACACATATGTATGTGTAAGGATAGATTCTTAGACTGATATGCATTTATCT
TAATTTACAATATTGGCTCATATCAATGCCAATCTGTAGAGTTTTTCGTTTTTTTTCTTA
TTGTTTATAGATCTCAAATTTCTGCTTGGAAATTTTAGTGTAAACAAAAATCCATGTTAT
AAAAAAAA
AGGTA

QA 3 550 3 550
DS 



AS 1 5

CO CL1210Contig1 1176 5 21 U
GGACTCCAGTGACAAGACAGACAACTCTCAATCTGACCAGACATTCACCCTATCAGGATT
CAGAAAGAAGAAGAAGAAGATGGAGATAACCCTGAACAGTGGCTACAAGATGCCGATCGT
CGGCTTAGGAGTGTGGAGAATGGAGAAAGAAGGGATTAGAGACCTCATCATCAACTCCAT
CAAGATCGGCTACCGCCACCTCGACTGCGCTGCTGATTATAAGAATGAAGCTGAAGTTGG
TGAGGCTCTCTCAGAAGCATTCAAGACTGGTTTAGTCAAGAGAGAGGATCTCTTCGTTAC
AACCAAGCTATGGAATTCAGACCATGGACATGTAATTGAGGCTTGCAAGGACAGTCTGAA
GAAACTTCAACTTGATTATCTCGACCTTTACCTCGTTCATTTCCCCGTTGCAACTAGGCA
CACTGGTGTTGGAACCACCGACAGTGCTTTGGGAGATGATGGAGTATTGGACATAGATAC
TACCATCTCTCTTGAAACTACATGGCATGACATGGAAAAGCTTGTTTCTATGGGTCTCGT
CCGCAGCATTGGAATCAGTAACTATGACGTATTCCTAACGAGGGATTGCTTGGCTTATTC
CAAGATCAAGCCAGCGGTGAATCAGATTGAGACGCATCCTTACTTTCAACGCGACTCTCT
TGTAAAATTCTGCCAGAAGCATGGTATTTGTGTCACAGCTCATACTCCTCTCGGAGGTGC
CACGGCCAATGCAGAGTGGTTTGGTACCGTCTCATGTCTCGATGACCCAGCTCTCAAAGA
AGTGGCGGAGAAGTACAAAAAGACAGTGGCACAGGTGGTGCTGAGGTGGG*AATACAGAG
GAAGACAGTGGTGATACCAAAGACATCCAAGGCTGAGAGGTTGGAAGAGAATTTCAAGGT
TTTCGACTTCGAACTGACGAAAGAGGACATGGAGGTGATCAAGAGCATGGACAGGAAGTA
CCGTACGAACCAACCAGCCAAGTTTTGGGGGATTGATCTCTACGCTTGAATGAATAGAAT
GATCACCACCGCTCTTGTCTCTCTCATGAATAAGAGAAGAAGCTAAGGCGTTTAGCTTCT
TCACCTGTGGGACATTCTCAATGGTTGTGAACCTACTTTATTTAAAACTCGTATGTTGAA
CATTTTATGGTTTTTAATATTACTCACATTTGATGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC67TF U 1
AF RR2C051TF U 1
AF RR2E353TF U 222
AF RR2C051JQ C 529
AF RR2E353JQ C 711
BS 1 77 RR2C051TF
BS 78 80 RR2DC67TF
BS 81 426 RR2C051TF
BS 427 427 RR2DC67TF
BS 428 453 RR2C051TF
BS 454 456 RR2DC67TF
BS 457 468 RR2C051TF
BS 469 469 RR2DC67TF
BS 470 648 RR2C051TF
BS 649 649 RR2E353TF
BS 650 666 RR2C051TF
BS 667 667 RR2E353TF
BS 668 711 RR2C051TF
BS 712 867 RR2E353TF
BS 868 868 RR2E353JQ
BS 869 912 RR2C051JQ
BS 913 913 RR2E353JQ
BS 914 999 RR2C051JQ
BS 1000 1000 RR2E353JQ
BS 1001 1139 RR2C051JQ
BS 1140 1176 RR2E353JQ

RD RR2DC67TF 555 0 0
GGACTCCAGTGACAAGACAGACAACTCTCAATCTGACCAGACATTCACCCTATCAGGATT
CAGAAAGAAGAAGAAGAAGATGGAGATAACCCTGAACAGTGGCTACAAGATGCCGATCGT
GGGCTTAGGAGTGTGGAGAATGGAGAAGGAAGGGATTCGAGACCTCATCATCAACTCCAT
CAAGATCGGCTACCGCCACCTCGACTGTGCTGCTGATTATAGGAATGAAGCTGAAGTTGG
TGAGGCTCTCTCAGAAGCATTCAAGACTGGTTTAGTCAAGAGAGAGGATCTCTTCGTTAC
AACCAAGCTATGGAATTCAGACCATGGACATGTAATTGAGGCTTGCAAGGACAGTCTGAA
AAAACTTCAACTTGATTATCTCGACCTTTACCTCGTTCATTTCCCCGTTGCAACTAGGCA
CACTGGTGTTGGAACCACCGACAGTGCTTTGGGAGATGATGGAGTATTGGACATAGATAC
TACCATCTCTCTTGAAACTACATGGCATGACATGGAAAAGCTTGTTTCTATGGGTCTCGT
CCGCAGCATTGGAAT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2C051TF 711 0 0
GGACTCCAGTGACAAGACAGACAACTCTCAATCTGACCAGACATTCACCCTATCAGGATT
CAGAAAGAAGAAGAAGA***TGGAGATAACCCTGAACAGTGGCTACAAGATGCCGATCGT
CGGCTTAGGAGTGTGGAGAATGGAGAAAGAAGGGATTAGAGACCTCATCATCAACTCCAT
CAAGATCGGCTACCGCCACCTCGACTGCGCTGCTGATTATAAGAATGAAGCTGAAGTTGG
TGAGGCTCTCTCAGAAGCATTCAAGACTGGTTTAGTCAAGAGAGAGGATCTCTTCGTTAC
AACCAAGCTATGGAATTCAGACCATGGACATGTAATTGAGGCTTGCAAGGACAGTCTGAA
GAAACTTCAACTTGATTATCTCGACCTTTACCTCGTTCATTTCCCCGTTGCAACTAGGCA
CACTGGGGTTGGAACCACCGACAGTGCTTTGGGCACTGATGGAGTATTAGACATAGATAC
TACCATCTCTCTTGAAACTACATGGCATGACATGGAAAAGCTTGTTTCTATGGGTCTCGT
CCGCAGCATTGGAATCAGTAACTATGACGTATTCCTAACGAGGGATTGCTTGGCTTATTC
CAAGATCAAGCCAGCGGTGAATCAGATTGAGACGCATCCTTACTTTCA*CGCGACTCTCT
TGTAAA*TTCTGCCAGAAGCATGGTATTTGTGTCACAGCTCATACTCCTCT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2E353TF 653 0 0
GGAAC
GAAGCTGAAGTTGGTGCGGCTCTCTCAGAAGCATTCAAGACTGGTTTAGTCAAGAGAGAG
GATCTCTTCGTTACAACCAAGCTATGGAATTCAGACCATGGACATGTAATTGAGGCATGC
AAGGACAGTCTGAAGAAACTTCAACTTGATTATCTCGACCTTTACCTCGTTCATTTCCCC
GTTGCAACTAGGCACACTGGTGTTGGAACCACCGACAGTGCCTTGGGAGATGATGGAGTA
TTGGACATAGATACTACCATCTCACTTGAAACTACATGGCATGACATGGAAAAGCTTGTT
TCTATGGGTCTCGTCCGCAGCATTGGAATCAGTAACTATGACGTGTTTCTAACGAGGGAT
TGCTTGGCTTATTCCAAGATCAAGCCAGCGGTGAATCAGAATGAGACGCATCCTTACTTT
CAACGCGACTCTCTTGTAAAATTCTGCCAGAAGCATGGTATTTGTGTCACAGCTCATACT
CCTCTCGGAGGTGCCACGGCCAATGCAGAGTGGTTTGGTACCGTCTCATGTCTCGATGAC
CCAGCTCTCAAAGAAGTGGCGGAGAAGTACAAAAAGACAGTGGCACAGGTGGTGCTGAGG
TGGG*AATACAGAGGAAGACAGTGGTGATACCAAAGACATC
CAAGCTG

QA 6 646 6 646
DS 

RD RR2C051JQ 613 0 0
TATGGGTCTCGTCCGCAGCATTGGAATCAGTAACTATGACGTATTCCTAACGAGGGATTG
CTTGGCTTATTCCAAGATCAAGCCAGCGGTGAATCAGATTGAGACGCATCCTTACTTTCA
ACGCGACTTTCTTGTAAAATTCTGCCAGAAGCATGGTATTTGTGTCACAGCTCATACTCC
TCTCGGAGGTGCCACGGCCAATGCAGAGTGGTTTGGTACCGTTTCATGTCTCGATGACCC
TGCTCTCAAAGAAGTGGCGGAGAAGTACAAAAAGACAGTGGCACAGGTGGTTTTGAGGTG
GGGAATACAGAGGAACACAGTGGTGATACCAAAGACATCGAAGGCTGAGAGGTTGGAAGA
GAATTTCAAGGTTTTCGACTTCGAGCTGACGAAAGAGGACATGGAGGTGATCAAGAGCAT
GGACAGGAAGTACCGTACGAACCAACCAGCCAAGTTTTGGGGGATTGATCTTTACGCTTG
AATGAATAGAATGATCACCACCGCTCTTGTCTCTCTCATGAATAAGAGAAGAAGCTAAGG
CGTTTAGCTTCTTCACCTGTGGGACATTCTCAATGGTTGTGAACCTACTTTATTTAAAAC
TCGTATGTTGA
GC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2E353JQ 466 0 0
TCGGAGGTGCCACGGCCAATGCAGAGTGGTTTGGTACCGTCTCATGTCTCGATGACCCAG
CTCTCAAAGAAGTGGCGGAGAAGTACAAAAAGACAGTGGCACAGGTGGTGCTGAGGTGGG
*AATACAGAGGAAGACAGTGGTGATACCAAAGACATCCAAGGCTGAGAGGTTGGAAGAGA
ATTTCAAGGTTTTCGACTTCGAACTGACGAAAGAGGACATGGAGGTGATCAAGAGCATGG
ACAGGAAGTACCGTACGAACCAACCAGCCAAGTTTTGGGGGATTGATCTCTACGCTTGAA
TGAATAGAATGATCACCACCGCTCTTGTCTCTCTCATGAATAAGAGAAGAAGCTAAGGCG
TTTAGCTTCTTCACCTGTGGGACATTCTCAATGGTTGTGAACCTATTTTATTTAAAACTC
GTATGTTGAACATTTTATGGTTTTTAATATTACTCACATTTGATGC

QA 1 466 1 466
DS 



AS 1 2

CO CL1211Contig1 798 2 1 U
GGGTAAAATATGTGAACCGTAATTCACGCCACGTCGTCTTCCATTTTTATATTTTAAAGA
ACTGATCAACTGAAGCCGAGACAATATAGAGCAACAAGATAGCTGAACATAAAATAAAGA
AGCATAGCAACAACCAGAGAGAATTATTTGTTATGACTCTGGCGAACTGATGATGCCTCA
TTTAGTAAGCGTCAGTATAAACAACAATAGGACTTCTAACGTTATGTGTCCCATCAGACC
AGATTAGATTTGCAGACGAAGGCAGTTCTGAGTCAAGATCCCTGCCTGTTACAGTTACCT
TGAACGATTGCTTCTCGTTGACCGTCTTAAAAGACAGAACGCTAGGAGTGACCACCACGC
TGAGCTTAGATCCATGACCAGGGACTACTTTTGAATTGTATGTTGAATTGGGTTTACCAA
CATTAGTGACGGTTCTGTTGAAAGTGACGATGAAGGAGTCATCAGAGCTTGACAACCGAG
CCGACATTGAAGGATAGTTGAGGTTTCTGGCTGAAAATTCTTTTTCTTTCGAGCAAGTGA
CAGTTTCACCAGAGATGATTTTAAGGATATTTGAAGTGTAGTTCATGCCGCATAGAAAGG
CGATGTGGTCTACTTTGTTTAATTCGTAGACAAGTCCAGGGTTTAGAGAGGCTATTGGGT
CGACATGTCCAGATCCATAAGCAAACTCAGTCGATGCGATGCCAGTTCCAGTAGCATTGA
CCGGCCATGCGGTTGTCATGATAGCAGATTGAATCATGGAGGGGGACCATTTAGGGTAAA
AGTTTTGATATATGCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG11JQ U 14
AF RR2FD58JQ U 1
BS 1 798 RR2FD58JQ

RD RR2CG11JQ 599 0 0
GA
ACCGTAATTCACGCCACGTCGTCTTCCATTTTTATATTTTAAAGAACTGATCAACTGAAG
CCGAGACAATATAGAGCAACAAGATAGCTGAACATAAAATAAAGAAGCATAGCAACAACC
AGAGAGAATTATTTGTTATGACTCTGGCGAACTGATGATGCCTCATTTAGTAAGCGTCAG
TATAAACAACAATAGGACTTCTAACGTTATGTGTCCCATCAGACCAGATTAGATTTGCAG
ACGAAGGCAGTTCTGAGTCAAGATCCCTGCCTGTTACAGTTACCTTGAACGATTGCTTCT
CGTTGACCGTCTTAAAAGACAGAACGCTAGGAGTGACCACCACGCTGAGCTTAGATCCAT
GACTAGGGACTACTTTTGAATTGTATGTTGAATTGGGTTTACCAACATTAGTGACGGTTC
TGTTGAAAGTGACGGTGAAGGAGTCATCAGAGCTTGACAACCGAGCCGACATTGAAGGAT
AGTTGAGGTTTCTGGCTGAAAATTCTTTTTCTTTCGAGCAAGTGACAGTTTCACCAGAGA
TGATTTTAAGGATATTTGAAGTGTAGTTCATGCCGCATAGAAAGGCGATGTGGTCTA

QA 3 599 3 599
DS 

RD RR2FD58JQ 798 0 0
GGGTAAAATATGTGAACCGTAATTCACGCCACGTCGTCTTCCATTTTTATATTTTAAAGA
ACTGATCAACTGAAGCCGAGACAATATAGAGCAACAAGATAGCTGAACATAAAATAAAGA
AGCATAGCAACAACCAGAGAGAATTATTTGTTATGACTCTGGCGAACTGATGATGCCTCA
TTTAGTAAGCGTCAGTATAAACAACAATAGGACTTCTAACGTTATGTGTCCCATCAGACC
AGATTAGATTTGCAGACGAAGGCAGTTCTGAGTCAAGATCCCTGCCTGTTACAGTTACCT
TGAACGATTGCTTCTCGTTGACCGTCTTAAAAGACAGAACGCTAGGAGTGACCACCACGC
TGAGCTTAGATCCATGACCAGGGACTACTTTTGAATTGTATGTTGAATTGGGTTTACCAA
CATTAGTGACGGTTCTGTTGAAAGTGACGATGAAGGAGTCATCAGAGCTTGACAACCGAG
CCGACATTGAAGGATAGTTGAGGTTTCTGGCTGAAAATTCTTTTTCTTTCGAGCAAGTGA
CAGTTTCACCAGAGATGATTTTAAGGATATTTGAAGTGTAGTTCATGCCGCATAGAAAGG
CGATGTGGTCTACTTTGTTTAATTCGTAGACAAGTCCAGGGTTTAGAGAGGCTATTGGGT
CGACATGTCCAGATCCATAAGCAAACTCAGTCGATGCGATGCCAGTTCCAGTAGCATTGA
CCGGCCATGCGGTTGTCATGATAGCAGATTGAATCATGGAGGGGGACCATTTAGGGTAAA
AGTTTTGATATATGCAGC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 2 6

CO CL1212Contig1 733 2 3 U
CTCCGTCTTCGCTTATCTGATCCTGCAAAGATGTTCTCCGCTCAGAACAAGATCAAGAAA
GACAAGAATGCTGCTACAACGGAGTGCGATGAGCTTGTTGCTCAGGCTCTCTTTGATCTG
GAGAACACCAACCAGGAGTTGAAAAGCGAGCTGAAAGATCTCTACATCAACCAAGCTGTT
AACATGGACATCTCTGGAAACCGCAAGGCTGTTGTGATTTACGTCCCATTCAGACGGAGG
AAAGCTTTCCGCAAGATTCATCCTCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTTAGTGGA
AAGGATGTGATCTTTGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCTCCCAAGAAGGGTGCTGCT
GTTCACAGGCCACGCAACAGAACTCTTACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGATGTC
GCTTACCCTGCTGAGATTGTTGGCAAACGTACTCGTTACCGTCTTGACGGTTCCAAGATC
ATGAAGGTCTACTTGGATACCAAGGAAAGAAACAACACAGAGTACAAGCTCGAGACTATG
ATTGGTGTGTACCGTAAACTCACTGGAAAGGATGTCACTTTTGAGTACCCAGTTGAAGCT
TGAAAGGAAGAATGATTCTGAGGAGAGAGAGCTTTTGATTCTGTTTTGTGATATTTTTAG
GATGAAGTAAACTCTCATTTGGTTCAGTTCCTTTATTCACAATCTTCATATTCTATTTTA
CAAAGACTAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ95TF U 20
AF RR2AQ95JQ C 1
BS 1 22 RR2AQ95JQ
BS 23 590 RR2AQ95TF
BS 591 733 RR2AQ95JQ

RD RR2AQ95TF 571 0 0
ATC
CTGCAAAGATGTTCTCCGCTCAGAACAAGATCAAGAAAGACAAGAATGCTGCTACAACGG
AGTGCGATGAGCTTGTTGCTCAGGCTCTCTTTGATCTGGAGAACACCAACCAGGAGTTGA
AAAGCGAGCTGAAAGATCTCTACATCAACCAAGCTGTTAACATGGACATCTCTGGAAACC
GCAAGGCTGTTGTGATTTACGTCCCATTCAGACGGAGGAAAGCTTTCCGCAAGATTCATC
CTCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTTAGTGGAAAGGATGTGATCTTTGTTGCCA
CAAGAAGGATCATGCGTCCTCCCAAGAAGGGTGCTGCTGTTCACAGGCCACGCAACAGAA
CTCTTACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGATGTCGCTTACCCTGCTGAGATTGTTG
GCAAACGTACTCGTTACCGTCTTGACGGTTCCAAGATCATGAAGGTCTACTTGGATACCA
AGGAAAGAAACAACACAGAGTACAAGCTCGAGACTATGATTGGTGTGTACCGTAAACTCA
CTGGAAAGGATGTCACTTTTGAGTACCC

QA 4 571 4 571
DS 

RD RR2AQ95JQ 733 0 0
CTCCGTCTTCGCTTATCTGATCCTGCAAAGATGTTCTCCGCTCAGAACAAGATCAAGAAA
GACAAGAATGCTGCTACAACGGAGTGCGATGAGCTTGTTGCTCAGGCTCTCTTTGATCTG
GAGAACACCAACCAGGAGTTGAAAAGCGAGCTGAAAGATCTCTACATCAACCAAGCTGTT
AACATGGACATCTCTGGAAACCGCAAGGCTGTTGTGATTTACGTCCCATTCAGACTGAGG
AAAGCTTTCCGCAAGATTCATCCTCGTCTCGTTAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTTAGTGGA
AAGGATGTGATCTTTGTTGCCACAAGAAGGATCATGCGTCCTCCCAAGAAGGGTGCTGCT
GTTCAGAGGCCACGCAACAGAACTCTTACCTCTGTTCATGAAGCTATGCTCGAGGATGTC
GCTTACCCTGCTGAGATTGTTGGCAAACGTACTCGTTACCGTCTTGACGGTTCCAAGATC
ATGAAGGTCTACTTGGATACCAAGGAAAGAAACAACACAGAGTACAAGCTCGAGACTATG
ATTGGTGTGTACCGTAAACTCACTGGAAAGGATGTCACTTTTGAGTACCCAGTTGAAGCT
TGAAAGGAAGAATGATTCTGAGGAGAGAGAGCTTTTGATTCTGTTTTGTGATATTTTTAG
GATGAAGTAAACTCTCATTTGGTTCAGTTCCTTTATTCACAATCTTCATATTCTATTTTA
CAAAGACTAGTTT

QA 1 733 1 733
DS 



CO CL1212Contig2 818 4 2 U
ATCAAAAGATGGTTTTCAAAATTGAACAGCACAGTAAACTAGTCTTTGTAAAATAGAATA
TGAAGATTGTGAATAAAGGAACTGAACCAAATGAGAGTTTACTTCATCCTAAATATCACA
AAAAACAGAATCAAAAGCGCTCTCTCCTCAGAATCATATTCTTCCTTTCAAGCTTCAACT
GGGTACTCAAAAGTGACATCCTTTCCAGTGAGTTTACGGTACACACCAATCATAGTCTCG
AGCTTGTACTCTGTGTTGTTTCTTTCCTTGGTATCCAAGTAGACCTTCATGATCTTGGAA
CCATCAAGACGGTAACGAGTACGTTTGCCAACAATCTCGGCAGGGTAAGCGACATCCTCG
AGCATAGCTTCGTGAACAGAGGTAAGAGTTCTGTTGCGTGGCCTCTGAACAGCAGCACCC
TTCTTGGGAGGACGCATGATCCTTCTTGTGGCAACAAAGATCACATCCTTTCCACTAAAC
TTCTTCTCAAGCTCTCTAACGAGACGAGGATGAATCTTGCGGAAAGCTTTCCTCAGTCTG
AATGGGACGTAAATTACAACAGCTTTGCTGTTTCCAGAGATGTCCATGTTAACAGCTTGG
TTGATGTAGAGATCTTTCAGCTCGCTTTTCAACTCCTGGTTGGTGTTCTCCAGATCAAAG
AGAGCCTGAGCAACAAGCTCATCGCACTCTGTTGTAGCAGCATTCTTGTCCTTCTTGATC
TTGTTCTGAGCGGAGAACATCTTTGCAGATCAGATAAGCGAAAACGGAGAAGGGAGAAGA
AAAAGGAGAGGTTGCGGCTTCTTCTTCTTAGAAGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE71JQ U 1
AF RR2AK34JQ U 24
AF RR2CE71TF C 121
AF RR2AK34TF C 50
BS 1 773 RR2CE71JQ
BS 774 818 RR2AK34TF

RD RR2CE71JQ 783 0 0
ATCAAAAGATGGTTTTCAAAATTGAACAGCACAGTAAACTAGTCTTTGTAAAATAGAATA
TGAAGATTGTGAATAAAGGAACTGAACCAAATGAGAGTTTACTTCATCCTAAATATCACA
AAAAACAGAATCAAAAGCGCTCTCTCCTCAGAATCATATTCTTCCTTTCAAGCTTCAACT
GGGTACTCAAAAGTGACATCCTTTCCAGTGAGTTTACGGTACACACCAATCATAGTCTCG
AGCTTGTACTCTGTGTTGTTTCTTTCCTTGGTATCCAAGTAGACCTTCATGATCTTGGAA
CCATCAAGACGGTAACGAGTACGTTTGCCAACAATCTCGGCAGGGTAAGCGACATCCTCG
AGCATAGCTTCGTGAACAGAGGTAAGAGTTCTGTTGCGTGGCCTCTGAACAGCAGCACCC
TTCTTGGGAGGACGCATGATCCTTCTTGTGGCAACAAAGATCACATCCTTTCCACTAAAC
TTCTTCTCAAGCTCTCTAACGAGACGAGGATGAATCTTGCGGAAAGCTTTCCTCAGTCTG
AATGGGACGTAAATTACAACAGCTTTGCTGTTTCCAGAGATGTCCATGTTAACAGCTTGG
TTGATGTAGAGATCTTTCAGCTCGCTTTTCAACTCCTGGTTGGTGTTCTCCAGATCAAAG
AGAGCCTGAGCAACAAGCTCATCGCACTCTGTTGTAGCAGCATTCTTGTCCTTCTTGATC
TTGTTCTGAGCGGAGAACATCTTTGCAGATCAGATAAGCGAAAACGGAGAAGG
AGAAGAAAAA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2AK34JQ 758 0 0
GAACAGCACAGTAAACTAGTCTTTGTAAAATAGAATATGAAGATTGTGAATAAAGGAACT
GAACCAAATGAGAGTTTACTTCATCCTAAATATCACAAAAAACAGAATCAAAAGCGCTCT
CTCCTCAGAATCATATTCTTCCTTTCAAGCTTCAACTGGGTACTCAAAAGTGACATCCTT
TCCAGTGAGTTTACGGTACACACCAATCATAGTCTCGAGCTTGTACTCTGTGTTGTTTCT
TTCCTTGGTATCCAAGTAGACCTTCATGATCTTGGAACCATCAAGACGGTAACGAGTACG
TTTGCCAACAATCTCGGCAGGGTAAGCGACATCCTCGAGCATAGCTTCGTGAACAGAGGT
AAGAGTTCTGTTGCGTGGCCTCTGAACAGCAGCACCCTTCTTGGGAGGACGCATGATCCT
TCTTGTGGCAACAAAGATCACATCCTTTCCACTAAACTTCTTCTCAAGCTCTCTAACGAG
ACGAGGATGAATCTTGCGGAAAGCTTTCCTCAGTCTGAATGGGACGTAAATTACAACAGC
TTTGCTGTTTCCAGAGATGTCCATGTTAACAGCTTGGTTGATGTAGAGATCTTTCAGCTC
GCTTTTCAACTCCTGGTTGGTGTTCTCCAGATCAAAGAGAGCCTGAGCAACAAGCTCATC
GCACTCTGTTGTAGCAGCATTCTTGTCCTTCTTGATCTTGTTCTGAGCGGAGAACATCTT
TGCAGATCAGATAAGCGAAAACGGAGAAGG
GAGAAGAA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2CE71TF 651 0 0
AAAAACAGAATCAAAAGCGCTCTCTCCTCAGAATCATATTCTTCCTTTCAAGCTTCAACT
GGGTACTCAAAAGTGACATCCTTTCCAGTGAGTTTACGGTACACACCAATCATAGTCTCG
AGCTTGTACTCTGTGTTGTTTCTTTCCTTGGTATCCAAGTAGACCTTCATGATCTTGGAA
CCATCAAGACGGTAACGAGTACGTTTGCCAACAATCTCGGCAGGGTAAGCGACATCCTCG
AGCATAGCTTCGTGAACAGAGGTAAGAGTTCTGTTGCGTGGCCTCTGAACAGCAGCACCC
TTCTTGGGAGGACGCATGATCCTTCTTGTGGCAACAAAGATCACATCCTTTCCACTAAAC
TTCTTCTCAAGCTCTCTAACGAGACGAGGATGAATCTTGCGGAAAGCTTTCCTCAGTCTG
AATGGGACGTAAATTACAACAGCTTTGCTGTTTCCAGAGATGTCCATGTTAACAGCTTGG
TTGATGTAGAGATCTTTCAGCTCGCTTTTCAACTCCTGGTTGGTGTTCTCCAGATCAAAG
AGAGCCTGAGCAACAAGCTCATCGCACTCTGTTGTAGCAGCATTCTTGTCCTTCTTGATC
TTGTTCTGAGCGGAGAACATCTTTGCAGATCAGATAAGCGAAAACGGAGAA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2AK34TF 769 0 0
AAAATAGAATATGAAGATTGTGAATAAAGGAACTGAACCAAATGAGAGTTTACTTCATC*
TAAATATCACAAAAAACAGAATCAAAAGCGCTCTCTCCTCAGAATCATATTCTTCCTTTC
AAGCTTCAACTGGGTACTCAAAAGTGACATCCTTTCCAGTGAGTTTACGGTACACACCAA
TCATAGTCTCGAGCTTGTACTCTGTGTTGTTTCTTTCCTTGGTATCCAAGTAGACCTTCA
TGATCTTGGAACCATCAAGACGGTAACGAGTACGTTTGCCAACAATCTCGGCAGGGTAAG
CGACATCCTCGAGCATAGCTTCGTGAACAGAGGTAAGAGTTCTGTTGCGTGGCCTCTGAA
CAGCAGCACCCTTCTTGGGAGGACGCATGATCCTTCTTGTGGCAACAAAGATCACATCCT
TTCCACTAAACTTCTTCTCAAGCTCTCTAACGAGACGAGGATGAATCTTGCGGAAAGCTT
TCCTCAGTCTGAATGGGACGTAAATTACAACAGCTTTGCTGTTTCCAGAGATGTCCATGT
TAACAGCTTGGTTGATGTAGAGATCTTTCAGCTCGCTTTTCAACTCCTGGTTGGTGTTCT
CCAGATCAAAGAGAGCCTGAGCAACAAGCTCATCGCACTCTGTTGTAGCAGCATTCTTGT
CCTTCTTGATCTTGTTCTGAGCGGAGAACATCTTTGCAGATCAGATAAGCGAAAACGGAG
AAGGGAGAAGAAAAAGGAGAGGTTGCGGCTTCTTCTTCTTAGAAGACCC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 6

CO CL1213Contig1 1258 6 5 U
GACTTTCGTGTGTGCCGTGCCTCTGCTTCGACAGGTTTTTACGTCATATCCGATGGCTTC
AAGTTCAGACAACACTCGTGATGAGAAAAACGATTCCAAGAGCAAGAGCCCTAAACAGGG
ATCTGGCTCAGGAGGTTCTCCTTCACCTTCACCTGCTGATTTTGGTATTGACTTCAATGC
TTTCGATTTCTCAAGCATGGCGGGTATCCTCAATGACCCAAGCATCAAGGAATTGGCTGA
GCAAATAGCCAAAGATCCCACCTTTAACCAGTTAGCTGAGCAGCTTCAGAAATCTGTTCC
AAGTGCATCAGGCGAAGGAGGAGGTCTCCCTAACTTTAATCCGGAACAGTACATGGCCAC
AATGAATCAGGTTATGGGAAACCCTGAGTTCAGAACCATGGCTGAGAAACTCGGCAACGC
CTTGGTACAGGATCCACAAATGTCTTCGTTTATGGAGGCTTTTGCTAACCCTGGAGCAAC
AGAGCAGTTTACTGAGCGTATGGCACAGATGAAAGAAGATCCTACCTTGAAACCTATATT
AGCTGAGATAGATGCTGATCCTTCCGCCATGATGAAGTACTGGAATGATAAAGATGTCTT
GAAGAAGCTGGGAGAAGCAATGGGTATAGCTGTTGGAGCTGAGCAGAATGTTGCAGCTGA
ACCTGAACCTGAGGAGGCGGAAGAAGGTGAAGATGAAGAAGAATCTATTGTTCATCAGAC
TGCTAGTCTTGGTGATGTTGAGGGTCTGAAAGCTGCGTTAGCACCTGGTGGTAACAAAGA
TGAAGAAGACTCTGAGGGAAGAACAGCGTTGCATTTTGCATGTGGATATGGCGAGGTGAA
ATGTGCTCAAGTTCTTGTAGATGCTGGAGCAAATGTCAATGCAGTTGACAAAAACAAAAA
CACTCCATTGCATTATGCCGCTGGTTACGGACGGAAAGAGTGTGTAAGCCTTCTCTTAGA
GAATGGTGCTGCAGTCACTCTGCAAAACACAGACAGTAAAACTCCGGTTGATGTGGCAAA
GCTTAACAATCAGCTCGAAGTTGTGAAGCTCCTTGAGAAGGATGCATTCCTCTAAGAGAT
TTGAGAACATGTCCTGTGGCTCTTCTGTGTTCTGTAATAGTTTCACAGGCCATTACTTTC
TACAACCTTCGACTTGGTCTTTTTCAATATTACCTTTGGAAAAAAAGAAAATATTAAGAA
AGAGTAAATGGATATTTTCTTTTATGGTTTTGCAATGAAGTATTTCTTCAACTTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FI01TF U 36
AF RR2GO54TF U 1
AF RR2EJ01TF U 36
AF RR2A415TF U 41
AF RR2FI01JQ C 856
AF RR2ER32JQ C 572
BS 1 469 RR2GO54TF
BS 470 470 RR2FI01TF
BS 471 673 RR2GO54TF
BS 674 800 RR2A415TF
BS 801 1258 RR2ER32JQ

RD RR2FI01TF 604 0 0
TTTTTACATCGTATC
CGATGGCTTCAAGTTCAGACAACACTCGTGATGAGAAAAACGATTCCAAGAGCAAGAGCC
CTAAACAGGGATCTGGCTCAGGAGGTTCTCCTTCACCTTCACCTGCTGATTTTGGTATTG
ACTTCAATGCTTTCGATTTCTCAAGCATGGCGGGTATCCTCAATGACCCAAGCATCAAGG
AATTGGCTGAGCAAATAGCCAAAGATCCCACCTTTAACCAGTTAGCTGAGCAGCTTCAGA
AATCTGTTCCAAGTGCATCAGGCGAAGGAGGAGGTCTCCCTAACTTTAATCCGGAACAGT
ACATGGCCACAATGAATCAGGTTATGGGAAACCCTGAGTTCAGAACCATGGCTGAGAAAC
TCGGCAACGCCTTGGTACAGGATCCACAAATGTCTTCGTTTATGGAGGCTTTTGCTAACC
CTGGAGCAACAGAGCAGTTTACTGAGCGTATGGCACAGATGAAAGAAGATCCTACCTTGA
AACCTATATTAGCTGAGATAGATGCTGATCCTTCCGCCATGATGAAGTACTGGAATGATA
AAGATGTCTTGAAGAAGCTGGGAGAAGCAATGGGTATAGCTGTTGGAGC

QA 16 604 16 604
DS 

RD RR2GO54TF 679 0 0
GACTTTCGTGTGTGCCGTGCCTCTGCTTCGACAGGTTTTTACGTCATATCCGATGGCTTC
AAGTTCAGACAACACTCGTGATGAGAAAAACGATTCCAAGAGCAAGAGCCCTAAACAGGG
ATCTGGCTCAGGAGGTTCTCCTTCACCTTCACCTGCTGATTTTGGTATTGACTTCAATGC
TTTCGATTTCTCAAGCATGGCGGGTATCCTCAATGACCCAAGCATCAAGGAATTGGCTGA
GCAAATAGCCAAAGATCCCACCTTTAACCAGTTAGCTGAGCAGCTTCAGAAATCTGTTCC
AAGTGCATCAGGCGAAGGAGGAGGTCTCCCTAACTTTAATCCGGAACAGTACATGGCCAC
AATGAATCAGGTTATGGGAAACCCTGAGTTCAGAACCATGGCTGAGAAACTCGGCAACGC
CTTGGTACAGGATCCACAAATGTCTTCGTTTATGGAGGCTTTTGCTAACTCTGGAGCAAC
AGAGCAGTTTACTGAGCGTATGGCACAGATGAAAGAAGATCCTACCTTGAAACCTATATT
AGCTGAGATAGATGCTGATCCTTCCGCCATGATGAAGTACTGGAATGATAAAGATGTCTT
GAAGAAGCTGGGAGAAGCAATGGGTATAGCTGTTGGAGCTGAGCAGAATGTTGCAGCTGA
ACCTGAACCTGAG
AGGCGG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2EJ01TF 636 0 0
TTTTTACGTGATATA
CGATGGCTTCTAGTTCAGACAACACTCGTGATGAGAAAAACGATTCCAAGAGCAAGAGCC
CTAAACAGGGATCTGGTTCAGGAGGTTCTCCTTCACCTTCACCTGCTGATTTTGGTATTG
ACTTCAATGCTTTCGATTTCTCAAGCATGGCGGGTATCCTCAATGACCCAAGCATCAAGG
AATTGGCTGAGAAAATAGCCAAAGATCCCACCTATAACCAGTTAGCTGAGCAGCTTCAGA
AATCTGTTCCAAGTGCATCAGGCGAAGGAGGAGGTCTCCCTAACTTTAATCCGGAACAGT
ACATGGCCACAATGAATCAGGTTATGGGAAACCCTGAGTTCAGAACCATGGCTGAGAAAC
TCGGCAACGCCTTGGTACAGGATCCACAAATGTCTTCGTTTATGGAGGCTTTTGCTAACC
CTGGAGCAACAGAGCAGTTTACTGAGCGTATGGCACAGATGAAAGAAGATCCTACCTTGA
AACCTATATTAGCTGAGATAGATGCTGATCCTTCCGCCATGATGAAGTACTGGAATGATA
AAGATGTCTTGAAGAAGCTGGGAGAAGCAATGGGTATAGCTGTTGGAGCTGAGCAGAATG
TTGCAGCTGAACCTGAACCTG

QA 16 636 16 636
DS 

RD RR2A415TF 760 0 0
ACGTCA
TATCCGATGGCTTCAAGTTCAGACAACACTCGTGATGAGAAAAACGATTCCAAGAGCAAG
AGCCCTAAACAGGGATCTGGCTCAGGAGGTTCTCCTTCACCTTCACCTGCTGATTTTGGT
ATTGACTTCAATGCTTTCGATTTCTCAAGCATGGCGGGTATCCTCAATGACCCAAGCATC
AAGGAATTGGCTGAGCAAATAGCCAAAGATCCCACCTTTAACCAGTTAGCTGAGCAGCTT
CAGAAATCTGTTCCAAGTGCATCAGGCGAAGGAGGAGGTCTCCCTAACTTTAATCCGGAA
CAGTACATGGCCACAATGAATCAGGTTATGGGAAACCCTGAGTTCAGAACCATGGCTGAG
AAACTCGGCAACGCCTTGGTACAGGATCCACAAATGTCTTCGTTTATGGAGGCTTTTGCT
AACCCTGGAGCAACAGAGCAGTTTACTGAGCGTATGGCACAGATGAAAGAAGATCCTGCC
TTGAAACCTATATTAGC*GAGATAGATGCTGATCCTTCCGCCATGATGAAGTACTGGAAT
GATAAAGATGTCTTGAAGAAGCTGGGAGAAGCAATGGGTATAGCTGTTGGAGCTGAGCAG
AATGTTGCAACTGAACCTGAACCTGAGGAGGCGGAAGAAGGTGAAGATGAAGAAGAATCT
ATTGTTCATCAGACTGCTAGTCTTGGTGATGTTGAGGGTCTGAAAGCTGCGTTAGCACCT
GGTGGTAACAAAGATGAAGAAGACTCTGAGGGAA

QA 7 760 7 760
DS 

RD RR2FI01JQ 300 0 0
TGTAGATGCTGGAGCAAATGTCAATGCAGTTGACAAAAACAAAAACACTCCATTGCATTA
TGCCGCTGGTTACGGACGGAAAGAGTGTGTAAGCCTTCTCTTAGAGAATGGTGCTGCAGT
CACTCTGCAAAACACAGACAGTAAAACTCCGGTTGATGTGGCAAAGCTTAACAATCAGCT
CGAAGTTGTGAAGCTCCTTGAGAAGGATGCATTCCTCTAAGAGATTTGAGAACATGTCCT
GTGGCTCTTCTGTGTTCTGTAATAGTTTCACAGGCCATTACTTTCTACAACCTTCGACTT

QA 1 300 1 300
DS 

RD RR2ER32JQ 687 0 0
ATGAAGTACTGGAATGATAAAGATGTCTTGAAGAAGCTGGGAGAAGCAATGGGTATAGCT
GTTGGAGCTGAGCAGAATGTTGCAGCTGAGCCTGAACCTGAGGAGGCGGAAGAAGGTGAA
GATGAAGAAGAATCTATTGTTCATCAGACTGCTAGTCTTGGTGATGTTGAGGGTCTGAAA
GCTGCGTTAGCATCTGGTGGTAACAAAGATGAAGAAGACTCTGAGGGAAGAACAGCGTTG
CATTTTGCATGTGGATATGGCGAGGTGAAATGTGCTCAAGTTCTTGTAGATGCTGGAGCA
AATGTCAATGCAGTTGACAAAAACAAAAACACTCCATTGCATTATGCCGCTGGTTACGGA
CGGAAAGAGTGTGTAAGCCTTCTCTTAGAGAATGGTGCTGCAGTCACTCTGCAAAACACA
GACAGTAAAACTCCGGTTGATGTGGCAAAGCTTAACAATCAGCTCGAAGTTGTGAAGCTC
CTTGAGAAGGATGCATTCCTCTAAGAGATTTGAGAACATGTCCTGTGGCTCTTCTGTGTT
CTGTAATAGTTTCACAGGCCATTACTTTCTACAACCTTCGACTTGGTCTTTTTCAATATT
ACCTTTGGAAAAAAAGAAAATATTAAGAAAGAGTAAATGGATATTTTCTTTTATGGTTTT
GCAATGAAGTATTTCTTCAACTTGGAC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 2 6

CO CL1214Contig1 743 3 35 U
GGGATTCTTCTTTCGCTTGCCGTTTTCATCGAAACAGAAACAGAGAAGATTCAGTGCGCT
GTGGAAGAATGGGTTTCAAGAGGAGAAAGGGTGACGGCGACGGAGAGGAAATGGAAGGCG
AAGATAACAGAAGACCGAGCTTCAACACGGCGGAGAGGAGGAACGTGATACTGCCGTCGA
TGATAAAGAACAAAGACAAGAGAGCCAAAGTGTACGCGAAGCAGAAACACGAGAAGAAAG
TCGAGAAGCAGAAGAAGATCAGAGCTCGTGACGCCGCTGAGAAACAAGCTCTCGAGCTTG
GCGAAGAGCCTCCACAGAAGATGGTTCCGAAGACGATTGAGAATACGAGAGAAGCTGATG
AGACTGTTTGCAGACCTGATGATGAAGAATTGTTTGCGGATATTGATGCTGATGAGTTTA
ATCCTGTCCTGAGACGTGAAGTTACTCCTAAGGTCTTGATCACTACATGTCGTTTCAATT
CCACTAGAGGACCTGCGTTTATATCGGAGTTACAGTCGGTGATCCCGAACTCTGATTATC
GCAAGAGAGGAACTTATGATTTGAAGAAGATTGTAGAGTACGCAAAGAAGAAGGATTATA
CATCTCTTATTGTAGTTCATACTAATCGCAGAGAGCCTGATGCGCTCCTTATCATTGGTT
TGCCAAACGGCCCTACTGCTCATTTCAAATTGTCAAAACTTGTTCTAAGAAAGATATTAA
GAATCATGGAAACCCTACAGCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D885TF U 1
AF RR2GZ62TF U 2
AF RR2GD46TF U 8
BS 1 11 RR2D885TF
BS 12 12 RR2GZ62TF
BS 13 34 RR2D885TF
BS 35 40 RR2GZ62TF
BS 41 143 RR2D885TF
BS 144 144 RR2GZ62TF
BS 145 268 RR2D885TF
BS 269 269 RR2GZ62TF
BS 270 346 RR2D885TF
BS 347 347 RR2GZ62TF
BS 348 400 RR2D885TF
BS 401 401 RR2GZ62TF
BS 402 403 RR2D885TF
BS 404 404 RR2GZ62TF
BS 405 519 RR2D885TF
BS 520 520 RR2GZ62TF
BS 521 531 RR2D885TF
BS 532 532 RR2GZ62TF
BS 533 547 RR2D885TF
BS 548 548 RR2GZ62TF
BS 549 595 RR2D885TF
BS 596 596 RR2GZ62TF
BS 597 649 RR2D885TF
BS 650 650 RR2GZ62TF
BS 651 667 RR2D885TF
BS 668 668 RR2GZ62TF
BS 669 670 RR2D885TF
BS 671 671 RR2GZ62TF
BS 672 688 RR2D885TF
BS 689 689 RR2GZ62TF
BS 690 697 RR2D885TF
BS 698 698 RR2GZ62TF
BS 699 705 RR2D885TF
BS 706 737 RR2GZ62TF
BS 738 743 RR2GD46TF

RD RR2D885TF 705 0 0
GGGATTCTTCTCTCGCTTGCCGTTTTCATCGAAAT*****CAGAGAAGATTCAGTGCGCT
GTGGAAGAATGGGTTTCAAGAGGAGAAAGGGTGACGGCGACGGAGAGGAAATGGAAGGCG
AAGATAACAGAAGACCGAGCTTCTACACGGCGGAGAGGAGGAACGTGATACTGCCGTCGA
TGATAAAGAACAAAGACAAGAGAGCCAAAGTGTACGCGAAGCAGAAACACGAGAAGAAAG
TCGAGAAGCAGAAGAAGATCAGAGCTCGGGACGCCGCTGAGAAACAAGCTCTCGAGCTTG
GCGAAGAGCCTCCACAGAAGATGGTTCCGAAGACGATTGAGAATACTAGAGAAGCTGATG
AGACTGTTTGCAGACCTGATGATGAAGAATTGTTTGCGGACATCGATGCTGATGAGTTTA
ATCCTGTCCTGAGACGTGAAGTTACTCCTAAGGTCTTGATCACTACATGTCGTTTCAATT
CCACTAGAGGACCTGCGTTTATATCGGAGTTACAGTCGGCGATCCCGAACTTTGATTATC
GCAAGAGGGGAACTTATGATTTGAAGAAGATTGTAGAGTACGCAAAGAAGAAGGAGTATA
CATCTCTTATTGTAGTTCATACTAATCGCAGAGAGCCTGATGCGCTCCTCATCATTGGTT
TGCCAAATGGTCCTACTGCTCATTTCAAGTTGTCAAATCTTGTTC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2GZ62TF 736 0 0
GGATTC
TTCTTTCGCTTGCCGTTTTCATCGAAACAGAAACAGAGAAGATTCAGTGCGCTGTGGAAG
AATGGGTTTCAAGAGGAGAAAGGGTGACGGCGACGGAGAGGAAATGGAAGGCGAAGATAA
CAGAAGACCGAGCTTCAACACGGCGGAGAGGAGGAACGTGATACTGCCGTCGATGATAAA
GAACAAAGTCAAGAGAGCCAAAGTGTACGCGAAGCAGAAACACGAGAAGAAAGTCGAGAA
GCAGAAGAAGATCAGAGCTCGTGACGCCGCTGAGAAACAAGCTCTCGAGCTTGGCGAAGA
GCCTCCACAGAAGATGGTTCCGAAGACGATTGAGAATACGAGAGAAGCTGATGAGACTGT
TTGCAGACCTGATGATGAAGAATTGTTTGCGGATATTGATGCTGATGAGTTTAATCCTGT
CCTGAGACGTGAAGTTACTCCTAAGGTCTTGATCACTACATGTCGTTTCAATTCCACTAG
AGGACCTGCGTTTATATCGGAGTTACAGTCGGTGATCCCGAACTCTGATTATCGCAAGAG
AGGAACTTATGATTTGAAGAAGATTGTAGAGTACGCAAAGAAGAAGGATTATACATCTCT
TATTGTAGTTCATACTAATCGCAGAGAGCCTGATGCGCTCCTTATCATTGGTTTGCCAAA
CGGCCCTACTGCTCATTTCAAATTGTCAAAACTTGTTCTAAGAAAGATATTAAGAATCAT
GGAAACCCTA

QA 7 736 7 736
DS 

RD RR2GD46TF 736 0 0
TTCTTTCGCTTGCCGTTTTCATCGAAACAGAAACAGAGAAGATTCAGTGCGCTGTGGAAG
AATGGGTTTCAAGAGGAGAAAGGGTGACGGCGACGGAGAGGAAATGGAAGGCGAAGATAA
CAGAAGACCGAGCTTCAACACGGCGGAGAGGAGGAACGTGATACTGCCGTCGATGATAAA
GAACAAAGACAAGAGAGCCAAAGTGTACGCGAAGCAGAAACACGAGAAGAAAGTCGAGAA
GCAGAAGAAGATCAGAGCTCGTGACGCCGCTGAGAAACAAGCTCTCGAGCTTGGCTAAGA
GCCTCCACGGAAGATGGTTCCGAAGACGATTGAGAATACGAGAGAAGCTGATGAGACTGT
TTGCAGACCTGATGATGAAGAATTGTTTGCGGATATTGATGCTGATGAGTTTAATCCTGT
CCTGAGACGTGAAGTTACTCCTAAGGTCTTGATCACTACATGTCGTTTCAATTCCACTAG
AGGACCTGCGTTTATATCGGAGTTACAGTCGGTGATCCCGAACTCTGATTATCGCAAGAG
AGGAACTTATGATTTGAAGAAGATTGTAGAGTACGCAAAGAAGAAGGATTATACATCTCT
TATTGTAGTTCATACTAATCGCAGAGAGCCTGATGCGCTCCTTATCATTGGTTTGCCAAA
CGGCCCTACTGCTCATTTCAA*TTGTCAAA*CTTGTTCTAAGAA*GATATTAAGAATCAT
GGAAACCCTACAGCCA

QA 1 736 1 736
DS 



CO CL1214Contig2 801 3 3 U
AGTTGAATCTTGATGGCTTATATTGAGAAGAAATGTGAAGTTTTAGAAGACGATTCAAGT
AAAAGCTACAGTTTTGGTTTGGGTTATAAAACTTCAAACGAAAATAAACACAAAACTTGG
GATGAAGACCCAGCAGCATTCAATCACAAGAAGAACCTCCTCCTGCTCGTGTCCATTTCA
GGCTTATGAACCCATTCGAACTCTCCGCCTTTTGTGTCAAAGGTTCCATGCTGTAAAGTT
ACTAGCTTAAGTGTGAATTGTGGACCACATTCCTGAAGACGAGGCTTGACTCTCTCTTTA
GCAACACCATCTTTTCCTTTCGCACCACTTTGTTTGTCTTCCTTTACGTCGAATATGTAA
CGATGATGTCTGAAAAATATAAAGTCACGCTGGTTGTGGAACGTTACAACTCTCCTACCA
CGGAAGTTAGGTACTTGAGGAAACAGTGACTGGAAAAACCTCCCAACACGGTTTCCCAAA
CGAGTTGTGAAGTTAGTTAAAATCAGTTCCGGTTCATGGCTTGTAGGGTTTCCATGATTC
TTAATATCCTTCCTTAGAACAAGTTTTGACAATTTGAAATGAGCAGTAGGGCCGTTTGGC
AAACCAATGATAAGGAGCGCATCAGGCTCTCTGCGATTAGTATGAACTACAATAAGAGAT
GTATAATCCTTCTTCTTTGCGTACTCTACAATCTTCTTCAAATCATAAGTTCCTCTCTTG
CGATAATCAGAGTTCGGGATCACCGACTGTAACTCCGATATAAACGCAGTCCTCTAGTGG
AATTGAAACGACATGTAGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2D885JQ U 4
AF RR2GZ62JQ U 1
AF RR2GD46JQ U 5
BS 1 408 RR2GZ62JQ
BS 409 409 RR2D885JQ
BS 410 801 RR2GZ62JQ

RD RR2D885JQ 740 0 0
CGG
ATCTTGATGGCTTATATTGAGAAGAAATGTGAAGTTTTAGAAGACGATTTAAGGAAAAGC
TACAGTTTTGGTTTGGGTTATAAAACGGCAAACGAAAATAAACACAAAACTTGGGGTGAA
GACACAGCAGCATTCAATCACAAGAAGAACCTCCTCCTGCTCGTGTCCATTTCAGGCTTA
TGAACCCATTCAAACTCTCCGCCTTTTGTGTCAAAGGTTCCATGCTGTAAAGTCACTAGC
TTAAGAGTGAATTTTGGACCACATTCCTGAAGACGAGGCTTGACTCTCTCTTTAGCAACA
CCATCTTTTCCTTTCGCACCACTTTGTTTGTCTTCCTTTACGTCGAATATGTAACGATGA
TGTCTGAAAAGTATAAAGTCACGCTGGTTATGGAACGTTACAACTCTCCTACCACGGAAG
TTAGGTACTTGAGGAAACAGTGACTGGAAAAACCTCCCAACACGGTTTCCTAGACGAGTT
GTGAAGTTATTTAAAATCAGTTCCGGTTCATGGCTTGTAGGGTTTCCATGATTCTTAATA
TCCTTCCTTAGAACAAGATTTGACAACTTGAAATGAGCAGTAGGACCATTTGGCAAACCA
ATGATGAGGAGCGCATCAGGCTCTCTGCGATTAGTATGAACTACAATAAGAGATGTATAC
TCCTTCTTCTTTGCGTACTCTACAATCTTCTTCAAATCATAAGTTCCCCTCTTGCGATAA
TCAAAGTTCGGGATC
GC

QA 4 738 4 738
DS 

RD RR2GZ62JQ 801 0 0
AGTTGAATCTTGATGGCTTATATTGAGAAGAAATGTGAAGTTTTAGAAGACGATTCAAGT
AAAAGCTACAGTTTTGGTTTGGGTTATAAAACTTCAAACGAAAATAAACACAAAACTTGG
GATGAAGACCCAGCAGCATTCAATCACAAGAAGAACCTCCTCCTGCTCGTGTCCATTTCA
GGCTTATGAACCCATTCGAACTCTCCGCCTTTTGTGTCAAAGGTTCCATGCTGTAAAGTT
ACTAGCTTAAGTGTGAATTGTGGACCACATTCCTGAAGACGAGGCTTGACTCTCTCTTTA
GCAACACCATCTTTTCCTTTCGCACCACTTTGTTTGTCTTCCTTTACGTCGAATATGTAA
CGATGATGTCTGAAAAATATAAAGTCACGCTGGTTGTGGAACGTTACAGCTCTCCTACCA
CGGAAGTTAGGTACTTGAGGAAACAGTGACTGGAAAAACCTCCCAACACGGTTTCCCAAA
CGAGTTGTGAAGTTAGTTAAAATCAGTTCCGGTTCATGGCTTGTAGGGTTTCCATGATTC
TTAATATCCTTCCTTAGAACAAGTTTTGACAATTTGAAATGAGCAGTAGGGCCGTTTGGC
AAACCAATGATAAGGAGCGCATCAGGCTCTCTGCGATTAGTATGAACTACAATAAGAGAT
GTATAATCCTTCTTCTTTGCGTACTCTACAATCTTCTTCAAATCATAAGTTCCTCTCTTG
CGATAATCAGAGTTCGGGATCACCGACTGTAACTCCGATATAAACGCAGTCCTCTAGTGG
AATTGAAACGACATGTAGTGA

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2GD46JQ 796 0 0
GG
ATCTTGATGGCTTATATTGAGAAGAAATGTGAAGTTTTAGAAGACGATTCAAGTAAAAGC
TACAGTTTTGGTTTGGGTTATAAAACTTCAAACGAAAATAAACACAAAACTTGGGATGAA
GACCCAGCAGCATTCAATCACAAGAAGAACCTCCTCCTGCTCGCGTCCATTTCAGGCTTA
TGAACCCATTCGAACTCTCCGCCTTTTGTGTCAAAGGTTCCATGCTGTAAAGTTACTAGC
TTAAGTGTGAATTGTGGACCACGTTCCTGAAGACGAGGCTTGACTCTCTCTTTAGCAACA
CCATCTTTTCCTTTCGCACCACTTTGTTTGTCTTCCTTTACGTCGAATATGTAACGATGA
TGTCTGAAAAATATAAAGTCACGCTGGTTGTGGAACGTTACAACTCTCCTACCACGGAAG
TTAGGTACTTGAGGAAACAGTGACTGGAAAAACCTCCCAACACGGTTTCCCAAACGAGTT
GTGAAGTTAGTTAAAATCAGTTCCGGTTCATGGCTTGTAGGGTTTCCATGATTCTTAATA
TCCTTCCTTAGAACAAGTTTTGACAATTTGAAATGAGCAGTAGGGCCGTTTGGCAAACCA
ATGATAAGGAGCGCATCAGGCTCTCTGCGATTAGTATGAACTACAATAAGAGATGTATAA
TCCTTCTTCTTTGCGTACTCTACAATCTTCTTCAAATCATAAGTTCCTCTCTTGCGATAA
TCAGAGTTCGGGATCACCGACTGTAACTCCGATATAAACGCAGTCCTCTAGTGGAATTGA
AACGACATGTAGTG

QA 3 796 3 796
DS 



AS 1 4

CO CL1215Contig1 1638 4 29 U
GGTACACTACATATGATGGACTTTACGAAATGGAGAAGATATTGGAGTTTCTAGGCAAGA
ACAAGTTTCCGTTGATTACAAAATTGAGTGAAAGCAATACTGCTTGGGTTTACTCTAGTC
CTGTTAAGCTTCAGGTTATGATCTTTGCCAAGGCTAATGACTTTCAGAATATGGCTCAGC
CTCTTGAAGATTTTGCAAGAAGATTTAAATCTAAGCTTATGTTTATATATATTGATATAA
CAAATGAGAACCTTGCGATGCCATTCTTGACCTTGTTTGGAATAGAGGATGCCAACAAAA
TTGTTGTTGCTGCTTTCGATAACAAACTCAACTCCAATTATTTACTCGAGTCAGATCCTT
CACAAAGCAATATAGAAGAGTTTTGTTCAGGACTTGCAGATGGAACCGTTCCACGCTACT
ACAGGTCAGAGCCAGTTCCAGATAATGAAAATGCAAGCATTGTGACTGTGGTAGGAAAGA
CTTTTGATGAGTTGGTATTGAACAGTCAATACAATGTTCTTCTTGAGGTACATACACCAT
GGTGTGTGAACTGCGAGGCAATGAGCAAACAGGTCGTGAAGTTAGCTAAGCATTTCAAAG
GCTTTGAGAATCTCGTTTTCGCAAGAATTGATGCGTCTACAAATGAGCATGCTAAATTAC
AGGTTGATGATTATCCGACGATCTTGCTCTACAAATCTGGTGAAAAGGAGAAGCCGTTAA
AGCTATCAACTAAATTGAGCGCCAAAGACATGGCTGTTTCGATCAATGAAGAGTTGAAAC
CAAGAGGTGGTTCTGTTAAGGATGAGTTGTAGTCAAGCTTTATTAAGGATATGTAGACAA
AAGAAGAGACAGAGAGAAAGATCACAATGTGATGACATTACATGTTTTTAATATATTGTC
TGGAATTGGAAAACAATTCATCACAACGAACTGACATTACAATTGATATTGTGTGATACA
AAATAAAAATTTGAAAAAGAAAAACAGAATACTAATAGTACCCTCTCTGTGATTAGCATT
CACACCCTGTTGATCTTTGTTGCTGACCTCCAGCAACATCAATGGTGTCTGGCATGTACG
GTTCTTCTTCAGGTTCATTCTTGAATGCATTTTTGGTAATGCACTCAAATGCTGCATCTA
CATTGAACCCTTCTTTGGCAGATGTCTCAAAGTAAGGAATGTTTCCTTTAGATGCACACC
ATGCCTTTGCTTTCTTCTCAAAAACCACTCGGCTCTTGCCACCATCAACATCGGTCTTGT
TCCCCAACACAACAAAAGGGAAGTTTTCAGGATCAGATGGACTAGCCTGAATCAAGAACT
CTTCTCTCCAGTTATTAAGATTCTCAAAAGACTTCATAACATTGACATCGTTCACAAGAA
CACAACAATCAGCTCCTCTGTAAAAAGCAACTCCCAAACTCTGGAACCTTTCTTGCCCAG
CAGTATCCCAAATCTGTAAAGTGAAGATCCTGTCATCAATTTGAACCTCTTTAGTCAAGA
AATCTGCTCCAATCGTCGCTTTATACTGATTGCTAAATTTGCGATTCACAAACTGATTCA
TCAACGATGTCTTTCCAACCCCGCTATCTCCAAGGATGATGACTTTCAGAAGAACTCTCC
GGCGAGACGACATTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2GQ21TF U 1
AF RR2GQ21JQ C 562
AF RR2A967JQ U 860
AF RR2CG56JQ U 890
BS 1 662 RR2GQ21TF
BS 663 663 RR2GQ21JQ
BS 664 694 RR2GQ21TF
BS 695 859 RR2GQ21JQ
BS 860 922 RR2A967JQ
BS 923 923 RR2CG56JQ
BS 924 1006 RR2A967JQ
BS 1007 1007 RR2CG56JQ
BS 1008 1147 RR2A967JQ
BS 1148 1148 RR2CG56JQ
BS 1149 1220 RR2A967JQ
BS 1221 1221 RR2CG56JQ
BS 1222 1261 RR2A967JQ
BS 1262 1262 RR2CG56JQ
BS 1263 1270 RR2A967JQ
BS 1271 1271 RR2CG56JQ
BS 1272 1276 RR2A967JQ
BS 1277 1277 RR2CG56JQ
BS 1278 1294 RR2A967JQ
BS 1295 1295 RR2CG56JQ
BS 1296 1300 RR2A967JQ
BS 1301 1301 RR2CG56JQ
BS 1302 1420 RR2A967JQ
BS 1421 1421 RR2CG56JQ
BS 1422 1483 RR2A967JQ
BS 1484 1484 RR2CG56JQ
BS 1485 1540 RR2A967JQ
BS 1541 1541 RR2CG56JQ
BS 1542 1638 RR2A967JQ

RD RR2GQ21TF 701 0 0
GGTACACTACATATGATGGACTTTACGAAATGGAGAAGATATTGGAGTTTCTAGGCAAGA
ACAAGTTTCCGTTGATTACAAAATTGAGTGAAAGCAATACTGCTTGGGTTTACTCTAGTC
CTGTTAAGCTTCAGGTTATGATCTTTGCCAAGGCTAATGACTTTCAGAATATGGCTCAGC
CTCTTGAAGATTTTGCAAGAAGATTTAAATCTAAGCTTATGTTTATATATATTGATATAA
CAAATGAGAACCTTGCGATGCCATTCTTGACCTTGTTTGGAATAGAGGATGCCAACAAAA
TTGTTGTTGCTGCTTTCGATAACAAACTCAACTCCAATTATTTACTCGAGTCAGATCCTT
CACAAAGCAATATAGAAGAGTTTTGTTCAGGACTTGCAGATGGAACCGTTCCACGCTACT
ACAGGTCAGAGCCAGTTCCAGATAATGAAAATGCAAGCATTGTGACTGTGGTAGGAAAGA
CTTTTGATGAGTTGGTATTGAACAGTCAATACAATGTTCTTCTTGAGGTACATACACCAT
GGTGTGTGAACTGCGAGGCAATGAGCAAACAGGTCGTGAAGTTAGCTAAGCATTTCAAAG
GCTTTGAGAATCTCGTTTTCGCAAGAATTGATGCGTCTACAAATGAGCATGCTAAATTAC
AG*TTGATGATTATCCGACGATCTTGCTCTACAA
TCTGGTG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2GQ21JQ 363 0 0
TGAGCAAACAGGTCGTGAAGTTAGCTAAGCATTTCAAAGGCTTTGAGAATCTCGTTTTCG
CAAGAATTGATGCGTCTACAAATGAGCATGCTAAATTACAGGTTGATGATTATCCGACGA
TCTTGCTCTACAAATCTGGTGAAAAGGAGAAGCCGTTAAAGCTATCAACTAAATTGAGCG
CCAAAGACATGGCTGTTTCGATCAATGAAGAGTTGAAACCAAGAGGTGGTTCTGTTAAGG
ATGAGTTGTAGTCAAGCTTTATTAAGGATATGTAGACAAAAGAAGAGACAGAGAGAAAGA
TCACAGTGTGATGACATTACATGTTTTTAATATATTGTCTGGAATTGGAAAACAATTCAT
TAC

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR2A967JQ 779 0 0
GATCACAATGTGATGACATTACATGTTTTTAATATATTGTCTGGAATTGGAAAACAATTC
ATCTCAACGAACTGACATTACAATTGATATTGTGTGATACAAAATAAAAATTTGAAAAAG
AAAAACAGAATACTAATAGTACCCTCTTTGTGATTAGCATTCACACCCTGTTGATCTTTG
TTGCTGACCTCCAGCAACATCAATGGTGTCTGGCATGTACGGTTCTTCTTCAGGTTCATT
CTTGAATGCATTTTTGGTAATGCACTCAAATGCTGCATCTACATTGAATCCTTCTTTGGC
AGATGTCTCAAAGTAAGGAATGTTTCCTTTAGATGCACACCATGCCTTTGCTTTCTTCTC
AGAAACCACTCGGCTCTTGCCACCATCAACATCGGTCTTGTTTCCCAACACGACAAACGG
GAAGTTTTCAGGATCTGATGGGCTAGCCTGAATCAAGAACTCTTCTCTCCAGTTATTAAG
ATTCTCAAAAGACTTCATAACATTGACATCGTTCACAAGAACACAACAATCAGCTCCTCT
GTAAAAAGCAACTCCCAAACTTTGGAACCTTTCTTGCCCAGCAGTATCCCAAATCTGTAA
AGTGAAGATCCTGTCATCAATTTGGACCTCTTTAGTCAAGAAATCTGCTCCAATCGTCGC
TTTATACTGATTGCTAAATTTTCGATTCACAAACTGATTCATCAACGATGTCTTTCCAAC
CCCGCTATCTCCAAGGATGATGACTTTCAGAAGAACTCTCCGGCGAGACGACATTTGGC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2CG56JQ 748 0 0
AATATATTGTCTGGAATTGGAAAACAATTCATTACAACGAACTGACATTACAATTGATAT
TGTGTGATACAAAATAAAAATTTGAAAAAGAAAAACAGAATACTAATAGTACCCTCTCTG
TGATTAGCATTCACACCCTGTTGATCTTTGTTGCTGACCTCCAGCAACATCAATGGTGTC
TGGCATGTACGGTTCTTCTTCAGGTTCATTCTTGAATGCGTTTTTGGTTATGCATTCAAA
TGCTGCATCTACATTGAACCCTTCTTTGGCAGATGTCTCAAAGTAAGGAATGTTTCCTTT
AGATGCACACCATGCCTTTGCTTTCTTCTCAAAAACCACTCGGCTCTTGCCACCATCAAC
ATCGGTCTTGTTCCCCAACACAACAAAAGGGAAGTTTTCAGGATCAGATGGACTAGCCTG
AATCAAGAACTCTTCTCTCCAGTTATTGAGATTCTCAAAAGACTTCATAACATTGACATC
GTTCACAAGAACACAACAATCAGCTCCTCTGTAGAAAGCAACTCCCAAACTCTGGAACCT
TTCTTGCCCAGCAGTATCCCAAATCTGTAAAGTGAAGATCCTGTCATCAATTTGAACCTC
TTTAGTCAAGAAATCTGCTCCAATCGTCGCTTTATACTGATTGCTAAATTTGCGATTCAC
AAACTGATTCATCAACGATGTCTTTCCAACCCCGCTATCTCCGAGGATGATGACTTTCAG
AAGAACTCTCCGGCGAGACGACATT
GGC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 6

CO CL1216Contig1 762 6 4 U
TTTTTAACTTCTCCTTTTCCTCAATCCCCAAATCTTCGAAGATAGATTCAGATCGGAAAC
GGAAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAACCAAAGGACAAGAGAGCCGATCACCACC
ACCATCACCACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGGCGTCGAGAGACCAAG
TGAAGGCGTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAGGAAGGCGTCGTGGAAGG
ATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTTAAAT
CGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAACTTCGAGGATGTGGCGGCTCGTGTTT
CCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCATTTGGTCGAGGTCAAATGC
AGAAACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCACTGAAGGTGGGAGATATAAGCGAGATTGTGG
ACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACAGCTTGATCTGTTTATCTCCTTCAAA
GCCTCCTCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTTTTTGATTTTACCTTCTCTTCTTTGA
CCAAGGATAGAAGATTGAATAATAAGATAAAAAGCTTTGCTATCGTGGCTTTGGTTCTGC
ATCTTTATATGGATTTGATACAACCAAACATATGATAAAGACAAGAAACTGTATCTTAGT
TACTTCTCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTGACAG


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BX27JQ C 127
AF RR2CR65TF U 36
AF RR2CR65JQ C 127
AF RR2BX27TF U 1
AF RR2AO63JQ C 6
AF RR2AO63TF U 6
BS 1 703 RR2BX27TF
BS 704 704 RR2CR65TF
BS 705 725 RR2BX27TF
BS 726 762 RR2AO63TF

RD RR2BX27JQ 552 0 0
ACCACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGGCGTCGAGAGACCAAGTGAAGG
CGTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCGG
AAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCGATCC
GTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAACTTCGAGGATGTGGCGGCTCGTGTTTCCGACT
GTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCATTTGGTCGAGGTCAAATGCAGAAAC
CGTTTGAGGAAGCAACATACGCACTGAAGGTGGGAGATATAAGCGAGATTGTGGACACAG
ACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACAGCTTGATCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCC
TCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTTTTTGATTTTACCTTTTCTTCTTTGACCAAGG
ATAGAAGATTGAATAATAAGATAAAAAGCTTTGCTATCGTGGCTTTGGTTCTGCATCTTT
ATATGGATTTGA

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2CR65TF 684 0 0
GG
GAAGATAGATTCAGATCGGAAACGGAAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAACCAAA
GGACAAGAGAGCCGATCACCACCACCATCACCACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAG
CAAGATGGCGTCGAGAGACCAAGTGAAGGCGTCGCACATTCTGATCAAGCATCAGGGATC
TCGCAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGA
AGCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAACTT
CGAGGATGTGGCGGCTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGG
TCCATTTGGTCGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCACTGAAGGT
GGGAGATATAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACAGC
TTGATCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTTTT
TGATTTTACCTTCTCTTCTTTGACCAAGGATAGAAGATTGAATAATAAGATAAAAAGCTT
TGCTATCGTGGCTTTGGTTCTGCATCTTTATATGGATTTGATACAACCAAACATATGATA
AAGACAAGAAACTGTATCTTAG

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR2CR65JQ 583 0 0
ACCACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGGCGTCGAGAGACCAAGTGAAGG
CGTCGCACATTCTGATCAAGCATCAGGGATCTCGCAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCGG
AAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCGATCC
GTGAAGACATCCTTTCTGGCAAAGCCAACTTCGAGGATGTGGCGGCTCGTGTTTCCGACT
GTAGTTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCATTTGGTCGAGGTCAAATGCAGAAAC
CGTTTGAGGAAGCAACATACGCACTGAAGGTGGGAGATATAAGCGAGATTGTGGACACAG
ACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACAGCTTGATCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCC
TCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTTTTTGATTTTACCTTTTCTTCTTTGACCAAGG
ATAGAAGATTGAATAATAAGATAAAAAGCTTTGCTATCGTGGCTTTGGTTCTGCATCTTT
ATATGGATTTGATACAACCAAACATATGATAAAGACAAGAAAC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2BX27TF 730 0 0
TTTTTAACTTCTCCTTTTCCTCAATCCCCAAATCTTCGAAGATAGATTCAGATCGGAAAC
GGAAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAACCAAAGGACAAGAGAGCCGATCACCACC
ACCATCACCACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGGCGTCGAGAGACCAAG
TGAAGGCGTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAGGAAGGCGTCGTGGAAGG
ATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTTAAAT
CGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAACTTCGAGGATGTGGCGGCTCGTGTTT
CCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCATTTGGTCGAGGTCAAATGC
AGAAACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCACTGAAGGTGGGAGATATAAGCGAGATTGTGG
ACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACAGCTTGATCTGTTTATCTCCTTCAAA
GCCTCCTCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTTTTTGATTTTACCTTCTCTTCTTTGA
CCAAGGATAGAAGATTGAATAATAAGATAAAAAGCTTTGCTATCGTGGCTTTGGTTCTGC
ATCTTTATATGGATTTGATACAACCAAACATATGATAAAGACA*GAAACTGTATCTTAGT
TACTT
TCATA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2AO63JQ 757 0 0
AACTTCTCCTTTTCCTCAATCCCCAAATCTTCGAAGATAGATTCAGATCGGAAACGGAAG
AAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAACCAAAGGACAAGAGAGCCGATCACCACCACCAT
CACCACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGGCGTCGAGAGACCAAGTGAAG
GCGTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCG
GAAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCGATC
CGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAACTTCGAGGATGTGGCGGCTCGTGTTTCCGAC
TGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCATTTGGTCGAGGTCAAATGCAGAAA
CCGTTTGAGGAAGCAACATACGCACTGAAGGTGGGAGATATAAGCAAGATTGTGGACACA
GACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACAGCTTGATCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTC
CTCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTTTTTGATTTTACCTTCTCTTCTTTGACCAAG
GATAGAAGATTGAATAATAAGATAAAAAGCTTTGCTATCGTGGCTTTGGTTCTGCATCTT
TATATGGATTTGATACAACCAAACATATGATAAAGACAAGAAACTGTATCTTAGTTACTT
CTCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTGACAG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2AO63TF 757 0 0
AACTTCTCCTTTTCCTCAATCCCCAAATCTTCGAAGATAGATTCAGATCGGAAACGGAAG
AAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAACCAAAGGACAAGAGAGCCGATCACCACCACCAT
CACCACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGGCGTCGAGAGACCAAGTGAAG
GCGTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCG
GAAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCGATC
CGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAACTTCGAGGATGTGGCGGCTCGTGTTTCCGAC
TGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCATTTGGTCGAGGTCAAATGCAGAAA
CCGTTTGAGGAAGCAACATACGCACTGAAGGTGGGAGATATAAGCAAGATTGTGGACACA
GACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACAGCTTGATCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTC
CTCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTTTTTGATTTTACCTTCTCTTCTTTGACCAAG
GATAGAAGATTGAATAATAAGATAAAAAGCTTTGCTATCGTGGCTTTGGTTCTGCATCTT
TATATGGATTTGATACAACCAAACATATGATAAAGACAAGAAACTGTATCTTAGTTACTT
CTCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTGACAG

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 6

CO CL1217Contig1 1266 6 29 U
GGTAGCATCCATACAATTAAACATTAAATTGAAACAACAAAGACGTGAGATAGTCTGAGG
CACAGCAAAACGGAACAGGGTTCAAAGCAAGGTTTGCTCCCTCCTAAAGAGGCAGGTCAT
AAAGACACCAAACTCACAAAACAAAAGAGAGAAAAGACGGAGCACTTAAGATAGACGCTG
AGTAGCGGTTCTTCTCTTCCTGAGCCGTTCAGCAACAATGAAGGCCAGTTCAAGAGACTG
AGATGCGTTGAGCCTTGGGTCACAGTGTGTGTGGTAGCGAGAGCTTAAGTCATCGTAAGT
CACAGTACGGGACCCTCCAATGCACTCTGTCACATTCTGTCCTGTCATCTCTAGATGGAT
ACCTCCCGCGTGGCTTCCTTCTTGCTCGTGCACATCTAGGAAGGCTCTCACTTCAGCCAG
GATAGAGTCAAAGGCTCTTGTTTTGAGACCGCAAGGTGCTTTGATGGTGTTTCCATGCAT
AGGATCGCAGACCCATGTCACAATCTGGCCTGACCTGCGCACTGCTCTGATTAGGTGAGG
AAGCTTAACCCTCATGTTCTCCGCACCCATTCTAACAATCACAGTGATTCTTCCAGGTTT
GTTGTTAGGATTCAGGATTTCCACAAGCTTTACAAGCTCATTGGGATCCATTTTGTTGCT
CACCTTAATGCCAAGAGGGTTAGCAATCCCCC*TGAGAAACTCGACATGAGCACCATCCA
ATTGTCGGGTACGCTCTCCACACCACACCATGTGGGCAGAGCAATCATAGTAGAGACCAG
AAGTTGAGTCCAACCTCGTGAGAGACTGTTCATAAGGCAAAAGCAAACACTCATGGGACG
TGTAGAAATCAGTTGTAGTCATAAGTGGATGATCAGTGGTAAGTCCACAAGCAGACATGA
ACCCCAAGGCCTCATCAACCCTGTTGGCCAGCTCCTGGTACCTGTCAGCTTGCTCGCTCT
GCTCAACGAAATCAAGGTTCCACTGTGTAACTCTTTGAATAGCAGCGTAACCTCCAGTAG
CAAAGGCTCTGAGAAGGTTCAACGTAGCTGCAGATTGCGTGTAAGCACGAATCATCCTGT
TGGGATCAGGGATTCTGGACTTCTCATCGAAAGTGTCGCCGTTGATGTTGTCTCCCTTGT
AGCTAGGTAACTTAACACCATCCTTCTCCTCGAATGGATCAGATCTAGGCTTCGCAAACT
GACCAGCCATTCTCCCAACCTTTATGACCGGAACTTGACCGCCGAAGGTAAGAACAATGC
TCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2DI07JQ U 42
AF RR2E552JQ U 10
AF RR2H351JQ U 1
AF RR2H351TF C 344
AF RR2E552TF C 512
AF RR2DI07TF C 488
BS 1 51 RR2H351JQ
BS 52 52 RR2E552JQ
BS 53 70 RR2H351JQ
BS 71 71 RR2E552JQ
BS 72 112 RR2H351JQ
BS 113 113 RR2E552JQ
BS 114 184 RR2H351JQ
BS 185 185 RR2E552JQ
BS 186 243 RR2H351JQ
BS 244 244 RR2E552JQ
BS 245 531 RR2H351JQ
BS 532 532 RR2E552JQ
BS 533 549 RR2H351JQ
BS 550 550 RR2E552JQ
BS 551 561 RR2H351JQ
BS 562 562 RR2E552JQ
BS 563 692 RR2H351JQ
BS 693 693 RR2H351TF
BS 694 769 RR2H351JQ
BS 770 955 RR2H351TF
BS 956 956 RR2DI07TF
BS 957 1018 RR2H351TF
BS 1019 1019 RR2DI07TF
BS 1020 1030 RR2H351TF
BS 1031 1031 RR2DI07TF
BS 1032 1078 RR2H351TF
BS 1079 1079 RR2DI07TF
BS 1080 1096 RR2H351TF
BS 1097 1266 RR2DI07TF

RD RR2DI07JQ 532 0 0
GACGTGAGATAGTCTGAGGCACAGCAAAACGGAACAGGGTTCAAAGCAAGGTTTGCTCCC
TCCTAAAGAGGCAGGTCATAAAGACACCAAACTCACAAAACAAAAGAGAGAAAAGACGGA
GCACTTAAGATAGACGCTGAGTAGCGGTTCTTCTCTTCCTGAGCCGTTCAGCAACAATGA
AGGCCAGTTCAAGAGACTGAGATGCGTTGAGCCTTGGGTCACAGTGTGTGTGGTAGCGAG
AGCTTAAGTCATCGTAAGTCACAGTACGGGACCCTCCAATGCACTCTGTCACATTCTGTC
CTGTCATCTCTAGATGGATACCTCCCGCGTGGCTTCCTTCTTGCTCGTGCACATCTAGGA
AGGCTCTCACTTCAGCCAGGATAGAGTCAAAGGCTCTTGTTTTGAGACCGCAAGGTGCTT
TGATGGTGTTTCCATGCATTGGATCGCAGACCCATGTCACAATCTGGCCTGACCTGCGCA
CTGCTCTGATTAGGTGAGGAAGCTTAACCCTCATGTTCTCCGCACCCATTCT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2E552JQ 653 0 0
CATACAGTTAAACATTAAATTGAAACAACAAAGACGTGAGATAGTCTGAGGCACAGCAAA
ACGGAACAGGGTTCAAAGCAAGGTTTGCTCCCTCCTAAAGAGGCAGGTCATAAAGACACC
AAACTCACAAAACAAAAGAGAGAAAAGACGGAGCACTTAAGATAGACGCTGAGTAGCGGT
TCTTCTCTTCCTGAGCCGTTCAGCAACAATGAAGGCCAGTTCAAGAGACTGAGATGCGTT
GAGCCTTGGGTCACAGTGTGTGTGGTAGCGAGAGCTTAAGTCATCGTAAGTCACAGTACG
GGACCCTCCAATGCACTCTGTCACATTCTGTCCTGTCATCTCTAGATGGATACCTCCCGC
GTGGCTTCCTTCTTGCTCGTGCACATCTAGGAAGGCTCTCACTTCAGCCAGGATAGAGTC
AAAGGCTCTTGTTTTGAGACCGCAAGGTGCTTTGATGGTGTTTCCATGCATTGGATCGCA
AACCCATGTCACAATCTGGCCTGACCTGCGCACTGCTCTGATTAGGTGAGGAAGCTTAAC
CCTCATGTTCTCCGCACCCATTCTAACAATCACAGTGATTCTTCCAGGTTTGTTGTTAGG
ATTCAGGATTTCCACAAGCTTTACAAGCTCATTGGGATCCATTTTGTTGCTCA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2H351JQ 769 0 0
GGTAGCATCCATACAATTAAACATTAAATTGAAACAACAAAGACGTGAGATTGTCTGAGG
CACAGCAAAAAGGAACAGGGTTCAAAGCAAGGTTTGCTCCCTCCTAAAGAGGTAGGTCAT
AAAGACACCAAACTCACAAAACAAAAGAGAGAAAAGACGGAGCACTTAAGATAGACGCTG
AGTAACGGTTCTTCTCTTCCTGAGCCGTTCAGCAACAATGAAGGCCAGTTCAAGAGACTG
AGACGCGTTGAGCCTTGGGTCACAGTGTGTGTGGTAGCGAGAGCTTAAGTCATCGTAAGT
CACAGTACGGGACCCTCCAATGCACTCTGTCACATTCTGTCCTGTCATCTCTAGATGGAT
ACCTCCCGCGTGGCTTCCTTCTTGCTCGTGCACATCTAGGAAGGCTCTCACTTCAGCCAG
GATAGAGTCAAAGGCTCTTGTTTTGAGACCGCAAGGTGCTTTGATGGTGTTTCCATGCAT
AGGATCGCAGACCCATGTCACAATCTGGCCTGACCTGCGCACTGCTCTGATGAGGTGAGG
AAGCTTAACTCTCATGTTCTCAGCACCCATTCTAACAATCACAGTGATTCTTCCAGGTTT
GTTGTTAGGATTCAGGATTTCCACAAGCTTTACAAGCTCATTGGGATCCATTTTGTTGCT
CACCTTAATGCCAAGAGGGTTAGCAATCCCCCCTGAGAAACTCGACATGAGCACCATCCA
ATTGTCGGGTACGCTCTCCACACCACACCATGTGGGCAGAGCAATCATA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2H351TF 758 0 0
GTCATCTCTAGATGGATAC*TCCCGCGTGGCTTC**TCT*GCTCGTGCACATCTAGGAAG
GCTCTCACTTCAGCCAGGATAGAGTCAAAGGCTCTTGTTTTGAGACCGCAAGGTGCTTTG
ATGGTGTTTCCATGCATAGGATCGCAGACCCATGTCACAATCTGGCCTGACCTGCGCACT
GCTCTGATGAGGTGAGGAAGCTTAACTCTCATGTTCTCAGCACCCATTCTAACAATCACA
GTGATTCTTCCAGGTTTGTTGTTAGGATTCAGGATTTCCACAAGCTTTACAAGCTCATTG
GGATCCATTTTGTTGCTCACCTTAATGCCAAGAGGGTTAGCAATCCCCC*TGAGAAACTC
GACATGAGCACCATCCAATTGTCGGGTACGCTCTCCACACCACACCATGTGGGCAGAGCA
ATCATAGTAGAGACCAGAAGTTGAGTCCAACCTCGTGAGAGACTGTTCATAAGGCAAAAG
CAAACACTCATGGGACGTGTAGAAATCAGTTGTAGTCATAAGTGGATGATCAGTGGTAAG
TCCACAAGCAGACATGAACCCCAAGGCCTCATCAACCCTGTTGGCCAGCTCCTGGTACCT
GTCAGCTTGCTCACTCTGCTCAACGAAATCAAGGTTCCACTGTGTAACTCTTTGAATAGC
AGCGTAACCTCCAGTGGCAAAGGCTCTAAGAAGGTTCAACGTAGCTGCAGATTGCGTGTA
AGCACGAATCATCCTATTGGGATCAGGGATTCT
AGACC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2E552TF 613 0 0
GACT
TGCGCACTGCTCTGATTAGGTGAGGAAGCTTAACCCTCATGTTCTCCGCACCCATTCTAA
CAATCACAGTGATTCTTCCAGGTTTGTTGTTAGGATTCAGGATTTCCACAAGCTTTACAA
GCTCATTGGGATCCATTTTGTTGCTCACCTTAATGCCAAGAGGGTTAGCAATCCCCC*TG
AGAAACTCGACATGAGCACCATCCAATTGTCGGGTACGCTCTCCACACCACACCATGTGG
GCAGAGCAATCATAGTAGAGACCAGAAGTTGAGTCCAACCTCGTGAGAGACTGTTCATAA
GGCAAAAGCAAACACTCATGGGACGTGTAGAAATCAGTTGTAGTCATAAGTGGATGATCA
GTGGTAAGTCCACAAGCAGACATGAACCCCAAGGC*TCATCAACCCTGTTGGCCAG*TCC
TGGTACCTGTCAGCTTGCTCGCTCTGCTCAACGAAATCAAGGTTCCACTGTGTAACTCTT
TGAATAGCAGCGTAACCTCCAGTAGCAAAGGCTCTGAGAAGGTTCAACGTAGCTGCAGAT
TGCGTGTAAGCACGAATCATCCTGTTGGGATCAGGGATTCTGGACTTCTCATCGAAAGTG
TCGCCGTT
C

QA 5 612 5 612
DS 

RD RR2DI07TF 779 0 0
CAGACCCATGTCACAATCTGGC*TGAC*TGCGCACTGCTCTGATTAGGTGAGGAAGCTTA
ACCCTCATGTTCTCCGCACCCATTCTAACAATCACAGTGAT*CTTCCAGGTTTGTTGTTA
GGATTCAGGATTTCCACAAGCTTTACAAGCTCACTGGGATCCATTTTGTTGCTCACCTTA
ATGCCAAGAGGGTTAGCAATCCCCC*TGAGAAACTCGACATGAGCACCATCAAATTGTCG
GGTACGCTCTCCACACCACACCATGTGGGCAGAGCAATCATAGTAGAGACCAGAAGTTGA
GTCCAACCTCGTGAGAGACTGTTCATAAGGCAAAAGCAAACACTCATGGGACGTGTAGAA
ATCAGTTGTAGTCATAAGTGGATGATCAGTGGTAAGTCCACAAGCAGACATGAACCCCAA
GGCCTCATCAACCCTGTTGGCCAGCTCCTGGTACCTGTCAGCTTGCTCGCTCTGCTCAAC
GAAATCAAGGTTCCACTGTGTAACTCTTTGAATAGCAGCGTAACCTCCAGTAGCAAAGGC
TCTGAGAAGGTTCAAAGTAGCTGCAGATTGCGTGTAAGCACGAATCATCCTGTTGGGATC
AGGGATTCTGGACTTCTCATCGAAAGTGTCGCCGTTGATGTTGTCTCCCTTGTAGCTAGG
TAACTTAACACCATCCTTCTCCTCGAATGGATCAGATCTAGGCTTCGCAAACTGACCAGC
CATTCTCCCAACCTTTATGACCGGAACTTGACCGCCGAAGGTAAGAACAATGCTCATCC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 2 6

CO CL1218Contig1 802 2 4 U
GTCTTTCAAGATGACAATGAAGACAGTCCACCAACAAGTTCTTGCCCTTCCAGCAGCCAA
TACTGCTCCATCATCAGATTACTTGCCTGATCCAGCTTCCATTAAAAAGCTCCAAATCCC
AACTTCTTCCAAGAAATCTGAACAAATCAAGGGAAAATATATTCTTAGAAAGAAGAAAAC
CGATAGCTTCACAAACGGAACTAAAGATCAGAACAAGTCAGGTCCCAAGCTGACTGAAAC
AGTCAAGAGAAAGCTATCCTTGGGAGCTAAGATCCTTCAAATGGGAGGCTTAGAGAAGAT
TTACAAACGGCTCTTCAAAGTCTACGATGAAGAGAAACTCTTCAAGGCGTACCAGTGTTA
CTTATCCACAACCGCAGGTCCCATCGCAGGCTTACTCTTCATCTCATCAAAGAAGATTGC
TTTCTGCAGCGAAAGATCGATCAAACTGTCTTCTCCTCAGGGAGATCTAACCAGGGTTCA
CTACAAAGTGTCAATCCCATTGTCCAAGATCAATGGAGTCAACCAGAGTGTAGACACGAA
GAAGCCGTCTCAGAAGTACCTAGAAGTAGTCACTGCGGATGGCTTTGAGTTCTGGTTCAT
GGGTTTCTTGAACAACAAGAAAGCTTTCAACTGTCTTCATCAAGCGCTTTCTATGAGCTT
GGAGCAATAACAAGCCTAATTAGGAGAGAGAGCCTAGAAAACCAGACAATATTGTACAAA
CTCTTTTTATTTTAGTTTTTAAAACCTTTTGTTATCCATTGTTGACAAGAGAAAGATATT
GAATATATTTAGCTTGATCCCG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AJ08JQ C 1
AF RR2AJ08TF U 1
BS 1 1 RR2AJ08JQ
BS 2 767 RR2AJ08TF
BS 768 768 RR2AJ08JQ
BS 769 802 RR2AJ08TF

RD RR2AJ08JQ 802 0 0
GTCTTTCAAGATGACAATGAAGACAGTCCACCAACAAGTTCTTGCCCTTCCAGCAGCCAA
TACTGCTCCATCATCAGATTACTTGCCTGATCCAGCTTCCATTAAAAAGCTCCAAATCCC
AACTTCTTCCAAGAAATCTGAACAAATCAAGGGAAAATATATTCTTAGAAAGAAGAAAAC
CGATAGCTTCACAAACGGAACTAAAGATCAGAACAAGTCAGGTCCCAAGCTGACTGAAAC
AGTCAAGAGAAAGCTATCCTTGGGAGCTAAGATCCTTCAAATGGGAGGCTTAGAGAAGAT
TTACAAACGGCTCTTCAAAGTCTACGATGAAGAGAAACTCTTCAAGGCGTACCAGTGTTA
CTTATCCACAACCGCAGGTCCCATCGCAGGCTTACTCTTCATCTCATCAAAGAAGATTGC
TTTCTGCAGCGAAAGATCGATCAAACTGTCTTCTCCTCAGGGAGATCTAACCAGGGTTCA
CTACAAAGTGTCAATCCCATTGTCCAAGATCAATGGAGTCAACCAGAGTGTAGACACGAA
GAAGCCGTCTCAGAAGTACCTAGAAGTAGTCACTGCGGATGGCTTTGAGTTCTGGTTCAT
GGGTTTCTTGAACAACAAGAAAGCTTTCAACTGTCTTCATCAAGCGCTTTCTATGAGCTT
GGAGCAATAACAAGCCTAATTAGGAGAGAGAGCCTAGAAAACCAGACAATATTGTACAAA
CTCTTTTTATTTTAGTTTTTAAAACCTTTTGTTATCCATTGTTGACAAGAGAAAGATATT
GAATATATTTAGCTTGATCCCG

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2AJ08TF 802 0 0
G
TCTTTCAAGATGACAATGAAGACAGTCCACCAACAAGTTCTTGCCCTTCCAGCAGCCAAT
ACTGCTCCATCATCAGATTACTTGCCTGATCCAGCTTCCATTAAAAAGCTCCAAATCCCA
ACTTCTTCCAAGAAATCTGAACAAATCAAGGGAAAATATATTCTTAGAAAGAAGAAAACC
GATAGCTTCACAAACGGAACTAAAGATCAGAACAAGTCAGGTCCCAAGCTGACTGAAACA
GTCAAGAGAAAGCTATCCTTGGGAGCTAAGATCCTTCAAATGGGAGGCTTAGAGAAGATT
TACAAACGGCTCTTCAAAGTCTACGATGAAGAGAAACTCTTCAAGGCGTACCAGTGTTAC
TTATCCACAACCGCAGGTCCCATCGCAGGCTTACTCTTCATCTCATCAAAGAAGATTGCT
TTCTGCAGCGAAAGATCGATCAAACTGTCTTCTCCTCAGGGAGATCTAACCAGGGTTCAC
TACAAAGTGTCAATCCCATTGTCCAAGATCAATGGAGTCAACCAGAGTGTAGACACGAAG
AAGCCGTCTCAGAAGTACCTAGAAGTAGTCACTGCGGATGGCTTTGAGTTCTGGTTCATG
GGTTTCTTGAACAACAAGAAAGCTTTCAACTGTCTTCATCAAGCGCTTTCTATGAGCTTG
GAGCAATAACAAGCCTAATTAGGAGAGAGAGCCTAGAAAACCAGACAATATTGTACAAAC
TCTTTTTATTTTAGTTTTTAAAACCTTTTGTTATCCATTGTTGACA*GAGAAAGATATTG
AATATATTTAGCTTGATCCCG

QA 2 802 2 802
DS 



CO CL1218Contig2 905 4 9 U
GGACCCATCACTCATAATCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGATCAAGATTAAGAT
TCAAGATCAAATCACCACTCAATCTTTCAAGATGACAATGAAGACAGTCCACCAACAAGT
TCTTGCCCTTCCAGCAGCCAATACTGCTCCATCAGATTACTTGCCTGATCCAACTTCCAT
CAAAAAGCTCCAAATCCCAACTTCTTCCAAGAAATCTGAACAAATCAAGGGCAAATATAT
TCTTAGAAAGAAGAAAACCGATAGCTTCACAAACGGAACTAAAGATCAGAACAAGTCAGG
TCCCAAGCTGACTGAAACAGTCAAGAGAAAGCTATCCTTGGGAGCTAAGATCCTTCAAAT
GGGAGGCTTAGAGAAGATTTACAAACGGCTCTTCAAAGTCTACGAAGAAGAGAAACTCTT
CAAGGCGTACCAGTGTTACCTATCCACAACCGCAGGTCCCATCGCAGGCTTACTCTTCAT
CTCATCAAAGAAGATTGCTTTCTGCAGCGAAAGATCGATCAAAGTGTCTTCTCCTCAGGG
AGATCTAACCAGGGTTCACTACAAAGTGTCAATCCCATTGTCCAAGATCAATGGAGTCAA
CCAGAGTGTAGACACGAAGAAGCCATCTCAGAAATACCTAGAAGTAGTCACTGCGGATGG
CTTTGAGTTCTGGTTCATGGGTTTCTTGAACAACAAGAAAGCTTTCAACTGTCTTCAGCA
AGCGCTTTCTATGAGCTTGGAGCAATAACAAGCCTAAGGCTGAAAAGGAAATGTTCAATT
TCTAATTAGGAGAGAGCCTAGAAAATTCAGACAATATTGTACAAACTCTTTTTATTTTAG
CTTTTTACCCTTTTGTTATCCATTGTTGACAAGAGCAAGATATTGAATATATTTAGCTTG
ATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 

AF RR2C032TF U 1
AF RR2B592TF U 8
AF RR2B592JQ C 79
AF RR2C032JQ C 172
BS 1 297 RR2C032TF
BS 298 298 RR2B592TF
BS 299 744 RR2C032TF
BS 745 745 RR2B592TF
BS 746 756 RR2C032TF
BS 757 757 RR2B592TF
BS 758 848 RR2B592JQ
BS 849 849 RR2C032JQ
BS 850 905 RR2B592JQ

RD RR2C032TF 762 0 0
GGACCCATCACTCATAATCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGATCAAGATTAAGAT
TCAAGATCAAATCACCACTCAATCTTTCAAGATGACAATGAAGACAGTCCACCAACAAGT
TCTTGCCCTTCCAGCAGCCAATACTGCTCCATCAGATTACTTGCCTGATCCAACTTCCAT
CAAAAAGCTCCAAATCCCAACTTCTTCCAAGAAATCTGAACAAATCAAGGGCAAATATAT
TCTTAGAAAGAAGAAAACCGATAGCTTCACAAACGGAACTAAAGATCAGAACAAGTCCGG
TCCCAAGCTGACTGAAACAGTCAAGAGAAAGCTATCCTTGGGAGCTAAGATCCTTCAAAT
GGGAGGCTTAGAGAAGATTTACAAACGGCTCTTCAAAGTCTACGAAGAAGAGAAACTCTT
CAAGGCGTACCAGTGTTACCTATCCACAACCGCAGGTCCCATCGCAGGCTTACTCTTCAT
CTCATCAAAGAAGATTGCTTTCTGCAGCGAAAGATCGATCAAAGTGTCTTCTCCTCAGGG
AGATCTAACCAGGGTTCACTACAAAGTGTCAATCCCATTGTCCAAGATCAATGGAGTCAA
CCAGAGTGTAGACACGAAGAAGCCATCTCAGAAATACCTAGAAGTAGTCACTGCGGATGG
CTTTGAGTTCTGGTTCATGGGTTTCTTGAACAACAAGAAAGCTTTCAACTGTCTTCAGCA
AGCGCTTTCTATGAGCTTGGAGCA*TAACAAGCCTA
GGCTGA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2B592TF 756 0 0
GG
ACTCATAATCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTC**AAGATCAAGATTAAGATTCAAGATCA
AATCACCACTCAATCTTTCAAGATGACAATGAAGACAGTCCACCAACAAGTTCTTGCCCT
TCCAGCAGCCAATACTGCTCCATCAGATTACTTGCCTGATCCAACTTCCATCAAAAAGCT
CCAAATCCCAACTTCTTCCAAGAAATCTGAACAAATCAAGGGCAAATATATTCTTAGAAA
GAAGAAAACCGATAGCTTCACAAACGGAACTAAAGATCAGAACAAGTCAGGTCCCAAGCT
GACTGAAACAGTCAAGAGAAAGCTATCCTTGGGAGCTAAGATCCTTCAAATGGGAGGCTT
AGAGAAGATTTACAAACGGCTCTTCAAAGTCTACGAAGAAGAGAAACTCTTCAAGGCGTA
CCAGTGTTACCTATCCACAACCGCAGGTCCCATCGCAGGCTTACTCTTCATCTCATCAAA
GAAGATTGCTTTCTGCAGCGAAAGATCGATCAAAGTGTCTTCTCCTCAGGGAGATCTAAC
CAGGGTTCACTACAAAGTGTCAATCCCATTGTCCAAGATCAATGGAGTCAACCAGAGTGT
AGACACGAAGAAGCCATCTCAGAAATACCTAGAAGTAGTCACTGCGGATGGCTTTGAGTT
CTGGTTCATGGGTTTCTTGAACAACAAGAAAGCTTTCAACTGTCTTCAGCAAGCGCTTTC
TATGAGCTTGGAGCAATAACAAGCCTAA
AGCTGA

QA 3 750 3 750
DS 

RD RR2B592JQ 827 0 0
TCAA
TCTTTCAAGATGACAATGAAGACAGTCCACCAACAAGTTCTTGCCCTTCCAGCAGCCAAT
ACTGCTCCATCAGATTACTTGCCTGATCCAACTTCCATCAAAAAGCTCCAAATCCCAACT
TCTTCCAAGAAATCTGAACAAATCAAGGGCAAATATATTCTTAGAAAGAAGAAAACCGAT
AGCTTCACAAACGGAACTAAAGATCAGAACAAGTCAGGTCCCAAGCTGACTGAAACAGTC
AAGAGAAAGCTATCCTTGGGAGCTAAGATCCTTCAAATGGGAGGCTTAGAGAAGATTTAC
AAACGGCTCTTCAAAGTCTACGAAGAAGAGAAACTCTTCAAGGCGTACCAGTGTTACCTA
TCCACAACCGCAGGTCCCATCGCAGGCTTACTCTTCATCTCATCAAAGAAGATTGCTTTC
TGCAGCGAAAGATCGATCAAAGTGTCTTCTCCTCAGGGAGATCTAACCAGGGTTCACTAC
AAAGTGTCAATCCCATTGTCCAAGATCAATGGAGTCAACCAGAGTGTAGACACGAAGAAG
CCATCTCAGAAATACCTAGAAGTAGTCACTGCGGATGGCTTTGAGTTCTGGTTCATGGGT
TTCTTGAACAACAAGAAAGCTTTCAACTGTCTTCAGCAAGCGCTTTCTATGAGCTTGGAG
CAATAACAAGCCTAAGGCTGAAAAGGAAATGTTCAATTTCTAATTAGGAGAGAGCCTAGA
AAATTCAGACAATATTGTACAAACTCTTTTTATTTTAGCTTTTTACTCTTTTGTTATCCA
TTGTTGACAAGAGCAAGATATTGAATATATTTAGCTTGATCAC

QA 5 827 5 827
DS 

RD RR2C032JQ 734 0 0
AACTTCCATCAAAAAGCTCCAAATCCCAACTTCTTCCAAGAAATCTGAACAAATCAAGGG
CAAATATATTCTTAGAAAGAAGAAAACCGATAGCTTCACAAACGGAACTAAAGATCAGAA
CAAGTCCGGTCCCAAGCTGACTGAAACAGTCAAGAGAAAGCTATCCTTGGGAGCTAAGAT
CCTTCAAATGGGAGGCTTAGAGAAGATTTACAAACGGCTCTTCAAAGTCTACGAAGAAGA
GAAACTCTTCAAGGCGTACCAGTGTTACCTATCCACAACCGCAGGTCCCATCGCAGGCTT
ACTCTTCATCTCATCAAAGAAGATTGCTTTCTGCAGCGAAAGATCGATCAAAGTGTCTTC
TCCTCAGGGAGATCTAACCAGGGTTCACTACAAAGTGTCAATCCCATTGTCCAAGATCAA
TGGAGTCAACCAGAGTGTAGACACGAAGAAGCCATCTCAGAAATACCTAGAAGTAGTCAC
TGCGGATGGCTTTGAGTTCTGGTTCATGGGTTTCTTGAACAACAAGAAAGCTTTCAACTG
TCTTCAGCAAGCGCTTTCTATGAGCTTGGAGCAATAACAAGCCTAAGGCTGAAAAGGAAA
TGTTCAATTTCTAATTAGGAGAGAGCCTAGAAAATTCAGACAATATTGTACAAACTCTTT
TTATTTTAGCTTTTTACCCTTTTGTTATCCATTGTTGACAAGAGCAAGATATTGAATATA
TTTAGCTTGATCAC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 5

CO CL1219Contig1 992 5 4 U
AAAAAAAAACAATTCACATGTTTCCGGAAAAATCAGTTAAGACAAGAGAGATGAAATGAG
ATAAGAATATGCGATGCTGAGCTTCCAGTCTCCATCTCCTTTCTTCTTCTCCGGCTACCA
AAACCGGACCACCACTTCTTACTCTCCTCGTGCATCCACCGAACTAACTTCTTCTCCTTC
TCCATCGCTAATCTCTCGCCGTCTCATCCTTCTCCGTCACGCTCACAGTTCCTGGGACCA
TCTTTCCCTCAAAGACCATGACCGTCCTCTTACTAAGACCGGACAAGCTGATGCTGCTAA
AGTTGCTCAAATCCTCTCCTCACTCGGCTGGCTTCCCCAACTCATCCTCTCAAGCGACGC
GACTCGGACCAAGGAGACGCTGAAGTCAATGCAAGCGCAAGTCGATGGCTTTATGGAGGC
GAACGTACATTTCATCCCTAGCTTCTACTCCATCGCCGCTATGGACGGCCAAACCGCCGA
CCATCTTCACCACATCATCTCCAAATACTCATCCCCTGACATCACCACTGTCATGTGTAT
GGGGCATAATAAGGGATGGGAAGAAGCAGCCTCCATGCTCTCTGGTGCTTCCGTAAAGCT
GAAAACTTGCAATGCTACTTTGCTTCATGCTTTTGGCAACTCCTGGGATGATGCTTTCTC
TCTGGCTGGACCTGGTGGTTGGAAACTTGAGGGTATTGTGGCTCCAGATAGCACCATTTG
TGTCTAAGAGATCCCATAGCTTCAAGTTGGTTTACTTTCTTATCCTCTATCCTTTGTAAC
TTTTGCTACAACACAATATACAAAAGGCTGTGTAGTTTCATCCTTTCATGTGTCAACTAG
TTATGAATGATGATAAACATGTCAAGAGCACAGACTAGTGCATCTCTTTATTGGATGGTT
TGCCTTTGTGTAAGATCCTATAGCATCATAGATATGTTTCAAATGCAGTTGTATTACTTT
ATTCATGTTATATCAAAATACACTTAAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK45TF U 21
AF RR2C923TF U 1
AF RR2D111TF U 24
AF RR2C923JQ C 130
AF RR2EK45JQ C 196
BS 1 689 RR2C923TF
BS 690 706 RR2D111TF
BS 707 910 RR2C923JQ
BS 911 992 RR2EK45JQ

RD RR2EK45TF 540 0 0
GGTCC
GGAAAAATCAGTTAAGACAAGAGAGATGAAATGAGATAAGAATATGCGATGCTGAGCTTC
CAGTCTCCATCTCCTTTCTTCTTCTCCGGCTACCAAAACCGGACCACCACTTCTTACTCT
CCTCGTGCATCCACCGAACTAACTTCTTCTCCTTCTCCATCGCTAATCTCTCGCCGTCTC
ATCCTTCTCCGTCACGCTCACAGTTCCTGGGACCATCTTTCCCTCAAAGACCATGACCGT
CCTCTTACTAAGACCGGACAAGCTGATGCTGCTAAAGTTGCTCAAATCCTCTCCTCACTC
GGCTGGCTTCCCCAACTCATCCTCTCAAGCGACGCGACTCGGACCAAGGAGACGCTGAAG
TCAATGCAAGCGCAAGTCGATGGCTTTATGGAGGCGAACGTACATTTCATCCCTAGCTTC
TACTCCATCGCCGCTATGGACGGCCAAACCGCCGACCATCTTCACCACATCATCTCCAAA
TACTCATCCCCTGACATCACCACTGTCATGTGTATGGGGCATAATAAGGGATGGG

QA 6 540 6 540
DS 

RD RR2C923TF 689 0 0
AAAAAAAAACAATTCACATGTTTCCGGAAAAATCAGTTAAGACAAGAGAGATGAAATGAG
ATAAGAATATGCGATGCTGAGCTTCCAGTCTCCATCTCCTTTCTTCTTCTCCGGCTACCA
AAACCGGACCACCACTTCTTACTCTCCTCGTGCATCCACCGAACTAACTTCTTCTCCTTC
TCCATCGCTAATCTCTCGCCGTCTCATCCTTCTCCGTCACGCTCACAGTTCCTGGGACCA
TCTTTCCCTCAAAGACCATGACCGTCCTCTTACTAAGACCGGACAAGCTGATGCTGCTAA
AGTTGCTCAAATCCTCTCCTCACTCGGCTGGCTTCCCCAACTCATCCTCTCAAGCGACGC
GACTCGGACCAAGGAGACGCTGAAGTCAATGCAAGCGCAAGTCGATGGCTTTATGGAGGC
GAACGTACATTTCATCCCTAGCTTCTACTCCATCGCCGCTATGGACGGCCAAACCGCCGA
CCATCTTCACCACATCATCTCCAAATACTCATCCCCTGACATCACCACTGTCATGTGTAT
GGGGCATAATAAGGGATGGGAAGAAGCAGCCTCCATGCTCTCTGGTGCTTCCGTAAAGCT
GAAAACTTGCAATGCTACTTTGCTTCATGCTTTTGGCAACTCCTGGGATGATGCTTTCTC
TCTGGCTGGACCTGGTGGTTGGAAACTTG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2D111TF 683 0 0
AG
GGAAAAATCAGTTAAGACAAGAGAGATGAAATGAGATAAGAATATGCGATGCTGAGCTTC
CAGTCTCCATCTCCTTTCTTCTTCTCCGGCTACCAAAACCGGGCCACCACTTCTTACTCT
CCTCGTGCATCCACCGAACTAACTTCTTCTCCTTCTCCATCGCTAATCTCTCGCCGTCTC
ATCCTTCTCCGTCACGTTCACAGTTCCTGGGACCATCTTTCCCTCAAAGACCATGACCGT
CCTCTTACTAAGACCGGACAAGCTGATGCTGCTAAAGTTGCTCAAATCCTCTCCTCACTC
GGCTGGCTTCCCCAACTCATCCTCTCAAGCGACGCGACTCGGACCAAGGAGACGCTGAAG
TCAATGCAAGCGCAAGTCGATGGCTTTATGGAGGCGAACGTACATTTCATCCCTAGCTTC
TACTCCATCGCCGCTATGGACGGCCAAACCGCCGACCATCTTCACCACATCATCTCCAAA
TACTCATCCCCTGACATCACCACTGTCATGTGTATGGGGCATAATAAGGGATGGGAAGAA
GCAGCCTCCATGCTCTCTGGTGCTTCCGTAAAGCTGAAAACTTGCAATGCTGCTTTGCTT
CATGCTTTTGGCAACTCCTGGGATGATGCTTTCTCTCTGGCTGGACCTGGTGGTTGGAAA
CTTGAGGGTATTGTGGCTCCA

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2C923JQ 781 0 0
CACCACTTCTTACTCTCCTCGTGCATCCACCGAACTAACTTCTTCTCCTTCTCCATCGCT
AATCTCTCGCCGTCTCATCCTTCTCCGTCACGCTCACAGTTCCTGGGACCATCTTTCCCT
CAAAGACCATGACCGTCCTCTTACTAAGACCGGACAAGCTGATGCTGCTAAAGTTGCTCA
AATCCTCTCCTCACTCGGCTGGCTTCCCCAACTCATCCTCTCAAGCGACGCGACTCGGAC
CAAGGAGACGCTGAAGTCAATGCAAGCGCAAGTCGATGGCTTTATGGAGGCGAACGTACA
TTTCATCCCTAGCTTCTACTCCATCGCCGCTATGGACGGCCAAACCGCCGACCATCTTCA
CCACATCATCTCCAAATACTCATCCCCTGACATCACCACTGTCATGTGTATGGGGCATAA
TAAGGGATGGGAAGAAGCAGCCTCCATGCTCTCTGGTGCTTCCGTAAAGCTGAAAACTTG
CAATGCTACTTTGCTTCATGCTTTTGGCAACTCCTGGGATGATGCTTTCTCTCTGGCTGG
ACCTGGTGGTTGGAAACTTGAGGGTATTGTGGCTCCAGATAGCACCATTTGTGTCTAAGA
GATCCCATAGCTTCAAGTTGGTTTACTTTCTTATCCTCTATCCTTTGTAACTTTTGCTAC
AACACAATATACAAAAGGCTGTGTAGTTTCATCCTTTCATGTGTCAACTAGTTATGAATG
ATGATAAACATGTCAAGAGCACAGACTAGTGCATCTCTTTATTGGATGGTTTGCCTTTGT
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2EK45JQ 797 0 0
TCTCGCGTCTCAT
CTTCTCCGTCACGCTCACAGTTCCTGGGACCATCTTTCCCTCAAAGACCATGACCGTCCT
CTTACTAAGACCGGACAAGCTGATGCTGCTAAAGTTGCTCAAATCCTCTCCTCACTCGGC
TGGCTTCCCCAACTCATCCTCTCAAGCGACGCGACTCGGACCAAGGAGACGCTGAAGTCA
ATGCAAGCGCAAGTCGATGGCTTTATGGAGGCGAACGTACATTTCATCCCTAGCTTCTAC
TCCATCGCCGCTATGGACGGCCAAACCGCCGACCATCTTCACCACATCATCTCCAAATAC
TCATCCCCTGACATCACCACTGTCATGTGTATGGGGCATAATAAGGGATGGGAAGAAGCA
GCCTCCATGCTCTCTGGTGCTTCCATAAAGCTGAAAACTTGCAATGCTGCTTTGCTTCAT
GCTTTTGGCAACTCCTGGGATGATGCTTTCTCTCTGGCTGGACCTGGTGGTTGGAAACTT
GAGGGTATTGTGGCTCCAGATAGCACCATTTGTGTCTAAGAGATCCCATAGCTTCAAGTT
GGTTTACTTTCTTATCCTCTATCCTTTGTAACTTTTGCTACAACACAATATACAAAAGGC
TGTGTAGTTTCATCCTTTCATGTGTCAACTAGTTATGAATGATGATAAACATGTCAAGAG
CACAGACTAGTGCATCTCTTTATTGGATGGTTTGCCTTTGTGTAAGATCCTATAGCATCA
TAGATATGTTTCAAATGCAGTTGTATTACTTTATTCATGTTATATCAAAATACACTTAAA
TCCC

QA 14 797 14 797
DS 



AS 1 6

CO CL1220Contig1 1489 6 19 U
AATAATGGAACACAGATTATTAAAATCGAACGGCTAAGCTGCCCTCTTAACACTTTCGAG
TATGATTAATAACCCATCATTTATTACATAAACCACATGTATTTCCAATTATACCATGGT
GTTCCCTTTCCCTTCTATATATCTTTCTATTATAAGATACAGCTGTAACAATTTAATACT
CACACTTTGATTCCCGTAAACAAAGGGTCACCGCAGAAACATTAATGATTTTGGCATTTT
TTAAAACAAAAAACTGAAAAATACAGAAATCTATCTTGTAAATAATTGTTTTTTT**TCT
TGTAAAACAGAAAATAGACATGTGATGATAATGAAGGGGAGAGAGAGAGAGAG**ATTAT
TAAGAGGATTCGTCGGCGCGAGAATTTTCCTTTTTCACCCTCGGCTGTATCCCATAATAA
CTAACGTACCACTTGACGAACTTCCTCAACCCCGCTGCGAGATCCGTCGTCGGTTTATAC
CCGAAATCTCTATACGCTAAGCTCACATTAGCATGCGTGTAAGGCACGTCACCGTTTCTA
GGCATTTTGATCAGATGCTTCTTCGCTTTCGTCCCCAACAACCCTTCCAATATCGAAACC
AATCTCCCCACCGGAACCGGAGATGTGTTCCCGAGATTATAAACACGTAACTGAGCCGGT
CCTCGCTTCTTTCCCCCGCTTCCGGTGCTCTTCTCCGCCGTGTCTAACGCACCGACACAT
CCTTTGACTATATCGTCGATGTAGGTGAAGTCACGCGCCACTTCTTGATTGTCCTGAGTT
CTGTAGATGTCGATGGACTTCCCGTGGAGTATGGCTTTAGTGAAGAAGAAGTAAGCCATG
TCCGGTCTTCCCCAAGGACCGTAAACCGTAAAGAACCGGAGTCCGGTTAAAGAAAGACCG
TAGATGTGATTGTAGGTATGTGCTATCTCCTCCCCTGCTTTCTTCGTCGCCGCGTAAAGA
CTCGCCGGCTGATCCGTTCTGTGCTCCTCCGAGAAAGGATTCTCGGTGTTGAGTCCGTAC
ACGGAGCTCGACGAAGCCCACACGATGGCGGGCTGAGGGTTAGCTGCTTTGGCGACTTCG
AGTAGGTTAACGAGACCGGCGATGTTGGAGCTGATGTAAGACTGAGGGTTCTTCATGGCG
TAACGAACTCCGGCTTGAGCTGCTAAGTGGAGGACGTGAGTGAAAGGGACGATGTCGAAG
AGCTTGCGTAAGAGAGGTCCGTCGTTGAGATCTCCTTGGACGATGAACACTTGGTTCTTC
TCTAGGAGCTGCTGTCTCGCTCTTTTGAGCGATGGATCGTAGTAGTCGTTGAAGTTGTCG
AATCCCAAAACTCCGTCGCCGCGTTTTCGACTTTTGATGGAAACTCGAACTGTTTTAGAT
TTGTCAATCGATTCTTCTCTCTGAATCGAGAGGCTTGAAAATGTGTTGATAACAATTTTT
TATGGGACTTGAGGGTTTTCAGAGAGTTTTTTTTCTTTCTAGCCCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET88JQ U 1
AF RR2BJ68JQ U 22
AF RR2BC96JQ U 62
AF RR2ET88TF C 158
AF RR2BJ68TF C 244
AF RR2BC96TF C 773
BS 1 215 RR2ET88JQ
BS 216 216 RR2BJ68JQ
BS 217 319 RR2ET88JQ
BS 320 320 RR2BJ68JQ
BS 321 324 RR2ET88JQ
BS 325 325 RR2BJ68JQ
BS 326 449 RR2ET88JQ
BS 450 450 RR2BJ68JQ
BS 451 740 RR2ET88JQ
BS 741 794 RR2BJ68JQ
BS 795 795 RR2BC96JQ
BS 796 805 RR2BJ68JQ
BS 806 935 RR2ET88TF
BS 936 965 RR2BJ68TF
BS 966 966 RR2BC96TF
BS 967 989 RR2BJ68TF
BS 990 990 RR2BC96TF
BS 991 1008 RR2BJ68TF
BS 1009 1489 RR2BC96TF

RD RR2ET88JQ 740 0 0
AATAATGGAACACAGATTATTAAAATCGAACGGCTAAGCTGCCCTCTTAACACTTTCGAG
TATGATTAATAACCCATCATTTATTACATAAACCACATGTATTTCCAATTATACCATGGT
GTTCCCTTTCCCTTCTATATATCTTTCTATTATAAGATACAGCTGTAACAATTTAATACT
CACACTTTGATTCCCGTAAACAAAGGGTCACCGCAAAAACATTAATGATTTTGGCATTTT
TTAAAACAAAAAACTGAAAAATACAGAAATCTATCTTGTAAATAATTGTTTTTTT**TCT
TGTAAAACAGAAAATAGACGTGTGGTGATAATGAAGGGGAGAGAGAGAGAGAG**ATTAT
TAAGAGGATTCGTCGGCGCGAGAATTTTCCTTTTTCACCCTCGGCTGTATCCCATAATAA
CTAACGTACCACTTGACGAACTTCCTCAATCCCGCTGCGAGATCCGTCGTCGGTTTATAC
CCGAAATCTCTATACGCTAAGCTCACATTAGCATGCGTGTAAGGCACGTCACCGTTTCTA
GGCATTTTGATCAGATGCTTCTTCGCTTTCGTCCCCAACAACCCTTCCAATATCGAAACC
AATCTCCCCACCGGAACCGGAGATGTGTTCCCGAGATTATAAACACGTAACTGAGCCGGT
CCTCGCTTCTTTCCCCCGCTTCCGGTGCTCTTCTCCGCCGTGTCTAACGCACCGACACAT
CCTTTGACTATATCGTCGAT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2BJ68JQ 784 0 0
AAAATCGAACGGCTAAGCTGCCCTCTTAACACTTTCGAGTATGATTA*TAACCCATCATT
TATTACATAAACCACATGTATTTCCAATTATACCATGGTGTTCCCTTTCCCTTCTATATA
TCTTTCTATTATAAGATACAGCTGTAACAATTTAATACTCACACTTTGATTCCCGTAAAC
AAAGGGTCACCGCAGAAACATTAATGATTTTGGCATTTTTTAAAACAAAAA*CTGAAAAA
TACAGAAATCTATCTTGTAAATAATTGTTTTTTTTTTCTTGTAAAACAGAAAATAGACAT
GTGACGATAATGAAGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGATTATTAAGAGGATTCGTCGGCGCGA
GAGCTTTCCTTTTTCACCCTCGGCTGTATCCCATAATAACTAACGTACCACTTGACGAAC
TTCCTCAACCCCGCTGCTAGATCCGTCGTCGGTTTATACCCGAAATCTCTATACGCTAAG
CTCACGTTAGCATGCGTGTAAGGCACGTCACCGTTTCTAGGCATTTTGATCAGATGCTTC
TTCGCTTTCGTCCCTAACAACCCTTCCAATATCGAAACCAATCTCCCGACCGGAACCGGA
GATGTGTTCCCGAGATTATAAACACGTAACTGAGCCGGTCCTCGCTTCTTCCCGCCGCTT
CCGGTGCTCTTCTCCGCCGTGTCTAACGCACCGACACATCCTTTGACTATATCGTCGATG
TAGGTGAAGTCACGCGCCACTTCTTGATTGTCCTGAGTTCTGTAGATGTCGATAGACTTC
CCGT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2BC96JQ 749 0 0
ATGATTA
ATAACCCATCATTTATTACATAAACCACATGTATTTCCAATTATACCATGGTGTTCCCTT
TCCCTTCTATATATCTTTCTATTATAAGATACAGCTGTAACAATTTAATACTCACACTTT
GATTCCCGTAAACAAAGGGTCACCGCAGAAACATTAATGATTTTGGCATTTTTTAAAACA
AAAAACTGAAAAATACAGAAATCTATCTTGTAAATAATTGTTTTTTT**TCTTGTAAAAC
AGAAAATAGACATGTGATGATAATGAAGGGGAGAGAGAGAGAGA****TTATTAAGAGGA
TTCGTCGGCGCGAGAATTTTCCTTTTTCACCCTCGGCTGTATCCCATAATAACTAACGTA
CCACTTGACGAACTTCCTCAACCCCGCTGCGAGATCCGTCGTCGGTTTATACCCGAAATC
TCTATACGCTAAGCTCACATTAGCATGCGTGTAAGGCACGTCACCGTTTCTAGGCATTTT
GATCAGATGCTTCTTCGCTTTCGTCCCCAACAACCCTTCCAATATCGAAACCAATCTCCC
CACCGGAACCGGAGATGTGTTCCCGAGATTATAAACACGTAACTGAGCCGGTCCTCGCTT
CTTTCCCCCGCTTCCGGTGCTCTTCTCCGCCGTGTCTAACGCACCGACACATCCTTTGAC
TATATCGTCGATGTAGGTGAAGTCACGCGCCACTTCTTGATTGTCCTGAGTTCTGTAGAT
GTCGATGGACTTCCCGT
GGAGT

QA 8 744 8 744
DS 

RD RR2ET88TF 779 0 0
TACAGCTGTAACAATTTAATACTCACACTTTGAT*CCCGTAAACAAAGGGTCACCGCAGA
AACATTAATGATTTTGGCATTTTT*AAAACAAAAAACTGAAAAATACAGAAATCTATCTT
GTAAATAATTGTTTTTTT***CTTGTAAAACAGAAAATAGACGTGTGGTGATAATGAAGG
GGAGAGAGAGAGAGAG**ATTATTAAGAGGATTCGTCGGCGCGAGAATTTTCCTTTTTCA
CCCTCGGCTGTATCCCATAATAACTAACGTACCACTTGACGAACTTCCTCAATCCCGCTG
CGAGATCCGTCGTCGGTTTATACCCGAAATCTCTATACGCTAAGCTCACATTAGCATGCG
TGTAAGGCACGTCACCGTTTCTAGGCATTTTGATCAGATGCTTCTTCGCTTTCGTCCCCA
ACAACCCTTCCAATATCGAAACCAATCTCCCCACCGGAACCGGAGATGTGTTCCCGAGAT
TATAAACACGTAACTGAGCCGGTCCTCGCTTCTTTCCCCCGCTTCCGGTGCTCTTCTCCG
CCGTGTCTAACGCACCGACACATCCTTTGACTATATCGTCGATGTAGGTGAAGTCACGCG
TCACTTCTTGATTGTCCTGAGTTCTGTAGATGTCGATGGACTTCCCGTGGAGTATGGCTT
TAGTGAAGAAGAAGTAAGCCATGTCCGGTCTTCCCCAAGGACCGTAAACCGTAAAGAACC
GGAGTCCGGTTAAAGAAAGACCGTAGATGTGATTGTAGGTATGTGCTATCTCCTCCCC
C

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2BJ68TF 766 0 0
AAAAC
AAAAACTGAAAAATACAGAAATCTATCTTGTAAATAATTGTTTTTTTTTTCTTGTAAAAC
AGAAAATAGACATGTGACGATAATGAAGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGATTATTAAGAGGA
TTCGTCGGCGCGAGAGCTTTCCTTTTTCACCCTCGGCTGTATCCCATAATAACTAACGTA
CCACTTGACGAACTTCCTCAACCCCGCTGCTAGATCCGTCGTCGGTTTATACCCGAAATC
TCTATACGCTAAGCTCACGTTAGCATGCGTGTAAGGCACGTCACCGTTTCTAGGCATTTT
GATCAGATGCTTCTTCGCTTTCGTCCCTAACAACCCTTCCAATATCGAAACCAATCTCCC
GACCGGAACCGGAGATGTGTTCCCGAGATTATAAACACGTAACTGAGCCGGTCCTCGCTT
CTTCCCGCCGCTTCCGGTGCTCTTCTCCGCCGTGTCTAACGCACCGACACATCCTTTGAC
TATATCGTCGATGTAGGTGAAGTCACGCGCCACTTCTTGATTGTCCTGAGTTCTGTAGAT
GTCGATAGACTTCCCGTGGAGTATGGCTTTAGTAAAGAAGAAGTAAGCCATGTCCGGTCT
TCCCCAAGGACCGTAAACCGTAAAGAACCGGAGTCCGGTTAAAGAAAGACCGTAGATGTG
ATTGTAAGTGTGTGCTATCTCCTCCCCTGCTTTCTTCGTCGCCGCGTAAAGACTCGCGGG
CTGATCCGTTCTGTGCTCCTCGGAGAAAGGATTCTCGGTG
C

QA 6 765 6 765
DS 

RD RR2BC96TF 717 0 0
CG
TGAGTTCTGTAGATGTCGATGGACTTCCCGTGGAGTATGGCTTTAGTGAAGAAGAAGTAA
GCCATGTCCGGTCTTCCCCAAGGACCGTAAACCGTAAAGAACCGGAGTCCGGTTAAAGAA
AGACCGTAGATGTGATTGTAGGTATGTGCTATCTCCTCCCCTGCTTTCTTCGTCGCCGCG
TAAAGACTCGCCGGCTGATCCGTTCTGTGCTCTTCCGAGAAGGGATTCTCGGTGTTGAGT
CCGTACACGGAGCTCGACGAAGCCCACACGATGGCGGGCTGAGGGTTAGCTGCTTTGGCG
ACTTCGAGTAGGTTAACGAGACCGGCGATGTTGGAGCTGATGTAAGACTGAGGGTTCTTC
ATGGCGTAACGAACTCCGGCTTGAGCTGCTAAGTGGAGGACGTGAGTGAAAGGGACGATG
TCGAAGAGCTTGCGTAAGAGAGGTCCGTCGTTGAGATCTCCTTGGACGATGAACACTTGG
TTCTTCTCTAGGAGCTGCTGTCTCGCTCTTTTGAGCGATGGATCGTAGTAGTCGTTGAAG
TTGTCGAATCCCAAAACTCCGTCGCCGCGTTTTCGACTTTTGATGGAAACTCGAACTGTT
TTAGATTTGTCAATCGATTCTTCTCTCTGAATCGAGAGGCTTGAAAATGTGTTGATAACA
ATTTTTTATGGGACTTGAGGGTTTTCAGAGAGTTTTTTTTCTTTCTAGCCCTCCC

QA 3 717 3 717
DS 



AS 1 6

CO CL1221Contig1 1505 6 23 U
GGCAGATACATCCAAGTGGCAACTCATCCGCTAATTTTCCGACACATCTCCAAAAGTCAC
TTGTATCCTCCACCGTTTCGCCACCGTCCGTGACAATAATGGCTCTTTCTCTCTCCGCCG
CATCTCACTCATTCTCCTCCACCAGAGTCTCTCTTTCACCCGCCGCCACCGTCTCCTCCC
ATCCTTCTCCCCCTCTCGTTGCTTTCTCTTCCTCACATTCCCTCTCTTCTCTCCGGAGCG
TCGCATCTTCCTCTCTCTTCCCTCATTCCCCATCCCTCGTTCAGAGAAAACATCCGATAA
ACGGGACGAACAGAGGTTCTAACAGCACGGTAGCTGCTGCTGCTGCCTCTGATGCATCTC
AACTGAAAAGCGCCAAAGAAGACATCAAAGTCCTTCTCCGCACAAAGTTCTGCCATCCAA
TTCTCGTAAGGTTGGGATGGCACGATGCTGGAACGTATAACAAGAATATAGAGGATTGGC
CACAGAGAGGTGGTGCTAATGGAAGTCTTAGGTTCGAGCCTGAGCTTAAACATGCTGCAA
ACGCTGGTCTCGTTAATGCTTTAAAGCTCATCGAACCTCTCAAAGAAAAGTATGCTAACA
TCTCTTACGCTGACTTGTTCCAGTTAGCTAGTGCCACTGCTGTAGAGGAGGCTGGTGGTC
CTGAAATACCGATGAAGTATGGGAGAGTTGATGTCTCAGCACCTGAGCAATGTCCAGAAG
AAGGAAGACTCCCTGATGCTGGACCGCCTTCACCAGCTGATCATCTGAGAGAAGCATTCT
ACAGAATGGGACTAAACGATAAGGAGATAGTTGCTTTATCTGGTGCACACACCCTAGGTC
GATCCAGACCAGAACGTAGCGGCTGGGGCAAACCCGAGACAAAATACACGAAAGCTGGAC
CTGGAGAACCAGGAGGACAGTCTTGGACAGTGAAATGGCTCAAGTTTGACAATTCCTACT
TCAAGGATATCAAAGAAAAGAGAGACGAAGACCTTCTGGTTTTGCCCACTGACGCAGCCC
TATTCGAAGATCCTTCGTTCAAGAACTATGCAGAGAGATATGCTGAAGATCCAGCTGCAT
TCTTCAAGGATTACGCTGAAGCTCATGCTAAGCTCAGCAATCTTGGAGCAAAGTTTGATC
CTCCTGAGGGCATTATCATTGACAATGCACAAGGAGAGAAGTTCGTAGCTGCTAAATATT
CCACTCAAAAGAAAGAGCTTTCGGATTCGATGAAGAAGAAGATAAGAGCAGAGTATGAAG
CAATTGGAGGAAGTCCTGATAAGCCATTACCCACTAACTACTTCCTCAACATCATAATTG
CCATCAGCGTCTTGGTCCTACTCTTCACTTTCTTGGGTAATAACAACTCCACTGATTACT
CTGGTTTCTAAATTGTAATACATTGGTTTTCATTCTTCTCTTTTGCATATATATATACAT
AACTATGTGATCTTCAAATATTCTTTATAAACGAAGACATCATTGTAATAAGAGAGACTA
GAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2DP82TF U 1
AF RR2EM30TF U 12
AF RR2FM55TF U 522
AF RR2EM30JQ C 1029
AF RR2F317TF U 694
AF RR2F317JQ C 994
BS 1 112 RR2DP82TF
BS 113 113 RR2EM30TF
BS 114 121 RR2DP82TF
BS 122 122 RR2EM30TF
BS 123 376 RR2DP82TF
BS 377 377 RR2EM30TF
BS 378 400 RR2DP82TF
BS 401 401 RR2EM30TF
BS 402 569 RR2DP82TF
BS 570 570 RR2EM30TF
BS 571 578 RR2DP82TF
BS 579 579 RR2EM30TF
BS 580 584 RR2DP82TF
BS 585 585 RR2EM30TF
BS 586 644 RR2DP82TF
BS 645 714 RR2EM30TF
BS 715 715 RR2FM55TF
BS 716 749 RR2EM30TF
BS 750 774 RR2FM55TF
BS 775 775 RR2F317TF
BS 776 1199 RR2FM55TF
BS 1200 1482 RR2F317TF
BS 1483 1505 RR2F317JQ

RD RR2DP82TF 644 0 0
GGCAGATACATCCAAGTGGCAACTCATCCGCTAATTTTCCGACACATCTCCAAAAGTCAC
TTGTATCCTCCACCGTTTCGCCACCGTCCGTGACAATAATGGCTCTTTCTCTTTCCGCCG
CCTCTCACTCATTCTCCTCCACCAGAGTCTCTCTTTCACCCGCCGCCACCGTCTCCTCCC
ATCCTTCTCCCCCTCTCGTTGCTTTCTCTTCCTCACATTCCCTCTCTTCTCTCCGGAGCG
TCGCATCTTCCTCTCTCTTCCCTCATTCCCCATCCCTCGTTCAGAGAAAACATCCGATAA
ACGGGACGAACAGAGGTTCTAACAGCACGGTAGCTGCTGCTGCTGCCTCTGATGCATCTC
AACTGAAAAGCGCCAAGGAAGACATCAAAGTCCTTCTCCGTACAAAGTTCTGCCATCCAA
TTCTCGTAAGGTTGGGATGGCACGATGCTGGAACGTATAACAAGAATATAGAGGATTGGC
CACAGAGAGGTGGTGCTAATGGAAGTCTTAGGTTCGAGCCTGAGCTTAAACATGCTGCAA
ACGCTGGTCTCGTTAATGCTTTAAAGCTCGTCGAACCTATCAAACAAAAGTATGCTAACA
TCTCTTACGCTGACTTGTTCCAGTTAGCTAGTGCCACTGCTGTA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2EM30TF 738 0 0
GG
AAGTGGCAACTCATCCGCTAATTTTCCGACACATCTCCAAAAGTCACTTGTATCCTCCAC
CGTTTCGCCACCGTCCGTGACAATAATGGCTCTTTCTTTCTCCGCCGCATCTCACTCATT
CTCCTCCACCAGAGTCTCTCTTTCACCCGCCGCCACCGTCTCCTCCCATCCTTCTCCCCC
TCTCGTTGCTTTCTCTTCCTCACATTCCCTCTCTTCTCTCCGGAGCGTCGCATCTTCCTC
TCTCTTCCCTCATTCCCCATCCCTCGTTCAGAGAAAACATCCGATAAACGGGACGAACAG
AGGTTCTAACAGCACGGTAGCTGCTGCTGCTGCCTCTGATGCATCTCAACTGAAAAGCGC
TAAAGAAGACATCAAAGTGCTTCTCCGCACAAAGTTCTGCCATCCAATTCTCGTAAGGTT
GGGATGGCACGATGCTGGAACGTATAACAAGAATATAGAGGATTGGCCACAGAGAGGTGG
TGCTAATGGAAGTCTTAGGTTCGAGCCTGAGCTTAAACATGCTGCAAACGCTGGTCTCGT
TAATGCTTTAAAGCTCATCGAACCTCTCAAAGAAAAGTATGCTAACATCTCTTACGCTGA
CTTGTTCCAGTTAGCTAGTGCCACTGCTGTAGAGGAGGCTGGTGGTCCTGAAATACCGAT
GAAGTATGGGAGAGTTGATGTCTCAGCACCTGAGCAATGTC*AGAAGAAGGAAGACTCCC
TGATGCTGGACCGCCT

QA 3 738 3 738
DS 

RD RR2FM55TF 689 0 0
GG
GCTTAAACATGCTGCAAACGCTGGTCCCGTTAATGCTTTAAAGCTCATCGAACCTCTCAA
AGAAAAGTATGCTAACATCTCTTACGCTGACTTGTTCCAGTTAGCTAGTGCCACTGCTGT
AGAGGAGGCTGGTGGTCCTGAAATACCGATGAAGTATGGGAGAGTTGATGTCTCAGCACC
TGAGCAATGTCCAGAAGAAGGAAGACTCCCTGATGCTGGACCGCCTTCACCAGCTGATCA
TCTGAGAGAAGTATTCTACAGAATGGGACTAAACGATAAGGAGATAGTTGCTTTATCTGG
TGCACACACCCTAGGTCGATCCAGACCAGAACGTAGCGGCTGGGGCAAACCCGAGACAAA
ATACACGAAAGCTGGACCTGGAGAACCAGGAGGACAGTCTTGGACAGTGAAATGGCTCAA
GTTTGACAATTCCTACTTCAAGGATATCAAAGAAAAGAGAGACGAAGACCTTCTGGTTTT
GCCCACTGACGCAGCCCTATTCGAAGATCCTTCGTTCAAGAACTATGCAGAGAGATATGC
TGAAGATCCAGCTGCATTCTTCAAGGATTACGCTGAAGCTCATGCTAAGCTCAGCAATCT
TGGAGCAAAGTTTGATCCTCCTGAGGGCATTATCATTGACAATGCACAAGGAGAGAAGTT
CGTAGCTGCTAAATAT
CCCTCAAAGAA

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR2EM30JQ 301 0 0
GATCCTTCGTTCAAGAACTATGCAGAGAGATATGCTGAAGATCCAGCTGCATTCTTCAAG
GATTACGTTGAAGCTCATGTTAAGCTCAGCAATCTTGGAGCAAAGTTTGATCCTCCTGAG
GTCATTATCATTGACAATGCACAAGGAGAGAAGTTGGTAGCTGCTAAATATTCCACTCAA
AAGAAAGAGCTTTCGGATTCGATGAAGAAGAAGATAAGAGCAGAGTATGAAGCAATTGGA
GGAAGTCCT*ATAAGCCATTACCCACTAACTACTTCCTCAACATCATAATTGCCATCAGC
G

QA 1 301 1 301
DS 

RD RR2F317TF 789 0 0
G
CTCAGCACCTGAGCAATGTCCAGAAGAAGGAAGACTCCCTGATGCTGGACCGCCTTCACC
AGCTGATCATCTGAGAGAAGCATTCTACAGAATGGGACTAAACGATAAGGAGATAGTTGC
TTTATCTGGTGCACACACCCTAGGTCGATCCAGACCAGAACGTAGCGGCTGGGGCAAACC
CGAGACAAAATACACGAAAGCTGGACCTGGAGAACCAGGAGGACAGTCTTGGACAGTGAA
ATGGCTCAAGTTTGACAATTCCTACTTCAAGGATATCAAAGAAAAGAGAGACGAAGATCT
TCTGGTTTTGCCCACTGACGCAGCCCTATTCGAAGATCCTTCGTTCAAGAACTATGCAGA
GAGATATGCTGAAGATCCAGCTGCATTCTTCAAGGATTACGCTGAAGCTCATGCTAAGCT
CAGCAATCTTGGAGCAAAGTTTGATCCTCCTGAGGGCATTATCATTGACAATGCACAAGG
AGAGAAGTTCGTAGCTGCTAAATATTCCACTCAAAAGAAAGAGCTTTCGGATTCGATGAA
GAAGAAGATAAGAGCAGAGTATGAAGCAATTGGAGGAAGTCCTGATAAGCCATTACCCAC
TAACTACTTCCTCAACATCATAATTGCCATCAGCGTCTTGGTCCTACTCTTCACTTTCTT
GGGTAATAACAACTCCACTGATTACTCTGGTTTCTAAATTGTAATACATTGGTTTTCATT
CTTCTCTTTTGCATATATATATACATAACTATGTGATCTTCAAATATTCTTTATAAACGA
AGACATCA

QA 2 789 2 789
DS 

RD RR2F317JQ 512 0 0
TTCTGGTTTTGCCCACTGACGCAGCCCTATTCGAAGATCCTTCGTTCAAGAACTATGCAG
AGAGATATGCTGAAGATCCAGCTGCATTCTTCAAGGATTACGCTGAAGCTCATGCTAAGC
TCAGCAATCTTGGAGCAAAGTTTGATCCTCCTGAGGGCATTATCATTGACAATGCACAAG
GAGAGAAGTTCGTAGCTGCTAAATATTCCACTCAAAAGAAAGAGCTTTCGGATTCGATGA
AGAAGAAGATAAGAGCAGAGTATGAAGCAATTGGAGGAAGTCCTGATAAGCCATTACCCA
CTAACTACTTCCTCAACATCATAATTGCCATCAGCGTCTTGGTCCTACTCTTCACTTTCT
TGGGTAATAACAACTCCACTGATTACTCTGGTTTCTAAATTGTAATACATTGGTTTTCAT
TCTTCTCTTTTGCATATATATATACATAACTATGTGATCTTCAAATATTCTTTATAAACG
AAGACATCATTGTAATAAGAGAGACTAGAGAC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 6

CO CL1222Contig1 1219 6 39 U
GGACAAAACCCATAAACAAGCTCTATTTTCTTCACACATTCTCTCTCTCTCACACACATC
AGAAACAAGAAATGGGAGGAGTTTCTTTCCTCTCCACTGTTCCCTCCTTCACCAACATCA
ACAATCGTCAACATCTCACACTCTCTTCTTCTCATCGCTCTGTTCTCATTCAATGTTGCA
AGATCGATCCTCAAGTTTCCGACAACACTTTATCATTTCACCGGCGGGATGTTCTCAAAC
TCGCCGGCACTGCCCTCGGAATGGAACTAACAGGTAACGGCTTCATTAACCATGTGGGCG
ATGCAAAAGCTGCTGATCTGAATCAGCGCAGGCAGCGATCCGAGTTTCAATCAAAGATCA
AGCTTTCACTTTCCAAAGCGGTTAAGGCTAAACCGGAGCTTGTACCTTCTTTACTAACTC
TAGCTCTTAATGATGCTATGACTTATGATAAGGCTACAAAATCTGGTGGAGCCAATGGAT
CCATACGGTTCAGCTCTGAGATAAGCAGAGCAGAGAACGCTGGGCTTTCTGATGGGTTAG
CTCTCATAGAGGAAGCCAAGAAGGAGATTGACTCGTTCTCAAAGGGTGGACCTATTTCAT
ATGCAGATCTTATTCAACTGGCAGGGCAATCAGCGGTGAAGGCAACATTTTTAGCATCAG
CAATACGTAAATGCGGTGGAAATGAAGAGAAAGGGAACTTACTCTACACAGCATATGGTT
CAAGTGGTCAGTGGGCTTTGTTTGATAGACAATTCGGAAGGAGTGATGCAACAGAGGCAG
ATCCAGAAGGGAGGATCCCATTACGGGGAAAAGCAACTGTGCAAGAGATGAAAGATAAGT
TCATTGCCATCGGACTGGGTCCTCGTCAGTTAGCTGTAATGTCTGCATTCTTGGGTCCTG
ATCAAGCCGCAACAGAAGAGCTCTTAGCTAGCGACCCACAAGTTGCACCATGGGTTCAGA
AGTACCAACGAAGCCGTGAAACTGTATCTCAGACAGATTACGAGGTTGATCTGATAACTG
CATTGACAAAGCTAAGTGGTCTAGGACAGCAAATCAACTATGAGGCATATACATATCCTG
TCGAGCGGATCAATCTAAGCAAACTCAAGCTATGAGCATAGAGCGTGACAACAAGTTTTA
AGTCAGTGTACACTATGCATAACTTGAGCAAACTTGAACTCATTAATATATATCCAAGAT
TTTTCTTGAAATTCAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 25 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR49TF U 1
AF RR2CR83TF U 43
AF RR2A673TF U 34
AF RR2A201TF U 50
AF RR2A673JQ C 428
AF RR2CR83JQ C 434
BS 1 51 RR2CR49TF
BS 52 52 RR2A673TF
BS 53 242 RR2CR49TF
BS 243 243 RR2A673TF
BS 244 266 RR2CR49TF
BS 267 267 RR2A673TF
BS 268 317 RR2CR49TF
BS 318 318 RR2A673TF
BS 319 369 RR2CR49TF
BS 370 370 RR2A673TF
BS 371 373 RR2CR49TF
BS 374 374 RR2A673TF
BS 375 463 RR2CR49TF
BS 464 464 RR2A673TF
BS 465 625 RR2CR49TF
BS 626 626 RR2A673TF
BS 627 640 RR2CR49TF
BS 641 641 RR2A673TF
BS 642 662 RR2CR49TF
BS 663 663 RR2A673TF
BS 664 667 RR2CR49TF
BS 668 668 RR2A673TF
BS 669 690 RR2CR49TF
BS 691 726 RR2A673TF
BS 727 754 RR2A201TF
BS 755 778 RR2A673JQ
BS 779 779 RR2CR83JQ
BS 780 854 RR2A673JQ
BS 855 855 RR2CR83JQ
BS 856 1096 RR2A673JQ
BS 1097 1097 RR2CR83JQ
BS 1098 1120 RR2A673JQ
BS 1121 1121 RR2CR83JQ
BS 1122 1157 RR2A673JQ
BS 1158 1158 RR2CR83JQ
BS 1159 1190 RR2A673JQ
BS 1191 1192 RR2CR83JQ
BS 1193 1208 RR2A673JQ
BS 1209 1219 RR2CR83JQ

RD RR2CR49TF 690 0 0
GGACAAAACCCATAAACAAGCTCTATTTTCTTCACACATTCTCTCTCTCTCTCACACATC
AGAAACAAGAAATGGGAGGAGTTTCTTTCCTCTCCACTGTTCCCTCCTTCACCAACATCA
ACAATCGTCAACATCTCACACTCTCTTCTTCTCATCGCTCTGTTCTCATTCAATGTTGCA
AGATCGATCCTCAAGTTTCCGACAACACTTTATCATTTCACCGGCGGGATGTTCTCAAAC
TCACCGGCACTGCCCTCGGAATGGAATTAACAGGTAACGGCTTCATTAACCATGTGGGCG
ATGCAAAAGCTGCTGATTTGAATCAGCGCAGGCAGCGATCCGAGTTTCAATCAAAGATCA
AGCTTTCACCTTCAAAAGCGGTTAAGGCTAAACCGGAGCTTGTACCTTCTTTACTAACTC
TAGCTCTTAATGATGCTATGACTTATGATAAGGCTACAAAATCCGGTGGAGCCAATGGAT
CCATACGGTTCAGCTCTGAGATAAGCAGAGCAGAGAACGCTGGGCTTTCTGATGGGTTAG
CTCTCATAGAGGAAGCCAAGAAGGAGATTGACTCGTTCTCAAAGGGTGGACCTATTTCAT
ATGCAGATCTTATTCAACTGGCAGG*CAATCAGCGGTGAAAGCAACATTTTTAGCATCAG
CA*TACGCAAATGCGGTGGAAATGAAGAGA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2CR83TF 647 0 0
GGCTCTCTCTC
ACACATCAGAAACAAGAAATGGGAGGAGTTTCTTTCCTCTCCACTGTTCCCTCCTTCACC
AACATCAACAATCGTCAACATCTCACACTCTCTTCTTCTCATCGCTCTGTTCTCATTCAA
TGTTGCAAGATCGATCCTCAAGTTTCCGAAAACACTTTATCATTTCACCGGCGGGATGTT
CTCAAACTCGCCGGCACTGCCCTCGGAATGGAGCTAACAGGTAACGGCTTCATTAACCAT
GTGGGCGATGCAAAAGCTGCTGATTTGAATCAGCGCAGGCAGCGATCCGAGTTTCAATCA
AAGATCAAGCTTTCACTTTCCAAAGCGGTTAAGGCTAAACCGGAGCTTGTACCTTCTTTA
CTAACTCTAGCTCTTAATGATGCTATGACTTATGATAAGGCTACAAAATCTGGTGGAGCC
AATGGATCCATACGGTTCAGCTCTGAGATAAGCAGAGCAGAGAACGCTGGGCTTTCTGAT
GGGTTAGCTCTCATAGAGGAAGCCAAGAAGGAGATTGACTCGTTCTCAAAGGGTGGACCA
ATTTCATATGCAGATCTCATTCAACTGGCAGGGCAATCAGCGGTGAAGGCAACATTTTTA
GCATCAGCAATACGTAAATGCGGTGGAAATGAAGAG

QA 12 647 12 647
DS 

RD RR2A673TF 693 0 0
GGACACAT
TCTCTCTCTCACACACATCAGAAACAAGAAATGGGAGGAGTTTCTTTCCTCTCCACTGTT
CCCTCCTTCACCAACATCAACAATCGTCAACATCTCACACTCTCTTCTTCTCATAGCTCT
GTTCTCGTTCGATGTTGCAAGATCGATCCTCAAGTTTCCGACAACACTTTATCATTTCAC
CGGCGGGATGTTCTCAAACTCGCCGGCACTGCCCTCGGAATGGAACTAACAGGTAACGGC
TTCATTAACCATGTGGGCGATGCAAAAGCTGCTGATCTGAATCAGCGCAGGCAGCGATCC
GAGTTTCAATCAAAGATCAAGCTTTCACTTTCCAAAGCGGTTAAGGCTAAACCGGAGCTT
GTACCTTCTTTATTAACTCTAGCTCTTAATGATGCTATGACTTATGATAAGGCTACAAAA
TCTGGTGGAGCCAATGGATCTATACGGTTCAGCCCTGAGATAAGCAGAGCAGAGAACGCT
GGGCTTTCTGATGGGTTAGCTCTCATAGAGGAAGCCAAGAAGGAGATTGACTCGTTCTCA
AAGGGTGGACCTATTTCATATGCAGATCTTATTCAACTGGCAGGGCAATCAGCTGTGAAG
GCTACATTTTTAGCATCAGCAATACGTAAATGCGGTGGAAATGAAGAGAAAGGGAACTTA
CTCTACACAGCATATGGTTCAAGTG

QA 9 693 9 693
DS 

RD RR2A201TF 705 0 0
GGAG
ACACATCAGAAACAAGAAATGGGAGGAGTTTCTTTCCTCTCCACTGTTCCCTCCTTCACC
AACATCAACAATCGTCAACATCTCACACTCTCTTCTTCTCATCGCTCTGTTCTCGTTCGA
TGTTGCAAGATCGATCCTCAAGTTTCCGACAACACTTTATCATTTCACCGGCGGGATGTT
CTCAAACTCGCCGGCACTGCCCTCGGAATGGAACTAACAGGTAACGGCTTCATTAACCAT
GTGGGCGATGCAAAAGCTGCTGATCTGAATCAGCGCAGGCAGCGATCCGAGTTTCAATCA
AAGATCAAGCTTTCACTTTCCAAAGCGGTTAAGGCTAAACCGGAGCTTGTACCTTCTTTA
TTAACTCTAGCTCTTAATGATGCTATGACTTATGATAAGGCTACAAAATCTGGTGGAGCC
AATGGATCTATACGGTTCAGCTCTGAGATAAGCAGAGCAGAGAACGCTGGGCTTTCTGAT
GGGTTAGCTCTCATAGAGGAAGCCAAGAAGGAGATTGACTCGTTCTCAAAGGGTGGACCT
ATTTCATATGCAGATCTTATTCAACTGGCAGGGCAATCAGCTGTGAAGGCTACATTTTTA
GCATCAGCAATACGTAAATGCGGTGGAAATGAAGAGAAAGGGAACTTACTCTACACAGCA
TATGGTTCAAGTGGTCAGTGGGCTTTGTTTGATAGACAATT

QA 5 705 5 705
DS 

RD RR2A673JQ 781 0 0
TAATGATGCTATGACTTATGATAAGGCTACAAAATCTGGTGGAGCCAATGGATCTATACG
GTTCAGCCCTGAGATAAGCAGAGCAGAGAACGCTGGGCTTTCTGATGGGTTAGCTCTCAT
AGAGGAAGCCAAGAAGGAGATTGACTCGTTCTCAAAGGGTGGACCTATTTCATATGCAGA
TCTTATTCAACTGGCAGGGCAATCAGCTGTGAAGGCTACATTTTTAGCATCAGCAATACG
TAAATGCGGTGGAAATGAAGAGAAAGGGAACTTACTCTACACAGCATATGGTTCAAGTGG
TCAGTGGGCTTTGTTTGATAGACAATTCGGAAGGAGTGATGCAACAGAGGCTGATCCAGA
AGGGAGGATCCCATTACGGGGAAAAGCAACTGTGCAAGAGATGAAAGATAAGTTCATTGC
CATCGGATTGGGTCCTCGTCAGTTAGCTGTAATGTCTGCATTCTTGGGTCCTGATCAAGC
CGCAACAGAAGAGCTCTTAGCTAGCGACCCACAAGTTGCACCATGGGTTCAGAAGTACCA
ACGAAGCCGTGAAACTGTATCTCAGACAGATTACGAGGTTGATCTGATAACTGCATTGAC
AAAGCTAAGTGGTCTAGGACAGCAAATCAACTATGAGGCATATACATATCCTGTCGAGCG
GATCAATCTTAGCAAACTCAAGCTATGAGCATA*AGCGTGACAACAAGTTTTAAGTCAGT
GTACACTATGTATAACTTGAGCAAACTTGAACTCATTAATATA**TCCAAGATTTTTCTT
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2CR83JQ 786 0 0
TGCTATGACTTATGATAAGGCTACAAAATCTGGTGGAGCCAATGGATCCATACGGTTCAG
CTCTGAGATAAGCAGAGCAGAGAACGCTGGGCTTTCTGATGGGTTAGCTCTCATAGAGGA
AGCCAAGAAGGAGATTGACTCGTTCTCAAAGGGTGGACCAATTTCATATGCAGATCTCAT
TCAACTGGCAGGGCAATCAGCGGTGAAGGCAACATTTTTAGCATCAGCAATACGTAAATG
CGGTGGAAATGAAGAGAAAGGGAACTTACTCTACACAGCATATGGTTCAAGTGGTCAGTG
GGCTTTGTTTGATAGACAATTCGGAAGGAGTGATGCAACAGAGGCAGATCCAGAAGGGAG
GATCCCATTATGGGGAAAAGCAACTGTGCAAGAGATGAAAGATAAGTTCATTGCCATCGG
ACTGGGTCCTCGTCAGTTAGCTGTGATGTCTGCATTCTTGGGTCCTGATCAAGCCGCAAC
AGAAGAGCTCTTAGCTAGCGACCCGCAAGTTGCACCATGGGTTCAGAAGTACCAACGTAG
CCGTGAAACTGTATCTCAGACAGATTACGAGGTTGATCTGATAACTGCATTGACAAAGCT
AAGTGGTCTAGGACAGCAAATCAACTATGAGGCATATACATATCCTGTCGAGCGGATCAA
TCTAAGCAAACTCAAGCTATGAGCATAGAGCGTGACAACAAGTTTTTAGTCATTGTACAC
TATGCATAACTTGAGCAAACTTGAACTCGTTAATATATATCCAAGATTTTTCTTGAAATT
CAAATG

QA 1 786 1 786
DS 



AS 2 5

CO CL1223Contig1 804 2 7 U
AAATCCTAAGAGCGCAAGACCCACATTATGATATAGGACTGCGTCACATTGTATATAAAT
AACCCCAATAGTTACACTGTCTTGTTGAATAAACTGTACATAACAGATCAATAATTTTTT
CAGGCAAAAGATAGAAGCTGTGAGAGATACACATATGTAAAAAGATGAAATCCTTTTAGT
CTTCTTGGTCGTGATCTCTAATCCATTTGGTCGCTACCCATTTCTCTCCTTTGGTCACCG
GGCAACTCCCATGAAGCGAAGTCTGATCAATTGTGCCATTAGGAAACACTGAATAAAAAA
GAAGACCATCTCCTTTCCGAGGTTTTACTTTTAGCCCAATACATTGCTTGTAATCATATC
CAACGCCCATATTACCACCGTTCTCAAATGGGAACATTGTTTCACCACCTTCTTCTACAT
CAGATAAGTAGAGCAGGAAGGAAGCAATCCTTTGGCTTTTCTTGTGGTCCGTATTCTGTA
GGGTTGAAAACATCATAGTGGGAATCATACTTTTGCCCAAGCTCATACCTTAAAATATTG
AATGCCTCTCCATGAGTCCTTGGGATCATAGTAGCTTTTGCGATTTTCTTTTCAACAAAC
TCCAAAGCACCAGAACTCTCTTCTGAAGCACTAACAAAAGTTCCTGAGCTTGTTCTAGTG
CCCTGAGTGCTCTCAGCAGTCTCTCCTAGCCGGAGAGCCAAAGCAGAAGGTTTCAGATTA
ACCTTTGCTCTCTCAATAATAGCTTGGCATTGTTCTGCAGTTGCGAAATTCGGAAAGTAT
AAAGCCCTCGGTTTCCAACTCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D645JQ U 128
AF RR2FQ62JQ U 1
BS 1 370 RR2FQ62JQ
BS 371 371 RR2D645JQ
BS 372 374 RR2FQ62JQ
BS 375 375 RR2D645JQ
BS 376 462 RR2FQ62JQ
BS 463 463 RR2D645JQ
BS 464 804 RR2FQ62JQ

RD RR2D645JQ 442 0 0
AAGATAA
AAGCTGTGAGAGATACACATATGTAAAA*GATGAAATGCTTTTAGTCTTCTTGGTCTTGA
TCTCTAATCCATTTGGTCGCTACCCATTTCTCTCCTTTGGTCACCGGGCAACTCCCGTGA
AGCGAAGTCTGATCAATTGTGCCATTAGGAAACACTGAATAAAAAAGAAGACCATCTCCT
TTCCGAGGTTTTACTTTTAGCCCAATACATTGCTTGTAATCATATCCAGCGCCCATATTA
CCACCGTTCTCAAATGGGAACATTGTTTCACCACCTTCTTCTACATCAGATAAGTAGAGC
AGGAAGGAAGCAATCCTTTGGCTTTTTTTGTGGTCCGTATTCTGTAGGGTTGAAAACATC
ATAGTGGGAATCATACTTTTGCCCAAGCTCATACCTTAAAATATTGAATGCCTCTCCATG
AGTCCTTGGGATCAT

QA 8 442 8 442
DS 

RD RR2FQ62JQ 804 0 0
AAATCCTAAGAGCGCAAGACCCACATTATGATATAGGACTGCGTCACATTGTATATAAAT
AACCCCAATAGTTACACTGTCTTGTTGAATAAACTGTACATAACAGATCAATAATTTTTT
CAGGCAAAAGATAGAAGCTGTGAGAGATACACATATGTAAAAAGATGAAATCCTTTTAGT
CTTCTTGGTCGTGATCTCTAATCCATTTGGTCGCTACCCATTTCTCTCCTTTGGTCACCG
GGCAACTCCCATGAAGCGAAGTCTGATCAATTGTGCCATTAGGAAACACTGAATAAAAAA
GAAGACCATCTCCTTTCCGAGGTTTTACTTTTAGCCCAATACATTGCTTGTAATCATATC
CAACGCCCATGTTAGCACCGTTCTCAAATGGGAACATTGTTTCACCACCTTCTTCTACAT
CAGATAAGTAGAGCAGGAAGGAAGCAATCCTTTGGCTTTTCT*GTGGTCCGTATTCTGTA
GGGTTGAAAACATCATAGTGGGAATCATACTTTTGCCCAAGCTCATACCTTAAAATATTG
AATGCCTCTCCATGAGTCCTTGGGATCATAGTAGCTTTTGCGATTTTCTTTTCAACAAAC
TCCAAAGCACCAGAACTCTCTTCTGAAGCACTAACAAAAGTTCCTGAGCTTGTTCTAGTG
CCCTGAGTGCTCTCAGCAGTCTCTCCTAGCCGGAGAGCCAAAGCAGAAGGTTTCAGATTA
ACCTTTGCTCTCTCAATAATAGCTTGGCATTGTTCTGCAGTTGCGAAATTCGGAAAGTAT
AAAGCCCTCGGTTTCCAACTCAGT

QA 1 804 1 804
DS 



CO CL1223Contig2 1109 3 5 U
GGACTACTTTCAAACACGGTGTAATGGTCTTTCTACTTATTACATCACTGGATCAAAGAA
AAGTCTCGTTCCCGGCTTGAATTTTCAGATCGGACGAAAGGAACACAGGTCAATGAAGAA
CAGATTGAAGAGCTACAAGAGGAAGAAGCTAGGGTTAGCCACAGTCATCGGCTTCTGTTC
CCTCTGTTTCCTCATCGGCTTCTACGCTTCAGCTCTACTCTCTCAGAATGTGCCTGGAGT
AAGACCGAGGTTGAGAATGGTGGAGATGGTGGAGAACGGTGAAGGAGAAGGTTCCTCGAT
GCCTCATGGTGTTACTGGAGATGAATCCGTTGGGTCGATTCCGTTTCAGGTACTGAGTTG
GAAACCGAGGGCTTTATACTTTCCGAATTTCGCAACTGCAGAACAATGCCAAGCTATTAT
TGAGAGAGCAAAGGTTAATCTGAAACCTTCTGCTTTGGCTCTCCGGCTAGGAGAGACTGC
TGAGAGCACTCAGGGCACTAGAACAAGCTCAGGAACTTTTGTTAGTGCTTCAGAAGAGAG
TTCTGGTGCTTTGGAGTTTGTTGAAAAGAAAATCGCAAAAGCTACTATGATCCCAAGGAC
TCATGGAGAGGCATTCAATATTTTAAGGTATGAGCTTGGGCAAAAGTATGATTCCCACTA
TGATGTTTTCAACCCTACAGAATACGGACCACAAAAAAAGCCAAAGGATTGCTTCCTTCC
TGCTCTACTTATCTGATGTAGAAGAAGGTGGTGAAACAATGTTCCCATTTGAGAACGGTG
CTAATATGGGCGCTGGATATGATTACAAGCAATGTATTGGGCTAAAAGTAAAACCTCGGA
AAGGAGATGGTCTTCTTTTTATTCAGTGTTTCCTAATGGCACAATTGATCAGACGTCGCT
TCACGGGAGTTGCCCGGTGACCAAAGGAGAGAAATGGGTAGCGACTAAATGGATCAGAGA
CCAAGACCAAGAAGACTAAAATGATTTCATCTTTTACATATGTATCTCTCACAGCTTCCA
TCTTTTGCCTGAAAAAAATTCTTGATCTGTTATGTACAGTTTATTCAACAAGACAGTGTA
ACTATTGGGGTTATTTATATACAATGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ62TF U 1
AF RR2D645TF U 312
AF RR2AK05JQ C 262
BS 1 591 RR2FQ62TF
BS 592 825 RR2D645TF
BS 826 826 RR2AK05JQ
BS 827 836 RR2D645TF
BS 837 1109 RR2AK05JQ

RD RR2FQ62TF 591 0 0
GGACTACTTTCAAACACGGTGTAATGGTCTTTCTACTTATTACATCACTGGATCAAAGAA
AAGTCTCGTTCCCGGCTTGAATTTTCAGATCGGACGAAAGGAACACAGGTCAATGAAGAA
CAGATTGAAGAGCTACAAGAGGAAGAAGCTAGGGTTAGCCACAGTCATCGGCTTCTGTTC
CCTCTGTTTCCTCATCGGCTTCTACGCTTCAGCTCTACTCTCTCAGAATGTGCCTGGAGT
AAGACCGAGGTTGAGAATGGTGGAGATGGTGGAGAACGGTGAAGGAGAAGGTTCCTCGAT
GCCTCATGGTGTTACTGGAGATGAATCCGTTGGGTCGATTCCGTTTCAGGTACTGAGTTG
GAAACCGAGGGCTTTATACTTTCCGAATTTCGCAACTGCAGAACAATGCCAAGCTATTAT
TGAGAGAGCAAAGGTTAATCTGAAACCTTCTGCTTTGGCTCTCCGGCTAGGAGAGACTGC
TGAGAGCACTCAGGGCACTAGAACAAGCTCAGGAACTTTTGTTAGTGCTTCAGAAGAGAG
TTCTGGTGCTTTGGAGTTTGTTGAAAAGAAAATCGCAAAAGCTACTATGAT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2D645TF 525 0 0
TTAG
TGGAGATGGATCCGTTGGGTCGATTCCGTTTCAGGTACTGAGTTGGAAACCGAGGGCTTT
ATACTTTCCGAATTTCGCAACTGCAGAACAATGCCAAGCTATTATTGAGAGAGCAAAGGT
TAATCTGAAACCTTCTGCTTTGGCTCTCCGGCTAGGAGAGACTGCTGAGAGCACTCAGGG
CACTAGAACAAGCTCAGGAACTTTTGTTAGTGCTTCAGAAGAGAGTTCTGGTGCTTCGGA
GTTTGTTGAAAAGAAAATCGCAAAAGCTACGATGATCCCAAGGACTCATGGAGAGGCATT
CAATATTTTAAGGTATGAGCTTGGGCAAAAGTATGATTCCCACTATGATGTTTTCAACCC
TACAGAATACGGACCACAAAAAAAGCCAAAGGATTGCTTCCTTCCTGCTCTACTTATCTG
ATGTAGAAGAAGGTGGTGAAACAATGTTCCCATTTGAGAACGGTGCTAATATGGGCGCTG
GATATGATTACAAGCAATGTATTGGGCTAAGAGTAAAACCT

QA 5 525 5 525
DS 

RD RR2AK05JQ 848 0 0
GGAGATGGTGGAGAACGGTGAAGGAGGAGGTTCCTCGATGCCTCATGGTGTTACTGGAGA
TGAATCCGTTGGGTCGATTCCGTTTCAGGTACTGAGTTGGAAACCGAGGGCGTTATATTT
TCCGAATTTCGCAACTGCAGAACAATGCCAAGCTATTATTGAGAGAGCAAAGGTTAATCT
GAAACCTTCTGCTTTGGCTCTCCGGCTAGGAGAGACTGCTGAGAGCACTCAGGGCACTAG
AACAAGCTCAGGAACTTTTGTTAGTGCTTCAGAAGAGAGTTCTGGTGCTTTGGAGTTTGT
TGAAAAGAAAATCGCAAAAGCTACTATGATCCCAAGGACTCATGGAGAGGCATTCAATAT
TTTAAGGTATGAGCTTGGGCATAAGTATGATTCCCACTATGATGTTTTCAACCCTACAGA
ATACGGACCACAGAAAA*GCCAAAGGATTGCTTCCTTCCTGCTCTACTTATCTGATGTAG
AAGAAGGTGGTGAAACAATGTTCCCATTTGAGAACGGTGCTAATATGGGTGCTGGATATG
ATTACAAGCAATGTATTGGGCTAAAAGTAAAACCTCGGAAAGGAGATGGTCTTCTTTTTA
TTCAGTGTTTCCTAATGGCACAATTGATCAGACGTCGCTTCACGGGAGTTGCCCGGTGAC
CAAAGGAGAGAAATGGGTAGCGACTAAATGGATCAGAGACCAAGACCAAGAAGACTAAAA
TGATTTCATCTTTTACATATGTATCTCTCACAGCTTCCATCTTTTGCCTGAAAAAAATTC
TTGATCTGTTATGTACAGTTTATTCAACAAGACAGTGTAACTATTGGGGTTATTTATATA
CAATGTGA

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 5

CO CL1224Contig1 853 5 12 U
GGACACAACAAAAACAAGAAGATAAAGATGGGTTTCATTGGTAAGAGTGTTTTGCTAACT
CTCATAGCACTCTGCTGCTTCATTTCCTCTGCTTTCAGTACTATAGCTCAACCTCCAATG
AAACTAATAACGCCATTGCCCACTCTCCCACCGGCCAAAGCCCCTATCAAGTTACCAACT
CTCCCACCGGCCAAAGCTCCGATCAAGCTACCAACACTCCCACCAACTAAAGCTCCGATC
AAGCCTCCGGTTCTCCCACCGGTTTCTCCACCTAAGTTCAACAGGACACTAGTGGCCGTG
CGGGGTGTTGTCTTCTGCAAAGCCTGCAAGTACGCCGGCATAAACAATCTCCAAGGCGCC
AAACCCGTTAAAGGTGCGGTGGTGAGACTTTTGTGCAAAAACAAAAAGAACGCGACATCA
GAGGCAACGACGGACAAGAACGGATACTTCCTGCTATATGCCCCCAAAACGGTGACCAAC
TACGCCATCAAAAATTGCCGAGCTTACCTAGTAAAGTCGCCGGACGCTAAATGCAGCAAA
GTGTCAAAGCTCCACGGTGGATATTTGGGCTCCTTTCTAAAACCGGTGGTGAAACCAGAG
AATGCAACGATCATCTTCAACAAGCTCACGTACGGTCTTTTCAACGTTGGTCCATTCGCA
TTCGAGCCTGTCTGCCCCAAATGAGATGGTTTTATTTAATAATATAGCTAGTGAAACTTT
GATTATGGGTATTGATCACACAGTTTAGTAATGATTGTGTTGAATGTATCAGCTTGGTTG
GGTTTCTTTATATGGGCTTTTGTATTAGTGTTTTCTGATTATCTATTGAATAAAAACGAT
TACGTTTACATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2BT28TF U 1
AF RR2BN21TF U 3
AF RR2CK28TF U 10
AF RR2BN21JQ C 47
AF RR2CK28JQ C 318
BS 1 379 RR2BT28TF
BS 380 380 RR2BN21TF
BS 381 677 RR2BT28TF
BS 678 678 RR2BN21JQ
BS 679 698 RR2BT28TF
BS 699 701 RR2BN21JQ
BS 702 715 RR2CK28TF
BS 716 716 RR2BN21JQ
BS 717 750 RR2CK28TF
BS 751 751 RR2BN21JQ
BS 752 759 RR2CK28TF
BS 760 853 RR2BN21JQ

RD RR2BT28TF 703 0 0
GGACACAACAAAAACAAGAAGATAAAGATGGGTTTCATTGGTAAGAGTGTTTTGCTAACT
CTCATAGCACTCTGCTGCTTCATTTCCTCTGCTTTCAGTACTATAGCTCAACCTCCAATG
AAACTAATAACGCCATTGCCCACTCTCCCACCGGCCAAAGCCCCTATCAAGTTACCAACT
CTCCCACCGGCCAAAGCTCCGATCAAGCTACCAACACTCCCACCAACTAAAGCTCCGATC
AAGCCTCCGGTTCTCCCACCGGTTTCTCCACCTAAGTTCAACAGGACACTAGTGGCCGTG
CGGGGTGTTGTCTTCTGCAAAGCCTGCAAGTACGCCGGCATAAACAATCTCCAAGGCGCC
AAACCCGTTAAAGGTGCGGCGGTGAGACTTTTGTGCAAAAACAAAAAGAACGCGACATCA
GAGGCAACGACGGACAAGAACGGATACTTCCTGCTATATGCCCCCAAAACGGTGACCAAC
TACGCCATCAAAAATTGCCGAGCTTACCTAGTAAAGTCGCCGGACGCTAAATGCAGCAAA
GTGTCAAAGCTCCACGGTGGATATTTGGGCTCCTTTCTAAAACCGGTGGTGAAACCAGAG
AATGCAACGATCATCTTCAACAAGCTCACGTACGGTCTTTTCAACGTTGGTCCATTCGCA
TTCGAGCCTGTCTGCCC*AAATGAGATGGTTTTATTTA
TAATA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2BN21TF 671 0 0
GGACAAC
AAAAACAAGAAGATAAAGATGGGTTTCATTGGTAAGAGTGTTTTGCTAACTCTCATAGCA
CTCTGCTGCTTCATTTCCTCTGCTTTCAGTACTATAGCTCAACCTCCAATGAAACTAATA
ACGCCATTGCCCACTCTCCCACCGGCCAAAGCCCCTATCAAGTTACCAACTCTCCCACCG
GCCAAAGCTCCGATCAAGCTACCAACACTCCCACCAACTAAAGCTCCGATCAAGCCTCCG
GTTCTCCCACCGGTTTCTCCACCTAAGTTCAACAGGACACTAGTGGCCGTGCGGGGTGTT
GTCTTCTGCAAAGCCTGCAAGTACGCCGGCATAAACAATCTCCAAGGCGCCAAACCC**T
AAAGGTGCGGTGGTGAGACTTTTGTGCAAAAACAAAAAGAACGCGACATCAGAGGCAACG
ACGGACAAGAACGGATACTTCCTGCTATATGCCCCCAAAACGGTGACCAACTACGCCATC
AAAAATTGCCGAGCTTACCTAGTAAAGTCGCCGGACGCTAAATGCAGCAAAGTGTCAAAG
CTCCACGGTGGATATTTGGGCTCCTTTCTAAAACCGGTGGTGAAACCAGAGAATGCAACG
ATCATCTTCA*CAAGCTCACGTACGGTCTTTTCAACGTTGGTCCATTCGCATTCGAGCCT
GTCT

QA 8 671 8 671
DS 

RD RR2CK28TF 752 0 0
AAAAACAAGAAGATAAAG*TGGGTTTCATTGGTAAGAGTGTTTTGCTAACTCTCATAGCA
CTCTGCTGCTTCATTTCCTCTGCTTTCAGTACTATAGCTCAACCTCCAATGAAACTAATA
ACGCCATTGCCCACTCTCCCACCGGCCAAAGCCCCTATCAAGTTACCAACTCTCCCACCG
GCCAAAGCTCCGATCAAGCTACCAACACTCCCACCAACTAAAGCTCCGATCAAGCCTCCG
GTTCTCCCACCGGTTTCTCCACCTAAGTTCAACAGGACACTAGTGGCCGTGCGGGGTGTT
GTCTTCTGCAAAGCCTGCAAGTACGCCGGCATAAACAATCTCCAAGGCGCCAAACCCGTT
AAAGGTGCGGTGGTGAGACTTTTGTGCAAAAACAAAAAGAACGCGACATCAGAGGCAACG
ACGGACAAGAACGGATACTTCCTGCTATATGCCCCCAAAACGGTGACCAACTACGCCATC
AAAAATTGCCGAGCTTACCTAGTAAAGTCGCCGGACGCTAAATGCAGCAAAGTGTCAAAG
CTCCACGGTGGATATTTGGGCTCCTTTCTAAAACCGGTGGTGAAACCAGAGAATGCGACG
ATCATCTTCAACAAGCTCACGTACGGTCTTTTCAACGTTGGTCCATTCGCATTCGAGCCT
GTCTGCCC*AAATGAGATGGTTTTATTTAT**ATATAGCTAGTGAA*CTTTGATTATGGG
TATTGATCACACAGTTTAGTA*TGATTGTG
TG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2BN21JQ 807 0 0
GTGTTTTGCTAACTCTCATAGCACTCTGCTGCTTCATTTCCTCTGCTTTCAGTACTATAG
CTCAACCTCCAATGAAACTAATAACGCCATTGCCCACTCTCCCACCGGCCAAAGCCCCTA
TCAAGTTACCAACTCTCCCACCGGCCAAAGCTCCGATCAAGCTACCAACACTCCCACCAA
CTAAAGCTCCGATCAAGCCTCCGGTTCTCCCACCGGTTTCTCCACCTAAGTTCAACAGGA
CACTAGTGGCCGTGCGGGGTGTTGTCTTCTGCAAAGCCTGCAAGTACGCCGGCATAAACA
ATCTCCAAGGCGCCAAACCC**TAAAGGTGCGGTGGTGAGACTTTTGTGCAAAAACAAAA
AGAACGCGACATCAGAGGCAACGACGGACAAGAACGGATACTTCCTGCTATATGCCCCCA
AAACGGTGACCAACTACGCCATCAAAAATTGCCGAGCTTACCTAGTAAAGTCGCCGGACG
CTAAATGCAGCAAAGTGTCAAAGCTCCACGGTGGATATTTGGGCTCCTTTCTAAAACCGG
TGGTGAAACCAGAGAATGCAACGATCATCTTCAACAAGCTCACGTACGGTCTTTTCAACG
TTGGTCCATTCGCATTCGAGCCTGTCTGCCCCAAATGAGATGGTTTTATTTAATAATATA
GCTAGTGAAACTTTGATTATGGGTATTGATCACACAGTTTAGTAATGATTGTGTTGAATG
TATCAGCTTGGTTGGGTTTCTTTATATGGGCTTTTGTATTAGTGTTTTCTGATTATCTAT
TGAATAAAAACGATTACGTTTACATAT

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2CK28JQ 534 0 0
CAAAGCCTGCAAGTACGCCGGCATAAACAATCTCCAAGGCGCCAAACCCGTTAAAGGTGC
GGTGGTGAGACTTTTGTGCAAAAACAAAAAGAACGCGACATCAGAGGCAACGACGGACAA
GAACGGATACTTCCTGCTATATGCCCCCAAAACGGTGACCAACTACGCCATCAAAAATTG
CCGAGCTTACCTAGTAAAGTCGCCGGACGCTAAATGCAGCAAAGTGTCAAAGCTCCACGG
TGGATATTTGGGCTCCTTTCTAAAACCGGTGGTGAAACCAGAGAATGCGACGATCATCTT
CAACAAGCTCACGTACGGTCTTTTCAACGTTGGTCCATTCGCATTCGAGCCTGTCTGCCC
CAAATGAGATGGTTTTATTTAATAATATAGCTAGTGAAACTTTGATTATGGGTATTGATC
ACACAGTTTAGTAATGATTGTGTTGAATGTATCAGCTTGGTTGGGTTTCTTTATATGGGC
TTTTGTATTAGTGTTTTCTGATTATCTATTGAATAAAAACGATTACGTTTACAT

QA 1 534 1 534
DS 



AS 2 6

CO CL1225Contig1 779 2 4 U
GGGGCATGTGACATTCTTCTGGAATGGAAACCGATCTGGATATTTCAACGAGAAACTGGA
GCAGTATGTTGAAATCCCAAGTGACAGTGGAATCTCGTTCAATGTCAAGCCAAAGATGAA
GGCTTTGGAGATTGCTGAGAAGGCAAGGGACGCAATTCTAAGTGGCAAGTTTGACCAGGT
GCGAGTTAACTTGCCAAACAGTGATATGGTTGGACATACAGGTGACATTGAAGCCACGGT
TGTTGCTTGCGAGGCTGCTGATGTTGCTGTCAAGATGATCCTAGATGCAATTGAACAAGT
GAAAGGTATTTACGTTGTAACTGCTGATCACGGAAACGCAGAGGACATGGTTAAGAGGGA
CAAGGCTGGGAAGCCTGCTTTGGACAAGGAAGGGAACCTTCAGATTCTAACCTCTCACAC
TCTCAAGCCAGTGCCTATTGCCATTGGAGGTCCAGGATTGTCTGAAGGAGTGAGATTCCG
TAAGGATCTGGAGACACCAGGACTTGCGAATGTAGCTGCAACAGTGATGAACCTCCATGG
GATTTGTGGCTCCCGCTGACTACGAGCCCACCCTCATTGAAGTTGTGGAGAAGAACTGAG
AGCCTTCTTAGGTTTTGAAGAGACGGCTGAAACTCTGAAACTACGTTATATTGTTTTCCA
TTTAATAAGGTTTACACACAAGACAAGCATTTTTGAATTTGCCTTTTGGCCACCAAACAC
ATTGATTTTGGTTTAAATGATATTCAAGCTTTCTCTTTAATATCTCTAGCCAGATTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL94TF U 1
AF RR2B168TF U 12
BS 1 611 RR2BL94TF
BS 612 612 RR2B168TF
BS 613 622 RR2BL94TF
BS 623 779 RR2B168TF

RD RR2BL94TF 622 0 0
GGGGCATGTGACATTCTTCTGGAATGGAAACCGATCTGGATATTTCAACGAGAAACTGGA
GCAGTATGTTGAAATCCCAAGTGACAGTGGAATCTCGTTCAATGTCAAGCCAAAGATGAA
GGCTTTGGAGATTGCTGAGAAGGCAAGGGACGCAATTCTAAGTGGCAAGTTTGACCAGGT
GCGAGTTAACTTGCCAAACAGTGATATGGTTGGACATACAGGTGACATTGAAGCCACGGT
TGTTGCTTGCGAGGCTGCTGATGTTGCTGTCAAGATGATCCTAGATGCAATTGAACAAGT
GAAAGGTATTTACGTTGTAACTGCTGATCACGGAAACGCAGAGGACATGGTTAAGAGGGA
CAAGGCTGGGAAGCCTGCTTTGGACAAGGAAGGGAACCTTCAGATTCTAACCTCTCACAC
TCTCAAGCCAGTGCCTATTGCCATTGGAGGTCCAGGATTGTCTGAAGGAGTGAGATTCCG
TAAGGATCTGGAGACACCAGGACTTGCGAATGTAGCTGCAACAGTGATGAACCTCCATGG
GATTTGTGGCTCCCGCTGACTACGAGCCCACCCTCATTGAAGTTGTGGAGAAGAACTGAG
AGCCTTCTTAG*TTTTGAAGAG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2B168TF 768 0 0
CATTCTTCTGGAATGGAAACCGATCTGGATATTTCAACGAGAAACTGGAGCAGTATGTTG
AAATCCCAAGTGACAGTGGAATCTCGTTCAATGTCAAGCCAAAGATGAAGGCTTTGGAGA
TTGCTGAGAAGGCAAGGGACGCAATTCTAAGTGGCAAGTTTGACCAGGTGCGAGTTAACT
TGCCAAACAGTGATATGGTTGGACATACAGGTGACATTGAAGCCACGGTTGTTGCTTGCG
AGGCTGCTGATGTTGCTGTCAAGATGATCCTAGATGCAATTGAACAAGTGAAAGGTATTT
ACGTTGTAACTGCTGATCACGGAAACGCAGAGGACATGGTTAAGAGGGACAAGGCTGGGA
AGCCTGCTTTGGACAAGGAAGGGAACCTTCAGATTCTAACCTCTCACACTCTCAAGCCAG
TGCCTATTGCCATTGGAGGTCCAGGATTGTCTGAAGGAGTGAGATTCCGTAAGGATCTGG
AGACACCAGGACTTGCGAATGTAGCTGCAACAGTGATGAACCTCCATGG*ATTTGTGGCT
CCCGCTGACTACGAGCCCACCCTCATTGAAGTTGTGGAGAAGAACTGAGAGCCTTCTTAG
GTTTTGAAGAGACGGCTGAAACTCTGAAACTACGTTATATTGTTTTCCATTTAATAAGGT
TTACACACAAGACAAGCATTTTTGAATTTGCCTTTTGGCCACCAAACACATTGATTTTGG
TTTAAATGATATTCAAGCTTTCTCTTTAATATCTCTAGCCAGATTTCT

QA 1 768 1 768
DS 



CO CL1225Contig2 993 4 6 U
GGCAGGGCTGACCGTATGGTGATGCACGCCAAGGCGCTTGAGTATGAGGACTTTGACAAT
TTTGACCGTGTGAGGTTCCCTAAGATCCGTTACGCTGGTATGCTTGAGTATGATGGTGAG
CTGAAGCTGCCGAGCCGTTACCTTGTCTCTCCCCCGGAGATTGATAGAACCTCTGGTGAA
TATTTGACTCACAATGGCGTCAGTACTTTTGCTTGCAGTGAGACGGTCAAGTTTGGGCAT
GTGACATTCTTCTGGAATGGAAACCGATCTGGATATTTCAACGAGAAACTGGAGCAGTAT
GTTGAAATCCCAAGTGACAGTGGAATCTCGTTCAATGTCAAGCCAAAGATGAAGGCTTTG
GAGATTGCTGAGAAGGCAAGGGACGCAATTCTAAGTGGCAAGTTTGATCAGGTGCGAGTT
AACTTGCCAAACAGTGATATGGTTGGACATACAGGTGACATTGAAGCCACGGTTGTTGCT
TGCGAGGCTGCTGATGTTGCTGTCAAGATGATCCTAGATGCAATTGAACAAGTGAAAGGT
ATTTACGTTGTAACTGCTGATCACGGAAACGCAGAGGACATGGTTAAGAGGGACAAGGCT
GGGAAGCCTGCTTTGGACAAAGAAGGGAACCTTCAGATTCTAACCTCCCACACCCTCAAG
CCAGTGCCTATTGCCATTGGAGGTCCAGGATTGTCTGAAGGAGTGAGATTCCGTAAGGAT
CTGGAGACACCAGGACTTGCGAATGTAGCTGCTACCGTGATGAACCTCCATGGATTTGTG
GCTCCCGCTGACTACGAGCCCACACTCATTGAAGTTGTGGAGAAGAACTGAGAGCCTTCT
TAGCTTTTGAAGAGAGGGCTAAAACTCTGAAACGATGTTATATTGTTTTCCATTTAATAA
GGTTTTACACACGAGACAAGCATTTTTGAATTTGCCTTTTTGGCCACCAAACACATTGAT
TTTGGTTTAAATGATATTCAAGCTTTCTCCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2CV22TF U 1
AF RR2BV26JQ C 152
AF RR2FB09TF U 280
AF RR2CV22JQ C 285
BS 1 628 RR2CV22TF
BS 629 629 RR2FB09TF
BS 630 685 RR2CV22TF
BS 686 978 RR2FB09TF
BS 979 989 RR2BV26JQ
BS 990 993 RR2CV22JQ

RD RR2CV22TF 685 0 0
GGCAGGGCTGACCGTATGGTGATGCACGCCAAGGCGCTTGAGTATGAGGACTTTGACAAT
TTTGACCGTGTGAGGTTCCCTAAGATCCGTTACGCTGGTATGCTTGAGTATGATGGTGAG
CTGAAGCTGCCGAGCCGTTACCTTGTCTCTCCCCCGGAGATTGATAGAACCTCTGGTGAA
TATTTGACTCACAATGGCGTCAGTACTTTTGCTTGCAGTGAGACGGTCAAGTTTGGGCAT
GTGACATTCTTCTGGAATGGAAACCGATCTGGATATTTCAACGAGAAACTGGAGCAGTAT
GTTGAAATCCCAAGTGACAGTGGAATCTCGTTCAATGTCAAGCCAAAGATGAAGGCTTTG
GAGATTGCTGAGAAGGCAAGGGACGCAATTCTAAGTGGCAAGTTTGATCAGGTGCGAGTT
AACTTGCCAAACAGTGATATGGTTGGACATACAGGTGACATTGAAGCCACGGTTGTTGCT
TGCGAGGCTGCTGATGTTGCTGTCAAGATGATCCTAGATGCAATTGAACAAGTGAAAGGT
ATTTACGTTGTAACTGCTGATCACGGAAACGCAGAGGACATGGTTAAGAGGGACAAGGCT
GGGAAGCCTGCTTTGGACAAAGAAGGGA*CCTTCAGATTCTAACCTCCCACACCCTCAAG
CCAGTGCCTATTGCCATTGGAGGTC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2BV26JQ 841 0 0
TCTCCCGGAGATGATAG
ACCTCTGGTGAATATT*GACTCACAATGGCGTCAGTACTTT*GCTTGCAGTGAGACGGTC
AAGTTTGGGCATGTGACATTCTTCTGGAATGGAAACCGATCTGGATATTTCAACGAGAAA
CTGGAGCAGTATGTTGAAATCCCAAGTGACAGTGGAATCTCGTTCAATGTCAAGCCAAAG
ATGAAGGCTTTGGAGATTGCTGAGAAGGCAAGGGACGCAATTCTAAGTGGCAAGTTTGAT
CAGGTGCGAGTTAACTTGCCAAACAGTGATATGGTTGGACATACAGGTGACATTGAAGCC
ACGGTTGTTGCTTGCGAGGCTGCTGATGTTGCTGTCAAGATGATCCTAGATGCAATTGAA
CAAGTGAAAGGTATTTACGTTGTAACTGCTGATCACGGAAACGCAGAGGACATGGTTAAG
AGGGACCAGGCTGGGAAGCCTGCTTTGGACAAAGAAGGGAACCTTCAGATTCTAACCTCC
CACACCCTCAAGCCAGTGCCTATTGCCATTGGAGGTCCAGGATTGTCTGAAGGAGTGAGA
TTCCGTAAGGACCTGGAGACACCAGGACTTGCGAATGTAGCTGCTACCGTGATGAACCAC
CATGGATTTGTGGCTCCCGCTGACTACGAGCCCACAATCATTGAAGTTGTGGAGAAGAAC
TGAGAGCCTTCTTAGCTTTTGAAGAGAGGGCTAAAACTCTGAAACGATGTTATATTGTTT
TCCATTTAATAAGGTTTTACACACGAGACAAGCATTTTTGAATTTGCCTTTTTGGCCACC
AAACACATTGATTTTGGTTTAAATGATATTCAAGCTTTCTC
CTT

QA 18 838 18 838
DS 

RD RR2FB09TF 699 0 0
G
ACGAGAAACTGGAGCAGTATGTTGAAATCCCAAGTGACAGTGGAATCTCGTTCAATGTCA
AGCCAAAGATGAAGGCTTTGGAGATTGCTGAGAAGGCAAGGGACGCAATTCTAAGTGGCA
AGTTTGATCAGGTGCGAGTTAACTTGCCAAACAGTGATATGGTTGGACATACAGGTGACA
TTGAAGCCACGGTTGTTGCTTGCGAGGCTGCTGATGTTGCTGTCAAGATGATCCTAGATG
CAATTGAACAAGTGAAAGGTATTTACGTTGTAACTGCTGATCACGGAAACGCAGAGGACA
TGGTTAAGAGGGACAAGGCTGGGAAGCCTGCTTTGGACAAAGAAGGGAACCTTCAGATTC
TAACCTCCCACACCCTCAAGCCAGTGCCTATTGCCATTGGAGGTCCAGGATTGTCTGAAG
GAGTGAGATTCCGTAAGGATCTGGAGACACCAGGACTTGCGAATGTAGCTGCTACCGTGA
TGAACCTCCATGGATTTGTGGCTCCCGCTGACTACGAGCCCACACTCATTGAAGTTGTGG
AGAAGAACTGAGAGCCTTCTTAGCTTTTGAAGAGAGGGCTAAAACTCTGAAACGATGTTA
TATTGTTTTCCATTTAATAAGGTTTTACACACGAGACAAGCATTTTTGAATTTGCCTTTT
TGGCCACCAAACACATTGATTTTGGTTTAAATGATATT

QA 2 699 2 699
DS 

RD RR2CV22JQ 709 0 0
GAAACTGGAGCAGTATGTTGAAATCCCAAGTGACAGTGGAATCTCGTTCAATGTCAAGCC
AAAGATGAAGGCTTTGGAGATTGCTGAGAAGGCAAGGGACGCAATTCTAAGTGGCAAGTT
TGATCAGGTGCGAGTTAACTTGCCAAACAGTGATATGGTTGGACATACAGGTGACATTGA
AGCCACGGTTGTTGCTTGCGAGGCTGCTGATGTTGCTGTCAAGATGATCCTAGATGCAAT
TGAACAAGTGAAAGGTATTTACGTTGTAACTGCTGATCACGGAAACGCAGAGGACATGGT
TAAGAGGGACAAGGCTGGGAAGCCTGCTTTGGACAAAGAAGGGAACCTTCAGATTCTAAC
CTCCCACACCCTCAAGCCAGTGCCTATTGCCATTGGAGGTCCAGGATTGTCTGAAGGAGT
GAGATTCCGTAAGGATCTGGAGACACCAGGACTTGCGAATGTAGCTGCTACCGTGATGAA
CCTCCATGGATTTGTGGCTCCCGCTGACTACGAGCCCACACTCATTGAAGTTGTGGAGAA
GAACTGAGAGCCTTCTTAGCTTTTGAAGAGAGGGCTAAAACTTTGAAACGATGTTATATT
GTTTTCCATTTAATAAGGTTTTACACACGAGACAAGCATTTTTGAATTTGCCTTTTTGGC
CACCAAACACATTGATTTTGGTTTAAATGATATTCAAGCTTTCTCCTCG

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 5

CO CL1226Contig1 558 5 5 U
GGGTGGACAGCAGACGAAACTCACTCAAAAGATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTAACCGG
AAAGACCATCACCCTCGAGGTTGAGTCCTCCGACACCATCGACAATGTCAAGGCCAAGAT
CCAAGACAAAGAAGGTATCCCTCCGGATCAGCAGAGGTTGATCTTCGCCGGTAAACAGCT
CGAAGATGGCCGTACTTTGGCTGACTACAACATCCAGAAAGAGTCGACGCTTCATCTTGT
GTTGAGGCTTAGGGGAGGTATCATCGAGCCTTCTTTGATGGCTTTGGCTCGTAAGTACAA
CCAAGACAAGATGATTTGCCGCAAGTGCTACGCTCGTCTTCACCCAAGGGCTGTGAACTG
CAGGAAGAAGAAGTGTGGCCACAGCAACCAGTTGAGGCCTAAGAAGAAGATCAAGTAGAC
TCGATTCAAGAACCTGATCTCTTGCCTCCGTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTCACCCTTG
ATAAGGTTGTTTTTGCTTCAGTGAAATTTGATGTTCAAAGATTTTATCAGTAAAAGGATT
TGGTTTCCTATTCATGCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2BR66JQ C 1
AF RR2FA45TF U 250
AF RR2G954TF U 1
AF RR2G954JQ C 1
AF RR2BR66TF U 1
BS 1 257 RR2G954TF
BS 258 549 RR2FA45TF
BS 550 550 RR2G954TF
BS 551 553 RR2BR66TF
BS 554 558 RR2BR66JQ

RD RR2BR66JQ 558 0 0
GGGTGGACAGCAGACGAAACTCACTCAAAAGATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTAACCGG
AAAGACCATCACCCTCGAGGTTGAGTCCTCCGACACCATCGACAATGTCAAGGCCAAGAT
CCAAGACAAAGAAGGTATCCCTCCGGATCAGCAGAGGTTGATCTTCGCCGGTAAACAGCT
CGAAGATGGCCGTACTTTGGCTGACTACAACATCCAGAAAGAGTCGACGCTTCATCTTGT
GTTGAGGCTTAGGGGAGGTATCATCGAGCCTTCTTTGATGGCTTTGGCTCGTAAGTACAA
CCAAGACAAGATGATTTGCCGCAAGTGCTACGCTCGTCTTCACCCAAGGGCTGTGAACTG
CAGGAAGAAGAAGTGTGGCCACAGCAACCAGTTGAGGCCTAAGAAGAAGATCAAGTAGAC
TCGATTCAAGAACCTGATCTCTTGCCTCCGTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTCACCCTTG
ATAAGGTTGTTTTTGCTTCAGTGAAATTTGATGTTCAAAGATTTTATCAGTAAAAGGATT
TGGTTTCCTATTCATGCC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2FA45TF 300 0 0
GGGGGGGT
GTATCATCGAGCCTTCTTTGATGGCTTTGGCTCGTAAGTACAACCAAGACAAGATGATTT
GCCGCAAGTGCTACGCTCGTCTTCACCCAAGGGCTGTGAACTGCAGGAAGAAGAAGTGTG
GCCACAGCAACCAGTTGAGGCCTAAGAAGAAGATCAAGTAGACTCGATTCAAGAACCTGA
TCTCTTGCCTCCGTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTCACCCTTGATAAGGTTGTTTTTGCT
TCAGTGAAATTTGATGTTCAAAGATTTTATCAGTAAAAGGATTTGGTTTCCT

QA 9 300 9 300
DS 

RD RR2G954TF 553 0 0
GGGTGGACAGCAGACGAAACTCACTCAAAAGATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTAACCGG
AAAGACCATCACCCTCGAGGTTGAGTCCTCCGACACCATCGACAATGTCAAGGCCAAGAT
CCAAGACAAAGAAGGTATCCCTCCGGATCAGCAGAGGTTGATCTTCGCCGGTAAACAGCT
CGAAGATGGCCGTACTTTGGCTGACTACAACATCCAGAAAGAGTCGACGCTTCATCTTGT
GTTGAGGCTTAGGGGAGGTATCATCGAGCCTTCTTTGATGGCTTTGGCTCGTAAGTACAA
CCAAGACAAGATGATTTGCCGCAAGTGCTACGCTCGTCTTCACCCAAGGGCTGTGAACTG
CAGGAAGAAGAAGTGTGGCCACAGCAACCAGTTGAGGCCTAAGAAGAAGATCAAGTAGAC
TCGATTCAAGAACCTGATCCCTTGCCTCCGTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTCACCCTTG
ATAAGGTTGTTTTTGCTTCAGTGAAATTTGATGTTCAAAGATTTTATCAGTAAAAGGATT
TGGTTTCCTA
TTC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2G954JQ 550 0 0
GGGTGGACAGCAGACGAAACTCACTCAAAAGATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTAACCGG
AAAGACCATCACCCTCGAGGTTGAGTCCTCCGACACCATCGACAATGTCAAGGCCAAGAT
CCAAGACAAAGAAGGTATCCCTCCGGATCAGCAGAGGTTGATCTTCGCCGGTAAACAGCT
CGAAGATGGCCGTACTTTGGCTGACTACAACATCCAGAAAGAGTCGACGCTTCATCTTGT
GTTGAGGCTTAGGGGAGGTATCATCGAGCCTTCTTTGATGGCTTTGGCTCGTAAGTACAA
CCAAGACAAGATGATTTGCCGCAAGTGCTACGCTCGTCTTCACCCAAGGGCTGTGAACTG
CAGGAAGAAGAAGTGTGGCCACAGCAACCAGTTGAGGCCTAAGAAGAAGATCAAGTAGAC
TCGATTCAAGAACCTGATCCCTTGCCTCCGTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTCACCCTTG
ATAAGGTTGTTTTTGCTTCAGTGAAATTTGATGTTCAAAGATTTTATCAGTAAAAGGATT
TGGTTTCCTA

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2BR66TF 558 0 0
GGGTGGACAGCAGACGAAACTCACTCAAAAGATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTAACCGG
AAAGACCATCACCCTCGAGGTTGAGTCCTCCGACACCATCGACAATGTCAAGGCCAAGAT
CCAAGACAAAGAAGGTATCCCTCCGGATCAGCAGAGGTTGATCTTCGCCGGTAAACAGCT
CGAAGATGGCCGTACTTTGGCTGACTACAACATCCAGAAAGAGTCGACGCTTCATCTTGT
GTTGAGGCTTAGGGGAGGTATCATCGAGCCTTCTTTGATGGCTTTGGCTCGTAAGTACAA
CCAAGACAAGATGATTTGCCGCAAGTGCTACGCTCGTCTTCACCCAAGGGCTGTGAACTG
CAGGAAGAAGAAGTGTGGCCACAGCAACCAGTTGAGGCCTAAGAAGAAGATCAAGTAGAC
TCGATTCAAGAACCTGATCTCTTGCCTCCGTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTCACCCTTG
ATAAGGTTGTTTTTGCTTCAGTGAAATTTGATGTTCAAAGATTTTATCAGTAAAAGGATT
TGGTTTCCTATTC
ATGCC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 5

CO CL1227Contig1 1159 5 14 U
GTACTTAACAAGCGTTATATCGAAAGTGTTTAAAACAGAAAGTGATCCGATATATTAGTA
TTACAAAGAGAAAGTTTGACACAAAAGTAACAACATTGGGAGTGAATGAAATTTGCGCAA
CTATTCTTCAATCTTTGCCTTCTTCCGAGCCAAAAACCGTTCTCTAGCAGCAGCAATCGC
GTCCTCGCTTTTCTTGTTGTTAATAACAGCCTTTGGAGCTTCTTTTGCTTCCACTTTTGT
TGATGCCTCTTTCTCTTCTCTAACATCTGAACCAATCTTCTTCTCAGATGCACCTTGCTC
CTCTTCGTCTTCTTCTTCTTGCGGTTCCATACCTCTCTTACGGCTTGGTCCAACATCTTG
AGATTCACGAAACACTTGCTTCTCCGGCAACTCTGCTTTCTTCTTCTCTTCTTTCCTCAG
CTCCTCCTCCAGCTTCTCAGCCTTTCTTCGTTCCTCCAGCTTCTCAGTCTCTTCTTCTTC
CTTACCTCGAGCTCCAAACGCAACGTTTTTATCAATGTTGAAGTAGAAGTCACTCAAGTC
CGTCTTCTTTGTAACATCATCTTTTGCCTCACGAATTTCACGTAACCTTTCTTCAGCAAG
CCACTTCTTTTGCTCCTCTAGCTTCTTCTTATACGCACCCGTTACAAACTTCTCTTTACC
AGAGTAAAGATGCTCGTCTTTCTCCCTCTCCTTGGCGAGTTTCCTCTCGTAAACAATCTC
CTGTTCCTTGTTTCTCTGCTCCGCCTTCTTCATCAAATGATGCACATACTTTGGCTTGCG
ATCTTGACGATCTTGCAGTTTAGGAACGACGGCTTTGTGTTTAATGTCGTCGTAGACTTC
ATCGTATGCAAAAGCAGAAGGATCTTCCTCCAAGGCTTTCTTATGCTGCTCCTCAATTTC
TTTAAGAGATTTGGCCTTTGAAGCTTGACGAGAGATCTCCTTCTCGACATCACCTTCGTC
TTCGTCTTCGTCGAAAATCGAAGCGCGGCGAGGTATTATTGGCTGCTTCTTCTGAGCCGG
AGCCCTGATTTGCAATCCGTACTTCTTCATTCTTCAACCCAGATCTAGAAGATTCTGATT
AAATCCAACCAAAAGATTGGTGGGTATACGGTGGAGCTGGGATCGATTAGGGTTCCGGTT
CACGGTGTGATTGTGCCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A278TF C 1
AF RR2A278JQ U 47
AF RR2DT64JQ U 47
AF RR2H213JQ U 1
AF RR2H213TF C 478
BS 1 227 RR2H213JQ
BS 228 228 RR2A278JQ
BS 229 344 RR2H213JQ
BS 345 345 RR2A278JQ
BS 346 367 RR2H213JQ
BS 368 368 RR2A278JQ
BS 369 505 RR2H213JQ
BS 506 506 RR2A278JQ
BS 507 582 RR2H213JQ
BS 583 583 RR2A278JQ
BS 584 584 RR2H213JQ
BS 585 585 RR2A278JQ
BS 586 779 RR2H213JQ
BS 780 1159 RR2H213TF

RD RR2A278TF 609 0 0
GTACTTAACAAGCGTTATATCGAAAGTGTTTAAAACAGAAAGTGATCCGATATATTAGTA
TTACAAAGAGAAAGTTTGACACAAAAGTAACAACATTGGGAGTGAATGAAATTTGCGCAA
CTATTCTTCAATCTTTGCCTTCTTCCGAGCCAAAAACCGTTCTCTAGCAGCAGCAATCGC
GTCCTCGCTTTTCTTGTTGTTAATAACAGCCTTTGGAGCTTCTTTTGCTTCCACTTTTGT
TGATGCCTCTTTCTCTTCTCTAACATCTGAACCAATCTTCTTCTCAGATGCACCTTGCTC
CTCTTCGTCTTCTTCTTCTTGCGGTTCCATACCTCTCTTACGGCTTGGTCCAACATCTTG
AGATTCACGAAACACTTGCTTCTCCGGCAACTCTGCTTTCTTCTTCTCTTCTTTCCTCAG
CTCCTCCTCCAGCTTCTCAGCCTTTCTTCGTTCCTCCAGCTTCTCAGTCTCTTCTTCTTC
CTTACCCCGAGCTCCAAACGCAACGTTTTTATCAATGTTGAAGTAGAAGTCACTCAAGTC
CGTCTTCTTTGTAACATCATCTTTTGCCTCACGAATTTCACGTAACCTTTCTTCAGCAAG
CCACTTCT
C

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2A278JQ 563 0 0
CCGATATATTAGTATTACAAAGAGAAAGTTTGACACAAAAGTAACAACATTGGGAGTGAA
TGAAATTTGCGCAACTATTCTTCAATCTTTGCCTTCTTCCGAGCCAAAAACCGTTCTCTA
GCAGCAGCAATCGCGTCCTCGCTTTTCTTGTTGTTAATAACAGCCTTTGGAGCTTCTTTT
GCTTCCACTTTTGTTGATGCCTCTTTCTCTTCTCTAACATCTGAACCAATCTTCTTCTCA
GATGCACCTTGCTCCTCTTCGTCTTCTTCTTCTTGCGGTTCCATACCTCTCTTACGGCTT
GGTCCAACATCTTGAGATTCACGAAACACTTGCTTCTCCGGCAACTCTGCTTTCTTCTTC
TCTTCTTTCCTCAGCTCCTCCTCCAGCTTCTCAGCCTTTCTTCGTTCCTCCAGCTTCTCA
GTCTCTTCTTCTTCCTTACCCCGAGCTCCAAACGCAACGTTTTTATCAATGTTGAAGTAG
AAGTCACTCAAGTCCGTCTTCTTTGTAACATCATCTTTTGCCTCACGAATTTCACGTAAC
CTTTCTTCAGCAAGCCACTTCT
C

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2DT64JQ 617 0 0
CCGATATATTAGTATTACAAAGAGAAAGTTTGACACAAAAGTAACAACATTGGGAGTGAA
TGAAATTTGCGCAACTATTCTTCAATCTTTGCCTTCTTCCGAGCCAAAAACCGTTCTCTA
GCAGCAGCAATCGCGTCCTCGCTTTTCTTGTTGTTAATAACAGCCTTTGGAGCTTCTTTT
GCTTCCACTTTTGTTGATGCCTCTTTCTCTTCTCTAACATCTGAACCAATCTTCTTCTCA
GATGCACCTTGCTCCTCTTCGTCTTCTTCTTCTTGCGGTTCCATACCTCTCTTACGGCTT
GGTCCAACATCTTGAGATTCAGGAAACACTTGCTTCTCCGGCAACTCTGCTTTCTTCTTC
TCTTCTTTCCTCAGCTCCTCCTCCAGCTTCTCAGCCTTTCTTCGTTCCTCCAGCTTCTCA
GTCTCTTCTTCTTCCTTACCTCGAGCTCCAAACGCAACGTTTTTATCAATGTTGAAGTAG
AAGTCACTCAAGTCCGTCTTCTTTGTAACATCATCTTTTGCCTCACGAATTTCACGTAAC
CTTTCTTCAGCAAGCCACTTCTTTTGCTCCTCTAGCTTCTTTTTATACGCGCCCGTTACA
AACTTCTCTTTACCAGA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2H213JQ 779 0 0
GTACTTAACAAGCGTTATATCGAAAGTGTTTAAAACAGAAAGTGATCCGATATATTAGTA
TTACAAAGAGAAAGTTTGACACAAAAGTAACAACATTGGGAGTGAATGAAATTTGCGCAA
CTATTCTTCAATCTTTGCCTTCTTCCGAGCCAAAAACCGTTCTCTAGCAGCAGCAATCGC
GTCCTCGCTTTTCTTGTTGTTAATAACAGCCTTTGGAGCTTCTTTTGTTTCCACTTTTGT
TGATGCCTCTTTCTCTTCTCTAACATCTGAACCAATCTTCTTCTCAGATGCACCTTGCTC
CTCTTCGTCTTCTTCTTCTTGCGGTTCCATACCTCTCTTACGGCATGGTCCAACATCTTG
AGATTCAGGAAACACTTGCTTCTCCGGCAACTCTGCTTTCTTCTTCTCTTCTTTCCTCAG
CTCCTCCTCCAGCTTCTCAGCCTTTCTTCGTTCCTCCAGCTTCTCAGTCTCTTCTTCTTC
CTTACCTCGAGCTCCAAACGCAACGCTTTTATCAATGTTGAAGTAGAAGTCACTCAAGTC
CGTCTTCTTTGTAACATCATCTTTTGCCTCACGAATTTCACGCAGCCTTTCTTCAGCAAG
CCACTTCTTTTGCTCCTCTAGCTTCTTCTTATACGCACCCGTTACAAACTTCTCTTTACC
AGAGTAAAGATGCTCGTCTTTCTCCCTCTCCTTGGCGAGTTTCCTCTCGTAAACAATCTC
CTGTTCCTTGTTTCTCTGCTCCGCCTTCTTCATCAAATGATGCACATACTTTGGCTTGC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2H213TF 682 0 0
CTT
CTTACCTCGAGCTCCAAACGCAACGCTTTTATCAATGTTGAAGTAGAAGTCACTCAAGTC
CGTCTTCTTTGTAACATCATCTTTTGCCTCACGAATTTCACGCAGCCTTTCTTCAGCAAG
CCACTTCTTTTGCTCCTCTAGCTTCTTCTTATACGCACCCGTTACAAACTTCTCTTTACC
AGAGTAAAGATGCTCGTCTTTCTCCCTCTCCTTGGCGAGTTTCCTCTCGTAAACAATCTC
CTGTTCCTTGTTTCTCTGCTCCGCCTTCTTCATCAAATGATGCACATACTTTGGCTTGCG
ATCTTGACGATCTTGCAGTTTAGGAACGACGGCTTTGTGTTTAATGTCGTCGTAGACTTC
ATCGTATGCAAAAGCAGAAGGATCTTCCTCCAAGGCTTTCTTATGCTGCTCCTCAATTTC
TTTAAGAGATTTGGCCTTTGAAGCTTGACGAGAGATCTCCTTCTCGACATCACCTTCGTC
TTCGTCTTCGTCGAAAATCGAAGCGCGGCGAGGTATTATTGGCTGCTTCTTCTGAGCCGG
AGCCCTGATTTGCAATCCGTACTTCTTCATTCTTCAACCCAGATCTAGAAGATTCTGATT
AAATCCAACCAAAAGATTGGTGGGTATACGGTGGAGCTGGGATCGATTAGGGTTCCGGTT
CACGGTGTGATTGTGCCCC

QA 4 682 4 682
DS 



AS 1 6

CO CL1228Contig1 673 6 7 U
GAAAAAAAAACTTCTGTTGAGTGAATTGGTTGAGTTTTAAATATGAGCTAAGATAACATC
AAAAAGTTGTCCCAAACATATCTCAAGTCAAGACATGTCCACTAAACAAGAATTAAATGA
CAAAAAAAAAGGACAAGAGGAAATAGCATCTGAAATCTGATTTTAGTTAGATTCAATATG
CTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAATCCTTGACAACAAGGCACGA
GCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCGATCTTGCAAAGACCAGCCCATTC
ACCGAGGGTTTTAGCACTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATGTTGTGATCAGCGCATAGAGC
TTTGACAAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAGTCTTCAGCCAAGACACAGAGCTGAGC
AACACGCTTCTCTATAAGCTTGGCGCTTTCATGGAGACCACGAGTCACACCTCCGTGAGC
ACGGGCTTTCCTTAGAGTCAGCTCCAATGCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTGGAATTGC
AGCTGGCTCAGCAGCCGGAGGAACAACAACAGCAGGAGCAGCTTCTTCCCCAGACATGGT
GAATTTTGGAAGAAAAGCAAAAGTCCTTTTGAATCT****TAGAGAGAGTTAGAGAGACT
ACGACCACGACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 

AF RR2DS17JQ U 39
AF RR2EW68JQ U 1
AF RR2DS17TF C 41
AF RR2EW68TF C 1
AF RR2B501JQ U 69
AF RR2B501TF C 69
BS 1 184 RR2EW68JQ
BS 185 185 RR2DS17JQ
BS 186 279 RR2EW68JQ
BS 280 280 RR2DS17JQ
BS 281 291 RR2EW68JQ
BS 292 292 RR2DS17JQ
BS 293 673 RR2EW68JQ

RD RR2DS17JQ 455 0 0
AA
ATATGAGCTAAGATAACATCAAAAAGTTGTCCCAAACATATCTCAAGTCAAGACATGTCC
ACTAAACAAGAATTAAATGACAAAAAAAAA**ACAAGAGGAAATAGCATCTGAAATCTGA
TTTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAA
TCCTTGACAACAAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCGATC
TTGCAAAGACCAGCCCATTCACCGAGGGTTTTAGCACTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATG
TTGTGGTCAGCGCATAGAGCTTTGACAAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAGTCTTCA
GCCAAGACACAGAGCTGAGCAACACGCTTCTCGATAAGCTTGGCGCTTTCATGGAGACCA
CGAGTCACACCTCCGTGAGCACGGGCCTTCCTT

QA 3 455 3 455
DS 

RD RR2EW68JQ 673 0 0
GAAAAAAAAACTTCTGTTGAGTGAATTGGTTGAGTTTTAAATATGAGCTAAGATAACATC
AAAAAGTTGTCCCAAACATATCTCAAGTCAAGACATGTCCACTAAACAAGAATTAAATGA
CAAAAAAAAAGGACAAGAGGAAATAGCATCTGAAATCTGATTTTAGTTAGATTCAATATG
CTTCCTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAATCCTTGACAACAAGGCACGA
GCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCGAT*TTGCAAAGACCGGCCCATTC
ACCGAGGGTTTTAGCACTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATGTTGTGATCAGCGCATAGAGC
TTTGACAAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAGTCTTCAGCCAAGACACAGAGCTGAGC
AACACGCTTCTCTATAAGCTTGGCGCTTTCATGGAGACCACGAGTCACACCTCCGTGAGC
ACGGGCTTTCCTTAGAGTCAGCTCCAATGCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTGGAATTGC
AGCTGGCTCAGCAGCCGGAGGAACAACAACAGCAGGAGCAGCTTCTTCCCCAGACATGGT
GAATTTTGGAAGAAAAGCAAAAGTCCTTTTGAATCT****TAGAGAGAGTTAGAGAGACT
ACGACCACGACCC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2DS17TF 639 0 0
ATATGAGCTAAGATAACATCAAAAAGTTGTCCCAAACATATCTCAAGTCAAGACATGTCC
ACTAAACAAGAATTAAATGACAAAAAAAAA**ACAAGAGGAAATAGCATCTGAAATCTGA
TTTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAA
TCCTTGACAACAAGGCACGAGCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCGATC
TTGCAAAGACCAGCCCATTCACCGAGGGTTTTAGCACTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATG
TTGTGGTCAGCGCATAGAGCTTTGACAAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAGTCTTCA
GCCAAGACACAGAGCTGAGCAACACGCTTCTCGATAAGCTTGGCGCTTTCATGGAGACCA
CGAGTCACACCTCCGTGAGCACGGGCCTTCCTTAGAGTCAGCTCCAATGCAGTCAACAGA
TCCATGTCCTCTGGAATTGCAGCTGGCTCAGCAGCCGGAGGAACAACAACAGCAGGAGCA
GCTTCTTCCCCAGACATGGTGAATTTACGAAGAAAAGCAAAAGTCCTTTTGAATCTGCCT
TAGAAAGAGTTAGAGAGACTACGACCACGAC
GAGGACCC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2EW68TF 673 0 0
GAAAAAAAAACTTCTGTTGAGTGAATTGGTTGAGTTTTAAATATGAGCTAAGATAACATC
AAAAAGTTGTCCCAAACATATCTCAAGTCAAGACATGTCCACTAAACAAGAATTAAATGA
CAAAAAAAAAGGACAAGAGGAAATAGCATCTGAAATCTGATTTTAGTTAGATTCAATATG
CTTCCTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAATCCTTGACAACAAGGCACGA
GCATCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCGAT*TTGCAAAGACCGGCCCATTC
ACCGAGGGTTTTAGCACTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATGTTGTGATCAGCGCATAGAGC
TTTGACAAGCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAGTCTTCAGCCAAGACACAGAGCTGAGC
AACACGCTTCTCTATAAGCTTGGCGCTTTCATGGAGACCACGAGTCACACCTCCGTGAGC
ACGGGCTTTCCTTAGAGTCAGCTCCAATGCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTGGAATTGC
AGCTGGCTCAGCAGCCGGAGGAACAACAACAGCAGGAGCAGCTTCTTCCCCAGACATGGT
GAATTTTGGAAGAAAAGCAAAAGTCCTTTTGAATCT****TAGAGAGAGTTAGAGAGACT
ACGACCACGACCC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2B501JQ 605 0 0
GTCCCAAACATATCTCAAGTCAAGACATGTCCACTAAACAAGAATTAAATGACAAAAAAA
AAGGACAAGAGGAAATAGCATCTGAAATCTGATTTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGA
CGATGCTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAATCCTTGACAACAAGGCACGAGCATCCAA
CAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCGATCTTGCAAAGACCAGCCCATTCACCGAGGG
TTTTAGCACTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATGTTGTGATCAGCGCATAGAGCTTTGACAA
GCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAGTCTTCAGCCAAGACACAGAGCTGAGCAACACGCT
TCTCTATAAGCTTGGAGCTTTCATGGAGACCACGAGTCACACCTCCGTGAGCACGGGCTT
TCCTTAGAGTCAGCTCCAATGCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTGGAATTGCAGCTGGCT
CAGCAGCCGGAGGAACAACAACAGCAGGAGCAGCTTCTTCCCCAGACATGGTGAATTTTG
GAAGAAAAGCAAAAGTCCTTTTGAATCT****TAGAGAGAGTTAGAGAGACTACGACCAC
GACCC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2B501TF 605 0 0
GTCCCAAACATATCTCAAGTCAAGACATGTCCACTAAACAAGAATTAAATGACAAAAAAA
AAGGACAAGAGGAAATAGCATCTGAAATCTGATTTTAGTTAGATTCAATATGCTTCTTGA
CGATGCTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAATCCTTGACAACAAGGCACGAGCATCCAA
CAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCGATCTTGCAAAGACCAGCCCATTCACCGAGGG
TTTTAGCACTTGGAACAGTAAGCAAGTTGATGTTGTGATCAGCGCATAGAGCTTTGACAA
GCTTGACGTAATCAGGCTGGTTGCAGTCTTCAGCCAAGACACAGAGCTGAGCAACACGCT
TCTCTATAAGCTTGGAGCTTTCATGGAGACCACGAGTCACACCTCCGTGAGCACGGGCTT
TCCTTAGAGTCAGCTCCAATGCAGTCAACAGATCCATGTCCTCTGGAATTGCAGCTGGCT
CAGCAGCCGGAGGAACAACAACAGCAGGAGCAGCTTCTTCCCCAGACATGGTGAATTTTG
GAAGAAAAGCAAAAGTCCTTTTGAATCT****TAGAGAGAGTTAGAGAGACTACGACCAC
GACCC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 5

CO CL1229Contig1 828 5 36 U
TTTTTTGATCTCTCTCCCCGCCGTCACTCTCTCCCGCGCGTCGCTTACCGATCTCAGCCA
TGGCCGCCGCCGCAGAGGTCGACGCAGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAACGAGGTCAAGC
TCTTCAACCGCTGGACCTACGATGACGTCTCGGTTGCAGACATCAGTCTTGTTGACTACA
TTGGAGTTCAGGCAGCCAAACACGCCACCTTTGTTCCCCACACTGCAGGAAGATACTCTG
TGAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGCCCCATTGTTGAGAGGCTCACCAACTCTCTCATGA
TGCACGGAAGAAACAACGGAAAGAAGCTGATGGCGGTGAGGATCATCAAGCACGCCATGG
AGATCATCCACCTCTTGACTGATGCTAACCCGATTCAGATCATCATTGATGCCATTGTTA
ACAGTGGTCCACGTGAAGATGCTACCAGAATTGGATCTGCTGGTGTCGTTAGGAGACAAG
CCGTTGATATCTCTCCTCTGAGACGTGTTAACCAGGCGATCTTCTTACTCACGACCGGGG
CTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAACATTAAGACTATTGCTGAGTGTCTTGCCGATGAGTTGA
TCAACGCAGCTAAGGGCTCGTCCAACAGCTACGCCATCAAAAAGAAGGATGAGATTGAGA
GAGTCGCCAAGGCCAATCGTTAAGGAGTTTCCTTTTGCCCTGATGGATACAATCTTATCA
ATGAAATTTATGTTTTGTTTTCACTCTGCTACAGATGTTTTGTTCTTTGTCTTATGATAT
GTTTATTTCGTCTGAACTACTTTCGAATAGATAAGTTTTTGATGCTTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2CY96TF U 1
AF RR2CB01TF U 2
AF RR2CB01JQ C 41
AF RR2AF20JQ C 139
AF RR2AF20TF U 139
BS 1 16 RR2CY96TF
BS 17 17 RR2CB01TF
BS 18 37 RR2CY96TF
BS 38 38 RR2CB01TF
BS 39 41 RR2CY96TF
BS 42 42 RR2CB01TF
BS 43 76 RR2CY96TF
BS 77 78 RR2CB01TF
BS 79 184 RR2CY96TF
BS 185 185 RR2CB01TF
BS 186 187 RR2CY96TF
BS 188 188 RR2CB01TF
BS 189 214 RR2CY96TF
BS 215 215 RR2CB01TF
BS 216 226 RR2CY96TF
BS 227 227 RR2CB01TF
BS 228 326 RR2CY96TF
BS 327 327 RR2CB01TF
BS 328 334 RR2CY96TF
BS 335 335 RR2CB01TF
BS 336 382 RR2CY96TF
BS 383 383 RR2CB01TF
BS 384 385 RR2CY96TF
BS 386 386 RR2CB01TF
BS 387 409 RR2CY96TF
BS 410 410 RR2CB01TF
BS 411 460 RR2CY96TF
BS 461 461 RR2CB01TF
BS 462 526 RR2CY96TF
BS 527 527 RR2CB01TF
BS 528 532 RR2CY96TF
BS 533 533 RR2CB01TF
BS 534 607 RR2CY96TF
BS 608 630 RR2CB01TF
BS 631 826 RR2AF20TF
BS 827 828 RR2AF20JQ

RD RR2CY96TF 607 0 0
TTTTTTGATCTCTCTCTCCGCCGTCACTCTCTCCCGCTCGTTGCTTACCGATCTCAGCCA
TGGCCGCCGCCGCAGAAATCGACGCAGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAACGAGGTCAAGC
TCTTCAACCGCTGGACCTACGATGACGTCTCGGTTGCAGACATCAGTCTTGTTGACTACA
TTGGTGTCCAGGCAGCCAAACACGCCACCTTTGTCCCCCACACTGCGGGAAGATACTCTG
TGAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGCCCCATTGTTGAGAGGCTCACCAACTCTCTCATGA
TGCACGGAAGAAACAACGGAAAGAAGTTGATGGCTGTGAGGATCATCAAGCACGCCATGG
AGATCATCCACCTCTTGACTGACGCAAACCCGATTCAGATCATCATTGACGCCATTGTTA
ACAGTGGTCCACGTGAAGATGCTACCAGAATTGGATCTGCGGGTGTCGTTAGGAGACAAG
CCGTTGATATCTCTCCTCTGAGACGTGTTAACCAGGCGATCTTCTTGCTCACAACCGGGG
CTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAACATTAAGACTATTGCTGAGTGTCTTGCCGATGAGTTGA
TCAACGC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2CB01TF 629 0 0
TTTTTGATCTCTCTCCCCGCCGTCCCTCTCTCCCGCGCGTCGCTTACCGATCTCAGCCAT
GGCCGCCGCCGCAGAGGTCGACGCAGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAACGAGGTCAAGCT
CTTCAACCGCTGGACCTACGATGACGTCTCGGTTGCAGACATCAGTCTTGTTGACTACAT
TGAAGTTCAGGCAGCCAAACACGCCACCTTTGTTCCCCACACTGCAGGAAGATACTCTGT
GAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGCCCCATTGTTGAGAGGCTCACCAACTCTCTCATGAT
GCACGGAAGAAACAACGGAAAGAAGCTGATGGCGGTGAGGATCATCAAGCACGCCATGGA
GATCATCCACCTCTTGACTGATGCTAACCCGATTCAGATCATCATTGATGCCATTGTTAA
CAGTGGTCCACGTGAAGATGCTACCAGAATTGGATCTGCTGGTGTCGTTAGGAGACAAGC
CGTTGATATCTCTCCTCTGAGACGTGTTAACCAGGCGATCTTCTTACTCACGACCGGGGC
TCGTGAGGCTGCTTTCAGAAACATTAAGACTATTGCTGAGTGTCTTGCCGATGAGTTGAT
CAACGCAGCTAAGGGCTCGTCCAACAGCT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2CB01JQ 787 0 0
TC
GCTTACCGATCTCAGCCATGGCCGCCGCCGCAGAGGTCGACGCAGAGATTCAGCAGCAGC
TTACCAACGAGGTCAAGCTCTTCAACCGCTGGACCTACGATGACGTCTCGGTTGCAGACA
TCAGTCTTGTTGACTACATTGAAGTTCAGGCAGCCAAACACGCCACCTTTGTTCCCCACA
CTGCAGGAAGATACTCTGTGAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGCCCCATTGTTGAGAGGC
TCACCAACTCTCTCATGATGCACGGAAGAAACAACGGAAAGAAGCTGATGGCGGTGAGGA
TCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCACCTCTTGACTGATGCTAACCCGATTCAGATCA
TCATTGATGCCATTGTTAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCTACCAGAATTGGATCTGCTG
GTGTCGTTAGGAGACAAGCCGTTGATATCTCTCCTTTGAGACGTGTTAACCAGGCGATCT
TCTTACTCACGACCGGGGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAACATTAAGACTATTGCTGAGT
GTCTTGCCGATGAGTTGATCAACGCAGCTAAGGGCTCGTCCAACAGCTACGCCATCAAAA
AGAAGGATGAGATTGAGAGAGTCGCCAAGGCCAATCGTTAAGGAGTTTCCTTTTGCCCTG
ATGGATACAATCTTATCAATGAAATTTATGTTTTGTTTTCACTCTGTTACAGATGTTTTG
TTCTTTGTCTTATGATATGTTTATTTCGTCTGAACTACTTTCGAATAGATAAGTTTTTGA
TGCT
G

QA 3 786 3 786
DS 

RD RR2AF20JQ 690 0 0
G
CGATGACGTCTCGGTTGCAGACATCAGTCTTGTTGACTACATTGGAGTTCAGGCAGCCAA
ACACGCCGCCTTTGTTCCCCACACTGCAGGAAGATACTCTGTGAAGAGATTCAGGAAGGC
TCAGTGCCCCATTGTTGAGAGGCTCACCAACTCTCTCATGATGCACGGAAGAAACAACGG
AAGGAAGCTGATGGCGGTGAGGATCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCACCTCTTGAC
TGATGCTAACCCGATTCAGATCATCATTGATGCCATTGTTAACAGTGGTCCACGTGAAGA
TGCTACCAGAATTGGATCTGCTGGTGTCGTTAGGAGACAAGCCGTTGATATCTCTCCTCT
GAGACGTGTTAACCAGGCGATCTTCTTACTCACGACCGGGGCTCGTGAGGCTGCTTTCAG
AAACATTAAGACTATTGCTGAGTGTCTTGCCGATGAGTTGATCAACGCAGCTAAGGGCTC
GTCCAACAGCTACGCCATCAAAAAGAAGGATGAGATTGAGAGAGTCGCCAAGGCCAATCG
TTAAGGAGTTTCCTTTTGCCCTGATGGATACAATCTTATCAATGAAATTTATGTTTTGTT
TTCACTCTGCTACAGATGTTTTGTTCTTTGTCTTATGATATGTTTATTTCGTCTGAACTA
CTTTCGAATAGATAAGTTTTTGATGCTTC

QA 2 690 2 690
DS 

RD RR2AF20TF 690 0 0
G
CGATGACGTCTCGGTTGCAGACATCAGTCTTGTTGACTACATTGGAGTTCAGGCAGCCAA
ACACGCCGCCTTTGTTCCCCACACTGCAGGAAGATACTCTGTGAAGAGATTCAGGAAGGC
TCAGTGCCCCATTGTTGAGAGGCTCACCAACTCTCTCATGATGCACGGAAGAAACAACGG
AAGGAAGCTGATGGCGGTGAGGATCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCACCTCTTGAC
TGATGCTAACCCGATTCAGATCATCATTGATGCCATTGTTAACAGTGGTCCACGTGAAGA
TGCTACCAGAATTGGATCTGCTGGTGTCGTTAGGAGACAAGCCGTTGATATCTCTCCTCT
GAGACGTGTTAACCAGGCGATCTTCTTACTCACGACCGGGGCTCGTGAGGCTGCTTTCAG
AAACATTAAGACTATTGCTGAGTGTCTTGCCGATGAGTTGATCAACGCAGCTAAGGGCTC
GTCCAACAGCTACGCCATCAAAAAGAAGGATGAGATTGAGAGAGTCGCCAAGGCCAATCG
TTAAGGAGTTTCCTTTTGCCCTGATGGATACAATCTTATCAATGAAATTTATGTTTTGTT
TTCACTCTGCTACAGATGTTTTGTTCTTTGTCTTATGATATGTTTATTTCGTCTGAACTA
CTTTCGAATAGATAAGTTTTTGATGCT
TC

QA 2 688 2 688
DS 



AS 1 5

CO CL1230Contig1 1514 5 25 U
GGATTACACAACGTGTGTCTGTCTTTAAAGTTAGTTCCTTTCTTCTCTCTCATTCCCAGG
GATCTGTTTCTTTTCTTTTTTGCTTTCACTCTTCTTCTCTTCCAGTGAGAGAGAATGAAG
AGGCTTCTGTCGTTAGTTGGGTTTCTTGCAGTGGTAGGAGCTCAAGCAAATGAGTATCTA
GATTTCAATGTGACAGAGATAGACCGCATTGAGGAACTAGAGTTTGGATTCTCCAAGTAC
AGCTCAAATTTGAACCCTTTATTAGTTGGTCTCACTCTTATCAGAGGAGCTGACTCAGGA
GCTGTTTGTTTGGATGGAACATTGCCTGGATACCACTTGCACCGTGGGCATGGATCTGGA
GCTAACAGCTGGCTCATTCAATTAGAGGGAGGAGGATGGTGCAACAACGTCAGGACGTGT
GTATACAGGAAGAAGACTCGACGTGGATCCTCTAACTACATGGAGAAACAGCTTCAGTTT
ACAGGAATACTGAGTGATAAAGCTCAAGAGAATCCTGACTTCTTTAACTGGAATAGAGTT
AAGCTTCGTTACTGTGATGGCGCTTCTTTCAGTGGAGATGGTCAGAATCAGGCTGCACAG
CTTCAGTTTAGAGGAGAGCGTATCTGGAGAGCCGCAATAGCTGATCTGAAATCAAAAGGA
ATGCGATACGCCAACCAGGCACTTCTCTCTGGATGTTCTGCTGGTGGCTTAGCAGCAATT
TTACGGTGCGATGAGTTTAGAAACTTGTTCCCTGGTTCCACCAAGGTCAAGTGCTTGAGT
GATGCTGGCTTGTTCTTGGACACAGCTGATGTTGCTGGTGGCCGCACAATCAGGAACTTA
TACAATGGTGTAGTACAGTTTCAGAGTGTGAAGAACAACCTGCCACGTATGTGCACAAAC
CATCTCGATCCAACCTCGTGTTTCTTCCCACAGAATCTCATCAGTCAGATCAAAACTCCA
CTTTTTATTGTCAATGCAGCATATGATTCATGGCAGATTCAAAGCAGCATAGCTCCAAGA
TCAGCTGACCCTAGTGGCTTTTGGCATGACTGTACACTAAACCATGCAAAATGCACACCT
TCACAAATGAGGTTCTTGCAAGGATTCAGGGATCAGATGCTGAGAGTAGTGAGGGGCTTC
TCAATGTCTAGGCATAATGGTTTGTTCATAAACTCCTGCTTTGCTCACTGCCAAACCGAG
AGGCAAGATACTTGGTTCGCTGATGATTCTCCTGTCATCAGGAAAAAGGCGGTGGCAATA
GCCGTGGGAGATTGGTATTTTGATAGAGCAGAAGTGAAGTTAGTTGACTGCCCTTATCCA
TGTGACAAGAGCTGCCACAACTTGGTGTTCAGATGATTTATATCTTCTTGATTCTTCTTT
TGTATACATAACCTTAGAAAAGCCTCCCCCTCAAATGGAGAAGCTTACTATTTTACCAAT
GCCTCATTGGAAGAAGTGTATGATTTGATTTGGAAAAAACCATAATAAACACCAAAAAAC
ATAAGTTGGCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 10 10 25 25 25 25 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2FB61TF U 1
AF RR2CQ05TF U 579
AF RR2F792JQ C 720
AF RR2FB61JQ C 800
AF RR2AZ23TFB U 1194
BS 1 721 RR2FB61TF
BS 722 740 RR2CQ05TF
BS 741 741 RR2F792JQ
BS 742 828 RR2CQ05TF
BS 829 829 RR2F792JQ
BS 830 911 RR2CQ05TF
BS 912 912 RR2F792JQ
BS 913 981 RR2CQ05TF
BS 982 982 RR2F792JQ
BS 983 1241 RR2CQ05TF
BS 1242 1243 RR2AZ23TFB
BS 1244 1247 RR2CQ05TF
BS 1248 1248 RR2AZ23TFB
BS 1249 1280 RR2CQ05TF
BS 1281 1281 RR2AZ23TFB
BS 1282 1292 RR2CQ05TF
BS 1293 1293 RR2AZ23TFB
BS 1294 1307 RR2CQ05TF
BS 1308 1309 RR2AZ23TFB
BS 1310 1313 RR2CQ05TF
BS 1314 1314 RR2AZ23TFB
BS 1315 1318 RR2CQ05TF
BS 1319 1489 RR2AZ23TFB
BS 1490 1490 RR2FB61JQ
BS 1491 1514 RR2AZ23TFB

RD RR2FB61TF 721 0 0
GGATTACACAACGTGTGTCTGTCTTTAAAGTTAGTTCCTTTCTTCTCTCTCATTCCCAGG
GATCTGTTTCTTTTCTTTTTTGCTTTCACTCTTCTTCTCTTCCAGTGAGAGAGAATGAAG
AGGCTTCTGTCGTTAGTTGGGTTTCTTGCAGTGGTAGGAGCTCAAGCAAATGAGTATCTA
GATTTCAATGTGACAGAGATAGACCGCATTGAGGAACTAGAGTTTGGATTCTCCAAGTAC
AGCTCAAATTTGAACCCTTTATTAGTTGGTCTCACTCTTATCAGAGGAGCTGACTCAGGA
GCTGTTTGTTTGGATGGAACATTGCCTGGATACCACTTGCACCGTGGGCATGGATCTGGA
GCTAACAGCTGGCTCATTCAATTAGAGGGAGGAGGATGGTGCAACAACGTCAGGACGTGT
GTATACAGGAAGAAGACTCGACGTGGATCCTCTAACTACATGGAGAAACAGCTTCAGTTT
ACAGGAATACTGAGTGATAAAGCTCAAGAGAATCCTGACTTCTTTAACTGGAATAGAGTT
AAGCTTCGTTACTGTGATGGCGCTTCTTTCAGTGGAGATGGTCAGAATCAGGCTGCACAG
CTTCAGTTTAGAGGAGAGCGTATCTGGAGAGCCGCAATAGCTGATCTGAAATCAAAAGGA
ATGCGATACGCCAACCAGGCACTTCTCTCTGGATGTTCTGCTGGTGGCTTAGCAGCAATT
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2CQ05TF 752 0 0
G
GGTCAGAATCAGGCTGCACAGCTTCAGTTTAGAGGAGAGCGTATCTGGAGAGCCGCAATA
GCTGATCTGAAATCAAAAGGAATGCGATACGCCAACCAGGCACTTCTCTCTGGATGTTCT
GCTGGTGGTTTAGCAGCAATTTTACGGTGCGATGAGTTTAGGAACTTGTTCCCTGGTTCC
ACCAAGGTCAAGTGCTTGAGTGATGCTGGCTTGTTCTTGGACACAGCTGATGTTGCTGGT
GGCCGCACAGTCAGGAACTTATACAATGGTGTAGTACAGTTTCAGAGTGTGAAGAACAAC
CTGCCACGTATGTGCACAAACCATCTCGATCCTACCTCGTGTTTCTTCCCACAGAATCTC
ATCAGTCAGATCAAAACTCCACTTTTTATTGTCAATGCAGCACATGATTCATGGCAGATT
CAAAGCAGCATAGCTCCAAGATCAGCTGACCCTAGTGGCTTTTGGCATGACTGTACACTA
AACCATGCAAAATGCACACCTTCACAAATGAGGTTCTTGCAAGGATTCAGGGATCAGATG
CTGAGAGTAGTGAGGGGCTTCTCAATGTCTAGGCATAATGGTTTGTTCATAAACTCCTGC
TTTGCTCACTGCCAAACCGAGAGGCAAGATACTTGGTTCGCTGATGATTCTCCTGTCATC
AG**AAAAAGCGGTGGCAATAGCCGTGGGAGATTGGTATTT*GATAGAGCAGA*GTGAAG
TTAGTTGAT*GCCCGTATC
ATGTGACAGAGC

QA 2 740 2 740
DS 

RD RR2F792JQ 754 0 0
TTTACGGTGCGATGAGTTTAGAAACTTGTTCCCTGGTTCCACCAAGGTCAAGTGCTTGAG
TGATGCTGGCTTGTTCTTGGACACAGCTGATGTTGCTGGTGGCCGCACAATCAGGAACTT
ATACAATGGTGTAGTACAGTTTCAGAGTGTGAAGAACAACCTGCCACGTATGTGCACAAA
CCATCTCGATCCAACTTCGTGTTTCTTCCCACAGAATCTCATCAGTCAGATTAAGACACC
ACTTTTTATTGTCAATGCAGCATATGATTCATGGCAGATTCAAAGCAGCATAGCTCCAAG
ATCAGCTGACCCTAGGGGCTTTTGGCATGACTGTACACTAAACCATGCAAAATGCACACC
TTCACAAATGAGGTTCTTGCAAGGATTCAGGGATCAGATGCTGAGAGTAGTGAGGGGCTT
CTCAATGTCTAGGCATAACGGTTTGTTCATAAACTCCTGCTTTGCTCACTGCCAAACCGA
GAGGCAAGATACTTGGTTTGCTGATGATTCTCCTGTCATCAGGAAAAAGGCGGTGGCAAT
AGCCGTGGGAGATTGGTATTTTGATAGAGCAGAAGTGAAGTTAGTTGATTGCCCTTATCC
ATGTGACAAGAGCTCCCACAACTTGGTGTTCAGATGATTCATTGATTCT*****CTTCTT
TA*TATACATA*CTTTAGAAA*GCCTCTC**TCAAATGGAGAAGCTTACTATTTTACCAA
TGCCTCATTGGAAGAAGTGTATGATTTGATTTGG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2FB61JQ 711 0 0
ATAG
AGCTGATGTTGCTGGTGGCCGCACAATTAGGAACTTATACAATGGTGTAGTACAGTTTCA
GAGTGTGAAGAACAACCTGCCACGTATGTGCA*AAACCATCTCGATCCAACCTCGTGTTT
CTTCCCACAGAATCTCATCAGTCAGATCAAAACTCCACTTTTTATTGTCAATGCAGCATA
TGATTCACGGCAGATTCAAAGCAGCATAGCTCCAAGATCAGCTGACCCTAGTGGCTTTTG
GCATGACTGTACACTAAACCATGCAAAATGCACACCTTCACAAATGAGGTTCTTGCAAGG
CTTCAGGGATCAGATGCTGAGAGTAGTGAGGGGCTTCTCGATGTCTAGGCATAATGGTTT
GTTCATAAACTCCTGCTTTGCTCACTGCCAAACCGAGAGGCAAGATACTTGGTTCGCTGA
TGATTCTCCTGTCATCAGGAAAAAGG*GGTGGCAATAGCTGTGGGAGATTGGTATTTTGA
TAGAGCAGAAGTGAAGTTAGTTGACTGCCCTTATCCATGTGACAAGAGCTGCCACAACTT
GGTGTTCAGATGATTTATATCTTCTTGATTCTTCTTTTGTATACATAACCTTAGAAAAGC
CTCCCCCTCAAATGGAGAAGCTTACTATTTTACCAATGCCTCATTGGAAGAAGTGTATGA
TTTGATTTGGAAAAAACCATAATAAACACCAAAAAACATAAGTTGG
T

QA 5 710 5 710
DS 

RD RR2AZ23TFB 321 0 0
AACCGAGAGGCAAGATACTTGGTTCGCTGATGATTCTCCTGTCATCAGGAAAAAGGCGGT
GGCAATAGCTGTGGGAGATTGGTATTTTGATAGAGCAGAAGTGAAGTTAGTTGACTGCCC
TTATCCATGTGACAAGAGCTGCCACAACTTGGTGTTCAGATGATTTATATCTTCTTGATT
CTTCTTTTGTATACATAACCTTAGAAAAGCCTCCCCCTCAAATGGAGAAGCTTACTATTT
TACCAATGCCTCATTGGAAGAAGTGTATGATTTGATTTGGAAAAAACCATAATAAATACC
AAAAAACATAAGTTGGCTCTC

QA 1 321 1 321
DS 



AS 1 6

CO CL1231Contig1 1075 6 4 U
AGTAAGCAATGTCATACTTTATTGACCATTATCTAAAAAGACCAAGCAGAAACAAATTGT
ATTTCGACAAGTAAACGACAAAAGAAGGGCCTTTTTAGCCATGTTCAGAGTACTAACAAC
AAATGGTCCTGGGTAGAAGAAATTTCATAAACGCAGATTGGCTTGTATCAAGGGGCATAG
AGAGGCTCAGGCATTTTTTCTCTTTGAATCCAGTTGTCTGGTGCCCATTTGCATCCATCA
AATTCTACCACATGTAAGCTATATGCATGTCTTGACTTGGCAGATAGATTCTCGAAACTT
TGATGGATTAGATCACCATGAATGGCGATCAATGAGCCTGCTTTCATTTCAATAAACACA
AAATCTTTCTGGTCGTAAGACGGTGATGGCCTATCAAACGTTACACCGTTTTCACCCCGG
ATAAACCTTCTAACCAGACCGTTCTTGTGAGATCCAGGTATGGCCCAAAGACAACCGTTA
ACAGTTGTGGAATCTTCTAAAGCCATCCAGAGACCAGTACAACTAGGTGGATCCGTGTAG
ACAAAAGAGTTATCTTGATGCGGCACAACTTCTCCTCCAATTCCAGGTTGCTTGAAAATG
TACATGGCCTGCATGACGACTGGTCTTCTGTAACCTAAGGAAGATACCAAGCTTGAAACC
TTGGACGAATACGTGAACTCCTTGTACAAAGGGTCAAGCTCGTGAAGTGCGTGGCCAACT
TTGTTTATAGAAAGCTCTTTCGGTTGCTTCAGTTCCCCATTGTCGCCAAAAGCTTTTTCT
TCAAAAAAGAAGGAGATTTTTTCAGCGCTCTCAAAGAAGTAATTATCGGTCGTGTTCTTC
TGGTTTTTAGTGGAGAAAATAGAAGAGACAGAGCAATCAAATTGAGTCAACAACTCATCC
ATCCTCTTCCTCAAGCCGACAATCTCATCCTCACTCGCGAATGATTCGATTACCAAATAC
CCTTGAGAGTTGTAAAACTCGAGCTGATCGGGTGTTAGACTTCCCGTGATTCCCATGATT
CCCAGTGGTGGTTCCGGTACAGATTTCTCCGGGGATTTTGTATTGTTCGAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP43JQ U 1
AF RR2DZ78JQ U 39
AF RR2GJ76JQB U 7
AF RR2GJ76TF C 425
AF RR2GP43TF C 440
AF RR2DZ78TF C 811
BS 1 545 RR2GP43JQ
BS 546 784 RR2GJ76JQB
BS 785 1068 RR2GJ76TF
BS 1069 1075 RR2DZ78TF

RD RR2GP43JQ 545 0 0
AGTAAGCAATGTCATACTTTATTGACCATTATCTAAAAAGACCAAGCAGAAACAAATTGT
ATTTCGACAAGTAAACGACAAAAGAAGGGCCTTTTTAGCCATGTTCAGAGTACTAACAAC
AAATGGTCCTGGGTAGAAGAAATTTCATAAACGCAGATTGGCTTGTATCAAGGGGCATAG
AGAGGCTCAGGCATTTTTTCTCTTTGAATCCAGTTGTCTGGTGCCCATTTGCATCCATCA
AATTCTACCACATGTAAGCTATATGCATGTCTTGACTTGGCAGATAGATTCTCGAAACTT
TGATGGATTAGATCACCATGAATGGCGATCAATGAGCCTGCTTTCATTTCAATAAACACA
AAATCTTTCTGGTCGTAAGACGGTGATGGCCTATCAAACGTTACACCGTTTTCACCCCGG
ATAAACCTTCTAACCAGACCGTTCTTGTGAGATCCAGGTATGGCCCAAAGACAACCGTTA
ACAGTTGTGGAATCTTCTAAAGCCATCCAGAGACCAGTACAACTAGGTGGATCCGTGTAG
ACAAA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2DZ78JQ 700 0 0
AGACCAAGCAGAAACAAATTGTATTTCGACAAGTAAACGACAAAAGAAGGGCCTTTTTAG
CCATGTTCAGAGTACTAACAACAAATGGTCCTGGGTAGAAGAAATTTCATAAACGCAGAT
TGGCTTGTATCAAGGGGCATAGAGAGGCTCAGGCATTTTTTCTCTTTGAATCCAGTTGTC
TGGTGCCCATTTGCATCCATCAGATTCTACCACATGTAAGCTATATGCATGTCTTGACTT
GGCAGATAGATTCTCGAAACTTTGATGGATTAGATCACCATGAATGGCGATCAATGAGCC
TGCTTTCATTTCAATAA*CACAAAATCTTTCTGGTCGTAAGACGGTGATGGCCTATCAAA
CGTTACACCGTTTTCACCCCGGATAAACCTTCTAACCAGACCGTTCTTGTGAGATCCAGG
TATGGCCCAAAGACAACCGTTAACAGTTGTGGAATCTTCTAAAGCCATCCAGAGACCAGT
ACAACTAGGTGGATCCGTGTAGACAAA*GAGTTATCTTGATGCGGCACAACTTCTCCTCC
AATTCCAGGTTGCTTGAAAATGTACATGGCCTGCATGACGACTGGTCTTCTGTAACCTAA
GGAAGATACCAAGCTTGAAACCTTGGACGAATACGTGAACTCCTTGTACAAAGGGTCAAG
CTCGTGAAGTGCGTGGCCAACTTTGTTTATAGAAAGCTCT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2GJ76JQB 778 0 0
CAATGTCATACTTTATTGACCATTATCTAAAAAGACCAAGCAAAAACAAATTGTATTTCG
ACAAGTAAACGACAAAAGAAGGGCCTTTTTAGCCATGTTCAAAGTACTAACAACAAATGG
TCCTGGGTAGAAAAAATTTCATAAACGCAGATTGGCTTGTATCAAGGGGCATAGAGAGGC
TCAGGCATTTTTTCTCTTTGAATCCAGTTGTCTGGTGCCCATTTGCATCCATCAAATTCT
ACCACATGTAAGCTATATGCATGTCTTGACTTGGCAAATAGATTCTCGAAACTTTGATGG
ATTAGATCACCATGAATGGTGATCAATGAGCCTGCTTTCATTTCAATAAACACAAAATCT
TTCTGGTCGTAAGACGGTGATGGCCTATCAAACGTTACACCGTTTTCACCCCGGATAAAC
CTTCTAACCAAACCGTTCTTGAGAGATCCAGGTATGGCCCAAAGACAACCGTTAACAGTT
GTGGAATCTTCTAAAGCCATCCAGAGACCAGTACAACTAGGGGGATCCGTGTAGACAAAA
GAGTTATCTTGATGCGGCACAACTTCTCCTCCAATTCCAGGTTGCTTGAAAATGTACATG
GCCTGCATGACGACTGGTCTTCTGTAACCTAAGGAAGATACCAAGCTTGAAACCTTGGAC
GAATACGTGAACTCCTTGTACAAAGGGTCAAGCTCGTGAAGTGCGTGGCCAACTTTGTTT
ATAGAAAGCTCTTTCGGTTGCTTCAGTTCCCCATTGTCGCCAAAAGCTTTTTCTTCAA

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2GJ76TF 646 0 0
AA
CTTCTAACCAGACCGTTCTTGAGAGATCCAGGTATGGCCCAAAGACAACCGTTAACAGTT
GTGGAATCTTCTAAAGCCATCCAGAGACCAGTACAACTAGGTGGATCCGTGTAGACAAAA
GAGTTATCTTGATGCGGCACAACTTCTCCTCCAATTCCAGGTTGCTTGAAAATGTACATG
GCCTGCATGACGACTGGTCTTCTGTAACCTAAGGAAGATACCAAGCTTGAAACCTTGGAC
GAATACGTGAACTCCTTGTACAAAGGGTCAAGCTCGTGAAGTGCGTGGCCAACTTTGTTT
ATAGAAAGCTCTTTCGGTTGCTTCAGTTCCCCATTGTCGCCAAAAGCTTTTTCTTCAAAA
AAGAAGGAGATTTTTTCAGCGCTCTCAAAGAAGTAATTATCGGTCGTGTTCTTCTGGTTT
TTAGTGGAGAAAATAGAAGAGACAGAGCAATCAAATTGAGTCAACAACTCATCCATCCTC
TTCCTCAAGCCGACAATCTCATCCTCACTCGCGAATGATTCGATTACCAAATACCCTTGA
GAGTTGTAAAACTCGAGCTGATCGGGTGTTAGACTTCCCGTGATTCCCATGATTCCCAGT
GGTGGTTCCGGTACAGATTTCTCCGGGGATTTTGTATTGTTC
CC

QA 3 644 3 644
DS 

RD RR2GP43TF 631 0 0
CGTTCTTGTGAGATCCAGGTATG*CCCAAAGACAACCGTTAACAGT*GTGGAATCTTCTA
AAGCCATCCAGAGACCAGTACAACTAGGTGGATCCGTGTAGACAAAAGAGTTATCTTGAT
GCGGCACAACTTCTCCTCCAATTCCAGGTTGCTTGAAAATGTACATGGCCTGCATGACGA
CTGGTCTTCTGTAACCTAAGGAAGATACCAAGCTTGAAACCTTGGACGAATACGTGAACT
CCTTGTACAAAGGGTCAAGCTCGTGAAGTGCGTGGCCAACTTTGTTTATAGAAAGCTCTT
TCGGTTGCTTCAGTTCCCCATTGTCGCCAAAAGCTTTTTCTTCAAAAAAGAAGGAGATTT
TTTCAGCGCTCTCAAAGAAGTAATTATCGGTCGTGTTCTTCTGGTTTTTAGTGGAGAAAA
TAGAAGAGACAGAGCAATCAAATTGAGTCAACAACTCATCCATCCTCTTCCTCAAGCCGA
CAATCTCATCCTCACTCGCGAATGATTCGATTACCAAATACCCTTGAGAGTTGTAAAACT
CGAGCTGATCGGGTGTTAGACTTCCCGTGATTCCCATGATTCCCAGTGGTGGTTCCGGTA
CAGATTTCTCCGGGGATTTTGTATTGTTC
CC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2DZ78TF 265 0 0
TCAAAGAAGTAATTATCGGTCGTGTTCTTCTGGTTTTTAGTGGAGAAAATAGAAGAGACA
GAGCAATCAAATTGAGTCAACAACTCATCCATCCTCTTCCTCAAGCCGACAATCTCATCC
TCACTCGCGAATGATTCGATTACCAAATACCCTTGAGAGTTGTAAAACTCGAGCTGATCG
GGTGTTAGACTTCCCGTGATTCCCATGATTCCCAGTGGTGGTTCCGGTACAGATTTCTCC
GGGGATTTTGTATTGTTCGAAATCC

QA 1 265 1 265
DS 



AS 1 5

CO CL1232Contig1 725 5 6 U
GGATTCGTCGTTCTCTTCTCCTCCACCACACGCTTATTTGGTTACTATCAGATTCTCATC
TGTTGCAACTTGCAATGTCGAAGAACAACGGAGCTCGTAGCTGTTTAGGTTCGATGGACG
ACATCCGCCGAGTCTTCCAGCGATTCGACAAAAACGGAGACGGAAAGATCTCCGTCGACG
AGCTCAAGGAGGTGATCCGCGCGCTGAGCCCCACCTCGTCGCCGGAGGAAACAGTGAAGA
TGATGAAACAGTTCGATCTGGACGGAAACGGATTCATCGACATGGACGAGTTCGTCTCTC
TTTTCCAGATCGGAATGAGTCAAGGAGGAAGCGGAGGAGGAGGAAACAGCAAGAACGATC
TGAAGGAAGCGTTCGAGCTGTACGATCTGGATGGTAACGGGCGGATCTCGGCGAAGGAGC
TTCACTCGGTGATGAAGAATCTGGGGGAGAAGTGTTCTGTTCAGGACTGCAGGAAGATGA
TTAGCAAAGTTGATACGGATGGTGATGGTTGCGTTAACTTTGAGGAGTTTAAGCTGATGA
TGAACAACGGCGGAGCTTGATTGATGAGATCGTTGTATTAGGGATTGTTTGTATAGAGGA
AGCTAGAAAAGTTTGGTTTTATGAGTTTTTTTTTTTTTACTTTAT*GTGCTACAACTTCC
GTTCTTCACTATTGAGATTGTTCTGATGGGCCTGACTTGCTAATCTGATGTTCCAATCTT
GTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 
20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 

AF RR2GY95JQ C 169
AF RR2BN05TF U 5
AF RR2E102TF U 1
AF RR2GK02TF U 4
AF RR2GK02JQ C 251
BS 1 173 RR2E102TF
BS 174 174 RR2GK02TF
BS 175 633 RR2E102TF
BS 634 636 RR2GK02TF
BS 637 722 RR2E102TF
BS 723 725 RR2GK02JQ

RD RR2GY95JQ 517 0 0
TCTCCGTCGACGAGCTCAAGGAGGTGATCCGCGCGCTCAGCCCCACCTCGTCGCCGGAGG
AAACAGTGAAGATGATGAAACAGTTCGATCTGGACGGGAACGGATTCATCGACATGGACG
AGTTCGTCTCTCTTTTCCAGATCGGAATGAGTCAAGGAGGAAGCGGAGGAGGAGGGAACA
GCAAGAACGATCTGAAGGAAGCGTTCGAGCTGTACGATCTGGACGGTAACGGGCGGATCT
CGGCGAAGGAGCTTCACTCGGTGATGAAGAATCTGGGGGAGAAGTGTTCTGTTCAGGACT
GCAGGAAGATGATTAGCAAAGTTGATACTGATGGTGATGGTTGCGTTAACTTTGAGGAGT
TTAAGCTGATGATGAACAACGGCGGAGCTTGATTGATGA**TCGTTGTATTAGGGATTGT
TTGTATAGAGGAAGCTAGAAAAGTTTGGTTTTATGAGTTTTTTTT***TTACTTTATTGT
GCAATAACTTCCCC*CTTCACTATTGAGATTGTTCTG

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2BN05TF 676 0 0
GG
GTCGTTCTCTTCTCCTCCACCACACGCTTATTTGGTTACTATCAGATTCTCATCTGTTGC
AACTTGCAATGTCGAAGAACAACGGAGCTCGTAGCTGTTTAGGTTCGATGGACGACATCC
GCCGAGTCTTCCAGCGATTCGACAAAAACGGAGACGGAAAGACCTCCGTCGACGAGCTCA
AGGAGGTGATCCGCGCGCTGAGCCCCACCTCGTCGCCGGAGGAAACAGTGAAGATGATGA
AACAGTTCGATCTGGACGGAAACGGATTCATCGACATGGACGAGTTCGTCTCTCTTTTCC
AGATCGGAATGAGTCAAGGAGGAAGCGGAGGAGGAGGAAACAGCAAGAACGATCTGAAGG
AAGCGTTCGAGCTGTACGATCTGGATGGTAACGGGCGGATCTCGGCGAAGGAGCTTCACT
CGGTGATGAAGAATCTGGGGGAGAAGTGTTCTGTTCAGGACTGCAGGAAGATGATTAGCA
AAGTTGATACGGATGGTGATGGTTGCGTTAACTTTGAGGAGTTTAAGCTGATGATGAACA
ACGGCGGAGCTTGATTGATGAGATCGTTG*ATTAGGGATTGTTTGTATAGAGGA*GCTAG
AAAAGTTTGGTTTTATGAGTTTTTTTTTTTTTACTTTAT*GTGCTACAACTTCCGTTCTT
CACTATTGAGATTG

QA 3 676 3 676
DS 

RD RR2E102TF 722 0 0
GGATTCGTCGTTCTCTTCTCCTCCACCACACGCTTATTTGGTTACTATCAGATTCTCATC
TGTTGCAACTTGCAATGTCGAAGAACAACGGAGCTCGTAGCTGTTTAGGTTCGATGGACG
ACATCCGCCGAGTCTTCCAGCGATTCGACAAAAACGGAGACGGAAAGATCTCCATCGACG
AGCTCAAGGAGGTGATCCGCGCGCTGAGCCCCACCTCGTCGCCGGAGGAAACAGTGAAGA
TGATGAAACAGTTCGATCTGGACGGAAACGGATTCATCGACATGGACGAGTTCGTCTCTC
TTTTCCAGATCGGAATGAGTCAAGGAGGAAGCGGAGGAGGAGGAAACAGCAAGAACGATC
TGAAGGAAGCGTTCGAGCTGTACGATCTGGATGGTAACGGGCGGATCTCGGCGAAGGAGC
TTCACTCGGTGATGAAGAATCTGGGGGAGAAGTGTTCTGTTCAGGACTGCAGGAAGATGA
TTAGCAAAGTTGATACGGATGGTGATGGTTGCGTTAACTTTGAGGAGTTTAAGCTGATGA
TGAACAACGGCGGAGCTTGATTGATGAGATCGTTGTATTAGGGATTGTTTGTATAGAGGA
AGCTAGAAAAGTTTGGTTTTATGAGTTTTTTTT***TTACTTTAT*GTGCTACAACTTCC
GTTCTTCACTATTGAGATTGTTCTGATGGGCCTGACTTGCTAATCTGATGTTCCAATCTT
GT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2GK02TF 720 0 0
GGG
GTCGTTCTCTTCTCCTCCACCACACGCTTATTTGGTTACTATCAGATTCTCATCTGTTGC
AACTTGCAATGTCGAAGAACAACGGAGCTCGTAGCTGTTTAGGTTCGATGGACGACATCC
GCCGAGTCTTCCAGCGATTCGACAAAAACGGAGACGGAAAGATCTCCGTCGACGAGCTCA
AGGAGGTGATCCGCGCGCTGAGCCCCACCTCGTCGCCGGAGGAAACAGTGAAGATGATGA
AACAGTTCGATCTGGACGGAAACGGATTCATCGACATGGACGAGTTCGTCTCTCTTTTCC
AGATCGGAATGAGTCAAGGAGGAAGCGGAGGAGGAGGAAACAGCAAGAACGATCTGAAGG
AAGCGTTCGAGCTGTACGATCTGGATGGTAACGGGCGGATCTTGGCGAAGGAGCTTCACT
CGGTGATGAAGAATCTGGAGGAGAAGTGTTCTGTTCAGGACTGCAGGAAGATGATTAGCA
AAGTTGATACGGATGGTGATGGTTGCGTTAACTTTGAGGAGTTTAAGCTGATGATGAACA
ACGGCGGAGCTTGATTGATGAGATCGTTGTATTAGGGATTGTTTGTATAGAGGAAGCTAG
AAAAGTTTGGTTTTATGAGTTTTTTTTTTTTTACTTTAT*GTGCTACAACTTCCGTTCTT
CACTATTGAGATTGTTCTGATGGGCCTGACTTGCTAATCTGATGTTCCAATCTTGT
T

QA 4 719 4 719
DS 

RD RR2GK02JQ 475 0 0
GTTCGATCTGGACGGAAACGGATTCATCGACATGGACGAGTTCGTCTTTCTTTTCCAGAT
CGGAATGAGTCAAGGAGGAAGCGGAGGAGGAGGAAACAGCAAGAACGATTTGAAGGAAGC
GTTCGAGCTGTACGATCTGGATGGTAACGGGCGGATCTTGGCGAAGGAGCTTCACTCGGT
GATGAAGAATCTGGAGGAGAAGTGTTCTGTTCAGGACTGCAGGAAGATGATTAGCAAAGT
TGATACGGATGGTGATGGTTGCGTTAACTTTGAGGAGTTTAAGCTGATGATGAACAACGG
CGGAGCTTGATTGATGAGATCGTTGTATTAGGGATTGTTTGTATAGAGGAAGCTAGAAAA
GTTTGGTTTTATGAGTTTTTTTTTTTTTACTTTAT*GTGCTACAACTTCCGTTCTTCACT
ATTGAGATTGTTCTGATGGGCCTGACTTGCTAATCTGATGTTCCAATCTTGTTTC

QA 1 475 1 475
DS 



AS 2 4

CO CL1233Contig1 1368 2 2 U
GGATCCACCTACGAACCACTCTTTTCTTCTTCGTCTTCGAGGTTTCTTCTTCAGCTCCGA
AACCATATATACCTTCATCGTCTTCTTCTTTTCCCTATCTTTCTTCTTCCGGATCTCCCA
AACACCAATCCTGACAGACCAAGCTTCTCCGCAATCCTCTTCCTCTCGTGGGGATGCGGA
ATCCTCCTCCAGTTCTCCGCCTGATGCTATGATATCTTCAAGAGATCCCGACGCTCTCTT
TAGCGGCGGTGGAATCAGGTTATCTAAGTGGCCGAGCACACACCTTCCTAATTCTAATTC
CTCAATTTTGTTTACTTTTCTTTTTTCCGAATCAGCTTTTTAGCGGGGAATCATCGGCCT
GTGAAGTTTAGTTATGGGTATTCTAGTCTCAAGGGTAAACGAGCAACAATGGAGGACTTC
TTCGAGACTAGAATATCTGATGTTGATGGACAAATGGTTGCCTTCTTCGGCGTCTTCGAT
GGTCACGGTGGTGCGAGAACTGCAGAATATCTTAAAAACAATCTTTTCAACAACTTAGTT
ACTCATCATGACTTTATCTCAGACACCAAGAAAGCCATTGTGCAAGTGTTTAAGCAGACG
GATGAGGAGTATCTCGTTGAAGAGAGGGGACAGCCTAAGAACGCTGGCTCAACCGCATCA
ACTGCTTTGCTTGTTGGAGATAAGTTGATCGTTGCTAATGTTGGTGATTCTAGAGTTGTA
GCGTCTATAAATGCCTCAGCTGTTCCACTTTCTAATGATCACAAACCTGATAGATCAGAT
GAGCGACAGAGGATTGAAGATGCTGGTGGCTTCATCATCTGGGCTGGAACACGGCGAGTT
GGTGGAATTCTTGCTGTGTCCCGGGCATTTGGAGACAAGCAACTTAAGCCATATGTAATT
GCGGAGCCAGAGATTCAGGAGGAGGATATAAGCACGCTGGACTTTATTGTTATAGCCAGC
GATGGATTGTGGAATGTGTTGTCAAACAAGGTTAGCTAGTTTTGAAAGTGCACATTTCTC
TTGCTGCGTTTTTTTAGTAGAAAACAAGGAACTCAGTAACCGCACTCTCAAAACTACCTC
TCTTTTTCTTTTCTTTTTCTTTTCAGGATGCCGTGGCAATAGCACGAGACATTTCAGATG
CGGAAACAGCTTCACGAAAGCTAGTTCAAGAAGCATACGCACGGGGTAGCTGCGACAATA
TCACTTGCATTGTTGTTCGATTTGAGGTTTCTTGAGATATAGCCAAAGGCGTACTTGTTC
TTCTTTGAATGCATCGTCTTCAGCTGTGGCCTTCTCCTTCCATGTATTTGATTGGTTATA
TAAAACAAAACAAAAACAATGAAACTCTATGATTTTTATTTGCAAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP82TF U 1
AF RR2BP82JQ C 639
BS 1 694 RR2BP82TF
BS 695 1368 RR2BP82JQ

RD RR2BP82TF 694 0 0
GGATCCACCTACGAACCACTCTTTTCTTCTTCGTCTTCGAGGTTTCTTCTTCAGCTCCGA
AACCATATATACCTTCATCGTCTTCTTCTTTTCCCTATCTTTCTTCTTCCGGATCTCCCA
AACACCAATCCTGACAGACCAAGCTTCTCCGCAATCCTCTTCCTCTCGTGGGGATGCGGA
ATCCTCCTCCAGTTCTCCGCCTGATGCTATGATATCTTCAAGAGATCCCGACGCTCTCTT
TAGCGGCGGTGGAATCAGGTTATCTAAGTGGCCGAGCACACACCTTCCTAATTCTAATTC
CTCAATTTTGTTTACTTTTCTTTTTTCCGAATCAGCTTTTTAGCGGGGAATCATCGGCCT
GTGAAGTTTAGTTATGGGTATTCTAGTCTCAAGGGTAAACGAGCAACAATGGAGGACTTC
TTCGAGACTAGAATATCTGATGTTGATGGACAAATGGTTGCCTTCTTCGGCGTCTTCGAT
GGTCACGGTGGTGCGAGAACTGCAGAATATCTTAAAAACAATCTTTTCAACAACTTAGTT
ACTCATCATGACTTTATCTCAGACACCAAGAAAGCCATTGTGCAAGTGTTTAAGCAGACG
GATGAGGAGTATCTCGTTGAAGAGAGGGGACAGCCTAAGAACGCTGGCTCAACCGCATCA
ACTGCTTTGCTTGTTGGAGATAAGTTGATCGTTG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2BP82JQ 730 0 0
GAACGCTGGCTCAACCGCATCAACTGCTTTGCTTGTTGGAGATAAGTTGATCGTTGCTAA
TGTTGGTGATTCTAGAGTTGTAGCGTCTATAAATGCCTCAGCTGTTCCACTTTCTAATGA
TCACAAACCTGATAGATCAGATGAGCGACAGAGGATTGAAGATGCTGGTGGCTTCATCAT
CTGGGCTGGAACACGGCGAGTTGGTGGAATTCTTGCTGTGTCCCGGGCATTTGGAGACAA
GCAACTTAAGCCATATGTAATTGCGGAGCCAGAGATTCAGGAGGAGGATATAAGCACGCT
GGACTTTATTGTTATAGCCAGCGATGGATTGTGGAATGTGTTGTCAAACAAGGTTAGCTA
GTTTTGAAAGTGCACATTTCTCTTGCTGCGTTTTTTTAGTAGAAAACAAGGAACTCAGTA
ACCGCACTCTCAAAACTACCTCTCTTTTTCTTTTCTTTTTCTTTTCAGGATGCCGTGGCA
ATAGCACGAGACATTTCAGATGCGGAAACAGCTTCACGAAAGCTAGTTCAAGAAGCATAC
GCACGGGGTAGCTGCGACAATATCACTTGCATTGTTGTTCGATTTGAGGTTTCTTGAGAT
ATAGCCAAAGGCGTACTTGTTCTTCTTTGAATGCATCGTCTTCAGCTGTGGCCTTCTCCT
TCCATGTATTTGATTGGTTATATAAAACAAAACAAAAACAATGAAACTCTATGATTTTTA
TTTGCAAGAG

QA 1 730 1 730
DS 



CO CL1233Contig2 1087 2 6 U
CTACGAACCACTCTTTTCTTCTTCGTCTTCGAGGTTTCTTCTTCAGCTCCGAAACCATAT
ATACCTTCATCGTCTTCTTCTTTTCCCTATCTTTCTTCTTCCGGATCTCCCAAACACCAA
TCCTGACAGACCAAGCTTCTCCGCAATCCTCTTCCTCTCGTGGGGATGCGGAATCCTCCT
CCAGTTCTCCGCCTGATGCTATGATATCTTCAAGAGATCCCGACGCTCTCTTTAGCGGCG
GTGGAATCAGCTTTTTAGCGGGGAATCATCGGCCTGTGAAGTTTAGTTATGGGTATTCTA
GTCTCAAGGGTAAACGAGCAACAATGGAGGACTTCTTCGAGACTAGAATATCTGATGTTG
ATGGACAAATGGTTGCCTTCTTCGGCGTCTTCGATGGTCACGGTGGTGCAAGAACTGCAG
AATATCTTAAAAACAATCTTTTCAACAACTTAGTTACTCATCATGACTTTATCTCAGACA
CCAAGAAAGCCATTGTGCAAGTGTTTAAGCAGACGGATGAGGAGTATCTCGTTGAAGAGA
GGGGACAGCCTAAGAACGCTGGCTCAACCGCATCAACTGCTTTGCTTGTTGGAGATAAGT
TGATCGTTGCTAATGTTGGTGATTCTAGAGTTGTAGCGTCTATAAATGCCTCAGCTGTTC
CACTTTCTAATGATCACAAACCTGATAGATCAGATGAGCGACAGAGGATTGAAGATGCTG
GTGGCTTCATCATCTGGGCTGGAACATGGCGAGTTGGTGGAATTCTTGCTGTGTCCCGGG
CATTTGGAGACAAGCAACTTAAGCCATATGTAATCGCGGAGCCAGAGATTCAGGAGGAGG
ATATAAGCACGCTGGACTTTATTGTTATAGCCAGCGATGGATTGTGGAATGTGTTGTCAA
ACAAGGATGCCGTGGCAATAGCACGAGACATTTCAGATGCGGAAACAGCTTCACGAAAGC
TAGTTCAAGAAGCATACGCACGGGGTAGCTGCGACAATATCACTTGCATTGTTGTTCGAT
TTGAGGTTTCTTGAGATATAGCCAAAGGCGTACTTGTTCTTCTTTGAATGCTTCGTCTTC
AGCTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ26TF U 1
AF RR2CZ26JQ C 382
BS 1 679 RR2CZ26TF
BS 680 680 RR2CZ26JQ
BS 681 706 RR2CZ26TF
BS 707 707 RR2CZ26JQ
BS 708 718 RR2CZ26TF
BS 719 1087 RR2CZ26JQ

RD RR2CZ26TF 718 0 0
CTACGAACCACTCTTTTCTTCTTCGTCTTCGAGGTTTCTTCTTCAGCTCCGAAACCATAT
ATACCTTCATCGTCTTCTTCTTTTCCCTATCTTTCTTCTTCCGGATCTCCCAAACACCAA
TCCTGACAGACCAAGCTTCTCCGCAATCCTCTTCCTCTCGTGGGGATGCGGAATCCTCCT
CCAGTTCTCCGCCTGATGCTATGATATCTTCAAGAGATCCCGACGCTCTCTTTAGCGGCG
GTGGAATCAGCTTTTTAGCGGGGAATCATCGGCCTGTGAAGTTTAGTTATGGGTATTCTA
GTCTCAAGGGTAAACGAGCAACAATGGAGGACTTCTTCGAGACTAGAATATCTGATGTTG
ATGGACAAATGGTTGCCTTCTTCGGCGTCTTCGATGGTCACGGTGGTGCAAGAACTGCAG
AATATCTTAAAAACAATCTTTTCAACAACTTAGTTACTCATCATGACTTTATCTCAGACA
CCAAGAAAGCCATTGTGCAAGTGTTTAAGCAGACGGATGAGGAGTATCTCGTTGAAGAGA
GGGGACAGCCTAAGAACGCTGGCTCAACCGCATCAACTGCTTTGCTTGTTGGAGATAAGT
TGATCGTTGCTAATGTTGGTGATTCTAGAGTTGTAGCGTCTATAAATGCCTCAGCTGTTC
CACTTTCTAATGATCACAA*CCTGATAGATCAGATGAGCGACAGAG*ATTGAAGATGC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2CZ26JQ 706 0 0
TCGGCGTCTTCGATGGTCACGGTGGTGCAAGAACTGCAGAATATCTTAAAAACAATCTTT
TCAACAACTTAGTTACTCATCATGACTTTATCTCAGACACCAAGAAAGCCATTGTGCAAG
TGTTTAAGCAGACGGATGAGGAGTATCTCGTTGAAGAGAGGGGACAGCCTAAGAACGCTG
GCTCAACCGCATCAACTGCTTTGCTTGTTGGAGATAAGTTGATCGTTGCTAATGTTGGTG
ATTCTAGAGTTGTAGCGTCTATAAATGCCTCAGCTGTTCCACTTTCTAATGATCACAAAC
CTGATAGATCAGATGAGCGACAGAGGATTGAAGATGCTGGTGGCTTCATCATCTGGGCTG
GAACATGGCGAGTTGGTGGAATTCTTGCTGTGTCCCGGGCATTTGGAGACAAGCAACTTA
AGCCATATGTAATCGCGGAGCCAGAGATTCAGGAGGAGGATATAAGCACGCTGGACTTTA
TTGTTATAGCCAGCGATGGATTGTGGAATGTGTTGTCAAACAAGGATGCCGTGGCAATAG
CACGAGACATTTCAGATGCGGAAACAGCTTCACGAAAGCTAGTTCAAGAAGCATACGCAC
GGGGTAGCTGCGACAATATCACTTGCATTGTTGTTCGATTTGAGGTTTCTTGAGATATAG
CCAAAGGCGTACTTGTTCTTCTTTGAATGCTTCGTCTTCAGCTGTG

QA 1 706 1 706
DS 



AS 2 5

CO CL1234Contig1 887 2 8 U
GGAAAGTCTTTTCTCCTTCACCTACCATTCTTCCTATCTCACTCACTCTGCCTTTTTGTA
CCTCTCGACAGCACCGGAGAGAGAGAGTGTGTGAAATGACTTGGTCGGTCTTCAAATCCA
TAAACCCTCAAACGCTCGACATCTCAGCCGCACTTCGCTCCACTCGTAGCCCTTTGTTCG
CCGCAGGTGCAGGCTGCGCAACACTCGCTGGTGTTTCTCTCTTACGAATGTCTTCTTCGA
GATCTCCTCCTTTCGCTTCTCTCAGTGTCTCAGCTTCTGCTTCTGGTAAGAAGGAAGTAG
TGGCTACAGAGAAAGCACCAGCTGCTTTGGGACCATACTCTCAGGCCATCAAAGCCAACA
ATCTCGCTTTCGTCTCCGGTGTTCTTGGTCTTATACCTGAGACTGGAAAGTTTGTTTCGG
ACGACGTTGAAGATCAGACTGAGCAGGTCCTCAAGAACATGGGGGAGATACTGAAAGCTA
GTGGTGTTGATTACTCCTCCGTGGTGAAGACAACCATCATGCTTGCTGACTTAGCCGACT
TCAAGAAAGTGAACGAGATTTACGCCAAATACTTCCCAGCTCCTTCTCCAGCAAGATCGA
CATATCAAGTCGCAGCTTTGCCACTAAACGCCAAGATTGAGATTGAATGTATTGCAACAC
TCTAGAACACCATCAAATCTCATCCAGGAGGGTTTAGATTCGGATAATGTCAGAACAAAT
AAAAGAGGAAACCATGGTTAGGTGGGCTTATCATATATCAACCATTAGGTTGGTTGCAAA
ACCCCACTACCTTAATCAAGAATAAATGGTTTTATTTTAGGACCTTCGTGTGCTGTTGAC
TTAGTATGTATTAAGTACAATATTTGATTAGAATTCCTTAATGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE13TF U 1
AF RR2CZ96TF U 318
BS 1 364 RR2CE13TF
BS 365 365 RR2CZ96TF
BS 366 661 RR2CE13TF
BS 662 662 RR2CZ96TF
BS 663 666 RR2CE13TF
BS 667 667 RR2CZ96TF
BS 668 686 RR2CE13TF
BS 687 887 RR2CZ96TF

RD RR2CE13TF 688 0 0
GGAAAGTCTTTTCTCCTTCACCTACCATTCTTCCTATCTCACTCACTCTGCCTTTTTGTA
CCTCTCGACAGCACCGGAGAGAGAGAGTGTGTGAAATGACTTGGTCGGTCTTCAAATCCA
TAAACCCTCAAACGCTCGACATCTCAGCCGCACTTCGCTCCACTCGTAGCCCTTTGTTCG
CCGCAGGTGCAGGCTGCGCAACACTCGCTGGTGTTTCTCTCTTACGAATGTCTTCTTCGA
GATCTCCTCCTTTCGCTTCTCTCAGTGTCTCAGCTTCTGCTTCTGGTAAGAAGGAAGTAG
TGGCTACAGAGAAAGCACCAGCTGCTTTGGGACCATACTCTCAGGCCATCAAAGCCAACA
ATCTTGCTTTCGTCTCCGGTGTTCTTGGTCTTATACCTGAGACTGGAAAGTTTGTTTCGG
ACGACGTTGAAGATCAGACTGAGCAGGTCCTCAAGAACATGGGGGAGATACTGAAAGCTA
GTGGTGTTGATTACTCCTCCGTGGTGAAGACAACCATCATGCTTGCTGACTTAGCCGACT
TCAAGAAAGTGAACGAGATTTACGCCAAATACTTCCCAGCTCCTTCTCCAGCAAGATCGA
CATATCAAGTCGCAGCTTTGCCACTAAACGCCAAGATTGAGATTGAATGTATTGCAACAC
TTTAGAGCACCATCAAATCTCATCCA
GG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2CZ96TF 570 0 0
G
CAGCTGCTTTGGGACCATACTCTCAGGCCATCAAAGCCAACAATCTCGTTTTCGTCTCCG
GTGTTCTTGGTCTTATACCTGAGACTGGAAAGTTTGTTTCGGACGACGTTGAAGATCAGA
CTGAGCAGGTCCTCAAGAACATGGGGGAGATACTGAAGGCTAGTGGTGTTGATTACTCCT
CCGTGGTGAAGACAACCATCATGCTTGCTGACTTAGCCGACTTCAAGAAAGTGAACGAGA
TTTACGCCAAATACTTCCCAGCTCCTTCTCCAGCAAGATCGACATATCAAGTCGCAGCTT
TGCCACTAAACGCCAAGATTGAGATTGAATGTATTGCAACACTCTAGAATACCATCAAAT
CTCATCCAGGAGGGTTTAGATTCGGATAATGTCAGAACAAATAAAAGAGGAAACCATGGT
TAGGTGGGCTTATCATATATCAACCATTAGGTTGGTTGCAAAACCCCACTACCTTAATCA
AGAATAAATGGTTTTATTTTAGGACCTTCGTGTGCTGTTGACTTAGTATGTATTAAGTAC
AATATTTGATTAGAATTCCTTAATGTTTG

QA 2 570 2 570
DS 



CO CL1234Contig2 939 3 9 U
GGATCTGCTTAAAATCCACATCGCTTCGGACAATTAGCTAAAAGTCTTTTCTCCTTCACC
TACCATTCTTCTATCTCACCCACTCCTGCCTTTTTGTACCTCTCGACACAGCGCCGGGGA
GAGAGAAGAGTGAAATGACTTGGTCGGTCTTCAGATCCATAAACCCTCAAACTCTCGACA
TCTCCGCCGCACTTCGCTCCTCCACTCGCAGCCCTTTGTTCGCCGCAGGTGCAGGCTGCG
CAACAACATTCGCTGGTGTTTCTCTCTTCCGAATGTCTTCTTCGAGATCTCCTCCTTTCG
CTTCTCTCAGTGTCTCAGCTTCTGCTGCTTCTGGTAAGAAGGAAGTAGTGGCTACAGAGA
AAGCACCAGCTGCTTTGGGACCATACTCTCAGGCCATCAAAGCCAACAATCTCGTTTTCG
TCTCCGGTGTTCTTGGTCTCATACCTGAGACTGGAAAGTTTGTTTCGGACGACGTTGAAG
ATCAGACTGAGCAGGTCCTCAAGAACATGGGGGAGATACTGAAAGCTAGTGGAGTTGATT
ACTCCTCCGTGGTGAAGACAACCATCATGCTTGCTGACTTAGGCGACTTCAAGAAAGTGA
ACGAGATTTACGCCAAATACTTCCCAGCTCCTTCTCCAGCAAGATCCACATATCAAGTCG
CAGCTTTGCCACTAAACGCCAAGATTGAGATTGAATGTATTGCAACACTCTAGAATATCA
TCAAATCTCATCCAAGAAGGGTTTAGATTCGGACAAATGTCAGAACAAATAAGAGGCTTA
TCATATCTATCAACCATTAGGTTGGTTGCAAAACCCACTACCTTAATCAAGAATAAATGG
TTTTAATTTAGGACCTTCGTGTGCTTGTTGACTTAATATGTATTAAGTACAATATTTGAT
TAGAATTCCTTAATGATTTGAGGTTCATTGCTGGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD47TF U 1
AF RR2EB59TF U 124
AF RR2FD47JQ C 440
BS 1 734 RR2FD47TF
BS 735 775 RR2EB59TF
BS 776 776 RR2FD47JQ
BS 777 800 RR2EB59TF
BS 801 801 RR2FD47JQ
BS 802 812 RR2EB59TF
BS 813 813 RR2FD47JQ
BS 814 843 RR2EB59TF
BS 844 939 RR2FD47JQ

RD RR2FD47TF 735 0 0
GGATCTGCTTAAAATCCACATCGCTTCGGACAATTAGCTAAAAGTCTTTTCTCCTTCACC
TACCATTCTTCTATCTCACCCACTCCTGCCTTTTTGTACCTCTCGACACAGCGCCGGGGA
GAGAGAAGAGTGAAATGACTTGGTCGGTCTTCAGATCCATAAACCCTCAAACTCTCGACA
TCTCCGCCGCACTTCGCTCCTCCACTCGCAGCCCTTTGTTCGCCGCAGGTGCAGGCTGCG
CAACAACATTCGCTGGTGTTTCTCTCTTCCGAATGTCTTCTTCGAGATCTCCTCCTTTCG
CTTCTCTCAGTGTCTCAGCTTCTGCTGCTTCTGGTAAGAAGGAAGTAGTGGCTACAGAGA
AAGCACCAGCTGCTTTGGGACCATACTCTCAGGCCATCAAAGCCAACAATCTCGTTTTCG
TCTCCGGTGTTCTTGGTCTCATACCTGAGACTGGAAAGTTTGTTTCGGACGACGTTGAAG
ATCAGACTGAGCAGGTCCTCAAGAACATGGGGGAGATACTGAAAGCTAGTGGAGTTGATT
ACTCCTCCGTGGTGAAGACAACCATCATGCTTGCTGACTTAGGCGACTTCAAGAAAGTGA
ACGAGATTTACGCCAAATACTTCCCAGCTCCTTCTCCAGCAAGATCCACATATCAAGTCG
CAGCTTTGCCACTAAACGCCAAGATTGAGATTGAATGTATTGCAACACTCTAGAATATCA
TCAAATCTCATCCA
A

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2EB59TF 721 0 0
GGAAGA
GTGAAATGACTTGGTCGGTCTTCAGATCCATAAACCCTCAAACTCTCGACATCTCCGCCG
CACTTCGCTCCTCCACTCGCAGCCCTTTGTTCGCCGCAGGTGCAGGCTGCGCAACAACAT
TCGCTGGTGTTTCTCTCTTCCGAATGTCTTCTTCGAGATCTCCTCCTTTCGCTTCTCTCA
GTGTCTCAGCTTCTGCTGCTTCTGGTAAGAAGGAAGTAGTGGCTACAGAGAAAGCACCAG
CTGCTTTGGGACCATACTCTCAGGCCATCAAAGCCAACAATCTCGTTTTCGTCTCCGGTG
TTCTTGGTCTTATACCTGAGACTGGAAAGTTTGTTTCGGACGACGTTGAAGATCAGACTG
AGCAGGTCCTCAAGAACATGGGGGAGATACTGAAAGCTAGTGGAGTTGATTACTCCTCCG
TGGTGAAGACAACCATCATGCTTGCTGACTTAGGCGACTTCAAGAAAGTGAACGAGATTT
ACGCCAAATACTTCCCAGCTCCTTCTCCAGCAAGATCCACATATCAAGTCGCAGCTTTGC
CACTAAACGCCAAGATTGAGATTGAATGTATTGCAACACTCTAGAATATCATCAAATCTC
ATCCAAGAAGGGTTTAGATTCGGACAAATGTCAGAACAAATAAGAG*CTTATCATATCTA
TCAACCATTAG*TTGGTTGCAAA*CCCACTACCTTAATCAAGAATAAATGGTTT
A

QA 7 720 7 720
DS 

RD RR2FD47JQ 500 0 0
C
ATACCTGAGACTGGAAAGTTTGTTTCGGACGACGTTGAAGATCAGACTGAGCAGGTCCTC
AAGAACATGGGGGAGATACTGAAAGCTAGTGGAGTTGATTACTCCTCCGTGGTGAAGACA
ACCATCATGCTTGCTGACTTAGGCGACTTCAAGAAAGTGAACGAGATTTACGCCAAATAC
TTCCCAGCTCCTTCTCCAGCAAGATCCACATATCAAGTCGCAGCTTTGCCACTAAACGCC
AAGATTGAGATTGAATGTATTGCAACACTCTAGAATATCATCAAATCTCATCCAAGAAGG
GTTTAGATTCGGACAAATGTCAGAACAAATAAGAGGCTTATCATATCTATCAACCATTAG
GTTGGTTGCAAAACCCACTACCTTAATCAAGAATAAATGGTTTTAATTTAGGACCTTCGT
GTGCTTGTTGACTTAATATGTATTAAGTACAATATTTGATTAGAATTCCTTAATGATTTG
AGGTTCATTGCTGGTGTCC

QA 2 500 2 500
DS 



AS 1 6

CO CL1235Contig1 790 6 11 U
TTTTGTCAACAAATCATTGAACTTACTCCGTAGAGCTTTATAACAAACGTATCTGACGGC
CTTGCATGACAAAGCATCATTAGATAACATAAACAAATCTTATTACTACCCGAACTTAAT
TACTTTCTACTTTCATCTGTCTGAGATGAGAATTTATTTTAACAGCTCGTGAGGCCAAAG
ATCTTAAAAGTTTTGGCAAGTAAATATGGAGATAAAGAAAACACAGCAGATGCAGCAACG
AAGAAAGGTTTCAGCTGAAACGCTGACATTTACAACCGCGATCTGGCTTGTTCCAAGGGA
GCGCTAAGAGGAGCTCCTTTAGATCCCCTTTCAGCCAAGAAATCACAAGGCTTGAAGAAA
CCACCATAAGCCTTCGACCACTCATCTAGCTTTGAGTAAATGTATTTCGATCCAATGGAA
TCAGCCCAGAACATGATCCCTCCTCTGTAAGGTGGAAACCCCATTCCAAATATGCCAGCG
ATGTCAAGGTCTGCTGCTTTGACAGCAATCCCTTCCGCAAAAACTCTACCTGCCTCGTTC
ACTACTGGGAAAAACATCATTTCAATAATTTCCTTTTCCGTAAGTTTCGCCAGCTTAGGG
TCAAGGTTCACTCCTGATACGCTTCTTGCCTTTTCGATATATTTCTTTATTTCAGGATCA
GGTTTAGCCTTGCGCTTTTCATCATAAAGATAGAAACCTTTACAGTGGCTTCACCAGCTC
TCTTGTCCTCTTGCATGAGTGGGATAATCATTGATTTGTTTGTCCGTTCTGGGAAGTTCT
CGATGACCCT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR13TF C 75
AF RR2GR13JQ U 5
AF RR2CL73JQ U 2
AF RR2CL73TF C 65
AF RR2H395JQ U 5
AF RR2H395TF C 1
BS 1 5 RR2H395TF
BS 6 465 RR2GR13JQ
BS 466 466 RR2CL73JQ
BS 467 554 RR2GR13JQ
BS 555 555 RR2CL73JQ
BS 556 556 RR2H395JQ
BS 557 566 RR2CL73JQ
BS 567 567 RR2H395JQ
BS 568 703 RR2CL73JQ
BS 704 748 RR2H395JQ
BS 749 790 RR2H395TF

RD RR2GR13TF 335 0 0
CATCATTAGATAACATAAACAAATCTTATTACTACCCGAACTTAATTACTTTCTACTTTC
ATCTGTCTGAGATGAGAATTTATTTTAACAGCTCGTGAGGCCAAAGATCTTAAAAGTTTT
GGCAAGTAAATATGGAGATAAAGAAAACACAGCAGATGCAGCAACGAAGAAAGGTTTCAG
CTGAAACGCTGACATTTACAACCGCGATCTGGCTTGTTCCAAGGGAGCGCTAAGAGGAGC
TCCTTTAGATCCCCTTTCAGCCAAGAAATCACAAGGCTTGAAGAAACCACCATAAGCCTT
CGACCACTCATCTAGCTTTGAGTAAATGTATTTCG

QA 1 335 1 335
DS 

RD RR2GR13JQ 550 0 0
G
TCAACAAATCATTGAACTTACTCCGTAGAGCTTTATAACAAACGTATCTGACGGCCTTGC
ATGACAAAGCATCATTAGATAACATAAACAAATCTTATTACTACCCGAACTTAATTACTT
TCTACTTTCATCTGTCTGAGATGAGAATTTATTTTAACAGCTCGTGAGGCCAAAGATCTT
AAAAGTTTTGGCAAGTAAATATGGAGATAAAGAAAACACAGCAGATGCAGCAACGAAGAA
AGGTTTCAGCTGAAACGCTGACATTTACAACCGCGATCTGGCTTGTTCCAAGGGAGCGCT
AAGAGGAGCTCCTTTAGATCCCCTTTCAGCCAAGAAATCACAAGGCTTGAAGAAACCACC
ATAAGCCTTCGACCACTCATCTAGCTTTGAGTAAATGTATTTCGATCCAATGGAATCAGC
CCAGAACATGATCCCTCCTCTGTAAGGTGGAAACCCCATTTCAAATATGCCAGCGATGTC
AAGGTCTGCTGCTTTGACAGCAATCCCTTCCGCAAAAACTCTACCTGCCTCGTTCACTAC
TGGGAAAAA

QA 2 550 2 550
DS 

RD RR2CL73JQ 708 0 0
GATA
TCAACAAATCATTGAACTTACTCCGTAAAGCTTTATAACAAATGTATCTGACGGCCTTGT
ATGACAAAGCATCATTAGATAACATAAACAAATCTTATTACTACCCGAACTTAATTACTT
TCTACTTTCATCTGTCTGAAATGAGAATTTATTTTAACAGCTCGTGAGGCCAAAGATCTT
AAAAGTTTCGGCAAGTAAATATGGAGATAAAGAAAACACAGAAGATGCAGCAACGAAAAA
AGGTTTCAGCTGAAACGTTGACATTTACAACCGCGATCTGGCTTGTTCCAAGGGAGCGCT
GAAAGGAGCTCCTTTAGATCCCCTTTCAGCCAAGAAATCACAAGGCTTGAAGAAACCACC
ATAAGCCTTCGACCACTCATCTAGCTTTGAGTAAATGTATTTCGATCCAATGGAATCAGC
CCAGAACATGATCCCTCCTCTGTAAGGTGGAAACCCCATTCCAAATATGCCAGCGATGTC
AAGATCTGCTGCTTTGACAGCAATCCCTTCCGCAAAAACTCTACACGCCTCGTTCACTAC
TGGGAAAAACGTCATTTCAATTATTTCCTTTTCCGTAAGTTTCGCCAGCTTAGGGTCAAG
GTTCACTCCTGATACGCTTCTTGCCTTTTCGATATATTTCTTTATTTCAGGATCAGGTTT
AGCCTTGCGCTTTTCATCATAAAGATAGAAACCTTTAC
GAGTGC

QA 5 702 5 702
DS 

RD RR2CL73TF 645 0 0
T
ATGACAAAGCATCATTAGATAACATAAACAAATCTTATTACTACCCGAACTTAATTACTT
TCTACTTTCATCTGTCTGAGATGAGAATTTATTTTAACAGCTCGTGAGGCCAAAGATCTT
AAAAGTTTCGGCAAGTAAATATGGAGATAAAGAAAACACAGAAGATGCAGCAACGAAGAA
AGGTTTCAGCTGAAACGTTGACATTTACAACCGCGATCTGGCTTGTTCCAAGGGAGCGCT
GAGAGGAGCTCCTTTAGATCCCCTTTCAGCCAAGAAATCACAAGGCTTGAAGAAACCACC
ATAAGCCTTCGACCACTCATCTAGCTTTGAGTAAATGTATTTCGATCCAATGGAATCAGC
CCAGAACATGATCCCTCCTCTGTAAGGTGGAAACCCCATTCCAAATATGCCAGCGATGTC
AAGATCTGCTGCTTTGACAGCAATCCCTTCCGCAAAAACTCTACACGCCTCGTTCACTAC
TGGGAAAAACGTCATTTCAATTATTTCCTTTTCCGTAAGTTTCGCCAGCTTAGGGTCAAG
GTTCACTCCTGATACGCTTCTTGCCTTTTCGATATATTTCTTTATTTCAGGATCAGGTTT
AGCCTTGCGCTTTTCATCATAAAGATAGAAACCTTTAC
GAGTGC

QA 2 639 2 639
DS 

RD RR2H395JQ 744 0 0
G
TCAACAAATCATTGAACTTACTCCGTAGAGCTTTATAACAAACGTATCTGACGGCCTTGC
ATGACAAAGCATCATTAGATAACATAAACAAATCTTATTACTACCCGAACTTAATTACTT
TCTACTTTCATCTGTCTGAGATGAGAATTTATTTTAACAGCTCGTGAGGCCAAAGATCTT
AAAAGTTTTGGCAAGTAAATATGGAGATAAAGAAAACACAGCAGATGCAGCAACGAAGAA
AGGTTTCAGCTGAAACGCTGACATTTACAACCGCGATCTGGCTTGTTCCAAGGGAGCGCT
AAGAGGAGCTCCTTTAGATCCCCTTTCAGCCAAGAAATCACAAGGCTTGAAGAAACCACC
ATAAGCCTTCGACCACTCATCTAGCTTTGAGTAAATGTATTTCGATCCAATGGAATCAGC
CCAGAACATGATCCCTCCTCTGTAAGGTGGAAACCCCATTCCAAATATGCCAGCGATGTC
AAGGTCTGCTGCTTTGACAGCAATCCCTTCCGCAAAAACTCTACCTGCCTCGTTCACTAC
TGGGAAAAACA*CATTTCAATAATTTCCTTTTCCGTAAGTTTCGCCAGCTTAGGGTCAAG
GTTCACTCCTGATACGCTTCTTGCCTTTTCGATATATTTCTTTATTTCAGGATCAGGTTT
AGCCTTGCGCTTTTCATCATAAAGATAGAAACCTTTACAGTGGCTTCACCAGCTCTCTTG
TCCTCTTGCATGAGTGGGATAAT

QA 2 744 2 744
DS 

RD RR2H395TF 790 0 0
TTTTGTCAACAAATCATTGAACTTACTCCGTAGAGCTTTATAACAAACGTATCTGACGGC
*TTGCATGACAAAGCATCATTAGATAACATAAACAAATCTTATTACTACCCGAACTTAAT
TACTTTCTACTTTCATCTGTCTGAGATGAGAATTTATTTTAACAGCTCGTGAGGCCAAAG
ATCTTAAAAGTTTTGGCAAGTAAATATGGAGATAAAGAAAACACAGCAGATGCAGCAACG
AAGAAAGGTTTCAGCTGAAACGCTGACATTTACAACCGCGATCTGGCTTGTTCCAAGGGA
GCGCTAAGAGGAGCTCCTTTAGATCCCCTTTCAGCCAAGAAATCACAAGGCTTGAAGAAA
CCACCATAAGCCTTCGACCACTCATCTAGCTTTGAGTAAATGTATTTCGATCCAATGGAA
TCAGCCCAGAACATGATCCCTCCTCTGTAAGGTGGAAACCCCATTCCAAATATGCCAGCG
ATGTCAAGGTCTGCTGCTTTGACAGCAATCCCTTCCGCAAAAACTCTACCTGCCTCGTTC
ACTACTGGGAAAAACA*CATTTCAATAATTTCCTTTTCCGTAAGTTTCGCCAGCTTAGGG
TCAAGGTTCACTCCTGATACGCTTCTTGCCTTTTCGATATATTTCTTTATTTCAGGATCA
GGTTTAGCCTTGCGCTTTTCATCATAAAGATAGAAACCTTTACAGTGGCTTCACCAGCTC
TCTTGTCCTCTTGCATGAGTGGGATAATCATTGATTTGTTTGTCCGTTCTGGGAAGTTCT
CGATGACCCT

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 5

CO CL1236Contig1 1062 5 4 U
GGACACATACACTTGCATACATTATCATCAAAAAGAACTTATAGAGAGAAAAGAGAGAGT
AAAAGAGATTAGCCACAATGTATTTTCGACTTCTCTGTCTTCTCCTCCTCCTAGCTTCTT
GCTTGACACATCAAGCTTTTGGCCGTGGTCGTAACCGGCCACCTAGGGAAGTAAGCTCGT
ATCCTTCATCAAGCATCACAGTCGTCGGAGTTGTCTACTGTGACACTTGTTCAAGCAACA
CTTTCTCAAGACAAAGCTATTTCTTACAAGGAGTGGACGTTCATGTCAGCTGTAGATTCA
AAGCGAGCTCACCAAGGACAACAGAGGAAGTGAACATATCAGTGAACAGAACAACAAACA
GAAGCGGCGTTTACAAGATCGAGATCCCTCACGTCGACGGGATAGATTGCGTGGACGGAA
TCGCCATAGCTTCTCAGTGCAGCGCCAAGCTACTCAGCCCTTCCAACATCAACATCGGCT
GCAACATCCCTGTTTTTCAGACAGCAACCAACGAAGTATCCATCAAGTCAAAGCAAGATC
GTGTCTGTATCTACAGCTTAAGCGCACTCAGCTACAAACCATCCCACAAAAACTCCACAC
TCTGCAGCGGCGGTGGCGGAAAGAGACATCACGGGCGAGAGAAAGAGGAGGAGAAAGTGG
AGAAGAAGTTTAGAGACTCCAAGTTCTTCTGGCCTTATCTGCCACCGTACTGGTTCCCTT
GGCCGTACTCCACTCTGCCACCGTTGCCTACTCTGCCTCCTCTTCCTTCCTTTCCTTTCC
CTTTTCTTCCTTTGGCAAACCCTAATCCAGCATTGCCGGCGTTTGACTGGAAAGATCCCA
CCACTTGGATACCTTATCTTCCACGTTTCCCTCCCAGTGATCACAATCTTTAGGGATCAC
TTTACCTCCACATTTGGCTTTCTTCTTCTCTCTCTTTTGGCTTTCTGCTTCTCTATTTTT
TTTTTGGTTGATCTCCTTTGCTTGTGTTTATGTGTGATTGATTTACTTATTAATGTGTAA
ATTACTCTTCCATTACAGAACATAAAGATTTGGTTTTGATGG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX31TF U 22
AF RR2H663TF U 3
AF RR2AU10TF U 1
AF RR2AU10JQ C 325
AF RR2H663JQB C 764
BS 1 143 RR2AU10TF
BS 144 144 RR2H663TF
BS 145 824 RR2AU10TF
BS 825 1062 RR2AU10JQ

RD RR2DX31TF 286 0 0
GG
ATCATCAAAAAGAACTTATAGAGAGAAAAGAGAGAGTAAAAGAGATTAGCCACAATGTAT
TTTCGACTTCTCTGTCTTCTCCTCCTCCTAGCTTCTTGCTTGACACATCAAGCTTTTGGC
CGTGGTCGTAACCGGCCACCTAGGGAAGTAAGCTCGTATCCTTCATCAAGCATCACAGTC
GTCGGAGTTGTCTACTGTGACACTTGTTCAAGCAACACTTTCTCAAGACAAAGCTATTTC
TTACAAGGAGTGGACTTTCATGTCAGCTGTAGATTCAAAGCGAG

QA 3 286 3 286
DS 

RD RR2H663TF 609 0 0
GG
ACATACACTTGCATACATTATCATCAAAAAGAACTTATAGAGAGAAAAGAGAGAGTAAAA
GAGATTAGCCACAATGTATTTTCGACTTCTCTGTCTTCTCCTCCTCCTAGCTTCTTGCTT
GACACATCAAGCTTTTGGCCGTGGTCGTAACCGGCCACCTAGGGAAGTAAGCTCGTATCC
TTCATCAAGCATCACAGTCGTCGGAGTTGTCTACTGTGACACTTGTTCAAGCAACACTTT
CTCAAGACAAAGCTATTTCTTACAAGGAGTGGACGTTCATGTCAGCTGTAGATTCAAAGC
GAGCTCACCAAGGACAACAGAGGAAGTGAACATATCAGTGAACAGAACAACAAACAGAAG
CGGCGTTTACAAGATCGAGATCCCTCACGTCGACGGGATAGATTGCGTGGACGGAATCGC
CATAGCTTCTCAGTGCAGCGCCAAGCTACTCAGCCCTTCCAACATCAACATCGGCTGCAA
CATCCCTGTTTTTCAGACAGCAACCAACGAAGTATCCATCAAGTCAAAGCAAGATCGTGT
CTGTATCTACAGCTTAAGCGCACTCAGCTACAAACCATCCCACAAAAACTCCACACTCTG
CAGCGGC

QA 3 609 3 609
DS 

RD RR2AU10TF 824 0 0
GGACACATACACTTGCATACATTATCATCAAAAAGAACTTATAGAGAGAAAAGAGAGAGT
AAAAGAGATTAGCCACAATGTATTTTCGACTTCTCTGTCTTCTCCTCCTCCTAGCTTCTT
GCTTGACACATCAAGCTTTTGGCTGTGGTCGTAACCGGCCACCTAGGGAAGTAAGCTCGT
ATCCTTCATCAAGCATCACAGTCGTCGGAGTTGTCTACTGTGACACTTGTTCAAGCAACA
CTTTCTCAAGACAAAGCTATTTCTTACAAGGAGTGGACGTTCATGTCAGCTGTAGATTCA
AAGCGAGCTCACCAAGGACAACAGAGGAAGTGAACATATCAGTGAACAGAACAACAAACA
GAAGCGGCGTTTACAAGATCGAGATCCCTCACGTCGACGGGATAGATTGCGTGGACGGAA
TCGCCATAGCTTCTCAGTGCAGCGCCAAGCTACTCAGCCCTTCCAACATCAACATCGGCT
GCAACATCCCTGTTTTTCAGACAGCAACCAACGAAGTATCCATCAAGTCAAAGCAAGATC
GTGTCTGTATCTACAGCTTAAGCGCACTCAGCTACAAACCATCCCACAAAAACTCCACAC
TCTGCAGCGGCGGTGGCGGAAAGAGACATCACGGGCGAGAGAAAGAGGAGGAGAAAGTGG
AGAAGAAGTTTAGAGACTCCAAGTTCTTCTGGCCTTATCTGCCACCGTACTGGTTCCCTT
GGCCGTACTCCACTCTGCCACCGTTGCCTACTCTGCCTCCTCTTCCTTCCTTTCCTTTCC
CTTTTCTTCCTTTGGCAAACCCTAATCCAGCATTGCCGGCGTTT

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2AU10JQ 738 0 0
AGGAAGTGAACATATCAGTGAACAGAACAACAAACAGAAGCGGCGTTTACAAGATCGAGA
TCCCTCACGTCGACGGGATAGATTGCGTGGACGGAATCGCCATAGCTTCTCAGTGCAGCG
CCAAGCTACTCAGCCCTTCCAACATCAACATCGGCTGCAACATCCCTGTTTTTCAGACAG
CAACCAACGAAGTATCCATCAAGTCAAAGCAAGATCGTGTCTGTATCTACAGCTTAAGCG
CACTCAGCTACAAACCATCCCACAAAAACTCCACACTCTGCAGCGGCGGTGGCGGAAAGA
GACATCACGGGCGAGAGAAGGAGGAGGAGAAGGTGGAGAAGAAGTTTAGAGACTCCAAGT
TCTTCTGGCCTTATCTGCCACCGTACTGGTTCCCTTGGCCGTACTCCACTCTGCCACCGT
TGCCTACTCTGCCTCCTCTTCCTTCCTTTCCTTTCCCTTTTCTTCCTTTGGCAAACCCTA
ATCCAGCATTGCCGGCGTTTGACTGGAAAGATCCCACCACTTGGATACCTTATCTTCCAC
GTTTCCCTCCCAGTGATCACAATCTTTAGGGATCACTTTACCTCCACATTTGGCTTTCTT
CTTCTCTCTCTTTTGGCTTTCTGCTTCTCTATTTTTTTTTTGGTTGATCTCCTTTGCTTG
TGTTTATGTGTGATTGATTTACTTATTAATGTGTAAATTACTCTTCCATTACAGAACATA
AAGATTTGGTTTTGATGG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2H663JQB 262 0 0
TCCTTCCTTTCCTTCCCCTTT*CTTCCTTTGGCAAACCCTAATCCAGCATTGCCGGCGTT
TGACTGGAAAGATCCCACCACTTGGATACCTTATCTTCCACGTTTCCCTCCCAGTGATCA
CAATCTTTAGGGATCACTTTACCTCCACGTTTGGCTTTCTTCTTCTCTCTCTTTTGGCTT
TCTGCTTCTCTATTTTTTTTTTGGTTGATCTCCTTTGCTTGTGTTTGTGTGTGATTGATT
TACTTATTAATGTGTAAATTAC

QA 1 262 1 262
DS 



AS 1 6

CO CL1237Contig1 1499 6 16 U
AAATAAAATTTAGATTCTTTTATTATCAGTAGTACGGATGATATTTCATGTGAAAGAGAA
TTAGGCAAAAAAAAAAATACAAAATTCAAAGGCCAAAAAAGGATTAACCAAAGACAAAAT
GCTCTGTAAGAAAAGAAAAATATGGTCTGAAAATTAAATAATTAAAAATCCCTTTTGTTT
TGTAAATATTCCATATGATATTTTTCTACCTGTGTTTGTTTGTATCTGAAATGCTTGTTC
TTGTTTTCTATGTCAACGAGATCACTTCTTTCTTTTAGACCTTTCCATCAGACTCGCCTG
TTTCAAATAACCCGTTGAGTTTTTGTGCCTTGGTTATGGGAATAGAGAGGCTACGACGCT
CTTTACCGCCCGGTTTAAAAGATGCATTACCGTACCAAATCATACCAAGGATGGCGATGA
GCATTCCAAGTACCACTTGCATGTTCAAGCCTTCCTTACCGAAAAAAGTGAACCCCAGAA
CCAAAACCAGGATTGTCTTCATGTGACCAAGTACTTGGAAAGTCACCGCCGTGAATCTTC
CGATACAGATGAATTGACTGAGATTGGTTCCAACCGCGATACTGCAAGAGAGTATCAAGA
AGAACAGAGATATGAATGAAAAGTTGAATGCATCAACTCTTTGGTTAGTCAACCAGTAGT
CTAGGAATGGTCCAACCAACAACAAGGATGCAGCTTGTACTGGAGCTGTATGCGCCAGTA
AATTGAAAGAACCAAGAGAATATTTCCGTTGTAGATAGTGTACGTAGTATTGCTGAAGGG
CGGTGCTCCAGACAGCGATAGCAGCAGCGAGGAAGCCGTTGAGGTCGACACTAACATCGG
TGACAGTACAGACGGCAACACCAGCAAGAACCAACAAAATGCTAAGCTTCGTATCTCTTG
AATACCTGACGTTGTCGAGAACAACTTCTAGAAGACAAGAAACTGGGATCATACTCAGCT
TCGCAATCTGGTAGAAGCCAACAGAGTTCCACATGAGGCTGACGTTCATCCCAACGATGG
AGAAGTTAGCGAACAGAACAAACTTCAGAAGATCAGGCCAGGGGAGCTGAGAAGGTTGGA
TATAACCAAGCCATGTCAAGAAAGTTGTCAACAGTGTGGTTGTTCCGAAATGCAAACCGG
TTAACGTCGTAGCGAAACTAAAGCCGTAAGTAGCCATCAAGGCTTTGTTAACGAGGATGA
TTCCAACAGAAGTAACGACATTGAACAGCCATGATGCAATGTCTAAAGCCGCCTTTTGAT
CCGTCTTCTTGCTTGTTCCGCTCATTTTCAGATCTCAGGTAACGGAGAAAAATGAGCCTT
*CGAAGACGACGATCGCTACGGCGGCAGCACGGAGACGGCGGAAGACGATTTAGTCAGAG
GCTAAATTAACATGAATTTCAGAGAGAGGGAGAGAGATTGTGGAACTTCGAGTGATTTTA
TTATTTTTCTCTCTTCCGTTTTTTTTTATTCATTTATTTTCAGTTATGGAGGACTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2BP05JQ U 19
AF RR2EN22JQ U 1
AF RR2BJ07JQ U 11
AF RR2BJ07TF C 589
AF RR2BP05TF C 821
AF RR2DF94TF C 915
BS 1 296 RR2EN22JQ
BS 297 297 RR2BJ07JQ
BS 298 551 RR2EN22JQ
BS 552 775 RR2BJ07JQ
BS 776 825 RR2BJ07TF
BS 826 826 RR2BP05TF
BS 827 871 RR2BJ07TF
BS 872 872 RR2BP05TF
BS 873 883 RR2BJ07TF
BS 884 884 RR2BP05TF
BS 885 1270 RR2BJ07TF
BS 1271 1271 RR2BP05TF
BS 1272 1408 RR2BJ07TF
BS 1409 1470 RR2BP05TF
BS 1471 1471 RR2DF94TF
BS 1472 1499 RR2BP05TF

RD RR2BP05JQ 362 0 0
TTTATTATCAGTAGTACGGATGATATTTCATGTGAAAAAAAATTAGGCAAAAAAAAAAAT
ACAAAATTCAAAGGCCAAAAAAGGATTAACCAAAAACAAAATGCTCTGTAAAAAAAAAAA
AATATGGTCTGAAAATTAAATAATTAAAAATCCCTTTTGTTTTGTAAATATTCCATATGA
TATTTTTCTACCTGTGTTTGTTGGTATCTGAAATGCCTGTTCTTGTTTTCTATGTCAACG
AAATCACTTCTTTCTTTTAAACCTTTCCATCAAACTCGTCTGTTTCAAATAACCCGTTGA
GTTTTTGTGCCTTGGTAATGGGAATAGAGAGGCTACGACGCTCTTTACCGCCCGGTTTA
GAA

QA 1 359 1 359
DS 

RD RR2EN22JQ 552 0 0
AAATAAAATTTAGATTCTTTTATTATCAGTAGTACGGATGATATTTCATGTGAAAGAGAA
TTAGGCAAAAAAAAAAATACAAAATTCAAAGGCCAAAAAAGGATTAACCAAAGACAAAAT
GCTCTGTAAGAAAAGAAAAATATGGTCTGAAAATTAAATAATTAAAAATCCCTTTTGTTT
TGTAAATATTCCATATGATATTTTTCTACCTGTGTTTGTTTGTATCTGAAATGCTTGTTC
TTGTTTTCTATGTCAACGAGATCACTTCTTTCTTTTAGACCTTTCCATCAGACTCGGCTG
TTTCAAATAACCCGTTGAGTTTTTGTGCCTTGGTTATGGGAATAGAGAGGCTACGACGCT
CTTTACCGCCCGGTTTAAAAGATGCATTACCGTACCAAATCATACCAAGGATGGCGATGA
GCATTCCAAGTACCACTTGCATGTTCAAGCCTTCCTTACCGAAAAAAGTGAACCCCAGAA
CCAAAACCAGGATTGTCTTCATGTGACCAAGTACTTGGAAAGTCACCGCCGTGAATCTTC
CGATACAGATG
C

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2BJ07JQ 765 0 0
TAGATTCTTTTATTATCAGTAGTACGGATGATATTTCATGTGAAAGAGAATTAGGCAAAA
AAAAA**TACAAAATTCAAAGGCCAAAAAAGGATTAACCAAAGACAAAATGCTCTGTAAG
AAAAGAAAAATATGGTCTGAAAATTAAATAATTAAAAATCCCTTTTGTTTTGTAAATATT
CCATATGATATTTTTCTACCTGTGTTTGTTTGTATCTGAGATGCTTGTTCTTGTTTTCTA
TGTCAACGAGATCACTTCTTTCTTTTAGACCTTTCCATCAGACTCGCCTGTTTCAAATAA
CCCGTTGAGTTTTTGTGCCTTGGTTATGGGAATAGAGAGGCTACGACGCTCTTTACCGCC
CGGTTTAGAAGATGCATTACCGTACCAGATCATACCAAGGATGGCGATGAGCATTCCAAG
TACCACTTGCATGTTCAAGCCTTCCTTACCGAAGAAAGTGAACCCCAGAACCAAAACCAG
GATTGTCTTCATGTGACCAAGTACTTGGAAAGTCACCGCCGTGAATCTTCCGATACAGAT
GAATTGACTGAGATTGGTTCCAACCGCGATACTGCAAGAGAGTATCAAGAAGAACAGAGA
TATGAATGAAAAGTTGAATGCATCAACTCTTTGGTTAGTCAACCAGTAGTCTAGGAATGG
TCCAACCAACAACAAGGATGCAGCTTGTACTGGAGCTGTATGCGCCAGTAAATTGAAAGA
ACCAAGAGAATATTTCCGTTGTAGATAGTGTACGTAGTATTGCTG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2BJ07TF 822 0 0
AGAGTATCAAGAAGAACAGAGATATGAATGAAAAGTTGAATGCATCAACTCTTTGGTTAG
TCAACCAGTAGTCTAGGAATGGTCCAACCAACAACAAGGATGCAGCTTGTACTGGAGCTG
TATGCGCCAGTAAATTGAAAGAACCAAGAGAATATTTCCGTTGTAGATAGTGTACGTAGT
ATTGCTGAAGGGCGGTGCTCCAGACAGCGATAGCAGCAGCGAGGAAGCCGTTGAGGTTGA
CACTAACATCGGTGACAGTACAGACGGCAACACCAGCAAGAACTAACAAAATGCTGAGCT
TCGTATCTCTTGAATACCTGACGTTGTCGAGAACAACTTCTAGAAGACAAGAAACTGGGA
TCATACTCAGCTTCGCAATCTGGTAGAAGCCAACAGAGTTCCACATGAGGCTGACGTTCA
TCCCAACGATGGAGAAGTTAGCGAACAGAACAAACTTCAGAAGATCAGGCCAGGGGAGCT
GAGAAGGTTGGATATAACCAAGCCATGTCAAGAAAGTTGTCAACAGTGTGGTTGTTCCGA
AATGCAAACCGGTTAACGTCGTAGCGAAACTAAAGCCGTAAGTAGCCATCAAGGCTTTGT
TAACGAGGATGATTCCAACAGAAGTAACGACATTGAACAGCCATGATGCAATGTCTAAAG
CCGCCTTTTGATCCGTCTTCTTACTTGTTCCGCTCATTTTCAGATCTCAGGTAACGGAGA
AAAATGAGCCTT*CGAAGACGACGATCGCTACGGCGGCAGCACGGAGACGGCGGAAGACG
ATTTAGTCAGAGGCTAAATTAACATGAATTTCAGAGAGAG
CC

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR2BP05TF 679 0 0
GAGGTCGACACTAACATCGGTGACAGTACAGACGGCAACGCCAGCAAGAACCAACAAAAT
GCTAAGCTTCGTATCTCTTGAATACCTGACGTTGTCGAGAACAACTTCTAGAAGACAAGA
AACTGGGATCATACTCAGCTTCGCAATCTGGTAGAAGCCAACAGAGTTCCACATGAGGCT
GACGTTCATCCCAACGATAGAGAAGTTAGCGAACAGAACAAACTTGAGAAGATCGGGCCA
GGGGAGCTGAGAAGGTTGGATATAACCAAGCCATGTTAAGAAAGTTGTCAACAGTGTGGT
TGTTCCGAAATGCAAACCGGTTAACGTCGTAGCGAAACTGAAGCCGTAAGTAGCCATCAA
GGCTTTGTTGACGAGGATGATTCCAACGGAAGTAACGACATTGAACAGCCATGATACAAT
GTCTAAAGCCGCCTTTTGATCCGTCTTCTTGCTTGTTCCGCTCATTTTCAGATCTCAGGT
AACGGAGAAAAAGGAGCCTTTCGAAGACGACGATCGCTACGGCGGCAGCACGGAGACGGC
GGAAGACGATTAAGTCAGAGGCTAAATTAAC*TGAATTTCAGAGAGAGGGAGAGAGATTG
TGGAACTTCGAGTGATTTTATTATTTTTCTCTCTTCCGTTTTTTTTTATTTATTTATTTT
CAGTTATGGAGGACTTCCC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2DF94TF 585 0 0
TCGAGAACAACTTCTAGAAGACAAGAAACTGGGATCATACTCAGCTTCGCAATCTGGTAG
AAGCCAACAGAGTTCCACATGAGGCTGACGTTCATCCCAACGATGGAGAAGTTAGCGAAC
AGAACAAACTTCAGAAGATCAGGCCAGGGGAGCTGAGAAGGTTGGATATAACCAAGCCAT
GTCAAGAAAGTTGTCAACAGTGTGGTTGTTCCGAAATGCAAACCGGTTAACGTCGTAGCG
AAACTAAAGCCGTAAGTAGCCATCAAGGCTTTGTTAACGAGGATGATTCCAACAGAAGTA
ACGACATTGAACAGCCATGATGCAATGTCTAAAGCCGCCTTTTGATCCGTCTTCTTGCTT
GTTCCGCTCATTTTCAGATCTCAGGTAACGGAGAAAAATGAGCCTT*CGAAGACGACGAT
CGCTACGGCGGCAGCACGGAGACGGCGGAAGACGATTTAGTCAGAGGCTAAATTAACATG
AATTTCAGAGAGAGGGAGAGAGATTGTGGAACTTCGAGTGATTTTATTATTTTTCTCTCT
TCCGTTTTTTTTTATTCATTTATTTTCAGTTATGGAGGACTTCCC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 6

CO CL1238Contig1 858 6 10 U
GTGGTACAGTTCTATATTGGAACAGCACATGCTGTGCTCTACCAAAAATGAAATTTTCTT
TTCAATGTATTCAATGAAAAATTTCAATACAAAAATTTATTGAGAATTACTCCTCAAAAG
CATCCCTAGAGAGATAAAATACCCCATTATAGAGCTATACAAGGTAACGTATGCTCTGAT
TCTGGGGTTTACATATACTCATTATTAGTGTTATAATTCAAATGGAAGAAGATTTCTTTT
TAATTGAAAAAACTCAATATAGATTAGTTATAAATCTATTTCTAATGATTTTCTTATATT
ATTAGAAATAAAAAATGTAAATTTGAATTCAAAAAAGGTCATGAATTTACAGTCAATAGT
TAATGGTTCTGATTTGTACTAGATTCTATATTTTGTGACTGAAAATCTATATTTTTTTCG
GAGTTGAAAAAAAAAACAAGAGAAAATTTGAATCTAGTACAAATAATTTTGGCGGCATGG
CCGAGTGGTAAGGCGGGGGACTGCAAATCCTTTTTCCCCAGTTCAAATCCGGGTGCCGCC
TCAACAGGAGACTTGAAATCTCCTGTTATAACTATAACAAACGTAGGAAAAGACTCTTGA
TACTTTCTTTTCGTGATTCTAAGCCCCTGGCTCTCGAGGTTCTATTCTCTAACCTAAAGT
TTTACCTATCAGATTAGAGGAAAACTCAAACGAGTGGAGGGAAATACATTAGATTGGATA
GGCAGAGAGGGAATTAAATTAATAGTTTTGGAAAGGACCTAAGATACTTTGGATATAGAC
TCATGAAAGTGTCGGAATGCTCAAACATTCAATCAATATTAGATTAGATCAAGAATTGCC
TTTCGTTTTACTTCAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2G223JQ U 1
AF RR2BT82TF U 412
AF RR2G223TF C 270
AF RR2BT82JQ C 237
AF RR2B883JQ C 255
AF RR2B883TF U 255
BS 1 335 RR2G223JQ
BS 336 336 RR2B883TF
BS 337 435 RR2G223JQ
BS 436 436 RR2BT82TF
BS 437 627 RR2G223JQ
BS 628 628 RR2BT82TF
BS 629 670 RR2G223JQ
BS 671 682 RR2BT82TF
BS 683 854 RR2B883TF
BS 855 858 RR2B883JQ

RD RR2G223JQ 670 0 0
GTGGTACAGTTCTATATTGGAACAGCACATGCTGTGCTCTACCAAAAATGAAATTTTCTT
TTCAATGTATTCAATGAAAAATTTCAATACAAAAATTTATTGAGAATTACTCCTCAAAAG
CATCCCTAGAGAGATAAAATACCCCATTATAGAGCTATACAAGGTAACGTATGCTCTGAT
TCTGGGGTTTACATATACTCATTATTAGTGTTATAATTCAAATGGAAGAAGATTTCTTTT
TAATTGAAAAAACTCAATATAGATTAGTTATAAATCTATTTCTAATGATTTTCTTATATT
ATTAGAAATAAAAAATGTAAATTTGAATTCAAAAA*GGTCATGAATTTACAGTCAATAGT
TAATGGTTCTGATTTGTACTAGATTCTATATTTTGTGACTGAAAATCTATATTTTTTTCG
GAGTTGAAAAAAAAA*CAAGAGAAAATTTGAATCTAGTACAAATAATTTTGGCGGCATGG
CCGAGTGGTAAGGCGGGGGACTGCAAATCCTTTTTCCCCAGTTCAAATCCGGGTGCCGCC
TCAACAGGAGACTTGAAATCTCCTGTTATAACTATAACAAACGTAGGAAAAGACTCTTGA
TACTTTCTTTTCGTGATTCTAAGCCCCCGGCTCTCGAGGTTCTATTCTCTAACCTAAAGT
TTTACCTATC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2BT82TF 271 0 0
TTTTTTTCGGAGTTGAAAAAAAAAACAAGAGAAAATTTGAATCTAGTACAAATAATTTTG
GTGGCATGGCCGAGTGGTAAGGCGGGGGACTGCAAATCCTTTTTCCCCAGTTCAAATCCG
GGTGCCGCCTCAACAGGAGACTTGAAATCTCCTGTTATAACTATAACAAACGTAGGAAAA
GACTCTTGATACTTTCTTTTCGTGATTCTAAGCCCCTGGCTCTCGAGGTTCTATTCTCTA
ACCTAAAGTTTTACCTATCAGATTAGAGGAA

QA 1 271 1 271
DS 

RD RR2G223TF 557 0 0
ATAAATCTATTTCTAATGATTTTCTTATATTATTAGAAATAAAAAATGTAAATTTGAATT
CAAAAA*GGTCATGAATTTACAGTCAATAGTTAATGGTTCTGATTTGTACTAGATTCTAT
ATTTTGTGACTGAAAATCTATATTTTTTTCGGAGTTGAAAAAAAAA*CAAGAGAAAATTT
GAATCTAGTACAAATAATTTTGGCGGCATGGCCGAGTGGTAAGGCGGGGGACTGCAAATC
CTTTTTCCCCAGTTCAAATCCGGGTGCCGCCTCAACAGGAGACTTGAAATCTCCTGTTAT
AACTATAACAAACGTAGGAAAAGACTCTTGATACTTTCTTTTCGTGATTCTAAGCCCCCG
GCTCTCGAGGTTCTATTCTCTAACCTAAAGTTTTACCTATCAGATTAGAGGAAAACTCAA
ACGAGTGGAGGGAAATACATTAGATTGGATAGGCAGAGAGGGAATTAAATTAATAGTTTT
GGAAAGGACCTAAGATACTTTGGATATAGACTCATGAAAGTGTCGGAATGCTCAAACATT
CAATCAATATTAGATTA

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2BT82JQ 618 0 0
TTTTTAATTGAAAAAACTCAATATAGATTAGTTATAAATCTATTTCTAATGATTTTCTTA
TATTATTAGAAATAAAAAATGTAAATTTGAATTCAAAAAAGGTCATGAATTTACAGTCAA
TAGTTAATGGTTCTGATTTGTACTAGATTCTATATTTTGTGACTGAAAATCTATATTTTT
TTCGGAGTTGAAAAAAAAAACAAGAGAAAATTTGAATCTAGTACAAATAATTTTGGTGGC
ATGGCCGAGTGGTAAGGCGGGGGACTGCAAATCCTTTTTCCCCAGTTCAAATCCGGGTGC
CGCCTCAACAGGAGACTTGAAATCTCCTGTTATAACTATAACAAACGTAGGAAAAGACTC
TTGATACTTTCTTTTCGTGATTCTAAGCCCCTGGCTCTCGAGGTTCTATTCTCTAACCTA
AAGTTTTACCTATCAGATTAGAGGAAAACTCAAACGAGTGGAGGGAAATACATTAGATTG
GATAGGCAGAGAGGGAATTAAATTAATAGTTTTGGAAAGGACCTAAGATACTTTGGATAT
AGACTCATGAAAGTGTCGGAATGCTCAAACATTCAATCAATATTAGATTAGATCAAGAAT
TGCCTTTCGTTTTACTTC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2B883JQ 604 0 0
CAATATAGATTAGTTATAAATCTATTTCTAATGATTTTCTTATATTATTAGAAATAAAAA
ATGTAAATTTGAATTCAAAAAAGGTCATGAATTTACAGTCAATAGTTAATGGTTCTGATT
TGTACTAGATTCTATATTTTGTGACTGAAAATCTATATTTTTTTCGGAGTTGAAAAAAAA
AACAAGAGAAAATTTGAATCTAGTACAAATAATTTTGGCGGCATGGCCGAGTGGTAAGGC
GGGGGACTGCAAATCCTTTTTCCCCAGTTCAAATCCGGGTGCCGCCTCAACAGGAGACTT
GAAATCTCCTGTTATAACTATAACAAACGTAGGAAAAGACTCTTGATACTTTCTTTTCGT
GATTCTAAGCCCCTGGCTCTCGAGGTTCTATTCTCTAACCTAAAGTTTTACCTATCAGAT
TAGAGGAAAACTCAAACGAGTGGAGGGAAATACATTAGATTGGATAGGCAGAGAGGGAAT
TAAATTAATAGTTTTGGAAAGGACCTAAGATACTTTGGATATAGACTCATGAAAGTGTCG
GAATGCTCAAACATTCAATCAATATTAGATTAGATCAAGAATTGCCTTTCGTTTTACTTC
AAAT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2B883TF 604 0 0
CAATATAGATTAGTTATAAATCTATTTCTAATGATTTTCTTATATTATTAGAAATAAAAA
ATGTAAATTTGAATTCAAAAAAGGTCATGAATTTACAGTCAATAGTTAATGGTTCTGATT
TGTACTAGATTCTATATTTTGTGACTGAAAATCTATATTTTTTTCGGAGTTGAAAAAAAA
AACAAGAGAAAATTTGAATCTAGTACAAATAATTTTGGCGGCATGGCCGAGTGGTAAGGC
GGGGGACTGCAAATCCTTTTTCCCCAGTTCAAATCCGGGTGCCGCCTCAACAGGAGACTT
GAAATCTCCTGTTATAACTATAACAAACGTAGGAAAAGACTCTTGATACTTTCTTTTCGT
GATTCTAAGCCCCTGGCTCTCGAGGTTCTATTCTCTAACCTAAAGTTTTACCTATCAGAT
TAGAGGAAAACTCAAACGAGTGGAGGGAAATACATTAGATTGGATAGGCAGAGAGGGAAT
TAAATTAATAGTTTTGGAAAGGACCTAAGATACTTTGGATATAGACTCATGAAAGTGTCG
GAATGCTCAAACATTCAATCAATATTAGATTAGATCAAGAATTGCCTTTCGTTTTACTTC
AAAT

QA 1 600 1 600
DS 



AS 2 6

CO CL1239Contig1 1007 4 8 U
GTATGGATTAACGGGCAGAGCGTGGGACGTCACTGGCCTGCATACAAAGCAGTTGGTTCT
TGCAGCGAGTGTTCTTACACCGGGACATTCAACGAGAACAAGTGCTTAAGAAACTGTGGA
GAGGCTTCTCAGAGATGGTACCATGTCCCAAGGTCATGGCTGAAACCAACAGGCAATCTA
TTGGTTGTCTTTGAGGAATGGGGAGGAGATCCGAACGGAATCTCGTTGGTCAGAAGAGAA
GTGGACAGTGTCTGTGCAGATATCTATGAGTGGCAATCGACGCTTGTGAACTACCAGCTG
CATGCTTCTGGAAAAGTTAATAAACCGCTGCATCCCAAAGTGCATTTACAGTGTGGGCCA
GGACGGAAGATCACCACTGTTAAGTTCGCTAGCTTTGGGACACCTGAAGGAACTTGTGGT
AGCTACCGTCAAGGAAGGTGTCATGCTCATCATTCTTATGATGCTTTCAACAGACTTTGT
GTTGGGCAGAACTGGTGTTCTGTAACTGTAGCACCGGCCATGTTTGGTGGCGATCCGTGT
CCAAATGTGATGAAGAAACTCGCAGTAGAAGCGGTTTGCGGTTAAACCAGAAGAAGCAGC
AGCAGCAATTTCACATTCTTACAGGTTTTTATTTTATTTCTGATCGTATTAGTATGTTTG
TGGCTATTTTACAAGTGGTGGAAGTTGTACAAAAGGGAAACAACACACCGTTGGAGAGTT
GTTGATTTTATATGTGAATAAGCTTTGTGTGGTAATTGTAACCCTAAGAAAGAAAGGAGA
AGAAGAAGAAGCACATTGAGACTGGAGAATAAGGTGTCCATGTGTTGATGATTCTTTGAG
GGCAAAACTGGGATTATATTGTTCTTTGAGTTTTGCTTCCAACCTTGTGTTTGTTGTTGT
TGCTGTAGTAATTGTATTAGCTGAGACATTTCTCTGCAATTATCTCATTGCTGTACTTAT
GTAACGTTTTTATTTCTCTTGAATGAAATATTTTCAAGTGATTATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B775TF U 1
AF RR2CD66TF U 85
AF RR2AJ91TF U 587
AF RR2B775JQ C 157
BS 1 688 RR2B775TF
BS 689 737 RR2CD66TF
BS 738 738 RR2AJ91TF
BS 739 759 RR2CD66TF
BS 760 760 RR2AJ91TF
BS 761 768 RR2CD66TF
BS 769 777 RR2AJ91TF
BS 778 1007 RR2B775JQ

RD RR2B775TF 688 0 0
GTATGGATTAACGGGCAGAGCGTGGGACGTCACTGGCCTGCATACAAAGCAGTTGGTTCT
TGCAGCGAGTGTTCTTACACCGGGACATTCAACGAGAACAAGTGCTTAAGAAACTGTGGA
GAGGCTTCTCAGAGATGGTACCATGTCCCAAGGTCATGGCTGAAACCAACAGGCAATCTA
TTGGTTGTCTTTGAGGAATGGGGAGGAGATCCGAACGGAATCTCGTTGGTCAGAAGAGAA
GTGGACAGTGTCTGTGCAGATATCTATGAGTGGCAATCGACGCTTGTGAACTACCAGCTG
CATGCTTCTGGAAAAGTTAATAAACCGCTGCATCCCAAAGTGCATTTACAGTGTGGGCCA
GGACGGAAGATCACCACTGTTAAGTTCGCTAGCTTTGGGACACCTGAAGGAACTTGTGGT
AGCTACCGTCAAGGAAGGTGTCATGCTCATCATTCTTATGATGCTTTCAACAGACTTTGT
GTTGGGCAGAACTGGTGTTCTGTAACTGTAGCACCGGCCATGTTTGGTGGCGATCCGTGT
CCAAATGTGATGAAGAAACTCGCAGTAGAAGCGGTTTGCGGTTAAACCAGAAGAAGCAGC
AGCAGCAATTTCACATTCTTACAGGTTTTTATTTTATTTCTGATCGTATTAGTATGTTTG
TGGCTATTTTACAAGTGGTGGAAGTTGT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2CD66TF 684 0 0
G
CATTCAACGAGAACAAGTGCTTAAGAAACTGTGGAGAGGCTTCTCAGAGATGGTACCATG
TCCCAAGGTCATGGCTGAAACCAACAGGCAATCTATTGGTTGTCTTTGAGGAATGGGGAG
GAGATCCGAACGGAATCTCGTTGGTCAGAAGAGAAGTGGACAGTGTCTGTGCAGATATCT
ATGAGTGGCAATCGACGCTTGTGAACTACCAGCTGCATGCTTCTGGAAAAGTTAATAAAC
CGCTGCATCCCAAAGTGCATTTACAGTGTGGGCCAGGACAGAAGATCACCACTGTTAAGT
TCGCTAGCTTTGGGACACCTGAAGGAACTTGTGGTAGCTACCGTCAAGGAAGGTGTCATG
CTCATCATTCTTATGATGCTTTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGTTCTGTAA
CTGTAGCACCGGCCATGTTTGGTGGCGATCCGTGTCCAAATGTGATGAAGAAACTCGCAG
TAGAAGCGGTTTGCGGTTAAACCAGAAGAAGCAGCGGCAGCAATTTCACATTCTTACAGG
TTTTTATTTTATTTCTGATCGTATTAGTATGTTTGTGGCTATTTTACAAGCGGTGGAAGT
TGTACAAAAGGGAAACAACACACCGTTGGAGAGTTGTTGATTTTATATGTGA*TAAGCTT
TGTGTGGTAATTGTTACCCTAAG

QA 2 684 2 684
DS 

RD RR2AJ91TF 196 0 0
G
CAGAAGAAGCAGCAGCAGCAATTTCACATTCTTACAGGTTTTTATTTTATTTCTGATCGT
ATTAGTATGTTTGTGGCTATTTTACAAGCGGTGGAAGTTGTACAAAAGGGAAACAACACA
CCGTTGGAGAGTTGTTGATTTTATATGTGAATAAGCTTTGTGTGGTAATTGTAACCCTAA
GAAAGAAAGG
AGAAG

QA 2 191 2 191
DS 

RD RR2B775JQ 851 0 0
TGGCTGAAACCAACAGGCAATCTATTGGTTGTCTTTGAGGAATGGGGAGGAGATCCGAAC
GGAATCTCGTTGGTCAGAAGAGAAGTGGACAGTGTCTGTGCAGATATCTATGAGTGGCAA
TCGACGCTTGTGAACTACCAGCTGCATGCTTCTGGAAAAGTTAATAAACCGCTGCATCCC
AAAGTGCATTTACAGTGTGGGCCAGGACGGAAGATCACCACTGTTAAGTTCGCTAGCTTT
GGGACACCTGAAGGAACTTGTGGTAGCTACCGTCAAGGAAGGTGTCATGCTCATCATTCT
TATGATGCTTTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGTTCTGTAACTGTAGCACCG
GCCATGTTTGGTGGCGATCCGTGTCCAAATGTGATGAAGAAACTCGCAGTAGAAGCGGTT
TGCGGTTAAACCAGAAGAAGCAGCAGCAGCAATTTCACATTCTTACAGGTTTTTATTTTA
TTTCTGATCGTATTAGTATGTTTGTGGCTATTTTACAAGTGGTGGAAGTTGTACAAAAGG
GAAACAACACACCGTTGGAGAGTTGTTGATTTTATATGTGAATAAGCTTTGTGTGGTAAT
TGTAACCCTAAGAAAGAAAGGAGAAGAAGAAGAAGCACATTGAGACTGGAGAATAAGGTG
TCCATGTGTTGATGATTCTTTGAGGGCAAAACTGGGATTATATTGTTCTTTGAGTTTTGC
TTCCAACCTTGTGTTTGTTGTTGTTGCTGTAGTAATTGTATTAGCTGAGACATTTCTCTG
CAATTATCTCATTGCTGTACTTATGTAACGTTTTTATTTCTCTTGAATGAAATATTTTCA
AGTGATTATAG

QA 1 851 1 851
DS 



CO CL1239Contig2 741 2 2 U
GGGGGAGGAGATCCGAACGGAATCTCGTTGGTCAGAAGAGAAGTGGACAGTGTCTGTGCA
GATATCTATGAGTGGCAATCGACGCTTGTGAACTACCAGTTGCATGCTTCTGGAAAAGTT
AATAAACCGCTGCATCCCAAAGTGCATTTACAGTGTGGGCCTGGACAGAAGATCACCACT
GTTAAGTTTGCTAGCTTTGGGACACCTGAAGGAACTTGCGGTAGCTACCGTCAAGGAAGG
TGTCACGCTCATCACTCTTATGATGCTTTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGT
TCTGTAACTGTAGCACCGGCTATGTTTGGTGGAGATCCGTGTCCAAATGTGATGAAGAAA
CTCGCAGTAGAAGCGGTTTGCGGTTAAACCAGCAATTTCACATTCTTACAGGGTTTTTTT
TTATATTTCTGATGGTATTAGTATGTTTGTGGCTATTTTACAAGCGGTGGAAGTTGTACA
AAAGGGAAACAACACACCGTTGGAGAGTTGTTGATTTTATATGTGAATAAGCTTTGTGTG
GTAATTGTAACCCTAAGAAAGAAAGGAGAAGAAGAAGAAGCACATTGAGACTGGAGAATA
AGGTGTCCATGTGTTGATGATTCTTTGAGGGCAAAACTGGGATTTATATTGTTCTTTGAG
TTTTGCTTTTGAAGTGTTTGTTGTTGCTGTAGTAATTGTATTAGCTGAGACATTTTTTTG
CAATTATCTCATTGCTGAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D309TF U 1
AF RR2D309JQ C 115
BS 1 566 RR2D309TF
BS 567 741 RR2D309JQ

RD RR2D309TF 566 0 0
GGGGGAGGAGATCCGAACGGAATCTCGTTGGTCAGAAGAGAAGTGGACAGTGTCTGTGCA
GATATCTATGAGTGGCAATCGACGCTTGTGAACTACCAGTTGCATGCTTCTGGAAAAGTT
AATAAACCGCTGCATCCCAAAGTGCATTTACAGTGTGGGCCTGGACAGAAGATCACCACT
GTTAAGTTTGCTAGCTTTGGGACACCTGAAGGAACTTGCGGTAGCTACCGTCAAGGAAGG
TGTCACGCTCATCACTCTTATGATGCTTTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGT
TCTGTAACTGTAGCACCGGCTATGTTTGGTGGAGATCCGTGTCCAAATGTGATGAAGAAA
CTCGCAGTAGAAGCGGTTTGCGGTTAAACCAGCAATTTCACATTCTTACAGGGTTTTTTT
TTATATTTCTGATGGTATTAGTATGTTTGTGGCTATTTTACAAGCGGTGGAAGTTGTACA
AAAGGGAAACAACACACCGTTGGAGAGTTGTTGATTTTATATGTGAATAAGCTTTGTGTG
GTAATTGTAACCCTAAGAAAGAAAGG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2D309JQ 627 0 0
AAAGTTAATAAACCGCTGCATCCCAAAGTGCATTTACAGTGTGGGCCTGGACAGAAGATC
ACCACTGTTAAGTTTGCTAGCTTTGGGACACCTGAAGGAACTTGCGGTAGCTACCGTCAA
GGAAGGTGTCACGCTCATCACTCTTATGATGCTTTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAAC
TGGTGTTCTGTAACTGTAGCACCGGCTATGTTTGGTGGAGATCCGTGTCCAAATGTGATG
AAGAAACTCGCAGTAGAAGCGGTTTGCGGTTAAACCAGCAATTTCACATTTTTACAGGGT
TTTTTTTTATATTTCTGATGGTATTAGTATGTTTGTGGCTATTTTACAAGCGGTGGAAGT
TGTACAAAAGGGAAACAACACACCGTTGGAGAGTTGTTGATTTTATATGTGAATAAGCTT
TGTGTGGTAATTGTAACCCTAAGAAAGAAAGGAGAAGAAGAAGAAGCACATTGAGACTGG
AGAATAAGGTGTCCATGTGTTGATGATTCTTTGAGGGCAAAACTGGGATTTATATTGTTC
TTTGAGTTTTGCTTTTGAAGTGTTTGTTGTTGCTGTAGTAATTGTATTAGCTGAGACATT
TTTTTGCAATTATCTCATTGCTGAACT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 5

CO CL1240Contig1 771 5 10 U
GCTCAAACATCAAAGTATATGATTAATATGGTTTTATTTGATCTTATTACCGGGTAACAC
TGAGTTCAAATGTCAGAAAGAGATAAAAGCAAAAAAAAAAAACAAGGCTTTTACAGCTCG
TCCTTTGCGGCCGATTCCCCAGTCTTATGTTCTCCACTCCTAACAGTAGTAGAAGACTCT
TCACGATGAGAAGCTGGCTTGTTCTTCTCAACGAAGCTTATGAAGTCTTCCTTTGTCCTG
CTTCCATCGTACAATACAACCTTTCCATCCGCTGATCTGAAGTAAATTGTTGGGAAGCCT
TTCACATCAAAGGTATCGCTGGGGATATCATTTGCGGTTGCGTCTAGTTTTGCTACGATG
ACACTTGGGTCGTTCTGGAACGACAAAGCCACTTCGTCCAAGATTGGGGCAAGTTTTTGG
CAATGTCCACACCACGGTGCGTAGAATTCAATCAACACATTCTTTCCAGAGTTGAAAACC
ATGTCGTCAAGGCTCTCAGCTACAACAACCTTCACTGGCTCGTTGTTTTCAGCTGGAATA
GGCTGAGATTTTTTGTGGGCGGCAACTTTCCCGTCCTTGAAGTCCTTCATCCATGAATCA
ATCTGGTCAACCACAACGTTTGCTTTCAAATACTTCTTGCTGTCAGGAGTCTGGATAATG
ATGAGGGGAACTTGGCTCTCTTCGAGTCCAAAGTACTGCAAAGCGCCTTGGCTGTTCTCG
GCATCACCAACAAGGAAGGCAAGATCTTGTCCTTTGTAGGATGTAGCAATT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 10 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G377JQ U 4
AF RR2G377TF C 49
AF RR2BJ01JQ U 19
AF RR2B134JQ U 1
AF RR2AQ84JQ U 22
BS 1 92 RR2B134JQ
BS 93 93 RR2G377JQ
BS 94 99 RR2B134JQ
BS 100 102 RR2G377JQ
BS 103 281 RR2B134JQ
BS 282 282 RR2G377JQ
BS 283 287 RR2B134JQ
BS 288 288 RR2G377JQ
BS 289 723 RR2B134JQ
BS 724 771 RR2AQ84JQ

RD RR2G377JQ 397 0 0
CAAACATCAAAGTATATGATTAATATGGTTTTATTTGATCTTATTACCGGGTAACACTGA
GTTCAAATGTCAGAAAGAGATAAAAGCAAAAAAAAAAAACAAGGCTTTTACAGCTCGTCC
TTTGCGGCCGATTCCCCAGTCTTATGTTCTCCACTCCTAACAGTAGTAAAAAACTCTTCA
CGATGAAAAGCTGGCTTGTTCTTCTCAACGAAGCTTATGAAGTCTTCCTTTGTCCTGCTT
CCATCGTACAATACAACCTTTCCATCCGCTGATCTGAAGTAAATTGTTGGGAAGCCTTTC
ACATCAAAGGTATCGCTGGGGATATCATTTGCGGTTGCGTCTAGTTTTGCTACGATGACA
CTTGGGTCGTTCTGGAACGACAAAGCCACTTCGTCCA

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR2G377TF 560 0 0
ACCGGGTAACACTGAGTTCAAATGTCAGAAAGAGATAAAAGCAAAAAAAAAAAACAAGGC
TTTTACAGCTCGTCCTTTGCGGCCGATTCCCCAGTCTTATGTTCTCCACTCCTAACAGTA
GTAGAAGACTCTTCACGATGAGAAGCTGGCTTGTTCTTCTCAACGAAGCTTATGAAGTCT
TCCTTTGTCCTGCTTCCATCGTACAATACAACCTTTCCATCCGCTGATCTGAAGTAAATT
GTTGGGAAGCCTTTCACATCAAAGGTATCGCTGGGGATATCATTTGCGGTTGCGTCTAGT
TTTGCTACGATGACACTTGGGTCGTTCTGGAACGACAAAGCCACTTCGTCCAAGATTGGG
GCAAGTTTTTGGCAATGTCCACACCACGGTGCGTAGAATTCAATCAACACATTCTTTCCA
GAGTTGAAAACCATGTCGTCAAGGCTCTCAGCTACAACAACCTTCACTGGCTCGTTGTTT
TCAGCTGGAATAGGCTGAGATTTTTTGTGGGCGGCAACTTTCCCGTCCTTGAAGTCCTTC
ATCCATGAATCAATCTGGTC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2BJ01JQ 695 0 0
G
TGATTAATATGGTTTTATTTGATCTTATTACCGGGTAACACTGAGTTCAAATGTCAGAAA
GAGATAAAAGCAAAAAAAAAAA*CAAGGCTTTTACAGCTCGTCCTTTGCGGCCGATTCCC
CAGTCTTATGTTCTCCACTCCTAACAGTAGTAGAAGACTCTTCACGATGAGAAGCTGGCT
TGTTCTTCTCAACGAAGCTTATGAAGTCTTCCTTTGTCCTGCTTCCATCGTACAATACAA
CCTTTCCATCCGCTGATCTGAAGTAAATTGTTGGGAAGCCTTTCACATCAAAGGTATCGC
TGGGGATATCATTTGCGGTTGCGTCTAGTTTTGCTACGATGACACTTGGGTCGTTCTGGA
ACGACAAAGCCACTTCGTCCAAGATTGGGGCAAGTTTTTGGCAATGTCCACACCACGGTG
CGTAAAATTCAATCAACACATTCTTTCCAGAGTTGAAAACCATGTCGTCAAGGCTCTCAG
CTACAACAACCTTCACTGGCTCGTTGTTTTCAGCTGGAATAGGCTGAGATTTTTTGTGGG
CGGCAACTTTCCCGTCCTTGAAGTCCTTCATCCATGAATCAATCTGGTCAACGACAACGT
TTGCTTTCAAATACTTCTTGCTGTCAGGAGTCTGGATACTGATGAGGGGAACTTGGCTCT
CTTCGAGTCCAAAGTACTGCAAAGCGCCTTGGCT

QA 2 695 2 695
DS 

RD RR2B134JQ 723 0 0
GCTCAAACATCAAAGTATATGATTAATATGGTTTTATTTGATCTTATTACCGGGTAACAC
TGAGTTCAAATGTCAGAAAGAGATAAAAGCAACAAAAAA***CAAGGCTTTTACAGCTCG
TCCTTTGCGGCCGATTCCCCAGTCTTATGTTCTCCACTCCTAACAGTAGTAGAAGACTCT
TCACGATGAGAAGCTGGCTTGTTCTTCTCAACGAAGCTTATGAAGTCTTCCTTTGTCCTG
CTTCCATCGTACAATACAACCTTTCCATCCGCTGATCTGAAATAAATCGTTGGGAAGCCT
TTCACATCAAAGGTATCGCTGGGGATATCATTTGCGGTTGCGTCTAGTTTTGCTACGATG
ACACTTGGGTCGTTCTGGAACGACAAAGCCACTTCGTCCAAGATTGGGGCAAGTTTTTGG
CAATGTCCACACCACGGTGCGTAGAATTCAATCAACACATTCTTTCCAGAGTTGAAAACC
ATGTCGTCAAGGCTCTCAGCTACAACAACCTTCACTGGCTCGTTGTTTTCAGCTGGAATA
GGCTGAGATTTTTTGTGGGCGGCAACTTTCCCGTCCTTGAAGTCCTTCATCCATGAATCA
ATCTGGTCAACCACAACGTTTGCTTTCAAATACTTCTTGCTGTCAGGAGTCTGGATAATG
ATGAGGGGAACTTGGCTCTCTTCGAGTCCAAAGTACTGCAAAGCGCCTTGGCTGTTCTCG
GCA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2AQ84JQ 750 0 0
ATTAATATGGTTTTATTTGATCTTATTACCGGGTAACACTGAGTTCAAATGTCAGAAAGA
GATAAAAGCAAAAAAAAAA**CAAGGCTTTTACAGCTCGTCCTTTGCGGCCGATTCCCCA
GTCTTATGTTCTCCACTCCTAACAGTAGTAGAAGACTCTTCACGATGAGAAGCTGGCTTG
TTCTTCTCAATGAAGCTTATGAAGTCTTCCTTTGTCCTGCTTCCATCGTACAATACAACC
TTTCCATCCGCTGATCTGAAGTAAATTGTTGGGAAGCCTTTCACATCAAAGGTATCGCTG
GGGATATCATTTGCGGTTGCGTCTAGTTTTGCTACGATGACACTTGGGTCGTTCTGGAAC
GACAAAGCCACTTCGTCCAAGATTGGGGCAAGTTTTTGGCAATGTCCACACCACGGTGCG
TAAAATTCAATCAACACATTCTTTCCAGAGTTGAAAACCATGTCGTCAAGGCTCTCAGCT
ACAACAACCTTCACTGGCTCGTTGTTTTCAGCTGGAATAGGCTGAGATTTTTTGTGGGCG
GCAACTTTCCCGTCCTTGAAGTCCTTCATCCATGAATCAATCTGGTCAACCACAACGTTT
GCTTTCAAATACTTCTTGCTGTCAGGAGTCTGGATAATGATGGGGGGAACTTGGCTCTCT
TCGAGTCCAAAGTACTGCAAAGCGCCTTGGCTGTTCTCGGCATCACCAACAAGGAAGGCA
AGATCTTGTCCTTTGTAGGATGTAGCAATT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 5

CO CL1241Contig1 1105 5 27 U
GGAGCTTGTCAATGGAGGTGAACTCTTTGATAAAATCGCTCAACAAGGGAGACTTAAGGA
GGATGAAGCTAGGAAATACGTTCAGCAGCTAATCAATGCCGTTGATTACTGCCACAGTCG
AGGGGTCTACCACAGAGATCTCAAGCCTGAAAATCTTCTCCTTGATTCAAATGGGGTTTT
AAAAGTTTCTGATTTTGGGTTAAGCGCTTTCTCACTACAAATTCGGGAAGATGGTTTGCT
TCACACAGCTTGTGGAACCCCCAACTATGTTGCTCCTGAGGTTCTTTCGGACAAAGGCTA
TGACGGTGCAGCAGCAGATGTATGGTCATGTGGTGTTATTCTATTTGTTCTCATGGCTGG
TTACTTGCCCTTTGACGAGCCAAATCTCATGACATTATACAAACGTATATGCAAGGCTGA
ATTCAACTGCCCACCATGGTTCTCGCCAGGTGCCAAGACTGTCATTAAGCGTATCCTTGA
TCCCAGCCCTATAACCAGAATAAGTATCGCAGAGTTACTAGAAGATGAATGGTTCAAGCA
AGGGTACAAGCCGCCATCTTTTGAGCAAGATGATGAGGACATAACCATTGATGATGTTGA
TGCTGCTCTCAGTAACTCCAAGGAATGTCTTGTAACAGAGAAGAAGGAGAAACCTGAATC
TATGAACGCTTTTGAACTTATCTCTAGCTCAAGCGAGTTCAGTCTTGAGAACTTGTTCGA
GAAGCAAGCCCAACTTGTGAAAAAAGAGACCCGGTTTACTTCAAACAGACCTGCGAGCGA
AATAATGTCCAAGATGGAAGAAACCGCAAAGCCATTAGGTTTCAATGTCCGTAAAGACAA
GTACAAGATAAAAATGAAAGGAGACAAAAGTGGTCGTAAAGGCCAGCTCTCAGTTGCTAC
AGAGGTGTTTGAAGTGGCACCATCATTGCATGTGGTAGAGCTTAGGAAAACCGGCGGTGA
TACCCTCGAGTTTCACAAGTTCTACAAAACCTTCTCATCTGGATTAAAGGATGTAGTCTG
GAATACTGACGGAGCAGCTCAAGAACATAAAGTTTAATAAGTTCATTAGCAATTTGTTCT
ATTTAAAAGCAAATTAAACTAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DX52TF U 1
AF RR2C857TF U 67
AF RR2BJ36TF U 226
AF RR2BJ36JQ C 445
AF RR2DX52JQ C 539
BS 1 131 RR2DX52TF
BS 132 132 RR2C857TF
BS 133 258 RR2DX52TF
BS 259 259 RR2C857TF
BS 260 285 RR2DX52TF
BS 286 286 RR2C857TF
BS 287 307 RR2DX52TF
BS 308 308 RR2C857TF
BS 309 393 RR2DX52TF
BS 394 394 RR2C857TF
BS 395 458 RR2DX52TF
BS 459 459 RR2C857TF
BS 460 474 RR2DX52TF
BS 475 475 RR2BJ36TF
BS 476 525 RR2DX52TF
BS 526 526 RR2BJ36TF
BS 527 537 RR2C857TF
BS 538 538 RR2BJ36TF
BS 539 576 RR2C857TF
BS 577 577 RR2BJ36TF
BS 578 607 RR2C857TF
BS 608 608 RR2BJ36TF
BS 609 690 RR2C857TF
BS 691 691 RR2BJ36TF
BS 692 717 RR2C857TF
BS 718 987 RR2BJ36TF
BS 988 1105 RR2BJ36JQ

RD RR2DX52TF 525 0 0
GGAGCTTGTCAATGGAGGTGAACTCTTTGATAAAATCGCTCAACAAGGGAGACTTAAGGA
GGATGAAGCTAGGAAATACGTTCAGCAGCTAATCAATGCCGTTGATTACTGCCACAGTCG
AGGGGTCTACCTCAGAGATCTCAAGCCTGAAAATCTTCTCCTTGATTCAAATGGGGTTTT
AAAAGTTTCTGATTTTGGGTTAAGCGCTTTCTCACTACAAATTCGGGAAGATGGTTTGCT
TCACACAGCTTGTGGAACGCCCAACTATGTTGCTCCTGAGGTTCTGTCGGACAAAGGCTA
TGACGGT*CAGCAGCAGATGTATGGTCATGTGGTGTTATTCTATTTGTTCTCATGGCTGG
TTACTTGCCCTTTGACGAGCCAAATCTCATGACGTTATACAAACGTATATGCAAGGCTGA
ATTCAACTGCCCACCATGGTTCTCGCCAGGTGCCAAGAGTGTCATTAAGCGTATTCTTGA
TCCCAGCCCTATAACCAGAATAAGTATCGCAGAGTTACTAGAAGA

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2C857TF 651 0 0
G
GCTAGGAAATATGTTCAGCAGCTAATCAATGCCGTTGATTACTGCCACAGTCGAGGGGTC
TACCACAGAGATCTCAAGCCTGAAAATCTTCTCCTTGATTCAAATGGGGTTTTAAAAGTT
TCTGATTTTGGGTTAAGCGCTTTCTCACTACAAATTCGGGAAGATGGTTTGCTTCACACA
GCTTGTGGAACCCCCAACTACGTTGCTCCTGAGGTTCTTTCGGACAAAGGCTATGACGGT
GCAGCAGCAGATGTATGGTCATGTGGTGTTATTCTATTTGTTCTCATGGCTGGTTACTTG
CCCTTTGACGAGCCAAATCTCATGACATTATACAAACGTATATGCAAGGCTGAATTCAAC
TGCCCACCATGGTTCTCGCCAGGTGCCAGGACTGTCATTAAGCGTATTCTTGATCCCAGC
CCTATAACCAGAATAAGTATCGCAGAGTTACTAGAAGACGAATGGTTCAATCAAGGGTAC
AAGCCGCCATCTTTTGAGCAAGATGATGAAGACATAACCATTGATGATGTTGATGCTGCT
TTCAGTAACTCCAAGGAATGTCTTGTAACAGAGAAGAAGGAGAAACCTGAATCTATGAAC
GCTTTTGAACTTATCTCTAGCTCGAGCGAGTTCAGTCTTGAGAACTTGTT

QA 2 651 2 651
DS 

RD RR2BJ36TF 762 0 0
GGAAGATGGTTTGCTTCACACAGCTTGTGGAACCCCCAACTATGTTGCTCCTGAGGTTCT
TTCGGACAAAGGCTATGACGGTGCAGCAGCAGATGTATGGTCATGTGGTGTTATTCTATT
TGTTCTCATGGCTGGTTACTTGCCCTTTGACGAGCCAAATCTCATGACATTATACAAACG
TATATGCAAGGCTGAATTCAACTGCCCACCATGGTTCTCGCCAGGTGCCAAGACTGTCAT
TAAGCGTATCCTTGATCCCAGCCCTATAACCAGAATAAGTATCGCAGAGTTACTAGAAGA
TGAATGGTTCAAGCAAGGGTACAAGCCGCCATCTTTTGAGCAAGATGATGAGGACATAAC
CATTGATGATGTTGATGCTGCTCTCAGTAACTCCAAGGAATGTCTTGTAACAGAGAAGAA
GGAGAAACCTGAATCTATGAACGCTTTTGAACTTATCTCTAGCTCAAGCGAGTTCAGTCT
TGAGAACTTGTTCGAGAAGCAAGCCCAACTTGTGAAAAAAGAGACCCGGTTTACTTCAAA
CAGACCTGCGAGCGAAATAATGTCCAAGATGGAAGAAACCGCAAAGCCATTAGGTTTCAA
TGTCCGTAAAGACAAGTACAAGATAAAAATGAAAGGAGACAAAAGTGGTCGTAAAGGCCA
GCTCTCAGTTGCTACAGAGGTGTTTGAAGTGGCACCATCATTGCATGTGGTAGAGCTTAG
GAAAACCGGCGGTGATACCCTCGAGTTTCACAAGTTCTACAA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2BJ36JQ 661 0 0
GCCAGGTGCCAAGACTGTCATTAAGCGTATCCTTGATCCCAGCCCTATAACCAGAATAAG
TATCGCAGAGTTACTAGAAGATGAATGGTTCAAGCAAGGGTACAAGCCGCCATCTTTTGA
GCAAGATGATGAGGACATAACCATTGATGATGTTGATGCTGCTCTCAGTAACTCCAAGGA
ATGTCTTGTAACAGAGAAGAAGGAGAAACCTGAATCTATGAACGCTTTTGAACTTATCTC
TAGCTCAAGCGAGTTCAGTCTTGAGAACTTGTTCGAGAAGCAAGCCCAACTTGTGAAAAA
AGAGACCCGGTTTACTTCAAACAGACCTGCGAGCGAAATAATGTCCAAGATGGAAGAAAC
CGCAAAGCCATTAGGTTTCAATGTCCGTAAAGACAAGTACAAGATAAAAATGAAAGGAGA
CAAAAGTGGTCGTAAAGGCCAGCTCTCAGTTGCTACAGAGGTGTTTGAAGTGGCACCATC
ATTGCATGTGGTAGAGCTTAGGAAAACCGGCGGTGATACCCTCGAGTTTCACAAGTTCTA
CAAAACCTTCTCATCTGGATTAAAGGATGTAGTCTGGAATACTGACGGAGCAGCTCAAGA
ACATAAAGTTTAATAAGTTCATTAGCAATTTGTTCTATTTAAAAGCAAATTAAACTAAAT
G

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2DX52JQ 567 0 0
CAAGGGTACAAGCCGCCATCTTTTGAGCAAGATGATGAGGACATAACCATTGATGATGTT
GATGCTGCTTTCAGTAACTCCAAGGAATGTCTTGTAACAGAGAAGAAGGAGAAACCTGAA
TCTATGAACGCTTTTGAACTTATCTCTAGCTCAAGCGAGTTCAGTCTTGAGAACTTGTTC
GAGAAGCAAGCCCAACTTGTGAAAAAAGAGACCCGGTTTACTTCAAACAGACCTGCGAGC
GAAATAATGTCCAAGATGGAAGAAACCGCAAAGCCATTAGGTTTCAATGTCCGTAAAGAC
AAGTACAAGATAAAAATGAAAGGAGACAAAAGTGGTCGTAAAGGCCAGCTCTCAGTTGCT
ACAG**GTGTTTGAAGTGGCACCATCATTGCATGTGGTAGAGCTTAGGAAAACCGGCGGT
GATACCCTCGAGTTTCACAAGTTTTACAAAACCTTCTCATCTGGATTAAAGGATGTAGTC
TGGAATACTGACGGAGCAGCTCAAGAACATAAAGTTTAATAAGTTCATTAGCAATTTGTT
CTATTTAAAAGCAAATTAAACTAAATG

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL1242Contig1 662 2 4 U
GTGAAGTATCCAATAATAATGCTTTTACTCTTCTGTGAACTCAGAAGTCATGCGTCTCAA
ATTTCACAATACAAAGCAGCCAGAAAAGGTTTTAAAGCAAAAAAAAACCAAACAAAACAC
CTTAGATCCTATCGATATCCTCGTCCTCAAAATCAATAACATCATCAGCGCCATTCTCCT
CATCATCGTCAAGATCACCAGCAATACCTTCGTTGAGACGAGTATTCTCGGGAAGCTCAC
CATAGGCCTTGAGAAGCCTTGCCTCATCAGACATGTACTTGAGGATGACATCAGCCTTGT
CATCCTGGTAGTCTCTCAGACCAACAAGTATGATACCACCTGCTGCGATCCAAACCTTCT
TGTGCATCTTGCCGCGGATATGGCAGAAACGCTTGGTGCCGTCGATGCACATGCACTCGC
ATCTCCCGTTGCCGAGCATACGGAGGACTTGCGCGTACTCTTGTACGTCTTCTTTGAATA
TAAGCTCACGCTTCTCGTCATCGGCTTCGTTCTTTCCTCTCTTCCTGTTCTTTCCTCCCT
TTCCCTTGTTCTTCGGCATGGTAACAGCTAAGAAGCGATCTGAGATAAAGCTGAGAAGAA
AAACTCTTGGATGAGATGAGAGATTCGGAGATTCTCTTTGAATTTGGATCAACGTTTTCT
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2BZ68JQ U 1
AF RR2AA72TF C 35
BS 1 141 RR2BZ68JQ
BS 142 142 RR2AA72TF
BS 143 591 RR2BZ68JQ
BS 592 662 RR2AA72TF

RD RR2BZ68JQ 591 0 0
GTGAAGTATCCAATAATAATGCTTTTACTCTTCTGTGAACTCAGAAGTCATGCGTCTCAA
ATTTCACAATACAAAGCAGCCAGAAAAGGTTTTAAAGCAAAAAAAAACCAAACAAAACAC
CTTAGATCCTATCGATATCCT*GTCCTCAAAATCAATAACATCATCAGCGCCATTCTCCT
CATCATCGTCAAGATCACCAGCAATACCTTCGTTGAGACGAGTATTCTCGGGAAGCTCAC
CATAGGCCTTGAGAAGCCTTGCCTCATCAGACATGTACTTGAGGATGACATCAGCCTTGT
CATCCTGGTAGTCTCTCAGACCAACAAGTATGATACCACCTGCTGCGATCCAAACCTTCT
TGTGCATCTTGCCGCGGATATGGCAGAAACGCTTGGTGCCGTCGATGCACATGCACTCGC
ATCTCCCGTTGCCGAGCATACGGAGGACTTGCGCGTACTCTTGTACGTCTTCTTTGAATA
TAAGCTCACGCTTCTCGTCATCGGCTTCGTTCTTTCCTCTCTTCCTGTTCTTTCCTCCCT
TTCCCTTGTTCTTCGGCATGGTAACAGCTAAGAAGCGATCTGAGATAAAGC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2AA72TF 628 0 0
GTGAACTCAGAAGTCATGCGTCTCAAATTTCACAATACAAAGCAGCCAGAAAAGGTTTTA
AAGCAAAAAAAAACCAAACAAAACACCTTAGATCCTATCGATATCCTCGTCCTCAAAATC
AATAACATCATCAGCGTCATTCTCCTCATCATCGTCAAGATCACCAGCAATACCTTCGTT
GAGACGAGTATTCTCGGGAAGCTCACCATAGGCCTTGAGAAGCCTTGCCTCATCAGACAT
GTACTTGAGGATGACATCAGCCTTGTCATCCTGGTAGTCTCTCAGACCAACAAGTATGAT
ATCACCTGCTGCGATCCAAACCTTCTTGTGCATCTTGCCGCGGATATGGCAGAGACGCTT
GGTGCCGTCGATGCACATGCACTCGCATCTCCCGTTGCCGAGCATACGGAGGACTTGCGC
GTACTCTTGTCCGTCTTCTTTGAATATAAGCTCACGCTTCTCGTCATCGGCTTCGTTCTT
TCCTCTCTTCCTGTTCTTTCCTCCCTTTCCCTTGTTCTTCGGCATGGTAACAGCTAAGAA
GCGATCTGAGATAAAGCTGAGAAGAAAAACTCTTGGATGAGATGAGAGATTCGGAGATTC
TCTTTGAATTTGGATCAACGTTTTCTCC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 2 5

CO CL1243Contig1 883 3 32 U
GCGACTGCAAAATTGTGGAAGGGGTTCTTTCCCACCAGATGAAACAGAATGTGATTGATG
GAAGCAAGGTTGTCTTAAGTGTAACCAGTCCCGAAACTAGGGTTGATGATGTTGAGTTTG
AAGAGAATGAAGTGTATGCTATAGATATTGTGGCAAGCACTGGTGATGGCAAGCCTAAGC
TGTTAGACGAGAAGCAAACAACTATTTACAGGAAAGATGAGAGTATTAACTATCAGTTGA
AGATGAAGGCCTCCAGATCCTTAATAAGCGAGGTTAAAGAGAACTTCCCCCACATGCCAT
TCACTTCAAGGTCATTGGAGGAGAAAAGGGCACGACTTGGACTTGTTGAGTGTGTGAACC
ATGGTCATTTGCAACCATATCCTGTTCTTTACGAGAAGCCTGGTGATTTTGTTGCCCAGA
TTAAATTCACAGTTCTGCTGATTCCAAATGGATCGGATAGGATCACATCACACACACTTC
AGGAGCTTCAACCTACGAAAACCATTGACGACCCTGAGATCAAAGGGTGGTTAGCCTTGG
GTATCAAAAAGAAGAAGGGTGGTGGAAAGAAGAAGAAAGCCAAGAAGGCTGGAGAGAAAG
GAGAGGCCTCAACGGAGGCTGAGCCAATGGAAGCAAGTAGCAATGCTGAAGCATGAGATC
TTTCTTTTGTTTTCTTTTAAAAGAATTTTTGGAACTTCAGGTCTTTTGTAGGTTTGAGTT
TCAGAGTCTCTCTTAGATAAAAAAAGAACAAAGAAAAACAATTTAAATGTGTCTTTTTGC
ACAAGTCCTTTTACTGAATCTTCATCATCATTGTTCTGATTTGACTTGCGTCATGAACGA
TATCAAATTATCAATGGCTTTCAAATATATAGGTTTTGGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ16TF U 25
AF RR2AK96TF U 1
AF RR2EJ16JQ C 98
BS 1 65 RR2AK96TF
BS 66 66 RR2EJ16TF
BS 67 84 RR2AK96TF
BS 85 86 RR2EJ16TF
BS 87 139 RR2AK96TF
BS 140 140 RR2EJ16TF
BS 141 247 RR2AK96TF
BS 248 248 RR2EJ16TF
BS 249 259 RR2AK96TF
BS 260 260 RR2EJ16TF
BS 261 262 RR2AK96TF
BS 263 263 RR2EJ16TF
BS 264 319 RR2AK96TF
BS 320 320 RR2EJ16TF
BS 321 346 RR2AK96TF
BS 347 347 RR2EJ16TF
BS 348 403 RR2AK96TF
BS 404 404 RR2EJ16TF
BS 405 442 RR2AK96TF
BS 443 443 RR2EJ16TF
BS 444 466 RR2AK96TF
BS 467 467 RR2EJ16TF
BS 468 499 RR2AK96TF
BS 500 500 RR2EJ16TF
BS 501 526 RR2AK96TF
BS 527 527 RR2EJ16TF
BS 528 541 RR2AK96TF
BS 542 542 RR2EJ16TF
BS 543 616 RR2AK96TF
BS 617 617 RR2EJ16JQ
BS 618 676 RR2AK96TF
BS 677 883 RR2EJ16JQ

RD RR2EJ16TF 558 0 0
G
TCTTTCCCACCAGATGAAACAGAATGTGATTGATGGAAGCAAGGTTGTCTTAAGTGTAAC
CAGTCCCGAAACTAGGGTTGATGATGTTGAGTTTGAAGAGAATGAAGTGTATGCTATAGA
TATTGTGGCAAGCACTGGTGATGGCAAGCCTAAGCTGTTAGACGAGAAGCAAACAACTAT
TTACAGGAAAGATGAGAGTATTAACTATCAGTTGAAGATGAAGGCCTCCAGATCCTTAAT
AAGCGAGGTTAAAGAGAACTTCCCCCACATGCCATTCACTTCAAGGTCATTGGAGGAGAA
AAGGGCACGACTTGGACTTGTTGAGTGTGTGAACCATGGTCATTTGCAACCATATCCTGT
TCTTTACGAGAAGCCTGGTGATTTTGTTGCCCAGATTAAATTCACAGTTCTGCTGATTCC
AAATGGATCGGATAGGATCACATCACACACACTTCAGGAGCTTCAACCTACGAAAACCAT
TGACGACCCTGAGATCAAAGGGTGGTTAGCCTTGGGTATCAAAAAGAAGAAGGGTGGTGG
AAAGAAGAAGAAAGCCA

QA 2 558 2 558
DS 

RD RR2AK96TF 676 0 0
GCGACTGCAAAATTGTGGAAGGGGTTCTTTCCCACCAGATGAAACAGAATGTGATTGATG
GAAGCGAGGTTGTCTTAAGTGTAATGAGTCCCGAAACTAGGGTTGATGATGTTGAGTTTG
AAGAGAATGAAGTGTATGCAATAGATATTGTGGCAAGCACTGGTGATGGCAAGCCTAAGC
TGTTAGACGAGAAGCAAACAACTATTTACAGGAAAGATGAGAGTATTAACTATCAGTTGA
AGATGAAAGCCTCCAGATCGTTGATAAGCGAGGTTAAAGAGAACTTCCCCCACATGCCAT
TCACTTCAAGGTCATTGGAAGAGAAAAGGGCACGACTTGGACTTGTGGAGTGTGTGAACC
ATGGTCATTTGCAACCATATCCTGTTCTTTACGAGAAGCCTGGGGATTTTGTTGCCCAGA
TTAAATTCACAGTTCTGCTGATGCCAAATGGATCGGATAGGATCACGTCACACACACTTC
AGGAGCTTCAACCTACGAAGACCATTGACGACCCTGAGATCAAAGGTTGGTTAGCCTTGG
GCATCAAAAAGAAGAAGGGTGGTGGAAAGAAGAAGAAAGCCAAGAAGGCTGGAGAGAAAG
GAGAGGCCTCAACGGATGCTGAGCCAATGGAAGCAAGTAGCAATGCTGAAGCATGAGATC
TTTCTTTTGTTTTCTT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2EJ16JQ 786 0 0
TAGGGTTGATGATGTTGAGTTTGAAGAGAATGAAGTGTATGCTATAGATATTGTGGCAAG
CACTGGTGATGGCAAGCCTAAGCTGTTAGACGAGAAGCAAACAACTATTTACAGGAAAGA
TGAGAGTATTAACTATCAGTTGAAGATGAAGGCCTCCAGATCCTTAATAAGCGAGGTTAA
AGAGAACTTCCCCCACATGCCATTCACTTCAAGGTCATTGGAGGAGAAAAGGGCACGACT
TGGACTTGTTGAGTGTGTGAACCATGGTCATTTGCAACCATATCCTGTTCTTTACGAGAA
GCCTGGTGATTTTGTTGCCCAGATTAAATTCACAGTTCTGCTGATTCCAAATGGATCGGA
TAGGATCACATCACACACACTTCAGGAGCTTCAACCTACGAAAACCATTGACGACCCTGA
GATCAAAGGGTGGTTAGCCTTGGGTATCAAAAAGAAGAAGGGTGGTGGAAAGAAGAAGAA
AGCCAAGAAGGC*********AGGAGAGGCCTCAACGGAGGCTGAGCCAATGGATGCAAG
TAGCAATGCTGAAGCATGAGATCTTTCTTTTGTTTTCTTTTAAAAGAATTTTTGGAACTT
CAGGTCTTTTGTAGGTTTGAGTTTCAGAGTCTCTCTTAGATAAAAAAAGAACAAAGAAAA
ACAATTTAAATGTGTCTTTTTGCACAAGTCCTTTTACTGAATCTTCATCATCATTGTTCT
GATTTGACTTGCGTCATGAACGATATCAAATTATCAATGGCTTTCAAATATATAGGTTTT
GGTATC

QA 1 786 1 786
DS 



CO CL1243Contig2 541 2 2 U
GAAAGCCATTGATAATTTGATATCGTTCATGACGCAAGTCAAATCAGAACAATGATGATG
AAGATTCAGTAAAAGGACTTGTGCAAAAAGACACATTTAATTTGTTTTTCTTTGTTCTTT
TTTTATCTAAGAGACTCTCGAAACTCAAACCTACAAAAAACCTGAAGTTCCAAAAATTCC
TTAAAAGAAAACAAAAGAAAGATCTCATGCTTCACCATTGCTACTTGCTTCCATTGGCTC
AGCATCCGTTGAGGCCTCTCCTTTCTCTCCAGCCTTCTTGGCTTTCTTCTTCTTTCCACC
ACCCTTCTTCTTTTTGATGCCCAAGGCTAACCAACCTTTGATCTCAGGGTCGTCAATGGT
CTTCGTAGGTTGAAGCTCCTGAAGTGTGTGTGACGTGATCCTATCCGATCCATTTGGCAT
CAGCAGAACTGTGAATTTAATATGGGCAGCAAAATCCCCAGGCTTCTCGTAAAGAACAGG
ATATGGTTGCAAATGACCATGGTCCACACACTCCACAAGTCCAAGTCGTGCCCTTTTCTC
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2ES41TF C 1
AF RR2AU95JQ U 67
BS 1 66 RR2ES41TF
BS 67 541 RR2AU95JQ

RD RR2ES41TF 407 0 0
GAAAGCCATTGATAATTTGATATCGTTCATGACGCAAGTCAAATCAGAACAATGATGATG
AAGATTCAGTAAAAGGACTTGTGCAAAAAGACACATTTAATTTGTTTTTCTTTGTTCTTT
TTTTATCTAAGAGACTCTCGAAACTCAAACCTACAAAAGACCTGAAGTTCCAAAAATTCC
TTAAAAGAAAACAAAAGAAAGATCTCATGCTTCAGCATTGCTACTTGCTTCCATTGGCTC
AGCATCCGTTGAGGCCTCTCCTTTCTCTCCAGCCTTCTTGGCTTTCTTCTTCTTTCCACC
ACCCTTCTTCTTTTTGATGCCCAAGGCTAACCAACCTTTGATCTCAGGGTCGTCAATGGT
CTTCGTAGGTTGAAGCTCCTGAAGTGTGTGTGACGTGATCCTATCC
C

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR2AU95JQ 475 0 0
CAGTAAAAGGACTTGTGCAAAAAGACACATTTAATTTGTTTTTCTTTGTTCTTTTTTTAT
CTAAGAGACTCTCGAAACTCAAACCTACAAAAAACCTGAAGTTCCAAAAATTCCTTAAAA
GAAAACAAAAGAAAGATCTCATGCTTCACCATTGCTACTTGCTTCCATTGGCTCAGCATC
CGTTGAGGCCTCTCCTTTCTCTCCAGCCTTCTTGGCTTTCTTCTTCTTTCCACCACCCTT
CTTCTTTTTGATGCCCAAGGCTAACCAACCTTTGATCTCAGGGTCGTCAATGGTCTTCGT
AGGTTGAAGCTCCTGAAGTGTGTGTGACGTGATCCTATCCGATCCATTTGGCATCAGCAG
AACTGTGAATTTAATATGGGCAGCAAAATCCCCAGGCTTCTCGTAAAGAACAGGATATGG
TTGCAAATGACCATGGTCCACACACTCCACAAGTCCAAGTCGTGCCCTTTTCTCT

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 6

CO CL1244Contig1 1282 6 36 U
GGACGAAGGAAGAAGAGAATCAATCTCACACGAAATTACACAACAATAATAATAGTTAGT
TATTTAAAAGATTTTATAAATAAAAACTCCAAAGCTTCTCTGTAACTACTACTCTCGTCT
TCAATGTTAATCATTTAGATCTTGAGAGAGAGAGAGAAACAAAAATCAAAAATCAAA**T
CATGGCGGCGAAATCGAAGAACAACCTTCGTTACCAACCGCGAAAATCAGCATCGCGATC
GACACAAGCGTTCACGGTGCTGATCGGTCTGCTGGTGGTGCTTATGATACTTCTAGGTCT
GGGGATCTTGTCGCTTCCCAATGCCAACAGAAACTCCTCCAAGCCCAACGATTTGACCAA
CATTGTACGCAAGAGCCAGGATGAGAGCTATGGAGGAGAGGAGGAAGGGAACGGAGAGCG
TTGGGTTGAAGTGATATCGTGGGAGCCTAGAGCTGTTGTTTACCACAATTTCTTGACCAA
TGAAGAATGTGAGCACCTCATCAGCCTCGCTAAACCCAACATGGTTAAGTCAACTGTGGT
CGATGAGAAAACCGGTGGCAGCAAAGATAGCAGAGTAAGGACTAGCTCTGGGACTTTTCT
TAAAAGAGGACATGACCAAGTTGTCGAGAGGATTGAGCAAAGGATTTCTGATTTCACCTT
CATTCCTGTTGAAAATGGAGAAGGTCTTCAGGTTCTTCACTACCAAGTTGGACAGAAGTA
TGAGCCTCACTATGATTATTTCTTACATGAGTTCAACACCAAGAACGGAGGACAACGAAT
AGCCACTGTTCTTATGTACCTCTCGGATGTTGATGATGGTGGCGAGACCGTGTTCCCAGC
AGCAAAAGGAAACATTAGTGCAGTCCCATGGTGGGACCAGCTCTCCAAATGTGGCAAAGA
AGGACTCTCTGTTCTACCAAAGAAGAGAGATGCTTTACTTTTCTGGAACATGAGACCTGA
TGCCTCTCTAGACCCTTCCAGTTTGCACGGTGGATGCCCAGTGGTGAAAGGAAACAAATG
GTCATCCACGAAATGGTTCCACGTCCATGAGTTCAAGGTTTAAGAAAAATAAGATAAGAG
GAGGTTTACACGACAGCACAGTTACAAACAGATGTATTGTTGTATTTCCCTTTTCAAGTG
AGAAATGATCTTTAGGCTGTGTTTTATCATGAGCGATATTTGAACTTTTTCTTTTAAACT
ATTTGAGATTTTTGTAACTTTACATGTTCTGTTGTTATAACATCAATAATTTAATACAAC
CACGCACTGGTTTAAGACTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2EW36TF U 1
AF RR2FV81TF U 109
AF RR2DL75TF U 109
AF RR2DL75JQ C 416
AF RR2FV81JQ C 674
AF RR2EW36JQ C 828
BS 1 155 RR2EW36TF
BS 156 157 RR2DL75TF
BS 158 177 RR2EW36TF
BS 178 179 RR2DL75TF
BS 180 200 RR2EW36TF
BS 201 201 RR2DL75TF
BS 202 294 RR2EW36TF
BS 295 295 RR2DL75TF
BS 296 309 RR2EW36TF
BS 310 310 RR2DL75TF
BS 311 312 RR2EW36TF
BS 313 313 RR2DL75TF
BS 314 315 RR2EW36TF
BS 316 316 RR2DL75TF
BS 317 336 RR2EW36TF
BS 337 337 RR2DL75TF
BS 338 369 RR2EW36TF
BS 370 370 RR2DL75TF
BS 371 483 RR2EW36TF
BS 484 484 RR2DL75TF
BS 485 490 RR2EW36TF
BS 491 491 RR2DL75TF
BS 492 587 RR2EW36TF
BS 588 836 RR2DL75TF
BS 837 837 RR2DL75JQ
BS 838 841 RR2DL75TF
BS 842 842 RR2FV81JQ
BS 843 848 RR2DL75TF
BS 849 849 RR2DL75JQ
BS 850 866 RR2DL75TF
BS 867 867 RR2DL75JQ
BS 868 877 RR2DL75TF
BS 878 1220 RR2DL75JQ
BS 1221 1233 RR2FV81JQ
BS 1234 1234 RR2EW36JQ
BS 1235 1282 RR2FV81JQ

RD RR2EW36TF 587 0 0
GGACGAAGGAAGAAGAGAATCAATCTCACACGAAATTACACAACAATAATAATAGTTAGT
TATTTAAAAGATTTTATAAATAAAAACTCCAAAGCTTCTCTGTAACTACTACTCTCGTCT
TCAATGTTAATCATTTAGATCTTGAGAGAGAGAGA**AACAAAAATCAAAAATCAAAAAT
CATGGCGGCGAAATCGAAGAGCAACCTTCGTTACCAACCGCGAAAATCAGCATCGCGATC
GACACAAGCGTTCACGGTGCTGATCGGTCTGCTGGTGGTGCTTATGATACTTCTGGGTCT
GGGGATCTTATCACTCCCCAATGCCAACAGAAACTCATCCAAGCCCAACGATTTGACCAA
CATTGTACGGAAGAGCCAGGATGAGAGCTATGGAGGAGAGGAGGAAGGGAACGGAGAGCG
TTGGGTTGAAGTGATATCGTGGGAGCCTAGAGCTGTTGTTTACCACAATTTCTTGACCAA
TGACGAATGTTAGCACCTCATCAGCCTCGCTAAACCCAACATGGTTAAGTCAACTGTGGT
CGATGAGAAAACCGGTGGCAGCAAAGATAGCAGAGTAAGGACTAGCT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2FV81TF 738 0 0
GG
ACTCTCGTCTTCAATGTTAATCATTTAGATCTTGAGAGAGAGAGAGAAACAAAAATCAAA
AATCAAA**TCATGGCGGCGAAATCGAAGAACAACCTTCGTTACCAACCGCGAAAATCAG
CATCGCGATCGACACAAGCGTTCACGGTGCTGATCGGTCTGCTGGTGGTGCTTATGATAC
TTCTAGGTCTGGGGATCTTGTCGCTTCCCAATGCCAACAGAAACTCCTCCAAGCCCAACG
ATTTGACCAACATTGTACGCAAGAGCCAGGATGAGAGCTATGGAGGAGAGGAGGAAGGGA
ACGGAGAGCGTTGGGTTGAAGTGATATCGTGGGAGCCTAGAGCTGTTGTTTACCACAATT
TCTTGACCAATGAAGAATGTGAGCACCTCATCAGCCTCGCTAAACCCAACATGGTTAATT
CAACTGTGGTCGATGAGAAAACCGGTGGCAGCAAAGATAGCAGAGTAAGGACTAGCTCTG
GGACTTTTCTTAAAAGAGGACATGACCAAGTTGTCGAGAGGATTGAGCAAAGGATTTCTG
ATTTCACCTTCATTCCTGTTGAAAATGGAGAAGGTCTTCAGGTTCTTCACTACCAAGTTG
GACAGAAGTATGAGCCTCACTATGATTATTTCTTAGATGAGTTCAACACCAAGAACGGAG
GACAACGAATAGCCACTGTTCTTATGTACCTCTCGGATGTTGATGATGGTGGCGAGACCG
TGTTCC
AGCAGCAAAA

QA 3 728 3 728
DS 

RD RR2DL75TF 782 0 0
GG
ACTCTCGTCTTCAATGTTAATCATTTAGATCTTGAGAGAGAGAGAGAAACAAAAATCAAA
AATCAAA**TCATGGCGGCGAAATCGAAGAACAACCTTCGTTACCAACCGCGAAAATCAG
CATCGCGATCGACACAAGCGTTCACGGTGCTGATCGGTCTGCTGGTGGTGCTTATGATAC
TTCTAGGTCTGGGGATCTTGTCGCTTCCCAATGCCAACAGAAACTCCTCCAAGCCCAACG
ATTTGACCAACATTGTACGCAAGAGCCAGGATGAGAGCTATGGAGGAGAGGAGGAAGGGA
ACGGAGAGCGTTGGGTTGAAGTGATATCGTGGGAGCCTAGAGCTGTTGTTTACCACAATT
TCTTGACCAATGAAGAATGTGAGCACCTCATCAGCCTCGCTAAACCCAACATGGTTAAGT
CAACTGTGGTCGATGAGAAAACCGGTGGCAGCAAAGATAGCAGAGTAAGGACTAGCTCTG
GGACTTTTCTTAAAAGAGGACATGACCAAGTTGTCGAGAGGATTGAGCAAAGGATTTCTG
ATTTCACCTTCATTCCTGTTGAAAATGGAGAAGGTCTTCAGGTTCTTCACTACCAAGTTG
GACAGAAGTATGAGCCTCACTATGATTATTTCTTACATGAGTTCAACACCAAGAACGGAG
GACAACGAATAGCCACTGTTCTTATGTACCTCTCGGATGTTGATGATGGTGGCGAGACCG
TGTTCC*AGCA*CAAAAG*AAACATTAGTGCAGTCC*ATGGTGGGAC
AGCTCTCAATGTG

QA 3 769 3 769
DS 

RD RR2DL75JQ 805 0 0
GAGAGCGTGGG
TGAAGTGATATCGTGG*AGC*TAGAGCTGTTGTT*ACCACAATTTCTTGACCAATGAAGA
ATGTGAGCAC*TCATCAGCCTCGCTAAACCCAACATGGTTAAGTCAACTGTGGTCGATGA
GAAAACCGGTGGCAGCAAAGATAGCAGAGTAAGGACTAGCTCTGGGACTTTTCTTAAAAG
AGGACATGACCAAGTTGTCGAGAGGATTGAGCAAAGGATTTCTGATTTCACCTTCATTCC
TGTTGAAAATGGAGAAGGTCTTCAGGTTCTTCACTACCAAGTTGGACAGAAGTATGAGCC
TCACTATGATTATTTCTTACATGAGTTCAACACCAAGAACGGAGGACAACGAATAGCCAC
TGTTCTTATGTACCTCTCGGATGTTGATGATGGTGGCGAGACCGTGTTCCCAGCAACAAA
AGGAAACATTAGTGCAGTCCCATGGTGGGACCAGCTCTCCAAATGTGGCAAAGAAGGACT
CTCTGTTCTACCAAAGAAGAGAGATGCTTTACTTTTCTGGAACATGAGACCTGATGCCTC
TCTAGACCCTTCCAGTTTGCACGGTGGATGCCCAGTGGTGAAAGGAAACAAATGGTCATC
CACGAAATGGTTCCACGTCCATGAGTTCAAGGTTTAAGAAAAATAAGATAAGAGGAGGTT
TACACGACAGCACAGTTACAAACAGATGTATTGTTGTATTTCCCTTTTCAAGTGAGAAAT
GATCTTTAGGCTGTGTTTTATCATGAGCGATATTTGAACTTTTTCTTTTAAACTATTTGA
GATTTTTGTAACTT

QA 12 805 12 805
DS 

RD RR2FV81JQ 609 0 0
AATGGAGAAGGTCTTCAGGTTCTTCACTACCAAGTTGGACAGAAGTATGAGCCTCACTAT
GATTATTTCTTAGATGAGTTCAACACCAAGAACGGAGGACAACGAATAGCCACTGTTCTT
ATGTACCTCTCGGATGTTGATGATGGTGGCGAGACCGTGTTCCCAGCAGCAAAAGGAAAC
ATTAGTGCAGTCCCATGGTGGGACCAGCTCTCCAAATGTGGCAAAGAAGGACTCTCTGTT
CTACCAAAGAAGAGAGATGCTTTACTTTTCTGGAACATGAGACCTGATGCCTCTCTAGAC
CCTTCCAGTTTGCACGGTGGATGCCCAGTGGTGAAAGGAAACAAATGGTCATCCACGAAA
TGGTTCCACGTCCATGAGTTCAAGGTTTAAGAAAAATAAGATAAGAGGAGGTTTACACGA
CAGCACAGTTACAAACAGATGTATTGTTGTATTTCCCTTTTCAAGTGAGAAATGATCTTT
AGGCTGTGTTTTATCATGAGCGATATTTGAACTTTTTCTTTTAAACTATTTGAGATTTTT
GTAACTTTACATGTTCTGTTTTTATAACATCAATAATTTAATACAACCACGCACTGGTTT
AAGACTGGC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2EW36JQ 455 0 0
CCGTGTTCCCAGCAGCAAAAGGAAACATTAGTGCAGTCCCATGGTGGGACCAGCTCTCCA
AATGTGGCAAAGAAGGACTCTCTGTTCTACCAAAGAAGAGAGATGCTTTACTTTTCTGGA
ACATGAGACCTGATGCCTCTCTAGACCCTTCCAGTTTGCACGGTGGATGCCCAGTGGTGA
AAGGAAACAAATGGTCATCCACGAAATGGTTCCACGTCCATGAGTTCAAGGTTTAAGAAA
AATACGATAAGAGGAGGTTTACACGACAGCACAGTTACAAACAGATGTATTGTTGTATTT
CCCTTTTCAAGTGAGAAATGATCTTTAGGCTGTGTTTTATCATGAGCGATATTTGAACTT
TTTCTTTTAAACTATTTGAGATTTTTGTAACTTTACATGTTCTGTTGTTATAACATCAAT
AATTTAATACAACCACGCACTGGTTTAAGACTGGC

QA 1 455 1 455
DS 



AS 2 5

CO CL1245Contig1 855 2 2 U
GTGATCCAAAGTCGAAACAACCATGAATCCCGAGTACGACTACCTCTTCAAGCTCCTGCT
CATAGGGGATTCTGGCGTGGGGAAGTCTTGTTTACTGTTGAGATACTCTGATGATTCGTA
TGTAGAAAGTTACATAAGTACTATTGGAGTCGATTTTAAAATTCGGACTGTGGAGCAAGA
CGGGAAGACGATTAAGCTCCAAATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCGGTTCAGGACAAT
TACTAGTAGTTATTACCGCGGCGCACATGGAATCATTATTGTCTACGACGTCACAGATCA
AGAAAGCTTTAACAATGTGAAGCAATGGTTGAGTGAAATTGATCGTTATGCAAGTGACAA
TGTGAACAAACTCCTGGTTGGAAACAAGTGTGATCTTACTGAAAACAGAGCCGTTCCATA
TGAAACGGCAAAGGCTTTTGCCGATGAAATTGGAATTCCTTTCATGGAGACTAGTGCAAA
AGATGCTACAAACGTGGAACAGGCTTTCATGGCGATGTCTGCATCCATCAAAGAGAGTAT
GGCAAGTCAACCAACTGGGAGCAATGCCAGACCGCCGACGGTGCAGATCAGAGGACAGCC
TGTTGTCCAAAAGAATGGCTGTTGCTAAACTTGATTGCCTAGCAATATCCTTTTCTTCGA
ATCCAAAATTGTTTTCTCTTCAGTTCACTTGTACTCTGTATGTAATATCTGGTCTGTAAT
TAAGCTCACTTGTCATTTGGGTGGTTGTTTTTCTCTTTGCGTATCAACATTTTCGTACCA
ACACATTTTTATGGCTGCCTTCATTGTATTTATATCGATACTGTCGTTTTGCTTAACAAT
GCTCATTAGAAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B226TF U 1
AF RR2B226JQ C 61
BS 1 835 RR2B226TF
BS 836 855 RR2B226JQ

RD RR2B226TF 848 0 0
GTGATCCAAAGTCGAAACAACCATGAATCCCGAGTACGACTACCTCTTCAAGCTCCTGCT
CATAGGGGATTCTGGCGTGGGGAAGTCTTGTTTACTGTTGAGATACTCTGATGATTCGTA
TGTAGAAAGTTACATAAGTACTATTGGAGTCGATTTTAAAATTCGGACTGTGGAGCAAGA
CGGGAAGACGATTAAGCTCCAAATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCGGTTCAGGACAAT
TACTAGTAGTTATTACCGCGGCGCACATGGAATCATTATTGTCTACGACGTCACAGATCA
AGAAAGCTTTAACAATGTGAAGCAATGGTTGAGTGAAATTGATCGTTATGCAAGTGACAA
TGTGAACAAACTCCTGGTTGGAAACAAGTGTGATCTTACTGAAAACAGAGCCGTTCCATA
TGAAACGGCAAAGGCTTTTGCCGATGAAATTGGAATTCCTTTCATGGAGACTAGTGCAAA
AGATGCTACAAACGTGGAACAGGCTTTCATGGCGATGTCTGCATCCATCAAAGAGAGTAT
GGCAAGTCAACCAACTGGGAGCAATGCCAGACCGCCGACGGTGCAGATCAGAGGACAGCC
TGTTGTCCAAAAGAATGGCTGTTGCTAAACTTGATTGCCTAGCAATATCCTTTTCTTCGA
ATCCAAAATTGTTTTCTCTTCAGTTCACTTGTACTCTGTATGTAATATCTGGTCTGTAAT
TAAGCTCACTTGTCATTTGGGTGGTTGTTTTTCTCTTTGCGTATCAACATTTTCGTACCA
ACACATTTTTATGGCTGCCTTCATTGTATTTATATCGATACTGTCGTTTTGCTTA
CAATGCTCATTAG

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR2B226JQ 795 0 0
CATA
GGGGATTCTGGCGTGGGGAAGTCTTGTTTACTGTTGAGATACTCTGATGATTCGTATGTA
GAAAGTTACATAAGTACTATTGGAGTCGATTTTAAAATTCGGACTGTGGAGCAAGACGGG
AAGACGATTAAGCTCCAAATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCGGTTCAGGACAATTACT
AGTAGTTATTACCGCGGCGCACATGGAATCATTATTGTCTACGACGTCACAGATCAAGAA
AGCTTTAACAATGTGAAGCAATGGTTGAGTGAAATTGATCGTTATGCAAGTGACAATGTG
AACAAACTCCTGGTTGGAAACAAGTGTGATCTTACTGAAAACAGAGCCGTTCCATATGAA
ACGGCAAAGGCTTTTGCCGATGAAATTGGAATTCCTTTCATGGAGACTAGTGCAAAAGAT
GCTACAAACGTGGAACAGGCTTTCATGGCGATGTCTGCATCCATCAAAGAGAGTATGGCA
AGTCAACCAACTGGGAGCAATGCCAGACCGCCGACGGTGCAGATCAGAGGACAGCCTGTT
GTCCAAAAGAATGGCTGTTGCTAAACTTGATTGCCTAGCAATATCCTTTTCTTCGAATCC
AAAATTGTTTTCTCTTCAGTTCACTTGTACTCTGTATGTAATATCTGGTCTGTAATTAAG
CTCACTTGTCATTTGG*TGGTTGTTTTTCTCTTTGCGTATCAACATTTTCGTACCAACAC
ATTTTTATGGCTGCCTTCATTGTATTTATATCGATACTGTCGTTTTGCTTAACAATGCTC
ATTAGAAAACC

QA 5 795 5 795
DS 



CO CL1245Contig2 847 3 4 U
GGGTTCGCATCCATCCAAAGTCGAAACAACCATGAATCCCGAGTACGACTACCTCTTCAA
GCTCCTGCTCATCGGGGATTCTGGCGTGGGGAAGTCTTGTCTACTGTTGAGATACTCTGA
TGACTCGTATGTAGAAAGTTACATAAGCACTATTGGAGTCGATTTTAAAATTCGGACTGT
GGAGCAAGACGGGAAGACGATTAAGCTTCAAATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCGGTT
CAGGACAATTACTAGCAGTTATTACCGCGGCGCACATGGAATCATTATTGTCTACGACGT
CACAGATCAAGAAAGCTTTAACAACGTGAAGCAATGGTTGAGTGAAATTGATCGTTATGC
TAGTGACAATGTGAACAAACTCCTGGTTGGAAACAAGTGTGATCTTACTGAAAACAGAGC
CGTTCCATATGAAACGGCAAAGGCTTTTGCCGATGAAATTGGAATTCCTTTCATGGAGAC
TAGTGCAAAAGATGCTACAAACGTGGAACAGGCTTTCATGGCGATGTCCGCATCGATCAA
AGCGAGTATGGCAAGCCAACCAGCTGGGAACAATGCCAGACCGCCGACGGTGCAGATCAG
AGGACAGCCTGTTGCCCAAAAGAATGGCTGTTGCTCAACTTGATTGCCTAGCAATATCCT
TTTCGTCGACTCCAAAATTGTTTTCTCTTCAGTTCACTTGTACTTTGTATTGTATGTAAT
TTCTGGTCTGTAATTAAGCTCAAGTGTCCTTTGGTGGTTGTTTTTCTCTTTGCGTATCAA
CATTTTCGTACCAACACATTTCTATGGCTGCCTTCAGTGTATTTATATCGATACTGTCGT
TTTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL60TF U 7
AF RR2FE91TF U 1
AF RR2FE91JQ C 297
BS 1 100 RR2FE91TF
BS 101 101 RR2GL60TF
BS 102 746 RR2FE91TF
BS 747 847 RR2FE91JQ

RD RR2GL60TF 385 0 0
GGATACATCG
AAAGTCGAAACCACCATGAATCCCGAGTACGACTACCTCTTTAAGCTCCTGCTCATCGGG
GATTCTGGCGTGGGGAAGTCTTGTCTACTGTTGAGATTCTCTGATGATTCGTATGTAGAA
AGTTACATAAGCACTATTGGAGTCGATTTTAAAATTCGGACTGTGGAGCAAGACGGGAAG
ACGATTAAGCTTCAAATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCGGTTCAGGACAATTACTAGC
AGTTATTACCGCGGCGCACGTGGAATCATTATTGTCTACGACGTCACAGATCAAGAAAGC
TTTAACAATGTGAAGCAATGGTTGAGTGAAATTGATCGTTATGCTAGTGACAATGTGAAC
AAACTCCTGGTTGGA

QA 11 385 11 385
DS 

RD RR2FE91TF 746 0 0
GGGTTCGCATCCATCCAAAGTCGAAACAACCATGAATCCCGAGTACGACTACCTCTTCAA
GCTCCTGCTCATCGGGGATTCTGGCGTGGGGAAGTCTTGTTTACTGTTGAGATACTCTGA
TGACTCGTATGTAGAAAGTTACATAAGCACTATTGGAGTCGATTTTAAAATTCGGACTGT
GGAGCAAGACGGGAAGACGATTAAGCTTCAAATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGCGGTT
CAGGACAATTACTAGCAGTTATTACCGCGGCGCACATGGAATCATTATTGTCTACGACGT
CACAGATCAAGAAAGCTTTAACAACGTGAAGCAATGGTTGAGTGAAATTGATCGTTATGC
TAGTGACAATGTGAACAAACTCCTGGTTGGAAACAAGTGTGATCTTACTGAAAACAGAGC
CGTTCCATATGAAACGGCAAAGGCTTTTGCCGATGAAATTGGAATTCCTTTCATGGAGAC
TAGTGCAAAAGATGCTACAAACGTGGAACAGGCTTTCATGGCGATGTCCGCATCGATCAA
AGCGAGTATGGCAAGCCAACCAGCTGGGAACAATGCCAGACCGCCGACGGTGCAGATCAG
AGGACAGCCTGTTGCCCAAAAGAATGGCTGTTGCTCAACTTGATTGCCTAGCAATATCCT
TTTCGTCGACTCCAAAATTGTTTTCTCTTCAGTTCACTTGTACTTTGTATTGTATGTAAT
TTCTGGTCTGTAATTAAGCTCAAGTG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2FE91JQ 551 0 0
ACGTCACAGATCAAGAAAGCTTTAACAACGTGAAGCAATGGTTGAGTGAAATTGATCGTT
ATGCTAGTGACAATGTGAACAAACTCCTGGTTGGAAACAAGTGTGATCTTACTGAAAACA
GAGCCGTTCCATATGAAACGGCAAAGGCTTTTGCCGATGAAATTGGAATTCCTTTCATGG
AGACTAGTGCAAAAGATGCTACAAACGTGGAACAGGCTTTCATGGCGATGTCCGCATCGA
TCAAAGCGAGTATGGCAAGCCAACCAGCTGGGAACAATGCCAGACCGCCGACGGTGCAGA
TCAGAGGACAGCCTGTTGCCCAAAAGAATGGCTGTTGCTCAACTTGATTGCCTAGCAATA
TCCTTTTCGTCGACTCCAAAATTGTTTTCTCTTCAGTTCACTTGTACTTTGTATTGTATG
TAATTTCTGGTCTGTAATTAAGCTCAAGTGTCCTTTGGTGGTTGTTTTTCTCTTTGCGTA
TCAACATTTTCGTACCAACACATTTCTATGGCTGCCTTCAGTGTATTTATATCGATACTG
TCGTTTTGCTT

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 5

CO CL1246Contig1 949 5 38 U
GGACCACCCAACAATGGCTGTTTCGCTCTCGTCTTCGTCGTCGTCGACGATCACTCCCAT
TACGCTGCAGCCGAAACTGAAAACGATTCACGGCTTAGGGACAGTAAACTTCGGTGGTTA
TTCGGTGAATTCTCACGGCGTCTCTCTCCGGCGAAGCGCCGTGGTCGTGTCGGCCATCAC
CGGCGCTTCAGGAACTGAAACTGCTGATTTGCTAGAGACGGTGAAAGTCTCGGACTTGAG
AGGAAACGAGATTCCCATCTCTGATTTATGGAAGAATAGGAAAGCCGTTGTTGCATTCGC
TCGTCATTTCGGATGCGTGCTGTGTCGGAAACGAGCAGCTTATCTTGCGGAAAAGAAGGA
TGTGATGGATGCCTCTGGTGTAACTCTTGTTCTCATTGGACCTGGAAGTATCGATCAGGC
CAAAACTTTTGTGGAACAGACGAAATTTGAAGGAGAGGTGTATGCGGATCCAAATCATGC
ATCATACGAGGCGCTTAAGTTTGCTTCAGGGGTTTCTGTCACATTTACTCCCAAGGCTGC
TATGAAGATAATAGAGTCTTACATGGAAGGATACCGCCAAGACTGGAAACTCTCGTTTAT
GAAAGATACTGTTGAAAGAGGCGGCTGGCAACAAGGTGGAATCCTAGTTGCTGGGCCTGG
GAAAAACAACATCTCTTACATCCGCAAGGACAAAGAAGCTGGAGATGATCCGCCTGTTGA
AGAGATCCTAAAAGCGTGTTGCGCTTAATGAATCCACATGCAAAGCTTAAAAGTCATCAT
TGCTCTTTATCGTAGAGTCGAGACTTTCCTCTCTTCTTGTAGTTCATAGGGGACATAAAA
CTTTGATATTGCTTCGTTCCGTAAAACGTGTTCATTTGGTATTTGTAAAGACTTAAAACC
CGATACATATAGTGTATATATATGATGATATATCTCTCCTTGTCGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FX86TF U 1
AF RR2CQ69TF U 43
AF RR2GO09TF U 190
AF RR2CQ69JQ C 197
AF RR2GC85JQ C 348
BS 1 100 RR2FX86TF
BS 101 101 RR2CQ69TF
BS 102 204 RR2FX86TF
BS 205 205 RR2CQ69TF
BS 206 230 RR2FX86TF
BS 231 231 RR2CQ69TF
BS 232 255 RR2FX86TF
BS 256 256 RR2CQ69TF
BS 257 274 RR2FX86TF
BS 275 275 RR2CQ69TF
BS 276 321 RR2FX86TF
BS 322 322 RR2CQ69TF
BS 323 345 RR2FX86TF
BS 346 346 RR2CQ69TF
BS 347 372 RR2FX86TF
BS 373 373 RR2CQ69TF
BS 374 381 RR2FX86TF
BS 382 382 RR2CQ69TF
BS 383 420 RR2FX86TF
BS 421 421 RR2CQ69TF
BS 422 447 RR2FX86TF
BS 448 448 RR2CQ69TF
BS 449 474 RR2FX86TF
BS 475 475 RR2CQ69TF
BS 476 477 RR2FX86TF
BS 478 478 RR2CQ69TF
BS 479 534 RR2FX86TF
BS 535 535 RR2CQ69TF
BS 536 578 RR2FX86TF
BS 579 665 RR2CQ69TF
BS 666 666 RR2GO09TF
BS 667 688 RR2CQ69TF
BS 689 689 RR2GO09TF
BS 690 696 RR2CQ69TF
BS 697 697 RR2GO09TF
BS 698 720 RR2CQ69TF
BS 721 927 RR2GO09TF
BS 928 949 RR2CQ69JQ

RD RR2FX86TF 578 0 0
GGACCACCCAACAATGGCTGTTTCGCTCTCGTCTTCGTCGTCGTCGACGATCACTCCCAT
TACGCTGCAGCCGAAACTGAAAACGATTCACGGCTTAGGGTCAGTAAACTTCGGTGGTTA
TTCGGTGAATTCTCACGGCGTCTCTCTCCGGCGAAGCGCCGTGGTCGTGTCGGCCATCAC
CGGCGCTTCAGGAACTGAAACTGCAGATTTGCTAGAGACGGTGAAAGTCTTGGACTTGAG
AGGAAACGAGATTCCGATCTCTGATTTATGGAAGGATAGGAAAGCCGTTGTTGCATTCGC
TCGTCATTTCGGATGCGTGCTCTGTCGGAAACGAGCAGCTTATCTCGCGGAAAAGAAGGA
TGTGATGGATGCGTCTGGTGTTACTCTTGTTCTCATTGGACCTGGAAGTATCGATCAGGC
GAAAACTTTTGTGGAACAGACGAAATTCGAAGGAGAGGTGTATGCGGATCCAAACCACGC
ATCATACGAGGCGCTTAAGTTTGCTTCAGGGGTTTCTGTCACATTTACTCCCAAAGCTGC
TATGAAGATAATAGAGTCTTACATGGAAGGATACCGCC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2CQ69TF 678 0 0
GGG
GACGATCACTCCCATTACGCTGCAGCCGAAACTGAAAACGATTCATGGCTTAGGGACAGT
AAACTTCGGTGGTTATTCGGTGAATTCTCACGGCGTCTCTCTCCGGCGAAGCGCCTTGGT
CGTGTCGGCCATCACCGGCGCTTCAGGAACTGAAACTGCTGATTTGCTAGAGACGGTGAA
AGTCTCGGACTTGAGAGGAAACGAGATTCCCATCTCTGATTTATGGAAGAATAGGAAAGC
CGTTGTTGCATTCGCTCGTCATTTCGGATGCGTGCTGTGTCGGAAACGAGCAGCTTATCT
TGCGGAAAAGAAGGATGTGATGGATGCCTCTGGTGTAACTCTTGTTCTCATTGGACCTGG
AAGTATCGATCAGGCCAAAACTTTTGTGGAACAGACGAAATTTGAAGGAGAGGTGTATGC
GGATCCAAATCATGCATCATACGAGGCGCTTAAGTTTGCTTCAGGGGTTTCTGTCACATT
TACTCCCAAGGCTGCTATGAAGATAATAGAGTCTTACGTGGAAGGATACCGCCAAGACTG
GAAACTCTCGTTTATGAAAGATACTGTTGAAAGAGGCGGCTGGCAACAAGGTGGAATCCT
AGTTGCTGGGCCTGGGAAAA*CAACATCTCTTACATCCGCAAG*ACAAAGA*GCTGGAGA
TGATCCGCCTGTTGA

QA 4 678 4 678
DS 

RD RR2GO09TF 738 0 0
GGGAAC
TGAAACTGCTGATTTGCTAGAGACGGTGAAAGTCTCGGACTTGAGAGGAAACGAGATTCC
CATCTCTGATTTATGGAAGAATAGGAAAGCCGTTGTTGCATTCGCTCGTCATTTCGGATG
CGTGCTGTGTCGGAAACGAGCAGCTTATCTTGCGGAAAAGAAGGATGTGATGGATGCCTC
TGGTGTAACTCTTGTTCTCATTGGACCTGGAAGTATCGATCAGGCCAAAACTTTTGTGGA
ACAGACGAAATTTGAAGGAGAGGTGTATGCGGATCCAAATCATGCATCATACGAGGCGCT
TAAGTTTGCTTCAGGGGTTTCTGTCACATTTACTCCCAAGGCTGCTATGAAGATAATAGA
GTCTTACATGGAAGGATACCGCCAAGACTGGAAACTCTCGTTTATGAAAGATACTGTTGA
AAGAGGCGGCTGGCAACAAGGTGGAATCCTAGTTGCTGGGCCTGGGAAAAACAACATCTC
TTACATCCGCAAGGACAAAGAAGCTGGAGATGATCCGCCTGTCGAAGAGATCCTAAAAGC
GTGTTGCGCTTAATGAATCCACATGCAAAGCTTAAAAGTCATCATTGCTCTTTATCGTAG
AGTCGAGACTTTCCTCTCTTCTTGTAGTTCATAGGGGACATAAAACTTTGATATTGCTTC
GTTCCGTAAAACGTGTTCATTTGGTATTTGTAAAGACTTAAAACCCGATACATATAGTGT
ATATATATGATG

QA 7 738 7 738
DS 

RD RR2CQ69JQ 753 0 0
GAAACTGCTGATTTGCTAGAGACGGTGAAAGTCTCGGACTTGAGAGGAAACGAGATTCCC
ATCTCTGATTTATGGAAGAATAGGAAAGCCGTTGTTGCATTCGCTCGTCATTTCGGATGC
GTGCTGTGTCGGAAACGAGCAGCTTATCTTGCGGAAAAGAAGGATGTGATGGATGCCTCT
GGTGTAACTCTTGTTCTCATTGGACCTGGAAGTATCGATCAGGCCAAAACTTTTGTGGAA
CAGACGAAATTTGAAGGAGAGGTGTATGCGGATCCAAATCATGCATCATACGAGGCGCTT
AAGTTTGCTTCAGGGGTTTCTGTCACATTTACTCCCAAGGCTGCTATGAAGATAATAGAG
TCTTACGTGGAAGGATACCGCCAAGACTGGAAACTCTCGTTTATGAAAGATACTGTTGAA
AGAGGCGGCTGGCAACAAGGTGGAATCCTAGTTGCTGGGCCTGGGAAAAACAACATCTCT
TACATCCGCAAGGACAAAGAAGCTGGAGATGATCCGCCTGTTGAAGAGATCCTAAAAGCG
TGTTGCGCTTAATGAATCCACATGCAAAGCTTAAAAGTCATCATTGCTCTTTATCGTAGA
GTCGAGACTTTCCTCTCTTCTTGTAGTTCATAGGGGACATAAAACTTTGATATTGCTTCG
TTCCGTAAAACGTGTTCATTTGGTATTTGTAAAGACTTAAAACCCGATACATATAGTGTA
TATATATGATGATATATCTCTCCTTGTCGTTGC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2GC85JQ 602 0 0
CGGAAAAGAAGGATGTGATGGATGCCTCTGGTGTAACTCTTGTTCTCATTGGACCTGGAA
GTATCGATCAGGCCAAAACTTTTGTGGAACAGACGAAATTTGAAGGAGAGGTGTATGCGG
ATCCAAATCATGCATCATACGAGGCGCTTAAGTTTGCTTCAGGGGTTTCTGTCACATTTA
CTCCCAAGGCTGCTATGAAGATAATAGAGTCTTACATGGAAGGATACCGCCAAGACTGGA
AACTCTCGTTTATGAAAGATACTGTTGAAAGAGGCGGCTGGCAACAAGGTGGAATCCTAG
TTGCTGGGCCTGGGAAAAACAACATCTCTTACATCCGCAAGGACAAAGAAGCTGGAGATG
ATCCGCCTGTTGAAGAGATCCTAAAAGCGTGTTGCGCTTAATGAATCCACATGCAAAGCT
TAAAAGTCATCATTGCTCTTTATCGTAGAGTCGAGACTTTCCTCTCTTCTTGTAGTTCAT
AGGGGACATAAAACTTTGATATTGCTTCGTTCCGTAAAACGTGTTCATTTGGTATTTGTA
AAGACTTAAAACCCGATACATATAGTGTATATATATGATGATATATCTCTCCTTGTCGTT
GC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 6

CO CL1247Contig1 735 6 9 U
TTTTTTTTCTTAAAACATTTATGCTTAAACTTGTATCCACGGGAACTATCAATTGCAGCA
ACGATCTTTTTTGGTAGAATTCGAATTCAGTTCTAACCATCAGTCTACATAACAACGCAA
AACTTCCACATAACAAAAACTATGCTGAAAACTACAGAGAGAGAGAGA**GCAAGCATTT
TATGAAGACAGCCATTTAAAGTCAGGCGACATGGGTGTTTTCAAGTTCCATTTGTGCAAC
AGTGGTGTTGATAGCATCTATAATCTCCATCTTCCCTGCACCAATAGCTTCGTCCATGGG
AGTCCGCTCGTACCGGTTCAAAAGACTAAGACTGGCTCCAGCCAAGATCATTTTCTTCAC
AACCTCGATATGTCCATTCAAACAAGCCCAATGCAGAGGAGCATTGTTCTCCTCGTTAAG
AGCGTTAATATCCACTCCTTGACTGATGAGATACTCCACTATACTCATATGTCCATTCGC
CGCAGCCATATGAAGCGCTGTTCGGCCTTGGGAATCGCGAGAGTTAAGAGAGACACCATC
AAAAGCCAAGCTTTTGAGATCATCTATATCATTGTATCTAGCTGCATCGAGCAAGTCGTC
GACTTTCTCAGCTTCCACGACCGTTTCTGCTCCCATCTTCTCCACCGGACAAAAATCTAA
TTTATCAATCCTGCGGGGTTTCCGTCGTTGGTTTTTTTAATTAGGGTTCTTGTCCGAAAC
TGTATAATACCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FX04TF C 1
AF RR2FX04JQ U 12
AF RR2C460TF C 27
AF RR2C460JQ U 95
AF RR2FS27JQ U 55
AF RR2FS27TF C 46
BS 1 11 RR2FX04TF
BS 12 40 RR2FX04JQ
BS 41 41 RR2FX04TF
BS 42 294 RR2FX04JQ
BS 295 295 RR2FS27JQ
BS 296 296 RR2FX04JQ
BS 297 297 RR2FS27JQ
BS 298 693 RR2FX04JQ
BS 694 735 RR2FS27JQ

RD RR2FX04TF 695 0 0
TTTTTTTTCTTAAAACATTTATGCTTAAACTTGTATCCACGGGAACTATCAATTGCAGCA
ACGATCTTTTTTGGTAGAATTCGAATTCAGTTCTAACCATCAGTCTACATAACAACGCAA
AACTTCCACATAACAAAAACTATGCTGAAAACTACAGAGAGAGAGAGA**GCAAGCATTT
TATGAAGACAGCCATTTAAAGTCAGGCGACATGGGTGTTTTCAAGTTCCATTTGTGCAAC
AGTGGTGTTGATAGCATCTATAATCTCCATCTTCCCTGCACCAATAGCTTCGTCAACGGG
AGTCCGCTCGTACCGGTTCAAAAGACTAAGACTGGCTCCAGCCAAGATCATTTTCTTCAC
AACCTCGATATGTCCATTCAAACAAGCCCAATGCAGAGGAGCATTGTTCTCCTCGTTAAG
AGCGTTAATATCCACTCCTTGACTGATGAGATACTCCACTATACTCATATGTCCATTCGC
CGCAGCCATATGAAGCGCTGTTCGGCCTTGGGAATCGCGAGAGTTAAGAGAGACACCATC
AAAAGCCAAGCTTTTGAGATCATCTATATCATTGTATCTAGCTGCATCGAGCAAGTCGTC
GACTTTCTCAGCTTCCACGACCGTTTCTGCTCCCATCTTCTCCACCGGACAAAAATCTAA
TTTATCAATCCTGCGGGGTTTCCGTCGTTGGTT
CC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2FX04JQ 684 0 0
AAAACATTTATGCTTAAACTTGTATCCACCGGAACTATCAATTGCAGCAACGATCTTTTT
TGGTAGAATTCGAATTCAGTTCTAACCATCAGTCTACATAACAACGCAAAACTTCCACAT
AACAAAAACTATGCTGAAAACTACAGAGAGAGAGAGA**GCAAGCATTTTATGAAGACAG
CCATTTAAAGTCAGGCGACATGGGTGTTTTCAAGTTCCATTTGTGCAACAGTGGTGTTGA
TAGCATCTATAATCTCCATCTTCCCTGCACCAATAGCTTCGTCAACGGGAGTCCGCTCGT
ACCGGTTCAAAAGACTAAGACTGGCTCCAGCCAAGATCATTTTCTTCACAACCTCGATAT
GTCCATTCAAACAAGCCCAATGCAGAGGAGCATTGTTCTCCTCGTTAAGAGCGTTAATAT
CCACTCCTTGACTGATGAGATACTCCACTATACTCATATGTCCATTCGCCGCAGCCATAT
GAAGCGCTGTTCGGCCTTGGGAATCGCGAGAGTTAAGAGAGACACCATCAAAAGCCAAGC
TTTTGAGATCATCTATATCATTGTATCTAGCTGCATCGAGCAAGTCGTCGACTTTCTCAG
CTTCCACGACCGTTTCTGCTCCCATCTTCTCCACCGGACAAAAATCTAATTTATCAATCC
TGCGGGGTTTCCGTCGTTGGTT
CC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2C460TF 691 0 0
AAACTTGTATCCACGGGAACTATCAATTACAGCAACGATCTTTTTTGGTAGAATTCGAAT
TCAGTTCTAACCATCAGTCTACATAACAACGCAAAACTTCCACATAACAAAAACTATGCT
GAAAACTACAGAGAGAGAGAGAGAGCAAGCATTTTATGAAGACAGCCATTTAAAGTCAGG
CGACATGGGTGTTTTCAAGTTCCATTTGTGCAACAGTGGTGTTGATAGCATCAATAATCT
CCATCTTCCCTGCACCAATAGCTTCGTCCATGGGCGTCCGCTCGTACCGGTTCAAAAGAC
TAAGACTGGCTCCAGCCAAGATCATTTTCTTCACAACCTCGATATGTCCATTCAAACAAG
CCCAATGCAGAGGAGAATTGTTCTCCTCGTTAAGAGCGTTAATATCCACTCCTTGACTGA
TGAGATACTCCACTATACTCATATGTCCATTCGCCGCAGCCATATGAAGCGCTGTTCGGC
CTTGGGAATCGCGAGAGTTAAGAGAGACACCATCAAAAGCCAAGCTTTTGAGATCATCTA
TATCATTGTATCTAGCTGCATCGAGCAAGTCGTCGACTTTCTCAGCTTCCACGACCGTTT
CTGCTCCCATCTTCTCCACCGGACAAAAATCTAATTTATCAATCCTGCGGGGTTTCCGTC
GTTGGGTTTTTTAATTAGGGTTCTTGTCC
CC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2C460JQ 623 0 0
AACCATCAGTCTACATAACAACGCAAAACTTCCACATAACAAAAACTATGCTGAAAACTA
CAGAGAGAGAGAGAGAGCAAGCATTTTATGAAGACAGCCATTTAAAGTCAGGCGACATGG
GTGTTTTCAAGTTCCATTTGTGCAACAGTGGTGTTGATAGCATCAATAATCTCCATCTTC
CCTGCACCAATAGCTTCGTCCATGGGCGTCCGCTCGTACCGGTTCAAAAGACTAAGACTG
GCTCCAGCCAAGATCATTTTCTTCACAACCTCGATATGTCCATTCAAACAAGCCCAATGC
AGAGGAGAATTGTTCTCCTCGTTAAGAGCGTTAATATCCACTCCTTGACTGATGAGATAC
TCCACTATACTCATATGTCCATTCGCCGCAGCCATATGAAGCGCTGTTCGGCCTTGGGAA
TCGCGAGAGTTAAGAGAGACACCATCAAAAGCCAAGCTTTTGAGATCATCTATATCATTG
TATCTAGCTGCATCGAGCAAGTCGTCGACTTTCTCAGCTTCCACGACCGTTTCTGCTCCC
ATCTTCTCCACCGGACAAAAATCTAATTTATCAATCCTGCGGGGTTTCCGTCGTTGGGTT
TTTTAATTAGGGTTCTTGTCC
CC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2FS27JQ 681 0 0
GCAGCAACGATCTTTTTTGGTAGAATTCGAATTCAGTTCTAACCATCAGTCTACATAACA
ACGCAAAACTTCCACATAACAAAAACTATGCTGAAAACTACAGAGAGAGAGAG****CAA
GCATTTTATGAAGACAGCCATTTAAAGTCAGGCGACATGGGTGTTTTCAAGTTCCATTTG
TGCAACAGTGGTGTTGATAGCATCTATAATCTCCATCTTCCCTGCACCAATAGCTTCGTC
CATGGGAGTCCGCTCGTACCGGTTCAAAAGACTAAGACTGGCTCCAGCCAAGATCATTTT
CTTCACAACCTCGATATGTCCATTCAAACAAGCCCAATGCAGAGGAGCATTGTTCTCCTC
GTTAAGAGCGTTAATATCCACTCCTTGACTGATGGGATACTCCACTATACTCATATGTCC
ATTCGCCGCAGCCATATGAAGCGCTGTTCGGCCTTGGGAATCGCGAGAGTTAAGAGAGAC
ACCATCAAAAGCCGAGCTTTTGAGATCATCTATATCATTGTATCTAGCTGCATCGAGCAA
GTCGTCGACTTTCTCAGCTTCCACGACCGTTTCTGCTCCCATCTTCTCCACCGGACAAAA
ATCTAATTTATCAATCCTGCGGGGTTTCCGTCGTTGGTTTTTTTAATTAGGGTTCTTGTC
CGAAACTGTATAATACCTTCC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2FS27TF 690 0 0
TTTTTTTTTG
CAGCAACGATCTTTTTTGGTAGAATTCGAATTCAGTTCTAACCATCAGTCTACATAACAA
CGCAAAACTTCCACATAACAAAAACTATGCTGAAAACTACAGAGAGAGAGAG****CAAG
CATTTTATGAAGACAGCCATTTAAAGTCAGGCGACATGGGTGTTTTCAAGTTCCATTTGT
GCAACAGTGGTGTTGATAGCATCTATAATCTCCATCTTCCCTGCACCAATAGCTTCGTCC
ATGGGAGTCCGCTCGTACCGGTTCAAAAGACTAAGACTGGCTCCAGCCAAGATCATTTTC
TTCACAACCTCGATATGTCCATTCAAACAAGCCCAATGCAGAGGAGCATTGTTCTCCTCG
TTAAGAGCGTTAATATCCACTCCTTGACTGATGGGATACTCCACTATACTCATATGTCCA
TTCGCCGCAGCCATATGAAGCGCTGTTCGGCCTTGGGAATCGCGAGAGTTAAGAGAGACA
CCATCAAAAGCCGAGCTTTTGAGATCATCTATATCATTGTATCTAGCTGCATCGAGCAAG
TCGTCGACTTTCTCAGCTTCCACGACCGTTTCTGCTCCCATCTTCTCCACCGGACAAAAA
TCTAATTTATCAATCCTGCGGGGTTTCCGTCGTTGGTTTTTTTAATTAGGGTTCTTGTCC
GAAACTGTATAATACCTTCC

QA 11 690 11 690
DS 



AS 1 6

CO CL1248Contig1 756 6 34 U
TTTTTTGGCAACAACATCGATTGGTACTTTTATTAATCAAATGCAAAAAAAACAAATACA
ACAGATATGGATGAACAATGAAGCAAAAGAAGTATAAACTTGCAGATAACACACACAAAC
CCATACATAATCCATATTATTGCATGTGAACGTTACATTCACCGTTTAAAACAATCCAAG
AGAAATACGTACAACAGAAATAATCACCAATTAAAAAACCACAAGAAGACAAGGTAATAA
GTTCAAGCATTCGTAAACCTTATGATTTTTTTTCTTAAGGTTGGCTTTAGATAAGTATTC
AACTTATGCGCATAGGAAATTCTTTGGAGCTTTTCTACTACAAACATTGAGGAGTACGCT
CAGATTGATGGGAAGGTTAAGGTTGATGCCAAGAATGCTAGCTTTGAGCATGGTACAGAG
ACAGACCGCAGCTTCAAGGTCAGCCAAGCCTGCAATGAGAGAGCAGCATGGCTTTACGGG
TGGGTTTCCCAATTTTAGGTTCACTAGATTGAGCACATTAGCGCAAACACCTAGCTGTAG
GGAATCTTTAGGACAAGAGCCTGTGCTTGTGGTGCTTGGGGTCGCTGGCGTGGGGATGCA
CTTGTAGCATGTAGCAGAAGTGTAAA*GAAGAAGAGGAGGTTGACAGCAAGGAAGAGTGA
AAGAGAGGTTCTTGGAGCCATTTGTTTGTAGCGGAAATGTTCTAACAAAGACTAAGAATT
AGTAGTGTGTTTATTTTTCTTGGAGATCGGGTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI92JQ U 7
AF RR2H044JQ U 7
AF RR2H044TF C 1
AF RR2EI92TF C 7
AF RR2DQ05JQ U 125
AF RR2DQ05TF C 170
BS 1 8 RR2H044TF
BS 9 18 RR2EI92JQ
BS 19 19 RR2H044JQ
BS 20 63 RR2EI92JQ
BS 64 64 RR2H044JQ
BS 65 88 RR2EI92JQ
BS 89 89 RR2H044JQ
BS 90 104 RR2EI92JQ
BS 105 105 RR2H044JQ
BS 106 179 RR2EI92JQ
BS 180 180 RR2H044JQ
BS 181 181 RR2EI92JQ
BS 182 182 RR2DQ05JQ
BS 183 196 RR2EI92JQ
BS 197 197 RR2H044JQ
BS 198 224 RR2EI92JQ
BS 225 225 RR2H044JQ
BS 226 227 RR2EI92JQ
BS 228 228 RR2H044JQ
BS 229 289 RR2EI92JQ
BS 290 290 RR2H044JQ
BS 291 309 RR2EI92JQ
BS 310 310 RR2H044JQ
BS 311 326 RR2EI92JQ
BS 327 327 RR2H044JQ
BS 328 357 RR2EI92JQ
BS 358 358 RR2H044JQ
BS 359 362 RR2EI92JQ
BS 363 363 RR2H044JQ
BS 364 392 RR2EI92JQ
BS 393 393 RR2H044JQ
BS 394 417 RR2EI92JQ
BS 418 549 RR2H044JQ
BS 550 756 RR2DQ05JQ

RD RR2EI92JQ 415 0 0
GA
CAACAACATCCATTGGTACTTTTATTAATCAAATGCAAAAAAAACAAATACAACAAATAT
GGATGAACAATGAAGCAAAAAAAGTATAAACTTGCAAATAACACACACAAACCCATACAT
AATCCATATTATTGCATGTGAACGTTACATTCACCGTTTAAAACAATCCAAAAAAAATAC
GTACAACAAAAATAATCACCAATTAAAAAACCACAAAAAAACAAGGTAATAAGTTCAAGC
ATTCGTAAACCTTATGATTTTTTTTCTTAAGGTTGGCTTTAAATAAGTATTCAACTTATG
CCCATAGGAAATTCTTTG*AGCTTTTCTACTACAAACATTGAGGAGTACCCTCAAATTGA
TGGGAAGGTTAAGGTTGATGCCAAAAATGCTAGCTTTGAGCATGGTACA
AAAA

QA 3 411 3 411
DS 

RD RR2H044JQ 543 0 0
GG
CAACAACATCGATTGGTACTTTTATTAATCAAATGCAAAAGAAACAAATACAACAGATAT
GGATGAACAATGAAGCAAAAGAAGTATAAACTTGCAGATAACACACACAAACCCATACAT
AATCCATATTATTGCATGTGAACGTTACATTCACCGTTTAAAACAATCCAAGAAAAATAC
GTACAACAGAAATAATCACCAATTAAAAAACCACAAGAAGACAAGGTAATAAGTTCAAGC
ATTCGTAAACCTTATGATTTTTTTTCTTAAGGTTGGCTTTAGATAAGTATTCAACTTATG
CGCATAGGAAATTCTTTGGAGCTTTTCTACTACAAACATTGAGGAGTACGCTCAGATTGA
TGGGAAGGTTAAGGTTGATGCCAAGAATGCTAGCTTTGAGCATGGTACAGAGACAGACCG
CAGCTTCAAGGTCAGCCAAGCCTGCAATGAGAGAGCAGCATGGCTTTACGGGTGGGTTTC
CCAATTTTAGGTTCACTAGATTGAGCACATTAGCGCAAACACCTAGCTGTAGGGAATCTT
T

QA 3 543 3 543
DS 

RD RR2H044TF 752 0 0
TTTTTTGGCAACAACATCGATTGGTACTTTTATTAATCAAATGCAAAGAAA*CAAATACA
ACAGATATGGATGAACAATGAAGCAAAAGAAGTATAAACTTGCAGATAACACACACAAAC
CCATACATAATCCATATTATTGCATGTGAACGTTACATTCACCGTTTAAAACAATCCAAG
AGAAATACGTACAACAGAAATAATCACCAATTAAAAAACCACAAGAAGACAAGGTAATAA
GTTCAAGCATTCGTAAACCTTATGATTTTTTTTCTTAAGGTTGGCTTTAGATAAGTATTC
AACTTATGCGCATAGGAAATTCTTTGGAGCTTTTCTACTACAAACATTGAGGAGTACGCT
CAGATTGATGGGAAGGTTAAGGTTGATGCCAAGAATGCTAGCTTTGAGCATGGTACAGAG
ACAGACCGCAGCTTCAAGGTCAGCCAAGCCTGCAATGAGAGAGCAGCATGGCTTTACGGG
TGGGTTTCCCAATTTTAGGTTCACTAGATTGAGCACATTAGCGCAAACACCTAGCTGTAG
GGAATCTTTAGGACAAGAGCCTGTGCTTGTGGTGCTTGGGGTCGCTGGCGTGGGGATGCA
CTTGTAGCATGTAGCAGAAGTGTAAGTGAAGAAGAGGAGGTTGACAGCAAGGAAGAGTGA
AAGAGAGGTTCTTGGAGCCATTTGTTTGTAGCGGAAATGTTCTAACAAAGACTAAGAATT
AGTAGTGTGTTTATTTTTCTTGGAGATCGG
CC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2EI92TF 750 0 0
GA
CAACAACATCGATTGGTACTTT*ATTAATCAAATGCAAAAGAAACAAATACAACAGATAT
GGATGAACAATGAAGCAAAAGAAGTATAAACTTGCAGATAACACACACAAACCCATACAT
AATCCATATTATTGCATGTGAACGTTACATTCACCGTTTAAAACAATCCAAGAGAAATAC
GTACAACAGAAATAATCACCAATTAAAAAACCACAAGAAGACAAGGTAATAAGTTCAAGC
ATTCGTAAACCTTATGATTTTTTTTCTTAAGGTTGGCTTTAGATAAGTATTCAACTTATG
CGCATAGGAAATTCTTTG*AGCTTTTCTACTACAAACATTGAGGAGTACGCTCAGATTGA
TGGGAAGGTTAAGGTTGATGCCAAGAATGCTAGCTTTGAGCATGGTACAGAGACAGACCG
CAGCTTCAAGGTCAGCCAAGCCTGCAATGAGAGAGCAGCATGGCTTTACGGGTGGGTTTC
CCAATTTTAGGTTCACTAGATTGAGCACATTAGCGCAAACACCTAGCTGTAGGGAATCTT
TAGGACAAGAGCCTGTGCTTGTGGTGCTTGGGGTCGCTGGCGTGGGGATGCACTTGTAGC
ATGTAGCAGAAGTGTAAGTGAAGAAGAGGAGGTTGACAGCAAGGAAGAGTGAAAGAGAGG
TTCTTGGAGCCATTTGTTTGTAGCGGAAATGTTCTAACAAAGACTAAGAATTAGTAGTGT
GTTTATTTTTCTTGGAGATCGG
GTCCCT

QA 3 744 3 744
DS 

RD RR2DQ05JQ 632 0 0
ACATAATCCATATTATTGCATGTGAACGTTACATTCACCGTTTAAAACAATCCAAGAGAA
ATACGTACAACAGAAATAATCACCAATTAAAAAACCACAAGAAGACAAGGTAATAAGTTC
AAGCATTCGTAAACCTTATGATTTTTTTTCTTAAGGTTGGCTTTAGATAAGTATTCAACT
TATGCGCATAGGAAATTCTTTGGAGCTTTTCTACTACAAACATTGAGGAGTACGCTCAGA
TTGATGGGAAGGTTAAGGTTGATACCAAGAATGCTAGCTTTGAGCATGGTACAGAGACAG
ACCGCAGCTTCAAGGTCAGCCAAGCCTGCAATGAGAGAGCAGCATGGCTTTACGGGTGGG
TTTCCCAATTTTAGGTTCACTAGATTGAGCACATTAGCGCAAACACCTAGCTGTAGGGAA
TCTTTAGGACAAGAGCCTGTGCTTGTGGTGCTTGGGGTCGCTGGCGTGGGGATGCACTTG
TAGCATGTAGCAGAAGTGTAAA*GAAGAAGAGGAGGTTGACAGCAAGGAAGAGTGAAAGA
GAGGTTCTTGGAGCCATTTGTTTGTAGCGGAAATGTTCTAACAAAGACTAAGAATTAGTA
GTGTGTTTATTTTTCTTGGAGATCGGGTGCCC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2DQ05TF 587 0 0
AACAATCCAAGAGAAATACGTACAACAGAAATAATCACCAATTAAAAAACCACAAGAAGA
CAAGGTAATAAGTTCAAGCATTCGTAAACCTTATGATTTTTTTTCTTAAGGTTGGCTTTA
GATAAGTATTCAACTTATGCGCATAGGAAATTCTTTGGAGCTTTTCTACTACAAACATTG
AGGAGTACGCTCAGATTGATGGGAAGGTTAAGGTTGATACCAAGAATGCTAGCTTTGAGC
ATGGTACAGAGACAGACCGCAGCTTCAAGGTCAGCCAAGCCTGCAATGAGAGAGCAGCAT
GGCTTTACGGGTGGGTTTCCCAATTTTAGGTTCACTAGATTGAGCACATTAGCGCAAACA
CCTAGCTGTAGGGAATCTTTAGGACAAGAGCCTGTGCTTGTGGTGCTTGGGGTCGCTGGC
GTGGGGATGCACTTGTAGCATGTAGCAGAAGTGTAAA*GAAGAAGAGGAGGTTGACAGCA
AGGAAGAGTGAAAGAGAGGTTCTTGGAGCCATTTGTTTGTAGCGGAAATGTTCTAACAAA
GACTAAGAATTAGTAGTGTGTTTATTTTTCTTGGAGATCGG
GTGCCC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL1249Contig1 816 2 6 U
GGAAATCTACACATGGCGAGTCTCTGTATCTCATCGTCCCGGATCGTCTCTCTCCACCAC
CACAAACCGTTTCTCTCTCTTAAACCCCAGCCTTGTTCGTCAGGTCTCTCCGTTGTAACT
CACCGTACGAGTTTTGCTGTTTGCTTCAACCCGCTAAGAGTATCGTTAGATCGTCAGCGA
ACCGCCGCTACTACTGTATCTACGAAGGCTGAGGAGAAGCAGAGAAAGAGAGGATCGAGT
GTGGTCTGTTATGCTGCTCCGATGTCTGTTCATAATCTACAATGGATCTCCTTAATCTCT
TGCGTTGCATTGATGCTTGCAAGAGGTACAGGTATCCACAAGTCCCTTGTTGTTCCGTTA
CTTGCTCTAACCGCACCATCCGGCATTATCTCCTGGGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGG
ACAGCATTTGTGGCGCTTCTTGCTCGACTTTTCTTCGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTG
CCATTCATTGCATTACTCTTGGCGATTGTGGCGCCATTTCAAGTTATGAGCATAAGAGGG
AAGCAAGAAGGGGCTCTCATTTCTTTGGCAATATCTTGTTTTCTGGCTTTTCAGCATTTC
TCACGAGCAGGCAGCTTGCAGAAAGCGTTCTATCAGGGCTCAGTTGTCGCCACTTTAGGC
ATCATTGGTGTCACACTTGTATCTGTCCTTTTCTTGATATAACCATACTCGTGTGACTCT
CATCTGTAAATCAATGTAACGCTGTCTACGAAGAGATGAGAAATAATGGGCTGTATTTAT
TTACTTAATGTTACTCAACTCAATGTGCTTATGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS18TF U 1
AF RR2CS18JQ C 96
BS 1 658 RR2CS18TF
BS 659 659 RR2CS18JQ
BS 660 701 RR2CS18TF
BS 702 702 RR2CS18JQ
BS 703 756 RR2CS18TF
BS 757 816 RR2CS18JQ

RD RR2CS18TF 758 0 0
GGAAATCTACACATGGCGAGTCTCTGTATCTCATCGTCCCGGATCGTCTCTCTCCACCAC
CACAAACCGTTTCTCTCTCTTAAACCCCAGCCTTGTTCGTCAGGTCTCTCCGTTGTAACT
CACCGTACGAGTTTTGCTGTTTGCTTCAACCCGCTAAGAGTATCGTTAGATCGTCAGCGA
ACCGCCGCTACTACTGTATCTACGAAGGCTGAGGAGAAGCAGAGAAAGAGAGGATCGAGT
GTGGTCTGTTATGCTGCTCCGATGTCTGTTCATAATCTACAATGGATCTCCTTAATCTCT
TGCGTTGCATTGATGCTTGCAAGAGGTACAGGTATCCACAAGTCCCTTGTTGTTCCGTTA
CTTGCTCTAACCGCACCATCCGGCATTATCTCCTGGGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGG
ACAGCATTTGTGGCGCTTCTTGCTCGACTTTTCTTCGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTG
CCATTCATTGCATTACTCTTGGCGATTGTGGCGCCATTTCAAGTTATGAGCATAAGAGGG
AAGCAAGAAGGGGCTCTCATTTCTTTGGCAATATCTTGTTTTCTGGCTTTTCAGCATTTC
TCACGAGCAGGCAGCTTGCAGAAAGCGTTCTATCAGGGCTCAGTTGTCGCCACTTTAG*C
ATCATTGGTGTCACACTTGTATCTGTCCTTTTCTTGATATA*CCATACTCGTGTGACTCT
CATCTGTAAATCAATGTAACGCTGTCTACGAAGAGA
TG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2CS18JQ 721 0 0
TTCGTCAGGTCTCTCCGTTGTAACTCACCGTACGAGTTTTGCTGTTTGCTTCAACCCGCT
AAGAGTATCGTTAGATCGTCAGCGAACCGCCGCTACTACTGTATCTACGAAGGCTGAGGA
GAAGCAGAGAAAGAGAGGATCGAGTGTGGTCTGTTATGCTGCTCCGATGTCTGTTCATAA
TCTACAATGGATCTCCTTAATCTCTTGCGTTGCATTGATGCTTGCAAGAGGTACAGGTAT
CCACAAGTCCCTTGTTGTTCCGTTACTTGCTCTAACCGCACCATCCGGCATTATCTCCTG
GGCAAAGGGTGAATATGGCATCTGGACAGCATTTGTGGCGCTTCTTGCTCGACTTTTCTT
CGCTTTTCCAGGTGAACTTGAGCTGCCATTCATTGCATTACTCTTGGCGATTGTGGCGCC
ATTTCAAGTTATGAGCATAAGAGGGAAGCAAGAAGGGGCTCTCATTTCTTTGGCAATATC
TTGTTTTCTGGCTTTTCAGCATTTCTCACGAGCAGGCAGCTTGCAGAAAGCGTTCTATCA
GGGCTCAGTTGTCGCCACTTTAGGCATCATTGGTGTCACACTTGTATCTGTCCTTTTCTT
GATATAACCATACTCGTGTGACTCTCATCTGTAAATCAATGTAACGCTGTCTACGAAGAG
ATGAGAAATAATGGGCTGTATTTATTTACTTAATGTTACTCAACTCAATGTGCTTATGTT
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 2 6

CO CL1250Contig1 852 3 7 U
GATTGATCTCCCTTTCGTATTCATTCGACCTGAGGCGTTCCTCTCAGTCATACAAAAAAG
AAAGGTTATTTCATGCAATGCATAACGGGTGGGCCTCCTATGGATTCCTCTAACTCAATG
AATGAAGGGAGGAGTATGAGGAAGGCCGGCTTTCTAGATGAAAATGAAAACAAAAAGGAA
AAGGGTCAAACCATATCTTACTTAATAATCTGACTGAATGACGAAGAGCTCTTTATGTGG
TCTCACTTTACCACCATCTGAAATGCGCGAAACTTCGATTGGTGGAAGCCAGTCCATGAA
GATTCTCCCTTTTCCTACGTGCACTTCCCCTCTTTTGGTAAGCATCCAGTATCTCAGCAA
ATAAACATTTCTCTAAGCTTATCCTGTAGCTTATACGTCGTTTGAAAGCTGCTTCAAGGA
TCCAACGAATAGCTAAGGTTTGTTGACGATCCCTGGCTACAATCCCAGGGACATCATAAA
TAGTACCCGCTACTCCTACTTTTGCTACTTCGCATATGGGCTTTATATTCTCTACGGCGT
CAACCATAAGTTTGATTACATCGCGTTCAGTTCGAGCTGGGCGATGAAAAGTTTGATAAA
CAATAGCACGAACTCTCGTTCTTTTACCTTCTTTCATGCGAAAATTGACCAACTTCTTGA
TCAATAGTTTTTGCTCACCATCCAAGCCCCCTATATAGCTGAAAATTTCC*GAGCAATTG
GAAGCCGCTTTCGATGACGAGGCCGAACAATTTATATTACGCAATCGTTACTGTCCATCT
TTATCAGCCAACTCCCCAGTTTCCATCTTTCCTTTTAGAGTTTAACACTCTTCTTAGCTT
CTTGAACTTTCT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H865JQ U 1
AF RR2B772JQ U 5
AF RR2AS68JQ U 1
BS 1 89 RR2AS68JQ
BS 90 90 RR2H865JQ
BS 91 698 RR2AS68JQ
BS 699 699 RR2H865JQ
BS 700 710 RR2AS68JQ
BS 711 711 RR2H865JQ
BS 712 852 RR2AS68JQ

RD RR2H865JQ 742 0 0
GATT
GATCTCCCTTTCGTATTCATTCGACCTGAGGCGTTCCTCTCAGTCATACAAAAAAGAAAG
GTTATTTCATGCAATGCATAACGGGTGGGCCTCCTATGGATTCCTCTAACTCAATGAATG
AAGGGAGGAGTATGAGGAAGGCCGGCTTTCTAGATGAAAATGAAAACAAAAAGGAAAAGG
GTCAAACCATATCTTACTTAATAATCTGACTGAATGACGAAGAGCTCTTTATGTGGTCTC
ACTTTACCACCATCTGAAATGCGCGAAACTTCGATTGGTGGAAGCCAGTCCATGAAGATT
CTCCCTTTTCCTACGTGCACTTCCCCTCTTTTGGTAAGCATCCAGTATCTCAGCAAATAA
ACATTTCTCTAAGCTTATCCTGTAGCTTATACGTCGTTTGAAAGCTGCTTCAAGGATCCA
ACGAATAGCTAAGGTTTGTTGACGATCCCTGGCTACAATCCCAGGGACATCATAAATAGT
ACCCGCTACTCCTACTTTTGCTACTTCGCATATGGGCTTTATATTCTCTACGGCGTCAAC
CATAAGTTTGATTACATCGCGTTCAGTTCGAGCTGGGCGATGAAAAGTTTGATAAACAAT
AGCACGAACTCTCGTTCTTTTACCTTCTTTCATGCGAAAATTGACCAACTTCTTGATCAA
TAGTTTTTGCTCACCATCCAAGCCCCCTATATAGCTGAAAATTTCC*GAGCAATTGGAAG
CCGCTTTCGATGACGAGG

QA 5 742 5 742
DS 

RD RR2B772JQ 782 0 0
GATCTCCCTTTCGTATTCATTCGACCTGAGGCGTTCCTCTCAGTCATACAAAAAAGAAAG
GTTATTTCATGCAATGCATAACGGGTGGGCATCCTATGGATTCCTCTAACTCAATGAATG
AAGGGAGGAGTATGAGGAAGGCCGGCTTTCTAGATGAAAATGAAAACAAAAAGGAAAAGG
GTCAAACCATATCTTACTTAATAATCTGACTGAATGACGAAGAGCTCTTTATGTGGTCTG
ACTTTACCACCATCTGAAATGCGCGAAACTTCGATTGGTGGAAGCCAGTCCATGAAGATT
CTCCCTTTTCCTACGTGCACTTCCCTTCTTTTGGTAAGCATCCAGTATCTCAGCAAATAA
ACATTTCTCTAAGCTTATCCTGTAGCTTATACGTCGTTTGAAAGCTGCTTCAAGGATCCA
ACGAATAGCTAAGGTTTGTTGACGATCCCTGGCTACAATCCCAGGGACATCATAAATAGT
ACCCGCTACTCCTACTTTTGCTACTTCGCATATGGGCTTTATATTCTCTACGGCGTCAAC
CATAAGTTTGATTACATCGCGTTCAGTTCGAGCTGGGCGATGAAAAGTTTGATAAACAAT
AGCACGAACTCTCGTTCTTTTACCTTCTTTCATGCGAAAATTGACCAACTTCTTGATCAA
TAGTTTTTGCTCACCATCCAAGCCCCCTATATAGCTGAAAATTTCC*GAGCAATTGGAAG
CCGCTTTCGATGACGAGGCCGAACAATTTATATTACGCAATCGTTACTGTCCATCTTTAT
CA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2AS68JQ 852 0 0
GATTGATCTCCCTTTCGTATTCATTCGACCTGAGGCGTTCCTCTCAGTCATACAAAAAAG
AAAGGTTATTTCATGCAATGCATAACGGGGGGGCCTCCTATGGATTCCTCTAACTCAATG
AATGAAGGGAGGAGTATGAGGAAGGCCGGCTTTCTAGATGAAAATGAAAACAAAAAGGAA
AAGGGTCAAACCATATCTTACTTAATAATCTGACTGAATGACGAAGAGCTCTTTATGTGG
TCTCACTTTACCACCATCTGAAATGCGCGAAACTTCGATTGGTGGAAGCCAGTCCATGAA
GATTCTCCCTTTTCCTACGTGCACTTCCCCTCTTTTGGTAAGCATCCAGTATCTCAGCAA
ATAAACATTTCTCTAAGCTTATCCTGTAGCTTATACGTCGTTTGAAAGCTGCTTCAAGGA
TCCAACGAATAGCTAAGGTTTGTTGACGATCCCTGGCTACAATCCCAGGGACATCATAAA
TAGTACCCGCTACTCCTACTTTTGCTACTTCGCATATGGGCTTTATATTCTCTACGGCGT
CAACCATAAGTTTGATTACATCGCGTTCAGTTCGAGCTGGGCGATGAAAAGTTTGATAAA
CAATAGCACGAACTCTCGTTCTTTTACCTTCTTTCATGCGAAAATTGACCAACTTCTTGA
TCAATAGTTTTTGCTCACCATCCAAGCCCCCTATATAGTTGAAAATTTCCCGAGCAATTG
GAAGCCGCTTTCGATGACGAGGCCGAACAATTTATATTACGCAATCGTTACTGTCCATCT
TTATCAGCCAACTCCCCAGTTTCCATCTTTCCTTTTAGAGTTTAACACTCTTCTTAGCTT
CTTGAACTTTCT

QA 1 852 1 852
DS 



CO CL1250Contig2 790 3 11 U
GCACCCCTTACTCTTCACCCGAAATAAGGCAGTCGAAGTCGGCACAAGAAGTAGGCGGAG
TAGAGGTCCAACGGAATTCGACTGAAAGGAGAGGCGTTCCTCGGTTGCGGGTTCAGGTGC
GGCTAAATCAATGGGGTTGGCGGAGTTGGTAGGCGTTCCTCGGTTGGCACAGTTCTGTAA
ATAAGAGATGTCTCATCCGGTTGAGCTGTCGCAATCAGTCTTTCTCTTCCTGGTAGCAGA
ACGAATAGGAGATCCAACATGACTGTATTAAGCCTGTCGCAATCAGGGTTAAGCTAGCTC
ATTGCCAGAAAGCAAACAGGAGCTCTTATTTAGATCAGAGGACGCTCATCCCAGGTGCTT
TAGCAACTCGACTGAAAAGGAGAGGTATTTCTTACTCGAGCACTTGTCTAGAGAGGAACG
AGAGTATTTCTAAAAGGAGAGGGCGTAAGCATGATTCCGGGGCGGAGCCATATGACGCGA
GAGTGTAGACTCTGGAACTCAGGGAGCAAGACCCTAAAGAAAGTTCAAGAAGCTATGAAG
AGTGGTAAACTCTAAAAGGAAAGATGGAAACTGGGG*AGTTGGCTGATAAAGATGGACAG
TAACGATTGCGTAATATAAATTGTTCGGCCTCGTCATCGAAAGCGGCTTCCAATTGCTCG
GAAATTTTCAGCTATATAGGGGGCTTGGATGGTGAGCAAAAACTATTGATCAAGAAGTTG
GTCAATTTTCGCATGAAAGAAGGTAAAAGAACGAGAGTTCGTGCTATTGTTATCAAACTT
TTCTCGCCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS68TF U 1
AF RR2B772TF U 69
AF RR2H865TF U 460
BS 1 535 RR2AS68TF
BS 536 536 RR2B772TF
BS 537 544 RR2AS68TF
BS 545 545 RR2B772TF
BS 546 576 RR2AS68TF
BS 577 577 RR2B772TF
BS 578 670 RR2AS68TF
BS 671 671 RR2B772TF
BS 672 682 RR2AS68TF
BS 683 771 RR2B772TF
BS 772 790 RR2H865TF

RD RR2AS68TF 682 0 0
GCACCCCTTACTCTTCACCCGAAATAAGGCAGTCGAAGTCGGCACAAGAAGTAGGCGGAG
TAGAGGTCCAACGGAATTCGACTGAAAGGAGAGGCGTTCCTCGGTTGCGGGTTCAGGTGC
GGCTAAATCAATGGGGTTGGCGGAGTTGGTAGGCGTTCCTCGGTTGGCACAGTTCTGTAA
ATAAGAGATGTCTCATCCGGTTGAGCTGTCGCAATCAGTCTTTCTCTTCCTGGTAGCAGA
ACGAATAGGAGATCCAACATGACTGTATTAAGCCTGTCGCAATCAGGGTTAAGCTAGCTC
ATTGCCAGAAAGCAAACAGGAGCTCTTATTTAGATCAGAGGACGCTCATCCCAGGTGCTT
TAGCAACTCGACTGAAAAGGAGAGGTATTTCTTACTCGAGCACTTGTCTAGAGAGGAACG
AGAGTATTTCTAAAAGGAGAGGGCGTAAGCATGATTCCGGGGCGGAGCCATATGACGCGA
GAGTGTAGACTCTGGAACTCAGGGAGCAAGACCCTAAAGAAAGTTCAAGAAGCTAAGAAG
AGTGTTAAACTCTAAAAGGAAAGATGGAAACTGGGGGAGTTGGCTGATAAAGATGGACAG
TAACGATTGCGTAATATAAATTGTTCGGCCTCGTCATCGAAAGCGGCTTCCAATTGCTCG
GAAATTTTCAACTATATAGGGG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2B772TF 704 0 0
G
AACGGAATTCGACTGAAAGGAGAGGCGTTCCTCGGTTGCGGGTTCAGGTGCGGCTAAATC
AATGGGGTTGGCGGAGTTGGTAGGCGTTCCTCGGTTGGCACAGTTCTGTAAATAAGAGAT
GTCTCATCCGGTTGAGCTGTCGCAATCAGTCTTTCTCTTCCTGGTAGCAGAACGAATAGG
AGATCCAACATGACTGTATTAAGCCTGTCGCAATCAGGGTTAAGCTAGCTCATTGCCAGA
AAGCAAACAGGAGCTCTTATTTAGATCAGAGGACGCTCATCCCAGGTGCTTTAGCAACTC
GACTGAAAAGGAGAGGTATTTCTTACTCGAGCACTTGTCTAGAGAGGAACGAGAGTATTT
CTAAAAGGAGAGGGCGTAAGCATGATTCCGGGGCGGAGCCATATGACGCGAAAGTGTAGA
CTCTGGAACTCAGGGAGCAAGACCCTAAAGAAAGTTCAAGAAGCTATGAAGAGTGGTAAA
CTCTAAAAGGAAAGATGGAAACTGGGG*AGTTGGCTGATAAAGATGGACAGTAACGATTG
CGTAATATAAATTGTTCGGCCTCGTCATCGAAAGCGGCTTCCAATTGCTCGGAAATTTTC
AGCTATATAGGGGGCTTGGATGGTGAGCAAAAACTATTGATCAAGAAGTTGGTCAATTTT
CGCATGAAAGAAGGTAAAAGAACGAGAGTTCGTGCTATTGTTT

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR2H865TF 331 0 0
GGGCGGAGCCATATGACGCGAGAGTGTAGACTCTGGAACTCAGGGAGCAAGACCCTAAAG
AAAGTTCAAGAAGCTATGAAGAGTGGTAAACTCTAAAAGGAAGGATGGAAACTGGGG*AG
TTGGCTGATAAAGATGGACAGTAACGATTGCGTAATATAAATTGTTCGGCCTCGTCATCG
AAAGCGGCTTCCAATTGCTCGGAAATTTTCAGCTATATAGGGGGCTTGGATGGTGAGCAA
AAACTATTGATCAAGAAGT*GGTCAATTTTCGCATGAAAGAAGG*AAAAGAACGAGAGT*
CGTGCTATTGTTATCAAACTTTTCTCGCCCA

QA 1 331 1 331
DS 



AS 1 6

CO CL1251Contig1 1274 6 5 U
CAACCATAAACAGTGATGGAATTTGTAATAGAGTCAATTTACACCAATAGAGTGATTTAC
AACGACTTTAGACATCTATAGCTTTATTGCGTTAGCATAACGAAAAGCATACAGTGTTAC
ATTTTATTTCAAACGGTGGATGTATCTCTTAATTAGTTTTTTGGCTACAATTTTATTGAA
TCGTTGGGTAGGATGGAAACTATCCCAAAATAAGTAAGCAGATATATTGGAGCACACATC
TGTTGTGAGTCGATTGCAGAGTATACCTGCTTCAAAAAGTCCAGTTCCACAACATCCTTT
CTTTATTTCCTCAAACCCATAATCTTGTGAGTTTTCTGTGATGTCACTGAAAGGAGAGTA
GATGTCGATGTAGAAGATATTTGAATTTGGAAGGGCCTGAGTCAATCGATCCAACGTGAT
GAAGAGTTTGGCATTGAAAAGCTGAGATGCATAGTTTAGTTCTTGAGCGCAGTCTCTATG
AGGACCTCCCTTTATGCTTCTTTGCGCTGGTATACATCCAAGTGGTGGTGTTCCTATCAC
TGCTATTTGTCTTGCTCCATATCCATGTAATTGCATAACGAAACTAGCGGCAGAATTAGC
CATCATTGATGTAAAGTTGTGAATGTCGTATATGAGCGATTGAGCCCCTTGACCATAGTA
TGTAATAAGCAGATCGTTGTTGCCTGCGACTACAATGGCTAAGCCCTTGGCTAATAAGTG
ATCAGTCTTATCTTTCCCTAGTGACCACTTTACCCTCGCTATGTATTGTTCGAAATATGT
CAACTGCTCCAACAGTGACCTCACCCTTGATATTTTGGATGTTAAATAGTGATAGCCACT
ACCACCCGAAGCAAATGATACGCCAGTGAGAAGTTCTTCTAGTTGTACGTTGGGTTCTAA
ATATGCCGGTACAATCGGCTTTAGTCCTAAATATTCGGATATATAATCAGTAGCGACCTT
TCCATCGCTGAATCTCCCGGTGGCAACTCCCGTAGGAAAATTCATGCCATAGGGACGAAA
ATTACATTTCATTTCTGTTGTTAGATTATTATTATTTCCCGTGACGATGATCGAATCACC
AAGGTAAAACACTGCCGGTGTAGCTGGGTTATGTGGTGATGGATCACGTGGTGGGCCTGG
ACCAGATTCTTGTGTTAGCCATGGCAACAGTCGTCGGTGGTGGATCACTTGGGAATGGGT
CGTCGTCACTAAAAAGATACAAAATGATGATAAGAGAAAGAAAACAAATCGAAGCAGCTT
ATATTGTTTCATAC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E925JQ U 185
AF RR2GG61JQB U 2
AF RR2GG61TF C 2
AF RR2FJ52JQ U 1
AF RR2FJ52TF C 313
AF RR2E925TF C 652
BS 1 199 RR2FJ52JQ
BS 200 200 RR2GG61JQB
BS 201 772 RR2FJ52JQ
BS 773 991 RR2FJ52TF
BS 992 1274 RR2E925TF

RD RR2E925JQ 187 0 0
TGGGTAGGATGGAAACTATCCCAAAATAAGTAAGCAGATATATTGGAGCACACATCTGTT
GTGAGTCGATTGCAGAGTATACCTGCTTCAAAAAGTCCAGTTCCACAACATCCTTTCTTT
ATTTCCTCAAACCCATAATCTTGTGAGTTTTCTGTGATGTCACTGAAAGGAGAGTAGATG
TCAATGT

QA 1 187 1 187
DS 

RD RR2GG61JQB 647 0 0
GG
CCATAAACAGTGATGGAATTTGTAATAGAGTCAATTTACACCAATAGAGTGATTTACAAC
GACTTTAGACATCTATAGCTTTATTGCGTTAGCATAACGAAAAGCATACAGTGTTACATT
TTATTTCAAACGGTGGATGTATCTCTTAATTAGTTTTTTGGCTACAATTTTATTGAATCG
TTGGGTAGGATGGAAACTATCCCAAAATAAGTAAGCAGATATATTGGAGCACACATCTGT
TGTGAGTCGATTGCAGAGTATACCTGCTTCAAAAAGTCCAGTTCCACAACATCCTTTCTT
TATTTCCTCAAACCCATAATCTTGTGAGTTTTCTGTGATGTCACTGAAAGGAGAGTAGAT
GTCGATGTAGAAGATATTTGAATTTGGAAGGGCCTGAGTCAATCGATCCAACGTGATGAA
GAGTTTGGCATTGAAAAGCTGAAATGCATAGTTTAGTTCTTGAGCGCAGTCTCTATGAGG
ACCTCCCTTTATGCTTCTTTGCGCTGGTATACATCCAAGTGGTGGTGTTCCTATCACTGC
TATTTGTCTTGCTCCATATCCATGTAATTGCATAACGAAACTAGCGGCAGAATTAGCCAT
CATTGATGTAAAGTTGTGAATGTCGTATATGAGCGATTGAGCCCC

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR2GG61TF 647 0 0
GG
CCATAAACAGTGATGGAATTTGTAATAGAGTCAATTTACACCAATAGAGTGATTTACAAC
GACTTTAGACATCTATAGCTTTATTGCGTTAGCATAACGAAAAGCATACAGTGTTACATT
TTATTTCAAACGGTGGATGTATCTCTTAATTAGTTTTTTGGCTACAATTTTATTGAATCG
TTGGGTAGGATGGAAACTATCCCAAAATAAGTAAGCAGATATATTGGAGCACACATCTGT
TGTGAGTCGATTGCAGAGTATACCTGCTTCAAAAAGTCCAGTTCCACAACATCCTTTCTT
TATTTCCTCAAACCCATAATCTTGTGAGTTTTCTGTGATGTCACTGAAAGGAGAGTAGAT
GTCGATGTAGAAGATATTTGAATTTGGAAGGGCCTGAGTCAATCGATCCAACGTGATGAA
GAGTTTGGCATTGAAAAGCTGAGATGCATAGTTTAGTTCTTGAGCGCAGTCTCTATGAGG
ACCTCCCTTTATGCTTCTTTGCGCTGGTATACATCCAAGTGGTGGTGTTCCTATCACTGC
TATTTGTCTTGCTCCATATCCATGTAATTGCATAACGAAACTAGCGGCAGAATTAGCCAT
CATTGATGTAAAGTTGTGAATGTCGTATATGAGCGATTGAGCCCC

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR2FJ52JQ 772 0 0
CAACCATAAACAGTGATGGAATTTGTAATAGAGTCAATTTACACCAATAGAGTGATTTAC
AACGACTTTAGACATCTATAGCTTTATTGCGTTAGCATAACGAAAAGCATACAGTGTTAC
ATTTTATTTCAAACGGTGGATGTATCTCTTAATTAGTTTTTTGGCTACAATTTTATTGAA
TCGTTGGGTAGGATGGAAAATATCCCAAAATAAGTAAGCAGATATATTGGAGCACACATC
TGTTGTGAGTCGATTGCAGAGTATACCTGCTTCAAAAAGTCCAGTTCCACAACATCCTTT
CTTTATTTCCTCAAACCCATAATCTTGTGAGTTTTCTGTGATGTCACTGAAAGGAGAGTA
GATGTCGATGTAGAAGATATTTGAATTTGGAAGGGCCTGAGTCAATCGATCCAACGTGAT
GAAGAGTTTGGCATTGAAAAGCTGAGATGCATAGTTTAGTTCTTGAGCGCAGTCTCTATG
AGGACCTCCCTTTATGCTTCTTTGCGCTGGTATACATCCAAGTGGTGGTGTTCCTATCAC
TGCTATTTGTCTTGCTCCATATCCATGTAATTGCATAACGAAACTAGCGGCAGAATTAGC
CATCATTGATGTAAAGTTGTGAATGTCGTATATGAGCGATTGAGCCCCTTGACCATAGTA
TGTAATAAGCAGATCGTTGTTGCCTGCGACTACAATGGCTAAGCCCTTGGCTAATAAGTG
ATCAGTCTTATCTTTCCCTAGTGACCACTTTACCCTCGCTATGTATTGTTCG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2FJ52TF 680 0 0
AAACCCATAATCTTGTGAGTTTTCTGTGATGTCACTGAAAGGAGAGTAGATGTCGATGTA
GAAGATATTTGAATTTGGAAGGGCCTGAGTCAATCGATCCAACGTGATGAAGAGTTTGGC
ATTGAAAAGCTGAGATGCATAGTTTAGTTCTTGAGCGCAGTCTCTATGAGGACCTCCCTT
TATGCTTCTTTGCGCTGGTATACATCCAAGTGGTGGTGTTCCTATCACTGCTATTTGTCT
TGCTCCATATCCATGTAATTGCATAACGAAACTAGCGGCAGAATTAGCCATCATTGATGT
AAAGTTGTGAATGTCGTATATGAGCGATTGAGCCCCTTGACCATAGTATGTAATAAGCAG
ATCGTTGTTGCCTGCGACTACAATGGCTAAGCCCTTGGCTAATAAGTGATCAGTCTTATC
TTTCCCTAGTGACCACTTTACCCTCGCTATGTATTGTTCGAAATATGTCAACTGCTCCAA
CAGTGACCTCACCCTTGATATTTTGGATGTTAAATAGTGATAGCCACTACCACCCGAAGC
AAATGATACGCCAGTGAGAAGTTCTTCTAGTTGTACGTTGGGTTCTAAATATGCCGGTAC
AATCGGCTTTAGTCCTAAATATTCGGATATATAATCAGTAGCGACCTTTCCATCGCTGAA
TCTCCCGGTGGCAACTCCC
C

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2E925TF 623 0 0
ACCATAGTATGTAATAAGCAGATCGTTGTTGC*TGCGACTACAATGGCTAAGCCCTTGGC
TAATAAGTGATCAGTCTTATCTTTCCCTAGTGACCACTTTACCCTCGCTATGTATTGTTC
GAAATATGTCAACTGCTCCAACAGTGACCTCACCCTTGATATTTTGGATGTTAAATAGTG
ATAGCCACTACCACCCGAAGCAAATGATACGCCAGTGAGAAGTTCTTCTAGTTGTACGTT
GGGTTCTAAATATGCCGGTACAATCGGCTTTAGTCCTAAATATTCGGATATATAATCAGT
AGCGACCTTTCCATTGCTGAATCTCCCGGTGGCAACTCCCGTAGGAAAATTCATGCCATA
GGGACGAAAATTACATTTCATTTCTGTTGTTAGATTATTATTATTTCCCGTGACGATGAT
CGAATCACCAAGGTAAAACACTGCCGGTGTAGCTGGGTTATGTGGTGATGGATCACGTGG
TGGGCCTGGACCAGATTCTTGTGTTAGCCATGGCAACAGTCGTCGGTGGTGGATCACTTG
GGAATGGGTCGTCGTCACTAAAAAGATACAAAATGATGATAAGAGAAAGAAAACAAATCG
AAGCAGCTTATATTGTTTCATAC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 2 6

CO CL1252Contig1 626 4 9 U
TTTTTCCGTTATAACTCACATAATTCTCTTCCAGAGTTCTTGGATTTGTCCCCGAATCAA
TTGGAGATCTAAGAAGAAGAAGGATCTTCAAATGTGTACTCATCATGATGACCAATCACA
ACACAACCTCCCTTGTCTCCATTGTCAACCACATTCATACATTCGCATGGTTCAAAATAT
GATAGAGAGATGCATTTTACTCCGTATGACTCGCGACGAATGCATCAAGGCGTTAGACCA
ACACGCAAGCATTCTACCGCTCGTTACGCTCACCATTTGGAGAGGACTTCAAAGGGAAAA
CAAGGATTTCTTTGAAATGTATGGGCATTTCGTCTCTCCTAGGCCATGCTTAAGTGGATA
TGTTCGGAGATCGCCGAGGTTTGCGAGAAGGACACAGTGAAGACTTTGCTTTAGGCTTCT
AGATATGTAGTAGAAAAAGCTTGAAACATAGGTTACTTATAGAAAGCTAAGATGAACTAG
TCACGCTTTTATGTAGACCTTTTATGTGAAAAAGTTTCTATTAGATCAAGCACAGATAAG
CTTTTATTGTGTGATCTATTTCTAAGCTTGCTTGTTTAGATGCAGTCTAGTAATTGAAAC
CCTTAATAAGAATTATTTACCGTTTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C759TF U 1
AF RR2C759JQ C 1
AF RR2C041TF U 1
AF RR2C041JQ C 336
BS 1 166 RR2C041TF
BS 167 167 RR2C759TF
BS 168 324 RR2C041TF
BS 325 325 RR2C759TF
BS 326 376 RR2C041TF
BS 377 377 RR2C759TF
BS 378 392 RR2C041TF
BS 393 393 RR2C759TF
BS 394 626 RR2C041TF

RD RR2C759TF 527 0 0
TTTTTCCGTTATAACTCACATAATTCTCTTCCAGAGTTCTTGGATTTGTCCCCGAATCAA
TTGGAGATCTAAGAAGAAGAAGGATCTTCAAATGTGTACTCATCATGATGACCAATCACA
ACACAACCTCCCTTGTCTCCATTGTCAACCACATTCATACATTCGCATGGTTCAAAATAT
GATAGAGAGATGCATTTTACTCCGTATGACTCGCGACGAATGCATCAAGGCGTTAGACCA
ACACGCAAGCATTCTACCGCTCGTTACGCTCACCATTTGGAGAGGACTTCAAAGGGAAAA
CAAGGATTTCTTTGAAATGTATGGGCATTTCGTCTCTCCTAGGCCATGCTTAAGTGGATA
TGTTCGGAGATCGCCGAGGTTTGCGAGAAGGACACAGTGAAGACTTTGCTTTAGGTTTCT
AGATATGTAGTAGAAAAAGCTTGAAACATAGGTTACTTATAGAAAGCTAAGATGAACTAG
TCACGCTTTTATGTAGACCTTTTATGTGAAAAAGTTTCTATTAGA
CC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2C759JQ 513 0 0
TTTTTCCGTTATAACTCACATAATTCTCTTCCAGAGTTCTTGGATTTGTCCCCGAATCAA
TTGGAGATCTAAGAAGAAGAAGGATCTTCAAATGTGTACTCATCATGATGACCAATCACA
ACACAACCTCCCTTGTCTCCATTGTCAACCACATTCATACATTCGCATGGTTCAAAATAT
GATAGAGAGATGCATTTTACTCCGTATGACTCGCGACGAATGCATCAAGGCGTTAGACCA
ACACGCAAGCATTCTACCGCTCGTTACGCTCACCATTTGGAGAGGACTTCAAAGGGAAAA
CAAGGATTTCTTTGAAATGTATGGGCATTTCGTCTCTCCTAGGCCATGCTTAAGTGGATA
TGTTCGGAGATCGCCGAGGTTTGCGAGAAGGACACAGTGAAGACTTTGCTTTAGGTTTCT
AGATATGTAGTAGAAAAAGCTTGAAACATAGGTTACTTATAGAAAGCTAAGATGAACTAG
TCACGCTTTTATGTAGACCTTTTATGTGAAAAA

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2C041TF 626 0 0
TTTTTCCGTTATAACTCACATAATTCTCTTCCAGAGTTCTTGGATTTGTCCCCGAATCAA
TTGGAGATCTAAGAAGAAGAAGGATCTTCAAATGTGTACTCATCATGATGACCAATCACA
ACACAACCTCCCTTGTCTCCATTGTCAACCACATTCATACATTCGCGTGGTTCAAAATAT
GATAGAGAGATGCATTTTACTCCGTATGACTCGCGACGAATGCATCAAGGCGTTAGACCA
ACACGCAAGCATTCTACCGCTCGTTACGCTCACCATTTGGAGAGGACTTCAAAGGGAAAA
CAAGGATTTCTTTGAAATGTATGGACATTTCGTCTCTCCTAGGCCATGCTTAAGTGGATA
TGTTCGGAGATCGCCG*GGTTTGCGAGAAGGATACAGTGAAGACTTTGCTTTAGGCTTCT
AGATATGTAGTAGAAAAAGCTTGAAACATAGGTTACTTATAGAAAGCTAAGATGAACTAG
TCACGCTTTTATGTAGACCTTTTATGTGAAAAAGTTTCTATTAGATCAAGCACAGATAAG
CTTTTATTGTGTGATCTATTTCTAAGCTTGCTTGTTTAGATGCAGTCTAGTAATTGAAAC
CCTTAATAAGAATTATTTACCGTTTT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2C041JQ 291 0 0
T
TCCTAGGCCATGCTTAAGTGGATATGTTCGGAGATCGCCG*GGTTTGCGAGAAGGATACA
GTGAAGACTTTGCTTTAGGCTTTTAGATATGTAGTAGAAAAAGCTTGAAACATAGGTTAC
TTATAGAAAGCTAAGATGAACTAGTCACGCTTTTATGTAGACCTTTTATGTGAAAAAGTT
TTTATTAGATCAAGCACAGATAAGCTTTTATTGTGTGATTTATTTTTAAGCTTGCTTGTT
TAGATGCAGTCTAGTAATTGAAACCCTTAATAAGAATTATTTACCGTTTT

QA 2 291 2 291
DS 



CO CL1252Contig2 910 2 2 U
TTTTTCCGTTATAACTCACATAATTCTCTTCCAGAGTTCTTGGATTTGTCCCCGAACCAA
TTGGAGATCTAAGAAGAAGAAGGATCTTCAAATGTGTACTCATCATGATGACCAATCACA
ACACAACCTCCCTTGTCTCCATTGTCAACCACATTCATACATTCGCATGGTTCAAAATAT
GATAGAGAGATGCATTTTACTCCGTATGACTCGCGACGAATGCATCAAGGCGTTAGACCA
ACACGCAAGCATTCTACCGCTCGTTACGCTCACCAGTTAGTCTTTATAACCATTACGCAT
ATATAGCCTTTGTTTGTACACAATCTACATATAAAATGTTTTAAGGGTTTGTCAAATTTG
ATCGAAGGTGATATTTTAGATATAGGTTTCCAAGAAATTGAGGAGAATATTGTGACGACG
TTTCGATCTTGTTAGTCATTTTTTTAGATATAGGTTTCCAAGAAATGTTTTTGTTTTGTT
TGTAGTTTGGAGAGGACTTCAAAGGGAAAACAAGGATTTCTTTGAAATGTATGGGCATTT
CGTCTCTCCTAGGCCATGCTTAAGTAAGATTTAATCGTGAATAAATTCCAAATTAATTTC
TCAATCAGCAAATTATTAGGGACAAAGGTCCCGAATTTAATACATATCTACCAAACATGA
AAACATAATGATGTTTAAAATATTTTTTTTACAAGTTATTTTTTCTCATTTTTTGATATG
ACTTTTGATCAGGTGGATATGTTCGGAGATCGCCGAGGTTTGCGAGAAGGATACAGTGAA
GACTTTGCTTTAGGCTTCTAGATATGTAGTAGAAAAAGCTTGAAACATAGGTTACTTATA
GAAAGTTAAGATGAACTAGTCACGCTTTTATGTAGACCTTTTATGTGAAAAAGTTTCTAT
TAGATCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E932TF U 1
AF RR2E932JQ C 135
BS 1 498 RR2E932TF
BS 499 910 RR2E932JQ

RD RR2E932TF 498 0 0
TTTTTCCGTTATAACTCACATAATTCTCTTCCAGAGTTCTTGGATTTGTCCCCGAACCAA
TTGGAGATCTAAGAAGAAGAAGGATCTTCAAATGTGTACTCATCATGATGACCAATCACA
ACACAACCTCCCTTGTCTCCATTGTCAACCACATTCATACATTCGCATGGTTCAAAATAT
GATAGAGAGATGCATTTTACTCCGTATGACTCGCGACGAATGCATCAAGGCGTTAGACCA
ACACGCAAGCATTCTACCGCTCGTTACGCTCACCAGTTAGTCTTTATAACCATTACGCAT
ATATAGCCTTTGTTTGTACACAATCTACATATAAAATGTTTTAAGGGTTTGTCAAATTTG
ATCGAAGGTGATATTTTAGATATAGGTTTCCAAGAAATTGAGGAGAATATTGTGACGACG
TTTCGATCTTGTTAGTCATTTTTTTAGATATAGGTTTCCAAGAAATGTTTTTGTTTTGTT
TGTAGTTTGGAGAGGACT

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2E932JQ 776 0 0
GTCTCCATTGTCAACCACATTCATACATTCGCATGGTTCAAAATATGATAGAGAGATGCA
TTTTACTCCGTATGACTCGCGACGAATGCATCAAGGCGTTAGACCAACACGCAAGCATTC
TACCGCTCGTTACGCTCACCAGTTAGTCTTTATAACCATTACGCATATATAGCCTTTGTT
TGTACACAATCTACATATAAAATGTTTTAAGGGTTTGTCAAATTTGATCGAAGGTGATAT
TTTAGATATAGGTTTCCAAGAAATTGAGGAGAATATTGTGACGACGTTTCGATCTTGTTA
GTCATTTTTTTAGATATAGGTTTCCAAGAAATGTTTTTGTTTTGTTTGTAGTTTGGAGAG
GACTTCAAAGGGAAAACAAGGATTTCTTTGAAATGTATGGGCATTTCGTCTCTCCTAGGC
CATGCTTAAGTAAGATTTAATCGTGAATAAATTCCAAATTAATTTCTCAATCAGCAAATT
ATTAGGGACAAAGGTCCCGAATTTAATACATATCTACCAAACATGAAAACATAATGATGT
TTAAAATATTTTTTTTACAAGTTATTTTTTCTCATTTTTTGATATGACTTTTGATCAGGT
GGATATGTTCGGAGATCGCCGAGGTTTGCGAGAAGGATACAGTGAAGACTTTGCTTTAGG
CTTCTAGATATGTAGTAGAAAAAGCTTGAAACATAGGTTACTTATAGAAAGTTAAGATGA
ACTAGTCACGCTTTTATGTAGACCTTTTATGTGAAAAAGTTTCTATTAGATCAAGC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 4

CO CL1253Contig1 954 4 2 U
GGAACACTATTATAGAGCTTTATAGATAAGTTGATAAAACCTTTTTCTTATACAAATAGT
AATAGTTTGATTGTGTCTCTTACAAACGACCACAATATCACAAGCACCTAATAATAATAC
ATTGACGACCAAGATGGAACACTTACAATACCATCTATTCACACAATACCACTTTATCAG
AATCCTCTCTGCTTTTTTCCGGCAGCCTTTTTTGGTGATGTTGCCAGCAGTGCCGTTGTC
GACCTGAGGTTCTCCAGCAAAGTGTCTCTCCCCGACAAGAGAATCTTGAAGAAGCAATCC
ACCTCCTTGGAAACAAGGTCTATCCCACTCGTTAACTCCGTGACCGAGTCCTTCAATGGC
TGCAGCACGATGGGATCTATTGACCCTTGTTGGATCGCAGGAGCAAGTTCCTTAACACCT
GAATCAACAGCCTCGAGCTCTTTCATAACGGTTAAACCGTCAGATAAAAAGATGCTCTTG
ATCTCTGCGTTCATCGTGTTCTGCATTTGCATGAAGGATGGTGCCCATGGAAGATCGTTT
GAGACCGTAACGTAAAGCAGGTTCTGCGATGAACCTGAGAAGGCAGCAGCGAAAACACCA
GAAATGTACAGAGTCTTGACCTTGACACCGTAAAGAGCACGCATCAGGACTTTTCCTTTG
GCAGAGTTTTTCACCTTGGGGAGATTCAAGGTCTGAACAAGGCTGGTCAGGATTGAATGA
CAGCTTTCCAACCTCGGGTTCTTGGAAACGATGTGTCGCTTCCAGGAGTCGAGGGAGGAT
TGAGCTTTGGAAAGATTCTGAGGAGCGTTCGTGTCCAAGTTATGCAAAGCATACTGGAGA
AAGAGATGGCCTTGGTTGAGGCGGCTTAGCTCAGAGCTAAAGGCGTTGCAGAGGTCAAGG
AGCTTGACGCTGATGTCTAGTAGACATCGACCCACTTGTCCTCCCAGTCAGAGA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM34JQ U 1
AF RR2H082JQ U 1
AF RR2DM34TF C 104
AF RR2B528JQ U 28
BS 1 541 RR2DM34JQ
BS 542 954 RR2B528JQ

RD RR2DM34JQ 541 0 0
GGAACACTATTATAGAGCTTTATAGATAAGTTGATAAAACCTTTTTCTTATACAAATAGT
AATAGTTTGATTGTGTCTCTTACAAACGACCACAATATCACAAGCACCTAATAATAATAC
ATTGACGACCAAGATGGAACACTTACAATACCATCTATTCACACAATACCACTTTATCAG
AATCCTCTCTGCTTTTTTCCGGCAGCCTTTTTTGGTGATGTTGCCAGCAGTGCCGTTGTC
GACCTGAGGTTCTCCAGCAAAGTGTCTCTCCCCGACAAGAGAATCTTGAAGAAGCAATCC
ACCTCCTTGGAAACAAGGTCTATCCCACTCGTTAACTCCGTGACCGAGTCCTTCAATGGC
TGCAGCACGATGGGATCTATTGACCCTTGTTGGATCGCAGGAGCAAGTTCCTTAACACCT
GAATCAACAGCCTCGAGCTCTTTCATAACGGTTAAACCGTCAGATAAAAAGATGCTCTTG
ATCTCTGCGTTCATCGTGTTCTGCATTTGCATGAAGGATGGTGCCCATGGAAGATCGTTT
G

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR2H082JQ 541 0 0
AA
AACACTATTATAGAGCTTTATAGATAAGTTGATAAAACCTTTTTCTTATACAAATAGTAA
TAGTTTGATTGTGTCTCTTACAAACGACCACAATATCACAAGCACCTAATAATAATACAT
TGACGACCAAAATGGAACACTTACAATACCATCTATTCACGCAATACCACTTTATCAAAA
TCCTCTCTGCTTTTTTCCGGCAGCCTTTTTTGGTGATGTTGCCAGCAGTGCCGTTGTCGA
CCTGAGGTTCTCCAGCAAAGTGTCTCTCCCCGACAAGAAAATCTTGAAAAAGCAATCCAC
CTCCTTGGAAACAAGGTCTATCCCACTCGTTAACTCCGTGACCAAGTCCTTCAATGGCTG
CAGCACGATGGGATCTATTGACCCTTGTTGGATCGCAGGAGCAAGTTCCTTAACACCTGA
ATCAACAGCTTCGAGCTCTTTCATAACGGTTAAACCGTCAGATAAAAAGATGCTCTTGAT
CTCTGCGTTCATCGTGTTCTGCATTTGCATGAAGGATGGTGCCCATGGAAGATCGTTTG

QA 3 541 3 541
DS 

RD RR2DM34TF 710 0 0
TCACAGCACTATATATACA
TGACGACCAAGATGGAACACTTACAATACCATCTATTCACACAATACCACTTTATCAGAA
TCCTCTCTGCTTTTT*CCGGCAGCCTTTTTTGGTGATGTTGCCAGCAGTGCCGTTGTCGA
C*TGAGGTTCTCCAGCAAAGTGTCTCTCCCCGACAAGAGAATCTTGAAGAAGCAATCCAC
CTCCTTGGAAACAAGGTCTATCCCACTCGTTAACTCCGTGACCGAGTCCTTCAATGGCTG
CAGCACGATGGGATCTATTGACCCTTGTTGGATCGCAGGAGCAAGTTCCTTAACACCTGA
ATCAACAGCCTCGAGCTCTTTCATAACGGTTAAACCGTCAGATAAAAAGATGCTCTTGAT
CTCTGCGTTCATCGTGTTCTGCATTTGCATGAAGGATGGTGCCCATGGAAGATCGTTTGA
GACCGTAACGTAGAGCAGGTTCTGCGATGAACCTGAGAAGGCAGCAGCGAAAACACCAGA
AATGTACAGAGTCTTGACCTTGACACCGTAAAGAGCACGCATCAGGACTTTTCCTTTGGC
AGAGTTTTTCACCTTGGGGAGATTCAAGGTCTGAACAAGGCTGGTCAGGATTGAATGACA
GCTTTCCAACCTCGGGTTCTTGGAAACGATGTGTCGCTTCCAGGAGTCGAGGGAGGATTG
AGCTTTGGAAAGATTCTGAGGAGCGTTCGT
C

QA 20 709 20 709
DS 

RD RR2B528JQ 927 0 0
AAGTTGATAAAACCTTTTTCTTATACAAATAGTAATAGTTTGATTGTGTCTCTTACAAAC
GACCACAATATCACAAGCACCTAATAATAATACATTGACGACCAAGATGGAACACTTACA
ATACCATCTATTCACACAATACCACTTTATCAGAATCCTCTCTGCTTTTTTCCGGCAGCC
TTTTTTGGTGATGTTGCCAGCAGTGCCGTTGTCGACCTGAGGTTCCCCAGCAAAGTGTCT
CTCCCCGACAAGAGAATCTTGAAGAAGCAATCCACCTCCTTGGAAACAAGGTCTATCCCA
CTCGTTAACTCCGTGACCGAGTCCTTCAATGGCTGCAGCACGATGGGATCTATTGACCCT
TGTTGGATCGCAGGAGCAAGTTCCTTAACACCTGAATCAACAGCCTCGAGCTCTTTCATA
ACGGTTAAACCGTCAGATAAAAAGATGCTCTTGATCTCTGCGTTCATCGTGTTCTGCATT
TGCATGAAGGATGGTGCCCATGGAAGATCGTTTGAGACCGTAACGTAAAGCAGGTTCTGC
GATGAACCTGAGAAGGCAGCAGCGAAAACACCAGAAATGTACAGAGTCTTGACCTTGACA
CCGTAAAGAGCACGCATCAGGACTTTTCCTTTGGCAGAGTTTTTCACCTTGGGGAGATTC
AAGGTCTGAACAAGGCTGGTCAGGATTGAATGACAGCTTTCCAACCTCGGGTTCTTGGAA
ACGATGTGTCGCTTCCAGGAGTCGAGGGAGGATTGAGCTTTGGAAAGATTCTGAGGAGCG
TTCGTGTCCAAGTTATGCAAAGCATACTGGAGAAAGAGATGGCCTTGGTTGAGGCGGCTT
AGCTCAGAGCTAAAGGCGTTGCAGAGGTCAAGGAGCTTGACGCTGATGTCTAGTAGACAT
CGACCCACTTGTCCTCCCAGTCAGAGA

QA 1 927 1 927
DS 



AS 1 6

CO CL1254Contig1 597 6 8 U
GGATTCAGTTTATTGTCAGCTTGTCTCTCGATCCCCAATTCGTGGATTAGGGTTAACTTT
AATATCTCTTCTCTTCTCGTGGCGCAAACAAACGAATTCGAGATCGAAAATGGCGATGAG
GAGAGTATACAGCGAGATCAAAGGGAAGAAGGTGAAGGAGCTTCCTTCCTACATCAAATC
GTCGTTCTCAACTCAGTCCGTGAAGACGTATGTGAAGAAAGGTCTCGATAACTACAACGA
CAAATACATCCAGACCAGCTCCGTCCAACCTCTCCTCCACATCTGCTTCGGAGGCATGGC
CTTCTCTTACCTCGTCGCTCTCCCTAACGAGCGTCGCCATCTCGAGCACCAGCAGCACGC
CAAGGAGCACGGTGGCCATTGATCTCCAGATGTTGGTTTCTTCGATGGTGACAGACTGAA
GATTGCATGTCTTTGTTATTTCTTATTTTCCTGAATCTCCTGGATTGATATTATTGTTGA
TCAAAAGGAAAACCTTTTTTTTTTTCTTTTCAAAACTGAAGCTTGATGATATTGATGAAT
AATGAAACTGTTGTTTCTTTTATCGTAATATAAGCTGTGAATTCAGCATTTCGTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR2BD63JQ C 1
AF RR2A666TF U 93
AF RR2FK56TF U 40
AF RR2FK56JQ C 61
AF RR2E541TF U 49
AF RR2BD63TF U 1
BS 1 41 RR2BD63TF
BS 42 93 RR2FK56TF
BS 94 324 RR2A666TF
BS 325 325 RR2FK56TF
BS 326 503 RR2A666TF
BS 504 505 RR2FK56TF
BS 506 595 RR2A666TF
BS 596 597 RR2BD63JQ

RD RR2BD63JQ 597 0 0
GGATTCAGTTTATTGTCAGCTTGTCTCTCGATCCCCAATTCGTGGATTAGGGTTAACTTT
AATATCTCTTCTCTTCTCGTGGCGCAAACAAACGAATTCGAGATCGAAAATGGCGATGAG
GAGAGTATACAGCGAGATCAAAGGGAAGAAGGTGAAGGAGCTTCCTTCCTACATCAAATC
GTCGTTCTCAACTCGGTCCGTGAAGACGTATGTGAAGAAAGGTCTCGATAACTACAACGA
CAAATACATCCAGACCAGCTCCGTCCAACCTCTCCTCCACATCTGCTTCGGAGGCATGGC
CTTCTCTTACCTCGTCGCTCTCCCTAACGAGCGTCGCCATCTCGAGCACCAGCAGCACGC
CAAGGAGCACGGTGGCCATTGATCTCCAGATGTTGGTTTCTTCTATGGTGACAGACTGAA
GATTGCATGTCTTTGTTATTTCTTATTTTCCTGAATCTCCTGGATTGATATTATTGTTGA
TCAAAAGGAAAACCTTTTTTTTTTTCTTTTCAAAACTGAAGCTTGATGATATTGATGAAT
AATGAAGCTGTTGTTTCTTTTATCGTAATATAAGCTGTGAATTCAGCATTTCGTTCT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2A666TF 504 0 0
G
GAATTCGAGATCGAAAATGGCGATGAGGAGAGTATACAGCGAGATCAAAGGGAAGAAGGT
GAAGGAGCTTCCTTCCTACATCAAATCGTCGTTCTCAACTCAGTCCGTGAAGACGTATGT
GAAGAAAGGTCTCGATAACTACAACGACAAATACATCCAGACCAGCTCCGTCCAACCTCT
CCTCCACATCTGCTTCGGAGGCATGGCCTTCTCTTACCTCGTCGCTCTCCCCAACGAGCG
TCGCCATCTCGAGCACCAGCAGCACGCCAAGGAGCACGGTGGCCATTGATCTCCAGATGT
TGGTTTCTTCGATGGTGACAGACTGAAGATTGCATGTCTTTGTTATTTCTTATTTTCCTG
AATCTCCTGGATTGATATTATTGTTGATCAAAAGGAAAACCTTTTTTTTT**CTTTTCAA
AACTGAAGCTTGATGATATTGATGAATAATGAAACTGTTGTTTCTTTTATCGTAATATAA
GCTGTGAATTCAGCATTTCGTT
T

QA 2 503 2 503
DS 

RD RR2FK56TF 522 0 0
GG
GTGGATTAGGGTTAACTTTAATATCTCTTCTCTTCTCGTGGCGCAAACAAACGAATTCGA
GATCGAAAATGGCGATGAGGAGAGTATACAGCGAGATCAAAGGGAAGAAGGTGAAGGAGC
TTCCTTCCTACATCAAATCGTCGTTCTCAACTCAGTCCGTGAAGACGTATGTGAAGAAAG
GTCTCGATAACTACAACGACAAATACATCCAGACCAGCTCCGTCCAACCTCTCCTCCACA
TCTGCCTCGGAGGCATGGCCTTCTCTTACCTCGTCGCTCTCCCTAACGAGCGTCGCCATC
TCGAGCACCAGCAGCACGCCAAGGAGCACGGTGGCCATTGATCTCCAGGTGTTGGTTTCT
TCGATGGTGACAGACTGAAGATTGCATGTCTTTGTTATTTCTTATTTTCCTGAATCTCCT
GGATTGATATTATTGTTGATCAAAAGGAAAACCTTTTTTTTTTTCTTTTCAAAACTGAAG
CTTGATGATATTGATGAATAATGAAACTGTTGTTTCTTT
C

QA 3 521 3 521
DS 

RD RR2FK56JQ 497 0 0
AATATCTCTTCTCTTCTCGTGGCGCAAACAAACGAATTCGAGATCGAAAATGGCGATGAG
GAGAGTATACAGCGAGATCAAAGGGAAGAAGGTGAAGGAGCTTCCTTCCTACATCAAATC
GTCGTTCTCAACTCAGTCCGTGAAGACGTATGTGAAGAAAGGTCTCGATAACTACAACGA
CAAATACATCCAGACCAGCTCCGTCCAACCTCTCCTCCACATCTGCCTCGGAGGCATGGC
CTTCTCTTACCTCGTCGCTCTCCCTAACGAGCGTCGCCATCTCGAGCACCAGCAGCACGC
CAAGGAGCACGGTGGCCATTGATCTCCAGGTGTTGGTTTCTTCGATGGTGACAGACTGAA
GATTGCATGTCTTTGTTATTTCTTATTTTCCTGAATCTCCTGGATTGATATTATTGTTGA
TCAAAAGGAAAACCTTTTTTTTTTTCTTTTCAAAACTGAAGCTTGATGATATTGATGAAT
AATGAAACTGTTGTTTC

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2E541TF 548 0 0
G
GGGTTAACTTTAATATCTCTTCTCTTCTCGTGGCGCAAACAAACGAATTCGAGATCGAAA
ATGGCGATGAGGAGAGTATACAGCGAGATCAAAGGGAAGAAGGTGAAGGAGCTTCCTTCC
TACATCAAATCGTCGTTCTCAACTCAGTCCGTGAAGACGTATGTGAAGAAAGGTCTCGAT
AACTACAACGACAAATACATCCAGACCAGCTCCGTCCAACCTCTCCTTCACATCTGCTTC
GGAGGCATGGCCTTCTCTTACCTCGTCGCTCTCCCTAACGAGCGTCGCCATCTCGAGCAC
CAGCAGCACGCCAAGGAGCACGGTGGCCATTGATCTCCAGATGTTGGTTTCTTCGATGGT
GACAGACTGAAGATTGCATGTCTTTGTTATTTCTTATTTTCCTGAATCTCCTGGATTGAT
ATTATTGTTGATCAAAAGGAAAACCTTTTTTTTT**CTTTTCAAAACTGAAGCTTGATGA
TATTGATGAATAATGAAACTGTTGTTTCTTTTATCGTAATATAAGCTGTGAATTCAGCAT
TTCGTT
T

QA 2 547 2 547
DS 

RD RR2BD63TF 597 0 0
GGATTCAGTTTATTGTCAGCTTGTCTCTCGATCCCCAATTCGTGGATTAGGGTTAACTTT
AATATCTCTTCTCTTCTCGTGGCGCAAACAAACGAATTCGAGATCGAAAATGGCGATGAG
GAGAGTATACAGCGAGATCAAAGGGAAGAAGGTGAAGGAGCTTCCTTCCTACATCAAATC
GTCGTTCTCAACTCGGTCCGTGAAGACGTATGTGAAGAAAGGTCTCGATAACTACAACGA
CAAATACATCCAGACCAGCTCCGTCCAACCTCTCCTCCACATCTGCTTCGGAGGCATGGC
CTTCTCTTACCTCGTCGCTCTCCCTAACGAGCGTCGCCATCTCGAGCACCAGCAGCACGC
CAAGGAGCACGGTGGCCATTGATCTCCAGATGTTGGTTTCTTCTATGGTGACAGACTGAA
GATTGCATGTCTTTGTTATTTCTTATTTTCCTGAATCTCCTGGATTGATATTATTGTTGA
TCAAAAGGAAAACCTTTTTTTTTTTCTTTTCAAAACTGAAGCTTGATGATATTGATGAAT
AATGAAGCTGTTGTTTCTTTTATCGTAATATAAGCTGTGAATTCAGCATTTCGTT
CT

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 6

CO CL1255Contig1 534 6 6 U
GGATCAATCGAAACACATCAAAATTCATATAAACAAAAATATTTGCTTAAGAAAAATGGC
AGACAACAAGCAAAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAA
TGTGCTGGTGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGACTGCTCAAACCGC
AGGACAGAAGATATCGGAGACCGCAGGAGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTGG
CATGAACAAGTAGTGGACTCAAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATTA
ATTGTTATGGTTTTAAATAAAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGTTG
TTGTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTGTTTAGTGTTTAA
AATACTTGAATTGATGTTTCTCCCCTTAGGTTTGTACGTTTGGATGTTTGTGTATTTAAT
TTTCCCAGTAATAAAAACAAATGTATAATTTTAAGTTCCAACAATATCTTATCC


BQ
10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 5 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE74JQ C 1
AF RR2GE74TF U 1
AF RR2A621TF U 2
AF RR2GO63TF U 60
AF RR2HA22TF U 2
AF RR2G740TF U -2
BS 1 1 RR2GE74JQ
BS 2 400 RR2GE74TF
BS 401 403 RR2A621TF
BS 404 444 RR2GE74TF
BS 445 522 RR2A621TF
BS 523 534 RR2G740TF

RD RR2GE74JQ 444 0 0
GGATCAATCGAAACACATCAAAATTCATATAAACAAAAATATTTGCTTAAGAAAAATGGC
AGACAACAAGCAAAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAA
TGTGCTGGTGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGACTGCTCAAACCGC
AGGACAGAAGATATCGGAGACCGCAGGAGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTGG
CATGAACAAGTAGTGGACTCAAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATTA
ATTGTTATGGTTTTAAATAAAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGTTG
TTGTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG***CTGTGTTTAGTGTTTAA
AATACTTGAATTGATGTTTCTCCC

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR2GE74TF 444 0 0
G
GATCAATCGAAACACATCAAAATTCATATAAACAAAAATATTTGCTTAAGAAAAATGGCA
GACAACAAGCAAAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAAT
GTGCTGGTGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGACTGCTCAAACCGCA
GGACAGAAGATATCGGAGACCGCAGGAGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTGGC
ATGAACAAGTAGTGGACTCAAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATTAA
TTGTTATGGTTTTAAATAAAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGTTGT
TGTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG***CTGTGTTTAGTGTTTAAA
ATACTTGAATTGATGTTTCTCCC

QA 2 444 2 444
DS 

RD RR2A621TF 521 0 0
GATCAATCGAAACACATCAAAATTCATATAAACAAAAATATTTGCTTAAGAAAAATGGCA
GACAACAAGCAAAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAAT
GTGCTGGTGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGACTGCTCAAACCGCA
GGACAGAAGATATCGGAGACCGCAGGAGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTGGC
ATGAACAAGTAGTGGACTCAAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATTAA
TTGTTATGGTTTTAAATAAAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGTTGT
TGTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTGTTTAGTGTTTAAA
ATACTTGAATTGATGTTTCTCCCCTTAGGTTTGTACGTTTGGATGTTTGTGTATTTAATT
TTCCCAGTAATAAAAACAAATGTATAATTTTAAGTTCCAAC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2GO63TF 438 0 0
CAGACAACAAGCAAAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTA
ATG*GCTGGTGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGACTGCTCAAACCG
CAGGACAGAAGATATCGGAGACCGCAGGAGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTG
GCATGAACAAGTAGTGGACTCAAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATT
AATTGTTATGGTTTTAAATAAAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGTT
GTTTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTGTTTAGTGTTTA
AAATACTTGAATTGATGTTTCTCCCCTTAGGTTTGTACGTTTGGATGTTTGTGTATTTAA
TTTTCCCAGTAATAAAAA

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR2HA22TF 496 0 0
GATCAATCGAAACACATCAAAATTCATATAAACAAAAATATTTGCTTAAGAAAAATGGCA
GACAACAAGCAAAGCTTCCAGGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAAT
GTGCTGGTGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGACTGCTCAAACCGCG
GGACAGAAGATATCGGAGACCGCAGGAGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTGGC
ATGAACAAGTAGTGGACTCAAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATTAA
TTGTTATGGTTTTAAATAAAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGTTGT
TGTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTGTTTAGTGTTTAAA
ATACTTGAATTGATGTTTCTCCCCTTAGGTTTGTACGTTTGGATGTTTGTGTATTTAATT
TTCCCAGTAATAAAAA

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2G740TF 537 0 0
GGATC
ATCAATCGAAACACATCAAAATTCATATAAACAAAAATATTTGCTTAAGAAAAATGGCAG
ACAACAAGCAAAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAATG
TGCTGGTGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGACTGCTCAAACCGCAG
GACAGAAGATATCGGAGACCGCAGGAGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTGGCA
TGAACAAGTAGTGGACTCAAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATTAAT
TGTTATGGTTTTAAATAAAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGCTGTT
GTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTGTTTAGTGTTTAAAA
TACTTGAATTGATGTTTCTCCCCTTAGGTTTGTACGTTTGGATGTTTGTGTATTTAATTT
TCCCAGTAATAAAAACAAATGTATAATTTTAAGTTCCAACAATATCTTATCC

QA 6 537 6 537
DS 



AS 1 6

CO CL1256Contig1 1087 6 5 U
GGACACATCACACTATCCCTCAAACAAACAACACATATAAAAACTCCTTTCTTCTACAAT
TTTTGAAATAAACCCCTTAACTTTCAATTCTATCATCTAGCCTCCCCCCCCCTACTCTAA
ATGGGTCAGTTCTTGAACCTCGCCGTGTTGGTGACCGTTCTTTTTCTAACAATGGCCGGA
ACTGCTTACTCCGGAAGCTTCAACGAAGAGTTCGACTTGACATGGGGTGAACACAGAGGC
AAAATCTTTAGCGGAGGGAAAATGCTCTCACTGTCACTAGACCGGGTTTCCGGGTCAGGT
TTCAAATCCAAGAAAGAGTACTTATTCGGAAGAATCGACATGCAGCTCAAGCTCGTCGCC
GGAAACTCCGCCGGAACCGTCACTGCCTATTACTTATCGTCGGAAGGACCAACACACGAC
GAGATAGACTTCGAGTTTCTTGGTAACGAGACAGGGAAGCCTTATGTTCTTCACACTAAT
GTCTTTGCACAAGGCAAAGGAAACAGAGAGCAACAGTTTTATCTCTGGTTCGACCCAACC
AAGAACTTCCACACTTACTCCCTTGTCTGGAGACCTCAACACATCATATTTATGGTAGAT
AATGTACCAATCAGAGTATTCAACAACGCAGAGCAACTTGGTGTTCCGTTTCCCAAGAAG
CAACCAATGAGGATCTACTCGAGCCTATGGAATGCTGATGACTGGGCCACGAGAGGTGGT
TTGGTCAAGACAGATTGGTCTAAAGCTCCTTTCACTGCTTACTACAGAGGCTTCAACGCC
GCGGCTTGTACCGTTTCGTCAGGGTCCTCTTACTGTGATCCTAAGTTCAGGAGCACATTC
GATAATGGTGAATCACAAGTGGCTAACGAGCTTAATGCTTATGGGAGAAGAAGATTGAGA
TGGGTTCAAAAGTATTTCATGATTTATGATTATTGCTCTGATGTTAAAAGGTTTCCTCAA
GGATTCCCACCCGAGTGTAGGAGGTCTAGAGTCTAACAAACAATTATTCCTATCTCTCTT
GTTGTTTAGTGCAAATTCTCTTTGTTGTTGCTCTCTTTTTTT*AATAAATTGATTTTCTT
CACTGGC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ38TF U 161
AF RR2GI01TF U 3
AF RR2CX49TF U 1
AF RR2GI01JQB C 343
AF RR2GQ38JQ C 529
AF RR2CX49JQ C 409
BS 1 671 RR2CX49TF
BS 672 672 RR2GI01JQB
BS 673 687 RR2CX49TF
BS 688 1079 RR2GI01JQB
BS 1080 1087 RR2CX49JQ

RD RR2GQ38TF 125 0 0
TTTTTCTAACAATGGCCGGAACTGCTTACTCCGGAAGCTTCAACGAAGAGTTCGACTTGA
CATGGGGTGAACACAGAGGCAAAATCTTTAGCGGAGGGAAAATGCTCTCACTGTCACTAG
ACCGG

QA 1 125 1 125
DS 

RD RR2GI01TF 596 0 0
GG
ACATCACACTATCCCTCAAACAAACAACACATATAAAAACTCCTTTCTTCTACAATTTTT
GAAATAAACCCCTTAACTTTCAATTCTATCATCTAGCCTCCCCCCCCCTACTCTAAATGG
GTCAGTTCTTGAACCTCGCCGTGTTGGTGACCGTTCTTTTTCTAACAATGGCCGGAACTG
CTTACTCCGGAAGCTTCAACGAAGAGTTCGACTTGACATGGGGTGAACACAGAGGCAAAA
TCTTTAGCGGAGGGAAAATGCTCTCACTGTCACTAGACCGGGTTTCCGGGTCAGGTTTCA
AATCCAAGAAAGAGTACTTATTCGGAAGAATCGACATGCAGCTCAAGCTCGTCGCCGGAA
ACTCCGCCGGAACCGTCACTGCCTATTACTTATCGTCGGAAGGACCAACACACGACGAGA
TAGACTTCGAGTTTCTTG*TAACGAGACAGGGAAGCCTTATGTTCTTCACACTAATGTCT
TTGCACAAGGCAAAGGAAACAGAGAGCAACAGTTTTATCTCTGGTTCGACCCAACCAAGA
ACTTCCACACTTACTCCCTTGTCTGGAGACCTCAACACATCATATTTATGGTAG

QA 3 596 3 596
DS 

RD RR2CX49TF 687 0 0
GGACACATCACACTATCCCTCAAACAAACAACACATATAAAAACTCCTTTCTTCTACAAT
TTTTGAAATAAACCCCTTAACTTTCAATTCTATCATCTAGCCTCCCCCCCCCTACTCTAA
ATGGGTCAGTTCTTGAACCTCGCCGTGTTGGTGACCGTTCTTTTTCTAACAATGGCCGGA
ACTGCTTACTCCGGAAGCTTCAACGAAGAGTTCGACTTGACATGGGGTGAACACAGAGGC
AAAATCTTTAGCGGAGGGAAAATGCTCTCACTGTCACTAGACCGGGTTTCCGGGTCAGGT
TTCAAATCCAAGAAAGAGTACTTATTCGGAAGAATCGACATGCAGCTCAAGCTCGTCGCC
GGAAACTCCGCCGGAACCGTCACTGCCTATTACTTATCGTCGGAAGGACCAACACACGAC
GAGATAGACTTCGAGTTTCTTGGTAACGAGACAGGGAAGCCTTATGTTCTTCACACTAAT
GTCTTTGCACAAGGCAAAGGAAACAGAGAGCAACAGTTTTATCTCTGGTTCGACCCAACC
AAGAACTTCCACACTTACTCCCTTGTCTGGAGACCTCAACACATCATATTTATGGTAGAT
AATGTACCAATCAGAGTATTCAACAACGCAGAGCAACTTGGTGTTCCGTTTCCCAAGAAG
CAACCAATGAG*ATCTACTCGAGCCTA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2GI01JQB 744 0 0
CAGCTCAAGCTCGTCGCCGGAAACTCCGCCGGAACCGTCACTGCCTATTACTTATCGTCG
GAAGGACCAACACACGACGAGATAGACTTCGAGTTTCTTG*TAACGAGACAGGGAAGCCT
TATGTTCTTCACACTAATGTCTTTGCACAAGGCAAAGGAAACAGAGAGCAACAGTTTTAT
CTCTGGTTCGACCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCCCTTGTCTGGAGACCTCAACAC
ATCATATTTATGGTAGATAATGTACCAATCAGAGTATTCAACAACGCAGAGCAACTTGGT
GTTCCGTTTCCCAAGAAGCAACCAATGAGGATCTACTCGAGCCTATGGAATGCTGATGAC
TGGGCCACGAGAGGTGGTTTGGTCAAGACAGATTGGTCTAAAGCTCCTTTCACTGCTTAC
TACAGAGGCTTCAACGCCGCGGCTTGTACCGTTTCGTCAGGGTCCTCTTACTGTGATCCT
AAGTTCAGGAGCACATTCGATAATGGTGAATCACAAGTGGCTAACGAGCTTAATGCTTAT
GGGAGAAGAAGATTGAGATGGGTTCAAAAGTATTTCATGATTTATGATTATTGCTCTGAT
GTTAAAAGGTTTCCTCAAGGATTCCCACCCGAGTGTAGGAGGTCTAGAGTCTAACAAACA
ATTATTCCTATCTCTCTTGTTGTTTAGTGCAAATTCTCTTTGTTGTTGCTCTCTTTTTTT
*AATAAATTGATTTTCT
TCACTGG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2GQ38JQ 553 0 0
TTCGACCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCCCTTGTCTGGAGACCTCAACACATCATA
TTTATGGTAGATAATGTACCAATCAGAGTATTCAACAACGCAGAGCAACTTGGTGTTCCG
TTTCCCAAGAAGCAACCAATGAGGATTTACTCGAGCCTATGGAATGCTGATGACTGGGCC
ACGAGAGGTGGTTTGGTCAAGACAGATTGGTCTAAAGCTCCTTTCACTGCTTACTACAGA
GGCTTCAACGCCGCGGCTTGTGCCGTTTCGTCAGGGTCCTCTTACTGTGATCCTAAGTTC
AGGAGCACATTCGATAATGGTGAATCACAAGTGGCTAACGAGCTTAATGCTTATGGGAGA
AGAAGATTGAGATGGGTTCAAAAGTATTTCATGATTTATGATTATTGCTCTGATGTTAAA
AGGTTTCCTCAAGGATTCCCACCCGAGTGTAGGAGGTCTAGAGTCTAACAAACAATTATT
CCTATCTCTCTTGTTGTTTAGTGCAAATTCTCTTTGTTGTTGCTCTCTTTTTTT*AATAA
ATTGATTTTCT
CC

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2CX49JQ 679 0 0
CCAACACACGACGAGATAGACTTCGAGTTTCTTGGTAACGAGACAGGGAAGCCTTATGTT
CTTCACACTAATGTCTTTGCACAAGGCAAAGGAAACAGAGAGCAACAGTTTTATCTCTGG
TTCGACCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCCCTTGTCTGGAGACCTCAACACATCATA
TTTATGGTAGATAATGTACCAATCAGAGTATTCAACAACGCAGAGCAACTTGGTGTTCCG
TTTCCCAAGAAGCAACCAATGAGGATTTACTCGAGCCTACGGAATGCTGATGACTGGGCC
ACGAGAGGTGGTTTGGTCAAGACAGATTGGTCTAAAGCTCCTTTCACTGCTTACTACAGA
GGCTTCAACGCCGCGGCTTGTACCGTTTCGTCAGGGTCCTCTTACTGTGATCCTAAGTTC
AGGAGCACATTCGATAATGGTGAATCACAAGTGGCTAACGAGCTTAATGCTCATGGGAGG
AGAAGATTGAGATGGGTTCAAAAGTATTTCATGATTTATGATTATTGCTCTGATGTTAAA
AGGTTTCCTCAAGGATTCCCACCCGAGTGTAGGAGGTCTAGAGTCTAACAAACAATTATT
CCTATCTCTCTTGTTGTTTAGTGCAAATTCTCTTTGTTGTTGCTCTCTTTTTTTTAATAA
ATTGATTTTCTTCACTGGC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 3

CO CL1257Contig1 543 3 2 U
GGCTCTCTGCTCGATCGTTGAAGCTGAAAGAAGAACCTGAAAGATGGGGAAGGACGGAAA
AGGTGGTGGGAAGGGTAAGGGAAAGCAAGCCAGTGGCAGTGATGAAGCTCCCTCCAAGGG
AAAAGGCAAAGCTGGAAAGGCTGCTGATGGTCTCGGCACCTGCACCTATGTTAAAGCGAG
ACATGTTCTGTGTGAAAAGCAAGGAAAGATCAACGAGGCGTACAAAAAGTTGCAGGATGG
TTGGTTGAGCAACGGTGACAAGGTTCCTCCTGCTGAGTTTGCAAAGATTGCAGCAGAGTA
CTCAGAGTGCCCATCAGGGAAAAAAGGAGGAGATCTTGGATGGTTCCCAAGGGGAAAGAT
GGCAGGTCCCTTCCAAGATGTCGCCTTCAATACACCTGTTGGTGTCACTAGTGCACCTTT
CAAATCTACGCACGGATACCACATCATCTTGTCGGAAGGAAGGAAGAACTGACAGATTAG
GTCTCTGTTCTGGCTGGCTCTGCTCTTATGGATGGATGTCACTTGCTAGTTATTGATGTA
ACC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2GP20TF U 1
AF RR2GP20JQ C 7
AF RR2GU13TF U 1
BS 1 499 RR2GP20TF
BS 500 543 RR2GU13TF

RD RR2GP20TF 505 0 0
GGCTCTCTGCTCGATCGTTGAAGCTGAAAGAAGAACCTGAAAGATGGGGAAGGACGGAAA
AGGTGGTGGGAAGGGTAAGGGAAAGCAAGCCAGTGGCAGTGATGAAGCTCCCTCCAAGGG
AAAAGGCAAAGCTGGAAAGGCTGCTGATGGTCTCGGCACCTGCACCTATGTTAAAGCGAG
ACATGTTCTGTGTGAAAAGCAAGGAAAGATCAACGAGGCGTACAAAAAGTTGCAGGATGG
TTGGTTGAGCAACGGTGACAAGGTTCCTCCTGCTGAGTTTGCAAAGATTGCAGCAGAGTA
CTCAGAGTGCCCATCAGGGAAAAAAGGAGGAGATCTTGGATGGTTCCCAAGGGGAAAGAT
GGCAGGTCCCTTCCAAGATGTCGCCTTCAATACACCTGTTGGTGTCACTAGTGCACCTTT
CAAATCTACGCACGGATACCACATCATCTTGTCGGAAGGAAGGAAGAACTGACAGATTAG
GTCTCTGTTCTGGCTGGCT
CTGCTC

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR2GP20JQ 493 0 0
CTGCTCGATCGTTGAAGCTGAAAGAAGAACCTGAAAGATGGGGAAGGACGGAAAAGGTGG
TGGGAAGGGTAAGGGAAAGCAAGCCAGTGGCAGTGATGAAGCTCCCTCCAAGGGAAAAGG
CAAAGCTGAAAAGGCTGCTGATGGTCTCGGCACCTGCACCTATGTTAAAGCGAGACATGT
TCTGTGTGAAAAGCAAGGAAAGATCAACGAGGCGTACAAAAAGTTGCAGGATGGTTGGTT
GAGCAACGGTGACAAGGTTCCTCCTGCTGAGTTTGCAAAGATTGCAGCAGAGTACTCAGA
GTGCCCATCAGGGAAAAAAGGAGGAGATCTTGGATGGTTCCCAAGGGGAAAGATGGCAGG
TCCCTTCCAAGATGTCGCCTTCAATACACCTGTTGGTGTCACTAGTGCCCCTTTCAAATT
TACGCACGGATACCACATCATCTTGTCGGAAGGAAGGAAGAACTGACAGATTAGGTCTCT
GTTCTGGCTGG
CT

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2GU13TF 543 0 0
GGCTCT
CTGCTCGATCGTTGAAGCTGAAAGAAGAACCTGAAAGATGGGGAAGGACGGAAAAGGTGG
TGGGAAGGGTAAGGGAAAGCAAGCCAGTGGCAGTGATGAAGCTCCCTCCAAGGGAAAAGG
CAAAGCTGGAAAGGCTGCTGATGGTCTCGGCACCTGCACCTATGTTAAAGCGAGACATGT
TCTGTGTGAAAAGCAAGGAAAGATCAACGAGGCGTACAAAAAGTTGCAGGATGGTTGGTT
GAGCAACGGTGACAAGGTTCCTCCTGCTGAGTTTGCAAAGATTGCAGCAGAGTACTCAGA
GTGCCCATCAGGGAAAAAAGGAGGAGATCTTGGATGGTTCCCAAGGGGAAAGATGGCAGG
TCCCTTCCAAGATGTCGCCTTCAATACACCTGTTGGTGTCACTAGTGCACCTTTCAAATC
TACGCACGGATACCACATCATCTTGTCGGAAGGAAGGAAGAACTGACAGATTAGGTCTCT
GTTCTGGCTGGCTCTGCTCTTATGGATGGATGTCACTTGCTAGTTATTGATGTAACC

QA 7 543 7 543
DS 



AS 2 5

CO CL1258Contig1 825 3 3 U
GGATTGCGGCTCATTGAGAGAGACGACAGATCTTCAGAGATGAGCTTGACGCTGCTTCAA
GGTTATTCATCTGCAGAAGAAGAAGATTCCGAGGAGAGGGATTACGAGAATTCAGACGAA
GAAGATGTGAATCATGGCGTTGAGAGATACGGATCTTCTTCTTCAGTGTTCGATTTCTCT
GCATCCAACTCTGCTAAAGACTCTGGCCTTCCTTCAGCTAACGACGTTTTCTCTCAGATA
TCAGGGCCACCGGAGTTTCTAAACAACCGTACAGAAGCGGATGAAGAAGCTACAGCTAGA
GATGCAGAGCATGCAAAACGTATTACCCGCAAAAAGAAGAAAGCTAAACCTAAAGGTGTT
GTCGTGGAAGCGAAACCTCAACTTGTCGGGATTCATGAGAGAGTCAGAAACGATATCGAT
GCACCACCATCTTCAGAGAATGGTGAGAAGCGGATATCTACTGCAACCAATCCAAATGCA
GAAGAAGCTGCAGATCTCTTAAGGATGTGTCTGCAATGTGGAGTACCAAAAACTTATACA
AGCGCGAGAGGAATGGTATGCCCACTTTGCGGTGACCGGCCATTACCGGACTCGGATGCA
AAGAAGAAAGGCTCTACGGTCAAAGATAAAGAGAAGAGCAAAAGAATGAGAGGGCAATCC
TCTCACGCTTCTTGGAAAAGTGAAACCGAGATGCAACTTAGCAACATTTCGATTAGAATG
TTTCCAAACTTTTTTCTCCTTTTATTACATTGTTGTTCCATCCAAATCCATCATTACTAA
AAACTATTGTCGGAGTGAAAACCCTTAAGTTCTTAAGTAATTGAT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C715JQ C 190
AF RR2C715TF U 4
AF RR2A279TF U 1
BS 1 283 RR2A279TF
BS 284 284 RR2C715TF
BS 285 825 RR2A279TF

RD RR2C715JQ 146 0 0
TCTGCTAAAGACTCTGGCCTTCCTTCAGCTAACGACGTTTTCTCTCAGATATCAGGGCCA
CCGGAGTTTCTAAACAACCGTACAGAAGCGGATGAAGAAGCTACAGCTAGAGATGCAGAG
CATGCAAAACGTATTACCCGCAAAAA

QA 1 146 1 146
DS 

RD RR2C715TF 645 0 0
GG
GCGGCTCATTGAGAGAGACGACAGATCTTCAGAGATGAGCTTGACGCTGCTTCAAGGT*A
TTCATCTGCAGAAGAAGAAGATTCCGAGGAGAGGGATTACGAGAATTCAGACGAAGAAGA
TGTGAATCATGGCGTTGAGAGATACGGATCTTCTTCTTCAGTGTTCGATTTCTCTGCATC
CAACTCTGCTAAAGACTCTGGCCTTCCTTCAGCTAACGACGTTTTCTCTCAGATATCAGG
GCCACCGGAGTTTCTAAACAACCGTACAGAAGCGGATGAAGAAGCTACAGCTAGAGATGC
AGAGCATGCAAAACGTATTACCCGCAAAAAGAAGAAAGCTAAACCTAAAGGTGTTGTCGT
GGAAGCGAAACCTCAACTTGTCGGGATTCATGAGAGAGTCAGAAACGATATCGATGCACC
ACCATCTTCAGAGAATGGTGAGAAGCGGATATCTACTGCAACCAATCCAAATGCAGAAGA
AGCTGCAGATCTCTTAAGGATGTGTCTGCAATGTGGAGTACCAAAAACTTATACAAGCGC
GAGAGGAATGGTATGCCCACTTTGCGGTGACCGGCCATTACCGGACTCGGATGCAAAGAA
GAAAGGCTCTACGGTCAAAGATAAAGAGAAGAGCAAAAGAATG

QA 3 645 3 645
DS 

RD RR2A279TF 825 0 0
GGATTGCGGCTCATTGAGAGAGACGACAGATCTTCAGAGATGAGCTTGACGCTGCTTCAA
GGTTATTCATCTGCAGAAGAAGAAGATTCCGAGGAGAGGGATTACGAGAATTCAGACGAA
GAAGATGTGAATCATGGCGTTGAGAGATACGGATCTTCTTCTTCAGTGTTCGATTTCTCT
GCATCCAACTCTGCTAAAGACTCTGGCCTTCCTTCAGCTAACGACGTTTTCTCTCAGATA
TCAGGGCCACCGGAGTTTCTAAACAACCGTACAGAAGCGGATGGAGAAGCTACAGCTAGA
GATGCAGAGCATGCAAAACGTATTACCCGCAAAAAGAAGAAAGCTAAACCTAAAGGTGTT
GTCGTGGAAGCGAAACCTCAACTTGTCGGGATTCATGAGAGAGTCAGAAACGATATCGAT
GCACCACCATCTTCAGAGAATGGTGAGAAGCGGATATCTACTGCAACCAATCCAAATGCA
GAAGAAGCTGCAGATCTCTTAAGGATGTGTCTGCAATGTGGAGTACCAAAAACTTATACA
AGCGCGAGAGGAATGGTATGCCCACTTTGCGGTGACCGGCCATTACCGGACTCGGATGCA
AAGAAGAAAGGCTCTACGGTCAAAGATAAAGAGAAGAGCAAAAGAATGAGAGGGCAATCC
TCTCACGCTTCTTGGAAAAGTGAAACCGAGATGCAACTTAGCAACATTTCGATTAGAATG
TTTCCAAACTTTTTTCTCCTTTTATTACATTGTTGTTCCATCCAAATCCATCATTACTAA
AAACTATTGTCGGAGTGAAAACCCTTAAGTTCTTAAGTAATTGAT

QA 1 825 1 825
DS 



CO CL1258Contig2 780 2 2 U
GGATTGCGGCTCATTGAGAGAGACGACAGATCTTCAGAGATGAGCTTGACGCTGCTTCAA
GGTTATTCGTCTGCAGAATAGGAAAATTCCGACGAGAGGGATTACGAGAGCTCCGGCGAG
GAAGATGAGAATCATGGCGTTGAGAGATACGGATCTTCTTCTTCAGTGTTCGATTTCTCT
GCATCCAACTCTGCTAAAGACTCTGGCCTTCCTTCAGCTAACGACGTTTTCTCTCAGATA
TCAGGCCCACCAGAGTTTCTAAACAACCGTACAGAAGCGGATGTAGAAGCTACAGCTAGA
GATGCAGAGCATGCTAAGCGTCTTACCCGTAAAAAGAAGAAAGCTAAACCTAAAGGTGTT
GTCATGGAAGCAAAACCTCAACTTGTCGGGATTCATGAGAGAGTCAGGAACGATATTGAT
GCACCACCATCTTCAGAGAATGGTGAAAAGCGGATATCTACTGCAACCAATCCAAATGCA
GAAGAAGCTGCAGATCTCTTAAGGATGTGTCTGCAATGTGGAGTACCAAAAACATATACA
AGCGCGAGAGGAATGGTATGCCCACTTTGCAGTGACCGGCCATTACCTGACTCGGATGGA
AAGAAGAAAGGGTCTACCGTCAAGGATAAAGAGAAGAGCAAAAGAATGAGAGGACAATCC
TCTCACGCTTCTTGGAAAAGTGAAACCGAGATGCAACTTAGGCAACATTTCGATTAGAAT
GTTTCCAAACTTTTCTTCTCCTTTTATTACATTGTTGTTCCATCCAAATCCATCATTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV94TF U 1
AF RR2GV94JQB C 238
BS 1 511 RR2GV94TF
BS 512 780 RR2GV94JQB

RD RR2GV94TF 511 0 0
GGATTGCGGCTCATTGAGAGAGACGACAGATCTTCAGAGATGAGCTTGACGCTGCTTCAA
GGTTATTCGTCTGCAGAATAGGAAAATTCCGACGAGAGGGATTACGAGAGCTCCGGCGAG
GAAGATGAGAATCATGGCGTTGAGAGATACGGATCTTCTTCTTCAGTGTTCGATTTCTCT
GCATCCAACTCTGCTAAAGACTCTGGCCTTCCTTCAGCTAACGACGTTTTCTCTCAGATA
TCAGGCCCACCAGAGTTTCTAAACAACCGTACAGAAGCGGATGTAGAAGCTACAGCTAGA
GATGCAGAGCATGCTAAGCGTCTTACCCGTAAAAAGAAGAAAGCTAAACCTAAAGGTGTT
GTCATGGAAGCAAAACCTCAACTTGTCGGGATTCATGAGAGAGTCAGGAACGATATTGAT
GCACCACCATCTTCAGAGAATGGTGAAAAGCGGATATCTACTGCAACCAATCCAAATGCA
GAAGAAGCTGCAGATCTCTTAAGGATGTGTC

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2GV94JQB 543 0 0
ATATCAGGCCCACCAGAGTTTCTAAACAACCGTACAGAAGCGGATGTAGAAGCTACAGCT
AGAGATGCAGAGCATGCTAAGCGTCTTACCCGTAAAAAGAAGAAAGCTAAACCTAAAGGT
GTTGTCATGGAAGCAAAACCTCAACTTGTCGGGATTCATGAGAGAGTCAGGAACGATATT
GATGCACCCCCATCTTCAGAGAATGGTGAAAAGCGGATATTTACTGCAACCAATCCAAAT
GCAGAAGAAGCTGCAGATCTCTTAAGGATGTGTCTGCAATGTGGAGTACCAAAAACATAT
ACAAGCGCGAGAGGAATGGTATGCCCACTTTGCAGTGACCGGCCATTACCTGACTCGGAT
GGAAAGAAGAAAGGGTCTACCGTCAAGGATAAAGAGAAGAGCAAAAGAATGAGAGGACAA
TCCTCTCACGCTTCTTGGAAAAGTGAAACCGAGATGCAACTTAGGCAACATTTCGATTAG
AATGTTTCCAAACTTTTCTTCTCCTTTTATTACATTGTTGTTCCATCCAAATCCATCATT
ACT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 6

CO CL1259Contig1 602 6 3 U
GGAAGATGACCTAGAACATTCCGTCTCCCATCTTCTTTTGCCCAAGAGGAACAACCCTAG
AGAATTCACAGTCACCTCACAGAGAATAGAATAGAGAGAAATGATGAAGCGACTGGTGCC
AACGTTCAACCGCATCCTGGTGAAGAGAGTCATCCAGCCTGCGAAAACCGAAAGCGGCAT
CCTCCTTCCAGAGAAAGCCTCCTCTCTGAACTCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGG
TTCAAGGGATAAGGACGGGAATTTGATTCCGGTCTCTGTCAAGGAAGGCGACACCGTTCT
TCTTCCTGAGTACGGTGGTACTCAGGTCAAACTCGGCGATAACGAGTACCATCTCTTCCG
GGATGAGGACGTCTTGGGAACCTTGCACGAGGATTGACAAGGCTAAACTCAACTACGAGC
GTTGTTCGTTTGTCTTGTGGGTGAAAAAGAGTCATTTTTCTTTTTATCTTTTTATATGAG
GTTGGACTTTGTTGATTATCACTGAAATTTAGACATCAATCATAAACGATGCATCTTCTG
ATTCCAATCTTTTCAACTTATCCAGATAATCTGGTTTGATAAAATAAAGCTCATTTCAGT
GC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2FQ83JQ C 1
AF RR2FQ83TF U 1
AF RR2GV70JQB C 38
AF RR2GV70TF U 38
AF RR2CH13JQ C 42
AF RR2CH13TF U 42
BS 1 540 RR2FQ83TF
BS 541 545 RR2GV70TF
BS 546 602 RR2CH13TF

RD RR2FQ83JQ 496 0 0
GGAAGATGACCTAGAACATTCCGTCTCCCATCTTCTTTTGCCCAAGAGGAACAACCCTAG
AGAATTCACAGTCACCTCACAGAGAATAGAATAGAGAGAAATGATGAAGCGACTGGTGCC
AACGTTCAACCGCATCCTGGTGAAGAGAGTCATCCAGCCTGCGAAAACCGAAAGCGGCAT
CCTCCTTCCAGAGAAAGCCTCCTCTCTGAACTCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGG
TTCAAGGGATAAGGACGGGAATTTGATTCCGGTCTCTGTCAAGGAAGGCGACACCGTTCT
TCTTCCTGAGTACGGTGGTACTCAGGTCAAACTCGGCGATAACGAGTACCATCTCTTCCG
GGATGAGGACGTCTTGGGAACCTTGCACGAGGATTGACAAGGCTAAACTCAACTACGAGC
GTTGTTCGTTTGTCTTGTGGGTGAAAAAGAGTCATTTTTCTTTTTATCTTTTTATATGAG
GTTGGACTTTGTTGAT

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2FQ83TF 540 0 0
GGAAGATGACCTAGAACATTCCGTCTCCCATCTTCTTTTGCCCAAGAGGAACAACCCTAG
AGAATTCACAGTCACCTCACAGAGAATAGAATAGAGAGAAATGATGAAGCGACTGGTGCC
AACGTTCAACCGCATCCTGGTGAAGAGAGTCATCCAGCCTGCGAAAACCGAAAGCGGCAT
CCTCCTTCCAGAGAAAGCCTCCTCTCTGAACTCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGG
TTCAAGGGATAAGGACGGGAATTTGATTCCGGTCTCTGTCAAGGAAGGCGACACCGTTCT
TCTTCCTGAGTACGGTGGTACTCAGGTCAAACTCGGCGATAACGAGTACCATCTCTTCCG
GGATGAGGACGTCTTGGGAACCTTGCACGAGGATTGACAAGGCTAAACTCAACTACGAGC
GTTGTTCGTTTGTCTTGTGGGTGAAAAAGAGTCATTTTTCTTTTTATCTTTTTATATGAG
GTTGGACTTTGTTGATTATCACTGAAATTTAGACATCAATCATAAACGATGCATCTTCTG

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2GV70JQB 508 0 0
GG
GCCCAAGAGGAACAACCCTAGAGAATTCACAGTCACCTCACAGAGAATAGAATAGAGAGA
AATGATGAAGCGACTGGTGCCAACGTTCAACCGCATCCTGGTGAAGAGAGTCATCCAGCC
TGCGAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTTCCAGAGAAAGCCTCCTCTCTGAACTCGGGAAA
GGTGATAGCAGTGGGACCTGGTTCAAGGGATAAGGACGGGAATTTGATTCCGGTCTCTGT
CAAGGAAGGCGACACCGTTCTTCTTCCTGAGTACGGTGGTACTCAGGTCAAACTCGGCGA
TAACGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGAACCTTGCACGAGGATTGACA
AGGCTAAACTCAACTACGAGCGTTGTTCGTTTGTCTTGTGGGTGAAAAAGAGTCATTTTT
CTTTTTATCTTTTTATATGAGGTTGGACTTTGTTGATTATCACTGAAATTTAGACATCAA
TCATAAACGATGCATCTTCTGATTCC

QA 3 508 3 508
DS 

RD RR2GV70TF 508 0 0
GG
GCCCAAGAGGAACAACCCTAGAGAATTCACAGTCACCTCACAGAGAATAGAATAGAGAGA
AATGATGAAGCGACTGGTGCCAACGTTCAACCGCATCCTGGTGAAGAGAGTCATCCAGCC
TGCGAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTTCCAGAGAAAGCCTCCTCTCTGAACTCGGGAAA
GGTGATAGCAGTGGGACCTGGTTCAAGGGATAAGGACGGGAATTTGATTCCGGTCTCTGT
CAAGGAAGGCGACACCGTTCTTCTTCCTGAGTACGGTGGTACTCAGGTCAAACTCGGCGA
TAACGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGAACCTTGCACGAGGATTGACA
AGGCTAAACTCAACTACGAGCGTTGTTCGTTTGTCTTGTGGGTGAAAAAGAGTCATTTTT
CTTTTTATCTTTTTATATGAGGTTGGACTTTGTTGATTATCACTGAAATTTAGACATCAA
TCATAAACGATGCATCTTCTGATTCC

QA 3 508 3 508
DS 

RD RR2CH13JQ 561 0 0
GG
AAGAGGAACAACCCTAGAGAATTCACAGTCACCTCACAGAGAATAGAATAGAGAGAAATG
ATGAAGCGACTGGTGCCAACGTTCAACCGCATCCTGGTGAAGAGAGTCATCCAGCCTGCG
AAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTTCCAGAGAAAGCCTCCTCTCTGAACTCGGGAAAGGTG
ATAGCAGTGGGACCTGGTTCAAGGGATAAGGACGGGAATTTGATTCCGGTCTCTGTCAAG
GAAGGCGACACCGTTCTTCTTCCTGAGTACGGTGGTACTCAGGTCAAACCCGGCGATAAC
GAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGAACCTTGCACGAGGATTGACAAGGC
TAAACTCAGCTACGAGCGTTGTTCGTTTGTCTTGTGGGTGAAAAAGAGTCATTTTTCTTT
TTATCTTTTTATATGAGGTTGGACTTTGTTGATTATCACTGAAATTTAGACATCAATCAT
AAACGATGCATCTTCTGATTCCAATCTTTTCAACTTATCCAGATAATCTGGTTTGATAAA
ATAAAGCTCATTTCAGTGC

QA 3 561 3 561
DS 

RD RR2CH13TF 561 0 0
GG
AAGAGGAACAACCCTAGAGAATTCACAGTCACCTCACAGAGAATAGAATAGAGAGAAATG
ATGAAGCGACTGGTGCCAACGTTCAACCGCATCCTGGTGAAGAGAGTCATCCAGCCTGCG
AAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTTCCAGAGAAAGCCTCCTCTCTGAACTCGGGAAAGGTG
ATAGCAGTGGGACCTGGTTCAAGGGATAAGGACGGGAATTTGATTCCGGTCTCTGTCAAG
GAAGGCGACACCGTTCTTCTTCCTGAGTACGGTGGTACTCAGGTCAAACCCGGCGATAAC
GAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGAACCTTGCACGAGGATTGACAAGGC
TAAACTCAGCTACGAGCGTTGTTCGTTTGTCTTGTGGGTGAAAAAGAGTCATTTTTCTTT
TTATCTTTTTATATGAGGTTGGACTTTGTTGATTATCACTGAAATTTAGACATCAATCAT
AAACGATGCATCTTCTGATTCCAATCTTTTCAACTTATCCAGATAATCTGGTTTGATAAA
ATAAAGCTCATTTCAGTGC

QA 3 561 3 561
DS 



AS 1 4

CO CL1260Contig1 720 4 12 U
GAAACACCTTCGTTATATTTTCTATCTTCCAATTCAGTTTCAACATTTCTCGCTATTCGT
CTCGGGTTTTGTTTTGTTGACTGAGAAAACATGGGAGGTGACAAAGACAGAGGGTTTCAT
GGGTATCCACCTGCTGGATACCCGGCCGGTACTGGGGCTTATCCACCAGCTGGATACCCA
CCACATCAAGGTTATCCTCCACCACCTGGTGCCTACCCTCCAGCTCATGGTTATGGAGGT
TATCCTCCTGCACCTGCTCATGCTGGTTATCCTGCTCATCACTCAGGACACGCAGGAGGA
ATCGGGGGTATGATTGCTGGTGCTGCAGCAGCCTATGGAGCTCACCACATAGCTCATAGC
TCTCACAGTCCTTACGGACACTCTACATAGGGTCACGGATATGGCCATGGTCATGGCTAT
GGTTATGGTCATGGTCATGGTAAGTTCAAGCATCACTGAGGCAAGTTTAAACGTGGGCAT
GGGATGTTTGGAGGAGGTAAGTTCAAGAAGTGGAAGTGATGCGAAATTCCCCTTTGATAT
GTCTCTCTGGACTGACCAGATGTTTAAAATAAATCACAAACATTATAAGTTAACTTTCGT
CGGTCTAGAGACCGCTGGTTCGAATTGGAATAACTCAGACTTAATAAAGAATATGGTACT
ATATGGAGGTGTCCTATCAAGCTATCGATGGCTTAATAATGACATATTCTGTTTTTAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2GI50TF U 1
AF RR2FY61TF U 22
AF RR2A861JQ C 373
AF RR2A861TF U 373
BS 1 297 RR2GI50TF
BS 298 298 RR2FY61TF
BS 299 389 RR2GI50TF
BS 390 390 RR2A861TF
BS 391 456 RR2GI50TF
BS 457 457 RR2A861TF
BS 458 505 RR2GI50TF
BS 506 584 RR2FY61TF
BS 585 585 RR2A861TF
BS 586 609 RR2FY61TF
BS 610 718 RR2A861TF
BS 719 720 RR2A861JQ

RD RR2GI50TF 505 0 0
GAAACACCTTCGTTATATTTTCTATCTTCCAATTCAGTTTCAACATTTCTCGCTATTCGT
CTCGGGTTTTGTTTTGTTGACTGAGAAAACATGGGAGGTGACAAAGACAGAGGGTTTCAT
GGGTATCCACCTGCTGGATACCCGGCCGGTACTGGGGCTTATCCACCAGCTGGATACCCA
CCACATCAAGGTTATCCTCCACCACCTGGTGCCTACCCTCCAGCTCATGGTTATGGAGGT
TATCCTCCTGCACCTGCTCATGCTGGTTATCCTGCTCATCACTCAGGACACGCAGGATGA
ATCGGGGGTATGATTGCTGGTGCTGCAGCAGCCTATGGAGCTCACCACATAGCTCATAGC
TCTCACAGTCCTTACGGACACTCTACATATGGTCACGGATATGGCCATGGTCATGGCTAT
GGTTATGGTCATGGTCATGGTAAGTTCAAGCATCACGGAGGCAAGTTTAAACGTGGGCAT
GGGATGTTTGGAGGAGGTAAGTTCA

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR2FY61TF 588 0 0
GG
ATCTTCCAATTCAGTTTCAACATTTCTCGCTATTCGTCTCGGGTTTTGTTTTGTTGACTG
AGAAAACATGGGAGGTGACAAAGACAGAGGGTTTCATGGGTATCCACCTGCTGGATACCC
GGCCGGTACTGGGGCTTATCCACCAGCTGGATACCCACCACATCAAGGTTATCCTCCACC
ACCTGGTGCCTACCCTCCAGCTCATGGTTATGGAGGTTATCCTCCTGCACCTGCTCATGC
TGGTTATCCTGCTCATCACTCAGGACACGCAGGAGGAATCGGGGGTATGATTGCTGGTGC
TGCAGCAGCCTATGGAGCTCACCACATAGCTCATAGCTCTCACAGTCCTTACGGACACTC
TACATATGGTCACGGATATGGCCATGGTCATGGCTATGGTTATGGTCATGGTCATGGTAA
GTTCAAGCATCACGGAGGCAAGTTTAAACGTGGGCATGGGATGTTTGGAGGAGGTAAGTT
CAAGAAGTGGAAGTGATGCGAAATTCCCCTTTGATATGTCTCTCTGGACTGACCAGATGT
TTAAAATAAATCACAAACATTGTAAGTTAACTTTCGTCGGTCTAGA

QA 3 588 3 588
DS 

RD RR2A861JQ 348 0 0
G
ACGGACACTCTACATAGGGTCACGGATATGGCCATGGTCATGGCTATGGTTATGGTCATG
GTCATGGTAAGTTCAAGCATCACTGAGGCAAGTTTAAACGTGGGCATGGGATGTTTGGAG
GAGGTAAGTTCAAGAAGTGGAAGTGATGCGAAATTCCCCTTTGATATGTCTCTCTGGACT
GACCAGATGTTTAAAATAAATCACAAACATTATAAGTTAACTTTCGTCGGTCTAGAGACC
GCTGGTTCGAATTGGAATAACTCAGACTTAATAAAGAATATGGTACTATATGGAGGTGTC
CTATCAAGCTATCGATGGCTTAATAATGACATATTCTGTTTTTAAAT

QA 2 348 2 348
DS 

RD RR2A861TF 348 0 0
G
ACGGACACTCTACATAGGGTCACGGATATGGCCATGGTCATGGCTATGGTTATGGTCATG
GTCATGGTAAGTTCAAGCATCACTGAGGCAAGTTTAAACGTGGGCATGGGATGTTTGGAG
GAGGTAAGTTCAAGAAGTGGAAGTGATGCGAAATTCCCCTTTGATATGTCTCTCTGGACT
GACCAGATGTTTAAAATAAATCACAAACATTATAAGTTAACTTTCGTCGGTCTAGAGACC
GCTGGTTCGAATTGGAATAACTCAGACTTAATAAAGAATATGGTACTATATGGAGGTGTC
CTATCAAGCTATCGATGGCTTAATAATGACATATTCTGTTTTTAA
AT

QA 2 346 2 346
DS 



AS 1 6

CO CL1261Contig1 708 6 9 U
GGGGGCGTTGGATTCGAGGCGCAACACAGAGATTTGGCATCCAGAGGAAGGAAGAAGAAG
AAGAAGACTGCTCCAATGGCTGATCCTGAACTAGAAGCTATTAGACAGAGGAGAATGCAA
GAGCTCATGGCTCGACATGGCACTGGGAAGCAGGGCAACCAACAGAATCCAGATCAAGAG
AGAGCTCAAGAAGATGCTAAAAGGGAAGCTGATGAACGGAGACAGATGATGCTTAGTCAA
ATATTGTCTTCCCAAGCCCGTGAGAGAATTGCTCGAATTGCCCTTGTGAAACCGGAGAAA
GCTAAAGGTGTTGAGGATGTTATTTTGAGGGCTGCTCAAATGGGACAGATTGTTGAGAAG
GTTTCTGAGGAGCGACTGATAACGCTGTTGGAACAAATAAACAGCCAAACAACCAAACAG
ACAAAAGTCACGATCCAGAGGCGTCGTGGGGTGGACGACGATTAGGAAGAAGAAGAAGAA
GATTATGCGATCTATGGGAGATCTCACTGTTGAGTTCACTAAGATGTACTTAAAAA*TGT
TTATTGTGAGTGAATCTTGATACTCTTTGGAATGAGATCATAAAAGTAAATCTCAAACTG
AAACTCTTCATTTTATCCTTTCTGGCATTTCCTCTGTGAACCATCCCTATCTCTTCTTTT
CTTCCTCTCCTCCTCGCATTGCCTTGTATGGTTTGAATATTAATCTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2DB61JQ C 145
AF RR2DB61TF U 5
AF RR2C692TF U 1
AF RR2CD60TF U 281
AF RR2FR30JQ C 3
AF RR2FR30TF U 3
BS 1 111 RR2C692TF
BS 112 112 RR2DB61TF
BS 113 497 RR2C692TF
BS 498 498 RR2CD60TF
BS 499 520 RR2C692TF
BS 521 521 RR2CD60TF
BS 522 696 RR2C692TF
BS 697 697 RR2CD60TF
BS 698 708 RR2C692TF

RD RR2DB61JQ 392 0 0
GGGAAGCAGGGCAACCAACAGAATCCAGATCAAGAGAGAGCTCAAGAAGATGCTAAAAGG
GAAGCTGATGAACGGAGACAGATGATGCTTAGTCAAATATTGTCTTCCCAAGCCCGTGAG
AGAATTGCTCGAATTGCCCTTGTGAAACCGGAGAAAGCTAAAGGTGTTGAGGATGTTATT
TTGAGGGCTGCTCAAATGGGACAGATTGTTGAGAAGGTTTCTGAGGAGCGACTGATAACG
CTGTTGGAACAAATAAACAGCCAAACAACCAAACAGACAAAAGTCACGATCCAGAGGCGT
CGTGGGGTGGACGACGATTAGGAAGAAGAAGAAGAAGATTATGCGATCTATGGGAGATCT
CACTGTTGAGTTCACTAAGATGTACTTAAAAA

QA 1 392 1 392
DS 

RD RR2DB61TF 607 0 0
GG
GTTGGATTCGAGGCGCAACACAGAGATTTGGCATCCAGAGGAAGGAAGAAGAAGAAGA**
*CTGCTCCAATGGCTGATCCTGAACTAGAAGCTATTAGACAGAGGAGAATGCAAGAGCTC
ATGGCTCGACATGGCACTGGGAAGCAGGGCAACCAACAGAATCCAGATCAAGAGAGAGCT
CAAGAAGATGCTAAAAGGGAAGCTGATGAACGGAGACAGATGATGCTTAGTCAAATATTG
TCTTCCCAAGCCCGTGAGAGAATTGCTCGAATTGCCCTTGTGAAACCGGAGAAAGCTAAA
GGTGTTGAGGATGTTATTTTGAGGGCTGCTCAAATGGGACAGATTGTTGAGAAGGTTTCT
GAGGAGCGACTGATAACGCTGTTGGAACAAATAAACAGCCAAACAACCAAACAGACAAAA
GTCACGATCCAGAGGCGTCGTGGGGTGGACGACGATTAGGAAGAAGAAGAAGAAGATTAT
GCGATCTATGGGAGATCTCACTGTTGAGTTCACTAAGATGTACTTAAAAA*TGTTTATTG
TGAGTGAATCTTGATACTCTTTGGAATGAGATCATAAAAGTAAATCTCAAACTGAAACT
AAAAAA

QA 3 601 3 601
DS 

RD RR2C692TF 708 0 0
GGGGGCGTTGGATTCGAGGCGCAACACAGAGATTTGGCATCCAGAGGAAGGAAGAAGAAG
AAGAAGACTGCTCCAATGGCTGATCCTGAACTAGAAGCTATTAGACAGAGGGGAATGCAA
GAGCTCATGGCTCGACATGGCACTGGGAAGCAGGGCAACCAACAGAATCCAGATCAAGAG
AGAGCTCAAGAAGATGCTAAAAGGGAAGCTGATGAACGGAGACAGATGATGCTTAGTCAA
ATATTGTCTTCCCAAGCCCGTGAGAGAATTGCTCGAATTGCCCTTGTGAAACCGGAGAAA
GCTAAAGGTGTTGAGGATGTTATTTTGAGGGCTGCTCAAATGGGACAGATTGTTGAGAAG
GTTTCTGAGGAGCGACTGATAACGCTGTTGGAACAAATAAACAGCCAAACAACCAAACAG
ACAAAAGTCACGATCCAGAGGCGTCGTGGGGTGGACGACGATTAGGAAGAAGAAGAAGAA
GATTATGCGATCTATGG*AGATCTCACTGTTGAGTTCACTGAGATGTACTTAAAAA*TGT
TTATTGTGAGTGAATCTTGATACTCTTTGGAATGAGATCATAAAAGTAAATCTCAAACTG
AAACTCTTCATTTTATCCTTTCTGGCATTTCCTCTGTGAACCATCCCTATCTCTTCTTTT
CTTCCTCTCCTCCTCGCATTGCCTTGTATGGTTTGA*TATTAATCTAA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2CD60TF 426 0 0
G
CCTTGTGAAACCGGAGAAAGCTAAAGGTGTAGAGGATGTTATTT*GAGGGCTGCTCAAAT
GGGACAGATTGTTGAGAAGGTTTCTGAGGAGCGACTGATAACGCTGTTGGAACAAATAAA
CAGCCAAACTACCAAACAGACAAAAGTCACGATCCAGAGGCGTCGTGGGGTGGACGACAA
TTAGGAAGAAGAAGAAGA***TTATGCGATCTATGGGAGATCTCACTGTTGAGTTCACTA
AGATGTACTTAAAAAATGTTTATTGTGAGTGAATCTTGATACTCTTTGGAATGAGATCAT
AAAAGTAAATCTCAAACTGAAACTCTTCATTTTATCCTTTCTGTCATTTCCTCTGTGAAC
CATCCCTATCTCTTCTTATCTTCCTCTCCTCCTCGCATTGCCTTGTATGGTTTGAATATT
AATCT

QA 2 426 2 426
DS 

RD RR2FR30JQ 689 0 0
GGGC
GTTGGATTCGAGGCGCAACACAGAGATTTGGCATCCAGAGGAAGGAAGAAGAAGAAGAAG
ACTGCTCCAATGGCTGATCCTGAACTAGAAGCTATTAGACAGAGGAGAATGCAAGAGCTC
ATGGCTCGACATGGCACTGGGACGCAGGGCAACCAACAGAATCCAGATCAAGAGAGAGCT
CAAGAAGATGCTAAAAGGGAAGCTGATGAACGGAGACAGATGATGCTTAGTCAAATATTG
TCTTCCCAAGCCCGTGAGAGAATTGCTCGAATTGCCCTTGTGAAACCGGAGAAAGCTAAA
GGTGTTGAGGATGTTATTTTGAGGGCTGCTCAAATGGGACAGATTGTTGAGAAGGTT*CT
GAGGAGCGACTGATAACGCTGTTGGAACAAATAAACAGCCAAACAACCAAACAGACAAAA
GTCACGATCCAGAGGCGTCGTGGGGTGGACGACGATTAGGAAGAAGAAGAAGAAGATTAT
GCGATCTATGGGAGATCTCACTGTTGAGTTCACTAAGATGTACTTAAAAA*TGTTTATTG
TGAGTGAATCTTGATACTCTTTGGAATGAGATCATAAAAGTAAATCTCAAACTGAAACTC
TTCATTTTATCCTTTCTGGCATTTCCTCTGTGAACCATCCCTATCTCTTCTTTTCTTCCT
CTCCTCCTCGCATTGCCTTGTATGG

QA 5 689 5 689
DS 

RD RR2FR30TF 689 0 0
GGGC
GTTGGATTCGAGGCGCAACACAGAGATTTGGCATCCAGAGGAAGGAAGAAGAAGAAGAAG
ACTGCTCCAATGGCTGATCCTGAACTAGAAGCTATTAGACAGAGGAGAATGCAAGAGCTC
ATGGCTCGACATGGCACTGGGACGCAGGGCAACCAACAGAATCCAGATCAAGAGAGAGCT
CAAGAAGATGCTAAAAGGGAAGCTGATGAACGGAGACAGATGATGCTTAGTCAAATATTG
TCTTCCCAAGCCCGTGAGAGAATTGCTCGAATTGCCCTTGTGAAACCGGAGAAAGCTAAA
GGTGTTGAGGATGTTATTTTGAGGGCTGCTCAAATGGGACAGATTGTTGAGAAGGTT*CT
GAGGAGCGACTGATAACGCTGTTGGAACAAATAAACAGCCAAACAACCAAACAGACAAAA
GTCACGATCCAGAGGCGTCGTGGGGTGGACGACGATTAGGAAGAAGAAGAAGAAGATTAT
GCGATCTATGGGAGATCTCACTGTTGAGTTCACTAAGATGTACTTAAAAA*TGTTTATTG
TGAGTGAATCTTGATACTCTTTGGAATGAGATCATAAAAGTAAATCTCAAACTGAAACTC
TTCATTTTATCCTTTCTGGCATTTCCTCTGTGAACCATCCCTATCTCTTCTTTTCTTCCT
CTCCTCCTCGCATTGCCTTGTATGG

QA 5 689 5 689
DS 



AS 2 5

CO CL1262Contig1 670 2 10 U
TATTATTAAGAATCAGAATCAGATTCAGATACATATGTAAGAAGAAAATAAATTATAAAT
CGAGAATGCAACCTTATGGCAATATACACAGAAACACATCCACAGGTGACAGGTCTTGGT
CACAAAAAGTGTCATCCTTATCTTAAAACATTCAAATAAGACTGGCTTTGATGATACACA
CAAAAAGATGAAAACGATCAACGTGAAAATTCATCAGTGTCCACTTGACGTTTTGAAGCT
TTATTTTATGTCTTAATCGAGCTTCACGTTTGAATATAGGAGCGTGTCCTTCGTCAACGG
CATGTACATAAGAAAGTACACCCCAAGGATAGTTGCAATGAGAAGGATTATTCCAGTTAA
CCATGCAAGCGTCAGCCTAACAAGTATAACTGGCGCGATAATGGCTGCACTTGGAACTCC
CTCTACCTCAGCCATCGACCGTGCAGATGAACCATAAGAAGAAGACCCAACGCTTAGGAA
TTAGCGGTTTCTTGATTTACTCTCTCATCAAGGAGAATCACCCCAACAATTTGGCCTTTA
TGAGATGTCTCCAACAGATCGAATAGCTTTGATAGTGTGGCAAGCAGTACATCCATCCCT
TGCTTGGCTATACCTTGTCCATACTCTTGTGCTAAAGCATGGATACCGCCAAAGCGTCCA
ACCGTTAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB45JQ U 1
AF RR2FK89JQ U 7
BS 1 116 RR2GB45JQ
BS 117 117 RR2FK89JQ
BS 118 139 RR2GB45JQ
BS 140 140 RR2FK89JQ
BS 141 207 RR2GB45JQ
BS 208 208 RR2FK89JQ
BS 209 440 RR2GB45JQ
BS 441 441 RR2FK89JQ
BS 442 465 RR2GB45JQ
BS 466 670 RR2FK89JQ

RD RR2GB45JQ 465 0 0
TATTATTAAGAATCAGAATCAGATTCAGATACATATGTAAGAAGAAAATAAATTATAAAT
CGAGAATGCAACCTTATGGCAATATACACAGAAACACATCCACAGGTGACAGGTCT*GGT
CACAAAAAGTGTCATCCTTCTCTTAAAACATTCAAATAAGACTGGCTTTGATGATACACA
CAAAAAGATGAAAACGATCAACGTGAAGATTCATCAGTGTCCACTTGACGTTTTGAAGCT
TTATTTTATGTCTTAATCGAGCTTCACGTTTGAATATAGGAGCGTGTCCTTCGTCAACGG
CATGTACATAAGAAAGTACACCCCAAGGATAGTTGCAATGAGAAGGATTATTCCAGTTAA
CCATGCAAGCGTCAGCCTAACAAGTATAACTGGCGCGATAATGGCTGCACTTGGAACTCC
CTCTACCTCAGCCATCGACCTTGCAGATGAACCATAAGAAGAAGA

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2FK89JQ 664 0 0
TATTATTA
AGAATCAGATTCAGATACATATGTAAGAAGAAAATAAATTATAAATCGAGAATGCAACCT
TATGGCAATATACACAGAAACACATCCACAGGTGACAGGTCTTGGTCACAAAAAGTGTCA
TCCTTATCTTAAAACATTCAAATAAGACTGGCTTTGATGATACACACAAAAAGATGAAAA
CGATCAACGTGAAAATTTATCGGTGTCCACTTGACGTTTTGAAGCTTTATTTTATGTCTT
AATCGAGCTTCACGTTTGAATATAGGAGCGTGTCCTTCGTCAACGGCATGTACATAAGGA
AGTACACCCCAAGGATAGTTGCAATGAGAAGGATTATTCCAGTTAACCATGCAAGCGTCA
GCCTAACAAGTATAACTTGGGCGATAATGGCTGCACTTGGAACTCCCTCTACCTCAGCCA
TCGACCGTGCAGATGAACCATAAGAAGAAGACCCAACGCTTAGGAATTAGCGGTTTCTTG
ATTTACTCTCTCATCAAGGAGAATCACCCCAACAATTTGGCCTTTATGAGATGTCTCCAA
CAGATCGAATAGCTTTGATAGTGTGGCAAGCAGTACATCCATCCCTTGCTTGGCTATACC
TTGTCCATACTCTTGTGCTAAAGCATGGATACCGCCAAAGCGTCCAACCGTTAACT

QA 9 664 9 664
DS 



CO CL1262Contig2 1375 3 25 U
GGTATTGATTGCCAAAGGTGTGTCTACCACTTCCATCACGAAATCTGGCTTTGTCTTGTC
TCCTCCATTAAACTTATCTCTCGCCAGATTAACTCCGATCTCTCTCTCTCCCCCACCCCC
CTCCTTTCTGGTTCTAAAGATACAAGCTTTGTACATATTCGTCGTCTCTCTGCTTCTCAC
CTTCAACTCCAGGGGAGAAGCCATTGGTTCTGTTTTCTTCATTGATGGATCCAACAACCA
ATACCTTCGTCCCTCTTCAGAGCAGGCGCTTCCCATGTCTCTCTCTGAAGTATCTGCAGC
TGTGTCTGCCTTGTTGGGTTTTGCACCTTCATCTACTTTGACACCTGATGGCTCCTCCAA
GCTGAACAAGATTCTAAAACCTAATCCATTTGAGAGGCCTCGTGCTGCTTTTGTGCTAGA
AATCGCTGGAGCTGATGATGCGCTTGTGGAAACCTTACCTAGTCATTCTTTCTTGGACAA
TGCCATTAGAGGCAGTATCAATTCCAATTCTGGAAAAGCTGATATTGAACTTCCAGAGAG
TGGAGTGGCTGTTATGTCTGTCAATGAACCCTCATCTGATGCGACTGATAAAGACATGAA
TGAGTTTGCATCTTGGTTGGGTGGATCATATGTCGCTGGCTCTGCTGAACCATTGACTGG
ATTGCTTAGTATCCCTCTGTCTGGTGGTGCTAACGTGGAGTTCCATTTGGAAAAGGAAGC
AGAGAGAAAATTTGCATCGAACCTTTTGGCTTTATATAAGAATATAAGAGGGGTAGTCAC
TCTTCATGAGGATTTAGCTCATGGTATTGAGAGACCTGCTGAGTTAACGGTTGGACGCTT
TGGCGGTATCAATGCTTTAGCACAAGAGTATGGACAAGGTATAGCCAAACAAGGGATGGA
TGTACTGCTTGCCACACTATCAAAACTATTCGATCTGTTGGAGACATCTCATAAAGGCCA
AATTGTTGGAGTGATTCTCCTTGATGAGAGAGTAAATCAAGAAACCGCTAATCTCCTAAG
CGTTGGGTCTTCTTCTTATGGTTCATCTGCAAGGTCGATGGCTGAGGTAGAGGGAGTTCC
AAGTGCAGCCATTATCGCCCAAGTTATACTTGTTAGGCTGACGCTTGCATGGTTAACTGG
AATAATCCTTCTCATTGCAACTATCCTTGGGGTGTACTTCCTTATGTACATGCCGTTGAC
GAAGGACACGCTCCTATATTCAAACGTGAAGCTCGATTAAGACATAAAATAAACCTTCAA
AACGTCAAGTGGACACTGATAAACTTTCACGTTGATCGTTTTCATCTTTTTGTGTGTATC
ATCAAAGCCAGTCTTATTTGAATGTTTTAAGAGAAGGATGAAACTTTTTGTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB45TF U 1
AF RR2FK89TF U 510
AF RR2AX43JQ C 650
BS 1 581 RR2GB45TF
BS 582 582 RR2FK89TF
BS 583 715 RR2GB45TF
BS 716 720 RR2FK89TF
BS 721 721 RR2AX43JQ
BS 722 772 RR2FK89TF
BS 773 773 RR2AX43JQ
BS 774 795 RR2FK89TF
BS 796 796 RR2AX43JQ
BS 797 850 RR2FK89TF
BS 851 851 RR2AX43JQ
BS 852 888 RR2FK89TF
BS 889 889 RR2AX43JQ
BS 890 924 RR2FK89TF
BS 925 925 RR2AX43JQ
BS 926 969 RR2FK89TF
BS 970 970 RR2AX43JQ
BS 971 1012 RR2FK89TF
BS 1013 1013 RR2AX43JQ
BS 1014 1051 RR2FK89TF
BS 1052 1052 RR2AX43JQ
BS 1053 1204 RR2FK89TF
BS 1205 1205 RR2AX43JQ
BS 1206 1237 RR2FK89TF
BS 1238 1375 RR2AX43JQ

RD RR2GB45TF 721 0 0
GGTATTGATTGCCAAAGGTGTGTCTACCACTTCCATCACGAAATCTGGCTTTGTCTTGTC
TCCTCCATTAAACTTATCTCTCGCCAGATTAACTCCGATCTCTCTCTCTCCCCCACCCCC
CTCCTTTCTGGTTCTAAAGATACAAGCTTTGTACATATTCGTCGTCTCTCTGCTTCTCAC
CTTCAACTCCAGGGGAGAAGCCATTGGTTCTGTTTTCTTCATTGATGGATCCAACAACCA
ATACCTTCGTCCCTCTTCAGAGCAGGCGCTTCCCATGTCTCTCTCTGAAGTATCTGCAGC
TGTGTCTGCCTTGTTGGGTTTTGCACCTTCATCTACTTTGACACCTGATGGCTCCTCCAA
GCTGAACAAGATTCTAAAACCTAATCCATTTGAGAGGCCTCGTGCTGCTTTTGTGCTAGA
AATCGCTGGAGCTGATGATGCGCTTGTGGAAACCTTACCTAGTCATTCTTTCTTGGACAA
TGCCATTAGAGGCAGTATCAATTCCAATTCTGGAAAAGCTGATATTGAACTTCCAGAGAG
TGGAGTGGCTGTTATGTCTGTCAATGAACCCTCATCTGATGTGACTGATAAAGACATGAA
TGAGTTTGCATCTTGGTTGGGTGGATCATATGTCGCTGGCTCTGCTGAACCATTGACTGG
ATTGCTTAGTATCCCTCTGTCTGGTGGTGCTAACGTGGAGTTCCATTTGGAAAAG
AAGCTG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2FK89TF 734 0 0
CTGGAAAAGCTGATATTGAACTTCCAGAGAGTGGAGTGGCTGTTATGTCTGTCAATGAAC
CCTCATCTGATGCGACTGATAAAGACATGAATGAGTTTGCATCTTGGTTGGGTGGATCAT
ATGTCGCTGGCTCTGCTGAACCATTGACTGGATTGCTTAGTATCCCTCTCTCTGGTGGTG
CTAACGTGGAGTTCCATTTGGAAAAGGAAGCTGAGAGAAAATTTGCATCGAACCTTTTGG
CTTTATATAAGAATATAAGAGGGTTAGTCACTCTTCATGAGGATTTGGCTCATGGTATTG
AGAGACCTGCTGAGTTAACGGTTGGACGCTTTGGCGGTATCCATGCTTTAGCACAAGAGT
ATGGACAAGGTATAGCCAAGCAAGGGATGGATGTACTGCTTGCCACACTATCAAAGCTAT
TCGATCTGTTGGAGACATCTCATAAAGGCCAAATTGTTGGGGTGATTCTCCTTGATGAGA
GAGTAAATCAAGAAACCGCTAAT*TCCTAAGCGTTGGGTCTTCTTCTTATGGTTCATCTG
CACGGTCGATGGCTGAGGTAGAGGGAGTTCCAAGTGCAGCCATTATCGCCCAAGTTATAC
TTGTTAGGCTGACGCTTGCATGGTTAACTGGAATAATCCTTCTCATTGCAACTATCCTTG
GGGTGTACTTCCTTATGTACATGCCGTTGACGAAG*ACACGCTCCTATATTCAAACGTGA
AGCTCGAT
AAACAT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2AX43JQ 726 0 0
CCATTGACTGGATTGCTTAGTATCCCTCTGTCTGGTGGTGCTAACGTGGAGTTCCATTTG
GAAAAGGAAGCAGAGAGAAAATTTGCATCGAACCTTTTGGCTTTATATAAGAGTATAAGA
GGGGTAGTCACTCTTCATGAGGATTTAGCTCATGGTATTGAGAGACCTGCTGAGTTAACG
GTTGGACGCTTTGGTGGTATCAATGCTTTAGCACAGGAGTATGGACAAGGTATGGCCAAA
CAAGGGATGGATGTACTGCTTGCCACACTATCAAAACTATTTGATCTGTTGGAGACATCT
CATAAAGGCCAAATTGTTGGAGTGATTCTCCTTGATGAGAGAGTAAGTCAAGAATCCGCT
AATCTGCTAAGCGTTGGGTCTTCTTCTTATGGTTCATCTGCAAGGTCGATGGCTGAGGTA
GAGGGAGTTCCAAGTGCAGCCATTATCGCTCAAGTTATACTTGTTAGGCTGACGCTTGCA
TGGTTAACTGGAATAATCCTTCTCATTGCAACTATCCTTGGGGTGTACTTCCTTATGTAC
ATGCCGTTGACGAAGGACACGCTCCTATATTCAAACGTGAAGCTCGATTAAGACATAAAA
TAAACCTTCAAAACGTCAAGTGGACACTGATAAACTTTCACGTTGATCGTTTTCATCTTT
TTGTGTGTATCATCAAAGCCAGTCTTATTTGAATGTTTTAAGAGAAGGATGAAACTTTTT
GTGACC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 2 6

CO CL1263Contig1 809 2 2 U
GGATACTTCGCCGCGGCGTCTCCGTTATCTCTTCCCGATTCCACTTTTCCCGTCCGTCGG
AGATTTCAAGCAACCCGAATCCCAAAAATGGCGTCGGAGAAGAAGCTATCGAACCCAATG
AGAGATATCAAAGTGCAGAAGCTGGTGCTCAACATCTCAGTCGGTGAGAGTGGAGATCGT
CCCACCAGAGCCTCCAAGGTGCTGGAGCAGTTGAGTGGCCAGACTCCTGTTTTCTCCAAG
GCAAGATACACTGTTCGTTCTTTCGGTATCAGACGTAACGAGAAGATTGCTTGCTACGTG
ACCGTCAGGGGAGACAAAGCTATGCAACTCCTGGAAAGTGGACTTAAAGTTAAAGAGTAT
GAGCTCTTGAGAAGGAACTTCAGCGACACTGGTTGCTTCGGTTTCGGTATTCAGGAGCAC
ATTGATTTGGGTATCAAGTATGACCCGTCGACTGGAATCTACGGTATGGATTTCTATGTT
GTTCTTGAGCGCCCTGGTTACCGCGTGGCGCGTCGCAGAAGATGCAAGGCTCGTGTTGGA
ATCCAGCACAGAGTCACCAAAGATGATGCCATGAGATGGTTCCAAGTGAAGTATGAAGGA
GTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTGGCTAAAACCATCGTCTCCAACAGAGGGAT
CTATTAATCATATAAATATGTGTGCTTTCCCCGGTTTTTTTTTTTTTTTTGATCAACGCT
TTCCCCGGTTTGAATCGTGTTTTCTTAGTTTTGCTATTTCATTTATCAGACATTTGGATA
TCTTTGCCTAATCTACAATGATTGCACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH43TF U 1
AF RR2BH43JQ C 139
BS 1 788 RR2BH43TF
BS 789 809 RR2BH43JQ

RD RR2BH43TF 788 0 0
GGATACTTCGCCGCGGCGTCTCCGTTATCTCTTCCCGATTCCACTTTTCCCGTCCGTCGG
AGATTTCAAGCAACCCGAATCCCAAAAATGGCGTCGGAGAAGAAGCTATCGAACCCAATG
AGAGATATCAAAGTGCAGAAGCTGGTGCTCAACATCTCAGTCGGTGAGAGTGGAGATCGT
CCCACCAGAGCCTCCAAGGTGCTGGAGCAGTTGAGTGGCCAGACTCCTGTTTTCTCCAAG
GCAAGATACACTGTTCGTTCTTTCGGTATCAGACGTAACGAGAAGATTGCTTGCTACGTG
ACCGTCAGGGGAGACAAAGCTATGCAACTCCTGGAAAGTGGACTTAAAGTTAAAGAGTAT
GAGCTCTTGAGAAGGAACTTCAGCGACACTGGTTGCTTCGGTTTCGGTATTCAGGAGCAC
ATTGATTTGGGTATCAAGTATGACCCGTCGACTGGAATCTACGGTATGGATTTCTATGTT
GTTCTTGAGCGCCCTGGTTACCGCGTGGCGCGTCGCAGAAGATGCAAGGCTCGTGTTGGA
ATCCAGCACAGAGTCACCAAAGATGATGCCATGAGATGGTTCCAAGTGAAGTATGAAGGA
GTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTGGCTAAAACCATCGTCTCCAACAGAGGGAT
CTATTAATCATATAAATATGTGTGCTTTCCCCGGTTTTTTTTTTTTTTTTGATCAACGCT
TTCCCCGGTTTGAATCGTGTTTTCTTAGTTTTGCTATTTCATTTATCAGACATTTGGATA
TCTTTGCC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2BH43JQ 671 0 0
AAGCTGGTGCTCAACATCTCAGTCGGTGAGAGTGGAGATCGTCCCACCAGAGCCTCCAAG
GTGCTGGAGCAGTTGAGTGGCCAGACTCCTGTTTTCTCCAAGGCAAGATACACTGTTCGT
TCTTTCGGTATCAGACGTAACGAGAAGATTGCTTGCTACGTGACCGTCAGGGGAGACAAA
GCTATGCAACTCCTGGAAAGTGGACTTAAAGTTAAAGAGTATGAGCTCTTGAGAAGGAAC
TTCAGCGACACTGGTTGCTTCGGTTTCGGTATTCAGGAGCACATTGATTTGGGTATCAAG
TATGACCCGTCGACTGGAATTTACGGTATGGATTTTTATGTTGTTCTTGAGCGCCCTGGT
TACCGCGTGGCGCGTCGCAGAAGATGCAAGGCTCGTGTTGGAATCCAGCACAGAGTCACC
AAAGATGATGCCATGAGATGGTTCCAAGTGAAGTATGAAGGAGTCATTCTCAACAAGTCT
CAGAACATTACTGGCTAAAACCATCGTCTCCAACAGAGGGATCTATTAATCATATAAATA
TGTGTGCTTTCCCCGGTTTTTTTTTTTTTTTTGATCAACGCTTTCCCCGGTTTGAATCGT
GTTTTCTTAGTTTTGCTATTTCATTTATCAGACATTTGGATATCTTTGCCTAATCTACAA
TGATTGCACGC

QA 1 671 1 671
DS 



CO CL1263Contig2 767 4 12 U
GGCCGCGGCGTCTCCGTTATCTCTTTTCGATTCCAGTTTTCCCGTCCGTCGGAGATTTCA
AGCAACCCGAATCCCAAAAATGGCGTCGGAGAAGAAGCTATCGAACCCAATGAGAGATAT
CAAAGTGCAGAAGCTGGTGCTCAACATCTCCGTCGGTGAGAGTGGAGATCGTCTCACCAG
AGCCTCCAAGGTGCTCGAGCAGTTGAGTGGCCAGACTCCTGTTTTCTCCAAGGCAAGATA
CACTGTCCGTTCTTTCGGTATCAGACGTAACGAGAAGATTGCTTGCTACGTGACCGTCAG
GGGAGACAAAGCTATGCAACTCCTTGAAAGTGGACTCAAAGTTAAAGAGTATGAGCTCTT
GAGAAGGAACTTCAGCGACACTGGTTGCTTCGGTTTCGGTATTCAGGAGCACATTGATTT
GGGTATCAAGTATGACCCGTCGACTGGAATCTACGGTATGGATTTCTATGTTGTTCTTGA
GCGCCCTGGTTACCGTGTGGCGCGTCGCAGAAGGTGCAAGGCTCGTGTTGGAATCCAGCA
CAGAGTCACCAAAGATGATGCCATGAAATGGTTCCAAGTGAAATACGAAGGAGTCATTCT
CAACAAGTCTCAGAACATTACTGGCTAAAACCATCCCTCTCGAACAGAGGGATCTATAAT
CATATAAATCTGTGTGTTTTCCCCGGTTCGAATCGTGTTTTCTTAGTTTTGCTATTTCGT
TTATCAGACATTTGGATATCTTTGCCTAGTCTACAATGATTGCACGG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2G868TF U 1
AF RR2HB67TF U 1
AF RR2DJ41JQ C 277
AF RR2DJ41TF U 516
BS 1 536 RR2G868TF
BS 537 537 RR2DJ41TF
BS 538 586 RR2G868TF
BS 587 679 RR2HB67TF
BS 680 680 RR2DJ41TF
BS 681 721 RR2HB67TF
BS 722 722 RR2DJ41TF
BS 723 726 RR2HB67TF
BS 727 728 RR2DJ41TF
BS 729 745 RR2HB67TF
BS 746 765 RR2DJ41TF
BS 766 767 RR2DJ41JQ

RD RR2G868TF 586 0 0
GGCCGCGGCGTCTCCGTTATCTCTTTTCGATTCCAGTTTTCCCGTCCGTCGGAGATTTCA
AGCAACCCGAATCCCAAAAATGGCGTCGGAGAAGAAGCTATCGAACCCAATGAGAGATAT
CAAAGTGCAGAAGCTGGTGCTCAACATCTCCGTCGGTGAGAGTGGAGATCGTCTCACCAG
AGCCTCCAAGGTGCTCGAGCAGTTGAGTGGCCAGACTCCTGTTTTCTCCAAGGCAAGATA
CACTGTCCGTTCTTTCGGTATCAGACGTAACGAGAAGATTGCTTGCTACGTGACCGTCAG
GGGAGACAAAGCTATGCAACTCCTTGAAAGTGGACTCAAAGTTAAAGAGTATGAGCTCTT
GAGAAGGAACTTCAGCGACACTGGTTGCTTCGGTTTCGGTATTCAGGAGCACATTGATTT
GGGTATCAAGTATGACCCGTCGACTGGAATCTACGGTATGGATTTCTATGTTGTTCTTGA
GCGCCCTGGTTACCGTGTGGCGCGTCGCAGAAGGTGCAAGGCTCGTGTTGGAATCCGGCA
CAGAGTCACCAAAGATGATGCCATGAAATGGTTCCAAGTGAAATAC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2HB67TF 745 0 0
G
GCCGCGGCGTCTCCGTTATCTCTTTTCGATTCCAGTTTTCCCGTCCGTCGGAGATTTCAA
GCAACCCGAATCCCAAAAATGGCGTCGGAGAAGAAGCTATCGAACCCAATGAGAGATATC
AAAGTGCAGAAGCTGGTGCTCAACATCTCCGTCGGTGAGAGTGGAGATCGTCTCACCAGA
GCCTCCAAGGTGCTCGAGCAGTTGAGTGGCCAGACTCCTGTTTTCTCCAAGGCAAGATAC
ACTGTCCGTTCTTTCGGTATCAGACGTAACGAGAAGATTGCTTGCTACGTGACCGTCAGG
GGAGACAAAGCTATGCAACTCCTTGAAAGTGGACTCAAAGTTAAAGAGTATGAGCTCTTG
AGAAGGAACTTCAGCGACACTGGTTGCTTCGGTTTCGGTATTCAGGAGCACATTGATTTG
GGTATCAAGTATGACCCGTCGACTGGAATCTACGGTATGGATTTCTATGTTGTTCTTGAG
CGCCCTGGTTACCGTGTGGCGCGTCGCAGAAGGTGCAAGGCTCGTGTTGGAATCCGGCAC
AGAGTCACCAAAGATGATGCCATGAAATGGTTCCAAGTGAAATACGAAGGAGTCATTCTC
AACAAGTCTCAGAACATTACTGGCTAAAACCATCCCTCTCGAACAGAGGGATCTATAATC
ATATAAATCTGTGTGTTT*CCCCGGTTCGAATCGTGTTTTCTTAGTTTTGCTATTTCGTT
*ATCAT*CATTTGGATATCTTTGC

QA 2 745 2 745
DS 

RD RR2DJ41JQ 491 0 0
GATTGCTTGCTACGTGACCGTCAGGGGAGACAAAGCTATGCAACTCCTTGAAAGTGGACT
CAAAGTTAAAGAGTATGAGCTCTTGAGAAGGAACTTCAGCGACACTGGTTGCTTCGGTTT
CGGTATTCAGGAGCACATTGATTTGGGTATCAAGTATGACCCGTCGACTGGAATCTACGG
TATGGATTTCTATGTTGTTCTTGAGCGCCCTGGTTACCGTGTGGCGCGTCGCAGAAGGTG
CAAGGCTCGTGTTGGAATCCAGCACAGAGTCACCAAAGATGATGCCATGAAATGGTTCCA
AGTGAAATACGAAGGAGTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTGGCTAAAACCATCC
CTCTCGAACAGAGGGATCTATAATCATATAAATCTGTGTGTTTTCCCCGGTTCGAATCGT
GTTTTTTTAGTTTTGCTATTTCGTTTATCAGACATTTGGATATCTTTGCCTAGTCTACAA
TGATTGCACGG

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2DJ41TF 250 0 0
CAAG
GGCTCGTGTTGGAATCCAGCACAGAGTCACCAAAGATGATGCCATGAAATGGTTCCAAGT
GAAATACGAAGGAGTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTGGCTAAAACCATCCCTC
TCGAACAGAGGGATCTATAATCATATAAATCTGTGTGTTTTCCCCGGTTCGAATCGTGTT
TTCTTAGTTTTGCTATTTCGTTTATCAGACATTTGGATATCTTTGCCTAGTCTACAATGA
TTGCAC

QA 5 250 5 250
DS 



AS 1 5

CO CL1264Contig1 1180 5 18 U
GCGTGGTACTCTTTTGTCTTTGCACCATTCTGCAACTCTGCGCCATGATGAGTTGGGTCA
GGAAACACTTCTGAATCTGTTGCTTCGCAACTACCTGCACTACAACCTTTATGACCAAGC
TGAGAAGCTGAGATCGAAAGCACCAAGATTTGAGGCCCATTCTAACCAGCAGTTCTGTAG
GTACTTGTTTTACCTCGGTAAAATCCGGACCATCCAACTCGAGTACACTGATGCAAAAGA
GAGCCTCCTCCAGGCGGCTAGGAAAGCACCTGTTGCTGCTCTAGGCTTCAGAGTCCAATG
CAACAAGTGGGCTATTCTAGTTCGACTCCTCTTGGGTGAGATTCCAGAGCGATCCATCTT
CATGCAGAAAGGAATGGACAAGGCTCTTAGGCCATACTTCGAACTTACCAATGCTGTGAG
GATTGGTGACTTGGAGCTCTTCAGGAACGTTCAGGAGAAGTTTGCAAAGACATTCTCTGA
GGACAGGACTCACAACCTCATCGTCAGACTCCGACACAACGTGATCAGAACAGGACTGCG
CAACATCAGCATCTCCTACTCAAGAATCTCTCTAACGGACGTGGCCCAGAAGCTAAGGCT
GAACTCTGCAAACCCTGTCGCAGATGCAGAAAGCATAGTGGCTAAAGCCATAAGAGACGG
AGCAATCGACGCGACCATCGACCACAACAAGGGTTATATGGTGTCGAAGGAAACAGGAGA
CATCTACTCCACGAACGAGCCGCAGAACGCGTTCAACTCGAGGATTGCCTTCTGTTTGAA
CATGCACAACGAAGCGGTGAGAGCGTTGAGGTTCCCTCCAAACACGCACAGGGAGAAAGA
GAGCGAGGAGAAGAGGAGGGAGATGAAACAGCAAGAAGAGGAGCTTGCTAAATACATGGC
TGAAGAAGATGACGACGATTTCTAAAGATTTTATGCAATGCTCTAGCGTTTCTTTGTCTC
TTTTGTTATTTCGAAAATTTCTGACGTTTTTCTTCTTGTTATGGCACTTCAGTTCTTGTA
CTTTATGAGAAACAGAACTCAATGTTTTTTTTACTTGTTTTCATTTTAAGTGCCCATTCA
CTGAAGAATTTGAGTTTAAAAAACATGGCATTTGTAATTGAAGGCAGTTGTAACTCATAA
ATCGAGAGTACTCTTCAAATCTGATCTGAAACTGCTAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ33TF U 1
AF RR2HA62TF U 157
AF RR2AL08JQ C 601
AF RR2AL08TF U 444
AF RR2HA62JQ C 358
BS 1 401 RR2BZ33TF
BS 402 402 RR2HA62TF
BS 403 453 RR2BZ33TF
BS 454 454 RR2HA62TF
BS 455 501 RR2BZ33TF
BS 502 502 RR2HA62TF
BS 503 561 RR2BZ33TF
BS 562 562 RR2HA62TF
BS 563 573 RR2BZ33TF
BS 574 574 RR2HA62TF
BS 575 576 RR2BZ33TF
BS 577 577 RR2HA62TF
BS 578 582 RR2BZ33TF
BS 583 583 RR2HA62TF
BS 584 593 RR2BZ33TF
BS 594 873 RR2HA62TF
BS 874 1052 RR2AL08TF
BS 1053 1180 RR2HA62JQ

RD RR2BZ33TF 593 0 0
GCGTGGTACTCTTTTGTCTTTGCACCATTCTGCAACTCTGCGCCATGATGAGTTGGGTCA
GGAAACACTTCTGAATCTGTTGCTTCGCAACTACCTGCACTACAACCTTTATGACCAAGC
TGAGAAGCTGAGATCGAAAGCACCAAGATTTGAGGCCCATTCTAACCAGCAGTTCTGTAG
GTACTTGTTTTACCTCGGTAAAATCCGGACCATCCAACTCGAGTACACTGATGCAAAAGA
GAGCCTCCTCCAGGCGGCTAGGAAAGCACCTGTTGCTGCTCTAGGCTTCAGAGTCCAATG
CAACAAGTGGGCTATTCTAGTTCGACTCCTCTTGGGTGAGATTCCAGAGCGATCCATCTT
CATGCAGAAAGGAATGGACAAGGCTCTTAGGCCATACTTCGTACTTACCAATGCTGTGAG
GATTGGTGACTTGGAGCTCTTCAGGAACGTTCAAGAGAAGTTTGCAAAGACATTCTCTGA
GGACAGGACTCACAACCTCATTGTCAGACTCCGACACAACGTGATCAGAACAGGACTGCG
CAACATCAGCATCTCCTACTCGAGAATCTCTCTTACAGACGTCGCCCAGAAGC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2HA62TF 733 0 0
G
CATTCTAACCAGCAGTTCTGTAGGTACTTGTTTTACCTCGGTAAAATCCGGACCATCCAA
CTCGAGTACACTGATGCAAAAGAGAGCCTCCTCCAGGCGGCTAGGAAAGCACCTGTTGCT
GCTCTAGGCTTCAGAGTCCAATGCAACAAGTGGGCTATTCTAGTTCGACTCCTCTTGGGT
GAGATTCCAGAGCGATCCATCTTCATGCAGAAAGGAATGGACAAGGCTCTTAGGCCATAC
TTCGAACTTACCAATGCTGTGAGGATTGGTGACTTGGAGCTCTTCAGGAACGTTCAGGAG
AAGTTTGCAAAGACATTCTCTGAGGACAGGACTCACAACCTCATCGTCAGACTCCGACAC
AACGTGATCAGAACAGGACTGCGCAACATCAGCATCTCCTACTCAAGAATCTCTCTAACG
GACGTGGCCCAGAAGCTAAGGCTGAACTCTGCAAACCCTGTCGCAGATGCAGAAAGCATA
GTGGCTAAAGCCATAAGAGACGGAGCAATCGACGCGACCATCGACCACAACAAGGGTTAT
ATGGTGTCGAAGGAAACAGGAGACATCTACTCCACGAACGAGCCGCAGAACGCGTTCAAC
TCGAGGATTGCCTTCTGTTTGAACATGCACAACGAAGCGGTGAGAGCGTTGAGGTTCCCT
CCAAACACGCACAGGGAGAAAGAGAGCGAGGAGAAGAGGAGGGAGATGAAACAGCA
GAAGAGAGCTTGCTAA

QA 2 717 2 717
DS 

RD RR2AL08JQ 452 0 0
GAACTCTGCAAACCCTGTCGCAGATGCAGAAAGCATAGTGGCTAAAGCCATAAGAGACGG
AGCAATGGACGCGACCATCGACCACAACAAGGGTTATATGGTGTGGAAGGAAACAGGAGA
CATTTACTCCACGAACGAGCCGCAGAACGCGTTCAACTCGAGGATTCCCTTCTGTTTGAA
CATGCACAACGAAGCGGTGAGAGCGTTGAGGTTCCCTCCAAACACGCACAGGGAGAAAGA
GAGCGAGGAGAAGAGGAGGGAGATGAAACAGCAAGAAGAGGAGCTTGCTAAATACATGGC
TGAAGAAGATGACGACGATTTTTAAAGATTTTATGCAATGTTCTAGCGTTTCTTTGTTTC
TTTTGTTATTTCGAAAATTTCTGACGTTTTTTTTCTTGTTATGGCACTTCAGTTCTTGTA
CTTTATGAGAAACAAAACTCAATGTTTTTTTT

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2AL08TF 609 0 0
GGAACGTTCAGGAGAAGTTTGCAAAGACATTCTCTGAGGACAGGACTCACAACCTCATCG
TCAGACTCCGACACAACGTGATCAGAACAGGACTGCGCAACATCAGCATCTCCTACTCAA
GAATCTCTCTAACGGACGTGGCCCAGAAGCTAAGGCTGAACTCTGCAAACCCTGTCGCAG
ATGCAGAAAGCATAGTGGCTAAAGCCATAAGAGACGGAGCAATCGACGCGACCATCGACC
ACAACAAGGGTTATATGGTGTCGAAGGAAACAGGAGACATCTACTCCACGAACGAGCCGC
AGAACGCGTTCAACTCGAGGATTGCCTTCTGTTTGAACATGCACAACGAAGCGGTGAGAG
CGTTGAGGTTCCCTCCAAACACGCACAGGGAGAAAGAGAGCGAGGAGAAGAGGAGGGAGA
TGAAACAGCAAGAAGAGGAGCTTGCTAAATACATGGCTGAAGAAGATGACGACGATTTCT
AAAGATTTTATGCAATGCTCTAGCGTTTCTTTGTCTCTTTTGTTATTTCGAAAATTTCTG
ACGTTTTTCTTCTTGTTATGGCACTTCAGTTCTTGTACTTTATGAGAAACAGAACTCAAT
GTTTTTTTT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2HA62JQ 823 0 0
CTTCATGCAGAAAGGAATGGACAAGGCTCTTAGGCCATACTTCGAACTTACCAATGCTGT
GAGGATTGGTGACTTGGAGCTCTTCAGGAACGTTCAGGAGAAGTTTGCAAAGACATTCTC
TGAGGACAGGACTCACAACCTCATCGTCAGACTCCGACACAACGTGATCAGAACAGGACT
GCGCAACATCAGCATCTCCTACTCAAGAATCTCTCTAACGGACGTGGCCCAGAAGCTAAG
GCTGAACTTTGCAAACCCTGTCGCAGATGCAGAAAGCATAGTGGCTAAAGCCATAAGAGA
CGGAGCAATCGACGCGACCATCGACCACAACAAGGGTTATATGGTGTCGAAGGAAACAGG
AGACATTTACTCCACGAACGAGCCGCAGAACGCGTTCAACTCGAGGATTGCCTTCTGTTT
GAACATGCACAACGAAGCGGTGAGAGCGTTGAGGTTCCCTCCAAACACGCACAGGGAGAA
AGAGAGCGAGGAGAAGAGGAGGGAGATGAAACAGCAAGAAGAGGAGCTTGCTAAATACAT
GGCTGAAGAAGATGACGACGATTTCTAAAGATTTTATGCAATGCTCTAGCGTTTCTTTGT
CTCTTTTGTTATTTCGAAAATTTCTGACGTTTTTCTTCTTGTTATGGCACTTCAGTTCTT
GTACTTTATGAGAAACAGAACTCAATGTTTTTTTTACTTGTTTTCATTTTAAGTGCCCAT
TCACTGAAGAATTTGAGTTTAAAAAACATGGCATTTGTAATTGAAGGCAGTTGTAACTCA
TAAATCGAGAGTACTCTTCAAATCTGATCTGAAACTGCTAACG

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 4

CO CL1265Contig1 1078 4 9 U
GGATGATTTAACATAAAGACCCCCATTGGTCCTTCTTGCTTCGAATAAACAACATTTCAG
CGACGAGATCTCTCCTTTTCTCTCTCTCCGGCTTTATATTGGGAAACTGCTTGGACGTAT
TCTCAGATCCGTCAAGTGTAGTTTGATAGATCTTCGAGGAATCAATGGCTCCGGTATCGG
CACTCGCAAAGTATAAGCTGATGTTTCTGGGAGATCAATCCGTGGGGAAGACGAGTATCA
TCACTCGATTCATGTACGACAAATTCGACAACACTTACCAGGCCACAATTGGTATTGATT
TTCTATCCAAGACTATGTACCTTGAAGATCGAACTGTCAGACTTCAGTTGTGGGATACAG
CTGGGCAAGAGAGGTTCAGGAGTCTTATTCCTAGCTATATCAGGGACTCTTCTGTTGCTG
TTATTGTCTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCGTTTCTAAACACTGCTAAGTGGATCGATG
AGGTTAGGACAGAGCGTGGTAGTGATGTCATAGTTGTGCTCGTGGGGAATAAGACCGACC
TTGTAGACAAAAGGCAAGTGTCAATAGAGGAAGCAGAAGCCAAGGCTCGTGAGCTTAATG
TAATGTTCATCGAAACCAGTGCCAAAGCGGGCTTCAACATAAAGGCTCTTTTCCGCAAGA
TAGCAGCAGCTTTGCCCGGAATGGAAACACTGTCTTCAACAAAGCAAGAGGATATGGTTG
ATGTTAATCTCAAGTCGTCCAACGCCAATGCATCTTCGGGTCAGCAGCAATCAGGAGGAT
GCTCTTGTTAAAAACAAAATAGGCAACAAAACGTTATAGAGAACAAAAGAACATACTCAG
AAAAAGCCGCCCTCGCATCATCTGATCCGCTATTATCTTCTTCTATGTGTAAAATTTTTG
CCTTTCTCCTTCATCAGATTTTTTTTGAAAAAGAGTCTACTTGCAAAGTTTATGGTTTGT
CCCCAACTCTAAAACTGTTCTCGTCTTTGGAGTTTTAAATCTATGTTTCACAACTTTTGT
TAAATACTGTGATTTTGTCTGTCGCCAAAAATTGAATTATATAACATTGAGCTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2HA40TF U 45
AF RR2F154TF U 1
AF RR2HA40JQ C 325
AF RR2EA07JQ C 402
BS 1 200 RR2F154TF
BS 201 201 RR2HA40TF
BS 202 774 RR2F154TF
BS 775 775 RR2HA40JQ
BS 776 793 RR2F154TF
BS 794 998 RR2HA40JQ
BS 999 999 RR2EA07JQ
BS 1000 1077 RR2HA40JQ
BS 1078 1078 RR2EA07JQ

RD RR2HA40TF 598 0 0
GG
AAACAACATTTCAGCGACGAGATCTCTCCTTTTCTCTCTCTCCGGCTTTATATTGGGAAA
CTGCTTGGACGTATTCTCAGATCCGTCAAGTGTAGTTTGATAGATCTTCGAGGAATCAAT
GGCTCCGGTATCGGCACTCGCAAAGTATAAGCTGATGTTTCTGGGAGATCAATCCGTGGG
GAAGACGAGTATCATCACTCGATTCATGTACGACAAATTCGACAACACTTACCAGGCCAC
AATTGGTATTGATTTTCTATCCAAGACTATGTACCTTGAAGATCGAACTGTCAGACTTCA
GTTGTGGGATACAGCTGGGCAAGAGAGGTTCAGGAGTCTTATTCCTAGCTATATCAGGGA
CTCTTCTGTTGCTGTTATTGTCTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCGTTTCTAAACACTGC
TAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACAGAGCGTGGTAGTGATGTCATAGTTGTGCTCGTGGG
GAATAAGACCGACCTTGTAGACAAAAGGCAAGTGTCAATAGAGGAAGCAGAAGCCAAGGC
TCGTGAGCTTAATGTAATGTTCATCGAAACCAGTGCCAAAGCGGGCTTCAACATAA

QA 3 598 3 598
DS 

RD RR2F154TF 798 0 0
GGATGATTTAACATAAAGACCCCCATTGGTCCTTCTTGCTTCGAATAAACAACATTTCAG
CGACGAGATCTCTCCTTTTCTCTCTCTCCGGCTTTATATTGGGAAACTGCTTGGACGTAT
TCTCAGATCCGTCAAGTGTAGTTTGATAGATCTTCGAGGAATCAATGGCTCCGGTATCGG
CACTCGCAAAGTATAAGCTGGTGTTTCTGGGAGATCAATCCGTGGGGAAGACGAGTATCA
TCACTCGATTCATGTACGACAAATTCGACAACACTTACCAGGCCACAATTGGTATTGATT
TTCTATCCAAGACTATGTACCTTGAAGATCGAACTGTCAGACTTCAGTTGTGGGATACAG
CTGGGCAAGAGAGGTTCAGGAGTCTTATTCCTAGCTATATCAGGGACTCTTCTGTTGCTG
TTATTGTCTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCGTTTCTAAACACTGCTAAGTGGATCGATG
AGGTTAGGACAGAGCGTGGTAGTGATGTCATAGTTGTGCTCGTGGGGAATAAGACCGACC
TTGTAGACAAAAGGCAAGTGTCAATAGAGGAAGCAGAAGCCAAGGCTCGTGAGCTTAATG
TAATGTTCATCGAAACCAGTGCCAAAGCGGGCTTCAACATAAAGGCTCTTTTCCGCAAGA
TAGCAGCAGCTTTGCCCGGAATGGAAACACTGTCTTCAACAAAGCAAGAGGATATGGTTG
ATGTTAATCTCAAGTCGTCCAACGCCAATGCATCTTCGGGTCAGCAGCAATCAG*AGGAT
GCTCTTGTTAAAA
CAAAT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2HA40JQ 754 0 0
AAGATCGAACTGTCAGACTTCAGTTGTGGGATACAGCTGGGCAAGAGAGGTTCAGGAGTC
TTATTCCTAGCTATATCAGGGACTCTTCTGTTGCTGTTATTGTCTATGATGTTGCAAGCA
GGCAATCGTTTCTAAACACTGCTAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACAGAGCGTGGTAGTG
ATGTCATAGTTGTGCTCGTGGGGAATAAGACCGACCTTGTAGACAAAAGGCAAGTGTCAA
TAGAGGAAGCAGAAGCCAAGGCTCGTGAGCTTAATGTAATGTTCATCGAAACCAGTGCCA
AAGCGGGCTTCAACATAAAGGCTCTTTTCCGCAAGATAGCAGCAGCTTTGCCCGGAATGG
AAACACTGTCTTCAACAAAGCAAGAGGATATGGTTGATGTTAATCTCAAGACGTCCAACG
CCAATGCATCTTCGGGTCAGCAGCAATCAGGAGGATGCTCTTGTTAAAAACAAAATAGGC
AACAAAACGTTATAGAGAACAAAAGAACATACTCAGAAAAAGCCGCCCTCGCATCATCTG
ATCCGCTATTATCTTCTTCTATGTGTAAAATTTTTGCCTTTCTCCTTCATCAGATTTTTT
TTGAAAAAGAGTCTACTTGCAAAGTTTATGGTTTGTCCCCAACTCTAAAACTGTTCTCGT
CTTTGGAGTTTTAAGTCTATGTTTCACAACTTTTGTTAAATACTGTGATTTTGTCTGTCG
CCAAAAATTGAATTATATAACATTGAGCTTATA
C

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2EA07JQ 677 0 0
AGGGACTCTTCTGTTGCTGTTATTGTCTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCGTTTCTAAAC
ACTGCTAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACAGAGCGTGGTAGTGATGTCATAGTTGTGCTC
GTGGGGAATAAGACCGACCTTGTAGACAAAAGGCAAGTGTCAATAGAGGAAGCAGAAGCC
AAGGCTCGTGAGCTTAATGTAATGTTCATCGAAACCAGTGCCAAAGCGGGCTTCAACATA
AAGGCTCTTTTCCGCAAGATAGCAGCAGCTTTGCCCGGAATGGAAACACTGTCTTCAACA
AAGCAAGAGGATATGGTTGATGTTAATCTCAAGTCGTCCAACGCCAATGCATCTTCGGGT
CAGCAGCAATCAGGAGGATGCTCTTGTTAAAAACAAAATAGGCAACAAAACGTTATAGAG
AACAAAAGAACATACTCAGAAAAAGCCGCCCTCGCATCATCTGATCCGCTATTATCTTCT
TCTATGTGTAAAATTTTTGCCTTTCTCCTTCATCAGATTTTTTTTGAAAAAGAGTCTACT
TGCAAAGTTTATGGTTTGTCCCCAACTCTAAAACTGTTCTCGTCTTTGGAGTTTTAAATC
TATGTTTCACAACTTTTGTTAAATACTGTGATTTTGTCTGTCGCCAAAAATTGAATTATA
TAACATTGAGCTTATAT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 2 6

CO CL1266Contig1 1516 4 31 U
CTCTTTCTACAAAAAGTCTTCTTGGTCTTTCAACAAACTCAAGGTTCATATTCTATACAC
TTCCTACTTATCTTTTCTTGATTGTGAATTTTATATATCATCACTTTGAGCCAGTTCTTG
CGGAGCAGGGTGTTTTTTTTTTTACTTTCCAATGAACAGATACAACCAACGCAATCAGCA
ACCTTCTTATATTGCTGATCATTTCAACAGCTTGGATCAGGTGATAACTTCTCTGAGAGA
AGCTGGACTAGAATCTTCAAATTTGATCTTAGGAATTGACTCCACCAAGAGCAATGAGTG
GACAGGAAGACACTCATTCAACAGAAAAAGCCTTCACGCTATTGGTAAAAGACAGAATCC
ATATGAGCAAGCAATATCCATAATTGGTCGTACACTGTCTCCATTTGATGAAGATGATCT
TATACCTTGTTTCGGCTTTGGAGATGTAACAACACGAGATCAATATGTATTCAACTTTTA
TTCCGAGAACAAAAGCTGCGATGGATTTGAAAACGCGGTTAAAAGATACAGAGAGATTGT
TCCACATTTGAAGTTGTCCGGTATTCAAAAAGGATCGGTTTAGTTCTTCTGTCTTAATTT
TAAAAACATTTTTTGTTTTCTTCTCTCGCCTCAGGTCCTACCTCGTTTGCACCGATAATT
AATGCAGCCATCGACATAGCGGAGCAGAACAATATGCAATACCATGTTCTTGTCATTATA
GCAGATGGTCAGGTCACTAGGAATCCAGATTTGCCATTTGGTAGGTTTAGTCCACAGGAA
GAAGCTACTATGAACTCTATAGTGGCAGCTAGCCATTACCCGTTGTCCATAGTCTTGGTT
GGTGTAGGAGATGGACCCTGGGACACAATGAAACAGTTTGATGACAATATCCCTCACCGC
GAATTCGATAACTTCCAGTTTGTGAACTTCACAGAGATAATGTCAGAGCACAAAGACGCA
GCTAAAAAGGAGGCTGCTTTTGCACTCGCAGCTCTAATGGAGATTCCTTTTCAGTACAAG
GCTACATTAAGTCTCGACAGAAAACAAGTGCGTGCTTCCCGTTTGCACCACAAGCCACTC
CCACCACCACTTGAGGTCATAGAGCGTGACAATACCGTTAGAGCAGTGCCAAATCCAGTA
ACAGAAACTGCAGAGAAAAGTGAAAGCACGGCTGCAGTAACACAACCGGTATGTCCGATT
TGCTTGACGAAACCAAAGGACATGGCTTTTAGCTGCGGCCACACTACGTGCAAGGAATGC
GGTGTGGTTGTCAAGACATGCCCAATGTGCAGACAACCAATAACAACGAGGATAAGGCTG
TACACTTGACTACATGAAGCCAAAGACCATATGGTTTAGGCAGCTAAGCTTCATGTCCAT
ACTTTTGTGTACCATATTCAATAGTTCAAGCAGGAGAATAATAAAAACCTAAAATCATGA
GCTGCAAGTAGTTTGTAATAACAGAAAATTCTTAGCTTGACAAAACAATGCGAGAAGAGT
TCTCTTTCTGACAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR93TF U 39
AF RR2BF31TF U 1
AF RR2BF31JQ C 665
AF RR2AR93JQ C 814
BS 1 172 RR2BF31TF
BS 173 173 RR2AR93TF
BS 174 541 RR2BF31TF
BS 542 542 RR2AR93TF
BS 543 740 RR2BF31TF
BS 741 741 RR2BF31JQ
BS 742 764 RR2BF31TF
BS 765 765 RR2BF31JQ
BS 766 815 RR2BF31TF
BS 816 830 RR2BF31JQ
BS 831 831 RR2AR93JQ
BS 832 1115 RR2BF31JQ
BS 1116 1116 RR2AR93JQ
BS 1117 1146 RR2BF31JQ
BS 1147 1148 RR2AR93JQ
BS 1149 1196 RR2BF31JQ
BS 1197 1197 RR2AR93JQ
BS 1198 1259 RR2BF31JQ
BS 1260 1260 RR2AR93JQ
BS 1261 1332 RR2BF31JQ
BS 1333 1333 RR2AR93JQ
BS 1334 1336 RR2BF31JQ
BS 1337 1338 RR2AR93JQ
BS 1339 1376 RR2BF31JQ
BS 1377 1377 RR2AR93JQ
BS 1378 1481 RR2BF31JQ
BS 1482 1482 RR2AR93JQ
BS 1483 1493 RR2BF31JQ
BS 1494 1494 RR2AR93JQ
BS 1495 1506 RR2BF31JQ
BS 1507 1516 RR2AR93JQ

RD RR2AR93TF 697 0 0
GG
AAGGTTCATATTCTATACACTTCCTACTTATCTTTTCTTGATTGTGAATTTTATATATCA
TCACTTTGAGCCAGTTCTTGCGGAGCAGGGTGTTTTTTTTT**ACTTTCCAATGAACAGA
TACAACCAACGGAATCAGCAACCTTCTTATATTGCTGATCATTTCAACAGCTTGGATCAG
GTGATAACTTCTCTGAGAGAAGCTGTACTAGAATCTTCAAATTTGATCTTAGGAATTGAC
TTCACCAAGAGCAATGAGTGGACAGGAAGACACTCATTCAACAGAAAAAGCCTTCACGCT
ATTGGTAAAAGACAGAATCCATATGAGCAAGCAATATCCATAATTGGTCGTACACTGTCT
CCATTTGATGAAGATGATCTTATACCTTGTTTCGGCTTTGGAGATGTAACAACACGAGAT
CAATATGTATTCAACTTTTATTCCGAGAACAAAAGCTGCGATGGATTTGAAAACGCGGTT
AAAAGATACAGAGAGATTGTTCCACATTTGAAGTTGTCCGGTATTCAAAAAGGATCGGTT
TAGTTCTTCTGTCTTAATTTTAAAAACATTTTT*GTTTTCTTCTCTCGCCTCAGGTCCTA
CCTCGTTTGCACCGATAATTAATGCAGCCATCGACATAGTGGAGCAGAACAATATGCAAT
ACCATGTTCTTGTCATTATAGCAGATGGTCAG
TCA

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR2BF31TF 815 0 0
CTCTTTCTACAAAAAGTCTTCTTGGTCTTTCAACAAACTCAAGGTTCATATTCTATACAC
TTCCTACTTATCTTTTCTTGATTGTGAATTTTATATATCATCACTTTGAGCCAGTTCTTG
CGGAGCAGGGTGTTTTTTTTTTTACTTTCCAATGAACAGATACAACCAACGCTATCAGCA
ACCTTCTTATATTGCTGATCATTTCAACAGCTTGGATCAGGTGATAACTTCTCTGAGAGA
AGCTGGACTAGAATCTTCAAATTTGATCTTAGGAATTGACTCCACCAAGAGCAATGAGTG
GACAGGAAGACACTCATTCAACAGAAAAAGCCTTCACGCTATTGGTAAAAGACAGAATCC
ATATGAGCAAGCAATATCCATAATTGGTCGTACACTGTCTCCATTTGATGAAGATGATCT
TATACCTTGTTTCGGCTTTGGAGATGTAACAACACGAGATCAATATGTATTCAACTTTTA
TTCCGAGAACAAAAGCTGCGATGGATTTGAAAACGCGGTTAAAAGATACAGAGAGATTGT
TTCACATTTGAAGTTGTCCGGTATTCAAAAAGGATCGGTTTAGTTCTTCTGTCTTAATTT
TAAAAACATTTTTTGTTTTCTTCTCTCGCCTCAGGTCCTACCTCGTTTGCACCGATAATT
AATGCAGCCATCGACATAGCGGAGCAGAACAATATGCAATACCATGTTCTTGTCATTATA
GCAGATGGTCAGGTCACTAG*AATCCAGATTTGCCATTTGGTAG*TTTAGTCCACAGGAA
GAAGCTACTATGAACTCTATAGTGGCAGCTAGCCA

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR2BF31JQ 842 0 0
CAGCCATCGACATAGCGGAGCAGAACAATATGCAATACCATGTTCTTGTCATTATAGCAG
ATGGTCAGGTCACTAGGAATCCAGATTTGCCATTTGGTAGGTTTAGTCCACAGGAAGAAG
CTACTATGAACTCTATAGTGGCAGCTAGCCATTACCCGTTGTCCATCGTCTTGGTTGGTG
TAGGAGATGGACCCTGGGACACAATGAAACAGTTTGATGACAATATCCCTCACCGCGAAT
TCGATAACTTCCAGTTTGTGAACTTCACAGAGATAATGTCAGAGCACAAAGACGCAGCTA
AAAAGGAGGCTGCTTTTGCACTCGCAGCTCTAATGGAGATTCCTTTTCAGTACAAGGCTA
CATTAAGTCTCGACAGAAAACAAGTGCGTGCTTCCCGTTTGCACCACAAGCCACTCCCAC
CACCACTTGAGGTCATAGAGCGTGACAATACTGTTAGAGCAGTGCCAAATCCAGTAACAG
AATTTGCAGAGAAAAGTGAAAGCACGGCTGCAGTAACACAACCGGTATGTCCTATTTGCT
TGACGAAACCAAAGGACATGGCTTTTAGCTGCGGCCACACTACGTGCAAGGAATGTGGTG
TGGTTGTCAAGACATGCCCAATGTGCAGACAACCAATAACAACGAGGATAAGGCTGTACA
CTTGACTAGATGCGGCCAAAGACCATATGGTTTAGGCAGCTAAGCTTCATGTTCATACTT
TTGTGTACCATATTCAATAGTTCAAGCAGGAGAATAATAAAAACCTAAAATCATGAGCTG
CAAGTAGTTTGTAATAACAGAAAATTCTTAGCTTGACGAAACAATGCGATAAGAGTTCTC
TT

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR2AR93JQ 703 0 0
CATTATT
CGTTGTCCATAGTCTTGGTTGGTGTAGGAGATGGACCCTGGGACACAATGAAACAGTTTG
ATGACAATATCCCTCACCGCGAATTCGATAACTTCCAGTTTGTGAGCTTCACAGAGATAA
TGTCAGAGCACAAAGACGCAGCTAAAAAGGAGGCTGCTTTTGCACTCGCAGCTCTAATGG
AGATTCCTTTTCAGTACAAGGCTACATTAAGTCTCGA***AAAACAAGTGCGTGCTTCCC
GTTTGCACCAGAAGCCACTCCCACCACCACTTGAGGTCATAGAGCGTGACAATGCCGTTA
GAGCAGTGCCAAATCCAGTAACAGAAACTGCAGAGAAAAGTGAAAGCACGGCTGCAGTAA
CACAACCGGTATGTCCGATTTGCTTGACGAAACCGAAGGACATGGCTTTTAGCTGCGGCC
ACACTACGTGCAAGGAATGCGGTGTGGTTGTCACGACATGCCCAATGTGCAGACAACCAA
TAACAACGAGGATACGGCTGTACACTTGACTCCATGAAGGCAAAGACCATATGGTTTAGG
CAGCTAAGCTTCATGTCCATACTTTTGTGTACCATATTCAATAGTTCAAGCAGGAGAATA
ATAAAAACCTAAAATCATGAGCTGCAAGTAGTTTGTAATAACTGAAAATTCTTAGCTTGA
CAAAACAATGCGAGAAGAGTTGTCTTTCTGACAGGT

QA 8 703 8 703
DS 



CO CL1266Contig2 841 2 4 U
GGGATTGTGAATTTTATATATCATCACTTTGAGCCAGTTCTTGCGGAGCAGGGTGTTTTT
TTTTTACTTTCCAATGAACAGATGCAACCAACGGAATCAGCAACCTTCTTATATTGCTGA
TCATTTCAACAGCTTGGATCAGGTGATAACTTCTCTGAGAGAAGCTGGACTAGAATCTTC
AAATTTGATCTTAGGAATTGACTTCCCCAAGAGCAATGAGTGGACAGGAAGACACTCATT
CAACAGAAAAAGCCTTCACGCTATTGGTAAAAGACAGAATCCATATGAGCAAGCAATATC
CATAATTGGTCGTACACTGTCTCCATTTGATGAAGATGATCTTATACCTTGTTTCGGCTT
TGGAGATGTAACAACACGAGATCAATATGTATTCAACTTTTATTCCGAGAACAAAAGCTG
CGATGGATTTGAAAACGCGGTTAAAAGATACAGAGAGATTGCTCCACATTTGAAGTTGTC
CGGTCCTACCTCGTTTGCACCGATAATTAATGCAGCCATCGACATAGTGGAGCAGAACAA
TATGCAATACCATGTTCTTGTCATTATAGCAGATGGTCAGGTGCAAGGAATGCGGTGTGG
TTGTCACGACATGCCCAATGTGCAGACAACCAATAACAACGAGGATACGGCTGTACACTT
GACTCCATGAAGGCAAAGACCATATGGTTTAGGCAGTTAAGCTTCATGTCCATACTTTTG
TGTACCATATTCAATAGTTCAAGCAGGAGAATAATAAAAACCTAAAATCATGAGCTGCAA
GTAGTTTGTAATAACTGAAAATTTTTAGCTTGACAAAACAATGCGAGAAGAGTTGTCTTT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2E944TF U 1
AF RR2E944JQ C 191
BS 1 536 RR2E944TF
BS 537 537 RR2E944JQ
BS 538 576 RR2E944TF
BS 577 841 RR2E944JQ

RD RR2E944TF 576 0 0
GGGATTGTGAATTTTATATATCATCACTTTGAGCCAGTTCTTGCGGAGCAGGGTGTTTTT
TTTTTACTTTCCAATGAACAGATGCAACCAACGGAATCAGCAACCTTCTTATATTGCTGA
TCATTTCAACAGCTTGGATCAGGTGATAACTTCTCTGAGAGAAGCTGGACTAGAATCTTC
AAATTTGATCTTAGGAATTGACTTCCCCAAGAGCAATGAGTGGACAGGAAGACACTCATT
CAACAGAAAAAGCCTTCACGCTATTGGTAAAAGACAGAATCCATATGAGCAAGCAATATC
CATAATTGGTCGTACACTGTCTCCATTTGATGAAGATGATCTTATACCTTGTTTCGGCTT
TGGAGATGTAACAACACGAGATCAATATGTATTCAACTTTTATTCCGAGAACAAAAGCTG
CGATGGATTTGAAAACGCGGTTAAAAGATACAGAGAGATTGCTCCACATTTGAAGTTGTC
CGGTCCTACCTCGTTTGCACCGATAATTAATGCAGCCATCGACATAGTGGAGCAGA*CAA
TATGCAATACCATGTTCTTGTCATTATAGCAGATGG

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2E944JQ 651 0 0
TTAGGAATTGACTTCCCCAAGAGCAATGAGTGGACAGGAAGACACTCATTCAACAGAAAA
AGCCTTCACGCTATTGGTAAAAGACAGAATCCATATGAGCAAGCAATATCCATAATTGGT
CGTACACTGTCTCCATTTGATGAAGATGATTTTATACCTTGTTTCGGCTTTGGAGATGTA
ACAACACGAGATCAATATGTATTCAACTTTTATTCCGAGAACAAAAGCTGCGATGGATTT
GAAAACGCGGTTAAAAGATACAGAGAGATTGCTCCACATTTGAAGTTGTCCGGTCCTACC
TCGTTTGCACCGATAATTAATGCAGCCATCGACATAGTGGAGCAGAACAATATGCAATAC
CATGTTCTTGTCATTATAGCAGATGGTCAGGTGCAAGGAATGCGGTGTGGTTGTCACGAC
ATGCCCAATGTGCAGACAACCAATAACAACGAGGATACGGCTGTACACTTGACTCCATGA
AGGCAAAGACCATATGGTTTAGGCAGTTAAGCTTCATGTCCATACTTTTGTGTACCATAT
TCAATAGTTCAAGCAGGAGAATAATAAAAACCTAAAATCATGAGCTGCAAGTAGTTTGTA
ATAACTGAAAATTTTTAGCTTGACAAAACAATGCGAGAAGAGTTGTCTTTC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 6

CO CL1267Contig1 767 6 9 U
GAGTCTTTCTCCGTAGAAGAAGACACTCGACAGCTCCTCAAGCCATGGGTATCGATCTTA
TCGCTGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGGACAGCTCCTAAGTCCGATGATGTCTACC
TCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATG
CTGTGATTCTTAAGAGACTTTTCATGAGCAAGGTCAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCTA
AGCTCGTGGAGTTTATGAAGGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACTATTA
CCGATGATTTGAGAGTGCACGAGATCCCTGCCATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACAG
AGAGGGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGGAGAGTGCTTGACCTTTGATCAGCTTG
CTCTCGTTGCTCCTTTGGGACAGAACACAGTTCTTCTTAGGGGACCAAAGAACTCGCGTG
AAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCGCACAGTCACTCCAAGCCTTATG
TTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCCAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGCTTCA
AGGTCTAAGATTGGTTTCGTTATGGTTGGTTTCGTTATCGAGATTTTGTTGCACAACTCT
TGTTCCTCTTCGCCTTTTGCAGACATTGTTTTGAGCTCTCTATCTTTCTGTTCTACTCGA
CAATTAAATGTTTTTCCTAATCTCCCTTTTAAGAGTTTAGTTATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2DU18TF U 1
AF RR2AK60TF U 327
AF RR2B992JQ C 11
AF RR2B992TF U 11
AF RR2AK60JQ C 63
AF RR2DU18JQ C 240
BS 1 234 RR2DU18TF
BS 235 235 RR2B992TF
BS 236 459 RR2DU18TF
BS 460 460 RR2B992TF
BS 461 489 RR2DU18TF
BS 490 490 RR2B992TF
BS 491 540 RR2DU18TF
BS 541 764 RR2B992TF
BS 765 767 RR2DU18JQ

RD RR2DU18TF 540 0 0
GAGTCTTTCTCCGTAGAAGAAGACACTCGACAGCTCCTCAAGCCATGGGTATCGATCTTA
TCGCTGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGGACAGCTCCTAAGTCCGATGATGTCTACC
TCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATG
CTGTGATTCTTAAGAGACTTTTCATGAGCAAGGTCAACAAAGCTCCTCTTTCGCCCTCTA
AGCTCGTGGAGTTTATGAAGGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACTATTA
CCGATGATTTGAGAGTGCACGAGATCCCTGCCATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACAG
AGAGGGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGGAGAGTGCTTGACCTTTGATCAGCTTG
CTCTCGTTGCTCCTTTGGGACAGAACACAGTTCTTCTTATGGGACCAAAGAACTCGCGTG
AAGCAGTGAGGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCGCACAGTCACTCCAAGCCTTATG

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2AK60TF 392 0 0
CCTGCCATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACAGAGAGGGCTAGGGCTAGGATTGAGAAA
GCTGGTGGAGAGTGCTTGACCTTTGATCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAAC
ACAGTTCTTCTTAGGGGACCAAAGAACTCGCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCT
CCTGGTGTGCCGCACAGTCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAG
AAAGCCAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGCTTCAAGGTCTAAGATTGGTTTCGTTAT***
************CGAGATTTTGTTTCACAACTCTTGTTCCTCTTCGCCTTTTGCAGACAT
TGTTTTGAGCTCTCTATCTTTATGTTCTACTC

QA 1 392 1 392
DS 

RD RR2B992JQ 754 0 0
GG
GTAGAAGAAGACACTCGACAGCTCCTCAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCTGGAGGTA
AGAGCAAGAAGACCAAAAGGACAGCTCCTAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCG
TCAAGCTGTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATTCTTA
AGAGACTTTTCATGAGCAAGGTCAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCTAAGCTCGTGGAGT
TTATGAAGGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACTATTACCGATGATTTGA
GAGTGTACGAGATCCCTGCCATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACAGAGAGGGCTAGGG
CTAGGATTGA*AAAGCTGGTGGAGAGTGCTTGACCTTTGATCAGCTTGCTCTCGTTGCTC
CTTTGGGACAGAACACAGTTCTTCTTAGGGGACCAAAGAACTCGCGTGAAGCAGTGAAGC
ACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCGCACAGTCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGG
GAAGGAAGTTTGAGAAAGCCAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGCTTCAAGGTCTAAGATT
GGTTTCGTTATGGTTGGTTTCGTTATCGAGATTTTGTTGCACAACTCTTGTTCCTCTTCG
CCTTTTGCAGACATTGTTTTGAGCTCTCTATCTTTCTGTTCTACTCGACAATTAAATGTT
TTTCCTAATCTCCCTTTTAAGAGTTTAGTTAT

QA 3 754 3 754
DS 

RD RR2B992TF 754 0 0
GG
GTAGAAGAAGACACTCGACAGCTCCTCAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCTGGAGGTA
AGAGCAAGAAGACCAAAAGGACAGCTCCTAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCG
TCAAGCTGTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATTCTTA
AGAGACTTTTCATGAGCAAGGTCAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCTAAGCTCGTGGAGT
TTATGAAGGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACTATTACCGATGATTTGA
GAGTGTACGAGATCCCTGCCATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACAGAGAGGGCTAGGG
CTAGGATTGA*AAAGCTGGTGGAGAGTGCTTGACCTTTGATCAGCTTGCTCTCGTTGCTC
CTTTGGGACAGAACACAGTTCTTCTTAGGGGACCAAAGAACTCGCGTGAAGCAGTGAAGC
ACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCGCACAGTCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGG
GAAGGAAGTTTGAGAAAGCCAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGCTTCAAGGTCTAAGATT
GGTTTCGTTATGGTTGGTTTCGTTATCGAGATTTTGTTGCACAACTCTTGTTCCTCTTCG
CCTTTTGCAGACATTGTTTTGAGCTCTCTATCTTTCTGTTCTACTCGACAATTAAATGTT
TTTCCTAATCTCCCTTTTAAGAGTTTAGTTAT

QA 3 754 3 754
DS 

RD RR2AK60JQ 659 0 0
GCC
GGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAG
CTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTG
ATTCTTAAGAGGCCTTTCATGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTTTAAGCTC
GTGGAGTTTATGAAGGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACTATTACCGAT
GATTTGAGAGTGCACGAGATCCCTGCCATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACAGAGAGG
GCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGGAGAGTGCTTGACCTTTGATCAGCTTGCTCTC
GTTGCTCCATTGGGACAGAACACAGTTCTTCTTAGGGGACCAAAGAACTCGCGTGAAGCA
GTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCGCACAGTCACTCCAAGCCTTATGTTAGG
TTTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCCAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGCTTCAAGGTT
TAAGATTGGTTTCGTTAT***************CGAGATTTTGTTTCACAACTCTTGTTC
CTTTTCGCCTTTTGCAGACATTGTTTTGAGCTCTCTATCTTTATGTTTTACTCGAC

QA 4 659 4 659
DS 

RD RR2DU18JQ 528 0 0
AAGCTCGTGGAGTTTATGAAGGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACTATT
ACCGATGATTTGAGAGTGCACGAGATCCCTGCCATGAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACA
GAGAGGGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGGAGAGTGCTTGACCTTTGATCAGCTT
GCTCTCGTTGCTCCTTTGGGACAGAACACAGTTCTTCTTAGGGGACCAAAGAACTCGCGT
GAAGCAGTGAGGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCGCACAGTCACTCCAAGCCTTAT
GTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCCAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGCTTC
AAGGTCTAAGATTGGTTTCGTTATGGTTGGTTTCGTTATCGAGATTTTGTTGCACAACTC
TTGTTCCTCTTCGCCTTTTGCAGACATTGTTTTGAGCTCTCTATCTTTCTGTTCTACTCG
ACAATTAAATGTTTTTCCTAATCTCCCTTTTAAGAGTTTAGTTATACC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 6

CO CL1268Contig1 1412 6 27 U
GGGGAGAGTACCAAACCACAGAGAGAGTAAACAATTAAATACAAAGAGAACCCCAAAGAA
GCTAATATTTACCGTTTCGCCGCTAAGTTTGTATTTCCGAACATCTAACACCCTCAACGA
AGTTTAACGCCGCCATGTGTGGAGGAGCTATAATCTCCGATTTCATCCCTCCGCCGAAGT
CCCGCCGCGTCACCAGCGAGTTTATCTGGCCGGATCTGAAAAACTCGAAGAAGAAGTCGA
AGAGGCGATCCAGTTTCTTCGATCTGGACGACGAATTCGAGGCTGATTTCAAAGGGTTCA
AGGATGATGATGATTATTCTTCTTTTGACTGCGAAGATGCGAAGAAGCCCTTTGTCTTCA
CCGCACCTACCAAACTCGTAGCTTCCCGTCCCACCACTGGTTCAGTTTCTTGCAAGAAGA
CCGTAGGGTCCGATGAGAAATCTGGCAAGAGGAAGAGAAAGAATCAGTACAGGGGGATTA
GGCCGCGCCCATGGGGAAAATGGGCTGCTGAGATCCGTGATCCTAGAAAAGGCTCTCGAG
AGTGGCTTGGAACGTTCGACACCGCTGAGGAAGCAGCAAGAGCTTATGATGCAGCTGCAC
GTAGGATCCGTGGCGATAAAGCTAAAGTGAACTTCCCCGAAGAGAAGATGGTTCCTACTG
GTAAGACCAGTAATCTTAAGAAGCCAGTGGCTAAACCAAACCAAACCGTAGCTTTGGTTC
AGCAGCCAACACATCTGAGTCAGTACTGCAACAACAACTCCTTTGACAACATGGGACATG
ACTCATTTGGTGATGTGGGTTTCGTTGAAGAGAAGCCTCAGATGTACAACAATCAGTTCT
TCGACGTTGGACAGTATTTCAGTTCTGATCAGGGCAGCGACTCATTCGACTGTTCTGAGT
TTGGGTGGAGTGATCATGGCCCCAAGACACCACCAGAGATCTCCTCAATGCTAGTCAATA
ACAACCATGCTGAAGAGACGAATGCAGCCAAGAAGGTCAAACTCAACTCTGAGGACGAGA
CGAGCAACAGTGATGATCTGATGGCATACCTTGACAACGCCATGTGGGAGTCTCCTTTAG
AAGTGGAAGATATGCTCGGCGTAGATGCTGCTGCTGGTGTGACTCAGGAAGAGGGAAACC
CAATGGAGCTTTGGAGCTTAGATGATATCAACTCCATGCTGGATGGAGGAGTCTTCTGAA
GTGTGATTGAATGATGGGTTGGCCTAGTTTGTAAATAGAGCTGTTTTTGTGTGTGTTGGT
GAGTTTCAAAAGCCCATTGTGAAGACAAACAGCGGTTTACTTTAAATCTTCAGTTTAGTT
TTTGTGTTTGTTGTTGTCTCACTGGGTTTTGTTTTGTATCCCCCAAGGCTTGTTTAACAT
TAATAATAATAACAATGTTGGAACCTCTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK93TF U 1
AF RR2E721TF U 138
AF RR2E721JQ C 697
AF RR2GE89TF U 671
AF RR2GE89JQ C 711
AF RR2FK93JQ C 723
BS 1 245 RR2FK93TF
BS 246 246 RR2E721TF
BS 247 348 RR2FK93TF
BS 349 349 RR2E721TF
BS 350 355 RR2FK93TF
BS 356 356 RR2E721TF
BS 357 483 RR2FK93TF
BS 484 484 RR2E721TF
BS 485 728 RR2FK93TF
BS 729 729 RR2E721TF
BS 730 750 RR2FK93TF
BS 751 751 RR2E721TF
BS 752 753 RR2FK93TF
BS 754 756 RR2E721TF
BS 757 767 RR2FK93TF
BS 768 768 RR2GE89TF
BS 769 788 RR2FK93TF
BS 789 808 RR2E721TF
BS 809 809 RR2GE89TF
BS 810 828 RR2E721TF
BS 829 1367 RR2GE89TF
BS 1368 1368 RR2GE89JQ
BS 1369 1376 RR2GE89TF
BS 1377 1377 RR2GE89JQ
BS 1378 1397 RR2GE89TF
BS 1398 1405 RR2GE89JQ
BS 1406 1412 RR2FK93JQ

RD RR2FK93TF 788 0 0
GGGGAGAGTACCAAACCACAGAGAGAGTAAACAATTAAATACAAAGAGAACCCCAAAGAA
GCTAATATTTACCGTTTCGCCGCTAAGTTTGTATTTCCGAACATCTAACACCCTCAACGA
AGTTTAACGCCGCCATGTGTGGAGGAGCTATAATCTCCGATTTCATCCCTCCGCCGAAGT
CCCGCCGCGTCACCAGCGAGTTTATCTGGCCGGATCTGAAAAACTCGAAGAAGAAGTCGA
AGAGGTGATCCAGTTTCTTCGATCTGGACGACGAATTCGAGGCTGATTTCAAAGGGTTCA
AGGATGATGATGATTATTCTTCTTTTGACTGCGAAGATGCGAAGAAGCTCTTTGT*TTCA
CCGCACCTACCAAACTCGTAGCTTCCCGTCCCACCACTGGTTCAGTTTCTTGCAAGAAGA
CCGTAGGGTCCGATGAGAAATCTGGCAAGAGGAAGAGAAAGAATCAGTACAGGGGGATTA
GGCTGCGCCCATGGGGAAAATGGGCTGCTGAGATCCGTGATCCTAGAAAAGGCTCTCGAG
AGTGGCTTGGAACGTTCGACACCGCTGAGGAAGCAGCAAGAGCTTATGATGCAGCTGCAC
GTAGGATCCGTGGCGATAAAGCTAAAGTGAACTTCCCCGAAGAGAAGATGGTTCCTACTG
GTAAGACCAGTAATCTTAAGAAGCCAGTGGCTAAACCAAACCAAACCGTAGCTTTGGTTC
AGCAGCCA*CACATCTGAGTCAGTACTGCA*CAC**ACTCCTTTGACGACATGGGACATG
ACTCATTT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2E721TF 692 0 0
TGTGGAGGAGCTATAATCTCCGATTTCATCCCTCCGCCGAAGTCCCGCCGCGTCACCAGC
GAGTTTATCTGGCCGGATCTGAAAAACTCGAAGAAGAAGTCGAAGAGGCGATCCAGTTTC
TTCGATCTGGACGACGAATTCGAGGCTGATTTCAAAGGGTTCAAGGATGATGATGATTAT
TCTTCTTTTGACTGCGAAGATGCGAAGAAGCCCTTTGTCTTCACCGCACCTACCAAACTC
GTAGCTTCCCGTCCCACCACTGGTTCAGTTTCTTGCAAGAAGACCGTAGGGTCCGATGAG
AAATCTGGCAAGAGGAAGAGAAAGAATCAGTACAGGGGGATTAGGCCGCGCCCATGGGGA
AAATGGGCTGCTGAGATCCGTGATCCTAGAAAAGGCTCTCGAGAGTGGCTTGGAACGTTC
GACACCGCTGAGGAAGCAGCAAGAGCTTATGATGCAGCTGCACGTAGGATCCGTGGCGAT
AAAGCTAAAGTGAACTTCCCCGAAGAGAAGATGGTTCCTACTGGTAAGACCAGTAATCTT
AAGAAGCCAGTGGCTAAACCAAACCAAACCGTAGCTTTGGTTCAGCAGCCAACACATCTG
AGTCAGTACTGCAACAACAACTCCTTTGAC*ACATGGGACATGACTCATTTGGTGATGTG
GGTTTCGTTGA*GAGAAGCCTCAGATGTACA
C

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2E721JQ 672 0 0
CA
AACCAAACCGTAGCTTTGGTTCAGCAGCCAACACATCTGAGTCAGTACTGCAACAACAAC
TCCTTTGACAACATGGGACATGACTCATTTGGTGATGTGGGTTTCGTTGAAGAGAAGCCT
CAGATGTACAACAATCAGTTCTTCGACGTTGGACAGTATTTCAGTTCTGATCAGGGCAGC
GACTCATTCGACTGTTCTGAGTTTGGGTGGAGTGATCATGGCCCCAAGGCACCACCAGAG
ATCTCCTCAATGCTAGTCAATAACAACCATGCTGAAGAGACGAATGCAGCCAAGAAGGTC
AAACTCAACTCTGAGGACGAGACGAGCAACAGTGATGATCTGATGGCATACCTTGACAAC
GCCATGTGGGAGTCTCCTTTAGAAGTGGAAGATATGCTCGGCGTAGATGCTGCTGCTGGT
GTGACTCAGGAAGAGGGAAACCCAATGGAGCTTTGGAGCTTAGATGATATCAACTCCATG
CTGGATGGAGGAGTCTTCTGAAGTGTGATTGAATGATGGGTTGGCCTAGTTTGTAAATAG
AGCTGTTTTTGTGTGTGTTGGTGAGTTTCAAAAGCCCATTGTGAAGACAAACAGCGGTTT
ACTTTAAATCTTCAGTTTAGTTTTTGTGTTTGTTGTTGTCTCACTGGGTTTTGTTTTGTA
TCCCCCAAG
G

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR2GE89TF 727 0 0
G
AATCTTAAGAAGCCAGTGGCTAAACCGAACCAAACCGTAGCTTTGGTTCAGCAGCCAACA
CATCTGAGTCAGTACTGCAACAACAACTCCTTTGACAACATGGGACATGACTCATTTGGT
GATGTGGGTTTCGTTGAAGAGAAGCCTCTGATGTACAACAATCAGTTCTTCGACGTTGGA
CAGTATTTCAGTTCTGATCAGGGCAGCGACTCATTCGACTGTTCTGAGTTTGGGTGGAGT
GATCATGGCCCCAAGACACCACCAGAGATCTCCTCAATGCTAGTCAATAACAACCATGCT
GAAGAGACGAATGCAGCCAAGAAGGTCAAACTCAACTCTGAGGACGAGACGAGCAACAGT
GATGATCTGATGGCATACCTTGACAACGCCATGTGGGAGTCTCCTTTAGAAGTGGAAGAT
ATGCTCGGCGTAGATGCTGCTGCTGGTGTGACTCAGGAAGAGGGAAACCCAATGGAGCTT
TGGAGCTTAGATGATATCAACTCCATGCTGGATGGAGGAGTCTTCTGAAGTGTGATTGAA
TGATGGGTTGGCCTAGTTTGTAAATAGAGCTGTTTTTGTGTGTGTTGGTGAGTTTCAAAA
GCCCATTGTGAAGACAAACAGCGGTTTACTTTAAATCTTCAGTTTAGTTTTTGTGTTTGT
TGTTGTCTCACTGGGTTTTGTTTTGTATCCCCCAAG*CTTGTTTA*CATTAATAATAATA
ACAATG

QA 2 727 2 727
DS 

RD RR2GE89JQ 695 0 0
GCTTTGGTTCAGCAGCCAACACATCTGAGTCAGTACTGCAACAACAACTCCTTTGACAAC
ATGGGACATGACTCATTTGGTGATGTGGGTTTCGTTGAAGAGAAGCCTCTGATGTACAAC
AATCAGTTCTTCGACGTTGGACAGTATTTCAGTTCTGATCAGGGCAGCGACTCATTCGAC
TGTTCTGAGTTTGGGTGGAGTGATCATGGCCCCAAGACACCACCAGAGATCTCCTCAATG
CTAGTCAATAACAACCATGCTGAAGAGACGAATGCAGCCAAGAAGGTCAAACTCAACTCT
GAGGACGAGACGAGCAACAGTGATGATCTGATGGCATACCTTGACAACGCCATGTGGGAG
TCTCCTTTAGAAGTGGAAGATATGCTCGGCGTAGATGCTGCTGCTGGTGTGACTCAGGAA
GAGGGAAACCCAATGGAGCTTTGGAGCTTAGATGATATCAACTCCATGCTGGATGGAGGA
GTCTTCTGAAGTGTGATTGAATGATGGGTTGGCCTAGTTTGTAAATAGAGCTGTTTTTGT
GTGTGTTGGTGAGTTTCAAAAGCCCATTGTGAAGACAAACAGCGGTTTACTTTAAATCTT
CAGTTTAGTTTTTGTGTTTGTTGTTGTCTCACTGGGTTTTGTTTTGTATCCCCCAAGGCT
TGTTTAACATTAATAATAATAACAATGTTGGAACC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2FK93JQ 690 0 0
CAGCCAACACATCTGAGTCAGTACTGCAACAACAACTCCTTTGACGACATGGGACATGAC
TCATTTGGTGATGTGGGTTTCGTTGAAGAGAAGCCTCAGATGTACAACAATCAGCTCTTC
GACGTTGGACAGTATTTCAGTTCTGATCAGGGCAGCGACTCATTCGACTGTTCTGAGTTT
GGGTGGAGTGATCATGGCCCCAAGACACCACCAGAGATCTCCTCAATGCTAGTCAATAAC
AACCATGCTGAAGAGACGAATGCAGCCAAGAAGGTCAAACTCAACTCTGAGGACGAGACG
AGCAACAGTGATGATCTGATGGCATACCTTGACAACGCCATGTGGGAGTCTCCTTTAGAA
GTGGAAGATATGCTCGGCGTAGATGCTGCTGCTGGTGTGACTCAGGAAGAGGGAAACCCA
ATGGAGCTTTGGAGCTTAGATGATATCAACTCCATGCTGGATGGAGGAGTCTTTTGAAGT
GTGATTGAATGATGGGTTGGCCTAGTTTGTAAATAGAGCTGTTTTTGTGTGTGTTGGTGA
GTTTCAAAAGCCCATTGTGAAGACAAACAGCGGTTTACTTTAAATCTTCAGTTTAGTTTT
TGTGTTTGTTGTTGTCTCACTGGGTTTTGTTTTGTATCCCCCAAGGCTTGTTTAACATTA
ATAATAATAACAATGTTGGAACCTCTGTTT

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 5

CO CL1269Contig1 1141 5 28 U
CGCAAAAAAATTAAAAATAATATGAATTTGAAGTTGAACTCTTGACTTTTTGAATAAACA
CCGATTTACATGACATGGTATAAACAAAAATAGAATCTTTTCTTTTGCTTACAAAACAAA
GTTCAGAATCTGAAAAAAAAAAA***CAGTGAAGATTTCATACACAAGCCAAAATGCTAC
ATAAAGCTGTCTCATACGGCGGCTCTCAGGGCTCCTCTCGCTGCTTCTCGTCTCAGTTCA
TCTTGTTTCCCACTGCCTCGGAAGTACATATATACTTGCTGAATAACCCAAATGCTGACC
ACTGATTCGAGGCAGAAAAACCCAAACCCAATGAAGTAAAATATCCCAACCAATGTATTA
CCGCTTAAGACATCTACTGCAGGTAAGATCCCAGCAAGAGATTTTCCTTTGAAGACAACA
GGTGGAGCAACCGCAGCAAAGACACAGAAAGCAATGTGGAGCATATAGAACATGAAAAAC
CATCCAAAGCTCAATGCACTATCAGTTCTGAAGGCACGGTAGAGGGGACGATACCATAGC
ACATAGCCTCCTGGGACACCAGCTATGAAGTAAATAAGGGCAAGAAGCCATATCGTCACT
CCTTCTCCTTTGATCCAAGCTGTAGTAATGGCAATAATATTCCAGAATAAACAAAGGACC
AACCCCAAGTAGGATGCAAAGGCAACATACTGTAGCCTTTGGAGATGAACAGGAATTTCA
TTAGCAATGTCATGGTGGATAAGTGGGAAGATAGGCGGCCAGTTTTTCACTTCAATCGTT
ATTCCAGCTCGTGCAGCCGCATCCTCTTTCCGTTTCACCTCCTGCTCTCGTCGTCTTAGG
TCAGCTTCTTTGGCTTGAAGTTCCTTTTCTTTCTTGTTCAAATTCTGTGTAGCACCAGAT
CTGTCATTGTTAAGAGGAATGTCAACGGTTCGACCATAATCGAAACCAACAGGCTCTGGA
GGCAAAGGCGAGAGTCTTGAGTTCGATGCCGCCGGAACACTCCCAGTATTAGCGAAAGGA
TTGACTTCTTCTTCCTCAGCGAATGGATTCCGATCATAGCGATTAGCCATGGCTTCAAGA
AGATTGGAGCTTTGGTATCAGAGAAGAAGAAGAAGACTTGAAATCGATTTTAAGATCTTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2FQ46JQ U 1
AF RR2DR28JQ U 30
AF RR2E841JQ U 28
AF RR2FQ46TF C 364
AF RR2DR28TF C 374
BS 1 125 RR2FQ46JQ
BS 126 126 RR2E841JQ
BS 127 153 RR2FQ46JQ
BS 154 154 RR2E841JQ
BS 155 314 RR2FQ46JQ
BS 315 315 RR2E841JQ
BS 316 368 RR2FQ46JQ
BS 369 369 RR2E841JQ
BS 370 386 RR2FQ46JQ
BS 387 387 RR2E841JQ
BS 388 399 RR2FQ46JQ
BS 400 400 RR2E841JQ
BS 401 448 RR2FQ46JQ
BS 449 449 RR2E841JQ
BS 450 487 RR2FQ46JQ
BS 488 488 RR2E841JQ
BS 489 766 RR2FQ46JQ
BS 767 797 RR2E841JQ
BS 798 798 RR2DR28JQ
BS 799 814 RR2E841JQ
BS 815 815 RR2FQ46TF
BS 816 827 RR2E841JQ
BS 828 828 RR2FQ46TF
BS 829 836 RR2E841JQ
BS 837 837 RR2FQ46TF
BS 838 856 RR2E841JQ
BS 857 1139 RR2FQ46TF
BS 1140 1141 RR2DR28TF

RD RR2FQ46JQ 766 0 0
CGCAAAAAAATTAAAAATAATATGAATTTGAAGTTGAACTCTTGACTTTTTGAATAAACA
CCGATTTACATGACATGGTATAAACAAAAATAGAATCTTTTCTTTTGCTTACAAAACAAA
GTTCAAAATCTGAAAAAAAAAAA***CAGTGAAAATTTCATACACAAGCCAAAATGCTAC
ATAAAGCTGTCTCATACGGCGGCTCTCAGGGCTCCTCTCGCTGCTTCTCGTCTCAGTTCA
TCTTGTTTCCCACTGCCTCGGAAGTACATATATACTTGCTGAATAACCCAAATGCTGACC
ACTGATTCGAGGCAAAAAAACCCAAACCCAATGAAGTAAAATATCCCAACCAATGTATTA
CCGCTTAAAACATCTACTGCAGGTAAAATCCCAGCAAGAAATTTTCCTTTGAAGACAACA
GGTGGAGCAACCGCAGCAAAGACACAGAGAGCAATGTGGAGCATATAGAACATGAAAAAC
CATCCAAGGCTCAATGCACTATCAGTTCTGAAGGCACGGTAGAGGGGACGATACCATAGC
ACATAGCCTCCTGGGACACCAGCTATGAAGTAAATAAGGGCAAGAAGCCATATCGTCACT
CCTTCTCCTTTGATCCAAGCTGTAGTAATGGCAATAATATTCCAGAATAAACAAAGGACC
AACCCCAAGTAGGATGCAAAGGCAACATACTGTAGCCTTTGGAGATGAACAGGAATTTCA
TTAGCAATGTCATGGTGGATAAGTGGGAAGATAGGCGGCCAGTTTT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2DR28JQ 779 0 0
GA
AGTTGAACTCTTGACTTTTTGAATAAACACCGATTTACATGACATGGTATAAACAAAAAT
AGAATCTTTTCTTTTGCTTACAAAACAAAGTTCAGAATCTGAAAAAAAAAAAAAACAGTG
AAGATTTCATACACAAGCCAAAATGCTACATAAAGCTGTCTCATACGGCGGCTCTCAGGG
CTCCTCTCGCTGCTTCTCGTCTCAGTTCATCTTGTTTCCCACTGCCTCGGAAGTACATAT
ATACTTGCTGAATAACCCAAATGCTGACCACTGATTCGAGGCAGAAAAACCCAAACCCAA
TGAAGTAAAATATCCCAACCAATGTATTACCGCTTAAGACATCTACTGCAGGTAAGATCC
CAGCAAGAGATTTTCCTTTGAAGACAACAGGTGGAGCAACCGCAGCAAAGACACAGAAAG
CAATGTGGAGCATATAGAACATGAAAAACCATCCAAAGCTCAATGCACTATCAGTTCTGA
AGGCACGGTAGAGGGGACGATACCATAGCACATAGCCTCCTGGGACACCAGCTATGAAGT
AAATAAGGGCAAGAAGCCATATCGTCACTCCTTCTCCTTTGATCCAAGCTGTAGTAATGG
CAATAATATTCCAGAATAAACAAAGGACCAACCCCAAGTAGGATGCAAAGGCAACATACT
GTAGCCTTTGGAGATGAACAGGAATTTCATTAGCAATGTCATGGTGGATAAGTGGGAAGA
TAGGCGGCCAGTTTTTCACTTCAATCGTTATTCCAGCTCGTGCAGCCGCATCCTCTT

QA 3 779 3 779
DS 

RD RR2E841JQ 829 0 0
CTGG
AGTTGAACTCTTGACTTTTTGAATAAACACCGATTTACATGACATGGTATAAACAAAAAT
AGAATCTTTTCTTTTGCTTACAAAACAAAGTTCAGAATCTGAAAAAAAAAA****CAGTG
AAGATTTCATACACAAGCCAAAATGCTACATAAAGCTGTCTCATACGGCGGCTCTCAGGG
CTCCTCTCGCTGCTTCTCGTCTCAGTTCATCTTGTTTCCCACTGCCTCGGAAGTACATAT
ATACTTGCTGAATAACCCAGATGCTGACCACTGATTCGAGGCAGAAAAACCCAAACCCAA
TGAAGTAGAATATCCCAACCAATGTATTACCGCTTAAGACATCTACTGCAGGTAAGATCC
CAGCAAGAGATTTTCCTTTGAAGACAACAGGTGGAGCAACCGCAGCAAAGACACAGAAAG
CAATGTGGAGCATATAGAACATGAAAAACCATCCAAAGCTCAATGCACTATCAGTTCTGA
AGGCACGGTAGAGGGGACGATACCATAAGACATAGCCTCCTGGGACACCAGCTATGAAGT
AGATAAGGGCAAGAAGCCATATCGTCACTCCTTCTCCTTTGATCCAAGCTGTAGTAATGG
CAATAATATTCCAGAATAGACATAGGAC*AACCCCAAATAGGATGCAAAGGCAACATACT
GTAGCCTTTGGAGATGAACAGGAATTTCATTAGCAATGTCATGGTGGATAAGTGGGAAGA
CAGGCGGCCAGTTTTTCACTTCAATCGTTATTCCAGCTCGTGCAGCAGCATCCTCTTTCC
GTT*CACCTCCTGCTCCCGTCGTCT*AGGTCAGCTTCTTTGGCTT

QA 5 829 5 829
DS 

RD RR2FQ46TF 778 0 0
CTTAAGACATCTACTGCAGGTAAGATCCCAGCAAGAGATTT*CCTTTGAAGACAACAGGT
GGAGCA*CCGCAGCAAAGACACAGAGAGCAATGTGGAGCATATAGAACATGAAAAACCAT
CCAAGGCTCAATGCACTATCAGTTCTGAAGGCACGGTAGAGGGGACGATACCATAGCACA
TAGCCTCCTGGGACACCAGCTATGAAGTAAATAAGGGCAAGAAGCCATATCGTCACTCCT
TCTCCTTTGATCCAAGCTGTAGTAATGGCAATAATATTCCAGAATAAACAAAGGACCAAC
CCCAAGTAGGATGCAAAGGCAACATACTGTAGCCTTTGGAGATGAACAGGAATTTCATTA
GCAATGTCATGGTGGATAAGTGGGAAGATAGGCGGCCAGTTTTTCACTTCAATCGTTATT
CCAGCTCGTGCAGCCGCATCCTCTTTCCGTTTCACCTCCTGCTCTCGTCGTCTTAGGTCA
GCTTCTTTGGCTTGAAGTTCCTTTTCTTTCTTGTTCAAATTCTGTGTAGCACCAGATCTG
TCATTGTTAAGAGGAATGTCAACGGTTCGACCATAATCGAAACCAACAGGCTCTGGAGGC
AAAGGCGAGAGTCTTGAGTTCGATGCCGCCGGAACACTCCCAGTATTAGCGAAAGGATTG
ACTTCTTCTTCCTCAGCGAATGGATTCCGATCATAGCGATTAGCCATGGCTTCAAGAAGA
TTGGAGCTTTGGTATCAGAGAAGAAGAAGAAGACTTGAAATCGATTTTAAGATCTT
CC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2DR28TF 768 0 0
ATCTACTGCAGT
AGATCCCAGCAAGAGATTT*CCTTTGAAGACAACAGGTGGAGCAAC*GCAGCAAAGACAC
AGAAAGCAATGTGGAGCATATAGAACATGAAAAACCATCCAAAGCTCAATGCACTATCAG
TTCTGAAGGCACGGTAGAGGGGACGATACCATAGCACATAGC*TCCTGGGACACCAGCTA
TGAAGTAAATAAGGGCAAGAAGCCATATCGTCACTCCTTCTCCTTTGATCCAAGCTGTAG
TAATGGCAATAATATTCCAGAATAAACAAAGGACCAACCCCAAGTAGGATGCAAAGGCAA
CATACTGTAGCCTTTGGAGATGAACAGGAATTTCATTAGCAATGTCATGGTGGATAAGTG
GGAAGATAGGCGGCCAGTTTTTCACTTCAATCGTTATTCCAGCTCGTGCAGCCGCATCCT
CTTTCCGTTTCACCTCCTGCTCTCGTCGTCTTAGGTCAGCTTCTTTGGCTTGAAGTTCCT
TTTCTTTCTTGTTCAAATTCTGTGTAGCACCAGATCTGTCATTGTTAAGGGGAATGTCAA
CGGTTCGACCATAATCGAAACCAACAGGCTCTGGAGGCAAAGGCGAGAGTCTTGAGTTCG
ATGCCGCCGGAACACTCCCAGTATTAGCGAAAGGATTGACTTCTTCTTCCTCAGCGAATG
GATTCCGATCATAGCGATTAGCCATGGCTTCAAGAAGATTGGAGCTTTGGTATCAGAGAA
GAAGAAGAAGACTTGAAATCGATTTTAAGATCTTCC

QA 13 768 13 768
DS 



AS 1 3

CO CL1270Contig1 828 3 11 U
GGACACCATCAAACAACAAAATCAACATGGCTTCTTCTTCTTCAACTCAATTTCTCTCCA
TCTCCCTCGCCCTTGTCGCCATTTCCTTCTTCATTACAGTCTCCGCAGATCCCGACATGC
TCCAAGACCTCTGTGTCGCTGATCTCTCCTCCGGAATCAAAGTCAATGGCTTCCCTTGCA
AAGACGCAGCCAACGTCACACCACTCGATTTCTTCTCCCAAGGAATAGCCAATCCAGGTC
TCACCAACAACACATTCGGCTCCCTGGTCACAGGCGCAAACGTGATGACCATCCCAGGTC
TCAACACCCTCGGCGTCTCCCTCGCACGCATCGACTACGCGCCGGGAGGCTTAAACCCGC
CTCACACTCACCCTCGCGCCACCGAAGTCGTCTACGTCCTCGAAGGAGCCCTCGACGTCG
GGTTCCTCACCACGGCCAACAAGCTCATCTCTCAGTCTCTCAAGAAAGGCGACGTCTTCG
CTTTCCCCAGAGGACTCGTCCATTTCCAGAAGAACAACGGTCGTGTCCCTGCCTCTGTCA
TCGCTGCTTTCAACAGCCAGCTTCCTGGGACTCAGTCTCTTGGTGCTACTCTGTTTGGTT
CTACCCCTCCTGTTCCTGATGAGATCTTGGCTCAAGCGTTTCAGACGTCTCCGGGGACTG
TTAAACACATCAAAACGAAGTTCCAACCCAAGAAGTAGTGATATGATCTTCTTGGTTCTG
TTTTTCTCCTTTATTTGTCCTTGTGTAATAAAACCAAATAACTGATCTTTGAGTGTGTAT
TTGAGCTTTCATTGTCTCATGTATTATCTTCTATATAATACAAAGTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A431TF U 1
AF RR2BJ79TF U 1
AF RR2BJ79JQ C 93
BS 1 19 RR2A431TF
BS 20 20 RR2BJ79TF
BS 21 247 RR2A431TF
BS 248 248 RR2BJ79TF
BS 249 362 RR2A431TF
BS 363 363 RR2BJ79TF
BS 364 626 RR2A431TF
BS 627 627 RR2BJ79TF
BS 628 672 RR2A431TF
BS 673 809 RR2BJ79TF
BS 810 828 RR2BJ79JQ

RD RR2A431TF 672 0 0
GGACACCATCAAACAACAAGATCAACATGGCTTCTTCTTCTTCAACTCAATTTCTCTCCA
TCTCCCTCGCCCTTGTCGCCATTTCCTTCTTCATTACAGTCTCCGCAGATCCCGACATGC
TCCAAGACCTCTGTGTCGCTGATCTCTCCTCCGGAATCAAAGTCAATGGCTTCCCTTGCA
AAGACGCAGCCAACGTCACACCACTCGATTTCTTCTCCCAAGGAATAGCCAATCCAGGTC
TCACCAATAACACATTCGGCTCCCTGGTCACAGGCGCAAACGTGATGACCATCCCAGGTC
TCAACACCCTCGGCGTCTCCCTCGCACGCATCGACTACGCGCCGGGAGGCTTAAACCCGC
CTTACACTCACCCTCGCGCCACCGAAGTCGTCTACGTCCTCGAAGGAGCCCTCGACGTCG
GGTTCCTCACCACGGCCAACAAGCTCATCTCTCAGTCTCTCAAGAAAGGCGACGTCTTCG
CTTTCCCCAGAGGACTCGTCCATTTCCAGAAGAACAACGGTCGTGTCCCTGCCTCTGTCA
TCGCTGCTTTCAACAGCCAGCTTCCTGGGACTCAGTCTCTTGGTGCTACTCTGTTTGGTT
CTACCCCTCCTGTTCCTGATGAGATCCTGGCTCAAGCGTTTCAGACGTCTCCGGGGACTG
TTAAACACATCA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2BJ79TF 809 0 0
GGACACCATCAAACAACAAAATCAACATGGCTTCTTCTTCTTCAACTCAATTTCTCTCCA
TCTCCCTCGCCCTTGTCGCCATTTCCTTCTTCATTACAGTCTCCGCAGATCCCGACATGC
TCCAAGACCTCTGTGTCGCTGATCTCTCCTCCGGAATCAAAGTCAATGGCTTCCCTTGCA
AAGACGCAGCCAACGTCACACCACTCGATTTCTTCTCCCAAGGAATAGCCAATCCAGGTC
TCACCAACAACACATTCGGCTCCCTGGTCACAGGCGCAAACGTGATGACCATCCCAGGTC
TCAACACCCTCGGCGTCTCCCTCGCACGCATCGACTACGCGCCGGGAGGCTTAAACCCGC
CTCACACTCACCCTCGCGCCACCGAAGTCGTCTACGTCCTCGAAGGAGCCCTCGACGTCG
GGTTCCTCACCACGGCCAACAAGCTCATCTCTCAGTCTCTCAAGAAAGGCGACGTCTTCG
CTTTCCCCAGAGGACTCGTCCATTTCCAGAAGAACAACGGTCGTGTCCCTGCCTCTGTCA
TCGCTGCTTTCAACAGCCAGCTTCCTGGGACTCAGTCTCTTGGTGCTACTCTGTTTGGTT
CTACCCCTCCTGTTCCTGATGAGATCTTGGCTCAAGCGTTTCAGACGTCTCCGGGGACTG
TTAAACACATCAAAACGAAGTTCCAACCCAAGAAGTAGTGATATGATCTTCTTGGTTCTG
TTTTTCTCCTTTATTTGTCCTTGTGTAATAAAACCAAATAACTGATCTTTGAGTGTGTAT
TTGAGCTTTCATTGTCTCATGTATTATCT

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2BJ79JQ 736 0 0
ATTACAGTCTCCGCAGATCCCGACATGCTCCAAGACCTCTGTGTCGCTGATCTCTCCTCC
GGAATCAAAGTCAATGGCTTCCCTTGCAAAGACGCAGCCAACGTCACACCACTCGATTTC
TTCTCCCAAGGAATAGCCAATCCAGGTCTCACCAACAACACATTCGGCTCCCTGGTCACA
GGCGCAAACGTGATGACCATCCCAGGTCTCAACACCCTCGGCGTCTCCCTCGCACGCATC
GACTACGCGCCGGGAGGCTTAAACCCGCCTCACACTCACCCTCGCGCCACCGAAGTCGTC
TACGTCCTCGAAGGAGCCCTCGACGTCGGGTTCCTCACCACGGCCAACAAGCTCATCTCT
CAGTCTCTCAAGAAAGGCGACGTCTTCGCTTTCCCCAGAGGACTCGTCCATTTCCAGAAG
AACAACGGTCGTGTCCCTGCCTCTGTCATCGCTGCTTTCAACAGCCAGCTTCCTGGGACT
CAGTCTCTTGGTGCTACTCTGTTTGGTTCTACCCCTCCTGTTCCTGATGAGATCTTGGCT
CAAGCGTTTCAGACGTCTCCGGGGACTGTTAAACACATCAAAACGAAGTTCCAACCCAAG
AAGTAGTGATATGATCTTCTTGGTTCTGTTTTTCTCCTTTATTTGTCCTTGTGTAATAAA
ACCAAATAACTGATCTTTGAGTGTGTATTTGAGCTTTCATTGTCTCATGTATTATCTTCT
ATATAATACAAAGTTG

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 5

CO CL1271Contig1 913 5 26 U
GGATACACAAGATTAAAGTCCAAATCACGGAGGAGAAAGGGAGGAGAGAAAGAATGGAGT
ATCTAGGGATCGACCTGAGCTGTGCGATGGGATCTCTCCGAAACGGTGAATTCCCGGAGA
AAGATTGTCTTCTTCCTCTAATTTCCAAGCTTCTCGGTTACATCCTTGTCGCTGCTTCCA
TCACCGTCAAGCTCCCTCAGATAATGAAAATCGTGCACCATAAAAGCGTACGAGGCCTAA
GTGTTGTGGCATTTGAGCTCGAAGTGGTTGGTTATACAATTTCTCTTGCCCATTGCCTTC
ACAAAGGTCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAAATGGCTTTTCTTTTGATTCAAGCTTTAA
TCTTGGTTGCTTGTATCTATTATTACTCTCAACCTGTCCCTATGACAACTTGGGTCAGAG
CACTCCTATATTGTGCTGTAGCACCAACTGTGCTTGCTGGGCAGATTAATCCAACGCTCT
TCGACGCTCTTTATGCTTCACAACATGCGATATTTCTGTTTGCAAGACTCCCTCAGATAT
GGAAGAACTTCAAAAACAAAAGCACTGGAGAACTCAGTTTCTTAACTTTCTTCATGAACT
TCGCTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAGGAAAATGCCCCAGTTAGCATTC
TTACGGGATTTGCACTT*GGAGTCTTCACCAACGGAACCATCCTGAGTCAGATTCTCCTG
TATCACAAGGCTGCTCCAGCAAAGGAGAAGAAAACCAATTAAAAGCTAGAAAGATAATCC
TAAATCAAATACTTCTGTTGTTGGCTCCAAAAACAAAAGAGATTAATCAGTGTTGCAGTT
TTAATATGACCAGACTTTGTTCACTGTATGGGTTTCCACTTGATTTCTGATAGTAAAGTA
GCTGTTTGAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 0 35 
35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 0 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2GS07TF U 54
AF RR2C195TF U 1
AF RR2BE42TF U 152
AF RR2C215TF U 163
AF RR2C215JQ C 171
BS 1 230 RR2C195TF
BS 231 231 RR2GS07TF
BS 232 290 RR2C195TF
BS 291 291 RR2C215TF
BS 292 478 RR2C195TF
BS 479 479 RR2C215TF
BS 480 552 RR2C195TF
BS 553 553 RR2GS07TF
BS 554 673 RR2C195TF
BS 674 674 RR2C215TF
BS 675 729 RR2C195TF
BS 730 730 RR2C215TF
BS 731 788 RR2BE42TF
BS 789 792 RR2C215TF
BS 793 812 RR2BE42TF
BS 813 815 RR2C215JQ
BS 816 825 RR2C215TF
BS 826 826 RR2C215JQ
BS 827 841 RR2C215TF
BS 842 843 RR2C215JQ
BS 844 850 RR2C215TF
BS 851 851 RR2C215JQ
BS 852 860 RR2C215TF
BS 861 861 RR2C215JQ
BS 862 909 RR2C215TF
BS 910 913 RR2C215JQ

RD RR2GS07TF 621 0 0
GG
GGAGTATCTAGGGATCGACCTGAGCTGTGCGATGGGATCTCTCCGGAACGGTGAATTCCC
GGAGAAAGATTGTCTTCTTCCTCTAATTTCCAAGCTTCTCGGTTACATCCTTGTCGCTGC
TTCCATCACCGTCAAGCTCCCTCAGATAATGAAAATCGTGCACCATAAAAGCGTACGAGG
CCTAAGTGTTGTGGCATTTGAGCTCGAAGTGGTTGGTTATACAATTTCTCTTGCCTATTG
CCTTCACAAAGGTCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAAATGGCTTTTCTTTTGATTCAAGC
TTTAATCTTGGTTGCTTGTATCTATTATTACTCTCAACCTGTCCCTATGACAACTTGGGT
CAGAGCACTCCTATATTGTGCTGTAGCACCAACCGTGCTTGCTGGGCAGATTAATCCAAC
GCTTTTCGACGCTCTTTATGCTTCACAACATGCGATATTTCTGTTTGCAAGACTCCCTCA
GATATGGAAGAACTTCAAAAACAAAAGCACTGGAGAACTCAGTTTCTTAACTTTCTTCAT
GAACTTCGCTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAGGAAAATGCCCCAGTTAG
CATTCTTACGGGATTTGCT

QA 3 621 3 621
DS 

RD RR2C195TF 739 0 0
GGATACACAAGATTAAAGTCCAAATCACGGAGGAGAAAGGGAGGAGAGAAAGAATGGAGT
ATCTAGGGATCGACCTGAGCTGTGCGATGGGATCTCTCCGAAACGGTGAATTCCCGGAGA
AAGATTGTCTTCTTCCTCTAATTTCCAAGCTTCTCGGTTACATCCTTGTCGCTGCTTCCA
TCACCGTCAAGCTCCCTCAGATAATGAAAATCGTGCACCATAAAAGCGTAAGAGGCCTAA
GTGTTGTGGCATTTGAGCTCGAAGTGGTTGGTTATACAATTTCTCTTGCCTATTGCCTTC
ACAAAGGTCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAAATGGCTTTTCTTTTGATTCAAGCTTTAA
TCTTGGTTGCTTGTATCTATTATTACTCTCAACCTGTCCCTATGACAACTTGGGTCAGAG
CACTCCTATATTGTGCTGTAGCACCAACTGTGCTTGCTGGGCAGATTAATCCAACGCTTT
TCGACGCTCTTTATGCTTCACAACATGCGATATTTCTGTTTGCAAGACTCCCTCAGATAT
GGAAGAACTTCAGAAACAAAAGCACTGGAGAACTCAGTTTCTTAACTTTCTTCATGAACT
TCGCTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAGGAAAATGCCCCAGTTAGCATTC
TTACGGGATTTGCTCTT*GGAGTCTTCACCAACGGAACCATCCTGAGTCAGATTCTCCTG
TATCACAAG
CTGCTGCAGC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2BE42TF 673 0 0
TCTCGGTTACATCCTTGTCGCTGCTTCCATCACCGTCAAGCTCCCTCAGATAATGAAAAT
CGTGCACCATAAAAGCGTACGAGGCCTAAGTGTTGTGGCATTTGAGCTCGAAGTGGTTGG
TTATACAATTTCTCTTGCCTATTGCCTTCACAAAGGTCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGA
AATGGCTTTTCTTTTGATTCAAGCTTTAATCTTGGTTGCTTGTATCTATTATTACTCTCA
ACCTGTCCCTATGACAACTTGGGTCAGAGCACTCCTATATTGTGCTGTAGCACCAACCGT
GCTTGCTGGGCAGATTAATCCAACTCTTTTCGACGCTCTTTATGCTTCACAACATGCGAT
ATTTCTGTTTGCAAGACTCCCTCAGATATGGAAGAACTTCAAAAACAAAAGCGCTGGAGA
ACTCAGTTTCTTAACTTTCTTCATGAACTTCGCTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAG
TATCCAGGAAAATGCCCCAGTTAGCATTCTTACGGGATTTGCTCTTTGGAGTCTTCACCA
ACGGAACCATCCTGAGTCAGATTCTCCTGTATCACAAG*CTGCTCCAGCAAAGGAGAAGA
AAACCAATTAAAAGCTAGAAAGATAATCCTAAATCAATACTTTCTGTTGTTGGCTCCAAA
A
CAAAGAGATTAT

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2C215TF 747 0 0
TCCTTGTCGCTGCTTCCATCACCGTCAAGCTCCCTCAGATAATGAAAATCGTGCACCATA
AAAGCGTACGAGGCCTAAGTGTTGTGGCATTTGAGCTCGAAGTGGTTGGTTATACAATTT
CTCTTGCCCATTGCCTTCACAAAGGTCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAAATGGCTTTTC
TTTTGATTCAAGCTTTAATCTTGGTTTCTTGTATCTATTATTACTCTCAACCTGTCCCTA
TGACAACTTGGGTCAGAGCACTCCTATATTGTGCTGTAGCACCAACTGTGCTTGCTGGGC
AGATTAATCCAACGCTCTTTGACGCTCTTTATGCTTCACAACATGCGATATTTCTGTTTG
CAAGACTCCCTCAGATATGGAAGAACTTCAAAAACAAAAGCACTGGAGAACTCAGTTTCT
TAACTTTCTTCATGAACTTCGCTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAGGAAA
ATGCCCCAGTTAGCATTCTTACGGGATTTGCACTT*GGAGTCTTCACCAACGGAACCATC
CTGAGTCAGATTCTCCTGTATCACAAGGCTGCTCCAGCAAAGGAGAAGAAAACCAATTAA
AAGCTAGAAAGATAATCCTAAATCAAATACTTCTGTTGTTGGCTCCAAAA**CAAAGAGA
TTA*TCAGTGTTGCAGTTT**ATATGAC*AGACTTTGT*CACTGTATGGGTTTCCACTTG
ATTTCTGATAGTAAAGTAGCTGTTTGA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2C215JQ 743 0 0
GCTGCTTCCATCACCGTCAAGCTCCCTCAGATAATGAAAATCGTGCACCATAAAAGCGTA
CGAGGCCTAAGTGTTGTGGCATTTGAGCTCGAAGTGGTTGGTTATACAATTTCTCTTGCC
CATTGCCTTCACAAAGGTCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAAATGGCTTTTCTTTTGATT
CAAGCTTTAATCTTGGTTTCTTGTATCTATTATTACTCTCAACCTGTCCCTATGACAACT
TGGGTCAGAGCACTCCTATATTGTGCTGTAGCACCAACTGTGCTTGCTGGGCAGATTAAT
CCAACGCTCTTTGACGCTCTTTATGCTTCACAACATGCGATATTTCTGTTTGCAAGACTC
CCTCAGATATGGAAGAACTTCAAAAACAAAAGCACTGGAGAACTCAGTTTCTTAACTTTC
TTCATGAACTTCGCTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAGGAAAATGCCCCA
GTTAGCATTCTTACGGGATTTGCACTT*GGAGTCTTCACCAACGGAACCATCCTGAGTCA
GATTCTCCTGTATCACAAGGCTGCTCCAGCAAAGGAGAAGAAAACCAATTAAAAGCTAGA
AAGATAATCCTAAATCAAATACTTCTGTTGTTGGCTCCAAAAACAAAAGAGATTAATCAG
TGTTGCAGTTTTATTATGACCAGACTTTGTTCACTGTATGGGTTTCCACTTGATTTCTGA
TAGTAAAGTAGCTGTTTGAAGTC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 5

CO CL1272Contig1 1064 5 14 U
GGAATGATGGCAGCATCTGAAAGTCTCATAAACCCTAAATCCCCAAATCGGAATCTGCAA
ACGAAGATGATGATGATGATTCGAAGAAGAATCTCTTCGATCATTTCAACACCACTCCTC
AATTCTTCGATTCACCACCACGCCTCCAAACCCAGATTCATCACCTCTTCCTCGCCGCTT
CTACAATGCCGTCGATCCCCGATCCTCCTCACTCAGATTCCTGCATCGGCGAGCAGAGTT
TCGTCGCTTCAGGGGATCAGGGCGTACAGTCTACTGAGCTTGAACGATCTGAGAGACGAT
GTGCCGAGGAAGCTCAAGACGAGGAAAGGAAGAGGTATCGGGTCGGGTAAAGGTAAAACA
GCGGGGAGAGGTCACAAGGGGCAGAAGGCGAGAGGGACGATGAAGTTTGGTTTCGAAGGT
GGGCAGACTCCTTTACGACGCCGTTTGCCCAAACGTGGGTTCAAGAACAAGTTTAAGCTT
CATTTCCAGCCGGTTGGTCTTGGAAAGATCGCTAAACTCATAAACGCTGGGGAGATTGAT
TCACACGAGTTGATCACAATGAAGACGCTCAAGGATGTGGGAGCCATAGGGAAGCAAATA
GAAGACGGAGTGAGACTAATGGGTCGTGGTGCTGATGAGATCAAATGGCCACTTCATTTT
GAGGTCTCGAGAGTGACGGTTAGGGCCAAAGAAGTGGTGGAAGCGGCAGGAGGATCGGTG
AGGAGAGTGTATTACAACAAATTGGGCTTGAGGGCGTTGCTTAAACCGGAATGGTTTGAG
AAGAAAGGAAGGCTATTGCCAAAAGCAGCGAGACCACCTCCTAAACAACAAGATAGGGTC
GATAGCATCGGGCGTCTTCCCGCTCCGAAGAAACCAATCCCGTTTTTTTCAGCTGAGGAA
AACAAAGTTGAGTCTCCTGTTGAATCGTGATGTTTGAGTTAGGTTTTTTTAACTTTTGAT
GTTTTGGTTTAAGTTGTTTGTGTTGTTTCTTGTTCATGTTCTTACAAGAAAAAAATTGAA
AATGGCGGATTTTTATTGGACGAAATAAGGCCATTCTCTCGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2G341TF U 77
AF RR2EY37TF U 1
AF RR2CL09TF U 132
AF RR2CL09JQ C 284
AF RR2G341JQ C 438
BS 1 297 RR2EY37TF
BS 298 298 RR2CL09TF
BS 299 344 RR2EY37TF
BS 345 345 RR2CL09TF
BS 346 431 RR2EY37TF
BS 432 433 RR2CL09TF
BS 434 440 RR2EY37TF
BS 441 441 RR2CL09TF
BS 442 630 RR2EY37TF
BS 631 632 RR2CL09TF
BS 633 674 RR2EY37TF
BS 675 815 RR2CL09JQ
BS 816 816 RR2G341JQ
BS 817 1064 RR2CL09JQ

RD RR2G341TF 492 0 0
TGATTCGAAGAAGAATCTCTTCGGTCATTTCAACACCACTCCTCAATTCTTCGATTCACC
ACCACGCCTCCAAACCCAGATTCATCACCTCTTCCTCGCCGCTTCTACAATGCCGTCGAT
CCCCGATCCTCCTCACTCAGATTCCTGCATCGGCGAGCAGAGTTTCGTCGCTTCAGGGGA
TCAGGGCGTACAGTCTACTGAGCTTGAACGATCTGAGAGACAATGTGCCGAGGAAGCTCA
AGACGAGGAAAGGAAGAGGTATCGGGTCTGGTAAAGGTAAAACAGCGGGGAGAGGTCACA
AGGGGCAGAAGGCGAGAGGGACGATGAAGTTTGGTTTCGAAGGTGGGCAGACTCCGCTAC
GACGTCGTTTGCCCAAACGTGGGTTCAAGAACAAGTTTAAGCTTCATTTCCAGCCGGTTG
GTCTTGGAAAGATCGCTAAACTCATAAACGCTGGGGAGATTGATTCACACGAGTTGATCA
CAATGAAGACGC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR2EY37TF 674 0 0
GGAATGATGGCAGCATCTGAAAGTCTCATAAACCCTAAATCCCCAAATCGGAATCTGCAA
ACGAAGATGATGATGATGATTCGAAGAAGAATCTCTTCGATCATTTCAACACCACTCCTC
AATTCTTCGATTCACCACCACGCCTCCAAACCCAGATTCATCACCTCTTCCTCGCCGCTT
CTACAATGCCGTCGATCCCCGATCCTCCTCACTCAGATTCCTGCATCGGCGAGCAGAGTT
TCGTCGCTTCAGGGGATCAGGGCGTACAGTCTACTGAGCTTGAACGATCTGAGAGACAAT
GTGCCGAGGAAGCTCAAGACGAGGAAAGGAAGAGGTATCGGGTCTGGTAAAGGTAAAACA
GCGGGGAGAGGTCACAAGGGGCAGAAGGCGAGAGGGACGATGAAGTTTGGTTTCGAAGGT
GGGCAGACTCCGCTACGACGTCGTTTGCCCAAACGTGGGTTCAAGAACAAGTTTAAGCTT
CATTTCCAGCCGGTTGGTCTTGGAAAGATCGCTAAACTCATAAACGCTGGGGAGATTGAT
TCACACGAGTTGATCACAATGAAGACGCTCAAGGATGTGGGAGCCATAGGGAAGCAAATA
GAAGACGGAGTGAGACTAATGGGTCGTGGTTGTGATGAGATCAAATGGCCACTTCATTTT
GAGGTCTCGAGAGT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2CL09TF 544 0 0
GATT
CACCACGCCTCCAAACCCAGATTCATCACCTCTTCCTCGCCGCTTCTACAATGCCGTCGA
TCTCCGATCCTCCTCACTCAGATTCCTGCATCGGCGAGCAGAGTTTCGTCGCTTCAGGGG
ATCAGGGCGTACAGTCTGCTGAGCCTGAACGATCTGAGAGACGATGTGCCGAGGAAGCTC
AAGACGAGGAAAGGAAGAGGTATCGGGTCGGGTAAAGGTAAAACAGCGGGGAGAGGTCAC
AAGGGGCAGAAGGCGAGAGGGACGATGAAGTTTGGTTTCGAAGGTGGGCAGACTCCTTTA
CGACGCCGTTTGCCCAAACGTGGGTTCAAGAACAAGTTTAAGCTTCATTTCCAGCCGGTT
GGTCTTGGAAAGATCGCTAAACTCATAAACGCTGGGGAGATTGATTCCCATGAGTTGATC
ACTATGAAGACGCTCAAGGATGTGGGAGCCATAGGGAAGCAAATAGAAGACGGAGTGAGA
CTAATGGGTCGTGGTGCTGATGAGATCAAATGGCCACTTCATTTTGAG*TCTCGAGAGT
G

QA 5 543 5 543
DS 

RD RR2CL09JQ 781 0 0
ACGATCTGAGAGACGATGTGCCGAGGAAGCTCAAGACGAGGAAAGGAAGAGGTATCGGGT
CGGGTAAAGGTAAAACAGCGGGGAGAGGTCACAAGGGGCAGAAGGCGAGAGGGACGATGA
AGTTTGGTTTCGAAGGTGGGCAGACTCCTTTACGACGCCGTTTGCCCAAACGTGGGTTCA
AGAACAAGTTTAAGCTTCATTTCCAGCCGGTTGGTCTTGGAAAGATCGCTAAACTCATAA
ACGCTGGGGAGATTGATTCCCATGAGTTGATCACTATGAAGACGCTCAAGGATGTGGGAG
CCATAGGGAAGCAAATAGAAGACGGAGTGAGACTAATGGGTCGTGGTGCTGATGAGATCA
AATGGCCACTTCATTTTGAGGTCTCGAGAGTGACGGTTAGGGCCAAAGAAGTGGTGGAAG
CGGCAGGAGGATCGGTGAGGAGAGTGTATTACAACAAATTGGGCTTGAGGGCGTTGCTTA
AACCGGAATGGTTTGAGAAGAAAGGAAGGCTATTGCCAAAAGCAGCGAGACCGCCTCCTA
AACAACAAGATAGGGTCGATAGCATCGGGCGTCTTCCCGCTCCGAAGAAACCAATCCCGT
TTTTTTCAGCTGAGGAAAACAAAGTTGAGTCTCCTGTTGAATCGTGATGTTTGAGTTAGG
TTTTTTTAACTTTTGATGTTTTGGTTTAAGTTGTTTGTGTTGTTTCTTGTTCATGTTCTT
ACAAGAAAAAAATTGAAAATGGCGGATTTTTATTGGACGAAATAAGGCCATTCTCTCGTG
T

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2G341JQ 622 0 0
ACGT
CGTTTGCCCAAACGTGGGTTCAAGAACAAGTTTAAGCTTCATTTCCAGCCGGTTGGTCTT
GGAAAGATCGCTAAACTCATAAACGCTGGGGAGATTGATTCACACGAGTTGATCACAATG
AAGACGCTCAAGGATGTGGGAGCCATAGGGAAGCAAATAGAAGACGGAGTGAGACTAATG
GGTCGTGGTTGTGATGAGATCAAATGGCCACTTCATTTTGAGGTCTCGAGAGTGACGGTT
AGGGCCAAAGAAGTGGTGGAAGCGGCAGGAGGATCGGTGAGGAGAGTGTATTACAACAAG
TTGGGCTTGAGGGCGTTGCTTAAACCGGAATGGTTTGAGAAGAAAGGAAGGCTATTGCCA
AAAGCAGCGAGACCACCTCCTAAACAGCAAGATAGGGTGGATAGCATCGGGCGTCTTCCC
GCTCCGAAGAAACCAATCCCGTTTTTTTCAGCTGAGGAAAACAAAGTTGAGTCTCCTGTT
GAATCGTGATGTTTGAGTTAGGTTTTTT*AACTTTTGATGTTTTGGTTTAAGTTGTTTGT
GTTGTTTCTTGTTCATGTTCTTACAAGAAAAAAATTGAAAATGGCGGATTTTTATTGGAC
GAAATAAGGCCATTCTCT

QA 5 622 5 622
DS 



AS 1 6

CO CL1273Contig1 1110 6 8 U
GTAAAATCGGATCAATAACTTTTTGGATAATAAAATTCACAGTAACAACAAACATGATTG
TAATTATTTGAGTGAAACTGACAAGTGCAACAGACAGAGAAACCTCCCATTATTGACAAA
ACAAATAGATCAGTTGAAATATCATATCTCGCCATCCCATAACTCTTCAAGAGACTTATA
AGGGCTCAGTGTCTCATGAACAAAGAATGGAGCAGTCAATAACCTGGCCTGTTCAATATC
AGAAAACTTGGCAAACAAGTCATCAGGTATTGACCAGTCGAAAACTTCAAAGTTCTCTCT
GATCCTTCCTTCATTTGTACTCTTGGGAAGTACGCTGTTACCCATTTGGAGTCCCCAGCG
AAGCGCAACTTGCGCAGGAGATTTTCCAAGTTTCTCAGCAACAGTATTTAGTATGGGGTT
CTTCAAAACATCGCTCTTGAGCCACGTTGTTCCTGGAGAGCCCAAGGGCGAGTATGCGGT
GAGGTGAACTCCTTTGGATTTGCAGAACTCTCGTAGCTTAGTCTGTCGCCAAGAAGGATG
ACATTCGACTTGAACAACGGCAGGAGGAACACGGGCTAACTTCAAAAGATCAGCTAGCTT
CTTGGTGGAGAAGTTGCTTACACCTATGGCTCGTGCCTTGCCCGAATCATAGAGTGCTTC
CATTGCTTTCCATGTGCTAGGAATATCTACAGGTAAAAGGTCCTCTGGCTTAGCTCCAAC
AGAACCTTTCTTCATCCGTACAGGCCAGTGCATCAAATAGAGGTCGACGTAGTCAAGTTG
TAGATCATGTAGAGTTCTGTTTAGTGCCTCTGGCACATCTTGAGGGTCATGATCAGTGCA
CCAGAGTTTGGAAGTGATGAACAACTCCTCGCGTTTCACTACATTGTCTTCAAACAACTT
TTTCAAAACTGCCCCTATCTCTTTCTCGTTGTCATAGATCTGAGCGCAATCAATATGACG
ATATCCGATCTTAACAGCGGCAGCCACAGCCTCGCCGACAAGGCCTGGAGAGGCTTGCCA
GGTTCCGAGACCCACCGAGGGGATCTTAGCGCCGGTGTTTAGCTCAAAGAATCTGATTGC
GTTCGCCATTATCAGAGAGATTTGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2F721JQ U 1
AF RR2A606JQ U 8
AF RR2AE36JQ U 93
AF RR2A606TF C 316
AF RR2AE36TF C 514
AF RR2F721TF C 514
BS 1 556 RR2F721JQ
BS 557 557 RR2A606JQ
BS 558 826 RR2F721JQ
BS 827 848 RR2A606JQ
BS 849 939 RR2AE36JQ
BS 940 1079 RR2A606TF
BS 1080 1080 RR2AE36TF
BS 1081 1110 RR2A606TF

RD RR2F721JQ 826 0 0
GTAAAATCGGATCAATAACTTTTTGGATAATAAAATTCACAGTAACAACAAACATGATTG
TAATTATTTGAGTGAAACTGACAAGTGCAACAGACAGAGAAACCTCCCATTATTGACAAA
ACAAATAGATCAGTTGAAATATCATATCTCGCCATCCCATAACTCTTCAAGAGACTTATA
AGGGCTCAGTGTCTCATGAACAAAGAATGGAGCAGTCAATAACCTGGCCTGTTCAATATC
AGAAAACTTGGCAAACAAGTCATCAGGTATTGACCAGTCGAAAACTTCAAAGTTCTCTCT
GATCCTTCCTTCATTTGTACTCTTGGGAAGTACGCTGTTACCCATTTGGAGTCCCCAGCG
AAGCGCAACTTGCGCAGGAGATTTTCCAAGTTTCTCAGCAACAGTATTTAGTATGGGGTT
CTTCAAAACATCGCTCTTGAGCCACGTTGTTCCTGGAGAGCCCAAGGGCGAGTATGCGGT
GAGGTGAACTCCTTTGGATTTGCAGAACTCTCGTAGCTTAGTCTGTCGCCAAGAAGGATG
ACATTCGACTTGAACAGCGGCAGGAGGAACACGGGCTAACTTCAAAAGATCAGCTAGCTT
CTTGGTGGAGAAGTTGCTTACACCTATGGCTCGTGCCTTGCCCGAATCATAGAGTGCTTC
CATTGCTTTCCATGTGCTAGGAATATCTACAGGTAAAAGGTCCTCTGGCTTAGCTCCAAC
AGAACCTTTCTTCATCCGTACAGGCCAGTGCATCAAATAGAGGTCGACGTAGTCAAGTTG
TAGATCATGTAGAGTTCTGTTTAGTGCCTCTGGCACATCTTGAGGG

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2A606JQ 841 0 0
CGGATCAATAACTTTTTGGATAATAAAATTCACAGTAACAACAAACATGATTGTAATTAT
TTGAGTGAAACTGACAAGTGCAACAGACAGAGAAACCTCCCATTATCGACAAAACAAATA
GATCAGTTGAAATATCATATCTCGCCATCCCATAACTCTTCAAGAGACTTATAAGGGCTC
AGTGTCTCATGAACAAAGAATGGAGCAGTCAATAACCTGGCCTGTTCAATATCAAAAAAC
TTGGCAAACAAGTCATCAGGTATTGACCAGTCGAAAACTTCAAAGTTCTCTCTGATCCTT
CCTTCATTTGTACTCTTGGGAAGTACGCTGTTACCCATTTGGAGTCCCCAGCGAAGCGCA
ACTTGCGCAGGAGATTTTCCAAGTTTCTCAGCAACAGTATTTAGTATGGGGTTCTTCAAA
ACATCGCTCTTGAGCCACGTTGTTCCTGGAGAGCCCAAGGGCGAGTATGCGGTGAGGTGA
ACTCCTTTGGATTTGCAGAACTCTCGTAGCTTAGTCTGTCGCCAAGAAGGATGACATTCG
ACTTGAACAACGGCAGGAGGAACACGGGCTAACTTCAAAAGATCAGCTAGCTTCTTGGTG
GAGAAGTTGCTTACACCTATGGCTCGTGCCTTGCCCGAATCATAGAGTGCTTCCATTGCT
TTCCATGTGCTAGGAATATCTACAGGTAAAAGGTCCTCTGGCTTAGCTCCAACAGAACCT
TTCTTCATCCGTACAGGCCAGTGCATCAAATAGAGGTCGACGTAGTCAAGTTGTAGATCA
TGTAGAGTTCTGTTTAGTGCCTCTGGCACATCTTGAGGGTCATGATCAGTGCACCAGAGT
T

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR2AE36JQ 847 0 0
GACAGAGAAACCTCCCATTATTGACAAAACAAATAGATCAGTTGAAATATCATATCTCGC
CATCCCATAACTCTTCAAGAGACTTATAAGGGCTCAGTGTCTCATGAACAAAGAATGGAG
CAGTCAATAACCTGGCCTGTTCAATATCAGAAAACTTGGCAAACAAGTCATCAGGTATTG
ACCAGTCGAAAACTTCAAAGTTCTCTCTGATCCTTCCTTCATTTGTACTCTTGGGAAGTA
CGCTGTTACCCATTTGGAGTCCCCAGCGAAGCGCAACTTGCGCAGGAGATTTTCCAAGTT
TCTCAGCAACAGTATTTAGTATGGGGTTCTTCAAAACATCGCCCTTGAGCCACGTTGTTC
CTGGAGAGCCCAAGGGCGAGTATGCGGTGAGGTGAACTCCTTTGGATTTGCAGAACTCTC
GTAGCTTAGTCTGTCGCCAAGAAGGATGACATTCGACTTGAACAACGGCAGGAGGAACAC
GGGCTAACTTCAAAAGATCAGCTAGCTTCTTGGTGGAGAAGTTGCTTACACCTATGGCTC
GTGCCTTGCCCGAATCATAGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTGCTAGGAATATCTACAG
GTAAAAGGTCCTCTGGCTTAGCTCCAACAGAACCTTTCTTCATCCGTACAGGCCAGTGAA
TCAAATAGAGGTCGACGTAGTCAAGTTGTAGATCATGTAGAGTTCTGTTTAGTGCCTCTG
GCACATCTTGAGGGTCATGATCAGTGCACCAGAGTTTGGAAGTGATGAACAACTCCTCGC
GTTTCACTACATTGTCTTCAAACAACTTTTTCAAAACTGCCCCTATCTCTTTCTCGTTGT
CATAGAT

QA 1 847 1 847
DS 

RD RR2A606TF 795 0 0
TGTACTCTTGGGAAGTACGCTGTTACCCATTTGGAGTCCCCAGCGAAGCGCAACTTGCGC
AGGAGATTTTCCAAGTTTCTCAGCAACAGTATTTAGTATGGGGTTCTTCAAAACATCGCT
CTTGAGCCACGTTGTTCCTGGAGAGCCCAAGGGCGAGTATGCGGTGAGGTGAACTCCTTT
GGATTTGCAGAACTCTCGTAGCTTAGTCTGTCGCCAAGAAGGATGACATTCGACTTGAAC
AACGGCAGGAGGAACACGGGCTAACTTCAAAAGATCAGCTAGCTTCTTGGTGGAGAAGTT
GCTTACACCTATGGCTCGTGCCTTGCCCGAATCATAGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGT
GCTAGGAATATCTACAGGTAAAAGGTCCTCTGGCTTAGCTCCAACAGAACCTTTCTTCAT
CCGTACAGGCCAGTGCATCAAATAGAGGTCGACGTAGTCAAGTTGTAGATCATGTAGAGT
TCTGTTTAGTGCCTCTGGCACATCTTGAGGGTCATGATCAGTGCACCAGAGTTTGGAAGT
GATGAACAACTCCTCGCGTTTCACTACATTGTCTTCAAACAACTTTTTCAAAACTGCCCC
TATCTCTTTCTCGTTGTCATAGATCTGAGCGCAATCAATATGACGATATCCGATCTTAAC
AGCGGCAGCCACAGCCTCGCCGACAAGGCCTGGAGAGGCTTGCCAGGTTCCGAGACCCAC
CGAGGGGATCTTAGCGCCGGTGTTTAGCTCAAAGAATCTGATTGTGTTCGCCATTATCAG
AGAGATTTGAGATCC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2AE36TF 597 0 0
TAGCTTAGTCTGTCGCCAAGAAGGATGACATTCGACTTGAACAACGGCAGGAGGAACACG
GGCTAACTTCAAAAGATCAGCTAGCTTCTTGGTGGAGAAGTTGCTTACACCTATGGCTCG
TGCCTTGCCCGAATCATAGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTGCTAGGAATATCTACAGG
TAAAAGGTCCTCTGGCTTAGCTCCAACAGAACCTTTCTTCATCCGTACAGGCCAGTGAAT
CAAATAGAGGTCGACGTAGTCAAGTTGTAGATCATGTAGAGTTCTGTTTAGTGCCTCTGG
CACATCTTGAGGGTCATGATCAGTGCACCAGAGTTTGGAAGTGATGAACAACTCCTCGCG
TTTCACTACATTGTCTTCAAACAACTTTTTCAAAACTGCCCCTATCTCTTTCTCGTTGTC
ATAGATCTGAGCGCAATCAATATGACGATATCCGATCTTAACAGCGGCAGCCACAGCCTC
GCCGACAAGGCCTGGAGAGGCTTGCCAGGTTCCGAGACCCACCGAGGGGATCTTAGCGCC
GGTGTTTAGCTCAAAGAATCTGATTGCGTTCGCCATTATCAGAGAGATTTGAGATC
C

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2F721TF 596 0 0
TAGCTTAGTCTGTCGCCAAGAAGGATGACATTCGACTTGAACAGCGGCAGGAGGAACACG
GGCTAACTTCAAAAGATCAGCTAGCTTCTTGGTGGAGAAGTTGCTTACACCTATGGCTCG
TGCCTTGCCCGAATCATAGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTGCTAGGAATATCTACAGG
TAAAAGGTCCTCTGGCTTAGCTCCAACAGAACCTTTCTTCATCCGTACAGGCCAGTGCAT
CAAATAGAGGTCGACGTAGTCAAGTTGTAGATCATGTAGAGTTCTGTTTAGTGCCTCTGG
CACATCTTGAGGGTCATGATCAGTGCACCAGAGTTTGGAAGTGATGAACAACTCCTCGCG
TTTCACTACATTGTCTTCAAACAACTTTTTCAAAACTGCCCCTATCTCTTTCTCGTTGTC
ATAGATCTGAGCGCAATCAATATGACGATATCCGATCTTAACAGCGGCAGCCACAGCCTC
GCCGACAAGGCCTGGAGAGGCTTGCCAGGTTCCGAGACCCACCGAGGGGATCTTAGCGCC
GGTGTTTAGCTCAAAGAATCTGATTGCGTTCGCCATTATCAGAGAGATTTGAGATC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 6

CO CL1274Contig1 592 6 1 U
GGGGTTGTCCTGACAAAACCTTTCAAGAACAAGTCGGTCTATCTCCACCGCCATCTTGTC
TTCCGTTGGAATTA**GAAAATGGATTTCTCATCTCCACCGCCGGGTATGGGTAGTGGTC
AATCACCGGAAGCACTGATGGAACAGGTGCAGGCGCAGCTAGCTCAAGCTTACATGGAGG
AGTTGGTTGAGACACTGAGAGGAAAATGCTTTGATAAATGCATAGCGAAGCCAGGATCAA
GCCTAAGCAGTGGTGAGAGCAGCTGCGTCTCTAGATGTGTTGATCGTTACATGGAAGCTA
CTGGAATCATCAAGCGTTCTCTCTTCTCCCAACAGCGTTGAGCAAACGCTCTCTTCTTTT
ACGAAGAAGGAAAAGCTGTTGTTTTACTTTTGTTTGAGTCTTTGCCATTAAGACAA*TCA
TATCGGGTTTGTTGGTCTCTTTATATTGTTTTTTGAAGGTGGTGATATAACTTTATTACA
GTGTTGACGACAATAATCTCCGCTTATGATCAGTAAAAGTTGTTTGGAAACCAAATGTGT
TATCTGTTGAATTTGTTTTTAGTCGATCAATCAATGAATATGTGAGATGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EB09JQ C 41
AF RR2EB09TF U 41
AF RR2AO70JQ C 5
AF RR2AO70TF U 5
AF RR2A243TF U 1
AF RR2A243JQ C 91
BS 1 592 RR2A243TF

RD RR2EB09JQ 471 0 0
GG
CTCCACCGCCATCTTGTCTTCCGTTGGAATTAAAGAAAATGGATTTCTCATCTCCATCGC
CGGGTATGGGTAGTGGTCAATCACCGGAAGCACTGATGGAACAGGTGCAGGCTCAGCTAG
CTCAAGCTTACATGGAGGAGTTGGTTGAGACACTGAGAGGAAAATGCTTTGATAAATGCA
TAGCGAAGCCAGGATCAAGCCTAAGCAGTGGCGAGAGTAGCTGCGTCTCTAGATGCGTTG
ATCGTTACATGGAAGCTACTGGAATCATTAAGCGTTCTCTCTTCTCCCAACAGCGTTGAG
CAAACGCTCTCTTCTTTTACGAAGAAGAAAAAGCTGTTGTTTTACTTTTGTTTGAGTCTT
TGCCATTAAGACAAATCATATCGGGTTTGTTGGTCTCTTTATATTGGTTTTTGAAGGTGG
TGATATAACTTTATTACAGTGTTGACGACAATAATCTCCGCTTATGA
CC

QA 3 469 3 469
DS 

RD RR2EB09TF 471 0 0
GG
CTCCACCGCCATCTTGTCTTCCGTTGGAATTAAAGAAAATGGATTTCTCATCTCCATCGC
CGGGTATGGGTAGTGGTCAATCACCGGAAGCACTGATGGAACAGGTGCAGGCTCAGCTAG
CTCAAGCTTACATGGAGGAGTTGGTTGAGACACTGAGAGGAAAATGCTTTGATAAATGCA
TAGCGAAGCCAGGATCAAGCCTAAGCAGTGGCGAGAGTAGCTGCGTCTCTAGATGCGTTG
ATCGTTACATGGAAGCTACTGGAATCATTAAGCGTTCTCTCTTCTCCCAACAGCGTTGAG
CAAACGCTCTCTTCTTTTACGAAGAAGAAAAAGCTGTTGTTTTACTTTTGTTTGAGTCTT
TGCCATTAAGACAAATCATATCGGGTTTGTTGGTCTCTTTATATTGGTTTTTGAAGGTGG
TGATATAACTTTATTACAGTGTTGACGACAATAATCTCCGCTTATGA
CC

QA 3 469 3 469
DS 

RD RR2AO70JQ 523 0 0
GG
GTCCTGACAAAACCTTTCAAGAACAAGTCGGTCTATCTCCACCGCCATCTTGTCTTCCGT
TGGAATTA**GAAAATGGATTTCTCATCTCCACCGCCGGGTATGGGTAGTGGTCAATCAC
CGGAAGCACTGATGGAACAGGTGCAGGCGCAGCTAGCTCAAGCTTACATGGAGGAGTTGG
TTGAGACACTGAGAGGAAAATGCTTTGATAAATGCATAGCGAAGCCAGGATCAAGCCTAA
GCAGTGGTGAGAGCAGCTGCGTCTCTAGATGTGTTGATCGTTACATGGAAGCTACTGGAA
TCATCAAGCGTTCTCTCTTCTCCCAACAGCGTTGAGCAAACGCTCTCTTCTTTTACGAAG
AAGGAAAAGCTGTTGTTTTACTTTTGTTTGAGTCTTTGCCATTAAGACAA*TCATATCGG
GTTTGTTGGTCTCTTTATATTGTTTTTTGAAGGTGGTGATATAACTTTATTACAGTGTTG
ACGACAATAATCTCCGCTTATGATCAGTAAAAGTTGTTTGG

QA 3 523 3 523
DS 

RD RR2AO70TF 523 0 0
GG
GTCCTGACAAAACCTTTCAAGAACAAGTCGGTCTATCTCCACCGCCATCTTGTCTTCCGT
TGGAATTA**GAAAATGGATTTCTCATCTCCACCGCCGGGTATGGGTAGTGGTCAATCAC
CGGAAGCACTGATGGAACAGGTGCAGGCGCAGCTAGCTCAAGCTTACATGGAGGAGTTGG
TTGAGACACTGAGAGGAAAATGCTTTGATAAATGCATAGCGAAGCCAGGATCAAGCCTAA
GCAGTGGTGAGAGCAGCTGCGTCTCTAGATGTGTTGATCGTTACATGGAAGCTACTGGAA
TCATCAAGCGTTCTCTCTTCTCCCAACAGCGTTGAGCAAACGCTCTCTTCTTTTACGAAG
AAGGAAAAGCTGTTGTTTTACTTTTGTTTGAGTCTTTGCCATTAAGACAA*TCATATCGG
GTTTGTTGGTCTCTTTATATTGTTTTTTGAAGGTGGTGATATAACTTTATTACAGTGTTG
ACGACAATAATCTCCGCTTATGATCAGTAAAAGTTGTTTGG

QA 3 523 3 523
DS 

RD RR2A243TF 592 0 0
GGGGTTGTCCTGACAAAACCTTTCAAGAACAAGTCGGTCTATCTCCACCGCCATCTTGTC
TTCCGTTGGAATTA**GAAAATGGATTTCTCATCTCCACCGCCGGGTATGGGTAGTGGTC
AATCACCGGAAGCACTGATGGAACAGGTGCAGGCGCAGCTAGCTCAAGCTTACATGGAGG
AGTTGGTTGAGACACTGAGAGGAAAATGCTTTGATAAATGCATAGCGAAGCCAGGATCAA
GCCTAAGCAGTGGTGAGAGCAGCTGCGTCTCTAGATGTGTTGATCGTTACATGGAAGCTA
CTGGAATCATCAAGCGTTCTCTCTTCTCCCAACAGCGTTGAGCAAACGCTCTCTTCTTTT
ACGAAGAAGGAAAAGCTGTTGTTTTACTTTTGTTTGAGTCTTTGCCATTAAGACAA*TCA
TATCGGGTTTGTTGGTCTCTTTATATTGTTTTTTGAAGGTGGTGATATAACTTTATTACA
GTGTTGACGACAATAATCTCCGCTTATGATCAGTAAAAGTTGTTTGGAAACCAAATGTGT
TATCTGTTGAATTTGTTTTTAGTCGATCAATCAATGAATATGTGAGATGTTT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2A243JQ 502 0 0
CATTTCCC
CCGCCGGGTATGGGTAGTGGTCAATCACCGGAAGCACTGATGGAACAGGTGCAGGGGCAG
CTAGCTCAAGCTTACATGGAGGAGTTGGTTGAGACACTGAGAGGAAAATGCTTTGATAAA
TGCATAGGGAAGCCAGGATCAAGCCTAAGCAGTGGTGAGAGCAGCTGCGTCTCTAGATGT
GTTGATCGTTACATGGAAGCTACTGGAATCATCAAGCGTTTTTTTTTTTCCCAACAGCGT
TGAGCAAACGCTTTTTTTTTTTACGAAGAAGGAAAAGCTGTTGTTTTACTTTTGTTTGAG
TTTTTGCCATTAAGACAA*TCATATCGGGTTTGTTGGTCTCTTTATATTGTTTTTTGAAG
GTGGTGATATAACTTTATTACAGTGTTGACGACAATAATTTCCGCTTATGATCAGTAAAA
GTTGTTTGGAAACCAAATGTGTTATTTGTTGAATTTGTTTTTAGTCGATCAATCAATGAA
TATGTGAGATGTTT

QA 9 502 9 502
DS 



AS 1 6

CO CL1275Contig1 844 6 12 U
GGGACTCTTTCTTTATGCAAACTCTCAATAACAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAGATTTTC
ATAATGTGCGACTCGGCTTCTCTTTCTCGTTGTTCCTCATACGAGACAGACTCTGAGATC
TTCACCAGCTCCAGCTCATGCTCCTCCTACAGTGAATCTGAAGAAGAGTTCGAGAATGCT
TTTGGTGGTGAGTCGCTGCAAGAAACCAAGAAGTTGGAGAAGAAGAAGAAGAGCAGTGTG
TTGCTTGAAGGTTACGTTGTTGATGATTTGAAGAGGACAAAGAGTTTAACGGACGATGAT
CTCGAGGAGCTTAAAGGTTGTGTAGATCTAGGCTTTGGTTTCAACTACGATGAGATTCCT
GAGCTTTGTAATACTTTGCCTGCTCTTGAGCTTTGTTACTCGATGAGTCACAAGTTTATG
GATCAAGATCATCATCACCACCACCATACTTCTTCGCCTGAGAAGATTGAATCTCCTATA
GCTAGCTGGAAGATCTCTAGTCCTGGGGACAGTCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAAG
TTTTGGGCACAAGCTGTGGCATGCACCGTGAGATTATGCACTTGAGATTTGGATTTTGAA
GCACATTCAAATGGGTGAGAGAAAGAAGACGATGAACAAACATAATTGCTGCATGCAGGA
ATGATGTCTCTTTATATTAGGCTGTTCTCTTTCAGCTTTTTATTTTTGAGACTGACCTGC
TTGAAAGAAACACCCATTTTGTTGTATGAGCTATGTTCATGTATGTATAAAAAAAGCTTA
GAGATTTTGCTAGGAAAATGTCTTGTAATGCTTTTTTAATAATAAAGATTTAATTCTTAT
TACG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 15 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 

AF RR2D295TF U 1
AF RR2AV15TF U 2
AF RR2C231TF U 2
AF RR2AV15JQ C 46
AF RR2D295JQ C 203
AF RR2C231JQ C 53
BS 1 489 RR2D295TF
BS 490 490 RR2AV15TF
BS 491 616 RR2D295TF
BS 617 654 RR2AV15TF
BS 655 680 RR2C231TF
BS 681 681 RR2AV15JQ
BS 682 706 RR2C231TF
BS 707 707 RR2AV15JQ
BS 708 725 RR2C231TF
BS 726 728 RR2AV15JQ
BS 729 764 RR2C231TF
BS 765 844 RR2AV15JQ

RD RR2D295TF 616 0 0
GGGACTCTTTCTTTATGCAAACTCTCAATAACAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAGATTTTC
ATAATGTGCGACTCGGCTTCTCTTTCTCGTTGTTCCTCATACGAGACAGACTCTGAGATC
TTCACCAGCTCCAGCTCATGCTCCTCCTACAGTGAATCTGAAGAAGAGTTCGAGAATGCT
TTTGGTGGTGAGTCGCTGCAAGAAACCAAGAAGTTGGAGAAGAAGAAGAAGAGCAGTGTG
TTGCTTGAAGGTTACGTTGTTGATGATTTGAAGAGGACAAAGAGTTTAACGGACGATGAT
CTCGAGGAGCTTAAAGGTTGTGTAGATCTAGGCTTTGGTTTCAACTACGATGAGATTCCT
GAGCTTTGTAATACTTTGCCTGCTCTTGAGCTTTGTTACTCGATGAGTCACAAGTTTATG
GATCAAGATCATCATCACCACCACCATACTTCTTCGCCTGAGAAGATTGAATCTCCTATA
GCTAGCTGGGAGATCTCTAGTCCTGGGGACAGTCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAAG
TTTTGGGCACAAGCTGTGGCATGCACCGTGAGATTATGCACTTGAGATTTGGATTTTGAA
GCACATTCAAATGGGT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2AV15TF 653 0 0
GGACTCTTTCTTTATGTAAACTCTCAATAACAAAAAAAAAAA******CAGAGATTTTCA
TAATGTGCGACTCGGCTTCTCCTTCTCGTTGTTCCTCATACGAGACAGACTCTGAGATCT
TCACCAGCTCCAGCTCATGCTCCTCCTACAGTGAATCTGAAGAAGAGTTCGAGAATGCTT
TTGGTGGTGAGTCGCTGCAAGAAACCAAGAAGTTGGAGAAGAAGAAGAAGAGCAGTGTGT
TGCTTGAAGGTTACGTTGTTGATGATTTGAAGAGGACAAAGAGTTTAACGGACAATGATC
TCGAGGAGCTTAAAGGTTGTGTAGATCTAGGCTTTGGTTTCAACTACGATGAGATCCCTG
AGCTTTGTAATACTTTGCCTGCTCTTGAGCTTTGTTACTCGATGCGTCACAAGTTTATGG
ATCAAGATCATCATCACCACCACCATACTTCTTCGCCTGAGAAGATTGAATCTCCTATAG
CTAGCTGGAAGATCTCTAGTCCTGGGGACAGTCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAAGT
TTTGGGCACAAGCTGTGGCATGCACCGTGAGATTATGCACTTGAGATTTGGATTTTGAAG
CACATTCAAATGGGTGAGAGAAAGAAGACGATGAACAAACATAATTGCTGCAT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2C231TF 771 0 0
GGACTCTTTCTTTATGCAAACTCTCAATAACAAAAAAAAAAAAAA***CAGAGATTTTCA
TAATGTGCGACTCGGCTTCTCTTTCTCGTTGTTCCTCATACGAGACAGACTCT*AGATCT
TCACCAGCTCCAGCTCATGCTCCTCCTACAGTGAATCTGAAGAAGAGTTCGAGAATGCTT
TTGGTGGTGAGTCGCTGCAAGAAACCAAGAAGTTGGAGAAGAAGAAGAAGAGCAGTGTGT
TGCTTGAAGGTTACGTTGTTGATGATTTGAAGAGGACAAAGAGTTTAACGGACGATGATC
TCGAGGAGCTTAAAGGTTGTGTAGATCTAGGCTTTGGTTTCAACTACGATGAGATTCCTG
AGCTTTGTAATACTTTGCCTGCTCTTGAGCTTTGTTACTCGATGAGTCACAAGTTTATGG
ATCAAGATCATCATCACCACCACCATACTTCTTCGCCTGAGAAGATTGAATCTCCTATAG
CTAGCTGGAAGATCTCTAGTCCTGGGGACAGTCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAAGT
TTTGGGCACAAGCTGTGGCATGCACCGTGAGATTATGCACTTGAGATTTGGATTTTGAAG
CACATTCAAATGGGTGAGAGAAAGAAGACGATGAACAAACATAATTGCTGCATGCAGGAA
TGATGTCTCTTTATATTAG*CTGTTCTCTTTCAGCTTTTTATTTT*GAGACTGACCTGCT
TGAAG**AACACCCATTTTGTTGTATGAGCTATGTTCATGTAT
ATAAAAAA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2AV15JQ 799 0 0
AAAACAGAGATTTTCATAATGTGCGACTCGGCTTCTCCTTCTCGTTGTTCCTCATACGAG
ACAGACTCTGAGATCTTCACCAGCTCCAGCTCATGCTCCTCCTACAGTGAATCTGAAGAA
GAGTTCGAGAATGCTTTTGGTGGTGAGTCGCTGCAAGAAACCAAGAAGTTGGAGAAGAAG
AAGAAGAGCAGTGTGTTGCTTGAAGGTTACGTTGTTGATGATTTGAAGAGGACAAAGAGT
TTAACGGACAATGATCTCGAGGAGCTTAAAGGTTGTGTAGATCTAGGCTTTGGTTTCAAC
TACGATGAGATCCCTGAGCTTTGTAATACTTTGCCTGCTCTTGAGCTTTGTTACTCGATG
CGTCACAAGTTTATGGATCAAGATCATCATCACCACCACCATACTTCTTCGCCTGAGAAG
ATTGAATCTCCTATAGCTAGCTGGAAGATCTCTAGTCCTGGGGACAGTCCTGATGATGTC
AAAGCAAGGTTGAAGTTTTGGGCACAAGCTGTGGCATGCACCGTGAGATTATGCACTTGA
GATTTGGATTTTGAAGCACATTCAAATGGGTGAGAGAAAGAAGACGATGAACAAACATAA
TTGCTGCATGCAGGAATGATGTCTCTTTATATTAGGCTGTTCTCTTTCAGCTTTTTATTT
TTGAGACTGACCTGCTTGAAAGAAACACCCATTTTGTTGTATGAGCTATGTTCATGTATG
TATAAAAAAAGCTTAGAGATTTTGCTAGGAAAATGTCTTGTAATGCTTTTTTAATAATAA
AGATTTAATTCTTATTACG

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2D295JQ 641 0 0
AAACCAAGAAGTTGGAGAAGAAGAAGAAGAGCAGTGTGTTGCTTGAAGGTTACGTTGTTG
ATGATTTGAAGAGGACAAAGAGTTTAACGGACGATGATCTCGAGGAGCTTAAAGGTTGTG
TAGATCTAGGCTTTGGTTTCAACTACGATGAGATTCCTGAGCTTTGTAATACTTTGCCTG
CTCTTGAGCTTTGTTACTCGATGAGTCACAAGTTTATGGATCAAGATCATCATCACCACC
ACCATACTTCTTCGCCTGAGAAGATTGAATCTCCTATAGCTAGCTGGGAGATCTCTAGTC
CTGGGGACAGTCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAAGTTTTGGGCACAAGCTGTGGCAT
GCACCGTGAGATTATGCACTTGAGATTTGGATTTTGAAGCACATTCAAATGGGTGAGAGA
AAGAAGACGATGAACAAACATAATTGCTGCATGCAGGAATGATGTCTCTTTATATTAGGC
TGTTCTCTTTCAGCTTTTTATTTTTGAGACTGACCTGCTTGAAAGAAACACCCATTTTGT
TGTATGAGCTATGTTCATGTATGTATAAAAAAAGCTTAGAGATTTTGCTAGGAAAATGTC
TTGTAATGCTTTTTTAATAATAAAGATTTAATTCTTATTAC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2C231JQ 791 0 0
GAGA
TTTCATAATGTGCGACTCGGCTTCTCTTTCTCGTTGTTC*TCATACGAGACAGACTCT*A
GATCTTCACCAGCTCCAGCTCATGCTCCTCCTACAGTGAATCTGAAGAAGAGTTCGAGAA
TGCTTTTGGTGGTGAGTCGCTGCAAGAAACCAAGAAGTTGGAGAAGAAGAAGAAGAGCAG
TGTGTTGCTTGAAGGTTACGTTGTTGATGATTTGAAGAGGACAAAGAGTTTAACGGACGA
TGATCTCGAGGAGCTTAAAGGTTGTGTAGATCTAGGCTTTGGTTTCAACTACGATGAGAT
TCCTGAGCTTTGTAATACTTTGCCTGCTCTTGAGCTTTGTTACTCGATGAGTCACAAGTT
TATGGATCAAGATCATCATCACCACCACCATACTTCTTCGCCTGAGAAGATTGAATCTCC
TATAGCTAGCTGGAAGATCTCTAGTCCTGGGGACAGTCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTT
GAAGTTTTGGGCACAAGCTGTGGCATGCACCGTGAGATTATGCACTTGAGATTTGGATTT
TGAAGCACATTCAAATGGGTGAGAGAAAGAAGACGATGAACAAACATAATTGCTGCATGC
AGGAATGATGTCTCTTTATATTAGGCTGTTCTCTTTCAGCTTTTTATTTTTGAGACTGAC
CTGCTTGAAAGAAACACCCATTTTGTTGTATGAGCTATGTTCATGTAT**ATAAAAAAAG
CTTAGAGATTTTGCTAGGAAAATGTCTTGTAATGCTTTTTTAATAATAAAGATTTAATTC
TTATTAC

QA 5 791 5 791
DS 



AS 1 6

CO CL1276Contig1 1020 6 22 U
TTTTTGCGGGGGAAGAATAAAAAAGGCATAACTAGAGAGGAAAGGTAATGGGTGGTGAGG
GAGGAGATGAAACAAGTGAGATGGAATCGGAGAAGTGTCTTGGTCGACCTATCTCCACGG
TCGTCTTCGTCATCGCTATGCAAGCGGAGGCTCAACCTCTGGTCAACAAGTTGGGACTCT
CCGAAACTACTTGTGATGATTCTCCGCTTGGTGGTAGTAAAGGATTGCCGTGGGTTGTGT
ATCAAGGTTTTCATAGAGATCTTCGTATCTATGTTGTCTGCCCCGGCAAGGATCC*TTCT
TTAGGGATTGATTGTGTTGGAACTGTTCCTTCTTCTCTCGTTACCTTTGCTTCTATCCAA
GCCTTACACCCTGACATTCTTATCAATGCCGGTACCTGCGGTGCCTCTAAGGTTAAAGGA
GCCAACATAGGCGATGTATTTCTTGCATCTGATGTTGTCTTCCATGCTCGTAGAATACCT
ATCCCTATGTTTGATCTGTATGGAGTTGGTCTTCGTCAGGCCTTCTCAACCCCCAATCTC
CTCAACCACCTCAATCTCAAGATTGGCAGGTTATCTACTGGTGACTCCTTGGATATGTCC
ACCCAAGATGAATCACTCATCATTGCCAATGATGCAACGCTTAAGGACATGGAGGGTGCT
GCCGTGGCTTACGTTGCTGAGCTTCTGAAAGTACCAGTAATTTTCTTAAAAGCAGTGACC
GATCTCATCGACGGTGATAAACCGACGGCAGAAGAATTCTTGAAGAACTTGGCACTTGTC
ACCTCTGCGCTAGAGGAAACTGCCACTAATGTCATTAGCTTCATCAATGGCAAAACCCTC
TCAGACCTTTAACTATCATATATACTTGTGTTTCTTTTAACCAGGCTTAAGCTGCGTTCC
AGCATCATTTGCAGTATAAACTCATTCCTGGTGATTACATTACTCCACAATAGTGGCTTC
AGTTCTCGAGACGTTTCTTGTTTTTGTTTCAAGTGTTGTATCTATATCAATTTTGGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 
25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E414TF U 1
AF RR2DL14TF U 4
AF RR2FY72TF U 4
AF RR2AP27TF U 6
AF RR2AP27JQ C 161
AF RR2FY72JQ C 437
BS 1 237 RR2E414TF
BS 238 238 RR2DL14TF
BS 239 406 RR2E414TF
BS 407 407 RR2AP27TF
BS 408 517 RR2E414TF
BS 518 565 RR2DL14TF
BS 566 645 RR2FY72TF
BS 646 646 RR2AP27JQ
BS 647 704 RR2FY72TF
BS 705 733 RR2AP27TF
BS 734 734 RR2AP27JQ
BS 735 826 RR2AP27TF
BS 827 827 RR2AP27JQ
BS 828 834 RR2AP27TF
BS 835 835 RR2AP27JQ
BS 836 842 RR2AP27TF
BS 843 843 RR2FY72JQ
BS 844 851 RR2AP27TF
BS 852 852 RR2AP27JQ
BS 853 867 RR2AP27TF
BS 868 985 RR2AP27JQ
BS 986 1020 RR2FY72JQ

RD RR2E414TF 517 0 0
TTTTTGCGGGGGAAGAATAAAAAAGGCATAACTAGAGAGGAAAGGTAATGGGTGGTGAGG
GAGGAGATGAAACAAGTGAGATGGAATCGGAGAAGTGTCTTGGTCGACCTATCTCCACGG
TCGTCTTCGTCATCGCTATGCAAGCGGAGGCTCAACCTCTGGTCAACAAGTTGGGACTCT
CCGAAACTACTTGTGATGATTCTCCGCTTGGTGGTAGTAAAGGATTGCCGTGGGTTGCGT
ATCAAGGTTTTCATAGAGATCTTCGTATCTATGTTGTCTGCCCCGGCAAGGATCC*TTCT
TTAGGGATTGATTGTGTTGGAACTGTTCCTTCTTCTCTCGTTACCTTTGCTTCTATCCAA
GCCTTACACCCTGACATTCTTATCAATGCCGGTACCTGCGGTGCCTTTAAGGTTAAAGGA
GCCAACATAGGCGATGTATTTCTTGCATCTGATGTTGTCTTCCATGCTCGTAGAATACCT
ATCCCTATGTTTGATCTGTATGGAGTTGGTCTTCGTC

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2DL14TF 562 0 0
GGGC
GGGGGAAGAATAAAAAAGGCATAACTAGAGAGGAAAGGTAATGGGTGGTGAGGGAGGAGA
TGAAACAAGTGAGATGGAATCGGAGAAGTGTCTTGGTCGACCTATCTCCACGGTCGTCTT
CGTCATCGCTATGCAAGCGGAGGCTCAACCTCTGGTCAACAAGTTGGGACTCTCCGAAAC
TACTTGTGATGATTCTCCGCTTGGTGGTAGTAAAGGATTGCCGTGGGTTGTGTATCAAGG
TTTTCATAGAGATCTTCGTATCTATGTTGTCTGCCCCGGCAAGGATCC*TTCTTTAGGGA
TTGATTGTGTTGGAACTGTTCCTTCTTCTCTCGTTACCTTTGCTTCTATCCAAGCCTTAC
ACCCTGACATTCTTATCAATGCCGGTACCTGCGGTGCCTTTAAGGTTAAAGGAGCCAACA
TAGGCGATGTATTTCTTGCATCTGATGTTGTCTTCCATGCTCGTAGAATACCTATCCCTA
TGTTTGATCTGTATGGAGTTGGTCTTCGTCAGGCCTTCTCAACCCCCAATCTCCTCAACC
ACCTCAATCTCAAGATTG

QA 5 562 5 562
DS 

RD RR2FY72TF 702 0 0
GGGC
GGGGGAAGAATAAAAAAGGCATAACTAGAGAGGAAAGGTAATGGGTGGTGAGGGAGGAGA
TGAAACAAGTGAGATGGAATCGGAGAAGTGTCTTGGTCGACCTATCTCCACGGTCGTCTT
CGTCATCGCTATGCAAGCGGAGGCTCAACCTCTGGTCAACAAGTTGGGACTCTCCGAAAC
TACTTGTGATGATTCTCCGCTTGGTGGTAGTAAAGGATTGCCGTGGGTTGTGTATCAAGG
TTTTCATAGAGATCTTCGTATCTATGTTGTCTGCCCCGGCAAGGATCC*TTCTTTAGGGA
TTGATTGTGTTGGAACTGTTCCTTCTTCTCTCGTTACCTTTGCTTCTATCCAAGCCTTAC
ACCCTGACATTCTTATCAATGCCGGTACCTGCGGTGCCTTTAAGGTTAAAGGAGCCAACA
TAGGCGATGTATTTCTTGCATCTGATGTTGTCTTCCATGCTCGTAGAATACCTATCCCTA
TGTTTGATCTGTATGGAGTTGGTCTTCGTCAGGCCTTCTCAACCCCCAATCTCCTCAACC
ACCTCAATCTCAAGATTGGCAGGTTATCTACTGGTGACTCCTTGGATATGTCCACCCAAG
ATGAATCACTCATCATTGCCAATGATGCAACGCTTAAG*ACATGGAGGGTGCTGCCGTGG
CTTACGTTGCTGAGCTTCTGAAAGTACCAGTAATTTT
C

QA 5 701 5 701
DS 

RD RR2AP27TF 862 0 0
GG
GGGGGAAGATTAAAAAAGGCATAACTAGAGAGGAAAGGTAATGGGTGGTGAGGGAGGAGA
TGAAACAAGTGAGATGGAATCGGAGAAGTGTCTTGGTCGACCTATCTCCGCGGTCGTCTT
CGTCATCGCTATGCAAGCGGAGGCTCAACCTCTGGTCAACAAGTTGGGACTCTCCGAAAC
TACTTGTGATGATTTTCCGCTTGGTGGTAGTAAAGGATTGCCGTGGGTTGTGTATCAAGG
TTTTCATAGAGATCTTCGTATCTATGTTGTCTGCCCCGGCAAGGATCC*TTCTTTAGGGA
TTGATTGTGTTGGAACTGTTCCTTCTTCTCTCGTTACCTTTGCTTCTATCCAAGCCTTAC
ACCCTGACATTCTTATCAATGCCGGTACCTGCGGTGCCTCTAAGGTTAAAGGAGCCAACA
TAGGCGATGTATTTCTTGCATCTGATGTTGTCTTCCATGCTCGTAGAATACCTATCCCTA
TGTTTGATCTGTATGGAGTTGGTCTTCGTCAGGCCTTCTCAACCCCCAATCTCCTCAACC
ACCTCAATCTCAAGATTGGCAGGTTATCTACTGGTGACTCCTTGGATATGTCCACCCAAG
ATGAATCACTCATCATTGCCAATGATGCAACGCTTAAG*ACATGGAGGGTGCTGCTGTGG
CTTACGTTGCTGAGCTTCTGAAAGTACCAGTAATTTTCTTAAAAGCAGTGACCGATCTCA
TCGACG*TGATAAACCGACGGCAGAAGAATTCTTGAAGAACTTGGCACTTGTCACCTCTG
CGCTAGAGGAAACTGCCACTAATGTCATTAGCTTCATCA*TGGCAAA*CCCTCTC*GACC
TTTA*CTATCATATATACTT

QA 3 862 3 862
DS 

RD RR2AP27JQ 825 0 0
GGTCAACAAGTTGGGACTCTCCGAAACTACTTGTGATGATTTTCCGCTTGGTGGTAGTAA
AGGATTGCCGTGGGTTGTGTATCAAGGTTTTCATAGAGATCTTCGTATCTATGTTGTCTG
CCCCGGCAAGGATCCCTTCTTTAGGGATTGATTGTGTTGGAACTGTTCCTTCTTCTCTCG
TTACCTTTGCTTCTATCCAAGCCTTACACCCTGACATTCTTATCAATGCCGGTACCTGCG
GTGCCTCTAAGGTTAAAGGAGCCAACATAGGCGATGTATTTCTTGCATCTGATGTTGTCT
TCCATGCTCGTAGAATACCTATCCCTATGTTTGATCTGTATGGAGTTGGTCTTCGTCAGG
CCTTCTCAACCCCCAATCTCCTCAACCACCTCAATCTCAAGATTGGCAGGTTATCTACTG
GTGACTCCTTGGATATGTCCACCCAAGATGAATCACTCATCATTGCCAATGATGCAACGC
TTAAGGACATGGAGGGTGCTGCTGTGGCTTACGTTGCTGAGCTTCTGAAAGTACCAGTAA
TTTTCTTAAAAGCAGTGACCGATCTCATCGACGGTGATAAACCGACGGCAGAAGAATTCT
TGAAGAACTTGGCACTTGTCACCTCTGCGCTAGAGGAAACTGCCACTAATGTCATTAGCT
TCATCAATGGCAAAACCCTCTCCGACCTTTAACTATCATATATACTTGTGTTTCTTTTAA
CCAGGCTTAAGCTGCGTTCCAGCATCATTTGCAGTATAAACTCATTCCTGGTGATTACAT
TACTCCACAATAGTGGCTTCAGTTCTCGAGACGTTTCTTGTTTTT

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR2FY72JQ 584 0 0
TATTTCTTGCATCTGATGTTGTCTTCCATGCTCGTAGAATACCTATCCCTATGTTTGATC
TGTATGGAGTTGGTTTTCGTCAGGCCTTCTCAACCCCCAATCTCCTCAACCACCTCAATT
TCAAGATTGGCAGGTTATTTACTGGTGACTCCTTGGATATGTCCACCCAAGATGAATCAC
TCATCATTGCCAATGATGCAACGCTTAAGGACATGGAGGGTGCTGCCGTGGCTTACGTTG
CTGAGCTTTTGAAAGTACCAGTAATTTTTTTAAAAGCAGTGACCGATTTCATCGACGGTG
ATAAACCGACGGCAGAAGAATTCTTGAAGAACTTGGCACTTGTCACCTTTGCGCTAGAGG
AAACTGCCACTAATGTCATTAGCTTCATCAATGGCAAAACCCTTTCAGACCTTTAACTAT
CATATATACTTGTGTTTCTTTTAACCAGGCTTAAGCTGCGTTCCAGCATCATTTGCAGTA
TAAACTCATTCCTGGTGATTACATTACTCCACAATAGTGGCTTCAGTTCTCGAGACGTTT
CTTGTTTTTGTTTCAAGTGTTGTATCTATATCAATTTTGGTTAT

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 6

CO CL1277Contig1 615 6 19 U
GGGACATCCAGATCGGTAGTGTGTTGAGTCCAGCCAGTTATATAATATTATGGCGGAGGG
AGTCCCATCATCGGTGTCGGTCACAGTCGCCCACGAACTTCTTCAAGCCGGCCACCGCTA
TTTGGACGTCAGGACTCCAGAAGAGTTCAGCCAGGGACATGCCTCTGCCGCTATCAACGT
TCCTTACTTGAACCGAGGGATGTCAAAGAATCCCAACTTCTTGGAACAAGTCTCCTCCCA
TTTCGGTAAAGCCGATGAAGTCGTTGTTGGTTGCCAGAGCGGGGGTAGATCTTTGAAAGC
CACCGCTGAGCTTCTTGATGCTGGTTTCACGGGAGTCAAAGATATCTCCGGTGGCTACTC
TGCCTGGACCCAGAATGGTCTTCCTACACAAGACTGATGATGATGACCCCCCACTCACCA
CCATAATGTCTTTTGTCTTTTTCTCTGATAATAAATACATCAGGAGTGCGTTTTCCAGAT
GTAAAATAAACTACTTTCTCTCTTCCATTGTGTGCTTGCAGCTGTTGTACCCACAACTTA
TGAGTGGGGTGTTGTGTTAATTGCATCGATATGTCCTATTGTATTTATATATATCAACAA
AGAATTGAGAAAGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV70TF U 1
AF RR2FF67JQ C 167
AF RR2DS31TF U 8
AF RR2EI08JQ C 15
AF RR2EI08TF U 15
AF RR2FF67TF U 9
BS 1 216 RR2AV70TF
BS 217 217 RR2DS31TF
BS 218 279 RR2AV70TF
BS 280 280 RR2DS31TF
BS 281 303 RR2AV70TF
BS 304 304 RR2DS31TF
BS 305 391 RR2AV70TF
BS 392 392 RR2DS31TF
BS 393 409 RR2AV70TF
BS 410 410 RR2DS31TF
BS 411 444 RR2AV70TF
BS 445 445 RR2DS31TF
BS 446 487 RR2AV70TF
BS 488 488 RR2DS31TF
BS 489 522 RR2AV70TF
BS 523 531 RR2DS31TF
BS 532 568 RR2AV70TF
BS 569 569 RR2DS31TF
BS 570 615 RR2AV70TF

RD RR2AV70TF 615 0 0
GGGACATCCAGATCGGTAGTGTGTTGAGTCCAGCCAGTTATATAATATTATGGCGGAGGG
AGTCCCATCATCGGTGTCGGTCACAGTCGCCCACGAACTTCTTCAAGCCGGCCACCGCTA
TTTGGACGTCAGGACTCCAGAAGAGTTCAGCCAGGGACATGCCTCTGCCGCTATCAACGT
TCCTTACTTGAACCGAGGGATGTCAAAGAATCCCAATTTCTTGGAACAAGTCTCCTCCCA
TTTCGGTAAAGCCGATGAAGTCGTTGTTGGTTGCCAGAGTGGGGGTAGATCTTTGAAAGC
CACGGCTGAGCTTCTTGATGCTGGTTTCACGGGAGTCAAAGATATCTCCGGTGGCTACTC
TGCCTGGACCCAGAATGGTCTTCCTACACAATACTGATGATGATGACCCACCACTCACCA
CCATAATGTCTTTTGTCTTTTTCTTTGATAATAAATACATCAGGAGTGCGTTTTCCAGAT
GTAAAATGAACTACTTTCTCTCTTCCATTGTGTGCTTGCAGC*********CACAACTTA
TGAGTGGGGTGTTGTGTTAATTGCATCGGTATGTCCTATTGTATTTATATATATCAACAA
AGAATTGAGAAAGTA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2FF67JQ 443 0 0
GCCGCTATCAACGTTCCATACTTGAACCGAGGGATGTCAAAGAATCCCAATTTCTTGGAA
CAAGTTTCCTCCCATTTCGGTAAAGCCGATGAAGTCGTTGTTGGTTGCCAGAGTGGGGGT
AGATTTTTGAAAGCCACGGCTGAGCTTTTTGATGCTGGTTTCACGGGAGTCAAAGATATT
TCCGGTGGCTATTTTGCCTGGACCCAGAATGGTCTTCCTACACAATACTGATGATGATGA
CCCCCCACTCACCACCATAATGTCTTTTGTCTTTTTCTTTGATAATAAATACATCAGGAG
TGCGTTTTCCAGATGTAAAATGAACTACTTTCTTTCTTCCATTGTGTGCTTGCAGC****
*****CACAACTTATGAGTGGGGTGTTGTGTTAATTGCATCGATATGTCCTATTGTATTT
ATATATATCAACAAAGAATTG
GG

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR2DS31TF 601 0 0
GGAGATC
GGTAGTGTGTTGAGTCCAGCCAGTTATATAATATTATGGCGGAGGGAGTCCCATCATCGG
TGTCGGTCACAGTCGCCCACGAACTTCTTCAAGCCGGCCACCGCTATTTGGACGTCAGGA
CTCCAGAAGAGTTCAGCCAGGGACATGCCTCTGCCGCTATCAACGTTCCTTACTTGAACC
GAGGGATGTCAAAGAATCCTAACTTCTTGGAACAAGTCTCCTCCCCTTTCGGTAAAGCCG
ATGAAGTCGTTGTTGGTTGCCAGAGCGGGGGTAGATCTTTGAAAGCCACCGCTGAGCTTC
TTGCTGCTGGTTTCACGGGAGTCAAAGATATCTCCGGTGGCTACTCTGCCTGGACCCAGA
ATGGTCTTCCTACACAAGACTGATGATGATGACCCCCCACTCACCACCATAATGCCTTTT
GTCTTTTTCTCTGATAATAAATACATCAGGAGTGCGTTTTCCAGATGTAAAATAAACTAC
TTTCTCTCTTCCATTGTGTGCTTGCAGCTGTTGTACCCACAACTTATGAGTGGGGTGTTG
TGTTAATTGCATCGATATGTCCTATTGTATTTATATATATCAACAAAGAATTG
A

QA 8 600 8 600
DS 

RD RR2EI08JQ 593 0 0
GGTAGTGTGTTGAGTCCAGCCAGTTATATAATATTATGGCGGAGGGAGTCCCATCATCGG
TGTCGGTCACAGTCGCCCACGAACTTCTTCAAGCCGGCCACCGCTATTTGGACGTCAGGA
CTCCAGAAGAGTTCAGCCAGGGACATGCCTCTGCCGCTATCAACGTTCCTTACTTGAACC
GAGGGATGTCAAAGAATCCTAACTTCTTGGAACAAGTCTCCTCCCATTTCGGTAAAGCCG
ATGAAGTCGTTGTTGGTTGCCAGAGCGGGGGTAGATCTTTGAAAGCCACCGCTGAGCTTC
TTGCTGCTGGTTTCACGGGAGTCAAAGATATCTCCGGTGGCTACTCTGCCTGGACCCAGA
ATGGTCTTCCTACACAAGACTGATGATGATGACCCCCCACTCACCACCATAATGTCTTTT
GTCTTTTTCTCTGATAATAAATACATCAGGAGTGCGTTTTCCAGATGTAAAATAAACTAC
TTTCTCTCTTCCATTGTGTGCTTGCAGCTGTTGTACCCACAACTTATGAGTGGGGTGTTG
TGTTAATTGCATCGATATGTCCTATTGTATTTATATATATCAACAAAGAATTG

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2EI08TF 593 0 0
GGTAGTGTGTTGAGTCCAGCCAGTTATATAATATTATGGCGGAGGGAGTCCCATCATCGG
TGTCGGTCACAGTCGCCCACGAACTTCTTCAAGCCGGCCACCGCTATTTGGACGTCAGGA
CTCCAGAAGAGTTCAGCCAGGGACATGCCTCTGCCGCTATCAACGTTCCTTACTTGAACC
GAGGGATGTCAAAGAATCCTAACTTCTTGGAACAAGTCTCCTCCCATTTCGGTAAAGCCG
ATGAAGTCGTTGTTGGTTGCCAGAGCGGGGGTAGATCTTTGAAAGCCACCGCTGAGCTTC
TTGCTGCTGGTTTCACGGGAGTCAAAGATATCTCCGGTGGCTACTCTGCCTGGACCCAGA
ATGGTCTTCCTACACAAGACTGATGATGATGACCCCCCACTCACCACCATAATGTCTTTT
GTCTTTTTCTCTGATAATAAATACATCAGGAGTGCGTTTTCCAGATGTAAAATAAACTAC
TTTCTCTCTTCCATTGTGTGCTTGCAGCTGTTGTACCCACAACTTATGAGTGGGGTGTTG
TGTTAATTGCATCGATATGTCCTATTGTATTTATATATATCAACAAAGAATTG

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2FF67TF 601 0 0
GGGATC
GGTAGTGTGTTGAGTCCAGCCAGTTATATAATATTATGGCGGAGGGAGTCCCATCGTCGG
TGTCGGTCACAGTCGCCCACGAACTTCTTCAAGCCGGCCACCGCTATTTGGACGTCAGGA
CTCCAGAAGAGTTCAGCCAGGGACATGCCTCTGCCGCTATCAACGTTCCATACTTGAACC
GAGGGATGTCAAAGAATCCCAATTTCTTGGAACAAGTCTCCTCCCATTTCGGTAAAGCCG
ATGAAGTCGTTGTTGGTTGCCAGAGTGGGGGTAGATCTTTGAAAGCCACGGCTGAGCTTC
TTGATGCTGGTTTCACGGGAGTCAAAGATATCTCCGGTGGCTACTCTGCCTGGACCCAGA
ATGGTCTTCCTACACAATACTGATGATGATGACCCACCACTCACCACCATAATGTCTTTT
GTCTTTTTCTTTGATAATAAATACATCAGGAGTGCGTTTTCCAGATGTAAAATGAACTAC
TTTCTCTCTTCCATTGTGTGCTTGCAGC*********CACAACTTATGAGTGGGGTGTTG
TGTTAATTGCATCGATATGTCCTATTGTATTTATATATATCAACAAAGAATTG
AG

QA 7 599 7 599
DS 



AS 1 6

CO CL1278Contig1 1308 6 15 U
GGAAGAAGAAGAAGTAGAAATGGAAGAGGAGAAGCGACATTCAACGGTGGAGATCTCCGG
ATTACGTTTCACGTATCCAGGAATCGACGGCCATCCACCTCCGGGATCAAAACCGCTTAT
CGAGGATTTTTCTCTGAAGCTCAATTCGAGCGAACGGTGTCTCCTCGTCGGATCCAATGG
CGCCGGGAAAACGACGATACTGAAGATATTGGGAGGGAAACACATGGTGGAGCCGCACAT
GGTTAGGGTTCTTGGTCGATCTGCGTTTCACGACACCGGTTTGACTTCTTCTGGTGATCT
CTGCTATCTCGGCGGCGAGTGGAGGCGTGATGTGGCATTTGCAGGATTTGAAGTTCCGAT
TCAGATGGACATTTCTGCTGAGAAAATGATATTTGGAGTGGCTGGTATTGATCCTCAGAG
AAGAGCTGAACTTATCAAGGTGTTGGATATTGATATCTCATGGAGATTGCACAAGGTCTC
TGATGGCCAGAGAAGACGCGTCCAGATTTGTATGGGCCTCCTCAAGCCTTTCAAGGTTCT
CCTTTTGGATGAAATCACTGTTGATCTTGACGTTCTCGCCAGAGCCGACCTTTTGACTTT
TCTGAGAAAGGAATGCCAAGAACGAGGAGCTACCATTATCTACGCCACTCATATTTTCGA
TGGTCTTGAGGATTGGCCTACGCACATTGTGTATGTAGCAAACGGGAAGTTGCAATTAGC
AATGCCAATGGAGAAAGTGAAGGAAACAAGCAAGAAGTCGTTGATGAGAACAGTTGAGAG
TTGGTTAAGGAAAGAAAGAGACGAGGAGAGGAAGACAAGGAGAGAAAGGAAAGCCAATGG
CCTTCCTGAGTTCGAAACGCGTGCTGAAGAAAGCCGTGTCACCGGTGATCCTGCTCGGAT
GCTCAACAATGGCTGGGCTGCCGGCAGACTTCACTCTACCATTGCAGGAGGTGAAGAACA
TTTCGTCCTTAGCTCAAACAGAGTTCTCAGATAAGCATTCATTCGAGCGACTCCAATGGA
GCAAAAGGTCATAATAATATGTTCTTCTTTTTCTTTCTTTCTTTTACCACGAATAATACT
TCTTTTTTCTGTAACCCGTTTGAGTGTTTGTTATTCTGAGATATGAATTTTATATTATTT
TCTAGCTATATCTTAGTTTGGTAATGAGAAGGATCAAGATTGAAGAAGTCAGAGAGAGTA
AAAATTCCTCTGTATTATTGTGTGTAGTTAAGTTGAGCTTTGTTAGTAAAGTAAAATTTA
TATTGTAATATCTCCATAACTTGGACTTTTCATTATATATTATATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC92TF U 12
AF RR2DG04TF U 1
AF RR2A884JQ C 352
AF RR2A884TF U 185
AF RR2EC92JQ C 638
AF RR2DG04JQ C 573
BS 1 96 RR2DG04TF
BS 97 97 RR2EC92TF
BS 98 698 RR2DG04TF
BS 699 699 RR2A884TF
BS 700 742 RR2DG04TF
BS 743 743 RR2A884TF
BS 744 769 RR2DG04TF
BS 770 770 RR2A884TF
BS 771 781 RR2DG04TF
BS 782 782 RR2A884TF
BS 783 809 RR2DG04TF
BS 810 953 RR2A884TF
BS 954 954 RR2DG04JQ
BS 955 985 RR2A884TF
BS 986 1308 RR2DG04JQ

RD RR2EC92TF 536 0 0
G
AGTAGAAATGGAAGAGGAGAAGCGACATTCAACGGTGGAGATCTCCGGATTACGTTTCAC
GTATCCAGGAATCGGCGGCCATCCACCTCCGGGATCAAAACCGCTTATCGAGGATTTTTC
TCTGAAGCTCAATTCGAGCGAACGGTGTCTCCTCGTCGGATCCAATGGCGCCGGGAAAAC
GACGATACTGAAGATATTGGGAGGGAAACACATGGTGGAGCCGCACATGGTTAGGGTTCT
TGGTCGATCTGCGTTTCACGACACCGGTTTGACTTCTTCTGGTGATCTCTGCTATCTCGG
CGGCGAGTGGAGGCGTGATGTGGCATTTGCAGGATTTGAAGTTCCGATTCAGATGGACAT
TTCTGCTGAGAAAATGATATTTGGAGTGGCTGGTATTGATCCTCAGAGAAGAGCTGAACT
TATCAAGGTGTTGGATATTGATATCTCATGGAGATTGCACAAGGTCTCTGATGGCCAGAG
AAGACGCGTCCAGATTTGTATGGGCCTCCTCAAGCCTTTCAAGGTTCTCCTTTTG

QA 2 536 2 536
DS 

RD RR2DG04TF 809 0 0
GGAAGAAGAAGAAGTAGAAATGGAAGAGGAGAAGCGACATTCAACGGTGGAGATCTCCGG
ATTACGTTTCACGTATCCAGGAATCGACGGCCATCCGCCTCCGGGATCAAAACCGCTTAT
CGAGGATTTTTCTCTGAAGCTCAATTCGAGCGAACGGTGTCTCCTCGTCGGATCCAATGG
CGCCGGGAAAACGACGATACTGAAGATATTGGGAGGGAAACACATGGTGGAGCCGCACAT
GGTTAGGGTTCTTGGTCGATCTGCGTTTCACGACACCGGTTTGACTTCTTCTGGTGATCT
CTGCTATCTCGGCGGCGAGTGGAGGCGTGATGTGGCATTTGCAGGATTTGAAGTTCCGAT
TCAGATGGACATTTCTGCTGAGAAAATGATATTTGGAGTGGCTGGTATTGATCCTCAGAG
AAGAGCTGAACTTATCAAGGTGTTGGATATTGATATCTCATGGAGATTGCACAAGGTCTC
TGATGGCCAGAGAAGACGCGTCCAGATTTGTATGGGCCTCCTCAAGCCTTTCAAGGTTCT
CCTTTTGGATGAAATCACTGTTGATCTTGACGTTCTCGCCAGAGCCGACCTTTTGACTTT
TCTGAGAAAGGAATGCCAAGAACGAGGAGCTACCATTATCTACGCCACTCATATTTTCGA
TGGTCTTGAGGATTGGCCTACGCACATTGTGTATGTAGTAAACGGGAAGTTGCAATTAGC
AATGCCAATGGAGAAAGTGAAG*AAACAAGCAAGAAGTCGTTGATGAGA*CAGTTGAGAG
T*GGTTAAGGAAAGAAAGAGACGAGGAGA

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2A884JQ 592 0 0
AGTTCCGATTCAGATGGACATTTCTGCTGAGAAAATGATATTTGGAGTGGCTGGTATTGA
TCCTCAGAGAAGAGCTGAACTTATCAAGGTGTTGGATATTGATATCTCATGGAGATTGCA
CAAGGTCTCTGATGGCCAGAGAAGACGCGTCCAGATTTGTATGGGCCTCCTCAAGCCTTT
CAAGGTTCTCCTTTTGGATGAAATCACTGTTGATCTTGACGTTCTCGCCAGAGCCGACCT
TTTGACTTTTCTGAGAAAGGAATGCCAAGAACGAGGAGCTACCATTATTTACGCCACTCA
TATTTTCGATGGTCTTGAGGATTGGCCTACGCACATTGTGTATGTAGCAAACGGGAAGTT
GCAATTAGCAATGCCAATGGAGAAAGTGAAGGAAACAAGCAAGAAGTCGTTGATGAGAAC
AGTTGAGAGTTGGTTAAGGAAAGAAAGAGACGAGGAGAGGAAGACAAGGAGAGAAAGGAA
AGCCAATGGCCTTCCTGAGTTCGAAACGCGTGCTGAAGAAAGCCGTGTCACCGGTGATCC
TGCTCGGATGCTCAACAATGGCTGGGCTGCCGGCAGACTTCACTCTACCATT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2A884TF 805 0 0
GGGAAAACGACGATACTGAAGATATTGGGAGGGAAACACATGGTGGAGCCGCACATGGTT
AGGGTTCTTGGTCGATCTGCGTTTCACGACACCGGTTTGACTTCTTCTGGTGATCTCTGC
TATCTCGGCGGCGAGTGGAGGCGTGGTGTGGCATTTGCAGGATTTGAAGTTCCGATTCAG
ATGGACATTTCTGCTGAGAAAATGATATTTGGAGTGGCTGGTATTGATCCTCAGAGAAGA
GCTGAACTTATCAAGGTGTTGGATATTGATATCTCATGGAGATTGCACAAGGTCTCTGAT
GGCCAGAGAAGACGCGTCCAGATTTGTATGGGCCTCCTCAAGCCTTTCAAGGTTCTCCTT
TTGGATGAAATCACTGTTGATCTTGACGTTCTCGCCAGAGCCGACCTTTTGACTTTTCTG
AGAAAGGAATGCCAAGAACGAGGAGCTACCATTATCTACGCCACTCATATTTTCGATGGT
CTTGAGGATTGGCCTACGCACATTGTGTATGTAGCAAACGGGAAGTTGCAATTAGCAATG
CCAATGGAGAAAGTGAAGGAAACAAGCAAGAAGTCGTTGATGAGAACAGTTGAGAGTTGG
TTAAGGAAAGAAAGAGACGAGGAGAGGAAGACAAGGAGAGAAAGGAAAGCCAATGGCCTT
CCTGAGTTCGAAACGCGTGCTGAAGAAAGCCGTGTCACCGGTGATCCTGCTCGGATGCTC
AACAATGGCTGGGCTGCCGGCAGACTTCACTCTACCATTGCAGGAGGTGGAGAACATTTC
GTCCTTAGCTCAAACAGAGTT
CTCA

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2EC92JQ 506 0 0
ATCTACGCCACTCATATTTTCGATGGTCTTGAGGATTGGCCTACGCACATTGTGTATGTA
GCAAACGGGAAGTTGCAATTAGCAATGCCAATGGAGAAAGTGAAGGAAACAAGCAAGAAG
TCGTTGATGAGAACAGTTGAGAGTTGGTTAAGGAAAGAAAGAGACGAGGAGAGGAAGGCA
AGGAGAGAAAGGAAAGCCAATGGCCTTCCTGAGTTCGAAACGCGTGCTGAAGAAAGCCGT
GTCACCGGTGATCCTGCTCGGATGCTCAACAATGGCTGGGCTGCCGGCAGACTTCACTCT
ACCATTGCAGGAGGTGAAGAACATTTCGTCCTTAGCTCAAACAGAGTTTTCAGATAAGCA
TTCATTCGAGCGACTCCAATGGAGCAAAAGGTCATAATAATATGTTCTTCTTTTTCTTTC
TTTCTTTTACCACGAATAATACTTCTTTTTTCTGTAACCCGTTTGAGTGTTTGTTATTTT
GAGATATGAATTTTATATTATTTTCT

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2DG04JQ 736 0 0
TTCTCGCCAGAGCCGAC*TTTTGACTTTTCTGAGAAAGGAATGCCAAGAACGAGGAGCTA
CCATTATCTACGCCACTCATATTTTCGATGGTCTTGAGGATTGGCCTACGCACATTGTGT
ATGTAGTAAACGGGAAGTTGCAATTAGCAATGCCAATGGAGAAAGTGAAGGAAACAAGCA
AGAAGTCGTTGATGAGAACAGTTGAGAGTTGGTTAAGGAAAGAAAGAGACGAGGAGAGGA
AGACAAGGAGAGAAAGGAAAGCCAATGGCCTTCCTGAGTTCGAAACGCGTGCTGAAGAAA
GCCGTGTCACCGGTGATCCTGCTCGGATGCTCAACAATGGCTGGGCTGCCGGCAGACTTC
ACTCTACCATTGCAGGAGGTGAAGAACATTTCGTCCTTAGCTCAAACAGAGTTCTCAGAT
AAGCATTCATTCGAGCGACTCCAATGGAGCAAAAGGTCATAATAATATGTTCTTCTTTTT
CTTTCTTTCTTTTACCACGAATAATACTTCTTTTTTCTGTAACCCGTTTGAGTGTTTGTT
ATTCTGAGATATGAATTTTATATTATTTTCTAGCTATATCTTAGTTTGGTAATGAGAAGG
ATCAAGATTGAAGAAGTCAGAGAGAGTAAAAATTCCTCTGTATTATTGTGTGTAGTTAAG
TTGAGCTTTGTTAGTAAAGTAAAATTTATATTGTAATATCTCCATAACTTGGACTTTTCA
TTATATATTATATTAC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 6

CO CL1279Contig1 1208 6 6 U
ATAATGATAAAACATCATTCAACAAATAGAAGGTTGATAAGTAGAGAATATATATAACAA
ATACATCAAATAAAAACATACACTCTACAAGCTTGGATACAGCAAACTGGTTTATAAAGT
CACTCACAAACCTTCCCCTCAAAGCAACAAATAATACACTAAACGTTACTCACCAATAAA
TTCTTTTTTATTATTATTTTGATTTTTTTTTTCCTTCCTCCTGGCCCAAGGAAATCTCCA
CCTCTTGGATAGTTTGAAAAATCAAATTCTAAGCGTGAAGCTCGTGAAGCTGGCTCCTCA
CTGACCCATAAGCCCTCATAGCACCAGCTCTCAACACAAACTGGTGGTACAAAGCTGCAA
TTGCTGCTCCCACAAATGGACCGACCCAGAAGATCCATTGATCATCCCAAGCCTTTTGAT
TGTTGTAGATGACTGCAGCTCCAAAACTCCTAGCCGGGTTAATTCCAGTTCCAGTGATTG
GGATTGTGGCTAAATGAACCATGAACACCGAAAATCCAATTGGCAATGGTGCCAATACAG
GAATGTAAGAGTCACGGGCATTACGCTTAGGGTCTGTAGCGGAGAAGACCGTGTAGACAA
GGACAAATGTGCCGATAATCTCAGCACCAACACCAACACCAACGTTGTATCCGTCGGCGA
GGACGTTGGCTCCACCGCCATATCGGTTGTAATAAGTTTTCTGGAAGACTTTCACCAAAC
CAACTCCGCAAGTGGCTCCGAGACACTGAGCCACTATGTAGGATATAGCTCTCACCAACG
GCACCTTGCTAGCCAAGAATAGTCCAAACGTCACTGCAGGGTTAATGTGCCCACCAGAGA
TGCCGGCAGTGCAGTAGACAAGGATGAAGATCATGCCACCGAAGGCCCAAGAGATGCCCA
GGAGGCCGACGCTGGCGCAGGCTCCACCGCCAGTTTTGAGATCCGTCTGGCTCTTGAAAC
CGATGACTGTCAAGACGGTGATGTATAGAAAGAGAAGAGTAGCTATGAACTCAGCGATGA
CTGCTCTATAGAAGGACCATTTTCCTAGCTCCCTCGCCTCGAAAATCTTGACACGCGGTG
GATCCTTGTAATCCTTGCCGGACAACGACTCCTCCTCCGTCAAGTCTGTCGACATTGTTT
ATTTTTTATGTGGTATATACTTATGTAGCTTCCACAGAGTTAGAGAGAGAGAGAGGGGAT
GTGGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GX74JQ U 1
AF RR2DG82JQ U 36
AF RR2CO01JQ U 39
AF RR2DG82TF C 419
AF RR2GX74TF C 513
AF RR2CO01TF C 475
BS 1 657 RR2GX74JQ
BS 658 712 RR2DG82JQ
BS 713 815 RR2CO01JQ
BS 816 1192 RR2DG82TF
BS 1193 1194 RR2GX74TF
BS 1195 1208 RR2DG82TF

RD RR2GX74JQ 657 0 0
ATAATGATAAAACATCATTCAACAAATAGAAGGTTGATAAGTAGAGAATATATATAACAA
ATACATCAAATAAAAACATACACTCTACAAGCTTGGATACAGCAAACTGGTTTATAAAGT
CACTCACAAACCTTCCCCTCAAAGCAACAAATAATACACTAAACGTTACTCACCAATAAA
TTCTTTTTTATTATTATTTTGATTTTTTTTTTCCTTCCTCCTGGCCCAAGGAAATCTCCA
CCTCTTGGATAGTTTGAAAAATCAAATTCTAAGCGTGAAGCTCGTGAAGCTGGCTCCTCA
CTGACCCATAAGCCCTCATAGCACCAGCTCTCAACACAAACTGGTGGTACAAAGCTGCAA
TTGCTGCTCCCACAAATGGACCGACCCAGAAGATCCATTGATCATCCCAAGCCTTTTGAT
TGTTGTAGATGACTGCAGCTCCAAAACTCCTAGCCGGGTTAATTCCAGTTCCAGTGATTG
GGATTGTGGCTAAATGAACCATGAACACCGAAAATCCAATTGGCAATGGTGCCAATACAG
GAATGTAAGAGTCACGGGCATTACGCTTAGGGTCTGTAGCGGAGAAGACCGTGTAGACAA
GGACAAATGTGCCGATAATCTCAGCACCAACACCAACACCAACGTTGTATCCGTCGG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2DG82JQ 677 0 0
GGTA
AGTAGAGGATATATATAACAAATACATCAAATAAAAACATACACTCTACAAGCTTGGATA
CAGCAAACTGGTTTATAAAGTCACTCACAAACCTTCCCCTCAAAGCAACAAATAATACAC
TAAACGTTACTCACCAATAAATTCTTTTTTATTATTATTTTGATTTTTTTTT*CCTTCCT
CCTGGCCCAAGGAAATCTCCACCTCTTGGATAGTTTGAAAAATCAAATTCTAAGCGTGAA
GCTCGTGAAGCTGGCTCCTCACTGACCCATAAGCCCTCATAGCACCAGCTCTCAACACAA
ACTGGCGGTACAAAGCTGCAATTGCTGCTCCCACGAATGGACCGACCCAGAAGATCCATT
GATCATCCCAAGCCTTTTGATTGTTGTAGATGACTGCAGCTCCAAAACTCCTAGCCGGGT
TAATTCCAGTTCCAGTGATTGGGATTGTGGCTAAATGAACCATGAACACCGAAAATCCAA
TTGGCAATGGTGCCAATACAGGAATGTAAGAGTCACGGGCATTACGCTTAGGGTCTGTAG
CGGAAAAGACCGTGTAGACAAGGACGAATGTGCCGATAATCTCAGCACCAACACCAACAC
CAACGTTGTATCCGTCGGCGAGGACGTTGGCTCCACCGCCATATCGGTTGTAATAAGTTT
TCTGGAAGACTTT

QA 5 677 5 677
DS 

RD RR2CO01JQ 777 0 0
G
AGTAGAGAATATATATAACAAATACATCAAATAAAAACATACACTCTACAAGCTTGGATA
CAGCAAACTGGTTTATAAAGTCATTCACAAACCTTCCCCTCAAAGCAACAAATAATACAC
TAAACGTTACTCACCAATAAATTCTTTTTTATTATTATTTTGATATTTTTTTTCCTTCCT
CCTGGCCCAAGGAAATCTCCACCTCTTGGATAGTTTGAAAAATCAAATTCTAAGCGTGAA
GCTCGTGAAGCTGGCTCCTCACTGACCCATAAGCCCTCATAGCACCAGCTCTCAACACAA
ACTGGTGGTACAAAGCTGCAATTGCTGCTCCCACAAATGGACCGACCCAGAAGATCCATT
GATCATCCCAAGCCTTTTGATTGTTGTAGATGACTGCAGCTCCAAAACTCCTAGCCGGGC
TAATTCCAGTTCCAGTGATTGGGATTGTGGCTAAATGAACCATGAACACCGAAAATCCAA
TTGGCAATGGTGCCAATACAGGAATGTGAGAGTCACGGGCATTACGCTTAGGGTCTGTAG
CGGAAAAGACCGTGTAGACAAGGACAAATGTGCCGATAATCTCAGCACCAACACCAACAC
CAACGTTGTATCCGTCGGCGAGGACGTTGGCTCCACCGCCATATCGGTTGTAATAAGTTT
TCTGGAAGACTTTCACCAAACCAACTCCGCAAGTGGCTCCGAGACACTGAGCCACTATGT
AGGATATAGCTCTCACCAACGGCACCTTGCTAGCCAAGAATAGTCCAAACGTCACT

QA 2 777 2 777
DS 

RD RR2DG82TF 790 0 0
ATTGTTGTAGATGACTGCAGCTCCAAA*CTCCTAGCCGGGTTA*TTCCAGTTCCAGTGAT
TGGGATTGTGGCTAAATGAACCATGAACAC*GAAAATCCAATTGGCAATGGTGCCAATAC
AGGAATGTAAGAGTCACGGGCATTACGCTTAGGGTCTGTAGCGGAGAAGACCGTGTAGAC
AAGGACGAATGTGCCGATAATCTCAGCACCAACACCAACACCAACGTTGTATCCGTCGGC
GAGGACGTTGGCTCCACCGCCATATCGGTTGTAATAAGTTTTCTGGAAGACTTTCACCAA
ACCAACTCCGCAAGTGGCTCCGAGACACTGGGCCACTATGTAGGATATAGCTCTCACCAA
CGACACCTTGCTAGCCAAGAATAGTCCAAACGTCACTGCAGGGTTAATGTGCCCACCAGA
GATGCCGGCAGTGCAGTAGACAAGGATGAAGATCATGCCACCGAAGGCCCAAGAGATGCC
CAGGAGGCCGACGCTGGCGCAGGCTCCACCGCCAGTTTTGAGATCCGTCTGGCTCTTGAA
ACCGATGACTGTCAAGACGGTGATGTATAGAAAGAGAAGAGTAGCTATGAACTCAGCGAT
GACTGCTCTATAGAAGGACCATTTTCCTAGCTCCCTCGCCTCGAAAATCTTGACACGCGG
TGGATCCTTGTAATCCTTGCCGGACAACGACTCCTCCTCCGTCAAGTCTGTCGACATTGT
TTATTTTTTATGTGGTATATACTTATGTAGCTTCCACAGAGTTAGAGAGAGAGA**GGGG
ATGTGGCTCC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2GX74TF 696 0 0
AATCCAATTGGCAATGGTGCCAATACAGGAATGTAAGAGTCACGGGCATTACGCTTAGGG
TCTGTAGCGGAGAAGACCGTGTAGACAAGGACAAATGTGCCGATAATCTCAGCACCAACA
CCAACACCAACGTTGTATCCGTCGGCGAGGACGTTGGCTCCACCGCCATATCGGTTGTAA
TAAGTTT*CTGGAAGACTTTCACCAAACCAACTCCGCAAGTGGCTCCGAGACAATGGGCC
ACTATGTAGGATATAGCTCTCACCAACGACACCTTGCTAGCCAAGAATAGTCCAAACGTC
ACTGCAGGGTTAATGTGCCCACCAGAGATGCCGGCAGTGCAGTAGACAAGGATGAAGATC
ATGCCACCGAAGGCCCAAGAGATGCCCAGGAGGCCGACGCTGGCGCAGGCTCCACCGCCA
GTTTTGAGATCCGTCTGGCTCTTGAAACCGATGACTGTCAAGACGGTGATGTATAGAAAG
AGAAGAGTAGCTATGAACTCAGCGATGACTGCTCTATAGAAGGACCATTTTCCTAGCTCC
CTCGCCTCGAAAATCTTGACACGCGGTGGATCCTTGTAATCCTTGCCGGACAACGACTCC
TCCTCCGTCAAGTCTGTCGACATTGTTTATTTTTTATGTGGTATATACTTATGTAGCTTC
CACAGAGTTAGAGAGAGAGAGAGGGGATGTGGCTCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2CO01TF 734 0 0
TGATTGGGATTGTG*CTAAATGAACCATGAACAC*GAAAATCCAATTGGCAATGGTGCCA
ATACAGGAATGTGAGAGTCACGGGCATTACGCTTAGGGTCTGTAGCGGAGAAGACCGTGT
AGACAAGGACAAATGTGCCGATAATCTCAGCACCAACACCAACACCAACGTTGTATCCGT
CGGCGAGGACGTTGGCTCCACCGCCATATCGGTTGTAATAAGTTTTCTGGAAGACTTTCA
CCAAACCAACTCCGCAAGTGGCTCCGAGACACTGAGCCACTATGTAGGATATAGCTCTCA
CCAACGGCACCTTGCTAGCCAAGAATAGTCCAAACGTCACTGCAGGGTTGATATGCCCAC
CAGAGATGCCGGAAGTGCAGTAGACAAGGATGAAGATCATGCCACCGAAGGCCCAAGAGA
TGCCCAGGAGGCTGACGCTGGCGCAGGCTCCACCGCCAGTTTTGAGATCCGTCTGGCTCT
TGAAACCGATGACTGTCAAGACGGTGATGTATAGAAAGAGAAGAGTAGCTATGAACTCAG
CGATGACTGCTCTATAGAAGGACCATTTTCCTAGCTCCCTCGCCTCGAAAATCTTGACAC
GCGGTGGATCCTTGTAATCCTTGCCGGACAACGACTCCTCCTCCGTCAAGTCTGTCGACA
TTGTTTATTTTTTATGTGGTATATACTTATGTAGCTTCCACAGAGTTAGAGAGAGAGAGA
AGGGATGTGGCTCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 2 5

CO CL1280Contig1 773 3 6 U
AAGTTACTAAACTGGTTTAGGATTCACCGGAGTCTTTATTATTAGGTTTTTCGGTTTGTC
GACCAAACCAAACCGAAATATTTGTTTTACAATAAGAGATATTCAACAACGATTTACAGA
TTTTTTTTAAAAGGGAAATTTTAGAGAGGTTGACCACTAATCCACCTCTGAAACATGATA
GAACTTTCCTTTGGTTTGAAAAATGCTGTATGCCCACCTCCTTTGACAGTAGCATATGTC
ATGTTATTGGCATAAGTCTGAGTGTATCCAACAACTTGATTGTTTATCATCCATGGTCTC
CACTTTTCAGTAATGGAATAACCAAGTGATCTTATCCACTCTTTCGTTGAAGTGAAAGGC
ACCATCCAGTCGTGATCACCGCTGTAAATGAAAGATCTGTATCCTTTGATGCTATTGTTC
ATATGATACGGTACGCTGCTTTTGATATCGGAATCGTAAGGCTTGCCCGAAAAACACCGT
ACCCATTCTTCTATACTTCCCTTTACTACATGGAGTGCTTTGCGCACGCTCTCGTCATTG
GCCCAGAGGGAAGATAGTGAATCCATGTACAAATAGCATACATCTGGGTTGAACGGAGCC
GAAACGTCTCCAAGGAGAAGGGATCTTCTTTGGACTAACGGGATTTCGCACCATTCCATC
AGAACATTACCATAGTTTAATCCAGAAATACTCTCTCGATATTCGTCAAAATGTTTCAAG
CACTCTGTGTTATTGTCATAGTAATTTCCTCTGCAACTTCTCTGCAGCGACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW43JQ U 57
AF RR2CO39JQ U 1
AF RR2AM03JQ U 19
BS 1 127 RR2CO39JQ
BS 128 128 RR2AM03JQ
BS 129 250 RR2CO39JQ
BS 251 251 RR2AM03JQ
BS 252 656 RR2CO39JQ
BS 657 773 RR2AM03JQ

RD RR2DW43JQ 327 0 0
TGTCGACCAAACCAAACCGAAATATTTGTTTTACAATAAGAGATATTCAACAACGATTTA
CAGATTTTTTTTAAAAGGGAAATTTTAGAGAGGTTGACCACTAATCCACCTCTGAAACAT
GATAGAACTTTCCTTTGGTTTGAAAAATGCTGTATGCCCACCTCCTTTGACAGTAGCATA
TGTCATGTTATTGGCATAAGTCTGAGTGTATCCAACAACTTGATTGTTTATCATCCATGG
TCTCCACTTTTCAGTAATGGAATAACCAAGTGATCTTATCCACTCTTTCGTTGAAGTGAA
AGGCACCATCCAGTCGTGATCACCGCT

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR2CO39JQ 656 0 0
AAGTTACTAAACTGGTTTAGGATTCACCGGAGTCTTTATTATTAGGTTTTTCGGTTTGTC
GACCAAACCAAACCGAAATATTTGTTTTACAATAAGAGATATTCAACAACGATTTACAGA
TTTTTTT*AAAAGGGAAATTTTAGAGAGGTTGACCACTAATCCACCTCTGAAACATGATA
GAACTTTCCTTTGGTTTGAAAAATGCTGTATGCCCACCTCCTTTGACAGTAGCATATGTC
ATGTTATTGGTATAAGTCTGAGTGTATCCAACAACTTGATTGTTTATCATCCATGGTCTC
CACTTTTCAGTAATGGAATAACCAAGTGATCTTATCCACTCTTTCGTTGAAGTGAAAGGC
ACCATCCAGTCGTGATCACCGCTGTAAATGAAAGATCTGTATCCTTTGATGCTATTGTTC
ATATGATACGGTACGCTGCTTTTGATATCGGAATCGTAAGGCTTGCCCGAAAAACACCGT
ACCCATTCTTCTATACTTCCCTTTACTACATGGAGTGCTTTGCGCACGCTCTCGTCATTG
GCCCAGAGGGAAGATAGTGAATCCATGTACAAATAGCATACATCTGGGTTGAACGGAGCC
GAAACGTCTCCAAGGAGAAGGGATCTTCTTTGGACTAACGGGATTTCGCACCATTC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2AM03JQ 755 0 0
G
GGATTCACCGGAGTCTTTATTATTAGGTTTTTCGGTTTGTCGACCAAACCAAACCGAAAT
ATTTGTTTTACAATAAGAGATATTCAACAACGATTTACAGATTTTTTTTAAAAGGGAAAT
TTTAGAGAGGTTGACCACTAATCCACCTCTGAAACATGATAGAACTTTCCTTTGGTTTGA
AAAATGCTGTATGCCCACCTCCTTTGACAGTAGCATATGTCATGTTATTGGCATAAGTCT
GAGTGTATCCAACAACTTGATTGTTTATCATCCATGGTCTCCACTTTTCAGTAATGGAAT
AACCAAGTGATCTTATCCACTCTTTCGTTGAAGTGAAAGGCACCATCCAGTCGTGATCAC
CGCTGTAGATGAAAGATCTGTATCCTTTGATGCTATTGTTCATATGATACGGTACGCTGC
TTTTGATATCGGAATCGTAAGGCTTGCCCGAAGAACACCGTACCCATTCTTCTATACTTC
CCTTTACTACATGGAGTGCTTTGCGCACGCTCTCGTCATTGGCCCAGAGGGAAGATAGTG
AATCCATGTACAGATAGCATACATCTGGGTTGAACGGAGCCGGAACGTCTCCAAGGAGAA
GGGATCTTCTTTGGACTAACGGGATTTCGCACCATTCCATCAGAACATTACCATAGTTTA
ATCCAGAAATACTCTCTCGATATTCGTCAAAATGTTTCAAGCACTCTGTGTTATTGTCAT
AGTAATTTCCTCTGCAACTTCTCTGCAGCGACTC

QA 2 755 2 755
DS 



CO CL1280Contig2 966 2 8 U
GGAAAATAATATTTAAGAATCATCTCGTTAAAACAAAACAGTGCTTTCCGTCCACTTTCT
TATCTTTTTATAAAAAGTTTCACATTATGGCTAAGAAGTTGCTTCTGCTTCTTTTACTTA
TTATCTTAAGCCTACATGCATGTTCTGGCTCTATCGTCAACTCTCTTCCTGGTTTTGAAG
GTCCTCTTCCTTTCGAGCTTGACACCGGGTATATTGGTGTTGGTGAAGAAGAGCAAGTGC
AATTGTTTTACTACTTCATTAAATCTGAGAAGAATCCAAAAGATGATCCTCTTCTTCTCT
GGTTAACTGGAGGACCTGGCTGTTCTTCTCTCAGTGGCCTCTTTTTTGAGAACGGGCCTT
TTACATTTAATCTTGATGAGGGTTACAGAGAAAGAAAACCCACCTTGCAATCTACAACAC
ATTCGTGGACAAAGGTGGCAAACATAATTTTCTTGGACCAGCCTGTTGGTACTGGCTTCT
CCTATGCAACAACTCAAATCCTTGATACACCTAGTGACTCAAGAGAAGCTAAGCAGATCC
ACCAATTTATTCGCAAGTGGTTAAGTAAGCACACAGAGTTTATCTCGAACCCTTTTTATG
TCGGTGGAGATTCGTATTCTGGTAAGGTTATTCCGGCCACTGTTCAAGAAATCTCCAAAG
GAAATGATCTTAAGCTTAAATCCCAAATAAATCTTGAGGGCTATGTGCTAGGAAATCCCC
TAACAGACGAAGAATTTGACAAAAACCACCGTATTCCATTTGCTCATGGAATGGCATTGA
TCTCTGATGAACTCTACGAGTCGCTGCAGAGAAGTTGCAGAGGAAATTACTATGACAATA
ACACAGAGTGCTTGAAACATTTTGACGAATATCGAGAGAGTATTTCTGGATTAAACTATG
GTAATGTTCTGATGGAATGGTGCGAAATCCGTTAGTCCAAAGAGATCCCTTCTCCTTGGA
GACGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO39TF U 1
AF RR2AM03TF U 152
BS 1 400 RR2CO39TF
BS 401 401 RR2AM03TF
BS 402 679 RR2CO39TF
BS 680 680 RR2AM03TF
BS 681 686 RR2CO39TF
BS 687 687 RR2AM03TF
BS 688 707 RR2CO39TF
BS 708 966 RR2AM03TF

RD RR2CO39TF 707 0 0
GGAAAATAATATTTAAGAATCATCTCGTTAAAACAAAACAGTGCTTTCCGTCCACTTTCT
TATCTTTTTATAAAAAGTTTCACATTATGGCTAAGAAGTTGCTTCTGCTTCTTTTACTTA
TTATCTTAAGCCTACATGCATGTTCTGGCTCTATCGTCAACTCTCTTCCTGGTTTTGAAG
GTCCTCTTCCTTTCGAGCTTGACACCGGGTATATTGGTGTTGGTGAAGAAGAGCAAGTGC
AATTGTTTTACTACTTCATTAAATCTGAGAAGAATCCAAAAGATGATCCTCTTCTTCTCT
GGTTAACTGGAGGACCTGGCTGTTCTTCTCTCAGTGGCCTCTTTTTTGAGAACGGGCCTT
TTACATTTAATCTTGATGAGGGTTACAGAGAAAGAAAACCGACCTTGCAATCTACAACAC
ATTCGTGGACAAAGGTGGCAAACATAATTTTCTTGGACCAGCCTGTTGGTACTGGCTTCT
CCTATGCAACAACTCAAATCCTTGATACACCTAGTGACTCAAGAGAAGCTAAGCAGATCC
ACCAATTTATTCGCAAGTGGTTAAGTAAGCACACAGAGTTTATCTCGAACCCTTTTTATG
TCGGTGGAGATTCGTATTCTGGTAAGGTTATTCCGGCCACTGTTCAAGAAATCTCCAAAG
GAAATGATCTTAAGCTTAA*TCCCAA*TAAATCTTGAGGGCTATGTG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2AM03TF 815 0 0
G
ATCGTCAACTCTCTTCCTGGTTTTGAAGGTCCTCTTCCTTTCGAGCTTGAGACCGGGTAT
ATTGGTGTTGGTGAAGAAGAGCAAGTGCAATTGTTTTACTACTTCATTAAATCTGAGAAG
AATCCAAAAGATGATCCTCTTCTTCTCTGGTTAACTGGAGGACCTGGCTGTTCTTCTCTC
AGTGGCCTCTTTTTTGAGAACGGGCCTTTTACATTTAATCTTGATGAGGGTTACAGAGGT
AGAAAACCCACCTTGCAATCTACAACACATTCGTGGACAAAGGTGGCAAACATAATTTTC
TTGGACCAGCCTGTTGGTACTGGCTTCTCCTATGCAACAACTCAAATCCTTGATACACCT
AGTGACTCAAGAGAAGCTAAGCAGATCCACCAATTTATTCTCAAGTGGTTAAGTAAGCAC
ACAGAGTTTATCTCGAACCCTTTTTATGTCGGTGGAGGTTCGTATTCTGGTAAGGTTATT
CCGGCCACTGTTCAAGAAATCTCCAAAGGAAATGATCTTAAGCTTAAATCCCAAATAAAT
CTTGAGGGCTATGTGCTAGGAAATCCCCTAACAGACGAAGAATTTGACAAAAACCACCGT
ATTCCATTTGCTCATGGAATGGCATTGATCTCTGATGAACTCTACGAGTCGCTGCAGAGA
AGTTGCAGAGGAAATTACTATGACAATAACACAGAGTGCTTGAAACATTTTGACGAATAT
CGAGAGAGTATTTCTGGATTAAACTATGGTAATGTTCTGATGGAATGGTGCGAAATCCGT
TAGTCCAAAGAGATCCCTTCTCCTTGGAGACGTT

QA 2 815 2 815
DS 



AS 1 3

CO CL1281Contig1 1351 3 22 U
AACATCAAAGATGATTTTATTATTGAAACAAAATACAAAAAGCTCAGAGTATAGACTGTC
TCGATCTTAAATAGAAATACACCATCACTATTTAAATAAACTCCGGCGACTTTAAAAACC
AACTGAATAATCACCGGGAAATGAGAGAAAACAAAACAGGGAAGCAAGGAAGATAGATAA
TAGGTTAAGCTAATAACCAAAACTGCAGTGGCGGCTGCTCAAGCTTTAGTGGCTGGGTTA
AGCTCATCCCAAGCTTCAATCCAAGTCACCATAGCATCAGCAAGCTTGTCAAAGTAAGGA
TCAATGGCGCTAAGCTTCTCCTTCACCATCTTGGACAGCTCAATGTAGCACTGTTGAACC
GTCACTGCTTCTTTCGAGAGCTTTGCACTCTGGAAGAAAGGAATGATATCCTCCTGCCAG
AAAATTCCCTTGTATTCCTTCTTCAGGTTCACAAAGGGGTTGCTTGCCTTGCTGTGGTAA
ATGTAGGGAAGACCAGTCTTCACTCCCAATCCCAAATGGTCACAGATCACCTTGACACAC
CATCCAGCCCACATATCGTCGTAGCGACCAATAGGCTGACCATCACCCATGAGACCAAAG
TACATAGCCGGACCAATGAGGTCACGGTCAAAGGCCAAGTTCATGCCACACATTGGGAAA
AGTGTTCCCTTTGGGATGGTCATGACAGCATCCACATACCTTGTGTTCCTTTCCTTGGGC
TTAACGAGTTGGGTAGGAGCATCGTAATCAGGGATGTTGAGCCGGAGACCATGAGAAACA
GCAGTGGAAAACACCCTCACGGAGACTGAAAGGGTATCCACGGACGAAGTCAGCACCTTC
ACGGTATGGGTCGTACAAGGTGTTGAAGAAAAGTGGAGAGGATGGGCATAGAAGGTTCTT
GATGTGTTGCTCAAGTGCGTTCACTGCTTTCCCAGATGGATCCTTAGCAACGAAGCAATC
GTCGTCAATGGTGAAGATATACTTCTTCTTAGACACCATGTAGCCGAAGCAGCGACAAGC
AGAGTCCTTGAAGGAGATGCATGAAGCTTTGGGACCGAGGATTCGGTTAATGTCGTTCCT
GTTGTAGAGCTCGTAATCGAACCCTTCAGGGACAGCAATGGTCTTGGAAGGATCTCCGTC
CTGGACGATGATCAGATGGTAAGGCTGGAGGAAAGGCCTCCACATCTCGAGGAAGTCGAG
GTTACGGATCGTCGGGATCACGATGTCGAGCTCATCTCTCAGCAGCGCGGCGTGGTTCAA
TGGGATTCCTACGGTATTGGCCGGTTCAACCATGATTGAGAGAGAGAGAGAGGTTTTGAG
ATCGGCTTTACGTTTGAAAACTGAGATATCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ93JQ U 2
AF RR2GX91JQ U 1
AF RR2GX91TF C 679
BS 1 151 RR2GX91JQ
BS 152 152 RR2EZ93JQ
BS 153 211 RR2GX91JQ
BS 212 212 RR2EZ93JQ
BS 213 296 RR2GX91JQ
BS 297 297 RR2EZ93JQ
BS 298 407 RR2GX91JQ
BS 408 408 RR2EZ93JQ
BS 409 471 RR2GX91JQ
BS 472 472 RR2EZ93JQ
BS 473 479 RR2GX91JQ
BS 480 480 RR2EZ93JQ
BS 481 488 RR2GX91JQ
BS 489 489 RR2EZ93JQ
BS 490 494 RR2GX91JQ
BS 495 495 RR2EZ93JQ
BS 496 497 RR2GX91JQ
BS 498 498 RR2EZ93JQ
BS 499 596 RR2GX91JQ
BS 597 597 RR2EZ93JQ
BS 598 761 RR2GX91JQ
BS 762 1351 RR2GX91TF

RD RR2EZ93JQ 637 0 0
ACATCAAAGATGATTTTATTATTGAAACAAAATACAAAAAGCTCAGAGTATAGACTGTCT
CGATCTTAAATAGAAATACACCATCACTATTTAAATAAACTCCGGCGACTTTAAAAACCA
ACTGAATAATCACCGGGAAATGAGAGAAAACAAAACAGGGAAGCAAGGAAGATAGATAAT
AGGTTAAGCTAATAACCAAAACTGCAGTGGCGGCTGCTCAAGCTTTAGTGGCTGGGTTAA
GCTCATCCCAAGCTTCAATCCAAGTCACCATAGCATCAGCAAGCTTGTCAAAGTAAGGAT
CAATGGCGCTAAGCTTCTCCTTCACCATCTTGGACAGCTCAATGTAGCACTGTTGAACCG
TCACTGCTTCTTTCGAGAGCTTTGCACTCTGGAAGAAAGGAATGATATCCTCCTGCCAGA
AGATTCCCTTGTATTCCTTCTTCAGGTTCACAAAGGGGTTGCTTGCCTTGCTGTGGTAAA
TGTAGGGAAGACCAGTCTTCACTCCCAATCCCAAATGGTCACAGATCACCTTGACACACC
ATCCAGCCCACATATCGTCGTAGCGACCAATAGGCTGACCATCACCCATGAGACCAAAGT
ACATAGCCGGACCAATGAGGTCACGGTCAAAGGCCAA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2GX91JQ 761 0 0
AACATCAAAGATGATTTTATTATTGAAACAAAATACAAAAAGCTCAGAGTATAGACTGTC
TCGATCTTAAATAGAAATACACCATCACTATTTAAATAAACTCCGGCGACTTTAAAAACC
AACTGAATAATCACCGGGAAATGAGAGAAAATAAAACAGGGAAGCAAGGAAGATAGATAA
TAGGTTAAGCTAATAACCAAAACTGCAGTGGTGGCTGCTCAAGCTTTAGTGGCTGGGTTA
AGCTCATCCCAAGCTTCAATCCAAGTCACCATAGCATCAGCAAGCTTGTCAAAGTACGGA
TCAATGGCGCTAAGCTTCTCCTTCACCATCTTGGACAGCTCAATGTAGCACTGTTGAACC
GTCACTGCTTCTTTCGAGAGCTTTGCACTCTGGAAGAAAGGAATGATGTCCTCCTGCCAG
AAAATTCCCTTGTATTCCTTCTTCAGGTTCACAAAGGGGTTGCTTGCCTTGTTGTGGTAG
ATGTAGGGCAGACCCGTTTTCACTCCCAATCCCAAATGGTCACAGATCACCTTGACACAC
CATCCAGCCCACATATCGTCGTAGCGACCAATAGGCTGACCATCACCCATGAGACCGAAG
TACATAGCCGGACCAATGAGGTCACGGTCAAAGGCCAAGTTCATGCCACACATTGGGAAA
AGTGTTCCCTTTGGGATGGTCATGACAGCATCCACATACCTTGTGTTCCTTTCCTTGGGC
TTAACGAGTTGGGTAGGAGCATCGTAATCAGGGATGTTGAG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2GX91TF 673 0 0
GTCATGACAGCATCCACATACCTTGTGTTCCTTTCCTTGGGCTTAACGAGTTGGGTAGGA
GCATCGTAATCAGGGATGTTGAGCCGGAGACCATGAGAAACAGCAGTGGAAAACACCCTC
ACGGAGACTGAAAGGGTATCCACGGACGAAGTCAGCACCTTCACGGTATGGGTCGTACAA
GGTGTTGAAGAAAAGTGGAGAGGATGGGCATAGAAGGTTCTTGATGTGTTGCTCAAGTGC
GTTCACTGCTTTCCCAGATGGATCCTTAGCAACGAAGCAATCGTCGTCAATGGTGAAGAT
ATACTTCTTCTTAGACACCATGTAGCCGAAGCAGCGACAAGCAGAGTCCTTGAAGGAGAT
GCATGAAGCTTTGGGACCGAGGATTCGGTTAATGTCGTTCCTGTTGTAGAGCTCGTAATC
GAACCCTTCAGGGACAGCAATGGTCTTGGAAGGATCTCCGTCCTGGACGATGATCAGATG
GTAAGGCTGGAGGAAAGGCCTCCACATCTCGAGGAAGTCGAGGTTACGGATCGTCGGGAT
CACGATGTCGAGCTCATCTCTCAGCAGCGCGGCGTGGTTCAATGGGATTCCTACGGTATT
GGCCGGTTCAACCATGATTGAGAGAGAGAGAGAGGTTTTGAGATCGGCTTTACGTTTGAA
AACTGAGATATCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 5

CO CL1282Contig1 846 5 27 U
GATGAGATAAGGATTGCAATGCAAACTTCAACTCTTCCATGTACAATATTCAACAAGATA
CAATCCAACAAGGATGATTGATCATATCGATACATCCAGATCAACAAGAAAA*GAGTAGG
AGAATCAAGAAGAAGAAGATACGGTCTTGAAGGAGTCCCGAAGGTGGGTTAATGTGTCTT
GGTCGCGGTTCCACTCGGGCGCAGGGGCGTTGACGAAATGGGCATATAGCTTGTTCTTAG
CGCAAGTGACGGTTATCAGACTGTGCTTCCCTACTCCATCGATCTCGTACAGATAGTACA
CCTGCCCTGTCTCTTCATCTTTCTTTTCCTCAGACACCACTTTATCAGCGCTTGCTATCA
GATCCTGGAGCTCCACGTCCGACAAGGCAAGGTTGTTGAGGATCACATCCCTCGGCGCCA
GCTGTCTGAACCCCGACAAGAACGTAAGGTACTCCTTCTCTGTCCTCTTCTTCGGGTTGT
AGAATTCGCTGTCTGTTCCGTTTGTGCCCTTCTCCACTTTCGACACCAGTCTCTCCTTCC
ACCCTTCCGGCACGTCGTAAACATACTCCGCCGATGTCTTCCTGTCAGAGTTCCCTCCGT
ATCCCCCGTAGTTCGCCGCGCTCGCTGCTGTCCCGTAGTATAATTTGTAAGCTTGGTTTC
CCTCACCCGCAGCAGGCAACGCCGGAACCATCGTCAGGACGGCAGTCGCGGCGACAACGG
CAGAAAGAGAGGTTCCTAGACATCGCGATACTATTGCCTTGGGGAGGACCGGCGTTTTGG
TGGTGGCTGAGGTGGCGGAGATGACAGGAGGAGTTGGAGAGAAGATTTTAGTGGCCATAT
TGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2EG25JQ U 48
AF RR2BX43JQ U 1
AF RR2CH49JQ U 15
AF RR2EG25TF C 115
AF RR2CH49TF C 40
BS 1 98 RR2BX43JQ
BS 99 99 RR2CH49JQ
BS 100 112 RR2BX43JQ
BS 113 113 RR2CH49JQ
BS 114 164 RR2BX43JQ
BS 165 165 RR2CH49JQ
BS 166 188 RR2BX43JQ
BS 189 189 RR2CH49JQ
BS 190 244 RR2BX43JQ
BS 245 245 RR2CH49JQ
BS 246 328 RR2BX43JQ
BS 329 329 RR2CH49JQ
BS 330 535 RR2BX43JQ
BS 536 536 RR2CH49JQ
BS 537 568 RR2BX43JQ
BS 569 569 RR2CH49JQ
BS 570 586 RR2BX43JQ
BS 587 587 RR2CH49JQ
BS 588 676 RR2BX43JQ
BS 677 677 RR2CH49JQ
BS 678 686 RR2BX43JQ
BS 687 687 RR2CH49JQ
BS 688 697 RR2BX43JQ
BS 698 698 RR2CH49JQ
BS 699 728 RR2BX43JQ
BS 729 791 RR2CH49JQ
BS 792 846 RR2CH49TF

RD RR2EG25JQ 665 0 0
ATTCAACAAGATACAATCCAACAAGGATGATTGATCATATCGATACATCCAAATCAACAA
GAAAA*GAGTAGGAGAATCAAGAAGAAGAAGATACGGTCTTGAAGGAGTCCCGAAGGTGG
GTTAATGTGTCTTGGTCGCGGTTCCACTCGGGCGCAGGGGCGTTGACGAAATGGGTATAT
AGCTTGTTCTTAGCGCAAGTGACGGTTATCAGACTGTGCTTCCCTACTCCATCGATCTCG
TACAGATAGTACACCTGCCCTGTCTCTTCATCTTTCTTTTCCTCAGACACCACTTTATCA
GCGCTTGCTATCAGATCCTGGAGCTCCACGTCCGACAAGGCAAGGTTGTTGAGGATCACA
TCCCTCGGCGCCAGCTGTCTGAACCCCGACAAGAACGTAAGGTACTCCTTCTCTGTCCTC
TTCTTCGGGTTGTAGAATTCGCTGTCTGTTCCGTTTGTGCCCTTCTCCACTTTCGACACC
AGTCTCTCCTTCCACCCTTCCGGCACGTCGTAAACATACTCCGCCGATGTCTTCCTGTCA
GAATTCCCTCCGTATCCCCCGTAGTTCGCCGCGCTCGCTGCTGTCCCGTAGTATAATTTG
TAAGCTTGGTTTCCCTCACCCGCAGCAGGCAACGCCGGAACCATCGTCAGGACGGCAGTC
GCGGC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2BX43JQ 728 0 0
GATGAGATAAGGATTGCAATGCAAACTTCAACTCTTCCATGTACAATATTCAACAAGATA
CAATCCAACAAGGATGATTGATCATATCGATACATCCAAATCAACAAGAAAACGAGTAGG
AGAATCAAGAAGAAGAAGATACGGTCTTGAAGGAGTCCCGAAGGCGGGTTAATGTGTCTT
GGTCGCGGCTCCACTCGGGCGCAGGGGCGTTGACGAAATGGGCATATAGCTTGTTCTTAG
CGCACGTGACGGTTATCAGACTGTGCTTCCCTACTCCATCGATCTCGTACAGATAGTACA
CCTGCCCTGTCTCTTCATCTTTCTTTTCATCAGACACCACTTTATCAGCGCTTGCTATCA
GATCCTGGAGCTCCACGTCCGACAAGGCAAGGTTGTTGAGGATCACATCCCTCGGCGCCA
GCTGTCTGAACCCCGACAAGAACGTAAGGTACTCCTTCTCTGTCCTCTTCTTCGGGTTGT
AGAATTCGCTGTCTGTTCCGTTTGTGCCCTTCTCCACTTTCGACACCAGTCTCTCTTTCC
ACCCTTCCGGCACGTCGTAAACATACTCGGCCGATGTCTTCCTGTCCGAGTTCCCTCCGT
ATCCCCCGTAGTTCGCCGCGCTCGCTGCTGTCCCGTAGTATAATTTGTAAGCTTGGTTTC
CCTCACCCGCAGCAGGAAACGCCGGAGCCATCGTCAGTACGGCAGTCGCGGCGACAACGG
CAGAAAGA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2CH49JQ 780 0 0
C
GCAATGCAAACTTCAACTCTTCCATGTACAATATTCAACAAGATACAATCCAACAAGGAT
GATTGATCATATCGATACATCCAGATCAACAAGAAAA*GAGTAGGAGAATCAAGAAGAAG
AAGATACGGTCTTGAAGGAGTCCCGAAGGTGGGTTAATGTGTCTTGGTCGCGGTTCCACT
CGGGCGCAGGGGCGTTGACGAAATGGGCATATAGCTTGTTCTTAGCGCAAGTGACGGTTA
TCAGACTGTGCTTCCCTACTCCATCGATCTCGTACAGATAGTACACCTGCCCTGTCTCTT
CATCTTTCTTTTCCTCAGACACCACTTTATCAGCGCTTGCTATCAGATCCTGGAGCTCCA
CGTCCGACAAGGCAAGGTTGTTGAGGATCACATCCCTCGGCGCCAGCTGTCTGAACCCCG
ACAAGAACGTAAGGTACTCCTTCTCTGTCCTCTTCTTCGGGTTGTAGAATTCGCTGTCTG
TTCCGTTTGTGCCCTTCTCCACTTTCGACACCAGTCTCTCCTTCCACCCTTCCGGCACGT
CGTAAACATACTCCGCCGATGTCTTCCTGTCAGAGTTCCCTCCGTATCCCCCGTAGTTCG
CCGCGCTCGCTGCTGTCCCGTAGTATAATTTGTAAGCTTGGTTTCCCTCACCCGCAGCAG
GCAACGCCGGAACCATCGTCAGGACGGCAGTCGCGGCGACAACGGCAGAAAGAGAGGTTC
CTAGACATCGCGATACTATTGCCTTGGGGAGGACCGGCGTTTTGGTGGTGGCTGAG
TGG

QA 2 777 2 777
DS 

RD RR2EG25TF 722 0 0
AGAGTAGAGAATC
AGAAGAAGAAGATACGGTCTTGAAGGAGTCCCGAAGGTGGGTTAATGTGTCTTGGTCGCG
GTTCCACTCGGGCGCAGGGGCGTTGACGAAATGGGTATATAGCTTGTTCTTAGCGCAAGT
GACGGTTATCAGACTGTGCTTCCCTACTCCATCGATCTCGTACAGATAGTACAC*TGCCC
TGTCTCTTCATCTTTCTTTTCCTCAGACACCACTTTATCAGCGCTTGCTATCAGATCCTG
GAGCTCCACGTCCGACAAGGCAAGGTTGTTGAGGATCACATCCCTCGGCGCCAGCTGTCT
GAACCCCGACAAGAACGTAAGGTACTCCTTCTCTGTCCTCTTCTTCGGGTTGTAGAATTC
GCTGTCTGTTCCGTTTGTGCCCTTCTCCACTTTCGACACCAGTCTCTCCTTCCACCCTTC
CGGCACGTCGTAAACATACTCCGCCGATGTCTTCCTGTCAGAGTTCCCTCCGTATCCCCC
GTAGTTCGCCGCGCTCGCTGCTGTCCCGTAGTATAATTTGTAAGCTTGGTTTCCCTCACC
CGCAGCAGGCAACGCCGGAACCATCGTCAGGACGGCAGTCGCGGCGACAACGGCAGAAAG
AGAGGTTCCTAGACATCGCGATACTATTGCCTTGGGGAGGACCGGCGTTTTGGTGGTGGC
TGAGGTGGCGGAGATGACGGGAGGAGTTGGAGAGAAGATTTTAGTGGCC

QA 14 722 14 722
DS 

RD RR2CH49TF 807 0 0
TGTACAATATTCAACAAGATACAATCCAACAAGGATGATTGATCATATCGATACATCCAG
ATCAACA*GAAAA*GAGTAGGAGAATCAAGAAGAAGAAGATACGGTCT*GAAGGAGTCCC
GAAGGTGGGTTAATGTGTCTTGGTCGCGGTTCCACTCGGGCGCAGGGGCGTTGACGAAAT
GGGCATATAGCTTGTTCTTAGCGCAAGTGACGGTTATCAGACTGTGCTTCCCTACTCCAT
CGATCTCGTACAGATAGTACACCTGCCCTGTCTCTTCATCTTTCTTTTCCTCAGACACCA
CTTTATCAGCGCTTGCTATCAGATCCTGGAGCTCCACGTCCGACAAGGCAAGGTTGTTGA
GGATCACATCCCTCGGCGCCAGCTGTCTGAACCCCGACAAGAACGTAAGGTACTCCTTCT
CTGTCCTCTTCTTCGGGTTGTAGAATTCGCTGTCTGTTCCGTTTGTGCCCTTCTCCACTT
TCGACACCAGTCTCTCCTTCCACCCTTCCGGCACGTCGTAAACATACTCCGCCGATGTCT
TCCTGTCAGAGTTCCCTCCGTATCCCCCGTAGTTCGCCGCGCTCGCTGCTGTCCCGTAGT
ATAATTTGTAAGCTTGGTTTCCCTCACCCGCAGCAGGCAACGCCGGAACCATCGTCAGGA
CGGCAGTCGCGGCGACAACGGCAGAAAGAGAGGTTCCTAGACATCGCGATACTATTGCCT
TGGGGAGGACCGGCGTTTTGGTGGTGGCTGAGGTGGCGGAGATGACAGGAGGAGTTGGAG
AGAAGATTTTAGTGGCCATATTGTTCC

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 5

CO CL1283Contig1 1074 5 4 U
GAAAAAAGAAAATCAAGCAACTGAGATAAAAAAGATGATTGATGGGTTCAGACTTGCCAG
AAATTATGATGCATGAATAAAAAGTAAATCGGCAAGCGACGACGACGACTTAGGAAACAT
ATAGACGAAAGAGAACAAAGTTTCAAACACCTAGAAGAAACTTAGCAGAGGTTGGACTCA
AAAGATTGTTACTGCCCTTCCTCTGTTGGTTTTGGAGCAGATGCTTCCTTGATCTCATCC
GCAGCATCATCCTGCATGTCGGATGTCCAGAGAGTGAGGTTGTCACGGAGAAGCTGCATG
ATCAAGGTACTGTCTTTGTATGACTCTTCTCCTAGAGTGTCCAACTCTGCTATCGCGTCA
TCAAAGGTCTGTTTGGCGAGGCTGCAGGCACGATCAGGAGAGTTAAGGATCTCGTAGTAG
AACACAGAGAAGTTCAATGCCAGACCTAGACGGATCGGGTGAGTTGGTGCGAGCTCTGCA
TTCGCAATATCCTGAGCAGATTTGTAGGCGGAGAGAGTGTTCTCGGCGGCGTCTTTCCTC
TCCTGACCAGTCTTGAACTCAGCCAAGTAGCGATGGTAATCACCCTTCATCTTCAGGTAA
AACACCTTGGAGTCGCCGGAAGCGGCGGCGGGGACGAGCCTGGAGTCGAGGAGCTTGAGG
ATCCCGTCGCAGATTCCCGAGAGCTCCGTCTCGATCTTGGATCTGCAGTCGCGGATCGCC
GCGACGTGGTCGTCGTTGCCGCGGCTCTCCTCCTTCTGCTCTATCGACGAGATGATCCGC
CACGAGGCGCGCCGAGCGCCGATCACGTTCTTGTAGGCGACGGAGAGGAGGTTTCGCTCC
TCGACGGTGAGCTCGTCGCCGTCGACGGCCGCGGAGACTTTCTCCATGAACTCCACCATC
TCCTCGTACCTCTCCGCTTGCTCGGCGAGCTTGGCCATGTACACGAACTCCTCGCGCGCA
GAAACCGCCATCTTCTTCTTCAGAGATCTGATGTGATTGGATTGTTTGATTAGAGAATCG
CTGTGTAGGTCAGGTCAAGCGAGAGGGAACGCGATTAATGCGTTTTTTAATCAC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA30JQ U 109
AF RR2BA30TF C 2
AF RR2A253JQ U 50
AF RR2BL32JQ U 1
AF RR2BL32TF C 373
BS 1 367 RR2BL32JQ
BS 368 368 RR2BA30JQ
BS 369 786 RR2BL32JQ
BS 787 1074 RR2BL32TF

RD RR2BA30JQ 499 0 0
CTTAGGAAACATATAGACGAAAGAGAACAAAGTTTCAAACACCTAGAAAAAACTTAGCAG
AGGTTGGACTCAAAAGATTGTTACTGCCCTTCCTCTGTTGGTTTTGGAGCAGATGCTTCC
TTGATCTCATCCGCAGCATCATCCTGCATGTCGGATGTCCAGAGAGTGAGGTTGTCACGG
AAAAGCTGCATGATCAAGGTACTGTCTTTGTATGACTCTTCTCCTAAAGTGTCCAACTCT
GCTATCGCGTCATCAAAGGTCTGTTTGGCGAGGCTGCAGGCACGATCAGGAGAGTTAAGG
ATCTCGTAGTAAAACACAGAGAAGTTCAATGCCAGACCTAAACGGATCGGGTGAGTTGGT
GCGAGCTCTGCATTCGCAATATCCTGAGCAGATTTGTAGGCGGAGAGAGTGTTCTCGGCG
GCGTCTTTCCTCTCCTGACCAGTCTTGAACTCAGCCAAGTAGCGATGGTAATCACCCTTC
ATCTTCAGGTAAAACACC
C

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2BA30TF 606 0 0
AAAAAAGAAAATCAAGCAACTGAGATAAAAAAGATGATTGATGGGTTCAGACTTGCCAGA
AATTATGATGCATGAATAAAAAGTAAATCGGCAAGCGACGACGACGACTTAGGAAACATA
TAGACGAAAGAGAACAAAGTTTCAAACACCTAGAAGAAACTTAGCAGAGGTTGGACTCAA
AAGATTGTTACTGCCCTTCCTCTGTTGGTTTTGGAGCAGATGCTTCCTTGATCTCATCCG
CAGCATCATCCTGCATGTCGGATGTCCAGAGAGTGAGGTTGTCACGGAGAAGCTGCATGA
TCAAGGTACTGTCTTTGTATGACTCTTCTCCTAGAGTGTCCAACTCTGCTATCGCGTCAT
CAAAGGTCTGTTTGGCGAGGCTGCAGGCACGATCAGGAGAGTTAAGGATCTCGTAGTAGA
ACACAGAGAAGTTCAATGCCAGACCTAGACGGATCGGGTGAGTTGGTGCGAGCTCTGCAT
TCGCAATATCCTGAGCAGATTTGTAGGCGGAGAGAGTGTTCTCGGCGGCGTCTTTCCTCT
CCTGACCAGTCTTGAACTCAGCCAAGTAGCGATGGTAATCACCCTTCATCTTCAGGTAAA
ACACC
C

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2A253JQ 654 0 0
AGACTTGCCAGAAATTATGATGCATGAATAAAAAGTAAATCGGCAAGCGACGACGACGAC
TTAGGAAACATATAGACGAAAGAGAACAAAGTTTCAAACACCTAGAAGAAACTTAGCAGA
GGTTGGACTCAAAAGATTGTTACTGCCCTTCCTCTGTTGGTTTTGGAGCAGATGCTTCCT
TGATCTCATCCGCAGCATCATCCTGCATGTCGGATGTCCAGAGAGTGAGGTTGTCACGGA
GAAGCTGCATGATCAAGGTACTGTCTTTGTATGACTCTTCTCCTAGAGTGTCCAACTCTG
CTATCGCGTCATCAAAGGCCTGTTTGGCGAGGCTGCAGGCACGATCAGGAGAGTTAAGGA
TCTCGTAGTAGAACACAGAGAAGTTCAATGCCAGACCTAGACGGATCGGGTGAGTTGGTG
CCAGCTCTGCATTCGCAATATCCTGAGCAGATTTGTAGGCGGAAAGAGTGTTCTCGGCGG
CGTCTTTCCTCTCCTGACCAGTCTTGAACTCAGCCAAGTAGCGATGGTAATCACCCTTCA
TCTTCAGGTAAAACACCTTGGAGTCGCCTGAAGCGGCGGCGGGGACGAGCCTGGAGTCGA
GGAGCTTAAGGATCCCGTCGCAGATCCCCGAGAGCTCCGTCTCGATCTCGGATC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2BL32JQ 798 0 0
GAAAAAAGAAAATCAAGCAACTGAGATAAAAAAGATGATTGATGGGTTCAGACTTGCCAG
AAATTATGATGCATGAATAAAAAGTAAATCGGCAAGCGACGACGACGACTTAGGAAACAT
ATAGACGAAAGAGAACAAAGTTTCAAACACCTAGAAGAAACTTAGCAGAGGTTGGACTCA
AAAGATTGTTACTGCCCTTCCTCTGTTGGTTTTGGAGCAGATGCTTCCTTGATCTCATCC
GCAGCATCATCCTGCATGTCGGATGTCCAGAGAGTGAGGTTGTCACGGAGAAGCTGCATG
ATCAAGGTACTGTCTTTGTATGACTCTTCTCCTAGAGTGTCCAACTCTGCTATCGCGTCA
TCAAAGGCCTGTTTGGCGAGGCTGCAGGCACGATCAGGAGAGTTAAGGATCTCGTAGTAG
AACACAGAGAAGTTCAATGCCAGACCTAGACGGATCGGGTGAGTTGGTGCGAGCTCTGCA
TTCGCAATATCCTGAGCAGATTTGTAGGCGGAGAGAGTGTTCTCGGCGGCGTCTTTCCTC
TCCTGACCAGTCTTGAACTCAGCCAAGTAGCGATGGTAATCACCCTTCATCTTCAGGTAA
AACACCTTGGAGTCGCCGGAAGCGGCGGCGGGGACGAGCCTGGAGTCGAGGAGCTTGAGG
ATCCCGTCGCAGATTCCCGAGAGCTCCGTCTCGATCTTGGATCTGCAGTCGCGGATCGCC
GCGACGTGGTCGTCGTTGCCGCGGCTCTCCTCCTTCTGCTCTATCGACGAGATGATCCGC
CACGAG
CGCGCGAGCGCC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2BL32TF 702 0 0
TTGGCGAGGCTGCAGGCACGATCAGGAGAGTTAAGGATCTCGTAGTAGAACACAGAGAAG
TTCAATGCCAGACCTAGACGGATCGGGTGAGTTGGTGCGAGCTCTGCATTCGCAATATCC
TGAGCAGATTTGTAGGCGGAGAGAGTGTTCTCGGCGGCGTCTTTCCTCTCCTGACCAGTC
TTGAACTCAGCCAAGTAGCGATGGTAATCACCCTTCATCTTCAGGTAAAACACCTTGGAG
TCGCCGGAAGCGGCGGCGGGGACGAGCCTGGAGTCGAGGAGCTTGAGGATCCCGTCGCAG
ATTCCCGAGAGCTCCGTCTCGATCTTGGATCTGCAGTCGCGGATCGCCGCGACGTGGTCG
TCGTTGCCGCGGCTCTCCTCCTTCTGCTCTATCGACGAGATGATCCGCCACGAGGCGCGC
CGAGCGCCGATCACGTTCTTGTAGGCGACGGAGAGGAGGTTTCGCTCCTCGACGGTGAGC
TCGTCGCCGTCGACGGCCGCGGAGACTTTCTCCATGAACTCCACCATCTCCTCGTACCTC
TCCGCTTGCTCGGCGAGCTTGGCCATGTACACGAACTCCTCGCGCGCAGAAACCGCCATC
TTCTTCTTCAGAGATCTGATGTGATTGGATTGTTTGATTAGAGAATCGCTGTGTAGGTCA
GGTCAAGCGAGAGGGAACGCGATTAATGCGTTTTTTAATCAC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 6

CO CL1284Contig1 1028 6 25 U
AAAAAAAAAAGCACTCAAAAGGGTTTTTGAGAAAGAGACAAAAGAAGACACACAACAAGT
AGCCACTCTCTCATCTCTCACCCATCTCTTGACACACATACAAGTAGCCAGCCACTACTC
TCTCTCCTTCTTCTTGCTCTTGGAGATCTCTTTCTCTA*TCTTCTCTACTTTTCTTTCTA
GAGGACAACTGTGACATTTT*TTTGTCTGAACGCATCTATGGCTGCTCTGGTTCTTTCAC
TTCTCCTTCTAGCCATGGCTGGCCATTCTAGTGCATCATGGTGTGTGTGCAAAACAGGGC
TGAGTGATACAGTGCTACAGAACACCCTAGACTATGCCTGTGGCAACGGAGCAGACTGTA
ATCCCACTCACCCAAAAGCACCTTGCTTCGACCCTGACAATGTTAGGTCTCATTGCAGCT
ATGCAGTCAATAGCTTCTTCCAAAAGAAGCATCAAGCTCCAGGCACTTGTGATTTCAGTG
GCACTGCCACTCCAACTAACTCTGATCCAAGTTACTCAGGATGCACCTTCCCTACTAGTG
CCAGTGGCTCCGGTGGTAGCACCACTGTGACACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCACCT
CAACCAGCACCACACTTCCTGGTGGCAATGGCAACAGTCCTCCTTATTCAGGAACCTCGA
CCAATGGAGTTTTTGGAAACAATAGCACAGGGATTAACCCGGACTACTCCACGACAGACA
GCAGCGCGTTTGCTCTCAAGAACTCAAGCAAATTTCTCACCTGCCTTCTCCTGATCGCTT
TGAGTGGATTCTCTTCTTTCTTGATGCTCTAAGAATGTTTAATGTTTCTCTGGTTTTGTT
TGGTGCACTTATTGTCTCAACGACATTTGAGTCTAGCTTAGTGGTAATACCTCTGCCTGT
CTGTTTTGAGTCTCTTTCTCTATGGTATGTTCTTGTTGTAAGAAGATTTCGTCTCATGCA
TTCAACTCATATCTCTTTTAGACTGTTTCTGGTAGATTTGATCGATCGTAGTGAAGAAAG
TTATATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 5 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV88TF U 114
AF RR2A427TF U 1
AF RR2D443TF U 89
AF RR2BP64TF U 140
AF RR2DV88JQ C 398
AF RR2A427JQ C 271
BS 1 217 RR2A427TF
BS 218 218 RR2DV88TF
BS 219 529 RR2A427TF
BS 530 530 RR2DV88TF
BS 531 688 RR2A427TF
BS 689 689 RR2D443TF
BS 690 700 RR2A427TF
BS 701 701 RR2D443TF
BS 702 715 RR2A427TF
BS 716 716 RR2D443TF
BS 717 760 RR2A427TF
BS 761 761 RR2D443TF
BS 762 808 RR2A427TF
BS 809 812 RR2D443TF
BS 813 813 RR2BP64TF
BS 814 819 RR2D443TF
BS 820 820 RR2BP64TF
BS 821 855 RR2D443TF
BS 856 859 RR2BP64TF
BS 860 860 RR2A427JQ
BS 861 861 RR2DV88JQ
BS 862 876 RR2BP64TF
BS 877 959 RR2A427JQ
BS 960 960 RR2DV88JQ
BS 961 1028 RR2A427JQ

RD RR2DV88TF 535 0 0
GGACTA
CTCTCTCCTTCTTCTTGCTCTTGGAGATCTCTTTCTCTA*TCTTCTCTACTTTTCTTTCT
AGAGGACAACTGTGACATTTT*TTTGTCTGAACGCATCTATGGCTGCTCTGGTTCTTTCA
CTTCTCCTTCTAGCCATGGCTGGCCATTCTATTGCATCATGGTGTGTGTGCAAAACAGGG
CTGAGTGATACAGTGCTACAGAACACCCTAGACTATGCCTGTGGCAATGGAGCAGACTGT
AATCCCACTCACCCAAAAGCACCTTGCTTTGACCCTGACAATGTTAGGTCTCATTGCAGC
TATGCAGTCAATAGCTTCTTCCAAAAGAGGCATCAAGCTCCAGGCACTTGTGATTTCAGT
GGCACTGCCACTCCAACTAACTCTGATCCAAGTTACTCAGGATGCACCTTCCCTACTAGT
GCCAGTGGCTCCGGTGGTAGCACCACTGTGACACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCACC
TCAACCAGCACCACACTTCCTGGTGGCAATGGCAACAGTCCTCCTTATT

QA 7 535 7 535
DS 

RD RR2A427TF 808 0 0
AAAAAAAAAAGCACTCAAAAGGGTTTTTGAGAAAGAGACAAAAGAAGACACACAACAAGT
AGCCACTCTCTCATCTCTCACCCATCTCTTGACACACATACAAGTAGCCAGCCACTACTC
TCTCTCCTTCTTCTTGCTCTTGGAGATCTCTTTCTCTA*TCTTCTCTACTTTTCTTTCTA
GAGGACAACTGTGACATTTT*TTTGTCTGAACGCATCGATGGCTGCTCTGGTTCTTTCAC
TTCTCCTTCTAGCCATGGCTGGCCATTCTAGTGCATCATGGTGTGTGTGCAAAACAGGGC
TGAGTGATACAGTGCTACAGAACACCCTAGACTATGCCTGTGGCAACGGAGCAGACTGTA
ATCCCACTCACCCAAAAGCACCTTGCTTCGACCCTGACAATGTTAGGTCTCATTGCAGCT
ATGCAGTCAATAGCTTCTTCCAAAAGAAGCATCAAGCTCCAGGCACTTGTGATTTCAGTG
GCACTGCCACTCCAACTAACTCTGATCCAAGTTACTCAGGATGCACCTTTCCTACTAGTG
CCAGTGGCTCCGGTGGTAGCACCACTGTGACACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCACCT
CAACCAGCACCACACTTCCTGGTGGCAATGGCAACAGTCCTCCTTATTCAGGAACCTCGA
CCAATGGAGTTTTTGGAAACAATAGCACTGGGATTAACCCAGACTACTCCACGACGGACA
GCAGCGCGTTTGCTCTCAAGAACTCAAGCAAATTTCTCACATGCCTTCTCCTGATCGCTT
TGAGTGGATTCTCTTCTTTCTTGATGCT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2D443TF 783 0 0
GG
GACACACATACAAGTAGCCAGCCACTACTCTCTCTCCTTCTTCTTGCTCTTGGAGATCTC
TTTCTCTA*TCTTCTCTACTTTTCTTTCTAGAGGACAACTGTGACATTTTCTTTGTCTGA
ACGCATCTATGGCTGCTCTGGTTCTTTCACTTCTCCTTCTAGCCATGGCTGGCCATTCTA
GTGCATCACGGTGTGTGTGCAAAACAGGGCTGAGTGATACAGTGCTACAGAACACCCTAG
ACTATGCCTGTGGCAATGGAGCAGACTGTAATCCCACTCACCCAAAAGCACCTTGCTTTG
ACCCTGACAATGTTAGGTCTCATTGCGGCTATGCAGTCAATAGCTTCTTCCAAAAGAAGC
ATCAAGCTCCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGCCACTCCAACTAACTCTGATCCAA
GTTACTCAGGATGCACCTTCCCTACTAGTGCCAGTGGCTCCGGTGGTAGCACCACTGTGA
CACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCACCTCAACCAGCACCACACTTCCTGGTGGCAATG
GCAACAGTCCTCCTTATTCAGGAACCTCGACCAATGGAGTTTTTGGAAACAATAGCACAG
GGATTAACCCGGACTACTCCACGACAGACAGCAGCGCGTTTGCTCTCAAGAACTCAAGCA
CATTTCTCACCTGCCTTCTCCTGATCGCTTTGAGTGGATTCTCTTCTTTCTTGATGCTCT
AATAATGTT*AATGTTTCTCTGGTTTTGTTTGGTGCACTTATTGT
GTCACGACATTTGAGT

QA 3 767 3 767
DS 

RD RR2BP64TF 737 0 0
GG
GGAGATCTCTTTCTCTAATCTTCTCTACTTTTCTTTCTAGAGGACAACTGTGACATTTC*
TTTGTCTGAACGCATCTATGGCTGCTCTGGTTCTTTCACTTCTCCTTCTAGCCATGGCTG
GCCATTCTAGTGCATCATGGTGTGTGTGCAAAACAGGGCTGAGTGATACAGTGCTACAGA
ACACCCTAGACTATGCCTGTGGCAATGGAGCAGACTGTAATCCCACTCGCCCAAAAGCAC
CTTGCTTTGACCCTGACAATGTTAGGTCTCATTGCAGCTATGCAGTCAATAGCTTCTTCC
AAAAGAAGCATCAAGCTCCGGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGCCACTCCAACTAACT
CTGATCCAAGTTACTCAGGATGCACCTTCCCTACTAGTGCCAGTGGCTCCGGTGGTAGCA
CCACTGTGACACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCACCTCAACCAGCACCACACTTCCTG
GTGGCAATGGCAACAGTCCTCCTTATTCAGGAACCTCGACCAATGGAGTTTTTGGAAACA
ATAGCACAGGGATTAACCCGGACTACTCCACGACAGACAGCAGCGCGTTTGCTCTCAACA
ACTCAAGCAAATTTCTCACCTGCCTTCTCTTGATCGCTTTGAGTGGATTCTCTTCTTTCT
TGATGCTCTGAGAATGTTTAATGTTTCTCTGGTTTTGTTTGGTGCACTTATTGTCTCAGT
GACATTTGAGTCTAG

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR2DV88JQ 603 0 0
CAATGTTAGGTCTCATTGCAGCTATGCAGTCAATAGCTTCTTCCAAAAGAGGCATCAAGC
TCCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGCCACTCCAACTAACTCTGATCCAAGTTACTC
AGGATGCACCTTCCCTACTAGTGCCAGTGGCTCCGGTGGTAGCACCACTGTGACACCAGG
CACAACCAATCCAAAAGGCACCTCAACCAGCACCACACTTCCTGGTGGCAATGGCAACAG
TCCTCCTTATTCAGGAACCTCGACCAATGGAGTTTTTGGAAACAATAGCACAGGGATTAA
CCCGGACTACTCCACGACAGACAGCAGCGCGTTTGCTCTCAAGAACTCAAGCACATTTCT
CCCCTGCCTTCTCCTGATCGCTTTGAGTGGATTCTCTTCTTTCTTGATGCTCTAATAATG
TTTAATGTTTCTCTGGTTTTGTTTGGTGCACTTATTGTGTCAACGACATTTGAGTCTAGC
TTAGTGGTAATATCTCTGCCTGTCTGTTTTGAGTCT**TTCTCTATGGTATGTTCTTGTT
GTAAGAAGATTTCGTCTCATGCATTCAACTCTTATCTCTTT*AGACTGTTTCTGGTAGAT
TTG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2A427JQ 758 0 0
GTGCATCATGGTGTGTGTGCAAAACAGGGCTGAGTGATACAGTGCTACAGAACACCCTAG
ACTATGCCTGTGGCAACGGAGCAGACTGTAATCCCACTCACCCAAAAGCACCTTGCTTCG
ACCCTGACAATGTTAGGTCTCATTGCAGCTATGCAGTCAATAGCTTCTTCCAAAAGAAGC
ATCAAGCTCCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGCCACTCCAACTAACTCTGATCCAA
GTTACTCAGGATGCACCTTTCCTACTAGTGCCAGTGGCTCCGGTGGTAGCACCACTGTGA
CACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCACCTCAACCAGCACCACACTTCCTGGTGGCAATG
GCAACAGTCCTCCTTATTCAGGAACCTCGACCAATGGAGTTTTTGGAAACAATAGCACTG
GGATTAACCCAGACTACTCCACGACGGACAGCAGCGCGTTTGCTCTCAAGAACTCAAGCA
AATTTCTCACATGCCTTCTCCTGATCGCTTTGAGTGGATTCTCTTCTTTCTTGATGCTCT
AAGAATGTTTAATGTTTCTCTGGTTTTGTTTGGTGCACTTATTGTCTCAAGGACATTTGA
GTCTAGCTTAGTGGTAATACCTCTGCCTGTCTGTTTTGAGTCTCTTTCTCTATGGTATGT
TCTTGTTGTAAGAAGATTTCGTCTCATGCCTTCAACTCATATCTCTTTTAGACTGTTTCT
GGTAGATTTGATCGATCGTAGTGAAGAAAGTTATATAC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 4

CO CL1285Contig1 966 4 11 U
GGGCGCTCACACTCCCTCTCTCAGATAATACCTTCCGCTCAAAGGAAGAAAATGGCAGAA
TCTAAAGTGGTGGTTCCAGAGTCTGTCTTGAAAAAGATCAAGAGAGAAGAGGAATGGGCA
TTGGCCAAGAAGCAAGAAGCTGAAGCTGCTAAGAAGAAGAGCGTTGAGACCCGCAAGCTT
ATCTTCAAGAGAGCTGAGCAATATGCCAAAGAATACGCTGAGAAGGACAATGAGTTGATC
AGATTGAAGCGTGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTACGTTGATCCAGAAGCTAAACTG
CTATTTATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGATCCAAAAACCAAGAAGATTCTG
CAGCTCCTGCGTTTGAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACA
ATCAACATGCTGCGTCGCGTTGAACCTTACGTGACCTACGGGTACCCAAACTTGAAGAGC
GTTAAGGAGCTGATCTACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATTGCGCTC
ACAGACAACTCTATAGTGAGCCAATGTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTGGAGGAT
CTGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAAGCCAACAACTTCCTTTGG
CCGTTCCAGCTGAAGGCGCCGCTCGGTGGACTTAAGAAGAAGAGGAACCACTACGTTGAA
GGTGGTGATGCTGGGAACAGGGAGAACTTCATCAACGAGCTTGTCAGGAGAATGAACTGA
TGATCAAAAGCTTTCCTTATTTTGTCTTTGTTCTTATATCAGTGACTGTGTTATGATATG
ATTATGTTACTTGTTTACGATAATCTTATTTAACTTTTGCTTACTTTGTAAGTCGAAAAA
GCGGCCCCACCCATCAACGAAGTCTCCTGTTTAGACTGGTTTATTTTATAATTCTAATCA
TATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD59TF U 1
AF RR2EK48TF U 141
AF RR2EK48JQ C 372
AF RR2CD59JQ C 592
BS 1 161 RR2CD59TF
BS 162 162 RR2EK48TF
BS 163 556 RR2CD59TF
BS 557 557 RR2EK48TF
BS 558 564 RR2CD59TF
BS 565 565 RR2EK48TF
BS 566 675 RR2CD59TF
BS 676 676 RR2EK48TF
BS 677 700 RR2CD59TF
BS 701 888 RR2EK48TF
BS 889 966 RR2CD59JQ

RD RR2CD59TF 713 0 0
GGGCGCTCACACTCCCTCTCTCAGATAATACCTTCCGCTCAAAGGAAGAAAATGGCAGAA
TCTAAAGTGGTGGTTCCAGAGTCTGTCTTGAAAAAGATCAAGAGAGAAGAGGAATGGGCA
TTGGCCAAGAAGCAAGAAGCTGAAGCTGCTAAGAAGAAGAGTGTTGAGACCCGCAAGCTT
ATCTTCAAGAGAGCTGAGCAATATGCCAAAGAATACGCTGAGAAGGACAATGAGTTGATC
AGATTGAAGCGTGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTACGTTGATCCAGAAGCTAAACTG
CTATTTATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGATCCAAAAACCAAGAAGATTCTG
CAGCTCCTGCGTTTGAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACA
ATCAACATGCTGCGTCGCGTTGAACCTTACGTGACCTACGGGTACCCAAACTTGAAGAGC
GTTAAGGAGCTGATCTACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATTGCGCTC
ACAGACAACTCTATAG*GAGCCAAGGTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTGGAGGAT
CTGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAAGCCAACAACTTCCTTTGG
CCGTTCCAGCTGAAG*CGCCGCTCGGTGGACTTAAGAAGA
GAGAACCACTACG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2EK48TF 748 0 0
G
GAAGCTGCTGAGAAGAAGAGCGTTGAGACCCGCAAGCTTATCTTCAAGAGAGCTGAGCAA
TATGCCAAAGAATACGCTGAGAAGGACAATGAGTTGATCAGATTGAAGCGTGAGGCTAAG
TTGAAAGGAGGGTTCTACGTTGATCCAGAAGCTAAACTGCTATTTATCATTCGTATCCGT
GGAATCAACGCTATTGATCCAAAAACCAAGAAGATTCTGCAGCTCCTGCGTTTGAGACAA
ATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACAATCAACATGCTGCGTCGCGTT
GAACCTTACGTGACCTACGGGTACCCAAACTTGAAGAGCGTTAAGGAGCTGATCTACAAG
AGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATTGCGCTCACAGACAACTCTATAGTGAGC
CAATGTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTGGAGGATCTGATCCACGAGATCATGACC
GTTGTACCTCACTTCAAAGAAGCCAACAACTTCCTTTGGCCGTTCCAGCTGAAGGCGCCG
CTCGGTGGACTTAAGAAGAAGAGGAACCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGGAACAGG
GAGAACTTCATCAACGAGCTTGTCAGGAGAATGAACTGATGATCAAAAGCTTTCCTTATT
TTGTCTTTGTTCTTATATCAGTGACTGTGTTATGATATGATTATGTTACTTGTTTACGAT
AATCTTATTTAACTTTTGCTTACTTTG

QA 2 748 2 748
DS 

RD RR2EK48JQ 518 0 0
TTTGAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACAATCAACATGCT
GCGTCGCGTTGAACCTTACGTGACCTACGGGTACCCAAACTTGAAGAGCGTTAAGGAGCT
GATCTACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATTGCGCTCACAGACAACTC
TATAGTGAGCCAATGTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTGGAGGATCTGATCCACGA
GATCATGACCGTTGTACCTCACTTCAAAGAAGCCAACAACTTCCTTTGGCCGTTCCAGCT
GAAGGCGCCGCTCGGTGGACTTAAGAAGAAGAGGAACCACTACGTTGAAGGTGGTGATGC
TGGGAACAGGGAGAACTTCATCAACGAGCTTGTCAGGAGAATGAACTGATGATCAAAAGC
TTTCCTTATTTTGTCTTTGTTCTTATATCAGTGACTGTGTTATGATATGATTATGTTACT
TGTTTACGATAATCTTATTTAACTTTTGCTTACTTTG
C

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2CD59JQ 375 0 0
GTGGAGGATCTGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAAGCCAACAAC
TTCCTTTGGCCGTTCCAGCTGAAGGCGCCGCTCGGTGGACTTAAGAAGAAGAGGAACCAC
TACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGGAACAGGGAGAACTTCATCAACGAGCTTGTCAGGAGA
ATGAACTGATGATCAAAAGCTTTCCTTATTTTGTCTTTGTTCTTATATCAGTGACCGTGT
TATGATATGATTATGTTACTTGTTTACGATAATCTTATTTAACTTTTGCTTACTTTGTAA
GTCGAAAAAGCGGCCCCACCCATCAACGAAGTCTCCTGTTTAGACTGGTTTATTTTATAA
TTCTAATCATATACC

QA 1 375 1 375
DS 



AS 1 6

CO CL1286Contig1 744 6 9 U
GGGATTCACATAGTTCTCTCTGTGTCTTCGCCGTTAGCTAGCTGGAGAAGTTTGAGTGTC
TGCTACTTCGATTTCGAGTGTTTTGAGCTTTTGAAGAATGGTGAGAATCAGTGTGCTTAA
CGATGCTCTTAAGAGTATGTACAACGCGGAGAAGAGAGGGAAGAGGCAAGTTATGATCAG
GCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTTTCTCATCGTCATGCAGAAACACGGTTACATTGG
TGAATTCGAGTACGTTGATGACCACAGGTCTGGTAAGATCGTGGTGGAGCTTAATGGAAG
ACTGAACAAATGTGGTGTCATCAGTCCTCGTTTCGACGTTGGTGTTAAGGAGATTGAGAG
CTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCGACAGTTTGGTTACATTGTTCTTACAACCTCCGC
TGGTATCATGGACCACGAAGAAGCAAGGAGGAAGAATGTTGGTGGCAAGGTTCTTGGATT
CTTTT*ACTGAAAAGCCAATATCTTTGTCCTCGTTATGCTTTGCTGCTTCTCCTTTTGGT
GAGATGAGGAGTTCGATTGAGCCCAGAGTCAAGAGAGGGTAGTAAGAGTTTTTGACGTGT
TCGTTTTCTTAGTTAACATTTTGTTTGTTTTGCGCAAATGTAGACAGTAATGTGCTTATT
TTGAGTTATTTTCTCTTCCCTTTGCTAGACACTTGTACCCTCTTGTTTTGATTGTTAAAG
CATCATAATCAATTTTCTAAATCG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2F635TF U 1
AF RR2GL02JQ C 83
AF RR2H329TF U 1
AF RR2GL02TF U 1
AF RR2H329JQ C 1
AF RR2F635JQ C 92
BS 1 49 RR2F635TF
BS 50 50 RR2GL02TF
BS 51 480 RR2F635TF
BS 481 481 RR2GL02TF
BS 482 485 RR2F635TF
BS 486 486 RR2GL02TF
BS 487 550 RR2F635TF
BS 551 743 RR2GL02TF
BS 744 744 RR2F635JQ

RD RR2F635TF 550 0 0
GGGATTCACATAGTTCTCTCTGTGTCTTCGCCGTTAGCTAGCTGGAGAATTTTGAGTGTC
TGCTACTTCGATTTCGAGTGTTTTGAGCTTTTGAAGAATGGTGAGAATCAGTGTGCTTAA
CGATGCTCTTAAGAGTATGTACAACGCGGAGAAGAGAGGGAAGAGGCAAGTTATGATCAG
GCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTTTCTCATCGTCATGCAGAAACACGGTTACATTGG
TGAATTCGAGTACGTTGATGACCACAGGTCTGGTAAGATCGTGGTGGAGCTTAATGGAAG
ACTGAACAAATGTGGTGTCATCAGTCCTCGTTTCGACGTTGGTGTTAAGGAGATTGAGAG
CTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCGACAGTTTGGTTACATTGTTCTTACAACCTCCGC
TGGTATCATGGACCACGAAGAAGCAAGGAGGAAGAATGTTGGTGGCAAGGTTCTTGGATT
TTTTTTACTGAAAAGCCAATATCTTTGTCCTCGTTATGCTTTGCTGCTTCTCCTTTTGGT
GAGATGAGGA

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2GL02JQ 619 0 0
TTGAGCTTTTGAAGAATGGTGAGAATCAGTGTGCTTAACGATGCTCTTAAGAGTATGTAC
AACGCGGAGAAGAGAGGGAAGAGGCAAGTTATGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATCATC
AAGTTTCTCATCGTCATGCAGAAACACGGTTACATTGGTGAATTCGAGTACGTTGATGAC
CACAGGTCTGGTAAGATCGTGGTGGAGCTTAATGGAAGACTGAACAAATGTGGTGTCATC
AGTCCTCGTTTCGACGTTGGTGTTAAGGAGATTGAGAGCTGGACCGCTCGTCTTCTTCCT
TCCCGACAGTTTGGTTACATTGTTCTTACAACCTCCGCTGGTATCATGGACCACGAAGAA
GCAAGGAGGAAGAATGTTGGTGGCAAGGTTCTTGGATTCTTTT*ACTGAAAAGCCAATAT
CTTTGTCCTCGTTATGCTTTGCTGCTTCTCCTTTTGGTGAGATGAGGAGTTCGATTGAGC
CCAGAGTCAAGAGAGGGTAGTAAGAGTTTTTGACGTGTTCGTTTTCTTAGTTAACATTTT
GTTTGTTTTGCGCAAATGTAGACAGTAATGTGCTTATTTTGAGTTATTTTCTCTTCCCTT
TGCTAGACACTTGTACCCT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2H329TF 705 0 0
GGGATTCACATAGTTCTCTCTGTGTCTTCGCCGTTAGCTAGCTGGAGAAGTTTGAGTGTC
TGCTACTTCGATTTCGAGTGTTTTGAGCTTTTGAAGAATGGTGAGAATCAGTGTGCTTAA
CGATGCTCTTAAGAGTATGTACAACGCGGAGAAGAGAGGGAAGAGGCAAGTTATGATCAG
GCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTTTCTCATCGTCATGCAGAAACACGGTTACATTGG
TGAATTCGAGTACGTTGATGACCACAGGTCTGGTAAGATCGTGGTGGAGCTTAATGGAAG
ACTGAACAAATGTGGTGTCATCAGTCCTCGTTTCGACGTTGGTGTTAAGGAGATTGAGAG
CTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCGACAGTTTGGTTACATTGTTCTTACAACCTCCGC
TGGTATCATGGACCACGAAGAAGCAAGGAGGAAGAATGTTGGTGGCAAGGTTCTTGGATT
CTTTT*ACTGAAAAGCCAATATCTTTGTCCTCGTTATGCTTTGCTGCTTCTCCTTTTGGT
GAGATGAGGAGTTCGATTGAGCCCAGAGTCAAGAGAGGGTAGTAAGAGTTTTTGACGTGT
TCGTTTTCTTAGTTAACATTTTGTTTGTTTTGCGCAAATGTAGACAGTAATGTGCTTATT
TTGAGTTATTTTCTCTTCCCTTTGCTAGACACTTGTACC
TCTTGT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2GL02TF 743 0 0
GGGATTCACATAGTTCTCTCTGTGTCTTCGCCGTTAGCTAGCTGGAGAAGTTTGAGTGTC
TGCTACTTCGATTTCGAGTGTTTTGAGCTTTTGAAGAATGGTGAGAATCAGTGTGCTTAA
CGATGCTCTTAAGAGTATGTACAACGCGGAGAAGAGAGGGAAGAGGCAAGTTATGATCAG
GCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTTTCTCATCGTCATGCAGAAACACGGTTACATTGG
TGAATTCGAGTACGTTGATGACCACAGGTCTGGTAAGATCGTGGTGGAGCTTAATGGAAG
ACTGAACAAATGTGGTGTCATCAGTCCTCGTTTCGACGTTGGTGTTAAGGAGATTGAGAG
CTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCGACAGTTTGGTTACATTGTTCTTACAACCTCCGC
TGGTATCATGGACCACGAAGAAGCAAGGAGGAAGAATGTTGGTGGCAAGGTTCTTGGATT
CTTTT*ACTGAAAAGCCAATATCTTTGTCCTCGTTATGCTTTGCTGCTTCTCCTTTTGGT
GAGATGAGGAGTTCGATTGAGCCCAGAGTCAAGAGAGGGTAGTAAGAGTTTTTGACGTGT
TCGTTTTCTTAGTTAACATTTTGTTTGTTTTGCGCAAATGTAGACAGTAATGTGCTTATT
TTGAGTTATTTTCTCTTCCCTTTGCTAGACACTTGTACCCTCTTGTTTTGATTGTTAAAG
CATCATAATCAATTTTCTAAATC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2H329JQ 743 0 0
GGGATTCACATAGTTCTCTCTGTGTCTTCGCCGTTAGCTAGCTGGAGAAGTTTGAGTGTC
TGCTACTTCGATTTCGAGTGTTTTGAGCTTTTGAAGAATGGTGAGAATCAGTGTGCTTAA
CGATGCTCTTAAGAGTATGTACAACGCGGAGAAGAGAGGGAAGAGGCAAGTTATGATCAG
GCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTTTCTCATCGTCATGCAGAAACACGGTTACATTGG
TGAATTCGAGTACGTTGATGACCACAGGTCTGGTAAGATCGTGGTGGAGCTTAATGGAAG
ACTGAACAAATGTGGTGTCATCAGTCCTCGTTTCGACGTTGGTGTTAAGGAGATTGAGAG
CTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCGACAGTTTGGTTACATTGTTCTTACAACCTCCGC
TGGTATCATGGACCACGAAGAAGCAAGGAGGAAGAATGTTGGTGGCAAGGTTCTTGGATT
CTTTT*ACTGAAAAGCCAATATCTTTGTCCTCGTTATGCTTTGCTGCTTCTCCTTTTGGT
GAGATGAGGAGTTCGATTGAGCCCAGAGTCAAGAGAGGGTAGTAAGAGTTTTTGACGTGT
TCGTTTTCTTAGTTAACATTTTGTTTGTTTTGCGCAAATGTAGACAGTAATGTGCTTATT
TTGAGTTATTTTCTCTTCCCTTTGCTAGACACTTGTACCCTCTTGTTTTGATTGTTAAAG
CATCATAATCAATTTTCTAAATC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2F635JQ 653 0 0
TGAAGAATGGTGAGAATCAGTGTGCTTAACGATGCTCTTAAGAGTATGTACAACGCGGAG
AAGAGAGGGAAGAGGCAAGTTATGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTTTCTC
ATCGTCATGCAGAAACACGGTTACATTGGTGAATTCGAGTACGTTGATGACCACAGGTCT
GGTAAGATCGTGGTGGAGCTTAATGGAAGACTGAACAAATGTGGTGTCATCAGTCCTCGT
TTCGACGTTGGTGTTAAGGAGATTGAGAGCTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCGACAG
TTTGGTTACATTGTTCTTACAACCTCCGCTGGTATCATGGACCACGAAGAAGCAAGGAGG
AAGAATGTTGGTGGCAAGGTTCTTGGATTCTTTT*ACTGAAAAGCCAATATCTTTGTCCT
CGTTATGCTTTGCTGCTTCTCCTTTTGGTGAGATGAGGAGTTCGATTGAGCCCAGAGTCA
AGAGAGGGTAGTAAGAGTTTTTGATGTGTTCGTTTTCTTAGTTAACATTTTGTTTGTTTT
GCGCAAATGTAGACAGTAATGTGCTTATTTTGAGTTATTTTCTCTTCCCTTTGCTAGACA
CTTGTACCCTCTTGTTTTGATGGTTAAAGCATCATAATCAATTTTCTAAATCG

QA 1 653 1 653
DS 



AS 2 6

CO CL1287Contig1 945 4 28 U
GGCGGTTGATTTGCTTTGAGACTTTCCTCATCAAATTTACTCATGCGTTGTTGATTTTCA
ATTTGTTTGATATCTGGAGGTTTGTGTTAGAGATGTATCCCTGTGGTTACGTTGCTGAAG
TCACCAACTTGTCTCCTCGAGCCACTGAGAAAGATGTTCATAGTTTCTTCTCTCATTGCG
GAATAGTCGAGCTCGTCGAGATCACTGGATGCGGAGGGAATGATGCGTTAACGGCTTATG
TAACATTCATTGATGCGTATGCTCTGGATATGGCCTTGTTACTTAACGGAGCTACGATCG
TTGATCAGACCGTGTGGATATCCATGTACGGTGTCTATCTACACGAATCTAACAATCTCA
CACGAGAAGGAGACTATACTGTAACGGTTACTCAAAGTCACGCGGATGCATTTGCTTCGT
CGCCTGGAGAAGCAGTAACCATTGCTCAGCAAGTCGTCAAGACAATGATATCTAAAGGCT
ACGTTCTAAGCAAGGATGCATTCGGTAAATCCAAGGCTTTGGACGAGTCTCAGAGATTCT
CAAGCTCGGTAGCCAATAAATTGGCAGAGATCGGCCGTTACATTGGCCTCACACAGAACA
TTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTGAGGTCAGCGGACGACAAGTATCACTTCTCTGATTTCA
CAAAATCAGCGGTTCTTGTCACTGGCACGGCTGCTGTGGCTGCAGCCACCATTACTGGAA
AAGTGGCTGCTGCTGCTGCCACCACTGTGGTCAACAGTCGATACTTTGCTA*CGGAGCTT
TATGGTTTTCAGATGCTTTGGGCCGGGCTGCAAAAGCAGCGGCCCATATGGGTGGTGGTG
GTGGAAACAGTTGATTATGTATAATATGAGGTTTTAAATCATAAAGATGCTGGAATAAAA
AAAAAACATAAATGTATAATTAATACAATCACATGATTTCCCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 5 20 20 5 20 5 5 20 20 5 5 20 5 20 5 20 20 5 5 5 5 20 20 5 5 5 5 20 
20 5 20 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H189TF U 32
AF RR2ES31TF U 1
AF RR2FB14TF U 30
AF RR2ES31JQ C 210
BS 1 32 RR2ES31TF
BS 33 33 RR2FB14TF
BS 34 35 RR2ES31TF
BS 36 36 RR2FB14TF
BS 37 37 RR2ES31TF
BS 38 39 RR2FB14TF
BS 40 41 RR2ES31TF
BS 42 43 RR2FB14TF
BS 44 44 RR2ES31TF
BS 45 45 RR2FB14TF
BS 46 46 RR2ES31TF
BS 47 47 RR2FB14TF
BS 48 49 RR2ES31TF
BS 50 53 RR2FB14TF
BS 54 55 RR2ES31TF
BS 56 59 RR2FB14TF
BS 60 61 RR2ES31TF
BS 62 62 RR2FB14TF
BS 63 63 RR2ES31TF
BS 64 68 RR2FB14TF
BS 69 105 RR2ES31TF
BS 106 106 RR2FB14TF
BS 107 721 RR2ES31TF
BS 722 722 RR2FB14TF
BS 723 753 RR2ES31TF
BS 754 754 RR2FB14TF
BS 755 787 RR2ES31TF
BS 788 945 RR2ES31JQ

RD RR2H189TF 747 0 0
G
AAATTTACTCATGCGTTGTTGATTTTCAATTTGTTTGATATCTGGAGGTTTGTGGTAGAG
ATGTATCCCTGTGGTTACGTTGCTGAAGTCACCAACTTGTCTCCTCGAGCCACTGAGAAA
GATGTTCATAGTTTCTTCTCTCATTGCGGAATAGTCGAGCTTGTCGAGATCACTGGATGC
GGAGGGAATGATGCGTTAACGGCTTATGTAACATTCAGAGATGCGTATGCTCTGGATATG
GCCTTGTTACTTAACGGAGCTACGATCGTTGATCAAACCGTGTGGATATCCATGTACGGT
GTCTATCTACACGAATCTAACAATCTCACACGAGAAGGAGACTATACTGTAACGGTTACT
CAAAGTCACGCGGATGCATTTGCTTCGTCGCCTGGAGAAGCAGTAACCATTGCTCAGCAA
GTCGTCAGGACAATGATATCTAAAGGCTACGTTCTAAGCAAGGATGCATTCGGTAAAGCC
AAGGCTTTGGACGAGTCTCAGAGATTCTCAAGCTCGGTAGCCAACAAATTGGCAGAGATC
GGCCGTTACATTGGCCTCACACAAAACATTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTGAGGTCAGCG
GACGACAAGTATCACTTCTCTGATTTCACAAAATCAGCGGTTCTTGTCACTGGCACGGCT
GCTGTGGCTGCAGCCAC*ATTACTGGAAAAGTGGCTGCTGCTGCTGCCACCACTGTGGTC
A*CAGTCGATACTTTGCTA
CGGGCTT

QA 2 740 2 740
DS 

RD RR2ES31TF 791 0 0
GGCGGTTGATTTGCTTTGAGACTTTCCTCATCTAACTATCTT*TACCTTAAAAATCAAAA
AATCA**GGATATCTGGAGGTTTGTGTTAGAGATGTATCCCTGTGTTTACGTTGCTGAAG
TCACCAACTTGTCTCCTCGAGCCACTGAGAAAGATGTTCATAGTTTCTTCTCTCATTGCG
GAATAGTCGAGCTCGTCGAGATCACTGGATGCGGAGGGAATGATGCGTTAACGGCTTATG
TAACATTCATTGATGCGTATGCTCTGGATATGGCCTTGTTACTTAACGGAGCTACGATCG
TTGATCAGACCGTGTGGATATCCATGTACGGTGTCTATCTACACGAATCTAACAATCTCA
CACGAGAAGGAGACTATACTGTAACGGTTACTCAAAGTCACGCGGATGCATTTGCTTCGT
CGCCTGGAGAAGCAGTAACCATTGCTCAGCAAGTCGTCAAGACAATGATATCTAAAGGCT
ACGTTCTAAGCAAGGATGCATTCGGTAAATCCAAGGCTTTGGACGAGTCTCAGAGATTCT
CAAGCTCGGTAGCCAATAAATTGGCAGAGATCGGCCGTTACATTGGCCTCACACAGAACA
TTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTGAGGTCAGCGGACGACAAGTATCACTTCTCTGATTTCA
CAAAATCAGCGGTTCTTGTCACTGGCACGGCTGCTGTGGCTGCAGCCACCATTACTGGAA
A*GTGGCTGCTGCTGCTGCCACCACTGTGGTCA*CAGTCGATACTTTGCTA*CGGAGCTT
TATGGTT
CTCA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2FB14TF 761 0 0
GGA
AAATTTACTCATGCGTTGTTGATTTTCAATTTGTTTGATATCTGGAGGTTTGTGTTAGAG
ATGTATCCCTGTGGTTACGTTGCTGAAGTCACCAACTTGTCTCCTCGAGCCACTGAGAAA
GATGTTCATAGTTTCTTCTCTCATTGCGGAATAGTCGAGCTCGTCGAGATCACTGGATGC
GGAGGGAATGATGCGTTAACGGCTTATGTAACATTCAGTGATGCGTATGCTCTGGATATG
GCCTTGTTACTTAACGGAGCTACGATCGTTGATCAGGCCGTGTGGATATCCATGTACGGT
GTCTATCTACACGAATCTAACAATCTCACACGAGAAGGAGACTATACTGTAACGGTTACT
CAAAGTCACGCGGATGCATTTGCTTCGTCGCCTGGAGAAGCAGTAACCATTGCTCAGCAA
GTCGTCAAGACAATGATATCTAAAGGCTACGTTCTAAGCAAGGATGCATTCGGTAAAGCC
AAGGCTTTGGACGAGTCTCAGAGATTCTCAAGCTCGGTAGCCAATAAATTGGCAGAGATC
GGCCGTTACATTGGCCTCACACAGAACATTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTGAGGTCAGCG
GACGACAAGTATCACTTCTCTGATTTCACAAAATCAGCGGTTCTTGTCACTGGCACGGCT
GCTGTGGCTGCAGCCACCATTACTGGAAAAGTGGCTGCTGCTGCTGCCACCACTGTGGTC
AACAGTCGATACTTTGCTA*CGGGGCTTTATGGT
CTCA

QA 4 757 4 757
DS 

RD RR2ES31JQ 736 0 0
TGCGGAGGGAATGATGCGTTAACGGCTTATGTAACATTCATTGATGCGTATGCTCTGGAT
ATGGCCTTGTTACTTAACGGAGCTACGATCGTTGATCAGACCGTGTGGATATCCATGTAC
GGTGTCTATCTACACGAATCTAACAATCTCACACGAGAAGGAGACTATACTGTAACGGTT
ACTCAAAGTCACGCGGATGCATTTGCTTCGTCGCCTGGAGAAGCAGTAACCATTGCTCAG
CAAGTCGTCAAGACAATGATATCTAAAGGCTACGTTCTAAGCAAGGATGCATTCGGTAAA
TCCAAGGCTTTGGACGAGTCTCAGAGATTCTCAAGCTCGGTAGCCAATAAATTGGCAGAG
ATCGGCCGTTACATTGGCCTCACACAGAACATTCAGTCCAGTATGGAAGCCGTGAGGTCA
GCGGACGACAAGTATCACTTCTCTGATTTCACAAAATCAGCGGTTCTTGTCACTGGCACG
GCTGCTGTGGCTGCAGCCACCATTACTGGAAAAGTGGCTGCTGCTGCTGCCACCACTGTG
GTCAACAGTCGATACTTTGCTAACGGAGCTTTATGGTTTTCAGATGCTTTGGGCCGGGCT
GCAAAAGCAGCGGCCCATATGGGTGGTGGTGGTGGAAACAGTTGATTATGTATAATATGA
GGTTTTAAATCATAAAGATGCTGGAATAAAAAAAAAACATAAATGTATAATTAATACAAT
CACATGATTTCCCTGT

QA 1 736 1 736
DS 



CO CL1287Contig2 611 2 13 U
AGAAAAAGTTTAGAACTCATATATATTCCCCTTCCATGTATAACTATTTAATATTTATAA
AATTTGTCTACAATTTCTCATATAACATACAGGGAAATCATGTGATTGTATTAATTATAC
ATTTATGTTTTTTTTTATTCCAGCATCTTTATGACTTAAAACCTCATATTATACATAATC
AACTGCTTCCACCACCACCACCCATATGGGCCGCTGCTTTTGCAGCCCGGCCCAAAGCAT
CTGAAAACCATAAAGCCCCGTTAGCAAAGTATCGACTGTTGACCACAGTGGTGGCAGCAG
CAGCAGCCACTTTTCCAGTAATGGTGGCTGCAGCCACAGCAGCCGTGCCAGTGACAAGAA
CCGCTGATTTTGTGAAATCAAAAAAGTGATACTTGTCGTCCGCTGACCTCACGGCTTCCA
TACTGGACTGAATGTTCTGTGTGAGGCCAATGTAACGGCCGATCTCTGCCAATTTATTGG
CTACCGAGCTTGAGAATCTCTGAAACTCGTCCAAAGCCTTGGCTTTACCGAATGCATCCT
TGCTTAAAACGTAGCCTTTAGATATCATTGTCCTGACGACTTGCTGAGCAATGGTTACTG
CTTCTCCAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB14JQ U 38
AF RR2H189JQ U 1
BS 1 141 RR2H189JQ
BS 142 142 RR2FB14JQ
BS 143 153 RR2H189JQ
BS 154 154 RR2FB14JQ
BS 155 198 RR2H189JQ
BS 199 201 RR2FB14JQ
BS 202 380 RR2H189JQ
BS 381 381 RR2FB14JQ
BS 382 436 RR2H189JQ
BS 437 437 RR2FB14JQ
BS 438 475 RR2H189JQ
BS 476 476 RR2FB14JQ
BS 477 611 RR2H189JQ

RD RR2FB14JQ 461 0 0
GTATAACTATTTAATATTTATAAAATTTGTCTACAATTTCTCATATAACATACAGGGAAA
TCATGTGATTGTATTAATTATACATTTATGTTTTTTTTTATTCCAGCATCTTTATGATTT
AAAACCTCATATTATACATAATCAACTGTTTCCACCACCACCACCCATATGGGCCGCTGC
TTTTGCAGCCCGGCCCAAAGCATCTGAAAACCATAAAGCCCCGTTAGCAAAGTATCGACT
GTTGACCACAGTGGTGGCAGCAGCAGCAGCCACTTTTCCAGTAATGGTGGCTGCAGCCAC
AGCAGCCGTGCCAGTGACAAGAACCGCTGATTTTGTGAAATCAAAAAAGTGATACTTGTC
GTCCGCTGACCTCACGGCTTCCATACTGGACTGAATGTTCTGTGTGAGGCCAATGTAACG
GCCGATCTCTGCCAATTTATTGGCTACCGAGCTTGAGAATC

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR2H189JQ 611 0 0
AGAAAAAGTTTAGAACTCATATATATTCCCCTTCCATGTATAACTATTTAATATTTATAA
AATTTGTCTACAATTTCTCATATAACATACAGGGAAATCATGTGATTGTATTAATTATAC
ATTTATGTTTTTTTTTATTCCGGCATCTTTATGGCTTAAAACCTCATATTATACATAATC
AACTGCTTCCACCACCAC***CCATATGGGCCGCTGCTTTTGCAGCCCGGCCCAAAGCAT
CTGAAAACCATAAAGCCCCGTTAGCAAAGTATCGACTGTTGACCACAGTGGTGGCAGCAG
CAGCAGCCACTTTTCCAGTAATGGTGGCTGCAGCCACAGCAGCCGTGCCAGTGACAAGAA
CCGCTGATTTTGTGAAATCAGAAAAGTGATACTTGTCGTCCGCTGACCTCACGGCTTCCA
TACTGGACTGAATGTTTTGTGTGAGGCCAATGTAACGGCCGATCTCTGCCAATTTGTTGG
CTACCGAGCTTGAGAATCTCTGAAACTCGTCCAAAGCCTTGGCTTTACCGAATGCATCCT
TGCTTAAAACGTAGCCTTTAGATATCATTGTCCTGACGACTTGCTGAGCAATGGTTACTG
CTTCTCCAGGC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 2 6

CO CL1288Contig1 682 4 2 U
GGGCCTCTCGCATCTCTTTTAACATTCCTCAACAGAGAGCAGCAGCAGCAACCGGTAGCC
ATGGCTGAACAGACTGAGAAGGCTTTTCTTAAGCAACCCAAGGTCTTCCTAAGCTCGAAG
ACATCAGGGAAAGGAAAGAGACCTGGCAAAGGCGGAAACCGTTTCTCGAAGAACATTGGT
TTGGGCTTCAAGACTCCCCGTGAAGCCATTGAGGGAACTTACATTGATAGGAAATGTCCA
TTCACCGGAACCGTCTCTGTAAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAG
ATGCAGAGAACCATCATCGTTCGCAGGAACTACCTCCACTTCGTGAAGAAGTATCAGAGG
TACGAGAAGAGGCACTCCAACATCCCAGCTCACGT*TCGCCCTGCTTCCGTGTGAAAGAA
GGTGATCATGTCATCATTGGCCAGTGCAGGCCCTTGTCGAAGACGGTGAGGTTTAATGTG
CTGAAGGTGATCCCTGCGGGCGCATCCGCTTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAA
GAGATTTTTTTTGAAGTATTGTTGTTACTTTTGCTTGGTTTTTTGATTTTGGAATGTTTT
GTTGGAAGTCTCTGTCTGATTGCCATTACCTACTTTCATCTGTTTTTATCTTGGTATCTC
TAGAAATCAATTGCTTTTGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2DW27TF U 1
AF RR2E750JQ C 29
AF RR2E750TF U 29
AF RR2DW27JQ C 121
BS 1 286 RR2DW27TF
BS 287 682 RR2E750TF

RD RR2DW27TF 286 0 0
GGGCCTCTCGCATCTCTTTTAACATTCCTCAACAGAGAGCAGCAGCAGCAACCGGTAGCC
ATGGCTGAACAGACTGAGAAGGCTTTTCTTAAGCAACCCAAGGTCTTCCTAAGCTCGAAG
ACATCAGGGAAAGGAAAGAGACCTGGCAAAGGCGGAAACCGTTTCTCGAAGAACATTGGT
TTGGGCTTCAAGACTCCCCGTGAAGCCATTGAGGGAACTTACATTGATAGGAAATGTCCA
TTCACCGGAACCGTCTCTGTAAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTT

QA 1 286 1 286
DS 

RD RR2E750JQ 654 0 0
GG
AACAGAGAGCAGCAGCAGCAACCGGTAGCCATGGCTGAACAGACTGAGAAGGCTTTTCTT
AAGCAACCCAAGGTCTTCCTAAGCTCGAAGACATCAGGGAAAGGAAAGAGACCTGGCAAA
GGCGGAAACCGTTTCTCGAAGAACATTGGTTTGGGCTTCAAGACTCCCCGTGAAGCCATT
GAGGGAACTTACATTGATAGGAAATGTCCATTCACCGGAACCGTCTCTGTAAGAGGACGT
ATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGAACCATCATCGTTCGCAGGAAC
TACCTCCACTTCGTGAAGAAGTATCAGAGGTACGAGAAGAGGCACTCCAACATCCCAGCT
CACGT*TCGCCCTGCTTCCGTGTGAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCCAGTGCAGG
CCCTTGTCGAAGACGGTGAGGTTTAATGTGCTGAAGGTGATCCCTGCGGGCGCATCCGCT
TTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAAGAGATTTTTTTTGAAGTATTGTTGTTACTT
TTGCTTGGTTTTTTGATTTTGGAATGTTTTGTTGGAAGTCTCTGTCTGATTGCCATTACC
TACTTTCATCTGTTTTTATCTTGGTATCTCTAGAAATCAATTGCTTTTGTCT

QA 3 654 3 654
DS 

RD RR2E750TF 654 0 0
GG
AACAGAGAGCAGCAGCAGCAACCGGTAGCCATGGCTGAACAGACTGAGAAGGCTTTTCTT
AAGCAACCCAAGGTCTTCCTAAGCTCGAAGACATCAGGGAAAGGAAAGAGACCTGGCAAA
GGCGGAAACCGTTTCTCGAAGAACATTGGTTTGGGCTTCAAGACTCCCCGTGAAGCCATT
GAGGGAACTTACATTGATAGGAAATGTCCATTCACCGGAACCGTCTCTGTAAGAGGACGT
ATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGAACCATCATCGTTCGCAGGAAC
TACCTCCACTTCGTGAAGAAGTATCAGAGGTACGAGAAGAGGCACTCCAACATCCCAGCT
CACGT*TCGCCCTGCTTCCGTGTGAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCCAGTGCAGG
CCCTTGTCGAAGACGGTGAGGTTTAATGTGCTGAAGGTGATCCCTGCGGGCGCATCCGCT
TTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAAGAGATTTTTTTTGAAGTATTGTTGTTACTT
TTGCTTGGTTTTTTGATTTTGGAATGTTTTGTTGGAAGTCTCTGTCTGATTGCCATTACC
TACTTTCATCTGTTTTTATCTTGGTATCTCTAGAAATCAATTGCTTTTGTCT

QA 3 654 3 654
DS 

RD RR2DW27JQ 562 0 0
ACATCAGGGAAAGGAAAGAGACCTGGCAAAGGCGGAAACCGTTTCTCGAAGAACATTGGT
TTGGGCTTCAAGACTCCCCGTGAAGCCATTGAGGGAACTTACATTGATAGGAAATGTCCA
TTCACCGGAACCGTCTCTGTAAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAG
ATGCAGAGAACCATCATCGTTCGCAGGAACTACCTCCACTTCGTGAAGAAGTATCAGAGG
TACGAGAAGAGGCACTCCAACATCCCAGCTCACGTCTCGCCCTGCTTCCGTGTGAAAGAA
GGTGATCATGTCATCATTGGCCAGTGCAGGCCCTTGTCGAGGACGGTGAGGTTTAATGTG
CTGAAGGTGATCCCTGCGGGCGCATCCGCTTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAA
GAGATTTTTTTTGAAGTATTGTTGTTACTTTTGCTTGGTTTTTTGATTTTGGAATGTTTT
GTTGGAAGTCTCTGTCTGATTGCCATTACCTACTTTCATCTGTTTTTATCTTGGTATCTC
TAGAAATCAATTGCTTTTGTCT

QA 1 562 1 562
DS 



CO CL1288Contig2 758 2 3 U
TTTTTTTTTGCTAATTTGATTTATTGCAGTAAGGTTTTCTGATCAAGACAGACAAAAAGT
AGTTGATTTCTAGAGATACCGAAGATAAAAACAGATGAAAGTTGGAAGTAGGTAATGGCA
AATCAGAGACTTAAACAAAACATTCCAAAATCAAAACCAAGCAAAAGTAACAATAATACT
TCAAAAAAGCTCTTACATTCCAGTGAATGCCTTCTTAGCAAAGGCGGATGCGCCAGCTGG
GATCACCTTCAGCACATTGAACCTCACCGTCTTCGACAAGGGCCTGCACTGGCCAATGAT
GACATGATCACCTTCTTTGACACGGAAGCAGGGCGAGACGTGAGCAGGGATGTTGGAGTG
CCTCCTCTCATACCTCTGATACTTCTTGACGAAGTGGAGGTAGTTCCTGCGAACGATGAT
GGTTCTCTGCATCTTGGCACTGTGGCAAGTACCAGCTAAGATACGTCCTCTTACAGAGAC
GGTTCCAGTGAATGGACATTTCCTATCAATGTAAGTTCCTTCAATGGCTTCACGAGGAGT
CTTGAAACCTAAGCCAATGTCCTTCGAGAAACGGTTTCCGCCTTTGCCAGGTCTCTTTCC
TTTCCCTGATGTCTTCGAGCTTAGGAAGACCTTGGGTTGCTTAAGAAAAGCCTTCTCAGT
CTGTTCAGCCATGGCTACCGGTTGCTGCTGCTGCTCTCTGTTGAGGAATGTTAAAAGAGA
TGCGAGAGGCGAGGCAGCGACTGATAAACTGAAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY86JQ U 9
AF RR2DY86TF C 1
BS 1 14 RR2DY86TF
BS 15 655 RR2DY86JQ
BS 656 758 RR2DY86TF

RD RR2DY86JQ 647 0 0
GCTAAT
TTTGATTTATTGCAGTAAGGTTTTCTGATCAAGACAGACAAAAAGTAGTTGATTTCTAGA
GATACCGAAGATAAAAACAGATGAAAGTTGGAAGTAGGTAATGGCAAATCAGAGACTTAA
ACAAAACATTCCAAAATCAAAACCAAGCAAAAGTAACAATAATACTTCAAAAAAGCTCTT
ACATTCCAGTGAATGCCTTCTTAGCAAAGGCGGATGCGCCAGCTGGGATCACCTTCAGCA
CATTGAACCTCACCGTCTTCGACAAGGGCCTGCACTGGCCAATGATGACATGATCACCTT
CTTTGACACGGAAGCAGGGCGAGACGTGAGCAGGGATGTTGGAGTGCCTCCTCTCATACC
TCTGATACTTCTTGACGAAGTGGAGGTAGTTCCTGCGAACGATGATGGTTCTCTGCATCT
TGGCACTGTGGCAAGTACCAGCTAAGATACGTCCTCTTACAGAGACGGTTCCAGTGAATG
GACATTTCCTATCAATGTAAGTTCCTTCAATGGCTTCACGAGGAGTCTTGAAACCTAAGC
CAATGTCCTTCGAGAAACGGTTTCCGCCTTTGCCAGGTCTCTTTCCTTTCCCTGATGTCT
TCGAGCTTAGGAAGACCTTGGGTTGCTTAAGAAAAGCCTTC

QA 7 647 7 647
DS 

RD RR2DY86TF 758 0 0
TTTTTTTTTGCTAATTTGATTTAT*GCAGTAAGGTTT*CTGATCA*GACAGACAAAAAGT
AGTTGATTTCTAGAGATACCGAAGATAAAAACAGATGAAAGTTGGAAGTAGGTAATGGCA
AATCAGAGACTTAAACAAAACATTCCAAAATCAAAACCAAGCAAAAGTAACAATAATACT
TCAAAAAAGCTCTTACATTCCAGTGAATGCCTTCTTAGCAAAGGCGGATGCGCCAGCTGG
GATCACCTTCAGCACATTGAACCTCACCGTCTTCGACAAGGGCCTGCACTGGCCAATGAT
GACATGATCACCTTCTTTGACACGGAAGCAGGGCGAGACGTGAGCAGGGATGTTGGAGTG
CCTCCTCTCATACCTCTGATACTTCTTGACGAAGTGGAGGTAGTTCCTGCGAACGATGAT
GGTTCTCTGCATCTTGGCACTGTGGCAAGTACCAGCTAAGATACGTCCTCTTACAGAGAC
GGTTCCAGTGAATGGACATTTCCTATCAATGTAAGTTCCTTCAATGGCTTCACGAGGAGT
CTTGAAACCTAAGCCAATGTCCTTCGAGAAACGGTTTCCGCCTTTGCCAGGTCTCTTTCC
TTTCCCTGATGTCTTCGAGCTTAGGAAGACCTTGGGTTGCTTAAGAAAAGCCTTCTCAGT
CTGTTCAGCCATGGCTACCGGTTGCTGCTGCTGCTCTCTGTTGAGGAATGTTAAAAGAGA
TGCGAGAGGCGAGGCAGCGACTGATAAACTGAAAGTCC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 5

CO CL1289Contig1 1232 5 12 U
GATCATTTATCTAACCCTCGTTCAAATTTTTTAACAAGATATAACCAGATTTTAATTTTC
TTCGTGGGAAGATTACGTTTTCGTTACAATCATATCGAAGGAGACTAGAACAGAATGTGG
TTTAAACATAAAGACGCTAATAATTGTTTCATTACACTACTCATTAGATGGCCAAAATAA
CAGTCTTTACGCTCGTTTTGCAACATCAAGCACCCATCATATTACCATGCAAGAAACCTC
TCCACCGTAAAGTCTAAGGCAACCAATTTTTCTTCTTCATCACCATCACAACTGTCTCTA
TGGGGATGGCAAATCCAATACCCACATCTGCAACCCCATAACTGCAATTCAAACCAACCA
CTTCGCCCTCGAGGTTTACAAGGGCCCCTCCAGAACTCCCCTCATCCAACCAACAATCGG
TTTGGAGGTAGAATTGGCATTTGCCTGGTACTTGTAGATCATCTTGTGAGCGGTTAAGAT
AACCTATTATGCCCATCGAAAGACTGTTGGAAAGCTGATGAGGATAACCTACAGACATAA
CCCAATCGCCTACTGCCATATCCTTCGAATGGCCAAACTTGGCAGGAGAGAGTGACACTG
GCGAATTGATCTTGACTAGTGCAAGATCATAGTCCAGGTCACTGTCAACAACGGTTCCCA
TAAACGATTGATCAAGGTTCGTTGTGACCAAAACTTCCATGCTCCCTGGACGATAGAGAG
GACTGAGTTCGAACACATGAGCACATGTGATGATGTGCTTTTCATCAAAGACAACTCCAG
ACCCATACAAATCTTTAGCTTTAGTGATATTCACGACAGAAGGGGCGATGATAGAGGCAG
CGGTTTTGAGAGAACTTCTCCCAAAGTAATCAGGGTCAGTGTTTTTTCCAGAGCAGAGCT
TGAAATGGTTCATGAGACTCAGATATTTCAATTCCTTGAAACGAAGGATCTGAAGAGATT
TCTGAGTTTGCCCTTGTTTCTCAAACAGTTTAGCCCACCGATTTAGATCAGATCTACTGA
TCTGAAACCCTTCTTCTCTCTCTATCTTGCTCAAGACGTTGGCACATGACTCCGAAGTTG
ATTTCAGAGTGGAAACGATCATCCTTTTCTGTGAAGCACTGGGAGTCGGAGTGTGAATGG
TGCTGGCGACGGAAGAGATCTGAGAAATCCTCCCCACATTGTTGAAAGAAGATGAGAAAA
GTTTACGTAACATTAGAACTCTAGTCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2E887JQ U 290
AF RR2AQ72JQ U 1
AF RR2FT79JQ U 43
AF RR2FT79TF C 469
AF RR2AQ72TF C 553
BS 1 480 RR2AQ72JQ
BS 481 481 RR2FT79JQ
BS 482 546 RR2AQ72JQ
BS 547 547 RR2FT79JQ
BS 548 749 RR2AQ72JQ
BS 750 818 RR2FT79JQ
BS 819 834 RR2FT79TF
BS 835 835 RR2AQ72TF
BS 836 1064 RR2FT79TF
BS 1065 1066 RR2AQ72TF
BS 1067 1230 RR2FT79TF
BS 1231 1232 RR2AQ72TF

RD RR2E887JQ 106 0 0
AACTGTCTCTATGGGGATGGGAAATCCAATACCCACATCTGCAACCCCATAACTGCAATT
CAAACCAACCACTTCCCCCTCGAGGTTTACAAGGGCCCCTCCA
AAA

QA 1 103 1 103
DS 

RD RR2AQ72JQ 749 0 0
GATCATTTATCTAACCCTCGTTCAAATTTTTTAACAAGATATAACCAGATTTTAATTTTC
TTCGTGGGAAGATTACGTTTTCGTTACAATCATATCGAAGGAGACTAGAACAGAATGTGG
TTTAAACATAAAGACGCTAATAATTGTTTCATTACACTACTCATTAGATGGCCAAAATAA
CAGTCTTTACGCTCGTTTTGCAACATCAAGCACCCATCATATTACCATGCAAGAAACCTC
TCCACCGTAAAGTCTAAGGCAACCAATTTTTCTTCTTCATCACCATCACAACTGTCTCTA
TGGGGATGGCAAATCCAATACCCACATCTGCAACCCCATAACTGCAATTCAAACCAACCA
CTTCGCCCTCGAGGTTTACAAGGGCCCCTCCAGAACTCCCCTCATCCAACCAACAATCGG
TTTGGAGGTAGAATTGGCATTTGCCTGGTACTTGTAGATCATCTTGTGAGCGGTTAAGAT
GACCTATTATGCCCATCGAAAGACTGTTGGAAAGCTGATGAGGATAACCTACAGACATAA
CCCAATTGCCTACTGCCATATCCTTCGAATGGCCAAACTTGGCAGGAGAGAGTGACACTG
GCGAATTGATCTTGACTAGTGCAAGATCATAGTCCAGGTCACTGTCAACAACGGTTCCCA
TAAACGATTGATCAAGGTTCGTTGTGACCAAAACTTCCATGCTCCCTGGACGATAGAGAG
GACTGAGTTCGAACACATGAGCACATGTG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2FT79JQ 776 0 0
G
ACCAGATTTTAATTTTCTTCGTGGGAAGATTACGTTTTCGTTACAATCATATCGAAGGAG
ACTAGAACAGAATGTGGTTTAAACATAAAGACGCTAATAATTGTTTCATTACACTACTCA
TTAGATGGCCAAAATAACAGTCTTTACGCTCGTTTTGCAACATCAAGCACCCATCATATT
ACCATGCAAGAAACCTCTCCACCGTAAAGTCTAAGGCAACCAATTTTTCTTCTTCATCAC
CATCACAACTGTCTCTATGGGGATGGCAAATCCAATACCCACATCTGCAACCCCATAACT
GCAATTCAAACCAACCACTTCGCCCTCGAGGTTTACAAGGGCCCCTCCAGAACTCCCCTC
ATCCAACCAACAATCGGTTTGGAGGTAGAATTGGCATTTGCCTGGTACTTGTAGATCATC
TTGTGAGCGGTTAAGATAACCTATTATGCCCATCGAAAGACTGTTGGAAAGCTGATGAGG
ATAACCTACAGACATAACCCAATCGCCTACTGCCATATCCTTCGAATGGCCAAACTTGGC
AGGAGAGAGTGACACTGGCGAATTGATCTTGACTAGTGCAAGATCATAGTCCAGGTCACT
GTCAACAACGGTTCCCATAAACGATTGATCAAGGTTCGTTGTGACCAAAACTTCCATGCT
CCCTGGACGATAGAGAGGACTGAGTTCGAACATATGAGCACATGTGATGATGTGCTTTTC
ATCAAAGACAACTCCAGACCCATACAAATCTTTAGCTTTAGTGATATTCACGACA

QA 2 776 2 776
DS 

RD RR2FT79TF 764 0 0
TGAGCGGTAAGAT
ACCTATTATGCCCATCGAAAGACTGTTGGAAAGCTGATGAGGATA*CCTACAGACATAAC
CCAATCGCCTACTGCCATATCCTTCGAATGGCCAAACTTGGCAGGAGAGAGTGACACTGG
CGAATTGATCTTGACTAGTGCAAGATCATAGTCCAGGTCACTGTCAACAACGGTTCCCAT
AAACGATTGATCAAGGTTCGTTGTGACCAAAACTTCCATGCTCCCTGGACGATAGAGAGG
ACTGAGTTCGAACATATGAGCACATGTGATGATGTGCTTTTCATCAAAGACAACTCCAGA
CCCATACAAATCTTTAGCTTTAGTGATATTCACGACAGAAGGGGCGATGATAGGGGCAGC
GGTTTTGAGAGAACTTCTCCCAAAGTAATCAGGGTCAGTGTTTTTTCCAGAGCAGAGCTT
GAAATGGTTCATGAGACTCAGATATTTCAATTCCTTGAAACGAAGGATCTGAAGAGATTT
CTGAGTTTGCCCTTGTTTCTCAAACAGTTTAGCCCACCGATTTAGATCAGATCTACTGAT
CTGAAACCCTTCTTCTCTCTCTATCTTGCTCAAGACGTTGGCA**TGACTCCGAAGTTGA
TTTCAGAGTGGAAACGATCATCCTTTTCTGTGAAGCACTGGGAGTCGGAGTGTGAATGGT
GCTGGCGACGGAAGAGATCTGAGAAATCCTCCCCACATTGTTGAAAGAAGATGAGAAAAG
TTTACGTAACATTAGAACTCTAGTCTCTC
CC

QA 14 762 14 762
DS 

RD RR2AQ72TF 680 0 0
CTGCCATATCTTTCGAATGGCCAAACTTGGCAGGAGAGAGTGACACTGGCGAATTGATCT
TGACTAGTGCAAGATCATAGTCCAGGTCACTGTCAACAACGGTTCCCATAAACGATTGAT
CAAGGTTCGTTGTGACCAAAACTTCCATGCTCCCTGGACGATAGAGAGGACTGAGTTCGA
ACACATGAGCACATGTGATGATGTGCTTTTCATCAAAGACAACTCCAGACCCATACAAAT
CTTTAGCTTTAGTGATATTCACGACAGAAGGGGCGATGATAGAGGCAGCGGTTTTGAGAG
AACTTCTCCCAAAGTAATCAGGGTCAGTGTTTTTTCCGGAGCAGAGCTTGAAATGGTTCA
TGAGACTCAGATATTTCAATTCCTTGAAACGAAGGATCTGAAGAGATTTCTGAGTTTGCC
CTTGTTTCTCAAACAGTTTAGCCCACCGATTTAGATCAGATCTACTGATCTGAAACCCTT
CTTCTCTCTCTATCTTGCTCAAGACGTTGGCACATGACTCCGAAGTTGATTTCAGAGTGG
AAACGATCATCCTTTTCTGTGAAGCACTGGGAGTCGGAGTGTGAATGGTGCTGGCGACGG
AAGAGATCTGAGAAATCCTCCCCACATTGTTGAAAGAAGATGAGAAAAGTTTACGTAACA
TTAGAACTCTAGTCTCTCCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 6

CO CL1290Contig1 1251 6 9 U
GGAGCTCTTATTACCAGAAAGGAAAGAAAGACCTTGTAATAAGGGTTTAGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGACTGTTTTATAAGGTGAAAAGAGAGGAGAAGATGGAAAACACAGACGAGGTC
GTGTCCATTGAGCTTCCAGCTCCTCCTTCATGGAAAAAACTGTTTTATCCGAAGAGAGCA
GGTACACCGAGGAAGACAGAGATTGTGTTCATGGCTCCAACGGGTGAAGAGATCAGCTCA
CGCAAGCAGCTTGAGAAGTACCTCAAGGCTCATCCTGGGAATCCTGTCATCTCTGAGTTT
GATTGGACAACCGGGGAGACTCCAAGACGGTCTTCAAGGATCAGCCAGAAGGTGAAGGCT
GCTACAAGCCCCACTCCTGAGAAAGAACCTCTCTTGAAGAAGAGACGCTCTTCTCTCACT
AAGAAGGATAACAAAGAGGCTGCTGAGAAGAACCAAGCAGAGGCTGACAAGAACGGACAG
ACAGAGGTTGCTGTTAAGGAGAACAAAGAGAGTGAAAAGACCGAAGCTGAGAAGCAAGCT
GAAATTGCAGAGGCTGTGAAGGAGAACAAGGAGGGTGAAAAGACTGAGGCTGAAAACAAA
GAAGGAGAAGCTGTGATGGACAAGAAAGAGCCTATGGAAGTGGCTACCTCTGAGTTTGAG
AAGAAGGCTGAGAGTGGAGGAGGAGATGAAGAAACTCCCAAAGTTGAAGACCTGAAGGAC
ACCGAAATGAAAGAACCACAGGAAGTAGTTACTGAGGGTGATGGAGAGAAGAAGCTTGCA
GAGAAAGAGACTGATATCAAGGACGGCAGCATGGGCGCTGAAGCAAACGGAAATGAAGCC
AAAGAAGCGGATGTGCACAAGAAAGATGGTGAGCCTAACCTTGATGCAGAGGCAGAAGCT
AATAAGGGGAATGCAACACAAGAAGCTGCAGCAGCTGTAGCTGAGGAGATAAGTAACGAG
GTGAAGGCTGAAGACACAAACAGAGGCCTAGAGGCGCAGCTAGGCGCTGCAGCGTCCGTG
AGCTGTTGAAAGCCCTATCGTCTGCACAGAACGTGGAGAGTTTGTTGTGGTCTGATTCAG
GTGTAGCATTAACTTTATGAGTGGTTGTTGTACGTGTAGAAGTAATTATAATATGTTCTC
TGTTATGTAGTTCATTTTTATTTCAGACTCTTGATTTTTCTTTTACTGTTGTTCTATTGT
ACTTGTGGTGTGTTGTTAATTTTAGGCATTTATTTTGGTCTGTTTATTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP19TF U 43
AF RR2CI84TF U 1
AF RR2EU47TF U 425
AF RR2EU47JQ C 517
AF RR2CI84JQ C 492
AF RR2DP19JQ C 503
BS 1 463 RR2CI84TF
BS 464 464 RR2DP19TF
BS 465 604 RR2CI84TF
BS 605 605 RR2DP19TF
BS 606 666 RR2CI84TF
BS 667 1079 RR2EU47TF
BS 1080 1080 RR2CI84JQ
BS 1081 1117 RR2EU47TF
BS 1118 1251 RR2CI84JQ

RD RR2DP19TF 607 0 0
GGGGGTTT
AGAGAGAGAGAGAGAGAGACTGTTTTATAAGGTGAAAAGAGAGGAGAAGATGGAAAACAC
AGACGAGGTCGTGTCCATTGAGCTTCCAGCTCCTCCTTCATGGAAAAAACTGTTTTATCC
GAAGAGAGCAGGTACACCGAGGAAGACAGAGATTGTGTTCATGGCTCCAACGGGTGAAGA
GATCAGCTCACGCAAGCAGCTTGAGAAGTACCTCAAGGCTCATCCTGGGAATCCTGTCAT
CTCTGAGTTTGATTGGACAACCGGGGAGACTCCAAGACGGTCTTCAAGGATCAGCCAGAA
GGTGAAGGCTGCTACAAGCCCCACTCCTGAGAAAGAACCTCTCTTGAAGAAGAGACGCTC
TTCTCTCACTAAGAAGGATAACAAAGAGGCTGCTGAGAAGAACCAAGCAGAGGCTGACAA
GAACGGACAGACAGAGGTTGCTGTTAAGGAGAACAAAGAGAGTGAAAAGACCGAAGCTGA
GAAGCAAGCTGAAATTGCAGAGGCTGTGAAGGAGAACAAGGAGGGTGAAAAGACTGAGGC
TGAAAACAAAGAAAGAGAAGCTGTGATGGACAAGAAAGAGCCTATGGAAGTGGCTACCT

QA 9 607 9 607
DS 

RD RR2CI84TF 674 0 0
GGAGCTCTTATTACCAGAAAGGAAAGAAAGACCTTGTAATAAGGGTTTAGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGACTGTTTTATAAGGTGAAAAGAGAGGAGAAGATGGAAAACACAGACGAGGTC
GTGTCCATTGAGCTTCCAGCTCCTCCTTCATGGAAAAAACTGTTTTATCCGAAGAGAGCA
GGTACACCGAGGAAGACAGAGATTGTGTTCATGGCTCCAACGGGTGAAGAGATCAGCTCA
CGCAAGCAGCTTGAGAAGTACCTCAAGGCTCATCCTGGGAATCCTGTCATCTCTGAGTTT
GATTGGACAACCGGGGAGACTCCAAGACGGTCTTCAAGGATCAGCCAGAAGGTGAAGGCT
GCTACAAGCCCCACTCCTGAGAAAGAACCTCTCTTGAAGAAGAGACGCTCTTCTCTCACT
AAGAAGGATAACAAAGAGGCTGCTGAGAAGAACCAAGCAGAGGTTGACAAGAACGGACAG
ACAGAGGTTGCTGTTAAGGAGAACAAAGAGAGTGAAAAGACCGAAGCTGAGAAGCAAGCT
GAAATTGCAGAGGCTGTGAAGGAGAACAAGGAGGGTGAAAAGACTGAGGCTGAAAACAAA
GAAGAAGAAGCTGTGATGGACAAGAAAGAGCCTATGGAAGTGGCTACCTCTGAGTTTGAG
AAGAAG
CTGAGAGT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2EU47TF 693 0 0
G
GGATAACAAAGAGGCTGCTGAGAAGAACCAAGCAGAGGCTGACAAGAACGGACAGACAGA
GGTTGCTGTTAAGGAGAACAAAGAGAGTGAAAAGACCGAAGCTGAGAAGCAAGCTGAAAT
TGCAGAGGCTGTGAAGGAGAACAAGGAGGGTGAAAAGACTGAGGCTGAAAACAAAGAAGG
AGAAGCTGTGATGGACAAGAAAGAGCCTATGGAAGTGGCTACCTCTGAGTTTGAGAAGAA
GGCTGAGAGTGGAGGAGGAGATGAAGAAACTCCCAAAGTTGAAGACCTGAAGGACACCGA
AATGAAAGAACCACAGGAAGTAGTTACTGAGGGTGATGGAGAGAAGAAGCTTGCAGAGAA
AGAGACTGATATCAAGGACGGCAGCATGGGCGCTGAAGCAAACGGAAATGAAGCCAAAGA
AGCGGATGTGCACAAGAAAGATGGTGAGCCTAACCTTGATGCAGAGGCAGAAGCTAATAA
GGGGAATGCAACACAAGAAGCTGCAGCAGCTGTAGCTGAGGAGATAAGTAACGAGGTGAA
GGCTGAAGACACAAACAGAGGCCTAGAGGCGCAGCTAGGCGCTGCAGCGTCCGTGAGCTG
TTGAAAGCCCTATCGTCTGCACAGAACGTGGAGAGTTTGTTGTGGTCTGATTCACGTGTA
GCATTAACTTTATGAGTGGTTGTTGTACGTGT

QA 2 693 2 693
DS 

RD RR2EU47JQ 676 0 0
AAAGA
CGAAGCTGAGAAGCAAGCTGAAATTGCAGAGGCTGTGAAGGAGAACAAGGAGGGTGAAAA
GACTGAGGCTGAAAACAAAGAAGGAGAAGCTGTGATGGACAAGAAAGAGCCTATGGAAGT
GGCTACCTCTGAGTTTGAGAAGAAGGCTGAGAGTGGAGGAGGAGATGAAGAAACTCCCAA
AGTTGAAGACCTGAAGGACACCGAAATGAAAGAACCACAGGAAGTAGTTACTGAGGGTGA
TGGAGAGAAGAAGCTTGCAGAGAAAGAGACTGATATCAAGGACGGCAGCATGGGCGCTGA
AGCAAACGGAAATGAAGCCAAAGAAGCGGATGTGCACAAGAAAGATGGTGAGCCTAACCT
TGATGCAGAGGCAGAAGCTAATAAGGGGAATGCAACACAAGAAGCTGCAGCAGCTGTAGC
TGAGGAGATAAGTAACGAGGTGAAGGCTGAAGACACAAACAGAGGCCTAGAGGCGCAGCT
AGGCGCTGCAGCGTCCGTGAGCTGTTGAAAGCCCTATCGTCTGCACAGAACGTGGAGAGT
TTGTTGTGGTCTGATTCAGGTGTAGCATTAACTTTATGAGTGGTTGTTGTACGTGTAGAA
GTAATTATAATATGTTCTCTGTTATGTAGTTCATTTTTATTTCAGACTCTTGATTTTTCT
TTTACTGTTGT

QA 6 676 6 676
DS 

RD RR2CI84JQ 760 0 0
TGTTAAGGAGAACAAAGAGAGTGAAAAGACCGAAGCTGAGAAGCAAGCTGAAATTGCAGA
GGCTGTGAAGGAGAACAAGGAGGGTGAAAAGACTGAGGCTGAAAACAAAGAAGAAGAAGC
TGTGATGGACAAGAAAGAGCCTATGGAAGTGGCTACCTCTGAGTTTGAGAAGAAGGCTGA
GAGTGGAGGAGGAGATGAAGAAACTCCCAAAGTTGAAGACCTGAAGGACACCGAAATGAA
AGAACCACAGGAAGTAGTTACTGAGGGTGATGGAGAGAAGAAGCTTGCAGAGAAAGAGAC
TGATATCAAGGACGGCAGCATGGGCGCTGAAGCAAACGGAAATGAAACCAAAGAAGCGGA
TGTGCACAAGAAAGATGGTGAGCCTAACCTTGATGCAGAGGCAGAAGCTAATAAGGGGAA
TGCAACACAAGAAGCTGTAGCAGCTGTAGCTGAGGAGATAAGTAACGAGGTGAAGGCTGA
AGACACAAACAGAGGCCTAGAGGCGCAGCTAGGCGCTGCAGCGTCCGTGAGCTGTTGAAA
GCCCTATCGTCTGCACAGAACGTGGAGAGTTTGTTGTGGTCTGATTCAGGTGTAGCATTA
ACTTTATGAGTGGTTGTTGTACGTGTAGAAGTAATTATAATATGTTCTCTGTTATGTAGT
TCATTTTTATTTCAGACTCTTGATTTTTCTTTTACTGTTGTTCTATTGTACTTGTGGTGT
GTTGTTAATTTTAGGCATTTATTTTGGTCTGTTTATTTGT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2DP19JQ 738 0 0
ACAAAGAGAGTGAAAAGACCGAAGCTGAGAAGCAAGCTGAAATTGCAGAGGCTGTGAAGG
AGAACAAGGAGGGTGAAAAGACTGAGGCTGAAAACAAAGAAGGAGAAGCTGTGATGGACA
AGAAAGAGCCTATGGAAGTGGCTACCTCTGGGTTTGAGAAGAAGGCTGAGAGTGGAGGAG
GAGATGAAGAAACTCCCAAAGTTGAAGACCTGAAGGACACCGAAATGAAAGAACCACAGG
AAGTAGTTACTGAGGGTGATGGAGAGAAGAAGCTTGCAGAGAAAGAGACTGATATCAAGG
ACGGCAGCATGGGCGCTGAAGCAAACGGAAATGAAACCAAAGAAGCGGATGTGCACAAGA
AAGATGGTGAGCCTAACCTTGATGCAGAGGCAGAAGCTAATAAGGGGAATGCAACACAAG
AAGCTGCAGCAGCTGTAGCTGAGGAGATAAGTAACGAGGTGAAGGCTGAAGACACAAACA
GAGGCCTAGAGGCGCAGCTAGGCGCTGCAGCGTCCGTGAGCTGTTGAAAGCCCTATCTTC
TGCACAGAACGTGGAGAGTTTGTTGTGGTCTGATTCAGGTGTAGCATTAACTTTATGAGT
GGTTGTTGTACGTGTAGAAGTAATTATAATATGTTCTCTGTTATGTAGTTCATTTTTATT
TCAGACTCTTGATTTTTCTTTTACTGTTGTTCTATTGTACTTGTGGTGTGTTGTTAATTT
TAGGCATTTATTTTGGTC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 5

CO CL1291Contig1 1499 5 21 U
GGATGGCGATGATGGCGATGAAAATCCGTAACTCTGCTTCCTGGCGAACGACCAGCCGTC
AAATCTCCTCGGGTTTGAGATCCATGTCGTCGTGGTGGAAGAACGTGGAGCCAGCTCCCA
AAGATCCGATCCTCGGTGTCACCGAGGCTTTTCTCGCTGATCCTAGTCCCGACAAAGTTA
ACGTCGGTGTGGGAGCATATCGTGATGATAATGGGAAGCCTGTTGTCTTGGAATGTGTCC
GAGAAGCTGAGCGTAGAATCGCTGGCGCCTCCTTCATGGAGTATCTTCCTATGGGAGGGA
GTGTTCAAATGGTGGAGGAGACATTGAAGCTTGCCTATGGGAAAAACTCTGAATTTATCA
AAGATAAAAGGATTGCTGCTGTTCAGTCTCTCTCTGGAACTGGTGCTTGCCGACTCTTTG
CTGATTTCCAGAAACGTTTTCGTCCCGATTCCCAGATCTACATTCCTGTACCTACCTGGT
CCAATCACCACAACATCTGGAGAGATGCACAAGTCCCTCAAAAGACGTACCATTACTATC
ATCCAGAAACCAAGGGCTTGGATTTCTCAGGATTGATGGATGATGTCAAGAATGCTCCCG
AAGGCTCCTTCTTCCTTCTTCATGCTTGTGCTCACAATCCTACTGGAGTGGACCCTACTG
AGGATCAATGGAGAGAGATTTCACAGCTATTCAAGGCCAAAAACCATTTTGCGTTCTTCG
ATATGGCCTATCAAGGTTTCGCAAGTGGTGATCCAAGGAAAGATGCCAAGTCCATCAGGA
TCTTTCTCGAGGATGGTCATCATATTGGAATTTCTCAGTCTTATGCGAAAAACATGGGAC
TCTACGGCCAGAGGGTCGGATGTCTCAGCGTGCTTTGTGAAGATGAGAAGCAAGCTGTGA
CTGTGAAAAGTCAGTTGCAGCAACTAGCTAGACCAATGTACAGCAACCCACCTTTACATG
GAGCTCAAATAGTCTCAATCATTCTTGGAGATCCACAGTTAAAGAACCAGTGGCTACAGG
AAGTTAAGATCATGGCTGATCGGATAATTGGCATGAGAACTACTTTGAGAGAAAGCCTAG
AGAAGTTAGGATCGCCTCTATCATGGGAGCACGTAACCAAGCAGATTGGAATGTTTTGCT
ACAGTGGGCTAACACCAGAACAGGTTGACCGCTTAACTAGCGAGTATCACATCTATATGA
CCCGTAATGGCCGTATCAGTATGGCCGGTGTTACAACAGGAAACGTGGAATACCTTGCGA
ATGCCATACATGAAGTCACCAAGTCATCTTAAATTGTTTTAGATGTCTCAAGTGAGGGAG
ATACATTTGTTTCTTTTCGAAAGAGTTAATAAAGACAGAGGAAGCTACAATATTTGTTGT
TCCTCAATTGTTTTGATGGGGACTGAAAGTCTTATCCACAAACAGTAACTAGCAGCGCTA
TAAATTCTTGAATTATCTTTAAAACCGACCTTTAGTTGATTTCACATGTTTTGACTGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR77TF U 1
AF RR2B128TF U 1
AF RR2G659TF U 449
AF RR2B128JQ C 648
AF RR2AR77JQ C 720
BS 1 52 RR2AR77TF
BS 53 53 RR2B128TF
BS 54 180 RR2AR77TF
BS 181 181 RR2B128TF
BS 182 548 RR2AR77TF
BS 549 549 RR2B128TF
BS 550 678 RR2AR77TF
BS 679 752 RR2B128TF
BS 753 755 RR2G659TF
BS 756 756 RR2B128JQ
BS 757 759 RR2G659TF
BS 760 760 RR2B128JQ
BS 761 991 RR2G659TF
BS 992 992 RR2B128JQ
BS 993 1030 RR2G659TF
BS 1031 1031 RR2B128JQ
BS 1032 1135 RR2G659TF
BS 1136 1136 RR2B128JQ
BS 1137 1151 RR2G659TF
BS 1152 1460 RR2B128JQ
BS 1461 1499 RR2AR77JQ

RD RR2AR77TF 678 0 0
GGATGGCGATGATGGCGATGAAAATCCGTAACTCTGCTTCCTGGCGAACGACTAGCCGTC
AAATCTCCTCGGGTTTGAGATCCATGTCGTCGTGGTGGAAGAACGTGGAGCCAGCTCCCA
AAGATCCGATCCTCGGTGTCACCGAGGCTTTTCTCGCTGATCCTAGTCCCGACAAAGTTA
GCGTCGGTGTGGGAGCATATCGTGATGATAATGGGAAGCCTGTTGTCTTGGAATGTGTCC
GAGAAGCTGAGCGTAGAATCGCTGGCGCCTCCTTCATGGAGTATCTTCCTATGGGAGGGA
GTGTTCAAATGGTGGAGGAGACATTGAAGCTTGCCTATGGGAAAAACTCTGAATTTATCA
AAGATAAAAGGATTGCTGCTGTTCAGTCTCTCTCTGGAACTGGTGCTTGCCGACTCTTTG
CTGATTTCCAGAAACGTTTTCGTCCCGATTCCCAGATCTACATTCCTGTACCTACCTGGT
CCAATCACCACAACATCTGGAGAGATGCACAAGTCCCTCAAAAGACGTACCATTACTATC
ATCCAGAATCCAAGGGCTTGGATTTCTCAGGATTGATGGATGATGTCAAGAATGCTCCCG
AAGGCTCCTTCTTCCTTCTTCATGCTTGTGCTCACAATCCTACTGGAGTGGACCCTACTG
AGGATCAATGGAGAGAGA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2B128TF 752 0 0
GGATGGCGATGATGGCGATGAAAATCCGTAACTCTGCTTCCTGGCGAACGACCAGCCGTC
AGATCTCCTCGGGTTTGAGATCCATGTCGTCGTGGTGGAAGAACGTGGAGCCAGCTCCCA
AAGATCCGATCCTCGGTGTCACCGAGGCTTTTCTCGCTGATCCTAGTCCCGACAAAGTTA
ACGTCGGTGTGGGAGCATATCGTGATGATAATGGGAAGCCTGTTGTCTTGGAATGTGTCC
GAGAAGCTGAGCGTAGAATCGCTGGCGCCTCCTTCATGGAGTATCTTCCTATGGGAGGGA
GTGTTCAAATGGTGGAGGAGACATTGAAGCTTGCCTATGGGAAAAACTCTGAATTTATCA
AAGATAAAAGGATTGCTGCTGTTCAGTCTCTCTCTGGAACTGGTGCTTGCCGACTCTTTG
CTGATTTCCAGAAACGTTTTCGTCCCGATTCCCAGATCTACATTCCTGTACCTACCTGGT
CCAATCACCACAACATCTGGAGAGATGCACAAGTCCCTCAAAAGACGTACCATTACTATC
ATCCAGAAACCAAGGGCTTGGATTTCTCAGGATTGATGGATGATGTCAAGAATGCTCCCG
AAGGCTCCTTCTTCCTTCTTCATGCTTGTGCTCACAATCTTACTGGAGTGGACCCTACTG
AGGATCAATGGAGAGAGATTTCACAGCTATTCAAGGCCAAAAACCATTTTGCGTTCTTCG
ATATGGCCTATCAAGGTTTCGCAAGTGGTGAT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2G659TF 708 0 0
G
TCCCAGATCTACATTCCTGTACCTACCTGGTCCAATCACCACAACATCTGGAGAGATGCA
CAAGTCCCTCAAAAGACGTACCATTACTATCATCCAGAAACCAAGGGCTTGGACTTCTCA
GGATTGATGGATGATGTGAAGAATGCTCCCGAAGGCTCCTTCTTCCTTCTTCATGCTTGT
GCTCACAATCCTACTGGAGTAGACCCTACTGAGGATCAATGGAGAGAGATTTCACAGCTA
TTCAAGGCCAAAAACCATTTTGCCTTCTTCGATATGGCCTATCAAGTTTTCGCAAGTGGT
GATCCAGGGAGAGATGCCAAGTCCATCAGGATCTTTCTCGAGGATGGTCATCATATTGGA
ATTTCTCAGTCTTATGCGAAAAACATGGGACTCTACGGCCAGAGGGTCGGATGTCTCAGC
GTGCTTTGTGAAGATGAGAAGCAAGCTGTGACTGTGAAAAGTCAGTTGCAGCAACTAGCT
AGACCAATGTACAGCAACCCACCTTTACATGGAGCTCAAATAGTCTCAATCATTCTTGGA
GACCCACAGTTAAAGAACCAGTGGCTACAGGAAGTTAAGATAATGGCTGATCGGATAATT
GGCATGAGAACTACTTTGAGAGAAAGCCTAGAGAAGTTAGGATCGCCTCTATCATGGGAG
CACGTAACCAAGCAGATTGGAATGTTCTGCTACAGTGGGCTA
CACCA

QA 2 703 2 703
DS 

RD RR2B128JQ 813 0 0
GTG
GACCCTACTGAGGATCAATGGAGAGAGATTTCACAGCTATTCAAGGCCAAAAACCATTTT
GCGTTCTTCGATATGGCCTATCAAGGTTTCGCAAGTGGTGATCCAAGGAAAGATGCCAAG
TCCATCAGGATCTTTCTCGAGGATGGTCATCATATTGGAATTTCTCAGTCTTATGCGAAA
AACATGGGACTCTACGGCCAGAGGGTCGGATGTCTCAGCGTGCTTTGTGAAGATGAGAAG
CAAGCTGTGACTGTGAAAAGTCAGTTGCAGCAACTAGCTAGACCAATGTACAGCAACCCA
CCTTTACATGGAGCTCAAATAGTCTCAATCATTCTTGGAGATCCACAGTTAAAGAACCAG
TGGCTACAGGAAGTTAAGATCATGGCTGATCGGATAATTGGCATGAGAACTACTTTGAGA
GAAAGCCTAGAGAAGTTAGGATCGCCTCTATCATGGGAGCACGTAACCAAGCAGATTGGA
ATGTTTTGCTACAGTGGGCTAACACCAGAACAGGTTGACCGCTTAACTAGCGAGTATCAC
ATCTATATGACCCGTAATGGCCGTATCAGTATGGCCGGTGTTACAACAGGAAACGTGGAA
TACCTTGCGAATGCCATACATGAAGTCACCAAGTCATCTTAAATTGTTTTAGATGTCTCA
AGTGAGGGAGATACATTTGTTTCTTTTCGAAAGAGTTAATAAAGACAGAGGAAGCTACAA
TATTTGTTGTTCCTCAATTGTTTTGATGGGGACTGAAAGTCTTATCCACAAACAGTAACT
AGCAGCGCTATAAATTCTTGAATTATCTTT

QA 4 813 4 813
DS 

RD RR2AR77JQ 780 0 0
GATATGGCCTATCAAGGTTTCGCAAGTGGTGATCCAAGGAAAGATGCCAAGTCCATCAGG
ATCTTTCTCGAGGATGGTCATCATATTGGAATTTCTCAGTCTTATGCGAAAAACATGGGA
CTCTACGGCCAGAGGGTCGGATGTCTCAGCGTGCTTTGTGAAGATGAGAAGCAAGCTGTG
ACTGTGAAAAGTCAGTTGCAGCAACTAGCTAGACCAATGTACAGCAACCCACCTTTACAT
GGAGCTCAAATAGTCTCAATCATTCTTGGAGATCCACAGTTAAAGAATCAGTGGCTACAG
GAAGTTAAGATCATGGCTGATCGGATAATTGGCATGAGAACTACTTTGAGAGAAAGCCTA
GAGAAGTTAGGATCGCCTCTATCATGGGAGCACGTAACCAAGCAGATTGGAATGTTTTGC
TACAGTGGGCTAACACCAGAACAGGTTGACCGCTTAACTAGCGAGTATCACATCTATATG
ACCCGTAATGGCCGTATCAGTATGGCCGGTGTTACAACAGGAAACGTGGAATACCTTGCG
AATGCCATACATGAAGTCACCAAGTCATCTTAAATTGTTTTAGATGTCTCAAGTGAGGGA
GATACATTTGTTTCTTTTCGAAAGAGTTAATAAAGACAGAGGAAGCTACAATATTTGTTG
TTTCTCAATTGTTTTGATGGGGACTGAAAGTCTTATCCACAAACAGTAACTAGCAGCGCT
ATAAATTCTTGAATTATCTTTAAAACCGACCTTTAGTTGATTTCACATGTTTTGACTGCT

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 6

CO CL1292Contig1 1185 6 17 U
GGAAATGTAAAAAGTCGAGAGCAGAGAGAAAAAAGAAGTCGAGAGTTTGCCGTGGTTTCA
ATATCTCCGGTGTCCGGCGCTCCGTCGTCGGCACCGTGGGAGTTTGCTTAGTTAGCTTGT
GTCTTTAGCTATCTTGCAGGGTCCTCTTTGTGTCTTCTCAAAACGGTTTATCGATCTGGA
TTTGTCATTCATGGAGTTTCAGATCTAGATCTCAAAATTTTGTTGTTGATAGATCTGGAC
GTGGGGTTAGCTTTCTGTTTGTTTCCTGCGACTACTATGAAGATGGTGGATCTAGTCGTT
GTCTGCAGTTAGCTCTCGTCTGTCTTTTTGTTTGGCCTGTGGTCCTTCTTATACCAGTTC
TTCCTTCAGCTGCTCTCTCTTTCTTCTACCGTGTCTCTGTTCCGGTAAAGAAGGTTCGAG
AGGGTTCAATGGAGCTCGATAACTGTTTCTTCTGTTTGAAGTTGAGAGGATGTCCCCACT
AAGCTTTGTTGGGCTCAGAAATAGTTCTTGTTAGTCTTGTGCCAGCAACGGTATTAGCGG
TGGCGTCTTGGCGTGTTCGTGAGTAGAACAGGGTTAGCATCTTCGTTGTGTTGAAGTTCG
TTAAGTCACCTCTCCAATTCCTGTCGGG*AAGGAGTCCTCGTCGCATCTTTCAATAAGGA
CCGTTCCCGGTTTGCTTGCTTCTCTCTTAATTCTCAGTGGCTTTGACTTGGATGTCTGAA
GCAATATTAAGAGATCGAGGTGTTGTTTCAACTAGATGAAGATGTGGTCATGGAGGTGTT
TGTCCCGGGTGTTTCAGTTCGTTTGGTTCTAGGGTGCAGGGCTCAGTTTTGTGTGGATTC
TGGCTTGGGTGTGATGCTAATTTGCGTGGTTCGACTCTTCAGATTTTCATCGTGAATGGA
GGTTCAGATGAGTTTCGGTCTTTCATGTCCTTTTCGTCGCTTGCTCTCTTGTCTTTCAAG
TTATCCGGCTGTTTTAGGCTCTCAGATTTTTTTCTTTAGCCTTTGATCTTTAATGTTTGT
GGGAGTAGAGTTATGATCTTGCTTTTAGCCTTAGTTATCTTTAAGTTTGTTGGTAGTCGT
CTTTTGTTTGGGCTTAAGTTCCCCTTGTATGGGTTCTAGTTCCGGAGGTTTCTTGTTGTT
CCGGTGATGTATTCTATCCTGTTTCTAATATCAATCAGTTGACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 
35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR2CK53TF U 50
AF RR2GA81TF U 1
AF RR2GA81JQ C 366
AF RR2CO05JQ C 497
AF RR2CO05TF U 497
AF RR2CK53JQ C 468
BS 1 658 RR2GA81TF
BS 659 659 RR2CO05TF
BS 660 719 RR2GA81TF
BS 720 720 RR2CO05TF
BS 721 723 RR2GA81TF
BS 724 724 RR2CO05TF
BS 725 727 RR2GA81TF
BS 728 728 RR2CO05TF
BS 729 750 RR2GA81TF
BS 751 751 RR2CO05TF
BS 752 759 RR2GA81TF
BS 760 760 RR2CO05TF
BS 761 775 RR2GA81TF
BS 776 1167 RR2CO05TF
BS 1168 1168 RR2GA81JQ
BS 1169 1184 RR2CO05TF
BS 1185 1185 RR2CK53JQ

RD RR2CK53TF 430 0 0
CCGTGGTTTCAATATCTCCGGTGTCCGGCGCTCCGTCGTCGGCACCGTGGGAGTTTGCTT
AGTTAGCTTGTGTCTTTAGCTATCTTGCAGGGTCCTCTTTGTGTCTTCTCAAAACGGTTT
ATCGATCTGGATTTGTCATTCATGGAGTTTCAGATCTAGATCTCAAAATTTTGTTGTTGA
TAGATCTGGATGTGGGGTTAGCTTTCTGTTTGTTTCCTGCGACTACTATGAAGATGGTGG
ATCTAGTCGTTGTCTGCAGTTAGCTCTCGTCTGTCTTTTTGTTTGGCCTGTGGTCCTTCT
TATACCAGTTCTTCCTTCAGCTGCTCTCTCTTTCTTCTACCGTGTCTCTGTTCCGGTAAA
GAAGGTTCGAGAGGGTTCAATGGAGCTCGATAACTGTTTCTTCTGTTTGAAGTTGAGAGG
ATGTCCCCAC

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2GA81TF 781 0 0
GGAAATGTAAAAAGTCGAGAGCAGAGAGAAAAAAGAAGTCGAGAGTTTGCCGTGGTTTCA
ATATCTCCGGTGTCCGGCGCTCCGTCGTCGGCACCGTGGGAGTTTGCTTAGTTAGCTTGT
GTCTTTAGCTATCTTGCAGGGTCCTCTTTGTGTCTTCTCAAAACGGTTTATCGATCTGGA
TTTGTCATTCATGGAGTTTCAGATCTAGATCTCAAAATTTTGTTGTTGATAGATCTGGAC
GTGGGGTTAGCTTTCTGTTTGTTTCCTGCGACTACTATGAAGATGGTGGATCTAGTCGTT
GTCTGCAGTTAGCTCTCGTCTGTCTTTTTGTTTGGCCTGTGGTCCTTCTTATACCAGTTC
TTCCTTCAGCTGCTCTCTCTTTCTTCTACCGTGTCTCTGTTCCGGTAAAGAAGGTTCGAG
AGGGTTCAATGGAGCTCGATAACTGTTTCTTCTGTTTGAAGTTGAGAGGATGTCCCCACT
AAGCTTTGTTGGGCTCAGAAATAGTTCTTGTTAGTCTTGTGCCAGCAACGGTATTAGCGG
TGGCGTCTTGGCGTGTTCGTGAGTAGAACAGGGTTAGCATCTTCGTTGTGTTGAAGTTCG
TTAAGTCACCTCTCCAATTCCTGTCGGG*AAGGAGTCCTCGTCGCATCTTTCAATAAG*A
CCGTTCCCGGTTTGCTTGCTTCTCTCTTAATTCTCAGTGGCTTTGACTTGGATGTCTGA*
GCA*TAT*AAGAGATCGAGGTGTTGTTTCA*CTAGATGA*GATGTGGTCATGGAG
TGTTTG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2GA81JQ 820 0 0
TCAGCTGCTCTCTCTTTCTTCTACCGTGTCTCTGT*CCGGTAAAGAAGGTTCGAGAGGGT
TCAATGGAGCTCGATAACTGTTTCTTCTGTTTGAAGTTGAGAGGATGTCCCCACTAAGCT
TTGTTGGGCTCAGAAATAGTTCTTGTTAGTCTTGTGCCAGCAACGGTATTAGCGGTGGCG
TCTTGGCGTGTTCGTGAGTAGAACAGGGTTAGCATCTTCGTTGTGTTGAAGTTCGTTAAG
TCACCTCTCCAATTCCTGTCGGG*AAGGAGTCCTCGTCGCATCTTTCAATAAGGACCGTT
CCCGGTTTGCTTGCTTCTCTCTTAATTCTCAGTGGCTTTGACTTGGATGTCTGAAGCAAT
ATTAAGAGATCGAGGTGTTGTTTCAACTAGATGAAGATGTGGTCATGGAGGTGTTTGTCC
CGGGTGTTTCAGTTCGTTTGGTTCTAGGGTGCAGGGCTCAGTTTTGTGTGGATTCTGGCT
TGGGTGTGATGCTAATTTGCGTGGTTCGACTCTTCAGATTTTCATCGTGAATGGAGGTTC
AGATGAGTTTCGGTCTTTCATGTCCTTTTCGTCGCTTGCTCTCTTGTCTTTCAAGTTATC
CGGCTGTTTTAGGCTCTCAGACTTTTTTCTTTAGCCTTTGATCTTTAATGTTTGTGGGAG
TAGAGTTATGATCTTGCTTTTAGCCTTAGTTATCTTTAAGCTTGTTGGTAGTCGTCTTTT
GTTTGGGCTTAAGTTCCCCTTGTATGGGTTCTAGTTCCGGAGGTTTCTTGTTGTTCCGGT
GATGTATTCTATCCTGTTTCTAATATCAATCAGTTGACG
G

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2CO05JQ 688 0 0
G
GAAATAGTTCTTGTTAGTCTTGTGCCAGCAACGGTATTAGCGGTGGCGTCTTGGCGTGTT
CGTGAGTAGAACAGGGTTAGCATCTTCGTTGTGTTGAAGTTCGTTAAGTCACCTCTCCAA
TTCCTGTCGGG*AAGGAGTCCTCGTCGCATCTTTCAATAAGGACCGTTCCCGGTTTGCTT
GCTTCTCTCTTAATTCTCAGTGGCTTTGACTTGGATGTTTGAAGCAATATTAAGAGATCG
AGGTGTTGTTTCAACTAGATGAAGATGTGGTCATGGAGGTGTTTGTCCCGGGTGTTTCAG
TTCGTTTGGTTTTAGGGTGCAGGGCTCAGTTTTGTGTGGATTCTGGCTTGGGTGTGATGC
TAATTTGCGTGGTTCGACTCTTCAGATTTTCATCGTGAATGGAGGTTCAGATGAGTTTCG
GTCTTTCATGTCCTTTTCGTCGCTTGCTCTCTTGTCTTTCAAGTTATCCGGCTGTTTTAG
GCTCTCAGATTTTTTTCTTTAGCCTTTGATCTTTAATGTTTGTGGGAGTAGAGTTATGAT
CTTGCTTTTAGCCTTAGTTATCTTTAAGTTTGTTGGTAGTCGTCTTTTGTTTGGGCTTAA
GTTCCCCTTGTATGGGTTCTAGTTCCGGAGGTTTCTTGTTGTTCCGGTGATGTATTCTAT
CCTGTTTCTAATATCAATCAGTTGACG

QA 2 688 2 688
DS 

RD RR2CO05TF 688 0 0
G
GAAATAGTTCTTGTTAGTCTTGTGCCAGCAACGGTATTAGCGGTGGCGTCTTGGCGTGTT
CGTGAGTAGAACAGGGTTAGCATCTTCGTTGTGTTGAAGTTCGTTAAGTCACCTCTCCAA
TTCCTGTCGGG*AAGGAGTCCTCGTCGCATCTTTCAATAAGGACCGTTCCCGGTTTGCTT
GCTTCTCTCTTAATTCTCAGTGGCTTTGACTTGGATGTCTGAAGCAATATTAAGAGATCG
AGGTGTTGTTTCAACTAGATGAAGATGTGGTCATGGAGGTGTTTGTCCCGGGTGTTTCAG
TTCGTTTGGTTCTAGGGTGCAGGGCTCAGTTTTGTGTGGATTCTGGCTTGGGTGTGATGC
TAATTTGCGTGGTTCGACTCTTCAGATTTTCATCGTGAATGGAGGTTCAGATGAGTTTCG
GTCTTTCATGTCCTTTTCGTCGCTTGCTCTCTTGTCTTTCAAGTTATCCGGCTGTTTTAG
GCTCTCAGATTTTTTTCTTTAGCCTTTGATCTTTAATGTTTGTGGGAGTAGAGTTATGAT
CTTGCTTTTAGCCTTAGTTATCTTTAAGTTTGTTGGTAGTCGTCTTTTGTTTGGGCTTAA
GTTCCCCTTGTATGGGTTCTAGTTCCGGAGGTTTCTTGTTGTTCCGGTGATGTATTCTAT
CCTGTTTCTA*TATCAATCAGTTGACG

QA 2 688 2 688
DS 

RD RR2CK53JQ 718 0 0
GGATGTCCCCACTAAGCTTTGTTGGGCTCAGAAATAGTTCTTGTTAGTCTTGTGCCAGCA
ACGGTATTAGCGGTGGCGTCTTGGCGTGTTCGTGAGCAGAACAGGGTTAGCATCTTCGTT
GTGTTGAAGTTCGTTAAGTCACCTCTCCAATTCCTGTCGGGGAAGGAGTCCTCGTCGCAT
CTTTCAATAAGGACCGTTCCCGGTTTGCTTGCTTCTCTCTTAATTCTCAGTGGCTTTGAC
TTGGATGTCTGAAGCAATATTAAGAGATCGAGGTGTTGTTTCAACTAGATGAAGATGTGG
TCATGGAGGTGTTTGTCCCGGGTGTTTCAGTTCGTTTGGTTCTAGGGTGCAGGGCTCAGT
TTTGTGTGGATTCTGGCTTGGGTGTGATGCTAATTTGCGTGGTTCGACTCTTCAGATTTT
CATCGTGAATGGAGGTTCAGATGAGTTTCGGTCTTTCATGTCCTTTTCGTCGCTTGCTCT
CTTGTCTTTCAAGTTATCCGGCTGTTTTAGGCTCTCAGACTTTTTTCTTTAGCCTTTGAT
CTTTAATGTTTGTGGGAGTAGAGTTATGATCTTGCTTTTAGCCTTAGTTATCTTTAAGTT
TGTTGGTAGTCGTCTTTTGTTTGGGCTTAAGTTCCCCTTGTATGGGTTCTAGTTCCGGAG
GTTTCTTGTTGTTCCGGTGATGTATTCTATCCTGTTTCTAATATCAATCAGTTGACGG

QA 1 718 1 718
DS 



AS 2 6

CO CL1293Contig1 544 2 1 U
GGAGCGGCTGAGAGAGAGAAAATGGCAACACCACAAGTGAAGACTGGTCTGTTCGTTGGG
TTGAACAAAGGTCACGTCGTCACCAGACGCGTATTGGCTCCTCGTCCCAACTCTCGCAAA
GGGAAAACGAGCAAGAGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGGGAGGTTGCTGGATTT
GCTCCTTACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGCAAAGACAAGAGGGCTCTT
AAGGTCGCTAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATG
TCTAGCGTTCTCCGTAAGATGAGGTCTGGTGGTGACAAGAAGTAAAAGCATCTCAAGTCT
TCTTCTATGTTATTGGAAGCTTTGTTATTTTTATCACTCTTTTTGTTCGCTCTTGCAAAT
CTGCTTTGTGCTCAAAATACTTTTGTGTTTTGTTAGAAATATGGATTAGTGTTTGCTTCA
CTCTTTTTCTATTAAGCTTTTTAAAACTTGCTACGTTTACATCGATCGATTCACTTTTAC
CCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2AV33TF U 1
AF RR2AV33JQ C 46
BS 1 544 RR2AV33TF

RD RR2AV33TF 544 0 0
GGAGCGGCTGAGAGAGAGAAAATGGCAACACCACAAGTGAAGACTGGTCTGTTCGTTGGG
TTGAACAAAGGTCACGTCGTCACCAGACGCGTATTGGCTCCTCGTCCCAACTCTCGCAAA
GGGAAAACGAGCAAGAGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGGGAGGTTGCTGGATTT
GCTCCTTACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGCAAAGACAAGAGGGCTCTT
AAGGTCGCTAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATG
TCTAGCGTTCTCCGTAAGATGAGGTCTGGTGGTGACAAGAAGTAAAAGCATCTCAAGTCT
TCTTCTATGTTATTGGAAGCTTTGTTATTTTTATCACTCTTTTTGTTCGCTCTTGCAAAT
CTGCTTTGTGCTCAAAATACTTTTGTGTTTTGTTAGAAATATGGATTAGTGTTTGCTTCA
CTCTTTTTCTATTAAGCTTTTTAAAACTTGCTACGTTTACATCGATCGATTCACTTTTAC
CCCT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2AV33JQ 499 0 0
GGTCTGTTCGTTGGGTTGAACAAAGGTCACGTCGTCACCAGACGCGTATTGGCTCCTCGT
CCCAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGG
GAGGTTGCTGGATTTGCTCCTTACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTTTCAAGGTTGGCAAA
GACAAGAGGGCTTTTAAGGTCGCTAAGAGGAAGTTGGGTACCCCCAAGAGAGCCAAGCGA
AAGAGAGAGGAGATGTTTAGCGTTCTCCGTAAGATGAGGTCTGGTGGTGACAAGAAGTAA
AAGCATCTCAAGTTTTTTTTTATGTTATTGGAAGCTTTGTTATTTTTATCACTCTTTTTG
TTCGCTCTTGCAAATTTGCTTTGTGCTCAAAATACTTTTGTGTTTTGTTAGAAATATGGA
TTAGTGTTTGCTTCACTCTTTTTTTATTAAGCTTTTTAAAACTTGCTACGTTTACATCGA
TCGATTCACTTTTACCCCT

QA 1 499 1 499
DS 



CO CL1293Contig2 522 4 8 U
CGATCGACATAAACGTAGCAAAAGCTTAATAGAAAAAGAGTGAAGCAAACACTAATCCAT
ATTTCTAACAAAACACAAAAGTCTTTTGAGCATAAAGCAGATTTGCAAGAGCGAACAAAA
AGAGTGATAAAAATAACAAAGCTTCCAATAACATAGAAGAAGACTTGAGATGCTTTTACT
TCTTGTCACCACCAGACCTCATCTTACGGAGAACGCTAGACATCTCCTCTCTCTTTCGCT
TGGCTCTCTTGTGGGTACCCAACTTCCTCTTAGCGACCTTGAGAGCCCTCTTGTCTTTGC
CAACCTTGAGAAGCTCAGTGATTCTCTTCTCGTAAGGAGCAAATCCAGCAACCTCCCTGA
TCAGTGATCTGATGAACAATGTCCTCTTGCTCGTTTTCCCTTTGCGAGAGTTAGGACGAG
GAGCCAATTCGCGTCTGGTGACGACGTGACCCTTGTTCAAACCAACGAACAGACCAGTCT
TCACTTGAGGTGTTGCCATTTTTCTCTCTCAGCCGCTCCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR2FP09JQ U 1
AF RR2FP09TF C 1
AF RR2AJ27JQ U 34
AF RR2AJ27TF C 34
BS 1 162 RR2FP09JQ
BS 163 163 RR2AJ27JQ
BS 164 443 RR2FP09JQ
BS 444 444 RR2AJ27JQ
BS 445 451 RR2FP09JQ
BS 452 452 RR2AJ27JQ
BS 453 519 RR2FP09JQ
BS 520 522 RR2AJ27JQ

RD RR2FP09JQ 519 0 0
CGATCGACATAAACGTAGCAAAAGCTTAATAGAAAAAGAGTGAAGCAAACACTAATCCAT
ATTTCTAACAAAACACAAAAGTCTTTTGAGCATAAAGCAGATTTGCAAGAGCGAACAAAA
AGAGTGATAAAAATAACAAAGCTTCCAATAACATAGAAGAAG*CTTGAGATGCTTTTACT
TCTTGTCACCACCAGACCTCATCTTACGGAGAACGCTAGACATCTCCTCTCTCTTTCGCT
TGGCTCTCTTGTGGGTACCCAACTTCCTCTTAGCGACCTTGAGAGCCCTCTTGTCTTTGC
CAACCTTGAGAAGCTCAGTGATTCTCTTCTCGTAAGGAGCAAATCCAGCAACCTCCCTGA
TCAGTGATCTGATGAACAATGTCCTCTTGCTCGTTTTCCCTTTGCGAGAGTTAGGACGAG
GAGCCAATTCGCGTCTGGTGACGGCGTGACCTTTGTTCAAACCAACGAACAGACCAGTCT
TCACTTGAGGTGTTGCCATTTTTCTCTCTCAGCCGCTCC

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2FP09TF 519 0 0
CGATCGACATAAACGTAGC
AAAAGCTTAATAGAAAAAGAGTGAAGCAAACACTAATCCATATTTCTAACAAAACACAAA
AGTCTTTTGAGCATAAAGCAGATTTGCAAGAGCGAACAAAAAGAGTGATAAAAATAACAA
AGCTTCCAATAACATAGAAGAAG*CTTGAGATGCTTTTACTTCTTGTCACCACCAGACCT
CATCTTACGGAGAACGCTAGACATCTCCTCTCTCTTTCGCTTGGCTCTCTTGTGGGTACC
CAACTTCCTCTTAGCGACCTTGAGAGCCCTCTTGTCTTTGCCAACCTTGAGAAGCTCAGT
GATTCTCTTCTCGTAAGGAGCAAATCCAGCAACCTCCCTGATCAGTGATCTGATGAACAA
TGTCCTCTTGCTCGTTTTCCCTTTGCGAGAGTTAGGACGAGGAGCCAATTCGCGTCTGGT
GACGGCGTGACCTTTGTTCAAACCAACGAACAGACCAGTCTTCACTTGAGGTGTTGCCAT
TTTTCTCTCTCAGCCGCTCC

QA 20 519 20 519
DS 

RD RR2AJ27JQ 489 0 0
AAAAGAGTGAAGCAA*CAGTAATCCATATTTCTAACAGAACACAAAGGTCTTTTGAGCAT
AAAGCAGATTTGCAAGAGCGAACAAAAAGAGTGATAAAAATAACAACGCTTCCAATAACA
TAGAAGAAGACTTGAGATGCTTTTACTTCTTGTCACCACCAGACCTCATCTTACGGAGAA
CGCTAGACATCTCCTCTCTCTTTCGCTTGGCTCTCTTGTGGGTACCCAACTTCCTCTTAG
CGACCTTGAGAGCCCTCTTGTCTTTGCCAACCTTGAGAAGCTCAGTGATTCTCTTCTCGT
AAGGAGCAAATCCAGCAACCTCCCTTATCAGTGATCTGATGAACAATGTCCTCTTGCTCG
TTTTCCCTTTGCGAGAGTTGGGACGAGGAGCCAATTCGCGTCTGGTGACGACGTGACCCT
TGTTCAGACCAACGAACAGACCAGTCTTCACTTGAGGTGTTGCCATTTTTCTCTCTCAGC
CGCTCCCCT

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2AJ27TF 489 0 0
AAAAGAGTGAAGCAA*CAGTAATCCATATTTCTAACAGAACACAAAGGTCTTTTGAGCAT
AAAGCAGATTTGCAAGAGCGAACAAAAAGAGTGATAAAAATAACAACGCTTCCAATAACA
TAGAAGAAGACTTGAGATGCTTTTACTTCTTGTCACCACCAGACCTCATCTTACGGAGAA
CGCTAGACATCTCCTCTCTCTTTCGCTTGGCTCTCTTGTGGGTACCCAACTTCCTCTTAG
CGACCTTGAGAGCCCTCTTGTCTTTGCCAACCTTGAGAAGCTCAGTGATTCTCTTCTCGT
AAGGAGCAAATCCAGCAACCTCCCTTATCAGTGATCTGATGAACAATGTCCTCTTGCTCG
TTTTCCCTTTGCGAGAGTTGGGACGAGGAGCCAATTCGCGTCTGGTGACGACGTGACCCT
TGTTCAGACCAACGAACAGACCAGTCTTCACTTGAGGTGTTGCCATTTTTCTCTCTCAGC
CGCTCC
CCT

QA 1 486 1 486
DS 



AS 2 5

CO CL1294Contig1 563 2 2 U
GACACTCGGACGTCATGGACGACAACATCCACATGGAACCATGCGCAGCTGATGATTCTG
TTGATGGCCAACACAACTCATGGCGTCCCGGTCATATTCTTGACTTCAGCGATTTATCCA
TAGGGGATCCCATCTTCGATTTGATACCAATACACTTGGACGTGTTCAGAGGAGACACTG
ATCTTTTCAAGAAGCTTCTAGAGAGCTACGGCCTTCCTTTAATCAGAAGTAAATCGGCGG
CAGCAGACGGTACGAGGAAGAAAGTACTGTCTCCTTCCTACCGCACAATGTGTTATTGTT
TATTGCATGAAGACAATGTGTTGGGTGCAATGTTCAGTATCTGGGATGAACTTCGGACAG
CTGAATCATGGGAACAGGTTGAACTCACTGTTTGGAGTCTGCTCAACTCGTACTAGTCTC
TTTCCAACCAATAATTTATATTACACATCACCAAACTAAATGTGTCTAAAATAAATCAAT
GCTGTAAAATCACGTTTTGTGTGTAGAACAAGAACATGAAATCTCTTTGTTTTTGGTAAT
GCAAATGAAAAAAAAATGGTCAC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GA19JQ C 1
AF RR2GA19TF U 1
BS 1 1 RR2GA19JQ
BS 2 563 RR2GA19TF

RD RR2GA19JQ 563 0 0
GACACTCGGACGTCATGGACGACAACATCCACATGGAACCATGCGCAGCTGATGATTCTG
TTGATGGCCAACACAACTCATGGCGTCCCGGTCATATTCTTGACTTCAGCGATTTATCCA
TAGGGGATCCCATCTTCGATTTGATACCAATACACTTGGACGTGTTCAGAGGAGACACTG
ATCTTTTCAAGAAGCTTCTAGAGAGCTACGGCCTTCCTTTAATCAGAAGTAAATCGGCGG
CAGCAGACGGTACGAGGAAGAAAGTACTGTCTCCTTCCTACCGCACAATGTGTTATTGTT
TATTGCATGAAGACAATGTGTTGGGTGCAATGTTCAGTATCTGGGATGAACTTCGGACAG
CTGAATCATGGGAACAGGTTGAACTCACTGTTTGGAGTCTGCTCAACTCGTACTAGTCTC
TTTCCAACCAATAATTTATATTACACATCACCAAACTAAATGTGTCTAAAATAAATCAAT
GCTGTAAAATCACGTTTTGTGTGTAGAACAAGAACATGAAATCTCTTTGTTTTTGGTAAT
GCAAATGAAAAAAAAATGGTCAC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2GA19TF 563 0 0
G
ACACTCGGACGTCATGGACGACAACATCCACATGGAACCATGCGCAGCTGATGATTCTGT
TGATGGCCAACACAACTCATGGCGTCCCGGTCATATTCTTGACTTCAGCGATTTATCCAT
AGGGGATCCCATCTTCGATTTGATACCAATACACTTGGACGTGTTCAGAGGAGACACTGA
TCTTTTCAAGAAGCTTCTAGAGAGCTACGGCCTTCCTTTAATCAGAAGTAAATCGGCGGC
AGCAGACGGTACGAGGAAGAAAGTACTGTCTCCTTCCTACCGCACAATGTGTTATTGTTT
ATTGCATGAAGACAATGTGTTGGGTGCAATGTTCAGTATCTGGGATGAACTTCGGACAGC
TGAATCATGGGAACAGGTTGAACTCACTGTTTGGAGTCTGCTCAACTCGTACTAGTCTCT
TTCCAACCAATAATTTATATTACACATCACCAAACTAAATGTGTCTAAAATAAATCAATG
CTGTAAAATCACGTTTTGTGTGTAGAACAAGAACATGAAATCTCTTTGTTTTTGGTAATG
CAAATGAAAAAAAAATGGTCAC

QA 2 563 2 563
DS 



CO CL1294Contig2 861 3 33 U
GCACACGTCCTGAGTTATTAAATGCAAACGATGTTCATGAGGAGTTGAAGATTCCACCAG
AATGGAAAGTCTTTGTCGATGATCTATGCCAAAAGAAGAAGGACGTCACTAGTCGTCTGG
AAAACTGGGGAAATCCTATCCCTAAGGCTTTGATGAACAAAATAGACGAATACATGCCTG
ATGAGTTCTTTGTAGAATTGCTCCATGTTTTCAAGGACACAGATGTTGGAGATGAAACCA
AGCCCTGCACCTGGATACACTCGGACGTCATGGACGACAACATCCACATGGAACCATACG
CAGATGATGGTTCCGTTGATGGTCTACACAACTCATGGCGTCCCGGTCATATTCTTGACT
TCAGCGATTTATCCATAGGGGATCCCATCTACGACTTGATACCAATTCACTTGGACGTGT
TCAGAGGAGACACTGATCTTTTCAATAAGCTTCTAGAAGGCTACGGCCTTCCTTTAATCA
GAAGTAAATCGGCGGCAGCAGACAGTACGACGAAGAAAGTACTGTCTCCTTCCTACCGCA
CAATGTGTTATTGTTTATTGCATGAAGACAATGTGTTGGGTGCAATGTTTAGTATCTGGG
ATGAACTTCGGACAGCTGAATCGTGGGAACAGGTTGAACTCACTGTTTGGAGTCTACTCA
ACTCGTACTAATCTCTTTCCAACCAATAATTTATATTACACATCACCAAACTAAATGTGT
CTAAAATAAATCAATGGTGTAAAAGAACTTTATAATCACGTTTTGTTTGTAGAAGAAAGC
TACAAGAACATTAAATCTCTTGTAAACAATGAGAATGTGAAAACGAAATGGTAACATGTT
TGCCTTTCCAGGGTTAGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H333TF U 1
AF RR2D620TF U 34
AF RR2D620JQ C 201
BS 1 58 RR2H333TF
BS 59 59 RR2D620TF
BS 60 196 RR2H333TF
BS 197 197 RR2D620TF
BS 198 309 RR2H333TF
BS 310 310 RR2D620TF
BS 311 313 RR2H333TF
BS 314 314 RR2D620TF
BS 315 324 RR2H333TF
BS 325 325 RR2D620TF
BS 326 373 RR2H333TF
BS 374 374 RR2D620TF
BS 375 406 RR2H333TF
BS 407 407 RR2D620TF
BS 408 445 RR2H333TF
BS 446 446 RR2D620TF
BS 447 458 RR2H333TF
BS 459 459 RR2D620TF
BS 460 475 RR2H333TF
BS 476 476 RR2D620TF
BS 477 510 RR2H333TF
BS 511 511 RR2D620TF
BS 512 589 RR2H333TF
BS 590 590 RR2D620TF
BS 591 610 RR2H333TF
BS 611 611 RR2D620TF
BS 612 620 RR2H333TF
BS 621 621 RR2D620TF
BS 622 622 RR2H333TF
BS 623 623 RR2D620TF
BS 624 632 RR2H333TF
BS 633 686 RR2D620TF
BS 687 861 RR2D620JQ

RD RR2H333TF 636 0 0
GCACACGTCCTGAGTTATTAAATGCAAACGATGTTCATGAGGAGTTGAAGATTCCACCTG
AATGGAAAGTCTTTGTCGATGATCTATGCCAAAAGAAGAAGGACGTCACTAGTCGTCTGG
AAAACTGGGGAAATCCTATCCCTAAGGCTTTGATGAACAAAATAGACGAATACATGCCTG
ATGAGTTCTTTGTAGATTTGCTCCATGTTTTCAAGGACACAGATGTTGGAGATGAAACCA
AGCCCTGCACCTGGATACACTCGGACGTCATGGACGACAACATCCACATGGAACCATACG
CAGATGATGATTCTGTTGATGGTCAACACAACTCATGGCGTCCCGGTCATATTCTTGACT
TCAGCGATTTATCAATAGGGGATCCCATCTACGACTTGATACCAATACACTTGGACGTGT
TCAGAGGAGACACTGATCTTTTCAAGAAGCTTCTAGAAAGCTACGGCCTTCCTTTGATCA
GAAGTAAATCGGCGGCAGCAGACAGTACGAGGAAGAAAGTACTGTCTCCTTCCTACCGCA
CAATGTGTTATTGTTTATTGCATGAAGACAATGTGTTGGGTGCAATGTTCAGTATCTGGG
ATGAACTTCG*ACAGCTGAAACATGGGAACAG
TTGA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2D620TF 653 0 0
GG
CATGAGGAGTTGAAGATTCCACCAGAATGGAAAGTCTTTGTCGATGATCTGTTCCAAAAG
AAGAAGGACGTCACTAGTCGTCTGGAAAACTGGGGAAATCCTATCCCTAAGGCTTTGATG
AACAAAATAGACGAATACATGCCTGATGAGTTCTTTGTGGAATTGCTCCATGTTTTCAAG
GACACAGATGTTGGAGATGAAACCAAGCCCTGCACCTGGATACACTCGGACGTCATGGAC
GACAACATCCACATGGAACCATACGCAGATGATGGTTCCGTTGATGGTCTACACAACTCA
TGGCGTCCCGGTCATATTCTTGACTTCAGCGATTTATCCATAGGGGATCCCATCTACGAC
TTGATACCAATTCACTTGGACGTGTTCAGAGGAGACACTGATCTTTTCAATAAGCTTCTA
GAAGGCTACGGCCTTCCTTTAATCAGAAGTAAATCGGCGGCAGCAGACAGTACGACGAAG
AAAGTACTGTCTCCTTCCTACCGCACAATGTGTTATTGTTTATTGCATGAAGACAATGTG
TTGGGTGCAATGTTTAGTATCTGGGATGAACTTCGGACAGCTGAATCGTGGGAACAGGTT
GAACTCACTGTTTGGAGTCTACTCAACTCGTACTAATCTCTTTCCAACCAA

QA 3 653 3 653
DS 

RD RR2D620JQ 661 0 0
CTCCATGTTTTCAAGGACACAGATGTTGGAGATGAAACCAAGCCCTGCACCTGGATACAC
TCGGACGTCATGGACGACAACATCCACATGGAACCATACGCAGATGATGGTTCCGTTGAT
GGTCTACACAACTCATGGCGTCCCGGTCATATTCTTGACTTCAGCGATTTATCCATAGGG
GATCCCATCTACGACTTGATACCAATTCACTTGGACGTGTTCAGAGGAGACACTGATCTT
TTCAATAAGCTTCTAGAAGGCTACGGCCTTCCTTTAATCAGAAGTAAATCGGCGGCAGCA
GACAGTACGACGAAGAAAGTACTGTCTCCTTCCTACCGCACAATGTGTTATTGTTTATTG
CATGAAGACAATGTGTTGGGTGCAATGTTTAGTATCTGGGATGAACTTCGGACAGCTGAA
TCGTGGGAACAGGTTGAACTCACTGTTTGGAGTCTACTCAACTCGTACTAATCTCTTTCC
AACCAATAATTTATATTACACATCACCAAACTAAATGTGTCTAAAATAAATCAATGGTGT
AAAAGAACTTTATAATCACGTTTTGTTTGTAGAAGAAAGCTACAAGAACATTAAATCTCT
TGTAAACAATGAGAATGTGAAAACGAAATGGTAACATGTTTGCCTTTCCAGGGTTAGTGA
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 2 4

CO CL1295Contig1 667 2 4 U
AAATAAGAGTACAAAAACATAAGACAAACTGATTCAACTTTCAAATATTTTTGTTCTTTT
GACCTTTTTATGCCGAACTGCAAGTGCAGCGAAAGAGTCGTTGAATAAGAAGAAAGAATA
AACTAAGTAAAAAGCTAAAGTCTCTGCATTTAAAAGCAGAGAAGCTTTCTTTCGAGAGTA
AACACATTATTCGACATTTCATTCTTATTTCATCCTTTTAATCATCACCTTTCTCTTTCA
AGTTTTCTCCCAAGTCTTTTCCTCAAACAAAATGTTGTTCCATCATCATCATCATACCGC
CTTTTGTTGCAACTCAGCAGCACTAACACCAACAGCTTCATCAGGTATAAACCTTCCCCA
GAACCAGTGTGCCTTCCACACTCTGTTCATCTCTTCGATTGGTACATTCTTCGTCTCAGG
CAACATCAAGTAGATGAATATCGTCATTATGAAGACAAACACCGCAAAGAAGAAGAATAG
TCCAAATTTCACGTGACAGAGCATTGTGAGGAAGAGCTGAGCTACAAGGAATGTGAAGAA
CATGTTGACCGCTACGTTAATGGCTTGTGCTGCTGATCGGATCTCTAGAGGAGATATCTC
ACTAGGTACCAGCCATCCCAACGGTCCCCATGACCAGGCGAAACCCGCTACATAGATGCA
GATCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM68JQ U 1
AF RR2F218JQ U 101
BS 1 491 RR2AM68JQ
BS 492 492 RR2F218JQ
BS 493 515 RR2AM68JQ
BS 516 667 RR2F218JQ

RD RR2AM68JQ 515 0 0
AAATAAGAGTACAAAAACATAAGACAAACTGATTCAACTTTCAAATATTTTTGTTCTTTT
GACCTTTTTATGCCGAACTGCAAGTGCAGCGAAAGAGTCGTTGAATAAGAAGAAAGAATA
AACTAAGTAAAAAGCTAAAGTCTCTGCATTTAAAAGCAGAGAAGCTTTCTTTCGAGAGTA
AACACATTATTCGACATTTCATTCTTATTTCATCCTTTTAATCATCACCTTTCTCTTTCA
AGTTTTCTCCCAAGTCTTTTCCTCAAACAAAATGTTGTTCCATCATCATCATCATACCGC
CTTTTGTTGCAACTCAGCAGCACTAACACCAACAGCTTCATCAGGTATAAACCTTCCCCA
GAACCAGTGTGCCTTCCACACTCTGTTCATCTCTTCGATTGGTACATTCTTCGTCTCAGG
CAACATCAAGTAGATGAATATCGTCATTATGAAGACAAACACCGCAAAGAAGAAGAATAG
TCCAAATTTCATGTGACAGAGCATTGTGAGGAAGA

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2F218JQ 567 0 0
TTGAATAAGAAGAAAGAATAAACTAAGTAAAAAGCTAAAGTCTCTGCATTTAAAAGCAGA
GAAGCTTTCTTTCGAGAGTAAACACATTATTCGACATTTCATTCTTATTTCATCCTTTTA
ATCATCACCTTTCTCTTTCAAGTTTTCTCCCAAGTCTTTTCCTCAAACAAAATGTTGTTC
CATCATCATCATCATACCGCCTTTTGTTGCAACTCAGCAGCACTAACACCAACAGCTTCA
TCAGGTATAAACCTTCCCCAGAACCAGTGTGCCTTCCACACTCTGTTCATCTCTTCGATT
GGTACATTCTTCGTCTCAGGCAACATCAAGTAGATGAATATCGTCATTATGAAGACAAAC
ACCGCAAAGAAGAAGAATAGTCCAAATTTCACGTGACAGAGCATTGTGAGGAAGAGCTGA
GCTACAAGGAATGTGAAGAACATGTTGACCGCTACGTTAATGGCTTGTGCTGCTGATCGG
ATCTCTAGAGGAGATATCTCACTAGGTACCAGCCATCCCAACGGTCCCCATGACCAGGCG
AAACCCGCTACATAGATGCAGATCAGT

QA 1 567 1 567
DS 



CO CL1295Contig2 1157 2 4 U
ACTTTCAAATGTTTTTGTTTTCTTGACTTTCTTTAGGCCGAAACTACAAGTGCAACAAAG
ATTCGTTGAATAAGAAGAAAGAATAAACTAAGTGATAAGCTGAAGTCTCTGCGTTAAAAA
GCAGAGAAGCTTTCTTTTAAGAATAAACACATTATTCGACATTTCATTCTTATTTCATCC
TTTTAATCATCACCTTTCTCTTTTCAAGTTTTCTCTCAAGTCTTTTGCTCAAAGAAAATG
TTGTTCCATCATCATCATACCGCCTTTTGTTGCAACTCAGCAGCACTTACACCAACGGCT
TCATCAGGTATAAACCTTCCCCAGAACCAGTGTGCCTTCCACACTCTGTTCATCTCTTCG
ATTGGTACATTCTTCGTCTCAGGCAACATCAAGTAGATGAATATCGTCATTATGAAGACA
AACACCGCAAAGAAGAAGAATAGTCCGAATTTCATGTGGCAGAACATTGTGAGGAAGAGC
TGAGCTACAAGGAATGTGAAGAACATGATGACCGCTACGTTTATGGCCTGTGCTGCTGAT
CGGATCTCTAGAGGAGATATCTCACTAGGTACCAGCCATCCCAACGGTCCCCATGACCAG
GCGAAACCCGCTACATAGATGCAGATCAGTGCCACGATTACATTAGCATCTGTTTTCCCT
ATGTTCCCTGTTCCTGCTGTTCCAAATTTGACTCCAATCATGATTCCAATAGCGATCTGA
GAGATAAGCATCTGGATACCTCCCTGGAGGAACAAGATTCTTCTTCCGAACCTATCAACT
GTGAAAACAGCGACGAAGGTAGACAAGAGCTCGATGATACCCGTTACCATAGCTGATAAG
AGCGAGGCTTTATTACCGAACCCTAAGGTTTGGAACAGAACGGGTGCGTAAAATGTAATG
ACATTGATTCCTGTAAGCTGTTGGAAGAAAGGAATGGAGCAAGTCATGATCAACTGTGGT
CTGTAACGTGGAAGCAAGATGTTCTTCCACGGATGTTTCACTTGCTTAGACTCCTCACTT
GCATCAATGAGATCTTGAAACGCTTCTTCGACTTCATCGGTTCCTCGGATAGATCGAAGC
ATTTCCTTGGCCTCTTCAGCGAAGCCACGTTCGATGAGGGAGTTTGGAGTGTCAGGAAGG
ACCAGAGCTCCGATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB71JQ U 1
AF RR2CP67TF C 451
BS 1 507 RR2HB71JQ
BS 508 508 RR2CP67TF
BS 509 705 RR2HB71JQ
BS 706 1157 RR2CP67TF

RD RR2HB71JQ 705 0 0
ACTTTCAAATGTTTTTGTTTTCTTGACTTTCTTTAGGCCGAAACTACAAGTGCAACAAAG
ATTCGTTGAATAAGAAGAAAGAATAAACTAAGTGATAAGCTGAAGTCTCTGCGTTAAAAA
GCAGAGAAGCTTTCTTTTAAGAATAAACACATTATTCGACATTTCATTCTTATTTCATCC
TTTTAATCATCACCTTTCTCTTTTCAAGTTTTCTCTCAAGTCTTTTGCTCAAAGAAAATG
TTGTTCCATCATCATCATACCGCCTTTTGTTGCAACTCAGCAGCACTTACACCAACGGCT
TCATCAGGTATAAACCTTCCCCAGAACCAGTGTGCCTTCCACACTCTGTTCATCTCTTCG
ATTGGTACATTCTTCGTCTCAGGCAACATCAAGTAGATGAATATCGTCATTATGAAGACA
AACACCGCAAAGAAGAAGAATAGTCCGAATTTCATGTGGCAGAACATTGTGAGGAAGAGC
TGAGCTACAAGGAATGTGAAGAACATGTTGACCGCTACGTTTATGGCCTGTGCTGCTGAT
CGGATCTCTAGAGGAGATATCTCACTAGGTACCAGCCATCCCAACGGTCCCCATGACCAG
GCGAAACCCGCTACATAGATGCAGATCAGTGCCACGATTACATTAGCATCTGTTTTCCCT
ATGTTCCCTGTTCCTGCTGTTCCAAATTTGACTCCAATCATGATT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2CP67TF 707 0 0
TTCATGTGGCAGAGCATTGTGAGGAAGAGCTGAGCTACAAGGAATGTGAAGAACATGATG
ACCGCTACGTTTATGGC*TGTGCTGCTGATCGGATCTCTAGAGGAGATATCTCACTAGGT
ACCAGCCATCCCAACGGTCCCCATGACCAGGCGAAACCCGCTACATAGATGCAGATCAGT
GCCACGATTACATTAGCATCTGTTTTCCCTATGTTCCCTGTTCCTGCTGTTCCAAATTTG
ACTCCAATCATGATTCCAATAGCGATCTGAGAGATAAGCATCTGGATACCTCCCTGGAGG
AACAAGATTCTTCTTCCGAACCTATCAACTGTGAAAACAGCGACGAAGGTAGACAAGAGC
TCGATGATACCCGTTACCATAGCTGATAAGAGCGAGGCTTTATTACCGAACCCTAAGGTT
TGGAACAGAACGGGTGCGTAAAATGTAATGACATTGATTCCTGTAAGCTGTTGGAAGAAA
GGAATGGAGCAAGTCATGATCAACTGTGGTCTGTAACGTGGAAGCAAGATGTTCTTCCAC
GGATGTTTCACTTGCTTAGACTCCTCACTTGCATCAATGAGATCTTGAAACGCTTCTTCG
ACTTCATCGGTTCCTCGGATAGATCGAAGCATTTCCTTGGCCTCTTCAGCGAAGCCACGT
TCGATGAGGGAGTTTGGAGTGTCAGGAAGGACCAGAGCTCCGATCAC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 2 6

CO CL1296Contig1 803 2 2 U
AATAAACACGGTTTGTACTTCGATAAAAAGAGAACTAAACAGAGGCAATTTAAAAGAGAA
ATCATAATTTCATAGTTGGACTACAATACTTTTTGAACAACTACATAACTGAACCGGGAA
ATCGCAAACTAAACCAATCAAAACCAGAAAGATGGATATGATATAGTGCGATATTATCAC
TGTTACAACCATAGAACAAGCCGAACAAGAGAACACACATTAGTGGCAGAAGATGACTTT
GAGCTCTCTAGGAGAAGAACAGTCATGCATAAGCGAAGGACTGTCATGAGCAAAAGTCAT
AGTCGAAGGGCACGCGTGCTTAAAGAACAGAGAGTGGGTCGAAGCACGACACGTCTGAGG
ACTATTGTAATGATTCCTACAACACAACTCGTCCGTACGGAACGCCTCGCACCCGCTCTT
ACATGCCACCACGTGTCCACCGCGTCCCGACCTGAGCTGAAGATGAGCCGGACACGTTTT
CAAGAGGTCTTCACGGCAGCCAACGACGGGACAAACACCACGGCCTTCGTGAGGAGTCAC
AGTCATCGGGACGTTGAAACCGTCGACGAGGGAGACACCGTAGGAGGATAAGTCTTGGTG
TCCACCGTGGTGGAGATCGAACTGAGCGAGAGAAGCCGGGGTTGCGCCGCCGAGACCGTT
GCACTCGAGACGGTTTCCGCAGTCTCCGGTGACGCAGGAGAATTTGCCGTTGTAGTGGGA
GCAGCCGGTTCGACCCCAGATGCGACCGGACCAGTGGGTGGTTGGTGCGGAGAAGAGCGG
TGGGTGTTGGTTGGGAGAGCGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E375JQ U 1
AF RR2FW80JQ U 52
BS 1 563 RR2E375JQ
BS 564 803 RR2FW80JQ

RD RR2E375JQ 563 0 0
AATAAACACGGTTTGTACTTCGATAAAAAGAGAACTAAACAGAGGCAATTTAAAAGAGAA
ATCATAATTTCATAGTTGGACTACAATACTTTTTGAACAACTACATAACTGAACCGGGAA
ATCGCAAACTAAACCAATCAAAACCAGAAAGATGGATATGATATAGTGCGATATTATCAC
TGTTACAACCATAGAACAAGCCGAACAAGAGAACACACATTAGTGGCAGAAGATGACTTT
GAGCTCTCTAGGAGAAGAACAGTCATGCATAAGCGAAGGACTGTCATGAGCAAAAGTCAT
AGTCGAAGGGCACGCGTGCTTAAAGAACAGAGAGTGGGTCGAAGCACGACACGTCTGAGG
ACTATTGTAATGATTCCTACAACACAACTCGTCCGTACGGAACGCCTCGCACCCGCTCTT
ACATGCCACCACGTGTCCACCGCGTCCCGACCTGAGCTGAAGATGAGCCGGACACGTTTT
CAAGAGGTCTTCACGGCAGCCAACGACGGGACAAACACCACGGCCTTCGTGAGGAGTCAC
AGTCATCGGGACGTTGAAACCGT

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2FW80JQ 752 0 0
AAAAGAGAAATCA
TAATTTCATAGTTGGACTACAATACTTTTTGAACAACTACATAACTGAACCGGGAAATCG
CAAACTAAACCAATCAAAACCAGAAAGATGGATATGATATAGTGCGATATTATCACTGTT
ACAACCATAGAACAAGCCGAACAAGAGAACACACATTAGTGGCAGAAGATGACTTTGAGC
TCTCTAGGAGAAGAACAGTCATGCATAAGCGAAGGACTGTCATGAGCAAAAGTCATAGTC
GAAGGGCACGCGTGCTTAAAGAACAGAGAGTGGGTCGAAGCACGACACGTCTGAGGACTA
TTGTAATGATTCCTACAACACAACTCGTCCGTACGGAACGCCTCGCACCCGCTCTTACAT
GCCACCACGTGTCCACCGTGTCCCGACCTGAGCTGAAGATGAGCCGGACACGTTTTCAAG
AGGTCTTCACGGCAGCCAACGACGGGACAAACACCACGGCCTTCGTGAGGAGTCACAGTC
ATCGGGACGTTGAAACCGTCGACGAGGGAGACACCGTAGGAGGATAAGTCTTGGTGTCCA
CCGTGGTGGAGATCGAACTGAGCGAGAGAAGCCGGGGTTGCGCCGCCGAGACCGTTGCAC
TCGAGACGGTTTCCGCAGTCTCCGGTGACGCAGGAGAATTTGCCGTTGTAGTGGGAGCAG
CCGGTTCGACCCCAGATGCGACCGGACCAGTGGGTGGTTGGTGCGGAGAAGAGCGGTGGG
TGTTGGTTGGGAGAGCGAA

QA 14 752 14 752
DS 



CO CL1296Contig2 971 4 17 U
GGGATACAACAGAGTTCCAAAAAAGCAAAAAG*AAAAAAGAACACAATGGCTTCTAGAGC
CTCTCTTCCTCTCGCCGCCTCCTTCCTCCTCCTTCTCATCTCTTCCTCCTTCGCTGCTGA
CACAGGCCGTCTCTTTCTCACCGTCGTCAACCACTGTCCCTTCACCGTCTGGCCAGCCAT
TCAGCCCAACGCCGGCCACCCCGTCCTCGAGAAAGGTGGCTTCGCTCTCCCAACCAACAC
CCACCGCTCCTTCTCCGCACCAACCACCCACTGGTCCGGTCGCATCTGGGGTCGAACCGG
CTGCTCCCACTACAACGGCAAATTCTCCTGCGTCACCGGAGACTGCGGAAACCGTCTCGA
GTGCAACGGTCTCGGCGGCGCAACCCCGGCTTCTCTCGCTCAGTTCGACCTCCACCACGG
TGGACACCAAGACTTATCCTCCTACGGTGTCTCCCTCGTCGACGGTTTCAACGTTCCGAT
GACTGTGACTCCTCACGAAGGCCGTGGTGTTTGTCCCGTCGTCGGCTGCCGTGAAGACCT
CTTGAAAACGTGCCCGGCTCATCTTCAGCTCCGGTCGGGACACGGTGGACACGTGGTGGC
ATGTAAGAGTGGGTGTGAGGCGTTCCGTACGGACGAGCTGTGTTGTAGGAATCATTACAA
TAGTCCTCAGACGTGTCGTGCTTCGACCCACTCTCTGTTCTTTAAGCACGCGTGCCCTTC
GACTATGACTTTTGCTCATGACAGTCCTTCGCTTATGCATGACTGTTCTTCTCCTAGAGA
GCTCAAAGTCATCTTCTGTCACTAATGTGTTTCTCTTGTTCGGCTTGTTCTATATGGTTG
TACTAGTGATATCGCACCGATCTCATATCTATCTTTCTGGTTTTGATTGGTTTAGTTTGC
GATTTCCCGGTTCAGTTATGTAGTTTTTTCAAAAAGTATTGTAGTCCAACTATGAAATTA
CGAATTATGTT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW80TF U 1
AF RR2E375TF U 2
AF RR2GL24TF U 3
AF RR2GL24JQ C 462
BS 1 210 RR2FW80TF
BS 211 211 RR2E375TF
BS 212 408 RR2FW80TF
BS 409 409 RR2E375TF
BS 410 474 RR2FW80TF
BS 475 475 RR2GL24TF
BS 476 522 RR2FW80TF
BS 523 523 RR2GL24TF
BS 524 552 RR2FW80TF
BS 553 553 RR2GL24TF
BS 554 569 RR2FW80TF
BS 570 584 RR2GL24TF
BS 585 585 RR2GL24JQ
BS 586 619 RR2GL24TF
BS 620 620 RR2GL24JQ
BS 621 631 RR2GL24TF
BS 632 971 RR2GL24JQ

RD RR2FW80TF 569 0 0
GGGATACAACAGAGTTCCAAAAAAGCAAAAAG*AAAAAAGAACACAATGGCTTCTAGAGC
CTCTCTTCCTCTCGCCGCCTCCTTCCTCCTCCTTCTCATCTCTTCCTCCTTCGCTGCTGA
CACAGGCCGTCTCTTTCTCACCGTCGTCAACCACTGTCCCTTCACCGTCTGGCCAGCCAT
TCAGCCCAACGCCGGCCACCCCGTCCTCGACAAAGGTGGCTTCGCTCTCCCAACCAACAC
CCACCGCTCCTTCTCCGCACCAACCACCCACTGGTCCGGTCGCATCTGGGGTCGAACCGG
CTGCTCCCACTACAACGGCAAATTCTCCTGCGTCACCGGAGACTGCGGAAACCGTCTCGA
GTGCAACGGTCTCGGCGGCGCAACCCCGGCTTCTCTCGCTCAGTTCGATCTCCACCACGG
TGGACACCAAGACTTATCCTCCTACGGTGTCTCCCTCGTCGACGGTTTCAACGTCCCGAT
GACTGTGACTCCTCACGAAGGCCGTGGTGTTTGTCCCGTCGTTGGCTGCCGTGAAGACCT
CTTGAAAACGTGTCCGGCTCATCTTCAGC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2E375TF 568 0 0
G
GATACAACAGAGTTCCAAAAAAGCAAAAAG*AAAAAAGAACACAATGGCTTCTAGAGCCT
CTCTTCCTCTCGCCGCCTCCTTCCTCCTCCTTCTCATCTCTTCCTCCTTCGCTGCTGACA
CAGGCCGTCTCTTTCTCACCGTCGTCAACCACTGTCCCTTCACCGTCTGGCCAGCCATTC
AGCCCAACGCCGGCCACCCCGTCCTCGAGAAAGGTGGCTTCGCTCTCCCAACCAACACCC
ACCGCTCCTTCTCCGCACCAACCACCCACTGGTCCGGTCGCATCTGGGGTCGAACCGGCT
GCTCCCACTACAACGGCAAATTCTCCTGCGTCACCGGAGACTGCGGAAACCGTCTCGAGT
GCAACGGTCTCGGCGGCGCAACCCCGGCTTCTCTCGCTCAGTTCGACCTCCACCACGGTG
GACACCAAGACTTATCCTCCTACGGTGTCTCCCTCGTCGACGGTTTCAACGTCCCGATGA
CTGTGACTCCTCACGAAGGCCGTGGTGTTTGTCCCGTCGTTGGCTGCCGTGAAGACCTCT
TGAAAACGTGTCCGGCTCATCTTCAGC

QA 2 568 2 568
DS 

RD RR2GL24TF 637 0 0
GATACAACAGAGTTCCAAAAAAGCAAAAAGCAAAAAAGAACACAATGGCTTCTAGAGCCT
CTCTTCCTCTCGCCGCCTCCTTCCTCCTCCTTCTCATCTCTTCCTCCTTCGCCGCTGACA
CCGGCCGTCTCTTTCTCACCGTCGTCAACCACTGCCCCTTCACCGTCTGGCCAGCCATTC
AGCCCAACGCCGGCCACCCCGTTCTCGAGAAAGGTGGCTTCGCTCTCC*AACCAACACCC
ACCGCTCCTTCTCCGCACCAACCTCCCACTGGTCCGGTCGCATCTGGGGTCGAACCGGCT
GCTCCCACTACAACGGCAAATTCTCCTGCGTCACCGGAGACTGCGGAAACCGTCTCGAGT
GCAACGGTCTCGGCGGCGCAACTCCGGCTTCTCTCGCTCAGTTCGACCTCCACCACGGTG
GACACCAAGACTTATCCTCCTACGGTGTCTCCCTCGTCGACGGTTTCAACGTTCCGATGA
CTGTGACTCCTCACGAAGGCCGTGGTGTTTGTCCCGTCGTCGGCTGCCGTGAAGACCTCT
TGAAAACGTGCCCGGCTCATCTTCAGCTCCGGTCGGGACACG*TGGACACGTGGTGGCAT
GTAAGAGTGGGTGTGAG*CGTTCCGTACG
ACGAGCTG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2GL24JQ 510 0 0
ACGGTTTCAACGTTCCGATGACTGTGACTCCTCACGAAGGCCGTGGTGTTTGTCCCGTCG
TCGGCTGCCGTGAAGACCTCTTGAAAACGTGCCCGGCTCATCTTCAGCTCCGGTCGGGAC
ACGGTGGACACGTGGTGGCATGTAAGAGTGGGTGTGAGGCGTTCCGTACGGACGAGCTGT
GTTGTAGGAATCATTACAATAGTCCTCAGACGTGTCGTGCTTCGACCCACTCTCTGTTCT
TTAAGCACGCGTGCCCTTCGACTATGACTTTTGCTCATGACAGTCCTTCGCTTATGCATG
ACTGTTCTTCTCCTAGAGAGCTCAAAGTCATCTTCTGTCACTAATGTGTTTCTCTTGTTC
GGCTTGTTCTATATGGTTGTACTAGTGATATCGCACCGATCTCATATCTATCTTTCTGGT
TTTGATTGGTTTAGTTTGCGATTTCCCGGTTCAGTTATGTAGTTTTTTCAAAAAGTATTG
TAGTCCAACTATGAAATTACGAATTATGTT

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 6

CO CL1297Contig1 804 6 4 U
GAGCCAACTCAAGCTATGTTTCCAGGTTATGAACTCTAAATAAAAAGTCACTGTAGCAAC
AATCTTAGATACTGAATGTTATATAAGTATTTATACAATGAAACACAAAAGGTAATGTCT
TGATAATCAAAAAAGCTTTAAAAGGAAACACCATCAAATCTTGAAACATCCTATCGAATC
AATGAAGGGACACTCATTTTAGTAAGGAGGGTTCTTGTAATCATCACGAGCACGAGAGTA
GCAGACGTAGTAGAACTGAGAGACGATAGCAGTGAAGAGCGCAAACGAAGCACCGGCAGC
AAACACTCCTTTACGGATCACTTCACAGCTAGGAGGGGCATCGATGTTCCACATCTTCCT
GTACTTAGTGTGGTACGCGTTTCTGATCGATGCAGCGAGCAAACAAATCTCAGCAATCAA
GAAAAACGCCCAGCAAATGAGGAAGAGCATGATGGCACAAGCTCTTGAACCACCAGGGTT
GAGAGACTTCCCACAGCAGAAGCAGCGACTAGCCACCATTATAATGACTTGACTGGTCAA
GAGAAGGACAAAAGCACCAGCTCCATAACTAGTAGCTATGTCTGAGCCATACTCACAGTA
CTCATACACCTTCTCCTTGTCCGGTACAACCTTACCGACGCTTCGTCTTTGCTCGGCGGC
AATGGCTAAACCGACGGCGATTAGATCTAGTATGAACACAATGATTATCACCAGCTTTGA
AGCCATTTTGGATTCTCTCTCACAAGCAGCAGGTTTTTTGTTTCTGGTGATTTCTCTTTC
CCTGCAAGCTGTTCTCTTTAAAAA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G853JQ U 282
AF RR2E086JQ U 1
AF RR2E086TF C 2
AF RR2G853TF C 191
AF RR2D253JQ U 55
AF RR2D253TF C 513
BS 1 348 RR2E086JQ
BS 349 349 RR2D253JQ
BS 350 659 RR2E086JQ
BS 660 804 RR2D253JQ

RD RR2G853JQ 264 0 0
CG
AACGAAGCACCGGCAGCAAACACACCTTTACGGATCACTTCACAGCTAGGAGGGGCATCG
ATGTTCCACATCTTCCTGTACTTAGTGTGGTACGCGTTTCTGATCGATGCAGCGAGCAAA
CAAATCTCAGCAATCAAGAAAAACGCCCAGCAAATGAGGAAGAACATGATGGCACAAGCT
CTTGAACCACCAGGGTTGAAAGACTTCCCACAGCAGAAGCAGCGACTAGCCACCATTATA
ATGACTTGACTGGTCAAGAGAA

QA 3 264 3 264
DS 

RD RR2E086JQ 659 0 0
GAGCCAACTCAAGCTATGTTTCCAGGTTATGAACTCTAAATAAAAAGTCACTGTAGCAAC
AATCTTAGATACTGAATGTTATATAAGTATTTATACAATGAAACACAAAAGGTAATGTCT
TGATAATCAAAAAAGCTTTAAAAGGAAACACCATCAAATCTTGAAACATCCTATCGAATC
AATGAAGGGACACTCATTTTAGTAAGGAGGGTTCTTGTAATCATCACGAGCACGAGAGTA
GCAGACGTAGTAGAACTGAGAGACGATAGCAGTGAAGAGCGCAAACGAAGCACCGGCAGC
AAACACTCCTTTACGGATCACTTCACAGCTAGGAGGGGCATCGATGTTTCACATCTTCCT
GTACTTAGTGTGGTACGCGTTTCTGATCGATGCAGCGAGCAAACAAATCTCAGCAATCAA
GAAAAACGCCCAGCAAATGAGGAAGAGCATGATGGCACAAGCTCTTGAACCACCAGGGTT
GAGAGACTTCCCACAGCAGAAGCAGCGACTAGCCACCATTATAATGACTTGACTGGTCAA
GAGAAGGACAAAAGCACCAGCTCCATAACTAGTAGCTATGTCTGAGCCATACTCACAGTA
CTCATACACCTTCTCCTTGTCCGGTACAACCTTACCGACGCTTCGTCTTTGCTCGGCGG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2E086TF 776 0 0
AGCCAACTCAAGCTATGTTTCCAGGTTATGAACTCTAAATAAAAAGTCACTGTAGCAACA
ATCTTAGATACTGAATGTTATATAAGTATTTATACAATGAAACACAAAAGGTAATGTCTT
GATAATCAAAAAAGCTTTAAAAGGAAACACCATCAAATCTTGAAACATCCTATCGAATCA
ATGAAGGGACACTCATTTTAGTAAGGAGGGTTCTTGTAATCATCACGAGCACGAGAGTAG
CAGACGTAGTAGAACTGAGAGACGATAGCAGTGAAGAGCGCAAACGAAGCACCGGCAGCA
AACACTCCTTTACGGATCACTTCACAGCTAGGAGGGGCATCGATGTTTCACATCTTCCTG
TACTTAGTGTGGTACGCGTTTCTGATCGATGCAGCGAGCAAACAAATCTCAGCAATCAAG
AAAAACGCCCAGCAAATGAGGAAGAGCATGATGGCACAAGCTCTTGAACCACCAGGGTTG
AGAGACTTCCCACAGCAGAAGCAGCGACTAGCCACCATTATAATGACTTGACTGGTCAAG
AGAAGGACAAAAGCACCAGCTCCATAACTAGTAGCTATGTCTGAGCCATACTCACAGTAC
TCATACACCTTCTCCTTGTCCGGTACAACCTTACCGACGCTTCGTCTTTGCTCGGCGGCA
ATGGCTAAACCGACGGCGATTAGATCTAGTATGAACACAATGATTATCACCAGCTTTGAA
GCCATTTTGGATTCTCTCTCACAAGCAGCAGGTTTTTTGTTTCTGGTGATTTC
CCC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2G853TF 575 0 0
CACTCATTTTAGTAAGGTGGGTTCTTGTAATCATCACGAGCACGAGAGTAGCAGACATAG
TAGAACTGAGAGACGATGGCAGTGGAGAGCGCGAACGAAGCACCGGCAGCAAACACACCT
TTACGGATCACTTCACAGCTAGGAGGGGCATCGATGTTCCACATCTTCCTGTACTTAGTG
TGGTACGCGTTTCTGATCGATGCAGCGAGCAAACAAATCTCAGCAATCAAGAAAAACGCC
CAGCAAATGAGGAAGAGCATGATGGCACAAGCTCTTGAACCACCAGGGTTGAGAGACTTC
CCACAGCAGAAGCAGCGACTAGCCACCATTATAATGACTTGACTGGTCAAGAGAAGGACA
AAAGCACCAGCTCCATAACTAGTAGCTATGTCTGAGCCATACTCACAGTACTCATACACC
TTCTCCTTGTCCGGTACAACCTTACCGACGCTTCGTCTTTGCTCGGCGGCAATGGCTAAA
CCGACGGCGATTAGATCTAGTATGAACACAATGATTATCACCAGCTTTGAAGCCATTTTG
GATTCTCTCTCACAAGCAGCAGGTTTTTTGTTTC
C

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2D253JQ 750 0 0
AGCAACAATCTTAGATACTGAATGTTATATAAGTATTTATACAATGAAACACAAAAGGTA
ATGTCTTGATAATCAAAAAAGCTTTAAAAGGAAACACCATCAAATCTTGAAACATCCTAT
CGAATCAATGAAGGGACACTCATTTTAGTAAGGAGGGTTCTTGTAATCATCACGAGCACG
AGAGTAGCAGACGTAGTAGAACTGAGAGACGATAGCAGTGAAGAGCGCAAACGAAGCACC
GGCAGCAAACACTCCTTTACGGATCACTTCACAGCTAGGAGGGGCATCGATGTTCCACAT
CTTCCTGTACTTAGTGTGGTACGCGTTTCTGATCGATGCAGCGAGCAAACAAATCCCAGC
AATCAAGAAAAACGCCCAGCAAATGAGGAAGAGCATGATGGCACAAGCTCTTGAACCACC
AGGGTTGAGAGACTTCCCACAGCAGAAGCAGCGACTAGCCACCATTATAATGACTTGACT
GGTCAAGAGAAGGACAAAAGCACCAGCTCCATAACTAGTAGCTATGTCTGAGCCATACTC
ACAGTACTCATACACCTTCTCCTTGTCCGGTACAACCTTACCGACGCTTCGTCTTTGCTC
GGCGGCAATGGCTAAACCGACGGCGATTAGATCTAGTATGAACACAATGATTATCACCAG
CTTTGAAGCCATTTTGGATTCTCTCTCACAAGCAGCAGGTTTTTTGTTTCTGGTGATTTC
TCTTTCCCTGCAAGCTGTTCTCTTTAAAAA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2D253TF 292 0 0
CCACCATTATAATGACTTGACTGGTCAAGAGAAGGACAAAAGCACCAGCTCCATAACTAG
TAGCTATGTCTGAGCCATACTCACAGTACTCATACACCTTCTCCTTGTCCGGTACAACCT
TACCGACGCTTCGTCTTTGCTCGGCGGCAATGGCTAAACCGACGGCGATTAGATCTAGTA
TGAACACAATGATTATCACCAGCTTTGAAGCCATTTTGGATTCTCTCTCACAAGCAGCAG
GTTTTTTGTTTCTGGTGATTTCTCTTTCCCTGCAAGCTGTTCTCTTTAAAAA

QA 1 292 1 292
DS 



AS 3 6

CO CL1298Contig1 674 2 1 U
ACATAATCCCTTTTTCATCTAAGTGAAATGAGTTCGTTATTGTTACACCTCGAAAACAAG
AAGCAAACGTCTTAAAGATCTTCAGAAAAGAATGAAACTAAACACTTTGGTAAGAAAGAA
ACATAAAAAAGATAGTAGTAGTAGTTTAACAGTTCCAATGCCAAGCCAATACAATGTCCA
TTAAAGCCGGACTTATACCCTCCTTCATCAATCTCTTATACTCCGCCGTATCTCCACCGC
TCTTCTTCATCACCACCATGTGGAAGCTTGGCGCAATCTCAAACACCTCCGCTTCCACCC
CTGCACCTTCTTTTCTACCTTCCATCTTCACCGTCCATCCTTCTTCCTTTTTCTTCACTT
TCATCTTAAGTTCCCTCCCAACCTCCACCAGCTTCTCCGTGATCTCTGACGCCTCTCGGT
TGGACGTAAACCTCATCTCCTCCTTCTCTTCACCTTTCTCAAACAGTCCCGAGAGGTCAA
ACCCGGTGGACAGCGAAATGATCTCAAAAGCATTCAGGTTGATACACTGCTTCTTTGCCT
TGTCACAGTCCTCATGCACCGTTGGCTCTGTTGGCTCTGCGTCGTCTGTCTCTGCATCAT
CAGCATCGTCTTTCTCCTTTCCTAGGCCTTTCCTGAACCAAGAACTCTGCATGATCTTTT
CAGTAGATATCCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO84JQ U 1
AF RR2GI87JQB U 1
BS 1 674 RR2GI87JQB

RD RR2GO84JQ 643 0 0
ACATAATCCCTTTTTCATCTAAGTGAAATGAGTTCGTTATTGTTACACCTCGAAAACAAG
AAGCAAACGTCTTAAAGATCTTCAGAAAAGAATGAAACTAAACACTTTGGTAAGAAAGAA
ACATAAAAAAGATAGTAGTAGTAGTTTAACAGTTCCAATGCCAAGCCAATACAATGTCCA
TTAAAGCCGGACTTATACCCTCCTTCATCAATCTCTTATACTCCGCCGTATCTCCACCGC
TCTTCTTCATCACCACCATGTGGAAGCTTGGCGCAATCTCAAACACCTCCGCTTCCACCC
CTGCACCTTCTTTTCTACCTTCCATCTTCACCGTCCATCCTTCTTCCTTTTTCTTCACTT
TCATCTTAAGTTCCCTCCCAACCTCCACCAGCTTCTCCGTGATCTCTGACGCCTCTCGGT
TGGACGTAAACCTCATCTCCTCCTTCTCTTCACCTTTCTCAAACAGTCCCGAGAGGTCAA
ACCCGGTGGACAGCGAAATGATCTCAAAAGCATTCAGGTTGATACACTGCTTCTTTGCCT
TGTCACAGTCCTCATGCACCGTTGGCTCTGTTGGCTCTGCGTCGTCTGTCTCTGCATCAT
CAGCATCGTCTTTCTCCTTTCCTAGGCCTTTCCTGAACCAAGA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2GI87JQB 674 0 0
ACATAATCCCTTTTTCATCTAAGTGAAATGAGTTCGTTATTGTTACACCTCGAAAACAAG
AAGCAAACGTCTTAAAGATCTTCAGAAAAGAATGAAACTAAACACTTTGGTAAGAAAGAA
ACATAAAAAAGATAGTAGTAGTAGTTTAACAGTTCCAATGCCAAGCCAATACAATGTCCA
TTAAAGCCGGACTTATACCCTCCTTCATCAATCTCTTATACTCCGCCGTATCTCCACCGC
TCTTCTTCATCACCACCATGTGGAAGCTTGGCGCAATCTCAAACACCTCCGCTTCCACCC
CTGCACCTTCTTTTCTACCTTCCATCTTCACCGTCCATCCTTCTTCCTTTTTCTTCACTT
TCATCTTAAGTTCCCTCCCAACCTCCACCAGCTTCTCCGTGATCTCTGACGCCTCTCGGT
TGGACGTAAACCTCATCTCCTCCTTCTCTTCACCTTTCTCAAACAGTCCCGAGAGGTCAA
ACCCGGTGGACAGCGAAATGATCTCAAAAGCATTCAGGTTGATACACTGCTTCTTTGCCT
TGTCACAGTCCTCATGCACCGTTGGCTCTGTTGGCTCTGCGTCGTCTGTCTCTGCATCAT
CAGCATCGTCTTTCTCCTTTCCTAGGCCTTTCCTGAACCAAGAACTCTGCATGATCTTTT
CAGTAGATATCCTC

QA 1 674 1 674
DS 



CO CL1298Contig2 743 2 1 U
GGGTGTGTCTTATCATTTGTGGCAAGCAGGTCCCCCTCTCTCTCTCTCTCGCATCTCTTC
CGCGCTTCATTTTTTCTTTTGTAACTTATCTCTTCCGTGCTTCATTAAGGAGGGTTTTGA
AACAAATGCAGAAACATGTATTTGAAAGCTGAACAGCAGTGCTCTACTACTAGTACTGCT
TTACACCTCCCTTCCCCTCCCTTTTTCTTCTCCACCCTCATCCCTCATCATCCCTGCTGT
CCCTCTCAGAATGTTCGAATCAACGCCTCGTGGAAGCATGTTCTATGCGTGGACGGTTGA
CTCTCTTCTTGCTTCTTGACACCACCCCCGTCCCATTTTTTTCATTTCTTTTCCTTTTTC
TTTTTTTAGTTGTATATTTGTAGCTCTTTATTACCCCTATTGCTCTTAGCATTACTAGTA
GTGAAACTAAATCCTATGGAGAAGAAAGGGACAGTGCTGATGCTCCGTTACGAAGTCGGC
AAGTTACTTGGCCAGGGTACCTTTGCCAAGGTCTATCATGCCAGGAATCTCATTTCTGGT
GATGGTGTCGCTGTTAAAGTCATCGATAAAGATAAAATCGTCAATGTTACTGGTATGACC
GACCAGATCAAGCGTGAGATCTCTGTCATGAGACTCCTGTCACACCCAAACATCGTCCAC
CTCCATGAAGTCATGGCCACTAAATCTAAAATCTACTTCGTCATGGAGCACGTTAAGGCG
GTGAGCTTTTCACCAAGTCTCCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO84TF U 1
AF RR2GI87TF U 1
BS 1 743 RR2GI87TF

RD RR2GO84TF 711 0 0
GGGTGTGTCTTATCATTTGTGGCAAGCAGGTCCCCCTCTCTCTCTCTCTCGCATCTCTTC
CGCGCTTCATTTTTTCTTTTGTAACTTATCTCTTCCGTGCTTCATTAAGGAGGGTTTTGA
AACAAATGCAGAAACATGTATTTGAAAGCTGAACAGCAGTGCTCTACTACTAGTACTGCT
TTACACCTCCCTTCCCCTCCCTTTTTCTTCTCCACCCTCATCCCTCATCATCCCTGCTGT
CCCTCTCAGAATGTTCGAATCAACGCCTCGTGGAAGCATGTTCTATGCGTGGACGGTTGA
CTCTCTTCTTGCTTCTTGACACCACCCCCGTCCCATTTTTTTCATTTCTTTTCCTTTTTC
TTTTTTTAGTTGTATATTTGTAGCTCTTTATTACCCCTATTGCTCTTAGCATTACTAGTA
GTGAAACTAAATCCTATGGAGAAGAAAGGGACAGTGCTGATGCTCCGTTACGAAGTCGGC
AAGTTACTTGGCCAGGGTACCTTTGCCAAGGTCTATCATGCCAGGAATCTCATTTCTGGT
GATGGTGTCGCTGTTAAAGTCATCGATAAAGATAAAATCGTCAATGTTACTGGTATGACC
GACCAGATCAAGCGTGAGATCTCTGTCATGAGACTCCTGTCACACCCAAACATCGTCCAC
CTCCATGAAGTCATGGCCACTAAATCTAAAATCTACTTCGTCATGGAGCAC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2GI87TF 743 0 0
GGGTGTGTCTTATCATTTGTGGCAAGCAGGTCCCCCTCTCTCTCTCTCTCGCATCTCTTC
CGCGCTTCATTTTTTCTTTTGTAACTTATCTCTTCCGTGCTTCATTAAGGAGGGTTTTGA
AACAAATGCAGAAACATGTATTTGAAAGCTGAACAGCAGTGCTCTACTACTAGTACTGCT
TTACACCTCCCTTCCCCTCCCTTTTTCTTCTCCACCCTCATCCCTCATCATCCCTGCTGT
CCCTCTCAGAATGTTCGAATCAACGCCTCGTGGAAGCATGTTCTATGCGTGGACGGTTGA
CTCTCTTCTTGCTTCTTGACACCACCCCCGTCCCATTTTTTTCATTTCTTTTCCTTTTTC
TTTTTTTAGTTGTATATTTGTAGCTCTTTATTACCCCTATTGCTCTTAGCATTACTAGTA
GTGAAACTAAATCCTATGGAGAAGAAAGGGACAGTGCTGATGCTCCGTTACGAAGTCGGC
AAGTTACTTGGCCAGGGTACCTTTGCCAAGGTCTATCATGCCAGGAATCTCATTTCTGGT
GATGGTGTCGCTGTTAAAGTCATCGATAAAGATAAAATCGTCAATGTTACTGGTATGACC
GACCAGATCAAGCGTGAGATCTCTGTCATGAGACTCCTGTCACACCCAAACATCGTCCAC
CTCCATGAAGTCATGGCCACTAAATCTAAAATCTACTTCGTCATGGAGCACGTTAAGGCG
GTGAGCTTTTCACCAAGTCTCCG

QA 1 743 1 743
DS 



CO CL1298Contig3 1187 2 2 U
GCTCCATGAAGTCATGGCCACTAAATCCAAAATCTACTTCGTCATGGAGCACGTTAAGGG
CGGTGAGCTTTTCAACCAAGTCTCCGCCGGCAAGCTCAAGGAAGGCGTCGCCAGAAAGTA
CTTCCAACAGCTTGTCCGCGCCGTACACTACTGCCACACCCTCGGAGTTTGCCACAGGGA
CTTGAAGCCTGAGAATCTTCTCTTGGATGAACATGGGAATCTCAAAGTCTCTGATTTTGG
ATTCAGCGCTCTTGCTGACTCTAGACGCCAAGATGGCTTGCTCCACACCACCTGTGGGAC
CCCTGCTTTGCACCTGAGGTTATGAGCAGGAATGGGTATGACGGGTTTAAAGCCGATGTG
TGGTCTTGTGGTGTCGTTCTTTACGTGCTCCTTGCTGGTTATCTCCCTTTCCGTGACTCC
AACCTCATTGACTTGTATAAGAAGATTGGTAAAGCTGAGTTCAAGTTCCCCAACTGGTTT
GCTCCCGGGGCAAGGAGATTGCTCAAGAAGATCTTGGATCCTAACCCCAACACGAGGATA
TCTACTGAGAAGATCATGCAGAGTTCTTGGTTCAGGAAAGGCCTAGAAAAGGAGAAAGAC
GATGCTGATGATGCAGAGACCGACGACGCAGAGCCAACAGAGCCAACGGTGCATGAGGAC
TGTGACAAAGCAAAGAAGCAGTGTATCAACCTGAATGCTTTTGAGATAATTTCGCTGTCC
ACCGGGTTTGATCTCTCGGGACTGTTTGAGAAAGGCGAAGAGAAGGAGGAGATGAGGTTT
ACGTCCAACCGAGAGGCGTCAGAGATCACGGAGAAGCTGGTGGAGGTTGGGAGGGAACTT
AAGATGAAAGTGAAGAAGAAGGAAGAAGGATGGAGGGTGAAGATGGAAGGTAAAAAAGAG
GGTGCAGGGGTGGAAGCGGAGGTGTTTGAGATTGCGCCAAGCTTCCACATGGTGGTGATG
AAGAAGAACGGTGGAGATACGGCGGAGTATAAGAGATTGATGAAGGAGAGTATAAGGCCG
GCTTTGATGGACATTGCATTGGCTTGGCATTGAAACTGTTAAACTACTACTATCTTTTTT
TTATGTTTCTTTCGTACTAAAATGTTTAGTTTCGTTCTTGATTCTGACGATCTTTAAGAC
GTTTGTTTCTTGTTTTCGAGGTGTAACAATAATAAACTCATTTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT75TF U 1
AF RR2GT75JQB C 459
BS 1 571 RR2GT75TF
BS 572 1187 RR2GT75JQB

RD RR2GT75TF 571 0 0
GCTCCATGAAGTCATGGCCACTAAATCCAAAATCTACTTCGTCATGGAGCACGTTAAGGG
CGGTGAGCTTTTCAACCAAGTCTCCGCCGGCAAGCTCAAGGAAGGCGTCGCCAGAAAGTA
CTTCCAACAGCTTGTCCGCGCCGTACACTACTGCCACACCCTCGGAGTTTGCCACAGGGA
CTTGAAGCCTGAGAATCTTCTCTTGGATGAACATGGGAATCTCAAAGTCTCTGATTTTGG
ATTCAGCGCTCTTGCTGACTCTAGACGCCAAGATGGCTTGCTCCACACCACCTGTGGGAC
CCCTGCTTTGCACCTGAGGTTATGAGCAGGAATGGGTATGACGGGTTTAAAGCCGATGTG
TGGTCTTGTGGTGTCGTTCTTTACGTGCTCCTTGCTGGTTATCTCCCTTTCCGTGACTCC
AACCTCATTGACTTGTATAAGAAGATTGGTAAAGCTGAGTTCAAGTTCCCCAACTGGTTT
GCTCCCGGGGCAAGGAGATTGCTCAAGAAGATCTTGGATCCTAACCCCAACACGAGGATA
TCTACTGAGAAGATCATGCAGAGTTCTTGGT

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2GT75JQB 729 0 0
GTTCAAGTTCCCCAACTGGTTTGCTCCCGGGGCAAGGAGATTGCTCAAGAAGATCTTGGA
TCCTAACCCCAACACGAGGATATCTACTGAGAAGATCATGCAGAGTTCTTGGTTCAGGAA
AGGCCTAGAAAAGGAGAAAGACGATGCTGATGATGCAGAGACCGACGACGCAGAGCCAAC
AGAGCCAACGGTGCATGAGGACTGTGACAAAGCAAAGAAGCAGTGTATCAACCTGAATGC
TTTTGAGATAATTTCGCTGTCCACCGGGTTTGATCTCTCGGGACTGTTTGAGAAAGGCGA
AGAGAAGGAGGAGATGAGGTTTACGTCCAACCGAGAGGCGTCAGAGATCACGGAGAAGCT
GGTGGAGGTTGGGAGGGAACTTAAGATGAAAGTGAAGAAGAAGGAAGAAGGATGGAGGGT
GAAGATGGAAGGTAAAAAAGAGGGTGCAGGGGTGGAAGCGGAGGTGTTTGAGATTGCGCC
AAGCTTCCACATGGTGGTGATGAAGAAGAACGGTGGAGATACGGCGGAGTATAAGAGATT
GATGAAGGAGAGTATAAGGCCGGCTTTGATGGACATTGCATTGGCTTGGCATTGAAACTG
TTAAACTACTACTATCTTTTTTTTATGTTTCTTTCGTACTAAAATGTTTAGTTTCGTTCT
TGATTCTGACGATCTTTAAGACGTTTGTTTCTTGTTTTCGAGGTGTAACAATAATAAACT
CATTTCACG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 4

CO CL1299Contig1 901 4 12 U
AGTGCCACGAGTTTCGAATAAACCAATCTAAAGTCAGAAACCAAAATGGATGTAAACCAA
TAGAAACACGACAACATAAAAAGAGGAGTTTTAAGCAATTCTGTCACAAAAGAGCAGTTG
TTAAATCCCAAATGGAAAACAAAACTCTACGATTCAAAGGTTGCAAGGACTCTAGAAGAT
ATCAAAACACTAGTAACAGAGTAAGCACCCAGTGGAGACAGAGGTGGGGTGAAGAAGAGC
ATCTCTCACTTGAAGCACTTGGCGTCCAAAAGGGCCTCACCTTCAAAAGGCTCGGCATCT
TCAATCATCTGGCTAACACGCTCTTTCTGTGCTTCGTCAGAGATATCAACTTTGGTCCAT
TCGTAGAGCTCCATGTCGTAAACCTCATCCATAATGAATTTGGGGATTTCTGGTCCACGG
AACAGCCACAAACCCTTCACCTTGAAAGGAGCCTCTGACCCGCAAATGAGCATCTTCCCA
AAGGCATACTTACGTGCCAAGTCCATTCGCTGGAGGAACCCACCAACCTTGTTCAGTGTA
ACAAACGAAACCATGTTCTCGTCATTGTACTTGTAGTCACAGAACCATAGTGAGTATTCC
TCTGGATCGTACATGTCCCAGAATCCTTTGATTGCAACCTCACGGAAGTTGGACTTGGTG
TTGGAGTAAAGCCTCTTCCACTCATCAAGAACCATTGGGCTAGGAGGTAGCAAATCAAGA
GGATTCTTGGCTTTGGGCTTTGGTGCTTCTTCCTCCTCAGCAAACTTGGGTGCCTCTGCT
GCAGGGGCAGGCTTCTTAGGCTCCTCCTTGGGCTGTGCAGCTTTCTTAGAAGTAACAGGA
GGGACAGCATCGGTCTGCTTGGCATCACCAATGACCTTCTTGAAGTTGGGTTGGTTGACC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2D291JQ U 1
AF RR2EC39JQ U 49
AF RR2EV59JQ U 95
AF RR2EV59TF C 154
BS 1 177 RR2D291JQ
BS 178 178 RR2EC39JQ
BS 179 236 RR2D291JQ
BS 237 237 RR2EC39JQ
BS 238 341 RR2D291JQ
BS 342 342 RR2EC39JQ
BS 343 574 RR2D291JQ
BS 575 597 RR2EC39JQ
BS 598 598 RR2EV59JQ
BS 599 672 RR2EC39JQ
BS 673 699 RR2EV59JQ
BS 700 901 RR2EV59TF

RD RR2D291JQ 574 0 0
AGTGCCACGAGTTTCGAATAAACCAATCTAAAGTCAGAAACCAAAATGGATGTAAACCAA
TAGAAACACGACAACATAAAAAGAGGAGTTTTAAGCAATTCTGTCACAAAAGAGCAGTTG
TTAAATCCCAAATGGAAAACAAAACTCTACGATTCAAAGGTTGCAAGGACTCTAGAAAAT
ATCAAAACACTAGTAACAGAGTAAGCACCCAGTGGAGACAGAGGTGGGGTGAAGAAAAGC
ATCTCTCACTTGAAGCACTTGGCGTCCAAAAGGGCCTCACCTTCAAAAGGCTCGGCATCT
TCAATCATCTGGCTAACACGCTCTTTCTGTGCTTCGTCAGAAATATCAACTTTGGTCCAT
TCGTAGAGCTCCATGTCGTAAACCTCATCCATAATGAATTTGGGGATTTCTGGTCCACGG
AACAGCCACAAACCCTTCACCTTGAAAGGAGCCTCTGACCCGCAAATGAGCATCTTCCCA
AAGGCATACTTACGTGCCAAGTCCATTCGCTGGAGGAACCCACCAACCTTGTTCAGTGTA
ACAAACGAAACCATGTTCTCGTCATTGTACTTGT

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2EC39JQ 624 0 0
GATGTAAACCAATAGAAACACGACAACATAGAAAGAGGAGTTTTAAGCAATTCTGTCACA
AAAGAGCAGTTGTTAAATCCCAAATGGAAAACAAAACTCTACGATTCAGAGGTTGCAAGG
ACTCTAGAAGATATCAAAACACTAGTAACAGAGTAAGCACCCAGTGGAGACAGAGGTGGG
GTGAAGAAGAGCATCTCTCACTTGAAGCACTTGGCGTCCAAAAGGGCCTCACCTTCAAAA
GGCTCGGCATCTTCAATCATCTGGCTAACACGCTCTTTCTGTGCTTCGTCAGAGATATCA
ACTTTGGTCCATTCGTAGAGCTCCATGTCGTAAACCTCATCCATAATGAATTTGGGGATT
TCTGGTCCACGGAACAGCCACAAACCCTTCACCTTGAAAGGAGCCTCTGACCCGCAAATG
AGCATCTTCCCAAAGGCATACTTACGTGCCAAGTCCATTCGCTGGGGGAACCCACCAACC
TTGTTCAGTGTAACAAACGAAACCATGTTCTCGTCATTGTACTTGTAGTCACAGAACCAT
AGTGAGTATCCCTCTGGATCGTACATGTCCCAGAATCCTTTGATTGCAACCTCACGGAAG
TTGGACTTGGTGTTGGAGTAAAGC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2EV59JQ 605 0 0
GCAATTCTGTCACAAAAGAGCAGTTGTTAAATCCCAAGTGGAAAACAAAACTCTACGATT
CAAAGGTTGCAAGGACTCTAGAAGATATCAAAACACTAGTAACAGAGTAAGCACCCAGTG
GAGACAGAGGTGGGGTGAAGAAGAGCATCTCTCACTTGAAGCACTTGGCGTCCAAAAGGG
CCTCACCTTCAAAAGGCTCGGCATCTTCAATCATCTGGCTAACACGCTCTTTCTGTGCTT
CGTCAGAAATATCAACTTTGGTCCATTCGTAGAGCTCCATGTCGTAAACCTCATCCATAA
TGAATTTGGGGATTTCTGGTCCACGGAACAGCCACAAACCCTTCACCTTGAAAGGAGCCT
CTGACCCGCAAATGAGCATCTTCCCAAAGGCATACTTACGTGCCAAGTCCATTCGCTGGA
GGAACCCACCAACCTTGTTCAGTGTAACAAACGAAACCATGTTCTCGTCATTGTACTTGT
AGTCACAGAACCATAGTGAGTATTCCTCTGGATCGTACATGTCCCAGAATCCTTTGATTG
CAACCTCACGGAAGTTGGACTTGGTGTTGGAGTAAAGCCTCTTCCACTCATCAAGAACCA
TTGGG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2EV59TF 748 0 0
TCAG
AGGTTGCAAGGACTCTAGAAGATATCAAAACACTAGTAACAGAGTAAGCACCCAGTGGAG
ACAGAGGTGGGGTGAAGAAGAGCATCTCTCACTTGAAGCACTTGGCGTCCAAAAGGGCCT
CACTTTCAAAAGGCTCGGCATCTTCAATCATCTGGCTAACACGCTCTTTCTGTGCTTCGT
CAGAGATATCAACTTTGGTCCATTCGTAGAGCTCCATGTCGTAGACCTCATCCATAATGA
ATTTGGGGATTTCTGGTCCACGGAACAGCCACAAACCCTTCACCTTGAAAGGAGCCTCTG
ACCCGCAAATGAGCATCTTCCCAAAGGCATACTTACGTGCCAAGTCCATTCGCTGGAGGA
ACCCACCAACCTTGTTCAGTGTAACAAACGAAACCATGTTCTCGTCATTGTACTTGTAGT
CACAGAACCATAGTGAGTATTCCTCTGGATCGTACATGTCCCAGAATCCTTTGATTGCAA
CCTCACGGAAGTTGGACTTGGTGTTGGAGTAAAGCCTCTTCCACTCATCAAGAACCATTG
GGCTAGGAGGTAGCAAATCAAGAGGATTCTTGGCTTTGGGCTTTGGTGCTTCTTCCTCCT
CAGCAAACTTGGGTGCCTCTGCTGCAGGGGCAGGCTTCTTAGGCTCCTCCTTGGGCTGTG
CAGCTTTCTTAGAAGTAACAGGAGGGACAGCATCGGTCTGCTTGGCATCACCAATGACCT
TCTTGAAGTTGGGTTGGTTGACCC

QA 5 748 5 748
DS 



AS 1 5

CO CL1300Contig1 845 5 5 U
GGTTACAAGATTTTATTAGATGTTTAAATGTTTCAATACCAGTAAGTAGTT*ACATAAAT
GACTGTTAACTAGAGAGACAGTACTTCCAATGACGTTGATCTCAATACCCCTTCTCGTGA
ACAGAAGTATATACAAGAGCAAAGGGTAAAAGATACAAGTATACAACAACTACTCTTATT
CGAATTATTTTACATTTTGGGATTAATAAAATAAACATGGTTGCAACTTCGGTATGGCCG
TAGTCATATGATCCTTATCTTCAAAATACTGCAGTTTTTAACCTTCCTCGTCCTCAGAGT
GATACTCAGTATTTGAACTAGTATCGATCTTAGTCTCCATCAATCGAGGTTGTCCACCTT
TGAGGAAATAATCAGAGGAAGGCCAACCGTGAGACGAATTGGTGGATAGAGTTTCTTCGT
CCGTCAACGGATTGGCCAGCTTCGCAACGAGCTGAGCGACTCCATGAGTCTGGGACCCGG
ATCCTGGAGGCGGGACATAGTACGAAGCGCCTGGAACAAAAGGGAGCCAATCAGGCGCCG
CTCTTCTTACAAATATCCGATGGACGGCGTCCTCTAGCTTCTGTATCAATGGATCCGACG
GCGAGGAGGTGTCGGTTTCGTGGAGATCGCCGCGGCGATCGGAGGATTGAGATCGGAAGG
ATAAGAGGCGTGACGAAGGGAGGAGAGAGGATGCAGTTGCGGCGGTGAGTCGGCTTTTAG
AGAGAGAGATAGAAAGGGAACGAGCCATAGAGACGGAAGTGGAGATGTTTGGTTTTGTGT
TCTGTTTCAAAGCTGTAATTAGAAAAAAAGATGAGATGAGTTTTGGTTGAGTTTGGTCTT
GGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2EW23JQ U 1
AF RR2EW23TF C 1
AF RR2C704JQ U 25
AF RR2H117JQ U 7
AF RR2H117TF C 149
BS 1 235 RR2EW23JQ
BS 236 308 RR2H117JQ
BS 309 309 RR2C704JQ
BS 310 627 RR2H117JQ
BS 628 845 RR2H117TF

RD RR2EW23JQ 235 0 0
GGTTACAAGATTTTATTAGATGTTTAAATGTTTCAATACCAGTAAGTAGTT*ACATAAAT
GACTGTTAACTAGAGAGACAGTACTTCCAATGACGTTGATCTCAATACCCCTTCTCGTGA
ACAGAAGTATATACAAGAGCAAAGGGTAAAAGATACAAGTATACAACAACTACTCTTATT
CGAATTATTTTACATTTTGGGATTAATAAAATAAACATGGTTGCAACTTCGGTAT

QA 1 235 1 235
DS 

RD RR2EW23TF 235 0 0
GGTTAC
AAGATTTTATTAGATGTTTAAATGTTTCAATACCAGTAAGTAGTT*ACATAAATGACTGT
TAACTAGAGAGACAGTACTTCCAATGACGTTGATCTCAATACCCCTTCTCGTGAACAGAA
GTATATACAAGAGCAAAGGGTAAAAGATACAAGTATACAACAACTACTCTTATTCGAATT
ATTTTACATTTTGGGATTAATAAAATAAACATGGTTGCAACTTCGGTAT

QA 7 235 7 235
DS 

RD RR2C704JQ 454 0 0
TAAATGTTTCAATACCAGTAAGTAGTTTACATAAATGACTGTTAACTAGAGAGACAGTAC
TTCCAATGACGTTGAACTCAATACCCCTTCTCGTGAACAGAAGTATATACAAGAGCAAAG
GGTAAAAGATACAAGTATACAACAACTACTTTTATTCGAATTATTTTACATTTTGGGATT
AATAAAATAAACATGGTTGCAACTTCGGTATGGCCGTAGTCATATGGTCCTTATCTTCAA
AATACTGCAGTTTTTAACCTTCCTCGTCCTCAGAGTGATACTCAGTATTTGAACTAGTAT
CGATCTTAGTCTCCATCAATCGAGGTTGTCCACCTTTGAGGAAATAATCAGAGGAAGGCC
AACCGTGAGACGAATTGGTGGAGAGAGTTTCTTCGTCGGTCAACGGGTTGGCCAGCTTCG
CAACGAGCTGAGCGACCCCGTGAGTCTGGGACCC

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR2H117JQ 621 0 0
AAGATTTTATTTTATGTTTAAATGTTTCAATACCAGTAAGTAGTT*ACATAAATGACTGT
TAACTAGAGAGACAGTACTTCCAATGACGTTGATCTCAATACCCCTTCTCGTGAACAGAA
GTATATACAAAAGCAAAGGGTAAAAGATACAAGTATACAACAACTACTCTTATTCGAATT
ATTTTACATTTTGGGATTAATAAAATAAACATGGTTGCAACTTCGGTATGGCCGTAGTCA
TATGATCCTTATCTTCAAAATACTGCAGTTTTTAACCTTCCTCGTCCTCAGAGTGATACT
CAATATTTGAACTAGTATCGATCTTAGTCTCCATCAATCGAGGTTGTCCACCTTTGAGGA
AATAATCAGAGGAAGGCCAACCGTGAGACGAATTGGTGGATAGAGTTTCTTCGTCCGTCA
ACGGATTGGCCAGCTTCGCAACGAGCTGAGCGACTCCATGAGTCTGGGACCCGGATCCTG
GAGGCGGGACATAGTACGAAGCGCCTGGAACAAAAGGGAGCCAATCAGGCGCCGCTCTTC
TTACAAATATCCGATGGACGGCGTCCTCTAGCTTCTGTATCAATGGATCCGACGGCGAGG
AGGTGTCGGTTTCGTGGAGAT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2H117TF 697 0 0
AAAGATACAAGTATACAACAACTACTCTTATTCGAATTATTTTACATTTTGGGATTAATA
AAATAAACATGGTTGCAACTTCGGTATGGCCGTAGTCATATGATCCTTATCTTCAAAATA
CTGCAGTTTTTAACCTTCCTCGTCCTCAGAGTGATACTCAGTATTTGAACTAGTATCGAT
CTTAGTCTCCATCAATCGAGGTTGTCCACCTTTGAGGAAATAATCAGAGGAAGGCCAACC
GTGAGACGAATTGGTGGATAGAGTTTCTTCGTCCGTCAACGGATTGGCCAGCTTCGCAAC
GAGCTGAGCGACTCCATGAGTCTGGGACCCGGATCCTGGAGGCGGGACATAGTACGAAGC
GCCTGGAACAAAAGGGAGCCAATCAGGCGCCGCTCTTCTTACAAATATCCGATGGACGGC
GTCCTCTAGCTTCTGTATCAATGGATCCGACGGCGAGGAGGTGTCGGTTTCGTGGAGATC
GCCGCGGCGATCGGAGGATTGAGATCGGAAGGATAAGAGGCGTGACGAAGGGAGGAGAGA
GGATGCAGTTGCGGCGGTGAGTCGGCTTTTAGAGAGAGAGATAGAAAGGGAACGAGCCAT
AGAGACGGAAGTGGAGATGTTTGGTTTTGTGTTCTGTTTCAAAGCTGTAATTAGAAAAAA
AGATGAGATGAGTTTTGGTTGAGTTTGGTCTTGGACC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 6

CO CL1301Contig1 1497 6 35 U
GGACTTTGAATTAAACAGTCAAACTTGCATTAAATTAGGAATGTTACTTAAACTTTCCTG
CCTTTCCGTTAAAATTATACCTCTCGAAGTTTTATTGTGGTCTCGTCTCATTTCTTGTCC
CATTCCCTTGTCTCTTCGCACCAATGAAGACCAAAGTCTCGAGCAGACTATCACTGACAT
GGGTTTCGCTTCTCTGCATCTCCTGCTTTTTTGTCGGGGCAATGTTCACCTCCAGATTTC
GTGGGTCGGATTCCGGTAGCCAGCTCATTCTAAAGCACCGGCGAGATCAGGAAGTTAACG
TGGCTACCGAGGAATATGCTCTTGAGAAAAAAAAATCACAAGAAAAGGATGTAATTCAAG
AGGTTCTAAAAACCCATAAAGCAATAGAATCATTGGATAAGTCAGTGTCTATGATTCAGA
AGCAGCTATCTGTTAGACACGACCATCAACATATTGTGGATGTCTCAACAACAAATACTT
CAACAACAGGAAACCAAACGAAGAAATTTTTCATGGTGATTGGTATCAACACTGCATTTA
GCAGTAGACAACGTCGTGATTCTCTTAGAGAAACTTGGATGCCTCAGGGAGAAAAGCTTG
AGAAATTGGAGAAAGAGAAGGGTATTGTCGTCAAGTTCATGATCGGACACAGTGCAACAC
CACATAGTATATTGGATAAGGAAATTGATTCAGAAGATGCTCAATACAAATTTTTCTTTA
GGCTGGATCATGTGG*AAGGATATTATAATCTGTCTGCGAAAACCAAAACCTTCCTTTCA
AGTGCAGTTGCAACATGGGATGCTGAGTTCTACGTTAAGATTGATGATGATGTTCATGTT
AATCTTGGTATGCTTGCTTCCACATTAGCTCTTCACCGTCACAAGCCGAGGGTCTACATT
GGATGCATGAAATCAGGACAAGTTCTTACTAAGAAGACGGCTAAATATCGTGAGCCTGAG
TTTTGGAAGTTTGGAGAGGAAGGGAACAACTATTTTCGACATGCTACAGGACAGATTTAT
GCCATCTCAAAGGATCTTGCGACATACATATCTAACAACCAGCCAATTTTGCACAAATAT
GCAAATGAAGATGTGACTCTCGGCTCATGGTTCCTCGGTCTTGAGGTTGAGCATATAGAT
GATCGTAATTTCTGTTGTGGTACTCCTCCAGTTTGTGAAATGAAGGCTGACGATGGAGAA
GTGTGTGTGGCGTCATTTGACTGGAAGTGCAGTGGGGTATGCAAATCAGTCGATAGAATG
TGGCTGGTTCATGCTGTGTGTGGAGAAGGTGACCGAGCTGTGTGGGATGCAAATTTGTAA
CTTTCGTAGATTAAAA***AAGAGACAAGAGGAGATAAACTTTTTGTGTTGTAAAGAACC
AAAAGGAATAAAAATTTGCTTACTGTAAAACAAGCTGAGCAAGACATTTTCATTCAGTAT
TTTCTTTTTGTTTGTGGAAAATAAAAAGAAAAAGAAATAATTAGACTTTTATAGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F572TF U 1
AF RR2AL70TF U 75
AF RR2BD73TF U 75
AF RR2BD73JQ C 708
AF RR2AL70JQ C 631
AF RR2F572JQ C 790
BS 1 137 RR2F572TF
BS 138 138 RR2AL70TF
BS 139 217 RR2F572TF
BS 218 218 RR2AL70TF
BS 219 321 RR2F572TF
BS 322 322 RR2AL70TF
BS 323 486 RR2F572TF
BS 487 487 RR2AL70TF
BS 488 607 RR2F572TF
BS 608 608 RR2AL70TF
BS 609 655 RR2F572TF
BS 656 656 RR2AL70TF
BS 657 680 RR2F572TF
BS 681 681 RR2AL70TF
BS 682 688 RR2F572TF
BS 689 689 RR2AL70TF
BS 690 710 RR2F572TF
BS 711 712 RR2AL70TF
BS 713 721 RR2F572TF
BS 722 722 RR2AL70TF
BS 723 736 RR2F572TF
BS 737 737 RR2AL70TF
BS 738 738 RR2F572TF
BS 739 739 RR2AL70TF
BS 740 744 RR2F572TF
BS 745 745 RR2AL70TF
BS 746 746 RR2F572TF
BS 747 747 RR2AL70TF
BS 748 764 RR2F572TF
BS 765 912 RR2AL70TF
BS 913 923 RR2BD73TF
BS 924 1197 RR2AL70JQ
BS 1198 1198 RR2BD73JQ
BS 1199 1462 RR2AL70JQ
BS 1463 1497 RR2F572JQ

RD RR2F572TF 765 0 0
GGACTTTGAATTAAACAGTCAAACTTGCATTAAATTAGGAATGTTACTTAAACTTTCCTG
CCTTTCCGTTAAAATTATACCTCTCGAAGTTTTATTGTGGTCTCGTCTCATTTCTTGTCC
CATTCCCTTGTCTCTTCACACCAATGAAGACCAAAGTCTCGAGCAGACTATCACTGACAT
GGGTTTCGCTTCTCTGCATCTCCTGCTTTTTTGTCGGAGCAATGTTCACCTCCAGATTTC
GTGGGTCGGATTCCGGTAGCCAGCTCATTCTAAAGCACCGGCGAGATCAGGAAGTTAACG
TGGCTACCGAGGAATATGCTCATGAGAAAAAAAAATCACAAGAAAAGGATGTAATTCAAG
AGGTTCTAAAAACCCATAAAGCAATAGAATCATTGGATAAGTCAGTGTCTATGATTCAGA
AGCAGCTATCTGTTAGACACGACCATCAACATATTGTGGATGTCTCAACAACAAATACTT
CAACAAAAGGAAACCAAACGAAGAAATTTTTCATGGTGATTGGTATCAACACTGCATTTA
GCAGTAGACAACGTCGTGATTCTCTTAGAGAAACTTGGATGCCTCAGGGAGAAAAGCTTG
AGAAATTAGAGAAAGAGAAGGGTATTGTCGTCAAGTTCATGATCGGACACAGTGCGACAC
CACATAGTATATTGGATAAG*AAATTGACTCAGAAGATGCTCAATACAAAGATTTCTTTA
G*CTGGATCATGTGG**AAGATAT*ACAATCTGTCTGCGAAAAC
A

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2AL70TF 838 0 0
GG
ATACCTCTCGAAGTTTTATTGTGGTCTCGTCTCACTTCTTGTCCCATTCCCTTGTCTCTT
CGCACCAATGAAGACCAAAGTCTCGAGCAGACTATCACTGACATGGGTTTCGCTTCTCTG
CATCTCCTGCTTTTTTGTCGGGGCAATGTTCACCTCCAGATTTCGTGGGTCGGATTCCGG
TAGTCAGCTCATTCTAAAGCACCGGCGAGATCAGGAAGTTAACGTGGCTACCGAGGAATA
TGCTCTTGAGAAAAAAAAATCACAAGAAAAGGATGTAATTCAAGAGGTTCTAAAAACCCA
TAAAGCAATAGAATCATTGGATAAGTCAGTGTCTATGATTCAGAAGCAGCTATCTGTTAG
ACACGACCATCAACATATTGTGGATGTCTCAACAACAAATACTTCAACAACAGGAAACCA
AACGAAGAAATTTTTCATGGTGATTGGTATCAACACTGCATTTAGCAGTAGACAACGTCG
TGATTCTCTTAGAGAAACTTGGATGCCTCAGGGAGAAAAGCTTGAGAAATTGGAGAAAGA
GAAGGGTATTGTCGTCAAGTTCATGATCGGACACAGTGCAACACCACATAGTATATTGGA
TAAGGAAATTGATTCAGAAGATGCTCAATACAAATTTTTCTTTAGGCTGGATCATGTGGG
AAGGATATTATAATCTGTCTGCGAAAACCAAAACCTTCCTTTCAAGTGCAGTTGCAACAT
GGGATGCTGAGTTCTACGTTAAGATTGATGATGATGTTCATGTTAATCTTGGTATGCTTG
CTTCCACATTAGCTCTTCACCGTCACAAGCCGAGGGTCTACATTGGATGCATGAAA

QA 3 838 3 838
DS 

RD RR2BD73TF 849 0 0
GG
ATACCTCTCGAAGTTTTATTGTGGTCTCGTCTCATTTCTTGTCCCATTCCCTTGTCTCTT
CGCACCAATGAAGACCAAAGTCTCGAGCAGACTATCACTGACATGGGTTTCGCTTCTCTG
CATCTCCTGCTTTTTTGTCGGGGCAATGTTCACCTCCAGATTTCGTGGGTCGGATTCCGG
TAGCCAGCTCATTCTAAAGCACCGGCGAGATCAGGAAGTTAACGTGGCTACCGAGGAATA
TGCTCTTGAGAAAAAAAAATCACAAGAAAAGGATGTAATTCAAGAGGTTCTAAAAACCCA
TAAAGCAATAGAATCATTGGATAAGTCAGTGTCTATGATTCAGAAGCAGCTATCTGTTAG
ACACGACCATCAACATATTGTGGATGTCTCAACAACAAATGCTTCAACAACAGGAAACCA
AACGAAGAAATTTTTCATGGTGATTGGTATCAACACTGCATTTAGCAGTAGACAACGTCG
TGATTCTCTTAGAGAAACTTGGATGCCTCAGGGAGAAAAGCTTGAGAAATTGGAGAAAGA
GAAGGGTATTGTCGTCAAGTTCATGATCGGACACAGTGCAACACCACATAGTATATTGGA
TAAGGAAATTGATTCAGAAGATGCTCAATACAAAGATTTCTTTAGGCTGGAGCATGTGG*
AAGGATATTATAATCTGTCTGCGAAAACCAAAACCTTCTTTTCAAGTGCAGTTGCAACAT
GGGATGCCGAGTTCTACGTTAAGATTGATGATGATGTTCATGTTAATCTTGGTATGCTTG
CTTCCACATTAGCTCTTCACCGTCACAAGCCGAGGGTCTACATTGGATGCATGAAATCAG
GACAAGT

QA 3 849 3 849
DS 

RD RR2BD73JQ 699 0 0
AAAGA
TTTCTTTAGGCTGGAGCATGTGG*AAGGATATTATAATCTGTCTGCGAAAACCAAAACCT
TCTTTTCAAGTGCAGTTGCAACATGGGATGCCGAGTTCTACGTTAAGATTGATGATGATG
TTCATGTTAATCTTGGTATGCTTGCTTCCACATTAGCTCTTCACCGTCACAAGCCGAGGG
TCTACATTGGATGCATGAAATCAGGACAAGTTCTTACTAAGAAGACGGCTAAATATCGTG
AGCCTGAGTTTTGGAAGTTTGGAGAGGAAGGGAACAACTATTTTCGACATGCTACAGGAC
AGATTTATGCCATCTCAAAGGATCTTGCGACATACATATCTAACAACCAGCCAATTTTGC
ACAAATATGCAAATGAAGATGTGACTCTCGGCTCATGGTTCCTCGGTCTTGAGGTTGAGC
ATATAGATGATCGTAATTTCTGTTGTGGTACTCCTCCAGTTTGTGAAATGAAGGCTGACG
ATGGAGAAGTGTGTGTGGCGTCATTTGACTGGAAGTGCAGTGGGGTATGCAAATCAGTCG
ATAGAATGTGGCTGGTTCATGCTGTGTGTGGAGAAGGTGACCGAGCTGTGTGGGATGCAA
ATTTGTAACTTTCGTAGATTAAAA***AAGAGACAAGAGGAGATAAACTTTTTGTGTTGT
AAAGAACCAAAAGGAATAAAAATTTGCTTACTG
C

QA 6 698 6 698
DS 

RD RR2AL70JQ 832 0 0
TCAAGTTCATGATCGGACACAGTGCAACACCACATAGTATATTGGATAAGGAAATTGATT
CAGAAGATGCTCAATACAAATTTTTCTTTAGGCTGGATCATGTGG*AAGGATATTATAAT
CTGTCTGCGAAAACCAAAACCTTCCTTTCAAGTGCAGTTGCAACATGGGATGCTGAGTTC
TACGTTAAGATTGATGATGATGTTCATGTTAATCTTGGTATGCTTGCTTCCACATTAGCT
CTTCACCGTCACAAGCCGAGGGTCTACATTGGATGCATGAAATCAGGACAAGTTCTTACT
AAGAAGACGGCTAAATATCGTGAGCCTGAGTTTTGGAAGTTTGGAGAGGAAGGGAACAAC
TATTTTCGACATGCTACAGGACAGATTTATGCCATCTCAAAGGATCTTGCGACATACATA
TCTAACAACCAGCCAATTTTGCACAAATATGCAAATGAAGATGTGACTCTCGGCTCATGG
TTCCTCGGTCTTGAGGTTGAGCATATAGATGATCGTAATTTCTGTTGTGGTACTCCTCCA
GTTTGTGAAATGAAGGCTGACGATGGATAAGTGTGTGTGGCGTCATTTGACTGGAAGTGC
AGTGGGGTATGCAAATCAGTCGATAGAATGTGGCTGGTTCATGCTGTGTGTGGAGAAGGT
GACCGAGCTGTGTGGGATGCAAATTTGTAACTTTCGTAGATTAAAA***AAGAGACAAGA
GGAGATAAACTTTTTGTGTTGTAAAGAACCAAAAGGAATAAAAATTTGCTTACTGTAAAA
CAAGCTGAGCAAGACATTTTCATTCAGTATTTTCTTTTTGTTTGTGGAAAAT

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR2F572JQ 708 0 0
GCAACATGGGATGCTGAGTTTTACGTTAAGATTGATGATGATGTTCATGTTAATCTTGGT
ATGCTTGCTTCCACATTAGCTCTTCACCGTCACAAGCCGAGGGTCTACATTGGATGCATG
AAATCAGGACAAGTTCTTACTAAGAAAACGGCCAAATATCGTGAGCCTGAGTTTTGGAAG
TTTGGAGAGGAAGGGAACAACTATTTTCGACATGCTACAGGACAGATCTATGCCATCTCA
AAGGATCTTGCGACATACATATCTAACAACCAGCCAATTTTGCACAAATATGCAAATGAA
GATGTGACACTTGGTTCATGGTTCCTCGGTCTTGAGGTTGAGCATATAGATGATCGTAAT
TTCTGTTGTGGTACTCCTCCAGTTTGTGAAATGAAGGCTGACGATGGAGAAGTGTGTGTG
GCGTCATTCGACTGGAAGTGCAGTGGCGTATGCAAATCAGTCGATAGAATGTGGCTGGTT
CATGCTGTGTGTGGAGAAGGTGACCGAGCTGTGTGGGATGCAAATTTGTAACTTTCGTAG
ATTAAAAAAAAAGAGACAAGAGGAGATAAACATTTTGTGTTGTAAAGAACCAAAAGGAAT
AAAAATTTGCTTACTGTAAAACAAGCTGAGCAAGACATTTTCATTCAGTATTTTCTTTTT
GTTTGTGGAAAATAAAAAGAAAAAGAAATAATTAGACTTTTATAGACG

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 6

CO CL1302Contig1 771 6 7 U
GGAGCAAAGAAGAAAAAAAAAACTTAAAAAGCGGAGAAAAAGATCTGAATCGTTGTCAAA
CAAAAGAAGAGGAAAAAAAAAACCTAACGTTCGTTCGTTCACAGATCTCGAGAGATGAAA
GGTGGTGAAACCAAAGCTCAAGCGAAGAGCACCGACGACAGATTGAAAACGAGAGGGAAG
AAAGCAGGGAAGAAAGTTAAGGATCCAAACAAGCCTAAGAGGCCGCCAAGTGCCTTCTTC
GTCTTCCTGGAGGGATTCCGGAAGGAGTTCAATCTGGCTAACCCTAACAACAAATCCGTC
GGAGCTGTTGGTAAAGCTGCTGGAGCCAAATGGAAGTCCATGACTGCTGATGATAAAGCA
CCTTATGTAGCCAAGGCTGAGACCAAAAAGACTGAATACGCCAAGACTATGCAAAAATAC
AACATGAAATTGGCTAATGGAACCAGTACAGCTGGAGATGATGACTCTGACAAGTCCAAG
TCTGAAGTCAACGATGAGGATGATGCTGCTAGTGATGAGGAGGAAGATGATGATTAAGAG
ATGGATCAGCAGCTGTTTGTTTAATGGAGTTTCTTCTCTTCTTATGTGTTGTTAGCTACT
AGTTTTAGGGAGAAGAATAGTTGTTTTACTCTATTGCTATGTTTCCCCCCCCCTTTTATG
TTGTTAACTGGGATTTAATTTCTTACTTCAACTCCTCATGATAACTTTGGATTTAGCTTT
GAACTTCGATGTTTCTAGTTTTATGAGAGATGGTATCAATTTGTTTGCTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 0 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CP51TF U 78
AF RR2GL90JQ C 1
AF RR2CP51JQ C 100
AF RR2CT19JQ C 54
AF RR2CT19TF U 54
AF RR2GL90TF U 1
BS 1 54 RR2GL90TF
BS 55 721 RR2CT19TF
BS 722 733 RR2GL90TF
BS 734 734 RR2GL90JQ
BS 735 741 RR2GL90TF
BS 742 742 RR2GL90JQ
BS 743 771 RR2GL90TF

RD RR2CP51TF 638 0 0
AAAAACCTAACGTTCGTTCGTTCACAGATCTCGAGAGATGAAAGGTGGTGAAACCAAAGC
TCAAGCGAAGAGCACCGACGACAGATTGAAAACGAGAGGGAAGAAAGCAGGGAAGAAAGT
TAAGGATCCAAACAAGCCTAAGAGGCCGCCAAGTGCCTTCTTCGTCTTCCTGGAGGGATT
CCGGAAGGAGTTCAATCTGGCTAACCCTAACAACAAATCCGTCGGAGCTGTTGGTAAAGC
TGCTGGAGCCAAATGGAAGTCCATGACTGCTGATGATAAAGCACCTTATGTAGCCAAGGC
TGAGACCAAAAAGACTGAATACGCCAAGACTATGCAAAAATACAACATGAAATTGGCTAA
TGGAACCAGTACAGCTGGAGATGATGACTCTGACAAGTCCAAGTCTGAAGTCAACGATGA
GGATGATGCTGCTAGTGATGAGGAGGAAGATGATGATTAAGAGATGGATCAGCAGCTGTT
TGTTTAATGGAGTTTCTTCCCTTCTTATGTGTTGTTAGCTACTAGTTTTAGGGAGAAGAA
TAGTTGTTTTACTCTATTGCTATGTTTCCCCCCC*TTTTTATGTTGTTAACTGGGATTTA
ATCTCTTACTTCGACTCCTCATGATAACTTTGGATTTA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2GL90JQ 771 0 0
GGAGCAAAGAAGAAAAAAAAAACTTAAAAAGCGGAGAAAAAGATCTGAATCGTTGTCAAA
CAAAAGAAGAGGAAAAAAAAAACCTAACGTTCGTTCGTTCACAGATCTCGAGAGATGAAA
GGTGGTGAAACCAAAGCTCAAGCGAAGAGCACCGACGACAGATTGAAAACGAGAGGGAAG
AAAGCAGGGAAGAAAGTTAAGGATCCAAACAAGCCTAAGAGGCCGCCAAGTGCCTTCTTC
GTCTTCCTGGAGGGATTCCGGAAGGAGTTCAATCTGGCTAACCCTAACAACAAATCCGTC
GGAGCTGTTGGTAAAGCTGCTGGAGCCAAATGGAAGTCCATGACTGCTGATGATAAAGCA
CCTTATGTAGCCAAGGCTGAGACCAAAAAGACTGAATACGCCAAGACTATGCAAAAATAC
AACATGAAATTGGCTAATGGAACCAGTACAGCTGGAGATGATGACTCTGACAAGTCTAAG
TCTGAAGTCAACGATGAGGATGATGCTGCTAGTGATGAGGAGGAAGATGATGATTAAGAG
ATGGATCAGCAGCTGTTTGTTTAATGGAGTTTCTTCTCTTCTTATGTGTTGTTAGCTACT
AGTTTTAGGGAGAAGAATAGTTGTTTTACTCTATTGCTATGTTTCCCCCCCCCTTTTATG
TTGTTAACTGGGATTTAATTTCTTACTTCAACTCCTCATGATAACTTTGGATTTAGCTTT
GAACTTCGATGTTTCTAGTTTTATGAGAGATGGTATCAATTTGTTTGCTTC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2CP51JQ 663 0 0
CACAGATCTCGAGAGATGAAAGGTGGTGAAACCAAAGCTCAAGCGAAGAGCACCGACGAC
AGATTGAAAACGAGAGGGAAGAAAGCAGGGAAGAAAGTTAAGGATCCAAACAAGCCTAAG
AGGCCGCCAAGTGCCTTCTTCGTCTTCCTGGAGGGATTCCGGAAGGAGTTCAATCTGGCT
AACCCTAACAACAAATCCGTCGGAGCTGTTGGTAAAGCTGCTGGAGCCAAATGGAAGTCC
ATGACTGCTGATGATAAAGCACCTTATGTAGCCAAGGCTGAGACCAAAAAGACTGAATAC
GCCAAGACTATGCAAAAATACAACATGAAATTGGCTAATGGAACCAGTACAGCTGGAGAT
GATGACTCTGACAAGTCCAAGTCTGAAGTCAACGATGAGGATGATGCTGCTAGTGATGAG
GAGGAAGATGATGATTAAGAGATGGATCAGCAGCTGTTTGTTTAATGGAGTTTCTTCCCT
TCTTATGTGTTGTTAGCTACTAGTTTTAGGGAGAAGAATAGTTGTTTTACTCTATTGCTA
TGTTTCCCCCCCCTTTTTATGTTGTTAACTGGGATTTAATCTCTTACTTCGACTCCTCAT
GATAACTTTGGATTTAGCTTTGAACTTCGATGTTTCTAGTTTTATGAGAGATGGTATCAA
TTT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2CT19JQ 669 0 0
G
GTCAAACAAAAGAAGAGGAAAAAAAAAACCTAACGTTCGTTCGTTCACAGATCTCGAGAG
ATGAAAGGTGGTGAAACCAAAGCTCAAGCGAAGAGCACCGACGACAGATTGAAAACGAGA
GGGAAGAAAGCAGGGAAGAAAGTTAAGGATCCAAACAAGCCTAAGAGGCCGCCAAGTGCC
TTCTTCGTCTTCCTGGAGGGATTCCGGAAGGAGTTCAATCTGGCTAACCCTAACAACAAA
TCCGTCGGAGCTGTTGGTAAAGCTGCTGGAGCCAAATGGAAGTCCATGACTGCTGATGAT
AAAGCACCTTATGTAGCCAAGGCTGAGACCAAAAAGACTGAATACGCCAAGACTATGCAA
AAATACAACATGAAATTGGCTAATGGAACCAGTACAGCTGGAGATGATGACTCTGACAAG
TCCAAGTCTGAAGTCAACGATGAGGATGATGCTGCTAGTGATGAGGAGGAAGATGATGAT
TAAGAGATGGATCAGCAGCTGTTTGTTTAATGGAGTTTCTTCTCTTCTTATGTGTTGTTA
GCTACTAGTTTTAGGGAGAAGAATAGTTGTTTTACTCTATTGCTATGTTTCCCCCCCCCT
TTTATGTTGTTAACTGGGATTTAATTTCTTACTTCAACTCCTCATGATAACTTTGGATTT
AGCTTTG
T

QA 2 668 2 668
DS 

RD RR2CT19TF 669 0 0
G
GTCAAACAAAAGAAGAGGAAAAAAAAAACCTAACGTTCGTTCGTTCACAGATCTCGAGAG
ATGAAAGGTGGTGAAACCAAAGCTCAAGCGAAGAGCACCGACGACAGATTGAAAACGAGA
GGGAAGAAAGCAGGGAAGAAAGTTAAGGATCCAAACAAGCCTAAGAGGCCGCCAAGTGCC
TTCTTCGTCTTCCTGGAGGGATTCCGGAAGGAGTTCAATCTGGCTAACCCTAACAACAAA
TCCGTCGGAGCTGTTGGTAAAGCTGCTGGAGCCAAATGGAAGTCCATGACTGCTGATGAT
AAAGCACCTTATGTAGCCAAGGCTGAGACCAAAAAGACTGAATACGCCAAGACTATGCAA
AAATACAACATGAAATTGGCTAATGGAACCAGTACAGCTGGAGATGATGACTCTGACAAG
TCCAAGTCTGAAGTCAACGATGAGGATGATGCTGCTAGTGATGAGGAGGAAGATGATGAT
TAAGAGATGGATCAGCAGCTGTTTGTTTAATGGAGTTTCTTCTCTTCTTATGTGTTGTTA
GCTACTAGTTTTAGGGAGAAGAATAGTTGTTTTACTCTATTGCTATGTTTCCCCCCCCCT
TTTATGTTGTTAACTGGGATTTAATTTCTTACTTCAACTCCTCATGATAACTTTGGATTT
AGCTTTG
T

QA 2 668 2 668
DS 

RD RR2GL90TF 771 0 0
GGAGCAAAGAAGAAAAAAAAAACTTAAAAAGCGGAGAAAAAGATCTGAATCGTTGTCAAA
CAAAAGAAGAGGAAAAAAAAAACCTAACGTTCGTTCGTTCACAGATCTCGAGAGATGAAA
GGTGGTGAAACCAAAGCTCAAGCGAAGAGCACCGACGACAGATTGAAAACGAGAGGGAAG
AAAGCAGGGAAGAAAGTTAAGGATCCAAACAAGCCTAAGAGGCCGCCAAGTGCCTTCTTC
GTCTTCCTGGAGGGATTCCGGAAGGAGTTCAATCTGGCTAACCCTAACAACAAATCCGTC
GGAGCTGTTGGTAAAGCTGCTGGAGCCAAATGGAAGTCCATGACTGCTGATGATAAAGCA
CCTTATGTAGCCAAGGCTGAGACCAAAAAGACTGAATACGCCAAGACTATGCAAAAATAC
AACATGAAATTGGCTAATGGAACCAGTACAGCTGGAGATGATGACTCTGACAAGTCTAAG
TCTGAAGTCAACGATGAGGATGATGCTGCTAGTGATGAGGAGGAAGATGATGATTAAGAG
ATGGATCAGCAGCTGTTTGTTTAATGGAGTTTCTTCTCTTCTTATGTGTTGTTAGCTACT
AGTTTTAGGGAGAAGAATAGTTGTTTTACTCTATTGCTATGTTTCCCCCCCC*TTTTATG
TTGTTAACTGGGATTTAATTTCTTACTTCAACTCCTCATGATAACTTTGGATTTAGCTTT
GAACTTCGATGTT*CTAGTTT*ATGAGAGATGGTATCAATTTGTTTGCTTC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 6

CO CL1303Contig1 807 6 8 U
GACCAGGGAACATAGGTAATGTTGTATAAAACAGAAGCAGACCCCAACTGAATCAGTACA
ATAGTAGTAGTAACAAGAATATTAACAGTTAACACAGAAAAGGATACATTTTGTTTTGTG
GAAATAAAAGAGATTCTAGTAGTGTCTCAAAAGGTGCCAAAATGAGGAGTTTTTTTTAAT
CACCCGATTACATTTAAACACAATCACAAAAGACCACAAAAGATTCAGAGGTTTGTCATC
AGTTTTGGTGATGTTTTTAGACAATGGGAGGATACTGCTTGGACTGAAGCTTAACCCTTT
TCTTGTACTCAACTGCATCCTGGATGAAGAGATGATAACCATCAGTCTGTGCAGGGTCAG
CGGGATTAGGAGTGTCAAGTAAATCCTGGATACCGACAAGAATCTGCTTCACTGTGATGG
CTGGTCTCCATCCCGAATCCTCGTTAAGGATGGAGAGACAGACAGTCCCCGATGGATAGA
CATTAGGGTGGAAAAAGCCTTGTGGGAATTTGCATTTGGGAGGCTTGCTCGGATAGTCCT
CGCTGAAGTGCATCGTCAATGGAAAGAATCCACCTTCCCAATCAGTACCGGCTTTACCAG
GAATAGTGCAATGCCACACCATTAGATTCACAGAACCATCGGCCCCAGTCTCCGGCTTCG
CCACAAAACCATGAGGATGATTCTTCCTCCACGACTTCCTCTCCTCAGCCAAACGACCAC
GAGCGATTCCACTAGCCATCTCTTTCTCTCTCTTAAGACAATCTCTGTTGTGCTTCTCAC
TCTCTGTCTTCGTCTCTCTATATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GI13JQB U 1
AF RR2H390TF C 148
AF RR2H390JQ U 148
AF RR2GI13TF C 95
AF RR2A490JQ U 63
AF RR2A490TF C 63
BS 1 495 RR2GI13JQB
BS 496 496 RR2A490JQ
BS 497 696 RR2GI13JQB
BS 697 697 RR2A490JQ
BS 698 724 RR2GI13JQB
BS 725 725 RR2A490JQ
BS 726 770 RR2GI13JQB
BS 771 807 RR2A490JQ

RD RR2GI13JQB 770 0 0
GACCAGGGAACATAGGTAATGTTGTATAAAACAGAAGCAGACCCCAACTGAATCAGTACA
ATAGTAGTAGTAACAAGAATATTAACAGTTAACACAGAAAAGGATACATTTTGTTTTGTG
GAAATAAAAGAGATTCTAGTAGTGTCTCAAAAGGTGCCAAAATGAGGAGTTTTTTTTAAT
CACCCGATTACATTTAAACACAATCACAAAAGACCACAAAAGATTCAGAGGTTTGTCATC
AGTTTTGGTGATGTTTTTAGACAATGGGAGGATACTGCTTGGACTGAAGCTTAACCCTTT
TCTTGTACTCAACTGCATCCTGGATGAAGAGATGATAACCATCAGTCTGTGCAGGGTCAG
CGGGATTAGGAGTGTCAAGTAAATCCTGGATACCGACAAGAATCTGCTTCACTGTGATGG
CTGGTCTCCATCCCGAATCCTCGTTAAGGATGGAGAGACAGACAGTCCCCGATGGATAGA
CATTAGGGTGGAAAA*GCCTTGTGGGAATTTGCATTTGGGAGGCTTGCTCGGATAGTCCT
CGCTGAAGTGCATCGTCAATGGAAAGAATCCACCTTCCCAATCAGTACCGGCTTTACCAG
GAATAGTGCAATGCCACACCATTAGATTCACAGAACCATCGGCCCCAGTCTCCGGCTTCG
CCACAAAACCATGAGGATGATTCTTCCTCCACGACTGCCTCTCCTCAGCCAAACGACCAC
GAGC*ATTCCACTAGCCATCTCTTTCTCTCTCTTAAGACAATCTCTGTTG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2H390TF 628 0 0
CAAAAGGTGCCAAAATGAGGAGTTTTTTT*AATCACCCGATTACATTTAAACACAATCAC
AAAAGACCACAAAAGATTCAGAGGTTTGTCATCAGTTTTGGTGATGTTTTTAGACAATGG
GAGGATACTGCTTGGACTGAAGCTTAACCCTTTTCTTGTACTCAACTGCATCCTGGATGA
AGAGATGATAACCATCAGTCTGTGCAGGGTCAGCGGGATTAGGAGTGTCAAGTAAATCCT
GGATACCGACAAGAATCTGCTTCACTGTGATGGCTGGTCTCCATCCCGAATCCTCGTTAA
GGATGGAGAGACAGACAGTCCCCGATGGATAGACATTAGGGTGGAAAAAGCCTTGTGGGA
ATTTGCATTTGGGAGGCTTGATCGGATAGTCCTCGCTGAAGTGCATCGTCAATGGAAAGA
ATCCACCTTCCCAATCAGTACCGGCTTTACCAGGAATAGTGCAATGCCACACCATTAGAT
TCACAGAACCATCGGCCCCAGTCTCCGGCTTCGCCACAAAACCATGAGGATGATTCTTCC
TCCACGACTTCCTCTCCTCAGCCAAACGACCACGAGCGATTCCACTAGCCATCTCTTTCT
CTCTCTTAAGACAATCTCTGTTGTGC
CC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2H390JQ 628 0 0
CAAAAGGTGCCAAAATGAGGAGTTTTTTTTAATCACCCGATTACATTTAAACACAATCAC
AAAAGACCACAAAAGATTCAAAGGTTTGTCATCAGTTTTGGTGATGTTTTTAGACAATGG
GAGGATACTGCTTGGACTGAAGCTTAACCCTTTTCTTGTACTCAACTGCATCCTGGATGA
AGAGATGATAACCATCAGTCTGTGCAGGGTCAGCGGGATTAGGAGTGTCAAGTAAATCCT
GGATACCGACAAGAATCTGCTTCACTGTGATGGCTGGTCTCCATCCCGAATCCTCGTTAA
GGATGGAGAGACAGACAGTCCCCGATGGATAGACATTAGGGTGGAAAAAGCCTTGTGGGA
ATTTGCATTTGGGAGGCTTGATCGGATAGTCCTCGCTGAAGTGCATCGTCAATGGAAAGA
ATCCACCTTCCCAATCAGTACCGGCTTTACCAGGAATAGTGCAATGCCACACCATTAGAT
TCACAGAACCATCGGCCCCAGTCTCCGGCTTCGCCACAAAACCATGAGGATGATTCTTCC
TCCACGACTTCCTCTCCTCAGCCAAACGACCACGAGCGATTCCACTAGCCATCTCTTTCT
CTCTCTTAAGACAATCTCTGTTGTGC
CC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2GI13TF 679 0 0
CAGAAAAGGATACATTTTGTTTTGTGGAAATAAAAGAGATTCTAGTAGTGTCTCAAAAGG
TGCCAAAATGAGGAGTTTTTTTTAATCACCCGATTACATTTAAACACAATCACAAAAGAC
CACAAAAGATTCAGAGGTTTGTCATCAGTTTTGGTGATGTTTTTAGACAATGGGAGGATA
CTGCTTGGACTGAAGCTTAACCCTTTTCTTGTACTCAACTGCATCCTGGATGAAGAGATG
ATAACCATCAGTCTGTGCAGGGTCAGCGGGATTAGGAGTGTCAAGTAAATCCTGGATACC
GACAAGAATCTGCTTCACTGTGATGGCTGGTCTCCATCCCGAATCCTCGTTAAGGATGGA
GAGACAGACAGTCCCCGATGGATAGACATTAGGGTGGAAAA*GCCTTGTGGGAATTTGCA
TTTGGGAGGCTTGCTCGGATAGTCCTCGCTGAAGTGCATCGTCAATGGAAAGAATCCACC
TTCCCAATCAGTACCGGCTTTACCAGGAATAGTGCAATGCCACACCATTAGATTCACAGA
ACCATCGGCCCCAGTCTCCGGCTTCGCCACAAAACCATGAGGATGATTCTTCCTCCACGA
CTGCCTCTCCTCAGCCAAACGACCACGAGC*ATTCCACTAGCCATCTCTTTCTCTCTCTT
AAGACAATCTCTGTTGT
CC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2A490JQ 745 0 0
G
GTAGTAGTAACAAGAATATTAACAGTTAACACAGAAAAGGATACATTTTGTTTTGTGGAA
ATAAAAGAGATTCTAGTAGTGTCTCAAAAGGTGCCAAAATGAGGAGTTTTTTTTAATCAC
CCGATTACATTTAAACACAATCACAAAAGACCACAAAAGATTCAGAGGTTTGTCATCAGT
TTTGGTGATGTTTTTAGACAATGGGAGGATACTGCTTGGACTGAAGCTTAACCCTTTTCT
TGTACTCAACTGCATCCTGGATGAAGAGATGATAACCATCAGTCTGTGCAGGGTCAGCGG
GATTAGGAGTGTCAAGTAAATCCTGGATACCGACAAGAATCTGCTTCACTGTGATGGCTG
GTCTCCATCCCGAATCCTCGTTAAGGATGGAGAGACAGACAGTCCCCGATGGATAGACAT
TAGGGTGGAAAAAGCCTTGTGGGAATTTGCATTTGGGAGGCTTGCTCGGATAGTCCTCGC
TGAAGTGCATCGTCAATGGAAAGAATCCACCTTCCCAATCAGTACCGGCTTTACCAGGAA
TAGTGCAATGCCACACCATTAGATTCACAGAACCATCGGCCCCAGTCTCCGGCTTCGCCA
CAAAACCATGAGGATGATTCTTCCTCCACGACTTCCTCTCCTCAGCCAAACGACCACGAG
CGATTCCACTAGCCATCTCTTTCTCTCTCTTAAGACAATCTCTGTTGTGCTTCTCACTCT
CTGTCTTCGTCTCTCTATATATCC

QA 2 745 2 745
DS 

RD RR2A490TF 745 0 0
G
GTAGTAGTAACAAGAATATTAACAGTTAACACAGAAAAGGATACATTTTGTTTTGTGGAA
ATAAAAGAGATTCTAGTAGTGTCTCAAAAGGTGCCAAAATGAGGAGTTTTTTTTAATCAC
CCGATTACATTTAAACACAATCACAAAAGACCACAAAAGATTCAGAGGTTTGTCATCAGT
TTTGGTGATGTTTTTAGACAATGGGAGGATACTGCTTGGACTGAAGCTTAACCCTTTTCT
TGTACTCAACTGCATCCTGGATGAAGAGATGATAACCATCAGTCTGTGCAGGGTCAGCGG
GATTAGGAGTGTCAAGTAAATCCTGGATACCGACAAGAATCTGCTTCACTGTGATGGCTG
GTCTCCATCCCGAATCCTCGTTAAGGATGGAGAGACAGACAGTCCCCGATGGATAGACAT
TAGGGTGGAAAAAGCCTTGTGGGAATTTGCATTTGGGAGGCTTGCTCGGATAGTCCTCGC
TGAAGTGCATCGTCAATGGAAAGAATCCACCTTCCCAATCAGTACCGGCTTTACCAGGAA
TAGTGCAATGCCACACCATTAGATTCACAGAACCATCGGCCCCAGTCTCCGGCTTCGCCA
CAAAACCATGAGGATGATTCTTCCTCCACGACTTCCTCTCCTCAGCCAAACGACCACGAG
CGATTCCACTAGCCATCTCTTTCTCTCTCTTAAGACAATCTCTGTTGTGCTTCTCACTCT
CTGTCTTCGTCTCTCTATATATCC

QA 2 745 2 745
DS 



AS 1 6

CO CL1304Contig1 1253 6 8 U
GGCATTACCTTTTGTTCATTTCGTAGCAGTGCGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGACGATCTTTCTTTCCCAACTGAAACTCTCGACGTCAAGTTGCGTAGCCGTCGTCGC
ACTTCCCGAGACTCGAAATCCCTAACTCCCTCGTATCTTTTCTGGATCGTCGAAGATGGT
AGCCGATAGCAAATCCGACCTTTCGCTGCCCAAAACATTCGCCTGCAGCGCCTTCGCTGC
CTGCGTCGCCGAGGTGTGTACGATTCCGTTGGACACTGCGAAGGTTAGGCTTCAGCTTCA
AAAGTCTGCCGTAGCTGGAGATCTCACTCTCCCTAAGTATCGGGGTTTGTTGGGAACTGT
TGGTACCATTGCAAGGGAAGAAGGGCTTCGTTCGCTATGGAAAGGTGTTGTTCCCGGATT
GCATCGCCAATGCTTGTTTGGTGGTCTGAGGATCGGAATGTATGAGCCGGTAAAAAACTT
GTACGTTGGGAAAGACCATGTTGGTGATGTTCCATTGAGCAAGAAAATCCTTGCTGGTTT
GACAACAGGTGCGCTGGGTATCATGGTGGCGAACCCCACCGATCTTGTCAAAGTTAGACT
TCAGGCTGAAGGGAAACTACCTGCAGGTGTGCCAAAACGGTATTCTGGATCGTTGAATGC
GTATTCAACTATCGTTAGACAGGAAGGAGTTCGAGCTCTTTGGACGGGTCTTGGACCTAA
CGTGGCAAGAAACGCAATCATCAATGCTGCTGAACTAGCGAGTTACGATCAAGTGAAGCA
GACAATCTTGAAGATTCCGGGTTTCACTGATAACGTTGTCACACATATTCTCTCTGGACT
AGGAGCAGGATTCTTTGCTGTCTGCATTGGTTCCCCTGTTGACGTGGTTAAGTCGAGAAT
GATGGGAGATCCTTCATACAAAGGCACTATTGACTGCTTTGTCAAAACCCTGAAGGCCGA
CGGTCCTATGGCATTCTATAAGGGTTTCATCCCCAACTTTGGACGTCTTGGCTCATGGAA
TGTCATCATGTTTTTGACCCTTGAACAGGCAAAGAAGTATGTCCGGGAACTAGATTCGTC
CAATAAACACTGAGAAACAAAACATTAAGCAGAGAGAGAGAGAGAATAAGAGCAACACTG
TTTTCTTCTTTAATTTCGGTGGTCGAGAGAGGCCAAAACTTCATTGAATATTGTTTTCGG
AATAGAGAGTCGTTTTCAAGCAAAACTATAAAATAAATTTATGTTGGTTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AK73TF U 1
AF RR2E094TF U 21
AF RR2DA48TF U 16
AF RR2AK73JQ C 490
AF RR2DA48JQ C 659
AF RR2E094JQ C 610
BS 1 707 RR2AK73TF
BS 708 822 RR2AK73JQ
BS 823 823 RR2DA48JQ
BS 824 1122 RR2AK73JQ
BS 1123 1124 RR2DA48JQ
BS 1125 1164 RR2AK73JQ
BS 1165 1165 RR2DA48JQ
BS 1166 1253 RR2AK73JQ

RD RR2AK73TF 710 0 0
GGCATTACCTTTTGTTCATTTCGTAGCAGTGCGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGACGATCTTTCTTTCCCAACTGAAACTCTCGACGTCAAGTTGCGTAGCCGTCGTCGC
ACTTCCCGAGACTCGAAATCCCTAACTCCCTCGTATCTTTTCTGGATCGTCGAAGATGGT
AGCCGATAGCAAATCCGACCTTTCGCTGCCCAAAACATTCGCCTGCAGCGCCTTCGCTGC
CTGCGTCGCCGAGGTGTGTACGATTCCGTTGGACACTGCGAAGGTTAGGCTTCAGCTTCA
AAAGTCTGCCGTAGCTGGAGATCTCACTCTCCCTAAGTATCGGGGTTTGTTGGGAACTGT
TGGTACCATTGCAAGGGAAGAAGGGCTTCGTTCGCTATGGAAAGGTGTTGTTCCCGGATT
GCATCGCCAATGCTTGTTTGGTGGTCTGAGGATCGGAATGTATGAGCCGGTAAAAAACTT
GTACGTTGGGAAAGACCATGTTGGTGATGTTCCATTGAGCAAGAAAATCCTTGCTGGTTT
GACAACAGGTGCGCTGGGTATCATGGTGGCGAACCCCACCGATCTTGTCAAAGTTAGACT
TCAGGCTGAAGGGAAACTACCTGCAGGTGTGCCAAAACGGTATTCTGGATCGTTGAATGC
GTATTCAACTATCGTTAGACAGGAAGGAGTTCGAGCTCTTTGGACGG
TCT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2E094TF 659 0 0
GG
GTAGCAGTGCGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACGATCTTTCTTTCCCAA
CTGAAACTCTCGACGTCAAGTTGCGTAGCCGTCGTCGCACTTCCCGAGACTCGAAATCCC
TAACTCCCTCGTATCTTTTCTGGATCGTCGAAGATGGTAGCCGATAGCAAATCCGACCTT
TCGCTGCCCAAAACATTCGCCTGCAGCGCCTTCGCTGCCTGCGTCGCCGAGGTGTGTACG
ATTCCGTTGGACACTGCGAAGGTTAGGCTTCAGCTTCAAAAGTCTGCCGTAGCTGGAGAT
CTCACTCTCCCTAAGTATCGGGGTTTGTTGGGAACTGTTGGTACCATTGCAAGGGAAGAA
GGGCTTCGTTCGCTATGGAAAGGTGTTGTTCCCGGATTGCATCGCCAATGCTTGTTTGGT
GGTCTGAGGATCGGAATGTATGAGCCGGTAAAAAACTTGTACGTTGGGAAAGACCATGTT
GGTGATGTTCCATTGAGCAAGAAAATCCTTGCTGGTTTGACAACAGGTGCGCTGGGTATC
ATGGTGGTGAACCCCACCGATCTTGTCAAAGTTAGACTTCAGGCTGAAGGGAAACTACCT
GCAGGTGTGCCAAAACGGTATTCTGGATCGTTGAATGCGTATTCAACTATCGTTAGA

QA 3 659 3 659
DS 

RD RR2DA48TF 687 0 0
GGATTTC
GTAGCAGTGCGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACGATCTTTCTTTCCCAA
CTGAAACTCTCGACGTCAAGTTGCGTAGCCGTCGTCGCACTTCCCGAGACTCGAAATCCC
TAACTCCCTCGTATCTTTTCTGGATCGTCGAAGATGGTAGCCGATAGCAAATCCGACCTT
TCGCTGCCCAAAACATTCGCCTGCAGCGCCTTCGCTGCCTGCGTCGCCGAGGTGTGTACG
ATTCCGTTGGACACTGCGAAGGTTAGGCTTCAGCTTCAAAAGTCTGCCGTAGCTGGAGAT
CTCACTCTCCCTAAGTATCGGGGTTTGTTGGGAACTGTTGGTACCATTGCAAGGGAAGAA
GGGCTTCGTTCGCTATGGAAAGGTGTTGTTCCCGGATTGCATCGCCGATGCTTGTTTGGT
GGTCTGAGGATCGGAATGTATGAGCCGGTAAAAAACTTGTACGTTGGGAAAGACCCTGTT
GGTGATGTTCCATTGAGCAAGAAAATCCTTGCTGGTTTGACAACAGGTGCGCTGGGTATC
ATGGCGGCGAACCCCACCGATCTTGTCAAAGTTAGACTTCAGGCTGAAGGGAAACTACCT
GCAGGTGTGCCAAAACGGTATTCTGGATCGTTGAATGCGTATTCAACTATCGTTAGACAG
GAAGGAGTTCGAGCTCTTTG

QA 8 687 8 687
DS 

RD RR2AK73JQ 764 0 0
GAAAGACCATGTTGGTGATGTTCCATTGAGCAAGAAAATCCTTGCTGGTTTGACAACAGG
TGCGCTGGGTATCATGGTGGCGAACCCCACCGATCTTGTCAAAGTTAGACTTCAGGCTGA
AGGGAAACTACCTGCAGGTGTGCCAAAACGGTATTCTGGATCGTTGAATGCGTATTCAAC
TATCGTTAGACAGGAAGGAGTTCGAGCTCTTTGGACGGGTCTTGGACCTAACGTGGCAAG
AAACGCAATCATCAATGCTGCTGAACTAGCGAGTTACGATCAAGTGAAGCAGACAATCTT
GAAGATTCCGGGTTTCACTGATAACGTTGTCACGCATATTCTCTCTGGACTAGGAGCAGG
ATTCTTTGCTGTCTGCATTGGTTCCCCTGTTGACGTGGTTAAGTCGAGAATGATGGGAGA
TCCTTCATACAAAGGCACTATTGACTGCTTTGTCAAAACCCTGAAGGCCGACGGTCCTAT
GGCATTCTATAAGGGTTTCATCCCCAACTTTGGACGTCTTGGCTCATGGAATGTCATCAT
GTTTTTGACCCTTGAACAGGCAAAGAAGTATGTCCGGGAACTAGATTCGTCCAATAAACA
CTGAGAAACAAAACATTAAGCAGAGAGAGAGAG**AATAAGAGCAACACTGTTTTCTTCT
TTAATTTCGGTGGTCTAGAGAGGCCAAAACTTCATTGAATATTGTTTTCGGAATAGAGAG
TCGTTTTCAAGCAAAACTATAAAATAAATTTATGTTGGTTGCTC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2DA48JQ 595 0 0
GCGTATTCAACTATCGTTAGACAGGAAGGAGTTCGAGCTCTTTGGACGGGTCTTGGACCT
AACGTGGCAAGAAACGCAATCATCAATGCTGCTGAACTAGCGAGTTACGATCAAGTGAAG
CAGACAATCTTGAAGATTCCGGGTTTCACTGATAACGTTGTCACACATATTCTTTCTGGA
CTAGGAGCAGGATTTTTTGCTGTCTGCATTGGTTCCCCTGTTGACGTGGTTAAGTCGAGA
ATGATGGGAGATCCTTCATACAAAGGCACTATTGACTGCTTTGTCAAAACCCTGAAGGCC
GACGGTCCTATGGCATTCTATAAGGGTTTCATCCCCAACTTTGGACGTCTTGGCTCATGG
AATGTCATCATGTTTTTGACCCTTGAACAGGCAAAGAAGTATGTCCGGGAACTAGATTCG
TCCAATAAACACTGAGAAACAAAACATTAAGCAGAGAGAGAGAGAGAATAAGAGCAACAC
TGTTTTTTTCTTTAATTTCGGTGGTCGAGAGAGGCCAAAACTTCATTGAATATTGTTTTC
GGAATAGAGAGTCGTTTTCAAGCAAAACTATAAAATAAATTTATGTTGGTTGC
AC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2E094JQ 644 0 0
AGGGAAACTACCTGCAGGTGTGCCAAAACGGTATTCTGGATCGTTGAATGCGTATTCAAC
TATCGTTAGACAGGAAGGAGTTCGAGCTCTTTGGACGGGTCTTGGACCTAACGTGGCAAG
AAACTCAATCATCAATGCTGCTGAACTAGCGAGTTACGATCAAGTGAAGCAGACAATCTT
GAAGATTCCGGGTTTCACTGATAACGTTGTCACACATATTCTCTCTGGACTAGGAGCAGG
ATTCTTTGCTGTCTGCATTGGTTCCCCTGTTGACGTGGTTAAGTCGAGAATGATGGGAGA
TCCTTCATACAAAGGCACTATTGACTGCTTTGTCAAAACCCTGAAGGCCGACGGTCCTAT
GGCATTCTATAAGGGTTTCATCCCCAACTTTGGACGTCTTGGCTCATGGAATGTCATCAT
GTTTTTGACCCTTGAACAGGCAAAGAAGTATGTCCGGGAACTAGATTCGTCCAATAAACA
CTGAGAAACAAAACATTAAGCAGAGAGAGAGAGAGAATAAGAGCAACACTGTTTCCTTCT
TTAATTTCGGTGGTCGAGAGAGGCCAAAACTTCATTGAATATTGTTTTCGGAATAGAGAG
TCGTTTCCAAGCAAAACTATAAAATAAATTTATGTTGGTTGC
TC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 6

CO CL1305Contig1 909 6 3 U
GGAGACTGCATGTAATAGTTACCTTCTTCCGATCATATTCAATATTCATAGCACACAAGA
GAAGCTCATACACATTTTACAAAGTTTTTTTTTGTTTATTTGACTTTTTCCGTCATGAGA
TATGCGATAGTTGGTGTGTTGCTTATGTTCTCTTTGGTCGTCTTGGAGTTGAGCAATGCC
ATGGCACCTTCTGTTTCGTATGAATGGGTTGTCTCTTATTCGGAACGTTCCATCCTCGGA
GCCCACAAGCAGGTCATAGTGATCAACGACATGTTTCCTGGACCGATTCTTAAGGCAACA
GCAGGCGATGTAGTAATTGTCAATATTTTCAACCATTTGACCGAACCATTTCTCATGACC
TGGAATGGGTTGCAGATGAGGAAAAACTCGTGGCAAGACGGAGTTCGAGGGACAAACTGT
CCCATATTACCGGGAACAAATTGGACGTACCGGTTTCAGATAAAGGATCAGATCGGAAGT
TACTTTTACTTCCCGACACTTCTGTTCCAAAAGGCGGCCGGAGGATACGGGTCAATTAGA
GTCTACAGTCCAGAACTTGTCCCGGTTCCATTTCCTCAGCCCGATGGCGAGTTTGACATC
TTGATCGGAGACTGGTTCAATAATGACTATAGGGATATGAGAGCTTCACTTGATAATGGT
CTCAGTTTAGCAACTCCTGATGGTATTCTTTTCAATGGGCATGGACCCGAAGAAGCCTTC
TTTGCATTTCAACCAGGTAAAACATATAGGCTGAGAATATCAAACGTGGGTCTCAAGACA
TCCTTAAACTTCAGGATCCAGGACCATGATATGCTCCTTGTTGAGACAGAGGGTTCGTAT
GTTCAGAAACGTAGCTTATCTAACTTGGATATCCATGTGGGTCAATCATATTCCGTTCTT
GTCACTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 15 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C383TF U 6
AF RR2EQ57TF U 1
AF RR2DM60TF U 5
AF RR2AR36TF U 94
AF RR2DW13TF U 117
AF RR2DM60JQ C 246
BS 1 726 RR2EQ57TF
BS 727 745 RR2DM60TF
BS 746 909 RR2DM60JQ

RD RR2C383TF 707 0 0
GG
GCATGTAATAGTTACCTTCTTCCGATCGTATTCAATATTCATAGCACACAAGAGAAGGTC
ATACACATTTTACAAAGTTTTTTTT*GTTTGTTTGACTTTTTCCGTCATGAGATATGCGA
TAGTTGGTGTGTTGCTTATGTTCTCTTT***CGTCTTGGAGTTGAGCAATGCCATGGCAC
CTTCTGTTTCGTATGAGTGGGTTGTCTCTTATTCGGAACGTTCCATCCTCGGAGCCCACA
AGCAGGTCATAGTGATCAACGACATGTTTCCTGGACCGATTCTTAAGGCAACAGCAGGCG
ATGTAGTAGTTGTCAATATTTTCAACCATTTGACCGAACCCTTTCTCATGACCTGGAATG
GGTTGCAAATGAGGAAAAACTCGTGGCAAGACGGAGTTCGAGGGACAAACTGTCCCATAC
TACCGGGAACAAATTGGACGTACCGGTTTCAGATAAAGGATCAGATCGGAAGTTACTTTT
ACTTCCCGACACTTCTGTTCCAAAAGGCTGCCGGAGGATACGGTTCAATCAGAGTCTACA
GTCCAGAACTTGTCCCGGTTCCATTTCCTCAGCCCGATGGCGAGTTTGACATCTTGATCG
GAGATTGGTTCAATACTGACTATAGGGGTATGAGAGCTTCACTTGACAATGGTCTCAGTT
TAG*AACTCCTGATGGTATTCTTTTCAATGGGCATGGACCCGAAG

QA 3 707 3 707
DS 

RD RR2EQ57TF 726 0 0
GGAGACTGCATGTAATAGTTACCTTCTTCCGATCATATTCAATATTCATAGCACACAAGA
GAAGCTCATACACATTTTACAAAGTTTTTTTTTGTTTATTTGACTTTTTCCGTCATGAGA
TATGCGATAGTTGGTGTGTTGCTTATGTTCTCTTTGGTCGTCTTGGAGTTGAGCAATGCC
ATGGCACCTTCTGTTTCGTATGAATGGGTTGTCTCTTATTCGGAACGTTCCATCCTCGGA
GCCCACAAGCAGGTCATAGTGATCAACGACATGTTTCCTGGACCGATTCTTAAGGCAACA
GCAGGCGATGTAGTAATTGTCAATATTTTCAACCATTTGACCGAACCATTTCTCATGACC
TGGAATGGGTTGCAGATGAGGAAAAACTCGTGGCAAGACGGAGTTCGAGGGACAAACTGT
CCCATATTACCGGGAACAAATTGGACGTACCGGTTTCAGATAAAGGATCAGATCGGAAGT
TACTTTTACTTCCCGACACTTCTGTTCCAAAAGGCGGCCGGAGGATACGGGTCAATTAGA
GTCTACAGTCCAGAACTTGTCCCGGTTCCATTTCCTCAGCCCGATGGCGAGTTTGACATC
TTGATCGGAGACTGGTTCAATAATGACTATAGGGATATGAGAGCTTCACTTGATAATGGT
CTCAGTTTAGCAACTCCTGATGGTATTCTTTTCAATGGGCATGGACCCGAAGAAGCCTTC
TTTGCA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2DM60TF 743 0 0
GGG
GCATGTAATAGTTACCTTCTTCCGATCATATTCAATATTCATAGCACACAAGAGAAGCTC
ATACACATTTTACAAAGTTTTTTTTTGTTTATTTGACTTTTTCCGTCATGAGATATGCGA
TAGTTGGTGTGTTGCTTATGTTCTCTTTGGTCGTCTTGGAGTTGAGCAATGCCATGGCAC
CTTCTGTTTCGTATGAATGGGTTGTCTCTTATTCGGAACGTTCCATCCTCGGAGCCCACA
AGCAGGTCATAGTGATCAACGACATGTTTCCTGGACCGATTCTTAAGGCAACAGCAGGCG
ATGTAGTAATTGTCAATATTTTCAACCATTTGACCGAACCATTTCTCATGACCTGGAATG
GGTTGCAGATGAGGAAAAACTCGTGGCAAGACGGAGTTCGAGGGACAAACTGTCCCATAT
TACCGGGAACAAATTGGACGTACCGGTTTCAGATAAAGGATCAGATCGGAAGTTACTTTT
ACTTCCCGACACTTCTGTTCCAAAAGGCGGCCGGAGGATACGGGTCAATTAGAGTCTACA
GTCCAGAACTTGTCCCGGTTCCATTTCCTCAGCCCGATAGCGAGTTTGACATCTTGATCG
GAGACTGGTTCAATAATGACTATAGGGATATGAGAGCTTCACTTGATAATGGTCTCAGTT
TAGCAACTCCTGATGGTATTCTTTTCAATGGGCATGGACCCGAAGAAGCCTTCTTTGCAT
TTCAACCAGGTAAAACAT
AT

QA 4 741 4 741
DS 

RD RR2AR36TF 652 0 0
GTTTGTTTGACTTTTTCCGTCATGAGATATGCGATAGTTGGTGTGTTGCTTATGTTCTCT
TT***CGTCTTGGAGTTGAGCAATGCCATGGCACCTTCTGTTTCGTATGAGTGGGTTGTC
TCTTATTCGGAACGTTCCATCCTCGGAGCCCACAAGCAGGTCATAGTGATCAACGACATG
TTTCCTGGACCGATTCTTAAGGCAACAGCAGGCGATGTAGTAGTTGTCAATATTTTCAAC
CATTTGACCGAACCCTTTCTCATGACCTGGAATGGGTTGCAAATGAGGAAAAACTCGTGG
CAAGACGGAGTTCGAGGGACAAACTGTCCCATACTACCGGGAACAAATTGGACGTACCGG
TTTCAGATAAAGGATCAGATCG*AAGTTACTTTTACTTCCCGACACTTCTGTTCCAAAAG
GCGGCCGGAGGATACGGTTCAATCAGAGTCTACAGTCCAGAACTTGTCCCGGTTCCATTT
CCTCAGCCCGATGGCGAGTTTGACATCTTGATCGGAGATTGGTTCAATACTGACTATAGG
GGTATGAGAGCTTCACTTGACAATGGTCTCAGTTTAGGAACTCCTGATGGTATTCTTTTC
AATGGGCATGGACCCGAAGAAGCCTTCTTTGCATTTCAACCAGGTAAAACAT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2DW13TF 616 0 0
GAGATATGCGATAGTTGGTGTGTTGCTTATGTTCTCTTTGGTCGTCTTGGAGTTGAGCAA
TGCCATGGCACCTTCTGTTTCGTATGAATGGGTTGTCTCTTATTCGGAACGTTCCATCCT
CGGAGCCCACAAGCAGGTCATAGTGATCAACGACATGTTTCCTGGACCGATTCTTAAGGC
AACAGCAGGCGATGTAGTAATTGTCAATATTTTCAACCATTTGACCGAACCATTTCTCAT
GACCTGGAATGGGTTGCAGATGAGGAAAAACTCGTGGCAAGACGGAGTTCGAGGGACAAA
CTGTCCCATATTACCGGGAACAAATTGGACGTACCGGTTTCAGATAAAGGATCAGATCGG
AAGTTACTTTTACTTCCCGACACTTCTGTTCCAAAAGGCGGCCGGAGGATACGGGTCAAT
TAGAGTCTACAGTCCAGAACTTGTCCCGGTTCCATTTCCTCAGCCCGATGGCGAGTTTGA
CATCTTGATCGGAGACTGGTTCAATAATGACTATAGGGATATGAGAGCTTCACTTGATAA
TGGTCTCAGTTTAGCAACTCCTGATGGTATTCTTTTCAATGGGCATGGACCCGAAGAAGC
CTTCTTTGCATTTCAA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2DM60JQ 664 0 0
CAAGCAGGTCATAGTGATCAACGACATGTTTCCTGGACCGATTCTTAAGGCAACAGCAGG
CGATGTAGTAATTGTCAATATTTTCAACCATTTGACCGAACCATTTCTCATGACCTGGAA
TGGGTTGCAGATGAGGAAAAACTCGTGGCAAGACGGAGTTCGAGGGACAAACTGTCCCAT
ATTACCGGGAACAAATTGGACGTACCGGTTTCAGATAAAGGATCAGATCGGAAGTTACTT
TTACTTCCCGACACTTCTGTTCCAAAAGGCGGCCGGAGGATACGGGTCAATTAGAGTCTA
CAGTCCAGAACTTGTCCCGGTTCCATTTCCTCAGCCCGATAGCGAGTTTGACATCTTGAT
CGGAGACTGGTTCAATAATGACTATAGGGATATGAGAGCTTCACTTGATAATGGTCTCAG
TTTAGCAACTCCTGATGGTATTCTTTTCAATGGGCATGGACCCGAAGAAGCCTTCTTTGC
ATTTCAACCAGGTAAAACATATAGGCTGAGAATATCAAACGTGGGTCTCAAGACATCCTT
AAACTTCAGGATCCAGGACCATGATATGCTCCTTGTTGAGACAGAGGGTTCGTATGTTCA
GAAACGTAGCTTATCTAACTTGGATATCCATGTGGGTCAATCATATTCCGTTCTTGTCAC
TGCC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 2 6

CO CL1306Contig1 303 2 5 U
ACGACTCCCAAATTTAAATACATATGAAAACCGTTAATATAGCTGACGATCCCATTAACT
TTTCCCGCGTTAACTCAAAACTCAAGCCGGAAAAATCCCCGGAAATCCTGAAACGCCCAA
TCATCAACGGAAACAACAACGACCTGTCTGTCCGCATCCCTCCTTGAAAACGACGGCAGA
GGCAGCGAGCTAGGCGCCGGAAAAACAACGAAAATGGAAAATCCCGCGTAAATATCGTCG
GGAGAAACCACTTCATGTCCATTACATCTCCGGTTCTTGATGTCCGAAAACGAATCAAAA
GAC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2DR11JQ U 7
AF RR2AJ50JQ U 1
BS 1 94 RR2AJ50JQ
BS 95 95 RR2DR11JQ
BS 96 117 RR2AJ50JQ
BS 118 118 RR2DR11JQ
BS 119 303 RR2AJ50JQ

RD RR2DR11JQ 170 0 0
CCCAAATTTAAATACATATGAAAACCGTTAATATAGCTGACGATCCCATTAATTTTTCCC
GCGTTAACTCAAAACTCAAGCCGGAAAAATCCCCGGAAATCCTGAAACGCCCAATCATCA
ACGGAAACAACAACGACCTGTCTGTCCGCATCCCTCCTTGAAAACGACGG

QA 1 170 1 170
DS 

RD RR2AJ50JQ 303 0 0
ACGACTCCCAAATTTAAATACATATGAAAACCGTTAATATAGCTGACGATCCCATTAACT
TTTCCCGCGTTAACTCAAAACTCAAGCCGGAAAAGTCCCCGGAAATCCTGAAACGCCGAA
TCATCAACGGAAACAACAACGACCTGTCTGTCCGCATCCCTCCTTGAAAACGACGGCAGA
GGCAGCGAGCTAGGCGCCGGAAAAACAACGAAAATGGAAAATCCCGCGTAAATATCGTCG
GGAGAAACCACTTCATGTCCATTACATCTCCGGTTCTTGATGTCCGAAAACGAATCAAAA
GAC

QA 1 303 1 303
DS 



CO CL1306Contig2 811 4 45 U
GGAACATAAACTCACTAATCATTTACAAACATAAACTTGAGCAGGAACCGAAGAAAAGGA
CCCTTCTACACCTTTTCTTCTTTCCTCTCTTTCCTT*CCCACCACCACCAAACGTTAATT
CAAGATTCTCCCTTTTCTAGTCTTATAA*CGATGGGAACCGAAGTCATCAGGCCTCAGAA
CTGTCTGGTTAACCGGATGAGAGATTCTCCGGCGACCATTTTTCACCATCCCCGGAGAAA
CCAATCTCACCGGAAGCCGCCTCTACGACCTGACCAAAGGAGACGGTTCGGATCCGTCGA
CTTCAGAACGACGGCCAAGGACGTCGTCAGGAGAAGAGGAGAGTCTTTTGATTCGTTTTC
GAACATCAAGAACCGGAGATCTAATGGACATGAAGTAGTCTCTCCCGACGACATCTACGC
GGGATCTTCCATTTTCGTTGTTTCTCCGGCGCCGAGTTCGCTGCCTTTGCCGTCGTTCTC
GAGGAGGGATGCGGAGAGCCAGGTCGTTGTTGTTTCCGTTGATGATTCGGCGTCTCAGGA
TCTCCGGCGACTTCTCCGGCTTGAGTTTTGAGTTAACGCGGGAAAATTAATGGGATCGTC
AGCTATATTAACGGTTCTCATATGTATTTAAATCTGGGAGTCGTCTCCGTTATTGTTTTT
ACCAATCTGGTCCTTCCTTCGAATAATTTGTTTTAGAAAAGGGTGGGGTCGGAAATATCG
TTAAAAGTACAGAGTCAGATTTAGAAACAAATGTTAAATATTAGCTGACTTTTCAGTTTT
ATGTGGGTCTTCGCGCGATATGGAATTAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR11TF U 1
AF RR2AW45TFB U 65
AF RR2AJ50TF U 19
AF RR2AW45JQ C 68
BS 1 96 RR2DR11TF
BS 97 97 RR2AW45TFB
BS 98 148 RR2DR11TF
BS 149 149 RR2AW45TFB
BS 150 243 RR2DR11TF
BS 244 244 RR2AW45TFB
BS 245 255 RR2DR11TF
BS 256 256 RR2AW45TFB
BS 257 264 RR2DR11TF
BS 265 265 RR2AW45TFB
BS 266 305 RR2DR11TF
BS 306 306 RR2AJ50TF
BS 307 361 RR2DR11TF
BS 362 362 RR2AW45TFB
BS 363 380 RR2DR11TF
BS 381 381 RR2AW45TFB
BS 382 391 RR2DR11TF
BS 392 392 RR2AJ50TF
BS 393 396 RR2DR11TF
BS 397 397 RR2AW45TFB
BS 398 411 RR2DR11TF
BS 412 412 RR2AW45TFB
BS 413 453 RR2DR11TF
BS 454 454 RR2AW45TFB
BS 455 456 RR2DR11TF
BS 457 457 RR2AW45TFB
BS 458 466 RR2DR11TF
BS 467 467 RR2AW45TFB
BS 468 480 RR2DR11TF
BS 481 481 RR2AW45TFB
BS 482 495 RR2DR11TF
BS 496 496 RR2AW45TFB
BS 497 498 RR2DR11TF
BS 499 499 RR2AW45TFB
BS 500 532 RR2DR11TF
BS 533 585 RR2AJ50TF
BS 586 586 RR2AW45TFB
BS 587 662 RR2AJ50TF
BS 663 663 RR2AW45JQ
BS 664 669 RR2AJ50TF
BS 670 670 RR2AW45JQ
BS 671 702 RR2AJ50TF
BS 703 703 RR2AW45JQ
BS 704 728 RR2AJ50TF
BS 729 811 RR2AW45JQ

RD RR2DR11TF 532 0 0
GGAACATAAACTCACTAATCATTTACAAACATAAACTTGAGCAGGAACCGAAGAAAAGGA
CCCTTCTACACCTTTTCTTCTTTCCTCTCTTTCCTTTCCCACCACCACCAAACGTTAATT
CAAGATTCTCCCTTTTCTAGTCTTATAAACGATGGGAACCGAAGTCATCAGGCCTCAGAA
CTGTCTGGTTAACCGGATGAGAGATTCTCCGGCGACCATTTTTCACCATCCCCGGAGAAA
CCATTCTCACCGGAAACCGCCTCTCCGACCTGACCAAAGGAGACGGTTCGGATCCGTCGA
CTTCACAACGACGGCCAAGGACGTCGTCAGGAGAAGAGGAGAGTCTTTTGATTCGTTTTC
GGACATCAAGAACCGGAGATGTAATGGACATTAAGTGGTCTCTCCCGACGATATCTACGC
GGGATCTTCCATTTTCGTTGTTTCTCCGGCGCCTAGCTCGCTGCCTCTGCCGTCGTTCTC
AAGGAGGGATGCGGACAGACAGGTCGTTGTTGTTTCCGTTGATGATTCGGCG

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2AW45TFB 567 0 0
TCT
ACACCTTTTCTTCTTTCCTCTCTTTCCTT*CCCACCACCACCAAACGTTAATTCAAGATT
CTCCCTTTTCTAGTCTTATAA*CGATGGGAACCGAAGTCATCAGGCCTCAGAACTGTCTG
GTTAACCGGATGAGAGATTCTCCGGCGACCATTTTTCACCATCCCCGGAGAAACCAATCT
CACCGGAAGCCGCCTCTACGACCTGACCAAAGGAGACGGTTCGGATCCGTCGACTTCAGA
ACGACGGCCAAGGACGTCGTCAGGAGAAGAGGAGAGTCTTTTGATTCGTTTTCGAACATC
AAGAACCGGAGATCTAATGGACATGAAGTAGTCTCTCCCGACGACATCTACGCGGGATCT
TCCATTTTCGTTGTTTCTCCGGCGCCGAGTTCGCTGCCTTTGCCGTCGTTCTCGAGGAGG
GATGCGGAGAGCCAGGTCGTTGTTGTTTCCGTTGATGATTCGGCGTCTCAGGATCTCCGG
CGACTTCTCCGGCTTGAGTTTTGAGTTAACGCGGGAAAATTAATGGGATCGTCAGCTATA
TTAACGGTTCTCATATGTATTTAA

QA 4 567 4 567
DS 

RD RR2AJ50TF 710 0 0
GG
ATTTACAAACATAAACTTGAGCAGGAACCGAAGAAAAGGACCCTTCTACACCTTTTCTTC
TTTCCTCTCTTTCCTTTCCCACCATCACCAAACGTTAATTCAAGATTCTCCCTTTTCTAG
TCTTATAAACGATGGGAACCGAAGTCATCAGGCCTCAGAACTGTCTGGTTAACCGGATGA
GAGATTCTCCGGCGACCATTTTTCACCATCCCCGGAGAAACCATTCTCACCGGAAACCGC
CTCTCCGACCTGACCAAAGGAGACGGTTCGGATCCGTCGACTTCAGAACGACGGCCAAGG
GTGTCGTCAGGAGAAGAGGAGAGTCTTTTGATTCGTTTTCGGACATCAAGAACCGGAGAT
GTAATGGACATGAAGTGGTCTCTCCCGACGATATCTACGCGGGATCTTCCATTTTCGTTG
TTTCTCCGGCGCCTAGCTCGCTGCCTCTGCCGTCGTTCTCAAGGAGGGATGCGGACAGAC
AGGTCGTTGTTGTTTCCGTTGATGATTCGGCGTCTCAGGATCTCCGGCGACTTCTCCGGC
TTGAGTTTTGAGTTAACGCGGGAAAGTTAATGGGATCGTCAGCTATATTAACGGTTCTCA
TATGTATTTAAATCTGGGAGTCGTCTCCGTTATTGTTTTTACTAATCTG*TCCTTCCTTC
GAATAATTTGTTTTAGAAAAGG*TGGGGTCGGAAATATCGTTAAAAGT

QA 3 710 3 710
DS 

RD RR2AW45JQ 744 0 0
ACACCTTTTCTTCTTTCCTCTCTTTCCTT*CCCACCACCACCAAACGTTAATTCAAGATT
CTCCCTTTTCTAGTCTTATAA*CGATGGGAACCGAAGTCATCAGGCCTCAGAACTGTCTG
GTTAACCGGATGAGAGATTCTCCGGCGACCATTTTTCACCATCCCCGGAGAAACCAATCT
CACCGGAAGCCGCCTCTACGACCTGACCAAAGGAGACGGTTCGGATCCGTCGACTTCAGA
ACGACGGCCAAGGACGTCGTCAGGAGAAGAGGAGAGTCTTTTGATTCGTTTTCGAACATC
AAGAACCGGAGATCTAATGGACATGAAGTAGTCTCTCCCGACGACATCTACGCGGGATCT
TCCATTTTCGTTGTTTTTCCGGCGCCGAGTTCGCTGCCTTTGCCGTCGTTCTCGAGGAGG
GATGCGGAGAGCCAGGTCGTTGTTGTTTCCGTTGATGATTCGGCGTCTCAGGATCTCCGG
CGACTTCTCCGGCTTGAGTTTTGAGTTAACGCGGGAAAATTAATGGGATCGTCAGCTATA
TTAACGGTTCTCATATGTATTTAAATCTGGGAGTCGTCTCCGTTATTGTTTTTACCAATC
TGGTCCTTCCTTCGAATAATTTGTTTTAGAAAAGGGTGGGGTCGGAAATATCGTTAAAAG
TACAGAGTCAGATTTAGAAACAAATGTTAAATATTAGCTGACTTTTCAGTTTTATGTGGG
TCTTCGCGCGATATGGAATTAAAA

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 5

CO CL1307Contig1 845 5 11 U
AGAAAGTAACAATTATTTATTTCTGAATATCGAGTAATTAAATTGTTAATTAACAATAAA
CTTTTCAATACAAATTTTCAAGAAAAAGAGTTATACAGATTCAAGAAAGTAAAAGCTAAT
CAATCATTTGGTCCAACATCTGGTTTTCATGATCAATGATATCTAAAACCTTCAAAGGAC
TATGGTAGATCTACCGATCTGCCCCCACTGTTCCGTCTTGAACGTATTATCCGGCGAACT
CCGACGATTTTACCTTTATATTAAACAGAGGAACATGGCGAAAAGAGCAAACATAATAGA
ACTAGAATCCATAAACCGATCTGAACCGGAACCTGGCGGTGGCGTATGATAGTAAAACGG
GAAATAAGGGACGATAGGGTTCGGCGGAGGCGGCGTAGGATAGTTTCCTGAATACGGCGG
AGGATAGTAATAACCTTGGCCGCCGTCACCGTAAGGAGGAGGGTATTTGTCGCCACCGGA
CTGTGAAGGAGGAGGGTAATAGTAAGAGCTACCGCCACCGGAGCTGGGAGGAGAAGGAGG
CGGAGGACATGCGGTAGTGGTTGATGGTGACGGTGGTGGACGAGAAGGCGGCGGAGGGGG
AGGATATGATGGGACGGGGTTACAAGGATTGTCGCAGGAAGAACACATTGTACAGGAAAC
AACCTCGTCCATTGATGTCACTGTCGAAGTCAGTGATAGCAGTAGAATGAGGACAAGTAT
AGACAAACCATATAACTGGTTTGCTTCCATTGTCAGAGATTTGGATTCAGATACTTGACT
TTGAAGTCTGGAAATCTACAGAGGTAAGAGAGAGAGTGAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAG
AGGCC


BQ
10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 20 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2GV66JQB U 2
AF RR2EN30JQ U 2
AF RR2ER47JQ U 1
AF RR2EN30TF C 218
AF RR2ER47TF C 90
BS 1 513 RR2ER47JQ
BS 514 514 RR2GV66JQB
BS 515 518 RR2ER47JQ
BS 519 519 RR2GV66JQB
BS 520 670 RR2ER47JQ
BS 671 671 RR2EN30JQ
BS 672 699 RR2ER47JQ
BS 700 700 RR2EN30JQ
BS 701 812 RR2ER47JQ
BS 813 813 RR2EN30TF
BS 814 845 RR2ER47TF

RD RR2GV66JQB 631 0 0
GAAAATAACAATTATTTATTTCTGAATATCGAGTAATTAAATTGTTAATTAACAATAAAC
TTTTCAATACAAATTTTCAAGAAAA*GAGTTATACAGATTCAAGAAAGTAAAAGCTAATC
AATCATTTGGTCCAACATCTGGTTTTCATGATTAATGATATCTAAAACCTTCAAAGGACT
ATGGTAGATCTGCCGATCTGCCACCACTGTTCCGACTTGAACGTATTATCCGGTGAACTC
CGACGATTTTACCGTTATACTAAACAGAGGAACATGGCGAAAAGAACAAAGAGAACAGAA
CTAGAACCCATAAACCGATCTGAACCGGAACCTGGCGGTGGCGTATGATAGTAGAACGGG
AAATAAGGGACGATGGGGTTCGGCGGAGGCGGCGTAGGATAGTTTCCTGAATACGGCGGA
GGATAGTAATAACCTTGGCCGCCGTCACCGTAAGGAGGAGGGTATTTGTCGCCACCGGAT
TGTGAAGGAGGAGGGTAATAGTAAGAGCTACCGCCACCGGAGCTGGGAGGAGAAGGAGGC
GGAGGACATGCGGTAGTGGTTGATGGTGACGGTGGTGGACGAGAAGGCGGCGGAGGGGGA
GGACATGATGGGACGGGGTTACAAGGATTGT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2EN30JQ 743 0 0
GAAAGTAACAATTATTTATTTCTGAATATCGAGTAATTAAATTGTTAATTAACAATAAAC
TTTTCAATACAAATTTTCAAGAAAAAGAGTTATACAGATTCAAGAAAGTAAAAGCTAATC
AATCATTTGATCCGACATCTGGTTTTCATGATCAATGATATCTAAAACCTTCAAAGGACT
ATGGTAGATCTACCGATCTGCCCCCACTGTTCCGTCTTGAACGTATTATCCGGCGAACTC
CGACGATTTTACCTTTATATTAAACAGAGGAACATGGCGAAAAGAGCAAACATAATAGAA
CTAGAATCCATAAACCGATCTGAACCGGGACCTGGCGGTGGCGTATGATAGTAAAACGGG
AAATAAGGGACGATAGGGTTCGGCGGAGGCGGCGTAGGATAGTTTCCTGAATACGGCGGA
GGATAGTAATAACCTTGGCCGCCGTCACCGTAAGGAGGAGGGTATTTGTCGCCACCGGAC
TGTGAAGGAGGAGGGTAATAGTAAGAGCTACCGCCACCGGAGCTGGGAGGAGAAGGAGGC
GGAGGACATGCGGTAGTGGTTGATGGTGACGGTGGTGGACGGGAAGGTGGCGGAGGGGGA
GGATATGATGGGACGGGATTACAAGGATTGTCGCAGGAAGAACACATTGTACAGGAAACA
ACCTCGTCCATTGATGTCACTGTCGAAGTCAGTGATAGCAGTAGAATGAGGACAAGTGTA
GACAAACCATATAACTGGTTTGC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2ER47JQ 831 0 0
AGAAAGTAACAATTATTTATTTCTGAATATCGAGTAATTAAATTGTTAATTAACAATAAA
CTTTTCAATACAAATTTTCAAGAAAAAGAGTTATACAGATTCAAGAAAGTAAAAGCTAAT
CAATCATTTGGTCCAACATCTGGTTTTCATGATCAATGATATCTAAAACCTTCAAAGGAC
TATGGTAGATCTACCGATCTGCCCCCACTGTTCCGTCTTGAACGTATTATCCGGCGAACT
CCGACGATTTTACCTTTATATTAAACAGAGGAACATGGCGAAAAGAGCAAACATAATAGA
ACTAGAATCCATAAACCGATCTGAACCGGAACCTGGCGGTGGCGTATGATAGTAAAACGG
GAAATAAGGGACGATAGGGTTCGGCGGAGGCGGCGTAGGATAGTTTCCTGAATACGGCGG
AGGATAGTAATAACCTTGGCCGCCGTCACCGTAAGGAGGAGGGTATTTGTCGCCACCGGA
CTGTGAAGGAGGAGGGTAATAGTAAGAGCTACCACCACTGGAGCTGGGAGGAGAAGGAGG
CGGAGGACATGCGGTAGTGGTTGATGGTGACGGTGGTGGACGAGAAGGCGGCGGAGGGGG
AGGATATGATGGGACGGGGTTACAAGGATTGTCGCAGGAAGAACACATTGTACAGGAAAC
AACCTCGTCCTTTGATGTCACTGTCGAAGTCAGTGATAGTAGTAGAATGAGGACAAGTAT
AGACAAACCATATAACTGGTTTGCTTCCATTGTCAGAGATTTGGATTCAGATACTTGACT
TTGAAGTCTGGAAATCTACAGAGGTAAGAGAG
CGAGTGAGAAAAGAAAGAA

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR2EN30TF 616 0 0
TTGAACGTATTATCCGGCGAACTCCGACGATTTTACCTTTATATTAAACAGAGGAACATG
GCGAAAAGAGCAAACATAATAGAACTAGAATCCATAAACCGATCTGAACCGGGACCTGGC
GGTGGCGTATGATAGTAAAACGGGAAATAAGGGACGATAGGGTTCGGCGGAGGCGGCGTA
GGATAGTTTCCTGAATACGGCGGAGGATAGTAATAACCTTGGCCGCCGTCACCGTAAGGA
GGAGGGTATTTGTCGCCACCGGACTGTGAAGGAGGAGGGTAATAGTAAGAGCTACCGCCA
CCGGAGCTGGGAGGAGAAGGAGGCGGAGGACATGCGGTAGTGGTTGATGGTGACGGTGGT
GGACGGGAAGGTGGCGGAGGGGGAGGATATGATGGGACGGGATTACAAGGATTGTCGCAG
GAAGAACACATTGTACAGGAAACAACCTCGTCCATTGATGTCACTGTCGAAGTCAGTGAT
AGCAGTAGAATGAGGACAAGTGTAGACAAACCATATAACTGGTTTGCTTCCATTGTCAGA
GATTTGGATTCAGATACTCGACTTTGAAGTCTGGAAATCTACAGAGGTAAGAGAGAGAG
GGAGAGAGTGAGAAAAA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2ER47TF 756 0 0
GTTATACAGATTCAAGAAAGTAAAAGCTAATCAATCATTTGGTCCAACATCTGGTTTTCA
TGATCAATGATATCTAAAAC*TTCAAAGGACTATGGTAGATCTACCGATCTGCCCCCACT
GTTCCGTCTTGAACGTATTATCCGGCGAACTCCGACGATTTTACCTTTATATTAAACAGA
GGAACATGGCGAAAAGAGCAAACATAATAGAACTAGAATCCATAAACCGATCTGAACCGG
AACCTGGCGGTGGCGTATGATAGTAAAACGGGAAATAAGGGACGATAGGGTTCGGCGGAG
GCGGCGTAGGATAGTTTCCTGAATACGGCGGAGGATAGTAATAACCTTGGCCGCCGTCAC
CGTAAGGAGGAGGGTATTTGTCGCCACCGGACTGTGAAGGAGGAGGGTAATAGTAAGAGC
TACCACCACTGGAGCTGGGAGGAGAAGGAGGCGGAGGACATGCGGTAGTGGTTGATGGTG
ACGGTGGTGGACGAGAAGGCGGCGGAGGGGGAGGATATGATGGGACGGGGTTACAAGGAT
TGTCGCAGGAAGAACACATTGTACAGGAAACAACCTCGTCCTTTGATGTCACTGTCGAAG
TCAGTGATAGTAGTAGAATGAGGACAAGTATAGACAAACCATATAACTGGTTTGCTTCCA
TTGTCAGAGATTTGGATTCAGATACTTGACTTTGAAGTCTGGAAATCTACAGAGGTAAGA
GAGCGAGTGAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAGAGGCC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 5

CO CL1308Contig1 1195 5 16 U
ACTGTTTTCACTGTTTTATTAGTATTTGATATCATAACCATGGCGGATGCGTAATAAGCA
TACATGAGTTCCCTTTTTCATGTATCTAGTTTTGCTCTAGTCTTAATATATTCACAGATC
TTGGGAGCGGGTTCAGAACAAGACATGAAGTTTTTTACATCTTTATTTTAGCAAAACTAA
TTGGAAACAGACTTAGCAGCTTGAAGCATTTCCACTATCAGTGTCTTCACATCCTTTCTG
TCTTGTGCGCGTCTTGGGAACGGAACTCGGATCTTGAAGGTGTTCCCTTGAAGAGTAGCC
TTAACGTTGAAACCAAGGCTGTCCAAATCAAGCATCAACGCGCTCTCCACAGGTATGGAT
GTTGTATGGTGTACAATAGCTTTGGTATCCTCTTCATGGTCTTTGTTCATGTGTGACGTT
ACAGGCTTTGCAAACTGAGCTATAGGATCGACTTTGGCTCCTTGGTACTCCTCTTTGCTG
AATTCTCCAGATCCTAGAAAAGCAGTTGCAACCCCTGAAACAAATCTCACAACTTTTGGT
TCAATTCGCATAAAGCTGAAGTCTCCAAAATCAACCCAGAAAGCATTGGGATGCTTGGCT
AAATAGGCAGATCGAACAGCCGCTTGATCTTTGTCAGAAACCAACACTGCATCACCATGT
AGGGTGATCCTCAAACCGGTCCTATCTTCTGGCTCTCTAGCAACCAGTAGTGAGCATTTT
GGATTAGCTAAGAGATCCTTTGTGTGTACAGCCAAGCTACTGACTGCAAGAATCGGAGAA
CCATCAGCATCACATGCAAAATCAACCATAGAGCCTGAAGGATAACCCTCATACTTCTGA
GAGAAAGTGGAAAGCATACCACAAACACTACCGTTAAGCACAGTTCGTATTTCCTCAACA
GGAGAAAGACGAGCAGCCTTCGCCTCATGAGCTTGAATCAATTTGAAAACATCTGTCTCA
CTGCCGATACTCCCCGGCGATACAGCCTGAGAAGAAGACTGAGCTGCTGAGGCCATCACG
GTGAGAGAAGACGACTTTCGACTGCGGAGGGAGGAGAGAGCGACGGTGGAGATCGATTGT
GGATGAATAAGACATGTAGTAGAGAAGAATCTAGCCGTGATTAAAGGCGTTGAGAAATGA
GCAACTACCGACTTCATCTTCCTGCTTCTTCACGAAACCTTCAATGTTCGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD38JQ U 1
AF RR2B853JQ U 18
AF RR2F526JQ U 94
AF RR2GD38TF C 295
AF RR2B853TF C 518
BS 1 49 RR2GD38JQ
BS 50 50 RR2B853JQ
BS 51 292 RR2GD38JQ
BS 293 293 RR2B853JQ
BS 294 299 RR2GD38JQ
BS 300 661 RR2B853JQ
BS 662 662 RR2GD38TF
BS 663 820 RR2F526JQ
BS 821 821 RR2GD38TF
BS 822 845 RR2F526JQ
BS 846 846 RR2GD38TF
BS 847 857 RR2F526JQ
BS 858 964 RR2GD38TF
BS 965 965 RR2B853TF
BS 966 1095 RR2GD38TF
BS 1096 1195 RR2B853TF

RD RR2GD38JQ 299 0 0
ACTGTTTTCACTGTTTTATTAGTATTTGATATCATAACCATGGCGGATGTGTAATAAGCA
TACATGAGTTCCCTTTTTCATGTATCTAGTTTTGCTCTAGTCTTAATATATTCACAGATC
TTGGGAGCGGGTTCAGAACAAGACATGAAGTTTTTTACATCTTTATTTTAGCAAAACTAA
TTGGAAACAGACTTAGCAGCTTGAAGCATTTCCACTATCAGTGTCTTCACATCCTTTCTG
TCTTGTGCGCGTCTTGGGAACGGAACTCGGATCTTGAAGGTGTTCCCTTGAAAAGTAGC

QA 1 299 1 299
DS 

RD RR2B853JQ 647 0 0
ATTAGTATTTGATATCATAACCATGGCGGATGCGTAATAAGCATACATGAGTTCCCTTTT
TCATGTATCTAGTTTTGCTCTAGTCTTAATATATTCACAGATCTTGGGAGCGGGTTCAGA
ACAAGACATGAAGTTTTTTACATCTTTATTTTAGCAAAACTAATTGGAAACAGACTTAGC
AGCTTGAAGCATTTCCACTATCAGTGTCTTCACATCCTTTCTGTCTTGTGCGCGTCTTGG
GAACGGAACTCGGATCTTGAAGGTGTTCCCTTGAAGAGTAGCCTTAACGTTGAAACCAAG
GCTGTCCAAATCAAGCATCAACGCGCTCTCCACAGGTATGGATGTTGTATGGTGTACAAT
AGCTTTGGTATCCTCTTCATGGTCTTTGTTCATGTGTGACGTTACAGGCTTTGCAAACTG
AGCTATAGGATCGACTTTGGCTCCTTGGTACTCCTCTTTGCTGAATTCTCCAGATCCTAG
AAAAGCAGTTGCAACCCCTGAAACAAATCTCACAACTTTTGGTTCAATTCGCATAAAGCT
GAAGTCTCCAAAATCAACCCAGAAAGCATTGGGATGCTTGGCTAAATAGGCAGATCGAAC
AGCCGCTTGATCTTTGTCAGAAACCAACACTGCATCACCATGTA
GGG

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2F526JQ 764 0 0
GCTCTAGTCTTAATATATTCACAGATCTTGGGAGCGGGTTCAGAACAAGACATGAAGTTT
TTTACATCTTTATTTTAGCAAAACTAATTGGAAACAGACTTAGCAGCTTGAAGCATTTCC
ACTATCAGTGTCTTCACATCCTTTCTGTCTTGTGCGCGTCTTGGGAACGGAACTCGGATC
TTGAAGGTGTTCCCTTGAAGAGTAGCCTTAACGTTGAAACCAAGGCTGTCCAAATCAAGC
ATCAAGGCGCTCTCCACAGGTATGGATGTTGTATGGTGTACAATAGCTTTGGTATCCTCT
TCATGGTCTTTGTTCATGTGTGACGTTACAGGCTTTGCAAACTGAGCTATAGGATCGACT
TTGGCTGCTTGGTACTCCTCTTTGCTGAATTCTCCAGATCCTAGAAAAGCAGTTGCAACC
CCTGAAACAAATCTCACAACTTTTGGTTCAATCCGCATAAAGCTGAAGTCTCCAAAATCA
ACCCAGGAAGCATTGGGATGCTTGGCTAAATAGGCAGATCGAACAGCCGCTTGATCTTTG
TCAGAAACCAACACTGCATCACCATGTAAGGTGATCCTCAAACCGGTCCTATCTTCTGGC
TCTCTAGCAACCAGTAGTGAGCATTTTGGATTAGCTAAGAGATCCTTTGTGTGTACAGCC
AAGCTACTGACTGCAAGAATCGGAGAACCATCAGCATCACATGCAAAATCAACCATAGAG
CCTGAAG*ATAACCCTCATACTTCTGAGAGAA*GTGGAAAGCAT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2GD38TF 803 0 0
GAGTAGCTTAACG
TGAAACCAAGGCTGTCCAAATCAAGCATCAACGCGCTCTCCACAGGTATGGATGT*GTAT
G*TGTACAATAGCTTTGGTATCCTCTTCATGGTCTTTGTTCATGTGTGACGTTACAGGCT
TTGCAAACTGAGCTATAGGATCGACTTTGGCTCCTTGGTACTCCTCTTTGCTGAATTCTC
CAGATCCTAGAAAAGCAGTTGCAACCCCTGAAACAAATCTCACAACTTTTGGTTCAATTC
GCATAAAGCTGAAGTCTCCAAAATCAACCCAGAAAGCATTGGGATGCTTGGCTAAATAGG
CAGATCGAACAGCCGCTTGATCTTTGTCAGAAACCAACACTGCATCACCATGTAGGGTGA
TCCTCAAACCGGTCCTATCTTCTGGCTCTCTAGCAACCAGTAGTGAGCATTTTGGATTAG
CTAAGAGATCCTTTGTGTGTACAGCCAAGCTACTGACTGCAAGAATCGGAGAACCATCAG
CATCACATGCAAAATCAACCATAGAGCCTGAAGGATAACCCTCATACTTCTGAGAGAAAG
TGGAAAGCATACCACAAACACTACCGTTAAGCACAGTTCGTATTTCCTCAACAGGAGAAA
GACGAGCAGCCTTCGCCTCATGAGCTTGAATCAATTTGAAAACATCTGTCTCACTGCTGA
TACTCCCCGGCGATACAGCCTGAGAAGAAGACTGAGCTGCTGAGGCCATCACGGTGAGAG
AAGACGACTTTCGACTGCGGAGGGAGGAGAGAGCGACGGTGGAGATCGATTGTGGATGAA
TAAGACAT
CC

QA 14 801 14 801
DS 

RD RR2B853TF 678 0 0
AAACAAATCTCACAACTTTTGGTTCAATTCGCATAAAGCTGAAGTCTCCAAAATCAACCC
AGAAAGCATTGGGATGCTTGGCTAAATAGGCAGATCGAACAGCCGCTTGATCTTTGTCAG
AAACCAACACTGCATCACCATGTAGGGTGATCCTCAAACCGGTCCTATCTTCTGGCTCTC
TAGCAACCAGTAGTGAGCATTTTGGATTAGCTAAGAGATCCTTTGTGTGTACAGCCAAGC
TACTGACTGCAAGAATCGGAGAACCATCAGCATCACATGCAAAATCAACCATAGAGCCTG
AAGGATAACCCTCATACTTCTGAGAGAAAGTGGAAAGCATACCACAAACACTACCGTTAA
GCACAGTTCGTATTTCCTCAACAGGAGAAAGACGAGCAGCCTTCGCCTCATGAGCTTGAA
TCAATTTGAAAACATCTGTCTCACTGCCGATACTCCCCGGCGATACAGCCTGAGAAGAAG
ACTGAGCTGCTGAGGCCATCACGGTGAGAGAAGACGACTTTCGACTGCGGAGGGAGGAGA
GAGCGACGGTGGAGATCGATTGTGGATGAATAAGACATGTAGTAGAGAAGAATCTAGCCG
TGATTAAAGGCGTTGAGAAATGAGCAACTACCGACTTCATCTTCCTGCTTCTTCACGAAA
CCTTCAATGTTCGTTTCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 2 5

CO CL1309Contig1 1248 3 18 U
GGGAACACAGAAACAAGAAAAACAAAACACGAAGTTTACGAGTTTCGTTTGAGAGCTCAA
AGGTTCCAGATTTCAAAAGAGCTTCCTTTTTATTTCTCCAGAATCATTTTCTAGATCAAT
AGCGGTTTCTGTCATTGGGTGAAAGATGTCGGATCATCTGAGTTTATGTACGGATCGTCT
CATAACGGGTGAGAGCTTGAAGTCAGAGAAGGATTGTGGAGAGAGTTCTTGTCCTCAAGG
CAGAGATGTGGCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTGCGTCTGTCGATGAAGCTGAAGATGCCAG
GAAGTACTATGCTGTTGTCGCTACAGAAGAGGAACCGCTTCTCCAGTCTGTTGAGTGCCG
TATTTGCCAGGAGGAAGATACCACTAACAACCTCGAGGCTCCTTGTGCTTGCAATGGCAG
TTTGAAGTATGCGCACCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAACGAGAAAGGCGACATTAT
CTGCGAAATATGCCACCAGCCTTATCAATCTGGATATACAGCACCTCCACCAACTCCTCC
TGACGAAACTATAATTCACATTGGTGAGGATTGGGAGACTGGAGTTCACTTGGACTTGAG
CGACCCGCGCATTCTAGCAATGGCTGCAGCAGAACGCCATTTCTTGGAAGCTGACTATGA
CGAGTGCACCGAGTCTAACTCGAGCGGTGCTGCCTTCTGTCGCTCTGCTGCTCTCATCCT
CATGGCACTTTTACTGTTAAGAGATGCACTAAACCTCACGACTAACCCCGATGACGAGGA
TGATCCCACTGCCTTCTTCTCTCTTTTTCTTCCTCGTGCTGCTGGTTTTCTCCTGCCGTG
TTACATCATGGCATGGGCCATTGGAATTCTCCAGCGCCGGAGGCAAAGACAGGAAGCTGC
TGCTCTAGCTGCCGCGGAAGTTGCCTTCATGATACACGGTGGTGTGCCTCAACGCAGGGG
ACTTCACTTTGCTTTATCACCAGAGCAGCAGCCGATTTCCAACCCAACACCAGTCTGATC
CTTCTCCCAGCAATGATTTTCTGGTAAGACTCTTAAGACAAAACCCTGAACTTTGTTGTA
AGAACTTCCACCTACTTATGCTCCTTCTTCTTCACATGTTTTATCATTTTGCTCGAATGT
TTATGTTCTCTGAATCTGTTAAATGTTACTTATCTACTACCAAATGTTGTCAAAGCTCTC
AGGGCACATTGTGTACAGTTTTATTGTTATTATGGTTTTCTTTCTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP21TF U 7
AF RR2BQ45TF U 1
AF RR2BQ45JQ C 529
BS 1 261 RR2BQ45TF
BS 262 267 RR2EP21TF
BS 268 318 RR2BQ45TF
BS 319 319 RR2EP21TF
BS 320 322 RR2BQ45TF
BS 323 323 RR2EP21TF
BS 324 387 RR2BQ45TF
BS 388 388 RR2EP21TF
BS 389 411 RR2BQ45TF
BS 412 412 RR2EP21TF
BS 413 462 RR2BQ45TF
BS 463 463 RR2EP21TF
BS 464 526 RR2BQ45TF
BS 527 527 RR2EP21TF
BS 528 731 RR2BQ45TF
BS 732 732 RR2BQ45JQ
BS 733 754 RR2BQ45TF
BS 755 1248 RR2BQ45JQ

RD RR2EP21TF 672 0 0
GG
AGAAACAAGAAAAACAAAACACGAAGTTTACGAGTTTCGTTTGAGAGCTCAAAGGTTCCA
GATTTCAAAAGAGCTTCCTTTTTATTTCTCCAGAATCATTTTCTAGATCAATAGCGGTTT
CTGTCATTGGGTGAAAGATGTCGGATCATCTGAGTTTATGTACGGATCGTCTCATAACGG
GTGAGAGCTTGGAGTCAGAGAAGGATTGTGGAGAGAGTTCTTGTCCTCAAGGCAGAGATG
TGGCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTGCGTCTGTCGATGAAGCTGAAGATGCCAGGAAGTACT
ATGCTGTTGTCGCTACAGAAGAGGAACCGCTTCTCCAGTCTGTTGAGTGCCGTATTTGCC
AGGAGGAAGATATCACTAACAACTTGGAGGCTCCTTGTGCTTGCAATGGCAGTTTGAAGT
ATGCGCACCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAACGAGAAAGGTGACATTATCTGCGAAA
TATGCCACCAGCCTTATCAATCTGGATATACAGCACCTCCACCTCCTCCTCCTGATGAAA
CTATAATTCACATTGGTGAGGATTGGGAGACTGGAGTTCACTTGGACTTGAGCGACCCGC
GCATTCTAGCAATGGCTGCAGCAGA*CGCCATTTCTTGGAAGCTGACTATGACGAGTACA
CCGAGTCTA
C

QA 3 671 3 671
DS 

RD RR2BQ45TF 760 0 0
GGGAACACAGAAACAAGAAAAACAAAACACGAAGTTTACGAGTTTCGTTTGAGAGCTCAA
AGGTTCCAGATTTCAAAAGAGCTTCCTTTTTATTTCTCCAGAATCATTTTCTAGATCAAT
AGCGGTTTCTGTCATTGGGTGAAAGATGTCGGATCATCTGAGTTTATGTACGGATCGTCT
CATAACGGGTGAGAGCTTGAAGTCAGAGAAGGATTGTGGAGAGAGTTCTTGTCCTCAAGG
CAGAGATGTGGCTTCTTCTTC******GTCTGCGTCTGTCGATGAAGCTGAAGATGCCAG
GAAGTACTATGCTGTTGTTGCTGCAGAAGAGGAACCGCTTCTCCAGTCTGTTGAGTGCCG
TATTTGCCAGGAGGAAGATACCACTAAGAACCTCGAGGCTCCTTGTGCTTGTAATGGCAG
TTTGAAGTATGCGCACCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACATTAT
CTGCGAAATATGCCACCAGCCTTATCAATCTGGATATACAGCACCTTCACCAACTCCTCC
TGACGAAACTATAATTCACATTGGTGAGGATTGGGAGACTGGAGTTCACTTGGACTTGAG
CGACCCGCGCATTCTAGCAATGGCTGCAGCAGAACGCCATTTCTTGGAAGCTGACTATGA
CGAGTGCACCGAGTCTAACTCGAGCGGTGCTGCCTTCTGTCGCTCTGCTGCTCTCATCCT
CATGGCACTTT*ACTGTTAAGAGATGCACTAAAC
TCACGA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2BQ45JQ 720 0 0
ACCAA
CTCCTCCTGACGAAACTATAATTCACATTGGTGAGGATTGGGAGACTGGAGTTCACTTGG
ACTTGAGCGACCCGCGCATTCTAGCAATGGCTGCAGCAGAACGCCATTTCTTGGAAGCTG
ACTATGACGAGTGCACCGAGTCTAACTCGAGCGGTGCTGCCTTCTGTCGCTCTGCTGCTC
TCATCCTCATGGCACTTTTACTGTTAAGAGATGCACTAAACCTCACGACTAACCCCGATG
ACGAGGATGATCCCACTGCCTTCTTCTCTCTTTTTCTTCCTCGTGCTGCTGGTTTTCTCC
TGCCGTGTTACATCATGGCATGGGCCATTGGAATTCTCCAGCGCCGGAGGCAAAGACAGG
AAGCTGCTGCTCTAGCTGCCGCGGAAGTTGCCTTCATGATACACGGTGGTGTGCCTCAAC
GCAGGGGACTTCACTTTGCTTTATCACCAGAGCAGCAGCCGATTTCCAACCCAACACCAG
TCTGATCCTTCTCCCAGCAATGATTTTCTGGTAAGACTCTTAAGACAAAACCCTGAACTT
TGTTGTAAGAACTTCCACCTACTTATGCTCCTTCTTCTTCACATGTTTTATCATTTTGCT
CGAATGTTTATGTTCTCTGAATCTGTTAAATGTTACTTATCTACTACCAAATGTTGTCAA
AGCTCTCAGGGCACATTGTGTACAGTTTTATTGTTATTATGGTTTTCTTTCTGCT

QA 6 720 6 720
DS 



CO CL1309Contig2 844 2 18 U
GGCAGCAAGAAAACCATAATAACAATAAAACTGTACATAATGCCCCGAGAGCTTTGACAA
CATTTAAAAGTAGAGAAGTAACATTTAACAGATTCAGAGAACATAAACATACGAGCAAAA
TGATAAAACATGTGAAGAAGAAGCATAAGTAGGTGGAAAGTTCTTACAACAAAGTTCAGG
GTTTTGTCTTAACAGTCTTACCGGAGAATCATTGCTGGGAGAAGGGATCAGACCGGTGTT
GGGTTGGACACTGGCGGCTGCTCTGGTGATAAAGCAAAGTGAAGTCCCCTGCGTTGAGGC
ACACCACCGTGTATCATGAACGCAACTTCCGCGGCAGCTAGAGCAGCAGCCTCCTGTCTT
TGCCTCCGGCGCTGGAGAATTCCAATGGCCCATGCCATGATGTAACATGGCAGGAGAAAA
CCAGCAGCACGAAGAAGAAAAAGAGAGAAGAAGGCAGTGGGATCGTCCTCGTCATCCGGG
TTAGTCGTGAGGTTTAGTGCATCTCGTAACAGTAAAAGTGCCATCAGGATGAGAGCAGCA
GAGCGACAGAAGGCAGCACCGCTTGAGTTAGACTCGGTGTACTCGTCATAGTCAGCTTCC
AAGAAATGGCGTTCTGCTGCAGCCATTGCTAGAATGCGCGGGTCGCTCAAGTCCAAGTGA
ACTCCAGTCTCCCAATCCTCACCAATGTGAATTATAGTTTCGTCAGGAGGAGGAGGTGGA
GGTGCTGTATATCCAGACTGATAAGCTGGTGGCATATTTCGCAGATATGTCACCTTTCTC
ATTACACCAACGCTGACACACTTGCGTGCGCATACTTCAAACTGCCATTGCAGCACAGGA
GCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2EP21JQ U 1
AF RR2EB44JQ U 13
BS 1 182 RR2EP21JQ
BS 183 184 RR2EB44JQ
BS 185 225 RR2EP21JQ
BS 226 226 RR2EB44JQ
BS 227 233 RR2EP21JQ
BS 234 234 RR2EB44JQ
BS 235 248 RR2EP21JQ
BS 249 249 RR2EB44JQ
BS 250 275 RR2EP21JQ
BS 276 276 RR2EB44JQ
BS 277 320 RR2EP21JQ
BS 321 321 RR2EB44JQ
BS 322 350 RR2EP21JQ
BS 351 351 RR2EB44JQ
BS 352 565 RR2EP21JQ
BS 566 566 RR2EB44JQ
BS 567 701 RR2EP21JQ
BS 702 844 RR2EB44JQ

RD RR2EP21JQ 702 0 0
GGCAGCAAGAAAACCATAATAACAATAAAACTGTACATAATGCCCCGAGAGCTTTGACAA
CATTTAAAAGTAGAGAAGTAACATTTAACAGATTCAGAGAACATAAACATACGAGCAAAA
TGATAAAACATGTGAAGAAGAAGCATAAGTAGGTGGAAAGTTCTTACAACAAAGTTCAGG
GT**TGTCTTAACAGTCTTACCGGAGAATCATTGCTGGGAGAAGG*ATCAGACTGGTGTT
GGGTTGGATACTGGCGGCTGCTCTGGTGATAAAGCGAAGTGAAGTCCCCTGCGTTGAGGC
ACACCACCGTGTATCATGAAGGCAACTTCCGCGGCAGCTAGAGCAGCAGCTTCCTGTCTT
TGCCTCCGGCGCTGGAGAATTCCAATGGCCCATGCCATGATGTAACATGGCAGGAGAAAA
CCAGCAGCACGAAGAAGAAAAAGAGAGAAGAAGGCAGTGGGATCGTCCTCGTCATCCGGG
TTAGTCGTGAGGTTTAGTGCATCTCGTAACAGTAAAAGTGCCATCAGGATGAGAGCAGCA
GAGCGACAGAAGGCAGCACCGCTTGGGTTAGACTCGGTGTACTCGTCATAGTCAGCTTCC
AAGAAATGGCGTTCTGCTGCAGCCATTGCTAGAATGCGCGGGTCGCTCAAGTCCAAGTGA
ACTCCAGTCTCCCAATCCTCACCAATGTGAATTATAGTTTC
A

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2EB44JQ 832 0 0
ACCATAGTAACAATAAAACTGTACATAATGCCCCGAGAGCTTTGACAACATTTAAAAGTA
GAGAAGTAACATTTAACAGATTCAGAGAACATAAACATACGAGCAAAATGATAAAACATG
TGAAGAAGAAGCATAGGTAGGTGGAAAGTTCTTACAACAAAGTTCAGGGTTTTGTCTTAA
CAGTCTTACCGGAGAATCATTGCTGGGAGAAGGGATCAGACCGGTGTTGGGTTGGACACT
GGCGGCTGCTCTGGTGATAAAGCAAAGTGAAGTCCCCTGCGTTGAGGCACACCACCGTGT
ATCATGAACGCAACTTCCGCGGCAGCTAGAGCAGCTGCCTCCTGTCTTTGCCTCCGGCGC
TGGAGAATTCCAATGGCCCATGCCATGATGTAACATGGCAGGAGAAAACCAGCAGCACGA
AGAAGAAAAAGAGAGAAGAAGGCAGTGGGATCGTCCTCGTCATCTGGGTTAGTCGTGAGG
TTTAGTGCATCTCTTAACAGTAAAAGTGCCATCAGGATGAGAGCAGCAGAGCGACAGAAG
GCAGCACCGCTTGAGTTAGACTCGGTGTACTCGTCATAGTCAGCTTCCAAGAAATGGCGT
TCTGCTGCAGCCATTGCTAGAATGCGCGGGTCGCTCAAGTCCAAGTGAACTCCAGTCTCC
CAATCCTCACCAATGTGAATTATAGTTTCGTCAGGAGGAGGAGGTGGAGGTGCTGTATAT
CCAGACTGATAAGCTGGTGGCATATTTCGCAGATATGTCACCTTTCTCATTACACCAACG
CTGACACACTTGCGTGCGCATACTTCAAACTGCCATTGCAGCACAGGAGCTC

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 2

CO CL1310Contig1 580 2 3 U
GGGGGCATCTGAACAAACCATCGATCCAGGCCTTGATTCATGGATTGAACAGACACTACT
ATTCTATAGCCATCAACTATAGGAAGAACGAGCTCGAGGAGAAGATGTTACTTAACCTCC
ACAAGAAGAAATGGACAGATGGTCTGACGTTAAGACGCTTTGACACCCACTCCAAACAAA
CGAACAGACTGTTCAGGAAATGTTGAGCTTGGCTGCTAAATATAACAAGGCGGTACAAGA
GGAGGACGAGTCGTCACCGGAGAAACTGGCGATCGTGAATGTGGGAAGACAAGACGCAAG
AAGCATCTGGAAGAACATGTTTCCAACTTGATGTCATCCAACATTGTTCAGACACTAGGC
ACCATGCTCGACACTGTTGTCTTCTAGAGTACTTGTTCACTTTACCAGCCAGGTGTACTC
TGCTTCAGTCATTTTGGCTGGGAAGTTGAACTTCGTTCTTCTGCATCTCTTTTGTTTCTG
TTGAATCAACTCTTTATGACTTATCTCCTAGCAAGTATCTGATAAGATTGTATTGTACTA
TGTGGTTTCGTTCTTCTCATTAAGGCTATGGATTGATTCT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2CQ40JQ C 1
AF RR2CQ40TF U 1
BS 1 2 RR2CQ40JQ
BS 3 578 RR2CQ40TF
BS 579 580 RR2CQ40JQ

RD RR2CQ40JQ 580 0 0
GGGGGCATCTGAACAAACCATCGATCCAGGCCTTGATTCATGGATTGAACAGACACTACT
ATTCTATAGCCATCAACTATAGGAAGAACGAGCTCGAGGAGAAGATGTTACTTAACCTCC
ACAAGAAGAAATGGACAGATGGTCTGACGTTAAGACGCTTTGACACCCACTCCAAACAAA
CGAACAGACTGTTCAGGAAATGTTGAGCTTGGCTGCTAAATATAACAAGGCGGTACAAGA
GGAGGACGAGTCGTCACCGGAGAAACTGGCGATCGTGAATGTGGGAAGACAAGACGCAAG
AAGCATCTGGAAGAACATGTTTCCAACTTGATGTCATCCAACATTGTTCAGACACTAGGC
ACCATGCTCGACACTGTTGTCTTCTAGAGTACTTGTTCACTTTACCAGCCAGGTGTATTC
TGCTTCAGTCATTTTGGCTGGGAAGTTGAACTTCGTTCTTCTGCATCTCTTTTGTTTCTG
TTGAATCAACTCTTTATGACTTATCTCCTAGCAAGTATCTGATAAGATTGTATTGTACTA
TGTGGTTTCGTTCTTCTCATTAAGGCTATGGATTGATTCT

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2CQ40TF 580 0 0
GG
GGGCATCTGAACAAACCATCGATCCAGGCCTTGATTCATGGATTGAACAGACACTACTAT
TCTATAGCCATCAACTATAGGAAGAACGAGCTCGAGGAGAAGATGTTACTTAACCTCCAC
AAGAAGAAATGGACAGATGGTCTGACGTTAAGACGCTTTGACACCCACTCCAAACAAACG
AACAGACTGTTCAGGAAATGTTGAGCTTGGCTGCTAAATATAACAAGGCGGTACAAGAGG
AGGACGAGTCGTCACCGGAGAAACTGGCGATCGTGAATGTGGGAAGACAAGACGCAAGAA
GCATCTGGAAGAACATGTTTCCAACTTGATGTCATCCAACATTGTTCAGACACTAGGCAC
CATGCTCGACACTGTTGTCTTCTAGAGTACTTGTTCACTTTACCAGCCAGGTGTACTCTG
CTTCAGTCATTTTGGCTGGGAAGTTGAACTTCGTTCTTCTGCATCTCTTTTGTTTCTGTT
GAATCAACTCTTTATGACTTATCTCCTAGCAAGTATCTGATAAGATTGTATTGTACTATG
TGGTTTCGTTCTTCTCATTAAGGCTATGGATTGATT
CT

QA 3 578 3 578
DS 



AS 1 6

CO CL1311Contig1 1253 6 11 U
GACCACGTAAATAAAAATATTATTTCGATGCATCAGTAGTTTTGAAGTTACTTATGGCCA
AAAATTTTAAACCAAATTAAAATTTTAAAAGTTCACGGACCAATCAACGACGGCAAAAAG
AATATCTCTCAGGTCTCAAACAGCTCCAATAATGCTTCTAAGGCATGTATATTGTTAAAA
AGGTAAATGAACACAATTCCAAAATTGTGATTTCGTTCTTCGCATCATCTTATTATTGGC
TCCGCACTTCACAAGGATTGCTTGAAGATCACATACCAATGGTCTTTTGGAACTTTGTAA
TCTGGTTCAGGAAGATCCATGTCATCATGACGTGAGGGGCGATCCTGACGCAGTAAACAG
GGAAACCTGTGTAGAATTTCAGAGGTCCTCCTGATTTCAAGGTTTGCATGGCACAGTCGA
GCGAACCCGTGTATGGATATTTACCCTGAGCGTCCGGTTGCATTTTCTGGATCTGAGTTT
TGACAAAGTCAAGCGGGAGACTGCACGCCGCTGCGCAGAATCCTGAAACAGCACTTGCTC
CTACGACAGTGGAAGTCTCCCCAAGACCAAGGTTATCTCTCATATATTCAGCACTTTGAT
CATAAGAAGCAAGCATCCCCATGTTCAAAGCCATTGCCCTGACCACAGTGGGACCACAAC
CTTTCCAAAGTGCTAAGACTCCTTCATCAGCGCTACTACGGTAAAGCGCATGGAAAGCAT
TGGTATAGTTCCTGCGCTGAGCTAACGGCAAGGTGTTATCAGCTTGCATTCTGATAAGCG
CCAAATCAGCTGGACTACCAACGCAAGCACCAATCGCACCAGCTGTTAGACCACATAGAG
CCTTCTGATACAGAGGTAGTGGCTTCCCATCGTTAGCCTCACTTGCTTTTGCCGTCAGCA
TCTTGAATGATCCAAGACGGGCAGTGGTGTAAGTTGCTTGCCTCAACAAACCAGCAGATA
AACCCTTGTAGAAAGCACCGATGCCTTCATTCTTCAACATGGTAGAGGTCACACTGGCTG
CAGATCCCTGGCCTAGTTGAATCCTCACCTTGATCATGTCGATCGGCTGGATAACGCAGG
TAGCGAGCATACCGGAGGTACCGCCATTGACGAAGGGCTTCACAGTGTTCCAGATACCAA
TCGGAGCTACTTTTTTCTCTTCCGCCATCTCCTCCTTTTTTCTCGGGGATATAGAAACGT
GCAACTAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGATTCTGAACTCGCTTTGGTGGAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B363JQ U 87
AF RR2B248JQ U 87
AF RR2D182JQ U 1
AF RR2D182TF C 505
AF RR2B363TF C 527
AF RR2B248TF C 546
BS 1 275 RR2D182JQ
BS 276 276 RR2B363JQ
BS 277 349 RR2D182JQ
BS 350 350 RR2B363JQ
BS 351 492 RR2D182JQ
BS 493 493 RR2B363JQ
BS 494 695 RR2D182JQ
BS 696 696 RR2B248JQ
BS 697 836 RR2D182JQ
BS 837 1246 RR2D182TF
BS 1247 1253 RR2B248TF

RD RR2B363JQ 598 0 0
AAAAGTTCACGGACCAATCAACGACGGCAAAAAGAATATCTCTCAGGTCTCAAACAGCTC
CAATAATGCTTCTAAGGCATGTATATTGTTAAAAAGGTAAATGAACACAATTCCAAAATT
GTGATTTCGTTCTTCGCATCATCTTATTATTGGCTCCGCACTTCACAAGGATTGCTTGAA
GATCACATACCAATGGTCTTTTGGAACTTTGTAATCTGGTTCAGGAAGATCCATGTCATC
ATGACGTGAGGGGCGATCCTGACGCAGTAAACAGGGAAACCTGTGTAGAATTTCAGAGGT
CCTCCTGATTTCAAGGTTTGCATGGCACAGTCGAGCGAACCCGTGTATGGATATTTACCC
TGAGCGTCCGGTTGCATTTTCTGGATCTGAGTTTTGACAAAGTCAAGCGGGAGACTGCAC
GCCGCTGCGCAGAATCCTGAAACGGCACTTGCTCCTACGACAGTGGAAGTCTCCCCAAGA
CCAAGGTTATCTCTCATATATTCAGCACTTTGATCATAAGAAGCAAGCATCCCCATGTTC
AAAGCCATTGCCCTGACCACAGTGGGACCACAACCTTTCCAAAGTGCTAAGACTCCTT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2B248JQ 641 0 0
AAAAGTTCACGGACCAATCAACGACGGCAAAAAGAATATCTCTCAGGTCTCAAACAGCTC
CAATAATGCTTCTAAGGCATGTATATTGTTAAAAAGGTAAATGAACACAATTCCAAAATT
GTGATTTCGTTCTTCGCATCATCTTATTATTGGCTCCGCACTTCACAAGGATTGCTTGAA
GATCACATACCAATAGTCTTTTGGAACTTTGTAATCTGGTTCAGGAAGATCCATGTCATC
ATGACGTGAGGGGCGATCCTGACGCAGTAAACAGGGAAACCTGTGTAGAATTTCAGAGGT
CCTCCTGATTTCAAGGTTTGCATGGCACAGTCGAGCGAACCCGTGTATGGATATTTACCC
TGAGCGTCCGGTTGCATTT*CTGGATCTGAGTTTTGACAAAGTCAAGCGGGAGACTGCAC
GCCGCTGCGCAGAATCCTGAAACGGCACTTGCTCCTACGACAGTGGAAGTCTCCCCAAGA
CCAAGGTTATCTCTCATATATTCAGCACTTTGATCATAAGAAGCAAGCATCCCCATGTTC
AAAGCCATTGCCCTGACCACAGTGGGACCACAACCTTTCCAAAGTGCTAAGACCCCTTCA
TCAGCGCTACTACGGTAAAGCGCATGGAAAGCATTGGTATA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2D182JQ 836 0 0
GACCACGTAAATAAAAATATTATTTCGATGCATCAGTAGTTTTGAAGTTACTTATGGCCA
AAAATTTTAAACCAAATTAAAATTTTAAAAGTTCACGGACCAATCAACGACGGCAAAAAG
AATATCTCTCAGGTCTCAAACAGCTCCAATAATGCTTCTAAGGCATGTATATTGTTAAAA
AGGTAAATGAACACAATTCCAAAATTGTGATTTCGTTCTTCGCATCATCTTATTATTGGC
TCCGCACTTCACAAGGATTGCTTGAAGATCACATAACAATGGTCTTTTGGAACTTTGTAA
TCTGGTTCAGGAAGATCCATGTCATCATGACGTGAGGGGCGATCCTGACACAGTAAACAG
GGAAACCTGTGTAGAATTTCAGAGGTCCTCCTGATTTCAAGGTTTGCATGGCACAGTCGA
GCGAACCCGTGTATGGATATTTACCCTGAGCGTCCGGTTGCATTTTCTGGATCTGAGTTT
TGACAAAGTCAAACGGGAGACTGCACGCCGCTGCGCAGAATCCTGAAACAGCACTTGCTC
CTACGACAGTGGAAGTCTCCCCAAGACCAAGGTTATCTCTCATATATTCAGCACTTTGAT
CATAAGAAGCAAGCATCCCCATGTTCAAAGCCATTGCCCTGACCACAGTGGGACCACAAC
CTTTCCAAAGTGCTAAGACTCCTTCATCAGCGCTAATACGGTAAAGCGCATGGAAAGCAT
TGGTATAGTTCCTGCGCTGAGCTAACGGCAAGGTGTTATCAGCTTGCATTCTGATAAGCG
CCAAATCAGCTGGACTACCAACGCAAGCACCAATCGCACCAGCTGTTAGACCACAT

QA 1 836 1 836
DS 

RD RR2D182TF 744 0 0
ACGCCGCTGCGCAGAATC*TGAAACAGCACTTGCTC*TACGACAGTGGAAGTCTCCCCAA
GACCAAGGTTATCTCTCATATATTCAGCACTTTGATCATAAGAAGCAAGCATCCCCATGT
TCAAAGCCATTGCCCTGACCACAGTGGGACCACAACCTTTCCAAAGTGCTAAGACTCCTT
CATCAGCGCTAATACGGTAAAGCGCATGGAAAGCATTGGTATAGTTCCTGCGCTGAGCTA
ACGGCAAGGTGTTATCAGCTTGCATTCTGATAAGCGCCAAATCAGCTGGACTACCAACGC
AAGCACCAATCGCACCAGCTGTTAGACCACATAGAGCCTTCTGATACAGAGGTAGTGGCT
TCCCATCGTTAGCCTCACTTGCTTTTGCCGTCAGCATCTTGAATGATCCAAGACGGGCAG
TGGTGTAAGTTGCTTGCCTCAACAAACCAGCAGATAAACCCTTGTAGAAAGCACCGATGC
CTTCATTCTTCAACATGGTAGAGGTCACACTGGCTGCAGATCCCTGGCCTAGTTGAATCC
TCACCTTGATCATGTCGATCGGCTGGATAACGCAGGTAGCGAGCATACCGGAGGTACCGC
CATTGACGAAGGGCTTCACAGTGTTCCAGATACCAATCGGAGCTACTTTTTTCTCTTCCG
CCATCTCCTCCTTTTTTCTCGGGGATATAGAAACGTGCAACTAGAAGAAGAAGAAGAAGA
GAGATTCTGAACTCGCTTTGGT
CC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2B363TF 727 0 0
AACG
GCACTTGCTC*TACGACAGTGGAAGTCTCCCCAAGACCAAGGTTATCTCTCATATATTCA
GCACTTTGATCATAAGAAGCAAGCATCCCCATGTTCAAAGCCATTGCCCTGACCACAGTG
GGACCACAACCTTTCCAAAGTGCTAAGACTCCTTCATCAGCGCTACTACGGTAAAGCGCA
TGGAAAGCATTGGTATAGTTCCTGCGCTGAGCTAACGGCAAGGTGTTATCAGCTTGCATT
CTGATAAGCGCCAAATCAGCTGGACTACCAACGCAAGCACCAATCGCACCAGCTGTTAGA
CCACATAGAGCCTTCTGATACAGAGGTAGTGGCTTCCCATCGTTAGCCTCACTTGCTTTT
GCCGTCAGCATCTTGAATGATCCAAGACGGGCAGTGGTGTAAGTTGCTTGCCTCAACAAA
CCAGCAGATAAACCCTTGTAGAAAGCACCGATGCCTTCATTCTTCAACATGGTAGAGGTC
ACACTGGCTGCAGATCCCTGGCCTAGTTGAATCCTCACCTTGATCATGTCGATCGGCTGG
ATAACGCAGGTAGCGAGCATACCGGAGGTACCGCCATTGACGAAGGGCTTCACAGTGTTC
CAGATACCAATCGGAGCTACTTTTTTCTCTTCCGCCATCTCCTCCTTTTTTCTCGGGGAT
ATAGAAACGTGCAACTAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGATTCTGAACTCGCTTTGGT
GGAGACC

QA 5 720 5 720
DS 

RD RR2B248TF 708 0 0
ACAGTGGAAGTCTCCCCAAGACCAAGGTTATCTCTCATATATTCAGCACTTTGATCATAA
GAAGCAAGCATCCCCATGTTCAAAGCCATTGCCCTGACCACAGTGGGACCACAACCTTTC
CAAAGTGCTAAGACCCCTTCATCAGCGCTACTACGGTAAAGCGCATGGAAAGCATTGGTA
TAGTTCCTGCGCTGAGCTAACGGCAAGGTGTTATCAGCTTGCATTCTGATAAGCGCCAAA
TCAGCTGGACTACCAACGCAAGCACCAATCGCACCAGCTGTTAGACCACATAGAGCCTTC
TGATACAGAGGTAGTGGCTTCCCATCGTTAGCCTCACTTGCTTTTGCCGTCAGCATCTTG
AATGATCCAAGACGGGCAGTGGTGTAAGTTGCTTGCCTCAACAAACCAGCAGATAAACCC
TTGTAGAAAGCACCGATGCCTTCATTCTTCAACATGGTAGAGGTCACACTGGCTGCAGAT
CCCTGGCCTAGTTGAATCCTCACCTTGATCATGTCGATCGGCTGGATAACGCAGGTAGCG
AGCATACCGGAGGTACCGCCATTGACGAAGGGCTTCACAGTGTTCCAGATACCAATCGGA
GCTACTTTTTTCTCTTCCGCCATCTCCTCCTTTTTTCTCGGGGATATAGAAACGTGCAAC
TAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGATTCTGAACTCGCTTTGGTGGAGACC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 2 6

CO CL1312Contig1 523 2 2 U
GGGAACAAGTTCGCCGTCGTTAATCTTTTATCTGCTTCTCCATCATCATGGCGTTGAACA
CCGGCATCAGATCTGTCTCAAGGCTCATAGCTTCTTCCGAATCATCTGTCTCCAGATCTG
TGAGCAGGAGCTTCCACTCAACTGGAGCTAAGAAGATGAGCGGAGGACATGGCCATGACG
AGCCTTACTACCTCCACGCCAAGCACATGTACAATTTGGACCGCATGAAGTTCCAAGGTC
TCAAGATGTCCCTCGCTGTCTTCACCGCTTTCAGCATCGGTGTTGGTGTTCCCATCTTTG
CTGTTGTCTTCCAGCAGAGGAAGACCGCTTCTGGCTGAATTGAATCTCTCTTCTCCCCTG
CTTCAATAATTTGTACGAAATCATAAACTTTTGCTTCTGTAATAGAGGTTGTTTCTTGCT
TCTTTTGGATCGTAGCTACAAGTATTTGTGTGTTTCTTCATCGTTTGCTGGCTGTTTGAC
GCTGGAATAATGATAATCTGACAATTATATATTTTTAATTTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2AA34JQ C 1
AF RR2AA34TF U 1
BS 1 522 RR2AA34TF
BS 523 523 RR2AA34JQ

RD RR2AA34JQ 523 0 0
GGGAACAAGTTCGCCGTCGTTAATCTTTTATCTGCTTCTCCATCATCATGGCGTTGAACA
CCGGCATCAGATCTGTCTCAAGGCTCATAGCTTCTTCCGAATCATCTGTCTCCAGATCTG
TGAGCAGGAGCTTCCACTCAACTGGAGCTAAGAAGATGAGCGGAGGACATGGCCATGACG
AGCCTTACTACCTCCACGCCAAGCACATGTACAATTTGGACCGCATGAAGTTCCAAGGTC
TCAAGATGTCCCTCGCTGTCTTCACCGCTTTCAGCATCGGTGTTGGTGTTCCCATCTTTG
CTGTTGTCTTCCAGCAGAGGAAGACCGCTTCTGGCTGAATTGAATCTCTCTTCTCCCCTG
CTTCAATAATTTGTACGAAATCATAAACTTTTGCTTCTGTAATAGAGGTTGTTTCTTGCT
TCTTTTGGATCGTAGCTACAAGTATTTGTGTGTTTCTTCATCGTTTGCTGGCTGTTTGAC
GCTGGAATAATGATAATCTGACAATTATATATTTTTAATTTGG

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2AA34TF 523 0 0
GGGAACAAGTTCGCCGTCGTTAATCTTTTATCTGCTTCTCCATCATCATGGCGTTGAACA
CCGGCATCAGATCTGTCTCAAGGCTCATAGCTTCTTCCGAATCATCTGTCTCCAGATCTG
TGAGCAGGAGCTTCCACTCAACTGGAGCTAAGAAGATGAGCGGAGGACATGGCCATGACG
AGCCTTACTACCTCCACGCCAAGCACATGTACAATTTGGACCGCATGAAGTTCCAAGGTC
TCAAGATGTCCCTCGCTGTCTTCACCGCTTTCAGCATCGGTGTTGGTGTTCCCATCTTTG
CTGTTGTCTTCCAGCAGAGGAAGACCGCTTCTGGCTGAATTGAATCTCTCTTCTCCCCTG
CTTCAATAATTTGTACGAAATCATAAACTTTTGCTTCTGTAATAGAGGTTGTTTCTTGCT
TCTTTTGGATCGTAGCTACAAGTATTTGTGTGTTTCTTCATCGTTTGCTGGCTGTTTGAC
GCTGGAATAATGATAATCTGACAATTATATATTTTTAATTTG
G

QA 1 522 1 522
DS 



CO CL1312Contig2 557 4 5 U
CGAACTGTGAAAAACATTCAGACAAAAGCTTCCGAATTCAAACTAAAAATACATAATTGT
CAGATTATCATTATTCCAGCGTTGAACATCCAGCAAACGATGAAGAAACACACAAATACT
TGTAGCTACGATCCAAAAGAAGCAAGAAACAACCTCTTTTGCAGAAGCAATAGTTTATGA
TTTCATACAAATTATTCAAGCAGGGGAGAAGAGAGATTCAATTCAGCCAGAAGCGGTCTT
CCTCTGCTGGAAGACAACAGCAAAGATGGGAACCCCAACACCGATGCTGAAAGCAGTGAA
CACAGCGAGAGACATCTTGAGGCCTTGGAACTTCATGCGGTCCAAATTGTACATGTGCTT
GGCGTGGAGGTAGTAAGGCTCGTCATGGCAATGTCCTCCGCTCATCTTCTTAGCTCCAGT
TGAGTGGAAACTCCTGCTCACAGATCTGGAGACAGATGATTCGGAAGAAGCTATGAGCCT
TGAGACAGATCTGATGCCGGTGTTCAACGCCATGATAGGAGAAGCAGATAAAGATTAACG
ACGGCGAACTTGTTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2GY26JQ U 1
AF RR2GY26TF C 1
AF RR2FE81JQ U 35
AF RR2FE81TF C 35
BS 1 146 RR2GY26JQ
BS 147 147 RR2FE81JQ
BS 148 389 RR2GY26JQ
BS 390 390 RR2FE81JQ
BS 391 557 RR2GY26JQ

RD RR2GY26JQ 557 0 0
CGAACTGTGAAAAACATTCAGACAAAAGCTTCCGAATTCAAACTAAAAATACATAATTGT
CAGATTATCATTATTCCAGCGTTGAACATCCAGCAAACGATGAAGAAACACACAAATACT
TGTAGCTACGATCCAAAAGAAGCAAGGAACAACCTCTTTTGCAGAAGCAATAGTTTATGA
TTTCATACAAATTATTCAAGCAGGGGAGAAGAGAGATTCAATTCAGCCAGAAGCGGTCTT
CCTCTGCTGGAAGACAACAGCAAAGATGGGAACCCCAACACCGATGCTGAAAGCAGTGAA
CACAGCGAGAGACATCTTGAGGCCTTGGAACTTCATGCGGTCCAAATTGTACATGTGCTT
GGCGTGGAGGTAGTAAGGCTCGTCATGGCCATGTCCTCCGCTCATCTTCTTAGCTCCAGT
TGAGTGGAAACTCCTGCTCACAGATCTGGAGACAGATGATTCGGAAGAAGCTATGAGCCT
TGAGACAGATCTGATGCCGGTGTTCAACGCCATGATAGGAGAAGCAGATAAAGATTAACG
ACGGCGAACTTGTTCCC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2GY26TF 557 0 0
CGAACTGTGAAAAACATTCAGACAAAAGCTTCCGAATTCAAACTAAAAATACATAATTGT
CAGATTATCATTATTCCAGCGTTGAACATCCAGCAAACGATGAAGAAACACACAAATACT
TGTAGCTACGATCCAAAAGAAGCAAGGAACAACCTCTTTTGCAGAAGCAATAGTTTATGA
TTTCATACAAATTATTCAAGCAGGGGAGAAGAGAGATTCAATTCAGCCAGAAGCGGTCTT
CCTCTGCTGGAAGACAACAGCAAAGATGGGAACCCCAACACCGATGCTGAAAGCAGTGAA
CACAGCGAGAGACATCTTGAGGCCTTGGAACTTCATGCGGTCCAAATTGTACATGTGCTT
GGCGTGGAGGTAGTAAGGCTCGTCATGGCCATGTCCTCCGCTCATCTTCTTAGCTCCAGT
TGAGTGGAAACTCCTGCTCACAGATCTGGAGACAGATGATTCGGAAGAAGCTATGAGCCT
TGAGACAGATCTGATGCCGGTGTTCAACGCCATGATAGGAGAAGCAGATAAAGATTAACG
ACGGCGAACTTGTTCCC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2FE81JQ 523 0 0
AATTCAAACTAAAAATACATAATTGTCAGATTATCATTATTCCAGCGTTGAACATCCAGC
AAACGATGAAGAAACACACAAATACTTGTAGCTACGATCCAAAAGAATCAAGAAACAACC
TCTTTTGCAGAAGCAATAGTTTATGATTTCATACAAATTATTCAAGCAGGGGAGAAGAGA
GATTCAATTCAGCCAGAAGCGGTCTTCCTCTGCTGGAAGACAACAGCAAAGATGGGAACC
CCAACACCGATGCTGAAAGCAGTGAACACAGCGAGAGACATCTTGAGGCCTTGGAACTTC
ATGCGGTCCAAATTGTACATGTGCTTGGCGTGGAGGTAGTAAGGCTCGTCATGGCAATGT
CCTCCGCTCATCTTCTTAGCTCCAGTTGAGTGGAAACTCCTGCTCACAGATCTGGAGACA
GATGATTCGGAAGAAGCTATGAGCCTTGAGACAGATCTGATGCCGGTGTTCAACGCCATG
ATAGGAGAAGCAGATAAAGATTAACGACGGCGAACTTGTTCCC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2FE81TF 523 0 0
AATTCAAACTAAAAATACATAATTGTCAGATTATCATTATTCCAGCGTTGAACATCCAGC
AAACGATGAAGAAACACACAAATACTTGTAGCTACGATCCAAAAGAATCAAGAAACAACC
TCTTTTGCAGAAGCAATAGTTTATGATTTCATACAAATTATTCAAGCAGGGGAGAAGAGA
GATTCAATTCAGCCAGAAGCGGTCTTCCTCTGCTGGAAGACAACAGCAAAGATGGGAACC
CCAACACCGATGCTGAAAGCAGTGAACACAGCGAGAGACATCTTGAGGCCTTGGAACTTC
ATGCGGTCCAAATTGTACATGTGCTTGGCGTGGAGGTAGTAAGGCTCGTCATGGCAATGT
CCTCCGCTCATCTTCTTAGCTCCAGTTGAGTGGAAACTCCTGCTCACAGATCTGGAGACA
GATGATTCGGAAGAAGCTATGAGCCTTGAGACAGATCTGATGCCGGTGTTCAACGCCATG
ATAGGAGAAGCAGATAAAGATTAACGACGGCGAACTTGTTCCC

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 5

CO CL1313Contig1 765 5 5 U
GGACAATCAAGAGGAGAGGACAGAACACAGAAGGCAGAGGGTGGAGAAAAATAACGATGG
CGACGAGGCTGAAAGCGATGGGGAGTTTACCAAAACTGATACAAAGCATGAGGAAAGAAG
CTCCAAAGCATTGCAATCCAGTTTTGCCGTCTCTGAGACGAGCTTTCTCCCTCTACGACC
AGATCAATCTCATTGACAATGTCCCTGAAGACCAGCTCCGCTTCCAAGGGTTTAATGAGA
CGAGTTTCACGGTGAATGGAGTCAAATACGAAGGTAGCTTGCTCTGTGTTGGGAACTTGC
TTATGTCATGGACCCCTCGTACCTTCTCCGACATCACTCCTGATAGTTTGTCTATCTTCC
AGACAATTCGTCCCATTCCAGAGCTCCTAATTGTTGGTTGTGGAAGAAACATTCACCCGG
TAACTCCCGAGCTCCGTCAGTTTGTCAAGTCTATTGGGATGAAGCTAGAAACCGTTGATT
CTAGAAATGCTGCATCAACTTACAACATTCTGAATGAAGAAGGAAGGGTCGTTGCTGCTG
CATTGCTTCCGTATGGTGTTACATCTTAAGAAAAAAA*CTAGCAATTCGAGCTCCATCTG
TATAACTGTTTATGAATGTCATGTCCAGACTTCATCTCTTGTGAACATAAACCGAAACCT
ATCGGCTTTTGTCTTGCTTCTCGAGCTTATTAATAACAGACGCTGTAGCAAATGTGATAC
CTTGTCATTACATTTCTCACCTTTCAATATATTATCCATAATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H136TF U 13
AF RR2FX19TF U 1
AF RR2BB02JQ C 15
AF RR2BB02TF U 15
AF RR2FX19JQ C 388
BS 1 228 RR2FX19TF
BS 229 229 RR2BB02TF
BS 230 738 RR2FX19TF
BS 739 743 RR2BB02TF
BS 744 765 RR2FX19JQ

RD RR2H136TF 557 0 0
GGA
GAGGACAGAACACCGAAGGCAGAGGGTGGAGAAAAATAACGATGGCGACGAGGCTGAAAG
CGATGGGGAGTTTGCCAAAACTGATACAAAGCATGAGGAAAGAATCTCCTAAGCATTGCA
ATCCAGTTTTGCCGTCTCTGAGACGAGCTTTCTCCCTCTACGACCAGATCAATCTCATTG
ACAATGTCCCCGAAGACCAGCTCCGCTTCCAAGAGTTTAATGAGACGAGTTTCACGGTGA
ATGGAGTCAAATACGAAGGTAGCTTGCTCTGTGTTGGGAACTTGCTTATGTCATGGACCC
CTCGTCAATTCTCCGACATCACTCCTGATAGTTTGTCTATCTTCCAGACAATTCGTCCCA
TTCCAGAGCTCCTAATTGTTGGTTGTGGAAGAAACATTCACCCGGTAACTCCCGAGCTCC
GTCAGTTTGTCAAGTCTATTGGGATGAAGCTAGAAACCGTTGATTCTAGAAATGCTGCAT
CAACTTACAACATTCTGAATGAAGAAGGAAGGGTCGTTGCTGCTGCATTGCTTCCGTATG
GTGTTACATCTTAA

QA 4 557 4 557
DS 

RD RR2FX19TF 738 0 0
GGACAATCAAGAGGAGAGGACAGAACACAGAAGGCAGAGGGTGGAGAAAAATAACGATGG
CGACGAGGCTGAAAGCGATGGGGAGTTTACCAAAACTGATACAAAGCATGAGGAAAGAAG
CTCCAAAGCATTGCAATCCAGTTTTGCCGTCTCTGAGACGAGCTTTCTCCCTCTACGACC
AGATCAATCTCATTGACAATGTCCCTGAAGACCAGCTCCGCTTCCAAGAGTTTAATGAGA
CGAGTTTCACGGTGAATGGAGTCAAATACGAAGGTAGCTTGCTCTGTGTTGGGAACTTGC
TTATGTCATGGACCCCTCGTACCTTCTCCGACATCACTCCTGATAGTTTGTCTATCTTCC
AGACAATTCGTCCCATTCCAGAGCTCCTAATTGTTGGTTGTGGAAGAAACATTCACCCGG
TAACTCCCGAGCTCCGTCAGTTTGTCAAGTCTATTGGGATGAAGCTAGAAACCGTTGATT
CTAGAAATGCTGCATCAACTTACAACATTCTGAATGAAGAAGGAAGGGTCGTTGCTGCTG
CATTGCTTCCGTATGGTGTTACATCTTAAGAAAAAAA*CTAGCAATTCGAGCTCCATCTG
TATAACTGTTTATGAATGTCATGTCCAGACTTCATCTCTTGTGAACATAAACCGAAACCT
ATCGGCTTTTGTCTTGCTTCTCGAGCTTATTAATAACAGACGCTGTAGCAAATGTGATAC
CTTGTCATTACATTTCTC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2BB02JQ 731 0 0
G
GAGGACAGAACACAGAAGGCAGAGGGTGGAGAAAAATAACGATGGCGACGAGGCTGAAAG
CGATGGGGAGTTTACCAAAACTGATACAAAGCATGAGGAAAGAAGCTCCAAAGCATTGCA
ATCCAGTTTTGCCGTCTCTGAGACGAGCTTTCTCCCTCTACGACCAGATCAATCTCATTG
ACAATGTCCCTGAAGACCAGCTCCGCTTCCAAGGGTTTAATGAGACGAGTTTCACGGTGA
ATGGAGTCAAATACGAAGGTAGCTTGCTCTGTGTTGGGAACTTGCTTATGTCATGGACCC
CTCGTACCTTCTCCGACATCACTCCTGATAGTTTGTCTATCTTCCAGACAATTCGTCCCA
TTCCAGAGCTCCTAATTGTTGGTTGTGGAAGAAACATTCACCCGGTAACTCCCGAGCTCC
GTCAGTTTGTCAAGTCTATTGGGATGAAGCTAGAAACCGTTGATTCTAGAAATGCTGCAT
CAACTTACAACATTCTGAATGAAGAAGGAAGGGTCGTTGCTGCTGCATTGCTTCCGTATG
GTGTTACATCTTAAGAAAAAAA*CTAGCAATTCGAGCTCCATCTGTATAACTGTTTATGA
ATGTCATGTCCAGACTTCATCTCTTGTGAACATAAACCGAAACCTATCGGCTTTTGTCTT
GCTTCTCGAGCTTATTAATAACAGACGCTGTAGCAAATGTGATACCTTGTCATTACATTT
CTCACCTT
CC

QA 2 729 2 729
DS 

RD RR2BB02TF 731 0 0
G
GAGGACAGAACACAGAAGGCAGAGGGTGGAGAAAAATAACGATGGCGACGAGGCTGAAAG
CGATGGGGAGTTTACCAAAACTGATACAAAGCATGAGGAAAGAAGCTCCAAAGCATTGCA
ATCCAGTTTTGCCGTCTCTGAGACGAGCTTTCTCCCTCTACGACCAGATCAATCTCATTG
ACAATGTCCCTGAAGACCAGCTCCGCTTCCAAGGGTTTAATGAGACGAGTTTCACGGTGA
ATGGAGTCAAATACGAAGGTAGCTTGCTCTGTGTTGGGAACTTGCTTATGTCATGGACCC
CTCGTACCTTCTCCGACATCACTCCTGATAGTTTGTCTATCTTCCAGACAATTCGTCCCA
TTCCAGAGCTCCTAATTGTTGGTTGTGGAAGAAACATTCACCCGGTAACTCCCGAGCTCC
GTCAGTTTGTCAAGTCTATTGGGATGAAGCTAGAAACCGTTGATTCTAGAAATGCTGCAT
CAACTTACAACATTCTGAATGAAGAAGGAAGGGTCGTTGCTGCTGCATTGCTTCCGTATG
GTGTTACATCTTAAGAAAAAAA*CTAGCAATTCGAGCTCCATCTGTATAACTGTTTATGA
ATGTCATGTCCAGACTTCATCTCTTGTGAACATAAACCGAAACCTATCGGCTTTTGTCTT
GCTTCTCGAGCTTATTAATAACAGACGCTGTAGCAAATGTGATACCTTGTCATTACATTT
CTCACCTT
CC

QA 2 729 2 729
DS 

RD RR2FX19JQ 378 0 0
TAATTGTTGGTTGTGGAAGAAACATTCACCCGGTAACTCCCGAGCTCCGTCAGTTTGTCA
AGTCTATTGGGATGAAGCTAGAAACCGTTGATTCTAGAAATGCTGCATCAACTTACAACA
TTCTGAATGAAGAAGGAAGGGTCGTTGCTGCTGCATTGCTTCCGTATGGTGTTACATCTT
AAGAAAAAAAACTAGCAATTCGAGCTCCATCTGTATAACTGTTTATGAATGTCATGTCCA
GACTTCATCTCTTGTGAACATAAACCGAAACCTATCGGCTTTTGTCTTGCTTCTCGAGCT
TATTAATAACAGACGCTGTAGCAAATGTGATACCTTGTCATTACATTTCTCACCTTTCAA
TATATTATCCATAATTTT

QA 1 378 1 378
DS 



AS 1 4

CO CL1314Contig1 1218 4 3 U
GGGATTTAAATCTCAGTAGGAGGGAGATGGTTATACTGGGGACTCAGTATGCGGGTGAGA
TGAAGAAGGGTCTTTTCAGTGTGATGCATTACCTTATGCCTAAGCGCCGGATCCTCTCCC
TTCACTCTGGTTGCAATATGGGAAAAGATGGAGATGTTGCCCTCTTCTTTGGACTGTCAG
GGACCGGGAAGACGACGCTGTCTACTGATCACAATAGGTATCTGATTGGAGATGATGAGC
ATTGTTGGACTGAGACTGGTGTCTCGAACATTGAGGGTGGATGCTATGCTAAGTGCGTTG
ATCTTTCGAGGGAGAAGGAGCCTGATATCTGGAACGCCATCAAGTTTGGAACAGTTTTAG
AAAATGTTGTGTTTGATGAGCACACTAGAGAAGTGGATTATTCTGATAAATCCGTTACAG
AGAACACACGTGCTGCATACCCGATTGAGTTCATTCCAAATGCGAAAATACCTTGTGTTG
GTCCACACCCCAAGAACGTGATACTTCTGGCTTGTGATGCCTTTGGTGTTCTCCCACCTG
TGAGCAAGCTGAATCTGGCGCAGACCATGTACCACTTCATCAGTGGTTACACTGCTCTGG
TTGCTGGAACAGAGGATGGGATCAAGGAGCCAACAGCAACATTCTCAGCATGCTTTGGTG
CAGCTTTCATAATGCTGCATCCAACAAAGTATGCAGCTATGCTAGCCGAGAAGATGAAGT
CACAAGGTGTTACCGGATGGCTCGTTAACACTGGCTGGTCTGGTGGCAGCTATGGTGTTG
GAAACAGGATCAAGCTGGCATATACTAGGAAGATCATTGATGCAATCCATTCAGGTAGCC
TTTTGAAGGCCAACTACAAGAAAACCGATATCTTTGGGTTTGAAATCCCAACTGAGATCG
AAGGGATACCATCAGAGACCTTGGATCCTGTCAACTCGTGGTCTGATAAGAAAGCACACA
AGGAGACTCTGTTGAAGCTGGGAGGTTTGTTCAAGAAGAACTTTGAGACGTTTGCTAGCC
ACAAGATTGGTGTGGATGGTAAGCTCACAGAGGAGATTCTCGCTGCTGGTCCTATCTTTT
AAGAGATGTGATGTTGTCGAAAAAACAAAAGAATAAATGACTCTGTGTGTGTGTGTTTGT
TGAGAGAGTACTTTGATATGAAGTGGTCTCGAGAACTTCCAAACGTGGTTGATATATGAA
ATATGACCTTATGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2BJ10TF U 1
AF RR2EJ41TF U 284
AF RR2BJ10JQ C 475
AF RR2EJ41JQ C 557
BS 1 719 RR2BJ10TF
BS 720 947 RR2EJ41TF
BS 948 1218 RR2BJ10JQ

RD RR2BJ10TF 719 0 0
GGGATTTAAATCTCAGTAGGAGGGAGATGGTTATACTGGGGACTCAGTATGCGGGTGAGA
TGAAGAAGGGTCTTTTCAGTGTGATGCATTACCTTATGCCTAAGCGCCGGATCCTCTCCC
TTCACTCTGGTTGCAATATGGGAAAAGATGGAGATGTTGCCCTCTTCTTTGGACTGTCAG
GGACCGGGAAGACGACGCTGTCTACTGATCACAATAGGTATCTGATTGGAGATGATGAGC
ATTGTTGGACTGAGACTGGTGTCTCGAACATTGAGGGTGGATGCTATGCTAAGTGCGTTG
ATCTTTCGAGGGAGAAGGAGCCTGATATCTGGAACGCCATCAAGTTTGGAACAGTTTTAG
AAAATGTTGTGTTTGATGAGCACACTAGAGAAGTGGATTATTCTGATAAATCCGTTACAG
AGAACACACGTGCTGCATACCCGATTGAGTTCATTCCAAATGCGAAAATACCTTGTGTTG
GTCCACACCCCAAGAACGTGATACTTCTGGCTTGTGATGCCTTTGGTGTTCTCCCACCTG
TGAGCAAGCTGAATCTGGCGCAGACCATGTACCACTTCATCAGTGGTTACACTGCTCTGG
TTGCTGGAACAGAGGATGGGATCAAGGAGCCAACAGCAACATTCTCAGCATGCTTTGGTG
CAGCTTTCATAATGCTGCATCCAACAAAGTATGCAGCTATGCTAGCCGAGAAGATGAAG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2EJ41TF 664 0 0
GG
ATGCTAAGTGCGTTGATCTTTCGAGGGAGAAGGAGCCTGATATCTGGAACGCCATCAAGT
TTGGAACAGTTTTAGAAAATGTTGTGTTTGATGAGCACACTAGAGAAGTGGATTATTCTG
ATAAATCCGTTACAGAGAACACACGTGCTGCATACCCGATTGAGTTCATTCCAAATGCGA
AAATACCTTGTGTTGGTCCACACCCCAAGAACGTGATACTTCTGGCTTGTGATGCCTTTG
GTGTTCTCCCACCTGTGAGCAAGCTGAATCTGGCGCAGACCATGTACCACTTCATCAGTG
GTTACACTGCTCTGGTTGCTGGAACAGAGGATGGGATCAAGGAGCCAACAGCAACATTCT
CAGCATGCTTTGGTGCAGCTTTCATAATGCTGCATCCAACAAAGTATGCAGCTATGCTAG
CCGAGAAGATGAAGTCACAAGGTGTTACCGGATGGCTCGTTAACACTGGCTGGTCTGGTG
GCAGCTATGGTGTTGGAAACAGGATCAAGCTGGCATATACTAGGAAGATCATTGATGCAA
TCCATTCAGGTAGCCTTTTGAAGGCCAACTACAAGAAAACCGATATCTTTGGGTTTGAAA
TCCCAACTGAGATCGAAGGGATACCATCAGAGACCTTGGATCCTGTCAACTCGTGGTCTG
AT

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR2BJ10JQ 744 0 0
GTGTTGGTCCACACCCCAAGAACGTGATACTTCTGGCTTGTGATGCCTTTGGTGTTCTCC
CACCTGTGAGCAAGCTGAATCTGGCGCAGACCATGTACCACTTCATCAGTGGTTACACTG
CTCTGGTTGCTGGAACAGAGGATGGGATCAAGGAGCCAACAGCAACATTCTCAGCATGCT
TTGGTGCAGCTTTCATAATGCTGCATCCAACAAAGTATGCAGCTATGCTAGCCGAGAAGA
TGAAGTCACAAGGTGCTACCGGATGGCTCGTTAACACTGGCTGGTCTGGTGGCAGCTATG
GTGTTGGAAACAGGATCAAGCTGGCATATACTAGGAAGATCATTGATGCAATCCATTCAG
GTAGCCTTTTGAAGGCCAACTACAAGAAAACCGATATCTTTGGGTTTGAAATCCCAACTG
AGATCGAAGGGACACCATCAGAGATCTTGGATCCTGTCAACTCGTGGTCTGATAAGAAAG
CACACAAGGAGACTCTGTTGAAGCTGGGAGGTTTGTTCAAGAAGAACTTTGAGACGTTTG
CTAGCCACAAGATTGGTGTGGATGGTAAGCTCACAGAGGAGATTCTCGCTGCTGGTCCTA
TCTTTTAAGAGATGTGATGTTGTCGAAAAAACAAAAGAATAAATGACTCTGTGTGTGTGT
GTTTGTTGAGAGAGTACTTTGATATGAAGTGGTCTCGAGAACTTCCAAACGTGGTTGATA
TATGAAATATGACCTTATGATTCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2EJ41JQ 662 0 0
GGCGCAGACCATGTACCACTTCATCAGTGGTTACACTGCTCTGGTTGCTGGAACAGAGGA
TGGGATCAAGGAGCCAACAGCAACATTCTCAGCATGCTTTGGTGCAGCTTTCATAATGCT
GCATCCAACAAAGTATGCAGCTATGCTAGCCGAGAAGATGAAGTCACAAGGTGTTACCGG
ATGGCTCGTTAACACTGGCTGGTCTGGTGGCAGCTATGGTGTTGGAAACAGGATCAAGCT
GGCATATACTAGGAAGATCATTGATGCAATCCATTCAGGTAGCCTTTTGAAGGCCAACTA
CAAGAAAACCGATATCTTTGGGTTTGAAATCCCAACTGAGATCGAAGGGATACCATCAGA
GACCTTGGATCCTGTCAACTCGTGGTCTGATAAGAAAGCACACAAGGAGACTCTGTTGAA
GCTGGGAGGTTTGTTCAAGAAGAACTTTGAGACGTTTGCTAGCCACAAGATTGGTGTGGA
TGGTAAGCTCACAGAGGAGATTCTCGCTGCTGGTCCTATCTTTTAAGAGATGTGATGTTG
TCGAAAAAACAAAAGAATAAATGACTCTGTGTGTGTGTGTTTGTTGAGAGAGTACTTTGA
TATGAAGTGGTCTCGAGAACTTCCAAACGTGGTTGATATATGAAATATGACCTTATGATT
TC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 2 6

CO CL1315Contig1 834 3 13 U
GGTAAGGAACTCAATTCATACATAAATTTTGTAGAAAATACACTTGTCAATATAAAAAAA
AAGTTACACAATTCATGTCTGAGGAAAAACAAGATTAAACAGAATAATAATAAACAACAT
TACCGCTCTAAGTTGAGCTTTT*AGTAGCCAAAACGAAAGAATCCATTCACATTTCCAGA
GTGCTCCTTCCAAAGTTTAGATGCAGTCACTTCCACTTAAAACTGGTTTTGATACCCCCT
TCAGCTTCCTCAAACGAAACTTCCTTCACTAACGAGGCAGAAGCATTGTACTCAAACCTG
TTGGAGAGAAGCACTTCGAGCTCATAGTCAGAAGCACTCTTAGTCACATCAACCATGACC
TGAACAAGCTCAGTCTTGCGAGTGCTGGCCATGAGCAGATCATACTCCGTCGGGATAATC
ACAGCGAAGAAGTTATCGCTCAGCTTGCTCAAACACACCTTCTCCACCGCAGCCAAACCT
ATCCTCCGCGTCATCGCCTCGCTCTCGGGATCGATCAGGTAGATCGCAAAGTCCGTCAGG
ATGAAGATTCGCCTCTTCATCTTCCCGGAGCCTGTGAACTTCAACACCTTATCGGCGAAT
CGTATCGACGTGTCACCTTGTTTCTCGAGAATCTTCATCAGGCTAGGACGAGTGGAGACG
TGGAGATAGTCGCCACGGTGCTCTCTGTAACGAGACGCTTTCCTCCTGATTTTAGCTCCG
GCGAATGGCTCCGGTGTCCTTCCATCTTCGTCACCGCCGTCAGAGTCAGGTGGAGGAGAC
TCTTCGCCGTCGTCGTACCTTGGTCGCTCCTTGAACCGGTCCATTTCTCGATCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY60JQ U 1
AF RR2BF10JQ U 4
AF RR2BF10TF C 82
BS 1 142 RR2DY60JQ
BS 143 143 RR2BF10JQ
BS 144 176 RR2DY60JQ
BS 177 177 RR2BF10JQ
BS 178 227 RR2DY60JQ
BS 228 228 RR2BF10JQ
BS 229 317 RR2DY60JQ
BS 318 318 RR2BF10JQ
BS 319 529 RR2DY60JQ
BS 530 530 RR2BF10JQ
BS 531 635 RR2DY60JQ
BS 636 663 RR2BF10JQ
BS 664 834 RR2BF10TF

RD RR2DY60JQ 635 0 0
GGTAAGGAACTCAATTCATACATAAATTTTGTAGAAAATACACTTGTCAATATAAAAAAA
AAGTTACACAATTCATGTCTGAGGAAAAACAAGATTAAACAGAATAATAATAAACAACAT
TACCGCTCTAAGTTGAGCTTTTTAGTAGCCAAAACGAAAGAATCCATTCACATTTCTAGA
GTGCTCCTTCCAAAGTTTAGATGCAGTCACTTCCACTTAAAACTGGTCTTGATACCCCCT
TCAGCTTCCTCAAACGAAACTTCCTTCACTAACGAGGCAGAAGCATTGTACTCAAACCTG
TTGGAGAGAAGCACTTCAAGCTCATAGTCAGAAGCACTCTTAGTCACATCAACCATGACC
TGAACAAGCTCAGTCTTGCGAGTGCTGGCCATGAGCAGATCATACTCCGTCGGGATAATC
ACAGCGAAGAAGTTATCGCTCAGCTTGCTCAAACACACCTTCTCCACCGCAGCCAAACCT
ATCCTCCGCGTCATCGCCTCGCTCTCGGGATCGATCAGGTAGATCGCAAGGTCCGTCAGG
ATGAAGATTCGCCTCTTCATCTTCCCGGAGCCTGTGAACTTCAACACCTTATCGGCGAAT
CGTATCGACGTGTCACCTTGTTTCTCGAGAATCTT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2BF10JQ 660 0 0
G
AGGAACTCAATTCATACATAAATTTTGTAGAAAATACACTTGTCAATATAAAAAAAAAGT
TACACAATTCATGTCTGAGGAAAAACAAGATTAAACAGAATAATAATAAACAACATTACC
GCTCTAAGTTGAGCTTTT*AGTAGCCAAAACGAAAGAATCCATTCACATTTCCAGAGTGC
TCCTTCCAAAGTTTAGATGCAGTCACTTCCACTTAAAACTGGTTTTGATACCCCCTTCAG
CTTCCTCAAACGAAACTTCCTTCACTAACGAGGCAGAAGCATTGTACTCAAACCTGTTGG
AGAGAAGCACTTCGAGCTCATAGTCAGAAGCACTCTTAGTCACATCAACCATGACCTGAA
CAAGCTCAGTCTTGCGAGTGCTGGCCATGAGCAGATCATACTCCGTCGGGATAATCACAG
CGAAGAAGTTATCGCTCAGCTTGCTCAAACACACCTTCTCCACCGCAGCCAAACCTATCC
TCCGCGTCATCGCCTCGCTCTCGGGATCGATCAGGTAGATCGCAAAGTCCGTCAGGATGA
AGATTCGCCTCTTCATCTTCCCGGAGCCTGTGAACTTCAACACCTTATCGGCGAATCGTA
TCGACGTGTCACCTTGTTTCTCGAGAATCTTCATCAGGCTAGGACGAGTGGAGACGTGG

QA 2 660 2 660
DS 

RD RR2BF10TF 753 0 0
AGGAAAAACAAGATTAAACAGAATAATAATAAACAACATTACCGCTCTAAGTTGAGCTTT
T*AGTAGCCAAAACGAAAGAATCCATTCACATTTCCAGAGTGCTCCTTCCAAAGTTTAGA
TGCAGTCACTTCCACTTAAAACTGGTTTTGATACCCCCTTCAGCTTCCTCAAACGAAACT
TCCTTCACTAACGAGGCAGAAGCATTGTACTCAAACCTGTTGGAGAGAAGCACTTCGAGC
TCATAGTCAGAAGCACTCTTAGTCACATCAACCATGACCTGAACAAGCTCAGTCTTGCGA
GTGCTGGCCATGAGCAGATCATACTCCGTCGGGATAATCACAGCGAAGAAGTTATCGCTC
AGCTTGCTCAAACACACCTTCTCCACCGCAGCCAAACCTATCCTCCGCGTCATCGCCTCG
CTCTCGGGATCGATCAGGTAGATCGCAAAGTCCGTCAGGATGAAGATTCGCCTCTTCATC
TTCCCGGAGCCTGTGAACTTCAACACCTTATCGGCGAATCGTATCGACGTGTCACCTTGT
TTCTCGAGAATCTTCATCAGGCTAGGACGAGTGGAGACGTGGAGATAGTCGCCACGGTGC
TCTCTGTAACGAGACGCTTTCCTCCTGATTTTAGCTCCGGCGAATGGCTCCGGTGTCCTT
CCATCTTCGTCACCGCCGTCAGAGTCAGGTGGAGGAGACTCTTCGCCGTCGTCGTACCTT
GGTCGCTCCTTGAACCGGTCCATTTCTCGATCC

QA 1 753 1 753
DS 



CO CL1315Contig2 857 3 19 U
GGGAATCTGAGAAAATCAAACCGATTCCAATTCATCGAGAAATGGACCGGTTCAAGGAGC
GACCAAGGTACGACGACGGCGAAGAGTCTCCTCCACCTGACTCTGACGGCGGAGACGAAG
ATGGAAGGACACCGGAGCCATTCGCCGGAGCCAAAATCAGGAGGAAAGCGTCTCGTTACA
GAGATCACCGTGGCGACTATCTCCACGTCTCCACCCGTCCTAGCCTGATGAAGATTCTCG
AGGAACAAGGTGACACGTCGATACGATTCGCGGACAAGGTGTTGAAGTTCACAGGCTCCG
GGAAGATGAAGAGGCGAATCTTCATCCTGACGGACTTTGCGATCTACCTGATCGATCCCG
AGAGCGAGGCGATGACGCGGAGGATAGGTTTGGCTGCGGTGGAGAAGGTGTGTTTGAGCA
AGCTGAGCGATAACTTCTTCGCTGTGATTATCCCGACGGAGTATGATCTGCTCATGGCCA
GCACTCGCAAGACTGAGCTTGTTCAGGTTATGGTTGATGTGACTAAGAGTGCTTCTGACT
ATGAGCTTGAAGTGCTTCTCTCCAACAGGTTTGAGTACAATGCTTCTGCTTCGTTAGTGA
AGGAAGTTTCGTTTGAGGAAGCTGAAGGGGGTATCAAGACCAGTTTTAAGTGGAAGTGAC
TGCATCTCAACTTTTACTCGCTGTTCATAAACTTTGGAGGGAGCAACTCTAGAAATGTGA
ATGGGTTCTTTCGTTTTGGCTACTAAAAAGCTCAACTCAGAGCGGTAATGTTGTTTATTA
TTATTCTGTTTAATCTTGTTTTTCCTCAGACATGAATTGTGTAACATTTTTTTTATATTG
ACAAGTGTATTTTCTAC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY60TF U 1
AF RR2D893TF U 3
AF RR2D893JQ C 152
BS 1 151 RR2DY60TF
BS 152 152 RR2D893TF
BS 153 184 RR2DY60TF
BS 185 185 RR2D893TF
BS 186 214 RR2DY60TF
BS 215 215 RR2D893TF
BS 216 242 RR2DY60TF
BS 243 243 RR2D893TF
BS 244 271 RR2DY60TF
BS 272 272 RR2D893TF
BS 273 274 RR2DY60TF
BS 275 275 RR2D893TF
BS 276 287 RR2DY60TF
BS 288 700 RR2D893TF
BS 701 701 RR2D893JQ
BS 702 705 RR2D893TF
BS 706 706 RR2D893JQ
BS 707 721 RR2D893TF
BS 722 857 RR2D893JQ

RD RR2DY60TF 287 0 0
GGGAATCTGAGAAAATCAAACCGATTCCAATTCATCGAGAAATGGACCGGTTCAAGGAGC
GACCAAGGTACGACGACGGCGAAGAGTCTCCTCCACCTGACTCTGACGGCGGAGACGAAG
ATGGAAGGACACCGGAGCCATTCGCCGGAGCTAAAATCAGGAGGAAAGCGTCTCGTTACA
GAGAGCACCGTGGCGACTATCTCCACGTCTCCACTCGTCCTAGCCTGATGAAGATTCTCG
AGAAACAAGGTGACACGTCGATACGATTCGCCGATAAGGTGTTGAAG

QA 1 287 1 287
DS 

RD RR2D893TF 719 0 0
GG
ATCTGAGAAAATCAAACCGATTCCAATTCATCGAGAAATGGACCGGTTCAAGGAGCGACC
AAGGTACGACGACGGCGAAGAGTCTCCTCCACCTGACTCTGACGGCGGAGACGAAGATGG
AAGGACACCGGAGCCATTCGCCGGAGCCAAAATCAGGAGGAAAGCGTCTCGTTACAGAGA
TCACCGTGGCGACTATCTCCACGTCTCCACCCGTCCTAGCCTGATGAAGATTCTCGAGGA
ACAAGGTGACACGTCGATACGATTCGCGGACAAGGTGTTGAAGTTCACAGGCTCCGGGAA
GATGAAGAGGCGAATCTTCATCCTGACGGACTTTGCGATCTACCTGATCGATCCCGAGAG
CGAGGCGATGACGCGGAGGATAGGTTTGGCTGCGGTGGAGAAGGTGTGTTTGAGCAAGCT
GAGCGATAACTTCTTCGCTGTGATTATCCCGACGGAGTATGATCTGCTCATGGCCAGCAC
TCGCAAGACTGAGCTTGTTCAGGTTATGGTTGATGTGACTAAGAGTGCTTCTGACTATGA
GCTTGAAGTGCTTCTCTCCAACAGGTTTGAGTACAATGCTTCTGCTTCGTTAGTGAAGGA
AGTTTCGTTTGAGGAAGCTGAAGGGGGTATCAAGACCAGTTTTAAGTGGAAGTGACTGCA
TCTCAACTTTTACTCGCTGTTCATAAACTTTGGAGG*AGCA*CTCTAGAAATGTGAA

QA 3 719 3 719
DS 

RD RR2D893JQ 706 0 0
C
AAAATCAGGAGGAAAGCGTCTCGTTACAGAGATCACCGTGGCGACTATCTCCACGTCTCC
ACCCGTCCTAGCCTGATGAAGATTCTCGAGGAACAAGGTGACACGTCGATACGATTCGCG
GACAAGGTGTTGAAGTTCACAGGCTCCGGGAAGATGAAGAGGCGAATCTTCATCCTGACG
GACTTTGCGATCTACCTGATCGATCCCGAGAGCGAGGCGATGACGCGGAGGATAGGTTTG
GCTGCGGTGGAGAAGGTGTGTTTGAGCAAGCTGAGCGATAACTTTTTCGCTGTGATTATC
CCGACGGAGTATGATCTGCTCATGGCCAGCACTCGCAAGACTGAGCTTGTTCAGGTTATG
GTTGATGTGACTAAGAGTGCTTCTGACTATGAGCTTGAAGTGCTTCTCTCCAACAGGTTT
GAGTACAATGCTTCTGCTTCGTTAGTGAAGGAAGTTTCGTTTGAGGAAGCTGAAGGGGGT
ATCAAGACCAGTTTTAAGTGGAAGTGACTGCATCTCAACTTTTACTCGCTGTTCATAAAC
TTTGGAGGGAGCAACTCTAGAAATGTGAATGGGTTCTTTCGTTTTGGCTACTAAAAAGCT
CAACTCAGAGCGGTAATGTTGTTTATTATTATTCTGTTTAATCTTGTTTTTCCTCAGACA
TGAATTGTGTAACATTTTTTTTATATTGACAAGTGTATTTTCTAC

QA 2 706 2 706
DS 



AS 1 6

CO CL1316Contig1 872 6 9 U
GGGAGAGAGAGAGACCGAACCTCATCTTATCATTCACTCTTCTCCGTTATCCTCTTCCTC
TCTGAGCTCCCTCCAGCGACAATGGCGTTATCGGTTTCAAACCTCGCCTCTTCACTCTCC
TCTCTCTCTTTCTCTTCCCAGGTCTCTCAGGGACCAACCACCCTTTCCTTCCCCCGAACG
AACTCGGTGTTCTCACTACCGACGAAATCAGCTCGTCGCGCCTCTCTCTCAATCACCGCC
ACGGTGGAAGCTCCTCCCGCGGAGGTAGCGGAGGATACGATGGAGCTGAAGAAGTACGTG
AAATCTAGGCTTCCGGGAGGCTTCGCAGCTCAGAAAATCATAGGCACTGGTCGGCGTAAG
TGCGCCATCGCTCGTGTCGTTCTCCAAGAAGGCACCGGCAAAGTTATTATTAACTATCGC
GATGCCAAGGAGTACCTTCAGGGCAACCCACTGTGGCTTCAGTACGTTAAAGTGCCGTTA
GTGACACTGGGTTACGAGAACAGCTACGACGTGTTTGTGAAAGCCCATGGTGGCGGTCTC
TCTGGTCAAGCCCAAGCCATTACTCTCGGAGTTGCTCGTGCCCTTCTCAAGGTGAGTGCG
GACCATAGATCGCCGTTGAAGAAGGAAGGTTTGCTCACCAGAGACGCGAGAGTCGTTGAG
AGAAAGAAGGTTGGGCTCAAGAAGGCCCGTAAAGCACCACAGTTCTCCAAGCGTTAACGA
GCTTCTTTTGTTTTGTTATTATTGTTGTTTTGGATATCAACTCTTATTCTAAGTACACTT
CTTTGCCTCCAAAATTCTGTTTCTAAGTTGATGTGTAGATGATGAACTAATCTTTGTGTT
GTTGATTGAATAGAATGCAAAA*GTTGTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2FQ29TF U 1
AF RR2CX10TF U 56
AF RR2FQ29JQ C 51
AF RR2CX10JQ C 112
AF RR2DG34JQ C 276
AF RR2DG34TF U 276
BS 1 363 RR2FQ29TF
BS 364 364 RR2CX10TF
BS 365 591 RR2FQ29TF
BS 592 592 RR2CX10TF
BS 593 619 RR2FQ29TF
BS 620 683 RR2CX10TF
BS 684 684 RR2DG34TF
BS 685 785 RR2CX10TF
BS 786 872 RR2DG34TF

RD RR2FQ29TF 619 0 0
GGGAGAGAGAGAGACCGAACCTCATCTTATCATTCACTCTTCTCCGTTATCCTCTTCCTC
TCTGAGCTCCCTCCAGCGACAATGGCGTTATCGGTTTCAAACCTCGCCTCTTCACTCTCC
TCTCTCTCTTTCTCTTCCCAGGTCTCTCAGGGACCAACCACCCTTTCCTTCCCCCGAACG
AACTCGGTGTTCTCACTACCGACGAAATCAGCTCGTCGCGCCTCTCTCTCAATCACCGCC
ACGGTGGAAGCTCCTCCCGCGGAGGTAGCGGAGGATACGATGGAGCTGAAGAAGTACGTG
AAATCTAGGCTTCCGGGAGGCTTCGCAGCTCAGAAAATCATAGGCACTGGTCGGCGTAAG
TGCCCCATCGCTCGTGTCGTTCTCCAAGAAGGCACCGGCAAAGTTATTATTAACTATCGC
GATGCCAAGGAGTACCTTCAGGGCAACCCACTGTGGCTTCAGTACGTTAAAGTGCCGTTA
GTGACACTGGGTTACGAGAACAGCTACGACGTGTTTGTGAAAGCCCATGGTGGCGGTCTC
TCTGGTCAAGCCCAAGCCATTACTCTCGGAGTTGCTCGTGCCCTTCTCAAG*TGAGTGCG
GACCATAGATCGCCGTTGA

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2CX10TF 730 0 0
GG
CTCTCTGAGCTCCCTCCAGCGACAATGGCGTTATCGGTTTCAAACCTCGCCTCTTCACTC
TTCTCTCTCTCTTTCTCTTCCCAGGTCTCTCAGGGACCAACCACCCTTTCCTTCCCCCGA
ACGAACTCGGTGTTCTCACTACCGACGAAATCAGCTCGTCGCGCCTCTCTCTCAATCACC
GCCACGGTGGAAGCTCCTCCCGCGGAGGTAGCGGAGGATACGATGGAGCTGAAGAAGTAC
GTGAAATCTAGGCTTCCGGGAGGCTTCGCAGCTCAGAAAATCATAGGCACTGGTCGGCGT
AAGTGCGCCATCGCTCGTGTCGTTCTCCAAGAAGGCACCGGCAAAGTTATTATTAACTAT
CGCGATGCCAAGGAGTACCTTCAGGGCAACCCACTGTGGCTTCAGTACGTTAAAGTGCCG
TTAGTGACACTGGGTTACGAGAACAGCTACGACGTGTTTGTGAAAGCCCATGGTGGCGGT
CTCTCTGGTCAAGCCCAAGCCATTACTCCCGGAGTTGCTCGTGCCCTTCTCAAGGTGAGT
GCGGACCATAGATCGCCGTTGAAGAAGGAAGGTTTGCTCACCAGAGACGCGAGAGTCGTT
GAGAGAAAGAAGGTTGGGCTCAAGAAAGCCCGTAAAGCACCACAGTTCTCCAAGCGTTAA
CGAGCTTCTTTTGTTTTGTTATTATTGTTGTTTTGGATATCAACTCTTATTCTAAGTACA
CTTCTTTG

QA 3 730 3 730
DS 

RD RR2FQ29JQ 794 0 0
CCTCTTC
CTCTCTGAGCTCCCTCCAGCGACAATGGCGTTATCGGTTTCAAACCTCGCCTCTTCACTC
TCCTCTCTCTCTTTCTCTTCCCAGGTCTCTCAGGGACCAACCACCCTTTCCTTCCCCCGA
ACGAACTCGGTGTTCTCACTACCGACGAAATCAGCTCGTCGCGCCTCTCTCTCAATCACC
GCCACGGTGGAAGCTCCTCCCGCGGAGGTAGCGGAGGATACGATGGAGCTGAAGAAGTAC
GTGAAATCTAGGCTTCCGGGAGGCTTCGCAGCTCAGAAAATCATAGGCACTGGTCGGCGT
AAGTGCCCCATCGCTCGTGTCGTTCTCCAAGAAGGCACCGGCAAAGTTATTATTAACTAT
CGCGATGCCAAGGAGTACCTTCAGGGCAACCCACTGTGGCTTCAGTACGTTAAAGTGCCG
TTAGTGACACTGGGTTACGAGAACAGCTACGACGTGTTTGTGAAAGCCCATGGTGGCGGT
CTCTCTGGTCAAGCCCAAGCCATTACTCTCGGAGTTGCTCGTGCCCTTCTCAAGGTGAGT
GCGGACCATAGATCGCCGTTGAAGAAGGAAGGTTTGCTCACCAGAGACGCGAGAGTCGTT
GAGAGAAAGAAGGTTGGGCTCAAGAAGGCCCGTAAAGCACCACAGTTCTCCAAGCGTTAA
CGAGCTTCTTTTGTTTTGTTATTATTGTTGTTTTGGATATCAACTCTTATTCTAAGTACA
CTTCTTTGCCTCCAAAATTCTGTTTTTAAGTTGATGTGTAGATGATGAACTAATCTTTGT
GTTGTTG

QA 8 794 8 794
DS 

RD RR2CX10JQ 761 0 0
TCACTCTTCTCTCTCTCTTTCTCTTCCCAGGTCTCTCAGGGACCAACCACCCTTTCCTTC
CCCCGAACGAACTCGGTGTTCTCACTACCGACGAAATCAGCTCGTCGCGCCTCTCTCTCA
ATCACCGCCACGGTGGAAGCTCCTCCCGCGGAGGTAGCGGAGGATACGATGGAGCTGAAG
AAGTACGTGAAATCTAGGCTTCCGGGAGGCTTCGCAGCTCAGAAAATCATAGGCACTGGT
CGGCGTAAGTGCGCCATCGCTCGTGTCGTTCTCCAAGAAGGCACCGGCAAAGTTATTATT
AACTATCGCGATGCCAAGGAGTACCTTCAGGGCAACCCACTGTGGCTTCAGTACGTTAAA
GTGCCGTTAGTGACACTGGGTTACGAGAACAGCTACGACGTGTTTGTGAAAGCCCATGGT
GGCGGTCTCTCTGGTCAAGCCCAAGCCATTACTCCCGGAGTTGCTCGTGCCCTTCTCAAG
GTGAGTGCGGACCATAGATCGCCGTTGAAGAAGGAAGGTTTGCTCACCAGAGACGCGAGA
GTCGTTGAGAGAAAGAAGGTTGGGCTCAAGAAGGCCCGTAAAGCACCACAGTTCTCCAAG
CGTTAACGAGCTTCTTTTGTTTTGTTATTATTGTTGTTTTGGATATCAACTCTTATTCTA
AGTACACTTCTTTGCCTCCAAAATTCTGTTTCTAAGTTGATGTGTAGATGATGAACTAAT
CTTTGTGTTGTTGATTGAATAGAATGCAAAAAGTTGTTATG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2DG34JQ 597 0 0
G
ACGATGGAGCTGAAGAAGTACGTGAAATCTAGGCTTCCGGGAGGCTTCGCAGCTTAGAAA
ATCATAGGCACTGGTCGGCGTAAGTGCGCCATCGCTCGTGTCGTTCTCCAAGAAGGCACC
GGCAAAGTTATTATTAACTATCGCGATGCCAAGGAGTACCTTCAGGGCAACCCACTGTGG
CTTCAGTACGTTAAAGCGCCGTTAGTGACACTGGGTTACGAGAACAGCTACGACGTGTTT
GTGAAAGCCCATGGTGGCGGTCTCTCTGGTCAAGCCCAAGCCATTACTCTCGGAGTTGCT
CGTGCCCTTCTCAAGGTGAGTGCGGACCATAGATCGCCGTTGAAGAAGGAAGGTTTGCTC
ACCAGAGACGCGAGAGTCGTTGAGAGAAAGAAGGTTGGGCTCAAGAAGGCCCGTAAAGCA
CCACAGTTCTCCAAGCGTTAACGAGCTTCTTTTGTTTTGTTATTATTGTTGTTTTGGATA
TCAACTCTTATTCTAAGTACACTTCTTTGCCTCCAAAATTCTGTTTCTAAGTTGATGTGT
AGATGATGAACTAATCTTTGTGTTGTTGATTGAATAGAATGCAAAA*GTTGTTATG

QA 2 597 2 597
DS 

RD RR2DG34TF 597 0 0
G
ACGATGGAGCTGAAGAAGTACGTGAAATCTAGGCTTCCGGGAGGCTTCGCAGCTTAGAAA
ATCATAGGCACTGGTCGGCGTAAGTGCGCCATCGCTCGTGTCGTTCTCCAAGAAGGCACC
GGCAAAGTTATTATTAACTATCGCGATGCCAAGGAGTACCTTCAGGGCAACCCACTGTGG
CTTCAGTACGTTAAAGCGCCGTTAGTGACACTGGGTTACGAGAACAGCTACGACGTGTTT
GTGAAAGCCCATGGTGGCGGTCTCTCTGGTCAAGCCCAAGCCATTACTCTCGGAGTTGCT
CGTGCCCTTCTCAAGGTGAGTGCGGACCATAGATCGCCGTTGAAGAAGGAAGGTTTGCTC
ACCAGAGACGCGAGAGTCGTTGAGAGAAAGAAGGTTGGGCTCAAGAAGGCCCGTAAAGCA
CCACAGTTCTCCAAGCGTTAACGAGCTTCTTTTGTTTTGTTATTATTGTTGTTTTGGATA
TCAACTCTTATTCTAAGTACACTTCTTTGCCTCCAAAATTCTGTTTCTAAGTTGATGTGT
AGATGATGAACTAATCTTTGTGTTGTTGATTGAATAGAATGCAAAA*GTTGTTATG

QA 2 597 2 597
DS 



AS 1 3

CO CL1317Contig1 913 3 5 U
GGGAGAAGCGAGCGCACCTCTTTTGAATCCTGTCAGTGATCCAAATCAACTGCAATTGAG
TAATCGAAGAAGATGAGCGACGTGTTCGAAGGGTACGAGCGGCAGTACTGCGAGCTATCA
ACTAATCTCACCCGTAAATCCAATTCAGCTTCCCTTCTCCCCCATGGAGATGATAAGAAA
GGGAAGCTTGGTGATATCAAATCTGGGATTGATGAAGCTGATGTCTTGATCAGAAAAATG
GACCTTGAGGCGAGGAGTTTGCAACCGAGTGCTAAGGCTACCTGTCTTGCTAAACTCAGA
GAATACAAATCTGACCTGAACCAACTCAAGAAAGAATTCAAGAGAGTTTCTTCTCCGGAT
GTTAATCAATCTGCACGTGAGGAGTTGATGGAATCTGGAATAGCAGATCCGCACTCGGTT
TCTGCTGATCAAAGAGAGAGATTGGCAATGTCCGTGGAGAGGCTTGATCAGTCTAGCGAC
AGAATCAGAGAGAGTAGAAGAACTATGATGGAGACCGAAGAGCTTGGTGTCTCCATTCTC
CAAGATCTCAGTCAGCAGCGCCAAACTCTCCTTCACTCCCACAGCAAGCTTCGTGGTGTG
GATGAGGCCATTGACAAGAGCAAGAAGGTCTTGACGGCTATGTCGAGAAGAATGACGAGG
AACAAATGGATCGTTACTTCAGTGATCATTGCTCTCATTCTCGCCATCATCCTCATCATT
TCATTCAAACTTTCTCATTGATATTTGCTCTCAGCCGTTTGTGTATAAGATTGTTGGTAC
TTTCCTTTGTAATGAATGGGCTTGGATCTCTTTGTCTCCCCCAGGTTTCCACTTGTATGA
CCCAAAAATGTGTTATGACATGTTTTTAGTTATCTATCTTATTAAAAGAGAAGTACAAAT
ATAGATTTACCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB39TF U 1
AF RR2EB39JQ C 158
AF RR2H743TF U 766
BS 1 606 RR2EB39TF
BS 607 607 RR2EB39JQ
BS 608 616 RR2EB39TF
BS 617 769 RR2EB39JQ
BS 770 913 RR2H743TF

RD RR2EB39TF 621 0 0
GGGAGAAGCGAGCGCACCTCTTTTGAATCCTGTCAGTGATCCAAATCAACTGCAATTGAG
TAATCGAAGAAGATGAGCGACGTGTTCGAAGGGTACGAGCGGCAGTACTGCGAGCTATCA
ACTAATCTCACCCGTAAATCCAATTCAGCTTCCCTTCTCCCCCATGGAGATGATAAGAAA
GGGAAGCTTGGTGATATCAAATCTGGGATTGATGAAGCTGATGTCTTGATCAGAAAAATG
GACCTTGAGGCGAGGAGTTTGCAACCGAGTGCTAAGGCTACCTGTCTTGCTAAACTCAGA
GAATACAAATCTGACCTGAACCAACTCAAGAAAGAATTCAAGAGAGTTTCTTCTCCGGAT
GTTAATCAATCTGCACGTGAGGAGTTGATGGAATCTGGAATAGCAGATCCGCACTCGGTT
TCTGCTGATCAAAGAGAGAGATTGGCAATGTCCGTGGAGAGGCTTGATCAGTCTAGCGAC
AGAATCAGAGAGAGTAGAAGAACTATGATGGAGACCGAAGAGCTTGGTGTCTCCATTCTC
CAAGATCTCAGTCAGCAGCGCCAAACTCTCCTTCACTCCCACAGCAAGCTTCGTGGTGTG
GATGAG*CCATTGACA
GAGCA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2EB39JQ 725 0 0
TCCCCCATGGAGATGATAAGAAAGGGAAGCTTGGTGATATCAAATCTGGGATTGATGAAG
CTGATGTCTTGATCAGAAAAATGGACCTTGAGGCGAGGAGTTTGCAACCGAGTGCTAAGG
CTACCTGTCTTGCTAAACTCAGAGAATACAAATCTGACCTGAACCAACTCAAGAAAGAAT
TCAAGAGAGTTTCTTCTCCGGATGTTAATCAATCTGCACGTGAGGAGTTGATGGAATCTG
GAATAGCAGATCCGCACTCGGTTTCTGCTGATCAAAGAGAGAGATTGGCAATGTCCGTGG
AGAGGCTTGATCAGTCTAGCGACAGAATCAGAGAGAGTAGAAGAACTATGATGGAGACCG
AAGAGCTTGGTGTCTCCATTCTCCAAGATCTCAGTCAGCAGCGCCAAACTCTCCTTCACT
CCCACAGCAAGCTTCGTGGTGTGGATGAGGCCATTGACAAGAGCAAGAAGGTCTTGACGG
CTATGTCGAGAAGAATGACGAGGAACAAATGGATCGTTACTTCAGTGATCATTGCTCTCA
TTCTCGCCATCATCCTCATCATTTCATTCAAACTTTCTCATTGATATTTGCTCTCAGCCG
TTTGTGTATAAGATTGTTGGTACTTTCCTTTGTAATGAATGGGCTTGGATCTCTTTGTCT
CCCCCAGGTTTCCACTTGTATGACCCAAAAATGTGTTATGACATGTTTTTA
CATATTACTATTCC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2H743TF 148 0 0
GAAG
ATTGTTGGTACTTTCCTTTGTAATGAATGGGCTTGGATCTCTTTGTCTCCCCCAGGTTTC
CACTTGTATGACCCAAAAATGTGTTATGACATGTTTTTAGTTATCTATCTTATTAAAAGA
GAAGTACAAATATAGATTTACCCT

QA 5 148 5 148
DS 



AS 2 6

CO CL1318Contig1 931 2 2 U
GTACCTGGTTTATCCTGCCGGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTG
TAAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTT
GTTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAA
ACCCCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGT
TGCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCA
TTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACG
GGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCC
AAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAAAAACCTGCTCCTCCTACACCGTCTTCTTC
TCCTCCTCCACCACCGCCTCCACCGCAGAAAGCTGTGGCTGTTGATGGTAAGAGTGTAAC
CACGGAGGAGTTTCAAAGGCAAAAAGCTAAAGAGCTTCAGGATTACTTTAAGCAGAAGAA
GCTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCCTTTTTTGGTTTCCAACCCAAAAACGAGATCTCCAA
TGGAAAGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGGGGATGCTGACAGAGTATGCAACAGGATC
AGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCTCCAATTTCGGCATTCTAGACTTGGAATA
ATAATGAAAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTTATATAGATATGATCTTTCTCTGATTTCCTTA
TGTTCAATCTTCATCTGCTTGTTTATTATTCTTCCTCCTGTATATGCTGCATCTCTTAAG
ATCTTTTAAATACAGGGCCCTTTTGTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE39TF U 1
AF RR2AE39JQ C 153
BS 1 757 RR2AE39TF
BS 758 931 RR2AE39JQ

RD RR2AE39TF 757 0 0
GTACCTGGTTTATCCTGCCGGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTG
TAAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTT
GTTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAA
ACCCCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGT
TGCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCA
TTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACG
GGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCC
AAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAAAAACCTGCTCCTCCTACACCGTCTTCTTC
TCCTCCTCCACCACCGCCTCCACCGCAGAAAGCTGTGGCTGTTGATGGTAAGAGTGTAAC
CACGGAGGAGTTTCAAAGGCAAAAAGCTAAAGAGCTTCAGGATTACTTTAAGCAGAAGAA
GCTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCCTTTTTTGGTTTCCAACCCAAAAACGAGATCTCCAA
TGGAAAGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGGGGATGCTGACAGAGTATGCAACAGGATC
AGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCTCCAAT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2AE39JQ 779 0 0
GTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAACCCCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAG
ATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGTTGCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATC
GCATGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGT
AGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGA
GGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAAA
AACCTGCTCCTCCTACACCGTCTTCTTCTCCTCCTCCACCACCGCCTCCACCGCAGAAAG
CTGTGGCTGTTGATGGTAAGAGTGTAACCACGGAGGAGTTTCAAAGGCAAAAAGCTAAAG
AGCTTCAGGATTACTTTAAGCAGAAGAAGCTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCCTTTTTTG
GTTTCCAACCCAAAAACGAGATCTCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGG
GGATGCTGACAGAGTATGCAACAGGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCT
CCAATTTCGGCATTCTAGACTTGGAATAATAATGAAAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTTATA
TAGATATGATCTTTCTCTGATTTCCTTATGTTCAATCTTCATCTGCTTGTTTATTATTCT
TCCTCCTGTATATGCTGCATCTCTTAAGATCTTTTAAATACAGGGCCCTTTTGTTGTTC

QA 1 779 1 779
DS 



CO CL1318Contig2 723 4 6 U
GGAGACAATTCGAAGTTAAAAGAAAAAGCCATTAACGGAAGATGTCATTAGCTTCACCGA
TTCAGTGCATCAGAATTGTAAATCCTTCTTCTTCTTCATCTTCATATAAGACAACTTCGT
CGTCTTTGAGATTCTCAACGAGTAAGCCATGTGTCTTCATCATCAGATGTTCTCAGGCCG
AAGGTCCATTGAGAAGGCCCTCGGCTCCTCCTACTCTCCGGGAGCCTACACCTCCCCAAA
AACCTGTTCCTCCTACGCCGTCTTCTTCTCCTCCACCACCACCGCCTCCACCGCAGAAAG
CTGTGGCTGTTGATGGTAAGAGTGTAACCACGGTGGAGTTTCAGAGGCAAAAAGCTAAAG
AGCTTCAGGATTACTTTAAGCAGAAGAAGCTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCCTTTTTTG
GTTTCCAACCCAAAAACGAGATCTCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGG
GGATGCTGACAGAGTATGCAACAGGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCT
CCAATTTCGGCATTCTAGACTTGGAATAATAATGAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTTATATA
GATATGATCTCTCTCTGATTCCCTTATGTTCAATCTTCATCTGCTTGTTTATTATTCTTC
CTCCTGTATATGCTGCATCTCTTAAGATCTTTTAAATACAGGGCCCTTTTGTTGTTCAAC
CAA


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2F834TF U 1
AF RR2BH71JQ C 5
AF RR2F834JQ C 263
AF RR2BH71TF U 5
BS 1 118 RR2F834TF
BS 119 119 RR2BH71TF
BS 120 550 RR2F834TF
BS 551 551 RR2BH71TF
BS 552 630 RR2F834TF
BS 631 723 RR2BH71TF

RD RR2F834TF 630 0 0
GGAGACAATTCGAAGTTAAAAGAAAAAGCCATTAACGGAAGATGTCATTAGCTTCACCGA
TTCAGTGCATCAGAATTGTAAATCCTTCTTCTTCTTCATCTTCATATAAGACAACTTCAT
CGTCTTTGAGATTCTCAACGAGTAAGCCATGTGTCTTCATCATCAGATGTTCTCAGGCCG
AAGGTCCATTGAGAAGGCCCTCGGCTCCTCCTACTCTCCGGGAGCCTACACCTCCCCAAA
AACCTGTTCCTCCTACGCCGTCTTCTTCTCCTCCACCACCACCGCCTCCACCGCAGAAAG
CTGTGGCTGTTGATGGTAAGAGTGTAACCACGGTGGAGTTTCAGAGGCAAAAAGCTAAAG
AGCTTCAGGATTACTTTAAGCAGAAGAAGCTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCCTTTTTTG
GTTTCCAACCCAAAAACGAGATCTCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGG
GGATGCTGACAGAGTATGCAACAGGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCT
CCAATTTCGGTATTCTAGACTTGGAATAATAATGAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTTATATA
GATATGATCTCTCTCTGATTCCCTTATGTT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2BH71JQ 717 0 0
GG
AATTCGAAGTTAAAAGAAAAAGCCATTAACGGAAGATGTCATTAGCTTCACCGATTCAGT
GCATCAGAATTGTAAATCCTTCTTCTTCTTCATCTTCATATAAGACAACTTCGTCGTCTT
TGAGATTCTCAACGAGTAAGCCATGTGTCTTCATCATCAGATGTTCTCAGGCCGAAGGTC
CATTGAGAAGGCCCTCGGCTCCTCCTACTCTCCGGGAGCCTACACCTCCCCAAAAACCTG
TTCCTCCTACGCCGTCTTCTTCTCCTCCACCACCACCGCCTCCACCGCAGAAAGCTGTGG
CTGTTGATGGTAAGAGTGTAACCACGGTGGAGTTTCAGAGGCGAAAAGCTAAAGAGCTTC
AGGATTACTTTAAGCAGAAGAAGTTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCCTTTTTTGGTTTCC
AACCCAAAAACGAGATCTCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGGGGATGC
TGACAGAGTATGCAACAGGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCTCCAATT
TCGGCATTCTAGACTTGGAATAATAATGAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTTATATAGATATG
ATCTCTCTCTGATTCCCTTATGTTCAATCTTCATCTGCTTGTTTATTATTCTTCCTCCTG
TATATGCTGCATCTCTTAAGATCTTTTAAATACAGGGCCCTTTTGTTGTTC
AACC

QA 3 713 3 713
DS 

RD RR2F834JQ 415 0 0
TTT
TTCTCCTCCACCACCACCGCCTCCACCGCAGAAAGCTGTGGCTGTTGATGGTAAGAGTGT
AACCACGGTGGAGTTTCAGAGGCAAAAAGCTAAAGAGCTTCAGGATTACTTTAAGCAGAA
GAAGCTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCCTTTTTTGGTTTCCAACCCAAAAACGAGATCTC
CAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGGGGATGCTGACAGAGTATGCAACAGG
ATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCTCCAATTTCGGTATTCTAGACTTGGA
ATAATAATGAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTTATATAGATATGATCTCTCTCTGATTCCCTT
ATGTTCAATCTTCATCTGCTTGTTTATTATTCTTCCTCCTGTATATGCTGCA

QA 4 415 4 415
DS 

RD RR2BH71TF 719 0 0
GG
AATTCGAAGTTAAAAGAAAAAGCCATTAACGGAAGATGTCATTAGCTTCACCGATTCAGT
GCATCAGAATTGTAAATCCTTCTTCTTCTTCATCTTCATATAAGACAACTTCGTCGTCTT
TGAGATTCTCAACGAGTAAGCCATGTGTCTTCATCATCAGATGTTCTCAGGCCGAAGGTC
CATTGAGAAGGCCCTCGGCTCCTCCTACTCTCCGGGAGCCTACACCTCCCCAAAAACCTG
TTCCTCCTACGCCGTCTTCTTCTCCTCCACCACCACCGCCTCCACCGCAGAAAGCTGTGG
CTGTTGATGGTAAGAGTGTAACCACGGTGGAGTTTCAGAGGCGAAAAGCTAAAGAGCTTC
AGGATTACTTTAAGCAGAAGAAGTTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCCTTTTTTGGTTTCC
AACCCAAAAACGAGATCTCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGGGGATGC
TGACAGAGTATGCAACAGGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCTCCAATT
TCGGCATTCTAGACTTGGAATAATAATGAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTTATATAGATATG
ATCTCTCTCTGATTCCCTTATGTTCAATCTTCATCTGCTTGTTTATTATTCTTCCTCCTG
TATATGCTGCATCTCTTAAGATCTTTTAAATACAGGGCCCTTTTGTTGTTCAACCAA

QA 3 719 3 719
DS 



AS 1 5

CO CL1319Contig1 1040 5 4 U
GGAATTCGAACGGATCTGCTTGTGATTGATACCTTCTTCTTCTCCTCCAAGCCAGAGCCT
GCGAATCATTAAGTTGCTCGATTGTTCTTAAAAATATAGGAATCAAATGGGACCAAAAGC
TGGAACGTTGGTTATTATCTTGCTGCTGGGGTTGACCTTGCTTTCTGACGCTAGATCTTT
CCTTCACTCTTCCATAGACTCAGAGGAAGTTTCAAAGAACGAAAAGGTTTGCACTCTGTG
TGAGGAATATGTTAACGTTGCTATCAGCTACCTTGAGAAAAACGAAACACAAGCACAGGT
TATCGAGGATCTCCATGAGCGCTGTTCCCATATGCGCGGTTTTGCACAGCAGTGCGTAAC
TTTGGTTGATTACTATGTTCCCCTTTTCTTCATACAACTTGAGTCGTTTCAACCTGAAGA
TTTCTGCAAGCGGATGAATCTTTGTGACAAAGTGGCAGCTCTTGTTGAAGAAGCCCGTCA
GGATAGCTGCGCTGTATGCCACAAGACTGTTTCAGATATTCTCATCAAACTCCAAGATCC
TGACACTCAGTTGGATATAGTTGAGCTACTTCTCAAGGGATGCAAATCATTCAAGAACTA
CGAGAAGAAGTGCAAGAAGTTGGTGTTCGAGTATGGACCTTTGATCCTGGTTAATGCAAA
CGATTTCCTTGTTAAAAATGACGTCTGCACACTCTTACGCGCATGTCCAGCGGCAGAGGA
AATGGTTCAAAGGCAGCCCGGGTCGGCTGATTCTTGAATGTTATAAAAAAAAGATGGTTG
CCGGAACACAACTGCTTGTGTATTATTCATACGAATCTTTGCAGACTTTCTGAACTGTCT
AAATGTATGGATTTAGACACGCGCGCACACACTCATTCCATAAACGTTTCTTTGCATTTG
TGTAAATAATGATCTACAATGGTCTTACCTGTATTATGTGATTGTATTGTACTTTTATCC
CTTCTCAGGTTCTTAACATGTTAAGAATAATGTGGAGGAGGGCACTGCAATTGTTCGTTT
GTCTGAATGATTTGTGTATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2CT31TF U 312
AF RR2BW82TF U 1
AF RR2BW82JQ C 223
AF RR2CT31JQ C 345
AF RR2AD60TF U 598
BS 1 718 RR2BW82TF
BS 719 719 RR2AD60TF
BS 720 732 RR2BW82TF
BS 733 1040 RR2AD60TF

RD RR2CT31TF 330 0 0
TCCATGAGCGCTGTTCCCATATGCGCGGTTTTGCACAGCAGTGCGTAACTTTGGTTGATT
ACTATGTTCCCCTTTTCTTCATACAACTTGAGTCGTTTCAACCTGAAGATTTCTGCAAGC
GGATGAATCTTTGTGACAAAGTGGCAGCTCTTGTTGAAGAAGCCCGTCAGGATAGCTGCG
CTGTATGCCACAAGACTGTTTCAGATATTCTCATCAAACTCCAAGATCCTGACACTCAGT
TGGATATAGTTGAGCTACTTCTCAAGGGATGCAAATCATTCAAGAACTACGAGAAGAAGT
GCAAGAAGTTGGTGTTCGAGTATGGACCTT

QA 1 330 1 330
DS 

RD RR2BW82TF 736 0 0
GGAATTCGAACGGATCTGCTTGTGATTGATACCTTCTTCTTCTCCTCCAAGCCAGAGCCT
GCGAATCATTAAGTTGCTCGATTGTTCTTAAAAATATAGGAATCAAATGGGACCAAAAGC
TGGAACGTTGGTTATTATCTTGCTGCTGGGGTTGACCTTGCTTTCTGACGCTAGATCTTT
CCTTCACTCTTCCATAGACTCAGAGGAAGTTTCAAAGAACGAAAAGGTTTGCACTCTGTG
TGAGGAATATGTTAACGTTGCTATCAGCTACCTTGAGAAAAACGAAACACAAGCACAGGT
TATCGAGGATCTCCATGAGCGCTGTTCCCATATGCGCGGTTTTGCACAGCAGTGCGTAAC
TTTGGTTGATTACTATGTTCCCCTTTTCTTCATACAACTTGAGTCGTTTCAACCTGAAGA
TTTCTGCAAGCGGATGAATCTTTGTGACAAAGTGGCAGCTCTTGTTGAAGAAGCCCGTCA
GGATAGCTGCGCTGTATGCCACAAGACTGTTTCAGATATTCTCATCAAACTCCAAGATCC
TGACACTCAGTTGGATATAGTTGAGCTACTTCTCAAGGGATGCAAATCATTCAAGAACTA
CGAGAAGAAGTGCAAGAAGTTGGTGTTCGAGTATGGACCTTTGATCCTGGTTAATGCAAA
CGATTTCCTTGTTAAAAATGACGTCTGCACACTCTTACGCGCATGTCCAGCGGCAGAG*A
AATGGTTCAAAG
CAGC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2BW82JQ 681 0 0
AAAGGTTTGCACTCTGTGTGAGGAATATGTTAACGTTGCTATCAGCTACCTTGAGAAAAA
CGAAACACAAGCACAGGTTATCGAGGATCTCCATGAGCGCTGTTCCCATATGCGCGGTTT
TGCACAGCAGTGCGTAACTTTGGTTGATTACTATGTTCCCCTTTTCTTCATACAACTGGA
GTCGTTTCAACCTGAAGATTTCTGCAAGCGGATGAATCTTTGTGACAAAGTGGCAGCTCT
TGTTGAAGAAGCCCGTCAGGATAGCTGCGCTGTATGCCACAAGACTGTTTCAGATATTCT
CATCAAACTCCAAGATCCTGACACTCAGTTGGATATAGTTGAGCTACTTCTCAAGGGATG
CAAATCATTCAAGAACTACGAGAAGAAGTGCAAGAAGTTGGTGTTCGAGTATGGACCTTT
GATCCTGGTTAATGCAAACGATTTCCTTGTTAAAAATGACGTCTGCACACTCTTACGCGC
ATGTCCAGCGGCAGAGGAAATGGTTCAAAGGCAGCCCGGGTCGGCTGATTCTTGAATGTT
ATAAAAAAAAGATGGTTGCCGGAACACAACT*CTTGTGTATTATTCATACGAATCTTTGC
AGACTTTCTGAACTGTCTAAATGTATGGATTTAGACACGCGCGCACACACTCATTCCATA
AACGTTTCTTTGCATTTGTG
C

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2CT31JQ 695 0 0
CACAGCAGTGCGTAACTTTGGTTGATTACTATGTTCCCCTTTTCTTCATACAACTTGAGT
CGTTTCAACCTGAAGATTTCTGCAAGCGGATGAATCTTTGTGACAAAGTGGCAGCTCTTG
TTGAAGAAGCCCGTCAGGATAGCTGCGCTGTATGCCACAAGACTGTTTCAGATATTCTCA
TCAAACTCCAAGATCCTGACACTCAGTTGGATATAGTTGAGCTACTTCTCAAGGGATGCA
AATCATTCAAGAACTACGAGAAGAAGTGCAAGAAGTTGGTGTTCGAGTATGGACCTTTGA
TCCTGGTTAATGCAAACGATTTCCTTGTTAAAAATGACGTCTGCACACTCTTACGCGCAT
GTCCAGCGGCAGAGGAAATGGTTCAAAGGCAGCCCGGGTCGGCTGATTCTTGAATGTTAT
AAAAAAAAGATGGTTGCCGGAACACAACTGCTTGTGTATTATTCATACGAATCTTTGCAG
ACTTTCTGAACTGTCTAAATGTATGGATTTAGACACGCGCGCACACACTCATTCCATAAA
CGTTTCTTTGCATTTGTGTAAATAATGATCTACAATGGTCTTACCTGTATTATGTGATTG
TATTGTACTTTTATCCCTTCTCAGGTTCTTAACATGTTAAGAATAATGTGGAGGAGGGCA
CTGCAATTGTTCGTTTGTCTGAATGATTTGTGTAT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2AD60TF 443 0 0
G
TACGAGAAGAAGTGCAAGAATTTGGTGTTCGAGTATGGACCTTTGATCCTGGTTAATGCA
AACGATTTCCTTGTTAAAAATGACGTCTGCACACTCTTACGCGCATGTCCAGCGGCAGAG
GAAATGGTTCAAAGGCAGCCCGGGTCGGCTGATTCTTGAATGTTATAAAAAAAAGATGGT
TGCCGGAACACAACTGCTTGTGTATTATTCATACGAATCTTTGCAGACTTTCTGAACTGT
CTAAATGTATGGATTTAGACACGCGCGCACACACTCATTCCATAAACGTTTCTTTGCATT
TGTGTAAATAATGATCTACAATGGTCTTACCTGTATTATGTGATTGTATTGTACTTTTAT
CCCTTCTCAGGTTCTTAACATGTTAAGAATAATGTGGAGGAGGGCACTGCAATTGTTCGT
TTGTCTGAATGATTTGTGTATA

QA 2 443 2 443
DS 



AS 3 6

CO CL1320Contig1 696 2 19 U
AAGTGCTGCAAAGATTTGAAAGAATAACAAAGATGCAGTGACAAAACCAAACAAGTGGCT
GTCTGAAAACACCCAAAGCTCAGTGTAGTAAGTAATAACAGAGAGTGCATCTAACAGTTC
CTTATATTACAACCACACACACCATCAACGAGAAATACAATACTTACTTATATATATGTA
TATATCGGGGGACCGGACTGCTAGGACTAAAGATATTCGTTCGTTTCAAAAGTCTTACTT
ACCTCCTTCCTCTTTGATCAGCGAACAATGAGCTCTTCAACGAAGTCGGCTTCTCCCGAC
TCAAACGGAACCAAAATATCATCTTCCGTGGTGAAGTTGTAGCTCTCTCCAATGGCCCTC
AAAAACTGGTACACCTCAAACATAGTAGGCCTCTGCCTTGCTACTTCCGGTAGAACGCAG
TTGCATGCTACTTTGAGCACTTTGAAAATCTCATCATTCACACCCTTCCCAAGTAAAGAC
CTGTCAATCGCTTCCTGCAGTTTCGACTCACTCGATAGCTTTGTAACCCATTCCACGAGG
TTACCCTTAAAGCTATTATCTTCTTCCTCCTCGGCTTCTTCGGATCCTAGTGTAGTCACG
CTAGTAGCTTTTTGACCCGTTACAAGCTCTAGAAGCACAACCCCGAAGCTGTACACATCT
CCTTTAGGAGTTGCCACCATGGTTCTCGAATACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE29JQ U 64
AF RR2A609JQ U 1
BS 1 119 RR2A609JQ
BS 120 120 RR2BE29JQ
BS 121 136 RR2A609JQ
BS 137 137 RR2BE29JQ
BS 138 296 RR2A609JQ
BS 297 297 RR2BE29JQ
BS 298 311 RR2A609JQ
BS 312 312 RR2BE29JQ
BS 313 356 RR2A609JQ
BS 357 357 RR2BE29JQ
BS 358 379 RR2A609JQ
BS 380 380 RR2BE29JQ
BS 381 383 RR2A609JQ
BS 384 384 RR2BE29JQ
BS 385 396 RR2A609JQ
BS 397 397 RR2BE29JQ
BS 398 550 RR2A609JQ
BS 551 551 RR2BE29JQ
BS 552 696 RR2A609JQ

RD RR2BE29JQ 520 0 0
TGAAAACACCCAAAGCTCAGTGTAGTAAGTAATAACAGAGAGTGCATCTAACAGTTCCTT
ATATTACAACCACACACACCATCAACGAGAAATACAATACTTACTTATATATATGTATAT
ATCGTGGGACCGGACTGCTAGGACTAAAGATATTCGTTCGTTTCAGAAGTCTTACTTACC
TCCTTCCTCTTTGATCAGCGAACAATGAGCTCTTCAACGAAGTCGGCTTCTCCCGACTCA
GACGGAACCAAGATATCATCTTCCGTGGTGAAGTTGTAGCTCTCTCCAATGGCCCTCAGA
AACTGGTACACCTCAAACATAGTAGGCCTCTGCCTTGCTACTTCCGGTAGAACGCAGTTG
CATGCTACTTTGAGCACTTTGAAGATCTCATCATTCACACCCTTCCCAAGTAAAGACCTG
TCAATCGCTTCCTGCAGTTTTGACTCACTCGATAGCTTTGTAACCCATTCCACGAGGTTA
CCCTTAAAGCTATTATCTTCTTCCTCCTCGGCTTCTTCGG

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2A609JQ 696 0 0
AAGTGCTGCAAAGATTTGAAAGAATAACAAAGATGCAGTGACAAAACCAAACAAGTGGCT
GTCTGAAAACACCCAAAGCTCAGTGTAGTAAGTAATAACAGAGAGTGCATCTAACAGTTT
CTTATATTACAACCACCCACACCATCAACGAGAAATACAATACTTACTTATATATATGTA
TATATCGGGGGACCGGACTGCTAGGACTAAAGATATTCGTTCGTTTCAAAAGTCTTACTT
ACCTCCTTCCTCTTTGATCAGCGAACAATGAGCTCTTCAACGAAGTCGGCTTCTCCTGAC
TCAAACGGAACTAAAATATCATCTTCCGTGGTGAAGTTGTAGCTCTCTCCAATGGCTCTC
AAAAACTGGTACACCTCAAGCATGGTAGGCCTCTGCTTTGCTACTTCCGGTAGAACGCAG
TTGCATGCTACTTTGAGCACTTTGAAAATCTCATCATTCACACCCTTCCCAAGTAAAGAC
CTGTCAATCGCTTCCTGCAGTTTCGACTCACTCGATAGCTTTGTAACCCATTCCACGAGG
TTACCCTTAAGGCTATTATCTTCTTCCTCCTCGGCTTCTTCGGATCCTAGTGTAGTCACG
CTAGTAGCTTTTTGACCCGTTACAAGCTCTAGAAGCACAACCCCGAAGCTGTACACATCT
CCTTTAGGAGTTGCCACCATGGTTCTCGAATACTCC

QA 1 696 1 696
DS 



CO CL1320Contig2 1221 2 12 U
GGAAGAATAACAAAGATGCAGTGACAAAACCAAACAAGTGGCTGTCTGAAAACACCCAAA
GCTCAGTGTAGTAAGTAATAACAGAGAGTGCATCTAACAGTTTCTTATATTACAACCACA
CACACCATCACAGAGAAATACAATACTTACTTAAATATATATATGTATATATATCGTGGG
ACTGCTAGGACTAAAGATATTCGTTCGTTTCAGAAGTCTTACTTACCTCCTTCCTCTTTG
ATCAGCGAACAATGAGCTCTTCAACGAAGTCGGCTTCTCCTGACTCAGACGGAACTAAGA
TATCATCTTCCGTGGTGAAGTTGTAGCTCTCTCCAATGGCCCTTAGAAACTGGTACACCT
CAAACATGGTAGGCCTCTGCTTTGCTACTTCCGGTAGAACGCAGTTGCATGCTACTTTGA
GCACTTTGAAGATCTCATCATTCACACCCTTCCCAAGTAAAGACCTGTCAATCGCTTCCT
GCAGTTTTGACTCACTCGACAGCTTTGTAACCCACTCCACGAGGTTACCCTTAAAGCTAT
TATCTTCTTCCTCCTCGGCTTCTTCGGATCCTAGTGTAGTCACACTAGTAGCTTTTTGAC
CCGTTACAAGCTCTAGAAGCACAACCCCGAAGCTGTACACATCTCCCTTAGGAGTCGCCA
CCATGGTTCTCGAATACTCCGGAGCAACATAACCAAAATCACCAAACTCCCCATTGACAA
ACGTGCTCAAATGCGTATCAATGGGATTCATAAGCCTAGCCAAACCGAAATCCGAGATCT
TAGCCTCGAAATCTGCGTTCAACAGTATGCATTTCGAGCTTATGTTGCGATGGATGATCC
TCGGGTTGCAGCTGTGGTGAAGCCACGCTAGTCCTTTCGCCGCGCCCAACGCGATTTTCA
GCCTCGTAGGCCAGTCCATAGGCTTGAAGACTCTTCATCTCCGCCTCCGGGATGCAACTG
ATCATAAAGGTAACCGTTGGGCATGTACTCGTATATCAGAAGCCTCTCCTTCTTGGCGAT
ACAGTAGCCCAAGAGAGGGACCAGGTTTCTGTGTTTTACGGATCCCAATGTCTTCATCTC
TGAGTCAAGCTCTTTCTCAGAGTGCTGAGAATCCTGCAGCCTCTTCACCATGAGAGGAGT
CCCGTCTTCCAGCACTCCTTTGTACATAGTTCCTGTTCTTCCTTTTCCGATCATGTTATC
TTTCTTGAACTCTTCCGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B986JQ U 1
AF RR2A609TF C 533
BS 1 649 RR2B986JQ
BS 650 650 RR2A609TF
BS 651 685 RR2B986JQ
BS 686 686 RR2A609TF
BS 687 712 RR2B986JQ
BS 713 713 RR2A609TF
BS 714 733 RR2B986JQ
BS 734 734 RR2A609TF
BS 735 751 RR2B986JQ
BS 752 752 RR2A609TF
BS 753 821 RR2B986JQ
BS 822 1221 RR2A609TF

RD RR2B986JQ 821 0 0
GGAAGAATAACAAAGATGCAGTGACAAAACCAAACAAGTGGCTGTCTGAAAACACCCAAA
GCTCAGTGTAGTAAGTAATAACAGAGAGTGCATCTAACAGTTTCTTATATTACAACCACA
CACACCATCACAGAGAAATACAATACTTACTTAAATATATATATGTATATATATCGTGGG
ACTGCTAGGACTAAAGATATTCGTTCGTTTCAGAAGTCTTACTTACCTCCTTCCTCTTTG
ATCAGCGAACAATGAGCTCTTCAACGAAGTCGGCTTCTCCTGACTCAGACGGAACTAAGA
TATCATCTTCCGTGGTGAAGTTGTAGCTCTCTCCAATGGCCCTTAGAAACTGGTACACCT
CAAACATGGTAGGCCTCTGCTTTGCTACTTCCGGTAGAACGCAGTTGCATGCTACTTTGA
GCACTTTGAAGATCTCATCATTCACACCCTTCCCAAGTAAAGACCTGTCAATCGCTTCCT
GCAGTTTTGACTCACTCGACAGCTTTGTAACCCACTCCACGAGGTTACCCTTAAAGCTAT
TATCTTCTTCCTCCTCGGCTTCTTCGGATCCTAGTGTAGTCACACTAGTAGCTTTTTGAC
CCGTTACAAGCTCTAGAAGCACAACCCCGAAGCTGTACACATCTCCCTTTGGAGTCGCCA
CCATGGTTCTCGAATACTCCGGAGCTACATAACCAAAATCACCAAACTCCCCGTTGACAA
ACGTGCTCAAATGGGTATCAATGGGATTCATCAGCCTAGCCAAACCGAAATCCGAGATCT
TAGCCTCGAAATCTGCGTTCAACAGTATGCATTTCGAGCTT

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR2A609TF 689 0 0
AAG
GCTATTATCTTCTTCCTCCTCGGCTTCTTCGGATCCTAGTGTAGTCACGCTAGTAGCTTT
TTGACCCGTTACAAGCTCTAGAAGCACAACCCCGAAGCTGTACACATCTCCTTTAGGAGT
TGCCACCATGGTTCTCGAATACTCCGGAGCAACGTAACCAAAATCACCAAACTCCCCATT
GACAAACGTGCTCAAATGCGTATCAATGGGATTCATAAGCCTAGCCAAACCGAAATCCGA
GATCTTAGCCTCGAAATCTGCGTTCAACAGTATGCATTTCGAGCTTATGTTGCGATGGAT
GATCCTCGGGTTGCAGCTGTGGTGAAGCCACGCTAGTCCTTTCGCCGCGCCCAACGCGAT
TTTCAGCCTCGTAGGCCAGTCCATAGGCTTGAAGACTCTTCATCTCCGCCTCCGGGATGC
AACTGATCATAAAGGTAACCGTTGGGCATGTACTCGTATATCAGAAGCCTCTCCTTCTTG
GCGATACAGTAGCCCAAGAGAGGGACCAGGTTTCTGTGTTTTACGGATCCCAATGTCTTC
ATCTCTGAGTCAAGCTCTTTCTCAGAGTGCTGAGAATCCTGCAGCCTCTTCACCATGAGA
GGAGTCCCGTCTTCCAGCACTCCTTTGTACATAGTTCCTGTTCTTCCTTTTCCGATCATG
TTATCTTTCTTGAACTCTTCCGTTGC

QA 4 689 4 689
DS 



CO CL1320Contig3 853 2 16 U
GCTGGATCAGTGTAAAGGTCCTGCTAGCTCTCGTGCTAAAGTTGTTGTTATAGCTGCGGT
TGGTGGACTGGTCGCAGCGGCGTTAGTGGTTGGGGTTGTTCTGTTCTTCTACTTCCGTAG
GTTGGCTGCTATTCGGAAGAAGTTGCAGGATGATCCTGAAGATAACAGATGGGCTAGGAT
CTTGAAAGAACAGAAAGGCGTTAAGGTTTTCATGTTTAAGAAGTCAGTTTCAAAGATGAA
GCTAAGCGATCTAATGAAGGCAACGGAAGAGTTCAAGAAAGATAACATGATCGGAAAAGG
AAGAACAGGAACTATGTACAAAGGAGTGCTCAAAGACGGAACTCCTCTCATGGTGAAGAG
GCTGCAGGATTCTCAACACACTGAGAAAGAGCTTGACTCAGAGATGAAGACATTGGGATC
TGTGAAACACAGAAACCTGGTCCCTCTCTTGGGCTACTGTATCGCCAAGAAAGAGAGGCT
TCTGATATACGAGTACATGCCCAAGGGTTACCTTTATGATCAGTTACATCCCGGCGGACA
AGATGAAGAGTCTTCCTTCAAGCCTATGGACTGGCCTACGAGGCTGAAAATCGCGTTGGG
GGCGGCCAAAGGACGAGCGTGGCTACACCACAGCTGCAACCCGAGGATCATCCATCGCAA
CATAAGCTCGAAATGCATACTGTTGAACGCAGATTTCGAGGCTAAGATCTCGGATTTCGG
TTTGGCTAGGCTGATGAATCCCATTGATACCCATTTGAGCACGTTTGTCAACGGGGAGTT
TGGTGATTTTGGTTATGTAGCTCCGGAGTATTCGAGAACCATGGTGGCGACTCCAAAGGG
AGATGTGTACAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 
15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE29TF U 1
AF RR2B986TF U 157
BS 1 267 RR2BE29TF
BS 268 268 RR2B986TF
BS 269 335 RR2BE29TF
BS 336 336 RR2B986TF
BS 337 456 RR2BE29TF
BS 457 457 RR2B986TF
BS 458 471 RR2BE29TF
BS 472 472 RR2B986TF
BS 473 538 RR2BE29TF
BS 539 540 RR2B986TF
BS 541 614 RR2BE29TF
BS 615 615 RR2B986TF
BS 616 686 RR2BE29TF
BS 687 687 RR2B986TF
BS 688 715 RR2BE29TF
BS 716 853 RR2B986TF

RD RR2BE29TF 715 0 0
GCTGGATCAGTGTAAAGGTCCTGCTAGCTCTCGTGCTAAAGTTGTTGTTATAGCTGCGGT
TGGTGGACTGGTCGCAGCGGCGTTAGTGGTTGGGGTTGTTCTGTTCTTCTACTTCCGTAG
GTTGGCTGCTATTCGGAAGAAGTTGCAGGATGATCCTGAAGATAACAGATGGGCTAGGAT
CTTGAAAGAACAGAAAGGCGTTAAGGTTTTCATGTTTAAGAAGTCAGTTTCAAAGATGAA
GCTAAGCGATCTAATGAAGGCAACGGAGGAGTTCAAGAAAGATAACATGATCGGAAAAGG
AAGAACAGGAACTATGTACAAAGGAGTGCTCAAAGGCGGAACTCCTCTCATGGTGAAGAG
GCTGCAGGATTCTCAACACACTGAGAAAGAGCTTGACTCAGAGATGAAGACATTGGGATC
TGTGAAACACAGAAACCTGGTCCCTCTCTTGGGCTATTGTATCGCCAAGAAGGAGAGGCT
TCTGATATACGAGTACATGCCCAAGGGTTACCTTTATGATCAGTTACATCCCGGCGGAGG
AGATGAAGAGTCTTCCTTCAAGCCTATGGACTGGCCTACGAGGCTGAAAATCGCGTTGGG
GGCGGCCAAAGGACTAGCGTGGCTACACCACAGCTGCAACCCGAGGATCATCCATCGCAA
CATAAGCTCGAAATGCATACTGTTGACCGCAGATTTCGAGGCTAAGATCTCGGAT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2B986TF 697 0 0
TGAAGATAACAGATGGGCTAGGATCTTGAAAGAACAGAAAGGCGTTAAGGTTTTCATGTT
TAAGAAGTCAGTTTCGAAGATGAAGCTAAGCGATCTAATGAAGGCAACGGAAGAGTTCAA
GAAAGATAACATGATCGGAAAAGGAAGAACAGGAACTATGTACAAAGGAGTGCTCGAAGA
CGGGACTCCTCTCATGTTGAAGAGGCTGCAGGATTCTCAACACTCTGAGAAAGAGCTTGA
CTCAGAGATGAAGACTTTGGGATCTGTGAAACACAGGAACCTGGTCCCTCTCTTGGGCTA
CTGTATCGCCAAGAAAGAGAGGCTTCTGATATACGAGTACATGCCCAAGGGTTACCTTTA
TGATCAGTTGCATCCCGGCGGCCAAGATGAGGGGTCTTCCTTCAAGCCTATGGACTGGCC
TACGAGGCTGAAAATCGCGTTGGGGGCGGCTAAAGGACGAGCGTGGCTACACCACAGCTG
CAACCCGAGGATCATCCATCGCAACATAAGCTCGAAATGCATACTGTTGAACGCAGATTT
CGAGGCTAAGATCTCGGATTTCGGTTTGGCTAGGCTGATGAATCCCATTGATACCCATTT
GAGCACGTTTGTCAACGGGGAGTTTGGTGATTTTGGTTATGTAGCTCCGGAGTATTCGAG
AACCATGGTGGCGACTCCAAAGGGAGATGTGTACAGC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 2 6

CO CL1321Contig1 855 3 6 U
GGTAGTTTAGTAATGTTTTTTATTAGAACTAGAAATACAGATAAAAAAACTGCAATTGAA
AGCCCAACCAATCAAACTAAATGTTTTCCATTGAATTTGCGAAGGTAGCCTGGAGTTTGT
TAACCAGATGCTCTCCATAGACAACTCTTTTGGAAACTTGAGATCTTTTATTTCCCGGGC
CTTTGAAGATATCCAATGGTTCAGCCATCGCATCAAAGTTGAACTCGTAGAAGAATCCGA
CGCATACACGGTATCGAGGAGAGTTATTGATCACTCTATGAATTGTGGATTCATATACTC
CATTTGAAAGTATCTTTAACATGTCACCGATGTTGCAAATAAATGATCCAGGGATCGGAG
TAACTGATATCCAACCACCGGCCAAGTTCTTCACCTGAAGAGCAGTTTTATCTTCATCTT
GATTTATAAGCGACAACAAGCCATAGTCAGTATGAGCTCCACATCCGATAACATTTTCTT
GGTTTACACCTGGATAACCAATAATACGCATTATCCAAAAAGGGTCTCCAACCAGTTTTC
CCTCAAATTCATAAGGTGATCCCCCAAGAGCTAAGGAGATTCCTCTGAGGATGTTTCTAG
ATAGATCTATGCATAGCTTAATATACTCATCCATCACTTCTTTGTAGTCTTGAGGATTAT
CTGGCCACTGGTTTGGCCCTTCCATGACCTTTCCAGTTTCTCCATACTTTCCTTGCTCGA
ACTCTCTGTAACAATCAATTGCTTCGTGAAAATCTTGTTTCCCATTCGTAAAGTTTTCTC
CAATTCTCTGATATCCTCTGTATCCAGCTGCTGGTTTAATCTTGATCTTAAGTTTCTCCT
CATATGGAAGCTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO13JQ U 4
AF RR2AJ45JQ U 1
AF RR2AK74JQ U 9
BS 1 232 RR2AJ45JQ
BS 233 233 RR2GO13JQ
BS 234 405 RR2AJ45JQ
BS 406 406 RR2GO13JQ
BS 407 789 RR2AJ45JQ
BS 790 855 RR2AK74JQ

RD RR2GO13JQ 551 0 0
GGTTT
AGTAATGTTTTTTATTAGAACTAGAAATACAGATAAAAAAACTGCAATTGAAAGCCCAAC
CAATCAAACTAAATGTTTTCCATTGAATTTGCGAAGGTAGCCTGGAGTTTGTTAACCAGA
TGCTCTCCATAGACAACTCTTTTGGAAACTTGAGATCTTTTATTTCCCGGGCCTTTGAAG
ATATCCAATGGTTCAGCCATCGCATCAAAGTTGAACTCGTAGAAGAATCCGACGCATACA
CGGTATCGAGGAGAGTTATTGATCACTCTATGAATTGTGGATTCATATACTCCATTTGAA
AGTATCTTCAACATGTCACCGATGTTGCAAATAAATGATCCAGGGATCGGAGTAACTGAT
ATCCAACCACCGGCCAAGTTCTTCACCTGAAGAGCAGTTTTATCTTCATCTTGATTTATA
AGCGACAACAAGCCATAGTCAGTATGAGCTCCACATCCGATAACATTTTCTTGGTTTACA
CCTGGATAACCAATAATACGCATTATCCAAAAAGGGTCTCCAACCAGTTTTCCCTCAAAT
TCATAA

QA 6 551 6 551
DS 

RD RR2AJ45JQ 789 0 0
GGTAGTTTAGTAATGTTTTTTATTAGAACTAGAAATACAGATAAAAAAACTGCAATTGAA
AGCCCAACCAATCAAACTAAATGTTTTCCATTGAATTTGCGAAGGTAGCCTGGAGTTTGT
TAACCAGATGCTCTCCATAGACAACTCTTTTGGAAACTTGAGATCTTTTATTTCCCGGGC
CTTTGAAGATATCCAATGGTTCAGCCATCGCATCAAAGTTGAACTCGTAGAAAAATCCGA
CGCATACACGGTATCGAGGAGAGTTATTGATCACTCTATGAATTGTGGATTCATATACTC
CATTTGAAAGTATCTTTAACATGTCACCGATGTTGCAAATAAATGATCCAGGGATCGGAG
TAACTGATATCCAACCACCGGCCAAGTTCTTCACCTGAAGAGCAGCTTTATCTTCATCTT
GATTTATAAGCGACAACAAGCCATAGTCAGTATGAGCTCCACATCCGATAACATTTTCTT
GGTTTACACCTGGATAACCAATAATACGCATTATCCAAAAAGGGTCTCCAACCAGTTTTC
CCTCAAATTCATAAGGTGATCCCCCAAGAGCTAAGGAGATTCCTCTGAGGATGTTTCTAG
ATAGATCTATGCATAGCTTAATATACTCATCCATCACTTCTTTGTAGTCTTGAGGATTAT
CTGGCCACTGGTTTGGCCCTTCCATGACCTTTCCAGTTTCTCCATACTTTCCTTGCTCGA
ACTCTCTGTAACAATCAATTGCTTCGTGAAAATCTTGTTTCCCATTCGTAAAGTTTTCTC
CAATTCTCT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2AK74JQ 847 0 0
AGTAATGTTTTTTATTAGAACTAGAAATACAGATAAAAAAACTGCAATTGAAAGCCCAAC
CAATCAAACTAAATGTTTTCCATTGAATTTGCGAAGGTAGCCTGGAGTTTGTTAACCAGA
TGCTCTCCATAGACAACTCTTTTGGAAACTTGAGATCTTTTATTTCCCGGGCCTTTGAAG
ATATCCAATGGTTCAGCCATCGCATCAAAGTTGAACTCGTAGAAGAATCCGACGCATACA
CGGTATCGAGGAGAGTTATTGATCACTCTATGAATTGTGGATTCATATACTCCATTAGAA
AGTATCTTTAACATGTCACCGATGTTGCAAATAAATGATCCAGGGATCGGAGTAACTGAT
ATCCAACCACCGGCCAAGTTCTTCACCTGAAGAGCAGTTTTATCTTCATCTTGATTTATA
AGCGACAACAAGCCATAGTCAGTATGAGCTCCACATCCGATAACATTTTCTTGGTTTACA
CCTGGATAACCAATAATACGCATTATCCAAAAAGGGTCTCCAACCAGTTTTCCCTCAAAT
TCATAAGGTGATCCCCCAAGAGCTAAGGAGATTCCTCTGAGGATGTTTCTAGATAGATCT
ATGCATAGCTTAATATACTCATCCATCACTTCTTTGTAGTCTTGAGGATTATCTGGCCAC
TGGTTTGGCCCTTCCATGACCTTTCCAGTTTCTCCATACTTTCCTTGCTCGAACTCTCTG
TAACAATCAATTGCTTCGTGAAAATCTTGTTTCCCATTCGTAAAGTTTTCTCCAATTCTC
TGATATCCTCTGTATCCAGCTGCTGGTTTAATCTTGATCTTAAGTTTCTCCTCATATGGA
AGCTTGA

QA 1 847 1 847
DS 



CO CL1321Contig2 820 3 10 U
GGATTCTCTAAGAATCTGAGATGGATACAGACTCTAAATCACTTCTACCAATTATTGACA
TCAGCCCTTTACTAGTCAAATGCGATGATCCCAGCATGAAGGAAGATGCCGGCGTTGCCG
AGGTTGTCCGTAGACTAGACCGAGCTTGTCGGGACGTCGGTTTCTTCTACGTGACTGACC
ATGGAATTTCTGAGAGTCTTATGAAGAAGGTGAAAGAGATGTCACATCAATTCTTCAAGC
TTCCATATGAGGAGAAACTTAAGATCAAGATTAAACCAGCAGCTGGATACAGAGGATATC
AGAGAATTGGAGAAAACTTTACGAATGGGAAACAAGATTTTCACGAAGCAATTGATTGTT
ACAGAGAGTTCGAGCAAGGAAAGTATGGAGAAACTGGAAAGGTCATGGAAGGGCCAAACC
AGTGGCCAGATAATCCTCAAGACTACAAAGAAGTGATGGATGAGTATATTAAGCTATGCA
TAGATCTATCTAGAAACATCCTCAGAGGAATCTCCTTAGCTCTTGGGGGATCACCTTATG
AATTTGAGGGAAAACTGGTTGGAGACCCTTTTTGGATAATGCGTATTATTGGTTATCCAG
GTGTAAACCAAGAAAATGTTATCGGATGTGGAGCTCATACTGACTATGGCTTGTTGTCGC
TTATAAATCAAGATGAAGATAAA*CTGCTCTTCAGTGAGACTTGGCCGGTGGTTGGATAT
CAGTTACTCCGATCCCTGGATCATTAATTGCACATCGGTGACATGTTGAGATACTTTCAA
TGGAGTATATGATCCACAATTCATAGAGTGATCATACTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ45TF U 11
AF RR2CV31TF U 1
AF RR2GO13TF U 1
BS 1 191 RR2CV31TF
BS 192 192 RR2GO13TF
BS 193 408 RR2CV31TF
BS 409 410 RR2GO13TF
BS 411 708 RR2CV31TF
BS 709 709 RR2GO13TF
BS 710 745 RR2CV31TF
BS 746 746 RR2GO13TF
BS 747 749 RR2CV31TF
BS 750 820 RR2GO13TF

RD RR2AJ45TF 681 0 0
GGAGAATCTGAGAG
ATACAGACTCTAAATCACTTCTACCAATTATTGACATCAGCCCTTTACTAGTCAAATGCG
ATGATCCCAGCATGAAGGAAGATGCCGGCGTTGCCGAGGTTGTCCGTAGACTAGACCGAG
CTTGTCGGGACGTCGGTTTCTTCTACGTGACTGACCATGGAATTTCTGAGAGTCTTATGA
AGAAGGTGAAAGAGATGTCACATCAATTCTTCAAGCTTCCATATGAGGAGAAACTTAAGA
TCAAGATTAAACCAGCAGCTGGATACAGAGGATATCAGAGAATTGGAGAAAACTTTACGA
ATGGGAAACAAGATTTTCACGAAGCAATTGATTGTTACAGAGAGTTCGAGCAAGGAAAGT
ATGGAGAAACTGGAAAGGTCATGGAAGGGCCAAACCAGTGGCCAGATAATCCTCAAGACT
ACAAAGAAGTGATGGATGAGTATATTAAGCTATGCATAGATCTATCTAGAAACATCCTCA
GAGGAATCTCCTTAGCTCTTGGGGGATCACCTTATGAATTTGAGGGAAAACTGGTTGGAG
ACCCTTTTTGGATAATGCGTATTATTGGTTATCCAGGTGTAAACCAAGAAAATGTTATCG
GATGTGGAGCTCATACTGACTATGGCTTGTTGTCGCTTATAAATCAAGATGAAGATAAAG
CTGCTCT

QA 15 681 15 681
DS 

RD RR2CV31TF 755 0 0
GGATTCTCTAAGAATCTGAGATGGATACAGACTCTAAATCACTTCTACCAATTATTGACA
TCAGCCCTTTACTAGTCAAATGCGATGATCCCAGCATGAAGGAAGATGCCGGCGTTGCCG
AGGTTGTCCGTAGACTAGACCGAGCTTGTCGGGACGTCGGTTTCTTCTACGTGACTGACC
ATGGAATTTCTAAGAGTCTTATGAAGAAGGTGAAAGAGATGTCACATCAATTCTTCAAGC
TTCCATATGAGGAGAAACTTAAGATCAAGATTAAACCAGCAGCTGGATACAGAGGATATC
AGAGAATTGGAGAAAACTTTACGAATGGGAAACAAGATTTTCACGAAGCAATTGATTGTT
ACAGAGAGTTCGAGCAAGGAAAGTATGGAGAAACTGGAAAGGTCATGGG*GGGCCAAACC
AGTGGCCAGATAATCCTCAAGACTACAAAGAAGTGATGGATGAGTATATTAAGCTATGCA
TAGATCTATCTAGAAACATCCTCAGAGGAATCTCCTTAGCTCTTGGGGGATCACCTTATG
AATTTGAGGGAAAACTGGTTGGAGACCCTTTTTGGATAATGCGTATTATTGGTTATCCAG
GTGTAAACCAAGAAAATGTTATCGGATGTGGAGCTCATACTGACTATGGCTTGTTGTCGC
TTATAAATCAAGATGAAGATAAA*CTGCTCTTCAGTGAGACTTGGCCG*TGGTTGGATAT
CAGTTACTCCGATCCCTGGATCATTTATT
GCAACA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2GO13TF 820 0 0
GGATTCTCTAAGAATCTGAGATGTATACAGACTCTAAATCACTTCTACCAATTATTGACA
TCAGCCCTTTACTAGTCAAATGCGATGATCCCAGCATGAAGGAAGATGCCGGCGTTGCCT
AGGTTGTCCGTAGACTAGACCGAGCTTGTCGGGACGTCGGTTTCTTCTACGTGACTGACC
ATGGAATTTCTGAGAGTCTTATGAAGAAGGTGAAAGAGATGTCACATCAATTCTTCAAGC
TTCCATATGAGGAGAAACTTAAGATCAAGATTAAACCAGCAGCTGGATACAGAGGATATC
AGAGAATTGGAGAAAACTTTACGAATGGGAAACAAGATTTTCACGAAGCAATTGATTGTT
ACAGAGAGTTCGAGCAAGGAAAGTATGGATAAACTGGAAAGGTCATGGAAGGGCCAAACC
AGTGGCCAGATAATCCTCAAGACTACAAAGAAGTGATGGATGAGTATATTAAGCTATGCA
TAGATCTATCTAGAAACATCCTCAGAGGAATCTCCTTAGCTCTTGGAGGATCACCTTATG
AATTTGAGGGAAAACTGGTTGGAGACCCTTTTTGGATAATGCGTATTATTGGTTATCCAG
GTGTAAACCAAGAAAATGTTATCGGATGTGGAGCTCATACTGACTATGGCTTGTTGTCGC
TTATAAATCAAGATGAAGATAAA*CTGCTCTTCAGTGAGACTTGGCCGGTGGTTGGATAT
CAGTTACTCCGATCCCTGGATCATTATTTGCACATCGGTGACATGTTGAGATACTTTCAA
TGGAGTATATGATCCACAATTCATAGAGTGATCATACTCT

QA 1 820 1 820
DS 



AS 2 5

CO CL1322Contig1 897 3 4 U
AAAATGTAAAAAGGTAAAAATATAAGAGTGGTAAAATGATCTTCAACAAACACAGCAAGG
CAGAGTAAACCATGATCGCAACAAATCAATGGCTCTCACCTGAGTAAATGCTCTCTCTGT
TTTTTTCTCACAACTCAGACTCTCAATCCTCTGAAACATTTCAATGGGACGAAAGAGTCT
AAAGAACCAAATCAGAGTTTTACATGAAATCGTCTTCGAGTTCTTGAAGAGATTTGTTGC
TTGCAGCAATGTCTTTGTTGGATGTCATTTTATCAGTTACCATCAGTCCCTTGTAACTCC
TAATCTCTGCTTGCCTCTCCTTCTCCAGCCTCTCTATGTCTTCACGTTTCTTCTTCTCCC
TGAGATGCTGCTTCCTCTCGGCTCTTTCTGCAGCATTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCA
GATCAGGGGTTCTCTCAACCTTTGTTTTGTTCAACCTGTTAACAATATCATTGACTCGTT
TCTCCACTCTGATAGTCCGGACCATCTTCGAATTGTGGAGGCAGTTTTCTTCAAGTTGGA
CCACGGGGTGTACACAACATCAACGTTGTTCACCTTGTTGCCTTGAATGGAGTTAGCTTT
CACAAGCTGAACACAGTCCTCCAGCACACCTTCGTTAATGTTATCAAAACCTTGGCCTTT
CTGAAGCCTTAAGTAAACGTGAGCTGAGGACATTTTGTCAACGTGAAACCAGACGTCTTC
GGGGAAGCCGTACTTGATGAGCTCCTCGTTCTCGAACTTGTCAAGCCCCATGAAGATGGT
GTAGTCTCCAGCATCTGGTCGTGCCTTGAAGTAGAACACCATCGCCTTTGATTCGAGAGA
GACGGAGCACAAGGAATCTAGGGTTTCCCCCTCTCTCTCCCCTCCTCTCTTCCCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU26JQ U 31
AF RR2BM44JQ U 1
AF RR2BM44TF C 215
BS 1 152 RR2BM44JQ
BS 153 153 RR2CU26JQ
BS 154 755 RR2BM44JQ
BS 756 897 RR2BM44TF

RD RR2CU26JQ 389 0 0
GTAAAATGATTTTCAACAAACACAGCAAGGCAGAGTAAACCATGATCGCAACAAATCAAT
GGCTCTCACCTGAGTAAATGCTCTCTCTGTTTTTTTCTCACAACTCAGACTCTCAATCCT
CTGAAACATTTCAATGGGACGAAAGAGTCTAAAGAACCAAATCAGAGTTTTACATGAAAT
CGTCTTCGAGTTCTTGAAGAGATTTGTTGCTTGCAGCAATGTCTTTGTTGGATGTCATTT
TATCAGTTACCATCAGTCCCTTGTAACTCCTAATCTCTGCTTGCCTCTCCTTCTCCAGCC
TCTCTATGTCTTCACGTTTCTTCTTCTCCCTGAGATGCTGCTTCCTCTCGGCTCTTTCTG
CAGCATTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2BM44JQ 763 0 0
AAAATGTAAAAAGGTAAAAATATAAGAGTGGTAAAATGATCTTCAACAAACACAGCAAGG
CAGAGTAAACCATGATCGCAACAAATCAATGGCTCTCACCTGAGTAAATGCTCTCTCTGT
TTTTTTCTCACAACTCAGACTCTCAATCCTCT*AAACATTTCAATGGGACGAAAGAGTCT
AAAGAACCAAATCAGAGTTTTACATGAAATCGTCTTCGAGTTCTTGAAGAGATTTGTTGC
TTGCAGCAATGTCTTTGTTGGATGTCATTTTATCAGTTACCATCAGTCCCTTGTAACTCC
TAATCTCTGCTTGCCTCTCCTTCTCCAGCCTCTCTATGTCTTCACGTTTCTTCTTCTCCC
TGAGATGCTGCTTCCTCTCGGCTCTTTCTGCAGCATTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCA
GATCAGGGGTTCTCTCAACCTTTGTTTTGTTCAACCTGTTAACAATATCATTGACTCGTT
TCTCCACTCTGATAGTCCGGACCATCTTCGAATTGTGGAGGCAGTTTTCTTCAAGTTGGA
CCACGGGGTGTACACAACATCAACGTTGTTCACCTTGTTGCCTTGAATGGAGTTAGCTTT
CACAAGCTGAACACAGTCCTCCAGCACACCTTCGTTAATGTTATCAAAACCTTGGCCTTT
CTGAAGCCTTAAGTAAACGTGAGCTGAGGACATTTTGTCAACGTGAAACCAGACGTCTTC
GGGGAAGCCGTACTTGATGAGCTCCTCGTTCTCGA
CTTGTCAG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2BM44TF 683 0 0
TCTCGAG
TCT*GAAGAGATTG**TGCT*GCAGCAATGTCTTG**TGGATGTCATTTTATCAGTTACC
ATCAGTCCCTTGTAACTC*TAATCTCTGCTTGCCTCTCCTTCTCCAGCCTCTCTATGTCT
TCACGTTTCTTCTTCTCCCTGAGATGCTGCTTCCTCTCGGCTCTTTCTGCAGCATTCACT
GCTTCTCTCTCGGCTCTCAGATCAGGGGTTCTCTCAACCTTTGTTTTGTTCAACCTGTTA
ACAATATCATTGACTCGTTTCTCCACTCTGATAGTCCGGACCATCTTCGAATTGTGGAGG
CAGTTTTCTTCAAGTTGGACCACGGGGTGTACACAACATCAACGTTGTTCACCTTGTTGC
CTTGAATGGAGTTAGCTTTCACAAGCTGAACACAGTCCTCCAGCACACCTTCGTTAATGT
TATCAAAACCTTGGCCTTTCTGAAGCCTTAAGTAAACGTGAGCTGAGGACATTTTGTCAA
CGTGAAACCAGACGTCTTCGGGGAAGCCGTACTTGATGAGCTCCTCGTTCTCGAACTTGT
CAAGCCCCATGAAGATGGTGTAGTCTCCAGCATCTGGTCGTGCCTTGAAGTAGAACACCA
TCGCCTTTGATTCGAGAGAGACGGAGCACAAGGAATCTAGGGTTTCCCCCTCTCTCTCCC
CTCCTCTCTTCCCTGA

QA 8 683 8 683
DS 



CO CL1322Contig2 917 2 12 U
GTAAAAGGATAAAAATATAAGAGTGGTAAAATGATTTTCAACAAACACAGCAAGGCAGAG
TAAACCATGATCGCAACAAATCAATGGCATCACCTGAGTAAATGCTCTCTGTTTTTTTTT
CCTCACAACTCAAAGACTCAATCCTCTGAAACATTTCAATGGGACGAAAGAGTCTTTAAG
AACCAAATCAGAGTTTTACATGAAATCGTCTTCGAGTTCTTGAAGAGATTTGTTGCTTGC
AGCAATGTCTTTGTTGGATGTCATTCTATCAGTTACCATCAGTCCCTTGTAACTCCTAAT
CTCTGCTTGCCTCTCCTTCTCCAGCCTCTCTATGTCTTCACGTTTCTTCTTCTCCCTGAG
ATGATGCTTCCTCTCAGCTCTTTCTGCAGCATTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCAGATC
AGGGGTTCTCTCAACCTTTGTTTTGTTCAACCTGTTAACAATATCATTGACTCGTTTCTC
CACTCTGATAGTCCGGACCATCTTCGAATTGTGGAAACCAACTTGACCAACATCCATGGA
GGCAGTTTTCTTCAAGTTGGACCACGGGGTGTACACAACATCAACGTTGTTCACCTTGTT
GCCTTGAATGGAGTTAGCTTTCACAAGCTGAGCACAGTCCTCCAGCACACCTTCGTTAAT
GTTATCAAAACCTTGGCCTTTATGAAGCCTTAAGTAAACGTGAGCTGAGGACATTTTGTC
AACGTGAAACCAGACGTCTTCGGGGAAGCCGTACTTGATGAGCTCCTCGTTCTCGAACTT
GTCAAGCCCCATGAAGATGGTGTAGTCTCCAGCATCTGGTCGTGCCTTGAAGTAGAACAC
CATCGCCTTTGATTCGAGAGAGACGGAGCACAAGGAATCTAGGGTTTCCCCCTCTCTCTC
CCCTCCTCTCTTCCCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW64JQ U 1
AF RR2CU26TF C 290
BS 1 297 RR2EW64JQ
BS 298 298 RR2CU26TF
BS 299 459 RR2EW64JQ
BS 460 460 RR2CU26TF
BS 461 465 RR2EW64JQ
BS 466 466 RR2CU26TF
BS 467 504 RR2EW64JQ
BS 505 505 RR2CU26TF
BS 506 543 RR2EW64JQ
BS 544 544 RR2CU26TF
BS 545 699 RR2EW64JQ
BS 700 917 RR2CU26TF

RD RR2EW64JQ 703 0 0
GTAAAAGGATAAAAATATAAGAGTGGTAAAATGATTTTCAACAAACACAGCAAGGCAGAG
TAAACCATGATCGCAACAAATCAATGGCATCACCTGAGTAAATGCTCTCTGTTTTTTTTT
CCTCACAACTCAAAGACTCAATCCTCTGAAACATTTCAATGGGACGAAAGAGTCTTTAAG
AACCAAATCAGAGTTTTACATGAAATCGTCTTCGAGTTCTTGAAGAGATTTGTTGCTTGC
AGCAATGTCTTTGTTGGATGTCATTCTATCAGTTACCATCAGTCCCTTGTAACTCCTCAT
CTCTGCTTGCCTCTCCTTCTCCAGCCTCTCTATGTCTTCACGTTTCTTCTTCTCCCTGAG
ATGATGCTTCCTCTCAGCTCTTTCTGCAGCATTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCAGATC
AGGGGTTCTCTCAACCTTTGTTTTGTTCAACCTGTTAACTATATCGTTGACTCGTTTCTC
CACTCTGATAGTCCGGACCATCTTTGAATTGTGGAAACCAACTTGACCAACATCCATGGA
GGCGGTTTTCTTCAAGTTGGACCACGGGGTGTACACAACATCAACGTTGTTCACCTTGTT
GCCTTGAATGGAGTTAGCTTTCACAAGCTGAGCACAGTCCTCCAGCACACCTTCGTTAAT
GTTATCAAAACCTTGGCCTTTATGAAGCCTTAAGTAAAC
ATGA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2CU26TF 628 0 0
TAACTCA
TAATCTCTGCTTGCCTCTCCTTCTCCAGCCTCTCTATGTCTTCACGTTTCTTCTTCTCCC
TGAGATGCTGCTTCCTCTCGGCTCTTTCTGCAGCATTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCA
GATCAGGGGTTCTCTCAACCTTTGTTTTGTTCAACCTGTTAACAATATCATTGACTCGTT
TCTCCACTCTGATAGTCCGGACCATCTTCGAATTGTGGAAACCAACTTGACCAACATCCA
TGGAGGCAGTTTTCTTCAAGTTGGACCACGGGGTGTACACAACATCAACGTTGTTCACCT
TGTTGCCTTGAATGGAGTTAGCTTTCACAAGCTGAGCACAGTCCTCCAGCACACCTTCGT
TAATGTTATCATAACCTTGGCCTTTCTGAAGCCTTAAGTAAACGTGAGCTGAGGACATTT
TGTCAACGTGAAACCAGACGTCTTCGGGGAAGCCGTACTTGATGAGCTCCTCGTTCTCGA
ACTTGTCAAGCCCCATGAAGATGGTGTAGTCTCCAGCATCTGGTCGTGCCTTGAAGTAGA
ACACCATCGCCTTTGATTCGAGAGAGACGGAGCACAAGGAATCTAGGGTTTCCCCCTCTC
TCTCCCCTCCTCTCTTCCCTG

QA 8 628 8 628
DS 



AS 1 4

CO CL1323Contig1 1489 4 16 U
AGTTGATTTCGAACCCTAAGCTAAAAAGAGGAAAGAGGTCTTTTCTCGGGAAACAAAACA
GATATTTTCTATCTCATCTCGCAGTGAGAAAAAAAAAAGATGCAGAATCCGAGGCTCAAA
CAGCAGCAGCAACAACAAGCAATGATGCAGCAAGCTTTGATGCAACAACACCACTCTCTC
TATCATCCTAGCCTCATGGCTCCTCCACCTCCTCCTCCTCCTCAAATGGAGCCTCTACCA
AGTGGAAACCTTCCTCCTGGTTTTGATCCCACTACTTGCCGCAGTGTGTATGCTGGCAAC
ATCCACACGCAGGTCACTGAGGTTCTTCTTCAAGAGATTTTTGCAAGCACCGGCCCTGTT
GAGAGCTGTAAACTCATCAGAAAAGATAAGTCATCATATGGATTTGTTCACTACTTTGAT
CGACGATCTGCTGGTTTGGCTATCATGTCTCTTAACGGAAGGCATCTGTTTGGACAGCCT
ATCAAAGTTAACTGGGCGTATGCTACTGGTCAAAGGGAAGACACATCAAGCCATTTCAAC
ATTTTTGTTGGAGATCTTAGTCCAGATGTTACTGATGCAGCTTTGTTTGAAAGCTTTTCT
GCCTTTAACACTTGCTCGGATGCAAGAGTAATGTGGGACCAGAAAACTGGACGATCAAGA
GGCTTTGGGTTTGTTTCCTTCCGCAATCAGCAGGATGCTCAAAATGCCATAAATGAAATG
AATGGTAAATGGTTAAGTAGCAGACAAATCAGATGCAACTGGGCGACAAAAGGTGCTACT
TTTGGCGATGACAAACAATCCTCAGTATACCACTGTGTATGTAGGAAACCTCGCTCCTGA
AGTAACTCAGCTTGATCTACACCGCCTGTTCCATACACTTGGCGCTGGAGTGATTGAAGA
GGTCCGTGTCCAGCGAGACAAAGGCTTTGGTTTTGTGAGATACAACACTCATGATGAGGC
TGCTCTTGCTATTCAAATGGGCAACTTTCAGCCTTTCCTCTTTAACAGACAGATAAAGTG
TTCATGGGGAAACAAGCCAACTCCAATAGGCACAGCTTCAAACCCGCTTCCACCACCAGT
GCCAGTGGCAGTCCCTGGTCTGTCCCCAATGGACCTTTTAGCCTATGAGAGGCAACTGGC
TTTAGCCAAGATGCACCCTCAGGCTCAGCATTCTTTAAGGCATGTCAATGCAGCTGGAGC
AAGTGCAGCAGCTATGTACGATGGTGGTTTTCAGAATGTAGCTGCGGCGCATCAGCAGCT
CATGTACTATCAGTAATAAACTCTTGGTGTCTTGGCGCTAAGATACCTTTTCTCCGTTTT
TTTTCCTTCTTAATTTTATCACTTTCTTGTTTTCTTTTTCTAGACCTTGTTCAGAGTCTC
TTATGTATGTGTGTCTCTCATCTGAAGTCGTTGATTCTATATGTATGCTTCTTGGTTTGT
AACCTATGAGTCTTACTTGGCTTGTATGCCAAGCAATAAAATAACGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO49TF U 1
AF RR2CJ05TF U 85
AF RR2CJ05JQ C 640
AF RR2G924JQ C 990
BS 1 314 RR2GO49TF
BS 315 315 RR2CJ05TF
BS 316 353 RR2GO49TF
BS 354 354 RR2CJ05TF
BS 355 371 RR2GO49TF
BS 372 372 RR2CJ05TF
BS 373 383 RR2GO49TF
BS 384 384 RR2CJ05TF
BS 385 500 RR2GO49TF
BS 501 772 RR2CJ05TF
BS 773 773 RR2CJ05JQ
BS 774 802 RR2CJ05TF
BS 803 1315 RR2CJ05JQ
BS 1316 1316 RR2G924JQ
BS 1317 1401 RR2CJ05JQ
BS 1402 1489 RR2G924JQ

RD RR2GO49TF 500 0 0
AGTTGATTTCGAACCCTAAGCTAAAAAGAGGAAAGAGGTCTTTTCTCGGGAAACAAAACA
GATATTTTCTATCTCATCTCGCAGTGAGAAAAAAAAAAGATGCAGAATCCGAGGCTCAAA
CAGCAGCAGCAACAACAAGCAATGATGCAGCAAGCTTTGATGCAACAACACCACTCTCTC
TATCATCCTAGCCTCATGGCTCCTCCACCTCCTCCTCCTCCTCAAATGGAGCCTCTACCA
AGTGGAAACCTTCCTCCTGGTTTTGATCCCACTACTTGCCGCAGTGTGTATGCTGGCAAC
ATCCACACGCAGGTGACTGAGGTTCTTCTTCAAGAGATTTTTGCAAGCACCGGTCCTGTT
GAGAGCTGTAAGCTCATCAGAAAGGATAAGTCATCATATGGATTTGTTCACTACTTTGAT
CGACGATCTGCTGGTTTGGCTATCATGTCTCTTAACGGAAGGCATCTGTTTGGACAGCCT
ATCAAAGTTAACTGGGCGTA

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2CJ05TF 718 0 0
GGGAG
AAAAAAAAAGATGCAGAATCCGAGGCTCAAACAGCAGCAGCAGCAACAAGCAATGATGCA
GCAAGCTTTGATGCAACAACACCACTCTCTCTATCATCCTAGCCTCATGGCTCCTCCACC
TCCTCCTCCTCCTCAGATGGAGCCTCTACCAAGTGGAAACCTTCCTCCTGGTTTTGATCC
CACTACTTGCCGCAGTGTGTATGCTGGCAACATCCATACGCAGGTCACTGAGGTTCTTCT
TCAAGAGATTTTTGCCAGCACCGGCCCTGTTGAGAGCTGTAAACTCATCAGAAAAGATAA
GTCATCATATGGATTTGTTCACTACTTTGATCGACGATCTGCTGGTTTGGCTATCATGTC
TCTTAACGGAAGGCATCTGTTTGGACAGCCTATCAAAGTTAACTGGGCGTATGCTACTGG
TCAAAGGGAAGACACATCAAGCCATTTCAACATTTTTGTTGGAGATCTTAGTCCAGATGT
TACTGATGCAGCTTTGTTTGAAAGCTTTTCTGCCTTTAACACTTGCTCGGATGCAAGAGT
AATGTGGGACCAGAAAACTGGACGATCAAGAGGCTTTGGGTTTGTTTCCTTCCGCAATCA
GCAGGATGCTCAAAATGCCATAAATGAAATGAATGGTAAATGGTTAAGTAGCAGACAAAT
CAGATGCAACTGGGCGACAAAAG*TGCTACTTTTGGCGATGACAAACAATCCT

QA 6 718 6 718
DS 

RD RR2CJ05JQ 765 0 0
CAGAAAACTGGACGATCAAGAGGCTTTGGGTTTGTTTC*TTCCGCAATCAGCAGGATGCT
CAAAATGCCATAAATGAAATGAATGGTAAATGGTTAAGTAGCAGACAAATCAGATGCAAC
TGGGCGACAAAAGGTGCTACTTTTGGCGATGACAAACAATCCTCAGTATACCACTGTGTA
TGTAGGAAACCTCGCTCCTGAAGTAACTCAGCTTGATCTACACCGCCTGTTCCATACACT
TGGCGCTGGAGTGATTGAAGAGGTCCGTGTCCAGCGAGACAAAGGCTTTGGTTTTGTGAG
ATACAACACTCATGATGAGGCTGCTCTTGCTATTCAAATGGGCAACTTTCAGCCTTTCCT
CTTTAACAGACAGATAAAGTGTTCATGGGGAAACAAGCCAACTCCAATAGGCACAGCTTC
AAACCCGCTTCCACCACCAGTGCCAGTGGCAGTCCCTGGTCTGTCCCCAATGGACCTTTT
AGCCTATGAGAGGCAACTGGCTTTAGCCAAGATGCACCCTCAGGCTCAGCATTCTTTAAG
GCATGTCAATGCAGCTGGAGCAAGTGCAGCAGCTATGTACGATGGTGGTTTTCAGAATGT
AGCTGCGGCGCATCAGCAGCTCATGTACTATCAGTAATAAACTCTTGGTGTCTTGGCGCT
AAGATACCTTTTCTCCTTTTTTTTTCCTTCTTAATTTTATCACTTTCTTGTTTTCTTTTT
CTAGACCTTGTTCAGAGTCTCTTATGTATGTGTGTCTCTCAT
TTG

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2G924JQ 500 0 0
AGCCTTTCCTCTTTAACAGACAGATAAAGTGTTCATGGGGAAACAAGCCAACTCCAATAG
GCACAGCTTCAAACCCGCTTCCACCACCAGTGCCAGTGGCAGTCCCTGGTCTGTCCCCAA
TGGACCTTTTAGCCTATGAGAGGCAACTGGCTTTAGCCAAGATGCACCCTCAGGCTCAGC
ATTTTTTAAGGCATGTCAATGCAGCTGGAGCAAGTGCAGCGGCTATGTACGATGGTGGTT
TTCAGAATGTAGCTGCGGCGCATCAGCAGCTCATGTACTATCAGTAA***ACTCTTGGTG
TCTTGGCGCTAAGATATCTTTTCTCCGTTTTTTTTC*TTCTTAATTTTATCACTTTCTTG
TTTTCTTTTTCTAGACCTTGTTCAGAGTCTCTTATGTATGTGTGTCTCTCATCTGAAGTC
GTTGATTCTATATGTATGCTTCTTGGTTTGTAACCTATGAGTCTTACTTGGCTTGTATGC
CAAGCAATAAAATAACGTTG

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 5

CO CL1324Contig1 571 5 7 U
GGATCGATCTCATTACTATTATTGCTTACATAATGATGAAAGCCATGAGAGTTGGGTTAG
CGATGGCACTGCTTACGACCATATCGGTTCTTACCATAGTCACTGCACAGCTCGATGACC
AGCAACCACCTCCACCGATGTTACCCGAGGAGGAAGTGGGAGGATGCAGCAGGACATTCT
TCTCAGCGATTGTACAACTGATACCTTGCAGAGCAGCAGTGGCTCCTTTCAGCCCAATCC
CACCAACCGAGTCATGTTGCTCTGCTGTTGTCACACTTGGTCGCCCTTGCCTTTGCCTCC
TCGCCAACGGACCTCCGCTCTCAGGCATTGACCGCACCATGGCTCTTCAGCTTCCTCAGA
GATGCTCTGCTAATTTCCCTCCTTGCGATATCATTAACTAGGAGTCTAGAACCAACCTAT
CATCTTTTTGTTATTTTTCTTATTTACCTTCCACTCTAATAAATACGCTGCTCAGATTAT
TACTGTACCGGTCTTTAAAAACATTATAATAAAGAAATAAGAATCGAAATCTCAGTCAAT
TCCAATCCCAACCGATATTAGATCTATTTGC


BQ
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FH42JQ C 1
AF RR2FH42TF U 1
AF RR2H714TF U -3
AF RR2HA70JQ C 1
AF RR2HA70TF U 1
BS 1 216 RR2FH42TF
BS 217 217 RR2H714TF
BS 218 477 RR2FH42TF
BS 478 496 RR2H714TF
BS 497 497 RR2HA70TF
BS 498 524 RR2H714TF
BS 525 571 RR2HA70TF

RD RR2FH42JQ 479 0 0
GGATCGATCTCATTACTATTATTGCTTACATAATGATGAAAGCCATGAGAGTTGGGTTAG
CGATGGCACTGCTTACGACCATATCGGTTCTTACCATAGTCACTGCACAGCTCGATGACC
AGCAACCACCTCCACCGATGTTACCCGAGGAGGAAGTGGGAGGATGCAGCAGGACATTCT
TTTCAGCGATTGTACAACTGATACCTTGCAGAGCAGTAGTGGCTCCTTTCAGCCCAATCC
CACCAACCGAGTCATGTTGCTCTGCTGTTGTCACACTTGGTCGCCCTTGCCTTTGCCTCC
TCGCCAACGGACCTCCGCTCTCAGGCATTGACCGCACCATGGCTCTTCAGCTTCCTCAGA
GATGCTCTGCTAATTTCCCTCCTTGCGATATCATTAACTAGGAGTCTAGAACCAACCTAT
CATCTTTTTGTTATTTTTCTTATTTACCTTCCACTCTAATAAATACGCTGCTCAGA
ATC

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR2FH42TF 478 0 0
GGATCGATCTCATTACTATTATTGCTTACATAATGATGAAAGCCATGAGAGTTGGGTTAG
CGATGGCACTGCTTACGACCATATCGGTTCTTACCATAGTCACTGCACAGCTCGATGACC
AGCAACCACCTCCACCGATGTTACCCGAGGAGGAAGTGGGAGGATGCAGCAGGACATTCT
TCTCAGCGATTGTACAACTGATACCTTGCAGAGCAGTAGTGGCTCCTTTCAGCCCAATCC
CACCAACCGAGTCATGTTGCTCTGCTGTTGTCACACTTGGTCGCCCTTGCCTTTGCCTCC
TCGCCAACGGACCTCCGCTCTCAGGCATTGACCGCACCATGGCTCTTCAGCTTCCTCAGA
GATGCTCTGCTAATTTCCCTCCTTGCGATATCATTAACTAGGAGTCTAGAACCAACCTAT
CATCTTTTTGTTATTTTTCTTATTTACCTTCCACTCTAATAAATACGCTGCTCAGAT
C

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2H714TF 528 0 0
GGATGC
ATCGATCTCATTACTATTATTGCTTACATAATGATGAAAGCCATGAGAGTTGGGTTAGCG
ATGGCACTGCTTACGACCATATCGGTTCTTACCATAGTCACTGCACAGCTCGATGACCAG
CAACCACCTCCACCGATGTTACCCGAGGAGGAAGTGGGAGGATGCAGCAGGACATTCTTC
TCAGCGATTGTACAACTGATACCTTGCAGAGCAGCAGTGGCTCCTTTCAGCCCAATCCCA
CCAACCGAGTCATGTTGCTCTGCTGTTGTCACACTTGGTCGCCCTTGCCTTTGCCTCCTC
GCCAACGGACCTCCGCTCTCAGGCATTGACCGCACCATGGCTCTTCAGCTTCCTCAGAGA
TGCTCTGCTAATTTCCCTCCTTGCGATATCATTAACTAGGAGTCTAGAACCAACCTACCA
TCTTTTTGTTATTTTTCTTATTTACCTTCCACTCTAATAAATACGCTGCTCAGATTATTA
CTGTACCGGTCTTTGAAAACATTATAATAAAGAAATAAGAAT

QA 7 528 7 528
DS 

RD RR2HA70JQ 571 0 0
GGATCGATCTCATTACTATTATTGCTTACATAATGATGAAAGCCATGAGAGTTGGGTTAG
CGATGGCACTGCTTACGACCATATCGGTTCTTACCATAGTCACTGCACAGCTCGATGACC
AGCAACCACCTCCACCGATGTTACCCGAGGAGGAAGTGGGAGGATGCAGCAGGACATTCT
TCTCAGCGATTGTACAACTGATACCTTGCAGAGCAGCAGTGGCTCCTTTCAGCCCAATCC
CACCAACCGAGTCATGTTGCTCTGCTGTTGTCACACTTGGTCGCCCTTGCCTTTGCCTCC
TCGCCAACGGACCTCCGCTCTCAGGCATTGACCGCACCATGGCTCTTCAGCTTCCTCAGA
GATGCTCTGCTAATTTCCCTCCTTGCGATATCATTAACTAGGAGTCTAGAACCAACCTAT
CATCTTTTTGTTATTTTTCTTATTTACCTTCCACTCTAATAAATACGCTGCTCAGATTAT
TACTGTACCGGTCTTTAAAAACATTATAATAAAGAAATAAGAATCGAAATCTCAGTCAAT
TCCAATCCCAACCGATATTAGATCTATTTGC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2HA70TF 571 0 0
GGATCGATCTCATTACTATTATTGCTTACATAATGATGAAAGCCATGAGAGTTGGGTTAG
CGATGGCACTGCTTACGACCATATCGGTTCTTACCATAGTCACTGCACAGCTCGATGACC
AGCAACCACCTCCACCGATGTTACCCGAGGAGGAAGTGGGAGGATGCAGCAGGACATTCT
TCTCAGCGATTGTACAACTGATACCTTGCAGAGCAGCAGTGGCTCCTTTCAGCCCAATCC
CACCAACCGAGTCATGTTGCTCTGCTGTTGTCACACTTGGTCGCCCTTGCCTTTGCCTCC
TCGCCAACGGACCTCCGCTCTCAGGCATTGACCGCACCATGGCTCTTCAGCTTCCTCAGA
GATGCTCTGCTAATTTCCCTCCTTGCGATATCATTAACTAGGAGTCTAGAACCAACCTAT
CATCTTTTTGTTATTTTTCTTATTTACCTTCCACTCTAATAAATACGCTGCTCAGATTAT
TACTGTACCGGTCTTTAAAAACATTATAATAAAGAAATAAGAATCGAAATCTCAGTCAAT
TCCAATCCCAACCGATATTAGATCTATTTGC

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 5

CO CL1325Contig1 959 5 7 U
GGAAACTAAAACATAGCATTTTCGTGGAACAATCATTGATTCACATCAAACTCCTCCACC
TTCTCACTAGAATTTTCTTCTGACCTCTTGGCTTTTCCGACTCCGGTTGCCCCCTTAGAG
CCGGAGTCGGGCTTTGTTTTTGTCCAGATGATTATGGGTCTGATCTAATTTTGGCTCTCT
CCCTCTTCTATTGGGTCGATGTTGTTCTAGATTCGATCTAGCCTTTGTCGTCTCCGGGAT
TTCGAGAGAGATTTGTTTGATCATCCCATTTCTTCTTACATGCATCAACTCGTCAGCCTT
GATCTGTCTTTCCTTCATGCAGATCCTCTTCTGTTTTGAAATCCAATAACCGATTGATGA
CTTGCATGTTGACTCCAAGCTTTGTTTGCTTCATCTCTGGTGTCGATCTTCTTCCTTTTC
GATCATTCGAGAATGGTTGAATCCGGAGTTGTCTTGATTCGCTCCATGTCATTTACCAAC
GATCTGATCGAGATCTCACTTTTGTATTGCTTCTTCATGGCGTTTTCTCGTCGGATCCGT
TCTTTTCCAGGACGGTTATGTTCCGTCGTCGCCGATTACGGTTGATAGCTTTAGATTCTC
TGAAGCTCTGTCTTGCCGAAGTTGGAAGCTATGTTCTCTCATATGCCTGGGCTATTCACT
ATTGGAGGTTTCACAAGTTGATGGTTTGGCCATGATTGCCTCATCGCTTTGTATTTTATC
AAACAATTCTTGTTGTAGCCTCTTGCAAGTTGTTCTTTGAAGTTTGGGTTTCAGTTGATC
TGGTTTTAGGCTGCAGTAGTTTGATGTTTATGTCTGTTTTTTATTTCACTGTGTTTCTCA
TCTGTGGGCTATCCTTTTCGGGGACTTTCTTTTGTCCATCGGACTTTGGTTTTCCGGGAT
TGTACTCGCCGGACTTTGTTGTAAGTCACAATATAATATAAACATATATTTTTAGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB28TF U 15
AF RR2GI12TF U 1
AF RR2GI12JQB C 318
AF RR2BL06TF U 552
AF RR2EX32TF U 353
BS 1 116 RR2GI12TF
BS 117 117 RR2GB28TF
BS 118 597 RR2GI12TF
BS 598 823 RR2BL06TF
BS 824 824 RR2EX32TF
BS 825 951 RR2BL06TF
BS 952 959 RR2GI12JQB

RD RR2GB28TF 515 0 0
G
GCATTTTCGTGGAACAATCATTGATTCACATCAAACTCCTCCACCTTCTCACTAGAATTT
TCTTCTGATCTCTTGGCTTTTCCGACTCCGGTTGCTCCCTTAGAGCCGGAGTCGGGCTTT
GTTTTTGTCCAGATGATTATGGGTCTGATCTAATTTTGGCTCTCTCCCTTTTCTATTGGG
TCGATGTTGTTCTAGATTCGATCTAGCCTTTGTCGTCTCCGGGATTTCGAGAGAGATTTG
TTTGATCATCCCATTTCTTCTTACATGCATCAACTCGTCAGCCTTGATCTGTCTTTCCTT
CATGCAGATCCTCTTCTGTTTTGAAATCCAATAACCGATTGATGACTTGCATGTTGACTC
CAAGCTTTGTTTGCTTCATCTCTGGTGTCGATCTTCTTCCTTTTCGATCATTCGAGAATG
GTTGAATCCGGAGTTGTCTTGATTCGCTCCATGTCATTTACCAACGATCTGATCGAGATC
TCACTTTTGTATTGCTTCTTCATGGCGTTTTCTC

QA 2 515 2 515
DS 

RD RR2GI12TF 599 0 0
GGAAACTAAAACATAGCATTTTCGTGGAACAATCATTGATTCACATCAAACTCCTCCACC
TTCTCACTAGAATTTTCTTCTGACCTCTTGGCTTTTCCGACTCCGGTTGCCCCCTTCGAG
CCGGAGTCGGGCTTTGTTTTTGTCCAGATGATTATGGGTCTGATCTAATTTTGGCTCTCT
CCCTCTTCTATTGGGTCGATGTTGTTCTAGATTCGATCTAGCCTTTGTCGTCTCCGGGAT
TTCGAGAGAGATTTGTTTGATCATCCCATTTCTTCTTACATGCATCAACTCGTCAGCCTT
GATCTGTCTTTCCTTCATGCAGATCCTCTTCTGTTTTGAAATCCAATAACCGATTGATGA
CTTGCATGTTGACTCCAAGCTTTGTTTGCTTCATCTCTGGTGTCGATCTTCTTCCTTTTC
GATCATTCGAGAATGGTTGAATCCGGAGTTGTCTTGATTCGCTCCATGTCATTTACCAAC
GATCTGATCGAGATCTCACTTTTGTATTGCTTCTTCATGGCGTTTTCTCGTCGGATCCGT
TCTTTTCCAGGACGGTTATGTTCCGTCGTCGCCGATTACGGTTGATAGCTTTAGATT
CT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2GI12JQB 642 0 0
TGCAGATCCTCTTCTGTTTTGAAATCCAATAACCGATTGATGACTTGCATGTTGACTCCA
AGCTTTGTTTGCTTCATCTCTGGTGTCGATCTTCTTCCTTTTCGATCATTCGAGAATGGT
TGAATCCGGAGTTGTCTTGATTCGCTCCATGTCATTTACCAACGATCTGATCGAGATCTC
ACTTTTGTATTGCTTCTTCATGGCGTTTTCTCGTCGGATCCGTTCTTTTCCAGGACGGTT
ATGTTCCGTTGTCGCCGATTACGGTTGATAGCTTTAGATTTTTTGAAGCTCTGTCTTGCC
GAAGTTGGAAGCTATGTTCTTTCATATGCCTGGGCTATTCACTATTGGAGGTTTCACAAG
TTGATGGTTTGGCCATGATTGCCTCATCGCTTTGTATTTTATCAAACAATTCTTGTTGTA
GCCTCTTGCAAGTTGTTCTTTGAAGTTTGGGTTTCAGTTGATCTGGTTTTAGGCTGCAGT
AGTTTGATGTTTATGTTTGTTTTTTATTTCACTGTGTTTTTCATCTGTGGGCTATCCTTT
TCGGGGACTTTCTTTTGTCCATCGGACTTTGGTTTTCCGGGATTGTACTCGCCGGACTTT
GTTGTAAGTCACAATATAATATAAACATATATTTTTAGTGTG

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2BL06TF 408 0 0
G
CGGTTATGTTCCGTCGTCGCCGATTACGGTTGATAGCTTTAGATTCTCTGAAGCTCTGTC
TTGCCGAAGTTGGAAGCTATGTTCTCTCATATGCCTGGGCTATTCACTATTGGAGGTTTC
ACAAGTTGATGGTTTGGCCATGATTGCCTCATCGCTTTGTATTTTATCAAACAATTCTTG
TTGTAGCCTCTTGCAAGTTGTTCTTTGAAGTTTGGGTTTCAGTTGATCTGGTTTTAGGCT
GCAGTAGTTTGATGTTTATGTCTGTTTTTTACTTCACTGTGTTTCTCATCTGTGGGCTAT
CCTTTTCGGGGACTTTCTTTTGTCCATCGGACTTTGGTTTTCCGGGATTGTACTCGCCGG
ACTTTGTTGTAAGTCACAATATAATATAAACATATATTT
CTAGTGTG

QA 2 400 2 400
DS 

RD RR2EX32TF 606 0 0
AGG
GATGACTTGCATGTTGACTCCAAGCTTTGTTTGCTTCATCTCTGGTGTCGATCTTCTTCC
TTTTCGATCATTCGAGAATGGTTGAATCCGGAGTTGTCTTGATTCGCTCCATGTCATTTA
CCAACGATCTGATCGAGATCTCACTTTTGTATTGCTTCCTCATGGCGTTTTCTCGTCGGA
TCCGTTCTTTTCCAGGACGGTTATGTTCCGTCGTCGCCGATTACGGTTGATAGCTTTAGA
TTCTCTGAAGCTCTGTCTTGCCGAAGTTGGAAGCTATGTTCTCTCATATGCCTGGGCTAT
TCACTATTGGAGGTTTCACAAGTTGATGGTTTGGCCATGATTGCCTCATCGCTTTGTATT
TTATCAAACAATTCTTGTTGTAGCCTCTTGCAAGTTGTTCTTTGAAGTTTGGGTTTCAGT
TGATCTGGTTTTAGGCTGCAGTAGTTTGATGTTTATGTCTGTTTTTTATTTCACTGTGTT
TCTCATCTGTGGGCTATCCTTTTCGGGGACTTTCTTTTGTCCATCGGACTTTGGTTTTCC
GGGATTGTACTCGCCGGACTTTGTTGTAAGTCACAATATAATATAAACATATATTT
CTAGTGT

QA 4 599 4 599
DS 



AS 1 6

CO CL1326Contig1 628 6 2 U
GGATAAGCATTCAATCACAAATCTCCGCCGGTTATCAAAAGATGTTTGAGATTATTCAGG
CGGCTATCACCGCTGGGGCTGCATTAGCTCTCTTGGTACTCGCCGGTATAACCATTGGCG
GCTCAGCCGTGGGATTAGCCATAACCACGCCGCTTTTTGTCCTTTTCAGCCCGATTCTCG
TGCCAGCAACTATAGCCACCGCTTTGCTAGCTACGGGTTTCACGGCCTCCGGCTCGATCG
GTGCCATGGCTGTCACCATCTTCATGTGGCTATTCAAGAAAATAACCCGCCAAAAATTCC
AGGATTAACCCCGAAAAATCCAACTACGGAAGGGCAAAAAAA*GAGGATGAAAAATGATA
AGTAGGTCTTTCGTACTTTAGAGGAACTTCATGATACTTTTAAATAAAACCAAAGTTTAA
CCATCGTCTCTTCAACAAAATACCTGATTATATGCGGATGTTTCAGATAATGTTCTCTTG
ATGTATATCGTGTTAGGAAATTACAATAAATATACTCGATTGTGGTGTATATTTTAAGAG
AATGAAGTGATATCATTGACATTACCATATAAAGATGATTGTTTTCAAGTTGTATTATTG
AGTCATTCGAATAAAGCAATTAAGACTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP11TF U 1
AF RR2E788JQ C 1
AF RR2E788TF U 1
AF RR2CE15JQ C 29
AF RR2CE15TF U 367
AF RR2CQ66TF U 193
BS 1 592 RR2AP11TF
BS 593 628 RR2CQ66TF

RD RR2AP11TF 592 0 0
GGATAAGCATTCAATCACAAATCTCCGCCGGTTATCAAAAGATGTTTGAGATTATTCAGG
CGGCTATCACCGCTGGGGCTGCATTAGCTCTCTTGGTACTCGCCGGTATAACCATTGGCG
GCTCAGCCGTGGGATTAGCCATAACCACGCCGCTTTTTGTCCTTTTCAGCCCGATTCTCG
TGCCAGCAACTATAGCCACCGCTTTGCTAGCTACGGGTTTCACGGCCTCCGGCTCGATCG
GTGCCATGGCTGTCACCATCTTCATGTGGCTATTCAAGAAAATAACCCGCCAAAAATTCC
AGGATTAACCCCGAAAAATCCAACTACGGAAGGGCAAAAAAA*GAGGATGAAAAATGATA
AGTAGGTCTTTCGTACTTTAGAGGAACTTCATGATACTTTTAAATAAAACCAAAGTTTAA
CCATCGTCTCTTCAACAAAATACCTGATTATATGCGGATGTTTCAGATAATGTTCTCTTG
ATGTATATCGTGTTAGGAAATTACAATAAATATACTCGATTGTGGTGTATATTTTAAGAG
AATGAAGTGATATCATTGACATTACCATATAAAGATGATTGTTTTCAAGTTG

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2E788JQ 566 0 0
GGATAAGCATTCAATCACAAATCTCCGCCGGTTATCAAAAGATGTTTGATATTATTCAGG
CGGCTATCACCGCTGGGGCTGCATTAGCTCTCTTGGTACTCGCCGGTATAACCATTGGCG
GCTCAGCCGTGGGATTAGCCATAACCACGCCGCTTTTTGTCCTTTTCAGCCCGATTCTCG
TGCCAGCAACTATAGCCACCGCTTTGCTAGCTACGGGTTTCACGGCCTCCGGCTCGATCG
GTGCCATGGCTGTCACCATCTTCATGTGGCTATTCAAGAAAATAACCCGCCAAAAATTCC
AGGATTAACCCCGAAAAATCCAACTACGGAAGGGCAAAAAAA*GAGGATGAAAAATGATA
AGTAGGTCTTTCGTACTTTAGAGGAACTTCATGATACTTTTAAATAAAACCAAAGTTTAA
CCATCGTCTCTTCAACAAAATACCTGATTATATGCGGATGTTTCAGATAATGTTCTCTTG
ATGTATATCGTGTTAGGAAATTACAATAAATATACTCGATTGTGGTGTATATTTTAAGAG
AATGAAGCGATATCATTGACATTACC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2E788TF 566 0 0
GGATAAGCATTCAATCACAAATCTCCGCCGGTTATCAAAAGATGTTTGATATTATTCAGG
CGGCTATCACCGCTGGGGCTGCATTAGCTCTCTTGGTACTCGCCGGTATAACCATTGGCG
GCTCAGCCGTGGGATTAGCCATAACCACGCCGCTTTTTGTCCTTTTCAGCCCGATTCTCG
TGCCAGCAACTATAGCCACCGCTTTGCTAGCTACGGGTTTCACGGCCTCCGGCTCGATCG
GTGCCATGGCTGTCACCATCTTCATGTGGCTATTCAAGAAAATAACCCGCCAAAAATTCC
AGGATTAACCCCGAAAAATCCAACTACGGAAGGGCAAAAAAA*GAGGATGAAAAATGATA
AGTAGGTCTTTCGTACTTTAGAGGAACTTCATGATACTTTTAAATAAAACCAAAGTTTAA
CCATCGTCTCTTCAACAAAATACCTGATTATATGCGGATGTTTCAGATAATGTTCTCTTG
ATGTATATCGTGTTAGGAAATTACAATAAATATACTCGATTGTGGTGTATATTTTAAGAG
AATGAAGCGATATCATTGACATTACC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2CE15JQ 568 0 0
CGGTTATCAAAAGATGTTTGAGATTATTCAGGCGGCTATCACCGCTGGGGCTGCATTAGC
TCTCTTGGTACTCGCCGGTATAACCATTGGCGGTTCAGCCGTGGGATTAGCCATAACCAC
GCCGCTTTTTGTCCTTTTCAGCCCGATTTTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCGCTTTGCT
AGGTACGGGTTTCACGGCCCCCGGCTCGATCGGTGCCATGGCTGTCACCATCTTCATGTG
GTTATTCAAGAAAATAACCCGCCAAAAATTCCAGGATTAACCCCGAAAAATCCAATTACG
GAAGGGCAAAAAAAAGAGGATGAAAAATGATAAGTAGGTCTTTCGTACTTTAGAGGGACT
TCATGATACTTTTAAATAAAACCAAAGTTTAACCATCGTCTCTTCAACAAAATACCTGAT
TATATGCGGATGTTTCAGATAATGTTCTCTTGATGTATATCGTGTTAGGAAATTACAATA
AATATACTCGATTGTGGTGTATATTTTAAGAGAATGAAGTGATATCATTGACATTACCAT
ATAAAGATGATTGTTTTCAAGTTG
TATT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2CE15TF 235 0 0
TCTTTCGTACTTTAAAGGGACTTCATGATACTTTTAAATAAAACCAAAGTTTAACCATCG
TCTCTTCAACAAAATACCTGATTATATGCGGATGTTTCAGATAATGTTCTCTTGATGTAT
ATCGTGTTAGGAAATTACAATAAATATACTCGATTGTGGTGTATATTTTAAGAGAATGAA
GTGATATCATTGACATTACCATATAAAGATGATTGTTTTCAAGTTGTATT
AAAAA

QA 1 230 1 230
DS 

RD RR2CQ66TF 436 0 0
G
AGCCACCGCTTTGCTAGCTACGGGTTTCACGGCCTCCGGCTCGATCGGTGCCATGGCTGT
CACCATCTTCATGTGGCTATTCAAGAAAATAACCCGCCAAAAATTCCAGGATTAACCCCG
AAAAATCCAACTACGGAAGGGCAAAAAAA*GAGGATGAAAAATGATAAGTAGGTCTTTCG
TACTTTAGAGGAACTTCATGATACTTTTAAATAAAACCAAAGTTTAACCATCGTCTCTTC
AACAAAATACCTGATTATATGCGGATGTTTCAGATAATGTTCTCTTGATGTATATCGTGT
TAGGAAATTACAATAAATATACTCGATTGTGGTGTATATTTTAAGAGAATGAAGTGATAT
CATTGACATTACCATATAAAGATGATTGTTTTCAAGTTGTATTATTGAGTCATTCGAATA
AAGCAATTAAGACTC

QA 2 436 2 436
DS 



AS 1 4

CO CL1327Contig1 641 4 21 U
GGTCAAAAAATCTTGTATTTCTGTCTCTTTTTTGTTTGGAGCATATTGTGTTTTTATTGT
CTAATTGCCAAGTTTAAAGTGTCCCGATTTTCAAGTTATTGCAACAAACAATATGACAAT
TCAACCATGACACGAACGACCAATAGTTAAGGCAAAAGAAACTCAACCAACTCCTTTGTG
CAGAAACATTGTCCAAAAGATATCTGCAAAACTAAGAAGAAAAGTTCTCTCGAGTAATGT
TCCCTTTCTTCTTTGTCATTATTTTTTTCAAAAACACCAGTACCTCGACAGAGTAAATTA
GATGCCGACTAGATAATGATACCCTCAGGAGGGTTAAATTTTGCTCCAAGGTTGCTCAGT
TTCGCATGGGATTCAGCATAATCCTTGAAGAAGGCATCTTGATCTGCAGCATACTTCTCA
GCATACACCTTGAAAGAAGGATCTTCAAAGATGGCAGCATCAGTGGGCAGGACAAGGAGA
TCTTCATCTCTCTTTTCCTTGATTTCTGTGAAGTAAGAATTGTCAAACTTCAACCACTCT
GGTGTCCATGACTGTCCTCCTGGTGCTCCCGGTCCTTCTTTCGTGTACTTCGTTTCTGGC
TTCCCCCAACCACTACGTTCTGGCCTGGATCTTCCTAAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B651JQ U 362
AF RR2FN63TF C 81
AF RR2FN63JQ U 83
AF RR2EC44JQ U 1
BS 1 113 RR2EC44JQ
BS 114 114 RR2FN63JQ
BS 115 125 RR2EC44JQ
BS 126 126 RR2FN63JQ
BS 127 215 RR2EC44JQ
BS 216 216 RR2FN63JQ
BS 217 218 RR2EC44JQ
BS 219 219 RR2FN63JQ
BS 220 267 RR2EC44JQ
BS 268 268 RR2FN63JQ
BS 269 300 RR2EC44JQ
BS 301 301 RR2FN63JQ
BS 302 350 RR2EC44JQ
BS 351 351 RR2FN63JQ
BS 352 363 RR2EC44JQ
BS 364 364 RR2B651JQ
BS 365 392 RR2EC44JQ
BS 393 393 RR2FN63JQ
BS 394 489 RR2EC44JQ
BS 490 490 RR2B651JQ
BS 491 641 RR2EC44JQ

RD RR2B651JQ 154 0 0
TCGCATGGGATTCAGCATAATCCTTGAAGAAAGCATCTTGATCTGCAGCATACTTCTCAG
CATACACCTTGAAAGAAGGATCTTCAAAGATGGCAGCATCAGTGGGCAGGACAAGGAGAT
CTTCATCTCTCTTTTCCTTGATTTCTGTGAAGTA

QA 1 154 1 154
DS 

RD RR2FN63TF 468 0 0
GT
CCCGATTTTCAAGTTATTGCAACAAACAATATGACAATTCAACCATGACACGAACGACCA
ATAGTTAAGGCAAAAGAAACTCAACCAACTCCTTTGTGCAGAAACATTGTCCAAAAGATA
TCTGCAAAACTAAGAAGAAAAGTTCTCTCGAGTAATGTTCCCTTTCTTCTTTGTCATTAT
TTTTTTCAAAAACACCAGTACCTCGACAGAGTAAATTAGATGCCGACTAGATAATGATAC
CCTCAGGAGGGTTAAATTTTGCTCCAAGGTTGCTCAGTTTCGCATGGGATTCAGCATAAT
CCTTGAAGAAGGCATCTTGATCTGCAGCATACTTCTCAGCATACACCTTGAAAGAAGGAT
CTTCAAAGATGGCAGCATCAGTGGGCAGGACAAGGAGATCTTCATCTCTCTTTTCCTTGA
TTTCTGTGAAGTAAGAATTGTCAAACTTCAACCACTCTGGTGTCC
C

QA 3 467 3 467
DS 

RD RR2FN63JQ 466 0 0
CCCGATTTTCAAGTTATTGCAACAAACAATATGACAATTCAACCATGACACGAACGACCA
ATAGTTAAGGCAAAAGAAACTCAACCAACTCCTTTGTGCAGAAACATTGTCCAAAAGATA
TCTGCAAAACTAAGAAGAAAAGTTCTCTCGAGTAATGTTCCCTTTCTTCTTTGTCATTAT
TTTTTTCAAAAACACCAGTACCTCGACAGAGTAAATTAGATGCCGACTAGATAATGATAC
CCTCAGGAGGGTTAAATTTTGCTCCAAGGTTGCTCAGTTTCGCATGGGATTCAGCATAAT
CCTTGAAGAAGGCATCTTGATCTGCAGCATACTTCTCAGCATACACCTTGAAAGAAGGAT
CTTCAAAGATGGCAGCATCAGTGGGCAGGACAAGGAGATCTTCATCTCTCTTTTCCTTGA
TTTCTGTGAAGTAAGAATTGTCAAACTTCAACCACTCTGGTGTCC
C

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2EC44JQ 641 0 0
GGTCAAAAAATCTTGTATTTCTGTCTCTTTTTTGTTTGGAGCATATTGTGTTTTTATTGT
CTAATTGCCAAGTTTAAAGTGTCCCGATTTTCAAGTTATTGCAACAAACAATACGACAAT
TCAACAATGACACGAACGACCAATAGTTAAGGCAAAAGAAACTCAACCAACTCCTTTGTG
CAGAAACATTGTCCAAAAGATATCTGCAAAACTAAAAAAAAAAGTTCTCTCGAGTAATGT
TCCCTTTCTTCTTTGTCATTATTTTTT*CAAAAACACCAGTACCTCGACAGAGTAAATTA
AATGCCGACTAGATAATGATACCCTCAGGAGGGTTAAATTTTGCTCCAAGATTGCTCAGT
TTCCCATGGGATTCAGCATAATCCTTGAAGAAAGCATCTTGATCTGCAGCATACTTCTCA
GCATACACCTTGAAAGAAGGATCTTCAAAGATGGCAGCATCAGTGGGCAGGACAAGGAGA
TCTTCATCTTTCTTTTCCTTGATTTCTGTGAAGTAAGAATTGTCAAACTTCAACCACTCT
GGTGTCCATGACTGTCCTCCTGGTGCTCCCGGTCCTTCTTTCGTGTACTTCGTTTCTGGC
TTCCCCCAACCACTACGTTCTGGCCTGGATCTTCCTAAGGT

QA 1 641 1 641
DS 



AS 2 5

CO CL1328Contig1 870 3 19 U
GACTCTTTAGCGCAGTCCTAGCCGCACGAAACCGAGTAAGCAGTCTCCGTTCACAGACGT
CAGCATGGGGAGGCTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCATCTGCTTTGCCATACAA
GCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTGATCAAGAAAGCTGTTGCTATCCGCAAG
GAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAA
CAATACCGGGCTCTTTGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTGCGAAG
AAGCATTACAGAGTACAAGGCTATGTTCCCTGCAATCGATTTTTCAATTATTGAAGGCGA
CAAGGATGTTTTGTGGAAGCCTAGTCCAAGAGAGACCCCAGATGAAGTTGCAGCGAGAGG
TGTAGAGTTCATTAACTGGCTATGGACGAGGAAAGAAAAGGAGATTGCAATTGTATCTCA
CAGTGGCTTCTTGCACGGTCTCCTGAGCTCTTATGGGAAGGATTGTGTCGACGACATAAA
GAAAGAATTGTCTATACACTTCAAAAACTGTGAGCCTCGTTCAATGGTTATCGTGGATCA
AGGGAACTTGGGGACTGATTCTACAGAGACCACAAACTATTCTGGCAAGGTTCCTCAAGG
ACTTGATCATCCAAGCGCCTAATCGATGATGAGTAAGAGATATAAATAATAAGGGAACAC
ATGATGGCTCCATTGGAATATTATTTGGCATTTACAGCTCGCATTGTATTTTAATAAACA
TAATTTAAATTTCAATATTTATGTCAGCTACTAAATGAATTTACTGATTATGGTTGTTAT
TTGGGGAAAATGAATAAATTTCAGAAGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 
0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D390TF U 1
AF RR2A954TF U 217
AF RR2E233JQ C 356
BS 1 293 RR2D390TF
BS 294 441 RR2A954TF
BS 442 442 RR2E233JQ
BS 443 502 RR2A954TF
BS 503 503 RR2E233JQ
BS 504 512 RR2A954TF
BS 513 513 RR2E233JQ
BS 514 575 RR2A954TF
BS 576 576 RR2E233JQ
BS 577 753 RR2A954TF
BS 754 754 RR2E233JQ
BS 755 772 RR2A954TF
BS 773 773 RR2E233JQ
BS 774 776 RR2A954TF
BS 777 777 RR2E233JQ
BS 778 794 RR2A954TF
BS 795 795 RR2E233JQ
BS 796 825 RR2A954TF
BS 826 870 RR2E233JQ

RD RR2D390TF 293 0 0
GACTCTTTAGCGCAGTCCTAGCCGCACGAAACCGAGTAAGCAGTCTCCGTTCACAGACGT
CAGCATGGGGAGGCTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCATCTGCTTTGCCATACAA
GCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTGATCAAGAAAGCTGTTGCTATCCGCAAG
GAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAA
CAATACCGGGCTCTTTGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCT

QA 1 293 1 293
DS 

RD RR2A954TF 609 0 0
G
GGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCTCTTTGAGTCTGGTAATTGGAATGAG
TACAATCTAAATCCCTTGCGAAGAAGCATTACAGAGTACAAGGCTATGTTCCCTGCAATC
GATTTTTCAATTATTGAAGGCGACAAGGATGTTTTGTGGAAGCCTAGTCCAAGAGAGACC
CCAGATGAAGTTGCAGCGAGAGGTGTAGAGTTCATTAACTGGCTGTGGACGAGGAAAGAA
AAGGAGATTGCAATTGTATCTCACAGTGGCTTCTTGCACGGTCTCTTGAGCTCTTTTGGG
AAGGATTGTGTCGACGACATAAAGAAAGAATTGTCTATACACTTCAAAAACTGTGAGCTT
CGTTCAATGGTTATCGTGGATCAAGGGAACTTGGGGACTGATTCTACAGAGACCACAAAC
TATTCTGGCAAGGTTCCTCAAGGACTTGATCATCCAAGCGCCTAATCGATGATGAGTAAG
AGATATAAATAATAAGGGAACACATGATGGCTCCATTGGAATATTATTTGGCATTTTCAG
CTCGCATTGTATTTTGATACACATAATTTAAATTTCAGTATTTATGTCAGCTACTAAATG
AATTTACT

QA 2 609 2 609
DS 

RD RR2E233JQ 515 0 0
A
GCGACAAGGATGTTTTGTGGAAGCCTAGTCCAAGAGAGACCCCAGATGAAGTTGCAGTGA
GAGGTGTAGAGTTTATTAACTGGCTATGGACGAGGAAAGAAAAGGAGATTGCAATTGTAT
CTCACAGTGGCTTCTTGCACGGTCTCCTGAGCTCTTATGGGAAGGATTGTGTCGACGACA
TAAAGAAAGAGTTGTCTATACACTTCAAAAACTGTGAGCCTCGTTCAATGGTTATCGTTG
ATCAAGGGAACTTGGGGACTGATTCTACAGAGACCACAAACTATTCTGGCAAGGTTCCTC
AAGGACTTGATCATCCAAGCGCCTAATCGATGATGAGTAAGAGATATAAATAATAAGGGA
ACACCTGATGGCTCCATTGGAATATTATTTGGCATTTACAGCTCGTATTGTATTTTAATA
AACA**ATTTAAATTTTAATATTTATGTCAGCTACTAAATGAATTTACTGATTATGGTTG
TTATTTGGGGAAAATGAATAAATTTCAGAAGTCT

QA 2 515 2 515
DS 



CO CL1328Contig2 898 2 14 U
GGATAGAAACTTGAAGATCCGGCGGTTTAGGATCTCTTCCCCCCCTCTCAGTTATATATC
TCATTTCCAAGGTAACATCAGTTTCTATAAGAAAATCAGATCTGATCTGAAAGCTACTGT
ATTAACCATGGACAAAGGCATAGGTCTCTACCCACTTCATCGTTGCAAAACCATTCACCT
GGTGAGACATGCTCAGGGGATTCATAATGTTGCTGGAGAAATAGACCATAGTGCTTACTC
TTCTGAGGACTATTTTGATGCTCATATCACCCCACTTGGTTGGCAACAGGTGGATCATCT
ACGGAACCATGTTCTAGAAACTCAACTCTTAAACAAAGTTGAACTTGTCATTGTCTCTCC
CTTGCTTAGAACTATACAAACTGCTGTCGGTGCTTTTGGAGGCGGAGAAGATACTAATGG
AGCAGATGCAACACCGCTAATGGTGGCCAACGCTGGGAGCAGCGACCGTCCTGCCATTTC
AAGCTTAAACAGCCCACCTTTCCTTGCTGTTGAGCTATGCAGAGAAACTATGGGTGATCA
TCCCTGTGACAGGCGAAGAAGCATTACAGAGTACAAGGCTATGTTCCCTGCAATCGATTT
TTCAATTATTGAAAGCGACAAGGATGTTTTGTGGAAGCCTAGTCCAAGAGAGACCCCAGA
TGAAGTTGCAGCGAGAGGTGTAGAGTTCATTAACTGGCTATGGACGAGGAAAGAAAAGAG
ATTGCAATTGTATCTCACAGTGGCTTCTTGCACGGTCTCCTGAGCTCTTATGGGAAGGAT
TGTGTCGACGACATAAAGAAAGAGTTGTCTATACACTTCAAAACTGTGAGCCTCGTTCAA
TGGTTATCGTTGATCAAGGAACTTGGGGACTGATTCTACAGAGACACAACTATTCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX34TF U 1
AF RR2E233TF U 87
BS 1 147 RR2FX34TF
BS 148 148 RR2E233TF
BS 149 220 RR2FX34TF
BS 221 221 RR2E233TF
BS 222 249 RR2FX34TF
BS 250 250 RR2E233TF
BS 251 402 RR2FX34TF
BS 403 403 RR2E233TF
BS 404 430 RR2FX34TF
BS 431 431 RR2E233TF
BS 432 699 RR2FX34TF
BS 700 700 RR2E233TF
BS 701 706 RR2FX34TF
BS 707 898 RR2E233TF

RD RR2FX34TF 706 0 0
GGATAGAAACTTGAAGATCCGGCGGTTTAGGATCTCTTCCCCCCCTCTCAGTTATATATC
TCATTTCCAAGGTAACATCAGTTTCTATAAGAAAATCAGATCTGATCTGAAAGCTACTGT
ATTAACCATGGACAAAGGCATAGGTCTTTACCCACTTCATCGTTGCAAAACCATTCACCT
GGTGAGACATGCTCAGGGGATTCATAATGTTGCTGGAGAAGTAGACCATAGTGCTTACTC
TTCTGAGGATTATTTTGATGCTCATATCACCCCACTTGGTTGGCAACAGGTGGATCATCT
ACGGAACCATGTTCTAGAAACTCAACTCTTAAACAAAGTTGAACTTGTCATTGTCTCTCC
CTTGCTTAGAACTATACAAACTGCTGTCGGTGCTTTTGGAGGGGGAGAAGATACTAATGG
AGCAGATGCAGCACCGCTAATGGTGGCCAACGCTGGGAGCAGCGACCGTCCTGCCATTTC
AAGCTTAAACAGCCCACCTTTCCTTGCTGTTGAGCTATGCAGAGAAACTATGGGTGATCA
TCCCTGTGACAGGCGAAGAAGCATTACAGAGTACAAGGCTATGTTCCCTGCAATCGATTT
TTCAATTATTGAAAGCGACAAGGATGTTTTGTGGAAGCCTAGTCCAAGAGAGACCCCAGA
TGAAGTTGCAGCGAGAGGTGTAGAGTTCATTAACTGGCTGTGGACG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2E233TF 812 0 0
GG
AAGAAAATCAGATCTGATCTGAAAGCTACTGT*TTAACCATGGACAAAGGCATAGGTCTC
TACCCACTTCATCGTTGCAAAACCATTCACCTGGTGAGACATGCTCAGGGGATTCATAAT
GTTGCTGGAGACATAGACCATAGTGCTTACTCTTCTGAGGACTATTTTGATGCTCATATC
ACCCCACTTGGTTGGCAACAGGTGGATCATCTACGGAACCATGTTCTAGAAACTCAACTC
TTAAACAAAGTTGAACTTGTCATTGTCTCTCCCTTGCTTAGAACTATACAAACTGCTGTC
GGTTCTTTTGGAGGCGGAGAAGATACTAATGGAGCAGATGCAACACCGCTAATGGTGGCC
AACGCTGGGAGCAGCGACCGTCCTGCCATTTCAAGCTTAAACAGCCCACCTTTCCTTGCT
GTTGAGCTATGCAGAGAAACTATGGGTGATCATCCCTGTGACAGGCGAAGAAGCGTTACA
GAGTACAAGGCTATGTTTCCTGCAATCGATTTTTCAATTATTGAAAGCGACAAGGATGTT
TTGTGGAAGCCTAGTCCAAGAGAGACCCCAGATGAAGTTGCAGTGAGAGGTGTAGAGTTT
ATTAACTGGCTATGGACGAGGAAAGAAAAGAGATTGCAATTGTATCTCACAGTGGCTTCT
TGCACGGTCTCCTGAGCTCTTATGGGAAGGATTGTGTCGACGACATAAAGAAAGAGTTGT
CTATACACTTCAAAACTGTGAGCCTCGTTCAATGGTTATCGTTGATCAAGGAACTTGGGG
ACTGATTCTACAGAGACACAACTATTCTGG

QA 3 812 3 812
DS 



AS 1 5

CO CL1329Contig1 974 5 18 U
GGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAAAATGATTCGAACGGCTTTATTAATCGTTGCT
TTACTCGTCGGAACGAGCGTACATGCGCAGCTAGTGCCCCCGCCGAGACGCGATGGATTC
GTGTATCCACCGGGAAGGAAAATCGAACCGGATACGATACTCATCGAAGCGTATTTTGAC
CCGGTTTGCCCCGATTGCGGAGACGCTTGGGAACCGCTAAAGCTAGCAGTTGATCACTAC
GGATCTCGCGTTGCTCTTGTTCTTCACCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGTTT
GTAGTATCTCGTGCCTTGCACATTGTGAATACGTTAGACTCCAATGCGACGTTCGGTTTG
TTGGAAGGGATCTTCAAGCACCAGGCATTGTTCTACAACTCGCAAACACAATTCATGCCA
AGACCTGCAGTTGTGGACAAATTAGTCAAACTCGGGACAGTTACATTAGGCAGCTCATTT
CATTATCCTCTTAAATCTGGCTTCCGCAACTCACAGTCTGATCTTGCTACTAGGGTTTCC
TTCAAGTATAGCGTTTCAAGAGGAGTTTCCGCAACACCAACCTTCTATGTGAATGGGTTC
GAGCTGCCCGATGCTGGTTCTCCCATTGATTTTGAAGGATGGAAAAACACCATTGATCCT
CTGGTTAAACCACGAGAAGCAAAGATAAAGGACACCTTCCTTTCATTCCTCACCCAACCA
TCTTATTAGTTTTGCTTTTTATGCTGCCTCAAAGTTCAAACCCACACCTAATTTACTAGA
CAAATTTAATTCTCCAAAATCCCTGTAATGAACTAGTCATCATTAACCCAGAAGCATAAA
AAGAGATGCATGCTCATAATTTTCAGATACATGTTTTGTTTTCCTAGCATTTTAACATTT
GATCAAAACTTCAGAATATGGTGATTGGTAAGTAGTTTTCAGTTTATTTTTTAAAATATA
TAAATATGCTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C382TF U 65
AF RR2CR82TF U 1
AF RR2A157TF U 18
AF RR2A157JQ C 124
AF RR2CR82JQ C 290
BS 1 445 RR2CR82TF
BS 446 446 RR2A157TF
BS 447 516 RR2CR82TF
BS 517 517 RR2A157TF
BS 518 637 RR2CR82TF
BS 638 638 RR2A157TF
BS 639 646 RR2CR82TF
BS 647 647 RR2A157TF
BS 648 668 RR2CR82TF
BS 669 669 RR2A157TF
BS 670 690 RR2CR82TF
BS 691 691 RR2A157TF
BS 692 718 RR2CR82TF
BS 719 719 RR2A157TF
BS 720 752 RR2CR82TF
BS 753 753 RR2A157TF
BS 754 853 RR2A157JQ
BS 854 974 RR2CR82JQ

RD RR2C382TF 560 0 0
CTCGTCGGACA
AGCGTACATGCGCAGCTAGTGCCCCCGCCGAGACGCGATGGATTCGTGTATCCACCGGGT
AGAAAAATCGAACCGGATACGATACTCATCGAAGCGTATTTTGACCCGGTTTGCCCCGAT
TGCGGAGACGCTTGGGAGCCGCTAAAGCTAGCGGTTGATCACTACGGATCTCGCGTCGCT
CTTGTTCTTCACCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGTTTGTAGTGTCTCGTGCC
TTGCACATTGTGAATACGTTAGATTATAATGCGACGTTCGGTTTGCTGGAAGGTATCTTC
AAGCACCAGGCATTGTTCTACAACTCGCAAACACAATTCATGCCAAGACCTGCAGTTGTG
GACAAATTAGTTAAACTCGGGACAGTTACATTAGGTAGCTCATTTCATTATCCTCTTAAA
TCTGGCTTCCGCAACTCACAGTCTGATCTTGCTACTAGGGTTTCCTTCAAGTATAGCGTT
TCAAGAGGAGTTTCCGCAACACCAACCTTCTATGTGAATGGGTTCGAGCTGCCCGATGCT
GGTTCTCCC

QA 12 560 12 560
DS 

RD RR2CR82TF 756 0 0
GGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAAAATGATTCGAACGGCTTTATTAATCGTTGCT
TTACTCGTCGGAACGAGCGTACATGCGCAGCTAGTGCCCCCGCCGAGACGCGATGGATTC
GTGTATCCACCGGGAAGGAAAATCGAACCGGATACGATACTCATCGAAGCGTATTTTGAC
CCGGTTTGCCCCGATTGCGGAGACGCTTGGGAACCGCTAAAGCTAGCAGTTGATCACTAC
GGATCTCGCGTTGCTCTTGTTCTTCACCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGTTT
GTAGTATCTCGTGCCTTGCACATTGTGAATACGTTAGACTCCAATGCGACGTTCGGTTTG
TTGGAAGGGATCTTCAAGCACCAGGCATTGTTCTACAACTCGCAAACACAATTCATGCCA
AGACCTGCAGTTGTGGACAAATTAGCCAAACTCGGGACAGTTACATTAGGCAGCTCATTT
CATTATCCTCTTAAATCTGGCTTCCGCAACTCACAGCCTGATCTTGCTACTAGGGTTTCC
TTCAAGTATAGCGTTTCAAGAGGAGTTTCCGCAACACCAACCTTCTATGTGAATGGGTTC
GAGCTGCCCGATGCTGGTTCTCCCATTGATTTTGAAG*ATGGAAAA*CACCATTGATCCT
CTGGTTAA*CCACGAGAAGCAAAGATAAAG*ACACCTTCCTTTCATTCCTCACCCAAC*A
TCTTATTAGTTTTGCTTTTTATGCTGCCTCAA
GTTC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2A157TF 754 0 0
GGG
GAGAGCGAAAATGATTCGAACGGCTTTATTAATCGTTGCTTTACTCGTCGGAACGAGCGT
ACATGCGCAGCTAGTGCCCCCGCCGAGACGCGATGGATTCGTGTATCCACCGGGAAGGAA
AATCGAACCGGATACGATACTCATCGAAGCGTATTTTGACCCGGTTTGCCCCGATTGCGG
AGACGCTTGGGAACCGCTAAAGCTAGCAGTTGATCACTACGGATCTCGCGTTGCTCTTGT
TCTTCACCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGTTTGTAGTATCTCGTGCCTTGCA
CATTGTGAATACGTTAGACTCCAATGCGACGTTCGGTTTGTTGGAAGGGATCTTCAAGCA
CCAGACATTGTTCTACAACTCGCAAACACAATTCATGCCAAGACCTGCAGTTGTGGACAA
ATTAGTCAAACTCGGGACAGTTACATTAGGCAGCTCATTTCATTATCCTCTTAAATCTGG
CTTCCGCAACTCACAGTCTGATCTTGCTACTAGGGTTTCCTTCAAGTATAGCGTTTCAAG
AGGAGTTTCCGCAACACCAACCTTCTATGTGAATGGGTTCGAGCTGCCCGATGCTGGTAC
TCCCATTGATTTTGAAGGATGGAAAAACACCATTGATCCTCTGGTTAAACCACGAGAAGC
AAAGATAAAGGACACCTTCCTTTCATTCCTCACCCAACCATCTTATTAGTTTTGCTTTTT
ATGCTGCCTCAAA
GTTCAAACCCACACCTAA

QA 4 736 4 736
DS 

RD RR2A157JQ 732 0 0
TATCCACCGGGAAGGAAAATCGAACCGGATACGATACTCATCGAAGCGTATTTTGACCCG
GTTTGCCCCGATTGCGGAGACGCTTGGGAACCGCTAAAGCTAGCAGTTGATCACTACGGA
TCTCGCGTTGCTCTTGTTCTTCACCTCATCCCTTTGCCGTTCCATGACAATGCGTTTGTA
GTATCTCGTGCCTTGCACATTGTGAATACGTTAGACTCCAATGCGACGTTCGGTTTGTTG
GAAGGGATCTTCAAGCACCAGACATTGTTTTACAACTCGCAAACACAATTCATGCCAAGA
CCTGCAGTTGTGGACAAATTAGTCAAACTCGGGACAGTTACATTAGGCAGCTCATTTCAT
TATCCTCTTAAATCTGGCTTCCGCAACTCACAGTCTGATCTTGCTACTAGGGTTTCCTTC
AAGTATAGCGTTTCAAGAGGAGTTTCCGCAACACCAACCTTCTATGTGAATGGGTTCGAG
CTGCCCGATGCTGGTACTCCCATTGATTTTGAAGGATGGAAAAACACCATTGATCCTCTG
GTTAAACCACGAGAAGCAAAGATAAAGGACACCTTCCTTTCATTCCTCACCCAACCATCT
TATTAGTTTTGCTTTTTATGCTGCCTCAAAGTTCAAACCCACACCTAATTTACTAGACAA
ATTTAATTCTCCAAAATCCCTGTAATGAACTAGTCATCATTAACCCAGAAGCATAAAAAG
AGATGCATGC
CC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2CR82JQ 685 0 0
ACAATGCGTTTGTAGTATCTCGTGCCTTGCACATTGTGAATACGTTAGACTCCAATGCGA
CGTTCGGTTTGTTGGAAGGGATCTTCAAGCACCAGGCATTGTTCTACAACTCGCAAACAC
AATTCATGCCAAGACCTGCAGTTGTGGACAAATTAGCCAAACTCGGGACAGTTACATTAG
GCAGCTCATTTCATTATCCTCTTAAATCTGGCTTCCGCAACTCACAGCCTGATCTTGCTA
CTAGGGTTTCCTTCAAGTATAGCGTTTCAAGAGGAGTTTCCGCAACACCAACCTTTTATG
TGAATGGGTTCGAGCTGCCCGATGCTGGTTCTCCCATTGATTTTGAAGGATGGAAAAACA
CCATTGATCCTCTGGTTAAACCACGAGAAGCAAAGATAAAGGACACCTTCCTTTCATTCC
TCACCCAACCATCTTATTAGTTTTGCTTTTTATGCTGCCTCAAAGTTCAAACCCACACCT
GATTTACTAGACAAATTTAATTCTCCAAAATCCCTGTAATGAACTAGTCATCATTAACCC
AGAAGCATAAAAAGAGATGCATGCTCATAATTTTCAGATACATGTTTTGTTTTCCTAGCA
TTTTAACATTTGATCAAAACTTCAGAATATGGTGATTGGTAAGTAGTTTTCAGTTTATTT
TTTAAAATATATAAATATGCTTAGC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 4

CO CL1330Contig1 1140 4 32 U
GTAAAAAAATCACCTGATAAATGGCATTAATAAGAAAGCAATCTTAGTTTCAGTACAAGG
CACAAAGCCCGACAACATTCAATCAAATAAGAAGAAAAAGAAACAAGATAATAGACCCAG
CAGCATCCACGATTAGGAAAGAGCAAACAAAGGACAAGAATAGACGGCCTTAGAAGCATC
GGGGATGGCAAACGGAAGAGATTAGAAAAAGAAACACAAGGGAAATAACATAATAGTTGG
ATGAGTTTAGAATACTGAATAACAGACTTAAGTCTCCTTCTCTTCTTCAGCAGGCTTTGT
TGCTGCCGCTTCTTTGATCTCCTCTGTACCTTCGTCCTGCATGTCAGAAGTCCAGAGAGT
AAGGTTGTCACGGAGAAGCTGCATGATCAAAGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCGCCTAG
AGTATCCAACTCAGCGATTGCATCATCAAACGCCTGCTTAGCGAGACTGCAAGCACGGTC
CGGAGAGTTGAGAATCTCATAGTAAAAGACAGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGACGGAT
CGGGTGCGTTGGAGCCAGTTCAGCGTTAGCAATGTCCTGAGCGGCTTTGTAAGCGGTTAG
AGTATGCTCAGCGGCGTCTTTCCTCTCCTGCCCCGTCTTAAACTCAGCCAAGTACCTATG
GTAATCTCCCTTCATCTTCAGGTAGAAAACCTTGGAATCTCCGTTGGCGGAGGCCGGGAC
GAGCCTCTCGTCGAGGAGCTTGAGGATGCCGTCGCAGATCTTCGAGAGCTCCGACTCGAT
CTTGCCTCGGTAGTCGCGGATCGTAGCGACGTGGTCGTCGTTGCCGCGGCTCTCTTCCTT
CTGCTCGATGGAGGAGATGATGCGCCACGAGGCGCGGCGTGCGCCGATCACGTTTTTGTA
GGCGACGGAGAGGAGGTTTCGCTCCTCCACGGTGAGCTCGTCTTTGTCGACGGCCTCGGC
GACTTTCTCCATGAACTCGACCATCTATTCGTATCGCTCCGCTTGCTCAGCGAGCTTCGC
TAGGTAGACGAACTCTTCCCTGGCCGAGGATGATGATGCTGGTGCTGCCGCCATCTTTGT
TTCTCTTCTTTGTTGTTAGATCGGAAAACGAAATGCTTCAAGGGGGGAAGGATTCAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 10 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
10 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F316JQ U 1
AF RR2G839JQ U 8
AF RR2G094JQ U 13
AF RR2F316TF C 428
BS 1 91 RR2F316JQ
BS 92 92 RR2G839JQ
BS 93 320 RR2F316JQ
BS 321 321 RR2G839JQ
BS 322 364 RR2F316JQ
BS 365 365 RR2G839JQ
BS 366 459 RR2F316JQ
BS 460 480 RR2G839JQ
BS 481 481 RR2G094JQ
BS 482 510 RR2G839JQ
BS 511 511 RR2G094JQ
BS 512 557 RR2G839JQ
BS 558 558 RR2G094JQ
BS 559 582 RR2G839JQ
BS 583 583 RR2G094JQ
BS 584 597 RR2G839JQ
BS 598 598 RR2G094JQ
BS 599 600 RR2G839JQ
BS 601 601 RR2G094JQ
BS 602 609 RR2G839JQ
BS 610 610 RR2G094JQ
BS 611 628 RR2G839JQ
BS 629 629 RR2G094JQ
BS 630 630 RR2G839JQ
BS 631 631 RR2G094JQ
BS 632 666 RR2G839JQ
BS 667 667 RR2G094JQ
BS 668 677 RR2G839JQ
BS 678 804 RR2G094JQ
BS 805 805 RR2F316TF
BS 806 814 RR2G094JQ
BS 815 1140 RR2F316TF

RD RR2F316JQ 459 0 0
GTAAAAAAATCACCTGATAAATGGCATTAATAAGAAAGCAATCTTAGTTTCAGTACAAGG
CACAAAGCCCGACAACATTCAATCAAATAAGGAGAAAAAGAAACAAGATAATAGACCCAG
CAGCATCCACGATTAGGAAAGAGCAAACAAAGGACAAGAATAGACGGCCTTAGAAGCATC
GGGGATGGCAAACGGAAGAGATTAGAAAAAGAAACACAAGGGAAATAACATAATAGTTGG
ATGAGTTTAGAATACTGAATAACAGACTTAAGTCTCCTTCTCTTCTTCAGCAGGCTTTGT
TGCTGCCGCTTCTTTGATCTTCTCTGTACCTTCGTCCTGCATGTCAGAAGTCCAGAGAGT
AAGGGTGTCACGGAGAAGCTGCATGATCAAAGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCGCCTAG
AGTATCCAACTCAGCGATTGCATCATCAAACGCCTGCTT

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR2G839JQ 670 0 0
CATCA
CCTGATAAATGGCATTAATAAGAAAGCAATCTTAGATTCAGTACAAGGCACAAAGTCCGA
CAACATTCAATCAAATAAGAAGAAAAAGAAACAAGATAATAAACCCAGCAGCATCCACGA
TTAGGAA*GAGCATACAAAGGACAAGAATAGACGGCCTTAGAAGCTTCGGGGATGGCAAA
CGGAAGAGATTAGAAAAACAAACACAAGGGAAATAACATAATAGTTGGATGAGTTTAGAA
TACTGAATAACAGACTTAAGTCTCCTTCTCCTCTTCGGCAGGCTTTGCTGCTGCCGCTTC
TTTGATCTCCTCTGTACCTTCGTCCTGCATGTCAAAAGTCCAAAGAGTAAGGTTGTCACG
GAGAAGCTGCATGATCAAAGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCGCCTAGAGTATCCAACTC
AGCGATTGCATCATCAAATGCCTGCTTAGCGAGACTGCAAGCACGGTCTGGAGAGTTGAG
AATCTCATAGTAAAAGACGGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGACGGATCGGGTGCGTTGG
AGCCAATTCAGCGTTAGCAATGTCCTGAGCAGCTTTGTAAGCGGTGAGGGTATGCTCTGC
GGCGTCTTTCCTCTCCCGGCCCGTCTTAAACTCAGCCAAGTACCTATGGTAATCCCCCTT
CATCT

QA 6 670 6 670
DS 

RD RR2G094JQ 802 0 0
CCTGATAAATGGCATTAATAAGAAAGCAATCTTAGTTTCAGTACAAGGCACAAAGCCCGA
CAACATTCAATCAAATAAGAAGAAAAAGAAACAAGATAATAGACCCAGCAGCATCCACGA
TTAGGAAAGAGCAAACAAAGGACAAGAATAGACGGCCTTAGAAGCATCGGGGATGGCAAA
CGGAAGAGATTAGAAAAAGAAACACAAGGGAAATAACATAATAGTTGGATGAGTTTAGAA
TACTGAATAACAGACTTAAGTCTCCTTCTCTTCTTCAGCAGGCTTTGTTGCTGCCGCTTC
TTTGATCTCCTCTGTACCTTCGTCCTGCATGTCAGAAGTCCAGAGAGTAAGGTTGTCACG
GAGAAGCTGCATGATCAAAGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCGCCTAGAGTATCCAACTC
AGCGATTGCATCATCAAACGCCTGCTTAGCGAGACTGCAAGCACGGTCCGGAGAGTTGAG
AATCTCATAGTAAAAGACAGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGACGGATCGGGTGCGTTGG
AGCCAGTTCAGCGTTAGCAATGTCCTGAGCGGCTTTGTAAGCGGTTAGAGTACGCTCAGC
GGCGTCTTTCCTCTCCTGCCCCGTCTTAAACTCAGCCAAGTACCTATGGTAATCTCCCTT
CATCTTCAGGTAGAAAACCTTGGAATCTCCGTTGGCGGAGGCCGGGACGAGCCTCTCGTC
GAGGAGCTTGAGGATGCCGTCGCAGATCTTCGAGAGCTCCGACTCGATCTTGCCTCGGTA
GTCGCGGATCGTGGCGACGTGG

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2F316TF 713 0 0
AACTCAGCGATTGCATCATCAAACGCGTGCTTAGCGAGACTGCAAGCACGGTCCGGAGAG
TTGAGAATCTCATAGTAAAAGACAGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGACGGATCGGGTGC
GTTGGAGCCAGTTCAGCGTTAGCAATGTCCTGAGCGGCTTTGTAAGCGGTTAGAGTATGC
TCAGCGGCGTCTTTCCTCTCCTGCCCCGTCTTAAACTCAGCCAAGTACCTATGGTAATCT
CCCTTCATCTTCAGGTAGAAAACCTTGGAATCTCCGTTGGCGGAGGCCGGGACGAGCCTC
TCGTCGAGGAGCTTGAGGATGCCGTCGCAGATCTTCGAGAGCTCCGACTCGATCTTGCCT
CGGTAGTCGCGGATCGTAGCGACGTGGTCGTCGTTGCCGCGGCTCTCTTCCTTCTGCTCG
ATGGAGGAGATGATGCGCCACGAGGCGCGGCGTGCGCCGATCACGTTTTTGTAGGCGACG
GAGAGGAGGTTTCGCTCCTCCACGGTGAGCTCGTCTTTGTCGACGGCCTCGGCGACTTTC
TCCATGAACTCGACCATCTATTCGTATCGCTCCGCTTGCTCAGCGAGCTTCGCTAGGTAG
ACGAACTCTTCCCTGGCCGAGGATGATGATGCTGGTGCTGCCGCCATCTTTGTTTCTCTT
CTTTGTTGTTAGATCGGAAAACGAAATGCTTCAAGGGGGGAAGGATTCAGATC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 4

CO CL1331Contig1 656 4 1 U
GACACAGCATCGTAAAAATGCCAGTATCATCATCTCCGTCTCCGCCTCGTCTCCAATCTC
CGTTCATCCACCGTCCGATCAATGCCACTCCGTCTTCTTCCCGTTTACTCTCCGCGAGGA
ACCTCCGTTCGCCGTCAACGACATCTTATCCGCGAATCAAATCAGAAGTCGATACGAACA
CGGTAATCGCAATCTCAGTTGGCGTGGCGAGCGTCGCGCTGGGAATCGGAATCCCTGTCT
TTTACGAGACGCAGATCGATAACGCCGCTAAGAGAGAGAATACTCAACCATGCTTTCCTT
GCAATGGCACTGGAGCTCAGAAGTGCAGGTTGTGTGTGGGGAGTGGTAACGTGACGGTGG
AGCTTGGTGGAGGAGAGAAGGAAGTCTCTAGCTGTATCAATTGTGATGGTGTTGGTTCCT
TGACTTGCACTACTTGTCAAGGCTCTGGTGTTCAACCTCGATACCTTGATCGAAGGGAGT
TCAAGGATGATGACTAGATATCTTCAACCAGTTAACCATACCAAA*GAGTCTCTCTTCTC
CTCCCTTTCTTCCTTGTGTGTCTACATTTGTACAATACTGTATTTTTTTGTTTCACCAAA
TCATATGACCTTGTAAACAATTGAAGGAGTAAGCTTCCTGCACTTGACTTTCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 

AF RR2AY41TFB U 1
AF RR2CP24JQ C 50
AF RR2AL76TF U 150
AF RR2AY41JQ C 148
BS 1 656 RR2AY41TFB

RD RR2AY41TFB 656 0 0
GACACAGCATCGTAAAAATGCCAGTATCATCATCTCCGTCTCCGCCTCGTCTCCAATCTC
CGTTCATCCACCGTCCGATCAATGCCACTCCGTCTTCTTCCCGTTTACTCTCCGCGAGGA
ACCTCCGTTCGCCGTCAACGACATCTTATCCGCGAATCAAATCAGAAGTCGATACGAACA
CGGTAATCGCAATCTCAGTTGGCGTGGCGAGCGTCGCGCTGGGAATCGGAATCCCTGTCT
TTTACGAGACGCAGATCGATAACGCCGCTAAGAGAGAGAATACTCAACCATGCTTTCCTT
GCAATGGCACTGGAGCTCAGAAGTGCAGGTTGTGTGTGGGGAGTGGTAACGTGACGGTGG
AGCTTGGTGGAGGAGAGAAGGAAGTCTCTAGCTGTATCAATTGTGATGGTGTTGGTTCCT
TGACTTGCACTACTTGTCAAGGCTCTGGTGTTCAACCTCGATACCTTGATCGAAGGGAGT
TCAAGGATGATGACTAGATATCTTCAACCAGTTAACCATACCAAA*GAGTCTCTCTTCTC
CTCCCTTTCTTCCTTGTGTGTCTACATTTGTACAATACTGTATTTTTTTGTTTCACCAAA
TCATATGACCTTGTAAACAATTGAAGGAGTAAGCTTCCTGCACTTGACTTTCAACC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2CP24JQ 607 0 0
TCTCCAATCTCCGTTCATCCACCGTCCGATCAATGCCACTCCGTCTTCTTCCCGTTTACT
CTCCGCGAGGAACCTCCGTTCGCCGTCAACGACATCTTATCCGCGAATCAAATCAGAAGT
CGATACGAACACGGTAATCGCAATCTCAGTTGGCGTGGCGAGCGTCGCGCTGGGAATCGG
AATCCCTGTCTTTTACGAGACGCAGATCGATAACGCCGCTAAGAGAGAGAATACTCAACC
ATGTTTTCCTTGCAATGGCACTGGAGCTCAGAAGTGCAGGTTGTGTGTGGGGAGTGGTAA
CGTGACGGTGGAGCTTGGTGGAGGAGAGAAGGAAGTCTCTAGCTGTATCAATTGTGATGG
TGTTGGTTCCTTGACTTGCACTACTTGTCAAGGCTCTGGTGTTCAACCTCGATGCCTTGA
TCGAAGGGAGTTCAAGGATGATGACTAGATATCTTCAACCAGTTAACCATACCAAA*GAG
TCTCTCTTCTCCTCCCTTTCTTCCTTGTGTGTCTACATTTGTACAATACTGTATTTTTTT
GTTTCACCAAATCATATGACCTTGTAAACAATTGAAGGAGTAAGCTTCCTGCACTTGACT
TTCAACC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2AL76TF 503 0 0
G
CGCGAATCAAATCAGAAGTCGATACGAACACGGTAATCGCAATCTCAGTTGGCGTGGCGA
GCGTCGCACTGGGAATCGGGATCCCTGTCTTCTACGAGACGCAGATCGATAACGCCGCTA
AGAGAGAGAATACTCAACCTTGTTTTCCTTGCAATGGCACTGGAGCTCAGAAGTGCAGGT
TGTGTGTGGGAAGTGGTAACGTGACGGTGGAGCTTGGTGGAGGAGAGAAGGAAGTCTCCA
GCTGTATCAATTGTGATGGTGTTGGTTCCTTGACTTGCACTACTTGTCAAGGCTCTGGTG
TTCAACCTCGATACCTTGATCGGAGGGAGTTCAAGGATGATGACTAGATATCTTCCACCA
GTTAACCATACCAAAAGAGTCTCTCTTCTCCTCCCTTTCTTCCTTGTGTGTCTACATTTG
TACAATACTGTATTTTTTTGTTTCACCAAATCATATGACCTTGTAAACAATTGAAGGAGT
AAGCTTCCTGCACTTGACTTTC

QA 2 503 2 503
DS 

RD RR2AY41JQ 509 0 0
ATCCGGGAATCAAATCAGAAGTCGATACGAACACGGTAATCGCAATCTCAGTTGGCGTGG
CGAGCGTCGCGCTGGGAATCGGAATCCCTGTCTTTTACGAGACGCAGATCGATAACGCCG
CTAAGAGAGAGAATACTCAACCATGCTTTCCTTGCAATGGCACTGGAGCTCAGAAGTGCA
GGTTGTGTGTGGGGAGTGGTAACGTGACGGTGGAGCTTGGTGGAGGAGAGAAGGAAGTCT
CTAGCTGTATCAATTGTGATGGTGTTGGTTCCTTGACTTGCACTACTTGTCAAGGCTCTG
GTGTTCAACCTCGATACCTTGATCGAAGGGAGTTCAAGGATGATGACTAGATATCTTCAA
CCAGTTAACCATACCAAA*GAGTCTCTCTTCTCCTCCCTTTCTTCCTTGTGTGTCTACAT
TTGTACAATACTGTATTTTTTTGTTTCACCAAATCATATGACCTTGTAAACAATTGAAGG
AGTAAGCTTCCTGCACTTGACTTTCAACC

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 6

CO CL1332Contig1 595 6 3 U
GGGACTAATAAACTCATCCCATATTTAATCAAAAAAAGAACAGCCCTAAAAATGGCAAGC
TTATCAGCTATTGCAATTTCCCTCCGCAACAAGGCACTCATCACCCCGAGAGTTTTCTCT
TCCGTCCCGACAAGACTCATCCATGGGAGTACGATCAAAGAAGCTTCCGTCTGTGACAAA
GCCACCGAGGCTCAACAAAAGGTGGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATCTCC
GAGGCCGCCGGTAACTTGAAGGATAAGGCGAAGAACACTGCAGAGGAGGCCTGGGATAAG
GTGAAGGACACTACAGAAAAGATCAAAGATACCGTCACAGGAAAAACCGAGGAAACCAAG
GAGTCTATCAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAA
TAATAAACATACTGTCAATTTTAAGTTATCCTTGAATCAACAAATTTATTTTAAGAAACA
AATCAAATAAAATGTACTTACGTAAAGTATGGAGCTTGGTTCAGTATGTTTACACCTGCT
TTTGTATTAACAAAATAAATTACTTTATCAGGTAAGAATAAATCTGGGGTTATCG


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 

AF RR2FS82JQ C 1
AF RR2FS82TF U 1
AF RR2CP91JQ C 2
AF RR2CP91TF U 2
AF RR2C213JQ C 22
AF RR2C213TF U 22
BS 1 1 RR2FS82JQ
BS 2 569 RR2FS82TF
BS 570 595 RR2CP91TF

RD RR2FS82JQ 569 0 0
GGGACTAATAAACTCATCCCATATTTAATCAAAAAAAGAACAGCCCTAAAAATGGCAAGC
TTATCAGCTATTGCAATTTCCCTCCGCAACAAGGCACTCATCACCCCGAGAGTTTTCTCT
TCCGTCCCGACAAGACTCATCCATGGGAGTACGATCAAAGAAGCTTCCGTCTGTGACAAA
GCCACCGAGGCTCAACAAAAGGTGGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATCTCC
GAGGCCGCCGGTAACTTGAAGGATAAGGCGAAGAACACTGCAGAGGAGGCCTGGGATAAG
GTGAAGGACACTACAGAAAAGATCAAAGATACCGTCACAGGAAAAACCGAGGAAACCAAG
GAGTCTATCAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAA
TAATAAACATACTGTCAATTTTAAGTTATCCTTGAATCAACAAATTTATTTTAAGAAACA
AATCAAATAAAATGTACTTACGTAAAGTATGGAGCTTGGTTCAGTATGTTTACACCTGCT
TTTGTATTAACAAAATAAATTACTTTATC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2FS82TF 569 0 0
G
GGACTAATAAACTCATCCCATATTTAATCAAAAAAAGAACAGCCCTAAAAATGGCAAGCT
TATCAGCTATTGCAATTTCCCTCCGCAACAAGGCACTCATCACCCCGAGAGTTTTCTCTT
CCGTCCCGACAAGACTCATCCATGGGAGTACGATCAAAGAAGCTTCCGTCTGTGACAAAG
CCACCGAGGCTCAACAAAAGGTGGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATCTCCG
AGGCCGCCGGTAACTTGAAGGATAAGGCGAAGAACACTGCAGAGGAGGCCTGGGATAAGG
TGAAGGACACTACAGAAAAGATCAAAGATACCGTCACAGGAAAAACCGAGGAAACCAAGG
AGTCTATCAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAAT
AATAAACATACTGTCAATTTTAAGTTATCCTTGAATCAACAAATTTATTTTAAGAAACAA
ATCAAATAAAATGTACTTACGTAAAGTATGGAGCTTGGTTCAGTATGTTTACACCTGCTT
TTGTATTAACAAAATAAATTACTTTATC

QA 2 569 2 569
DS 

RD RR2CP91JQ 594 0 0
GGACTAATAAACTCATCCCATATTTAATCAAAAAAAGAACAGCCCTAAAAATGGCAAGCT
CATCAGCTATTGCAATTTCCCTCCGCAACAAGGCACTCATCACCCCGAGAGTTTTTTCTT
CCGTCCCGACAAGACTCATCCATGGGAGTACGATCAAAGAAGCTTCCGTCTGTGACAAAG
CCACCGAGGCTCAACAAAAGGTGGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATTTCCG
AGGCCGCCGGTAACTTGAAGGATAAGGCGAAGAACACTGCAGAGGAGGCCTGGGATAAGG
TGAAGGACACTACAGAAAAGATCAAAGATACCGTCACAGGAAAAACCGAGGAAACCAGGG
AGTCTATCAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAAT
AATAAACATACTGTCAATTTTAAGTTATCCTTGAATCAACAAATTTATTTTAAGAAACAA
ATCAAATAAAATGTACTTACGTAAAGTATGGAGCTTGGTTCAGTATGTTTACACCTGCTT
TTGTATTAACAAAATAAATTACTTTATCAGGTAAGAATAAATCTGGGGTTATCG

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2CP91TF 594 0 0
GGACTAATAAACTCATCCCATATTTAATCAAAAAAAGAACAGCCCTAAAAATGGCAAGCT
CATCAGCTATTGCAATTTCCCTCCGCAACAAGGCACTCATCACCCCGAGAGTTTTCTCTT
CCGTCCCGACAAGACTCATCCATGGGAGTACGATCAAAGAAGCTTCCGTCTGTGACAAAG
CCACCGAGGCTCAACAAAAGGTGGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATCTCCG
AGGCCGCCGGTAACTTGAAGGATAAGGCGAAGAACACTGCAGAGGAGGCCTGGGATAAGG
TGAAGGACACTACAGAAAAGATCAAAGATACCGTCACAGGAAAAACCGAGGAAACCAGGG
AGTCTATCAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAAT
AATAAACATACTGTCAATTTTAAGTTATCCTTGAATCAACAAATTTATTTTAAGAAACAA
ATCAAATAAAATGTACTTACGTAAAGTATGGAGCTTGGTTCAGTATGTTTACACCTGCTT
TTGTATTAACAAAATAAATTACTTTATCAGGTAAGAATAAATCTGGGGTTATCG

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2C213JQ 574 0 0
TT
TTTAATCAAAAAAAAGAAAGCCCCAAAAATGGCAAGCTTATCAGCTATTGCAATTTCCCT
CCGCAACAAGGGACTCATCACTCCGAGAGTTTTTTCTTCCGTCCCGACAAGACTCATCCA
TGGGAGTACGATGAAAGAAGCTTCCGTCCGTGACAAAGCCACCGAGGCTCAACAAAAGGT
GGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATCTCCGAGGCCGCCGGTAACTTGAAGGA
TAAGGCGAAGAACACTGCCGAGGAGGCCTGGGATAAGGTGAAGGACACTACAGAAAAGAT
CAAAGATACCGTCACAGGAAAAACCGAGGAAACCAAGGAGTCTATCAAAGCCAAAGCCAA
GACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAGATAATAAACATACTGTCAATTTTA
AGTTATCCCTAAATCAACTAATTTATTTTAAGAAACAAATCAAATAAAATGTACTTACGT
AATGTATGGAGCTTGGTTCAGTATGTTTACACCTGGTTTTGTATTAACAAAATAAATTAC
TTTATCAGGTAAGAATAAATCTGGGTTTATCG

QA 3 574 3 574
DS 

RD RR2C213TF 574 0 0
TT
TTTAATCAAAAAAAAGAAAGCCCCAAAAATGGCAAGCTTATCAGCTATTGCAATTTCCCT
CCGCAACAAGGGACTCATCACTCCGAGAGTTTTCTCTTCCGTCCCGACAAGACTCATCCA
TGGGAGTACGATGAAAGAAGCTTCCGTCCGTGACAAAGCCACCGAGGCTCAACAAAAGGT
GGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATCTCCGAGGCCGCCGGTAACTTGAAGGA
TAAGGCGAAGAACACTGCCGAGGAGGCCTGGGATAAGGTGAAGGACACTACAGAAAAGAT
CAAAGATACCGTCACAGGAAAAACCGAGGAAACCAAGGAGTCTATCAAAGCCAAAGCCAA
GACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAGATAATAAACATACTGTCAATTTTA
AGTTATCCCTAAATCAACTAATTTATTTTAAGAAACAAATCAAATAAAATGTACTTACGT
AATGTATGGAGCTTGGTTCAGTATGTTTACACCTGGTTTTGTATTAACAAAATAAATTAC
TTTATCAGGTAAGAATAAATCTGGGTTTATCG

QA 3 574 3 574
DS 



AS 2 4

CO CL1333Contig1 586 2 9 U
GGATCCTTCAAAGCCATTTCGAAACCATTCTTGTATTGAGAGAGAGTACACAGACGAAAA
CAAGAAGAAAGTTTCAACCTTTATTGTCTGTTCTATCTCTCTCTCTTTCAAGAAACCACA
TACTTCGAAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATCGTATCTGCTTTCGTTTCT
CAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCAACGCAAGCGGCC
GGTGTGAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTGATGAAGAAGAAGAGAGTGGAAGAATCG
ACCCAAAAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACTTGT
TCAAAGGAGATAGACCCAGCAGAGCTACGAGCAGCTCTCTTGAACAACAAGCAGTAACGA
AAAAAAAAAAAAACAAGCAGTGATGAATTAACCGAAGAAAGCTCTTTTTTCAGTTAATTA
TTTTGTTGTTAGTTTTAATGTCTTGGGGGAATAGGCTAATGATCCTTTGCGGTGAACCCT
ATGTTTGTCTGTCTGCTACGTGCGATTCTGCAATTAATAACATAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A163TF U 199
AF RR2AI93TF U 1
BS 1 417 RR2AI93TF
BS 418 418 RR2A163TF
BS 419 469 RR2AI93TF
BS 470 470 RR2A163TF
BS 471 471 RR2AI93TF
BS 472 472 RR2A163TF
BS 473 483 RR2AI93TF
BS 484 484 RR2A163TF
BS 485 586 RR2AI93TF

RD RR2A163TF 322 0 0
ATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCAACGCAAGCGGCCGGTGTGAAAGGTGGAGCC
GTTGTTTCGGCGGTGATGAAGAAGAAGAGAGTGGAAGAATCGACCCAAAAGATTGCTTGG
ATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACTTGTTCAAAGGAGATAGACCCA
GCAGAGCTACGAGCAGCTCTCTTGAACAACAAGCAGTAACGAAAAAAAAAAAAAACAAGC
AGTGATGAATTAACCGAAGAAAGCTCTTTTTTCAGTTAATTATTTTGTTGTTAGTTTTAA
TGTCTTGGGGGAATAGGCTAAT

QA 1 322 1 322
DS 

RD RR2AI93TF 586 0 0
GGATCCTTCAAAGCCATTTCGAAACCATTCTTGTATTGAGAGAGAGTACACAGACGAAAA
CAAGAAGAAAGTTTCAACCTTTATTGTCTGTTCTATCTCTCTCTCTTTCAAGAAACCACA
TACTTCGAAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATCGTATCTGCTTTCGTTTCT
CAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCAACGCAAGCGGCC
GGTGTGAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTGATGAAGAAGAAGAGAGTGGAAGAATCG
ACCCAAAAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACTTGT
TCAAAGGAGATAGACCCAGCAGAGCTACGAGCAGCTCTCTTGAACAACAAGCAGTAATGA
AAAAAAAAAAAAACAAGCAGTGATGAATTAACCGAAGAAAGCTCTTTTT*CTGTTAATTA
TTT*GTTGTTAGTTTTAATGTCTTGGGGGAATAGGCTAATGATCCTTTGCGGTGAACCCT
ATGTTTGTCTGTCTGCTACGTGCGATTCTGCAATTAATAACATAGA

QA 1 586 1 586
DS 



CO CL1333Contig2 678 2 1 U
GGGACATCCTTCAAGCCATTTCGAAACCATTCTTGTATTGAGAGAGAGTACACAGACGAA
AACAAGAAGAAAGTTTCAACGTTTATTGTCTGTTCTATCTCTCTCTCTTTCAAGAAACCA
CATACTTCGAAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATCGTATCTGCTTTCGTTT
CTCAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCAACGCAAGCGG
CCGGTGTGAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTGATGAAGAAGAAGAGAGTGGAAGAAT
CGACCCAAAAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACTT
GTTCAAAAGAGATAGACCCAGCAGAGCTACGAGCAGCTCTCTTGAACAACAAGCAGTAAT
GAAAAAAAGAAACAAGCAGTGATGAAATTAACCGAAAAGAAGCTCTTTTTCTGTTAATTA
TTTGTTGTTAGTTTTAACGTCTTGGGGGAATAGGGTAATGATCCTTTGCGGTGAACCCTA
TGTTTGTCTGTCTGCACGTGCAATTCTGCCATTAATAACATAGAGAAGTCTTTTGGTTCC
TCTACACTTTGTAACAAAATGATCGATGGATGTATGATGTATTCTGTAATAATTATACAA
TTTTTTTACTTGTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FN33TF U 1
AF RR2FN33JQ C 2
BS 1 678 RR2FN33TF

RD RR2FN33TF 678 0 0
GGGACATCCTTCAAGCCATTTCGAAACCATTCTTGTATTGAGAGAGAGTACACAGACGAA
AACAAGAAGAAAGTTTCAACGTTTATTGTCTGTTCTATCTCTCTCTCTTTCAAGAAACCA
CATACTTCGAAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATCGTATCTGCTTTCGTTT
CTCAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCAACGCAAGCGG
CCGGTGTGAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTGATGAAGAAGAAGAGAGTGGAAGAAT
CGACCCAAAAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACTT
GTTCAAAAGAGATAGACCCAGCAGAGCTACGAGCAGCTCTCTTGAACAACAAGCAGTAAT
GAAAAAAAGAAACAAGCAGTGATGAAATTAACCGAAAAGAAGCTCTTTTTCTGTTAATTA
TTTGTTGTTAGTTTTAACGTCTTGGGGGAATAGGGTAATGATCCTTTGCGGTGAACCCTA
TGTTTGTCTGTCTGCACGTGCAATTCTGCCATTAATAACATAGAGAAGTCTTTTGGTTCC
TCTACACTTTGTAACAAAATGATCGATGGATGTATGATGTATTCTGTAATAATTATACAA
TTTTTTTACTTGTTTGCC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2FN33JQ 677 0 0
GGGACATCTTC
AAGCCATTTCGAAACCATTCTTGTATTGAGAGAGAGTACACAGACGAAAACAAGAAGAAA
GTTTCAACGTTTATTGTCTGTTCTATCTCTCTCTCTTTCAAGAAACCACATACTTCGAAA
ACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATCGTATCTGCTTTCGTTTCTCAAGAACTCT
CCAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCAACGCAAGCGGCCGGTGTGAAAG
GTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTGATGAAGAAGAAGAGAGTGGAAGAATCGACCCAAAAGA
TTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACTTGTTCAAAAGAGA
TAGACCCAGCAGAGCTACGAGCAGCTCTCTTGAACAACAAGCAGTAATGAAAAAAAGAAA
CAAGCAGTGATGAAATTAACCGAAAAGAAGCTCTTTTTCTGTTAATTATTTGTTGTTAGT
TTTAACGTCTTGGGGGAATAGGGTAATGATCCTTTGCGGTGAACCCTATGTTTGTCTGTC
TGCACGTGCAATTCTGCCATTAATAACATAGAGAAGTCTTTTGGTTCCTCTACACTTTGT
AACAAAATGATCGATGGATGTATGATGTATTCTGTAATAATTATACAATTTTTTTACTTG
TTTGCC

QA 12 677 12 677
DS 



AS 1 6

CO CL1334Contig1 663 6 8 U
GGGCCCGCTTGCTAAGAAGGGTTTTGAGGGTTTCGCAGTTTCTGCAGTCTTCTCTCCTCT
CCGATCTCTTCGTCTTCTCCACAGGATCCCCAAAGATGAAGCTCGTCAGGTTTTTGATGA
AGTTGAACAATGAGACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAACGGAACTGTGGTCCATGGAACCA
TCACTGGTGTTGATGTGAGCATGAACACTCACTTGAAGACGGTTAAAATGACTCTCAAGG
GGAAGAATCCAGTGACAATGGACCATTTAAGCTTGAGGGGTAACAACATCCGCTACTACA
TTCTTCCCGATAGCTTGAACCTGGAGACTTTGCTTGTGGAAGACACTCCTCGAGTTAAAC
CTAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGACGAGGCCGTGGACGTGGTGGTCGTGGGC
GTGGTGGGGCTGGTCGTGGCAGAGGTCGTTAAGTTTCAGCAAAGCAGTGCACTGGAAACA
GTTGAAGGCGAGTGAGTTTGAATTTTGTAGGAAGTGGGAACCCTTTGGTGTCTTAGGAGA
ATGTACTGAACTATGATGTATTTAGCAACTCTTTGCAAAGGAAACATCTGTGGTAAGATT
TGGGCTGTGTAATGCGACTTCGTGGAAGATTTAGCTTTTCATTTCATAAGAGCATGTGCA
AGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2F813TF U 12
AF RR2F813JQ C 475
AF RR2A076JQ C 73
AF RR2FD86JQ C 1
AF RR2FD86TF U 1
AF RR2AU24TF U 14
BS 1 13 RR2FD86TF
BS 14 92 RR2F813TF
BS 93 93 RR2FD86TF
BS 94 379 RR2F813TF
BS 380 380 RR2FD86TF
BS 381 496 RR2F813TF
BS 497 645 RR2FD86TF
BS 646 663 RR2AU24TF

RD RR2F813TF 485 0 0
GG
AAGAAGGGTTTTGAGGGTTTCGCAGTTTCTGCAGTCTTCTCTCCTCTCCGATCTCTTCGT
CTTCTCCACAGGATCCCCAGAGATGAAGCTCGTCAGGTTTTTGATGAAGTTGAACAATGA
GACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAACGGAACTGTGGTCCATGGAACCATCACTGGTGTTGA
TGTGAGCATGAACACTCACTTGAAGACGGTTAAAATGACTCTCAAGGGGAAGAATCCAGT
GACAATGGACCATTTAAGCTTGAGGGGTAACAACATCCGCTACTACATTCTTCCCGATAG
CTTGAACCTGGAGACTTTGCTTGTGGAAGACACTCCTCGAGTTAAACCTAAGAAGCCTGT
TGCTGGAAAGCCTGTTGGACGAGGCCGTGGACGTGGTGGTCGTGGGCGTGGTGGGGCTGG
TCGTGGCAGAGGTCGTTAAGTTTCAGCAAAGCAGTGCACTGGAAACAGTTGAAGGCGAGT
GAG

QA 3 485 3 485
DS 

RD RR2F813JQ 126 0 0
GAAACAGTTGAAGGGGAGTGAGTTTGAATTTTGTAGGAAGTGGGAACCCTTTGGTGTCTT
AGGAGAATGTACTGAACTATGATGTATTTAGCAACTCTTTGCAAAGGAAACATCTGTGGT
AAGATT

QA 1 126 1 126
DS 

RD RR2A076JQ 501 0 0
TCTTCTCCACAGGATCCCCAAAGATGAAGCTCGTCAGGTTTTTGATGAAGTTGAACAATG
AGACTGTGTCGATTGAGCTGAAGAACGGAACTGTGGTCCATGGAACCATCACTGGTGTTG
ATGTGAGCATGAACACTCACTTGAAGACGGTTAAAATGACTCTCAAGGGGAAGAATCCAG
TGACAATGGACCATTTAAGCTTGAGGGGTAACAACATCCGCTACTACATTCTTCCCGATA
GCTTGAACCTGGAGACTTTGCTTGTGGAAGACACTCCTCGAGTTAAACCTAAGAAGCCTG
TTGCTGGGAAGCCTGTTGGACGAGGCCGTGGACGTGGTGGTCGTGGGCGTGGTGGGGCTG
GTCGTGGCAGAGGTCGTTAAGTTTCAGCAAAGTAGTGCACTGGAAACAGTTGAAGGCGAG
TGAGTTTGAATTTTGTAGGAAGTGGGAACCCTTTGGTGTCTTAGGAGAATGTACTGAACT
ATGATGTATTTAGCAACTCTT

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR2FD86JQ 645 0 0
GGGCCCGCTTGCTAAGAAGGGTTTTGAGGGTTTCGCAGTTTCTGCAGTCTTCTCTCCTCT
CCGATCTCTTCGTCTTCTCCACAGGATCCCCAAAGATGAAGCTCGTCAGGTCTTTGATGA
AGTTGAACAATGAGACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAACAGAACTGTGGTCCATGGAACCA
TCACTGGTGTTGATGTGAGCATGAACACTCACTTGAAGACGGTTAAAATGACTCTCAAGG
GGAAGAATCCAGTGACAATGGACCATTTAAGCTTGAGGGGTAACAACATCCGCTACTACA
TTCTTCCCGATAGCTTGAACCTGGAGACTTTGCTTGTGGAAGACACTCCTCGAGTTAAAC
CTAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGACGAGGCCGTGGACGTGGTGGTCGTGGGC
GTGGTGGGGCTGGTCGTGGCAGAGGTCGTTAAGTTTCAGCAAAGCAGTGCACTGGAAACA
GTTGAAGGCGAGTGAGTTTGAATTTTGTAGGAAGTGGGAACCCTTTGGTGTCTTAGGAGA
ATGTACTGAACTATGATGTATTTAGCAACTCTTTGCAAAGGAAACATCTGTGGTAAGATT
TGGGCTGTGTAATGCGACTTCGTGGAAGATTTAGCTTTTCATTTC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2FD86TF 645 0 0
GGGCCCGCTTGCTAAGAAGGGTTTTGAGGGTTTCGCAGTTTCTGCAGTCTTCTCTCCTCT
CCGATCTCTTCGTCTTCTCCACAGGATCCCCAAAGATGAAGCTCGTCAGGTCTTTGATGA
AGTTGAACAATGAGACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAACAGAACTGTGGTCCATGGAACCA
TCACTGGTGTTGATGTGAGCATGAACACTCACTTGAAGACGGTTAAAATGACTCTCAAGG
GGAAGAATCCAGTGACAATGGACCATTTAAGCTTGAGGGGTAACAACATCCGCTACTACA
TTCTTCCCGATAGCTTGAACCTGGAGACTTTGCTTGTGGAAGACACTCCTCGAGTTAAAC
CTAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGACGAGGCCGTGGACGTGGTGGTCGTGGGC
GTGGTGGGGCTGGTCGTGGCAGAGGTCGTTAAGTTTCAGCAAAGCAGTGCACTGGAAACA
GTTGAAGGCGAGTGAGTTTGAATTTTGTAGGAAGTGGGAACCCTTTGGTGTCTTAGGAGA
ATGTACTGAACTATGATGTATTTAGCAACTCTTTGCAAAGGAAACATCTGTGGTAAGATT
TGGGCTGTGTAATGCGACTTCGTGGAAGATTTAGCTTTTCATTTC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2AU24TF 650 0 0
AAGAAGGGTTTTGAGGGTTTCGCAGTTTCCGCAGTCTTCTCTCCTCTCCGATCTCTTCGT
CTTCTCCACAGGATCCCCAAAGATGAAGCTCGTCAGGTTTTTGATGAAGTTGAACAATGA
GACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAACGGAACTGTGGTCCATGGAACCATCACTGGTGTTGA
TGTGAGCATGAACACTCACTTGAAGACGGTTAAAATGACTCTCAAGGGGAAGAATCCAGT
GACAATGGACCATTTAAGCTTGAGGGGTAACAACATCCGCTACTACATTCTTCCCGATAG
CTTGAACCTGGAGACTTTGCTCGTGGAAGACACTCCTCGAGTTAAACCTAAGAAGCCTGT
TGCTGGGAAGCCTGTTGGACGAGGCCGTGGACGTGGTGGTCGTGGGCGTGGTGGGGCTGG
TCGTGGCAGAGGTCGCTAAGTTTCAGCAAAGCAGTGCACTGGAAACAGTTGAAGGCGGGT
GAGTTTGAATTTTGTAGGAAGTGGGAACCCTTTGGTGTCTTAGGAGAATGTACTGAACTA
TGATGTATTTAGCAACTCTTTGCAAAGGAAACATCTGTGGTAAGATTTGGGCTGTGTAAT
GCGACTTCGTGGAAGATTTAGCTTTTCATTTCATAAGAGCATGTGCAAGT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 6

CO CL1335Contig1 980 6 13 U
GTAGGTACCGGTAGATTCAGCAACGGAAAGGTCGCTTCTGATTTTATATCCAAATATATG
GGAGTAAAAGAAATAGTACCCGCATATTTAGACCAGAAACTACAACAAAACAAACTACAA
CGTAGCGATCTACTTACGGGCGTCTCTTTTGCCTCGGGTGGTGCTGGCTTCGATCCTGAA
ACATCTGAATCATTGGATGTCATACCAATGTTGGACCAATTGTCATATTTTCAAGACTAC
ATAAAGAGACTGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAAGAGGCTAAACGAATAGTGTCCAACGGA
GTAGCCATTGTGGTCGCAGGAGGCACCGATCTGATTTACACATATTTTGGAATTGGTGCT
CAACACCTTAAAACTGACGTCGACTCTTTCACCACTGTCATGGCTGACTCTGCTGCCAGT
TTCGTTTTGCAACTGTATGGATTTGGAGCAAGACGTATAGGAGTGATAGGAACACCACCG
CTTGGTTGTACACCATCACAAAGGGTTAAAAACAAAAAATTATGTGATGAAGAGATAAAT
TATGCTGCTCAGCTTTTTAATTCCAAGCTCGCTATAATTTTGGGTCAGTTGTCGGAAACC
CTACGAAATTCGACAATGATTTACATGGACATCTACTCTATCTTCAGTAAAATACTAGAA
AGCCCTGCGCACTATGGATTTGAGGAGGTAAAGAAACCGTGCTGCAAAATCGGAATAACG
GGAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAAGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCGTCTTAT
TTGTTTTGGGATGGTGCCCACCCTACTGAGAGAGCTTATGAAACATTAAACAAAAAACTT
GTTAAAAAATACCTCCGTTATATCTGATTAATAACTGTCATTATTACATTATTAATCTCA
CCAAAAGGACAACTTTTGCAACGTATTAATAATGTAGGCATGAGCGGTTTCTGCGACTAA
TAATCCAAACAACATTTGAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 25 40 20 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF84TF U 1
AF RR2BS34TF U 1
AF RR2DS78TF U 59
AF RR2BS34JQ C 70
AF RR2CF84JQ C 150
AF RR2EG90TF U 554
BS 1 687 RR2BS34TF
BS 688 688 RR2CF84TF
BS 689 708 RR2BS34TF
BS 709 709 RR2CF84TF
BS 710 714 RR2BS34TF
BS 715 716 RR2CF84TF
BS 717 717 RR2BS34TF
BS 718 718 RR2DS78TF
BS 719 725 RR2BS34TF
BS 726 726 RR2DS78TF
BS 727 740 RR2BS34TF
BS 741 742 RR2DS78TF
BS 743 980 RR2EG90TF

RD RR2CF84TF 717 0 0
GTAGGTACCGGTAGATTCAGCAACGGAAAGGTCGCTTCTGATTTTATATCCAAATATATG
GGAGTAAAAGAAATAGTACCCGCATATTTAGACCAGAAACTACAACAAAACAAACTACAA
CGTAGCGATCTACTTACGGGCGTCTCTTTTGCCTCGGGTGGTGCTGGCTTCGATCCTGAA
ACATCTGAATCATTGGATGTCATACCAATGTTGGACCAATTGTCATATTTTCAAGACTAC
ATAAAGAGACTGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAAGAGGCTAAACGAATAGTGTCCAACGGA
GTAGCCATTGTGGTCGCAGGAGGCACCGATCTGATTTACACATATTTTGGAATTGGTGCT
CAACACCTTAAAACTGACGTCGACTCTTTCACCACTGTCATGGCTGACTCTGCTGCCAGT
TTCGTTTTGCAACTGTATGGATTTGGAGCAAGACGTATAGGAGTGATAGGAACACCACCG
CTTGGTTGTACACCATCACAAAGGGTTAAAAACAAAAAATTATGTGATGAAGAGATAAAT
TATGCTGCTCAGCTTTTTAATTCCAAGCTCGCTATAATTTTGGGTCAGTTGTCGGAAACC
CTACGAAATTCGACAATGATTTACATGGACATCTACTCTATCTTCAGTAAAATACTAGAA
AGCCCTGCGCACTATGGATTTGAGGAGGTAAAGAAACCGTGCTGCAAAATCGGAATA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2BS34TF 740 0 0
GTAGGTACCGGTAGATTCAGCAACGGAAAGGTCGCTTCTGATTTTATATCCAAATATATG
GGAGTAAAAGAAATAGTACCCGCATATTTAGACCAGAAACTACAACAAAACAAACTACAA
CGTAGCGATCTACTTACGGGCGTCTCTTTTGCCTCGGGTGGTGCTGGCTTCGATCCTGAA
ACATCTGAATCATTGGATGTCATACCAATGTTGGACCAATTGTCATATTTTCAAGACTAC
ATAAAGAGACTGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAAGAGGCTAAACGAATAGTGTCCAACGGA
GTAGCCATTGTGGTCGCAGGAGGCACCGATCTGATTTACACATATTTTGGAATTGGTGCT
CAACACCTTAAAACTGACGTCGACTCTTTCACCACTGTCATGGCTGACTCTGCTGCCAGT
TTCGTTTTGCAACTGTATGGATTTGGAGCAAGACGTATAGGAGTGATAGGAACACCACCG
CTTGGTTGTACACCATCACAAAGGGTTAAAAACAAAAAATTATGTGATGAAGAGATAAAT
TATGCTGCTCAGCTTTTTAATTCCAAGCTCGCTATAATTTTGGGTCAGTTGTCGGAAACC
CTACGAAATTCGACAATGATTTACATGGACATCTACTCTATCTTCAGTAAAATACTAGAA
AGCCCTGCGCACTATGGATTTGAGGAG*TAAAGAAACCGTGCTGCAAA*TCGGATAA*CG
GGAGGGGGTGTATTCTGCAA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2DS78TF 685 0 0
G
GGGAGTAAAAGAAATAGTACCCGCATATTTAGACCAGAAACTACAACAAAACAAACTACA
ACGTAGCGATCTACTTACGGGCGTCTCTTTTGCCTCGGGTGGTGCTGGCTTCGATCCTGA
AACATCTGAATCATTGGATGTCATACCAATGTTGGACCAATTGTCATATTTTCAAGACTA
CATAAAGAGACTGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAAGAGGCTAAACGAATAGTGTCCAACGG
AGTAGCCATTGTGGTCGCAGGAGGCACCGATCTGATTTACACATATTTTGGAATTGGTGC
TCAACACCTTAAAACTGACGTCGACTCTTTCACCACTGTCATGGCTGACTCTGCTGCCAG
TTTCGTTTTGCAACTGTATGGATTTGGAGCAAGACGTATAGGAGTGATAGGAACACCACC
GCTTGGTTGTACACCATCACAAAGGGTTAAAAACAAAAAATTATGTGATGAAGAGATAAA
TTATGCTGCTCAGCTTTTTAATTCCAAGCTCGCTATAATTTTGGGTCAGTTGTCGGAAAC
CCTACGAAATTCGACAATGATTTACATGGACATCTACTCTATCTTCAGTAAAATACTAGA
AAGCCCTGCGCACTATGGATTTGAGGAGGTAAAGAAACCGTGCTGCAAAATCGGAATAAC
GGGAGGAGGTGTATTCTGCAAAA
G

QA 2 684 2 684
DS 

RD RR2BS34JQ 818 0 0
GAAATAGTACCCGCATATTTAGACCAGAAACTACAACAAAACAAACTACAACGTAGCGAT
CTACTTACGGGCGTCTCTTTTGC*TCGGGTGGTGCTGGCTTCGATCCTGAAACATCTGAA
TCATTGGATGTCATACCAATGTTGGACCAATTGTCATATTTTCAAGACTACATAAAGAGA
CTGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAAGAGGCTAAACGAATAGTGTCCAACGGAGTAGCCATT
GTGGTCGCAGGAGGCACCGATCTGATTTACACATATTTTGGAATTGGTGCTCAACACCTT
AAAACTGACGTCGACTCTTTCACCACTGTCATGGCTGACTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTG
CAACTGTATGGATTTGGAGCAAGACGTATAGGAGTGATAGGAACACCACCGCTTGGTTGT
ACACCATCACAAAGGGTTAAAAACAAAAAATTATGTGATGAAGAGATAAATTATGCTGCT
CAGCTTTTTAATTCCAAGCTCGCTATAATTTTGGGTCAGTTGTCGGAAACCCTACGAAAT
TCGACAATGATTTACATGGACATCTACTCTATCTTCAGTAAAATACTAGAAAGCCCTGCG
CACTATGGATTTGAGGAGGTAAAGAAACCGTGCTGCAAAATCGGAATAACGGGAGGAGGT
GTATTCTGCAAAAAGAAGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCGTCTTATTTGTTTTGG
GATGGTGCCCACCCTACTGAGAGAGCTTATGAAACATTAAACAAAAAACTTGTTAAAAAA
TACCTCCGTTATATCTGATTAATAACTGTCATTATTAC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2CF84JQ 738 0 0
TGCCTCGGGTGGTGCTGGCTTCGATCCTGAAACATCTGAATCATTGGATGTCATACCAAT
GTTGGACCAATTGTCATATTTTCAAGACTACATAAAGAGACTGAAGAAGCTAGTAGGAAA
AAAAGAGGCTAAACGAATAGTGTCCAACGGAGTAGCCATTGTGGTCGCAGGAGGCACCGA
TCTGATTTACACATATTTTGGAATTGGTGCTCAACACCTTAAAACTGACGTCGACTCTTC
CACCACTGTCATGGCTGACTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGATTTGGAGC
AAGACGTATAGGAGTGATAGGAACACCACCGCTTGGTTGTACACCATCACAAAGGGTTAA
AAACAAAAAATTATGTGATGAAGAGATAAATTATGCTGCTCAGCTTTTTAATTCCAAGCT
CGCTATAATTTTGGGTCAGTTGTCGGAAACCCTACGAAATTCGACAATGATTTACATGGA
CATCTACTCTATCTTCAGTAAAATACTAGAAAGCCCTGCGCACTATGGATTTGAGGAGGT
AAAGAAACCGTGCTGCAAAATCGGAATAACGGGAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAAGAC
ATCAAAAATATGTCCCAATACATCGTCTTATTTGTTTTGGGATGGTGCCCACCCTACTGA
GAGAGCTTATGAAACATTAAACAAAAAACTTGTTAAAAAATACCTCCGTTATATCTGATT
AATAACTGTCATTATTAC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2EG90TF 427 0 0
TTTTTAATTCCAAGCTCGCTATTATTTTGGGTCAGTTGTCGGAAACCCTACGAAATTCGA
CAATGATTTACATGGACATCTACTCTATCTTCAGTAAAATACTAGAAAGCCCTGCGCACT
ATGGACTTGAGGAGGTAAAGAAACCGTGCTGCAAAATCGGAATAACGGGAGGAGGTGTAT
TCTGCAAAAAGAAGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCGTCTTATTTGTTTTGGGATG
GTGCCCACCCTACTGAGAGAGCTTATGAAACATTAAACAAAAAACTTGTTAAAAAATACC
TCCGTTATATCTGATTAATAACTGTCATTATTACATTATTAATCTCACCAAAAGGACAAC
TTTTGCAACGTATTAATAATGTAGGCATGAGCGGTTTCTGCGACTAATAATCCAAACAAC
ATTTGAG

QA 1 427 1 427
DS 



AS 2 6

CO CL1336Contig1 842 4 13 U
GAAAGTAAAAAAAAGACCTTCATGACTATGCACTCTTATCACGCAAAACCAAAATAACCC
TTTAAACAGTCCTCTGCAACACCAAAATCAAGTATATTCTCTAATTCGTACAAGTTCTGA
AACTGTGCTTAACTGCTAAACACAACAACGCAAAATGCAGTTCTGTCTCATTATCGTTTC
ACTAATTTAGCGTCTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGCTGCATTGGACTTTGAAGGTGTTGC
TACTAAGTATACGAACAAAACCACCATGGAGACCACTGAAACAAGTGATCCATATTTTGC
CAGCACCCTCTTTGCCAGGGCAAGCGGGTCTGTTGGAGGAATGTCCGCGAGGATGTCTAG
AGGTAGTATTGGAGTTGAGTACACTTGCTGTAGAGCAGTCTTTGTGGGGATGCGGAAAGT
AACCACAGCGGGAGCACCATAGAAGAGTCCTTTAACCTTAGCCTCTAATTCGAAAGAATG
AGACAGAATACCTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGATCTTGAAGTGTTTCCATTAACAAC
TTCAAAAGTTTTCTTATCCCAGGTATTATCAGTCAGAGTCACATCATACGCCGTCGCAGA
TCCTTGGTTGTAGATGTCGAAGGAAACGAGGACACGCTCAGCGCGGGATTTGAGCCTGTT
GAGAGTAGCTTTCTTGTGAACCACCATGAACGGCATTTCCGAGGTCGCGAACGAAGCAGA
GACGAGCATGAAAACCGCAACGGCGGAGATCAGAAGCTTAGCTAAGGGGATCTCCATGGT
GTTTGATCTTTCGAAGAAGATGAAGATGCGAAACAGATCTGTGATTGATTGATTTCTCTC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 

AF RR2D007JQ U 1
AF RR2CQ89JQ U 121
AF RR2CQ89TF C 96
AF RR2D007TF C 100
BS 1 234 RR2D007JQ
BS 235 235 RR2CQ89JQ
BS 236 392 RR2D007JQ
BS 393 393 RR2CQ89JQ
BS 394 424 RR2D007JQ
BS 425 425 RR2CQ89JQ
BS 426 435 RR2D007JQ
BS 436 436 RR2CQ89JQ
BS 437 441 RR2D007JQ
BS 442 765 RR2CQ89JQ
BS 766 796 RR2CQ89TF
BS 797 797 RR2D007TF
BS 798 842 RR2CQ89TF

RD RR2D007JQ 447 0 0
GAAAGTAAAAAAAAGACCTTCATGACTATGCACTCTTATCACGCAAAACCAAAATAACCC
TTTAAACAGTCCTCTGCAACACCAAAATCAAGTATATTCTCTAATTCGTACAAGTTCTGA
AACTGTGCTTAACTGCTAAACACAACAACGCAAAATGCAGTTCTGTCTCATTATCGTTTC
ACTAATTTAGCGTCTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGCTGCATTGGACTTTGAAGGGGTTGC
TACTAAGTATACGAACAAAACCACCATGGAGACCACTGAAACAAGTGATCCATATTTTGC
CAGCACCCTCTTTGCCAGGGCAAGCGGGTCTGTTGGAGGAATGTCCGCGAGGATGTCTAG
AGGTAGTATTGGAGTTGAGTACACTTGCTGTAAAGCAGTCTTTGTGGGGATGCGGAAAGT
AACCCCAGCGGGAGCCCCATA
AAAAAA

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR2CQ89JQ 650 0 0
AACTGTGCTTAACTGCTAAACACAACAACGCAAAATGCAGTTCTGTCTCATTATCGTTTC
ACTAATTTAGCGTCTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGCTGCATTGGACTTTGAAGGTGTTGC
TACTAAGTATACGAATAAAACCACCATGGAGACCACTGAAACAAGTGATCCATATTTTGC
CAGCACCCTCTTTGCCAGGGCAAGCGGGTCTGTTGGAGGAATGTCCGCGAGGATGTCTAG
AGGTAGTATTGGAGTTGAGTACACTTGCTGTAGAGCAGTCTTTGTGGGGATGCGGAAAGT
AACCACAGCGGGAGCACCATAGAAGAGTCCTTTAACCTTAGCCTCTAATTCGAAAGAATG
AGACAGAATACCTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGATCTTGAAGTGTTTCCATTAACAAC
TTCAAAAGTTTTCTTATCCCAGGTATTATCAGTCAGAGTCACATCATACGCCGTCGCAGA
TCCTTGGTTGTAGATGTCGAAGGAAACGAGGACACGCTCAGCGCGGGATTTGAGCCTGTT
GAGAGTAGCTTTCTTGTGAACCACCATGAACGGCATTTCCGAGGTCGCGAACGAAGCAGA
GACGAGCATGAAAACCGCAACGGCGGAGATCAGAAGCTTAGCTAA
AGGGA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2CQ89TF 747 0 0
TA
TCTCTAATTCGTACAAGT*CTGAAACTGTGCTTAACTGCTAAACACAACAACGCAAAATG
CAGTTCTGTCTCATTATCGTTTCACTAATTTAGCGTCTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGCT
GCATTGGACTTTGAAGGTGTTGCTACTAAGTATACGAATAAAACCACCATGGAGACCACT
GAAACAAGTGATCCATATTTTGCCAGCACCCTCTTTGCCAGGGCAAGCGGGTCTGTTGGA
GGAATGTCCGCGAGGATGTCTAGAGGTAGTATTGGAGTTGAGTACACTTGCTGTAGAGCA
GTCTTTGTGGGGATGCGGAAAGTAACCACAGCGGGAGCACCATAGAAGAGTCCTTTAACC
TTAGCCTCTAATTCGAAAGAATGAGACAGAATACCTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGAT
CTTGAAGTGTTTCCATTAACAACTTCAAAAGTTTTCTTATCCCAGGTATTATCAGTCAGA
GTCACATCATACGCCGTCGCAGATCCTTGGTTGTAGATGTCGAAGGAAACGAGGACACGC
TCAGCGCGGGATTTGAGCCTGTTGAGAGTAGCTTTCTTGTGAACCACCATGAACGGCATT
TCCGAGGTCGCGAACGAAGCAGAGACGAGCATGAAAACCGCAACGGCGGAGATCAGAAGC
TTAGCTAAGGGGATCTCCATGGTGTTTGATCTTTCGAAGGAGATGAAGATGCGAAACAGA
TCTGTGATTGATTGATTTCTCTCCC

QA 3 747 3 747
DS 

RD RR2D007TF 743 0 0
TCTAATTCGTACAAGTTCTGAAACTGTGCTTAACTGCTAAACACAACAACGCAAAATGCA
GTTCTGTCTCATTATCGTTTCACTAATTTAGCGTCTCTTCTTGCCGCTCGCTTTTGCTGC
ATTGGACTTTGAAGGTGTTGCTACTAAGTATACGAACAAAACCACCATGGAGACCACTGA
AACAAGTGATCCATATTTTGCCAGCACCCTCTTTGCCAGGGCAAGCGGGTCTGTTGGAGG
AATGTCCGCGAGGATGTCTAGAGGTAGTATTGGAGTTGAGTACACTTGCTGTAGAGCAGT
CTTTGTGGGGATGCGGAAAGTAACCACAGCGGGAGCACCATAGAAGAGTCCTTTAACCTT
AGCCTCTAATTCGAAAGAATGAGACAGAATACCTCCTGCATCAAGTCTCTCCCATGATCT
TGAAGTGTTTCCATTAACAACTTCAAAAGTTTTCTTATCCCAGGTATTATCAGTCAGAGT
CACATCATACGCCGTCGCAGATCCTTGGTTGTAGATGTCGAAGGAAACGAGGACACGCTC
AGCGCGGGATTTGAGCCTGTTGAGAGTAGCTTTCTTGTGAACCACCATGAACGGCATTTC
CGAGGTCGCGAACGAAGCAGAGACGAGCATGAAAACCGCAACGGCGGAGATCAGAAGCTT
AGCTAAGGGGATCTCCATGGTGTTTGATCTTTCGAAGAAGATGAAGATGCGAAACAGATC
TGTGATTGATTGATTTCTCTCCC

QA 1 743 1 743
DS 



CO CL1336Contig2 794 2 8 U
GGAATCAATCACAGATCTCTTTCGCATCTTCATCCTCTTCGAAAGATCAAACACCATGGC
GACCCCCTTAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCGATGGCGGTTCTCATGCTCGTCTCCGCTTC
GTTCGCGACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTTCACAAGAAAGCTACTCTCAACAGGCT
CAAATCCGGCGCTGAGCGTGTCCTCGTTTCCTTCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGAC
GGCGTATGATGTGACTCTGACTGATAATACCTGGGATAAGAAAACTTTTGAAGTTGTTAA
TGGAAACACATCAAGATCATGGGAAAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCTTT
CGAATTAGAGGCTAAGGTTAAAGGACTCTTCTATGGTGCTCCTGCTGTGGTTACTTTCCG
CATCCCAACAAAGACAGCTCTACAGCAAGTGTACTCAACTCCAATACTACCTCTAGACAT
CCTCGCGGACATTCCTCCAACAGACCCGCTTGCCCTGGCAAAGAGGGTGCTGGCAAAATA
TGGATCACTTGTTTCAGTGGTCTCCATGGTGGTTTTGTTCGTATACTTGGTAGCAACACC
TTCAAAGTCCAATGCAGCAAAAGCGAGCGGCAAGAAGAAACGCTAAAAGTAGTGAGACGA
TAATGAGAAAGATCTGCATTGTTCGTTGTTGTGTTTAGCAGTTAAAGCACAGTTTCCGAA
CTTGTACGAATTAGAGAATATACTTGATTTTGGTGTTGCAGAGGACTATTTAAAGAGTTA
TTTTGGTTTGCGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK74TF U 1
AF RR2EK74JQ C 118
BS 1 719 RR2EK74TF
BS 720 720 RR2EK74JQ
BS 721 729 RR2EK74TF
BS 730 730 RR2EK74JQ
BS 731 737 RR2EK74TF
BS 738 738 RR2EK74JQ
BS 739 783 RR2EK74TF
BS 784 794 RR2EK74JQ

RD RR2EK74TF 783 0 0
GGAATCAATCACAGATCTCTTTCGCATCTTCATCCTCTTCGAAAGATCAAACACCATGGC
GACCCCCTTAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCGATGGCGGTTCTCATGCTCGTCTCCGCTTC
GTTCGCGACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTTCACAAGAAAGCTACTCTCAACAGGCT
CAAATCCGGCGCTGAGCGTGTCCTCGTTTCCTTCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGAC
GGCGTATGATGTGACTCTGACTGATAATACCTGGGATAAGAAAACTTTTGAAGTTGTTAA
TGGAAACACATCAAGATCATGGGAAAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTCTTT
CGAATTAGAGGCTAAGGTTAAAGGACTCTTCTATGGTGCTCCTGCTGTGGTTACTTTCCG
CATCCCAACAAAGACAGCTCTACAGCAAGTGTACTCAACTCCAATACTACCTCTAGACAT
CCTCGCGGACATTCCTCCAACAGACCCGCTTGCCCTGGCAAAGAGGGTGCTGGCAAAATA
TGGATCACTTGTTTCAGTGGTCTCCATGGTGGTTTTGTTCGTATACTTGGTAGCAACACC
TTCAAAGTCCAATGCAGCAAAAGCGAGCGGCAAGAAGAAACGCTAAAAGTAGTGAGACGA
TAATGAGAAAGATCTGCATTGTTCGTTGTTGTGTTTAGCAGTTAAAGCACAGTTTCCGA*
CTTGTACGA*TTAGAGA*TATACTTGATTTTGGTGTTGCAGAGGACTATTTAAAGAGTTA
TTT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2EK74JQ 677 0 0
TTCGTTCGCGACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTTCACAAGAAAGCTACTCTCAACAG
GCTCAAATCCGGCGCTGAGCGTGTCCTCGTTTCCTTCGACATCTACAACCAAGGATCTGC
GACGGCGTATGATGTGACTCTGACTGATAATACCTGGGATAAGAAAACTTTTGAAGTTGT
TAATGGAAACACATCAAGATCATGGGAAAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCATTC
TTTCGAATTAGAGGCTAAGGTTAAAGGACTCTTCTATGGTGCTCCTGCTGTGGTTACTTT
CCGCATCCCAACAAAGACAGCTCTACAGCAAGTGTACTCAACTCCAATACTACCTCTAGA
CATCCTCGCGGACATTCCTCCAACAGACCCGCTTGCCCTGGCAAAGAGGGTGCTGGCAAA
ATATGGATCACTTGTTTCAGTGGTCTCCATGGTGGTTTTGTTCGTATACTTGGTAGCAAC
ACCTTCAAAGTCCAATGCAGCAAAAGCGAGCGGCAAGAAGAAACGCTAAAAGTAGTGAGA
CGATAATGAGAAAGATCTGCATTGTTCGTTGTTGTGTTTAGCAGTTAAAGCACAGTTTCC
GAACTTGTACGAATTAGAGAATATACTTGATTTTGGTGTTGCAGAGGACTATTTAAAGAG
TTATTTTGGTTTGCGTG

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 6

CO CL1337Contig1 716 6 29 U
GGGAAGGATAAGAGAGAAGTCCATAAACAAACACAAAAATGCTTCAACTCTGCTCCACTT
TCCGTCCTCAACTTCTCTTTTCTCCCCAAATCCGATTCACAGATGGAGTTTTGATTCGCC
AACTAAAGTTTGGTTCGAGCAATTCAGTTGTGAGTATCCGTCCAGTGATACGTTGCCAGA
GAGTAAGTGGAGGTCGAGGAGGAGCTAACCGAAGCAAACCCGCCAAGCCTCCTGTTAAAG
AAGGGAGCAACAAAACAGTGATCGAAGGTTTAGTCACCGAATCGCTTCCCAACGGCATGT
TTCGAGTTGATCTTGAGAATGGAGATAACATTCTTGGGTACATTTGTGGTAAGATCAGGA
AGAATTTCATAAGAATTCTCCCTGGTGATAAAGTGAAAGTTGAAATGAGTGTTTATGATT
CTACGAAAGGTCGTATCGTTTTCAGAATGAGTAGTAGAGACTAAGACGAATCCGGAAAGG
GGTTGTTTCAAGATCATGTTATATTCTATTTTTAAGTGTAGGCAAAGTTTGATAAAGCTT
TAACATTTATGCAATATGAAATACATGATTAGGCTTTCATGGATAAAGCTTTTTTTTTTA
TGTCCAAGTTGATTCTTGTTTCGATACTAGTGTTGTTCTGCGGTTTGATAACCAGACGAA
GTTGCTAAAACCCTTTATTGAGAACGACTGTATGTAAAATTATAGCTTTGTCTTCT


BQ
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM93JQ C 1
AF RR2EM93TF U 1
AF RR2GL46JQ C 1
AF RR2GL46TF U 1
AF RR2EI95TF U -4
AF RR2EI95JQ C 162
BS 1 19 RR2EM93TF
BS 20 20 RR2GL46TF
BS 21 92 RR2EM93TF
BS 93 93 RR2GL46TF
BS 94 122 RR2EM93TF
BS 123 123 RR2GL46TF
BS 124 127 RR2EM93TF
BS 128 128 RR2GL46TF
BS 129 179 RR2EM93TF
BS 180 180 RR2GL46TF
BS 181 232 RR2EM93TF
BS 233 233 RR2GL46TF
BS 234 244 RR2EM93TF
BS 245 245 RR2GL46TF
BS 246 256 RR2EM93TF
BS 257 257 RR2GL46TF
BS 258 371 RR2EM93TF
BS 372 372 RR2GL46TF
BS 373 441 RR2EM93TF
BS 442 442 RR2GL46TF
BS 443 473 RR2EM93TF
BS 474 475 RR2GL46TF
BS 476 484 RR2EM93TF
BS 485 485 RR2GL46TF
BS 486 525 RR2EM93TF
BS 526 526 RR2GL46TF
BS 527 582 RR2EM93TF
BS 583 625 RR2EI95TF
BS 626 716 RR2EI95JQ

RD RR2EM93JQ 577 0 0
GGGAAGGATAAGAGAGAAGCCCATAAACAAACACAAAAATGCTTCAACTCTGCTCCACTT
TCCGTCCTCAACTTCTCTTTTCTCCCCAAATCTGATTCACAGATGGAGTTTTGATTCGCC
AAGTAAACTTTGGTTCGAGCAATTCAGTTGTGAGTATCCGTCCAGTGATACGTTGCCAGC
GAGTAAGTGGAGGTCGAGGAGGAGCTAACCGAAGCAAACCCGCCAAGCCTCCAGTTAAAG
AAGGCAGCAACAAAACCGTGATCGAAGGTTTAGTCACCGAATCGCTTCCCAACGGCATGT
TTCGAGTTGATCTTGAGAATGGAGATAACATTCTTGGGTACATTTGTGGTAAGATCAGGA
AGAATTTCATACGAATTCTCCCTGGTGATAAAGTGAAAGTTGAAATGAGTGTTTATGATT
CTACGAAAGGTCGTATCGTTT*CAGAATGAGTAGTAGAGACTAAGACGAATCCCAAAAGG
GGTTTTTTCAAGATCATGTTATATTCTATTTTTAAGTGTAGGCAATGTTTGATAAAGCTT
TAACATTTATGCAATATGAAATACATGATTAGGCTTT

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2EM93TF 582 0 0
GGGAAGGATAAGAGAGAAGCCCATAAACAAACACAAAAATGCTTCAACTCTGCTCCACTT
TCCGTCCTCAACTTCTCTTTTCTCCCCAAATCTGATTCACAGATGGAGTTTTGATTCGCC
AAGTAAACTTTGGTTCGAGCAATTCAGTTGTGAGTATCCGTCCAGTGATACGTTGCCAGC
GAGTAAGTGGAGGTCGAGGAGGAGCTAACCGAAGCAAACCCGCCAAGCCTCCAGTTAAAG
AAGGCAGCAACAAAACCGTGATCGAAGGTTTAGTCACCGAATCGCTTCCCAACGGCATGT
TTCGAGTTGATCTTGAGAATGGAGATAACATTCTTGGGTACATTTGTGGTAAGATCAGGA
AGAATTTCATACGAATTCTCCCTGGTGATAAAGTGAAAGTTGAAATGAGTGTTTATGATT
CTACGAAAGGTCGTATCGTTT*CAGAATGAGTAGTAGAGACTAAGACGAATCCCAAAAGG
GGTTTTTTCAAGATCATGTTATATTCTATTTTTAAGTGTAGGCAATGTTTGATAAAGCTT
TAACATTTATGCAATATGAAATACATGATTAGGCTTTCATGG

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2GL46JQ 582 0 0
GGGAAGGATAAGAGAGAAGTCCATAAACAAACACAAAAATGCTTCAACTTTGCTCCACTT
TCCGTCCTCAACTTTTCTTTTCTCCCCAAATCCGATTCACAGATGGAGTTTTGATTCGCC
AACTAAAGTTTGGTTCGAGCAATTCAGTTGTGAGTATCCGTCCAGTGATACGTTGCCAGA
GAGTAAGTGGAGGTCGAGGAGGAGCTAACCGAAGCAAACCCGCCAAGCCTCCTGTTAAAG
AAGGGAGCAACAAAACAGTGATCGAAGGTTTAGTCACCGAATCGCTTCCCAACGGCATGT
TTCGAGTTGATCTTGAGAATGGAGATAACATTCTTGGGTACATTTGTGGTAAGATCGGGA
AGAATTTCATAAGAATTCTCCCTGGTGATAAAGTGAAAGTTGAAATGAGTGTTTATGATT
CTACGAAAGGTCGTATCGTTTTCAGAATGAGTAGTAGAGACTAAGACGAATCCGGAAAGG
GGTTGGTTCAAGATCATGTTATATTCTATTTTTAAGTGTAGGCAAAGTTTGATAAAGCTT
TAACATTTATGCAATATGAAATACATGATTAGGCTTTCATGG

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2GL46TF 582 0 0
GGGAAGGATAAGAGAGAAGTCCATAAACAAACACAAAAATGCTTCAACTCTGCTCCACTT
TCCGTCCTCAACTTCTCTTTTCTCCCCAAATCCGATTCACAGATGGAGTTTTGATTCGCC
AACTAAAGTTTGGTTCGAGCAATTCAGTTGTGAGTATCCGTCCAGTGATACGTTGCCAGA
GAGTAAGTGGAGGTCGAGGAGGAGCTAACCGAAGCAAACCCGCCAAGCCTCCTGTTAAAG
AAGGGAGCAACAAAACAGTGATCGAAGGTTTAGTCACCGAATCGCTTCCCAACGGCATGT
TTCGAGTTGATCTTGAGAATGGAGATAACATTCTTGGGTACATTTGTGGTAAGATCGGGA
AGAATTTCATAAGAATTCTCCCTGGTGATAAAGTGAAAGTTGAAATGAGTGTTTATGATT
CTACGAAAGGTCGTATCGTTTTCAGAATGAGTAGTAGAGACTAAGACGAATCCGGAAAGG
GGTTGGTTCAAGATCATGTTATATTCTATTTTTAAGTGTAGGCAAAGTTTGATAAAGCTT
TAACATTTATGCAATATGAAATACATGATTAGGCTTTCATGG

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2EI95TF 630 0 0
GGAGATT
GAAGGATAAGAGAGAAGTCCATAAACAAACACAAAAATGCTTCAACTCTGCTCCACTTTC
CGTCCTCAACTTCTCTTTTCTCCCCAAATCCGATTCACAGATGGAGTTTTGATTCGCCAA
CTAAAGTTTGGTTCGAGCAATTCAGTTGTGAGTATCCGTCCAGTGATACGTTGCCAGAGA
GTAAGTGGAGGTCGAGGAGGAGCTAACCGAAGCAAACCCGCCAAGCCTCCTGTTAAAGAA
GGGAGCAACAAAACAGTGATCGAAGGTTTAGTCACCGAATCGCTTCCCAACGGCATGTTT
CGAGTTGATCTTGAGAATGGAGATAACATTCTTGGGTACATTTGTGGTAAGATCAGGAAG
AATTTCATAAGAATTCTCCCTGGTGATAAAGTGAAAGTTGAAATGAGTGTTTATGATTCT
ACGAAAGGTCGTATCGTTTTCAGAATGAGTAGTAGAGACTAAGACGAATCCGGAAAGGGG
TTGTTTCAAGATCATGTTATATTCTATTTTTAAGTGTAGGCAAAGTTTGATAAAGCTTTA
ACATTTATGCAATATGAAATACATGATTAGGCTTTCATGGATAAAGCTTTTTTTTTTATG
TCCAAGTTGATTCTTGTTTCGAT

QA 8 630 8 630
DS 

RD RR2EI95JQ 555 0 0
CCAGTGATACGTTGCCAGAGAGTAAGTGGAGGTCGAGGAGGAGCTAACCGAAGCAAACCC
GCCAAGCCTCCTGTTAAAGAAGGGAGCAACAAAACAGTGATCGAAGGTTTAGTCACCGAA
TCGCTTCCCAACGGCATGTTTCGAGTTGATCTTGAGAATGGAGATAACATTCTTGGGTAC
ATTTGTGGTAAGATCAGGAAGAATTTCATAAGAATTCTCCCTGGTGATAAAGTGAAAGTT
GAAATGAGTGTTTATGATTCTACGAAAGGTCGTATCGTTTTCAGAATGAGTAGTAGAGAC
TAAGACGAATCCGGAAAGGGGTTGTTTCAAGATCATGTTATATTTTATTTTTAAGTGTAG
GCAAAGTTTGATAAAGCTTTAACATTTATGCAATATGAAATACATGATTAGGCTTTCATG
GATAAAGCTTTTTTTTTTATGTCCAAGTTGATTCTTGTTTCGATACTAGTGTTGTTCTGC
GGTTTGATAACCAGACGAAGTTGCTAAAACCCTTTATTGAGAACGACTGTATGTAAAATT
ATAGCTTTGTCTTCT

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 6

CO CL1338Contig1 536 6 3 U
AAAGCTTAAAGCCAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAATTAAGCACGAGAAGAAATGGCA
AAGATATCCAACTTTGCATGCTTGACCACAACCGTTTTACTTGTCCTCTTGGTTGTTTCC
AATGGAATCCCGAAGAGCAACGCATGTCATACATTCTTAGGTGAATGCGATGTGCCATCA
CCATGTACTGAAACCAATTGTGAAGCCTGTTGTCTATCAAAGTTTGGAGCTCTCCATTGT
GACGGGGTGTGTGAAGTTGAAGGTACGGAAGAACACTGCCACTGCTATGGACAGCCATGA
AAATTTAATCAACCACCAAGCAAATATACGTGCAAAACATCTCGCTTTATCACTTTGTTT
GTAATTCACGTATCTGTGCATAAATAATAGATGGGGGAGTTGTTCCACTGCTCAAGCCTA
TTTATACATGTACTCTTGTGTTGTGTGCTCTTTTAATAAAATACATCTGATGTTTGTTTG
TAACTTTGTATATCTTATCATTGATAAGTCCCAACTATCGATAATCTGTTTTCCAG


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2F608JQ C 1
AF RR2AN72TF U 1
AF RR2F608TF U 1
AF RR2B293JQ C 1
AF RR2B293TF U 1
AF RR2CZ68TF U 1
BS 1 481 RR2AN72TF
BS 482 534 RR2B293TF
BS 535 536 RR2CZ68TF

RD RR2F608JQ 351 0 0
AAAGCTTAAAGCCAAA*AAAAAGAAAAAGAAAAAGAAATTAAGCACGAGAAGAAATGGCA
AAGATATCCAACTTTGCATGCTTGACCACAACCGTTTTACTTGTCCTTTTGGTTGTTTCC
AATGGAATCCCGAAGAGCAACGCATGTCATACATTTTTAGGTGAATGGGATGTGCCATCA
CCATGTACTGAAACCAATTGTGAAGCCTGTTGTCTATCAAAGTTTGGAGCTTTCCATTGT
GACGGGGTGTGTGAAGTTGAAGGTACGGAAGAACACTGCCACTGCTATGGACAGCCATGA
AAATTTAATCAACCACCAAGCAAATATACGTGCAAAACATCTCGCTTTATC

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR2AN72TF 481 0 0
AAAGCTTAAAGCCAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAATTAAGCACGAGAAGAAATGGCA
AAGATATCCAACTTTGCATGCTTGACCACAACCGTTTTACTTGTCCTCTTGGTTGTTTCC
AATGGAATCCCGAAGAGCAACGCATGTCATACATTCTTAGGTGAATGCGATGTGCCATCA
CCATGTACTGAAACCAATTGTGAAGCCTGTTGTCTATCAAAGTTTGGAGCTCTCCATTGT
GACGGGGTGTGTGAAGTTGAAGGTACGGAAGAACACTGCCACTGCTATGGACAGCCATGA
AAATTTAATCAACCACCAAGCAAATATACGTGCAAAACATCTCGCTTTATCACTTTGTTT
GTAATTCACGTATCTGTGCATAAATAATAGATGGGGGAGTTGTTCCACTGCTCAAGCCTA
TTTATACATGTACTCTTGTGTTGTGTGCTCTTTTAATAAAATACATCTGATGTTTGTTTG
T

QA 1 481 1 481
DS 

RD RR2F608TF 481 0 0
AAAGCTTAAAGCCAAA*AAAAAGAAAAAGAAAAAGAAATTAAGCACGAGAAGAAATGGCA
AAGATATCCAACTTTGCATGCTTGACCACAACCGTTTTACTTGTCCTCTTGGTTGTTTCC
AATGGAATCCCGAAGAGCAACGCATGTCATACATTCTTAGGTGAATGCGATGTGCCATCA
CCATGTACTGAAACCAATTGTGAAGCCTGTTGTCTATCAAAGTTTGGAGCTCTCCATTGT
GACGGGGTGTGTGAAGTTGAAGGTACGGAAGAACACTGCCACTGCTATGGACAGCCATGA
AAATTTAATCAACCACCAAGCAAATATACGTGCAAAACATCTCGCTTTATCACTTTGTTT
GTAATTCACGTATCTGTGCATAAATAATAGATGGGGGAGTTGTTCCACTGCTCAAGCCTA
TTTATACATGTACTCTTGTGTTGTGTGCTCTTTTAATAAAATACATCTGATGTTTGTTTG
T

QA 1 481 1 481
DS 

RD RR2B293JQ 534 0 0
AAAGCTTAAAGCCAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAATTAAGCACGAGAAGAAATGGCA
AAGATAGCCAACTTTGCATGCTTGACCACAACCGTTTTACTTGTCCTCTTGGTTGTTTCC
AATGGAATCCCGAGGAGCAACGCATGTCATACATTCTTAGGTGAATGCGATGTGCCATCA
CCATGTACTGAAACCAATTGTGAAGCCTGTTGTCTATCAAAGTTTGGAGCTCTCCATTGT
GACGGGGTGTGTGAAGTTGAAGGTACGGAAGAACACTGCCACTGCTATGGACAGCCATGA
AAATTTAATCAACCACCAAGCAAATATACGTGCAAAACATCTCGCTTTATCACTTTGTTT
GTAATTCACGTATCTGTGCATAAATAATAGATGGGGGAGTTGTTCCACTGCTCAAGCCTA
TTTATACATGTACTCTTGTGTTGTGTGCTCTTTTAATAAAATACATCTGATGTTTGTTTG
TAACTTTGTATATCTTATCATTGATAAGTCCCAACTATCGATAATCTGTTTTCC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2B293TF 534 0 0
AAAGCTTAAAGCCAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAATTAAGCACGAGAAGAAATGGCA
AAGATAGCCAACTTTGCATGCTTGACCACAACCGTTTTACTTGTCCTCTTGGTTGTTTCC
AATGGAATCCCGAGGAGCAACGCATGTCATACATTCTTAGGTGAATGCGATGTGCCATCA
CCATGTACTGAAACCAATTGTGAAGCCTGTTGTCTATCAAAGTTTGGAGCTCTCCATTGT
GACGGGGTGTGTGAAGTTGAAGGTACGGAAGAACACTGCCACTGCTATGGACAGCCATGA
AAATTTAATCAACCACCAAGCAAATATACGTGCAAAACATCTCGCTTTATCACTTTGTTT
GTAATTCACGTATCTGTGCATAAATAATAGATGGGGGAGTTGTTCCACTGCTCAAGCCTA
TTTATACATGTACTCTTGTGTTGTGTGCTCTTTTAATAAAATACATCTGATGTTTGTTTG
TAACTTTGTATATCTTATCATTGATAAGTCCCAACTATCGATAATCTGTTTTCC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2CZ68TF 536 0 0
AAAGCTTAAAGCCAAAGAAAA*GAAAAAGAAAAAGAAATTAAGCACGAGAAGAAATGGCA
AAGATATCCAACTTTGCATGCTTGACCACAACCGTTTTACTTGTCCTCTTGGTTGTTTCC
AATGGAATCCCGAAGAGCAACGCATGTCATACATTCTTAGGTGAATGCGATGTGCCATCA
CCATGTACTGAAACCAATTGTGAAGCCTGTTGTCTATCAAAGTTTGGAGCTCTCCATTGT
GACGGGGTGTGTGAAGTTGAAGGTACGGAAGAACACTGCCACTGCTATGGACAGCCATGA
AAATTTAATCAACCACCAAGCAAATATACGTGCAAAACATCTCGCTTTATCACTTTGTTT
GTAATTCACATATCTGTGCATAAATAATAGATGGGGGAGTTGTTCCACTGCTCAAGCCTA
TTTATACATGTACTCTTGTGTTGTGTGCTCTTTTAATAAAATACATCTGATGTTTGTTTG
TAACTTTGTATATCTTATCATTGATAAGTCCCAACTATCGATAATCTGTTTTCCAG

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 5

CO CL1339Contig1 653 5 9 U
GGGCGATTAGGGAATCGAAGAAGAAGAAACAAACAACCAACAAAAGAAAGAAAAATGGCA
GATCAGCTAACCGATGACCAGATCTCCGAGTTTAAGGAAGCCTTCAGCCTTTTCGACAAG
GACGGAGATGGCTGCATCACGACAAAGGAGCTGGGGACAGTCATGAGATCGCTTGGTCAG
AACCCGACAGAAGCAGAGCTCCAGGACATGATCAACGAGGTTGACGCCGACGGAAACGGA
ACGATTGATTTCCCTGAGTTCTTGAACCTCATGGCCCGCAAGATGAAAGACACTGACTCC
GAGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTCTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCC
GCCGCTGAGCTCCGCCACGTCATGACTAACCTCGGTGAGAAGCTCACTGACGAGGAAGTT
GATGAGATGGTCCGTGAGGCTGACGTCGATGGTGATGGCCAGATCAACTATGATGAGTTC
GTCAAAGTTATGATGGCTAAGTGAGATTCTTCTTTTTTTTTT*ACAGATTTGCTTCCTTT
GTGTTTTGTTTT**CGTGATTCTGACCTTCGTTTTGCTTT*GCTTTTTATT*TTTATTTG
GGTGGTTTACTCTGATTCGTTTTTTTTTGTTTGAGACCTTTCCTACCGTGCCT


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B729JQ C 1
AF RR2FZ48TF U 3
AF RR2EZ89JQ C 131
AF RR2EZ89TF U 3
AF RR2B729TF U 1
BS 1 4 RR2B729JQ
BS 5 117 RR2FZ48TF
BS 118 119 RR2EZ89TF
BS 120 305 RR2FZ48TF
BS 306 306 RR2EZ89TF
BS 307 354 RR2FZ48TF
BS 355 355 RR2EZ89TF
BS 356 606 RR2FZ48TF
BS 607 653 RR2B729TF

RD RR2B729JQ 653 0 0
GGGCGATTAGGGAATCGAAGAAGAAGAAACAAACAACCAACAAAAGAAAGAAAAATGGCA
GATCAGCTAACCGATGACCAGATCTCCGAGTTTAAGGAAGCCTTCAGCCTTTTCGACAAG
GACGGAGATGGCTGCATCACGACAAAGGAGCTAGGCACTGTCATGAGATCGCTTGGTCAG
AACCCGACCGAAGCCGAGCTCCAGGACATGATCAACGAGGTTGACGCGGACGGCAACGGA
ACGATTGATTTCCCGGAGTTCTTGAACCTCATGGCCCGCAAGATGAAAGACACTGACTCC
GAGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTCTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCC
GCCGCTGAGCTCCGCCACGTCATGACTAACCTCGGTGAGAAGCTCACTGACGAGGAAGTT
GATGAGATGGTCCGTGAGGCTGACGTCGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTC
GTCAAAGTTATGATGGCTAAGTGAGATTCTTCTTTTTTTTT**ACAGATTTGCTTCCTTT
GTGTTTTGTTTTTTCTTGATTCTGACCTTCGCTTTGCTTTTGCTTTTTATTATTTATTTG
GGTTGGTTACTCTGATTCGTTTTTTTTTGTTTGAGACCTTTCCTACCGTGCCT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2FZ48TF 609 0 0
GG
GATTAGGGAATCGAAGAAGAAGAAACAAACAACCAACAAAAGAAAGAAAAATGGCAGATC
AGCTAACCGATGACCAGATCTCCGAGTTTAAGGAAGCCTTCAGCCTTTTCGAC**GGACG
GAGATGGCTGCATCACGACAAAGGAGCTGGGGACAGTCATGAGATCGCTTGGTCAGAACC
CGACAGAAGCAGAGCTCCAGGACATGATCAACGAGGTTGACGCCGACGGAAACGGAACGA
TTGATTTCCCTGAGTTCTTGAACCTCATGGCCCGCAAGATGAAAGACACTGACTCCGAGG
AGGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTCTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCGTCTCCGCCG
CTGAGCTCCGCCACGTCATGACTAACCTCGGTGAGAAGCTCACTGACGAGGAAGTTGATG
AGATGGTCCGTGAGGCTGACGTCGATGGTGATGGCCAGATCAACTATGATGAGTTCGTCA
AAGTTATGATGGCTAAGTGAGATTCTTCTTTTTTTTTT*ACAGATTTGCTTCCTTTGTGT
TTTGTTTT**CGTGATTCTGACCTTCGTTTTGCTTT*GCTTTTTATT*TTTATTTGGGTG
GT
TACTC

QA 3 604 3 604
DS 

RD RR2EZ89JQ 477 0 0
GCTGCATCACGACAAAGGAGCTGGGGACAGTCATGAGATCGCTTGGTCAGAACCCGACAG
AAGCAGAGCTCCAGGACATGATCAACGAGGTTGACGCCGACGGAAACGGAACGATTGATT
TCCCTGAGTTCTTGAACCTCATGGCCCGCAAGATGAAAGACACTGACTCCGAGGAAGAGC
TCAAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCCGCTGAGC
TCCGCCACATCATGACTAACCTCGGTGAGAAGCTCACTGACGAGGAAGTTGATGAGATGG
TCCGTGAGGCTGACGTCGATGGTGATGGCCAGATCAACTATGATGAGTTCGTCAAAGTTA
TGATGGCTAAGTGAGATTCTTCTTTTTTTTTTTACAGATTTGCTTCCTTTGTGTTTTGTT
TT**CGTGATTCTGACCTTCGTTTTGCTTT*GCTTTTTATT*TTTATTTGGGTGGT
C

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR2EZ89TF 605 0 0
GG
GATTAGGGAATCGAAGAAGAAGAAACAAACAACCAACAAAAGAAAGAAAAATGGCAGATC
AGCTAACCGATGACCAGATCTCCGAGTTTAAGGAAGCCTTCAGCCTTTTCGACAAGGACG
GAGATGGCTGCATCACGACAAAGGAGCTGGGGACAGTCATGAGATCGCTTGGTCAGAACC
CGACAGAAGCAGAGCTCCAGGACATGATCAACGAGGTTGACGCCGACGGAAACGGAACGA
TTGATTTCCCTGAGTTCTTGAACCTCATGGCCCGCAAGATGAAAGACACTGACTCCGAGG
AAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTCTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCCG
CTGAGCTCCGCCACATCATGACTAACCTCGGTGAGAAGCTCACTGACGAGGAAGTTGATG
AGATGGTCCGTGAGGCTGACGTCGATGGTGATGGCCAGATCAACTATGATGAGTTCGTCA
AAGTTATGATGGCTAAGTGAGATTCTTCTTTTTTTTTTTACAGATTTGCTTCCTTTGTGT
TTTGTTTT**CGTGATTCTGACCTTCGTTTTGCTTT*GCTTTTTATT*TTTATTTGGGTG
GT
C

QA 3 604 3 604
DS 

RD RR2B729TF 653 0 0
GGGC
GATTAGGGAATCGAAGAAGAAGAAACAAACAACCAACAAAAGAAAGAAAAATGGCAGATC
AGCTAACCGATGACCAGATCTCCGAGTTTAAGGAAGCCTTCAGCCTTTTCGACAAGGACG
GAGATGGCTGCATCACGACAAAGGAGCTAGGCACTGTCATGAGATCGCTTGGTCAGAACC
CGACCGAAGCCGAGCTCCAGGACATGATCAACGAGGTTGACGCGGACGGCAACGGAACGA
TTGATTTCCCGGAGTTCTTGAACCTCATGGCCCGCAAGATGAAAGACACTGACTCCGAGG
AAGAGCTCAAGGAAGCCTTCAGGGTCTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCCG
CTGAGCTCCGCCACGTCATGACTAACCTCGGTGAGAAGCTCACTGACGAGGAAGTTGATG
AGATGGTCCGTGAGGCTGACGTCGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTCA
AAGTTATGATGGCTAAGTGAGATTCTTCTTTTTTTTT**ACAGATTTGCTTCCTTTGTGT
TTTGTTTTTTCTTGATTCTGACCTTCGCTTTGCTTTTGCTTTTTATTATTTATTTGGGTT
GGTTACTCTGATTCGTTTTTTTTTGTTTGAGACCTTTCCTACCGTGCCT

QA 5 653 5 653
DS 



AS 1 3

CO CL1340Contig1 1043 3 9 U
GGGAAGAAGCAGCGTGTTCAAAAATGGGTGTTCAGAAACTGTCAACCGCCGATAACATGA
GGACAGAGGAGAAAGAACAATGGCGACCAGAATTGGTGCACAAGATGCTAATGGTTGTAT
TTCCCTATCCTCACTCATTGTACGAGCTCCTATCCATGTCGGGAGTTACTCCGGCGTTTA
GAAACGCCATTAGAGAACAAACCCTTTTATGGAAAAAGGTGGTTGTTGAACAACCCTTGA
GTTCTCGTCTAACCGACGATATTCTATGGGAGTTCACTTCAAAATCCGCGGGAAAGTTGA
ACACGTTGATTCTCCGAAAATGTAGTAGAGTCACCAACAAAGGGCTTCGCCGTGTGGTTG
ACGCAAACCCTTTGATTAAAAAGTTGATTGTGACGGGATGCACGGAGTTATCTCCAGAAG
TAATCATTGCATGTGTTGAAAGCTTGACGAAGAACAATCATAAGTTGGAGACACTTCACA
TCAATGGCGTCCCTGGCTTCACTATAGACCATCTCTCAGCACTTTCGACTTACCTTCCTC
AAGAGGGAGCAATCGACCTCGAGGTGTGTCCCAAATGCGACCAAGTCAGGATGATTCCTC
CTTGCTCAAGAGAATCATGTAAACGTGAGGGAAGCAACGAACGGGAGTGCAGGGGATACT
GGTATTGCGTCACTAGATGCATGGAGTGTGCAGTGTGTCTCGGAC*AGACAATGAG*CTG
A*GAAGCAGCGTGTGGGGGAGAGGTTTTGTGTCTTGAATGTTTCCAAGCGCTTCCAAAGT
GCAGGTTTTGCAACAAACCCTACTGCACAAGTCACAGCAGCCTGCGACAAGAGAACACAG
CGACGGATTCGGCTATGTTTGCATGCCAAGCTTGTCACTACATGACAGGAACAAGCGCAA
GTGAGCCCCTCGAGTATCAATTCTAGAAACACTTGTCGTTTTAAAGCGAAGCTTGTTACT
AAGCCGATAAGAAGATGTGAACTTGCATATCTAAAAACATTTGTTGTTCTTTTTATATGA
AAACTGTTGATTGTGTAAAATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ82TF U 1
AF RR2GV44TF U 1
AF RR2GJ82JQB C 319
BS 1 54 RR2GJ82TF
BS 55 55 RR2GV44TF
BS 56 129 RR2GJ82TF
BS 130 130 RR2GV44TF
BS 131 733 RR2GJ82TF
BS 734 734 RR2GV44TF
BS 735 739 RR2GJ82TF
BS 740 757 RR2GV44TF
BS 758 1043 RR2GJ82JQB

RD RR2GJ82TF 744 0 0
GGGAAGAAGCAGCGTGTTCAAAAATGGGTGTTCAGAAACTGTCAACCGCCGATAGCATGA
GGACAGAGGAGAAAGAACAATGGCGACCAGAATTGGTGCACAAGATGCTAATGGTTGTAT
TTCCCTATCTTCACTCATTGTACGAGCTCCTATCCATGTCGGGAGTTACTCCGGCGTTTA
GAAACGCCATTAGAGAACAAACCCTTTTATGGAAAAAGGTGGTTGTTGAACAACCCTTGA
GTTCTCGTCTAACCGACGATATTCTATGGGAGTTCACTTCAAAATCCGCGGGAAAGTTGA
ACACGTTGATTCTCCGAAAATGTAGTAGAGTCACCAACAAAGGGCTTCGCCGTGTGGTTG
ACGCAAACCCTTTGATTAAAAAGTTGATTGTGACGGGATGCACGGAGTTATCTCCAGAAG
TAATCATTGCATGTGTTGAAAGCTTGACGAAGAACAATCATAAGTTGGAGACACTTCACA
TCAATGGCGTCCCTGGCTTCACTATAGACCATCTCTCAGCACTTTCGACTTACCTTCCTC
AAGAGGGAGCAATCGACCTCGAGGTGTGTCCCAAATGCGACCAAGTCAGGATGATTCCTC
CTTGCTCAAGAGAATCATGTAAACGTGAGGGAAGCAACGAACGGGAGTGCAGGGGATACT
GGTATTGCGTCACTAGATGCATGGAGTGTGCAGTGTGTCTCGGAC*AGACAATGAG*CTG
A*GAAGCAGCGTGGGGGGG
GAGAG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2GV44TF 769 0 0
GGGAAGAAGCAGCGTGTTCAAAAATGGGTGTTCAGAAACTGTCAACCGCCGATAACATGA
GGACAGAGGAGAAAGAACAATGGCGACCAGAATTGGTGCACAAGATGCTAATGGTTGTAT
TTCCCTATCCTCACTCATTGTACGAGCTCCTATCCATGTCGGGAGTTGCTCCGGCGTTTA
GAAACGCCATTAGAGAACAAACCCTTTTATGGAAAAAGGTGGTTGTTGAACAACCCTTGA
GTTCTCGTCTAACCGACGATATTCTATGGGAGTTCACTTCAAAATCCGCGGGAAAGTTGA
ACACGTTGATTCTCCGAAAATGTAGTAGAGTCACCAACAAAGGGCTTCGCCGTGTGGTTG
ACGCAAACCCTTTGATTAAAAAGTTGATTGTGACGGGATGCACGGAGTTATCTCCAGAAG
TAATCATTGCATGTGTTGAAAGCTTGACGAAGAACAATCATAAGTTGGAGACACTTCACA
TCAATGGCGTCCCTGGCTTCACTATAGACCATCTCTCAGCACTTTCGACTTACCTTCCTC
AAGAGGGAGCAATCGACCTCGAGGTGTGTCCCAAATGCGACCAAGTCAGGATGATTCCTC
CTTGCTCAAGAGAATCATGTAAACGTGAGGGAAGCAACGAACGGGAGTGCAGGG*ATGCT
GGTATTGCGTCACTAGATGCATGGAGTGTGCAGTGTGTCTCGGAC*AGACAATGAG*CTG
A*GAAGCAGCGTGTGGGGGAGAGGTTTTGTGTCTTGA
TGTTTCCAGCGC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2GJ82JQB 725 0 0
AATGTAGTAGAGTCACCAACAAAGGGCTTCGCCGTGTGGTTGACGCAAACCCTTTGATTA
AAAAGTTGATTGTGACGGGATGCACGGAGTTATCTCCAGAAGTAATCATTGCATGTGTTG
AAAGCTTGACGAAGAACAATCATAAGTTGGAGACACTTCACATCAATGGCGTCCCTGGCT
TCACTATAGACCATCTCTCAGCACTTTCGACTTACCTTCCTCAAGAGGGAGCAATCGACC
TCGAGGTGTGTCCCAAATGCGACCAAGTCAGGATGATTCCTCCTTGCTCAAGAGAATCAT
GTAAACGTGAGGGAAGCAACGAACGGGAGTGCAGGGGATACTGGTATTGCGTCACTAGAT
GCATGGAGTGTGCAGTGTGTCTCGGACCAGACAATGAGGCTGAAGAAGCAGCGTGTGGGG
GAGAGGTTTTGTGTCTTGAATGTTTCCAAGCGCTTCCAAAGTGCAGGTTTTGCAACAAAC
CCTACTGCACAAGTCACAGCAGCCTGCGACAAGAGAACACAGCGACGGATTCGGCTATGT
TTGCATGCCAAGCTTGTCACTACATGACAGGAACAAGCGCAAGTGAGCCCCTCGAGTATC
AATTCTAGAAACACTTGTCGTTTTAAAGCGAAGCTTGTTACTAAGCCGATAAGAAGATGT
GAACTTGCATATCTAAAAACATTTGTTGTTCTTTTTATATGAAAACTGTTGATTGTGTAA
AATCC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 4

CO CL1341Contig1 986 4 8 U
GGGAGTCGAGTCGCTTCTGGGAAATTGATTCTTAAGGAACGACGATGGCGTTGTCCGCTT
TGAATCAGCTCTATCTTACCCTCGCGGATAAACCCGAGCAGGAGAAGATAACGGCGGAAG
AGATGAGTGTGATTGCCTCTTGCCATATCAAAGTTCTGTGGACTGCTGGCTTTGCCTCTG
GTCTAGCTGGTGGTTTAGGTTGGCAAGTGGCGAAAAAGATGAAAATGCTGAAGCTTCCTC
TTACAGTTTTACCTGCTGTGGCGGCTTTTACTGCTGCTTGGGATTGGTCAAACTCCACTA
CTGCTGTTCCATGCCTTGATAATATTCTTAGGCAAGATGCTACACGTATGCAGAGAGAGC
TTGTCAATGTCTTAGTTAAGTACAACAGAGGTGAAGCTTGGAGATGGCAGCTTATGTCCA
AGCATTTCTACCCTGAAGCTGTTTACAACGATCAAGGAGAGAAACCTCAGATGCGCTGGC
GTAAGAGGAGAACTTTCACTGAAATTCCCGCTTCTTATGATGATGATGATGGTGTAGATG
ATGCCAAACCTCAGAGAACCAACAACACTAATGCTTCAAAGACTAAACCAGTGCTCCAAA
ATGCCTCTGGAAATTCGGATGGCGAAATGGCGGATGAAGAAGAAGATGCTCTTGACCGTG
TATTTGGTGGTTCAGAACCAACAGAGAGCGTTCCTGCTGCGCCGGTTAATGCGAAAGCTT
CAAGCAAAGCGCAAACTCGCAAACAGAAGAGAGCTCAACGAAGACAGAGACGGAAAAACC
GTGAAGAAGCTTCCATTAATAATAGTACTCCTCAGTACGAACGTGCTTAAGACGAGACAA
AACAAGAATGCTTTGGACTGCTTGATGATTTTCACTTTTGTTGACTTTCTGTAAGCTCCA
TTAACTTATACTCCATCTGTACCATTTTAAGTGATGTTTAAGGTTTTTACACAATTATTA
AGAAAATACAAATTTTTATGCACTTT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 15 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H634TF U 1
AF RR2EV71TF U 1
AF RR2EV71JQ C 260
AF RR2BK31JQ C 258
BS 1 77 RR2EV71TF
BS 78 78 RR2H634TF
BS 79 704 RR2EV71TF
BS 705 705 RR2BK31JQ
BS 706 739 RR2EV71TF
BS 740 794 RR2BK31JQ
BS 795 795 RR2EV71JQ
BS 796 986 RR2BK31JQ

RD RR2H634TF 671 0 0
GGGA
GTCGAGTCGCTTCTGGGAAATTGATTCTTAAGGAACGACGATGGCGTTGTCCGCTTTGAA
TCAGCTCTATCTTACCCTCGCGGATAAACCCGAGCAGGAGAAGATAACGGCGGAAGAGAT
GAGTGTGATTGCCTCTTGCCATATCAAAGTTCTGTGGACTGCTGGCTTTGCCTCTGGTCT
AGCTGGTGGTTTAGGTTGGCAAGTGGCGAAAAAGATGAAAATGCTGAAGCTTCCTCTTAC
AGTTTTACCTGCTGTGGCGGCTTTTACTGCTGCTTGGGATTGGTCAAACTCCACTACTGC
TGTTTCATGCCTTGATAATATTCTTAGGCAAGATGCTACACGTATGCAGAGAGAGCTTGT
CAATGTCTTAGTTAAGTACAACAGAGGTGAAGCTTGGAGATGGCAGCTTATGTCCAAGCA
TTTCTACCCTGAAGCTGTTTACAACGATCAAGGAGAGAAACCTCAGATGCGCTGGCGTAA
GAGGAGAACTTTCACTGAAATTCCCGCTTCTTATGATGATGAGGATGATGTAGATGATGC
CAAACCTCAGAGAACCAACAACACTAATGCTTCAAAGACTAAACCAGTGCCCCAAAATGC
CTCTGGAAATTCGGATGGCGAAATGGCGGATGAAGAAGAAGATGCTCTTGACTGTGTATT
TGGTGGT

QA 5 671 5 671
DS 

RD RR2EV71TF 739 0 0
GGGAGTCGAGTCGCTTCTGGGAAATTGATTCTTAAGGAACGACGATGGCGTTGTCCGCTT
TGAATCAGCTCTATCTTGCCCTCGCGGATAAACCCGAGCAGGAGAAGATAACGGCGGAAG
AGATGAGTGTGATTGCCTCTTGCCATATCAAAGTTCTGTGGACTGCTGGCTTTGCCTCTG
GTCTAGCTGGTGGTTTAGGTTGGCAAGTGGCGAAAAAGATGAAAATGCTGAAGCTTCCTC
TTACAGTTTTACCTGCTGTGGCGGCTTTTACTGCTGCTTGGGATTGGTCAAACTCCACTA
CTGCTGTTCCATGCCTTGATAATATTCTTAGGCAAGATGCTACACGTATGCAGAGAGAGC
TTGTCAATGTCTTAGTTAAGTACAACAGAGGTGAAGCTTGGAGATGGCAGCTTATGTCCA
AGCATTTCTACCCTGAAGCTGTTTACAACGATCAAGGAGAGAAACCTCAGATGCGCTGGC
GTAAGAGGAGAACTTTCACTGAAATTCCCGCTTCTTATGATGATGATGATGGTGTAGATG
ATGCCAAACCTCAGAGAACCAACAACACTAATGCTTCAAAGACTAAACCAGTGCTCCAAA
ATGCCTCTGGAAATTCGGATGGCGAAATGGCGGATGAAGAAGAAGATGCTCTTGACCGTG
TATTTGGTGGTTCAGAACCAACAGAGAGCGTTCCTGCTGCGCCG*TTAATGCGAAAGCTT
CAAGCAAAGCGCAAACTCG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2EV71JQ 618 0 0
GGCGGCTTTTACTGCTGCTTGGGATTGGTCAAACTCCACTACTGCTGTTCCATGCCTTGA
TAATATTCTTAGGCAAGATGCTACACGTATGCAGAGAGAGCTTGTCAATGTCTTAGTTAA
GTACAACAGAGGTGAAGCTTGGAGATGGCAGCTTATGTCCAAGCATTTCTACCCTGAAGC
TGTTTACAACGATCAAGGAGAGAAACCTCAGATGCGCTGGCGTAAGAGGAGAACTTTCAC
TGAAATTCCCGCTTCTTATGATGATGATGATGGTGTAGATGATGCCAAACCTCAGAGAAC
CAACAACACTAATGCTTCAAAGACTAAACCAGTGCTCCAAAATGCCTCTGGAAATTCGGA
TGGCGAAATGGCGGATGAAGAAGAAGATGCTCTTGACCGTGTATTTGGTGGTTCAGAACC
AACAGAGAGCGTTCCTGCTGCGCCGGTTAATGCGAAAGCTTCAAGCAAAGCGCAAACTCG
CAAACAGAAGAGAGCTCAACGAAGACAGAGACGGAAAAACCGTGAAGAAGCTTCCATTAA
TAATAGTACTCCTCAGTATGAACGTGCTTAAGACGAGACTAAACAAGAATGCTTTGTACT
GCTTGATGATTTTCACTT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2BK31JQ 729 0 0
GTGGCGGCTTTTACTGCTGCTTGGGATTGGTCAAACTCCACTACTGCTGTTTCATGCCTT
GATAATATTCTTAGGCAAGATGCTACACGTATGCAGAGAGAGCTGGTCAATGTTTTAGCC
AAGTACAACAGAGGTGAAGCTTGGAGATGGCAGCTTATGTCCAAGCATTTCTACCCTGAA
GCTGTTTACAACGATCAAGGAGAGAAACCTCAGATGCGCTGGCGTAAGAGGAGAACTTTC
ACTGAAATCCCCGCTTCTTATGATGATGATGATG***TAGATGATGCCAAACCTCAGAGA
ACCAACAACACTGATGCTTCAAAGACTAAACCACTGCTCCAAAATGCCTCTGGAAATTCG
GATGGCGAAATGGCGGATGAAGAAGAAGATGCTCTTGACAGTGTATTTGGTGGTTCAGAA
CCAACAGAGAGTGTTCCTGCTGCGCCGGTTAATGCGAAAGCTTCAAGCAAAGCGCAAACT
CGCAAACAGAAGAGAGCTCAACGAAGACAGAGACGGAAAAACCGTGAAGAAGCTTCCGTT
AATAATAGTACTCCTCAGTACGAACGTGCTTAAGACGAGACAAAACAAGAATGCTTTGGA
CTGCTTGATGATTTTCACTTTTGTTGACTTTCTGTAAGCTCCATTAACTTATACTCCATC
TGTACCATTTTAAGTGATGTTTAAGGTTTTTACACAATTATTAAGAAAATACAAATTTTT
ATGCACTTT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 2 6

CO CL1342Contig1 856 2 10 U
GGTCTCTGTTTGTTTCGTTTACTCGCGCGCTTCCGAGCTCCGATTTTGGCAGAGAAGGAG
AAGAAGGAGAAATGGGCTCACGACAAGGACCACCGAAGCGTCAGAACAAATTCGCATGGG
TACCCAACGCCGGCGTGAAGATCAACGAAACCGAAGTGGGCGGGAGATTCAGACCGCTCT
CGGAGATAACCGGAGTTTGCCTTCGCTGTCGGGAGCAGATCGCTTGGAAACGCAAATACG
GAAAATACAAAAAGCTAACCGAACCCGCCAAATGTCAGAAGTGTACGAAGCGTAATGTTC
GTCAAGCGTATCACAAGTTATGCTCTGGTTGTGCCAAGGAGCAGAAAGTGTGTGCCAAGT
GTTATTCTTCTACTGAGCAAATCATGGGAAGAGATATTTATGAGGTAGAGGCTGAGCAGA
AGCTGCTTGATGAGACTATCAAGAATGCTAGGGAAAGAGATAGAAGGACGCTTTTGCGTG
CTATGAACAAAGATAACAACCCAAAGAAATCAGATGAAGGAGCAGCAACAAGGAGCGATA
GCAGCAAGGTTGGTGATGTGTTTCCATCCACATCTCTTGAAGAATATGCAAACAAGTCTG
GAAAAGTTAGCGGGATTGTTGGTCATGGTAGTGTGCCTGATCATGGCCATGTTGTCGAGG
ATGAAGAAGAAGATGATGATGTTGGTAGTGAACCTGAATTAGATGAAGATCACTGTGGTG
ATGATGATGATGATGATGATGAACTCCAGAAGTGAATGTAACTTTGGTTGTTAGTTCTGT
CAATTTTGATAGGCTTGTGAGATTTTACAAAACTGATTATCCTTCTTGTTTTAATACACT
TCACTCTGTTATGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV08TF U 1
AF RR2BV08JQ C 36
BS 1 670 RR2BV08TF
BS 671 671 RR2BV08JQ
BS 672 691 RR2BV08TF
BS 692 692 RR2BV08JQ
BS 693 697 RR2BV08TF
BS 698 698 RR2BV08JQ
BS 699 706 RR2BV08TF
BS 707 707 RR2BV08JQ
BS 708 750 RR2BV08TF
BS 751 856 RR2BV08JQ

RD RR2BV08TF 756 0 0
GGTCTCTGTTTGTTTCGTTTACTCGCGCGCTTCCGAGCTCCGATTTTGGCAGAGAAGGAG
AAGAAGGAGAAATGGGCTCACGACAAGGACCACCGAAGCGTCAGAACAAATTCGCATGGG
TACCCAACGCCGGCGTGAAGATCAACGAAACCGAAGTGGGCGGGAGATTCAGACCGCTCT
CGGAGATAACCGGAGTTTGCCTTCGCTGTCGGGAGCAGATCGCTTGGAAACGCAAATACG
GAAAATACAAAAAGCTAACCGAACCCGCCAAATGTCAGAAGTGTACGAAGCGTAATGTTC
GTCAAGCGTATCACAAGTTATGCTCTGGTTGTGCCAAGGAGCAGAAAGTGTGTGCCAAGT
GTTATTCTTCTACTGAGCAAATCATGGGAAGAGATATTTATGAGGTAGAGGCTGAGCAGA
AGCTGCTTGATGAGACTATCAAGAATGCTAGGGAAAGAGATAGAAGGACGCTTTTGCGTG
CTATGAACAAAGATAACAACCCAAAGAAATCAGATGAAGGAGCAGCAACAAGGAGCGATA
GCAGCAAGGTTGGTGATGTGTTTCCATCCACATCTCTTGAAGAATATGCAAACAAGTCTG
GAAAAGTTAGCGGGATTGTTGGTCATGGTAGTGTGCCTGATCATGGCCATGTTGTCGAGG
ATGAAGAAGA*GATGATGATGTTGGTAGTGA*CCTGA*TTAGATGA*GATCACTGTGGTG
ATGATGATGATGATGATGATGAACTCCAGA
GTGATG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2BV08JQ 821 0 0
AGCTCCGATTTTGGCAGAGAAGGAGAAGAAGGAGAAATGGGCTCACGACAAGGACCAC*G
AAGCGTCAGAACAAATTCGCATGGGTACCCAACGCCGGCGTGAAGATCAACGAAACCGAA
GTGGGCGGGAGATTCAGACCGCTCTCGGAGATAACCGGAGTTTGCCTTCGCTGTCGGGAG
CAGATCGCTTGGAAACGCAAATACGGAAAATACAAAAAGCTAACCGAACCCGCCAAATGT
CAGAAGTGTACGAAGCGTAATGTTCGTCAAGCGTATCACAAGTTATGCTCTGGTTGTGCC
AAGGAGCAGAAAGTGTGTGCCAAGTGTTATTCTTCTACTGAGCAAATCATGGGAAGAGAT
ATTTATGAGGTAGAGGCTGAGCAGAAGCTGCTTGATGAGACTATCAAGAATGCTAGGGAA
AGAGATAGAAGGACGCTTTTGCGTGCTATGAACAAAGATAACAACCCAAAGAAATCAGAT
GAAGGAGCAGCAACAAGGAGCGATAGCAGCAAGGTTGGTGATGTGTTTCCATCCACATCT
CTTGAAGAATATGCAAACAAGTCTGGAAAAGTTAGCGGGATTGTTGGTCATGGTAGTGTG
CCTGATCATGGCCATGTTGTCGAGGATGAAGAAGAAGATGATGATGTTGGTAGTGAACCT
GAATTAGATGAAGATCACTGTGGTGATGATGATGATGATGATGATGAACTCCAGAAGTGA
ATGTAACTTTGGTTGTTAGTTCTGTCAATTTTGATAGGCTTGTGAGATTTTACAAAACTG
ATTATCCTTCTTGTTTTAATACACTTCACTCTGTTATGGCG

QA 1 821 1 821
DS 



CO CL1342Contig2 928 4 13 U
GGAATGGTTTCTTCTTCTTCCTCTTTTGGCTCGCCGTCTTACTGATTGAATCATTTACTC
TGTTTCGTTTTCTCGCGCGCTTCCGAGCTCCGATTTTGGTAAAGAAGGAGAAGAAGGAGA
GATGGGCTCACGACAAGGACCACCGAAGCATCAGAACAAATTCGCATGGGTACCCAACGC
CGGCGTGAAGATCAACGAAACCGAAGTGGGCGGGAGATTCAGACCGCTCTCGGAGATAAC
CGGAGTTTGCCTTCGCTGTCGGGAGCAGATCGCTTGGAAACGCAAATACGGCAAATACAA
AAAGCTAACCGAACCCGCCAAATGTCAGAAGTGTACGAAGCGTAATGTTCGTCAAGCGTA
TCACAAGTTATGCTCTGGTTGTGCCAAGGAGCAGAAAGTGTGTGCCAAGTGTTATTCTTC
TACTGAGCAAATCATGGGAAGAGATATTTATGAGGTAGAGGCTGAACAGAAGATGCTTGA
TGAGACTATCAAGAATGCTAGGGAAAGAGATAGAAGGACGCTTTTGCGTGCTATGAACAA
AGATAACAACCCAAAGAAATCAGATGAAGGAGCAGCAACAAGGAGCGATAGCAGCAAGGT
TGGGTGATGTGTTTCCATCCACATCTCTTGAAGAATATGCAAACAAGTCTGGAAAAGTTA
GCGGG*ATTGTTGGTCATGG*TAGTGTGCCTGATCATGGCCATGTTGTTGAGGACGAAGA
AGAAGATGATGATGATG***TTGGTAGTGAACCTGAATTAGATGAAGATCACTGTGGTGA
TGATGATGATGATGAACTCCAGAAGTGAATGTAACTTTGGTTGTTAGTTCTGTCAATTTT
GATAGGCTTGTGAGATTTTACAAAACTGATTATCCTTCTTGTTTTAATACACTTCACTCT
GTTATGGCTATAAAGTATTGGGCTGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2HA92TF U 1
AF RR2B318TF U 31
AF RR2B318JQ C 148
AF RR2HA92JQ C 192
BS 1 512 RR2HA92TF
BS 513 513 RR2B318TF
BS 514 598 RR2HA92TF
BS 599 599 RR2B318TF
BS 600 655 RR2HA92TF
BS 656 656 RR2B318TF
BS 657 658 RR2HA92TF
BS 659 659 RR2B318JQ
BS 660 699 RR2HA92TF
BS 700 820 RR2B318TF
BS 821 862 RR2B318JQ
BS 863 863 RR2HA92JQ
BS 864 928 RR2B318JQ

RD RR2HA92TF 699 0 0
GGAATGGTTTCTTCTTCTTCCTCTTTTGGCTCGCCGTCTTACTGATTGAATCATTTACTC
TGTTTCGTTTTCTCGCGCGCTTCCGAGCTCCGATTTTGGTAAAGAAGGAGAAGAAGGAGA
GATGGGCTCACGACAAGGACCACCGAAGCATCAGAACAAATTCGCATGGGTACCCAACGC
CGGCGTGAAGATCAACGAAACCGAAGTGGGCGGGAGATTCAGACCGCTCTCGGAGATAAC
CGGAGTTTGCCTTCGCTGTCGGGAGCAGATCGCTTGGAAACGCAAATACGGCAAATACAA
AAAGCTAACCGAACCCGCCAAATGTCAGAAGTGTACGAAGCGTAATGTTCGTCAAGCGTA
TCACAAGTTATGCTCTGGTTGTGCCAAGGAGCAGAAAGTGTGTGCCAAGTGTTATTCTTC
TACTGAGCAAATCATGGGAAGAGATATTTATGAGGTAGAGGCTGAACAGAAGATGCTTGA
TGAGACTATCAAGAATGCTAGGGAAAGAGATATAAGGACGCTTTTGCGTGCTATGAACAA
AGATAACAACCCAAAGAAATCAGATGAAGGAGCAGCAACAAGGAGCGATAGCAGCAAG*T
TGGGTGATGTGTTTCCATCCACATCTCTTGAAGAATATGCAAACAAGTCTGGAAA*GT*A
GCGGG*ATTGTTGGTCATGG*TAGTGTGCCTGATCATGG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2B318TF 795 0 0
GG
GCCGTCTTACTGATTGAATCATTTACTCTGTTTCGTTTTCTCGCGCGCTTCCGAGCTCCG
ATTTTGGTAAAGAAGGAGAAGAAGGAGAGATGGGCTCACGACAAGGACCACCGAAGCATC
AGAACAAATTCGCATGGGTACCCAACGCCGGCGTGAAGATCAACGAAACCGAAGTGGGCG
GGAGATTCAGACCGCTCTCGGAGATAACCGGAGTTTGCCTTCGCTGTCGGGAGCAGATCG
CTTGGAAACGCAAATACGGCAAATACAAAAAGCTAACCGAACCCGCCAAATGTCAGAAGT
GTACGAAGCGTAATGTTCGTCAAGCGTATCACAAGTTATGCTCTGGTTGTGCCAAGGAGC
AGAAAGTGTGTGCCAAGTGTTATTCTTCTACTGAGCAAATCATGGGAAGAGATATTTATG
AGGTAGAGGCTGAACAGAAGATGCTTGATGAGACTATCAAGAATGCTAGGGAAAGAGATA
GAAGGACGCTTTTGCGTGCTATGAACAAAGATAACAACCCAAAGAAATCAGATGAAGGAG
CAGCAACAAGGAGCGATAGCAGCAAGGTTGGGTGATGTGTTTCCATCCACATCTCTTGAA
GAATATGCAAACAAGTCTGGAAAAGT*AGCGGGGATTGTTGGTCGTGGGTAGTGTGCCTG
ATCATGGCCATGTTGTTGAGGACGAAGAAGAAGATGATGATGATG***TTGGTAGTGAAC
CTGAATTAGATGAAGATCACTGTGGTGATGATGATGATGATGAACTCCAGAAGTGAATGT
AACTTTGG
GTTGT

QA 3 790 3 790
DS 

RD RR2B318JQ 781 0 0
GCA
TCAGAACAAATTCGCATGGGTACCCAACGCCGGCGTGAAGATCAACGAAACCGAAGTGGG
CGGGAGATTCAGACCGCTCTCGGAGATAACCGGAGTTTGCCTTCGCTGTCGGGAGCAGAT
CGCTTGGAAACGCAAATACGGCAAATACAAAAAGCTAACCGAACCCGCCAAATGTCAGAA
GTGTACGAAGCGTAATGTTCGTCAAGCGTATCACAAGTTATGCTCTGGTTGTGCCAAGGA
GCAGAAAGTGTGTGCCAAGTGTTATTCTTCTACTGAGCAAATCATGGGAAGAGATATTTA
TGAGGTAGAGGCTGAACAGAAGATGCTTGATGAGACTATCAAGAATGCTAGGGAAAGAGA
TAGAAGGACGCTTTTGCGTGCTATGAACAAAGATAACAACCCAAAGAAATCAGATGAAGG
AGCAGCAACAAGGAGCGATAGCAGCAAGGTTGG*TGATGTGTTTCCATCCACATCTCTTG
AAGAATATGCAAACAAGTCTGGAAAAGTTAGCGGG*ATTGTTGGTCGTGG*TAGTGTGCC
TGATCATGGCCATGTTGTTGAGGACGAAGAAGAAGATGATGATGATG***TTGGTAGTGA
ACCTGAATTAGATGAAGATCACTGTGGTGATGATGATGATGATGAACTCCAGAAGTGAAT
GTAACTTTGGTTGTTAGTTCTGTCAATTTTGATAGGCTTGTGAGATTTTACAGAACTGAT
TATCCTTCTTGTTTTAATACACTTCACTCTGTTATGGCTATAAAGTATTGGGCTGAAC

QA 4 781 4 781
DS 

RD RR2HA92JQ 732 0 0
TCAACGAAACCGAAGTGGGCGGGAGATTCAGACCGCTCTCGGAGATAACCGGAGTTTGCC
TTCGCTGTCGGGAGCAGATCGCTTGGAAACGCAAATACGGCAAATACAAAAAGCTAACCG
AACCCGCCAAATGTCAGAAGTGTACGAAGCGTAATGTTCGTCAAGCGTATCACAAGTTAT
GCTCTGGTTGTGCCAAGGAGCAGAAAGTGTGTGCCAAGTGTTATTCTTCTACTGAGCAAA
TCATGGGAAGAGATATTTATGAGGTAGAGGCTGAACAGAAGATGCTTGATGAGACTATCA
AGAATGCTAGGGAAAGAGATATAAGGACGCTTTTGCGTGCTATGAACAAAGATAACAACC
CAAAGAAATCAGATGAAGGAGCAGCAACAAGGAGCGATAGCAGCAAGGTTGG*TGATGTG
TTTCCATCCACATCTCTTGAAGAATATGCAAACAAGTCTGGAAAAGTTAGCGGG*ATTGT
TGGTCATGG*TAGTGTGCCTGATCATGGCCATGTTGTTGAGGATGAAGAAGAAGATGATG
ATGATGATGTTGGTAGTGAACCTGAATTAGATGAAGATCACTGTGGTGATGATGATGATG
ATGAACTCCAGAAGTGAATGTAACTTTGGTTGTTAGTTCTGTCAATTTTGATAGGCTTGT
GAGATTTTACAAAATTGATTATCCTTCTTGTTTTAATACACTTCACTCTGTTATGGCTAT
AAAGTATTGGGC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 2 6

CO CL1343Contig1 810 4 27 U
GGGTATCGGAAGCTCTCTCTCCTTCCTCCGGACCCGTTCCTTTCCGATCCTTTTTTTTTG
TCTCCGTCCATAGGAGAACACACGATCATGATCACTCCAATCAAACTAGCCTTTCTCCTC
TTAACCCTCACAGCAACTGCAACCGCTGCACCCAAAGCCAAACGCAGGAACTACCTTTTC
ACACCGCATGCAAAAGCAGTCGCGGGAATATGCACCGTCGTCGTAACAAACACAAGTCTA
TGCTGCAAAACCCTTAAACACGTTCCCACCAATGACCCCATCGAATTGATCCAAGCGTTA
GCGGCTGCGACTGAATCTTCCGTGAAGAGAAGTGTAACTTTCCTCTCCGAGATCAAACCA
AAACACAAATCGAACGCAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGCCAGAAAAACTTGAAC
TACGCGTTGGAAGATTTCGCCGAGTTTTGGAACGCTACGGGGAAAGATGTAACGACGTTG
GCTCATAACTATTTCACGTGTAAGAAGACGTTGATGTCGATCATGGGGTATCACTGGACT
TGTTTGGATGATATTGATGATAAGAATCTGTTGAAGGAAGTGGAGACTGGGATCAGTGTT
GGGAAGAATCTAAGCAGTAATACGTTTGATGTGTTCAATGGTTTGAAAACTATTTTTAAG
ACGTTTGGTATTAAG*TGAAGCTTAACGAGGAAGACACTTCGCCCCAACCCCCACCATTG
TCGAATTATTACTTCTGATTAAATGATCTGGATGTAATAATTGATTAATATCATCGTATA
ATGCCTAAAGCGTCGTGTATGGTGTATGTT


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D795TF U 3
AF RR2H233TF U 1
AF RR2DK07TF U 1
AF RR2B139TF U 1
BS 1 56 RR2B139TF
BS 57 59 RR2H233TF
BS 60 207 RR2B139TF
BS 208 208 RR2H233TF
BS 209 266 RR2B139TF
BS 267 267 RR2H233TF
BS 268 292 RR2B139TF
BS 293 293 RR2H233TF
BS 294 295 RR2B139TF
BS 296 296 RR2H233TF
BS 297 308 RR2B139TF
BS 309 309 RR2H233TF
BS 310 312 RR2B139TF
BS 313 313 RR2H233TF
BS 314 326 RR2B139TF
BS 327 327 RR2H233TF
BS 328 413 RR2B139TF
BS 414 415 RR2H233TF
BS 416 428 RR2B139TF
BS 429 429 RR2H233TF
BS 430 443 RR2B139TF
BS 444 444 RR2H233TF
BS 445 675 RR2B139TF
BS 676 676 RR2H233TF
BS 677 716 RR2B139TF
BS 717 717 RR2H233TF
BS 718 810 RR2B139TF

RD RR2D795TF 500 0 0
GG
ATCGGAAGCTCTCTCTCCTTCCTCCGGACCCGTTCCTTTCCGATCCTTTTTTTTTGTCTC
CGTCCATAGGAGAACACACGATCGTGATCACTCCAATCAAACTAGCCTTTCTCCTCTTAA
CCCTCACAGCAACTGCAACCGCTGCACCCAAAGCCAAACGCAGGAACTACCTTTTCACAC
CGCATGCAAAAGCAGTCGCGGGAATATGCACCGTCGTCGTAACAAACACAAGTCTATGCT
GCAAAACCCTTAAACACGTTCCCACCAATGACCCCATCGAATTGATCCAAGCGTTAGCGG
CTGCGACTGAATCTTCCGTGAAGAGAAGTGTAACTTTCCTCTCCGAGATCAAACCAAAAC
ACAAATCGAACGCAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGCCAGAAAAACTTGAACTACG
CGTTGGAAGATTTCGCCGAGTTTTGGAACGCTACGGGGAATGATGTAACGACGTTGGCTC
ATAACTATTTCACGTGTA

QA 3 500 3 500
DS 

RD RR2H233TF 763 0 0
GGGT
ATCGGAAGCTCTCTCTCCTTCCTCCGGACCCGTTCCTTTCCGATCCTTTTTTTTTGTCTC
CGTCCATAGGAGAACACACGATCATGATCACTCCAATCAAACTAGCCTTTCTCCTCTTAA
CCCTCACAGCAACTGCAACCGCTGCACCCAAAGCCAAACGCAGGAACTACCTTTTCACAC
CGCATGCAAAAGCAGTCGCGGGAATATGCACCGTCGTCGTAACAAACACAAGTCTATGCT
GCAAAACCCTTAAACACGTTCCCACCAATGACCCCATCGAATTGATCCAAGCGTTAGCGG
CTGCGACTGAATCTTCCGTGAAGAGAAGTGTAACTCTCCTCTCCGAGATCAAACCAAAAC
ACAAATCGAACGCAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGCCAGAAAAACTTGAACTACG
CGTTGGAAGATTTCGCCGAGTTTTGGAACGCTACGGGGAAAGATGTAACGACGTTGGCTC
ATAACTATTTCACGTGTAAGAAGACGTTGATGTCGATCATGGGGTATCACTGGACTTGTT
TGGATGATATTGATGATAAGAATCTGTTGAAGGAAGTGGAGACTGGGATCAGTGTTGGGA
AGAATCTAAGCAGTAATACGTTTGATGTGTTCAATGGTTTGAAA*CTATTTTTAAGACGT
TTGGTATTAAG*TGAAGCTTAACGAGGAAGACACTTCGCCCCAACCCCCACCATTGTCGA
ATTATTACTTCTGAT*AAATGATTTGGATGTA
TAATTGA

QA 5 756 5 756
DS 

RD RR2DK07TF 753 0 0
GGGT
ATCGGAAGCTCTCTCTCCTTCCTCCGGACCCGTTCCTTTCCGATCCTTTTTTTTTGTCTC
CGTCCATAGGAGAACACACGATCATGATCACTCCAATCAAACTAGCCTTTCTCCTCTTAA
CCCTCACAGCAACTGCAACCGCTGCACCCAAAGCCAAACGCAGGAACTACCTTTTCACAC
CGCATGCAAAAGCAGTCGCGGGAATATGCACCGTCGTCGTAACAAACACAAGTCTATGCT
GCAAAACCCTTAAACACGTTCCCACCAATGACCCCATCGAATTGATCCAAGCGTTAGCGG
CTGCGACTGAATCTTCCGTGAAGAGAAGTGTAACTTTCCTCTCCGAGATCAAACCAAAAC
ACAAATCGAACGCAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGCCAGAAAAACTTGAACTACG
CGTTGGAAGATTTCGCCGAGTTTTGGAATGCTACGGGGAAAGATGTAACGACGTTGGCTC
ATAACTATTTCACGTGTAAGAAGACGTTGATGTCGATCATGGGGTATCACTGGACTTGTT
TGGATGATATTGATGATAAGAATCTGTTGAAGGAAGTGGAGACTGGGATCAGTGTTGGGA
AGAATCTAAGCAGTAATACGTTTGATGTGTTCAATGGTTTGAAAACTATTTTTAAGACGT
TTGGTATTAAG*TGAAGCTTAACGAGGAAGACACTTCGCCCCA*CCCCCACCATTGTCGA
ATTATTACTTCTGATTAA
TGATTTGGATG

QA 5 742 5 742
DS 

RD RR2B139TF 810 0 0
GGGTATCGGAAGCTCTCTCTCCTTCCTCCGGACCCGTTCCTTTCCGATCCTTTTTT**GG
TCTCCGTCCATAGGAGAACACACGATCATGATCACTCCAATCAAACTAGCCTTTCTCCTC
TTAACCCTCACAGCAACTGCAACCGCTGCACCCAAAGCCAAACGCAGGAACTACCTTTTC
ACACCGCATGCAAAAGCAGTCGCGGGAGTATGCACCGTCGTCGTAACAAACACAAGTCTA
TGCTGCAAAACCCTTAAACACGTTCCTACCAATGACCCCATCGAATTGATCCGAGTGTTA
GCGGCTGCTACTAAATCTTCCGTGAAAAGAAGTGTAACTTTCCTCTCCGAGATCAAACCA
AAACACAAATCGAACGCAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGCCAGAAAAATCTGAAC
TACGCGTTAGAAGATTTCGCCGATTTTTGGAACGCTACGGGGAAAGATGTAACGACGTTG
GCTCATAACTATTTCACGTGTAAGAAGACGTTGATGTCGATCATGGGGTATCACTGGACT
TGTTTGGATGATATTGATGATAAGAATCTGTTGAAGGAAGTGGAGACTGGGATCAGTGTT
GGGAAGAATCTAAGCAGTAATACGTTTGATGTGTTCAATGGTTTGAAAACTATTTTTAAG
ACGTTTGGTATTAAGGTGAAGCTTAACGAGGAAGACACTTCGCCCCAACCCCCACCGTTG
TCGAATTATTACTTCTGATTAAATGATCTGGATGTAATAATTGATTAATATCATCGTATA
ATGCCTAAAGCGTCGTGTATGGTGTATGTT

QA 1 810 1 810
DS 



CO CL1343Contig2 739 2 8 U
GTGAAGCTGTGCCACCACGTATCAATTATTGTGTTGACGCAATTATTACAAATGCTTCTC
TCCCACTAGTGAGCGAGTCATCAAAATCTATCAAATAGTAATCAACAAAAAAATAAAGAT
CACATTTCATTAATATATATCCTTTCCAATCATCTCGAATATCCGTCCGTGCATGTATAA
AACCTAGAACATACATCATACACGACACTTTAGGCATTGTACGATGATATTAATCAATTA
TTACATACAAATCATTTAATCAGAAGTAATAATTCGACAATGGTGGGGGTTGGGGCGAAG
TGTCTTCCTCGTTAAGCTTCACCTTAATACCAAACGTCTTAAAAATAGTTTTCAAACCAT
TGAACACATCAAACGTATTACTGCTTAGATTCTTCCCAACACTGATCCCAGTCTCCACTT
CCTTCAACAGATTCTTATCATCAATATCATCCAAACAAGTCCAGTGATACCCCATGATCG
ACATCAACGTCTTCTTACACGTGAAATAGTTATGAGCCAACGTCGTTACATCATTCCCCG
TAGCATTCCAAAACTCGGCGAAATCTTCCAACGCGTAGTTCAAGTTTTTCTGGCAGCTGT
AGATCGCTGCAGCTGCGGTTGCGTTCGATTTGTGTTTTGGTTTGATCTCGGAGAGGAAAG
TTACACTTCTCTTCACGGAAGATTCAGTCGCAGCCGCTAACGCTTGGATCAATTCGATGG
GGTCATTGGTGGGAACGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D795JQ U 1
AF RR2DK07JQ U 112
BS 1 206 RR2D795JQ
BS 207 207 RR2DK07JQ
BS 208 298 RR2D795JQ
BS 299 299 RR2DK07JQ
BS 300 544 RR2D795JQ
BS 545 545 RR2DK07JQ
BS 546 603 RR2D795JQ
BS 604 739 RR2DK07JQ

RD RR2D795JQ 603 0 0
GTGAAGCTGTGCCACCACGTATCAATTATTGTGTTGACGCAATTATTACAAATGCTTCTC
TCCCACTAGTGAGCGAGTCATCAAAATCTATCAAATAGTAATCAACAAAAAAATAAAGAT
CACATTTCATTAATATATATCCTTTCCAATCATCTCGAATATCCGTCCGTGCATGTATAA
AACCTAGAACATACATCATACACGACGCTTTAGGCATTGTACGATGATATTAATCAATTA
TTACATACAAATCATTTAATCAGAAGTAATAATTCGACAATGGTGGGGGTTGGGGCGAGG
TGTCTTCCTCGTTAAGCTTCACCTTAATACCAAACGTCTTAAAAATAGTTTTCAAACCAT
TGAACACATCAAACGTATTACTGCTTAGATTCTTCCCAACACTGATCCCAGTCTCCACTT
CCTTCAACAGATTCTTATCATCAATATCATCCAAACAAGTCCAGTGATACCCCATGATCG
ACATCAACGTCTTCTTACACGTGAAATAGTTATGAGCCAACGTCGTTACATCATTCCCCG
TAGCGTTCCAAAACTCGGCGAAATCTTCCAACGCGTAGTTCAAGTTTTTCTGGCAGCTGT
AGA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2DK07JQ 628 0 0
AG
TAAAGATCACATTTCATTAATATATATCCTTTCCAATCATCTCGAATATCCGTCCGTGCA
TGTATAAAACCTAGAACATACATCATACACGACACTTTAGGCATTGTACGATGATATTAA
TCAATTATTACATCCAAATCATTTAATCAGAAGTAATAATTCGACAATGGTGGGGGTTGG
GGCGAAGTGTCTTCCTCGTTAAGCTTCACCTTAATACCAAACGTCTTAAAAATAGTTTTC
AAACCATTGAACACATCAAACGTATTACTGCTTAGATTCTTCCCAACACTGATCCCAGTC
TCCACTTCCTTCAACAGATTCTTATCATCAATATCATCCAAACAAGTCCAGTGATACCCC
ATGATCGACATCAACGTCTTCTTACACGTGAAATAGTTATGAGCCAACGTCGTTACATCT
TTCCCCGTAGCATTCCAAAACTCGGCGAAATCTTCCAACGCGTAGTTCAAGTTTTTCTGG
CAGCTGTAGATCGCTGCAGCTGCGGTTGCGTTCGATTTGTGTTTTGGTTTGATCTCGGAG
AGGAAAGTTACACTTCTCTTCACGGAAGATTCAGTCGCAGCCGCTAACGCTTGGATCAAT
TCGATGGGGTCATTGGTGGGAACGTG

QA 3 628 3 628
DS 



AS 1 6

CO CL1344Contig1 655 6 18 U
GAAGAACCATTCGACATATCTTGTTTGATTTGACACAGAAACTAAAATCTCACTGGCAAA
AGTAAACGTTGAACAAAACCATAATATAAGTAGATAACTAGAATCAAGATTAAGACATAA
CACAAGTCTAAGACGAAAACAAAGCATCCTCAACAGAGGTCTGATAAAA*GTTCAACAAC
CACAAAAAGAGAGATAGATCTTAAACGATGGCGTTAGCAGCACTAGCGATCCTCGGCCAC
AGGTCAGCACACTCCTTTCCGATTGGTCCAGTGATAGCAGATCCTTTCATTTCACCCTTG
GGATTGACAATGACACCAGCATTATCTTCGAAGTACATGAAGACACCATCCTTTCGGCGC
CAAGGCTTCCTCTGCCTAACAATGACAGCTGGCATAACCTTCTTACGGAGATCAGGTTTT
CCTTTCTTCACGGTAGCCATCACCATGTCACCGACACAAGCGGATGGTAGACGGTTAAGA
CGACCCTTGATACCTTTGACGGAGATGATGTACAGATTCTTGGCTCCGGTGTTGTCAGCA
CAGTTCACGGTGGCTGCCACTGGAAGACCCAGTGACATCCTGAACTTGTTTCCAGAGGTT
CCTCCTCTTCCTCGCTTCGACATGGTTGCA*AGTAACAGGCTCTCTCGTTGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A209JQ U 33
AF RR2A209TF C 1
AF RR2CH53JQ U 71
AF RR2CH53TF C 71
AF RR2CA23JQ U 75
AF RR2CA23TF C 81
BS 1 32 RR2A209TF
BS 33 281 RR2A209JQ
BS 282 282 RR2CH53JQ
BS 283 408 RR2A209JQ
BS 409 478 RR2CH53JQ
BS 479 479 RR2A209TF
BS 480 503 RR2CH53JQ
BS 504 504 RR2A209TF
BS 505 512 RR2CH53JQ
BS 513 513 RR2CA23JQ
BS 514 515 RR2CH53JQ
BS 516 516 RR2CA23JQ
BS 517 538 RR2CH53JQ
BS 539 539 RR2CA23JQ
BS 540 630 RR2CH53JQ
BS 631 631 RR2CA23JQ
BS 632 647 RR2CH53JQ
BS 648 655 RR2A209TF

RD RR2A209JQ 376 0 0
ACACAGAAACTAAAATCTCACTGGCAAAAGTAAACGTTGAACAAAACCATAATATAAGTA
GATAACTAGAATCAAGATTAAGACATAACACAAGTCTAAGACGAAAACAAAGCATCCTCA
ACAGAGGTCTGATAAAA*GTTCAACAACCACAAAAAGAGAGATAGATCTTAAACGATGGC
GTTAGCAGCACTAGCGATCCTCGGCCACAGGTCAGCACACTCCTTTCCGATTGGTCCAGT
GATAGCAGAACCTTTCATTTCACCCTTGGGATTGACAATGACACCAGCATTATCTTCGAA
GTACATGAAGACACCATCCTTTCGGCGCCAAGGCTTCCTCTGCCTAACAATGACAGCTGG
CATAACCTTCTTACGG

QA 1 376 1 376
DS 

RD RR2A209TF 655 0 0
GAAGAACCATTCGACATATCTTGTTTGATTTGACACAGAAACTAAAATCTCACTGGCAAA
AGTAAACGTTGAACAAAACCATAATATAAGTAGATAACTAGAATCAAGATTAAGACATAA
CACAAGTCTAAGACGAAAACAAAGCATCCTCAACAGAGGTCTGATAAAA*GTTCAACAAC
CACAAAAAGAGAGATAGATCTTAAACGATGGCGTTAGCAGCACTAGCGATCCTCGGCCAC
AGGTCAGCACACTCCTTTCCGATTGGTCCAGTGATAGCAGATCCTTTCATTTCACCCTTG
GGATTGACAATGACACCAGCATTATCTTCGAAGTACATGAAGACACCATCCTTTCGGCGC
CAAGGCTTCCTCTGCCTAACAATGACAGCTGGCATAACCTTCTTACGGAGATCAGGTTTT
CCTTTCTTCACGGTAGCCATCACCATGTCACCGACACAAGCGGATGGTAGACGGTTAAGA
CGACCCTTGATACCTTTGACGGAGATGATGTACAGATTCTTGGCTCCGGTGTTGTCAGCA
CAGTTCACGGTGGCTGCCACTGGAAGACCCAGTGACATCCTGAACTTGTTTCCAGAGGTT
CCTCCTCTTCCTCGCTTCGACATGGTTGCA*AGTAACAGGCTCTCTCGTTGGGCC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2CH53JQ 579 0 0
GAACAAAACCATAATATAAGTA****ACTAGAATCAAGATTAAGACATAACACA*GTCTA
AGACGAAAACAAAGCATCCTCAACAGAGGTCTGAAAAAACGTTCAACAAACACAAAAAGA
GAGATAGATCTTAAACGATGGCGTTAGCAGCACTAGCGATCCTCGGCCACAGGTCAGCAC
ACTCCTTTCCGATTGGTCCGGTGATAGCAGATCCTTTCATTTCACCCTTGGGATTGACAA
TGACACCAGCATTATCTTCGAAGTACATGAAGACACCATCCTTTCGGCGCCAAGGCTTCC
TCTGCCTAACAATGACAGCTGGCATAACCTTCTTACGGAGATCAGGTTTTCCTTTCTTCA
CGGTAGCCATCACCATGTCACCGACACAAGCGGATGGTAGACGGTTAAAACGACCCTTGA
TACCTTTGACGGAAATGATGTAAAGGTTCTTGGCTCCGGTGTTGTCAGAACAGTTCACGG
TGGCTGCCACTGGAAGACCCAGTGACATCCTGAACTTGTTTCCAGAGGTTCCTCCTCTTC
CTCGCTTCGACATGGTTGCAGAGTAACAGGCTCTCTC
CC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2CH53TF 579 0 0
GAACAAAACCATAATATAAGTA****ACTAGAATCAAGATTAAGACATAACACA*GTCTA
AGACGAAAACAAAGCATCCTCAACAGAGGTCTGAAAAAACGTTCAACAAACACAAAAAGA
GAGATAGATCTTAAACGATGGCGTTAGCAGCACTAGCGATCCTCGGCCACAGGTCAGCAC
ACTCCTTTCCGATTGGTCCGGTGATAGCAGATCCTTTCATTTCACCCTTGGGATTGACAA
TGACACCAGCATTATCTTCGAAGTACATGAAGACACCATCCTTTCGGCGCCAAGGCTTCC
TCTGCCTAACAATGACAGCTGGCATAACCTTCTTACGGAGATCAGGTTTTCCTTTCTTCA
CGGTAGCCATCACCATGTCACCGACACAAGCGGATGGTAGACGGTTAAGACGACCCTTGA
TACCTTTGACGGAGATGATGTAAAGGTTCTTGGCTCCGGTGTTGTCAGAACAGTTCACGG
TGGCTGCCACTGGAAGACCCAGTGACATCCTGAACTTGTTTCCAGAGGTTCCTCCTCTTC
CTCGCTTCGACATGGTTGCAGAGTAACAGGCTCTCTC
CC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2CA23JQ 581 0 0
TTTTTTC
TAATATAAGTAGATAACTAGAATCAAGATTAAGACATAACACAAGTCTAAAACGAAAACA
AAGCATCCTCAACAGAGGTCTGATAAAA*GTTCAACAACCACAAAAAGAGAGATAGATCT
TAAACGATGGCGTTAGCAGCACTAGCGATCCTCGGCCACAGGTCAGCACACTCCTTTCCG
ATTGGTCCAGTGATAGCAAATCCTTTCATTTCACCCTTGGGATTGACAATGACACCAGCA
TTATCTTCGAAGTACATGAAGACACCATCCTTTCGGCGCCAAGGCTTCCTCTGCCTAACA
ATGACAGCTGGCATAACCTTCTTACGGAGATCAGGTTTTCCTTTCTTCACGGTAGCCATC
ACCATGTCACCGACACAAGCGGATGGTAGACGGTTAAAACGACCCTTGATACCTTTGACG
GAAATGATGTACAGATTCTTGGCTCCGGTGTTGTCAGCACAGTTCACGGTGGCTGCCACT
GGAAAACCCAGTGACATCCTGAACTTGTTTCCAGAGGTTCCTCCTCTTCCTCGCTTCGAC
ATGGTTGCA*AGTAACAGGCTCTCTC
GTTGGGCC

QA 8 573 8 573
DS 

RD RR2CA23TF 575 0 0
C
TAATATAAGTAGATAACTAGAATCAAGATTAAGACATAACACAAGTCTAAGACGAAAACA
AAGCATCCTCAACAGAGGTCTGATAAAA*GTTCAACAACCACAAAAAGAGAGATAGATCT
TAAACGATGGCGTTAGCAGCACTAGCGATCCTCGGCCACAGGTCAGCACACTCCTTTCCG
ATTGGTCCAGTGATAGCAGATCCTTTCATTTCACCCTTGGGATTGACAATGACACCAGCA
TTATCTTCGAAGTACATGAAGACACCATCCTTTCGGCGCCAAGGCTTCCTCTGCCTAACA
ATGACAGCTGGCATAACCTTCTTACGGAGATCAGGTTTTCCTTTCTTCACGGTAGCCATC
ACCATGTCACCGACACAAGCGGATGGTAGACGGTTAAGACGACCCTTGATACCTTTGACG
GAGATGATGTACAGATTCTTGGCTCCGGTGTTGTCAGCACAGTTCACGGTGGCTGCCACT
GGAAGACCCAGTGACATCCTGAACTTGTTTCCAGAGGTTCCTCCTCTTCCTCGCTTCGAC
ATGGTTGCA*AGTAACAGGCTCTCTC
GTTGGGCC

QA 2 567 2 567
DS 



AS 2 5

CO CL1345Contig1 791 2 6 U
GTAATTGTGTTTGAATTATTGTTTCATGTAATTAAGAGATTTGGTTCTACAAAAATCCTC
AAGACTGAATACAATCAAACCTCATACATATAAGTTTCAATATCCTGAGAAAAGCTGATT
CAGGTATTAACGTCTAGCCTTGTCAATGAGAGGCTTCAGCTTCTTCTTATCCGCAAGAAT
CTTGAGGAAGTTGAAGAGGAACGGAACATAGTTATGTTTCCTCCTCAAGTTCTCTTTCTT
CCAGTTCTTGGACCTCTCTTCCTCCATTACAATCTTCTGCGACACGGTCTCGATCCCGAC
ATTGACTTCAGAAAGAGACTTATCCAGAGCCTCGTAGCTGCTCTTCTCCGCGTACTTATC
AGCTTACAGAGTTCCCACCTGCTGCAAAATCCTCTCTCGCTTCATCTGATACTCTTTCAG
CTCAGCTCGGTACATCTCTTTCCTGTTCTTAACCACAGCCAAGAGACTAAACCGAATCTC
GTTCTGCATATACCGATCAATCCGCTCTTGCACAACAGGTTGGACCATTTTGAGCCATTC
GATTCCGTCTGGCTCGCCGAGACACTGTCCAAGGCTAATGGGTCCTTCTTTGAGACCATC
AAGCTCGTATAAGATACCATCAACAGGTAAGTAGCTGATGTAGTGATACACATCGTCATC
TTCCTCTTCCTTTTTCTTCCTCCTGGCAGCTATCTCATCCTCTTCCGTGGTGGTGGAAGT
TGAGTCAGGCCTAGCAAAGGTGTTGTGAGCTGCACGTATCGCCTCGTTGTTGCTGATGGC
TAAGCCTTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA31JQ U 1
AF RR2GL31JQ U 13
BS 1 108 RR2EA31JQ
BS 109 109 RR2GL31JQ
BS 110 365 RR2EA31JQ
BS 366 366 RR2GL31JQ
BS 367 724 RR2EA31JQ
BS 725 791 RR2GL31JQ

RD RR2EA31JQ 724 0 0
GTAATTGTGTTTGAATTATTGTTTCATGTAATTAAGAGATTTGGTTCTACAAAAATCCTC
AAGACTGAATACAATCAAACCTCATACATATAAGTTTCAATATCCTGA*AAAAGCTGATT
CAGGTATTAACGTCTAGCCTTGTCAATGAGAGGCTTCAGCTTCTTCTTATCCGCAAGAAT
CTTGAGGAAGTTGAAGAGGAACGGAACATAGTTATGTTTCCTCCTCAAGTTCTCTTTCTT
CCAGTTCTTGGACCTCTCTTCCTCCATTACAATCTTCTGCGACACGGTCTCGATCCCGAC
ATTGACTTCAGAAAGAGACTTATCCAGAGCCTCGTAGCTGCTCTTCTCCGCGTACTTATC
AGCTTGCAGAGTTCCCACCTGCTGCAAAATCCTCTCTCGCTTCATCTGATACTCTTTCAG
CTCAGCTCGGTACATCTCTTTCCTGTTCTTAACCACAGCCAAGAGACTAAACCGAATCTC
GTTCTGCATATACCGATCAATCCGCTCTTGCACAACAGGTTGGACCATTTTGAGCCATTC
GATTCCGTCTGGCTCGCCGAGACACTGTCCAAGGCTAATGGGTCCTTCTTTGAGACCATC
AAGCTCGTATAAGATACCATCAACAGGTAAGTAGCTGATGTAGTGATACACATCGTCATC
TTCCTCTTCCTTTTTCTTCCTCCTGGCAGCTATCTCATCCTCTTCCGTGGTGGTGGAAGT
TGAG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2GL31JQ 779 0 0
GAA
TTATTGTTTCATGTAATTAAGAGATTTGGTTCTACAAAAATCCTCAAGACTGAATACAAT
CAAACCTCATACATATAAGTTTCAATATCCTGCGAAAAGCTGATTCAGGTATTAACGTCT
AGCCTTGTCAATGAGAGGCTTCAGCTTCTTCTTATCCGCAAGAATCTTGAGGAAGTTGAA
GAGGAACGGGACATAGTTATGTTTCCTCCTCAAGTTCTCTTTCTTCCAGTTCTTGGACCT
CTCTTCCTCCATTACAATCTTCTGCGACACGGTCTCGATCCCGACATTGACTTCAGAAAG
AGACTTATCCAGAGCCTCGTAGCTGCTCTTCTCCGCGTACTTATCAGCTTACAGAGTTCC
CACCTGCTGCAAAATCCTCTCTCGCTTCATCTGATACTCTTTCAGCTCAGCTCGGTACAT
CTCTTTCCTGTTCTTAACCACAGCCAAGAGACTAAACCGAATCTCGTTCTGCATATACCG
ATCAATCCGCTCTTGCACAACAGGTTGGACCATTTTGAGCCATTCGATTCCGTCTGGCTC
GCCGAGACACTGTCCAAGGCTAATGGGTCCTTCTTTGAGACCATCAAGCTCGTATAAGAT
ACCATCAACAGGTAAGTAGCTGATGTAGTGATACACATCGTCATCTTCCTCTTCCTTTTT
CTTCCTCCTGGCAGCTATCTCATCCTCTTCCGTGGTGGTGGAAGTTGAGTCAGGCCTAGC
AAAGGTGTTGTGAGCTGCACGTATCGCCTCGTTGTTGCTGATGGCTAAGCCTTTGA

QA 4 779 4 779
DS 



CO CL1345Contig2 1292 3 4 U
GGGACCGCACCAGTGTAGAGAGAAAGAGAGACTCTTGATTGACTCAAACAACAGCTATCT
TGGAGAAAGACGATGGATTCGAAGAAGGGGGATTAGCGAATCTCCAGAGAGACAAATCCT
AATTCACCAGTTTCTCAATCTCATCTTCATCGTTGAAATCATGTCTTGGCTCCCTGTAGA
ATCTGATCCTGGTGTTTTCACAGAGATTATACAACAAATGCAAGTGAAAGGTGTGCAGGT
TGAAGAGTTGTACTCCTTGGACATTACTTCTCTTGATGAAATCAGACCTGTATACGGATT
GGTATTGCCTTACAAGTGGCGTCCCGAGGAAAAGGAGTCTCGTGTTGTCATCACTGAACC
AAACCCGAACTTCTTCTTCGCCAGCCAGATAATCAACAATGCTTGTGCTACACAAGCCTT
ACTGTCTGTCCTAATGAACTCTTCTAGTATCGAGATTGGTTCTGAGCTAACAGAACTTAA
AGAGTTTGCCAAAGACTTCCCACCTGAACTCAAAGGCTTAGCCATCAGCAACAACGAGGC
GATACGTGCAGCTCACAACACCTTTGCTAGGCCTGACTCAACTTCCACCACCACGGAAGA
GGATGAGATAGCTGCCAGGAGGAAGAAAAAGGAAGAAGAAGATGACGATGTGTATCACTA
CATCAGCTACTTACCTGTTGATGGTATCTTATACGAGCTTGATGGTCTCAAAGAAGGACC
TATTAGCCTTGGACAGTGTCTCGGCGAGCCAGACGGAATCGAATGGCTCAAAATGGTCCA
ACCTGTAGTGCAAGAGCGGATTGATCGGTATATGCAGAACTAGATCCGGTTTAGTCTCTT
GGCTGTGGTTAAGAACAGGAAAGAGATGTATCGAGCTGAGCTGAAAGAGTATCAGATGAA
GCGAGAGAGGATTTTGCAGCAGGTGGGTACTCTTCAAGCTGATAAATACGCTGAGAAGAG
CAGTTACGAGGCTCTGGATAAGTCTCTTTCAGAAGTCAATGTCGGGATCGAGACAGTGTC
GCAGAAGATTGTAATGGAGGAAGAGAGGTCCAAGAACTAGAAGAAAGAGAACTTGAGGAG
GAAACATAACTATGTCCCTTTCCTCTTCAACTTCCTCAAGATTCTTGCAGACAAGAAGAA
GCTCAAGCCTCTCATTGACAAGGCTAGACGTTAACAGCTTTTCGCAGGATATTGAAACTT
ATATGTATGAGGTTTGATTGTATTCAGTCTTGAAGATTTTTGTAGAACCAAATCTCTTAA
TTACATGAAACAATAAATCAAACACAATTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA31TF U 4
AF RR2GL31TF U 1
AF RR2AF51JQ C 464
BS 1 601 RR2GL31TF
BS 602 602 RR2AF51JQ
BS 603 614 RR2GL31TF
BS 615 1292 RR2AF51JQ

RD RR2EA31TF 564 0 0
GGGGCACCAGTGTAGAG
AGAAAGAGAGACTCTTGATTGACTCAAACAACAGCTATCTTGGAGAAAGACGATGGATTC
GAAGAAGGGGGATTAGCGAATCTCCAGAGAGACAAATCCTAATTCACCAGTTTCTCAATC
TCATCTTCATCGTTGAAATCATGTCTTGGCTCCCTGTAGAATCTGATCCTGGTGTTTTCA
CGGAGATTATACAACAAATGCAAGTGAAAGGTGTGCAGGTTGAAGAGTTGTACTCCTTGG
ACATTACTTCTCTTGATGAAATCAGACCTGTATACGGATTGGTATT*CTTTACAAGTGGC
GTCCCGAGGAAAAGGAGTCTCGTGTTGTCATCACTGAACCAAACCCGAACTTCTTCTTCG
CCAGCCAGATAATCAACAATGCTTGTGCTACACAAGCCTTACTGTCTGTCCTAATGAACT
CTTCTAGTATCGAGATTGGTTCTGAGCTAACAGAACTTAAAGAGTTTGCCAAAGACTTCC
CACCTGAACTCAAAGGCTTAGCCATCAGCAACAACGAGGCGATACGTGCAGCTCACAACA
CCTTTGC

QA 18 564 18 564
DS 

RD RR2GL31TF 614 0 0
GGGACCGCACCAGTGTAGAGAGAAAGAGAGACTCTTGATTGACTCAAACAACAGCTATCT
TGGAGAAAGACGATGGATTCGAAGAAGGGGGATTAGCGAATCTCCAGAGAGACAAATCCT
AATTCACCAGTTTCTCAATCTCATCTTCATCGTTGAAATCATGTCTTGGCTCCCTGTAGA
ATCTGATCCTGGTGTTTTCACAGAGATTATACAACAAATGCAAGTGAAAGGTGTGCAGGT
TGAAGAGTTGTACTCCTTGGACATTACTTCTCTTGATGAAATCAGACCTGTATACGGATT
GGTATTGCCTTACAAGTGGCGTCCCGAGGAAAAGGAGTCTCGTGTTGTCATCACTGAACC
AAACCCGAACTTCTTCTTCGCCAGCCAGATAATCAACAATGCTTGTGCTACACAAGCCTT
ACTGTCTGTCCTAATGAACTCTTCTAGTATCGAGATTGGTTCTGAGCTAACAGAACTTAA
AGAGTTTGCCAAAGACTTCCCACCTGAACTCAAAGGCTTAGCCATCAGCAACAACGAGGC
GATACGTGCAGCTCACAACACCTTTGCTAGGCCTGACTCAACTTCCACCACCACGGAAGA
G*ATGAGATAGCTG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2AF51JQ 829 0 0
GAGCTAACAGAACTTAAAGAGTTTGCCAAAGACTTCCCACCTGAACTCAAAGGCTTAGCC
ATCAGCAACAACGAGGCCATACGTGCAGCTCACAACACCTTTGCTAGGCCTGACTCAACT
TCCACCACCACGGAAGAGGATGAGATAGCTGCCAGGAGGAAGAAAAAGGAAGAAGAAGAT
GACGATGTGTATCACTACATCAGCTACTTACCTGTTGATGGTATCTTATACGAGCTTGAT
GGTCTCAAAGAAGGACCTATTAGCCTTGGACAGTGTCTCGGCGAGCCAGACGGAATCGAA
TGGCTCAAAATGGTCCAACCTGTAGTGCAAGAGCGGATTGATCGGTATATGCAGAACTAG
ATCCGGTTTAGTCTCTTGGCTGTGGTTAAGAACAGGAAAGAGATGTATCGAGCTGAGCTG
AAAGAGTATCAGATGAAGCGAGAGAGGATTTTGCAGCAGGTGGGTACTCTTCAAGCTGAT
AAATACGCTGAGAAGAGCAGTTACGAGGCTCTGGATAAGTCTCTTTCAGAAGTCAATGTC
GGGATCGAGACAGTGTCGCAGAAGATTGTAATGGAGGAAGAGAGGTCCAAGAACTAGAAG
AAAGAGAACTTGAGGAGGAAACATAACTATGTCCCTTTCCTCTTCAACTTCCTCAAGATT
CTTGCAGACAAGAAGAAGCTCAAGCCTCTCATTGACAAGGCTAGACGTTAACAGCTTTTC
GCAGGATATTGAAACTTATATGTATGAGGTTTGATTGTATTCAGTCTTGAAGATTTTTGT
AGAACCAAATCTCTTAATTACATGAAACAATAAATCAAACACAATTACG

QA 1 829 1 829
DS 



AS 1 6

CO CL1346Contig1 1584 6 17 U
GGAGATCACCAACTCTCACCCTCTCTTCTCAGGTAATAGTCGTAAAAAAGAGATGGCCCA
AAAGGTGGAAGCACAAGGAGGAAATGGAGGCAACCAATGGGATGATGGATCAGAATACGA
TGCTGTAACCAAGATTCAGGTTGCCGCAGGTGGGAGCGGTATTCAATATGTTCAGTTCGA
CTATGTCAAGAACGGACAACCCGAAACCGCCCCTCTTCGCGGTGTCAAGGGCCGTGCCAT
CCCAGCTGATCCGTTTGTGATTAACCATCCAGAGGAGCATCTAGTTTCCGTAGAAGGTTG
GTATGACTCTTCTGGTGTCATACAAGGGCTTAAGTTCAACTCCAACAAGAAGTCTTCTTA
TGTCATTGGATACAATGATGGTACTCCATTTACCCTCCAAGTTCAAGACAAGAAGATAAT
TGGCTTTCATGGCTTCGCCGGAGACAATCTTAATTCTCTTGGAGCTTACCTTGCTCCATT
GATAGCCGCCCCTCCTTCAGTTCCCCCGAAGAAGCTTGAAGCTAAGGGTGGTGAGTCTGG
AGCTGTGTGGGACGATGGTGCACACGACAATGTTAAAAAGGTGTCTGTAGGACAAGGCGA
AGATGGTATAGCAGCTGTCAAGTTTGAATACACAAATGGTTCTCAAGTGGTCATTGGAGC
TGAACGTGGGACGCCAACATTGCTTGGATACGAAGAGTTTGAGCTTGAATCAGATGAATA
CATAACCATCATGGAAGGCACCTACGACAAAATCTTAGGGAGTGATGGGCTGACGATGCT
CACTTTCAAGACTAACAAGAACAAAACATATGGACCGTATGGTCTCGAAGGTAGCACACA
CTTTGATTTCAAGGAGGAAGGTCACAAGATTACAGGGTTCCATGGACGAGCTGGTTCAAC
TATTAGTGCTATTGGAGTTTACTTAGCTCCAGTAGGCACCATCCCCTTGACTCCTGCCGA
ACCAACCAAGAAGCTAGAAGCCAAGGGTGGTGAGGGAGGAACATCATGGGATGATGGTGC
TTTCGACGGCGTAAGAAAAGTCTCTGTAGGACAAGCCCAAGATGGTATATCAGCGGTTAA
GTTTGTCTACAACAAAGGTTCTTCTGAAATCATAGGAGATGAACATGGAAAGAGTACTCT
ACTTGGATTCGAAGAGTTTGAGCTCGACTATCCAAGTGAATACATCACGGAAGTAAATGG
CACATTCGATATAATCTTTGGGAGTGACTCCGCGGTCCTTACCATGCTTACGTTCAAGAC
TAATAAGCCAGCAACATATGGTCCCTTTGGGCTTACCGC**TGGTGAGGCCTTCCATCTC
AAAGAGGAAGGCCACAAGATCGTGGGTTTCCATGG*AAGTGCTGGTGATTTGCTTCATAA
ATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCATCACCAACTGATCGTGGATCACATGAATTTGTCACAG
CTTTTGTGGTCTCTCTC**ATAATGGTCTTTGAACTTTAAATAAGTTGTTTCTACCTATT
ACTAGTTTCTATTTGTTTCAAGTTCTTCTGTTGTTGTTGTTCTGTCTAAGATGGATTTGT
GATCCCTCTATGATCAATTTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F040TF U 1
AF RR2C834TF U 643
AF RR2FB59JQ C 1099
AF RR2C834JQ C 762
AF RR2CL81TF U 793
AF RR2CL81JQ C 830
BS 1 731 RR2F040TF
BS 732 1199 RR2C834TF
BS 1200 1200 RR2CL81TF
BS 1201 1224 RR2C834TF
BS 1225 1225 RR2CL81TF
BS 1226 1291 RR2C834TF
BS 1292 1299 RR2CL81TF
BS 1300 1302 RR2C834JQ
BS 1303 1355 RR2CL81TF
BS 1356 1356 RR2C834JQ
BS 1357 1473 RR2CL81TF
BS 1474 1474 RR2C834JQ
BS 1475 1537 RR2CL81TF
BS 1538 1540 RR2C834JQ
BS 1541 1548 RR2CL81TF
BS 1549 1549 RR2C834JQ
BS 1550 1584 RR2CL81TF

RD RR2F040TF 731 0 0
GGAGATCACCAACTCTCACCCTCTCTTCTCAGGTAATAGTCGTAAAAAAGAGATGGCCCA
AAAGGTGGAAGCACAAGGAGGAAATGGAGGCAACCAATGGGATGATGGATCAGAATACGA
TGCTGTAACCAAGATTCAGGTTGCCGCAGGTGGGAGCGGTATTCAATATGTTCAGTTCGA
CTATGTCAAGAACGGACAACCCGAAACCGCCCCTCTTCGCGGTGTCAAGGGCCGTGCCAT
CCCAGCTGATCCGTTTGTGATTAACCATCCAGAGGAGCATCTAGTTTCCGTAGAAGGTTG
GTATGACTCTTCTGGTGTCATACAAGGGCTTAAGTTCAACTCCAACAAGAAGTCTTCTTA
TGTCATTGGATACAATGATGGTACTCCATTTACCCTCCAAGTTCAAGACAAGAAGATAAT
TGGCTTTCATGGCTTCGCCGGAGACAATCTTAATTCTCTTGGAGCTTACCTTGCTCCATT
GATAGCCGCCCCTCCTTCAGTTCCCCCGAAGAAGCTTGAAGCTAAGGGTGGTGAGTCTGG
AGCTGTGTGGGACGATGGTGCACACGACAATGTTAAAAAGGTGTCTGTAGGACAAGGCGA
AGATGGTATAGCAGCTGTCAAGTTTGAATACACAAATGGTTCTCAAGTGGTCATTGGAGC
TGAACGTGGGACGCCAACATTGCTTGGATACGAAGAGTTTGAGCTTGAATCAGATGAATA
CATAACCATCA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2C834TF 649 0 0
G
CAAGTGGTCATTTGAGCTGAACGTGGGACGCCAACATTGCTTGGATACGAAGAGTTTGAG
CTTGAATCAGATGAATACATAACCATCATGGAAGGCACCTACGACAAAATCTTAGGGAGT
GATGGGCTGACGATGCTCACTTTCAAGACTAACAAGAACAAAACATATGGACCGTATGGT
CTCGAAGGTAGCACACACTTTGATTTCAAGGAGGAAGGTCACAAGATTACAGGGTTCCAT
GGACGAGCTGGTTCAACTATTAGTGCTATTGGAGTTTACTTAGCTCCAGTAGGCACCATC
CCCTTGACTCCTGCCGAACCAACCAAGAAGCTAGAAGCCAAGGGTGGTGAGGGAGGAACA
TCATGGGATGATGGTGCTTTCGACGGCGTAAGAAAAGTCTCTGTAGGACAAGCCCAAGAT
GGTATATCAGCGGTTAAGTTTGTCTACAACAAAGGTTCTTCTGAAATCATAGGAGATGAA
CATGGAAAGAGTACTCTACTTGGATTCGAAGAGTTTGAGCTCGACTATCCAAGTGAATAC
ATCACGGAAGTAAATGACACATTCGATATAATCTTTGGGAG*GACTCCGCGGTCCTTACC
ATGCTTACGTTCAAGACTAATAAGCCAGCAACATATGGTCCCTTTGGG

QA 2 649 2 649
DS 

RD RR2FB59JQ 203 0 0
TTTTTT
TGAAATCATAGGAGATGAACATGGAAAGAGTACTCTACTTGGATTCGAAGAGTTTGAGCT
CGACTATCCAAGTGAATACATCACGGAAGTAAATGGCACATTCGATATAATTTTTGGGAG
TGACTCCGCGGTCCTTACCATGCTTACGTTCAAGAATAATAAGCCAGCAACATATGGTCC
CTTTGGGCTTACC
ACTG

QA 7 199 7 199
DS 

RD RR2C834JQ 798 0 0
GTGATGGGCTGACGATGCTCACTTTCAAGACTAACAAGAACAAAACATATGGACCGTATG
GTCTCGAAGGTAGCACACACTTTGATTTCAAGGAGGAAGGTCACAAGATTACAGGGTTCC
ATGGACGAGCTGGTTCAACTATTAGTGCTATTGGAGTTTACTTAGCTCCAGTAGGCACCA
TCCCCTTGACTCCTGCCGAACCAACCAAGAAGCTAGAAGCCAAGGGTGGTGAGGGAGGAA
CATCATGGGATGATGGTGCTTTCGACGGCGTAAGAAAAGTCTCTGTAGGACAAGCCCAAG
ATGGTATATCAGCGGTTAAGTTTGTCTACAACAAAGGTTCTTTTGAAATCATAGGAGATG
AACATGGAAAGAGTACTCTACTTGGATTCGAAGAGTTTGAGCTCGACTATCCAAGTGAAT
ACATCACGGAAGTAAATGACACATTCGATATAATCTTTGGGAGTGACTCCGCGGTCCTTA
CCATGCTTACGTTCAAGACTAATAAGCCAGCAACATATGGTCCCTTTGGGCTTACCGC**
TGGTGAGGCCTTCCATCTCAAAGAGGAAGGCCACAAGATCGTGGGTTTCCATGG*AAGTG
CTGGTGATTTGCTTCATAAATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCATCACCAACTGATCGTGGA
TCACATGAATTTGTCACAGCTTTTGTGGTCTCTCTCTCATAATGGTCTTTGAACTTTAAA
TAAGTTGTTTCTACCTATTACTAGTTTCTATTTGTTTCAAGTTCTTCTGTTGTTGTTGTT
CTGTTTAAGATGGATTTG

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2CL81TF 792 0 0
G
AACAAGAACAAAACATATGGACCGTATGGTCTCGAAGGTAGCACACACTTTGATTTCAAG
GAGGAAGGTCACAAGATTACAGGGTTCCATGGACGAGCTGGTTCAACTATTAGTGCTATT
GGAGTTTACTTAGCTCCAGTAGGCACCATCCCCTTGACTCCTGCCGAACCAACCAAGAAG
CTAGAAGCCAAGGGTGGTGAGGGAGGAACATCATGGGATGATGGTGCTTTCGACGGCGTA
AGAAAAGTCTCTGTAGGACAAGCCCAAGATGGTATATCAGCGGTTAAGTTTGTCTACAAC
AAAGGTTCTTCTGAAATCATAGGAGATGAACATGGAAAGAGTACTCTACTTGGATTCGAA
GAGTTTGAGCTCGACTATCCAAGTGAATACATCACGGAAGTAAATGGCACATTCGATATA
ATCTTTGGGAGTGACTCCGCGGTCCTTACCATGCTTACGTTCAAGACTAATAAGCCAGCA
ACATATGGTCCCTTTGGGCTTACCGCCTGGGTGAGGCCTTCCATCTCAAAGAGGAAGGCC
ACAAGATCGTGGGTTTCCATGGGAAGTGCTGGTGATTTGCTTCATAAATTTGGAGTTTAT
GTCCTTCCCATCACCAACTGATCGTGGATCACATGAATTTGTCACAGCTTTTGTGGTCTC
TCTC**ATAATGGTCTTTGA*CTTTAAATAAGTTGTTTCTACCTATTACTAGTTTCTATT
TGTTTCAAGTTCTTCTGTTGTTGTG**TCTGTCTA*GATGGATTTGTGATCCCTCTATGA
TCAATTTATTG

QA 2 792 2 792
DS 

RD RR2CL81JQ 745 0 0
GGTAGCACACACTTTGATTTCAAGGAGGAAGGTCACAAGATTACAGGGTTCCATGGACGA
GCTGGTTCAACTATTAGTGCTATTGGAGTTTACTTAGCTCCAGTAGGCACCATCCCCTTG
ACTCCTGCCGAACCAACCAAGAAGCTAGAAGCCAAGGGTGGTGAGGGAGGAACATCATGG
GATGATGGTGCTTTCGACGGCGTAAGAAAAGTCTCTGTAGGACAAGCCCAAGATGGTATA
TCAGCGGTTAAGTTTGTCTACAACAAAGGTTCTTCTGAAATCATAGGAGATGAACATGGA
AAGAGTACTCTACTTGGATTCGAAGAGTTTGAGCTCGACTATCCAAGTGAATACATCACG
GAAGTAAATGGCACATTCGATATAATCTTTGGGAGTGACTCCGCGGTCCTTACCATGCTT
ACGTTCAAGACTAATAAGCCAGCAACATATGGTCCCTTTGGGCTTACCGC**TGGTGAGG
CCTTCCATCTCAAAGAGGAAGGCCACAAGATCGTGGGTTTCCATGG*AAGTGCTGGTGAT
TTGCTTCATAAATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCATCACCAACTGATCGTGGATCACATGA
ATTTGTCACAGCTTTTGTGGTCTCTCTC**ATAATGGTCTTTGAACTTTAAATAAGTTGT
TTCTACCTATTACTAGTTTCTATTTGTTTCAAGTTCTTCTGTTGTTGTTGTTCTGTCTAA
GATGGATTTGTGATCCCTCT
TAATG

QA 1 740 1 740
DS 



AS 2 6

CO CL1347Contig1 749 2 2 U
GCCCAGTACCCTGTCCTCTCCATACTCACAAACTCTCTCTATTTCTTCTCTCTGTTTATC
TCTCTAACACATGAGAGAGAAAAATCTTCTGACAATCTCAGCCGTTGATAATTTCGCCAC
CGTAGATGGAGAACACTCAAGAATACTCGCCGCCGCACATGGACGCTTCTCGACCGTCAC
TAGGATTCCCTCTAGGCACGGCTCTGCTTCTCATAATCATTTTCAGTCTCTCGGGAATAT
TCTCTTGCTGTTACCATTGGGACAAACATCGCTCTCTCCGCCGCTCTTTGGCCAATGCCT
CCGGTCATCCCTCCGCCGCCTCTGCTGACATAGAGTCCTCTCCGTTCAAACCTAGACTCC
CTTTTCCGGATTTGAAGAAAAACAAGAATCTGAGCGTTACAGTGTTGATGCCTGGAGATA
ATACGCCGAAGTTTATAGCATTGCCGTGTCCTTGTGCACCGCCTCGTCCGGAGAAGCTTA
CCGTCGATGTTCAAAGTCCGCCGCACTCACCTCCTGTCAAGCCGCCGCGTTTTCCTGTTC
CTCTGTATTAGATTTAATTTAGCTAAAAGATAACAAAAATCTTGGTTTGATGTACATATG
GATCATAAATTTTCATTTAAATTTTATTCACTGATTATTCATTTTTTGGATTCAGTTGGT
AACATATTATGGAGTGGTTTGATTGTGAGAAAACAAAATATGTAGAGAATGGCACTGTTA
TTAACAAATAAATTATGAAATTATATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A131TF U 1
AF RR2D904TF U 6
BS 1 638 RR2A131TF
BS 639 749 RR2D904TF

RD RR2A131TF 638 0 0
GCCCAGTACCCTGTCCTCTCCATACTCACAAACTCTCTCTATTTCTTCTCTCTGTTTATC
TCTCTAACACATGAGAGAGAAAAATCTTCTGACAATCTCAGCCGTTGATAATTTCGCCAC
CGTAGATGGAGAACACTCAAGAATACTCGCCGCCGCACATGGACGCTTCTCGACCGTCAC
TAGGATTCCCTCTAGGCACGGCTCTGCTTCTCATAATCATTTTCAGTCTCTCGGGAATAT
TCTCTTGCTGTTACCATTGGGACAAACATCGCTCTCTCCGCCGCTCTTTGGCCAATGCCT
CCGGTCATCCCTCCGCCGCCTCTGCTGACATAGAGTCCTCTCCGTTCAAACCTAGACTCC
CTTTTCCGGATTTGAAGAAAAACAAGAATCTGAGCGTTACAGTGTTGATGCCTGGAGATA
ATACGCCGAAGTTTATAGCATTGCCGTGTCCTTGTGCACCGCCTCGTCCGGAGAAGCTTA
CCGTCGATGTTCAAAGTCCGCCGCACTCACCTCCTGTCAAGCCGCCGCGTTTTCCTGTTC
CTCTGTATTAGATTTAATTTAGCTAAAAGATAACAAAAATCTTGGTTTGATGTACATATG
GATCATAAATTTTCATTTAAATTTTATTCACTGATTAT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2D904TF 744 0 0
GG
ACCCTGTCCTCTCCATACTCACAAACTCTCTCTATTTCTTCTCTCTGTTTATCTCTCTAA
CACATGAGAGAGAAAAATCTTCTGACAATCTCAGCCGTTGATAATTTCGCCACCGTAGAT
GGAGAACACTCAAGAATACTCGCCGCCGCACATGGACGCTTCTCGACCGTCACTAGGATT
CCCTCTAGGCACGGCTCTGCTTCTCATAATCATTTTCAGTCTCTCGGGAATATTCTCTTG
CTGTTACCATTGGGACAAACATCGCTCTCTCCGCCGCTCTTTGGCCAATGCCTCCGGTCA
TCCCTCCGCCGCCTCTGCTGACATAGAGTCCTCTCCGTTCAAACCTAGACTCCCTTTTCC
GGATTTGAAGAAAAACAAGAATCTGAGCGTTACAGTGTTGATGCCTGGAGATAATACGCC
GAAGTTTATAGCATTGCCGTGTCCTTGTGCACCGCCTCGTCCGGAGAAGCTTACCGTCGA
TGTTCAAAGTCCGCCGCACTCACCTCCTGTCAAGCCGCCGCTTTTTCCTGTTCCTCTGTA
TTAGATTTAATTTAGCTAAAAGATAACAAAAATCTTGGTTTGATGTACATATGGATCATA
AATTTTCATTTAAATTTTATTCACTGATTATTCATTTTTTGGATTCAGTTGGTAACATAT
TATGGAGTGGTTTGATTGTGAGAAAACAAAATATGTAGAGAATGGCACTGTTATTAACAA
ATAAATTATGAAATTATATGTT

QA 3 744 3 744
DS 



CO CL1347Contig2 762 4 8 U
AATATATAATTTCATAATTTATTTGGTTTAATAACAGTGTCATTCTCTACATATTTAATT
TTCTCACAATCAAACCACTCCATAATATGTTACCAACTGAATACAAAAAAAAAAATGAAT
AATCAGTGAATAAAATTTAAATGAAAATTTATGAAGGATCCGTATGTACATCAAACCAAG
ATTTTTGTTATCTTTTAGCTAAATTAAATCTAATACAGAGGAACAGGAAAACGCGGCGGC
TTAACAGGAGGTGAGTGCGGCGGACTTTGACCATCGACGAAAAGCTTCTCCGGACGAGGA
GGTGCACAAGGACACGGCAATGCTATAAACTTCGGCGTATTATCTCCAGGCATCAACACT
GTAACGCTCAGATTCTTGTTTTTCTTCAAATCCGGCAAAGGGAGTCTAGGTTTGAACGGA
GAGGACTCTATGTCAGCAGAGGCGGCGGAGGGATGACCGGAAGCATTGGCCAAAGAGCGG
CGGAGAGAGCGATGTTTGTCCCAATGGTAACAGCAAGAGAATATTCCCGAGAGACTGAAA
ATGATTATGAGAAGCAGAGCTGTGCCTAGAGGGAATCCTAGTGACGGTCGAGAAGCGTCC
ATGTGCGGTGGCGAGTATTCTTGAGTGTTCTCCATCTACGGTGGCGAAATTATCAACGGC
TGAGATTGTCAGAAGATTTTTCTCTCTCTCATGTGTTAGAGAGATAAACAGAGAGAAGAA
ATAGAGAGAGTTTGTGAGTATGGAGAGGACAGGGTACTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM40JQ U 1
AF RR2GM40TF C 3
AF RR2BD90JQ U 112
AF RR2BD90TF C 112
BS 1 24 RR2GM40JQ
BS 25 25 RR2GM40TF
BS 26 56 RR2GM40JQ
BS 57 57 RR2GM40TF
BS 58 484 RR2GM40JQ
BS 485 485 RR2BD90JQ
BS 486 743 RR2GM40JQ
BS 744 762 RR2BD90JQ

RD RR2GM40JQ 743 0 0
AATATATAATTTCATAATTTATTTTGTTTAATAACAGTGTCATTCTCTACATATTTTATT
TTCTCACAATCAAACCACTCCATAATATGTTACCAACTGAATACAAAAAAAAAAATGAAT
AATCAGTGAATAAAATTTAAATGAAAATTTATGAAGGATCCGTATGTACATCAAACCAAG
ATTTTTGTTATCTTTTAGCTAAATTAAATCTAATACAGAGGAACAGGAAAACGCGGCGGC
TTAACAGGAGGTGAGTGCGGCGGACTTTGACCATCGACGAAAAGCTTCTCCGGACGAGGA
GGTGCACAAGGACACGGCAATGCTATAAACTTCGGCGTATTATCTCCAGGCATCAACACT
GTAACGCTCAGATTCTTGTTTTTCTTCAAATCCGGCAAAGGGAGTCTAGGTTTGAACGGA
GAGGACTCTATGTCAGCAGAGGCGGCGGAGGGATGACCGGAAGCATTGGCCAAAGAGCGG
CGGAAAGAGCGATGTTTGTCCCAATGGTAACAGCAAGAGAATATTCCCGAGAGACTGAAA
ATGATTATGAGAAGCAGAGCTGTGCCTAGAGGGAATCCTAGTGACGGTCGAGAAGCGTCC
ATGTGCGGTGGCGAGTATTCTTGAGTGTTCTCCATCTACGGTGGCGAAATTATCAACGGC
TGAGATTGTCAGAAGATTTTTCTCTCTCTCATGTGTTAGAGAGATAAACAGAGAGAAGAA
ATAGAGAGAGTTTGTGAGTATGG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2GM40TF 755 0 0
AATATATAATTCAT
ATTTATTTG**TTAATAACAGTGTCATTCTCTACATATTTA**TTTCTCACAATCAAACC
ACTCCATAATATGTTACCAACTGAATACAAAAAAAAAAATGAATAATCAGTGAATAAAAT
TTAAATGAAAATTTATGAAGGATCCGTATGTACATCAAACCAAGATTTTTGTTATCTTTT
AGCTAAATTAAATCTAATACAGAGGAACAGGAAAACGCGGCGGCTTAACAGGAGGTGAGT
GCGGCGGACTTTGACCATCGACGAAAAGCTTCTCCGGACGAGGAGGTGCACAAGGACACG
GCAATGCTATAAACTTCGGCGTATTATCTCCAGGCATCAACACTGTAACGCTCAGATTCT
TGTTTTTCTTCAAATCCGGCAAAGGGAGTCTAGGTTTGAACGGAGAGGACTCTATGTCAG
CAGAGGCGGCGGAGGGATGACCGGAAGCATTGGCCAAAGAGCGGCGGAGAGAGCGATGTT
TGTCCCAATGGTAACAGCAAGAGAATATTCCCGAGAGACTGAAAATGATTATGAGAAGCA
GAGCTGTGCCTAGAGGGAATCCTAGTGACGGTCGAGAAGCGTCCATGTGCGGTGGCGAGT
ATTCTTGAGTGTTCTCCATCTACGGTGGCGAAATTATCAACGGCTGAGATTGTCAGAAGA
TTTTTCTCTCTCTCATGTGTTAGAGAGATAAACAGAGAGAAGAAATAGAGAGAGTTTGTG
AGTATGGAGAGGACAGGGT
CC

QA 15 753 15 753
DS 

RD RR2BD90JQ 651 0 0
AAAATGAATAATCAGTGAATAAAATTTAAATGAAAATTTATGAAGGATCCGTATGTACAT
CAAACCAAGATTTTTGTTATCTTTTAGCTAAATTAAATCTAATACAGAGGAACAGGAAAA
CGCGGCGGCTTAACAGGAGGTGAGTGCGGCGGACTTTGACCATCGACGAAAAGCTTCTCC
GGACGAGGAGGTGCACAAGGACACGGCAATGCTATAAACTTCGGCGTATTATCTCCAGGC
ATCAACACTGTAACGCTCAGATTCTTGTTTTTCTTCAAATCCGGCAAAGGGAGTCTAGGT
TTGAACGGAGAGGACTCTATGTCAGCAGAGGCGGCGGAGGGATGACCGGAAGCATTGGCC
AAAGAGCGGCGGAGAGAGCGATGTTTGTCCCAATGGTAACAGCAAGAGAATATTCCCGAG
AGACTGAAAATGATTATGAGAAGCAGAGCTGTGCCTAGAGGGAATCCTAGTGACGGTCGA
GAAGCGTCCATGTGCGGTGGCGAGTATTCTTGAGTGTTCTCCATCTACGGTGGCGAAATT
ATCAACGGCTGAGATTGTCAGAAGATTTTTCTCTCTCTCATGTGTTAGAGAGATAAACAG
AGAGAAGAAATAGAGAGAGTTTGTGAGTATGGAGAGGACAGGGTACTGGCC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2BD90TF 651 0 0
AAAATGAATAATCAGTGAATAAAATTTAAATGAAAATTTATGAAGGATCCGTATGTACAT
CAAACCAAGATTTTTGTTATCTTTTAGCTAAATTAAATCTAATACAGAGGAACAGGAAAA
CGCGGCGGCTTAACAGGAGGTGAGTGCGGCGGACTTTGACCATCGACGAAAAGCTTCTCC
GGACGAGGAGGTGCACAAGGACACGGCAATGCTATAAACTTCGGCGTATTATCTCCAGGC
ATCAACACTGTAACGCTCAGATTCTTGTTTTTCTTCAAATCCGGCAAAGGGAGTCTAGGT
TTGAACGGAGAGGACTCTATGTCAGCAGAGGCGGCGGAGGGATGACCGGAAGCATTGGCC
AAAGAGCGGCGGAGAGAGCGATGTTTGTCCCAATGGTAACAGCAAGAGAATATTCCCGAG
AGACTGAAAATGATTATGAGAAGCAGAGCTGTGCCTAGAGGGAATCCTAGTGACGGTCGA
GAAGCGTCCATGTGCGGTGGCGAGTATTCTTGAGTGTTCTCCATCTACGGTGGCGAAATT
ATCAACGGCTGAGATTGTCAGAAGATTTTTCTCTCTCTCATGTGTTAGAGAGATAAACAG
AGAGAAGAAATAGAGAGAGTTTGTGAGTATGGAGAGGACAGGGT
ACTGGCC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 6

CO CL1348Contig1 1116 6 43 U
GGGGGGCATACGTGGCGGATATCTAGAGAGACTAGAGAGAGAGAGGAGGAGGAGTTTGGT
CGTTCGTCAATGGAGATCTCTGCTGCGTCTGCTTCTCTAACTTCCTCTGGACTCGTTCCT
CGACTTCTTCCTCCCTTGTTCTATCCTCCTCAAGCTCGAACTACTTCCTCCGCACCATTT
TCCTCTGTTAAACTCATTTCTCCACACAGACGTATAGCTCCGTCTCCGTGTCTCGCCGAT
CAGTCTGCCTCCACCGGGGTCAATGTTGTTGATTCAGATCCCACTGATGCTGTTAAGAGG
AAAGCTATGGACATATCCCCTCAACTCAAAGGAGCTTCCATATTTCTGGTTGGGATTAAT
AACCACATTAAA*CCGACTTGGGGAAGCTTTTGGCTGAGTCTTTACGATATTACTACTTT
GATAGTGATAAGTTGATCGCAGAGGCGGCTGGTGGAAATTCATCCGTTCAAGCTTTGAAG
GAGGCTGATGAGATGGCTTTTAAGGAATCAGAGACTGAAGTGCTGAAGCAGCTATCATCT
ATGGGTCGGCTTGTAGTTTGCGCTGGAGACGGTGCAGTCCAGAGCTTGACAAATCTTGCA
CTTCTAAGACACGGGATCTCCATATGGATCGATGTTCCTCTAGAAATCGCAGCTAAAGGA
GATGATCCATTCAGCTCAGAACCTTCCCCTGAGTTGTATGACGCAGTAAAAGCGAGTTAC
GAAAAATCAAGAAAGGGTTACGATACAGCAGATGCAGTTATTTCCCTTGAGAGAATAGCT
ACAAAGCTGGGATGGGAAGACTTGGAAACAGTAACTTCTGAAGAGCTCGCTTTGGAGGTC
TTGAAAGAAATAGAGAAGTTGACGAGAGTGAAGAAAATGATGGAAGAAGCTTCTCGACCT
TTCTAGGTTGATATTTT*ACTCACTCAATCATGCATCGCAAAATCTGTGAATTTTTTAT*
AGGGTTTCTATCATGTTGTATATCATAAACATGTTATTTTTCATCGTTATGACGGACATA
TATTAGGCATTTTTTGCATAAAATGTTCGGCATTGGGTGGAGGAGAAACACGTAGCGTCT
CTATCACGTGAGATCACGTGTAGGACTTATTCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 5 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ05TF U 1
AF RR2BK73TF U 52
AF RR2B928TF U 8
AF RR2BK73JQ C 276
AF RR2B928JQ C 644
AF RR2GJ05JQB C 373
BS 1 229 RR2GJ05TF
BS 230 230 RR2B928TF
BS 231 258 RR2GJ05TF
BS 259 259 RR2B928TF
BS 260 283 RR2GJ05TF
BS 284 285 RR2BK73TF
BS 286 306 RR2GJ05TF
BS 307 307 RR2BK73TF
BS 308 357 RR2GJ05TF
BS 358 358 RR2BK73TF
BS 359 372 RR2GJ05TF
BS 373 373 RR2BK73TF
BS 374 375 RR2GJ05TF
BS 376 376 RR2BK73TF
BS 377 503 RR2GJ05TF
BS 504 504 RR2BK73TF
BS 505 641 RR2B928TF
BS 642 642 RR2BK73TF
BS 643 645 RR2B928TF
BS 646 646 RR2BK73TF
BS 647 868 RR2B928TF
BS 869 917 RR2BK73JQ
BS 918 918 RR2GJ05JQB
BS 919 957 RR2BK73JQ
BS 958 958 RR2GJ05JQB
BS 959 959 RR2BK73JQ
BS 960 960 RR2GJ05JQB
BS 961 966 RR2BK73JQ
BS 967 967 RR2GJ05JQB
BS 968 972 RR2BK73JQ
BS 973 973 RR2GJ05JQB
BS 974 986 RR2BK73JQ
BS 987 987 RR2GJ05JQB
BS 988 1000 RR2BK73JQ
BS 1001 1001 RR2GJ05JQB
BS 1002 1010 RR2BK73JQ
BS 1011 1011 RR2GJ05JQB
BS 1012 1023 RR2BK73JQ
BS 1024 1024 RR2GJ05JQB
BS 1025 1034 RR2BK73JQ
BS 1035 1070 RR2GJ05JQB
BS 1071 1071 RR2B928JQ
BS 1072 1116 RR2GJ05JQB

RD RR2GJ05TF 504 0 0
GGGGGGCATACGTGGCGGATATCTAGAGAGACTAGAGAGAGAGAGGAGGAGGAGTTTGGT
CGTTCGTCAATGGAGATCTCTGCTGCGTCTGCTTCTCTAACTTCCTCTGGACTCGTTCCT
CGACTTCTTCCTCCCTTGTTCTATCCTCCTCAAGCTCGAACTACTTCCTCCGCACCATTT
TCCTCTGTTAAACTCATTTCTCCACACAGACGTATAGCTCCGTCTCCGTATCTCGCCGAT
CAGTCTGCCTCCACCGGGATCAATGTTGTTGATTCAGATCCCATCGATGCTGTTAAGAGG
AAAGCTGTGGACATATCCCCTCAACTCAAAGGAGCTTCCATATTTCTGGTTGGGATTGAT
AACCACATTAAAACCAACTTGGGGAAGCTTTTGGCTGAGTCTTTACGATATTACTACTTT
GATAGTGATAAGTTGATCGCAGAGGCGGCTGGTGGAAATTCATCCGTTCAAGCTTTGAAG
GAGGCTGATGAGATGGCTTTTAA
T

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2BK73TF 677 0 0
GAGTTTGGTCGTTCGTCAATGGAGATCTCTGCTGCGTCTGCTTCTCTAACTTCCTCTGGA
CTCGTTCCTCGACTTCTTCCTCCCTTGTTCTATCCTCCTCAAGCTCGAACTACTTCCTGT
GCACCATTTTCCTCTGCTAAACTCATTTCTCCTCACAGACGTATAGCTCCCTCTCAGTGT
CTCGCCGATCAGTCTGCCTCCACCGGGGTCAATGTTGTTGATTCAGATCCCACTGATGCT
GTTAAGAGGAAAGCTATGGACATATCCCCTCAACTCAAAGGAGCTTCCATATTTCTGGTT
GGGATTAATAACCACATTAAA*CCGACTTGGGGAAGCTTTTGGCTGAGTCTTTACGATAT
TACTACTTTGATAGTGATAAGTTGATCGCAGAGGCGGCTGGTGGTAATACATCCATTCAA
GCTTTGAAGGAGGCTGATGAGAATGCTTTTAAGGAATCAGAGACTGAAGTGCTGAAGCAG
CTATCATCTATGGGTCGGCTTGTAGTTTGCGCTGGAGATGGTGCAGTCCAGAGCTTGACA
AATCTTGCACTTCTAAGACACGGGATCTCCATATGGATCGATGTTCCTCTAGAAATCGCA
GCCAAAGGAGATGATCCATTCAGCTCAGAACCTTCCCCTGAGTTGTATGACGCAGTAAAA
GCGAGTTACGAAAA
TCA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2B928TF 861 0 0
GG
ACGTGGCGGATATCTAGAGAGACTAGAGAGAGAGAGGAGGAGGAGTTTGGTCGTTCGTCA
ATGGAGATCTCTGCTGCGTCTGCTTCTCTAACTTCCTCTGGACTCGTTCCTCGACTTCTT
CCTCCCTTGTTCTATCCTCCTCAAGCTCGAACTACTTCCTCCGCACCATTTTCCTCTGTT
AAACTCATTTCTCCACACAGACGTATAGCTCCGTCTCCGTGTCTCGCCGATCAGTCTGCC
TCCACCGGGGTCGATGTTGTTGATTCAGATCCCATCGATGCTGTTAAGAGGAAAGCTGTG
GACATATCCCCTCAACTCAAAGGAGCTTCCATATTTCTGGTTGGGATTGATAACCACATT
AAAACCAACTTGGGGAAGCTTTTGGCTGAGTCTTTACGATATTACTACTTTGATAGTGAT
AAGTTGATCGCAGAGGCGGCTGGTGGAAATTCATCCGTTCAAGCTTTGAAGGAGGCTGAT
GAGATGGCTTTTAATGAATCAGAGACTGAAGTGCTGAAGCAGCTATCATCTATGGGTCGG
CTTGTAGTTTGCGCTGGAGACGGTGCAGTCCAGAGCTTGACAAATCTTGCACTTCTAAGA
CACGGGATCTCCATATGGATCGATGTTCCTCTCGAAGTCGCAGCTAAAGGAGATGATCCA
TTCAGCTCAGAACCTTCCCCTGAGTTGTATGACGCAGTAAAAGCGAGTTACGAAAAATCA
AGAAAGGGTTACGATACAGCAGATGCAGTTATTTCCCTTGAGAGAATAGCTACAAAGCTG
GGATGGGAAGACTTGGAAACAGTAACTTCTGAAGAGCTCGCTTTGGAGGTCTTGAAAGAA
ATAGAGAAGTTGACGAGAG

QA 3 861 3 861
DS 

RD RR2BK73JQ 761 0 0
AGATCCCACTGATGCTGTTAAGAGGAAAGCTATGGACATATCCCCTCAACTCAAAGGAGC
TTCCATATTTCTGGTTGGGATTAATAACCACATTAAA*CCGACTTGGGGAAGCTTTTGGC
TGAGTCTTTACGATATTACTACTTTGATAGTGATAAGTTGATCGCAGAGGCGGCTGGTGG
TAATACATCCATTCAAGCTTTGAAGGAGGCTGATGAGAATGCTTTTAAGGAATCAGAGAC
TGAAGTGCTGAAGCAGCTATCATCTATGGGTCGGCTTGTAGTTTGCGCTGGAGATGGTGC
AGTCCAGAGCTTGACAAATCTTGCACTTTTAAGACACGGGATCTCCATATGGATCGATGT
TCCTCTAGAAATCGCAGCCAAAGGAGATGATCCATTCAGCTCAGAACCTTCCCCTGAGTT
GTATGACGCAGTAAAAGCGAGTTACGAAAAATCAAGAAAGGGTTACGATACAGCAGATGC
AGTTATTTCCCTTGAGAGAATAGCTACAAAGCTGGGATGGGAAGACTTGGAAACAGTAAC
TTCTGAAGAGCTTGCTTTGGAGGTCTTGAAAGAAATAGAGAAGTTGACGAGAGTGAAGAA
AATGATGGAAGAAGCTTCTCGACCTTTCTAGGTTGATATTTTTACTCACTCAATCATGCA
TCGCAAAATCTGTGAATTTTTTTTTAGGGTTGCTATCGTGTTGTATATCATGAACATGTT
ATTTT*CATCGTTATCACGGACATATATCAGGCATTTTT
GC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2B928JQ 434 0 0
AAG
TCGCAGCTAAAGGAGATGATCCATTCAGCTCAGAACCTTTCCCTGAGTTGTATGACGCAG
TAAAAGCGAGTTACGAAAAATCAAGAAAGGGTTACGATACAGCAGATGCAGTTATTTCCC
TTGAGAGAATAGCTACAAAGCTGGGATGGGAAGACTTGGAAACAGTAACTTTTGAAGAGC
TCGCTTTGGAGGTCTTGAAAGAAATAGAGAAGTTGACGAGAGTGAAGAAAATGATGGAAG
AAGCTTCTCGACCTTTTTAGGTTGATATTTT*ACTCACTCAATCATGCATCGCAAAATCT
GTGAATTTTTTAT*AGGGTTTTTATCATGTTGTATATCATAAACATGTTATTTTTCATCG
TTATGACGGACATATATTAGGCATTTTTTGCATAAAATGTTTGGCATTGGGTGGAGGGGA
AACACGTAG
GG

QA 4 432 4 432
DS 

RD RR2GJ05JQB 744 0 0
ACCA
ACTTGGGGAAGCTTTTGGCTGAGTCTTTACGATATTACTACTTTGATAGTGATAAGTTGA
TCGCAGAGGCGGCTGGTGGAAATTCATCCGTTCAAGCTTTGAAGGAGGCTGATGAGATGG
CTTTTAATGAATCAGAGACTGAAGTGCTGAAGCAGCTATCATCTATGGGTCGGCTTGTAG
TTTGCGCTGGAGACGGTGCAGTCCAGAGCTTGACAAATCTTGCACTTCTAAGACACGGGA
TCTCCATATGGATCGATGTTCCTCTCGAAATCGCAGCTAAAGGAGATGATCCATTCAGCT
CAGAACCTTCCCCTGAGTTGTATGACGCAGTAAAAGCGAGTTACGAAAAATCAAGAAAGG
GTTACGATACAGCAGATGCAGTTATTTCCCTTGAGAGAATAGCTACAAAGCTGGGATGGG
CAGACTTGGAAACAGTAACTTCTGAAGAGCTCGCTTTGGAGGTCTTGAAAGAAATAGAGA
AGTTGACGAGAGTGAAGAAAATGATGGAAGAAGCTTCTCGACCTTTCTAGGTTGATATTT
T*ACTCACTCAATCATGCATCGCAAAATCTGTGAATTTTTTAT*AGGGTTTCTATCATGT
TGTATATCATAAACATGTTATTTTTCATCGTTATGACGGACATATATTAGGCATTTTTTG
CATAAAATGTTCGGCATTGGGTGGAGGAGAAACATGTAGCGTCTCTATCACGTGAGATCA
CGTGTAGGACTTATTCTGTT

QA 5 744 5 744
DS 



AS 1 6

CO CL1349Contig1 865 6 6 U
GGCACTCAGTTTTGAAAATCCCAATCACGCTCTTCTCCAGAAAAAAAG***AAAAAAAGA
AAGGGTTTTAACAATGGCGAGAAGACCGGAAGAAGAGTACGACTACTTGTTTAAAGTGGT
TCTCATCGGAGACTCCGGTGTCGGCAAGTCGAATCTCCTCTCTAGATTCACTCGCGACGA
GTTCTGCTTGGAATCCAAATCTACCATCGGTGTCGAATTCGCTACTCGCACTCTCCAAGT
GGAAGGAAGGACTGTGAAGGCTCAGATATGGGACACGGCTGGGCAAGAACGATACAGAGC
CATAACCAGCGCCTACTACAGAGGTGCGCTTGGTGCTCTCTTGGTCTACGACGTCACGAA
ACCAACAACGTTCGAGAACGTTAGCCGGTGGTTGAAAGAGCTCAGAGACCACGCGGATTC
CAACATCGTCATCATGTTGATCGGAAACAAGACGGATCTGAAGCATCTCAGAGCTGTCGC
CACGGAGGATGCTCAGAGCTTCGCCGAGAAAGAAGGCTTGTCTTTCATCGAGACGTCGGC
CCTCGAGGCGCTGAACGTGGAGAAGGCCTTTCAGACGATTCTCTCTGAGATTTACAGGAT
CATCAGCAAGAAATCGATAGCTTCGGACCAGGCAGATGCAAATGGTAACGTCAGGGAAGG
TCAAACAATCGATGTCGCTACTACCTCTTCTGAATCAAACACTAAGAAGCCTTGTTGCTC
TTCTTCCTGAAAGGGGCTTATCACACTTCGAAAGCCAATATCTATGTATTTCCT***TAC
GGCTTGCTTGCGTTGTGTAATATAACTCAAGGATCATTCCTATATGAATTGTGACATTCA
AATGCAAGTAATTGTTCTCTCATCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C054TF U 1
AF RR2FO53TF U 21
AF RR2AB13TF U 2
AF RR2C054JQ C 73
AF RR2AB13JQ C 169
AF RR2FO53JQ C 103
BS 1 290 RR2C054TF
BS 291 291 RR2AB13TF
BS 292 535 RR2C054TF
BS 536 801 RR2AB13TF
BS 802 802 RR2AB13JQ
BS 803 865 RR2C054JQ

RD RR2C054TF 535 0 0
GGCACTCAGTTTTGAAAATCCCAATCACGCTCTTCTCCAGAAAAAAAG***AAAAAAAGA
AAGGGTTTTAACAATGGCGAGAAGACCGGAAGAAGAGTACGACTACTTGTTTAAAGTGGT
TCTCATCGGAGACTCCGGTGTCGGCAAGTCGAATCTCCTCTCTAGATTCACTCGCGACGA
GTTCTGCTTGGAATCCAAATCTACCATCGGTGTCGAATTCGCTACTCGCACTCTCCAAGT
GGAAGGAAGGACTGTGAAGGCTCAGATATGGGACACGGCTGGGCAAGAACTATACAGAGC
CATAACCAGCGCCTACTACAGAGGTGCGCTTGGTGCTCTCTTGGTCTACGACGTCACGAA
ACCAACAACGTTCGAGAACGTTAGCCGGTGGTTGAAAGAGCTCAGAGACCACGCGGATTC
CAACATCGTCATCATGTTGATCGGAAACAAGACGGATCTGAAGCATCTCAGAGCTGTCGC
CACGGAGGATGCTCAGAGCTTCGCCGAGAAAGAAGGCTTGTCTTTCATCGAGACG

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2FO53TF 630 0 0
GG
AATCACGCTCTTCTCCAGAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAGGGTTCTAACAATGGCGAGA
AGACCGGAAGAAGAATACGACTACTTGTTTAAAGTGGTTCTCATCGGAGATTCCGGTGTC
GGCAAGTCGAATCTCCTCTCTAGATTCACTCGCGACGAGTTCTGCTTGGAATCCAAATCT
ACCATCGGTGTCGAATTCGCTACTCGTACTCTCCAAGTGGAAGGAAGGACTGTGAAAGCG
CAGATATGGGACACGGCTGGGCAAGAACGATACAGAGCCATAACCAGCGCCTACTACAGA
GGTGCGCTCGGTGCTCTCTTGGTCTACGACGTCACTAAACCAACAACGTTTGAGAACGTT
AGCCGGTGGTTGAAAGAGCTCAGAGACCACGCGGATTCCAACATCGTCATCATGTTGATC
GGAAACAAGACGGATCTGAAGCATCTCAGAGCTGTTGCCACGGAGGATGCTCAGAGCTTC
GCCGAGAAAGAAGGCTTGTCTTTCATCGAGACCTCGGCTCTCGAGGCGTTGAACGTGGAG
AAGGCCTTTCAGACGATTCTCTCTGAGATTTACAGGATCATCAGCAAGAAATCGATATCT
TCGGACCAGGCAGATGCAAATGGTAACG

QA 3 630 3 630
DS 

RD RR2AB13TF 801 0 0
GCACTCAGTTTTGAAAATCCCAATCACGCTCTTCTCCAGAAAAAAAG***AAAAAAAGAA
AGGGTTTTAACAATGGCGAGAAGACCGGAAGAAGAGTACGACTACTTGTTTAAAGTGGTT
CTCATCGGAGACTCCGGTGTCGGCAAGTCGAATCTCCTCTCTAGATTCACTCGCGACGAG
TTCTGCTTGGAATCCAAATCTACCATCGGTGTCGAATTCGCTACTCGCACTCTCCAAGTG
GAAGGAAGGACTGTGAAGGCTCAGATATGGGACACGGCTGGGCAAGAACGATACAGAGCC
ATAACCAGCGCCTACTACAGAGGTGCGCTTGGTGCTCTCTTGGTCTACGACGTCACGAAA
CCAACAACGTTCGAGAACGTTAGCCGGTGGTTGAAAGAGCTCAGAGACCACGCGGATTCC
AACATCGTCATCATGTTGATCGGGAACAAGACGGATCTGAAGCATCTCAGAGCTGTCGCC
ACGGAGGATGCTCAGAGCTTCGCCGAGAAAGAAGGCTTGTCTTTCATCGAGACGTCGGCC
CTCGAGGCGCTGAACGTGGAGAAGGCCTTTCAGACGATTCTCTCTGAGATTTACAGGATC
ATCAGCAAGAAATCGATAGCTTCGGACCAGGCAGATGCAAATGGTAACGTCAGGGAAGGT
CAAACAATCGATGTCGCTACTACCTCTTCTGAATCAAACACTAAGAAGCCTTGTTGCTCT
TCTTCCTGAAAGGGGCTTATCACACTTCGAAAGCCAATATCTATGTATTTCCT***TACG
GCTTGCTTGCGTTGTGTAAT
A

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2C054JQ 793 0 0
C
ATGGCGAGAAGACCGGAAGAAGAGTACGACTACTTGTTTAAAGTGGTTCTCATCGGAGAC
TCCGGTGTCGGCAAGTCGAATCTCCTCTCTAGATTCACTCGCGACGAGTTCTGCTTGGAA
TCCAAATCTACCATCGGTGTCGAATTCGCTACTCGCACTCTCCAAGTGGAAGGAAGGACT
GTGAAGGCTCAGATATGGGACACGGCTGGGCAAGAACTATACAGAGCCATAACCAGCGCC
TACTACAGAGGTGCGCTTGGTGCTCTCTTGGTTTACGACGTCACGAAACCAACAACGTTC
GAGAACGTTAGCCGGTGGTTGAAAGAGCTCAGAGACCACGCGGATTCCAACATCGTCATC
ATGTTGATCGGAAACAAGACGGATCTGAAGCATCTCAGAGCTGTCGCCACGGAGGATGCT
CAGAGCTTCGCCGAGAAAGAAGGCTTGTCTTTCATCGAGACGTCGGCCCTCGAGGCGCTG
AACGTGGAGAAGGCCTTTCAGACGATTCTCTCTGAGATTTACAGGATCATCAGCAAGAAA
TCGATAGCTTCGGACCAGGCAGATGCAAATGGTAACGTCAGGGAAGGTCAAACAATCGAT
GTCGCTACTACCTCTTCTGAATCAAACACTAAGAAGCCTTGTTGCTCTTCTTCCTGAAAG
GGGCTTATCACACTTCGAAAGCCAATATCTATGTATTTCCT***TACGGCTTGCTTGCGT
TGTGTAATGTAACTCAAGGATCATTCCTATATGAATTGTGACATTCAAATGCAAGTAATT
GTTCTCTCATCC

QA 2 793 2 793
DS 

RD RR2AB13JQ 693 0 0
CACTCGCGACGAGTTCTGCTTGGAATCCAAATCTACCATCGGTGTCGAATTCGCTACTCG
CACTCTCCAAGTGGAAGGAAGGACTGTGAAGGCTCAGATATGGGACACGGCTGGGCAAGA
ACGATACAGAGCCATAACCAGCGCCTACTACAGAGGTGCGCTTGGTGCTCTCTTGGTTTA
CGACGTCACGAAACCAACAACGTTCGAGAACGTTAGCCGGTGGTTGAAAGAGCTCAGAGA
CCACGCGGATTCCAACATCGTCATCATGTTGATCGGGAACAAGACGGATTTGAAGCATTT
CAGAGCTGTCGCCACGGAGGATGCTCAGAGCTTCGCCGAGAAAGAAGGCTTGTCTTTCAT
CGAGACGTCGGCCCTCGAGGCGCTGAACGTGGAGAAGGCCTTTCAGACGATTCTTTTTGA
GATTTACAGGATCATCAGCAAGAAATCGATAGCTTCGGACCAGGCAGATGCAAATGGTAA
CGTCAGGGAAGGTCAAACAATCGATGTCGCTACTACCTCTTTTGAATCAAACACTAAGAA
GCCTTGTTGCTTTTCTTCCTGAAAGGGGCTTATCACACTTCGAAAGCCAATATCTATGTA
TTTCCT***TACGGCTTGCTTGCGTTGTGTAATATAACTCAAGGATCATTCCTATATGAA
TTGTGACATTCAAATGCAAGTAATTGTT
CTCAC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2FO53JQ 758 0 0
CTACTTGTTTAAAGTGGTTCTCATCGGAGATTCCGGTGTCGGCAAGTCGAATCTCCTCTC
TAGATTCACTCGCGACGAGTTCTGCTTGGAATCCAAATCTACCATCGGTGTCGAATTCGC
TACTCGTACTCTCCAAGTGGAAGGAAGGACTGTGAAAGCGCAGATATGGGACACGGCTGG
GCAAGAACGATACAGAGCCATAACCAGCGCCTACTACAGAGGTGCGCTCGGTGCTCTCTT
GGTCTACGACGTCACTAAACCAACAACGTTTGAGAACGTTAGCCGGTGGTTGAAAGAGCT
CAGAGACCACGCGGATTCCAACATCGTCATCATGTTGATCGGAAACAAGACGGATCTGAA
GCATCTCAGAGCTGTTGCCACGGAGGATGCTCAGAGCTTCGCCGAGAAAGAAGGCTTGTC
TTTCATCGAGACCTCGGCTCTCGAGGCGTTGAACGTGGAGAAGGCCTTTCAGACGATTCT
CTCTGAGATTTACAGGATCATCAGCAAGAAATCGATATCTTCGGACCAGGCAGATGCAAA
TGGTAACGTCAGGGAAGGTCAAACAATCGATGTCGCTGCTGCCTCTTCTGAATCAAACAC
TAAGAAGCCTTGTTGCTCTTCTTCCTGAAAAGGGCTTATCACACTTCGAAAGCCAATATC
TATGTATCTCCTTTTTACGGCTTGCTTGCGTTGTGTAATATAACTCAAGGATCAT*CCTA
TATGAATTCTGAAATTCAAATGCAAGTAATTGTT
GTCT

QA 1 754 1 754
DS 



AS 2 5

CO CL1350Contig1 973 3 4 U
GGGAATCAAGTTTAAAGTGTATAAACGGATGATGATAATATGAGCAGAGTCTCATAACAG
TTTGCATACTACAGAAGTACAAAATGTGTCGAAGTTTCTGTTTTGAAAGAAAGAAGATAT
ATTGGTGGCGCCGGAATCAGGCTGATATATGTCCGGAAAAGTCTGCTAAATTACGAAAAT
AGCCTTAGGTTCCTCCCCTCTTTACCATAGCTTGTTCTTGACCCAGAAAAGAAGGAAAAC
TACACCCAACACGATCGCTACTGGTGCCCATTTCCTGATCAAAGCCTGGCGATTCAAATC
TTTAGCTTTATCAGCATATATACGAGATTCAGAAGTTAGCCTACTCGACATCTCGCTCAC
CTGGTCCAGCTTTTCACCAACACCTAAGACTTCCTGCACATTCCGCGTCATTATCTGATG
GACCTCATA**GTTCATCATTCAACTTGGCGATATTTCGTTGCGTACGAGTGTCTTGGTA
CAGTTTCTTGGTTTTCTGTATGAAAGTATCAAATTTAATAAAAGCATAAGGTCTAGCAGC
AGTTTCAATGTTAGGCCCATTGACACGTTCGAACTCATTCTTGAGATCTTCCAGGTACTG
GAACGCGAGTTTCTTCGGGTAAGAGCGGTCACACATCGTCAAATAGCAAACACGTCCTTC
TATAATGTAATGGAAAACATAAGGGCCAGTTTCAACAGACATTCTTGAAGCTTCGTTATG
ACCTCGGGAGAGATTCTTGAACAAAGACTTAACCTGTTGCTTATACATGTCGGAATCTGG
TAAGTCACGACCATCGTCGAGTCCCTCTGCTAGAGGCAAACCGTCAGTAACAAGAGCTAT
CAATGTCATCTTCACCATCTCCGCCCTGGTTCCTTCTTCTCCAATTACAAAAATCTCACT
GCAACTGATACGAGTAATTCAAATGCTTCTTCTCGATTCAAGGATCTGAGAACCAGAACC
AGAAGATAGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV56JQ U 17
AF RR2BH31JQ U 1
AF RR2BH31TF C 278
BS 1 46 RR2BH31JQ
BS 47 48 RR2DV56JQ
BS 49 813 RR2BH31JQ
BS 814 973 RR2BH31TF

RD RR2DV56JQ 664 0 0
GT
GTATAAACGGATGATGATAATATGAGCAGAGTCTCATAACAGTTTGCATACTACAGAAGT
ACAAAATGTGTCGAAGTTTCTGTTTTGAAAGAAAGAAGATATTTTGGTGGCGCCGGAATC
AGGCTGATATATGTCCGGAAAAGTCTGCTAAATTACGAAAATAGCCTTAGGTTCCTCCTC
TCTTTACCATAGCTTGTTCTTGACCCAGAAAAGAAGGAAAACTACACCCAACACGATCGC
TACTGGTGCCCATTTCCTGATCAAAGCCTGGCGATTCAAGTCTTTAGCTTTATCAGCATA
TATACGAGATTCAGAAGTTAGCCTACTCGACATCTCGCTCACCTGGTCCAGCTTTTCACC
AACACCTAAGACTTCCTGCACATTCCGCGTCATTATCTGATGGACCTCATAGAGTTCATC
ATTCAACTTGGCGATATTTCGTTGCGTACGAGTGTCTTGGTACAGTTTCTTAGTTTTCTG
TATGAAAGTATCAAATTTAATAAAAGCATAAGGTCTAGCAGCTGTTTCAATGTTGGGCCC
ATTGACACGTTCGAACTCATTCTTGAGATCTTCCAGGTACTGGAACGCGAGTTTCTTCGG
GTAAGAGCGGTCACACATCGTCAAATAGCAAACACGTCCTTCTATAATGTAATGGAAAAC
AT

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR2BH31JQ 814 0 0
GGGAATCAAGTTTAAAGTGTATAAACGGATGATGATAATATGAGCA**GTCTCATAACAG
TTTGCATACTACAGAAGTACAAAATGTGTCGAAGTTTCTGTTTTGAAAGAAAGAAGATAT
ATTGGTGGCGCCGGAATCAGGCTGATATATGTCCGGAAAAGTCTGCTAAATTACGAAAAT
AGCCTTAGGTTCCTCCCCTCTTTACCATAGCTTGTTCTTGACCCAGAAAAGAAGGAAAAC
TACACCCAACACGATCGCTACTGGTGCCCATTTCCTGATCAAAGCCTGGCGATTCAAATC
TTTAGCTTTATCAGCATATATACGAGATTCAGAAGTTAGCCTACTCGACATCTCGCTCAC
CTGGTCCAGCTTTTCACCAACACCTAAGACTTCCTGCACATTCCGCGTCATTATCTGATG
GACCTCATA**GTTCATCATTCAACTTGGCGATATTTCGTTGCGTACGAGTGTCTTGGTA
CAGTTTCTTGGTTTTCTGTATGAAAGTATCAAATTTAATAAAAGCATAAGGTCTAGCAGC
AGTTTCAATGTTAGGCCCATTGACACGTTCGAACTCATTCTTGAGATCTTCCAGGTACTG
GAACGCGAGTTTCTTCGGGTAAGAGCGGTCACACATCGTCAAATAGCAAACACGTCCTTC
TATAATGTAATGGAAAACATAAGGGCCAGTTTCAACAGACATTCTTGAAGCTTCGTTATG
ACCTCGGGAGAGATTCTTGAACAAAGACTTAACCTGTTGCTTATACATGTCGGAATCTGG
TAAGTCACGACCATCGTCGAGTCCCTCTGCTAG
A

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2BH31TF 696 0 0
ATCAAAGCCTGGCGATTCAAATCTTTAGCTTTATCAGCATATATACGAGATTCAGAAGTT
AGCCTACTCGACATCTCGCTCACCTGGTCCAGCTTTTCACCAACACCTAAGACTTCCTGC
ACATTCCGCGTCATTATCTGATGGACCTCATA**GTTCATCATTCAACTTGGCGATATTT
CGTTGCGTACGAGTGTCTTGGTACAGTTTCTTGGTTTTCTGTATGAAAGTATCAAATTTA
ATAAAAGCATAAGGTCTAGCAGCAGTTTCAATGTTAGGCCCATTGACACGTTCGAACTCA
TTCTTGAGATCTTCCAGGTACTGGAACGCGAGTTTCTTCGGGTAAGAGCGGTCACACATC
GTCAAATAGCAAACACGTCCTTCTATAATGTAATGGAAAACATAAGGGCCAGTTTCAACA
GACATTCTTGAAGCTTCGTTATGACCTCGGGAGAGATTCTTGAACAAAGACTTAACCTGT
TGCTTATACATGTCGGAATCTGGTAAGTCACGACCATCGTCGAGTCCCTCTGCTAGAGGC
AAACCGTCAGTAACAAGAGCTATCAATGTCATCTTCACCATCTCCGCCCTGGTTCCTTCT
TCTCCAATTACAAAAATCTCACTGCAACTGATACGAGTAATTCAAATGCTTCTTCTCGAT
TCAAGGATCTGAGAACCAGAACCAGAAGATAGACCC

QA 1 696 1 696
DS 



CO CL1350Contig2 988 2 4 U
GGACTAATAAAGACAATAATTCACTCTCCCTTGGATCATCATCTATCTTCTGGTTCTGGC
TCTCAGATCCTTGAATCGAGAAGAAGCATTTGAATACTCGTATCAGTTTCAGTGAGATTT
GTAATTGGAGAAGAAGGAATCAGGGCGGAGATGGTGAAGATGACATTGATAGCTCGTGTT
ACTGACGGGTTGCCTCTAGCAGAGGGACTCGACGATGGTCGTGACTTGCCAGATTCCGGC
ATGTATAAGCAACAGGTCAAGTCTCTGTTCAAAAATCTCTCCAGAGGTCATAACGAAGCT
TCACGAATGTCTGTTGAAACTGGCCCCTATGTTTTCCATTACATCATAGAAGGACGTGTT
TGCTACCTGACGATGTGTGACCGCTCTTACCCGAAGAAACTCGCGTTCCAGTACCTGGAA
GATCTCAAGAATGAGTTTGAACGTGTCAATGGGCCTAACATTGAAACAGCAGCTAGACCT
TATGCTTTTATTAAGTTTGATACTTTCATACAGAAAACCAAGAAACTGTACCAAGACACT
CGTACGCAACGAAATATCGCCAAGTTGAATGATGAACTCTATGAGGTCCATCAGATAATG
ACGCGGAATGTGCAGGAAGTCTTAGGTGTTGGTGAAAAGCTGGACCAGGTGAGCGAGATG
TCGAGTAGGCTAACTTCTGAATCTCGTATATATGCTGATAAAGCTAAAGATTTGAATCGT
CAGGTTTTGATCAGGAAATGGGCACCAGTAGCTATCGTGTTGGGTGTAGTTTTCCTTCTT
TTCTGGGTCAAGAACAAGCTATGGTAAAGAGAGGAGGAACCAAAGGCTATTTTCGTAATT
TAGCAGACTTTTCCGGACATATATCAGCCTGATTCCGGCACCACCAAAATATCTTCTTTC
TTTCAAAAGAGAAACTTCGACACATTTTGTACTTCTGTAGTATGCAAACTTTTATGAGAC
TGCTCATATTATCATCATCCGTTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ16TF U 1
AF RR2EQ16JQ C 196
BS 1 668 RR2EQ16TF
BS 669 669 RR2EQ16JQ
BS 670 710 RR2EQ16TF
BS 711 988 RR2EQ16JQ

RD RR2EQ16TF 710 0 0
GGACTAATAAAGACAATAATTCACTCTCCCTTGGATCATCATCTATCTTCTGGTTCTGGC
TCTCAGATCCTTGAATCGAGAAGAAGCATTTGAATACTCGTATCAGTTTCAGTGAGATTT
GTAATTGGAGAAGAAGGAATCAGGGCGGAGATGGTGAAGATGACATTGATAGCTCGTGTT
ACTGACGGGTTGCCTCTAGCAGAGGGACTCGACGATGGTCGTGACTTGCCAGATTCCGGC
ATGTATAAGCAACAGGTCAAGTCTCTGTTCAAAAATCTCTCCAGAGGTCATAACGAAGCT
TCACGAATGTCTGTTGAAACTGGCCCCTATGTTTTCCATTACATCATAGAAGGACGTGTT
TGCTACCTGACGATGTGTGACCGCTCTTACCCGAAGAAACTCGCGTTCCAGTACCTGGAA
GATCTCAAGAATGAGTTTGAACGTGTCAATGGGCCTAACATTGAAACAGCAGCTAGACCT
TATGCTTTTATTAAGTTTGATACTTTCATACAGAAAACCAAGAAACTGTACCAAGACACT
CGTACGCAACGAAATATCGCCAAGTTGAATGATGAACTCTATGAGGTCCATCAGATAATG
ACGCGGAATGTGCAGGAAGTCTTAGGTGTTGGTGAAAAGCTGGACCAGGTGAGCGAGATG
TCGAGTAG*CTAACTTCTGAATCTCGTATATATGCTGATAAAGCTAAAGA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2EQ16JQ 793 0 0
CTAGCAGAGGGACTCGACGATGGTCGTGACTTGCCAGATTCCGGCATGTATAAGCAACAG
GTCAAGTCTCTGTTCAAAAATCTCTCCAGAGGTCATAACGAAGCTTCACGAATGTCTGTT
GAAACTGGCCCCTATGTTTTCCATTACATCATAGAAGGACGTGTTTGCTACCTGACGATG
TGTGACCGCTCTTACCCGAAGAAACTCGCGTTCCAGTACCTGGAAGATCTCAAGAATGAG
TTTGAACGTGTCAATGGGCCTAACATTGAAACAGCAGCTAGACCTTATGCTTTTATTAAG
TTTGATACTTTCATACAGAAAACCAAGAAACTGTACCAAGACACTCGTACGCAACGAAAT
ATCGCCAAGTTGAATGATGAACTCTATGAGGTCCATCAGATAATGACGCGGAATGTGCAG
GAAGTCTTAGGTGTTGGTGAAAAGCTGGACCAGGTGAGCGAGATGTCGAGTAGGCTAACT
TCTGAATCTCGTATATATGCTGATAAAGCTAAAGATTTGAATCGTCAGGTTTTGATCAGG
AAATGGGCACCAGTAGCTATCGTGTTGGGTGTAGTTTTCCTTCTTTTCTGGGTCAAGAAC
AAGCTATGGTAAAGAGAGGAGGAACCAAAGGCTATTTTCGTAATTTAGCAGACTTTTCCG
GACATATATCAGCCTGATTCCGGCACCACCAAAATATCTTCTTTCTTTCAAAAGAGAAAC
TTCGACACATTTTGTACTTCTGTAGTATGCAAACTTTTATGAGACTGCTCATATTATCAT
CATCCGTTTATAC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 5

CO CL1351Contig1 1005 5 11 U
GGACGCGCTTTACTATTTCTTCGCCTCATTAGTTGTCTTTCGCCATACTTTCCGCAACAC
TGTTCTGTTCTTGAAACATCCGTTCCAAGATGAGTGAAAAAATGAAAGAGAATCAATCTG
ACAAGCTTCAGAGAACAGCTCCACGTTTGAACGAGAGGATACTCTCATCTTTATCAAGGA
GATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTGGAGCTCCGGCGATCT
TCAATGTGGTTATTGAGATCTCAAA*GGGTAGCAAGGTCAAATACGAACTTGACAAAAAG
ACAGGACTCATCAAGGTTGATCGGATTCTATATTCATCGGTCGTGTATCCTCATAACTAT
GGTTTTATCCCCCGAACATTATGTGAAGACAATGACCCTTTAGATGTGCTAGTCATCATG
CAGGAACCTGTTCTTCCAGGTTGTTTTCTACGCGCACGAGCTATTGGATTAATGCCTATG
ATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCGGTTTGTGTTGATGATCCTGAGTAT
AAGCATTACACTGACATAAAAGAACTTCCACCGCATCGTCTCTCAGAAATCCGGCGATTC
TTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGATTTTCTACCTAAT
GGTCCTGCCGTTGAAGCCATTCAATACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACATTCTTCAC
ACCCTGAGGAGATAAAACAAGAACATTCCTGCCAAATTTTTGCTCTGCCAATCTCAGATT
TTGTAGCAGAGGAAAAAGAAAACAAAACAAGAATTTGTCTGATATTTGGATTTTGAATAA
ACACGTGTTCCTGACACTGTTCTAATACTCTGCTTCGTAGCTTGTTGTTGTTGTTGTTGT
TCTCTTCTGGAGATCTGTTGTCTGAACATTAACCCCTACTACGATTTGATTTTTCACTTG
TATTGTAATCTTTTATCCATTTAAAGTTTCGATTTAGTTCCAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B273TF U 1
AF RR2B424TF U 54
AF RR2BJ49TF U 57
AF RR2B424JQ C 169
AF RR2BJ49JQ C 230
BS 1 153 RR2B273TF
BS 154 154 RR2B424TF
BS 155 464 RR2B273TF
BS 465 465 RR2B424TF
BS 466 791 RR2B273TF
BS 792 793 RR2BJ49TF
BS 794 806 RR2B273TF
BS 807 864 RR2BJ49TF
BS 865 865 RR2B424JQ
BS 866 882 RR2BJ49TF
BS 883 1005 RR2B424JQ

RD RR2B273TF 808 0 0
GGACGCGCTTTACTATTTCTTCGCCTCATTAGTTGTCTTTCGCCATACTTTCCGCAACAC
TGTTCTGTTCTTGAAACATCCGTTCCAAGATGAGTGAAAAAATGAAAGAGAATCAATCTG
ACAAGCTTCAGAGAACAGCTCCACGTTTGAACGGGAGGATACTCTCATCTTTATCAAGGA
GATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTGGAGCTCCGGCGATCT
TCAATGTGGTTATTGAGATCTCAAA*GGGTAGCAAGGTCAAATACGAACTTGACAAAAAG
ACAGGACTCATCAAGGTTGATCGGATTCTATATTCATCGGTCGTGTATCCTCATAACTAT
GGTTTTATCCCCCGAACATTATGTGAAGACAATGACCCTTTAGATGTGCTAGTCATCATG
CAGGAACCTGTTCTTCCAGGTTGTTTTCTACGCGCACGAGCTATCGGATTAATGCCTATG
ATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCGGTTTGTGTTGATGATCCTGAGTAT
AAGCATTACACTGACATAAAAGAACTTCCACCGCATCGTCTCTCAGAAATCCGGCGATTC
TTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGATTTTCTACCTAAT
GGTCCTGCCGTTGAAGCCATTCAATACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACATTCTTCAC
ACCCTGAGGAGATAAAACAAGAACATTCCTGCCAAATTTTTGCTCTGCCAATCTCAGATT
TTGTAGCAGAG**AAAAGAAAACAAA
CA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2B424TF 736 0 0
GGAAC
ACTGTTCTGTTCTTCAAACATCCGTTCCAAGATGAGTGAAAAAATGAAAGAGAATCAATC
TGACAAGCTTCAGAGAACAGCTCCACGTTTGAACGAGAGGATACTCCCATCTTTATCAAG
GAGATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTGGAGCTCCGGCGAT
CTTCAATGTGGTTATTGAGATCTCAAA*GGGTAGCAAGGTCAAATACGAACTTGACAAAA
AGA**GGACTCATCAAGGTTGATCGGATTCTATATTCATCAGTCGTGTATCCTCATAACT
ATGGTTTTATCCCCCGCACATTATGTGAAGACAATGACCCTTTAGATGTGCTAGTCATCA
TGCAGGAACCTGTTCTTCCAGGTTGTTTTCTACGCGCACGAGCTATTGGATTAATGCCTA
TGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCGGTTTGTGTTGATGATCCTGAGT
ATAAGCATTACACTGACATAAAAGAACTTCCACCGCATCGTCTCTCAGAAATCCGGCGGT
TCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGATTTTCTACCTA
ATGGTCCTGCCGTTGAAGCCATTCAATACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACATTCTTC
ACACCCTGAGGAGATAAAACAAGAACATTCCTGCCAAATTTTTGCTCTGCCAATCTCAGA
TTTTGTAGCAG

QA 6 736 6 736
DS 

RD RR2BJ49TF 843 0 0
GG
ACTGTTCTGTTCTTGAAACATCCGTTCCAAGATGAGTGAAAAAATGAAAGAGAATCAATC
TGACAAGCTTCAGAGAACAGCTCCACGTTTGAACGAGAGGATACTCTCATCTTTATCAAG
GAGATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTGGAGCTCCGGCGAT
CTTCAATGTGGTTATTGAGATCTCAAA*GGGTAGCAAGGTCAAATACGAACTTGACAAAA
AGACAGGACTCATCAAGGTTGATCGGATTCTATATTCATCGGTCGTGTATCCTCATAACT
ATGGTTTTATCCCTCGAACATTATGTGAAGACAATGACCCTTTAGATGTGTTAGTCATCA
TGCAGGAACCTGTTCTTCCAGGTTGTTTTCTACGCGCACGAGCTATTGGATTAATGCCTA
TGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCGGTTTGTGTTGATGATCCTGAGT
ATAAGCATTACACTGACATAAAAGAACTTCCACCGCATCGTCTCTCAGAAATCCGGCGAT
TCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGATTTTCTACCTA
ATGGTCCTGCCGTTGAAGCCATTCAATACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACATTCTTC
ACACCCTGAGGAGATAAAACAAGAACATTCCTGCCAAATTTTTGCTCTGCCAATCTCAGA
TTTTGTAGCAGAGGAAAAAGAAAACAAAACAAGAATTTGTCTGATATTTGGATTTTGAAT
AAACACGTGTTCCTGACACTGTTCTA*TACTCTGCTTCGTAGCT
GTGTGTGTGTGTCTCTT

QA 3 826 3 826
DS 

RD RR2B424JQ 837 0 0
CTTTATCAAGGAGATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTGGAG
CTCCGGCGATCTTCAATGTGGTTATTGAGATCTCAAA*GGGTAGCAAGGTCAAATACGAA
CTTGACAAAAAGA**GGACTCATCAAGGTTGATCGGATTCTATATTCATCAGTCGTGTAT
CCTCATAACTATGGTTTTATCCCCCGCACATTATGTGAAGACAATGACCCTTTAGATGTG
CTAGTCATCATGCAGGAACCTGTTCTTCCAGGTTGTTTTCTACGCGCACGAGCTATTGGA
TTAATGCCTATGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCGGTTTGTGTTGAT
GATCCTGAGTATAAGCATTACACTGACATAAAAGAACTTCCACCGCATCGTCTCTCAGAA
ATCCGGCGGTTCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGAT
TTTCTACCTAATGGTCCTGCCGTTGAAGCCATTCAATACTCAATGGACCTTTACGCTGAG
TACATTCTTCACACCCTGAGGAGATAAAACAAGAACATTCCTGCCAAATTTTTGCTCTGC
CAATCTCAGATTTTGTAGCAGAGGAAAAAGAAAACAAAACAAGAATTTGTCTGATATTTG
GATTTTGAATAAGCACGTGTTCCTGACACTGTTCTAATACTCTGCTTCGTAGCTTGTTGT
TGTTGTTGTTGTTCTCTTCTGGAGATCTGTTGTCTGAACATTAACCCCTACTACGATTTG
ATTTTTCACTTGTATTGTAATCTTTTATCCATTTAAAGTTTCGATTTAGTTCCAACG

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR2BJ49JQ 749 0 0
TCCGGCGATCTTCAATGTGGTTATTGAGATCTCAAAAGGGTAGCAAGGTCAAATACGAAC
TTGACAAAAAGACAGGACTCATCAAGGTTGATCGGATTCTATATTCATCGGTCGTGTATC
CTCATAACTATGGTTTTATCCCTCGAACATTATGTGAAGACAATGACCCTTTAGATGTGT
TAGTCATCATGCAGGAACCTGTTCTTCCAGGTTGTTTTCTACGCGCACGAGCTATTGGAT
TAATGCCTATGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCGGTTTGTGTTGATG
ATCCTGAGTATAAGCATTACACTGACATAAAAGAACTTCCACCGCATCGTCTTTCAGAAA
TCCGGCGATTCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGATT
TTCTACCTAATGGTCCTGCCGTTGAAGCCATTCAATACTCAATGGACCTTTACGCTGAGT
ACATTCTTCACACCCTGAGGAGATAAAACAAGAACATTCCTGCCAAATTTTTGTTCTGCC
AATCTCAGATTTTGTAGCAGAGGAAAAAGAAAACAAAACAAGAATTTGTCTGATATTTGG
ATTTTGAATAAACACGTGTTCCTGACACTGTTCTAATACTCTGCTTCGTAGCTTGTTGTT
GTTGTTGTTGTTTTCTTCTGGAGATCTGTTGTCTGAACATTAACCCCTACTACGATTTGA
TTTT*CACTTGTATTGTAATCTTTTATCC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 6

CO CL1352Contig1 584 6 7 U
GGAAAAAGAAATTCTACGCAACCGAATCGGACATCGACAGAGAGAAAGCGAAAACTCGGA
GATCGAAATAGATGGATTCGCTGAAAGGAAAAGGGAAAGGATCGAAGGGAGCTTCCTCCT
CTTCCAAGATGGATCTCCTCAAGGAATGGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCCAAAGTCG
CGACTCAATACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAACTCCGATCCCAAGC
CACATCTCTTCCAACTCCTTAGCCCTGTCTGATCCTACTATTTCATCATCATCATCATCC
TCAACCAGATCAAATCAATCGTTTCCGATGTTTCTCTGGTTTGGCTTCATATCTTTACGC
GTGCGTCGTCTTTGATTCGCCGGATCTTTTTTATGTTTTTCATTAGCTATGTTCTAGAAT
GCTTTATCTATGCTTCTTATACTCTCTGTGTGGAATCAGTTAAGATTATGATAATGTGAT
ATCGAATTCACGCTTTGAATCTGTGTTCGCTAGGATTTTCTTATTCAAAGTTTAACGTTT
GACTTTTCTTCTTTGAGAATTGAAATTATTAGCTGTGTTATTCC


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DO35JQ C 46
AF RR2DO35TF U 46
AF RR2FJ70JQ C 1
AF RR2AJ05JQ C 3
AF RR2AJ05TF U 3
AF RR2FJ70TF U 1
BS 1 3 RR2FJ70JQ
BS 4 46 RR2AJ05TF
BS 47 261 RR2DO35TF
BS 262 262 RR2AJ05TF
BS 263 476 RR2DO35TF
BS 477 548 RR2AJ05TF
BS 549 584 RR2FJ70TF

RD RR2DO35JQ 431 0 0
G
AGCGAAAACTCGGAGATCGAAATAGATGGATTCGCTGAAAGGAAAAGGGAAAGGATCGAA
GGGAGCTTCCTCCTCTTCCAAGATGGATCTCCTCAAGGAATGGACCAATTGGTCTCTGAA
GAAGGCCAAAGTCGCGACTCAATACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAA
CTCCGATCCCAAGCCACATCTCTTCCAACTCCTTATCCCTGTCTGATCCTACTATTTCAT
CATCATCATCATCCTCAACCAGATCAAATCAATCGTTTCCGATGTTTCTCTGGTTTGGCT
TCATATCTTTACGCGTGCGTCGTCTTTGATTCGCCGGATCTTTTTTATGTTTTTCATTAG
CTATGTTCTAGAATGCTTTATCTATGCTTCTTATACTCTCTGTGTGGAATCAGTTAAGAT
TATGATAATG

QA 2 431 2 431
DS 

RD RR2DO35TF 431 0 0
G
AGCGAAAACTCGGAGATCGAAATAGATGGATTCGCTGAAAGGAAAAGGGAAAGGATCGAA
GGGAGCTTCCTCCTCTTCCAAGATGGATCTCCTCAAGGAATGGACCAATTGGTCTCTGAA
GAAGGCCAAAGTCGCGACTCAATACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAA
CTCCGATCCCAAGCCACATCTCTTCCAACTCCTTATCCCTGTCTGATCCTACTATTTCAT
CATCATCATCATCCTCAACCAGATCAAATCAATCGTTTCCGATGTTTCTCTGGTTTGGCT
TCATATCTTTACGCGTGCGTCGTCTTTGATTCGCCGGATCTTTTTTATGTTTTTCATTAG
CTATGTTCTAGAATGCTTTATCTATGCTTCTTATACTCTCTGTGTGGAATCAGTTAAGAT
TATGATAATG

QA 2 431 2 431
DS 

RD RR2FJ70JQ 584 0 0
GGAAAAAGAAATTCTACGCAACCGAATCGGACATCGACAGAGAGAAAGCGAAAACTCGGA
GATCGAAATAGATGGATTCGCTGAAAGGAAAAGGGAAAGGATCGAAGGGAGCTTCCTCCT
CTTCCAAGATGGATCTCCTCAAGGAATGGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCCAAAGTCG
CGACTCAATACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAGCTCCGATCCCAAGC
CACATCTCTTCCAACTCCTTAGCCCTGTCTGATCCTACTATTTCATCATCATCATCATCC
TCAACCAGATCAAATCAATCGTTTCCGATGTTTCTCTGGTTTGGCTTCATATCTTTACGC
GTGCGTCGTCTTTGATTCGCCGGATCTTTTTTATGTTTTTCATTAGCTATGTTCTAGAAT
GCTTTATCTATGCTTCTTATACTCTCTGTGTGGAATCAGTTAAGATTATGATAATGTGAT
ATCGAATTCACGCTTTGAATCTGTGTTCGCTAGGATTTTCTTATTCAAAGTTTAACGTTT
GACTTTTCTTCTTTGAGAATTGAAATTATTAGCTGTGTTATTCC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2AJ05JQ 546 0 0
G
AAAAGAAATTCTACGCAACCGAATCGGACATCGACAGAGAGAAAGCGAAAACTCGGAGAT
CGAAATAGATGGATTCGCTGAAAGGAAAAGGGAAAGGATCGAAGGGAGCTTCCTCCTCTT
CCAAGATGGATCTCCTCAAGGAATGGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCCAAAGTCGCGA
CTCAATACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAACTCCGATCCCAAGCCAC
ATCTCTTCCAACTCCTTAGCCCTGTCTGATCCTACTATTTCATCATCATCATCATCCTCA
ACCAGATCAAATCAATCGTTTCCGATGTTTCTCTGGTTTGGCTTCATATCTTTACGCGTG
CGTCGTCTTTGATTCGCCGGATCTTTTTTATGTTTTTCATTAGCTATGTTCTAGAATGCT
TTATCTATGCTTCTTATACTCTCTGTGTGGAATCAGTTAAGATTATGATAATGTGATATC
GAATTCACGCTTTGAATCTGTGTTCGCTAGGATTTTCTTATTCAAAGTTTAACGTTTGAC
TTTTC

QA 2 546 2 546
DS 

RD RR2AJ05TF 546 0 0
G
AAAAGAAATTCTACGCAACCGAATCGGACATCGACAGAGAGAAAGCGAAAACTCGGAGAT
CGAAATAGATGGATTCGCTGAAAGGAAAAGGGAAAGGATCGAAGGGAGCTTCCTCCTCTT
CCAAGATGGATCTCCTCAAGGAATGGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCCAAAGTCGCGA
CTCAATACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAACTCCGATCCCAAGCCAC
ATCTCTTCCAACTCCTTAGCCCTGTCTGATCCTACTATTTCATCATCATCATCATCCTCA
ACCAGATCAAATCAATCGTTTCCGATGTTTCTCTGGTTTGGCTTCATATCTTTACGCGTG
CGTCGTCTTTGATTCGCCGGATCTTTTTTATGTTTTTCATTAGCTATGTTCTAGAATGCT
TTATCTATGCTTCTTATACTCTCTGTGTGGAATCAGTTAAGATTATGATAATGTGATATC
GAATTCACGCTTTGAATCTGTGTTCGCTAGGATTTTCTTATTCAAAGTTTAACGTTTGAC
TTTTC

QA 2 546 2 546
DS 

RD RR2FJ70TF 584 0 0
GGA
AAAAGAAATTCTACGCAACCGAATCGGACATCGACAGAGAGAAAGCGAAAACTCGGAGAT
CGAAATAGATGGATTCGCTGAAAGGAAAAGGGAAAGGATCGAAGGGAGCTTCCTCCTCTT
CCAAGATGGATCTCCTCAAGGAATGGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCCAAAGTCGCGA
CTCAATACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAGCTCCGATCCCAAGCCAC
ATCTCTTCCAACTCCTTAGCCCTGTCTGATCCTACTATTTCATCATCATCATCATCCTCA
ACCAGATCAAATCAATCGTTTCCGATGTTTCTCTGGTTTGGCTTCATATCTTTACGCGTG
CGTCGTCTTTGATTCGCCGGATCTTTTTTATGTTTTTCATTAGCTATGTTCTAGAATGCT
TTATCTATGCTTCTTATACTCTCTGTGTGGAATCAGTTAAGATTATGATAATGTGATATC
GAATTCACGCTTTGAATCTGTGTTCGCTAGGATTTTCTTATTCAAAGTTTAACGTTTGAC
TTTTCTTCTTTGAGAATTGAAATTATTAGCTGTGTTATTCC

QA 4 584 4 584
DS 



AS 2 6

CO CL1353Contig1 1215 4 9 U
GGGAAGAAGAATAAACAAACTCCTCCGACGAAGATGAGAGGCGGAAAAGCAAATCAAGAG
GAGGACGATTACGGAGAAGAAGACTTCGGCTCCAAACGCGAAGGTCCTTCCAACAACCAC
AACAGTAACTCCGCCGCAGCAGCGAGCAGAGATGCGAAGGAAAACGATAAGGCTAGTGCG
ATACGCTCTAAGCATTCGGTGACTGAGCAGAGGAGACGAAGCAAAATCAATGAAAGGTTT
CAGATATTGAGAGAAATCATTCCCAATAGTGAACAGAAAAGAGATACTGCTTCCTTCCTT
CTAGAGGTCATAGATTACGTCCAGTATTTACAAGAGAAGGTGCAAAAGTATGAAGGATCT
TATCCAGGATGGAGTCAAGAACCTACTAAGTTGACACCTTGGAGGAATAATCACTGGCGA
GTTCAGGGTTTAGCTAACCCTCCAGTAGCTGCTGCGAGTAATGGATCTGTTCCAGTTATA
CCATTTCCTGGAAAGTTTGAAGAAAACACTCTGCCCTCTTCCGCACCTGCAATCGTTGCG
GAAATGCAAAACCCTGTTGACTCTGATCTAGGAAGAGTTTACAAACCAATAGACAGTCAA
CACGAGTTAGACCACGACAACGACAAGGAGTTACCGCCTGTACAACCAATCAACCATCCA
ACATTTGTACACGGTGAACAAAGTGATGGGGCAGGCCAAAGTAATAATAATGACCTGATT
ATTGAAGGTGGAACCATTAGCATCTCTACTGCTTACTCGCATGAGCTATTGAGCTCATTA
ACACAGGCCTCCAGAACGCAGACGTTGATCTGTCTCATGCTAAACTTTCCGTGCAGATCG
ATCTTGGGAAGCGAGCCAACCAAGGACTAACGCATAGCGATCCATCCAATAAGATTCCAT
TATCGTTTGATACTGAAGGCTCTACACCATCAAGGGGAGAATCTGAACATGCTCATAAGC
GGGTGAAAACACTGTAATGTCGTCTCTCTTAGGCTCTCCCATGCTCTGGAATATATAATA
TCTTCTTTTGTGTACATTTGTTCGGCTTCTAGAGGCATCATCCTATGATCGTTAAGATAA
TAATTATGGTTAGTTGAGTCTATCGTTTCTCATGGTTTTGAGTTTGTACTATCTTCTGCA
TCATTCATCATTGTAACCTATCAAATATAATCTCTTGTTGAATATCAGATTCTGTTTCAA
GTTCTTGTTATCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ16TF U 1
AF RR2A765TF U 11
AF RR2A765JQ C 407
AF RR2DZ16JQ C 980
BS 1 146 RR2DZ16TF
BS 147 690 RR2A765TF
BS 691 1005 RR2A765JQ
BS 1006 1006 RR2DZ16JQ
BS 1007 1132 RR2A765JQ
BS 1133 1133 RR2DZ16JQ
BS 1134 1135 RR2A765JQ
BS 1136 1136 RR2DZ16JQ
BS 1137 1215 RR2A765JQ

RD RR2DZ16TF 147 0 0
GGGAAGAAGAATAAACAAACTCCTCCGACGAAGATGAGAGGCGGAAAAGCAAATCAAGAG
GAGGACGATTACGGAGAAGAAGACTTCGGCTCCAAACGCGAAGGTCCTTCCAACAACCAC
AACAGTAACTCCGCCGCAGCAGCGAG
T

QA 1 146 1 146
DS 

RD RR2A765TF 680 0 0
GG
AAACAAACTCCTCCGACGAAGATGAGAGGCGGAAAAGCAAATCAAGAGGAGGACGATTAC
GGAGAAGAAGACTTCGGCTCCAAACGCGAAGGTCCTTCCAACAACCACAACAGTAACTCC
GCCGCAGCAGCGAGCAGAGATGCGAAGGAAAACGATAAGGCTAGTGCGATACGCTCTAAG
CATTCGGTGACTGAGCAGAGGAGACGAAGCAAAATCAATGAAAGGTTTCAGATATTGAGA
GAAATCATTCCCAATAGTGAACAGAAAAGAGATACTGCTTCCTTCCTTCTAGAGGTCATA
GATTACGTCCAGTATTTACAAGAGAAGGTGCAAAAGTATGAAGGATCTTATCCAGGATGG
AGTCAAGAACCTACTAAGTTGACACCTTGGAGGAATAATCACTGGCGAGTTCAGGGTTTA
GCTAACCCTCCAGTAGCTGCTGCGAGTAATGGATCTGTTCCAGTTATACCATTTCCTGGA
AAGTTTGAAGAAAACACTCTGCCCTCTTCCGCACCTGCAATCGTTGCGGAAATGCAAAAC
CCTGTTGACTCTGATCTAGGAAGAGTTTACAAACCAATAGACAGTCAACACGAGTTAGAC
CACGACAACGACAAGGAGTTACCGCCTGTACAACCAATCAACCATCCAACATTTGTACAC
GGTGAACAAAGTGATGGG

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR2A765JQ 809 0 0
ATAATCACTGGCGAGTTCAGGGTTTAGCTAACCCTCCAGTAGCTGCTGCGAGTAATGGAT
CTGTTCCAGTTATACCATTTCCTGGAAAGTTTGAAGAAAACACTCTGCCCTCTTCCGCAC
CTGCAATCGTTGCGGAAATGCAAAACCCTGTTGACTCTGATCTAGGAAGAGTTTACAAAC
CAATAGACAGTCAACACGAGTTAGACCACGACAACGACAAGGAGTTACCGCCTGTACAAC
CAATCAACCATCCAACATTTGTACACGGTGAACAAGGTGATGGGGCAGGCCAAAGTAATA
ATAATGACCTGATTATTGAAGGTGGAACCATTAGCATCTCTACTGCTTACTCGCATGAGC
TATTGAGCTCATTAACACAGGCCTCCAGAACGCAGACGTTGATCTGTCTCATGCTAAACT
TTCCGTGCAGATCGATCTTGGGAAGCGAGCCAACCAAGGACTAACGCATAGCGATCCATC
CAATAAGATTCCATTATCGTTTGATACTGAAGGCTCTACACCATCAAGGGGAGAATCTGA
ACATGCTCATAAGCGGGTGAAAACACTGTAATGTCGTCTCTCTTAGGCTCTCCCATGCTT
TGGAATATATAATATCTTCTTTTGTGTACATTTGTTCGGCTTCTAGAGGCATCATCCTAT
GATCGTTAAGATAATAATTATGGTTAGTTGAGTCTATCGTTTCTCATGGTTTTGAGTTTG
TACTATTTTTTGCATCATTCATCATTGTAACCTATCAAATATAATCTCTTGTTGAATATC
AGATTCTGTTTCAAGTTCTTGTTATCTCG

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2DZ16JQ 224 0 0
TCGTCTCTCTTAGGCTCTCCCATGTTCTGGAATATATAATATCTTCTTTTGTGTACATTT
GTTCGGCTTCTAGAGGCATCATCCTATGATCGTTAAGATAATAATTATGGTTAGTTGAGT
CTATCGTTTCTCATGGTTTTGAGTTTGTACTATCTTCTGCATCATTCATCATTGTAACCT
ATCAAATATAATCTCTTGTTGAATATCAGATTCTGTTTCAAGTT

QA 1 224 1 224
DS 



CO CL1353Contig2 845 2 4 U
GAAGAGAAGGTGCAAAAGTATGAAGGACCATATCCCGGTTGGAGTCAAGAACTAACTAAG
TTGACACCTTGGAGGAATAATCACTGGCGAGTTCAGAGTTTAGCTAACCCTCCAGTAGCT
GCTGCGAGTAATGGATCTGTTCCAGTTATACCATTTCCTGGAAAGTTTGAAGAAAACACT
ATACCCTCTTCCGCACCTGCAATCGTTGCGAAAAATAAAACCCTGTTGACTCTGATCTAG
GAAGAGTTTACAAGCCAATAGACAGTCAACACGAGTTAGACCACGACGAAGACAAGGAGT
TACCGCCTGTACAACCAATCAACCATCCAACATTTGTACACGGTGAACAAGGTGATGGGG
CGGGCCAAAGTAATAACGACCTGGTTATTGAAGGTGGAACCATTAGCATCTCTACTGCTT
ACTCGCATGAGTTGTTGAGCTCATTAACACAGGCACTCCAGAACCAGGCGTTGATCTGTC
TCATGCTAAACTTTCCGTGCAGATCGATCTTGGGAAGCGAGCCAACCAAAGACTAACGCA
TAGCGATCCATCCAATAAGATTCCATTATCCTCTGATACTGAAAGCTCTACACCATCAAG
GGGAGAATCTGAACATGCTCATAAGCGGGTGAAAACACTGTAATGTCCTCTCTCTTAGGC
TCCAATGCTCCGGAATATATAATATCTTCTTTTGTGTACATTTGTTCGGCTTCTAGAGGC
ATCATCCTATGATCCGTTAAGATAATAATTATTGTTAGTTGAGTCTATCGTTTCTCATGG
TTTTGAGTTTGTATTATCTTCTGCATCATTCATCATTGTAACCTATCAAATATAATCTCT
TGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2F487TF U 1
AF RR2F487JQ C 174
BS 1 658 RR2F487TF
BS 659 659 RR2F487JQ
BS 660 683 RR2F487TF
BS 684 845 RR2F487JQ

RD RR2F487TF 683 0 0
GAAGAGAAGGTGCAAAAGTATGAAGGACCATATCCCGGTTGGAGTCAAGAACTAACTAAG
TTGACACCTTGGAGGAATAATCACTGGCGAGTTCAGAGTTTAGCTAACCCTCCAGTAGCT
GCTGCGAGTAATGGATCTGTTCCAGTTATACCATTTCCTGGAAAGTTTGAAGAAAACACT
ATACCCTCTTCCGCACCTGCAATCGTTGCGAAAAATAAAACCCTGTTGACTCTGATCTAG
GAAGAGTTTACAAGCCAATAGACAGTCAACACGAGTTAGACCACGACGAAGACAAGGAGT
TACCGCCTGTACAACCAATCAACCATCCAACATTTGTACACGGTGAACAAGGTGATGGGG
CGGGCCAAAGTAATAACGACCTGGTTATTGAAGGTGGAACCATTAGCATCTCTACTGCTT
ACTCGCATGAGTTGTTGAGCTCATTAACACAGGCACTCCAGAACCAGGCGTTGATCTGTC
TCATGCTAAACTTTCCGTGCAGATCGATCTTGGGAAGCGAGCCAACCAAAGACTAACGCA
TAGCGATCCATCCAATAAGATTCCATTATCCTCTGATACTGAAAGCTCTACACCATCAAG
GGGAGAATCTGAACATGCTCATAAGCGGGTGAAAACACTGTAATGTCCTCTCTCTTAG*C
TCCAATGCTCCGGAATATATAAT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2F487JQ 672 0 0
AAACACTATACCCTCTTCCGCACCTGCAATCGTTGCGAAAAATAAAACCCTGTTGACTCT
GATCTAGGAAGAGTTTACAAGCCAATAGACAGTCAACACGAGTTAGACCACGACGAAGAC
AAGGAGTTACCGCCTGTACAACCAATCAACCATCCAACATTTGTACACGGTGAACAAGGT
GATGGGGCGGGCCAAAGTAATAACGACCTGGTTATTGAAGGTGGAACCATTAGCATCTCT
ACTGCTTACTCGCATGAGTTGTTGAGCTCATTAACACAGGCACTCCAGAACCAGGCGTTG
ATCTGTCTCATGCTAAACTTTCCGTGCAGATCGATCTTGGGAAGCGAGCCAACCAAGGAC
TAACGCATAGCGATCCATCCAATAAGATTCCATTATCCTCTGATACTGAAGGCTCTACAC
CATCAAGGGGAGAATCTGAACATGCTCATAAGCGGGTGAAAACACTGTAATGTCCTCTCT
CTTAGGCTCCAATGCTCCGGAATATATAATATCTTCTTTTGTGTACATTTGTTCGGCTTC
TAGAGGCATCATCCTATGATCCGTTAAGATAATAATTATTGTTAGTTGAGTCTATCGTTT
CTCATGGTTTTGAGTTTGTATTATCTTCTGCATCATTCATCATTGTAACCTATCAAATAT
AATCTCTTGTTG

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 5

CO CL1354Contig1 1366 5 23 U
GGGCTAGACCAAAACTAATTCTCAATATCAAGAAAAAAATACATAAAGAGAGATAAACGA
CGGTGGTTGCTTCGCCGGAAATCTCGCCGGAGCTCGACCTCTCGATTTGTCCTCCCATTT
GTTTTATTGTTTTCCGGCGAGGTCCGAGAGGGAGGTAACAATCATGCAGAAACGGAGAGC
GGTGAGGGAATCTTCCAAGACAACACCGTCAAGAAATGAAAAGGCTTTGGATTCATGTGA
GAAGAAGAGATCTGAGAAGAGATTGATGAAGTTCGAGGAGTTGCCAAGGTATCTCAAAGA
CAACGAGTACATACACAATCATTACCGATGTGAATGGTCTCTCAAGGAGACTTTCCTCAG
CGCTTTCTCATGGCACAACGAGACTCTCAACATCTGGACGCACTTAGGTGGGTTTCTGAT
ATTCGGATGGATGATGGTGGTGAGCTCCATGGAAACGACGGAGCTCGGCCTTGCCGGATT
TGTCAGCGCCTTCTCCGGAGTAACAATTCGCTGGCCGTGGTCGTCAATGGCTAAAGCCGT
TTACTTCTTCTCCAGCGATCATCACGACTCGAACGTGACACACACTAGCTCGTTCTTGAA
CACACAAGGAGAAGTTAACTACGAAACAGTTCCCAAATGGCCATGGCTAGTCTTCTTAAC
CGGAGCAATGACCTGTTTGATATGCAGCTCCATGTCACACCTCTTCGCCTGCCACTCCAG
ACGTTTCAACCTCTTCTTCTGGCGCCTAGACTACGCAGGAATCTCCCTCATGATCGTCTG
TTCCTTCTTCGCACCAATCTACTACGCGTTCTCTTGCCACACTAACTGGCGTCTCTTCTA
CCTCTCCACGATCTCAATCCTCGGCCTCCTCGCCATCTTTGCTCTCCTCTCTCCAGCGCT
CTCAGCTCCACGTTTCAGATCTTTCAGAGCGGCTCTTTTCCTAACGATGGGATTCTCAGG
CGTCATACCCGCTTCGCACGTGCTTTACCTTCACTGGGATCATCCCAACGTCGTTATCGC
TCTTGGTTACGAGCTAGCTATGGCTGTGTTGTATGCAACGGGAGCAGGGTTTTACGTTAG
CCGTATACCTGAGAGATGGAAGCCTGGTGCTTTCGATATTGCGGGACATAGCCATCAGAT
ATTCCATGTGTTTGTAGTGTTAGGAGCCCTTGCTCATAGTGCTGCCTCTCTTCTTATCAT
GGATTTTCGACGTGCTTCGCCTTCTTGTGCCTTTTGAAGCAAGTAACAGAACTGTAAAAC
GTTTAGTGATATTTCATTCAACGTATCATAATGTATGTGTTACATAGAAGATACGCATTG
GCAATGTACTACACAACCCAAAATATTAAACGCTTATTCTGGTGGC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2G633TF U 4
AF RR2AL81TF U 1
AF RR2GT64TF U 436
AF RR2G633JQ C 806
AF RR2GT64JQB C 836
BS 1 138 RR2AL81TF
BS 139 140 RR2G633TF
BS 141 575 RR2AL81TF
BS 576 576 RR2G633TF
BS 577 758 RR2AL81TF
BS 759 759 RR2GT64TF
BS 760 873 RR2AL81TF
BS 874 874 RR2GT64TF
BS 875 886 RR2AL81TF
BS 887 1163 RR2GT64TF
BS 1164 1164 RR2G633JQ
BS 1165 1168 RR2GT64TF
BS 1169 1169 RR2G633JQ
BS 1170 1181 RR2GT64TF
BS 1182 1182 RR2G633JQ
BS 1183 1191 RR2GT64TF
BS 1192 1194 RR2G633JQ
BS 1195 1206 RR2GT64TF
BS 1207 1207 RR2G633JQ
BS 1208 1222 RR2GT64TF
BS 1223 1342 RR2G633JQ
BS 1343 1343 RR2GT64JQB
BS 1344 1366 RR2G633JQ

RD RR2G633TF 731 0 0
GG
AGACCAAAACTAATTCTCAATATCAAGAAAAAAATACATAAAGAGAGATAAACGACGGTG
GTTGCTTCGCCGGAAATCTCGCCGGAGCTCGACCTCTCGATTTGTCCTCCCATTTGTTTT
ATTGTTTTCCGGCGAGGTCCGAGAGGGAGGTAACAATCATGCAGAAACGGAGAGCGGTGA
GGGAATCTTCCAAGACAACACCGTCAAGAAATGAAAAGGCTTTGGATTCATGTGAGAAGA
AGAGATCTGAGAAGAGATTGATGAAGTTCGAGGAGTTGCCAAGGTATCTCAAAGACAACG
AGTACATACGCAATCATTACCGATGTGAATGGTCTCTCAAGGAGACTTTCCTCAGCGCTT
TCTCATGGCACAACGAGACTCTCAACATCTGGACGCACTTAGGTGGGTTTCTGATATTCG
GATGGATGATGGTGGTGAGCTCCATGGAAACGACGGAGCTCGGCCTTGCCGGATTTGTCA
GCGCCTTCTCCGGAGTAACAATTCGCTGGCCGTGGTCGTCAATGGCTAAAGCCGTTTACT
TCTTCTCCAGCGATCATCACGACTCGAACGTGACACACACTAGCTCGTTCTTGAACACAC
AAGGAGAAGTTAACTACGAAACAGTTCCCAAATGGCCATGGCTAGTCTTCTTAACCGGAG
CAATGACCTGTTTGATATGCAGCTCCATGTCACACCTCTTCGCCTGCCACTCCAGACGTT
TCA
ACCTCT

QA 3 725 3 725
DS 

RD RR2AL81TF 888 0 0
GGGCTAGACCAAAACTAATTCTCAATATCAAGAAAAAAATACATAAAGAGAGATAAACGA
CGGTGGTTGCTTCGCCGGAAATCTCGCCGGAGCTCGACCTCTCGATTTGTCCTCCCATTT
GTTTTATTGTTTTCCGGC**GGTCCGAGAGGGAGGTAACAATCATGCAGAAACGGAGAGC
GGTGAGGGAATCTTCCAAGACAACACCGTCAAGAAATGAAAAGGCTTTGGATTCATGTGA
GAAGAAGAGATCTGAGAAGAGATTGATGAAGTTCGAGGAGTTGCCAAGGTATCTCAAAGA
CAACGAGTACATACACAATCATTACCGATGTGAATGGTCTCTCAAGGAGACTTTCCTCAG
CGCTTTCTCATGGCACAACGAGACTCTCAACATCTGGACGCACTTAGGTGGGTTTCTGAT
ATTCGGATGGATGATGGTGGTGAGCTCCATGGAAACGACGGAGCTCGGCCTTGCCGGATT
TGTCAGCGCCTTCTCCGGAGTAACAATTCGCTGGCCGTGGTCGTCAATGGCTAAAGCCGT
TTACTTCTTCTCCAGCGATCATCACGACTCGAACGCGACACACACTAGCTCGTTCTTGAA
CACACAAGGAGAAGTTAACTACGAAACAGTTCCCAAATGGCCATGGCTAGTCTTCTTAAC
CGGAGCAATGACCTGTTTGATATGCAGCTCCATGTCACACCTCTTCGCCTGCCACTCCAG
ACGTTTCAACCTCTTCTTCTGGCGCCTAGACTACGCAG*AATCTCCCTCATGATCGTCTG
TTCCTTCTTCGCACCAATCTACTACGCGTTCTCTTGCCACACTAACTGGCGTCTCTTCTA
CCTCTCCACGATCTCAATCCTCGGCCTCCTCGC*ATCTTTGCTCTC
TC

QA 1 886 1 886
DS 

RD RR2GT64TF 789 0 0
GGTGGTGAGCTCCATGGAAACGACGGAGCTCGGCCTTGCCGGATTTGTCAGCGCCTTCTC
CGGAGTAACAATTCGCTGGCCGTGGTCGTCAATGGCTAAAGCCGTTTACTTCTTCTCCAG
CGATCATCACGACTCGAACGTGACACACACTAGCTCGTTCTTGAACACACAAGGAGAAGT
TAACTACGAAACAGTTCCCAAATGGCCATGGCTAGTCTTCTTAACCGGAGCAATGACCTG
TTTGATATGCAGCTCCATGTCACACCTCTTCGCCTGCCACTCCAGACGTTTCAACCTCTT
CTTCTGGCGCCTAGACTACGCAGGAATCTCCCTCATGATCGTCTGTTCCTTCTTCGCACC
AATCTACTACGCGTTCTCTTGCCACACTAACTGGCGTCTCTTCTACCTCTCCACGATCTC
AATCCTCGGCCTCCTCGCCATCTTTGCTCTCCTCTCTCCAGCGCTCTCAGCTCCACGTTT
CAGATCTTTCAGAGCGGCTCTTTTCCTAACGATGGGATTCTCAGGCGTCATACCCGCTTC
GCACGTGCTTTACCTTCACTGGGATCATCCCAACGTCGTTATCGCTCTTGGTTACGAGCT
AGCTATGGCTGTGTTGTATGCAACGGGAGCAGGGTTTTACGTTAGCCGTATACCTGAGAG
ATGGAAGCCTGGTGCTTTCGATATTGCGGGACATAGCCATCAGATATTCCATGTGTTTGT
AGTGTTAG*AGCC*TTGCTCATAGTG*TGCCTCTCTC**TATCATGGATTT*CGACGTGC
TTCGCCT
CT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2G633JQ 561 0 0
GCGTTCTCTTGCCACACTAACTGGCGTCTCTTCTACCTCTCCACGATCTCAATCCTCGGC
CTCCTCGCCATCTTTGCTCTCCTCTCTCCAGCGCTCTCAGCTCCACGTTTCAGATCTTTC
AGAGCGGCTCTTTTCCTAACGATGGGATTCTCAGGCGTCATACCCGCTTCGCACGTGCTT
TACCTTCACTGGGATCATCCCAACGTCGTTATCGCTCTTGGTTACGAGCTAGCTATGGCT
GTGTTGTATGCAACGGGAGCAGGGTTTTACGTTAGCCGTATACCTGAGAGATGGAAGCCT
GGTGCTTTCGATATTGCGGGACATAGCCATCAGATATTCCATGTGTTTGTAGTGTTAGGA
GCCCTTGCTCATAGTGCTGCCTCTCTTCTTATCATGGATTTTCGACGTGCTTCGCCTTCT
TGTGCCTTTTGAAGCAAGTAACAGAACTGTAAAACGTTTAGTGATATTTCATTCAACGTA
TCATAATGTATGTGTTACATAGAAGATACGCATTGGCAATGTACTACACAACCCAAAGTA
TTAAACGCTTATTCTGGTGGC

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2GT64JQB 531 0 0
TTCTACCTCTCCACGATCTCAATCCTCGGCCTCCTCGCCATCTTTGCTCTCCTCTCTCCA
GCGCTCTCAGCTCCACGTTTCAGATCTTTCAGAGCGGCTCTTTTCCTAACGATGGGATTC
TCAGGCGTCATACCCGCTTCGCACGTGCTTTACCTTCACTGGGATCATCCCAACGTCGTT
ATCGCTCTTGGTTACGAGCTAGCTATGGCTGTGTTGTATGCAACGGGAGCAGGGTTTTAC
GTTAGCCGTATACCTGAGAGATGGAAGCCTGGTGCTTTCGATATTGCGGGACATAGCCAT
CAGATATTCCATGTGTTTGTAGTGTTAGGAGCCCTTGCTCATAGTGTTGCCTCTCTTCTT
ATCATGGATTTTCGACGTGCTTCGCCTTCTTGTGCCTTTTGAAGCAAGTAACAGAACTGT
AAAACGTTTAGTGATATTTCATTCAACGTATCATAATGTATGTGTTACATAGAAGATACG
CATTGGCAATGTACTACACAACCCAAAATATTAAACGCTTATTCTGGTGGC

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 6

CO CL1355Contig1 829 6 8 U
CAGTGAAAAATGGCACTCTTTTGTTTTCATTGATGACTAATATAGGATTCACAAGGTACA
AAAACACACGTAGATCCTACGTAACACGAACCAAGCGGCGCCGTATAAGCATATGTTAGC
ACACTAAAATCCTCGTCCGTGTTAGCTTAATGACTTACTACTAATTACAACGTCAAGCAA
GCTCCAGATTTATCGTTTCCTATTTTAATTTATACAAATCTGATTCATCTTTTTTTTTCT
TATATTCAAATTAACGCGGGTTAACTCGGACACCGAGTGAACTCGCTACCAGCACTGATC
GGTTTCCCAGTTCCGGCCAACGTAACCGCCCATCCCCGAGTTACCGACGGTCAAAGGCCT
GCTCCGGCGAAGCATCCTCCGATCGTAGACAGATCGTTTCTCGGGATCAGAGAGCGTACA
GTAAGCCGCGTGGATCTTCATGAACTCATCGGCCGACGTCCGATCGGTTCCCGCCGCCAC
GTCTGGATGGCAGATCCTGGCCAGTCTCCGGTAAGCCGATTTGATATCCTGGCTCGTCGC
GCCGAGAGGAACCTCCAGAATCTCGTAGAGAGAAGCGTTCGCCGTCGTCAGTCGCAGCGG
GATCTGGTGCAGCCGCGGGGCGTCCTCCGTGCAGGTGTATGAGCAAGAGGCGGAGACGGG
AGGAGGCGAGATACGGGCGGAGCGAGACGGTGGAGATACGGGGGAGAGAGGGGGAGAAGA
GGAGAGGAATGGATTAGCGAAGGAGGTTGGAGAAGAAGAAAGCATCTTTTG*CTGTGAAA
*CGGTGTCGTTTGCGTAGTTCTGGTTGAGTTTCTCTGCTTTGGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 30 30 
30 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RR2E538JQ U 1
AF RR2E538TF C 143
AF RR2B283JQ U 239
AF RR2DH19JQ U 242
AF RR2DH19TF C 242
AF RR2B283TF C 239
BS 1 242 RR2E538JQ
BS 243 243 RR2B283JQ
BS 244 387 RR2E538JQ
BS 388 388 RR2B283JQ
BS 389 471 RR2E538JQ
BS 472 472 RR2B283JQ
BS 473 537 RR2E538JQ
BS 538 829 RR2B283JQ

RD RR2E538JQ 537 0 0
CAGTGAAAAATGGCACTCTTTTGTTTTCATTGATGACTAATATAGGATTCACAAGGTACA
AAAACACACGTAGATCCTACGTAACACGAACCAAGCGGCGCCGTATAAGCATATGTTAGC
ACACTAAAATCCTCGTCCGTGTTAGCTTAATGACTTACTACTAATTACAACGTCAAGCAA
GCTCCAGATTTATCGTTTCCTATTTTAATTTATACAAATCTGATTCATCTTTTTTTTTCT
TAAATTCAAATTAACGCGGGTTAACTCGGACACCGAGTGAACTCGCTACCAGCACTGATC
GGTTTCCCAGTTCCGGCCAACGTAACCGCCCATCCCCGAGTTACCGACGGTCAAAGGCCT
GCTCCGGCGAAGCATCCTCCGATCGTATACAGATCGTTTCTCGGGATCAGAGAGCGTACA
GTAAGCCGCGTGGATCTTCATGAACTCATCGGCCGACGTCCGATCGGTTCCTGCCGCCAC
GTCTGGATGGCAGATCCTGGCCAGTCTCCGGTAAGCCGATTTGATATCCTGGCTCGT

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2E538TF 687 0 0
GTAGCTT
ATGACTTACTACTAAT*ACAACGTCAAGCAAGCTCCAGATTTATCGTTTC*TATTT*AAT
TTATACAAATCTGATTCATCTTTTTTTT*CTTAAATTCAAATTAACGCGGGTTAACTCGG
ACACCGAGTGAACTCGCTACCAGCACTGATCGGTTTCCCAGTTCCGGCCAACGTAACCGC
CCATCCCCGAGTTACCGACGGTCAAAGGCCTGCTCCGGCGAAGCATCCTCCGATCGTATA
CAGATCGTTTCTCGGGATCAGAGAGCGTACAGTAAGCCGCGTGGATCTTCATGAACTCAT
CGGCCGACGTCCGATCGGTTCCTGCCGCCACGTCTGGATGGCAGATCCTGGCCAGTCTCC
GGTAAGCCGATTTGATATCCTGGCTCGTCGCGCCGAGAGGAACCTCCAGGATCTCGTAGA
GAGAAGCGTTCGCCGTCGTCAGTCGCAGCGGGATCTGGTGCAGCCGCGGGGC*TCCTCCG
TGCAGGTGTATGAGCAGGAGGCGGAGACGGGAGGAGGCGAGATACGGGCGGAGCGAGACG
GAGGAGACACGGGGGAGAGAGGGGGAGAAGTGGAGAGGAATGGATTAGCGAAAGAGGTTG
GAGAAGAAGAAAGCATCTTTTGGCTGTGAAAACGGTGTCGTTTGCGTAGTTCTGATTGAT
TTTCTCTGCTTTGGTTTTCC

QA 8 687 8 687
DS 

RD RR2B283JQ 591 0 0
CTTATATTCAAATTAACGCGGGTTAACTCGGACACCGAGTGAACTCGCTACCAGCACTGA
TCGGTTTCCCAGTTCCGGCCAACGTAACCGCCCATCCCCGAGTTACCGACGGTCAAAGGC
CTGCTCCGGCGAAGCATCCTCCGATCGTAGACAGATCGTTTCTCGGGATCAGAGAGCGTA
CAGTAAGCCGCGTGGATCTTCATGAACTCATCGGCCTACGTCCGATCGGTTCCCGCCGCC
ACGTCTGGATGGCAAATCCTGGCCAGTCTCCGGTAAGCCGATTTGATATCCTGGCTCGTC
GCGCCGAGAGGAACCTCCAGAATCTCGTAGAGAGAAGCGTTCGCCGTCGTCAGTCGCAGC
GGGATCTGGTGCAGCCGCGGGGCGTCCTCCGTGCAGGTGTATGAGCAAGAGGCGGAGACG
GGAGGAGGCGAGATACGGGCGGAGCGAGACGGTGGAGATACGGGGGAGAGAGGGGGAGAA
GAGGAGAGGAATGGATTAGCGAAGGAGGTTGGAGAAGAAGAAAGCATCTTTTG*CTGTGA
AA*CGGTGTCGTTTGCGTAGTTCTGGTTGAGTTTCTCTGCTTTGGTTTTCC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2DH19JQ 588 0 0
ATATTCAAATTAACGCGGGTTAACTCGGACACCGAGTGAACTCGCTACCAGCACTGATCG
GTTTCCCAGTTCCGGCCAACGTAACCGCCCATCCCCGAGTTACCGACGGTCAAAGGCCTG
CTCCGGCGAAGCATCCTCCGATCGTAGACAGATCGTTTCTCGGGATCAGAGAGCGTACAG
TAAGCCGCGTGGATCTTCATGAACTCATTGGCCGACGTCCGATCGGTTCCCGCCGCCACG
TCTGGATGGCAGATCCTGGCCAGTCTCCGGTAAGCCGATTTGATATCCTGGCTCGTCGCG
CCGAGAGGAACCTCCAGAATCTCGTAGAGAGAAGCGTTCGCCGTCGTCAGTCGCAGCGGG
ATCTGGTGCAGCCGCGGGGCGTCCTCCGTGCAGGTGTATGAGCAAGGGGCGGAGACGGGA
GGAGGCGAGATACGGGCGGAGCGAGACGGTGGAGATACGGGGGAGAGAGGGGGAGAAGAG
GAGAGGAATGGATTAGCGAAGGAGGTTGGAGAAGAAGAAAGCATCTTTTG*CTGTGAAA*
CGGTGTCGTTTGCGTAGTTCTGGTTGAGTTTCTCTGCTTTGGTTTTCC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2DH19TF 588 0 0
ATATTCAAATTAACGCGGGTTAACTCGGACACCGAGTGAACTCGCTACCAGCACTGATCG
GTTTCCCAGTTCCGGCCAACGTAACCGCCCATCCCCGAGTTACCGACGGTCAAAGGCCTG
CTCCGGCGAAGCATCCTCCGATCGTAGACAGATCGTTTCTCGGGATCAGAGAGCGTACAG
TAAGCCGCGTGGATCTTCATGAACTCATTGGCCGACGTCCGATCGGTTCCCGCCGCCACG
TCTGGATGGCAGATCCTGGCCAGTCTCCGGTAAGCCGATTTGATATCCTGGCTCGTCGCG
CCGAGAGGAACCTCCAGAATCTCGTAGAGAGAAGCGTTCGCCGTCGTCAGTCGCAGCGGG
ATCTGGTGCAGCCGCGGGGCGTCCTCCGTGCAGGTGTATGAGCAAGGGGCGGAGACGGGA
GGAGGCGAGATACGGGCGGAGCGAGACGGTGGAGATACGGGGGAGAGAGGGGGAGAAGAG
GAGAGGAATGGATTAGCGAAGGAGGTTGGAGAAGAAGAAAGCATCTTTTG*CTGTGAAA*
CGGTGTCGTTTGCGTAGTTCTGGTTGAGTTTCTCTGCTTTGGTTTTCC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2B283TF 591 0 0
CTTATATTCAAATTAACGCGGGTTAACTCGGACACCGAGTGAACTCGCTACCAGCACTGA
TCGGTTTCCCAGTTCCGGCCAACGTAACCGCCCATCCCCGAGTTACCGACGGTCAAAGGC
CTGCTCCGGCGAAGCATCCTCCGATCGTAGACAGATCGTTTCTCGGGATCAGAGAGCGTA
CAGTAAGCCGCGTGGATCTTCATGAACTCATCGGCCTACGTCCGATCGGTTCCCGCCGCC
ACGTCTGGATGGCAAATCCTGGCCAGTCTCCGGTAAGCCGATTTGATATCCTGGCTCGTC
GCGCCGAGAGGAACCTCCAGAATCTCGTAGAGAGAAGCGTTCGCCGTCGTCAGTCGCAGC
GGGATCTGGTGCAGCCGCGGGGCGTCCTCCGTGCAGGTGTATGAGCAAGAGGCGGAGACG
GGAGGAGGCGAGATACGGGCGGAGCGAGACGGTGGAGATACGGGGGAGAGAGGGGGAGAA
GAGGAGAGGAATGGATTAGCGAAGGAGGTTGGAGAAGAAGAAAGCATCTTTTG*CTGTGA
AA*CGGTGTCGTTTGCGTAGTTCTGGTTGAGTTTCTCTGCTTTGGTTTTCC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL1356Contig1 932 2 4 U
CCTGTCAAGCATTGTCACATGCATAAACCAAACTTTATTCATTTCACAAATTAGTCGGAT
TAGAGCTTTGTCAAGCTGAGCTCCACATATAGATTTATTACCAAGTCTATTTATTTGGTA
ACTGTGCTCATGTCAAGTACAACACCATAGAAAACATACATAGATGAATCTCTAGATTTG
GGAGAACGATGTGACAGTCTTGAACCCGTGATTGTCTGGAAGAGAAGCGTTACCAGGTCG
AATCGATATAACCGCCTCCAGACCTGCAGCTTTTGCAGCAGTAGCTTCTTGATAAACATC
TGTGACAAAAAGAATCTCTGAAGGATCATCCACTCCCAATGTTTCTGTAATCTCCTTGTA
ACTCTTGCTTTCTTTCTTGTTTCCGATTGTAGTGTCGAAAAAGCCTGATAAATACTTCCT
CAGGTCTCCATAGTTTGTGTTCCCAAAGAGAAGCCTTTGCGCTAATCGACTACCACTTGA
ATATATGTAAACCTTTATTCCTGAAGAATGCCATTTCTCTAAAGCCTCTGCTACATCATC
AAAAACAACAGACTTCAGTTCATTACATTCAAAACCTGTTCTCCATATGTGACCTTGCAA
TTCCTTTAAAGCAGTGATCTTTCTATCGGCTTTGATCATTGCCTCTACATTAGAGACCAC
AGCTGCAATGACCTTCTCTTTTCCTTCATCAGCATGAGGTATAGGAACCGCACCGGCTAA
ACCCTCTCTCAAGTCTTCTTCAACCTGAGACCGCAACAACTCGATATCCTCTTGTGTTTC
TGCTGTGTCGAACGTCAAATTCAAATGCTTTCCAACGTTTTCACGAGCATAGGGAAAGAG
AACATCTGTAACGAATGTTATGGGGCGTAGTTGTGCCTTCAATGTCCAGGACATGCATCT
CCGAGGTGGTTCTGTTTGGTTTTGTGAATCCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AU16JQ U 1
AF RR2AY65JQ U 1
BS 1 864 RR2AU16JQ
BS 865 865 RR2AY65JQ
BS 866 910 RR2AU16JQ
BS 911 932 RR2AY65JQ

RD RR2AU16JQ 910 0 0
CCTGTCAAGCATTGTCACATGCATAAACCAAACTTTATTCATTTCACAAATTAGTCGGAT
TAGAGCTTTGTCAAGCTGAGCTCCACATATAGATTTATTACCAAGTCTATTTATTTGGTA
ACTGTGCTCATGTCAAGTACAACACCATAGAAAACATACATAGATGAATCTCTAGATTTG
GGAGAACGATGTGACAGTCTTGAACCCGTGATTGTCTGGAAGAGAAGCGTTACCAGGTCG
AATCGATATAACCGCCTCCAGACCTGCAGCTTTTGCAGCAGTAGCTTCTTGATAAACATC
TGTGACAAAAAGAATCTCTGAAGGATCATCCACTCCCAATGTTTCTGTAATCTCCTTGTA
ACTCTTGCTTTCTTTCTTGTTTCCGATTGTAGTGTCGAAAAAGCCTGATAAATACTTCCT
CAGGTCTCCATAGTTTGTGTTCCCAAAGAGAAGCCTTTGCGCTAATCGACTACCACTTGA
ATATATGTAAACCTTTATTCCTGAAGAATGCCATTTCTCTAAAGCCTCTGCTACATCATC
AAAAACAACAGACTTCAGTTCATTACATTCAAAACCTGTTCTCCATATGTGACCTTGCAA
TTCCTTTAAAGCAGTGATCTTTCTATCGGCTTTGATCATTGCCTCTACATTAGAGACCAC
AGCTGCAATGACCTTCTCTTTTCCTTCATCAGCATGAGGTATAGGAACCGCACCGGCTAA
ACCCTCTCTCAAGTCTTCTTCAACCTGAGACCGCAACAACTCGATATCCTCTTGTGTTTC
TGCTGTGTCGAACGTCAAATTCAAATGCTTTCCAACGTTTTCACGAGCATAGGGAAAGAG
AACATCTGTAACGAATGTTATGGG*CGTAGTTGTGCCTTCAATGTCCAGGACATGCATCT
CCGAGGTGGT

QA 1 910 1 910
DS 

RD RR2AY65JQ 932 0 0
CCTGTCAAGCATTGTCACATGCATAAACCAAACTTTATTCATTTCACAAATTAGTCGGAT
TAGAGCTTTGTCAAGCTGAGCTCCACATATAGATTTATTACCAAGTCTATTTATTTGGTA
ACTGTGCTCATGTCAAGTACAACACCATAGAAAACATACATAGATGAATCTCTAGATTTG
GGAGAACGATGTGACAGTCTTGAACCCGTGATTGTCTGGAAGAGAAGCGTTACCAGGTCG
AATCGATATAACCGCCTCCAGACCTGCAGCTTTTGCAGCAGTAGCTTCTTGATAAACATC
TGTGACAAAAAGAATCTCTGAAGGATCATCCACTCCCAATGTTTCTGTAATCTCCTTGTA
ACTCTTGCTTTCTTTCTTGTTTCCGATTGTAGTGTCGAAAAAGCCTGATAAATACTTCCT
CAGGTCTCCATAGTTTGTGTTCCCAAAGAGAAGCCTTTGCGCTAATCGACTACCACTTGA
ATATATGTAAACCTTTATTCCTGAAGAATGCCATTTCTCTAAAGCCTCTGCTACATCATC
AAAAACAACAGACTTCAGTTCATTACATTCAAAACCTGTTCTCCATATGTGACCTTGCAA
TTCCTTTAAAGCAGTGATCTTTCTATCGGCTTTGATCATTGCCTCTACATTAGAGACCAC
AGCTGCAATGACCTTCTCTTTTCCTTCATCAGCATGAGGTATAGGAACCGCACCGGCTAA
ACCCTCTCTCAAGTCTTCTTCAACCTGAGACCGCAACAACTCGATATCCTCTTGTGTTTC
TGCTGTGTCGAACGTCAAATTCAAATGCTTTCCAACGTTTTCACGAGCATAGGGAAAGAG
AACATCTGTAACGAATGTTATGGGGCGTAGTTGTGCCTTCAATGTCCAGGACATGCATCT
CCGAGGTGGTTCTGTTTGGTTTTGTGAATCCT

QA 1 932 1 932
DS 



AS 1 6

CO CL1357Contig1 748 6 4 U
GGCTGCTGCAGCCGTATTCGTCTTTGAGATAACAAGGACTTCTGCTTATTTTCCGGTCTT
TAAAAATCATTTTAAAGAGACAACATGTCGGGCGAAGAGGCTGCTCCAGTTGTTGTTCCT
CCCGTTGCCGAGCCAGCGGCCGTCATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACCGCATTGGAG
CTGACTCTTAGGAAAGCTCGTGCTCATGGTGGTGTTGTACGTGGTCTCCACGAGAGCGCT
AAGCTTATTGAGAAGCGTGTGGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCT
GATTACGTGAAGCTTGTTAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTT
CCAAGTGCAAAGACCCTTGGCGAATGGGCTGGTCTCTGTAAGATCGACTCTGAGGGCAAT
GCCAGGAAGGTTGTTGGATGCTCCTGTCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACT
GCGCTCAATATCGTCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTTAAGGAGCATTTCGAAT
CTCGAATATTACAATGTGTTTTTTTCTTTCTTTCATCTCAGTGTCGTTTATCTTGGTTAT
AATATTTTAGCAGACAGCTCTCTCTCGCGCTTTGTTTGGAACATGATCAAGTTTTGCTGT
TATGTAAGCCACGACTCTTACAAGGCCCCATTTTTATTGAGGTTTTCTTTGCCTACTATT
TTGTTTTTTTTTAATAAAATAAATGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E769TF U 6
AF RR2DV52TF U 1
AF RR2F645TF U 8
AF RR2DV52JQ C 17
AF RR2C096TF U 170
AF RR2E769JQ C 47
BS 1 684 RR2DV52TF
BS 685 686 RR2F645TF
BS 687 700 RR2C096TF
BS 701 748 RR2E769JQ

RD RR2E769TF 378 0 0
GGGC
AGCCGTATTCGTCTTTGAGATAACAAGGACTTCTGCTTATTTTCCGGTCTTTAAAAATCA
TTTTAAAGAGACAACATGTCGGGCGAAGAGGCTGCTCCAGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCC
GAGCCAGCGGCCGTCATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACCGCATTGGAGCTGACTCTT
AGGAAAGCTCGTGCTCATGGTGGTGTTGTACGTGGTCTCCACGAGAGCGCTAAGCTTATT
GAGAAGCGTGTGGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTGATTACGTG
AAGCTTGTTAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGT
CAAGACCCTTGGCGATG

QA 5 361 5 361
DS 

RD RR2DV52TF 688 0 0
GGCTGCTGCAGCCGTATTCGTCTTTGAGATAACAAGGACTTCTGCTTATTTTCCGGTCTT
TAAAAATCATTTTAAAGAGACAACATGTCGGGCGAAGAGGCTGCTCCAGTTGTTGTTCCT
CCCGTTGCCGAGCCAGCGGCCGTCATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACCGCATTGGAG
CTGACTCTTAGGAAAGCTCGTGCTCATGGTGGTGTTGTACGTGGTCTCCACGAGAGCGCT
AAGCTTATTGAGAAGCGTGTGGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCT
GATTACGTGAAGCTTGTTAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTT
CCAAGTGCAAAGACCCTTGGCGAATGGGCTGGTCTCTGTAAGATCGACTCTGAGGGCAAT
GCCAGGAAGGTTGTTGGATGCTCCTGTCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACT
GCGCTCAATATCGTCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTTAAGGAGCATTTCGAAT
CTCGAATATTACAATGTGTTTTTTTCTTTCTTTCATCTCAGTGTCGTTTATCTTGGTTAT
AATATTTTAGCAGACAGCTCTCTCTCGCGCTTTGTTTGGAACATGATCAAGTTTTGCTGT
TATGTAAGCCACGACTCTTACAAG
CCCC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2F645TF 679 0 0
GG
AGCCGTATTCGTCTTTGAGATAACAAGGACTTCCGCTTATTTTCCGGTCTTTAAAAATCA
TTTTAAAGAGACAACATGTCGGGCGAAGAGGCTGCTCCAGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCC
GAGCCAGCGGCCGTCATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACCGCATTGGAGCTGACTCTT
AGGAAAGCTCGTGCTCATGGTGGTGTTGTACGTGGTCTCCACGAGAGCGCTAAGCTTATT
GAGAAGCGTGTGGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTGATTACGTG
AAGCTTGTTAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCA
AAGACCCTTGGCGAATGGGCTGGTCTCTGTAAGATCGACTCTGAGGGCAATGCCAGGAAG
GTTGTTGGATGCTCCTGTCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCGCTCAAT
ATCGTCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTTAAGGAGCATTTCGAATCTCGAATAT
TACAATGTGTTTTTTTCTTTCTTTCATCTCAGTGTCGTTTATCTTGGTTATAATATTTTA
GCAGACAGCTCTCTCTCGCGCTTTGTTTGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATGTAAGC
CACGACTCTTACAAGGC

QA 3 679 3 679
DS 

RD RR2DV52JQ 684 0 0
TTCGTCTTTGAGATAACAAGGACTTCTGCTTATTTTCCGGTCTTTAAAAATCATTTTAAA
GAGACAACATGTCGGGCGAAGAGGCTGCTCCAGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCCGAGCCAG
CGGCCGTCATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACCGCATTGGAGCTGACTCTTAGGAAAG
CTCGTGCTCATGGTGGTGTTGTACGTGGTCTCCACGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGC
GTGTGGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTGCAACCAGCCTGATTACGTGAAGCTTG
TTAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCAAAGACCC
TTGGCGAATGGGCTGGTCTCTGTAAGATCGACTCTGAGGGCAATGCCAGGAAGGTTGTTG
GATGCTCCTGTCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCGCTCAATATCGTCA
AGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTTAAGGAGCATTTCGAATCTCGAATATTACAATG
TGTTTTTTTCTTTCTTTCATCTCAGTGTCGTTTATCTTGGTTATAATATTTTAGCAGACA
GCTCTCTCTCGCGCTTTGTTTGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATGTAAGCCACGACT
CTTACAAGGCCCCATTTTTATTGA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2C096TF 531 0 0
G
CGCATTGGAGCTGACTCTTAGGAAAGCTCGTGCTCATGGTGGTGTTGTACGTGGTCTCCA
CGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTGGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGACTG
CAACCAGCCTGATTACGTGAAGCTTGTTAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAGCATCAACTT
GCTTACTGTTCCAAGTGCAAAGACCCTTGGCGAATGGGCTGGTCTCTGTAAGATCGACTC
TGAGGGCAATGCCAGGAAGGTTGTTGGATGCTCCTGTCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGA
GGATACAACTGCGCTCAATATCGTCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTTAAGGAG
CATTTCGAATCTCGAATATTACAATGTGTTTTTTTCTTTCTTTCATCTCAGTGTCGTTTA
TCTTGGTTATAATATTTTAGCAGACAGCTCTCTCTCGCGCTTTGTTTGGAACATGATCAA
GTTTTGCTGTTATGTAAGCCACGACTCTTACAAGGCCCCATTTTTATTGA

QA 2 531 2 531
DS 

RD RR2E769JQ 702 0 0
TATTTTCCGGTCTTTAAAAATCATTTTAAAGAGACAACATGTCGGGCGAAGAGGCTGCTC
CAGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCCGAGCCAGCGGCCGTCATCCCAGAGGACATGGACTTGT
TGACCGCATTGGAGCTGACTCTTAGGAAAGCTCGTGCTCATGGTGGTGTTGTACGTGGTC
TCCACGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTGGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAG
ACTGCAACCAGCCTGATTACGTGAAGCTTGTTAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAGCATCA
ACTTGCTTACTGTTCCAAGT*CAAAGACCCTTGGCGAATGGACTGGTCTCTGTAAGATCG
ACTCTGAGGGCAATGCCAGGAAGGTTGTTGGATGCTCCTGTCTTGTAGTCAAGGACTACG
GTGAGGATACAACTGCGCTCAATATCGTCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTTAA
GGAGCATTTCGAATCTCGAATATTACAATGTGTTTTTTTCTTTCTTTCATCTCAGTGTCG
TTTATCTTGGTTATAATATTTTAGCAGACAGCTCTCTCTCGCGCTTTGTTTGGAACATGA
TCAAGTTTTGCTGTTATGTAAGCCACGACTCTTACAAGGCCCCATTTTTATTGAGGTTTT
CTTTGCCTACTATTTTGTTTTTTTTTAATAAAATAAATGTGC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 2 6

CO CL1358Contig1 825 3 4 U
GAATCTCTTCATTATAGTTACTATTTTAACCAAGACAATAAGCATTCGCAAGTGTTATTC
ACAGAGGAAGTGTTGGCTTTATCAACA**TTATTGTAACAAAA*AAAAAGAGTTCAGGGA
AAAGAGATTGATTCAAAAACAAAGCACCAAATAGAGATGTTTACAGTTTTTGACAACTAC
ATATGATTGAAGCTGTTGTCTCCGTTTATTAGCCTCACTCTCAATGTAAGGTAGATCAGT
ATCAATGTTCCCACACTTGATAAGATGGAGAATAAGATGACGATTTTCCTAGAATCAAAT
GAAGCAGCACGCTTGTATCTTCTCCACCTGTTTGTTGGTGCATCATGCCATCTCTCTGAG
ATAGCTTTATCGAAACATTTGTAATCATCTTTATCAGTGCTCAAGCTTGCTTGTCTCTGC
AATACCTT*********ATTCTCGGATTTGAGACTTGCAACAACTTCTTCTTCTGACTCA
GCACGGTTCCCTTTCTCGACGTTGATGTCAACAACGCAAGATTGGTAGGAATCAGTGCCT
CCAAGTAGCACATTGATGCGGTTCTGAGTTTTCTGGCAGTTGAGTTGTGCATCGATGAGC
ATCTGGTTTTTAGAAGGAAGCAGAGACTTGACGAAGCTCAAGAGAGTAAACCGGTGAGGG
ATTATGTTTCCTTCATCAGGTAAGACTGCTATAGTGCACACGTCTTGGATTAGTGAATGA
TCGATGCAACGGTCTTGTTTCAAAGGAAATGCAGACTCCTTAACAAGAGGAAACACATCT
ATAGAGGTATGTTTGGCAACATCAGTGAAGCTAGGCTTAGAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP62JQ U 1
AF RR2EC45JQ U 47
AF RR2FR82JQ U 40
BS 1 359 RR2BP62JQ
BS 360 360 RR2FR82JQ
BS 361 706 RR2BP62JQ
BS 707 825 RR2FR82JQ

RD RR2BP62JQ 706 0 0
GAATCTCTTCATTATAGTTACTATTTTAACCAAGACAATAAGCATTCGCAAGTGTTATTC
ACAGAGGAAGTGTTGGCTTTATCAACA**TTATTGTAACAAAA*AAAAAGAGTTCAGGGA
AAAGAGATTGATTCAAAAACAAAGCACCAAATAGAGATGTTTACAGTTTTTGACAACTAC
ATATGATTGAAGCTGTTGTCTCCGTTTATTAGCCTCACTCTCAATGTAAGGTAGATCAGT
ATCAATGTTCCCACACTTGATAAGATGGAGAATAAGATGACGATTTTCCTAGAATCAAAT
GAAGCAGCACGCTTGTATCTTCTCCACCTGTTTGTTGGTGCATCATGCCATCTCTCTGAA
ATAGCTTTATCGAAACATTTGTAATCATCTTTATCAGTGCTCAAGCTTGCTTGTCTCTGC
AATACCTT*********ATTCTCGGATTTGAGACTTGCAACAACTTCTTCTTCTGACTCA
GCACGGTTCCCTTTCTCGACGTTGATGTCAACAACGCAAGATTGGTAGGAATCAGTGCCT
CCAAGTAGCACATTGATGCGGTTCTGAGTTTTCTGGCAGTTGAGTTGTGCATCGATGAGC
ATCTGGTTTTTAGAAGGAAGCAGAGACTTGACGAAGCTCAAGAGAGTAAACCGGTGAGGG
ATTATGTTTCCTTCATCAGGTAAGACTGCTATAGTGCACACGTCTT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2EC45JQ 701 0 0
C
GCAAGTGTTATTCACAGAGGAAGTGTTGGCTTTATCAACA**TTATTGTAACAAAA**AA
AAGAGTTCAGGGAAAAGAGATTGATTCAAAAACAAAGCACCAAATAGAGATGTTTACAGT
TTTTGACAACTACATATGATTGAAGCTGTTGTCTCCGTTTATTAGCCTCACTCTCAATGT
AAGGTAGATCAGTATCAATGTTCCCACACTTGATAAGATGGAGAATAAGATGACGATTTT
CCTAGAATCAAATGAAGCAGCACGCTTGTATCTTCTCCACCTGTTTGTTGGTGCATCATG
CCATCTCTCTGAGATAGCTTTATCGAAACATTTGTAATCATCTTTATCAGTGCTCAAGCT
TGCTTGTCTCTGCAATACCTT*********ATTCTCGGATTTGAGACTTGCAACAACTTC
TTCTTCTGACTCAGCACGGTTCCCTTTCTCGACGTTGATGTCAACAACGCAAGATTGGTA
GGAATCAGTGCCTCCAAGTAGCACATTGATGCGGTTCTGAGTTTTCTGGCAGTTGAGTTG
TGCATCGATGAGCATCTGGTTTTTAGAAGGAAGCAGAGACTTGACGAAGCTCAAGAGAGT
AAACCGGTGAGGGATTATGTTTCCTTCATCAGGTAAGACTGCTATAGTGCACACGTCTTG
GATTAGTGAATGATCGATGCAACGGTCTTGTTTCAAAGGA

QA 2 701 2 701
DS 

RD RR2FR82JQ 786 0 0
AAGCATTA
GCAAGTGTTATTCACAGAGGAATTGTTGGCTTTATCAACACATTATTGTAACAAAACAAA
AAGAGTTTAGGGAAAAGAGATTGATTCAAAAACAATGCACCAAATAGAGATGTTTACAGT
TTTTGACAACTACATATGATTGAAGCTGTTGTCTCCGTTTATTAGCCTCACTCTCAATGT
CAGGTAGATCAGTATCAATGTCCCCACACTTGATAAGATGGAGAATAAGATGACGATTTT
CCTAGAATCAAATGAAGCAGCACGCTTGTATCTTCTCCACCTGTTTGTTGGTGCATCATG
CCATCTCTCTGAGATAGCTTTATCGAAACATTTGTAATCATCTTTATCAGTGCTCAAGCT
TGCTTGTCTCTGCAATACCTTCTGCATATGATTCTCGGATTTGAGACTTGCAACAACTTC
TTCTTCTGACTCAGCACGGTTCCCTTTCTCGACGTTGATGTCAACAACGCAAGATTGGTA
GGAATCAGTGCCTCCAAGTAGCACATTGATGCGGTTCTGAGTTTTCTGGCAGTTGAGTTG
TGCATCGATGAGCATCTGGTTTTTAGAAGGAAGCAGAGACTTGACGAAGCTCAAGAGAGT
AAACCGGTGAGGGATTATGTTTCCTTCATCAGGTAAGACTGCTATAGTGCACACGTCTTG
GATTAGTGAATGATCGATGCAACGGTCTTGTTTCAAAGGAAATGCAGACTCCTTAACAAG
AGGAAACACATCTATAGAGGTATGTTTGGCAACATCAGTGAAGCTAGGCTTAGAGCTT

QA 9 786 9 786
DS 



CO CL1358Contig2 835 3 6 U
GGAATCACAGCCGGGACCTGAGAAGTAAGAGTATAGCCTTGTTCTGAACTCTTTCTCTCT
CTCTGTATATACACTTCTGCTTCTTTACATGCAACAACAAGTCTCTTGAGAACTACTTCT
CCGTGGGTTCACACGATTCTCTCTGCGATGGCTGCGACTACTTGTGGTGAAGGGGGGAAG
CAACAACTCCCAAGTGTTGCAGACTTGAACGCCCCAGTCATCAAGTATCCAAGCTTCAAA
GCTCCTAAGCCTAGCTTCACTGATGTTGCCAAACATACCTCTATAGATGTGTTTCCTCTT
GTTAAGGAGTCTGCATTTCCTTTGAAACAAGACCGTTGCATCGATCATTCACTAATCCAA
GACGTGTGCACTATAGCAGTCTTACCTGATGAAGGAAACATAATCCCTCACCGGTTTACT
CTCTTGAGCTTCGTCAAGTCTCTGCTTCCTTCTAAAAACCAGATGCTCATCGATGCACAA
CTCAACTGCCAGAAAACTCAGAACCGCATCAATGTGCTACTTGGAGGCACTGATTCCTAC
CAATCTTGCGTTGTTGACATCAACGTCGAGAAAGGGAACCGTGCTGAGTCAGAAGAAGAA
GTTGTTGCAAGTCTCAAATCCGAGAAT*********AAGGTATTGCAGAGACAAGCAAGC
TTGAGCACTGATAAAGATGATTACAAATGTTTCGATAAAGCTATCTCAGAGAGATGGCAT
GATGCACCAACAAACAGGTGGAGAAGATACAAGCGTGCTGCTTCATTTGATTCTAGGAAA
TCGTCATCTTATTCTCATCTTATCAAGTGTGGGAACATTGATACTGATCTACTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC45TF U 1
AF RR2FR82TF U 97
AF RR2BP62TF U 97
BS 1 251 RR2EC45TF
BS 252 252 RR2BP62TF
BS 253 639 RR2EC45TF
BS 640 640 RR2BP62TF
BS 641 733 RR2EC45TF
BS 734 835 RR2BP62TF

RD RR2EC45TF 733 0 0
GGAATCACAGCCGGGACCTGAGAAGTAAGAGTATAGCCTTGTTCTGAACTCTTTCTCTCT
CTCTGTATATACACTTCTGCTTCTTTACATGCAACAACAAGTCTCTTGAGAACTACTTCT
CCGTGGGTTCACACGATTCTCTCTGCGATGGCTGCGACTACTTGTGGTGAAGGGGGGAAG
CAACAACTCCCAAGTGTTGCAGACTTGAACGCCCCAGTCATCAAGTATCCAAGCTTCAAA
GCTCCTAAGCCCAGCTTCACTGATGTTGCCAAACATACCTCTATAGATGTGTTTCCTCTT
GTTAAGGAGTCTGCATTTCCTTTGAAACAAGACCGTTGCATCGATCATTCACTAATCCAA
GACGTGTGCACTATAGCAGTCTTACCTGATGAAGGAAACATAATCCCTCACCGGTTTACT
CTCTTGAGCTTCGTCAAGTCTCTGCTTCCTTCTAAAAACCAGATGCTCATCGATGCACAA
CTCAACTGCCAGAAAACTCAGAACCGCATCAATGTGCTACTTGGAGGCACTGATTCCTAC
CAATCTTGCGTTGTTGACATCAACGTCGAGAAAGGGAACCGTGCTGAGTCAGAAGAAGAA
GTTGTTGCAAGTCTCAAATCCGAGAAT*********AAG*TATTGCAGAGACAAGCAAGC
TTGAGCACTGATAAAGATGATTACAAATGTTTCGATAAAGCTATCTCAGAGAGATGGCAT
GATGCACCAACAA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2FR82TF 637 0 0
GG
AAGTCTCTTGAGAACTACTTCTCCGTGGGTTCACACGATTCTCTCTGCGATGGCTGCGAC
TACTTGTGGTGAAGGGGGGAAGCAACAACTCCCAAGTGTTGCAGACTTGAACGCCCCAGT
CATCAAGTATCCAAGCTTCAAAGCTCCTAAGCCTAGCTTCACTGATGTTGCCAAACATAC
CTCTATAGATGTGTTTCCTCTTGTTAAGGAGTCTGCATTTCCTTTGAAACAAGACCGTTG
CATCGATCATTCACTAATCCAAGACGTGTGCACTATAGCAGTCTTACCTGATGAAGGAAA
CATAATCCCTCACCGGTTTACTCTCTTGAGCTTCGTCAAGTCTCTGCTTCCTTCTAAAAA
CCAGATGCTCATCGATGCACAACTCAACTGCCAGAAAACTCAGAACCGCATCAATGTGCT
ACTTGGAGGCACTGATTCCTACCAATCTTGCGTTGTTGACATCAACGTCGAGAAAGGGAA
CCGTGCTGAGTCAGAAGAAGAAGTTGTTGCAAGTCTCAAATCCGAGAATCATATGCAGAA
GGTATTGCAGAGACAAGCAAGCTTGAGCACTGATAAAGATGATTACAAATGTTTCGATAA
AGCTATCTCAGAGAGATGGCATGATGCACCAACAA

QA 3 637 3 637
DS 

RD RR2BP62TF 739 0 0
GG
AAGTCTCTTGAGAACTACTTCTCCGTGGGTTCACACGATTCTCTCTGCGATGGCTGCGAC
TACTTGTGGTGAAGGGGGGAAGCAACAACTCCCAAGTGTTGCAGACTTGAACGCCCCAGT
CATCAAGTATCCAAGCTTCAAAGCTCCTAAGCCTAGCTTCACTGATGTTGCCAAACATAC
CTCTATAGATGTGTTTCCTCTTGTTAAGGAGTCTGCATTTCCTTTGAAACAAGACCGTTG
CATCGATCATTCACTAATCCAAGACGTGTGCACTATAGCAGTCTTACCTGATGAAGGAAA
CATAATCCCTCACCGGTTTACTCTCTTGAGCTTCGTCAAGTCTCTGCTTCCTTCTAAAAA
CCAGATGCTCATCGATGCACAACTCAACTGCCAGAAAACTCAGAACCGCATCAATGTGCT
ACTTGGAGGCACTGATTCCTACCAATCTTGCGTTGTTGACATCAACGTCGAGAAAGGGAA
CCGTGCTGAGTCAGAAGAAGAAGTTGTTGCAAGTCTCAAATCCGAGAAT*********AA
GGTATTGCAGAGACAAGCAAGCTTGAGCACTGATAAAGATGATTACAAATGTTTCGATAA
AGCTATCTCAGAGAGATGGCATGATGCACCAACAAACAGGTGGAGAAGATACAAGCGTGC
TGCTTCATTTGATTCTAGGAAATCGTCATCTTATTCTCATCTTATCAAGTGTGGGAACAT
TGATACTGATCTACTTA

QA 3 739 3 739
DS 



AS 1 5

CO CL1359Contig1 929 5 44 U
GGACACCTCTCTCTCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCCAGATTTGA
ATCATCGACCTGATCTCAGATCCAAATCACAAGCCTTCGACATGTCTACCTTCAGCGGCG
ATGAAACAGCTCCTTTCTTCGGCTTCCTCGGCGCTGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTA
TGGGAGCTGCTTATGGAACAGCAAAGAGTGGAGTTGGTGTGGCTTCTATGGGAGTCATGA
GGCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCATTGTCCCCGTTGTCATGGCTGGTGTCTTGGGTATTT
ACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGTATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTACT
ACCTCTTCGATGGATACGCACATCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTTT
CTGCTGGTATGGCCATTGGTATTGTCGGAGACGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGC
CTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAGGCGCTTGCTCTTTACG
GTCTTATTGTGGGAATCATCCTCTCCTCGCGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAGT
GTAACCCACCA****TAAGATTTTTCCCCGAAGGTACTTTTATTTTCTGTGTGTGTTTTG
TTGTTCTATCGTTCTTTAGCATATGTATCTTCGGGAACTGAAAAAAAAACAAATTATTGG
ACACTTGGGAACTTTGTTTCGGAAGCTCTCCTATTTCTCTCTCTCGGTGGTTTCTCTCCG
ATGTAGGGATTTTTTTTATTATTTTGTTCTGTAATAAAGAGAGCTCTGATGGAGCTTGGT
ATGTTTTTGTATTCTTGTATTGTCCTGAGGAAGTTAAATACATTTATTTGTAAAGAAGTT
TGCTTTCTGAAATCATCTCTCGAGTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D324TF U 1
AF RR2EY93TF U 37
AF RR2FG86TF U 45
AF RR2EE37JQ C 428
AF RR2FG86JQ C 366
BS 1 157 RR2D324TF
BS 158 158 RR2EY93TF
BS 159 248 RR2D324TF
BS 249 249 RR2EY93TF
BS 250 265 RR2D324TF
BS 266 266 RR2EY93TF
BS 267 289 RR2D324TF
BS 290 290 RR2EY93TF
BS 291 334 RR2D324TF
BS 335 335 RR2EY93TF
BS 336 349 RR2D324TF
BS 350 350 RR2EY93TF
BS 351 373 RR2D324TF
BS 374 374 RR2EY93TF
BS 375 409 RR2D324TF
BS 410 410 RR2EY93TF
BS 411 439 RR2D324TF
BS 440 440 RR2EY93TF
BS 441 448 RR2D324TF
BS 449 449 RR2EY93TF
BS 450 451 RR2D324TF
BS 452 452 RR2FG86TF
BS 453 473 RR2D324TF
BS 474 474 RR2EY93TF
BS 475 523 RR2D324TF
BS 524 524 RR2FG86TF
BS 525 541 RR2D324TF
BS 542 542 RR2EY93TF
BS 543 568 RR2D324TF
BS 569 570 RR2FG86TF
BS 571 611 RR2D324TF
BS 612 615 RR2EY93TF
BS 616 616 RR2FG86TF
BS 617 637 RR2D324TF
BS 638 640 RR2EY93TF
BS 641 641 RR2FG86TF
BS 642 689 RR2EY93TF
BS 690 690 RR2FG86TF
BS 691 708 RR2EY93TF
BS 709 709 RR2FG86JQ
BS 710 713 RR2FG86TF
BS 714 765 RR2EY93TF
BS 766 772 RR2FG86TF
BS 773 929 RR2FG86JQ

RD RR2D324TF 637 0 0
GGACACCTCTCTCTCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCCAGATTTGA
ATCATCGACCTGATCTCAGATCCAAATCACAAGCCTTCGACATGTCTACCTTCAGCGGCG
ATGAAACAGCTCCTTTCTTCGGCTTCCTCGGCGCTGCCGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTA
TGGGAGCTGCTTATGGAACAGCAAAGAGTGGAGTTGGTGTGGCTTCTATGGGAGTCATGA
GGCCAGAGCTGGTCATGAAGTCCATCGTCCCCGTTGTCATGGCTGGTGTATTGGGTATTT
ACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGCCAAGTCTTACT
ACCTCTTCGATGGGTACGCACATCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTTT
CTGCTGGTATGGCCATTGGGATTGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTTAGCAGC
CTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAAGCGCTTGCTCTTTACG
GCCTTATTGTGGGAATCATCCTCTCCTCAAGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAGT
GTAACCCACCAACCACAAGATTTTTCCCCGAAGGTAC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2EY93TF 730 0 0
CTCTCTCTCTCTCGCCAGATTTGAATCATCGACCTGATCTCAGATCCAAATCACAAGCCT
TCGACATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTCCTTTCTTCGGCTTCCTCGGCGCTG
CAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATGGAACAGCACAGAGTGGAGTTG
GTGTGGCTTCCATGGGAGTCATGAGGCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCATTGTCCCCGTTG
TCATGGCTGGTGTCTTGGGTATTTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGTA
TTAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGATGGATACGCTCATCTCTCCTCCGGTC
TTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTTTCTGCTGGTATGGCGATTGGTATTGTCGGAGATGCCG
GTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATCT
TCGCAGAAGCGCTTGCTCTTTACGGTCTTATTGTGGGAATCATCCTCTCCTCAAGAGCTG
GCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAGTGTAACCCACCA****CAAGATTTTTCCCCGAAG*TA
CTTT*ATTTTCTGTGTGTGTTTTGTTGTTCTATCGTTCTTTAGCATATGTATCATCGGGA
ACTGAAAAAAAA*****TTATTGGACACTTGGGAACTTTGTTTCGGAAGCTCTCCTATTT
CTCTCTCTC
T

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2FG86TF 738 0 0
GG
CTCGCCAGATTTGAATCATCGACCTGATCTCAGATCCAAATCACAAGCCTTCGACATGTC
TACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTCCTTTCTTCGGCTTCCTCGGCGCTGCAGCCGCACT
CGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCTTATGGAACAGCAAAGAGTGGATTTGGTGTGGCTTC
TATGGGAGTCATGAGGCCAGAGTTGGTCATGAAGTCCATTGTCCCCGTTGTCATGGCTGG
TGTCTTGGGTATTTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGTATTAACCCCAA
GGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGACGGATACGCACATCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGG
TCTCGCTGGTCTTTCTGCTGGTATGGCCATTGGTATTGTCGGAGACGCCGGTGTCAGGGC
AAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAGGC
GCTTGCTCTTTACGGTCTTATTGTGGGAATCATCCTCTCCTCGCGAGCTGGCCAGTCTAG
AGCTGAATGAGAGTGTAACCCACCA****TAAGATTTTTCCCCGAAGGTACTTTTATTTT
CTGTGTGTGTTTTGTTGTTCTATCGTTCTTTAGCATATGTATCTTCGGGAACTGAAAAAA
AA*CAAATTATTGGACACTTGGGAACTTTGTTTCGGAAGCTCTCCTATTTCTCTCTCTCG
GTGGTT
CTCTCCGATG

QA 3 728 3 728
DS 

RD RR2EE37JQ 395 0 0
TATGGCCATTGGTATTGTCGGAGACGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCC
CTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATCTTCGCAGAGGCGCTTGCTCTTTACGGTCTTAT
TGTGGGAATCATCCTCTCCTCGCGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATG*GAGTGTAACCC
ACCA****TAAGATTTTTCCCCGAAGGTACTTTTATTTTCTGTGGGTGTTTTGTTGTTCT
ATCGTTCTTTAGCATATGTATCTTCGGGAACTGAAAAAAAAACAAATTATTGGACACTTG
GGAACTTTGTTTCGGAAGCTCTCCTATTTCTCTCTCTCGGTGGTTTCTCTCCGGTGTAGG
GATTTTTTTTATTATTTTGTTCTGTAATAAAGAGA

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR2FG86JQ 564 0 0
TTCGACGGA
TACGCACATCTCTCCTCCGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTTTCTGCTGGTATGGCC
ATTGGTATTGTCGGAGACGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTC
GGGATGATTTTTATCCTTATCTTCGCAGAGGCGCTTGCTCTTTACGGTCTTATTGTGGGA
ATCATCCTCTCCTCGCGAGCTGGCCAGTCTAGAGCTGAATGAGAGTGTAACCCCCCA***
*TAAGATTTTTCCCCGAAGGTACTTTTATTTTCTGTGTGTGTTTTGTTGTTCTATCGTTC
TTTAGCATATGTATTTTCGGGAACTGAAAAAAAAACAAATTATTGGACACTTGGGAACTT
TGTTTCGGAAGCTCTCCTATTTCTCTCTCTCGGTGGTTTCTCTCCGATGTAGGGATTTTT
TTTATTATTTTGTTCTGTAATAAAGAGAGCTCTGATGGAGCTTGGTATGTTTTTGTATTC
TTGTATTGTCCTGAGGAAGTTAAATACATTTATTTGTAAAGAAGTTTGCTTTCTGAAATC
ATCTCTCGAGTCTCT

QA 10 564 10 564
DS 



AS 1 6

CO CL1360Contig1 1118 6 37 U
GGCCGAACAAAAATCAAAAAATCTTAACCCCCCACCTTGACCATATCATTCTCCTCTCAA
TTCACTATTGACGACGATTAGGAAGAGAGCTATGGCGGCACCGATTGTTAACGCTGAGTA
CACGAAAGAGATCAACAAGGCTCGCCGTGATCTCCGCTCAATCATCTCGAACAAGAACTG
TGCTCCGATCATGCTTCGATTGGCATGGCACGATGCTGGAACCTACGATGCACAGTCGAA
GACAGGGGGACCTAATGGGTCTATAAGGAACGAGGAGGAGTACACTCACGGTGCCAATAG
TGGTTTAAAGATCGCTCTTGAAATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAAACATCCTAAAATCAC
CTATGCGGATCTATACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCAGTGGAGGTTACTGGTGGACCTGA
CATCAGTTTCCAACCTGGGAGAAAAGATTCAAATGTTTGCCCTAGGGAAGGAAGACTTCC
AGATGCTACAAAAAA*TTTCCAACATCTTAGAGATGTCTTCTACCGCATGGGATTATCTG
ATAAGGATATTGTAGCACTCTCAGGGGCTCACACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGGT
CCGGCTTCGATGGTCCGTGGACTCAAGAGCCTCTGAAGTTTGATAACTCATACTTCGTGG
AACTGCTGAAAGGAGAATCAGAGGGCTTGTTGAAACTTCCATCTGACAAGACTTTGTTGG
AAGACCCAGAGTTCCGTCGTTATGTTGACCTTTATGCTAA*GGATGAAGATGCGTTCTTC
AGAGACTACGCAGAATCTCACAAGAAACTCTCTGAGCTCGGTTTCAACCCCAACGCCTCG
GCGGCCAAAGCTTGTTCAGACAGCACTGTTCTGGCTCAGGGAGCTTTCGGTGTTGCTATT
GCGGCTGCTGTCGTTGCCTTAAGTTACTTTTACGAGATCCGAAAGAAGATGAAGTAAAAA
GGAGCCACGAAGCAAAACGATTATCTTATCTTTTGCATTAAAGATACTATCAATCATCTT
ACAGAATGTGTAATGCATGCTACAAAGATGTTAAAACTCTTTAATCCACGGTCATACTAT
GTTTTAGTAAGAAAAAGACAAAGTTAATGGTTTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 10 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C022TF U 1
AF RR2AA28TF U 74
AF RR2B718TF U 117
AF RR2AA28JQ C 199
AF RR2B718JQ C 227
AF RR2C022JQ C 302
BS 1 122 RR2C022TF
BS 123 123 RR2AA28TF
BS 124 144 RR2C022TF
BS 145 145 RR2AA28TF
BS 146 225 RR2C022TF
BS 226 226 RR2AA28TF
BS 227 288 RR2C022TF
BS 289 289 RR2AA28TF
BS 290 495 RR2C022TF
BS 496 496 RR2AA28TF
BS 497 520 RR2C022TF
BS 521 521 RR2AA28TF
BS 522 580 RR2C022TF
BS 581 760 RR2AA28TF
BS 761 761 RR2B718TF
BS 762 773 RR2AA28TF
BS 774 774 RR2B718TF
BS 775 797 RR2AA28TF
BS 798 798 RR2B718TF
BS 799 839 RR2AA28TF
BS 840 840 RR2B718TF
BS 841 845 RR2AA28TF
BS 846 846 RR2B718TF
BS 847 875 RR2AA28TF
BS 876 880 RR2B718TF
BS 881 881 RR2AA28JQ
BS 882 952 RR2B718TF
BS 953 1004 RR2AA28JQ
BS 1005 1005 RR2B718JQ
BS 1006 1011 RR2AA28JQ
BS 1012 1012 RR2B718JQ
BS 1013 1019 RR2AA28JQ
BS 1020 1020 RR2B718JQ
BS 1021 1021 RR2AA28JQ
BS 1022 1022 RR2B718JQ
BS 1023 1095 RR2AA28JQ
BS 1096 1118 RR2C022JQ

RD RR2C022TF 580 0 0
GGCCGAACAAAAATCAAAAAATCTTAACCCCCCACCTTGACCATATCATTCTCCTCTCAA
TTCACTATTGACGACGATTAGGAAGAGAGCTATGGCGGCACCGATTGTTAACGCTGAGTA
CATGAAAGAGATCAACAAGGCTCGTCGTGATCTCCGCTCAATCATCTCGAACAAGAACTG
TGCTCCGATCATGCTTCGATTGGCATGGCACGATGCTGGAACCTATGATGCACAGTCGAA
GACAGGGGGACCTAATGGGTCTATAAGGAACGAGGAGGAGTACACTCATGGTGCCAATAG
TGGTTTAAAGATCGCTCTTGAAATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAAACATCCTAAAATCAC
CTATGCGGATCTATACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCAGTGGAGGTTACTGGTGGACCTGA
CATCAGTTTCCAACCTGGGAGAAAAGATTCAAATGTTTGCCCTAGGGAAGGAAGACTTCC
AGATGCTACAAAAAAATTTCCAACATCTTAGAGATGTCTTATACCGCATGGGATTATCTG
ATAAGGATATTGTAGCACTCTCAGGGGCTCACACTCTGGG

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2AA28TF 802 0 0
GG
GATTAGGAAGAGAGCTATGGCGGCACCGATTGTTAACGCTGAGTACACGAAAGAGATCAA
CAAGGCTCGCCGTGATCTCCGCTCAATCATCTCGAGCAAGAACTGTGCTCCGATCATGCT
TCGATTGGCATGGCACGATGCTGGAACCTACGATGCACAGTCGAAGACAGGGGGACCTAA
TGGGTCTATAAGGAACGAGGAGGAGTACACTCACGGTGCCAATAGTGGTTTAAAGATCGC
TCTTGAAATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAAACATCCTAAAATCACCTATGCGGATCTATA
CCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCAGTGGAGGTTACTGGTGGACCTGACATCAGTTTCCAACC
TGGGAGAAAAGATTCAAATGTTTGCCCTAGGGAAGGAAGACTTCCGGATGCTACAAAAAA
*TTTCCAACATCTTAGAGATGTCTTCTACCGCATGGGATTATCTGATAAGAATATTGTAG
CACTCTCAGGGGCTCACACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGGTCCGGCTTCGATGGTC
CGTGGACTCAAGAGCCTCTGAAGTTTGATAACTCATACTTCGTGGAACTGCTGAAAGGAG
AATCAGAGGGCTTGTTGAAACTTCCATCTGACAAGACTTTGTTGGAAGACCCAGAGTTCC
GTCGTTATGTTGACCTTTATGCTAAAGGATGAAGATGCTTTCTTCAGAGACTACGCAGAA
TCCCACAAGAAACTCTCTGAGCTCGGTTTCAACCCCAACGCCTCAGCGGC*AAAGCTTGT
TCAGACAGCACTGTTCTGGC

QA 3 802 3 802
DS 

RD RR2B718TF 836 0 0
G
GTACACGAAAGAGATCAACAAGGCTCGCCGTGATCTCCGCTCAATCATCTCGAACAAGAA
CTGTGCTCCGATCATGCTTCGATTGGCATGGCACGATGCTGGAACCTATGATGCACAGTC
GAAGACAGGGGGACCTAATGGGTCTATAAGGAACGAGGAGGAGTACACCCACGGTGCCAA
TAGTGGTTTAAAGATCGCTCTTGAAATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAAACATCCTAAAAT
CACCTATGCGGATCTATACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCAGTGGAGGTTACTGGTGGACC
TGACATCAGTTTCCAACCTGGGAGAAAAGATTCAAATGTTTGCCCTAGGGAAGGAAGACT
TCCTGATGCTACAAAAAA*TTTCCAACATCTTAGAGATGTCTTCTACCGCATGGGATTAT
CTGATAAGGATATTGTAGCACTCTCAGGGGCTCACACTCTGGGAAGTGCTCATCCAGAGA
GGTCCGGCTTCGATGGTCCGTGGACTCAAGAGTCTCTGAAGTTTGATAACTCATACTTCG
TGGAACTGCTGAAAGGAGAATCAGAGGGCTTGTTGAAACTTCCATCTGACAAGACTTTAT
TGGAAGACCCAGAGTTCCGTCGTTATGTTGACCTTTATGCTAA*GGATGAAGATGCGTTC
TTCAGAGACTACGCAGAATCTCACAAGAAACTCTCTGAGCTCGGTTTCAACCCCAACGCC
TCGGCGGCCAAAGCTTGTTCAGACAGCACTGTTCTGGCTCAGG*AGCTTTCGGTGTTGCT
ATTGCGGCTGCTGTCGTTGCCTTAAGTTACTTTTACGAGATCCGAAAGAAGATGA

QA 2 836 2 836
DS 

RD RR2AA28JQ 900 0 0
ATTGGCATGGCACGATGCTGGAACCTACGATGCACAGTCGAAGACAGGGGGAC*TAATGG
GTCTATAAGGAACGAGGAGGAGTACACTCACGGTGCCAATAGTGGTTTAAAGATCGCTCT
TGAAATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAAACATCCTAAAATCACCTATGCGGATCTATACCA
GCTTGCTGGTGTGGTAGCAGTGGAGGTTACTGGTGGACCTGACATCAGTTTCCAACCTGG
GAGAAAAGATTCAAATGTTTGCCCTAGGGAAGGAAGACTTCCGGATGCTACAAAAAA*TT
TCCAACATCTTAGAGATGTCTTCTACCGCATGGGATTATCTGATAAGAATATTGTAGCAC
TCTCAGGGGCTCACACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGGTCCGGCTTCGATGGTCCGT
GGACTCAAGAGCCTCTGAAGTTTGATAACTCATACTTCGTGGAACTGCTGAAAGGAGAAT
CAGAGGGCTTGTTGAAACTTCCATCTGACAAGACTTTGTTGGAAGACCCAGAGTTCCGTC
GTTATGTTGACCTTTATGCTAA*GGATGAAGATGCTTTCTTCAGAGACTACGCAGAATCC
CACAAGAAACTCTCTGAGCTCGGTTTCAACCCCAACGCCTCAGCGGC*AAAGCTTGTTCA
GACAGCACTGTTCTGGCTCAGGGAGCTTTCGGTGTTGCTATTGCGGCTGCGGTCGTTGCC
TTAAGTTACTTTTACGAGATCCGAAAGAAGATGAAGTAAAAAGGAGCCACGAAGCAAAAC
GATTATCTTATCTTTTGCATTAAAGAAACTATCGATCATCT*ATAGAATGTGTAATGCAT
GCTACAAAGATGTTAAAACTCTTTAATCCACGGTCATACTATGTTTTAGTAAGAAAA
GAC

QA 1 897 1 897
DS 

RD RR2B718JQ 878 0 0
GATGCACAGTCGAAGACAGGGGGACCTAATGGGTCTATAAGGAACGAGGAGGAGTACACC
CACGGTGCCAATAGTGGTTTAAAGATCGCTCTTGAAATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAAA
CATCCTAAAATCACCTATGCGGATCTATACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCAGTGGAGGTT
ACTGGTGGACCTGACATCAGTTTCCAACCTGGGAGAAAAGATTCAAATGTTTGCCCTAGG
GAAGGAAGACTTCCTGATGCTACAAAAAA*TTTCCAACATCTTAGAGATGTCTTCTACCG
CATGGGATTATCTGATAAGGATATTGTAGCACTCTCAGGGGCTCACACTCTGGGAAGTGC
TCATCCAGAGAGGTCCGGCTTCGATGGTCCGTGGACTCAAGAGTCTCTGAAGTTTGATAA
CTCATACTTCGTGGAACTGCTGAAAGGAGAATCAGAGGGCTTGTTGAAACTTCCATCTGA
CAAGACTTTATTGGAAGACCCAGAGTTCCGTCGTTATGTTGACCTTTATGCTAA*GGATG
AAGATGCGTTCTTCAGAGACTACGCAGAATCTCACAAGAAACTCTCTGAGCTCGGTTTCA
ACCCCAACGCCTCGGCGGCCAAAGCTTGTTCAGACAGCACTGTTCTGGCTCAGGGAGCTT
TCGGTGTTGCTATTGCGGCTGCTGTCGTTGCCTTAAGTTACTTTTACGAGATCCGAAAGA
AGATGAAGTAAAAAGGAGCCACGAAGCAAAACGATTATCTTATCTTTTGCATTAAAGATA
CTATCAATCATCTTACAGAATGTGTAATGCATGCTACAAAGATGTTAAAACTCTTTAATC
CACGGTCATACTATGTTTTAGTAAGAAAA
GACAAAGTC

QA 1 869 1 869
DS 

RD RR2C022JQ 817 0 0
GGTTTAAAGATCGCTCTTGAAATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAAACATCCTAAAATCACC
TATGCGGATCTATACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCAGTGGAGGTTACTGGTGGACCTGAC
ATCAGTTTCCAACCTGGGAGAAAAGATTCAAATGTTTGCCCTAGGGAAGGAAGACTTCCA
GATGCTACAAAAAAATTTCCAACATCTTAGAGATGTCTTATACCGCATGGGATTATCTGA
TAAGGATATTGTAGCACTCTCAGGGGCTCACACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGGTC
CGGCTTCGATGGTCCGTGGACTCAAGAGCCTCTGAAGTTTGATAACTCATACTTCGTGGA
ACTTCTGAAAGGAGAATCAGAGGGCTTGTTGAAACTTCCATCTGACAAGACTTTGTTGGA
AGACCCAGAGTTCCGTCGTTATGTTGACCTTTATGCTAA*GGATGAAGATGCGTTCTTCA
GAGACTACGCAGAATCTCACAAGAAACTCTCTGAGCTCGGTTTCAACCCCAACGCCTCGG
CGGCCAAAGCTTGTTCAGACAGCACTGTTTTGGCTCAGGGAGCATTCGGTGTTGCTATTG
CGGCTGCGGTCGTTGCCTTAAGTTACTTTTACGAGATCCGAAAGAAGATGAAGTAAAAAG
GAGCCACGAAGCAAAACGATTATCTTATCTTTTGCATTAAAGATACTATCAATCATCTTA
CAGAATGTGTAATGCATGCTACAAAGATGTTAAAACTCTTTAATCCACGGTCATACTATG
TTT*AGTAAGAAAAAGACAAAGTTAATGGTTTTGGTT

QA 1 817 1 817
DS 



AS 2 5

CO CL1361Contig1 819 2 6 U
GAAGCCCAATGCCATTTTTATTCACATTATTAATAAAAGCCCATGGCTATTATTGATCCA
ACATGTTTTGCTAGATCATGTATTTTAAAACTCTTGAATATAAAATAACACAAGTTTCAA
AACCGAGTAACGAAACCAAAAGATGCAAAGTGAGTCTAAAGAAACAAAAGTCATCTAAAA
CGACACAACAAAAGCACTGAAAACACAAAACTTAAGCAGCCTGCTGGCCAGCCAGCCTCT
TCCTGGCTTCCTCGATGATGGTCAACTTAATACCTTTACCCTTAGGAAGAGAAACCCATG
GCTTAGTTCCTTTGCCGAGGGTGAAGACGTTTCCCAACCTAGTTGCAAACTCGTGCCCTG
TAAAGTCTTGGATGTGAATTGTCTCAAAGCTTCCCTTATGCTTCTCACGGTTCTTAATCA
CACCAACACGCCCTCTGTTTCTTCCTCCAGTCACCATCACAACATTGCCGACATCAAACT
TGATGAAGTCCACAACCTTGTTCTCCTCCAAGTCGAGCTTGATGGTGTCATTAGGCTTGA
TGAGTGGGTCAGGGTAACGGATGGTGCGACCATCGTATGTGTTCAGGTAAGGAATGCCCT
TCTGTCCTAACTGGATAGTTCGGAATTTGCACAGCTTAAACTTGGCTTACTAGTCCCTGA
GGGAGTGGAGACGGAAACGTCCCTTGGTATCATAGAGGAGACGGAAGTTCTCGTTAGTCT
TGGGGATAGAAACAACATCCATGAAACCAGCAGGGTAGGTCTTGTCAGTCCTGACTTTGC
CATCAACTTGGATATGCCTTTGCATCAAGATAGAGATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH41JQ U 1
AF RR2GO12JQ U 87
BS 1 362 RR2FH41JQ
BS 363 363 RR2GO12JQ
BS 364 515 RR2FH41JQ
BS 516 516 RR2GO12JQ
BS 517 693 RR2FH41JQ
BS 694 819 RR2GO12JQ

RD RR2FH41JQ 693 0 0
GAAGCCCAATGCCATTTTTATTCACATTATTAATAAAAGCCCATGGCTATTATTGATCCA
ACATGTTTTGCTAGATCATGTATTTTAAAACTCTTGAATATAAAATAACACAAGTTTCAA
AACCGAGTAACGAAACCAAAAGATGCAAAGTGAGTCTAAAGAAACAAAAGTCATCTAAAA
CGACACAACAAAAGCACTGAAAACACAAAACTTAAGCAGCCTGCTGGCCAGCCAGCCTCT
TCCTGGCTTCCTCGATGATGGTCAACTTAATACCTTTACCCTTAGGAAGAGAAACCCATG
GCTTAGTTCCTTTGCCGAGGGTGAAGACGTTTCCCAACCTAGTTGCAAACTCGTGCCCTG
TAGAGTCTTGGATGTGAATTGTCTCAAAGCTTCCCTTATGCTTCTCACGGTTCTTAATCA
CACCAACACGCCCTCTGTTTCTTCCTCCAGTCACCATCACAACATTGCCGACATCAAACT
TGATGAAGTCCACAACCTTGTTCTCCTCCAAGTCGGGCTTGATGGTGTCATTAGGCTTGA
TGAGTGGGTCAGGGTAACGGATGGTGCGACCATCGTATGTGTTCAGGTAAGGAATGCCCT
TCTGTCCTAACTGGATAGTTCGGAATTTGCACAGCTTAAACTTGGCTTACTAGTCCCTGA
GGGAGTGGAGACGGAAACGTCCCTTGGTATCAT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2GO12JQ 733 0 0
AAAACTCTTGAATATAAAATAACACAAGTTTCAAAACCGAGTAACGAAACCAAAAGATGC
AAAGTGAGTCTAAAGAAACGAGAGTCATCTAAAACGACACAACAAAAGCACTGAAAACAC
AAAACTTAAGCAGCCTGCTGGCCAGCCAGCCTCTTCCTGGCTTCCTCGATGATGGTCAAC
TTAATACCTTTACCCTTAGGAAGAGAAACCCATGGCTTAGTTCCTTTGCCGAGGGTGAAG
ACGTTTCCCAACCTAGTTGCAAACTCGTGCCCTGTAAAGTCTTGGATGTGAATTGTCTCA
AAGCTTCCCTTATGCTTCTCACGGTTCTTAATCACACCAACACGCCCTCTGTTTCTTCCT
CCAGTCACCATCACAACATTGCCGACATCAAACTTGATGAAGTCCACAACCTTGTTCTCC
TCCAAGTCGAGCTTGATGGTGTCATTAGGCTTGATGAGTGGGTCAGGGTAACGGATGGTG
CGACCATCGTATGTGTTCAGGTAAGGAATGCCCTTCTGTCCTAACTGGATAGTTCGGACT
TTGCACAGCTTAAACTTGGCTTCCTCGTCCCTGAGGGAGTGGAGACGGAAACGTCCCTTG
GTATCATAGAGGAGACGGAAGTTCTCGTTAGTCTTGGGGATAGAAACAACATCCATGAAA
CCAGCAGGGTAGGTCTTGTCAGTCCTGACTTTGCCATCAACTTGGATATGCCTTTGCATC
AAGATAGAGATGA

QA 1 733 1 733
DS 



CO CL1361Contig2 971 3 7 U
GGCTCTCACAACTTCTTCACCAGTCGTTCGGAGCTAAACGAGAGAAGTGGTCTGCACCGC
AGTTACGCTCGCAAACTCCAAACATGGCGAGAGGTTTGAAGAAGCATTTGAAGAGGCTCA
ATGCCCCTCACCATTGGAGCCTTGACAAACTCGGTGGTGCTTTTACCCCCAAGCCATCTT
CTGGACCCCACAAGTCGAGGGAGTGTCTTCCCCTCGTTCTTATCATCAGGAACAGGTTGA
AGTATGCTCTTACCTACCGTGAAGTCATCTCCATCTTGATGCAAAGGCATATCCAAGTTG
ATGGCAAAGTCAGGACTGACAAGACCTACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCC
CCAAGACTAACGAGAACTTCCGTCTCCTCTATGATACCAAGGGACGTTTCCGTCTCCACT
CCCTCAGGGACGAGGAAGCCAAGTTTAAGCTGTGCAAAGTCCGGACTATCCAGTTAGGAC
AGAAGGGCATTCCCTACCTGAACACATACGATGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCAC
TCATCAAGCCTAACGACACCATCAAGCTCGACCTGGAGGAGAACAAGGTTGTGGACTTCA
TCAAGTTTGATGTCGGCAATGTTGTGATGGTGACTGGAGGAAGAAACAGAGGGCGTGTTG
GTGTGATTAAGAACCGTGAGAAGCACAAGGGAAGCTTTGAGACTATCCACATCCAAGACT
CTACAGGACATGAGTTTGCAACTAGGTTGGGAAACGTCTTCACCCTCGGCAAAGGAACTA
AGCCATGGGTTTCTCTTCCTAAGGGAAAAGGTATTAAGTTGACCATCATCGAGGAAGCCA
GGAAGAGGCTCGCTGGCCAACAGGCTGCTTAATTTTGTTGTGTTTTCAGTCGTTTTAGAT
GACTTTTGTTTCCTTAGACTCACTTTGCATCTTTTGGTTTCGCTACTCGGTTTTGAAACT
TGTGTTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW60TF U 1
AF RR2GO12TF U 11
AF RR2GW60JQ C 221
BS 1 20 RR2GW60TF
BS 21 21 RR2GO12TF
BS 22 54 RR2GW60TF
BS 55 55 RR2GO12TF
BS 56 665 RR2GW60TF
BS 666 681 RR2GO12TF
BS 682 971 RR2GW60JQ

RD RR2GW60TF 665 0 0
GGCTCTCACAACTTCTTCACTAGTCGTTCGGAGCTAAACGAGAGAAGTGGTCTGGACCGC
AGTTACGCTCGCAAACTCCAAACATGGCGAGAGGTTTGAAGAAGCATTTGAAGAGGCTCA
ATGCCCCTCACCATTGGAGCCTTGACAAACTCGGTGGTGCTTTTACCCCCAAGCCATCTT
CTGGACCCCACAAGTCGAGGGAGTGTCTTCCCCTCGTTCTTATCATCAGGAACAGGTTGA
AGTATGCTCTTACCTACCGTGAAGTCATCTCCATCTTGATGCAAAGGCATATCCAAGTTG
ATGGCAAAGTCAGGACTGACAAGACCTACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCC
CCAAGACTAACGAGAACTTCCGTCTCCTCTATGATACCAAGGGACGTTTCCGTCTCCACT
CCCTCAGGGACGAGGAAGCCAAGTTTAAGCTGTGCAAAGTCCGGACTATCCAGTTAGGAC
AGAAGGGCATTCCCTACCTGAACACATACGATGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCAC
TCATCAAGCCTAACGACACCATCAAGCTCGACCTGGAGGAGAACAAGGTTGTGGACTTCA
TCAAGTTTGATGTCGGCAATGTTGTGATGGTGACTGGAGGAAGAAACAGAGGGCGTGTTG
GTGTG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2GO12TF 671 0 0
GGAA
CTTCACCAGTCGTTCGGTGCTAAACTAGAGAAGTGGTCTGCATCGGAGTTACGCTCGCAA
ACTCCAAACATGGCGAGAGGTTTGAAGAAGCATTTGAAGAGGCTCAATGCCCCTCACCAT
TGGAGCCTTGACAAACTCGGTGGTGCTTTTGCCCCCAAGCCGTCTTCTGGACCCCACAAG
TCGAGGGAGTGTCTTCCCCTCGTTCTTATCATCAGGAACAGGTTGAAGTATGCTCTTACC
TACCGTGAAGTCATCTCTATCTTGATGCAAAGGCATATCCAAGTTGATGGCAAAGTCAGG
ACTGACAAGACCTACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTTTCTATCCCCAAGACTAACGAG
AACTTCCGTCTCCTCTATGATACCAAGGGACGTTTCCGTCTCCACTCCCTCAGGGACGAG
GAAGCCAAGTTTAAGCTGTGCAAAGTCCGAACTATCCAGTTAGGACAGAAGGGCATTCCT
TACCTGAACACATACGATGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCACTCATCAAGCCTAAT
GACACCATCAAGCTCGACTTGGAGGAGAACAAGGTTGTGGACTTCATCAAGTTTGATGTC
GGCAATGTTGTGATGGTGACTGGAGGAAGAAACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAAC
CGTGAGA

QA 5 671 5 671
DS 

RD RR2GW60JQ 751 0 0
TATCATCAGGAACAGGTTGAAGTATGCTCTTACCTACCGTGAAGTCATCTCCATCTTGAT
GCAAAGGCATATCCAAGTTGATGGCAAAGTCAGGACTGACAAGACCTACCCTGCTGGTTT
CATGGATGTTGTCTCTATCCCCAAGACTAACGAGAACTTCCGTCTCCTCTATGATACCAA
GGGACGTTTCCGTCTCCACTCCCTCAGGGACGAGGAAGCCAAGTTTAAGCTGTGCAAAGT
CCGGACTATCCAGTTAGGACAGAAGGGCATTCCCTACCTGAACACATACGATGGTCGCAC
CATCCGTTACCCTGACCCACTCATCAAGCCTAACGACACCATCAAGCTCGACCTGGAGGA
GAACAAGGTTGTGGACTTCATCAAGTTTGATGTCGGCAATGTTGTGATGGTGACTGGAGG
AAGAAACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGAAGCACAAGGGAAGCTTTGA
GACTATCCACATCCAAGACTCTACAGGACATGAGTTTGCAACTAGGTTGGGAAACGTCTT
CACCCTCGGCAAAGGAACTAAGCCATGGGTTTCTCTTCCTAAGGGAAAAGGTATTAAGTT
GACCATCATCGAGGAAGCCAGGAAGAGGCTCGCTGGCCAACAGGCTGCTTAATTTTGTTG
TGTTTTCAGTCGTTTTAGATGACTTTTGTTTCCTTAGACTCACTTTGCATCTTTTGGTTT
CGCTACTCGGTTTTGAAACTTGTGTTATTTT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 5

CO CL1362Contig1 1068 5 10 U
GGGAAGCTTTTAGTCCAAACAAAAAAAAATGGTGGCGAGAAAGAGAGTCAAGTACTCAGT
GGTTGATGCTTTCGCTGATTCCGCCTTCAAGGGCAATCCAGCTGCTGTTTGCTTCCTCGA
CGATGATGATCTGAGAGATGACGCTTGGCTTCAGTCTCTCGCCGCTGAGTTCAACTTATC
CGAGACCTGTTTCCTTACTCCGATCACCGTCTCCGATGATCACAGCGGTTTCCCTCGCTT
TAGTCTCCGGTGGTTCACTCCAGTCGCTGAGGTGGATCTGTGTGGTCATGCGACTTTAGC
ATCTGCTCACGTTATCTTCTCAAACAGTTTGGTTGATTCAGAGGTAGTTGAGTTCGCCAC
AAGGTCAGGGATCCTAACTGCTAAACGTGTTCCACTTACTACAGAGCTCAAAGATGGCGG
AGAAAAAGAATCAACCTTTTTGATTGAATTGGATTTCCCCGTCGTTCCAACTTGTGATAT
CAACTCCGCTGATGATCTGTCTGTGTTCTCCAATGCCGTGAATGGAGCTACCATTGTTGA
TATTAAATCCACAGAGAAAGACGTCCTCGTTGTGCTTTCGTCGTGGGAGTCTGTTACTGA
GTTGCAGCCAAGAATAGATGAGATATCGAAATGCCCTTGCGAAGGATTGATGGTGACCGC
TGCTGCTGCTGAAGGATCTCAATATGATTTCTGTAGTCGCTACTTCGCTCCTAACTTTGG
AATTAATGAGGACCCTGTTACTGGGAGTGCGCATTGTGCTTTAGCACATTACTGGAGCAC
CAAGATGAACAAGTGTGATTTCTTAGCCTACCAGGCGTCAAGCAGAGGAGGAACACTGAA
TGTTCACCTGGACAAAGAGAAGCAGAGGGTTCTGCTGAGAGGCAAAGCAATCACTGTTAT
GGAAGGATGTGTCTTAGTTTGATTTCTTCTTGGCTATTATCAAATCAGCCTCTTCTTGTA
AACCCATGAAATGAAATAAAGGAAGCCTATGTCTTCTCCGAGAGATGTTTGTATCCATAA
ATATTTGAATTTGCTTATGATGATGAGATAGATAACAAGGTTGTCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM86TF U 10
AF RR2AR86TF U 3
AF RR2D735TF U 1
AF RR2D735JQ C 279
AF RR2CM86JQ C 503
BS 1 205 RR2D735TF
BS 206 206 RR2CM86TF
BS 207 673 RR2D735TF
BS 674 674 RR2D735JQ
BS 675 730 RR2D735TF
BS 731 733 RR2AR86TF
BS 734 795 RR2D735TF
BS 796 969 RR2D735JQ
BS 970 974 RR2CM86JQ
BS 975 1068 RR2D735JQ

RD RR2CM86TF 661 0 0
GGGGTCCAAACA
AAAAAAAATGGTGGCGAGAAAGAGAGTCAAGTACTCAGTGGTTGATGCTTTCGCTGATTC
CGCCTTCAAGGGCAATCCAGCTGCTGTTTGCTTCCTCGACGATGATGATCTGAGAGATGA
CGCTTGGCTTCAGTCTCTCGCCGCTGAGTTCAACTTATCCGAGACCTGTTTCCTTACTCC
GATCACCGTCTCCGATGATCACAGCGGTTTCCCTCGCTTTAGTCTCCGGTGGTTCACTCC
AGTCGCTGAGGTGGATCTGTGTGGTCATGCGACTTTAGCATCTGCTCACGTTATCTTCTC
AAACAGTTTGGTTGATTCAGAGGTAGTTGAGTTCGCCACAAGGTCAGGGATCCTAACTGC
TAAACGTGTTCCACTTACTACAGAGCTCAAAGATGGCGGAGAAAAAGAATCAACCTTTTT
GATTGAATTGGATTTCCCCGTCGTTCCAACTTGTGATATCAACTCCGCTGATGATCTGTC
TGTGTTCTCCAATGCCGTGAATGGAGCTACCATTGTTGATATTAAAGCCACACAGAAAGA
CGTCCTCGTTGTGCTTTCGTCGTGGGAGTCTGTTACTGAGTTGCAGCCGAGAATAGATGA
GATATCAAAATGCCCTTGCGAAGGATTGATGGTGACCGCTGCTGCT
TCT

QA 13 658 13 658
DS 

RD RR2AR86TF 772 0 0
AGGGGCTTTTAGTCCAAAC
AAAAAAAATGGTGGCGAGAAAGAGAGTCAAGTACTCAGTGGTTGATGCTTTCGCTGATTC
CGCCTTCAAGGGCAATCCAGCTGCTGTTTGCTTCCTCGACGATGATGATCTGAGAGATGA
CGCTTGTCTTCAGTCTCTCGCCGCTGAGTTCAACTTATCCGAGACCTGTTTCCTTACTCC
GATCACCGTCTCCGATGATCACAGCGGTTTCCCTCGCTTTAGTCTCCGGTGGTTCACTCC
AGTCGCTGAGGTGGATCTGTGTGGTCATGCGACTTTAGCATCTGCTCACGTTATCTTCTC
AAACAGTTTGGTTGATTCAGAGGTAGTTGAGTTCGCCACAAGGTCAGGGATCCTAACTGC
TAAACGTGTTCCACTTACTACAGAGCTCAAAGATGGCGGAGAAAAAGAATCAACCTTTTT
GATTGAATTGGATTTCCCCGTCGTTCCAACTTGTGATATCAACTCCGCTGATGATCTGTC
TGTGTTCTCCAATGCCGTGAATGGAGCTACCATTGTTGATATTAAATCCACGGAGAAAGA
CGTCCTCGTTGTGCTTTCGTCGTGGGAGTCTGTTACTGAGTTGCAGCCAAGAATAGATGA
GATATCGAAATGCCCTTGCGAAAGATTGATGGTGACCGCTGCTGCTGCTGAAAGATCTCA
ATATGATTTCTGTAGTCGCTACTTCGCTCCTAACTTTGGAATTAATGAGGACCCTGTTAC
TGGGAGTGCGCATTGTGCTTTAGCACATTACTG

QA 20 772 20 772
DS 

RD RR2D735TF 795 0 0
GGGAAGCTTTTAGTCCAAACAAAAAAAAATGGTGGCGAGAAAGAGAGTCAAGTACTCAGT
GGTTGATGCTTTCGCTGATTCCGCCTTCAAGGGCAATCCAGCTGCTGTTTGCTTCCTCGA
CGATGATGATCTGAGAGATGACGCTTGGCTTCAGTCTCTCGCCGCTGAGTTCAACTTATC
CGAGACCTGTTTCCTTACTCCGATCGCCGTCTCCGATGATCACAGCGGTTTCCCTCGCTT
TAGTCTCCGGTGGTTCACTCCAGTCGCTGAGGTGGATCTGTGTGGTCATGCGACTTTAGC
ATCTGCTCACGTTATCTTCTCAAACAGTTTGGTTGATTCAGAGGTAGTTGAGTTCGCCAC
AAGGTCAGGGATCCTAACTGCTAAACGTGTTCCACTTACTACAGAGCTCAAAGATGGCGG
AGAAAAAGAATCAACCTTTTTGATTGAATTGGATTTCCCCGTCGTTCCAACTTGTGATAT
CAACTCCGCTGATGATCTGTCTGTGTTCTCCAATGCCGTGAATGGAGCTACCATTGTTGA
TATTAAATCCACAGAGAAAGACGTCCTCGTTGTGCTTTCGTCGTGGGAGTCTGTTACTGA
GTTGCAGCCAAGAATAGATGAGATATCGAAATGCCCTTGCGAAGGATTGATGGTGACCGC
TGCTGCTGCTGAA*GATCTCAATATGATTTCTGTAGTCGCTACTTCGCTCCTAACTTTGG
AATTAATGAG**ACCTGTTACTGGGAGTGCGCATTGTGCTTTAGCACATTACTGGAGCAC
CAAGATGAACAAGTG

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2D735JQ 790 0 0
TGTGTGGTCATGCGACTTTAGCATCTGCTCACGTTATCTTCTCAAACAGTTTGGTTGATT
CAGAGGTAGTTGAGTTCGCCACAAGGTCAGGGATCCTAACTGCTAAACGTGTTCCACTTA
CTACAGAGCTCAAAGATGGCGGAGAAAAAGAATCAACCTTTTTGATTGAATTGGATTTCC
CCGTCGTTCCAACTTGTGATATCAACTCCGCTGATGATCTGTCTGTGTTCTCCAATGCCG
TGAATGGAGCTACCATTGTTGATATTAAATCCACAGAGAAAGACGTCCTCGTTGTGCTTT
CGTCGTGGGAGTCTGTTACTGAGTTGCAGCCAAGAATAGATGAGATATCGAAATGCCCTT
GCGAAGGATTGATGGTGACCGCTGCTGCTGCTGAAGGATCTCAATATGATTTCTGTAGTC
GCTACTTCGCTCCTAACTTTGGAATTAATGAGGACCCTGTTACTGGGAGTGCGCATTGTG
CTTTAGCACATTACTGGAGCACCAAGATGAACAAGTGTGATTTCTTAGCCTACCAGGCGT
CAAGCAGAGGAGGAACACTGAATGTTCACCTGGACAAAGAGAAGCAGAGGGTTCTGCTGA
GAGGCAAAGCAATCACTGTTATGGAAGGATGTGTCTTAGTTTGATTTCTTCTTGGCTATT
ATCAAATCAGCCTCTTCTTGTAAACCCATGA*****AATAAAGGAAGCCTATGTCTTCTC
CGAGAGATGTTTGTATCCATAAATATTTGAATTTGCTTATGATGATGAGATAGATAACAA
GGTTGTCTGT

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2CM86JQ 531 0 0
GTGTTCTCCAATGCCGTGAATGGAGCTACCATTGTTGATATTAAAGCCACACAGAAAGAC
GTCCTCGTTGTGCTTTCGTCGTGGGAGTCTGTTACTGAGTTGCAGCCGAGAATAGATGAG
ATATCAAAATGCCCTTGCGAAGGATTGATGGTGACCGCTGCTGCTTCTGCAGGATCTCAG
TATGATTTCTGTAGTCGCTACTTCGCTCCTAACTTTGGAATTAATGAGGACCCCGTAACT
GGAAGTGCACATTGTGCCTTAGCACATTACTGGAGCAACAAGATGAACAAGTGTGATTTC
TTAGCCTACCAGGCGTCAAGCAGAGGAGGAACGCTGAATGTTCACCTGGACAAAGAGAAG
CAGAGGGTTCTGCTGAGAGGCAAAGCAGTCACTGTTATGGAAGGATGTGTTTTAGTTTGA
TTTCTTCTTGGCTATTATCAAATCAGCCTCTTCTTGTAAACCCATGAAATGAAATAAAGG
AAGCCTATGTCTTCTCCGAGAGATGTTTGTATCCATAAATATTTGAATTTG

QA 1 531 1 531
DS 



AS 2 5

CO CL1363Contig1 654 3 3 U
ACTCCATCCCTGACCCAAAGGCGGTCCAGTATGTGCGTAATGACCGTGGTACACCCATGG
TATTAGACAACTACTACCGTAACATCCTAGACAACAAGGGTTTGCTCCTTGTGAACCACC
AGCTCGCACACGACAAACGAACCAGACCAATTGTTAAGAAGATGGCTAAGGACCAGGCTT
ACTTCTTCAAGGAGTTTACTAGAGCCATCCAGATCTTGTCTGAGAACAACCCTTTGACTG
GTTCCAAGGGTGAGATCAGGAAGCAGTGCAATCTCGCAAACAAGATTCACTGAGATTGCA
AAGAGTGACAAGAGAGAGAGAGAGCCTCTTTGTGTTTTGGGTTCTCTCTGCACTTTCTTG
GCATCGAACCAAGATGAATAATATTATATTTTAAGAAGTTAAAAATGAAATGAAGGGTGA
TGATGATGATGTATGCATCATAGTGGTGACCACATATGCACTCTTCTTTTTGTGTGTTGT
TTTAGCCTTAATGCTTTAATTATGGTGGTAGTCGCCTTTGGAGTTAATTAATCTGTATGT
TGTTTCTTTGTTGATTTTGGGTTTGTGGTGGGGTTGATGATGGAATGGATGTATGATATG
ATGGACTGTGTGTTATGTAATAATAAGTGGTGAAATCGTACCTTAATTTTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF61JQ C 327
AF RR2FF61TF U 327
AF RR2AI87TF U 1
BS 1 519 RR2AI87TF
BS 520 520 RR2FF61TF
BS 521 654 RR2AI87TF

RD RR2FF61JQ 199 0 0
G
CTTTGTGTTTTGGGTTCTCTCTGCACTTTCTTGGCATCGAACCAAGATGAATAATATTAT
ATTTTAAGAAGTTAAAAATGAAATGAAGGGTGATGATGATGATGTATGCATCATAGTGGT
GACCACATATGCACTCTTCTTTTTGTGTGTTGTTTTAGCCTTAATGCTTTAATTATGGTG
GTAGTCGCCTTTGGAGTT

QA 2 199 2 199
DS 

RD RR2FF61TF 199 0 0
G
CTTTGTGTTTTGGGTTCTCTCTGCACTTTCTTGGCATCGAACCAAGATGAATAATATTAT
ATTTTAAGAAGTTAAAAATGAAATGAAGGGTGATGATGATGATGTATGCATCATAGTGGT
GACCACATATGCACTCTTCTTTTTGTGTGTTGTTTTAGCCTTAATGCTTTAATTATGGTG
GTAGTCGCCTTTGGAGTT

QA 2 199 2 199
DS 

RD RR2AI87TF 654 0 0
ACTCCATCCCTGACCCAAAGGCGGTCCAGTATGTGCGTAATGACCGTGGTACACCCATGG
TATTAGACAACTACTACCGTAACATCCTAGACAACAAGGGTTTGCTCCTTGTGAACCACC
AGCTCGCACACGACAAACGAACCAGACCAATTGTTAAGAAGATGGCTAAGGACCAGGCTT
ACTTCTTCAAGGAGTTTACTAGAGCCATCCAGATCTTGTCTGAGAACAACCCTTTGACTG
GTTCCAAGGGTGAGATCAGGAAGCAGTGCAATCTCGCAAACAAGATTCACTGAGATTGCA
AAGAGTGACAAGAGAGAGAGAGAGCCTCTTTGTGTTTTGGGTTCTCTCTGCACTTTCTTG
GCATCGAACCAAGATGAATAATATTATATTTTAAGAAGTTAAAAATGAAATGAAGGGTGA
TGATGATGATGTATGCATCATAGTGGTGACCACATATGCACTCTTCTTTTTGTGTGTTGT
TTTAGCCTTAATGCTTTAATTATGGTGGTAGTCGCCTTTTGAGTTAATTAATCTGTATGT
TGTTTCTTTGTTGATTTTGGGTTTGTGGTGGGGTTGATGATGGAATGGATGTATGATATG
ATGGACTGTGTGTTATGTAATAATAAGTGGTGAAATCGTACCTTAATTTTTGAT

QA 1 654 1 654
DS 



CO CL1363Contig2 703 2 9 U
CATGAAACTAAATCAAAGATTAAGGCACGATTTCACCACTTATTATTACATAACACACAG
TCCATCATATCATACATCCATTCCATCATTAACCCCACCACAAACCCAAAATCAACAAAG
AAACAACATTAAGATTAATTAACTCAAAAGACCACTACTACAATAATTAAAGCATTAAGG
CTGAAACAACACACAAAAAGAAAAGTGCATATGTGGTCACCACCATGATGAATACATCAT
CATCATCACCCTTCATTTCATTTAACTTCTTAAAATATAATTTTATTCATCTTGGTTCGA
TGCCAAGAAAGTGCAAAAAGAACCCCAAACACAAAGAGGCTCTCTCTCTCTTCTCACTCT
TTGCAATCTCAGTGAATCTTGTTTGCGAGATTGCACTGCTTCCTGATCTCACCCTTGGAA
CCAGTCAAAGGGTTGTTCTCAGACAAGATCTGGATGGCTCTAGTGAACTCCTTGAAGAAG
TAAGCCTGGTCCTTAGCCATCTTCTTAACAATTGGTCTGGTTCGTTTGTCGTGTGCGAGC
TGGTGATCAACAAGGAGCAAACCCTTGTTGTCTAGGATGTTACGGTAGTAGTTGTTGTCT
AATACCATGGGTGTACCGCGGTCATTACGCACATACTGGACCGCCTTTGGGTCAGGGATG
GAGTCGGGACACTTGTGTAGCATGTGAGGGACGTGGTCCGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS68JQ U 24
AF RR2EV82JQ U 1
BS 1 202 RR2EV82JQ
BS 203 203 RR2FS68JQ
BS 204 272 RR2EV82JQ
BS 273 273 RR2FS68JQ
BS 274 315 RR2EV82JQ
BS 316 316 RR2FS68JQ
BS 317 317 RR2EV82JQ
BS 318 318 RR2FS68JQ
BS 319 703 RR2EV82JQ

RD RR2FS68JQ 420 0 0
GGT
ACGATTTCACCACTTATTATTACATAACACACAGTCCATCATATCATACATCCATTCCAT
CATTAACCCCACCACAAACCCAAAATCAACAAAGAAACAACATTAAGATTAATTAACTCA
AAAGACCACTACTACAATAATTAAAGCATTAAGGCTGAAACAACACACAAAAAGAAAAGT
GCATATGTGGTCACCACCATGATGCATACATCATCATCA***CCCTTCATTTCATTTAAC
TTCTTAAAATATAATTTTATTCATCTTGGTTCGATGCCAAGAAAGTGCAAAAAGAACCCC
AAACACAAAGAGGCTCTCTCTCTCTTCTCACTCTTTGCAATCTCAGTGAATCTTGTTTGC
GAGATTGCACTGCTTCCTGATCTCACCCTTGGAACCAGTCAAAGGGTTGTTCTCA
GA

QA 4 418 4 418
DS 

RD RR2EV82JQ 703 0 0
CATGAAACTAAATCAAAGATTAAGGCACGATTTCACCACTTATTATTACATAACACACAG
TCCATCATATCATACATCCATTCCATCATTAACCCCACCACAAACCCAAAATCAACAAAG
AAACAACATTAAGATTAATTAACTCAAAAGACCACTACTACAATAATTAAAGCATTAAGG
CTGAAACAACACACAAAAAGAAGAGTGCATATGTGGTCACCACCATGATGAATACATCAT
CATCATCACCCTTCATTTCATTTAACTTCTTAGAATATAATTTTATTCATCTTGGTTCGA
TGCCAAGAAAGTGCAGAGAGAACCCCAAACACAAAGAGGCTCTCTCTCTCTTCTCACTCT
TTGCAATCTCAGTGAATCTTGTTTGCGAGATTGCACTGCTTCCTGATCTCACCCTTGGAA
CCAGTCAAAGGGTTGTTCTCAGACAAGATCTGGATGGCTCTAGTGAACTCCTTGAAGAAG
TAAGCCTGGTCCTTAGCCATCTTCTTAACAATTGGTCTGGTTCGTTTGTCGTGTGCGAGC
TGGTGATCAACAAGGAGCAAACCCTTGTTGTCTAGGATGTTACGGTAGTAGTTGTTGTCT
AATACCATGGGTGTACCGCGGTCATTACGCACATACTGGACCGCCTTTGGGTCAGGGATG
GAGTCGGGACACTTGTGTAGCATGTGAGGGACGTGGTCCGGGT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 6

CO CL1364Contig1 851 6 6 U
GTAACACACCAAACACTAATTATAACTCGCAACTTAACTAAATATGCCCAATTAGATGGA
CATCAATAGTTACTTGTCTTATTACAGTATCATGTTTCACTGACAACCCCAAAAGTTTCA
CTTGTCACACATTACCCCCCAAAACCTTCAAGACTTTCACCACCTTTTGGCAATATAATC
AAATCAAAGTAGCTAAGATTTCACAGAATGATTATTAACTAATGATTCAAAAGTTCAAAT
CTACGTTTCACATCTGATCATTCACAAACTCCTTTCTAACATTTCTTGAGATCTCCTATA
AGATTCCACTTTCTCGAGCAAAAACTTCTCATGACAATTAGCGATGAACATATCTGCCAA
ATGATCAATATCATTATCATCTTCCGCTTCTCCAACATCTCTGTTCTCTTCCAAATCATC
CACCTTCTTGTGCTCCAGCCACTCGAGGTAGCCAGAGAGCTGAGACTCATCATCTTCTGC
GCCATTGATGTCAGAGACAGAAAAAGGGAAAGGTTGAGGGACAGGAACAACATCAGATGA
ACACCAGTTGTAATGCAACCTGAACGATCCAAAAAAGATCTTGCGTTGATTCTTCGAAGC
CTTTCTTGGATAAAACATCGTGAGCTTTCGTTTCTTGTTGTTATGTTTAGAGATCTCTAG
AAAGATTGATTTGGCTCTCGAAACAGCTCTAAGGAAACGGTAGAGAGGATGTGCGAGGAG
ATTTTGGATTATGGTTTTGAGTTTCATGGAAGGTGATGAAGTTGAAGATGAACATGATGA
TGATGATTTGAACTGCATGACTTAATTAAAGACTCAAGAGAGAGACTCTTTCTATCTTTC
TCACACTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AQ01JQ U 24
AF RR2DQ18JQ U 165
AF RR2BC24JQ U 1
AF RR2DQ18TF C 542
AF RR2AQ01TF C 25
AF RR2BC24TF C 168
BS 1 46 RR2BC24JQ
BS 47 47 RR2AQ01JQ
BS 48 145 RR2BC24JQ
BS 146 146 RR2AQ01JQ
BS 147 744 RR2BC24JQ
BS 745 851 RR2AQ01TF

RD RR2AQ01JQ 635 0 0
A
ACTCGCAACTTAACTAAATATGCCCAATTAGATGGACATCAATAGTTATTTGTCTTATTA
CAGTATCATGTTTCACTGACAACCCCAAAAGTTTCACTTGTCACACATTACCCCCCAAAA
CCTTCAAGACTTTCACCACCTTTTGGCAATATAATCAAATCAAAGTAGCTAAAATTTCAC
AGAATGATTATTAACTAATGATTCAAAAGTTCAAATCTACGTTTCACATCTGATCATTCA
CAAACTCCTTTCTAACATTTCTTGAGATCTCCTATAAAATTCCACTTTCTCGAGCAAAAA
CTTCTCATGACAATTAGCGATGAACATATCTGCCAAATGATCAATATCATTATCATCTTC
CGCTTCTCCAACATCTCTGTTCTCTTCCAAATCATCCACCTTCTTGTGCTCCAGCCACTC
GAGGTAGCCAGAGAGCTGAAACTCATCATCTTCTGCGCCATTGATGTCAAAAACAGAAAA
AGGGAAAGGTTGAGGGACAGGAACAACATCAGATGAACACCAGTTGTAATGCAACCTGAA
CGATCCAAAAAAGATCTTGCGTTGATTCTTCGAAGCCTTTCTTGGATAAAACATCGTGAG
CTTTCGTTTCTTGTTGTTATGTTTAGAGATCTCT

QA 2 635 2 635
DS 

RD RR2DQ18JQ 518 0 0
TTTTGGCAATATAATCAAATCAAAGTAGCTAAGATTTCACAGAATGATTATTAACTAATG
ATTCAAAAGTTCAAATCTACGTTTCACATCTGATCATTCACAAACTCCTTTCTAACTTTT
CTTGAGATCTCCTATAAGATTCCACTTTCTCGAGCAAAAACTTCTCATGACAATTAGCGA
TGAACATATCTGCCAAATGATCAATATCATTATCATCATCCGCTTCTCCAACATCTCTGT
TCTCTTCCAGATCATCCACCTTCTTGTGCTCCAGCCACTCGAGGTAGCCAGAGAGCTGAG
ACTCATCATCTTCTGCGCCATTGATGTCAGAGACAGAAAAATGGAAAGGCTG**GGACAG
GGACAACATCAGATGAACACCAGTTGTAATGCAACCTGAACGATCCAAAAAAGATCTTGC
GTTGATTCTTCGAAGCCTTTCTTGGATAAAACATCGTGAGCTTTCGTTTCTTGTTGTTAT
GTTTAGAGATCTCTAGAAAGATTGATTTGGCTCTCGAA

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2BC24JQ 744 0 0
GTAACACACCAAACACTAATTATAACTCGCAACTTAACTAAATATGTCCAATTAGATGGA
CATCAATAGTTACTTGTCTTATTACAGTATCATGTTTCACTGACAACCCCAAAAGTTTCA
CTTGTCACACATTACCCCCCAAAACTTTCAAGACTTTCACCACCTTTTGGCAATATAATC
AAATCAAAGTAGCTAAGATTTCACAGAATGATTATTAACTAATGATTCAAAAGTTCAAAT
CTACGTTTCACATCTGATCATTCACAAACTCCTTTCTAACATTTCTTGAGATCTCCTATA
AGATTCCACTTTCTCGAGCAAAAACTTCTCATGACAATTAGCGATGAACATATCTGCCAA
ATGATCAATATCATTATCATCTTCCGCTTCTCCAACATCTCTGTTCTCTTCCAAATCATC
CACCTTCTTGTGCTCCAGCCACTCGAGGTAGCCAGAGAGCTGAGACTCATCATCTTCTGC
GCCATTGATGTCAGAGACAGAAAAAGGGAAAGGTTGAGGGACAGGAACAACATCAGATGA
ACACCAGTTGTAATGCAACCTGAACGATCCAAAAAAGATCTTGCGTTGATTCTTCGAAGC
CTTTCTTGGATAAAACATCGTGAGCTTTCGTTTCTTGTTGTTATGTTTAGAGATCTCTAG
AAAGATTGATTTGGCTCTCGAAACAGCTCTAAGGAAACGGTAGAGAGGATGTGCGAGGAG
ATTTTGGATTATGGTTTTGAGTTT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2DQ18TF 250 0 0
CACCAGTTGTAATGCAACCTGAACGATCCAAAAAAGATCTTGCGTTGATTCTTCGAAGCC
TTTCTTGGATAAAACATCGTGAGCTTTCGTTTCTTGTTGTTATGTTTAGAGATCTCTAGA
AAGATTGATTTGGCTCTCGAAACAGCTCTAAGAAAACGGTAGAGAGGATGTGCGAGGAGA
TTTTGGATTATGGTTTTGAGTTTCATGGAAGGTGATGAAGTTGAAGATGAACATGATGAT
GATGATTTGA

QA 1 250 1 250
DS 

RD RR2AQ01TF 827 0 0
ACTCGCAACTTAACTAAATATGCCCAATTAGATGGACATCAATAGTTA*TTGTCTA**TA
CAGTATCATGTT*CACTGACAACCCCAAAAGTTTCACTTGTCACACATTACCCCCCAAAA
C*TTCAAGACTTTCACCACATTTTGGCAATATAATCAAATCAAAGTAGCTAAGATTTCAC
AGAATGATTATTAACTAATGATTCAAAAGTTCAAATCTACGTTTCACATCTGATCATTCA
CAAACTCCTTTCTAACATTTCTTGAGATCTCCTATAAGATTCCACTTTCTCGAGCAAAAA
CTTCTCATGACAATTAGCGATGAACATATCTGCCAAATGATCAATATCATTATCATCTTC
CGCTTCTCCAACATCTCTGTTCTCTTCCAAATCATCCACCTTCTTGTGCTCCAGCCACTC
GAGGTAGCCAGAGAGCTGAGACTCATCATCTTCTGCGCCATTGATGTCAGAGACAGAAAA
AGGGAAAGGTTGAGGGACAGGAACAACATCAGATGAACACCAGTTGTAATGCAACCTGAA
CGATCCAAAAAAGATCTTGCGTTGATTCTTCGAAGCCTTTCTTGGATAAAACATCGTGAG
CTTTCGTTTCTTGTTGTTATGTTTAGAGATCTCTAGAAAGATTGATTTGGCTCTCGAAAC
AGCTCTAAGGAAACGGTAGAGAGGATGTGCGAGGAGATTTTGGATTATGGTTTTGAGTTT
CATGGAAGGTGATGAAGTTGAAGATGAACATGATGATGATGATTTGAACTGCATGACTTA
ATTAAAGACTCAAGAGAGAGACTCTTTCTATCTTTCTCACACTTATT

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2BC24TF 684 0 0
TGGCAATATAATCAAATCAAAGTAGCTAAGATTTCACAGAATGATTATTAACTAATGATT
CAAAAGTTCAAATCTACGTTTCACATCTGATCATTCACAAACTCCTTTCTAACATTTCTT
GAGATCTCCTATAAGATTCCACTTTCTCGAGCAAAAACTTCTCATGACAATTAGCGATGA
ACATATCTGCCAAATGATCAATATCATTATCATCTTCCGCTTCTCCAACATCTCTGTTCT
CTTCCAAATCATCCACCTTCTTGTGCTCCAGCCACTCGAGGTAGCCAGAGAGCTGAGACT
CATCATCTTCTGCGCCATTGATGTCAGAGACAGAAAAAGGGAAAGGTTGAGGGACAGGAA
CAACATCAGATGAACACCAGTTGTAATGCAACCTGAACGATCCAAAAAAGATCTTGCGTT
GATTCTTCGAAGCCTTTCTTGGATAAAACATCGTGAGCTTTCGTTTCTTGTTGTTATGTT
TAGAGATCTCTAGAAAGATTGATTTGGCTCTCGAAACAGCTCTAAGGAAACGGTAGAGAG
GATGTGCGAGGAGATTTTGGATTATGGTTTTGAGTTTCATGGAAGGTGATGAAGTTGAAG
ATGAACATGATGATGATGATTTGAACTGCATGACTTAATTAAAGACTCAAGAGAGAGACT
CTTTCTATCTTTCTCACACTTATT

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 5

CO CL1365Contig1 909 5 9 U
GGATTTTACATATACAAGAAAGACAATAATAATAATGAGTGCGAACTTGAAAACAGTTGT
TGATCTTAAAGATATGGCGGACGAACTGGTTCTTCTTGATTTTTGGCCAAGCATGTTCGG
GATGAGGACGAAGATGGCTTTGGCTGAGAAAGGAGTGACTTATGAGTACATTGAGACAGA
TCCATGGATTAAGACTCCTTTACTCATCGAGATGAATCCCATTCACAAGAAGATTCCGGT
TCTCATCCACAAAGGTAAACCGATCTGTGAATCTATTATCCAGCTCGAGTACATCGATGA
GGTTTGGTCCGGTACGTACCCAATGCTCCCTTCTGATCCTTACCAGAAAGCTCAAGCAAG
GTTCTGGGCAGATTTCATTGACAAAAAGCTTTACGACCCAGCATGGAAAATATGGGGAAC
AAAGGGAGAAGATCAAGTTGCAGCCAAGAAAGAACTGCTTGAACATTTCAAGACACTTGA
AACAGAGCTTGGAGACAAAGCTTACTACGGTGGGGAAGTGTTTGGGTTCGTAGACATCGC
GTTGATGGGTTATTACAGCTGGTTCGTAGTTATGGAGAAGTTTGGTGAGTTTAGTTTTGA
AACAGAGTTCCCAAAGCTGACTGAGTGGACCAAGAGGTGTTTAGAGAGAGAGAGCGTGGT
TAAGGCATTAGCTGATTCTGACAAGATTATTGAGTATGCTTATGCCCTCAGGAAGAAGTT
TGGAGCCGAGTAGATGCTTTTGACGTTTGCCTTGGTCTGAACACACAAGGAAAGAAAATA
GTTCCGTATCAAGACCATTATGTTCTGTTCTTATGTGAAATTTGTATTTTCTCTCCTGTA
TTTTCTTTGTTCGTGTACTTTCTAGCTTCTAAAAGCATGAAAATCCATAATAAATAAATG
TTTGAATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 10 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C261TF U 1
AF RR2EE07TF U 8
AF RR2D445TF U 8
AF RR2A042TF U 159
AF RR2EE07JQ C 336
BS 1 326 RR2C261TF
BS 327 327 RR2D445TF
BS 328 473 RR2C261TF
BS 474 474 RR2D445TF
BS 475 659 RR2C261TF
BS 660 664 RR2D445TF
BS 665 665 RR2A042TF
BS 666 704 RR2D445TF
BS 705 909 RR2EE07JQ

RD RR2C261TF 659 0 0
GGATTTTACATATACAAGAAAGACAATAATAATAATGAGTGCGAACTTGAAAACAGTTGT
TGATCTTAAAGATATGGCGGACGAACTGGTTCTTCTTGATTTTTGGCCAAGCATGTTCGG
GATGAGGACGAAGATGGCTTTGGCTGAGAAAGGAGTGACTTATGAGTACATTGAGACAGA
TCCATGGATTAAGACTCCTTTACTCATCGAGATGAATCCCATTCACAAGAAGATTCCGGT
TCTCATCCACAAAGGTAAACCGATCTGTGAATCTATTATCCAGCTCGAGTACATCGATGA
GGTTTGGTCCGGTACGTACCCAATGCCCCCTTCTGATCCTTACCAGAAAGCTCAAGCAAG
GTTCTGGGCAGATTTCATTGACAAAAAGCTTTACGACCCAGCATGGAAAATATGGGGAAC
AAAGGGAGAAGATCAAGTTGCAGCCAAGAAAGAACTGCTTGAACATTTCAAGATACTTGA
AACAGAGCTTGGAGACAAAGCTTACTACGGTGGGGAAGTGTTTGGGTTCGTAGACATCGC
GTTGATGGGTTATTACAGCTGGTTCGTAGTTATGGAGAAGTTTGGTGAGTTTAGTTTTGA
AACAGAGTTCCCAAAGCTGACTGAGTGGACCAAGAGGTGTTTAGAGAGAGAGAGCGTGG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2EE07TF 594 0 0
GG
ATATACAAGAAAGACAATAATAATAATGAGTGCGAACTTGAAAACAGTTGTTGATCTTAA
AGATATGGCGGACGAACTGGTTCTTCTTGATTTTTGGCCAAGCATGTTCGGGATGAGGAC
GAAGATGGCTTTGGCTGAGAAAGGAGTGACTTATGAGTACATTGAGACAGATCCATGGAT
TAAGACTCCTTTACTCATCGAGATGAATCCCATTCACAAGAAGATTCCGGTTCTCATCCA
CAAAGGTAA*CCGATCTGTGAATCTATTATCCAGCTCGAGTACATCGATGAGGTTTGGTC
CGGTACGTACCCATTGCTCCCTTCTGATCCTTACCAGAAAGCTCAAGCAAGGTTCTGGGC
AGATTTCATTGACAAAAAGCTTTACGACCCAGCATGGAAAATATGGGGAACAAAGGGAGA
AGATCAAGTTGCAGCCAAGAAAGAACTGCTTTAACATTTCAAGACACTTGAAACAGAGCT
TGGAGACAAAGCTTACTACGGTGGGGAAGTGTTTGGGTTCGTAGACATCGCGTTGATGGG
TTATTACAGCTGGTTCGTAGTTATGGAGAAGTTTGGTGAGTTTAGTTTTGAA

QA 3 594 3 594
DS 

RD RR2D445TF 702 0 0
GG
ATATACAAGAAAGACAATAATAATAATGAGTGCGAACTTGAAAACAGTTGTTGATCTTAA
AGATATGGCGGACGAACTGGTTCTTCTTGATTTTTGGCCAAGCATGTTCGGGATGAGGAC
GAAGATGGCTTTGGCTGAGAAAGGAGTGACTTATGAGTACATTGAGACAGATCCATGGAT
TAAGACTCCTTTACTCATCGAGATGAATCCCATTCACAAGAAGATTCCGGTTCTCATCCA
CAAAGGTAAACCGATCTGTGAATCTATTATCCAGCTCGAGTACATCGATGAGGTTTGGTC
CGGTACGTACCCATTGCTCCCTTCTGATCCTTACCAGAAAGCTCAAGCAAGGTTCTGGGC
AGATTTCATTGACAAAAAGCTTTACGACCCAGCATGGAAAATATGGGGAACAAAGGGAGA
AGATCAAGTTGCAGCCAAGAAAGAACTGCTTGAACATTTCAAGACACTTGAAACAGAGCT
TGGAGACAAAGCTTACTACGGTGGGGAAGTGTTTGGGTTCGTAGACATCGCGTTGATGGG
TTATTACAGCTGGTTCGTAGTTATGGAGAAGTTTGGTGAGTTTAGTTTTGAAACAGAGTT
CCCAAAGCTGACTGAGTGGACCAAGAGGTGTTTAGAGAGAGAGAGCGTGGTTAAG*CATT
AGCTGATTCTGACAAGATTATTGAGTATGCTTATG
CCCTC

QA 3 697 3 697
DS 

RD RR2A042TF 549 0 0
CTTATGAGTACATTGAGACAGATCCATGGATTAAGACTCCTTTACTCATCGAGATGAATC
CCATTCACAAGAAGATTCCGGTTCTCATCCACAAAGGTAAACCGATCTGTGAATCTATTA
TCCAGCTCGAGTACATCGATGAGGTTTGGTCCGGTACGTACCCAATGCTCCCTTCTGATC
CTTACCAGAAAGCTCAAGCAAGGTTCTGGGCAGATTTCATTGACAAAAAGCTTTACGACC
CAGCATGGAAAATATGGGGAACAAAGGGAGAAGATCAAGTTGCAGCCAAGAAAGAACTGC
TTGAACATTTCAAGACACTTGAAACAGAGCTTGGAGACAAAGCTTACTACGGTGGGGAAG
TGTTTGGGTTCGTAGACATCGCGTTGATGGGTTATTACAGCTGGTTCGTAGCTATGGAGA
AGTTTGGTGAGTTTAGTTTTGAAACAGAGTTCCCAAAGCTGACTGAGTGGACCAAGAGGT
GTTTCGAGAGAGAGAGCGTGGTTAAGGCATTGGCTGATTCTGACAAGATTATCGAGTATG
CTTATG
TCC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2EE07JQ 574 0 0
ATCCTTACCAGAAAGCTCAAGCAAGGTTCTGGGCAGATTTCATTGACAAAAAGCTTTACG
ACCCAGCATGGAAAATATGGGGAACAAAGGGAGAAGATCAAGTTGCAGCCAAGAAAGAAC
TGCTTTAACATTTCAAGACACTTGAAACAGAGCTTGGAGACAAAGCTTACTACGGTGGGG
AAGTGTTTGGGTTCGTAGACATCGCGTTGATGGGTTATTACAGCTGGTTCGTAGTTATGG
AGAAGTTTGGTGAGTTTAGTTTTGAAACAGGGCTCCCAAAGCTGACTGAGTGGACCAAGA
GGTGTTTAGAGAGAGAGAGCGTGGTTAAGGCATTAGCTGATTCTGACAAGATTATTGAGT
ATGCTTATGCCCTCAGGAAGAAGTTTGGAGCCGAGTAGATGCTTTTGACGTTTGCCTTGG
TCTGAACACACAAGGAAAGAAAATAGTTCCGTATCAAGACCATTATGTTCTGTTCTTATG
TGAAATTTGTATTTTCTCTCCTGTATTTTCTTTGTTCGTGTACTTTCTAGCTTCTAAAAG
CATGAAAATCCATAATAAATAAATGTTTGAATCG

QA 1 574 1 574
DS 



AS 2 6

CO CL1366Contig1 546 2 2 U
GGACTTGCAATTTTAGAAAACGCTTAAGCATCTCGAATCAAACCTAAAACCCTAAGCAAC
CCTTCGCTCTCTCTACTCCACACATCTCTGAAATGGCGATCTCTAAGTCTACCGTCGTTG
CTCTCGTCGCGGTGATTCTCTCCGTCGTTGCTACCGCCGCTTCGGCTCAGGCTGAGGCTC
CCGCGCCAGCCCCTACTTCTGGATCTGGTTCGTTCTCGCCGTCGATCGTCTCAGCTGGTG
TTGCAGCAGTCGCGGCTCTGGTTTTCGGCTCTGCTCTTCGAATCTAAGTTCTATGCGATG
TGAGATTCGTACAGAGATTTAGGTTTTGAAATTTTTCAATCGGATATATAGGCAGCATTT
CATGATATTCGTCGTGTGTATTCCGGAGCTATAGATCTCACCTCTTCTTTTGCTATTATC
TACTTTCGTGTCGTTGTGAAGGATATATTTGTGGCTTTGTGATTTCTAGACGGTTTTAGT
TATGCGATATTGTTTTTGATTATGGTTCGGATATATATTTATTTATTTATGGATGATGGT
TCTCAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM41TF U 1
AF RR2FM41JQ C 1
BS 1 530 RR2FM41TF
BS 531 546 RR2FM41JQ

RD RR2FM41TF 546 0 0
GGACTTGCAATTTTAGAAAACGCTTAAGCATCTCGAATCAAACCTAAAACCCTAAGCAAC
CCTTCGCTCTCTCTACTCCACACATCTCTGAAATGGCGATCTCTAAGTCTACCGTCGTTG
CTCTCGTCGCGGTGATTCTCTCCGTCGTTGCTACCGCCGCTTCGGCTCAGGCTGAGGCTC
CCGCGCCAGCCCCTACTTCTGGATCTGGTTCGTTCTCGCCGTCGATCGTCTCAGCTGGTG
TTGCAGCAGTCGCGGCTCTGGTTTTCGGCTCTGCTCTTCGAATCTAAGTTCTATGCGATG
TGAGATTCGTACAGAGATTTAGGTTTTGAAATTTTTCAATCGGATATATAGGCAGCATTT
CATGATATTCGTCGTGTGTATTCCGGAGCTATAGATCTCACCTCTTCTTTTGCTATTATC
TACTTTCGTGTCGTTGTGAAGGATATATTTGTGGCTTTGTGATTTCTAGACGGTTTTAGT
TATGCGATATTGTTTTTGATTATGGTTCGGATATATATTTATTTATTTAT
GGATGATGGTTCTCAG

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2FM41JQ 546 0 0
GGACTTGCAATTTTAGAAAACGCTTAAGCATCTCGAATCAAACCTAAAACCCTAAGCAAC
CCTTCGCTCTCTCTACTCCACACATCTCTGAAATGGCGATCTCTAAGTCTACCGTCGTTG
CTCTCGTCGCGGTGATTCTCTCCGTCGTTGCTACCGCCGCTTCGGCTCAGGCTGAGGCTC
CCGCGCCAGCCCCTACTTCTGGATCTGGTTCGTTCTCGCCGTCGATCGTCTCAGCTGGTG
TTGCAGCAGTCGCGGCTCTGGTTTTCGGCTCTGCTCTTCGAATCTAAGTTCTATGCGATG
TGAGATTCGTACAGAGATTTAGGTTTTGAAATTTTTCAATCGGATATATAGGCAGCATTT
CATGATATTCGTCGTGTGTATTCCGGAGCTATAGATCTCACCTCTTCTTTTGCTATTATC
TACTTTCGTGTCGTTGTGAAGGATATATTTGTGGCTTTGTGATTTCTAGACGGTTTTAGT
TATGCGATATTGTTTTTGATTATGGTTCGGATATATATTTATTTATTTATGGATGATGGT
TCTCAG

QA 1 546 1 546
DS 



CO CL1366Contig2 547 4 8 U
CCTGAGAAACATCCATAAATAAATAAATAAATATATATCCGAACCATAATCAAAAACAAT
ATCGCATAACTAAAACCGTCTAGAAATCACAAAGCCACAAATATATCCTTCACAACGACA
CGAAAGTAGATAATAGCAAAAGAAGAGGTGAGATCTATAGCTCCGGAATACACACGACGA
ATATCATGAAATGCTGCCTATATATCCGATTGGAAAATTTTCAAAACCCAATCTCTGTAC
GAATCTCACATCGCATAGAACCTAGATCCGAAGAGCAGAGCCGAAAACCAGAGCCGCGAC
TGCTGCAACACCAGCTGAGACGATCGACGGCGAGAACGAACCAGATCCAGAGGTAGGGGC
TGGCGCGGGAGCCTCAACCTGAGCCGAAGCGACGGTAGCAACGACGGAGACAATCACCGC
GACGAGAGCAACAACGGTAGCCTTAGAGATCGCCATTTCAGAGATGTGTAGAGTAGAGAG
CGAAGGGTTGCTTAGGGTTTTAGTTTTGATTCGAGATGCTTTAAGCGTTCTCTAAAATTG
CAAGTCC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 

AF RR2GP59JQ U 1
AF RR2GP59TF C 1
AF RR2A772JQ U 2
AF RR2A772TF C 2
BS 1 119 RR2GP59JQ
BS 120 120 RR2A772JQ
BS 121 228 RR2GP59JQ
BS 229 229 RR2A772JQ
BS 230 261 RR2GP59JQ
BS 262 262 RR2A772JQ
BS 263 474 RR2GP59JQ
BS 475 547 RR2A772JQ

RD RR2GP59JQ 474 0 0
CCTGAGAAACATCCATAAATAAATAAATAAATATATATCCGAACCATAATCAAAAACAAT
ATCGCATAACTAAAACCGTCTAGAAATCACAAAGCCACAAATATATCCTTCACAACGACG
CGAAAGTAGATAATAGCAAAAGAAGAGGTGAGATCTATAGCTCCGGAATACACACGACGA
ATATCATGAAATGCTGCCTATATATCCGATTGGAAAATTTTCAAAACCTAATCTCTGTAC
GAATCTCACATCGCATAGAACTTAGATCCGAAGAGCAGAGCCGAAAACCAGAGCCGCGAC
TGCTGCAACACCAGCTGAGACGATCGACGGCGAGAACGAACCAGATCCAGAGGTAGGGGC
TGGCGCGGGAGCCTCAACCTGAGCCGAAGCGACGGTAGCAACGACGGAGACAATCACCGC
GACGAGAGCAACAACGGTAGCCTTAGAGATCGCCATTTCAGAGATGTGTAGAGT

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2GP59TF 548 0 0
C
CTGAGAAACATCCATAAAAAAATAAATAAATATATATCCGAACCATAATCAAAAACAATA
TCGCATAACTAAAACCGTCTAGAAATCACAAAGCCACAAATATATCCTTCACAACGACGC
GAAAGTAGATAATAGCAAAAGAAGAGGTGAGATCTATAGCTCCGGAATACACACGACGAA
TATCATGAAATGCTGCCTATATATCCGATTGGAAAATTTTCAAAACCTAATCTCTGTACG
AATCTCACATCGCATAGAACTTAGATCCGAAGAGCAGAGCCGAAAACCAGAGCCGCGACT
GCTGCAACACCAGCTGAGACGATCGACGGCGAGAACGAACCAGATCCAGAGGTAGGGGCT
GGCGCGGGAGCCTCAACCTGAGCCGAAGCGACGGTAGCAACGACGGAGACAATCACCGCG
ACGAGAGCAACAACGGTAGCCTTAGAGATCGCCATTTCAGAGATGTGTAGAGTAGAGAGC
GAAGGGTTGCTTAGGGTTTTAGTTTTGATTCGAGATGCTTTAAGCGTTTTCTAAAATTGC
AAGT
GTC

QA 2 545 2 545
DS 

RD RR2A772JQ 546 0 0
CTGAGAAACATCCATAAATAAATAAATAAATATATATCCGAACCATAATCAAAAGCAATA
TCGCATAACTAAAACCGTCTAGAAATCACAAAGCCACAAATATATCCTTCACAACGACAC
GAAAGTAGATAATAGCAGAAGAAGAGGTGAGATCTATAGCTCCGGAATACACACGACGAA
TATCATGAAATGCTGCCTATATATCCGATTGGAAAATTTTCAAAACCCAATCTCTGTACG
AATCTCACATCGCATAGAACCTAGATCCGAGGAGCAGAGCCGAAAACCAGAGCCGCGACT
GCTGTAACACCAGCTGAGACGATCGACGGCGAGAACGAACCAGATCCAGAGGTAGGGGCT
GGCGCGGGAGCCTCAACCTGAGCCGAAGCGACGGTAGCAACGACGGAGACAATCACCGCG
ACGAGAGCAACAACGGTAGCCTTAGAGATCGCCATTTCAGAGATGTGTAGAGTAGAGAGC
GAAGGGTTGCTTAGGGTTTTAGTTTTGATTCGAGATGCTTTAAGCGTTCTCTAAAATTGC
AAGTCC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2A772TF 546 0 0
CTGAGAAACATCCATAAATAAATAAATAAATATATATCCGAACCATAATCAAAAGCAATA
TCGCATAACTAAAACCGTCTAGAAATCACAAAGCCACAAATATATCCTTCACAACGACAC
GAAAGTAGATAATAGCAGAAGAAGAGGTGAGATCTATAGCTCCGGAATACACACGACGAA
TATCATGAAATGCTGCCTATATATCCGATTGGAAAATTTTCAAAACCCAATCTCTGTACG
AATCTCACATCGCATAGAACCTAGATCCGAGGAGCAGAGCCGAAAACCAGAGCCGCGACT
GCTGTAACACCAGCTGAGACGATCGACGGCGAGAACGAACCAGATCCAGAGGTAGGGGCT
GGCGCGGGAGCCTCAACCTGAGCCGAAGCGACGGTAGCAACGACGGAGACAATCACCGCG
ACGAGAGCAACAACGGTAGCCTTAGAGATCGCCATTTCAGAGATGTGTAGAGTAGAGAGC
GAAGGGTTGCTTAGGGTTTTAGTTTTGATTCGAGATGCTTTAAGCGTTCTCTAAAATTGC
AAGTCC

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 6

CO CL1367Contig1 600 6 14 U
GGATAGTCAATATTAACGAAAAAAAAAACCTTTGATCTTAGAAATGGCAGCCAAATTCCA
CCTCTCGTCTTCCTTTAGCCAGAAGGCCAAAGATTCCACAACTTCATCATCTTCCTCATA
TTCAGCGTTGCTTGCTCTGCCTCATTTCCTCTGTACACCGTCTTCATCAGGCTTTACGCA
GTTCAAGCTTCACGCCAAATTAGGTGGAGGAGATGGAGAAGTGAAACCTAAAGAAAAGAA
GAAGTTCATAACCAAAGACGAAGAACCAGAACAGTATTGGCAAAGCGCTGGCGAAAGAGA
AGGGGAGAATCCGATGAAGACGCCTCTCCCTTACATAATCATTTTTGGTATGTCAACTCC
ATTCGTCATCTTAGCCATTGCTTTTGCTAATGGCTGGATCAAAGTTCCTATTCGCTGAGC
ACTTATT*AAATTCTTCTTCCCTTGTTTAAGTTTCTAAACATGAAATGAATCATAGACAT
CTTCTTCGGCTGTAAAAGAAAGTAAAAGAAAACAAAGTCTGCGTTTATATTGTATGGTTC
TCTCCTGCATCTTTCGTTTTTGCGCTTTTTTTTAGTTTATTTAATTTTCGAGTTCTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ19TF U 1
AF RR2DD23TF U 23
AF RR2FC31TF U 24
AF RR2EH82JQ C 53
AF RR2G441JQ C 32
AF RR2G441TF U 32
BS 1 81 RR2EJ19TF
BS 82 82 RR2DD23TF
BS 83 258 RR2EJ19TF
BS 259 259 RR2DD23TF
BS 260 312 RR2EJ19TF
BS 313 313 RR2DD23TF
BS 314 421 RR2EJ19TF
BS 422 422 RR2DD23TF
BS 423 427 RR2EJ19TF
BS 428 428 RR2DD23TF
BS 429 488 RR2EJ19TF
BS 489 489 RR2DD23TF
BS 490 531 RR2EJ19TF
BS 532 600 RR2FC31TF

RD RR2EJ19TF 531 0 0
GGATAGTCAATATTAACGAAAAAAAAAACCTTTGATCTTAGAAATGGCAGCCAAATTCCA
CCTCTCGTCTTCCTTTAGCCACAAGGCCAAAGATTCCACAACTTCATCATCTTCCTCATA
TTCAGCGTTGCTTGCTCTGCCTCATTTCCTCTGTACACCGTCTTCATCAGGCTTTACGCA
GTTCAAGCTTCACGCCAAATTAGGTGGAGGAGATGGAGAAGTGAAACCTAAAGAAAAGAA
GAAGTTCATAACCAAAGAGGAAGAACCAGAACAGTATTGGCAAAGCGCTGGCGAAAGAGA
AGGGGAGAATCCAATGAAGACGCCTCTCCCTTACATAATCATTTTTGGTATGTCAACTCC
ATTCGTCATCTTAGCCATTGCTTTTGCTAATGGCTGGATCAAAGTTCCTATTCGCTGAGC
ATTTATTTAAATTCTTCTTCCCTTGTTTAAGTTTCTAAACATGAAATGAATCATAGACAT
CTTCTTCGTCTGTAAAAGAAAGTAAAAGAAAACAAAGTCTGCGTTTATATT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2DD23TF 474 0 0
GGGAACCT
TTTGATCTTAGAAATGGCAGCCAAATTCCACCTCTCGTCTTCCTTTAGCCAGAAGGCCAA
AGATTCCACAACTTCATCATCTTCCTCATATTCAGCGTTGCTTGCTCTGCCTCATTTCCT
CTGTACACCGTCTTCATCAGGCTTTACGCAGTTCAAGCTTCACGCCAAATTAGGTGGAGG
AGATGGAGAAGTGAAACCTAAAGAAAAGAAGAAGTTCATAACCAAAGACGAAGAACCAGA
ACAGTATTGGCAAAGCGCTGGCGAAAGAGAAGGGGAAAATCCGATGAAGACGCCTCTCCC
TTACATAATCATTTTTGGTATGTCAACTCCATTCGTCATCTTAGCCATTGCTTTTGCTAA
TGGCTGGATCAAAGTTCCTATTCGCTGAGCACTTATT*AAATTCTTCTTCCCTTGTTTAA
GTTTCTAAACATGAAATGAATCATAGACATCTTCTTCGGCTG
CAAA

QA 9 470 9 470
DS 

RD RR2FC31TF 577 0 0
GGAACCT
TTTGATCTTAGAAATGGCAGCCAAATTCCACCTCTCGTCTTCCTTTAGCCAGAAGGCCAA
AGATTCCACAACTTCATCATCTTCCTCATATTCAGCGTTGCTTGCTCTGCCTCATTTCCT
CTGTACACCGTCTTCATCAGGCTTTACGCAGTTCAAGCTTCACGCCAAATTAGGTGGAGG
AGATGGAGAAGTGAAACCTAAAGAAAAGAAGAAGTTCATAACCAAAGACGAAGAACCAGA
ACAGTATTGGCAAAGCGCTGGCGAAAGAGAAGGGGAAAATCCGATGAAGACGCCTCTCCC
TTACATAATCATTCTTGGTATGTCAACTCCATTCGTCATCTTAGCCATTGCTTTTGCTAA
TGGCTGGATCAAAGTTCCTATTCGCTGAGCACTTATT*AAATTCTTCTTCCCTTGTTTAA
GTTTCTAAACATGAAATGAATCATAGACATCTTCTTCGGCTGTAAAAGAAAGTAAAAGAA
AACAAAGTCTGCGTTTATATTGTATGGTTCTCTCCTGCATCTTTCGTTTTTGCGCTTTTT
TTTAGTTTATTTAATTTTCGAGTTCTTTAT

QA 8 577 8 577
DS 

RD RR2EH82JQ 496 0 0
AAATTCCACCTCTCGTCTTCCTTTAGCCAGAAGGCCAAAGATTCCACAACTTCATCATCT
TCCTCATATTCAGCGTTGCTTGCTCTGCCTCATTACCTCTGTACACCGTCTTCATCAGGC
TTTACGCAGTTCAAGCTTCACGCCAAATTAGGTGGAGGAGATGGAGAAGTGAAACCTAAA
GAAAAGAAGAAGTTCATAACCAAAGACGAAGAACCAGGACAGTATTGGCAAAGCGCTGGC
GAAAGAGAAGGGGAGAATCCGATGAAGACGCCTCTCCCTTACATAATCATTTTTGGTATG
TCAACTCCATTCGTCATCTTAGCCATTGCTTTTGCTAATGGCTGGATCAAAGTTCCTATT
CGCTGAGCACTTATT*AAATTCTTCTTCCCTTGTTTAAGTTTCTAAACATGAAATGAATC
ATAGACATCTTCTTCGGCTGTAAAAGAAAGTAAAAGAAAACAAAGTCTGCGTTTATATTG
TATGGTTCTCTCCTG
C

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR2G441JQ 517 0 0
GG
GATCTTAGAAATGGCAGCCAAATTCCACCTCTCGTCTTCCTTTAGCCAGAAGGCCAAAGA
TTCCACAACTTCATCATCTTCCTCATATTCAGCGTTGCTTGCTCTGCCTCATTTCCTCTG
TACACCGTCTTCATCAGGCTTTACGCAGTTCAAGCTTCACGCCAAATTAGGTGGAGGAGA
TGGAGAAGTGAAACCTAAAGAAAAGAAGAAGTTCATAACCAAAGACGAAGAACCAGAACA
GTATTGGCAAAGCGCTGGCGAAAGAGAAGGGGAGAATCCGATGAAGACGCCTCTCCCTTA
CATAATCATTTTTGGTATGTCAACTCCATTCGTCATCTTAGCCATTGCTTTTGCTAATGG
CTGGATCAAAGTTCCTATTCGCTGAGCACTTATT*AAATTCTTCTTCCCTTGTTTAAGTT
TCTAAACATGAAATGAATCATAGACATCTTCTTCGGCTGTAAAAGAAAGTAAAAGAAAAC
AAAGTCTGCGTTTATATTGTATGGTTCTCTCCTG
T

QA 3 516 3 516
DS 

RD RR2G441TF 517 0 0
GG
GATCTTAGAAATGGCAGCCAAATTCCACCTCTCGTCTTCCTTTAGCCAGAAGGCCAAAGA
TTCCACAACTTCATCATCTTCCTCATATTCAGCGTTGCTTGCTCTGCCTCATTTCCTCTG
TACACCGTCTTCATCAGGCTTTACGCAGTTCAAGCTTCACGCCAAATTAGGTGGAGGAGA
TGGAGAAGTGAAACCTAAAGAAAAGAAGAAGTTCATAACCAAAGACGAAGAACCAGAACA
GTATTGGCAAAGCGCTGGCGAAAGAGAAGGGGAGAATCCGATGAAGACGCCTCTCCCTTA
CATAATCATTTTTGGTATGTCAACTCCATTCGTCATCTTAGCCATTGCTTTTGCTAATGG
CTGGATCAAAGTTCCTATTCGCTGAGCACTTATT*AAATTCTTCTTCCCTTGTTTAAGTT
TCTAAACATGAAATGAATCATAGACATCTTCTTCGGCTGTAAAAGAAAGTAAAAGAAAAC
AAAGTCTGCGTTTATATTGTATGGTTCTCTCCTG
T

QA 3 516 3 516
DS 



AS 1 4

CO CL1368Contig1 1044 4 28 U
GATGAAATCAAGAAGGAGAATCCTGAAGCTGACTTTAAGGAGACTTCGAACATTCTCGGC
GCTAAATGGAAGTCTCTTAGCGCGGAAGAGAAGAAGCCTTACGAGGAGAGGTACAAGGTG
GAAAAGGAAGCTTACCTCCAGGTGGTTGCTAAGGAGAAGCGTGAGAGAGAGGCCATGAAG
CTTCTGGATGATGGGCAGAAGCAGAAGACTGCTATGGATTTGCTTGATCAGTATCTGCAG
TTTGTGCAGGAAGGTGAACAGGACAACAAGAAGAAGAGCAAGAAGCAGAAGGATCCTCGG
AAGCCAAAGCATCCCATATCCGCCTTCCTGGTTTATGCCAACCAGAGGAGAGCTGAGTTA
CGTGAAGAGAACAAGAACGTTGTGGAGGTCGCAAAGATGACAGGAGAAGAGTGGAAGAAG
CTGTCAGATAAACAAAAAGCACCCTTCGAAGAGGTGGCAAAGAAGAACAAGGAGACATAC
CTGCAAGCAATGGAGGAGTACAAAAGAACGAAGGAAGAAGAGGCGATGAGCCAGAAGAAA
GAAGAAGAGGAGCTCTTGAAACTCCACAAACAGGAAGCTCTCCAGCTTCTTAAGAAGAAG
GAGAAAACAGACAATCTAATCAAGAAGGAAAAAGAGACCAAGAAGAAGAAGAACGAAAAC
GTTGACCCAAACAAACCCAAGAAGCCCGCTTCATCATTCTTTCTCTTCAGCAAAGATGCA
AGGAAGACTTTGACAGAAGAACGTCCTGGGACGAGCAACTCAACAGTTACCGCTCTAATC
TCAGTGAAATGGAAGGAATTGGGTGAAGAAGAGAAGCAAAGTTACAACAACAAAGCAGCA
AAGTTGATGGAAGCATACAAGAAGGAACTTGAAGATTGCAACAAGAAGAGTGCTGAGGCT
ACGACCAGTAGCTAGAAGAAT***TATCTATCTCTCTTTAAAATTGAAATAATGTTCAAG
TCCTGTTGAACATGTGTCTTTTTATGCATTGTGTTAGAATCTGAAACTCAAGTGATTTCT
TCTATAAAATGATTACTTGGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B341TF U 1
AF RR2FG26TF U 215
AF RR2FG26JQ C 216
AF RR2B341JQ C 271
BS 1 236 RR2B341TF
BS 237 237 RR2FG26TF
BS 238 263 RR2B341TF
BS 264 264 RR2FG26TF
BS 265 265 RR2B341TF
BS 266 267 RR2FG26TF
BS 268 437 RR2B341TF
BS 438 438 RR2FG26TF
BS 439 446 RR2B341TF
BS 447 447 RR2FG26TF
BS 448 503 RR2B341TF
BS 504 504 RR2FG26TF
BS 505 668 RR2B341TF
BS 669 669 RR2FG26TF
BS 670 686 RR2B341TF
BS 687 687 RR2FG26TF
BS 688 714 RR2B341TF
BS 715 864 RR2FG26TF
BS 865 865 RR2FG26JQ
BS 866 897 RR2FG26TF
BS 898 898 RR2FG26JQ
BS 899 919 RR2FG26TF
BS 920 920 RR2FG26JQ
BS 921 933 RR2FG26TF
BS 934 990 RR2FG26JQ
BS 991 991 RR2B341JQ
BS 992 1021 RR2FG26JQ
BS 1022 1044 RR2B341JQ

RD RR2B341TF 714 0 0
GATGAAATCAAGAAGGAGAATCCTGAAGCTGACTTTAAGGAGACTTCGAACATTCTCGGC
GCTAAATGGAAGTCTCTTAGCGCGGAAGAGAAGAAGCCTTACGAGGAGAGGTACAAGGTG
GAAAAGGAAGCTTACCTCCAGGTGGTTGCTAAGGAGAAGCGTGAGAGAGAGGCCATGAAG
CTTCTGGATGATGGGCAGAAGCAGAAGACTGCTATGGATTTGCTTGATCAGTATCTTCAG
TTTGTGCAGGAAGGTGAACAGGATATAAAGAAGAAGAGCAAGAAGCAGAAGGATCCTCGG
AAGCCAAAGCATCCCATATCCGCCTTCCTGGTTTATGCCAACCAGAGGAGAGCTGAGTTA
CGTGAAGAGAACAAGAACGTTGTGGAGGTCGCAAAGATGACAGGAGAAGAGTGGAAGAAG
CTGTCAGATAAACAAAAGGCACCCTTTGAAGAGGTGGCAAAGAAGAACAAGGAGACATAC
CTGCAAGCAATGGAGGAGTACAAGAGAACGAAGGAAGAAGAGGCGATGAGCCAGAAGAAA
GAAGAAGAGGAGCTCTTGAAACTCCACAAACAGGAAGCTCTCCAGCTTCTTAAGAAGAAG
GAGAAAACAGACAATCTAATCAAGAAGGAAAAAGAGACCAAGAAGAAGAAGAACGAAAAC
GTTGACCCTAACAAACCCAAGAAGCCTGCTTCATCATTCTTTCTCTTCAGCAAA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2FG26TF 736 0 0
G
GGATTTGCTTGATCAGTATCTGCAGTTTGTGCAGGAAGGTGAACAGGACAACAAGAAGAA
GAGCAAGAAGCAGAAGGATCCTCGGAAGCCAAAGCATCCCATATCTGCCTTCCTGGTTTA
TGCCAACCAGAGGAGAGCTGAGTTACGTGAAGAGAACAAGAACGTTGTGGAGGTCGCAAA
GATGACAGGAGAAGAGTGGAAGAAGTTGTCAGATAAACAAAAAGCACCCTTCGAAGAGGT
GGCGAAGAAGAACAAGGAGACATACCTGCAAGCAATGGAGGAGTACAAAAGAACGAAGGA
AGAAGAGGCGATGAGCCAGAAGAAAGAAGAAGAGGAGCTCTTGAAACTCCACAAACAGGA
AGCTCTCCAGCTTCTTAAGAAGAAGGAGAAAACAGACAATCTGATCAAGAAGGAAAAAGA
GACCAAGAAGAAGAAGAACGAAAACGTTGACCCAAACAAACCCAAGAAGCCCGCTTCATC
ATTCTTTCTCTTCAGCAAAGATGCAAGGAAGACTTTGACAGAAGAACGTCCTGGGACGAG
CAACTCAACAGTTACCGCTCTAATCTCAGTGAAATGGAAGGAATTGGGTGAAGAAGAGAA
GCAAAGTTACAACAACAAAGCAGCAAAGTTGATGGAAGCATACAAGAAG*AACTTGAAGA
TTGCAACAAGAAGAGTGCTGAG*CTACGACCAGTAGCTAGAAGA*T***TATCTATCT
CTCTTTAAATTGAAAAA

QA 2 719 2 719
DS 

RD RR2FG26JQ 808 0 0
GGATTTGCTTGATCAGTATCTGCAGTT*GTGCAGGAAGGTGAACAGGACAACAAGAAGAA
GAGCAAGAAGCAGAAGGATCCTCGGAAGCCAAAGCATCCCATATCTGCCTTCCTGGTTTA
TGCCAACCAGAGGAGAGCTGAGTTACGTGAAGAGAACAAGAACGTTGTGGAGGTCGCAAA
GATGACAGGAGAAGAGTGGAAGAAGTTGTCAGATAAACAAAAAGCACCCTTCGAAGAGGT
GGCGAAGAAGAACAAGGAGACATACCTGCAAGCAATGGAGGAGTACAAAAGAACGAAGGA
AGAAGAGGCGATGAGCCAGAAGAAAGAAGAAGAGGAGCTCTTGAAACTCCACAAACAGGA
AGCTCTCCAGCTTCTTAAGAAGAAGGAGAAAACAGACAATCTGATCAAGAAGGAAAAAGA
GACCAAGAAGAAGAAGAACGAAAACGTTGACCCAAACAAACCCAAGAAGCCCGCTTCATC
ATTCTTTCTCTTCAGCAAAGATGCAAGGAAGACTTTGACAGAAGAACGTCCTGGGACGAG
CAACTCAACAGTTACCGCTCTAATCTCAGTGAAATGGAAGGAATTGGGTGAAGAAGAGAA
GCAAAGTTACAACAACAAAGCAGCAAAGTTGATGGAAGCATACAAGAAGGAACTTGAAGA
TTGCAACAAGAAGAGTGCTGAGGCTACGACCAGTAGCTAGAAGAAT***TATCTATCTCT
CTTTAAAATTGAAATAATGTTCAAGTCCTGTTGAACATGTGTCTTTTTATGCATTTTGTT
AGAATCTGAAACTCAAGTGATTTCTT
TT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2B341JQ 774 0 0
AAGAAGAGCAAGAAGCAGAAGGATCCTCGGAAGCCAAAGCATCCCATATCCGCCTTCCTG
GTTTATGCCAACCAGAGGAGAGCTGAGTTACGTGAAGAGAACAAGAACGTTGTGGAGGTC
GCAAAGATGACAGGAGAAGAGTGGAAGAAGCTGTCAGATAAACAAAAGGCACCCTTTGAA
GAGGTGGCAAAGAAGAACAAGGAGACATACCTGCAAGCAATGGAGGAGTACAAGAGAACG
AAGGAAGAAGAGGCGATGAGCCAGAAGAAAGAAGAAGAGGAGCTCTTGAAACTCCACAAA
CAGGAAGCTCTCCAGCTTCTTAAGAAGAAGGAGAAAACAGACAATCTAATCAAGAAGGAA
AAAGAGACCAAGAAGAAGAAGAACGAAAACGTTGACCCTAACAAACCCAAGAAGCCTGCT
TCATCATTCTTTCTCTTCAGCAAAGATGCAAGGAAGACTTTGACAGAAGAACGTCCTGGG
ACGAGCAACTCAACAGTTACCGCTCTAATCTCAGTGAAATGGAAGGAATTGGGTGAAGAA
GAGAAGCAAAGTTACAACAACAAAGCAGCAAAGTTGATGGAAGCATACAAGAAGGAACTT
GAAGATTACAACAAGAAGAGTGCTGAGGCTACGACCAGTAGCTAGAAGATTATCTATCTA
TCTCTCTTTAAAATTGAAATAATGTTCAAGTCCTGTTGAACATGTGTCTTTTTATGCTTT
GTGTTAGAATCTGAAACTCAAGTGATTTCTTCTATAAAATGATTACTTGGTTTT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 5

CO CL1369Contig1 1406 5 5 U
AGTTGGTGCAAAACGATCATATTAACGATAATGAAGAAACAAAAACTAGTCACACATAAG
AAGAGTATTATAATAACTCAAACACCAAAATCAAGCTCAAGTTTTGAGTTCTGGTCAACG
GAACCATTCATACATATAAGCTTAATAGGTGTAGCCTTTTACAAACATACCCTCCTTGGC
ATCCTCGGACTCACCTTCTCCTGTGTATTTCCCTAGCTGAGCCAGCGAGTTGGCTTTGGC
TCGGGTCAAGAGAGTGTCCTGAGCCGCCTTCACGTTCTCTTCTCTGCCTCCCCATGTCTT
CAAGCAAGTGTTCTGCAAGGCACGTGCATAGGAGAAGGACACGTGCCACGGGTTCGGTCC
TTGGTTCATTGCGTTCAGGTTCAAGGTCGCCTCCAACTCGGACTGACCTCCAGACAGGAA
CATGATTCCGGGTACAGCGGGAGGAACTCTGTTGGAAAGAAGCTTGAGAGTGTAGGAAGC
AACTTGCTCGGGAGTAGCTCTGTCTTTGGACTCAGCACCAGGAGTAACCATGCTCGGCTT
CAGGAGGATACCTTCGAACATGACGTTATTCTGAGCGAGATAGAAGAAGACCTCAGACCA
GACCTTCTCTGCAACCTCATATGTCCTGTCAATGCAGTGTTCTCCGTCCAACATAATCTC
CGGCTCCACAATCGGTACCAGACCGCTGTCCTGAGAAATAGCGGCGTAGCGGGCAAGTCC
CCAGGCTGCTTCTTTAACAGCCAAAGCAGATGGTCCATTTGGAATGCTCACAACAGTACG
CCATTTGGCGAAACGAGCACCTTGTTGGTAGTAAGCAGCGGTACGAGAGGCTAAACCGTC
AAGTCCTTGGCACCATGACTCGTCGTTAGACCCAACAAGTGGCACCAAACCCTTGTCGAC
TTTGATGCCAGGGACGATGTTCTGCTGGACGAGAACGTCGACCATTTTCTTGCCGTCCAC
GGTTGATTGGTAGAGAGTTTCCTCGAACAGGATAGCTCCGGAGATGTACTGTCCCAGTCC
TGGAGCCGACACAAGCAGTGTCCTGTAAGCCTGACGGTTAGCCTCCGTATTCTCTAGCCC
AATCGACGCCAAACGCTTCCCGCAAGTCGCATTTGACTCATCCATCGCCAAGATTCCGCG
TCCCGGAGACGCGATTGTTTTAGCTGTTTTGACGAGCTCGTCGGCGTAGGCAGAGGCGGC
ATGGACGGTGAGAGCGGAAGGTGCCACGTGGCTCCGGAAAGGAGAGACGGAGGAAGGTTG
ACGGGGTAGGAGACTCTGTCCTTTGAGCCGGTCAGATTTAACCGGTGAGGCTTTGAGTAG
AGTCGCAGAGCTTGAGGCCATCGCTGCTTTATCTTCTTGTTAGACTACGCTTGAAACTCT
TATAACGTTCTTGACCACCACTACCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FV11JQ U 1
AF RR2GR65JQ U 5
AF RR2CM56JQ U 34
AF RR2FV11TF C 695
AF RR2GR65TF C 703
BS 1 592 RR2FV11JQ
BS 593 721 RR2CM56JQ
BS 722 722 RR2FV11TF
BS 723 799 RR2CM56JQ
BS 800 1406 RR2FV11TF

RD RR2FV11JQ 592 0 0
AGTTGGTGCAAAACGATCATATTAACGATAATGAAGAAACAAAAACTAGTCACACATAAG
AAGAGTATTATAATAACTCAAACACCAAAATCAAGCTCAAGTTTTGAGTTCTGGTCAACG
GAACCATTCATACATATAAGCTTAATAGGTGTAGCCTTTTACAAACATACCCTCCTTGGC
ATCCTCGGACTCACCTTCTCCTGTGTATTTCCCTAGCTGAGCCAGCGAGTTGGCTTTGGC
TCGGGTCAAGAGAGTGTCCTGAGCCGCCTTCACGTTCTCTTCTCTGCCTCCCCATGTCTT
CAAGCAAGTGTTCTGCAAGGCACGTGCATAGGAGAAGGACACGTGCCACGGGTTCGGTCC
TTGGTTCATTGCGTTCAGGTTCAAGGTCGCCTCCAACTCGGACTGACCTCCAGACAGGAA
CATGATTCCGGGTACAGCGGGAGGAACTCTGTTGGAAAGAAGCTTGAGAGTGTAGGAAGC
AACTTGCTCGGGAGTAGCTCTGTCTTTGGACTCAGCACCAGGAGTAACCATGCTCGGCTT
CAGGAGGATACCTTCGAACATGACGTTATTCTGAGCGAGATAGAAGAAGACC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2GR65JQ 589 0 0
GGTGCAAAACGATCATATTAACGATAATGAAGAAACAAAAACTAGTCACACATAAGAAGA
GTATTATAATAACTCAAACACCAAAATCAAGCTCAAGTTTTGAGTTCTGGTCAACGGAAC
CATTCATACATATAAGCTTAATAGGTGTAGCCTTTTACAAACATACCCTCCTTGGCATCC
TCGGACTCACCTTCTCCTGTGTATTTCCCTAGCTGAGCCAGCGAGTTGGCTTTGGCTCGG
GTCAAGAGAGTGTCCTGAGCCGCCTTCACGTTCTCTTCTCTGCCTCCCCATGTCTTCAAG
CAAGTGTTCTGCAAGGCACGTGCATAGGAGAAGGACACGTGCCACGGGTTCGGTCCTTGG
TTCATTGCGTTCAGGTTCAAGGTCGCCTCCAACTCGGACTGACCTCCAGACAGGAACATG
ATTCCGGGTACAGCGGGAGGAACTCTGTTGGAAAGAAGCTTGAGAGTGTAGGAAGCAACT
TGCTCGGGAGTAGCTCTGTCTTTGGACTCAGCACCAGGAGTAACCATGCTCGGCTTCAGG
AGGATACCTTCGAACATGACGTTATTCTGAGCGAGATAGAAGAAGACC
T

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2CM56JQ 766 0 0
AAGAAACAAAAACTAGTCACACATAAGAAGAGTATTATAATAACTCAAACACCAAAATCA
AGCTCAAGTTTTGAGTTCTGGTCAACGGAACCATTCATACATATAAGCTTAATAGGTGTA
GCCTTTTACAAACATACCCTCCTTGGCATCCTCGGACTCACCTTCTCCTGTGTATTTCCC
TAGCTGAGCCAGCGAGTTGGCTTTGGCTCGGGTCAAGAGAGTGTCCTGAGCCGCCTTCAC
GTTCTCTTCTCTGCCTCCCCATGTCTTCAAGCAAGTGTTCTGCAAGGCACGTGCATAGGA
GAAGGACACGTGCCACGGGTTCGGTCCTTGGTTCATTGCGTTCAGGTTCAAGGTCGCCTC
CAACTCGGACTGACCTCCAGACAGGAACATGATTCCGGGTACAGCGGGAGGAACTCTGTT
GGAAAGAAGCTTGAGAGTGTAGGAAGCAACTTGCTCGGGAGTAGCTCTGTCTTTGGACTC
AGCACCAGGAGTAACCATGCTCGGCTTCAGGAGGATACCTTCGAACATGACGTTATTCTG
AGCGAGATAGAAGAAGACCTCAGACCAGACCTTCTCTGCAACCTCATATGTCCTGTCAAT
GCAGTGTTCTCCGTCCAACATAATCTCCGGCTCCACAATCGGTACCAGACCGCTGTCCTG
AGAAATAGCGGCGTAGCGGGCAAGTCCC*AGGCTGCTTCTTTAACAGCCAAAGCAGATGG
TCCATTTGGAATGCTCACAACAGTACGCCATTTGGCGAAACGAGCA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2FV11TF 712 0 0
GAAATAGCGGCGTAGCGGGCAAGTCCCCAGGCTGCTTCTTTAACAGCCAAAGCAGATGGG
CCATTTGGAATGCTCACAACAGTACGCCATTTGGCGAAACGAGCACCTTGTTGGTAGTAA
GCAGCGGTACGAGAGGCTAAACCGTCAAGTCCTTGGCACCATGACTCGTCGTTAGACCCA
ACAAGTGGCACCAAACCCTTGTCGACTTTGATGCCAGGGACGATGTTCTGCTGGACGAGA
ACGTCGACCATTTTCTTGCCGTCCACGGTTGATTGGTAGAGAGTTTCCTCGAACAGGATA
GCTCCGGAGATGTACTGTCCCAGTCCTGGAGCCGACACAAGCAGTGTCCTGTAAGCCTGA
CGGTTAGCCTCCGTATTCTCTAGCCCAATCGACGCCAAACGCTTCCCGCAAGTCGCATTT
GACTCATCCATCGCCAAGATTCCGCGTCCCGGAGACGCGATTGTTTTAGCTGTTTTGACG
AGCTCGTCGGCGTAGGCAGAGGCGGCATGGACGGTGAGAGCGGAAGGTGCCACGTGGCTC
CGGAAAGGAGAGACGGAGGAAGGTTGACGGGGTAGGAGACTCTGTCCTTTGAGCCGGTCA
GATTTAACCGGTGAGGCTTTGAGTAGAGTCGCAGAGCTTGAGGCCATCGCTGCTTTATCT
TCTTGTTAGACTACGCTTGAAACTCTTATAACGTTCTTGACCACCACTACCC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2GR65TF 704 0 0
C
GCGTAGCGGGCAAGTCCCCAGGCTGCTTCTTTAACAGCCAAAGCAGATGGTCCATTTGGA
ATGCTCACAACAGTACGCCATT*GGCGAAACGAGCACCT*GTTGGTAGTAAGCAGCGGTA
CGAGAGGCTAAACCGTCAAGTCCTTGGCACCATGACTCGTCGTTAGACCCAACAAGTGGC
ACCAAACCCTTGTCGACTTTGATGCCAGGGACGATGTTCTGCTGGACGAGAACGTCGACC
ATTTTCTTGCCGTCCACGGTTGATTGGTAGAGAGTTTCCTCGAACAGGATAGCTCCGGAG
ATGTACTGTCCCAGTCCTGGAGCCGACACAAGCAGTGTCCTGTAAGCCTGACGGTTAGCC
TCCGTATTCTCTAGCCCAATCGACGCCAAACGCTTCCCGCAAGTCGCATTTGACTCATCC
ATCGCCAAGATTCCGCGTCCCGGAGACGCGATTGTTTTAGCTGTTTTGACGAGCTCGTCG
GCGTAGGCAGAGGCGGCATGGACGGTGAGAGCGGAAGGTGCCACGTGGCTCCGGAAAGGA
GAGACGGAGGAAGGTTGACGGGGTAGGAGACTCTGTCCTTTGAGCCGGTCAGATTTAACC
GGTGAGGCTTTGAGTAGAGTCGCAGAGCTTGAGGCCATCGCTGCTTTATCTTCTTGTTAG
ACTACGCTTGAAACTCTTATAACGTTCTTGACCACCACTACCC

QA 2 704 2 704
DS 



AS 1 6

CO CL1370Contig1 720 6 4 U
GAGCAAAAACTTGGTGGACGGAAAGGTCAGGTTTGGACTCAACGGTGTATCACACATTGA
TACCGAGACTCCCTTGAAGCTTGCTGAGTACTTCGAGATGTCCGAGAAGGTCTTCAAATA
CAACGTCATCAAGGACGAGCCAGCAGCCAAGATCACAACACTAACCGTCGAGCCCAATGT
TTTGAACATCACTTTCCGTACCTTTGTGGAAATCGTCTTCGAGAACCATGAGAAGAGCAT
GCAATCCTTCAATTTGGATGGTTACTCATTCTTCTCAGTCGCCTCTGAGCCCGGAAGATG
GACCCCAGAGAAGAGAAACAACTACAACTTGCTCGATGCCGTCAGCAGACACACCGTGCA
AGTGTTCCCCAAGTCCTGGTCCGCCATCCTCTTGACATTCGACAATGCTGGTATGTGGAA
CATCAGATCAGAGAACTGGGAGAGAAGATACTTGGGACAGCAAATGTACGTCAGTGTCCT
CTCGCCTGAGAAATCTCTAAGAGACGAGTACAACATCCCACTCAACACCATCCTCTGCGG
TATCGTCAAGGGCTTGCCATTACCTACACCCTACACTATTTAAACTCATCACTTCCTCAA
AGTTTCTTTTTGTATTTCTAATTGATATGTAAAATTGTACTTTCCACAAGTGAGTGTATT
ACGCGACTAAAATAACCCTTTCCTAATTCCATTAAACATTACTACTATATTTACAGATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 0 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU30JQ C 1
AF RR2CU30TF U 1
AF RR2AI91JQ C 156
AF RR2AI91TF U 156
AF RR2A446JQ C 302
AF RR2A446TF U 302
BS 1 204 RR2CU30TF
BS 205 205 RR2AI91TF
BS 206 708 RR2CU30TF
BS 709 720 RR2A446JQ

RD RR2CU30JQ 714 0 0
GAGCAAAAACTTGGTGGACGGAAAGGTCAGGTTTGGACTCAACGGTGTATCACACATTGA
TACCGAGACTCCCTTGAAGCTTGCTGAGTACTTCGAGATGTCCGAGAAGGTCTTCAAATA
CAACGTCATCAAGGACGAGCCAGCAGCCAAGATCACAACACTAACCGTCGAGCCCAATGT
TTTGAACATCACTTTCCGTACCTT*GTGGAAATCGTCTTCGAGAACCATGAGAAGAGCAT
GCAATCCTTCAATTTGGATGGTTACTCATTCTTTTCAGTCGCCTCTGAGCCCGGAAGATG
GACCCCAGAGAAGAGAAACAACTACAACTTGCTCGATGCCGTCAGCAGACACACCGTGCA
AGTGTTCCCCAAGTCCTGGTCCGCCATCCTCTTGACATTCGACAATGCTGGTATGTGGAA
CATCAGATCAGAGAACTGGGAGAGAAGATACTTGGGACAGCAAATGTACGTCAGTGTCCT
CTCGCCTGAGAAATCTCTAAGAGACGAGTACAACATCCCACTCAACACCATCCTCTGCGG
TATCGTCAAGGGCTTGCCATTACCTACACCCTACACTATTTAAACTCATCACTTCCTCAA
AGTTTCTTTTTGTATTTCTAATTGATATGTAAAATTGTACTTTCCACAAGTGAGTGTATT
ACGCGACTAAAATAACCCTTTCCTAATTCCATTAAACATTACTACTAT
TTACAG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2CU30TF 717 0 0
GAGCAAAAACTTGGTGGACGGAAAGGTCAGGTTTGGACTCAACGGTGTATCACACATTGA
TACCGAGACTCCCTTGAAGCTTGCTGAGTACTTCGAGATGTCCGAGAAGGTCTTCAAATA
CAACGTCATCAAGGACGAGCCAGCAGCCAAGATCACAACACTAACCGTCGAGCCCAATGT
TTTGAACATCACTTTCCGTACCTT*GTGGAAATCGTCTTCGAGAACCATGAGAAGAGCAT
GCAATCCTTCAATTTGGATGGTTACTCATTCTTCTCAGTCGCCTCTGAGCCCGGAAGATG
GACCCCAGAGAAGAGAAACAACTACAACTTGCTCGATGCCGTCAGCAGACACACCGTGCA
AGTGTTCCCCAAGTCCTGGTCCGCCATCCTCTTGACATTCGACAATGCTGGTATGTGGAA
CATCAGATCAGAGAACTGGGAGAGAAGATACTTGGGACAGCAAATGTACGTCAGTGTCCT
CTCGCCTGAGAAATCTCTAAGAGACGAGTACAACATCCCACTCAACACCATCCTCTGCGG
TATCGTCAAGGGCTTGCCATTACCTACACCCTACACTATTTAAACTCATCACTTCCTCAA
AGTTTCTTTTTGTATTTCTAATTGATATGTAAAATTGTACTTTCCACAAGTGAGTGTATT
ACGCGACTAAAATAACCCTTTCCTAATTCCATTAAACATTACTACTAT
TTACAGAAA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2AI91JQ 538 0 0
G
AACACTAACCGTCGAGCCCAATGTTTTGAACATCACTTTCCGTACCTTTGTGGAAATCGT
CTTCGAGAACCATGAGAAGAGCATGCAATCCTTCAATTTGGATGGTTACTCATTCTTTTC
AGTCGCCTTTGAGCCCGGAAGATGGACCCCAGAGAAGAGAAACAACTACAACTTGCTCGA
TGCCGTCAGCAGACACACCGTGCAAGTGTTCCCCAAGTCCTGGTCCGCCATCCTCTTGAC
ATTCGACAATGCTGGTATGTGGAACATCAGATCAGAGAACTGGGAGAGAAGATACTTGGG
ACAGCAAATGTACGTCAGTGTCCTCTCGCCTGAGAAATCTTTAAGAGACGAGTACAACAT
CCCACTCAACACCATCCTTTGCGGTATCGTCAAGGGCTTGCCATTACCTACACCCTACAC
TATTTAAACTCATCACTTCCTCAAAGTTTCTTTTTGTATTTTTAATTGATATGTAAAATT
GTACTTTCCACAAGTGAGTGTATTACGCGACTAAAATAACCCTTTCCTAATTCCATT

QA 2 538 2 538
DS 

RD RR2AI91TF 538 0 0
G
AACACTAACCGTCGAGCCCAATGTTTTGAACATCACTTTCCGTACCTTTGTGGAAATCGT
CTTCGAGAACCATGAGAAGAGCATGCAATCCTTCAATTTGGATGGTTACTCATTCTTCTC
AGTCGCCTCTGAGCCCGGAAGATGGACCCCAGAGAAGAGAAACAACTACAACTTGCTCGA
TGCCGTCAGCAGACACACCGTGCAAGTGTTCCCCAAGTCCTGGTCCGCCATCCTCTTGAC
ATTCGACAATGCTGGTATGTGGAACATCAGATCAGAGAACTGGGAGAGAAGATACTTGGG
ACAGCAAATGTACGTCAGTGTCCTCTCGCCTGAGAAATCTCTAAGAGACGAGTACAACAT
CCCACTCAACACCATCCTCTGCGGTATCGTCAAGGGCTTGCCATTACCTACACCCTACAC
TATTTAAACTCATCACTTCCTCAAAGTTTCTTTTTGTATTTCTAATTGATATGTAAAATT
GTACTTTCCACAAGTGAGTGTATTACGCGACTAAAATAACCCTTTCCTAATTCCATT

QA 2 538 2 538
DS 

RD RR2A446JQ 419 0 0
GCA
CCAGAGAAGAGAAACAACTACAACTTGCTCGATGCCGTCAGCAGACACACCGTGCAAGTG
TTCCCCAAGTCCTGGTCCGCCATCCTCTTGACATTCGACAATGCTGGTATGTGGAACATC
AGATCAGAGAACTGGGAGAGAAGATACTTGGGACAGCAAATGTACGTCAGTGTCCTCTCA
CCTGAGAAATCTCTAAGAGACGAATACAACATCCCACTCAACACCAACCTTTGCGGTATC
GTCAAGGGCTTGCCATTACCTACACCCTACACTATTTAAACTCATCACTTCCT*AAAGTT
TCTTTTTGTATTTCTAATTGATATGTAAAATTGTACTTTCCATAAGTGAGTGTATTACGC
GACTAAAATAACCCTTTCCTAATTCCATTAAACATTACTACTATATTTACAGATCC

QA 4 419 4 419
DS 

RD RR2A446TF 419 0 0
GCA
CCAGAGAAGAGAAACAACTACAACTTGCTCGATGCCGTCAGCAGACACACCGTGCAAGTG
TTCCCCAAGTCCTGGTCCGCCATCCTCTTGACATTCGACAATGCTGGTATGTGGAACATC
AGATCAGAGAACTGGGAGAGAAGATACTTGGGACAGCAAATGTACGTCAGTGTCCTCTCA
CCTGAGAAATCTCTAAGAGACGAATACAACATCCCACTCAACACCAACCTTTGCGGTATC
GTCAAGGGCTTGCCATTACCTACACCCTACACTATTTAAACTCATCACTTCCT*AAAGTT
TCTTTTTGTATTTCTAATTGATATGTAAAATTGTACTTTCCATAAGTGAGTGTATTACGC
GACTAAAATAACCCTTTCCTAATTCCATTAAACATTACTACTAT
ATTTACAGATCC

QA 4 407 4 407
DS 



AS 1 5

CO CL1371Contig1 1069 5 24 U
GGAGACTAAGACAAAAAA*GAGTGGAGGAAAAGATAAGACATGGATACACAAAGGTTACC
AAAGAGAGAAGAGCAAGAAGAAGAAGTGGCTGATCATCAACGTTTTTCAATCTTCGAGTC
CATTAATGCTTTCTCTAAAGAGCAACACAACCATTCTATGGATGATTTCGACCGCATTTT
CGACATCAGCATTGACAGTTTGGGCTGCTCTCACGAGCTCAACTGGGATTTCTGGAAAGA
AGAAGATGACGAAGAAGATGTGAAGGAAGAAGAGAAGAGTTTGAGTACTGATCAAGAAGG
CTCAAGTTCTGGTTTTTGGGATAATATGTCGACTGATTATGAAGACAGAGAGTTGGCTCT
GAAGCTGAATCTGAACCATCAAGAAGTTATTGATGCTTGGTCTGATCGCCGACAGCAACC
TCTGTGGACAGATACCTCAATGCTAATGGCTCCGCCCAGTGCCCTTTATAGTGGAGAAGT
GCCGGTGATGGATGAAGAGAGAAACACGAGAAGAGTAGCAAGTGTGTTAAGGTACAAAGA
GAAGAGACAGAGTAGGCTCTTCTCTAAGAAGATAAGGTATCAGGTCCGAAAACTCAACGC
TGATAAACGACCTCGTTTCAAGGGTCGGTTCGTTAAAAGGGACACTTAAAAGGGGAAATA
AATATCAGGAAGAAAAATATCTTCAATCTTCGATGTGTCTTTTTATTAGTATTATTATTA
ATATTTCACGTTTTATTTGTATTTTTATGAGATATCATTATCGACTTGTACAACTTTGTC
AAATTTGAAACGAAAATATCTCCTTCACGAAACAAAGAGATGCATAAATATTTTTTAAGT
AAAGGAGTCGAATATTACATGAAGAGGACGTTTATGGCAAGTCTTTATCGAGCTTGGTGG
GGATAAGTTTAAAAATGGGTTCACCACATGTTTGAATCGAAAACTAACCAATCCTTTGTA
GGGGCCAAGTACCAACTATGTTTCAACTTATGTAATTTCATATTACGGTCAGTGAACGGC
ATTTGAAATGTCAGATAAAAATGTTATAACAATGCTTTTAGTTACCTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF78TF U 1
AF RR2G195TF U 1
AF RR2H920TF U 1
AF RR2G195JQ C 25
AF RR2H920JQ C 320
BS 1 101 RR2FF78TF
BS 102 102 RR2G195TF
BS 103 106 RR2FF78TF
BS 107 108 RR2G195TF
BS 109 260 RR2FF78TF
BS 261 261 RR2G195TF
BS 262 267 RR2FF78TF
BS 268 268 RR2G195TF
BS 269 322 RR2FF78TF
BS 323 323 RR2G195TF
BS 324 427 RR2FF78TF
BS 428 428 RR2G195TF
BS 429 526 RR2FF78TF
BS 527 527 RR2G195TF
BS 528 581 RR2FF78TF
BS 582 582 RR2G195TF
BS 583 654 RR2FF78TF
BS 655 655 RR2G195TF
BS 656 664 RR2FF78TF
BS 665 665 RR2G195TF
BS 666 719 RR2G195JQ
BS 720 720 RR2H920JQ
BS 721 763 RR2G195JQ
BS 764 1069 RR2H920JQ

RD RR2FF78TF 664 0 0
GGAGACTAAGACAAAAAA*GAGTGGAGGAAAAGATAAGACATGGATACACAAAGGTTACC
AAAGAGAGAAGAGCAAGAAGAAGAAGTGGCTGATCATCAACCTTTTCAAATCTTCGAGTC
CATTAATGCTTTCTCTAAAGAGCAACACAACCATTCTATGGATGATTTCGACCGCATTTT
CGACATCAGCATTGACAGTTTGGGCTGCTCTCACGAGCTCAACTGGGATTTCTGGAAAGA
AGAAGATGACGAAGAAGATGCGAAGGAGGAAGAGAAGAGTTTGAGTACTGATCAAGAAGG
CTCAAGTTCTGGTTTTTGGGATGATATGTCGACTGATTATGAAGACAGAGAGTTGGCTCT
GAAGCTGAATCTGAACCATCAAGAAGTTATTGATGCTTGGTCTGATCGCCGACAGCAACC
TCTGTGGGCAGATACCTCAATGCTAATGGCTCCGCCCAGTGCCCTTTATAGTGGAGAAGT
GCCGGTGATGGATGAAGAGAGAAACACGAGAAGAGTAGCAAGTGTGCTAAGGTACAAAGA
GAAGAGACAGAGTAGGCTCTTCTCTAAGAAGATAAGGTATCGGGTCCGAAAACTCAACGC
TGATAAACGACCTCGTTTCAAGGGTCGGTTCGTTAAAAGGGACACTTAAAAGGG*AAATA
AATA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2G195TF 665 0 0
GGAGACTAAGACAAAAAAAGAGTGGAGGAAAAGATAAGACATGGATACACAAAGGTTACC
AAAGAGAGAAGAGCAAGAAGAAGAAGTGGCTGATCATCAACGTTTTTCAATCTTCGAGTC
CATTAATGCTTTCTCTAAAGAGCAACACAACCATTCTATGGATGATTTCGACCGCATTTT
CGACATCAGCATTGACAGTTTGGGCTGCTCTCACGAGCTCAACTGGGATTTCTGGAAAGA
AGAAGATGACGAAGAAGATGTGAAGGAAGAAGAGAAGAGTTTGAGTACTGATCAAGAAGG
CTCAAGTTCTGGTTTTTGGGATAATATGTCGACTGATTATGAAGACAGAGAATTGGCTCT
GAAGCTGAATCTGAACCATCAAGAAGTTATTGATGCTTGGTCTGATCGCCGCCAGCAACC
TTTGTGGACAGATACCTCAATGCTAATGGCTCCGGCCAATGCCGTTTATAGTGGAGAAGT
GCCGGTGATGGATGAAGAGAGAAACACGAGAAGAGAAGCAAGTGTGTTAAGGTACAAAGA
GAAGAGACAGAGTAGGCTCTTCTCTAAGAAGATAAGGTATCAGGTCCGAAA*CTCAACGC
TGATAAACGACCTCGTTTCAAGGGCCGGTTCGTGAAAAGGGACACTTAAAAGGGGAAATA
AATAT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2H920TF 665 0 0
GGAGACTAAGACAAAAAA*GAGTGGAGGAAAAGATAAGACATGGATACACAAAGGTTACC
AAAGAGAGAAGAGCAAGAAGAAGAAGTGGCTGATCATCAACCTTTTCAAATCTTCGAGTC
CATTAATGCTTTCTCTAAAGAGCAACACAACCATTCTATGGATGATTTCGACCGCATTTT
CGACATCAGCATTGACAGTTTGGGCTGCTCTCACGAGCTCAACTGGGATTTCTGGAAAGA
AGAAGATGACGAAGAAGATGTGAAGGAAGAAGAGAAGAGTTTGAGTA*TGATCAAGAAGG
CTCAAGTTCTGGTTTTTGGGATAATATGTCGACTGATTATGAAGACAGAGAGTTGGCTCT
GAAGCTGAATCTGAACCATCAAGAAGTTATTGATGCTTGGTCTGATCGCCGACAGCAACC
TCTGTGGACAGATACCTCAATGCTAATGGCTCCGCCCAGTGCCCTTTATAGTGGAGAAGT
GCCGGTGATGGATGAAGAGAGAAACACGAGAAGAGTAGCAAGTGTGTTAAGGTACAAAGA
GAAGAGACAGAGTAGGCTCTTCTCTAAGGAGATAAGGTATCAGGTCCGAAAACTCAACGC
TGATAAACGACC*CTTTTCAAGGGTCGGTTCGTTAAAAGGGACACTTAAAAGGGGAAATA
AATAT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2G195JQ 739 0 0
GAGGAAAAGATAAGACATGGATACACAAAGGTTACCAAAGAGAGAAGAGCAAGAAGAAGA
AGTGGCTGATCATCAACGTTTTTCAATCTTCGAGTCCATTAATGCTTTCTCTAAAGAGCA
ACACAACCATTCTATGGATGATTTCGACCGCATTTTCGACATCAGCATTGACAGTTTGGG
CTGCTCTCACGAGCTCAACTGGGATTTCTGGAAAGAAGAAGATGACGAAGAAGATGTGAA
GGAAGAAGAGAAGAGTTTGAGTACTGATCAAGAAGGCTCAAGTTCTGGTTTTTGGGATAA
TATGTCGACTGATTATGAAGACAGAGAATTGGCTCTGAAGCTGAATCTGAACCATCAAGA
AGTTATTGATGCTTGGTCTGATCGCCGCCAGCAACCTTTGTGGACAGATACCTCAATGCT
AATGGCTCCGGCCAATGCCGTTTATAGTGGAGAAGTGCCGGTGATGGATGAAGAGAGAAA
CACGAGAAGAGAAGCAAGTGTGTTAAGGTACAAAGAGAAGAGACAGAGTAGGCTCTTCTC
TAAGAAGATAAGGTATCAGGTCCGAAAACTCAACGCTGATAAACGACCTCGTTTCAAGGG
CCGGTTCGTGAAAAGGGACACTTAAAAGGGGAAATAAATATCAGGAAGAAAAATATCTTC
AATCTTCGATGTGTCTTTTTATTAGTATTATTATTCATATTTCACGTTTTATTTGTATTT
TTATGAGATATCATTATCG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2H920JQ 750 0 0
GATAATATGTCGACTGATTATGAAGACAGAGAGTTGGCTCTGAAGCTGAATCTGAACCAT
CAAGAAGTTATTGATGCTTGGTCTGATCGCCGACAGCAACCTCTGTGGACAGATACCTCA
ATGCTAATGGCTCCGCCCAGTGCCCTTTATAGTGGAGAAGTGCCGGTGATGGATGAAGAG
AGAAACACGAGAAGAGTAGCAAGTGTGTTAAGGTACAAAGAGAAGAGACAGAGTAGGCTT
TTCTCTAAGGAGATAAGGTATCAGGTCCGAAAACTCAACGCTGATAAACGACC*CTTTTC
AAGGGTCGGTTCGTTAAAAGGGACACTTAAAAGGGGAAATAAATATCAGGAAGAAAAATA
TCTTCAATTTTCGATGTGTCTTTTTATTAGTATTATTATTAATATTTCACGTTTTATTTG
TATTTTTATGAGATATCATTATCGACTTGTACAACTTTGTCAAATTTGAAACGAAAATAT
CTCCTTCACGAAACAAAGAGATGCATAAATATTTTTTAAGTAAAGGAGTCGAATATTACA
TGAAGAGGACGTTTATGGCAAGTCTTTATCGAGCTTGGTGGGGATAAGTTTAAAAATGGG
TTCACCACATGTTTGAATCGAAAACTAACCAATCCTTTGTAGGGGCCAAGTACCAACTAT
GTTTCAACTTATGTAATTTCATATTACGGTCAGTGAACGGCATTTGAAATGTCAGATAAA
AATGTTATAACAATGCTTTTAGTTACCTTG

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 6

CO CL1372Contig1 1121 6 7 U
GGAAACGTAAACACACACATTCATGGAGGGAATCGATCATAGAATGGTGAGCGTCAATGG
CATCACAATGCACATTGCCGAGAAAGGTCCAAAAGAAGGAACCGTGGTGCTTCTCCTCCA
CGGATTCCCTGATCTCTGGTACACATGGCGTCACCAGATCACTGGGTTGTCATCTCTAGG
TTACCGAGCCGTAGCTCCTGACCTCCGAGGCTACGGAGACTCCGAGTCGCCAGTGTCTTT
CTCAGAGTACACGTGTCTTCACCTCGTTGGTGACCTCGTGGCTCTTCTTGACAGTGTTGC
TGGAGATCAAGAGAAGGTGTTTCTAGTGGGTCATGACTGGGGAGCTATTGTCGGATGGTA
TCTCTGTTTGTTCCGACCGGAGAAGATCAAGGGCTTTGTGTGTTTGAGTGTGCCGTATAA
GCCAAGAAACCCTAAGGTCAAGCCTGTTGAAGGTTTTAAGGCTGTGTTTGGAGATGATTA
CTACATTTGTAGATTTCAGGAACCTGGAAAGGCTGAAAGAGAGATTGCATGTGCGGATCC
AAGAAGAGTTCTGAGGAACATCTTCACAGGGAGGGAACTCGGCCCGCCGATTCTACCTAA
GGATAACCCCTTTGGAGAAAACCCTAACCCTAACTGCGAACAAGTTGAACTTCCTGACTG
GTTTTCGAAGGAGGATCTCGATTTCTATGTCTCCACATTCGAGAAGACAGGATTTACCGG
TGGACTGAACTACTACAGAGCCATGGATTTGACATGGGAACTCACTGCACCATGGACCGG
GGCAAAGATTCAAGTTCCGGTGAAGTTCATGACAGGTGACTTGGACATGGTCTACACCAC
GCCGGGGGTTAAAGAGTACATTCACGGTGGTGGGTTTGCTGCAGATGTTCCAAATCTTCT
AGAGGTCGTTGTGATTGAAGATGCTGGTCACTTTGTCAACCAAGAGAAACCTCAAGAGGT
CACTGCTCACATCAATGACTTCTTTACCAAGCTTCAGGACAAGTACAAAAGCTTTTAGGG
TTCTTGGTGAAGTCTGTATTTCATTGACTCTCAAATAACAATCTCGTTCTTGCAAGTGTT
TTGTACTTCGAACAGATTATGAATAAGACTTTCATATTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2DS12TF U 1
AF RR2AC91TF U 13
AF RR2AI16TF U 19
AF RR2AC91JQ C 267
AF RR2DS12JQ C 693
AF RR2AI16JQ C 272
BS 1 645 RR2DS12TF
BS 646 646 RR2AC91TF
BS 647 664 RR2DS12TF
BS 665 667 RR2AC91TF
BS 668 874 RR2AC91JQ
BS 875 875 RR2DS12JQ
BS 876 1121 RR2AC91JQ

RD RR2DS12TF 664 0 0
GGAAACGTAAACACACACATTCATGGAGGGAATCGATCATAGAATGGTGAGCGTCAATGG
CATCACAATGCACATTGCCGAGAAAGGTCCAAAAGAAGGAACCGTGGTGCTTCTCCTCCA
CGGATTCCCTGATCTCTGGTACACATGGCGTCACCAGATCACTGGGTTGTCATCTCTAGG
TTACCGAGCCGTAGCTCCTGACCTCCGAGGCTACGGAGACTCCGAGTCGCCAGTGTCTTT
CTCAGAGTACACGTGTCTTCACCTCGTTGGTGACCTCGTGGCTCTTCTTGACAGTGTTGC
TGGAGATCAAGAGAAGGTGTTTCTAGTGGGTCATGACTGGGGAGCTATTGTCGGATGGTA
TCTCTGTTTGTTCCGACCGGAGAAGATCAAGGGCTTTGTGTGTTTGAGTGTGCCGTATAA
GCCAAGAAACCCTAAGGTCAAGCCTGTTGAAGGTTTTAAGGCTGTGTTTGGAGATGATTA
CTACATTTGTAGATTTCAGGAACCTGGAAAGGCTGAAAGAGAGATTGCATGTGCGGATCC
AAGAAGAGTTCTGAGGAACATCTTCACAGGGAGGGAACTCGGCCCGCCGATTCTACCTAA
GGATAACCCCTTTGGAGAAAACCCTAACCCTAACTGCGAACAAGTCGAACTTCCTGACTG
GTTT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2AC91TF 655 0 0
GGACAC
ATTCATGGAGGGAATCGATCATAGAATGGTGAGCGTCAATGGCATCACAATGCACATTGC
CGAGAAAGGTCCAAAAGAAGGAACCGTGGTGCTTCTCCTCCACGGATTCCCTGATCTCTG
GTACACATGGCGTCACCAGATCACTGGGTTGTCATCTCTAGGTTACCGAGCCGTAGCTCC
TGACCTCCGAGGCTACGGAGACTCCGAGTCGCCAGTGTCTTTCTCAGAGTACACGTGTCT
TCACCTCGTTGGTGACCTCGTGGCTCTTCTTGACAGTGTTGCTGGAGATCAAGAGAAGGT
GTTTCTAGTGGGTCATGACTGGGGAGCTATTGTCGGATGGTATCTCTGTTTGTTCCGACC
GGAGAAGATCAAGGGCTTTGTGTGTTTGAGTGTGCCGTATAAGCCAAGAAACCCTAAGGT
CAAGCCTGTTGAAGGTTTTAAGGCTGTGTTTGGAGATGATTACTACATTTGTAGATTTCA
GGAACCTGGAAAGGCTGAAAGAGAGATTGCATGTGCGGATCCAAGAAGAGTTCTGAGGAA
CATCTTCACAGGGAGGGAACTCGGCCCGCCGATTCTACCTAAGGATAACCCCTTTGGAGA
AAACCCTAACCCTAACTGCGAACAAGTTGAACTTCCTGACTGGTTTTCG

QA 7 655 7 655
DS 

RD RR2AI16TF 649 0 0
ATTCATGGAGGGAATCGATCATAGAATGGTGAGCGTCAATGGCATCACAATGCACATTGC
CGAGAAAGGTCCAAAAGAAGGAACCGTGGTGCTTCTCCTCCACGGATTCCCTGATCTCTG
GTACACATGGCGTCACCAGATCACTGGGTTGTCATCTCTAGGTTACCGAGCCGTAGCTCC
TGACCTCCGAGGCTACGGAGACTCCGAGTCGCCAGTGTCTTTCTCAGAGTACACGTGTCT
TCACCTCGTTGGTGACCTCGTGGCTCTTCTTGACAGTGTTGCTGGAGATCAAGAGAAGGT
GTTTCTAGTGGGTCATGACTGGGGAGCTATTGTCGGATGGTATCTCTGTTTGTTCCGACC
GGAGAAGATCAAGGGCTTTGTGTGTTTGAGTGTGCCGTATAAGCCAAGAAACCCTAAGGT
CAAGCCTGTTGAAGGTTTTAAGGCTGTGTTTGGAGATGATTACTACATTTGTAGATTTCA
GGAACCTGGAAAGGCTGAAAGAGAGATTGCATGTGCGGATCCAAGAAGAGTTCTGAGGAA
CATCTTCACAGGGAGGGAACTCGGCCCGCCGATTCTACCTAAGGATAACCCCTTTGGAGA
AAACCCTAACCCTAACTGCGAACAAGTTGAACTTCCTGACTGGTTTTCG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2AC91JQ 855 0 0
TTGGTGACCTCGTGGCTCTTCTTGACAGTGTTGCTGGAGATCAAGAGAAGGTGTTTCTAG
TGGGTCATGACTGGGGAGCTATTGTCGGATGGTATCTCTGTTTGTTCCGACCGGAGAAGA
TCAAGGGCTTTGTGTGTTTGAGTGTGCCGTATAAGCCAAGAAACCCTAAGGTCAAGCCTG
TTGAAGGTTTTAAGGCTGTGTTTGGAGATGATTACTACATTTGTAGATTTCAGGAACCTG
GAAAGGCTGAAAGAGAGATTGCATGTGCGGATCCAAGAAGAGTTCTGAGGAACATCTTCA
CAGGGAGGGAACTCGGCCCGCCGATTCTACCTAAGGATAACCCCTTTGGAGAAAACCCTA
ACCCTAACTGCGAACAAGTTGAACTTCCTGACTGGTTTTCGAAGGAGGATCTCGATTTCT
ATGTCTCCACATTCGAGAAGACAGGATTTACCGGTGGACTGAACTACTACAGAGCCATGG
ATTTGACATGGGAACTCACTGCACCATGGACCGGGGCAAAGATTCAAGTTCCGGTGAAGT
TCATGACAGGTGACTTGGACATGGTCTACACCACGCCGGGGGTTAAAGAGTACATTCACG
GTGGTGGGCTTGCTGCAGATGTTCCAAATCTTCTAGAGGTCGTTGTGATTGAAGATGCTG
GTCACTTTGTCAACCAAGAGAAACCTCAAGAGGTCACTGCTCACATCAATGACTTCTTTA
CCAAGCTTCAGGACAAGTACAAAAGCTTTTAGGGTTCTTGGTGAAGTCTGTATTTCATTG
ACTCTCAAATAACAATCTCGTTCTTGCAAGTGTTTTGTACTTCGAACAGATTATGAATAA
GACTTTCATATTATG

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR2DS12JQ 428 0 0
CCACATTCGAGAAGACAGGATTTACCGGTGGACTGAACTACTACAGAGCCATGGATTTGA
CATGGGAACTCACTGCACCATGGACCGGGGCAAAGATTCAAGTTCCGGTGAAGTTCATGA
CAGGTGACTTGGACATGGTTTACACCACGCCGGGGGTTAAAGAGTACATTCACGGTGGTG
GGTTTGCTGCAGATGTTCCAAATTTTTTAGAGGTCGTTGTGATTGAAGATGCTGGTCACT
TTGCCAACCAAGAGAAACCTCAAGAGGTCACTGCTCACATCAATGACTTTTTTACCAAGC
TTCAGGACAAGTACAAAAGCTTTTAGGGTTTTTGGTGAAGTCTGTATTTCATTGACTCTC
AAATAACAATTTCGTTCTTGCAAGTGTTTTGTACTTCGAACAGATTATGAATAAGACTTT
CATATTAT

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR2AI16JQ 849 0 0
GACCTCGTGGCTCTTCTTGACAGTGTTGCTGGAGATCAAGAGAAGGTGTTTCTAGTGGGT
CATGACTGGGGAGCTATTGTCGGATGGTATCTCTGTTTGTTCCGACCGGAGAAGATCAAG
GGCTTTGTGTGTTTGAGTGTGCCGTATAAGCCAAGAAACCCTAAGGTCAAGCCTGTTGAA
GGTTTTAAGGCTGTGTTTGGAGATGATTACTACATTTGTAGATTTCAGGAACCTGGAAAG
GCTGAAAGAGAGATTGCATGTGCGGATCCAAGAAGAGTTCTGAGGAACATCTTCACAGGG
AGGGAACTCGGCCCGCCGATTCTACCTAAGGATAACCCCTTTGGAGAAAACCCTAACCCT
AACTGCGAACAAGTTGAACTTCCTGACTGGTTTTCGAAGGAGGATCTCGATTTCTATGTC
TCCACATTCGAGAAGACAGGATTTACCGGTGGACTGAACTACTACAGAGCCATGGATCTG
ACATGGGAACTCACTGCACCATGGACCGGGGCAAAGATTCAAGTTCCGGTGAAGTTCATG
ACAGGTGACTTGGACATGGTCTACACCACGCCGGGGGTTAAAGAGTACATTCACGGTGGT
GGGTTTGCTGCAGATGTTCCAAATCTTCTAGAGGTCGTTGTGATTGAAGATGCTGGTCAC
TTTGTCAACCAAGAGAAACCTCAAGAGGTCACTGCTCACATCAATGACTTCTTTACCAAG
CTTCAGGACAAGTACAAAAGCTTTTAGGGTTCTTGGTGAAGTCTGTATTTCATTGACTCT
CAAATAACAATCTCGTTCTTGCAAGTGTTTTGTACTTCGAACAGATTATGAATAAGACTT
TCATATTAT

QA 1 849 1 849
DS 



AS 2 6

CO CL1373Contig1 1156 4 6 U
AGAAACCAAATTATCATTAACCATTAAGGAGTTTAGAAACCAAAAACAACCTAACAATCT
TTGAAGAAGACATAGAGAGTTTTCATAAAGCAGAGAGAGATAGGATAACCAAAAACATAA
CAGCTCGATCAAAAACAACAATCACTGGTCTCCGGGAAGCGACTTGATGATGTCGGAATC
ACCTGGATCAACAATGCTGAGACAGGAAACACGGAA**ACTTCCCGCAAGCAGTTCCCAA
ATCGACATTGTTCCCGTTGTAGTGATGAACACCGACTTTAGCAAGCATAGCGTAATACTC
AATCTCTGATCTCCTCAACGGAGGGCAGTTGCTAGAGGTAAGAATCAACTTACCTTTGGA
ACTGCGAAGGGACTTGAGAACAGATTTGTAGCCGAGAGTGTACTTTCCACTCTTCATGAC
CAGAGCTAATCTGCTGTTGATTCCCTCATGGGACTTCTTCGTCTTCTTCGCTGCAACCAT
TTTCTCAAGAGTCGCTGAATCACCGAGTTAACAAGAAGAGAGGCCTTTCCGGGGGGGGTG
ACGCAGAAGCTGTTGGGCGGCGCAAAATGAGAAGTTAAATAGAGAGACACGAAGGAACCC
TAATTGTTTTGTCCTTCTCCTCAAGATAACAGGCTCACGGCTCCAAATAAAATTGACTAA
GGCCCAATGAAACAATAAGGCCCATGAATTCGGAATTCTGTTTGTGAGCATATAAAGGGG
AAGATCAGTCTTCAAAAATTGGACAGAAAGAACGTGGTACATGTAAATCCATCGTCGTAA
TGGACAAAACCCATAGTGCTGAGACCAAACATCATTTCTAGAGCCGAGACAAGGAACAAG
AGTTTTGTGAAACCGATATGGAGTGTTATGATCTTGAAGTAGCAGACAGCGAAGAAGAGC
AAATAGTCCTACGAACTACAACGTCAAGTAGTCTTAGTTTACCACGCAAGAACCATGTCA
TCAAAAGAGCTAACCAATTGAAGATTCTCGATCTAATCTACAATGGGTTCTCAGTTGAAG
CCTTGGAAACATTATACATGGCATGTTCATCATCAGGATCTCGAACTGGCACTGCTCAAA
GGGCAATCTGAAAGACGAGATTGTTCATTTTCATGTCAAAGAAAGAAGTGTTGTGGAGTA
AAATCATGTGGCAGAA


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB83JQ U 1
AF RR2AB83TF C 1
AF RR2FX09TF C 94
AF RR2AA37TF U 400
BS 1 498 RR2AB83JQ
BS 499 499 RR2AA37TF
BS 500 501 RR2AB83JQ
BS 502 502 RR2AA37TF
BS 503 528 RR2AB83JQ
BS 529 1156 RR2AA37TF

RD RR2AB83JQ 543 0 0
AGAAACCAAATTATCATTAACCATTAAGGAGTTTAGAAACCAAAAACAACCTAACAATCT
TTGAAGAAGACATAGAGAGTTTTCATAAAGCAGAGAGAGATAGGATAACCAAAAACATAA
CAGCTCGATCAAAAACAACAATCACTGGTCTCCGGGAAGCGACTTGATGATGTCGGAATC
ACCTGGATCAACAATGCTGAGACAGGAAACACGGAA**ACTTCCCGCAAGCAGTTCCCAA
ATCGACATTGTTCCCGTTGTAGTGATGAACACCGACTTTAGCAAGCATAGCGTAATACTC
AATCTCTGATCTCCTCAACGGAGGGCAGTTGCTAGAGGTAAGAATCAACTTACCTTTGGA
ACTGCGAAGGGACTTGAGAACAGATTTGTAGCCGAGAGTGTACTTTCCACTCTTCATGAC
CAGAGCTAATCTGCTGTTGATTCCCTCATGGGACTTCTTCGTCTTCTTCGCTGCAACCAT
TTTCTCAAGAGTCGCTGA*TCGCCGAGTTAACAAGAAGAGAGGCCTTT
TCGGAGGGGTGACCC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2AB83TF 543 0 0
AG
AAACCAAATTATCATTAACCATTAAGGAGTTTAGAAACCAAAAACAACCTAACAATCTTT
GAAGAAGACATAGAGAGTTTTCATAAAGCAGAGAGAGATAGGATAACCAAAAACATAACA
GCTCGATCAAAAACAACAATCACTGGTCTCCGGGAAGCGACTTGATGATGTCGGAATCAC
CTGGATCAACAATGCTGAGACAGGAAACACGGAA**ACTTCCCGCAAGCAGTTCCCAAAT
CGACATTGTTCCCGTTGTAGTGATGAACACCGACTTTAGCAAGCATAGCGTAATACTCAA
TCTCTGATCTCCTCAACGGAGGGCAGTTGCTAGAGGTAAGAATCAACTTACCTTTGGAAC
TGCGAAGGGACTTGAGAACAGATTTGTAGCCGAGAGTGTACTTTCCACTCTTCATGACCA
GAGCTAATCTGCTGTTGATTCCCTCATGGGACTTCTTCGTCTTCTTCGCTGCAACCATTT
TCTCAAGAGTCGCTGA*TCGCCGAGTTAACAAGAAGAGAGGCCTTT
TCGGAGGGGTGACCC

QA 3 528 3 528
DS 

RD RR2FX09TF 453 0 0
AGAGAGATAGGACAACAAAAAACATAACAGCTCGATCAAAATCAACAATCACTGGTCTCC
GGGAAGCGACTTGATGATGTCGGAATCACCTGGATCAACAATGCTGAGACAGGAAACACG
GAAGTACTTCCCGCAAGCAGTTCCCAAATCGACATTGTTGCCATTGTAATGATGAACACC
GACTTTAGCAAGCATAGCGTAGTATTCAATCTCTGATCTCCTCAACGGAGGGCAGTTGCT
AGAGATAAGAATCAACTTACCTTTGGAACTGCGAAGGGACTTGAGAACAGATTTGTAGCC
GAGAGTGTACTTTCCACTCTTCATGACCAGAGCTAATCTGCTGTTGATTCCCTCATGGGA
CTTCTTCGTCTTCTTCGCTGCAACCATTTTCTCAAGAGTCGCTGAATCACCGAGTTTACA
AGAAGAGAGGCCTTT
CCGGGGGGGGTGACGCCC

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR2AA37TF 757 0 0
GTACTTTCCACTCTTCATGACCAGAGCTAATCTGCTGTTGATTCCCTCATGGGACTTCTT
CGTCTTCTTCGCTGCAACCATTTTCTCAAGAGTCGCTGAATCACCGAGTTTACAAGAAGA
GAGGCCTTTCCGGGGGGGGTGACGCAGAAGCTGTTGGGCGGCGCAAAATGAGAAGTTAAA
TAGAGAGACACGAAGGAACCCTAATTGTTTTGTCCTTCTCCTCAAGATAACAGGCTCACG
GCTCCAAATAAAATTGACTAAGGCCCAATGAAACAATAAGGCCCATGAATTCGGAATTCT
GTTTGTGAGCATATAAAGGGGAAGATCAGTCTTCAAAAATTGGACAGAAAGAACGTGGTA
CATGTAAATCCATCGTCGTAATGGACAAAACCCATAGTGCTGAGACCAAACATCATTTCT
AGAGCCGAGACAAGGAACAAGAGTTTTGTGAAACCGATATGGAGTGTTATGATCTTGAAG
TAGCAGACAGCGAAGAAGAGCAAATAGTCCTACGAACTACAACGTCAAGTAGTCTTAGTT
TACCACGCAAGAACCATGTCATCAAAAGAGCTAACCAATTGAAGATTCTCGATCTAATCT
ACAATGGGTTCTCAGTTGAAGCCTTGGAAACATTATACATGGCATGTTCATCATCAGGAT
CTCGAACTGGCACTGCTCAAAGGGCAATCTGAAAGACGAGATTGTTCATTTTCATGTCAA
AGAAAGAAGTGTTGTGGAGTAAAATCATGTGGCAGAA

QA 1 757 1 757
DS 



CO CL1373Contig2 545 2 2 U
GAGTTTAGAAACCAAATTATCATTAACCATAAGGAGTTTAGAAACCAAAAACAACCTAAC
AATCTTTGAAGAAGACATAAGAGTTTTCATAAAGCAGAGAGAGATAGGATAACAAAAAAC
ATAACAGCTCGATCAAAAACAACAATCACTGGTCTCCGGGAAGCGACTTGATGATGTCGG
AATCACCTGGATCAACAATGCTGAGACAGGAAACACGGAAGTACTTCCCGCAAGCAGTTC
CCAAATCGACATTGTTCCCGTTGTAGTGATGAACACCGACTTTAGCAAGCATAGCGTAGT
ACTCAATCTCTGATCTCCTCAACGGAGGGCAGTTGCTAGAGATAAGAATCAACTTACCTT
TGGAGCTGCGAAGGGACTTGAGAACAGATTTGTAGCCGAGTGTGTACTTTCCACTCTTCA
TGACCAAAGCTAATCTGCTGTTGATTCCCTCATGGGACTTCTTCGTATTCTTCGCCGCAA
CCATTTTCTCAACGCCGGGAGGAGTCCGCTGATCGCCGAGTTAACAAGAAGAGAGGCCTT
TTCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2B206TF C 1
AF RR2B206JQ U 1
BS 1 8 RR2B206TF
BS 9 545 RR2B206JQ

RD RR2B206TF 545 0 0
GAGTTTAGAAACCAAATTATCATTAACCATAAGGAGTTTAGAAACCAAAAACAACCTAAC
AATCTTTGAAGAAGACATAAGAGTTTTCATAAAGCAGAGAGAGATAGGATAACAAAAAAC
ATAACAGCTCGATCAAAAACAACAATCACTGGTCTCCGGGAAGCGACTTGATGATGTCGG
AATCACCTGGATCAACAATGCTGAGACAGGAAACACGGAAGTACTTCCCGCAAGCAGTTC
CCAAATCGACATTGTTCCCGTTGTAGTGATGAACACCGACTTTAGCAAGCATAGCGTAGT
ACTCAATCTCTGATCTCCTCAACGGAGGGCAGTTGCTAGAGATAAGAATCAACTTACCTT
TGGAGCTGCGAAGGGACTTGAGAACAGATTTGTAGCCGAGTGTGTACTTTCCACTCTTCA
TGACCAAAGCTAATCTGCTGTTGATTCCCTCATGGGACTTCTTCGTATTCTTCGCCGCAA
CCATTTTCTCAACGCCGGGAGGAGTCCGCTGATCGCCGAGTTAACAAGAAGAGAGGCCTT
TTCGA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2B206JQ 545 0 0
GAGTTTAA
AAACCAAATTATCATTAACCATAAGGAGTTTAGAAACCAAAAACAACCTAACAATCTTTG
AAGAAGACATAAGAGTTTTCATAAAGCAGAGAGAGATAGGATAACAAAAAACATAACAGC
TCGATCAAAAACAACAATCACTGGTCTCCGGGAAGCGACTTGATGATGTCGGAATCACCT
GGATCAACAATGCTGAGACAGGAAACACGGAAGTACTTCCCGCAAGCAGTTCCCAAATCG
ACATTGTTCCCGTTGTAGTGATGAACACCGACTTTAGCAAGCATAGCGTAGTACTCAATC
TCTGATCTCCTCAACGGAGGGCAGTTGCTAGAGATAAGAATCAACTTACCTTTGGAGCTG
CGAAGGGACTTGAGAACAGATTTGTAGCCGAGTGTGTACTTTCCACTCTTCATGACCAAA
GCTAATCTGCTGTTGATTCCCTCATGGGACTTCTTCGTATTCTTCGCCGCAACCATTTTC
TCAACGCCGGGAGGAGTCCGCTGATCGCCGAGTTAACAAGAAGAGAGGCCTTTTCGA

QA 9 545 9 545
DS 



AS 1 6

CO CL1374Contig1 892 6 8 U
AAATACTGAAGGATATTAGAGAAAAGAAATGATACAAAAATAGATTAGCCTAATAGGAGA
TGGTTATCACTGTTTTGGTCTAAAAAACAATTTTCTCTTTTTCTTTTCTAATCAAACAAG
CAATAGAATAATGTAAAAACCCATTTATTAATACCCAATACTAATAATCGGATGCAGATT
ATTCTCTCAAGCATCAATCTTGAGACTAACATCCCTAGAGGAAGAGTTCCCATTGACGTT
CCTGTTCTCAGTTTCATCAAAATGGTCTTCACGCGCGTTATCAGCGAGCATCAGAGCGAC
CAACCAGAAAAGGCACGAGTCTAATGACACGAAGGCACCTCCACCAAGCAGACCGGTCTT
AGCCGTGGGGCAAGCGGTCTCTAAGTTGCGATGAACATTACGCGTCAAGTGAAGTTGCTC
TGTAATGGTTGGCCATAGCAACAGAGACAGTGCAAGTCCAGATGTGATCAAGGCAATGTT
GAAGAAGACGGAGAAGCTGGTGCTTTTGAACAAGACAGAGTTGGGAACAGACTTTCCCTT
GTAAGACATGAAGAGGGATTTGTATCCAGCTACGGTGGAGGCAAGGAGAAGGGCAGCAGA
AAGGTAACCCAGGGCAACAGTTGGATCAGATGGATATTTGCAGATAACCACTCCCTTTCC
GTTAATTGGAGTCCCAGACGCAGGCTTCTTGTTCTCAGCGATGACACCAAGAAGGAAGGA
CAATACGCCAAACAAAGAGACGATCAACGACATATGCTTCATAGTAACCGCCATCTTTTC
TCCTCCTCTTCTTCTCTGTAGATATACCTCAGGGCGACGATGAATCTGGAGATCGGAGGA
GGTTGTTAGGGGTTGGTTTGATTTGATGATAAGACTTTATCAAGTTGCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D282JQ U 18
AF RR2FV20JQ U 1
AF RR2CA73JQ U 130
AF RR2FV20TF C 99
AF RR2CA73TF C 131
AF RR2D282TF C 245
BS 1 483 RR2FV20JQ
BS 484 484 RR2D282JQ
BS 485 492 RR2FV20JQ
BS 493 493 RR2CA73JQ
BS 494 597 RR2FV20JQ
BS 598 808 RR2CA73JQ
BS 809 847 RR2FV20TF
BS 848 892 RR2CA73TF

RD RR2D282JQ 471 0 0
AGAGAAAGGAAATGATACAAAAATAGATTAGCCTAATAGGAGATGGTTATCACTGTTTTG
GTCTAAAAAACAATTTTCTCTTTTTCTTTTCTAATCAAACAAGCAATAGAATAATGTAAA
AACCCATTTATTAATACCCAATACTAATAATCGGATGCAGATTATTCTCTCAAGCATCAA
TCTTGAGACTAACATCCCTAGAGGAAGAGTTCCCATTGACGTTCCTGTTCTCAGTTTCAT
CAAAATGGTCTTCACGCGCGTTACCAGCGAGCATCAGAGCGACCAACCAGAAAAGGCACG
AGTCTAATGACACGAAGGCACCTCCACCAAGCAGACCGGTCTTAGCCGTGGGGCAAGCGG
TCTCTAAGTTGCGATGAACATTACGCGTCAAGTGAAGTTGCTCTGTAATGGTTGGCCATA
GCAACAGAGACAGTGCAAGTCCAGATGTGATCAAGGCAATGTTGAAGAAGA

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR2FV20JQ 597 0 0
AAATACTGAAGGATATTAGAGAAAAGAAATGATACAAAAATAGATTAGCCTAATAGGAGA
TGGTTATCACTGTTTTGGTCTAAAAAACAATTTTCTCTTTTTCTTTTCTAATCAAACAAG
CAATAGAATAATGTAAAAACCCATTTATTAATACCCAATACTAATAATCGGATGCAGATT
ATTCTCTCAAGCATCAATCTTGAGACTAACATCCCTAGAGGAAGAGTTCCCATTGACGTT
CCTGTTCTCAGTTTCATCAAAATGGTCTTCACGCGCGTTATCAGCGAGCATCAGAGCGAC
CAACCAGAAAAGGCACGAGTCTAATGACACGAAGGCACCTCCACCAAGCAGACCGGTCTT
AGCCGTGGGGCAAGCGGTCTCTAAGTTGCGATGAACATTACGCGTCAAGTGAAGTTGCTC
TGTAATGGTTGGCCATAGCAACAGAGACAGTGCAAGTCCAGATGTGATCAAGGCAATGTT
GAAAAAGACGGAAAAGCTGGTGCTTTTGAACAAGACAGAGTTGGGAACAGACTTTCCCTT
GTAAGACATGAAGAGGGATTTGTATCCAGCTACGGTGGAGGCAAGGAGAAGGGCAGC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2CA73JQ 679 0 0
AGTGTA
AAAACCCATTTATTAATACCCAATACTAATAATCGGATGCAGATTATTCTCTCAAGCATC
AATCTTGAGACTAACATCCCTAGAGGAAGAGTTCCCATTGACGTTCCTGTTCTCAGTTTC
ATCAAAATGGCCATCACGCGCGTTATCAGCGAGCATCAGAGCGACCAACCAGAAAAGGCA
CGAGTCTAATGACACGAAGGCACCTCCACCAAGCAGACCGGTCTTAGCCGTGGGGCAAGC
GGTCTCTAAGTTGCGATGAACATTACGCGTCAAGTGAAGTTGCTCTGTAATGGTTGGCCA
TAGCAACAGAGACAGTGCAAGTCCAGATGTGATCAAGGCAATGTTGAAGAAGACGGAGAA
GCTGGTGCTTTTGAACAAGACAGAGTTGGGAACAGACTTTCCCTTGTAAGACATGAAGAG
GGATTTGTATCCAGCTACGGTGGAGACAAGGAGAAGGGCAGCAGAAAGGTAACCCAGGGC
AACAGTTGGATCAGATGGATATTTGCAGATAACCACTCCCTTTCCGTTAATTGGAGTCCC
AGACGCAGGCTTCTTGTTCTCAGCGATGACACCAAGAAGGAAGGACAATACGCCAAACAA
AGAGACGATCAACGACATATGCTTCATAGTAACCGCCATCTTTTCTCCTCCTCTTCTTCT
CTGTAGATATACC

QA 7 679 7 679
DS 

RD RR2FV20TF 752 0 0
TTTTTTTTTCTAATCAAACAAGCAATAGAATAATGTAAAA*CCCATTTATTA*TACCCAA
TACTAATAATCGGATGCAGATTAT*CTCTCAAGCATCAATCTTGAGACTAACATCCCTAG
AGGAAGAGTTCCCATTGACGTTCCTGTTCTCAGTTTCATCAAAATGGTCTTCACGCGCGT
TATCAGCGAGCATCAGAGCGACCAACCAGAAAAGGCACGAGTCTAATGACACGAAGGCAC
CTCCACCAAGCAGACCGGTCTTAGCCGTGGGGCAAGCGGTCTCTAAGTTGCGATGAACAT
TACGCGTCAAGTGAAGTTGCTCTGTAATGGTTGGCCATAGCAACAGAGACAGTGCAAGTC
CAGATGTGATCAAGGCAATGTTGAAGAAGACGGAGAAGCTGGTGCTTTTGAACAAGACAG
AGTTGGGAACAGACTTTCCCTTGTAAGACATGAAGAGGGATTTGTATCCAGCTACGGTGG
AGGCAAGGAGAAGGGCAGCAGAAAGGTAACCCAAGGCAACAGTTGGATCAGATGGATATT
TGCAGATAACCACTCCCTTTCCGTTAATTGGAGTCCCAGACGCAGGCTTCTTGTTCTCAG
CGATGACACCAAGAAGGAAGGACAATACGCCAAACAAAGAGACGATCAGCGACATATGCT
TCATAGTAACCGCCATCTTTTCTCCTCCTCTTCTTCTCTGTAGATATACCTCAGGGCGAC
GATGAATCTGGAGATCGGAGGAGGTTGTT
CCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2CA73TF 762 0 0
AGTGT
AAAACCCATTTATTAATACCCAATACTAATAATCGGATGCAGATTAT*CTCTCAAGCATC
AATCTTGAGACTAACATCCCTAGAGGAAGAGTTCCCATTGACGTTCCTGTTCTCAGTTTC
ATCAAAATGGCCATCACGCGCGTTATCAGCGAGCATCAGAGCGACCAACCAGAAAAGGCA
CGAGTCTAATGACACGAAGGCACCTCCACCAAGCAGACCGGTCTTAGCCGTGGGGCAAGC
GGTCTCTAAGTTGCGATGAACATTACGCGTCAAGTGAAGTTGCTCTGTAATGGTTGGCCA
TAGCAACAGAGACAGTGCAAGTCCAGATGTGATCAAGGCAATGTTGAAGAAGACGGAGAA
GCTGGTGCTTTTGAACAAGACAGAGTTGGGAACAGACTTTCCCTTGTAAGACATGAAGAG
GGATTTGTATCCAGCTACGGTGGAGACAAGGAGAAGGGCAGCAGAAAGGTAACCCAGGGC
AACAGTTGGATCAGATGGATATTTGCAGATAACCACTCCCTTTCCGTTAATTGGAGTCCC
AGACGCAGGCTTCTTGTTCTCAGCGATGACACCAAGAAGGAAGGACAATACGCCAAACAA
AGAGACGATCAACGACATATGCTTCATAGTAACCGCCATCTTTTCTCCTCCTCTTCTTCT
CTGTAGATATACCTCAGGGCGACGATGAATCTGGAGATCGGAGGAGGTTGTTAGGGGTTG
GTTTGATTTGATGATAAGACTTTATCAAGTTGCACCC

QA 6 762 6 762
DS 

RD RR2D282TF 644 0 0
TTCTCAGTTTCATCAAAATGGTCTTCACGCGCGTTACCAGCGAGCATCAGAGCGACCAAC
CAGAAAAGGCACGAGTCTAATGACACGAAGGCACCTCCACCAAGCAGACCGGTCTTAGCC
GTGGGGCAAGCGGTCTCTAAGTTGCGATGAACATTACGCGTCAAGTGAAGTTGCTCTGTA
ATGGTTGGCCATAGCAACAGAGACAGTGCAAGTCCAGATGTGATCAAGGCAATGTTGAAG
AAGACGGAGAAGCTGGTGCTTTTGAACAAGACAGAGTTGGGAACAGACTTTCCCTTGTAA
GACATGAAGAGGGATTTGTATCCAGCTACGGTGGAGGCAAGGAGAAGGGCAGCAGAAAGG
TAACCCAAGGCAACAGTTGGATCAGATGGATATTTGCAGATAACCACTCCCTTTCCGTTA
ATTGGAGTCCCAGACGCAGGCTTCTTGTTCTCAGCGATGACACCAAGAAGGAAGGACAAT
ACGCCAAACAAAGAGACGATCAACGACATATGCTTCATAGTAACCGCCATCTTTTCTCCT
CCTCTTCTTCTCTGTAGATATACCTCAGGGCGACGATGAATCTGGAGATCGGAGGAGGTT
GTTAGGGGTTGGTTTGATTTGATGATAAGACTTTATCAAGTT
CC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 5

CO CL1375Contig1 1241 5 20 U
GGGAGAGTCACCAAACAAACTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCGTCTCCCTCGTGCGCC
AGACTGACAAAGACTTCAGAGAGACAGAAAGATAAAGAAAGATCAAGACCTTTCAATGGC
GGCAGGAGCAGGAGGAGGAACATCGTCTGCGGGACGGACTCCGACGTGGAAGGAAAGGGA
GAACAATAAGAAGAGGGAAAGGAGAAGAAGAGCCATCACGGCCAAGATTTACTCTGGCCT
CAGAGCTCAAGGTAACTACAAGCTCCCTAAGCACTGCGACAACAACGAAGTCCTTAAAGC
TCTCTGTCTCGAAGCTGGTTGGATCGTTGAAGACGACGGCACCACTTATCGCAAGGGTTA
TAAGCCACTAGCGTCGGAACTATCAGGAACTCCGACGAACTACAGCACGAACTCATCAAT
CCAACCAAGTCCACAATCCTCTGCTTTCCCAAGCCCTGCACCTTCTTACCACGGAAGTCC
TGTTTCATCTTCCTTCCCAAGCCCCACTCGTTACGACGCGAGTAACCCTTCCTCGTACCT
TCTCCTCCCTTTCCTCCACAACATCGCTTCTTCCATCCCATCAAACCTTCCTCCTCTCAG
AATCTCCAACAGCGCTCCCGTAACGCCTCCCTTATCCTCTCCCACCTCTCGCGGTTCGAA
GCGGAGACTCATCACTGAACAGTTACCAAACGGCGGGTCTTTGCTAAGACATCCGCTTTT
CGCTATCTCTGCTCCGTCTAGTCCTACACGGCGCGGCGGTCATCAAACACCGCCTACGAT
ACCTGAATGCGACGAGTCAGAGGAGGATTCGTTAGAAGATTCAGGAAGGTGGATCAGTTT
TCAATCTACAGCTCCTCCTTCGCCGACCTTTAACCTTGTTCAGCAGACGTCTATGGACAT
TGACATGAAAAGACCAGAGTGGGGGATGTCTGGG*AGGGGTTCAGAGTTTGAGTTCGAGA
ACGGTACTGTTAAGCCATGGGAAGGCGAAATGATTCATGAAGTTGGCGTAGAAGATCTTG
AGCTCACTCTCGGTGGCGCTAAGACAAGATGCTAAAGAGCCTCGATCATAACAGAGCTAA
ATATTTTTAGGCATTGTACAGAAGCTCTCGTGTGGTCAAAGCCAAAAGGGTCGAACCTTT
TATATAACCGTTTATACTTCAATGTTTTCTTCTATGGTGATAATGTTATTTGGAGGTATA
ATGTGTGTTTAGTCACATGATTAAGAAAAGGTTTTTGGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E783TF U 1
AF RR2AO51TF U 5
AF RR2A946TF U 421
AF RR2AO51JQ C 480
AF RR2A946JQ C 728
BS 1 22 RR2E783TF
BS 23 23 RR2AO51TF
BS 24 139 RR2E783TF
BS 140 140 RR2AO51TF
BS 141 519 RR2E783TF
BS 520 520 RR2AO51TF
BS 521 594 RR2E783TF
BS 595 595 RR2AO51TF
BS 596 687 RR2E783TF
BS 688 786 RR2AO51TF
BS 787 787 RR2A946TF
BS 788 816 RR2AO51TF
BS 817 925 RR2A946TF
BS 926 926 RR2AO51JQ
BS 927 934 RR2A946TF
BS 935 935 RR2AO51JQ
BS 936 1167 RR2A946TF
BS 1168 1168 RR2AO51JQ
BS 1169 1177 RR2A946TF
BS 1178 1241 RR2AO51JQ

RD RR2E783TF 687 0 0
GGGAGAGTCACCAAACAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCGTCTCCCTCGTGCGCC
AGACTGACAAAGACTTCAGAGAGACAGAAAGATAAAGAAAGATCAAGACCTTTCAATGGC
GGCAGGAGCAGGAGGAGGATCATCGTCTGCGGGACGGACTCCGACGTGGAAGGAAAGGGA
GAACAATAAGAAGAGGGAAAGGAGAAGAAGAGCCATCACGGCCAAGATTTACTCTGGCCT
CAGAGCTCAAGGTAACTACAAGCTCCCTAAGCACTGCGACAACAACGAAGTCCTTAAAGC
TCTCTGTCTCGAAGCTGGTTGGATCGTTGAAGACGACGGCACCACTTATCGCAAGGGTTA
TAAGCCACTAGCGTCGGAACTATCAGGAACTCCGACGAACTACAGCACGAACTCATCAAT
CCAACCAAGTCCACAATCCTCTGCTTTCCCAAGCCCTGCACCTTCTTACCACGGAAGTCC
TGTTTCATCTTCCTTCCCAAGCCCCACTCGTTACGACGCTAGTAACCCTTCCTCGTACCT
TCTCCTCCCTTTCCTCCACAACATCGCTTCTTCCATCCCATCAAACCTTCCTCCCCTCAG
AATCTCCAACAGCGCTCCCGTAACGCCTCCCTTATCCTCTCCCACCTCTCGCGGTTCGAA
GCGGAGACTCATCACTGAACAGTTACC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2AO51TF 815 0 0
GG
GTCACCAAACAAACTCCCTCTCTCTCTCTCTCT**ATCGTCTCCCTCGTGCGCCAGACTG
ACAAAGACTTCAGAGAGACAGAAAGATAAAGAAAGATCAAGACCTTTCAATGGCGGCAGG
AGCAGGAGGAGGAACATCGTCTGCGGGACGGACTCCGACGTGGAAGGAAAGGGAGAACAA
TAAGAAGAGGGAAAGGAGAAGAAGAGCCATCACGGCCAAGATTTACTCTGGCCTCAGAGC
TCAAGGTAACTACAAGCTCCCTAAGCACTGCGACAACAACGAAGTCCTTAAAGCTCTCTG
TCTCGAAGCTGGTTGGATCGTTGAAGACGACGGCACCACTTATCGCAAGGGTTATAAGCC
ACTAGCGTCGGAACTATCAGGAACTCCGACGAACTACAGCACGAACTCATCAATCCAACC
AAGTCCACAATCCTCTGCTTTCCCAAGCCCTGCACCTTCTTACCACGGAAGTCCTGTTTC
ATCTTCCTTCCCAAGCCCCACTCGTTACGACGCGAGTAACCCTTCCTCGTACCTTCTCCT
CCCTTTCCTCCACAACATCGCTTCTTCCATCCCATCAAACCTTCCTCCTCTCAGAATCTC
CAACAGCGCTCCCGTAACGCCTCCCTTATCCTCTCCCACCTCTCGCGGTTCGAAGCGGAG
ACTCATCACTGAACAGTTACCAAACGGCGGGTCTTTGCTAAGACATCCGCTTTTCGCTAT
CTCTGCTCCGTCTAGTCCTACACGGCGCGGCGGTCATCAAACACCGCCTACGATACCTGA
*TGCGACGAGTCAGAGGAGGATTCGTTAGA
GAT

QA 3 812 3 812
DS 

RD RR2A946TF 766 0 0
G
CAACCAAGTCCACAATCCTCTGCTTTCCCAAGCCCTGCACCTTCTTACCACGGAAGTCCT
GTTTCATCTTCCTTCCCAAGCCCCACTCGTTACGACGCGAGTAACCCTTCCTCGTACCTT
CTCCTCCCTTTCCTCCACAACATCGCTTCTTCCATCCCATCAAACCTTCCTCCTCTCAGA
ATCTCCAACAGCGCTCCCGTAACGCCTCCCTTATCCTCTCCCACCTCTCGCGGTTCGAAG
CGGAGACTCATCACTGAACAGTTACCAAACGGCGGGTCTTTGCTAAGACATCCGCTTTTC
GCTATCTCTGCTCCGTCTAGTCCTACACGGCGCGGCGGTCATCAAACACCGCCTACGATA
CCTGAATGCGACGAGTCAGAGGAGGATTCGTTAGAAGATTCAGGAAGGTGGATCAGTTTT
CAATCTACAGCTCCTCCTTCGCCGACCTTTAACCTTGTTCAGCAGACGTCTATGGACATT
GACATGAAAAGACCAGAGTGGGGGGTGTCTGGGGAGGGGTTCAGAGTTTGAGTTCGAGAA
CGGTACTGTTAAGCCATGGGAAGGCGAAATGATTCATGAAGTTGGCGTAGAAGATCTTGA
GCTCACTCTCGGTGGCGCTAAGACAAGATGCTAAAGAGCCTCGATCATAACAGAGCTAAA
TATTTTTAGGCATTGTACAGAAGCTCTCGTGTGGTCAAAGCCAAAAGGGTCGAACCTTTT
ATATAACCGTTTATACTTCAATGTTT*CTTCTATGG
GTGATAATG

QA 2 757 2 757
DS 

RD RR2AO51JQ 762 0 0
CTGTTTCATCTTCCTTCCCAAGCCCCACTCGTTACGACGCGAGTAACCCTTCCTCGTACC
TTCTCCTCCCTTTCCTCCACAACATCGCTTCTTCCATCCCATCAAACCTTCCTCCTCTCA
GAATCTCCAACAGCGCTCCCGTAACGCCTCCCTTATCCTCTCCCACCTCTCGCGGTTCGA
AGCGGAGACTCATCACTGAACAGTTACCAAACGGCGGGTCTTTGCTAAGACATCCGCTTT
TCGCTATCTCTGCTCCGTCTAGTCCTACACGGCGCGGCGGTCATCAAACACCGCCTACGA
TACCTGAATGCGACGAGTCAGAGGAGGATTCGTTAGAAGATTCAGGAAGGTGGATCAGTT
TTCAATCTACAGCTCCTCCTTCGCCGACCTTTAACCTTGTTCAGCAGACGTCTATGGACA
TTGACATGAAAAGACCAGAGTGGGGGATGTCTGGG*AGGGGTTCAGAGTTTGAGTTCGAG
AACGGTACTGTTAAGCCATGGGAAGGCGAAATGATTCATGAAGTTGGCGTAGAAGATCTT
GAGCTCACTCTCGGTGGCGCTAAGACAAGATGCTAAAGAGCCTCGATCATAACAGAGCTA
AATATTTTTAGGCATTGTACAGAAGCTCTCGTGTGGTCAAAGCCAAAAGGGTCGAACCTT
TTATATAACCGTTTATACTTCAATGTTTTCTTCTATGGTGATAATGTTATTTGGAGGTAT
AATGTGTGTTTAGTCACATGATTAAGAAAAGGTTTTTGGAGT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2A946JQ 495 0 0
TCTGCTCCGTCTAGTCCTACACGGCGCGGCGGTCATCAAACACCGCCTACGATACCTGAA
TGCGACGAGTCAGAGGAGGATTCGTTAGAAGATTCAGGAAGGTGGATCAGTTTTCAATTT
ACAGCTCCTCCTTCGCCGACCTTTAACCTTGTTCAGCAGACGTCTATGGACATTGACATG
AAAAGACCAGAGTGGGGGATGTCTGGG*AGGGGTTCAGAGTTTGAGTTCGAGAACGGTAC
TGTTAAGCCATGGGAAGGCGAAATGATTCATGAAGTTGGCGTAGAAGATCTTGAGCTCAC
TCTCGGTGGCGCTAAGACAAGATGCTAAAGAGCCTCGATCATAACAGAGCTAAATATTTT
TAGGCATTGTACAGAAGCTCTCGTGTGGTCAAAGCCAAAAGGGTCGAACCTTTTATATAA
CCGTTTATACTTCAATGTTTTCTTCTATGGTGATAATGTTATTTGGAGGTATAATGTGTG
TTTAGTC
CCCTGATT

QA 1 487 1 487
DS 



AS 2 6

CO CL1376Contig1 850 4 1 U
TACGGCCGGGGGGAGAGAGAAAAAAACTCACGATGAGAAAGATGAGACGAAGGAGCAATT
AAAACTGTGGAGAGATGCAAATAAGAAGGAACAATATAATGAACCTTCTCCTACGGTGAA
GGTGCATACAGACCATAAAATTGATAGCTTTTCCAGTGTGGACATGGACTTTACATTAGG
ATTGCCACCTCAAGCAGCTTACGACCTTTTAACTAATCAAGACAACAAAACATACTCCAG
AGAAATCAATGGCCGCCCACTTCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGATAGG
TATGGGGAATAGGCCGGTCCTGGAGGTTGAGAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTT
TTCAGGAACTATCCCAATACGTCTAAATGTCCTCGAAGAGCCAAAAGAACTTGCTGCATA
TAACTGGAAAATGAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGTTCAAGGTTAACTATAGAGT
GGAGCCAATGTATGTTGATGCAGAACGCTTGTGCAAGCACCAGAAGCTGAAGAGTATAGA
AGAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGATTGATTGCGTCCAAGGTTAAAGTGGACCA
GAATTTTAGGCCTTCTTTTCCTTGGAATCTGCCACTGCTGTCTTGGTACTTTCGCCGGTT
CACTGTTGCGACCACTAAGAAAGTGGTGGAAGATCTTCAAACGCGGGCTGGCGATATCCG
TCGGTTGTAACGTAACGTCTTCGTAAAACAAGACATCAAATAGTGTTTTAAAATCGCATT
ATCATAAATTCGAATAGCAGAATCTTTTAAATCTTGATATTTTCACAATAAGTACCGGGG
AAAGATTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT23TF U 17
AF RR2A242JQ C 259
AF RR2BT40TF U 135
AF RR2A242TF U 1
BS 1 850 RR2A242TF

RD RR2GT23TF 574 0 0
GAGG
AAAAAACTCACGATGAGAAAGATGAGACGAAGGAGCAATTAAAACTGTGGAGAGATGCAA
ATAAGAAGGAACAATATAATGAACCTTCTCCTACGGTGAAGGTGCATACAGACCATAAAA
TTGATAGCTTTTCCAGTGTGGACATGGACTTTACATTAGGATTGCCACCTCAAGCAGCTT
ACGACCTTTTAACTAATCAAGACAACAAAACATACTCCAGAGAAATCAATGGCCGCCCAC
TTCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGATAGGTATGGGGAATAGGCCGGTCC
TGGAGGTTGAGAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTTTTCAGGAACTATCCCAATAC
GTCTAAATGTCCTCGAAGAGCCAAAAGAACTTGCTGCATATAACTGGAAAATGAGAAAAG
GAATGGACTACATGGAAACGTTCAAGGTTAACTATAGAGTGGAGCCAATGTATGTTGATG
CAGAACGCTTGTGCAAGCACAAGAAGCCGAAGAGTATAGAAGAATACAGAAAATGTAGTG
GTGGAAAAGGATTGATTGCGTCCAAAGTTA

QA 5 574 5 574
DS 

RD RR2A242JQ 488 0 0
ACTTCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGATAGGTATGGGGAATAGGCCGGT
CCTGGAGGTTGAGAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTTTTCAGGAACTATCCCAAT
ACGTTTAAATGTCCTCGAAGAGCCAAAAGAACTTGCTGCATATAACTGGAAAATGAGAAA
AGGAATGGACTACATGGAAACGTTCAAGGTTAACTATAGAGTGGAGCCAATGTATGTTGA
TGCAGAACGCTTGTGCAAGCACCAGAAGCTGAAGAGTATAGAAGAATACAGAAAATGTAG
TGGTGGAAAAGGATTGATTGCGTCCAAGGTTAAAGTGGACCAGAATTTTAGGCCTTCTTT
TCCTTGGAATCTGCCACTGCTGTCTTGGTACTTTCGCCGGTTCACTGTTGCGACCACTAA
GAAAGTGGTGGAAGATCTTCAAACGCGGGCTGGCGATATCCGTCGGTTGTAA
CGTAACGTCTTCGTAA

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2BT40TF 663 0 0
G
TAAAATTGATAGCTTTTCCAGTGTGGACATGGACTTTACATTAGGATTGCCACCTCAAGC
AGCTTACGACCTTTTAACTAATCAAGACAACAAAACATACTCCAGAGAAATCAATGGCCG
CCCACTTCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGATAGGTATGGGGAATAGGCC
GGTCCTGGAGGTTGAGAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTTTTCAGGAACTATCCC
AATACGTCTAAATGTCCTCGAAGAGCCAAAAGAACTTGCTGCATATAACTGGAAAATGAG
AAAAGGAATGGACTACATGGAAACGTTCAAGGTTAACTATAGAGTGGAGCCAATGTATGT
TGATGCAGAACGCTTGTGCAAGCACAAGAAGCCGAAGAGTATAGAAGAATACAGAAAATG
TAGTGGTGGAAAAGGATTGATTGCGTCCAAGGTTAAAGTGGACCAGAATTTTAGGCCTTC
TTTTCCTTGGAATCTGCCACTGCTGTCTTGGTACTTTCGCCGGTTCACTGTTGCGACCAC
TAAGAAAGTGGTGGAAGATCTTCAAACGCGGGCTGGCGATATCCGTCGGTTGTAACGTAA
CGTCTTCGTAAAACAAGACATCAAATAGTGTTTTAAAATCGCATTATCATAAATTCGA
TAGC

QA 2 659 2 659
DS 

RD RR2A242TF 850 0 0
TACGGCCGGGGGGAGAGAGAAAAAAACTCACGATGAGAAAGATGAGACGAAGGAGCAATT
AAAACTGTGGAGAGATGCAAATAAGAAGGAACAATATAATGAACCTTCTCCTACGGTGAA
GGTGCATACAGACCATAAAATTGATAGCTTTTCCAGTGTGGACATGGACTTTACATTAGG
ATTGCCACCTCAAGCAGCTTACGACCTTTTAACTAATCAAGACAACAAAACATACTCCAG
AGAAATCAATGGCCGCCCACTTCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGATAGG
TATGGGGAATAGGCCGGTCCTGGAGGTTGAGAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTT
TTCAGGAACTATCCCAATACGTCTAAATGTCCTCGAAGAGCCAAAAGAACTTGCTGCATA
TAACTGGAAAATGAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGTTCAAGGTTAACTATAGAGT
GGAGCCAATGTATGTTGATGCAGAACGCTTGTGCAAGCACCAGAAGCTGAAGAGTATAGA
AGAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGATTGATTGCGTCCAAGGTTAAAGTGGACCA
GAATTTTAGGCCTTCTTTTCCTTGGAATCTGCCACTGCTGTCTTGGTACTTTCGCCGGTT
CACTGTTGCGACCACTAAGAAAGTGGTGGAAGATCTTCAAACGCGGGCTGGCGATATCCG
TCGGTTGTAACGTAACGTCTTCGTAAAACAAGACATCAAATAGTGTTTTAAAATCGCATT
ATCATAAATTCGAATAGCAGAATCTTTTAAATCTTGATATTTTCACAATAAGTACCGGGG
AAAGATTGCG

QA 1 850 1 850
DS 



CO CL1376Contig2 798 2 2 U
GGACCTTTTAACTAATCAAGACAACAAAACATACTCCAGAGAAATCAATGGCCGCCCACT
TCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGATAGGTATGGGGAATAGGCCGATCCT
GGAGGTTGAGAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTTTTCAGGAACTATCCCAATACG
TCTAAATGTCCTCGAAGAGCCAAAAGAACTTTCTGTATATAACTGGAAAATGAGAAAAGG
AATGGACTACATGGAAACGTTCACGCTTAACTATATAGTGGAGCCGATGTATGTTGATGC
AGAACGCTTGTGTAAGCACAAGAAGCCGAAGAGTATAGAAGAATACAGAAAATGTAGTGG
TGGAAAAGGATTGATTGCGTCCAAGGTTAAAGTGGACCAGACTTTTAGGCCTTCTTTTCC
TTGGAATCTGCCACTGCTGTCTTGGTACTTTCGCCGGTTCACTGTTGCGACCACTAAGAA
AGTGGTGGAAGATCTTCAAACGCGGGCTGGCGATATCCGTCGGTTGTAAACGTCTTCGTA
AAACAACACATCAAATAGTGTTTTAAAATCGCATTATCATAAATTCGAATAGCAGAATTT
TTTAAAATCTTGATATTTTTCACCAATAAGTACCGGGGAAAGATTTGCGCCTAGCGCAGG
GGTGAAGGTGATGAACAAATTTTCCTAAACATGATATTAATTATGTTACATCAATTATTT
GCATCGGTAAATAAGAAATTTTACAACCCCGAAAAGGCAAAAAGATGTAATATACTATAT
GGCGTAATATACGGTAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL75TF U 1
AF RR2FL75JQ C 273
BS 1 665 RR2FL75TF
BS 666 798 RR2FL75JQ

RD RR2FL75TF 665 0 0
GGACCTTTTAACTAATCAAGACAACAAAACATACTCCAGAGAAATCAATGGCCGCCCACT
TCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGATAGGTATGGGGAATAGGCCGATCCT
GGAGGTTGAGAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTTTTCAGGAACTATCCCAATACG
TCTAAATGTCCTCGAAGAGCCAAAAGAACTTTCTGTATATAACTGGAAAATGAGAAAAGG
AATGGACTACATGGAAACGTTCACGCTTAACTATATAGTGGAGCCGATGTATGTTGATGC
AGAACGCTTGTGTAAGCACAAGAAGCCGAAGAGTATAGAAGAATACAGAAAATGTAGTGG
TGGAAAAGGATTGATTGCGTCCAAGGTTAAAGTGGACCAGACTTTTAGGCCTTCTTTTCC
TTGGAATCTGCCACTGCTGTCTTGGTACTTTCGCCGGTTCACTGTTGCGACCACTAAGAA
AGTGGTGGAAGATCTTCAAACGCGGGCTGGCGATATCCGTCGGTTGTAAACGTCTTCGTA
AAACAACACATCAAATAGTGTTTTAAAATCGCATTATCATAAATTCGAATAGCAGAATTT
TTTAAAATCTTGATATTTTTCACCAATAAGTACCGGGGAAAGATTTGCGCCTAGCGCAGG
GGTGA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2FL75JQ 526 0 0
ATAT
AGTGGAGCCGATGTATGTTGATGCAGAACGCTTGTGTAAGCACAAGAAGCCGAAGAGTAT
AGAAGAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGATTGATTGCGTCCAAGGTTAAAGTGGA
CCAGACTTTTAGGCCTTTTTTTCCTTGGAATTTGCCACTGCTGTTTTGGTACTTTCGCCG
GTTCACTGTTGCGACCACTAAGAAAGTGGTGGAAGATTTTCAAACGCGGGCTGGCGATAT
CCGTCGGTTGTAAACGTTTTTGTAAAACAACACATCAAATAGTGTTTTAAAATCGCATTA
TCATAAATTCGAATAGCAGAATTTTTTAAAATCTTGATATTTTTCACCAATAAGTACCGG
GGAAAGATTTGCGCCTAGGGCAGGGGTGAAGGTGATGAACAAATTTTCCTAAACATGATA
TTAATTATGTTACATCAATTATTTGCATCGGTAAATAAGAAATTTTACAACCCCGAAAAG
GCAAAAAGATGTAATATACTATATGGCGTAATATACGGTAGA

QA 5 526 5 526
DS 



AS 2 5

CO CL1377Contig1 701 2 2 U
GGATTTCTGTTGTAAGCCAATTGTCTGACTATATGGCACATCCCAATAGATGCATAAATG
ATGAAAGTTCTGTTTTGTTATCTTATTTCAAATATAGACGTATAAGCTTTTTTATTATAG
AGCCAAAACCAAGTTAAATTTATACAAATCATAGTACTAGCTGATTAGAATCGACCTTAG
GGAAAGGTACTTTTGTATTCCAAATCACATTCATTTCACAAATTATCGCCATAGTTATGC
CAAAGCAGAGGACTTTGCAGCAGTCTCCTTCAAATGAAGCATCAAGAATGAGTGAAAATA
GCTAAGATACATATAAAACCAGGTGAAGACCAGCAAGAGATAATAGCCATACAGAAAGTG
ATCTTGAAAAACAAAGCGGTCCATGTTTCATCCAACTGAATACCCAATACGGGTGATACA
AATGATGACCACCAAAGCCCATCATTTTACAACTTTTGATTAATATTCACAAATTATAGA
TGAACAAAATGATTGATAATGCTTGCATTTCAGAGAAATTGATGTTTAATGAAGTGGTAA
CAAAGTAGTGTTTAACAAAATCATCGGAGTGGTAACAAAGTAGCAGAAGACTTTTACTTT
CGAATCATTTGTCCTATAATTAAAATCTTGTGTTGGGTCTGATAAAACTAATGCAAGAAA
CTGAGTTGGTTAATAACTTAATATTAGTTTGAAATTGAGCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C020JQ C 1
AF RR2C020TF U 1
BS 1 1 RR2C020JQ
BS 2 701 RR2C020TF

RD RR2C020JQ 701 0 0
GGATTTCTGTTGTAAGCCAATTGTCTGACTATATGGCACATCCCAATAGATGCATAAATG
ATGAAAGTTCTGTTTTGTTATCTTATTTCAAATATAGACGTATAAGCTTTTTTATTATAG
AGCCAAAACCAAGTTAAATTTATACAAATCATAGTACTAGCTGATTAGAATCGACCTTAG
GGAAAGGTACTTTTGTATTCCAAATCACATTCATTTCACAAATTATCGCCATAGTTATGC
CAAAGCAGAGGACTTTGCAGCAGTCTCCTTCAAATGAAGCATCAAGAATGAGTGAAAATA
GCTAAGATACATATAAAACCAGGTGAAGACCAGCAAGAGATAATAGCCATACAGAAAGTG
ATCTTGAAAAACAAAGCGGTCCATGTTTCATCCAACTGAATACCCAATACGGGTGATACA
AATGATGACCACCAAAGCCCATCATTTTACAACTTTTGATTAATATTCACAAATTATAGA
TGAACAAAATGATTGATAATGCTTGCATTTCAGAGAAATTGATGTTTAATGAAGTGGTAA
CAAAGTAGTGTTTAACAAAATCATCGGAGTGGTAACAAAGTAGCAGAAGACTTTTACTTT
CGAATCATTTGTCCTATAATTAAAATCTTGTGTTGGGTCTGATAAAACTAATGCAAGAAA
CTGAGTTGGTTAATAACTTAATATTAGTTTGAAATTGAGCC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2C020TF 701 0 0
G
GATTTCTGTTGTAAGCCAATTGTCTGACTATATGGCACATCCCAATAGATGCATAAATGA
TGAAAGTTCTGTTTTGTTATCTTATTTCAAATATAGACGTATAAGCTTTTTTATTATAGA
GCCAAAACCAAGTTAAATTTATACAAATCATAGTACTAGCTGATTAGAATCGACCTTAGG
GAAAGGTACTTTTGTATTCCAAATCACATTCATTTCACAAATTATCGCCATAGTTATGCC
AAAGCAGAGGACTTTGCAGCAGTCTCCTTCAAATGAAGCATCAAGAATGAGTGAAAATAG
CTAAGATACATATAAAACCAGGTGAAGACCAGCAAGAGATAATAGCCATACAGAAAGTGA
TCTTGAAAAACAAAGCGGTCCATGTTTCATCCAACTGAATACCCAATACGGGTGATACAA
ATGATGACCACCAAAGCCCATCATTTTACAACTTTTGATTAATATTCACAAATTATAGAT
GAACAAAATGATTGATAATGCTTGCATTTCAGAGAAATTGATGTTTAATGAAGTGGTAAC
AAAGTAGTGTTTAACAAAATCATCGGAGTGGTAACAAAGTAGCAGAAGACTTTTACTTTC
GAATCATTTGTCCTATAATTAAAATCTTGTGTTGGGTCTGATAAAACTAATGCAAGAAAC
TGAGTTGGTTAATAACTTAATATTAGTTTGAAATTGAGCC

QA 2 701 2 701
DS 



CO CL1377Contig2 824 3 39 U
GATAAAACAGCTTATACGTCTTATATTTGACATAAGATAACAAAACAGAACTTTCATCAT
TTATGCATCTATCGGGATGTGCCATATACTCAGACAAATAGCTTACAACAGAAATCAAAA
GCGCTTATGTTTG*TACGT*GACTCAAGCCAAGTACTTCTCCAGCTTCTCAACTTCTTCA
GTGCTTCCAATGTAAAGCGGAACCCTCTGATGTATCTCGGTCGGTTGGATATCTAGCACT
CTCTGGTGACCATCTGATCCTTTCCCTCCTGCTTGTTCAACGATGAAACTCATCGGTGCA
CACTTATACAAAAGCCTAAGCTTCCCGTTTTTGCTCTTGGCGTCACGTGGGTACCCGTAG
ATCCCACCGTACAACAAAGTCCTGTGAAAATCTCCCACCAAACTACCAATGTACCTTGCC
GAGTAAGGCTTCCCGCTCGGACCAGGGTCCTTGAGATCATCCATGTACTTCTTCAGTTTA
TCGTCCCACATCTGGTAGTTCCCTTCGTTGAAAGAGTATATTTTCCCGGCTTTGGGGATT
TGAATGTTCTCTTGAGTCAGGACGAACTCGCCGTACATTGGGTCGAGGGTGAAGGAGAAA
ACGCCTTTGCCTAAGGTGAGGACGAAGATGACCGAGCTGGAGTACATACAGTATCCAGCT
GCTAGCAAGTTGTTCCCTGGTTGGCACACGTTTACAATACACCTTTGTTCTTCTGACCCA
AGAGCGGAGATATCGTCAGAATCATCGACGATGCACTCGTCATTGGGGCTGTAGATACCG
AAGATGGAACCGGTGGACACTGCCATTTTTCTGCGTTGGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D924JQ U 1
AF RR2HA76JQ U 39
AF RR2HA76TF C 117
BS 1 85 RR2D924JQ
BS 86 86 RR2HA76JQ
BS 87 94 RR2D924JQ
BS 95 95 RR2HA76JQ
BS 96 101 RR2D924JQ
BS 102 102 RR2HA76JQ
BS 103 108 RR2D924JQ
BS 109 109 RR2HA76JQ
BS 110 121 RR2D924JQ
BS 122 122 RR2HA76JQ
BS 123 129 RR2D924JQ
BS 130 130 RR2HA76JQ
BS 131 133 RR2D924JQ
BS 134 134 RR2HA76JQ
BS 135 137 RR2D924JQ
BS 138 138 RR2HA76JQ
BS 139 139 RR2D924JQ
BS 140 140 RR2HA76JQ
BS 141 269 RR2D924JQ
BS 270 270 RR2HA76JQ
BS 271 275 RR2D924JQ
BS 276 276 RR2HA76JQ
BS 277 304 RR2D924JQ
BS 305 305 RR2HA76JQ
BS 306 347 RR2D924JQ
BS 348 348 RR2HA76JQ
BS 349 395 RR2D924JQ
BS 396 396 RR2HA76JQ
BS 397 419 RR2D924JQ
BS 420 420 RR2HA76JQ
BS 421 476 RR2D924JQ
BS 477 477 RR2HA76JQ
BS 478 479 RR2D924JQ
BS 480 480 RR2HA76JQ
BS 481 542 RR2D924JQ
BS 543 543 RR2HA76JQ
BS 544 706 RR2D924JQ
BS 707 769 RR2HA76JQ
BS 770 824 RR2HA76TF

RD RR2D924JQ 716 0 0
GATAAAACAGCTTATACGTCTTATATTTGACATAAGATAACAAAACAGAACTTTCATCAT
TTATGCATCTATCGGGATGTGCCATGTACTCAGA*AAATAGTTTACAATAGAAATCAAAA
G*GCTTATGCTTGGTACATTGACTCAAGCCAAGTACTTCTCCAGCTTCTCAACTTCTTCA
GTGCTTCCAATGTAAAGCGGAACCCTCTGATGTATCTCGGTCGGTTGGATATCTAGCACT
CTCTGGTGACCATCTGATCCTTTCCCTCCAGCTTGCTCAACGATGAAACTCATCGGTGCA
CACTCATACAAAAGCCTAAGCTTCCCGTTTTTGCTCTTGGCGTCACGAGGGTACCCGTAG
ATCCCACCGTACAACAAAGTCCTGTGAAAATCTCCGACCAAACTACCAATGTACCTTGCA
GAGTAAGGCTTCCCGCTCGGACCAGGGTCCTTGAGATCATCCATGTACTTCTTCAGCTTC
TCGTCCCACATCTGGTAGTTCCCTTCGTTGAAAGAGTATATTTTCCCGGCTTTGGGGATT
TGGATGTTCTCTTGAGTCAGGACGAACTCGCCGTACATTGGGTCGAGGGTGAAGGAGAAA
ACGCCTTTGCCTAAGGTGAGGACGAAGATGACCGAGCTGGAGTACATACAGTATCCAGCT
GCTAGCAAGTTGTTCCCTGGTTGGCACACGTTTACAATACACCTTT
CTGCTCTTGT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2HA76JQ 731 0 0
AG
CAAAACAGAACTTTCATCATTTATGCATCTATTGGGATGTGCCATATAGTCAGACAATTG
GCTTACAACAGAAATCAAAAGCGCTTATGTTTG*TACGT*GACTCAAGCCAAGTACTTCT
CCAGCTTCTCAACTTCTTCAGTGCTTCCAATGTAAAGCGGAACCCTCTGATGTATCTCGG
TCGGTTGGATATCTAGCACTCTCTGGTGACCATCTGATCCTTTCCCTCCTGCTTGTTCAA
CGATGAAACTCATCGGTGCACACTTATACAAAAGCCTAAGCTTCCCGTTTTTGCTCTTGG
CGTCACGTGGGTACCCGTAGATCCCACCGTACAACAAAGTCCTGTGAAAATCTCCCACCA
AACTACCAATGTACCTTGCCGAGTAAGGCTTCCCGCTCGGACCAGGGTCCTTGAGATCAT
CCATGTACTTCTTCAGTTTATCGTCCCACATCTGGTAGTTCCCTTCGTTGAAAGAGTATA
TTTTCCCGGCTTTGGGGATTTGAATGTTCTCTTGAGTCAGGACGAACTCCCCGTACATTG
GGTCGAGGGTGAAGGAGAAAACGCCTTTGCCTAAGGTGAGGACGAAGATGACCGAGCTGG
AGTACATACAGTATCCAGCTGCTAGCAAGTTGTTCCCTGGTTGGCACACGTTTACAATAC
ACCTTTGTTCTTCTGACCCAAGAGCGGAGATATCGTCAGAATCATCGACGATGCACTCGT
CATTGGGGC

QA 3 731 3 731
DS 

RD RR2HA76TF 708 0 0
AAAAGCGCTTATGTTTG*TACGT*GACTCAAGCCAAGTACTTCTCCAGCTTCTCAACTTC
TTCAGTGCTTCCAATGTAAAGCGGAACCCTCTGATGTATCTCGGTCGGTTGGATATCTAG
CACTCTCTGGTGACCATCTGATCCTTTCCCTCCTGCTTGTTCAACGATGAAACTCATCGG
TGCACACTTATACAAAAGCCTAAGCTTCCCGTTTTTGCTCTTGGCGTCACGTGGGTACCC
GTAGATCCCACCGTACAACAAAGTCCTGTGAAAATCTCCCACCAAACTACCAATGTACCT
TGCCGAGTAAGGCTTCCCGCTCGGACCAGGGTCCTTGAGATCATCCATGTACTTCTTCAG
TTTATCGTCCCACATCTGGTAGTTCCCTTCGTTGAAAGAGTATATTTTCCCGGCTTTGGG
GATTTGAATGTTCTCTTGAGTCAGGACGAACTCGCCGTACATTGGGTCGAGGGTGAAGGA
GAAAACGCCTTTGCCTAAGGTGAGGACGAAGATGACCGAGCTGGAGTACATACAGTATCC
AGCTGCTAGCAAGTTGTTCCCTGGTTGGCACACGTTTACAATACACCTTTGTTCTTCTGA
CCCAAGAGCGGAGATATCGTCAGAATCATCGACGATGCACTCGTCATTGGGGCTGTAGAT
ACCGAAGATGGAACCGGTGGACACTGCCATTTTTCTGCGTTGGTGTCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 5

CO CL1378Contig1 577 5 2 U
GGATAGTGATTATATCAGTACAAGAGAGACTTGTGAGTTATTAAAGATGTCGTCGTCTAT
AGTTTCTTTGATGCTATCTCTTCTTCTCCTGGTGGTGTTGCTTAATATGGATCACGCATT
TAGTGCTCAGACTGAGATCCGTAAACTTAAAGATACAAGGATGAAATTGGAAGGAGATGA
CAACAGAAGCTCCAAAGTGGAGATGGAACCGAGCAGATCAATACGTTGCGGGGGCGGGAA
AACTTTTGAAAACATGGCGACCGCTTATCGTACTGATCATGGTCATCTTCCAGGAGGATA
CTTGTCTTCTCTCTGTCAGCCATGCAGCTCGGGAAAATGTATTGTTTATAGGTGTATTAC
CACCAAAATCTGCCAATACGTCAACGGCTCACCAACGACGTGCACAAGCTCCGAGGACTG
TCAACCCGTATCTAGCAACTGATCGGATTATAAAACTTTGTTATACATATATCGTGTTTT
TTTTT***GCTTTTTCTATGGTTATTCGTTTCACATGTATGTTTGTGTGTTGCCACATAT
ATTCTCATATTTTTATCGGATGCAAAATCTTTACATT


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C876JQ C 1
AF RR2FZ59TF U 1
AF RR2C876TF U 100
AF RR2D485JQ C 3
AF RR2D485TF U 3
BS 1 4 RR2C876JQ
BS 5 577 RR2FZ59TF

RD RR2C876JQ 562 0 0
GGATAGTGATTATATCAGTACAAGAGAGACTTGTGAGTTATTAAAGATGTCGTCGTCTAT
AGTTTCTTTGATGCTATCTCTTCTTCTCCTGGTGGTGTTGCTTAATATGGATCACGCATT
TGGTGCTCAGACTGAGATCCGTAAACTTAAAGATACAAGGATGAAATTGGAAGGAGATGA
CAACAGAAGCTCCAAAGTGGAGATGGAACCGAGCAGATCAATACGTTGCGGGGGCGGGAA
AACTTTTAAAAACATGGCGACCAGTTATCGTACTGATCATGGTCATCTTCCAGGAGGATA
CTTGTCTTCTCTCTGTCAGCCATGCAGCTCGGGAAAATGTATTGTTTATAGGTGTATTAC
CACCAAAGTCTGCCAATACATCAACGGCTCACCAACGACGTGCACAAGCTCCGAGGACTG
TCAACCCGTATCTAGCAACTGATCGGATTATAAAACTTTGTTATACATATATCGTGTTTT
TTTTTTTTGCTTTTTCTATGGTTATTCGTTTCACATGTATGTTTGTGTGTTGCCACATAT
ATTCTCATATTTTTATCGGATG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2FZ59TF 577 0 0
GGAT
AGTGATTATATCAGTACAAGAGAGACTTGTGAGTTATTAAAGATGTCGTCGTCTATAGTT
TCTTTGATGCTATCTCTTCTTCTCCTGGTGGTGTTGCTTAATATGGATCACGCATTTAGT
GCTCAGACTGAGATCCGTAAACTTAAAGATACAAGGATGAAATTGGAAGGAGATGACAAC
AGAAGCTCCAAAGTGGAGATGGAACCGAGCAGATCAATACGTTGCGGGGGCGGGAAAACT
TTTGAAAACATGGCGACCGCTTATCGTACTGATCATGGTCATCTTCCAGGAGGATACTTG
TCTTCTCTCTGTCAGCCATGCAGCTCGGGAAAATGTATTGTTTATAGGTGTATTACCACC
AAAATCTGCCAATACGTCAACGGCTCACCAACGACGTGCACAAGCTCCGAGGACTGTCAA
CCCGTATCTAGCAACTGATCGGATTATAAAACTTTGTTATACATATATCGTGTTTTTTTT
T***GCTTTTTCTATGGTTATTCGTTTCACATGTATGTTTGTGTGTTGCCACATATATTC
TCATATTTTTATCGGATGCAAAATCTTTACATT

QA 5 577 5 577
DS 

RD RR2C876TF 464 0 0
GCTTAATATGGATCACGCATTTGGTGCTCAGACTGAGATCCGTAAACTTAAAGATACAAG
GATGAAATTGGAAGGAGATGACAACAGAAGCTCCAAAGTGGAGATGGAACCGAGCAGATC
AATACGTTGCGGGGGCGGGAAAACTTTTAAAAACATGGCGACCAGTTATCGTACTGATCA
TGGTCATCTTCCAGGAGGATACTTGTCTTCTCTCTGTCAGCCATGCAGCTCGGGAAAATG
TATTGTTTATAGGTGTATTACCACCAAAGTCTGCCAATACATCAACGGCTCACCAACGAC
GTGCACAAGCTCCGAGGACTGTCAACCCGTATCTAGCAACTGATCGGATTATAAAACTTT
GTTATACATATATCGTGTTTTTTTTTTTTGCTTTTTCTATGGTTATTCGTTTCACATGTA
TGTTTGTGTGTTGCCACATATATTCTCATATTTTTATCGGATG
T

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2D485JQ 557 0 0
GG
AGTGATTATATCAGTACAAGAGAGACTTGTGAGTTATTAAAGATGTCGTCGTCTATAGTT
TCTTTGATGCTATCTCTTCTTCTCCTGGTGGTGTTGCTTAATATGGATCACGCATTTAGT
GCTCAGACTGAGATCCGTAAACTTAAAGATACAAGGATGAAATTGGAAGGAGATGACAAC
AGAAGCTCCAAAGTGGAGATGGAACCGAGCAGATCAATACGTTGCGGGGGTGGGAAAACT
TTTGAAAACATGGCGACCGCTTATCGTACTGATCATGGTCATCTTCCAGGAGGATACTTG
TCTTCTCTCTGTCAGCCATGCAGCTCGGGAAAATGTATTGTTTATAGGTGTATTACCACC
AAAATCTGCCAATACGTCAACGGCTCACCAACGACGTGCACAAGCTCCGAGGACTGTCAA
CCCGTATCTAGCAACTGATCGGATTATAAAACTTTGTTATACATATATCGTGTTTTTTTT
T***GCTTTTTCTATGGTTATTCGTTTCACATGTATGTTTGTGTGTTGCCACATATATTC
TCATATTTTTATCG
C

QA 3 556 3 556
DS 

RD RR2D485TF 557 0 0
GG
AGTGATTATATCAGTACAAGAGAGACTTGTGAGTTATTAAAGATGTCGTCGTCTATAGTT
TCTTTGATGCTATCTCTTCTTCTCCTGGTGGTGTTGCTTAATATGGATCACGCATTTAGT
GCTCAGACTGAGATCCGTAAACTTAAAGATACAAGGATGAAATTGGAAGGAGATGACAAC
AGAAGCTCCAAAGTGGAGATGGAACCGAGCAGATCAATACGTTGCGGGGGTGGGAAAACT
TTTGAAAACATGGCGACCGCTTATCGTACTGATCATGGTCATCTTCCAGGAGGATACTTG
TCTTCTCTCTGTCAGCCATGCAGCTCGGGAAAATGTATTGTTTATAGGTGTATTACCACC
AAAATCTGCCAATACGTCAACGGCTCACCAACGACGTGCACAAGCTCCGAGGACTGTCAA
CCCGTATCTAGCAACTGATCGGATTATAAAACTTTGTTATACATATATCGTGTTTTTTTT
T***GCTTTTTCTATGGTTATTCGTTTCACATGTATGTTTGTGTGTTGCCACATATATTC
TCATATTTTTATCG
C

QA 3 556 3 556
DS 



AS 1 6

CO CL1379Contig1 1184 6 4 U
GGTTAAAGGACTTAACGAAACAGCCTTTCTAACCAACAACAACGTTGTACAGAAATATTA
TTATAACGGGTCTTTAGAAAAAAAAACTTCCGTAAAACGTATACAACAACTTTATAATAC
ATATATAACCATAACCCTCATTGTTCAACTTATTAAGCATATATGCTCTTCGGGTATGGA
ACTTACAAGGTGGCTTGAGGAAAGCAAGACTAGAATTTGGAGATGAAGTCAACGATAATT
TGGAGGATCTCTTGTGGCTTCTCTTGGTTAATGAAGTGAGCAACCCCTTCCATGACCACA
GGCTCTTCGAGCAAAGGAACATCTTCCTTGAACTTGGGACCATGTATGTATTCCTTCGCA
CCCGGAAAATAGTAGACCAGATCCTGGTCCCCAATCACAAATTTTGTAGGTACCTGGATT
TTGCATCCTACCCATGGACCCAACAGCTCATTGTTTAGGTCAAAATTGCGGTAGTAATTA
ACTCCACCAGTGTAACCTTTCTCTTGAAACTTGCTAACATAGTAAGCAACATCTTCCTCC
GTTAGCCATGACGGTAAAGGAATAGTTTCGTCTTTAGGTCCCCAAAAGCTTTTATCCTTG
GGCAAAATAAGCGGTCGAGGTGTTCTATATGTGAGCATCTTCCTCATTACTCTCTCAATC
CCAACCTCTGAAATCTCAGCTTCTATTTCTCCCACTTCCTGAAACCTACACATGTAGAAA
TCGTCGCCATAGAACTTACGCAGCGCGTCAAGAGGTTTAACGGTAGAATCTTTAGGACCG
AAAGAGAAAGGAACAGAGAGGTTGACCAGAGCTTTGACTTTATCAGGTCGGAAAAGACAA
AGATACCAAGCGATCAGAGCTCCCCAATCATGTCCAACCACAAACACTTTATCTTCGGTT
AAGGCGGATATGACAGCGATCAGGTCACCCACCATGTGGAAGCAAGTGTAGGAAGAGATC
TCAGGCGGAGCGTCGGAGTCACCGTAACCGCGTAAGTCAGGAGCGACGGCGCGGTATCCG
AGAGCAGCGAGTCCGGGGATCTGGTGACGCCATGAGTACCAAAGAGTAGGGAATCCATGG
AGGAGGAGGACTACAGGGCCATCAGAAGGGCCTTGGATCGCCACGTGGATGTCTACGCCG
TTACCTCTTATCTTTCGGTGCTCCATATGTTGTTTCCTTGGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG96JQ U 1
AF RR2BG96TF C 1
AF RR2AI95JQ U 60
AF RR2E607JQ U 31
AF RR2E607TF C 333
AF RR2AI95TF C 503
BS 1 543 RR2BG96JQ
BS 544 771 RR2E607JQ
BS 772 935 RR2E607TF
BS 936 1184 RR2AI95TF

RD RR2BG96JQ 544 0 0
GGTTAAAGGACTTAACGAAACAGCCTTTCTAACCAACAACAACGTTGTACAGAAATATTA
TTATAACGGGTCTTTAGAAAAAAAAACTTCCGTAAAACGTATACAACAACTTTATAATAC
ATATATAACCATAACCCTCATTGTTCAACTTATTAAGCATATATGCTCTTCGGGTATGGA
ACTTACAAGGTGGCTTGAGGAAAGCAAGACTAGAATTTGGAGATGAAGTCAACGATAATT
TGGAGGATCTCTTGTGGCTTCTCTTGGTTAATGAAGTGAGCAACCCCTTCCATGACCACA
GGCTCTTCGAGCAAAGGAACATCTTCCTTGAACTTGGGACCATGTATGTATTCCTTCGCA
CCCGGAAAATAGTAGACCAGATCCTGGTCCCCAATCACAAATTTTGTAGGTACCTGGATT
TTGCATCCTACCCATGGACCCAACAGCTCATTGTTTAGGTCAAAATTGCGGTAGTAATTA
ACTCCACCAGTGTAACCTTTCTCTTGAAACTTGCTAACATAGTAAGCAACATCTTCCTCC
GTT
C

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2BG96TF 544 0 0
GGTTAAAGGACTTAACGAAACAGCCTTTCTAACCAACAACAACGTTGTACAGAAATATTA
TTATAACGGGTCTTTAGAAAAAAAAACTTCCGTAAAACGTATACAACAACTTTATAATAC
ATATATAACCATAACCCTCATTGTTCAACTTATTAAGCATATATGCTCTTCGGGTATGGA
ACTTACAAGGTGGCTTGAGGAAAGCAAGACTAGAATTTGGAGATGAAGTCAACGATAATT
TGGAGGATCTCTTGTGGCTTCTCTTGGTTAATGAAGTGAGCAACCCCTTCCATGACCACA
GGCTCTTCGAGCAAAGGAACATCTTCCTTGAACTTGGGACCATGTATGTATTCCTTCGCA
CCCGGAAAATAGTAGACCAGATCCTGGTCCCCAATCACAAATTTTGTAGGTACCTGGATT
TTGCATCCTACCCATGGACCCAACAGCTCATTGTTTAGGTCAAAATTGCGGTAGTAATTA
ACTCCACCAGTGTAACCTTTCTCTTGAAACTTGCTAACATAGTAAGCAACATCTTCCTCC
GTT
C

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2AI95JQ 572 0 0
G
TTATAACGGGTCTTTAGAAAAAAAA*CTTCCGTAAAACGTACACAACAACTTTATAATAC
ATATATAGCCATAACCCTCATTGTTCAACTTATTAAGCATATATGCTCTTCGGGTATGGA
ACTTACAAGGTGGCTTGAGGAAAGCAAGACTAGAATTTGGAGATGAAGTCAACGATAATT
TGGAGGATCTCTTGTGGCTTCTCTTGGTTAATGAAGTGAGCAACCCCTTCCATGACCACA
GGCTCTTCGAGCAAAGGAACATCTTCCTTGAACTTGGGACCATGTATGTATTCCTTCGCA
CCCGGAAAATAGTAAACCAGATCCTGGTCCCCAATCACAAATTTTGTAGGTACCTGGATT
TTGCATCCTACCCATGGACCCAACAGCTCATTGTTTAGGTCAAAATTGCGGTAGTAATTA
ACTCCACCAGTGTAACCTTTCTCTTGAAACTTGCTAACATAGTAAGCAACATCTTCCTCC
GTTAGCCATGACGGTAAAGGAATAGTTTCGTCTTTAGGTCCCCAAAAGCTTTTATCCTTG
GGCAAAATAAGCGGTCGAGGTGTTCTATATG

QA 2 572 2 572
DS 

RD RR2E607JQ 741 0 0
AACCAACAACAACGTTGTACAGAAATATTATTATAACGGGTCTTTA*AAAAAAAAACTTC
CGTAAAACGTACACAACAACTTTATAATACATATATAACCATAACCCTCATTGTTCAACT
TATTAAGCATATATGCTCTTCGGGTATGGAACTTACAAGGTGGCTTGAGGAAAGCAAGAC
TAAAATTTGGAGATGAAGTCAACGATAATTTGGAGGATCTCTTGTGGCTTCTCTTGGTTA
ATGAAGTGAGCAACCCCTTCCATGACCACAGGCTCTTCGAGCAAAGGAACATCTTCCTTG
AACTTGGGACCATGTATGTATTCCTTCGCACCCGGAAAATAGTAAACCAAATCCTGGTCC
CCAATCACAAATTTTGTAGGTACCTGGATTTTGCATCCTACCCATGGACCCAACAGCTCA
TTGTTTAGGTCAAAATTGCGGTAGTAATTAACTCCACCAGTGTAACCTTTCTCTTGAAAC
TTGCTAACATAGTAAGCAACATCTTCCTCCGTTAGCCATGACGGTAAAGGAATAGTTTCG
TCTTTAGGTCCCCAAAAGCTTTTATCCTTGGGCAAAATAAGCGGTCGAGGTGTTCTATAT
GTGAGCATCTTCCTCATTACTCTCTCAATCCCAACCTCTGAAATCTCAGCTTCTATTTCT
CCCACTTCCTGAAACCTACACATGTAGAAATCGTCGCCATAGAACTTACGCAGCGCGTCA
AGAGGTTTAACGGTAGAATCT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2E607TF 604 0 0
ACTT
GGACCATGTATGTAT**CTTCGCACC*GGAAAATAGTAGACCAGATCCTGGTCCCCAATC
ACAAATTT*GTAGGTACCTGGATTTTGCATCCTACCCATGGACCCAACAGCTCATTGTTT
AGGTCAAAATTGCGGTAGTAATTAACTCCACCAGTGTAACCTTTCTCTTGAAACTTGCTA
ACATAGTAAGCAACATCTTCCTCCGTTAGCCATGACGGTAAAGGAATAGTTTCGTCTTTA
GGTCCCCAAAAGCTTTTATCCTTGGGCAAAATAAGCGGTCGAGGTGTTCTATATGTGAGC
ATCTTCCTCATTACTCTCTCAATCCCAACCTCTGAAATCTCAGCTTCTATTTCTCCCACT
TCCTGAAACCTACACATGTAGAAATCGTCGCCATAGAACTTACGCAGCGCGTCAAGAGGT
TTAACGGTAGAATCTTTAGGACCGAAAGAGAAAGGAACAGAGAGGTTGACCAGAGCTTTG
ACTTTATCAGGTCGGAAAAGACAAAGATACCAAGCGATCAGAGCTCCCCAATCATGTCCA
ACCACAAACACTTTATCTTCGGTTAAGGCGGATATGACAGCGATCAGGTCACCCACCAT
C

QA 5 603 5 603
DS 

RD RR2AI95TF 682 0 0
CTTGAAACTTGCTAACATAGTAAGCAACATCTTCCTCCGTTAGCCATGACGGTAAAGGAA
TAGTTTCGTCTTTAGGTCCCCAAAAGCTTTTATCCTTGGGCAAAATAAGCGGTCGAGGTG
TTCTATATGTGAGCATCTTCCTCATTACTCTCTCAATCCCAACCTCTGAAATCTCAGCTT
CTATTTCTCCCACTTCCTGAAACCTACACATGTAGAAATCGTCGCCATAGAACTTACGCA
GCGCGTCAAGAGGTTTAACGGTAGAATCTTTAGGACCGAAAGAGAAAGGAACAGAGAGGT
TGACCAGTGCTTTGACTTTATCAGGTCGGAAAAGACAAAGATACCAAGCGATCAGAGCTC
CCCAATCATGTCCAACCACAAACACTTTATCTTCGGTTAAGGCGGATATGACAGCGATCA
GGTCACCCACCATGTGGAAGCAAGTGTAGGAAGAGATCTCAGGCGGAGCGTCGGAGTCAC
CGTAACCGCGTAAGTCAGGAGCGACGGCGCGGTATCCGAGAGCAGCGAGTCCGGGGATCT
GGTGACGCCATGAGTACCAAAGAGTAGGGAATCCATGGAGGAGGAGGACTACAGGGCCAT
CAGAAGGGCCTTGGATCGCCACGTGGATGTCTACGCCGTTACCTCTTATCTTTCGGTGCT
CCATATGTTGTTTCCTTGGTCC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 6

CO CL1380Contig1 1344 6 34 U
GGAATCTTTGGCTCACTTCTTCTTCCTCACCAAAACAGCCCTTATCCCCTGTTCTTTCAT
TTCAATAAAAACTTTCTATTTATATAAGATTTTTAAGATCAAATCAAAAGACAATGATAA
GCAAGAATCCAAGATCAAGCTTACCACCAGGGTTTCGATTTCATCCAACAGATGAAGAAC
TCATCCTCCATTACTTGAGGAAGAAGGTTTCTTCTTCACCAGTCCCGCTTTCAATCATCG
CAGATGTTGATATCTATAAGTCTGATCCATGGGATTTACCAGCCAAGGCTCCGTTTGGAG
AGAAAGAATGGTACTTTTTCAGTCCAAGGGACCGGAAGTATCCTAATGGAGCGAGACCAA
ACAGAGCGGCTGCGTCTGGATATTGGAAAGCCACTGGAACTGATAAATTAATTGCGGTAC
CAAACCGTGAAGGGTTTAATGAAAACATTGGTATAAAAAAGGCTCTTGTGTTTTACACTG
GAAAGCCACCCAAAGGTGTTAAAACCAATTGGATCATGCATGAGTATCGACTTGCCGAAT
CCATCACGCCCAAAAGAGTGACCCATGCTAGGAACGGTGGCCAAGTCAATAATTTGGGAG
ATATGAATTTGAAGTCTAAAGAATACTCAATGAGGCTGGATGATTGGGTGCTTTGCCGGA
TTTACAAGAAATCACACGCTTCACTATCATCAGCAGAGGTTGCTTCAGCTACAAGCGATG
ATCAAGAACATGAGGAAAATGGCAACGAACCATTTGTAGTCAGCGAACCCCTTTTGCCAA
ACGATCAAACCCTTAAACGCCAGAAATCTTCTTTCTCCAACTTACTAGACGCTACAGATT
TCACGTTCTTGACAAACTTTCTAAACGAGACTCCGGACAATCGTACTGAATCAGACTTTT
CTTTCATGTTTGGAGATTTCTCAAACCCTGACATTTACGGGAACCGTTTCTTGGATCACA
AGTTACCGAAGCTGAGCTCTCCAACTTCAGAGACCAGAGTTATCGGAAACAAAAGAGAAC
GATTGGACTATTTTGAAGAAATGATCAACACTTCGAAGAAGATGATCAACAACTTTAGTT
ACAATAATAGCATGGATCATTTGGATCATAGTATGGTTCAACAATCTAGTTTTTTGAATC
AGGAATTCTTGATGAGTCCTCCTCACCTTCACTATCAAGGCTAGAGATGTTCAAAACCCA
ATTATGCGAATTAGGGCCCATTTGATGATTGAAAAGTAGGAGTCGTTACTATTATATAAA
ATTACAAAAGTATTGTGGGGAGGGGGGAAATATATAAAATAGTGGTAGTCGATATTTGAT
CGTATCAATACAACCATATTTTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2DD94TF U 1
AF RR2F215TF U 1
AF RR2B244TF U 150
AF RR2B244JQ C 492
AF RR2F215JQ C 813
AF RR2DD94JQ C 642
BS 1 126 RR2DD94TF
BS 127 127 RR2F215TF
BS 128 328 RR2DD94TF
BS 329 329 RR2F215TF
BS 330 412 RR2DD94TF
BS 413 413 RR2F215TF
BS 414 634 RR2DD94TF
BS 635 635 RR2F215TF
BS 636 666 RR2DD94TF
BS 667 667 RR2F215TF
BS 668 698 RR2DD94TF
BS 699 699 RR2B244TF
BS 700 713 RR2DD94TF
BS 714 714 RR2F215TF
BS 715 724 RR2DD94TF
BS 725 725 RR2F215TF
BS 726 727 RR2DD94TF
BS 728 728 RR2B244TF
BS 729 738 RR2DD94TF
BS 739 739 RR2B244TF
BS 740 744 RR2DD94TF
BS 745 745 RR2B244TF
BS 746 748 RR2DD94TF
BS 749 749 RR2F215TF
BS 750 762 RR2DD94TF
BS 763 770 RR2F215TF
BS 771 772 RR2B244TF
BS 773 777 RR2F215TF
BS 778 778 RR2B244TF
BS 779 795 RR2F215TF
BS 796 905 RR2B244TF
BS 906 961 RR2B244JQ
BS 962 962 RR2F215JQ
BS 963 1344 RR2B244JQ

RD RR2DD94TF 762 0 0
GGAATCTTTGGCTCACTTCTTCTTCCTCACCAAAACAGCCCTTATCCCCTGTTCTTTCAT
TTCAATAAAAACTTTCTATTTATATAAGATTTTTAAGATCAAATCAAAAGACAATGATAA
GCAAGAGTCCAAGATCAAGCTTACCACCAGGGTTTCGATTTCATCCAACAGATGAAGAAC
TCATCCTCCATTACTTGAGGAAGAAGGTTTCTTCTTCACCAGTCCCGCTTTCAATCATCG
CAGATGTTGATATCTATAAGTCTGATCCATGGGATTTACCAGCCAAGGCTCCGTTTGGAG
AGAAAGAATGGTACTTTTTCAGTCCAAGAGACCGGAAGTATCCTAATGGAGCGAGACCAA
ACAGAGCGGCTGCGTCTGGATATTGGAAAGCCACTGGAACTGATAAATTAATCGCGGTAC
CAAACCGTGAAGGGTTTAATGAAAACATTGGTATAAAAAAGGCTCTTGTGTTTTACACTG
GAAAGCCACCCAAAGGTGTTAAAACCAATTGGATCATGCATGAGTATCGACTTGCCGAAT
CCATCACGCCCAAAAGAGTGACCCATGCTAGGAACGGTGGCCAAGTCAATAATTTGGGAG
ATATGAATTTGAAGTCTAAAGAATACTCAATGAG*CTGGATGATTGGGTGCTTTGCCGGA
TTTACA*GAAATCACACGCTTCACTATCATCAGCAGAG*TTGCTTCAGCTACA*GCGATG
ATCA*GA*CATGAGGAAA*TGGCA*CGA*CCATTTGTAGTCA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2F215TF 795 0 0
GGAATCTTTGGCTCACTTCTTCTTCCTCACCAAAACAGCCCTTATCCCCTGTTCTTTCAT
TTCAATAAAAACTTTCTATTTATATAAGATTTTTAAGATCAAATCAAAAGACAATGATAA
GCAAGGATCCAAGATCAAGCTTACCACCAGGGTTTCGATTTCATCCAACAGATGAAGAAC
TCATCCTCCATTACTTGAGGAAGAAGGTTTCTTCTTCACCAGTCCCGCTTTCAATCATCG
CAGATGTTGATATCTATAAGTCTGATCCATGGGATTTACCAGCCAAGGCTCCGTTTGGAG
AGAAAGAATGGTACTTTTTCAGTCCAAGGGACCGGAAGTATCCTAATGGAGCGAGACCAA
ACAGAGCGGCTGCGTCTGGATATTGGAAAGCCACTGGAACTGATAAATTAATTGCGGTAC
CAAACCGTGAAGGGTTTAATGAAAACATTGGTATAAAAAAGGCTCTTGTGTTTTACACTG
GAAAGCCACCCAAAGGTGTTAAAACCAATTGGATCATGCATGAGTATCGACTTGCCGAAT
CCATCACGCCCAAAAGAGTGACCCATGCTAGGAACGGTGGCCAAGTCAATAATTTGGGAG
ATATGAATTTGAAGTCTAAAGAATACTCAATGAGGCTGGATGATTGGGTGCTTTGCCGGA
TTTACAAGAAATCACACGCTTCACTATCATCAGCAGAG*TTGCTTCAGCTACAAGCGATG
ATCAAGA*CATGAGGAAA*TGGCA*CGAACCATTTGTAGTCAGCGAACCC**TTTGC*AA
ACGATCAAACCCTTA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2B244TF 759 0 0
GGGTTTCGATTTCATCCAACAGATGAAGAACTCATCCTCCATTACTTGAGGAAGAAGGTT
TCTTCTTCACCAGTCCCGCTTTCAATCATCGCAGATGTTGATATCTATAAGTCTGATCCA
TGGGATTTACCAGCCAAGGCTCCGTTTGGAGAGAAAGAATGGTACTTTTTCAGTCCAAGG
GACCGGAAGTATCCTAATGGAGCGAGACCAAACAGAGCGGCTGCGTCTGGATATTGGAAA
GCCACTGGAACTGATAAATTAATTGCGGTACCAAACCGTGAAGGGTTTAATGAAAACATT
GGTATAAAAAAGGCTCTTGTGTTTTACACTGGAAAGCCACCCAAAGGTGTTAAAACCAAT
TGGATCATGCATGAGTATCGACTTGCCGAATCCATCACGCCCAAAAGAGTGACCCATGCT
AGGAACGGTGGCCAAGTCAATAATTTGGGAGATATGAATTTGAAGTCTAAAGAATACTCA
ATGAGGCTGGATGATTGGGTGCTTTGCCGGATTTACAAGAAATCACACGCTTCACTATCA
TCAGCAGAGGTTGCTTCAGCTACAAGCGATGATCAAGAACATGAGGAAAATGGCAACGAA
CCATTTGTAGTCAGCGAACCCCTTTTGCCAAACGATCAAACCCTTAAACGCCAGAAATCT
TCTTTCTCCAACTTACTAGACGCTACAGATTTCACGTTCTTGACAAACTTTCTAAACGAG
ACTCCGGACAATCGTACTGAATCAGACTTTTCTTTC
CTT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2B244JQ 853 0 0
AAAGGTGTTAAAACCAATTGGATCATGCATGAGTATCGACTTGCCGAATCCATCACGCCC
AAAAGAGTGACCCATGCTAGGAACGGTGGCCAAGTCAATAATTTGGGAGATATGAATTTG
AAGTCTAAAGAATACTCAATGAGGCTGGATGATTGGGTGCTTTGCCGGATTTACAAGAAA
TCACACGCTTCACTATCATCAGCAGAGGTTGCTTCAGCTACAAGCGATGATCAAGAACAT
GAGGAAAATGGCAACGAACCATTTGTAGTCAGCGAACCCCTTTTGCCAAACGATCAAACC
CTTAAACGCCAGAAATCTTCTTTCTCCAACTTACTAGACGCTACAGATTTCACGTTCTTG
ACAAACTTTCTAAACGAGACTCCGGACAATCGTACTGAATCAGACTTTTCTTTCATGTTT
GGAGATTTCTCAAACCCTGACATTTACGGGAACCGTTTCTTGGATCACAATTTACCGAAG
CTGAGCTCTCCAACTTCAGAGACCAGAGTTATCGGAAACAAAAGAGAACGATTGGACTAT
TTTGAAGAAATGATCAACACTTCGAAGAAGATGATCAACAACTTTAGTTACAATAATAGC
ATGGATCATTTGGATCATAGTATGGTTCAACAATCTAGTTTTTTGAATCAGGAATTCTTG
ATGAGTCCTCCTCACCTTCACTATCAAGGCTAGAGATGTTCAAAACCCAATTATGCGAAT
TAGGGCCCATTTGATGATTGAAAAGTAGGAGTCGTTACTATTATATAAAATTACAAAAGT
ATTGTGGGGAGGGGGGAAATATATAAAATAGTGGTAGTCGATATTTGATCGTATCAATAC
AACCATATTTTGG

QA 1 853 1 853
DS 

RD RR2F215JQ 531 0 0
TTCTCCAACTTACTAGACGCTACAGATTTCACGTTCTTGACAAACTTTCTAAACGAGACT
CCGGACAATCGTACTGAATCAGACTTTTTTTTCATGTTTGGAGATTTTTCAAACCCTGAC
ATTTACGGGAACCGTTTCTTGGATCACAAGTTACCGAAGCTGAGCTTTCCAACTTCAGAG
ACCAGAGTTATCGGAAACAAAAGAGAACGATTGGACTATTTTGAAGAAATGATCAACACT
TCGAAGAAGATGATCAACAACTTTAGTTACAATAATAGCATGGATCATTTGGATCATAGT
ATGGTTCAGCAATCTAGTTTTTTGAATCAGGAATTCTTGATGAGTCCTCCTCACCTTCAC
TATCAAGGCTAGAGATGTTCAAAACCCAATTATGCGAATTAGGGCCCATTTGATGATTGA
AAAGTAGGAGTCGTTACTATTATATAAAATTACAAAAGTATTGTGGGGAGGGGGGAAATA
TATAAAATAGTGGTAGTCGATATTTGATCGTATCAATACAACCATATTTTG

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2DD94JQ 702 0 0
GATTGGGTGCTTTGCCGGATTTACAAGAAATCACACGCTTCACTATCATCAGCAGAGGTT
GCTTCAGCTACAAGCGATGATCAAGAACATGAGGAAAATGGCAACGAACCATTTGTAGTC
AGCGAACCCCTTTTGCCAAACGATCAAACCCTTAAACGCCAGAAATCTTCTTTCTCCAAC
TTACTAGACGCTACAGATTTCACGTTCTTGACAAACTTTCTAAACGAGACTCCGGACAAT
CGTACTGAATCAGACTTTTCTTTCATGTTTGGAGATTTCTCAAACCCTGACATCTACGGG
AACCGTTTCTTGGATCACAAGTTACCGAAGCTGAGCTCTCCAACTTCAGAGACCAGAGTT
ATCGGAAACAAAAGAGAACGATTGGACTATTCTGAAGAGATGATCAACACTTCGAAGAAG
ATGATCAACAACTTTAGTTACAATAATAGCATGGATCATTTGGATCATAGTATGGTTCAA
CAATCTAGTTTTCTGAATCAGGAATTCTTGATGAGTCCTCCTCACCTTCACTATCAAGGC
TAGAGATGTTCAAAACCCAATTATGCGAATTAGAGCCCATTTGATGATTGAAAAGTAGGA
GTCGTTACTATTATATAAAATTACAAAAGTATTGTGGGGAGGGGGGAAATATATAAAATA
GTGGTAGTCGATATTTGATCGTATCAATACAACCATATTTTG

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 6

CO CL1381Contig1 960 6 21 U
GGAAAATCAAAAGTTGCTCACAGAGTCTTTAACTTTCAGAGAAAAAAAAATCAAAAACGC
AATCTTTACTCACAGATTCAACAGAGAGATGTGGAAAAAATTGAATTTCTAATCTTAAAG
AGAGGGCGAGAGAGAACTCGGTGAAATGGCGATTTTATCGTCGGCTACGTTCGGAACCTA
CCGGCCGATGAAGACGGAGCTTAGACCAATTACACGGTGGAGAGTGAAGTGTCAGGTGTC
ATCCGTAAAACCCGCCACGTATTCGTCAAGACTCTCCACAGATATTCCTCTCCACGAGGC
TCCTCAGGCGTTGTTCGATGACTATTTGGAGAATACACCGAGAGTGTTCGAAGCAATGTT
CCCTGATAAACCCAGAAGCCATAAACTCAACGAGGAAGAGTGGAGGATACAGATGTTACC
AATTAACTTCCTCTTCCTCACTGTGTGGCCTGTGGTGGATATGCGTTTGAGTTGCAAATC
CAACGGTCAGGATTACCCCGCAGACGTACCTTTAGACATAACCAAAGTTGTTGAGCTCAA
CGTGACGAGATGGCAGCTCAAAGGGCTTGACCGAGTGATGGAACCGTCTGACTTTAGTTT
GGGAGTCAAAGGAGCATTGTACCCAGACCGGAGAGGAAAACACACAAGGCTCAGAGGTCA
GCTAGAGATGAACATAAGCTTTGTTCTTCCTCCGGTTCTTGAATTGGTACCTGAAGACGT
TAGGAGAAACGTGGCCAATGCGGTTTTGACCGGTTTAGTGGATAATATGAAGCATAAGGT
TAATGGGAGTTTGCTCGCTGATTATGGCAGGTTCAAGAATGAGAGAAGATTACACAAGTT
ATCTACTAAAGCCGAGTTTTAATGTCAATGCTCAACCATGTATAGTTTCTCAATCCAACA
TGAACAAATCGTTTATGAGTACAGTCAACGTAACATACTATATAAGATTTTGATTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2G410TF U 20
AF RR2CG40TF U 1
AF RR2G494TF U 20
AF RR2G410JQ C 248
AF RR2G494JQ C 183
AF RR2CG40JQ C 256
BS 1 451 RR2CG40TF
BS 452 452 RR2G410TF
BS 453 541 RR2CG40TF
BS 542 542 RR2G410TF
BS 543 563 RR2CG40TF
BS 564 564 RR2G410TF
BS 565 648 RR2CG40TF
BS 649 649 RR2G494JQ
BS 650 682 RR2CG40TF
BS 683 714 RR2G494TF
BS 715 715 RR2G494JQ
BS 716 723 RR2G494TF
BS 724 724 RR2G494JQ
BS 725 736 RR2G494TF
BS 737 737 RR2G494JQ
BS 738 764 RR2G494TF
BS 765 765 RR2G494JQ
BS 766 778 RR2G494TF
BS 779 779 RR2G494JQ
BS 780 806 RR2G494TF
BS 807 960 RR2G494JQ

RD RR2G410TF 624 0 0
GG
AGAGTCTTTAACTTTCAGAGAAAAAAAAATCAAAAACGCAATCTTTACTCACAGATTCAA
CAGAGAGATGTGGAAAAAATTGAATTTCTAATCTTAAAGAGAGGGCGAGAGAGAACTCGG
TGAAATGGCGATTTTATCGTCGGCTACGTTCGGAACCTACCGGCCGATGAAGACGGAGCT
TAGACCAATTACACGGTGGAGAGTGAAGTGTCAGGTGTCATCCGTAAAACCCGCCACGTA
TTCGTCAAGACTCTCCACAGATATTCCTCTCCACGAGGCTCCTCAGGCGTTGTTCGATGA
CTATTTGGAGAATACACCGAGAGTGTTCGAAGCAATGTTCCCTGATAAACCCAGAAGCCA
TAAACTCAACGAGGAAGAGTGGAGGATACAGATGTTACCAATTAACTTCCTCTTCCTCAC
TGTGTGGCCTGTGGTGGATATGCGTTTGAGTTGCAAATCCAACGGTCAGGATTACCCCGC
AGACGTACCTTTAGACATAACCAAAGTTGTTGAGCTCAACGTGACGAGATGGCAGCTCAA
AGGGCTTGACCGAGTGATGGAACCGTCTGACTTTAGTTTGGGAGTCAAAGGAGCATTGTA
CCCAGACCGGAGAGGAAAACAC

QA 3 624 3 624
DS 

RD RR2CG40TF 682 0 0
GGAAAATCAAAAGTTGCTCACAGAGTCTTTAACTTTCAGAGAAAAAAAAATCAAAAACGC
AATCTTTACTCACAGATTCAACAGAGAGATGTGGAAAAAATTGAATTTCTAATCTTAAAG
AGAGGGCGAGAGAGAACTCGGTGAAATGGCGATTTTATCGTCGGCTACGTTCGGAACCTA
CCGGCCGATGAAGACGGAGCTTAGACCAATTACACGGTGGAGAGTGAAGTGTCAGGTGTC
ATCCGTAAAACCCGCCACGTATTCGTCAAGACTCTCCACAGATATTCCTCTCCACGAGGC
TCCTCAGGCGTTGTTCGATGACTATTTGGAGAATACACCGAGAGTGTTCGAAGCAATGTT
CCCTGATAAACCCAGAAGCCATAAACTCAACGAGGAAGAGTGGAGGATACAGATGTTACC
AATTAACTTCCTCTTCCTCACTGTGTGGCCTTTGGTGGATATGCGTTTGAGTTGCAAATC
CAACGGTCAGGATTACCCCGCAGACGTACCTTTAGACATAACCAAAGTTGTTGAGCTCAA
CATGACGAGATGGCAGCTCAAAGAGCTTGACCGAGTGATGGAACCGTCTGACTTTAGTTT
GGGAGTCAAAGGAGCATTGTACCCAGACCGGAGAGGAAAACACACAAG*CTCAGAGGTCA
GCTAGAGATGAACATAAGCTTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2G494TF 787 0 0
GG
AGAGTCTTTAACTTTCAGAGAAAAAAAAATCAAAAACGCAATCTTTACTCACAGATTCAA
CAGAGAGATGTGGAAAAAATTGAATTTCTAATCTTAAAGAGAGGGCGAGAGAGAACTCGG
TGAAATGGCGATTTTATCGTCGGCTACGTTCGGAACCTACCGGCCGATGAAGACGGAGCT
TAGACCAATTACACGGTGGAGAGTGAAGTGTCAGGTGTCATCCGTAAAACCCGCCACGTA
TTCGTCAAGACTCTCCACAGATATTCCTCTCCACGAGGCTCCTCAGGCGTTGTTCGATGA
CTATTTGGAGAATACACCGAGAGTGTTCGAAGCAATGTTCCCTGATAAACCCAGAAGCCA
TAAACTCAACGAGGAAGAGTGGAGGATACAGATGTTACCAATTAACTTCCTCTTCCTCAC
TGTGTGGCCTGTGGTGGATATGCGTTTGAGTTGCAAATCCAACGGTCAGGATTACCCCGC
AGACGTACCTTTAGACATAACCAAAGTTGTTGAGCTCAACGTGACGAGATGGCAGCTCAA
AGGGCTTGACCGAGTGATGGAACCGTCTGACTTTAGTTTGGGAGTCAAAGGAGCATTGTA
CCCAGACCGGAGAGGAAAACACACAAG*CTCAGAGGTCAGCTAGAGATGAACATAAGCTT
TGTTCTTCCTCCGGTTCTTGAATTGGTACCTGA*GACGTTAG*AGAAACGTGGCCCATGC
GGTTTTGACCGGTTTAGTGGATA*TATGAAGCATAAG*TTAATGGGAGTTTGCTCGCTGA
TTATG

QA 3 787 3 787
DS 

RD RR2G410JQ 598 0 0
AAACCCGCCACGTATTCGTCAAGACTCTCCACAGATATTCCTCTCCACGAGGCTCCTCAG
GCGTTGTTCGATGACTATTTGGAGAATACACCGAGAGTGTTCGAAGCAATGTTCCCTGAT
AAACCCAGAAGCCATAAACTCAACGAGGAAGAGTGGAGGATACAGATGTTACCAATTAAC
TTCCTCTTCCTCACTGTGTGGCCTGTGGTGGATATGCGTTTGAGTTGCAAATCCAACGGT
CAGGATTACCCCGCAGACGTACCTTTAGACATAACCAAAGTTGTTGAGCTCAACGTGACG
AGATGGCAGCTCAAAGGGCTTGACCGAGTGATGGAACCGTCTGACTTTAGTTTGGGAGTC
AAAGGAGCATTGTACCCAGACCGGAGAGGAAAACACACAAGGCTCAGAGGTCAGCTAGAG
ATGAACATAAGCTTTGTTCTTCCTCCGGTTCTTGAATTGGTACCTGAAGACGTTAGGAGA
AACGTGGCCAATGCGGTTTTGACCGGTTTAGTGGATAATATGAAGCATAAGGTTAATGGG
AGTTTGCTCGCTGATTATGGCAGGTTCAAGAATGAGAGAAGATTACACAAGTTATCTA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2G494JQ 778 0 0
GGCCGATGAAGACGGAGCTTAGACCAATTACACGGTGGAGAGTGAAGTGTCAGGTGTCAT
CCGTAAAACCCGCCACGTATTCGTCAAGACTCTCCACAGATATTCCTCTCCACGAGGCTC
CTCAGGCGTTGTTCGATGACTATTTGGAGAATACACCGAGAGTGTTCGAAGCAATGTTCC
CTGATAAACCCAGAAGCCATAAACTCAACGAGGAAGAGTGGAGGATACAGATGTTACCAA
TTAACTTCCTCTTCCTCACTGTGTGGCCTGTGGTGGATATGCGTTTGAGTTGCAAATCCA
ACGGTCAGGATTACCCCGCAGACGTACCTTTAGACATAACCAAAGTTGTTGAGCTCAACG
TGACGAGATGGCAGCTCAAAGGGCTTGACCGAGTGATGGAACCGTCTGACTTTAGTTTGG
GAGTCAAAGGAGCATTGTACCCAGACCGGAGAGGAAAACACACAAGGCTCAGAGGTCAGC
TAGAGATGAACATAAGCTTTGTTCTTCCTCCGGTTCTTGAATTGGTACCTGAAGACGTTA
GGAGAAACGTGGCCAATGCGGTTTTGACCGGTTTAGTGGATAATATGAAGCATAAGGTTA
ATGGGAGTTTGCTCGCTGATTATGGCAGGTTCAAGAATGAGAGAAGATTACACAAGTTAT
CTACTAAAGCCGAGTTTTAATGTCAATGCTCAACCATGTATAGTTTCTCAATCCAACATG
AACAAATCGTTTATGAGTACAGTCAACGTAACATACTATATAAGATTTTGATTGTTTT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2CG40JQ 705 0 0
CACGTATTCGTCAAGACTCTCCACAGATATTCCTCTCCACGAGGCTCCTCAGGCGTTGTT
CGATGACTATTTGGAGAATACACCGAGAGTGTTCGAAGCAATGTTCCCTGATAAACCCAG
AAGCCATAAACTCAACGAGGAAGAGTGGAGGATACAGATGTTACCAATTAACTTCCTCTT
CCTCACTGTGTGGCCTTTGGTGGATATGCGTTTGAGTTGCAAATCCAACGGTCAGGATTA
CCCCGCAGACGTACCTTTAGACATAACCAAAGTTGTTGAGCTCAACATGACGAGATGGCA
GCTCAAAGAGCTTGACCGAGTGATGGAACCGTCTGACTTTAGTTTGGGAGTCAAAGGAGC
ATTGTACCCAGACCGGAGAGGAAAACACACAAGGCTCAGAGGTCAGCTAGAGATGAACAT
AAGCTTTGTTCTTCCTCCGGTTCTTGAATTGGTACCTGAAGACGTTAGGAGAAACGTGGC
CAATGCGGTTTTGACCGGTTTAGTGGATAATATGAAGCATAAGGTTAATGGGAGTTTGCT
CGCTGATTATGGCAGGTTCAAGAATGAGAGAAGATTACACAAGTTATCTACTAAAGCCGA
GTTTTAATGTCAATGCTCAACCATGTATAGTTTCTCAATCCAACATGAACAAATCGTTTA
TGAGTACAGTCAACGTAACATACTATATAAGATTTTGATTGTTTT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 6

CO CL1382Contig1 694 6 7 U
TTGGAATGGCGTCGCTGCAAAGCTCAGGGATGTTGACGAAAGAGCAGATGGTTTATCTCT
TTGATCGATTCGATTACTTGACCTCGCAATCTGATGTGAAGAAAAGAATCTCCGACGCCG
TTGAGGATAAACAGGAAGCTGTAGCGGTCACAACTGCAATTCAAGAGGAGATATTCTTGG
AGATGGGAATTGACCCAGGATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTCAACTCTGCGTTTG
AAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAA*******GGAGGAG
ATGGCGTGTGAAGAAGCTGAGCTTGGACCAGATGGTTTTCAACAGAAAATGGAAGCACAA
CAGCAATTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCCTCTGGAC
GACCAATCTGCTATCCTTAAAAAGCTTCAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTTCGAGCCT
GAGGCATCCCTTTTGTCAGGAGAGCAATTGGAGGAAGCTGGAAGAAGAAGAGTTTCACCA
GTTTTTGGAAGCAGATGATAGCTTTCTCGTTTCTCAC*AAGCCACTTCAATTTGTAAACT
GTCTCTGTCTCTTTTCACTTCCATATACTTAAC*CTTTTTAGATGCAAATGTAAACAAAT
AATTTGGTTGAACTTTTCATTTGTATGGGAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2E718JQ C 237
AF RR2FL52TF U 1
AF RR2GM56JQ C 4
AF RR2GM56TF U 4
AF RR2E718TF U 10
AF RR2FL52JQ C 241
BS 1 529 RR2FL52TF
BS 530 654 RR2GM56TF
BS 655 655 RR2E718TF
BS 656 670 RR2GM56TF
BS 671 671 RR2E718TF
BS 672 672 RR2FL52JQ
BS 673 694 RR2E718TF

RD RR2E718JQ 177 0 0
TTTGAAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAA*******GGA
GGAGATGGCGTGTGAAGAAGCTGAGCTTGGCCCAGATGGTTTTCAACAGAAAAGGGAAGC
ACAACAGCAATTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGGGTAAGTTTCC

QA 1 177 1 177
DS 

RD RR2FL52TF 529 0 0
TTGGAATGGCGTCGCTGCAAAGCTCAGGGATGTTGACGAAAGAGCAGATGGTTTATCTCT
TTGATCGATTCGATTACTTGACCTCGCAATCTGATGTGAAGAAAAGAATCTCCGACGCCG
TTGAGGATAAACAGGAAGCTGTAGCGGTCACAACTGCAATTCAAGAGGAGATATTCTTGG
AGATGGGAATTGACCCAGGATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTCAACTCTGCGTTTG
AAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAA*******GGAGGAG
ATGGCGTGTGAAGAAGCTGAGCTTGGACCAGATGGTTTTCAACAGAAAATGGAAGCACAA
CAGCAATTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCCTCTGGAC
GACCAATCTGCTATCCTTAAAAAGCTTCAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTTCGAGCCT
GAGGCATCCCTTTTGTCAGGAGAGCAATTGGAGGAAGCTGGAAGAAGAA

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2GM56JQ 667 0 0
GAATGGCGTCGCTGC
AAAGCTCAGGGATGTTGACGAAAGAGCAGATGGTTTATCTCTTTGATCGATTCGATTACT
TGACCTCGCAATTTGATGTGAAGAAAAGAATCTCCGACGCCGTTGAGGATAAACAGGAAG
CTGTAGCGGTCACAACTGCAATTCAAGAGGAGATATTCTTGGAGATGGGAATTGACCCAG
GATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTCAACTTTGCGTTTGAAAACGATAAAGAGTTGA
TGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAATTAATAGGGAGGAGATGGCGTGTGAAGAAGCT
GAGCTTGGACCAGATGGTTTTCAACAGAAAATGGAAGCACAACAGCAATTACATGAACAG
CAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCCTCTGGACGACCAATTTGCTATCCTT
AAAAAGCTTCAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTTCGAGCCTGAGGCATCCCTTTTGTCA
GGAGAGTAATTGGAGGAAGCTGGAAGAAGAAGAGTTTCACCAGTTTTTGGAAGCAGATGA
TAGCTTTCTCGTTTCTCACTAAGCCACTTCAATTTGTAAACTGTCTCTGTCTCTTTTCAC
TTCCATATACTTAACTCTTTTTAGATGCAAATGTAAACAAATAATTTGGTTG

QA 16 667 16 667
DS 

RD RR2GM56TF 667 0 0
GAATGGCGTCGCTGC
AAAGCTCAGGGATGTTGACGAAAGAGCAGATGGTTTATCTCTTTGATCGATTCGATTACT
TGACCTCGCAATCTGATGTGAAGAAAAGAATCTCCGACGCCGTTGAGGATAAACAGGAAG
CTGTAGCGGTCACAACTGCAATTCAAGAGGAGATATTCTTGGAGATGGGAATTGACCCAG
GATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTCAACTCTGCGTTTGAAAACGATAAAGAGTTGA
TGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAATTAATAGGGAGGAGATGGCGTGTGAAGAAGCT
GAGCTTGGACCAGATGGTTTTCAACAGAAAATGGAAGCACAACAGCAATTACATGAACAG
CAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCCTCTGGACGACCAATCTGCTATCCTT
AAAAAGCTTCAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTTCGAGCCTGAGGCATCCCTTTTGTCA
GGAGAGTAATTGGAGGAAGCTGGAAGAAGAAGAGTTTCACCAGTTTTTGGAAGCAGATGA
TAGCTTTCTCGTTTCTCAC*AAGCCACTTCAATTTGTAAACTGTCTCTGTCTCTTTTCAC
TTCCATATACTTAAC*CTTTTTAGATGCAAATGTAA*CAAATAATTTGGTTG

QA 16 667 16 667
DS 

RD RR2E718TF 685 0 0
GGGTCGCTG
AAAGCTCAGGGATGTTGACGAAAGAGCAGATGGTTTATCTCTTTGATCGATTCGATTACT
TGACCTCGCAATCTGATGTGAAGAAAAGAATCTCCGACGCCGTTGAGGATAAACAGGAAG
CTGTAGCGGTCACAACTGCAATTCAAGAGGAGATATTCTTGGAGATGGGAATTGACCCAG
GATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTCAACTCTGCGTTTGAAAACGATAAAGAGTTGA
TGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAA*******GGAGGAGATGGCGTGTGAAGAAGCT
GAGCTTGGACCAGATGGTTTTCAACAGAAAATGGAAGCACAACAGCAATTACATGAACAG
CAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCCTCTGGACGACCAATCTGCTATCCTT
AAAAAGCTTCAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTTCGAGCCTGAGGCATCCCTTTTGTCA
GGAGAGCAATTGGAGGAAGCTGGAAGAAGAAGAGTTTCACCAGTTTTTGGAAGCAGATGA
TAGCTTTCTCGTTTCTCAC*AAGCCACTTCAATTTGTAAACTGTCTCTGTCTCTTTTCAC
TTCCATATACTTAAC*CTTTTTAGATGCAAATGTAAACAAATAATTTGGTTGA*CTTTTC
ATTTGTATGGGAAATG

QA 10 685 10 685
DS 

RD RR2FL52JQ 449 0 0
AAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAA*******GGAGGAG
ATGGCGTGTGAAGAAGCTGAGCTTGGACCAGATGGTTTTCAACAGAAAATGGAAGCACAA
CAGCAATTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCCTCTGGAC
GACCAATCTGCTATCCTTAAAAAGCTTCAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTTCGAGCCT
GAGGCATCCCTTTTGTCAGGAGAGCAATTGGAGGAAGCTGGAAGAAGAAGAGTTTCACCA
GTTTTTGGAAGCAGATGATAGCTTTCTCGTTTCTCAC*AAGCCACTTCAATTTGTAAACT
GTCTCTGTCTCTTTTCACTTCCATATACTTAAC*CTTTTTAGATGCAAATGTAAACAAAT
AATTTGGTTGAACTTTTCATTTGTATGGG

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 4

CO CL1383Contig1 1216 4 36 U
GGCTCTCCTCTCTCGCCTAACACTTACCACACACTTTTCACGCCTTTCATCATCCTCCTT
TCTCTTCCCAAACTTCTTTTTTCTTCTCAGTTAAAATTTTTATTTTCAGTTCTCTTTTTA
AATTAAATCTATGTTCTAGCTCGTATCACCATATTTCTCTGGCAATAGAAGCTGTACAGT
TAAGCTTAAGGTAAAAACAAATTTTCATTTATTTTTTTTGGATCGAAAAAAAAAAAAAGA
AAACGATGAATCACTGGGCGGTTCAACCAAACGCTTTCGCTGCGGGTGGAGATCTGAGGA
ACTCCGTGTCAGTGGTGGAAAGAGACCAGGCTGTTGTCGTTTGTCCAAAACCACGTCGTA
TTGGTCTTCGTAACCCTCTCCACTGTCCTTCTCGATCTCTGCGATGTTACAACCACCAAG
TTGAATCGAAGGCAGAGGCTGATATCTTAGATATCATTCTGACAAAGGATGGTTATGGTA
CGGAACAAGTTCACCAAACGCAGGTATTAGACCCGCCGTCCCCGTTTTTATGTGGGTCGC
CGCCGAGCAGAGTCGCTAACCCTTTAACACAGGATGCTCGATTCAGAGATGAAATCTTTT
CTTCGCCGATCCCGACTCCGCTGGGCCAACCTCCCTCGTCTCCTTCTTCTTCTTCCTCTG
GGAGGAAAGGAGGATGTGTTAGAGGCAATTTTGGTAACAGCCCAGCGGTTAGGATCGAA*
GGGTTTGATTGCCTCGATAGGGACAGTAGAAACTGCAGCATCCCTACCTTGGCTTAGAAA
CCACAAACCTCAAAGAACTAACCACACATACTCCGTTGAATTTAAACTTCACAAAAACCA
GTTAGTGCGTCGTACATAAA*TGTTGTTAAATGATATGGAGATGTGTGGAATGAGTCTTT
TGAGTGAAGTTGAGAAAGTACAAGAGATCGATCATTTGGAGTTTTTTTTCTTCTAAGAGT
GTAAATAGGTGACGAAGTACGCAGTTTTCTTGGGTTAAGTATGTAGTATTTGTCGTCATT
TTGTAAAGTATTAATATTCGGAAAGTCAGGTTCTCTTCTATGGTTATGTAAAGAGATGGA
GATAGAAGAGGAGGGTATTTTGGGTATTTTTCGTTTGTAGTTTTCTTTTCTGTTGGAGTG
TCGGTTACGAAGATGAGGAAACAAATTTGTACAAAAAGAAAGAATTGAAATGATATAAAA
TATTTTACTTTGGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2AL07TF U 1
AF RR2BB48TF U 149
AF RR2BB48JQ C 356
AF RR2AL07JQ C 650
BS 1 218 RR2AL07TF
BS 219 219 RR2BB48TF
BS 220 233 RR2AL07TF
BS 234 234 RR2BB48TF
BS 235 289 RR2AL07TF
BS 290 290 RR2BB48TF
BS 291 359 RR2AL07TF
BS 360 360 RR2BB48TF
BS 361 367 RR2AL07TF
BS 368 368 RR2BB48TF
BS 369 383 RR2AL07TF
BS 384 385 RR2BB48TF
BS 386 400 RR2AL07TF
BS 401 401 RR2BB48TF
BS 402 403 RR2AL07TF
BS 404 404 RR2BB48TF
BS 405 427 RR2AL07TF
BS 428 428 RR2BB48TF
BS 429 480 RR2AL07TF
BS 481 481 RR2BB48TF
BS 482 492 RR2AL07TF
BS 493 493 RR2BB48TF
BS 494 512 RR2AL07TF
BS 513 513 RR2BB48TF
BS 514 584 RR2AL07TF
BS 585 585 RR2BB48TF
BS 586 711 RR2AL07TF
BS 712 712 RR2BB48TF
BS 713 719 RR2AL07TF
BS 720 720 RR2BB48TF
BS 721 775 RR2AL07TF
BS 776 940 RR2BB48TF
BS 941 1174 RR2BB48JQ
BS 1175 1175 RR2AL07JQ
BS 1176 1213 RR2BB48JQ
BS 1214 1216 RR2AL07JQ

RD RR2AL07TF 775 0 0
GGCTCTCCTCTCTCGCCTAACACTTACCACACACTTTTCACGCCTTTCATCATCCTCCTT
TCTCTTCCCAAACTTCTTTTTTCTTCTCAGTTAAAATTTTTATTTTCAGTTCTCTTTTTA
AATTAAATCTATGTTCTAGCTCGTATCACCATATTTCTCTGGCAATAGAAGCTGTACAGT
TAAGCTTAAGGTAAAAACAAATTTTCATTTATTTTTTT*GGATCGAAAAAAAAGAAAAGA
AAACGATGAATCACTGGGCGGTTCAACCAAACGCTTTCGCTGCGGGTGGTGATCTGAGGA
ACTCCGTGTCAGTGGTGGAAAGAGACCAGGCTGTTGTCGTTTGTCCAAAACCACGTCGTG
TTGGTCTCCGTAACCCTCTCCACCATCCTTCTCGATCTCTTCGGTGTTACAACCACCAAG
TTGAATCCAAGGCAGAGGCTGATATCTTAGATATCATTCTGACAAAGGATGGTTATGGTA
TGGAACAAGTTCCCCAAACGCAGGTATTAGACTCGCCGTCCCCGTTTTTATGTGGGTCGC
CGCCGAGCAGAGTCGCTAACCCTTTAACACAGGATGCTCGATTCCGAGATGAAATCTTTT
CTTCGCCGATCCCGACTCCGCTGGGCCAACCTCCCTCGTCTCCTTCTTCTTCTTCCTCTG
GGAGGAAAGGAGGATGTGTTAGAGGCAATTTTGGTAACAGCCCAGCGGTTATGATCGAAA
GGGTTTGATTGCCTCGATAGGGACAGTAGAAACTGCAGCATCCCTACCTTGGCTT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2BB48TF 792 0 0
GGATAGC
TCTCTGGCAATAGAGGCTGTACAGTTAAGCTTAAGGTAAAAACAAATTTTCATTTATTTT
TTTTGGATCGGAAAAAAAAAAAAGAAAACGATGAATCACTGGGCGGTTCAACCAAACGCT
TTCGCTGCGGGTGGAGATCTGAGGAACTCCGTGTCAGTGGTGGAAAGAGACCAGGCTGTT
GTCGTTTGTCCAAAACCACGTCGTATTGGTCTTCGTAACCCTCTCCACTGTCCTTCTCGA
TCTCTGCGATGTTACAACCACCAAGTTGAATCGAAGGCAGAGGCTGATATCTTAGATATC
ATTCTGACAAAGGATGGTTATGGTACGGAACAAGTTCACCAAACGCAGGTATTAGACCCG
CCGTCCCCGTTTTTATGTGGGTCGCCGCCGAGCAGAGTCGCTAACCCTTTAACACAGGAT
GCTCGATTCAGAGATGAAATCTTTTCTTCGCCGATCCCGACTCCGCTGGGCCAACCTCCC
TCGTCTCCTTCTTCTTCTTCCTCTGGGAGGAAAGGAGGATGTGTTAGAGGCAATTTTGGT
AACAGCCCAGCGGTTAGGATCGAA*GGGTTTGATTGCCTCGATAGGGACATTAGAAACTG
CAGCATCCCTACCTTGGCTTAGAAACCACAAACCTCAAAGAACTAACCACACATACTCCG
TTGAATTTAAACTTCACAAAAACCAGTTAGTGCGTCGTACATAAA*TGTTGTTAAATGAT
ATGGAGATGTGTGGAATGAGTCTTTTGAGTGAAGTTGAGAAAGTACAAGAGATCGATCAT
TTGGA

QA 8 792 8 792
DS 

RD RR2BB48JQ 858 0 0
TCGTATTT
GTCTTCGTAACCCTCTCCACTGTCCTTCTCGATCTCTGCGATGTTACAACCACCAAGTTG
AATCGAAGGCAGAGGCTGATATCTTAGATATCATTCTGACAAAGGATGGTTATGGTACGG
AACAAGTTCACCAAACGCAGGTATTAGACCCGCCGTCCCCGTTTTTATGTGGGTCGCCGC
CGAGCAGAGTCGCTAACCCTTTAACACAGGATGCTCGATTCAGAGATGAAATCTTTTCTT
CGCCGATCCCGACTCCGCTGGGCCAACCTCCCTCGTCTCCTTCTTCTTCTTCCTCTGGGA
GGAAAGGAGGATGTGTTAGAGGCAATTTTGGTAACAGCCCAGCGGTTAGGATCGAA*GGG
TTTGATTGCCTCGATAGGGACATTAGAAACTGCAGCATCCCTACCTTGGCTTAGAAACCA
CAAACCTCAAAGAACTAACCACACATACTCCGTTGAATTTAAACTTCACAAAAACCAGTT
AGTGCGTCGTACATAAA*TGTTGTTAAATGATATGGAGATGTGTGGAATGAGTCTTTTGA
GTGAAGTTGAGAAAGTACAAGAGATCGATCATTTGGAGTTTTTTTTCTTCTAAGAGTGTA
AATAGGTGACGAAGTACGCAGTTTTCTTGGGTTAAGTATGTAGTATTTGTCGTCATTTTG
TAAAGTATTAATATTCGGAAAGTCAGGTTCTCTTCTATGGTTATGTAAAGAGATGGAGAT
AGAAGAGGAGGGTATTTTGGGTATTTTTCGTTTGTAGTTTTCTTTTCTGTTGGAGTGTCG
GTTACGAAGATGAGGAAACAAATTTGTACAAGAAGAAAGAATTGAAATGATATAAAATAT
TTTACTTTGG

QA 9 858 9 858
DS 

RD RR2AL07JQ 567 0 0
TTCTTCCTCTGGGAGGAAAGGAGGATGTGTTAGAGGCAATTTTGGTAACAGCCCAGCGGT
TAGGATCGAA*GGGTTTGATTGCCTCGATAGGGACAGTAGAAACTGCAGCATCCCTACCT
TGGCTTAGAAACCACAAAACTCAATGAACTAACCACACATACTCCGTTGAATTTAAT*TT
CATAAAAACCAGTTAGTGCGTCGTACATAAAATGTTGTTAAATGATATGGAGATGTGTGG
AATGAGTCTTT*GAGTGAAGTTGAGAAAGTACAAGAGATCGATCATTTGGAGTTTTTTTT
TTTCTAAGAGTGTAAATAGGTGACGAAGTACGCAGTTTTCTTGGGTTAAGTATGTAGTAT
TTGTCGTCATTTTGTAAAGTATTAATATTCGGAAGGTCAGGTTCTCTTCTATGGTTATGT
AAAGAGATGGAGATAGAAGAGGAGGGTATTTTGGGTATTTT*CGTTTGTAGTTTTCTTTT
CTGTTGGAGTGTCGGTTACGAAGATGAGGAAACAAATTTGTACAAAAAGAAAGAATTGAA
ATGATATAAAATATTTTACTTTGGAAG

QA 1 567 1 567
DS 



AS 2 5

CO CL1384Contig1 997 3 2 U
GGGAACGTATAGACAAAAAAAAGCTTAGCAACACAACTCAACTCCACACACCACAAACAA
ACAAAGCAAAAGAAAGCAGACCCCACTAGTTGAAGGAGAGAGCTCGAGAACCTTTGGAGT
GAACGAACCAACACCTAACCCACTCCTTCGATTTTTTTTTCATTTGCTGTTAGTTCACAA
TCCATTGATCATGCCGTCTGGTGCCAAGAAGAGAAAGGCCCTGAAGAAAAAGAAGGAACA
AGAAGCCTTTGGAGGCAGTCCAAGCAACAAAACCTTCAATGGTCATGGGTATGATGAACA
TCATGGAAGCCAAGATGAAGGAGAAAGTGATGGCAACTTGAGTTCCCCTGGTTCTCAAGG
AAACGGAGAAATCTGGACAAGAGATCCATCACCTTCTCCTTTATCTGGTCTGAGGAAGGA
CACTTTTAAAGAGAAAACAGACGTTCCTCAGGAACAAGAAGCTGAAGGTGAAGACGTTGC
TGCTGCTGCACTTGGAAGGGGCACATGTCACGAGGAGAAGAACGGTGTGAACGGAAAAGC
TTTGGAAATTGCACCTGCTGATGATGCTTCTGTCGAGCCTGTGGACTCTTCTGTTTCAGA
GATTGTGATTACCAACAAAAATGAGCAAGCTGAAAGCTCGACAGACTCAGATTCTGTCCA
ACATAAGGCTAACGAAAGTCAAGAGAAGCGTAGACTGGAAGAATCAAAGGAGGGTAACAT
CACAGGATCTGCTGCAGAAACATCTCAAGTGCCAGAATGTTCTGAAGAAAAGAGTCATCT
CCCTTCTGGTGGTCCACCAGTTGCTCGAACCTCGTGGTTTAGTTGCTGCGGTTTGTTTGA
TGTGATGGCAGGGTCAGAAAGATAATACAGAACATGAGGAGGAAATCATTCAGCAAACAG
TGGGCATCAAAAGCTACATGGTCATCACTAGATTATTTTCTGTACATTCAGCCATTAATG
TCTCTGCTAGATAATAATGAGAGTGTTTTGAAAAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C735TF U 1
AF RR2GZ65TF U 313
AF RR2C735JQ C 397
BS 1 695 RR2C735TF
BS 696 997 RR2GZ65TF

RD RR2C735TF 695 0 0
GGGAACGTATAGACAAAAAAAAGCTTAGCAACACAACTCAACTCCACACACCACAAACAA
ACAAAGCAAAAGAAAGCAGACCCCACTAGTTGAAGGAGAGAGCTCGAGAACCTTTGGAGT
GAACGAACCAACACCTAACCCACTCCTTCGATTTTTTTTTCATTTGCTGTTAGTTCACAA
TCCATTGATCATGCCGTCTGGTGCCAAGAAGAGAAAGGCCCTGAAGAAAAAGAAGGAACA
AGAAGCCTTTGGAGGCAGTCCAAGCAACAAAACCTTCAATGGTCATGGGTATGATGAACA
TCATGGAAGCCAAGATGAAGGAGAAAGTGATGGCAACTTGAGTTCCCCTGGTTCTCAAGG
AAACGGAGAAATCTGGACAAGAGATCCATCACCTTCTCCTTTATCTGGTCTGAGGAAGGA
CACTTTTAAAGAGAAAACAGACGTTCCTCAGGAACAAGAAGCTGAAGGTGAAGACGTTGC
TGCTGCTGCACTTGGAAGGGGCACATGTCACGAGGAGAAGAACGGTGTGAACGGAAAAGC
TTTGGAAATTGCACCTGCTGATGATGCTTCTGTCGAGCCTGTGGACTCTTCTGTTTCAGA
GATTGTGATTACCAACAAAAATGAGCAAGCTGAAAGCTCGACAGACTCAGATTCTGTCCA
ACATAAGGCTAACGAAAGTCAAGAGAAGCGTAGAC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2GZ65TF 685 0 0
AGATGAAGGAGAAAGTGATGGCAACTTGAGTTCCCCTGGTTCTCAAGGAAACGGAGAAAT
CTGGACAAGAGATCCATCACCTTCTCCTTTATCTGGTCTGAGGAAGGACACTTTTAAAGA
GAAAACAGACGTTCCTCAGGAACAAGAAGCTGAAGGTGAAGACGTTGCTGCTGCTGCACT
TGGAAGGGGAACATGTCACGAGGAGAAGGACGGTGTGAACGGAAAAGCTTTGGAAATTGC
ACCTGCTGATGATGCTTCTGTCAAGCCTGTGGACTCTTCTGTTTCAGAGATTGTGATTAC
CAACAAAAATGAGCAAGCTGAAAGCTCGACAGACTCAGATTCTGTCCAACATAAGGCTAA
CGAAAGTCAAGAGAAGCGTAGACTGGAAGAATCAAAGGAGGGTAACATCACAGGATCTGC
TGCAGAAACATCTCAAGTGCCAGAATGTTCTGAAGAAAAGAGTCATCTCCCTTCTGGTGG
TCCACCAGTTGCTCGAACCTCGTGGTTTAGTTGCTGCGGTTTGTTTGATGTGATGGCAGG
GTCAGAAAGATAATACAGAACATGAGGAGGAAATCATTCAGCAAACAGTGGGCATCAAAA
GCTACATGGTCATCACTAGATTATTTTCTGTACATTCAGCCATTAATGTCTCTGCTAGAT
AATAATGAGAGTGTTTTGAAAAGAT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2C735JQ 600 0 0
TCCTTTATCTGGTCTGAGGAAGGACACTTTTAAAGAGAAAACAGACGTTCCTCAGGAACA
AGAAGCTGAAGGTGAAGACGTTGCTGCTGCTGCACTTGGAAGGGGCACATGTCACGAGGA
GAAGAACGGTGTGAACGGAAAAGCTTTGGAAATTGCACCTGCTGATGATGCTTCTGTCGA
GCCTGTGGACTCTTCTGTTTCAGAGATTGTGATTACCAACAAAAATGAGCAAGCTGAAAG
CTCGACAGACTCAGATTCTGTCCAACATAAGGCTAACGAAAGTCAAGAGAAGCGTAGACT
GGAAGAATCAAAGGAGGGTAACATCACAGGATCTGCTGCAGAAACATCTCAAGTGCCAGA
ATGTTCTGAAGAAAAGAGTCATCTCCCTTCTGGTGGTCCACCAGTTGCTCGAACCTCGTG
GTTTAGTTGCTGCGGTTTGTTTGATGTGATGGCAGGGTCAGAAAGATAATACAGAACATG
AGGAGGAAATCATTCAGCAAACAGTGGGCATCAAAAGCTACATGGTCATCACTAGATTAT
TTTCTGTACATTCAGCCATTAATGTTTCTGCTAGATAATAATGAGAGTGTTTT
TGAAAAA

QA 1 593 1 593
DS 



CO CL1384Contig2 1078 2 16 U
GGGATCATGCCGTCTGGTGCCAAGAAGAGAAAGGCCTTGAAGAAAAAGAAGGAACAAGAA
GCCTTTGGAGGCAGTCCAAGCAACAAAGATTTCAATGGTCATGGGTATGATGAACATCAT
GGAAGCCAAGATGAAGGAGAAAGTGATGGCAACTTGAGTTCCCCTGGTTCTCAAGGAAAC
GGAGAAATCTAGACAAGAGATCCATCACCTTCTCCTTTATCTGGTCTGAGGAAGGACACT
TTTAAAGAGAAAACAGACGTTCCTCAGGAACAAGAAGCTGAAGGTGAAGACGTTGCTGCT
GCTGCACTTGGAAGAGGAACATGTCACGAGGAGAAGAACGGTGTGAACGGAAAAGCAGCA
TCTAAAGAGTCTGGTGGTGGTACTTTGGAAATTGCACCTGTCAAGCCTGTGGACTCTTCT
GTTTCAGAGATTGTGATTACTAACAAAAATGGGCAAGCTGAAAGCTCAACAGACTCAGAT
TCTGTCCAACATAAGGCTAATGAAAGTCAAGAGAAGCGTAGACTGGAAGAGGCAAAGGAG
GGTAACATCACAGGATCTGCTGCAGAAACATCTCAAGTGCCAGAATGTTCTGAAGAAAAG
AGTGTTCTCCCTTCTGGTGGTCCACCAGTTGCTCGAACCTCGTGGTTGAGTTGCTGCGGT
TTGTTTGATATGATGGCAGGGTCAGAAAGATAATACAGGTTAGTCTTTCTCTAAAGAATC
TTGAAAGCTTCAGTGTTTCTTTTATTAAGTAATGTCCACCACTTGAAGTTTTAATAGCAT
TTGAACATACTAGTAAGCTAAGTAAGAGGGTTCATCATGGACTCATAGATATGTTTGTTG
TGATGATGAAGAACATGAGGAGGAAACCATTCAGCAAACAGTGGGCATCAAAAGCTACAT
GGTCAGTAGATTATTTTCTGTACGTCCAGCCATTAATGTCTTTGGTAGATAATAATGAGA
GTGTTTTGGAAAAAAAATATACGAACAAGAACAAAAGTTATTTTATATTCATGTAAGGAG
TTTTGAAAAAACATAGTTATGTATTTCTTTTGTGTGATATATATTGTCTTATGAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D925TF U 1
AF RR2D925JQ C 402
BS 1 680 RR2D925TF
BS 681 681 RR2D925JQ
BS 682 698 RR2D925TF
BS 699 699 RR2D925JQ
BS 700 751 RR2D925TF
BS 752 752 RR2D925JQ
BS 753 771 RR2D925TF
BS 772 772 RR2D925JQ
BS 773 784 RR2D925TF
BS 785 785 RR2D925JQ
BS 786 804 RR2D925TF
BS 805 805 RR2D925JQ
BS 806 811 RR2D925TF
BS 812 812 RR2D925JQ
BS 813 828 RR2D925TF
BS 829 1078 RR2D925JQ

RD RR2D925TF 828 0 0
GGGATCATGCCGTCTGGTGCCAAGAAGAGAAAGGCCTTGAAGAAAAAGAAGGAACAAGAA
GCCTTTGGAGGCAGTCCAAGCAACAAAGATTTCAATGGTCATGGGTATGATGAACATCAT
GGAAGCCAAGATGAAGGAGAAAGTGATGGCAACTTGAGTTCCCCTGGTTCTCAAGGAAAC
GGAGAAATCTAGACAAGAGATCCATCACCTTCTCCTTTATCTGGTCTGAGGAAGGACACT
TTTAAAGAGAAAACAGACGTTCCTCAGGAACAAGAAGCTGAAGGTGAAGACGTTGCTGCT
GCTGCACTTGGAAGAGGAACATGTCACGAGGAGAAGAACGGTGTGAACGGAAAAGCAGCA
TCTAAAGAGTCTGGTGGTGGTACTTTGGAAATTGCACCTGTCAAGCCTGTGGACTCTTCT
GTTTCAGAGATTGTGATTACTAACAAAAATGGGCAAGCTGAAAGCTCAACAGACTCAGAT
TCTGTCCAACATAAGGCTAATGAAAGTCAAGAGAAGCGTAGACTGGAAGAGGCAAAGGAG
GGTAACATCACAGGATCTGCTGCAGAAACATCTCAAGTGCCAGAATGTTCTGAAGAAAAG
AGTGTTCTCCCTTCTGGTGGTCCACCAGTTGCTCGAACCTCGTGGTTGAGTTGCTGCGGT
TTGTTTGATATGATGGCAGG*TCAGAAAGATAATACAG*TTAGTCTTTCTCTAAAGAATC
TTGAAAGCTTCAGTGTTTCTTTTATTAAGTA*TGTCCACCACTTGAAGTTT*AATAGCAT
TTGA*CATACTAGTAAGCTAAGTA*GAGGGT*CATCATGGACTCATAG

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2D925JQ 677 0 0
CAAGCCTGTGGACTCTTCTGTTTCAGAGATTGTGATTACTAACAAAAATGGGCAAGCTGA
AAGCTCAACAGACTCAGATTCTGTCCAACATAAGGCTAATGAAAGTCAAGAGAAGCGTAG
ACTGGAAGAGGCAAAGGAGGGTAACATCACAGGATCTGCTGCAGAAACATCTCAAGTGCC
AGAATGTTCTGAAGAAAAGAGTGTTCTCCCTTCTGGTGGTCCACCAGTTGCTCGAACCTC
GTGGTTGAGTTGCTGCGGTTTGTTTGATATGATGGCAGGGTCAGAAAGATAATACAGGTT
AGTCTTTCTCTAAAGAATCTTGAAAGCTTCAGTGTTTCTTTTATTAAGTAATGTCCACCA
CTTGAAGTTTTAATAGCATTTGAACATACTAGTAAGCTAAGTAAGAGGGTTCATCATGGA
CTCATAGATATGTTTGTTGTGATGATGAAGAACATGAGGAGGAAACCATTCAGCAAACAG
TGGGCATCAAAAGCTACATGGTCAGTAGATTATTTTCTGTACGTCCAGCCATTAATGTCT
TTGGTAGATAATAATGAGAGTGTTTTGGAAAAAAAATATACGAACAAGAACAAAAGTTAT
TTTATATTCATGTAAGGAGTTTTGAAAAAACATAGTTATGTATTTCTTTTGTGTGATATA
TATTGTCTTATGAGTTC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 5

CO CL1385Contig1 932 5 18 U
GATTCTATCAAACCTCAAATTCATTTATTAGTGTGACAAAGTACAACAAAAAGCTGAAGC
ACAAGTGTTTGTAATGCTTATTCCTCTTGACAAGAAAACCAAAAGAGAAGTGTACGTAGA
AACCCCAAAAACATGATCTAGTGAGAAGGAACCATAAGTCCTAGAGACTTGTTGAGCCAA
GCCTTCCATTTCCCAGAGGTCTTCCTGATTGTTGTTGTTGATGTGTCCACAGAACCTCCA
AGATTTTGTGCTTCTAACTTCTTAGACAGAACAAAGTTCCTGGATCCGGTTGAACCAATC
TTTCCCCATGGATTGAATGCTTCAACTGCATAGTAAGGAGAGTAGAGGAGGAAAAAGCTA
GAATCAGAACCGAGTAGTGGAAGTCTGCCTTCACGAGCATAGCATTTGAGAGCATAGTCA
ATGACATTTGAAACAGTTTCATCTTCTTTGACAACAAAACGAATGGGTCCAGCACTTCCT
AAGAAACTGATGCTAACGAGGAACCTGTTAATCTTGGACTTGTGTGTTTTCTTCTGCTTG
TTGTTGTTGTTGT***ACAGCAACATCTTTAACAATAAACGCCAAAAAAAGAAAAAAAGA
CTTTTGATGGGAGTTTGGGTTGCTTCAAGGGTCGACACCGATGCAACGGAAGTACCAGGA
TTCCTTGCAAGAGCCAAAAGTGAAGGAGGAGGAGGAGGAGAGAGGGAGGAGAAAGCTCGT
CCTTGCGGTGGTGCAATGGGAGAGCATAAATTCTCTGGTTCTCGGAGTTGTCTCTACCAT
TCAAGACGCTGCTTCAGAGAGA**GGGATCGATGAAATGAGATGGTGAAGGATGTATGTG
AATAAGAAAAGACAGAGTCTCTGATGGTAAAGATAGGTTTCAGAATCTAAAAGGAAGAAA
GAGAGAGTTTTGAGATGGAGGCCGAGATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DE18JQ U 7
AF RR2EJ78JQ U 7
AF RR2AP42JQ U 1
AF RR2AP42TF C 209
AF RR2EJ78TF C 214
BS 1 114 RR2AP42JQ
BS 115 115 RR2DE18JQ
BS 116 180 RR2AP42JQ
BS 181 181 RR2DE18JQ
BS 182 363 RR2AP42JQ
BS 364 364 RR2DE18JQ
BS 365 462 RR2AP42JQ
BS 463 463 RR2DE18JQ
BS 464 550 RR2AP42JQ
BS 551 553 RR2DE18JQ
BS 554 685 RR2AP42JQ
BS 686 686 RR2DE18JQ
BS 687 692 RR2AP42JQ
BS 693 693 RR2EJ78JQ
BS 694 805 RR2AP42JQ
BS 806 868 RR2AP42TF
BS 869 869 RR2EJ78TF
BS 870 932 RR2AP42TF

RD RR2DE18JQ 684 0 0
G
TCAAACCTCAAATTCATTTATTAGTGTGACAAAGTACAACAAAAAGCTGAAGCACAAGTG
TTTGTAATGCTTATTCCTCTTGACAAGAAAACCAAAAGAGAAGTGTACGTAGAAACCCCA
AAAACATGATCTAGTGAGAAGGAACCATAAGTCCTAGAGACTTGTTGAGCCAAGCCTTCC
ATTTCCCAGAGGTCTTCCTGATTGTTGTTGTTGATTTGTCCACAGAACCTCCAAGATTTT
GTGCTTCTAACTTCTTAGACAGAACAAAGTTCCTGGATCCGGTTGAACCAATCTTTCCCC
ATGGATTGAATGCTTCAACTGCATAGTAAGGAGAGTAGAGGAGGAAAAAGCTAGAATCAG
AACCGAGTAGTGGAAGCCTGCCTTCACGAGCATAGCATTTGAGGGCATAATCAATAACAT
TTGAAACAGTTTCATCTTCTTTGACAACAAAACGAATGGGTCCAGCACTTCCTAAGAAAC
TGATGCTAACGAGGAACCTGTTAATCTTGGACTTGTGTGTTTTCTTCTGCTTGTTGTTGT
TGTTGT***ACAGCAACATCTTTAACAATAAACGCCAAAAAAAGAAAATAAGACTTTTGA
TGGGAGTTTGGGTTGCTTCAAGGGTCGACACCGATGCAACGGAAGTACCAGGATTCCTTG
CAAGAGCCAAAAGTGAAGGAGGA

QA 2 684 2 684
DS 

RD RR2EJ78JQ 717 0 0
A
TCAAACCTCAAATTCATTTATTAGTGTGACAAAGTACAACAAAAAGCTGAAGCACAAGTG
TTTGTAATGCTTATTCCTCTTGACAAGAAAACCAAAAGAGAAGTGTACGTAGAAACCC*A
AAAACATGATCTAGTGAGAAGGAACCATAAGTCCTAGAGACTTGTTGAGCCAAGCCTTCC
ATTTCCCAGAGGTCTTCCTGATTGTTGTTGTTGATGTGTCCACAGAACCTCCAAGATTTT
GTGCTTCTAACTTCTTAGACAGAACAAAGTTCCTGGATCCGGTTGAACCAATCTTTCCCC
ATGGATTGAATGCTTCAACTGCATAGTAAGGAGAGTAGAGGAGGAAAAAGCTAGAATCAG
AACCGAGTAGTGGAAGTCTGCCTTCACGAGCATAGCATTTGAGAGCATAGTCAATGACAT
TTGAAACAGTTTCATCTTCTTTGACAACAAAACGAATGGGTCCAGCACTTCCTAAGAAAC
TGATGCTAACGAGGAACCTGTTAATCTTGGACTTGTGTGTTTTCTTCTGCTTGTTGTTGT
TGTTGTTGTACAGCAACATCTTTAACAATAAACGCCAAAAAAAGAAAAAAAGACTTTTGA
TGGGAGTTTGGGTTGCTTCAAGGGTCGACACCGATGCAACGGAAGTACCAGGATTCCTTG
CAAGAGCCAAAAGTGAAGGAGGAGGAGGAGGAGAGAGGGAGGAGAAAGCTCG
CCCT

QA 2 713 2 713
DS 

RD RR2AP42JQ 813 0 0
GATTCTATCAAACCTCAAATTCATTTATTAGTGTGACAAAGTACAACAAAAAGCTGAAGC
ACAAGTGTTTGTAATGCTTATTCCTCTTGACAAGAAAACCAAAAGAGAAGTGTAAGTAGA
AACCCCAAAAACATGATCTAGTGAGAAGGAACCATAAGTCCTAGAGACTTGTTGAGCCAA
ACCTTCCATTTCCCAGAGGTCTTCCTGATTGTTGTTGTTGATGTGTCCACAGAACCTCCA
AGATTTTGTGCTTCTAACTTCTTAGACAGAACAAAGTTCCTGGATCCGGTTGAACCAATC
TTTCCCCATGGATTGAATGCTTCAACTGCATAGTAAGGAGAGTAGAGGAGGAAAAAGCTA
GAAACAGAACCGAGTAGTGGAAGTCTGCCTTCACGAGCATAGCATTTGAGAGCATAGTCA
ATGACATTTGAAACAGTTTCATCTTCTTTGACAACAAAACGA*TGGGTCCAGCACTTCCT
AAGAAACTGATGCTAACGAGGAACCTGTTAATCTTGGACTTGTGTGTTTTCTTCTGCTTG
TTGTTGTTGT******ACAGCAACATCTTTAACAATAAACGCCAAAAAAAGAAAAAAAGA
CTTTTGATGGGAGTTTGGGTTGCTTCAAGGGTCGACACCGATGCAACGGAAGTACCAGGA
TTCCTTGCAAGAGCCAAAAGTGAAGAAGGAGGTGGAGGAGAGAGGGAGGAGAAAGCTCGT
CCTTGCGGTGGTGCAATGGGAGAGCATAAATTCTCTGGTTCTCGGAGTTGTCTCTACCAT
TCAAGACGCTGCTTCAGAGAGA**G
GGATCGAT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2AP42TF 724 0 0
TTGTTGTTGTTGATGTGTCCACAGAACCTCCAAGATTTTGTGCTTCTAACTTCTTAGACA
GAACAAAGTTCCTGGATCCGGTTGAACCAATCTTTCCCCATGGATTGAATGCTTCAACTG
CATAGTAAGGAGAGTAGAGGAGGAAAAAGCTAGAAACAGAACCGAGTAGTGGAAGTCTGC
CTTCACGAGCATAGCATTTGAGAGCATAGTCAATGACATTTGAAACAGTTTCATCTTCTT
TGACAACAAAACGA*TGGGTCCAGCACTTCCTAAGAAACTGATGCTAACGAGGAACCTGT
TAATCTTGGACTTGTGTGTTTTCTTCTGCTTGTTGTTGTTGT******ACAGCAACATCT
TTAACAATAAACGCCAAAAAAAGAAAAAAAGACTTTTGATGGGAGTTTGGGTTGCTTCAA
GGGTCGACACCGATGCAACGGAAGTACCAGGATTCCTTGCAAGAGCCAAAAGTGAAGAAG
GAGGTGGAGGAGAGAGGGAGGAGAAAGCTCGTCCTTGCGGTGGTGCAATGGGAGAGCATA
AATTCTCTGGTTCTCGGAGTTGTCTCTACCATTCAAGACGCTGCTTCAGAGAGA**GGGA
TCGATGAAATGAGATGGTGAAGGATGTATGTGAATAAGAAAAGACAGAGTCTCTGATGGT
GAAGATAGGTTTCAGAATCTAAAAGGAAGAAAGAGAGAGTTTTGAGATGGAGGCCGAGAT
GTCC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2EJ78TF 712 0 0
GTGTG
TGATGTGTCCACAGAACCTCCAAGATTT*GTGCT*CTAACTC**TAGACAGAACAAAGTT
CCTGGATCCGGTTGAACCAATCTTTCCCCATGGATTGAATGCTTCAACTGCATAGTAAGG
AGAGTAGAGGAGGAAAAAGCTAGAATCAGAACCGAGTAGTGGAAGTCTGCCTTCACGAGC
ATAGCATTTGAGAGCATAGTCAATGACATTTGAAACAGTTTCATCTTCTTTGACAACAAA
ACGAATGGGTCCAGCACTTCCTAAGAAACTGATGCTAACGAGGAACCTGTTAATCTTGGA
CTTGTGTGTTTTCTTCTGCTTGTTGTTGTTGTTGTTGTACAGCAACATCTTTAACAATAA
ACGCCAAAAAAAGAAAAAAAGACTTTTGATGGGAGTTTGGGTTGCTTCAAGGGTCGACAC
CGATGCAACGGAAGTACCAGGATTCCTTGCAAGAGCCAAAAGTGAAGGAGGAGGAGGAGG
AGAGAGGGAGGAGAAAGCTCGCCCTTGCGGTGGTGCAATGGTAGAGCATAAATTCTCTGG
TTCTCGGAGTTGTTTCTACCATTCAAGACGCTGCTTCAGAGAGAGAGGGATCGATGAAAT
GAGATGGTGAAGGATGTATGTGAATAAGAAAAGACAGAGTCTCTGATGGTAAAGATAGGT
TTCAGAATCTAAAAGGAAGAAAGAGAGAGTTTTGAGATGGAGGCCGA

QA 6 712 6 712
DS 



AS 1 6

CO CL1386Contig1 1557 6 24 U
CTCTCTCTACTTCCCCCCTCTCTCAAATTCGTGTTCTAATTTCTGCCACGAAACCCTAAA
TTTTCTAGAACCCTCCCGTGATTTTGCAACAGTATCTGAAACCAATTGATTACGAATCTG
TTTTCAATCTACCTGCATTTCCTCCTTTTAGTCAGATTCGATTATTATAAGAGAAGCTAA
GCTAGCCACACAAGTTAGCTTTTAATTTGATTGCAATGATGTTGTACAATGGAAGAAACT
AAAGGAATCTCTGATCCGGAGAATGGGAGTTCGAGTTACGGCGGTTTACCGCCGAATCCT
CTCTCCTTCTCTTCCTCCTCTTCCTCCGCCGCCGCCTTCTTATACAGGCAGCAGCAGACC
TCGGCCCCCAAGTCGCTGGTTCGACACCCATCTCTCGTGAAGACAAAGGTGTCAGCTTTA
TCCGTTGAGAACGAGTTCGCTCTAGACAAGATTGACTTTGTTCCTGCCATGCGTTCCGGA
GCTTGGTCTGATATCGGCTCCAGGTCCAGCATGGAGGATGCTTACCTATGCCTCGACAAT
CTCATGGATAGTTTTGGTCTCGAGGATCCTCCTGAGGATGTACCGACTGCCTTTTACGGG
GTGTTCGATGGACACGGTGGGAAGCATGCTGCTGAATTCGCGTGTCAGCATATACCAAGG
TACATCGTTGAGGATCAAGAGTTTCCTAGTGACATCAATAAAGTGATTTCTTCAACTTTC
CTTCAAACAGACACTGCCTTCTCAGAGGCTTGTGCATTGGATGGTAGCCTCTCTTCAGGA
ACTACTGCTTTGGCTGCTCTTCTTACTGGAAGGTCGTTGGTTGTGGCAAACGCTGGAGAT
TGTAGAGCAGTCTTGTCTCGTCAGGGCAAAGCCATTGAAATGTCAAAGGACCACAAACCC
ATGAGCTGTAAAGAGAGAAGACGCATCGAAGCGTCGGGTGGATACATATACGATGGCTAT
CTGAACGGGCAGCTTAATGTGGCTCGTGCCCTCGGGGATTTTCATATGGAAGGCATGAAG
AGAAAGAAGGACGGTTCTAACGGTGGACCTCTCATTGCGGATCCTGAGCTCATGACGACT
AAACTAACGCAAGAGGACGAGTTCCTCATAATGGGCTGCGATGGGGTTTGGGATGTGTTC
ATGAGCCAGAACGCTGTTGATTTCGCTAGGAGGAGACTGCAGGAGCACAATGACCCGGTT
ATGTGTAGTAAAGAGTTGGTTGAAGAAGCTTTGAAGAGGAAGAGTGGGGATAATGTGACT
GCGGTGGTTGTGTGCCTTCAGCCACATCCGCCACCAAACTTGGTTGCACCGAGGTTGAGG
GTTCAACGGAGCTTCTCAGCGGAGGGTTTAAAAGATTTGCAGAGCTACTTGGATGACTTG
GGGTGCTAATTGGGAGGATGGTGACGAATGATTTAATTTTCTCTGTTTTGTTTTTT*GTC
TTTTGGCTATAATTTATAGTTTTGGGTTTGGGTTTGTGGCGGTTTTGTTATTGAATTGTT
ACAATTTGAGTAAGTTATAACATAAGGCGGCATACAATAATATCTTTGCTTGGTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2AX01TFB U 259
AF RR2BC84TF U 1
AF RR2FI28TF U 449
AF RR2BC84JQ C 755
AF RR2AX01JQ C 798
AF RR2FI28JQ C 897
BS 1 492 RR2BC84TF
BS 493 493 RR2AX01TFB
BS 494 778 RR2BC84TF
BS 779 779 RR2FI28TF
BS 780 810 RR2BC84TF
BS 811 1095 RR2FI28TF
BS 1096 1096 RR2BC84JQ
BS 1097 1110 RR2FI28TF
BS 1111 1111 RR2BC84JQ
BS 1112 1150 RR2FI28TF
BS 1151 1151 RR2BC84JQ
BS 1152 1172 RR2FI28TF
BS 1173 1173 RR2BC84JQ
BS 1174 1182 RR2FI28TF
BS 1183 1183 RR2BC84JQ
BS 1184 1189 RR2FI28TF
BS 1190 1190 RR2BC84JQ
BS 1191 1199 RR2FI28TF
BS 1200 1200 RR2BC84JQ
BS 1201 1219 RR2FI28TF
BS 1220 1436 RR2BC84JQ
BS 1437 1437 RR2AX01JQ
BS 1438 1535 RR2BC84JQ
BS 1536 1557 RR2AX01JQ

RD RR2AX01TFB 298 0 0
GAGAATGGGAGTTCGAGTTACGGCGGTTTACCGCCGAATCCTCTCTCCTTCTCTTCCTCC
TCTTCCTCCGCCGCCGCCTTCTTATACAGGCAGCAGCAGACCTCGGCCCCCAAGTCGCTG
GTTCGACACCCATCTCTCGTGAAGACAAAGGTGTCAGCTTTATCCGTTGAGAACGAGTTC
GCTCTAGACAAGATTGACTTTGTTCCTGCCATGCGTTCCGGAGCTTGGTCTGATATCGGC
TCCAGGTCCAGCATGGAGGATGCTTACCTATGCCTCGACAATCTCATGGATAGTTTTG

QA 1 298 1 298
DS 

RD RR2BC84TF 810 0 0
CTCTCTCTACTTCCCCCCTCTCTCAAATTCGTGTTCTAATTTCTGCCACGAAACCCTAAA
TTTTCTAGAACCCTCCCGTGATTTTGCAACAGTATCTGAAACCAATTGATTACGAATCTG
TTTTCAATCTACCTGCATTTCCTCCTTTTAGTCAGATTCGATTATTATAAGAGAAGCTAA
GCTAGCCACACAAGTTAGCTTTTAATTTGATTGCAATGATGTTGTACAATGGAAGAAACT
AAAGGAATCTCTGATCCGGAGAATGGGAGTTCGAGTTACGGCGGTTTACCGCCGAATCCT
CTCTCCTTCTCTTCCTCCTCTTCCTCCGCCGCCGCCTTCTTATACAGGCAGCAGCAGACC
TCGGCCCCCAAGTCGCTGGTTCGACACCCATCTCTCGTGAAGACAAAGGTGTCAGCTTTA
TCCGTTGAGAACGAGTTCGCTCTAGACAAGATTGACTTTGTTCCTGCCATGCGTTCCGGA
GCTTGGTCTGAT*TCGGCTCCAGGTCCAGCATGGAGGATGCTTACCTATGCCTCGACAAT
CTCATGGATAGTTTTGGTCTCGAGGATCCTCCTGAGGATGTACCGACTGCCTTTTACGGG
GTGTTCGATGGACACGGTGGGAAGCATGCTGCTGAATTCGCGTGTCAGCATATACCAAGG
TACATCGTTGAGGATCAAGAGTTTCCTAGTGACATCAATAAAGTGATTTCTTCAACTTTC
CTTCAAACAGACACTGCCTTCTCAGAGGCTTGTGCATTGGATGGTAGCCTCTCTTCAG*A
ACTACTGCTTTGGCTGCTCTTCTTACTGGA

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR2FI28TF 771 0 0
G
GATTGACTTTGTTCCTGCCATGCGTTCCGGAGCTTGGTCTGATATCGGCTCCAGGTCCAG
CATGGAGGATGCTTACCTATGCCTCGACAATCTCATGGATAGTTTTGGTCTCGAGGATCC
TCCTGAGGATGTACCGACTGCCTTTTACGGGGTGTTCGATGGACACGGTGGGAAGCATGC
TGCTGAATTCGCGTGTCAGCATATACCAAGGTACATCGTTGAGGATCAAGAGTTTCCTAG
TGACATCAATAAGGTGATTTCTTCAGCTTTCCTTCAAACAGACACTGCCTTCTCAGAGGC
TTGTGCATTGGATGGTAGCCTCTCTTCAGGAACTACTGCTTTGGCTGCTCTTCTTACTGG
AAGGTCGTTGGTTGTGGCAAACGCTGGAGATTGTAGAGCAGTCTTGTCTCGTCAGGGCAA
AGCCATTGAAATGTCAAAGGACCACAAACCCATGAGCTGTAAAGAGAGAAGACGCATCGA
AGCGTCGGGTGGATACATATACGATGGCTATCTGAACGGGCAGCTTAATGTGGCTCGTGC
CCTCGGGGATTTTCATATGGAAGGCATGAAGAGAAAGAAGGACGGTTCTAACGGTGGACC
TCTCATTGCGGATCCTGAGCTCATGACGACTAAACTAACGCAAGAG*ACGAGTTCCTCAT
A*TGGGCTGCGATGGGGTTTGGGATGTGTTCATGAGCCAGA*CGCTGTTGATTTCGCTAG
GAG*AGACTGCAG*AGCACA*TGACCCGGT*ATGTGTAGTAAAGAGTTGG

QA 2 771 2 771
DS 

RD RR2BC84JQ 781 0 0
CATTGGATGGTAGCCTCTCTTCAGGAACTACTGCTTTGGCTGCTCTTCTTACTGGAAGGT
CGTTGGTTGTGGCAAACGCTGGAGATTGTAGAGCAGTCTTGTCTCGTCAGGGCAAAGCCA
TTGAAATGTCAAAGGACCACAAACCCATGAGCTGTAAAGAGAGAAGACGCATCGAAGCGT
CGGGTGGATACATATACGATGGCTATCTGAACGGGCAGCTTAATGTGGCTCGTGCCCTCG
GGGATTTTCATATGGAAGGCATGAAGAGAAAGAAGGACGGTTCTAACGGTGGACCTCTCA
TTGCGGATCCTGAGCTCATGACGACTAAACTAACGCAAGAGGACGAGTTCCTCATAATGG
GCTGCGATGGGGTTTGGGATGTGTTCATGAGCCAGAACGCTGTTGATTTCGCTAGGAGGA
GACTGCAGGAGCACAATGACCCGGTTATGTGTAGTAAAGAGTTGGTTGAAGAAGCTTTGA
AGAGGAAGAGTGGGGATAATGTGACTGCGGTGGTTGTGTGCCTTCAGCCACATCCGCCAC
CAAACTTGGTTGCACCGAGGTTGAGGGTTCAACGGAGCTTCTCAGCGGAGGGTTTAAAAG
ATTTGCAGAGCTACTTGGATGACTTGGGGTGCTAATTGGGAGGATGGTGACGAATGATTT
AATTTTCTCTGTTTTGTTTTTTTGTCTTTTGGCTATAATTTATAGTTTTGGGTTTGGGTT
TGTGGCGGTTTTGTTATTGAATTGTTACAATTTGAGTAAGTTATAACATAAGGCGGCATA
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2AX01JQ 760 0 0
TCTTCTTACTGGAAGGTCGTTGGTTGTGGCAAACGCTGGAGATTGTAGAGCAGTCTTGTC
TCGTCAGGGCAAAGCCATTGAAATGTCAAAGGACCACAAACCCATGAGCTGTAAAGAGAG
AAGACGCATCGAAGCGTCGGGTGGATACATATACGATGGCTATCTGAACGGGCAGCTTAA
TGTGGCTCGTGCCCTCGGGGATTTTCATATGGAAGGCATGAAGAGAAAGAAGGACGGTTC
TAACGGTGGACCTCTCATTGCGGATCCTGAGCTCATGACGACTAAACTAACGCAAGAGGA
CGAGTTCCTCATAATGGGCTGCGACGGGGTTTGGGATGTGTTCATGAGCCAGAACGCTGT
TGATTTCGCTAGGAGTAGACTGCAGGAGCACAATGACCCGGTTATGTGTTGTAAAGAGTT
GGTTGAAGAAGCTTTGAAGAGGAAGAGTGGGGATAATGTGACTGCGGTGGTTGTGTGCCT
TCAGCCACATCCGCCACCAAACTTGGTTGCACCGAGGTTGAGGGTTCAACGGAGCTTCTC
AGCGGAGGGTTTAAAAGATTTGCAGAGCTACTTGGATGACTTGGGGTGCTAATTGGGAGG
ATGGTGACGAATGATTTAATTTTCTCTGTTTTGTTTTTT*GTCTTTTGGCTATAATTTAT
AGTTTTGGGTTTGGGTTTGTGGCGGTTTTGTTATTGAATTGTTACAATTTGAGTAAGTTA
TAACATAAGGCGGCATACAATAATATCTTTGCTTGGTGGC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2FI28JQ 661 0 0
ACCCATGAGCTGTAAAGAGAGAAGACGCATCGAAGCGTCGGGTGGATACATATACGATGG
CTATCTGAACGGGCAGCTTAATGTGGCTCGTGCCCTCGGGGATTTTCATATGGAAGGCAT
GAAGAGAAAGAAGGACGGTTCTAACGGTGGACCTCTCATTGCGGATCCTGAGCTCATGAC
GACTAAACTAACGCAAGAGGACGAGTTCCTCATAATGGGCTGCGATGGGGTTTGGGATGT
GTTCATGAGCCAGAACGCTGTTGATTTCGCTAGGAGGAGACTGCAGGAGCACAATGACCC
GGTTATGTGTAGTAAAGAGTTGGTTGAAGAAGCTTTGAAGTGGAAGAGTGGGGATAATGT
GACTGCGGTGGTTGTGTGCCTTCAGCCACATCCGCCACCAAACTTGGTTGCACCGAGGTT
GAGGGTTCAACGGAGCTTCTCAGCGGAGGGTTTAGAAGATTTGCAGAGCTACTTGGATGA
CTTGGGGTGCTAATTGGGAGGATGGTGACGAATGATTTAATTTTCTCTGTTTTGTTTTTT
*GTCTTTTGGCTATAATTTATAGTTTTGGGTTTGGGTTTGTGGCGGTTTTGTTATTGAAT
TGTTACAATTTGAGTAAGTTATAACATAAGGCGGCATACAATAATATCTTTGCTTGGTGG
G

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 6

CO CL1387Contig1 824 6 5 U
GGATTATATGTGTGTACGATAATTCATAGTTGGATGATCAATCAAATCATCAGCTTCGGG
AGATCTTCTCTGGGAATCGAGGATCTGTGGAGTTATCTGTGGTCATCATGATACATTTTG
TGCTTCTAGTTAGTCGACAAGGAAAAGTAAGGCTCACCAAGTGGTATTCGCCTTACACAC
AGAAGGAAAGGTCTAAGGTCATACGCGAACTCAGCGGTGTAATCCTGAACAGAGGTCCCA
AGCTCTGTAATTTCATCGAATGGAGAGGATACAAGGTTGTCTACAAAAGGTATGCAAGCC
TTTACTTCTGCATGTGCATTGATGAGGCGGATAACGAGTTAGAGGTACTGGAGATCATTC
ATCACTACGTCGAGATTCTTGACCGTTACTTTGGCAGTGTGTGTGAACTGGATTTGATTT
TTAACTTCCACAAGGCGTATTATATATTGGATGAGTTGTTGATCGCCGGTGAGCTTCAAG
AGTCGAGCAAGAAAACAGTGGCGAGGATAATATCAGCTCAGGATCAATTGGTGGAGGCTG
CTAAAGAGGAGGCTAGTTCCATAAGTAACATCATTGCTCAGGCTACCAAGTAGTTTCTTT
CTGATTTGTTGTTAAAAAGCATTCGTTAATGGTTTAATATTTCCTTATTTTCTGAGAAAT
TCTATTCTAAATAACACTTTTCCATTCCATGTTATGTCATGTGTTTTGTCTGTTTGATAA
GAAGAAAGAAACATATATTGATCGGTGTGGGTTTATGAGTAGTGATTCCTTTGTAAAGAC
AACATACAGCACTTTCTTTGCGATCTACCATGATTGATAAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO61TF U 1
AF RR2AJ87JQ C 38
AF RR2FO61JQ C 369
AF RR2AJ87TF U 107
AF RR2A195TF U 47
AF RR2A195JQ C 72
BS 1 389 RR2FO61TF
BS 390 390 RR2A195TF
BS 391 715 RR2FO61TF
BS 716 810 RR2A195TF
BS 811 824 RR2A195JQ

RD RR2FO61TF 716 0 0
GGATTATATGTGTGTACGATAATTCATAGTTGGATGATCAATCAAATCATCAGCTTCGGG
AGATCTTCTCTGGGAATCGAGGATCTGTGGAGTTATCTGTGGTCATCATGATACATTTTG
TGCTTCTAGTTAGTCGACAAGGAAAAGTAAGGCTCACCAAGTGGTATTCGCCTTACACAC
AGAAGGAAAGGTCTAAGGTCATACGCGAACTCAGCGGTGTAATCCTGAACAGAGGTCCCA
AGCTCTGTAATTTCATCGAATGGAGAGGATACAAGGTTGTCTACAAAAGGTATGCAAGCC
TTTACTTCTGCATGTGCATTGATGAGGCGGATAACGAGTTAGAGGTACTGGAGATCATTC
ATCACTACGTCGAGATTCTTGACCGTTACCTTGGCAGTGTGTGTGAACTGGATTTGATTT
TTAACTTCCACAAGGCGTATTATATATTGGATGAGTTGTTGATCGCCGGTGAGCTTCAAG
AGTCGAGCAAGAAAACAGTGGCGAGGATAATATCAGCTCAGGATCAATTGGTGGAGGCTG
CTAAAGAGGAGGCTAGTTCCATAAGTAACATCATTGCTCAGGCTACCAAGTAGTTTCTTT
CTGATTTGTTGTTAAAAAGCATTCGTTAATGGTTTAATATTTCCTTATTTTCTGAGAAAT
TCTATTCTAAATAACACTTTTCCATTCCATGTTATGTCATGTGTTTTGTCTGTTT
A

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2AJ87JQ 679 0 0
GG
AATCAAATCATCAGCTTCGGGAGATCTTCTCTGGGAATCGAGGATCTGTGGAGTTATCTG
TGGTCATCATGATACATTTTGTGCTTCTAGTTAGTCGACAAGGAAAAGTAAGGCTCACCA
AGTGGTATTCGCCTTACACACAGAAGGAAAGGTCTAAGGTCATACGCGAACTCAGCGGTG
TAATCCTGAACAGAGGTCCCAAGCTCTGTAATTTCATCGAATGGAGAGGATACAAGGTTG
TCTACAAAAGGTATGCAAGCCTTTACTTCTGCATGTGCATTGATGAGGCGGATAACGAGT
TAGAGGTACTGGAGATCATTCATCACTACGTCGAGATTCTTGACCGTTACTTTGGCAGTG
TGTGTGAACTGGATTTGATTTTTAACTTCCACAAGGCGTATTATATATTGGATGAGTTGT
TGATCGCCGGTGAGCTTCAAGAGTCGAGCAAGAAAACAGTGGCGAGGATAATATCAGCTC
AGGATCAATTGGTGGAGGCTGCTAAAGAGGAGGCTAGTTCCATAAGTAACATCATTGCTC
AGGCTACCAAGTAGTTTCTTTCTGATTTGTTGTTAAAAAGCATTCGTTAATGGTTTAATA
TTTCCTTATTTTCTGAGAAATTCTATTCTAAATAACACTTTTCCATTCCATGTTATGTCA
TGTGTTTTGTCTGTTTG

QA 3 679 3 679
DS 

RD RR2FO61JQ 349 0 0
GTCGAGATTCTTGACCGTTACCTTGGCAGTGTGTGTGAACTGGATTTGATTTTTAACTTC
CCCAAGGCGTATTATATATTGGATGAGTTGTTGATCGCCGGTGAGCTTCAAGAGTCGAGC
AAGAAAACAGTGGGGAGGATAATATCAGCTCAGGATCAATTGGTGGAGGCTGCTAAAGAG
GAGGCTAGTTCCATAAGTAACATCATTGCTCAGGCTACCAAGTAGTTTTTTTTTGATTTG
TTGTTAAAAAGCATTCGTTAATGGTTTAATATTTCCTTATTTTTTGAGAAATTTTATTTT
AAATAACACTTTTCCATTCCATGTTATGTCATGTGTTTTGTCTGTTT
AC

QA 1 347 1 347
DS 

RD RR2AJ87TF 615 0 0
CATGATACATTTTGTGCTTCTAGTTAGTCGACAAGGAAAAGTAAGGCTCACCAAGTGGTA
TTCGCCTTACACACAGAAGGAAAGGTCTAAGGTCATACGCGAACTCAGCGGTGTAATCCT
GAACAGAGGTCCCAAGCTCTGTAATTTCATCGAATGGAGAGGATACAAGGTTGTCTACAA
AAGGTATGCAAGCCTTTACTTCTGCATGTGCATTGATGAGGCGGATAACGAGTTAGAGGT
ACTGGAGATCATTCATCACTACGTCGAGATTCTTGACCGTTACTTTGGCAGTGTGTGTGA
ACTGGATTTGATTTTTAACTTCCACAAGGCGTATTATATATTGGATGAGTTGTTGATCGC
CGGTGAGCTTCAAGAGTCGAGCAAGAAAACAGTGGCGAGGATAATATCAGCTCAGGATCA
ATTGGTGGAGGCTGCTAAAGAGGAGGCTAGTTCCATAAGTAACATCATTGCTCAGGCTAC
CAAGTAGTTTCTTTCTGATTTGTTGTTAAAAAGCATTCGTTAATGGTTTAATATTTCCTT
ATTTTCTGAGAAATTCTATTCTAAATAACACTTTTCCATTCCATGTTATGTCATGTGTTT
TGTCTGTTTG
ACAAA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2A195TF 764 0 0
GG
ATCAGCTTCGGGAGATCTCCTCTGGGAATCGAGGATCTGTGGAGTTATCTGTGGTCATCA
TGATACATTTTGTGCTTCTAGTTAGTCGACAGGGAAAAGTAAGGCTCACCAAGTGGTATT
CGCCTTACACACAGAAGGAAAGGTCTAAGGTCATACGCGAACTCAGCGGTGTAATCCTGA
ACAGAGGTCCCAAGCTCTGTAATTTCATCGAATGGAGAGGATACAAGGTTGTCTACAAAA
GATATGCAAGCCTGTACTTCTGCATGTGCATTGATGAGGCGGATAACGAGTTAGAAGTAC
TGGAGATCATTCATCACTACGTCGAGATTCTTGACCGTTACTTTGGCAGTGTGTGTGAAC
TGGATTTGATTTTTAACTTCCACAAGGCGTATTATATATTGGATGAGTTGTTGATCGCCG
GTGAGCTTCAAGAGTCGAGCAAGAAAACAGTGGCGAGGATAATATCAGCTCAGGATCAAT
TGGTGGAGGCTGCTAAAGAGGAGGTTAGTTCCATAAGTAACATCATTGCTCAGGCTACGA
AGTAGTTTCTTTCTGATTTGTTGTTAAAAAGCATTCGTTAATGGTTTAACATTTCCTTAT
TTTCTGAGAAGTTCTATTCTAAATCACACTTTCCTTTTCCATGTTATGTCATGTGTTTTG
TCTGTTTGATAAGAAGAAAGAAACATATATTGATCGGTGTGGGTTTATGAGTAGTGATTC
CTTTGTAAAGACAACATACAGCACTTTCTTTGCGATCTACCA

QA 3 764 3 764
DS 

RD RR2A195JQ 753 0 0
GGGAATCGAGGATCTGTGGAGTTATCTGTGGTCATCATGATACATTTTGTGCTTCTAGTT
AGTCGACAGGGAAAAGTAAGGCTCACCAAGTGGTATTCGCCTTACACACAGAAGGAAAGG
TCTAAGGTCATACGCGAACTCAGCGGTGTAATCCTGAACAGAGGTCCCAAGCTCTGTAAT
TTCATCGAATGGAGAGGATACAAGGTTGTCTACAAAAGATATGCAAGCCTGTACTTCTGC
ATGTGCATTGATGAGGCGGATAACGAGTTAGAAGTACTGGAGATCATTCATCACTACGTC
GAGATTCTTGACCGTTACTTTGGCAGTGTGTGTGAACTGGATTTGATTTTTAACTTCCAC
AAGGCGTATTATATATTGGATGAGTTGTTGATCGCCGGTGAGCTTCAAGAGTCGAGCAAG
AAAACAGTGGCGAGGATAATATCAGCTCAGGATCAATTGGTGGAGGCTGCTAAAGAGGAG
GTTAGTTCCATAAGTAACATCATTGCTCAGGCTACGAAGTAGTTTCTTTCTGATTTGTTG
TTAAAAAGCATTCGTTAATGGTTTAACATTTCCTTATTTTCTGAGAAGTTCTATTCTAAA
TCACACTTTCCTTTTCCATGTTATGTCATGTGTTTTGTCTGTTTGATAAGAAGAAAGAAA
CATATATTGATCGGTGTGGGTTTATGAGTAGTGATTCCTTTGTAAAGACAACATACAGCA
CTTTCTTTGCGATCTACCATGATTGATAAGAGC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 2 6

CO CL1388Contig1 694 3 7 U
CGCAACATCCCTCCTCCTCCGTCTTTGTTTCCTCATCATTTTTTGCCGCCGCCTTCAGGT
AAGTCAACAGCTTTAAACTAAGCTTAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACCGTGAAG
AAATCATCACGTCAAGTGATCGAGAAGTACTACTCTCGCATGACGCTCGACTTCCACACC
AACAAGAAGATCCTCGAGGAAGTCGCAATCATCCCTTCCAAGCGTCTCCGCAACAAGATT
GCTGGATTCTCCACTCATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCGGTACGTGGTATCTCG
CTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGTATGGACTTTGTGCCCGATGAGTCTGCT
ATCAAGACCGATGAGATTAAGGTCGACAAGGAGACTCTTGAGATGCTTGCTTCCCTTGGG
ATGTCTGACGTTGCCGGCGTCTCTGTCGTTAAGCCTCTGACTGTGGCTTCTACTTTTGGT
GGCAGGCCACAAAGAGGGTTCTAAAGGAGTTTATTATCATTATTATGAGTCAATCAAAGA
GAAACCTGCTGTTCTTATAGTGTTTATTGTTTCTTTTGATTCGAGATTTTTATGTCCCAA
GCCGAAAGCGAGACTACTTTTCTACTATATGAGTTTTTGTTGATCGTTTGTTAAGAGACA
TCAAGATTTGAGTTAAAAATGCTTTCTTAGTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B647JQ C 1
AF RR2G753TF U 39
AF RR2B647TF U 1
BS 1 39 RR2B647TF
BS 40 450 RR2G753TF
BS 451 451 RR2B647TF
BS 452 495 RR2G753TF
BS 496 496 RR2B647TF
BS 497 674 RR2G753TF
BS 675 694 RR2B647JQ

RD RR2B647JQ 694 0 0
CGCAACATCCCTCCTCCTCCGTCTTTGTTTCCTCATCATTTTTTGCCGCCGCCTTCAGGT
AAGTCAACAGCTTTAAACTAAGCTTAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACCGTGAAG
AAATCATCACGTCAAGTGATCGAGAAGTACTACTCTCGCATGACGCTCGACTTCCACACC
AACAAGAAGATCCTCGAGGAAGTCGCAATCATCCCTTCCAAGCGTCTCCGCAACAAGATT
GCTGGATTCTCCACTCATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCGGTACGTGGTATCTCG
CTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGTATGGACTTTGTGCCCGATGAGTCTGCT
ATCAAGACCGATGAGATTAAGGTCGACAAGGAGACTCTTGAGATGCTTGCTTCCCTTGGG
ATGTCTGACGTTGCCGGCGTCTCTGTCGTTAAGCCTCTGACTGTGGCTTCTACTTTTGGT
GGCAGGCCACAAAGAGGGTTCTAAAGGAGTTTATTATCATTATTATGAGTCAATCAAAGA
GAAACCTGCTGTTCTTATAGTGTTTATTGTTTCTTTTGATTCGAGATTTTTATGTCCCAA
GCCGAAAGCGAGACTACTTTTCTACTATATGAGTTTTTGTTGATCGTTTGTTAAGAGACA
TCAAGATTTGAGTTAAAAATGCTTTCTTAGTTCT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2G753TF 636 0 0
T
TTTTTGCCGCCGCCTTCAGGTAAGTCAACAGCTTTAAACTAAGCTTAAAAGATGGGGCGT
GTCCGAACCAAGACCGTGAAGAAATCATCACGTCAAGTGATCGAGAAGTACTACTCTCGC
ATGACGCTCGACTTCCACACCAACAAGAAGATCCTCGAGGAAGTCGCAATCATCCCTTCC
AAGCGTCTCCGCAACAAGATTGCTGGATTCTCCACTCATCTCATGAAGAGGATCCAGAAG
GGACCGGTACGTGGTATCTCGCTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGTATGGAC
TTTGTGCCCGATGAGTCTGCTATCAAGACCGATGAGATTAAGGTCGACAAGGAGACTCTT
GAGATGCTTGCTTCCCTTGGGATGTCTGACGTTGCCGGCGTCTCTGTCGTTGAGCCTCTG
ACTGTGGCTTCTACTTTTGGTGGCAGGCCACAAAGAAGGTTCTAAAGGAGTTTATTATCA
TTATTATGAGTCAATCAAAGAGAAACCTGCTGTTCTTATAGTGTTTATTGTTTCTTTTGA
TTCGAGATTTTTATGTCCCAAGCCGAAAGCGAGACTACTTTTCTACTATATGAGTTTTTG
TTGATCGTTTGTTAAGAGACATCAAGATTTGAGTT

QA 2 636 2 636
DS 

RD RR2B647TF 674 0 0
CGCAACATCCCTCCTCCTCCGTCTTTGTTTCCTCATCATTTTTTGCCGCCGCCTTCAGGT
AAGTCAACAGCTTTAAACTAAGCTTAAAAGATGGGGCGTGTCCGAACCAAGACCGTGAAG
AAATCATCACGTCAAGTGATCGAGAAGTACTACTCTCGCATGACGCTCGACTTCCACACC
AACAAGAAGATCCTCGAGGAAGTCGCAATCATCCCTTCCAAGCGTCTCCGCAACAAGATT
GCTGGATTCTCCACTCATCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCGGTACGTGGTATCTCG
CTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGTATGGACTTTGTGCCCGATGAGTCTGCT
ATCAAGACCGATGAGATTAAGGTCGACAAGGAGACTCTTGAGATGCTTGCTTCCCTTGGG
ATGTCTGACGTTGCCGGCGTCTCTGTCGTTAAGCCTCTGACTGTGGCTTCTACTTTTGGT
GGCAGGCCACAAAGAGGGTTCTAAAGGAGTTTATTATCATTATTATGAGTCAATCAAAGA
GAAACCTGCTGTTCTTATAGTGTTTATTGTTTCTTTTGATTCGAGATTTTTATGTCCCAA
GCCGAAAGCGAGACTACTTTTCTACTATATGAGTTTTTGTTGATCGTTTGTTAAGAGACA
TCAAGATTTGAGTT

QA 1 674 1 674
DS 



CO CL1388Contig2 586 3 2 U
TTTTTGCCGCCGCCTTCAGGTAAGTCAACAGCTTTAAACTAAGCTTAAAAGATGGGGCGT
GTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCACGTCAAGTGATCGAGAAGTACTACTCTCGC
ATGACGCTCGACTTCCACACCAACAAGAAGATCCTCGAGGAAGTAGCCATCATCCCTTCG
AAGAGGCTCCGCAACAAGATCGCTGGGTTCTCCACTCATCTCATGAAACGTATCCAGAAG
GGACCGGTCCGCGGTATCTCGCTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGAC
TTTGTGCCCGATGAGTCTGCTATCAAGACCGATGAGATCAAGGTCGACAAGGAGACTCTT
GAGATGCTTGCTTCCCTTGGGATGTCTGACGTTGCTGGCGTCTCTGTGGTTGAGCCTCTG
ACTGTGGCTCCTGCTTTTGGTGGCAGGCCACAAAGAAGGTTCTAAAGGAGTTTATTATCA
TTATTATGAGTCAATCAAAGAGAAACCTGCTGTTCTTATAGTGTTTATTGTTTCTTTTGA
TTCGAGATTTTTATGTCCCAAGCTGAAAGTGAGACTACTTTTCTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EJ05TF U 1
AF RR2FF81TF U 1
AF RR2FF81JQ C 66
BS 1 452 RR2EJ05TF
BS 453 586 RR2FF81TF

RD RR2EJ05TF 452 0 0
TTTTTGCCGCCGCCTTCAGGTAAGTCAACAGCTTTAAACTAAGCTTAAAAGATGGGGCGT
GTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCACGTCAAGTGATCGAGAAGTACTACTCTCGC
ATGACGCTCGACTTCCACACCAACAAGAAGATCCTCGAGGAAGTAGCCATCATCCCTTCG
AAGAGGCTCCGCAACAAGATCGCTGGGTTCTCCACTCATCTCATGAAACGTATCCAGAAG
GGACCGGTCCGCGGTATCTCGCTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGAC
TTTGTGCCCGATGAGTCTGCTATCAAGACCGATGAGATCAAGGTCGACAAGGAGACTCTT
GAGATGCTTGCTTCCCTTGGGATGTCTGACGTTGCTGGCGTCTCTGTGGTTGAGCCTCTG
ACTGTGGCTCCTGCTTTTGGTGGCAGGCCACA

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2FF81TF 586 0 0
TTTTTGCCGCCGCCTTCAGGTAAGTCAACAGCTTTAAACTAAGCTTAAAAGATGGGGCGT
GTCCGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCACGTCAAGTGATCGAGAAGTACTACTCTCGC
ATGACGCTCGACTTCCACACCAACAAGAAGATCCTCGAGGAAGTAGCCATCATCCCTTCG
AAGAGGCTCCGCAACAAGATCGCTGGGTTCTCCACTCATCTCATGAAACGTATCCAGAAG
GGACCGGTCCGCGGTATCTCGCTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGAC
TTTGTGCCCGATGAGTCTGCTATCAAGACCGATGAGATCAAGGTCGACAAGGAGACTCTT
GAGATGCTTGCTTCCCTTGGGATGTCTGACGTTGCTGGCGTCTCTGTGGTTGAGCCTCTG
ACTGTGGCTCCTGCTTTTGGTGGCAGGCCACAAAGAAGGTTCTAAAGGAGTTTATTATCA
TTATTATGAGTCAATCAAAGAGAAACCTGCTGTTCTTATAGTGTTTATTGTTTCTTTTGA
TTCGAGATTTTTATGTCCCAAGCTGAAAGTGAGACTACTTTTCTAC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2FF81JQ 521 0 0
AACCAAGACGGTGAAGAAATCATCACGTCAAGTGATCGAGAAGTACTACTCTCGCATGAC
GCTCGACTTCCACACCAACAAGAAGATCCTCGAGGAAGTAGCCATCATCCCTTCGAAGAG
GCTCCGCAACAAGATCGCTGGGTTCTCCACTCATCTCATGAAACGTATCCAGAAGGGACC
GGTCCGCGGTATCTCGCTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGT
GCCCGATGAGTCTGCTATCAAGACCGATGAGATCAAGGTCGACAAGGAGACTCTTGAGAT
GCTTGCTTCCCTTGGGATGTCTGACGTTGCTGGCGTCTCTGTGGTTGAGCCTCTGACTGT
GGCTCCTGCTTTTGGTGGCAGGCCACAAAGAAGGTTCTAAAGGAGTTTATTATCATTATT
ATGAGTCAATCAAAGAGAAACCTGCTGTTCTTATAGTGTTTATTGTTTCTTTTGATTCGA
GATTTTTATGTCCCAAGCTGAAAGTGAGACTACTTTTCTAC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 2 6

CO CL1389Contig1 1172 4 8 U
CAACCAAACAATCATTCCCAGCATCCTTTTAAAAATACTTTACATCATGGAAGTTTCATT
TCATTGATAACAAAGCAAAAAATAAAACACACTCCAAGGACAGAAATGACGACTACATCA
CACAAGCATCGATAATTTCATCTTATTACAACCTCATTAAGCGTCTCTTTATTTATAAGG
TTGTTTGACCCATATATATGACAAAGATGTAGAGATTACTAAGCCGAGACGATATTGGTC
ACAGAGACCTTAACCATTTCAGCTTCAAAGATAATGGCATCATTCACCAAATACCCTTTC
GATGGATCCTTTAAATCTGCTAACAATATGATATTGTTCACTCCCACACCATAATCCCTT
CGAATCGGGTACCAAGCGGCAAAATATAATTGTCTGTGGTTGGAGTTTCGCTGATTCTTC
AACCGCAAGTTAACTGCTCCCCAAGTGTTTGTAGCAACTGCGTTTTCCTTAAAGCCTTGA
GCAAATAGGAAGAGTGGAAGTGCATGTGGTCGTCCATCTCCATCCCCTTTCGGGTTAAAG
CCTAATCTCCAGTATCGGTCTCCAACGAGAAAATCGGCAGAATAGTAAAATTTATCTTCC
AAGCTGGAGAAACGAAGTATCTTCCAAGTGAAAATATTGTTTGGAGGGTTTGATATGAAT
GTGACTTTCTCTTGTACCTTGGCAGGTTTAACAATGAGGATCTCAGCACCAAAAGAACAA
GTGTCTTGCACAATGTACCCATTGTTAGTATTCTCGAATGTTGAAAGAGGGATCAATTTT
CCAAATCCCC*ACTCCTTTTTTGCAGCATTGTATCGCTTCACGGTTCCATCTGTGACAGT
CAAGTACTTATGGGTCTTGGGATTGTGGACAAAGAGTTTGAGATCAACATTGACTTCCCA
ACCATAAGGAAGAGATTCAGCGCCTTCGATTCTCGCGTAAAGTGATATATGGCCAGCTCC
ACCGTCGTTCTTATTACCAATCACGTACAAAACTAATCTCCATTTGTAACCAGAAGCTTC
AAAAACAGAGGATTCGTAGGGTTCGAATCTCCCTTTAATCACAGAGTACCCTGCTATTGT
GACTATCTTACTTGATGTCGCTCCTCTCTAAACGCTCTTGTCTCTCCAAGATGCGCCTCG
ACATTGTAAGTACTGTTGTTCTCTGTTCCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV63JQ U 1
AF RR2BW95JQ U 708
AF RR2AV63TF C 265
AF RR2A972TF C 552
BS 1 823 RR2AV63JQ
BS 824 867 RR2BW95JQ
BS 868 928 RR2AV63TF
BS 929 929 RR2A972TF
BS 930 1013 RR2AV63TF
BS 1014 1014 RR2A972TF
BS 1015 1020 RR2AV63TF
BS 1021 1172 RR2A972TF

RD RR2AV63JQ 823 0 0
CAACCAAACAATCATTCCCAGCATCCTTTTAAAAATACTTTACATCATGGAAGTTTCATT
TCATTGATAACAAAGCAAAAAATAAAACACACTCCAAGGACAGAAATGACGACTACATCA
CACAAGCATCGATAATTTCATCTTATTACAACCTCATTAAGCGTCTCTTTATTTATAAGG
TTGTTTGACCCATATATATGACAAAGATGTAGAGATTACTAAGCCGAGACGATATTGGTC
ACAGAGACCTTAACCATTTCAGCTTCAAAGATAATGGCATCATTCACCAAATACCCTTTC
GATGGATCCTTTAAATCTGCTAACAATATGATATTGTTCACTCCCACACCATAATCCCTT
CGAATCGGGTACCAAGCGGCAAAATATAATTGTCTGTGGTTGGAGTTTCGCTGATTCTTC
AACCGCAAGTTAACTGCTCCCCAAGTGTTTGTAGCAACTGCGTTTTCCTTAAAGCCTTGA
GCAAATAGGAAGAGTGGAAGTGCATGTGGTCGTCCATCTCCATCCCCTTTCGGGTTAAAG
CCTAATCTCCAGTATCGGTCTCCAACGAGAAAATCGGCAGAATAGTAAAATTTATCTTCC
AAGCTGGAGAAACGAAGTATCTTCCAAGTGAAAATATTGTTTGGAGGGTTTGATATGAAT
GTGACTTTCTCTTGTACCTTGGCAGGTTTAACAATGAGGATCTCAGCACCAAAAGAACAA
GTGTCTTGCACAATGTACCCATTGTTAGTATTCTCGAATGTTGAAAGAGGGATCAATTTT
CCAAATCCCC*ACTCCTTTTTTGCAGCATTGTATCGCTTCACG

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR2BW95JQ 160 0 0
ACCAAAAGAACAAGTGTCTTGCACAATGTACCCATTGTTATTATTCTCGAATGTTGAAAG
AGGGATCAATTTTCCAAATCCCC*ACTCCTTTTTTGCAGCATTGTATCGCTTCACGGTTC
CATCTGTGACAGTCAAGTACTTATGGGTCTTGGGATTGTG

QA 1 160 1 160
DS 

RD RR2AV63TF 756 0 0
TCAAAGATAATGGCATCATTCACCAAATACCCTTTCGATGGATCCTTTAAATCTGCTAAC
AATATGATATTGTTCACTCCCACACCATAATCCCTTCGAATCGGGTACCAAGCGGCAGAA
TATAATTGTCTGTGGTTGGAGTTTCGCTGATTCTTCAACCGCAAGTTAACTGCTCCCCAA
GTGTTTGTAGCAACTGCGTTTTCCTTAAAGCCTTGAGCAAATAGGAAGAGTGGAAGTGCA
TGTGGTCGTCCATCTCCATCCCCTTTCGGGTTAAAGCCTAATCTCCAGTATCGGTCTCCA
ACGAGAAAATCGGCAGAATAGTAAAATTTATCTTCCAAGCTGGAGAAACGAAGTATCTTC
CAAGTGAAAATATTGTTTGGAGGGTTTGATATGAATGTGACTTTCTCTTGTACCTTGGCA
GGTTTAACAATGAGGATCTCAGCACCAAAAGAACAAGTGTCTTGCACAATGTACCCATTG
TTAGTATTCTCGAATGTTGAAAGAGGGATCAATTTTCCAAATCCCC*ACTCCTTTTTTGC
AGCATTGTATCGCTTCACGGTTCCATCTGTGACAGTCAAGTACTTATGGGTCTTGGGATT
GTGGACAAAGAGTTTGAGATCAACATTGACTTCCCAACCATAAGGAAGAGATTCAGCGCC
TTCGGTTCTCGCGTAAAGTGATATATGGCCAGCTCCACCGTCGTTCTTATTACCAATCAC
GTACAAAACTAATCTCCATTTGTAACCAGCAGCTTC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2A972TF 621 0 0
GTATCGGTCTCCAACGAGAAAATCGGCAGAATAGTAAAATTTATCTTCCAAGCTGGAGAA
ACGAAGTATCTTCCAAGTGAAAATATTGTTTGGAGGGTTTGATATGAATGTGACTTTCTC
TTGTATCTCGGCAGGTTTAACAATGAGGATCTCAGCACCAAAAGAACAAGTGTCTTGCAC
AATGTACCCATTGTTAGTATTCTCGAATGTTGAAAGAGGGATCAATTTTCCAAATCCCCC
ACTCCTTTTTTGCAGCATTGTATCGCTTCACGGTTCCATCTGTGACAGTCAAGTACTTAT
GGGTCTTGGGATTGTGGACAAAGAGTTTGAGATCAACATTGACTTCCCAACCATAAGGAA
GAGATTCAGCGCCTTCGATTCTCGCGTAAAGTGATATATGGCCAGCTCCACCGTCGTTCT
TATTACCAATCACGTACAAAACTAATCTCCATTTGTAACCAGAAGCTTCAAAAACAGAGG
ATTCGTAGGGTTCGAATCTCCCTTTAATCACAGAGTACCCTGCTATTGTGACTATCTTAC
TTGATGTCGCTCCTCTCTAAACGCTCTTGTCTCTCCAAGATGCGCCTCGACATTGTAAGT
ACTGTTGTTCTCTGTTCCTCT

QA 1 621 1 621
DS 



CO CL1389Contig2 632 2 1 U
TGGATAGTCACAAAAAGAGCTTGTGCTTCATATCTCTCGCTTTTTTCTTCATCACTTGCT
CTTCTGCTGAGCTCCTCATTCAGCAGGTCACAGAAAGAGAAGTAACGGAGAACAACAGTT
CTTACAATCTCGAGGCGAATCTTGGAGCGACAAGAACATTTAGAGAGGAGAGACCATCAA
GTAAGATAGTGACAATAGCAGGCTACTCCGTGATTAAAGGGAGATTCGAACCCTACGAAT
CCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTTTTGTACGTGATTGGTAATA
AGAACGACGGTGGAGCTGGCCATATATCACTTTACGCGAGGATCGAAGGCACTGAATCTC
TTCCCTATGGTTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCCACAATCCCAAGACCC
ATAAGTACTTGACTGTCACAGATGGAACCGTGAAGCGATACAACGCTGCAAAAAAGGAGT
GGGGATTCGGAAAATTGATCCCTCTTTCAACATTCGAGGACACGAACAATGGGTACATTG
TGCAGGACACTTGTTCTTTTGGTGCTGAGATCCTCATCGTTAAACCGGCCGAGATACAAG
AGAAAGTCACTTTTATATCAAACCCTCCAAAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AX54JQ C 1
AF RR2AX54TFB U 1
BS 1 632 RR2AX54TFB

RD RR2AX54JQ 632 0 0
TGGATAGTCACAAAAAGAGCTTGTGCTTCATATCTCTCGCTTTTTTCTTCATCACTTGCT
CTTCTGCTGAGCTCCTCATTCAGCAGGTCACAGAAAGAGAAGTAACGGAGAACAACAGTT
CTTACAATCTCGAGGCGAATCTTGGAGCGACAAGAACATTTAGAGAGGAGAGACCATCAA
GTAAGATAGTGACAATAGCAGGCTACTCCGTGATTAAAGGGAGATTCGAACCCTACGAAT
CCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTTTTGTACGTGATTGGTAATA
AGAACGACGGTGGAGCTGGCCATATATCACTTTACGCGAGGATCGAAGGCACTGAATCTC
TTCCCTATGGTTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCCACAATCCCAAGACCC
ATAAGTACTTGACTGTCACAGATGGAACCGTGAAGCGATACAACGCTGCAAAAAAGGAGT
GGGGATTCGGAAAATTGATCCCTCTTTCAACATTCGAGGACACGAACAATGGGTACATTG
TGCAGGACACTTGTTCTTTTGGTGCTGAGATCCTCATCGTTAAACCGGCCGAGATACAAG
AGAAAGTCACTTTTATATCAAACCCTCCAAAC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2AX54TFB 632 0 0
TGGATAGTCACAAAAAGAGCTTGTGCTTCATATCTCTCGCTTTTTTCTTCATCACTTGCT
CTTCTGCTGAGCTCCTCATTCAGCAGGTCACAGAAAGAGAAGTAACGGAGAACAACAGTT
CTTACAATCTCGAGGCGAATCTTGGAGCGACAAGAACATTTAGAGAGGAGAGACCATCAA
GTAAGATAGTGACAATAGCAGGCTACTCCGTGATTAAAGGGAGATTCGAACCCTACGAAT
CCTCTGTTTTCGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTTTTGTACGTGATTGGTAATA
AGAACGACGGTGGAGCTGGCCATATATCACTTTACGCGAGGATCGAAGGCACTGAATCTC
TTCCCTATGGTTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCCACAATCCCAAGACCC
ATAAGTACTTGACTGTCACAGATGGAACCGTGAAGCGATACAACGCTGCAAAAAAGGAGT
GGGGATTCGGAAAATTGATCCCTCTTTCAACATTCGAGGACACGAACAATGGGTACATTG
TGCAGGACACTTGTTCTTTTGGTGCTGAGATCCTCATCGTTAAACCGGCCGAGATACAAG
AGAAAGTCACTTTTATATCAAACCCTCCAAAC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 2 5

CO CL1390Contig1 773 3 31 U
GGACACAACTTTCATTTCATAACTTAAACTTCAGAGCTACAACAGGAAAGAGAGTTTAAA
ACTCTACAATCAGAAAACATTACAACATAAAACATAGCTAAGACATTGAAATAGGATGAC
AGCGAATTCAGAGTCGGGCTTGAATGCGTCAAAGCAAGGTTCGCGGCACTGCCGGACACT
TGAAATTTAGTCACTTTGAGACGTGACGTTAATACCCAATCCGCACCTCGGAATATCGTC
GAAACGAAATCCGTTGCATCTTCAGGCCCCAAACGGACCGGTACACAAGATAGCAAAACG
GTTATAGATATGAGCACACACCTCCATTTAACGTTTGGAGGGGAAACATTCCTCTTGACT
GAGGCAGGGGTTGATAAGGTTCGCTTCTTCAGAAATCCTGATGAATCCACCAGTAATTGA
GCGACAAGACTCTTCACAAAAGAGAAATAAGGCGTTGAAAGCAAACTATCAGTGATAGAT
TTTGGACTTGTTAGGCCCACACCCAAACTTTGTAAACCCAGCCCACTTGATGTATCAAAT
TGTCTTTGCCGGTGGAATCCCAACTCGGCGCAAACGGAGCAGTGACATGTGAACGGCTGG
AGGCTTTTTCGTGACAAATTGATGGACGGTTCGGCTCTCCGATCTGTAGACGATATGGTA
TAGCACTGCGGAGAAACTTGACTGAGATCCTCACCTTCTCGGAGAGGAAGCAAAATCTTC
AGAGCTGAACCAAACATGATGGACAGCGGGGATGGTGTCAGATCCGGCGGGTG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX46JQ U 1
AF RR2E931JQ U 1
AF RR2F619JQ U 51
BS 1 105 RR2E931JQ
BS 106 106 RR2FX46JQ
BS 107 113 RR2E931JQ
BS 114 114 RR2FX46JQ
BS 115 123 RR2E931JQ
BS 124 124 RR2FX46JQ
BS 125 140 RR2E931JQ
BS 141 141 RR2FX46JQ
BS 142 230 RR2E931JQ
BS 231 231 RR2FX46JQ
BS 232 279 RR2E931JQ
BS 280 280 RR2FX46JQ
BS 281 285 RR2E931JQ
BS 286 286 RR2FX46JQ
BS 287 300 RR2E931JQ
BS 301 301 RR2FX46JQ
BS 302 331 RR2E931JQ
BS 332 332 RR2FX46JQ
BS 333 434 RR2E931JQ
BS 435 435 RR2FX46JQ
BS 436 538 RR2E931JQ
BS 539 539 RR2FX46JQ
BS 540 600 RR2E931JQ
BS 601 601 RR2F619JQ
BS 602 647 RR2E931JQ
BS 648 648 RR2F619JQ
BS 649 731 RR2E931JQ
BS 732 732 RR2F619JQ
BS 733 746 RR2E931JQ
BS 747 747 RR2F619JQ
BS 748 773 RR2E931JQ

RD RR2FX46JQ 596 0 0
GA
ACACAACTTTCATTTCATAACTTAAACTTCAGAGCTACAATAGGAAAGAGAGTTTAAAAC
TCTACAATCAGAAAACATTACAACATAAAACATAGCTAAAACATTGAAATAGGATGACAG
CGAATTCAGAGTCGGGCTTGAATGCGTCAAAGCAAGGTTCGCGGCACTGCCGGACACTTG
AAATTTAGTCACTTTGGGACGTGACGTTAATACCCAATCCGCACCTCGGAATATCGTCAA
AACGAAATCCGTTGCATCTTCAGGCCCCAAACGGACCGGTACACAAAATAGCAAAACGGT
TATAGATATGAGCACACCCCTCCATTTAACGTTTGGAGGGGAAACATTCCTCTTGACTGA
GGCAGGGGTTGATAAGGTTCGCTTCTTCAAAAATCCTGATGAATCCACCAGTAATTGAGC
GACAAGACTCTTCACAAAAAAAAAATAAGGCGTTGAAGGCAAACTATCAGTGGTAAATTT
TGGACTTGTTAGGCCCACACCCAAACTTTGTAAACCCAGCCCACTTGATGTATCAAATTG
TCTTTGCCGGTGGAATCCCAACTCGGCGCAAACGGAGCAGTGACATGTGAACGG

QA 3 596 3 596
DS 

RD RR2E931JQ 773 0 0
GGACACAACTTTCATTTCATAACTTAAACTTCAGAGCTACAACAGGAAAGAGAGTTTAAA
ACTCTACAATCAGAAAACATTACAACATAAAACATAGCTAAGACACTGAAATATGATGAC
AGCAAATTCAGAGTCGGGCTCGAATGCGTCAAAGCAAGGTTCGCGGCACTGCCGGACACT
TGAAATTTAGTCACTTTGAGACGTGACGTTAATACCCAATCCGCACCTCGAAATATCGTC
GAAACGAAATCCGTTGCATCTTCAGGCCCCAAACGGACCAGTACATAAGATAGCAAAACG
ATTATAGATATGAGCACACACCTCCATTTAATGTTTGGAGGGGAAACATTCCTCTTGACT
GAGGCAGGGGTTGATAAGGTTCGCTTCTTCAGAAATCCTGATGAATCCACCAGTAATTGA
GCGACAAGACTCTTTACAAAAGAGAAATAAGGCGTTGAAAGCAAACTATCAGTGATAGAT
TTTGGACTTGTTAGGCCCACACCCAAACTTTGTAAACCCAGCCCACTTGATGTATCAATT
TGTCTTTGCCGGTGGAATCCCAACTCGGCGCAAACGGAGCAGTGACATGTGAACGGCTGG
TGGCTTTTTCGTGACAAATTGATGGACGGTTCGGCTCTCCGATCTGTTGACGATATGGTA
TAGCACTGCGGAGAAACTTGACTGAGATCCTCACCTTCTCGGAGAGGAAGCAAAATCTTC
AGAGCTGAACCGAACATGATGGACAGTGGGGATGGTGTCAGATCCGGCGGGTG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2F619JQ 712 0 0
AGAGTTTAAAACTCTACAATCAGAAAACATTACAACATAAAACATAGCTAAGACATTGAA
ATAGGATGACAGCGAATTCAGAGTCGGGCTTGAATGCGTCAAAGCAAGGTTCGCGGCACT
GCCGGCCACTTGAAATTTAGTCACTTTGAGACGTGACGTTAATACCCAATCCGCACCTCG
GAATATCGTCGAAACGAAATCCGTTGCATCTTCAGGCCCCAAACGGACCGGTACACAAGA
TAGCAAAACGGTTATAGATATGAGCACACACCTCCATTTAACGTTTGGAGGGGAAACATT
CCTCTTGACTGAGGCAGGGGTTGATAAGGTTCGCTTCTTCAGAAATCCTGATGAATCCAC
CAGTAATTGAGCGACAAGACTCTTCACAAAAGAGAAATAAGGCGTTGAAAGCAAACTATC
AGTGATAGATTTTGGACTTGTTAGGCCCACACCCAAACTTTGTAAACCCAGCCCACTTGA
TGTATCAAATTGTCTTTGCCGGTGGAATCCCAACTCGGCGCAAACGGAGCAGTGACATGT
GAACGGCTGGAGGCTTTTTGGTGACAAATTGATGGACGGTTCGGCTCTCCGATCTGTAGA
CGATATGGTATAGCACTGCGGAGAAACTTGACTGAGATTCTCACCTTCTCGGAGAGGAAG
CAAAATCTTCAGAGCTGAACCAAACATGATGGACAGCGGGGATGGTGTCAGA

QA 1 712 1 712
DS 



CO CL1390Contig2 670 2 4 U
GCGAGTTCGCCCTAAACTCTCTCAGGTCCAGTTATCGAGACAGCGCCGTCACTTCGTCTC
CTTGACGCCGGTGGTGCCTCTGGCCGCCGGCGTCGAGCCATCTCCGCCACTGTTCAACCT
CGCCCTCGATTCTGTTGCATCTTCCCAGTCTCGACGAGATCTCTCGTCTACTTTCTTATG
TGCTCTTCTCAAGACGACGGATCTGTTCAGAGAAGGTTCGCCGCTGTGATTAGGAGAGCT
CCGTCTTTGCGTTACAGGTGGGACTCCACCGGTTTCAAATCTTACTGGGGGATTCCCCAT
TATTGTTGCTTCTTGGCCTTACTCACCAGTTTCACTCACACTGTTGTGTCTGATCTTTCA
ATTTGCTCCACCGACCTTCTAATCGGTGCATCTCTACTCCTTTATGAAGAAGAAACCGTG
AGCGTTTCCAGATCTAGGTCTCACCCGCCGGATCTGACACCATCCCCGCTGTCCATCATG
TTTGGTTCAGCTCTGAAGATTTTGCTTCCTCTCCGAGAAGGTGAGAATCTCAGTCAAGTT
TCTCCGCAGTGCTATACCATATCGTCTACAGATCGGAGAGCCGAACCGTCCATCAATTTG
TCACCAAAAAGCCTCCAGCCGTTCACATGTCACTGCTCCGTTTGCGCCGAGTTGGGATTC
CACCGGCAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F619TF U 1
AF RR2FX46TF U 8
BS 1 143 RR2F619TF
BS 144 144 RR2FX46TF
BS 145 517 RR2F619TF
BS 518 670 RR2FX46TF

RD RR2F619TF 517 0 0
GCGAGTTCGCCCTAAACTCTCTCAGGTCCAGTTATCGAGACAGCGCCGTCACTTCGTCTC
CTTGACGCCGGTGGTGCCTCTGGCCGCCGGCGTCGAGCCATCTCCGCCACTGTTCAACCT
CGCCCTCGATTCTGTTGCATCTTTCCAGTCTCGACGAGATCTCTCGTCTACTTTCTTATG
TGCTCTTCTCAAGACGACGGATCTGTTCAGAGAAGGTTCGCCGCTGTGATTAGGAGAGCT
CCGTCTTTGCGTTACAGGTGGGACTCCACCGGTTTCAAATCTTACTGGGGGATTCCCCAT
TATTGTTGCTTCTTGGCCTTACTCACCAGTTTCACTCACACTGTTGTGTCTGATCTTTCA
ATTTGCTCCACCGACCTTCTAATCGGTGCATCTCTACTCCTTTATGAAGAAGAAACCGTG
AGCGTTTCCAGATCTAGGTCTCACCCGCCGGATCTGACACCATCCCCGCTGTCCATCATG
TTTGGTTCAGCTCTGAAGATTTTGCTTCCTCTCCGAG

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2FX46TF 663 0 0
CGCCCTAAACTCTCTCAGGTCCAGTTATCGAGACAGCGCCGTCACTTCGTCTCCTTGACG
CCGGTGGTGCCTCTGGCCGCCGGCGTCGAGCCATCTCCGCCACTGTTCAACCTCGCCCTC
GATTCTGTTGCATCTTCCCAGTCTCGACGAGATCTCTCGTCTACTTTCTTATGTGCTCTT
CTCAAGACGACGGATCTGTTCAGAGAAGGTTCGCCGCTGTGATTAGGAGAGCTCCGTCTT
TGCGTTACAGGTGGGACTCCACCGGTTTCAAATCTTACTGGGGGATTCCCCATTATTGTT
GCTTCTTGGCCTTACTCACCAGTTTCACTCACACTGTTGTGTCTGATCTTTCAATTTGCT
CCACCGACCTTCTAATCGGTGCATCTCTACTCCTTTATGAAGAAGAAACCGTGAGCGTTT
CCAGATCTAGGTCTCACCCGCCGGATCTGACACCATCCCCGCTGTCCATCATGTTTGGTT
CATCTCTGAAGATTTTGCTTCCTCTCCGAGAAGGTGAGAATCTCAGTCAAGTTTCTCCGC
AGTGCTATACCATATCGTCTACAGATCGGAGAGCCGAACCGTCCATCAATTTGTCACCAA
AAAGCCTCCAGCCGTTCACATGTCACTGCTCCGTTTGCGCCGAGTTGGGATTCCACCGGC
AAA

QA 1 663 1 663
DS 



AS 2 5

CO CL1391Contig1 1160 2 6 U
GGAGAGAAGAGAAGATCGATCGAAACGACGCCGTCGAAGCTATGCTCCGGTACGCCGACG
CCGGTCTCTCTACTTTCGACATGGCCGATCACTATGGTCCTGCGGAAGATCTCTACGGCA
TTTTTATCAATAGGGTTCGTCGAGAGCGTCCACCAGATTATTTGGAAAAGGTTAAAGGTT
TGACAAAATGGGTGCCTCCTCCAGTGAAAATGACGAGCAGCTATGTTCGTCAAAACATTG
ACATATCTCGGAAGAGAATGGATGTTGCTTCTCTTGATATGCTTCAGTTTCACTGGTGGG
ATTACGCGAATGACGGTTATCTTGATGCATTGAAACACCTCACTGACTTAAAAGAAGAAG
GTAAGATCAAGACTGTTGCTTTGACAAATTTTGATACAAAGAGACTTGAGATCATCTTAG
AGAATGGAATCCCTGTTGTTAGCAACCAGGTGCAACACTCCATTGTAGACATGCGTCCTT
AACAGAGAATGGCTCAGCTTTGTGAGCTTACAGGCGTCAAACTTATAACATATGGGACAG
TAATGGGTGGTCTACTGTCAGAGAAGTTCCTTGATGCCAATCTAACTATCCCTTTTGCTG
GCCCTAGTTTGAATATTCCTTCTCTCCAAAAGTACAAAAGGATGGTTGATGCTTGGGGAG
GGTGGAATCTATTCCAAGGTTTGCTTCGCACGATGAAGAGCATAGCCACAAAACATGGAG
TTTCTATTCCGACCGTGGCCGTGAGATACGTACTAGATCAGCAAGGAGTTGGTGGATCAA
TGATTGGGGTGAGGCTTGGGTTAGCGGAACACATACAAGATGCAAACGCTATATTCTCAT
TGGTATTGGATGATGAAGATGTGAATAGCATACAAGAGGCTACCAAGAAAGGTAAAAATC
TTCTTCAAGTGATTGGTGACTGTGGAGACGAGTACCGACGTGCCTGATCTTGTAGAATAC
CGTACACATGTACTCAAGACACAAGATCTGTGTTAGGATTCGTATATATGAGTTCAATAC
TTGACCAAATTTGAGATTGTTTAAATGGATGTATTACCCTATTTTGACTCGAACTGTCCC
AACAACTAAACTATGTATTGTACTATTGTTACACGGGCTAAAACCTTAAAAATATATTAA
ACTAGGAGTTTTCCTGCGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN82TF U 1
AF RR2FN82JQ C 494
BS 1 630 RR2FN82TF
BS 631 631 RR2FN82JQ
BS 632 640 RR2FN82TF
BS 641 641 RR2FN82JQ
BS 642 654 RR2FN82TF
BS 655 1160 RR2FN82JQ

RD RR2FN82TF 654 0 0
GGAGAGAAGAGAAGATCGATCGAAACGACGCCGTCGAAGCTATGCTCCGGTACGCCGACG
CCGGTCTCTCTACTTTCGACATGGCCGATCACTATGGTCCTGCGGAAGATCTCTACGGCA
TTTTTATCAATAGGGTTCGTCGAGAGCGTCCACCAGATTATTTGGAAAAGGTTAAAGGTT
TGACAAAATGGGTGCCTCCTCCAGTGAAAATGACGAGCAGCTATGTTCGTCAAAACATTG
ACATATCTCGGAAGAGAATGGATGTTGCTTCTCTTGATATGCTTCAGTTTCACTGGTGGG
ATTACGCGAATGACGGTTATCTTGATGCATTGAAACACCTCACTGACTTAAAAGAAGAAG
GTAAGATCAAGACTGTTGCTTTGACAAATTTTGATACAAAGAGACTTGAGATCATCTTAG
AGAATGGAATCCCTGTTGTTAGCAACCAGGTGCAACACTCCATTGTAGACATGCGTCCTT
AACAGAGAATGGCTCAGCTTTGTGAGCTTACAGGCGTCAAACTTATAACATATGGGACAG
TAATGGGTGGTCTACTGTCAGAGAAGTTCCTTGATGCCAATCTAACTATCCCTTTTGCTG
GCCCTAGTTTGAATATTCCTTCTCTCCAAA*GTACAAAAG*ATGGTTGATGCTT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2FN82JQ 667 0 0
TCAGCTTTGTGAGCTTACAGGCGTCAAACTTATAACATATGGGACAGTAATGGGTGGTCT
ACTGTCAGAGAAGTTCCTTGATGCCAATCTAACTATCCCTTTTGCTGGCCCTAGTTTGAA
TATTCCTTCTCTCCAAAAGTACAAAAGGATGGTTGATGCTTGGGGAGGGTGGAATCTATT
CCAAGGTTTGCTTCGCACGATGAAGAGCATAGCCACAAAACATGGAGTTTCTATTCCGAC
CGTGGCCGTGAGATACGTACTAGATCAGCAAGGAGTTGGTGGATCAATGATTGGGGTGAG
GCTTGGGTTAGCGGAACACATACAAGATGCAAACGCTATATTCTCATTGGTATTGGATGA
TGAAGATGTGAATAGCATACAAGAGGCTACCAAGAAAGGTAAAAATCTTCTTCAAGTGAT
TGGTGACTGTGGAGACGAGTACCGACGTGCCTGATCTTGTAGAATACCGTACACATGTAC
TCAAGACACAAGATCTGTGTTAGGATTCGTATATATGAGTTCAATACTTGACCAAATTTG
AGATTGTTTAAATGGATGTATTACCCTATTTTGACTCGAACTGTCCCAACAACTAAACTA
TGTATTGTACTATTGTTACACGGGCTAAAACCTTAAAAATATATTAAACTAGGAGTTTTC
CTGCGCT

QA 1 667 1 667
DS 



CO CL1391Contig2 508 3 17 U
AAGGTTTTAGCCCATGTAACAATAGTACAATACATAGTTTAGTTTTTGAGACAGTTCGAG
TCAAAATAGGGTAATACATCCATTTAAACCATCTCAAATTTGGTCAAGTATTGAACTCAT
ATATACGAATCCTAACACAGATCTTGTGTCTTGAGTACATGTGTACGGTATTTTACAAGA
TCAGGCACGTCGG*ACTCGTCTCCACAGTCACCAATCACTTGGAGAAGATTTTTACCTTT
CTTTGTAGCCTCTTGTATGCTATTCACATCTTCTTCATCCAATACCAATGAGAATATAGC
GTTTGCATCTTGTATATGTTCCGCTAACCCTAGCCTCACCCCAATCATTGATCCACCAAC
TCCTTGCTGATCTAGTACGTATCTCACGGCCACGGTGGGAATAGAAACTCCATGTTTTGT
GGCTATGCTCTTCATCGTGCGAAGCAAACCTTGGAAAAAATTCCACCCTCCCCATGCATC
AACCATCCTTTTGTACTTTTGGAGAGAA


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H953JQ U 2
AF RR2H953TF C 2
AF RR2G086JQ U 1
BS 1 168 RR2G086JQ
BS 169 169 RR2H953JQ
BS 170 172 RR2G086JQ
BS 173 173 RR2H953JQ
BS 174 185 RR2G086JQ
BS 186 186 RR2H953JQ
BS 187 193 RR2G086JQ
BS 194 194 RR2H953JQ
BS 195 227 RR2G086JQ
BS 228 228 RR2H953JQ
BS 229 291 RR2G086JQ
BS 292 292 RR2H953JQ
BS 293 400 RR2G086JQ
BS 401 401 RR2H953JQ
BS 402 403 RR2G086JQ
BS 404 404 RR2H953JQ
BS 405 508 RR2G086JQ

RD RR2H953JQ 431 0 0
AGGTTTTAGCCCATGTAACAATAGTACAATACATAGTTTAGTTTTTGAGACAGTTCGAGT
CAAAATAGGGTAATACATCCATTTAAACCATCTCAAATTTGGTCAAGTATTGAACTCATA
TATACGAATCCTAACACAGATCTTGTGTCTTGAGTACATGTGTACGGTATTTTACAAGAT
CAGGCACGTCGG*ACTCGTCTCCACAGTCACCAATCACTTGGAGAAGATTTTTACCTTTC
TTTGTAGCCTCTTGTATGCTATTCACATCTTCTTCATCCAATACCAATGAGAATATAGCG
TTTGCATCTTGTATATGTTCCGCTAACCCTAGCCTCACCCCAATCATTGATCCACCAACT
CCTTGCTGATCTAGTACGTATCTCACGGCCACGGTGGGAATAGAAACTCCATGTTTTGTG
GCTATGCTCT
C

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2H953TF 431 0 0
AGGTTTTAGCCCATGTAACAATAGTACAATACATAGTTTAGTTTTTGAGACAGTTCGAGT
CAAAATAGGGTAATACATCCATTTAAACCATCTCAAATTTGGTCAAGTATTGAACTCATA
TATACGAATCCTAACACAGATCTTGTGTCTTGAGTACATGTGTACGGTATTTTACAAGAT
CAGGCACGTCGG*ACTCGTCTCCACAGTCACCAATCACTTGGAGAAGATTTTTACCTTTC
TTTGTAGCCTCTTGTATGCTATTCACATCTTCTTCATCCAATACCAATGAGAATATAGCG
TTTGCATCTTGTATATGTTCCGCTAACCCTAGCCTCACCCCAATCATTGATCCACCAACT
CCTTGCTGATCTAGTACGTATCTCACGGCCACGGTGGGAATAGAAACTCCATGTTTTGTG
GCTATGCTCT
C

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2G086JQ 508 0 0
AAGGTTTTAGCCCATGTAACAATAGTACAATACATAGTTTAGTTTTTGAGACAGTTCGAG
TCAAAATAGGGTAATACATCCATTTAAACCATCTCAAATTTGGTCAAGTATTGAACTCAT
ATATACGAATCCTAACACAGATCTTGTGTCTTGAGTACATGTGTACGGGATTCTACAAGA
TCAGGAACGTCGGTACTCGTCTCCACAGTCACCAATCACTTGGAGAAAATTTTTACCTTT
CTTTGTAGCCTCTTGTATGCTATTCACATCTTCTTCATCCAATACCAATGAAAATATAGC
GTTTGCATCTTGTATATGTTCCGCTAACCCTAGCCTCACCCCAATCATTGATCCACCAAC
TCCTTGCTGATCTAGTACGTATCTCACGGCCACGGTGGGAGTAAAAACTCCATGTTTTGT
GGCTATGCTCTTCATCGTGCGAAGCAAACCTTGGAAAAAATTCCACCCTCCCCATGCATC
AACCATCCTTTTGTACTTTTGGAGAGAA

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 5

CO CL1392Contig1 1124 5 28 U
GGGCCTCCTCGTCACTCATCTCACATAGCTAAACAATGGTGTTTGTGAAGCCATCCAAGT
CGAATGCTTACTTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGGAGAGCTGGAAAGACTG
ATTACAGAGCAAGAATCCGCCTCATCAACCAAGACAAGAACAAGTACAACACCCCCAAAT
ACCGTTTCGTCGTCCGTTTCACCAACAAAGACATCGTCGCGCAAATCGTGTCCGCGAGCA
TAGCTGGTGACATTGTCAAGGCTTCTGCTTATGCACATGAGCTGCCTCACTATGGGCTCA
CTGTTGGGCTCTCCAACTATGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCTTCTCTTGGCTCGCCGTG
TTTTGAAGATGTTGGAAATGGATGCTGAGTATGAAGGCAACGTGGAGGCCACTGGAGAAG
ACTTCTCTGTGGAACCAACTGAGTCGAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTGATGTCGGTC
TTATCAGGACCACAACAGGAAACCGTGTCTTCGGTGCACTCAAGGGTGCATTGGACGGAG
GTCTTGATATCCCTCACAGTGACAAGAGATTTGCCGGTTTCAACAAAGAAAACAAACAGC
TTGATGCTGAGATCCACAGGAACTACATATATGGTGGCCATGTCTCGAACTATATGAAGA
TGTTGAATGAAGATGAGCCGGAAAAGTTTCAAACTCACTTCAGCCAGTACTTGAAGAAAG
GAGTTGATGCCGAGAGCATGGAGGGGTTGTACAAGAAGGTTCATGCGGCCATCCGTGCTG
ACCCCAACCCAAAGAAGACTGAGAAACCTGCTCCCAAGGCACACAAGAGGTACAATTTGA
AGAAGCTGACGTATGAAGAAAGGAAGAACAAGTTGATTGAGAGAGTTAAGGCATTGAATG
GAGCAGCTGGTGGTGATGACGATGATGAGGAGGACGAAGAGTAAATCAGTGCAACTCTTA
CCGTCTCATGATGTTGTCTCTTGTAGCTTTTTACTGTTTTGAGCTTAATGCCTCTTTTAT
TCTATTTTCAAGACTAAAACACTCAGTTTTTGTTTTCACATTTGAATTGGGTTATCTGAG
GATTTACTTCTTTTTTCCTTTTAAGAAGTTATTATCGTCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2GH69TF U 1
AF RR2BY81TF U 12
AF RR2BJ46TF U 10
AF RR2BJ46JQ C 280
AF RR2GH69JQB C 368
BS 1 229 RR2GH69TF
BS 230 230 RR2BJ46TF
BS 231 283 RR2GH69TF
BS 284 284 RR2BJ46TF
BS 285 361 RR2GH69TF
BS 362 362 RR2BJ46TF
BS 363 424 RR2GH69TF
BS 425 425 RR2BJ46TF
BS 426 439 RR2GH69TF
BS 440 440 RR2BJ46TF
BS 441 523 RR2GH69TF
BS 524 524 RR2BJ46TF
BS 525 536 RR2GH69TF
BS 537 586 RR2BJ46TF
BS 587 587 RR2BY81TF
BS 588 758 RR2BJ46TF
BS 759 759 RR2BJ46JQ
BS 760 814 RR2BJ46TF
BS 815 901 RR2BJ46JQ
BS 902 902 RR2GH69JQB
BS 903 1028 RR2BJ46JQ
BS 1029 1029 RR2GH69JQB
BS 1030 1070 RR2BJ46JQ
BS 1071 1071 RR2GH69JQB
BS 1072 1097 RR2BJ46JQ
BS 1098 1098 RR2GH69JQB
BS 1099 1119 RR2BJ46JQ
BS 1120 1124 RR2GH69JQB

RD RR2GH69TF 536 0 0
GGGCCTCCTCGTCACTCATCTCACATAGCTAAACAATGGTGTTTGTGAAGCCATCCAAGT
CGAATGCTTACTTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGGAGAGCTGGAAAGACTG
ATTACAGAGCAAGAATCCGCCTCATCAACCAAGACAAGAACAAGTACAACACCCCCAAAT
ACCGTTTCGTCGTCCGTTTCACCAACAAAGACATCGTCGCGCAAATCGTTTCCGCGAGCA
TAGCTGGTGACATTGTCAAGGCTTCTGCTTATGCACATGAGCTTCCTCACTATGGGCTCA
CTGTTGGGCTCTCCAACTATGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCTTCTCTTGGCTCGCCGTG
TGTTGAAGATGTTGGAAATGGATGCTGAGTATGAAGGCAACGTGGAGGCCACTGGAGAAG
ACTTTTCTGTGGAACCAACCGAGTCGAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTGATGTCGGTC
TTATCAGGACCACAACAGGAAACCGTGTCTTCGGTGCACTCAAAGGTGCATTGGAC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2BY81TF 673 0 0
GGACTC
ATCTCACATAGCTAAACAATGGTGTTTGTGAAGCCATCCAAGTCGAATGCTTACCTCAAG
AGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGGAGAGCTGGAAAGACTGATTACAGAGCAAGAATC
CGTCTCATCAACCAAGACAAGAACAAGTACAACACCCCCAAGTACCGTTTTGTTGTCCGT
TTCACCAACAAAGACATCGTCGCGCAAATCGTGTCCGCGAGCATAGCCGGTGATATTGTC
AAGGCTTCTGCCTATGCACATGAGCTGCCACACTATGGGCTTACTGTTGGGCTCTCCAAC
TACGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCTTCTCTTGGCTCGCCGTGTTTTGAAGATGTTGGAA
ATGGATGCTGAGTATGGAGGCAACGTGGAGGCCACTGGGGAAGACTTCTCTGTGGAACCA
ACTGAGTCGAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTGATGTCGGTCTTATCAGGACCACAACA
GGAAACCGCGTCTTCGGTGCACTCAAGGGTGCATTGGACGGAGGTCTTGATATCCCTCAC
AGTGACAAGAGATTTGCCGGTTTCAACAAAGAAAACAAACAGCTTGATGCTGAGATCCAC
AGGAACTACATATATGGTGGCCATGTCTCGA*CTATATGAAGATGGTGAATGAAGATGAG
CCGGAAA

QA 7 673 7 673
DS 

RD RR2BJ46TF 805 0 0
GGACTCAT
ATCTCACATAGCTAAACAATGGTGTTTGTGAAGCCATCCAAGTCGAATGCTTACTTCAAG
AGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGGAGAGCTGGAAAGACTGATTACAGAGCAAGAATC
CGCCTCATCAACCAAGACAAGAACAAGTACAACACCCCCAAATACCGCTTCGTCGTCCGT
TTCACCAACAAAGACATCGCCGCGCAAATCGTGTCCGCGAGCATAGCTGGTGACATTGTC
AAGGCTTCTGCTTACGCACATGAGCTGCCTCACTATGGGCTCACTGTTGGGCTCTCCAAC
TATGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCTTCTCTTGGCTCGCCGTGTTTTGAAGATGTTGGAA
ATGGATGCTGAGTATGAAGGCAACGTCGAGGCCACTGGAGAAGACTTCTCTGTGGAACCA
ACTGAGTCGAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTGATGTCGGTCTTATCAGGACCACAACA
GGAAACCGTGTCTTCGGTGCACTCAAGGGTGCATTGGACGGAGGTCTTGATATCCCTCAC
AGTGACAAGAGATTTGCCGGTTTCAACAAGGAAAACAAACAGCTTGATGCTGAGATCCAC
AGGAACTACATATATGGTGGCCATGTCTCGAACTATATGAAGATGTTGAATGAAGATGAG
CCGGAAAAGTTTCAAACTCACTTCAGCCAGTACTTGAAGAAAGGAGTTGATGCCGAGAGC
ATGGAGGGGTTGTACAAGAAG*TTCATGCGGCCATCCGTGCTGACCCCAACCCAAAGAAG
ACTGAGAAACCTGCTCC

QA 9 805 9 805
DS 

RD RR2BJ46JQ 843 0 0
AGCTGCCTCACTATGGGCTCACTGTTGGGCTCTCCAACTATGCTGCAGCTTACTGTACTG
GCCTTCTCTTGGCTCGCCGTGTTTTGAAGATGTTGGAAATGGATGCTGAGTATGAAGGCA
ACGTCGAGGCCACTGGAGAAGACTTCTCTGTGGAACCAACTGAGTCGAGGAGACCTTTCC
GTGCTCTTCTTGATGTCGGTCTTATCAGGACCACAACAGGAAACCGTGTCTTCGGTGCAC
TCAAGGGTGCATTGGACGGAGGTCTTGATATCCCTCACAGTGACAAGAGATTTGCCGGTT
TCAACAAGGAAAACAAACAGCTTGATGCTGAGATCCACAGGAACTACATATATGGTGGCC
ATGTCTCGAACTATATGAAGATGTTGAATGAAGATGAGCCGGAAAAGTTTCAAACTCACT
TCAGCCAGTACTTGAAGAAAGGAGTTGATGCCGAGAGCATGGAGGGGTTGTACAAGAAGG
TTCATGCGGCCATCCGTGCTGACCCCAACCCAAAGAAGACTGAGAAACCTGCTCCCAAGG
CACACAAGAGGTACAATTTGAAGAAGCTGACGTATGAAGAAAGGAAGAACAAGTTGATTG
AGAGAGTTAAGGCATTGAATGGTGCAGCTGGTGGTGATGACGATGATGAGGAGGACGAAG
AGTAAATCAGTGCAACTCTTACCGTCTCATGATGTTGTCTCTTGTAGCTTTTTACTGTTT
TGAGCTTAATGCCTCTTTTATTCTATTTTTAAGACTAAAACACTCAGTTTTTGTTTTCAC
ATTTGAATTGGTTTATCTGAGGATTTACTTCTTTTTTC*TTTTAAGAAGTTATTATCGTC
CAG

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2GH69JQB 757 0 0
GATGTTGGAAATGGATGCTGAGTATGAAGGCAACGTGGAGGCCACTGGAGAAGACTTTTC
TGTGGAACCAACCGAGTCGAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTGATGTCGGTCTTATCAG
GACCACAACAGGAAACCGTGTCTTCGGTGCACTCAAGGGTGCATTGGACGGAGGTCTTGA
TATCCCGCACAGTGACAAGAGATTTACCGGTTTCAACAAAGAGAACAAACAGCTCGATTC
TGAGATCCACAGGAACTACATCTATGGTGGCCATGTCTCGAACTATATGAAGATGTTGAA
CGAAGATGAGCCGGAAAAGTTTCAAACTCACTTCAGTCAGTACTTGAAGAAAGGAGTTGA
TGCCGAGAGCATGGAGGAGTTGTACAAGAAGGTTCATGCTGCCATCCGTGCTGACCCCAA
CCCGAAGAAGACTCAGAAACCTGCTCCCAAGGCACACAAGAGGTACAATTTGAAGAAGCT
GACGTATGAAGAGAGGAAGAACAAGTTGATTGAGAGAGTTAAGGCATTGAATGGAGCAGC
TGGTGGTGATGACGATGATGAGGAGGACGAAGAGTAAATCAGTGCAACTCTTACTGTCTC
ATGATGTTGTCTCTTGTAGCTTTTTACTGTTTTGAGCTTAATGCCTCTTTTATTTTATTT
TCAAGACTAAAACACTCAGTTTTTGTTTTCACATTTGAATTGGGTTATCTGAGGATTTAC
TTCTTTTTTCCTTTTAAGAAGTTATTATCGTCTTCCC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 6

CO CL1393Contig1 697 6 4 U
GGGAGCAACCGCTTAAACCACTACCTCTACTTGTTTCCGCTACTCTTCCGCCATTTT*CA
CTCAGCTGCTTGCTTGTTAGCTAAAAAAATGGGAAGCGATACAGAAGCAGAGAAGTCGAT
TCAAAAGGAGAAGAAGAAGGTCATCTCCCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTCGCCGGAAA
AAAGCTCCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAAAAGTGTTTGAA
GAGAGGCGTTAAGGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGTCAGAAAGGAATATGTGTTAT
AGCTGGAAACATATCTCCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGC
CGGTATTCCTTACGTCTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGGGCTACAAA
GCGACCAACTTGTTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGA
GGATCTCGAGAAGTTGAAGCCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTC
ATCATCTGTAATCTGAATCAGAAAAACACATGAACGTGTCTTTCTTATTTTGTTTGTTGT
TGCTTAATGAATATGACGAGATTTTAAAGCCTGGGAAAATGCTTATTCTATTTGCCAACT
AACAAAACCAAAAAGAAACTGTAAGCCCAAAAAAAAA


BQ
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ94JQ C 1
AF RR2H255TF U 1
AF RR2AQ94TF U 1
AF RR2DO88TF U 2
AF RR2H148JQ C 1
AF RR2H148TF U 1
BS 1 625 RR2H255TF
BS 626 631 RR2AQ94TF
BS 632 654 RR2DO88TF
BS 655 697 RR2H148TF

RD RR2AQ94JQ 631 0 0
GGGAGCAACCGCTTAAACCACTACCTCTACTTGTTTCCGCTACTCTTCCGCCATTTT*CA
CTCAGCTGCTTGCTTGTTAGCTAAAAAAATGGGAAGCGATACAGAAGCAGAGAAGTCGAT
TCAAAAGGAGAAGAAGAAGGTCATCTCCCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTCGCCGGAAA
AAAGCTCCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAAAAGTGTTTGAA
GAGAGGCGTTAAGGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGTCAGAAAGGAATATGTGTTAT
AGCTGGAAACATATCTCCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGC
CGGTATTCCTTACGTCTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGGGCTACAAA
GCGACCAACTTGTTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGA
GGATCTCGAGAAGTTGAAGCTAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTC
ATCATCTGTAATCTGAATCAGAAAAACACATGAACGTGTCTTTCTTATTTTGTTTGTTGT
TGCTTAATGAATATGACGAGATTTTAAAGCC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2H255TF 625 0 0
GGGAGCAACCGCTTAAACCACTACCTCTACTTGTTTCCGCTACTCTTCCGCCATTTT*CA
CTCAGCTGCTTGCTTGTTAGCTAAAAAAATGGGAAGCGATACAGAAGCAGAGAAGTCGAT
TCAAAAGGAGAAGAAGAAGGTCATCTCCCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTCGCCGGAAA
AAAGCTCCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAAAAGTGTTTGAA
GAGAGGCGTTAAGGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGTCAGAAAGGAATATGTGTTAT
AGCTGGAAACATATCTCCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGC
CGGTATTCCTTACGTCTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGGGCTACAAA
GCGACCAACTTGTTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGA
GGATCTCGAGAAGTTGAAGCCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTC
ATCATCTGTAATCTGAATCAGAAAAACACATGAACGTGTCTTTCTTATTTTGTTTGTTGT
TGCTTAATGAATATGACGAGATTTT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2AQ94TF 632 0 0
GGGAGCAACCGCTTAAACCACTACCTCTACTTGTTTCCGCTACTCTTCCGCCATTTT*CA
CTCAGCTGCTTGCTTGTTAGCTAAAAAAATGGGAAGCGATACAGAAGCAGAGAAGTCGAT
TCAAAAGGAGAAGAAGAAGGTCATCTCCCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTCGCCGGAAA
AAAGCTCCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAAAAGTGTTTGAA
GAGAGGCGTTAAGGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGTCAGAAAGGAATATGTGTTAT
AGCTGGAAACATATCTCCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGC
CGGTATTCCTTACGTCTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGGGCTACAAA
GCGACCAACTTGTTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGA
GGATCTCGAGAAGTTGAAGCTAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTC
ATCATCTGTAATCTGAATCAGAAAAACACATGAACGTGTCTTTCTTATTTTGTTTGTTGT
TGCTTAATGAATATGACGAGATTTTAAAGCC
C

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2DO88TF 653 0 0
GGAGCAACCGCTTAAACCACTACCTCTACTTGTTTCCGCTACTCTTCCGCCATTTTTCAC
TCAGCTGCTTG****TTAACTAAAAACATGGGAAGCGATACAGAAGCAGAGAAGTCGATT
CAAAAGGAGAAGAAGAAGGTCATCTCCCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTCGCCGGGAAG
AAGCTCCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAGAAGTGTTTGAAG
AGAGGTGTTAAAGAAGTGGTTAAGAGCATAAGACGTGGTCAGAAAGGGATATGTGTTATA
GCTGGAAACATATCTCCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGCC
GGTATCCCTTACGTCTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGGGCTACAAAG
CGACCAACTTGTTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAG
GATCTCGAGAAGTTGAAGCCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTCA
TCATCTGTAATCTGAATCAGAAAAACACATGAACGTGTCTTTCTTATTTTGTTTGTTGTT
GCTTAATGAATATGACGAGATTTTAAAGCCTGGGAAAATGCTTATTCTATTTG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2H148JQ 688 0 0
GGGAGCAACCGCTTAAACCACTACCTCTACTTGTTTCCGCTACTCTTCCGCCATTTT*CA
CTCAGCTGCTTGCTTGTTAGCTAAAAAAATGGGAAGCGATACAGAAGCAGAGAAGTCGAT
TCAAAAGGAGAAGAAGAAGGTCATCTCCCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTCGCCGGAAA
AAAGCTCCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAAAAGTGTTTGAA
GAGAGGCGTTAAGGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGTCAGAAAGGAATATGTGTTAT
AGCTGGAAACATATCTCCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGC
CGGTATTCCTTACGTCTACGTTCCACCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGGGCTACAAA
GCGACCAACTTGTTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGA
GGATCTCGAGAAGTTGAAGCCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTC
ATCATCTGTAATCTGAATCAGAAAAACACATGAACGTGTCTTTCTTATTTTGTTTGTTGT
TGCTTAATGAATATGACGAGATTTTAAAGCCTGGGAAAATGCTTATTCTATTTGCCAACT
AACAAAACCAAAAAGAAACTGTAAGCCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2H148TF 697 0 0
GGGAGCAACCGCTTAAACCACTACCTCTACTTGTTTCCGCTACTCTTCCGCCATTTT*CA
CTCAGCTGCTTGCTTGTTAGCTAAAAAAATGGGAAGCGATACAGAAGCAGAGAAGTCGAT
TCAAAAGGAGAAGAAGAAGGTCATCTCCCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTCGCCGGAAA
AAAGCTCCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAAAAGTGTTTGAA
GAGAGGCGTTAAGGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGTCAGAAAGGAATATGTGTTAT
AGCTGGAAACATATCTCCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGC
CGGTATTCCTTACGTCTACGTTCCACCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGGGCTACAAA
GCGACCAACTTGTTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGA
GGATCTCGAGAAGTTGAAGCCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTC
ATCATCTGTAATCTGAATCAGAAAAACACATGAACGTGTCTTTCTTATTTTGTTTGTTGT
TGCTTAATGAATATGACGAGATTTTAAAGCCTGGGAAAATGCTTATTCTATTTGCCAACT
AACAAAACCAAAAAGAAACTGTAAGCCCAAAAAAAAA

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 6

CO CL1394Contig1 1210 6 28 U
CAGAATGATCTTATAAAATCTATTGTACCGTTTCTGTCAAGACTCACACATCTTCAGAAA
AAAACTTTCTCATGTGCTTAAAAGATGAACAAATCAATTACATATAAACTCTGCTGCAAA
AGAATTGGTACTAACATAAACTCGTACTAGAGCCTGTCTTTCAGTTTATACAAGTAACTT
CATCAGTCTTAAACTTCATTGGACAGCTACTATGTACATGAGATAGGAAGGTTACACTGA
TTATATTTCCTCAATTTTTGGAGGACTTTTGAACCTCTTGATCCACAGTTTCCGAGGGAA
ATTTGCTGAGTAGCCAAACCAACACAACACCGACAAGAGCACCAGAGAGATGCGCAATGT
GATTAACAGTCTGCAAAGAATAGCCACCATATATAGTCCCAGATACTCCAGCTGAAGCCT
GAGCTGCTTCCATTACCCTCTCAATAACGAACTGACCCAATATAAGAACTTCAAGGATCT
TCCTCCAATCCCAAGACATCTTGACGAGGACGCTAATAGCAAACAACCCAAAAACAGCTC
CAGAGGCTCCAACGGAAACAGCATTTCTCGGCAAAACTAACCAAGAAACCAGGTTAGCTC
CAACACCAGTGAACAAGTAAGACAGCCACAAACCAAAGTTCCCTTCCTCTTCTTCAACAA
GCTTTCCAAAGATGTAGAGGAAGAAAAGGTTGCTGGAGAGATGGTTCCAGCTAGCATGAC
AGAACGTTGCAGTTACAAACTGGTACCAGGCTGGAAAATTGTGATAGAGATAGAGAGACT
TGATGCTGCGAACCTGAAAGAAGTGATCTGCTACATAGACGCCAAGATTGATGAGTATGA
TCCAGAATATGCCATTGGCTCTCTTTTGTGGATTCTGTTTATCTCCTCCTTTACTAAGCT
CAAGTTGTGGCGTTATGTCGGATTGGCTGAACCTGCAAGCGATACGAAATTTTGAGAAGG
TGGGTGGGCGAAAGGTTGTGGCTTTTGATGAATTGAGCTTAGGAGTTGAGGAAAGTTGGA
AGCTTTTGATGTTGTTGGTGAGTGGTATCGGCGACGGAGGTGCGCGGCGGAGATGGGAGG
GAGGTGAAGGCGGTGTTGTGAAACGAGTGGAAGATTGTGGGAGGGAGAGACGGTGAAGGT
GAAGCTGCGACATTTGCGAGCTCGTTTGTATTGTACTCAGCAAGCAGAGCAAGCAAGAGA
CCAAACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM75JQ U 1
AF RR2CB09JQ U 129
AF RR2CF59JQ U 55
AF RR2CB09TF C 423
AF RR2EM75TF C 477
AF RR2CF59TF C 488
BS 1 204 RR2EM75JQ
BS 205 205 RR2CB09JQ
BS 206 799 RR2EM75JQ
BS 800 800 RR2CF59JQ
BS 801 838 RR2EM75JQ
BS 839 884 RR2CF59JQ
BS 885 947 RR2CB09TF
BS 948 948 RR2EM75TF
BS 949 978 RR2CB09TF
BS 979 979 RR2EM75TF
BS 980 999 RR2CB09TF
BS 1000 1001 RR2EM75TF
BS 1002 1002 RR2CB09TF
BS 1003 1003 RR2EM75TF
BS 1004 1005 RR2CB09TF
BS 1006 1006 RR2EM75TF
BS 1007 1028 RR2CB09TF
BS 1029 1029 RR2EM75TF
BS 1030 1039 RR2CB09TF
BS 1040 1040 RR2EM75TF
BS 1041 1070 RR2CB09TF
BS 1071 1071 RR2EM75TF
BS 1072 1123 RR2CB09TF
BS 1124 1124 RR2EM75TF
BS 1125 1162 RR2CB09TF
BS 1163 1163 RR2EM75TF
BS 1164 1194 RR2CB09TF
BS 1195 1210 RR2CF59TF

RD RR2EM75JQ 838 0 0
CAGAATGATCTTATAAAATCTATTGTACCGTTTCTGTCAAGACTCACACATCTTCAGAAA
AAAACTTTCTCATGTGCTTAAAAGATGAACAAATCAATTACATATAAACTCTGCTGCAAA
AGAATTGGTACTAACATAAACTCGTACTAGAGCCTGTCTTTCAGTTTATACAAGTAACTT
CATCAGTCTTAAACTTCATTGGACGGCTACTATGTACATGAGATAGGAAGGTTACACTGA
TTATATTTCCTCAATTTTTGGAGGACTTTTGAACCTCTTGATCCACAGTTTCCGAGGGAA
ATTTGCTGAGTAGCCAAACCAACACAACACCGACAAGAGCACCAGAGAGATGCGCAATGT
GATTAACAGTCTGCAAAGAATAGCCACCATATATAGTCCCAGATACTCCAGCTGAAGCCT
GAGCTGCTTCCATTACCCTCTCAATAACGAACTGACCCAATATAAGAACTTCAAGGATCT
TCCTCCAATCCCAAGACATCTTGACGAGGACGCTAATAGCAAACAACCCAAAAACAGCTC
CAGAGGCTCCAACGGAAACAGCATTTCTCGGCAAAACTAACCAAGAAACCAGGTTAGCTC
CAACACCAGTGAACAAGTAAGACAGCCACAAACCAAAGTTCCCTTCCTCTTCTTCAACAA
GCTTTCCAAAGATGTAGAGGAAGAAAAGGTTGCTGGAGAGATGGTTCCAGCTAGCATGAC
AGAACGTTGCAGTTACAAACTGGTACCAGGCTGGAAAATTGTGATAGAGATAGAGAGACT
TGATGCTGCGAACCTGAAA*AAGTGATCTGCTACATAGACGCCAAGATTGATGAGTAT

QA 1 838 1 838
DS 

RD RR2CB09JQ 659 0 0
TACTAACATAAACTCGTACTAGAGCCTGTCTTTCAGTTTATACAAGTAACTTCATCAGTC
TTAAACTTCATTGGACAGCTACTATGTACATGAGATAGGAAGGTTACACTGATTATATTT
CCTCAATTTTTGGAGGACTTTTGAACCTCTTGATCCACAGTTTCCGAGGGAAATTTGCTG
AGTAGCCAAACCAACACAACACCGACAAGAGCACCAGAGAGATGCGCAATGTGATTAACA
GTCTGCAAAGAATAGCCACCATATATAGTCCCAGATACTCCAGCTGAAGCCTGAGCTGCT
TCCATTACCCTCTCAATAACGAACTGACCCAATATAAGAACTTCAAGGATCTTCCTCCAA
TCCCAAGACATCTTGACGAGGACGCTAATAGCAAACAACCCAAAAACAGCTCCAGAGGCT
CCAACGGAAACAGCATTTCTCGGCAAAACTAACCAAGAAACCAGGTTAGCTCCAACACCA
GTGAACAAGTAAGACAGCCACAAACCAAAGTTCCCTTCCTCTTCTTCAACAAGCTTTCCA
AAGATGTAGAGGAAGAAAAGGTTGCTGGGGAGATGGTTCCAGCTAGCATGACAGAACGTT
GCAGTTACAAACTGGTACCAGGCTGGAAAATTGTGATAGAGATAGAGAGACTTGATGCT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2CF59JQ 830 0 0
CG
GAAAAAAACTTTCTCATGTGCTTAAAAGATGAACAAATCAATTACATATAAACTCTGCTG
CAAAAGAATTGGTACTAACATAAACTCGTACTAGAGCCTGTCTTTCAGTTTATACAAGTA
ACTTCATCAGTCTTAAACTTCATTGGACAGCTACTATGTACATGAGATAGGAAGGTTACA
CTGATTATATTTCCTCAATTTTTGGAGGACTTTTGAACCTCTTGATCCACAGTTTCCGAG
GGAAATTTGCTGAGTAGCCAGACCAACACAACACCGACAAGAGCACCAGAGAGATGCGCA
ATGTGATTAGCAGTCTGCAAAGAATAGCCACCATATATAGTCCCAGATACTCCAGCTGAA
GCCTGAGCTGCTTCCATTACCCTCTCAATAACGAACTGACCCAATATAAGAACTTCAAGG
ATCTTCCTCCAATCCCAAGACATCTTGACGAGGACGCTAATAGCAAACAACCCAAAAACA
GCTCCAGAGGCTCCAACGGAAACAGCATTTCTCGGCAAAACTAACCAAGAAACCAGGTTA
GCTCCAACACCAGTGAACAAGTAAGACAGCCACAAACCAAAGTTCCCTTCCTCTTCTTCA
ACAAGCTTTCCAAAGATGTAGAGGAAGAAAAGGTTGCTGGAGAGATGGTTCCAGCTAGCA
TGACAGAACGTTGCAGTTACAAACTGGTACCAGGCTGGAAAATTGTGATAGAGATAGAGA
GACTTGATGCTGCGAACCTGAAAGAAGTGATCTGCTACATAGACGCCAAGATTGATGAGT
ATGATCCAGAATATGCCATTGGCTCTCTTTTGTGGATTCTGTTTATCT

QA 3 830 3 830
DS 

RD RR2CB09TF 774 0 0
GCTGCTTCCATTACCCTCTCAATAACGAACTGACCCAATATAAGAACTTCAAGGATCTTC
CTCCAATCCCAAGACATCTTGACGAGGACGCTAATAGCAAACAACCCAAAAACAGCTCCA
GAGGCTCCAACGGAAACAGCATTTCTCGGCAAAACTAACCAAGAAACCAGGTTAGCTCCA
ACACCAGTGAACAAGTAAGACAGCCACAAACCAAAGTTCCCTTCCTCTTCTTCAACAAGC
TTTCCAAAGATGTAGAGGAAGAAAAGGTTGCTGGGGAGATGGTTCCAGCTAGCATGACAG
AACGTTGCAGTTACAAACTGGTACCAGGCTGGAAAATTGTGATAGAGATAGAGAGACTTG
ATGCTGCGAACCTGAAAGAAGTGATCTGCTACATAGACGCCAAGATTGATGAGTATGATC
CAGAATATGCCATTGGCTCTCTTTTGTGGATTCTGTTTATCTCCTCCTTTACTAAGCTCA
AGTTGTGGCGTTATGTCGGATTGGCTGAACCTGCAAGCGATACGAGATTTTGAGAAGGTG
GGTGGGCGAAAGGTTGAGGCTTTTGATGAATTGAGCTCGGAAGCTGAGGAAAGTTGGAAG
CTTTTGTTGTTGTTGGTAAGTGGTATCGGCGACGGAGGTGCGCGGCGGCGATGGGAGGGA
GGTGAAGGCGGTGTTGTGAAACGAGTGGAAGATTGTGGGAGAGAGAGACGGTGAAGGTGA
AGCTGCGACATTTGCGAGCTTGTTTGTATTGTACTCAGCAAGCAGAGCAAGC
CC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2EM75TF 720 0 0
GGATCTCCTCC
ATCCCAAGACATCTTGACGAGGACGCTAATAGCAAACAACCCAAAAACAGCTCCAGAGGC
TCCAACGGAAACAGCATTTCTCGGCAAAACTAACCAAGAAACCAGGTTAGCTCCAACACC
AGTGAACAAGTAAGACAGCCACAAACCAAAGTTCCCTTCCTCTTCTTCAACAAGCTTTCC
AAAGATGTAGAGGAAGAAAAGGTTGCTGGAGAGATGGTTCCAGCTAGCATGACAGAACGT
TGCAGTTACAAACTGGTACCAGGCTGGAAAATTGTGATAGAGATAGAGAGACTTGATGCT
GCGAACCTGAAAGAAGTGATCTGCTACATAGACGCCAAGATTGATGAGTATGATCCAGAA
TATGCCATTGGCTCTCTTTTGTGGATTCTGTTTATCTCCTCCTTTACTAAGCTCAAGTTG
TGGCGTTATGTCGGATTGGCTGAACCTGCAAGCGATACGAAATTTTGAGAAGGTGGGTGG
GCGAAAGGTTGTGGCTTTTGATGAATTGAGCTTAGGAGTTGAGGAAAGTTGGAAGCTTTT
GATGTTGTTGGTGAGTGGTATCGGCGACGGAGGTGCGCGGCGGAGATGGGAGGGAGGTGA
AGGCGGTGTTGTGAAACGAGTGGAAGATTGTGGGAGGGAGAGACGGTGAAGGTGAAGCTG
CGACATTTGCGAACTCGTTTGTATTGTACTCAGCAAGCAGAGCAAGC
CC

QA 12 718 12 718
DS 

RD RR2CF59TF 723 0 0
CAATCCCAGACATC
TGACGAGGACGCTAATAGCAAACAACCCAAAAACAGCTCCAGAGGCTCCAACGGAAACAG
CATTTCTCGGCAAAACTAACCAAGAAACCAGGTTAGCTCCAACACCAGTGAACAAGTAAG
ACAGCCACAAACCAAAGTTCCCTTCCTCTTCTTCAACAAGCTTTCCAAAGATGTAGAGGA
AGAAAAGGTTGCTGGAGAGATGGTTCCAGCTAGCATGACAGAACGTTGCAGTTACAAACT
GGTACCAGGCTGGAAAATTGTGATAGAGATAGAGAGACTTGATGCTGCGAACCTGAAAGA
AGTGATCTGCTACATAGACGCCAAGATTGATGAGTATGATCCAGAATATGCCATTGGCTC
TCTTTTGTGGATTCTGTTTATCTCCTCCTTTACTAGGCTCAAGTTGTGGCGTTATGTCGG
ATTGGCTGAACCTGCAAGCGATACGAAATTTTGAGAAGGTGGGTGGGCGAAAGGTTGTGG
CTTTTGATGAATTGAGCTTAGGAGTTGAGGAAAGTTGGAAGCTTTTGATGTTGTTGGTGA
GTGGTATCGGCGACGGAGGTGCGCGGCGGAGATGGGAGGGAGGTGAAGGCGGTGTTGTGA
AACGAGTGGAAGATTGTGGGAGGGAGAGACGGTGAAGGTGAAGCTGCGACATTTGCGAGC
TCGTTTGTATTGTACTCAGCAAGCAGAGCAAGCAAGAGACCAAACCTCC

QA 15 723 15 723
DS 



AS 1 6

CO CL1395Contig1 1023 6 9 U
GGGAGGAAGAGGTTTTGGCGACCGTGGCGGTAGAGGCATGAGAGGAGGTAGAGGAGGAGA
TCGTGGTCGCCGCGGCAGAGGAACACCCGGAGGACGTGGCGGAATGAAGGGAGGTAGCAA
GGTGATTGTAGAGCCACACAGACACGCTGGAGTGTTTATTGCAAAGGGTAAAGAGGATGC
TCTTGTCACTAAGAACTTGGTCCCTGGTGAAGCTGTTTACAACGAGAAGAGAATCTCTGT
TCAGAATGAAGATGGAACCAAGACTGAATACAGGGTGTGGAATCCTTTCCGTTCTAAGTT
GGCTGCTGCTATTCTCGGTGGTGTTGATCACATTCACATCAAACCTGGTGCTAAAGTTCT
ATACCTTGGTGCTGCTTCTGGAACAACAGTCTCTCATGTCTCTGACATAGTTGGACCTGA
GGGATGTGTTTACGCTGTTGAGTTCTCTCACCGAAGTGGTAGAGATTTGGTGAACATGGC
GAAGAAGAGAACTAATGTTATTCCGATCATCGAGGATGCTAGACACCCTGCTAAATACAG
AATGCTTGTTGGCATGGTTGATGTTGTCTTCTCTGATGTTGCTCAGCCTGATCAGGCTAG
GATCGTGGCTTTGAACTCGAGCTTCTTCCTCAAAACAGGAGGTCACTTTGTTATCTCCAT
CAAGGCAAACTGTATTGACTCGACGGTTCCAGCAGAGGCAGTGTTTCAGAGTGAAGTGAA
GAAGCTGCAACAGGAGCAGTTCAAGCCAGCTGAGCAAGTGACGCTTGAGCCATTTGAACG
TGACCATGCCTGTGTCGTCGGTACCTACCGTGCACCTAAGAAGAACAAGGTTGCTGCTTA
GAAGTTTCATGTGTTGGGATTTGGTTCTTTGGATTTTTCGTTAGGGTTTTATCTAGTATT
GTGGTTTGTAATCGCTTTGAACCTGAATAGGCTTTTTTCTGTGTTTTTATACTTAAAACT
CATTACCTCTTTAATCACATTTTGTTCACTTGAGAAAGTTGATATTTTTAAATGGAGAAA
TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2D447TF U 1
AF RR2F751TF U 213
AF RR2BI19TF U 34
AF RR2BI19JQ C 118
AF RR2F751JQ C 232
AF RR2D447JQ C 416
BS 1 634 RR2D447TF
BS 635 800 RR2BI19TF
BS 801 801 RR2BI19JQ
BS 802 829 RR2BI19TF
BS 830 830 RR2BI19JQ
BS 831 878 RR2BI19TF
BS 879 991 RR2BI19JQ
BS 992 1009 RR2F751JQ
BS 1010 1023 RR2D447JQ

RD RR2D447TF 634 0 0
GGGAGGAAGAGGTTTTGGCGACCGTGGCGGTAGAGGCATGAGAGGAGGTAGAGGAGGAGA
TCGTGGTCGCCGCGGCAGAGGAACACCCGGAGGACGTGGCGGAATGAAGGGAGGTAGCAA
GGTGATTGTAGAGCCACACAGACACGCTGGAGTGTTTATTGCAAAGGGTAAAGAGGATGC
TCTTGTCACTAAGAACTTGGTCCCTGGTGAAGCTGTTTACAACGAGAAGAGAATCTCTGT
TCAGAATGAAGATGGAACCAAGACTGAATACAGGGTGTGGAATCCTTTCCGTTCTAAGTT
GGCTGCTGCTATTCTCGGTGGTGTTGATCACATTCACATCAAACCTGGTGCTAAAGTTCT
ATACCTTGGTGCTGCTTCTGGAACAACAGTCTCTCATGTCTCTGACATAGTTGGACCTGA
GGGATGTGTTTACGCTGTTGAGTTCTCTCACCGAAGTGGTAGAGATTTGGTGAACATGGC
GAAGAAGAGAACTAATGTTATTCCGATCATCGAGGATGCTAGACACCCTGCTAAATACAG
AATGCTTGTTGGCATGGTTGATGTTGTCTTCTCTGATGTTGCTCAGCCTGATCAGGCTAG
GATCGTGGCTTTGAACTCGAGCTTCTTCCTCAAA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2F751TF 418 0 0
CTGTTTACAACGAGAAGAGAATCTCTGTTCAGAATGAAGATGGAACCAAGACTGAATACA
GGGTGTGGAATCCTTTCCGTTCTAAGTTGGCTGCTGCTATTCTCGGTGGTGTTGATCACA
TTCACATCAAACCTGGTGCTAAAGTTCTATACCTTGGTGCTGCTTCTGGAACAACAGTCT
CTCATGCCTCTGACATAGTTGGACCTGAGGGATGTGTTTACGCTGTTGAGTTCTCTCACC
GAAGTGGTAGAGATTTGGTGAACATGGCGAAGAAGAGAACTAATGTTATTCCGATCATCG
AGGATGCTAGACACCCTGCTAAATACAGAATGCTTGTTGGCATGGTTGATGTTGTCTTCT
CTGATGTTGCTCAGCCTGATCAG*CTAG*ATCGTGGCTTTGAACTCGAGCTTCTTCCT

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR2BI19TF 845 0 0
G
GGCATGAGAGGAGGTAGAGGAGGAGATCGTGGTCGCCGCGGCAGAGGAACACCCGGAGGA
CGTGGCGGAATGAAGGGAGGTAGCAAGGTGATTGTAGAGCCACACAGACACGCTGGAGTG
TTTATTGCAAAGGGTAAAGAGGATGCTCTTGTCACTAAGAACTTGGTCCCTGGTGAAGCT
GTTTACAACGAGAAGAGAATCTCTGTTCAGAATGAAGATGGAACCAAGACTGAATACAGG
GTGTGGAATCCTTTCCGTTCTAAGTTGGCTGCTGCTATTCTCGGTGGTGTTGATCACATT
CACATCAAACCTGGTGCTAAAGTTCTATACCTTGGTGCTGCTTCTGGAACAACAGTCTCT
CATGTCTCTGACATAGTTGGACCTGAGGGATGTGTTTACGCTGTTGAGTTCTCTCACCGA
AGTGGTAGAGATTTGGTGAACATGGCGAAGAAGAGAACTAATGTTATTCCGATCATCGAG
GATGCTAGACACCCTGCTAAATACAGAATGCTTGTTGGCATGGTTGATGTTGTCTTCTCT
GATGTTGCTCAGCCTGATCAGGCTAGGATCGTGGCTTTGAACTCGAGCTTCTTCCTCAAA
ACAGGAGGTCACTTTGTTATCTCCATCAAGGCAAACTGTATTGACTCGACGGTTCCAGCA
GAGGCAGTGTTTCAGAGTGAAGTGAAGAAGCTGCAACAGGAGCAGTTCAAGCCAGCTGAG
CAAGTGACGCTTGAGCCATTTGAACGTGACCATGCCTGTGTCGTCG*TACCTACCGTGCA
CCTAAGAAGAACAAG*TTGCTGCTTAGAAGTTTCATGTGTTGGGATTTGGTTCTTTGGAT
TTTT

QA 2 845 2 845
DS 

RD RR2BI19JQ 877 0 0
CAAGGTGATTGTAGAGCCACACAGACACGCTGGAGTGTTTATTGCAAAGGGTAAAGAGGA
TGCTCTTGTCACTAAGAACTTGGTCCCTGGTGAAGCTGTTTACAACGAGAAGAGAATCTC
TGTTCAGAATGAAGATGGAACCAAGACTGAATACAGGGTGTGGAATCCTTTCCGTTCTAA
GTTGGCTGCTGCTATTCTCGGTGGTGTTGATCACATTCACATCAAACCTGGTGCTAAAGT
TCTATACCTTGGTGCTGCTTCTGGAACAACAGTCTCTCATGTCTCTGACATAGTTGGACC
TGAGGGATGTGTTTACGCTGTTGAGTTCTCTCACCGAAGTGGTAGAGATTTGGTGAACAT
GGCGAAGAAGAGAACTAATGTTATTCCGATCATCGAGGATGCTAGACACCCTGCTAAATA
CAGAATGCTTGTTGGCATGGTTGATGTTGTCTTCTCTGATGTTGCTCAGCCTGATCAGGC
TAGGATCGTGGCTTTGAACTCGAGCTTCTTCCTCAAAACAGGAGGTCACTTTGTTATCTC
CATCAAGGCAAACTGTATTGACTCGACGGTTCCAGCAGAGGCAGTGTTTCAGAGTGAAGT
GAAGAAGCTGCAACAGGAGCAGTTCAAGCCAGCTGAGCAAGTGACGCTTGAGCCATTTGA
ACGTGACCATGCCTGTGTCGTCGGTACCTACCGTGCACCTAAGAAGAACAAGGTTGCTGC
TTAGAAGTTTCATGTGTTGGGATTTGGTTCTTTGGATTTTTCGTTAGGGTTTTATCTAGT
ATTGTGGTTTGTAATCGCTTTGAACCTGAATAGGCTTTTTTCTGTGTTTTTATACTTAAA
ACTCATTACCTCTTTAATCACATTTTGTTCACTT
AAG

QA 1 874 1 874
DS 

RD RR2F751JQ 778 0 0
AGATCTCTG
TCAGAATGAAGATG*AACCAAGACTGAATACAGGGTGTGGAATCCTTTCCGTTCTAAGTT
GGCTGCTGCTATTCTCGGTGGTGTTGATCACATTCACATCAAACCTGGTGCTAAAGTTCT
ATACCTTGGTGCTGCTTCTGGAACAACAGTCTCTCATGCCTCTGACATAGTTGGACCTGA
GGGATGTGTTTACGCTGTTGAGTTCTCTCACCGAAGTGGTAGAGATTTGGTGAACATGGC
GAAGAAGAGAACTAATGTTATTCCGATCATCGAGGATGCTAGACACCCTGCTAAATACAG
AATGCTTGTTGGCATGGTTGATGTTGTCTTCTCTGATGTTGCTCAGCCTGATCAGGCTAG
GATCGTGGCTTTGAACTCGAGCTTCTTCCTCAAAACAGGAGGTCACTTTGTTATCTCCAT
CAAGGCAAACTGTATTGACTCGACGGTTCCAGCAGAGGCAGTGTTTCAGAGTGAAGTGAA
GAAGCTGCAACAGGAGCAGTTCAAGCCAGCTGAGCAAGTGACGCTTGAGCCATTTGAACG
TGACCATGCCTGTGTCGTCGGTACCTACCGTGCACCTAAGAAGAACAAGGTTGCTGCTTA
GAAGTTTCATGTATTGGGATTTGGTTCTTTGGATTTTTCGTTAGGGTTTTATCTAGTATT
GTGGTTTGTAATCGCTTTGAGCCTGAATAGGCTTTTTTCTGTGTTTTTATACTTAAAACT
CATTACCTCTTTAATCACATTTTGTTCACTTGAGAAAGTTGATATTTTT

QA 10 778 10 778
DS 

RD RR2D447JQ 608 0 0
CCTGAGGGATGTGTTTACGCTGTTGAGTTCTCTCACCGAAGTGGTAGAGATTTGGTGAAC
ATGGCGAAGAAGAGAACTAATGTTATTCCGATCATCGAGGATGCTAGACACCCTGCTAAA
TACAGAATGCTTGTTGGCATGGTTGATGTTGTCTTTTCTGATGTTGCTCAGCCTGATCAG
GCTAGGATCGTGGCTTTGAACTCGAGCTTTTTCCTCAAAACAGGAGGTCACTTTGTTATC
TCCATCAAGGCAAACTGTATTGACTCGACGGTTCCAGCAGAGGCAGTGTTTCAGAGTGAA
GTGAAGAAGCTGCAACAGGAGCAGTTCAAGCCAGCTGAGCAAGTGACGCTTGAGCCATTT
GAACGTGACCATGCCTGTGTCGTCGGTACCTACCGTGCACCTAAGAAGAACAAGGTTGCT
GCTTAGAAGTTTCATGTGTTGGGATTTGGTTCTTTGGATTTTTCGTTAGGGTTTTATCTA
GTATTGTGGTTTGTAATCGCTTTGAACCTGAATAGGCTTTTTTCTGTGTTTTTATACTTA
AAACTCATTACCTCTTTAATCACATTTTTTTCACTTGAGAAAGTTGATATTTTTAAATGG
AGAAATCC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 3

CO CL1396Contig1 1039 3 22 U
GGATTCATTCTCCAATTGAAAACGAAAGACGAAGTTAATTAGTAATAATCACACACTCAT
ATCATCATCAGAGCCAATAGATACAGAGAGAAAGATCTAAAAGATGAAGGCGGAGAAGAG
TCCGATTCAGACCGTGACGTCGTGGATTCGCCGGCAGCCACCGAAGGTTAAGGCGTTTCT
TTGCGTGGTTACGGCAATGACGATCCTCGTCTTCCTCAGGATCATTGTACACGAGCACGA
CAACCTTTTCATCGCGTCCGAGGCTGTCCATGCCGTTGGGATCTCAGTTCTTATCTACAA
ACTCACCAAGGAAAAGACATGCGCTGGGATATCTCTCAAGACGCAGGAGCTAACGGCTTT
GTTTCTGGCTGTGCGGTTGTATTGTAGCTTTGTAATGGAGTTTGATCTTCACA*GTTACT
TGATTCTGCTACTTTGGCCACCACCCTTTGGGTCATTTATATGATCCGTTTCAATCTTAG
ACCTACTTATATGGAAGATAAGGACAACTTTCCCATCTACTACGTTGTAGTCCCATGTGC
TGTTGTATCTTTGCTCATTCATCCATCAACACGTCACCACATCATAAACAGGCTCTTTTG
GGCCTACTGTGTTTATCTTGAAGCTGTGTCAGTTCTTCCTCAATTAAGAGTCATGCAGAA
CACTAAGATCGTGGAACCATTCACAGCACATTACGTATTTGCTTTGGGAATCGCTAGGTT
CTTGAGTTGTGCACACTGGATCCTTCAGGTTTTGGATACGAGAGGGAGGTTGCTGACTGC
ATTAGGATATGGACTATGGCCTTTAATGGTCCTCCTCTCTGAAATTATCCAAACTTTCAT
CCTTGAAGATTTTTGCTATTACTATGTTCAGAGTTTAATGGGTGGGCAGCTCGTTCTTCG
TCTTCCTTCTGGTGTGGTGTAAGAAGCTTTATTAAAGGATTGCTTGAGCTTTTTAAAAAA
CTTTTAATTTTACTAGACTTTGAGATGTAATTTAATACTTTTGCTAGCAACCAACCCTTG
GCTAGAAACTAGTTTTTAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA20TF U 1
AF RR2C252TF U 1
AF RR2DA20JQ C 394
BS 1 14 RR2C252TF
BS 15 15 RR2DA20TF
BS 16 67 RR2C252TF
BS 68 70 RR2DA20TF
BS 71 81 RR2C252TF
BS 82 87 RR2DA20TF
BS 88 285 RR2C252TF
BS 286 286 RR2DA20TF
BS 287 413 RR2C252TF
BS 414 414 RR2DA20TF
BS 415 417 RR2C252TF
BS 418 418 RR2DA20TF
BS 419 518 RR2C252TF
BS 519 519 RR2DA20TF
BS 520 605 RR2C252TF
BS 606 606 RR2DA20TF
BS 607 642 RR2C252TF
BS 643 643 RR2DA20TF
BS 644 659 RR2C252TF
BS 660 660 RR2DA20JQ
BS 661 744 RR2C252TF
BS 745 1039 RR2DA20JQ

RD RR2DA20TF 654 0 0
GGATTCATTCTCCAATTGAAAACGAAAGACGAAGTTAATTAGTAATAATCACACACTCAT
ATCATCATCAGAGCCAATAGATACAGAGAGAGAGATCTGAAAGATGAAGGCGGAGAAGAG
TCCGATTCAGACCGTGACGTCGTGGATTCGCCGGCAGCCACCGAAGGTTAAGTCGTTTCT
TTGCGTGGTTACGGCAATGACGATCCTCGTCTTCCTCAGGATCATTGTACACGAGCACGA
CAACCTTTTCATCGCGTCCGAGGCTGTCCATGCCGTTGGGATCTCAGTTCTTATCTACAA
ACTCACCAAGGAGAAGACATGCGCTGGGATATCTCTCAAGACGCAGGAGCTAACGGCTTT
GTTTCTGGCTGTGCGGTTGTATTGTAGCTTTGTAATGGAGTTTGATCTTCACA*GTTACT
TGATTCTGCTACTTTGGCCACCACCCTTTGGGTCATTTATATGATCCGTTTCAATCTTAG
ACCTACTTATATGGAAGATAAGGACAACTTTCCCATCTACTACGTTGTAGTCCCATGTGC
TGTTGTATCTTTGCTCATTCATCCATCAACACGTCACCACATCATAAACAGGCTCTTTTG
GGCCTACTGTGTTTATCTTGAAGCTGTGTCAGTTCTTCCTCAATTAAGAGTCAT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2C252TF 744 0 0
GGATTCATTCTCCATTTGAAAACGAAAGACGAAGTTAATTAGTAATAATCACACACTCAT
ATCATCA***GAGCCAATAGA******GAGAAAGATCTAAAAGATGAAGGCGGAGAAGAG
TCCGATTCAGACCGTGACGTCGTGGATTCGCCGGCAGCCACCGAAGGTTAAGGCGTTTCT
TTGCGTGGTTACGGCAATGACGATCCTCGTCTTCCTCAGGATCATTGTACACGAGCACGA
CAACCTTTTCATCGCGTCCGAGGCTGTCCATGCCGTTGGGATCTCTGTTCTTATCTACAA
ACTCACCAAGGAAAAGACATGCGCTGGGATATCTCTCAAGACGCAGGAGCTAACGGCTTT
GTTTCTGGCTGTGCGGTTGTATTGTAGCTTTGTAATGGAGTTTGATCTTCACACGTTTCT
TGATTCTGCTACTTTGGCCACCACCCTTTGGGTCATTTATATGATCCGTTTCAATCTTAG
ACCTACTTATATGGAAGATAAGGACAACTTTCCCATCTGCTACGTTGTAGTCCCATGTGC
TGTTGTATCTTTGCTCATTCATCCATCAACACGTCACCACATCATAAACAGGCTCTTTTG
GGCCTTCTGTGTTTATCTTGAAGCTGTGTCAGTTCTTCCTCAGTTAAGAGTCATGCAGA*
CACTAAGATCGTGGAACCATTCACAGCACATTACGTATTTGCTTTGGGAATCGCTAGGTT
CTTGAGTTGTGCACACTGGATCCT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2DA20JQ 646 0 0
AATGGAGTTTGATCTTCACA*GTTACTTGATTCTGCTACTTTGGCCACCACCCTTTGGGT
CATTTATATGATCCGTTTCAATCTTAGACCTACTTATATGGAAGATAAGGACAACTTTCC
CATCTACTACGTTGTAGTCCCATGTGCTGTTGTATCTTTGCTCATTCATCCATCAACACG
TCACCACATCATAAACAGGCTCTTTTGGGCCTACTGTGTTTATCTTGAAGCTGTGTCAGT
TCTTCCTCAATTAAGAGTCATGCAGAACACTAAGATCGTGGAACCATTCACAGCACATTA
CGTATTTGCTTTGGGAATCGCTAGGTTCTTGAGTTGTGCACACTGGATCCTTCAGGTTTT
GGATACGAGAGGGAGGTTGCTGACTGCATTAGGATATGGACTATGGCCTTTAATGGTCCT
CCTCTCTGAAATTATCCAAACTTTCATCCTTGAAGATTTTTGCTATTACTATGTTCAGAG
TTTAATGGGTGGGCAGCTCGTTCTTCGTCTTCCTTCTGGTGTGGTGTAAGAAGCTTTATT
AAAGGATTGCTTGAGCTTTTTAAAAAACTTTTAATTTTACTAGACTTTGAGATGTAATTT
AATACTTTTGCTAGCAACCAACCCTTGGCTAGAAACTAGTTTTTAT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 6

CO CL1397Contig1 650 6 3 U
TTTTTATTTGAAGTTTTGCATAAAAACAGATAATAATAGCTCCAAAAGTGTCGAATTACA
AAACAATCAAAAGCCAAAATAATGGTTTCTTTTATGGAAAAATGAAAGAGTCACAAGGAT
ATGCTCCAATTTATTTGCAAAATCTCATTTTCAAGAGATACCTTGAGAGAACATCATACA
AACAAAA*CAAAAGGAGAGAAACCACGAGAGATCAGCTAGACATAGGATGGTTGAAAACG
TATTCAATGGCAAGAGGGCAAGAGTCGATCTTGTCAGCTTCTTTGTCTGGGATCTCAAGC
TTGAACTCCTCTTCAATAGCCATCACTATCTCCACAGTGTCCAAACTATCTAATCCCAAA
TCCTTTTGGAAATGAACTTCAGGAGTCACCTTAGCTGGATCGACTTTAGGGAAGCACTTG
ACAACATCGAGAACTCTGTCGACGACATCCTGCTTGCTGAGATGATCATCGTGAGAAGAG
AAAGCACGGATCGAACCAAGGTACCCAATTTGAGGCTGGTTCGACGCCGTCACGGGAACT
CTGAGGTGACGAAGGACTGCAGTTCTCAGTGCCATCTCCGTCGAGCTCTCGAGATTTAGG
GATTTGGATGAGAGAGAGAGAGAGTGATACACCGAAAGAAACGAAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GA60JQ U 72
AF RR2FF47JQ U 10
AF RR2FF47TF C 10
AF RR2FS70TF C 1
AF RR2FS70JQ U 10
AF RR2FX21TF C 20
BS 1 9 RR2FS70TF
BS 10 407 RR2FF47JQ
BS 408 650 RR2FS70JQ

RD RR2GA60JQ 190 0 0
AGCCAAAATAATGGTTTCTTTTATGGAAAAATGAAAGAGTCACAAGGATATGCTCCAATT
TATTTGCAAAATCTCATTTTCAAAAAATACCTTGAGAGAACATCATACAAACAAAAACAA
AAGGAGAGAAACCACGAGAGATCAGCTAGACATAGGATGGTTGAAAACGTATTCAATGGC
AAGAGGGCAA

QA 1 190 1 190
DS 

RD RR2FF47JQ 398 0 0
GAAGTTTTGCATAAAAACAGATAATAATAGCTCCAAAAGTGTCGAATTACAAAACAATCA
AAAGCCAAAATAATGGTTTCTTTTATGGAAAAATGAAAGAGTCACAAGGATATGCTCCAA
TTTATTTGCAAAATCTCATTTTCAAGAGATACCTTGAGAGAACATCATACAAACAAAA*C
AAAAGGAGAGAAACCACGAGAGATCAGCTAGACATAGGATGGTTGAAAACGTATTCAATG
GCAAGAGGGCAAGAGTCGATCTTGTCAGCTTCTTTGTCTGGGATCTCAAGCTTGAACTCC
TCTTCAATAGCCATCACTATCTCCACAGTGTCCAAACTATCTAATCCCAAATCCTTTTGG
AAATGAACTTCAGGAGTCACCTTAGCTGGATCGACTTT

QA 1 398 1 398
DS 

RD RR2FF47TF 591 0 0
GAAGTTTTGCATAAAAACAGATAATAATAGCTCCAAAAGTGTCGAATTACAAAACAATCA
AAAGCCAAAATAATGGTTTCTTTTATGGAAAAATGAAAGAGTCACAAGGATATGCTCCAA
TTTATTTGCAAAATCTCATTTTCAAGAGATACCTTGAGAGAACATCATACAAACAAAA*C
AAAAGGAGAGAAACCACGAGAGATCAGCTAGACATAGGATGGTTGAAAACGTATTCAATG
GCAAGAGGGCAAGAGTCGATCTTGTCAGCTTCTTTGTCTGGGATCTCAAGCTTGAACTCC
TCTTCAATAGCCATCACTATCTCCACAGTGTCCAAACTATCTAATCCCAAATCCTTTTGG
AAATGAACTTCAGGAGTCACCTTAGCTGGATCGACTTTAGGGAAGCACTTGACAACATCG
AGAACTCTGTCGACGACATCCTGCTTGCTGAGATGATCATCGTGAGAAGAGAAAGCACGG
ATCGAACCAAGGTACCCAATTTGAGGCTGGTTCGACGCCGTCACGGGAACTCTGAGGTGA
CGAAGGACTGCAGTTCTCAGTGCCATCTCCGTCGAGCTCTCGAGATTT
TCC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2FS70TF 650 0 0
TTTTTATTTGAAGTTTTGCATAAAAACAGATAATAATAGCTCCAAAAGTGTCGAATTACA
AAACAATCAAAAGCCAAAATAATGGTTTCTTTTATGGAAAAATGAAAGAGTCACAAGGAT
ATGCTCCAATTTATTTGCAAAATCTCATTTTCAAGAGATACCTTGAGAGAACATCATACA
AACAAAA*CAAAAGGAGAGAAACCACGAGAGATCAGCTAGACATAGGATGGTTGAAAACG
TATTCAATGGCAAGAGGGCAAGAGTCGATCTTGTCAGCTTCTTTGTCTGGGATCTCAAGC
TTGAACTCCTCTTCAATAGCCATCACTATCTCCACAGTGTCCAAACTATCTAATCCCAAA
TCCTTTTGGAAATGAACTTCAGGAGTCACCTTAGCTGGATCGACTTTAGGGAAGCACTTG
ACAACATCGAGAACTCTGTCGACGACATCCTGCTTGCTGAGATGATCATCGTGAGAAGAG
AAAGCACGGATCGAACCAAGGTACCCAATTTGAGGCTGGTTCGACGCCGTCACGGGAACT
CTGAGGTGACGAAGGACTGCAGTTCTCAGTGCCATCTCCGTCGAGCTCTCGAGATTTAGG
GATTTGGATGAGAGAGAGAGAGAGTGATACACCGAAAGAAACGAAAGTCC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2FS70JQ 641 0 0
GAAGTTTTGCATAAAAACAGATAATAATAGCTCCAAAAGTGTCGAATTACAAAACAATCA
AAAGCCAAAATAATGGTTTCTTTTATGGAAAAATGAAAGAGTCACAAGGATATGCTCCAA
TTTATTTGCAAAATCTCATTTTCAAGAGATACCTTGAGAGAACATCATACAAACAAAA*C
AAAAGGAGAGAAACCACGAGAGATCAGCTAGACATAGGATGGTTGAAAACGTATTCAATG
GCAAGAGGGCAAGAGTCGATCTTGTCAGCTTCTTTGTCTGGGATCTCAAGCTTGAACTCC
TCTTCAATAGCCATCACTATCTCCACAGTGTCCAAACTATCTAATCCCAAATCCTTTTGG
AAATGAACTTCAGGAGTCACCTTAGCTGGATCGACTTTAGGGAAGCACTTGACAACATCG
AGAACTCTGTCGACGACATCCTGCTTGCTGAGATGATCATCGTGAGAAGAGAAAGCACGG
ATCGAACCAAGGTACCCAATTTGAGGCTGGTTCGACGCCGTCACGGGAACTCTGAGGTGA
CGAAGGACTGCAGTTCTCAGTGCCATCTCCGTCGAGCTCTCGAGATTTAGGGATTTGGAT
GAGAGAGAGAGAGAGTGATACACCGAAAGAAACGAAAGTCC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2FX21TF 608 0 0
ATAAAAACAGATAATAATAGCTCCAAAAGTGTCGAATTACAAAACAATCAAAAGCCAAAA
TAATGGTTTCTTTTTTGGAAAAATGAAAGAGTCACAAAGATATGCTCCAATTTATTTGCA
AAATCTCATTTTCAAGAGATACCTTGAGAGAACCTCATACAAACAAAA*CAAAAGGAGAG
AAACCACGA*AGATCAGCTAGACATAGGATGGTTGAAAACGTATTCAATGGCAAGAGGGC
AAGAGTCGATCTTGTCAGCTTCTTTGTCTGGGATCTCAAGCTTGAACTCCTCTTCAATAG
CCATCACTATCTCCACCGTGTCCAAACTATCTAACCCCAAATCCTTTTGGAAATGAACTT
CAGGAGTCACCTTAGCTGGATCGACTTTAGGGAAGCACTTGACAACATCGAGAACTCTGT
CGACGACATCCTGCTTGCTGAGATGGTCATCGTGAGAAGAGAAAGCGCGGATCGAACCAA
GGAACCCAATTTGAGGCTGGTTCGATCCCGTCACGGGAACCCTAAGATGACGAAGGACTG
CAGTTCTCAGTGCCATCTCCGTCGAGCTCTCGAGATTTAGGGATTTGGATGAGAGAGAGA
GAGAGT
CC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 6

CO CL1398Contig1 663 6 17 U
CGCACAAGAAACATAAGCATAAGAAAACTCCTTTAAAGATAATGAGAAGGAGCATAGTGT
TATGATTCAACTTCAACACATAAAAGCTGTTCATCAAACTCTTTTAGTTTGAAAAACACA
CACTCTGAACAAAAAAAAAGGCCTATTAAGCTTGACGGTTTCTTTGCTTGGCACCGGACT
TGGCAACCCTAATGCTTTTGCTGATGACACTGAGTCTAGCAAGAGCAAATTTCTTCAAGT
CTGGCCTGTAGTAGTTGTCAACCACCTGGTTAGCAACAGCCTTGGACATCCTTGGGAATT
CCTTCTTGAGGATAGACTTGTTGACAGAGATCTTAGGCTTGTTCTGCTTCTTGGTCTTGG
TGGTGGCGAGGACAACACCTTGTTCCTTGTCAGCTGGCTGGATGGTCACTGTCTTCTTGT
TTGCAAGACCAGAGTGCTTGTAGGAGTTGAGGTTGCAGAGATTGTTGGTCTCCTTGCTGA
ACTGAACCTTGGCGTTGCCTCTTCCGAACTGTTTGACCAAAAAACAGTTGTTTGTCTTAA
CGATCTCCCATATCAATTGTCCTGGTACTGTCGCCATTTCCGTGAAATTTAGCAGCGAGA
GATCGAGAGGCGTTTAATGGTGGCGCCGGCGCTTTGTTATAGAGTGTTTATAACTGCCCA
CCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
10 10 10 

AF RR2E445JQ U 1
AF RR2E445TF C 3
AF RR2ES28JQ U 15
AF RR2ES28TF C 15
AF RR2DQ95TF C 184
AF RR2DQ95JQ U 15
BS 1 22 RR2E445JQ
BS 23 23 RR2ES28JQ
BS 24 244 RR2E445JQ
BS 245 245 RR2ES28JQ
BS 246 328 RR2E445JQ
BS 329 329 RR2ES28JQ
BS 330 348 RR2E445JQ
BS 349 384 RR2ES28JQ
BS 385 385 RR2DQ95JQ
BS 386 407 RR2ES28JQ
BS 408 408 RR2DQ95JQ
BS 409 487 RR2ES28JQ
BS 488 488 RR2DQ95JQ
BS 489 520 RR2ES28JQ
BS 521 521 RR2DQ95JQ
BS 522 659 RR2ES28JQ
BS 660 663 RR2DQ95JQ

RD RR2E445JQ 348 0 0
CGCACAAGAAACATAAGCATAAAAAAACTCCTTTAAAGATAATGAGAAGGAGCATAGTGT
TATGATTCAACTTCAACACATAAAAGCTGTTCATCAAACTCTTTTAGTTTGAAAAACACA
CACTCTGAACAAAAAAAAAGGCCTATTAAGCTTGACGGTTTCTTTGCTTGGCACCGGACT
TGGCAACCCTAATGCTTTTGCTGATGACACTGAGTCTAGCAAGAGCAAATTTCTTCAAGT
CTGGTCTGTAGTAGTTGTCAACCACCTGGTTAGCAACAGCCTTGGACATCCTTGGGAATT
CCTTCTTGAGGATAGACTTGTTGACAGAAATCTTAGGCTTGTTCTGCT

QA 1 348 1 348
DS 

RD RR2E445TF 622 0 0
CACAAGAAACATAAGCATAAGAAAACTCCTTTAAAGATAATGAGAAGGAGCATAGTGTTA
TGATTCAACTTCAACACATAAAAGCTGTTCATCAAACTCTTTTAGTTTGAAAAACACACA
CTCTGAACAAAAAAAAAGGCCTATTAAGCTTGACGGTTTCTTTGCTTGGCACCGGACTTG
GCAACCCTAATGCTTTTGCTGATGACACTGAGTCTAGCAAGAGCAAATTTCTTCAAGTCT
GGTCTGTAGTAGTTGTCAACCACCTGGTTAGCAACAGCCTTGGACATCCTTGGGAATTCC
TTCTTGAGGATAGACTTGTTGACAGAGATCTTAGGCTTGTTCTGCTTCTTGGTCTTGGTG
GTGGCGAGGACAACACCTTGTTCCTTGTCAGCTGGCTGGATGGTCACTGTCTTCTTGTTT
GCAAGACCAGAGTGCTTGTAGGAGTTGAGGTTGCAGAGATTGTTGGTCTCCTTGCTGAAC
TGAACCTTGGCGTTGCCTCTTCCGAACTGTTTGACCAA*AAACAGTTGTTTGTCTTAACG
ATCTCCCATATCAATTGTCCTGGTACTGTCGCCATTTCCGTGAAATTTAGCAGCGAGAGA
TCGAGAGGCGTTTAATGGTG
CC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2ES28JQ 648 0 0
G
AGCATAAGAAAACCCCTTTAAAGATAATAAAAAGGAGCATAGTGTTATGATTCAACTTCA
ACACATAAAAGCTGTTCATCAAACTCTTTTACTTTGAAAAACACACACTCTGAACAAAAA
AAAAGGCCTATTAAGCTTGACGGTTTCTTTGCTTGGCACCGGACTTGGCAACTCTAATGC
TTTTGCCGATGACACTGAGTCTAGCAAGAGCAAATTTCTTCAAGTCTGGCCTGTAGTAGT
TGTCAACCACCTGGTTAGCAACAGCCTTGGACATCCTTGGGAATTCCTTCTTGAGGATAG
ACTTGTTGACAGAGATCTTAGGCTTGTTCTGCTTCTTGGTCTTGGTGGTGGCGAGGACAA
CACCTTGTTTCTTGTCAGCTGGCTGGATGGTCGCTGTCTTCTTGTTTGCAAGACCAGAGT
GCTTGTAGGAGTTGAGGTTGCAGAGATTGTTGGTCTCCTTGCTGAACTGAACTTTGGCGT
TGCCTCTTCCGAACTGTTTGACCAAGAAACAGTTGTTTGTCTTAACGATCTCCCATATCA
ATTGTCCTGGTACTGTCGCCATTTCCGTGAAATTTAGCAGCGAGAGATCGAGAGGCGTTT
AATGGTGGCGCCGGCGCTTTGTTATAGAGTGTTTATAACTGCCC
CCC

QA 2 645 2 645
DS 

RD RR2ES28TF 648 0 0
G
AGCATAAGAAAACCCCTTTAAAGATAATAAAAAGGAGCATAGTGTTATGATTCAACTTCA
ACACATAAAAGCTGTTCATCAAACTCTTTTACTTTGAAAAACACACACTCTGAACAAAAA
AAAAGGCCTATTAAGCTTGACGGTTTCTTTGCTTGGCACCGGACTTGGCAACTCTAATGC
TTTTGCCGATGACACTGAGTCTAGCAAGAGCAAATTTCTTCAAGTCTGGCCTGTAGTAGT
TGTCAACCACCTGGTTAGCAACAGCCTTGGACATCCTTGGGAATTCCTTCTTGAGGATAG
ACTTGTTGACAGAGATCTTAGGCTTGTTCTGCTTCTTGGTCTTGGTGGTGGCGAGGACAA
CACCTTGTTTCTTGTCAGCTGGCTGGATGGTCGCTGTCTTCTTGTTTGCAAGACCAGAGT
GCTTGTAGGAGTTGAGGTTGCAGAGATTGTTGGTCTCCTTGCTGAACTGAACTTTGGCGT
TGCCTCTTCCGAACTGTTTGACCAAGAAACAGTTGTTTGTCTTAACGATCTCCCATATCA
ATTGTCCTGGTACTGTCGCCATTTCCGTGAAATTTAGCAGCGAGAGATCGAGAGGCGTTT
AATGGTGGCGCCGGCGCTTTGTTATAGAGTGTTTATAACTGCCC
CCC

QA 2 645 2 645
DS 

RD RR2DQ95TF 480 0 0
CAACCCTAATGCTTTTGCTGATGACACTGAGTCTAGCAAGAGCAAATTTCTTCAAGTCTG
GCCTGTAGTAGTTGTCAACCACCTGGTTAGCAACAGCCTTGGACATCCTTGGGAATTCCT
TCTTGAGGATAGACTTGTTGACAGAGATCTTAGGCTTGTTCTGCTTCTTGGTCTTGGTGG
TGGCGAGGACAACACCTTGTTCCTTGTCAGCTGGCTGGATGGTCACTGTCTTCTTGTTTG
CAAGACCAGAGTGCTTGTAGGAGTTGAGGTTGCAGAGATTGTTGGTCTCCTTGCTGAACT
GAACCTTGGCGTTGCCTCTTCCGAACTGTTTGACCAAAAAACAGTTGTTTGTCTTAACGA
TCTCCCATATCAATTGTCCTGGTACTGTCGTCATTTCCGTGAAATTTAGCAGCGAGAGAT
CGAGAGGCGTTTAATGGTGGCGCCGGCGCTTTGTTATAGAGTGTTTATAACTGCCC
ACCC

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR2DQ95JQ 649 0 0
AC
GCATAAGAAAACTCCTTTAAAGATAATGAGAAGGAGCATAGTGTTATGATTCAACTTCAA
CACATAAAAGCTGTTCATCAAACTCTTTTAGTTTGAAAAACACACACTCTGAACAAAAAA
AAAGGCCTATTAAGCTTGACGGTTTCTTTGCTTGGCACCGGACTTGGCAACCCTAATGCT
TTTGCTGATGACACTGAGTCTAGCAAGAGCAAATTTCTTCAAGTCTGGCCTGTAGTAGTT
GTCAACCACCTGGTTAGCAACAGCCTTGGACATCCTTGGGAATTCCTTCTTGAGGATAGA
CTTGTTGACAGAGATCTTAGGCTTGTTCTGCTTCTTGGTCTTGGTGGTGGCGAGGACAAC
ACCTTGTTCCTTGTCAGCTGGCTGGATGGTCACTGTCTTCTTGTTTGCAAGACCAGAGTG
CTTGTAGGAGTTGAGGTTGCAGAAATTGTTGGTCTCCTTGCTGAACTGAACCTTGGCGTT
GCCTCTTCCGAACTGTTTGACCAAAAAACAGTTGTTTGTCTTAACGATCTCCCATATCAA
TTGTCCTGGTACTGTCGTCATTTCCGTGAAATTTAGCAGCGAGAGATCGAGAGGCGTTTA
ATGGTGGCGCCGGCGCTTTGTTATAGAGTGTTTATAACTGCCCACCC

QA 3 649 3 649
DS 



AS 1 5

CO CL1399Contig1 907 5 18 U
CTAATAATAGTTTCTCTTTAGATAAAAGCCAGGTAAGTCGTAAAGGACATATTACTGAGA
TGATAGGAAATAAAAAAGTATGTAAAAGACTAAAACACAGCGAACTGCTGACGACACTAA
TGAAGAAGACTCTCACACTTGTCGCAAATAAACTGTTTTGACAGGAAGCTAAATCACCAA
AAAAAAAAA**CCGTTCCAAAATTATCTGCTAAAGAAAAAGTCACTAAAGAACTAAACTT
ATTCTTCTTCTCACTTCTTCGACCTTTTCGCTGGGAACTCTGCAGTTTAGGCAGGTGGTG
CGGCGGCAGGTACATTTCCTCCAGGACCCATGGCAAGTCTCTCCTCTCTACGAGCATGCT
TCCTCTCTCTACTAGCCTTGTTCTTAGCCCTCTTAGCCTCAAACTGATCAGACAAAGTCT
TCTCTCTCGCCTTCTCAGCCTTGGACTTATGGATACTCTCCATCAACACACGCTTGTTCT
TGAAAACATTTCCCTTCACCTTCATGTACATATCATGGTACATGTGCCTGTCAATCTTCT
TTGACTCCCTGTACTTCTTCAAAAGACGCCTCAACACTCTCATCCTCCTCATCCACAACA
CTTTAGTCGGCAACCTCGCCTCCCTGGTACCCTTCCTCTTACCGTAACCAGAGTGACGTC
CCTTCATCTTGGCGATCTTCATGCGTCGTGCTCTGGAGCGTGAGTGGATCTTCGTTGGCT
TCTTGATGATGAATCCATCGTTCACAAGCCTCCTTATGTTTTGGCGAGAGTTGGCCATGG
CGATGTCGTTGCCTTCGTTTGGATCGAGCCATACTTTGCCCTCTCCGCACTTGAGCACTG
AGGCTGCGATACGCTTCTGGAGCTTCAACGCCACCATTTCTTTCGCCTTCTCTCCCTTCT
CCAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2EZ27JQ U 35
AF RR2GC56JQ U 1
AF RR2GN42JQ U 37
AF RR2EZ27TF C 192
AF RR2GC56TF C 207
BS 1 169 RR2GC56JQ
BS 170 170 RR2EZ27JQ
BS 171 189 RR2GC56JQ
BS 190 191 RR2EZ27JQ
BS 192 209 RR2GC56JQ
BS 210 210 RR2EZ27JQ
BS 211 219 RR2GC56JQ
BS 220 220 RR2EZ27JQ
BS 221 337 RR2GC56JQ
BS 338 338 RR2EZ27JQ
BS 339 506 RR2GC56JQ
BS 507 507 RR2EZ27JQ
BS 508 761 RR2GC56JQ
BS 762 769 RR2GN42JQ
BS 770 822 RR2EZ27TF
BS 823 823 RR2GC56TF
BS 824 899 RR2EZ27TF
BS 900 907 RR2GC56TF

RD RR2EZ27JQ 549 0 0
GAG
TCGTAAAGGACATATTACTGAGATGATAGGAAATAAAAAAGTATGTAAAAGACTAAAACA
CAGCGAACTGCTGACGACACTAATGAAGAAGACTCTCACACTTGTCGCAGATAAACTGTT
TTGACAGGAAGCTAAATCACCAAAAAAAAAA***CCGTTCCAAAATTATCTGCTAAAGAA
AAAGTCACTAAAGAACTAAACTTATTCTTCTTCTCACTTCTTCGACCTTTTCGCCGGGAA
CTCTGCAGTTTAGGCAGGTGGTGCGGCGGCAGGTACATTTCCTCCAGGACCCATGGCAAG
TCTCTCCTCTCTACGAGCATGCTTCCTCTCTCTACTAGCCTTGTTCTTAGCCCTCTTAGC
CTCAAACTGATCAGACAAAGTCTCCTCTCTCGCCTTCTCAGCCTTGGACTTATGGATACT
CTCCATCAACACACGCTTGTTCTTGAAAACATTTCCCTTCACCTTCATGTACATATCATG
GTACATGTGCCTGTCAATCTTCTTTGACTCCCTGTACTTCTTCAAAAGACGCCTCAACAC
TCTCAT

QA 4 549 4 549
DS 

RD RR2GC56JQ 764 0 0
CTAATAATAGTTTCTCTTTAGATAAAAGCCAGGTAAGTCGTAAAGGACATATTACTGAGA
TGATAGGAAATAAAAAAGTATGTAAAAGACTAAAACACAGCGAACTGCTGACGACACTAA
TGAAGAAGACTCTCACACTTGTCGCAAATAAACTGTTTTGACAGGAAGCAAAATCACCAA
AAAAAAAAAAACCGTTCCAAAATTATCTGATAAAGAAAA*GTCACTAAAGAACTAAACTT
ATTCTTCTTCTCACTTCTTCGACCTTTTCGCTGGGAACTCTGCAGTTTAGGCAGGTGGTG
CGGCGGCAGGTACATTTCCTCCAGGACCCATGGCAAGCCTCTCCTCTCTACGAGCATGCT
TCCTCTCTCTACTAGCCTTGTTCTTAGCCCTCTTAGCCTCAAACTGATCAGACAAAGTCT
TCTCTCTCGCCTTCTCAGCCTTGGACTTATGGATACTCTCCATCAACACACGCTTGTTCT
TGAAAACATTTCCCTTCACCTTCATGCACATATCATGGTACATGTGCCTGTCAATCTTCT
TTGACTCCCTGTACTTCTTCAAAAGACGCCTCAACACTCTCATCCTCCTCATCCACAACA
CTTTAGTCGGCAACCTCGCCTCCCTGGTACCCTTCCTCTTACCGTAACCAGAGTGACGTC
CCTTCATCTTGGCGATCTTCATGCGTCGTGCTCTGGAGCGTGAGTGGATCTTCGTTGGCT
TCTTGATGATGAATCCATCGTTCACAAGCCTCCTTATGTTT
GGC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2GN42JQ 733 0 0
A
TCGTAAAGGACATATTACTGAGATGATAGGAAATAAAAAAGTATGTAAAAGACTAAAACA
CAGCGAACTGCTGACGACACTAATGAAGAAGACTCTCACACTTGTCGCAAATAAACTGTT
TTGACAGGAAGCTAAATCACCAAAAAAAAAAA**CCGTTCCAAAATTATCTGCTAAAGAA
AAAGTCACTAAAGAACTAAACTTATTCTTCTTCTCACTTCTTCGACCTTTTCGCTGGGAA
CTCTGCAGTTTAGGCAGGTGGTGCGGCGGCAGGTACATTTCCTCCAGGACCCATGGCAAG
TCTCTCCTCTCTACGAGCATGCTTCCTCTCTCTACTAGCCTTGTTCTTAGCCCTCTTAGC
CTCAAACTGATCAAACAAAGTCTTCTCTCTCGCCTTCTCAGCCTTGGACTTATGGATACT
CTCCATCAACACACGCTTGTTCTTGAAAACATTTCCCTTCACCTTCACGTACATATCATG
GTACATGTGCCTGTCAATCTTCTTTGACTCCCTGTACTTCTTCAAAAGACGCCTCAACAC
TCTCATCCTCCTCATCCACAACACTTTAGTCGGCAACCTCGCCTCCCTGGTACCCTTCCT
CTTACCGTAACCAGAGTGACGTCCCTTCATCTTGGCGATCTTCATGCGTCGTGCTCTGGA
GCGTGAGTGGATCTTCGTTGGCTTCTTGATGATGAATCCATCGTTCACAAGCCTCCTTAT
GTTTTGGCGAGA

QA 2 733 2 733
DS 

RD RR2EZ27TF 710 0 0
CCGTTCCAAAATTATCTGCTAAAGAAAAAGTCACTAAAGAACTAAACTTATTCTTCTTCT
CACTTCTTCGACCTTTTCGCCGGGAACTCTGCAGTTTAGGCAGGTGGTGCGGCGGCAGGT
ACATTTCCTCCAGGACCCATGGCAAGTCTCTCCTCTCTACGAGCATGCTTCCTCTCTCTA
CTAGCCTTGTTCTTAGCCCTCTTAGCCTCAAACTGATCAGACAAAGTCTCCTCTCTCGCC
TTCTCAGCCTTGGACTTATGGATACTCTCCATCAACACACGCTTGTTCTTGAAAACATTT
CCCTTCACCTTCATGTACATATCATGGTACATGTGCCTGTCAATCTTCTTTGACTCCCTG
TACTTCTTCAAAAGACGCCTCAACACTCTCATCATCCTCATCCACAACACTTTAGTCGGC
AACCTCGCCTCCCTGGTACCCTTCCTCTTACCGTAACCAGAGTGACGTCCCTTCATCTTG
GCGATCTTCATGCGTCGTGCTCTGGAGCGTGAGTGGATCTTCGTTGGCTTCTTGATGATG
AATCCATCGTTCACAAGCCTCCTTATGTTTTGGCGAGAGTTGGCCATGGCGATGTCGTTG
CCTTCGTTTGGATCGAGCCATACTTTGCCCTTTCCGCACTTGAGCACTGAGGCTGCGATA
CGCTTCTGGAGCTTCAACGCCACCATTTCTTTCGCCTTCTCTCCCTTC
CC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2GC56TF 701 0 0
TCTGATAAAG
AAAAGTCACTAAAGAACTAAACTTATTCTTCTTCTCACTTCTTCGACCTTTTCGCTGGGA
ACTCTGCAGTTTAGGCAGGTGGTGCGGCGGCAGGTACATTTCCTCCAGGACCCATGGCAA
GCCTCTCCTCTCTACGAGCATGCTTCCTCTCTCTACTAGCCTTGTTCTTAGCCCTCTTAG
CCTCAAACTGATCAGACAAAGTCTTCTCTCTCGCCTTCTCAGCCTTGGACTTATGGATAC
TCTCCATCAACACACGCTTGTTCTTGAAAACATTTCCCTTCACCTTCATGCACATATCAT
GGTACATGTGCCTGTCAATCTTCTTTGACTCCCTGTACTTCTTCAAAAGACGCCTCAACA
CTCTCATCCTCCTCATCCACAACACTTTAGTCGGCAACCTCGCCTCCCTGGTACCCTTCC
TCTTACCGTAACCAGAGTGACGTCCCTTCATCTTGGCGATCTTCATGCGTCGTGCTCTGG
AGCGTGAGTGGATCTTCGTTGGCTTCTTGATGATGAATCCATCGTTCACAAGCCTCCTTA
TGTTTTGGCGAGAGTTGGCCATGGCGATGTCGTTGCCTTCGTTTGGATCGAGCCATACTT
TGCCCTCTCCGCACTTGAGCACTGAGGCTGCGATACGCTTCTGGAGCTTCAACGCCACCA
TTTCTTTCGCCTTCTCTCCCTTCTCCAAGCC

QA 11 701 11 701
DS 



AS 1 6

CO CL1400Contig1 805 6 14 U
TTTTTTCTCATTTAAACTAAAAAGGTCTAAATCAAATAAATAAAATGGCGGGTCGCGACA
CTTTCCAGCTGCGTTTCGTGGCTGTCGTGGCATCCGCCGCCGTATTGATCTTCCTTGTAT
CCAGCCAAGTCGCGGAGGCATCGCGTATGATGAACATATGCTCTCACACTCCGTATCCAT
CTCTGTGCCAGCCTTTGGTGAAGCGTGAAACGAACCCAAGAAGAGCCACTCACAAAACCA
TACAGGCTTTGGAGGCTAAGACAAGACTAGCTCTAACTGAAGCGGCCAGGTACAAAAGCG
GTAACCAAGAGATCACGACATGTTATGAAACGCTTACCGACGCGCTTTATAATTTGGCAA
GCGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGATGTGATGGCGATGAACATGTTTTTAACTGCGG
CTGTGTCTGATTACGGTGTATGCGTTGAAGGGTTCATTGACAAGGGTCAGGTTAATACGG
TTCAAAATTCAGCGGTTGATTTGAGGAAAACTGGCAGCAATTGCTTGACGTTGTCTACAT
TGATTAGATGATAAACTAACAAACAATTGTTATTTTCTCCAAAAAATACTAATTAATTTC
TTCAAAATGAAAAAA*GAGAACAAAA*AATCGAACTAATGAAAAACGGGTTTTTTCTTTG
TTGTTTTTATTTCGGGGAGCTGTTTATTGATCATCATTCGTCGTGTAAACGCCACTGGGT
ATAATTAATTATATTTATCTTATGTAATTAATTGCTATTAGATTATTTTTTCTTGTGGTA
ATTTCAATGATATGATAACTTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 10 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW72TF U 7
AF RR2EV45TF U 1
AF RR2EV45JQ C 29
AF RR2BU12TF U 1
AF RR2AN17TF U 17
AF RR2BU12JQ C 443
BS 1 22 RR2BU12TF
BS 23 23 RR2EV45TF
BS 24 132 RR2BU12TF
BS 133 133 RR2EV45TF
BS 134 163 RR2BU12TF
BS 164 164 RR2EV45TF
BS 165 229 RR2BU12TF
BS 230 230 RR2EV45TF
BS 231 532 RR2BU12TF
BS 533 533 RR2EV45TF
BS 534 708 RR2BU12TF
BS 709 710 RR2AN17TF
BS 711 777 RR2BU12TF
BS 778 805 RR2BU12JQ

RD RR2DW72TF 284 0 0
GG
CATTTAAACTAAAAAGGTCTAAATCAAATAAATAAAATGGCGGGTCGCGACACTTTCCAG
CTGCGTTTCGTGGCTGTCGTGGCATCCGCCGCCATATTGATCTTCCTTGTATCCAGCCAA
GTCGCGGAGGCATCGCGTATGATGAACATATGCTCTCACACTCCGTATCCATCTCTGTGC
CAGCCTTTGGTGAAGCGTGAAACGAACCCAAGAAGAGCCACTCACAAAACCATACAGGCT
TTGGAGGCTAAGACAAGACTAGCTCTAACTGAAGCGGCCAGG

QA 3 284 3 284
DS 

RD RR2EV45TF 604 0 0
TTTTTTCT
CATTTAAACTAAAAAGGTCTAAATCAAATAAATAAAATGGCGGGTCGCGACACTTTCCAG
CTGCGTTTCGTGGCTGTCGTGGCATCCGCCGCCGTATTGATCTTCCTTGTATCCAGCCAA
GTCGCGGAGGCATCGCGTATGATGAACATATGCTCTCACACTCCGTATCCATCTCTGTGC
CAGCCTTTGGTGAAGCGTGAAACGAACCCAAGAAGAGCCACTCACAAAACCATACAGGCT
TTGGAGGCTAAGACAAGACTAGCTCTAACTGAAGCGGCCAGGTACAAAAGCGGTAACCAA
GAGATCACGACATGTTATGAAACGCTTACCGACGCGCTTTATAATTTGGCAAGCGCGAGG
AAGAGTATAAGGAAACGTGATGTGATGGCGATGAACATGTTTTTAACTGCGGCTGTGTCT
GATTACGGTGTATGCGTTGAAGGGTTCATTGACAAGGGTCAGGTTAATACGGTTCAAAAT
TCAGCGGTTGATTTGAGGAAAACTGGCAGCAATTGCTTGACGTTGTCTACATTGATTAGA
TGATAAACTAACAAACATTTGTTACTTTCTCCAAAAAATACTAATTAATTT
CTTCT

QA 9 599 9 599
DS 

RD RR2EV45JQ 535 0 0
AAATCAAATAAATAAAATGGCGGGTCGCGACACTTTCCAGCTGCGTTTCGTGGCTGTCGT
GGCATCCGCCGCCGTATTGATCTTCCTTGTATCCAGCCAAGTCGCGGAGGCATCGCGTAT
GATGAACATATGCTCTCACACTCCGTATCCATCTCTGTGCCAGCCTTTGGTGAAGCGTGA
AACGAACCCAAGAAGAGCCACTCACAAAACCATACAGGCTTTGGAGGCTAAGACAAGACT
AGCTCTAACTGAAGCGGCCAGGTACAAAAGCGGTAACCAAGAGATCACGACATGTTATGA
AACGCTTACCGACGCGCTTTATAATTTGGCAAGCGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGA
TGTGATGGCGATGAACATGTTTTTAACTGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGCGTTGA
AGGGTTCATTGACAAGGGTCAGGTTAATACGGTTCAAAATTCAGCGGTTGATTTGAGGAA
AACTGGCAGCAATTGCTTGACGTTGTCTACATTGATTAGATGATAAACTAACAAA

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2BU12TF 777 0 0
TTTTTTCTCATTTAAACTAAAA*GGTCTAAATCAAATAAATAAAATGGCGGGTCGCGACA
CTTTCCAGCTGCGTTTCGTGGCTGTCGTGGCATCCGCCGCCGTATTGATCTTCCTTGTAT
CCAGCCAAGTCGTGGAGGCATCGCGTATGATGAACATATGCTCCCACACTCCGTATCCAT
CTCTGTGCCAGCCTTTGGTGAAGCGTGAAACGAACCCAAGAAGAGCCACGCACAAAACCA
TACAGGCTTTGGAGGCTAAGACAAGACTAGCTCTAACTGAAGCGGCCAGGTACAAAAGCG
GTAACCAAGAGATCACGACATGTTATGAAACGCTTACCGACGCGCTTTATAATTTGGCAA
GCGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGATGTGATGGCGATGAACATGTTTTTAACTGCGG
CTGTGTCTGATTACGGTGTATGCGTTGAAGGGTTCATTGACAAGGGTCAGGTTAATACGG
TTCAAAATTCAGCGGTTGATTTGAGGAAAACTGGCAGCAATTGCTTGACGTTATCTACAT
TGATTAGATGATAAACTAACAAACAATTGTTATTTTCTCCAAAAAATACTAATTAATTTC
TTCAAAATGAAAAAA*GAGAACAAAA*AATCGAACTAATGAAAAACGGGTTTTTTCTTTG
TTGTTTTTATTTCGGGGAGCTGTTTATTGATCATCATTCGTCGTGTAAT*GCCACTGGGT
ATAATTAATTATATTTATCTTATGTAATTAATTGCTATTAGATTATTTTTTCTTGTG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2AN17TF 741 0 0
GGA
AAAAGGTCTAAATCAAATAAATAAAATGGCGGGTCGCGACACTTTCCAGCTGCGTTTCGT
GGCTGTCGTGGCATCCGCCGCCGTATTGATCTTCCTTGTATCCAGCCAAGTCGCGGAGGC
ATCGCGTATGATGAACATATGCTCTCACACTCCGTATCCATCTCTGTGCCAGCCTTTGGT
GAAGCGTGAAACGAATCCAAGAAGAGCCACTCACAAAACCATACAGGCTTTGGAGGCTAA
GACAAGACTAGCTCTAACTGAAGCGGCCAGGTACAAAAGCGGTAACCAAGAGATCACGAC
ATGCTATGAAACGCTTACCGACGCGCTTTATAATTTGGCAAGCGCGAGGAAGAGTATAAG
GAAACGTGATGTGATGGCGATGAACATGTTTTTAACTGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGT
ATGCGTTGAAGGGTTCATTGACAAGGGTCAGGTTAATACGGTTCAAAATTCAGCGGTTGA
TTTGAGGAAAACTGGCAGCAATTGCTTGACGTTGTCTACATTGATTAGATGATAAACTAA
CAAACATTTGTTACTTTCTCCAAAAAATACTAATTAATTTCTTCTAAATGAAAAAAAGAG
AACAAAAGAATCGAACTAATGAAAAACGGGGTTTTTCTTTGTTGTTTTTATTTCGGGGAG
CTGTTTGTTGATCATCATTCGTCGTGTAAACGCCACTGGGTATAATTAATTATATTAATC
TTATGTAATTAATTGCTA

QA 4 741 4 741
DS 

RD RR2BU12JQ 363 0 0
CGTTGAAGGGTTCATTGACAAGGGTCAGGTTAATACGGTTCAAAATTCAGCGGTTGATTT
GAGGAAAACTGGCAGCAATTGCTTGACGTTATTTACATTGATTAGATGATAAACTAACAA
ACAATTGTTATTTTTTCCAAAAAATACTAATTAATTTTTTCAAAATGAAAAAA*GAGAAC
AAAA*AATCGAACTAATGAAAAACGGGTTTTTTTTTTGTTGTTTTTATTTCGGGGAGCTG
TTTATTGATCATCATTCGTCGTGTAAATGCCACTGGGTATAATTAATTATATTTATCTTA
TGTAATTAATTGCTATTAGATTATTTTTTCTTGTGGTAATTTCAATGATATGATAACTTT
CCG

QA 1 363 1 363
DS 



AS 1 5

CO CL1401Contig1 1454 5 10 U
GGGCTCTCAACAGTGAACAATTTTTTTTATAATAGTTAATAGAGTTGCAGACATTTAATT
TGAAACAGAGGAAAGACAAAAGAAGAGCTATACGGAACTCCACAGAGATATGGTTGAATG
GCGTATTCAATCGTCGTCAACGTAGATGGTCTCCTGTTTAAACAGTCCTCCGAACACTTT
CCTCACCTCTTTCTCTGGTTTCTTAGGGCTCTCTTCTTTTTGTTTGGACGCAAACGCAGC
TGTGGCTGGTTTCACCACTGCTTTCTTGGGTGGCAAGTTTCTAGCCTTTGCCTGTCCCCT
GACAGTAGCGACCTGCACTTTCGGCGTTTCTGAAGCGTTCTGAACCGCGGTAGCAATTTG
AGAACTGAGTGTATTCCAGGAGAGTCCGGATCCAATATTGAGTCCGGATCCAATATCTTT
CGCCTTGTTAAATAGACCGTCCACTGAGATTCCCACAGCTTCTGCCTTTTGCTGCGCGTC
CTCAGCTAGGCTTGCAGCTTCTGCTTCTTTCTCAGAGAGCTTCAGCATTTGCATCTCAAG
CTCTTTGGCTGCTTCCGCTGCCTCTCGGGCTCTCTC*GCAGCGACTTTAGCTTCTTCCTC
GGCTCCTGCCTTTGCCATCGCATCTGCGTACACTTTCCTCCTCCCGTCTTCCGGGATTAC
ACTGAAAAGCTCATCGAATGGCCGTGACGGTGCGGATGGATCTGTAAAAACTTCTACTAC
CTTATTTTCTGCCACTGCCGTGTTAGCAAAAATGTCTGAGGTCGAGACTGGGGTGTCGGG
GCCGTTCTCTGTCGCCCCGATGGTAATCACAACTTTGGTCGCGTTTCCAATGGCTTTGGC
GATTGATTCTGCGTCTTGGAATGGCGATTCCACCGCGTTTAGCCTTTTGATCTCATCCTT
TGATAGAATCTTGTAAGTAGCAGCGACACGAGCAAGGTCCTGAGCGGCTCCAAGATCAGG
AACACCAGCTCGGACGCTGAAGCCTTGTTGCAAGAGCGTTTGAGCTATGCGTATACCGGC
TTGTCCTGTAGCTCCGGCCACAAAAACCGTACCGGGATCTTTTTTCCTGTTGTTACCGAA
AGCTAAACCGGTCGAAGGGCTCGTCACGACCGGCATCAACGACTTCATGTCAGGTAACTT
ACCGAAATCAAACCGGAAACGGTTTGAATCTGGCGATTTCCCCGTTTGTTTTCCCTCCGA
GTCATCGCCCTTGGGTCTCCCGAGCTGAAACCCGGTCTGTTTGGCAGCCAACACGGTTAA
CACTGGTTTTCTCCGGTTAAACTTTGCACCCGGCGTGGTGGTTAACAGGAATGAAGTGGA
GCTGGAAGTCATTAGAGAAGGTTGAAGAGCTTAGGCTTAGTTTGATTGTTCCTCAAGTAA
AAAGTGTGGATGACGATGTCATAGATTAAAGATGAGACACCATGGGGGGAGTGCGAAAGA
CTTTCGTTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW19JQ U 1
AF RR2DR94JQ U 15
AF RR2BJ67JQ U 13
AF RR2DR94TF C 470
AF RR2EW19TF C 777
BS 1 575 RR2EW19JQ
BS 576 576 RR2BJ67JQ
BS 577 577 RR2DR94JQ
BS 578 605 RR2BJ67JQ
BS 606 606 RR2DR94JQ
BS 607 747 RR2BJ67JQ
BS 748 894 RR2DR94TF
BS 895 895 RR2EW19TF
BS 896 1098 RR2DR94TF
BS 1099 1454 RR2EW19TF

RD RR2EW19JQ 575 0 0
GGGCTCTCAACAGTGAACAATTTTTTTTATAATAGTTAATAGAGTTGCAGACATTTAATT
TGAAACAGAGGAAAGACAAAAGAAGAGCTATACGGAACTCCACAGAGATATGGTTGAATG
GCGTATTCAATCGTCGTCAACGTAGATGGTCTCCTGTTTAAACAGTCCTCCGAACACTTT
CCTCACCTCTTTCTCTGGTTTCTTAGGGCTCTCTTCTTTTTGTTTGGACGCAAACGCAGC
TGTGGCTGGTTTCACCACTGCTTTCTTGGGTGGCAAGTTTCTAGCCTTTGCCTGTCCCCT
GACAGTAGCGACCTGCACTTTCGGCGTTTCTGAAGCGTTCTGAACCGCGGTAGCAATTTG
AGAACTGAGTGTATTCCAGGAGAGTCCGGATCCAATATTGAGTCCGGATCCAATATCTTT
CGCCTTGTTAAATAGACCGTCCACTGAGATTCCCACAGCTTCTGCCTTTTGCTGCGCGTC
CTCAGCTAGGCTTGCAGCTTCTGCTTCTTTCTCAGAGAGCTTCAGCATTTGCATCTCAAG
CTCTTTGGCTGCTTCCGCTGCCTCTCGGGCTCTCT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2DR94JQ 677 0 0
GAACAAT
TTTTTTTATAATAGTTAATAGAGTTGCAGACATTTAATTTGAAACAGAGGAAAGACAAAA
GAAGAGCTATACGGAACTCCACAGAGATATGGTTGAATGGCGTATTCAACCGTCGTCAAC
GTAGATGGTCTCCTGTTTAAACAGTCCTCCGAACACTTTCCTCACCTCTTTCTCTGGTTT
CTTAGGGCTCTCTTCTTTTTGTTTGGACGCAAACGCAGCTGTGGCTGGTTTCACCACTGC
TTTCTTGGGTGGCAAGTTTCTAGCCTTTGCCTGTCCCCTGACAGTAGCGACCTGCACTTT
CGGCGTTTCTGAAGCGTTCTGAACCGCGGTAGCAATTTGAGAACTGAGTGTATTCCAGGA
GAGTCCGGATCCAATATTGAGTCCGGATCCAATATCTTTCGCCTTGTTAAATAGACCGTC
CACTGAGATTCCCACAGCTTCTGCCTTTTGCTGCGCGTCCTCAGCTAGGCTTGCAGCTTC
TGCTTCTTTCTCAGAGAGCTTCAGCATTTGCATCTCAAGCTCTTTGGCTGCTTCCGCTGC
CTCTCGGGCTCTCTC*GCAGCGACTTTAGCTTCTTCCTCGGCTCCTGCCTTTGCCATCGC
ATCTGCGTACACTTTCCTCCTCCCGTCTTCCGGGATTACACTGAAAAGCTCATCGAATGG
CCGTGACGGT

QA 8 677 8 677
DS 

RD RR2BJ67JQ 735 0 0
CGTGAACAA
TTTTTTTATAATAGTTAATAGAGTTGCAGACATTTAATTTGAAACAGAGGAAAGACAAAA
GAAGAGCTATACGGAACTCCACAGAGATATGGTTGAATGGCGTATTCAATCGTCGTCAAC
GTAGATGGTCTCCTGTTTAAACAGTCCTCCGAACACTTTCCTCACCTCTTTCTCTGGTTT
CTTAGGGCTCTCTTCTTTTTGTTTGGACGCAAACGCAGCTGTGGCTGGTTTCACCACTGC
TTTCTTGGGTGGCAAGTTTCTAGCCTTTGCCTGTCCCCTGACAGTAGCGACCTGCACTTT
CGGCGTTTCTGAAGCGTTCTGAACCACGGTAGCAATTTGAGAACTGAGTGTATTCCAGGA
GAGTCCGGATCCAATATTGAGTCCGGATCCAATATCTTTCGCCTTGTTAAATAGACCGTC
CACTGAGATTCCCACAGCTTCTGCCTTTTGCTGCGCGTCCTCAGCTAGGCTTGCAGCTTC
TGCTTCTTTCTCAGAGAGCTTCAGCATTTGCATCTCAAGCTCTTTGGCTGCTTCCGCTGC
CTCTCGGGCTCTCTCAGCAGCGACTTTAGCTTCTTCCTCGGCTCTTGCCTTTGCCATCGC
ATCTGCGTACACTTTCCTCCTCCCGTCTTCCGGGATTACACTGAAAAGCTCATCGAATGG
CCGTGACGGTGCGGATGGATCTGTAAAAACTTCTACTACCTTATTTTCTGCCACTGCCGT
GTTAGC

QA 10 735 10 735
DS 

RD RR2DR94TF 630 0 0
TGCTGCGCGTCCTCAGCTAGGCTTGCAGCTTCTGCTTCTTTCTCAGAGAGCTTCAGCATT
TGCATCTCAAGCTCTTTGGCTGCTTCCGCTGCCTCTCGGGCTCTCTC*GCAGCGACTTTA
GCTTCTTCCTCGGCTCCTGCCTTTGCCATCGCATCTGCGTACACTTTCCTCCTCCCGTCT
TCCGGGATTACACTGAAAAGCTCATCGAATGGCCGTGACGGTGCGGATGGATCTGTAAAA
ACTTCTGCTACCTTATTTTCTGCCACTGGCGTGTTAGCAAAAATGTCTGAGGTCGAGACT
GGGGTGTCGGGGCCGTTCTCTGTCGCCCCGATGGTAATCACAACTTTGGTCGCGTTTCCA
ATGGCTTTGGCGATTGATTCTGCGTCTTGGAATGGCGATTCCACCGCGTTTAGCCTTTTG
ATCTCGTCCTTTGATAGAATCTTGTAAGTAGCAGCGACACGAGCAAGGTCCTGAGCGGCT
CCAAGATCAGGAACACCAGCTCGGACGCTGAAGCCTTGTTGCAAGAGCGTTTGAGCTATG
CGTATACCGGCTTGTCCTGTAGCTCCGGCCACAAAAACCGTACCGGGATCTTTTTTCCTG
TTGTTACCGAAAGCTAAACCGGTCGAAGG
C

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2EW19TF 678 0 0
CGGGGCCGTTCTCTGTCGCCCCGATGGTAATCACAACTTTGGTCGCGTTTCCAATGGCTT
TGGCGATTGATTCTGCGTCTTGGAATGGCGATTCCACCGCGTTTAGC*TTTTGATCTCAT
CCTTTGATAGAATCTTGTAAGTAGCAGCGACACGAGCAAGGTCCTGAGCGGCTCCAAGAT
CAGGAACACCAGCTCGGACGCTGAAGCCTTGTTGCAAGAGCGTTTGGGCTATGCGTATAC
CGGCTTGTCCTGTAGCTCCGGCCACAAAAACCGTACCGGGATCTTTTTTCCTGTTGTTAC
CGAAAGCTAAACCGGTCGAAGGGCTCGTCACGACCGGCATCAACGACTTCATGTCAGGTA
ACTTACCGAAATCAAACCGGAAACGGTTTGAATCTGGCGATTTCCCCGTTTGTTTTCCCT
CCGAGTCATCGCCCTTGGGTCTCCCGAGCTGAAACCCGGTCTGTTTGGCAGCCAACACGG
TTAACACTGGTTTTCTCCGGTTAAACTTTGCACCCGGCGTGGTGGTTAACAGGAATGAAG
TGGAGCTGGAAGTCATTAGAGAAGGTTGAAGAGCTTAGGCTTAGTTTGATTGTTCCTCAA
GTAAAAAGTGTGGATGACGATGTCATAGATTAAAGATGAGACACCATGGGGGGAGTGCGA
AAGACTTTCGTTGTTTCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 6

CO CL1402Contig1 1768 6 22 U
GGGACGAAGAAGAAGAAGAAGATAACGAAACACACACACACTCAAGCATGAACGGAGCTT
CGCTCTGCAATTCCCTTCTGCTCCATTCTCGCTTCAAACCACCGTGCTCCATCCCTTCCT
CTTCGTCTGTTTATCTGATTTCTCCCTGCTTCACAACCTCTGCGCACATCTCATTTCCTC
GAGCAGTCGTTATCAAAAGGAGTGACGTGTTTCGTTCTTCCGCTGTAAACAAACGTAGAA
GCAATACAGAAGAAGAGGATGAGGATGAAGAAGAAGATGATGAAGATTGGAGTGAGTTTG
AAGTAGAAGCTGAAGGAGATGAAGACGAAGACGAAGGAGAGTTCTTGCCGATGGATAAGA
TGAAGCAATGGCTAGAGAAGAAGCCACGCGGGTTCGGCGCTGGCAAAAAGTACGAGACTT
TAATAGAAGACAAGCTCCTCGAGGAGATTGAGAAGAGCTGGAAAGCTCAAGCTGCTAATC
TCAACAACCTCAAGAACAACGATCCTCTTAAACGCGACCATAATAATAATAATAATCTCA
TCAAAGGTGAAACTCAAAGTGGGTTTCGTGTTCGTGTGACCAATCTTCCTAAGAAGAAGA
ATGTTCACAGAGATCTCAAGGCGGCTTTTAAAGAAGTGAGTGGGGTGTTGAACATAGAAC
CAGCTGTGTCTGGGAATAAGAAGACTAAGGATCCTGTCTGTAAAGGGTTCGCTCTTGTTG
ATTTCAAAACCGGTGTTGATGCTAACAGGTTTGTGGAGCAATTCAATGGACAGAGATTGT
CATTTGGGAAGGTTGTGAAGCAGATAAAATGTCAGGTTGTGGAGTTTGCTGCTTCGAACC
AATCAGTTTCTGAGGAGCTACGCTCGGATACAGTCTTTGAGGAGCTTCCTTTTCCTGGTT
TTGAGGCAGTTTCTAGTGTTGATGTTGTTGAAGAAGATGCTTTTGTGGATTCGTGGGAAG
AAGAATCATTGGATGATTCAGTCAAAGATGCAGATGAAACAGAAGTGGAAGAAGAAGAAG
ATGAACGTATCATAGAATCTCCCAAAGTACATACCAATGTAAGGTCTCAGAAACAAGCTG
TGAAGCGAGAGACTAGAGAACAGGAGTTAGAGACACCTCTAGTTTCATTCCAGGCAGTGA
ATAAACCCGAGGAAGCTGTGGCAGAAGCACGTGTGGATGATGATGAACATGATAGGTCTG
ATGAAGAGGAAGAAGTTGACGAAGAGAATCCTGAACCTCTGAAAAGTTCAGTGTCATCAT
CAGATGAGGAAAGGATTGAGAGAATCCGTAGGCTGGAGCTGAAGCTTCTAGGTAGAGAAA
AACTATTGGGTGGAGGAGCTGGCTCTGATAAACCAGAAGCAAAAACTGGTGGTAGAGTGG
AAGGAGAGAAGAAAAAGGAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGATTATTGTGAAAGGGAAGAAGT
CCTCAACCATAGAGATTCCTGGATCTTCAAAGAGGTTAAAGATGAAGGAGAAGGCTCTGT
TAACTGGGGTCTTAGTCAAGTATGCAGCAAAAGCTGCTTCAACCTCAAATGATGAATGAT
CACTAGGAGCAGAGTGAATCTTTTAAGTGTTTAGTCTCATCATGTCTTCTTTTGACGTTT
CAATTCATGGGTATTGTCCTTAGGAATGCATCACGGATGCGCATGCATGCTCAAGCTAAC
TTGGGTACAGATCTCTGTGGTTTAGAATCCTTTTGGACCCTTTTCTCTTGTATGGTTTGT
GCTTTATTATAGATATATATTGAAAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2AU40TF U 1
AF RR2AP32TF U 42
AF RR2DF41TF U 262
AF RR2AP32JQ C 629
AF RR2DF41JQ C 889
AF RR2AU40JQ C 1081
BS 1 688 RR2AU40TF
BS 689 689 RR2DF41TF
BS 690 728 RR2AU40TF
BS 729 729 RR2AP32TF
BS 730 744 RR2AU40TF
BS 745 787 RR2AP32TF
BS 788 905 RR2DF41TF
BS 906 906 RR2AP32JQ
BS 907 961 RR2DF41TF
BS 962 962 RR2AP32JQ
BS 963 985 RR2DF41TF
BS 986 986 RR2AP32JQ
BS 987 1003 RR2DF41TF
BS 1004 1274 RR2AP32JQ
BS 1275 1275 RR2DF41JQ
BS 1276 1344 RR2AP32JQ
BS 1345 1345 RR2DF41JQ
BS 1346 1391 RR2AP32JQ
BS 1392 1410 RR2DF41JQ
BS 1411 1413 RR2AU40JQ
BS 1414 1766 RR2DF41JQ
BS 1767 1768 RR2AU40JQ

RD RR2AU40TF 744 0 0
GGGACGAAGAAGAAGAAGAAGATAACGAAACACACACACACTCAAGCATGAACGGAGCTT
CGCTCTGCAATTCCCTTCTGCTCCATTCTCGCTTCAAACCACCGTGCTCCATCCCTTCCT
CTTCGTCTGTTTATCTGATTTCTCCCTGCTTCACAACCTCTGCGCACATCTCATTTCCTC
GAGCAGTCGTTATCAAAAGGAGTGACGTGTTTCGTTCTTCCGCTGTAAACAAACGTAGAA
GCAATACAGAAGAAGAGGATGAGGATGAAGAAGAAGATGATGAAGATTGGAGTGAGTTTG
AAGTAGAAGCTGAAGGAGATGAAGACGAAGACGAAGGAGAGTTCTTGCCGATGGATAAGA
TGAAGCAATGGCTAGAGAAGAAGCCACGCGGGTTCGGCGCTGGCAAAAAGTACGAGACTT
TAATAGAAGACAAGCTCCTCGAGGAGATTGAGAAGAGCTGGAAAGCTCAAGCTGCTAATC
TCAACAACCTCAAGAACAACGATCCTCTTAAACGCGACCATAATAATAATAATAATCTCA
TCAAAGGTGAAACTCAAAGTGGGTTTCGTGTTCGTGTGACCAATCTTCCTAAGAAGAAGA
ATGTTCACAGAGATCTCAAGGCGGCTTTTAAAGAAGTGAGTGGGGTGTTGAACATAGAAC
CAGCTGTGTCTGGGAATAAGAAGACTAA*GATCCTGTCTGTAAAGGGTTCGCTCTTGTTG
ATTTCAAA*CCGGTGTTGATGCTA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2AP32TF 746 0 0
GG
AAGCATGAACGGAGCTTCGCTCTGCAATTCCCTTCTGCTCCATTCTCGCTTCAAACCACC
GTGCTCCATCCCTTCCTCTTCGTCTGTTTATCTGATTTCTCCCTGCTTCACAACCTCTGC
GCACATCTCATTTCCTCGAGCAGTCGTTATCAAAAGGAGTGACGTGTTTCGTTCTTCCGC
TGTAAACAAACGTAGAAGCAATACAGAAGAAGAGGATGAGGATGAAGAAGAAGATGATGA
AGATTGGAGTGAGTTTGAAGTAGAAGCTGAAGGAGATGAAGACGAAGACGAAGGAGAGTT
CTTGCCGATGGATAAGATGAAGCGATGGCTAGAGAAGAAGCCACGCGGGTTCGGCGCTGG
CAAAAAGTACGAGACTTTAATAGAAGACAAGCTCCTCGAGGAGATTGAGAAGAGCTGGAA
AGCTCAAGCTGCTAATCTCAACAACCTCAAGAACAACGATCCTCTTAAACGCGACCATAA
TAATAATAATAATCTCATCAAAGGTGAAACTCAAAGTGGGTTTCGTGTTCGTGTGACCAA
TCTTCCTAAGAAGAAGAATGTTCACAGAGATCTCAAGGCGGCTTTTAAAGAAGTGAGTGG
GGTGTTGAACATAGAACCAGCTGTGTCTGGGAATAAGAAGACTAAAGATCCTGTCTGTAA
AGGGTTCGCTCTTGTTGATTTCAAAACCGGTGTTGATGCTAACAGGTTTGTGGAGCAATT
CAATGGACAGAGATTGTCATTTGG

QA 3 746 3 746
DS 

RD RR2DF41TF 742 0 0
GGGAAGAG
GAAGAAGAAGATGAAGATTGGAGTGAGTTTGAAGTAGAAGCTGAAGGAGATGAAGACGAA
GACGAAGGAGAGTTCTTGCCGATGGATAAGATGAAGCAATGGCTAGAGAAGAAGCCACGC
GGGTTCGGCGCTGGCAAAAAGTACGAGACTTTAATAGAAGACAAGCTCCTCGAGGAGATT
GAGAAGAGCTGGAAAGCTCAAGCTGCTAATCTCAACAACCTCAAGAACAACGATCCTCTT
AAACGCGACCATAATAATAATAATAATCTCATCAAAGGTGAAACTCAAAGTGGGTTTCGT
GTTCGTGTGACCAATCTTCCTAAGAAGAAGAATGTTCACAGAGATCTCAAGGCGGCTTTT
AAAGAAGTGAGTGGGGTGTTGAACATAGAACCAGCTGTGTCTGGGAATAAGAAGACTAAG
GATCCTGTCTGTAAAGGGTTCGCTCTTGTTGATTTCAAAACCGGTGTTGATGCTAACAGG
TTTGTGGAGCAATTCAATGGACAGAGATTGTCATTTGGGAAGGTTGTGAAGCAGATAAAA
TGTCAGGTTGTGGAGTTTGCTGCTTCGAACCAATCAGTTTCTGAGGAGCTACGCTCGGAT
ACAGTCTTTGAGGAGCTTCCTTTTCCTGGTTTTGAG*CAGTTTCTAGTGTTGATGTTGTT
GAAGAAGATGCTTTTGTGGATTCGTGGGAAGA*GAATCATTGGATGATTCAGTCAA*GAT
GCAGATGAAACAGA

QA 9 742 9 742
DS 

RD RR2AP32JQ 763 0 0
TAAAGAAGTGAGTGGGGTGTTGAACATAGAACCAGCTGTGTCTGGGAATAAGAAGACTAA
GGATCCTGTCTGTAAAGGGTTCGCTCTTGTTGATTTCAAAACCGGTGTTGATGCTAACAG
GTTTGTGGAGCAATTCAATGGACAGAGATTGTCATTTGGGAAGGTTGTGAAGCAGATAAA
ATGTCAGGTTGTGGAGTTTGCTGCTTCGAACCAATCAGTTTCTGAGGAGCTACGCTCGGA
TACAGTCTTTGAGGAGCTTCCTTTTCCTGGTTTTGAGGCAGTTTCTAGTGTTGATGTTGT
TGAAGAAGATGCTTTTGTGGATTCGTGGGAAGAAGAATCATTGGATGATTCAGTCAAAGA
TGTAGATGAAACAGAAGTGGAAGAAGAAGAAGATGAACGTATCATAGAATCTCCCAAAGT
ACATACCAATGTAAGGTCTCAGAAACAAGCTGTGAAGCGAGAGACTAGAGAACAGGAGTT
AGAGACACCTCTAGTTTCATTCCAGGCAGTGAATAAACCCGAGGAAGCTGTGGCAGAAGC
ACGTGTGGATGATGATGAACATGATAGGTCTGATGAAGAGGAAGAAGTTGACGAAGAGAA
TCCTGAACCTCTGAAAAGTTCAGTGTCATCATCAGATGAGGAAAGGGTTGAGAGAATCCG
TAGGCTGGAGCTGAAGCTTCTAGGTAGAGAAAAACTATTGGGTGGAGGAGCTGGCTTTGA
TAAACCAGAAGCAAAAACTGGTGGTAGAGTGGAAGGAGAGAAG

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2DF41JQ 880 0 0
TCTTTTCCTGTTTTGAG
GCAGTTTCTAGTGTTGATGTG**TGAAGAAGATGCTTTTGTGGATTCGTGGGAAGAAGAA
TCATTGGATGATTCAGTCAAAGATGCAGATGAAACAGAAGTGGAAGAAGAAGAAGATGAA
CGTATCATAGAATCTCCCAAAGTACATACCAATGTAAGGTCTCAGAAACAAGCTGTGAAG
CGAGAGACTAGAGAACAGGAGTTAGAGACACCTCTAGTTTCATTCCAGGCAGTGAATAAA
CCCGAGGAAGCTGTGGCAGAAGCACGTGTGGATGATGATGAACATGATAGGTCTGATGAA
GAGGAAGAAGTTGACGAAGAGAATCCTGAACCTCTGAAAAGTTCAGTGTCATCATCAGAT
GAGGAAAGGATTGAGAGAATCCGTAGGCTGGAGCTGAAGCTTCTAGGTAGAGAAAAACTA
TTGGGTGGAGGAGCTGGCTCTGATAAACCAGAAGCAAAAACTGGTGGTAGAGTGGAAGGA
GAGAAGAAAAAGGAGAAGAAGAAGA***AAAAGATTATTGTGAAAGGGAAGAAGTCCTCA
ACCATAGAGATTCCTGGATCTTCAAAGAGGTTAAAGATGAAGGAGAAGGCTCTGTTAACT
GGGGTCTTAGTCAAGTATGCAGCAAAAGCTGCTTCAACCTCAAATGATGAATGATCACTA
GGAGCAGAGTGAATCTTTTAAGTGTTTAGTCTCATCATGTCTTCTTTTGACGTTTCAATT
CATGGGTATTGTCCTTAGGAATGCATCACGGATGCGCATGCATGCTCAAGCTAACTTGGG
TACAGATCTCTGTGGTTTAGAATCCTTTTGGACCCTTTTCTCTTGTATGGTTTGTGCTTT
ATTATAGATATATATTGAAAG
TC

QA 18 878 18 878
DS 

RD RR2AU40JQ 688 0 0
TGAAGCGAGAGACTAGAGAACAGGAGTTAGAGACACCTCTAGTTTCATTCCAGGCAGTGA
ATAAACCCGAGGAAGCTGTGGCAGAAGCACGTGTGGATGATGATGAACATGATAGGTCTG
ATGAAGAGGAAGAAGTTGACGAAGAGAATCCTGAACCTCTGAAAAGTTCAGTGTCATCAT
CAGATGAGGAAAGGATTGAGAGAATCCGTAGGCTGGAGCTGAAGCTTCTAGGTAGAGAAA
AACTATTGGGTGGAGGAGCTGGCTCTGATAAACCAGAAGCAAAAACTGGTGGTAGAGTGG
AAGGAGAGAAGAAAAAGGAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGATTATTGTGAAAGGGAAGAAGT
CCTCAACCATAGAGATTCCTGGATCTTCAAAGAGGTTAAAGATGAAGGAGAAGGCTCTGT
TAACTGGGGTCTTAGTCAAGTATGCAGCAAAAGCTGCTTCAACCTCAAATGATGAATGAT
CACTAGGAGCAGAGTGAATCTTTTAAGTGTTTAGTCTCATCATGTCTTCTTTTGACGTTT
CAATTCATGGGTATTGTCCTTAGGAATGCATCACGGATGCGCATGCATGCTCAAGCTAAC
TTGGGTACAGATCTCTGTGGTTTAGAATCCTTTTGGACCCTTTTCTCTTGTATGGTTTGT
GCTTTATTATAGATATATATTGAAAGGC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 6

CO CL1403Contig1 2276 6 20 U
GGCGGGAAGATGAAGGCGGAGACGGTGAAGGAGCCGCCCGAGGACTCGCTTGTTGCTTCG
GAGTTGAACTTGGCCGTGCTGAAAGAGGCGAGGATTTTTCATTTCAATTCAGAAGTGTTG
ACGTCACCTACAATGCAATCAACTCTGTTCAAGGCAATACAATGGTCCAAGAAGTTCGGA
GGGCTTATTTTCTTTGATTTGAATCTTCCGTTACCGTTGTGGAGATCACGAAACGAGACT
AGGAAGCTGATCAAGAAAGCATGGGATGAAGCGAACATCATCGAAGTTTCGCAGCAAGAG
CTTGAGTTTCTACTCGATGAAGAGTACTACGAGAGGAGAAGAAACTACACGCCGCAGTAC
TTTGCTGAGGATTTCGAGCAGACTAAGAACAGGAGAGACTATTACCATTACACACCAGAG
GAGATCAAGCCGTTGTGGCACGACGATCTGAAGCTGTTGGTTGTGACTGATGGAACACTA
AGGCTACATTACTATACTCCTAAGTTCGATGGTGTTGTGGTTGGGACGGAAGATGTGCTC
ATAACTCCTTTCACATGCGATAGGACGGGTTCTGGTGATGCTGTTGTTGCAGGCATAATG
AGGAAGCTAACGACTTGTCCTGAGATGTTTGAGGACCAAGATGTGTTGGAGCGACAGCTC
CGGTTCGCAGTCGCTGCCGGGATCATATCGCAGTGGACAATTGGTGCGGTTAGAGGCTTC
CCAACTGAAAGCGCCACACAGAATTCGAAAGAGCAGGTTTATGTTCCATCAATGTGGTAG
TTAGAAAGACCAAGAGATGAGCTTCTTCTACTAAATCTTTTTGAACAATGTGAGATGTAT
ACTGATTTCAAAACTGTAATCCAATGTACAATCATTTTTTGAGTTCACTGATAACAACAA
TGTGAGAGGGTGGTAAGAACATGATACCCTAGTGAAATCTATGTTTGGTTACCGTGCGGA
GTCACAAAAATGCTCTAGCTGATCCAAGTCTTCATGCTCTTCTGTATAGAAAATCTATTC
CAAAGACTGTCTGAGCAGAACTCGGGTTACCTCTTTACCTATGTTGTACAAAAAGCTATA
AACTCGAAGCGGGTTGTTCTGTGTCCTGATCCTGCAGTGTTTGACGTGGGAATCTCAAAC
TGTTTTTGATTACCGTATCAACGCTATTTTAAAGCACTCTTGTTCCATGTCTTTGTCTCC
GTTCTTAGACTTGATTTTTTTCCAGAGCTGCCAGAATGAGACTTGGTACAGATGCAATCG
GGTTGTGGATTCGCATAGAAATTCTCCTCTAGCCTGGGAAGTGCAGCAGGCAGTCTCGCA
TATGGCGCTCCAATCCTGTCTCTGTTTAATCGCTTAACCTCTGAAGTAAACTCTTCCCAA
GATATGAAGCCATCATCAAAATGATCTATCAGTCTAACAAAATTCAACCTGTCTGGATTT
ATCGACTTCCTAAACCCTTCAAACCTTCTGTGCCCTTGTACTGCCTTAGCCATATTTCCA
TCGTATGTATAAACAAAAACATCGCTTTCAAGGGCCACAATATAGTCCAACGCAGCAAGC
CGGTTCTGGTAAGGACTGAAAGGCTCTAACTCTTCTTCAGTCGCAAGAGTTGAATGAGAG
AAGACATTTGGGTACTCTGCACGGAAAGCATCCATACTCTTGCTTCCATAGATTTCACCA
GCAACTATATATACAGTAGTGGAGGATGGATATCCCATTGCCTTTAGAAATATGGCTGCT
TCTCGCGGAGACATAGGACATCCGCCTTGGATCCGTCTCTCTGCGCTATCAATCTCTTTC
TCCTTCCAGTGTTTGACATTGTACCTCATGATCCTCAAATCTTCGGCTTCCTCAGATGTA
AGATTGTGGCTGCAACCAGTAAAGGCAAGCATGTCCTTCTCGTATCTCAAATGCAGAGCG
ATATACGGCTCACTGTTGTTTCTTAAACGGTTAACCAATACCTTTCCGAGGTCCTCGATC
TCCTTGGTGTACACCAGTGCCTTGTAATTAGCACGACATCTCAGTCTTTGGATCGATGGT
GGCAAGCCATTGTTAGCAAGCCGTGAGTCTGTAAGCATGAACTTTAACACCTTGTAGCGT
TTAAGAAGTGGCAGCATTTCGCTTCTGTAGTAACTAGCCTTTGACCAAGAAACAGGGGCT
TTGAGAAGAGGCTTCATGGCGGCATACTCAGGAGGCAGATACTCTACAATGTCAACGTCG
TGTTTCAGTACCTCCATGAAGTTTCTCCAGTCGAAAATATCTTTGAACGTGCTCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D911TF U 1
AF RR2DJ94TF U 109
AF RR2DJ94JQ C 245
AF RR2D911JQ C 213
AF RR2AO42JQ U 823
AF RR2AO42TF C 1469
BS 1 113 RR2D911TF
BS 114 114 RR2DJ94TF
BS 115 209 RR2D911TF
BS 210 210 RR2DJ94TF
BS 211 416 RR2D911TF
BS 417 417 RR2DJ94TF
BS 418 438 RR2D911TF
BS 439 439 RR2DJ94TF
BS 440 542 RR2D911TF
BS 543 543 RR2DJ94TF
BS 544 554 RR2D911TF
BS 555 555 RR2DJ94TF
BS 556 593 RR2D911TF
BS 594 594 RR2DJ94TF
BS 595 658 RR2D911TF
BS 659 745 RR2DJ94TF
BS 746 746 RR2DJ94JQ
BS 747 824 RR2D911JQ
BS 825 1657 RR2AO42JQ
BS 1658 2276 RR2AO42TF

RD RR2D911TF 658 0 0
GGCGGGAAGATGAAGGCGGAGACGGTGAAGGAGCCGCCCGAGGACTCGCTTGTTGCTTCG
GAGTTGAACTTGGCCGTGCTGAAAGAGGCGAGGATTTTTCATTTCAATTCAGAGGTGTTG
ACGTCACCTACAATGCAATCAACTCTGTTCAAGGCAATACAATGGTCCAAGAAGTTCGGA
GGGCTTATTTTCTTTGATTTGAATCTTCCTTTACCGTTGTGGAGATCACGAAACGAGACT
AGGAAGCTGATCAAGAAAGCATGGGATGAAGCGAACATCATCGAAGTTTCGCAGCAAGAG
CTTGAGTTTCTACTCGATGAAGAGTACTACGAGAGGAGAAGAAACTACACGCCGCAGTAC
TTTGCTGAGGATTTCGAGCAGACTAAGAACAGGAGAGACTATTACCATTACACACCTGAG
GAGATCAAGCCGTTGTGGTACGACGATCTGAAGCTGTTGGTTGTGACTGATGGAACACTA
AGGCTACATTACTATACTCCTAAGTTCGATGGTGTTGTGGTTGGGACGGAAGATGTGCTC
ATTACTCCTTTCACCTGCGATAGGACGGGTTCTGGTGATGCTGTTGTTGCAGGGATAATG
AGGAAGCTAACGACTTGTCCTGAGATGTTTGAGGACCAAGATGTGTTGGAGCGACAGC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2DJ94TF 639 0 0
TCAGAAGTGTTGACGTCACCTACAATGCAGTCAACTCTGTTCAAGGCAATACAATGGTCC
AAGAAGTTCGGAGGGCTTATTTTCTTTGATTTGAATCTTCCGTTACCGTTATGGAGATCA
CGAAACGAGACTAGGAAGCTGATCAAGAAAGCATGGGATGAAGCGAACATCATCGAAGTT
TCGCAGCAAGAGCTTGAGTTTCTACTTGATGAAGAGTACTACGAGAGGAGAAGAAACTAC
ACGCCGCAGTACTTTGCTGAGGATTTCGAGCAGACTAAGAACCGGAGAGACTATTACCAT
TACACACCAGAGGAGATCAAGCCGTTGTGGCACGACGATCTGAAGCTGTTGGTTGTGACT
GATGGAACACTTCGGCTTCATTACTATACTCCTAAGTTCGATGGTGTTGTGGTTGGGACG
GAAGATGTGCTTATAACTCCTTTCACATGCGATAGGACGGGTTCTGGTGATGCTGTTGTT
GCAGGCATAATGAGGAAGCTAACGACTTGTCCTGAGATGTTTGAGGACCAAGATGTGTTG
GAGCGACAGCTCCGGTTCGCAGTCGCTGCCGGGATCATATCGCAGTGGACAATTGGTGCG
GTTAGAGGCTTCCCAACTGAAAGCGCCACACAGAATT
CG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2DJ94JQ 646 0 0
AGCTGATCAAGAAAGCATGGGATGAAGCGAACATCATCGAAGTTTCGCAGCAAGAGCTTG
AGTTTCTACTTGATGAAGAGTACTACGAGAGGAGAAGAAACTACACGCCGCAGTACTTTG
CTGAGGATTTCGAGCAGACTAAGAACCGGAGAGACTATTACCATTACACACCAGAGGAGA
TCAAGCCGTTGTGGCACGACGATCTGAAGCTGTTGGTTGTGACTGATGGAACACTTCGGC
TTCATTACTATACTCCTAAGTTCGATGGTGTTGTGGTTGGGACGGAAGATGTGCTTATAA
CTCCTTTCACATGCGATAGGACGGGTTCTGGTGATGCTGTTGTTGCAGGCATAATGAGGA
AGCTAACGACTTGTCCTGAGATGTTTGAGGACCAAGATGTGTTGGAGCGACAGCTCCGGT
TCGCAGTCGCTGCCGGGATCATATCGCAGTGGACAATTGGTGCGGTTAGAGGCTTCCCAA
CTGAAAGCGCCACACAGAATTCGAAAGAGCAGGTTTATGTTCCATCAATGTGGTAGTTAG
AAAGACCAAGAGATGAGCTTCTTCTACTAAATGTTTTTGAACAATGTGAGATGTATACTG
ATTTCAAAACTGTAATCCAATGTACAATCATTTTTTGAGTTCAC
CG

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2D911JQ 738 0 0
ACCGTTGTGGAGATCACGAAACGAGACTAGGAAGCTGATCAAGAAAGCATGGGATGAAGC
GAACATCATCGAAGTTTCGCAGCAAGAGCTTGAGTTTCTACTCGATGAAGAGTACTACGA
GAGGAGAAGAAACTACACGCCGCAGTACTTTGCTGAGGATTTCGAGCAGACTAAGAACAG
GAGAGACTATTACCATTACACACCTGAGGAGATCAAGCCGTTGTGGTACGACGATCTGAA
GCTGTTGGTTGTGACTGATGGAACACTAAGGCTACATTACTATACTCCTAAGTTCGATGG
TGTTGTGGTTGGGACGGAAGATGTGCTCATTACTCCTTTCACCTGCGATAGGACGGGTTC
TGGTGATGCTGTTGTTGCAGGGATAATGAGGAAGCTAACGACTTGTCCTGAGATGTTTGA
GGACCAAGATGTGTTGGAGCGACAGCTCCGGTTCGCAGTCGCTGCCGGGATCATATCGCA
GTGGACAATTGGTGCGGTTAGAGGCTTCCCAACTGAAAGCGTGACACAGAATTTGAAAGA
GCAGGTTTATGTTCCATCAATGTGGTAGTTAGAAAGACCAAGAGATGAGCTTCTTCTACT
AAATCTTTTTGAACAATGTGAGATGTATACTGATTTCAAAAATGTAATCCAATGTACAAT
CATTTTTTGAGTTCACTGATAACAACAATGTGAGAGGGTGGTAAGAACATGATACCCTAG
TGAAATCTATGTTTGGTT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2AO42JQ 835 0 0
GG
ACAATGTGAGATGTATACTGATTTCAAAACTGTAATCCAATGTACAATCATTTTTTGAGT
TCACTGATAACAACAATGTGAGAGGGTGGTAAGAACATGATACCCTAGTGAAATCTATGT
TTGGTTACCGTGCGGAGTCACAAAAATGCTCTAGCTGATCCAAGTCTTCATGCTCTTCTG
TATAGAAAATCTATTCCAAAGACTGTCTGAGCAGAACTCGGGTTACCTCTTTACCTATGT
TGTACAAAAAGCTATAAACTCGAAGCGGGTTGTTCTGTGTCCTGATCCTGCAGTGTTTGA
CGTGGGAATCTCAAACTGTTTTTGATTACCGTATCAACGCTATTTTAAAGCACTCTTGTT
CCATGTCTTTGTCTCCGTTCTTAGACTTGATTTTTTTCCAGAGCTGCCAGAATGAGACTT
GGTACAGATGCAATCGGGTTGTGGATTCGCATAGAAATTCTCCTCTAGCCTGGGAAGTGC
AGCAGGCAGTCTCGCATATGGCGCTCCAATCCTGTCTCTGTTTAATCGCTTAACCTCTGA
AGTAAACTCTTCCCAAGATATGAAGCCATCATCAAAATGATCTATCAGTCTAACAAAATT
CAACCTGTCTGGATTTATCGACTTCCTAAACCCTTCAAACCTTCTGTGCCCTTGTACTGC
CTTAGCCATATTTCCATCGTATGTATAAACAAAAACATCGCTTTCAAGGGCCACAATATA
GTCCAACGCAGCAAGCCGGTTCTGGTAAGGACTGAAAGGCTCTAACTCTTCTTCAGTCGC
AAGAGTTGAATGAGAGAAGACATTTGGGTACTCTGCACGGAAAGCATCCATAC

QA 3 835 3 835
DS 

RD RR2AO42TF 808 0 0
TGTGCCCTTGTACTGC*TTAGCCATATTTCCATCGTATGTATAAACAAAAACATCGCTTT
CAAGGGCCACAATATAGTCCAACGCAGCAAGCCGGTTCTGGTAAGGACTGAAAGGCTCTA
ACTCTTCTTCAGTCGCAAGAGTTGAATGAGAGAAGACATTTGGGTACTCTGCACGGAAAG
CATCCATACTCTTGCTTCCATAGATTTCACCAGCAACTATATATACAGTAGTGGAGGATG
GATATCCCATTGCCTTTAGAAATATGGCTGCTTCTCGCGGAGACATAGGACATCCGCCTT
GGATCCGTCTCTCTGCGCTATCAATCTCTTTCTCCTTCCAGTGTTTGACATTGTACCTCA
TGATCCTCAAATCTTCGGCTTCCTCAGATGTAAGATTGTGGCTGCAACCAGTAAAGGCAA
GCATGTCCTTCTCGTATCTCAAATGCAGAGCGATATACGGCTCACTGTTGTTTCTTAAAC
GGTTAACCAATACCTTTCCGAGGTCCTCGATCTCCTTGGTGTACACCAGTGCCTTGTAAT
TAGCACGACATCTCAGTCTTTGGATCGATGGTGGCAAGCCATTGTTAGCAAGCCGTGAGT
CTGTAAGCATGAACTTTAACACCTTGTAGCGTTTAAGAAGTGGCAGCATTTCGCTTCTGT
AGTAACTAGCCTTTGACCAAGAAACAGGGGCTTTGAGAAGAGGCTTCATGGCGGCATACT
CAGGAGGCAGATACTCTACAATGTCAACGTCGTGTTTCAGTACCTCCATGAAGTTTCTCC
AGTCGAAAATATCTTTGAACGTGCTCCA

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 6

CO CL1404Contig1 642 6 6 U
TCACAAAAGAAATTAACCTTCGTTATAACAAAACATCTAAAAGTTATCTGAATAAACGAT
AATTCAGTTTTAAATAAGAGACAAAAACATAACACCTAGTAATAA***TCTCTCTCTCAT
TGATCACTCTTCATCAGGCTTCTTGAAGACATAAGTGGTTCCACACTTGCCACAGTAATG
CCTATCGAAATGACTCGCCATGAACGTCCCCGGACCACAGCTCGCCGAAGGACACTCTTT
CCTCAGCCTCTGAACCTTGCCGCTTCCGTCGACCTTGTAAAACTGCAGAACCGCGAGCTT
CACTTTCTTGTGCTTGTGCTTGATCTTCTTCGGCTTCGTGTACGTCTTCTTCTTCCTCTT
CTTCGCTCCTCCTCTCAGACGGAGAACCAGGTGAAGCGTCGACTCCTTCTGGATGTTGTA
ATCCGCGAGCGTCCTCCCGTCTTCCAGCTGCTTCCCGGCGAAGATCAGTCGCTGCTGGTC
CGGTGGGATCCCTTCCTTGTCCTGGATCTTGGCCTTCACGTTGTCTATCGTGTCGGATGA
TTCGACCTCTAGGGTTATCGTCTTCCCCGTTAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTCTT
GTGAGTGCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTGGGTCGGAGGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB36JQ U 1
AF RR2FB36TF C 152
AF RR2CQ20JQ U 9
AF RR2CQ20TF C 9
AF RR2AL17JQ U 16
AF RR2AL17TF C 16
BS 1 37 RR2FB36JQ
BS 38 38 RR2CQ20JQ
BS 39 160 RR2FB36JQ
BS 161 161 RR2CQ20JQ
BS 162 628 RR2FB36JQ
BS 629 642 RR2CQ20TF

RD RR2FB36JQ 642 0 0
TCACAAAAGAAATTAACCTTCGTTATAACAAAACATC*AAAAGTTATCTGAATAAACGAT
AATTCAGTTTTAAATAAGAGACAAAAACATAACACCTAGTAATAA***TCTCTCTCTCAT
TGATCACTCTTCATCAGGCTTCTTGAAGACATAAGTGGTTTCACACTTGCCACAGTAATG
CCTATCGAAATGACTCGCCATGAACGTCCCCGGACCACAGCTCGCCGAAGGACACTCTTT
CCTCAGCCTCTGAACCTTGCCGCTTCCGTCGACCTTGTAAAACTGCAGAACCGCGAGCTT
CACTTTCTTGTGCTTGTGCTTGATCTTCTTCGGCTTCGTGTACGTCTTCTTCTTCCTCTT
CTTCGCTCCTCCTCTCAGACGGAGAACCAGGTGAAGCGTCGACTCCTTCTGGATGTTGTA
ATCCGCGAGCGTCCTCCCGTCTTCCAGCTGCTTCCCGGCGAAGATCAGTCGCTGCTGGTC
CGGTGGGATCCCTTCCTTGTCCTGGATCTTGGCCTTCACGTTGTCTATCGTGTCGGATGA
TTCGACCTCTAGGGTTATCGTCTTCCCCGTTAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTCTT
GTGAGTGCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTT
TTTTTTGGGTCGCC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2FB36TF 491 0 0
TAAGTGGTTTCACACTTGCCACAGTAATGCCTATCGAAATGACTCGCCATGAACGTCCCC
GGACCACAGCTCGCCGAAGGACACTCTTTCCTCAGCCTCTGAACCTTGCCGCTTCCGTCG
ACCTTGTAAAACTGCAGAACCGCGAGCTTCACTTTCTTGTGCTTGTGCTTGATCTTCTTC
GGCTTCGTGTACGTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCGCTCCTCCTCTCAGACGGAGAACCAGG
TGAAGCGTCGACTCCTTCTGGATGTTGTAATCCGCGAGCGTCCTCCCGTCTTCCAGCTGC
TTCCCGGCGAAGATCAGTCGCTGCTGGTCCGGTGGGATCCCTTCCTTGTCCTGGATCTTG
GCCTTCACGTTGTCTATCGTGTCGGATGATTCGACCTCTAGGGTTATCGTCTTCCCCGTT
AGGGTTTTCACGAAGATTTGCATTTTCTTGTGAGTGCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTT
TTTTTTGGGTCGCC

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2CQ20JQ 623 0 0
GAAATTA
ACCTTCGTTATAACAAAACATCTAAAAGTTATCTGAATAAACGATAATTCAGTTTTAAAT
AAGAGACAAAAACATAACACCTAGTAATAA***TCTCTCTCTCATTGATCACTCTTCATC
AGGCTTCTTGAAGACATAAGTGGTTCCACACTTGCCACAGTAATGCCTATCGAAATGACT
CGCCATGAACGTCCCCGGACCACAGCTCGCCGAAGGACACTCTTTCCTCAGCCTCTGAAC
CTTGCCGCTCCCGTCGACCTTGTAAAACTGCAGAACCGCGAGCTTCACTTTCTTGTGCTT
GTGCTTGATCTTCTTCGGCTTCGTGTACGTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCGCTCCTCCTCT
CAGACGGAGAACCAGGTGAAGCGTCGACTCCTTCTGGATGTTGTAATCCGCGAGCGTCCT
CCCGTCTTCCAGCTGCTTCCCGGCGAAAATCAGTCGCTGCTGGTCCGGTGGGATCCCTTC
CTTGTCCTGGATCTTGGCCTTCACGTTGTCTATCGTGTCGGATGATTCGACCTCTAGGGT
TATAGTCTTCCCCGTTAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTATTGTGAGTGCTCTCTCT
GTTTTTTTTTTTT
GGG

QA 8 620 8 620
DS 

RD RR2CQ20TF 634 0 0
GAAATTA
ACCTTCGTTATAACAAAACATCTAAAAGTTATCTGAATAAACGATAATTCAGTTTTAAAT
AAGAGACAAAAACATAACACCTAGTAATAA***TCTCTCTCTCATTGATCACTCTTCATC
AGGCTTCTTGAAGACATAAGTGGTTCCACACTTGCCACAGTAATGCCTATCGAAATGACT
CGCCATGAACGTCCCCGGACCACAGCTCGCCGAAGGACACTCTTTCCTCAGCCTCTGAAC
CTTGCCGCTCCCGTCGACCTTGTAAAACTGCAGAACCGCGAGCTTCACTTTCTTGTGCTT
GTGCTTGATCTTCTTCGGCTTCGTGTACGTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCGCTCCTCCTCT
CAGACGGAGAACCAGGTGAAGCGTCGACTCCTTCTGGATGTTGTAATCCGCGAGCGTCCT
CCCGTCTTCCAGCTGCTTCCCGGCGAAGATCAGTCGCTGCTGGTCCGGTGGGATCCCTTC
CTTGTCCTGGATCTTGGCCTTCACGTTGTCTATCGTGTCGGATGATTCGACCTCTAGGGT
TATAGTCTTCCCCGTTAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTATTGTGAGTGCTCTCTCT
GTTTTTTTTTTTTGGGTCGGAGGAGCC

QA 8 634 8 634
DS 

RD RR2AL17JQ 608 0 0
ACCTTCGTTATAACAAAACATCTAAAAGTTATACGAATAAACGATAATTCAGTTTTAAAT
AAGAGACAAAAACATAACACCTAGTAATCTCTCTCTCTCTCTCATTGATCACTCTTCATC
AGGCTTCTTGAAGACATAAGTGGTTCCACACTTTCCACAGTAATGCCTATCGAAATGACT
CGCCATGAACGTCCCCGGACCACAGCTCGCCGAAGGACACTCTTTCCTCAGCCTCTGAAC
CTTGCCGCTTCCATCCACCTTGTAAAACTGCAGAACCGCGAGCTTCACTTTCTTGTGCTT
GTGCTTGATCTTCTTCGGCTTCGTGTACGTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCGCTCCTCCCCT
CAGACGGAGAACCAGGTGAAGCGTCGACTCCTTCTGGATGTTGTAATACGCGAGCGTCCT
TCCGTCCTCCAGCTGCTTCCCGGCGAAGATCAGTCGCTGCTGGTCCGGTGGGATCCCTTC
CTTGTCCTGGATCTTGGCCTTCACATTGTCGATCGTGTCGGATGATTCGACTTCTAGGGT
TATCGTCTTCCCCGTTAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTCTTGTGAGTGCTCTCTCT
GTTTTT
CC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2AL17TF 608 0 0
ACCTTCGTTATAACAAAACATCTAAAAGTTATACGAATAAACGATAATTCAGTTTTAAAT
AAGAGACAAAAACATAACACCTAGTAATCTCTCTCTCTCTCTCATTGATCACTCTTCATC
AGGCTTCTTGAAGACATAAGTGGTTCCACACTTTCCACAGTAATGCCTATCGAAATGACT
CGCCATGAACGTCCCCGGACCACAGCTCGCCGAAGGACACTCTTTCCTCAGCCTCTGAAC
CTTGCCGCTTCCATCCACCTTGTAAAACTGCAGAACCGCGAGCTTCACTTTCTTGTGCTT
GTGCTTGATCTTCTTCGGCTTCGTGTACGTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCGCTCCTCCCCT
CAGACGGAGAACCAGGTGAAGCGTCGACTCCTTCTGGATGTTGTAATACGCGAGCGTCCT
TCCGTCCTCCAGCTGCTTCCCGGCGAAGATCAGTCGCTGCTGGTCCGGTGGGATCCCTTC
CTTGTCCTGGATCTTGGCCTTCACATTGTCGATCGTGTCGGATGATTCGACTTCTAGGGT
TATCGTCTTCCCCGTTAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATTTTCTTGTGAGTGCTCTCTCT
GTTTTT
CC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 5

CO CL1405Contig1 1193 5 46 U
GGATTACACGAGCGTAATAAACTACGATTGTCGATGTCTTTTTTTAGTTAGTTCCTCCGT
CTTCTGATCTCTTTCGTTGCACCGACTCTCGTTCAATCTTAGATCCGATCCACAAAACGA
TGTCGATGTCTCATAATGTATCGTTTTTGTTCTTGGCTATATTATTTTTCTCCGTCCTGC
TTCAATCTTCCACAAGCGCAATTGTTAATCCTTCCAAAGTGAAGCAGGTTTCATCCAAAC
CCAGGGCGTTTGTGTATGAAGGGTTCCTCACGGAATTGGAATGTGATCATATGGTTTCGC
TTGCAAAAGCGAGCCTCAAGAGATCAGCTGTAGCTGATAATGATAGTGGAGAGAGCAAGC
TCAGCGAAGTTCGAACCAGCTCTGGCACCTTTATCCCCAAAGCAAAGGATCCCATTGTTG
CTGGTATAGAAGACAAGATTTCCACTTGGACATTTCTTCCTAAAGAGAATGGGGAAGACA
TTCAGGTACTGAGATATGAGTACGGTCAAAAATACGATGCTCACTTTGACTACTTTCATG
ACAAAGTGAATATTGTACGTGGTGGACACCGCATAGCAACAGTTCTCATGTATCTATCTA
ATGTCACAAGAGGTGGAGAAACCGTCTTCCCCCATGCAGAGATACCTTCTCGCCGAGTAC
TATCTGAGAAACAAGAAGACCTTTCTGATTGTGCCAAGAAAGGAATCGCCGTGAAACCAA
GGAAAGGGGATGCTTTGTTGTTCTTCAACCTCCACCCTGACGCAATCCCTGACCCGTTGA
GCCTTCACGGTGGATGCCCCGTGATCGAAGGAGAAAAATGGTCAGCGACCAAGTGGATCC
ACGTGGACTCATTCGACAAGATTGTGACGCCTGGTGGAAACTGCACTGATATGAACGAGA
GCTGTGAGAGATGGGCAGTCCTTGGGGAATGCACAAAGAACCCAGAGTACATGGTTGGTT
CTGCTGAGCTTCCTGGCTATTGCAGGCGTAGCTGTAAGGCTTGCTAGACTACACTCTAGT
CTACCCTCTTATAAAACTCTATGTCGATGTCTATTGTAGAGTTGTTATCGTTGGTTAATC
TTTTTCTAACTTAAATATGTAAAACTACAAGAGTTCTCTGGAGAGAATATTATGTAAACA
CATATATAGACATATATATCCAATAGTAACGCAAGAAAGTGCACTGCATCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E355TF U 74
AF RR2HB73TF U 115
AF RR2D494TF U 1
AF RR2HB73JQ C 415
AF RR2D494JQ C 531
BS 1 288 RR2D494TF
BS 289 289 RR2E355TF
BS 290 372 RR2D494TF
BS 373 373 RR2E355TF
BS 374 437 RR2D494TF
BS 438 438 RR2E355TF
BS 439 439 RR2D494TF
BS 440 440 RR2HB73TF
BS 441 442 RR2D494TF
BS 443 443 RR2HB73TF
BS 444 529 RR2D494TF
BS 530 530 RR2HB73TF
BS 531 535 RR2D494TF
BS 536 536 RR2HB73TF
BS 537 538 RR2D494TF
BS 539 539 RR2HB73TF
BS 540 670 RR2D494TF
BS 671 671 RR2E355TF
BS 672 704 RR2D494TF
BS 705 705 RR2HB73JQ
BS 706 731 RR2D494TF
BS 732 781 RR2HB73JQ
BS 782 782 RR2D494JQ
BS 783 796 RR2HB73JQ
BS 797 797 RR2D494JQ
BS 798 799 RR2HB73JQ
BS 800 800 RR2D494JQ
BS 801 814 RR2HB73JQ
BS 815 815 RR2D494JQ
BS 816 919 RR2HB73JQ
BS 920 920 RR2D494JQ
BS 921 1030 RR2HB73JQ
BS 1031 1031 RR2D494JQ
BS 1032 1044 RR2HB73JQ
BS 1045 1045 RR2D494JQ
BS 1046 1052 RR2HB73JQ
BS 1053 1053 RR2D494JQ
BS 1054 1092 RR2HB73JQ
BS 1093 1093 RR2D494JQ
BS 1094 1151 RR2HB73JQ
BS 1152 1152 RR2D494JQ
BS 1153 1159 RR2HB73JQ
BS 1160 1161 RR2D494JQ
BS 1162 1170 RR2HB73JQ
BS 1171 1171 RR2D494JQ
BS 1172 1193 RR2HB73JQ

RD RR2E355TF 639 0 0
GG
GTTGCACCGACTCTCGTTCAATCTTAGATCCGATCCACAAAACGATGTCGATGTCTCATA
ATGTATCGTTTTTGTTCTTGGCTATATTATTTTTCTCCGTCCTGCTTCAATCTTCCACAA
GCGCAATTGTTAATCCTTCCAAAGTGAAGCAGGTTTCATCCAAACCCAGGGCGTTTGTGT
ATGAAGGGTTCCTCACGGAATTGGAATGTGATCATATGGTTTCGCTTGCAAAAGCGAGCC
TCAAGAGATCAGCTGTAGCTGATAATGATAGTGGAGAGAGCAAGCTCAGCGAAGTTCGAA
CCAGCTCTGGCACCTTTATCCCCAAAGCAAAGGATCCCATTGTTGCTGGTATAGAAGACA
AGATCTCTACTTGGACATTTCTTCCTAAAGAGAATGGGGAAGACATTCAGGTACTGAGAT
ATGAGTACGGTCAAAAATACGATGCTCACTTTGATTACTTCCACGACAAAGTGAATATTG
TACGTGGTGGACACCGCATAGCAACAGTTCTCATGTATCTATCTAATGTCACAAGAGGTG
GAGAAACCGTCTTCCCCCATGCAGAGATACCTTCTCGCCGAGTACTATCTGAGAAACAAG
AAGACCTTTCTGATTGTGCCAAGAAAGGA
ATCGCCGT

QA 3 631 3 631
DS 

RD RR2HB73TF 554 0 0
AAACGATGTCGATGTCTCATAATGTATCGTTTATGTTCTTGGCTATATTATTTTTCTCCG
TCCTGCTCCAATCTTCCACAAGCGCAATTGTTAATCCTTCCAAAGTGAAGCAGGTTTCAT
CCAAACCCAGGGCGTTTGTGTATGAAGGGTTCCTCACGGAATTGGAATGTGATCATATGG
TTTCGCTTGCAAAAGCGAGCCTCAAGAGATCAGCTGTAGCTGATAATGATAGTGGAGAGA
GCAAGCTCAGCGAGGTTCGAACCAGCTCTGGCACCTTTATCCCCAAAGCAAAGGATCCCA
TTGTTGCTGGTATAGAAGACAAGATTTCCACTTGGACATTTCTTCCTAAAGAGAATGGGG
AAGACATTCAGGTACTGAGATATGAGTACGGTCAAAAATACGATGCTCACTTTGACTACT
TTCATGACAAAGTGAATATTGTACGTGGTGGACACCGCATAGCAACAGTTCTCATGTATC
TCTCTAATGTCACAAGAGGTGGAGAAACCGTCTTCCCCCATGCAGAGATACCTTCTCGCC
GAGTACTATCTGAG

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2D494TF 731 0 0
GGATTACACGAGCGTAATAAACTACGATTGTCGATGTCTTTTTTTAGTTAGTTCCTCCGT
CTTCTGATCTCTTTCGTTGCACCGACTCTCGTTCAATCTTAGATCCGATCCACAAAACGA
TGTCGATGTCTCATAATGTATCGTTTTTGTTCTTGGCTATATTATTTTTCTCCGTCCTGC
TTCAATCTTCCACAAGCGCAATTGTTAATCCTTCCAAAGTGAAGCAGGTTTCATCCAAAC
CCAGGGCGTTTGTGTATGAAGGGTTCCTCACGGAATTGGAATGTGATCGTATGGTTTCGC
TTGCAAAAGCGAGCCTCAAGAGATCAGCTGTAGCTGATAATGATAGTGGAGAGAGCAAGC
TCAGCGAAGTTCAAACCAGCTCTGGCACCTTTATCCCCAAAGCAAAGGATCCCATTGTTG
CTGGTATAGAAGACAAGGTCTCTACTTGGACATTTCTTCCTAAAGAGAATGGGGAAGACA
TTCAGGTACTGAGATATGAGTACGGTCAAAAATACGATGCTCACTTTGATTACTTCCACG
ACAAAGTGAATATTGTACGTGGTGGACACCGCATAGCAACAGTTCTCATGTATCTATCTA
ATGTCACAAGAGGTGGAGAAACCGTCTTCCCCCATGCAGAGATACCTTCTCGCCGAGTAC
TATCTGAGAA*CAAGAAGACCTTTCTGATTGTGCCAAGAAAGGA*TCGCCGTGAAACCAA
GGAAAGGGGAT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2HB73JQ 779 0 0
TTGTTGCTGGTATAGAAGACAAGATTTCCACTTGGACATTTCTTCCTAAAGAGAATGGGG
AAGACATTCAGGTACTGAGATATGAGTACGGTCAAAAATACGATGCTCACTTTGACTACT
TTCATGACAAAGTGAATATTGTACGTGGTGGACACCGCATAGCAACAGTTCTCATGTATC
TCTCTAATGTCACAAGAGGTGGAGAAACCGTCTTCCCCCATGCAGAGATACCTTCTCGCC
GAGTACTATCTGAGAACCAAGAAGACCTTTCTGATTGTGCCAAGAAAGGAATCGCCGTGA
AACCAAGGAAAGGGGATGCTTTGTTGTTCTTCAACCTCCACCCTGACGCAATCCCTGACC
CGTTGAGTCTTCACGGTGGATGTCCTGTGATCGAAGGAGAGAAATGGTCAGCGACCAAGT
GGATCCACGTGGACTCATTCGACAAGATTGTGACGCCTGGTGGAAACTGCACTGATATGA
ACGAGAGCTGTGAGAGATGGGCAGTGCTTGGGGAATGCACAAAGAACCCAGAGTACATGG
TTGGTTCTGCTGAGCTTCCTGGCTATTGCAGGCGTAGCTGTAAGGCTTGCTAGACTACAC
TCTAGTCTACCCTCTTCTAAAACTCTATGTTGATGTCTGTTGTAGAGTTGTTATCGTTGG
TTAATCTTTTTCTAACTTGAATATGTAAAACTACAAGAGTTCTCTGGAGAGAATATTATG
TAAACACATATATAGACTTATATATTGAATAGTAACTCAAGAAAGTGCACTGCATCAGT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2D494JQ 652 0 0
TACTTCCAC
GACAAAGTGAATATTGTACGTGGTGGACACCGCATAGCAACAGTTCTCATGTATCTATCT
AATGTCACAAGAGGTGGAGAAACCGTCTTCCCCCATGCAGAGATACCTTCTCGCCGAGTA
CTATCTGAGAAACAAGAAGACCTTTCTGATTGTGCCAAGAAAGGAATCGCCGTGAAACCA
AGGAAAGGGGATGCTTTGTTGTTCTTCAACCTCCACCCTGACGCAATCCCTGACCCGTTG
AGCCTTCACGGTGGATGCCCCGTGATCGAAGGAGAAAAATGGTCAGCGACCAAGTGGATC
CACGTGGACTCATTCGATAAGATTGTGACGCCTGGTGGAAACTGCACTGATATGAACGAG
AGCTGTGAGAGATGGGCGGTCCTTGGGGAATGCACAAAGAACCCAGAGTATATGGTTGGT
TCTGCTGAGCTTCCTGGCTATTGCAGGCGTAGCTGTAAGGCTTGCTAGACTACACTCTAG
TCTACCCTCTTATAAAACTCTATGTCGATGTCTATTGTAGAGTTGTTATCGTTGGTTAAT
CTTTTTCTAACTTAAATATGTAAAACTACAAGGGTTCTCTGGAGAGAATATTATGTAAAC
ACATA****GACATATATATCCAATAGTAACGCAAGAAAGTGC

QA 10 652 10 652
DS 



AS 2 6

CO CL1406Contig1 812 2 3 U
TTTCGGGAAAATCATGTTATGTGATAATCAAAGGCAGAGGTTACAGATAAAAGTGTTGAT
GATCAGATCATAAACAAAGAAAGCAAATGAATAATACATATTCTTTCTTCGGGAAAAACA
TGTAATGTGATATATGATCAACGGCAAGCGAGATTTATTAAACAGAGCAGGTTGAAGAAA
TCATGCACTGGGAGGCTTGTAGAGCTTCTCAACCATCTTCATATACTCTTCTTGGTTGCT
CCATAGCTGAGCTGCTTGAGTGTTCAATGGTGAGCTGATGTTCGGTTCTCCCAGAAGGCT
CTGAATCGATAGTAGTATTGTCCTCACATCATATGCAGATGACCATTTATCCTGAAGAAT
GTCCAAACAGATATTGCCGTGGAGATCAACATTGGGGTGGAAGCAAGTAGTCTGGAACTT
GATCTTGGGAGGTTTGAAAGGATAGTCATTGGAGAAAGTGAGGCAGAGTCTGTACTCAGT
TCCTTCAAAGACAGTGTCTTTGCTTCCTGCTATCGTCCCTTTCCAACAGAAGATGTTGTC
TTCCTCCGGGAAAGCAGAGATTCCCGGGTCACCTCCCATCATCAAGCCCATGAGTTCAGA
TTGCAGCCTTTTGAGAACAGATTGGCTGTCGACAGTCTTAGTGGGAGGAGCAGATTGCTT
TGATCCGTTTGACGCCGGAGGATCTGCGGCAGGAGTATTCCCTTGGTACCCATTAACGGC
AGCCATCACAAAAGATCGAAAGTAGAAGAAGAAGGAGAAAAGAGAGGGAATACAAAGATC
CTTCTTCTTTCTTTCTTCCGATGAGTAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ64JQ U 4
AF RR2AQ64TF C 1
BS 1 5 RR2AQ64TF
BS 6 754 RR2AQ64JQ
BS 755 812 RR2AQ64TF

RD RR2AQ64JQ 754 0 0
CG
GGAAAATCATGTTATGTGATAATCAAAGGCAGAGGTTACAGATAAAAGTGTTGATGATCA
GATCATAAACAAAGAAAGCAAATGAATAATACATATTCTTTCTTCGGGAAAAACATGTAA
TGTGATATATGATCAACGGCAAGCGAGATTTATTAAACAGAGCAGGTTGAAGAAATCATG
CACTGGGAGGCTTGTAGAGCTTCTCAACCATCTTCATATACTCTTCTTGGTTGCTCCATA
GCTGAGCTGCTTGAGTGTTCAATGGTGAGCTGATGTTCGGTTCTCCCAGAAGGCTCTGAA
TCGATAGTAGTATTGTCCTCACATCATATGCAGATGACCATTTATCCTGAAGAATGTCCA
AACAGATATTGCCGTGGAGATCAACATTGGGGTGGAAGCAAGTAGTCTGGAACTTGATCT
TGGGAGGTTTGAAAGGATAGTCATTGGAGAAAGTGAGGCAGAGTCTGTACTCAGTTCCTT
CAAAGACAGTGTCTTTGCTTCCTGCTATCGTCCCTTTCCAACAGAAGATGTTGTCTTCCT
CCGGGAAAGCAGAGATTCCCGGGTCACCTCCCATCATCAAGCCCATGAGTTCAGATTGCA
GCCTTTTGAGAACAGATTGGCTGTCGACAGTCTTAGTGGGAGGAGCAGATTGCTTTGATC
CGTTTGACGCCGGAGGATCTGCGGCAGGAGTATTCCCTTGGTACCCATTAACGGCAGCCA
TCACAAAAGATCGAAAGTAGAAGAAGAAG
GAG

QA 3 751 3 751
DS 

RD RR2AQ64TF 812 0 0
TTTCGGGAAAATCATGTTATGTGATAATCAAAGGCAGAGGTTACAGATAAAAGTGTTGAT
GATCAGATCATAAACAAAGAAAGCAAATGAATAATACATATTCTTTCTTCGGGAAAAACA
TGTAATGTGATATATGATCAACGGCAAGCGAGATTTATTAAACAGAGCAGGTTGAAGAAA
TCATGCACTGGGAGGCTTGTAGAGCTTCTCAACCATCTTCATATACTCTTCTTGGTTGCT
CCATAGCTGAGCTGCTTGAGTGTTCAATGGTGAGCTGATGTTCGGTTCTCCCAGAAGGCT
CTGAATCGATAGTAGTATTGTCCTCACATCATATGCAGATGACCATTTATCCTGAAGAAT
GTCCAAACAGATATTGCCGTGGAGATCAACATTGGGGTGGAAGCAAGTAGTCTGGAACTT
GATCTTGGGAGGTTTGAAAGGATAGTCATTGGAGAAAGTGAGGCAGAGTCTGTACTCAGT
TCCTTCAAAGACAGTGTCTTTGCTTCCTGCTATCGTCCCTTTCCAACAGAAGATGTTGTC
TTCCTCCGGGAAAGCAGAGATTCCCGGGTCACCTCCCATCATCAAGCCCATGAGTTCAGA
TTGCAGCCTTTTGAGAACAGATTGGCTGTCGACAGTCTTAGTGGGAGGAGCAGATTGCTT
TGATCCGTTTGACGCCGGAGGATCTGCGGCAGGAGTATTCCCTTGGTACCCATTAACGGC
AGCCATCACAAAAGATCGAAAGTAGAAGAAGAAGGAGAAAAGAGAGGGAATACAAAGATC
CTTCTTCTTTCTTTCTTCCGATGAGTAAGTCC

QA 1 812 1 812
DS 



CO CL1406Contig2 821 4 14 U
GGCCTCTCTAACTTACTCATCGGAAGAAAGAAAGAAGAAAGATCTTTGTTATCGTTCTCT
TCTCTCCTTCTTCTTCTTCTACTTTCGATCTTTGTGATGGCTGCCGTTAATGGATACCAA
GGGAATACTCCTGCCGCAGATCCTCCGGCGTCAAACGGATCAAAGCAATCTGCTCCTCCC
ACTAAGACTGTTGACAGCCAATCTGTTCTCAAAAGGCTGCAATCTGAACTCATGGGCTTG
ATGATGGGAGGTGACCCGGGAATCTCTGCTTTCCCGGAGGAAGACAACATCTTCTGTTGG
AAAGGGACGATAACAGGAAGCAAAGACACTGCGTTTGAAGGAACTGAGTACAGACTCTCC
CTCTCTTTCTCCAATGACTACCCTTTCAAACCTCCAAAGATCAAGTTCCAGACTACTTGC
TTCCACCCCAACGTTGATCTCCATGGCAATATCTGTTTGGACATTCTTCAGGATAAATGG
TCATCTGCATATGATGTGAGGACAATACTACTATCGATTCAGAGCCTTCTGGGAGAACCG
AACATCAGCTCACCATTGAACACTCAAGCAGCTCAGCTCTGGAGCAACCAAGAAGAGTAT
AGGAAGATGGTTGAGAAGCTCTACAAGCCTCCCAGTGCACGATTTCTTCAACCCGCTCTG
TTTAATAAATCTCGCTTGCCGTTGATCATATATCACATTATATGTTTTTCCCGAAGAAAG
AATATGTCTTATTCATTTGCTTTCTTTGTTTATGATCTGATCATCA*CACTTCTATCTGT
AACCTTTGCCTTTGATTATCACATAACATGATTTTCCATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 15 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2CF23TF U 1
AF RR2H432TF U 39
AF RR2CF23JQ C 151
AF RR2H432JQB C 265
BS 1 331 RR2CF23TF
BS 332 332 RR2H432TF
BS 333 379 RR2CF23TF
BS 380 381 RR2H432TF
BS 382 639 RR2CF23TF
BS 640 640 RR2H432TF
BS 641 673 RR2CF23TF
BS 674 674 RR2H432TF
BS 675 714 RR2CF23TF
BS 715 715 RR2H432TF
BS 716 721 RR2CF23TF
BS 722 722 RR2CF23JQ
BS 723 804 RR2CF23TF
BS 805 821 RR2CF23JQ

RD RR2CF23TF 804 0 0
GGCCTCTCTAACTTACTCATCGGAAGAAAGAAAGAAGAAAGATCTTTGTTATCGTTCTCT
TCTCTCCTTCTTCTTCTTCTACTTTCGATCTTTGTGATGGCTGCCGTTAATGGATACCAA
GGGAATACTCCTGCCGCAGATCCTCCGGCGTCAAACGGATCAAAGCAATCTGCTCCTCCC
ACTAAGACTGTTGACAGCCAATCTGTTCTCAAAAGGCTGCAATCTGAACTCATGGGCTTG
ATGATGGGAGGTGACCCGGGAATCTCTGCTTTCCCGGAGGAAGACAACATCTTCTGTTGG
AAAGGGACGATAACAGGAAGCAAAGACACTGTGTTTGAAGGAACTGAGTACAGACTCTCC
CTCTCTTTCTCCAATGACTGTCCTTTCAAACCTCCAAAGATCAAGTTCCAGACTACTTGC
TTCCACCCCAACGTTGATCTCCATGGCAATATCTGTTTGGACATTCTTCAGGATAAATGG
TCATCTGCATATGATGTGAGGACAATACTACTATCGATTCAGAGCCTTCTGGGAGAACCG
AACATCAGCTCACCATTGAACACTCAAGCAGCTCAGCTCTGGAGCAACCAAGAAGAGTAT
AGGAAGATGGTTGAGAAGCTCTACAAGCCTCCCAGTGCATGATTTCTTCAACCCGCTCTG
TTTAATAAATCTCTCTTGCCGTTGATCATATATCACATTATATGTTTTTCCCGA*GAAAG
A*TATGTCTTATTCATTTGCTTTCTTTGTTTATGATCTGATCATCA*CACTTCTATCTGT
AACCTTTGCCTTTGATTATCACAT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2H432TF 759 0 0
AG
GATCTTTGTTATCGTTCTCTTCTCTCCTTCTTCTTCTTCTACTTTCGATCTTTGTGATGG
CTGCCGTTAATGGATACCAAGGGAATACTCCTGCCGCAGATCCTCCGGCGTCAAACGGAT
CAAAGCAATCTGCTCCTCCCACTAAGACTGTTGACAGCCAATCTGTTCTCAAAAGGCTGC
AATCTGAACTCATGGGCTTGATGATGGGAGGTGACCCGGGAATCTCTGCTTTCCCGGAGG
AAGACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGACGATAACAGGAAGCAAAGACACTGCGTTTGAAG
GAACTGAGTTCAGACTCTCCCTCTCTTTCTCCAATGACTACCCTTTCAAACCTCCAAAGA
TCAAGTTCCAGACTACTTGCTTCCACCCCAACGTTGATCTCCATGGCAATATCTGTTTGG
ACATTCTTCAGGATAAATGGTCATCTGCATATGATGTGAGGACAATACTACTATCGATTC
AGAGCCTTCTGGGAGAACCGAACATCAGCTCACCATTGAACACTCAAGCAGCTCAGCTCT
GGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGGTTGAGAAGCTCTACAAGCCTCCCAGTGCAC
GATTTCTTCAACCTGCTCTGTTTAATAAATCTCGCTTGCCGTTGATCATATATCACATTA
TATGTTTTTCCCGAAGAAGAA*TATGTCTTATTCATTTGCTTT*TTTGTTT*TGATCTGA
TCATCA*GCACTCTATCTGTAACCTTTGCCTTTGATT

QA 3 759 3 759
DS 

RD RR2CF23JQ 671 0 0
TCAAACGGATCAAAGCAATCTGCTCCTCCCACTAAGACTGTTGACAGCCAATCTGTTCTC
AAAAGGCTGCAATCTGAACTCATGGGCTTGATGATGGGAGGTGACCCGGGAATCTCTGCT
TTCCCGGAGGAAGACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGACGATAACAGGAAGCAAAGACACT
GTGTTTGAAGGAACTGAGTACAGACTCTCCCTCTCTTTCTCCAATGACTGTCCTTTCAAA
CCTCCAAAGATCAAGTTCCAGACTACTTGCTTCCACCCCAACGTTGATCTCCATGGCAAT
ATCTGTTTGGACATTCTTCAGGATAAATGGTCATCTGCATATGATGTGAGGACAATACTA
CTATCGATTCAGAGCCTTCTGGGAGAACCGAACATCAGCTCACCATTGAACACTCAAGCA
GCTCAGCTCTGGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGGTTGAGAAGCTCTACAAGCCT
CCCAGTGCATGATTTCTTCAACCCGCTCTGTTTAATAAATCTCTCTTGCCGTTGATCATA
TATCACATTATATGTTTTTCCCGAAGAAAGAATATGTCTTATTCATTTGCTTTCTTTGTT
TATGATCTGATCATCAACACTTCTATCTGTAACCTTTGCCTTTGATTATCACATAACATG
ATTTTCCATAG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2H432JQB 553 0 0
TCTGCTTTCCCGGAGGAAGACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGACGATAACAGGAAGCAAA
GACACTGCGTTTGAAGGAACTGAGTTCAGACTCTCCCTCTCTTTCTCCAATGACTACCCT
TTCAAACCTCCAAAGATCAAGTTCCAGACTACTTGCTTCCACCCCAACGTTGATCTCCAT
GGCAATATCTGTTTGGACATTCTTCAGGATAAATGGTCATCTGCATATGATGTGAGGACA
ATACTACTATCGATTCAGAGCCTTCTGGGAGAACCGAACATCAGCTCACCATTGAACACT
CAAGCAGTTCAGCTCTGGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGGTTGAGAAGCTCTAC
AAGCCTCCCAGTGCACGATTTCTTCAACCTGCTCTGTTTAATAAATCTCGCTTGCCGTTG
ATCATATATCACATTATATGTTTTTCCCGAAGAAAGAATATGTCTTATTCATTTGCTTTC
TTTGTTTATGATCTGATCATCAGCACTTCTATCTGTAACCTTTGCCTTTGATTATCACAT
AACATGATTTTCC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 2 5

CO CL1407Contig1 1213 3 5 U
AACTGCTGGGAGTTTCTCACCATCTAACATTCCACTCATAGAAACCTCTAACTGCAAAAG
AGGATGAGAGAGGCACAACAAGGAGCTCACACAGTGAGGTCCCATGGAATGACAGTAGCA
AGAACTCACATGCATGACTGGATCATACTCGTACTACTCGTTATCCTCGAGGGCATACTC
CTCATAATCCACCCGTTTTACCGCTTTGTCGGGAAAGATATGATGACTGATCTAAGTTAC
CCTCTAAAGAGTAACACCGTACCTATCTGGTCTGTCCCGGTGTATGCGATACTGTTGCCA
TTGGCAATCTCCATCTTCATCTACTTCCGCAGAAGAGACGTATACGATCTTCACCATGCG
GTGCTAGGTCTGTTATACTCTGTTCTGGTGACGGCAGTACTTACAGATTCGATAAAGAAT
GCAGTTGGTAGACCACGCCCTGACTTCTTCTGGCGTTGTTTCCCTGATGGCAAAGCTCTT
TATGATAGCCTTGGAGATGTGATATGCCATGGTGATAAAAGTGCTATAAGGGAAGGACAC
AAAAGCTTCCCAAGTGGACACACTTCATGGTCTTTTGCGGGACTAGGATTCTTGTCGCTC
TACTTATCAGGGAAGATTCGAGCGTTTGATGGTAAAGGACATGTTGCGAAGCTGTGTATT
GTCATACTCCCTTTGCTAGTTGCTTCTCTTGTTGGTATCTCCCGTGTAGATGACTATTGG
CATCACTGGCAAGACGTCTTTGCTGGAGGCTTGCTAGGTCTTGTGGTCTCTACGTTCTGT
TATCTTCAGTTCTTCCCGCCACCTTATCGCACCGAAGCTTGGGGGCCATATGCTTACTTC
CTAATGTTGGAAGCTGCGCGAGCGCAAGCAGAAGCTCAAGCAGCGGTCCAACCACCGTCA
CATGGAGATAACGTTGAAGAGGAAGACGGTGGGTTTATGGGACTGCATTTGGTTGATAAT
CCGAGCATGAGGAGAGAGGAAGATGTAGAAACTGGTAGAGTGCCGCCTAGAGGCTGAGTT
ATGAAAGTTTAACACTGAAGCTGGTTTTGTTACTGCTTAGGACACACTTTCTTCTGTTCT
TATACGTTATTTTTTTGTTTGATTGCTTTGTCTTTTGTTGTTTGGTTTACTGCCTGGTCA
TACACCCGGTTTTTGTTTAAGTTTAAGTGTATTGCTTTTAATTTGTTCAGTTTGGATTAA
TCGTTATCGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D201TF U 1
AF RR2EG14TF U 139
AF RR2EG14JQ C 468
BS 1 320 RR2D201TF
BS 321 321 RR2EG14TF
BS 322 328 RR2D201TF
BS 329 884 RR2EG14TF
BS 885 1213 RR2EG14JQ

RD RR2D201TF 328 0 0
AACTGCTGGGAGTTTCTCACCATCTAACATTCCACTCATAGAAACCTCTAACTGCAAAAG
AGGATGAGAGAGGCACAACAAGGAGCTCACACAGTGAGGTCCCATGGAATGACAGTAGCA
AGAACTCACATGCATGACTGGATCATACTCGTACTACTCGTTATCCTCGAGGGCATACTC
CTCATAATCCACCCGTTTTACCGCTTTGTCGGGAAAGATATGATGACTGATCTAAGTTAC
CCTCTAAAGAGTAACACCGTACCTATCTGGTCTGTCCCGGTGTATGCGATACTGTTGCCA
TTGGCAATCTCCATCTTCATTTACTTCC

QA 1 328 1 328
DS 

RD RR2EG14TF 756 0 0
G
GGATCATACTCGTACTACTCGTTATCCTCGAGGGCATACTCCTCATAATCCACCCGTTTT
ACCGCTTTGTCGGGAAAGATATGATGACTGATCTAAGTTACCCTCTAAAGAGTAACACCG
TACCTATCTGGTCTGTCCCGGTGTATGCGATACTGTTGCCATTGGCAATCTTCATCTTTA
TCTACTTCCGCAGAAGAGACGTATACGATCTTCACCATGCGGTGCTAGGTCTGTTATACT
CTGTTCTGGTGACGGCAGTACTTACAGATTCGATAAAGAATGCAGTTGGTAGACCACGCC
CTGACTTCTTCTGGCGTTGTTTCCCTGATGGCAAAGCTCTTTATGATAGCCTTGGAGATG
TGATATGCCATGGTGATAAAAGTGCTATAAGGGAAGGACACAAAAGCTTCCCAAGTGGAC
ACACTTCATGGTCTTTTGCGGGACTAGGATTCTTGTCGCTCTACTTATCAGGGAAGATTC
GAGCGTTTGATGGTAAAGGACATGTTGCGAAGCTGTGTATTGTCATACTCCCTTTGCTAG
TTGCTTCTCTTGTTGGTATCTCCCGTGTAGATGACTATTGGCATCACTGGCAAGACGTCT
TTGCTGGAGGCTTGCTAGGTCTTGTGGTCTCTACGTTCTGTTATCTTCAGTTCTTCCCGC
CACCTTATCGCACCGAAGCTTGGGGGCCATATGCTTACTTCCTAATGTTGGAAGCTGCGC
GAGCGCAAGCAGAAGCTCAAGCAGC
GGTCCACCAC

QA 2 746 2 746
DS 

RD RR2EG14JQ 746 0 0
TGGCAAAGCTCTTTATGATAGCCTTGGAGATGTGATATGCCATGGTGATAAAAGTGCTAT
AAGGGAAGGACACAAAAGCTTCCCAAGTGGACACACTTCATGGTCTTTTGCGGGACTAGG
ATTCTTGTCGCTCTACTTATCAGGGAAGATTCGAGCGTTTGATGGTAAAGGACATGTTGC
GAAGCTGTGTATTGTCATACTCCCTTTGCTAGTTGCTTCTCTTGTTGGTATCTCCCGTGT
AGATGACTATTGGCATCACTGGCAAGACGTCTTTGCTGGAGGCTTGCTAGGTCTTGTGGT
CTCTACGTTCTGTTATCTTCAGTTCTTCCCGCCACCTTATCGCACCGAAGCTTGGGGGCC
ATATGCTTACTTCCTAATGTTGGAAGCTGCGCGAGCGCAAGCAGAAGCTCAAGCAGCGGT
CCAACCACCGTCACATGGAGATAACGTTGAAGAGGAAGACGGTGGGTTTATGGGACTGCA
TTTGGTTGATAATCCGAGCATGAGGAGAGAGGAAGATGTAGAAACTGGTAGAGTGCCGCC
TAGAGGCTGAGTTATGAAAGTTTAACACTGAAGCTGGTTTTGTTACTGCTTAGGACACAC
TTTCTTCTGTTCTTATACGTTATTTTTTTGTTTGATTGCTTTGTCTTTTGTTGTTTGGTT
TACTGCCTGGTCATACACCCGGTTTTTGTTTAAGTTTAAGTGTATTGCTTTTAATTTGTT
CAGTTTGGATTAATCGTTATCGAACC

QA 1 746 1 746
DS 



CO CL1407Contig2 746 2 5 U
GGATGTAGAAGCGTTTTGGCTCAACATGTGTCCGATAACGATTAATCCAAACTGAACAAA
TTAAAAGCAATACACTTAAACAAAAACCGGGGTATAACCAGGCAGTAAACCAAACAACAA
ACGACAAAAAGCAATCAAACAAAAAATATAATGTATTAAGAACAGAAGAAAGTGTGTCCT
AAGCAGCAACAAAAGCAGCTTCAGTGTTAAAACTTTCATAACTCAGCCTCTAGGCGGCAC
TCTACCAGTTTCTACATCTTCTTCTCTCCTCATGCTCGGATTATCCACCAAATGTAGTCC
CATAAACCCACCGTCTTCCTCTTCAACGTTATCTCTATCTGGCGGTGGTTGGGCGGCTGC
TTGAGCTTCTGCTTGCGCTCGCGCAGCTTCCAACATTAGGAAGTAAGCATATGGCCCCCA
AGCTTCGGTGAGATAAGGTGGCGGGAAGAACTGAAGATAACAGAACGTAGAGACCACAAG
ACCAAGCAAGCCTCCAGCAAAGACGTCTTGCCAGTGATGCCAATAGTCATCTACACGGGA
GATACCAACAAGAGAAGCAACTAGCAAAGGGAGTATGACAATGCACAGCTTCGCAACGTG
TCCTTTACCATCAAACGCTCGAATCTTCCCTGATAAGTACAGCGACAAGAATCCTAGTCC
CGCAAATGACCATGAAGTGTGTCCACTTGGGAAGCTTTTGTGCCCTTCCCTTATGACGCT
TTTATCGCCATGGCATATCACATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2DP41JQ U 1
AF RR2D201JQ U 18
BS 1 430 RR2DP41JQ
BS 431 431 RR2D201JQ
BS 432 483 RR2DP41JQ
BS 484 484 RR2D201JQ
BS 485 746 RR2DP41JQ

RD RR2DP41JQ 746 0 0
GGATGTAGAAGCGTTTTGGCTCAACATGTGTCCGATAACGATTAATCCAAACTGAACAAA
TTAAAAGCAATACACTTAAACAAAAACCGGGGTATAACCAGGCAGTAAACCAAACAACAA
ACGACAAAAAGCAATCAAACAAAAAATATAATGTATTAAGAACAGAAGAAAGTGTGTCCT
AAGCAGCAACAAAAGCAGCTTCAGTGTTAAAACTTTCATAACTCAGCCTCTAGGCGGCAC
TCTACCAGTTTCTACATCTTCTTCTCTCCTCATGCTCGGATTATCCACCAAATGTAGTCC
CATAAACCCACCGTCTTCCTCTTCAACGTTATCTCTATCTGGCGGTGGTTGGGCGGCTGC
TTGAGCTTCTGCTTGCGCTCGCGCAGCTTCCAACATTAGGAAGTAAGCATATGGCCCCCA
AGCTTCGGTGCGATAAGGTGGCGGGAAGAACTGAAGATAACAGAACGTAGAGACCACAAG
ACCTAGCAAGCCTCCAGCAAAGACGTCTTGCCAGTGATGCCAATAGTCATCTACACGGGA
GATACCAACAAGAGAAGCAACTAGCAAAGGGAGTATGACAATGCACAGCTTCGCAACGTG
TCCTTTACCATCAAACGCTCGAATCTTCCCTGATAAGTACAGCGACAAGAATCCTAGTCC
CGCAAATGACCATGAAGTGTGTCCACTTGGGAAGCTTTTGTGCCCTTCCCTTATGACGCT
TTTATCGCCATGGCATATCACATCTC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2D201JQ 727 0 0
GGCTTAACATGTGTCCGATAGCGATTAATCCAAACTGAGCAAATTAAAAGCAATACAGTT
AAACAAAAACCGGGGTATAACCAGGCAGTAAACCAAACAACAAACGACAAAAAGCAATCA
AACAAAAAATA**ATGTATTAAGAACAGAAGAAAGTGTGTCCTAAGCAGCAACAAAAGCA
GCTTCAGTGTTAAAACTTTCATAACTCAGCCTCTAGGCGGCACTCTCCCAGTTTCTACAT
CTTCTTCTCTCCTCATGCTCGGATTATCCACCAAATGTAGTCCCATAAACCCACCGTCTT
CCTCTTCAACGTTATCTCTATCTGGCGGTGGTTGGGCGGCTGCTTGAGCTTCTGCTTGCG
CTCGCGCAGCTTCCAACATTAGGAAGTAAGCATATGGCCCCCAAGCTTCGGTGAGATAAG
GTGGCGGGAAGAACTGAAGATAACAGAACGTAGAGACCACAAGACCAAGCAAGCCTCCAG
CAAAGACGTCTTGCCAGTGATGCCAATAGTCATCTACACGGGAGATACCAACAAGAGAAG
CAACTAGCAAAGGGAGTATGACAATGCACAGCTTCGCTACGTGTCCTTTACCATCAAACG
CTCGAATCTTCCCTGATAAGTACAGTGACAAGAATCCTAGTCCCGCAAATGACCATGAAG
TGTGTCCACTTGGGAAGCTTTTGTGCCCTTCCCTTATGACGCTTTTATCGCCATGGCATA
TCACATC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 6

CO CL1408Contig1 1332 6 34 U
GGTCTTGGTTGCCGGTAGCACAAGCAACAGCAACTGCAGTCTAGAAGATCTCTCTGAGTT
CCACCTCAGCCCACAAGACTGTTCCCTGGCAGCCGCAGCCGCAGCTTCTGTTCATCAGCT
TCACATCAATACTCCTCCTAGTTGTGATCACCAACTCCAGAGTTTAATACACCAAAACTT
TCAAGATCCACCCTACGCTCCACAGTCTAACAATTGGGACAACGGTTACCAAGACTTTGT
GACTTTAGGTTCTAATCACACAACTCCTGACCTACTCAGCCTCTTGCAGCTGCCAAGATC
CTCACTTCCACCTTTCGCAACACCTAGCCTTCACGACATGATCATGACATCTTCCTCTGC
CGCCTCTGCTGCCTTTGACCCGCTCTACCATCTGAACTTCCCTTTGCAGCCTCCTAGTGG
AACTCTACTAGGAGTTGAGGATCAAACCGAGTTCAATGGAGTGAACGGTTTGATATATGC
TGAAGAAAACAACAACACCGAGAATGGTCTTAACCCTAAAGGGAGAGGATCGAGAAAGCG
TAAAGTCTTCCCTACAGAACGTGAGAGAAGAGTTCACTTCAAAGACCGGTTTGGTGACTT
AAAGAACTTAATTCCAAACCCTACCAAGAATGATAGAGCATCAATCGTTGGAGAAGCGAT
AGATCACATCAAAGAGTTGCTAAGAACCATCGAGGAGTTCAAGATGCTACTGGAGAAGAA
AAGAATCACAAGACAGAGGAACAAGAGAGGCAGAATCGAAGTGGGGGAAGATGATGTTGG
TGATGAGAACTACAATGCTCAAAGCGAAGTAGTGGAACAGTGTTTGGTCAATAAGAAGAA
CAATGCCTTGAGATGCTCGTGGCTGAAGAGGAAATCAAAATTCACTGAAGTCGATGTGCG
TATCATAGACGATGAAGTTACTATCAAGATCGTGCAAAAGAAGAAAATCAACTGTTTAGT
GTTCGTCTCCAAAGTGATTGATCAGCTTCAGCTTGATCTTCATCATGTAGCTGGTGCACA
GATTGGAGAGCACCACAGCTTCTTGTTCAACACCAAGATTTGTGAAGGATCTAGTGTTTA
TGCAAGTGCCATAGCAGATAGAGTTATGGAAGTGCTGGAGAAACAATACATGGAAGCTCT
TTCGTCGAACAATGGCTATCACTGCTACACTAGTGATTAATGCGTTTTCTTC***TATCT
AGTAATGACTTCCATAATGGATGATTAATAATATCACATTAGTAATGTTTCGTATTATTT
CGTTTTATCTATGTGGGCTTGAAGCTAGTTTTTTTTCCTCGGAGGATTAATAACATCACA
TTAGTTAAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ39TF U 1
AF RR2CI26TF U 247
AF RR2FJ39JQ C 597
AF RR2CI26JQ C 544
AF RR2AN37JQ C 676
AF RR2AN37TF U 676
BS 1 371 RR2FJ39TF
BS 372 372 RR2CI26TF
BS 373 420 RR2FJ39TF
BS 421 421 RR2CI26TF
BS 422 672 RR2FJ39TF
BS 673 673 RR2CI26TF
BS 674 698 RR2FJ39TF
BS 699 699 RR2CI26TF
BS 700 721 RR2FJ39TF
BS 722 724 RR2CI26TF
BS 725 730 RR2FJ39TF
BS 731 731 RR2CI26TF
BS 732 740 RR2FJ39TF
BS 741 741 RR2CI26TF
BS 742 749 RR2FJ39TF
BS 750 750 RR2CI26TF
BS 751 759 RR2FJ39TF
BS 760 760 RR2CI26TF
BS 761 771 RR2FJ39TF
BS 772 772 RR2CI26TF
BS 773 774 RR2FJ39TF
BS 775 775 RR2CI26TF
BS 776 788 RR2FJ39TF
BS 789 789 RR2CI26TF
BS 790 794 RR2FJ39TF
BS 795 795 RR2CI26TF
BS 796 807 RR2FJ39TF
BS 808 879 RR2CI26TF
BS 880 880 RR2AN37TF
BS 881 941 RR2CI26TF
BS 942 942 RR2AN37TF
BS 943 1023 RR2CI26TF
BS 1024 1326 RR2AN37TF
BS 1327 1332 RR2AN37JQ

RD RR2FJ39TF 810 0 0
GGTCTTGGTTGCCGGTAGCACAAGCAACAGCAACTGCAGTCTAGAAGATCTCTCTGAGTT
CCACCTCAGCCCACAAGACTGTTCCCTGGCAGCCGCAGCCGCAGCTTCTGTTCATCAGCT
TCACATCAATACTCCTCCTAGTTGTGATCACCAACTCCAGAGTTTAATACACCAAAACTT
TCAAGATCCACCCTACGCTCCACAGTCTAACAATTGGGACAACGGTTACCAAGACTTTGT
GACTTTAGGTTCTAATCACACAACTCCTGACCTACTCAGCCTCTTGCAGCTGCCAAGATC
CTCACTTCCACCTTTCGCAACACCTAGCCTTCACGACATGATCATGACATCTTCCTCTGC
CGCCTCTGCTGTCTTTGACCCGCTCTACCATCTGAACTTCCCTTTGCAGCCTCCTAGTGG
GACTCTACTAGGAGTTGAGGATCAAACCGAGTTCAATGGAGTGAACGGTTTGATATATGC
TGAAGAAAACAACAACACCGAGAATGGTCTTAACCCTAAAGGGAGAGGATCGAGAAAGCG
TAAAGTCTTCCCTACAGAACGTGAGAGAAGAGTTCACTTCAAAGACCGGTTTGGTGACTT
AAAGAACTTAATTCCAAACCCTACCAAGAATGATAGAGCATCAATCGTTGGAGAAGCGAT
AGATCACATCAAGGAGTTGCTAAGAACCATCGAGGAGT*CAAGATGCTACTGGAGAAGAA
A**GATCACA*GACAGAGGA*CAAGAGAG*CAGAATCGA*GTGGGGGAAGAGGACGTTGG
TGATGAGA*CTACA*TGCTCAAAGCGA
GTA

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2CI26TF 777 0 0
GGGTC
CTAATCACACAACTCCTGACCTACTCATCCTCTTGCAGCTGCCAAGATCCTCACTTCCAC
CTTTCGCAACACCTAGCCTTCACGACATGATCATGACATCTTCCTCTGCCGCCTCTGCTG
CCTTTGACCCGCTCTACCATCTTAACTTCCCTTTGCAGCCTCCTAGTGGAACTCTACTAG
GAGTTGAGGATCAAACCGAGTTCAATGGAGTGAACGGTTTGATATATGCTGAAGAAAACA
ATAACACCGAGAATGGTCTTAACCCTAAAGGGAGAGGATCGAGAAAGCGTAAAGTCTTCC
CTACAGAACGTGAGAGAAGAGTTCACTTCAAAGACCGGTTTGGTGACTTAAAGAACTTAA
TTCCAAACCCTACCAAGAATGATAGAGCATCAATCGTTGGAGAAGCGATAGATCACATCA
AAGAGTTGCTAAGAACCATCGAGGAGTTCAAGATGCTACTGGAGAAGAAAAGAATCACAA
GACAGAGGAACAAGAGAGGCAGAATCGAAGTGGGGGAAGATGATGTTGGTGATGAGAACT
ACAATGCTCAAAGCGAAGTAGTGGAACAGTGTTTGGTCAATAAGAAGAACAATGCCTTGA
GATGCTCGTGGCTGAAGAGGAAATCAAA*TTCACTGAAGTCGATGTGCGTATCATAGACG
ATGAAGTTACTATCAAGATCGTGCAAAAGA*GAAAATCAACTGTTTAGTGTTCGTCTCCA
AAGTGATTGATCAGCTTCAGCTTGATCTTCATCATGTAGCTGGTGCACAGAT

QA 6 777 6 777
DS 

RD RR2FJ39JQ 700 0 0
ACTTAAAGAACTTAATTCCAAACCCTACCAAGAATGATAGAGCATCAATCGTTGGAGAAG
CGATAGATCACATCAAGGAGTTGCTAAGAACCATCGAGGAGTTCAAGATGCTACTGGAGA
AGAAAAGAATCACAAGACAGAGGAACAAGAGAGGCAGAATCGAAGTGGGGGAAGAGGACG
TTGGTGATGAGAACTACAATGCTCAAAGCGAAGTAGTGGAACAGTGTTTGGTCAATAAGA
AGAACAATGCCTTGAGATGCTCGTGGCTGAAGAGGAAATCAAAATTCACTGAAGTCGACG
TGCGTATCATAGACGATGAAGTTACTATCAAGATCGTGCAAAAGAAGAAAATCAACTGTT
TAGTGTTCGTCTCCAAAGTGATTGATCAGCTTCAGCTTGATCTTCATCATGTAGCTGGTG
CACAGATCGGAGAGCACCACAGCTTCTTGTTCAACACCAAGATTTGTGAAGGATCTAGTG
TTTATGCAAGTGCCATAGCAGATAGAGTTATGGAAGTGTTGGAGAAACAATACATGGAAG
CTCTTTCGTCGAACAATGGCTATCACTGCTACACTAGTGATTAATGCGTTTTCTTCTTCT
ATTTAGTAATGACTTCCATAATGGATGATCAATAATATCACATTAGTAATGTTTCGTATT
ATTTCGTTTTATCTATGTGGGCTTGAAGCTAGTTTTTT
CC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2CI26JQ 783 0 0
AAGTC
TCCCTACAGAACGTGAGAGAAGAGT*CACTTCAAAGACCGGTTTGGTGACTTAAAGAACT
TAATTCCAAACCCTACCAAGAATGATAGAGCATCAATCGTTGGAGAAGCGATAGATCACA
TCAAAGAGTTGCTAAGAACCATCGAGGAGTTCAAGATGCTACTGGAGAAGAAAAGAATCA
CAAGACAGAGGAACAAGAGAGGCAGAATCGAAGTGGGGGAAGATGATGTTGGTGATGAGA
ACTACAATGCTCAAAGCGAAGTAGTGGAACAGTGTTTGGTCAATAAGAAGAACAATGCCT
TGAGATGCTCGTGGCTGAAGAGGAAATCAAA*TTCACTGAAGTCGATGTGCGTATCATAG
ACGATGAAGTTACTATCAAGATCGTGCAAAAGAAGAAAATCAACTGTTTAGTGTTCGTCT
CCAAAGTGATTGATCAGCTTCAGCTTGATCTTCATCATGTAGCTGGTGCACAGATTGGAG
AGCACCACAGCTTCTTGTTCAACACCAAGATTTGTGAAGGATCTAGTGTTTATGCAAGTG
CCATAGCGGATAGAGTTATGGAAGTGCTGGAGAAACAATACATGGAAGCTCCTTCGTCGA
ACAATGGCTATCACTGCTACACTAGTGATTAATGCGTTTTCTTC***TATCTAGTAATGA
CTTCCATAATGGATGATTAATAATATCACATTAGCAATGTTTCGTATTATTTCGTTTTAT
CTATGTGGGCTTGAAGCTAGTTTTTTTTCCTCGGAGGATTAATAACATCACATTAGTT

QA 6 783 6 783
DS 

RD RR2AN37JQ 657 0 0
GTTGCTAAGAACCATCGAGGAGTTCAAGATGCTACTGGAGAAGAAAAGAATCACAAGACA
GAGGAACAAGAGAGGCAGAATCGAAGTGGGGGAAGATGATGTTGGTGATGAGAACTACAA
TGCTCAAAGCGAAGTAGTGGAACAGTGTTTGGTCAATAAGAAGAACAATGCCTTGAGATG
CTCGTGGCTGAAGAGGAAATCAAAATTCACTGAAGTCGATGTGCGTATCATAGACGATGA
AGTTACTATCAAGATCGTGCAAAAGAAGAAAATCAACTGTTTAGTGTTCGTCTCCAAAGT
GATTGATCAGCTTCAGCTTGATCTTCATCATGTAGCTGGTGCACAGATTGGAGAGCACCA
CAGCTTCTTGTTCAACACCAAGATTTGTGAAGGATCTAGTGTTTATGCAAGTGCCATAGC
AGATAGAGTTATGGAAGTGCTGGAGAAACAATACATGGAAGCTCTTTCGTCGAACAATGG
CTATCACTGCTACACTAGTGATTAATGCGTTTTCTTC***TATCTAGTAATGACTTCCAT
AATGGATGATTAATAATATCACATTAGTAATGTTTCGTATTATTTCGTTTTATCTATGTG
GGCTTGAAGCTAGTTTTTTTTCCTCGGAGGATTAATAACATCACATTAGTTAAAACC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2AN37TF 657 0 0
GTTGCTAAGAACCATCGAGGAGTTCAAGATGCTACTGGAGAAGAAAAGAATCACAAGACA
GAGGAACAAGAGAGGCAGAATCGAAGTGGGGGAAGATGATGTTGGTGATGAGAACTACAA
TGCTCAAAGCGAAGTAGTGGAACAGTGTTTGGTCAATAAGAAGAACAATGCCTTGAGATG
CTCGTGGCTGAAGAGGAAATCAAAATTCACTGAAGTCGATGTGCGTATCATAGACGATGA
AGTTACTATCAAGATCGTGCAAAAGAAGAAAATCAACTGTTTAGTGTTCGTCTCCAAAGT
GATTGATCAGCTTCAGCTTGATCTTCATCATGTAGCTGGTGCACAGATTGGAGAGCACCA
CAGCTTCTTGTTCAACACCAAGATTTGTGAAGGATCTAGTGTTTATGCAAGTGCCATAGC
AGATAGAGTTATGGAAGTGCTGGAGAAACAATACATGGAAGCTCTTTCGTCGAACAATGG
CTATCACTGCTACACTAGTGATTAATGCGTTTTCTTC***TATCTAGTAATGACTTCCAT
AATGGATGATTAATAATATCACATTAGTAATGTTTCGTATTATTTCGTTTTATCTATGTG
GGCTTGAAGCTAGTTTTTTTTCCTCGGAGGATTAATAACATCACATTAGTT
AAAACC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 5

CO CL1409Contig1 1498 5 2 U
CCGAACCCAAACCAAACTTGTAGATTTACTAGAATGGGACCTACAAGGTGTTACAAAATA
GAACCGAAATTCAAAAAACCCGAACCGAACCCGAATGAGTACCCAAACGCCCAGACCTAC
TGATAATGGTGTGTAATAGTTAACTGATAGAAGATAAATGAAAATGAAAAAGACATTGGA
TATAAAAACTGCATTCTACTTGCCTTTATACTTCTAAGCCTAACTCTGTTCTGTGGATGT
ACTAAAACTTTAGAAACCCCAGTGAAGCTGTTTACATGTAAGTTTTAATAAAATCAAAGA
TCATAGACAGCAACAAAATTCATCAACACACTCCCCAACCAAAGCTTCCCATCTTTTTCT
TCTACCTCACTCACTGATCTCACAACTTTTCCTTCGCTATCTTCCAATACCTTCACAAGC
TTCCCTTCGGGGCTATACTTCACAACCAAGCCGTGCGGCCGCATCCCGATCTGGAACATG
TAGTGTATTCTTGCGGTGATTGGGAGTCTCAGTATGAACATCCTTAGCTTAGGGTATCTT
GCCATTATGTACGAGTAGTAGTTGCGCCTGCAGTGAAGCGCCACCCAAAATTCACCTTCT
TTGTTTGTCCTTACGTTATCAGGATGCCCTGGTAACATTGCAAACACATCTGTCGTTCCA
GCTTTCTCTCCTTTTAACCAGTATCTTCGCAGGCTTCCTATATCACCCTCGCAGAAAACA
AAGAAAGAACCGTCTTTGCTGATAGACACACCGTCCGGAAACTGAACATTTGAGACTAGA
ACAACAGCTTTCTTTGCTATTGGATCATATCTGAGAACCCTCCCAGTATTGTCTCCAGAG
AAGACAAGCTGCAAAAAGTTCCTTCTCTGGTAATTGATGCTGCTATCAGTAAAGTAAACA
GTTCCATCATCATCAATGTCAAGGTCGTTAGTAAACCCCAACGGGACGCCATCAGCTTCA
GCTACAAGCGGCATTGCTAAGCCACCTTCAGGACCTACTTTCAAAAGTCCCATATATGCG
TCGGCTATGTACAAATCTCCGGTTCTCTTATCGAAACGGAGTCCCAGAGGACGCCCACAT
ATATGCTCGTTCCTCAAGTAACTCATAGCAGAAGGCTTCGGATCACAAATCTTCGACCTA
TTGCTTGACGTGTACGCGAAGTCAGTCCAGTTGTGGCCATTCCAGAACAAAACCCTACCA
TCAGCAACGCCGGTGTATGGACCGCGTCCTAGAGGATCAAAGGCGACGCTCTCAGGACCC
TGGACTTGGTTCTGAAACAGAATCTCGGATCTCTGGAGAGAGTTCTGTGAGTCTCTCTCC
CATGGCACTTGATCGGGGCGTGGAGAGACAACCTCGTGAGCTACGAAGTTTGGGAAGTCG
GAGATGGCGCAGTGGTTGAAGGGGTCGAGGCTGCAGTAGAGGGCGATGGAGACGGTGAGG
AAGAGAAGAGCGGAGGTAGCAGGGGAGAAGTACAAGGCCATGATGGAACCGAGGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DD65JQ U 178
AF RR2AO24JQ U 1
AF RR2D305JQ U 218
AF RR2AO24TF C 730
AF RR2D305TF C 1177
BS 1 836 RR2AO24JQ
BS 837 1498 RR2AO24TF

RD RR2DD65JQ 579 0 0
GGATATAAAAACTGTATTCTACTTGCCTTTATACTTCTAAGCCTAACTCTGTTCTGTGGA
TGTACTAAAACTTTAGAAACCCCAGTGAAGCTGTTTACATGTACGTTTTAATAAAATCAA
AGATCATAGACAGCAACAAAATTCATCAACACACTCCCCAACCAAAGCTTCCCATCTTTT
TCTTCTACCTCACTCACTGATCTCACAACTTTTCCTTCGCTATCTTCCAATACCTTCACA
AGCTTCCCTTCAGGGCTATACTTCACCACCAAACCGTGAGGCCGCATCCCGATCTGGAAC
ATGTAGTGTATTCTTGCGGTGATTGGGAGTCTCAGTATGAACATCCTTAGCTTAGGGTAT
CTTGCCATTATGTACGAGTAGTAGTTTCGTCTGCAGTGAAGCGCCACCCAAAATTCACCT
TCTTTGTTTGTCCTTACGTTATCAGGATGCCCTGGTAACATTGCAAACACATCTGATGTT
CCAGCTTTCTCGCCTTTTAACCAGTATCTTCGCAGGCTTCCAATATCACCCTCGCAGAAA
ACAAAGAAAGAACCGTCTTTGCTGATAGACACACCGT
TC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2AO24JQ 836 0 0
CCGAACCCAAACCAAACTTGTAGATTTACTAGAATGGGACCTACAAGGTGTTACAAAATA
GAACCGAAATTCAAAAAACCCGAACCGAACCCGAATGAGTACCCAAACGCCCAGACCTAC
TGATAATGGTGTGTAATAGTTAACTGATAGAAGATAAATGAAAATGAAAAAGACATTGGA
TATAAAAACTGCATTCTACTTGCCTTTATACTTCTAAGCCTAACTCTGTTCTGTGGATGT
ACTAAAACTTTAGAAACCCCAGTGAAGCTGTTTACATGTAAGTTTTAATAAAATCAAAGA
TCATAGACAGCAACAAAATTCATCAACACACTCCCCAACCAAAGCTTCCCATCTTTTTCT
TCTACCTCACTCACTGATCTCACAACTTTTCCTTCGCTATCTTCCAATACCTTCACAAGC
TTCCCTTCGGGGCTATACTTCACAACCAAGCCGTGCGGCCGCATCCCGATCTGGAACATG
TAGTGTATTCTTGCGGTGATTGGGAGTCTCAGTATGAACATCCTTAGCTTAGGGTATCTT
GCCATTATGTACGAGTAGTAGTTGCGCCTGCAGTGAAGCGCCACCCAAAATTCACCTTCT
TTGTTTGTCCTTACGTTATCAGGATGCCCTGGTAACATTGCAAACACATCTGTCGTTCCA
GCTTTCTCTCCTTTTAACCAGTATCTTCGCAGGCTTCCTATATCACCCTCGCAGAAAACA
AAGAAAGAACCGTCTTTGCTGATAGACACACCGTCCGGAAACTGAACATTTGAGACTAGA
ACAACAGCTTTCTTTGCTATTGGATCATATCTGAGAACCCTCCCAGTATTGTCTCC

QA 1 836 1 836
DS 

RD RR2D305JQ 574 0 0
GCCTAACTATGTTCTGTGGATGTACTAAAACTTTAGAAACCCCAGTGAAGCTGTTTACAT
GTAAGTTTTAATAAAATCAAAGATCATAGACAGCAACAAAATTCATCAACACACTCCCCA
ACCAAAGCTTCCCATCTTTTTCTTCTACCTCACTCACTGATCTCACAACTTTTCCTTCGC
TATCTTCCAATACCTTCACAAGCTTCCCTTCGGGGCTATACTTCACAACCAAGCCGTGCG
GCCGCATCCCGATCCGGAACATGTAGTGTATTCTTGCGGTGATTGGGAGTCTCAGTATGA
ACATCCTTAGCTTAGGGTATCTTGCCATTATGTACGAATAGTAGTTGCGCCTGCAGTGAA
GCGCCACCCAAAATTCACCTTCTTTGTTTGTCCTTACGTTATCAGGATGCCCTGGTAACA
TTGCAAACACATCTGTCGTTCCAGCTTTCTCTCCTTTTAACCAGTATCTTCGCAGGCTTC
CTATATCACCCTCGCAGAAAACAAAGAAAGAACCGTCTTTGCTGATAGACACACCGTTCG
GAAACTGAACATTTGAGACTAGAACAACAGCTTT

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2AO24TF 769 0 0
CCGTCTTTGCTGATAGACACACCGTCCGGAAACTGAACATTTGAGACTAGAACAACAGCT
TTCTTTGCTATTGGATCATATCTGAGAACCCTCCCAGTATTGTCTCCAGAGAAGACAAGC
TGCAAAAAGTTCCTTCTCTGGTAATTGATGCTGCTATCAGTAAAGTAAACAGTTCCATCA
TCATCAATGTCAAGGTCGTTAGTAAACCCCAACGGGACGCCATCAGCTTCAGCTACAAGC
GGCATTGCTAAGCCACCTTCAGGACCTACTTTCAAAAGTCCCATATATGCGTCGGCTATG
TACAAATCTCCGGTTCTCTTATCGAAACGGAGTCCCAGAGGACGCCCACATATATGCTCG
TTCCTCAAGTAACTCATAGCAGAAGGCTTCGGATCACAAATCTTCGACCTATTGCTTGAC
GTGTACGCGAAGTCAGTCCAGTTGTGGCCATTCCAGAACAAAACCCTACCATCAGCAACG
CCGGTGTATGGACCGCGTCCTAGAGGATCAAAGGCGACGCTCTCAGGACCCTGGACTTGG
TTCTGAAACAGAATCTCGGATCTCTGGAGAGAGTTCTGTGAGTCTCTCTCCCATGGCACT
TGATCGGGGCGTGGAGAGACAACCTCGTGAGCTACGAAGTTTGGGAAGTCGGAGATGGCG
CAGTGGTTGAAGGGGTCGAGGCTGCAGTAGAGGGCGATGGAGACGGTGAGGAAGAGAAGA
GCGGAGGTAGCAGGGGAGAAGTACAAGGCCATGATGGAACCGAGGGTCC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2D305TF 322 0 0
CCATTCCAGAACAAAACCCTACCATCAGCAACGCCGGTGTATGGACCGCGTCCTAGAGGA
TCAAAGGCGACGCTCTCAGGACCCTGGACTTGGTTCTGAAACAGAATCTCGGATCTCTGG
AGAGAGTTCTGTGAGTCTCTCTCCCATGGCACTTGATCGGGGCGTGGAGAGACAACCTCG
TGAGCTACGAAGTTTGGGAAGTCGGAGATGGCGCAGTGGTTGAAGGGGTCGAGGCTGCAG
TAGAGGGCGATGGAGACGGTGAGGAAGAGAAGAGCGGAGGTAGCAGGGGAGAAGTACAAG
GCCATGATGGAACCGAGGGTCC

QA 1 322 1 322
DS 



AS 1 5

CO CL1410Contig1 1686 5 35 U
GGATGCGACCCAAAAGAGATGGAATCTTTCATGAGACTGTTCCTGCCTCTGTATATGTTC
TTCATCGCGTCTCCTCAGCAGGTTTCCTCGGAATCTATCAGCAGAGAGAGTCTCCCAGAT
GGGTTTGTGTTCGGGACAGCTTCCTCAGCATACCAGTTTGAAGGAGCTGTGAATGAAGGA
AACAAAGGAGATAGCATATGGGACACTTTCACCAAGAAACCAGGAAAGATATTGGATTTC
AGCAATGCAGATACCACGGTTGATCAATATAACAGATTCCCTAGTGATATAGACCTGATG
AAAGATCTGGGAATGGATGCTTACAGATTCTCTATATCTTGGACAAGAATATTCCCTAAT
GGAACAGGGAAAGTAAACCCAGATGGACTTAACTACTACAACAGTCTCATAGACACGCTT
TTAGCCAAAGGAATCAAACCGTATGTGACATTGTATCACTGGGATCTCCCACAAGCTTTA
GAAGACAGATATCAAGGATGGCTAAGCAGACAAGTCGCGGATGATTTCGAGCGTTATGCA
TTCACCTGTTTCAAAGCATTCGGGGATAGAGTGAAGTACTGGATCACTTTCAACGAGCCA
CGCGGGCTAACGATCCAAGGCTATGACACGGGGATACAAGCTCCAGGGAGGTGCTCACTT
CTGGGGCATTGGTTCTGTAAGGAAGGTAAATCGTCGGTGGAGCCTTATGTTGTAGCTCAT
AACATTCTCTTGTCTCATGCCGCTGCTTACCACACCTATCAGAGACACTTCAAGAAGAAA
CAAGGTGGTCGAATTGGGATGTCTTTAGATGCAAAATGGTTTGAGCCAATGTCTGATTGT
GATGAGGACAGAGATGCAGCTCGTAGAGCAATGGATTTTGGGATCGGATGGTTTATGGAT
CCTCTAATAAATGGAGACTATCCAGCATCAATGAAGAGACAAGTGGAAGAGAGACTACCA
AAGATAACAGAAGAGATGTCTAAAACAATAAAAGGGGCATTTGATTTCTTTGGAATCAAC
CACTACACGACGTTATACGCTAGGAACGACAGAACAAGGATAAGGAAACTGATTCTACAA
GATGCTTCTTCGGATGCAGCCGTTATCACAAGCTCCTTTCGAGGAGGAGTCCCTATAGGA
GAAAAAGCAGGATCAAGCTGGCTACACATAGTCCCATGGGGAATTAGGAAACTAGCAGTG
TATCTCAAAGACGTCTATGGAAACCCACCTGTATTCACCACAGAAAACGGAATGGATGAG
AAGAACAACCCATTCACAGACATGGAGAAAGCATTACAAGATGACAAGAGGATTAGCTTC
CACAGAGATTACCTCTCAAACTTATCAGCCGCCATTAGGAAGGATGGTTGTGATGTGAGA
GGATACTTCGTGTGGTCATTGTTAGACAACTGGGAGTGGAACTCGGGATACACGGTCCGG
TTCGGGATATACTATGTGGACTATAAGAATAACCTCACAAGGGTTCCGAAAGCCTCTGCT
CGATGGTTTCGAACGTTGCTTGATTCTGAACGTTCTGATAAGCTTTTGCGGGAGAAATGA
GAGGTCGAATTTATACGTACTGTTCTTCATACGAAAAAGAAAGAAGATCAAAAAAATTTA
CAGGATTTGTTAACAATTGAGACGATGATTCAAGCAGAAATATGACGGAATCAAAATTAA
TTGATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE74TF U 1
AF RR2FC54TF U 1
AF RR2G843TF U 535
AF RR2G843JQ C 910
AF RR2AE74JQ C 843
BS 1 56 RR2AE74TF
BS 57 57 RR2FC54TF
BS 58 73 RR2AE74TF
BS 74 74 RR2FC54TF
BS 75 235 RR2AE74TF
BS 236 236 RR2FC54TF
BS 237 344 RR2AE74TF
BS 345 345 RR2FC54TF
BS 346 369 RR2AE74TF
BS 370 370 RR2FC54TF
BS 371 390 RR2AE74TF
BS 391 391 RR2FC54TF
BS 392 392 RR2AE74TF
BS 393 393 RR2FC54TF
BS 394 397 RR2AE74TF
BS 398 398 RR2FC54TF
BS 399 412 RR2AE74TF
BS 413 413 RR2FC54TF
BS 414 440 RR2AE74TF
BS 441 441 RR2FC54TF
BS 442 467 RR2AE74TF
BS 468 468 RR2FC54TF
BS 469 506 RR2AE74TF
BS 507 507 RR2FC54TF
BS 508 517 RR2AE74TF
BS 518 518 RR2FC54TF
BS 519 678 RR2AE74TF
BS 679 1146 RR2G843TF
BS 1147 1226 RR2AE74JQ
BS 1227 1227 RR2G843JQ
BS 1228 1237 RR2AE74JQ
BS 1238 1238 RR2G843JQ
BS 1239 1595 RR2AE74JQ
BS 1596 1596 RR2G843JQ
BS 1597 1686 RR2AE74JQ

RD RR2AE74TF 678 0 0
GGATGCGACCCAAAAGAGATGGAATCTTTCATGAGACTGTTCCTGCCTCTGTATATTTTC
TTCATCGCGTCTCGTCAGCAGGTTTCCTCGGAATCTATCAGCAGAGAGAGTCTCCCAGAT
GGGTTTGTGTTCGGGACAGCTTCCTCAGCATACCAGTTTGAAGGAGCTGTGAATGAAGGA
AACAAAGGAGATAGCATATGGGACACTTTCACCAAGAAACCAGGAAAGATATTGGGTTTC
AGCAATGCAGATACCACGGTTGATCAATATAACAGATTCCCTAGTGATATAGACCTGATG
AAAGATCTGGGAATGGATGCTTACAGATTCTCTATATCTTGGACTAGAATATTCCCTAAT
GGAACAGGGGAAGTAAACCCAGATGGACTTGAGTACTGCAACAGTCTCATAGGCACGCTT
TTAGCCAAAGGAATCAAACCTTATGTGACATTGTATCACTGGGATCTTCCACAAGCTTTA
GAAGACAGATATCAAGGATGGCTAAGTAGACAAGTCGTGGATGATTTCGAGCGTTATGCA
TTCACCTGTTTCAAAGCATTCGGGGATAGAGTGAAGTACTGGATCACTTTCAACGAGCCA
CGCGGGCTAACGATCCAAGGCTATGACACGGGGATACAAGCTCCAGGGAGGTGCTCACTT
CTGGGGCATTGGTTCTGT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2FC54TF 683 0 0
GGATGCGACCCAAAAGAGATGTAATCTTTCATGAGACTGTTCCTGGCTCTGTATATGTTC
TTCATCGCGTCTCCTCAGCAGGTTTCCTCGGAATCTATCAGCAGAGAGAGTTTCCCAGAT
GGGTTTGTGTTCGGGACAGCTTCCTCAGCTTACCAGTTTGAAGGAGCTGTGAATGAAGGA
AACAAAGGAGATAGCATATGGGACACTTTCACCAAGAAACCAGGAAAGATATTGGATTTC
AGCAATGCAGATACCACGGTTGATCAATATCACAGATTCCCTAGTGATATAGACCTGATG
AAAGATCTGGGAATGGATGCTTACAGATTCTCTATATCTTGGACAAGAATATTCCCTAAT
GGAACAGGGAAAGTAAACCCAGATGGACTTAACTACTACAACAGTCTCATAGACACGCTT
TTAGCCAAAGGAATCAAACCGTATGTGACATTGTATCATTGGGATCTCCCACAAGCTTTA
GAAGACAGATATCAAGGATGGCTAAGCAGACAAGTCGCGGATGATTTCGAGCGTTATGCA
TTCACCTGTTTCAAAGCATTCGGAGATAGAGTGAAGTACTGGATCACTTTCAACGAGCCA
CGCGGGCTAACGATCCAAGGCTATGACACGGGGATACAAGCGCCAGGGAGGTGCTCACTT
CTGGGGCATTGGTTCTGT
AAGAA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2G843TF 612 0 0
G
ATGCATTCACCTGTTTCAAAGCATTCGGGGATAGAGTGAAGTACTGGATCACTTTCAACG
AGCCACGCGGGCTAACGATCCAAGGCTATGACACGGGGATACAAGCTCCAGGGAGGTGCT
CACTTCTGGGGCATTGGTTCTGTAAGGAAGGTAAATCGTCGGTGGAGCCTTATGTTGTAG
CTCATAACATTCTCTTGTCTCATGCCGCTGCTTACCACACCTATCAGAGACACTTCAAGA
AGAAACAAGGTGGTCGAATTGGGATGTCTTTAGATGCAAAATGGTTTGAGCCAATGTCTG
ATTGTGATGAGGACAGAGATGCAGCTCGTAGAGCAATGGATTTTGGGATCGGATGGTTTA
TGGATCCTCTAATAAATGGAGACTATCCAGCATCAATGAAGAGACAAGTGGAAGAGAGAC
TACCAAAGATAACAGAAGAGATGTCTAAAACAATAAAAGGGGCATTTGATTTCTTTGGAA
TCAACCACTACACGACGTTATACGCTAGGAACGACAGAACAAGGATAAGGAAACTGATTC
TACAAGATGCTTCTTCGGATGCAGCCGTTATCACAAGCTCCTTTCGAGGAGGAGTCCCTA
TAGGAGAAAAA

QA 2 612 2 612
DS 

RD RR2G843JQ 708 0 0
AATGGAGACTATCCAGCATCAATGAAGAGACAAGTGGAAGAGAGACTACCAAAGATAACA
GAAGAGATGTCTAAAACAATAAAAGGGGCATTTGATTTCTTTGGAATCAACCACTACACG
ACGTTATACGCTAGGAACGACAGAACAAGGATAAGGAAACTGATTCTACAAGATGCTTCT
TCGGATGCAGCCGTTATCACAAGCTCCTTTCGAGGAGGAGTCCCTATAGGAGAAAAAGCA
GGATCAAGCTGGCTACACATAGTCCCATGGGGAATTAGGAAACTAGCAGTGTATCTCAAA
GACGTCTATGGAAACCCACCTGTATTCACCACAGAAAACGGAATGGATGAGAAGAACAAC
CCATTCATAGACATGGAGAAAGCATTACAAGATGACAAGAGGATTAGCTTCCACAGAGAT
TACCTCTCAAACTTATCAGCCGCCATTAGGAAGGATGGTTGTGATGTGAGAGGATACTTC
GTGTGGTCATTGTTAGACAACTGGGAGTGGAACTCGGGATACACGGTCCGGTTCGGGATA
TACTATGTGGACTATAAGAATAACCTCACAAGGGTTCCGAAAGCCTCTGCTCGATGGTTT
CGAACGTTGCTTGATTCTGAACGTTCTGATAAGCTTTTGCGGGAGAAATGAGAGGTCGAA
TTTATACGTACTGTTTTTCATACGAAAAAGAAAGAAGATCAAAAAAA
A

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2AE74JQ 844 0 0
TGAGGACAGAGATGCAGCTCGTAGAGCAATGGATTTTGGGATCGGATGGTTTATGGATCC
TCTAATAAATGGAGACTATCCAGCATCAATGAAGAGACAAGTGGAAGAGAGACTACCAAA
GATAACAGAAGAGATGTCTAAAACAATAAAAGGGGCATTTGATTTCTTTGGAATCAACCA
CTACACGACGTTATACGCTAGGAACGACAGAACAAGGATAAGGAAACTGATTCTACAAGA
TGCTTCTTCGGATGCAGCCGTTATCACAAGCTCCTTTCGAGGAGGAGTCCCTATAGGAGA
AAAAGCAGGATCAAGCTGGCTACACATAGTCCCATGGGGAATTAGGAAACTAGCAGTGTA
TCTCAAAGACGTCTATGGAAACCCGCCTGTATTCATCACAGAAAACGGAATGGATGAGAA
GAACAACCCATTCACAGACATGGAGAAAGCATTACAAGATGACAAGAGGATTAGCTTCCA
CAGAGATTACCTCTCAAACTTATCAGCCGCCATTAGGAAGGATGGTTGTGATGTGAGAGG
ATACTTCGTGTGGTCATTGTTAGACAACTGGGAGTGGAACTCGGGATACACGGTCCGGTT
CGGGATATACTATGTGGACTATAAGAATAACCTCACAAGGGTTCCGAAAGCCTCTGCTCG
ATGGTTTCGAACGTTGCTTGATTCTGAACGTTCTGATAAGCTTTTGCGGGAGAAATGAGA
GGTCGAATTTATACGTACTGTTCTTCATACGAAGAAGAAAGAAGATCAAAAAAATTTACA
GGATTTGTTAACAATTGAGACGATGATTCAAGCAGAAATATGACGGAATCAAAATTAATT
GATT

QA 1 844 1 844
DS 



AS 2 6

CO CL1411Contig1 933 3 8 U
GGAAGGGAGAAAAAAAAGCAAAAAAAATGGCTTCCAATTTCTGGACATCAACGCACTTCA
AAGAGCTTAAGGACCCAGAAGAGATTAATGTTGTTCATCCTCTTGACGCTCAGAGAGGAA
TCTCTGTCGAAGATTTGAGACTCATTAAGCTTCATATGTCTAATTATATATCGAAGCTGG
CACAACACATTAAGATTAGGCAAAGAGTTGTTGCAACTGCTATAACCTATATGCGCCGTG
TTTACACTAGGAAGAGTTTGACAGAGTATGAGCCTAGGCTTGTTGCTCCCACCTGCTTGT
ATTTGGCTTGCAAAGCTGAGGAGAGTGTGGTCCATGCCAAGATTCTTGTCTTCTACATCA
GAAAATTGTATGCTGATGAGAAGTTCAGGTATGAGATTAAAGATATTCTGGAGATGGAGA
TGAAGATCTTGGAGGCTTTGAACTTCTATCTTGTTGTCTTCCACCCTTACCGATCTTTAC
CTGAGTTCTTGCAGGATTCTGGACTCAATGACACAAGTATGACCCATTTAACTTGGGGTA
TCGTCAACGACACTTACAGAATGGACCTTATCCTTACGCATCCGCCTTATCTCATCACCC
TCGCTTGCATTTACGTTGCTTCTGTTTACAAAGAGAAAGACATAAAAACGTGGTTTGAAG
AGCTCTCTGCGGACATGAACATTGTGAAGAATATCGCAATGGAGATATTAGATTTCTATG
AGAACCACAGAATGTTCACTGAAGAGAGAGTTCACGCCGCCTTCAACAAGCTTGCTACAA
GTCCATAAGAGTTTTTGTTTTTGTTTCTCTGAGAATAATATGTTTTGCCAGCAGTTTCTG
TCATGAGGGATCATTTGTACATTGGTTTTGCTAGTCTTGGTTCAAGCAAGTCTTTGACTA
TGCACAATATGAAAGTGGTGTGCAAATTTGCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK61TF U 1
AF RR2DC82TF U 1
AF RR2DK61JQ C 544
BS 1 230 RR2DC82TF
BS 231 231 RR2DK61TF
BS 232 690 RR2DC82TF
BS 691 691 RR2DK61JQ
BS 692 723 RR2DC82TF
BS 724 724 RR2DK61JQ
BS 725 738 RR2DC82TF
BS 739 933 RR2DK61JQ

RD RR2DK61TF 648 0 0
GGAAGGGAGAAAAAAAAGCAAAAAAAATGGCTTCCAATTTCTGGACATCAACGCACTTCA
AAGAGCTTAAGGACCCAGAAGAGATTAATGTTGTTCATCCTCTTGATGCTCAGAGAGGAA
TCTCTGTCGAAGATTTGAGACTCATTAAGCTTCATATGTCTAATTATATATCGAAGCTGG
CACAACACATTAAGATTAGGCAAAGAGTTGTTGCAACTGCTATAACCTATATGCGCCGTG
TTTACACTAGGAAGAGTTTGACAGAGTATGAGCCTAGGCTTGTTGCTCCCACCTGCTTGT
ATTTGGCTTGCAAAGCTGAGGAGAGTGTGGTCCATGCCAAGATTCTTGTCTTCTACATCA
GAAAATTGTATGCTGATGAGAAGTTCAGGTATGAGATTAAAGATATTCTGGAGATGGAGA
TGAAGATCTTGGAGGCTTTGAACTTCTATCTTGTTGTCTTCCACCCTTACCGATCTTTAC
CTGAGTTCTTGCAGGATTCTGGACTCAATGACACAAGTATGACCCATTTAACTTGGGGTA
TCGTCAACGACACTTACAGAATGGACCTTATCCTTACGCATCCGCCTTATCTCATCACCC
TCGCTTGCATTTACGTTGCTTCTGTTTACAAAGAGAAAGACATAAA
AA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2DC82TF 738 0 0
GGAAGGGAGAAAAAAAAGCAAAAAAAATGGCTTCCAATTTCTGGACATCAACGCACTTCA
AAGAGCTTAAGGACCCAGAAGAGATTAATGTTGTTCATCCTCTTGACGCTCAGAGAGGAA
TCTCTGTCGAAGATTTGAGACTCATTAAGCTTCATATGTCTAATTATATATCGAAGCTGG
CACAACACATTAAGATTAGGCAAAGAGTTGTTGCAACTGCTATAACCTATGTGCGCCGTG
TTTACACTAGGAAGAGTTTGACAGAGTATGAGCCTAGGCTTGTTGCTCCCACCTGCTTGT
ATTTGGCTTGCAAAGCTGAGGAGAGTGTGGTCCATGCCAAGATTCTTGTCTTCTACATCA
GAAAATTGTATGCTGATGAGAAGTTCAGGTATGAGATTAAAGATATTCTGGAGATGGAGA
TGAAGATCTTGGAGGCTTTGAACTTCTATCTTGTTGTCTTCCACCCTTACCGATCTTTAC
CTGAGTTCTTGCAGGATTCTGGACTCAATGACACAAGTATGACCCATTTAACTTGGGGTA
TCGTCAACGACACTTACAGAATGGACCTTATCCTTACGCATCCGCCTTATCTCATCACCC
TCGCTTGCATTTACGTTGCTTCTGTTTACAAAGAGAAAGACATAAAAACGTGGTTTGAAG
AGCTCTCTGCGGACATGAACATTGTGAAGA*TATCGCAATGGAGATATTAGATTTCTATG
AGA*CCACAGAATGTTCA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2DK61JQ 390 0 0
TCAACGACACTTACAGAATGGACCTTATCCTTACGCATCCGCCTTATCTCATCACCCTCG
CTTGCATTTACGTTGCTTCTGTTTACAAAGAGAAAGACATAAAAACGTGGTTTGAAGAGC
TCTCTGCGGACATGAACATTGTGAAGAATATCGCAATGGAGATATTAGATTTCTATGAGA
ACCACAGAATGTTCACTGAAGAGAGAGTTCACGCCGCCTTCAACAAGCTTGCTACAAGTC
CATAAGAGTTTTTGTTTTTGTTTCTCTGAGAATAATATGTTTTGCCAGCAGTTTCTGTCA
TGAGGGATCATTTGTACATTGGTTTTGCTAGTCTTGGTTCAAGCAAGTCTTTGACTATGC
ACAATATGAAAGTGGTGTGCAAATTTGCAT

QA 1 390 1 390
DS 



CO CL1411Contig2 1026 3 9 U
GTGCATAGTCAAAGACATGCTTTAACCAAGACTAGCAAAACCAATGTACAAATGATCCTC
ATGATAGAAACTGCTGGCAAAACATATTTTTTCTCAAGTCAAACAAAACAAAAGACAAAT
AAAAAACTCTTATGGACTTGTAGCAAGCTTGTTGAAGGCAGCGTGAACTCTCTCTTCAGT
GAACATTCTGTGGTTCTCATAAAAATCTAATATCTCCATTGCAATATTCTTCACTATGTT
CATGTCCACAGAGAGCTCTTCAAACCATGTCTTTATGTCTTTCTCTTTGTACACAGAAGC
AACGTAAATGCAAGCGAGAGTGATGAGATAAGGCGGGTGCGTAAGGATGAGATCCATTCT
GTAAGTGTCGTTGACAATACCCCAAGTTAAATGGGTCATACTTGTGTCATTGAGTCCAGA
ATCCTGCAAGAACTCAGGGAGAGATCGGTATGGATGGAAGACAACAAGATAGAAGTTCAA
AGCTTCCAAGATCTTCATCTCCATCTCCAGAATATCTTTAATCTCATACCTGAACTTCTC
ATCAGCATACAATTTTCTGATGTAGAAGACAAGAATCTTGGCATGGACCACACTCTCCTC
AGCTTTGCAAGCCAGATACAAGCAGGTGGGAGCAACAAGCCTAGGCTCATACTCTGTCAA
ACTCTTCCTGCCACCAAACAACAAACAAAACAGTACCATAAAATAAATCAGCAACCGAAC
CTCCCCGCTCTCTCATCAAATCAACAGTACACACATACCTTGTGTAAACACGGCGCATAT
AGGTTATAGCAGTTGCAACAACTCTTTGCCTAATCTTAATGTGTTGTGCCAGCTTCGATA
TATAATTAGACATATGAAGCTTAATGAGTCTCAAATCTTCGACAGAGATTCCTCTCTGAG
CATCAAGAGGATGAACAACATTAATCTCTTCTGGGTCCTTAAGCTCTTTGCTGTCCGAAC
AAAACCCAGAAACAAAAAAAGGACAAGGAACATGATTAGAGAAACTGAACAATTATCTGT
TAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2H025JQ U 1
AF RR2CB19JQ U 87
AF RR2CB19TF C 343
BS 1 350 RR2H025JQ
BS 351 351 RR2CB19JQ
BS 352 548 RR2H025JQ
BS 549 549 RR2CB19JQ
BS 550 569 RR2H025JQ
BS 570 772 RR2CB19JQ
BS 773 773 RR2CB19TF
BS 774 793 RR2CB19JQ
BS 794 1026 RR2CB19TF

RD RR2H025JQ 569 0 0
GTGCATAGTCAAAGACATGCTTTAACCAAGACTAGCAAAACCAATGTACAAATGATCCTC
ATGATAGAAACTGCTGGCAAAACATATTTTTTCTCAAGTCAAACAAAACAAAAGACAAAT
AAAAAACTCTTATGGACTTGTAGCAAGCTTGTTGAAGGCAGCGTGAACTCTCTCTTCAGT
GAACATTCTGTGGTTCTCATAAAAATCTAATATCTCCATTGCAATATTCTTCACTATGTT
CATGTCCACAGAGAGCTCTTCAAACCATGTCTTTATGTCTTTCTCTTTGTACACAGAAGC
AACGTAAATGCAAGCGAGAGTGATGAGATAAGGCGGGTGCGTAAGGATGAAATCCATTCT
GTAAGTGTCGTTGACAATACCCCAAGTTAAATGGGTCATACTTGTGTCATTGAGTCCAGA
ATCCTGCAAGAACTCAGGGAGAGATCGGTATGGATGGAAGACAACAAGATAGAAGTTCAA
AGCTTCCAAGATCTTCATCTCCATCTCCAGAATATCTTTAATCTCATACCTGAACTTCTC
ATCAGCATGCAATTTTCTGATGTAGAAGA

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2CB19JQ 707 0 0
TTTTTTCTCAAGTCAAACAAAACAAAAGACAAATAAAAAACTCTTATGGACTTGTAGCAA
GCTTGTTGAAGGCAGCGTGAACTCTCTCTTCAGTGAACATTCTGTGGTTCTCATAGAAAT
CTAATATCTCCATTGCAATATTCTTCACTATGTTCATGTCCACAGAGAGCTCTTCAAACC
ATGTCTTTATGTCTTTCTCTTTGTACACAGAAGCAACGTAGATGCAAGCGAGAGTGATGA
GATAAGGCGGGTGCGTAAGGATGAGATCCATTCTGTAAGTGTCGTTGACAATACCCCAAG
TTAAATGGGTCATACTTGTGTCATTGAGTCCAGAATCCTGCAAGAACTCAGGGAGAGATC
GGTATGGATGGAAGACAACAAGATAGAAGTTCAAAGCTTCCAAGATCTTCATCTCCATCT
CCAGAATATCTTTAATCTCATACCTGAACTTCTCATCAGCATACAATTTTCTGATGTAGA
AGACAAGAATCTTGGCATGGACCACACTCTCCTCAGCTTTGCAAGCCAGATACAAGCAGG
TGGGAGCAACAAGCCTAGGCTCATACTCTGTCAAACTCTTCCTGCCACCAAACAACAAAC
AAAACAGTACCATAAAATAAATCAGCAACCGAACCTCCCCGCTCTCTCATCAAATCAACA
GTACACACATACCTTGTGTAAACACG*CGCATATAGGTTATAGCAGT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2CB19TF 684 0 0
AAGGATGAGATCCATTCTGTAAGTGTCGTTGACAATACCCCAAGTTAAATGGGTCATACT
TGTGTCATTGAGTCCAGAATCCTGCAAGAACTCAGGGAGAGATCGGTATGGATGGAAGAC
AACAAGATAGAAGTTCAAAGCTTCCAAGATCTTCATCTCCATCTCCAGAATATCTTTAAT
CTCATACCTGAACTTCTCATCAGCATACAATTTTCTGATGTAGAAGACAAGAATCTTGGC
ATGGACCACACTCTCCTCAGCTTTGCAAGCCAGATACAAGCAGGTGGGAGCAACAAGCCT
AGGCTCATACTCTGTCAAACTCTTCCTGCCACCAAACAACAAACAAAACAGTACCATAAA
ATAAATCAGCAACCGAACCTCCCCGCTCTCTCATCAAATCAACAGTACACACATACCTTG
TGTAAACACGGCGCATATAGGTTATAGCAGTTGCAACAACTCTTTGCCTAATCTTAATGT
GTTGTGCCAGCTTCGATATATAATTAGACATATGAAGCTTAATGAGTCTCAAATCTTCGA
CAGAGATTCCTCTCTGAGCATCAAGAGGATGAACAACATTAATCTCTTCTGGGTCCTTAA
GCTCTTTGCTGTCCGAACAAAACCCAGAAACAAAAAAAGGACAAGGAACATGATTAGAGA
AACTGAACAATTATCTGTTAAAAA

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 3

CO CL1412Contig1 452 3 1 U
CGATAGAAACCATCTTTCTTTTCTTTTGAAATGAAATTGTGGCGAAAGCAAACATATGTT
ATGGGATAGGAAGAGTCACTCCCCTACAGACATGATAGGAAGTTACACAAACATTATAAG
TTGATAAATAAGCACTCTGTCAAAGACACGCTTCATGGATACAAAGCGGGATTATTTCTT
GCCACTCTTCTTAAGACCAGAGCCTCCAAAAGATCCCTTCTGCGATGCCTTGGCTCTTAG
TTCTTTAAGTGCCTTTTCCTCGTCTTTCTTCTTCTGAAGGTTGGCCATATCGTGCTCATC
GTATTCCTTCTTATCAGCTTTTGGCTGCTTCAAAGGTTTCGCCTTCCCTCCTTGCTTGGA
CGACATGGCTGGTTCCTCGAGCTCTAGGGTTTGATGCTGATCTGAAAATTGGGGAAAATT
TAAGTTTCAAACGATGGACTTGCAGTGTGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ08JQ U 230
AF RR2GN34JQ U 1
AF RR2GN34TF C 1
BS 1 452 RR2GN34JQ

RD RR2AZ08JQ 174 0 0
TTC
GCTCTTAATTCTTTAAGTGCCTTTTCCTCGTCTTTCTTCTTCTGAAGGTTGGCCATATCG
TGCTCATCGTATTCCTTCTTATCAGCCTTTGGCTGCTTCAAAGGTTTCGCCTTTCCTCCT
TGCTTGGACGACATGGCTGGTTCCTCGAGCTCTAGGGTTTGATGCTGATCT

QA 4 174 4 174
DS 

RD RR2GN34JQ 452 0 0
CGATAGAAACCATCTTTCTTTTCTTTTGAAATGAAATTGTGGCGAAAGCAAACATATGTT
ATGGGATAGGAAGAGTCACTCCCCTACAGACATGATAGGAAGTTACACAAACATTATAAG
TTGATAAATAAGCACTCTGTCAAAGACACGCTTCATGGATACAAAGCGGGATTATTTCTT
GCCACTCTTCTTAAGACCAGAGCCTCCAAAAGATCCCTTCTGCGATGCCTTGGCTCTTAG
TTCTTTAAGTGCCTTTTCCTCGTCTTTCTTCTTCTGAAGGTTGGCCATATCGTGCTCATC
GTATTCCTTCTTATCAGCTTTTGGCTGCTTCAAAGGTTTCGCCTTCCCTCCTTGCTTGGA
CGACATGGCTGGTTCCTCGAGCTCTAGGGTTTGATGCTGATCTGAAAATTGGGGAAAATT
TAAGTTTCAAACGATGGACTTGCAGTGTGTCC

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2GN34TF 452 0 0
CGATAGAAACCATCTTTCTTTTCTTTTGAAATGAAATTGTGGCGAAAGCAAACATATGTT
ATGGGATAGGAAGAGTCACTCCCCTACAGACATGATAGGAAGTTACACAAACATTATAAG
TTGATAAATAAGCACTCTGTCAAAGACACGCTTCATGGATACAAAGCGGGATTATTTCTT
GCCACTCTTCTTAAGACCAGAGCCTCCAAAAGATCCCTTCTGCGATGCCTTGGCTCTTAG
TTCTTTAAGTGCCTTTTCCTCGTCTTTCTTCTTCTGAAGGTTGGCCATATCGTGCTCATC
GTATTCCTTCTTATCAGCTTTTGGCTGCTTCAAAGGTTTCGCCTTCCCTCCTTGCTTGGA
CGACATGGCTGGTTCCTCGAGCTCTAGGGTTTGATGCTGATCTGAGAATTGGGGAAAATT
TAAGTTTCAGACGATGG
ACTTGCAGTGTGTCC

QA 1 437 1 437
DS 



AS 2 6

CO CL1413Contig1 764 2 2 U
GGATATTCTTCCACTTTCTCGATCTTAAAAAAAAACCACGATGTCCGCCGAATCAGCCAG
CGAGATTCCGAAGGGACAGGTTGATCTGTTAGATTTCATTGACTGGTCAGGTGTTCAATG
CCTCAACCAAAGCTCAACTCACTCTTTGCCCAACGCTCTCAAGCAGGGGTATAGAGAAGA
TGCAGGTTTGAACTTAGAGAGTGATGCTGATGAGCAACTCCTAATCTATATTCCTTTTAA
CCAAGTTATCAAACTACATTCCTTTGCTATCAAAGGTCCTGAAGAGGATGGTCCTAAAAC
AGTGAAGTTTTTCTCAAACAAAGAGCACATGTGCTTCAGCAATGTTAATGATTTTCCTCC
AAGTGACACCGCTGAACTAACTGAAGAAAACCTCAAGGGAAAACCAGTGGTCCTTAAATA
TGTAAAGTTTCAGAACGTTCGTAGCTTGACGATCTTCGTTGAAGACAACCAATCAGGTTC
TGAGGTCACAAAGGTCCAGAAGATCGCTCTCTACGGTTCAACGGTGGAGACGACTGATAT
GAAGGGTTTGAAAAAGATTGAAGATCACTGAGCAGACCAAAAGGGTTTATAATGATAATA
TGGGTGTTTATCACTTTGGTTTCTAGTCTTCTGTTGTTGGTTTCTTTTCTTCTTCACTTA
CTTTTTCAAGTTTTTAAAAAAATTGGAATGGACTTAAAACTTTCCATTGTCTATTGTTAC
CAGTGCGAAACGAATTTTAAGCTGAATAAACATTATTTCCAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG56TF U 1
AF RR2BG56JQ C 27
BS 1 675 RR2BG56TF
BS 676 764 RR2BG56JQ

RD RR2BG56TF 675 0 0
GGATATTCTTCCACTTTCTCGATCTTAAAAAAAAACCACGATGTCCGCCGAATCAGCCAG
CGAGATTCCGAAGGGACAGGTTGATCTGTTAGATTTCATTGACTGGTCAGGTGTTCAATG
CCTCAACCAAAGCTCAACTCACTCTTTGCCCAACGCTCTCAAGCAGGGGTATAGAGAAGA
TGCAGGTTTGAACTTAGAGAGTGATGCTGATGAGCAACTCCTAATCTATATTCCTTTTAA
CCAAGTTATCAAACTACATTCCTTTGCTATCAAAGGTCCTGAAGAGGATGGTCCTAAAAC
AGTGAAGTTTTTCTCAAACAAAGAGCACATGTGCTTCAGCAATGTTAATGATTTTCCTCC
AAGTGACACCGCTGAACTAACTGAAGAAAACCTCAAGGGAAAACCAGTGGTCCTTAAATA
TGTAAAGTTTCAGAACGTTCGTAGCTTGACGATCTTCGTTGAAGACAACCAATCAGGTTC
TGAGGTCACAAAGGTCCAGAAGATCGCTCTCTACGGTTCAACGGTGGAGACGACTGATAT
GAAGGGTTTGAAAAAGATTGAAGATCACTGAGCAGACCAAAAGGGTTTATAATGATAATA
TGGGTGTTTATCACTTTGGTTTCTAGTCTTCTGTTGTTGGTTTCTTTTCTTCTTCACTTA
CTTTTTCAAGTTTTT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2BG56JQ 738 0 0
AAAAAAAAACCACGATGTCCGCCGAATCAGCCAGCGAGATTCCGAAGGGACAGGTTGATC
TGTTAGATTTCATTGACTGGTCAGGTGTTCAATGCCTCAACCAAAGCTCAACTCACTCTT
TGCCCAACGCTCTCAAGCAGGGGTATAGAGAAGATGCAGGTTTGAACTTAGAGAGTGATG
CTGATGAGCAACTCCTAATCTATATTCCTTTTAACCAAGTTATCAAACTACATTCCTTTG
CTATCAAAGGTCCTGAAGAGGATGGTCCTAAAACAGTGAAGTTTTTCTCAAACAAAGAGC
ACATGTGCTTCAGCAATGTTAATGATTTTCCTCCAAGTGACACCGCTGAACTAACTGAAG
AAAACCTCAAGGGAAAACCAGTGGTCCTTAAATATGTAAAGTTTCAGAACGTTCGTAGCT
TGACGATCTTCGTTGAAGACAACCAATCAGGTTCTGAGGTCACAAAGGTCCAGAAGATCG
CTCTCTACGGTTCAACGGTGGAGACGACTGATATGAAGGGTTTGAAAAAGATTGAAGATC
ACTGAGCAGACCAAAAGGGTTTATAATGATAATATGGGTGTTTATCACTTTGGTTTCTAG
TCTTCTGTTGTTGGTTTCTTTTCTTCTTCACTTACTTTTTCAAGTTTTTAAAAAAATTGG
AATGGACTTAAAACTTTCCATTGTCTATTGTTACCAGTGCGAAACGAATTTTAAGCTGAA
TAAACATTATTTCCAGTC

QA 1 738 1 738
DS 



CO CL1413Contig2 616 4 6 U
GGTTGAGAGGACGACTAATTTGTCTGGGGTCTATTTAGTTGAACTTACCTTGGCGATGCT
GATGAGCAACTCCTAATCTATATTCCTTTTAACCAAGTTATCAAACTACATTCCTTTGCT
ATCAAAGGTCCTGAAGACGAAGGTCCTAAAACAGTGAAGTTTTTCTCAAACAAAGAGCAC
ATGTGCTTCAGCAATGTCAATGATTTTCCTCCAAGTGACACCGCTGAACTAACTGAAGAA
AACCTCAAGGGAAAACCAGTGGTCCTTAAATATGTAAAGTTTCAGAACGTTCGTAGCTTG
ACGATCTTCATTGAAGACAACCAATCAGGTTCTGAGGTCACAAAGGTCCAGAAGATTGCT
CTCTACGGTTCAACGGTGGAGACGACTGATATGAAGGGTTTGAAAAAGATTGAAGATCAC
TGAGCAAACCAAAAGGGTTTATAATGATAATATGATTGTTTATCACTTTGGTTTCTAGTC
TTCTGTTACTGGTTTCTTTTCTTCTTCACTTACTTTTTCAAGTTTTTTAAAAAATTGGAA
TGGACTTAAAACTTTCCATTGCCAATTGTTACCAGTGCGAAACGAATTCTATGCCGAATA
AACATTATTTCCATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR2E815JQ C 1
AF RR2E815TF U 1
AF RR2CX96JQ C 96
AF RR2CX96TF U 96
BS 1 415 RR2E815TF
BS 416 416 RR2CX96TF
BS 417 451 RR2E815TF
BS 452 452 RR2CX96TF
BS 453 613 RR2E815TF
BS 614 616 RR2CX96JQ

RD RR2E815JQ 616 0 0
GGTTGAGAGGACGACTAATTTGTCTGGGGTCTATTTAGTTGAACTTACCTTGGCGATGCT
GATGAGCAACTCCTAATCTATATTCCTTTTAACCAAGTTATCAAACTACATTCCTTTGCT
ATCAAAGGTCCTGAAGACGAAGGTCCTAAAACAGTGAAGTTTTTCTCAAACAAAGAGCAC
ATGTGCTTCAGCAATGTCAATGATTTTCCTCCAAGTGACACCGCTGAACTAACTGAAGAA
AACCTCAAGGGAAAACCAGTGGTCCTTAAATATGTAAAGTTTCAGAACGTTCGTAGCTTG
ACGATCTTCATTGAAGACAACCAATCAGGTTCTGAGGTCACAAAGGTCCAGAAGATTGCT
CTCTACGGTTCAACGGTGGAGACGACTGATATGAAGGGTTTGAAAAAGATTGAAGGTCAC
TGAGCAAACCAAAAGGGTTTATAATGATAATGTGATTGTTTATCACTTTGGTTTCTAGTC
TTCTGTTACTGGTTTCTTTTCTTCTTCACTTACTTTTTCAAGTTTTTTAAAAAATTGGAA
TGGACTTAAAACTTTCCATTGCCAATTGTTACCAGTGCGAAACGAATTCTATGCCGAATA
AACATTATTTCCA
GCT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2E815TF 616 0 0
GGTTGAGAGGACGACTAATTTGTCTGGGGTCTATTTAGTTGAACTTACCTTGGCGATGCT
GATGAGCAACTCCTAATCTATATTCCTTTTAACCAAGTTATCAAACTACATTCCTTTGCT
ATCAAAGGTCCTGAAGACGAAGGTCCTAAAACAGTGAAGTTTTTCTCAAACAAAGAGCAC
ATGTGCTTCAGCAATGTCAATGATTTTCCTCCAAGTGACACCGCTGAACTAACTGAAGAA
AACCTCAAGGGAAAACCAGTGGTCCTTAAATATGTAAAGTTTCAGAACGTTCGTAGCTTG
ACGATCTTCATTGAAGACAACCAATCAGGTTCTGAGGTCACAAAGGTCCAGAAGATTGCT
CTCTACGGTTCAACGGTGGAGACGACTGATATGAAGGGTTTGAAAAAGATTGAAGGTCAC
TGAGCAAACCAAAAGGGTTTATAATGATAATGTGATTGTTTATCACTTTGGTTTCTAGTC
TTCTGTTACTGGTTTCTTTTCTTCTTCACTTACTTTTTCAAGTTTTTTAAAAAATTGGAA
TGGACTTAAAACTTTCCATTGCCAATTGTTACCAGTGCGAAACGAATTCTATGCCGAATA
AACATTATTTCCA
GCT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2CX96JQ 521 0 0
G
GTTATCAAACTACATTCCTTTGCTATCAAAGGTCCTGAAGACGAAGGTCCTAAAACAGTG
AAGTTTTTCTCAAACAAAGAGCACATGTGCTTCAGCAATGTCAATGATTTTCCTCCAAGT
GACACCGCTGAACTAACTGAAGAAAACCTCAAGGGAAAACCAGTGGTCCTTAAATATGTA
AAGTTTCAGAACGTTCGTAGCTTGACGATCTTCATTGAAGACAACCAATCAGGTTCTGAG
GTCACAAAGGTCCAGAAGATTGCTCTCTACGGTTCAACGGTGGAGACGACTGATATGAAG
GGTTTGAAAAAGATTGAAGATCACTGAGCAAACCAAAAGGGTTTATAATGATAATATGAT
TGTTTATCACTTTGGTTTCTAGTCTTCTGTTACTGGTTTCTTTTCTTCTTCACTTACTTT
TTCAAGTTTTTTAAAAAATTGGAATGGACTTAAAACTT*CCATTGCCAATTGTTACCAGT
GCGAAACGAATTCTATGCTGAATAAACATTATTTCCATTT

QA 2 521 2 521
DS 

RD RR2CX96TF 521 0 0
G
GTTATCAAACTACATTCCTTTGCTATCAAAGGTCCTGAAGACGAAGGTCCTAAAACAGTG
AAGTTTTTCTCAAACAAAGAGCACATGTGCTTCAGCAATGTCAATGATTTTCCTCCAAGT
GACACCGCTGAACTAACTGAAGAAAACCTCAAGGGAAAACCAGTGGTCCTTAAATATGTA
AAGTTTCAGAACGTTCGTAGCTTGACGATCTTCATTGAAGACAACCAATCAGGTTCTGAG
GTCACAAAGGTCCAGAAGATTGCTCTCTACGGTTCAACGGTGGAGACGACTGATATGAAG
GGTTTGAAAAAGATTGAAGATCACTGAGCAAACCAAAAGGGTTTATAATGATAATATGAT
TGTTTATCACTTTGGTTTCTAGTCTTCTGTTACTGGTTTCTTTTCTTCTTCACTTACTTT
TTCAAGTTTTTTAAAAAATTGGAATGGACTTAAAACTT*CCATTGCCAATTGTTACCAGT
GCGAAACGAATTCTATGCTGAATAAACATTATTTCCA
TTT

QA 2 518 2 518
DS 



AS 1 5

CO CL1414Contig1 1567 5 44 U
GGAAGCCTTTCTGCTTCCATTGTTCCATTTTATCAGATGGGGTTTGCCAAGCAAGCTTCT
AGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTATACCCTTAAAATGCCACCACCTCCTAGGGAG
GACACGCCTCTTCTCGGCAAAGGGCCTCCTCTTTCTAGCCAGTTCAAGACCTTCGCCAAC
ATCTTCATTGCTGTCGTCGGCGCTGGTGTTCTTGGTCTTCCTTACGCCTTCAAGCGCACC
GGATGGCTCATGGGCGTCCTCCTTCTCCTCTCCGTCTCCCTTTTGACCCATCACTGCATG
ATGCTCCTCGTTTATACCCGCCGCAAGCTCGACTCTCTCAACGGCGGTGGTTTCTCCAAG
ATCGGCTCTTTTGGTGACCTTGGCTTTGCCGTCTGCGGTTCCCTCGGCAGGCTCGTCGTT
GACCTCTTTATTATTTTGTCTCAAGCTGGCTTTTGTGTCGGATATCTTATCTTCATCGGC
ACTACTCTAGCTAATCTTTTCGATCCTGATTCCCCCACCAGTCTCAGGCATCAGTTTACA
CGCCTCGGCTCTGAATTCCTCGGAGTCTCCTCTAAGAGTCTCTACATCTGGGGATGCTTC
CCCTTCCAGCTTGGTCTCAATTCCATCAAGACCCTCACTCACTTGGCTCCTCTCAGCATC
TTCGCCGACGTTGTTGATCTTGCCGCTATGGCCGTCGTCATTGTTGAGGATTCCATGATT
ATACTCAAGCAAAGGCCTGACGTTGTTGCCTTTGGTGGTATGTCTCTCTTCTTCTATGGG
ATGGGCGTGGCCGTTTATTCTTTCGAAGGCGTTGGAATGGTATTGCCTCTTGAATCGGAG
ATGAAA*GACAAGGACAAGCTTGGCAAAGTCTTGGCACTCGGCATGGG*ATTCATCTCTT
TCATATACATAGCCTTTGGTTTCTTAGGTTACTTGGCTTTTGGTGAGGACACAA*TGGAC
ATCATCACCGCTAACTTGGGGGCAGGACTTATCAGCACTATCGTTCAGCTTGGACTCCGC
ATCAACCTCTTCTTCACCTTCCCCTTGATGACGAATCCAGTATTTGAGATAGTGGAGAGG
CGGTTCTCAGGTGGGATGTACTCTGCGTGCCTGAGATGGCTGCTAGTATTGGCAGTGACT
CTGGTGGCTCTCTTTGTGCCAAACTTTACAGATTTTTTGTCATTGGTGGGGAGCAGCACT
TGCTGCATCTTAGGGTTTGTGTTACCTGCTTTGTTTCATTTGCTGGTGTTCAAGGAAGAG
ATGGGGTGGAAGCAATGGAGCCTGGACATGGCGATAGTGGGACTGGGAGTGGTTCTTGCT
GTGTCGGGAACTTGGAGTTCCCTGAGTGAGATCTTCTCGGTCAAAGTGTAAGCAGTGAAG
CTTGTATCCAAGATGTGTCATATACCCATATACTGATGGTTTTAAGAGCATCTGGTTTGT
GATTGGATTTGTATATTGATGATGGTCGGAATAAAAGACATGAGCTCTGTTTTCTGGTTT
GTAAATATACACAAAATACAAATGTGTTGTGTTGTTATGTCTGCATTTGAAATAAACAAA
TATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 0 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2CS20TF U 1
AF RR2DI45TF U 185
AF RR2A078JQ C 754
AF RR2A078TF U 444
AF RR2DI45JQ C 860
BS 1 257 RR2CS20TF
BS 258 258 RR2DI45TF
BS 259 278 RR2CS20TF
BS 279 280 RR2DI45TF
BS 281 296 RR2CS20TF
BS 297 297 RR2DI45TF
BS 298 336 RR2CS20TF
BS 337 337 RR2DI45TF
BS 338 341 RR2CS20TF
BS 342 342 RR2DI45TF
BS 343 548 RR2CS20TF
BS 549 549 RR2DI45TF
BS 550 620 RR2CS20TF
BS 621 621 RR2DI45TF
BS 622 734 RR2CS20TF
BS 735 735 RR2DI45TF
BS 736 764 RR2CS20TF
BS 765 765 RR2A078TF
BS 766 780 RR2CS20TF
BS 781 803 RR2DI45TF
BS 804 804 RR2A078TF
BS 805 807 RR2DI45TF
BS 808 808 RR2A078TF
BS 809 809 RR2DI45TF
BS 810 810 RR2A078TF
BS 811 859 RR2DI45TF
BS 860 860 RR2A078TF
BS 861 927 RR2DI45TF
BS 928 928 RR2A078TF
BS 929 953 RR2DI45TF
BS 954 954 RR2A078TF
BS 955 973 RR2DI45TF
BS 974 1001 RR2A078TF
BS 1002 1002 RR2DI45JQ
BS 1003 1016 RR2A078TF
BS 1017 1018 RR2DI45JQ
BS 1019 1089 RR2A078TF
BS 1090 1090 RR2DI45JQ
BS 1091 1109 RR2A078TF
BS 1110 1110 RR2DI45JQ
BS 1111 1127 RR2A078TF
BS 1128 1128 RR2DI45JQ
BS 1129 1158 RR2A078TF
BS 1159 1567 RR2DI45JQ

RD RR2CS20TF 780 0 0
GGAAGCCTTTCTGCTTCCATTGTTCCATTTTATCAGATGGGGTTTGCCAAGCAAGCTTCT
AGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTATACCCTTAAAATGCCACCACCTCCTAGGGAG
GACACGCCTCTTCTCGGCAAAGGGCCTCCTCTTTCTAGCCAGTTCAAGACCTTCGCCAAC
ATCTTCATTGCTGTCGTCGGCGCTGGTGTTCTTGGTCTTCCTTACGCCTTCAAGCGCACC
GGATGGCTCATGGGCGTTCTCCTTCTCCTCTCCGTCTCTGTTTTGACCCATCACTGTATG
ATGCTCCTCGTTTATACCCGCCGCAAGCTCGACTCTTTCAATGGCGGTGGTTTCTCCAAG
ATCGGCTCTTTTGGTGACCTTGGCTTTGCCGTCTGCGGTTCCCTCGGCAGGCTCGTCGTT
GACCTCTTTATTATTTTGTCTCAAGCTGGCTTTTGTGTCGGATATCTTATCTTCATCGGC
ACTACTCTAGCTAATCTTTTCGATCCTGATTCCCCCACCAGTCTCAGGCATCAGTTTACA
CGCCTCGGTTCTGAATTCCTCGGAGTCTCCTCTAAGAGTCTCTACATCTGGGGATGCTTC
CCCTTCCAGCTTGGTCTCAACTCCATCAAGACCCTCACTCACTTGGCTCCTCTCAGCATC
TTCGCCGACGTTGTTGATCTTGCCGCTATGGCCGTCGTCATTGTTGAGGATTCCATGATT
ATACTCAAGCAAAG*CCTGACGTTGTTGCCTTTGGTGGTATGTCCCTCTTCTTCTATGGG

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2DI45TF 800 0 0
G
CATTGCTGTCGTCGGCGCTGGTGTTCTTGGTCTTCCTTACGCCTTCAAGCGCACCGGATG
GCTCATGGGCGTCCTCCTTCTCCTCTCCGTCTCCCTTTTGACCCATCACTGCATGATGCT
CCTCGTTTATACCCGCCGCAAGCTCGACTCTCTCAACGGCGGTGGTTTCTCCAAGATCGG
CTCTTTTGGTGACCTTGGCTTTGCCGTCTGCGGTTCCCTCGGCAGGCTCGTCGTTGACCT
CTTTATTATTTTGTCTCAAGCTGGCTTTTGTGTCGGATATCTTATCTTCATCGGCACTAC
TCTAGCTAATCTTTTCGATCCTGATTCCCCCACCAGTCTCAGGCATCAGTTTACACGCCT
CGGCTCTGAATTCCTTGGAGTCTCCTCTAAGAGTCTCTACATCTGGGGATGCTTCCCCTT
CCAGCTTGGTCTCAATTCCATCAAGACCCTCACTGACTTGGCTCCTCTCAGCATCTTCGC
CGACGTTGTTGATCTTGCCGCTATGGCCGTCGTCATTGTTGAGGATTCCATGATTATACT
CAAGCAAAGGCCTGACGTTGTTGCCTTTGGTGGTATGTCCCTCTTCTTCTATGGGATGGG
CGTGGCCGTTTATTCTTTTGAAAGTGTTGGAATGGTATTGCCTCTTGAATCGGAGATGAA
A*GACAAGGACAAGTTTGGCAAAGTCTTGGCACTCGGCATGGG*ATTCATCTCTTTCATA
TACATAGCCTTTGGTTTCTTAG*TTACTTGGCTTTTGGTGAGGACACA**TGGACATCAT
CACCGCTA
CTTGGGGGCAG

QA 2 789 2 789
DS 

RD RR2A078JQ 229 0 0
GGTGGTATGTCTCTCTTCTTCTATGGGATGGGCGTGGCCGTTTATTCTTTCGAAGGCGTT
GGAATGGTATTGCCTCTTGAATCGGAGATGAAAAGACAAGGACAAGCTTGGCAAAGTCTT
GGTACTCGGCATGGGGATTCATCTCTTTCATATACATTGCCTTTGGTTTCTTAGGTTACT
TGGCTTTTGGTGAGGACACAAATGGACATCATCACCGCTA
ACTTGGGGG

QA 1 220 1 220
DS 

RD RR2A078TF 715 0 0
AGCTGGCTTTTGTGTCGGATATCTTATCTTCATCGGCACTACTCTAGCTAATCTCTTCGA
TCCTGATTCCCCCACCAGTCTCAGCCATCAGTTTACACGCCTCGGCTCTGACTTCTTGGG
TGTCTCCTCTAAGAGTCTCTACATCTGGGGATGCTTCCCCTTCCAGCTTGGTCTCAATTC
CATCAAGACCCTCACTCACTTGGCTCCTCTCAGCATCTTCGCCGACCTTGTTGATCTTGC
CGCTATGGCTGTCGTCATTGTTGAGGATTCCATGATTATACTCAAGCAAAGGCCTGACGT
TGTTGCCTTTGGTGGTATGTCTCTCTTCTTCTATGGGATGGGCGTGGCCGTTTATTCTTT
CGAAGGCGTTGGAATGGTATTGCCTCTTGAATCGGAGATGAAA*GACAAGGACAAGCTTG
GCAAAGTCTTGGTACTCGGCATGGG*ATTCATCTCTTTCATATACATTGCCTTTGGTTTC
TTAGGTTACTTGGCTTTTGGTGAGGACACAA*TGGACATCATCACCGCTAACTTGGGGGC
AGGACTTATCAGCACTATTGTTCAGCTTGGACTTTGCATCAACCTCTTCTTCACCTTCCC
CTTGATGACGAATCCAGTATTTGAGATAGTGGAGAGGCGGTTCTCATGTGGGATGTACTC
TGCGTGGCTGAGATGGCTGCTAGTCTTGGCAGTGACTCTGGTGGCTCTCTTTGTG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2DI45JQ 708 0 0
T
TTGGCAAAGTCTTGGCACTCGGCATGGG*ATTCATCTCTTTCATATACATAGCCTTTGGT
TTCTTAGGTTACTTGGCTTTTGGTGAGGACACAA*TGGACATCATCACCGCTAACTTGGG
GGCAGGACTTATCAGCACTATCGTTCAGCTTGGACTCCGCATCAACCTCTTCTTCACCTT
CCCCTTGATGATGAATCCAGTATTTGAGATAGTGGAGAGGCGGTTCTCAGGTGGGATGTA
CTCTGCGTGCCTGAGATGGCTGCTAGTATTGGCAGTGACTCTGGTGGCTCTCTTTGTGCC
AAACTTTACAGATTTTTTGTCATTGGTGGGGAGCAGCACTTGCTGCATCTTAGGGTTTGT
GTTACCTGCTTTGTTTCATTTGCTGGTGTTCAAGGAAGAGATGGGGTGGAAGCAATGGAG
CCTGGACATGGCGATAGTGGGACTGGGAGTGGTTCTTGCTGTGTCGGGAACTTGGAGTTC
CCTGAGTGAGATCTTCTCGGTCAAAGTGTAAGCAGTGAAGCTTGTATCCAAGATGTGTCA
TATACCCATATACTGATGGTTTTAAGAGCATCTGGTTTGTGATTGGATTTGTATATTGAT
GATGGTCGGAATAAAAGACATGAGCTCTGTTTTCTGGTTTGTAAATATACACAAAATACA
AATGTGTTGTGTTGTTATGTCTGCATTTGAAATAAACAAATATTATC

QA 2 708 2 708
DS 



AS 2 5

CO CL1415Contig1 808 3 15 U
GGACACTGAACATATGTCAATTCAATTCGAATGAATCTACAATATCAATCAAAAGTTTCC
TCTCCAATTTAGTGGAAAAGTAAACGATTAAAAAAAAGTTTTCAGCGATGAGCGATAACA
GTTTGTCCAAAACATTACCATAATTCTCTATCTTAATATGCTACAGCAGAAAACACAAAT
AAAATCAAAAACAACATTTAGAAGAAAAAAAAA*TCTTAATCTTTCTTTTCAAACAGCTT
TGCTTCTCATTCTAAAACACCTTTTTTTCTTCTAATTATCACGTCTCGGTTGCCTTTTGC
GGGGAGCAGCGGTTTCTTCCTTCTTCTCTGACTCATCTCCACTCTTTGAACTCTCTCCTA
CTTCTGGTTTCTTCTTCTTCTCCACAGTTGCCGCCGGCGCCACCTTTTTGCCACCGAAGA
TAAGCTTGATGAAGAGCGAGAAGAATACTACGACAATGGAGACTAGAACACCAATGGTTA
AGTTTGGTTGTTCCTCAGCTTTCTCAATCAGCTCCGTGATCTTAGACTTGTATGCACTTA
GGAAAGAAAGGTCCGCAACCTTGTTCAACAGATCGAACACAACCTTCTGGTAGCTCTTGA
GACCATCTGCAGATTCAGCAGCCTTCTCTTCCGCCTTTTGTTTCTCTTTCTCAACATCGA
ACTTAGGCTTCCACGTCGTCTGTCTGTAACTCTCGGCGACCTTCTCGTCTTTCGCTATCA
AAATGTTGTCAAACAGGATACCGTCTTGCATCGTCCAGATCTCAATACCGATGGCGGAAA
TGGGCTCGTAATCAGGTCTGTCTAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH12JQ U 1
AF RR2EB47JQ U 71
AF RR2FV80JQ U 110
BS 1 94 RR2DH12JQ
BS 95 95 RR2EB47JQ
BS 96 258 RR2DH12JQ
BS 259 259 RR2EB47JQ
BS 260 456 RR2DH12JQ
BS 457 457 RR2EB47JQ
BS 458 484 RR2DH12JQ
BS 485 485 RR2EB47JQ
BS 486 638 RR2DH12JQ
BS 639 639 RR2EB47JQ
BS 640 748 RR2DH12JQ
BS 749 775 RR2EB47JQ
BS 776 776 RR2FV80JQ
BS 777 791 RR2EB47JQ
BS 792 808 RR2FV80JQ

RD RR2DH12JQ 748 0 0
GGACACTGAACATATGTCAATTCAATTCGAATGAATCTACAATATCAATCAAAAGTTTCC
TCTCCAATTTAGTGGAAAAGTAAACGATTAAAAACAAGTTTTCAGCGATGAGCGATAACA
GTTTGTCCAAAACATTACCATAATTCTCTATCTTAATATGCTACAGCAGAAAACACAAAT
AAAATCAAAAACAACATTTAGAAGAAAAAAAAA*TCTTAATCTTTCTTTTCAAACAGCTT
TGCTTCTCATTCTAAAACTCCTTTTTTTCTTCTAATTATCACGTCTCGGTTGCCTTTTGC
GGGGAGCAGCGGTTTCTTCCTTCTTCTCTGACTCATCTCCACTCTTTGAACTCTCTCCTA
CTTCTGGTTTCTTCTTCTTCTCCACAGTTGCCGCCGGCGCCACCTTTTTGCCACCGAAGA
TAAGCTTGATGAAGAGCGAGAAGAATACTACGACAACGGAGACTAGAACACCAATGGTTA
AGTTCGGTTGTTCCTCAGCTTTCTCAATCAGCTCCGTGATCTTAGACTTGTATGCACTTA
GGAAAGAAAGGTCCGCAACCTTGTTCAACAGATCGAACACAACCTTCTGGTAGCTCTTGA
GACCATCTGCAGATTCAGCAGCCTTCTCTTCCGCCTTTCGTTTCTCTTTCTCAACATCGA
ACTTAGGCTTCCACGTCGTCTGTCTGTAACTCTCGGCGACCTTCTCGTCTTTCGCTATCA
AAATGTTGTCAAACAGGATACCGTCTTG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2EB47JQ 721 0 0
AGTGGAAAAGTAAACGATTAAAAAAAAGTTTTCAGCGATGAGCGATAACAGTTTGTCCAA
AACATTACCATAATTCTCTATCTTAATATGCTACAGCAGAAAACACAAATAAAATCAAAA
ACAACATTTAGAAGAAAAAAAA**TCTTAATCTTTCTTTTCAAACAGCTTTGCTTCTCAT
TCTAAAACACCTTTTTTTCTTCTAATTATCACGTCTCAGTTGCCTTTTGCGGGGAGCAGC
GGTTTCTTCCTTCTTCTCTGACTCATCTCCACTCTTTGAACTCTCTCCTACTTCTGGTTT
CTTCTTCTTCTCCACAGTTGCCGCCGGCGCCACCTTTTTGCCACCGAAGATGAGCTTGAT
GAAGAGCGAGAAGAATACTACAACAATGGAGACTAGAACACCAATGGTTAAGTTTGGTTG
TTCCTCTGCTTTCTCAATCAGCTCCGTGATCTTAGACTTGTATGCACTTAGGAAAGAAAG
GTCCGCAACCTTGTTCAACAGATCGAACACAACCTTCTGGTAGCTCTTGAGACCATCAGC
GGATTCAGCAGCCTTCTCTTCCGCCTTTTGTTTCTCTTTCTCAACATCGAACTTAGGCTT
CCACGTCGTCTGTCTGTAACTCTCGGCGACCTTCTCGTCTTTCGCTATCAAAATGTTGTC
AAACAGGATACCGTCTTGCATCGTCCAGATCTCAATACCGATGGCTGAAATGGGCTCGTA
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2FV80JQ 699 0 0
GAGCGATAACAGTTTGTCCAAAACATTACCATAATTCTCTATCTTAATATGCTACAGCAG
AAAACACAAATAAAATCAAAAACAACATTTAGAAGAAAAAAAAAATCTTAATCTTTCTTT
TCAAACAGCTTTGCTTCTCGTTCTAAAACACCTTTTTT*CTTCTAATTATCACGTCTCGG
TTGCCTTTTGCGGGGAGCAGCGGTTTCTTCCTTCTTCTCTGACTCATCTCCACTCTTTGA
ACTCTCTCCTACTTCTGGTTTCTTCTTCTTCTCCACAGTTGCCGCCGGCGCCACCTTTTT
GCCACCGAAGATAAGCTTGATGAAGAGCGAGAAGAATACTACGACAATGGAGACTAGGAC
ACCAATGGTTAAGTTTGGTTGTTCCTCGGCTTTCTCAATCAGTTCCGTGATCTTGGACTT
GTATGCACTTAGGAAAGATAGGTCTGCAACCTTGTTTAACAGATCGAACACAACCTTCTG
GTAGCTCTTGAGACCATCTGCAGATTCAGCAGCCTTCTCTTCCGCCTTTTGTTTCTCTTT
CTCAACATCGAACTTAGGCTTCCACGTCGTCTGTCTGTAACTCTCGGCGACCTTCTCGTC
TTTCGCTATCAAAATGTTGTCAAACAGGATACCGTCTTGCATCGTCCAGATCTCGATACC
GATGGCGGCAATGGGCTCGTAATCAGGTCTGTCTAGCTC

QA 1 699 1 699
DS 



CO CL1415Contig2 1015 2 14 U
GGGGAAAATCACATCCTTCTCTACTCTCTCTCCGATCTACTCTCCGGTGAACGACCGTTA
AGATTCCCGACGATGAGAGACCGGCAGCTGTTCTCCGCCGTTTTGCTTATCTTAGCTCTC
GTTTCGCTCCAGAAGCTTTGCTACTGCGACGACGATCAAACGGTGTTGTATGAATCGTTC
GACGAGGCGTTTGATGGTCGCTGGATCGTTTCGAAGAATGGCGATTACGAAGGTGTGTGG
AAGCATGAGAAGAGTGAGGGACATGATGATTACGGACTTCTCGTGAGCGAGAAGGCTCGT
AAGTACGGTATAGTGAAGGTTCTTGACGAGCCACTTAACCTCAAGGAAGGAACGATTGTT
CTTCAGTACGAGGTTCGGTTCCAGGAAGGGCTAGAGTGTGGTGGTGCTTACTTGAAGTAC
CTCCGTCCTCAGGAAGCTGGATGGACACCTGAAGGATTCGATAGTGAGTCTCCTTACTCT
ATCATGTTTGGGCCTGACAAGTGTGGAGCTACGAACAAAGTTCATTTCATCTTGAAACAC
AAGAACCCCAAGAGCGGGAAGTACGTTGAGCATCATCTCAAGTTCCCTCCCTCTGTTCCT
TATGACAAGCTTTCCCATGTCTACACCGCCATCTTGAAGCCAGACAACGAGGTTAGAATT
TTGGTTGATGGAGAGGAGAAGAAGAAGGCAAACTTGCTCTCTGGAGAGGACTTTGAGCCT
GCTTTGATCCCTGACAAGACCATCCCTGACCCTGAAGACAAGAAACCAGAAGACTGGGAT
GAGAGAGCCAAGATCCCTGATCCTAACGCCGTGAAGCCTGAGGACTGGGACGAGGAAGCA
CCAATGGAGATCGAAGACGAGGAAGCTGAGAAACCAGAAAGATGGTTAGATGATGAGCCT
GAGGAGGTCGACGACCCAGAGCGACCAAACCCGAAGACTGGGACGATGAGGAGATGGTAT
GTGGGAGGCTCCAAAGATTGACAACCCCAAGTGTGAGTCAGCACCAGGTTGCGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH12TF U 1
AF RR2FV80TF U 231
BS 1 377 RR2DH12TF
BS 378 378 RR2FV80TF
BS 379 452 RR2DH12TF
BS 453 453 RR2FV80TF
BS 454 458 RR2DH12TF
BS 459 459 RR2FV80TF
BS 460 576 RR2DH12TF
BS 577 577 RR2FV80TF
BS 578 578 RR2DH12TF
BS 579 579 RR2FV80TF
BS 580 620 RR2DH12TF
BS 621 621 RR2FV80TF
BS 622 670 RR2DH12TF
BS 671 1015 RR2FV80TF

RD RR2DH12TF 670 0 0
GGGGAAAATCACATCCTTCTCTACTCTCTCTCCGATCTACTCTCCGGTGAACGACCGTTA
AGATTCCCGACGATGAGAGACCGGCAGCTGTTCTCCGCCGTTTTGCTTATCTTAGCTCTC
GTTTCGCTCCAGAAGCTTTGCTACTGCGACGACGATCAAACGGTGTTGTATGAATCGTTC
GACGAGGCGTTTGATGGTCGCTGGATCGTTTCGAAGAATGGCGATTACGAAGGTGTGTGG
AAGCATGAGAAGAGTGAGGGACATGATGATTACGGACTTCTCGTGAGCGAGAAGGCTCGT
AAGTACGGTATAGTGAAGGTTCTTGACGAGCCACTTAACCTCAAGGAAGGAACGATTGTT
CTTCAGTACGAGGTTCGTTTCCAGGAAGGGCTAGAGTGTGGTGGTGCTTACTTGAAGTAC
CTCCGTCCTCAGGAAGCTGGATGGACACCTGAGGGATTTGATAGTGAGTCTCCTTACTCT
ATCATGTTTGGGCCTGACAAGTGTGGAGCTACGAACAAAGTTCATTTCATCTTGAAACAC
AAGAACCCCAAGAGCGGGAAGTACGTTGAGCATCATTTGAAGTTCCCTCCCTCTGTTCCT
TATGACAAGCTTTCCCATGTGTACACCGCCATCTTGAAGCCAGACAACGAGGTTAGAATT
TTGGTTGATG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2FV80TF 785 0 0
G
GGTGTGTGGGAGCATGAGAAGAGTGAGGGACATGATGATTACGGACTTCTCGTGAGCGAG
AAGGCTCGTAAGTACGGTATAGTGAAGGTTCTTGACGAGCCGCTTAACCTCAAGGAAGGA
ACGATTGTTCTTCAGTACGAGGTTCGGTTCCAGGAAGGGCTCGAGTGTGGTGGTGCTTAC
TTGAAGTACCTCCGTCCTCAGGAAGCTGGATGGACACCTGAAGGGTTCGATAGTGAGTCT
CCTTACTCTATCATGTTTGGGCCTGACAAGTGTGGAGCTACGAACAAAGTTCATTTCATC
TTGAAGCACAAGAACCCCAAGAGCGGGGAGTACGTTGAGCATCATCTCAAGTTCCCTCCC
TCTGTTCCTTATGACAAGCTTTCCCATGTCTACACCGCCATCTTGAAGCCAGACAACGAG
GTTAGAATTTTGGTTGATGGAGAGGAGAAGAAGAAGGCAAACTTGCTCTCTGGAGAGGAC
TTTGAGCCTGCTTTGATCCCTGACAAGACCATCCCTGACCCTGAAGACAAGAAACCAGAA
GACTGGGATGAGAGAGCCAAGATCCCTGATCCTAACGCCGTGAAGCCTGAGGACTGGGAC
GAGGAAGCACCAATGGAGATCGAAGACGAGGAAGCTGAGAAACCAGAAAGATGGTTAGAT
GATGAGCCTGAGGAGGTCGACGACCCAGAGCGACCAAACCCGAAGACTGGGACGATGAGG
AGATGGTATGTGGGAGGCTCCAAAGATTGACAACCCCAAGTGTGAGTCAGCACCAGGTTG
CGGT

QA 2 785 2 785
DS 



AS 2 5

CO CL1416Contig1 1393 3 5 U
GGATAGCAAATCATCTTTTGCTTTAAGCAACACGCTCACACACACAAAAATCAGAGCGTT
TCTCCCCGTCCTCTATTCTATCTGTACTTCTGGTCTCACTTTAAAGATCAAATACGTAAA
TATAAGTTGAGAGATTTTTGCAGTGAAAGATATGTTGGAAAGTCTTGTCTCTCTCGAAAG
CATGTCCTTGAGCTCCATGGATGTGTCTGTACTTGAAAGGCTTAAATGGCTGCAACAGCA
ACAACAACAACAACAAGTTCTGAGCAGTACTAATGCTTCACCTGAACTTCTTCAGTTCCA
TGGAACCAACAATGATGAGTTGTTGCAGAATACCTTCAGCCATTTTCAAATGCTTAGATC
TGGTTTTGGACCAAACTATAGCATGGGTTTTGGTCCTTCACATGAACCTATGGATGGCTG
CATTTCAAGAACAAATAGCTGCCAGATGGATCAAGCGGATACAGTGGGGGTAATGTTGAA
GAACAGTGAAGAAAACATTGCTTTTTCCTTGAAAAGCAAGAGAAAATCAGAGGTTAAGAC
AAGGGCAGAGGAAAAGACAGAGAAGAAGATCAAAGTAGAGGCTGAGACAGAGTCAAAGAT
GAAAGTAAAATCAAACTTGAGTAACACAGAAGCATCTTCAGAAACTTCAAAGCAGACATC
AAAGGGAGCTTCCGAGATCCAGAAATTGGATTATATACACGTGAGAGCTCGTCGAGGCCA
AGCTACAGACAGACACAGTTTAGCAGAAAGGGCAAGAAGAGAAAAGATCAGCAAGAAGAT
GAAGTATCTGCAAGATCTTGTCCCTGGATGCAACAAAGTTACTGGAAGAGCTGGTATGCT
TGATGAGATCATTAATTATGTTCAATCTCTCCAGAGACAAGTTGAGTTCTTGTCGATGAA
ACTGGCTGTCCTAAACCCAGAACTCGAGCTTGCTATGGAGGACTTATCTGTAAAACAGTT
TCAGGCTTACTTTACAAATCTTCCTGTATTAGTTGCTTCAAAGCCATCACTAATGGTTGA
TGCGCCATTGTTTCCGCTGGACCAGCAAGGATCTCTAGATTTATCAGTGATAAACCCAAA
CCAAGCAACATCTATTGAAGCTCCATCTGCAAGCTGGGAAACTCAGTCACAGAGTCTCTA
CAACACATCTAGCCTCGGATTTCAGTACTAAAAAAATATTCGTTGAAGCTATGAAATTGA
CATCATCAGGATCAGATTGAGAACCATATTCCACTTTATATGGTGATAAATGTGACAACT
ACGTGTTCATGGAATATTTTTCAGCTTTAGCATTATCTTTTGATCCTTGTTTTCTGATAT
TTAAACCAGAAGAACTGGAGACAGCAATTTAGTGGTCTTGTCACCATCAATCTTTGTATA
AATCTTGGTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP88TF U 1
AF RR2FW40TF U 36
AF RR2FW40JQ C 569
BS 1 665 RR2EP88TF
BS 666 666 RR2FW40TF
BS 667 712 RR2EP88TF
BS 713 751 RR2FW40TF
BS 752 1393 RR2FW40JQ

RD RR2EP88TF 712 0 0
GGATAGCAAATCATCTTTTGCTTTAAGCAACACGCTCACACACACAAAAATCAGAGCGTT
TCTCCCCGTCCTCTATTCTATCTGTACTTCTGGTCTCACTTTAAAGATCAAATACGTAAA
TATAAGTTGAGAGATTTTTGCAGTGAAAGATATGTTGGAAAGTCTTGTCTCTCTCGAAAG
CATGTCCTTGAGCTCCATGGATGTGTCTGTACTTGAAAGGCTTAAATGGCTGCAACAGCA
ACAACAACAACAACAAGTTCTGAGCAGTACTAATGCTTCACCTGAACTTCTTCAGTTCCA
TGGAACCAACAATGATGAGTTGTTGCAGAATACCTTCAGCCATTTTCAAATGCTTAGATC
TGGTTTTGGACCAAACTATAGCATGGGTTTTGGTCCTTCACATGAACCTATGGATGGCTG
CATTTCAAGAACAAATAGCTGCCAGATGGATCAAGCGGATACAGTGGGGGTAATGTTGAA
GAACAGTGAAGAAAACATTGCTTTTTCCTTGAAAAGCAAGAGAAAATCAGAGGTTAAGAC
AAGGGCAGAGGAAAAGACAGAGAAGAAGATCAAAGTAGAGGCTGAGACAGAGTCAAAGAT
GAAAGTAAAATCAAACTTGAGTAACACAGAAGCATCTTCAGAAACTTCAAAGCAGACATC
AAAGG*AGCTTCCGAGATCCAGAAATTGGATTATATACACGTGAGAGCTCGT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2FW40TF 718 0 0
GG
ACACACACAAAAATCAGAGCGTTTCTCCCCGTCCTCTATTCTATCTGTACTTCTGGTCTC
ACTTTAAAGATCAAATACGTAAATATAAGTTGAGAGATTTTTGCAGTGAAAGATATGTTG
GAAAGTCTTGTCTCTCTCGAAAGCATGTCCTTGAGCTCCATGGATGTGTCTGTACTTGAA
AGGCTTAAATGGCTGCAACAGCAACAACAACAACAACAAGTTCTGAGCAGTACTAATGCT
TCACCTGAACTTCTTCAGTTCCATGGAACCAACAATGATGAGTTGTTGCAGAATACCTTC
AGCCATTTTCAAATGCTTAGATCTGGTTTTGGACCAAACTATAGCATGGGTTTTGGTCCT
TCACATGAACCTATGGATGGCTGCATTTCAAGAACAAATAGCTGCCAGATGGATCAAGCG
GATACAGTGGGGGTAATGTTGAAGAACAGTGAAGAAAACATTGCTTTTTCCTTGAAAAGC
AAGAGAAAATCAGAGGTTAAGACAAGGGCAGAGGAAAAGACAGAGAAGAAGATCAAAGTA
GAGGCTGAGACAGAGTCAAAGATGAAAGTAAAATCAAACTTGAGTAACACAGAAGCATCT
TCAGAAACTTCAAAGCAGACATCAAAGGGAGCTTCCGAGATCCAGAAATTGGATTATATA
CACGTGAGAGCTCGTCGAGGCCAAGCTACAGACAGACACAGTTTAGCAGAAAGG
CA

QA 3 716 3 716
DS 

RD RR2FW40JQ 825 0 0
ATCAAAGTAGAGGCTGAGACAGAGTCAAAGATGAAAGTAAAATCAAACTTGAGTAACACA
GAAGCATCTTCAGAAACTTCAAAGCAGACATCAAAGGGAGCTTCCGAGATCCAGAAATTG
GATTATATACACGTGAGAGCTCGTCGAGGCCAAGCTACAGACAGACACAGTTTAGCAGAA
AGGGCAAGAAGAGAAAAGATCAGCAAGAAGATGAAGTATCTGCAAGATCTTGTCCCTGGA
TGCAACAAAGTTACTGGAAGAGCTGGTATGCTTGATGAGATCATTAATTATGTTCAATCT
CTCCAGAGACAAGTTGAGTTCTTGTCGATGAAACTGGCTGTCCTAAACCCAGAACTCGAG
CTTGCTATGGAGGACTTATCTGTAAAACAGTTTCAGGCTTACTTTACAAATCTTCCTGTA
TTAGTTGCTTCAAAGCCATCACTAATGGTTGATGCGCCATTGTTTCCGCTGGACCAGCAA
GGATCTCTAGATTTATCAGTGATAAACCCAAACCAAGCAACATCTATTGAAGCTCCATCT
GCAAGCTGGGAAACTCAGTCACAGAGTCTCTACAACACATCTAGCCTCGGATTTCAGTAC
TAAAAAAATATTCGTTGAAGCTATGAAATTGACATCATCAGGATCAGATTGAGAACCATA
TTCCACTTTATATGGTGATAAATGTGACAACTACGTGTTCATGGAATATTTTTCAGCTTT
AGCATTATCTTTTGATCCTTGTTTTCTGATATTTAAACCAGAAGAACTGGAGACAGCAAT
TTAGTGGTCTTGTCACCATCAATCTTTGTATAAATCTTGGTTTAT

QA 1 825 1 825
DS 



CO CL1416Contig2 883 2 2 U
GCTTCAAAGGAGACATCAAAGGGAGCTTCAGAGATCCAGAAATTGGATTATATCCACGTG
AGAGCTCGTCGAGGACAAGCCACAGACAGACACAGTTTAGCAGAAAGGGCAAGAAGAGAA
AAGATCAGCAAGAAGATGAAATATTTGCAAGATCTTGTCCCTGGATGCAACACAATCACT
GGAAAAGCTGGTGTGCTTGATGAGATTATCAATTATGTTCAATCTCTCCAGAGACAAGTT
GAGTTCTTGTCGATGAAACTTGCAGTCCTAAACCCAGAACTCGAGCTTGCTGTGGAAGAT
TTATCTGTAAATCAGTTTCAGGCTTACCTTACAAATTTTCCAGTAGTAATTGCTTCAAAA
CCATCAGTAATGGTTGATTTACCATTGTTTCCACTAGATCAGCAAGGATCTCTAGATCTA
TCAGTGATAAATCCGAACCAAACATCTATTGACGCTCCATCTGCAAGCTGGGAAACTCAG
TCACATAGTCTCTTTGCTTCAGTACTAAGATAAGATCTATTGAAGCAACCAAGTTGACAT
CATCAAAATCAGAACGTTTCCACTGTATATGCTGATCAAAGTGACAATTTCGCCGAGAAC
AAAAATTCAGCTTCTGCATTATCCTTTGATCCTTTTCTGATATTTAAACCAGAAGAACTT
GAGATATCAATTTAATGATCATGCATCCATCACTCTTTGTATATAGATTATATTCTGTTT
TAATTTGTAAGATAAGATAAAGAGAGAAAGAGGGTAAATAAATACTAGGTTTTAAAGTTT
TTATAGATGTGTGATATGTCATGTGTAGAAGAAGAAAAAGAAAAGTCTTGTGATGCTACA
ATTCCTTGTTGGATATATTAATACGGAAGCAAGTTATTGAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG44TF U 1
AF RR2GG44JQB C 53
BS 1 650 RR2GG44TF
BS 651 883 RR2GG44JQB

RD RR2GG44TF 650 0 0
GCTTCAAAGGAGACATCAAAGGGAGCTTCAGAGATCCAGAAATTGGATTATATCCACGTG
AGAGCTCGTCGAGGACAAGCCACAGACAGACACAGTTTAGCAGAAAGGGCAAGAAGAGAA
AAGATCAGCAAGAAGATGAAATATTTGCAAGATCTTGTCCCTGGATGCAACACAATCACT
GGAAAAGCTGGTGTGCTTGATGAGATTATCAATTATGTTCAATCTCTCCAGAGACAAGTT
GAGTTCTTGTCGATGAAACTTGCAGTCCTAAACCCAGAACTCGAGCTTGCTGTGGAAGAT
TTATCTGTAAATCAGTTTCAGGCTTACCTTACAAATTTTCCAGTAGTAATTGCTTCAAAA
CCATCAGTAATGGTTGATTTACCATTGTTTCCACTAGATCAGCAAGGATCTCTAGATCTA
TCAGTGATAAATCCGAACCAAACATCTATTGACGCTCCATCTGCAAGCTGGGAAACTCAG
TCACATAGTCTCTTTGCTTCAGTACTAAGATAAGATCTATTGAAGCAACCAAGTTGACAT
CATCAAAATCAGAACGTTTCCACTGTATATGCTGATCAAAGTGACAATTTCGCCGAGAAC
AAAAATTCAGCTTCTGCATTATCCTTTGATCCTTTTCTGATATTTAAACC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2GG44JQB 831 0 0
TC
CACGTGAGAGCTCGTCGAGGACAAGCCACAGACAGACACAGTTTAGCAGAAAGG*CAAGA
AGAGAAAAGATCAGCAAGAAGATGAAATATTTGCAAGATCTTGTCCCTGGATGCAACACA
ATCACTGGAAAAGCTGGTGTGCTTGATGAGATTATCAATTATGTTCAATCTCTCCAGAGA
CAAGTTGAGTTCTTGTCGATGAAACTTGCAGTCCTAAACCCAGAACTCGAGCTTGCTGTG
GAAGATTTATCTGTAAATCAGTTTCAGGCTTACCTTACAAATTTTCCAGTAGTAATTGCT
TCAAAACCATCAGTAATGGTTGATTTACCATTGTTTCCACTAGATCAGCAAGGATCTCTA
GATCTATCAGTGATAAATCCGAACCAAACATCTATTGACGCTCCATCTGCAAGCTGGGAA
ACTCAGTCACATAGTCTCTTTGCTTCAGTACTAAGATAAGATCTATTGAAGCAACCAAGT
TGACATCATCAAAATCAGAACGTTTCCACTGTATATGCTGATCAAAGTGACAATTTCGCC
GAGAACAAAAATTCAGCTTCTGCATTATCCTTTGATCCTTTTCTGATATTTAAACCAGAA
GAACTTGAGATATCAATTTAATGATCATGCATCCATCACTCTTTGTATATAGATTATATT
CTGTTTTAATTTGTAAGATAAGATAAAGAGAGAAAGAGGGTAAATAAATACTAGGTTTTA
AAGTTTTTATAGATGTGTGATATGTCATGTGTAGAAGAAGAAAAAGAAAAGTCTTGTGAT
GCTACAATTCCTTGTTGGATATATTAATACGGAAGCAAGTTATTGAACT

QA 3 831 3 831
DS 



AS 1 6

CO CL1417Contig1 1339 6 11 U
GGATTCATCATTTTGTTTCTGTCTCTTCGAAGACCGTAGCTTTTGTTTTCTACTGCCGGA
AACGATGCCAGTCGACGAATCTTTAACGCCAGGGAAAACAGTCTGTGTCACTGGAGCTGG
TGGATACATCGCTTCTTGGATCGTTAAGTTACTACTTGAGAGAGGCTACACGGTCAAAGG
AACCGTACGGAATCCAGATGATCCAAAGAATACACATTTGAGAGAACTAGAGGGTGCCAA
GGAGAGACTGATTCTGTGCAAAGCAGATCTCCAGGACTATGATGCTCTTAAGGAGGCTAT
CGATGGTTGCGATGGCGTCTTTCACACGGCTTCTCCGGTCACTGACGATCCCGAACAAAT
GGTGGAGCCGGCAGTGAACGGAGCCAAGTTCGTAATTAATGCTGCAGCTGAAACCAAGGT
GAAGCGCGTGGTAATCACCTCCTCAATTGGTACGGTCTACATGGACCCGAAGCGTGACCC
TGAAGCCGTTGTTGACGAAAGTTGTTGGAGTGATCTTGAGTTCTGCAAAAACACTAAGAA
TTGGTATTGTTACGGCAAGATGGTGGCGGAGCAAGCCGCGTGGGAGACGGCAGAGGAGAA
AGGTGTTGACCTGGTGGTTTTGAATCCGGTGCTGGTTCTTGGTCCGCCGTTACAGCCGAC
GATCAACGCCAGTCTCTTCCACGTACTAAAGTATCTAACCGGCTCGGCTAAGACTTACGC
TAATTTGACTCAGGCTTATGTGGATGTTCGTGATGTCGCACTAGCTCATGTTCTTGTCTA
CGAGGCACCCTCAGCCTCTGGACGTTATCTCCTTGCGGAAAGCGCACTTCACCGGGGCGA
AGTTGTTGAGATTTTGGCTAAGTTATTCCCGGAGTACCCACTTCCAACCAAGTGCAAGGA
CGAGAAGAACCCAAGAGCCAAGCCGTACAAGTTCACTAACCAAAAGATAAAGGACTTAGG
CTTAGCGTTCACGTCCACCAAGCAAAGCCTTTACGACACTGTCAAGAGCTTGCAAGAGAA
AGGTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCGACATCACAAGAATCAAGCCAAAACGG
CATCAAGATCGAGCCTTGAATAACTTATTCCCTGATGTATTATCCTTAGCCATTGGCGTT
TCCTTTGATTTAGAAAAATAAACCAGATGTTTAGTTATCGTCTCTGGTTATGTGAAACCT
TTGTGTCAAAATGGTTTGCTCGGTTATGAATCTGTTTATTCAGATCTTTAGCCAAATCAT
TTGATAGATTTTGTTCTGTATAAACTACAAAGGCTTAAATGCTTCATGTTTATTATATTT
ACTTCTTAATGCTAAGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA28TF U 1
AF RR2B738TF U 50
AF RR2BA11TF U 489
AF RR2FA28JQ C 887
AF RR2BA11JQ C 513
AF RR2B738JQ C 677
BS 1 351 RR2FA28TF
BS 352 352 RR2B738TF
BS 353 451 RR2FA28TF
BS 452 452 RR2B738TF
BS 453 694 RR2FA28TF
BS 695 731 RR2B738TF
BS 732 990 RR2BA11TF
BS 991 991 RR2BA11JQ
BS 992 1153 RR2BA11TF
BS 1154 1256 RR2BA11JQ
BS 1257 1339 RR2B738JQ

RD RR2FA28TF 694 0 0
GGATTCATCATTTTGTTTCTGTCTCTTCGAAGACCGTAGCTTTTGTTTTCTACTGCCGGA
AACGATGCCAGTCGACGAATCTTTAACGCCAGGGAAAACAGTCTGTGTCACTGGAGCTGG
TGGATACATCGCTTCTTGGATCGTTAAGTTACTACTTGAGAGAGGCTACACGGTCAAAGG
AACCGTACGGAATCCAGATGATCCAAAGAATACACATTTGAGAGAACTAGAGGGTGCCAA
GGAGAGACTGATTCTGTGCAAAGCAGATCTCCAGGACTATGATGCTCTTAAGGAGGCTAT
CGATGGTTGCGATGGCGTCTTTCACACGGCTTCTCCGGTCACTGACGATCCGGAACAAAT
GGTGGAGCCGGCAGTGAACGGAGCCAAGTTCGTAATTAATGCTGCAGCTGAAACCAAGGT
GAAGCGCGTGGTAATCACCTCCTCAATTGGTGCGGTCTACATGGACCCGAAGCGTGACCC
TGAAGCCGTTGTTGACGAAAGTTGTTGGAGTGATCTTGAGTTCTGCAAAAACACTAAGAA
TTGGTATTGTTACGGCAAGATGGTGGCGGAGCAAGCCGCGTGGGAGACGGCAGAGGAGAA
AGGTGTTGACCTGGTGGTTTTGAATCCGGTGCTGGTTCTTGGTCCGCCGTTACAGCCGAC
GATCAACGCCAGTCTCTTCCACGTACTAAAGTAT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2B738TF 682 0 0
GG
ACTGCCGGAAACGATGCCAGTCGACGAATCTTTAACGCCAGGGAAAACAGTCTGTGTCAC
TGGAGCTGGTGGATACATCGCTTCTTGGATTGTTAAGTTACTACTTGAGAGAGGCTACAC
GGTCAAAGGAACCGTACGGAATCCAGATGATCCAAAGAATACACATTTGAGAGAACTAGA
GGGTGCCAAGGAGAGACTGATTCTGTGCAAAGCAGATCTCCAGGACTATGATGCTCTTAA
GGAGGCTATCGATGGTTGCGATGGCGTCTTTCACACGGCTTCTCCGGTCACTGACGATCC
CGAACAAATGGTGGAGCCGGCAGTGAACGGAGCCAAGTTCGTAATTAATGCTGCAGCTGA
AACCAAGGTGAAGCGCGTGGTAATCACCTCCTCAATTGGTACGGTCTACATGGACCCGAA
GCGTGACCCTGAAGCCGTTGTTGATGAAAGTTGTTGGAGTGATCTTGAGTTCTGCAAAAA
CACTAAGAATTGGTATTGTTACGGCAAGATGGTGGCGGAGCAAGCCGCGTGGGAGACGGC
AGAGGAGAAAGGTGTTGACCTGGTGGTTTTGAATCCGGTGCTGGTTCTTGGTCCGCCGTT
ACAGCCGACGATCAACGCCAGTCTCTTCCACGTACTAAAGTATCTAACCGGCTCGGCTAA
GACTTACGCTAATTTGACTC

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR2BA11TF 665 0 0
GG
GTTGACGAAAGTTGTTGGAGTGATCTTGAGTTCTGCAAAAACACTAAGAATTGGTATTGT
TACGGCAAGATGGTGGCGGAGCAAGCCGCGTGGGAGACGGCAGAGGAGAAAGGTGTTGAC
CTGGTGGTTTTGAATCCGGTGCTGGTTCTTGGTCCGCCGTTACAGCCGACGATCAACGCC
AGTCTCTTCCACGTACTAAAGTATCTAACCGGCTCGGCTAAGACTTACGCTAATTTGACT
CAGGCTTATGTGGATGTTCGTGATGTCGCACTAGCTCATGTTCTTGTCTACGAGGCACCC
TCAGCCTCTGGACGTTATCTCCTTGCGGAAAGCGCACTTCACCGGGGCGAAGTTGTTGAG
ATTTTGGCTAAGTTATTCCCGGAGTACCCACTTCCAACCAAGTGCAAGGACGAGAAGAAC
CCAAGAGCCAAGCCGTACAAGTTCACTAACCAAAAGATAAAGGACTTAGGCTTAGCGTTC
ACGTCCACCAAGCAAAGCCTCTACGACACTGTCAAGAGCTTGCAAGAGAAAGGTCATCTT
CCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCGACATCACAAGAATCAAGCCAAAACGGCATCAAGATC
GAGCCTTGAATAACTTATTCCCTGATGTATTATCCTTAGCCATTGGCGTTTCCTTTGATT
TAG

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR2FA28JQ 272 0 0
ACCAAGTGCAAGGACGAGAAGAACCCAAGAGCCAAGCCGTACAAGTTCACTAACCAAAAG
ATAAAGGACTTAGGCTTAGCGTTCACGTCCACCAAGCAAAGCCTTTACGACACTGTCAAG
AGCTTGCAAGAGAAAGGTCATTTTCCTCCTCCTCCTCCTCCT***TGGACATCACAAGAA
TCAAGCCAAAACGGCATCAAGATCGAGCCTTGAATAACTTATTCCCTGATGTATTATCCT
TAGCCATTGGCGTTTCCTTTGATTTAG
AAAAA

QA 1 267 1 267
DS 

RD RR2BA11JQ 746 0 0
ATCTTGAGTTCTGCAAAAACACTAAGAATTGGTATTGTTACGGCAAGATGGTGGCGGAGC
AAGCCGCGTGGGAGACGGCAGAGGAGAAAGGTGTTGACCTGGTGGTTTTGAATCCGGTGC
TGGTTCTTGGTCCGCCGTTACAGCCGACGATCAACGCCAGTCTCTTCCACGTACTAAAGT
ATCTAACCGGCTCGGCTAAGACTTACGCTAATTTGACTCAGGCTTATGTGGATGTTCGTG
ATGTCGCACTAGCTCATGTTCTTGTCTACGAGGCACCCTCAGCCTCTGGACGTTATCTCC
TTGCGGAAAGCGCACTTCACCGGGGCGAAGTTGTTGAGATTTTGGCTAAGTTATTCCCGG
AGTACCCACTTCCAACCAAGTGCAAGGACGAGAAGAACCCAAGAGCCAAGCCGTACAAGT
TCACTAACCAAAAGATAAAGGACTTAGGCTTAGCGTTCACGTCCACCAAGCAAAGCCTTT
ACGACACTGTCAAGAGCTTGCAAGAGAAAGGTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTT
CGACATCACAAGAATCAAGCCAAAACGGCATCAAGATCGAGCCTTGAATAACTTATTCCC
TGATGTATTATCCTTAGCCATTGGCGTTTCCTTTGATTTAGAAAAATAAACCAGATGTTT
AGTTATCGTCTCTGGTTATGTGAAACCTTTGTGTCAAAATGGTTTGCTCGGTTATGAATC
TGTTTATTCAGATCTTTAGCCAAA
CC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2B738JQ 663 0 0
TTCCACGTACTAAAGTATCTAACCGGCTCGGCTAAGACTTACGCTAATTTGACTCAGGCT
TATGTGGATGTTCGTGATGTCGCACTAGCTCATGTTCTTGTTTACGAGGCACCCTCAGCC
TCTGGACGTTATCTCCTTGCGGAAAGCGCACTTCACCGGGGGGAAGTTGTTGAGATTTTG
GCTAAGTTATTCCCGGAGTACCCACTTCCAACCAAGTGCAAGGACGAGAAGAACCCAAGA
GCCAAGCCGTACAAGTTCACTAACCAAAAGATAAAGGACTTAGGCTTAGCGTTCACGTCC
ACCAAGCAAAGCCTTTACGACACTGTCAAGAGCTTGCAAGAGAAAGGTCATTTTCCTCCT
CCTCCTCCTCCTCCTTCGACATCACAAGAATCAAGCCAAAACGGCATCAAGATCGAGCCT
TGAATAACTTATTCCCTGATGTATTATCCTTAGCCATTGGCGTTTCCTTTGATTTAGAAA
AATAAACCAGATGTTTAGTTATCGTCTCTGGTTATGTGAAACCTTTGTGTCAAAATGTTT
TGCTCGGTTATGAATCTGTTTATTCAGATCTTTAGCCAAATCATTTGATAGATTTTGTTC
TGTATAAACTACAAAGGCTTAAATGCTTCATGTTTATTATATTTACTTCTTAATGCTAAG
AGT

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 5

CO CL1418Contig1 790 5 10 U
GGAAAGAAAGCAAAAACCAGACAAATAAATTTAAAAGAAAACTGATGATGAGGGGTCTTC
ATTTCAATCTCTTCCTGGTCACCATGACGGTTGTTGCATCCATCTCCGCGGCTACACCAG
CAGCTCCTGCGGCAGGGGGAGCTTTGGCAGACGAGTGCAGCCAAGATTTTCAAAAGGTGA
CATTATGTTTGGATTTCGCGACCGGGAAGGCACCAAATCCGTCCAAAAAGTGTTGTGACG
CTATCGAAGATACAAAAGAGAGGGATCCAAAGTGTTTGTGTTACGTGATACAGCAAGCGA
AGACAGGAGGACAAGCTTTGAAGGATCTTGGTGTCCAAGAAGATAAACTTATTCAGCTTC
CAACTTCTTGTCAGCTCCACAACGCTAGCATCTCCGACTGTCCAAAGCTTCTCGGGATTT
CACCGAGCTCACCAGACGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCCACATCAACAACAACACCAG
CGGCTCCAGTAGGGAAGTCTCCTGCAACTCCAACGACGTCTACGGGTACAGGAGGATCAC
CTTCCATAAGAGATGGTCACGCCACCGTGGCTCTAGCTCTCGCTTTGATGACCTTCTCCT
TTGTCTCGATCTTGCCTAGGATGGCTTTGGCCTAGATGGTAGGCACGTAACATTAGGGAT
GTAACCTTTCTTTGTTATGTGGTGCTTTTGTTTCAAAAATTTCAAGACTATCGTTTCAAC
TGTGTTTCTTGGTTCGGACCATTTGTTGTAATGAGGGAACATTCCACTTAATCGAATCCC
TTTCCGCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2GC94TF U 6
AF RR2EX08JQ C 194
AF RR2BB20JQ C 1
AF RR2BB20TF U 1
AF RR2EX08TF U 85
BS 1 7 RR2BB20JQ
BS 8 86 RR2GC94TF
BS 87 87 RR2BB20TF
BS 88 358 RR2GC94TF
BS 359 360 RR2BB20TF
BS 361 698 RR2GC94TF
BS 699 699 RR2BB20TF
BS 700 718 RR2GC94TF
BS 719 787 RR2BB20TF
BS 788 790 RR2EX08TF

RD RR2GC94TF 719 0 0
GG
AAGCAAAAACCAGACAAATAAATTTAAAAGAAAACTGATGATGAGGGGTCTTCATTTCAA
TCTCTTCCTGGTCACCATGTCGGTTGTTGCATCCATCTCCGCGGCTACACCAGCAGCTCC
TGCGGCAGGGGGAGCTTTGGCAGACGAGTGCAGCCAAGATTTTCAAAAGGTGACATTATG
TTTGGATTTCGCGACCGGGAAGGCACCAAATCCGTCCAAAAAGTGTTGTGACGCTATCGA
AGATACAAAAGAGAGGGATCCAAAGTGTTTGTGTTACGTGATACAGCAAGCGAAGACAGG
AGGACAAGCTTTGAAGGATCTTGGTGTCCAAGAAGATAAACTTATTCAGCTCTCAACTTC
TTGTCAGCTCCACAACGCTAGCATCTCCGACTGTCCAAAGCTTCTCGGGATTTCACCGAG
CTCACCAGACGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCCACATCAACAACAACACCAGCGGCTCC
AGTAGGGAAGTCTCCTGCAACTCCAACGACGTCTACGGGTACAGGAGGATCACCTTCCAT
AAGAGATGGTCACGCCACCGTGGCTCTAGCTCTCGCTTTGATGACCTTCTCCTTTGTCTC
GATCTTGCCTAGGATGGCTTTGGCCTAGATGGTAGGCACGTAACATTAGGGATGTAACCT
TTCTTTGTTATGTGGTGCTTTTGTTTCAAAA*TTTCAAGACTATCGTTTCA
CTGTGT

QA 3 713 3 713
DS 

RD RR2EX08JQ 558 0 0
TTTCGCGACCGGGAAGGCACCAAATCCGTCCAAAAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGATAC
AAAAGAGAGGGATCCAAAGTGTTTGTGTTACGTGATACAGCAAGCGAAGACAGGAGGACA
AGCTTTGAAGGATCTTGGTGTCCAAGAAGATAAACTTATTCAGCTTCCAACTTCTTGTCA
GCTCCACAACGCTAGCATCTCCGACTGTCCAAAGCTTCTCGGGATTTCACCGAGCTCACC
AGACGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCCACATCAACAACAACACCAGCGGCTCCAGTAGG
GAAGTCTCCTGCAACTCCAACGACGTCTACGGGTACAGGAGGATCACCTTCCATAAGAGA
TGGTCACGCCACCGTGGCTCTAGCTCTCGCTTTGATGACCTTCTCCTTTGTCTCGATCTT
GCCTAGGATGGCTTTGGCCTAGATGGTAGGCACGTAACATTAGGGATGTAACCTTTCTTT
GTTATGTGGTGCTTTTGTTTCAAAAATTTCAAGACTATCGTTTCAACTGTGTTTCTTGGT
TCGGACCATTTGTTGTAA

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2BB20JQ 787 0 0
GGAAAGAAAGCAAAAACCAGACAAATAAATTTAAAAGAAAACTGATGATGAGGGGTCTTC
ATTTCAATCTCTTCCTGGTCACCATGACGGTTGTTGCATCCATCTCCGCGGCTACACCAG
CAGCTCCTGCGGCAGGGGGAGCTTTGGCAGACGAGTGCAGCCAAGATTTTCAAAAGGTGA
CATTATGTTTGGATTTCGCGACCGGGAAGGCACCAAATCCGTCCAAAAAGTGTTGTGACG
CTATCGAAGATACAAAAGAGAGGGATCCAAAGTGTTTGTGTTACGTGATACAGCAAGCGA
AGACAGGAGGACAAGCTTTGAAGGATCTTGGTGTCCAAGAAGATAAACTTATTCAGCTTC
CAACTTCTTGTCAGCTCCACAACGCTAGCATCTCCGACTGTCCAAAGCTTCTCGGGATTT
CACCGAGCTCACCAGACGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCCACATCAACAACAACACCAG
CGGCTCCAGTAGGGAAGTCTCCTGCAACTCCAACGACGTCTACGGGTACAAGAGGATCAC
CTTCCATAAGAGATGGTCACGCCACCGTGGCTCTAGCTCTCGCTTTGATGACCTTCTCCT
TTGTCTCGATCTTGCCTAGGATGGCTTTGGCCTAGATGGTAGGCACGTAACATTAGGGAT
GTAACCTTTCTTTGTTATGTGGTGCTTTTGTTTCAAAAATTTCAAGACTATCGTTTCAAC
TGTGTTTCTTGGTTCGGACCATTTGTTGTAATGAGGGAACATTCCACTTAATCGAATCCC
TTTCCGC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2BB20TF 787 0 0
GGAAAGA
AAGCAAAAACCAGACAAATAAATTTAAAAGAAAACTGATGATGAGGGGTCTTCATTTCAA
TCTCTTCCTGGTCACCATGACGGTTGTTGCATCCATCTCCGCGGCTACACCAGCAGCTCC
TGCGGCAGGGGGAGCTTTGGCAGACGAGTGCAGCCAAGATTTTCAAAAGGTGACATTATG
TTTGGATTTCGCGACCGGGAAGGCACCAAATCCGTCCAAAAAGTGTTGTGACGCTATCGA
AGATACAAAAGAGAGGGATCCAAAGTGTTTGTGTTACGTGATACAGCAAGCGAAGACAGG
AGGACAAGCTTTGAAGGATCTTGGTGTCCAAGAAGATAAACTTATTCAGCTTCCAACTTC
TTGTCAGCTCCACAACGCTAGCATCTCCGACTGTCCAAAGCTTCTCGGGATTTCACCGAG
CTCACCAGACGCAGCCGTATTCACAAGCAATGCCACATCAACAACAACACCAGCGGCTCC
AGTAGGGAAGTCTCCTGCAACTCCAACGACGTCTACGGGTACAAGAGGATCACCTTCCAT
AAGAGATGGTCACGCCACCGTGGCTCTAGCTCTCGCTTTGATGACCTTCTCCTTTGTCTC
GATCTTGCCTAGGATGGCTTTGGCCTAGATGGTAGGCACGTAACATTAGGGATGTAACCT
TTCTTTGTTATGTGGTGCTTTTGTTTCAAAAATTTCAAGACTATCGTTTCAACTGTGTTT
CTTGGTTCGGACCATTTGTTGTAATGAGGGAACATTCCACTTAATCGAATCCCTTTCCGC

QA 8 787 8 787
DS 

RD RR2EX08TF 706 0 0
GGA
CGGTTGTTGCATCCATCTCCGCGGCTACACCAGCAGCTCCTGCGGCAGGGGGAGCTTTGG
CAGACGAGTGTAGCCAAGATTTTCAAAAGGTGACATTATGTTTGGATTTCGCGACCGGGA
AGGCACCAAATCCGTCCAAAAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGATACAAAAGAGAGGGATC
CAAAGTGTTTGTGTTACGTGATACAGCAAGCGAAGACAGGAGGACAAGCTTTGAAGGATC
TTGGTGTCCAAGAAGATAAACTTATTCAGCTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCACAACGCTA
GCATCTCCGACTGTCCAAAGCTTCTCGGGATTTCACCGAGCTCACCAGACGCAGCCGTAT
TCACAAGCAATGCCACATCAACAACAACACCAGCGGCTCCAGTAGGGAAGTCTCCTGCAA
CTCCAACGACGTCTACGGGTACAGGAGGATCACCTTCCATAAGAGATGGTCACGCCACCG
TGGCTCTAGCTCTCGCTTTGATGACCTTCTCCTTTGTCTCGATCTTGCCTAGGATGGCTT
TGGCCTAGATGGTAGGCACGTAACATTAGGGATGTAACCTTTCTTTGTTATGTGGTGCTT
TTGTTTCAAAAATTTCAAGACTATCGTTTCAACTGTGTTTCTTGGTTCGGACCATTTGTT
GTAATGAGGGAACATTCCACTTAATCGAATCTCTTTCCGCACT

QA 4 706 4 706
DS 



AS 2 5

CO CL1419Contig1 722 3 2 U
CGTGTTGTCAAAGAGTTGAACTATGAAAATAGATGGCGAGTGCCTGATCGAATTGATCAG
GTCATGTAGGAACAAGGTTCAAGTCTACCGGTCTGTTAGGATGCCTCAGCTGCATACATC
ACTGCACTTCCACTTGACACCTATCGTAATGATAAACGGCTCGTCTCGCCGTGACCTTCT
CTTGAATTCTCAAAACTTCTGTCACTCCATCCCCGCAGGGGCGGAGAACCCGTTGCTGTC
TCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTG
GGCTTACTACTTAGATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTA
CCGTGGGCACGATAACTGGTACACCAGAGGTGCGTCCTTCCCGGTCCTCTCGTACTAGGG
AAAGGTCCTCTCAATGCTCTAACGCCCACACCGGATATGGACCGAACTGTCTCACGACGT
TCTGAACCCAGCTCACGTACCGCTTTAATGGGCGAACAGCCCAACCCTTGGAACATACTA
CAGCCCCAGGTGGCGAAGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACCTTCCCGTCGATGTGAGCTC
TTGGGGAAGATCAGCCTGTTATCCCTAGAGTAACTTTTATCCGTTGAGCGACGGCCCTTC
CACTCGGCAGTCAAGCTCCCTTCTGCCTTTGCACTCGAGGGCCAATCTCCGTCCGGCCCG
AG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2C334TF C 1
AF RR2C334JQ U 1
AF RR2DP20JQ U 1
BS 1 668 RR2C334JQ
BS 669 722 RR2DP20JQ

RD RR2C334TF 573 0 0
CGTGTTGTCAAAGAGTTGAACTATGAAAATAGATGGCGAGTGCCTGATCGAATTGATCAG
GTCATGTAGGAACAAGGTTCAAGTCTACCGGTCTGTTAGGATGCCTCAGCTGCATACATC
ACTGCACTTCCACTTGACACCTATCGTAATGATAAACGGCTCGTCTCGCCGTGACCTTCT
CTTGAATTCTCAAAACTTCTGTCACTCCATCCCCGCAGGGGCGGAGAACCCGTTGCTGTC
TCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTG
GGCTTACTACTTAGATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTA
CCGTGGGCACGATAACTGGTACACCAGAGGTGCGTCCTTCCCGGTCCTCTCGTACTAGGG
AAAGGTCCTCTCAATGCTCTAACGCCCACACCGGATATGGACCGAACTGTCTCACGACGT
TCTGAACCCAGCTCACGTACCGCTTTAATGGGCGAACAGCCCAACCCTTGGAACATACTA
CAGCCCCAGGTGGCGAAGAGCCGACATCGAGGT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2C334JQ 669 0 0
CGTGTTGTCAAAGAGTTGAACTATGAAAATAGATGGCGAGTGCCTGATCGAATTGATCAG
GTCATGTAGGAACAAGGTTCAAGTCTACCGGTCTGTTAGGATGCCTCAGCTGCATACATC
ACTGCACTTCCACTTGACACCTATCGTAATGATAAACGGCTCGTCTCGCCGTGACCTTCT
CTTGAATTCTCAAAACTTCTGTCACTCCATCCCCGCAGGGGCGGAGAACCCGTTGCTGTC
TCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTG
GGCTTACTACTTAGATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTA
CCGTGGGCACGATAACTGGTACACCAGAGGTGCGTCCTTCCCGGTCCTCTCGTACTAGGG
AAAGGTCCTCTCAATGCTCTAACGCCCACACCGGATATGGACCGAACTGTCTCACGACGT
TCTGAACCCAGCTCACGTACCGCTTTAATGGGCGAACAGCCCAACCCTTGGAACATACTA
CAGCCCCAGGTGGCGAAGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACCTTCCCGTCGATGTGAGCTC
TTGGGGAAGATCAGCCTGTTATCCCTAGAGTAACTTTTATCCGTTGAGCGACGGCCCTTC
CACTCGGC
C

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2DP20JQ 722 0 0
CGTGTTGTCAAAGAGTTGAACTATGAAAATAGATGGCGAGTGCCTGATCGAATTGATCAG
GTCATGTAGGAACAAGGTTCAAGTCTACCGGTCTGTTAGGATGCCTCAGCTGCATACATC
ACTGCACTTCCACTTGACACCTATCGTAATGATAAACGGCTCGTCTCGCCGTGACCTTCT
CTTGAATTCTCAAAACTTCTGTCACTCCATCCCCGCAGGGGCGGAGAACCCGTTGCTGTC
TCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTG
GGCTTACTACTTAGATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTA
CCGTGGGCACGATAACTGGTACACCAGAGGTGCGTCCTTCCCGGTCCTCTCGTACTAGGG
AAAGGTCCTCTCAATGCTCTAACGCCCACACCGGATATGGACCGAACTGTCTCACGACGT
TCTGAACCCAGCTCACGTACCGCTTTAATGGGCGAACAGCCCAACCCTTGGAACATACTA
CAGCCCCAGGTGGCGAAGAGCCGACATTGAGGTGCCAAACCTTCCCGTCGATGTGAGCTC
TTGGGGAAGATCAGCCTGTTATCCCTAGAGTAACTTTTATCCGTTGAGCGACGGCCCTTC
CACTCGGCAGTCAAGCTCCCTTCTGCCTTTGCACTCGAGGGCCAATCTCCGTCCGGCCCG
AG

QA 1 722 1 722
DS 



CO CL1419Contig2 1158 2 2 U
CCCCAACTATAGCCATTCATCACTCATTCCATAATTCATGTATAATAAACATAAGTCACA
AGCCAACGGAAAGAAGAAGAAACATACAACAAACATTGGAAACTGAAATTAGATATACGT
CTTGACTGAGCATTCCTCTTGAGCGACAAAAGCCGCATTAAAACACGTCAGGATGAAACC
GTCCCGGGATTGACCCGTTGTTCTGCTGCGCTTGTTTCAAATGAAGCGTGAGAGCATAGT
TATTCACCTCGAGAGTCCTCAGCTGCTCCTGGTACTGAGTGACCATCTGCCTCAGATGCT
GCAGCTCCTGGCTTTGATCTTCACTCTCTCTCTGCCGCTTCTGCTGCGTCACCACAGCTC
GTTTCAGCAAACTGTTCTCCTGGACGATAGCTTCTAACTGCTGCCTCAGCATCGAGTTCT
CCTGCTGGAGACTGCTGCTCTGCGCCGCGTCGGCACCACCAGCACGTGCCTTGATCGACT
TCTCCAAAGCTTCTAACGCTCTTGCGGCACGGTCTTTCGCGTCTTTCATGTCTGAAGCAC
TCATCATCTCCCTCACGAAGAGGTCAACCCACTCAGCGCCATCCATGTTCAAGACTTCCT
CCTTCCCTTGCTGCTGAGCCTGAGGAGCTTCAACTTTTGCTTCCTCCTGGATAGATGATT
CTGAGTTCTTATTGGTTGATTCTAAACGAAGCTGATTCAAACATCTAATCGCTGAATCAA
TATCATCTCCACATTCCTCAATTGCCCTCTCAAGAATCTGATGATCCATATCGGGGAAAA
TCGCGGCGAGGTGATTGAGGAGGAACGAGGAGGAGGAGGGAGGAGGTGGGGGGAAACGAG
GGGGAGAAGAGGAAGAAAAGCAACGGAGTTTCTGGGAGACGGGAGGCGAAGAAGAAGAAG
AAGGAGAAGCGGCGGACAAATCCTCGAACAGAGATCTCTTGCTACCGCAAACAATTGCAG
ACATGTTATCTGCTTCCACCACCTTCTTTCTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTAGCTTC
TTCCCTTTCAGATCTCAACCTTTCCTTTTTGTTTGGTTTTTTCATGTTGTCAAAGAGTTG
AACAATGGTTTTTTCGTGTTGTCAAAGAGTTGAACTATGAAAATAGATGGCGAGTGCCTG
ATCGGATTGATCAGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ39JQ U 1
AF RR2GN58TF C 365
BS 1 654 RR2GQ39JQ
BS 655 1158 RR2GN58TF

RD RR2GQ39JQ 654 0 0
CCCCAACTATAGCCATTCATCACTCATTCCATAATTCATGTATAATAAACATAAGTCACA
AGCCAACGGAAAGAAGAAGAAACATACAACAAACATTGGAAACTGAAATTAGATATACGT
CTTGACTGAGCATTCCTCTTGAGCGACAAAAGCCGCATTAAAACACGTCAGGATGAAACC
GTCCCGGGATTGACCCGTTGTTCTGCTGCGCTTGTTTCAAATGAAGCGTGAGAGCATAGT
TATTCACCTCGAGAGTCCTCAGCTGCTCCTGGTACTGAGTGACCATCTGCCTCAGATGCT
GCAGCTCCTGGCTTTGATCTTCACTCTCTCTCTGCCGCTTCTGCTGCGTCACCACAGCTC
GTTTCAGCAAACTGTTCTCCTGGACGATAGCTTCTAACTGCTGCCTCAGCATCGAGTTCT
CCTGCTGGAGACTGCTGCTCTGCGCCGCGTCGGCACCACCAGCACGTGCCTTGATCGACT
TCTCCAAAGCTTCTAACGCTCTTGCGGCACGGTCTTTCGCGTCTTTCATGTCTGAAGCAC
TCATCATCTCCCTCACGAAGAGGTCAACCCACTCAGCGCCATCCATGTTCAAGACTTCCT
CCTTCCCTTGCTGCTGAGCCTGAGGAGCTTCAACTTTTGCTTCCTCCTGGATAG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2GN58TF 794 0 0
TTCAGCAACTGTCTCCTG
GACGATAGCTTCTAACTGCTGC*TCAGCATCGAGT*CTC*TGCTGGAGACTGCTGCTCTG
CGCCGCGTCGGCACCACCAGCACGTGC*TTGATCGACTTCTCCAAAGCTTCTAACGCTCT
TGCGGCACGGTCTTTCGCGTCTTTCATGTCTGAAGCATTCATCATCTCCCTCACGAAGAG
GTCAACCCACTCAGCGCCATCCATGTTCAAGACTTCCTCCTTCCCTTGCTGCTGAGCCTG
AGGAGCTTCAACTTTTGCTTCCTCCTGGATAGATGATTCTGAGTTCTTATTGGTTGATTC
TAAACGAAGCTGATTCAAACATCTAATCGCTGAATCAATATCATCTCCACATTCCTCAAT
TGCCCTCTCAAGAATCTGATGATCCATATCGGGGAAAATCGCGGCGAGGTGATTGAGGAG
GAACGAGGAGGAGGAGGGAGGAGGTGGGGGGAAACGAGGGGGAGAAGAGGAAGAAAAGCA
ACGGAGTTTCTGGGAGACGGGAGGCGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGCGGCGGACAAATC
CTCGAACAGAGATCTCTTGCTACCGCAAACAATTGCAGACATGTTATCTGCTTCCACCAC
CTTCTTTCTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTAGCTTCTTCCCTTTCAGATCTCAACCTT
TCCTTTTTGTTTGGTTTTTTCATGTTGTCAAAGAGTTGAACAATGGTTTTTTCGTGTTGT
CAAAGAGTTGAACTATGAAAATAGATGGCGAGTGCCTGATCGGATTGATCAGGTCC

QA 19 794 19 794
DS 



AS 1 6

CO CL1420Contig1 709 6 3 U
TTTTTTTTATCAGCGCACATAAGCGAAAATTATGTGTCAATATTTCAAATAGAACAAACA
CAAGCAAGAAAAAAAGTTCTTTATTAAAAACATAAACTGCGACATTATTTTTGGTAGATT
ATACGCGCGAAGAAGACATTTCTTTCTAGTCATCCTTGACAATGGTGACAGGGCAAGGCG
CGTGGTCGATCACAAAGCTGCTCACGCTTCCCATTATTATTCTTTGAAGGGCACTGAGTC
CTCTGCTTCCCATGACAATAGAATCCAGTTTGAGTTCTTTAACAGCATCAACCAGCTTCT
CTCTTGCATCACCCCAGTATAGTTTTGTCACTACATGAACCTCTTTCTTCCTTGAACCAG
TGTCGAGCATGTCAAGACATGCTATGTCGATCTTGACACCGTAGTTCTCCATGATCTTCG
GTTCCCTAAATTCAGCCAACGGTATGAGAGGAGAACCGGATTCGAGCCAGAGGGCGTTGC
GAGATTCAGCTTCAGAGGTAGGTAACGTGTGGATGATGTAAAGTGTGTCTCCTTTGTCAG
CTAAGTTCTCGATGGCCCATTTGAGTGCGTTCTTGCTGCTCTCCGAGAAATCCATGGCGA
TTCCGATCTTCCTGTCTTTAGGCATCGTTCTTGGTTTTCTTGATCGAACTTGAAATGAGT
TTTGTTAAGATTTTTAGAGAGAGAGATGGTGAAGAGTTGTGAGAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR2GO81JQ U 142
AF RR2E120JQ U 24
AF RR2E120TF C 1
AF RR2AX45TFB C 19
AF RR2A187TF C 23
AF RR2A187JQ U 39
BS 1 23 RR2E120TF
BS 24 607 RR2E120JQ
BS 608 709 RR2A187JQ

RD RR2GO81JQ 120 0 0
CTTTCTAGTCATCCTTGACAATGGTGACAGGGCAAGGCGCGTGGTCCATCACCAAGCTGC
TCACGCTTCCCATTATTATTCTTTGAAGGGCACTGAGTCCTCTGCTTCCCATGACAATAG

QA 1 120 1 120
DS 

RD RR2E120JQ 584 0 0
CGAAAATTATGTGTCAATATTTCAAATAGAACAAACACAAGCAAGAAAAAAAGTTCTTTA
TTAAAAACATAAACTGCGACATTATTTTTGGTAGATTATACGCGCGAAGAAGACATTTCT
TTCTAGTCATCCTTGACAATGGTGACAGGGCAAGGCGCGTGGTCGATCACAAAGCTGCTC
ACGCTTCCCATTATTATTCTTTGAAGGGCACTGAGTCCTCTGCTTCCCATGACAATAGAA
TCCAGTTTGAGTTCTTTAACAGCATCAACCAGCTTCTCTCTTGCATCACCCCAGTATAGT
TTTGTCACTACATGAACCTCTTTCTTCCTTGAACCAGTGTCGAGCATGTCAAGACATGCT
ATGTCGATCTTGACACCGTAGTTCTCCATGATCTTCGGTTCCCTAAATTCAGCCAACGGT
ATGAGAGGAGAACCGGATTCGAGCCAGAGGGCGTTGCGAGATTCAGCTTCAGAGGTAGGT
AACGTGTGGATGATGTAAAGTGTGTCTCCTTTGTCAGCTAAGTTCTCGATGGCCCATTTG
AGTGCGTTCTTGCTGCTCTCCGAGAAATCCATGGCGATTCCGAT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2E120TF 708 0 0
TTTTTTTTATCAGCGCACATAAGCGAAAATTATGTGTCAATATTTCAAATAGAACAAACA
CAAGCAAGAAAAAAAGTTCTTTATTAAAAACATAAACTGCGACATTATTTTTGGTAGATT
ATACGCGCGAAGAAGACATTTCTTTCTAGTCATCCTTGACAATGGTGACAGGGCAAGGCG
CGTGGTCGATCACAAAGCTGCTCACGCTTCCCATTATTATTCTTTGAAGGGCACTGAGTC
CTCTGCTTCCCATGACAATAGAATCCAGTTTGAGTTCTTTAACAGCATCAACCAGCTTCT
CTCTTGCATCACCCCAGTATAGTTTTGTCACTACATGAACCTCTTTCTTCCTTGAACCAG
TGTCGAGCATGTCAAGACATGCTATGTCGATCTTGACACCGTAGTTCTCCATGATCTTCG
GTTCCCTAAATTCAGCCAACGGTATGAGAGGAGAACCGGATTCGAGCCAGAGGGCGTTGC
GAGATTCAGCTTCAGAGGTAGGTAACGTGTGGATGATGTAAAGTGTGTCTCCTTTGTCAG
CTAAGTTCTCGATGGCCCATTTGAGTGCGTTCTTGCTGCTCTCCGAGAAATCCATGGCGA
TTCCGATCTTCCGGTCTTTAGGCATCGTTCTTGGTTTTCTTGATCGAACTTGAAATGAGT
TTTGTTAAGATTTTTAGAGAGAGAGATGGTGAAGAGTTGTGAGAA
TCC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2AX45TFB 690 0 0
TTAAG
CGAAAATTATGTGTCAATATTTCAAATAGAACAAACACAAGCAAGAAAAAAAGTTCTTTA
TTAAAAACATAAACTGCGACATTATTTTTGGTAGATTATACGCGCGAAGAAGACATTTCT
TTCTAGTCATCCTTGACAATGGTGACAGGGCAAGGCGCGTGGTCGATCACAAAGCTGCTC
ACGCTTCCCATTATTATTCTTTGAAGGGCACTGAGTCCTCTGCTTCCCATGACAATAGAA
TCCAGTTTGAGTTCTTTAACAGCATCAACCAGCTTCTCTCTTGCATCACCCCAGTATAGT
TTTGTCACTACATGAACCTCTTTCTTCCTTGAACCAGTGTCGAGCATGTCAAGACATGCT
ATGTCGATCTTGACACCGTAGTTCTCCATGATCTTCGGTTCCCTAAATTCAGCCAACGGT
ATGAGAGGAGAACCGGATTCGAGCCAGAGGGCGTTGCGAGATTCAGCTTCAGAGGTAGGT
AACGTGTGGATGATGTAAAGTGTGTCTCCTTTGTCAGCTAAGTTCTCGGTGGCCCATTTG
AGTGCGTTCTTGCTGCTCTCCGAGAAATCCATGGCGATTCCGATCTTCCTGTCTTTAGGC
ATCGTTCTTGGTTTTCTTGATCGAACTTGAAATGAGTTTTGTTAAGATTTTTAGAGAGAG
AGATGGTGAAGAGTTGTGAGAA
TCC

QA 6 687 6 687
DS 

RD RR2A187TF 687 0 0
G
CGAAAATTATGTGTCAATATTTCAAATAGAACAAACACAAGCAAGAAAAAAAGTTCTTTA
TTAAAAACATAAACTGCGACATTATTTTTGGTAGATTATACGCGCGAAGAAGACATTTCT
TTCTAGTCATCCTTGACAATGGTGACAGGGCAAGGCGCGTGGTCGATCACAAAGCTGCTC
ACGCTTCCCATTATTATTCTTTGAAGGGCACTGAGTCCTCTGCTTCCCATGACAATAGAA
TCCAGTTTGAGTTCTTTAACAGCATCAACCAGCTTCTCTCTTGCATCACCCCAGTATAGT
TTTGTCACTACATGAACCTCTTTCTTCCTTGAACCAGTGTCGAGCATGTCAAGACATGCT
ATGTCGATCTTGACACCGTAGTTCTCCATGATCTTCGGTTCCCTAAATTCAGCCAACGGT
ATGAGAGGAGAACCGGATTCGAGCCAGAGGGCGTTGCGAGATTCAGCTTCAGAGGTAGGT
AACGTGTGGATGATGTAAAGTGTGTCTCCTTTGTCAGCTAAGTTCTCGATGGCCCATTTG
AGTGCGTTCTTGCTGCTCTCCGAGAAATCCATGGCGATTCCGATCTTCCTGTCTTTAGGC
ATCGTTCTTGGTTTTCTTGATCGAACTTGAAATGAGTTTTGTTAAGATTTTTAGAGAGAG
AGATGGTGAAGAGTTGTGAGAA
ATCC

QA 2 683 2 683
DS 

RD RR2A187JQ 671 0 0
AATATTTCAAATAGAACAAACACAAGCAAGAAAAAAAGTTCTTTATTAAAAACATAAACT
GCGACATTATTTTTGGTAGATTATACGCGCGAAGAAGACATTTCTTTCTAGTCATCCTTG
ACAATGGTGACAGGGCAAGGCGCGTGGTCGATCACAAAGCTGCTCACGCTTCCCATTATT
ATTCTTTGAAGGGCACTGAGTCCTCTGCTTCCCATGACAATAGAATCCAGTTTGAGTTCT
TTAACAGCATCAACCAGCTTCTCTCTTGCATCACCCCAGTATAGTTTTGTCACTACATGA
ACCTCTTTCTTCCTTGAACCAGTGTCGAGCATGTCAAGACATGCTATGTCGATCTTGACA
CCGTAGTTCTCCATGATCTTCGGTTCCCTAAATTCAGCCAACGGTATGAGAGGAGAACCG
GATTCGAGCCAGAGGGCGTTGCGAGATTCAGCTTCAGAGGTAGGTAACGTGTGGATGATG
TAAAGTGTGTCTCCTTTGTCAGCTAAGTTCTCGATGGCCCATTTGAGTGCGTTCTTGCTG
CTCTCCGAGAAATCCATGGCGATTCCGATCTTCCTGTCTTTAGGCATCGTTCTTGGTTTT
CTTGATCGAACTTGAAATGAGTTTTGTTAAGATTTTTAGAGAGAGAGATGGTGAAGAGTT
GTGAGAAATCC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 2 4

CO CL1421Contig1 834 2 5 U
TCTACGGGTTCTACGACGAGTGCAAGAAGAGATATAGCGTTAAATGTGGAAGGTGTTCAC
GACTGTTTTAACTGTCTCCCTGTTGCTGCCTTGATCGATGAGAAGATACTGTGTATGCAC
GGTGGGTTGTCCCCTGAGTTGAAGCATTTGGATGAGATCAGGAACATTGCCCGTCCTATC
GATATTCCTGATCATGGGTTGTTGTGTGATCTGTTGTGGTCTGATCCGGACAAGGATATT
GAAGGGTGGGGAGAGAATGACAGGGGGGTTTCTTATACCTTTGGGGTTGATAAGGTTGAG
GAGTTTCTTCAGAAGCATGACCTTGACCTAATCTGCAGAGCTCACCAGGTTGTGGAAGAT
GGGTATGAGTTCTTTGCAAACAGGCAGCTAGTTACGATATTTTCGGCACCAAACTACTGT
GGAGAGTTTGACAACGCAGGTGCGATGATGAGCGTGGATGATTCTTTGACATGCTCTTTT
CAAATCCTTAAAGCTTCTGAAAAGAAAGGAAACTTCGGGTTTGGCAAGAACGGTAGGCGA
GGAACCCCACCTCGCAAGGGTGGTGGAAAAGGTTGAAAGACAAAATCATGTTTCCTGGCT
CAAGACACTTTGCTGCTTGAGCTGAATGTTATTAATCATCAATCAAACTGTCATCTTCTT
CTGCTCTCTGGATCACTTATGGCAAAAGGGTTATTCCTATCTTTTCCCTCACCGAGTGAA
TATGAAATTTCTGACTATATAAATCTTGTATCTTTGAGTGAATCTTAGATATTATCTGTG
AGATACACTGTTGTTTCTTTTCCCTTTTAATGAAAACCCTGATGTTCTCCTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E509TF U 225
AF RR2ET84JQ C 1
BS 1 225 RR2ET84JQ
BS 226 510 RR2E509TF
BS 511 511 RR2ET84JQ
BS 512 646 RR2E509TF
BS 647 834 RR2ET84JQ

RD RR2E509TF 422 0 0
G
CCGGACAAGGATATTGAAGGGTGGGGAGAGAATGACAGGGGGGTTTCTTATACCTTTGGG
GTTGATAAGGTTGAGGAGTTTCTTCAGAAGCATGACCTTGACCTAATCTGCAGAGCTCAC
CAGGTTGTGGAAGATGGGTATGAGTTCTTTGCAAACAGGCAGCTAGTTACGATATTTTCG
GCACCAAACTACTGTGGAGAGTTTGACAACGCAGGTGCGATGATGAGCGTGGATGATTCT
TTGACATGCTCTTTTCAAATCCTTAAAGCTTCTGAAAAGAAAGGAGACTTCGGGTTTGGC
AAGAACGGTAGGCGAGGAACCCCACCTCGCAAGGGTGGTGGAAAAGGTTGAAAGACAAAA
TCATGTTTCCTGGCTCAAGACACTTTGCTGCTTGAGCTGAATGTTATTAATCATCAATCA
A

QA 2 422 2 422
DS 

RD RR2ET84JQ 834 0 0
TCTACGGGTTCTACGACGAGTGCAAGAAGAGATATAGCGTTAAATGTGGAAGGTGTTCAC
GACTGTTTTAACTGTCTCCCTGTTGCTGCCTTGATCGATGAGAAGATACTGTGTATGCAC
GGTGGGTTGTCCCCTGAGTTGAAGCATTTGGATGAGATCAGGAACATTGCCCGTCCTATC
GATATTCCTGATCATGGGTTGTTGTGTGATCTGTTGTGGTCTGATCCGGACAAGGATATT
GAAGGGTGGGGAGAGAATGACAGGGGGGTTTCTTATACCTTTGGGGTTGATAAGGTTGAG
GAGTTTCTTCAGAAGCATGACCTTGACCTAATTTGCAGAGCTCACCAGGTTGTGGAAGAT
GGGTATGAGTTCTTTGCAAACAGGCAGCTAGTTACGATATTTTCGGCACCAAACTACTGT
GGAGAGTTTGACAACGCAGGTGCGATGATGAGCGTGGATGATTCTTTGACATGCTCTTTT
CAAATCCTTAAAGCTTCTGAAAAGAAAGGAAACTTCGGGTTTGGCAAGAACGGTAGGCGA
GGAACCCCACCTCGCAAGGGTGGTGGAAAAGGTTGAAAGACAAAATCATGTTTCCTGGCT
CAAGACACTTTGCTGCTTGAGCTGAATGTTATTAATCATCAATCAAACTGTCATCTTCTT
CTGCTCTCTGGATCACTTATGGCAAAAGGGTTATTCCTATCTTTTCCCTCACCGAGTGAA
TATGAAATTTCTGACTATATAAATCTTGTATCTTTGAGTGAATCTTAGATATTATCTGTG
AGATACACTGTTGTTTCTTTTCCCTTTTAATGAAAACCCTGATGTTCTCCTGTG

QA 1 834 1 834
DS 



CO CL1421Contig2 762 2 3 U
GGACCTTCACAAAAACTCAATTCTCTCTGCGTCTACCTACCTTACCTACAGAGAGACTAT
TGATCGGAGACGTTATTATCATCATCTCACAACCCGGAGGTCGTCGGAAACCGAAACTCT
TCAATCTCGGAAAATCCGAGGGGGCTTTTGTTCCTTTTGATGGAAGATAGTGTGGTGGAT
GATGTGATAAAGAGGTTATTGGGTGCCAAAAACGGCAAGACGACGAAGCAGGTGCAGTTG
ACGGACGACGAGATCAAACACCTCTGCTCCACCGCCAAACAAATCTTCCTCAGCCAACCT
AATCTCCTCGAACTCGAGGCTCCCATCAAGATTTGTGGAGATACACATGGACAGTTCTCA
GATCTCTTGAGGCTGTTTGAGTACGGAGGCTACCCACCTGCTGCGAACTATCTCTTCCTC
GGGGACTACGTAGACCGTGGCAAGCAGAGCGTTGAGACCATATGCCTCCTCCTCGCCTAC
AAGATCAAATACAAAGAGAACTTCTTCCTCTTGCGTGGGAACCATGAGTGCGCCTCTATA
AACCGTATCTACGGGTTCTACGACGAGTGCAAGAAGAGATATAGCGTTAAAATGTGGAAG
GTGTTCACCGACTGTTTTAACTGTCTCCCTGTTGCTGCCTTGATCGATGAGAAGATACTG
TGTATGCACGGTGGGTTGTCCCCTGAGTTGAAGCATTTGGATGAGATCAGAACATTGCTC
GTCCTATCGATATTCTGATCATGGGTTGTTGTGTGATCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET84TF U 7
AF RR2FW42TF U 1
BS 1 118 RR2FW42TF
BS 119 119 RR2ET84TF
BS 120 762 RR2FW42TF

RD RR2ET84TF 701 0 0
GG
ACAAAAACTCAATTCTCTCTGCGTCTACCTACCTTACCTACAGAGAGACTATTGATCGGA
GACGTTATTATCATCATCTCACAACCCGGAGGTCGTCGGAAACCGAAACTCTTCAATCTC
GGAAAATCCGAGGGGGCTTTTGTTCCTTTTGATGGAAGATAGTGTGGTGGATGATGTGAT
AAAGAGGTTATTGGGTGCCAAAA*CGGCAAGACGACGAAGCAGGTGCAGTTGACGGACGA
CGAGATCAAACACCTCTGCTCCACCGCCAAACAAATCTTCCTCAGTCAACCTAATCTCCT
CGAACTCGAGGCTCCCATCAAGATTTGTGGAGATACACATGGACAGTTCTCAGATCTCTT
GAGGCTGTTTGAGTACGGAGGCTACCCACCTGCTGCGAACTATCTCTTCCTCGGGGACTA
CGTAGACCGTGGCAAGCAGAGCGTTGAGACCATATGCCTCCTCCTCGCCTACAAGATCAA
ATACAAAGAGAACTTCTTCCTCTTGCGTGGGAACCATGAGTGCGCCTCTATAAACCGTAT
CTACGGGTTCTACGACGAGTGCAAGAAGAGATATAGCGTTAAAATGTGGAAGGTGTTCAC
CGACTGTTTTAACTGTCTCCCTGTTGCTGCCTTGATCGATGAGAAGATACTGTGTATGCA
CGGTGGGTTGTCCCCTGAGTTGAAGCATTTGGATGAGAT

QA 3 701 3 701
DS 

RD RR2FW42TF 762 0 0
GGACCTTCACAAAAACTCAATTCTCTCTGCGTCTACCTACCTTACCTACAGAGAGACTAT
TGATCGGAGACGTTATTATCATCATCTCACAACCCGGAGGTCGTCGGAAACCGAAACTTT
TCAATCTCGGAAAATCCGAGGGGGCTTTTGTTCCTTTTGATGGAAGATAGTGTGGTGGAT
GATGTGATAAAGAGGTTATTGGGTGCCAAAAACGGCAAGACGACGAAGCAGGTGCAGTTG
ACGGACGACGAGATCAAACACCTCTGCTCCACCGCCAAACAAATCTTCCTCAGCCAACCT
AATCTCCTCGAACTCGAGGCTCCCATCAAGATTTGTGGAGATACACATGGACAGTTCTCA
GATCTCTTGAGGCTGTTTGAGTACGGAGGCTACCCACCTGCTGCGAACTATCTCTTCCTC
GGGGACTACGTAGACCGTGGCAAGCAGAGCGTTGAGACCATATGCCTCCTCCTCGCCTAC
AAGATCAAATACAAAGAGAACTTCTTCCTCTTGCGTGGGAACCATGAGTGCGCCTCTATA
AACCGTATCTACGGGTTCTACGACGAGTGCAAGAAGAGATATAGCGTTAAAATGTGGAAG
GTGTTCACCGACTGTTTTAACTGTCTCCCTGTTGCTGCCTTGATCGATGAGAAGATACTG
TGTATGCACGGTGGGTTGTCCCCTGAGTTGAAGCATTTGGATGAGATCAGAACATTGCTC
GTCCTATCGATATTCTGATCATGGGTTGTTGTGTGATCTGTT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL1422Contig1 824 2 8 U
GGAGGTTTGGACCGTGGGAGTAAAAAAGAAAAGGGAACTATTAGAAAGAAACATCTGATC
GGATCTAGCTCTCTTCTTCTTCTTCCCCGACAGATCGAAGAAGTAACATAAATGGACAAG
GGCAAATCCGTGATGGGTGCTGGTCGGAGATGGGCCGTCGATTTCTCGGACCAATCCACC
GTTCCATCTTCCCGCGACATCCTCGATCCCCCTGGCTTCTCTCGTGCTTCTGCCGAACAG
GATGACTCAGCAACGAGCCGCCAAAAGAAAGACGCCGAAGCTAATTGGAAACTTCAGAAA
GCATGGGAGGTAGCGCAATCGCCATTTAAGAATCTGATGATGATGGGTTTCATGATGTGG
ATGGCTGGCAACACTGTTCATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCCGCTCTTTGGCAG
CCTCTCAGCGCCGTCCAGAGCGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAGGTG
GAACTACTTATGCCGAAACTTGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGT
ATCTGGAAGCTTAATACTCTGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCAGATTGGGTTTCATCT
CTACCACCTCCTCAGGAAGTTGAACACTCTGGCGGAGGATTTGCTTTCCACTGATGAGAT
AACTGCAAAAGATGCTTGAGTGATTTCTTCAATCCTGACATGAGGGGAAGGAAGATTCAT
GTGGACCTTGTCATCTTGTGATCTTCTTGTAGCATTTTCAAAACTCAGAAACCATAGCTT
TTTCACTTTCTAGTATGATGTTCATTCCTCATCATAACTATGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM51TF U 1
AF RR2A069TF U 77
BS 1 370 RR2EM51TF
BS 371 371 RR2A069TF
BS 372 685 RR2EM51TF
BS 686 686 RR2A069TF
BS 687 712 RR2EM51TF
BS 713 713 RR2A069TF
BS 714 761 RR2EM51TF
BS 762 824 RR2A069TF

RD RR2EM51TF 761 0 0
GGAGGTTTGGACCGTGGGAGTAAAAAAGAAAAGGGAACTATTAGAAAGAAACATCTGATC
GGATCTAGCTCTCTTCTTCTTCTTCCCCGACAGATCGAAGAAGTAACATAAATGGACAAG
GGCAAATCCGTGATGGGTGCTGGTCGGAGATGGGCCGTCGATTTCTCGGACCAATCCACC
GTTCCATCTTCCCGCGACATCCTCGATCCCCCTGGCTTCTCTCGTGCTTCTGCCGAACAG
GATGACTCAGCAACGAGCCGCCAAAAGAAAGACGCCGAAGCTAATTGGAAACTTCAGAAA
GCATGGGAGGTAGCGCAATCGCCATTTAAGAATCTGATGATGATGGGTTTCATGATGTGG
ATGGCTGGCAGCACTGTTCATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCCGCTCTTTGGCAG
CCTCTCAGCGCCGTCCAGAGCGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAGGTG
GAACTACTTATGCCGAAACTTGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGT
ATCTGGAAGCTTAATACTCTGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCAGATTGGGTTTCATCT
CTACCACCTCCTCAGGAAGTTGAACACTCTGGCGGAGGATTTGCTTTCCACTGATGAGAT
AACTGCAAAAGATGCTTGAGTGATT*CTTCAATCCTGACATGAGGGGAAGGA*GATTCAT
GTGGACCTTGTCATCTTGTGATCTTCTTGTAGCATTTTCAA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2A069TF 748 0 0
GG
CTTCTTCCCCGACAGATCGAAGAAGTAACATAAATGGACAAGGGCAAATCCGTGATGGGT
GCTGGTCGGAGATGGGCCGTCGATTTCTCGGACCAATCCACCGTTCCATCTTCCCGCGAC
ATCCTCGATCCCCCTGGCTTCTCTCGTGCTTCTGCCGAACAGGATGACTCAGCAACGAGC
CGCCAAAAGAAAGACGCCGAAGCTAATTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAGGTAGCGCAA
TCGCCATTTAAGAATCTGATGATGATGGGTTTCATGATGTGGATGGCTGGCAACACTGTT
CATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCCGCTCTTTGGCAGCCTCTCAGCGCCGTCCAG
AGTGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAGGTGGAACTACTTATGCCGAAA
CTTGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTTAATACT
CTGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCAGATTGGGTTTCATCTCTACCACCTCCTCAGGAA
GTTGAACACTCTGGCGGAGGATTTGCTTTCCACTGATGAGATAACTGCAAAAGATGCTTG
AGTGATTTCTTCAATCCTGACATGAGGGGAAGGAAGATTCATGTGGACCTTGTCATCTTG
TGATCTTCTTGTAGCATTTTCAAAACTCAGAAACCATAGCTTTTTCACTTTCTAGTATGA
TGTTCATTCCTCATCATAACTATGGA

QA 3 748 3 748
DS 



AS 1 6

CO CL1423Contig1 1470 6 10 U
GGAAAAACACTTTCGTCGTCTCTCTCTCAACTGTTTGTTCTCTCTTCTCTCGAATTGAGT
TTCGAAGTTCGTTAAGTCTTTCCCACACGGCGACGATGGGGTCGGTCTCCGATCCAGGCG
AGTTGACGGAGTTAGCTCAGCCGAGTTTCGAGGAGTTTCAGAAGCAGACGTCGCTGATGA
CGAGCTGCACGCTTCTGTGGAAAGAGCTCTCCGATCACTTCACCACGCTTGAGGAGAATC
TGATGAAGAAATCGGAGGCTGCTTGTTACTCCGAGGGTTGAGGAGAGAGCTAAGGAGATT
GCGGAGACGTGGAAGGCGGGTTTGGAGGAGAGAGGAGGGAGGGTGGAGAATGTGAAGACA
CCTGATGCGCATACGTTTCTTCAGCATGTTGTGACGTTTGGGATTGTTAAGAGTGAGGAT
CTTGGTCTGTATAGGAAGCTCGTTGTTGGATCCGCGTGGCGTAAACAGATGCCGAAGCTT
GCTGTTTTAGTTGGTTTGGGTGATCAAATGCCTGACATGATTGAAGAGTTAATCAGCAGG
GGTCAACAGCTTGATGCTGTTCATTTCACTTATGAAGTTGGCCTTGTGGATAAGTTCCCT
CCCGTTCCTTTACTCAAAGCCTATCTAAGGGACGCAAAGAAGACAGAAGACTCCAGCAAT
ACCGGCCGAGCTTCGCATCTTGTGGCGCGCAAGGAGCAATCAGCGCTTAAGGCAGTCCTG
AAATGCATTGAAGAGTACAAACTCGAGGAAGAGTTCCCTCCAGAGAACCTCAAGAAGCGG
TTGGAACAGCTAGAGAAGACCAAAACCGAGAAGAGGAAACCAGCAGCTGTACCGGCGAAC
AAGAGAACCAGAGCCAGCTACAACGGTCCAATGCCACCAGCGAAAGCCGGGCGTATCACA
AACGCATACGTCTCTTCCTTCCCTTTCATCAGATCACCCTCTCACTCCCCTCAGTACGCT
TCACCTGCAGCATCTTACCCATCACCACCTACCACTGTCTACAGCAACAGGAGCCCACCT
TATCCATACTCCCCTGAGCTTATCCCCGCCTCATACCAAGCCTCACCTATGGGTTACCCA
GCGTACAACGGTTATTGCAACGGCCCTGTCCCTGTTCCCGCTCCAGCTCCTCCGGTTTAC
CACCCGCACTACCCTCAGCAGCACCACCAACACGCCCACCATCAGCAAGCTTACTACTGA
ACTTAGACAGTGTGTGTGATGACAAATCAAGAAGGAAGGAATGGTAATAACCAACAACCA
CTGATACTGTGACAACTACTCTGTATCTGCATCTTTGTGTCTCTCTACGTTGTCGTTTTG
TCTGTTGTAATATTTTCGAAGCCTAACTCTGTTTTAGTAAGTTAGCTATCTTCCTGTTGT
GTGTTAAAAA*ACATCGGGCTCTGTTTCTGCTCATAAGCTTTTGTAATGCCTAATATTCT
GTCAAACAATCTCATCTTTCTGTTTATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK53TF U 1
AF RR2F575TF U 358
AF RR2CG78JQ C 761
AF RR2CG78TF U 761
AF RR2EK53JQ C 773
AF RR2F575JQ C 763
BS 1 522 RR2EK53TF
BS 523 523 RR2F575TF
BS 524 541 RR2EK53TF
BS 542 1010 RR2F575TF
BS 1011 1011 RR2CG78TF
BS 1012 1046 RR2F575TF
BS 1047 1047 RR2CG78TF
BS 1048 1066 RR2F575TF
BS 1067 1445 RR2CG78TF
BS 1446 1470 RR2CG78JQ

RD RR2EK53TF 541 0 0
GGAAAAACACTTTCGTCGTCTCTCTCTCAACTGTTTGTTCTCTCTTCTCTCGAATTGAGT
TTCGAAGTTCGTTAAGTCTTTCCCACACGGCGACGATGGGGTCGGTCTCCGATCCAGGCG
AGTTGACGGAGTTAGCTCAGCCGAGTTTCGAGGAGTTTCAGAAGCAGACGTCGCTGATGA
CGAGCTGCACGCTTCTGTGGAAAGAGCTCTCCGATCACTTCACCACGCTTGAGGAGAATC
TGATGAAGAAATCGGAGGCTGCTTGTTACTCCGAGGGTTGAGGAGAGAGCTAAGGAGATT
GCGGAGACGTGGAAGGCGGGTTTGGAGGAGAGAGGAGGGAGGGTGGAGAATGTGAAGACA
CCTGATGCGCATACGTTTCTTCAGCATGTTGTGACGTTTGGGATTGTTAAGAGTGAGGAT
CTTGGTCTGTATAGGAAGCTCGTTGTTGGATCCGCGTGGCGTAAACAGATGCCGAAGCTT
GCTGTTTTAGTTGGTTTGGGTGATCAAATGCCTGACATGATTTAAGAGTTAATCAGCAGG
G

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR2F575TF 709 0 0
G
CACCTGATGTGCATACGTTTCTTCAGCATGTTGTGACGTTTGGGATTGTTAAGAGTGAGG
ATCTTGGTCTGTATAGGAAGCTTGTTGTTGGATCCGCGTGGCGTAAACAGATGCCGAAGC
TTGCTGTTTTAGTTGGTTTGGGTGATCAAATGCCTGACATGATTGAAGAGTTAATCAGCA
GGGGTCAACAGCTTGATGCTGTTCATTTCACTTATGAAGTTGGCCTTGTGGATAAGTTCC
CTCCCGTTCCTTTACTCAAAGCCTATCTAAGGGACGCAAAGAAGACAGAAGACTCCAGCA
ATACCGGCCGAGCTTCGCATCTTGTGGCGCGCAAGGAGCAATCAGCGCTTAAGGCAGTCC
TGAAATGCATTGAAGAGTACAAACTCGAGGAAGAGTTCCCTCCAGAGAACCTCAAGAAGC
GGTTGGAACAGCTAGAGAAGACCAAAACCGAGAAGAGGAAACCAGCAGCTGTACCGGCGA
ACAAGAGAACCAGAGCCAGCTACAACGGTCCAATGCCACCAGCGAAAGCCGGGCGTATCA
CAAACGCATACGTCTCTTCCTTCCCTTTCATCAGATCACCCTCTCACTCCCCTCAGTACG
CTTCACCTGCAGCATCTTACCCATCACCACCTACCACTGTCTACAGCAACAG*AGCCCAC
CTTATCCATACTCCCCTGAGCTTATCCC*GCCTCATACCAAGCCTCAC

QA 2 709 2 709
DS 

RD RR2CG78JQ 710 0 0
GAGAGAAC
CTCAAGAAGCGGTTGGAACAGCTAGAGAAGACCAAAACCGAGAAGAGGAAACCAGCAGCT
GTACCGGCGAACAAGAGAACCAGAGCCAGCTACAACGGTCCAATGCCACCAGCGAAAGCC
GGGCGTATCACAAACGCATACGTCTCTTCCTTCCCTTTCATCAGATCACCCTCTCACTCC
CCTCAGTACGCTTCACCTACAGCATCTTACCCATCACCACCTACCACTGTTTACAGCAAC
AGGAGCCCACCTTATCCATACTCCCCTGAGCTTATCCCCGCCTCATACCAAGCCTCACCT
ATGGGTTACCCAGCGTACAACGGTTATTGCAACGGCCCTGTCCCTGTTCCCGCTCCAGCT
CCTCCGGTTTACCACCCGCACTACCCTCAGCAGCACCACCAACACGCCCACCATCAGCAA
GCTTACTACTGAACTTAGACAGTGTGTGTGATGACAAATCAAGAAGGAAGGAATGGTAAT
AACCAACAACCACTGATACTGTGACAACTACTCTGTATCTGCATCTTTGTGTCTCTCTAC
GTTGTCGTTTTGTCTGTTGTAATATTTTCGAAGCCTAACTCTGTTTTAGTAAGTTAGCTA
TCTTCCTGTTGTGTGTTAAAAA*ACATCGGGCTCTGTTTCTGCTCATAAGCTTTTGTAAT
GCCTAATATTCTGTCAAACAATCTCATCTTTCTGTTTATTAT

QA 9 710 9 710
DS 

RD RR2CG78TF 694 0 0
GAGAGAAC
CTCAAGAAGCGGTTGGAACAGCTAGAGAAGACCAAAACCGAGAAGAGGAAACCAGCAGCT
GTACCGGCGAACAAGAGAACCAGAGCCAGCTACAACGGTCCAATGCCACCAGCGAAAGCC
GGGCGTATCACAAACGCATACGTCTCTTCCTTCCCTTTCATCAGATCACCCTCTCACTCC
CCTCAGTACGCTTCACCTACAGCATCTTACCCATCACCACCTACCACTGTCTACAGCAAC
AGGAGCCCACCTTATCCATACTCCCCTGAGCTTATCCCCGCCTCATACCAAGCCTCACCT
ATGGGTTACCCAGCGTACAACGGTTATTGCAACGGCCCTGTCCCTGTTCCCGCTCCAGCT
CCTCCGGTTTACCACCCGCACTACCCTCAGCAGCACCACCAACACGCCCACCATCAGCAA
GCTTACTACTGAACTTAGACAGTGTGTGTGATGACAAATCAAGAAGGAAGGAATGGTAAT
AACCAACAACCACTGATACTGTGACAACTACTCTGTATCTGCATCTTTGTGTCTCTCTAC
GTTGTCGTTTTGTCTGTTGTAATATTTTCGAAGCCTAACTCTGTTTTAGTAAGTTAGCTA
TCTTCCTGTTGTGTGTTAAAAA*ACATCGGGCTCTGTTTCTGCTCATAAGCTTTTGTAAT
GCCTAATATTCTGTCAA
CATCTCATC

QA 9 685 9 685
DS 

RD RR2EK53JQ 671 0 0
AGAAGCGGTTGGAACAGCTAGAGAAGACCAAAACCGAGAAGAGGAAACCAACAGCTGTAC
CGGCGAACAAGAGAACCAGAGCCAGCTACAACGGTCCAATGCCACCAGCGAAGGCCGGGC
GTATCACAAACGCATACGTGTCTTCCTTCCCTTTCATCAGATCACCCTCTCACTCCCCTC
AGTACGCTTCACCTGCCGCATCTTACCCATCACCACCTACCACTGTCTACAGCAACAGGA
GCCCACCTTATCCTTACTCCCCTGAGCTTATCCCCGCCTCATACCGAGCCTCACCAATGG
GTTACCCAGCGTACAACGGTTATTGCAACGGCCCTGTCCCTGTTCCAGCTCCAGCTCCTC
CGGTTTACCACCCGCACTACCCTCAGCAGCACCACCAACACGCCCACCATCAGCAAGCTT
ACTACTGAACTTAGACAGTGTGTGTGATGACAAATCAAGAAGGAAAGAATGGTAATAACC
AACAACCACTGATACTGTGACAACTACTCTGTATCTGCATCTTTGTCTCTCTCTACGTTG
TCGTTTTGTCTGTTGTAATATTTTCGAAGCCTAACTCTGTTTTAGTAAGTTAGCTATCTT
CCTGTTGTGTGTTAAAAACATCTCGGGCTCTGTTTCTGCTCATAAGCTTCTGTAATGCCT
AATATTCTGTC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2F575JQ 681 0 0
AGAGAA
CTCAAGAAGCGGTTGGAACAGCTAGAGAAGACCAAAACCGAGAAGAGGAAACCAGCAGCT
GTACCGGCGAACAAGAGAACCAGAGCCAGCTACAACGGTCCAATGCCACCAGCGAAAGCC
GGGCGTATCACAAACGCATACGTCTCTTCCTTCCCTTTCATCAGATCACCCTCTCACTCC
CCTCAGTACGCTTCACCTGCAGCATCTTACCCATCACCACCTACCACTGTCTACAGCAAC
AGGAGCCCACCTTATCCATACTCCCCTGAGCTTATCCCCGCCTCATACCAAGCCTCACCT
ATGGGTTACCCAGCGTACAACGGTTATTGCAACGGCCCTGTCCCTGTTCCCGCTCCAGCT
CCTCCGGTTTACCACCCGCACTACCCTCAGCAGCACCACCAACACGCCCACCATCAGCAA
GCTTACTACTGAACTTAGACAGTGTGTGTGATGACAAATCAAGAAGGAAGGAATGGTAAT
GACCAACAACCACTGATACTGTGACAACTACTCTGTATCTGCATCTTTGTGTCTCTCTAC
GTTGTCGTTTTGTCTGTTGTAATATTTTCGAAGCCTAACTCTGTTTTAGTAAGTTAGCTA
TCTTCCTGTTGTGTGTTAAAAA*ACATCGGGCTCTGTTTCTGCTCATAAGCTTTTGTAAT
GCCTAATATTCTGTC

QA 7 681 7 681
DS 



AS 1 6

CO CL1424Contig1 1231 6 12 U
GGGCCTAACTTGTTCTTGTTTATTGATATGTGGTAAAAGGACTCCACAAAATCCAAATAC
AGATAAGTACACAGAAGTTTAGAAGATGATTGATCACAAAAAGTTGTACACAACTTAAAA
GAGAGAAGATAAGAGTTCGGATATCACTGTAACAGAGTATGATGCTCTCATGTTACCATT
TCTCTATCCTTCTCTTCTTACAAACCCTTCGCTTGTTTCATCTCCTTCTCCAGCTTGTTC
TTTGTTTGGTCCCTTTTCTTTGTTGCTCATCAACTTGTACCCGTAAAACGCCAACACACC
GCCACTCGTAAGGGTGGTTAAGAACCCCATGAACGTAGATCTCTGAAACAGTACCAACTT
CAACTCTCTCAAAAATATGATTGCCACTATAGCCATTTGTCCTTTTAAGAACTTAGCAGA
TGACTCTCCAATCCTCTGAGCCTTAAGACTAGCCATGCTCAGTGCAAAAAGAGCTCCACC
AAGAATGACCCCGAACCTAATGGCAGGAATGCTCCCCGATATCATAAACGAAAGAAACCC
ACCC*ACAAACAGAAGCAGACCATAAGGTATCCCAACATGAAAATCTTGAGTCCGAGACA
CATCCCTCAGATCCTCAGTGGAAGAGAAAGCTTCAACGATCTCCTTCACATCAGAAGGTG
ACTCCTCCGCTGCTTTCAGAATATACTCTCTCCCTTCCTCCCCAACCTCTTTAGCCTTAG
TACCCAACTCTTCCTTAGCCTTCTCCGCTTGAATCCTAAGCTGCTCGGAAGTATCTTTCA
AAATAGTCATCGCCTTTTGCGAGTCCACATTGTACGCCTCCGACGACACGCTCTGAATCT
TCGAAACCTGCTCCTTAACAGACGCGAGGGTTTGCTTCCACGCCTCCTGAGATGTATCGA
CATCGTCACCATCTACTACACTCTTCTCCTTCTCCACCTCAACACCTGATGGTTCCGAAT
CCTCGTGGGAAGCGGCGGAAGTAACGAAGAAGGAGCGATTAAGCTTGGTATCTGAGCTAA
ACCCGAGAGGCAGCCTCCCAGTACAAGAAACGAGAGATGGAGAAGTGGAGAGGCGTCGGT
TGGGGAGGTGTTGGGAACGGAGAGAAGGAAGCGTGGCGGGTGGTGGGCGAGAGTGAGGTC
TGTGGAGGAGGAAGGTTGAATTAGGGGTTCTGATGGACATCAGCTCCATTGGGATACTCA
TTGCCTTGTGAAAAGAATTAAGTACTCTCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2E603JQ U 3
AF RR2CI88JQ U 1
AF RR2A096JQ U 3
AF RR2CI88TF C 446
AF RR2A096TF C 696
AF RR2E603TF C 923
BS 1 148 RR2CI88JQ
BS 149 149 RR2A096JQ
BS 150 161 RR2CI88JQ
BS 162 162 RR2A096JQ
BS 163 677 RR2CI88JQ
BS 678 759 RR2A096JQ
BS 760 804 RR2CI88TF
BS 805 805 RR2A096TF
BS 806 872 RR2CI88TF
BS 873 873 RR2A096TF
BS 874 1023 RR2CI88TF
BS 1024 1231 RR2A096TF

RD RR2E603JQ 651 0 0
GCCTAACTTGTTCTTGTTTATTGATATGTGGTAAAAGGACTCCACAAAATCCAAATACAG
ATAAGTACACAGAAGTTTAGAAGATGATTGATCACAAAAAGTTGTACACAACTTAAAAGA
GAGAAGATAAGAGTTCGGATATCACTGTAACAGAGTATGATGCTCTCATGTTACCATTTC
TCTATCCTTCTCTTCTTACAAACCCTTCGCTTGTTTCATCTCCTTCTCCAGCTTGTTCTT
TGTTTGGTCCCTTTTCTTTGTTGCTCATCAACTTGTACCCGTAAAACGCCAACACACCGC
CACTCGTAAGGGTGGTTAAGAACCCCATGAACGTAGATCTCTGAAACAGTACCAACTTCA
ACTCTCTCAAAAATATGATTGCCACTATAGCCATTTGTCCTTTTAAGAACTTAGCAGATG
ACTCTCCAATCCTCTGAGCCTTAAGACTAGCCATGCTCAGTGCAAAAAGAGCTCCACCAA
GAATGACCCCGAACCTAATGGCAGGAATGCTCCCCGATATCATAAACGAAAGAAACCCAC
CC*ACAAACAGAAGCAGACCATAAGGTATCCCAACATGAAAATCTTGAGTCCGAGACACA
TCCCTCAGATCCTCAGTGGAAGAGAAAGCTTCAACGATCTCCTTCACATCA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2CI88JQ 677 0 0
GGGCCTAACTTGTTCTTGTTTATTGATATGTGGTAAAAGGACTCCACAAAATCCAAATAC
AGATAAGTACACAGAAGTTTAGAAGATGATTGATCACAAAAAGTTGTACACAACTTAAAA
GAGAGAAGATAAGAGTTCGGATATCACTATAACAGAGTATGGTGCTCTCATGTTACCATT
TCTCTATCCTTCTCTTCTTACAAACCCTTCGCTTGTTTCATCTCCTTCTCCAGCTTGTTC
TTTGTTTGGTCCCTTTTCTTTGTTGCTCATCAACTTGTACCCGTAAAACGCCAACACACC
GCCACTCGTAAGGGTGGTTAAGAACCCCATGAACGTAGATCTCTGAAACAGTACCAACTT
CAACTCTCTCAAAAATATGATTGCCACTATAGCCATTTGTCCTTTTAAGAACTTAGCAGA
TGACTCTCCAATCCTCTGAGCCTTAAGACTAGCCATGCTCAGTGCAAAAAGAGCTCCACC
AAGAATGACCCCGAACCTAATGGCAGGAATGCTCCCCGATATCATAAACGAAAGAAACCC
ACCC*ACAAACAGAAGCAGACCATAAGGTATCCCAACATGAAAATCTTGAGTCCGAGACA
CATCCCTCAGATCCTCAGTGGAAGAGAAAGCTTCAACGATCTCCTTCACATCAGAAGGTG
ACTCCTCCGCTGCTTTC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2A096JQ 757 0 0
GCCTAACTTGTTCTTGTTTATTGATATGTGGTAAAAGGACTCCACAAAATCCAAATACAG
ATAAGTACACAGAAGTTTAGAAGATGATTGATCACAAAAAGTTGTACACAACTTAAAAGA
GAGAAGATAAGAGTTCGGATATCACTGTAACAGAGTATGATGCTCTCATGTTACCATTTC
TCTATCCTTCTCTTCTTACAAACCCTTCGCTTGTTTCATCTCCTTCTCCAGCTTGTTCTT
TGTTTGGTCCCTTTTCTTTGTTGCTCATCAACTTGTACCCGTAAAACGCCAACACACCGC
CACTCGTAAGGGTGGTTAAGAACCCCATGAACGTAGATCTCTGAAACAGTACCAACTTCA
ACTCTCTCAAAAATATGATTGCCACTATAGCCATTTGTCCTTTTAAGAACTTAGCAGATG
ACTCTCCAATCCTCTGAGCCTTAAGACTAGCCATGCTCAGTGCAAAAAGAGCTCCACCAA
GAATGACCCCGAACCTAATGGCAGGAATGCTCCCCGATATCATAAACGAAAGAAACCCAC
CC*ACAAACAGAAGCAGACCATAAGGTATCCCAACATGAAAATCTTGAGTCCGAGACACA
TCCCTCAGATCCTCAGTGGAAGAGAAAGCTTCAACGATCTCCTTCACATCAGAAGGTGAC
TCCTCCGCTGCTTTCAGAATATACTCTCTCCCTTCCTCCCCAACCTCTTTAGCCTTAGTA
CCCAACTCTTCCTTAGCCTTCTCCGCTTGAATCCTAA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2CI88TF 578 0 0
AGACTAGCCATGCTCAGTGCAAAAAGAGCTCCACCAAGAATGACCCCGAACCTAATGGCA
GGAATGCTCCCCGATATCATAAACGAAAGAAACCCACCCCACAAACAGAAGCAGACCATA
AGGTATCCCAACATGAAAATCTTGAGTCCGAGACACATCCCTCAGATCCTCAGTGGAAGA
GAAAGCTTCAACGATCTCCTTCACATCAGAAGGTGACTCCTCCGCTGCTTTCAGAATATA
CTCTCTCCCTTCCTCCCCAACCTCTTTAGCCTTAGTACCCAACTCTTCCTTAGCCTTCTC
CGCTTGAATCCTAAGCTGCTCGGAAGTATCTTTCAAAATAGTCATCGCCTTTTGCGAGTT
CACATTGTACGCCTCCGACGACACGCTCTGAATCTTCGAAACCTGCTCCTTAACAGACGC
GAGGGTT*GCTTCCACGCCTCCTGAGATGTATCGACATCGTCACCATCTACTACACTCTT
CTCCTTCTCCACCTCAACACCTGATGGTTCCGAATCCTCGTGGGAAGCGGCGGAAGTAAC
GAAGAAGGAGCGATTAAGCTTGGTATCTGAGCTAAACC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2A096TF 536 0 0
TCCTCCCCAACCTCTTTAGCCTTAGTACCCAACTCTTCCTTAGCCTTCTCCGCTTGAATC
CTAAGCTGCTCGGAAGTATCTTTCAAAATAGTCATCGCCTTTTGCGAGTCCACATTGTAC
GCCTCCGACGACACGCTCTGAATCTTCGAAACCTGCTCCTTAACAGACGCGAGGGTTTGC
TTCCACGCCTCCTGAGATGTATCGACATCGTCACCATCTACTACACTCTTCTCCTTCTCC
ACCTCAACACCTGATGGTTCCGAATCCTCGTGGGAAGCGGCGGAAGTAACGAAGAAGGAG
CGATTAAGCTTGGTATCTGAGCTAAACCCGAGAGGCAGCCTCCCAGTACAAGAAACGAGA
GATGGAGAAGTGGAGAGGCGTCGGTTGGGGAGGTGTTGGGAACGGAGAGAAGGAAGCGTG
GCGGGTGGTGGGCGAGAGTGAGGTCTGTGGAGGAGGAAGGTTGAATTAGGGGTTCTGATG
GACATCAGCTCCATTGGGATACTCATTGCCTTGTGAAAAGAATTAAGTACTCTCCC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2E603TF 309 0 0
CTTCTCCTTCTCCACCTCAACACCTGATGGTTCCGAATCCTCGTGGGAAGCGGCGGAAGT
A*CGAAGAAGGAGCGATTAAGCTTGGTATCTGAGCTAAACCCGAGAGGCAGCCTCCCAGT
ACAAGAAACGAGAGATGGAGAAGTGGAGAGGCGTCGGTTGGGGAGGTGTTGGGAACGGAG
AGAAGGAAGCGTGGCGGGTGGTGGGCGAGAGTGAGGTCTGTGGAGGAGGAAGGTTGAATT
AGGGGTT*TGATGGACATCAGCTCCATTGGGATACTCATTGCCTTGTGAAAAGAATTAAG
TACTCTCCC

QA 1 309 1 309
DS 



AS 2 6

CO CL1425Contig1 843 4 13 U
GTGGACTCCAAGGGACTGATCGTAGCTCCCGCAAAGAGTCGCTTCAGCATTTCAAGCAGC
CATGGGCGCATGAGTACGAACCTGTCAAGGACCTCATTGGTGCTGTGAATGCGATCAAAC
CAACTGTTCTCATTGGAACATCAGGTGTGGGTCAGACTTTCACAAAGGAAGTTGTTGAAG
CCATGGCTACCAACAACGAGAAACCGTTGATTCTTGCTCTCTCAAACCCTACTTCTCAAG
CTGAGTGTACCGCAGAACAGGCTTACACATGGACCGAGGGTCGTGCAATCTTTGGTAGTG
GAAGCCCGTTTGATCCCGTTGAGTACAACGGCAAAACTTACTTGCCTGGCCAGGCAAACA
ACTGTTACATTTTCCCTGGTCTGGGACTTGGTTTGATCATGTCCGGTGCAATTCGTGTCC
GTGATGACATGCTCCTCGCAGCTTCTGAAGCATTGGCAGCTCAAGTCACAGAGGAGAACT
TCGCCAACGGTTTGATCTACCCACCATTCTCAAACATCAGAGAGATCTCTGCTAACATTG
CAGCCAGTGTCGCCGCAACAACCTATGACCTCGGATTGGCGTCGAACCTCCCACGTGCGA
AGGATCTGGTGAAGTTTGCAGAGAGCTGCATGTACAGCCCTGTCTACAGAAACTACCGTT
AAAAAGAAGTGTTGCTGAAGAAACCACCTGCAGATTCTTCTTGTATTCACAACCTTGTTG
AGGCTTTTGTATAAGTGTTGTTTGT*TTGTTTTCTACTTTTTCCTACACTATGATGCTTC
GAGCACTCTCTCTTTTGTCTTTGCTTCTTGTTTCTGGAATAAATAAAATCCAATCTACCA
ATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 

AF RR2FX73TF U 257
AF RR2G719JQ C 138
AF RR2E251TF U 55
AF RR2CM15JQ C 1
BS 1 55 RR2CM15JQ
BS 56 257 RR2E251TF
BS 258 373 RR2FX73TF
BS 374 566 RR2E251TF
BS 567 567 RR2CM15JQ
BS 568 722 RR2E251TF
BS 723 723 RR2CM15JQ
BS 724 795 RR2E251TF
BS 796 796 RR2CM15JQ
BS 797 808 RR2E251TF
BS 809 809 RR2CM15JQ
BS 810 818 RR2E251TF
BS 819 843 RR2CM15JQ

RD RR2FX73TF 117 0 0
G
CAGGCTTACACATGGACCGAGGGTCGTGCAATCTTTGGTAGTGGAAGCCCGTTTGATCCC
GTTGAGTACAACGGCAAAACTTACTTGCCTGGCCAGGCAAACAACTGTTACATTTT

QA 2 117 2 117
DS 

RD RR2G719JQ 702 0 0
ACATCAGGTGTGGGTCAGACTTTCACAAAGGAAGTTGTTGAAGCCATGGCTACCAACAAC
GAGAAACCGTTGATTCTTGCTCTCTCAAACCCTACTTCTCAAGCTGAGTGTACCGCAGAA
CAGGCTTACACATGGACCGAGGGTCGTGCAATCTTTGGTAGTGGAAGCCCGTTTGATCCC
GTTGAGTACAACGGCAAAACTTACTTGCCTGGCCAGGCAAACAACTGTTACATTTTCCCT
GGTCTGGGACTTGGTTTGATCATGTCCGGTGCAATTCGTGTCCGTGATGACATGCTCCTC
GCAGCTTCTGAAGCATTGGCAGCTCAAGTCACAGAGGAGAACTTCGCCAACGGTTTGATC
TACCCACCATTCTCAAACATCAGAGAGATTTCTGCTAACATTGCAGCCAGTGTCGCCGCA
ACAACCTATGACCTCGGATTGGCGTCGAACCTCCCACGTGCGAAGGATCTGGTGAAGTTT
GCAGAGAGCTGCATGTACAGCCCTGTCTACAGAAACTACCGTTAAAAAGAAGTGTTGCTG
AAGAAACCACCTGCAGATTCTTCTTGTATTCACAACCTTGTTGAGGCTTTTGTATAAGTG
TTGTTTGT*TTGTTTTCTACTTTTTCCTACACTATGATGCTTCGAGCACTCTCTCTTTTG
TCTTTGCTTCTTGTTTCTGGAATAAATAAAATCCAATCTACC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2E251TF 781 0 0
G
GCAGCCATGGGCGCATGAGTACGAACCTGTCAAGGACCTCATTGGTGCTGTGAATGCGAT
CAAACCAACTGTTCTCATTGGAACATCAGGTGTGGGTCAGACTTTCACAAAGGAAGTTGT
TGAAGCCATGGCTACCAACAACGAGAAACCGTTGATTCTTGCTCTCTCAAACCCTACTTC
TCAAGCTGAGTGTACCGCAGAACAGGCTTACACATGGACCGAGGGTCGTGCAATCTTTGG
TAGTGGAAGCCCGTTTGATCCCGTTGAGTACAACGGCAAAACTTACTTGCCTGGCCAGGC
AAACAACTGTTACATTTTCCCTGGTCTGGGACTTGGTTTGATCATGTCCGGTGCAATTCG
TGTCCGTGATGACATGCTCCTCGCAGCTTCTGAAGCATTGGCAGCTCAAGTCACAGAGGA
GAACTTCGCCAACGGTTTGATCTACCCACCATTCTCAAACATCAGAGAGATCTCTGCTAA
CATTGCAGCCAGTGTCGCCGCAACAACCTATAACCTCGGATTGGCGTCGAACCTCCCACG
TGCGAAGGATCTGGTGAAGTTTGCAGAGAGCTGCATGTACAGCCCTGTCTACAGAAACTA
CCGTTAAAAAGAAGTGTTGCTGAAGAAACCACCTGCAGATTCTTCTTGTATTCACAACCT
TGTTGAG*CTTTTGTATAAGTGTTGTTTGT*TTGTTTTCTACTTTTTCCTACACTATGAT
GCTTCGAGCACTCTCTCTTT*GTCTTTGCTTCT*GTTTCTGGA
TAATAAATCCATCTACC

QA 2 764 2 764
DS 

RD RR2CM15JQ 843 0 0
GTGGACTCCAAGGGACTGATCGTAGCTCCCGCAAAGAGTCGCTTCAGCATTTCAAGCAGC
CATGGGCGCATGAGTACGAAC*TGTCAAGGAC*TCATTGGTGCTGTGAATGCGATCAAAC
CAACTGTTCTCATTGGAACATCAGGTGTGGGTCAGACTTTCACAAAGGAAGTTGTTGAAG
CCATGGCTACCAACAACGAGAAACCGTTGATTCTTGCTCTCTCAAACCCTACTTCTCAAG
CTGAGTGTACCGCAGAACAGGCTTACACATGGACCGAGGGTCGTGCAATCTTTGGTAGTG
GAAGCCCGTTTGATCCCGTTGAGTACAACGGCAAAACTTACTTGCCTGGCCAGGCAAACA
ACTGTTACATTTTCCCTGGTCTGGGACTTGGTTTGATCATGTCCGGTGCAATTCGTGTCC
GTGATGACATGCTCCTCGCAGCTTCTGAAGCATTGGCAGCTCAAGTCACAGAGGAGAACT
TCGCCAACGGTTTGATCTACCCACCATTCTCAAACATCAGAGAGATCTCTGCTAACATTG
CAGCCAGTGTCGCCGCAAAAACCTATGACCTCGGATTGGCGTCGAACCTGCCACGTGCAA
AGGATCTGGTGAAGTTTGCAGAGAGCTGCATGTACAGCCCTGTCTACAGAAACTACCGTT
AAAAAGAAGTGTTGCTGAAGAAACCACCTGCAGATTCTTCTTGTATTCACAACCTTGTTG
AGGCTTTTGTATAAGTGTTGTTTGTGTTGTTTTCTACTTTCTACTACACTATGATGCTTC
GAGCACTCTCTCTTTTGTCTTTGCTTCTTGTTTCTGGAATAAATAAAATCCAATCTACCA
ATT

QA 1 843 1 843
DS 



CO CL1425Contig2 819 2 2 U
GCTACATTGGCCTTAAACAGAGAAGAGCAACTGGCCAGGAGTATTCAGACTTTCTGCATG
AGTTCATGTGCGCTGTGAAGCAGAACTATGGAGAGAAAGTGTTGGTACAGTTTGAAGATT
TTGCAAACCACAACGCGTTTGACCTTCTGTCTAAGTACATGGATACTCATCTTGTCTTCA
ATGACGATATCCAGGGTACTGCATCAGTGGTGCTTGCTGGGCTTATTGCCGCTCAAAAGG
TGCTTGGTAAAAGCCTTGCTGACCATACCTTCTTGTTCTTGGGTGCCGGAGAGGCTGGAA
CTGGTATTGCTGAGTTAATTGCTCTTAAAATTTCGAAAGAGACTGGAGCTCCTATCGAGG
AGACCAGGAAGAAGATTTGGCTCGTGGACTCCAAGGGACTGATCGTTAGCTCCCGCAAAG
AGTCGCTTCAGCATTTCAAGCAGCCATGGGCGCATGAGTACGAACCTGTCAAGGACCTCA
TTGGTGCTGTGAATGCGATCAAACCAACTGTTCTCATTGGAACATCAGGTGTGGGTCAGA
CTTTCACAAAGGAAGTTGTTGAAGCCATGGCTACCAACAACGAGAAACCGTTGATTCTTG
CTCTCTCAAACCCTACTTCTCAAGCTGAGTGTACCGCAGAACAGCTTACACATGGACCGA
GGGTCGTGCAATCTTTGGTAGTGGAAGCCCGTTTGATCCCGTTGAGTACAACGGCAAACT
TACTTGCCTGGCAGGCAACACTGTTACATTTCCTGGTCTGGGACTGGTTGATCATGTCGG
TGCAATCGTGTCCGTGATGACATGCTCTCGCAGCTCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G719TF U 1
AF RR2CM15TF U 16
BS 1 732 RR2G719TF
BS 733 819 RR2CM15TF

RD RR2G719TF 733 0 0
GCTACATTGGCCTTAAACAGAGAAGAGCAACTGGCCAGGAGTATTCAGACTTTCTGCATG
AGTTCATGTGCGCTGTGAAGCAGAACTATGGAGAGAAAGTGTTGGTACAGTTTGAAGATT
TTGCAAACCACAACGCGTTTGACCTTCTGTCTAAGTACATGGATACTCATCTTGTCTTCA
ATGACGATATCCAGGGTACTGCATCAGTGGTGCTTGCTGGGCTTATTGCCGCTCAAAAGG
TGCTTGGTAAAAGCCTTGCTGACCATACCTTCTTGTTCTTGGGTGCCGGAGAGGCTGGAA
CTGGTATTGCTGAGTTAATTGCTCTTAAAATTTCGAAAGAGACTGGAGCTCCTATCGAGG
AGACCAGGAAGAAGATTTGGCTCGTGGACTCCAAGGGACTGATCGTTAGCTCCCGCAAAG
AGTCGCTTCAGCATTTCAAGCAGCCATGGGCGCATGAGTACGAACCTGTCAAGGACCTCA
TTGGTGCTGTGAATGCGATCAAACCAACTGTTCTCATTGGAACATCAGGTGTGGGTCAGA
CTTTCACAAAGGAAGTTGTTGAAGCCATGGCTACCAACAACGAGAAACCGTTGATTCTTG
CTCTCTCAAACCCTACTTCTCAAGCTGAGTGTACCGCAGAACAGCTTACACATGGACCGA
GGGTCGTGCAATCTTTGGTAGTGGAAGCCCGTTTGATCCCGTTGAGTACAACGGCAAACT
TACTTGCCTGGC
A

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2CM15TF 804 0 0
G
ACAGAGAAGAGCAACTGGCCAGGAGTATTCAGACTTTCTGCATGAGTTCATGTGCGCTGT
GAAGCAGAACTATGGAGAGAAAGTGTTGGTACAGTTTGAAGATTTTGCAAACCACAACGC
GTTTGACCTTCTGTCTAAGTACATGGATACTCATCTTGTCTTCAATGACGATATCCAGGG
TACTGCATCAGTGGTGCTTGCTGGGCTTATTGCCGCTCAAAAGGTGCTTGGTAAAAGCCT
TGCTGACCATACCTTCTTGTTCTTGGGTGCCGGAGAGGCTGGAACTGGTATTGCTGAGTT
AATTGCTCTTAAAATTTCGAAAGAGACTGGAGCTCCTATCGAGGAGACCAGGAAGAAGAT
TTGGCTCGTGGACTCCAAGGGACTGATCGTTAGCTCCCGCAAAGAGTCGCTTCAGCATTT
CAAGCAGCCATGGGCGCATGAGTACGAACCTGTCAAGGACCTCATTGGTGCTGTGAATGC
GATCAAACCAACTGTTCTCATTGGAACATCAGGTGTGGGTCAGACTTTCACAAAGGAAGT
TGTTGAAGCCATGGCTACCAACAACGAGAAACCGTTGATTCTTGCTCTCTCAAACCCTAC
TTCTCAAGCTGAGTGTACCGCAGAACAGCTTACACATGGACCGAGGGTCGTGCAATCTTT
GGTAGTGGAAGCCCGTTTGATCCCGTTGAGTACA*CGGCAAACTTACTTGCCTGGCAGGC
AACACTGTTACATTTCCTGGTCTGGGACTGGTTGATCATGTCGGTGCAATCGTGTCCGTG
ATGACATGCTCTCGCAGCTCTGA

QA 2 804 2 804
DS 



AS 1 6

CO CL1426Contig1 897 6 30 U
GGAATCACACGAAGAACAGAGACGACACTTTCTTCGCCCAGAAATATCTCATCTCAAAAA
AGAAAAAAACTTTCCGACAATGTCTTCTCGCCGGAGAGTTCTTCTGAAGGTTATCATCCT
CGGTGATAGCGGGGTTGGCAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAATCGCAAGTTTAG
CAATCAGTATAAAGCTACGATTGGAGCTGATTTCTTGACCAAAGAGGTTCAAATCGATGA
CAGGATCTTCACTTTACAGATTTGGG*ATACTGCTGGGCAA*GAAAGGTTCCAAA*GTCT
GGG*AGTTGCTTTCTACAGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTA
TGAAGTCTTTCGAGAATCTTAATAACTGGAGGGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTAGTCCAT
CAGATCCTGAAAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAACAAGACCGATATTGACGGTGGCA
AGAGCCGAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCATCTAAAGGTAACATTC
CTTACTTTGAGACATCCGCTAAAGAAGGATTCAACGTCGATGCGGCTTTCGAATGCATCA
CCAAGAATGCCTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACATGCCTGACACTATTGATG
TTGCTAGAGGTCAGCAACAAAGATCAACAGGGTGTGAATGCTAAATCAAAGTTTGTTGCA
GAGGGTTACCATACAACTATAAAGTTAATTTCAGTTCATTGATTCACAGATTCTAAGGAT
TGAGTTCCTTTCTTTTACAATTCAGACACAATATAATGTCACAAAACTCTCATCTATGAT
CTTTCTCTGTCTCTTCTTGTGTATACATTGCCTCGAACTTGATTACAATTCATCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A036TF U 191
AF RR2GJ93TF U 5
AF RR2BW18TF U 7
AF RR2BW18JQ C 249
AF RR2CS34TF U 1
AF RR2GJ93JQB C 276
BS 1 39 RR2CS34TF
BS 40 40 RR2GJ93TF
BS 41 58 RR2CS34TF
BS 59 60 RR2GJ93TF
BS 61 67 RR2CS34TF
BS 68 68 RR2GJ93TF
BS 69 76 RR2CS34TF
BS 77 77 RR2GJ93TF
BS 78 87 RR2CS34TF
BS 88 88 RR2GJ93TF
BS 89 180 RR2CS34TF
BS 181 181 RR2GJ93TF
BS 182 234 RR2CS34TF
BS 235 235 RR2GJ93TF
BS 236 391 RR2CS34TF
BS 392 392 RR2GJ93TF
BS 393 457 RR2CS34TF
BS 458 458 RR2GJ93TF
BS 459 523 RR2CS34TF
BS 524 524 RR2GJ93TF
BS 525 556 RR2CS34TF
BS 557 557 RR2GJ93TF
BS 558 574 RR2CS34TF
BS 575 575 RR2GJ93TF
BS 576 589 RR2CS34TF
BS 590 590 RR2GJ93TF
BS 591 652 RR2CS34TF
BS 653 653 RR2BW18TF
BS 654 726 RR2CS34TF
BS 727 897 RR2GJ93JQB

RD RR2A036TF 437 0 0
AAAGCTACGATTGGAGCTGATTTCTTGACCAAAGAGGTTCAAATTGATGACAGGATCTTC
ACTTTACAGATTTGGG*ATACTGCTGGGCAA*GAAAGGTTCCAAA*GTCTGGG*AGTTGC
TTTCTACAGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTATGAAGTCTTT
CGAGAATCTTAATAACTGGAGAGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTAGTCCATCAGATCCTGA
AAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAATAAGACCGATATTGACGGTGGCAAGAGCCGAGT
GGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCTTCTAAAGGTAACATTCCTTACTTTGA
GACATCTGCTAAAGAAGGATTCAATGTCGATGCGGCTTTTGAATGCATCACCAAGAATGC
CTTCAAGAATGAACCTG

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR2GJ93TF 627 0 0
GGAC
ACGAAGAACAGAGACGACACTTTCTTCGCCCAGAAATATCTCATCTCAAAAAAGAAAAAA
ACTTTCCGACAATGTCTTCTCGCTGGAGAGTTCTTCTGAAGGTTATCATCCTCGGTGATA
GCGGGGTTGGCAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAATCGCAAGTTTAGCAATCAGT
ATAAAGCTACGATTGGAGCTGATTTCTTGACCAAAGAGGTTCAAATCGATGACAGGATCT
TCACTTTACAGATTTGGG*ATACTGCTGGGCAA*GAAAGGTTCCAAA*GTCTGGG*AGTT
GCTTTCTACAGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTATGAAGTCT
TTCGAGAATCTTAATAACTGGAGGGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTAGTCCATCAGATCCT
GAAAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAACAAGACCGATATTGACGGTGGCAAGAGCCGA
GTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCATCTAAAGGTAACATTCCTTACTTT
GAGACATCCGCTAAAGAAGGATTCAACGTCGATGCGGCTTTCGAATGCATCACCAAGAAT
GCCTTCAAGAATGAACCTGAAGA

QA 5 627 5 627
DS 

RD RR2BW18TF 713 0 0
GG
ACGAAGAACAGAGACGACACTTTCTTCGCCCAGAAATATCTCATCTCAAAAAAGAAAAAA
ACTTTCCGACGATGTCTTCTCGCCGGAGAGTTCTTCTGAAGGTTATCATCCTCGGTGATA
GCGGGGTTGGCAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAATCGCAAGTTTAGCAATCAGT
ATAAAGCTACGATTGGAGCTGATTTCTTGACCAAAGAGGTTCAAATCGATGACAGGATCT
TCACTTTACAGATTTGGG*ATACTGCTGGGCAA*GAAAGGTTCCAAA*GTCTGGG*AGTT
GCTTTCTACAGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTATGAAGTCT
TTCGAGAATCTTAATAACTGGAGGGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTAGTCCATCAGATCCT
GAAAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAACAAGACCGATATTGACGGTGGCAAGAGCCGA
GTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCATCTAAAGGTAACATTCCTTACTTT
GAGACATCCGCTAAAGAAGGATTCAACGTCGATGCGGCTTTCGAATGCATCACCAAGAAT
GCCTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACATGCCTGACACTATTGATGTTGCTAGA
GGTCAGCAACAAAGATCAACAGGGTGTGA*TGCTAAATCAAAGTTTGTTGC

QA 3 713 3 713
DS 

RD RR2BW18JQ 431 0 0
TCACTTTACAGATTTGGGGATACTGCTGGGCAAAGAAAGGTTCCAAAAGTCTGGGGAGTT
GCTTTCTACAGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTATGAAGTCT
TTCGAGAATCTTAATAACTGGAGGGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTAGTCCATCAGATCCT
GAAAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAACAAGACCGATATTGACGGTGGCAAGAGCCGA
GTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCATCTAAAGGTAACATTCCTTACTTT
GAGACATCCGCTAAAGAAGGATTCAACGTCGATGCGGCTTTCGAATGCATCACCAAGAAT
GCCTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACATGCCTGACACTATTGATGTTGCTAGA
GGTCAGCAACA

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR2CS34TF 728 0 0
GGAATCACACGAAGAACAGAGACGACACTTTCTTCGCCCCGAAATATCTCATCTCAAA**
AGAAAAACACTTTCCGTCAATGTCTTCGCGCCGGAGAGTTCTTCTGAAGGTTATCATCCT
CGGTGATAGCGGGGTTGGCAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAATCGCAAGTTTAG
TAATCAGTATAAAGCTACGATTGGAGCTGATTTCTTGACCAAAGAGGTTCAAATTGATGA
CAGGATCTTCACTTTACAGATTTGGG*ATACTGCTGGGCAA*GAAAGGTTCCAAA*GTCT
GGG*AGTTGCTTTCTACAGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTA
TGAAGTCTTTCGAGAATCTTAATAACTGGAGAGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTAGTCCAT
CAGATCCTGAAAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAATAAGACCGATATTGACGGTGGCA
AGAGCCGAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCTTCTAAAGGTAACATTC
CTTACTTTGAGACATCTGCTAAAGAAGGATTCAATGTCGATGCGGCTTTTGAATGCATCA
CCAAGAATGCCTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACATGCCTGACACCATTGATG
TTGCTAGAGGTCAGCAACAAAGATCAACAGGGTGTGAATGCTAAATCAAAGTTTGTTGCA
GAGGGT
AC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2GJ93JQB 622 0 0
GGGCAA*GAAAGGTTCCAAA*GTCTGGG*AGTTGCTTTCTACAGAGGAGCTGATTGTTGT
GTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTATGAAGTCTTTCGAGAATCTTAATAACTGGAGGGAA
GAGTTCTTGATTCAGGCTAGTCCATCAGATCCTGAAAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGG
AACAAGACCGATATTGACGGTGGCAAGAGCCGAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCA
TGGTGTGCATCTAAAGGTAACATTCCTTACTTTGAGACATCCGCTAAAGAAGGATTCAAC
GTCGATGCGGCTTTCGAATGCATCACCAAGAATGCCTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAA
CCGTACATGCCTGACACTATTGATGTTGCTAGAGGTCAGCAACAAAGATCAACAGGGTGT
GAATGCTAAATCAAAGTTTGTTGCAGAGGGTTACCATACAACTATAAAGTTAATTTCAGT
TCATTGATTCACAGATTCTAAGGATTGAGTTCCTTTCTTTTACAATTCAGACACAATATA
ATGTCACAAAACTCTCATCTATGATCTTTCTCTGTCTCTTCTTGTGTATACATTGCCTCG
AACTTGATTACAATTCATCTCT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 2 6

CO CL1427Contig1 689 4 9 U
CAATCTTCTTCTTCCGCGTAGTTTCCCTGGAAAAAAAATCAATTTTCGTGGAGTCGTCAG
CTTCATCCCTTCTTTATTACTTAATTCTCTCGCTGCCTGCTGTTGCTGTTCGTTTGCTTC
ATCTTTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGAGACGGTGATCGGAGTACCGTATTACG
CGGGGCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCCGCCGAACGCAATCTATGGAGATCCGA
TGGGTGCTCCGATCCATCAAACGTTTTATCGGGATACTCCTGCTCCTTTCAATTGCCTCT
ATTGCGGCAATACTGGTCTCACCCATATCAGATCAAAGCCCGGTGTAGCTGCTGTTGTTG
CTTGCATGACTCCGTTTATGCTTGGATTCTGTTTTCTCTGCCCTTCAATGGATTGCCTCT
GGAACAAACAGCATCATTGCCCTCAGTGTGGGAATAAGGTTGCTGACTTTGAGAAATCAG
ATCCCTGTCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGGACGCAACCGAGCTTTGCACTCCCTGCAT
GATATAAGACTGCATTCTTTTTTTCTTGTTAATATTACTT*GTGAAGTTGAGACCTTGTG
ATTGCACGTACCTACAAAAAATTGAAGATTCTGAATAAACCCTGTAAAATGTGTGAGATA
AGGAACATATACAATTGTCTTTATCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL81TF U 1
AF RR2FR59JQ C 93
AF RR2FR59TF U 93
AF RR2BL81JQ C 21
BS 1 580 RR2BL81TF
BS 581 581 RR2FR59TF
BS 582 620 RR2BL81TF
BS 621 621 RR2FR59TF
BS 622 629 RR2BL81TF
BS 630 630 RR2FR59TF
BS 631 648 RR2BL81TF
BS 649 657 RR2FR59TF
BS 658 689 RR2BL81JQ

RD RR2BL81TF 655 0 0
CAATCTTCTTCTTCCGCGTAGTTTCCCTGGAAAAAAAATCAATTTTCGTGGAGTCGTCAG
CTTCATCCCTTCTTTATTACTTAATTCTCTCGCTGCCTGCTGTTGCTGTTCGTTTGCTTC
ATCTTTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGAGACGGTGATCGGAGTACCGTATTACG
CGGGGCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCCGCCGAACGCAATCTATGGAGATCCGA
TGGGTGCTCCGATCCATCAAACGTTTTATCGGGATACTCCTGCTCCTTTCAATTGCCTCT
ATTGCGGCAATACTGGTCTCACCCATATCAGATCAAAGCCCGGTGTAGCTGCTGTTGTTG
CTTGCATGACTCCGTTTATGCTTGGATTCTGTTTTCTCTGCCCTTCAATGGATTGCCTCT
GGAACAAACAGCATCATTGCCCTCAGTGTGGGAATAAGGTTGCTGACTTTGAGAAATCAG
ATCCCTGTCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGGACGCAACCGAGCTTTGCACTCCCTGCAT
GATATAAGACTGCATTCTTTTTTTCTTGTTAATATTACTTTGTGAAGTTGAGACCTTGTG
ATTGCACGTACCTACAAAAA*TTGAAGAT*CTGAATAAACCCTGTAAA
TGTGTGA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2FR59JQ 565 0 0
GG
GCCTGCTGTTGCTGTTCGTTTGCTTCATCTTTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGA
GACGGTGATCGGAGTACCGTATTACGCGGGGCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCC
GCCGAACGCAATCTATGGAGATCCGATGGGTGCTCCGATCCATCAAACGTTTTATCGGGA
TACTCCTGCTCCTTTCAATTGCCTCTATTGCGGCAATACTGGTCTCACCCATATCAGATC
AAAGCCCGGTGTAGCTGCTGTTGTTGCTTGCATGACTCCGTTTATGCTTGGATTCTGTTT
TTTCTGCCCTTCAATGGATTGCCTCTGGAACAAACAGCATCATTGCCCTCAGTGTGGGAA
TAAGGTTGCTGACTTTGAGAAATCAGATCCCTGTCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGGAC
GCAACCGAGCTTTGCACTCCCTGCATGATATAAGACTGCATTCTTTTTTTCTTGTTAATA
TTACTT*GTGAAGTTGAGACCTTGTGATTGCACGTACCTACAAAAAATTGAAGATTCTGA
ATAAACCCTGTAAAATGTGTGAG

QA 3 565 3 565
DS 

RD RR2FR59TF 565 0 0
GG
GCCTGCTGTTGCTGTTCGTTTGCTTCATCTTTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGA
GACGGTGATCGGAGTACCGTATTACGCGGGGCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCC
GCCGAACGCAATCTATGGAGATCCGATGGGTGCTCCGATCCATCAAACGTTTTATCGGGA
TACTCCTGCTCCTTTCAATTGCCTCTATTGCGGCAATACTGGTCTCACCCATATCAGATC
AAAGCCCGGTGTAGCTGCTGTTGTTGCTTGCATGACTCCGTTTATGCTTGGATTCTGTTT
TCTCTGCCCTTCAATGGATTGCCTCTGGAACAAACAGCATCATTGCCCTCAGTGTGGGAA
TAAGGTTGCTGACTTTGAGAAATCAGATCCCTGTCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGGAC
GCAACCGAGCTTTGCACTCCCTGCATGATATAAGACTGCATTCTTTTTTTCTTGTTAATA
TTACTT*GTGAAGTTGAGACCTTGTGATTGCACGTACCTACAAAAAATTGAAGATTCTGA
ATAAACCCTGTAAAATGTGTGAG

QA 3 565 3 565
DS 

RD RR2BL81JQ 669 0 0
GTTTCCCTGGAAAAAAAATCAATTTTCGTGGAGTCGTCAGCTTCATCCCTTCTTTATTAC
TTAATTCTCTCGCTGCCTGCTGTTGCTGTTCGTTTGCTTCATCTTTAATCGTTGACGATG
TCGAAAGAGGGAGAGACGGTGATCGGAGTACCGTATTACGCGGGGCAGAACCCGTATCAG
GCGGGGATTGTGCCGCCGAACGCAATCTATGGAGATCCGATGGGTGCTCCGATCCATCAA
ACGTTTTATCGGGATACTCCTGCTCCTTTCAATTGCCTCTATTGCGGCAATACTGGTCTC
ACCCATATCAGATCAAAGCCCGGTGTAGCTGCTGTTGTTGCTTGCATGACTCCGTTTATG
CTTGGATTCTGTTTTCTCTGCCCTTCAATGGATTGCCTCTGGAACAAACAGCATCATTGC
CCTCAGTGTGGGAATAAGGTTGCTGACTTTGAGAAATCAGATCCCTGTCTGGTGATGGAT
CCGCCACAGTGGACGCAACCGAGCTTTGCACTCCCTGCATGATATAAGACTGCATTCTTT
TTTTCTTGTTAATATTACTT*GTGAAGTTGAGACCTTGTGATTGCACGTACCTACAAAAA
ATTGAAGATTCTGAATAAACCCTGTAAAATGTGTGAGATAAGGAACATATACAATTGTCT
TTATCGTCC

QA 1 669 1 669
DS 



CO CL1427Contig2 736 2 4 U
GGCCAATCTTCTTCTTCCGCGTAGTTTCCCTGGAAAAAAAATCAATTTTCGTGGAGTCGT
CAGCTTCATCCCTTCTTTATTACTTAATTTCTCGCTGCCTGCTGTTGCTGTTCGTTTGCT
TCATCTTTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGAGACGGTGATCGGAGTACCGTATTA
CGCGGGGCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCCGCCGAACGCAATCTATGGAGATCC
GATGGGTGCTCCGATCCATCAAACGTTTTATCGGGATACTCCTGCTCCTTTCAATTGCCT
CTATTGCGGCAATACTGGTCTCACCCATATCAGATCAAAGCCCGGTGTAGCTGCTGTTGT
TGCTTGCATGACTCCGTTTATGCTTGGATTCTGTTTTCTCTGCCCTTCAATGGATTGCCT
TTGGAACAAACAGCATCATTGCCCTCAGTGTGGGAATAAGGTTGCTGACTTTGAGAAATC
AGATCCCTGCCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGGACGCAACCAAGCTTTGCCCTCCCTGC
ATGATAAAAGACTGCATTATTTTCTTCTTCTTTTTCTTGTTAATATTACATGTGAAGTTG
AGACCTTGTGTTTGCACGTACCTACAAAAATTGAAGATTCTGAATAAACCCTGTGAAATG
TGTGAGAAAAGGAACATATACAATTGTCTGTATCGTCCAGTGATTCGTTAATTGCACCGT
TTAGTGTCTTGATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G851TF U 1
AF RR2G851JQ C 122
BS 1 629 RR2G851TF
BS 630 630 RR2G851JQ
BS 631 664 RR2G851TF
BS 665 736 RR2G851JQ

RD RR2G851TF 664 0 0
GGCCAATCTTCTTCTTCCGCGTAGTTTCCCTGGAAAAAAAATCAATTTTCGTGGAGTCGT
CAGCTTCATCCCTTCTTTATTACTTAATTTCTCGCTGCCTGCTGTTGCTGTTCGTTTGCT
TCATCTTTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGAGACGGTGATCGGAGTACCGTATTA
CGCGGGGCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCCGCCGAACGCAATCTATGGAGATCC
GATGGGTGCTCCGATCCATCAAACGTTTTATCGGGATACTCCTGCTCCTTTCAATTGCCT
CTATTGCGGCAATACTGGTCTCACCCATATCAGATCAAAGCCCGGTGTAGCTGCTGTTGT
TGCTTGCATGACTCCGTTTATGCTTGGATTCTGTTTTCTCTGCCCTTCAATGGATTGCCT
TTGGAACAAACAGCATCATTGCCCTCAGTGTGGGAATAAGGTTGCTGACTTTGAGAAATC
AGATCCCTGCCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGGACGCAACCAAGCTTTGCCCTCCCTGC
ATGATAAAAGACTGCATTATTTTCTTCTTCTTTTTCTTGTTAATATTACATGTGAAGTTG
AGACCTTGTGTTTGCACGTACCTACAAAA*TTGAAGATTCTGAATAAACCCTGTGAAATG
TGTG

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2G851JQ 615 0 0
CATCTTTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGAGACGGTGATCGGAGTACCGTATTAC
GCGGGGCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCCGCCGAACGCAATCTATGGAGATCCG
ATGGGTGCTCCGATCCATCAAACGTTTTATCGGGATACTCCTGCTCCTTTCAATTGCCTC
TATTGCGGCAATACTGGTCTCACCCATATCAGATCAAAGCCCGGTGTAGCTGCTGTTGTT
GCTTGCATGACTCCGTTTATGCTTGGATTCTGTTTTCTCTGCCCTTCAATGGATTGCCTT
TGGAACAAACAGCATCATTGCCCTCAGTGTGGGAATAAGGTTGCTGACTTTGAGAAATCA
GATCCCTGCCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGGACGCAACCAAGCTTTGCCCTCCCTGCA
TGATAAAAGACTGCATTATTTTCTTCTTCTTTTTCTTGTTAATATTACATGTGAAGTTGA
GACCTTGTGTTTGCACGTACCTACAAAAATTGAAGATTCTGAATAAACCCTGTGAAATGT
GTGAGAAAAGGAACATATACAATTGTCTGTATCGTCCAGTGATTCGTTAATTGCACCGTT
TAGTGTCTTGATTCT

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 5

CO CL1428Contig1 1046 5 16 U
AGGAGAGCAATATCTTATCCAATTATTATTCTTTTGTTTTATTCTTTAAACATTCTTTAA
AAAAGTAGTACTTGATGTTACATAAGCTTTTGATTGGAAAAAAAACAAACAAAAAGTTAA
TTATTTATTTAACTTTTTAAATACTCGACCGGCTTGTTAATAAAAGGATAAAACTCAAAC
CTAAAAGTACAGCTTGTACCCACAAATCTCGCTCCTCGTTTATCATTCAAGCAATCTTGA
AAATGCAACCTATTGAAAACCAAACACTCTTCACAAGCTTGTGGTGATATGTCTTTGGTA
CACTGCACCATTCCATAAATCGTATCACCCTTGAACCGAGTCTCCCCCACAGAGTATAAT
GCTGTTGGCTGACTGTAGTTAACTTGACTGAGGGCTAACGTCGTCAGATTGTCCATGAGA
GTATTCCAAACACTTCCAAACCCGAGTTTATCTCCCAACTTCTTTGCGTTGGACATACAA
AAGATATTGTCGTAATCGATCTTTCCAGTAGCATATGTGGACGAAAACGAGAGAAGACAT
TGGTCATACCATACTATTCTCCCCTTATACCACGGACATTTCTTACGAAGCACAGCCATG
GAGGTGGCAAAGCAGTCGCGGCATTTGGGGCCATAGGAATCGCCACGGCACTGAAGGATA
GCGGATAAGTCATCAGAGCCGAGCAGAGCGAAACCTGGTTTATCGTTACTGTTTTTATAG
AACATTCTTATGACTTTTTTTAAAAGTTCCTGGTAATCGCTTCCCGGCTTATATTTTCCT
TGACTATCCAAGCATTTGTGGTTGAGATACGCATTTGTAGTGTTTAAGGACAATTTGCTG
CTTATAAAGAGAAGTTGTATGGCTAAGACATGAATCAAAATGAGGCGTTTTGATACAGAT
GATGAAGAGTACATTGTTCTGATTTATTTTTCTCAAAGAGGATTTTTTCTAGATGATTAG
TTGGGACTGATGTTTATGTAAGACTCAACAGATATATGATGTTTATACATATAATATATT
TTTCTGGTTACCCAGTTCGCAATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK07JQ U 1
AF RR2C309JQ U 19
AF RR2B316JQ U 12
AF RR2B316TF C 256
AF RR2C309TF C 373
BS 1 67 RR2AK07JQ
BS 68 68 RR2B316JQ
BS 69 146 RR2AK07JQ
BS 147 147 RR2B316JQ
BS 148 201 RR2AK07JQ
BS 202 202 RR2B316JQ
BS 203 209 RR2AK07JQ
BS 210 435 RR2B316JQ
BS 436 436 RR2C309JQ
BS 437 780 RR2B316JQ
BS 781 862 RR2B316TF
BS 863 863 RR2C309TF
BS 864 931 RR2B316TF
BS 932 932 RR2C309TF
BS 933 945 RR2B316TF
BS 946 1046 RR2C309TF

RD RR2AK07JQ 209 0 0
AGGAGAGCAATATCTTATCCAATTATTATTCTTTTGTTTTATTCTTTAAACATTCTTTAA
AAAAGTAATACTTGATGTTACATAAGCTTTTGATTGGAAAAAAAACAAACAAAAAGTTAA
TTATTTATTTAACTTTTTAAATACTCCACCGGCTTGTTAATAAAAGGATAAAACTCAAAC
CTAAAAGTACAGCTTGTACCCCCAAATCT

QA 1 209 1 209
DS 

RD RR2C309JQ 495 0 0
CCAATTATTATTCTTTTGTTTTATTCTTTGAACATTCTTTAAAAAAGTAGTACTTGATGT
TACATAAGCTTTTGATTGGAAAAAAAACAAACAAAAAGTTAATTATTTATTTAACTTTTT
AAATACTCGACCGGCTTGTTAATAAAAGGATAAAACTCAAACCTAAAAGTACAGCTCGTA
CCCACAAATCTCGCTCCTCGTTTATCATTCAAGCAATCTTGAAAATGCAACCTATTGAAA
ACCAAACACTCTTCACAAGCTTGTGGTGATATGTCTTTCGTACACTGCACCATTCCATAA
ATTGTATCACCCTTGAACCGAGTCTCCCCCACAGAGTATAATGCTGTTGGCCGACTGTAG
TTGACTTGACTGAGGGCTAACGTCGTCAGATTGTCCATGAAAGTATTCCAAACACTTCCA
AACCCGAGTTTATCTCCCAACTTCTTTGCGTTGGACATACAAAAAATATTTTCGTAATCG
ATCTTTCCAGTAGCA

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR2B316JQ 769 0 0
ATCTTAT
CCAATTATTATTCTTTTGTTTTATTCTTTAAACATTCTTTAAAAAAGTAGTACTTGATGT
TACATAAGCTTTTGATTGGAAAAAAAACAAACAAAAAGTTAATTATTTATTTAACTTTTT
AAATACTCGACCGGCTTGTTAATAAAAGGATAAAACTCAAACCTAAAAGTACAGCTTGTA
CCCACAAATCTCGCTCCTCGTTTATCATTCAAGCAATCTTGAAAATGCAACCTATTGAAA
ACCAAACACTCTTCACAAGCTTGTGGTGATATGTCTTTGGTACACTGCACCATTCCATAA
ATCGTATCACCCTTGAACCGAGTCTCCCCCACAGAGTATAATGCTGTTGGCTGACTGTAG
TTAACTTGACTGAGGGCTAACGTCGTCAGATTGTCCATGAGAGTATTCCAAACACTTGCA
AACCCGAGTTTATCTCCCAACTTCTTTGCGTTGGACATACAAAAGATATTGTCGTAATCG
ATCTTTCCAGTAGCATATGTGGACGAAAACGAGAGAAGACATTGGTCATACCATACTATT
CTCCCCTTATACCACGGACATTTCTTACGAAGCACAGCCATGGAGGTGGCAAAGCAGTCG
CGGCATTTGGGGCCATAGGAATCGCCACGGCACTGAAGGATAGCGGATAAGTCATCAGAG
CCGAGCAGAGCGAAACCTGGTTTATCGTTACTGTTTTTATAGAACATTCTTATGACTTTT
TTTAAAAGTTCCTGGTAATCGCTTCCCGGCTTATATTTTCCT

QA 8 769 8 769
DS 

RD RR2B316TF 690 0 0
AAAACCAAACACTCTTCACAAGCTTGTGGTGATATGTCTTTGGTACACTGCACCATTCCA
TAAATCGTATCACCCTTGAACCGAGTCTCCCCCACAGAGTATAATGCTGTTGGCTGACTG
TAGTTAACTTGACTGAGGGCTAACGTCGTCAGATTGTCCATGAGAGTATTCCAAACACTT
GCAAACCCGAGTTTATCTCCCAACTTCTTTGCGTTGGACATACAAAAGATATTGTCGTAA
TCGATCTTTCCAGTAGCATATGTGGACGAAAACGAGAGAAGACATTGGTCATACCATACT
ATTCTCCCCTTATACCACGGACATTTCTTAAGAAGCACAGCCATGGAGGTGGCAAAGCAG
TCGCGGCATTTGGGGCCATAGGAATCGCCACGGCACTGAAGGATAGCGGATAAGTCATCA
GAGCCGAGCAGAGCGAAACCTGGTTTATCGTTACTGTTTTTATAGAACATTCTTATGACT
TTTTTTAAAAGTTCCTGGTAATCGCTTCCCGGCTTATATTTTCCTTGACTATCCAAGCAT
TTGTGGTTGAGATACGCATTTGTAGTGTTTAAGGACAATTTGCTGCTTATAAAGAGAAGT
TGTATGGGTAAGACATGAATCAAAATGAGGCGTTTTGATACAGATGATGAAGAGTACATT
GTTCTGATTTATTTTTGTCAAAGAGGATTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2C309TF 674 0 0
CTGTAGTTGACTTGACTGAGGGCTAACGTCGTCAGATTGTCCATGAGAGTATTCCAAACA
CTTCCAAACCCGAGTTTATCTCCCAACTTCTTTGCGTTGGACATACAAAAGATATTTTCG
TAATCGATCTTTCCAGTAGCATATGTGGACGAAAACGAGAGAAGACATTGGTCATACCAT
ACTATTCTCCCCTTATACCACGGACATCTCTTACGAAGCACAGCCATGGAGGTGGCAAAG
CAGTCGCGGCATTTGGGGCCATAGGAATCGCCACGGCACTGAAGGATAGCGGATAAGTCA
TCAGAGCCGAGCAGAGCGAAACCTGGTTTATCGTTACTGTTTTTATAGAACATTCTTATG
ACTTTTTTTAAAAGTTCCTGGTAATCGCTTCCCGGCTTGTATTTTCCTTGACTATCCAAG
CATTTGTGGTTGAGATACGCATTTGTAGTGTTTAAGGACAATTTGCTGCTTATAAAGAGA
AGTTGTATGGCTAAGACATGAATCAAAATGAGGCGTTTTGATACAGATGATGAAGAGTAC
ATTGTTCTGATTTATTTTTCTCAAAGAGGATTTTTTCTAGATGATTAGTTGGGACTGATG
TTTATGTAAGACTCAACAGATATATGATGTTTATACATATAATATATTTTTCTGGTTACC
CAGTTCGCAATTTG

QA 1 674 1 674
DS 



AS 2 6

CO CL1429Contig1 731 4 19 U
GAGGCTGAAAGATCACTACATGATGCCTTATGTGTACTCTCCCAAACGGTGAATGACAGT
AGGGTGTTGCTCGGAGGTGGATGGCCAGAGATGGTGATGGCAAAGGAAGTAGATGAGCTT
GCAAGGAAAACCGCAGGCAAAAAAATCACATGCCATTGAAGCTTTCTCACGGGCTCTTGT
GGCTATACCGACCACAATCGCTGACAATGCTGGTTTAGACAGTGCCGAATTAGTCGCTCA
GCTACGTGCGGAGCACCATAACGAAGGGTGTAACGCAGGGATCGATGTCATCTCTGGAGC
TGTAGGAGACATGGAGGAGAGAGGAATCTATGAAGCATTCAAAGTGAAGCAAGCGGTTCT
GCTTTCCGCAACAGAAGCAGCTGAGATGATACTGCGAGTGGATGAGATCATTACATGTGC
TCCTAGGAGGAGAGAAGATAGGATGTGATGACATTACACTATCACAAACCTCCTTCAATG
CAGTAGGTTGTGTTTTTGATTTGGACCAGAAAACAGCTTTATATGTTTAATGTTTTGCTC
CTTGAACTTGTCTCCTTTGTTTGGTTCTTTTTTCGGATATGGTTTTGACTTTGGTTTGAG
AGGTTTTGACGAAATGCAA*GGAGTCGCCTGCATCCGATACAATCTGATTTATTTGTATC
TGTTTCGGTGAGAGTATTATTCATGTATGGTTGATAATTTAGTTTTCTTACAAGCTTATC
ACTATTCCACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C561JQ C 96
AF RR2C561TF U 96
AF RR2AK03JQ C 1
AF RR2AK03TF U 1
BS 1 95 RR2AK03TF
BS 96 101 RR2C561TF
BS 102 102 RR2AK03TF
BS 103 134 RR2C561TF
BS 135 135 RR2AK03TF
BS 136 144 RR2C561TF
BS 145 145 RR2AK03TF
BS 146 147 RR2C561TF
BS 148 148 RR2AK03TF
BS 149 192 RR2C561TF
BS 193 193 RR2AK03TF
BS 194 276 RR2C561TF
BS 277 277 RR2AK03TF
BS 278 288 RR2C561TF
BS 289 289 RR2AK03TF
BS 290 366 RR2C561TF
BS 367 367 RR2AK03TF
BS 368 709 RR2C561TF
BS 710 731 RR2AK03TF

RD RR2C561JQ 614 0 0
GATGGCGAAGGAAGTAGATGAGCTTGCAAGGAAAACCGCTGGCAAAAAA*TCCCATGCCA
TTGAAGCTTTCTCACGGGCTCTTGTGGCTATACCGACGACAATCGCTGACAATGCTGGTT
TAGACAGTGCCGAATTAGTCGCTCAGCTACGTGCGGAGCACCATAACGAAGGGTGTAACG
CTGGGATCGATGTTATCTCTGGAGCTGTAGGAGACATGGAGGAGAGAGGAATCTATGAAG
CATTCAAAGTGAAGCAAGCGGTTCTGCTTTCTGCAACAGAAGCAGCTGAGATGATACTGC
GAGTGGATGAGATCATTACATGTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGATAGGATGTGATGACATT
ACACTATCACAAACCTCCTTCAATGCAGTAGGTTGTGTTTTTGATTTGGACCAGAAAACA
GCTTTATATGTTTAATGTTTTGCTCCTTGAACTTGTCTCCTTTGTTTGGTTCTTTTTTCG
GATATGGTTTTGACTTTGGTTTGAGAGGTTTTGACGAAATGCAA*GGAGTCGCCTGCATC
CGATACAATCTGATTTATTTGTATCTGTTTCGGTGAGAGTATTATTCATGTATGGTTGAT
AATTTAGTTTTCTT

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2C561TF 614 0 0
GATGGCGAAGGAAGTAGATGAGCTTGCAAGGAAAACCGCTGGCAAAAAA*TCCCATGCCA
TTGAAGCTTTCTCACGGGCTCTTGTGGCTATACCGACGACAATCGCTGACAATGCTGGTT
TAGACAGTGCCGAATTAGTCGCTCAGCTACGTGCGGAGCACCATAACGAAGGGTGTAACG
CTGGGATCGATGTTATCTCTGGAGCTGTAGGAGACATGGAGGAGAGAGGAATCTATGAAG
CATTCAAAGTGAAGCAAGCGGTTCTGCTTTCTGCAACAGAAGCAGCTGAGATGATACTGC
GAGTGGATGAGATCATTACATGTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGATAGGATGTGATGACATT
ACACTATCACAAACCTCCTTCAATGCAGTAGGTTGTGTTTTTGATTTGGACCAGAAAACA
GCTTTATATGTTTAATGTTTTGCTCCTTGAACTTGTCTCCTTTGTTTGGTTCTTTTTTCG
GATATGGTTTTGACTTTGGTTTGAGAGGTTTTGACGAAATGCAA*GGAGTCGCCTGCATC
CGATACAATCTGATTTATTTGTATCTGTTTCGGTGAGAGTATTATTCATGTATGGTTGAT
AATTTAGTTTTCTT

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2AK03JQ 731 0 0
GAGGCTGAAAGATCACTACATGATGCCTTATGTGTACTCTCCCAAACGGTGAATGACAGT
AGGGTGTTGCTCGGAGGTGGATGGCCAGAGATGGTGATGGCAAAGGAAGTAGATGAGCTT
GCAAGGAAAACCGCAGGCAAAAAAATCACATGCCATTGAAGCTTTCTCACGGGCTCTTGT
GGCTATACCGACCACAATCGCTGACAATGCTGGTTTAGACAGTGCCGAATTAGTCGCTCA
GCTACGTGCGGAGCACCATAACGAAGGGTGTAACGCAGGGATTGATGTCATCTCTGGAGC
TGTAGGAGACATGGAGGAGAGAGGAATCTATGAAGCATTCAAAGTGAAGCAAGCGGTTCT
GCTTTCCGCAACAGAAGTTGCTGAGATGATACTGCGAGTGGATGAGATCATTACATGTGC
TCCTAGGAGGAGAGAAGATAGGATGTGATGACATTACACTATCACAAACCTCCTTCAATG
CAGTAGGTTGTGTTTTTGATTTGGACCAGAAAACAGCTTTATATGTTTAATGTTTTGCTC
CTTGAACTTGTCTCCTTTGTTTGGTTCTTTTTTCGGATATGGTTTTGACTTTGGTTTGAG
AGGTTTTGACGAAGTGCAA*GGAGTCGCCTGCATCCGATACAATCTGATTTATTTGTATC
TGTTTCGGTGAGAGTA***TTCATGTATGGTTGATAATTTAGTTTTCTTACAAGCTTATC
ACTATTCCACC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2AK03TF 731 0 0
GAGGCTGAAAGATCACTACATGATGCCTTATGTGTACTCTCCCAAACGGTGAATGACAGT
AGGGTGTTGCTCGGAGGTGGATGGCCAGAGATGGTGATGGCAAAGGAAGTAGATGAGCTT
GCAAGGAAAACCGCAGGCAAAAAAATCACATGCCATTGAAGCTTTCTCACGGGCTCTTGT
GGCTATACCGACCACAATCGCTGACAATGCTGGTTTAGACAGTGCCGAATTAGTCGCTCA
GCTACGTGCGGAGCACCATAACGAAGGGTGTAACGCAGGGATTGATGTCATCTCTGGAGC
TGTAGGAGACATGGAGGAGAGAGGAATCTATGAAGCATTCAAAGTGAAGCAAGCGGTTCT
GCTTTCCGCAACAGAAGTTGCTGAGATGATACTGCGAGTGGATGAGATCATTACATGTGC
TCCTAGGAGGAGAGAAGATAGGATGTGATGACATTACACTATCACAAACCTCCTTCAATG
CAGTAGGTTGTGTTTTTGATTTGGACCAGAAAACAGCTTTATATGTTTAATGTTTTGCTC
CTTGAACTTGTCTCCTTTGTTTGGTTCTTTTTTCGGATATGGTTTTGACTTTGGTTTGAG
AGGTTTTGACGAAGTGCAAAGGAGTCGCCTGCATCCGATACAATCTGATTTATTTGTATC
TGTTTCGGTGAGAGTA***TTCATGTATGGTTGATAATTTAGTTTTCTTACAAGCTTATC
ACTATTCCACC

QA 1 731 1 731
DS 



CO CL1429Contig2 1137 2 4 U
GGACTCTTCAGAGCAAAAGCAACCACACTAGGTTCCTTTGTCACTAAGATCTCCAAAACC
GAGAATCCCTCCGTCGTCTTCTGATCTTATCAATGCCGATCGATAAGATCTTCAAAGATG
ATGCTAATGAAGAGAAAGGAGAACGTGCAAGGATGGCATCGTTTATCGGTGCAATGGCTG
TTGCTGATCTCGTCAAGTCCACCTTAGGCCCAAAGGGAATGGATAAGATCTTGCAATCTA
CTGGTAGGGATACTGATAAAGTGAAAATTTATGGTGCCCGCGTCCGTGTGGACTCGATGA
GCAAGGTTGCTGAGATCGAAGGGGCTGAAAAGGAAAAGATGAAAGACAAGGTGAAGAAGA
TTCTGGCCCACGGTATCAACTGCTTTGTTAACAGGCAGTTGATCTACAATTTCCCCGAGG
AACTCTTTGCAGATGCTGGTGTACTTGCTATTGAGCATGCCGACTTTGAGGGAATCGAGC
GTCTTGGATTGGTTACAGGCGGTGAGATCGCTTCAACCTTTGACAACCCTGAGTCTGTCA
AGCTTGCAAGGAAAACCGCAGGCAAAAAATCACATGCCATTGAAGCTTTCTCACGGGCTC
TGGTGGCTATACCGACCACAATCGCTGACAATGCTGGTTTAGACAGTGCCGAATTAGTCG
CTCAGCTACGTGCGGAGCACCATAACGACGGGTGTAACGCAGGGATTGATGTCATCTCTG
GAGCTGTAGGAGACATGGAGGAGAGAGGAATCTATGAAGCATTCAAAGTGAAGCAAGCGG
TTTTGCTTTCTGCAACAGAAGCAGCTGAGATGATACTGCGAGTGGATGAGATCATTACAT
GTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGATAGGATGTGATGACATTACACTATCACAAACCTCCTTC
AATGCAGTAGGTTGTGTTTTTGATTTGGACCAGAAAACAGCTTTATATGTTTAATGTTTT
GCTCCTTGAACTTGTCTCCTTTGTTTGGTTCTTTTTTCGGATATGGTTTTGACTTTGGTT
TGAGAGGTTTTGACGAAGTGCAAGGAGTCGCCTGCATCCGATACAATCTGATTTATTTGT
ATCTGTTTCGGTGAGAGTATTCATGTATGGTTGATAATTTAGTTTTCTTACAAGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT26TF U 1
AF RR2AT26JQ C 346
BS 1 729 RR2AT26TF
BS 730 730 RR2AT26JQ
BS 731 763 RR2AT26TF
BS 764 1137 RR2AT26JQ

RD RR2AT26TF 763 0 0
GGACTCTTCAGAGCAAAAGCAACCACACTAGGTTCCTTTGTCACTAAGATCTCCAAAACC
GAGAATCCCTCCGTCGTCTTCTGATCTTATCAATGCCGATCGATAAGATCTTCAAAGATG
ATGCTAATGAAGAGAAAGGAGAACGTGCAAGGATGGCATCGTTTATCGGTGCAATGGCTG
TTGCTGATCTCGTCAAGTCCACCTTAGGCCCAAAGGGAATGGATAAGATCTTGCAATCTA
CTGGTAGGGATACTGATAAAGTGAAAATTTATGGTGCCCGCGTCCGTGTGGACTCGATGA
GCAAGGTTGCTGAGATCGAAGGGGCTGAAAAGGAAAAGATGAAAGACAAGGTGAAGAAGA
TTCTGGCCCACGGTATCAACTGCTTTGTTAACAGGCAGTTGATCTACAATTTCCCCGAGG
AACTCTTTGCAGATGCTGGTGTACTTGCTATTGAGCATGCCGACTTTGAGGGAATCGAGC
GTCTTGGATTGGTTACAGGCGGTGAGATCGCTTCAACCTTTGACAACCCTGAGTCTGTCA
AGCTTGCAAGGAAAACCGCAGGCAAAAAATCACATGCCATTGAAGCTTTCTCACGGGCTC
TGGTGGCTATACCGACCACAATCGCTGACAATGCTGGTTTAGACAGTGCCGAATTAGTCG
CTCAGCTACGTGCGGAGCACCATAACGACGGGTGTAACGCAGGGATTGATGTCATCTCTG
GAGCTGTAG*AGACATGGAGGAGAGAGGAATCTATGAAGCATT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2AT26JQ 792 0 0
ACAAGGTGAAGAAGATTCTGGCCCACGGTATCAACTGCTTTGTTAACAGGCAGTTGATCT
ACAATTTCCCCGAGGAACTCTTTGCAGATGCTGGTGTACTTGCTATTGAGCATGCCGACT
TTGAGGGAATCGAGCGTCTTGGATTGGTTACAGGCGGTGAGATCGCTTCAACCTTTGACA
ACCCTGAGTCTGTCAAGCTTGCAAGGAAAACCGCAGGCAAAAAATCACATGCCATTGAAG
CTTTCTCACGGGCTCTGGTGGCTATACCGACCACAATCGCTGACAATGCTGGTTTAGACA
GTGCCGAATTAGTCGCTCAGCTACGTGCGGAGCACCATAACGACGGGTGTAACGCAGGGA
TTGATGTCATCTCTGGAGCTGTAGGAGACATGGAGGAGAGAGGAATTTATGAAGCATTCA
AAGTGAAGCAAGCGGTTTTGCTTTCTGCAACAGAAGCAGCTGAGATGATACTGCGAGTGG
ATGAGATCATTACATGTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGATAGGATGTGATGACATTACACTA
TCACAAACCTCCTTCAATGCAGTAGGTTGTGTTTTTGATTTGGACCAGAAAACAGCTTTA
TATGTTTAATGTTTTGCTCCTTGAACTTGTCTCCTTTGTTTGGTTCTTTTTTCGGATATG
GTTTTGACTTTGGTTTGAGAGGTTTTGACGAAGTGCAAGGAGTCGCCTGCATCCGATACA
ATCTGATTTATTTGTATCTGTTTCGGTGAGAGTATTCATGTATGGTTGATAATTTAGTTT
TCTTACAAGCCG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 5

CO CL1430Contig1 861 5 14 U
GGGCCGCATATTTCAACTGATTATTATCACCGTCGAAGAGATGAGCACCACTCAGATATC
CGAGATCGAACAGGAGCAGCTGATCGAGAAGCTTGAGATCTTCAAGATCCATGGCAGAGA
CAAACGAGGACGTAAGATCCTTCGTATCATCGGCAAGTTCTTTCCAGCTCGGCTTCTATC
ACTGGATGTGTTAAAGAAGTATCTAGAGGAGAAGATCTTTCCTCGATTAGGGAGAAAACC
TTTCTCAGTTCTCTACGTTCACACCGGCGTGCAGAGGAGCGAGAATTTTCCGGGAATCTC
AGCTCTACGAGCGATCTACGACGCGATTCCGGTTAACGTAAGAGACAATAATCTCCAGGA
GGTTTACTTCCTCCACCCAGGCCTTCAGTCACGTCTCTTCCTCGCCACTTGCGGACGATT
CCTCTTCTCCGGTGGGTTGTACGGGAAGCTAAGGTACATAAGCAGAGTTGAGTACTTGTG
GGAACACGTGAGGAGGAACGAGATAGAGATGCCGGAGTTTGTGTACGATCACGACGAGGA
TTTAGAGTATCGTCCGATGATGGATTACGGTCAAGAGAGCGATCACGCTAGGGTTTACGC
CGGAGCCGCCGTTGATTCGTCAGTCTCCAGTTTCTCCATGAGGCGTATCTCTTAGCGCAG
ATCACGGATCGTGTATTGTAATATACGATTATGAAAATATAAAAATGTTACTACAAATAG
TGCTTTTCGGAATCAGTGAGCGCTTTTTACGGAAAAGAATAGACAGCTGTTGGCGTAGGT
TGAGAATCTGTAGATTCTTTTTCTTCTTAAACCTGTTCTCTCTTGTTTTTAATTACATAT
CGGTTTATCCGGTTTAGTTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY84TF U 1
AF RR2FX41TF U 1
AF RR2H578TF U 1
AF RR2H578JQB C 145
AF RR2BY84JQ C 145
BS 1 284 RR2BY84TF
BS 285 565 RR2FX41TF
BS 566 641 RR2H578TF
BS 642 642 RR2BY84JQ
BS 643 696 RR2H578TF
BS 697 697 RR2BY84JQ
BS 698 704 RR2H578TF
BS 705 705 RR2BY84JQ
BS 706 716 RR2H578TF
BS 717 717 RR2BY84JQ
BS 718 726 RR2H578TF
BS 727 735 RR2BY84JQ
BS 736 736 RR2H578JQB
BS 737 861 RR2BY84JQ

RD RR2BY84TF 284 0 0
GGGCCGCATATTTCAACTGATTATTATCACCGTCGAAGAGATGAGCACCACTCAGATATC
CGAGATCGAACAGGAGCAGCTGATCGAGAAGCTTGAGATCTTCAAGATCCATGGCAGAGA
CAAACGAGGACGTAAGATCCTTCGTATCATCGGCAAGTTCTTTCCAGCTCGGCTTCTATC
ACTGGATGTGTTAAAGAAGTATCTAGAGGAGAAGATCTTTCCTCGATTAGGGAGAAAACC
TTTCTCAGTTCTCTACGTTCACACCGGCGTGCAGAGGAGCGAGA

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2FX41TF 565 0 0
GG
GCCGCATATTTCAACTGATTATTATCACCGTCGAAGAGATGAGCACCACTCAGATATCCG
AGATCGAACAGGAGCAGCTGATCGAGAAGCTTGAGATCTTCAAGATCCATGGCAGAGACA
AACGAGGACGTAAGATCCTTCGTATCATCGGCAAGTTCTTTCCAGCTCGGCTTCTATCAC
TGGATGTGTTAAAGAAGTATCTAGAGGAGAAGATCTTTCCTCGATTAGGGAGAAAACCTT
TCTCAGTTCTCTACGTTCACACCGGCGTGCAGAGGAGCGAGAATTTTCCGGGAATCTCAG
CTCTACGAGCGATCTACGACGCGATTCCGGTTAACGTAAGAGACAATAATCTCCAGGAGG
TTTACTTCCTCCACCCAGGCCTTCAGTCACGTCTCTTCCTCGCCACTTGCGGACGATTCC
TCTTCTCCGGTGGGTTGTACGGGAAGCTAAGGTACATAAGCAGAGTTGAGTACTTGTGGG
AACACGTGAGGAGGAACGAGATAGAGATGCCGGAGTTTGTGTACGATCACGACGAGGATT
TAGAGTATCGTCCGATGATGGAT

QA 3 565 3 565
DS 

RD RR2H578TF 744 0 0
GG
GCCGCATATTTCAACTGATTATTATCACCGTCGAAGAGATGAGCACCACTCAGATATCCG
AGATCGAACAGGAGCAGCTGATCGAGAAGCTTGAGATCTTCAAGATCCATGGCAGAGACA
AACGAGGACGTAAGATCCTTCGTATCATCGGCAAGTTCTTTCCAGCTCGGCTTCTATCAC
TGGATGTGTTAAAGAAGTATCTAGAGGAGAAGATCTTTCCTCGATTAGGGAGAAAACCTT
TCTCAGTTCTCTACGTTCACACCGGCGTGCAGAGGAGCGAGAATTTTCCGGGAATCTCAG
CTCTACGAGCGATCTACGACGCGATTCCGGTTAACGTAAGAGACAATAATCTCCAGGAGG
TTTACTTCCTCCACCCAGGCCTTCAGTCACGTCTCTTCCTCGCCACTTGCGGACGATTCC
TCTTCTCCGGTGGGTTGTACGGGAAGCTAAGGTACATAAGCAGAGTTGAGTACTTGTGGG
AACACGTGAGGAGGAACGAGATAGAGATGCCGGAGTTTGTGTACGATCACGACGAGGATT
TAGAGTATCGTCCGATGATGGATTACGGTCAAGAGAGCGATCACGCTAGGGTTTACGCCG
GAGCCGCCGTTGATTCGTCAGTCTCCAGTTTCTCCATGACGCGTATCTCTTAGCGCAGAT
CACGGATCGTGTATTGTAATATACGATTATGAAA*TATAAAA*TGTTACTACAA*TAGTG
CTTT
CGGATCAGTGAGCGCTTT

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR2H578JQB 644 0 0
TATCATCGGCAAGTTCTTTCCAGCTCGGCTTCTATCACTGGATGTGTTAAAGAAGTATCT
AGAGGAGAAGATCTTTCCTCGATTAGGGAGAAAACCTTTCTCAGTTCTCTACGTTCACAC
CGGCGTGCAGAGGAGCGAGAATTTTCCGGGAATCTCAGCTCTACGAGCGATCTACGACGC
GATTCCGGTTAACGTAAGAGACAATAATCTCCAGGAGGTTTACTTCCTCCACCCAGGCCT
TCAGTCACGTTTCTTCCTCGCCACTTGCGGACGATTCCTCTTCTCCGGTGGGTTGTACGG
GAAGCTAAGGTACATAAGCAGAGTTGAGTACTTGTGGGAACACGTGAGGAGGAACGAGAT
AGAGATGCCGGAGTTTGTGTACGATCACGACGAGGATTTAGAGTATCGTCCGATGATGGA
TTACGGTCAAGAGAGCGATCACGCTAGGGTTTACGCCGGAGCCGCCGTTGATTCGTCAGT
CTCCAGTTTCTCCATGAGGCGTATCTCTTAGCGCAGATCACGGATCGTGTATTGTAATAT
ACGATTATGAAAATATAAAAATGTTACTACAAATAGTGCTTTTCGGAATCAGTGAGCGCT
TTTTACGGAAAAGAATAGACAGCTGTTGGCGTAGGTTGAGAATC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2BY84JQ 717 0 0
TATCATCGGCAAGTTCTTTCCAGCTCGGCTTCTATCACTGGATGTGTTAAAGAAGTATCT
AGAGGAGAAGATCTTTCCTCGATTAGGGAGAAAACCTTTCTCAGTTCTCTACGTTCACAC
CGGCGTGCAGAGGAGCGAGAATTTTCCGGGAATCTCAGCTCTACGAGCGATCTACGACGC
GATTCCGGTTAACGTAAGAGACAATAATCTCCAGGAGGTTTACTTCCTCCACCCAGGCCT
TCAGTCACGTCTCTCCCTCGCCACTTGCGGACGATTCCTCTTCTCCGGTGGGTTGTACGG
GAAGCTAAGGTACATAAGCAGAGTTGAGTACTTGTGGGAACACGTGAGGAGGAACGAGAT
AGAGATGCCGGAGTTTGTGTACGATCACGACGAGGATTTAGAGTATCGTCCGATGATGGA
TTACGGTCAAGAGAGCGATCACGCTAGGGTTTACGCCGGAGCCGCCGTTGATTCGTCAGT
CTCCATTTTCTCCATGAGGTGTATCTCTTAGCGCAGATCACGGATCGTGTATTATAATAT
ACGATTATGAAAATATAAAAATGTTACTACAAATAGTGCTTTTCGGAATCATTGAGCGCT
TTTTACGGAAAAGAATAGACAGCTGTTGGCGTAGGTTGAGAATCTGTAGATTCTTTTTCT
TCTTAAACCTGTTCTCTCTTGTTTTTAATTACATATCGGTTTATCCGGTTTAGTTCC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 6

CO CL1431Contig1 685 6 15 U
TTTTTTCTTGAGAATGATTTTCATTGATCTGAAAAAAATTCGGGCACCAAAAGATTAAGA
GGAGACAGATAGAAACTCGTGGATACAGACACTACTACTAAACCATTGGGACAAAGACAG
GACTCACTTGACACATTAAAAGAAACATAATGAAAACAACAAACTCAAAGCCTTGCTCTG
TTTTTATTTTTGAGGGGTAAAAACTAAACTTAAAAGTTACTTCTTGGCTTGCATGAGCTC
TTCGATGAGTTCAGCAGCTTGCTCAACTGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTCCGCCAT
TTGGATACCAAACTCTTCCTCTAAACCCATCACTATCTCAACAGTGTCGAGAGAATCTGC
TCCAAGATCGACAAATTTGGTTTCTGCAACGACTTTTTGATCGTCTTTGAGCGAGAGTTG
CTTCTTGACTATCTCAGATACTTTCTCTACTGTCTCTTGTTTGGCCGCGCAAGAGATTGA
GAGGCGAGTGCGGCTTAGGTTGAAGGAGAGATTAGTCCTTCCATGGTTTGAAACCAAAGA
AGGCTTATGGAAACTAATCCTCGTTGTTGTTGTT***GCCAGAGAGGTAGCTTGCATGGA
CACCGAAGAGCTGAAAGTGGTCGCCATTTTCGTTACTCACGAGAGAGATGGAGAGAGATG
GCGGAGTGTACAAAGAGCGTCCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RR2DT58JQ U 6
AF RR2CB12JQ U 10
AF RR2FM72TF C 1
AF RR2FM72JQ U 10
AF RR2DT58TF C 16
AF RR2CB12TF C 26
BS 1 11 RR2FM72TF
BS 12 119 RR2DT58JQ
BS 120 120 RR2CB12JQ
BS 121 384 RR2DT58JQ
BS 385 385 RR2CB12JQ
BS 386 411 RR2DT58JQ
BS 412 412 RR2CB12JQ
BS 413 470 RR2DT58JQ
BS 471 474 RR2CB12JQ
BS 475 475 RR2FM72JQ
BS 476 497 RR2CB12JQ
BS 498 498 RR2FM72JQ
BS 499 541 RR2CB12JQ
BS 542 682 RR2FM72JQ
BS 683 685 RR2CB12TF

RD RR2DT58JQ 465 0 0
GCTTGA
GAATGATTTTCATTGATCTGAAAAAAATTCGGGCACCAAAAGATTAAGAGGAGACAGATA
GAAACTCGTGGATACAGACACTACTACTAAACCATTGGGACAAAGACAAGACTCACTTGA
CACATTAAAAGAAACATAATGAAAACAACAAACTCAAAGCCTTGCTCTGTTTTTATTTTT
GAGGGGTAAAAACTAAACTTAAAAGTTACTTCTTGGCTTGCATGAGCTCTTCGATGAGTT
CAGCAGCTTGCTCAACTGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTCCGCCATTTGGATACCAA
ACTCTTCCTCTAAACCCATCACTATCTCAACAGTGTCGAGAGAATCTGCTCCAAGATCGA
CAAATTTGGTTTCCGCAACGACTTTTTGATCGTCTTTGAGTGAGAGTTGCTTCTTGACTA
TCTCAGATACTTTCTCTACTGTCTCTTGTTTGGCCGCGC

QA 7 465 7 465
DS 

RD RR2CB12JQ 532 0 0
GG
GAATGATTTTCATTGATCTGAAAAAAATTCGGGAACCAAAAGATTAAGGGGAGACAGATA
GAAACTCGTGGATACAGACACTACTACTAAACCATTGGGACAAAGACAGGACTCACTTGA
CACATTAAAAGAAACATAATGAAAACAACAAACTCAAAGCCTTGCTCTGTTTTTATTTTT
GAGGGGTAAAAACTAAACTTAAAAGTTACTTCTTGGCTTGCATGAGCTCTTCGATGAGTT
CAGCAGCTTGCTCAACTGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTCCGCCATTTGGATACCAA
ACTCTTCCTCTAAACCCATCACTATCTCAACAGTGTCGAGAGAATCTGCTCCAAGATCGA
CAAATTTGGTTTCTGCAACGACTTTTTGATCGTCTTTGAGCGAGAGTTGCTTCTTGGCTA
TCTCAGATACTTTCTCTACTGTCTCTTGTTTGGCCGCGCAAGAAATTGAGAGGCGAGTGC
GGCTTAAGTTGAAGGAGAGATTAGTCCTTCCATGGTTTGAAACCAAAGAA

QA 3 532 3 532
DS 

RD RR2FM72TF 682 0 0
TTTTTTCTTGAGAATGATTTTCATTGATCTGAAAAAAATTCGGGCACCAAAAGATTAAGA
GGAGACAGATAGAAACTCGTGGATACAGACACTACTACTAAACCATTGGGACAAAGACAG
GACTCACTTGACACATTAAAAGAAACATAATGAAAACAACAAACTCAAAGCCTTGCTCTG
TTTTTATTTTTGAGGGGTAAAAACTAAACTTAAAAGTTACTTCTTGGCTTGCATGAGCTC
TTCGATGAGTTCAGCAGCTTGCTCAACTGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTCCGCCAT
TTGGATACCAAACTCTTCCTCTAAACCCATCACTATCTCAACAGTGTCGAGAGAATCTGC
TCCAAGATCGACAAATTTGGTTTCTGCAACGACTTTTTGATCGTCTTTGAGCGAGAGTTG
CTTCTTGACTATCTCAGATACTTTCTCTACTGTCTCTTGTTTGGCCGCGCAAGAGATTGA
GAGGCGAGTGCGGCTTAGGTTGAAGGAGAGATTAGTCCTTCCATGGTTTGAAACCAAAGA
AGGCTTATGGAAACTAATCCTCGTTGTTGTTGTT***GCCAGAGAGGTAGCTTGCATGGA
CACCGAAGAGCTGAAAGTGGTCGCCATTTTCGTTACTCACGAGAGAGATGGAGAGAGATG
GCGGAGTGTACAAAGAGCGTCC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2FM72JQ 673 0 0
GA
GAATGATTTTCATTGATCTGAAAAAAATTCGGGCACCAAAAGATTAAGAGGAGACAGATA
GAAACTCGTGGATACAGACACTACTACTAAACCATTGGGACAAAGACAGGACTCACTTGA
CACATTAAAAGAAACATAATGAAAACAACAAACTCAAAGCCTTGCTCTGTTTTTATTTTT
GAGGGGTAAAAACTAAACTTAAAAGTTACTTCTTGGCTTGCATGAGCTCTTCGATGAGTT
CAGCAGCTTGCTCAACTGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTCCGCCATTTGGATACCAA
ACTCTTCCTCTAAACCCATCACTATCTCAACAGTGTCGAGAGAATCTGCTCCAAGATCGA
CAAATTTGGTTTCTGCAACGACTTTTTGATCGTCTTTGAGCGAGAGTTGCTTCTTGACTA
TCTCAAATACTTTCTCTACTGTCTCTTGTTTGGCCGCGCAAGAGATTGAGAGGCGAGTGC
GGCTTAGGTTGAAGGAGAGATTAGTCCTTCCATGGTTTGAAACCAAAGAAGGCTTATGGA
AACTAATCCTCGTTGTTGTTGTT***GCCAGAGAGGTAGCTTGCATGGACACCGAAGAGC
TGAAAGTGGTCGCCATTTTCGTTACTCACGAGAGAGATGGAGAGAGATGGCGGAGTGTAC
AAAGAGCGTCC

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR2DT58TF 667 0 0
GATTTTCATTGATCTGAAAAAAATTCGGGCACCAAAAGATTAAGAGGAGACAGATAGAAA
CTCGTGGATACAGACACTACTACTAAACCATTGGGACAAAGACAAGACTCACTTGACACA
TTAAAAGAAACATAATGAAAACAACAAACTCAAAGCCTTGCTCTGTTTTTATTTTTGAGG
GGTAAAAACTAAACTTAAAAGTTACTTCTTGGCTTGCATGAGCTCTTCGATGAGTTCAGC
AGCTTGCTCAACTGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTCCGCCATTTGGATACCAAACTC
TTCCTCTAAACCCATCACTATCTCAACAGTGTCGAGAGAATCTGCTCCAAGATCGACAAA
TTTGGTTTCCGCAACGACTTTTTGATCGTCTTTGAGTGAGAGTTGCTTCTTGACTATCTC
AGATACTTTCTCTACTGTCTCTTGTTTGGCCGCGCAAGAGATTGAGAGGCGAGTGCGGCT
TAGGTTGAAGGAGAGATTAGTCCTTGCATGGTTTGAAACCAAAGCAGGCTTATGGAAACT
AATCCTCGTTGTTGTTGTTGTTGCCAGAGAGGTAGCTTGCATGGAGACCGAAGAGCTGAA
AGTGGCCGCCATTGTCGTTACTCACGAGAGAGATGGAGAGAGATGGCGGAGTGTACAAAG
AGCGTCC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2CB12TF 660 0 0
GATCTGAAAAAAATTCGGGAACCAAAAGATTAAGGGGAGACAGATAGAAACTCGTGGATA
CAGACACTACTACTAAACCATTGGGACAAAGACAGGACTCACTTGACACATTAAAAGAAA
CATAATGAAAACAACAAACTCAAAGCCTTGCTCTGTTTTTATTTTTGAGGGGTAAAAACT
AAACTTAAAAGTTACTTCTTGGCTTGCATGAGCTCTTCGATGAGTTCAGCAGCTTGCTCA
ACTGTTGCAATCTTCTGTGCTTTCTCTTCCGCCATTTGGATACCAAACTCTTCCTCTAAA
CCCATCACTATCTCAACAGTGTCGAGAGAATCTGCTCCAAGATCGACAAATTTGGTTTCT
GCAACGACTTTTTGATCGTCTTTGAGCGAGAGTTGCTTCTTGGCTATCTCAGATACTTTC
TCTACTGTCTCTTGTTTGGCCGCGCAAGAGATTGAGAGGCGAGTGCGGCTTAGGTTGAAG
GAGAGATTAGTCCTTCCATGGTTTGAAACCAAAGAAGGCTTATGGAAACTAATCCTCGTT
GTTGTTGTT***GCCAGAGAGGTAGCTTGCATGGACACCGAAGAGCTGAAAGTGGTCGCC
ATTTTCGTTACTCACGAGAGAGATGGAGAGAGATGGCGGAGTGTACAAAGAGCGTCCCCT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 5

CO CL1432Contig1 862 5 25 U
GAAAATCAAAATAGGAACAGAAAAAACTGAGCAAAAACTAGAACATTACCATATCCATAA
CTTAAAAACTGAGCAGAAGTACCCGTTTGAGAAGAGATGAAAATTTAAGATGTAATCC*A
GCAACATAGAGTAATACTACCAAAGGTTCACCATAAGCATAAACTCATGAAAGGATAATC
CAAAACCAAAACAGGGGAAACTGTTGTTATTTAGGCGGCTTGGTCTTCACCCTCGGTGAT
GACTTTCGTAGTTGTAGTTCCCTTCATGGCCAACAGATCTGTGTACTCTTGATACGGGGA
TTTTTTAAAGCTCGTCTCCTTCCAGAACTCTGGTGTGAGGAATCCGTAAGTCTTCTGAAG
GCAATCGAATGTAGCCTTGACAAAGTTTCCAAGAGTCTTAGTAGAACCTCTCGAGGAAGT
GAAAACATCATCAATACCAGCAAACTGAAGAACCTTCTTAGGAACCCTAGCGGCCACAAT
ACCAGCACCTCTAGGAGCAGGAACCATCCTCACAGTAACGGAACCACACTTCCCCGTAAC
CTTACAAGGAACCGTATGCGGCTTCCCAATCTTGTTACCCCAGTAACCTCTCCTCACCGG
AATCACAGACAGCTTCGCCAGTATAATCCCACCTCTGATCGCCGTAGCCACCTCCTTGGA
GCATTTCACACCAAGACCCACGTGTCCGTTCGTGTCCCCGACAACGACAAAGGCCTTGAA
CCTCGTCCTCTGACCGGCCCTGGTCTGTTTCTGAACCGGCATGATCTTCATCACCTCGTC
TTTCAAGGTGGGACCCACGAGGAGGTCGATGATCTGGTACTCCTTGACTGGGAGCGAGTG
GAGGTAGATCTGCTCTAGTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G018TF C 1
AF RR2G018JQ U 1
AF RR2EZ56JQ U 29
AF RR2AL21JQ U 29
AF RR2AL21TF C 86
BS 1 92 RR2G018JQ
BS 93 93 RR2AL21JQ
BS 94 121 RR2G018JQ
BS 122 122 RR2AL21JQ
BS 123 178 RR2G018JQ
BS 179 179 RR2AL21JQ
BS 180 232 RR2G018JQ
BS 233 233 RR2AL21JQ
BS 234 251 RR2G018JQ
BS 252 252 RR2AL21JQ
BS 253 265 RR2G018JQ
BS 266 266 RR2AL21JQ
BS 267 300 RR2G018JQ
BS 301 301 RR2AL21JQ
BS 302 405 RR2G018JQ
BS 406 406 RR2AL21JQ
BS 407 441 RR2G018JQ
BS 442 442 RR2AL21JQ
BS 443 450 RR2G018JQ
BS 451 451 RR2AL21JQ
BS 452 467 RR2G018JQ
BS 468 468 RR2AL21JQ
BS 469 581 RR2G018JQ
BS 582 783 RR2AL21JQ
BS 784 862 RR2AL21TF

RD RR2G018TF 149 0 0
GAAAATCAAAATAGGAACAGAAAAAACTGAGCAAAAACTAGAACATTACCATATCCATAA
CTTAAAAACTGAGCAGAAGTACCCGTTTGAGAGGAGATGAAAATTTAAGATGTAATCCCA
GTAACATAGAGTAATACTACCAAA
AGGTT

QA 1 144 1 144
DS 

RD RR2G018JQ 582 0 0
GAAAATCAAAATAGGAACAGAAAAAACTGAGCAAAAACTAGAACATTACCATATCCATAA
CTTAAAAACTGAGCAGAAGTACCCGTTTGAGAGGAGATGAAAATTTAAGATGTAATCC*A
GTAACATAGAGTAATACTACCAAAGGTTCACCATAAGCATAAACTCATGAAAGGATAACC
CAAAACCAAAACAGGGGAAACTGTTGTTATTTAGGCGGCTTGGTCTTCACCCCCGGTGAT
GACTTTCGTAGCTGTAGTTCCCTTCGTGGCCAACAGATCTGTGTACTCTTGATACGGGGA
CTTTTTAAAGCTCGTCTCCTTCCAGAACTCTGGTGTGAGGAATCCGTAAGTCTTCTGAAG
GCAATCGAATGTAGCCTTGACAAAGTTTCCAAGAGTCTTAGTAGATCCTCTCGAGGAAGT
GAAAACATCATCAATACCAGCGAACTGAAGCACCTTCTTAGGAACCCCAGCGGCCACAAT
ACCAGCACCTCTAGGAGCAGGAACCATCCTCACAGTAACGGAACCACACTTCCCCGTAAC
CTTACAAGGAACCGTATGCGGCTTCCCAATCTTGTTACCCC
C

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2EZ56JQ 680 0 0
GAGC
AAAAACTAGAACATTACCATATCCATAACTTAAAAACTGAGCAGAAGTACCCGTTTGAGA
AGAGATGAAAATTTAAGATGTAATCC*AGCAACATAGAGTAATACTACCAAAGGTTCACC
ATAAGCATAAACTCATGAAAGGATAACCCAAAACCAAAACAGGGGAAACTGTTGTTATTT
AGGCGGCTTGGTCTTCACCCTCGGTGATGACTTTCGTAGCTGTAGTTCCCTTCGTGGCCA
ACAGATCTGTGTACTCTTGATACGGGGACTTTTTAAAGCTCGTCTCCTTCCAGAACTCTG
GTGTGAGGAATCCGTAAGTCTTCTGAAGGCAATCGAATGTAGCCTTGACAAAGTTTCCAA
GAGTCTTAGTAGATCCTCTCGAGGAAGTGAAAACATCATCAATACCAGCGAACTGAAGCA
CCTTCTTAGGAACCCTAGCGGCCACAATACCAGCACCTCTAGGAGCAGGAACCATCCTCA
CAGTAACGGAACCACACTTCCCCGTAACCTTACAAGGAACCGTATGCGGCTTCCCAATCT
TGTTACCCCAGTAACCTCTCCTCACCGGAATCACAGACAGCTTCGCCAGTATAATCCCAC
CTCTGATCGCCGTAGCAACCTCCTTGGAGCATTTCACACCCAGACCCACGTGTCCGTTCG
TGTCTCCGACAAC
AAC

QA 5 677 5 677
DS 

RD RR2AL21JQ 755 0 0
GGGG
AAAAACTAGAACATTACCATATCCATAACTTAAAAACTGAGCAGAAGTACCCGTTTGAGA
AGAGATGAAAATTTAAGATGTAATCC*AGCAACATAGAGTAATACTACCAAAGGTTCACC
ATAAGCATAAACTCATGAAAGGATAATCCAAAACCAAAACAGGGGAAACTGTTGTTATTT
AGGCGGCTTGGTCTTCACCCTCGGTGATGACTTTCGTAGTTGTAGTTCCCTTCATGGCCA
ACAGATCTGTGTACTCTTGATACGGGGATTTTTTAAAGCTCGTCTCCTTCCAGAACTCTG
GTGTGAGGAATCCGTAAGTCTTCTGAAGGCAATCGAATGTAGCCTTGACAAAGTTTCCAA
GAGTCTTAGTAGAACCTCTCGAGGAAGTGAAAACATCATCAATACCAGCAAACTGAAGAA
CCTTCTTAGGAACCCTAGCGGCCACAATACCAGCACCTCTAGGAGCAGGAACCATCCTCA
CAGTAACGGAACCACACTTCCCCGTAACCTTACAAGGAACCGTATGCGGCTTCCCAATCT
TGTTACCCCAGTAACCTCTCCTCACCGGAATCACAGACAGCTTCGCCAGTATAATCCCAC
CTCTGATCGCCGTAGCCACCTCCTTGGAGCATTTCACACCAAGACCCACGTGTCCGTTCG
TGTCCCCGACAACGACAAAGGCCTTGAACCTCGTCCTCTGACCGGCCCTGGTCTGTTTCT
GAACCGGCATGATCTTCATCACCTCGTCTTT

QA 5 755 5 755
DS 

RD RR2AL21TF 777 0 0
G
TTGAGAAGAGATGAAAATTTAAGATGTAATCC*AGCAACATAGAGTAATACTACCAAAGG
TTCACCATAAGCATAAACTCATGAAAGGATAATCCAAAACCAAAACAGGGGAAACTGTTG
TTATTTAGGCGGCTTGGTCTTCACCCTCGGTGATGACTTTCGTAGTTGTAGTTCCCTTCA
TGGCCAACAGATCTGTGTACTCTTGATACGGGGATTTTTTAAAGCTCGTCTCCTTCCAGA
ACTCTGGTGTGAGGAATCCGTAAGTCTTCTGAAGGCAATCGAATGTAGCCTTGACAAAGT
TTCCAAGAGTCTTAGTAGAACCTCTCGAGGAAGTGAAAACATCATCAATACCAGCAAACT
GAAGAACCTTCTTAGGAACCCTAGCGGCCACAATACCAGCACCTCTAGGAGCAGGAACCA
TCCTCACAGTAACGGAACCACACTTCCCCGTAACCTTACAAGGAACCGTATGCGGCTTCC
CAATCTTGTTACCCCAGTAACCTCTCCTCACCGGAATCACAGACAGCTTCGCCAGTATAA
TCCCACCTCTGATCGCCGTAGCCACCTCCTTGGAGCATTTCACACCAAGACCCACGTGTC
CGTTCGTGTCCCCGACAACGACAAAGGCCTTGAACCTCGTCCTCTGACCGGCCCTGGTCT
GTTTCTGAACCGGCATGATCTTCATCACCTCGTCTTTCAAGGTGGGACCCACGAGGAGGT
CGATGATCTGGTACTCCTTGACTGGGAGCGAGTGGAGGTAGATCTGCTCTAGTTTC

QA 2 777 2 777
DS 



AS 1 3

CO CL1433Contig1 883 3 5 U
TTTTTTTTTCATGTCACACAAAACTTTGTTCTTTTGCAAACATCACACAATAAGCTCGAA
GAGCCCACAAGAAGAAAAAAAGTGTCCAGAGAAAGAATGGTAATAATCCATGGATGGGGG
GAGCTATATACTTCCATCATATTCTTCTCTTCAGAATCAAGCTTCCAAAGGTTCTTCAAG
TACTTTTCTCTTTGTTGAAGCCATTTCTGCAGTGGGAGCAGCGAGGGGGGGTTTTGTCGG
CACATCAGGGAGATCCAATATCTCGTCTTCTTCACGCATTGGCTCTGTTGTAGGCACGTC
AGGCATGTCTTCAACGTTGAGCTGACTTTCAAGGTTGTCGAATTCTGCCAAGATCTCTTC
TTCATCTTCTTCTGATAGTTTCTCCCCCAGTATGGCACTCAGCTCATCCTGATAAGCCTT
GGCCTCGGCAGTGTCATCCATAAGTTTTTGAACATCGTCAAGGTTGACTTCACTCTGAAT
CGCCTTAATGGCACTGTTACCTTGCTTCAAGCTCCCAAAGACTGCCTTCTGCTTGCTTGT
TAGTTCAATATCTGCCAATTGTTGTTCGACATTGATGACCCACTGATCAACTTGCTTCAA
TAAGTCTTCTTGGGTCCGCTTCTTCTTCAATGCTGACAAGGCCCTGTCTTTCCGCTTCTC
ACGGATTAGGTCTCTTGCAGCTTGCTTTTCGGCCTCAATTACTTTCTCAAGCTGTTGCTG
GTATTGACCAAGCTTGCGGCGTTGGGTTTTGAGAGAGAGAATCGCTCGATCAACCTCTGT
GATCTTCGGTTTCTTCACGAACATATTCCCCATCTCTCTCCTACTCCAAGAAAGAATTCG
TGAAGAGAGCTATACGCGATTTCAAACGACCCCAAGTCCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H986JQ U 1
AF RR2ET13JQ U 9
AF RR2ET13TF C 121
BS 1 66 RR2H986JQ
BS 67 67 RR2ET13JQ
BS 68 165 RR2H986JQ
BS 166 795 RR2ET13JQ
BS 796 883 RR2ET13TF

RD RR2H986JQ 165 0 0
TTTTTTTTTCATGTCACACAAAACTTTGTTCTTTTGCAAACATCACACAATAAGCTCGAA
GAGCCCCCAAGAAGAAAAAAAGTGTCCAGAGAAAGAATGGTAATAATCCATGGATGGGGG
GAGCTATATACTTCCATCATATTCTTCTCTTCAGAATCAAGCTTC

QA 1 165 1 165
DS 

RD RR2ET13JQ 787 0 0
C
CATGTCACACAGAACTTTGTTCTTTTGCAAACATCACACAATAAGCTCGAAGAGCCCACA
AGAAGAAAAAAAGTGTCCAGAGAAAGAATGGTAATAATCCATGGATGGGGGGAGCTATAT
ACTTCCATCATATTCTTCTCTTCAGAATCAAGCTTCCAAAGGTTCTTCAAGTACTTTTCT
CTTTGTTGAAGCCATTTCTGCAGTGGGAGCAGCGAGGGGGGGTTTTGTCGGCACATCAGG
GAGATCCAATATCTCGTCTTCTTCACGCATTGGCTCTGTTGTAGGCACGTCAGGCATGTC
TTCAACGTTGAGCTGACTTTCAAGGTTGTCGAATTCTGCCAAGATCTCTTCTTCATCTTC
TTCTGATAGTTTCTCCCCCAGTATGGCACTCAGCTCATCCTGATAAGCCTTGGCCTCGGC
AGTGTCATCCATAAGTTTTTGAACATCGTCAAGGTTGACTTCACTCTGAATCGCCTTAAT
GGCACTGTTACCTTGCTTCAAGCTCCCAAAGACTGCCTTCTGCTTGCTTGTTAGTTCAAT
ATCTGCCAATTGTTGTTCGACATTGATGACCCACTGATCAACTTGCTTCAATAAGTCTTC
TTGGGTCCGCTTCTTCTTCAATGCTGACAAGGCCCTGTCTTTCCGCTTCTCACGGATTAG
GTCTCTTGCAGCTTGCTTTTCGGCCTCAATTACTTTCTCAAGCTGTTGCTGGTATTGACC
AAGCTTGCGGCGTTGGGTTTTGAGAGAGAGAATCGCTCGATCAACCTCTGTGATCTTCGG
TTTCTT

QA 2 787 2 787
DS 

RD RR2ET13TF 763 0 0
GAGCTATATACTTCCATCATATTCTTCTCTTCAGAATCAAGCTTCCAAAGGTTCTTCAAG
TACTTT*CTCTTTGTTGAAGCCATTTCTGCAGTGGGAGCAGCGAGGGGTGGTTTTGTCGG
CACATCAGGGAGATCCAATATCTCGTCTTCTTCACGCATTGGCTCTGTTGTAGGCACGTC
AGGCATGTCTTCAACGTTGAGCTGACTTTCAAGGTTGTCGAATTCTGCCAAGATCTCTTC
TTCATCTTCTTCTGATAGTTTCTCCCCCAGTATGGCACTCAGCTCATCCTGATAAGCCTT
GGCCTCGGCAGTGTCATCCATAAGTTTTTGAACATCGTCAAGGTTGACTTCACTCTGAAT
CGCCTTAATGGCACTGTTACCTTGCTTCAAGCTCCCAAAGACTGCCTTCTGCTTGCTTGT
TAGTTCAATATCTGCCAATTGTTGTTCGACATTGATGACCCACTGATCAACTTGCTTCAA
TAAGTCTTCTTGGGTCCGCTTCTTCTTCAATGCTGACAAGGCCCTGTCTTTCCGCTTCTC
ACGGATTAGGTCTCTTGCAGCTTGCTTTTCGGCCTCAATTACTTTCTCAAGCTGTTGCTG
GTATTGACCAAGCTTGCGGCGTTGGGTTTTGAGAGAGAGAATCGCTCGATCAACCTCTGT
GATCTTCGGTTTCTTCACGAACATATTCCCCATCTCTCTCCTACTCCAAGAAAGAATTCG
TGAAGAGAGCTATACGCGATTTCAAACGACCCCAAGTCCCTCC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 6

CO CL1434Contig1 473 6 7 U
GGAAAAACACAATTATTTTATTTTCGAAGATGAAAGTTGCTTTCAAACCTTGGTTTATTG
GTTTCGTTATCATCACAATTCTCTTGATGGGAGAAACAACAATTGCTCAGAAAGGAAAAG
GTGTTAACCAATGTACTGAAACATTACAAAACCAAAGTGGAACATGTGAGGTCAACAAAT
GTAAAGCCGCATGTGTTCAGAAGTATAAAAAAGCAGCAGGTTCTTGCACAAAAGGCGAAG
ACAACCACAAAGGAAAAATTATATGCGTATGTCATTATCAATGTCCTCGCTGATTTTTT*
ATTTATATTGACACTCAAATAATTTTTATAATAATATTTTTTGTAAAAGATTTATAATAA
TATTACCTTTTGTAAAAGAAAAAATAAAATTTTTAATAAATTGTTGCTGATGTTTTGGCA
TAATAAGGTGTAATATATATTACTAAATACAAAATTGTTGCTAATGTTTTGAC


BQ
10 10 10 10 30 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DS66TF U 2
AF RR2FO15JQ C 1
AF RR2FO15TF U 1
AF RR2F755JQ C 3
AF RR2F755TF U 3
AF RR2AG90TF U 4
BS 1 4 RR2FO15JQ
BS 5 8 RR2FO15TF
BS 9 299 RR2DS66TF
BS 300 300 RR2FO15TF
BS 301 419 RR2DS66TF
BS 420 421 RR2FO15TF
BS 422 473 RR2F755TF

RD RR2DS66TF 419 0 0
GGAAAAT
ACAATTATTTTATTTTCGAAGATGAAAGTTGCTTTCAAACCTTGGTTTATTGGTTTCGTT
ATCATCACAATTCTCTTGATGGGAGAAACAACAATTGCTCAGAAAGGAAAAGGTGTTAAC
CAATGTACTGAAACATTACAAAACCAAAGTGGAACATGTGAGGTCAACAAATGTAAAGCC
GCATGTGTTCAGAAGTATAAAAAAGCAGCAGGTTCTTGCACAAAAGGCGAAGACAACCAC
AAAGGAAAAATTATATGCGTATGTCATTATCAATGTCCTCGCTGATTTTTTTATTTATAT
TGACACTCAAATAATTTTTATAATAATATTTTTTGTAAAAGATTTATAATAATATTACCT
TTTGTAAAAGAAAAAATAAAATTTTTAATAAATTGTTGCTGATGTTTTGGC
C

QA 8 418 8 418
DS 

RD RR2FO15JQ 421 0 0
GGAAAAACACAATTATTTTATTTTCGAAGATGAAAGTTGCTTTCAAACCTTGGTTTATTG
GTTTCGTTATCATCACAATTCTCTTGATGGGAGAAACAACAATTGCTCAGAAAGGAAAAG
GTGTTAACCAATGTACTGAAACATTACAAAACCAAAGTGGAACATGTGAGGTCAACAAAT
GTAAAGCCGCATGTGTTCAGAAGTATAAAAAAGCAGCAGGTTCTTGCACAAAAGGCGAAG
ACAACCACAAAGGAAAAATTATATGCGTATGTCATTATCAATGTCCTCGCTGATTTTTT*
ATTTATATTGACACTCAAATAATTTTTATAATAATATTTTTTGTAAAAGATTTATAATAA
TATTACCTTTTGTAAAAGAAAAAATAAAATTTTTAATAAATTGTTGCTGATGTTTTGGCA
T

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR2FO15TF 421 0 0
GGAA
AAACACAATTATTTTATTTTCGAAGATGAAAGTTGCTTTCAAACCTTGGTTTATTGGTTT
CGTTATCATCACAATTCTCTTGATGGGAGAAACAACAATTGCTCAGAAAGGAAAAGGTGT
TAACCAATGTACTGAAACATTACAAAACCAAAGTGGAACATGTGAGGTCAACAAATGTAA
AGCCGCATGTGTTCAGAAGTATAAAAAAGCAGCAGGTTCTTGCACAAAAGGCGAAGACAA
CCACAAAGGAAAAATTATATGCGTATGTCATTATCAATGTCCTCGCTGATTTTTT*ATTT
ATATTGACACTCAAATAATTTTTATAATAATATTTTTTGTAAAAGATTTATAATAATATT
ACCTTTTGTAAAAGAAAAAATAAAATTTTTAATAAATTGTTGCTGATGTTTTGGCAT

QA 5 421 5 421
DS 

RD RR2F755JQ 471 0 0
GG
AAACACAATTATTTTATTTTCGAAGATGAAAGTTGCTTTCAAACCTTGGTTTATTGGTTT
CGTTATCATCACAATTCTCTTGATGGGAGAAACAACAATTGCTCAGAAAGGAAAAGGTGT
TAACCAATGTACTGAAACATTACAAAACCAAAGTGGAACATGTGAGGTCAACAAATGTAA
AGCCGCATGTGTTCAGAAGTATAAAAAAGCAGCAGGTTCTTGCACAAAAGGGGAAGACAA
CCACAAAGGAAAAATTAT**GCGTATGTCATTATCAATGTCCTCGCTGATTTTTT*ATTT
ATATTGACACTCAAATAATTTTTATAATAATATTTTTTGTAAAAGATTTATAATAATATT
ACCTTTTGTAAAAGAAAAAATAAAATTTTTAATAAATTGTTGCTGATGTTTTGGCATAAT
AAGGTGTAATATATATTACTAAATACAAAATTGTTGCTAATGTTTTGAC

QA 3 471 3 471
DS 

RD RR2F755TF 471 0 0
GG
AAACACAATTATTTTATTTTCGAAGATGAAAGTTGCTTTCAAACCTTGGTTTATTGGTTT
CGTTATCATCACAATTCTCTTGATGGGAGAAACAACAATTGCTCAGAAAGGAAAAGGTGT
TAACCAATGTACTGAAACATTACAAAACCAAAGTGGAACATGTGAGGTCAACAAATGTAA
AGCCGCATGTGTTCAGAAGTATAAAAAAGCAGCAGGTTCTTGCACAAAAGGCGAAGACAA
CCACAAAGGAAAAATTAT**GCGTATGTCATTATCAATGTCCTCGCTGATTTTTT*ATTT
ATATTGACACTCAAATAATTTTTATAATAATATTTTTTGTAAAAGATTTATAATAATATT
ACCTTTTGTAAAAGAAAAAATAAAATTTTTAATAAATTGTTGCTGATGTTTTGGCATAAT
AAGGTGTAATATATATTACTAAATACAAAATTGTTGCTAATGTTTTGAC

QA 3 471 3 471
DS 

RD RR2AG90TF 459 0 0
GG
AACACAATTATTTTATTTTCGAAGATGAAAGTTGCTTTCAAACCTTGGTTTATTGGTTTC
GTTATCATCACAATTCTCTTGATGGGAGAAACAACAATTGCTCAGAAAGGAAAAGGTGTT
AACCAATGTACTGAAACATTACAAAACCAAAGTGGAACATGTGAGGTCAACAAATGTAAA
GCCGCATGTGTTCAGAAGTATAAAAAAGCAGCAGGTTCTTGCACAAAAGGCGAAGACAAC
CACAAAGGAAAAATTATATGCGTATGTCATTATCAATGTCCT*GCTGATTTTTT*ATTTA
TATTGACACTCAAATAATTTTTATAATAATATTTTTTGTAAAAGATTTATAATAATATTA
CCTTTTGTAAAAGAAAAAATAAAATTTTTAATAAATTGTTGCTGATGTTTTGGCATAATA
AGGTGTAATACATATTACTAAATACAAAATTGTTGCT

QA 3 459 3 459
DS 



AS 1 3

CO CL1435Contig1 1427 3 10 U
CCGAAAAATCTCTCTTAGTTGAAAACGATGAACTCGGAACTGGTATTCTTACATTTCAAG
TACACACTACTAAGTGTTTAGGCAGTAAAAAAAACTCTGTTTTCAAACGCTTAAAGAACA
AACAGAATAGATTCTGGAGAGAACAGAGAACAGAGATATTCCTACTTCCAGAGCTTACGC
AGAGACATGTTCTTCTCTGTGTCTTTCTTCATAACCTTCGCCACCGCCATCTCAAAGTCT
TCCTGTGTCACGTGTACTCTCCTCTCCCTCAAAGCAAACATGCCTGCCTCCGTGCACACA
GCCTTCAGCTCAGCACCTGAAGCACCATTCATCTTCTCTGCAATCTTCTCCAGATCAATT
CCACGCATCAAGTTCATCTTCCTCGAGTGGATCCTCAAGATATCAAAACGTGAATCTTAG
TTAGGATTTGGGAATTCAATTTTCCTATCAATCCTTCCTGGCCTGAGAAGAGCTTGATCC
AGAATATCTATACGATTCGTCGCCATCAGAACCTTGATCTTGTTTGACGCTTCGAAACCG
TCAAGTTGATTGAGAAGCTCAAGCATAGTCCGCTGAACCTCACTGTCACCGTTTCCACTT
CCAGATTCCATACGAGCAGACCCGATACTATCGATCTCATCCATGAATATGATCGATGGT
GCATGCTCCCTTGCCATCACAAAAAGTTCTCTGACCATTCTAGAACCTTCTCCAATGTAC
TTCTGGACCAGCTCGGAACCAGAAACTCTGATGAACGTACAGTCAGTGTGATGTGCCACA
GCCCGAGAGACTCAAACAATTCAGGATGCTTGATTGGTAGCTCAATGACCTCCTTAATTT
CCTTAATCTGCTGGTCAAGACCACCAATCATGTCATAAGTGGAGTCAGGAACCTTCTCAA
CTTTCATAAGGTTAACCAGGGGATCAACTTTACTTGGCAGGACAAGGTGGAGAACATAGC
TATCATTACGGAGAGCAACTCTTGTTGATGGTGTAAGCTTCGTTATGTCTATGCTTTTGT
CAATATCAACAACATACTTCCCCTCTGGATGAACCTTAACCAAGACCTTGTTTTTCCCCA
TCACTTTGACCACTTCACCCACATAGGAGCCAGGTTCCTGAAGCAGCTGCAACTCTTCTC
TCAGCATTCGTACTCGAGAGTTGAGATCATTCCTCTGAGCTTCGAGGCGATTGAGGTTGT
TAGATTTCTGGCGGAGAAGTCGCTGGAGCTCGTCGATGTGCTGGAGATAGTACTGCTTAA
GCCCATCTCCTTGTTTCGCCACCGCTCCTTTGACGTTGCAGGTTTCCTCCATCGCGGTCT
CGGGACGCCTCGACTCGATTCCTACGGCCGCCATTTTTATCGGTGGTTGCGAAAATTATC
GACGAGAGAGAGCGGGAGAGAGATCTAGTATTGGCGAGGACGATCCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A237JQ U 1
AF RR2AY45JQ U 2
AF RR2A237TF C 714
BS 1 72 RR2A237JQ
BS 73 73 RR2AY45JQ
BS 74 93 RR2A237JQ
BS 94 94 RR2AY45JQ
BS 95 418 RR2A237JQ
BS 419 419 RR2AY45JQ
BS 420 497 RR2A237JQ
BS 498 498 RR2AY45JQ
BS 499 787 RR2A237JQ
BS 788 1427 RR2A237TF

RD RR2A237JQ 800 0 0
CCGAAAAATCTCTCTTAGTTGAAAACGATGAACTCGGAACTGGTATTCTTACATTTCAAG
TACACACTACTA*GTGTTTAGGCAGTAAAAAAA*CTCTGTTTTCAAACGCTTAAAGAACA
AACAGAATAGATTCTGGAGAGAACAGAGAACAGAGATATTCCTACTTCCAGAGCTTACGC
AGAGACATGTTCTTCTCTGTGTCTTTCTTCATAACCTTCGCCACCGCCATCTCAAAGTCT
TCCTGTGTCACGTGTACTCTCCTCTCCCTCAAAGCAAACATGCCTGCCTCCGTGCACACA
GCCTTCAGCTCAGCACCTGAAGCACCATTCATCTTCTCTGCAATCTTCTCCAGATCAATT
CCACGCATCAAGTTCATCTTCCTCGAGTGGATCCTCAAGATATCAAAACGTGAATCTTCG
TTAGGATTTGGGAATTCAATTTTCCTATCAATCCTTCCTGGCCTGAGAAGAGCTTGATCC
AGAATATCTATACGATTTGTCGCCATCAGAACCTTGATCTTGTTTGACGCTTCGAAACCG
TCAAGTTGATTGAGAAGCTCAAGCATAGTCCGCTGAACCTCACTGTCACCGTTTCCACTT
CCAGATTCCATACGAGCAGACCCGATACTATCGATCTCATCCATGAATATGATCGATGGT
GCATGCTCCCTTGCCATCACAAAAAGTTCTCTGACCATTCTAGAACCTTCTCCAATGTAC
TTCTGGACCAGCTCGGAACCAGAAACTCTGATGAACGTACAGTCAGTGTGATGTGCCACA
GCCCGAG
AGACTCAAACAAT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2AY45JQ 799 0 0
CGAAAAATCTCTCTTAGTTGAAAACGATGAACTCGGAACTGGTATTCTTACATTTCAAGT
ACACACTACTAAGTGTTTAGGCAGTAAAAAAAACTCTGTTTTCAAACGCTTAAAGAACAA
ACAGAATAGATTCTGGAGAGAACAGAGAACAGAGATATTCCTACTTCCAGAGCTTACGCA
GAGACATGTTCTTCTCTGTGTCTTTCTTCATAACCTTCGCCACCGCCATCTCAAAGTCTT
CCTGTGTCACGTGTACTCTCCTCTCCCTCAAAGCAAACATGCCTGCCTCCGTGCACACTG
CCTTCAGCTCAGCACCTGAAGCACCATTCATCTTCTCTGCAATCTTCTTCAGATCAATTC
CACGCATCAAGTTCATCTTCCTCGAGTGGATCTTCAAGATATCAAAACGTGAATCTTAGT
TAGGATTTGGGAATTCAATTTTCCTATCAATCCTTCCTGGCCTGAGAAGAGCTTGATCCA
GAATATCTATACGATTCGTCGCCATCAGAACCTTGATCTTGTTTGACGCTTCGAAACCGT
CAAGTTGATTGAGAAGCTCAAGCATAGTCCGCTGAACCTCACTGTCACCGTTTCCACTTC
CAGATTCCATACGAGCAGACCCGATACTATCGATTTCATCCATGAATATGATCGATGGTG
CATGCTCCCTTGCCATCACAAAAAGTTCTCTGACCATTCTAGAACCTTCTCCAATGTATT
TCTGGACCAGCTCGGAACCAGAAACTCTGATGAACGTACAGTCAGTGTGATGTGCCACAG
CCCGAG
CTAAAAGTGTCTT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2A237TF 714 0 0
AATGTACTTCTGGACCAGCTCGGAACCAGAAACTCTGATGAACGTACAGTCAGTGTGATG
TGCCACAGCCCGAGAGACTCAAACAATTCAGGATGCTTGATTGGTAGCTCAATGACCTCC
TTAATTTCCTTAATCTGCTGGTCAAGACCACCAATCATGTCATAAGTGGAGTCAGGAACC
TTCTCAACTTTCATAAGGTTAACCAGGGGATCAACTTTACTTGGCAGGACAAGGTGGAGA
ACATAGCTATCATTACGGAGAGCAACTCTTGTTGATGGTGTAAGCTTCGTTATGTCTATG
CTTTTGTCAATATCAACAACATACTTCCCCTCTGGATGAACCTTAACCAAGACCTTGTTT
TTCCCCATCACTTTGACCACTTCACCCACATAGGAGCCAGGTTCCTGAAGCAGCTGCAAC
TCTTCTCTCAGCATTCGTACTCGAGAGTTGAGATCATTCCTCTGAGCTTCGAGGCGATTG
AGGTTGTTAGATTTCTGGCGGAGAAGTCGCTGGAGCTCGTCGATGTGCTGGAGATAGTAC
TGCTTAAGCCCATCTCCTTGTTTCGCCACCGCTCCTTTGACGTTGCAGGTTTCCTCCATC
GCGGTCTCGGGACGCCTCGACTCGATTCCTACGGCCGCCATTTTTATCGGTGGTTGCGAA
AATTATCGACGAGAGAGAGCGGGAGAGAGATCTAGTATTGGCGAGGACGATCCC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 4

CO CL1436Contig1 1080 4 5 U
GCTTCTACCACAGGTCCAAGGGCTTGTGGTCAAGAAA****ATAACAGTTTGCCACACTA
CTGCAGTAAAATATTCTGCCATAAGCTTTTTACTCAGCTTGTTCGTTGGTGAAAAGATAA
ATCAACTTTGAACTACTCTTCTATTTATAGCTGCACTGTATGAATTCCCGTTCGCCTTCC
CTCCCAGTCGTCTAGCAGCTAGCCTCTGCTTCCGGTTCCGGTTATTCCATTGCCTGTAAC
CCCTGATCAAGAACATTCCTGCTACAAGAAACGACACACCCAACGAAACCTTCTGAATCG
TTGTCCTTACGCGAACCCATTGCAAAAGATCTTTAAAACATGATAATGTCTCAGTCTTCA
AAGGGGACTTTTTCTTCTTCTTTCTGGAGACTCTCCGCGGCCGTGACTCCACCACCGATT
CTAGACTTGCTTTGCTTCCATAACACGGTTCTTCTCTAGAATCATCTTTTGTTTGAACAG
AGAAACCAGCTGCTTCGCAGAACGATGTGCCGTTAGACTCCCACTTTAACGTTTTAACGC
AGATGATGTCGTTTACTCCACATGGCCCAATCATCTGTGTAAGTGCATTACTGGCGAAGT
ACACGTCTTTGCAAGCTTCGAAGACTTTGTTACAGAACGAAGCGCAAATGCGTGGAGGAC
CCGGTTGAATCCCAACGTTCGGGTTACAGATTGAACACTCCAATGCCTCGAACAGATTCA
GACAATCTTGACTAGCTTCTCCAAAAGTAGCCAAGTTTCTGACAGCTACGAAAGCATGGT
TTGTCTGAGCAGGAGAGCAACAGGTTCTTTTACTGAACACTCCACACAAAGTTAGATCCT
TTGATCCTCCTCTACCAACGGGTTTTGGAGGCTTTCCTTCTGATTCATATGGTGGAAACC
TCCCTCCTTTAGAAACGCATACTCCTTTCAAATCCGTTTTCATTGCACCGGATGAGAAGG
AGATCAAGAGATGGAGAAACAGGATCGGACTCTGAATCAGAAACACTTTCTTCGTTGAAC
ATCTTCCCATCTTTCCCTTGATTGATCTAAAAGCTCGAAGCAAAATGATATAAAACACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 10 25 10 25 25 10 10 25 10 10 10 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G570JQ U 1
AF RR2G570TF C 1
AF RR2BQ16JQ U 19
AF RR2BQ16TF C 373
BS 1 550 RR2G570JQ
BS 551 792 RR2BQ16JQ
BS 793 793 RR2BQ16TF
BS 794 803 RR2BQ16JQ
BS 804 1080 RR2BQ16TF

RD RR2G570JQ 550 0 0
GCTTCTACCACAGGTCCAAGGGCTTGTGGTCAAGAAA****ATAACAGTTTGCCACACTA
CTGCAGTAAAATATTCTGCCATAAGCTTTTTACTCAGCTTGTTCGTTGGTGAAAAGATAA
ATCAACTTTGAACTACTCTTCTATTTATAGCTGCACTGTATGAATTCCCGTTCGCCTTCC
CTCCCAGTCGTCTAGCAGCTAGCCTCTGCTTCCGGTTCCGGTTATTCCATTGCCTGTAAC
CCCTGATCAAGAACATTCCTGCTACAAGAAACGACACACCCAACGAAACCTTCTGAATCG
TTGTCCTTACGCGAACCCATTGCAAAAGATCTTTAAAACATGATAATGTCTCAGTCTTCA
AAGGGGACTTTTTCTTCTTCTTTCTGGAGACTCTCCGCGGCCGTGACTCCACCACCGATT
CTAGACTTGCTTTGCTTCCATAACACGGTTCTTCTCTAGAATCATCTTTTGTTTGAACAG
AGAAACCAGCTGCTTCGCAGAACGATGTGCCGTTAGACTCCCACTTTAACGTTTTAACGC
AGATGATGTC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2G570TF 550 0 0
GCTTCTACCACAGGTCCAAGGGCTTGTGGTCAAGAAA****ATAACAGTTTGCCACACTA
CTGCAGTAAAATATTCTGCCATAAGCTTTTTACTCAGCTTGTTCGTTGGTGAAAAGATAA
ATCAACTTTGAACTACTCTTCTATTTATAGCTGCACTGTATGAATTCCCGTTCGCCTTCC
CTCCCAGTCGTCTAGCAGCTAGCCTCTGCTTCCGGTTCCGGTTATTCCATTGCCTGTAAC
CCCTGATCAAGAACATTCCTGCTACAAGAAACGACACACCCAACGAAACCTTCTGAATCG
TTGTCCTTACGCGAACCCATTGCAAAAGATCTTTAAAACATGATAATGTCTCAGTCTTCA
AAGGGGACTTTTTCTTCTTCTTTCTGGAGACTCTCCGCGGCCGTGACTCCACCACCGATT
CTAGACTTGCTTTGCTTCCATAACACGGTTCTTCTCTAGAATCATCTTTTGTTTGAACAG
AGAAACCAGCTGCTTCGCAGAACGATGTGCCGTTAGACTCCCACTTTAACGTTTTAACGC
AGATGATGTC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2BQ16JQ 786 0 0
GG
GACATGAAGGTTCGAATTTTGATAACAGTTTGCCACACTACTGCAGTAAAATATTCTGCC
ATAAGCTTTTTACTCAGCTTGTTCGTTGGTGAAAAGATAAACCAACTTTGAACTACTATT
CTATTTATAGCTGCACTGTATGAATTCCCGTTCGCCTTCCCTCCCAGTCGTCTAGCAGCT
AGCCTCTGCTTCCGGTTCCGGTTATTCCATTGCCGGTAACCCCTGATCAAGAACATTCCT
GCTACAAGAAACGACACACCCAACGAAACCTTCTGAATCGTTGTCCTTACGCGAACCCAT
TGCAAAAGATCTTTAAAACATGATAATGTCTCAGTCTTCAAAGGGGACTTTTTCTTCTTC
TTTCTGGAGACTCTCCGCGGCCGTGACTCCACCACCGATTCTAGACTTGCTTTGCTTCCA
TAACACGGTTCTTCTCTAGAATCATCTTTTGTTTGAACAGAGAAACCAGCTGCTTCGCAG
AACGATGTGCCGTTAGACTCCCACTTTAACGTTTTAACGCAGATGATGTCGTTTACTCCA
CATGGCCCAATCATCTGTGTAAGTGCATTACTGGCGAAGTACACGTCTTTGCAAGCTTCG
AAGACTTTGTTACAGAACGAAGCGCAAATGCGTGGAGGACCCGGTTGAATCCCAACGTTC
GGGTTACAGATTGAACACTCCAATGCCTCGAACAGATTCAGACAATCTTGACTAGCTTCT
CCAAAAGTAGCCAAGTTTCTGACAGCTACGAAAGCATGGTTTGTCTGAGCAG*AGAGCAA
CAG
T

QA 3 785 3 785
DS 

RD RR2BQ16TF 708 0 0
TTTCTTCTCTTTCT
GAGACTCTCCGCGGCCGTGACTCCACCACCGATTCTAGACTTGCTTTGCTTCCATAACAC
GGTTCTTCTCTAGAATCATCTTTTGTTTGAACAGAGAAACCAGCTGCTTCGCAGAACGAT
GTGCCGTTAGACTCCCACTTTAACGTTTTAACGCAGATGATGTCGTTTACTCCACATGGC
CCAATCATCTGTGTAAGTGCATTACTGGCGAAGTACACGTCTTTGCAAGCTTCGAAGACT
TTGTTACAGAACGAAGCGCAAATGCGTGGAGGACCCGGTTGAATCCCAACGTTCGGGTTA
CAGATTGAACACTCCAATGCCTCGAACAGATTCAGACAATCTTGACTAGCTTCTCCAAAA
GTAGCCAAGTTTCTGACAGCTACGAAAGCATGGTTTGTCTGAGCAGGAGAGCAACAGGTT
CTTTTACTGAACACTCCACACAAAGTTAGATCCTTTGATCCTCCTCTACCAACGGGTTTT
GGAGGCTTTCCTTCTGATTCATATGGTGGAAACCTCCCTCCTTTAGAAACGCATACTCCT
TTCAAATCCGTTTTCATTGCACCGGATGAGAAGGAGATCAAGAGATGGAGAAACAGGATC
GGACTCTGAATCAGAAACACTTTCTTCGTTGAACATCTTCCCATCTTTCCCTTGATTGAT
CTAAAAGCTCGAAGCAAAATGATATAAAACACCC

QA 15 708 15 708
DS 



AS 1 5

CO CL1437Contig1 840 5 39 U
GGATAAAACCATATATTTAAGACAGGAGAGGAAAGATAACACACCGAATAATGGAACTTC
TGTTTTGACGTTATAGAGAATGAAAGACTAAAGGCATTGCCCACACAATTATATATCATG
TGAATCTGAATATCTACTAGTACAACTAGAGACGCACACACTAGATCATTCAAAAGAGTT
CTGTTTCTCTTTTTTCTCTTCTCATGTATGTCTCTCTCAGACAAAAGAACACCACATGGT
TTGTGTAGCTTTTGGAATTTAGTCATCAGCTGGGTCTTGTGGACTTTCCTCAGCATTGCG
TTTGATTACGATGACTGGGCATTCTGCATGCTTCACACAAAACTCACTCACCGTTCCAAC
AAACACCTTCTGAAAAGGACCGAGACCACGACTTCCCACAACCAGAAAATCTGGCCTAAC
ACGCCTCACTTCATGGCATATCACTTCCGTGGGATCACCTTTCCTGATCCAGGCCTCACA
CCCAACCCCAATCTCATGACATTTATTAACGAAAAACTCAAGAAGGTGAAGTCCTTTAGC
CTTGTTACGCTCCCTCATATGTCGGAAATCATCAGGGGAAGCATATATGCTGTCTACGTC
ATCAAAACCGTCTTCGTCCTGGACTTGAGCGTGAAGCAAAAGAAGCTTGAAGCCAGAGGT
ATTGTCCCTAACGATCTTCCTCAGTGTCCACTCGAACGCCTTTTTGCTACTTATCGACGC
GTGCGGGTAGCCTTTGATCGTCGACTCGTTCACCGCCACCATCACTCTAGTTGGCTCGCT
CTCCATTTCTGAAATCGTCGTCTCTGGAGTAAGAAGGCGGTGAAGAGACAATGTAATCCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2CP05JQ U 1
AF RR2EG50JQ U 2
AF RR2AX28JQ U 2
AF RR2AX28TFB C 106
AF RR2EG50TF C 195
BS 1 37 RR2CP05JQ
BS 38 38 RR2AX28JQ
BS 39 129 RR2CP05JQ
BS 130 130 RR2AX28JQ
BS 131 139 RR2CP05JQ
BS 140 140 RR2AX28JQ
BS 141 215 RR2CP05JQ
BS 216 217 RR2AX28JQ
BS 218 222 RR2CP05JQ
BS 223 223 RR2AX28JQ
BS 224 233 RR2CP05JQ
BS 234 234 RR2AX28JQ
BS 235 242 RR2CP05JQ
BS 243 243 RR2AX28JQ
BS 244 273 RR2CP05JQ
BS 274 274 RR2AX28JQ
BS 275 288 RR2CP05JQ
BS 289 289 RR2AX28JQ
BS 290 309 RR2CP05JQ
BS 310 310 RR2AX28JQ
BS 311 333 RR2CP05JQ
BS 334 334 RR2AX28JQ
BS 335 351 RR2CP05JQ
BS 352 352 RR2AX28JQ
BS 353 372 RR2CP05JQ
BS 373 373 RR2AX28JQ
BS 374 471 RR2CP05JQ
BS 472 472 RR2AX28JQ
BS 473 594 RR2CP05JQ
BS 595 595 RR2AX28JQ
BS 596 639 RR2CP05JQ
BS 640 640 RR2AX28JQ
BS 641 667 RR2CP05JQ
BS 668 668 RR2AX28JQ
BS 669 705 RR2CP05JQ
BS 706 816 RR2AX28JQ
BS 817 817 RR2AX28TFB
BS 818 839 RR2AX28JQ
BS 840 840 RR2EG50TF

RD RR2CP05JQ 705 0 0
GGATAAAACCATATATTTAAGACAGGAGAGGAAAGATTACACACCGAATAATGGAACTTC
TGTTTTGACGTTATAGAGAATGAAAGACTAAAGGCATTGCCCACACAATTATATATCATG
TGAATCTGAGTATCTACTACTACAACTAGAGACGCACACACTAGATCATTCAAAAGAGTT
CTGTTTCTCTTTTTTCTCTTCTCATGTATGTCTCT**CAGACGAAAGAACACCGCATGGT
TTCTGTAGCTTTTGGAATTTAGTCATCAGCTGGATCTTGTGGACTTTCTTCAGCATTGCG
TTTGATTACAATGACTGGGCATTCTGCATGCTTTACACAAAACTCACTCACGGTTCCAAC
AAACACCTTCTGGAAAGGACCGAGACCACGACTTCCCACAACCAGAAAATCTGGCCTAAC
ACGCCTCACTTCATGGCATATCACTTCCGTGGGATCACCTTTCCTGATCCAAGCCTCACA
CCCAACCCCAATCTCATGACATTTATTAACGAAAAACTCAAGAAGGTGAAGTCCTTTAGC
CTTGTTACGCTCCCTCATATGTCGGAAATCATCAGGGGAAGCATATATGCTGTCCACGTC
ATCAAAACCGTCTTCGTCCTGGACTTGAGCGTGAAGCAATAGAAGCTTGAAGCCAGAGGT
ATTGTCC*TAACGATCTTCCTCAGTGTCCACTCGAACGCCTTTTT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2EG50JQ 711 0 0
GA
TAAAACCATATATTTAAGACAGGAGAGGAAAGATAACACACCGAATAATGGAACTTCTGT
TTTGACGTTATAGAGAATGAAAGACTAAAGGCATTGCCCACACAATTATATATCATGTGA
ATCTGAATATCTACTAGTACAACTAGAGACGCACACACTAGATCATTCAAAAGAGTTCTG
TTTCTCTTTTTTCTCTTCTCATGTATGTCTCTCTCAGACAAAAGAACACCACATGGTTTG
TGTAGCTTTTGGAATTTAGTCATCAGCTGGGTCTTGTGGACTTTCCTCAGCATTGCGTTT
GATTACGATGACTGGGCATTCTGCATGCTTCACACAAAACTCACTCACCGTTCCAACAAA
CACCTTCTGAAAAGGACCGAGACCACGACTTCCCACAACCAGAAAATCTGGCCTAACACG
CCTCACTTCATGGCATATCACTTCCGTGGGATCACCTTTCCTGATCCAGGCCTCACACCC
AACCCCAATCTCATGACATTTATTAACGAAAAACTCAAGAAGGTGAAGTCCTTTAGCCTT
GTTACGCTCCCTCATATGTCGGAAATCATCAGGGGAAGCATATATGCTGTCTACGTCATC
AAAACCGTCTTCGTCCTGGACTTGAGCGTGAAGCAAAAGAAGCTTGAAGCCAGAGGTATT
GTCCCTAACGATCTTCCTCAGTGTCCACTCGAACGCCTTTTTGCTACTT

QA 3 711 3 711
DS 

RD RR2AX28JQ 838 0 0
GG
TAAAACCATATATTTAAGACAGGAGAGGAAAGATAACACACCGAATAATGGAACTTCTGT
TTTGACGTTATAGAGAATGAAAGACTAAAGGCATTGCCCACACAATTATATATCATGTGA
ATCTGAATATCTACTAGTACAACTAGAGACGCACACACTAGATCATTCAAAAGAGTTCTG
TTTCTCTTTTTTCTCTTCTCATGTATGTCTCTCTCAGACAAAAGAACACCACATGGTTTG
TGTAGCTTTTGGAATTTAGTCATCAGCTGGGTCTTGTGGACTTTCCTCAGCATTGCGTTT
GATTACGATGACTGGGCATTCTGCATGCTTCACACAAAACTCACTCACCGTTCCAACAAA
CACCTTCTGAAAAGGACCGAGACCACGACTTCCCACAACCAGAAAATCTGGCCTAACACG
CCTCACTTCATGGCATATCACTTCCGTGGGATCACCTTTCCTGATCCAGGCCTCACACCC
AACCCCAATCTCATGACATTTATTAACGAAAAACTCAAGAAGGTGAAGTCCTTTAGCCTT
GTTACGCTCCCTCATATGTCGGAAATCATCAGGGGAAGCATATATGCTGTCTACGTCATC
AAAACCGTCTTCGTCCTGGACTTGAGCGTGAAGCAAAAGGAGCTTGAAGCCAGAGGTATT
GTCCCTAGCGATCTTCCTCAGTGTCCACTCGAACGCCTTTTTGCTACTTATCGACGCGTG
CGGGTAGCCTTTGATCGTCGACTCGTTCACCGCCACCATCACTCTAGTTGGCTCGCTCTC
CATTTCTGAAATCGTCGTCTCTGGAGTAAGAAG*CGGTGAAGAGACAATGTAATCC

QA 3 838 3 838
DS 

RD RR2AX28TFB 734 0 0
AAC
TTATATATCATGTGAATCTGAATATCTACTAGTACAACTAGAGACGCACACACTAGATCA
TTCAAAAGAGTTCTGTTTCTCTTTTTTCTCTTCTCATGTATGTCTCTCTCAGACAAAAGA
ACACCACATGGTTTGTGTAGCTTTTGGAATTTAGTCATCAGCTGGGTCTTGTGGACTTTC
CTCAGCATTGCGTTTGATTACGATGACTGGGCATTCTGCATGCTTCACACAAAACTCACT
CACCGTTCCAACAAACACCTTCTGAAAAGGACCGAGACCACGACTTCCCACAACCAGAAA
ATCTGGCCTAACACGCCTCACTTCATGGCATATCACTTCCGTGGGATCACCTTTCCTGAT
CCAGGCCTCACACCCAACCCCAATCTCATGACATTTATTAACGAAAAACTCAAGAAGGTG
AAGTCCTTTAGCCTTGTTACGCTCCCTCATATGTCGGAAATCATCAGGGGAAGCATATAT
GCTGTCTACGTCATCAAAACCGTCTTCGTCCTGGACTTGAGCGTGAAGCAAAAGGAGCTT
GAAGCCAGAGGTATTGTCCCTAGCGATCTTCCTCAGTGTCCACTCGAACGCCTTTTTGCT
ACTTATCGACGCGTGCGGGTAGCCTTTGATCGTCGACTCGTTCACCGCCACCATCACTCT
AGTTGGCTCGCTCTCCATTTCTGAAATCGTCGTCTCTGGAGTAAGAAGGCGGTGAAGAGA
CAATGTAATCC

QA 4 734 4 734
DS 

RD RR2EG50TF 646 0 0
TTCTC
TCTCATGTATGTCTCTCTCAGACAAAAGAACACCACATGGTTTGTGTAGCTTTTGGAATT
TAGTCATCAGCTGGGTCTTGTGGACTTTCCTCAGCATTGCGTTTGATTACGATGACTGGG
CATTCTGCATGCTTCACACAAAACTCACTCACCGTTCCAACAAACACCTTCTGAAAAGGA
CCGAGACCACGACTTCCCACAACCAGAAAATCTGGCCTAACACGCCTCACTTCATGGCAT
ATCACTTCCGTGGGATCACCTTTCCTGATCCAGGCCTCACACCCAACCCCAATCTCATGA
CATTTATTAACGAAAAACTCAAGAAGGTGAAGTCCTTTAGCCTTGTTACGCTCCCTCATA
TGTCGGAAATCATCAGGGGAAGCATATATGCTGTCTACGTCATCAAAACCGTCTTCGTCC
TGGACTTGAGCGTGAAGCAAAAGAAGCTTGAAGCCAGAGGTATTGTCCCTAACGATCTTC
CTCAGTGTCCACTCGAACGCCTTTTTGCTACTTATCGACGCGTGCGGGTAGCCTTTGATC
GTCGACTCGTTCACCGCCACCATCACTCTAGTTGGCTCGCTCTCCATTTCTGAAATCGTC
GTCTCTGGAGTAAGAAGGCGGTGAAGAGACAATGTAATCCC

QA 6 646 6 646
DS 



AS 1 6

CO CL1438Contig1 922 6 18 U
GGGTCCTCTTCTCAAACATAACTCAACTTATCGTTTTTGAAATTAAACTATTATAAAGAG
AAATCAAAAAGAAGAGAAGACCACCAAACAAAACACAAAAACAAAGAAAATAATTATTTT
AACAAAAATGGCTTCCAAAGCAATCTTCTTCTCTCTCTTTATTGTCTCCACCGTGTGTTT
GTCTTCTCTCGCCAGTTTTGCTGCCGCAGATGCTGATGATTCTGACATTTTCCAGATTCA
GGGATCAGTTTACTGTGACACTTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTCCT
CGAAGGTGCGAAAGTGAAGTTGGAGTGCAGAAGCAGAACAAACGGAACCCTAACGTTGAC
CAAAGAAGCCGTTACCGACAAATCAGGAAGCTACAAGATGGAAGTAACCGGTGACCACGA
AGAAGAAGTTTGCGAGCTCGTGTTGGTCCAATCACCAGACAGTGGTTGCAGTGATGTCAG
CAAAGATGATTACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTTTAACGGCGAATGACGGAATCGT
CTCTCATGAGACACGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTAAGACACCATCAGCTGA
TTGTCCTGCTGCTTTCAAGGAACTCGGTATCGTCCCTGACGTCACTTTCTAAGCGAATAA
CCAAAATATATGACGTCGCCAAAAAAATAATATATATATATATATGACGTGAGAGATTTT
TATTTTGTATTTGCATCATCTTTAAGGGGTTTTTGCCAAGTTTATCGATTATTTATTATT
ATGGATTAATATCATCCTGATTTGTTCATTTCGTTTTTTTTTTT*GTTTAATTTGAATGG
TACATTCTTGTTCTATAGAAAAAAGGATGGGGCTAATTTTGGTCATATATACAATGCTGA
AGAAACTATCCATTATTACGGT


BQ
10 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 10 10 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY18TF U 2
AF RR2ER52TF U 1
AF RR2F278TF U 1
AF RR2F278JQ C 123
AF RR2DY18JQ C 677
AF RR2ER52JQ C 299
BS 1 6 RR2ER52TF
BS 7 7 RR2DY18TF
BS 8 183 RR2ER52TF
BS 184 184 RR2F278TF
BS 185 548 RR2ER52TF
BS 549 549 RR2F278TF
BS 550 586 RR2ER52TF
BS 587 587 RR2F278TF
BS 588 656 RR2ER52TF
BS 657 657 RR2F278TF
BS 658 681 RR2ER52TF
BS 682 686 RR2F278TF
BS 687 687 RR2F278JQ
BS 688 732 RR2F278TF
BS 733 858 RR2F278JQ
BS 859 869 RR2ER52JQ
BS 870 870 RR2DY18JQ
BS 871 922 RR2ER52JQ

RD RR2DY18TF 506 0 0
GGTCCTCTTCTCAAACATAACTCAACTTATCGTTTTTGAAATTAAACTATTATAAAGAGA
AATCGAAAAGAAGAGAAGACCACCAAACAAAACACAAAAACAAAGAAAATAATTATTTTA
ACAAAAATGGCTTCCAAAGCAATCTTCTTCTCTCTCTTTATTGTCTCCACCGTGTGTTTG
TCCTCTCTCGCCAGTTTTGCTGCCGCAGATGCTGATGATTCTGACATTTTCCAGATTCAG
GGATCAGTTTACTGTGACACTTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTCCTC
GAAGGTGCGAAAGTGAAGTTGGAGTGCAGAAGCAGAACAAACGGAACCCTAACGTTGACC
AAAGAAGCCGTTACCGACAAATCAGGAAGCTACAAGATGGAAGTAACCGGTGACCACGAA
GAAGAAGTTTGCGAGCTCGTGTTGGTCCAATCACCAGACAGTGGTTGCAGTGATGTCAGC
AAAGATGATTACTTACGTAACGCCGC

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2ER52TF 681 0 0
GGGTCCCCTTCTCAAACATAACTCAACTTATCGTTTTTGAAATTAAACTATTATAAAGAG
AAATCAAAAAGAAGAGAAGACCACCAAACAAAACACAAAAACAAAGAAAATAATTATTTT
AACAAAAATGGCTTCCAAAGCAATCTTCTTCTCTCTCTTTATTGTCTCCACCGTGTGTTT
GTCCTCTCTCGCCAGTTTTGCTGCCGCAGATGCTGATGATTCTGACATTTTCCAGATTCA
GGGATCAGTTTACTGTGACACTTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTCCT
CGAAGGTGCGAAAGTGAAGTTGGAGTGCAGAAGCAGAACAAACGGAACCCTAACGTTGAC
CAAAGAAGCCGTTACCGACAAATCAGGAAGCTACAAGATGGAAGTAACCGGTGACCACGA
AGAAGAAGTTTGCGAGCTCGTGTTGGTCCAATCACCAGACAGTGGTTGCAGTGATGTCAG
CAAAGATGATTACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTTTAACGGCGAATGACGGAATCGT
CTCTCATGTGACACGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTAAGGCACCATCAGCTGA
TTGTCCTGCTGCTTTCAAGGAACTCGGTATCGTCCCTGACGTCACTTTCTAAGCGA*TAA
CCAAAATATATGACGTCGCCA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2F278TF 732 0 0
G
GGTCCTCTTCTCAAACATAACTCAACTTATCGTTTTTGAAATTAAACTATTATAAAGAGA
AATCAAAAAGAAGAGAAGACCACCAAACAAAACACAAAAACAAAGAAAATAATTATTTTA
ACAAAAATGGCTTCCAAAGCAATCTTCTTCTCTCTCTTTATTGTCTCCACCGTGTGTTTG
TCTTCTCTCGCCAGTTTTGCTGCCGCAGATGCTGATGATTCTGACATTTTCCAGATTCAG
GGATCAGTTTACTGTGACACTTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTCCTC
GAAGGTGCGAAAGTGAAGTTGGAGTGCAGAAGCAGAACAAACGGAACCCTAACGTTGACC
AAAGAAGCCGTTACCGACAAATCAGGAAGCTACAAGATGGAAGTAACCGGTGACCACGAA
GAAGAAGTTTGCGAGCTCGTGTTGGTCCAATCACCAGACAGTGGTTGCAGTGATGTCAGC
AAAGATGATTACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTTTAACGGCGAATGACGGAATCGTC
TCTCATGAGACACGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTAAGACACCATCAGCTGAT
TGTCCTGCTGCTTTCAAGGAACTCGGTATCGTCCCTGACGTCACTTTCTAAGCGAATAAC
CAAAATATATGACGTCGCCAAAAAA*TAATATATATATATATATGACGTGAGAGATTTTT
ATTTTGTATTT

QA 2 732 2 732
DS 

RD RR2F278JQ 737 0 0
CAAAAATGGCTTCCAAAGCAATCTTCTTCTCTCTCTTTATTGTCTCCACCGTGTGTTTGT
CTTCTCTCGCCAGTTTTGCTGCCGCAGATGCTGATGATTCTGACATTTTCCAGATTCAGG
GATCAGTTTACTGTGACACTTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTCCTCG
AAGGTGCGAAAGTGAAGTTGGAGTGCAGAAGCAGAACAAACGGAACCCTAACGTTGACCA
AAGAAGCCGTTACCGACAAATCAGGAAGCTACAAGATGGAAGTAACCGGTGACCACGAAG
AAGAAGTTTGCGAGCTCGTGTTGGTCCAATCACCAGACAGTGGTTGCAGTGATGTCAGCA
AAGATGATTACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTTTAACGGCGAATGACGGAATCGTCT
CTCATGAGACACGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTAAGACACCATCAGCTGATT
GTCCTGCTGCTTTCAAGGAACTCGGTATCGTCCCTGACGTCACTTTTTAAGCGAATAACC
AAAATATATGACGTCGCCAAAAAAATAATATATATATATATATGACGTGAGAGATTTTTA
TTTTGTATTTGCATCATCTTTAAGGGGTTTTTGCCAAGTTTATCGATTATTTATTATTAT
GGATTAATATCATCCTGATTTGTTCATTTCGTTTTTTTTTTT*GTTTAATTTGAATGGTA
CATTCTTGTTCTATAG
G

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2DY18JQ 198 0 0
TCGCCAAAAAAAATA
ATATATATATATATGACGTGAGAGATTTTTATTTTGTATTTGCATCATCTTTAAGGGGTT
TTTGCCAAGTTTATCGATTATTTATTATTATGGATTAATATCATCCTGATTTGTTCATTT
CGTTTTTTTTTTTTGTTTAATTTGAATGGTACATTCTTGTTCTATAGAAAAAAGGATGGG
GCT

QA 16 198 16 198
DS 

RD RR2ER52JQ 624 0 0
CTCGAAGGTGCGAAAGTGAAGTTGGAGTGCAGAAGCAGAACAAACGGAACCCTAACGTTG
ACCAAAGAAGCCGTTACCGACAAATCAGGAAGCTACAAGATGGAAGTAACCGGTGACCAC
GAAGAAGAAGTTTGCGAGCTCGTGTTGGTCCAATCACCAGACAGTGGTTGCAGTGATGTC
AGCAAAGATGATTACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTTTAACGGCGAATGACGGAATC
GTCTCTCATGTGACACGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTAAGGCACCATCAGCT
GATTGTCCTGCTGCTTTCAAGGAACTCGGTATCGTCCCTGACGTCACTTTTTAAGCGAAT
AACCAAAATATATGACGTCGCCAAAAAAAATA*ATATATATATATATGACGTGAGAGATT
TTTATTTTGTATTTGCATCATCTTTAAGGGGTTTTTGCCAAGTTTATCGATTATTTATTA
TTATGGATTAATATCATCCTGATTTGTTCATTTCGTTTTTTTTTTT*GTTTAATTTGAAT
GGTACATTCTTGTTCTATAGAAAAAAGGATGTGGCTAATTTTGGTCATATATACAATGCT
GAAGAAACTATCCATTATTACGGT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 4

CO CL1439Contig1 1465 4 13 U
GGGTCCCTTTCCCCTTTCCCCTTTCTCTCTCTCCCCATCTAGTTTCTTCTCCTAACTCCA
GAGTTTTGATTCTCAAGGATCTCAAAAGTGCTTTCCTTTCCTTTTTCTTCTACCTTGAGA
TAAAGAGATGGGGACATACCTAAGCTCTCCCAAAACTGATAAGTTATCAGAAGAAGGCGA
GAATGATAAACTCAGATATGGTTTATCCTCTATGCAAGGTTGGCGTGCCACCATGGAAGA
TGCGCATGCTGCAATTCTTGATCTAGATGATAAGACATCCTTCTTCGGTGTGTATGATGG
CCATGGAGGTAAAGTTGTGGCAAAGTTCTGTGCCAAGTATCTACACCAACAGGTTCTCAG
TAATGAAGCATATGGAGCTGGAGATATTGAAACATCTCTTCAGAGAGCATTCTTTAGAAT
GGATGACATGATGCAAGGACAGAGAGGATGGCGAGAGCTAGCTGTACTCGGTGACAAGAT
GAATAAATTTAGCGGCATGATTGAAGGATTCATATGGTCACCAAGAAGCGGTGACGCCAA
TAACCAGCCTGATAATTGGCCTCTTGAGGATGGTCCTCATTCTGATTTCCCGGGACCTAC
TTCCGGGTGTACAGCATGTGTAGCTCTTATTAAAGACAAGAAGCTGTTCGTTGCAAATGC
TGGTGACTCACGTTGTGTGATATCAAGGAAAGGTCAGGCTTGCAATCTTTCTAAAGATCA
CAAACCTGATCTTGAAGTTGAGAAAGAGAGGATATTGAAAGCTGGTGGCTTTATTCATGC
TGGGCGTATTAATGGAAGCTTGAATCTGACTAGAGCCATTGGTGACATGGAGTTCAAGCA
GAATAAGTTCTTACCATCTGAGAAGCAAATGGTTACTGCTGATCCAGATATAAACACTCT
TGACCTATGTGATGATGATGATTTTCTTGTTGTTGCATGTGATGGAATCTGGGACTGTAT
GTCAAGCCAGCAACTGGTGGATTTTATCCATGAACAGTTAAAATCTGAAACAAAACTTTC
AACCGTATGTGAAAAAGTTGTTGATAGATGTTTGGCTCCAGACACTGCGAGAGGTGAAGG
TTGTGATAATATGACCATCATCTTGGTTCAGTTCAAGAAGTCCAATAACACATCTGAGCC
TGAACCAGAAGAAGAAACCAAACCAGAACGGAGCCAGGACGAGCCGAGCTCATCAAGCTA
GATGGTCCCTAAAAGAGCCAGGGGGAGATGTGAAACGGTTATATCGTTTGACTTTGGTTT
CGAGCGGCTTATAGAAGCAGATGCTGGATGTTTGTTGAGATTTTAGATTTTATTTCCTCA
GTTTTCAGAGCTTCTCTTTACTCACACTGGTTCCATTGGTTCCTGTAATAAAATCGACCC
TGTATAGTTTTCTTGTGGTTTATGAGAAAGTTATCACACTCTGATGTACACAAGCCATTA
ATGAGATTCAGAATGTTGTTAGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C083TF U 1
AF RR2CJ49TF U 238
AF RR2B604TF U 693
AF RR2FA58JQ C 842
BS 1 688 RR2C083TF
BS 689 966 RR2CJ49TF
BS 967 967 RR2FA58JQ
BS 968 968 RR2B604TF
BS 969 969 RR2FA58JQ
BS 970 1071 RR2B604TF
BS 1072 1072 RR2FA58JQ
BS 1073 1264 RR2B604TF
BS 1265 1265 RR2FA58JQ
BS 1266 1378 RR2B604TF
BS 1379 1379 RR2FA58JQ
BS 1380 1448 RR2B604TF
BS 1449 1465 RR2FA58JQ

RD RR2C083TF 688 0 0
GGGTCCCTTTCCCCTTTCCCCTTTCTCTCTCTCCCCATCTAGTTTCTTCTCCTAACTCCA
GAGTTTTGATTCTCAAGGATCTCAAAAGTGCTTTCCTTTCCTTTTTCTTCTACCTTGAGA
TAAAGAGATGGGGACATACCTAAGCTCTCCCAAAACTGATAAGTTATCAGAAGAAGGCGA
GAATGATAAACTCAGATATGGTTTATCCTCTATGCAAGGTTGGCGTGCCACCATGGAAGA
TGCGCATGCTGCAATTCTTGATCTAGATGATAAGACATCCTTCTTCGGTGTGTATGATGG
CCATGGAGGTAAAGTTGTGGCAAAGTTCTGTGCCAAGTATCTACACCAACAGGTTCTCAG
TAATGAAGCATATGGAGCTGGAGATATTGAAACATCTCTTCAGAGAGCATTCTTTAGAAT
GGATGACATGATGCAAGGACAGAGAGGATGGCGAGAGCTAGCTGTACTCGGTGACAAGAT
GAATAAATTTAGCGGCATGATTGAAGGATTCATATGGTCACCAAGAAGCGGTGACGCCAA
TAACCAGCCTGATAATTGGCCTCTTGAGGATGGTCCTCATTCTGATTTCCCGGGACCTAC
TTCCGGGTGTACAGCATGTGTAGCTCTTATTAAAGACAAGAAGCTGTTCGTTGCAAATGC
TGGTGACTCACGTTGTGTGATATCAAGG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2CJ49TF 735 0 0
G
GATGCGCATGCTGCAATTCTTGATCTAGATGATAAGACATCCTTCTTCGGTGTGTATGAT
GGCCATGGAGGTAAAGTTGTGGCAAAGTTCTGTGCCAAGTATCTACACCAACAGGTTCTC
AGTAATGAAGCATATGGAGCTGGAGATATTGAAACATCTCTTCAGAGAGCATTCTTTAGA
ATGGATGACATGATGCAAGGACAGAGAGGATGGCGAGAGCTAGCTGTACTCGGTGACAAG
ATGAATAAATTTAGCGGCATGATTGAAGGATTCATATGGTCACCAAGAAGCGGTGACGCC
AATAACCAGCCTGATAATTGGCCTCTTGAGGATGGTCCTCATTCT*ATTTCCCGGGACCT
ACTTCCGGGTGTACAGCATGTGTAGCTCTTATTAAAGACAAGAAGCTGTTCGTTGCAAAT
GCTGGTGACTCACGTTGTGTGATATCAAGGAAAGGTCAGGCTTGCAATCTTTCTAAAGAT
CACAAACCTGATCTTGAAGTTGAGAAAGAGAGGATATTGAAAGCTGGTGGCTTTATTCAT
GCTGGGCGTATTAATGGAAGCTTGAATCTGACTAGAGCCATTGGTGACATGGAGTTCAAG
CAGAATAAGTTCTTACCATCTGAGAAGCAAATGGTTACTGCTGATCCAGATATAAACACT
CTTGACCTATGTGATGATGATGATTTTCTTGTTGTTGCATGTGATGGAATCTGGGACTGT
ATGTCAAG
CCAGCA

QA 2 729 2 729
DS 

RD RR2B604TF 769 0 0
GTCAGGCTTGCAATCTTTCTAAAGATCACAAACCTGATCTTGAAGTTGAGAAAGAGAGGA
TATTGAAAGCTGGTGGCTTTATTCATGCTGGGCGTATTAATGGAAGCTTGAATCTGACTA
GAGCCATTGGTGACATGGAGTTCAAGCAGAATAAGTTCTTACCATCTGAGAAGCAAATGG
TTACTGCTGATCCAGATATAAACACTCTTGACCTATGTGATGATGATGATTTTCTTGTTG
TTGCATGTGATGGAATCTGGGACTGTATGTCAAGTCGGCAACTGGTGGATTTTATCCATG
AACAGTTAAAATCTGAAACAAAACTTTCAACCGTATGTGAAAAAGTTGTTGATAGATGTT
TGGCTCCAGACACTGCGAGTGGTGAAGGTTGTGATAATATGACCATCATCTTGGTTCAGT
TCAAGAAGTCCAATAACACATCTGAGCCTGAACCAGAAGAAGAAACCAAACCAGAACGGA
GCCAGGACGAGCCGAGCTCATCAAGCTAGATGGTCCCTAAAAGAGCCAGGGGGAGATGTG
AAACGGTTATATCGTTTGACTTTGGTTTCGAGTGGCTTATAGAAGCAGATGCTGGATGTT
TGTTGAGATTTTAGATTTTATTTCCTCAGTTTTCAGAGCTTCTCTTTACTCACACTGGTT
CCATTGGTTCCTGTAATAAAATCGACTCTGTATAGTTTTCTTGTGGTTTATGAGAAAGTT
ATCACACTCTGATGTACACAAGCCATTAATGAGATT
TACAGAATGTTGT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2FA58JQ 624 0 0
AATAAGTTCTTGCCATCTGAGAAGCAAATGGTTACTGCTGATCCAGATATAAACACTCTT
GACCTATGTGATGATGATGATTTTCTTGTTGTTGCATGTGATGGAATCTGGGACTGTATG
TCAAGCCAGCAACTGGTGGATTTTATCCATGAACAGTTAAAATCTGAAACAAAACTTTCA
ACCGTATGTGAAAAAGTTGTTGATAGATGTTTGGCTCCAGACACTGCGAGAGGTGAAGGT
TGTGATAATATGACCATCATCTTGGTTCAGTTCAAGAAGTCTAATAACACATCTGAGCCT
GAACCAGAAGAAGAAACCAAACCAGAACGGAGCCAGGACGAGCCGAGCTCATCAAGCTAG
ATGGTCCCTAAAAGAGCCAGGGGGAGATGTGAAACGGTTATATCGTTTGACTTTGGTTTC
GAGCGGCTTATAGAAGCAGATGCTGGATGTTTGTTGAGATTTTAGATTTTATTTCCTCAG
TTTTCAGAGCTTCTCTTTACTCACACTGGTTCCATTGGTTCCTGTAATAAAATCGACCCT
GTATAGTTTTCTTGTGGTTTATGAGAAAGTTATCACATTCTGATGTACACAAGCCATTAA
TGAGATTCAGAATGTTGTTAGGCC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 6

CO CL1440Contig1 844 6 11 U
GGAAACATAACTTCCTAAACTTTTCTTCCGCAATTCATTCTCTTTAAAGAATCCGAGTAG
AGAAGGCTCTGCCAGAGGAGACATGGAGGATCTTGTGGGACTTCTTAGAATCCGAGTGAA
AAGAGGGACTAATCTTGTTAGTAGAGACTCTCAGAGCAGCGACCCTTTCGTTGTCGTAAC
TATGGGTCCACAGACATTGAAGACTAGTCGTGTGGAAAATAACTGTAACCCTGAGTGGAA
CGACGAACTGACTCTTGCATTCAATGATCATAATCAACCTGTGAATCTCGAAGTTTATGA
TAAAGATACATTCACTTCCCATGACAAGATGGGAGATGCGGAAATAGACGTCAGGCCGTT
TCTTGAGATTCAAGCAATGGGTCTTCAAGAACTCCCTGATGGAACCGAGGTCAAGAGAGT
GAAGCCGAGTAAAGACAATTGCTTGGCTCAAGAGAGCAGGATCATGTTTAGTAATGGAAA
GATCGTCCAAGACATGATTCTCAGGCTGAGAAATGTCGAAAGAGGTGAGGTTGAGATTCA
AATTGAGTGGATCAGTGTTCCATAGGGTCAAGGGATCGTTGAAAGAAGACATGAAATAAG
CACAAAGTTAAAACTGATTTGTATTGAGTTTAATAAATGTGGTGACAGTGTCGATATGCT
CGTAGCTAACTCAAAAGGTTAGAACTTGCATACGCAAACAGAAAGAGTAGAAATATATTT
ATTCCTTGGACAAGAGGTGTTCGTTTGATCTCTTTGGCAGTGATGATTTAAAGAACTGAA
ACAGAGTTTTATTAAACAAGCCCAGGAAGAGTATTGAAGCCCATGTTTCTAGTGGCAGCC
TCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2E680TF U 1
AF RR2EK29TF U 72
AF RR2E680JQ C 177
AF RR2AE69TF U 77
AF RR2AE69JQ C 77
AF RR2EU44TF U 72
BS 1 339 RR2E680TF
BS 340 340 RR2EK29TF
BS 341 679 RR2E680TF
BS 680 680 RR2EK29TF
BS 681 697 RR2E680TF
BS 698 698 RR2EK29TF
BS 699 712 RR2E680TF
BS 713 732 RR2EK29TF
BS 733 733 RR2EU44TF
BS 734 750 RR2EK29TF
BS 751 844 RR2EU44TF

RD RR2E680TF 718 0 0
GGAAACATAACTTCCTAAACTTTTCTTCCGCAATTCATTCTCTTTAAAGAATCCGAGTAG
AGAAGGCTCTGCCAGAGGAGACATGGAGGATCTTGTGGGACTTCTTAGAATCCGAGTGAA
AAGAGGGACTAATCTTGTTAGTAGAGACTCTCAGAGCAGCGACCCTTTCGTTGTCGTAAC
TATGGGTCCACAGACATTGAAGACTAGTCGTGTGGAAAATAACTGTAACCCTGAGTGGAA
CGACGAACTGACTCTTGCATTCAATGATCATAATCAACCTGTGAATCTCGAAGTTTATGA
TAAAGATACATTCACTTCCCATGACAAGATGGGAGATGCAGAAATAGACGTCAGGCCGTT
TCTTGAGATTCAAGCAATGGGTCTTCAAGAACTCCCTGATGGAACCGAGGTCAAGAGAGT
GAAGCCGAGTAAAGACAATTGCTTGGCTCAAGAGAGCAGGATCATGTTTAGTAATGGAAA
GATCGTCCAAGACATGATTCTCAGGCTGAGAAATGTCGAAAGAGGTGAGGTTGAGATTCA
AATTGAGTGGATCAGTGTTCCATAGGGTCAAGGGATCGTTGAAAGAAGACATGAAATAAG
CACAAAGTTAAAACTGATTTGTATTGAGTTTAATAAATGTGGTGACAGTGTCGATATGCT
CGTAGCTAACTCAAAAGGT*AGAACTTGCATACGCAA*CAGAAAGAGTAGAA
TATATT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2EK29TF 686 0 0
GGAGA
GGAGACATGGAGGATCTTGTGGGACTTCTTAGAATCCGAGTGAAAAGAGGGACTAATCTT
GTTAGTAGAGACTCTCAGAGCAGCGACCCTTTCGTTGTCGTAACTATGGGTCCACAGACA
TTGAAGACTAGCCGTGTGGAAAATAACTGTAACCCTGAGTGGAACGACGTACTGACTCTT
GCATTCAATGATCATAATCAACCTGTGAATCTCGAAGTTTATGATAAAGATACATTCACT
TCCCATGACAAGATGGGAGATGCGGAAATAGACGTCAGGCCGTTTCTTGAGATTCAAGCA
ATGGGTCTTCAAGAACTCCCTGATGGAACCGAGGTCAAGAGAGTGAAGCCGAGTAAAGAC
AATTGCTTGGCTCAAGAGAGCAGGATCATGTTTAGTAATGGAAAGATCGTCCAAGACATG
ATTCTCAGGCTGAGAAATGTCGAAAGAGGTGAGGTTGAGATTCAAATTGAGTGGATCAGT
GTTCCATAGGGTCAAGGGATCGTTGAAAGAAGACATGAAATAAGCACAAAGTTAAAACTG
ATTTGTATTGAGTTTAATAA*TGTGGTGACAGTGTCGATATGCTCGTAGCTAACTCAAAA
GGTTAGAACTTGCATACGCAAACAGAAAGAGTAGAAATATATTTATTCCTTGGACA*GAG
GTGTTCGTTTGATC
TCTTTGG

QA 6 679 6 679
DS 

RD RR2E680JQ 576 0 0
TAACTATGGGTCCACAGACATTGAAGACTAGTCGTGTGGAAAATAACTGTAACCCTGAGT
GGAACGACGAACTGACTCTTGCATTCAATGATCATAATCAACCTGTGAATCTCGAAGTTT
ATGATAAAGATACATTCACTTCCCATGACAAGATGGGAGATGCAGAAATAGACGTCAGGC
CGTTTCTTGAGATTCAAGCAATGGGTCTTCAAGAACTCCCTGATGGAACCGAGGTCAAGA
GAGTGAAGCCGAGTAAAGACAATTGCTTGGCTCAAGAGAGCAGGATCATGTTTAGTAATG
GAAAGATCGTCCAAGACATGATTCTCAGGCTGAGAAATGTCGAAAGAGGTGAGGTTGAGA
TTCAAATTGAGTGGATCAGTGTTCCATAGGGTCAAGGGATCGTTGAAAGAAGACATGAAA
TAAGCACAAAGTTAAAACTGATTTGTATTGAGTTTAATAAATGTGGTGACAGTGTCGATA
TGCTCGTAGCTAACTCAAAAGGTTAGAACTTGCATACGCAAACAGAAAGAGTAGAAATAT
ATTTATTCCTTGGACAAGAGGTGTTCGTTTGATC
CC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2AE69TF 656 0 0
GGAGACATGGAGGATCTTGTGGGACTTCTTAGAATCCGAGTGAAAAGAGGGACTAATCTT
GTTAGTAGAGACTCTCAGAGCAGCGACCCTTTCGTTGTCGTAACTATGGGTCCACAGACA
TTGAAGACTAGTCGTGTGGAAAATAACTGTAACCCTGAGTGGAACGACGAACTGACTCTT
GCATTCAATGATCATAATCAACCTGTGAATCTCGAAGTTTATGATAAAGATACATTCACT
TCCCATGACAAGATGGGAGATGCGGAAATAGACGTCAGGCCGTTTCTTGAGATTCAAGCA
ATGGGTCTTCAAGAACTCCCTGATGGAACCGAGGTCAAGAGAGTGAAGCCGAGTAAAGAC
AATTGCTTGGCTCAAGAGAGCAGGATCATGTTTAGTAATGGAAAGATCGTCCAAGACATG
ATTCTCAGGCTGAGAAATGTCGAAAGAGGTGAGGTTGAGATTCAAATTGAGTGGATCAGT
GTTCCATAGGGTCAAGGGATCGTTGAAAGAAGACATGAAATAAGCACAAAGTTAAAACTG
ATTTGTATTGAGTTTAATAAATGTGGTGACAGTGTCGATATGCTCGTAGCTAACTCAAAA
GGTTAGAACTTGCATACGCAAACAGAAAGAGTAGAAATATATTTATTCCTTGGACA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2AE69JQ 655 0 0
GGAGACATGGAGGATCTTGTGGGACTTCTTAGAATCCGAGTGAAAAGAGGGACTAATCTT
GTTAGTAGAGACTCTCAGAGCAGCGACCCTTTCGTTGTCGTAACTATGGGTCCACAGACA
TTGAAGACTAGTCGTGTGGAAAATAACTGTAACCCTGAGTGGAACGACGAACTGACTCTT
GCATTCAATGATCATAATCAACCTGTGAATCTCGAAGTTTATGATAAAGATACATTCACT
TCCCATGACAAGATGGGAGATGCGGAAATAGACGTCAGGCCGTTTCTTGAGATTCAAGCA
ATGGGTCTTCAAGAACTCCCTGATGGAACCGAGGTCAAGAGAGTGAAGCCGAGTAAAGAC
AATTGCTTGGCTCAAGAGAGCAGGATCATGTTTAGTAATGGAAAGATCGTCCAAGACATG
ATTCTCAGGCTGAGAAATGTCGAAAGAGGTGAGGTTGAGATTCAAATTGAGTGGATCAGT
GTTCCATAGGGTCAAGGGATCGTTGAAAGAAGACATGAAATAAGCACAAAGTTAAAACTG
ATTTGTATTGAGTTTAATAAATGTGGTGACAGTGTCGATATGCTCGTAGCTAACTCAAAA
GGTTAGAACTTGCATACGCAAACAGAAAGAGTAGAAATATATTTATTCCTTGGAC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2EU44TF 773 0 0
GGAGA
GGAGACATGGAGGATCTTGTGGGACTTCTTAGAATCCGAGTGAAAAGAGGGACTAATCTT
GTTAGTAGAGACTCTCAGAGCAGCGACCCTTTCGTTGTCGTAACTATGGGTCCACAGACA
TTGAAGACTAGTCGTGTGGAAAATAACTATAACCCTGAGTGGAACGACGAACTGACTCTT
GCATTCAATGATCATAATCAACCTGTGAATCTCGAAGTTTATGATAAAGATACATTCACT
TCCCATGACAAGATGGGAGATGCGGAAATAGACGTCAGGCCGTTTCTTGAGATTCAAGCA
ATGGGTCTTCAAGAACTCCCTGATGGAACCGAGGTCAAGAGAGTGAAGCCGAGTAAAGAC
AATTGCTTGGCTCAAGAGAGCAGGATCATGTTTAGTAATGGAAAGATCGTCCAAGACATG
ATTCTCAGGCTGAGAAATGTCGAAAGAGGTGAGGTTGAGATTCAAATTGAGTGGATCAGT
GTTCCATAGGGTCAAGGGATCGTTGAAAGAAGACATGAAATAAGCACAAAGTTAAAACTG
ATTTGTATTGAGTTTAATAAATGTGGTGACAGTGTCGATATGCTCGTAGCTAACTCAAAA
GGTTAGAACTTGCATACGCAAACAGAAAGAGTAGAA*TATATTTATTCCTTGGACAAGAG
GTGTTCGTTTGATCTCTTTGGCAGTGATGATTTAAAGAACTGAAACAGAGTTTTATTAAA
CAAGCCCAGGAAGAGTATTGAAGCCCATGTTTCTAGTGGCAGCCTCTC

QA 6 773 6 773
DS 



AS 1 5

CO CL1441Contig1 781 5 11 U
GGATCTCTTTAGAAACAGAACAGAACAGAACAGAACAGAGAGACACACAAAAATGTATTT
TGCAGCCATAGCTTCTTCACGACATAGCTTTTTGTCAGACTCTTTCAGTTCCCGACACAG
CTTCAAACCCAGACACAGTAATAAGCTCACACGTCCCAATTCAATCTGTTGCAAGTCTCC
ACACCACGACGACGAAACTGATTCTTCCCGGAAACATGAGAATCATCTGGCTAAATTGTC
AATAGCGACGTTAGCGGTTGGCGTTTTGGCTTTGGGATCCGTTGGAGATGCGTCTGCGGC
TAAGAGCGGCGGAAGAATCGGTGGTCAAGCGTTTCGGTCTTCAGCTCCTCGGCCTCCTCC
TAGAATTAACAACCGATCGAGGACCAATATCTACGTGAATCCTCAGGTTGCACCACCTTT
GATCGGTGGCTATGGATATGGCTACGGCGGTTGGGGATGGTCACCGTTTTCTTACTTTGC
CCCCGGTCCTGCGGTAGCAGTTGGTGGCGGCGGTGGCTTCGACCTCCTCGTTCTCTTCAT
GTTTTTTGGAGCCGCTTCAGCCGTGGCCAGAAACGTTTTCCGATCAAGAAATGAAGAAGA
TGACGAAGATGACTATTAGGGCTGGGAAAGAATAAAATCAGAGAGGCATGTCTTATTACA
AACATAGTCGAATATACGATTTTGTGTTAAAAGTTAATGATGGAAAAGACGGTTTGTAGT
GTTCAAAAAAAAGGAAAAGACGGTTTGTAATATGTAAACCTTGAGACAAATTACTAAGAG
C


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 

AF RR2ES39TF U 2
AF RR2DU54TF U 1
AF RR2A344JQ C 355
AF RR2A344TF U 43
AF RR2DU54JQ C 26
BS 1 592 RR2DU54TF
BS 593 593 RR2ES39TF
BS 594 616 RR2DU54TF
BS 617 617 RR2ES39TF
BS 618 661 RR2DU54TF
BS 662 662 RR2A344TF
BS 663 691 RR2DU54TF
BS 692 723 RR2A344TF
BS 724 769 RR2DU54JQ
BS 770 770 RR2A344JQ
BS 771 781 RR2DU54JQ

RD RR2ES39TF 660 0 0
GATCTCTTTAGAAATAGAACAGAACAGAACAGAACAGAGAGACACACAAAAATGTATTTT
GCAGCCATAGCTTCTTCACGACATAGCTTTTTGTCAGACTCTTTCAGTTCCCGACACAGC
TTCAAACCCAGACACAGTAATAAGCTCACACGTCCCAATTCAATCTGTTGCAAGTCTCCA
CACCACGACGACGAAACTGATTCTTCCCGGAAACATGAGAATCATCTGGCTAAATTGGCA
ATAGCGACGTTAGCGGTTGGCGTTTTGGCTTTGGGATCCGTTGGAGATGCGTCTGCGGCT
AAGAGCGGCGGAAGAATCGGTGGTCAAGCGTTTCGGTCTTCAGCTCCTCGGCCTCCTCCT
AGAATTAACAACCGATCGAGGACCAACATCTACGTGAATCCTCAGGTTGCACCACCTTTG
ATCGGTGGCTATGGATATGGCTACGGCGGTTGGGGATGGTCACCGTTTTCTTACTTTGCC
CCCGGTCCTGCGGTAGCAGTTGGTGGCGGCGGTGGCTTCGACCCCCTCGTTCTCTTCATG
TTTTTTGGAGCCGCTTCAGCCGTGGCCAGAAACGTTTTCCGGTCAAGAAATGAAGAAGAT
GACGAAGATGACTATTAGGGCTGGGAAAGAATAAAATCAGAGA
AATCAGTTTCAAAAAAA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2DU54TF 697 0 0
GGATCTCTTTAGAAACAGAACAGAACAGAACAGAACAGAGAGACACACAAAAATGTATTT
TGCAGCCATAGCTTCTTCACGACATAGCTTTTTGTCAGACTCTTTCAGTTCCCGACACAG
CTTCAAACCCAGACACAGTAATAAGCTCACACGTCCCAATTCAATCTGTTGCAAGTCTCC
ACACCACGACGACGAAACTGATTCTTCCCGGAAACATGAGAATCATCTGGCTAAATTGTC
AATAGCGACGTTAGCGGTTGGCGTTTTGGCTTTGGGATCCGTTGGAGATGCGTCTGCGGC
TAAGAGCGGCGGAAGAATCGGTGGTCAAGCGTTTCGGTCTTCAGCTCCTCGGCCTCCTCC
TAGAATTAACAACCGATCGAGGACCAATATCTACGTGAATCCTCAGGTTGCACCACCTTT
GATCGGTGGCTATGGATATGGCTACGGCGGTTGGGGATGGTCACCGTTTTCTTACTTTGC
CCCCGGTCCTGCGGTAGCAGTTGGTGGCGGCGGTGGCTTCGACCTCCTCGTTCTCTTCAT
GTTTTTTGGAGCCGCTTCAGCCGTGGCCAGAAACGTTTTCCGATCAAGAAATTAAGAAGA
TGACGAAGATGACTATCAGGGCTGGGAAAGAATAAAATCAGAGAGGCATGTCTTATTACA
A*CATAGTCGAATATACGATTTTGTGTTAAA
GTTAAT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2A344JQ 425 0 0
TCCTCCTAGAATTAACAACCGATCGAGGACCAATATCTACGTGAATCCTCAGGTTGCACC
ACCTTTGATCGGTGGCTATGGATATGGCTACGGCGGTTGGGGATGGTCACCGTTTTCTTA
CTTTGCCCCCGGTCCTGCGGTAGCAGTTGGTGGCGGCGGTGGCTTCGACCTCCTCGTTCT
CTTCATGTTTTTTGGAGCCGCTTCAGCCGTGGCCAGAAACGTTTTCCGATCAAGAAACGA
AGAAGATGACGAAGATGACTATTAGGGCTGGGAAAGAATAAAATCAGAGAGGCATGTCTT
ATTACAAACATAGTCGAATATACGATTTTGTGTTAAAAGTTAATGATGGAAAAGACGGTT
TGTAGTGTTCAAAAAAAAGGAAAAGACGGTTTGTAATATGTAAACCTTGAGACAAATTAC
TAAGA

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR2A344TF 681 0 0
GG
ACACAAAAATGTATTTTGCAGCCATAGCTTCTTCACGACATAGCTTTTTGTCAGACTCTT
TCAGTTCCCGACACAGCTTCAAACCCAGACACAGTAATAAGCTCACACGTCCCAATTCAA
TCTGTTGCAAGTCTCCACACCACGACGACGAAACTGATTCTTCCCGGAAACATGAGAATC
ATCTGGCTAAATTGGCAATAGCGACGTTAGCGGTTGGCGTTTTGGCTTTGGGATCCGTTG
GAGATGCGTCTGCGGCTAAGAGCGGCGGAAGAATCGGTGGTCAAGCGTTTCGGTCTTCTG
CTCCTCGGCCTCCTCCTAGAATTAACAACCGATCGAGGACCAATATCTACGTGAATCCTC
AGGTTGCACCACCTTTGATCGGTGGCTATGGATATGGCTACGGCGGTTGGGGATGGTCAC
CGTTTTCTTACTTTGCCCCCGGTCCTGCGGTAGCAGTTGGTGGCGGCGGTGGCTTCGACC
TCCTCGTTCTCTTCATGTTTTTTGGAGCCGCTTCAGCCGTGGCCAGAAACGTTTTCCGAT
CAAGAAACGAAGAAGATGACGAAGATGACTATTAGGGCTGGGAAAGAATAAAATCAGAGA
GGCATGTCTTATTACAAACATAGTCGAATATACGATTTTGTGTTAAAAGTTAATGATGGA
AAAGACGGTTTGTAGTGTT

QA 3 681 3 681
DS 

RD RR2DU54JQ 756 0 0
CAGAACAGAACAGAGAGACACACAAAAATGTATTTTGCAGCCATAGCTTCTTCACGACAT
AGCTTTTTGTCAGACTCTTTCAGTTCCCGACACAGCTTCAAACCCAGACACAGTAATAAG
CTCACACGTCCCAATTCAATCTGTTGCAAGTCTCCACACCACGACGACGAAACTGATTCT
TCCCGGAAACATGAGAATCATCTGGCTAAATTGTCAATAGCGACGTTAGCGGTTGGCGTT
TTGGCTTTGGGATCCGTTGGAGATGCGTCTGCGGCTAAGAGCGGCGGAAGAATCGGTGGT
CAAGCGTTTCGGTCTTCAGCTCCTCGGCCTCCTCCTAGAATTAACAACCGATCGAGGACC
AATATCTACGTGAATCCTCAGGTTGCACCCCCTTTGATCGGTGGCTATGGATATGGCTAC
GGCGGTTGGGGATGGTCACCGTTTTCTTACTTTGCCCCCGGTCCTGCGGTAGCAGTTGGT
GGCGGCGGTGGCTTCGACCTCCTCGTTCTCTTCATGTTTTTTGGAGCCGCTTCAGCCGTG
GCCAGAAACGTTTTCCGATCAAGAAATTAAGAAGATGACGAAGATGACTATCAGGGCTGG
GAAAGAATAAAATCAGAGAGGCATGTCTTATTACAAACATAGTCGAATATACGATTTTGT
GTTAAAAGTTAATGATGGAAAAGACGGTTTGTAGTGTTCAAAAAAAAGGAAAAGACGGTT
TGTAATATGTAAACCTTGAGACAAGTTACTAAGAGC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 2 5

CO CL1442Contig1 673 3 2 U
AGAAAAATGTGAAATATTTATATTTATGTATTATCCTTACAATGAGACGACCAATTCAAT
CTTTTGCATTTTGAGATTGAAATTAAAATAAAATTACTACTGGGATTTAATCACTGTAGT
TTACAAATAATTGAGACTGTTACGTGTGTTAACTATTTATAAAAGCCAAAAGAGAAAAGC
CTCTGGTAGACTAAAAGGTTTACTTGGTCGACAATATGAACAAAGACGTGAAATCCCAAA
ACAACAGTCCTTTATCAACGGAAGAGACGAGTCAAAGTTTCAGCTTACCTGACAATAGCT
TTTCGGATCCTGAAGGAACAGCTTTACTCTGTACTCTCAGAACAGCTTCATCAAGAGAGA
GAGAGAGAGATCTCTATTGAAAAGTTCTTCCAAGTACAACTCCGCTAAATATAATAGCAC
CAAACCACTTGTTTGACACAAATTTTCTACTGCAGTCAGCGCCAGATGATAAGTCAGCTG
TCCCTATTTGCCATCCTAACTGTCCCAATGCAGCCACCAGTGATGCGTAGTATTGCCACC
CAAGATCTGCACACAGTCCAGAAAGTGCGAGCAACCCCATGGATGCTGTGCCGAACCCAG
TGAGCCAAAGCTTTGTATTATCTCCGAACCTAAGAGCAGTCGACTTCACACCAACCTTCA
CATCATCATCTTT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX25TF C 1
AF RR2GR53JQ U 6
AF RR2G619JQ U 6
BS 1 5 RR2CX25TF
BS 6 673 RR2G619JQ

RD RR2CX25TF 473 0 0
AGAAAAATGTGAAATATTTATATTTATGTATTATCCTTACAATGAGACGACCAATTCAAT
CTTTTGCATTTTGAGATTGAAATTAAAATAAAATTACTACTGGGATTTAATCACTGTAGT
TTACAAATAATTGAGACTGTTACGTGTGTTAACTATTTATAAAAGCCAAAAGAGAAAAGC
CTCTGGTAGACTAGAAGGTTTACTTGGTCGACAATATGAACAAAGACGTGAAATCCCAAA
ACAACAGTCCTTTATCAACGGAAGAGACGAGTCAAAGTTTCAGCTTATCTGACAATAGCT
TTTCGGATCCTGAAGGAACAGCTTTACTCTGTACTCTCAGAACAGCTTCATCAAGAGAGA
GAGAGAG**ATCTCTATTGAAAAGTTCTTCCAAGTACAACTCCGCTAAATATAATAGCAC
CAAACCACTTGTTTGACACAAATTTTCTACTGCAGTCAGCGCCAGATGATAAG

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2GR53JQ 448 0 0
AATGTGAAATATTTATATTTATGTATTATCCTTACAATGAGACGACCAATTCAATCTTTT
GCATTTTGAGATTGAAATTAAAATAAAATTACTACTGGGATTTAATCACTGTAGTTTACA
AATAATTGAGACTGTTACGTGTGTTAACTATTTATAAAAGCCAAAAGAGAAAAGCCTCTG
GTAGACTAAAAGGTTTACTTGGTCGACAATATGAACAAAGACGTGAAATCCCAAAACAAC
AGTCCTTTATCAACGGAAGAGACGAGTCAAAGTTTCAGCTTACCTGACAATAGCTTTTCG
GATCCTGAAGGAACAGCTTTACTCTGTACTCTCAGAACAGCTTCATCAAGAGAGAGAGAG
AGAGATCTCTATTGAAAAGTTCTTCCAAGTACAACTCCGCTAAATATAATAGCACCAAAC
CACTTGTTTGACACAAA
TTTTTCTACTG

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR2G619JQ 668 0 0
AATGTGAAATATTTATATTTATGTATTATCCTTACAATGAGACGACCAATTCAATCTTTT
GCATTTTGAGATTGAAATTAAAATAAAATTACTACTGGGATTTAATCACTGTAGTTTACA
AATAATTGAGACTGTTACGTGTGTTAACTATTTATAAAAGCCAAAAGAGAAAAGCCTCTG
GTAGACTAAAAGGTTTACTTGGTCGACAATATGAACAAAGACGTGAAATCCCAAAACAAC
AGTCCTTTATCAACGGAAGAGACGAGTCAAAGTTTCAGCTTACCTGACAATAGCTTTTCG
GATCCTGAAGGAACAGCTTTACTCTGTACTCTCAGAACAGCTTCATCAAGAGAGAGAGAG
AGAGATCTCTATTGAAAAGTTCTTCCAAGTACAACTCCGCTAAATATAATAGCACCAAAC
CACTTGTTTGACACAAATTTTCTACTGCAGTCAGCGCCAGATGATAAGTCAGCTGTCCCT
ATTTGCCATCCTAACTGTCCCAATGCAGCCACCAGTGATGCGTAGTATTGCCACCCAAGA
TCTGCACACAGTCCAGAAAGTGCGAGCAACCCCATGGATGCTGTGCCGAACCCAGTGAGC
CAAAGCTTTGTATTATCTCCGAACCTAAGAGCAGTCGACTTCACACCAACCTTCACATCA
TCATCTTT

QA 1 668 1 668
DS 



CO CL1442Contig2 771 2 5 U
GACATCAACCCTTTGTGTAAGCATACTCTATGGAATAATCGTGACCACCAAGCTAATAGA
TTAGTTGGCGGAATGTGGTCGTCCTCTTTGGTTTTGGAGAGGGGTCGTAAGGAAATGAGT
GATTTCGGTGGTGTTAAGGAAGAAGATTCTTGGATAGATTTGTATTTACCAGAAAAAGCT
AGAGGTCATGCTAAGCTTGCTCGTTTTGATAAACCTATTGGTACTTGGTTGCTTGCTTGG
CCTTGTATGTGGTCAATTGCGTTGGCTGCTGATCCTGGGAGCCTTCCAAGTTTTAAAATG
ATGGGTTTGTTTGGTTGTGGAGCTATACTTCTTAGAGGTGCTGGCTGTACTATTAATGAT
CTGCTTGATCAGGACATTGATACAAAGGTTGATCGTACAAGATTAAGACCTATAGCCAGT
GGTCTTTTAACACCATTCCAAGGGCTTAAATTTCTTGCCCTACAGTTGCTTTTTAGGCTT
AGGGATTCTTCTCCAACTTAACAATTACAGCCGTGTGTTAGGGGCTTCCTCTTTGTTCCT
TGTCTTCTCTTACCCACTTATGAAGAGGTTTACATTTTGGCCTCAAGCATTTTTAGGGTT
GACCATAAACTGGGGGAGCATTGTTAGGATGGGCTGCAGTTAAAGGAAGCGTAGAGCCAG
CTGTTGTACTCCCTCTTTATCTCTCAGAATCTGCTGGACCCTTGTTTATGATACTATTTA
TGCACATCACGATAAAGATGATGATGTGAAGTTGGTGTGAAGTCGACGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB62TF U 142
AF RR2DB87TF U 1
BS 1 428 RR2DB87TF
BS 429 429 RR2CB62TF
BS 430 473 RR2DB87TF
BS 474 474 RR2CB62TF
BS 475 771 RR2DB87TF

RD RR2CB62TF 499 0 0
GAAGATTCTTGGATATATTTGTATTTACCAGAAAAAGCTAGAGGTCATGCTAAGCTTGCT
CGTTTTGATAAACCTATTGGTACTTGGTTGCTTGCTTGGCCTTGTATGTGGTCAATTGCG
TTGGCTGCTGATCCTGGGAGCCTTCCAAGTTTTAAAATGATGGGTTTGTTTGGTTGTGGA
GCTATACTTCTTAGAGGTGCTGGCTGTACTATTAATGATCTGCTTGATCAGGACATTGAT
ACAAAGGTTGATCGTACAAGATTAAGACCTATAGCCAGTGGTCTTTTAACACCATTCCAA
GGGCTTAAATTTCTTGCCCTACAGTTGCTTTTTAGGCTTAGGGATTCTTCTCCAACTTAA
CAATTACAGCCGTGTGTTAGGGGCTTCCTCTTTGTTCCTTGTCTTCTCTTACCCACTTAT
GAAGAGGTTTACATTTTGGCCTCAAGCATTTTTAGGGTTGACCATAAACTGGGG*AGCAT
TGTTAGGATGGGCTGCAGT

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR2DB87TF 771 0 0
GACATCAACCCTTTGTGTAAGCATACTCTATGGAATAATCGTGACCACCAAGCTAATAGA
TTAGTTGGCGGAATGTGGTCGTCCTCTTTGGTTTTGGAGAGGGGTCGTAAGGAAATGAGT
GATTTCGGTGGTGTTAAGGAAGAAGATTCTTGGATAGATTTGTATTTACCAGAAAAAGCT
AGAGGTCATGCTAAGCTTGCTCGTTTTGATAAACCTATTGGTACTTGGTTGCTTGCTTGG
CCTTGTATGTGGTCAATTGCGTTGGCTGCTGATCCTGGGAGCCTTCCAAGTTTTAAAATG
ATGGGTTTGTTTGGTTGTGGAGCTATACTTCTTAGAGGTGCTGGCTGTACTATTAATGAT
CTGCTTGATCAGGACATTGATACAAAGGTTGATCGTACAAGATTAAGACCTATAGCCAGT
GGTCTTTTGACACCATTCCAAGGGCTTAAATTTCTTGCCCTACAGTTGCTTTT*AGGCTT
AGGGATTCTTCTCCAACTTAACAATTACAGCCGTGTGTTAGGGGCTTCCTCTTTGTTCCT
TGTCTTCTCTTACCCACTTATGAAGAGGTTTACATTTTGGCCTCAAGCATTTTTAGGGTT
GACCATAAACTGGGGGAGCATTGTTAGGATGGGCTGCAGTTAAAGGAAGCGTAGAGCCAG
CTGTTGTACTCCCTCTTTATCTCTCAGAATCTGCTGGACCCTTGTTTATGATACTATTTA
TGCACATCACGATAAAGATGATGATGTGAAGTTGGTGTGAAGTCGACGCTC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 6

CO CL1443Contig1 841 6 4 U
GGATAGCTTCCACCGAGAAAGATTGATTGTTCCTGTCTCCGACGACAAACCAGACCTACG
TGCGACACCCCTTGAGATAGAGAGAGAGGGAAAATGGGTTTCTTCTCGTTTCTCGGAAGA
GTTCTCTTCGCTTCTCTATTCATCCTCTCCGCTTGGCAAATGTTCAGTGACTTTGGATCT
GACGGTGGTCCAGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCAAAGCTTCACCTGACCAAAGCACATCTC
TCTTCCAGATTAGGAGTAGCATTGCCCGACATTGAGGTGAAACAAGTCGTATGGGCAATT
GTTGCTCTGAAAGGACTCGGATGCTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCCTTGGTGCCTAT
CTTCTGGCTTTCTACTTGGTGATCGTTAGCCCCATCTTATATGATTTCTACAACTATGGA
CCTCAGGACCGCGAGTTCTCTCTTCTCTTTACTGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCACTTCTT
GGGGCATTGCTGTTTTTTATCGGAATGAAGAATGCAACGACAACCTCCTCCTCCTCCTCC
TCCCAGAGGAACCTGAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAAGCTGCTTAGAGTTCTTCTTCT
GGTCTCTTCCGCACAAATGTGTTGAGGCTTTTAGAACAACCAGCTTCTGATGTCTTCAAA
AGCTCTACGTTCTGTTTTTTTTCTTCCTTACAACTTTTGCTTCTTTTTCTACTGTGGGAT
TCTAGAGTTAGCCACATTTTGTAATTTCTCTTCTGGTTTTTATTTTATTTTGGAATCTAA
GAGTTTTCTTTTGTTGGATCATACAATTCTTTCTCCTTTTTTTTAATATTAATTTTGGTT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BY11TF U 1
AF RR2DU21TF U 3
AF RR2EN14TF U 9
AF RR2DU21JQ C 511
AF RR2EN14JQ C 493
AF RR2BY11JQ C 75
BS 1 631 RR2BY11TF
BS 632 634 RR2DU21TF
BS 635 655 RR2EN14TF
BS 656 841 RR2BY11JQ

RD RR2BY11TF 631 0 0
GGATAGCTTCCACCGAGAAAGATTGATTGTTCCTGTCTCCGACGACAAACCAGACCTACG
TGCGACACCCCTTGAGATAGAGAGAGAGGGAAAATGGGTTTCTTCTCGTTTCTCGGAAGA
GTTCTCTTCGCTTCTCTATTCATCCTCTCCGCTTGGCAAATGTTCAGTGACTTTGGATCT
GACGGTGGTCCAGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCAAAGCTTCACCTGACCAAAGCACATCTC
TCTTCCAGATTAGGAGTAGCATTGCCCGACATTGAGGTGAAACAAGTCGTATGGGCAATT
GTTGCTCTGAAAGGACTCGGATGCTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCCTTGGTGCCTAT
CTTCTGGCTTTCTACTTGGTGATCGTTAGCCCCATCTTATATGATTTCTACAACTATGGA
CCTCAGGACCGCGAGTTCTCTCTTCTCTTTACTGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCACTTCTT
GGGGCATTGCTGTTTTTTATCGGAATGAAGAATGCAACGACAACCTCCTCCTCCTCCTCC
TCCCAGAGGAACCTGAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAAGCTGCTTAGAGTTCTTCTTCT
GGTCTCTTCCGCACAAATGTGTTGAGGCTTT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2DU21TF 632 0 0
GGAGCTTC
CACCGAGAAAGATTGATTGTTCCTGTCTCCGACGACAAACCAGACCTACGTGCGACACCC
CTTGAGATAGAGAGAGAGGGAAAATGGGTTTCTTCTCGTTTCTCGGAAGAGTTCTCTTCG
CTTCTCTATTCATCCTCTCCGCTTGGCAAATGTTCAATGACTTTGGATCTGACGGTGGTC
CAGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCAAAGCTTCACCTGACCAAAGCACATCTCTCTTCCAGAT
TAGGAGTAGCATTGCCCGACATTGAGGTGAAACAAGTCGTATGGGCAATTGTTGCTCTGA
AAGGACTCGGAGGCTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCCTTGGTGCCTATCTTCTGGCTT
TCTACTTGGTGATCGTTAGCCCCATCTTATATGATTTCTACAACTATGGACCTCAGGACC
GCGAGTTCTCTCTTCTCTTTACTGAGTTCTTTCAGAGCGTTGCACTTCTTGGGGCATTGC
TGTTTTTTATCGGAATGAAGAATGCAACGACAACCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCAGAGGA
ACCTGAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAAGCTGCTTAGAGTTCTTCTTCTGGTCTCTTCC
GCACAAATGTGTTGAGGCTTTTAG

QA 9 632 9 632
DS 

RD RR2EN14TF 647 0 0
GG
CACCGAGAAAGATTGATTGTTCCTGTCTCCGACGACAAACCAGACCTACGTGCGACACCC
CTTGAGATAGAGAGAGAGGGAAAATGGGTTTCTTCTCGTTTCTCGGAAGAGTTCTCTTCG
CTTCTCTATTCATCCTCTCCGCTTGGCAAATGTTCAGTGACTTTGGATCTGACGGTGGTC
CAGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCAAAGCTTCACCTGACCAAAGCACATCTCTCTTCCAGAT
TAGGAGTAGCATTGCCCGACATTGAGGTGAAACAAGTCGTATGGGCAATTGTTGCTCTGA
AGGGACTCGGAGGCTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCCTTGGTGCCTATCTTCTGGCTT
TCTACTTGGTGATCGTTAGCCCCATCTTATATGATTTCTACAACTATGGACCTCAGGACC
GCGAGTTCTCTCTTCTCTTTACTGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCACTTCTTGGGGCATTGC
TGTTTTTTATCGGAATGAAGAATGCAAC***AACCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCAGAGGA
ACCTGAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAAGCTGCTTAGAGTTCTTCTTCTGGTCTCTTCC
GCACAAATGTGTTGAGGCTTTTAGAACAACCAGCTTCTGATGTCT

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR2DU21JQ 135 0 0
AATGCAACGACAACCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCAGAGGAACCTGAAGAAGAGGATACCC
AAGCCTAAAGCTGCTTAGAGTTCTTCTTCTGGTTTTTTCCGCACAAATGTGTTGAGGCTT
TTAGAACAACCAGCT

QA 1 135 1 135
DS 

RD RR2EN14JQ 317 0 0
TTTTTTATCGGAATGAAGAATGCAAC***AACCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCAGAGGAAC
CTGAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAAGCTGCTTAGAGTTCTTCTTCTGGTCTCTTCCGC
ACAAATGTGTTGAGGCTTTTAGAACAACCAGCTTCTGATGTCTTCAAAAGCTCTACGTTC
TGTTTTTTTTCTTCCTTACAACTTTTGCTTCTTTTTTTACTGTGGGATTCTAGAGTTAGC
CACATTTTGTAATTTCTCTTCTGGTTTTTATTTTATTTTGGAATCTAAGAGTTTTCTTTT
GTTGGATCATACAATTC

QA 1 317 1 317
DS 

RD RR2BY11JQ 767 0 0
AGATAGAGAGAGAGGGAAAATGGGTTTCTTCTCGTTTCTCGGAAGAGTTCTCTTCGCTTC
TCTATTCATCCTCTCCGCTTGGCAAATGTTCAGTGACTTTGGATCTGACGGTGGTCCAGC
AGCTAAAGAGTTGGCTCCAAAGCTTCACCTGACCAAAGCACATCTCTCTTCCAGATTAGG
AGTAGCATTGCCCGACATTGAGGTGAAACAAGTCGTATGGGCAATTGTTGCTCTGAAAGG
ACTCGGATGCTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCCTTGGTGCCTATCTTCTGGCTTTCTA
CTTGGTGATCGTTAGCCCCATCTTATATGATTTCTACAACTATGGACCTCAGGACCGCGA
GTTCTCTCTTCTCTTTACTGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCACTTCTTGGGGCATTGCTGTT
TTTTATCGGAATGAAGAATGCAACGACAACCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCAGAGGAACCT
GAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAAGCTGCTTAGAGTTCTTCTTCTGGTCTCTTCCGCAC
AAATGTGTTGAGGCTTTTAGAACAACCAGCTTCTGATGTCTTCAAAAGCTCTACGTTCTG
TTTTTTTTCTTCCTTACAACTTTTGCTTCTTTTTCTACTGTGGGATTCTAGAGTTAGCCA
CATTTTGTAATTTCTCTTCTGGTTTTTATTTTATTTTGGAATCTAAGAGTTTTCTTTTGT
TGGATCATACAATTCTTTCTCCTTTTTTTTAATATTAATTTTGGTTC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 6

CO CL1444Contig1 843 6 6 U
GGGCTCTCATCAATCATGTCGGCTTCAATCGCGAAACCCATCTCCACAACTCCTCTCCGT
TTCCATTTCAATCCAAAGACCAACATTTCATTCTCCGATTGCATCTCGATTTCTTCTGGA
TTCCAACATTCCTCACCGTCTTCCCTCGGTTTGGTCGCAAAACCACCGACCAACACTCGC
GTTTCCCATCTCGTCAGAGCCCAGAGCTCTTATGATTATATTCCAGACTCCAAGTTTTAC
AAGGTTGAAGCAATTGTCAGGCCATGGAGGATCCAGCATGTTTCATCGGCTTTATTGAAA
ATCGGGATTCGAGGTGTTACTGTTTCTGATGTCCGAGGGTTTGGTGCACAAGGTGGATCC
AAGGAGAGACATGGTGGGTCTGAGTTCTCTGAAGACAAGTTCGTCGCTAAAGTTAAAATG
GAGATCGTTGTCAAGAAAGAACAAGTGGAGTCTGTAATCAACACCATAATCGATGGAGCA
AGGACAGGAGAGATCGGTGATGGCAAAATATTCGTTTTGCCTGTGTCAGATGTCATAAGG
GTTCGGACAGGTGAGCGTGGAGAAGAAGCAGAGAAGATGACTGGTGATATGCTTTCGTCA
TCTTAGGAACAAAACAGCGCTCAAAGAATGGCTCTCTGGTAATAATAAAATGAATGGAGT
CTTTAGTTTCCTTTTTGTGTTTGCTGTTGAGTTGATCAAGATGTGTGTTTAAACTGTACA
TGAATGATGCAGAAACATCTGTCTTGGTTCTTAGACATCGAAACTCTCTCTTCCTAATAA
AAGCATGTAGTCCTTGCCTTTTTGTTCCAGTATTTTGAAACCATAATGCTTTTGTTCATT
CAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 0 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2CX01TF U 1
AF RR2BE96JQ C 328
AF RR2CX01JQ C 213
AF RR2FX88JQ C 354
AF RR2FX88TF U 354
AF RR2BE96TF U 318
BS 1 398 RR2CX01TF
BS 399 399 RR2BE96TF
BS 400 404 RR2CX01TF
BS 405 405 RR2BE96TF
BS 406 416 RR2CX01TF
BS 417 843 RR2BE96TF

RD RR2CX01TF 419 0 0
GGGCTCTCATCAATCATGTCGGCTTCAATCGCGAAACCCATCTCCACAACTCCTCTCCGT
TTCCATTTCAATCCAAAGACCAACATTTCATTCTCCGATTGCATCTCGATTTCTTCTGGA
TTCCAACATTCCTCACCGTCTTCCCTCGGTTTGGTCGCAAAACCACCGACCAACACTCGC
GTTTCCCATCTCGTCAGAGCCCAGAGCTCTTATGATTATATTCCAGACTCCAAGTTTTAC
AAGGTTGAAGCAATTGTCAGGCCATGGAGGATCCAGCATGTTTCATCGGCTTTATTGAAA
ATCGGGATTCGAGGTGTTACTGTTTCTGATGTCCGAGGGTTTGGTGCACAAGGTGGATCC
AAGGAGAGACATGGTGGGTCTGAGTTCTCTGAAGACAAATTCGTTGCTAAAGTTAA
GAT

QA 1 416 1 416
DS 

RD RR2BE96JQ 267 0 0
GATGTCCGAGGGTTTGGTGCACAAGGTGGATCCAAGGAGAGACATGGTGGGTTTGAGTTT
TCTGAAGACAAGTTTGTCGCTAAAGTTAAAATGGAGATCGTTGTCAAGAAAGAACAAGTG
GAGTCTGTAATCAACCCCATAATCGATGGAGCAAGGACAGGAGAGATCGGTGATGGCAAA
ATATTCGTTTTGCCTGTGTCAGATGTCATAAGGGTTCGGACAGGTGAGCGTGGAGAAGAA
GCAGAGAAGATGACTGGTGATATGCTT

QA 1 267 1 267
DS 

RD RR2CX01JQ 587 0 0
TGATTATATTCCAGACTCCAAGTTTTACAAGGTTGAAGCAATTGTCAGGCCATGGAGGAT
CCAGCATGTTTCATCGGCTTTATTGAAAATCGGGATTCGAGGTGTTACTGTTTCTGATGT
CCGAGGGTTTGGTGCACAAGGTGGATCCAAGGAGAGACATGGTGGGTCTGAGTTCTCTGA
AGACAAATTCGTTGCTAAAGTTAAGATGGAGATCGTTGTCAAGAAAGAACAAGTGGAGTC
TGTAATCAACACCATAATAGATGGAGCAAGGACAGGAGAGATCGGTGATGGCAAAATATT
CGTTTTGCCTGTGTCAGATGTCATAAGGGTTCGGACAGGTGAGCGAGGAGAAGAAGCAGA
GAAGATGACTGGTGACATGCTTTCGTCATCTTAGGAACAAAACAGCACTCAAAGAATGGC
TCTCTGGTAATAATAAAATGAATGGAGTCTTTAGTTTCCTTTTTGTGTTTGCCGTTGAGT
TAATCAAGATGTGTGTTTAAACTGTACATGAATGATGCAGAAACATCTGTCTTGGTTCTT
AGACATCGAA**TCTCTCTTCCTAATAAAAGCATTTAGTCCTTGCC
T

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2FX88JQ 446 0 0
G
GGATCCAAGGAGAGACATGGTGGGTCTGAGTTCTCTGAAGACAAGTT*GTCGCTAAAGTT
AAAATGGAGATCGTTGTCAAGAAAGAACAAGTGGAGTCTGTAATCAACACCATAATCGAT
GGAGCAAGGACAGGAGAGATCGGTGATGGCAAAATATTCGTTTTGCCTGTGTCAGATGTT
ATAAGGGTTCGGACAGGTGAGCGTGGAGAAGAAGCAGAGAAGATGACTGGTGATATGCTT
TCGTCATCTTAGGAACAAAACAGCGCTCAAAGAATGGCTCTCTGGTAATAATAAAATGAA
TGGAGTCTTTAGTTTCCTTTTTGTGTTTGCTGTTGAGTTGATCAAGATGTGTGTTTAAAC
TGTACATGAATGATGCAGAAACATCTGTCTTGGTTCTTAGACATCGAAACTCTCTCTTCC
TAATAAAAGCATGTAGTCCTTGCC
C

QA 2 445 2 445
DS 

RD RR2FX88TF 446 0 0
G
GGATCCAAGGAGAGACATGGTGGGTCTGAGTTCTCTGAAGACAAGTT*GTCGCTAAAGTT
AAAATGGAGATCGTTGTCAAGAAAGAACAAGTGGAGTCTGTAATCAACACCATAATCGAT
GGAGCAAGGACAGGAGAGATCGGTGATGGCAAAATATTCGTTTTGCCTGTGTCAGATGTT
ATAAGGGTTCGGACAGGTGAGCGTGGAGAAGAAGCAGAGAAGATGACTGGTGATATGCTT
TCGTCATCTTAGGAACAAAACAGCGCTCAAAGAATGGCTCTCTGGTAATAATAAAATGAA
TGGAGTCTTTAGTTTCCTTTTTGTGTTTGCTGTTGAGTTGATCAAGATGTGTGTTTAAAC
TGTACATGAATGATGCAGAAACATCTGTCTTGGTTCTTAGACATCGAAACTCTCTCTTCC
TAATAAAAGCATGTAGTCCTTGCC
C

QA 2 445 2 445
DS 

RD RR2BE96TF 526 0 0
GACG
GTTTCTGATGTCCGAGGGTTTGGTGCACAAGGTGGATCCAAGGAGAGACATGGTGGGTCT
GAGTTCTCTGAAGACAAGTTTGTCGCTAAAGTTAAAATGGAGATCGTTGTCAAGAAAGAA
CAAGTGGAGTCTGTAATCAACACCATAATCGATGGAGCAAGGACAGGAGAGATCGGTGAT
GGCAAAATATTCGTTTTGCCTGTGTCAGATGTCATAAGGGTTCGGACAGGTGAGCGTGGA
GAAGAAGCAGAGAAGATGACTGGTGATATGCTTTCGTCATCTTAGGAACAAAACAGCGCT
CAAAGAATGGCTCTCTGGTAATAATAAAATGAATGGAGTCTTTAGTTTCCTTTTTGTGTT
TGCTGTTGAGTTGATCAAGATGTGTGTTTAAACTGTACATGAATGATGCAGAAACATCTG
TCTTGGTTCTTAGACATCGAAACTCTCTCTTCCTAATAAAAGCATGTAGTCCTTGCCTTT
TTGTTCCAGTATTTTGAAACCATAATGCTTTTGTTCATTCAT

QA 5 526 5 526
DS 



AS 2 6

CO CL1445Contig1 812 4 2 U
GGTTGGATACATATATAGATTAGTAATGGAAATCATACTGGCACATGGGGCAGTTTGAGT
TCTTTGCAGACGTGTTTCAGAGAAACGAGATGGTGAAGTGAAAGAAGGAGATAATAAATA
CACATACAGATTTTTATTTTATAGCAATTTGATAGATAACAGTACTATCAAATGTATTGA
AGACTTTGCAGCGGCAGTTCTAGCTCTAGCTCCCACGGTATGTGGTGAAAGAAAAGGGTG
AAAGTAACAGCGGGACGTGGAAATGCTCCCATTTCTGAGATTCAGTGACCTCAAACGCAA
TGGAAACATAAGGGAAGAAGCCTCCTGGGCAATACTTTCCAGTGTTGAAGCTTATCCTAT
ACGTCACTGGCTTCAAAGCCTCGACCAAACCCATCAGTTGCCCGCTACGCCCATCTTTAT
CAGTAGCTGAGGTTCCCACCATGGACCAGTCCCCACGACCTTCATAACCAAAGGAAGGAC
TCGTAGTACCGTTCCACACCTCCAAGTGCACCTCAACACCTACAGCTGGAGCACCACGTG
AGACGTCTAAGACATGAGTGGTGATGGGTGGCCTACTTCTCTTGGGAGCTTCTTGTGGTT
TT**GTGGACTCG***GTTTGTGAAACAACTTTGGCCTTTTCGGAGAAGAGCTTTGCCAT
CCGGAGCTCAGTTATTTTCATCTGCTCCTTAGCAGCAATCTCGAGCTCCACTATTGGTCT
GTTTGCATACCTTCCCTTTAACTCGGCGAGCATCTCAGCGTGAGTCCTGCCGGAGGCGAA
AATAATAAAGATAAAACCAAACTTTTGTCTGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 25 
25 10 10 25 25 10 10 25 25 25 10 25 10 25 25 10 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H666JQB U 91
AF RR2C570JQ U 64
AF RR2D977JQ U 1
AF RR2D977TF C 1
BS 1 693 RR2D977JQ
BS 694 812 RR2D977TF

RD RR2H666JQB 364 0 0
TGGG
GAAGTGAAAAAAGGAAATAATAAATACACATACAGATTTTTATTTTATAGCAATTTGATA
AATAACAGTACTATCAAATGTATTGAAAACTTTGCAGCGGCAGCTCTAGCTCTAGCTCCC
ACGGTATGTGGTGAAAAAAAAGGGTGAAAGTAACAGCGGGACGTGGAAATGCCCCCATTT
CTGAAATTCAGTGACCTCAAACCCAATGGAAACATAAGGGAAAAAGCCTCCTGGGCAATA
CTTTCCAGTGTTGAAGCTTATCCTATACGTCCCTGGCTTCAAAGCCTCGACCAAATCCAT
CAGTTGCCCGCTACCCCCATCTTTATCAGTAGCTGAGGTTCCCACAATGGACCAGTCCCC

QA 5 364 5 364
DS 

RD RR2C570JQ 559 0 0
TTGCAGACGTGTTTCAGAGAAACGAGATGGTGAAGTGAAAGAAGGAGATAATAAATACAC
ATACAGATTTTTATTTTATAGCAATTTGATAGATAACAGTACTATCAAATGTATTGAAGA
CTTTGCAGCGGCAGCTCTAGCTCTAGCTCCCACGGTATGTGGTGAAAGAAAAGGGTGAAA
GTAACAGCGGGACGTGGAAATGCTCCCATTTCTGAAATTCAGTGACCTCAAACGCAATGG
AAACATAAGGGAAGAAGTCTCCTGGGCAATACTTTCCAGTGTTGAAGCTTATCCTATACG
TCCCTGGCTTCAAAGCCTCGACCAAATCCATCAGTTGCCCGCTACGCCCATCTTTATCAG
TAGCTGAGGTTCCCACCATGGACCAGTCCCCACGACCTTCATAACCAAAGGAAGGACTCG
TAGTACCGTTCCACACCTCCAAGTGCACCTCAACACCTACAGCTGGAGCACCACGTGAGA
CGTCTAAGACATGAGTGGTGATGGGTGGCCTACTTCTCTTGGGAGCTTCTGCAACATTCA
AATGCCCTCCTATGATTCT

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2D977JQ 693 0 0
GGTTGGATACATATATAGATTAGTAATGGAAATCATACTGGCACATGGGGCAGTTTGAGT
TCTTTGCAGACGTGTTTCAGAGAAACGAGATGGTGAAGTGAAAGAAGGAGATAATAAATA
CACATACAGATTTTTATTTTATAGCAATTTGATAGATAACAGTACTATCAAATGTATTGA
AGACTTTGCAGCGGCAGTTCTAGCTCTAGCTCCCACGGTATGTGGTGAAAGAAAAGGGTG
AAAGTAACAGCGGGACGTGGAAATGCTCCCATTTCTGAGATTCAGTGACCTCAAACGCAA
TGGAAACATAAGGGAAGAAGCCTCCTGGGCAATACTTTCCAGTGTTGAAGCTTATCCTAT
ACGTCACTGGCTTCAAAGCCTCGACCAAACCCATCAGTTGCCCGCTACGCCCATCTTTAT
CAGTAGCTGAGGTTCCCACCATGGACCAGTCCCCACGACCTTCATAACCAAAGGAAGGAC
TCGTAGTACCGTTCCACACCTCCAAGTGCACCTCAACACCTACAGCTGGAGCACCACGTG
AGACGTCTAAGACATGAGTGGTGATGGGTGGCCTACTTCTCTTGGGAGCTTCTTGTGGTT
TT**GTGGACTCG***GTTTGTGAAACAACTTTGGCCTTTTCGGAGAAGAGCTTTGCCAT
CCGGAGCTCAGTTATTTTCATCTGCTCCTTAGC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2D977TF 812 0 0
T
GTTGGATACATATATAGATTAGTAATGGAAATCATACTGGCACATGGGGCAGTT*GAGTT
CTTTGCAGACGTGTTTCAGAGAAACGAGATGGTGAAGTGAAAGAAGGAGATAATAAATAC
ACATACAGATTTTTATTTTATAGCAATTTGATAGATAACAGTACTATCAAATGTATTGAA
GACTTTGCAGCGGCAGTTCTAGCTCTAGCTCCCACGGTATGTGGTGAAAGAAAAGGGTGA
AAGTAACAGCGGGACGTGGAAATGCTCCCATTTCTGAGATTCAGTGACCTCAAACGCAAT
GGAAACATAAGGGAAGAAGCCTCCTGGGCAATACTTTCCAGTGTTGAAGCTTATCCTATA
CGTCACTGGCTTCAAAGCCTCGACCAAACCCATCAGTTGCCCGCTACGCCCATCTTTATC
AGTAGCTGAGGTTCCCACCATGGACCAGTCCCCACGACCTTCATAACCAAAGGAAGGACT
CGTAGTACCGTTCCACACCTCCAAGTGCACCTCAACACCTACAGCTGGAGCACCACGTGA
GACGTCTAAGACATGAGTGGTGATGGGTGGCCTACTTCTCTTGGGAGCTTCTTGTGGTTT
T**GTGGACTCG***GTTTGTGAAACAACTTTGGCCTTTTCGGAGAAGAGCTTTGCCATC
CGGAGCTCAGTTATTTTCATCTGCTCCTTAGCAGCAATCTCGAGCTCCACTATTGGTCTG
TTTGCATACCTTCCCTTTAACTCGGCGAGCATCTCAGCGTGAGTCCTGCCGGAGGCGAAA
ATAATAAAGATAAAACCAAACTTTTGTCTGC

QA 2 812 2 812
DS 



CO CL1445Contig2 835 2 12 U
GGATGGCGATGACGATGAAGATCAGGGAAGAAGACTGGATGGTTTGCTGCGGAAGTCTCC
TTCGCCTTCCAGCAACTCCGATTTCGCTCGCCGGAGCGTGACGGAGCAGTCCACTGCCTT
CGCCACAACCTCTGCTTCTGCCTTGGAGGAGCTTGCAGAGTGGAATGTACTGTACAGACA
AAAGTTTGGTTTTATCTTTATTATTTGCGCCTCCGGCAGGACTCACGCTGAGATGCTCGC
CGAGTTAAAGGGAAGGTATGCAAACAGACCAATAGTGGAGCTCGAGATTGCTGCTAAGGA
GCAGATGAAAATAACTGAGCTCCGGATGGCAAAGCTCTTCTCCGAAAAGGCCAAAGTTGT
TTCACAAACCGAGTCCACAAAACCACAAGAAGATCGTCTGAGAATCATAGGAGGGCATTT
GAATGTTGCAGAAGCTCCCAAGAGAAGTAGGCCACCCATCACCACTCATGTCTTAGACGT
CTCACGTGGTGCTCCAGCTGTAGGTGTTGAGGTGCACTTGGAGGTGTGGAACGGTACTAC
GAGTCCTTCCTTTGGTTATGAAGGTCGTGGGGACTGGTCCATGGTGGGAACCTCAGCTAC
TGATAAAGATGGGCGTAGCGGGCAACTGATGGATTTGGTCGAGGCTTTGAAGCCAGGGAC
GTATAGGATAAGCTTCAACACTGGAAAGTATTGCCCAGGAGACTTCTTCCCTTATGTTTC
CATTGCGTTTGAGGTCACTGAATCTCAGAAATGGGAGCATTTCCACGTCCCGCTGTTACT
TTCACCCTTTTCTTTCACCACATACCGTGGGAGCTAGAGCTAGAGCTGCCGCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H666TF U 1
AF RR2C570TF U 396
BS 1 531 RR2H666TF
BS 532 532 RR2C570TF
BS 533 554 RR2H666TF
BS 555 555 RR2C570TF
BS 556 571 RR2H666TF
BS 572 572 RR2C570TF
BS 573 582 RR2H666TF
BS 583 583 RR2C570TF
BS 584 677 RR2H666TF
BS 678 678 RR2C570TF
BS 679 694 RR2H666TF
BS 695 835 RR2C570TF

RD RR2H666TF 694 0 0
GGATGGCGATGACGATGAAGATCAGGGAAGAAGACTGGATGGTTTGCTGCGGAAGTCTCC
TTCGCCTTCCAGCAACTCCGATTTCGCTCGCCGGAGCGTGACGGAGCAGTCCACTGCCTT
CGCCACAACCTCTGCTTCTGCCTTGGAGGAGCTTGCAGAGTGGAATGTACTGTACAGACA
AAAGTTTGGTTTTATCTTTATTATTTGCGCCTCCGGCAGGACTCACGCTGAGATGCTCGC
CGAGTTAAAGGGAAGGTATGCAAACAGACCAATAGTGGAGCTCGAGATTGCTGCTAAGGA
GCAGATGAAAATAACTGAGCTCCGGATGGCAAAGCTCTTCTCCGAAAAGGCCAAAGTTGT
TTCACAAACCGAGTCCACAAAACCACAAGAAGATCGTCTGAGAATCATAGGAGGGCATTT
GAATGTTGCAGAAGCTCCCAAGAGAAGTAGGCCACCCATCACCACTCATGTCTTAGACGT
CTCACGTGGTGCTCCAGCTGTAGGTGTTGAGGTGCACTTGGAGGTGTGGAATGGTACTAC
GAGTCCTTCCTTTG*TTATGAAGGTCGTGGG*ACTGGTCCATTGTGGGAACCTCAGCTAC
TGATAAAGATGGGCGTAGCGGGCAACTGATGGATTTGGTCGAGGCTTTGAAGCCAGGGAC
GTATAGGATAAGCTTCA*CACTGGAAAGTATTGC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2C570TF 440 0 0
GTCTG
AGAATCATAGGAGGGCATTTGAATGTTGCAGAAGCTCCCAAGAGAAGTAGGCCACCCATC
ACCACTCATGTCTTAGACGTCTCACGTGGTGCTCCAGCTGTAGGTGTTGAGGTGCACTTG
GAGGTGTGGAACGGTACTACGAGTCCTTCCTTTGGTTATGAAGGTCGTGGGGACTGGTCC
ATGGTGGGAACCTCAGCTACTGATAAAGATGGGCGTAGCGGGCAACTGATGGATTTGGTC
GAGGCTTTGAAGCCAGGGACGTATAGGATAAGCTTCAACACTGGAAAGTATTGCCCAGGA
GACTTCTTCCCTTATGTTTCCATTGCGTTTGAGGTCACTGAATCTCAGAAATGGGAGCAT
TTCCACGTCCCGCTGTTACTTTCACCCTTTTCTTTCACCACATACCGTGGGAGCTAGAGC
TAGAGCTGCCGCTGC

QA 6 440 6 440
DS 



AS 1 6

CO CL1446Contig1 972 6 7 U
GGGAGAAGATTCATATTTAACTAAATACCTCTTCTGATTCATATATATATCGGAGACTCA
GATCTGCAATCGAAGTTCTTGGGGGGATCCAATTTGAAGGGAGAGGAAGCATGGACACTT
TTACGGCGGAGGATCTCTCGACGATCGGCGGAATCGCCACCGTGTCGCTCCTTCACTCGT
TTATTCCGACGCATTGGTTACCTTTCTCAATCGTTGGACGCGCGCAGAAATGGACGCTTT
CCAGAACTCTCTTAGTCACTGCATTTGGAGCAGTCCTGCATGTCATATCCACTTCCCTTC
TCGGTATAACAGCGATCACAATGGCGAATACCATCGCCGGTGAAGAGACTGTTCACAAGC
TTGCTTCTCTTTTGCTTGTGATTCTCGGTGGAAGCTACGTCGTATTGTTTTTGGCTGGTA
AAGGTGGTCACACTCATTCTCATAACAAACCCATGGAGAAGATGGCTGTTGCTGGGCTTG
TCCTTGTCCCTGCGTTATCTCCATGTGCTACAACTCTCCCTGTTTTCCTCGCTGTTGGAA
ATTCTAAGCCCATGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTGCTGATAAGCACCATATTGGTGA
TGACATCTCTGGTGGCTCTATCGTTCTATGGTGCAAGCCAGCTGAAGTTTCACTGGGTGG
AGCGATACGACAAGCTTCTGGTTGGTTCGGTTCTGTGTCTGGTAGGTATCTTAACCCTTC
TCTTCCATGATCATGACCACCATGGTCATGAAGCACATCAACTCCCCAGGAAAATCATTA
CTCTTTAGAGACCCCTTCCGAATCTCTGTTTTGTCTGTCATGTCTGTTTGTTGTTGAGAG
AGCCTTAAGGTCTTTCCCGTTGTATGTCTATAACTTAACTGTAACGCTCTTTGTTTGCGC
GTGAAAAAACATATTGCAGTGTTAAATTCCTTTAATAGAACAATATTAGTTGTGAATGTG
ATTCTGTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AC35TF U 1
AF RR2A408TF U 45
AF RR2AC35JQ C 127
AF RR2DB80TF U 289
AF RR2A408JQ C 206
AF RR2F735TF U 448
BS 1 581 RR2AC35TF
BS 582 582 RR2A408TF
BS 583 769 RR2AC35TF
BS 770 845 RR2A408TF
BS 846 892 RR2F735TF
BS 893 893 RR2DB80TF
BS 894 972 RR2F735TF

RD RR2AC35TF 769 0 0
GGGAGAAGATTCATATTTAACTAAATACCTCTTCTGATTCATATATATATCGGAGACTCA
GATCTGCAATCGAAGTTCTTGGGGGGATCCAATTTGAAGGGAGAGGAAGCATGGACACTT
TTACGGCGGAGGATCTCTCGACGATCGGCGGAATCGCCACCGTGTCGCTCCTTCACTCGT
TTATTCCGACGCATTGGTTACCTTTCTCAATCGTTGGACGCGCGCAGAAATGGACGCTTT
CCAGAACTCTCTTAGTCACTGCATTTGGAGCAGTCCTGCATGTCATATCCACTTCCCTTC
TCGGTATAACAGCGATCACAATGGCGAATACCATCGCCGGTGAAGAGACTGTTCACAAGC
TTGCTTCTCTTTTGCTTGTGATTCTCGGTGGAAGCTACGTCGTATTGTTTTTGGCTGGTA
AAGGTGGTCACACTCATTCTCATAACAAACCCATGGAGAAGATGGCTGTTGCTGGGCTTG
TCCTTGTCCCTGCGTTATCTCCATGTGCTACAACTCTCCCTGTTTTCCTCGCTGTTGGAA
ATTCTAAGCCCATGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTGCTGGTAAGCACCATATTGGTGA
TGACATCTCTGGTGGCTCTATCGTTCTATGGTGCAAGCCAGCTGAAGTTTCACTGGGTGG
AGCGATACGACAAGCTTCTGGTTGGTTCGGTTCTGTGTCTGGTAGGTATCTTAACCCTTC
TCTTCCATGATCATGACCACCATGGTCATGAAGCACATCAACTCCCCAG

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2A408TF 801 0 0
GG
ATATCGGAGACTCAGATCTGCAATCGAAGTTCTTGGGGGGATCCAATTTGAAGGGAGAGG
AAGCATGGACACTTTTACGGCGGAGGATCTCTCGACGATCGGCGGAATCGCCACCGTGTC
GCTCCTTCACTCGTTTATTCCGACGCATTGGTTACCTTTCTCAATCGTTGGACGCGCGCA
GAAATGGACGCTTTCCAGAACTCTCTTAGTCACTGCATTTGGAGCAGTCCTGCATGTCAT
ATCCACTTCCCTTCTCGGTATAACAGCGATCACAATGGCGAATACCATCGCCGGTGAAGA
GACTGTTCACAAGCTTGCTTCTCTTTTGCTTGTGATTCTCGGTGGAAGCTACGTCGTATT
GTTTTTGGCTGGTAAAGGTGGTCACACTCATTCTCATAACAAACCCATGGAGAAGATGGC
TGTTGCTGGGCTTGTCCTTGTCCCTGCGTTATCTCCATGTGCTACAACTCTCCCTGTTTT
CCTCGCTGTTGGAAATTCTAAGCCCATGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTGCTGATAAG
CACCATATTGGTGATGACATCTCTGGTGGCTCTATCGTTCTATGGTGCAAGCCAGCTGAA
GTTTCACTGGGTGGAGCGATACGACAAGCTTCTGGTTGGTTCGGTTCTGTGTCTGGTAGG
TATCTTAACCCTTCTCTTCCATGATCATGACCACCATGGTCATGAAGCACATCAACTCCC
CAGGAAAATCATTACTCTTTAGAGACCCCTTCCGAATCTCTGTTTTGTCTGTCATGTCTG
TTTGTTGTTGAGAGAGCCT

QA 3 801 3 801
DS 

RD RR2AC35JQ 828 0 0
CGGAGGATCTCTCGACGATCGGCGGAATCGCCACCGTGTCGCTCCTTCACTCGTTTATTC
CGACGCATTGGTTACCTTTCTCAATCGTTGGACGCGCGCAGAAATGGACGCTTTCCAGAA
CTCTCTTAGTCACTGCATTTGGAGCAGTCCTGCATGTCATATCCACTTCCCTTCTCGGTA
TAACAGCGATCACAATGGCGAATACCATCGCCGGTGAAGAGACTGTTCACAAGCTTGCTT
CTCTTTTGCTTGTGATTCTCGGTGGAAGCTACGTCGTATTGTTTTTGGCTGGTAAAGGTG
GTCACACTCATTCTCATAACAAACCCATGGAGAAGATGGCTGTTGCTGGGCTTGTCCTTG
TCCCTGCGTTATCTCCATGTGCTACAACTCTCCCTGTTTTCCTCGCTGTTGGAAATTCTA
AGCCCATGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTGCTGGTAAGCACCATATTGGTGATGACAT
CTCTGGTGGCTCTATCGTTCTATGGTGCAAGCCAGCTGAAGTTTCACTGGGTGGAGCGAT
ACGACAAGCTTCTGGTTGGTTCGGTTCTGTGTCTGGTAGGTATCTTAACCCTTCTCTTCC
ATGATCATGACCACCATGGTCATGAAGCACATCAACTCCCCAGGAAAATCATTACTCTTT
AGAGACCCCTTCCGAATCTCTGTTTTGTCTGTCATGTCTGTTTGTTGTTGAGAGAGCCTT
AAGGTCTTTCCCGTTGTATGTCTATAACTTAACTGTAACGCTCTTTGTTTGCGCGTGAAA
AAACATATTGCAGTGTTAAATTCCTTTAATAGAACAATATTAGTTGTG

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2DB80TF 666 0 0
G
CACTTCCCTTCTCGGTATAACAGCGATCACAATGGCGAATACCATCGCCGGTGAAGAGAC
TGTTCACAAGCTTGCTTCTCTTTTGCTTGTGATTCTCGGTGGAAGCTACGTCGTATTGTT
TTTTGCTGGTAAAGGTGGTCACACTCATTCTCATAACAAACCCATGGAGAAGATGGCTGT
TGCTGGGCTTGTCCTTGTCCCTGCGTTATCTCCATGTGCTACAACTCTCCCTGTTTTCCT
CGCTGTTGGAAATTCTAAGCCCATGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTGCCGATAAGCAC
CATATTGGTGATGACATCTCTGGTGGCTCTATAGTTCTATGGTGCAAGCCAGCTGAATTT
TCACTGGGTGGAGCGATACGACAAGCTTCTGGTTGGTTCGGTTCTGTGTCTGGTAGGTAT
CTTAACCCTTCTCTTCCATGATCATGACCACCATGGTCATGAAGCACATCAACTCCCCAG
GAAAATCATTACTCTTTAGAGACCCCCTCCGAATCTCTGTTTTGTCTGTCATGTCTGTTT
GTTGTTGAGAGAGCCTTAAGGTCTTTCCCGTTGTATGTCTATAACTTAACTGTAACGCTC
TTTGTTTGCGCGTGAAAAA*CATATTGCAGTGTTAAATTCCTTTAATAGAACAATATTAG
TTGTG

QA 2 666 2 666
DS 

RD RR2A408JQ 767 0 0
CTCAATCGTTGGACGCGCGCAGAAATGGACGCTTTCCAGAACTCTCTTAGTCACTGCATT
TGGAGCAGTCCTGCATGTCATATCCACTTCCCTTCTCGGTATAACAGCGATCACAATGGC
GAATACCATCGCCGGTGAAGAGACTGTTCACAAGCTTGCTTCTCTTTTGCTTGTGATTCT
CGGTGGAAGCTACGTCGTATTGTTTTTGGCTGGTAAAGGTGGTCACACTCATTCTCATAA
CAAACCCATGGAGAAGATGGCTGTTGCTGGGCTTGTCCTTGTCCCTGCGTTATCTCCATG
TGCTACAACTCTCCCTGTTTTCCTCGCTGTTGGAAATTCTAAGCCCATGATGGTTCTCGC
CATCATAGTTCTGCTGATAAGCACCATATTGGTGATGACATCTCTGGTGGCTCTATCGTT
CTATGGTGCAAGCCAGCTGAAGTTTCACTGGGTGGAGCGATACGACAAGCTTCTGGTTGG
TTCGGTTCTGTGTCTGGTAGGTATCTTAACCCTTTTCTTCCATGATCATGACCACCATGG
TCATGAAGCACATCAACTCCCCAGGAAAATCATTACTCTTTAGAGACCCCTTCCGAATCT
CTGTTTTGTCTGTCATGTCTGTTTGTTGTTGAGAGAGCCTTAAGGTCTTTCCCGTTGTAT
GTCTATAACTTAACTGTAACGCTCTTTGTTTGCGCGTGAAAAAACATATTGCAGTGTTAA
ATTCCTTTAATAGAACAATATTAGTTGTGAATGTGATTCTGTTAAGC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2F735TF 525 0 0
G
ACCCATGGAGAAGATGGCTGTTGCTGGGCTTGTCCTTGTCCCTGCGTTATCTCCATGTGC
TACAACTCTCCCTGTTTTCCTCGCTGTTGGAAATTCTAAGCCCATGATGGTTCTCGCCAT
CATAGTTCTGCTGATAAGCACCATATTGGTGATGACATCTCTGGTGGCTCTATCGTTCTA
TGGTGCAAGCCAGCTGAAGTTTCACTGGGTGGAGCGATACGACAAGCTTCTGGTTGGTTC
GGTTCTGTGTCTGGTAGGTATCTTAACCCTTCTCTTCCATGATCATGACCACCATGGTCA
TGAAGCACACCAACTCCCCAGGAAAATCATTACTCTTTAGAGACCCCTTCCGAATCTCTG
TTTTGTCTGTCATGTCTGTTTGTTGTTGAGAGAGCCTTAAGGTCTTTCCCGTTGTATGTC
TATAACTTAACTGTAACGCTCTTTTTTTGCGCGTGAAAAAACATATTGCAGTGTTAAATT
CCTTTAATAGAACAATATTAGTTGTGAATGTGATTCTGTTAAGC

QA 2 525 2 525
DS 



AS 1 6

CO CL1447Contig1 751 6 2 U
GGCTCACTTTCCGAGCTTTTCCAGTGAACTTCTTTTTTTTTTTAAAAACAATGGCGGCTC
CGATCATAATTTCCTCTTTCCTTTTCTTATTCTTCTCTGTCTCCGTCTCTGCTCTTAACG
TTGGTGTTCAGCTCACACATCCCACCGTTTCTCTGAGCAAAGAATGTAGCCGGAAATGTG
AATCAGAGTTCTGTTCAGTGCCTCCACTTTTGAGGTATGGGAAGTACTGTGGACTATTGT
ATAGTGGATGTCCTGGAGAGAGACCTTGTGATGGTCTTGATTCATGTTGCATGAAGCATG
ATGCTTGTGTTCAATCCAAGAATAATGATTATCTAAGCCAAGAGTGTAGTCAGAAGTTCA
TAAACTGCATGGACAATTTCAGCAATACGAAGCAACCAACGTTTAGTGGTAACACATGTG
ATCCCGATGAAGTCATTGATGTCATCTCTATTGTCATGGACGCCGCTCTTATCGCCGGCA
GAGTCTTCCGCAAACCCTAAATATGTTTTTGTATTGGTTAATCGTTTCTCTTGTTTCTTA
AGTACTCTCACACATTTGTCTTTTGTTTTATCTAGTGTCTTCATTTATATCATCTATTTT
ACTGGAAAACACACTAATATTACGAATTGTATTACTATATAGCTTTATGTGTCTAGGATT
CTAAGGGCCGCACTAAGGCCATGTTAGAGAACTAGTGTATATGTACTTGATCAGGAATAT
GGTCACGAGGAAATAAATTGTCGTTTTGGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EC41JQ C 1
AF RR2GS68JQB C 225
AF RR2EC41TF U 1
AF RR2GS68TF U 44
AF RR2B691TF U 42
AF RR2B691JQ C 52
BS 1 616 RR2EC41TF
BS 617 751 RR2B691TF

RD RR2EC41JQ 616 0 0
GGCTCACTTTCCGAGCTTTTCCAGTGAACTTCTTTTTTTTTTTAAAAACAATGGCGGCTC
CGATCATAATTTCCTCTTTCCTTTTCTTATTCTTCTCTGTCTCCGTCTCTGCTCTTAACG
TTGGTGTTCAGCTCACACATCCCACCGTTTCTCTGAGCAAAGAATGTAGCCGGAAATGTG
AATCAGAGTTCTGTTCAGTGCCTCCACTTTTGAGGTATGGGAAGTACTGTGGACTATTGT
ATAGTGGATGTCCTGGAGAGAGACCTTGTGATGGTCTTGATTCATGTTGCATGAAGCATG
ATGCTTGTGTTCAATCCAAGAATAATGATTATTTAAGCCAAGAGTGTAGTCAGAAGTTCA
TAAACTGCATGGACAATTTCAGCAATACGAAGCAACCAACGTTTAGTGGTAACACATGTG
ATCCCGATGAAGTCATTGATGTCATCTCTATTGTCATGGACGCCGCTCTTATCGCCGGCA
GAGTCTTCCGCAAACCCTAAATATGTTTTTGTATTGGTTAATCGTTTCTCTTGTTTCTTA
AGTACTCTCACACATTTGTCTTTTGTTTTATCTAGTGTCTTCATTTATATCATCTATTTT
ACTGGAAAACACACTA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2GS68JQB 381 0 0
TACTGTGGACTATTGTATAGTGGATGTCCTGGAGAGAGACCTTGTGATGGTCTTGATTCA
TGTTGCATGAAGCATGATGCTTGTGTTCAATCCAAGAATAATGATTATTTAAGCCAAGAG
TGTAGTCAGAAGTTCATAAACTGCATGGACAATTTCAGCAATACGAAGCAACCAACGTTT
AGTGGTAACACATGTGATCCCGATGAAGTCATTGATGTCATCTCTATTGTCATGGACGCC
GCTCTCATCGCCGGCAGAGTCTTCCGCAAACCCTAAATATGTTTTTGTATTGGTTAATCG
TTTCTCTTGTTTCTTAAGTACTCTCACACATTTGTCTTTTGTTTTATCTAGTGTCTTCAT
TTATATCATCTATTTTACTGG

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR2EC41TF 616 0 0
GGCTCACTTTCCGAGCTTTTCCAGTGAACTTCTTTTTTTTTTTAAAAACAATGGCGGCTC
CGATCATAATTTCCTCTTTCCTTTTCTTATTCTTCTCTGTCTCCGTCTCTGCTCTTAACG
TTGGTGTTCAGCTCACACATCCCACCGTTTCTCTGAGCAAAGAATGTAGCCGGAAATGTG
AATCAGAGTTCTGTTCAGTGCCTCCACTTTTGAGGTATGGGAAGTACTGTGGACTATTGT
ATAGTGGATGTCCTGGAGAGAGACCTTGTGATGGTCTTGATTCATGTTGCATGAAGCATG
ATGCTTGTGTTCAATCCAAGAATAATGATTATCTAAGCCAAGAGTGTAGTCAGAAGTTCA
TAAACTGCATGGACAATTTCAGCAATACGAAGCAACCAACGTTTAGTGGTAACACATGTG
ATCCCGATGAAGTCATTGATGTCATCTCTATTGTCATGGACGCCGCTCTTATCGCCGGCA
GAGTCTTCCGCAAACCCTAAATATGTTTTTGTATTGGTTAATCGTTTCTCTTGTTTCTTA
AGTACTCTCACACATTTGTCTTTTGTTTTATCTAGTGTCTTCATTTATATCATCTATTTT
ACTGGAAAACACACTA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2GS68TF 562 0 0
AAAAACAATGGCGGCTCCGATCATAATTTCCTCTTTCCTTTTCTTATTCTTCTCTGTCTC
CGTCTCTGCTCTTAACGTTGGTGTTCAGCTCACACATCCCACCGTTTCTCTGAGCAAAGA
ATGTAGCCGGAAATGTGAATCAGAGTTCTGCTCAGTGCCTCCACTTTTGAGGTATGGGAA
GTACTGTGGACTATTGTATAGTGGATGTCCTGGAGAGAGACCTTGTGATGGTCTTGATTC
ATGTTGCATGAAGCATGATGCTTGTGTTCAATCCAAGAATAATGATTATCTAAGCCAAGA
GTGTAGTCAGAAGTTCATAAACTGCATGGACAATTTCAGCAATACGAAGCAACCAACGTT
TAGTGGTAACACATGTGATCCCGATGAAGTCATTGATGTCATCTCTATTGTCATGGACGC
CGCTCTCATCGCCGGCAGAGTCTTCCGCAAACCCTAAATATGTTTTTGTATTGGTTAATC
GTTTCTCTTGTTTCTTAAGTACTCTCACACATTTGTCTTTTGTTTTATCTAGTGTCTTCA
TTTATATCATCTATTTTACTGG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2B691TF 710 0 0
AC
AAAAACAATGGCGGCTCAGATCATAATTTCCTCTTTCCTTTTCTTATTCTTCTCTGTCTC
CGTCTCTGCTCTTAACGTCGGTGTTCAGCTCACACATCCCACCGTTTCTCTGAGCAAAGA
ATGTAGCCGGAAATGCGAATCAGAGTTCTGTTCAGTGCCTCCACTTTTGAGGTATGGGAA
GTACTGTGGACTATTGTACAGTGGATGTCCTGGAGAGAGACCTTGTGATGGTCTTGATTC
ATGTTGCATGAAGCATGATGCTTGTGTTCAATCCAAAAATAATGATTACCTAAGCCAAGA
GTGTAGTCAGAAGTTCATAAACTGCATGGACAATTTCAGCAATACGAAGCAACCGACGTT
TACAGGTAACACATGCGATCCCGATGAAGTCATTGATGTCATCTCCATTGTCATGGACGC
CGCCCTTATCGCCGGCAGAGTCTTCCGCAAACCCTGAATATGTTATTGTATTGGTTAATC
GTTTCTCTTGTTTCTTAAGTACTCTCACACATTTGTCTTTTGTTTTATCTAATGTCTTCT
TTTATATCATCTGTTTTACTGGAAAACACACTAATATTACGAATTGTATTACTATATAGC
TTTATGTGTCTAGGATTCTAAGGGCCGCACTAAGGCCATGTTAGAGAACTAGTGTATATG
TACTTGATCAGGAATATGGTCACGAGGAAATAAATTGTCGTTTTGGCC

QA 3 710 3 710
DS 

RD RR2B691JQ 700 0 0
TGGCGGCTCAGATCATAATTTCCTCTTTCCTTTTCTTATTCTTCTCTGTCTCCGTCTCTG
CTCTTAACGTCGGTGTTCAGCTCACACATCCCACCGTTTCTCTGAGCAAAGAATGTAGCC
GGAAATGCGAATCAGAGTTCTGTTCAGTGCCTCCACTTTTGAGGTATGGGAAGTACTGTG
GACTATTGTACAGTGGATGTCCTGGAGAGAGACCTTGTGATGGTCTTGATTCATGTTGCA
TGAAGCATGATGCTTGTGTTCAATCCAAAAATAATGATTACCTAAGCCAAGAGTGTAGTC
AGAAGTTCATAAACTGCATGGACAATTTCAGCAATACGAAGCAACCGACGTTTACAGGTA
ACACATGCGATCCCGATGAAGTCATTGATGTCATCTCCATTGTCATGGACGCCGCCCTTA
TCGCCGGCAGAGTCTTCCGCAAACCCTGAATATGTTATTGTATTGGTTAATCGTTTCTCT
TGTTTCTTAAGTACTCTCACACATTTGTCTTTTGTTTTATCTAATGTCTTCTTTTATATC
ATCTGTTTTACTGGAAAACACACTAATATTACGAATTGTATTACTATATAGCTTTATGTG
TCTAGGATTCTAAGGGCCGCACTAAGGCCATGTTAGAGAACTAGTGTATATGTACTTGAT
CAGGAATATGGTCACGAGGAAATAAATTGTCGTTTTGGCC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 6

CO CL1448Contig1 1017 6 11 U
AGCGGACCATGTTATTGGTACCAAAAGTAAAATAAAAAAGTTTAAATAAAAACAAAGCAA
AATGAGTTATTGACATTTTCACTACAAATCAATCAGAGACCTTTCAGGTGAAATTTTCAA
ATACAAAAATAAAAGAAATAGTCTGTTTCCTTTGTTCTTTTTCCTGTGTGGCACGTAGAA
CTCAGGTGGTTATGTGCTCTTCATAATGTATCCCAGAATTAGACCGATTAGTCCGACCAG
AAGAACGTACATCAAAGGCATACCACTTTGGCCTCTCTTACTGTCACGTCTCAACTGGTC
CAGTTCTCTTTGAAGTTTGTTGTTTAGTTGAAGGGCAGACTGTTTTTCCTCGGTTAGCTT
TGTGATGAGAGCCCTTGCCTCAGATGTGTTTTCTTGAGGTTCAACCTTGTCCGCTATATG
TCTCTGAGAAGAAAACTCAGAAGCCTGTGTGCCGTTATCAGAAACAGAAGCCCGTGGAGA
AGAACCCTCTTCTGAACCTTCGTGAACCGGTGATGGTGGTTGTGGTGGAGCAACATAAGT
AACTCTCAGCTTAGTCTCCTCAACTAAATGCCCAGCCTCTTTGCTAAACATCTCAGGAGT
GACATCCTTGGGCGTGACACCAGGACTAGCAATCACACCTTGAAGTAGAAACTTGTCCTT
GCATTGCATATCGGAAGGAGCTTCCTTTTGAGCTTGCATTGTCACGAGAACTTCACAAGT
GGACCTTGGAAGAACAACTCCAGTGTTAGGCCTTACGCAATACTTTTTCGGATTCGTTGT
CTTAACCTTGAATGCCACATGATTGTCCGTCTTGTTGGTCAAGTAAAGAGAGCATGAGAT
CTGCTTCCTCAATTCAAAGGGGAATTGAAGATCGAGAGGCTCGACGGTGAGAAGCTCGCT
GTTACTCATCGCAATCGGATCGCCGTTTGAGATTTATTTCGATTTTGAGTTTCACGGCGG
TTAAATCGGTCTCGTCTCCGGTTCAGTCGTCGATCGAGAACCGAGATCGAGAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C958JQ U 171
AF RR2GW95JQ U 29
AF RR2FT78JQ U 1
AF RR2FT78TF C 241
AF RR2GW95TF C 343
AF RR2C958TF C 301
BS 1 749 RR2FT78JQ
BS 750 750 RR2GW95JQ
BS 751 791 RR2FT78JQ
BS 792 792 RR2FT78TF
BS 793 826 RR2FT78JQ
BS 827 827 RR2FT78TF
BS 828 851 RR2FT78JQ
BS 852 978 RR2FT78TF
BS 979 979 RR2GW95TF
BS 980 1008 RR2FT78TF
BS 1009 1017 RR2C958TF

RD RR2C958JQ 525 0 0
GCACGTAGAACTCAGGGGGTTATGTGCTCTTCATAATGTATCCCAGAATTAGACCGATTA
GTCCGACCAGAAGAACGTACATCAAAGGCATACCACTTTGGCCTCTCTTACTGTCACGTC
TCAACTGGTCCAGTTCTCTTTGAAGTTTGTTGTTTAGTTGAAGGGCAGACTGTTTTTCCT
CGGTTAGCTTTGTGATGAGAGCCCTTGCCTCAAATGTGTTTTCTTGAGGTTCAACCTTGT
CCGCTATATGTCTCTGAAAAGAAAACTCAGAAGCCTGTGTGCCGTAATCAGAAACAGAAG
CCCGTGGAGAAGAACCCTCTTCTGAACCTTCGTGAACCGGTGATGGTGGTTGTGGTGGAG
CAACATAAGTAACTCTCAGCTTAGTCTCCTCAACTAAATGCCCAGCCTCTTTGCTAAACA
TCTCAGGAGTGACATCCCTGGGCGTGACACCAGGACTAGCAATCACACCTTGAAGTAGAA
ACTTGTCCTTGCATTGCATATCGGAAGGAGCTTCCTTTTGAGCTT

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2GW95JQ 739 0 0
AAAATAAAAAAGTTTAAATAAAAACAAAGCAAAATGAGTTATTGACATTTTCACTACAAA
TCAATCAGAGACCTTTCAGGTGAAATTTTCAAATACAAAAATAAAAGAAATAGTCTGTTT
CCTTTGTTCTTTTTCCTGTGTGGCACGTAGAACTCAGGTGGTTATGTGCTCTTCATAATG
TATCCCAGAATTAGACCGATTAGTCCGACCAGAAGAACGTACATCAAAGGCATACCACTT
TGGCCTCTCTTACTGTCACGTCTCAACTGGTCCAGTTCTCTTTGAAGTTTGTTGTTTAGT
TGAAGGGCAGACTGTTTTTCCTCGGTTAGCTTTGTGATGAGAGCCCTTGCCTCAGATGTA
TTTTCTTGAGGTTCAACCTTGTCCGCTATATGTCTCTGAAAAGAAAACTCAGAAGCCTGT
GTGCCGTTATCAGAAACAGAAGCCCGTGGAGAAGAACCCTCTTCTGAACCTTCGTGAACC
GGTGATGGTGGTTGTGGTGGAGCAACATAAGTAACTCTCAGCTTAGTCTCCTCAACTAAA
TGCCCAGCCTCTTTGCTAAACATCTCAGGAGTGACATCCTTGGGCGTGACACCAGGACTA
GCAATCACACCTTGAAGTAGAAACTTGTCCTTGCATTGCATATCGGAAGGAGCTTCCTTT
TGAGCTTGCATTGTCACGAGAACTTCACAAGTGGACCTTGGAAGAACAACTCCAGTGTTA
GGCCTTACGCAATACTTTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2FT78JQ 854 0 0
AGCGGACCATGTTATTGGTACCAAAAGTAAAATAAAAAAGTTTAAATAAAAACAAAGCAA
AATGAGTTATTGACATTTTCACTACAAATCAATCAGAGACCTTTCAGGTGAAATTTTCAA
ATACAAAAATAAAAGAAATAGTCTGTTTCCTTTGTTCTTTTTCCTGTGTGGCACGTAGAA
CTCAGGTGGTTATGTGCTCTTCATAATGTATCCCAGAATTAGACCGATTAGTCCGACCAG
AAGAACGTACATCAAAGGCATACCACTTTGGCCTCTCTTACTGTCACGTCTCAACTGGTC
CAGTTCTCTTTGAAGTTTGTTGTTTAGTTGAAGGGCAGACTGTTTTTCCTCGGTTAGCTT
TGTGATGAGAGCCCTTGCCTCAGATGTGTTTTCTTGAGGTTCAACCTTGTCCGCTATATG
TCTCTGAGAAGAAAACTCAGAAGCCTGTGTGCCGTTATCAGAAACAGAAGCCCGTGGAGA
AGAACCCTCTTCTGAACCTTCGTGAACCGGTGATGGTGGTTGTGGTGGAGCAACATAAGT
AACTCTCAGCTTAGTCTCCTCAACTAAATGCCCAGCCTCTTTGCTAAACATCTCAGGAGT
GACATCCTTGGGCGTGACACCAGGACTAGCAATCACACCTTGAAGTAGAAACTTGTCCTT
GCATTGCATATCGGAAGGAGCTTCCTTTTGAGCTTGCATTGTCACGAGAACTTCACAAGT
GGACCTTGGAAGAACAACTCCAGTGTTAG*CCTTACGCAATACTTTTTCGGATTCGTTGT
CTTAACCTTGA*TGCCACATGATTGTCCGTCTTGTTGGTCAAGTAA*GAGAGCATGAGAT
CTGCTTCCTCA
TTC

QA 1 851 1 851
DS 

RD RR2FT78TF 777 0 0
GAGG
ACGTACATCAAAGGCATACCACTTTGGCCTCTCTTACTGTCACGTCTCAACTGGTCCAGT
TCTCTTTGAAGTTTGTTGTTTAGTTGAAGGGCAGACTGTTTT*CCTCGGTTAGCTTTGTG
ATGAGAGCCCTTGCCTCAGATGTGTTTTCTTGAGGTTCAACCTTGTCCGCTATATGTCTC
TGAGAAGAAAACTCAGAAGCCTGTGTGCCGTTATCAGAAACAGAAGCCCGTGGAGAAGAA
CCCTCTTCTGAACCTTCGTGAACCGGTGATGGTGGTTGTGGTGGAGCAACATAAGTAACT
CTCAGCTTAGTCTCCTCAACTAAATGCCCAGCCTCTTTGCTAAACATCTCAGGAGTGACA
TCCTTGGGCGTGACACCAGGACTAGCAATCACACCTTGAAGTAGAAACTTGTCCTTGCAT
TGCATATCGGAAGGAGCTTCCTTTTGAGCTTGCATTGTCACGAGAACTTCACAAGTGGAC
CTTGGAAGAACAACTCCAGTGTTAGGCCTTACGCAATACTTTTTCGGATTCGTTGTCTTA
ACCTTGAATGCCACATGATTGTCCGTCTTGTTGGTCAAGTAAAGAGAGCATGAGATCTGC
TTCCTCAATTCAAAGGGGAATTGAAGATCGAGAGGCTCGACGGTGAGAAGCTCGCTGTTA
CTCATCGCAATCGGATCGCCGTTTGAGATTTATTTCGATTTTGAGTTTCACGGCGGTTAA
ATCGGTCTCGTCTCTGGTTCAGTCGTCGATCGAGAACCGAGATC
GAGAGAGCC

QA 5 768 5 768
DS 

RD RR2GW95TF 668 0 0
TTTTTCCTCGGTTAGCTTTGTGATGAGAGCCCTTGCCTCAGATGTATTTTCTTGAGGTTC
AACCTTGTCCGCTATATGTCTCTGAGAAGAAAACTCAGAAGCCTGTGTGCCGTTATCAGA
AACAGAAGCCCGTGGAGAAGAACCCTCTTCTGAACCTTCGTGAACCGGTGATGGTGGTTG
TGGTGGAGCAACATAAGTAACTCTCAGCTTAGTCTCCTCAACTAAATGCCCAGCCTCTTT
GCTAAACATCTCAGGAGTGACATCCTTGGGCGTGACACCAGGACTAGCAATCACACCTTG
AAGTAGAAACTTGTCCTTGCATTGCATATCGGAAGGAGCTTCCTTTTGAGCTTGCATTGT
CACGAGAACTTCACAAGTGGACCTTGGAAGAACAACTCCAGTGTTAGGCCTTACGCAATA
CTTTTTCGGATTCGTTGTCTTAACCTTGAAAGCCACATGATTGTCCGTCTTGTTGGTCAA
GTAAAGAGAGCATGAGATCTGCTTCCTCAATTCAAAGGGGAATTGAAGATCGAGAGGCTC
GACGGTGAGAAGCTCGCTGTTACTCATCGCAATCGGATCGCCG***GAGATTTATTTCGA
TTTTGAGTTTCACGGCGGTTAAATCGGTCTCGTCTCCGGTTCAGTCGTCGATCGAGAACC
GAGATC
CC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2C958TF 717 0 0
CAGTTCTCTTTGAAGTTTGTTGTTTAGTTGAAGGGCAGACTGTTTTTCCTCGGTTAGCTT
TGTGATGAGAGCCCTTGCCTCAGATGTGTTTTCTTGAGGTTCAACCTTGTCCGCTATATG
TCTCTGAGAAGAAAACTCAGAAGCCTGTGTGCCGTAATCAGAAACAGAAGCCCGTGGAGA
AGAACCCTCTTCTGAACCTTCGTGAACCGGTGATGGTGGTTGTGGTGGAGCAACATAAGT
AACTCTCAGCTTAGTCTCCTCAACTAAATGCCCAGCCTCTTTGCTAAACATCTCAGGAGT
GACATCCCTGGGCGTGACACCAGGACTAGCAATCACACCTTGAAGTAGAAACTTGTCCTT
GCATTGCATATCGGAAGGAGCTTCCTTTTGAGCTTGCATTGTCACGAGAACTTCACAAGT
GGACCTTGGAAGAACAACTCCAGTGTTAGGCCTTACGCAATACTTTTTCGGATTCGTTGT
CTTAACCTTGAATGCCACATGATTGTCCGTCTTGTTGGTCAAGTAAAGAGAGCATGAGAT
CTGCTTCCTCAATTCAAAGGGGAATTGAAGATCGAGAGGCTCGACGGTGAGAAGCTCGCT
GTTACTCATCGCAATCGGATCGCCGTTTGAGATTTATTTCGATTTTGAGTTTCACGGCGG
TTAAATCGGTCTCGTCTCCGGTTCAGTCGTCGATCGAGGACCGAGATCGAGAGAGCC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 2 6

CO CL1449Contig1 623 2 1 U
GGAGAACAGCAATGGCTCCTTGTTCTTCCATCTCCTTCTCATGCGCACCTTCACTCTTCT
CCACCAAACCCATCAACCATTCTTCTCCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGAA
CCCGAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAACAGACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAA
CCACCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTGGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTACG
GCAGTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACGTTGAACAGTATTTCAATTACATGG
GGATGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAGCACTTCTTAACCTAAACATTC
ATCCCGTTGATATCCTACTGATGTTGGCAGCCGCAGAAGGTGACAAACCGAAGATAGAGG
AGCTGCTTAGAGCTGGCGCGAGCTACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTG
ACAGAGCTAATAGTGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTT
GAATATCATCTTTGGTCAGAGGTTAATGTCCCAGAGTTTGTTTTTTAAGAATATTGTGCT
AGAATAAACTGTCTTTATGGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FL36TF U 1
AF RR2FL36JQ C 24
BS 1 623 RR2FL36TF

RD RR2FL36TF 623 0 0
GGAGAACAGCAATGGCTCCTTGTTCTTCCATCTCCTTCTCATGCGCACCTTCACTCTTCT
CCACCAAACCCATCAACCATTCTTCTCCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGAA
CCCGAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAACAGACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAA
CCACCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTGGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTACG
GCAGTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACGTTGAACAGTATTTCAATTACATGG
GGATGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAGCACTTCTTAACCTAAACATTC
ATCCCGTTGATATCCTACTGATGTTGGCAGCCGCAGAAGGTGACAAACCGAAGATAGAGG
AGCTGCTTAGAGCTGGCGCGAGCTACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTG
ACAGAGCTAATAGTGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTT
GAATATCATCTTTGGTCAGAGGTTAATGTCCCAGAGTTTGTTTTTTAAGAATATTGTGCT
AGAATAAACTGTCTTTATGGGTT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2FL36JQ 600 0 0
TCTTCCATCTCCTTCTCATGCGCACCTTCACTCTTCTCCACCAAACCCATCAACCATTCT
TCTCCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGAACCCGAAACTTAAAGCTTCGGATC
CGACCCAACAGACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAACCACCTGCTGGTTCAAGTTCGGC
AAGAACGGCGTGGATGCTGAAAGTGCCGGAATCTACGGCAGTCAGACACGCGATGACTTC
GACAAAGACGACGTTGAACAGTATTTCAATTACATGGGGATGCTTGCGGTAGAAGGCACC
TATTCAAAGATGGAAGCACTTCTTAACCTAAACATTCATCCCGTTGATATCCTACTGATG
TTGGCAGCCGCAGAAGGTGACAAACCGAAGATAGAGGAGCTGCTTAGAGCTGGCGCGAGC
TACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGACAGAGCTAATAGTGAAGAGATT
CGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAATATCATCTTTGGTCAGAGGT
TAATGTCCCAGAGTTTGTTTTTTAAGAATATTGTGCTAGAATAAACTGTCTTTATGGGTT

QA 1 600 1 600
DS 



CO CL1449Contig2 692 4 4 U
TTTTTTTTCGAGATGAAGATGGATTTTATGACCTACTCATCCGCGGAACCCATAAAGACA
GTTTATTCTAGCACAACATTCTTTATAATAACTCAGAAACATAACTTAAGACAAAAGAAG
ATATTCAAGCCTTCTGAGTGGAGTAGCCAAGGATCAAGTCACGAATCTCTTCACTATTAG
CTCTGTCAAGAGCGGTTCTTCCATCAGCATCCTTGACCGAGTAGCTAGCGCCAGCTCTAA
GCAGCTCCTCTATCTTTGGTTTGTCACCTTCTGTGGCTGCCAACATCAGTAGAATATCAA
CGGGGTGAATGCTTAGGTTTAGAAGTGCTTCCATCTTCGAATAGGTGCCTTCTACCGCAA
GCATCCC*ATGTAATTGAAATATTGTTCAACGTCGTCTTTGTCGAAGCCATCGCGTGTCT
GACTGTCGTAGATTCCGGCACTCTCAGCATCGACGCCGTTCTTGCCGAACTTGAACCAGC
AGGTGGTTCTTGAACCGTTTGAGGGTCCGAGTCTGTTGGGTCGGGACCGAAGCTTTAAGT
TTCGGGTTCCGAGGAATTTAGAGGAGAGCAGCCTTGGTGAAGAAGAATGGTTGATGGGTT
TGGTGGAGAAGAGTGAAGGTGCGCATGAGAAGGAGATGGAAGAACAAGGAGCCATTGCTG
TTCTGTCTCTTGATGCTTCCAACTATCCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE38JQ U 28
AF RR2GE38TF C 1
AF RR2G321JQ U 47
AF RR2G321TF C 47
BS 1 27 RR2GE38TF
BS 28 336 RR2GE38JQ
BS 337 661 RR2G321JQ
BS 662 692 RR2GE38TF

RD RR2GE38JQ 309 0 0
ATGACCTACTCATCCGCGGAACCCATAAAGACAGTTTATTCTAGCACAACATTCTTTATA
ATAACTCAGAAACATAACTTAAGACAAAAGAAGATATTCAAGCCTTCTGAGTGGAGTAGC
CAAGGATCAAGTCACGAATCTCTTCACTATTAGCTCTGTCAAGAGCGGTTCTTCCATCAG
CATCCTTGACCGAGTAGCTAGCGCCAGCTCTAAGCAGCTCCTCTATCTTTGGTTTGTCAC
CTTCTGTGGCTGCCAACATCAGTAGAATATCAACGGGGTGAATGCTTAGGTTTAGAAGTG
CTTCCATCT

QA 1 309 1 309
DS 

RD RR2GE38TF 692 0 0
TTTTTTTTCGAGATGAAGATGGATTTTATGACCTACTCATCCGCGGAACCCATAAAGACA
GTTTATTCTAGCACAACATTCTTTATAATAACTCAGAAACATAACTTAAGACAAAAGAAG
ATATTCAAGCCTTCTGAGTGGAGTAGCCAAGGATCAAGTCACGAATCTCTTCACTATTAG
CTCTGTCAAGAGCGGTTCTTCCATCAGCATCCTTGACCGAGTAGCTAGCGCCAGCTCTAA
GCAGCTCCTCTATCTTTGGTTTGTCACCTTCTGTGGCTGCCAACATCAGTAGAATATCAA
CGGGGTGAATGCTTAGGTTTAGAAGTGCTTCCATCTTCGAATAGGTGCCTTCTACCGCAA
GCATCCCCATGTAATTGAAATATTGTTCAACGTCGTCTTCGTCGAAGTCATCGCGTGTCT
GACTGCCGTAGATTCCGGCACTCTCAGCATCGACGCCGTTCTTGCCGAACTTGAACCAGC
AGGTGGTTCTTGAACCGTTTGAGGGTCCGAGTCTGTTGGGTCGGGACCGAAGCTTTAAGT
TTCGGGTTCCGAGGAATT*AGAGGAGAGCAGCCTTGGTGGAGAAGAATGGTTGATGGGTT
TGGTGGAGAAGAGTGAAGGTGCGCATGAGAAGGAGATGGAAGAACAAGGAGCCATTGCTG
TTCTGTCTCTTGATGCTTCCAACTATCCGTCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2G321JQ 620 0 0
AACCCATAAAGACAGTTTATTCTAGCACAACATTCTTTATAATAACTCAGAAACATAACT
TAAGACAAAAGAAGATATTCAAGTCTTCTGAGTGGAGTAGCCAAGGATCAAGTCACGAAT
CTCTTCACTATTAGCTCTGTCAAGAGCGGTTCTTCCATCAGCATCCTTGACCGAGTAGCT
AGCGCCAGCTCTAAGCAGCTCCTCTATCTTTGGTTTGTCACCTTCTGTGGCTGCCAACAT
CAGTAGAATATCAACGGGGTGAATGTTTAGGTTTAGAAGTGCTTCCATCTTCGAATAGGT
GCCTTCTACCGCAAGCATCCC*ATGTAATTGAAATATTGTTCAACGTCGTCTTTGTCGAA
GCCATCGCGTGTCTGACTGTCGTAGATTCCGGCACTCTCAGCATCGACGCCGTTCTTGCC
GAACTTGAACCAGCAGGTGGTTCTTGAACCGTTTGAGGGTCCGAGTCTGTTGGGTCGGGA
CCGAAGCTTTAAGTTTCGGGTTCCGAGGAATTTAGAGGAGAGCAGCCTTGGTGAAGAAGA
ATGGTTGATGGGTTTGGTGGAGAAGAGTGAAGGTGCGCATGAGAAGGAGATGGAAGAACA
AGGAGCCATTGCTGT
CCTCC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2G321TF 620 0 0
AACCCATAAAGACAGTTTATTCTAGCACAACATTCTTTATAATAACTCAGAAACATAACT
TAAGACAAAAGAAGATATTCAAGTCTTCTGAGTGGAGTAGCCAAGGATCAAGTCACGAAT
CTCTTCACTATTAGCTCTGTCAAGAGCGGTTCTTCCATCAGCATCCTTGACCGAGTAGCT
AGCGCCAGCTCTAAGCAGCTCCTCTATCTTTGGTTTGTCACCTTCTGTGGCTGCCAACAT
CAGTAGAATATCAACGGGGTGAATGTTTAGGTTTAGAAGTGCTTCCATCTTCGAATAGGT
GCCTTCTACCGCAAGCATCCC*ATGTAATTGAAATATTGTTCAACGTCGTCTTTGTCGAA
GCCATCGCGTGTCTGACTGTCGTAGATTCCGGCACTCTCAGCATCGACGCCGTTCTTGCC
GAACTTGAACCAGCAGGTGGTTCTTGAACCGTTTGAGGGTCCGAGTCTGTTGGGTCGGGA
CCGAAGCTTTAAGTTTCGGGTTCCGAGGAATTTAGAGGAGAGCAGCCTTGGTGAAGAAGA
ATGGTTGATGGGTTTGGTGGAGAAGAGTGAAGGTGCGCATGAGAAGGAGATGGAAGAACA
AGGAGCCATTGCTGT
CCTCC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 5

CO CL1450Contig1 1459 5 8 U
CGACCAATGTTTTCCTTTAACATTGCAAATTTCATTCAATGTCATAAGCCTCGGTTTGTT
TCGTTCACGCATCCTTTTAGTTTTAGTCAAAAAGTCATAAGGAAGTATATGATACCAACA
GAAAAGAATCCTTAGTGTATAAACCAAGGAACATGTTTTTTTTTCCTTTTATTAGACAAA
ACAAGAAATATATCGTCTGGCTATAGTTTAGCCAACGCGGGTAACTGCAGCATGTATAGC
TTCGACCAGGTGAGGCACCGTCTTCGAACTGAGGCCTGCCATGCTTATTCTCCCGTCAGA
CGTCATGTAAATGTGATACTCTTTGGTCATGAAGGCAACTTGCTCCTTGTTCAATCCAGT
AAAAGTGAACATCCCAATCTGTTTTATAATGTGACTCCAATCACCAGGTGTGCCTTTAGC
TTGTAGAGCTTCAAATAACTGGTGG*CGCATGCTAATAATGCGGTCAGCCATTCCTTTCA
GCTCGATGGTCC*AGTCGTTGAACATATCACTGCTTTTCAGGATGGTGGCAACAATTGAT
GCTCCATGAATAGGTGGGCTCGAGTACATGGG*TCGCACAACAAGTTTCACCTGGCTCTC
AACCTTACTAGCCACATCTGCCGACTTGCAGACAATGCTAAGGGCACCAACACGCTCCCC
ATAAAGTCCCATATTTTTGGCATAACTTTGAGCTATCAAGCATTCACCGCCATCAGCAAC
AAAGGTGCGGACTGAATGTGCATCTGTGTCAAGGCTACCACTAGCAAAACCCTGATATGC
ACTGTCAAAAAACGGTAACAAGCTTTTAGATCTCACTAGTTGTCGAATCTGTTCCCACTG
TTCAGAGGTTGGGTCAACTCCAGTGGGATTGTGAGCACATGCATGAAGTAAGACAATCGC
TCCAGATGGTGCAGCGCCAAGATCCTCAAGCAAGCCTTGGAAGTCAAGTCCACGGGTTGC
AGGATCATAGTAACGGTAGTACTCAACAGACAAGCCAGCCAGGTTGAAAACTTTGGGATG
GTTCCCCCAAGTTGGTTTCGGAATGAAAATGACACTCTGGTGGTAGTGTTTTTTGAGGAA
CTCAGCACCAACTCTCAAAGAACCAGTACCAGACAAGCACTGGATTGTAGCAACTCTACT
CTCTTGAATTGCAGGACTATCAGCACCTAAGATGAGCTTGGCGCTAAGTTTGTTAAAATC
AGCAAGTCCAGCAATAGGAATATATTCCTTGACACGAGACAGATCGTTCACAAGCTGTTG
CTCTGCCCTTCGCACCACGTCAAGAACAAGTGGCTTCCCTTCCTCAGTACGATAGGCACT
GACACCCAAATTGAGCTTAGCTGGGCTTGGATCATTGTTGTAAGCAACTGTCACACCGAG
AATAGGATCTTCGGGAGCACGAACGACGTTTGAGAAGACGGACTCCATTACAGCAAGGAT
TGAAACGAGAGATCGGTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK63JQ U 428
AF RR2BN60JQ U 3
AF RR2BN60TF C 169
AF RR2AU56JQ U 1
AF RR2AU56TF C 704
BS 1 163 RR2AU56JQ
BS 164 164 RR2BN60JQ
BS 165 298 RR2AU56JQ
BS 299 299 RR2BN60JQ
BS 300 714 RR2AU56JQ
BS 715 715 RR2AK63JQ
BS 716 901 RR2AU56JQ
BS 902 1459 RR2AU56TF

RD RR2AK63JQ 293 0 0
GCTTCAAATAACTGGTGGGCGCATGCTAATAATGCGGTCAGCCATTCCTTTCAGCTCGAT
GGTCCCAGTCGTTGAACAAATCACTGCTTTTCAGGATGGTGGCAACAATTGATGCTCCAT
GAATAGGTGGGCTCGAGTACATGGGGTCGCACAACAAGTTTCACCTGGCTCTCAACCTTA
CTAGCCACATCTGCCGACTTGCAGACAATGCTAAGGGCACCAACACGCTCCCCATAAAGT
CCCATATTTTTGGCATAACTTTGAGCTATCAAGCATTCACCGCCATCAGCAAC

QA 1 293 1 293
DS 

RD RR2BN60JQ 715 0 0
ACCAATGTTTTCCTTTAACATTGCAAATTTCATTCAATGTCATAAGCCTCGGTTTGTTTC
GTTCACGCATCCTTTTAGTTTTAGTCAAAAAGTCATAAGGAAGTATATGATACCAACAGA
AAAGAATCCTTAGTGTATAAACCAAGGAACATGTTTTTTTTTCCTTTTATTAGACAAAAC
AAGAAATATATCGTCTGGCTATAGTTTAGCCAACGCGGGTAACTGCAGCATGTATAGCTT
CGACCAGGTGAGGCACCGTCTTCGAACTGAGGCCTGCCATGCTTATTCTCCCGTCAGACG
TCATGTAAATGTGATACTCTTTGGTCATGAAGGCAACTTGCTCCTTGTTCAATCCAGTAA
AAGTGAACATCCCAATCTGTTTTATAATGTGACTCCAATCACCAGGTGTGCCTTTAGCTT
GTAAAGCTTCAAATAACTGGTGG*CGCATGCTAATAATGCGGTCAGCCATTCCTTTCAGC
TCGATGGTCC*AGTCGTTGAACATATCACTGCTTTTCAGGATGGTGGCAACAATTGATGC
TCCATGAATAGGTGGGCTCGAGTACATGGG*TCGCACAACAAGTTTCACCTGGCTCTCAA
CCTTACTAGCCACATCTGCCGACTTGCAGACAATGCTAAGGGCACCAACACGCTCCCCAT
AAAGTCCCATATTTTTGGCATAACTTTGAGCTATCAAGCATTCACCGCCATCAGC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2BN60TF 684 0 0
TTATTAGACAAAACAAGAAATATATCGTCTGGCTATAGTTTAGCCAACGCGGGTAACTGC
AGCATGTATAGCTTCGACCAGGTGAGGCACCGTCTTCGAACTGAGGCCTGCCATGCTTAT
TCTCCCGTCAGACGTCATGTAAATGTGATACTCTTTGGTCATGAAGGCAACTTGCTCCTT
GTTCAATCCAGTAAAAGTGAACATCCCAATCTGTTTTATAATGTGACTCCAATCACCAGG
TGTGCCTTTAGCTTGTAGAGCTTCAAATAACTGGTGG*CGCATGCTAATAATGCGGTCAG
CCATTCCTTTCAGCTCGATGGTCC*AGTCGTTGAACATATCACTGCTTTTCAGGATGGTG
GCAACAATTGATGCTCCATGAATAGGTGGGCTCGAGTACATGGG*TCGCACAACAAGTTT
CACCTGGCTCTCAACCTTACTAGCCACATCTGCCGACTTGCAGACAATGCTAAGGGCACC
AACACGCTCCCCATAAAGTCCCATATTTTTGGCATAACTTTGAGCTATCAAGCATTCACC
GCCATCAGCAACAAAGGTGCGGACTGAATGTGCATCTGTGTCAAGGCTACCACTAGCAAA
ACCCTGATATGCACTGTCAAAAAACGGTAACAAGCTTTTAGATCTCACTAGTTGTCGAAT
CTGTTCCCACTGTTCAGAGGTTG
C

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2AU56JQ 901 0 0
CGACCAATGTTTTCCTTTAACATTGCAAATTTCATTCAATGTCATAAGCCTCGGTTTGTT
TCGTTCACGCATCCTTTTAGTTTTAGTCAAAAAGTCATAAGGAAGTATATGATACCAACA
GAAAAGAATCCTTAGTGTATAAACCAAGGAACATGTTTTTTTT*CCTTTTATTAGACAAA
ACAAGAAATATATCGTCTGGCTATAGTTTAGCCAACGCGGGTAACTGCAGCATGTATAGC
TTCGACCAGGTGAGGCACCGTCTTCGAACTGAGGCCTGCCATGCTTATTCTCCCGTCAAA
CGTCATGTAAATGTGATACTCTTTGGTCATGAAGGCAACTTGCTCCTTGTTCAATCCAGT
AAAAGTGAACATCCCAATCTGTTTTATAATGTGACTCCAATCACCAGGTGTGCCTTTAGC
TTGTAGAGCTTCAAATAACTGGTGG*CGCATGCTAATAATGCGGTCAGCCATTCCTTTCA
GCTCGATGGTCC*AGTCGTTGAACATATCACTGCTTTTCAGGATGGTGGCAACAATTGAT
GCTCCATGAATAGGTGGGCTCGAGTACATGGG*TCGCACAACAAGTTTCACCTGGCTCTC
AACCTTACTAGCCACATCTGCCGACTTGCAGACAATGCTAAGGGCACCAACACGCTCCCC
ATAAAGTCCCATATTTTTGGCATAACTTTGAGCTATCAAGCATTCACCGCCATCGGCAAC
AAAGGTGCGGACTGAATGTGCATCTGTGTCAAGGCTACCACTAGCAAAACCCTGATATGC
ACTGTCAAAAAACGGTAACAAGCTTTTAGATCTCACTAGTTGTCGAATCTGTTCCCACTG
TTCAGAGGTTGGGTCAACTCCAGTGGGATTGTGAGCACATGCATGAAGTAAGACAATCGC
T

QA 1 901 1 901
DS 

RD RR2AU56TF 756 0 0
TCACCGCCATCGGCAACAAAGGTGCGGACTGAATGTGCATCTGTGTCAAGGCTACCACTA
GCAAAACC*TGATATGCACTGTCAAAAAACGGTAACAAGCTTTTAGATCTCACTAGTTGT
CGAATCTGTTCCCACTGTTCAGAGGTTGGGTCAACTCCAGTGGGATTGTGAGCACATGCA
TGAAGTAAGACAATCGCTCCAGATGGTGCAGCGCCAAGATCCTCAAGCAAGCCTTGGAAG
TCAAGTCCACGGGTTGCAGGATCATAGTAACGGTAGTACTCAACAGACAAGCCAGCCAGG
TTGAAAACTTTGGGATGGTTCCCCCAAGTTGGTTTCGGAATGAAAATGACACTCTGGTGG
TAGTGTTTTTTGAGGAACTCAGCACCAACTCTCAAAGAACCAGTACCAGACAAGCACTGG
ATTGTAGCAACTCTACTCTCTTGAATTGCAGGACTATCAGCACCTAAGATGAGCTTGGCG
CTAAGTTTGTTAAAATCAGCAAGTCCAGCAATAGGAATATATTCCTTGACACGAGACAGA
TCGTTCACAAGCTGTTGCTCTGCCCTTCGCACCACGTCAAGAACAAGTGGCTTCCCTTCC
TCAGTACGATAGGCACTGACACCCAAATTGAGCTTAGCTGGGCTTGGATCATTGTTGTAA
GCAACTGTCACACCGAGAATAGGATCTTCGGGAGCACGAACGACGTTTGAGAAGACGGAC
TCCATTACAGCAAGGATTGAAACGAGAGATCGGTCC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 2 6

CO CL1451Contig1 1058 2 2 U
GGGAAAAGAAAACAAACAGATGTGAACTCTCTCTTCTTCTCTCTTTGTCTTAAAACTTTT
AATATCCTCTCCTCTCAGTTACTACCACTACTCGTCAATGGCTAGCGACGGTGGCGTTTC
TTGTCTACGGAGGCCAGAGATGATGAACGTCGGCATCGGAGGAATGGAACATCCTCCTTT
GGATGTAGATGAAGTTCATGTCCTGGCCGTCGACGACAGCCTCGTTGATCGGATTGTCAT
CGAGAGATTGCTTCGTATTACCTCCTGCAAAGTCACGGCGGTAGACAGCGGATGGCGTGC
TCTGGAGTTTCTAGGGCTAGACAACGATAAAGCCTCTGCAGAACTCGATAGATTGAAAGT
TGATCTGATCATCACGGATTACTGCATGCCTGGAATGACAGGCTACGAGCTCCTCAAGAA
GATCAAGGAATCGTCCAGTTTCCGACAAGTTCCGGTTGTAATAATGTCGTCGGAGAATGT
AATAACAAGAATCGACAGGTGCCTCGAGGAAGGTGCGGAGGATTTCTTACTGAAACCGGT
GAAGCTCGCCGACGTGAAACGCCTGAGAAATTATTTAACCAAAGACGTTAAACTTTCCAA
CGGAAACAAACGGAAGCTTCCAGACGATTCGCCTCCGTTGACTCTCTCGCCTGATTCGTC
GGACTCTTCTCCGCCGCCGTCGACTCTCTCGCCTGATTCGTCGGACTCTTCTCCCTCGCC
GTTATCTCCCGTGGAGACCGTTTCCTCGCCGCCCTCATCTCCGATAGACGATGAAGATGA
CGATGTGCTGACGTCGTCGCCGGAGGAATCGCCGGTTCGACGGCAGAAGATGAGGAGTCC
CGGGTTAGATTAGTGACCTTTTATTCTGTGGGGTCCGTGTAATATCTATTACTGTTTAAC
TTCTTTTTTTTTTTTACCTTTTGACGGTGTTTTTAATTGCACGTTGACTCAATGCCGTCG
ATTTTATAGATGTCCTTTAATCTCGCTCCACGTGGGCCTTTTCTATAAGCTTTTCGACTT
ATAAGCTTTAATTAAAGGATAATGGAAGATTTATAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU04TF U 1
AF RR2FU04JQ C 269
BS 1 776 RR2FU04TF
BS 777 1058 RR2FU04JQ

RD RR2FU04TF 776 0 0
GGGAAAAGAAAACAAACAGATGTGAACTCTCTCTTCTTCTCTCTTTGTCTTAAAACTTTT
AATATCCTCTCCTCTCAGTTACTACCACTACTCGTCAATGGCTAGCGACGGTGGCGTTTC
TTGTCTACGGAGGCCAGAGATGATGAACGTCGGCATCGGAGGAATGGAACATCCTCCTTT
GGATGTAGATGAAGTTCATGTCCTGGCCGTCGACGACAGCCTCGTTGATCGGATTGTCAT
CGAGAGATTGCTTCGTATTACCTCCTGCAAAGTCACGGCGGTAGACAGCGGATGGCGTGC
TCTGGAGTTTCTAGGGCTAGACAACGATAAAGCCTCTGCAGAACTCGATAGATTGAAAGT
TGATCTGATCATCACGGATTACTGCATGCCTGGAATGACAGGCTACGAGCTCCTCAAGAA
GATCAAGGAATCGTCCAGTTTCCGACAAGTTCCGGTTGTAATAATGTCGTCGGAGAATGT
AATAACAAGAATCGACAGGTGCCTCGAGGAAGGTGCGGAGGATTTCTTACTGAAACCGGT
GAAGCTCGCCGACGTGAAACGCCTGAGAAATTATTTAACCAAAGACGTTAAACTTTCCAA
CGGAAACAAACGGAAGCTTCCAGACGATTCGCCTCCGTTGACTCTCTCGCCTGATTCGTC
GGACTCTTCTCCGCCGCCGTCGACTCTCTCGCCTGATTCGTCGGACTCTTCTCCCTCGCC
GTTATCTCCCGTGGAGACCGTTTCCTCGCCGCCCTCATCTCCGATAGACGATGAAG

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2FU04JQ 790 0 0
AAAGTCACGGCGGTAGACAGCGGATGGCGTGCTCTGGAGTTTCTAGGGCTAGACAACGAT
AAAGCCTCTGCAGAACTCGATAGATTGAAAGTTGATCTGATCATCACGGATTACTGCATG
CCTGGAATGACAGGCTACGAGCTCCTCAAGAAGATCAAGGAATCGTCCAGTTTCCGACAA
GTTCCGGTTGTAATAATGTCGTCGGAGAATGTAATAACAAGAATCGACAGGTGCCTCGAG
GAAGGTGCGGAGGATTTCTTACTGAAACCGGTGAAGCTCGCCGACGTGAAACGCCTGAGA
AATTATTTAACCAAAGACGTTAAACTTTCCAACGGAAACAAACGGAAGCTTCCAGACGAT
TCGCCTCCGTTGACTCTCTCGCCTGATTCGTCGGACTCTTCTCCGCCGCCGTCGACTCTC
TCGCCTGATTCGTCGGACTCTTCTCCCTCGCCGTTATCTCCCGTGGAGACCGTTTCCTCG
CCGCCCTCATCTCCGATAGACGATGAAGATGACGATGTGCTGACGTCGTCGCCGGAGGAA
TCGCCGGTTCGACGGCAGAAGATGAGGAGTCCCGGGTTAGATTAGTGACCTTTTATTCTG
TGGGGTCCGTGTAATATCTATTACTGTTTAACTTCTTTTTTTTTTTTACCTTTTGACGGT
GTTTTTAATTGCACGTTGACTCAATGCCGTCGATTTTATAGATGTCCTTTAATCTCGCTC
CACGTGGGCCTTTTCTATAAGCTTTTCGACTTATAAGCTTTAATTAAAGGATAATGGAAG
ATTTATAATT

QA 1 790 1 790
DS 



CO CL1451Contig2 1076 4 17 U
GGAGGAAAAGAAAACAAACAGATGTGAACTCTCTCTTCTTCTCTCTTTGTCTTAAAACTT
TTAATATCCTCTCTCCTTTCAGTTACTACCACTACTCGTCAATGGCTAGCGACGGTGGCG
TTTCTTGTCTACGGAGGCCAGAGATGATGAACGTCGGCATCGGAGGAATGGAACATCGTC
CTTTGGATGTAGATGAAGTTCATGTCCTGGCCGTCGACGACAGCCTCGTTGATCGGATTG
TCATCGAGAGACTGCTTCGTATTACCTCCTGCAAAGTCACGGCGGTAGACAGCGGATGGC
GTGCCCTGGAGTTTCTAGGGCTAGACAACGAGAAAGCCTCTGCAGAGCTCGATAGATTGA
AAGTTGATCTGATCATCACGGATTACTGCATGCCTGGAATGACAGGCTACGAGCTCCTCA
AGAAGATCAAGGAATCGTCCAGTTTCCGACAAGTCCCGGTTGTAATAATGTCGTCGGAGA
ATGTAATAACAAGAATCGACAGGTGCCTTGAGGAAGGTGCGGAGGATTTCTTACTCAAAC
CGGTGAAACTCGCCGACGTGAAACGCCTCAAAAACTATCTGACCAGAGACGTTAAATTTT
CGAACGGAAACAAACGGAAGCTTCCAGAAGACTCGCCGCCGTTGACTCTCTCGCCCGATT
CGTCGGTCTCTTTTCCGCCGCCGTCGACTCTCTCGCCTGATTTGTCGGACTCTTCTCCCT
CGCCGTTATCTCCCGTGGAGATCTTTTCCTCTCCGCCCTCATCTCCGATAGACGATGAAG
ACGACGATATGCTCACATCGTCGCCGGAGGAATCGCCAGTTCGACGGCAGAAGATGAGGA
GTCCCGGGTTAGATTAGTGACCTTTTCTCTGTGGGGTCCGTGCAATATCTATCTCCGTTA
ACTTTTACTTTTTTACCTTTTGACGGTGTTTTTAATTGCACGTTGACTTGATGCCGTCGA
TTTTATAGATGTCCTTCAATCTCGCTCCACGTGGGCCTTTTCTATAAGCTTTTCGACTTA
TAAGCTTTAATTAAAGGACAATGTAAGATTTATAATGAAGATTTATAATTCATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H276TF U 1
AF RR2CB49TF U 19
AF RR2CB49JQ C 315
AF RR2H276JQ C 476
BS 1 210 RR2H276TF
BS 211 211 RR2CB49TF
BS 212 346 RR2H276TF
BS 347 347 RR2CB49TF
BS 348 416 RR2H276TF
BS 417 417 RR2CB49TF
BS 418 648 RR2H276TF
BS 649 669 RR2CB49JQ
BS 670 670 RR2H276JQ
BS 671 817 RR2CB49JQ
BS 818 818 RR2H276JQ
BS 819 882 RR2CB49JQ
BS 883 883 RR2H276JQ
BS 884 976 RR2CB49JQ
BS 977 977 RR2H276JQ
BS 978 1056 RR2CB49JQ
BS 1057 1076 RR2H276JQ

RD RR2H276TF 648 0 0
GGAGGAAAAGAAAACAAACAGATGTGAACTCTCTCTTCTTCTCTCTTTGTCTTAAAACTT
TTAATATCCTCTCTCCTTTCAGTTACTACCACTACTCGTCAATGGCTAGCGACGGTGGCG
TTTCTTGTCTACGGAGGCCAGAGATGATGAACGTCGGCATCGGAGGAATGGAACATCGTC
CTTTGGATGTAGATGAAGTTCATGTCCTGGTCGTCGACGACAGCCTCGTTGATCGGATTG
TCATCGAGAGACTGCTTCGTATTACCTCCTGCAAAGTCACGGCGGTAGACAGCGGATGGC
GTGCCCTGGAGTTTCTAGGGCTAGACAACGAGAAAGCCTCTGCAGAACTCGATAGATTGA
AAGTTGATCTGATCATCACGGATTACTGCATGCCTGGAATGACAGGCTACGAGCTCATCA
AGAAGATCAAGGAATCGTCCAGTTTCCGACAAGTCCCGGTTGTAATAATGTCGTCGGAGA
ATGTAATAACAAGAATCGACAGGTGCCTTGAGGAAGGTGCGGAGGATTTCTTACTCAAAC
CGGTGAAACTCGCCGACGTGAAACGCCTCAAAAACTATCTGACCAGAGACGTTAAATTTT
CGAACGGAAACAAACGGAAGCTTCCAGAAGACTCGCCGCCGTTGACTC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2CB49TF 630 0 0
G
AGATGTGAACTCTCTCTTCTTCTCTCTTTGTCTTAAAACTTTTAATATCCTCTCTCCTTT
CAGTTACTACCACTACTCGTCAATGGCTAGCGACGGTGGCGTTTCTTGTCTACGGAGGCC
AGAGATGATGAACGTCGGCATCGGAGGAATGGAACATCGTCCTTTGGATGTAGATGAAGT
TCATGTCCTGGCCGTCGACGACAGCCTCGTTGATCGGATTGTCATCGAGAGACTGCTTCG
TATTACCTCCTGCAAAGTCACGGCGGTAGACAGCGGATGGCGTGCTCTGGAGTTTCTAGG
GCTAGACAACGAGAAAGCCTCTGCAGAGCTCGATAGATTGAAAGTTGATCTGATCATCAC
GGATTACTGCATGCCTGGAATGACAGGCTACGAGCTCCTCAAGAAGATCAAGGAATCGTC
CAGTTTCCGACAAGTCCCGGTTGTAATAATGTCGTCGGAGAATGTAATAACAAGAATCGA
CAGGTGCCTTGAGGAAGGTGCGGAGGATTTCTTACTCAAACCGGTGAAACTCGCCGACGT
GAAACGCCTCAAAAACTATCTGACCAGAGACGTTAAATTTTCGAACGGAAACAAACGGAA
GCTTCCAGAAGACTCGCCGCCGTTGACTC

QA 2 630 2 630
DS 

RD RR2CB49JQ 743 0 0
CTAGGGCTAGACAACGAGAAAGCCTCTGCAGAGCTCGATAGATTGAAAGTTGATCTGATC
ATCACGGATTACTGCATGCCTGGAATGACAGGCTACGAGCTCCTCAAGAAGATCAAGGAA
TCGTCCAGTTTCCGACAAGTCCCGGTTGTAATAATGTCGTCGGAGAATGTAATAACAAGA
ATCGACAGGTGCCTTGAGGAAGGTGCGGAGGATTTTTTACTCAAACCGGTGAAACTCGCC
GACGTGAAACGCCTCAAAAACTATTTGACCAGAGACGTTAAATTTTCGAACGGAAACAAA
CGGAAGCTTCCAGAAGACTCGCCGCCGTTGACTCTCTCGCCCGATTCGTCGGTCTTTTTT
CCGCCGCCGTCGACTCTCTCGCCTGATTTGTCGGACTCTTCTCCCTCGCCGTTATCTCCC
GTGGAGATCTTTTCCTCTCCGCCCTCATCTCCGATAGACGATGAAGACGACGATATGCTC
ACATCGTCGCCGGAGGAATCGCCGGTTCGACGGCAGAAGATGAGGAGTCCCGGGTTAGAT
TAGTGACCTTTTCTCTGTGGGGTCCGTGTAATATCTATCTCCGTTAACTTTTACTTTTTT
ACCTTTTGACGGTGTTTTTAATTGCACGTTGACTTGATGCCGTCGATTTTATAGATGTCC
TTTAATCTCGCTCCACGTGGGCCTTTTCTATAAGCTTTTCGACTTATAAGCTTTAATTAA
AGGACAATGTAAGATTTATAAT
G

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2H276JQ 601 0 0
GGAGAATGTAATAACAAGAATCGACAGGTGCCTTGAGGAAGGTGCGGAGGATTTCTTACT
CAAACCGGTGAAACTCGCCGACGTGAAACGCCTCAAAAACTATCTGACCAGAGACGTTAA
ATTTTCGAACGGAAACAAACGGAAGCTTCCAGAAGACTCGCCGCCGTTGACTCTCTCGCC
CGATTCGTCGGTCTCTTTTCCGCCGCCGTCGACTCTCTCGCCTGATTTGTCGGACTCTTC
TCCCTCGCCGTTATCTCCCGTGGAGATCTTTTCCTCTCCGCCCTCATCTCCGATAGACGA
TGAAGACGACGATATGCTCACATCGTCGCCGGAGGAATCGCCAGTTCGACGGCAGAAGAT
GAGGAGTCCCGGGTTAGATTAGTGACCTTTTCTCTGTGGGGTCCGTGCAATATCTATCTC
CGTTAACTTTTACTTTTTTACCTTTTGACGGTGTTTTTAATTGCACGTTGACTTGATGCC
GTCTATTTTATAGATGTCCTTCAATCTCGCTCCACGTGGGCCTTTTCTATAAGCTTTTCG
ACTTATAAGCTTTAATTAAAGGACAATGTAAGATTTATAATGAAGATTTATAATTCATAC
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 4

CO CL1452Contig1 816 4 19 U
GGGAACCGGCGCATCGCGGAAACAACAGAACCGGAAGTCTCGTGCCTTACTCCTGTTTGT
TTCCGACCAGAATCTCGTAACCGAAGCCAAACTCTACCGAATCTCGCCCACCACTAACCT
TGTCCTAATCGAAGTTAAGTTGGAGAAGAACAAGAAACACCAGGGGGGAATAGATCGTAG
GGAGAAGGAAGGAGGAAGATGGGAGATATTTGGGCATGGCTTATATCCTTCTTCTTCCTC
ATCGCTCTTGTCGGAATCATCGTCTACCAGCTTGTTTGCTTAGCGGATCTTGAATTTGAT
TACATAAACCCTTACGACTCTGCATCGAGGATAAACTCCGTGGTTTTACCGGAGTT*CAT
TGTACAAGGAGTTCTATGTGTATTCTATCTCTTGACAGGACACTGGTTCATGGCAATCCT
ATGCCTTCCTTATCTCTACTACAACTTCCAACTATACTCGAAGCGACAACACTTGGTAGA
TGTGACAGAGATCTTCAATTTGCTTAACTGGGAAGAGAAGAAACGGCTGTTCAAGCTTGC
TTACATAGTCCTTAACCTCTTTCTCACTATCTTCTGGATGATTTATTCAGCACTGGATGA
TCATGATGACTGATTGACAAGACGCTGTTCATTATTTCGGTCTCTTTCCATCTGATCAAA
CACCCATGGTCGAGGACATGAAATGAACAAAGTGTTTGTTGTTGTTGATACCAGTTTGGT
GTTTGTAAGAATAGTGCCAGAAAGATTTGTGTATTTCTTTTTTTTTTTCTTTTAGAAACA
TTTTTTTCAGACAAGAAGTCGGAAGTTCAAAGTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU19TF U 1
AF RR2BR80TF U 102
AF RR2DT06TF U 153
AF RR2BR80JQ C 102
BS 1 142 RR2GU19TF
BS 143 143 RR2BR80TF
BS 144 159 RR2GU19TF
BS 160 160 RR2BR80TF
BS 161 163 RR2GU19TF
BS 164 164 RR2BR80TF
BS 165 167 RR2GU19TF
BS 168 168 RR2BR80TF
BS 169 415 RR2GU19TF
BS 416 416 RR2BR80TF
BS 417 426 RR2GU19TF
BS 427 427 RR2BR80TF
BS 428 514 RR2GU19TF
BS 515 515 RR2BR80TF
BS 516 546 RR2GU19TF
BS 547 547 RR2BR80TF
BS 548 633 RR2GU19TF
BS 634 767 RR2BR80TF
BS 768 816 RR2BR80JQ

RD RR2GU19TF 637 0 0
GGGAACCGGCGCATCGCGGAAACAACAGAACCGGAAGTCTCGTGCCTTACTCCTGTTTGT
TTCCGACCAGAATCTCGTAACCGAAGCCAAACTCTACCGAATCTCGCCCACCACTAACCT
TGTCCTAATCGAAGTTAAGTTGAAGAAGAACAAGAAACAGCAGAGGG*AATAGATCGTAG
GGAGAAGGAAGGAGGAAGATGGGAGATATTTGGGCATGGCTTATATCCTTCTTCTTCCTC
ATCGCTCTTGTCGGAATCATCGTCTACCAGCTTGTTTGCTTAGCGGATCTTGAATTTGAT
TACATAAACCCTTACGACTCTGCATCGAGGATAAACTCCGTGGTTTTACCGGAGTT*CAT
TGTACAAGGAGTTCTATGTGTATTCTATCTCTTGACAGGACACTGGTTCATGGCACTCCT
ATGCCTCCCTTATCTCTACTACAACTTCCAACTATACTCGAAGCGACAACACTTGGTAGA
TGTGACAGAGATCTTCAATTTGCTTAACTGGGAAAAGAAGAAACGGCTGTTCAAGCTTGC
TTACATTGTCCTTAACCTCTTTCTCACTATCTTCTGGATGATTTATTCAGCACTGGATGA
TCATGATGACTGATTGACAAGACGCTGTTCATT
TTTT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2BR80TF 672 0 0
GGGCCCACTACTAACTTG
TTGTCCTAATCGAAGTTAAGTTGGAGAAGAACAAGAAACACCAGGGGGGAATAGATCGTA
GGGAGAAGGAAGGAGGAAGATGGGAGATATTTGGGCATGGCTTATATCCTTCTTCTTCCT
CATCGCTCTTGTCGGAATCATCGTCTACCAGCTTGTTTGCTTAGCGGATCTTGAATTTGA
TTACATAAACCCTTACGACTCTGCATCGAGGATAAACTCCGTGGTTTTACCGGAGTT*CA
TTGTACAAGGAGTTCTATGTGTATTCTATCTCTTGACAGGACACTGGTTCATGGCAATCC
TATGCCTTCCTTATCTCTACTACAACTTCCAACTATACTCGAAGCGACAACACTTGGTAG
ATGTGACAGAGATCTTCAATTTGCTTAACTGGGAAGAGAAGAAACGGCTGTTCAAGCTTG
CTTACATAGTCCTTAACCTCTTTCTCACTATCTTCTGGATGATTTATTCAGCACTGGATG
ATCATGATGACTGATTGACAAGACGCTGTTCATTATTTCGGTCTCTTTCCATCTGATCAA
ACACCCATGGTCGAGGACATGAAATGAACAAAGTGTTTGTTGTTGTTGATACCAGTTTGG
TGTTTGTAAGAATAGTGCCAGAAAGATTTGTGTATTTCTTTTTTTTTT
TCTTTT

QA 19 666 19 666
DS 

RD RR2DT06TF 606 0 0
AGAAACACCAGGG
GGGAATAGATCGTAGGGAGAAGGAAGGAGGAAGATGGGAGATATCTGGGCATGGCTTATA
TCCTTCTTCTTCCTCATCGCTCTTGTCGGAATCATCGTCTACCGGCTTGTTTGCTTAGCG
GATCTTGAATTTGATTACATAAACCCTTACGACTCTGCATCGAGGATAAACTCCGTGGTT
TTACCGGGGTTTCATTGTACAAGGAGTTCTATGTGTATTCTATCTCTTGACAGGACACTG
GTTCATGGCAATCCTATGCCTTCCTTATCTCTACTACAACTTCCAACTATACTCGAAGCG
ACAACACTTGGTAGATGTGACAGAGATCTTCAATTTGCTTAACTGGGAAAAGAAGAAACG
GCTGTTCAAGCTTGCTTACATAGTCCTTAACCTCTTTCTCACTATCTTCTGGATGATTTA
TTCAGCACTGGATGATCATGATGACTGATTGACAAGACGCTGTTCATTATTTCGGTCTCT
TTCCATCTGATCAAACACCCATGGTCGAGGACATGAAATGAACAAAGTGTTTGTTGTTGT
TGATACCAGTTTGGTGTTTGTAAGAATAGTGCCAGAAAGATTTGTGTATTTCT

QA 14 606 14 606
DS 

RD RR2BR80JQ 715 0 0
GGGCCCACTACTAACTTG
TTGTCCTAATCGAAGTTAAGTTGGAGAAGAACAAGAAACACCAGGGGGGAATAGATCGTA
GGGAGAAGGAAGGAGGAAGATGGGAGATATTTGGGCATGGCTTATATCCTTCTTCTTCCT
CATCGCTCTTGTCGGAATCATCGTCTACCAGCTTGTTTGCTTAGCGGATCTTGAATTTGA
TTACATAAACCCTTACGACTCTGCATCGAGGATAAACTCCGTGGTTTTACCGGAGTT*CA
TTGTACAAGGAGTTCTATGTGTATTCTATCTCTTGACAGGACACTGGTTCATGGCAATCC
TATGCCTTCCTTATCTTTACTACAACTTCCAACTATACTCGAAGCGACAACACTTGGTAG
ATGTGACAGAGATCTTCAATTTGCTTAACTGGGAAGAGAAGAAACGGCTGTTCAAGCTTG
CTTACATAGTCCTTAACCTCTTTCTCACTATTTTCTGGATGATTTATTCAGCACTGGATG
ATCATGATGACTGATTGACAAGACGCTGTTCATTATTTCGGTCTCTTTCCATCTGATCAA
ACACCCATGGTCGAGGACATGAAATGAACAAAGTGTTTGTTGTTGTTGATACCAGTTTGG
TGTTTGTAAGAATAGTGCCAGAAAGATTTGTGTATTTCTTTTTTTTTTTCTTTTAGAAAC
ATTTTTTTCAGACAAGAAGTCGGAAGTTCAAAGTGCT

QA 19 715 19 715
DS 



AS 1 6

CO CL1453Contig1 1278 6 14 U
TTCTCTTCATCTCATCTGCCTCTTCAAGTTCCTTCATACGGCAATACACTGATGACATCA
ACACAAACTTTCAACAGGAGAATGGAGCAGTACCAGACGCAATCCAGGGAGAAGCGCATT
ACTTACGTAAACATGATCAAGAGATCTCGTCACGTGACTATAAAGTCTCAGCTTCAAACA
CAGTTAAGGGTCTAAGAGATCGTCCTCCATCTTCTTACTCTTTGAAGATGGAGTCTTTTA
ACACGCTCCTCAAGTCAACCTACGCAGACAAATATGTTTCACGTCCTTTCTCGGCTGCTG
GATATAAGTGGACACTTGTTGTGTACCCGAACGGGAACAAGAATGATAATGGTGCAGGGT
TCCTTTCGCTTTACGTAGCCATAGACAACTCAACTCTCTCTCCACACCAAGAGGTTTACG
TGGATCTCAGGTTTTACGTCTTCAACAGGGTAGAGAAGAAGTACTTCACGATCCAAGATA
CCGATGGATGGAGGTTTAGTTATTTCAAAACGATGTGGGGGTTCTCTCAGGTTCTACCTG
TTAATACATTTAAAGACTCGAACAACGGATACCTCTACGATGGAGATCACTGCGAGTTTG
GTGTTGATGTGACCACTCCCACTGTCTTTAAAGAATCCGAACTTTTCACTGTTACTGACA
AGTTCTATAACGCGAAGTACACATGGAATATTCTGAAGTTCTCCACCTTGGTCAAAGATA
GTGAGCTCTCTGATGTGTTCTCCATCGGAGGAAGAAGATGGAATATAAAAGTGTATCCGG
GTGGTTCTGCCACGGGGAAGGGAAAAGCTGTGTCCATCTACCTAATCCTTAATGAGAACG
AGAAATTCAGACCCTATGAGAAAATTTATGTTGGAGCCAAGCTTCGAGTTCTTAACCAAC
GCAACCTCAATAACATCGAAAAGACAATTGATAATTGGTACAATGGTCCGGGATATGGAG
ATGAATCTGGTTGGGGTTATCATGAATTTATCCCATTCTCTGATCTCAAAGATTCATCAA
AGGGTTTTCTTGTGAATGATGTGTTGATGATTCAAGTCGAAATTGAAGCCATTTCTTCAA
CCAAGTACTTCCCTAGTTAGATTTTCTCTAACCATGGATGGAACTTGCAACTTCATGTGT
GTTTGCTTTGTCATAAAAACCACCTAAAATAATATGTTTGTGTAAGTTTGTATTCTCAGC
ATGTATGCTTTTTAAATATTAATTGTGTTCATGGAAAGATCGTGTAATATTAAATAAACA
GTGGTGACAACAAGAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H206TF U 1
AF RR2AB09TF U 105
AF RR2CM11TF U 447
AF RR2H206JQ C 478
AF RR2CM11JQ C 650
AF RR2AB09JQ C 499
BS 1 137 RR2H206TF
BS 138 138 RR2AB09TF
BS 139 331 RR2H206TF
BS 332 332 RR2AB09TF
BS 333 699 RR2H206TF
BS 700 700 RR2AB09TF
BS 701 715 RR2H206TF
BS 716 716 RR2AB09TF
BS 717 739 RR2H206TF
BS 740 774 RR2AB09TF
BS 775 1089 RR2CM11TF
BS 1090 1230 RR2H206JQ
BS 1231 1231 RR2CM11JQ
BS 1232 1278 RR2H206JQ

RD RR2H206TF 739 0 0
TTCTCTTCATCTCATCTGCCTCTTCAAGTTCCTTCATACGGCAATACACTGATGACATCA
ACACAAACTTTCAACAGGAGAATGGAGCAGTACCAGACGCAATCCAGGGAGAAGCGCATT
ACTTACGTAAACATGAT*AAGAGATCTCGTCACGTGACTATAAAGTCTCAGCTTCAAACA
CAGTTAAGGGTCTAAGAGATCGTCCTCCATCTTCTTACTCTTTGAAGATGGAGTCTTTTA
ACACGCTCCTCAAGTCAACCTACGCAGACAAATATGTTTCACGTCCTTTCTCGGCTGCTG
GATATAAGTGGACACTTGTTGTGTACCCGAATGGGAACAAGAATGATAATGGTGCAGGGT
TCCTTTCGCTTTACGTAGCCATAGACAACTCAACTCTCTCTCCACACCAAGAGGTTTACG
TGGATCTCAGGTTTTACGTCTTCAACAGGGTAGAGAAGAAGTACTTCACGATCCAAGATA
CCGATGGATGGAGGTTTAGTTATTTCAAAACGATGTGGGGGTTCTCTCAGGTTCTACCTG
TTAATACATTTAAAGACTCGAACAACGGATACCTCTACGATGGAGATCACTGCGAGTTTG
GTGTTGATGTGACCACTCCCACTGTCTTTAAAGAATCCGAACTTTTCACTGTTACTGACA
AGTTCTATAACGCGAAGTACACATGGAATATTCTGAAGT*CTCCACCTTGGTCAA*GATA
GTGAGCTCTCTGATGTGTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2AB09TF 670 0 0
G
AGGGAGAAGCGCATTACTTACGTAAACATGATCAAGAGATCTCGTCACGTGACTATAAAG
TCTCAGCTTCAAACACAGTTAAGGGTCTAAGAGATCGTCCTCCATCTTCTTACTCTTTGA
AGATGGAGTCTTTTAACACGCTCCTCAAGTCAACCTACGCAGACAAATATGTTTCACGTC
CTTTCTCGGCTGCTGGATATAAGTGGACACTTGTTGTGTACCCGAACGGGAACAAGAATG
ATAATGGTGCAGGGTTCCTTTCGCTTTACGTAGCCATAGACAACTCAACTCTCTCTCCAC
ACCAAGAGGTTTACGTGGATCTCAGGTTTTACGTCTTCAACAGGGTAGAGAAGAAGTACT
TCACGATCCAAGATACCGATGGATGGAGGTTTAGTTATTTCAAAACGATGTGGGGGTTCT
CTCAGGTTCTACCTGTTAATACATTTAAAGACTCGAACAATGGATACCTCTACGATGGAG
ATCACTGCGAGTTTGGTGTTGATGTGACCACTCCCACTGTCTTTAAAGAATCCGAACTTT
TCACTGTTATTGACAAGTTCTATAACGCGAAGTACACATGGAATATTCTGAAGTTCTCCA
CCTTGGTCAAAGATAGTGAGCTCTCTGATGTGTTCTCCATCGGAGGAAGAAGATGGAATA
TAAAAGTGT

QA 2 670 2 670
DS 

RD RR2CM11TF 643 0 0
G
GGGTAGAGAAGAAGTACTTCACGATCCAAGATACCGATGGATGGAGGTTTAGTTATTTCA
AAACGATGTGGGGGTTCTCTCAGGTTCTACCTGTTAATACTTTTAAAGACTCGAACAACG
GATACCTCTACGATGGAGATCACTGCGAGTTTGGTGTTGATGTGACCACTCCCACTGTCT
TTAAAGAATCCGAACTTTTCACTGTTACTGACAAGTTCTATAACGCGAAGTACACATGGA
ATATTCTGAAGTTCTCCACCTTGGTCAAAGATAGTGAGCTCTCTGATGTGTTCTCCATCG
GAGGAAGAAGATGGAATATAAAAGTGTATCCGGGTGGTTCTGCCACGGGGAAGGGAAAAG
CTGTGTCCATCTACCTAATCCTTAATGAGAACGAGAAATTCAGACCCTATGAGAAAATTT
ATGTTGGAGCCAAGCTTCGAGTTCTTAACCAACGCAACCTCAATAACATCGAAAAGACAA
TTGATAATTGGTACAATGGTCCGGGATATGGAGATGAATCTGGTTGGGGTTATCATGAAT
TTATCCCATTCTCTGATCTCAAAGATTCATCAAAGGGTTTTCTTGTGAATGATGTGTTGA
TGATTCAAGTCGAAATTGAAGCCATTTCTTCAACCAAGTACT

QA 2 643 2 643
DS 

RD RR2H206JQ 801 0 0
ATACCGATGGATGGAGGTTTAGTTATTTCAAAACGATGTGGGGGTTCTCTCAGGTTCTAC
CTGTTAATACATTTAAAGACTCGAACAACGGATACCTCTACGATGGAGATCACTGCGAGT
TTGGTGTTGATGTGACCACTCCCACTGTCTTTAAAGAATCCGAACTTTTCACTGTTACTG
ACAAGTTCTATAACGCGAAGTACACATGGAATATTCTGAAGTTCTCCACCTTGGTCAAAG
ATAGTGAGCTCTCTGATGTGTTCTCCATCGGAGGAAGAAGATGGAATATAAAAGTGTATC
CGGGTGGTTCTGCCACGGGGAAGGGAAAAGCTGTGTCCATCTACCTAATCCTTAATGAGA
ACGAGAAATTCAGACCCTATGAGAAAATTTATGTTGGAGCCAAGCTTCGAGTTCTTAACC
AACGCAACCTCAATAACATCGAAAAGACAATTGATAATTGTTACAATGGTCCGGGATATG
GAGATGAATCTGGTTGGGGTTATCATGAATTTATCCCATTCGCTGATCTCAAAGATTCAT
CAAAGGGTTTTCTTGTGAATGATGTGTTGATGGTTCAAGTCGAAATTGAAGCCATTTCTT
CAACTAAGTACTTCCCTAGTTAGATTTTCTCTAACCATGGATGGAACTTGCAACTTCATG
TGTGTTTGCTTTGTCATAAAAACCACCTAAAATAATATGTTTGTGTAAGTTTGTATTCTC
AGCATGTATGCTTTTTAAATATTAATTGTGTTCCTGGAAAGATCGTGTAATATTAAATAA
ACAGTGGTGACAACAAGAACT

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2CM11JQ 628 0 0
TGTTACTGACAAGTTCTATAACGCGAAGTACACATGGAATATTTTGAAGTTCTCCACCTT
GGTCAAAGATAGTGAGCTCTTTGATGTGTTCTCCATCGGAGGAAGAAGATGGAATATAAA
AGTGTATCCGGGTGGTTCTGCCACGGGGAAGGGAAAAGCTGTGTCCATCTACCTAATCCT
TAATGAGAACGAGAAATTCAGACCCTATGAGAAAATTTATGTTGGAGCCAAGCTTCGAGT
TCTTAACCAACGCAACCTCAATAACATCGAAAAGACAATTGATAATTGGTACAATGGTCC
GGGATATGGAGATGAATCTGGTTGGGGTTATCATGAATTTATCCCATTCTCTGATCTCAA
AGATTCATCAAAGGGTTTTCTTGTGAATGATGTGTTGATGATTCAAGTCGAAATTGAAGC
CATTTCTTCAACCAAGTACTTCCCTAGTTAGATTTTCTCTAACCATGGATGGAACTTGCA
ACTTCATGTGTGTTTGCTTTGTCATAAAAACCACCTAAAATAATATGTTTGTGTAAGTTT
GTATTCTCAGCATGTATGCTTTTTAAATATTAATTGTGTTCATGGAAAGATCGTGTAATA
TTAAATAAACAGTGGTGACAAC
AAGAGG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2AB09JQ 773 0 0
GTTATTTCAAAACGATGTGGGGGTTCTCTCAGGTTCTACCTGTTAATACATTTAAAGACT
CGAACAATGGATACCTCTACGATGGAGATCACTGCGAGTTTGGTGTTGATGTGACCACTC
CCACTGTCTTTAAAGAATCCGAACTTTTCACTGTTATTGACAAGTTCTATAACGCGAAGT
ACACATGGAATATTCTGAAGTTCTCCACCTTGGTCAAAGATAGTGAGCTCTCTGATGTGT
TCTCCATCGGAGGAAGAAGATGGAATATAAAAGTGTATCCGGGTGGTTCTGCCACGGGGA
AGGGAAAAGCTGTGTCCATCTACCTAATCCTTAATGCGAACGAGAAATTCAGACCCTATG
AGAAAATTTATGTTGGAGCCAAGCTTCGAGTTCTTAACCAACGCAACCTCAATAACGTCG
AAAAGACAATTGATAATTGGTACAATGGTCCGGGATATGGAGATGAATCTGGTTGGGGTT
ATCATGAATTTATCCCATTCT*TGATCTCAAGGATTCATCAAAGGGTTTTCTTGCGAATG
ATGTGTTGATGGTTCAAGTCGAAATTGAAGCCATTTCTTCAACCAAGTACTTCCCTAGTT
AGATTTTCTCTAACCATGGATGGAACTTGCAACTTCATGTGTGTTTGCTTTGTCATAAAA
ACCACCTAAAATAATATGTTTGT*TAAGTTTGTATTCTCAGCATGTATGCTTTTTAAATA
TTAATTGTGTTCATGGAAAGATCGTGTAATATTAAATAAACAGTGGTGACAAC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 5

CO CL1454Contig1 886 5 7 U
CATACCCAACTAGTTACTCAAGGATTCTCTCAAAAGTCAAAAGGAATCGTTCAACAACGC
GAAGACAATACATCTAAAATTTTTTGTCTTAAGAAAATACATAGATTACAACCAAAATTA
AAGGGTTACTAAACAATCACCTGAGTATTAAATTATCCTTCATTGCACGCTTTGACAAAA
GAATAGAGAATCCAAGGCAAGATCAATAAACACTAAGTAGATATAAATCTCTAGGGCGAG
TTATTACATTTGATGATGAGTTTGCTTGCACCTATCTTCTAAACCGACATATTTCCATTT
GTGGTGACAAGAGTGAAGGCTCTGTCCCAATCTTGGCTAACAGATTCTTGAATCTTGTAG
TCCCCAATGAAAGGACACCAAGCCTCTTCTACGCCGTTTGTCCCTGACCAAATGACCTTC
TCCGGAACATTCAGAAAATCAAAGTCCAACGGCTTTGGTGGTGGGGGTGGTGGCTGCTCG
TTAGCCTTTTTGTTGGGTTGGGCCAGCCGCTTATAGCTTCCTCGGTCTTCAGAACGTTGT
GATTTGGTATTACTGTTACTGTTGCTAACCGTATTCTTGTTTTTCTTTTTAGGAGTTCCG
TGTTCCAAGTAGTACATCACCTCGGTCCTTGACCGGAACTTACGATTTGTAACAGGTTCG
TAGTAGAACTTATCCACCAAACCAGCTTTTGTACCGGATGTTCGAACCTTTTCTTCGGTT
GTCCAACCAGGAGGCGGCGCCCAGTTATCCCCCGGAGATGAACGCTTCTTCGGCCTTGAT
TCCACCAGAAGACCCGTCTTTTCCGCCGGTGGTTGCGCCTGATCCGTGCCGTTCGACATC
CTGGAGCAATCCACTCTAGGTTTCCGTTAGCAGCAGGTCGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU30JQ U 1
AF RR2AK37JQ U 106
AF RR2DJ49JQ U 150
AF RR2AK37TF C 162
AF RR2DJ49TF C 164
BS 1 466 RR2BU30JQ
BS 467 661 RR2AK37JQ
BS 662 702 RR2DJ49JQ
BS 703 760 RR2AK37TF
BS 761 761 RR2DJ49TF
BS 762 879 RR2AK37TF
BS 880 886 RR2DJ49TF

RD RR2BU30JQ 466 0 0
CATACCCAACTAGTTACTCAAGGATTCTCTCAAAAGTCAAAAGGAATCGTTCAACAACGC
GAAGACAATACATCTAAAATTTTTTGTCTTAAGAAAATACATAGATTACAACCAAAATTA
AAGGGTTACTAAACAATCACCTGAGTATTAAATTATCCTTCATTGCACGCTTTGACAAAA
GAATAGAGAATCCAAGGCAAGATCAATAAACACTAAGTAGATATAAATCTCTAGGGCGAG
TTATTACATTTGATGATGAGTTTGCTTGCACCTATCTTCTAAACCGACATATTTCCATTT
GTGGTGACAAGAGTGAAGGCTCTGTCCCAATCTTGGCTAACAGATTCTTGAATCTTGTAG
TCCCCAATGAAAGGACACCAAGCCTCTTCTACGCCGTTTGTCCCTGACCAAATGACCTTC
TCCGGAACATTCAGAAAATCAAAGTCCAACGGCTTTGGTGGTGGGG

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR2AK37JQ 556 0 0
TTACAACCAAAATTAAAGGGTTACTAAACAATCACCTGAGTATTAAATTATCCTTCATTG
CACGCTTTGACAAAAGAATAAAGAATCCAAGGCAAGATCAATAAACACTAAGTAGATATA
AATCTCTAGGGCGAGTTATTACATTTGATGATGAGTTTGCTTGCACCTATCTTCTAAACC
GACATATTTCCATTTGTGGTGACAAGAGTGAAGGCTCTGTCCCAATCTTGGCTAACAGAT
TCTTGAATCTTGTAGTCCCCAATGAAAGGACACCAAGCCTCTTCTACGCCGTTTGTCCAT
GACCAAGTGACCTTCTCCGGAACATTCAAAAAATCAAAGTCCAACGGCTTTGGTGGTGGG
GGTGGTGGCTGCTCGTTAGCCTTTTTGTTGGGTTGGGCCAGCCGCTTATAGCTTCCTCGG
TCTTCAGAACGTTGTGATTTGGTATTACTGTTACTGTTGCTAACCGTATTCTTGTTTTTC
TTTTTAGGAGTTCCGTGTTCCAAGTAGTACATCACCTCGGTCCTTGACCGGAACTTACGA
TTTGTAACAGGTTCGT

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2DJ49JQ 553 0 0
AAATTATCCTTCAT
TGCACGCTTTGACAAAAGAATAAAGAATCCAAGGCAAGATCAATAAACACTAAGTAGATA
TAAATCTCTAGGGCGAGTTATTACATTTGATGATGAGTTTGCTTGCACCTATCTTCTAAA
CCGACATATTTCCATTTGTGGTGGCAAGAGTGAAGGCTCTGTCCCAATCTTGGCTAACAG
ATTCTTGAATCTTGTAGTCCCCAATGAAAGGACACCAAGCCTCTTCTACGCCGTTTGTCC
CTGACCAAATGACCTTCTCCGGAACATTCAGAAAATCAAAGTCCAACGGCTTTGGTGGTG
GGGGTGGTGGCTGCTCGTTAGCCTTTTTGTTGGGTTGGGCCAGCCGCTTATAGCTTCCTC
GGTCTTCAGAACGTTGTGATTTGGTATTACTGTTACTGTTGCTAACCGTATTCTTGTTTT
TCTTTTTAGGAGTTCCGTGTTCCAAGTAGTACATCACCTCGGTCCTTGACCGGAACTTAC
GATTTGTAACAGGTTCGTAGTAGAACTTATCCACCAAACCAGCTTTTGTACCGGATGTT

QA 15 553 15 553
DS 

RD RR2AK37TF 720 0 0
ATTGCACGCTTTGACAAAAGAATAGAGAATCCAAGGCAAGATCAATAAACACTAAGTAGA
TATAAATCTCTAGGGCGAGTTATTACATTTGATGATGAGTTTGCTTGCACCTATCTTCTA
AACCGACATATTTCCATTTGTGGTGACAAGAGTGAAGGCTCTGTCCCAATCTTGGCTAAC
AGATTCTTGAATCTTGTAGTCCCCAATGAAAGGACACCAAGCCTCTTCTACGCCGTTTGT
CCATGACCAAGTGACCTTCTCCGGAACATTCAGAAAATCAAAGTCCAACGGCTTTGGTGG
TGGGGGTGGTGGCTGCTCGTTAGCCTTTTTGTTGGGTTGGGCCAGCCGCTTATAGCTTCC
TCGGTCTTCAGAACGTTGTGATTTGGTATTACTGTTACTGTTGCTAACCGTATTCTTGTT
TTTCTTTTTAGGAGTTCCGTGTTCCAAGTAGTACATCACCTCGGTCCTTGACCGGAACTT
ACGATTTGTAACAGGTTCGTAGTAGAACTTATCCACCAAACCAGCTTTTGTACCGGATGT
TCGAACCTTTTCTTCGGTTGTCCAACCAGGAGGCGGCGCCCAGTTATCCCCCGGAGATGC
ACGCTTCTTCGGCCTTGATTCCACCAGAAGACCCGTCTTTTCCGCCGGTGGTTGCGCCTG
ATCCGTGCCGTTCGACATCCTGGAGCAATCCACTCTAGGTTTCCGTTAGCAGCAGGTC
CC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2DJ49TF 723 0 0
TGCACGCTTTGACAAAAGAATAGAGAATCCAAGGCAAGATCAATAAACACTAAGTAGATA
TAAATCTCTAGGGCGAGTTATTACATTTGATGATGAGTTTGCTTGCACCTATCTTCTAAA
CCGACATATTTCCATTTGTGGTGGCAAGAGTGAAGGCTCTGTCCCAATCTTGGCTAACAG
ATTCTTGAATCTTGTAGTCCCCAATGAAAGGACACCAAGCCTCTTCTACGCCGTTTGTCC
CTGACCAAATGACCTTCTCCGGAACATTCAGAAAATCAAAGTCCAACGGCTTTGGTGGTG
GGGGTGGTGGCTGCTCGTTAGCCTTTTTGTTGGGTTGGGCCAGCCGCTTATAGCTTCCTC
GGTCTTCAGAACGTTGTGATTTGGTATTACTGTTACTGTTGCTAACCGTATTCTTGTTTT
TCTTTTTAGGAGTTCCGTGTTCCAAGTAGTACATCACCTCGGTCCTTGACCGGAACTTAC
GATTTGTAACAGGTTCGTAGTAGAACTTATCCACCAAACCAGCTTTTGTACCGGATGTTC
GAACCTTTTCTTCGGTTGTCCAACCAGGAGGCGGCGCCCAGTTATCCCCCGGAGATGAAC
GCTTCTTCGGCCTTGATTCCACCAGAAGACCCGTCTTTTCCGCCGGTGGTTGCGCCTGAT
CCGTGCCGTTCGACATCCTGGAGCAATCCACTCTAGGTTTCCGTTAGCAGCAGGTCGATC
TCC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 2 6

CO CL1455Contig1 724 2 2 U
GGGACCAAAAAAAAACAAAACAAAGAAGCTCTGTTCCTCGTTGCAGCGAAAGCTCTTACC
AACAACAAGACGATGATTATATCAGAGACCAACCGCAGAGAGATCTGCAAGTACCTCTTC
AAAGAAGGAGTATTGTTTGCCAAGAAGGACTTCAACCTCGCAAAGCATCCGTTGATCGAG
TCAGTGCCAAACTTGCAAGTGATCAAGCTCATGCAGAGTTTCAAATCCAAGGAGTACGTT
AGGGAGACATTCGCCTGGATGCATTATTATTGGTTTTTGACCAATGAAGGCATTGAGTTT
TTGAGAACTTATCTTAACCTTCCGTCTGATGTTGTACCTGCGACTTTGAAGAAGTCTGCT
AAGCCCATTGGTCGTCCTTTTGGTGGCCCACCTGGTGATCGCCCAAGAGGACCACCTCGT
TTTGAGGGAGACCGTCCAAGATATGGTGAACGTGATGGGTACCGTGGAGGGCCACGTGGT
GGTGATGTTGGAGGTGAAAAGGGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCCTCTTTCCAAGGA
AGTGGTGGTAGGCCTGGATTTGGCCGTGGTGCAGGTGGTTACAGCGCAGCAGCACCATCT
GGTTTTGGTTTACCTTGAAAGAATTGTTGTTATCGTTAAGGAATGGAAAGACTGTTTTTG
TTTTTCGCTTTAGTTTTGTTTTTGTAATCCAAATCCGGAATCTATAATTTATCTATTTCT
CACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2EB82TF U 1
AF RR2EB82JQ C 3
BS 1 466 RR2EB82TF
BS 467 724 RR2EB82JQ

RD RR2EB82TF 467 0 0
GGGACCAAAAAAAAACAAAACAAAGAAGCTCTGTTCCTCGTTGCAGCGAAAGCTCTTACC
AACAACAAGACGATGATTATATCAGAGACCAACCGCAGAGAGATCTGCAAGTACCTCTTC
AAAGAAGGAGTATTGTTTGCCAAGAAGGACTTCAACCTCGCAAAGCATCCGTTGATCGAG
TCAGTGCCAAACTTGCAAGTGATCAAGCTCATGCAGAGTTTCAAATCCAAGGAGTACGTT
AGGGAGACATTCGCCTGGATGCATTATTATTGGTTTTTGACCAATGAAGGCATTGAGTTT
TTGAGAACTTATCTTAACCTTCCGTCTGATGTTGTACCTGCGACTTTGAAGAAGTCTGCT
AAGCCCATTGGTCGTCCTTTTGGTGGCCCACCTGGTGATCGCCCAAGAGGACCACCTCGT
TTTGAGGGAGACCGTCCAAGATATGGTGAACGTGATGGGTACCGTG
G

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR2EB82JQ 722 0 0
GACCA
AAAAAAAACAAAACAAAGAAGCTCTGTTCCTCGTTGCAGCGAAAGCTCTTACCAACAACA
AGACGATGATTATATCAGAGACCAACCGCAGAGAGATCTGCAAGTACCTCTTCAAAGAAG
GAGTATTGTTTGCCAAGAAGGACTTCAACCTCGCAAAGCATCCGTTGATCGAGTCAGTGC
CAAACTTGCAAGTGATCAAGCTCATGCAGAGTTTCAAATCCAAGGAGTACGTTAGGGAGA
CATTCGCCTGGATGCATTATTATTGGTTTTTGACCAATGAAGGCATTGAGTTTTTGAGAA
CTTATCTTAACCTTCCGTCTGATGTTGTACCTGCGACTTTGAAGAAGTCTGCTAAGCCCA
TTGGTCGTCCTTTTGGTGGCCCACCTGGTGATCGCCCAAGAGGACCACCTCGTTTTGAGG
GAGACCGTCCAAGATATGGTGAACGTGATGGGTACCGTGGAGGGCCACGTGGTGGTGATG
TTGGAGGTGAAAAGGGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCCTCTTTCCAAGGAAGTGGTG
GTAGGCCTGGATTTGGCCGTGGTGCAGGTGGTTACAGCGCAGCAGCACCATCTGGTTTTG
GTTTACCTTGAAAGAATTGTTGTTATCGTTAAGGAATGGAAAGACTGTTTTTGTTTTTCG
CTTTAGTTTTGTTTTTGTAATCCAAATCCGGAATCTATAATTTATCTATTTCTCACT

QA 6 722 6 722
DS 



CO CL1455Contig2 805 4 19 U
ACTCATGTCAGAAAATAGTAAGAAAAACGTGGAATTTAACACTGACACTGGAAACTTATA
GGATTTGTTTCTTTAAACCAAAAGTCAGAGAAATAGATAGATTATAAATTCCGGATTTGG
ATTACAAAAA*CAAAACTAAAGCCAAAACTGAAAACTGTCTTTCAATTGCTTAACGATAA
GCACAGCTCTTTCAGGGTAAACCGGAACCAGATGGAGCTGCAGCGCTGTAACCACCTGCA
CCACGGCCAAATCCAGGCCTACCACCACTTCCTTGGAAAGAAGGCTGGTAATCAGCAGGA
GCTCCACCCTTTTCACCTCCAACATCACCACCACGTGGCCCTGCACGGTACCCATCACGT
TCACCATATCTTGGACGGTCTCCCTCAAAACGAGGTGGTCCTCTTGGGCGATCACCAGGT
GGGCCACCAAAAGGACGGCCAATGGGCTTAGCAAACTTCTTCAATGTCGCAGGAACAACA
TCAGACGGAAGGTTAAGATAAGTTCTCAAAAACTCAATGCCTTCGTTGGTCAAAAACCAA
TAATAGTGCATCCAAGCGAACGTCTCCCTAACGTACTCCTTGGACTTGAAACTCTGCATG
AGCTTGATCACTTGCAAGTTTGGCACTGACTCAATCAACGGATGCTTTGCGAGGTTGAAA
TCCTTCTTCGCAAACAATACTCCTTCTTTGAAAAGGTACTTGCAGATCTCTCTGCGGTTG
GTCTCTGAGATAATCATCGTCTTGTCGGTAGGAGCTTTCGCTGCAACGAGGAACAGAGCT
TCTTTGTTTTGTTTTTTTTGGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG83JQ U 1
AF RR2EV69JQ U 86
AF RR2EA33TF C 115
AF RR2EV69TF C 209
BS 1 130 RR2EG83JQ
BS 131 131 RR2EV69JQ
BS 132 359 RR2EG83JQ
BS 360 360 RR2EV69JQ
BS 361 365 RR2EG83JQ
BS 366 366 RR2EV69JQ
BS 367 371 RR2EG83JQ
BS 372 372 RR2EV69JQ
BS 373 464 RR2EG83JQ
BS 465 465 RR2EV69JQ
BS 466 539 RR2EG83JQ
BS 540 540 RR2EV69JQ
BS 541 554 RR2EG83JQ
BS 555 555 RR2EV69JQ
BS 556 623 RR2EG83JQ
BS 624 624 RR2EV69JQ
BS 625 685 RR2EG83JQ
BS 686 743 RR2EV69JQ
BS 744 805 RR2EA33TF

RD RR2EG83JQ 695 0 0
ACTCATGTCAGAAAATAGTAAGAAAAACGTGGAATTTAACACTGACACTGGAAACTTATA
GGATTTGTTTCTTTAAACCAAAAGTCAGAGAAATAGATAGATTATAAATTCCGGATTTGG
ATTACAAAAAACAAAACTAAAGCCAAAACTGAAAACTGTCTTTCAATTGCTTAACGATAA
GCACAGCTCTTTCAGGGTAAACCGGAACCAGATGGAGCTGCAGCGCTGTAACCACCTGCA
CCACGGCCAAATCCAGGCCTACCACCACTTCCTTGGAAAGAAGGCTGGTAATCAGCAGGA
GCTCCACCCTTTTCACCTCCAACATCACCACCACGTGGCCCTGCACGGTACCCATCACGG
TCACCGTATCTGGGACGGTCTCCCTCAAAACGAGGTGGTCCTCTTGGGCGATCACCAGGT
GGGCCACCAAAAGGACGGCCAATGGGCTTAGCAAACTTCTTCAAGGTCGCAGGAACAACA
TCAGACGGAAGGTTAAGATAAGTTCTCAAAAACTCAATGCCTTCGTTGGTCAAAAACCAG
TAATAGTGCATCCATGCGAACGTCTCCCTAACGTACTCCTTGGACTTGAAACTCTGCATG
AGCTTGATCACTTGCAAGTTTGGAACTGACTCAATCAACGGATGCTTTGCGAGGTTGAAA
TCCTTCTTCGCAAACAATACTCCTT
TCTTTGAAGA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2EV69JQ 658 0 0
CA
GAGAAATAGATAGATTATAGATTCCGGATTTGGATTACAAAAA*CAAAACTAAAGCCAAA
ACTGAAAACTGTCTTTCAATTGCTTAACGATAAGCACAGCTCTTTCAGGGTAAACCGGAA
CCAGATGGAGCTGCAGCGCTGTAACCACCTGCACCACGGCCAAATCCAGGCCTACCACCA
CTTCCTTGGAAAGAAGGCTGGTAATCAGCAGGAGCTCCACCCTTTTCACCTCCAACATCA
CCACCACGTGGCCCTGCACGGTACCCATCACGTTCACCATATCTTGGACGGTCTCCCTCA
AAACGAGGTGGTCCTCTTGGGCGATCACCAGGTGGGCCACCAAAAGGACGGCCAATGGGC
TTAGCAAACTTCTTCAATGTCGCAGGAACAACATCAGACGGAAGGTTAAGATAAGTTCTC
AAAAACTCAATGCCTTCGTTGGTCAAAAACCAATAATAGTGCATCCAAGCGAACGTCTCC
CTAACGTACTCCTTGGACTTGAAACTCTGCATGAGCTTGATCACTTGCAAGTTTGGCACT
GACTCAATCAACGGATGCTTTGCGAGGTTGAAATCCTTCTTCGCAAACAATACTCCTTCT
TTGAAAAGGTACTTGCAGATCTCTCTGCGGTTGGTCTCTGAGATAATCATCGTCTT

QA 3 658 3 658
DS 

RD RR2EA33TF 691 0 0
ATTTGGATTACAAAAA*CAAAACTAAAGCCAAAACTGAAAACTGTCTTTCAATTGCTTAA
CGATAAGCACAGCTCTTTCAGGGTAAACCGGAACCAGATGGAGCTGCAGCGCTGTAACCA
CCTGCACCACGGCCAAATCCAGGCCTACCACCACTTCCTTGGAAAGAAGGCTGGTAATCA
GCAGGAGCTCCACCCTTTTCACCTCCAACATCACCACCACGTGGCCCTGCACGGTACCCA
TCACGTTCACCATATCTTGGACGGTCTCCCTCAAAACGAGGTGGTCCTCTTGGGCGATCA
CCAGGTGGGCCACCAAAAGGACGGCCAATGGGCTTAGCAGACTTCTTCAATGTCGCAGGA
ACAACATCAGACGGAAGGTTAAGATAAGTTCTCAAAAACTCAATGCCTTCGTTGGTCAAA
AACCAATAATAGTGCATCCAAGCGAACGTCTCCCTAACGTACTCCTTGGACTTGAAACTC
TGCATGAGCTTGATCACTTGCAAGTTTGGCACTGACTCAATCAACGGATGCTTTGCGAGG
TTGAAATCCTTCTTCGCAAACAATACTCCTTCTTTGAAAAGGTACTTGCAGATCTCTCTG
CGGTTGGTCTCTGAGATAATCATCGTCTTGTCGGTAGGAGCTTTCGCTGCAACGAGGAAC
AGAGCTTCTTTGTTTTGTTTTTTTTGGTCCC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2EV69TF 597 0 0
CAGATGGAGCTGCAGCGCTGTAACCAC*TGCACCACGGCCAAATCCAGGCCTACCACCAC
TTCCTTGGAAAGAAGGCTGGTAATCAGCAGGAGCTCCACCCTTTTCACCTCCAACATCAC
CACCACGTGGCCCTGCACGGTACCCATCACGTTCACCATATCTTGGACGGTCTCCCTCAA
AACGAGGTGGTCCTCTTGGGCGATCACCAGGTGGGCCACCAAAAGGACGGCCAATGGGCT
TAGCAGACTTCTTCAATGTCGCAGGAACAACATCAGACGGAAGGTTAAGATAAGTTCTCA
AAAACTCAATGCCTTCGTTGGTCAAAAACCAATAATAGTGCATCCAAGCGAACGTCTCCC
TAACGTACTCCTTGGACTTGAAACTCTGCATGAGCTTGATCACTTGCAAGTTTGGCACTG
ACTCAATCAACGGATGCTTTGCGAGGTTGAAATCCTTCTTCGCAAACAATACTCCTTCTT
TGAAAAGGTACTTGCAGATCTCTCTGCGGTTGGTCTCTGAGATAATCATCGTCTTGTCGG
TAGGAGCTTTCGCTGCAACGAGGAACAGAGCTTCTTTGTTTTGTTTTTTTT
GGTCCC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 2 6

CO CL1456Contig1 971 4 13 U
GCATTAAAATTGGCCTACATTTGGCGTGCTTCACATTCAAAGGGGATATATTGACATGCA
GTCAGCAGATTTCAAATGTATCACCCATATAAACCGCATTTGAAATATTTTAATAACAGT
TATTCACTGGCTGACAAAAAAAAAGAAGTTATTCACTGAGTTAACTCGTTCGCGTTAACC
CCAACAATATAACCTTTCCATAGTATATACTTTACAAGTTTCTTAATCCTCTCCTAACTC
AATTTACTACGAATGAACTCATATTAGAAACGTGTATGTTCTTCTTCTATATTCACAGGA
ACTTGGGATCACCTCTGTTTCTTAGATTCTGGTCTCGGAGAATCATCAGTTTCTTCTGTA
CTCCGGTCAAGCCCAAAACACTTAAGGAATGCAGTTCCAGCAAGCTGAAACAGATTGCAG
GGATGATACAAAATACTACTACTACTCGAGTCTTCATCAGAAGAAGAACTTTCTTCTTCC
TCTGTTCTCGTCACTCTCCTTGTTTCAGCTGGTGCTATCTCTCCTTTTATGGCCTGAGAA
CTTCCCATCTGATTAGACTGTACTACGGAGAACCCCAAGCCATGGTGGCGGCTGATCGGA
ATCGGATCTCCAGATAGAAACCTCCGAGAGGCGGACGAAGAAGGAAGTGAATCAGCGGAT
GAGACGCTGATATCTGAGGAGGATAATAATCCGAAGACGCAGAAGAGGAGTAGGAGGAGG
AAGAAGACGAACATTTGGATCCATACCAGCCACGAGAGGTTACTGTAGCTCTCTACCATC
AGAAAACTCCTTCTCGGAATCTATTATATAAATAGAGAGAGAATTTGAATTTGACGGAAG
GAGAGAGATTCTGAATCCTCGAGAGACTCTCTTTGATTGATTGATGGGAAGAAGATGATC
AACGGAAGACGACGAGATTATTGGGTGGGTGGGTGGATGGCTGGATAGATAAAGGGACGG
AGCTGTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU38JQ U 1
AF RR2BB43JQ U 128
AF RR2BU38TF C 254
AF RR2BB43TF C 123
BS 1 247 RR2BU38JQ
BS 248 248 RR2BB43JQ
BS 249 266 RR2BU38JQ
BS 267 267 RR2BB43JQ
BS 268 309 RR2BU38JQ
BS 310 310 RR2BB43JQ
BS 311 339 RR2BU38JQ
BS 340 340 RR2BB43JQ
BS 341 611 RR2BU38JQ
BS 612 612 RR2BB43JQ
BS 613 624 RR2BU38JQ
BS 625 697 RR2BB43JQ
BS 698 971 RR2BB43TF

RD RR2BU38JQ 624 0 0
GCATTAAAATTGGCCTACATTTGGCGTGCTTCACATTCAAAGGGGATATATTGACATGCA
GTCAGCAGATTTCAAATGTATCACCCATATAAACCGCATTTGAAATATTTTAATAACAGT
TATTCACTGGCTGACAAAAAAAAAGAAGTTATTCACTGAGTTAACTCGTTCGCGTTAACC
CCAACAATATAACCTTTCCATAGTATATACTTTACAAGTTTCTTAATCCTCTCCTAACTC
AATTTACCACGAATGAACTCATATTAAAAACGTGTATGTTCTTCTTCTATATTCACAGGA
ACTTGGGATTACCTCTGTTTCTTAGATTCTGGTCTCGGAAAATCATCAGTTTCTTCTGTA
CTCCGGTCAAGCCCAAAACACTTAAGGAATGCAGTTCCAGCAAGCTGAAACAGATTGCAG
GGATGATACAAAATACTACTACTACTCGAGTCTTCATCAGAAGAAGAACTTTCTTCTTCC
TCTGTTCTCGTCACTCTCCTTGTTTCAGCTGGTGCTATCTCTCCTTTTATGGCCTGAGAA
CTTCCCATCTGATTAGACTGTACTACGGAGAACCCCAAGCCATGGTGGCGGCTGATCGGA
ATCGGATCTCCTGATAGAAACCTC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2BB43JQ 570 0 0
GGCTGACA
AAAAAAAAAGAAGTTATTCACTGAGTTAACTCGTTCGCGTTAACCCCAACAATATAACCT
TTCCATAGTATATACTTTACAAGTTTCTTAATCCTCTCCTAACTCAATTTACTACGAATG
AACTCATATTAGAAACGTGTATGTTCTTCTTCTATATTCACAGGAACTTGGGATCACCTC
TGTTTCTTAGATTCTGGTCTCGGAGAATCATCAGTTTCTTCTGTACTCCGGTCAAGCCCA
AAACACTTAAGGAATGCAGTTCCAGCAAGCTGAAACAGATTGCAGGGATGATACAAAATA
CTACTACTACTCGAGTCTTCATCAGAAGAAGAACTTTCTTCTTCCTCTGTTCTCGTCACT
CTCCTTGTTTCAGCTGGTGCTATCTCTCCTTTTATGGCCTGAGAACTTCCCATCTGATTA
GACTGTACTACGGAGAACCCCAAGCCATGGTGGCGGCTGATCGGAATCGGATCTCCAGAT
AGAAACCTCCGAGAGGCGGACGAAGAAGGAAGTGAATCAGCGGATGAGACGCTGATATCT
GAGGAGGATAATAATCCGAAGA

QA 9 570 9 570
DS 

RD RR2BU38TF 419 0 0
TGAACTCATATTAGAA*CGTGTATGTTCT*CTTCTATATTCACAGGAACTTGGGATTACC
TCTGTTTCTTAGATTCTGGTCTCGGAGAATCATCAGTTTCTTCTGTACTCCGGTCAAGCC
CAAAACACTTAAGGAATGCAGTTCCAGCAAGCTGAAACAGATTGCAGGGATGATACAAAA
TACTACTACTACTCGAGTCTTCATCAGAAGAAGAACTTTCTTCTTCCTCTGTTCTCGTCA
CTCTCCTTGTTTCAGCTGGTGCTATCTCTCCTTTTATGGCTTGAGAACTTCCCATCTGAT
TAGACTGTACTACGGAGAACCCCAAGCCATGGTGGCGGCTGATCGGAATCGGATCTCATG
ATAGAAACCTCCGAGAGGCGGACGAAGAAGGAAGTGAATCAGCGGATGAGACGCTGATA

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR2BB43TF 849 0 0
TTTTGGCTGACAA
AAAAAAAAAGAAGTTATTCACTGAGTTAACTCGTTCGCGTTAACCCCAACAATATAACCT
TTCCATAGTATATACTTTACAAGTTTCTTAATCCTCTCCTAACTCAATTTACTACGAATG
AACTCATATTAGAAACGTGTATGTTCTTCTTCTATATTCACAGGAACTTGGGATCACCTC
TGTTTCTTAGATTCTGGTCTCGGAGAATCATCAGTTTCTTCTGTACTCCGGTCAAGCCCA
AAACACTTAAGGAATGCAGTTCCAGCAAGCTGAAACAGATTGCAGGGATGATACAAAATA
CTACTACTACTCGAGTCTTCATCAGAAGAAGAACTTTCTTCTTCCTCTGTTCTCGTCACT
CTCCTTGTTTCAGCTGGTGCTATCTCTCCTTTTATGGCCTGAGAACTTCCCATCTGATTA
GACTGTACTACGGAGAACCCCAAGCCATGGTGGCGGCTGATCGGAATCGGATCTCCAGAT
AGAAACCTCCGAGAGGCGGACGAAGAAGGAAGTGAATCAGCGGATGAGACGCTGATATCT
GAGGAGGATAATAATCCGAAGACGCAGAAGAGGAGTAGGAGGAGGAAGAAGACGAACATT
TGGATCCATACCAGCCACGAGAGGTTACTGTAGCTCTCTACCATCAGAAAACTCCTTCTC
GGAATCTATTATATAAATAGAGAGAGAATTTGAATTTGACGGAAGGAGAGAGATTCTGAA
TCCTCGAGAGACTCTCTTTGATTGATTGATGGGAAGAAGATGATCAACGGAAGACGACGA
GATTATTGGGTGGGTGGGTGGATGGCTGGATAGATAAAGGGACGGAGCTGTGATCC

QA 14 849 14 849
DS 



CO CL1456Contig2 681 2 2 U
ACGTTAACCCCAACAATATAACCTTTCCATAGTATATACTTACAAGTTTCTTAATTCTCT
CCTACTCAATTTACTACGAACGAGAACTCATATTAAAAACGTGTATATTGTGCTTCTATA
TTCACAAGAACTTGGGGTCACCTCTGTTTCTTAGATTCTGGTCTCAGAGAATCATCAGTT
TCTTCTGTACTCCGGTCAAGCCCAAAACACTTAAGGAATGCAGTTCCAGCAAGCTGAAAC
AAATTGCAGGGATGATACAAAATACTACTACTACTCGAGTCTTCATCAGAAGAAGAACTT
TCTTCTTCCTCTGTTCTCGTCACTCTCCTTGTTTCAGCTGGTGCTATCTCTCCTTTTATG
GCCTGAGAACTTCCCATCTGATTAGACTGTACTACGGAGAACCCCAAGCCGTGGTGGCGG
CTGATCGGAATCGGATCTCCAGATAGAAACTGCCGAGAGGCGGACGAAGAAGGAAGTGAA
TCACCGGACGAGACGCTGATATCTGAGGAGGATAGTAATCCGAAGACGCAGAAGAGGAGT
AGGAGGAGGAAGAAGACGAACATTTGGATCCATACGAGCCACGATAGGTTACTGTAGCTC
TCTGCCATCAGAAAACTCCTTCTCGGAATCTATTATATAAAGAAAGAGAATTTGAATTTG
ACGGAAGGAGAGAGATTCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GW76TF C 1
AF RR2GW76JQ U 19
BS 1 18 RR2GW76TF
BS 19 681 RR2GW76JQ

RD RR2GW76TF 681 0 0
ACGTTAACCCCAACAATATAACCTTTCCATAGTATATACTTACAAGTTTCTTAATTCTCT
CCTACTCAATTTACTACGAACGAGAACTCATATTAAAAACGTGTATATTGTGCTTCTATA
TTCACAAGAACTTGGGGTCACCTCTGTTTCTTAGATTCTGGTCTCAGAGAATCATCAGTT
TCTTCTGTACTCCGGTCAAGCCCAAAACACTTAAGGAATGCAGTTCCAGCAAGCTGAAAC
AAATTGCAGGGATGATACAAAATACTACTACTACTCGAGTCTTCATCAGAAGAAGAACTT
TCTTCTTCCTCTGTTCTCGTCACTCTCCTTGTTTCAGCTGGTGCTATCTCTCCTTTTATG
GCCTGAGAACTTCCCATCTGATTAGACTGTACTACGGAGAACCCCAAGCCGTGGTGGCGG
CTGATCGGAATCGGATCTCCAGATAGAAACTGCCGAGAGGCGGACGAAGAAGGAAGTGAA
TCACCGGACGAGACGCTGATATCTGAGGAGGATAGTAATCCGAAGACGCAGAAGAGGAGT
AGGAGGAGGAAGAAGACGAACATTTGGATCCATACGAGCCACGATAGGTTACTGTAGCTC
TCTGCCATCAGAAAACTCCTTCTCGGAATCTATTATATAAAGAAAGAGAATTTGAATTTG
ACGGAAGGAGAGAGATTCTGA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2GW76JQ 663 0 0
TAACCTTTCCATAGTATATACTTACAAGTTTCTTAATTCTCTCCTACTCAATTTACTACG
AACGAGAACTCATATTAAAAACGTGTATATTGTGCTTCTATATTCACAAGAACTTGGGGT
CACCTCTGTTTCTTAGATTCTGGTCTCAGAGAATCATCAGTTTCTTCTGTACTCCGGTCA
AGCCCAAAACACTTAAGGAATGCAGTTCCAGCAAGCTGAAACAAATTGCAGGGATGATAC
AAAATACTACTACTACTCGAGTCTTCATCAGAAGAAGAACTTTCTTCTTCCTCTGTTCTC
GTCACTCTCCTTGTTTCAGCTGGTGCTATCTCTCCTTTTATGGCCTGAGAACTTCCCATC
TGATTAGACTGTACTACGGAGAACCCCAAGCCGTGGTGGCGGCTGATCGGAATCGGATCT
CCAGATAGAAACTGCCGAGAGGCGGACGAAGAAGGAAGTGAATCACCGGACGAGACGCTG
ATATCTGAGGAGGATAGTAATCCGAAGACGCAGAAGAGGAGTAGGAGGAGGAAGAAGACG
AACATTTGGATCCATACGAGCCACGATAGGTTACTGTAGCTCTCTGCCATCAGAAAACTC
CTTCTCGGAATCTATTATATAAAGAAAGAGAATTTGAATTTGACGGAAGGAGAGAGATTC
TGA

QA 1 663 1 663
DS 



AS 3 6

CO CL1457Contig1 608 2 5 U
ATACACATAAATACTATATATATGTAACTTGTTTCACAAACTTTTAAAATTATTTACACG
AAAGCCAATGATCCCTCAAAGACCTGCATTGCATTTTTAACAGCTCCTACGTCGATATCT
GCTAAATTTCCAGTCTTTGAAGCAACAATGACACAGTTACTCTTCTCTTCTGCGTCTGGG
ACAAATAGCTTCGCTTTCTCTTCTGAAAAAAACAACCCAATACTGGGTTTGTCTCGAGCA
TTAGCTAGTTGAATAGCAGCCGTGTTTGTAGCGATAACTCCAGCAAAATCGTTTATCAAA
ACAGCCAACTGTCCTGGTGTTGTGATGAACACTATTGATGTATCATCACCCACAAATTCA
TCGACGTTTTCTCTCTCTTTCTCATGTGGAACCACATAAACCGGCTTGAATCCCCTTATA
CCCCTTGATATCTGACCCCATTTTATAAGTGGAAGCAAACTATCACTATCTCCTTTTGAT
TGCATTGATGCCTTTGAATCTGATTCGATCCCATGGATCACTATAAACTTCCCTGTCTCC
ACTCCAGCTTTCCTATACTTGTCAGCCACAACCTCTTTCAATCTCCGTGAAACCGACACC
CTAAGTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY15JQ U 1
AF RR2D749JQ U 1
BS 1 391 RR2D749JQ
BS 392 392 RR2DY15JQ
BS 393 444 RR2D749JQ
BS 445 445 RR2DY15JQ
BS 446 608 RR2D749JQ

RD RR2DY15JQ 573 0 0
ATACACATAAATACTATATATATGTAACTTGTTTCACAAACTTTTAAGATTATTTACACG
AGAGCCAATGATCCCTCAAAGACCTGCATTGCATTTTTAACAGCTCCTACGTCGATATCT
GCTAGATTTCCAGTCTTTGAAGCAACAATGACACAGTTACTCTTCTCTTCTGCGTCTGGT
ACAAATAGCTTCGCTTTCTCTTCTGAAGAGAACAACCCAATACTGGGTTTGTCTCGAGCA
TTAGCTAGTTGAATAGCAGCCGTGTTTGTAGCGATAACTCCAGCAGAATCGTTTATCAGA
GCAGCCAACTGTCCTGGTGTTGTGATGAACACTATTGATGTATCATCACCCACAAATTCT
TCGACGTTTTCTCTCTCTTTCTCATGTGGAACCACATAGACCGGCTTGAATCCCCTTATA
CCCCTTGATATCTGACCCCATTTTATAAGTGGAAGCAAACTATCACTATCTCCTTTTGAT
TGCATTGATGCCTTTGAATCTGATTCGATCCCATGGATCACTATAAACTTCCCTGTCTCC
ACTCCAGCTTTCCTATACTTGTCAGCCAC
AACC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2D749JQ 608 0 0
ATACACATAAATACTATATATATGTAACTTGTTTCACAAACTTTTAAAATTATTTACACG
AAAGCCAATGATCCCTCAAAGACCTGCATTGCATTTTTAACAGCTCCTACGTCGATATCT
GCTAAATTTCCAGTCTTTGAAGCAACAATGACACAGTTACTCTTCTCTTCTGCGTCTGGG
ACAAATAGCTTCGCTTTCTCTTCTGAAAAAAACAACCCAATACTGGGTTTGTCTCGAGCA
TTAGCTAGTTGAATAGCAGCCGTGTTTGTAGCGATAACTCCAGCAAAATCGTTTATCAAA
ACAGCCAACTGTCCTGGTGTTGTGATGAACACTATTGATGTATCATCACCCACAAATTCA
TCGACGTTTTCTCTCTCTTTCTCATGTGGAATCACATAAACCGGCTTGAATCCCCTTATA
CCCCTTGATATCTGACCCCATTTTGTAAGTGGAAGCAAACTATCACTATCTCCTTTTGAT
TGCATTGATGCCTTTGAATCTGATTCGATCCCATGGATCACTATAAACTTCCCTGTCTCC
ACTCCAGCTTTCCTATACTTGTCAGCCACAACCTCTTTCAATCTCCGTGAAACCGACACC
CTAAGTGG

QA 1 608 1 608
DS 



CO CL1457Contig2 616 2 6 U
CCAACTGTCCTGGTGTTGTGATGAATACTATAGATGTATCATCACCCACAAATTCTTCAA
CGTTTTCTCTCTCTTTCTCATGTGGAATCACATAGACCGGCTTGAATCCCCTTATACCCC
TTGATATCTGACCCCATTTTGTAAGTGGAAGCAAACTATCACTATCTCCTTTTGATTGCA
TTGATGCCTTTGAATCTGATTCGATCCCATGGATCACTATAAACTTCCCTGTCTCCACTC
CAGCTTTCCTATACTTGTCAGCCACAACCTCTTTCAATCTCCGTGAAACCGACACCCTAA
GTGGCAGCACAGGAGTCCTTGGAACACTCCTAAACGGCCTTCCTAACCAATCCTCCATCT
GGTCATACATTTTGTAACCTAATTCTGACAGGTTGGTGTTTTCTGCTGTAAAGGTCTCAG
ATAGCACCAGACCAGCTCCAGCAGAGTTAACATTCGGGTAAATGTAACTAACTCTGTCTC
TAGCCGTTGTCATGAACAAGAACGCTGCATGGCCTAGCCCTGCGAGCTTCGTTGACAGAA
TCATGTCATAGTACCTTCCTTTGAGAAGTCCGATCATGTCTGTATATTCAGCTGGCTCAG
GCCAATGATCGTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO70JQ U 1
AF RR2D749TF C 113
BS 1 265 RR2GO70JQ
BS 266 266 RR2D749TF
BS 267 282 RR2GO70JQ
BS 283 283 RR2D749TF
BS 284 409 RR2GO70JQ
BS 410 616 RR2D749TF

RD RR2GO70JQ 409 0 0
CCAACTGTCCTGGTGTTGTGATGAATACTATAGATGTATCATCACCCACAAATTCTTCAA
CGTTTTCTCTCTCTTTCTCATGTGGAATCACATAGACCGGCTTGAATCCCCTTATACCCC
TTGATATCTGACCCCATTTTGTAAGTGGAAGCAAACTATCACTATCTCCTTTTGATTGCA
TTGATGCCTTTGAATCTGATTCGATCCCATGGATCACTATAAACTTCCCTGTCTCCACTC
CAGCTTTCCTATACTTGTCAGCCACGACCTCTTTCAATCTCCTTGAAACCGACACCCTAA
GTGGCAGCACAGGAGTCCTTGGAACACTCCTAAACGGCCTTCCTAACCAATCCTCCATCT
GGTCATACATTTTGTAACCTAATTCTGACAGGTTGGTGTTTTCTGCTGT

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR2D749TF 504 0 0
TATACCCCTTGATATCTGACCCCATTTTGTAAGTGGAAGCAAACTATCACTATCTCCTTT
TGATTGCATTGATGCCTTTGAATCTGATTCGATCCCATGGATCACTATAAACTTCCCTGT
CTCCACTCCAGCTTTCCTATACTTGTCAGCCACAACCTCTTTCAATCTCCGTGAAACCGA
CACCCTAAGTGGCAGCACAGGAGTCCTTGGAACACTCCTAAACGGTCTTCCTAACCAATC
CTCCATCTGGTCATACATTTTGTAACCTAATTCTGACAGGTTGGTGTTTTCTGCTGTAAA
GGTCTCAGATAGCACCAGACCAGCTCCAGCAGAGTTAACATTCGGGTAAATGTAACTAAC
TCTGTCTCTAGCCGTTGTCATGAACAAGAACGCTGCATGGCCTAGCCCTGCGAGCTTCGT
TGACAGAATCATGTCATAGTACCTTCCTTTGAGAAGTCCGATCATGTCTGTATATTCAGC
TGGCTCAGGCCAATGATCGTCTGC

QA 1 504 1 504
DS 



CO CL1457Contig3 781 2 6 U
GGGGGCTCAAAAACACCTTCACCACTCCAATGGCTTCTTCACTTCCTCAATCACCCAAAC
CCATCTCTCCCTTCCTCAAAACGCCGCCGTTTCCAACCACCAAACCACTCGTCTTCCTCA
ACTTCCAAACCCGGCTAGCCTCGAGACCCTTGGATGTATCAGTCAATCTCAAGAAGAAGA
AGAGCGTGTGGCTCGACCCCTTTGACGACGGTGAAGACCTCAACAACGAATACGGGTCAC
TGTTCGCCGATGGAAAGCAAGAAGAGGATCCGAGACCACCGGATAATCCTGATAATCCTT
ACGGGTTCTTGAAGTTTCCAATGGGCTACACCGTCGAGCTCGCTTCTCTGCCGTTGAAAA
TCAGAGGAGATGTTCGACGGTGCTGTTGCGTCGTCTCCGGTGGAGTGTACGAGAATCTAC
TCTTTTTCCCGACGATTCAGTTACTTAAAGACAGGTATCCTGGTGTTCAGGTAGATGTCT
TAACGACAGATAGAGGAAAACAAACGTACGAGTTAAACAAAAACGTGAGATGGGCAAATG
TGTACGATCCAGACGATCATTGGCCTGAACCTGCTGAATATACAGACATGATCGGACTTC
TCAAAGGAAGGTACTATGACATGATTCTGTCAACGAAGCTCGTAGGGCTAGGCCACGCAG
CGTTCTTGTTCATGACAACGGCTAGAGACAGAGTTAGTTACATTTACCCCAATGTTAACT
CTGCTGGAGCCGTCTGATGCTATCCGAAACCTTTACAGCAGAAAACACCAACCTGTCAGA
A


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2GO70TF U 1
AF RR2DG69TF U 4
BS 1 147 RR2GO70TF
BS 148 148 RR2DG69TF
BS 149 325 RR2GO70TF
BS 326 326 RR2DG69TF
BS 327 641 RR2GO70TF
BS 642 781 RR2DG69TF

RD RR2GO70TF 641 0 0
GGGGGCTCAAAAACACCTTCACCACTCCAATGGCTTCTTCACTTCCTCAATCACCCAAAC
CCATCTCTCCCTTCCTCAAAACGCCGCCGTTTCCAACCACCAAACCACTCGTCTTCCTCA
ACTTCCAAACCCGGCTAGCCTCGAGACTCTTGGATGTATCAGTCAATCTCAAGAAGAAGA
AGAGCGTGTGGCTCGACCCCTTTGACGACGGTGAAGACCTCAACAACGAATACGGGTCAC
TGTTCGCCGATGGAAAGCAAGAAGAGGATCCGAGACCACCGGATAATCCTGATAATCCTT
ACGGGTTCTTGAAGTTTCCAATGGGTTACACCGTCGAGCTCGCTTCTCTGCCGTTGAAAA
TCAGAGGAGATGTTCGACGGTGCTGTTGCGTCGTCTCCGGTGGAGTGTACGAGAATCTAC
TCTTTTTCCCGACGATTCAGTTACTTAAAGACAGGTATCCTGGTGTTCAGGTAGATGTCT
TAACGACAGATAGAGGAAAACAAACGTACGAGTTAAACAAAAACGTGAGATGGGCAAATG
TGTACGATCCAGACGATCATTGGCCTGAACCTGCTGAATATACAGACATGATCGGACTTC
TCAAAGGAAGGTACTATGACATGATTCTGTCAACGAAGCTC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2DG69TF 778 0 0
GGCTCAAAAACACCTTCACCACTCCAATGGCTTCTTCACTTCCTCAATCACCCAAACCCA
TCTCTCCCTTCTTCAAAACGCCGCCGTTTCCAACCACCAAACCACTCGTCTTCCTCAACT
TCCAAACCCGGCTAGCCTCGAGACCCTTGGATGTATCAGTCAATCTCAAGAAGAAGAAGA
GCGTGTGGCTCGACCCCTTTGACGACGGTGAAGACCTCAACAACGAATACGGGTCACTGT
TCGCCGATGGAAAGCAAGAAGAGGGTCCGAGACCACCGGATAATCCTGATAATCCTTACG
GGTTCTTGAAGTTTCCAATGGGCTACACCGTCGAGCTCGCTTCTCTGCCGTTGAAAATCA
GAGGAGATGTTCGACGGTGCTGTTGCGTCGTCTCCGGTGGAGTGTACGAGAATCTACTCT
TTTTCCCGACGATTCAGTTACTTAAAGACAGGTATCCTGGTGTTCAGGTAGATGTCTTAA
CGACAGATAGAGGAAAACAAACGTACGAGTTAAACAAAAACGTGAGATGGGCAAATGTGT
ACGATCCAGACGATCATTGGCCTGAACCTGCTGAATATACAGACATGATCGGACTTCTCA
AAGGAAGGTACTATGACATGATTCTGTCAACGAAGCTCGTAGGGCTAGGCCACGCAGCGT
TCTTGTTCATGACAACGGCTAGAGACAGAGTTAGTTACATTTACCCCAATGTTAACTCTG
CTGGAGCCGTCTGATGCTATCCGAAACCTTTACAGCAGAAAACACCAACCTGTCAGAA

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 6

CO CL1458Contig1 836 6 12 U
GGGAACATATTTAAAACTGAATAACAACCGGAAAAAAAAA***GGAGAAAAATAAAATAA
AACTTCCGACGCATAAAAAATGGCAACGTTCTCCGCTTTGTCCACTTTCGCCGCGGCGGC
AATTACCTTGCAACTACTCCTAGTTCCAGCTTTAGCCTCTCCTCACATGAAATACATTGA
TGCTATCTGCGATCGCTCCCACGACCAGGATTACTGCGTTAAAACATTGACTACCAACCC
CCCTACGGCTGCTCCCATTGGCCTGAATCCACTCGCCGAGGCCGTAATGGAGCTCACCAT
TGCCCACGCCGAGAAGACAGCGGCTTTCCTGGACGAGACGGCGAAGAAAAATCCAGCGGT
GCAGGCTGCGTATGCCGACTACCACAAGGCCTATCTAGCCGTGGTGGCTGATCTCAAGAG
CGCAAACCTGAAGCTCAAGCAATCCCCTGACACGGCTCACTACGACGTTAGGTCTTCGAC
CGACGAGATGAAGCGCGTGGAGGGATTAGTTGCGAAAAACAATGACCAGGCTTCAACCAC
TCTCAAGGAAATGACCGTGCAGATGGAGAAGCTACTTGATCTTGCAGCTAGTGCCGCCGA
TGCTGTGGACGATGATGATGAGAACATCCACCGTCGCGAATGATTTTAAAGCAGTGATCC
GGTTTCGTTTTTTTGTGTTCACAATACAAAATATAATAAATAAATGAATACATATACACA
CACACACACAAAATGTGGTGTGATAAACTAGTAATTAAGTTCTTGAAATATTTGCAGACT
GATGTCAATTTTTGGCATATATAAAAAGTTTGCTGTATGATCTTTTTTACAAAACT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D011TF U 1
AF RR2DT25JQ C 467
AF RR2DT25TF U 2
AF RR2G535TF U 2
AF RR2FA07TF U 2
AF RR2E596JQ C 179
BS 1 50 RR2D011TF
BS 51 51 RR2DT25TF
BS 52 200 RR2D011TF
BS 201 201 RR2DT25TF
BS 202 616 RR2D011TF
BS 617 667 RR2DT25TF
BS 668 746 RR2FA07TF
BS 747 747 RR2E596JQ
BS 748 767 RR2FA07TF
BS 768 768 RR2E596JQ
BS 769 787 RR2FA07TF
BS 788 836 RR2E596JQ

RD RR2D011TF 616 0 0
GGGAACATATTTAAAACTGAATAACAACCGGAAAAAAAAA***GGAGAAAGATAAAATAA
AACTTCCGACGCATAAAAAATGGCAACGTTCTCCGCTTTGTCCACTTTCGCCGCGGCGGC
AATTACCTTGCAACTACTCCTAGTTCCAGCTTTAGCCTCTCCTCACATGAAATACATTGA
TGCTATCTGCGATCGCTCCCGCGACCAGGATTACTGCGTTAAAACATTGACTACCAACCC
CCCTACGGCTGCTCCCATTGGCCTGAATCCACTCGCCGAGGCCGTAATGGAGCTCACCAT
TGCCCACGCCGAGAAGACAGCGGCTTTCCTGGACGAGACGGCGAAGAAAAATCCAGCGGT
GCAGGCTGCGTATGCCGACTACCACAAGGCCTATCTAGCCGTGGTGGCTGATCTCAAGAG
CGCAAACCTGAAGCTCAAGCAATCCCCTGACACGGCTCACTACGACGTTAGGTCTTCGAC
CGACGAGATGAAGCGCGTGGAGGGATTAGTTGCGAAAAACAATGACCAGGCTTCAACCAC
TCTCAAGGAAATGACCGTGCAGATGGAGAAGCTACTTGATCTTGCAGCTAGTGCCGCCGA
TGCTGTGGACGATGAT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2DT25JQ 142 0 0
GTTAGGTCTTCGACCGACGAGATGAAGCGCGTGGAGGGATTAGTTGCGAAAAACAATGAC
CAGGCTTCAACCACTTTCAAGGAAATGACCGTGCAGATGGAGAAGCTACTTGATCTTGCA
GCTAGTGCCGCCGATGCTGTGG

QA 1 142 1 142
DS 

RD RR2DT25TF 666 0 0
GGAACATATTTAAAACTGAATAACAACCGGAAAAAAAA****GGAGAAAAATAAAATAAA
ACTTCCGACGCATAAAAAATGGCAACGTTCTCCGCTTTGTCCACTTTCGCCGCGGCGGCA
ATTACCTTGCAACTACTCCTAGTTCCAGCTTTAGCCTCTCCTCACATGAAATACATTGAT
GCTATCTGCGATCGCTCCCACGACCAGGATTACTGCGTTAAAACATTGACTACCAACCCC
CCTACGGCTGCTCCCATTGGCCTGAATCCACTCGCCGAGGCCGTAATGGAGCTCACCATT
GCCCACGCCGAGAAGACAGCGGCTTTCCTGGACGAGACGGCGAAGAAAAATCCAGCGGTG
CAGGCTGCGTATGCCGACTACCACAAGGCCTATCTAGCCGTGGTGGCTGATCTCAAGAGC
GCAAACCTGAAGCTCAAGCAATCCCCTGACACGGCTCACTACGACGTTAGGTCTTCGACC
GACGAGATGAAGCGCGTGGAGGGATTAGTTGCGAAAAACAATGACCAGGCTTCAACCACT
CTCAAGGAAATGACCGTGCAGATGGAGAAGCTACTTGATCTTGCAGCTAGTGCCGCCGAT
GCTGTGGACGATGATGATGAGAACATCCACCGTCGCGAATGATTTTAAAGCAGTGATCCG
GTTTCG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2G535TF 706 0 0
GGAACATATTTAAAACTGAATAACAACCGGAAAAAAAAA***GGAGAAAAATAAAATAAA
ACTTCCGACGCATAAAAAATGGCAACGTTCTCCGCTTTGTCCACTTTCGCCGCGGCGGCA
ATTACCTTGCAACTACTCCTAGTTCCAGCTTTAGCCTCTCCTCACATGAAATACATTGAT
GCTATCTGCGGTCGCTCCCACGACCAGGATTACTGCGTTAAAACATTGACTACCAACCCC
CCTACGGCTGCTCCCATTGGCCTGAATCCACTCGCCGAGGCCGTAATGGAGCTCACCATT
GCCCACGCCGAGAAGACAGCGGCTTTCCTGGACGAGACGGCGAAGAAAAATCCAGCGGTG
CAGGCTGCGTATGCCGACTACCACAAGGCCTATCTAGCCGTGGTGGCTGATTTCAAGAGC
GCAAACCTGAAGCTCAAGCAATCCCCTGACACGGCTCACTACGACGTTAGGTCTTCGACC
GACGAGATGAAGCGCGTGGAGGGATTAGTTGCGAAAAACAATGACCAGGCTTCAACCACT
CTCAAGGAAATGACCGTGCAGATGGAGAAGCTACTTGATCTTGCAGCTAGTGCCGCCGAT
GCTGTGGACGATGATGATGAGAACATCCACCGTCGCGAATGATTTTAAAGCAGTGATCCG
GTTTCGTTTTTTTGTGTTCACAATACAAAATATAATAAATAAATGA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2FA07TF 786 0 0
GGAACATATTTAAAACTGAATAACAACCGGAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAATAAAATAAA
ACTTCCGACGCATAAAAAATGGCAACGTTCTCCGCTTTGTCCACTTTCGCCGCGGCGGCA
ATTACCTTGCAACTACTCCTAGTTCCAGCTTTAGCCTCTCCTCACATGAAATACATTGAT
GCCATCTGCGATCGCTCCCACGACCAGGATTACTGCGTTAAAACATTGACTACCAACCCC
CCTACGGCTGCTCCCATTGGCCTGAATCCACTCGCCGAGGCCGTAATGGAGCTCACCATT
GCCCACGCCGAGAAGACAGCGGCTTTCCTGGACGAGACGGCGAAGAAAAATCCAGCGGTG
CAGGCTGCGTATGCCGACTACCACAAGGCCTATCTAGCCGTGGTGGCTGATCTCAAGAGC
GCAAACCTGAAGCTCAAGCAATCCCCTGACACGGCTCACTACGACGTTAGGTCTTCGACC
GACGAGATGAAGCGCGTGGAGGGATTAGTTGCGAAAAACAATGACCAGGCTTCAACCACT
CTCAAGGAAATGACCGTGCAGATGGAGAAGCTACTTGATCTTGCAGCTAGTGCCGCCGAT
GCTGTGGACGATGATGATGAGAACATCCACCGTCGCGAATGATTTTAAAGCAGTGATCCG
GTTTCGTTTTTTTGTGTTCACAATACAAAATATAATAAATAAATGAATACATATACACAC
ACACACACAAAATGTGGTGTGATAA*CTAGTAATTAAGTTCTTGAA*TATTTGCAGACTG
ATGTCA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2E596JQ 658 0 0
GATGCTATCTGCGATCGCTCCCACGACCAGGATTACTGCGTTAAAACATTGACTACCAAC
CCCCCTACGGCTGCTCCCATTGGCCTGAATCCACTCGCCGAGGCCGTAATGGAGCTCACC
ATTGCCCACGCCGAGAAGACAGCGGCTTTCCTGGACGAGACGGCGAAGAAAAATCCAGCG
GTGCAGGCTGCGTATGCCGACTACCACAAGGCCTATCTAGCCGTGGTGGCTGATCTCAAG
AGCGCAAACCTGAAGCTCAAGCAATCCCCTGACACGGCTTACTACGACGTTAGGTCTTCG
ACCGACGAGATGAAGCGCGTGGAGGGATTAGTTGCGAAAAACAATGACCAGGCTTCAACC
ACTCTCAAGGAAATGACCGTGCAGATGGAGAAGCTACTTGATCTTGCAGCTAGTGCCGCC
GATGCTGTGGACGATGATGATGAGAACATCCACCGTCGCGAATGATTTTAAAGCAGTGAT
CCGGTTTCGTTTTTTTGTGTTCACAATACAAAATATAATAAATAAATGAATACATATACA
CACACACACACAAAATGTGGTGTGATAAACTAGTAATTAAGTTCTTGAAATATTTGCAGA
CTGATGTCAATTTTTGGCATATATAAAAAGTTTGCTGTATGATCTTTTTTACAAAACT

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 5

CO CL1459Contig1 862 5 14 U
TTTTTCTTTTCCTCACCAAACCAAACACAAAACCTCAAACTTCAAACAGCTTCTGAACAA
CTCTTGAAACCAAAGACTTCTCTAATGTCGGAAGAGATACGCGAGCACGGTAGTGACACC
AACCCTAAACCTTCTCCACCGCCGCCAAAACGTGGTCTCATCAGCCGCAAGAGACAGCTC
GTGTTTCTCTCCCTCATGATATTACTAGCCGCAAAAGGACTCGTGGGGATAGGCGAAGTA
GCGTTTGTAATACTATCTTACATATACTTGTATGAGTTCCTCTCTAGGTTTGCCTTCCCA
CGCAAGCAAAACGAGCAGAAGAGGAGACTCTCGAACCCTAAAAACAAACTCTTCCAAACT
TACTTCCTCGCCACTGCTATTATCGGCCTACTCTTCCCGATTTGCTACATCGGAGATGGA
CTATACCGGGGAGACATTCACGGTGTTAGAGCCGCAGCTCCACATCTCTTCCTCCTCTCC
GGTCAAGCCTTCACAGAACCAATTGGTTTCTCTGACCGCTTTGCGACTCCCATTGGTATT
CTTGGACCGGTTTTCTACAACGCTCGTCGTATCTTCGCGCTGTTGGATTGGGTTAAAGCC
GAGTTCTCAGATACACAGCGTCCTGGTGGTCCAGTGAGATTGTACGGAGGAAGAGCCATT
GCTTCTGTTAACACTGTCATGTGGTTTTACAATCTGCTTGGTCTCTTGTTGCCTGTGTTT
CTTCCTCGGTCTTGTGAGATTTACTTCTCAGCCGACAACAAAGGAGATTAGTTTCTGATC
TCTTTTGTATACTGTCTACTTTAGAACTTTTATGTTGTGTTTGTGTTCTCGTTTCCATCA
GGTAAAAGATTATTGCTAATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 10 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ70TF U 16
AF RR2FV58TF U 1
AF RR2AJ72TF U 53
AF RR2DN86TF U 43
AF RR2DN86JQ C 134
BS 1 263 RR2FV58TF
BS 264 264 RR2DN86TF
BS 265 353 RR2FV58TF
BS 354 354 RR2DN86TF
BS 355 518 RR2FV58TF
BS 519 519 RR2DN86TF
BS 520 614 RR2FV58TF
BS 615 615 RR2DN86TF
BS 616 696 RR2FV58TF
BS 697 697 RR2DN86TF
BS 698 736 RR2FV58TF
BS 737 738 RR2DN86TF
BS 739 753 RR2FV58TF
BS 754 862 RR2DN86JQ

RD RR2FQ70TF 633 0 0
AGGGGAA
AAACACAAAACCTCAAACTTCAAACAGCTTCTGAACAACTCTTGAAACCAAAGACTTCTC
TAATGTCGGAAGAGATACGCGAGCACGGTAGTGACACCAACCCTAAACCTTCTCCATCGC
CGACAAAACGTGGTCTCATCAGCCGCAAGAGACAGCTCGTGTTTCTCTCCTTCATGATAT
TACTAGCCGCAAAAGGACTCGTGGGGATAGGAGAAATAGCGTTTGTGATACTATCTTACA
TCTACTTGTATGAGTTCCTCTCTAGGTTTGCCTTCCCGCGCAAGCAAAACGAGCAGAAGA
GGAGACTCTCAAACCCTAAAAACAAACTCTTTCAAACTTACTTCCTCGCCACTGCTATTA
TCGGCCTACTCTTCCCAATTTGCTACATCGGAGATGGACTATACCGGGGAGACATTCACG
GTGTTAGAGCCGCAGCTCCACATCTCTTCCTCCTCTCCGGTCAAGCCTTCACAGAACCAA
TTGGTTTCTCTGACCGGTTTGCGGCTCCCATTGGTATTCTTGGACCTGTTTTCTACAACG
CTCGTCGTATCTTCGCGCTGTTGGATTGGGTTAAAGCTGAGTTCTCAGATACTCAGCGTC
CTGGTGGTCCAGTGAGATTGTA
GAGA

QA 8 629 8 629
DS 

RD RR2FV58TF 753 0 0
TTTTTCTTTTCCTCACCAAACCAAACACAAAACCTCAAACTTCAAACAGCTTCTGAACAA
CTCTTGAAACCAAAGACTTCTCTAATGTCGGAAGAGATACGCGAGCACGGTAGTGACACC
AACCCTAAACCTTCTCCACCGCCGCCAAAACGTGGTCTCATCAGCCGCAAGAGACAGCTC
GTGTTTCTCTCCCTCATGATATTACTAGCCGCAAAAGGACTCGTGGGGATAGGCGAAGTA
GCGTTTGTAATACTATCTTACATCTACTTGTATGAGTTCCTCTCTAGGTTTGCCTTCCCA
CGCAAGCAAAACGAGCAGAAGAGGAGACTCTCGAACCCTAAAAACAAACTCTTTCAAACT
TACTTCCTCGCCACTGCTATTATCGGCCTACTCTTCCCGATTTGCTACATCGGAGATGGA
CTATACCGGGGAGACATTCACGGTGTTAGAGCCGCAGCTCCACATCTCTTCCTCCTCTCC
GGTCAAGCCTTCACAGAACCAATTGGTTTCTCTGACCGGTTTGCGACTCCCATTGGTATT
CTTGGACCGGTTTTCTACAACGCTCGTCGTATCTTCGCGCTGTTGGATTGGGTTAAAGCC
GAGTTCTCAGATACTCAGCGTCCTGGTGGTCCAGTGAGATTGTACGGAGGAAGAGCCATT
GCTTCTGTTAACACTGTCATGTGGTTTTACAATCTGTTTGGTCTCTTGTTGCCTGTGTTT
CTTCCTCGGTCTTGTG**ATTTACTTCTCAGCC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2AJ72TF 695 0 0
GG
GAACAACTCTTGAAACCAAAGACTTCTCTAATGTCGGAAGAGATACGCGAGCACGGTAGT
GACACCAACCCTAAACCTTCTCCATCGCCGACAAAACGTGGTCTCATCAGCCGCAAGAGA
CAGCTCGTGTTTCTCTCCTTCATGATATTACTAGCCGCAAAAGGACTCGTGGGGATAGGA
GAAATAGCGTTTGTGATACTATCTTACATCTACTTGTATGAGTTCCTCTCTAGGTTTGCC
TTCCCGCGCAAGCAAAACGAGCAGAAGAGGAGACTCTCAAACCCTAAAAACAAACTCTTT
CAAACTTACTTCCTCGCCACTGCTATTATCGGCCTACTCTTCCCAATTTGCTACATCGGA
GATGGACTATACCGGGGAGACATTCGCGGTGTTAGAGCCGCAGCTCCACATCTCTTCCTC
CTCTCCGGTCAAGCCTTCACAGAACCAATTGGTTTCTCTGACCGGTTTGCGACTCCCATT
GGTATTCTTGGACCTGTTTTCTACAACGCTCGTCGTATCTTCGCGCTGTTGGATTGGGTT
AAAGCTGAGTTCTCAGATACTCAGCGTCCTGGTGGTCCAGTGAGATTGTACGGAGGAAGA
GCCATTGCTTCTGTTAACACTGTCATGTGGTTTTACAATCTGTTTGGTCTCTTGTTGCCT
GTGTTTCTTCCTCGGTCTTGTG**A
GATTTACT

QA 3 687 3 687
DS 

RD RR2DN86TF 711 0 0
G
AAACAGCTTCTGAACAACTCTTGAAACCAAAGACTTCTCTAATGTCGGAAGAGATACGCG
AGCACGGTAGTGACACCAACCCTAAACCTTCTCCACCGCCGCCAAAACGTGGTCTCATCA
GTCGCAAGAGACAGCTCGTGTTTCTCTCCCTCATGATATTACTAGCCGCAAAAGGACTCG
TGGGGATAGGCGAAGTAGCGTTTGTAATACTATCTTACATATACTTGTATGAGTTCCTCT
CTAGGTTTGCCTTCCCACGCAAGCAAAACGAGCAGAAGAGGAGACTCTCGAACCCTAAAA
ACAAACTCTTCCAAACTTACTTCCTTGCCACTGCTATTATCGGCCTACTCTTCCCGATTT
GCTACATCGGATATGGACTATACCGGGGAGACATTCACGGTGTTAGAGCTGCAGCTCCAC
ATCTCTTCCTCCTCTCCGGTCAAGCCTTCACAGAACCAATTGGTTTCTCTGACCGCTTTG
CGACTCCCATTGGTATTCTTGGACCGGTTTTCTACAACGCTCGTCGTATCTTCGCGCTGT
TGGATTGGGTTAAAGCCGAGTTCTCAGATACACAGCGTCCTGGTGGTCCAGTGAGATTGT
ACGGAGGAAGAGCCATTGCTTCTGTTAACACTGTCATGTGGTTTTACAATCTGCTTGGTC
TCTTGTTGCCTGTGTTTCTTCCTCGGTCTTGTGAGATTTACTTCTCAGCC

QA 2 711 2 711
DS 

RD RR2DN86JQ 729 0 0
CTCCACCGCCGCCAAAACGTGGTCTCATCAGTCGCAAGAGACAGCTCGTGTTTCTCTCCC
TCATGATATTACTAGCCGCAAAAGGACTCGTGGGGATAGGCGAAGTAGCGTTTGTAATAC
TATCTTACATATACTTGTATGAGTTCCTCTCTAGGTTTGCCTTCCCACGCAAGCAAAACG
AGCAGAAGAGGAGACTCTCGAACCCTAAAAACAAACTCTTCCAAACTTACTTCCTTGCCA
CTGCTATTATCGGCCTACTCTTCCCGATTTGCTACATCGGATATGGACTATACCGGGGAG
ACATTCACGGTGTTAGAGCTGCAGCTCCACATCTCTTCCTCCTCTCCGGTCAAGCCTTCA
CAGAACCAATTGGTTTCTCTGACCGCTTTGCGACTCCCATTGGTATTCTTGGACCGGTTT
TCTACAACGCTCGTCGTATCTTCGCGCTGTTGGATTGGGTTAAAGCCGAGTTCTCAGATA
CACAGCGTCCTGGTGGTCCAGTGAGATTGTACGGAGGAAGAGCCATTGCTTCTGTTAACA
CTGTCATGTGGTTTTACAATCTGCTTGGTCTCTTGTTGCCTGTGTTTCTTCCTCGGTCTT
GTGAGATTTACTTCTCAGCCGACAACAAAGGAGATTAGTTTCTGATCTCTTTTGTATACT
GTCTACTTTAGAACTTTTATGTTGTGTTTGTGTTCTCGTTTCCATCAGGTAAAAGATTAT
TGCTAATAA

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 6

CO CL1460Contig1 885 6 6 U
GGTTACAAATTCTTTAAGACTTATTCCTTAAACCATTATTTATTTGAACAAAAAGAACAT
TGGAATCAAAACAGTATTCAGACTGCTTTTTTCCTCTGGGAAAAAAAAATTATAAGATTT
CTATCTTGGAAAGGAGGAAAGATATTGTAGAGATAACACCTACACTTGATCATTCCTGGG
ACCTATCCATTTTCTGAACAGACTAAATTGAGTTGGAAGAAAGAGCTAGGTCTTTATCAT
CTAGCTTCTTGAGTATGTTTGACTTGTAAGTTGAAATGTCTGAATCTTCAGAGGAATCTG
GAGTCGATTTGACGATAGAGAGTGCTCCTTTAGATCCCAGGAAGTTTGCAGCTTCATCTG
ATTTAGAGAGAGCGGCAAGAGCTTTTAGAGCTTCTTTCCTTGTCTTGTCATCTTTAGCAG
CACCCAGCATGTGAAGAAGCTCTTGAGCCCCACCCAACTCTACAACCTTCATCCTCCTTT
CATCATCAATGGCGAAACGGGAAAGCCTTGAAGCACCTATTCTCTTAAACAAGGGATCTT
TCACATGTAAAAGCGAGACTGATTGCTGAATCAAAGTATCACCCATATAAGGGAAGAACT
GGTATCCAACATAGGTAGCTGTCCCAGCAAAGAAAAGCTTCAGCATCCATCCTATTTTCC
TCTCAGCTTCTTCCTCCAGTGTAAGGTCATCTTTCTTGGTCAACGAGGAGAAGTTTCGAG
ATGGAGGATACCCATTTCTACCTCTGCGAAAATGATTAGCGAGGCGAGCAGCAAAGATTC
GCATGACTTATCAGTGGCTTCGTGATCTTCCTCTCTCGTCTCCTTCTTCTTCGACCACTG
TGTGTTGTTGAGAGGTTCTTTGGTCCTAAATTGTAAGAAACCTCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF71JQ U 156
AF RR2GT66JQB U 1
AF RR2AC85JQ U 2
AF RR2AC85TF C 43
AF RR2BF71TF C 119
AF RR2GT66TF C 187
BS 1 92 RR2GT66JQB
BS 93 93 RR2AC85JQ
BS 94 601 RR2GT66JQB
BS 602 814 RR2AC85JQ
BS 815 849 RR2AC85TF
BS 850 885 RR2BF71TF

RD RR2BF71JQ 155 0 0
ACACCTACACTTGATCATTCCTGGGACCTATCCATTTTCTGAACAGACTAAATTGAGTTG
GAAAAAAGAGCTAGGTCTTTATCATCTAGCTTCTTGAGTATGTTTGACTTGTAAGTTGAA
ATGTCTGAATCTTCAGAGGAATCTGGAGTCGATTT

QA 1 155 1 155
DS 

RD RR2GT66JQB 601 0 0
GGTTACAAATTCTTTAAGACTTATTCCTTAAACCATTATTTATTTGAACAAAAAGAACAT
TGGAATCAAAACAGTATTCAGACTGCTTTTTTTCTCTGGGAAAAAAAAATTATAAGATTT
CTATCTTGGAAAGGAGGAAAGATATTGTAGAGATAACACCTACACTTGATCATTCCTGGG
ACCTATCCATTTTCTGAACAGACTAAATTGAGTTGGAAGAAAGAGCTAGGTCTTTATCAT
CTAGCTTCTTGAGTATGTTTGACTTGTAAGTTGAAATGTCTGAATCTTCAGAGGAATCTG
GAGTCGATTTGACGATAGAGAGTGCTCCTTTAGATCCCAGGAAGTTTGCAGCTTCATCTG
ATTTAGAGAGAGCGGCAAGAGCTTTTAGAGCTTCTTTCCTTGTCTTGTCATCTTTAGCAG
CACCCAGCATGTGAAGAAGCTCTTGAGCCCCACCCAACTCTACAACCTTCATCCTCCTTT
CATCATCAATGGCGAAACGGGAAAGCCTTGAAGCACCTATTCTCTTAAACAAGGGATCTT
TCACATGTAAAAGCGAGACTGATTGCTGAATCAAAGTATCACCCATATAAGGGAAGAACT
G

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2AC85JQ 813 0 0
GTTACAAATTCTTTAAGACTTATTCCTTAAACCATTATTTATTTGAACAAAAAGAACATT
GGAATCAAAACAGTATTCAGACTGCTTTTTTCCTCTGGGAAAAAAAAATTATAAGATTTC
TATCTTGGAAAGGAGGAAAGATATTGTAGAGATAACACCTACACTTGATCATTCCTGGGA
CCTATCCATTTTCTGAACAGACTAAATTGAGTTGGAAGAAAGAGCTAGGTCTTTATCATC
TAGCTTCTTGAGTATGTTTGACTTGTAAGTTGAAATGTCTGAATCTTCAGAGGAATCTGG
AGTCGATTTGACGATAGAGAGTGCTCCTTTAGATCCCAGGAAGTTTGCAGCTTCATCTGA
TTTAGAGAGAGCGGCAAGAGCTTTTAGAGCTTCTTTCCTTGTCTTGTCATCTTTAACAGC
ACCCAGCATGTGAAGAAGCTCTTGAGCCCCACCCAACTCTACAACCTTCATCCTCCTTTC
ATCATCAGTGGCGAAACGGGAAAGCCTTGAAGCACCTATTCTCTTAAACAAGGGATCTTT
CACATGTAAAAGCGAGACTGATTGCTGAATCAAAGTATCACCCATATAAGGGAAGAACTG
GTATCCAACATAGGTAGCTGTCCCAGCAAAGAAAAGCTTCAGCATCCATCCTATTTTCCT
CTCAGCTTCTTCCTCCAGTGTAAGGTCATCTTTCTTGGTCAACGAGGAGAAGTTTCGAGA
TGGAGGATACCCATTTCTACCTCTGCGAAAATGATTAGCGAGGCGAGCAGCAAAGATTCG
CATGACTTATCAGTGGCTTCGTGATCTTCCTCT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2AC85TF 809 0 0
TATTTGAC
AAAAGAACATTGGAATCAAAACAGTATTCAGACTGCTTTTTTCCTCTGGGAAAAAAAAAT
TATAAGATTTCTATCTTGGAAAGGAGGAAAGATATTGTAGAGATAACACATACACTTGAT
CATTCCTGGGACCTATCCATTTTCTGAACAGACTAAATTGAGTTGGAAGAAAGAGCTAGG
TCTTTATCATCTAGCTTCTTGAGTATGTTTGACTTGTAAGTTGAAATGTCTGAATCTTCA
GAGGAATCTGGAGTCGATTTGACGATAGAGAGTGCTCCTTTAGATCCCAGGAAGTTTGCA
GCTTCATCTGATTTAGAGAGAGCGGCAAGAGCTTTTAGAGCTTCTTTCCTTGTCTTGTCA
TCTTTAACAGCACCCAGCATGTGAAGAAGCTCTTGAGCCCCACCCAACTCTACAACCTTC
ATCCTCCTTTCATCATCAGTGGCGAAACGGGAAAGCCTTGAAGCACCTATTCTCTTAAAC
AAGGGATCTTTCACATGTAAAAGCGAGACTGATTGCTGAATCAAAGTATCACCCATATAA
GGGAAGAACTGGTATCCAACATAGGTAGCTGTCCCAGCAAAGAAAAGCTTCAGCATCCAT
CCTATTTTCCTCTCAGCTTCTTCCTCCAGTGTAAGGTCATCTTTCTTGGTCAACGAGGAG
AAGTTTCGAGATGGAGGATACCCATTTCTACCTCTGCGAAAATGATTAGCGAGGCGAGCA
GCAAAGATTCGCATGACTTATCAGTGGCTTCGTGATCTTCCTCTCTCGTCTCCTTCTTCT
TCGACCACTGTGTGTTGTT
CC

QA 9 807 9 807
DS 

RD RR2BF71TF 767 0 0
TTCTATCTTGGAAAGGAGGAAAGATATTGTAGAGATAACACCTACACTTGATCATTCCTG
GGACCTATCCATTTTCTGAACAGACTAAATTGAGTTGGAAGAAAGAGCTAGGTCTTTATC
ATCTAGCTTCTTGAGTATGTTTGACTTGTAAGTTGAAATGTCTGAATCTTCAGAGGAATC
TGGAGTCGATTTGACGATAGAGAGTGCTCCTTTAGATCCCAGGAAGTTTGCAGCTTCATC
TGATTTAGAGAGAGCGGCAAGAGCTTTTAGAGCTTCTTTCCTTGTCTTGTCATCTTTAGC
AGCACCCAGCATGTGAAGAAACTCTTGAGCCCCACCCAACTCTACAACCTTCATCCTCCT
TTCATCATCAATGGCGAAACGGGAAAGCCTTGAAGCACCTATTCTCTTAAACAAGGGATC
TTTCACATGTAAAAGCGAGACTGATTGCTGAATCAAAGTATCACCCATATAAGGGAAGAA
CTGGTATCCAACATAGGTAGCTGTCCCAGCAAAGAAAAGCTTCAGCATCCATCCTATTTT
CCTCTCAGCTTCTTCCTCCAGTGTAAGGTCATCTTTCTTGGTCAACGAGGAGAAGTTTCG
AGATGGAGGATACCCATTTCTACCTCTGCGAAAATGATTAGCGAGGCGAGCAGCAAAGAT
TCGCATGACTTATCAGTGGCTTCGTGATCTTCCTCTCTCGTCTCCTTCTTCTTCGACCAC
TGTGTGTTGTTGAGAGGTTCTTTGGTCCTAAATTGTAAGAAACCTCC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2GT66TF 688 0 0
CCATTTTCTGAACAGACTAAATTGAGT*GGAAGAAAGAGCTAGGTCTTTATCATCTAGCT
TCTTGAGTATGTTTGACTTGTAAGTTGAAATGTCTGAATCTTCAGAGGAATCTGGAGTCG
ATTTGACGATAGAGAGTGCTCCTTTAGATCCCAGGAAGTTTGCAGCTTCATCTGATTTAG
AGAGAGCGGCAAGAGCTTTTAGAGCTTCTTTCCTTGTCTTGTCATCTTTAGCAGCACCCA
GCATGTGAAGAAGCTCTTGAGCCCCACCCAACTCTACAACCTTCATCCTCCTTTCATCAT
CAATGGCGAAACGGGAAAGCCTTGAAGCACCTATTCTCTTAAACAAGGGATCTTTCACAT
GTAAAAGCGAGACTGATTGCTGAATCAAAGTATCACCCATATAAGGGAAGAACTGGTATC
CAACATAGGTAGCTGTCCCAGCAAAGAAAAGCTTCAGCATCCATCCTATTTTCCTCTCAG
CTTCTTCCTCCAGTGTAAGGTCATCTTTCTTGGTCAACGAGGAGAAGTTTCGAGATGGAG
GATACCCATTTCTACCTCTGCGAAAATGATTAGCGAGGCGAGCAGCAAAGATTCGCATGA
CTTATCAGTGGCTTCGTGATCTTCCTCTCTCGTCTCCTTCTTCTTCGACCACTGTGTGTT
GTTGAGAGGTTCTTTGGTCCTAAATT
CC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 6

CO CL1461Contig1 893 6 10 U
GTAGTAGATCAATAATCTCACATTTCATTTCATGGAATTTAATGAACAAATTTCATAATC
CAAACCGGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACGATCACAATATTCAGAAGATA
AACTTCAAACACAAGACAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCCTCTCACCA
GATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAA
ACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGGGCAGGAGCGATCGGGGAAA*GCTTGTGCTCTCCGAA
CATCTCACCAGGCAACAAAACC*ATGTCCACAACATACACCGCGAGAGGACGCTGTGATC
TCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCCGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTT
CACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCAGAAGCTTGAGTCCTAACCG
GGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAACGTGTAGAATTTGGGGCTAACGTGGTAGAGAA
TGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTAAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGAA
AAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAATGT
CTACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGC
CTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACCAGCAGGGCCTGGAGCTGGTGCTGCCG
GCTGAGCTAATGTCTCCGTTGAGAGAAGCACCGCGGCGATGAGGAGGAGAGGAGCTAGAG
TTAGACGTGTGATAGCCATTGCTATGTTGTTTACTTAACCTCTGAAGAGTCCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2CW71JQ U 1
AF RR2CW71TF C 41
AF RR2FB08JQ U 34
AF RR2B094JQ U 6
AF RR2FB08TF C 169
AF RR2B094TF C 216
BS 1 353 RR2CW71JQ
BS 354 354 RR2B094JQ
BS 355 488 RR2CW71JQ
BS 489 489 RR2B094JQ
BS 490 722 RR2CW71JQ
BS 723 871 RR2B094JQ
BS 872 872 RR2FB08TF
BS 873 873 RR2B094TF
BS 874 892 RR2FB08TF
BS 893 893 RR2B094TF

RD RR2CW71JQ 723 0 0
GTAGTAGATCAATAATCTCACATTTCATTTCATGGAATTTAATGAACAAATTTCATAATC
CAAACCGGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACGATCACAATATTCAGAAGATA
AACTTCAAACACAAGACAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCCTCTCACCA
GATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAA
ACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGGGCAGGAGCGATCGGGGAAA*GCTTGTGCTCTCCGAA
CATCTCACCAGGCAACAAAACC*ATGTCCACAACATACACCGCGAGAGGACGCCGTGATC
TCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCCGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTT
CACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCAGAAGCTTGAGTCCTAACCG
GGTTACTCGCGGAGAGGAGATCGTCCAACGTGTAGAATTTGGGGCTAACGTGGTAGAGAA
TGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTAAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGAA
AAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAATGT
CTACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGC
CT
C

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2CW71TF 683 0 0
AATGAACAAATTTCATAATCCAAAC*GGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACG
ATCACAATATTCAGAAGATAAACTTCAAACACAAGACAACAAGTCCAAAACCAAACC*TA
GTCCAACTCTCCTCTCACCAGATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGG
AGTTGGTGTTGTCATCGGAAACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGGGCAGGAGCGATCGGGG
AAA*GCTTGTGCTCTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACC*ATGTCCACAACATACAC
CGCGAGAGGACGCCGTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCCGTTGA
GACATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCC
AGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTCGCGGAGAGGAGATCGTCCAACGTGTAGAATTT
GGGGCTAACGTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTAAGAGT
TCCGGCTTTGAGGTTTTGAAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGA
TGAACTGTTGACTTGAATGTCTACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCAT
GAAAGTAGTGAATTGACCGCCT
C

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2FB08JQ 692 0 0
GGAATTT
AATGAACAAATTTCATAATCCAAACCGGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACG
ATCACAATATTCAGAAGATAAACTTCAAACACAAGACAACAAGTCCAAAACCAAACCCTA
GTCCAACTCTCCTCTCACCAGATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGG
AGTTGGTGTTGTCATCGGAAACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGGGCAGGAGCGATCGGGG
AAA*GCTTGTGCTCTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACC*ATGTCCACAACATACAC
CGCGAGAGGACGCTGTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCCGTTGA
GACATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCC
AGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAACGTGTAGAATTT
GGGGCTAACGTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTAAGAGT
TCCGGCTTTGAGGTTTTGAAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGA
TGAACTGTTGACTTGAATGTCTACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCAT
GAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTTT

QA 8 692 8 692
DS 

RD RR2B094JQ 866 0 0
AGATTAATAATCTCAGATTTCATTTCATGGAATTTAATGAACAAATTTCATAACCCAAAC
CGGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACGATCACAATATTCAGAAGATAAACTT
CAAACACAAGACAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCCTCTCACCAGATGC
TAACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAAACCCC
AGTGGTCGGAGATTTAGGGGCAGGAGCGATCGGGGAAA*GCTTGTGCTCTCCGAACATCT
CACCAGGCAACAAAACC*ATGTCCACAACATACACCGCGAGAGGACGCTGTGATCTCAAC
GCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCACCG
GTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTA
CTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTTGGGGCTGACGTGGTAGAGAATGAGT
TTGACTTGTTCATCTGCGCTCAACTTGTTTAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGAAAAGCA
TTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAATGTCCACT
TGGCTACCGATTTGAGCGATTTTCAAAAGATGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTTT
TCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACCAGCAGGGCCTGGAGCTGGTGCTGCCGGCTGA
GCTAATGTCTCCGTTGAGAGAAGCACCGCGGCGATGAGGAGGAGAGGAGCTAGAGTTAGA
CGTGTGATAGCCATTGCTATGTTGTT

QA 1 866 1 866
DS 

RD RR2FB08TF 724 0 0
CTCCTCTCACCAGATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGC*TTTTTAGTGGAGTTGGTG
TTGTCATCGGAAACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGGGCAGGAGCGATCGGGGAAA*GCTT
GTGCTCTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACC*ATGTCCACAACATACACCGCGAGAG
GACGCTGTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCCGTTGAGACATTGA
CTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCAGAAGCTT
GAGTCCTAACCGGGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAACGTGTAGAATTTGGGGCTAA
CGTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTAAGAGTTCCGGCTT
TGAGGTTTTGAAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGT
TGACTTGAATGTCTACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCATGAAAGTAG
TGAATTGACCGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACCAGCAGGGCCTGGAG
CTGGTGCTGCCGGCTGAGCTGATGTCTCCGTTGAGAGAATCACGGCGGCGATGAGGAGGA
GAGGAGCTGGAGCTAGACGGGTGATAGCCATTGCTAGGTTGTTTGCTTAACCTCTGAAGA
GTCC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2B094TF 678 0 0
AGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAAACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGGGCAGGAGCGAT
CGGGGAAAAGCTTGTGCTCTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCCATGTCCACAACA
TACACCGCGAGAGGACGCTGTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCG
GTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCA
CGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAG
AATTTGGGGCTGACGTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCATCTGCGCTCAACTTGTTT
AGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGAAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCT
TCGGATGAACTGTTGACTTGAATGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGCGATTTTCAAAAGA
TGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACCA
GCAGGGCCTGGAGCTGGTGCTGCCGGCTGAGCTAATGTCTCCGTTGAGAGAAGCACCGCG
GCGATGAGGAGGAGAGGAGCTAGAGTTAGACGTGTGATAGCCATTGCTATGTTGTTTACT
TAATCTCTGAAGAGTCCT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 5

CO CL1462Contig1 1049 5 9 U
GGATTCAAAAGCAGTTTCCATCGACGATACAAAACACGACCAATCTCCGCACGGTTCCTG
TCGTAAAGCTCTCTTTCCTTTTGTTTCCTAACTTCCTAAGAGAACAAGTTGTATCAGTTA
TTTTGCTTGTGAGATAAAAAAAAGGGG*TGCAATGGCGAGGATAAAACCTCAGGCTCTGC
TAAATCAAAGCAAGAAGAAGAAGGGTCCTAGTCGGATAAGTATTTCGACAATTGTCGTGT
GTAATCTCGTAGTTGCTGTAGTTGTACTCTCCTTGGTCACTACTTATCGTCATTGGTCCC
AGAGGTCAAGAAACACACTTGAAACCCAGAGTCATAGTTTTGAGGACACAAATGCTGTAT
CACAACAAAAGAATAACGATCGTCCTGGCTATGCCGATATAAGCACATCAAAAGGTCTCA
TAACGGTGGAACTCTTTAAAGATGCTTCCCCTGAAGCTGTCGACAAGTTTCTAGATCTAT
GTAAAAATGACCACTTTAAGGGAATGCCGTTTCATCGGGTTATAAAAAACTACTTGGTAC
AAGCTGGTCACTCCTCGAGCTCTATACCTGTAGAAGAATGGACTGCTAAAGGAAAGCTCC
GTGGTCGCCTTGACACAAGCCCAAAACATGAAGCATTCATGTTGGGGACACCAAAAAACA
AAGGGAACAACAACAACAAGGACTTCGAGCTTCTGATCACAACGGCGCCAATCCCGGATC
TGAATGATCAGCTTATAGTGTTCGGAAGAGTCCTTAAGGGAGAGGATGTAGTACAGGAGA
TTGAGGAAGTGGATACAGATGAACATTTCCAGCCGAAATCGCAGATAGGGATCATTAGCA
TTGTATTGAAACTAGAATTATGAAATGAAAAATTTCTCTTGTTTAGTACGTGACGCCAAA
TCTTTTCTTCACACTCGCCTGTTTGTCTAAATCCTTTTTTTTTTATAATCTTCATTTTAC
TGATTATTTCCTGTTGTTTTGTAACTTTAATAGGTCTCTATCCAGGAAATAACATCTTTT
GTTTAAGTTATCATAATTGGTTGTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C549TF U 1
AF RR2GD66TF U 34
AF RR2F859TF U 34
AF RR2GD66JQ C 276
AF RR2C549JQ C 277
BS 1 194 RR2C549TF
BS 195 195 RR2F859TF
BS 196 657 RR2C549TF
BS 658 779 RR2F859TF
BS 780 943 RR2GD66JQ
BS 944 944 RR2C549JQ
BS 945 1011 RR2GD66JQ
BS 1012 1012 RR2C549JQ
BS 1013 1049 RR2GD66JQ

RD RR2C549TF 657 0 0
GGATTCAAAAGCAGTTTCCATCGACGATACAAAACACGACCAATCTCCGCACGGTTCCTG
TCGTAAAGCTCTCTTTCCTTTTGTTTCCTAACTTCCTAAGAGAACAAGTTGTATCAGTTA
TTTTGCTTGTGAGATAAAAAAAAGGGG*TGCAATGGCGAGGATAAAACCTCAGGCTCTGC
TAAATCAAAGCAAGGAGAAGAAGGGTCCTAGTCGGATAAGTATTTCGACAATTGTCGTGT
GTAATCTCGTAGTTGCTGTAGTTGTACTCTCCTTGGTCACTACTTATCGTCATTGGTCCC
AGAGGTCAAGAAACACACTTGAAACCCAGAGTCATAGTTTTGAGGACACAAATGCTGTAT
CACAACAAAAGAATAACGATCGTCCTGGCTATGCCGATATAAGCACATCAAAAGGTCTCA
TAACGGTGGAACTCTTTAAAGATGCTTCCCCTGAAGCTGTCGACAAGTTTCTAGATCTAT
GTAAAAATGACCACTTTAAGGGAATGCCGTTTCATCGGGTTATAAAAAACTACTTGGTAC
AAGCTGGTCACTCCTCGAGCTCTATACCTGTAGAAGAATGGACTGCTAAAGGAAAGCTCC
GTGGTCGCCTTGACACAAGCCCAAAACATGAAGCATTCATGTTGGGGACACCAAAAA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2GD66TF 625 0 0
GG
ACGACCAATCTCCGCACGGTTCCTGTCGTAAAGCTCTCTTTCCTTTTGTTTCCTAACTTC
CTAAGAGAACAAGTTGTATCAGTTATTTTGCTTGTGAGATAAAAAAAAGGGG*TGCAATG
GCGAGGATAAAACCTCAGGCTCTGCTAAATCAAAGCAAGAAGAAGAAGGGTCCTAGTCGG
ATAAGTATTTCGACAATTGTCGTGTGTAATCTCGTAGTTGCTGTAGTTGTACTCTCCTTG
GTCACTACTTATCGTCATTGGTCCCAGAGGTCAAGAAACACACTTGAAACCCAGAGTCAT
AGTTTTGAGGACACAAATGCTGTATCACAACAAAAGAATAACGATCGTCCTGGCTATGCC
GATATAAGCACATCAAAAGGTCTCATAACGGTGGAACTCTTTAAAGATGCTTCCCCTGAA
GCTGTCGACAAGTTTCTAGATCTATGTAAAAATGACCACTTTAAGGGAATGCCGTTTCAT
CGGGTTATAAAAAACTACTTGGTACAAGCTGGTCACTCCTCGAGCTCTATACCTGTAGAA
GAATGGACTGCTAAAGGAAAGCTCCGTGGTCGCCTTGACACAAGCCCAAAACATGAAGCA
TTCATGTTGGGGACACCAAAAAA

QA 3 625 3 625
DS 

RD RR2F859TF 749 0 0
GG
ACGACCAATCTCCGCACGGTTCCTGTCGTAGCGCTCTCTTTCCTTTTGTTTCCTAACTTC
CTAAGAGAACAAGTTGTATCAGTTATTT*GCTTGTGAGATAAAAAAAAGGGGGTGCAATG
GCGAGGATAAAACCTCAGGCTCTGCTAAATCAAAGCAAGAAGAAGAAGGGTCCTAGTCGG
ATAAGTATTTCTACAATTGTCGTGTGTAATCTCGTAGTTGCTGTAGTTGTACTCTCCTTG
GTCACTACTTATCGTCATTGGTCCCAGAGGTCAAGAAACACACTTGAAACCCAGAGTCAT
AGTTTTGAGGACACAAATGCTGTATCACAACAAAAGAATAACGATCGTCCTGGCTATGCC
GATATAAGCACATCAAAAGGTCTCATAACTGTGGAACTCTTTAAAGATGCTTCCCCTGAA
GCTGTCAACAAGTTTCTAGATCTGTGTAAAAAAGATCACTTCAAGGGAATGCCGTTTCAA
CGGGTTATAAAAAACTACTTGGTGCAAGCTGGTCACTCCTCGAGCTCTATACCTGTAGAA
GAATGGACTGCTAAAGGAAAGCTCCGTGGTCGCCTTGACACAAGCCCAAAACATGAAGCA
TTCATGTTGGGGACACCAAAAAACAAAGGGAACAACAACAACAAGGACTTCGAGCTTCTG
ATCACAACGGCGCCAATCCCGGATCTGAATGATCAGCTTATAGTGTTCGGAAGAGTCCTT
AAGGGAGAGGATGTAGTACAGGAG
GTG

QA 3 746 3 746
DS 

RD RR2GD66JQ 774 0 0
GTCACTACTTATCGTCATTG*TCCCAGAGGTCAAGAAACACACTTGAAACCCAGAGTCAT
AGTTTTGAGGACACAAATGCTGTATCACAACAAAAGAATAACGATCGTCCTGGCTATGCC
GATATAAGCACATCAAAAGGTCTCATAACGGTGGAACTCTTTAAAGATGCTTCCCCTGAA
GCTGTCGACAAGTTTCTAGATCTATGTAAAAATGACCACTTTAAGGGAATGCCGTTTCAT
CGGGTTATAAAAAACTACTTGGTACAAGCTGGTCACTCCTCGAGCTCTATACCTGTAGAA
GAATGGACTGCTAAAGGAAAGCTCCGTGGTCGCCTTGACACAAGCCCAAAACATGAAGCA
TTCATGTTGGGGACACCAAAAAACAAAGGGAACAACAACAACAAGGACTTCGAGCTTCTG
ATCACAACGGCGCCAATCCCGGATCTGAATGATCAGCTTATAGTGTTCGGAAGAGTCCTT
AAGGGAGAGGATGTAGTACAGGAGATTGAGGAAGTGGATACAGATGAACATTTCCAGCCG
AAATCGCAGATAGGGATCATTAGCATTGTATTGAAACTAGAATTATGAAATGAAAAATTT
CTCTTGTTTAGTACGTGACGCCAAATCTTTTCTTCACACTCGCCTGTTTGTCTAAATCCT
TTTTTTTT*ATAATCTTCATTTTACTGATTATTTCCTGTTGTTTTGTAACTTTAATAGGT
CTCTATCCAGGAAATAGCATCTTTTGTTTAAGTTATCATAATTGGTTGTTTCTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2C549JQ 753 0 0
TCACTACTTATCGTCATTGGTCCCAGAGGTCAAGAAACACACTTGAAACCCAGAGTCATA
GTTTTGAGGACACAAATGCTGTATCACAACAAAAGAATAACGATCGTCCTGGCTATGCCG
ATATAAGCACATCAAAAGGTCTCATAACGGTGGAACTCTTTAAAGATGCTTCCCCTGAAG
CTGTCGACAAGTTTCTAGATCTATGTAAAAATGACCACTTTAAGGGAATGCCGTTTCATC
GGGTTATAAAAAACTACTTGGTACAAGCTGGTCACTCCTCGAGCTCTATACCTGTAGAAG
AATGGACTGCTAAAGGAAAGCTCCGTGGTCGCCTTGACACAAGCCCAAAACATGAAGCAT
TCATGTTGGGGACACCAAAAA*CAAAGGGAACAACAACAACAAGGACTTCGAGCTTCTGA
TCACAACGGCGCCAATCCCGGATTTGAATGATCAGCTTATAGTGTTCGGAAGAGTCCTTA
AGGGAGAGGATGTAGTACAGGAGATTGAGGAAGTGGATACAGATGAACATTTCCAGCCGA
AATCGCAGATAGGGATCATTAGCATTGTATTGAAACTAGAATTATGAAATGAAAAATTTT
TCTTGTTTAGTACGTGACGCCAAATCTTTTCTTCACACTCGCCTGTTTGTCTAAATCCTT
TTTTTTTTATAATCTTCATTTTACTGATTATTTCCTGTTGTTTTGTAACTTTAATAGGTC
TCTATCCAGGAAATAACATCTTTTGTTTAA
GTT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 2 6

CO CL1463Contig1 640 4 10 U
CTTTTAAAAGCAACAGTTGATTTGATATTCATTGGGAATTTCATCGAACACGTTAACGAC
AATTCTAAACGAAGACTACAACACTTGAAACCAAATCTAAACACGAGGAAATTAAAAGAA
GATATACAGATCCGACAAAGACCAAACAAGAGATCACTCCATCTTCTCCTCTTAAGCCCT
CTCTCCCCTGATTCTCCTCGCAAGCTGGATATCCTTGGGCATGATCGTAACCCTCTTGGC
GTGAATCGCGCAGAGATTGGTGTCCTCAAACAACCCGACGAGGTAAGCCTCGGCCGCTTC
CTGGAGAGCCGCGACGGCGCTGCTCTGGAACCTCAGATCCGTCTTGAAGTCCTGAGCGAT
CTCACGGACCAGACGCTGGAAGGGGAGCTTGCGGATCAGAAGCTCGGTGCTCTTCTGGTA
CTTCCTGATCTCCCTCAGCGCCACCGTTCCGGGACGGAATCTGTGCGGCTTCTTTACTCC
TCCGGTCGCCGGAGCTGATTTCCTGGCGGCTTTCGTCGCGAGCTGCTTCCTTGGGGCTTT
GCCTCCGGTGGATTTCCTGGCGGTTTGCTTGGTACGAGCCATTTGTGATTTCTAGATT*G
CTATTTGCTTTGGGAGAGAATGTGTTTGATTGTGCATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR2D822JQ U 51
AF RR2DJ73TF C 1
AF RR2D822TF C 7
AF RR2DJ73JQ U 6
BS 1 11 RR2DJ73TF
BS 12 50 RR2DJ73JQ
BS 51 254 RR2D822JQ
BS 255 255 RR2DJ73JQ
BS 256 370 RR2D822JQ
BS 371 371 RR2DJ73JQ
BS 372 372 RR2DJ73TF
BS 373 398 RR2DJ73JQ
BS 399 399 RR2DJ73TF
BS 400 640 RR2DJ73JQ

RD RR2D822JQ 320 0 0
CGTTAACGACAATTCTAAACGAAGACTACAACACTTGAAACCAAATCTAAACACGAGGAA
ATTAAAAGAAGATATACAGATCCGACAAAGACCAAACAAGAGATCACTCCATCTTCTCCT
CTTAAGCCCTCTCTCCCCTGATTCTCCTCGCAAGCTGGATATCCTTGGGCATGATCGTAA
CCCTCTTGGCGTGAATCGCGCAGAAATTGGTGTCCTCAAACAACCCGACGAGGTAAGCCT
CGGCCGCTTCCTGGAGAGCCGCGACGGCGCTGCTCTGGAACCTCAGATCCGTCTTGAAGT
CCTGAGCGATCTCACGGACC

QA 1 320 1 320
DS 

RD RR2DJ73TF 640 0 0
CTTTTAAAAGCAACAGTTGATTTGATATTCATTGGGAATTTCATCGAACACGTTAACGAC
AATTCTAAACGAAGACTACAACACTTGAAACCAAATCTAAACACGAGGAAATTAAAAGAA
GATATACAGATCCGACAAAGACCAAACAAGAGATCACTCCATCTTCTCCTCTTAAGCCCT
CTCTCCCCTGATTCTCCTCGCAAGCTGGATATCCTTGGGCATGATCGTAACCCTCTTGGC
GTGAATCGCGCAGAGATTGGTGTCCTCAAACAACCCGACGAGGTAAGCCTCGGCCGCTTC
CTGGAGAGCCGCGACGGCGCTGCTCTGGAACCTCAGATCCGTCTTGAAGTCCTGAGCGAT
CTCACGGACCAGACGCTGGAAGGGGAGCTTGCGGATCAGAAGCTCGGTGCTCTTCTGGTA
CTTCCTGATCTCCCTCAGCGCCACCGTTCCGGGACGGAATCTGTGCGGCTTCTTTACTCC
TCCGGTCGCCGGAGCTGATTTCCTGGCGGCTTTCGTCGCGAGCTGCTTCCTTGGGGCTTT
GCCTCCGGTGGATTTCCTGGCGGTTTGCTTGGTACGAGCCATTTGTGATTTCTAGATT*G
CTATTTGCTTTGGGAGAGAATGTGTTTGATTGTGC
ATCCC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2D822TF 630 0 0
AAAGC
AACAGTTGATTTGATATTCATTGGGAATTTCATCGAACACGTTAACGACAATTCTAAACG
AAGACTACAACACTTGAAACCAAATCTAAACACGAGGAAATTAAAAGAAGATATACAGAT
CCGACAAAGACCAAACAAGAGATCACTCCATCTTCTCCTCTTAAGCCCTCTCTCCCCTGA
TTCTCCTCGCAAGCTGGATATCCTTGGGCATGATCGTAACCCTCTTGGCGTGAATCGCGC
AGAGATTGGTGTCCTCAAACAACCCGACGAGGTAAGCCTCGGCCGCTTCCTGGAGAGCCG
CGACGGCGCTGCTCTGGAACCTCAGATCCGTCTTGAAGTCCTGAGCGATCTCACGGACCA
GACGCTGGAAGGGGAGCTTGCGGATCAGAAGCTCGGTGCTCTTCTGGTAC***CTGATCT
CCCTCAGCGCCACCGTTCCGGGACGGAATCTGTGCGGCTTCTTTACTCCTCCGGTCGCCG
GAGCTGATTTCCTGGCGGCTTTCGTCGCGAGCTGCTTCCTTGGGGCTTTGCCTCCGGTGG
ATTTCCTGGCGGTTTGCTTGGTACGAGCCATTTGTGATTTCTAGATTTGCTATTTGCTTT
GGGAGAGAATGTGTTTGATTGTGC
C

QA 6 629 6 629
DS 

RD RR2DJ73JQ 635 0 0
AAAAGC
AACAGTTGATTTGATATTCATTGGGAATTTCATCGAACACGTTAACGACAATTCTAAACG
AAGACTACAACACTTGAAACCAAATCTAAACACGAGGAAATTAAAAGAAGATATACAGAT
CCGACAAAGACCAAACAAGAGATCACTCCATCTTCTCCTCTTAAGCCCTCTCTCCCCTGA
TTCTCCTCGCAAGCTGGATATCCTTGGGCATGATCGTAACCCTCTTGGCGTGAATCGCGC
AAAGATTGGTGTCCTCAAACAACCCGACGAGGTAAGCCTCGGCCGCTTCCTGGAGAGCCG
CGACGGCGCTGCTCTGGAACCTCAAATCCGTCTTGAAGTCCTGAGCGATCTCACGGACCA
AACGCTGGAAGGGGAGCTTGCGGATCAAAAGCTCGGTGCTCTTCTGGTACTTCCTGATCT
CCCTCAGCGCCACCGTTCCGGGACGGAATCTGTGCGGCTTCTTTACTCCTCCGGTCGCCG
GAGCTGATTTCCTGGCGGCTTTCGTCGCGAGCTGCTTCCTTGGGGCTTTGCCTCCGGTGG
ATTTCCTGGCGGTTTGCTTGGTACGAGCCATTTGTGATTTCTAGATT*GCTATTTGCTTT
GGGAGAGAATGTGTTTGATTGTGCATCCC

QA 7 635 7 635
DS 



CO CL1463Contig2 627 2 2 U
TTCTCTCTTCTAAAGCAAAAACAGTAAATCCACCGGAGCAAACAAATGGCTCGTACCAAA
CAAACCGCCAGGAAATCCACCGGAGGCAAAGCTCCCAGGAAGCAGCTCGCGACCAAAGCC
GCCAGGAAGTCGGCTCCGGCGACCGGAGGAGTGAAGAAGCCGCACAGATTCCGTCCCGGA
ACCGTGGCGCTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACGGAGCTTCTCATCCGCAAG
CTCCCCTTCCAGCGTCTGGTCCGTGAGATCGCTCAGGACTTCAAGACGGATCTGAGGTTC
CAGAGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAAGCGGCGGAGGCTTACCTCGTCGGGTTGTTC
GAGGACACCAATCTCTGCGCGATTCACGCCAAGAGGGTTACGATTATGCCGAAGGATATC
CAGCTCGCAAGGAGAATCAGGGGAGAGAGGGCTTAAGGGGAGAAGATGGAGTGATCTCTT
GTTTGGTCTTTGTCGGATCTGTATATCTTCTTTTTAATTTCCTCGTTTTTAGATTTCGTT
TCGAGTGTTGTAGTCTTTGTTTAGAATTGTCGTCAACTTGTTCGATGAAATTCCCTAATG
AATATCAGATCTACTGTTATTTTCATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO74JQ C 1
AF RR2EO74TF U 1
BS 1 618 RR2EO74TF
BS 619 627 RR2EO74JQ

RD RR2EO74JQ 627 0 0
TTCTCTCTTCTAAAGCAAAAACAGTAAATCCACCGGAGCAAACAAATGGCTCGTACCAAA
CAAACCGCCAGGAAATCCACCGGAGGCAAAGCTCCCAGGAAGCAGCTCGCGACCAAAGCC
GCCAGGAAGTCGGCTCCGGCGACCGGAGGAGTGAAGAAGCCGCACAGATTCCGTCCCGGA
ACCGTGGCGCTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACGGAGCTTTTCATCCGCAAG
CTCCCCTTCCAGCGTCTGGTCCGTGAGATCGCTCAGGACTTCAAGACGGATCTGAGGTTC
CAGAGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAAGCGGCGGAGGCTTACCTCGTCGGGTTGTTC
GAGGACACCAATCTCTGCGCGATTCACGCCAAGAGGGTTACGATTATGCCGAAGGATATC
CAGCTCGCAAGGAGAATCAGGGGAGAGAGGGCTTAAGGGGAGAAGATGGAGTGATCTCTT
GTTTGGTCTTTGTCGGATCTGTATATCTTCTTTTTAATTTCCTCGTTTTTAGATTTCGTT
TCGAGTGTTGTAGTCTTTGTTTAGAATTGTCGTCAACTTGTTCGATGAAATTCCCTAATG
AATATCAGATCTACTGTTATTTTCATC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2EO74TF 627 0 0
TTCTCTCTTCTAAAGCAAAAACAGTAAATCCACCGGAGCAAACAAATGGCTCGTACCAAA
CAAACCGCCAGGAAATCCACCGGAGGCAAAGCTCCCAGGAAGCAGCTCGCGACCAAAGCC
GCCAGGAAGTCGGCTCCGGCGACCGGAGGAGTGAAGAAGCCGCACAGATTCCGTCCCGGA
ACCGTGGCGCTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACGGAGCTTCTCATCCGCAAG
CTCCCCTTCCAGCGTCTGGTCCGTGAGATCGCTCAGGACTTCAAGACGGATCTGAGGTTC
CAGAGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAAGCGGCGGAGGCTTACCTCGTCGGGTTGTTC
GAGGACACCAATCTCTGCGCGATTCACGCCAAGAGGGTTACGATTATGCCGAAGGATATC
CAGCTCGCAAGGAGAATCAGGGGAGAGAGGGCTTAAGGGGAGAAGATGGAGTGATCTCTT
GTTTGGTCTTTGTCGGATCTGTATATCTTCTTTTTAATTTCCTCGTTTTTAGATTTCGTT
TCGAGTGTTGTAGTCTTTGTTTAGAATTGTCGTCAACTTGTTCGATGAAATTCCCTAATG
AATATCAGATCTACTGTT
ATTTTCATC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 6

CO CL1464Contig1 1171 6 7 U
GGGTACATAATAATCCTGGCTTTTAATTATTATCTGAGCTAAGATAATGGGAAGCAGCGA
GGAGATGCCAGTGGTGCTCATCACGGGATGCTCTCAGGGAGGAATCGGCAACGCGCTTGC
TCGTGAATTCTCTGCGAAGGGTTGCCGAGTGGTGGCGACGAGTCGATCGCAAAGCACGAT
GGCCGATTTGGAGAAAGATCCCAAATTTTTAGTACAAGAGCTCGATGTTGGGTCGGAACA
GAGCGTGAGTAAAGTCTTGTCGGAAGTTTTCGACAAGTTTGGTCAGATCGATGTTCTGGT
CAACAACGCCGGAGTTCAATGCATCGGACCACTCGCGGAGGTTCCAATTCAGACCATGGA
GAACACTTTTAACACCAATGTGTTCGGTTCCATGAGGATGACTCAAGCTGTTATACCTCA
CATGGCGTTAAAGAAGAAAGGAAAGATTGTGAACATAGGAAGTATCAGCACAATGGCACC
AGGACCATGGGCAGGGGTTTATACCGCATCAAAAGCTGCTCTTCATGCTCTTACAGACAC
TTTACGGTTGGAGCTAAGGCCATTTGGGATTGATGTAATCAACATTGTCCCAGGAGGTAT
TCAATCAAACATAGCCGAGTCAGGAGTATCTAGCTTCAACGATTTACCTGAACTGAAACT
ATACAAGCCGTTCGAGGAAGCTATCCGTGAAAGGGCTTTTTTGTCGCAAAACGTTAAGCC
AATACCCGCAGAGACATTTGCGAAAGAGGTGGTATCGGTGGTGCTGAAGGAACACCCACC
GGCTTGGTACTCTACAGGAAGGTTATCCACTGTCGCCGCGATCATGCACCATATGCCCAT
TTCCGTCAAAGATTATCTCCTGACCAAGAGCTTCATGAAAAAGGGGCCAAAAGAAACTGT
TTGAATGTGTGTATCCAACAAGTAAAAATGTTGCATAACCATGAAACAAGCTAAATACAA
AGCCACACAAAAAAAAATTATATGATATTAGTGGGTCCACAAGACCAACACAGTTAGAGT
AAGATCCCAGTAAGACTAAAGTCTGGTTCTTATTTCTTATCACACAACTATCCTAAAGTA
TGTAATAGCCTAATTGTACTAGGTAATAAATCAAGGCAATAATGTGTCTGTTTGGTGGGA
ATATCAATATCAACAAATATCCTTCCAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B117TF U 211
AF RR2HA53TF U 1
AF RR2BZ14TF U 6
AF RR2B117JQ C 353
AF RR2HA53JQ C 385
AF RR2BZ14JQ C 368
BS 1 437 RR2HA53TF
BS 438 438 RR2BZ14TF
BS 439 553 RR2HA53TF
BS 554 604 RR2BZ14TF
BS 605 1061 RR2B117JQ
BS 1062 1062 RR2HA53JQ
BS 1063 1171 RR2B117JQ

RD RR2B117TF 139 0 0
AGTACAAGAGCTCGATGTTGGGTCGGAACAGAGCGTGAGTAAAGTCTTGTCGGAAGTTT*
CGACAAGTTTGGTCAGATCGATGTTCTGGTCAACAACGCCGGAGTTCAATGCATCGGACC
ACTCGCGGAGGTTCCAATT

QA 1 139 1 139
DS 

RD RR2HA53TF 553 0 0
GGGTACATAATAATCCTGGCTTTTAATTATTATCTGAGCTAAGATAATGGGAAGCAGCGA
GGAGATGCCAGTGGTGCTCATCACGGGATGCTCTCAGGGAGGAATCGGCAACGCGCTTGC
TCGTGAATTCTCTGCGAAGGGTTGCCGAGTGGTGGCGACGAGTCGATCGCAAAGCACGAT
GGCCGATTTGGAGAAAGATCCCAAATTTTTAGTACAAGAGCTCGATGTTGGGTCGGAACA
GAGCGTGAGTAAAGTCTTGTCGGAAGTTTTCGACAAGTTTGGTCAGATCGATGTTCTGGT
CAACAACGCCGGAGTTCAATGCATCGGACCACTCGCGGAGGTTCCAATTCAGACCATGGA
GAACACTTTTAACACCAATGTGTTCGGTTCCATGAGGATGACTCAAGCTGTTATACCTCA
CATGGCGTTAAAGAAGAGAGGAAAGATTGTGAACATAGGAAGTATCAGCACAATGGCACC
AGGACCATGGGCAGGGGTTTATACCGCATCAAAAGCTGCTCTTCATGCTCTTACAGACAC
TTTACGGTTGGAG

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2BZ14TF 599 0 0
GGG
AATAATCCTGGCTTTTAATTATTATCTGAGCTAAGATAATGGGAAGCAGCGAGGAGATGC
CAGTGGTGCTCATCACGGGATGCTCTCAGGGAGGAATCGGCAACGCGCTTGCTCGTGAAT
TCTCTGCGAAGGGTTGCCGAGTGGTGGCGACGAGTCGATCGCAAAGCACGATGGCCGATT
TGGAGAAAGATCCCAAATTTTTAGTACAAGAGCTCGATGTTGGGTCGGAACAGAGCGTGA
GTAAAGTCTTGTCGGAAGTTTTCGACAAGTTTGGTCAGACCGATGTTCTGGTCAACAACG
CCGGAGTTCAATGCATCGGACCACTCGCGGAGGTTCCAATTCAGACCATGGAGAACACTT
TTAACACCAATGTGTTCGGTTCCATGAGGATGACTCAAGCTGTTATACCTCACATGGCGT
TAAAGAAGAAAGGAAAGATTGTGAACATAGGAAGTATCAGCACAATGGCACCAGGACCAT
GGGCAGGGGTTTATACCGCATCAAAAGCTGCTCTTCATGCTCTTACAGACACTTTACGGT
TGGAGCTAAGGCCATTTGGGATTGATGTAATCAACATTGTCCCAGGAGGTATTCAA

QA 4 599 4 599
DS 

RD RR2B117JQ 819 0 0
ACCATGGAGAACACTTTTAACACCAATGTGTTCGGTTCCATGAGGATGACTCAAGCTGTT
ATACCTCACATGGCGTTAAAGAAGAAAGGAAAGATTGTGAACATAGGAAGTATCAGCACA
ATGGCACCAGGACCATGGGCAGGGGTTTATACCGCATCAAAAGCTGCTCTTCATGCTCTT
ACAGACACTTTACGGTTGGAGCTAAGGCCATTTGGGATTGATGTAATCAACATTGTCCCA
GGAGGTATTCAATCAAACATAGCCGAGTCAGGAGTATCTAGCTTCAACGATTTACCTGAA
CTGAAACTATACAAGCCGTTCGAGGAAGCTATCCGTGAAAGGGCTTTTTTGTCGCAAAAC
GTTAAGCCAATACCCGCAGAGACATTTGCGAAAGAGGTGGTATCGGTGGTGCTGAAGGAA
CACCCACCGGCTTGGTACTCTACAGGAAGGTTATCCACTGTCGCCGCGATCATGCACCAT
ATGCCCATTTCCGTCAAAGATTATCTCCTGACCAAGAGCTTCATGAAAAAGGGGCCAAAA
GAAACTGTTTGAATGTGTGTATCCAACAAGTAAAAATGTTGCATAACCATGAAACAAGCT
AAATACAAAGCCACACAAAAAAAAATTATATGATATTAGTGGGTCCACAAGACCAACACA
GTTAGAGTAAGATCCCAGTAAGACTAAAGTCTGGTTCTTATTTCTTATCGCACAACTATC
CTAAAGTATGTAATAGCCTAATTGTACTAGGTAATAAATCAAGGCAATAATGTGTCTGTT
TGGTGGGAATATCAATATCAACAAATATCCTTCCAACAC

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2HA53JQ 782 0 0
CGGTTCCATGAGGATGACTCAAGCTGTTATACCTCACATGGCGTTAAAGAAGAAAGGAAA
GATTGTGAACATAGGAAGTATCAGCACAATGGCACCAGGACCATGGGCAGGGGTTTATAC
CGCATCAAAAGCTGCTCTTCATGCTCTTACAGACACTTTACGGTTGGAGCTAAGGCCATT
TGGGATTGATGTAATCAACATTGTCCCAGGAGGTATTCAATCAAACATAGCCGAGTCAGG
AGTATCTAGCTTCAACGATTTACCTGAACTGAAACTATACAAGCCGTTCGAGGAAGCTAT
CCGTGAAAGGGCTTTTTTGCCGCAAAACGTTAAGCCAATACCCGCAGAGACATTTGCGAA
AGAGGTGGTATCGGTGGTGCTGAAGGAACACCCACCGGCTTGGTACTCTACAGGAAGGTT
ATCCACTGTCGCCGCGATCATGCACCATATGCCCATTTCCGTCAAAGATTATCTCCTGAC
CAAGAGCTTCATGAAAAAGGGGCCAAAAGAAACTGTTTGAATGTGTGTATCCAACAAGTA
AAAATGTTGCATAACCATGAAACAAGCTAAATACAAAGCCACACAAAAAAAAATTATATG
ATATTAGTGGGTCCACAAGACCAACACAGCTAGAGTAAGATCCCAGTAAGACTAAAGTCT
GGTTCTTATTTCTTATCACACAACTATCCTAAAGTATGTAATAGCCTAATTGTACTAGGT
AATAAATCAAGGCAATAATGTGTCTGTTTGGTGGGAATATCAATATCAACAAATA
TCCTTCC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2BZ14JQ 797 0 0
TTTAACACCAATGTGTTCGGT*CCATGAGGATGACTCAAGCTGTTATACCTCACATGGCG
TTAAAGAAGAAAGGAAAGATTGTGAACATAGGAAGTATCAGCACAATGGCACCAGGACCA
TGGGCAGGGGTTTATACCGCATCAAAAGCTGCTCTTCATGCTCTTACAGACACTTTACGG
TTGGAGCTAAGGCCATTTGGGATTGATGTAATCAACATTGTCCCAGGAGGTATTCAATCA
AACATAGCCGAGTCAGGAGTATCTAGCTTCAACGATTTACCTGAACTGAAACTATACAAG
CCGTTCGAGGAAGCTATCCGTGAAAGGGCTTTTTTGTCGCAAAACGTTAAGCCAATACCC
GCAGAGACATTTGCGAAAGAGGTGGTATCGGTGGTGCTGAAGGAACACCCACCGGCTTGG
TACTCTACAGGAAGGTTATCCACTGTCGCCGCGATCATGCACCATATGCCCATTTCCGTC
AAAGATTATCTCCTGACCAAGAGCTTCATGAAAAAGGGGCCAAAAGAAACTGTTTGAATG
TGTGTATCCAACAAGTAAAAATGTTGCATAACCATGAAACAAGCTAAATACAAAGCCACA
CAAAAAAAAATTATATGATATTAGTGGGTCCACAAGACCAACACAGTTAGAGTAAGATCC
CAGTAAGACTAAAGTCTGGTTCTTATTTCTTATCACACAACTATCCTAAAGTATGTAATA
GCCTAATTGTACTAGGTAATAAATCAAGGCAATAATGTGTCTGTTTGGTGGGAATATCAA
TATCAACAAATA
CCTTC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 2 5

CO CL1465Contig1 997 3 8 U
GGAGGATATCCAAGTTTTATGTTTCAAGATGTCTTGTATGATATAGTGCCTCAAGGTATT
AGCATTTTAATATGACTGAAGAAATATAATACAAATCCGAACAACATAGTAAACTACGGA
TAAAACAAGTGTAATAGTAATAATTCCTGAGTGAGCACAACGTGTGGGAAGTATCTTTAC
AAGATGAATAGAGCTATTAATCAAAGTCTGTTGAGAGGAATCCTATGACTTTGTTGGTGA
GAAGTTCTACTCTTTGTCCTGTCCACATGAGATATCACTTGCGGCATCGTCATCCCCACC
GATACTATAATCTCTATTCCTTCTCGGATCGATAAATTTGGCCTAATGATTTCTTCACTG
TTCACCAGAAATATATCTCCTATGTACAGATGATTCGTAGGCACATAAACACTACACAAC
TCCTCTTCTCCCTGGTCCGTCTGAAGTGTCACCGATGATGTGATAAATCCAAAGGCATAT
TCACCAATGCGAGGGTGACGGATGATTGCTACCTCTTTAAAGGCGGTTGTGTTTTGGTCG
GGAGAAATAGCAGTGCTAACTTGTTTGGAAGCTGAATAAAGGTGCATCACAAAGGGCATT
CTCCTTATAAACTGCTCCCCAAGCCAGAAAACCGTAGAGCCAAGCCACGAGGACGCAAAT
ATTCCGACAAAGAAAGTGAAAAGTACAGATGTAATGAACCCAAGTCCAAAGATGTCAACA
CCAAGGGTCTCGTATATGGGACTGAAGAAACCATCAACGAACTGGATAAACCACCAGGTG
ATGAGGAATGTAACAGCAACAGGAAATAGGACACCCAACTCTGAAGAACAGCATAGCAAG
CCTTGCGAGTAGAAGAATTGGGAGAGTTGGGAGGAGACTTGGGAGGATCTTCAGGGTCTT
GAGGAGCGAGTCCTTGACTCAGTGAACTCGTCGTAGCTTCCTTGTCTTCTGCCATCTCTC
CCTCCCTTCACACCAGAGGCGGACCAGATCTTCGATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G412JQ U 1
AF RR2A573JQ U 1
AF RR2B274TF C 176
BS 1 498 RR2A573JQ
BS 499 499 RR2G412JQ
BS 500 585 RR2A573JQ
BS 586 586 RR2G412JQ
BS 587 600 RR2A573JQ
BS 601 601 RR2G412JQ
BS 602 757 RR2A573JQ
BS 758 997 RR2B274TF

RD RR2G412JQ 681 0 0
GGAGGATATCCAAGTTTTATGTTTCAAGATGTCTTGTATGATATAGTGCCTCAAGGTATT
AGCATTTTAATATGACTGAAGAAATATAATACAAATCCGAACAACATAGTAAACTACGGA
TAAAACAAGTGTATTAGTAATAATTCCTGAGTGAGCACAACGTGTGGGAAGTATCTTTAC
AAGATGAATAGAGCTATTAATCAAAGTCTGTTGAGAGGAATCCTATGACTTTGTTGGTGA
GAAGTTCTACTCTTTGTCCTGTCCACATGAGATATCACTTGCGGCATCGTCATCCCCACC
GATACTATAATCTCTATTCCTTCTCGGATCGATAAATTTGGCCTAATGATTTCTTCACTG
TTCACCAGAAATATATCTCCTATGTACAGATGATTCGTAGGCACATAAACACTACACAAC
TCCTCTTCTCCCTGGTCCGTCTGAAGTGTCACCGATGATGTGATAAATCCAAAGGCATAT
TCACCAATGCGAGGGTGACGGATGATTGCTACCTCTTTAAAGGCGGTTGTGTTTTGGTCG
GGAGAAATAGCAGTGCTAACTTGTTTGGAAGCTGAATAAAGGTGCATCACAAAGGGCATT
CTCCTTATAAACTGCTCCCCAAGCCAGAAAACCGTAGAGCCAAGCCACGAGGACGCAAAT
ATTCCGACAAAGAAAGTGAAA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2A573JQ 757 0 0
GGAGGATATCCAAGTTTTATGTTTCAAGATGTCTTGTATGATATAGTGCCTCAAGGTATT
AGCATTTTAATATGACTGAAGAAATATAATACAAATCCGAACAACATAGTAAACTACGGA
TAAAACAAGTGTAATAGTAATAATTCCTGAGTGAGCACAACGTGTGGGAAGTATCTTTAC
AAGATGAATAGAGCTATTAATCAAAGTCTGTTGAGAGGAATCCTATGACTTTGTTGGTGA
GAAGTTCTACTCTTTGTCCTGTCCACATGAGATATCACTTGCGGCATCGTCATCCCCACC
GATACTATAATCTCTATTCCTTCTCGGATCGATAAATTTGGCCTAATGATTTCTTCACTG
TTCACCAGAAATATATCTCCTATGTACAGATGATTCGTAGGCACATAAACACTACACAAC
TCCTCTTCTCCCTGGTCCGTCTGAAGTGTCACCGATGATGTGATAAATCCAAAGGCATAT
TCACCAATGCGAGGGTGATGGATGATTGCTACCTCTTTAAAGGCGGTTGTGTTTTGGTCG
GGAGAAATAGCAGTGCTAACTTGTTTGGAAGCTGAATAAAGGTGCCTCACAAAGGGCATT
*TCCTTATAAACTGCTCCCCAAGCCAGAAAACCGTAGAGCCAAGCCACGAGGACGCAAAT
ATTCCGACAAAGAAAGTGAAAAGTACAGATGTAATGAACCCAAGTCCAAAGATGTCAACA
CCAAGGGTCTCGTATATGGGACTGAAGAAACCATCAA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2B274TF 822 0 0
TTTACAAGATGAATAGAGCTATTAATCAAAGTCTGTTGAGAGGAATCCTATGACTTTGTT
GGTGAGAAGTTCTACTCTTTGTCCTGTCCACATGAGATATCACTTGCGGCATCGTCATCC
CCACCGATACTATAATCTCTATTCCTTCTCGGATCGATAAATTTGGCCTAATGATTTCTT
CACTGTTCACCAGAAATATATCTCCTATGTACAGATGATTCGTAGGCACATACACACTAC
ACAACTCCTCTTCTCCCTGGTCCGTCTGAAGTGTCACCGATGATGTGATAAATCCAAATG
CATATTCACCAATGCGAGGGTGACGGGTGATTGCTACCTCTTTAAAGGCGGTTGTGTTTT
GGTCGGGAGAAATAGCAGTGCTGACTTGTTTAGAAGCTGAATAAAGGTGCTTCACAAAGG
GCATTCTCCTTATAAACTGCTCCCCAAGCCAGAAAACCGTAGAACCAAGCCACGAGGACG
CAAATATTCCGACAAAGAAAGTGAAAAGTACAGATGTAATGAACCCAAGTCCAAAGATGT
CAACACCAAGGGTCTCGTATATGGGACTGAAGAAACCATCAACGAACTGGATAAACCACC
AGGTGATGAGGAATGTAACAGCAACAGGAAATAGGACACCCAACTCTGAAGAACAGCATA
GCAAGCCTTGCGAGTAGAAGAATTGGGAGAGTTGGGAGGAGACTTGGGAGGATCTTCAGG
GTCTTGAGGAGCGAGTCCTTGACTCAGTGAACTCGTCGTAGCTTCCTTGTCTTCTGCCAT
CTCTCCCTCCCTTCACACCAGAGGCGGACCAGATCTTCGATC

QA 1 822 1 822
DS 



CO CL1465Contig2 788 2 8 U
GGAAGTCCCAAAAGAAGATCCACCGCTTATCGAAGATCTGGTCCGCCTCTGGTGTGAAGG
GAGGGAGAGATGGCAGAAGACAAGGAAGCTACGACGAGTTCACTGAGTCAAGGACTCGCT
CCTCAAGACCCTGAAGATCCTCCCAAGTCTCCTCCCAACTCTCCCAATTCTTCTACTCGC
AAGGCTTGCTATGCTGTTCTTCAGAGTTGGGTGTCCAAGAAGTTTATGACTGGCTTTGTC
GTCCTATTTCCTGTTGCTGTTACATTCCTCATCACCTGGTGGTTTATCCAGTTCGTTGAT
GGTTTCTTCAGTCCCATATACGAGACCCTTGGTGTTGACATCTTTGGACTTGGGTTCATT
ACATCTGTACTTTTCACTTTCTTTGTCGGAATATTTGCGTCCTCGTGGCTTGGCTCTACG
GTTTTCTGGCTTGGGGAGCAGTTTATAAGGAGAATGCCCTTTGTGAGGCACCTTTATTCA
GCTTCCAAACAAGTTAGCACTGCTATTTCTCCCGACCAAAACACAACCGCCTTTAAAGAG
GTAGCAATCATCCATCACCCTCGCATTGGTGAATATGCCTTTGGATTTATCACATCATCG
GTGACACTTCAGACGGACCAGGGAGAAGAGGAGTTGTGTAGTGTTTATGTGCCTACGAAT
CATCTGTACATAGGAGATATATTTCTGGTGAACAGTGAAGAAATCATTAGGCCAAATTTA
TCGATCCGAGAAGGAATAGAGATTATAGTATCGGTGGGGATGACGATGCCGCAAGTGATA
TCTCATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G412TF U 1
AF RR2A573TF U 89
BS 1 245 RR2G412TF
BS 246 246 RR2A573TF
BS 247 466 RR2G412TF
BS 467 467 RR2A573TF
BS 468 553 RR2G412TF
BS 554 554 RR2A573TF
BS 555 588 RR2G412TF
BS 589 788 RR2A573TF

RD RR2G412TF 588 0 0
GGAAGTCCCAAAAGAAGATCCACCGCTTATCGAAGATCTGGTCCGCCTCTGGTGTGAAGG
GAGGGAGAGATGGCAGAAGACAAGGAAGCTACGACGAGTTCACTGAGTCAAGGACTCGCT
CCTCAAGACCCTGAAGATCCTCCCAAGTCTCCTCCCAACTCTCCCAATTCTTCTACTCGC
AAGGCTTGCTATGCTGTTCTTCAGAGTTGGGTGTCCAAGAAGTTTATGACTGGCTTTGTC
GTCCTGTTTCCTGTTGCTGTTACATTCCTCATCACCTGGTGGTTTATCCAGTTCGTTGAT
GGTTTCTTCAGTCCCATATACGAGACCCTTGGTGTTGACATCTTTGGACTTGGGTTCATT
ACATCTGTACTTTTCACTTTCTTTGTCGGAATATTTGCGTCCTCGTGGCTTGGCTCTACG
GTTTTCTGGCTTGGGGAGCAGTTTATAAGGAGAATGCCCTTTGTGATGCACCTTTATTCA
GCTTCCAAACAAGTTAGCACTGCTATTTCTCCCGACCAAAACACAACCGCCTTTAAAGAG
GTAGCAATCATCCGTCACCCTCGCATTGGTGAATATGCCTTTGGATTT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2A573TF 700 0 0
GG
ACGACGAGTTCACTGAGTCAAGGACTCTCTCCTCAAGACCCTGAAGATCCTCCCAAGTCT
CCTCCCAACTCTCCCAATTCTTCTACTCGCAAGGCTTGCTATGCTGTTCTTCAGAGTTGG
GTGTCCAAGAAGTTTATGACTGGCTTTGTCGTCCTATTTCCTGTTGCTGTTACATTCCTC
ATCACCTGGTGGTTTATCCAGTTCGTTGATGGTTTCTTCAGTCCCATATACGAGACCCTT
GGTGTTGACATCTTTGGACTTGGGTTCATTACATCTGTACTTTTCACTTTCTTTGTCGGA
ATATTTGCGTCCTCGTGGCTTGGCTCTACGGTTTTCTGGCTTGGGGAGCAGTTTATAAGG
A*AATGCCCTTTGTGAGGCACCTTTATTCAGCTTCCAAACAAGTTAGCACTGCTATTTCT
CCCGACCAAAACACAACCGCCTTTAAAGAGGTAGCAATCATCCATCACCCTCGCATTGGT
GAATATGCCTTTGGATTTATCACATCATCGGTGACACTTCAGACGGACCAGGGAGAAGAG
GAGTTGTGTAGTGTTTATGTGCCTACGAATCATCTGTACATAGGAGATATATTTCTGGTG
AACAGTGAAGAAATCATTAGGCCAAATTTATCGATCCGAGAAGGAATAGAGATTATAGTA
TCGGTGGGGATGACGATGCCGCAAGTGATATCTCATGT

QA 3 700 3 700
DS 



AS 1 5

CO CL1466Contig1 673 5 10 U
GGGTTTAGTTAAAATCAAAAGATCGTGATATCGCAGTTGAGATTAAATGGCGATGGAAAT
AGCAACTCCGGTTCATGCACCGGTTACACCTCCGGCGAGCAACCTCATCATATCAGCAAC
GACGGCCGGAGAAACTCAGAAGAAGAACAGGATTCAAGTTTCTAACACCAAGAAACCCTT
GTTCTTCTACGTTAATCTCGCCAAGAGGTACATTCAACAACACAACGAGGTTGAGCTTTC
TGCACTTGGAATGGCAATCACAACAGTGGTTACCATCTCAGAAATATTGAAGAACAATGG
GCTTGCAACAGAGAAGAAAGTTCTGACATCGACAGTGGGAATGAAAGACGAGGTCAAAGG
GAAAATAGTTCAGAAGACAAAGATAGAGATTGTGTTGGGGAAATCAGATAAATTTGATTC
TCTGATGACTCCAGCGCCGGAGGAGGAGGCGGTGGCGAATATGGGGGAGAAACCAGTAGA
AGCTGAAGCTCGTGAAGGCAAGAATGAGTGACCAACTAAACATATTTCGAGGATTAGTAT
CATTTTCTTTATAACTATAACAAGCAAACTGTTTGTGCGACGACACATAACAAAGAATGC
TTTATTATTAACTCAAAAGTGATATTTTATGGAAAGACAATGAAATGTTTCTTCTTTTTG
GAGAAGGACAATG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF29JQ C 201
AF RR2FP92TF U 1
AF RR2FF29TF U -2
AF RR2FP92JQ C 1
AF RR2GC76TF U 1
BS 1 2 RR2FP92JQ
BS 3 7 RR2FP92TF
BS 8 416 RR2GC76TF
BS 417 417 RR2FP92TF
BS 418 519 RR2GC76TF
BS 520 520 RR2FP92TF
BS 521 601 RR2GC76TF
BS 602 602 RR2FF29TF
BS 603 665 RR2GC76TF
BS 666 673 RR2FP92JQ

RD RR2FF29JQ 428 0 0
CCAAGAGGTACATTCAACAACACAACGAGGTTGAGCTTTCTGCACTTGGAATGGCAATCA
CAACAGTGGTTACCATTTCAGAAATATTGAAGAACAATGGGCATGCAACAGAGAAGAAAG
TTTTGACATCGACAGTGGGAATGAAAGACGAGGTCAAAGGGAAAATAGTTCAGAAGACAA
AGATTGAGATTGTGTTGGGGAAATCAGATAAATTTGATTTTTTGATGACTCCAGCGGGGG
AGGAGGAGGCGGTGGGGAATATGGGGGAGAAACCAGTAGAAGCTGAAGCTCGTGAAGGCA
AGAATGAGTGACCAACTAAACATATTTCGAGGATTAGTATCATTTTCTTTATAACTATAA
CAAGCAAACTGTTTGTGCGACGACACATAACAAAGAATGCTTTATTATTAACCCAAAAGT
TATATTTT

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR2FP92TF 638 0 0
GG
GTTTAGTTAAAATCAAAAGATCGTGATATCGCAGTTGAGATTAAATGGCGATGGAAATAG
CAACTCCGGTTCATGCACCGGTTACACCTCCGGCGAGCAACCTCATCATATCAGCAACGA
CGGCCGGAGAAACTCAGAAGAAGAACAGGATTCAAGTTTCTAACACCAAGAAACCCTTGT
TCTTCTACGTTAATCTCGCCAAGAGGTACATTCAACAACACAACGAGGTTGAGCTTTCTG
CACTTGGAATGGCAATCACAACAGTGGTTACCATCTCAGAAATATTGAAGAACAATGGGC
TTGCAACAGAGAAGAAAGTTCTGACATCGACAGTGGGAATGAAAGACGAGGTCAAAGGGA
AAATAGTTCAGAAGACAAAGATAGAGATTGTGTTGGGGAAATCAGATAAATTTGATTCTC
TGATGACTCCAGCGCCGGAGGAGGAGGCGGTGGCGAATATGGGGGAGAAACCAGTAGAAG
CTGAAGCTCGTGAAGGCAAGAATGAGTGACCAACTAAACATATTTCGAGGATTAGTATCA
TTTTCTTTATAACTATAACAAGCAAACTGTTTGTGCGACGACACATAACAAAGAATGCTC
TATTATTAACTCAAAAGTGATATTTTATGGAAAGAC

QA 3 638 3 638
DS 

RD RR2FF29TF 631 0 0
GGAAAGTTTG
GTTAAACTCAAAAGATCGTGATATCGCAGTTGAGATTAAATGGCGATGGAAATAGCAACT
CCGGTTCATGCACCGGTTACACCTCCGGCGAGCAACCTCATCATATCAGCAACGACGGCC
GGAGAAACTCAGAAGAAGAACAGGATTCAAGTTTCTAACACCAAGAAACCCTTGTTCTTC
TACGTTAATCTCGCCAAGAGGTACATTCAACAACACAACGAGGTTGAGCTTTCTGCACTT
GGAATGGCAATCACAACAGTGGTTACCATCTCAGAAATATTGAAGAACAATGGGCATGCA
ACAGAGAAGAAAGTTCTGACATCGACAGTGGGAATGAAAGACGAGGTCAAAGGGAAAATA
GTTCAGAAGACAAAGATTGAGATTGTGTTGGGGAAATCAGATAAATTTGATTCTCTGATG
ACTCCAGCGGCGGAGGAGGAGGCGGTGGCGAATATGGGGGAGAAACCAGTAGAAGCTGAA
GCTCGTGAAGGCAAGAATGAGTGACCAACTAAACATATTTCGAGGATTAGTATCATTTTC
TTTATAACTATAACAAGCAAACTGTTTGTGCGACGACACATAACAAAGAATGCTTTATTA
TTAACCCAAAAGTTATATTTT

QA 11 631 11 631
DS 

RD RR2FP92JQ 673 0 0
GGGTTTAGTTAAAATCAAAAGATCGTGATATCGCAGTTGAGATTAAATGGCGATGGAAAT
AGCAACTCCGGTTCATGCACCGGTTACACCTCCGGCGAGCAACCTCATCATATCAGCAAC
GACGGCCGGAGAAACTCAGAAGAAGAACAGGATTCAAGTTTTTAACACCAAGAAACCCTT
GTTTTTTTACGTTAATCTCGCCAAGAGGTACATTCAACAACACAACGAGGTTGAGCTTTT
TGCACTTGGAATGGCAATCACAACAGTGGTTACCATTTCAGAAATATTGAAGAACAATGG
GCTTGCAACAGAGAAGAAAGTTTTGACATCGACAGTGGGAATGAAAGACGAGGTCAAAGG
GAAAATAGTTCAGAAGACAAAGATAGAGATTGTGTTGGGGAAATCAGATAAATTTGATTT
TTTGATGACTCCAGCGCCGGAGGAGGAGGCGGTGGCGAATATGGGGGAGAAACCAGTAGA
AGCTGAAGCTCGTGAAGGCAAGAATGAGTGACCAACTAAACATATTTCGAGGATTAGTAT
CATTTTCTTTATAACTATAACAAGCAAACTGTTTGTGCGACGACACATAACAAAGAATGC
TTTATTATTAACTCAAAAGTGATATTTTATGGAAAGACAATGAAATGTTTTTTCTTTTTG
GAGAAGGACAATG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2GC76TF 665 0 0
GGGTCTA
GTTAAAATCAAAAGATCGTGATATCGCAGTTGAGATTAAATGGCGATGGAAATAGCAACT
CCGGTTCATGCACCGGTTACACCTCCGGCGAGCAACCTCATCATATCAGCAACGACGGCC
GGAGAAACTCAGAAGAAGAACAGGATTCAAGTTTCTAACACCAAGAAACCCTTGTTCTTC
TACGTTAATCTCGCCAAGAGGTACATTCAACAACACAACGAGGTTGAGCTTTCTGCACTT
GGAATGGCAATCACAACAGTGGTTACCATCTCAGAAATATTGAAGAACAATGGGCTTGCA
ACAGAGAAGAAAGTTCTGACATCGACAGTGGGAATGAAAGACGAGGTCAAAGGGAAAATA
GTTCAGAAGACAAAGATAGAGATTGTGTTGGGGAAATCAGATAAATTTGGTTCTCTGATG
ACTCCAGCGCCGGAGGAGGAGGCGGTGGCGAATATGGGGGAGAAACCAGTAGAAGCTGAA
GCTCGTGAAGGCAAGAATGAGTGACCAACTAA*CATATTTCGAGGATTAGTATCATTTTC
TTTATAACTATAACAAGCAAACTGTTTGTGCGACGACACATAACAAAGAATGCTCTATTA
TTAACTCAAAAGTGATATTTTATGGAAAGACAATGAAATGTTTCTTCTTTTTGGAGAA

QA 8 665 8 665
DS 



AS 1 5

CO CL1467Contig1 1254 5 9 U
GGATCAACATCTTCCCAATTTACAATATCCCGTTATTTCATCTTTTTTTTT*CTTTAATT
GCGTATCAAATTCCTAGCACCATGACTGTTCTTGTTGAACATTTCGCCTCCGATTCAAGA
ATCGAGGAAAAGAAAATGAAAGATGAGAGGGATGATGAACTGTTGTGGGATGGAGGTTTC
GTGGTTCCAAAATCTAAAGAAGCTGATGGATTTGATGCTCCTGATATCAATTTCTTGGGC
CACTCTTTTAGGGATTATGAGAATGGTGCAAGCGAGAGACAGCAAAGTGTTGAGGAATTC
TATCGGATGCAACACATTCACCAGACTTATGACTTTGTGAAAGAAATGAGAAAAGAGTAT
GGAAAACTTAGCAAAATGGAAATGAGTATATGGGAATGTTGTGAACTATTGAACAACGTG
GTCGATGACAGTGATCCCGATCTGGACGAGCCTCAAATTCAACACCTTCTCCAAACCGCT
GAAGCCATTAGGAGGGATTATCCTAATGAAGACTGACTCCATCTCACTGCTTTAATCCAT
GATCTTGGAAAGGTTCTGCTTTTGCCAGAATTCGGTGGTCTTCCCCAGTGGGCTGTCGTT
GGCGATACATTTCCAGTTGGATGCGCCTTTGACTCGGCCAATATCCACCACAAGTATTTC
AAAGAAAATCCTGATAATAACACCCCAAAATACAATACCAAAAATGGAGTATACAGTGA*
AAGGATGTGGACTGGACAATGTTTTTATGTCATGGGGTCATGACGACTACATGTATTTGG
TGGCTAAGGAGAATGGCACAACTCTTCCTCACGCTGGTCTCTTCATTATTCGATACCATT
CCTTTTATCCATTGCACAAGGCGGGGACCTACACACACTTGATGAACGGTGAAGACAGGG
AGGATCTCAAGTGGCTCCATGTATTCAATAAGTATGACCTATACAGTAAGAGCAAAGTTC
ATGTAGACGTCGAACAGGTGAAGCCTTACTACATTTCACTTATCAACAAGTATTTTCCGG
CAAAACTAAAATGGTGAAGAATAAAAACTGGGAGAGCACTTATTACATTTTACTTGGAGG
AGGATATCGAAGATTTGTGAGTTTATGTTCTATAAATCGAAAGATTAATCTTATCTAATA
AAAAGTTATGATGTTTTTTTTTTTTTTTTTGACAAAAGAAAAGTTATGATGTTCATTCTT
GTTTTTCTTGTCGATCATTTTCAAGAAACATTTTGTATTCAAAAGCATTTTATC


BQ
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D407TF U 1
AF RR2CT09TF U 1
AF RR2BH34TF U 1
AF RR2FQ81TF U 304
AF RR2D407JQ C 509
BS 1 102 RR2BH34TF
BS 103 103 RR2CT09TF
BS 104 515 RR2BH34TF
BS 516 516 RR2D407TF
BS 517 787 RR2BH34TF
BS 788 788 RR2FQ81TF
BS 789 792 RR2BH34TF
BS 793 973 RR2FQ81TF
BS 974 1254 RR2D407JQ

RD RR2D407TF 710 0 0
GGATCGACATCTTCCCAATTTACAATATCCCGTTATTTCATCTTTTTTTTTTCTTTAATT
GCGTACCAAATTCCTAGCACCATGACTGTTCTTGTTGAACATTTCGCCTCCGATTCAAGA
ATCGAGGAAAAGAAAATGAAAGATGAGAGGGATGATGAACTGTTGTGGGATGGAGGTTTC
GTGGTTCCAAAATCTAAAGAAGCTGATGGATTTGATGCTCCTGATATCAATTTCTTGGGC
CACTCTTTTAGGGATTATGAGAATGGTGCAAGCGAGAGACAGCAAAGTGTTGAGGAATTC
TATCGGATGCAACACATTCACCAGACTTATGACTTTGTGAAAGAAATGAGAAAAGAGTAT
GGAAAACTTAGCAAAATGGAAATGAGTATATAGGAATGTTGTGAACTATTGAACAACGTG
GTCGATGACAGTGATCCCGATCTGGACGAGCCTCAAATTCAACACCTTCTCCAAACCGCT
GAAGCCATTAGGAGGGATTATCCTAATGAAGACTGACTCCATCTCACTGCTTTAATCCAT
GATCTTGGAAAGGTTCTGCTTTTGCCAGAATTCGGTGGTCTTCCCCAGTGGGCTGTCGTT
GGCGATACATTTCCAGTTGGATGCGCCTTTGACTCGGCCAATATCCACCACAAGTATTTC
AAAGAAAATCCTGATAATAACACCCCAAAATACAATACCAAAA
TGGAGTA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2CT09TF 778 0 0
GGATCAACATCTTCCCAATTTACAATATCCCGTTATTTCATCTTTTTTTTT*CTTTAATT
GCGTATCAAATTCCTAGCACCATGACTGTTCTTGTTGAACATTTCGCCTCCGATTCAAGA
ATCGAGGAAAAGAAAATGAAAGATGAGAGGGATGATGAACTGTTGTGGGATGGAGGTTTC
GTGGTTCCAAAATCTAAAGAAGCTGATGGATTTGATGCTCCTGATATCAATTTCTTGGGC
CACTCTTTTAGGGATTATGAGAATGGTGCAAGCGAGAGACAGCAAAGTGTTGAGGAATTC
TATCGGATGCAACACATTCACCAGACTTATGACTTTGTGAAAGAAATGAGAAAAGAGTAT
GGAAAACTTAGCAAAATGGAAATGAGTATATGGGAATGTTGTGAACTATTGAACAACGTG
GTCGATGACAGTGATCCCGATCTGGACGAGCCTCAAATTCAACACCTTCTCCAAACCGCT
GAAGCCATTAGGAGGGATTATCCTAATGAAGACTGGCTCCATCTCACTGCTTTAATCCAT
GATCTTGGAAAGGTTCTGCTTTTGCCAGAATTCGGTGGTCTTCCCCAGTGGGCTGTCGTT
GGCGATACATTTCCAGTTGGATGCGCCTTTGACTCGGCCAATATCCACCACAAGTATTTC
AAAGAAAATCCTGATAATAACACCCCAAAATACAATACCAAAAATGGAGTATACAGTGA*
A*GGATGTGGACTGGACAATGTTTTTATGTCATGGGGTCATGACGACTACATGTATTT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2BH34TF 793 0 0
GGATCAACATCTTCCCAATTTACAATATCCCGTTATTTCATCTTTTTTTTT*CTTTAATT
GCGTATCAAATTCCTAGCACCATGACTGTTCTTGTTGAACATCTCGCCTCCGATTCAAGA
ATCGAGGAAAAGAAAATGAAAGATGAGAGGGATGATGAACTGTTGTGGGATGGAGGTTTC
GTGGTTCCAAAATCTAAAGAAGCTGATGGATTTGATGCTCCTGATATCAATTTCTTGGGC
CACTCTTTTAGGGATTATGAGAATGGTGCAAGCGAGAGACAGCAAAGTGTTGAGGAATTC
TATCGGATGCAACACATTCACCAGACTTATGACTTTGTGAAAGAAATGAGAAAAGAGTAT
GGAAAACTTAGCAAAATGGAAATGAGTATATGGGAATGTTGTGAACTATTGAACAACGTG
GTCGATGACAGTGATCCCGATCTGGACGAGCCTCAAATTCAACACCTTCTCCAAACCGCT
GAAGCCATTAGGAGGGATTATCCTAATGAAGACTGGCTCCATCTCACTGCTTTAATCCAT
GATCTTGGAAAGGTTCTGCTTTTGCCAGAATTCGGTGGTCTTCCCCAGTGGGCTGTCGTT
GGCGATACATTTCCAGTTGGATGCGCCTTTGACTCGGCCAATATCCACCACAAGTATTTC
AAAGAAAATCCTGATAATAACACCCCAAAATACAATACCAAAAATGGAGTATACAGTGA*
AAGGATGTGGACTGGACAATGTTTTTATGTCATGGGGTCATGACGACTACATGTATTTGG
TGGCTAAAGAGA
A

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2FQ81TF 670 0 0
G
GGATGCAACACATTCACCAGACTTATGACTTTGTGAAAGAAATGAGAAAAGAGTATGGAA
AACTTAGCAAAATGGAAATGAGTATATGGGAATGTTGTGAACTATTGAACAACGTGGTCG
ATGACAGTGATCCCGATCTGGACGAGCCTCAAATTCAACACCTTCTCCAAACCGCTGAAG
CCATTAGGAGGGATTATCCTAATGAAGACTGGCTCCATCTCACTGCTTTAATCCATGATC
TTGGAAAGGTTCTGCTTTTGCCAGAATTCGGTGGTCTTCCCCAGTGGGCTGTCGTTGGCG
ATACATTTCCAGTTGGATGCGCCTTTGACTCGGCCAATATCCACCACAAGTATTTCAAAG
AAAATCCTGATAATAACACCCCAAAATACAATACCAAAAATGGAGTATACAGTGTGAAGG
ATGTGGACTGGACAATGTTTTTATGTCATGGGGTCATGACGACTACATGTATTTGGTGGC
TAAGGAGAATGGCACAACTCTTCCTCACGCTGGTCTCTTCATTATTCGATACCATTCCTT
TTATCCATTGCACAAGGCGGGGACCTACACACACTTGATGAACGGTGAAGACAGGGAGGA
TCTCAAGTGGCTCCATGTATTCAATAAGTATGACCTATACAGTAAGAGCAAAGTTCATGT
AGACGTCGA

QA 2 670 2 670
DS 

RD RR2D407JQ 746 0 0
AAGACTGACTCCATCTCACTGCTTTAATCCATGATCTTGGAAAGGTTCTGCTTTTGCCAG
AATTCGGTGGTCTTCCCCAGTGGGCTGTCGTTGGCGATACATTTCCAGTTGGATGCGCCT
TTGACTCGGCCAATATCCACCACAAGTATTTCAAAGAAAATCCTGATAATAACACCCCAA
AATACAATACCAAAAATGGAGTATACAGTG**AAGGATGTGGACTGGACAATGTTTTTAT
GTCATGGGGTCATGACGACTACATGTATTTGGTGGCTAAGGAGAATGGCACAACTCTTCC
TCACGCTGGTCTCTTCATTATTCGATACCATTCCTTTTATCCATTGCACAAGGCGGGGAC
CTACACACACTTGATGAACGGTGAAGACAGGGAGGATCTCAAGTGGCTCCATGTATTCAA
TAAGTATGACCTATACAGTAAGAGCGAAGTTCATGTAGACGTCGAACAGGTGAAGCCTTA
CTACATTTCACTTATCAACAAGTATTTTCCGGCAAAACTAAAATGGTGAAGAATAAAAAC
TGGGAGAGCACTTATTACATTTTACTTGGAGGAGGATATCGAAGATTTGTGAGTTTATGT
TCTATAAATCGAAAGATTAATCTTATCTAATAAAAAGTTATGATGTTTTTTTTTTTTTTT
TTGACAAAAGAAAAGTTATGATGTTCATTCTTGTTTTTCTTGTCGATCATTTTCAAGAAA
CATTTTGTATTCAAAAGCATTTTATC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 4

CO CL1468Contig1 830 4 43 U
GAGGATACCCCCATCCCACCCAGATCGATAAGCAAGCAACCTCCCAAACTAAAAATTTTC
ATATTTTCCCGATTCAGATCAAACCACGCACCATCGCCGTTGCCTCCGCCACTTTCTGCT
AAATCCAGTCAGAAGAGAGAGAGAG**GATGGGAGCATTCGCATCGAGGTTTTGGTTCAT
GATGTTCCCTGCGAAAGAGTATAAGATCGTCGTCGTTGGTTTGGATAACGCCGGCAAAAC
GACGACGCTTTATAAGCTTCACTTGGGTGAAGTTGTCACCACTCATCCTACTGTCGGAAG
CAATGTCGAAGAGCTCGTTTACAAGAACATCCGCTTCGAGGTTTGGGATCTTGGTGGGCA
AGACAGGCTCAGAACCTCATGGGCAACTTACTACAGAGGCACGAACGCTGTAATCGTGGT
TATCGACAGCACAGACAGAGCCAGGATCTCTTTGATGAAAGATGAGCTTTCCAGATTACT
CGGGCACGAGGATCTTCAGAACTCGGTGATACTCGTGTTCGCAAACAAACAGGACCTGAA
GGATGCTATGAGCCCAGCTGAGATCACGGACGCGCTTAACCTTCACAGCATCAAGAACCA
TGATTGGCACATTCAAGCAAGCTGTGCAGTCACCGGAGAAGGGTTGCATGATGGGCTTGG
CTGGATTGCCCAGAAAGTTACTGAGAAACCTCCAAGTTAAAGAGGAAATGTCAGCAACCG
AATCACATAACAATGAACCTTTCACATTTTCTCTTTATGGTTGATTGATTTTTCTTTTTA
TACAGTGTATTAATTCCACTCTTCGTGTATGAGTTTTATCTATTTGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB20TF U 5
AF RR2BD95TF U 1
AF RR2G615TF U 59
AF RR2EE22JQ C 194
BS 1 54 RR2BD95TF
BS 55 55 RR2CB20TF
BS 56 145 RR2BD95TF
BS 146 147 RR2CB20TF
BS 148 258 RR2BD95TF
BS 259 259 RR2CB20TF
BS 260 294 RR2BD95TF
BS 295 295 RR2CB20TF
BS 296 354 RR2BD95TF
BS 355 355 RR2CB20TF
BS 356 375 RR2BD95TF
BS 376 376 RR2CB20TF
BS 377 387 RR2BD95TF
BS 388 388 RR2CB20TF
BS 389 402 RR2BD95TF
BS 403 403 RR2CB20TF
BS 404 458 RR2BD95TF
BS 459 459 RR2CB20TF
BS 460 468 RR2BD95TF
BS 469 469 RR2CB20TF
BS 470 477 RR2BD95TF
BS 478 478 RR2CB20TF
BS 479 483 RR2BD95TF
BS 484 484 RR2CB20TF
BS 485 608 RR2BD95TF
BS 609 609 RR2CB20TF
BS 610 633 RR2BD95TF
BS 634 634 RR2CB20TF
BS 635 670 RR2BD95TF
BS 671 724 RR2G615TF
BS 725 725 RR2EE22JQ
BS 726 731 RR2G615TF
BS 732 732 RR2EE22JQ
BS 733 749 RR2G615TF
BS 750 750 RR2EE22JQ
BS 751 772 RR2G615TF
BS 773 773 RR2EE22JQ
BS 774 790 RR2G615TF
BS 791 791 RR2EE22JQ
BS 792 796 RR2G615TF
BS 797 797 RR2EE22JQ
BS 798 817 RR2G615TF
BS 818 830 RR2EE22JQ

RD RR2CB20TF 654 0 0
GG
ACCCCCATCCCACCCAGATCGATAAGCAAGCAACCTCCCAAACTAAAAATTTTCATTTTT
TCCCGATTCAGATCAAACCGCGCACCATCGCCGTTGCCTCCGCCACTTTCTGCTAAATCC
AGTCAGAAGAGAGAGAGAG**GATGGGAGCATTCGCATCGAGGTTTTGGTTCATGATGTT
CCCTGCGAAAGAGTATAAGATCGTCGTCGTTGGTTTGGATAACGCCGGCAAAACGACGAC
GCTTTATAAGCTTCACTTGGGTGAAGTTGTCACCACTCATCCTACTGTCGGAAGCAATGT
CGAAGAGCTCGTTTACAAGAACATCCGCTTCGAGGTTTGGGATCTTGGTGGGCAAGACAG
GCTCAGAACCTCATGGGCAACTTACTACAGAGGCACGAACGCTGTAATCGTGGTTATCGA
CAGCACAGACAGAGCCAGGATCTCTTTGATGAAAGATGAGCTTTCCAGATTACTCGGGCA
CGAGGATCTTCAGAACTCGGTGATACTCGTGTTCGCAAACAAACAGGACCTGAAGGATGC
TATGAGCCCAGCTGAGATCACGGACGCGCTTAACCTTCACAGCATCAAGAGCCATGATTG
GCACATTCAAGCAAGCTGTGCAGTCACCGGAGAAAGGTTGCATGATGGG
GTT

QA 3 651 3 651
DS 

RD RR2BD95TF 670 0 0
GAGGATACCCCCATCCCACCCAGATCGATAAGCAAGCAACCTCCCAAACTAAAA*TTTTC
ATATTTTCCCGATTCAGATCAAACCACGCACCATCGCCGTTGCCTCCGCCACTTTCTGCT
AAATCCAGTCAGAAGAGAGAGAGAGAGGATGGGAGCATTCGCATCGAGGTTTTGGTTCAT
GATGTTCCCTGCGAAAGAGTATAAGATCGTCGTCGTTGGTTTGGATAACGCCGGCAAAAC
GACGACGCTTTATAAGCTCCACTTGGGTGAAGTTGTCACCACTCATCCTACTGTTGGAAG
CAATGTCGAAGAGCTCGTTTACAAGAACATCCGCTTCGAGGTTTGGGATCTTGGCGGGCA
AGACAGGCTCAGAACATCATGGGCAACGTACTACAGAGGCACAAACGCTGTAATCGTGGT
TATCGACAGCACAGACAGAGCCAGGATCTCTTTGATGAGAGATGAGCTATCCAGATTGCT
CGGTCACGAGGATCTTCAGAACTCGGTGATACTCGTGTTCGCAAACAAACAGGACCTGAA
GGATGCTATGAGCCCAGCTGAGATCACGGACGCGCTTAACCTTCACAGCATCAAGAACCA
TGATTGGCGCATTCAAGCAAGCTGTGCAGTCACTGGAGAAGGGTTGCATGATGGGCTTGG
CTGGATTGCC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2G615TF 759 0 0
GGATA
TTTTCCCGATTCAGATCAAACCACGCACCATCGCCGTTGCCTCCGCCACTTTCTGCTAAA
TCCAGTCAGAAGAGAGAGAGAG**GATGGGAGCATTCGCATCGAGGTTTTGGTTCATGAT
GTTCCCTGCGAAAGAGTATAAGATCGTCGTCGTTGGTTTGGATAACGCCGGCAAAACGAC
GACGCTTTATAAGCTCCACTTGGGTGAAGTTGTCACCACTCATCCTACTGTTGGAAGCAA
TGTCGAAGAGCTCGTTTACAAGAACATCCGCTTCGAGGTTTGGGATCTTGGCGGGCAAGA
CAGGCTCAGAACATCATGGGCAACGTACTACAGAGGCACAAACGCTGTAATCGTGGTTAT
CGACAGCACAGACAGAGCCAGGATCTCTTTGATGAAAGATGAGCTATCCAGATTGCTCGG
GCACGAGGATCTTCAGAACTCGGTGATACTCGTGTTCGCAAACAAACAGGACCTGAAGGA
TGCTATGAGCCCAGCTGAGATCACGGACGCGCTTAACCTTCACAGCATCAAGAACCATGA
TTGGCACATTCAAGCAAGCTGTGCAGTCACTGGAGAAGGGTTGCATGATGGGCTTGGCTG
GATTGCCCAGAAAGTTACTGAGAAACCTCCAAGTTAAAGAGGAAATGTCAGCAACCGAAT
CGCATAACTATGAACCTTTCACATTT*CTCTTTATGGTTGATTGATTTT*CTTTTTATAC
AGTGTAT*AATTCTACTCTTCGTGTATGAGTTTT

QA 6 759 6 759
DS 

RD RR2EE22JQ 637 0 0
AAAGAGTATAAGATCGTCGTCGTTGGTTTGGATAACGCCGGCAAAACGACGACGCTTTAT
AAGCTTCACTTGGGTGCAGTTGTCACCACTCATCCTACTGTCGGAAGCAGTGTCGAAGAG
CTCGTTTACAAGAACATCCGCTTCGAGGTTTGGGATCTTGGTGGGCAAGACAGGCTCAGA
ACCTCATGGGCAACTTACTACAGAGGCACGAACGCTGTAATCGTGGTTATCGACAGCACA
GACAGAGCCAGGATCTCTTTGATGAAAGATGAGCTTTCCAGATTACTCGGGCACGAGGAT
CTTCAGAACTCGGTGATACTCGTGTTCGCAAACAAACAGGACCTGAAGGACGCTATGAGC
CCAGCTGAGATCACGGACGCGCTTAACCTTCACAGCATCAAGAACCATGATTGGCACATT
CAAGCAAGCTGTGCAGTCACCGGAGAAGGGTTGCATGATGGGCTTGGCTGGATTGCCCAG
AAAGTTACTGAGAAACCTCCAAGTTAAAGAGGAAATGTCAGGAACCGAATCACATAACAT
TGAACCTTTCGCATTTTCTCTTTATGGTTGATTGATTTTTCTTTTTATACAGTGTATTAA
TTCCACTCTTCGTGTATGAGTTTTATCTATTTGGTTT

QA 1 637 1 637
DS 



AS 2 5

CO CL1469Contig1 1035 3 3 U
GCAATAATGGGTCTAGTAATCCCAGAAACTAAAGCAACTTAAAGAGTTGATAGGCAAAAG
TATATTTCAAGCCCCCCCCTACAGGCAACAAGACCGGCGAATAAAGTCACAAAATACATA
CCACGTCTATCGTTTGGTTGCCTTAAACCACTTAAAAAAAAGCCGAGAGAGATCCTAAGG
ATAAAAGCCGATTACTAGAGTACTTAAAAGAGCCAAGTTGTGGAAAACAGACTTCTGCAC
ATTAGAGAGAGAGATACTTCTTCTTCTTCTACACCTAACAGAAGAACATGGAATTGGCGA
CGTTGTCTTTGAGTTTAGGGAGCTGCGCAACAGAGATTGGTCCTGGAGCTGTCACGCCAC
CATGGCTTGAGGACGTCTCTGACTGATCTTCAAACTTCATGAACGTTCCTAGCTGAGAAG
CTGCCAAGTGAGCATAGCATATCGGTGCAACAACGGAGATGGCGGTCGTGCTTCTTTGGT
ACACGCAAGAGAGCGAGTGGACGAGCTCTTGAAGCTCATCAGGTGAGAAATGAATCTCAT
CATACAGGACGTGGTAATGCGTAGGACGTGTTGTTCCAATCATTCCAGCATGCGCACAAA
GGTAGAAATCGTTGTTCTTTGGGTGACAGATTTTGCTGTCGATGATTGTCCCTGGAGGAA
CGTTGTCAGGAGAGTTTGTCTGGAAAAACTTGGTGTGGTGATTCTTTTGAGCCACCAACA
ACAGAAACTTTGGATTCCAGTTCTCATCTAGAAGCTTGCAGGCCTCAATGATCTGATCTA
GTTCAATGTTCAGAACCTGGTTGAACTGAGATTCACTAACTCCATCCCTGAAGATGATGA
TATGCTCTGGCTTTCTCTTGCCCGAGCTGGTGTAGAAATCTACCAGCAACTCCTTGATTA
TGCCATCATCTTCTGTTCCATTCTTCTTGACCAGTGACTCAATCATCTCAGCTTTTGAAG
GCTGTGTGCGAACAGATGCCCTGTACTTCGAGACTAGAGGCCACTGCCTTGAACTCACCA
CAGCAGCGATGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR46JQ U 1
AF RR2CS91JQ U 52
AF RR2DR46TF C 295
BS 1 757 RR2DR46JQ
BS 758 849 RR2CS91JQ
BS 850 1035 RR2DR46TF

RD RR2DR46JQ 757 0 0
GCAATAATGGGTCTAGTAATCCCAGAAACTAAAGCAACTTAAAGAGTTGATAGGCAAAAG
TATATTTCAAGCCCCCCCCTACAGGCAACAAGACCGGCGAATAAAGTCACAAAATACATA
CCACGTCTATCGTTTGGTTGCCTTAAACCACTTAAAAAAAAGCCGAGAGAGATCCTAAGG
ATAAAAGCCGATTACTAGAGTACTTAAAAGAGCCAAGTTGTGGAAAACAGACTTCTGCAC
ATTAGAGAGAGAGATACTTCTTCTTCTTCTACACCTAACAGAAGAACATGGAATTGGCGA
CGTTGTCTTTGAGTTTAGGGAGCTGCGCAACAGAGATTGGTCCTGGAGCTGTCACGCCAC
CATGGCTTGAGGACGTCTCTGACTGATCTTCAAACTTCATGAACGTTCCTAGCTGAGAAG
CTGCCAAGTGAGCATAGCATATCGGTGCAACAACGGAGATGGCGGTCGTGCTTCTTTGGT
ACACGCAAGAGAGCGAGTGGACGAGCTCTTGAAGCTCATCAGGTGAGAAATGAATCTCAT
CATACAGGACGTGGTAATGCGTAGGACGTGTTGTTCCAATCATTCCAGCATGCGCACAAA
GGTAGAAATCGTTGTTCTTTGGGTGACAGATTTTGCTGTCGATGATTGTCCCTGGAGGAA
CGTTGTCAGGAGAGTTTGTCTGGAAAAACTTGGTGTGGTGATTCTTTTGAGCCACCAACA
ACAGAAACTTTGGATTCCAGTTCTCATCTAGAAGCTT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2CS91JQ 798 0 0
G
GGCAAAAGTATATTTCAAGCCCCCCCCTACAGGCAACAAGACCGGCGAATAAAGTCACAA
AATACATACCACGTCTATCGTTTGGTTGCCTTAAACCACTTAAAAAAAAGCCGAGAGAGA
TCCTAAGGATAAAAGCCGATTACTAGAGTACTTAAAAGAGCCAAGTTGTGGAAAACAGAC
TTCTGCACATTAGAGAGAGAGATACTTCTTCTTCTTCTACACCTAACAGAAGAACATGGA
ATTGGCGACGTTGTCTTTGAGTTTAGGGAGCTGCGCAACAGAGATTGGTCCTGGAGCTGT
CACGCCACCATGGCTTGAGGACGTCTCTGACTGATCTTCAAACTTCATGAACGTTCCTAG
CTGAGCAGCTGCCAAGTGAGCATAGCATATCGGTGCAACAACGGAGATGGCGGTCGTGCT
TCTTTGGTACACGTAAGAAAGCGAGTGGACGAGCTCTTGAAGCTCATCATGTGAGAAATG
AATCTCATCATACAGGACGTGGTAATGCGTAGGACGTGTTGTTCCAATCATTCCAGCATG
CGCACAAAGGTAGAAATCGTTATTCTTTGGGTGACAGATTTTGCTGTCGATGATTGTCCC
TGGAGGAACGTTGTCAGGAGAGTTTGTCTGGAAAAACTTGGTGTGGTGATTCTTTTGAGC
CACCAACAACAGAAACTTTGGATTCCAGTTCTCATCTAGAAGCTTGCAGGCCTCAATGAT
CTGATCTAGTTCAATGTTCAGAACCTGGTTGAACTGAGATTCACTAACTCCATCCCTGAA
GATGATGATATGCTCTG

QA 2 798 2 798
DS 

RD RR2DR46TF 741 0 0
TGGCGACGTTGTCTTTGAGTT*AGGGAGCTGCGCAACAGAGATTGGTCCTGGAGCTGTCA
CGCCACCATGGCTTGAGGACGTCTCTGACTGATCTTCAAACTTCATGAACGTTCCTAGCT
GAGAAGCTGCCAAGTGAGCATAGCATATCGGTGCAACAACGGAGATGGCGGTCGTGCTTC
TTTGGTACACGCAAGAGAGCGAGTGGACGAGCTCTTGAAGCTCATCAGGTGAGAAATGAA
TCTCATCATACAGGACGTGGTAATGCGTAGGACGTGTTGTTCCAATCATTCCAGCATGCG
CACAAAGGTAGAAATCGTTGTTCTTTGGGTGACAGATTTTGCTGTCGATGATTGTCCCTG
GAGGAACGTTGTCAGGAGAGTTTGTCTGGAAAAACTTGGTGTGGTGATTCTTTTGAGCCA
CCAACAACAGAAACTTTGGATTCCAGTTCTCATCTAGAAGCTTGCAGGCCTCAATGATCT
GATCTAGTTCAATGTTCAGAACCTGGTTGAACTGAGATTCACTAACTCCATCCCTGAAGA
TGATGATATGCTCTGGCTTTCTCTTGCCCGAGCTGGTGTAGAAATCTACCAGCAACTCCT
TGATTATGCCATCATCTTCTGTTCCATTCTTCTTGACCAGTGACTCAATCATCTCAGCTT
TTGAAGGCTGTGTGCGAACAGATGCCCTGTACTTCGAGACTAGAGGCCACTGCCTTGAAC
TCACCACAGCAGCGATGGACC

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL1469Contig2 972 2 6 U
CCAAAAATACCGTTTACGGTTATCACTTAGCGTCTTGTTTACTAGAAGATCGTCAGCAAA
TACATAAATTTGCAATATTGGGTCTAGTAATCCCAGCAATTAAAGCAACTTAAAGAGTTG
ATGGGCAAAAGTATATTTCAAGCCCCCCCTACAGGCAAACAAGACTGGCGAATAAAGTCA
CAAAATACATACCACGTCTATCGTTTGGTTGCCTTAAACCACTTAAAAAAAGCCGAGAGA
GATCCTAAGGATAAAAGCCGATTACTAGAGTACTTAAAAAAGCCAAGTTGTGGAAAACAG
ACTTCTGCACATTAGAGAGAGAGATACTTCTTCTTCTTCTTCTACACCTAACAGAAGAAC
ATGGAATTGGCGACGTTGTCTTTGAGTTTAGGGAGCTGCGTAACGGAGATTGGTCCTGGA
GCTGTCACGCCACCATGGCTTGAGGACGTCTCTGACTGATCTCCAAACTTCATGAACGTT
CCTAGCTGAGCAGCTGCCAAGTGTGCATAGCAGATCGGTGCAACAACGGAGATGGCGGTC
GTGCTTCTTTGGTACACGTAAGAGAGGGAGTGGACGAGCTCTTGAAGCTCATCAGGTGAG
AAATGAATCTCATCATACAGGACATGGTAATGCGTAGGACGGGTTGTTCCAATCATTCCA
GCGTGCGCACAGAGATAGAAATCATTGTTCTTTGGGTGACAGATTTTACTGTCAATGATT
GTCCCTGGTGGAACGTTATCAGGAGAGTTGGTCTGGAAAAACTTGGTGTGATGATTCTTT
TGAGCCACCAACAGCAGGAACTTTGGATTCCAGTTCTCATCTAGAAGCTTGCAGGCCTCA
ATGATCTGATCTAGTTCAATGTTCAGAACCTGGTTGAACTGAGATTCACTAACTCCATCC
CTGAAGATGATGATATGCTCTGGCTTTCTCTTTCCCGAGCTGGTGTAGAAATCTACCAGC
AACTCCTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA08JQ U 1
AF RR2A010TF C 236
BS 1 338 RR2HA08JQ
BS 339 341 RR2A010TF
BS 342 462 RR2HA08JQ
BS 463 463 RR2A010TF
BS 464 668 RR2HA08JQ
BS 669 972 RR2A010TF

RD RR2HA08JQ 668 0 0
CCAAAAATACCGTTTACGGTTATCACTTAGCGTCTTGTTTACTAGAAGATCGTCAGCAAA
TACATAAATTTGCAATATTGGGTCTAGTAATCCCAGCAATTAAAGCAACTTAAAGAGTTG
ATGGGCAAAAGTATATTTCAAGCCCCCCCTACAGGCAAACAAGACTGGCGAATAAAGTCA
CAAAATACATACCACGTCTATCGTTTGGTTGCCTTAAACCACTTAAAAAAAGCCGAGAGA
GATCCTAAGGATAAAAGCCGATTACTAGAGTACTTAAAAAAGCCAAGTTGTGGAAAACAG
ACTTCTGCACATTAGAGAGAGAGATACTTCTTCTTCTT***CTACACCTAACAGAAGAAC
ATGGAATTGGCGACGTTGTCTTTGAGTTTAGGGAGCTGCGTAACGGAGATTGGTCCTGGA
GCTGTCACGCCACCATGGCTTGAGGACGTCTCTGACTGATCTTCAAACTTCATGAACGTT
CCTAGCTGAGCAGCTGCCAAGTGTGCATAGCAGATCGGTGCAACAACGGAGATGGCGGTC
GTGCTTCTTTGGTACACGTAAGAGAGGGAGTGGACGAGCTCTTGAAGCTCATCAGGTGAG
AAATGAATCTCATCATACAGGACATGGTAATGCGTAGGACGGGTTGTTCCAATCATTCCA
GCGTGCGC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2A010TF 737 0 0
AGAGAGATCCTAAGGATAAAAGCCGATTACTAGAGTACTTAAAAAAGCCAAGTTGTGGAA
AACAGACTTCTGCACATTAGAGAGAGAGATACTTCTTCTTCTTCTTCTACACCTAACAGA
AGAACATGGAATTGGCGACGTTGTCTTTGAGTTTAGGGAGCTGCGTAACGGAGATTGGTC
CTGGAGCTGTCACGCCACCATGGCTTGAGGACGTCTCTGACTGATCTCCAAACTTCATGA
ACGTTCCTAGCTGAGCAGCTGCCAAGTGTGCATAGCAGATCGGTGCAACAACGGAGATGG
CGGTCGTGCTTCTTTGGTACACGTAAGAGAGGGAGTGGACGAGCTCTTGAAGCTCATCAG
GTGAGAAATGAATCTCATCATACAGGACATGGTAATGCGTAGGACGGGTTGTTCCAATCA
TTCCAGCGTGCGCACAGAGATAGAAATCATTGTTCTTTGGGTGACAGATTTTACTGTCAA
TGATTGTCCCTGGTGGAACGTTATCAGGAGAGTTGGTCTGGAAAAACTTGGTGTGATGAT
TCTTTTGAGCCACCAACAGCAGGAACTTTGGATTCCAGTTCTCATCTAGAAGCTTGCAGG
CCTCAATGATCTGATCTAGTTCAATGTTCAGAACCTGGTTGAACTGAGATTCACTAACTC
CATCCCTGAAGATGATGATATGCTCTGGCTTTCTCTTTCCCGAGCTGGTGTAGAAATCTA
CCAGCAACTCCTTGATC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 2 5

CO CL1470Contig1 839 3 23 U
GGAATAACACTACAAAGTAGTAGGATCAGGAATCTGGAAGAAGCTCCAGAGGCAAACACA
AAGTCTCAACCTTTCTTGAGGCAGAGAAGATGAGAGGAGGGAGTCTATGGCAGCTAGGGC
AATCCATAACCCGTCGTCTTGCTCAATCCGACAAGAAAGCTGTGTCACGCCGCTGCTTCG
CCTCTGATGCCGACCTGAAAAAGACAGCTCTTTACGACTTCCACGTCGCACACGGTGGAA
AGATGGTTCCTTTCGCTGGTTGGAGTATGCCGATTCAGTACAAAGACTCCATCATGGACT
CTACCGTTAACTGCAGGGTCAATGGCAGTTTGTTTGATGTTGCGCATATGTGTGGTTTGA
GTCTTAAGGGCAAAGACTGTGTTCCTTTTCTCGAGACGCTCGTGGTTGCTGACGTGGCTG
GTTTGGCTCCTGGAACAGGGAGCTTGACGGTGTTCACAAACGAGAAAGGAGGTGCTATTG
ATGACTCGGTGATTACCAAAGTGACGGATGAGCATATCTATTTGGTGGTGAATGCTGGTT
GTAGGGATAAGGATTTGGCTCATATTGAAGAGCACATGAAGGCTTTTAAATCCAAAGGAG
GTGATGTCTCTTGGCATATACATGATGAGAGATCTCTTCTCGCTCTTCAGGGTCCTTTGG
CTGCTCCGGTGCTTCAACACTTGACCAAAGAAGACTTGAGCAAGCTTTACTTTGGACAGT
TCCAGATCCTGGACATTAATGGTTCCACCTGCTTCCTTACCAGGACCGGGTATACTGGGG
AAGATGGGTTTGAGATCTCGGTTCCATCGGAGCATGCAGTTGATTTAGCCAAAGCATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL19TF U 46
AF RR2G837TF U 11
AF RR2AK61TF U 1
BS 1 178 RR2AK61TF
BS 179 179 RR2G837TF
BS 180 188 RR2AK61TF
BS 189 189 RR2G837TF
BS 190 274 RR2AK61TF
BS 275 275 RR2G837TF
BS 276 301 RR2AK61TF
BS 302 302 RR2G837TF
BS 303 356 RR2AK61TF
BS 357 357 RR2G837TF
BS 358 361 RR2AK61TF
BS 362 362 RR2G837TF
BS 363 364 RR2AK61TF
BS 365 365 RR2G837TF
BS 366 391 RR2AK61TF
BS 392 392 RR2G837TF
BS 393 412 RR2AK61TF
BS 413 413 RR2G837TF
BS 414 433 RR2AK61TF
BS 434 434 RR2DL19TF
BS 435 574 RR2AK61TF
BS 575 575 RR2G837TF
BS 576 839 RR2AK61TF

RD RR2DL19TF 507 0 0
GGG
GAGGCAAACGCAAAGTCTCAACCTTTCTTGAGGCAGAGAAGATGAGAGGAGGGAGTCTAT
GGCAGCTAGGGCAATCCATAACCCGTCGTCTTGCTCAATCCGACAAGAAAGCTGTGTCAC
GCCGCTGCTTCGCCTCTGATGCCGACCTGAAAAAGACAGCTCTTTACGACTTCCACGTCG
CACACGGTGGAAAGATGGTTCCTTTCGCTGGTTGGAGTATGCCGATTCAGTACAAAGACT
CCATCATGGACTCTACCGTTAACTGCAGGGTCAATGGCAGTTTGTTTGATGTTGCGCATA
TGT*TGGTTTGAGTCTTAAGGGCAAAGACTGTGTTCCTTTTCTCGAGACGCTCGTGGTCG
CTGACGTGGCTGGTTTGGCTCCTGGAACAGGGAGCTTGACGGTGTTCACAACCGAGAAAG
GAGGTGCTATTGATGACTCGGTGATTACCAAAGTGACGGATGAGCATATCTATTTGGTGG
TGAATGCTGGTTGTAGGGATAAGG

QA 4 507 4 507
DS 

RD RR2G837TF 603 0 0
TACAAAGTAGTAGGATCAGGAATCTGGAAGAAGCTCCAGAGGCAAACACAAAGTCTCAAC
CTTTCTTGAGGCAGAGAAGATGAGAGGAGGGAGTCTATGGCAGCTAGGTCAATCCATCAC
CCGTCGTCTTGCTCAATCCGACAAGAAAGCTGTGTCACGCCGCTGCTTCGCCTCTGACGC
TGACCTGAAAAAGACAGCTCTTTACGACTTCCACGTCGCACACGGTGGAAAGATGGTTCC
TTTCGCTGGTTGGAGTATGCCGATTCAGTACAAAGACTCCATCATGGACTCTACCGTTAA
CTGCAGGGTCAATGGCAGTTTGTTCGATGTTGCGCATATGTGTGGTTTGAGTCTTAAGGG
CAAAGACTGTGTTCCTTTTCTCGAGACGCTCGTGGTTGCTGACGTGGCTGGTTTGGCTCC
TGGCACAGGGAGCTTGACGGTGTTCACAAACGAGAAAGGAGGTGCTATTGATGACTCGGT
GATTACCAAAGTGACGGATGAGCATATCTATTTGGTGGTGAATGCTGGTTGTAGGGATAA
GGATTTGGCTCATATTGAAGAGCACATGAAGGCTTTTAAATCCAAAGGTGGTGATGTCTC
TTG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2AK61TF 839 0 0
GGAATAACACTACAAAGTAGTAGGATCAGGAATCTGGAAGAAGCTCCAGAGGCAAACACA
AAGTCTCAACCTTTCTTGAGGCAGAGAAGATGAGAGGAGGGAGTCTATGGCAGCTAGGGC
AATCCATAACCCGTCGTCTTGCTCAATCCGACAAGAAAGCTGTGTCACGCCGCTGCTTTG
CCTCTGATTCCGACCTGAAAAAGACAGCTCTTTACGACTTCCACGTCGCACACGGTGGAA
AGATGGTTCCTTTCGCTGGTTGGAGTATGCCGATCCAGTACAAAGACTCCATCATGGACT
CAACCGTTAACTGCAGGGTCAATGGCAGTTTGTTTGATGTTGCGCATATGTGTGGTCTGA
GCCTCAAGGGCAAAGACTGTGTTCCTTTTCTGGAGACGCTCGTGGTTGCTGATGTGGCTG
GTTTGGCTCCTGGGACAGGGAGCTTGACGGTGTTCACAAACGAGAAAGGAGGTGCTATTG
ATGACTCGGTGATTACCAAAGTGACGGATGAGCATATCTATTTGGTGGTGAATGCTGGTT
GTAGGGATAAGGATTTGGCTCATATTGAAGAGCATATGAAGGCTTTTAAATCCAAAGGAG
GTGATGTCTCTTGGCATATACATGATGAGAGATCTCTTCTCGCTCTTCAGGGTCCTTTGG
CTGCTCCGGTGCTTCAACACTTGACCAAAGAAGACTTGAGCAAGCTTTACTTTGGACAGT
TCCAGATCCTGGACATTAATGGTTCCACCTGCTTCCTTACCAGGACCGGGTATACTGGGG
AAGATGGGTTTGAGATCTCGGTTCCATCGGAGCATGCAGTTGATTTAGCCAAAGCATCT

QA 1 839 1 839
DS 



CO CL1470Contig2 883 2 3 U
ACTCAACTGTGTGAGCATGGTTACAATTTGGTGTTAAAAGATTTATTTCAATAACAGTGG
AATAAGCATATGCCCTCTTGGCAAAAGAACGTACTCTTTCAGACCAAATCAGAACAGAAG
TCATTTAAGAAAAGAAAGAGAAACAGGTCAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
ACACACATATTATTATGATGGCTTGTAGTATTTGGGGGCCACAAACGGCATCTTGGTGAT
GCTACCTTCATAAGGTTTCCCACGGACCAAGATCTTCACTTTGGTCCCATTCTTGTGCTG
ACCTGACTTCACGTACCCCATGGCTACGTTCTTCTTCAAGTTGGGGCTAAACCCACCGCT
CGTGATCTCTCCAATCTTGTCCCCATTCTCATCGTGCACCCCGCTATGCGACCTCGCCGG
GGGTCCAGAAGAAAAAAACCCGACCCTTCTGATAGTAGGTCCGTCTTGAAGCTGTTTGAG
GATCACATCAGCTCCAAGAAACCCTCCTTCTGCTCTTCTGCGTTTCCCTATGGCCCATGT
GAGTCCAGCTTCGACAGGAGTAATGTGCTGCTCCATGTCGTTTCCGTACAGACAAAGCCC
TGCTTCTAGCCTGAGACTGTCTCTTGCTCCTAGACCCGTGAGCCTCACCTTCCCCTCTGA
CTTCTCCAAGATCGCTTTGGCTAAATCAACTGCATGCTCTGATGGAACAGAGATCTCAAA
CCCATCTTCTCCAGTATACCCGGTCCTGGTAAGGAAGCAGGTGGAACCATTAATGTCAAG
GATCTGGAACTGTCCAAAGTAAAGCTTACTCAAGTCTTCTTTAGTCAAGTGTTGAAGCAC
CGGAGCAGCCAAAGGACCCTGAAGGCGAGAGAGATCTCTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB58JQ U 186
AF RR2F343JQ U 1
BS 1 215 RR2F343JQ
BS 216 216 RR2GB58JQ
BS 217 883 RR2F343JQ

RD RR2GB58JQ 235 0 0
CATAT
TATTATGATGGCTTGTAGTATTTGGGGGCCACAAACGGCATCTTGGTGATGCTACCTTCA
TAAGGTTTCCCACGGACCAAGATCTTCACTTTGGTCCCATTCTTGTGCTGACCTGACTTC
ACGTACCCCATGGCTACGTTCTTCTTCAAGTTGGGGCTAAACCCACCGCTCGTGATCTCT
CCAATCTTGTCCCCATTCTCATCGTGCACCTCGCTATGCGACCTCGC
CGG

QA 6 232 6 232
DS 

RD RR2F343JQ 883 0 0
ACTCAACTGTGTGAGCATGGTTACAATTTGGTGTTAAAAGATTTATTTCAATAACAGTGG
AATAAGCATATGCCCTCTTGGCAAAAGAACGTACTCTTTCAGACCAAATCAGAACAGAAG
TCATTTAAGAAAAGAAAGAGAAACAGGTCAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
ACACACATATTATTATGATGGCTTGTAGTATTTGGTGGCCACAAACGGCATCTTGGTGAT
GCTACCTTCATAAGGTTTCCCACGGACCAAGATCTTCACTTTGGTCCCATTCTTGTGCTG
ACCTGACTTCACGTACCCCATGGCTACGTTCTTCTTCAAGTTGGGGCTAAACCCACCGCT
CGTGATCTCTCCAATCTTGTCCCCATTCTCATCGTGCACCCCGCTATGCGACCTCGCCGG
GGGTCCAGAAGAAAAAAACCCGACCCTTCTGATAGTAGGTCCGTCTTGAAGCTGTTTGAG
GATCACATCAGCTCCAAGAAACCCTCCTTCTGCTCTTCTGCGTTTCCCTATGGCCCATGT
GAGTCCAGCTTCGACAGGAGTAATGTGCTGCTCCATGTCGTTTCCGTACAGACAAAGCCC
TGCTTCTAGCCTGAGACTGTCTCTTGCTCCTAGACCCGTGAGCCTCACCTTCCCCTCTGA
CTTCTCCAAGATCGCTTTGGCTAAATCAACTGCATGCTCTGATGGAACAGAGATCTCAAA
CCCATCTTCTCCAGTATACCCGGTCCTGGTAAGGAAGCAGGTGGAACCATTAATGTCAAG
GATCTGGAACTGTCCAAAGTAAAGCTTACTCAAGTCTTCTTTAGTCAAGTGTTGAAGCAC
CGGAGCAGCCAAAGGACCCTGAAGGCGAGAGAGATCTCTCATC

QA 1 883 1 883
DS 



AS 1 6

CO CL1471Contig1 979 6 6 U
GGTAAATTAGCCCAATATGATAACGAAAAACATAGTGAACATACAAATTCTGTTTCTAGA
CATTGAAACTTATTTGTAAAAATTTGAAGTTTTAACTTATTTGGAGCATTGGATTTTAAC
CATGTGGCTGATACGAGAAGCCATTGACAGAGAGACCTCCATCGACACAAATGGTCTGAC
CAGTTATGTAAGAAGCTGCAGGCATACATAGAAAAGCCACAAGTGAGGCAACCTCTTCAG
GCTCCCCAAAACGCCCCAACGGCTTTCTAGATATCACAGCCTTCTTAAACTCTTCATCAT
ACACAGCTTTAGCCAGATCAGTTGCGATGACAGCAGGAGCCACAGCATTAGCCCTAATGC
CATCACTAGCCCATTCGCAGGCCAAATTCCTTGCTAGCTGATTCATAGCCCCTTTTGTTG
CAGAGTAGATGGAACCGACGCTAAGCGATACAACTCCAGCAACAGAGGACATGAACACGA
TGCTACCGTATCCTGAAGCCTTAAGCAAGGGGTGTGAAAGCTGGCTTAGATGGAAAGCAG
ATTCTAAGTTGGTCGAGATATGAAATGAAAAGTCTTCTGCTGTATGATCCACTGTTGCCT
TTGACCGAATGGCTCCAGCATTGTTTACAAGGATATCGAGCTTCCCGCCAAACATTGATG
AAACCGTCTCCATGAGCTTCTCTCTGTCTGTTCTAGAAGTGACGTCACAGACTGAACCTG
TGACTTGAAACCCTTTCTTTTGCCATTGGCTTATACACTCGTTAAGCTGAGATTCGTCTC
TGGCGCAAGTATGTATTATGGCTCCAAATCCTGCAAGTTCCTCTACCACAGCATGTCCAA
TGCCTTTGGTTCCACCGGTTACAAGTGCAGTCTTGACTTGAAGGCTCCATCTTTGGAGTT
GCTCTGCTCCAGTCATTGCTCTGCTACGGCTAAAGATCTCAGATTGTAATGAATGTTATG
AAGAGAATACGTGGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GZ95JQ U 1
AF RR2GW12JQ U 14
AF RR2GM58JQ U 22
AF RR2GM58TF C 285
AF RR2GZ95TF C 295
AF RR2GW12TF C 313
BS 1 118 RR2GZ95JQ
BS 119 119 RR2GW12JQ
BS 120 760 RR2GZ95JQ
BS 761 786 RR2GM58JQ
BS 787 927 RR2GM58TF
BS 928 979 RR2GZ95TF

RD RR2GZ95JQ 760 0 0
GGTAAATTAGCCCAATATGATAACGAAAAACATAGTGAACATACAAATTCTGTTTCTAGA
CATTGAAACTTATTTGTAAAAATTTGAAGTTTTAACTTATTTGGAGCATTGGATTTTAGC
CATGTGGCTGATACGAGAAGCCATTGACAGAGAGACCTCCATCGACACAAATGGTCTGAC
CAGTTATGTAAGAAGCTGCAGGCATACATAGAAAAGCCACAAGTGAGGCAACCTCTTCAG
GCTCCCCAAAACGCCCCAACGGCTTTCTAGATATCACAGCCTTCTTAAACTCTTCATCAT
ACACAGCTTTAGCCAGATCAGTTGCGATGACAGCAGGAGCCACAGCATTAGCCCTAATGC
CATCACTAGCCCATTCGCAGGCCAAATTCCTTGCTAGCTGATTCATAGCCCCTTTTGTTG
CAGAGTAGATGGAACCGACGCTAAGCGATACAACTCCAGCAACAGAGGACATGAACACGA
TGCTACCGTATCCTGAAGCCTTAAGCAAGGGGTGTGAAAGCTGGCTTAGATGGAAAGCAG
ATTCTAAGTTGGTCGAGATATGAAATGAAAAGTCTTCTGCTGTATGATCCACTGTTGCCT
TTGACCGAATGGCTCCAGCATTGTTTACAAGGATATCGAGCTTCCCGCCAAACATTGATG
AAACCGTCTCCATGAGCTTCTCTCTGTCTGTTCTAGAAGTGACGTCACAGACTGAACCTG
TGACTTGAAACCCTTTCTTTTGCCATTGGCTTATACACTC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2GW12JQ 721 0 0
AATATGATAACGAAAAACATAGTGAACATACAAATTCTGTTTCTAGACATTGAAACTTAT
TTGTAAAAATTTGAAGTTTTAACTTATTTGGAGCATTGGATTTTAACCATGTGGCTGATA
CGAGAAGCCATTGACAGAGAGACCTCCATCGACACAAATGGTCTGACCAGTTATGTAAGA
AGCTGCAGGCATACATAGAAAAGCCACAAGTGAGGCAACCTCTTCAGGCTCCCCAAAACG
CCCCAACGGCTTTCTAGATATCACAGCCTTCTTAAACTCTTCATCATACACAGCTTTAGC
CAGATCAGTTGCGATGACAGCAGGAGCCACAGCATTAGCCCTAATGCCATCACTAGCCCA
TTCGCAGGCCAAATTCCTTGCTAGCTGATTCATAGCCCCTTTTGTTGCAGAGTAGATGGA
ACCGACGCTAAGCGATATAACTCCAGCAACAGAGGACATGAACACGATGCTACCGTATCC
TGAAGCCTTAAGCAAGGGGTGTGAAAGCTGGCTTAGATGGAAAGCAGATTCTAAGTTGGT
CGAGATATGAAATGAAAAGTCTTCTGCTGTATGATCCACTGTTGCCTTTGACCGAATGGC
TCCAGCATTGTTTACAAGGATATCGAGCTTCCCGCCAAACATTGATGAAACCGTCTCCAT
GAGCTTCTCTCTGTCTGTTCTAGAAGTGACGTCACAGACTGAACCTGTGACTTGAAACCC
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2GM58JQ 765 0 0
AACGAAAAACATAGTGAACATACAAATTCTGTTTCTAGACATTGAAACTTGTTTGTAAAA
ATTTGAAGTTTTAACTTATTTGGAGCATTGGATTTTAACCATGTGGCTGATACGAGAAGC
CATTGACAGAGAGACCTCCATCGACACAAATGGTCTGACCAGTTATGTAAGAAGCTGCAG
GCATACATAGAAAAGCCACAAGTGAGGCAACCTCTTCAGGCTCCCCAAAACGCCCCAACG
GCTTTCTAGATATCACAGCCTTCTTAAACTCTTCATCATACACAGCTTTAGCCAGATCAG
TTGCGATGACAGCAGGAGCCACAGCATTAGCCCTAATGCCATCACTAGCCCATTCGCAGG
CCAAATTCCTTGCTAGCTGATTCATAGCCCCTTTTGTTGCAGAGTAAATGGAACCGACGC
TAAGCGATACAACTCCAGCAACAGAGGACATGAACACGATGCTACCGTATCCTGAAGCCT
TAAGCAAGGGGTGTGAAAGCTGGCTTAAATGGAAAGCAAATTCTAAGTTGGTCGAGATAT
GAAATGAAAAGTCTTCTGCTGTATGATCCACTGTTGCCTTTGACCGAATGGCTCCAGCAT
TGTTTACAAGGATATCGAGCTTCCCGCCAAACATTGATGAAACCGTCTCCATGAGCTTCT
CTCTGTCTGTTCTAGAAGTGACGTCACAGACTGAACCTGTGACTTGAAACCCTTTCTTTT
GCCATTGGCTTATACACTCGTTAAGCTGAGATTCGTCTCTGGCGC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2GM58TF 645 0 0
TTAAACTCTTCATCATACACAGCTTTAGCCAGATCAGTTGCGATGACAGCAGGAGCCACA
GCATTAGCCCTAATGCCATCACTAGCCCATTCGCAGGCCAAATTCCTTGCTAGCTGATTC
ATAGCCCCTTTTGTTGCAGAGTAGATGGAACCGACGCTAAGCGATACAACTCCAGCAACA
GAGGACATGAACACGATGCTACCGTATCCTGAAGCCTTAAGCAAGGGGTGTGAAAGCTGG
CTTAGATGGAAAGCAGATTCTAAGTTGGTCGAGATATGAAATGAAAAGTCTTCTGCTGTA
TGATCCACTGTTGCCTTTGACCGAATGGCTCCAGCATTGTTTACAAGGATATCGAGCTTC
CCGCCAAACATTGATGAAACCGTCTCCATGAGCTTCTCTCTGTCTGTTCTAGAAGTGACG
TCACAGACTGAACCTGTGACTTGAAACCCTTTCTTTTGCCATTGGCTTATACACTCGTTA
AGCTGAGATTCGTCTCTGGCGCAAGTATGTATTATGGCTCCAAATCCTGCAAGTTCCTCT
ACCACAGCATGTCCAATGCCTTTGGTTCCACCGGTTACAAGTGCAGTCTTGACTTGAAGG
CTCCATCTTTGGAGTTGCTCTGCTCCAGTCATTGCTCTGCTAC
CC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2GZ95TF 685 0 0
CATCATACACAGCTTTAGCCAGATCAGTTGCGATGACAGCAGGAGCCACAGCATTAGCCC
TAATGCCATCACTAGCCCATTCGCAGGCCAAATTCCTTGCTAGCTGATTCATAGCCCCTT
TTGTTGCAGAGTAGATGGAACCGACGCTAAGCGATACAACTCCAGCAACAGAGGACATGA
ACACGATGCTACCGTATCCTGAAGCCTTAAGCAAGGGGTGTGAAAGCTGGCTTAGATGGA
AAGCAGATTCTAAGTTGGTCGAGATATGAAATGAAAAGTCTTCTGCTGTATGATCCACTG
TTGCCTTTGACCGAATGGCTCCAGCATTGTTTACAAGGATATCGAGCTTCCCGCCAAACA
TTGATGAAACCGTCTCCATGAGCTTCTCTCTGTCTGTTCTAGAAGTGACGTCACAGACTG
AACCTGTGACTTGAAACCCTTTCTTTTGCCATTGGCTTATACACTCGTTAAGCTGAGATT
CGTCTCTGGCGCAAGTATGTATTATGGCTCCAAATCCTGCAAGTTCCTCTACCACAGCAT
GTCCAATGCCTTTGGTTCCACCGGTTACAAGTGCAGTCTTGACTTGAAGGCTCCATCTTT
GGAGTTGCTCTGCTCCAGTCATTGCTCTGCTACGGCTAAAGATCTCAGATTGTAATGAAT
GTTATGAAGAGAATACGTGGAGTCC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2GW12TF 667 0 0
CCAGATCAGTTGCGATGACAGCAGGAGCCACAGCATTAGCCCTAATGCCATCACTAGCCC
ATTCGCAGGCCAAATTCCTTGCTAGCTGATTCATAGCCCCTTTTGTTGCAGAGTAGATGG
AACCGACGCTAAGCGATATAACTCCAGCAACAGAGGACATGAACACGATGCTACCGTATC
CTGAAGCCTTAAGCAAGGGGTGTGAAAGCTGGCTTAGATGGAAAGCAGATTCTAAGTTGG
TCGAGATATGAAATGAAAAGTCTTCTGCTGTATGATCCACTGTTGCCTTTGACCGAATGG
CTCCAGCATTGTTTACAAGGATATCGAGCTTCCCGCCAAACATTGATGAAACCGTCTCCA
TGAGCTTCTCTCTGTCTGTTCTAGAAGTGACGTCACAGACTGAACCTGTGACTTGAAACC
CTTTCTTTTGCCATTGGCTTATACACTCGTTAAGCTGAGATTCGTCTCTGGCGCAAGTAT
GTATTATGGCTCCAAATCCTGCAAGTTCCTCTACCACAGCATGTCCAATGCCTTTGGTTC
CACCGGTTACAAGTGCAGTCTTGACTTGAAGGCTCCATCTTTGGAGTTGCTCTGCTCCAG
TCATTGCTCTGCTACGGCTAAAGATCTCAGATTGTAATGAATGTTATGAAGAGAATACGT
GGAGTCC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 6

CO CL1472Contig1 1290 6 7 U
GGATTCCATATCAAAGCTTAAAACACTTTATACGACAACCACCCCCAAAAAGAAAAAACA
ACCGCCACTTTCAAAATGGGTTTCAAATTGGTTTCGAGTCTTTCGACATCTGAAGACACT
ATAAAAGGACAGTTAATGGTTCGCAGAAACACACACTTCGTGCTGGTTGATGGAATGTCT
AAACTGATGACTCGCAAAGGCAATCATTTTTGGTCATCGGATTTCCATATTGCTGGTCTC
CAGTGGAGGTTGATTATTAGTTGGAAAAAAGCCCAAAATGACAATTTATATCTTCATCTC
CGGATCATCGATGAAAAGTGTACCGGTCCTAATTGGAGTGTCAAGTGCGAATGCATATTC
GGCTTAGTCGATGAGAGAGGAAATCGTCACGTACTGGAATCGTTTCCGGCACGTTTCAAG
GAAGTCACGAAAGGCTACAAAAAGTCAATACCATGTGGGCTGTTGAACTGTTTTCTTGTG
AACGACAAAGCGGTTTTCATGAGCGAAATCATCAATGTGGAAGCAAGCTTTCCTGTTACC
CCTATCGCTCGAAACATGGGGACAGCGGAATGCATTAAACTATTTGAGGTGCCCGAGAAC
AAATCTAGATTCACCTGGCATATCACTCGGTTTTCCTCCTTCACTGGTAAACGTCATTCC
TCGTACGAGTTCACGGTTGGACCACGGAGATGGAGAATAGTGATGTACCCAGAAGGAAAG
GCAGGAAATTTTTCGTTGTATTTGTCAGCTTCCGATTACGTGACTGGTAGTCCAAAGAGA
CCAACTTTTGCCAACTATAAACTGCGAGTGTTGGACCAAGTCAACCGCAATCACCGTGAA
TCTGGGCACCAAGGTTGGTTTTTCTACGATACATCGGAAACTTCGCGCAAAGGCACGAGC
AAGTTTATGCCGATGGAAGAACTCCATGATTCTTCAAATGGATACCTGGTGAGAGATCTG
ATATATATTGGTGTTGAGTTCTTACTTGTCTCAGTTACCGAGGATCTCTGAGACGCATGC
ATTACTGGATTCGATCAAGACCCACAAGAATAAATACCCCTTGATGCACTACTTATCTAT
CTATCTATCATTCCACATTTCATATCGATGTGTGTTTAAATATCCTGCAAGTTTGTTAAA
ATAAAGTGACGGGTCAAATTGGTTGATTGTATTGTATGTCACGATGACATTCAACCGAAT
TCGTTGCAACGTTTTCTCTGGTGGAGAAAACTTGTTGTGTACATGTTTGTACCTTCCTTG
TTTGTAATAACAACAATAATGTATGACCGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF15TF U 1
AF RR2EB96TF U 1
AF RR2AF39JQ C 641
AF RR2AF39TF U 257
AF RR2BF15JQ C 661
AF RR2EB96JQ C 664
BS 1 109 RR2BF15TF
BS 110 110 RR2EB96TF
BS 111 714 RR2BF15TF
BS 715 1119 RR2AF39TF
BS 1120 1215 RR2BF15JQ
BS 1216 1216 RR2EB96JQ
BS 1217 1290 RR2BF15JQ

RD RR2BF15TF 716 0 0
GGATTCCATATCAAAGCTTAAAACACTTTATACGACAACCACCCCCAAAAAGAAAAAACA
ACCGCCACTTTCAAAATGGGTTTCAAATTGGTTTCGAGTCTTTCGACATTTGAAGACACT
ATAAAAGGACAGTTAATGGTTCGCAGAAACACACACTTCGTGCTGGTTGATGGAATGTCT
AAACTGATGACTCGCAAAGGCAATCATTTTTGGTCATCGGATTTCCATATTGCTGGTCTC
CAGTGGAGGTTGATTATTAGTTGGAAAAAAGCCCAAAATGACAATTTATATCTTCATCTC
CGGATCATCGATGAAAAGTGTACCGGTCCTAATTGGAGTGTCAAGTGCGAATGCATATTC
GGCTTAGTCGATGAGAGAGGAAATCGTCACGTACTGGAATCGTTTCCGGCACGTTTCAAG
GAAGTCACGAAAGGCTACAAAAAGTCAATACCATGTGGGCTGTTGAACTGTTTTCTTGTG
AACGACAAAGCGGTTTTCATGAGCGAAATCATCAATGTGGAAGCAAGCTTTCCTGTTACC
CCTATCGCTCGAAACATGGGGACAGCGGAATGCATTAAACTATTTGAGGTGCCCGAGAAC
AAATCTAGATTCACCTGGCATATCACTCGGTTTTCCTCCTTCACTGGTAAACGTCATTCC
TCGTACGAGTTCACGGTTGGACCACGGAGATGGAGAATAGTGATGTACCCAGAA
AG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2EB96TF 709 0 0
GGATTCCATATCAAAGCTTAAAACACTTTATACGACAACCACCCCCAAAAAGAAAAAACA
ACCGCCACTTTCAAAATGGGTTTCAAATTGGTTTCGAGTCTTTCGACATCTGAAGACACT
ATAAAAGGACAGTTAATGGTTCGCAGAAACACACACTTCGTGCTGGTTGATGGAATGTCT
AAACTGATGACTCGCAAAGGCAATCATTTTTGGTCATCGGATTTCCATATTGCTGGTCTC
CAGTGGAGGTTGATTATTAGTTGGAAAAAAGCCCAAAATGACAATTTATATCTTCATCTC
CGGATCATCGATGAAAAGTGTACCGGTCCTAATTGGAGTGTCAAGTGCGAATGCATATTC
GGCTTAGTCGATGAGAGAGGAAATCGTCACGTACTGGAATCGTTTCCGGCACGTTTCAAG
GAAGTCACGAAAGGCTACAAAAAGTCAATACCATGTGGGCCGTTGAACTGTTTTCTTGTG
AACGACAAAGCGGTTTTCATGAGCGAAATCATCAATGTGGAAGCAAGCTTTCCTGTTACC
CCTATCGCTCGAAACATGGGGACAGCGGAATGCATTAAACTATTTGAGGTGCCCGAGAAC
AAATCTAGATTCACCTGGCATATCACTCGGTTTTCCTCCTTCACTGGTAAACGTCATTCC
TCGTACGAGTTCACGGTTGGACCACGGAGATGGAGAATAGTGATGTAC
T

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2AF39JQ 364 0 0
TCACTGGTAAACGTCATTCCTCGTACGAGTTCACGGTTGGACCACGGAGATGGAGAATAG
TGATGTACCCAGAAGGAAAGGCAGGAAATTTTTCGTTGTATTTGTCAGCTTCCGATTACG
TGACTGGTAGTCCAAAGAGACCAACTTTTGCCAACTATAAACTGCGAGTGTTGGACCAAG
TCAACCGCAATCACCGTGAATCTGGGCACCAAGGTTGGTTTTTTTACGATACATCGGAAA
CTTCGCGCAAAGGCACGAGCAAGTTTATGCCGATGGAAGAACTCCATGATTCTTCAAATG
GATACCTGGTGAGAGATCTGATATATATTGGTGTTGAGTTCTTACTTGTCTCAGTTACCG
AGGA

QA 1 364 1 364
DS 

RD RR2AF39TF 867 0 0
GG
AGTTGGAAAAAAGCCCAAAATGACAATTTATATCTTCATCTCCGGATCATCGATGAAAAG
TGTACCGGTCCTAATTGGAGTGTCAAGTGCGAATGCATATTCGGCTTAGTCGATGAGAGA
GGAAATCGTCACGTACTGGAATCGTTTCCGGCACGTTTCAAGGAAGTCACGAAAGGCTAC
AAAAAGTCAATACCATGTGGGCTGTTGAACTGTTTTCTTGTGAACGACAAAGCGGTTTTC
ATGAGCGAAATTATCAATGTGGAAGCAAGCTTTCCTGTTACCCCTATCGCTCGAAACATG
GGGACAGCGGAATGCATTAAACTATTTGAGGTGCCCGAGAACAAATCTAGATTCACCTGG
CATATCACTCGGTTTTCCTCCTTCACTGGTAAACGTCATTCCTCGTACGAGTTCACGGTT
GGACCACGGAGATGGAGAATAGTGATGTACCCAGAAGGAAAGGCAGGAAATTTTTCGTTG
TATTTGTCAGCTTCCGATTACGTGACTGGTAGTCCAAAGAGACCAACTTTTGCCAACTAT
AAACTGCGAGTGTTGGACCAAGTCAACCGCAATCACCGTGAATCTGGGCACCAAGGTTGG
TTTTTCTACGATACATCGGAAACTTCGCGCAAAGGCACGAGCAAGTTTATGCCGATGGAA
GAACTCCATGATTCTTCAAATGGATACCTGGTGAGAGATCTGATATATATTGGTGTTGAG
TTCTTACTTGTCTCAGTTACCGAGGATCTCTGAGACGCATGCATTACTGGATTCGATCAA
GACCCACAAGAATAAATACCCCTTGATGCACTACTTATCTATCTATCTATCATTCCACAT
TTCATATCGATGTGTGTTTAA
TATC

QA 3 863 3 863
DS 

RD RR2BF15JQ 630 0 0
TCGTACGAGTTCACGGTTGGACCACGGAGATGGAGAATAGTGATGTACCCAGAAGGAAAG
GCAGGAAATTTTTCGTTGTATTTGTCAGCTTCCGATTACGTGACTGGTAGTCCAAAGAGA
CCAACTTTTGCCAACTATAAACTGCGAGTGTTGGACCAAGTCAACCGCAATCACCGTGAA
TCTGGGCACCAAGGTTGGTTTTTTTACGATACATCGGAAACTTCGCACAAAGGCACGAGC
AAGTTTATGCCGATGGAAGAACTCCATGATTCTTCAAATGGATATCTGGTGAGAGATCAG
ATATATATTGGTGTTGAGTTCTTACTTGTCTCAGTTACCGAGGATTTTTGAGACGCATGC
ATTACTGGATTCGATCAAGACCCACAAGAATAAATACCCCTTGATGCACTACTTATCTAT
CTATCTATCATTCCACATTTCATATCGATGTGTGTTTAAATATCCTGCAAGTTTGTTAAA
ATAAAGTGACGGGTCAAATTGGTTGATTGTATTGTATGTCACGATGACATTCAACCGAAT
TCGTTGCAACGTTTTTTCTGGTGGAGAAAACTTGTTGTGTACATGTTTGTACCTTCCTTG
TTTGTAATAACAACAATAATGTATGACCGT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2EB96JQ 619 0 0
TACGAGTTCACGGTTGGACCACGGAGATGGAGAATAGTGATGTACCCAGAAGGAAAGGCA
GGAAATTTTTCGTTGTATTTGTCAGCTTCCGATTACGTGACTGGTAGTCCAAAGAGACCA
ACTTTTGCCAACTATAAACTGCGAGTGTTGGACCAAGTCAACCGCAATCACTGTGAATCT
GGGCACCAAGGTTGGTTTTTCTACGATACATCGGAAACTTCGCGCAAAGGCACGAGCAAG
TTTATGCCGATGGAAGAACTCCATGATTTTTCAAATGGATATCTGGTGAGAGATCAGATA
TATATTGGTGTTGAGTTCTTACTTGTCTCAGTTACCGAGGATCTCTGAGACGCATGCATT
ACTGGATTCGATCAAGACCCACAAGAATAAATACCCCTTGATGCACTACTTATCTATCTA
TCTATCATTCCACATTTCATATCGATGTGTGTTTAAATATCCTGCAAGTTTGTTAAAATA
AAGTGACGGGTCAAATTGGTTGATTGTATTGTATGTCACGATGACATTCAACCGAATTCG
TTGCAACGTTTTCTCTGGTGGAGAAAACTTGTTGTGTACATGTTTGTACCTTCCTTGTTT
GTAATAACAACAATAATGT

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 5

CO CL1473Contig1 1381 5 8 U
AGGTTGCTGCGTGTGTAATTAGTTAGAGATACATTCTTTCCCTTGGCCTTTAGGGTTCTA
TCTATTATATATTAATCCAATCCAATCTGCTTTCTTCTTCTAATCTCAAAATCCAATATG
AAACTTGTTAAGATTTCCCTTCTCCTTGTTTCTTTCCTCCTCGTCTCCGTCTCTGTCTCT
TCTTCATCGTCCGACGGCGATGATGCCGTGATCCGGCAGGTGGTTGATGGAGGAGCCGAG
CCGCATGTTTTATCTTCAGAGGATCACTTTTCTGTGTTCAAGAGCAAGTTCGGAAAGGTG
TACGGTTCGAGGGAGGAGCATGACTACAGATTGTCCGTATTCAAAGCGAATCAGAGGAGA
GCGAGGCGTCACCAGAAGATGGATCCCTCTGCTCGTCACGGTGTTACACAGTTCTCGGAT
CTGACTCGATCTGAGTTCAAGAAGAAGCATCTCGGGGTCAGAGGAGGGTTCAAGCTTCCC
AAAGACGCCAACAAGGCTCCCATTCTCCCTACCGAGAATCTCCCTCAGGATTTTGATTGG
AGAGATCACGGAGCCGTCACCCCCGTCAAAAACCAGGGATCATGCGGGTCTTGCTGGAGC
TTCAGCGCCACCGGAGCTCTTGAAGGTGCTAACCTCCTCTCTACCGGCAAACTCCTCAGC
CTTAGCGAACAACAGCTCGTTGACTGTGAGCATGAGTGTGACCCAGATGAGGCCGGTTCA
TGCGACTCTGGTTGCAATGGTGGCCTCATGAACAGCGCTTTTGAACACACCCTCAAATCC
GGAGGCCTCATGAGAGAACAAGACTATCCTTACACCGGCGAGGACGGCTCTATCTGCAAA
TTAGACAAGTCCAAGATCGTTGCCTCTGTCTCCAACTTCAGTGTCATCTCCATCGACGAA
GACCAGATTGCTGCCAACCTTGTTCAAAACGGACCTCTTGCTGTTGCCATCAACGCTGCC
TATATGCAGACTTACATTGGCGGAGTCTCCTGCCCTTACATTTGCACCAGGAGGCTCAAC
CACGGTGTCTTATTGGTTGGTTACGGCTCCGCTGGTTATGCCCCGGCTAGGTTCAAGGAG
AAGCCTTACTGGATCATCAAGAACTCATGGGGTGAGACTTGGGGTGAGAAGGGTTTCTAC
AAGATTTGCAAAGGCCGTAACATCTGTGGCGTTGACAGCCTTGTCTCCACCGTTACTGCC
GCCGTCTCTACCACCGCACATTAACTAAGCCAAAAAAGAGGCTTTCATTTAATAAAATTT
AATTCACTCTGGTGATTTGTGTGAGCGAGCACTCTTTGACTTGACTCTCTATTTCTCTCT
GCTTTTTTTTTTTTAAGAAAGATGAAGTTTGTAAATAATAAAAATGCATTCTCTTCTGAG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 

AF RR2A762TF U 1
AF RR2DE55JQ C 690
AF RR2DE55TF U 690
AF RR2H813TF U 690
AF RR2H813JQ C 690
BS 1 689 RR2A762TF
BS 690 690 RR2DE55TF
BS 691 749 RR2A762TF
BS 750 928 RR2DE55TF
BS 929 929 RR2H813TF
BS 930 1326 RR2DE55TF
BS 1327 1378 RR2DE55JQ
BS 1379 1381 RR2H813JQ

RD RR2A762TF 749 0 0
AGGTTGCTGCGTGTGTAATTAGTTAGAGATACATTCTTTCCCTTGGCCTTTAGGGTTCTA
TCTATTATATATTAATCCAATCCAATCTGCTTTCTTCTTCTAATCTCAAAATCCAATATG
AAACTTGTTAAGATTTCCCTTCTCCTTGTTTCTTTCCTCCTCGTCTCCGTCTCTGTCTCT
TCTTCATCGTCCGACGGCGATGATGCCGTGATCCGGCAGGTGGTTGATGGAGGAGCCGAG
CCGCATGTTTTATCTTCAGAGGATCACTTTTCTGTGTTCAAGAGCAAGTTCGGAAAGGTG
TACGGTTCGAGGGAGGAGCATGACTACAGATTGTCCGTATTCAAAGCGAATCAGAGGAGA
GCGAGGCGTCACCAGAAGATGGATCCCTCTGCTCGTCACGGTGTTACACAGTTCTCGGAT
CTGACTCGATCTGAGTTCAAGAAGAAGCATCTCGGGGTCAGAGGAGGGTTCAAGCTTCCC
AAAGACGCCAACAAGGCTCCCATTCTCCCTACCGAGAATCTCCCTCAGGATTTTGATTGG
AGAGATCACGGAGCCGTCACCCCCGTCAAAAACCAGGGATCATGCGGGTCTTGCTGGAGC
TTCAGCGCCACCGGAGCTCTTGAAGGTGCTAACCTCCTCTCTACCGGCAAACTCCTCAGC
CTTAGCGAACAACAGCTCGTTGACTGTGATCATGAGTGTGACCCAGATGAGGCCGGTTCA
TGCGACTCTGGTTGCAATGGTGGCCTCAT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2DE55JQ 689 0 0
GCATGAGTGTGACCCAGATGAGGCCGGTTCATGCGACTCTGGTTGCAATGGTGGCCTCAT
GAACAGCGCTTTTGAACACACCCTCAAATCCGGAGGCCTCATGAGAGAACAAGACTATCC
TTACACCGGCGAGGACGGCTCTATCTGCAAATTAGACAAGTCCAAGATCGTTGCCTCTGT
CTCCAACTTCAGTGTCATCTCCATCGACGAAGACCAGATTGCTGCCAACCTTGTTCAAAG
CGGACCTCTTGCTGTTGCCATCAACGCTGCCTATATGCAGACTTACATTGGCGGAGTCTC
CTGCCCTTACATTTGCACCAGGAGGCTCAACCACGGTGTCTTATTGGTTGGTTACGGCTC
CGCTGGTTATGCCCCGGCTAGGTTCAAGGAGAAGCCTTACTGGATCATCAAGAACTCATG
GGGTGAGACTTGGGGTGAGAAGGGTTTTTACAAGATTTGCAAAGGCCGTAACATCTGTGG
CGTTGACAGCCTTGTCTCCACCGTTACTGCCGCCGTCTCTACCACCGCACATTAACTAAG
CCAAAAAAGAGGCTTTCATTTAATAAAATTTAATTCACTCTGGTGATTTGTGTGAGCGAG
CACTCTTTGACTTGACTCTCTATTTCTCTCTGCTTTTTTTTTTTTAAGAAAGATGAAGTT
TGTAAATAATAAAAATGCATTCTCTTCTG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2DE55TF 637 0 0
GCATGAGTGTGACCCAGATGAGGCCGGTTCATGCGACTCTGGTTGCAATGGTGGCCTCAT
GAACAGCGCTTTTGAACACACCCTCAAATCCGGAGGCCTCATGAGAGAACAAGACTATCC
TTACACCGGCGAGGACGGCTCTATCTGCAAATTAGACAAGTCCAAGATCGTTGCCTCTGT
CTCCAACTTCAGTGTCATCTCCATCGACGAAGACCAGATTGCTGCCAACCTTGTTCAAAG
CGGACCTCTTGCTGTTGCCATCAACGCTGCCTATATGCAGACTTACATTGGCGGAGTCTC
CTGCCCTTACATTTGCACCAGGAGGCTCAACCACGGTGTCTTATTGGTTGGTTACGGCTC
CGCTGGTTATGCCCCGGCTAGGTTCAAGGAGAAGCCTTACTGGATCATCAAGAACTCATG
GGGTGAGACTTGGGGTGAGAAGGGTTTCTACAAGATTTGCAAAGGCCGTAACATCTGTGG
CGTTGACAGCCTTGTCTCCACCGTTACTGCCGCCGTCTCTACCACCGCACATTAACTAAG
CCAAAAAAGAGGCTTTCATTTAATAAAATTTAATTCACTCTGGTGATTTGTGTGAGCGAG
CACTCTTTGACTTGACTCTCTATTTCTCTCTGCTTTT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2H813TF 637 0 0
GCATGAGTGTGACCCAGATGAGGCCGGTTCATGCGACTCTGGTTGCAATGGTGGCCTCAT
GAACAGCGCTTTTGAATACACCCTCAAATCCGGAGGCCTCATGAGAGAACAAGACTATCC
TTACACCGGCGAGGACGGCTCTATCTGCAAATTAGACAAGTCCAAGATCGTTGCCTCTGT
CTCCAACTTCAGTGTCATCTCCATCGACGAAGACCAGATTGCTGCCAACCTTGTTCAAAA
CGGACCTCTTGCTGTTGCCATCAACGCTGCCTATATGCAGACTTACATTGGCGGAGTCTC
CTGCCCTTACATTTGCACCAGGAGGCTCAACCACGGTGTCTTATTGGTTGGTTACGGCTC
CGCTGGTTATGCCCCGGCTAGGTTCAAGGAGAAGCCTTACTGGATCATCAAGAACTCATG
GGGTGAGACTTGGGGTGAGAAGGGTTTCTACAAGATTTGCAAAGGCCGTAACATCTGTGG
CGTTGGCAGCCTTGTCTCCACCGTTACTGTCGCCGTCTCTACCACCGCACATTAACTAAG
CCAAAAAAGAGGCTTTCATTTAATAAAATTTAATTCACTCTGGTGATTTGTGTGAGCGAG
CACTCTTTGACTTGACTCTCTATTTCTCTCTGCTTTT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2H813JQ 692 0 0
GCATGAGTGTGACCCAGATGAGGCCGGTTCATGCGACTCTGGTTGCAATGGTGGCCTCAT
GAACAGCGCTTTTGAATACACCCTCAAATCCGGAGGCCTCATGAGAGAACAAGACTATCC
TTACACCGGCGAGGACGGCTCTATCTGCAAATTAGACAAGTCCAAGATCGTTGCCTCTGT
CTCCAACTTCAGTGTCATCTCCATCGACGAAGACCAGATTGCTGCCAACCTTGTTCAAAA
CGGACCTCTTGCTGTTGCCATCAACGCTGCCTATATGCAGACTTACATTGGCGGAGTCTC
CTGCCCTTACATTTGCACCAGGAGGCTCAACCACGGTGTCTTATTGGTTGGTTACGGCTC
CGCTGGTTATGCCCCGGCTAGGTTCAAGGAGAAGCCTTACTGGATCATCAAGAACTCATG
GGGTGAGACTTGGGGTGAGAAGGGTTTCTACAAGATTTGCAAAGGCCGTAACATCTGTGG
CGTTGGCAGCCTTGTCTCCACCGTTACTGTCGCCGTCTCTACCACCGCACATTAACTAAG
CCAAAAAAGAGGCTTTCATTTAATAAAATTTAATTCACTCTGGTGATTTGTGTGAGCGAG
CACTCTTTGACTTGACTCTCTATTTCTCTCTGCTTTTTTTTTTT*AAGAAAGATGAAGTT
TGTAAATAATAAAAATGCATTCTCTTCTGAGC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL1474Contig1 648 2 1 U
GGGATTCTTCTGTTGCTGTTATTGTCTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCCTTCCTAAACA
CTACTAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACCGAGCGTGGTAGTGACGTCATTGTTGTACTTG
TGGGAAATAAAACCGACCTTGTGGACAAAAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGCAGAAGCTA
AGGCTCGTGAGCTTAATGTGATGTTTATCGAAACCAGTGCCAAAGCAGGCTTCAACATTA
AGGCGCTTTTCCGTAAGATAGCAGCAGCTTTGCCAGGAACGGAAACACTGTCTTCGACAA
AGCAAGAGGACATGGTTGATGTCAATCTCAAATCTTCCAATGCAAATGCATCTTTGGCTC
AACAGCAATCAGGAGGATGCTTTGTTAGAACAACAAAAAACACACACACACAAAACTCCT
CGAGCCTTTGCATGATCCCAAACACTATCATCGTTCGTCTGTAAAATTTTTGCCTGCTTT
ATAATCAGATTTTTTTTAGAGTGACTTTGTCTTTGGAGTTTCAAATACTCTGCTTCAGCA
CTGTGATTTGTATGTCTATGATTTTGATTATATAACTGTGAGCACACTCATCTCGTTTCT
TCCTTCGATGTGAAGACATGTGGATAGAGAAAGCAAAGCAGCATAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D570TF U 1
AF RR2D570JQ C 30
BS 1 648 RR2D570TF

RD RR2D570TF 648 0 0
GGGATTCTTCTGTTGCTGTTATTGTCTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCCTTCCTAAACA
CTACTAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACCGAGCGTGGTAGTGACGTCATTGTTGTACTTG
TGGGAAATAAAACCGACCTTGTGGACAAAAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGCAGAAGCTA
AGGCTCGTGAGCTTAATGTGATGTTTATCGAAACCAGTGCCAAAGCAGGCTTCAACATTA
AGGCGCTTTTCCGTAAGATAGCAGCAGCTTTGCCAGGAACGGAAACACTGTCTTCGACAA
AGCAAGAGGACATGGTTGATGTCAATCTCAAATCTTCCAATGCAAATGCATCTTTGGCTC
AACAGCAATCAGGAGGATGCTTTGTTAGAACAACAAAAAACACACACACACAAAACTCCT
CGAGCCTTTGCATGATCCCAAACACTATCATCGTTCGTCTGTAAAATTTTTGCCTGCTTT
ATAATCAGATTTTTTTTAGAGTGACTTTGTCTTTGGAGTTTCAAATACTCTGCTTCAGCA
CTGTGATTTGTATGTCTATGATTTTGATTATATAACTGTGAGCACACTCATCTCGTTTCT
TCCTTCGATGTGAAGACATGTGGATAGAGAAAGCAAAGCAGCATAGAA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2D570JQ 619 0 0
GATGTTGCAAGCAGGCAATCCTTCCTAAACACTACTAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACC
GAGCGTGGTAGTGACGTCATTGTTGTACTTGTGGGAAATAAAACCGACCTTGTGGACAAA
AGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGCAGAAGCTAAGGCTCGTGAGCTTAATGTGATGTTTATC
GAAACCAGTGCCAAAGCAGGCTTCAACATTAAGGCGCTTTTCCGTAAGATAGCAGCAGCT
TTGCCAGGAACGGAAACACTGTTTTCGACAAAGCAAGAGGACATGGTTGATGTCAATCTC
AAATCTTCCAATGCAAATGCATCTTTGGCTCAACAGCAATCAGGAGGATGCTTTGTTAGA
ACAACAAAAAACACACACACACAAAACTCCTCGAGCCTTTGCATGATCCCAAACACTATC
ATCGTTCGTCTGTAAAATTTTTGCCTGCTTTATAATCAGATTTTTTTTAGAGTGACTTTG
TCTTTGGAGTTTCAAATACTCTGCTTCAGCACTGTGATTTGTATGTCTATGATTTTGATT
ATATAACTGTGAGCACACTCATCTCGTTTCTTCCTTCGATGTGAAGACATGTGGATAGAG
AAAGCAAAGCAGCATAGAA

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 6

CO CL1475Contig1 835 6 5 U
GGGAGATACGACGACTTTGATTTTCTTAAGTTTTGGTATACAAAATGTAATTGTTTACTA
TAAACAAGTGAATAATAAAAAACACAACCTCCTTTACATTATTGGTTCCAGACGGGAATA
ATCCCTTGTGCAGCAAGGCGCTTCTCGACCCAAAACACAACGTGGTTTGCAGTTGGTTTC
CTCTCGTCGACTAGAAACGGCTCTACGGTACTTGGACCTGATCCGTATGAGGAGATTGAA
AAGCCCTTTGCTCCTGTGAGATTACCACTGGGGAAGAAGGCCCAGAAGGAATATTGAATA
CCTTTCTTGAAGAAAAAACCCTCAAGCTTATCGTCTTGGAAAGATAAATCAATCTCAGAT
ATATCATCTTGAGCTTCAAGAATGGCTTTTAACGGAGGAATCACGTCTTCTTCCATCATT
TCTCCCAGTGGTTTTGCCACGGCTGCCTTGGCAGCTGCCGGTTTTGGTTTCTTTGCTGGA
ACTTCCACTGTTGAGTCTTCTTTTTCTTTTCCTTTTTCTTTCTTCTCAGTAGCAACAGCA
GAAGTGGAAGACTCTTGCACGGCACAACGCAGCTGACCATCCTTTTTATTACCTGACTGA
TGCAATGTTAGTGGTGGAAACAAAGAAGAGGATGAAAGAGTTGGGGTGAGTATAGAGATA
CGAGAGCTGGTAGCTCCAAATGATCCTCCTGCTATTGTTGTCATCTTCAGAAAGAACGCA
GAAAATTGTAACTGATCTTCACCAACAAAAGA*****TACACTTAGGTTCTTCTCTCCAT
CTTCTGCCTCAAACTAAGTAGTAATGTTTTCCTTTTTTTTTGTGGAGCAAAGCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO63JQ U 1
AF RR2E604JQ U 1
AF RR2CD24JQ U 20
AF RR2CD24TF C 94
AF RR2E604TF C 222
AF RR2CO63TF C 124
BS 1 27 RR2CO63JQ
BS 28 28 RR2E604JQ
BS 29 639 RR2CO63JQ
BS 640 758 RR2CD24JQ
BS 759 835 RR2CD24TF

RD RR2CO63JQ 639 0 0
GGGAGATACGACGACTTTGATTTTCTTCAGTTTTGGTATACAAAATGTAATTGTTTACTA
TAAACAAGTGAATAATAAAAAACACAACCTCCTTTACATTATTGGTTCCAGACGGGAATA
ATCCCTTGTGCAGCAAGGCGCTTCTCGACCCAAAACACAACGTGGTTTGCAGTTGGTTTC
CTCTCGTCGACTAGAAACGGCTCTACGGTACTTGGACCTGATCCGTATGAGGAGATTGAA
AAGCCCTTTGCTCCTGTGAGATTACCACTGGGGAAGAAGGCCCAGAAGGAATATTGAATA
CCTTTCTTGAAGAAAAAACCCTCAAGCTTATCGTCTTGGAAAGATAAATCAATCTCAGAT
ATATCATCTTGAGCTTCAAGAATGGCTTTTAACGGAGGAATCACGTCTTCTTCCATCATT
TCTCCCAGTGGTTTTGCCACGGCTGCCTTGGCAGCTGCCGGTTTTGGTTTCTTTGCTGGA
ACTTCCACTGTTGAGTCTTCTTTTTCTTTTCCTTTTTCTTTCTTCTCAGTAGCAACAGCA
GAAGTGGAAGACTCTTGCACGGCACAACGCAGCTGACCATCCTTTTTATTACCTGACTGA
TGCAATGTTAGTGGTGGAAACAAAGAAGAGGATGAAAGA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2E604JQ 625 0 0
GA
GAGATACGACGACTTTGATTTTCTTAAGTTTTGGTATACAAAATGTAATTGTTTACTATA
AACAAGTGAATAATAAAAAACACAACCTCCTTTACATTATTGGTTCCAGACGGGAATAAT
CCCTTGTGCAGCAAGGCGCTTATCGACCCAAAACACAACGTGGTTTGCAGTTGGTTTCCT
CTCGTCGACTAGAAACGGCTCTACGGTACTTGGACCTGATCCGTATGAGGAGATTGAAAA
GCCCTTTGCTCCTGTGAGATTACCACTGGGGAAGAAGGCCCAGAAGGAATATTGAATACC
TTTCTTGAAGAAAAAACCCTCAAGCTTATCGTCTTGGAAAGATAAATCAATCTCAGATAT
ATCATCTTGAGCTTCAAGAATGGCTTTTAACGGAGGAATCACGTCTTCTTCCATCATTTC
TCCCAGTGGTTTTGCCACGGCTGCCTTGGCAGCTGCCGGTTTTGGTTTCTTTGTTGGAAC
TTCCACTGTTGAGTCTTCTTTTTCTTTTCCTTTTTCTTTCTTCTCAGTAGCAACAGCAGA
AGTGGAAGACTCTTGCACGGCACAACGCAGCCGACCATCCTTTTTATTACCTGACTGATG
CAATGTTAGTGGTGGAAACAAAG

QA 3 625 3 625
DS 

RD RR2CD24JQ 743 0 0
GGTTAATCCAT
TTTTGGTATACGAAATGTAATTGTTTGTTATAAACAAGTGAATAA**AAAAACACAACCT
CCTTTACATTATTGGTTCCAGACGGGAATAATCCCTTGTGCAGCAAGGCGCTTCTCGACC
CAAAACACAACGTGGTTTGCAGTTGGTTTCCTCTCGTCGACTAGAAACGGCTCTACGGTA
CTTGGACCTGATCCGTATGAGGAGATTGAAAAGCCCTTTGCTCCTGTGAGATTACCACTG
GGGAAGAAGGCCCAGAAGGAATATTGAATACCTTTTTTGAAGAAAAAACCCTCCAGCTTA
TCGTCTTGGAAAGATAAATCAATCTCAGATATATCGTCTTGAGCTTCAAGAATGGCTTTT
AACGGAGGAATCACGTCTTCTTCCATCATTTCTCCCAGTGGTTTTGCCACGGCTGCCTTG
GCAGCTGCCGGTTTTGGTTTCTTTGCTGGAACTTCCACTGTTGAGTCTTCTTTTTCTTTT
CCTTTTTCTTTCTTCTCAGTAGCAACTGCAGAAGTGGAAGACTCTTGCACGGCACAACGC
AGCTGACTATCCTTTTTATTACCTGACTGATGCAATGTTAGTGGTGGAAACAAAGAAGAG
GATGAAAGAGTTGGGGTGAGTATAGAGATACGAGAGCTGGTAGCTCCAAATGATCCTCCT
GCTATTGTTGTCATCTTCAGAAAGAACGCAGAAAATTGTAACTGATCTTCACCAACAAAA
GA*****T
ACAC

QA 12 739 12 739
DS 

RD RR2CD24TF 742 0 0
TTACATTATTGGTTCCAGACGGGAATAATCCCTTGTGCAGCAAGGCGCTTCTCGACCCAA
AACACAACGTGGTTTGCAGTTGGTTTCCTCTCGTCGACTAGAAACGGCTCTACGGTACTT
GGACCTGATCCGTATGAGGAGATTGAAAAGCCCTTTGCTCCTGTGAGATTACCACTGGGG
AAGAAGGCCCAGAAGGAATATTGAATACCTTTTTTGAAGAAAAAACCCTCCAGCTTATCG
TCTTGGAAAGATAAATCAATCTCAGATATATCGTCTTGAGCTTCAAGAATGGCTTTTAAC
GGAGGAATCACGTCTTCTTCCATCATTTCTCCCAGTGGTTTTGCCACGGCTGCCTTGGCA
GCTGCCGGTTTTGGTTTCTTTGCTGGAACTTCCACTGTTGAGTCTTCTTTTTCTTTTCCT
TTTTCTTTCTTCTCAGTAGCAACTGCAGAAGTGGAAGACTCTTGCACGGCACAACGCAGC
TGACTATCCTTTTTATTACCTGACTGATGCAATGTTAGTGGTGGAAACAAAGAAGAGGAT
GAAAGAGTTGGGGTGAGTATAGAGATACGAGAGCTGGTAGCTCCAAATGATCCTCCTGCT
ATTGTTGTCATCTTCAGAAAGAACGCAGAAAATTGTAACTGATCTTCACCAACAAAAGA*
****TACACTTAGGTTCTTCTCTCCATCTTCTGCCTCAAACTAAGTAGTAATGTTTTCCT
TTTTTTTTGTGGAGCAAAGCCC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2E604TF 591 0 0
TCCGTATGAGGAGATTGAAAAGCCCTTTGCTCCTGTGAGATTACCACTGGGGAAGAAGGC
CCAGAAGGAATATTGAATACCTTTCTTGAAGAAAAAACCCTCAAGCTTATCGTCTTGGAA
AGATAAATCAATCTCAGATATATCATCTTGAGCTTCAAGAATGGCTTTTAACGGAGGAAT
CACGTCTTCTTCCATCATTTCTCCCAGTGGTTTTGCCACGGCTGCCTTGGCAGCTGCCGG
TTTTGGTTTCTTTGTTGGAACTTCCACTGTTGAGTCTTCTTTTTCTTTTCCTTTTTCTTT
CTTCTCAGTAGCAACAGCAGAAGTGGAAGACTCTTGCACGGCACAACGCAGCCGACCATC
CTTTTTATTACCTGACTGATGCAATGTTAGTGGTGGAAACAAAGAAGGGGATGAAAGAGT
TGGGGTGAGTATAGAGATACGAGAGCTGGTGGCTCCAAATGATCCTCCTGCTATTGTTGT
CATCTCCAGAAAGAACGCAGAAAATTGTAACTGATCTTCACCAACAAAAGATTTGTTACA
CTTAGGTTCTTCTCTCCATCTTCTGCCTCAAACTAAGTAGTA
ATGTTTTCC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2CO63TF 683 0 0
CCTTGTGCAGCAAGGCGCT*CTCGACCCAAAACACAACGTGGTTTGCAGTTGGTTTCCTC
TCGTCGACTAGAAACGGCTCTACGGTACTTGGACCTGATCCGTATGAGGAGATTGAAAAG
CCCTTTGCTCCTGTGAGATTACCACTGGGGAAGAAGGCCCAGAAGGAATATTGAATACCT
TTCTTGAAGAAAAAACCCTCAAGCTTATCGTCTTGGAAAGATAAATCAATCTCAGATATA
TCATCTTGAGCTTCAAGAATGGCTTTTAACGGAGGAATCACGTCTTCTTCCATCATTTCT
CCCAGTGGTTTTGCCACGGCTGCCTTGGCAGCTGCCGGTTTTGGTTTCTTTGCTGGAACT
TCCACTGTTGAGTCTTCTTTTTCTTTTCCTTTTTCTTTCTTCTCAGTAGCAACAGCAGAA
GTGGAAGACTCTTGCACGGCACAACGCAGCTGACCATCCTTTTTATTACCTGACTGATGC
AATGTTAGTGGTGGAAACAAAGAAGAGGATGAAAGAGTTGGGGTGAGTATAGAGATACGA
GAGCTGGTAGCTCCAAATGATCCTCCTGCTATTGTTGTCATCTTCAGAAAGAACGCAGAA
AATTGTAACTGATCTTCACCAACAAAAGATTTGTTACA*TTAGGTTCTTCTCTCCATCTT
CTGCCTCAAACTAAGTAGTA
TCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 2 6

CO CL1476Contig1 913 2 2 U
TAAACAACACAGCAGCGCAAAAGCAGAGAGGGGACGAAAAAGAAGGCTTCTCCCAAGAGA
GAAAAAGCAGCAACAACTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCGCTTTGATTTTGAGATTTTGAAC
TTCCTCTTCCTGATTCAATCTCGAGAAAGGCATAGATGCAGAGTCTTCGGCTTTTGGAGT
TGTGATAAAGAACACACAAAAAAAAACAAACATAATGGGAGGCTGCTGTTGTCGTTCTTC
TTCACGAAGAGGAGCTGATGTTGATAATGGACCTCCCTACTATTACTATCCGAGAGCAAC
AGAAGAGCGTGTTCCTTTATCTTCCGCTCTTAACAGGACTTCCTCTACAATCTCCTCTGG
TGTTGTTGTAGTTGACACAAACTTAGAGACTTCATCTCCCGATGCTTATATACCACCACC
GCTCCCTACTCCTTTCGATGTGGCTATAGGTGTTCCTCAAACTCCAGAAATCCGTGAAGA
GTCTGCTTGTGTTGATATAAGAGAAGTCTCAGTTGAAGCCCCTAATACTGAGTCAGCTCA
AGCAACAGTCGATGGTATCACTCTCGGGGTTCCAGCTACAACATGCCCGTGTAAAGAAAC
AGAAAGCAAACAACAGGGAGAGATTGATCTTGGAGCTACTGAAGAAATAGACCCCAAGAA
GCTATCGAAAGACGTCTTTGTACCAATAGAGGAAGAGGAGGATTGTCCTATATGCTTGGA
AGAATATGATATGGATAACCCGAAACTTCTAGCCAAATGTGAGCACCATTTTCACCTTGC
ATGCATTCTAGAATGGATGGAGAGAAGTGAAACTTGCCCCGTCTGCAACAAGGAAATGGT
GTTTGACTCTCCCCTCGACTAGCAACCTGCAAGTACCCCACAGCTTAGAAGACTCGTTTC
GGCTCTGAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E066TF U 1
AF RR2E066JQ C 407
BS 1 611 RR2E066TF
BS 612 913 RR2E066JQ

RD RR2E066TF 612 0 0
TAAACAACACAGCAGCGCAAAAGCAGAGAGGGGACGAAAAAGAAGGCTTCTCCCAAGAGA
GAAAAAGCAGCAACAACTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCGCTTTGATTTTGAGATTTTGAAC
TTCCTCTTCCTGATTCAATCTCGAGAAAGGCATAGATGCAGAGTCTTCGGCTTTTGGAGT
TGTGATAAAGAACACACAAAAAAAAACAAACATAATGGGAGGCTGCTGTTGTCGTTCTTC
TTCACGAAGAGGAGCTGATGTTGATAATGGACCTCCCTACTATTACTATCCGAGAGCAAC
AGAAGAGCGTGTTCCTTTATCTTCCGCTCTTAACAGGACTTCCTCTACAATCTCCTCTGG
TGTTGTTGTAGTTGACACAAACTTAGAGACTTCATCTCCCGATGCTTATATACCACCACC
GCTCCCTACTCCTTTCGATGTGGCTATAGGTGTTCCTCAAACTCCAGAAATCCGTGAAGA
GTCTGCTTGTGTTGATATAAGAGAAGTCTCAGTTGAAGCCCCTAATACTGAGTCAGCTCA
AGCAACAGTCGATGGTATCACTCTCGGGGTTCCAGCTACAACATGCCCGTGTAAAGAAAC
AGAAAGCAAAC
A

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2E066JQ 507 0 0
TATATACCACCACCGCTCCCTACTCCTTTCGATGTGGCTATAGGTGTTCCTCAAACTCCA
GAAATCCGTGAAGAGTCTGCTTGTGTTGATATAAGAGAAGTTTCAGTTGAAGCCCCTAAT
ACTGAGTCAGCTCAAGCAACAGTCGATGGTATCACTCTCGGGGTTCCAGTTACAACATGC
CCGTGTAAAGAAACAGAAAGCAAACAACAGGGAGAGATTGATCTTGGAGCTACTGAAGAA
ATAGACCCCAAGAAGCTATCGAAAGACGTCTTTGTACCAATAGAGGAAGAGGAGGATTGT
CCTATATGCTTGGAAGAATATGATATGGATAACCCGAAACTTCTAGCCAAATGTGAGCAC
CATTTTCACCTTGCATGCATTCTAGAATGGATGGAGAGAAGTGAAACTTGCCCCGTCTGC
AACAAGGAAATGGTGTTTGACTCTCCCCTCGACTAGCAACCTGCAAGTACCCCACAGCTT
AGAAGACTCGTTTCGGCTCTGAATCCC

QA 1 507 1 507
DS 



CO CL1476Contig2 1108 4 7 U
AATAAAACCCTAATTCTTATCTTTAATAGTCTTTGTAGACGACTTCAAACGTCTGTACAA
GCATACATATTTATATATATCAACACTAACGTGTAATTTGCAAATTGTGAATCAAGAACG
TTACTGTTGTGTATTTTCTTACCATCTTTTTTTCTTTTCTTTTATGTTTCTTCGTTTTGT
TTTTCTTTTTTGGGATTCAGAGCCGAAACGAGTCTTCTAAGCTGTGGGTACTTACAGGTT
GCTAGTCGAGGGGAGAGTCGAACACCATTTCCTTGTTGCAGACGGGGCAAGTTTCACTTC
TCTCCATCCATTCTAGAATGCATGCGAGGTGAAAATGGTGCTCACATTTGGCAAGAAGTT
TCGGGTTATCCATATCATATTCTTCCAAGCATATGGGACAATCCTCCTCTTCCTCTATTG
GTACGAAGACGTCTTTCGATAGCTTCTTGGGGTCTATATCTTCAGTAGATTCAAGGTCAA
TCTCTGCCTGTGGTTTGGTTTCTGTTTCTTTACACGGGCATGTTGTAGTTGGAACCCCGA
GAGTGATACCACCGACTGTTGCTTGAGCTGACTCAGTATTAGGGGCTTCAACTGAGACTT
CTCTTATATCAACACAAGCAGACTCTTCACGGATTTCTGGAGTTTGAGGAACACCTATAG
CCACATCGAAAGGAGTAGGGAGTGGCGGTGGTATATAAGCATCAGGAGATGAAGTCTCTA
AGTTTGTGTCAACTACAACGACACCAGAGGAGATTGTAGAGGAAGTCCTGTTAAGAGCGG
AAGATAAAGGAACACGCTCTTCTGTTGCTCTCGGATAGTAATAGTAGGGAGGTCCATTAT
CAACATCGGCTCTTCGTGAAGAAGAACAACAACAGCAGCCTCCCATTATGTTTTTCTTTT
TTTGTGTGTTCTGTATCACAATTCCAAAAACCGAAGACTCTGCATCTATGCCTTTCTCGA
GATTGAATCAGGAAGAGGAAGTTCAAAAATCTCAAAATCAAAGGGGGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGTATTTGCTTTTTCTCTCTTGGGAGAAACCTTCTTTTTCGTCCCCTCTCTGCTT
TTGCGCTGCTGTGTTGTTTATCGTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2H679JQB U 1
AF RR2F311JQ U 192
AF RR2H679TF C 340
AF RR2F311TF C 359
BS 1 233 RR2H679JQB
BS 234 234 RR2F311JQ
BS 235 295 RR2H679JQB
BS 296 296 RR2F311JQ
BS 297 666 RR2H679JQB
BS 667 734 RR2F311JQ
BS 735 1108 RR2H679TF

RD RR2H679JQB 666 0 0
AATAAAACCCTAATTCTTATCTTTAATAGTCTTTGTAGACGACTTCAAACGTCTGTACAA
GCATACATATTTATATATATCAACACTAACGTGTAATTTGCAAATTGTGAATCAAGAACG
TTACTGTTGTGTATTTTCTTACCATCTTTTTTTCTTTTCTTTTATGTTTCTTCGTTTTGT
TTTTCTTTTTTGGGATTCAGAGCCGAAACGAGTCTTCTAAGCTGTGGGTACTTGCAGGTT
GCTAGTCGAGGGGAGAGTCGAACACCATTTCCTTGTTGCAGACGGGGCAAGTTTCGCTTC
TCTCCATCCATTCTAGAATGCATGCGAGGTGAAAATGGTGCTCACATTTGGCAAGAAGTT
TCGGGTTATCCATATCATATTCTTCCAAGCATATGGGACAATCCTCCTCTTCCTCTATTG
GTACGAAGACGTCTTTCGATAGCTTCTTGGGGTCTATATCTTCAGTAGATTCAAGGTCAA
TCTCTGCCTGTGGTTTGGTTTCTGTTTCTTTACACGGGCATGTTGTAGTTGGAACCCCGA
GAGTGATACCACCGACTGTTGCTTGAGCTGACTCAGTATTAGGGGCTTCAACTGAGACTT
CTCTTATATCAACACAAGCAGACTCTTCACGGATTTCTGGAGTTTGAGGAACACCTATAG
CCACAT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2F311JQ 543 0 0
GGGATTCGGAGCCGAAACGAGTCTTCTAAGCTGTGGGTACTTACAGGTTGCTAGTTGAGG
GGAGAGTCGAACACCATTTCCTTGTTGCAGACGGGGCAAGTTTCACTTCTCTCCATCCAT
TCTAGAATGCATGCGAGGTGAAAATGGTGCTCACATTTGGCAAGAAGTTTCGGGTTATCC
ATATCATATTCTTCCAAGCATATGGGACAATCCTCCTCTTCCTCTATTGGTACGAAGACG
TCTTTCGATAGCTTCTTGGGGTCTATATCTTCAGTAGATTCAAGGTCAATCTCTGCCTGT
GGTTTGGTTTCTGTTTCTTTACACGGGCATGTTGTAGTTGGAACCCCGAGAGTGATACCA
TCGACTGTTGCTTGAGTTGACTCAGTATTAGGGGCTTCAACTGAGACTTCTCTTATATCA
ACACAAGCAGACTCTTCACGGATTTCTGGAGTTTGAGGAACACCTATAGCCACATCGAAA
GGAGTAGGGAGTGGCGGTGGTATATAAGCATCAGGAGATGAAGTCTCTAAGTTTGTGTCA
ACT

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2H679TF 769 0 0
GCTCACATTTGGCAAGAAGTTTCGGGTTATCCATATCATATTCTTCCAAGCATATGGGAC
AATCCTCCTCTTCCTCTATTGGTACGAAGACGTCTTTCGATAGCTTCTTGGGGTCTATAT
CTTCAGTAGATTCAAGGTCAATCTCTGCCTGTGGTTTGGTTTCTGTTTCTTTACACGGGC
ATGTTGTAGTTGGAACCCCGAGAGTGATACCACCGACTGTTGCTTGAGCTGACTCAGTAT
TAGGGGCTTCAACTGAGACTTCTCTTATATCAACACAAGCAGACTCTTCACGGATTTCTG
GAGTTTGAGGAACACCTATAGCCACATCGAAAGGAGTAGGGAGTGGCGGTGGTATATAAG
CATCAGGAGATGAAGTCTCTAAGTTTGTGTCAACTACAACGACACCAGAGGAGATTGTAG
AGGAAGTCCTGTTAAGAGCGGAAGATAAAGGAACACGCTCTTCTGTTGCTCTCGGATAGT
AATAGTAGGGAGGTCCATTATCAACATCGGCTCTTCGTGAAGAAGAACAACAACAGCAGC
CTCCCATTATGTTTTTCTTTTTTTGTGTGTTCTGTATCACAATTCCAAAAACCGAAGACT
CTGCATCTATGCCTTTCTCGAGATTGAATCAGGAAGAGGAAGTTCAAAAATCTCAAAATC
AAAGGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTATTTGCTTTTTCTCTCTTGGGAGAAACCTTC
TTTTTCGTCCCCTCTCTGCTTTTGCGCTGCTGTGTTGTTTATCGTGCCC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2F311TF 750 0 0
TTTCGGGTTATCCATATCATATTCTTCCAAGCATATGGGACAATCCTCCTCTTCCTCTAT
TGGTACGAAGACGTCTTTCGATAGCTTCTTGGGGTCTATATCTTCAGTAGATTCAAGGTC
AATCTCTGCCTGTGGTTTGGTTTCTGTTTCTTTACACGGGCATGTTGTAGTTGGAACCCC
GAGAGTGATACCATCGACTGTTGCTTGAGTTGACTCAGTATTAGGGGCTTCAACTGAGAC
TTCTCTTATATCAACACAAGCAGACTCTTCACGGATTTCTGGAGTTTGAGGAACACCTAT
AGCCACATCGAAAGGAGTAGGGAGTGGCGGTGGTATATAAGCATCAGGAGATGAAGTCTC
TAAGTTTGTGTCAACTACAACGACACCAGAGGAGATTGTAGAGGAAGTCCTGTTAAGAGC
GGAAGATAAAGGAACACGCTCTTCTGTTGCTCTCGGATAGTAATAGTAGGGAGGTCCATT
ATCAACATCGGCTCTTCGTGAAGAAGAACAACAACAGCAGCCTCCCATTATGTTTTTCTT
TTTTTGTGTGTTCTGTATCACAATTCCAAAAACCGAAGACTCTGCATCTATGCCTTTCTC
GAGATTGAATCAGGAAGAGGAAGTTCAAAAATCTCAAAATCAAAGGGGGAGAGAGAGAGA
GAGAGAG**TATTTGCTTTTTCTCTCTTGGGAGAAACCTTCTTTTTCGTCCCCTCTCTGC
TTTTGCGCTGCTGTGTTGTTTATCGTGCCC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 3

CO CL1477Contig1 1225 3 17 U
GTGAGCAACTGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCATCACACTTTCTACAATGAGCTCCGT
ATTGCTCCTGAGGAGCACCCCGTTCTTCTTACCGAGGCTCCTCTTAACCCAAAGGCCAAC
AGAGAGAAGATGACTCAGATCATGTTCGAGACCTTTAACTCTCCGGCTATGTATGTCGCT
ATCCAATCTGTTCTCTCCCTGTACGCCAGTGGTCGTACTACCGGTATTGTGCTGGATTCT
GGTGATGGTGTGTCTCACACTGTGCCAATCTACGAGGGTTTCTCTCTTCCACACGCCATC
CTCCGTCTTGACCTTGCTGGTCGTGACCTTACTGATTACCTCATGAAGATTCTCACCGAG
AGAGGTTACATGTTCACCACAACAGCAGAGCGGGAAATTGTAAGAGACATCAAGGAGAAG
CTTTCCTTTGTCGCTGTGGACTACGAGCAGGAGATGGAGACTTCCAAATCCAGCTCCTCC
ATCGAGAAGAACTACGAGTTACCCGACGGACAAGTGATCACCATCGGTGCCGAGAGATTC
AGGTGCCCAGAGGTTCTTTTCCAGCCATCGTTCGTGGGAATGGAAGCTGCTGGAATACAC
GAGACGACCTACAACTCGATCATGAAGTGTGACGTGGATATCAGGAAGGACTTGTACGGT
AACATTGTGCTCAGTGGTGGAACCACTATGTTCTCGGGGATTGCAGACCGTATGAGCAAA
GAGATCACGGCACTTGCACCAAGCAGCATGAAGATTAAGGTCGTTGCACCTCCCGAGAGG
AAGTACAGTATCTGGATCGGTGGTTCAATTCTTGCTTCCCTCAGCACATTCCAGCAGATG
TGGATCTCCAAGGCTGAGTACGATGAGGCAGGTCCAGGGATTGTTCACAGGAAATGCTTC
TAAGCTCTCTCTCTCTCAATGAGAAGGCTACACAAGCTGGGTATTATGAATGGGATCAAA
GTTTTTTTTTTTTGTTTCTATTTGCTTCTCCATTTGTTTGTTTCATTTGCTTTCTTTTTG
TTGTCGTTTCTATGCACTTGCGTGTGACAAAACTCTCTGGGTTTTACTTTACGTCTGCGT
TTCAAGAAACAGCTTTCGTTTTGCGTTTTAGTCCCATTGTTTTGTAGCTCGAGTGCGCCT
CTATTTTTCTGTATTTCTTTCAAAAAAACTGGGAAGAAGGAGCTTGATAATACTCTTTGC
ATTTGTTAATATAAAGTATTGTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D338TF U 1
AF RR2EB19TF U 356
AF RR2EB19JQ C 431
BS 1 557 RR2D338TF
BS 558 558 RR2EB19TF
BS 559 566 RR2D338TF
BS 567 567 RR2EB19TF
BS 568 596 RR2D338TF
BS 597 597 RR2EB19TF
BS 598 641 RR2D338TF
BS 642 1088 RR2EB19TF
BS 1089 1089 RR2EB19JQ
BS 1090 1101 RR2EB19TF
BS 1102 1102 RR2EB19JQ
BS 1103 1108 RR2EB19TF
BS 1109 1109 RR2EB19JQ
BS 1110 1114 RR2EB19TF
BS 1115 1115 RR2EB19JQ
BS 1116 1138 RR2EB19TF
BS 1139 1225 RR2EB19JQ

RD RR2D338TF 641 0 0
GTGAGCAACTGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCATCACACTTTCTACAATGAGCTCCGT
ATTGCTCCTGAGGAGCACCCCGTTCTTCTTACCGAGGCTCCTCTTAACCCAAAGGCCAAC
AGAGAGAAGATGACTCAGATCATGTTCGAGACCTTTAACTCTCCGGCTATGTATGTCGCT
ATCCAATCTGTTCTCTCCCTGTACGCCAGTGGTCGTACTACCGGTATTGTGCTGGATTCT
GGTGATGGTGTGTCTCACACTGTGCCAATCTACGAGGGTTTCTCTCTTCCACACGCCATC
CTCCGTCTTGACCTTGCTGGTCGTGACCTTACTGATTACCTCATGAAGATTCTCACCGAG
AGAGGTTACATGTTCACCACAACAGCAGAGCGGGAAATTGTAAGAGACATCAAGGAGAAG
CTTTCCTTTGTCGCTGTGGACTACGAGCAGGAGATGGAGACTTCCAAATCCAGCTCCTCC
ATCGAGAAGAACTACGAGTTACCCGACGGACAAGTGATCACCATCGGTGCCGAGAGATTC
AGGTGCCCAGAGGTTCTGTTCCAGCCTTCGTTCGTGGGAATGGAAGCTGCTGGAATCCAC
GAGACGACCTACAACTCGATCATGAAGTGTGACGTGGATAT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2EB19TF 785 0 0
G
CGAGAGAGGTTACATGTTCACCACAACAGCAGAGCGGGAAATTGTGAGAGACATCAAGGA
GAAGCTTTCCTTTGTCGCTGTGGACTACGAGCAGGAGATGGAGACTTCCAAATCCAGCTC
CTCCATCGAGAAGAACTACGAGTTACCCGACGGACAAGTGATCACCATCGGTGCCGAGAG
ATTCAGGTGCCCAGAGGTTCTTTTCCAGCCATCGTTCGTGGGAATGGAAGCTGCTGGAAT
ACACGAGACGACCTACAACTCGATCATGAAGTGTGACGTGGATATCAGGAAGGACTTGTA
CGGTAACATTGTGCTCAGTGGTGGAACCACTATGTTCTCGGGGATTGCAGACCGTATGAG
CAAAGAGATCACGGCACTTGCACCAAGCAGCATGAAGATTAAGGTCGTTGCACCTCCCGA
GAGGAAGTACAGTATCTGGATCGGTGGTTCAATTCTTGCTTCCCTCAGCACATTCCAGCA
GATGTGGATCTCCAAGGCTGAGTACGATGAGGCAGGTCCAGGGATTGTTCACAGGAAATG
CTTCTAAGCTCTCTCTCTCTCAATGAGAAGGCTACACAAGCTGGGTATTATGAATGGGAT
CAAAGTTTTTTTTTTTTGTTTCTATTTGCTTCTCCATTTGTTTGTTTCATTTGCTTTCTT
TTTGTTGTCGTTTCTATGCACTTGCGTGTGACAAAACTCTCTGGGTTTTACTTTACGTCT
GCGTTTCAAGAA*CAGCTTTCGTTT*GCGTTT*AGTCC*ATTGTTTTGTAGCTCGAGTGC
GC
TC

QA 2 783 2 783
DS 

RD RR2EB19JQ 795 0 0
TCGCTGTGGACTACGAGCAGGAGATGGAGACTTCCAAATCCAGCTCCTCCATCGAGAAGA
ACTACGAGTTACCCGACGGACAAGTGATCACCATCGGTGCCGAGAGATTCAGGTGCCCAG
AGGTTCTTTTCCAGCCATCGTTCGTGGGAATGGAAGCTGCTGGAATACACGAGACGACCT
ACAACTCGATCATGAAGTGTGACGTGGATATCAGGAAGGACTTGTACGGTAACATTGTGC
TCAGTGGTGGAACCACTATGTTCTCGGGGATTGCAGACCGTATGAGCAAAGAGATCACGG
CACTTGCACCAAGCAGCATGAAGATTAAGGTCGTTGCACCTCCCGAGAGGAAGTACAGTA
TTTGGATCGGTGGTTCAATTCTTGCTTCCCTCAGCACATTCCAGCAGATGTGGATCTCCA
AGGCTGAGTACGATGAGGCAGGTCCAGGGATTGTTCACAGGAAATGCTTTTAAGCTCTCT
CTCTCTCAATGAGAAGGCTACACAAGCTGGGTATTATGAATGGGATCAAAGTTTTTTTTT
TTTGTTTCTATTTGCTTCTCCATTTGTTTGTTTCATTTGCTTTCTTTTTGTTGTCGTTTC
TATGCACTTGCGTGTGACAAAACTCTCTGGGTTTTACTTTACGTCTGCGTTTCAAGAAAC
AGCTTTCGTTTTGCGTTTTAGTCCCATTGTTTTGTAGCTCGAGTGCGCCTCTATTTTTCT
GTATTTCTTTCAAAAAAACTGGGAAGAAGGAGCTTGATAATACTCTTTGCATTTGTTAAT
ATAAAGTATTGTACG

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 4

CO CL1478Contig1 1429 4 31 U
GGATACCATAACTTTGTCGCGAAGACCAGACTCTCGAACTCGCAGATTGTTGTTCTTTTC
CTCAGATGGCAATTCATTACCTGACAGCCCTATCGCTAGTGTTGTCATGCCTTGTCAGTG
TTTCATATGCTAGTCTTGGCGATGCCGATCCAAACTACAGGACATGTGTTGCAGAATGCG
AGAGAAACGGTTGCGTTGGACAAGTGTGCTTTCCTCAGTGCAATTCTTCTTCCACTGGTG
GTGGTCCATGGTACACACAAGAACCTCTGTATCTACAGTGGCAGAAGCTGGGCTGTCAAA
GTGATTGCCGTTATCACTGTATGGTTAATAGAGAGAAAGAACGAGAATCTCTTGGCCATG
TCCCTGTCAAGTACCATGGTAAATGGCCTTTCAAGCGTGTCCTTGGGATTCAGGAGCCTG
CTTCTGTTGCTTTCTCTGTGCTCAACCTAGCGATGCATTTCCATGGCTGG*CTTTCCTTC
TTCATCACACTATACTATAAGCTGCCTCTCAAACAAGACAAGACGGCTTACTATGAGTAC
GTCGGTTTGTGGCATATGTACGGTCTCCTCTCCATGAACTCTTGGTTCTGGAGTGTAGTT
TTCCACAGCCGGGATGTTGATCTCACAGAGAGGTTAGACTACTCATCTGCAATTGCAGTT
CTCGGATTCTCACTCATCTTAGCCATCCTAAGAACCTTTGATGTTCGAGTCGAGGCTGCG
AGAGTCATGGTATCCGCTCCAATACTAGCTTTCGTCACCACCCACATACTATACATTAAC
TTCTACAAACTCGACTATGGTTGGAACATGATCGTGTGTGTGACCATGGGAGTCGCTCAG
CTATTGCTATGGGCAAGATGGGCAGCTGTCTCGAGACATCCTTCTAGTTGGAAACTTTGG
GTGGTTGTGATTGCTGGAGGCTTAGCTATGCTTTTGGAGATATATGATTTTCCTCCGTTT
GAAGGCTACTTCGATGCTCACTCCATCTGGCACGCCATCACAGTTCCTCTTACTGTTCTC
TGGTGGAGCTTTATTAGAGACGATGCTGAGTTCAGAACTTCTAGTCTTCTCAAGAAATCT
AAGACAAAGGCCAAGTAAGTCTCACAGGGATATTTTTCTATCGATCATAAAATCAAAAGC
ACTGGGGAAAAAGACGAGGGAATATGGATTCAAACATCAAGAAGAAAGCAGTTTCGTTTT
TTTTGTTTTAAAATAGGTGGTCTGTGATTTTTATTTACCGACAGTTGCAGAGGTTTCTTG
TTTTTTTTCACAATGGTTTAATTCAGACATTTGTCATGGCCTTACTTTGATCAGTTGAGA
TTTTGATAACAGTTTCTAATTCCTACACACGCTTTTGCAAGTCTTGTTGGAGTCAGGGAC
AAACTCTTGTGATCTATATGATTGTGTTAACAAAAATTTGATTCTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F030TF U 50
AF RR2GE05TF U 1
AF RR2F030JQ C 430
AF RR2CK43JQ C 700
BS 1 100 RR2GE05TF
BS 101 101 RR2F030TF
BS 102 299 RR2GE05TF
BS 300 300 RR2F030TF
BS 301 375 RR2GE05TF
BS 376 376 RR2F030TF
BS 377 595 RR2GE05TF
BS 596 596 RR2F030TF
BS 597 759 RR2GE05TF
BS 760 760 RR2F030JQ
BS 761 778 RR2GE05TF
BS 779 779 RR2F030JQ
BS 780 799 RR2GE05TF
BS 800 812 RR2F030JQ
BS 813 813 RR2CK43JQ
BS 814 854 RR2F030JQ
BS 855 855 RR2CK43JQ
BS 856 920 RR2F030JQ
BS 921 921 RR2CK43JQ
BS 922 1011 RR2F030JQ
BS 1012 1012 RR2CK43JQ
BS 1013 1103 RR2F030JQ
BS 1104 1104 RR2CK43JQ
BS 1105 1201 RR2F030JQ
BS 1202 1203 RR2CK43JQ
BS 1204 1218 RR2F030JQ
BS 1219 1219 RR2CK43JQ
BS 1220 1238 RR2F030JQ
BS 1239 1239 RR2CK43JQ
BS 1240 1298 RR2F030JQ
BS 1299 1429 RR2CK43JQ

RD RR2F030TF 690 0 0
TTGTTCTTTTCCT
CAGATGGCAGTTCATTACCTGACAGCCCTATCGCTAGTGTTGTCATGCCTTGTCAGTGTT
TCATATGCTAGTCTTGGCGATGCCGATCCAAACTACAGGACATGTGTTGCAGAATGCGAG
AGAAACGGTTGCGTTGGACAAGTGTGCTTTCCTCAGTGCAATTCTTCTTCCACTGGTGGT
GGTCCATGGTACACACAAGAACCTCTGTATCTACAGTGGCAGAAGCTGGGCTGTCAAAGT
GATTGCCGTTATCACTGTATGGTTAATAGAGAGAAAGAACGAGAATCTCTTGGCCATGTC
CCTGTCAAGTACCATGGTAAATGGCCTTTCAAGCGTGTCCTTGGGATTCAGGAGCCTGCT
TCTGTTGCTTTCTCTGTGCTCAACCTAGCGATGCATTTCCATGGCTGGGCTTTCCTTCTT
CATCACACTATACTATAAGCTGCCTCTCAAACAAGACAAGACGGCTTACTATGAGTACGT
CGGTTTGTGGCATATGTACGGTCTCCTCTCCATGAACTCTTGGTTCTGGAGTGTAGTTTT
CCACAGCCGGGATGTTGATCTCACAGAGAGGTTAGACTACTCATCTGCAATTGCAGTTCT
CGGATTCTCACTCATCTTAGCCATCCTAAGAACCTTTGATGTTCGAGTCGAGGCTGCGAG
AGTCATGGTATCCGCTC

QA 14 690 14 690
DS 

RD RR2GE05TF 799 0 0
GGATACCATAACTTTGTCGCGAAGACCAGACTCTCGAACTCGCAGATTGTTGTTCTTTTC
CTCAGATGGCAATTCATTACCTGACAGCCCTATCGCTAGTTTTGTCATGCCTTGTCAGTG
TTTCATATGCTAGTCTTGGCGATGCCGATCCAAACTACAGGACATGTGTTGCAGAATGCG
AGAGAAACGGTTGCGTTGGACAAGTGTGCTTTCCTCAGTGCAATTCTTCTTCCACTGGTG
GTGGTCCATGGTACACACAAGAACCTCTGTATCTACAGTGGCAGAAGCTGGGCTGTCAAG
GTGATTGCCGTTATCACTGTATGGTTAATAGAGAGAAAGAACGAGAATCTCTTGGCCATG
TCCCTGTCAAGTACCTTGGTAAATGGCCTTTCAAGCGTGTCCTTGGGATTCAGGAGCCTG
CTTCTGTTGCTTTCTCTGTGCTCAACCTAGCGATGCATTTCCATGGCTGG*CTTTCCTTC
TTCATCACACTATACTATAAGCTGCCTCTCAAACAAGACAAGACGGCTTACTATGAGTAC
GTCGGTTTGTGGCATATGTACGGTCTCCTCTCCATGAACTCTTGGTTCTGGAGTGCAGTT
TTCCACAGCCGGGATGTTGATCTCACAGAGAGGTTAGACTACTCATCTGCAATTGCAGTT
CTCGGATTCTCACTCATCTTAGCCATCCTAAGAACCTTTGATGTTCGAGTCGAGGCTGCG
AGAGTCATGGTATCCGCTCCAATACTAGCTTTCGTCACC*CCCACATACTATACATTAGC
TTCTACAAACTCGACTATG

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2F030JQ 871 0 0
GC
TTCTCTGTGCTCA*CCTAGCGATGCATT*CCATGGCTG**CTTTC*TTCTTCATCACACT
ATACTATAAGCTGC*TCTCAAACAAGACAAGACGGCTTACTATGAGTACGTCGGTTTGTG
GCATATGTACGGTCTCCTCTCCATGAACTCTTGGTTCTGGAGTGTAGTTTTCCACAGCCG
GGATGTTGATCTCACAGAGAGGTTAGACTACTCATCTGCAATTGCAGTTCTCGGATTCTC
ACTCATCTTAGCCATCCTAAGAACCTTTGATGTTCGAGTCGAGGCTGCGAGAGTCATGGT
ATCCGCTCCAATACTAGCTTTCGTCACCACCCACATACTATACATTAACTTCTACAAACT
CGACTATGGTTGGAACATGATTGTGTGTGTGACCATGGGAGTCGCTCAGCTATTGCTATG
GGCGAGATGGGCAGCTGTCTCGAGACATCCTTCTAGTTGGAAACTTTGGGTGGTTGTGAT
TGCTGGAGGGTTAGCTATGCTTTTGGAGATATATGATTTTCCTCCGTTTGAAGGCTACTT
CGATGCTCACTCCATCTGGCACGCCATCACAGTTCCTCTTGCTGTTCTCTGGTGGAGCTT
TATTAGAGACGATGCTGAGTTCAGAACTTCTAGTCTTCTCAAGAAATCTAAGACAAAGGC
CAAGTAAGTCTCGCAGGGATATTTTTCTATCGATCATAAAATCAAAAGCACTGGGGAAAA
AGACGAGGGAATATGGATTCAAACATCAAGAAGAAAGCAGTTTCGTTTTT**TGTTTTAA
AATAGGTTGTCTGTGATTTTTATTTACTGACAGTTGCAGAGGTTTCTTGTTTTTTTTCAC
AATGGTTTAATTCAGACATTTGTCATG
CC

QA 3 869 3 869
DS 

RD RR2CK43JQ 730 0 0
GATGTTCGAGTCGAGGCTGCAAGAGTCATGGTATCCGCTCCAATACTAGCTTTCGTCACC
ACCCACATACTATACATTAACTTCTACAAACTCGACTATGGTTGGAACATGATCGTGTGT
GTGACCATGGGAGTCGCTCAGCTATTTCTATGGGCAAGATGGGCAGCTGTCTCGAGACAT
CCTTCTAGTTGGAAACTTTGGGTGGTTGTGATTGCTGGAGGCTTAGCTATGCTTTTGGAG
ATATATGATTTTCCTCCGTTTGAAGGCTACTTCGATGCTCACTCCATCTGGCACGCCATC
ACTGTTCCTCTTACTGTTTTCTGGTGGAGCTTTATTAGAGACGATGCTGAGTTCAGAACT
TCTAGTCTTCTCAAGAAATCTAAGACAAAGGCCAAGTAAGTCTCACATGGATATTTTTCT
ATCGATCATAAAATCAAAAGCACTGGGGAAAAAGACGAGGGAATATGGATTCAAACATCA
AGAAGAAAGCAGTTTCGTTTTTTTTGTTTTAAAATAGGTGGTCTGTGATTTTTATTTATC
GACAGTTGCAGAGGTTTCTTGTTTTT***CACAATGGTTTATTTCAGACATTTGTCATGG
CCTTACTTTGATCAGTTGAGATTTTGATAACAGTTTCTAATTCCTACACACGCTTTTGCA
AGTCTTGTTGGAGTCAGGGACAAACTCTTGTGATCTATATGATTGTGTTAACAAAAATTT
GATTCTACAT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 5

CO CL1479Contig1 895 5 35 U
GGAAACGAAGCTACGGAAAGAAGCTACATCCTTGCAGCGTTACGAGGAAGAAGAAGAAGA
GCAATCGATCCTCTTGTTTTGATAATCAATGGCGGTTTCTTCTGTAACCTCGTTCTTATT
ACCCTCTTTCTCCAATCCCACCTATTCGTCTTCTTCTACCAGACAGAAACTCTCTCTGCT
CTCCTTGCTCCCCCCACCTTCTTCCACTCATAGCTCCTCCCTCCTTAACAAACCTTCCCT
CTCGTTTACGAAGAGGGTCTTCGCAGCTCCCGAAACCCTAACTCCTGAAACTCTCGAAGA
ACCCGTCTCTGAGGTTCCGAGCTCTTCCTCGATCGGTGTAGACGCGGATAAGATGGCGCC
AAAGCAGAAAATTAGGATCAAGCTGAGATCATACTGGGTGCCTCTTATTGAGGACTCATG
CAAGCAGATACTCGACGCTGCGAGGAATACTAATGCTAAGACAATGGGTCCTGTCCCATT
GCCGACCAAGAAGCGTATCTACTGTGTTCTCAAGTCTCCTCACGTCCACAAGGATGCAAG
GTTCCATTTTGAGATCAGGACCCACCAGCGGATGATTGATATTCTCTACCCCACTGCTCA
AACCATTGATTCCTTGATGCAGCTGGATCTTCCTGCTGGTGTTGATGTCGAGGTCAAGCT
CTGAAGATCAGGGGTAACTACAATGGTGATGGGAACTTGCATTGCATGAACAGACTGTTT
TAGATCAACGACGTTGGTTAGAACTTGTAAGCCCTGTATAATCTTTTTGAGAGCCTCTGT
ACTGAGTATTTTCTGTTAGTGATCTTTGGTCTTTTATTAATTACAATATTTTTTTCTTTT
GTATTTAATTCGGATCTTTATTTGAATATCAGTATGAACAGAAACGAGGAAAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
0 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM87TF U 257
AF RR2BY07TF U 1
AF RR2CU04TF U 11
AF RR2BY07JQ C 59
AF RR2CM87JQ C 299
BS 1 84 RR2BY07TF
BS 85 85 RR2CU04TF
BS 86 330 RR2BY07TF
BS 331 331 RR2CU04TF
BS 332 366 RR2BY07TF
BS 367 367 RR2CU04TF
BS 368 369 RR2BY07TF
BS 370 370 RR2CU04TF
BS 371 384 RR2BY07TF
BS 385 385 RR2CU04TF
BS 386 447 RR2BY07TF
BS 448 448 RR2CU04TF
BS 449 462 RR2BY07TF
BS 463 463 RR2CU04TF
BS 464 483 RR2BY07TF
BS 484 484 RR2CU04TF
BS 485 666 RR2BY07TF
BS 667 667 RR2CU04TF
BS 668 673 RR2BY07TF
BS 674 674 RR2BY07JQ
BS 675 720 RR2BY07TF
BS 721 721 RR2BY07JQ
BS 722 727 RR2BY07TF
BS 728 728 RR2CU04TF
BS 729 734 RR2BY07TF
BS 735 735 RR2CU04TF
BS 736 738 RR2BY07TF
BS 739 739 RR2BY07JQ
BS 740 742 RR2BY07TF
BS 743 743 RR2BY07JQ
BS 744 774 RR2BY07TF
BS 775 775 RR2BY07JQ
BS 776 791 RR2BY07TF
BS 792 864 RR2BY07JQ
BS 865 895 RR2CM87JQ

RD RR2CM87TF 407 0 0
GGGTCTTCG
GCTCCCGAAACCCTAACTCCCGAAACTCTCGAAGAACCCGTCTCTGAGGTTCCGAGCTCT
TCCTCGATCGGTTTAGACGCGGATAAGATGGCGCCAAAGCAGAAAATTAGGATCAAGCTG
AGATCATACTGGGTGCCTCTTATTGAGGACTCATGCAAGCAGATACTCGACGCTGCGAGG
AATACTAATGCTAAGACAATGGGTCCTGTCCCATTGCCGACCAAGAAGCGTATCTACTGT
GTTCTCAAGTCTCCTCACGTCCACAAGGATGCAAGGTTCCATTTTGAGATCAGGACCCAC
CAGCGGATGATTGATATTCTCTACCCCACTGCTCAAACCATTGATTCCTTGATGCAGCTG
GATCTTCCTGCTGGTGTTGATGTCGAGGTCAAGCTCTG

QA 10 407 10 407
DS 

RD RR2BY07TF 804 0 0
GGAAACGAAGCTACGGAAAGAAGCTACATCCTTGCAGCGTTACGAGGAAGAAGAAGAAGA
GCAATCGATCCTCTTGTTTTGATATTCAATGGCGGTTTCTTCTGTAACCTCGTTCTTATT
ACCCTCTTTCTCCAATCCCACCTATTCGTCTTCTTCTACCAGACAGAAACTCTCTCTGCT
CTCCTTGCTCCCCCCACCTTCTTCCACTCATAGCTCCTCCCTCCTTAACAAACCTTCCCT
CTCGTTTACGAAGAGGGTCTTCGCAGCTCCCGAAACCCTAACTCCTGAAACTCTCGAAGA
ACCCGTCTCTGAGGTTCCGAGCTCTTCCTCTATCGGTGTAGACGCGGATAAGATGGCGCC
AAAGCAAAAGATTAGGATCAAGCTTAGATCATACTGGGTGCCTCTTATTGAGGACTCATG
CAAGCAGATACTCGACGCTGCGAGGAACACTAATGCTAAGACGATGGGTCCTGTCCCATT
GCCCACCAAGAAGCGTATCTACTGTGTTCTCAAGTCTCCTCACGTCCACAAGGATGCAAG
GTTCCATTTTGAGATCAGGACCCACCAGCGGATGATTGATATTCTCTACCCCACTGCTCA
AACCATTGATTCCTTGATGCAGCTGGATCTTCCTGCTGGTGTTGATGTCGAGGTCAAGCT
CTGAAGTTCAGGG*TAACTACAATGGTGATGGGAACTTGCATTGCATGAACAGACTGTTT
*AGATCA*CGACGTGGGT*AGA*CTTGTAAGCCCTGTATAATCTTTTTGAGAGC*TCTGT
ACTGAGTATTT
CTGTAGTGATCTT

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2CU04TF 777 0 0
GG
ACGGAAAGAAGCTACATCCTTGCAGCGTTACGAGGAAGAAGAAGAAGAGCAATCGATCCT
CTTGTTTGGAAAATCAATGGCGGTTTCTTCTGTAACTTCGTTCGTATTACCCTCTTTCTC
CAATCCCACCTATTCGTCTTCTTCTACCAGACAGAAACTCTCTCTGCTCTCCTTGCTCCC
CCCACCTTCTTCCACTCATAGCTCCTCCCTCCTTAACAAACCTTCCATCTCGTTTACGAA
GAGGGTTTTCGCAGCTCCCGAAACCCTAACTCCTGAAACTCTCGAAGAACCCGTCTCTGA
GGTTCCGAGCTCTTCCTCGATCGGTGTAGACGCGGATAAGATGGCACCAAAGCAGAAAAT
TAGGATCAAGCTGAGATCATACTGGGTGCCTCTTATTGAGGACTCATGCAAGCAGATACT
CGACGCTGCGAGGAATACTAATGCTAAGACAATGGGTCCTGTCCCATTGCCGACCAAGAG
GCGTATCTACTGTGTTCTCAAGTCTCCTCACGTCCACAAGGATGCAAGGTTCCATTTTGA
GATCAGGACTCACCAGCGGATGATTGATATTCTCTACCCCACTGCTCAGACCATTGATTC
CTTGATGCAACTTGATCTTCCTGCTGGTGTTGATGTCGAGGTCAAGCTCTGAAGATCAGG
G*TAACTACAATGGTGATGGGAACTTGCATTGCATGAACAGACTGTTC*AGATCAACAAC
GTTGGT*AGA*CTTGTAAGCCCTGTATA*TCTTTT*GAGAGC*TCTGTACTGAGT

QA 3 777 3 777
DS 

RD RR2BY07JQ 806 0 0
GAGCAATCGATCCTCTTGTTTTGATA*TCAATGGCGGTTTCTTCTGTAACCTCGTTCTTA
TTACCCTCTTTCTCCAATCCCACCTATTCGTCTTCTTCTACCAGACAGAAACTCTCTCTG
CTCTCCTTGCTCCCCCCACCTTCTTCCACTCATAGCTCCTCCCTCCTTAACAAACCTTCC
CTCTCGTTTACGAAGAGGGTCTTCGCAGCTCCCGAAACCCTAACTCCTGAAACTCTCGAA
GAACCCGTCTCTGAGGTTCCGAGCTCTTCCTCTATCGGTGTAGACGCGGATAAGATGGCG
CCAAAGCAAAAGATTAGGATCAAGCTTAGATCATACTGGGTGCCTCTTATTGAGGACTCA
TGCAAGCAGATACTCGACGCTGCGAGGAACACTAATGCTAAGACGATGGGTCCTGTCCCA
TTGCCCACCAAGAAGCGTATTTACTGTGTTCTCAAGTCTCCTCACGTCCACAAGGATGCA
AGGTTCCATTTTGAGATCAGGACCCACCAGCGGATGATTGATATTCTCTACCCCACTGCT
CAAACCATTGATTCCTTGATGCAGCTGGATCTTCCTGCTGGTGTTGATGTCGAGGTCAAG
CTCTGAAGTTCAGGGGTAACTACAATGGTGATGGGAACTTGCATTGCATGAACAGACTGT
TTTAGATCAACGACGTTGGTTAGAACTTGTAAGCCCTGTATAATCTTTTTGAGAGCCTCT
GTACTGAGTATTTTCTGTTAGTGATCTTTGGTCTTTTATTAATTACAATATTTTTTTCTT
TTGTATTTAATTCGGATCTTTATTTG

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2CM87JQ 597 0 0
GAACCCGTCTTTGAGGTTCCGAGCTCTTCCTCGATCGGTTTAGACGCGGATAAGATGGCG
CCAAAGCAGAAAATTAGGATCAAGCTGAGATCATACTGGGTGCCTCTTATTGAGGACTCA
TGCAAGCAGATACTCGACGCTGCGAGGAATACTAATGCTAAGACAATGGGTCCTGTCCCA
TTGCCGACCAAGAAGCGTATTTACTGTGTTCTCAAGTCTCCTCACGTCCACAAGGATGCA
AGGTTCCATTTTGAGATCAGGACCCACCAGCGGATGATTGATATTCTCTACCCCACTGCT
CAAACCATTGATTCCTTGATGCAGCTGGATCTTCCTGCTGGTGTTGATGTCGAGGTCAAG
CTCTGAAGATCAGGGGTAACTACAATGGTGATGGGAACTTGCATTGCATGAACAGACTGT
TTTAGATCAACGACGTTGGTTAGAACTTGTAAGCCCTGTATAATCTTTTTGAGAGCCTCT
GTACTGAGTATTTTCTGTTAGTGATCTTTGGTCTTTTATTAATTACAATATTTTTT*CTT
TTGTATTTAATTCGGATCTTTATTTGAATATCAGTATGAACAGAAACGAGGAAAGCT

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 6

CO CL1480Contig1 1972 6 10 U
GGACAGAAAACAATACACAGAACACTGAGAAAGAGTTTTGATTGGTTAGCTAAGAAAAGA
GAGAAAACAAAAAGCTTTGGAAAATGGATTTGACACGTCCCTCTTCTGGTCATGATCAAG
CAGAGGATCCACTCAAGATTCACCATCCAGAGGAAGAAGAGCATCATGAGAGCCGAGCAT
CTAAAATGTTCGGGAAAGTAAAGGCAAAAGCTAAGAAGTTGAAGAACAGACTTACTAAAC
ATGGCGATGAGCAAGAAGATCACGATGTAGTTGACGAAGAAGAAGAAGATGAATCTGACG
AGCCAGAGCCAGAGCCAGAGAAGCATCTCTCACCAGTGAATGAAGTTACCAATGTGAGAA
GCTATAGAACGAGTCAACCTGAGTCTTTGACTCATCCGACGACAGAGGAGATCATTCCTT
CAGGGACGAAGGGTTCTTCAACTGATTACACCGGACGAATCGAACCTGAACCATTACGAG
ATGCTAGTACTTACGAACATGAGGCACCGTCTTATCCTGTAAGAACATCAGACGTGTCGG
AGGACAGGGAAGAGAGCAGAGGAGAGACTCATCACGTGCCACTGAAGACTCCCGTGTCTC
TGCTCTCCTCAACAGAGGATGAGACAAGTCCTGGTGAAGATGGGTTGATCGGTGGTCAAC
GGGAAGTCAACACTGATATGCCCAAAAGATTCGAGGACGATCTGAGCGGTGGTGAATCTA
CTTATTATCACACCCAACAAGGGAGTGGGGAAGCTGGAGAAGATGATCAAAAGAAGTCAG
GACTAGGAGCTGAAACGGACCTTCCGACAAGAAGCTTCGAATCTGAAATCGGCAACGATT
CGCCGGCCGTTTTTGGCGGGAAACCAGAAACTGGGCCGGGGGA*TGATTTTGATCAGAAG
ATCGAATTTGGGAACGATGGTGGAAAGCTAGGAGCTGATGAGCTGAGTGAAGATTTTCCG
GCGAAGAGCCTTGAATTTGAACAGACGATCGGATCTGCGATCATCGGCGAGGATAACGGC
GCGGGAAAAGCAGGAACAGAGCGGAGGGAAGATTTT**GGGGAAAAGCTATGAGTTCGAT
CAGGAGATTGAATCTGCATTCGGCAATGATTCGCCCACGAGACTTCCCGAAGACAAAAAT
CTTCCGACAAGAAGTGATGCTATTGGGTTGGGAAGAGACTTGTCGACAGAAACAACTGAT
GATCACTTCTCACCAGAATTTTCTGGTCCGAAAGAGAGAGATGATTTCGATTCACAGGCT
GAGCAGACAAGACAAGAGGTGAAACCCACCACCTACTCAGAGATGATTGGTTCAGCGACC
GAAACTGCTGATAAGTTGGCCACTGACCACCAAAATGTCAAAGAAACTGCATCACCTGTG
ACGATTGAAGCGGATGAAACAGAACAAGGGGAAGACAAATTTGTGCCGACTAGAGATCAT
CTGGAGGAGAAGCTGACACCTGAAGAAGAAGAAGACAAAGCCTTTTCTGATATGGTCGCC
GAGAAACTTAATCTTGGAGGAGAGAAGCAGACAACGATAAAGGAGGAAGTAGCCACGGAG
AAGATCCCTTCGGAGAAGTTACCGGAAGAGACGAAAGGCGGTGAGGCGGTTGAAGAGGAA
GGGAAAGGAGAAGGAGGAGTAGGAATAGTGGGGACGATTAAAGGGGTGTACAATTATTGG
CTCGGTGGTACAGAGGAGGTGAAGCCTAAATCTCCAAATTCAGTTGAAGAGTCATCATCA
CAACCACTTAGCTCCACCGTTGGGACTAAAGGATTTTCGGATTCTGGTGAAAGCGGCACA
GGCAGTACTACAGGAGCTGTTGCAGTTCAGGAACAACTTTGAGAATTTGGGAACTGAGAT
TTGGGGTCTGTCTACTAAATAATGTTTGTGTTGTTGGTGTCTTTGTGTGTTGCCACTTGA
ATGTATTTTGATGAGATGTAATCCTTATTGGTGTTTTAAAAGCAGTATTTTT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G831TF U 1
AF RR2F943TF U 1
AF RR2A555TF U 459
AF RR2A555JQ C 620
AF RR2H961TF U 797
AF RR2H961JQ C 1203
BS 1 194 RR2F943TF
BS 195 195 RR2G831TF
BS 196 760 RR2F943TF
BS 761 761 RR2A555TF
BS 762 771 RR2F943TF
BS 772 1253 RR2A555TF
BS 1254 1505 RR2H961TF
BS 1506 1506 RR2H961JQ
BS 1507 1539 RR2H961TF
BS 1540 1972 RR2H961JQ

RD RR2G831TF 612 0 0
AA
ACAGAAAACAATACACAGAACACTGAGAAAGAGTTTTGATTGGTTAGCTAAGAAAAGAGA
GAAAACAAAAAGCTTTGGAAAATGGATTTGACACGTCCCTCTTCTGGTCATGATCAAGCA
GAGGATCCACTCAAGATTCACCATCCAGAGGAAGAAGAGCATCATGAGAGCCGAGCATCT
AAAATGTTCGGGAAAGTAAAGGCAAAAGCTAAGAAGTTGAAGAACAGACTTACTAAACAT
GGCGATGAGCAAGAAGATCACGATGTAGTTGACGAAGAAGAAGAAGATGAATCTGACGAG
CCAGAGCCAGAGCCAGAGAAGCATCTCTCACCAGTGAATGAAGTTACCAATGTGAGAAGC
TATAGAACGAGTCAACCTGAGTCTTTGACTCATCCGACGACAGAGGAGATCATTCCTTCA
GGGACGAAGGGTTCTTCAACTGATTACACCGGACGAATCGAACCTGAACCATTACGAGAT
GCTAGTACTTACGAACATGAGGCACCGTCTTATCCTGTAAGAACATCAGACGTGTCGGAG
GACAGGGAAGAGAGCAGAGGAGAGACTCATCACGTGCCACTGAAGACTCCCGTGTCTCTG
CTCTCCTCA
C

QA 3 611 3 611
DS 

RD RR2F943TF 788 0 0
GGACAGAAAACAATACACAGAACACTGAGAAAGAGTTTTGATTGGTTAGCTAAGAAAAGA
GAGAAAACAAAAAGCTTTGGAAAATGGATTTGACACGTCCCTCTTCTGGTCATGATCAAG
CAGAGGATCCACTCAAGATTCACCATCCAGAGGAAGAAGAGCATCATGAGAGCCGAGCAT
CTAAAATGTTCGGGGAAGTAAAGGCAAAAGCTAAGAAGTTGAAGAACAGACTTACTAAAC
ATGGCGATGAGCAAGAAGATCACGATGTAGTTGACGAAGAAGAAGAAGATGAATCTGACG
AGCCAGAGCCAGAGCCAGAGAAGCATCTCTCACCAGTGAATGAAGTTACCAATGTGAGAA
GCTATAGAACGAGTCAACCTGAGTCTTTGACTCATCCGACGACAGAGGAGATCATTCCTT
CAGGGACGAAGGGTTCTTCAACTGATTACACCGGACGAATCGAACCTGAACCATTACGAG
ATGCTAGTACTTACGAACATGAGGCACCGTCTTATCCTGTAAGAACATCAGACGTGTCGG
AGGACAGGGAAGAGAGCAGAGGAGAGACTCATCACGTGCCACTGAAGACTCCCGTGTCTC
TGCTCTCCTCAACAGAGGATGAGACAAGTCCTGGTGAAGATGGGTTGATCGGTGGTCAAC
GGGAAGTCAACACTGATATGCCCAAAAGATTCGAGGACGATCTGAGCGGTGGTGAATCTA
CTTATTATCACACCCAACAAGGGAGTGGGGAAGCTGGAGA*GATGATCAAA
GAAGTCAGACTAGAGCT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2A555TF 795 0 0
G
TCGAACCTGAACCATTACGAGATGCTAGTACTTACGAACATGAGGCACCGTCTTATCCTG
TAAGAACATCAGACGTGTCGGAGGACAGGGAAGAGAGCAGAGGAGAGACTCATCACGTGC
CACTGAAGACTCCCGTGTCTCCGCTCTCCTCAACAGAGGATGAGACAAGTCCTGGTGAAG
ATGGGTTGATCGGTGGTCAACGGGAAGTCAACACTGATATGCCCAAAAGATTCGAGGACG
ATCTGAGCGGTGGTGAATCTACTTATTATCACACCCAACAAGGGAGTGGGGAAGCTGGAG
AAGATGATCAAAAGAAGTCAGGACTAGGAGCTGAAACGGACCTTCCGACAAGAAGCTTCG
AATCTGAAATCGGCAACGATTCGCCGGCCGTTTTTGGCGGGAAACCAGAAACTGGGCCGG
GGGA*TGATTTTGATCAGAAGATCGAATTTGGGAACGATGGTGGAAAGCTAGGAGCTGAT
GAGCTGAGTGAAGATTTTCCGGCGAAGAGCCTTGAATTTGAACAGACGATCGGATCTGCG
ATCATCGGCGAGGATAACGGCGCGGGAAAAGCAGGAACAGAGCGGAGGGAAGATTTT**G
GGGAAAAGCTATGAGTTCGATCAGGAGATTGAATCTGCATTCGGCAATGATTCGCCCACG
AGACTTCCCGAAGACAAAAATCTTCCGACAAGAAGTGATGCTATTGGGTTGGGAAGAGAC
TTGTCGACAGAAACAACTGATGATCACTTCTCACCAGAATTTTCTGGTCCGAAAGAGAGA
GATGATTTCGATTC

QA 2 795 2 795
DS 

RD RR2A555JQ 732 0 0
TGAGACAAGTCCTGGTGAAGATGGGTTGATCGGTGGTCAACGGGAAGTCAACACTGATAT
GCCCAAAAGATTCGAGGACGATCTGAGCGGTGGTGAATCTACTTATTATCACACCCAACA
AGGGAGTGGGGAAGCTGGAGAAGATGATCAAAAGAAGTCAGGACTAGGAGCTGAAACGGA
CCTTCCGACAAGAAGCTTCGAATCTGAAATCGGCAACGATTCGCCGGCCGTTTTTGGCGG
GAAACCAGAAACTGGGCCGGGGGA*TGATTTTGATCAGAAGATGGAATTTGGGAACGATG
GTGGAAAGCTAGGAGCTGATGAGCTGAGTGAAGATTTTCCGGCGAAGAGCCTTGAATTTG
AACAGACGATCGGATCTGCGATCATCGGCGAGGATAACGGCGCGGGAAAAGCAGGAACAG
AGCGGAGGGAAGATTTT**GGGGAAAAGCTATGAGTTCGATCAGGAGATTGAATCTGCAT
TCGGCAATGATTCGCCCACGAGACTTCCCGAAGACAAAAATCTTCCGACAAGAAGTGATG
CTATTGGGTTGGGAAGAGACTTGTCGACAGAAACAACTGATGATCACTTCTCACCAGAAT
TTTCTGGTCCGAAAGAGAGAGATGATTTCGATTCACAGGTTGAGCAGACAAGACAAGAGG
TGAAACCCACCACCTACTCAGAGATGATTGGTTCAGCGACCGAAACTGCTGATAAGTTGG
CCACTGACCACC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2H961TF 743 0 0
GGACCTTCCGACAAGAAGCTTCGAATCTGAAATCGGCAACGATTCGCCGGCCGTTTTTGG
CGGGAAACCAGAAACTGGGCCGGGGGAATGATTTTGATCAGAAGATCGAATTTGGGAACG
ATGGTGGAAAGCTAGGAGCTGATGAGCTGAGTGAAGATTTTCCGGCGAAGAGCCTTGAAT
TTGAACAGACGATCGGATCTGCGATCATCGGCGAGGATAACGGCGCGGGAAAAGCAGGAA
CAGAGCGGAGGGAAGATTTTTTGGGGAAAAGCTATGAGTTCGATCAGGAGATTGAATCTG
CATTCGGCAATGATTCGCCCACGAGACTTCCCGAAGACAAAAATCTTCCGACAAGAAGTG
ATGCTATTGGGTTGGGAAGAGACTTGTCGACAGAAACAACTGATGATCACTTCTCACCAG
AATTTTCTGGTCCGAAAGAGAGAGATGATTTCGATTCACAGGCTGAGCAGACAAGACAAG
AGGTGAAACCCACCACCTACTCAGAGATGATTGGTTCAGCGACCGAAACTGCTGATAAGT
TGGCCACTGACCACCAAAATGTCAAAGAAACTGCATCACCTGTGACGATTGAAGCGGATG
AAACAGAACAAGGGGAAGACAAATTTGTGCCGACTAGAGATCATCTGGAGGAGAAGCTGA
CACCTGAAGAAGAAGAAGACAAAGCCTTTTCTGATATGGTCGCCGAGAA*CTTAATCTTG
GAGGAGAGAAGCAGACAACGATA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2H961JQ 770 0 0
TCACTTCTCACCAGAATTTTCTGGTCCGAAAGAGAGAGATGATTTCGATTCACAGGCTGA
GCAGACAAGACAAGAGGTGAAACCCACCACCTACTCAGAGATGATTGGTTCAGCGACCGA
AACTGCTGATAAGTTGGCCACTGACCACCAAAATGTCAAAGAAACTGCATCACCTGTGAC
GATTGAAGCGGATGAAACAGAACAAGGGGAAGACAAATTTGTGCCGACTAGAGATCATCT
GGAGGAGAAGCTGACACCTGAAGAAGAAGAAGACAAAGCCTTTTTTGATATGGTCGCCGA
GAAACTTAATCTTGGAGGAGAGAAGCAGACAACGATAAAGGAGGAAGTAGCCACGGAGAA
GATCCCTTCGGAGAAGTTACCGGAAGAGACGAAAGGCGGTGAGGCGGTTGAAGAGGAAGG
GAAAGGAGAAGGAGGAGTAGGAATAGTGGGGACGATTAAAGGGGTGTACAATTATTGGCT
CGGTGGTACAGAGGAGGTGAAGCCTAAATCTCCAAATTCAGTTGAAGAGTCATCATCACA
ACCACTTAGCTCCACCGTTGGGACTAAAGGATTTTCGGATTCTGGTGAAAGCGGCACAGG
CAGTACTACAGGAGCTGTTGCAGTTCAGGAACAACTTTGAGAATTTGGGAACTGAGATTT
GGGGTCTGTCTACTAAATAATGTTTGTGTTGTTGGTGTCTTTGTGTGTTGCCACTTGAAT
GTATTTTGATGAGATGTAATCCTTATTGGTGTTTTAAAAGCAGTATTTTT

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 6

CO CL1481Contig1 1282 6 23 U
GGAAACTAAACCCTTTGCAACTTCTTCATCTTCTACTGTCGCCGCCGTTTAAGGATTATT
TTTTTCAGAGGCGGCGATGGCGGATCTTCTTCCACCTCTTGCGACGGCACAAATCGATGG
GAAGACTAAAGTAGATGAGAAAGTTGATTACTCGAATCTCCCTTGCCCTGTTCCTTATGA
GGAACTCCACCGTGAAGCTATCATGTCTTTAAAGGCAGACAATTTTGAGGGTTTGCGCTT
CGACTTTTCAAAGGGACTGAATCAAAAGTTTTCTCTCAGCCACAGTGTAATGATGGGACC
AACAGAAGTTCCTTCTCAGTCACCTGACACGACGATCAAAATTCCAACAGCCCATTATGA
GTTTGGTGCCAATTATTTTGATCCAAAGTTGATGCTTATTGGAAGGCTTATGACTGATGG
TAGGCTAAACGCAAGAGTTAAAGCTGATTTAACTGATAGGTTGGTCTTAAAGGCGAATGG
TCAGCTGTCAAATGAGCCTCATATGTCGCATGCAATGTTCAACTTTGATTACATGGGATC
AGACTACAGGGCCCAACTTCAACTTGGGAACAGTGCTCTAATTGGAGCAACCTATATTCA
GAGTGTGACACCCCGTCTATCTTTGGGTGGGGAAGTTTTTTGGGCTGGTGTGCCTCGGAA
GTCTGGTATAGGTTACGCTGCAAGATACGACACTGATAAAATGGTGGCTACTGCGCAAGT
TGCTAGCACCGGAACTATAGCTATGAACTATGTTCAGAAGATTTCCGAGAAGGTCTCACT
CGCCACTGATTTCGCGTACAACTACTTATCAAGAGATGTTGTGGCTAGTGTTGGGTATGA
CTACATTCTCAGACAGTCTCGTGTGCGGGGAAAGATTGATTCAAACGGTGTTGCATCCGC
TCTCTTGGAAGAAAGATTGAGTATGGGACTCAATTTTCTCCTTTCTGCAGAGCTTGACCA
TAAGAAGAAGGACTACAAGTTTGGATTCGGTTTAACAGTCGGCTGATAAA**GGATGATG
GCTCCACGCAATAAGCCTGGCTCTACACACGCAGCGCAGGGGTTTCATCTTGTGCCGGGA
TTCAGTTAAATTTGTTGTATTTTAGGCTTTTTGGTCGGGGAACATTGGGAA*GTTAAAAC
AAAAACAAAGGGAATTTTGTGTTGTTTTTTATGCGGTTTAGGTTTTGTCGTTACTATTTT
TTTTTTTAAAGATCTGGTAAACTTGCCAAGAGGTGTATCATTTACTTTCCATACAAGAAA
AAA*CATTTTTCCTCGTTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 5 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE63TF U 59
AF RR2FC21TF U 1
AF RR2CE63JQ C 502
AF RR2BB06TF U 560
AF RR2FC21JQ C 578
AF RR2BB06JQ C 658
BS 1 111 RR2FC21TF
BS 112 112 RR2CE63TF
BS 113 221 RR2FC21TF
BS 222 222 RR2CE63TF
BS 223 249 RR2FC21TF
BS 250 250 RR2CE63TF
BS 251 276 RR2FC21TF
BS 277 277 RR2CE63TF
BS 278 281 RR2FC21TF
BS 282 282 RR2CE63TF
BS 283 351 RR2FC21TF
BS 352 352 RR2CE63TF
BS 353 577 RR2FC21TF
BS 578 578 RR2CE63TF
BS 579 666 RR2FC21TF
BS 667 667 RR2BB06TF
BS 668 708 RR2FC21TF
BS 709 709 RR2BB06TF
BS 710 716 RR2FC21TF
BS 717 717 RR2BB06TF
BS 718 758 RR2FC21TF
BS 759 1274 RR2BB06TF
BS 1275 1282 RR2BB06JQ

RD RR2CE63TF 565 0 0
TTTTTTTCAGAGGCGGCGATGGCGGATCTTCTTCCACCTCTTGGGACGGCACAAATCGAT
GGGAAGACTAAAGTAGATGAGAAAGTTGATTACTCGAATCTCCCTTGCCCTGTTCCTTAT
GAGGAACTCCACCGTGAAGCTATCATGTCTTTAAAGGCAGACAATTTTGAGGGTTTGCGC
TTTGACTTTTCAAAGGGACTGAATCAAAAGTTTTCTCTCAGCCACAGTGTAATGATGGGA
CCAACAGAAGTTCCTTCTCAGTCACCTGACACGACGATCAAAATTCCAACTGCCCATTAT
GAGTTTGGTGCCAATTATTTTGATCCAAAGTTGATGCTTATTGGAAGGCTTATGACTGAT
GGTAGGCTAAACGCAAGAGTTAAAGCTGATTTAACTGATAGGTTGGTCTTAAAGGCGAAT
GGTCAGCTGTCAAATGAGCCTCATATGTCGCATGCAATGTTCAACTTTGATTACATGGGA
TCAGACTACAGGGCCCAACTTCAACTTGGGAACAGTGCTCTAATTGGAGCAACCTATATT
CAGAGTGTGACACCCCGTCT
ATCTC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2FC21TF 758 0 0
GGAAACTAAACCCTTTGCAACTTCTTCATCTTCTACTGTCGCCGCCGTTTAAGGATTATT
TTTTTCAGAGGCGGCGATGGCGGATCTTCTTCCACCTCTTGCGACGGCACACATCGATGG
GAAGACTAAAGTAGATGAGAAAGTTGATTACTCGAATCTCCCTTGCCCTGTTCCTTATGA
GGAACTCCACCGTGAAGCTATCATGTCTTTAAAGGCAGACAGTTTTGAGGGTTTGCGCTT
CGACTTTTCCAAGGGACTGAATCAAAAGTTTTCTCTTAGCCGCAGTGTAATGATGGGACC
AACAGAAGTTCCTTCTCAGTCACCTGACACGACGATCAAAATTCCAACAGCTCATTATGA
GTTTGGTGCCAATTATTTTGATCCAAAGTTGATGCTTATTGGAAGGCTTATGACTGATGG
TAGGCTAAACGCAAGAGTTAAAGCTGATTTAACTGATAGGTTGGTCTTAAAGGCGAATGG
TCAGCTGTCAAATGAGCCTCATATGTCGCATGCAATGTTCAACTTTGATTACATGGGATC
AGACTACAGGGCCCAACTTCAACTTGGGAACAGTGCTTTAATTGGAGCAACCTATATTCA
GAGTGTGACACCCCGTCTATCTTTGGGTGGGGAAGTTTTTTGGGCTGGTGTGCCTCGGAA
GTCTGGAATAGGTTACGCTGCAAGATACGACACTGATAAAATGGTGGCCACTGCGCTAGT
TGCTAGCACCGGAACTATAGCTATGAACTATGTTCAGA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2CE63JQ 778 0 0
TATGTCGCATGCAATGTTCAACTTTGATTACATGGGATCAGACTACAGGGCCCAACTTCA
ACTTGGGAACAGTGCTCTAATTGGAGCAACCTATATTCAGAGTGTGACACCCCGTCTATC
TCTGGGTGGGGAAGTTTTTTGGGCTGGCGTGCCTCGGAAGTCTGGTATAGGTTACGCTGC
AAGATACGACACTGATAAAATGGTGGCTACTGCGCAAGTTGCTAGCACCGGAACTATAGC
TATGAACTATGTTCAGAAGATTTCCGACAAGGTCTCACTCGCCACTGATTTCGCGTACAA
CTACTTATCAAGAGATGTTGTGGCTAGTGTTGGGTATGACTACATTTTCAGACAGTCTCG
TGTGCGGGGAAAGATTGATTCAAACGGTGTTGCATCCGCTCTCTTGGAAGAAAGATTGAG
TATGGGACTCAATTTTCTCCTATCCGCAGAGCTTGACCATAAGAAGAAGGACTACAAGTT
TGGATTCGGTTTAACAGTCGGCTGATAAAAAGGATGATG*CTCCACGCAATAAGCCTGGC
TCTACACACGCAGCGCAGGGGTTTCATCTTGTGCCGGGATTCAGTTAAATTTGTTGTATT
TTAGGCTTTTTGGTCGGGGAACATTGGGAA*GTTAAAACAAAAACAAAGGGAATTTTGTG
TTGTTTTTTATGCGGTTTAGGTTTTGTCGTTA****TATTTTTTTTAAAGATCTGGTAAA
CTTGCTAAGAGGTGTATCATTTACTTTCCATACAAGAAAAAA*CATTTTTCCT
CGTTT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2BB06TF 723 0 0
G
AACTTGGGAACAGTGCTCTAATTGGAGCAACCTATATTCAGAGTGTGACACCCCGTCTGT
CTTTGGGTGGGGAAGTTTTTTGGGCTGGTGTGCCTCGGAAGTCTGGTATAGGTTACGCTG
CAAGATACGACACTGATAAAATGGTGGCTACTGCGCAAGTTGCTAGCACCGGAACTATAG
CTATGAACTATGTTCAGAAGATTTCCGAGAAGGTCTCACTCGCCACTGATTTCGCGTACA
ACTACTTATCAAGAGATGTTGTGGCTAGTGTTGGGTATGACTACATTCTCAGACAGTCTC
GTGTGCGGGGAAAGATTGATTCAAACGGTGTTGCATCCGCTCTCTTGGAAGAAAGATTGA
GTATGGGACTCAATTTTCTCCTTTCTGCAGAGCTTGACCATAAGAAGAAGGACTACAAGT
TTGGATTCGGTTTAACAGTCGGCTGATAAA**GGATGATGGCTCCACGCAATAAGCCTGG
CTCTACACACGCAGCGCAGGGGTTTCATCTTGTGCCGGGATTCAGTTAAATTTGTTGTAT
TTTAGGCTTTTTGGTCGGGGAACATTGGGAA*GTTAAAACAAAAACAAAGGGAATTTTGT
GTTGTTTTTTATGCGGTTTAGGTTTTGTCGTTACTATTTTTTTTTTTAAAGATCTGGTAA
ACTTGCCAAGAGGTGTATCATTTACTTTCCATACAAGAAAAAA*CATTTTTCCT
CGTTTACT

QA 2 715 2 715
DS 

RD RR2FC21JQ 704 0 0
T
TAATTGGAGCAACCTATATTCAGAGTGTGACACCCCGTCTATCTTTGGGTGGGGAAGTTT
TTTGGGCTGGTGTGCCTCGGAAGTCTGGAATAGGTTACGCTGCAAGATACGACACTGATA
AAATGGTGGCCACTGCGCTAGTTGCTAGCACCGGAACTATAGCTATGAACTATGTTCAGA
AGATTTCCGACAAGGTCTCACTCGCCACTGATTTCGCGTACAACTACTTATCAAGAGATG
TTGTGGCTAGTGTTGGGTATGACTACATTTTCAGACAGTCTCGTGTGCGGGGAAAGATCG
ATTCAAACGGTGTTGCATCCGCTCTCTTGGAAGAAAGATTGAGTATGGGACTCACTTTTC
TCCTATCTGCAGAGCTTGACCATAAGAAGAAGGACTACAAGTTTGGATTCGGTTTAACAG
TCGGCTGATAAA**GGATGATGGCTCCACGCAATAAGCCTGGCTCTACACACGCAGCGCA
GGGGTTTCATCTTGTGCCGGGATTCACTTAAATTTGTTGTATTTTAGGCTTTTTGGTCGG
GGAACGTTGGGAAAGTTAAAACAAAAACAAAGGGACTGTTGTGTTGTTTTTTATGCGGTT
TAGGTTTTGTCGTTACTA*TTTTTTTTTTAAAGATCTGGTAAACTTGCCAAGAGGTGTAT
CATTTCCTTTCCATACAAGAAAAAAACATTTTTCCT
TTTTTAC

QA 2 697 2 697
DS 

RD RR2BB06JQ 625 0 0
GAAGTCTGGTATAGGTTACGCTGCAAGATACGACACTGATAAAATGGTGGCTACTGCGCA
AGTTGCTAGCACCGGAACTATAGCTATGAACTATGTTCAGAAGATTTCCGAGAAGGTCTC
ACTCGCCACTGATTTCGCGTACAACTACTTATCAAGAGATGTTGTGGCTAGTGTTGGGTA
TGACTACATTCTCAGACAGTCTCGTGTGCGGGGAAAGATTGATTCAAACGGTGTTGCATC
CGCTCTCTTGGAAGAAAGATTGAGTATGGGACTCAATTTTCTCCTTTCTGCAGAGCTTGA
CCATAAGAAGAAGGACTACAAGTTTGGATTCGGTTTAACAGTCGGCTGATAAA**GGATG
ATGGCTCCACGCAATAAGCCTGGCTCTACACACGCAGCGCAGGGGTTTCATCTTGTGCCG
GGATTCAGTTAAATTTGTTGTATTTTAGGCTTTTTGGTCGGGGAACATTGGGAA*GTTAA
AACAAAAACAAAGGGAATTTTGTGTTGTTTTTTATGCGGTTTAGGTTTTGTCGTTACTAT
TTTTTTTTTTAAAGATCTGGTAAACTTGCCAAGAGGTGTATCATTTACTTTCCATACAAG
AAAAAA*CATTTTTCCTCGTTTACT

QA 1 625 1 625
DS 



AS 2 6

CO CL1482Contig1 372 4 1 U
GGGAAACAACTTCAGTTAAGAAAGAAAAACAAATCATGTCGGACAAGTGTGGAAGCTGCG
TGTGCTGACAAGACCCAGTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAG
ACTCAGGAGAGCTACAAGGAAGCCATGTTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGTTGC
CAATGCAAGTGTGACTCTACCTGCAGTTGCGTCAACTGCACTTGCAACTAGAATCAAAAT
CTAATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATCTAGTAAGCTCATATCTTTCTTATGATTC
TCTATTATGGTTTATGGTGTGTGATGTAATCGGTTTATGGCCCCTTATAATCTAATACAT
CATATTATCTGT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2BC07JQ C 1
AF RR2F265JQ C 1
AF RR2F265TF U 1
AF RR2BC07TF U 1
BS 1 372 RR2F265TF

RD RR2BC07JQ 372 0 0
GGGAAACAACTTCAGTTAAGAAAGAAAAACAAATCATGTCGGACAAGTGTGGAAGCTGCG
TGTGCTGACAAGGCCCAGTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAG
ACTCAGGAGAGCTACAAGGAAGCCATGTTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGTTGC
CAATGCAAGTGTGACTCTACCTGCAGTTGCGTCAACTGCACTTGCAACTAGAATCAAAAT
CTAATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATCTAGTAAGCTCATATCTTTCTTATGATTC
TCTATTATGGTTTATGGTGTGTGATGTAATCGGTTTATGGCCCCTTATAATCTAATACAT
CATATTATCTGT

QA 1 372 1 372
DS 

RD RR2F265JQ 372 0 0
GGGAAACAACTTCAGTTAAGAAAGAAAAACAAATCATGTCGGACAAGTGTGGAAGCTGCG
TGTGCTGACAAGACCCAGTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAG
ACTCAGGAGAGCTACAAGGAAGCCATGTTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGTTGC
CAATGCAAGTGTGACTCTACCTGCAGTTGCGTCAACTGCACTTGCAACTAGAATCAAAAT
CTAATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATCTAGTAAGCTCATATCTTTCTTATGATTC
TCTATTATGGTTTATGGTGTGTGATGTAATCGGTTTATGGCCCCTTATAATCTAATACAT
CATATTATCTGT

QA 1 372 1 372
DS 

RD RR2F265TF 372 0 0
GGGAAACAACTTCAGTTAAGAAAGAAAAACAAATCATGTCGGACAAGTGTGGAAGCTGCG
TGTGCTGACAAGACCCAGTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAG
ACTCAGGAGAGCTACAAGGAAGCCATGTTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGTTGC
CAATGCAAGTGTGACTCTACCTGCAGTTGCGTCAACTGCACTTGCAACTAGAATCAAAAT
CTAATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATCTAGTAAGCTCATATCTTTCTTATGATTC
TCTATTATGGTTTATGGTGTGTGATGTAATCGGTTTATGGCCCCTTATAATCTAATACAT
CATATTATCTGT

QA 1 372 1 372
DS 

RD RR2BC07TF 372 0 0
GGGAAACAACTTCAGTTAAGAAAGAAAAACAAATCATGTCGGACAAGTGTGGAAGCTGCG
TGTGCTGACAAGGCCCAGTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAG
ACTCAGGAGAGCTACAAGGAAGCCATGTTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGTTGC
CAATGCAAGTGTGACTCTACCTGCAGTTGCGTCAACTGCACTTGCAACTAGAATCAAAAT
CTAATATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATCTAGTAAGCTCATATCTTTCTTATGATTC
TCTATTATGGTTTATGGTGTGTGATGTAATCGGTTTATGGCCCCTTATAATCTAATACAT
CATATTATCTGT

QA 1 372 1 372
DS 



CO CL1482Contig2 361 2 3 U
GGAACTTCAGTTAAGAAAGAAAAACAAATCATGTCGGACAAGTGTGGAAGCTGCGACTGT
GCTGACAAGACCCAGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAGACTCAGGAG
AGCTACAAGGAAGCCATGTTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGTTGCCAATGCAAG
TGTGACTCTACCTGCAGTTGCGTCAACTACACTTGCAACTAGAATCAAAATCTAATATGA
ATAAAAGTTGATGTGAGCTCATCTAGTAAGCTCATATCTTTCTTATGATTCTCTATTATG
GTTTATGGTGTGTGATGTAATCGGTTTATGGCCCCTTATAATCTAATACATCATATTATC
C


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 

AF RR2DD62TF U 1
AF RR2DD62JQ C 1
BS 1 2 RR2DD62JQ
BS 3 360 RR2DD62TF
BS 361 361 RR2DD62JQ

RD RR2DD62TF 361 0 0
GG
AACTTCAGTTAAGAAAGAAAAACAAATCATGTCGGACAAGTGTGGAAGCTGCGACTGTGC
TGACAAGACCCAGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAGACTCAGGAGAG
CTACAAGGAAGCCATGTTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGTTGCCAATGCAAGTG
TGACTCTACCTGCAGTTGCGTCAACTACACTTGCAACTAGAATCAAAATCTAATATGAAT
AAAAGTTGATGTGAGCTCATCTAGTAAGCTCATATCTTTCTTATGATTCTCTATTATGGT
TTATGGTGTGTGATGTAATCGGTTTATGGCCCCTTATAATCTAATACATCATATTATC
C

QA 3 360 3 360
DS 

RD RR2DD62JQ 361 0 0
GGAACTTCAGTTAAGAAAGAAAAACAAATCATGTCGGACAAGTGTGGAAGCTGCGACTGT
GCTGACAAGACCCAGAAGAAGGGAACCAGCTACACCTTCGACATCGTCGAGACTCAGGAG
AGCTACAAGGAAGCCATGTTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAACGGTTGCCAATGCAAG
TGTGACTCTACCTGCAGTTGCGTCAACTACACTTGCAACTAGAATCAAAATCTAATATGA
ATAAAAGTTGATGTGAGCTCATCTAGTAAGCTCATATCTTTCTTATGATTCTCTATTATG
GTTTATGGTGTGTGATGTAATCGGTTTATGGCCCCTTATAATCTAATACATCATATTATC
C

QA 1 361 1 361
DS 



AS 1 4

CO CL1483Contig1 896 4 10 U
GATTCCAAGATATTTTGACGTTATTCACTGACAGAGAGCTGCAGCACGTGACATGTTAAG
ACTTATCCAAAACAAATTGCAACAGAGGTTTTTTTTTCAAGGAACACTGCAAC*AAAAGG
AGATGAAACAGAAGAACAAACAAATAGCAAGTTGAGAAATCTGTCAACTTCACTCGACCT
ACGATGATCATCAATCTCTCATCACGCTCATTCTGGCTTCCGGGCCAAGAAAAAATAAAT
TGGCGTGAATATCTCTCTCCTTCCACCGTCGACTAATCCTTCCGCGGCCTTCTCCAGAAA
ATCTGAAACCCTTTGGCTTCCTTTAGGTGCCAGTCTTATGTACTCAAGGAGCTTCACCAT
GTTTTTGGTTATGAATCGTCCAACAGCTGTTAGGCGGAAGCTACTGAGCGAAAAGTGATT
TTTGTCTAGAGGTGAGTACCATGGGACTGGCGAGTCCTTGGCCAGATCCTTTTCCCATAT
GACTTCAAAACCGGCCTGCTTCAAAGCTTCTAGGCACTTTGAAGTCAGCCTAATGTCAGG
GAGACCATCTCCAATCTCTATCTCTGCCTTTATCTTCTGATGTTGGGCGTTATCAGGGTC
AAATGCATCAGTCATGCACCACTCATAGGCAGCAAAACATTGCCCCGGCTTTAGCACCCT
GTAGATCTCTTTGTAGCATCCATATGCATCAGGTGCGTGGCAGGTTGCCTCTATAGCATA
AACTGCATCAAAAGTGTTTTCAGGAAATGGCATCTTCATGAAGTCAGCCTTGACAAAGTT
ACATGTCTTATCGACACCTGCAAGTCGGTTTAGTTCCTTGCCTCTGGTGATCTGGTATTC
ATTATTGTTGATCCCGGTAACAGATGATTGCTGATCGTGCATTTCTCTCAGTGGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 15 30 30 15 30 30 30 15 15 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN59JQ U 10
AF RR2AN59TF C 1
AF RR2AJ43JQ U 1
AF RR2BT68JQ U 48
BS 1 237 RR2AJ43JQ
BS 238 238 RR2AN59JQ
BS 239 433 RR2AJ43JQ
BS 434 434 RR2AN59JQ
BS 435 480 RR2AJ43JQ
BS 481 481 RR2BT68JQ
BS 482 657 RR2AJ43JQ
BS 658 658 RR2BT68JQ
BS 659 796 RR2AJ43JQ
BS 797 896 RR2BT68JQ

RD RR2AN59JQ 468 0 0
ATATTTTGACGTTATTCACTGACAGAGAGCTGCAGCACGTGACATGTTAAGACTTATCCA
AAACAAATTGCAACAGAGGTTTTTTTTTCAAGGAACACTGCAAC*AAAAGGAGATGAAAC
AGAAGAACAAACAAATAGCAAGTTGAGAAATCTGTCAACTTCACTCGACCTACGATGATC
ATCAATCTCTCATCACGCTCATTCTGGCTTCCGGGCCAAGAAAAAATAAATTGGCGTGAA
TATCTCTCTCCTTCCACCGTCGACTAATCCTTCCGCGGCCTTCTCCAGAAAATCTGAAAC
CCTTTGGCTTCCTTTAGGTGCCAGTCTTATGTACTCAAGGAGCTTCACCATGTTTTTGGT
TATGAATCGTCCAACAGCTGTTAGGCGGAAGCTACTGAGCGAAAAGTGATTTTTGTCTAG
AGGTGAGTACCATGGGACTGGCGAGTCCTTGGCCAGATCCTTTTCCC
C

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2AN59TF 477 0 0
GATTCCAAGATATTTTGACGTTATTCACTGACAGAGAGCTGCAGCACGTGACATGTTAAG
ACTTATCCAAAACAAATTGCAACAGAGGTTTTTTTTTCAAGGAACACTGCAAC*AAAAGG
AGATGAAACAGAAGAACAAACAAATAGCAAGTTGAGAAATCTGTCAACTTCACTCGACCT
ACGATGATCATCAATCTCTCATCACGCTCATTCTGGCTTCCGGGCCAAGAAAAAATAAAT
TGGCGTGAATATCTCTCTCCTTCCACCGTCGACTAATCCTTCCGCGGCCTTCTCCAGAAA
ATCTGAAACCCTTTGGCTTCCTTTAGGTGCCAGTCTTATGTACTCAAGGAGCTTCACCAT
GTTTTTGGTTATGAATCGTCCAACAGCTGTTAGGCGGAAGCTACTGAGCGAAAAGTGATT
TTTGTCTAGAGGTGAGTACCATGGGACTGGCGAGTCCTTGGCCAGATCCTTTTCCC
C

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR2AJ43JQ 796 0 0
GATTCCAAGATATTTTGACGTTATTCACTGACAGAGAGCTGCAGCACGTGACATGTTAAG
ACTTATCCAAAACAAATTGCAACAGAGGTTTTTTTTTCAAGGAACACTGCAAC*AAAAGG
AGATGAAACAGAAGAACAAACAAATAGCAAGTTGAGAAATCTGTCAACTTCACTCGACCT
ACGATGATCATCAATCTCTCATCACGCTCATTCTGGCTTCCGGGCCAAGAAAAAATACAT
TGGCGTGAATATCTCTCTCCTTCCACCGTCGACTAATCCTTCCGCGGCCTTCTCCAGAAA
ATCTGAAACCCTTTGGCTTCCTTTAGGTGCCAGTCTTATGTACTCAAGGAGCTTCACCAT
GTTTTTGGTTATGAATCGTCCAACAGCTGTTAGGCGGAAGCTACTGAGCGAAAAGTGATT
TTTGTCTAGAGGTAAGTACCATGGGACTGGCGAGTCCTTGGCCAGATCCTTTTCCCATAT
TACTTCAAAACCGGCCTGCTTCAAAGCTTCTAGGCACTTTGAAGTCAGCCTAATGTCAGG
GAGACCATCTCCAATCTCTATCTCTGCCTTTATCTTCTGATGTTGGGCGTTATCAGGGTC
AAATGCATCAGTCATGCACCACTCATAGGCAGCAAAACATTGCCCCGGCTTTAGCACTCT
GTAGATCTCTTTGTAGCATCCATATGCATCAGGTGCGTGGCAGGTTGCCTCTATAGCATA
AACTGCATCAAAAGTGTTTTCAGGAAATGGCATCTTCATGAAGTCAGCCTTGACAAAGTT
ACATGTCTTATCGACA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2BT68JQ 849 0 0
C
TGACATGTTAAGACTTATCCAAAACAAGTTGCAACAAAGATTTGTTTT***AGGAACACT
GCAAATAAAAGGAGATGAAACAGAACAAACAAAAAAA**CAAATTGAGAAATCTGTCAAC
TTCACTCGACCTACGATGATCATCAATCTCTCATCACGCTCATTCTGGCTTCCGGGCCAA
GAAAAAATACATTGGCGTGAATATCTCTCTCCTTCCACCGTCGACTAATCCTTCCGCGGC
CTTCTCCAGAAAATCTGAAACCCTTTGGCTTCCTTTAGGTGCCAGTCTTATGTACTCAAG
GAGCTTCACCATGTTTTTGGTTATGAATCGTCTAACAGCTGTTAGCCGGAAGCTACTGAG
CGAAAAGTGATTTTTGTCTAGAGGTAAGTACCATGGGACTGGCGAGTCCTTGGCCAGATC
CTTTTCCCATATGACTTCAAAACCGGCCTGCTTCAGAGCTTCTAGGCACTTTGAAGTCAG
CCTAATGTCAGGGAGACCATCTCCAATCTCTATCTCTGCCTTTATCTTCTGATGTTGGGC
GTTATCAGGGTCAAATGCATCAGTCATGCACCACTCATAGGCAGCAAAACATTGCCCCGG
CTTTAGCACCCTGTAGATCTCTTTGTAGCATCCATATGCATCAGGTGCGTGGCAGGTTGC
CTCTATAGCATAAACTGCATCAAAAGTGTTTTCAGGGAATGGCATCTTCATGAAGTCAGC
CTTGACAAAGTTACATGTCTTATCGACACCTGCAAGTCGGTTTAGTTCCTTGCCTCTGGT
GATCTGGTATTCATTATTGTTGATCCCGGTAACAGATGATTGCTGATCGTGCATTTCTCT
CAGTGGTC

QA 2 849 2 849
DS 



AS 1 6

CO CL1484Contig1 1311 6 34 U
GGAGATATAATTATAAGGCTTCATTTGAGAATCAGTTCCATACCATTTGTAGCAATGTCG
CGACCAATACCTATTGAAGAAATGGTGAGATTGTTCAAATCACGTCACAGAACAAGTCAC
TTGTTCAAGATAGACAACTTCTCGTTATTCAAAAAATACAAAATCGAGAAGGTCTACTCC
TCAGTTTTTGATCTCGGTGGTCACAAATGGAGACTTCGTGTGTATCCAAATGGGAGTAAT
CGTATGAAAGCAAGGGGTCATGTTTCTATCTTCTTAACGAATCAAGCTTCGGTAAATGTA
AAGATCGAATATGAGGTCTTTGTCGTCAGTCAACTAGAACAGATATGGGAATCTTCTGGC
CACAAAGTATTTGGTACCTATTCAGAACCGGTTAGCAAGGGGAGTCCAAAACTTATATCT
CTTGTTGATCTTAAGAGGAACGGGTTCCTTATTGGAGATTGTTGTATGTGTGGTGTCAAG
CTTCATGGGATTGAACCTTCTGCTTCCGGAACAGCGGAATGTTTTAGCTTAATTGAGAAA
CCTCCCAACCACAAAGTCACTTGGATGATGACCAGGTTCTCGTCTTTCGATCCTGAGAAG
GTTCATCATTCTCATGAATTTGTCGTTGGAAACAGGAAATGGAGAATTCAAGTTCATCCA
AGAGGGTTTGAGGAAGAAAAAGACGAATCATTTTCTGTGTATCTAATAGGAGAAGGGTTC
ATAAACAACGCGCCAAATACAGAGACTTACGCGAAATTTAAGCTGAGGGTATTGGTTCAA
GTTAACCGCAATCATGTTGAGAAAACATGTTCGGGTGGGTTGGAGACATCTAAAGGCTTT
GCAGACTTCATGTGCCTGACGAAACTTGTTGAACCTTATCTGGTGAATGATAAACTGTAT
GTGGGAGTAGATTTTGAAGTCGTTTCTGTGGCTACATATTGCTAATTCGGCAGCTTCTTG
CCTTTCATAAAGTCATGCTGTGAAACTACTATACCAATAAGTGATATAATGTAATGAATA
AGATCGGAGAATATACTTTGTGGAGAACTTCCAGCTATCCAAGAGACGAAAAACTATACA
CATATGGTGTGTAACGTTCCTAGAGCTCAACTTTCACGCTGATGTCCTAGCAAAGGAAAC
TAGAACCAGAAACGTTTTATTTTTTTCATGTAAACCATATATGGTCAGTTATTCTCGGCA
ATAATTTTAATGTCAGTCAAAACTTAGTTTAAGAATATGGATAATTGATAAAATATGTAT
ATATATTGTGTGTAAAAGAAATAATATATATGGTGTGTATCAGTTTCTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 
0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU05TF U 1
AF RR2AR53TF U 5
AF RR2AR53JQ C 190
AF RR2DE28TF U 274
AF RR2DE28JQ C 583
AF RR2EU05JQ C 550
BS 1 176 RR2EU05TF
BS 177 177 RR2AR53TF
BS 178 221 RR2EU05TF
BS 222 222 RR2AR53TF
BS 223 261 RR2EU05TF
BS 262 262 RR2AR53TF
BS 263 338 RR2EU05TF
BS 339 339 RR2AR53TF
BS 340 621 RR2EU05TF
BS 622 622 RR2AR53TF
BS 623 680 RR2EU05TF
BS 681 681 RR2AR53TF
BS 682 705 RR2EU05TF
BS 706 712 RR2AR53TF
BS 713 908 RR2DE28TF
BS 909 909 RR2AR53JQ
BS 910 961 RR2DE28TF
BS 962 962 RR2AR53JQ
BS 963 984 RR2DE28TF
BS 985 985 RR2AR53JQ
BS 986 1017 RR2DE28TF
BS 1018 1020 RR2EU05JQ
BS 1021 1030 RR2DE28TF
BS 1031 1031 RR2EU05JQ
BS 1032 1046 RR2DE28TF
BS 1047 1047 RR2EU05JQ
BS 1048 1061 RR2DE28TF
BS 1062 1088 RR2EU05JQ
BS 1089 1089 RR2DE28JQ
BS 1090 1165 RR2EU05JQ
BS 1166 1166 RR2DE28JQ
BS 1167 1203 RR2EU05JQ
BS 1204 1204 RR2DE28JQ
BS 1205 1311 RR2EU05JQ

RD RR2EU05TF 705 0 0
GGAGATATAATTATAAGGCTTCATTTGAGAATCAGTTCCATACCATTTGTAGCAATGTCG
CGACCAATACCTATTGAAGAAATGGTGAGATTGTTCAAATCACGTCACAGAACAAGTCAC
TTGTTCAAGATAGACAACTTCTCGTTATTCAAAAAATACAAAATCGAGAAGGTCTATTCC
TCAGTTTTTGATCTCGGTGGTCACAAATGGAGACTTCGTGTTTATCCAAATGGGAGTAAT
CGTATGAAAGCAAGGGGTCATATTTCTATCTTCTTAACGAATCAAGCTTCGGTAAATGTA
AAGATCGAATATGAGGTCTTTGTCGTCAGTCAACTAGAGCAGATATGGGAATCTTCTGGC
CACAAAGTATTTGGTACCTATTCAGAACCGGTTAGCAAGGGGAGTCCAAAACTTATATCT
CTTGTTGATCTTAAGAGGAACGGGTTCCTTATTGGAGATTGTTGTATGTGTGGTGTCAAG
CTTCATGGGATTGAACCTTCTGCTTCCGGAACAGCGGAATGTTTTAGCTTAATTGAGAAA
CCTCCCAACCACAAAGTCACTTGGATGATGACCAGGTTCTCGTCTTTCGATCCTGAGAAG
GTTCATCATTCTCATGAATTTATCGTTGGAAACAGGAAATGGAGAATTCAAGTTCATCCA
AGAGGGTTTGAGGAAGAAAA*GACGAATCATTTTCTGTGTATCTA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2AR53TF 708 0 0
GG
ATAATTATAAGGCTTCATTTGAGAATCAGTTCCATACCATTTGTAGCAATGTCGCGACCA
ATACCTATTGAAGAAATGGTGAGATTGTTCAAATCACGTCACAGAACAAGTCACTTGTTC
AAGATAGACAACTTCTCGTTATTCAAAAAATACCAAATCGAGAAGGTCTACTCCTCAGTT
TTTGATCTCGGTGGTCACAAATGGAGACTTCGTGTGTATCCAAATGGGAGTAATCGTATG
AAAGCAAGGGGTCATGTTTCTATCTTCTTAACGAATCAAGCTTCGGTAAATGTAAAGATC
GAATATGAGGTCTTTGTCGTCAGTCAACTAGAACAGATATGGGAATCTTCTGGCCACAAA
GTATTTGGTACCTATTCAGAACCGGTTAGCAAGGGGAGTCCAAAACTTATATCTCTTGTT
GATCTTAAGAGGAACGGGTTCCTTATTGGAGATTGTTGTATGTGTGGTGTCAAGCTTCAT
GGGATTGAACCTTCTGCTTCCGGAACAGCGGAATGTTTTAGCTTAATTGAGAAACCTCCC
AACCACAAAGTCACTTGGATGATGACCAGGTTCTCGTCTTTCGATCCTGAGAAGGTTCAT
CATTCTCATGAATTTGTCGTTGGAAACAGGAAATGGAGAATTCAAGTTCATCCAAAAGGG
TTTGAGGAAGAAAAAGACGAATCATTTTCTGTGTATCTAATAGGAG

QA 3 708 3 708
DS 

RD RR2AR53JQ 830 0 0
GATCTCGGTGGTCACAAATGGAGACTTCGTGTGTATCCAAATGGGAGTAATCGTATGAAA
GCAAGGGGTCATGTTTCTATCTTCTTAACGAATCAAGCTTCGGTAAATGTAAAGATCGAA
TATGAGGTCTTTGTCGTCAGTCAACTAGAACAGATATGGGAATCTTCTGGCCACAAAGTA
TTTGGTACCTATTCAGAACCGGTTAGCAAGGGGAGTCCAAAACTTATATCTCTTGTTGAT
CTTAAGAGGAACGGGTTCCTTATTGGAGATTGTTGTATGTGTGGTGTCAAGCTTCATGGG
ATTGAACCTTCTGCTTCCGGAACAGCGGAATGTTTTAGCTTAATTGAGAAACCTCCCAAC
CACAAAGTCACTTGGATGATGACCAGGTTCTCGTCTTTCGATCCTGAGAAGGTTCATCAT
TCTCATGAATTTGTCGTTGGAAACAGGAAATGGAGAATTCAAGTTCATCCAAAAGGGTTT
GAGGAAGAAAAAGACGAATCATTTTCTGTGTATCTAATAGGAGAAGGGTTCATCAACAAC
GCGCCAAATACAGAGACTTACGCGAAATTTAAGCTGAGGGTATTGGATCAAGTTAACCGC
AATCATGTTGAGAAAACATGTTCGGGTGGGTTGGAGACATCTAAAGGCTTTGCAGACTTC
ATGTGTCTGACGAAACTTGTTGAACCTTATCTGGTGAATGATAAACTGTATGTGGGAGTA
GATTTTGAAGTCGTTTCTGTGGCTACATATTGCTAATTCGGCAACTTCTTGCCTTTCATA
AGGTCATGCTGTGAAACTACTATACCAATAAGTGATATAATGTAATGA
AT

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2DE28TF 793 0 0
GG
AACGAATCAAGCTTCGGTAAATGTAAAGATCGAATATGAGGTCTTTGTCGTCAGTCAACT
AGAGCAGATATGGGAATCTTCTGGACACAAAGTATTTGGTACCTATTCAGAACCGGTTAG
CAAGGGGAGTCCAAAACTTATATCTCTTGTTGATCTTAAGAGGAACGGGTTCCTTATTGG
AGATTGTTGTATGTGTGGTGTCAAGCTTCATGGGATTGAACCTTCTGCTTCCGGAACAGC
GGAATGTTTTAGCTTAATTGAGAAACCTCCCAACCACAGAGTCACTTGGATGATGACCAG
GTTCTCGTCTTTCGATCCTGAGAAGGTTCATCATTCTCATGAATTTGTCGTTGGAAACAG
GAAATGGAGAATTCAAGTTCATCCAAGAGGGTTTGAGGAAGAAAAAGACGAATCATTTTC
TGTGTATCTAATAGGAGAAGGGTTCATAAACAACGCGCCAAATACAGAGACTTACGCGAA
ATTTAAGCTGAGGGTATTGGTTCAAGTTAACCGCAATCATGTTGAGAAAACATGTTCGGG
TGGGTTGGAGACATCTAAAGGCTTTGCAGACTTCATGTGCCTGACGAAACTTGTTGAACC
TTATCTGGTGAATGATAAACTGTATGTGGGAGT*GATTTTGAAGTCGTTTCTGTGGCTAC
ATATTGCTAATTCGGCAGCTTCTTGC*TTTCATAAAGTCATGCTGTGAA*CTACTATACC
AATAAGTGATATAATGTAATGAT**AGATCGGAGA*TATACTTTGTGGAGA*CTTCCAGC
TATCCA
GAGAC

QA 3 788 3 788
DS 

RD RR2DE28JQ 669 0 0
TCTTTCGATCCTGAGAAGGTTCATCATTCTCATGAATTTGTCGTTGGAAACAGGAAATGG
AGAATTCAAGTTCATCCAAGAGGGTTTGAGGAAGAAAAAGACGAATCATTTTCTGTGTAT
CTAATAGGAGAAGGGTTCATAAACAACGCGCCAAATACAGAGACTTACGCGAAATTTAAG
CTGAGGGTATTGGTTCAAGTTAACCGCAATCATGTTGAGAAAACATGTTCGGGTGGGTTG
GAGACATCTAAAGGCTTTGCAGACTTCATGTCCCTGACGAAACTTGTTGACCCTTATCTG
GTGAATGATAAACTGTATGTGGGAGTTGATTTTGAAGTCGTTTCTGTGGCTACATATTGC
TAATTCGGCAGCTTCTTGCCTTTCATAAAGTCATGCTGTGAAACTACTATACCAATAAGT
GATATAATGTAATGAATAAGATCGGAGAATATACTTTGTGGAGAACTTCCAGCTATCCAA
GAGACGGAAAACTATATACATATGGTGTGTAACGTTCCTAGAGCTCAACTTTCACGCTGA
TGTCCTAGCAAAGGAAACTAGAACCAGAAACGTTTTATTTTTTTCATGTAAACCATATAT
GGTCAGTTATTCTTGGGACTAATTTTAATGTCAGTCAAAACTTAGTTTAAGAATATGGAT
AATT
TTAGC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2EU05JQ 762 0 0
CACAAAGTCACTTGGATGATGACCAGGTTCTCGTCTTTCGATCCTGAGAAGGTTCATCAT
TCTCATGAATTTATCGTTGGAAACAGGAAATGGAGAATTCAAGTTCATCCAAGAGGGTTT
GAGGAAGAAAAAGACGAATCATTTTCTGTGTATCTAATAGGAGAAGGGTTCATCAACAAC
GCGCCAAATACAGAGACTTACGCGAAATTTAAGCTGAGGGTATTGGATCAAGTTAACCGC
AATCATGTTGAGAAAACATGTTCGGGTGGGTTGGAGACATCTAAAGGCTTTGCAGACTTC
ATGTGTCTGACGAAACTTGTTGAACCTTATCTGGTGAATGATAAACTGTATGTGGGAGTA
GATTTTGAAGTCGTTTCTGTGGCTACATATTGCTAATTCGACAGCTTCTTGCCTTTCATA
AAGTCATGCTGTGAAACTACTATACCAATAAGTGATATAATGTAATGAATAAGATCGGAG
AATATACTTTTTGGAGAACTTCCAGCTATCCAAGAGACGAAAAACTATACACATATGGTT
TGTAACGTTCCTAGAGCTCAACTTTCACGCTGATGTCCTAGCAAAGGAAACTAGAACCAG
AAACGTTTTATTTTTT*CATGTAAACCATATATGGTCAGTTATTCTCGGCAATAGTTTTA
ATGTCAGTCAAAACTTAGTTTAAGAATATGGATAATTGATAAAATATGTATATATATTGT
GTGTAAAAGAAATAATATATATGGTGTGTATCAGTTTCTTCG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 4

CO CL1485Contig1 1008 4 17 U
CTAGTATGAAAAAGCTTAAAGTTATAAACTCCAAATACTCTCATCAAAAGGATCTTTGTG
CTTCAATCACAGACGTGAGATGAAACCGTCTCCTGTGACCGATAACATAACACAATCAAT
CTCTCACTCACTTTCTCAGTTCTTTTGCACTACAACATATATGTTACTACTAATTAATAT
CTCTTACTGATTACATAGTTATTACAAACCATAACAGTTACGCTAATCACTCCATTTTAT
TCATAGTTTTTGATTCAATCCGATACAAACGAGATAGTAACGAGCGAGTGAAAGATGAAG
AACACAAACAGGGAAACTAACCCATAGAGTATGAGGGCGTAGGCAAGTTAATGACAGTGG
TCTTCACTTTGGTCATCAAATTGATGCTATTTGTCACACCTTGTGATCCTATTCCACTGT
CCTTTAGTCCCTGGAAAGGGAAATGGTCTGGTCCACGAGCTGGCGCAGAGTTGATCTGAA
CCGTTCCTGTCTCCATTGCATCACTGATCAGCATTGCCTTATTGATGTCTTTAGTGAATA
CACATCCCTGGAGACCAAAGTTACTAGCATTGCAATGATTAATGCCTTCCTCAACCGAAC
TGATCCTCA***AGACAGGCAAGACAGGACCGAAAGGTTCCTCCCAAGCAATCCTCATGT
CCGGTCTGACATTGTCCAAAAGCAACGGCCAAATCAAGTTACCTTCTCTTTTATACTCTT
GACAGAACGTTGCTCCTTTCTCCTTAGCATCCATCACCAATCCTTCAATGAAATTAGCTG
AGGATTCCGACACCACGGCTGTAATATCACAGTTCTCTTCCGGCGGTCCCACCGTGAGTT
TCACCACTTTAGCTTTCACCTTCTCAACAAGCTCATCCGCCACTGATTCCATCACTAGGA
CTACCTTAACCGCAGTGCATCTCTGCCCACTGTAGGAGAATCCTCCTTTGATGATATTCG
AAGCCACTAAATCAAGATCGGCATCCTCCAGGACATGCATGCATCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP72JQ U 1
AF RR2E075TF C 65
AF RR2BV46JQ U 147
AF RR2BI43JQ U 161
BS 1 99 RR2FP72JQ
BS 100 100 RR2E075TF
BS 101 299 RR2FP72JQ
BS 300 300 RR2BV46JQ
BS 301 326 RR2FP72JQ
BS 327 327 RR2BV46JQ
BS 328 557 RR2FP72JQ
BS 558 661 RR2BV46JQ
BS 662 662 RR2BI43JQ
BS 663 670 RR2BV46JQ
BS 671 671 RR2BI43JQ
BS 672 820 RR2BV46JQ
BS 821 821 RR2BI43JQ
BS 822 865 RR2BV46JQ
BS 866 866 RR2BI43JQ
BS 867 921 RR2BV46JQ
BS 922 1008 RR2BI43JQ

RD RR2FP72JQ 557 0 0
CTAGTATGAAAAAGCTTAAAGTTATAAACTCCAAATACTCTCATCAAAAGGATCTTTGTG
CTTCAATCACAGACGTGAGATGAAACCGTCTCCTGTGACTGATAACATAACACAATCAAT
CTCTCACTCACTTTCTCAGTTCTTTTGCACTACAACATATATGTTACTACTAATTAATAT
CTCTTACTGATTACATAGTTATTACAAACCATAACAGTTACGCTAATCACTCCATTTTAT
TCATAGTTTTTGATTCAATCCGATACAAACGAGATAGTAACGAGCGAGTGAAAGATGAAA
AACACAAACAGGGAAACTAACCCATAAAGTATGAGGGCGTAGGCAAGTTAATGACAGTGG
TCTTCACTTTGGTCATCAAATTGATGCTATTTGTCACACCTTGTGATCCTATTCCACTGT
CCTTTAGTCCCTGGAAAGGGAAATGGTCTGGTCCACGAGCTGGCGCAGAGTTGATCTGAA
CCGTTCCTGTCTCCATTGCATCACTGATCAGCATTGCCTTATTGATGTCTTTAGTGAATA
CACATCCCTGGAGACCA

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2E075TF 766 0 0
AATCACAGACGTGAGATGAAAC*GTCTC*TGTGACCGATAACATAACACAATCAATCTCT
CACTCACTTTCTCAGTTCTTT*GCACTACAACATATATGTTACTACTAATTAATATCTCT
TACTGATTACATAGTTATTACAAACCATAACAGTTACGCTAATCACTCCATTTTATTCAT
AGTTTTTGATTCAATCCGATACAAACGAGATAGTAACGAGCGAGTGAAAGATGAAGAACA
CAAACAGGGAAACTAACCCATAGAGTATGAGGGCGTAGGCAAGTTAATGACAGTGGTCTT
CACTTTGGTCATCAAATTGATGCTATTTGTCACACCTTGTGATCCTATTCCACTGTCCTT
TAGTCCCTGGAAAGGGAAATGGTCTGGTCCACGAGCTGGCGCAGAGTTGATCTGAACCGT
TCCTGTCTCCATTGCATCACTGATCAGCATTGCCTTATTGATGTCTTTAGTGAATACACA
TCCCTGGAGACCAAAGTTACTAGCATTGCAATGATTAATGCCTTCCTCAACCGAACTGAT
CCTCATCAAGACAGGCAAGACAGGACCGAAAGGTTCCTCCCAAGCAATCCTCATGTCCGG
TCTGACATTGTCCAAAAGCAACGGCCAAATCAAGTTACCTTCTCTTTTATACTCTTGACA
GAACGTTGCTCCTTTCTCCTTAGCATCCATCACCAATCCTTCAATGAAATTAGCTGAGGA
TTCCGACACCACGGCTGTAATATCACAGTTCTCTTCCGGCGGTCCC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2BV46JQ 775 0 0
GCAG
TACAACATATATGTTACTACTAATTAATATCTCTTACTGATTACATAGTTATTACAAACC
ATAACAGTTACGCTAATCACTCCATTTTATTCATAGTTTTTGATTCAATCCGATACAAAC
GAGATAGTAAAGAGCGATTGAAAGATGAAGAACACAAATAGGGAAACTAACCCATAGAGT
ATGAGGGTGTAGGCAAGTTAATGACAGTGGTCTTCACTTTGGTCATCAAATTGATGCTAT
TTGTCACACCTTGTGATCCTATTCCACTGTCCTTTAGTCCCTGGAAAGGGAAATGGTCTG
GTCCACGTGCTGGCGCAAAGTTGATCTGAACCGTTCCTGTCTCCATTGCATCACTGATCA
GCATTGCCTTATTGATGTCTTTAGTGAATACACATCCCTGGAGGCCAAAGTTACTAGCAT
TGCAATGATTAATGCCTTCCTCAACCGAACTGATCCTCA***AGACAGGCAAGACAGGAC
CGAAAGGTTCCTCCCAAGCAATCCTCATGTCTGGTCTGACGTTGTCCAAAAGCAACGGCC
AAATCAAGTTACCTTCTCTTTTATACTCTTGACAGAACGTTGCTCCTTTCTCCTTAGCAT
CCATCACCAATCCTTCAATGAAATTAGCTGAGGATTCCGACACCACGGCTGTAATATCAC
AGTTCTCTTCAGGCGGTCCCACCGTGAGTTTCACCACTTTAGCTTTCACCTTCTCTACAA
GCTCATCCGCCACTGATTCCATCACTAGGACTACCTTAACCGCAGTGCATC

QA 5 775 5 775
DS 

RD RR2BI43JQ 848 0 0
ATGTTACTACTAATTAATATCTCTTACTGATTACATAGTTATTACAAACCATAACAGTTA
CGCTAATCACTCCATTTTATTCATAGTTTTTGATTCAATCCGATACAAACGAGATAGTAA
CGAGCGAGTGAAAGATGAAGAACACAAACAGGGAAACTAACCCATAGAGTATGAGGGCGT
AGGCAAGTTAATGACAGTGGTCTTCACTTTGGTCATCAAATTGATGCTATTTGTCACACC
TTGTGATCCTATTCCACTGTCCTTTAGTCCCTGGAAAGGGAAATGGTCTGGTCCACGAGC
TGGCGCAAAGTTGATCTGAACCGTTCCTGTCTCCATTGCATCACTGATCAGCATTGCCTT
ATTGATGTCTTTAGTGAATACACATCCCTGGAGACCAAAGTTACTAGCATTGCAATGATT
AATGCCTTCCTCAACCGAACTGATCCTCA***AGACAGGCAAGACAGGACCGAAAGGTTC
CTCCCAAGCAATCCTCATGTCCGGTCTGACATTGTCCAAAAGCAACGGCCAAATCAAGTT
ACCTTCTCTTTTATACTCTTGACAGAACGTTGCTCCTTTCTCCTTAGCATCCATCACCAA
TCCTTCAATGAAATTAGCTGAGGATTCCGACACCACGGCTGTAATATCACAGTTCTCTTC
CGGCGGTCCCACCGTGAGTTTCGCCACTTTAGCTTTCACTTTCTCAACAAGCTCATCCGC
CACTGATTCCATCACTAGGACTACCTTAACCGCAGTGCATCTCTGCCCACTGTAGGAGAA
TCCTCCTTTGATGATATTCGAAGCCACTAAATCAAGATCGGCATCCTCCAGGACATGCAT
GCATCTTT

QA 1 848 1 848
DS 



AS 2 5

CO CL1486Contig1 606 3 6 U
AAAACACAAATCTCGTTACGCTTTTTGTGCAAACACACCAAAGAGAGAAACCAATGTTCC
AATCTAAAAAGTTGTGTAATACTTATGCACACTCTGAAAGTTACAACGGTAGCAAGAGAG
GAACAAAACGAAAGTAGTGGATACCAAACACACACACGAACTCAAATCTTTTGAATTAAA
CTGAGGGACTCTGGCTCTGACCGTTGTTCAATCCGTACTTCTCTCTGATTCTGGACCTCC
AGTTGTCAATATTGCTTGATCCAGAAGATGTCTGGTTAGCCTGTGGAGCAAGAAGATTCT
CCCGCGCTCTATTAATCGGATTCTCATAATCATCTTCGTCATCAAGCTCTGATTGCCTAG
GAAAAACCATAGCTCTTAGAACCATAGCCAGTAGCAAAGACAGTAGCTGGATAGCTACCA
CGCCAACCCCAACCCATTTGCAAATATCGATGTTTGCTTCAATGAAAGCTCGAAGGCTAG
TGAGTTCTCCAGTTGGATCATAAGGAAAATCCTTCTCCCAGTGACGGTCAATGGCAATGA
ATCCAACGAGAGCTGCTTCAAGTATGATGACAAGAGTTTTGAGGATTGAATAGAAACACA
AGCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2D748JQ U 45
AF RR2A379JQ U 1
AF RR2EW87JQ U 59
BS 1 173 RR2A379JQ
BS 174 174 RR2EW87JQ
BS 175 358 RR2A379JQ
BS 359 359 RR2EW87JQ
BS 360 591 RR2A379JQ
BS 592 606 RR2EW87JQ

RD RR2D748JQ 132 0 0
GAGAAACCAATGTTCCAATCTAAAAAGTTGTGTAATACTTATGCACACTCTGAAAGTTAC
AACGGTAGCAAGAGAGGAACAAAACGAAAGTAGTGGATACCAAACACACACACGAACTCA
AATCTTTTG
GAT

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR2A379JQ 591 0 0
AAAACACAAATCTCGTTACGCTTTTTGTGCAAACACACCAAAGAGAGAAACCAATGTTCC
AATCTAAAAAGTTGTGTAATACTTATGCACACTCTGAAAGTTACAACGGTAGCAAGAGAG
GAACAAAACGAAAGTAGTGGATACCAAACACACACACGAACTCAAATCTTTTGGATTAAA
CTGAGGGACTCTGGCTCTGACCGTTGTTCAATCCGTACTTCTCTCTGATTCTGGACCTCC
AGTTGTCAATATTGCTTGATCCAGAAGATGTCTGGTTAGCCTGTGGAGCAAGAAGATTCT
CCCGCGCTCTATTAATCGGATTCTCATAATCATCTTCGTCATCAAGCTCTGATTGCCTTG
GAAAAACCATAGCTCTTAGAACCATAGCCAGTAGCAAAGACAGTAGCTGGATAGCTACCA
CGCCAACCCCAACCCATTTGCAAATATCGATGTTTGCTTCAATGAAAGCTCGAAGGCTAG
TGAGTTCTCCAGTTGGATCATAAGGAAAATCCTTCTCCCAGTGACGGTCAATGGCAATGA
ATCCAACGAGAGCTGCTTCAAGTATGATGACAAGAGTTTTGAGGATTGAAT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2EW87JQ 548 0 0
G
CAATCTAAAAAGTTGTGTAATACTTATGCACACTCTGAAAGTTACAAAGGTAGCAAGAGA
GGAACAATACGAAAGTAGTGGATACCAAACACACACACAAACTCAAATCTTTTGAATTAG
ACTGAGGGATTCTGGCTCTGACCGTTGTTCAATCCGTACTTTTCTCTGATTCTGGACCTC
CAGTTGTCAATATTGCTTGATCCAGAAGATGTCTGGTTAGTCTGTGGAGCAAGAAGATTC
TCCCGCGCTCTATTAATCGGATTCTCATAATCATCTTCGTCATCAAGCTCTGATTGCCTA
GGAGAAACCATAGCTCTTAGAACCATAGCCAGTAGCAAAGACAGTAGCTGGATAGCTACC
ACGCCAACCCCAACCCATTTGCAAATATCGATGTTTGCTTCAATGAAAGCTCGAAGGCTA
GTGAGTTCTCCAGTTGGATCATAAGGAAGATCCTTCTCCCAGTGACGGTCAATGGCAATG
AATCCAACGAGAGCTGCTTCGAGTATGATGACAAGAGTTTTGAGGATTGAATAGAAACAC
AAGCAGC

QA 2 548 2 548
DS 



CO CL1486Contig2 712 2 17 U
GGAAAACTGGTTACAATTGAGATCGCTCGCTCATCAGAATTTTCAATCTTCCTCCGATAT
CGAGAGAGAAACCACACAAAAAAAAAATGAGACACAACTGCTGCCATCTCTCCTTCGCTT
CCGTCCTGAAGATCCTCAATTTCCTCCAAGCCTTCATCGGTATCTCCATCATCATCTACT
CTATATGGATGCTCGATCAATACAATCGCCACGTCCCCGTCGACCCTCCTCCTCCTTCTC
AGCCTCCCTCCGCTTCTTATCCCTTCTCCAGCTCAGGAATCGCTATCAACAGTCTCTCTG
ACTCCCTGAACAAACCCATCGGTCTCCTTCTCCGAGATTCGGGTTTCCACCTCCGTTCCC
TAGATCTTCCTGCTCCATGGTTTATCTACTCTTTCATGGCGATTGGGATCTTGGTCTGTA
TTGTCACTGTCATCGGTTTCATTGCAGCTGAAGCTATCAACGGCTGCTGCTTGTGTTTCT
ATTCAATCCTCAAAACTCTTGTCATCATACTTGAAACAGCTCTCGTTGGATTCATTGCCA
TTGACCGTCACTGGGAGAAGGATCTTCCTTATGATCCAACTGGAGAACTCACTAGCCTTC
GAGCTTTCATTGAAGCAAACATCGATATTTGCAAATGGGTTGGGGTTGGCGTGGTAGCTA
TCCAGCTACTGTCTTTGCTACTGGCTATGGTTCTAAGAGCTATGGTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E440TF U 1
AF RR2D748TF U 31
BS 1 37 RR2E440TF
BS 38 38 RR2D748TF
BS 39 85 RR2E440TF
BS 86 87 RR2D748TF
BS 88 175 RR2E440TF
BS 176 176 RR2D748TF
BS 177 268 RR2E440TF
BS 269 269 RR2D748TF
BS 270 284 RR2E440TF
BS 285 285 RR2D748TF
BS 286 332 RR2E440TF
BS 333 333 RR2D748TF
BS 334 517 RR2E440TF
BS 518 518 RR2D748TF
BS 519 643 RR2E440TF
BS 644 644 RR2D748TF
BS 645 712 RR2E440TF

RD RR2E440TF 712 0 0
GGAAAACTGGTTACAATTGAGATCGCTCGCTCATCAGGATTTTCAATCTTCCTCCGATAT
CGAGAGAGAAACCACACAAAAAAAA**TGAGACACAACTGCTGCCATCTCTCCTTCGCTT
CCGTCCTGAAGATCCTCAATTTCCTCCAAGCCTTCATCGGTATCTCCATCATCATTTACT
CTATATGGATGCTCGATCAATACAATCGCCACGTCCCCGTCGACCCTCCTCCTCCTTCTC
AGCCTCCCTCCGCTTCTTATCCCTTCTCTAGCTCAGGAATCGCTGTCAACAGTCTCTCTG
ACTCCCTGAACAAACCCATCGGTCTCCTTCTCGGAGATTCGGGTTTCCACCTCCGTTCCC
TAGATCTTCCTGCTCCATGGTTTATCTACTCTTTCATGGCGATTGGGATCTTGGTCTGTA
TTGTCACTGTCATCGGTTTCATTGCAGCTGAAGCTATCAACGGCTGCTGCTTGTGTTTCT
ATTCAATCCTCAAAACTCTTGTCATCATACTTGAAACCGCTCTCGTTGGATTCATTGCCA
TTGACCGTCACTGGGAGAAGGATCTTCCTTATGATCCAACTGGAGAACTCACTAGCCTTC
GAGCTTTCATTGAAGCAAACATCGATATTTGCAAATGGGTTGGTGTTGGCGTGGTAGCTA
TCCAGCTACTGTCTTTGCTACTGGCTATGGTTCTAAGAGCTATGGTTTCTCC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2D748TF 657 0 0
GG
ATCAGAATTTTCAATCTTCCTCCGATATCGAGAGAGAAACCACACAAAAAAAAAATGAGA
CACAACTGCTGCCATCTCTCCTTCGCTTCCGTCCTGAAGATCCTCAATTTCCTCCAAGCC
TTCATCGGTATCTCCATCATCATCTACTCTATATGGATGCTCGATCAATACAATCGCCAC
GTCCCCGTCGACCCTCCTCCTCCTTCTCAGTCTCCCTCGGCTTCTTATCCCTTCTCCAGC
TCAGGAATCGCTATCAACAGTCTCTCTGACTCCCTGAACAAACCCATCGGTCTCCTTCTC
CGAGATTCGGGTTTCCACCTCCGTTCCCTAGATCTTCCTGCTCCCTGGTTTATCTACTCT
TTCATGGCGATTGGGATCTTGGTCTGTATTGTCACTGTCATCGGTTTCATTGCAGCTGAA
GCTATCAGTGGCTGCTGCTTGTGTTTCTATTCAATCCTCAAAACTCTTGTCATCATACTT
GAAGCAGCTCTCGTTGGATTCATTGCCATTGACCGTCACTGGGAGAAGGATCTTCCTTAT
GATCCAACTGGAGAACTCACTAGCCTTCGAGCTTTCATTGAAGCAAACATCGATATTTGC
AAATGGGTTGGGGTTGGCGTGGTAGCTATCCAGCTACTGTCTTTGCTACTGGCTA

QA 3 657 3 657
DS 



AS 2 6

CO CL1487Contig1 905 3 7 U
GGTAAAGAAGTGTAAATATTTCTGAACAGAATGATGTATTTACCAGTTCAATTCAAATGG
AGAAAAGAAAAACAATTCAAGTCAACTGAAATTGAGAATTTTTTTTCTTTTTTTTTGAAA
TTAACAATTCGAAAACAGAGATTTATTTGGTTAAAAGCAAAGTGCATTGTCTTCTTCTTC
T***GATTGCCATCATGAATGAATAAGGAGAAGAAGAAGGATGTGATATGAAGGAGGAGA
AGAACTTCTCAGTATAAACGGAACTTCTCCTTAGTGTTCTGGAACACTTGTTCAGCAATC
ACAGCTCCGTTCCCGTCGGCTTTCTTGATCACCAGGTTAGATTTCTGGTAAACACCGGTT
CCTCTCAGAGCATCAGCTATGAAGTCATCAAACCCGATTGCTATGGCTGCTTCAGCTTTC
GCTCCATACACCAATCTCTTGAGTCTGGAGAGATGGATGGCTCCGAAGCACATGGGACAC
GGCTCACAGGATGCGTAAATCTCGCATTCTGAGAGCTCGATTTGGTTAAGTTTCTTGCAT
GCCTCTCGAATGGCAGTGACTTCGGCATGTGCAGTAGGGTCAGTGTACTTGAGAACCATG
TTGTGGCAGCTAGCGACGACCTCGTTATTGTGGACAATAACAGCACCAAAAGGGCCACCA
TCACCACAGTCAACACCCTTGTAAGCTTCTTCAACAGCTTGGGTTAGGAACTTGTGGTCA
CTGTCTTGCACAGCTTGTTGGTGACCGGCGAATGCAGTAGCAACGGAGATGGTTCCGTCT
TTTGCTTCCACTTTAGCTTCTTCCATTGACTTATTGATGAGAATTTGACGAATTGAATTT
TTTTTTTTTTGCTGGGGGAGAATTCTAGAAGAGGCGATTGTGTTTGTGTGGTGGGTGAAG
GTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2BB58JQ U 1
AF RR2DD04JQ U 117
AF RR2BB58TF C 42
BS 1 464 RR2BB58JQ
BS 465 465 RR2DD04JQ
BS 466 616 RR2BB58JQ
BS 617 622 RR2DD04JQ
BS 623 623 RR2BB58TF
BS 624 719 RR2DD04JQ
BS 720 905 RR2BB58TF

RD RR2BB58JQ 616 0 0
GGTAAAGAAGTGTAAATATTTCTGAACAGAATGATGTATTTACCAGTTCAATTCAAATGG
AGAAAAGAAAAACAATTCAAGTCAACTGAAATTGAGAATTTTTTTTCTTTTTTTTTGAAA
TTAACAATTCGAAAACAGAGATTTATTTGGTTAAAAGCAAAGTGCATTGTCTTCTTCTTC
T***GATTGCCATCATGAATGAATAAGGAGAAGAAGAAGGATGTGATATGAAGGAGGAGA
AGAACTTCTCAGTATAAACGGAACTTCTCCTTAGTGTTCTGGAACACTTGTTCAGCAATC
ACAGCTCCGTTCCCGTCGGCTTTCTTGATCACCAGGTTAGATTTCTGGTAAACACCGGTT
CCTCTCAGAGCATCAGCTATGAAGTCATCAAACCCGATTGCTATGGCTGCTTCAGCTTTC
GCTCCATACACCAATCTCTTGAGTCTGGAGAGATGGATGGCTCCCAAGCACATGGGACAC
GGCTCACAGGATGCGTAAATCTCGCATTCTGAGAGCTCGATTTGGTTAAGTTTCTTGCAT
GCCTCTCGAATGGCAGTGACTTCGGCATGTGCAGTAGGGTCAGTGTACTTGAGAACCATG
TTGTGGCAGCTAGCGA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2DD04JQ 603 0 0
GAAATTAACAATTCGAAAACAGAGATTTATTTGGTTAAAAGCAAAGTGCATTGTCTTCTT
CTTCTTCTGATTGCCATCATGAATGAATAAGGAGAAGAAGAAGGATGTGATATGAAGGAG
GAGAAGAACTTCTCAGTATAAACGGAACTTCTCCTTAGTGTTCTGGAACACTTGTTCAGC
AATCACAGCTCCGTTCCCGTCGGCTTTCTTGATCACCAGGTTAGATTTCTGGTAAACACC
GGTTCCTCTCAGAGCATCAGCTATGAAGTCATCAAACCCGATTGCTATGGCTGCTTCAGC
TTTCGCTCCATATACCAATCTCTTGAGTCTGGAGAGATGGATGGCTCCGAAGCGCATGGG
ACAGGGCTCACAGGATGCGTAAATCTCGCATTCTGAGAGCTCGATTTTGTTAAGTTTCTT
GCATGCCTCTCGAATGGCAGTGACTTCGGCATGAGCAGTAGGGTCAGTGTACTTGAGAAC
CATGTTGTGGCAGCTAGCGACGACCTGGTTATTGTGGACAATAACAGCACCAAAAGGGCC
ACCATCACCACAGTCAACACCCTTGTAAGCTTCTTCAACAGCTTGGGTTAGGAACTTGTG
GTC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2BB58TF 864 0 0
TTTACCAGTTCATC
AATGGAGAAAAGAAAA*CAATTCAAGTCA*CTGAAATTGAGA**TTTTTTTCTTTTTTTT
*GAAATTAACAATTCGAAAACAGAGATTTATTTGGTTAAAAGCAAAGTGCATTGTCTTCT
TCTTCT***GATTGCCATCATGAATGAATAAGGAGAAGAAGAAGGATGTGATATGAAGGA
GGAGAAGAACTTCTCAGTATAAACGGAACTTCTCCTTAGTGTTCTGGAACACTTGTTCAG
CAATCACAGCTCCGTTCCCGTCGGCTTTCTTGATCACCAGGTTAGATTTCTGGTAAACAC
CGGTTCCTCTCAGAGCATCAGCTATGAAGTCATCAAACCCGATTGCTATGGCTGCTTCAG
CTTTCGCTCCATACACCAATCTCTTGAGTCTGGAGAGATGGATGGCTCCGAAGCACATGG
GACACGGCTCACAGGATGCGTAAATCTCGCATTCTGAGAGCTCGATTTGGTTAAGTTTCT
TGCATGCCTCTCGAATGGCAGTGACTTCGGCATGTGCAGTAGGGTCAGTGTACTTGAGAA
CCATGTTGTGGCAGCTAGCGACGACTTCGTTATTGTGGACAATAACAGCACCAAAAGGGC
CACCATCACCACAGTCAACACCCTTGTAAGCTTCTTCAACAGCTTGGGTTAGGAACTTGT
GGTCACTGTCTTGCACAGCTTGTTGGTGACCGGCGAATGCAGTAGCAACGGAGATGGTTC
CGTCTTTTGCTTCCACTTTAGCTTCTTCCATTGACTTATTGATGAGAATTTGACGAATTG
AATTTTTTTTTTTTTGCTGGGGGAGAATTCTAGAAGAGGCGATTGTGTTTGTGTGGTGGG
TGAAGGTTCC

QA 15 864 15 864
DS 



CO CL1487Contig2 682 3 5 U
GGATGGAAACAAGGAGATATAATGGGGTGGATTAATCTGAGGGTTTAGTTAATCTAATCT
TGTAATCAAGGAAACGTTTGTTTTAATTAACCCAATTTTTTTTTTTTGTTTTGGTTTTGT
TTCCTTGCAAAGCAGATTCACTTTCCAAATCATCATCTCTATCACAGACACACATCAATA
GCTTTATATTTTTAATTTTTGTGATCGTTCTCTATCCTCCCCCACCCCAACCCAAACCTT
TTCTCTGATTATTGTTTTGTCTATAAAAGCACGTCAGTTGGTTCTCTTCTTCGTCAACCT
TCACCCACCACACAACACAATCGCCTCTTCTAGAATTCTCCTCCCCAGATAAAAAAAATC
AATTCGTTAAATCCTCATCATCAGTCAAATGGAAGAAGCTAAAGTGGAAGCAAAAGACGG
AACCATCTCCGTTGCTACTGCTTTTGCCGGTCACCAACAAGCTGTGCAAGACAGTGACCA
CAAGTTCCTAACCCAAGCTGTTGAAGAAGCTTACAAGGGTGTTGACTGTGGTGATGGTGG
CCCTTTTGGTGCTGTTATTGTCCACAATAACCAGGTCGTCGCTAGCTGCCACAACATGGT
TCTCAAGTACACTGACCCTACTGCTCATGCCGAAGTCACTGCCATTCGAGAGGCATGCAA
GAAACTTAACAAAATCGAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD04TF U 117
AF RR2D044TF U 189
AF RR2CG88TF U 1
BS 1 128 RR2CG88TF
BS 129 129 RR2DD04TF
BS 130 176 RR2CG88TF
BS 177 177 RR2DD04TF
BS 178 682 RR2CG88TF

RD RR2DD04TF 395 0 0
GG
GTTTCCTTGCAAAGCAGATTCACTTTCCAAATCATCATCTCTATCACAGACACACATCAA
TAGCTTTATATTTTTAATTTTTGTGATCGTTCTCTATCCTCCCCCACCCCAACCCAAACC
TTTTCTCTGATTATTGTTTTGTCTATAAAAGCACGTCAGTTGGTTCTCTTCTTCGTCAAC
CTTCACCCACCACACAACACAATCGCCTCTTCTAGAATTCTCCTCCCCAGATAAAAAAAA
TCAATTCGTTAAATCCTCATCATCAGTCAAATGGAAGGAGCTAAAGTGGAAGCAAAAGAC
GCA*CCATCTCCGTTGCTACTGCTTTTGCCGGTCACCAACAAGCTGTGCAAGACAGTGAC
CACAAGTTCCTAACCCAAGCTGTTGAAGAAGCT

QA 3 395 3 395
DS 

RD RR2D044TF 359 0 0
TTTTTAATTTTTGTGATCGTTCTCTATCCTCCCCCACCCCAACCCAAACCTTTTCTCTGA
TTATCGTTTTGTCTATAAAAGCACGGCAGTTGGTTCTCTTCTTCGTCAACCTTCACCCAC
CACACAACACAATCGCCTCTTCTAGAATTCTCCTCCCCAGATAAAAAAAATCAATTCGTT
AAATCCTCATCATCAGTCAAATGGAAGAAGCTAAAGTGGAAGCAAAAGACGGAACCATCT
CCGTTGCTACTGCTTTTGCCGGTCACCAACAAGCTGTGCAAGACAGTGACCACAAGTTCC
TAACCCAAGCTGTTGAAGAAGCTTACAAGGGTGTTGACTGTGGTGATGGTGGCCCTTTT

QA 1 359 1 359
DS 

RD RR2CG88TF 682 0 0
GGATGGAAACAAGGAGATATAATGGGGTGGATTAATCTGAGGGTTTAGTTAATCTAATCT
TGTAATCAAGGAAACGTTTGTTTTAATTAACCCAATTTTTTTTTTTTGTTTTGGTTTTGT
TTCCTTGCGAAGCAGATTCACTTTCCAAATCATCATCTCTATCACAGACACACATCGATA
GCTTTATATTTTTAATTTTTGTGATCGTTCTCTATCCTCCCCCACCCCAACCCAAACCTT
TTCTCTGATTATTGTTTTGTCTATAAAAGCACGTCAGTTGGTTCTCTTCTTCGTCAACCT
TCACCCACCACACAACACAATCGCCTCTTCTAGAATTCTCCTCCCCAGATAAAAAAAATC
AATTCGTTAAATCCTCATCATCAGTCAAATGGAAGAAGCTAAAGTGGAAGCAAAAGACGG
AACCATCTCCGTTGCTACTGCTTTTGCCGGTCACCAACAAGCTGTGCAAGACAGTGACCA
CAAGTTCCTAACCCAAGCTGTTGAAGAAGCTTACAAGGGTGTTGACTGTGGTGATGGTGG
CCCTTTTGGTGCTGTTATTGTCCACAATAACCAGGTCGTCGCTAGCTGCCACAACATGGT
TCTCAAGTACACTGACCCTACTGCTCATGCCGAAGTCACTGCCATTCGAGAGGCATGCAA
GAAACTTAACAAAATCGAGCTC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 5

CO CL1488Contig1 847 5 16 U
GGGGCTAAACAAAAACCTACTCTCTCTTCTCCACACGACATTTACAGAGGTTTTGAGCCA
TGGCCGCCGCCGCAGAAATCGACGCTGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAACGAAGTCAAGC
TCTTCAACCGTTGGAGCTTCGATGACGTCTCGGTCACAGACATTAGTCTTGTTGACTACA
TTGGTGTCCAGCCTGCGAAACACGCAACCTTTGTTCCCCACACTGCTGGAAGATACTCTG
TGAAGAGGTTCAGGAAGGCTCAGTGCCCTATTGTTGAGAGGCTCACAAACTCTCTCATGA
TGCACGGGAGGAACAACGGTAAGAAGCTGATGGCTGTGAGGATCATCAAGCACGCCATGG
AGATTATCCACCTCTTGACTGACGCCAACCCTATCCAGGTTATCATTGACGCCATTGTTA
ACAGTGGTCCACGTGAAGATGCTACCAGGATTGGATCTGCTGGTGTGGTTAGGAGGCAGG
CTGTTGATATCTCTCCTCTCAGACGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACTGGTG
CACGTGAAGCTGCCTTCAGAAACATCAAGACAATCGCTGAGTGTCTTGCTGATGAGCTCA
TCAATGCTGCTAAGGGATCTTCCAACAGCTATGCTATCAAGAAGAAAGATGAGATTGAGA
GAGTTGCCAAGGCCAACCGTTAAGGGATCTTCTTTTGTCCTGAGTTTGCATTGTATCTCA
AAGACCTTT*GTTGTGCC****TGCTTTCCTTAGCTTTTGGATATGTTTCAAACGATGCT
TGTCTTATCTTTAATGAAGTTTTGACGGTTTAAACCACTTTTTATCTTATTAAATGGTTT
CATATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2AY05TFB U 287
AF RR2FC46TF U 1
AF RR2AY05JQ C 19
AF RR2ER88TF U 43
AF RR2FC46JQ C 21
BS 1 196 RR2FC46TF
BS 197 197 RR2ER88TF
BS 198 286 RR2FC46TF
BS 287 287 RR2ER88TF
BS 288 299 RR2FC46TF
BS 300 300 RR2AY05TFB
BS 301 326 RR2FC46TF
BS 327 327 RR2AY05TFB
BS 328 430 RR2FC46TF
BS 431 431 RR2AY05TFB
BS 432 432 RR2FC46TF
BS 433 433 RR2AY05TFB
BS 434 786 RR2FC46TF
BS 787 787 RR2ER88TF
BS 788 821 RR2FC46TF
BS 822 847 RR2FC46JQ

RD RR2AY05TFB 466 0 0
A
AACTCTCTCATGATGCATGGGAGGAACAACGGTAAGAAACTGATGGCTGTGAGGATCATC
AAGCACGCCATGGAGATTATCCACCTCTTGACTGACGCCAACCCCATCCAAGTCATCATT
GACGCCATTGTTAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCTACCAGGATTGGATCTGCTGGTGTG
GTTAGGAGGCAGGCTGTTGATATCTCTCCTCTCAGACGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTG
CTCACCACTGGTGCGCGTGAAGCTGCCTTCAGAAACATCAAGACAATCGCTGAGTGTCTT
GCTGATGAGCTCATCAATGCTGCTAAGGGATCTTCCAACAGCTATGCTATTAAGAAGAAA
GATGAGATTGAGAGAGTTGCCAAGGCCAACCGTTAAGGGATCTTCTTTTGTCCTGAGTTT
GCATTGTATCTCAAAGACCTTTTGTTGTGC*****TGCTTTCCTT

QA 2 466 2 466
DS 

RD RR2FC46TF 824 0 0
GGGGCTAAACAAAAACCTACTCTCTCTTCTCCACACGACATTTACAGAGGTTTTGAGCCA
TGGCCGCCGCCGCAGAAATCGACGCTGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAACGAAGTCAAGC
TCTTCAACCGTTGGAGCTTCGATGACGTCTCGGTCACAGACATTAGTCTTGTTGACTACA
TTGGTGTCCAGCCTGCTAAACACGCAACCTTTGTTCCCCACACTGCTGGAAGATACTCTG
TGAAGAGGTTCAGGAAGGCTCAGTGCCCTATTGTTGAGAGGCTCACTAACTCTCTCATGG
TGCACGGGAGGAACAACGGTAAGAAGTTGATGGCTGTGAGGATCATCAAGCACGCCATGG
AGATTATCCACCTCTTGACTGACGCCAACCCTATCCAGGTTATCATTGACGCCATTGTTA
ACAGTGGTCCGCTTGAAGATGCTACCAGGATTGGATCTGCTGGTGTGGTTAGGAGGCAGG
CTGTTGATATCTCTCCTCTCAGACGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACTGGTG
CACGTGAAGCTGCCTTCAGAAACATCAAGACAATCGCTGAGTGTCTTGCTGATGAGCTCA
TCAATGCTGCTAAGGGATCTTCCAACAGCTATGCTATCAAGAAGAAAGATGAGATTGAGA
GAGTTGCCAAGGCCAACCGTTAAGGGATCTTCTTTTGTCCTGAGTTTGCATTGTATCTCA
AAGACCTTT*GTTGTGCC****TGCTTTCCTTAGCTTTTGGATATGTTTCAAACGATGCT
TGTCTT*TCTTTAATGAAGTTTTGACGGTTTAAACCACTTT
TTA

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR2AY05JQ 811 0 0
TACT
TCTCTTCTCCAAACGACATTTACAGAGATTT*GAGCCATGGCCGCCGCCGTAGAAATCGA
CGCTGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAACGAAGTCAAGCTCTTCAACCGTTGGAGCTTCGA
TGACGTCTCGGTCACAGACATTAGTCTTGTTGACTACATTGGTGTCCAGCCTGCGAAACA
CGCCACCTTTGTTCCCCACACTGCTGGAAGATACTCTGTGAAGAGGTTCAGGAAGGCTCA
GTGCCCTATTGTTGAGAGGCTCACAAACTCTCTCATGATGCATGGGAGGAACAACGGTAA
GAAACTGATGGCTGTGAGGATCATCAAGCACGCCATGGAGATTATCCACCTCTTGACTGA
CGCCAACCCCATCCAAGTCATCATTGACGCCATTGTTAACAGTGGTCCACGTGAAGATGC
TACCAGGATTGGATCTGCTGGTGTGGTTAGGAGGCAGGCTGTTGATATCTCTCCTCTCAG
ACGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACTGGTGCGCGTGAAGCTGCCTTCAGAAA
CATCAAGACAATCGCTGAGTGTCTTGCTGATGAGCTCATCAATGCTGCTAAGGGATCTTC
CAACAGCTATGCTATTAAGAAGAAAGATGAGATTGAGAGAGTTGCCAAGGCCAACCGTTA
AGGGATCTTCTTTTGTCCTGAGTTTGCATTGTATCTCAAAGACCTTTTGTTGTGC*****
TGCTTTCCTTAGCTTTTGGATATGTTTCAGACGATGCTTGTCTTATCTTTAATGAAGTTT
TGACGGTTTAAACCACTTT
GGATCTTG

QA 5 803 5 803
DS 

RD RR2ER88TF 761 0 0
GGACAGAGG
TTTGAGCCATGGCCGCCGTCGCAGAAATCGACTCTGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAACG
AAGTCAAGCTCTTCAACCGTTGGAGCTTCGATGACGTCTCGGTCACAGACATTAGTCTTG
TTGACTACATTGGTGTCCAGCCTGCGAAACACGCAACCTTTGTTCCCCACACTGCTGGAA
GATACTCTGTGAAGAGGTTCAGGAAGGCTCAGTGCCCTATTGTTGAGAGGCTCACAAACT
CTCTCATGATGCACGGGAGGAACAACGGTAAGAAGCTGATGGCTGTGAGGATCATCAAGC
ACGCCATGGAGATTATCCACCTCTTGACTGACGCCAACCCTATCCAGGTTATCATTGACG
CCATTGTTAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCTACCAGGATTGGATCTGCTGGTGTGGTTA
GAAGACAGGCCGTTGATATCTCTCCTCTCAGACGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTCA
CCACTGGTGCACGTGAAGCTGCCTTCAGAAACATCAAGACGATCGCTGAGTGTCTTGCTG
ATGAGCTCATCAATGCTGCTAAGGGATCTTCCAACAGCTATGCTATCAAGAAGAAAGATG
AGATTGAGAGAGTTGCCAAGGCCAACCGTTAAGGGATCTTCTTTTGTCCTGAGTTTGCAT
TGTATCTCAAAGACCTTT*GTTGTGCTGCTTTGCTTTCCTTAGCTTTTGGATATGTTTCA
GACGATGCTTGTCTTATCTTTAATGAAGTTTT

QA 10 761 10 761
DS 

RD RR2FC46JQ 827 0 0
TC
TCTCTTCTCCACACGACATTTACAGAGGTTT*GAGCCATGGCCGCCGCCGCAGAAATCGA
CGCTGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAACGAAGTCAAGCTCTTCAACCGTTGGAGCTTCGA
TGACGTCTCGGTCACAGACATTAGTCTTGTTGACTACATTGGTGTCCAGCCTGCTAAACA
CGCAACCTTTGTTCCCCACACTGCTGGAAGATACTCTGTGAAGAGGTTCAGGAAGGCTCA
GTGCCCTATTGTTGAGAGGCTCACTAACTCTCTCATGGTGCACGGGAGGAACAACGGTAA
GAAGTTGATGGCTGTGAGGATCATCAAGCACGCCATGGAGATTATCCACCTCTTGACTGA
CGCCAACCCTATCCAGGTTATCATTGACGCCATTGTTAACAGTGGTCCGCTTGAAGATGC
TACCAGGATTGGATCTGCTGGTGTGGTTAGGAGGCAGGCTGTTGATATCTCTCCTTTCAG
ACGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACTGGTGCACGTGAAGCTGCCTTCAGAAA
CATCAAGACAATCGCTGAGTGTCTTGCTGATGAGCTCATCAATGCTGCTAAGGGATCTTC
CAACAGCTATGCTATCAAGAAGAAAGATGAGATTGAGAGAGTTGCCAAGGCCAACCGTTA
AGGGATCTTCTTTTGTCCTGAGTTTGCATTGTATCTCAAAGACCTTT*GTTGTGCC****
TGCTTTCCTTAGCTTTTGGATATGTTTCAAACGATGCTTGTCTTATCTTTAATGAAGTTT
TGACGGTTTAAACCACTTTTTATCTTATTAAATGGTTTCATATTT

QA 3 827 3 827
DS 



AS 3 6

CO CL1489Contig1 1092 2 4 U
AGGGGAACTCCAAAAACAAACAAAGAAGCAAAGAGAGAATGGAGTTACGCAATGGGCAGA
GAACTATGTTAATTATTGTGGTGTTGATTGTAATAATGTGGAGCTGTTGTTACAGCCACG
CCCAGCTGAGCCCCGATTTCTACAAGCAAAGCTGTCCCTCATTGTTTTATGTGGTGAGAC
GCGAGGTGCAGCGAGCGGTGACCAGGGAGCGCCGCATGGCTGCTTCTCTCCTCCGGTTAT
TCTTTCACGACTGTTTTGTCAATGGGTGCGACGGATCAATATTGTTGGACGACACTACCT
CATCTATGGGAGAGAAAACGGCAGGCCCAAACAATAACTCTGTGAGGGGATTTGACGTGG
TTGACAAAATCAAGTCCAGGGTTGAGAGACTATGCCCAGGCGTCGTCTCATGCGCAGACA
TTCTCGCTATCACTGCCCGTGACTCTGTCCTCCTTTTGGACGGGCCAGGTTGGAGTGTCA
AACTTGGAAGAAGAGATTCCACCACGGCGAGCTTCTCAACCGCCAATTCAGGCGTTATAC
CTCCTCCAACATCTACTCTCAACAACCTCATCAACCGGTTTAGAGCACAAGGTTTATCCT
CACGCGACATGGTCACACTCTCTGGTGCACACACTATAGGAGAAGCTAGATGCGTCACTT
TTAGAGACCGTATCTACAACGAAAGCAACAACATCGAACTTTCTTTCGCCTTGTCTAGAC
AAAGGAGCTGTTCGGCTGACTCGGGCTCTAGCGACAACAATGAAGCCACTCTTGATATCC
ACTCTCCTGGAAGGTTTGATATCAACTACTACAGACAGCTTCTCAACCACAGGGGTCTAC
TCACTTCGGACCAAGTTCTTTACAGCGGCGGTTCAACTGACTCGCTTGTCGTGTCTTATA
GTCGTAGTCTGAACGCCTTTTACCGCGATTTTGTAAGGGCTATGGTTAAGATGGGCGATA
TCAAACCACTCACTGGATCCAATGGTGAGATCCGTAACAACTGTCGCAGACCCAATTGAA
TCTCTTACGTGTTTTGTGTTATATTATTTTTACGTGCTTTCTACGTCAACTGTTTAAATA
TACATCTACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH02TF U 1
AF RR2CH02JQ C 371
BS 1 734 RR2CH02TF
BS 735 735 RR2CH02JQ
BS 736 770 RR2CH02TF
BS 771 1092 RR2CH02JQ

RD RR2CH02TF 770 0 0
AGGGGAACTCCAAAAACAAACAAAGAAGCAAAGAGAGAATGGAGTTACGCAATGGGCAGA
GAACTATGTTAATTATTGTGGTGTTGATTGTAATAATGTGGAGCTGTTGTTACAGCCACG
CCCAGCTGAGCCCCGATTTCTACAAGCAAAGCTGTCCCTCATTGTTTTATGTGGTGAGAC
GCGAGGTGCAGCGAGCGGTGACCAGGGAGCGCCGCATGGCTGCTTCTCTCCTCCGGTTAT
TCTTTCACGACTGTTTTGTCAATGGGTGCGACGGATCAATATTGTTGGACGACACTACCT
CATCTATGGGAGAGAAAACGGCAGGCCCAAACAATAACTCTGTGAGGGGATTTGACGTGG
TTGACAAAATCAAGTCCAGGGTTGAGAGACTATGCCCAGGCGTCGTCTCATGCGCAGACA
TTCTCGCTATCACTGCCCGTGACTCTGTCCTCCTTTTGGACGGGCCAGGTTGGAGTGTCA
AACTTGGAAGAAGAGATTCCACCACGGCGAGCTTCTCAACCGCCAATTCAGGCGTTATAC
CTCCTCCAACATCTACTCTCAACAACCTCATCAACCGGTTTAGAGCACAAGGTTTATCCT
CACGCGACATGGTCACACTCTCTGGTGCACACACTATAGGAGAAGCTAGATGCGTCACTT
TTAGAGACCGTATCTACAACGAAAGCAACAACATCGAACTTTCTTTCGCCTTGTCTAGAC
AAAGGAGCTGTTCG*CTGACTCGGGCTCTAGCGACAACAATGAAGCCACT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2CH02JQ 722 0 0
CAAGTCCAGGGTTGAGAGACTATGCCCAGGCGTCGTCTCATGCGCAGACATTCTCGCTAT
CACTGCCCGTGACTCTGTCCTCCTTTTGGACGGGCCAGGTTGGAGTGTCAAACTTGGAAG
AAGAGATTCCACCACGGCGAGCTTCTCAACCGCCAATTCAGGCGTTATACCTCCTCCAAC
ATTTACTCTCAACAACCTCATCAACCGGTTTAGAGCACAAGGTTTATCCTCACGCGACAT
GGTCACACTCTCTGGTGCACACACTATAGGAGAAGCTAGATGCGTCACTTTTAGAGACCG
TATCTACAACGAAAGCAACAACATCGAACTTTCTTTCGCCTTGTCTAGACAAAGGAGCTG
TTCGGCTGACTCGGGCTCTAGCGACAACAATGAAGCCACTCTTGATATCCACTCTCCTGG
AAGGTTTGATATCAACTACTACAGACAGCTTCTCAACCACAGGGGTCTACTCACTTCGGA
CCAAGTTCTTTACAGCGGCGGTTCAACTGACTCGCTTGTCGTGTCTTATAGTCGTAGTCT
GAACGCCTTTTACCGCGATTTTGTAAGGGCTATGGTTAAGATGGGCGATATCAAACCACT
CACTGGATCCAATGGTGAGATCCGTAACAACTGTCGCAGACCCAATTGAATCTCTTACGT
GTTTTGTGTTATATTATTTTTACGTGCTTTCTACGTCAACTGTTTAAATATACATCTACA
TT

QA 1 722 1 722
DS 



CO CL1489Contig2 775 2 10 U
GGGACTCAACTCCAAAAACAAACAAAGAAGCAAAGATAGAATGGAGTTATGCAATGAGCA
GAGAACTATCTTAATTGTGGTGTTGATTGTAATAATGTGGAGCTGTTGTTTCAGCCACGC
CCAGCTGAGCACTGACTTCTACAAGCAAAGCCGTCCCTCATTGTTTTATGTGGTGAGACG
CGAGGTGCAGCGAGCGGTTACCAGGGAGCGCCGCATGGCTGCTTCTCTCCTCCGGTTATT
CTTTCACGACTGTTTTGTCAATGTAAGATGCCATTTTTCTAATGACACAAGCTAAGAGTT
CCATCAATAATATCTCATGACATATCTTGTTAGTATTTTCTAAATATAAAATTGAAATAA
AAAATAAAAGCAAGAGAGAGAATATATACATTTCTTTACATTTTGGAATCCTTCCACCCA
TATAATTATTTTCATTGGACAATTAATTTACCGACAAAAATCTTAAAATTAAAAAATTTA
AGAATTTGCATGGGATCTACCAATGAGGCTATGATGCATGGTTGGCATGTTCCATTAATT
ACTCCAAAAAATTTAAAGTGCATGGTTTACAGGGGTGCGACGGATCAATATTGTTGGACG
ACACTTCCTCATCTATGGGAGAGAAAACGGCAGGCCCAAACAATAACTCTGTGAGGGGAT
TTGACGTGGTTGACAAAATCAAGTCCAGGGTTGAGAGACTATGCCCTGGCGTCGTCTCAT
GCGCAGACATCTTGCTATCACTGCCCGTGACTCTGTCCTCCTCGTTAGTACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY41TF U 1
AF RR2G567TF U 1
BS 1 64 RR2DY41TF
BS 65 65 RR2G567TF
BS 66 151 RR2DY41TF
BS 152 152 RR2G567TF
BS 153 198 RR2DY41TF
BS 199 199 RR2G567TF
BS 200 236 RR2DY41TF
BS 237 237 RR2G567TF
BS 238 255 RR2DY41TF
BS 256 775 RR2G567TF

RD RR2DY41TF 255 0 0
GGGACTCAACTCCAAAAACAAACAAAGAAGCAAAGATAGAATGGAGTTATGCAATGAGCA
GAGAGCTATCTTAATTGTGGTGTTGATTGTAATAATGTGGAGCTGTTGTTTCAGCCACGC
CCAGCTGAGCACTGACTTCTACAAGCAAAGCTGTCCCTCATTGTTTTATGTGGTGAGACG
CGAGGTGCAGCGAGCGGT*ACCAGGGAGCGCCGCATGGCTGCTTCTCTCCTCCGGT*ATT
CTTTCACGACTGTTT

QA 1 255 1 255
DS 

RD RR2G567TF 775 0 0
GGGACTC
AACTCCAAAAACAAACAAAGAAGCAAAGATAGAATGGAGTTATGCAATGAGCAGAGAACT
ATCTTAATTGTGGTGTTGATTGTAATAATGTGGAGCTGTTGTTTCAGCCACGCCCAGCTG
AGCACTGACTTCTACAAGCAAAGCCGTCCCTCATTGTTTTATGTGGTGAGACGCGAGGTG
CAGCGAGCGGTTACCAGGGAGCGCCGCATGGCTGCTTCTCTCCTCCGGTTATTCTTTCAC
GACTGTTTTGTCAATGTAAGATGCCATTTTTCTAATGACACAAGCTAAGAGTTCCATCAA
TAATATCTCATGACATATCTTGTTAGTATTTTCTAAATATAAAATTGAAATAAAAAATAA
AAGCAAGAGAGAGAATATATACATTTCTTTACATTTTGGAATCCTTCCACCCATATAATT
ATTTTCATTGGACAATTAATTTACCGACAAAAATCTTAAAATTAAAAAATTTAAGAATTT
GCATGGGATCTACCAATGAGGCTATGATGCATGGTTGGCATGTTCCATTAATTACTCCAA
AAAATTTAAAGTGCATGGTTTACAGGGGTGCGACGGATCAATATTGTTGGACGACACTTC
CTCATCTATGGGAGAGAAAACGGCAGGCCCAAACAATAACTCTGTGAGGGGATTTGACGT
GGTTGACAAAATCAAGTCCAGGGTTGAGAGACTATGCCCTGGCGTCGTCTCATGCGCAGA
CATCTTGCTATCACTGCCCGTGACTCTGTCCTCCTCGTTAGTACTTTT

QA 8 775 8 775
DS 



CO CL1489Contig3 652 2 5 U
CTGAGCAGTGGTAATGCATTTTTCTCATAGTATTTTGGAGCCAATGTGACAACTGAGAAG
AGACGGAAACATAAATGAAACTGCATTGCTACAAACTTTTATCATGATCTCTGTTATATT
ATGTTTTTATTAATGTAGATGTATATTTAAACAGGTGACGTAAAAAACACGTAAAAATGG
TATAACACAAAACACGTAAGAGATTCAATTGGGTCTGCGACAGTTGTTACGGATCTCACC
ATTGGATCCAGTGAGTGGTTTGATATCGCCCATCTTAACCATAGCCCTTACGAAATCGCG
GTAAAAGGCGTTCAGACTACGACTATAAGACACGACAAGCGAGTCAGTTGAACCGCCGCT
GTAAAGAACTTGGTCCGAGGTGAGTAGACCCCTGTGGTTGAGAAGCTGTCTGTAGTAGTT
GATGTCAAACCTTCCAGGGGAGTGAATATCAAGAGTGGCTTCATTGTTGTCGCTAGAGCC
AGAGTCAGCCGAACAGCTCCTTTGTCTAGACAAGGCGAAAGAAAGTTCGATGTTGTTGCT
TTCGTTGCAGATACGGTCTCTAAAAGTGACGCATCTAGCTTGTCCAATAGTGTGTGCACC
AGAGAGGGCGACCATGTCGCGTGAGGTTAAACCTTGTGCTCTAAAACGGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G567JQ U 1
AF RR2DY41JQ U 101
BS 1 364 RR2G567JQ
BS 365 365 RR2DY41JQ
BS 366 547 RR2G567JQ
BS 548 548 RR2DY41JQ
BS 549 652 RR2G567JQ

RD RR2G567JQ 652 0 0
CTGAGCAGTGGTAATGCATTTTTCTCATAGTATTTTGGAGCCAATGTGACAACTGAGAAG
AGACGGAAACATAAATGAAACTGCATTGCTACAAACTTTTATCATGATCTCTGTTATATT
ATGTTTTTATTAATGTAGATGTATATTTAAACAGGTGACGTAAAAAACACGTAAAAATGG
TATAACACAAAACACGTAAGAGATTCAATTGGGTCTGCGACAGTTGTTACGGATCTCACC
ATTGGATCCAGTGAGTGGTTTGATATCGCCCATCTTAACCATAGCCCTTACGAAATCGCG
GTAAAAGGCGTTCAGACTACGACTATAAGACACGACAAGCGAGTCAGTTGAACCGCCGCT
GTAAGGAACTTGGTCCGAGGTGAGTAGACCCCTGTGGTTGAGAAGCTGTCTGTAGTAGTT
GATGTCAAACCTTCCAGGGGAGTGAATATCAAGAGTGGCTTCATTGTTGTCGCTAGAGCC
AGAGTCAGCCGAACAGCTCCTTTGTCTAGACAAGGCGAAAGAAAGTTCGATGTTGTTGCT
TTCGTTGTAGATACGGTCTCTAAAAGTGACGCATCTAGCTTGTCCAATAGTGTGTGCACC
AGAGAGGGCGACCATGTCGCGTGAGGTTAAACCTTGTGCTCTAAAACGGTTG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2DY41JQ 521 0 0
ATCATGATCTCTGTTATATTATGTTTTTATTAATGTAGATGTATATTTAAACAGGTGACG
TAGAAAACACGTAAAAATGGTATAACACAAAACACGTAAGAGATTCAATTGGGTCTGCGA
CAGTTGTTACGGATCTCACCATTGGATCCAGTGAGTGGTTTGATATCGCCCATCTTAACC
ATAGCCCTTACGAAATCGCGGTAAAAGGCGTTCAGACTACGACTATAAGACACGACAAGC
GAGTCAGTTGAACCGCCGCTGTAAAGAACTTGGTCCGAGGTGAGTAGACCCCTGTGGTTG
AGAAGCTGTCTGTAGTAGTTGATGTCAAACCTTCCAGGGGAGTGAATATCAAGAGTGGCT
TCATTGTTGTCGCTAGAGCCAGAGTCAGCCGAACAGCTCCTTTGTCTAGACAAGGCGAAA
GAAAGTTCGATGTTGTTGCTTTCGTTGCAGATACGGTCTCTAAAAGTGACGCATCTAGCT
TGTCCAATAGTGTGTGCACCAGAGAGGGCGACCATGTCGCG

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 5

CO CL1490Contig1 700 5 3 U
GGACACAACTCACTAGCCGCTTCTAGCTAACTATGGCATCTCTTGTAGAGAAGCAACTCC
TTAAGTCCCTTTTCTCATTCTTACTGCTAGTTATACTCTTTTCCGATACTGTTTTTTCGT
CCCGCAAAACATTTGATCAGAGAAAGCCCTGCAAACATTTCTCCTTCTACTTTCATGACA
TCCTCTACGATGGTGACAATGTAGCAAACGCAACCTCAGCCGCCATCGTGAGCCCTCCAG
GATTAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATCTTTGATGGCCCTATAACAATGGACA
AGAACTATCTCTCAGAACCCCTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAAA
TGGACTTCAACGCGTGGTTTTGCTACACCTTGGTGTTTAACTCCACGCAACACAAAGGGA
CATTGAACATAATGGGTGCAGATTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTCG
GTGGGACCGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGGATCGCTACCTTCGTAACAGATATATTTC
AAGGGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATGTTAAACTCTATGAATGTTAGTAACTGA
TTATATGTGTTTTGCTTGTTAAAGTTTGTGTGTTGGTTGACAGTACACAGAGATAAAATG
TGTTACTAAGAATAAATTATGTTTCTTTTGTTTTTGTTTT


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR2BN46TF U 3
AF RR2AR13JQ C 1
AF RR2EG11JQ C 51
AF RR2EG11TF U 2
AF RR2AR13TF U 1
BS 1 4 RR2AR13JQ
BS 5 699 RR2EG11TF
BS 700 700 RR2AR13JQ

RD RR2BN46TF 656 0 0
GG
ACAACTCACTAGCCGCTTCTAGCTAACTATGGCATCTCTTGTAGAGAAGCAACTCCTTAA
GTCCCTTTTCTCATTCTTACTGCTAGTTATACTCTTTTCCGATACTGTTTTTTCGTCCCG
CAAAACATTTGATCAGAGAAAGCCCTGCAAACATTTCTCCTTCTACTTTCATGACATCCT
CTACGATGGTGACAATGTAGCAAACGCAACCTCAGCCGCCATCGTGAGCCCTCCAGGATT
ATGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATCTTTGATGGCCCTATAACAATGGACAAGAA
CTATCTCTCAGAACCCCAGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAAATGGA
CTTCAACGCGTGGTTTTGCTACACCTTGGTGTTTAACTCCACGCAACACAAAGGGACATT
GAACATAATGGGTGCAGATTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTCGGTGG
GACCGGTGATTTCTTCATTGCTCGTGGGATCGCTACCTTCGTAACAGATATATTTCAAGG
GGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATGTTAAACTCTATGAATGTTAGTAACTGATTAT
ATGTGTTTTGCTTGTTAAAGTTTGTGTGTTGGTTGACAGTACACAGAGATAAAA

QA 3 656 3 656
DS 

RD RR2AR13JQ 700 0 0
GGACACAACTCACTAGCCGCTTCTAGCTAACTATGGCATCTCTTGTAGAGAAGCAACTCC
TTAAGTCCCTTTTCTCATTCTTACTGCTAGTTATACTCTTTTCCGATACTGTTTTTTCGT
CCCGCAAAACATTTGATCAGAGAAAGCCCTGCAAACATTTCTCCTTCTACTTTCATGACA
TCCTCTACGATGGTGACAATGTAGCAAACGCAACCTCAGCCGCCATCGTGAGCCCTCCAG
GATTAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATCTTTGATGGCCCTATAACAATGGACA
AGAACTATCTCTCAGAACCCCTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAAA
TGGACTTCAACGCGTGGTTTTGCTACACCTTGGTGTTTAACTCCACGCAACACAAAGGGA
CATTGAACATAATGGGTGCAGATTTGATGATGGAGCCGACGAGAGATCTATCGGTCGTCG
GTGGGACCGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGGATCGCTACCTTCGTAACAGATATATTTC
AAGGGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATGTTAAACTCTATGAATGTTAGTAACTGA
TTATATGTGTTTTGCTTGTTAAAGTT*GTGTGTTGGTTGACAGTACACAGAGATAAAATG
TGTTACTAAGAATAAATTATGTTTCTTTTGTTTTTGTTTT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2EG11JQ 650 0 0
AAGCAACTCCTTAAGTCCCTTTTCTCATTCTTACTGCTAGTTATACTCTTTTCCGATACT
GTTTTTTCGTCCCGCAAAACATTTGATCAGAGAAAGCCCTGCAAACATTTCTCCTTCTAC
TTTCATGACATCCTCTACGATGGTGACAATGTAGCAAACGCAACCTCAGCCGCCATCGTG
AGCCCTCCAGGATTAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATCTTTGATGGCCCTATA
ACAATGGACAAGAACTATCTCTCAGAACCCCTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTTTAT
GACATGAAAATGGACTTCAACGCGTGGTTTTGCTACACCTTGGTGTTTAACTCCACGCAA
CACAAAGGGACATTGAACATAATGGGTGCAGATTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTA
TCGGTCGTCGGTGGGACCGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGGATCGCTACCTTCGTAACA
GATATATTTCAAGGGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATGTTAAACTCTATGAATGT
TAGTAACTGATTATATGTGTTTTGCTTGTTAAAGTTTGTGTGTTGGTTGACAGTACACAG
AGATAAAATGTGTTACTAAGAATAAATTATGTTTCTTTTGTTTTTGTTT
T

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2EG11TF 698 0 0
GAC
ACAACTCACTAGCCGCTTCTAGCTAACTATGGCATCTCTTGTAGAGAAGCAACTCCTTAA
GTCCCTTTTCTCATTCTTACTGCTAGTTATACTCTTTTCCGATACTGTTTTTTCGTCCCG
CAAAACATTTGATCAGAGAAAGCCCTGCAAACATTTCTCCTTCTACTTTCATGACATCCT
CTACGATGGTGACAATGTAGCAAACGCAACCTCAGCCGCCATCGTGAGCCCTCCAGGATT
AGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATCTTTGATGGCCCTATAACAATGGACAAGAA
CTATCTCTCAGAACCCCTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAAATGGA
CTTCAACGCGTGGTTTTGCTACACCTTGGTGTTTAACTCCACGCAACACAAAGGGACATT
GAACATAATGGGTGCAGATTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTCGGTGG
GACCGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGGATCGCTACCTTCGTAACAGATATATTTCAAGG
GGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATGTTAAACTCTATGAATGTTAGTAACTGATTAT
ATGTGTTTTGCTTGTTAAAGTTTGTGTGTTGGTTGACAGTACACAGAGATAAAATGTGTT
ACTAAGAATAAATTATGTTTCTTTTGTTTTTGTTT

QA 4 698 4 698
DS 

RD RR2AR13TF 700 0 0
GGAC
ACAACTCACTAGCCGCTTCTAGCTAACTATGGCATCTCTTGTAGAGAAGCAACTCCTTAA
GTCCCTTTTCTCATTCTTACTGCTAGTTATACTCTTTTCCGATACTGTTTTTTCGTCCCG
CAAAACATTTGATCAGAGAAAGCCCTGCAAACATTTCTCCTTCTACTTTCATGACATCCT
CTACGATGGTGACAATGTAGCAAACGCAACCTCAGCCGCCATCGTGAGCCCTCCAGGATT
AGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATCTTTGATGGCCCTATAACAATGGACAAGAA
CTATCTCTCAGAACCCCTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAAATGGA
CTTCAACGCGTGGTTTTGCTACACCTTGGTGTTTAACTCCACGCAACACAAAGGGACATT
GAACATAATGGGTGCAGATTTGATGATGGAGCCGACGAGAGATCTATCGGTCGTCGGTGG
GACCGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGGATCGCTACCTTCGTAACAGATATATTTCAAGG
GGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATGTTAAACTCTATGAATGTTAGTAACTGATTAT
ATGTGTTTTGCTTGTTAAAGTT*GTGTGTTGGTTGACAGTACACAGAGATAAAATGTGTT
ACTAAGAATAAATTATGTTTCTTTTGTTTTTGTTT
T

QA 5 699 5 699
DS 



AS 2 5

CO CL1491Contig1 571 3 16 U
GGAAACTATGATGCGCTTTGCTTTCTCAATTTGCTTTTAAATAAAGAAGTCTCTTAAGAA
GAAGAAAGGTTTTATAACGTCACAAAGGAAACAGTGATGAAAAATGATTCCCAACGCTTG
TATATTCTAATGTCAAATGATTTTCCGAATACGATTTGCAATTATTTGGATAAAGAGAGC
AAATTGTATGGGATGCTCTAAAATCTCTGATGAGGCAGTTTCAGTAAGTAGGAATTGATG
GGTCAACCTTGAGAGAATAGGCTTGTATTCCACCGGCTATATTGTACACACTCTTGAAGC
CCTGAGACTGCAGCCAGTTCGCAACCTGCAACGACCTGCCACCAACCTTACACAGGACGA
ATGTATCCTTCTCAGGGTTCAGCTTTGAAGTGATGTCTGGTGCCCAGGTTCCGAATTGGC
GGAACAAAAACACTTTAAATCCTGGCAAGGATGCTGTGGCTATCTCGTCAGGTTCTCTGA
CATCAATCAACTGAGCCTCGTCCATGAAAACTGGATCTTGCATTTTGGAATGCAGCTCCT
CCACCTGGATGTCTTTCACAGGTTCCCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF88JQ U 1
AF RR2FH16JQ U 179
AF RR2GU04JQB U 39
BS 1 67 RR2EF88JQ
BS 68 68 RR2GU04JQB
BS 69 80 RR2EF88JQ
BS 81 81 RR2GU04JQB
BS 82 200 RR2EF88JQ
BS 201 201 RR2GU04JQB
BS 202 210 RR2EF88JQ
BS 211 211 RR2GU04JQB
BS 212 279 RR2EF88JQ
BS 280 281 RR2GU04JQB
BS 282 352 RR2EF88JQ
BS 353 353 RR2GU04JQB
BS 354 379 RR2EF88JQ
BS 380 423 RR2GU04JQB
BS 424 424 RR2FH16JQ
BS 425 571 RR2GU04JQB

RD RR2EF88JQ 379 0 0
GGAAACTATGATGCGCTTTGCTTTCTCAATTTGCTTTTAAATAAAGAAGTCTCTTAAGAA
GAAGAAATGTTTTATAACGTTACAAAGGAAACAGTGATGAAAAATGATTCCCAACGCTTG
TATATTCTAATGTCAAATGATTTTCCGAATACGATTTGCAATTATTTGGATAAAGAGAGC
AAATTGTATGGGATGCTCTAGAATCTCTGACGAGGCAGTTTCAGTAAGTAGGAATTGATG
GGTCAACCTTGAGAGAATAGGCTTGTATTCCACCGGCTACGTTGTACACACTCTTGAAGC
CCTGAGACTGCAGCCAGTTCGCAACCTGCAACGACCTGCCACCAACCTTACATAGGACGA
ATGTATCCTTCTCAGGGTT

QA 1 379 1 379
DS 

RD RR2FH16JQ 315 0 0
GCAAATTGTATGGGATGCCCTAAAATCTCTGATGAGGCAGTTTCAGTAAGTAGGAATTGA
TGGGTCAACCTTGAAAAAATAGGCTTGTATTCCACCGGCTATATTGTACACACTCTTGAA
GCCCTGAAACTGCAGCCAGTTCGCAACCTGCAACGACCTGCCACCAACCTTACACAGGAC
GAATGTATCCTTCTCAGGGTTCAGCTTTGAAGTGATGTCTGGTGCCCAGGTTCCGAATTG
GCGGAACGGAAACACTTTAAATCCTGGCAAGGATGCTGTGGCTATCTCGTCAGGTTCTCT
GACATCAATCAACTG

QA 1 315 1 315
DS 

RD RR2GU04JQB 533 0 0
AAATAAAGAAGTCTCTTAAGAAGAAGAAAGGTTTTATAACGTCACAAAGGAAACAGTGAT
GAAAAATGATTCCCAACGCTTGTATATTCTAATGTCAAATGATTTTCCGAATACGATTTG
CAATTATTTGGATAAAGAGAGCAAATTGTATGGGATGCTCTAAAATCTCTGATGAGGCAG
TTTCAGTAAGTAGGAATTGATGGGTCAACCTTGAGAGAATAGGCTTGTATTCCACCGGCT
ATATTGTACACACTCTTGAAGCCCTGAGACTGCAGCCAGTTCGCAACCTGCAACGACCTG
CCACCAACCTTACACAGGACGAATGTATCCTTCTCAGGGTTCAGCTTTGAAGTGATGTCT
GGTGCCCAGGTTCCGAATTGGCGGAGCAAAAACACTTTAAATCCTGGCAAGGATGCTGTG
GCTATCTCGTCAGGTTCTCTGACATCAATCAACTGAGCCTCGTCCATGAAAACTGGATCT
TGCATTTTGGAATGCAGCTCCTCCACCTGGATGTCTTTCACAGGTTCCCTCTC

QA 1 533 1 533
DS 



CO CL1491Contig2 770 2 5 U
GGGAACTCGTTATTAGACCCAAAAATGTTTAGAATCACCGGCAATCTCTCTGCGGTATCA
TCTCCTGCGGCGTCGTCTTTCTCCGCCGCACTGAGACTCTCCATCTCCCACACTCTCGCT
CTCGCATCACCTCCTCCCCATCCCCGCCGCTTCTCGACGTTCTCTCGTTCATTTCTCGGC
ACACACATCTCTTCGCTCCGAGTCCGACCACGCGTTCCTTCCATGTACCCTATGAGACTC
TCTGGCTTCTCGTCTCTCAAAGCGAGAGCTTCGTTTAGCAGTGGGAGTAGTAGTAGTCAA
AGCAGAGAGATTCTGGTGCAGCATGTGCTTGTTAAGGAGGGTGACTCTGAGCTCTTTGCT
GAACTCCAGAAGCGAATCTTGGATGGAGAGGATATGAGTGATCTTGCAGCTGAGTACTCT
ATTTGTCCATCTAAAAAGGAGGGTGGTATACTTGGATGGGTTAAACTTGGTCAAATGGTA
CCAGAGTTTGAGGAAGCTGCGTTTAAAGCAGAGCCGAATCATGTAGTCAGGTGTAAAACC
CAGTTTGGCTGGCACTTGTTGCAAGTTCTATCTGAGAGGGAACCTGTGAAAGACATCCAG
GTGGAGGAGCTGCATTCCAAAATGCAAGATCCAGTTTTCATGGACGAGGCTCAGTTGATT
GATGTCAGAGAACCTGACGAGATAGCCACAGCATCCTTGCCAGGATTTAAAGTGTTTCCG
CTCCGCCAATTCGAACCTGGGCACCAGACATCACTTCAAAGCTGACCCTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH16TF U 1
AF RR2GU04TF U 1
BS 1 700 RR2FH16TF
BS 701 701 RR2GU04TF
BS 702 733 RR2FH16TF
BS 734 734 RR2GU04TF
BS 735 770 RR2FH16TF

RD RR2FH16TF 770 0 0
GGGAACTCGTTATTAGACCCAAAAATGTTTAGAATCACCGGCAATCTCTCTGCGGTATCA
TCTCCTGCGGCGTCGTCTTTCTCCGCCGCACTGAGACTCTCCATCTCCCACACTCTCGCT
CTCGCATCACCTCCTCCCCATCCCCGCCGCTTCTCGACGTTCTCTCGTTCATTTCTCGGC
ACACACATCTCTTCGCTCCGAGTCCGACCACGCGTTCCTTCCATGTACCCTATGAGACTC
TCTGGCTTCTCGTCTCTCAAAGCGAGAGCTTCGTTTAGCAGTGGGAGTAGTAGTAGTCAA
AGCAGAGAGATTCTGGTGCAGCATGTGCTTGTTAAGGAGGGTGACTCTGAGCTCTTTGCT
GAACTCCAGAAGCGAATCTTGGATGGAGAGGATATGAGTGATCTTGCAGCTGAGTACTCT
ATTTGTCCATCTAAAAAGGAGGGTGGTATACTTGGATGGGTTAAACTTGGTCAAATGGTA
CCAGAGTTTGAGGAAGCTGCGTTTAAAGCAGAGCCGAATCATGTAGTCAGGTGTAAAACC
CAGTTTGGCTGGCACTTGTTGCAAGTTCTATCTGAGAGGGAACCTGTGAAAGACATCCAG
GTGGAGGAGCTGCATTCCAAAATGCAAGATCCAGTTTTCATGGACGAGGCTCAGTTGATT
GATGTCAGAGAACCTGACGAGATAGCCACAGCATCCTTGC*AGGATTTAAAGTGTTTCCG
CTCCGCCAATTCGGACCTGGGCACCAGACATCACTTCAAAGCTGACCCTG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2GU04TF 755 0 0
GGGAACTCGTTATTAGACCCAAAAATGTTTAGAATCACCGGCAATCTCTCTGCGGTATCA
TCTCCTGCGGCGTCGTCTTTCTCCGCCGCACTGAGACTCTCCATCTCCCACACTCTCGCT
CTCGCATCACCTCCTCCCCATCCCCGCCGCTTCTCGACGTTCTCTCGTTCATTTCTCGGC
ACACACATCTCTTCGCTCCGAGTCCGACCACGCGTTCCTTCCATGTACCCTATGAGACTC
TCTGGCTTCTCGTCTCTCAAAGCGAGAGCTTCGTTTAGCAGTGGGAGTAGTAGTAGTCAA
AGCAGAGAGATTCTGGTGCAGCATGTGCTTGTTAAGGAGGGTGACTCTGAGCTCTTTGCT
TAACTCCAGAAGCGAATCTTGGATGGAGAGGATATGAGTGATCTTGCAGCTGAGTACTCT
ATTTGTCCATCTAAAAAGGAGGGTGGTATACTTGGATGGGTTAAACTTGGTCAAATGGTA
CCAGAGTTTGAGGAAGCTGCGTTTAAAGCAGAGCCGAATCATGTAGTCAGGTGTAAAACC
CAGTTTGGCTGGCACTTGTTGCAAGTTCTATCTGAGAGGGAACCTGTGAAAGACATCCAG
GTGGAGGAGCTGCATTCCAAAATGCAAGATCCAGTTTTCATGGACGAGGCTCAGTTGATT
GATGTCAGAGAACCTGACGAGATAGCCACAGCATCCTTGCCAGGATTTAAAGTGTT*CTG
CTCCGCCAAT*CGAACCTGGGCACCAGACATCACT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 5

CO CL1492Contig1 1441 5 15 U
GGATGTCTATCTGTATAATCCGGTTTTCGATTCGAAGCAAACACAGTATGAAGCTGAAAG
CTTTCTCCTGAATCTTGTCTTTGTATCCGTCTTTGTTCAAACTTCTTTTCTCCATGGAAG
CTGTGCTTCTCTGCTCAAAGGTCGTCCCTCTAAGGACGCCGTTGGAAGGAAACCGAAAGT
TTTCGTTCAGGCATTTAAACAAACACCTTAAGTGCAATTCTCTTCCTGCCACTTCCAGAA
ACGCTCCGTTACTCCGCAGCTTTGAGGCCATTAAGGGTCCGTCTAGCTTGAGATATCCTC
CGTCCCCAGTGAGAAAAGGTTTGTCTTTTCTGCCCAGATGCTCGATTTCCACATCGACCG
TTTCCGATTCCGACAACCCTTTCCTCAGCAAGTTCCGACAGCTTCTCGATAAAGTCTCTC
AGCTGAAAGTGAAGCCCTTTGATGCCGTCAAGTTAACTCTTGTACTATCAATCGCGACTC
TGGCCGCGAAAAAGATTGTGACTTTGGCCTTGAACCCATTCTTCTGGATGTATTTCAGCT
GGACGTGGCTCTTCTGGCCTTGGTTTATCGCCTTGGGTCTCGCGGGCTACGGTCTTTACT
GCTTCCGTAAGCATTTGCTAGGCGAAGCCAACGCCTTTGAGCAGCTTGGCGTCGTAACTT
CACTCTTCACGTGGCTTACACTCGTCCCTCCTGCTTACTTCAACGGCTATCTCCAAGGCT
GGCCCTTTGTCTTCTTCTTGGCTTACCATTACTTCTTCTTCTTCAACGTAAGCGTGAGGA
AACGCCTCTATGGAGACTACTACGCACGCACTCATGATCCCAAATGGGACGTGGAGACGC
CTCTGTGGTCTCGTGTTTTGTTCGGTGTTGGCGTCGTGGTTGGACACTGGCTCGCGGCTT
TCGAAGGCCCCGAGCTCCACCGTTTACCTGGTGGTTGGGCTAATGTAGGGATATGGGGTT
TGATTGTGGTTACAATGCTTATGCATTACGATTCGACGCTGTATCTAGCTAGGTATTCAG
AAAAAGTTGTTGTTCCCACGGATGTTGTGCAGTTTGGTCCTTATAGGTGGATCAGGCATC
CGATATATGCGTCTACGATGCTTCTTTTCGCGACCTACTGCACCACGCTGCGTGCGCCTT
TGAGCCTGTTGTTTCTTGTGGCGGTTTGTTTGGTTTACTACAGCAAGAAGGCGAAGCTGG
AGGAGGAATTGATGGTGGAGAGCTTCGGGGAAAGGTATTTGGATTATGCTGGTAAGGTTA
GGCACAAGTTCATTCCTTTTGTTTACTAGTGCGTTAGAGGGAGAACATGTGTTGTCGTGT
CTAAATTATTATCTGGTATCTATCTATCAGTCAAAGATGCATGAGTTGGATTGTTCCATT
TTTATGTGGAAATGTTAGGCATGTGAAAAGGATATGCTGTTATGTTATTTGCGACTCTCC
C


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2E861TF U 3
AF RR2B719TF U 1
AF RR2GU32TF U 75
AF RR2B719JQ C 576
AF RR2GU32JQB C 753
BS 1 132 RR2B719TF
BS 133 133 RR2E861TF
BS 134 861 RR2B719TF
BS 862 862 RR2B719JQ
BS 863 876 RR2B719TF
BS 877 1092 RR2B719JQ
BS 1093 1093 RR2GU32JQB
BS 1094 1207 RR2B719JQ
BS 1208 1208 RR2GU32JQB
BS 1209 1210 RR2B719JQ
BS 1211 1211 RR2GU32JQB
BS 1212 1359 RR2B719JQ
BS 1360 1360 RR2GU32JQB
BS 1361 1408 RR2B719JQ
BS 1409 1441 RR2GU32JQB

RD RR2E861TF 591 0 0
GG
GTCTATCTGTTTAATCCGGTTTTCGATTCGAAGCGAACACAGTATGAAGCTGAAAGCTTT
CTCCTGAATCTTGTCTTTGTATCCGTCTTTGTTCAAACTTCTTTTCTCCATGGAAGCTGT
GCTTCTCTGCTCAAAGGTCGTCCCTCTAAGGACGCCGTTGGAAGGAAACCGAAAGTTTTC
GTTCAGGCATTTAAACAAACACCTTAGGTGCAATTCTCTTCCTGCTACTTCCAGAAACGC
TCCGTTACTCCGAAGCTTTGAAGCCATCAAGGGTCCGTCTAGCCTGAGATATCCTCCGTC
CCCAGTGAGAAAAGGTTTGTCCTTTCCGCCCAGATGCTCGATTTCCACCTCAACCGTTTC
CGATTCCGACAACCCTTTCCTTATCAAGTTCCGACAGCTTCTCGATAAAGTCTCTCAGCT
GAAATTGAAGCCCTTTGATGCCGTCAAGTTAACTCTTGTACTATCAATCGCGACTCTGGC
CGCGAAAAAGATTGTGACTTTGGCCTTAAACCCATTCTTCTGGATGTATTTCAGCTGGGC
TTGGCTCTTCTGGCCTTGGTTTATCGCCTTGGGTCTCGCGGGCTACGGT

QA 3 591 3 591
DS 

RD RR2B719TF 876 0 0
GGATGTCTATCTGTATAATCCGGTTTTCGATTCGAAGCAAACACAGTATGAAGCTGAAAG
CTTTCTCCTGAATCTTGTCTTTGTATCCGTCTTTGTTCAAACTTCTTTTCTCCATGGAAG
CTGTGCTTCTCTACTCAAAGGTCGTCCCTCTAAGGACGCCGTTGGAAGGAAACCGAAAGT
TTTCGTTCAGGCATTTAAACAAACACCTTAAGTGCAATTCTCTTCCTGCCACTTCCAGAA
ACGCTCCGTTACTCCGCAGCTTTGAGGCCATTAAGGGTCCGTCTAGCTTGAGATATCCTC
CGTCCCCAGTGAGAAAAGGTTTGTCTTTTCTGCCCAGATGCTCGATTTCCACATCGACCG
TTTCCGATTCCGACAACCCTTTCCTCAGCAAGTTCCGACAGCTTCTCGATAAAGTCTCTC
AGCTGAAAGTGAAGCCCTTTGATGCCGTCAAGTTAACTCTTGTACTATCAATCGCGACTC
TGGCCGCGAAAAAGATTGTGACTTTGGCCTTGAACCCATTCTTCTGGATGTATTTCAGCT
GGACGTGGCTCTTCTGGCCTTGGTTTATCGCCTTGGGTCTCGCGGGCTACGGTCTTTACT
GCTTCCGTAAGCATTTGCTAGGCGAAGCCAACGCCTTTGAGCAGCTTGGCGTCGTAACTT
CACTCTTCACGTGGCTTACACTCGTCCCTCCTGCTTACTTCAACGGCTATCTCCAAGGCT
GGCCCTTTGTCTTCTTCTTGGCTTACCATTACTTCTTCTTCTTCAACGTAAGCGTGAGGA
AACGCCTCTATGGAGACTACTACGCACGCACTCATGATCCCAAATGGGACGTGGAGACGC
CTCTGTGGTCTCGTGTTTTGT*CGGTGTTGGCGTCG

QA 1 876 1 876
DS 

RD RR2GU32TF 782 0 0
GG
GTCTTTGTATCCGTCTTTGTTCAAACTTCTTTTCTCCATGGAAGCTGTGCTTCTCTGCTC
AAAGGTCGTCCCTCTAAGGACGCCGTTGGAAGGAAACCGAAAGTTTTCGTTCAGGCATTT
AAACAAACACCTTAAGCGCAATTCTCTTCCTGCCACTTCCAGAAACGCTCCGTTACTCCG
CAGCTTTGAGGCCATTAAGGGTCCGTCTAGCTTGAGATATCCTCCGTCCCCAGTGAGAAA
AGGTTTGTCTTTTCTGCCCAGATGCTCGATTTCCACATCGACCGTTTCCGATTCCGACAA
CCCTTTCCTCAGCAAGTTCCGACAGCTTCTCAATAAAGTCTCTCAGCTGAAAGTGAAGCC
CTTTGACGCCGTCAAGTTAACTCTTGTACTATCAATCGCGACTCTGGCCGCGAAAAAGAT
TGTGACTTTGGCCTTGAACCCATTCTTCGGGATGTATTTCAGCTGGACGTGGCTCTTCTG
GCCTTGGTTTATCGCCTTGGGTCTCGCGGGCTACGGTCTTTACTGCTTCCGTAAGCATTT
GCTAGGCGAAGCCAACGCCTTTGAGCAGCTTGGCGTCGTAACTTCACTCTTCACGTGGCA
TACACTCGTCCCTCCTGCTTACTTCAACGGCTATCTCCAAAGCTGGCCCTTTGTCTTCTT
CTTGGCTTACCATTACTTCTTCTTCTTCAACGTAAGCGTGAGGAAACGCCTCTATGGAGA
CTACTACGCACGCACTCATGATCCCAAATGGGACGTG*AGACGCCTCTGTGGTCTCGTGT

QA 3 782 3 782
DS 

RD RR2B719JQ 834 0 0
GGTCTCGCGGGCTACGGTCTTTACTGCTTCCGTAAGCATTTGCTAGGCGAAGCCAACGCC
TTTGAGCAGCTTGGCGTCGTAACTTCACTCTTCACGTGGCTTACACTCGTCCCTCCTGCT
TACTTCAACGGCTATCTCCAAGGCTGGCCCTTTGTCTTCTTCTTGGCTTACCATTACTTC
TTCTTCTTCAACGTAAGCGTGAGGAAACGCCTCTATGGAGACTACTACGCACGCACTCAT
GATCCCAAATGGGACGTGGAGACGCCTCTGTGGTCTCGTGTTTTGTTCGGTGTTGGCGTC
GTGGTTGGACACTGGCTCGCGGCTTTCGAAGGCCCCGAGCTCCACCGTTTACCTGGTGGT
TGGGCTAATGTAGGGATATGGGGTTTGATTGTGGTTACAATGCTTATGCATTACGATTCG
ACGCTGTATCTAGCTAGGTATTCAGAAAAAGTTGTTGTTCCCACGGATGTTGTGCAGTTT
GGTCCTTATAGGTGGATCAGGCATCCGATATATGCGTTTACGATGCTTCTTTTCGCGACC
TACTGCACCACGCTGCGTGCGCCTTTGAGCCTGTTGTTTCTTGTGGCGGTTTGTTTGGTT
TACTACAGCAAGAAGGCGAAGCTGGAGGAGGAGTTTATGGTGGAGAGCTTCGGGGAAAGG
TATTTGGATTATGCTGGTAAGGTTAGGCACAAGTTCATTCCTTTTGTTTACTAGTGCGTT
AGAGGGAGAACATGTGTTGTCGTGTCTAAATTATTATCTGGTATCTATCTATCAGTCAAA
GATGTATGAGTTGGATTGTTCCATTTTTATGTGGAAATGTTAGGCATGTGAAA
G

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2GU32JQB 689 0 0
TTCTTCTTCTTCAACGTAAGCGTGAGGAAACGCCTCTATGGAGACTACTACGCACGCACT
CATGATCCCAAATGGGACGTGGAGACGCCTCTGTGGTCTCGTGTTTTGTTCGGTGTCGGC
GTCGTGGTTGGACACTGGCTCGCGGCTTTCGAAGGCCCCGAGCTCCACCGTTTACCTGGT
GGTTGGGCTAATGTAGGGATATGGGGTTTGATTGTGGTTACAATGCTTATGCATTACGAT
TCGACGCTGTATCTAGCTAGGTATTCAGAAAAAGTTGTTGTTCCCACGGATGTTGTGCAG
TTTGGTCCTTATAGGTGGATCAGGCATCCGATATATGCGTCTACGATGCTTCTTTTCGCG
CCCTACTGCACCACGCTGCGTGCGCCTTTGAGCCTGTTGTTTCTTGTGGCGGTTTGTTTG
GTTTACTACAGCAAGAAGGCGAAGCTGGAGGAGGAATTGATGGTGGAGAGCTTCGGGGAA
AGGTATTTGGATTATGCTGGTAAGGTTAGGCACAAGTTCATTCCTTTTGTTTACTAGTGC
GTTAGAGGGAGAACATGTGTTGTTGTGTCTAAATTATTATCTGGTATCTATCTATCAGTC
AAAGATGCATGAGTTGGATTGTTCCATTTTTATGTGGAAATGTTAGGCATGTGAAAAGGA
TATGCTGTTATGTTATTTGCGACTCTCCC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 2 5

CO CL1493Contig1 762 2 6 U
AGGCACATCTGTATCTATCTCTCTCTTTCTAGAGCTGGAGTGAACTGTTGAGCCCTTTGG
TTTCATCGAGAGACCCCTAAAACCCGATCTAGGTGAAGAATGGCGTCTTCTTCTTCGTTC
TCCCTCACCTCTCCGGCTGCTTCCGTCTATGGAGCTGCCACTCGAAACTCCTCGCAGTTA
CCTCTCCCAACCACTCGCTCTCGCCTCCCTCGCAGAGTTTCCTTCCGTCTCTCCTCCGCC
AAGCCTAAGCTTCGCTTTCTCTCCAAGCCTACTCGCAGTAGCTACCCTGTAGTGAAAGCC
CTTTCTAACCAGGTTGGTGGAGGTGCATCATCAAATGCTTCAGCTCCTGCAAAACTTGAG
GGGCCATCAAGTGAAGAAAAGGATACAAACTCATCAAAAGACTCTTCTTCACCTGAATTA
GCTACAGAGGAGTCTATCTCTGAATTCCTGACCCAAGTCACAACTCTTGTCAAGCTTGTG
GATTCTAGAGACATTGTCGAGTTGCAGCTGAAACAACTCGACTGTGAACTTGTCATCCAG
AAAAAGGAAGCCTTACCTCAACCACAAGCCCCTGCGCCCTACGTTATGATGCAGCAACCA
AACCAACCATCTTATGTGCAAGCAACGGCTCCTCCTCCTTCTGCTCCTGCTGCCTCACCT
CCACCTTCCTCTACTCCAGCCTCTTTGCCCGCACCATCCCCACCTACTCCAGCGAAATCA
TCGCTTCCTACTGTTAAAGTCCCATGGCAGCACATTTTACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AU60TF U 1
AF RR2G016TF U 61
BS 1 290 RR2AU60TF
BS 291 291 RR2G016TF
BS 292 538 RR2AU60TF
BS 539 539 RR2G016TF
BS 540 728 RR2AU60TF
BS 729 762 RR2G016TF

RD RR2AU60TF 730 0 0
AGGCACATCTGTATCTATCTCTCTCTTTCTAGAGCTGGAGTGAACTGTTGAGCCCTTTGG
TTTCATCGAGAGACCCCTAAAACCCGATCTAGGTGAAGAATGGCGTCTTCTTCTTCGTTC
TCCCTCACCTCTCCGGCTGCTTCCGTCTATGGAGCTGCCACTCGAAACTCCTCGCAGTTA
CCTCTCCCAACCACTCGCTCTCGCCTCCCTCGCAGAGTTTCCTTCCGTCTCTCCTCCGCC
AAGCCTAAGCTTCGCTTTCTCTCCAAGCCTACTCGCAGTAGCTACCCTGTGGTGAAAGCC
CTTTCTAACCAGGTTGGTGGAGGTGCATCATCAAATGCTTCAGCTCCTGCAAAACTTGAG
GGGCCATCAAGTGAAGAAAAGGATACAAACTCATCAAAAGACTCTTCTTCACCTGAATTA
GCTACAGAGGAGTCTATCTCTGAATTCCTGACCCAAGTCACAACTCTTGTCAAGCTTGTG
GATTCTAGAGACATTGTCGAGTTGCAGCTGAAACAACTCGACTGTGAACTTGTCATCCGG
AAAAAGGAAGCCTTACCTCAACCACAAGCCCCTGCGCCCTACGTTATGATGCAGCAACCA
AACCAACCATCTTATGTGCAAGCAACGGCTCCTCCTCCTTCTGCTCCTGCTGCCTCACCT
CCACCTTCCTCTACTCCAGCCTCTTTGCCCGCACCATCCCCACCTACTCCAGCGAAATCA
TCGCTTCC
TA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2G016TF 702 0 0
TTTCATCGAGAGACCCCTAAAACCCGATCTAGGTGAAGAATGGCGTCTTCTTCTTCGTTC
TCCCTCACCTCTCCGGCTGCTTCCGTCTATGGAGCTGCCACTCGAAACTCCTCGCAGTTA
CCTCTCCCAACCACTCGCTCTCGCCTCCCTCGCAGAGTTTCCTTCCGTCTCTCCTCCGCC
AAGCCTAAGCTTCGCTTTCTCTCCAAGCCTACTCGCAGTAGCTACCCTGTAGTGAAAGCC
CTTTCTAACCAGGTTGGTGGAGGTGCATCATCAAATGCTTCAGCTCCTGCAAAACTTGAG
GGGCCATCAAGTGAAGAAAAGGATACAAACTCATCAAAAGACTCTTCTTCACCTGAATTA
GCTACAGAGGAGTCTATCTCTGAATTCCTGACCCAAGTCACAACTCTTGTCAAGCTTGTG
GATTCTAGAGACATTGTCGAGTTGCAGCTGAAACAACTCGACTGTGAACTTGTCATCCAG
AAAAAGGAAGCCTTACCTCAACCACAAGCCCCTGCGCCCTACGTTATGATGCAGCAACCA
AACCAACCATCTTATGTGCAAGCAACGGCTCCTCCTCCTTCTGCTCCTGCTGCCTCACCT
CCACCTTCCTCTACTCCAGCCTCTTTGCCCGCACCATCCCCACCTACTCCAGCGAAATCA
TCGCTTCCTACTGTTAAAGTCCCATGGCAGCACATTTTACCG

QA 1 702 1 702
DS 



CO CL1493Contig2 1172 3 9 U
TAAAACAGAACCAAGAATGTGCGTGTGTATAAGAAAGAAATAAAACAGAGTCTCATCTTT
TTTTCTTTTTCTTTTTTGTTTAACCAATAGAAACTAAAAACTCTTTCTTCCTCCTCACAA
AAAAAAAACTAGAAAGTTTGACAGTAACAATGAAGAAGACATTCGTAAAACTCAAGAAAA
CAGTAAAACCAAAGCAGAAAGATTGAATTAAAGTAGCCACGTTTATCCGTTTCTCATGGT
GTCGATTCTACGGTTGAACCACAAACAGAGGAGTGTCGAGGCTAACAGGCTTGCCGTCTT
CTGCAACGATATCCACTACGGTACCGGTTTGATCAGACTCTATTTCATTCATTAACTTCA
TGGCTTCGACGATGCATAGAACTTGCCCCTTCTGCACTTTGTCTCCAACCTTGATAAAAG
GTGGTTCACCAGGTCCTGGACTGCGGTAGAATGTGCCTGCCATGGGACTTTTAACAGTTG
GAAGCGATGATTTGGCTGGAGTAGGCGGGGATGGTGGAGGCAAAGAGGCTGGGGTAGAAG
AAGGTGGAGGTGAGGCAGCAGGTGCAGAAGGAGGAGGAGCCGTTGCTTGCACATAAGATT
GTTGGTTTGGTTGCTGCATCATAACATAGGGCGCAGGGGCTTGTGCCTGAGGTAAGGCTT
CCTTTTTCCGGATGACAAGTTCACAGTCGAGTTGTTTCAGCTGCAACTCGACAATGTCTC
TGGAATCCACAAGCTTGACGAGAGTTGTGACTTGGGTCAGGAACTCAGAGATAGACTCCT
CTGTAGCTAAATCAGGTGACGAAGAGTCTTTTGATGAGTTTGTAGCCTTTCCTTCAGCTG
AAGGCCCATCAACTTTTGCAGGAGCTGAAGCATTTGATGATGCACCTCCACCAACCTGGT
TAGAAAGGGCTTTCACCACAGGATGGCTACTACGAGTAGGCTTGGAGAGAAAGCGAAGCT
TAGGCTTGGCGGAGGAGAGACGGAAGGAAACTCTGCGAGGGAGGCGAGAGCGAGTGGTTG
GGAGAGGTAACTGCGACGAGGTTTGAGTGGCGGCTCCATAGACGGAAGCAGCCGGAGAGG
TGAGGGAGAACGAAGAAGAAGATGCCATTCTTCAGCTAGATCGGGTTTAGGGGTCTCTCG
ATGAAACCAAAGGGCTCAACAGTTCACTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G016JQ U 1
AF RR2GB71JQ U 96
AF RR2GB71TF C 501
BS 1 224 RR2G016JQ
BS 225 225 RR2GB71JQ
BS 226 364 RR2G016JQ
BS 365 760 RR2GB71JQ
BS 761 761 RR2GB71TF
BS 762 795 RR2GB71JQ
BS 796 796 RR2GB71TF
BS 797 824 RR2GB71JQ
BS 825 1172 RR2GB71TF

RD RR2G016JQ 364 0 0
TAAAACAGAACCAAGAATGTGCGTGTGTATAAGAAAGAAATAAAACAGAGTCTCATCTTT
TTTTCTTTTTCTTTTTTGTTTAACCAATAGAAACTAAAAACTCTTTCTTCCTCCTCACAA
AAAAAAAACTAGAAAGTTTGACAGTAACAATGAAGAAGACATTCGTAAAACTCAAGAAAA
CAGTAAAACCAAAGCAGAAAGATTGAATTAAAGTAGCCACGTTTCTCCGTTTCTCATGGT
GTCGATTCTACGGTTGAACCACAAACAGAGGAGTGTCGAGGCTAACAGGCTTGCCGTCTT
CTGCAACGATATCCACTACGGTACCGGTTTGATCAGACTCTATTTCATTCATTAACTTCA
TGGC

QA 1 364 1 364
DS 

RD RR2GB71JQ 729 0 0
AAAAACTCTTTCTTCCTCCTCACAAAAAAAAA*CTAGAGAGTTTGACAGTAACAATGAAG
AAGACATTCGTAAAACTCAAGAAAACAGTATTACCAAAGCAGAGAGATTGAATTAAAGTA
GCCACGTTTATCCGTTTCTCATGGTGTCGATTCTATGGTTGAACCACAAACAGAGGAGTG
TCGAGGCTAACAGGCTTGCCGTCTTCTGCAACGATATCCACTACGGTACCGGTTTGATCA
GACTCTATTTCATTCATTAACTTCATGGCTTCGACGATGCATAGAACTTGCCCCTTCTGC
ACTTTGTCTCCAACCTTGATAAAAGGTGGTTCACCAGGTCCTGGACTGCGGTAGAATGTG
CCTGCCATGGGACTTTTAACAGTTGGAAGCGATGATTTGGCTGGAGTAGGCGGGGATGGT
GGAGGCAAAGAGGCTGGGGTAGAAGAAGGTGGAGGTGAGGCAGCAGGTGCAGAAGGAGGA
GGAGCCGTTGCTTGCACATAAGATTGTTGGTTTGGTTGCTGCATCATAACATAGGGCGCA
GGGGCTTGTGCCTGAGGTAAGGCTTCCTTTTTCCGGATGACAAGTTCACAGTCGAGTTGT
TTCAGCTGCAACTCGACAATGTCTCTGGAATCCACAAGCTTGACGAGAGTTGTGACTTGG
GTCAG*AACTCAGAGATAGACTCCTCTGTAGCTAAATCAG*TGACGAAGAGTCTTTTGAT
GAGTTTGTA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2GB71TF 672 0 0
GTAGGCGGGGATGGTGGAGGCAAAGAGGCTGGGGTAGAAGAAGGTGGAGGTGAGGCAGCA
GGTGCAGAAGGAGGAGGAGCCGTTGCTTGCACATAAGATTGTTGGTTTGGTTGCTGCATC
ATAACATAGGGCGCAGGGGCTTGTGCCTGAGGTAAGGCTTCCTTTTTCCGGATGACAAGT
TCACAGTCGAGTTGTTTCAGCTGCAACTCGACAATGTCTCTGGAATCCACAAGCTTGACG
AGAGTTGTGACTTGGGTCAGGAACTCAGAGATAGACTCCTCTGTAGCTAAATCAGGTGAC
GAAGAGTCTTTTGATGAGTTTGTAGCCTTTCCTTCAGCTGAAGGCCCATCAACTTTTGCA
GGAGCTGAAGCATTTGATGATGCACCTCCACCAACCTGGTTAGAAAGGGCTTTCACCACA
GGATGGCTACTACGAGTAGGCTTGGAGAGAAAGCGAAGCTTAGGCTTGGCGGAGGAGAGA
CGGAAGGAAACTCTGCGAGGGAGGCGAGAGCGAGTGGTTGGGAGAGGTAACTGCGACGAG
GTTTGAGTGGCGGCTCCATAGACGGAAGCAGCCGGAGAGGTGAGGGAGAACGAAGAAGAA
GATGCCATTCTTCAGCTAGATCGGGTTTAGGGGTCTCTCGATGAAACCAAAGGGCTCAAC
AGTTCACTCCCC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 6

CO CL1494Contig1 683 6 10 U
GGAACCAATACTTCTCTCTCAGTACTCATCTTTTAGAAACTCAAACCAAAAGAAACCAAA
CTAGTTTGAGTAGATCTAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTAACAAAACAGAAATGGCTAAGTC
ATATGGAGCTCTCTTCCTCCTGGCCCTCGTTGTCTTCTCCTTGCTCCAAACCATGGTTAT
GGCCTCAAAGGGATCTGGAGGGAATTGGAACCCAAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTAAA
ACGTTCCCAATGCCCGAAGGAGTGCGATAGGAGGTGTAGCCAAACACAGTACCACAACGC
GTGCATTTTATTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAATGTTTGTGTGTGCCTCCGGGTTACTA
TGGGAACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAAGGTGGACCAAA
ATGCCCTTGAAAACATCCCAATCGTTTTAATATTATCGGTTCCTTTTTATAATTAAAGTT
TTCGATGATATTTATATTTCACTTTGATCCAACTGTTGGTTTTGTGTTTCTTGTTCTATC
TATTTTATTCCTAATGTTGTAATGCTATGCCACTCCTTTGGGACTT****TGTTCTAAAT
CCCTTAAAATATGAGAGTGGCCTATAAATGAATGATATTTTCATAAATAATAATTTGTTT
TAAACTCTTCACAAACAAAATAC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR81TF U 2
AF RR2E067TF U 1
AF RR2ES72TF U 1
AF RR2E067JQ C 222
AF RR2G207JQ C 1
AF RR2G207TF U 262
BS 1 46 RR2E067TF
BS 47 47 RR2ES72TF
BS 48 106 RR2E067TF
BS 107 107 RR2ES72TF
BS 108 139 RR2E067TF
BS 140 140 RR2ES72TF
BS 141 586 RR2E067TF
BS 587 590 RR2ES72TF
BS 591 643 RR2E067TF
BS 644 683 RR2G207TF

RD RR2CR81TF 593 0 0
GAACCAATACTTCTCTCTCAGTACTCATCTTTTAGAAACTCAAACAAAAAGAAACCAAAC
TAGTTTGAGTAGATCTAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTAACAAAACAAAAATGGCTAAGTCA
TATGGAGCTCTCTTCCTCTTGGCCCTCGTTGTCTTCTCCTTGCTCCAAACCATGGTTATG
GCCTCAAAGGGATCTGGAGGGAATTGGAACCCAAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTAAAA
CGTTCCCAATGCCCGAAGGAGTGCGATAGGAGGTGTAGCCAAACACAGTACCACAACGCG
TGCATTTTATTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAATGTTTGTGTGTGCCTCCGGGTTACTAT
GGGAACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAAGGTGGACCAAAA
TGCCCTTGAAAACATCCCAATCGTTTTAATATTATCGGTTCCTTTTTATAATTAAAGTTT
TCGATGATATTTATATTTCACTTTGATCCAACTGTTGGTTTTGTGTTTCTTGTTCTATCT
ATTTTATTCCTAATGTTGTAATGCTATGCCACTCCTTTGGGACTT
AATTTGTT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2E067TF 644 0 0
GGAACCAATACTTCTCTCTCAGTACTCATCTTTTAGAAACTCAAACAAAAAGAAACCAAA
CTAGTTTGAGTAGATCTAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTAACAAAACAAAAATGGCTAAGTC
ATATGGAGCTCTCTTCCTCTTGGCCCTCGTTGTCTTCTCCTTGCTCCAAACCATGGTTAT
GGCCTCAAAGGGATCTGGAGGGAATTGGAACCCAAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTAAA
ACGTTCCCAATGCCCGAAGGAGTGCGATAGGAGGTGTAGCCAAACACAGTACCACAACGC
GTGCATTTTATTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAATGTTTGTGTGTGCCTCCGGGTTACTA
TGGGAACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAAGGTGGACCAAA
ATGCCCTTGAAAACATCCCAATCGTTTTAATATTATCGGTTCCTTTTTATAATTAAAGTT
TTCGATGATATTTATATTTCACTTTGATCCAACTGTTGGTTTTGTGTTTCTTGTTCTATC
TATTTTATTCCTAATGTTGTAATGCTATGCCACTCCTTTGGGACTTAATTTGTTCTAAAT
CCCTTAAAATATGAGAGTGGCCTATAAATGAATGATATTTTCA
C

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2ES72TF 641 0 0
G
GAACCAATACTTCTCTCTCAGTACTCATCTTTTAGAAACTCAAACCAAAAGAAACCAAAC
TAGTTTGAGTAGATCTAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTAACAAAACAGAAATGGCTAAGTCA
TATGGAGCTCTCTTCCTCCTGGCCCTCGTTGTCTTCTCCTTGCTCCAAACCATGGTTATG
GCCTCAAAGGGATCTGGAGGGAATTGGAACCCAAA*CGTTATGGACCAGGAAGCCTAAAA
CGTTCCCAATGCCCGAAGGAGTGCGATAG*AGGTGTAGCCAAACACAGTACCACAACGCG
TGCATTTTATTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAATGTTTGTGTGTGCCTCCGGGTTACTAT
GGGAACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAATAAGGTGGACCAAAA
TGCCCTTGAAAACATCCCAATCGTTTTAATATTATCGGTTCCTTTTTATAATTAAAGTTT
TCGATGATATTTATATTTCACTTTGATCCAACTGTTGGTTTTGTGTTTCTTGTTCTATCT
ATTTTATTCCTAATGTTGTAATGTTATGCCACTCCTTTGGGACTT****TGTTCTAAATC
CCTTAAAATATGAGAGTGGCCTATAAATGAATGATATTTT

QA 2 641 2 641
DS 

RD RR2E067JQ 423 0 0
ATGGACCAGGAAGCCTAAAACGTTCCCAATGCCCGAAGGAGTGCGATAGGAGGTGTAGCC
AAACACAGTACCACAACGCGTGCATTTTATTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAATGTTTGT
GTGTGCCTCCGGGTTACTATGGGAACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAA
CTCAACAAGGTGGACCAAAATGCCCTTGAAAACATCCCAATCGTTTTAATATTATCGGTT
CCTTTTTATAATTAAAGTTTTCGATGATATTTATATTTCACTTTGATCCAACTGTTGGTT
TTGTGTTTCTTGTTCTATCTATTTTATTCCTAATGTTGTAATGCTATGCCACTCCTTTGG
GACTTAATTTGTTCTAAATCCCTTAAAATATGAGAGTGGCCTATAAATGAATGATATTTT
CA
C

QA 1 422 1 422
DS 

RD RR2G207JQ 672 0 0
G
GAACCAATACTTCTCTCTCAGTACTCATCTTTTAGAAACTCAAACCAAAAGAAACCAAAC
TAGTTTGAGTAGATCTAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTAACAAAACAGAAATGGCTAAGTCA
TATGGAGCTCTCTTCCTCCTGGCCCTCGTTGTCTTCTCCTTGCTCCAAACCATGGTTATG
GCCTCAAAGGGATCTGGAGGGAATTGGAACCCAAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTAAAT
CGTTCCCAATGCCCGAAGGAGTGCGATAGGAGGTGTAGCCAAACACAGTACCACAACGCG
TGCATTTTATTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAATGTTTGTGTGTGCCTCCGGGTTACTAT
GGGAACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAAGGTGGACCAAAA
TGCCCTTGAAAACATCCCAATCGTTTTAATATTATCGGTTCCTTTTTATAATTAAAGTTT
TCGATGATATTTATATTTCACTTTGATCCAACTGTTGGTTTTGTGTTTCTTGTTCTATCT
ATTTTATTCCTAATGTTGTAATGTTATGCCACTCCTTTGGGACTT****TGTTCTAAATC
CCTTAAAATATGAGAGTGGCCTATAAATGAATGATATTTTCATAAATAATAATTTGTTTT
AAACTCTTCAC

QA 2 672 2 672
DS 

RD RR2G207TF 422 0 0
GTGCGATAGGAGGTGTAGCCAAACACAGTACCACAACGCGTGCATTTTATTCTGCAACAA
ATGCTGCAGAAAATGTTTGTGTGTGCCTCCGGGTTACTATGGGAACAAACAAGTTTGCTC
TTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAAGGTGGACCAAAATGCCCTTGAAAACATCCCAA
TCGTTTTAATATTATCGGTTCCTTTTTATAATTAAAGTTTTCGATGAAATTTATATTTCA
CTTTGATCCAACTGGTGGTTTTGTGTTTCTTGTTCTATCTATTTTATTCCTAATGTTGTA
ATGTTATGCCACTCCTTTGGGACTT****TGTTCTAAATCCCTTAAAATATGAGAGTGGC
CTATAAATGAATGATATTTTCATAAATAATAATTTGTTTTAAACTCTTCACAAACAAAAT
AC

QA 1 422 1 422
DS 



AS 1 6

CO CL1495Contig1 1366 6 15 U
GGATCAGATCAGAGAGGAATCACAAAGTTTAGGTATCTCATTTAAAACTCGTTTGCGATC
TCTCTCAGGCAAGGAAGCAAATGGCGGCGGCGGCAAGTGAGATACAGAACGGATCAAAGG
CTCCTCCTTTGCCTTCTCCTCTCCGCAACTCCAAGTTTCTCCAGTCGAATATGAGGATCT
TGATATCGGGAGGAGCAGGGTTCATCGGTTCGCACTCGGTTGATAACCTAATGGAAAATG
AGAAGAATGAGGTTGTGGTTGCTGATAATTATTTCACTGGCTCTAAAGATAACCTCAAGA
AGCGGATCGGTCACCCCAGGTTTGAGCTTATTCGTCACGATGTTACGGAGCCTCTATTGC
TTGAAGTTGATAGGATTTACCATCTTGCTTGTCCTGCCTCTCCTATCTTCTACAAGTACA
ACCCCGTCAAGACAATCAAGACCAATGTGATGGGTACAATGAACATGCTCGGTCTTGCCA
AGCGTGTTGGAGCAAGGATTCTGCTCACCTCAACCTCGGAAGTGTATGGAGACCCTCTCA
TCCACCCTCAACCAGAGAGCTACTGGGGAAATGTCAACCCCATTGGTGTTCGGAGTTGCT
ATGACGAAGGCAAACGTGTAGCTGAGACTTTGATGTTTGACTACCACAGGCAACACGGCA
TTGAAATCCGCATTGCTAGGATCTTCAACACGTATGGTCCTCGTATGAACATCGATGACG
GGCGTGTGGTGAGCAACTTCATTGCTCAAGCACTCCGAGGTGAGGCATTGACTGTTCAGA
AACCGGGGACACAGACCCGCAGTTTCTGCTATGTCTCTGACATGGTGGATGGACTTATCC
GTCTCATGGAAGGCGATGATACTGGCCCTATCAACATCGGTAACCCAGGTGAATTCACCA
TGGTGGAACTGGCTGAAACGGTTAAGGAGCTTATCAATCCGAGCATAGAGATAAAGATGG
TGGAGAACACACCGGACGATCCAAGACAGAGGAAGCCAGACATAAGCAAGGCTAAACAAG
TGTTGGGTTGGGAGCCAAAGGTGAAGCTCAGAGAAGGACTTCCTCTCATGGAAGAAGATT
TCCGTCTAAGGCTTAAAGTTCCCAAAAACTGAAAACGCAAACGCAGGACGCGTTCTTTGA
TTTGAGGAGTTTGTCAGTTTTTTTTTTTTGGAGTGATATGATGCTTACAATATTCTACAA
AGTGGGGGGTGGTCCGGTTTGGTTTTGTTTCATGTCTGTTTTCATTGATCTTTGCTTCTG
TTCGTAGAGAAATAAGTTGGGATATGTTTTCTGTTTTTGTTTTAATGAGGAACGACTCGT
TTTGTTTTCAATATATTAAATATAATAAAAGAAATGTATTATATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN13TF U 197
AF RR2CJ57TF U 1
AF RR2CZ57TF U 464
AF RR2CZ57JQ C 838
AF RR2BN13JQ C 916
AF RR2CJ57JQ C 838
BS 1 226 RR2CJ57TF
BS 227 227 RR2BN13TF
BS 228 302 RR2CJ57TF
BS 303 303 RR2BN13TF
BS 304 469 RR2CJ57TF
BS 470 470 RR2BN13TF
BS 471 609 RR2CJ57TF
BS 610 610 RR2CZ57TF
BS 611 649 RR2CJ57TF
BS 650 650 RR2CZ57TF
BS 651 707 RR2CJ57TF
BS 708 1056 RR2CZ57TF
BS 1057 1057 RR2CJ57JQ
BS 1058 1090 RR2CZ57TF
BS 1091 1366 RR2CJ57JQ

RD RR2BN13TF 356 0 0
G
GGGTTCATCGGTTCGCACTTGGTTGATAACCTAATGGAAAATGAGAAGAATGAGGTTGTG
GTTGCTGATAATTATTTCACTGGCTCTAAAGATAACCTCAAGAAGCGGATCGGTCACCCC
AGGTTTGAGCTTATTCGTCACGATGTTACGGAGCCTCTATTGCTTGAAGTTGATAGGATT
TACCATCTTGCTTGTCCTGCCTCTCCTATCTTCTACAAGTACAACCCCGTCAAGACAATC
AAGACCAATGTGATGGGTACAATGAACATGCTCGGTCTTGCCAAGCGTGTTGGAGCAAGG
ATTCTGCTCACCTCAACCTCGGAAGTGTATGGAGACCCTCTCATCCACCCTC
GAC

QA 2 353 2 353
DS 

RD RR2CJ57TF 707 0 0
GGATCAGATCAGAGAGGAATCACAAAGTTTAGGTATCTCATTTAAAACTCGTTTGCGATC
TCTCTCAGGCAAGGAAGCAAATGGCGGCGGCGGCAAGTGAGATACAGAACGGATCAAAGG
CTCCTCCTTTGCCTTCTCCTCTCCGCAACTCCAAGTTTCTCCAGTCGAATATGAGGATCT
TGATATCGGGAGGAGCAGGGTTCATCGGTTCGCACTCGGTTGATAAGCTAATGGAAAATG
AGAAGAATGAGGTTGTGGTTGCTGATAATTATTTCACTGGCTCTAAAGATAACCTCAAGA
AGTGGATCGGTCACCCCAGGTTTGAGCTTATTCGTCACGATGTTACGGAGCCTCTATTGC
TTGAAGTTGATAGGATTTACCATCTTGCTTGTCCTGCCTCTCCTATCTTCTACAAGTACA
ACCCCGTCAAGACAATCAAGACCAATGTGATGGGTACAATGAACATGCTTGGTCTTGCCA
AGCGTGTTGGAGCAAGGATTCTGCTCACCTCAACCTCGGAAGTGTATGGAGACCCTCTCA
TCCACCCTCAACCAGAGAGCTACTGGGGAAATGTCAACCCCATTGGTGTTCGGAGTTGCT
ATGACGAAG*CAAACGTGTAGCTGAGACTTTGATGTTTGACTACCACAG*CAACACGGCA
TTGAAATCCGCATTGCTAGGATCTTCAACACGTATGGTCCTCGTATG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2CZ57TF 628 0 0
GCATGCT
GGTCTTGCCAAGCGTGTTGGAGCAAGGATTCTGCTCACCTCAACCTCGGAAGTGTATGGA
GACCCTCTCATCCACCCTCAACCAGAGAGCTACTGGGGAAATGTCAACCCCATTGGTGTT
CGGAGTTGCTATGACGAAGGCAAACGTGTAGCTGAGACTTTGATGTTTGACTACCACAGG
CAACACGGCATTGAAATCCGCATTGCTAGGATCTTCAACACGTATGGTCCTCGTATGAAC
ATCGATGACGGGCGTGTGGTGAGCAACTTCATTGCTCAAGCACTCCGAGGTGAGGCATTG
ACTGTTCAGAAACCGGGGACACAGACCCGCAGTTTCTGCTATGTCTCTGACATGGTGGAT
GGACTTATCCGTCTCATGGAAGGCGATGATACTGGCCCTATCAACATCGGTAACCCAGGT
GAATTCACCATGGTGGAACTGGCTGAAACGGTTAAGGAGCTTATCAATCCGAGCATAGAG
ATAAAGATGGTGGAGAACACACCGGACGATCCAAGACAGAGGAAGCCAGACATAAGCAAG
GCTAAACAAGTGTTGGGTTGGGAGCCAAAGGTGAAGCTCAGAGAAG*ACTTCCTCTCATG
GAAGAAGATTTCCGTCTAAG
C

QA 8 627 8 627
DS 

RD RR2CZ57JQ 353 0 0
TCCGTCTCATGGAAGGCGATGATACTGGCCCTATCAACATCGGTAACCCAGGTGAATTCA
CCATGGTGGAACTGGCTGAAACGGTTAAGGAGCTTATCAATCCGAGCATAGAGATAAAGA
TGGTGGAGAACACACCGGACGATCCAAGACAGAGGAAGCCAGACATAAGCAAGGCTAAAC
AAGTGTTGGGTTGGGAGCCAAAGGTGAAGCTCAGAGAAGGACTTCCTCTCATGGAAGAAG
ATTTCCGTTTAAGGGTTAAAGTTCCCAAAAACTGAAAACGCAAACGCAGGACGCGTTCTT
TGATTTGAGGAGTTTGTCAGTTTTTTTTTTTTGGAGTGATATGATGCTTACAA

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR2BN13JQ 316 0 0
AAACGGTTAAGGAGCTTATCAATCCGAGCATAGAGATAAAGATGGTGGAGAACACACCGG
ACGATCCAAGACAGAGGAAGCCGGACATAAGCAAGGCTAAACAAGTGTTGGGTTGGGAGC
CAAAGGTGAAGCTCAGAGGAGGACTTCCTCTCATGGAAGAAGATTTCCGTCTAAGGCTTA
AAGTTCCCAAAAACTGAAAACGCAAACGCAGGACGCGTTCTTTGATTTGAGTAGTTTGTC
AGTTTTTTTTTTTTGGAGTGATATGATGCTTACAATATTCTACAAAGTGGGGGGTGGTCC
GGTTTGGTTTTGTTTC

QA 1 316 1 316
DS 

RD RR2CJ57JQ 529 0 0
TCCGTTTCATGGAAGGGGATGATACTGGCCCTATCAACATCGGTAACCCAGGTGAATTCA
CCATGGTGGAACTGGCTGAAACGGTTAAGGAGCTTATCAATCCGAGCATAGAGATAAAGA
TGGTGGAGAACACACCGGACGATCCAAGACAGAGGAAGCCAGACATAAGCAAGGCTAAAC
AAGTGTTGGGTTGGGAGCCAAAGGT*AAGCTCAGAGAAGGACTTCCTCTCATGGAAGAAG
ATTTCCGTTTAAGGCTTAAAGTTCCCAAAAACTGAAAACGCAAACGCAGGACGCGTTCTT
TGATTTGAGGAGTTTGTCAGTTTTTTTTTTTTGGAGTGATATGATGCTTACAATATTCTA
CAAAGTGGGGGGTGGTCCGGTTTGGTTTTGTTTCATGTCTGTTTTCATTGATCTTTGCTT
CTGTTCGTAGAGAAATAAGTTGGGATATGTTTTCTGTTTTTGTTTTAATGAGGAACGACT
CGTTTTGTTTTCAATATATTAAATATAATAAAAGAAATGTATTATATAC

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL1496Contig1 1113 2 2 U
GGGGGAAGTGCAGCAGTGTACTCTCCTCTCCATAAAGACTGGAGGGTACAGTGAGGACTG
TTCTTACTGTCCTCAGTCCTCCAGATATGACACTGGAGTCAAGGCCCAAAGACTCATGTC
CAAGGACGCTGTCATTGTTGCTGCTAAGAAGGCAAAAGAAGCTGGTAGCACAAGGTTTTG
TATGGGTGCTGCGTGGCGAGACACAGTAGGACGCAAAACCAATTTCAACCAGATACTTGA
CTACATCAAAGAAATAAGAGGCATGGGAATGGAGGTTTGCTGCACATTGGGCATGATTGA
GAAACAACAAGCGTTAGAGCTGAAGAAAGCTGGCCTCACTGCATACAACCACAATCTCGA
TACCTCGAGAGAGTACTACCCCAACGTCATCACTACAAGAAGTTATGACGAACGCCTTGA
AACTCTTGACCATGTGCGTGAAGCTGGTATCAACGTCTGTTCAGGAGGAATAATAGGGCT
TGGGGAGGCAGAGGAGGACAGAGTAGGTTTGTTACACACATTGGCAACACTTCCTTCTCA
CCCTGAGAGTGTTCCCATCAATGCTCTGCTTGCAGTTAAAGGCACTCCTCTTGAAGACCA
GAAGCCGGTTGAGATATGGGAGATGATAAGGATGATTGGAACAGCGAGAATCGTGATGCC
AAAAGCAATGGTGAGGCTCTCTGCCGGTAGAGTCCGGTTCTCGATGCCAGAGCAAGCCCT
GTGTTTTCTCGCTGGTGCAAACTCTATCTTCACAGGAGAGAAGCTTTTGACAACACCAAA
CAATGATTTTGACGCCGACCAACTCATGTTCAAGACGCTGGGACTCACTCCTAAGCCCCC
AAGCTTCTCGGAAGAGGATTCTGAATCAGAAAGCTGCGAGAAAGTTGCTTCTTCTCACTA
AAGTTTGGACAAACTATGAAGTAGAGCTATCTTTCCACTATGTAGCATGATCGGATGATT
TAAATGATACCACTTTTTTATTGCTTGATGTTATGTTGGATTGAACTGGTCTCTCAAGTT
TGTCACACTTGCTACAGTTATTGTGCTTGTTTTGCAAAGACAGAGAAGCTATTGGCATCT
GCTTAAGCATAAAAGTTCAATGTGCTAGCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H471TF U 1
AF RR2H471JQB C 568
BS 1 692 RR2H471TF
BS 693 1113 RR2H471JQB

RD RR2H471TF 692 0 0
GGGGGAAGTGCAGCAGTGTACTCTCCTCTCCATAAAGACTGGAGGGTACAGTGAGGACTG
TTCTTACTGTCCTCAGTCCTCCAGATATGACACTGGAGTCAAGGCCCAAAGACTCATGTC
CAAGGACGCTGTCATTGTTGCTGCTAAGAAGGCAAAAGAAGCTGGTAGCACAAGGTTTTG
TATGGGTGCTGCGTGGCGAGACACAGTAGGACGCAAAACCAATTTCAACCAGATACTTGA
CTACATCAAAGAAATAAGAGGCATGGGAATGGAGGTTTGCTGCACATTGGGCATGATTGA
GAAACAACAAGCGTTAGAGCTGAAGAAAGCTGGCCTCACTGCATACAACCACAATCTCGA
TACCTCGAGAGAGTACTACCCCAACGTCATCACTACAAGAAGTTATGACGAACGCCTTGA
AACTCTTGACCATGTGCGTGAAGCTGGTATCAACGTCTGTTCAGGAGGAATAATAGGGCT
TGGGGAGGCAGAGGAGGACAGAGTAGGTTTGTTACACACATTGGCAACACTTCCTTCTCA
CCCTGAGAGTGTTCCCATCAATGCTCTGCTTGCAGTTAAAGGCACTCCTCTTGAAGACCA
GAAGCCGGTTGAGATATGGGAGATGATAAGGATGATTGGAACAGCGAGAATCGTGATGCC
AAAAGCAATGGTGAGGCTCTCTGCCGGTAGAG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2H471JQB 546 0 0
GCTTGCAGTTAAAGGCACTCCTCTTGAAGACCAGAAGCCGGTTGAGATATGGGAGATGAT
AAGGATGATTGGAACAGCGAGAATCGTGATGCCAAAAGCAATGGTGAGGCTTTCTGCCGG
TAGAGTCCGGTTCTCGATGCCAGAGCAAGCCCTGTGTTTTCTCGCTGGTGCAAACTCTAT
CTTCACAGGAGAGAAGCTTTTGACAACACCAAACAATGATTTTGACGCCGACCAACTCAT
GTTCAAGACGCTGGGACTCACTCCTAAGCCCCCAAGCTTCTCGGAAGAGGATTCTGAATC
AGAAAGCTGCGAGAAAGTTGCTTCTTCTCACTAAAGTTTGGACAAACTATGAAGTAGAGC
TATCTTTCCACTATGTAGCATGATCGGATGATTTAAATGATACCACTTTTTTATTGCTTG
ATGTTATGTTGGATTGAACTGGTCTCTCAAGTTTGTCACACTTGCTACAGTTATTGTGCT
TGTTTTGCAAAGACAGAGAAGCTATTGGCATCTGCTTAAGCATAAAAGTTCAATGTGCTA
GCCCCC

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 5

CO CL1497Contig1 767 5 17 U
GGGGAGTTAAGCCCTTTCCCTCTACTCGCCGTCGCCTCCGATCACATTTATCACCTGTCG
CAGTGTACTGGAATCGAAAATTTCCGATTATTGCGAGAAATGAATTTCTTAAACTCAGCA
GCATCCTTATGCAGAAGAGTTAGTTTGAGGGAACTCATCACCGAGGTTCCTGCTTACGGT
GGCAGTGGCATCTCTGATTGTTCCTCAAGTGGGTTAAGTTTGGTGCTAAAGCGTTGGGCT
ACTAAGAAAACCGCCGGTTCCACCAAGAACGGACGTGACTCTAAGCCCAAGAATCTCGGC
GTCAAGAAGTTCGGAGGAGAGAATGTGATTCCGGGAAACATAATAGTCCGTCAACGTGGA
ACTCGGTTTCATCCGGGAGACTATGTCGGGATCGGGAAGGACCATACTCTGTTTGCATTG
AAAGAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAACAAGATCACTGGACGCAAATGGATTCATGTT
GATCCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCACCCTATCTACACTAAAGCTGCAATGGCCAAGTCG
ACTAAGGTGGAGACAGCTTCTTCGTCCTGAAAAGAGATTTGATTCAACAATCTAAAGGTG
TTTCTTTCTTTTGTTAGATAATACTTTCTCTTGACTAGAAGATTGTGGTGGTATCTTAGA
ACAGAAAACACTCAATTCAATAATGCATGCTGTTTTTTTGTCTGAATACTGATCATGTGG
TTATTTACGCCAAGGAACAAGTTCAATTCGTCAAAAAGATTTATCAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK86TF U 1
AF RR2H614TF U 2
AF RR2CV15TF U 22
AF RR2CV15JQ C 37
AF RR2H614JQB C 244
BS 1 50 RR2FK86TF
BS 51 52 RR2CV15TF
BS 53 59 RR2FK86TF
BS 60 60 RR2CV15TF
BS 61 77 RR2FK86TF
BS 78 78 RR2CV15TF
BS 79 89 RR2FK86TF
BS 90 91 RR2CV15TF
BS 92 426 RR2FK86TF
BS 427 427 RR2H614TF
BS 428 604 RR2FK86TF
BS 605 605 RR2H614TF
BS 606 698 RR2FK86TF
BS 699 699 RR2CV15JQ
BS 700 730 RR2CV15TF
BS 731 752 RR2CV15JQ
BS 753 767 RR2H614JQB

RD RR2FK86TF 703 0 0
GGGGAGTTAAGCCCTTTCCCTCTACTCGCCGTCGCCTCCGATCACATTTA**ACCTGTCT
CAGTGTACTGGAATCGAGAATTTCCGATTTGTGCGAGAAATGAATTTCTTAAACTCAGCA
GCATCCTTATGCAGAAGAGTTAGTTTGAGGGAACTCATCACCGAGGTTCCTGCTTACGGT
GGCAGTGGCATCTCTGATTGTTCCTCAAGTGGGTTAAGTTTGGTGCTAAAGCGTTGGGCT
ACTAAGAAAACCGCCGGTTCCACCAAGAACGGACGTGACTCTAAGCCCAAGAATCTCGGC
GTCAAGAAGTTCGGAGGAGAGAATGTGATTCCGGGAAACATAATAGTCCGTCAACGTGGA
ACTCGGTTTCATCCGGGAGACTATGTCGGGATCGGGAAGGACCATACTCTGTTTGCATTG
AAAGAATGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAACAAGATCACTGGACGCAAATGGATTCATGTT
GATCCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCACCCTATCTACACTAAAGCTGCAATGGCCAAGTCG
ACTAAGGTGGAGACAGCTTCTTCGTCCTGAAAAGAGATTTGATTCAACAATCTAAAGGTG
TTTCCTTCTTTTGTTAGATAATACTTTCTCTTGACTAGAAGATTGTGGTGGTATCTTAGA
ACAGAAAACACTCAATTCAATAATGCATGCTGTTTTTT
GTCTG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2H614TF 709 0 0
GGGAGTTAAGCCCTTTCCCTCTACTCGCCGTCGCCTCCGATCACATTTA**ACCTGTCTC
AGTGTACTGGAATCGAGAATTTCCGATTTGTGCGAGAAATGAATTTCTTAAACTCAGCAG
CATCCTTATGCAGAAGAGTTAGTTTGAGGGAACTCATCACCGAGGTTCCTGCTTACGGTG
GCAGTGGCATCTCTGATTGTTCCTCAAGTGGGTTAAGTTTGGTGCTAAAGCGTTGGGCTA
CTAAGAAAACCGCCGGTTCCACCAAGAACGGACGTGACTCTAAGCCCAAGAATCTCGGCG
TCAAGAAGTTCGGAGGAGAGAATGTGATTCCGGGAAACATAATAGTCCGTCAACGTGGAA
CTCGGTTTCATCCGGGAGACTATGTCGGGATCGGGAAGGACCATACTCTGTTTGCATTGA
AAGAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAACAAGATCACTGGACGCAAATGGATTCATGTTG
ATCCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCACCCTATCTACACTAAAGCTGCAATGGCCAAGTCGA
CTAAGGTGGAGACAGCTTCTTCGTCCTGAAAAGAGATTTGATTCAACAATCTAAAGGTGT
TTCTTTCTTTTGTTAGATAATACTTTCTCTTGACTAGAAGATTGTGGTGGTATCTTAGAA
CAGAAA*CACTCAATTCA*TAATGCATGCTGTTTTTT
GTTGAATACTGA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2CV15TF 709 0 0
GG
ACTCGCCGTCGCCTCCGATCACATTTATCACCTGTCGCAGTGTACTGGAATCGAAAATTT
CCGATTATTGCGAGAAATGAATTTCTTAAACTCAGCAGCATCCTTATGCAGAAGAGTTAG
TTTGAGGGAACTCATCACCGAGGTTCCTGCTTACGGTGGCAGTGGCATCTCTGATTGTTC
CTCAAGTGGGTTAAGTTTGGTGCTAAAGCGTTGGGCTACTAAGAAAACCGCCGGTTCCAC
CAAGAACGGACGTGACTCTAAGCCCAAGAATCTCGGCGTCAAGAAGTTCGGAGGAGAGAA
TGTGATTCCGGGAAACATAATAGTCCGTCAACGTGGAACTCGGTTTCATCCGGGAGACTA
TGTCGGGATCGGGAAGGACCATACTCTGTTTGCATTGAAAGAAGGACGAGTCAGGTTCGA
GAAAAACAAGATCACTGGACGCAAATGGATTCATGTTGATCCTAAGGGAGGTCATGTTCT
TCACCCTATCTACACTAAAGCTGCAATGGCCAAGTCGACTAAGGTGGAGACAGCTTCTTC
GTCCTGAAAAGAGATTTGATTCAACAATCTAAAGGTGTTTCTTTCTTTTGTTAGATAATA
CTTTCTCTTGACTAGAAGATTGTGGTGGTATCTTAGAACAGAAAACACTCAATTCAATAA
TGCATGCTGTTTTTT*GTCTGAATACTGATCATGTGGTTATTTACGC

QA 3 709 3 709
DS 

RD RR2CV15JQ 716 0 0
TCCGATCACATTTATCACCTGTCGCAGTGTACTGGAATCGAAAATTTCCGATTATTGCGA
GAAATGAATTTCTTAAACTCAGCAGCATCCTTATGCAGAAGAGTTAGTTTGAGGGAACTC
ATCACCGAGGTTCCTGCTTACGGTGGCAGTGGCATCTCTGATTGTTCCTCAAGTGGGTTA
AGTTTGGTGCTAAAGCGTTGGGCTACTAAGAAAACCGCCGGTTCCACCAAGAACGGACGT
GACTCTAAGCCCAAGAATCTCGGCGTCAAGAAGTTCGGAGGAGAGAATGTGATTCCGGGA
AACATAATAGTCCGTCAACGTGGAACTCGGTTTCATCCGGGAGACTATGTCGGGATCGGG
AAGGACCATACTCTGTTTGCATTGAAAGAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAACAAGATC
ACTGGACGCAAATGGATTCATGTTGATCCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCACCCTATCTAC
ACTAAAGCTGCAATGGCCAAGTCGACTAAGGTGGAGACAGCTTCTTCGTCCTGAAAAGAG
ATTTGATTCAACAATCTAAAGGTGTTTCTTTCTTTTGTTAGATAATACTTTCTCTTGACT
AGAAGATTGTGGTGGTATCTTAGAACAGAAAACACTCAATTCAATAATGCATGCTGTTTT
TTTGTCTGAATACTGATCATGTGGTTATTTACGCCAAGGAACAAGTTCAATTCGTC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2H614JQB 524 0 0
AAGAAAACCGCCGGTTCCACCAAGAACGGACGTGACTCTAAGCCCAAGAATCTCGGCGTC
AAGAAGTTCGGAGGAGAGAATGTGATTCCGGGAAACATAATAGTCCGTCAACGTGGAACT
CGGTTTCATCCGGGAGACTATGTCGGGATCGGGAAGGACCATACTCTGTTTGCATTGAAA
GAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAACAAGATCACTGGACGCAAATGGATTCATGTTGAT
CCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCACCCTATCTACACTAAAGCTGCAATGGCCAAGTCGACT
AAGGTGGAGACAGCTTCTTCGTCCTGAAAAGAGATTTGATTCAACAATCTAAAGGTGTTT
CTTTCTTTTGTTAGATAATACTTTCTCTTGACTAGAAGATTGTGGTGGTATCTTAGAACA
GAAAACACTCAATTCAATAATGCATGCTGTTTTTTTGTCTGAATACTGATCATGTGGTTA
TTTACGCCAAGGAACAAGTTCAATTCGTCAAAAAGATTTATCAA

QA 1 524 1 524
DS 



AS 2 6

CO CL1498Contig1 572 4 2 U
GGGAAGAAGTTGTTCCTTCCATTCGAAGAAGAAGATGGCTCTTCTCTGTTTCAATTCTCT
CGCTCCTCTCTCTTCTCCAAGGCTTCAACTTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTCAGCGT
TAAACCCAACACCGTCGAGTCAAAGAACAGAGTCTCTCTCAGTGCTTACAACTTGAGCAG
TACTCATGGAAGAGCAGTGATTGTGAAGGCAACTGCTTCTGGAGTCGACGGAGCTGAGCC
CGAGAGTAATGAGGAACCACCTAAGACTGTTGTCGCCGCTGTTCCAGTTGACAAACTACC
ATTGGAATCGAAAGAAGCTAAAGAGAAGTTACTCCTGGAACAGAGGATGAAGATGAAGCT
GGCCAAGAAGATTAGGCTACGCAGGAAACGTTTGGTTCGTAAGCGTAAGCTGAGGAAGAA
GGGTCGTTGGCCACCTTCCAAGATGAAGAAGCTCAAGAATGTTTAGAGCTAATGCTGATC
CCTTTGCTCCCCTCTCATTTGAATTTTTCTTTGTAAACTTTCTTTGTTTTTCGGATTAAT
CTCAAGCTGAGTTATTTAAAACGATTCATTGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK78JQ C 37
AF RR2AC21JQ C 1
AF RR2AC21TF U 1
AF RR2AK78TF U 1
BS 1 566 RR2AC21TF
BS 567 572 RR2AC21JQ

RD RR2AK78JQ 439 0 0
GGCTCTTTTCTGTTTCAATTCTCTCGCTCCTCTCTCTTCTCCAAGGCTTCAACTTTCGTC
TTTCGCTTCACCAGTTTTCAGCGTTAAACCCAACACCGTCGAGTCAAAGAACAGAGTCTC
TCTCAGTGCTTACAACTTGAGCAGTACTCATGGAAGAGCAGTGATTGTGAAGGCAACTGC
TTCTGGAGTCGACGGAGCTGAGCCCGAGAGTAATGAGGAACCACCTAAGACTGTTGTCGC
CGCTGTTCCAGTTGACAAACTACCATTGGAATCGAAAGAAGCTAAAGAGAAGTTACTCCT
GGAACAGAGGATGAAGATGAAGCTGGCCAAGAAGATTAGGCTACCCAGGAAACGTTTGGT
TCGTAAGCGTAAGCTGAGGAAGAAGGGTCGTTGCCCCCCTTCCAAGATGAAGAAGCTCAA
GAATGTTTAGAGCTAATGC

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2AC21JQ 572 0 0
GGGAAGAAGTTGTTCCTTCCATTCGAAGAAGAAGATGGCTCTTCTCTGTTTCAATTCTCT
CGCTCCTCTCTCTTCTCCAAGGCTTCAACTTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTCAGCGT
TAAACCCAACACCGTCGAGTCAAAGAACAGAGTCTCTCTCAGTGCTTACAACTTGAGCAG
TACTCATGGAAGAGCAGTGATTGTGAAGGCAACTGCTTCTGGAGTCGACGGAGCTGAGCC
CGAGAGTAATGAGGAACCACCTAAGACTGTTGTCGCCGCTGTTCCAGTTGACAAACTACC
ATTGGAATCGAAAGAAGCTAAAGAGAAGTTACTCCTGGAACAGAGGATGAAGATGAAGCT
GGCCAAGAAGATTAGGCTACGCAGGAAACGTTTGGTTCGTAAGCGTAAGCTGAGGAAGAA
GGGTCGTTGGCCACCTTCCAAGATGAAGAAGCTCAAGAATGTTTAGAGCTAATGCTGATC
CCTTTGCTCCCCTCTCATTTGAATTTTTCTTTGTAAACTTTCTTTGTTTTTCGGATTAAT
CTCAAGCTGAGTTATTTAAAACGATTCATTGC

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2AC21TF 572 0 0
GGGAAGAAGTTGTTCCTTCCATTCGAAGAAGAAGATGGCTCTTCTCTGTTTCAATTCTCT
CGCTCCTCTCTCTTCTCCAAGGCTTCAACTTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTCAGCGT
TAAACCCAACACCGTCGAGTCAAAGAACAGAGTCTCTCTCAGTGCTTACAACTTGAGCAG
TACTCATGGAAGAGCAGTGATTGTGAAGGCAACTGCTTCTGGAGTCGACGGAGCTGAGCC
CGAGAGTAATGAGGAACCACCTAAGACTGTTGTCGCCGCTGTTCCAGTTGACAAACTACC
ATTGGAATCGAAAGAAGCTAAAGAGAAGTTACTCCTGGAACAGAGGATGAAGATGAAGCT
GGCCAAGAAGATTAGGCTACGCAGGAAACGTTTGGTTCGTAAGCGTAAGCTGAGGAAGAA
GGGTCGTTGGCCACCTTCCAAGATGAAGAAGCTCAAGAATGTTTAGAGCTAATGCTGATC
CCTTTGCTCCCCTCTCATTTGAATTTTTCTTTGTAAACTTTCTTTGTTTTTCGGATTAAT
CTCAAGCTGAGTTATTTAAAACGATT
CATTGC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2AK78TF 566 0 0
GGGAAGAAGTTGTTCCTTCCATTCGAAGAAGAAGATGGCTCTTCTCTGTTTCAATTCTCT
CGCTCCTCTCTCTTCTCCAAGGCTTCAACTTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTCAGCGT
TAAACCCAACACCGTCGAGTCAAAGAACAGAGTCTCTCTCAGTGCTTACAACTTGAGCAG
TACTCATGGAAGAGCAGTGATTGTGAAGGCAACTGCTTCTGGAGTCGACGGAGCTGAGCC
CGAGAGTAATGAGGAACCACCTAAGACTGTTGTCGCCGCTGTTCCAGTTGACAAACTACC
ATTGGAATCGAAAGAAGCTAAAGAGAAGTTACTCCTGGAACAGAGGATGAAGATGAAGCT
GGCCAAGAAGATTAGGCTACGCAGGAAACGTTTGGTTCGTAAGCGTAAGCTGAGGAAGAA
GGGTCGTTGGCCACCTTCCAAGATGAAGAAGCTCAAGAATGTTTAGAGCTAATGCTGATC
CCTTTGCTCCCCTCTCATTTGAATTTTTCTTTGTAAACTTTCTTTGTTTTTCGGATTAAT
CTCAAGCTGAGTTATTTAAAACGATT

QA 1 566 1 566
DS 



CO CL1498Contig2 563 2 1 U
GGATTCGAAGAAGATGGCTCTTCTCTGTCTCAATTCTCTCGCTCCTCTCTCTTCTCCAAG
GCTTCAACTTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTCAGCGTTAAACCCAACACCGTCGAGTC
AAAAAACAGAGTCTCTCTCAGTGCTTACAACTTGAGCAGTACTCATGGAAGAGCAGTGAT
TGTGAAAGCAGCTGCCTCTGGAGTCGACGGAGCTGAGCCCGCGAGCAATGAGGAACCACC
AAAGACTGTTGTCGCTGCTGTTCCAGTGGACAAACTACCATTGGAATCGAAAGAAGCTAA
AGAGAAGCTACTCCTGGAACAGAGGATGAAGATGAAGCTGGCCAAGAAAATCAGGCTACG
CAGGAAACGTCTGGTTCGTAAGCGTAAGCTGAGGAAGAAGGGTCGCTGGCCACCTTCCAA
GATGAAGAAGCTCAAGAATGTTTAGAGCTAATGCTGATCCCTTTGCTCCCTCTCATTTGA
ATTTTTTTTCTTTGTGATGGTGTTTGTAAACTTTCTGGAACCATTGTTTTGGATTAATCT
CAAGCTGAGTTATTTAAAACGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FM52TF U 1
AF RR2FM52JQ C 132
BS 1 563 RR2FM52TF

RD RR2FM52TF 563 0 0
GGATTCGAAGAAGATGGCTCTTCTCTGTCTCAATTCTCTCGCTCCTCTCTCTTCTCCAAG
GCTTCAACTTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTCAGCGTTAAACCCAACACCGTCGAGTC
AAAAAACAGAGTCTCTCTCAGTGCTTACAACTTGAGCAGTACTCATGGAAGAGCAGTGAT
TGTGAAAGCAGCTGCCTCTGGAGTCGACGGAGCTGAGCCCGCGAGCAATGAGGAACCACC
AAAGACTGTTGTCGCTGCTGTTCCAGTGGACAAACTACCATTGGAATCGAAAGAAGCTAA
AGAGAAGCTACTCCTGGAACAGAGGATGAAGATGAAGCTGGCCAAGAAAATCAGGCTACG
CAGGAAACGTCTGGTTCGTAAGCGTAAGCTGAGGAAGAAGGGTCGCTGGCCACCTTCCAA
GATGAAGAAGCTCAAGAATGTTTAGAGCTAATGCTGATCCCTTTGCTCCCTCTCATTTGA
ATTTTTTTTCTTTGTGATGGTGTTTGTAAACTTTCTGGAACCATTGTTTTGGATTAATCT
CAAGCTGAGTTATTTAAAACGAT

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2FM52JQ 432 0 0
TCTCTCTCAGTGCTTACAACTTGAGCAGTACTCATGGAAGAGCAGTGATTGTGAAAGCAG
CTGCCTCTGGAGTCGACGGAGCTGAGCCCGCGAGCAATGAGGAACCACCAAAGACTGTTG
TCGCTGCTGTTCCAGTGGACAAACTACCATTGGAATCGAAAGAAGCTAAAGAGAAGCTAC
TCCTGGAACAGAGGATGAAGATGAAGCTGGCCAAGAAAATCAGGCTACGCAGGAAACGTC
TGGTTCGTAAGCGTAAGCTGAGGAAGAAGGGTCGCTGGCCCCCTTCCAAGATGAAGAAGC
TCAAGAATGTTTAGAGCTAATGCTGATCCCTTTGCTCCCTCTCATTTGAATTTTTTTTCT
TTGTGATGGTGTTTGTAAACTTTCTGGAACCATTGTTTTGGATTAATCTCAAGCTGAGTT
ATTTAAAACGAT

QA 1 432 1 432
DS 



AS 2 5

CO CL1499Contig1 1309 3 4 U
GGAGGAAAGAACTCGAAGAACCAACTGAAGTGGAAATTGAACTGAAACGAAGACTTGACC
AGCTAACTGACCATCTTATTCAAAAACAATCCCAGGTCGAAGCGCTTTCCTCGGAGAAAG
CAACTCTATCGTTTAGAATCGAGGCCGTATCAAGGCTAATAGAAGAGAACAAAGGCATGT
CTGCAACAGAAGCCTCGTCCCAAGATCTTGAAGCAGGGGAATGGCAACTCTCAGGGTCAA
AGTTCAAACCAGCTTTACAAGATAAAATCAGGTCAGGCAAGAAACACTTGGGATGGTTAG
TGATGCAGCTAAACGCTATATTCGTCTCTGGAGCTGTGTTCTTGCGTAAAAACCCCACTG
CAAAAATCTGGGCTCTAGTGTATCTGGTCTGCCTTCATCTCTGGGTACTATACATTTTAC
TCTCTCATTCAAGTGATTCTTCCTCGAGTGAACTGAGATCAGGTGCAGTGATTTCCTTAG
AGAATTTCAGTAATAGTTCCCTTCGTCAGTAGCTTTTTCTCCTTAGAAACGATAAAAGAA
ATTACTTTATTGAATTATATGCAATTTTCCTGCTTCCAACATCTTTTTAAGCTTTGATTT
GAATCTTAATTGTATTCTCAATCAATGTATCAATCACGTTTCACAAATATTTGAAGATAA
TGAGAATCTATACAAAAGCAGAGTTTGATCATAAGGGAACACAGGACATGTGTTGGCCAA
AAGACTGTAATCATCTCTTCATCTCCCCAGTCAATGTTTCTTTTTTGAGTTTCGTCAGAC
TGTAGTTTCGTGAGGGAGATTCTTGCTGTACAAAGGAAACTCAAAGAGAAAGACGGTCTT
GCACCAATTTGGTAAGTACCCGTAAACTCCTCGAGGCAACAGAATTAGGGGACTGGTTGT
CTTCTTATAGTGTCTATAAGCTCCCAAGTTACCGTACTTTTTGTCCGCCGATTCCTCGAG
TAATGGTATGCCGCTAACGAAGAAAAGCAGCAAAGTGAGAAAGATTGGTCCAACTATGAC
AAGGTACTCTGCACCTCTAGGAACAGGCAATGAAGCCACATATATGCCCCACCACAGTAA
CATCTCTCCAAAGTAGTTAGGGTGGCGTGAATACTTCCACAGTCCAACATCGCACCATTT
TCCTTTATTTTCTTGATGATTCTTAAACAAAAGCTTTTGTTGATCAGCTATAGCTTCAAC
CAAGAAACCTGCAACAAACATTGTCCAGCCAATAACATCCGCGGGCTGAAACAATCTTCC
ACCGTTGCTTGCATTCACAAGAGTAACTGGTAAACTGACTGTCCAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC75TF U 1
AF RR2EC75JQ C 102
AF RR2FW52JQ U 534
BS 1 536 RR2EC75TF
BS 537 561 RR2FW52JQ
BS 562 562 RR2EC75JQ
BS 563 1309 RR2FW52JQ

RD RR2EC75TF 536 0 0
GGAGGAAAGAACTCGAAGAACCAACTGAAGTGGAAATTGAACTGAAACGAAGACTTGACC
AGCTAACTGACCATCTTATTCAAAAACAATCCCAGGTCGAAGCGCTTTCCTCGGAGAAAG
CAACTCTATCGTTTAGAATCGAGGCCGTATCAAGGCTAATAGAAGAGAACAAAGGCATGT
CTGCAACAGAAGCCTCGTCCCAAGATCTTGAAGCAGGGGAATGGCAACTCTCAGGGTCAA
AGTTCAAACCAGCTTTACAAGATAAAATCAGGTCAGGCAAGAAACACTTGGGATGGTTAG
TGATGCAGCTAAACGCTATATTCGTCTCTGGAGCTGTGTTCTTGCGTAAAAACCCCACTG
CAAAAATCTGGGCTCTAGTGTATCTGGTCTGCCTTCATCTCTGGGTACTATACATTTTAC
TCTCTCATTCAAGTGATTCTTCCTCGAGTGAACTGAGATCAGGTGCAGTGATTTCCTTAG
AGAATTTCAGTAATAGTTCCCTTCGTCAGTAGCTTTTTCTCCTTAGAAACGATAAA

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2EC75JQ 572 0 0
GCGCTTTCCTCGGAGAAAGCAACTCTATCGTTTAGAATCGAGGCCGTATCAAGGCTAATA
GAAGAGAACAAAGGCATGTCTGCAACAGAAGCCTCGTCCCAAGATCTTGAAGCAGGGGAA
TGGCAACTCTCAGGGTCAAAGTTCAAACCAGCTTTACAAGATAAAATCAGGTCAGGCAAG
AAACACTTGGGATGGTTAGTGATGCAGCTAAACGCTATATTCGTCTCTGGAGCTGTGTTC
TTGCGTAGAAACCCCACTGCAAAAATCTGGGCTCTAGTGTATCTGGTCTGCCTTCATCTC
TGGGTACTATACATTTTACTCTCTCATTCAAGTGATTCTTCCTCGAGTGAACTGAGATCA
GGTGCAGTGATTTCCTTAGAGAATTTCAGTAATAGTTCCCTTCGTCAGTAGCTTTTTCTC
CTTAGAAACGATAAAAGAAATTACTTTATTGAATTATATGCAATTTTCCTGCTTCCAACA
TCTTTTTAAGCTTTGATTTGAATCTTAATTGTATTCTCAATCAATGTATCAATCACGTTT
CACAAATATTTGAAGATAATGAGAATCTATAC

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2FW52JQ 776 0 0
AAAAGAAATTACTTTATTGAATTATATGTAATTTTCCTGCTTCCAACATCTTTTTAAGCT
TTGATTTGAATCTTAATTGTATTCTCAATCAATGTATCAATCACGTTTCACAAATATTTG
AAGATAATGAGAATCTATACAAAAGCAGAGTTTGATCATAAGGGAACACAGGACATGTGT
TGGCCAAAAGACTGTAATCATCTCTTCATCTCCCCAGTCAATGTTTCTTTTTTGAGTTTC
GTCAGACTGTAGTTTCGTGAGGGAGATTCTTGCTGTACAAAGGAAACTCAAAGAGAAAGA
CGGTCTTGCACCAATTTGGTAAGTACCCGTAAACTCCTCGAGGCAACAGAATTAGGGGAC
TGGTTGTCTTCTTATAGTGTCTATAAGCTCCCAAGTTACCGTACTTTTTGTCCGCCGATT
CCTCGAGTAATGGTATGCCGCTAACGAAGAAAAGCAGCAAAGTGAGAAAGATTGGTCCAA
CTATGACAAGGTACTCTGCACCTCTAGGAACAGGCAATGAAGCCACATATATGCCCCACC
ACAGTAACATCTCTCCAAAGTAGTTAGGGTGGCGTGAATACTTCCACAGTCCAACATCGC
ACCATTTTCCTTTATTTTCTTGATGATTCTTAAACAAAAGCTTTTGTTGATCAGCTATAG
CTTCAACCAAGAAACCTGCAACAAACATTGTCCAGCCAATAACATCCGCGGGCTGAAACA
ATCTTCCACCGTTGCTTGCATTCACAAGAGTAACTGGTAAACTGACTGTCCAAACC

QA 1 776 1 776
DS 



CO CL1499Contig2 1120 2 2 U
GGGCCGGCTAATAAGAAAAAGGAAAAAAAAGAAAGAATAGGTTTGGTGGGGAGAGAATGG
TAAAGGTAATCGATTCCCATTACCTGACCATCACCGCCATTGTCACTGTGGTGTATCAAT
TGGTATTCTTCGTGATCACAGCTCTTTTCAAATTCGATCAAGTTACCGACTTTGCCGGAA
GTACCAATTTCGTGATACTTGCTGTCTTGACTCTGGTTCTCAAGGGAACATGGCATTTTC
GTCAGGTAGTCTTGACTTCACTAGTAGTAGTATGGGGACTTCGTCTTGGAATGTTCCTCC
TTATGAGGATCCTGAAATGGGGTGAAGACCGACGCTTTGATGAAATTCGTGAAAATATGG
GGAAACTAGTTGTCTTTTGGACTTTTCAGGCCGTGTGGGTTTGGACAGTTAGTTTACCTG
TTACTCTTGTGAATGCAAGCAACGGTGGAAGATTGTTTCAGCCCGCGGATGTTATTGGCT
GGACTATGTGGGTTGCAGGTTTCTTGGTTGAAGCTATAGCTGATCAACAAAAGCTTTTGT
TTAAGAATCATCAAGAAAATAAAGGAAAATGGTGCGATGTTGGACTGTGGAAGTATTCAC
GCCATCCAAACTACTTTGGAGAGATGTTACTGTGGTGGGGCATATATGTGGCTTCATTGC
CTGTTCTTAAAGGTGCAGAGTACCTTGTCATAGTTGGACCCATCTTTCTCACTTTGCTCC
TTTTTTTCGTTAGCGGCATACCATTACTCGAGGAATCGGCGGACAAAAAGTACGGTAACT
TGGGAGCTTATAGACACTATAAGAAGACAACAAGTCCCCTTATTCTGTTGCCTCGAGGAG
TGTACGGGTACTTACCAAAGTGGTGCAAGACAGTCTTTCTCTTTGAGTTTCCTTTGTACA
GCAAGAATCTCCCTCACGAAATCACAGTCTGACGAAACTCAAAAAAGAAACATTGACTGA
GGAGATGAAGAGATGATCACATGTCCTGTGTTCCCTTATGATCAAACTCTGCTTTTGTAT
AGATTCTCATTATCTTCAAATATTTGTGAAACGTTATTGATACATTGATTGAGAATACAA
TTAAGATTGAAATCAAACTTAAAAAGATGTTGGAAGCAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH36TF U 1
AF RR2EH36JQ C 525
BS 1 723 RR2EH36TF
BS 724 1120 RR2EH36JQ

RD RR2EH36TF 739 0 0
GGGCCGGCTAATAAGAAAAAGGAAAAAAAAGAAAGAATAGGTTTGGTGGGGAGAGAATGG
TAAAGGTAATCGATTCCCATTACCTGACCATCACCGCCATTGTCACTGTGGTGTATCAAT
TGGTATTCTTCGTGATCACAGCTCTTTTCAAATTCGATCAAGTTACCGACTTTGCCGGAA
GTACCAATTTCGTGATACTTGCTGTCTTGACTCTGGTTCTCAAGGGAACATGGCATTTTC
GTCAGGTAGTCTTGACTTCACTAGTAGTAGTATGGGGACTTCGTCTTGGAATGTTCCTCC
TTATGAGGATCCTGAAATGGGGTGAAGACCGACGCTTTGATGAAATTCGTGAAAATATGG
GGAAACTAGTTGTCTTTTGGACTTTTCAGGCCGTGTGGGTTTGGACAGTTAGTTTACCTG
TTACTCTTGTGAATGCAAGCAACGGTGGAAGATTGTTTCAGCCCGCGGATGTTATTGGCT
GGACTATGTGGGTTGCAGGTTTCTTGGTTGAAGCTATAGCTGATCAACAAAAGCTTTTGT
TTAAGAATCATCAAGAAAATAAAGGAAAATGGTGCGATGTTGGACTGTGGAAGTATTCAC
GCCATCCAAACTACTTTGGAGAGATGTTACTGTGGTGGGGCATATATGTGGCTTCATTGC
CTGTTCTTAAAGGTGCAGAGTACCTTGTCATAGTTGGACCCATCTTTCTCACTTTGCTCC
TTT
TCTTCGTTAGCGGCAT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2EH36JQ 596 0 0
CAACAAAAGCTTTTGTTTAAGAATCATCAAGAAAATAAAGGAAAATGGTGCGATGTTGGA
CTGTGGAAGTATTCACGCCATCCAAACTACTTTGGAGAGATGTTACTGTGGTGGGGCATA
TATGTGGCTTCATTGCCTGTTCTTAAAGGTGCAGAGTACCTTGTCATAGTTGGACCCATC
TTTCTCACTTTGCTCCTTTTTTTCGTTAGCGGCATACCATTACTCGAGGAATCGGCGGAC
AAAAAGTACGGTAACTTGGGAGCTTATAGACACTATAAGAAGACAACAAGTCCCCTTATT
CTGTTGCCTCGAGGAGTGTACGGGTACTTACCAAAGTGGTGCAAGACAGTCTTTCTCTTT
GAGTTTCCTTTGTACAGCAAGAATCTCCCTCACGAAATCACAGTCTGACGAAACTCAAAA
AAGAAACATTGACTGAGGAGATGAAGAGATGATCACATGTCCTGTGTTCCCTTATGATCA
AACTCTGCTTTTGTATAGATTCTCATTATCTTCAAATATTTGTGAAACGTTATTGATACA
TTGATTGAGAATACAATTAAGATTGAAATCAAACTTAAAAAGATGTTGGAAGCAGG

QA 1 596 1 596
DS 



AS 3 6

CO CL1500Contig1 876 2 8 U
GCCGAAGAGAAGAAACTTGAGCTAAAGCTTGGTCCCCCTGGCGAAGACGAAGATGGTTCA
TCGATGAGAAGACACATCAAGAAAGAACCAAAAGACAAATCTATCCTCTCTCTCGCTGCC
AACCACTTCTCTTCTCCTTCTTCCACCACCACCAACAAAACCACATCTCAGAAAAGAACT
GCTCCTGGTCCAGTGGTGGGTTGGCCTCCGGTTAGATCATTCAGGAAGAACTTAACAAAT
GGAAGCTCTTCAAAGCTTGGAAACGAGTCCACCTCCAATGGAGTGGTCCTCAAGAACCAG
AAGTGTGATGATGATAATGGCCGAGAAAAGCCAATGGGAGCAAAGAGGCAAGGAGGCTTG
TTCGTGAAGATCAACATGCACGGCGTTCCCATTGGTCGTAAAGTCGACCTCAATGCACAT
AATAGCTATGAACAGTTATCTCTCACTGTCGACAAGCTCTTTAGAGGTCTTCTTGCAGCC
CAAAAAGAGTCATCATCATTTGGAGAAGAAGAGAAGCCAATCACTGGATTGTTGGATGGG
AATGGAGAATATACTCTTACTTACGAGGACAATGAAGGAGACAAGATGCTTGTAGGAGAT
GTTCCATGGCATATGTTTGTATCTTCCGTGAAAAGGCTGCGTGTGATCAAAACCTCTGAG
ATTTCTTCAGCATTAACACATGGAAATGGAAATGGTAAGCAAGAGAAGAACAGAATCTGA
TGAAATTAACTTTCACAGCTTAATGAAGTAGGGATGTTTTTTTTTGCTTTTGCCTTTTTT
TTTTAACTTTGATGAGTTTTGTGGTATTTGAAATGTGTTTTTAATTCAAGTTTGATGTAC
ATTCTGGTGTGTTACATCTTCTTTTGAGAATTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED30TF U 1
AF RR2ED30JQ C 248
BS 1 709 RR2ED30TF
BS 710 710 RR2ED30JQ
BS 711 724 RR2ED30TF
BS 725 725 RR2ED30JQ
BS 726 742 RR2ED30TF
BS 743 743 RR2ED30JQ
BS 744 763 RR2ED30TF
BS 764 876 RR2ED30JQ

RD RR2ED30TF 766 0 0
GCCGAAGAGAAGAAACTTGAGCTAAAGCTTGGTCCCCCTGGCGAAGACGAAGATGGTTCA
TCGATGAGAAGACACATCAAGAAAGAACCAAAAGACAAATCTATCCTCTCTCTCGCTGCC
AACCACTTCTCTTCTCCTTCTTCCACCACCACCAACAAAACCACATCTCAGAAAAGAACT
GCTCCTGGTCCAGTGGTGGGTTGGCCTCCGGTTAGATCATTCAGGAAGAACTTAACAAAT
GGAAGCTCTTCAAAGCTTGGAAACGAGTCCACCTCCAATGGAGTGGTCCTCAAGAACCAG
AAGTGTGATGATGATAATGGCCGAGAAAAGCCAATGGGAGCAAAGAGGCAAGGAGGCTTG
TTCGTGAAGATCAACATGCACGGCGTTCCCATTGGTCGTAAAGTCGACCTCAATGCACAT
AATAGCTATGAACAGTTATCTCTCACTGTCGACAAGCTCTTTAGAGGTCTTCTTGCAGCC
CAAAAAGAGTCATCATCATTTGGAGAAGAAGAGAAGCCAATCACTGGATTGTTGGATGGG
AATGGAGAATATACTCTTACTTACGAGGACAATGAAGGAGACAAGATGCTTGTAGGAGAT
GTTCCATGGCATATGTTTGTATCTTCCGTGAAAAGGCTGCGTGTGATCAAAACCTCTGAG
ATTTCTTCAGCATTAACACATGGAAATGGAAATGGTAAGCAAGAGAAGA*CAGAATCTGA
TGAA*TTAACTTTCACAGCTTA*TGAAGTAGGGATGTTTTTTT
GCT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2ED30JQ 629 0 0
CTTCAAAGCTTGGAAACGAGTCCACCTCCAATGGAGTGGTCCTCAAGAACCAGAAGTGTG
ATGATGATAATGGCCGAGAAAAGCCAATGGGAGCAAAGAGGCAAGGAGGCTTGTTCGTGA
AGATCAACATGCACGGCGTTCCCATTGGTCGTAAAGTCGACCTCAATGCACATAATAGCT
ATGAACAGTTATCTCTCACTGTCGACAAGCTCTTTAGAGGTCTTCTTGCAGCCCAAAAAG
AGTCATCATCATTTGGAGAAGAAGAGAAGCCAATCACTGGATTGTTGGATGGGAATGGAG
AATATACTTTTACTTACGAGGACAATGAAGGAGACAAGATGCTTGTAGGAGATGTTCCAT
GGCATATGTTTGTATTTTCCGTGAAAAGGCTGGGTGTGATCAAAACCTTTGAGATTTTTT
CAGCATTAACACATGGAAATGGAAATGGTAAGCAAGAGAAGAACAGAATTTGATGAAATT
AACTTTCACAGCTTAATGAAGTAGGGATGTTTTTTTTTGCTTTTGCCTTTTTTTTTTAAC
TTTGATGAGTTTTGTGGTATTTGAAATGTGTTTTTAATTCAAGTTTGATGTACATTCTGG
TGTGTTACATCTTCTTTTGAGAATTTCAC

QA 1 629 1 629
DS 



CO CL1500Contig2 595 2 8 U
CGTACATCAGACTTGAATTAGAAACACATTTCAAATACCACAAAACTCATCAAAGTTAAG
AAAAAAAAAGGCAAAAGCAAAAAAAAAAAACCATCCCTACTTCATTAAGCTGTGAAAGTT
AATTTCATCAGCTTCTGTTCTTCTCTTGCTTACCGTTTCCATTTCCATATGTTAATGCTG
AAAAAATCTCAAAGGTTTTGATCACACGCAGCCTTTTCACGGAAGATACAAACATATGCC
ATGGGACATCTCCTACAAGCATCTTGTCTCCTTCATTGTCCTCGTAAGTAAAAGTATATT
CTCCATTCCCATCCAACAATCCAGTGATTGGTTTCTCTTCTTCTCCAAATGATGATGACT
CTTTTTGGGCTGCAAGAAGACCTCTAAAGAGCTTGTCGACAGTGAGAGACAACTGTTCAT
AGCTATTATGCGCATTGAGGTCGACTTTACGACCAATGGGAACGCCGTGCATGTTGATCT
TCACGAACAAGCCTCCTTGCCTCTTGGCTCCCATTGGCTTTTCTCGGCCATTATCATCGC
TACACTTCTGGTTCGTGAGGACCACTTCATTGGAGGTGGACTCGTTTCCAAGCTT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK34JQ U 1
AF RR2H018JQ U 1
BS 1 52 RR2GK34JQ
BS 53 53 RR2H018JQ
BS 54 182 RR2GK34JQ
BS 183 183 RR2H018JQ
BS 184 291 RR2GK34JQ
BS 292 292 RR2H018JQ
BS 293 580 RR2GK34JQ
BS 581 595 RR2H018JQ

RD RR2GK34JQ 580 0 0
CGTACATCAGACTTGAATTAGAAACACATTTCAAATACCACAAAACTCATCAGAGTTAAG
AAAAAAAAAGGCAAAAGCAAAAAAAAAAAACCATCCCTACTTCATTAAGCTGTGAAAGTT
AATTTCATCAGCTTCTGTTCTTCTCTTGCTTACCGTTTCCATTTCCATATGTTAATGCTG
AAGAAATCTCAAAGGTTTTGATCACACGCAGCCTTTTCACGGAAGATACAAACATATGCC
ATGGGACATCTCCTACAAGCATCTTGTCTCCTTCATTGTCCTCGTAAGTAAGAGTATATT
CTCCATTCCCATCCAACAATCCAGTGATTGGTTTCTCTTCTTCTCCAAATGATGATGACT
CTTTTTGGGCTGCAAGAAGACCTCTAAAGAGCTTGTCGACAGTGAGAGACAACTGTTCAT
AGCTATTATGCGCATTGAGGTCGACTTTACGACCAATGGGAACGCCGTGCATGTTGATCT
TCACGAACAAGCCTCCTTGCCTCTTGGCTCCCATTGGCTTTTCTCGGCCATTATCATCGC
TACACTTCTGGTTCGTGAGGACCACTTCATTGGAGGTGGA

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2H018JQ 595 0 0
C
GTACATCAGACTTGAATTAGAAACACATTTCAAATACCACAAAACTCATCAAAGTTAAGA
AAAAAAAAGGCAAAAGCAAAAAAAAAAAACCATCCCTACTTCATTAAGCTGTGAAAGTTA
ATTTCATCAGCTTCTGTTCTTCTCTTGCTTACCGTTTCCATTTCCATATGTTAATGCTGA
AAAAATCTCAAAGGTTTTGATCACACGCAGCCTTTTCACGGAAGATACAAACATATGCCA
TGGGACATCTCCTACAAGCATCTTGTCTCCTTCATTGTCCTCGTAAGTAAAAGTATATTC
TCCATTCCCATCCAACAATCCAGTGATTGGTTTCTCTTCTTCTCCAAATGATGATGACTC
TTTTTGGGCTGCAAGAAGACCTCTAAAGAGCTTGTCGACAGTGAGAGACAACTGTTCATA
GCTATTATGCGCATTGAGGTCGACTTTACGACCAATGGGAACGCCGTGCATGTTGATCTT
CACGAACAAGCCTCCTTGCCTCTTGGCTCCCATTGGCTTTTCTCGGCCATTATCATCGCT
ACACTTCTGGTTCGTGAGGACCACTTCATTGGAGGTGGACTCGTTTCCAAGCTT

QA 2 595 2 595
DS 



CO CL1500Contig3 816 2 4 U
GGATTCCATCTCCTTCCTCCCTCTTCTGTCTTTCAGAGATTTGTTCTGTCGCGTGAACAA
GTTGTCGACTTTCGGACAAACACTTTCGGTCCAAGAACACCAAATTTCTCTTAAAAAAAA
CATAATGGAGGGTTACACAAGAAACTGGTTTCACGATGGCAAAGCCTCTGTTTACAACTC
CGAAGAGAAGAAACTTGAGCTAAAGCTTGGTCCCCCTGGTGAAGACCAAGATGGTTCATC
GATTATAAGACACATCAAGAAAGAACCAAAAGACAAATCTATCCTCTCTCTCGCTGCCAA
CCACTTCTCTTCTCCTTCTTCCACCACCACCAACAAAACCACATCTCAGAAAAGAACTGC
TCCTGGTCCAGTGGTGGGTTGGCCTCCGGTTAGATCATTCAGGAAGAACTTAACAAATGG
AAGCTCTTCGAAGCTTGGAAACGAGTCCACCTCCAATGAAGTGGTCCTCACGAACCAGAA
GTGTAGCGATGATAATGGCCGAGAAAAGCCAATGGGAGCCAAGAGGCAAGGAGGCTTGTT
CGTGAAGATCAACATGCACGGCGTTCCCATTGGTCGTAAAGTCGACCTCAATGCGCATAA
TAGCTATGAACAGTTGTCTCTCACTGTCGACAAGCTCTTTAGAGGTCTTCTTGCAGCCCA
AAAAGAGTCATCATCATTTGGAGAAGAAGAGAAACCAATCACTGGATTGTTGGATGGGAA
TGGAGAATATACTCTTACTTACGAGGACATGAAGAGACAGATGCTTGTAGAGATGTCCAT
GGCATATGTTTGTATCTTCGTGAAAGGTGCGTGTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK34TF U 1
AF RR2H018TF U 1
BS 1 687 RR2GK34TF
BS 688 688 RR2H018TF
BS 689 749 RR2GK34TF
BS 750 816 RR2H018TF

RD RR2GK34TF 754 0 0
GGATTCCATCTCCTTCCTCCCTCTTCTGTCTTTCAGAGATTTGTTCTGTCGCGTGAACAA
GTTGTCGACTTTCGGACAAACACTTTCGGTCCAAGAACACCAAATTTCTCTTAAAAAAAA
CATAATGGAGGGTTACACAAGAAACTGGTTTCACGATGGCAAAGCCTCTGTTTACAACTC
CGAAGAGAAGAAACTTGAGCTAAAGCTTGGTCCCCCTGGTGAAGACCAAGATGGTTCATC
GATTATAAGACACATCAAGAAAGAACCAAAAGACAAATCTATCCTCTCTCTCGCTGCCAA
CCACTTCTCTTCTCCTTCTTCCACCACCACCAACAAAACCACATCTCAGAAAAGAACTGC
TCCTGGTCCAGTGGTGGGTTGGCCTCCGGTTAGATCATTCAGGAAGAACTTAACAAATGG
AAGCTCTTCGAAGCTTGGAAACGAGTCCACCTCCAATGAAGTGGTCCTCACGAACCAGAA
GTGTAGCGATGATAATGGCCGAGAAAAGCCAATGGGAGCCAAGAGGCAAGGAGGCTTGTT
CGTGAAGATCAACATGCACGGCGTTCCCATTGGTCGTAAAGTCGACCTCAATGCGCATAA
TAGCTATGAACAGTTGTCTCTCACTGTCGACAAGCTCTTTAGAGGTCTTCTTGCAGCCCA
AAAAGAGTCATCATCATTTGGAGAAGA*GAGAAACCAATCACTGGATTGTTGGATGGGAA
TGGAGAATATACTCTTACTTACGAGGACA
TGAAG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2H018TF 816 0 0
GGATTCCATCTCCTTCCTCCCTCTTCTGTCTTTCAGAGATTTGTTCTGTCGCGTGAACAA
GTTGTCGACTTTCGGACAAACACTTTCGGTCCAAGAACACCAAATTTCTCTTAAAAAAAA
CATAATGGAGGGTTACACAAGAAACTGGTTTCACGATGGCAAAGCCTCTGTTTACAACTC
CGAAGAGAAGAAACTTGAGCTAAAGCTTGGTCCCCCTGGTGAAGACCAAGATGGTTCATC
GATTATAAGACACATCAAGAAAGAACCAAAAGACAAATCTATCCTCTCTCTCGCTGCCAA
CCACTTCTCTTCTCCTTCTTCCACCACCACCAACAAAACCACATCTCAGAAAAGAACTGC
TCCTGGTCCAGTGGTGGGTTGGCCTCCGGTTAGATCATTCAGGAAGAACTTAACAAATGG
AAGCTCTTCGAAGCTTGGAAACGAGTCCACCTCCAATGAAGTGGTCCTCACGAACCAGAA
GTGTAGCGATGATAATGGCCGAGAAAAGCCAATGGGAGCCAAGAGGCAAGGAGGCTTGTT
CGTGAAGATCAACATGCACGGCGTTCCCATTGGTCGTAAAGTCGACCTCAATGCGCATAA
TAGCTATGAACAGTTGTCTCTCACTGTCGACAAGCTCTTTAGAGGTCTTCTTGCAGCCCA
AAAAGAGTCATCATCATTTGGAGAAGAAGAGAAAC*AATCACTGGATTGTTGGATGGGAA
TGGAGAATATACTCTTACTTACGAGGACATGAAGAGACAGATGCTTGTAGAGATGTCCAT
GGCATATGTTTGTATCTTCGTGAAAGGTGCGTGTGA

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 4

CO CL1501Contig1 1254 4 15 U
GTGAAAATACACAAATACATAAATATATAGTAAGAGGTCAACTACAAGTTTTGTTCTCAT
GCCACCACGCACCAAAACCACAAAAAAAAGTGAAGCAGAAGCAAAGTTTACAAGTAAATT
CAAGAATCGAGACCGACAAGATGACCTAACACAAATTTTAGACTACCATTTCACAACACA
ATCCCACATTTCAAAGACCAAAACACTGGGCACATGCATGCAAAAAAAAAGTAAAAAACA
CGAAAACGACTCCTAATCCTTCTTCTTGTCCTTTAATGGCCCCCTTGGGATTTTGCTCAA
TACCCTTGCGTCCAACACAGCATAATGCTTCTTCAACTCAGCCATTGCTTTCTCACCATA
TGAGTCTACTTTGTCTTCGTACTTGCCGTAAACAAGAGGAACAGTGAAGAGTAAAACCAG
AGCTATGTATGCCAATGTCAAGAAACTACAGCATCCACCCAAGATAGATAGAATCCACAG
CCCGAACAGAGCTGAGAGGAACTTCTTGAGATCCCTTCCAGATGCAATCTCGTGAAGAGA
AGAAAACCCACGGTTAATTTCGATTCTGAGCCCAGATGCAAGCTGAAGAAGAGACTCCTC
AGGGATATGCAGTTCAGGAATCTTTGGTGTAGACTTGTGAATGAACATGGTGACATTAGA
CCAAAGAAACAGCACAGCGAGAGCGACGATCATAACGTGACAGAGCAGAGTGAGAAGATG
ATACTCCATGAGTTCAAAGAGCACCCAGGCTACAGTTGCGCCACCAAGCACACCACCTGA
CATCTTCTTGTTCTTCCACATAAATATATCAGCCGGTTTTCCGCCACCGAGAACCTTGTG
AACGGGCCTCTCCCTGCCGAACAAACGGTAAACCTTCGATTTCAGAGACGACGGTTTCTT
CTCGCTCTCGTCATCTGATGAAGACGACGAGTCACCTTTGTGGTGGATCTTCTCAGATAT
CTTGTCCATCAACGATTCTCTCTCTACGATTTCAACCGCCGGATCCGAATTAGGGAGAGA
TTCTTCGTGCTTGTGTTCGTCCGCCATTGTTTCCGATCGATTTCGTGAAGCAGAATCTAG
GGAACAACCAAATAAAGCGACTTCTGAGGGAAGAATCTCGAAGGAGGCCCTAAAACGATA
TTTAACTCGATCTGAGCCGTTGAATTGGTTTGATCTGAGCCGTTGATTTAACCTGCTTCT
TTTTTTAACTCGAGCGACGCTTGGGGGAAACGATAAAAGGCATGATGGTGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU72JQ U 73
AF RR2DP85JQ U 1
AF RR2DP85TF C 438
AF RR2CU72TF C 562
BS 1 200 RR2DP85JQ
BS 201 201 RR2CU72JQ
BS 202 208 RR2DP85JQ
BS 209 209 RR2CU72JQ
BS 210 233 RR2DP85JQ
BS 234 234 RR2CU72JQ
BS 235 385 RR2DP85JQ
BS 386 386 RR2CU72JQ
BS 387 390 RR2DP85JQ
BS 391 391 RR2CU72JQ
BS 392 413 RR2DP85JQ
BS 414 414 RR2CU72JQ
BS 415 709 RR2DP85JQ
BS 710 1064 RR2DP85TF
BS 1065 1254 RR2CU72TF

RD RR2CU72JQ 422 0 0
CAAAACCACAAAAAAAAGTGAAGCAGAAGCAAAGTTTACAAGTAAATTCAAGAATCGAGA
CCGACAAGATGACCTAACACAAATTTTAGACTACCATTTCACAACACAATCCCACATTTC
AAAGACCAAAACACTGGGCACATGCATGCAAAAAAAAAGTAAAAAACACGAAAACGACTC
CTAATCCTTCTTCTTGTCCTTTAATGGCCCCCTTGGGATTTTGCTCAATACCTTTGCGTC
CAACACAGCATAATGCTTCTTCAACTCAGCCATTGCTTTCTCACCATATGAGTCTACTTT
GTCTTCGTACTTGCCGTAAACAAGAGGAACAGTGAAGAGTAAAACCAGAGCTATGTATGC
CAATGTCAAGAAACTACAGCATCCACCCAAGATAGATAGAATCCACAGCCCGAACAGAGC
TG

QA 1 422 1 422
DS 

RD RR2DP85JQ 709 0 0
GTGAAAATACACAAATACATAAATATATAGTAAGAGGTCAACTACAAGTTTTGTTCTCAT
GCCACCACGCACCAAAACCACAAAAAAAAGTGAAGCAGAAGCAAAGTTTACAAGTAAATT
CAAGAATCGAGACCGACAAGATGACCTAACACAAATTTTAGACTACCATTTCACAACACA
ATCCCACATTTCAAAGACCAGAACACTGTGCACATGCATGCAAAAAAAAAGTAGAAAACA
CGAAAACGACTCCTAATCCTTCTTCTTGTCCTTTAATGGCCCCCTTGGGATTTTGCTCAA
TACCCTTGCGTCCAACACAGCATAATGCTTCTTCAACTCAGCCATTGCTTTCTCACCATA
TGAGTCTACTTTGTCTTCGTACTTGTCGTAGACAAGAGGAACAGTGAAGAGTAGAACCAG
AGCTATGTATGCCAATGTCAAGAAACTACAGCATCCACCCAAGATAGATAGAATCCACAG
CCCGAACAGAGCTGAGAGGAACTTCTTGAGATCCCTTCCAGATGCAATCTCGTGAAGAGA
AGAAAACCCACGGTTAATTTCGATTCTGAGCCCAGATGCAAGCTGAAGAAGAGACTCCTC
AGGGATATGCAGTTCAGGAATCTTTGGTGTAGACTTGTGAATGAACATGGTGACATTAGA
CCAAAGAAACAGCACAGCGAGAGCGACGATCATAACGTGACAGAGCAGA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2DP85TF 630 0 0
TCAAGAAACTACAGCATCCACCCAAGATAGATAGAATCCACAGCCCGAACAGAGCTGAGA
GGAACTTCTTGAGATCCCTTCCAGATGCAATCTCGTGAAGAGAAGAAAACCCACGGTTAA
TTTCGATTCTGAGCCCAGATGCAAGCTGAAGAAGAGACTCCTCAGGGATATGCAGTTCAG
GAATCTTTGGTGTAGACTTGTGAATGAACATGGTGACATTAGACCAAAGAAACAGCACAG
CGAGAGCGACGATCATAACGTGACAGAGCAGAGTGAGAAGATGATACTCCATGAGTTCAA
AGAGCACCCAGGCTACAGTTGCGCCACCAAGCACACCACCTGACATCTTCTTGTTCTTCC
ACATAAATATATCAGCCGGTTTTCCGCCACCGAGAACCTTGTGAACGGGCCTCTCCCTGC
CGAACAAACGGTAAACCTTCGATTTCAGAGACGACGGTTTCTTCTCGCTCTCGTCATCTG
ATGAAGACGACGAGTCACCTTTGTGGTGGATCTTCTCAGATATCTTGTCCATCAACGATT
CTCTCTCTACGATTTCAACCGCCGGATCCGAATTAGGGAGAGATTCTTCGTGCTTGTGTT
CGTCCGCCATTGTTTCCGATCGATTTC
CCT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2CU72TF 693 0 0
GATTCTGAGCCCAGATGCAAGCTGAAGAAGAGGCTCCTCAGGGATATGCAGTTCAGGAAT
CTTTGGTGTAGACTTGTGAATGAACATGGTGACATTAGACCAAAGAAACAGCACAGCGAG
AGCGACGATCATAACGTGACAGAGCAGAGTGAGAAGATGATACTCCATGAGTTCAAAGAG
CACCCAGGCTACAGTTGCGCCACCAAGCACACCACCTGACATCTTCTTGTTCTTCCACAT
AAATATATCAGCCGGTTTTCCGCCACCGAGAACCTTGTGAACGGGCCTCTCCCTGCCGAA
CAAACGGTAAACCTTCGATTTCAGAGACGACGGTTTCTTCTCGCTCTCGTCATCTGATGA
AGACGACGAGTCACCTTTGTGGTGGATCTTCTCAGATATCTTGTCCATCAACGATTCTCT
CTCTACGATTTCAACCGCCGGATCCGAATTAGGGAGAGATTCTTCGTGCTTGTGTTCGTC
CGCCATTGTTTCCGATCGATTTCGTGAAGCAGAATCTAGGGAACAACCAAATAAAGCGAC
TTCTGAGGGAAGAATCTCGAAGGAGGCCCTAAAACGATATTTAACTCGATCTGAGCCGTT
GAATTGGTTTGATCTGAGCCGTTGATTTAACCTGCTTCTTTTTTTAACTCGAGCGACGCT
TGGGGGAAACGATAAAAGGCATGATGGTGGTCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 2 4

CO CL1502Contig1 810 2 3 U
AAATCGAAAAACCCATTAATCTGAAAATCCGGGGAAAGAAAGATGGAGCCATTGGTGGAA
GACGAAGAGTACAGCTTCAGGGAAGTGGTGTTGCCGTCGCTGATCCCTGTCGTGCCGGAG
CCGGAGCTAGAGAGGGAGAACGGAGAGAGGAGAATAGGGAGAGATGTGATCGTGGCCGTT
GATCATGGTCCCAACAGCAAACACGCCTTTGATTGGGCTCTCGTTCATTTCTGCCGCCTC
GCCGATACTCTTCACCTCGTCCACGCCGTCTCAAGTGTTAAGAACGATGTTGTGTACGAG
ACTAGCCGAGCACTGATGGAGAAGCTCGCTGTTGAGGCCTTTCAAGTTGCCATGGTGAAG
AGTGTGGCTCGTGTTGTTGAAGGGGACGCTGGTAAAGTAATCTGCAAGGAAGCTGAGATA
TTGAAGCCTGCGGCTGTCATTATGGGTACCCGAGGCCGGGGCTTAGTGAGGAGTGTGCTT
CAAGGGAGTGTAAGCGAGTATTGTTTCCACAATTGCAAATCCGCTCCTGTCATCATCGTT
CCTGGGAAAGAAGCTGGAGACGAATCGATTGTAAGTTGGACAAAATCAGGAGATCCTAAA
CCCTGAAGAAAAAGCTCTCCAGTCTCTTTGTACCTTTTTATCTTTCTCATTGTAGTTGCA
GTCCTTGTGTCAGAATGTGTTGTAGAACCTTCAAGTAATTGTCTTTTGCTATTCTTCTTC
TCTCTGTGTGTATGTGTTTTGTAGTTTCAATTTTTGTGTATAAAAAAAATAACATTTGTT
ATGAGTATGCAATGGTGTTGTGATGTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX26TFB U 67
AF RR2AX26JQ C 1
BS 1 66 RR2AX26JQ
BS 67 740 RR2AX26TFB
BS 741 810 RR2AX26JQ

RD RR2AX26TFB 675 0 0
GAGTACAGCTTCAGGGAAGTGGTGTTGCCGTCGCTGATCCCTGTCGTGCCGGAGCCGGAG
CTAGAGAGGGAGAACGGAGAGAGGAGAATAGGGAGAGATGTGATCGTGGCCGTTGATCAT
GGTCCCAACAGCAAACACGCCTTTGATTGGGCTCTCGTTCATTTCTGCCGCCTCGCCGAT
ACTCTTCACCTCGTCCACGCCGTCTCAAGTGTTAAGAACGATGTTGTGTACGAGACTAGC
CGAGCACTGATGGAGAAGCTCGCTGTTGAGGCCTTTCAAGTTGCCATGGTGAAGAGTGTG
GCTCGTGTTGTTGAAGGGGACGCTGGTAAAGTAATCTGCAAGGAAGCTGAGATATTGAAG
CCTGCGGCTGTCATTATGGGTACCCGAGGCCGGGGCTTAGTGAGGAGTGTGCTTCAAGGG
AGTGTAAGCGAGTATTGTTTCCACAATTGCAAATCCGCTCCTGTCATCATCGTTCCTGGG
AAAGAAGCTGGAGACGAATCGATTGTAAGTTGGACAAAATCAGGAGATCCTAAACCCTGA
AGAAAAAGCTCTCCAGTCTCTTTGTACCTTTTTATCTTTCTCATTGTAGTTGCAGTCCTT
GTGTCAGAATGTGTTGTAGAACCTTCAAGTAATTGTCTTTTGCTATTCTTCTTCTCTCTG
TGTGTATGTGTTTT
G

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2AX26JQ 810 0 0
AAATCGAAAAACCCATTAATCTGAAAATCCGGGGAAAGAAAGATGGAGCCATTGGTGGAA
GACGAAGAGTACAGCTTCAGGGAAGTGGTGTTGCCGTCGCTGATCCCTGTCGTGCCGGAG
CCGGAGCTAGAGAGGGAGAACGGAGAGAGGAGAATAGGGAGAGATGTGATCGTGGCCGTT
GATCATGGTCCCAACAGCAAACACGCCTTTGATTGGGCTCTCGTTCATTTCTGCCGCCTC
GCCGATACTCTTCACCTCGTCCACGCCGTCTCAAGTGTTAAGAACGATGTTGTGTACGAG
ACTAGCCGAGCACTGATGGAGAAGCTCGCTGTTGAGGCCTTTCAAGTTGCCATGGTGAAG
AGTGTGGCTCGTGTTGTTGAAGGGGACGCTGGTAAAGTAATCTGCAAGGAAGCTGAGATA
TTGAAGCCTGCGGCTGTCATTATGGGTACCCGAGGCCGGGGCTTAGTGAGGAGTGTGCTT
CAAGGGAGTGTAAGCGAGTATTGTTTCCACAATTGCAAATCCGCTCCTGTCATCATCGTT
CCTGGGAAAGAAGCTGGAGACGAATCGATTGTAAGTTGGACAAAATCAGGAGATCCTAAA
CCCTGAAGAAAAAGCTCTCCAGTCTCTTTGTACCTTTTTATCTTTCTCATTGTAGTTGCA
GTCCTTGTGTCAGAATGTGTTGTAGAACCTTCAAGTAATTGTCTTTTGCTATTCTTCTTC
TCTCTGTGTGTATGTGTTTTGTAGTTTCAATTTTTGTGTATAAAAAAAATAACATTTGTT
ATGAGTATGCAATGGTGTTGTGATGTTACG

QA 1 810 1 810
DS 



CO CL1502Contig2 771 2 3 U
GGAACCCATTTATCGAAAATCCGGGGAAAGAAAGATGGAGCCATTGGTGGAAGACGAAGA
GTACAGCTTCAGGGAAGTGGTGTTGCCGTCGCTGATCCCGGTCGTGCCGGAGCCGGAGCT
AGAGAGGGAGAACGGAGAGAGGAGAAGAGGGAGAGATGTGATCGTGGCCGTAGATCATGG
TCCCAACAGCAAACACGCCTTTGACTGGGCTCTCGTTCATTTCTGCCGCCTCGCCGATAC
CCTACACCTCGTCCACGCCGTCTCAAGTGTTAAGAACGATGTTGTGTACGAGACGAGCCA
AGCACTGATGGAGAAGCTCGCTGTTGAGGCCTTTCAAGTTGCCATGGTGAAGAGTGTGGC
TCGTGTTGTTGAAGGGGGAGCAGGTAAAGTAATCTGCAAGGAAGCTGAGAAATTGAAGCC
TGCGGCTGTCATTATGGGTACCCGAGGCCGGAGCTTAGTTAGGAGTGTGCCACAAGGGAG
TGTAAGCGAGTATTGTTTCCACAATTGCAAATCCGCTCCTGTCATTATCGTTCCTGGGAA
AGAAGCTGGAGACGAATCGATTGTAAATTGGACAAAATCACGAGATCATAAACCCTGAAG
AAAAAGCTCTCCAGTCTCTGTGTACCTTGTATCTTTCTCATTGTAGTTGCAGTCCTTGTT
TCAGAATGTGTTGTACTTCAAGTAATTGTCTTTTGCTATTCTTCTTCTTCTCTGTGTGTA
TGTGTTTTGTAGTTTCAAGTTTGTTATGAAAAAAAAACATTTGTTATGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC71TF U 1
AF RR2EC71JQ C 1
BS 1 14 RR2EC71JQ
BS 15 659 RR2EC71TF
BS 660 771 RR2EC71JQ

RD RR2EC71TF 661 0 0
GGAACCCATTTATC
GAAAATCCGGGGAAAGAAAGATGGAGCCATTGGTGGAAGACGAAGAGTACAGCTTCAGGG
AAGTGGTGTTGCCGTCGCTGATCCCGGTCGTGCCGGAGCCGGAGCTAGAGAGGGAGAACG
GAGAGAGGAGAAGAGGGAGAGATGTGATCGTGGCCGTAGATCATGGTCCCAACAGCAAAC
ACGCCTTTGACTGGGCTCTCGTTCATTTCTGCCGCCTCGCCGATACCCTACACCTCGTCC
ACGCCGTCTCAAGTGTTAAGAACGATGTTGTGTACGAGACGAGCCAAGCACTGATGGAGA
AGCTCGCTGTTGAGGCCTTTCAAGTTGCCATGGTGAAGAGTGTGGCTCGTGTTGTTGAAG
GGGGAGCAGGTAAAGTAATCTGCAAGGAAGCTGAGAAATTGAAGCCTGCGGCTGTCATTA
TGGGTACCCGAGGCCGGAGCTTAGTTAGGAGTGTGCCACAAGGGAGTGTAAGCGAGTATT
GTTTCCACAATTGCAAATCCGCTCCTGTCATTATCGTTCCTGGGAAAGAAGCTGGAGACG
AATCGATTGTAAATTGGACAAAATCACGAGATCATAAACCCTGAAGAAAAAGCTCTCCAG
TCTCTGTGTACCTTGTATCTTTCTCATTGTAGTTGCAGTCCTTGT
TT

QA 15 659 15 659
DS 

RD RR2EC71JQ 771 0 0
GGAACCCATTTATCGAAAATCCGGGGAAAGAAAGATGGAGCCATTGGTGGAAGACGAAGA
GTACAGCTTCAGGGAAGTGGTGTTGCCGTCGCTGATCCCGGTCGTGCCGGAGCCGGAGCT
AGAGAGGGAGAACGGAGAGAGGAGAAGAGGGAGAGATGTGATCGTGGCCGTAGATCATGG
TCCCAACAGCAAACACGCCTTTGACTGGGCTCTCGTTCATTTCTGCCGCCTCGCCGATAC
CCTACACCTCGTCCACGCCGTCTCAAGTGTTAAGAACGATGTTGTGTACGAGACGAGCCA
AGCACTGATGGAGAAGCTCGCTGTTGAGGCCTTTCAAGTTGCCATGGTGAAGAGTGTGGC
TCGTGTTGTTGAAGGGGGAGCAGGTAAAGTAATCTGCAAGGAAGCTGAGAAATTGAAGCC
TGCGGCTGTCATTATGGGTACCCGAGGCCGGAGCTTAGTTAGGAGTGTGCCACAAGGGAG
TGTAAGCGAGTATTGTTTCCACAATTGCAAATCCGCTCCTGTCATTATCGTTCCTGGGAA
AGAAGCTGGAGACGAATCGATTGTAAATTGGACAAAATCAGGAGATCATAAACCCTGAAG
AAAAAGCTCTCCAGTCTCTGTGTACCTTGTATCTTTCTCATTGTAGTTGCAGTCCTTGTT
TCAGAATGTGTTGTACTTCAAGTAATTGTCTTTTGCTATTCTTCTTCTTCTCTGTGTGTA
TGTGTTTTGTAGTTTCAAGTTTGTTATGAAAAAAAAACATTTGTTATGCAC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 6

CO CL1503Contig1 986 6 12 U
GGACAAGGACGTTGGTTGATTAGTCGTCGGTCGTTGAAGGAAGAAGAAGTCTTTTCTCCT
TCTTTCTTCACCGTACGATCGTTGTCTATACAATGAGAGAAACATCAAAGCCAATGGCTA
CAAGCTCTTCTTCCTCCTCCATCTCCTCAATTCCTCCTTCGTCTCCATCATCTTCTCCAG
CCACCACGACCACGCCGCCACGTCAGAACAATCTCGTCAAGCCACCATCTTCAAAAAAGA
AGAAAAACAAATCAAACGTGTTCGGAGTCTTACGCACCGTGTTTCGCTCTTTCCCTATCT
TCACAACATCATCCCTAGCATGCAAAATCCCGGTTATCAATCCCGGTTTAGGCGTAGCAG
AACCTCATCACAACACGTCAAGAGTCACCGGCACGTTGTTCGGATACCGCAAAGGCCGAG
TAAGTCTCTCCATTCAAGAAACCCCTAAATGTCTACCTTCTTTAGTCGTAGAGCTCGCCA
TGCAAACCACAACGTTTCAAAAAGAGCTTAGCATGGGGATGGTTAGAATCGCTCTCGAGA
CCGAGAAACAACCTAACAATAATAACA***AGACAGAAAAGAGCACAAATATTTTGGATG
AACCGTTGTGGACAATGTTTTGTAAAGGAGAGAAAACTGGTTACGGTGTGAGACGTGAAG
CGAACGATGAAGACTTAAGCGTGATGGAACTGTTACGACCGGTGTCTATGGGCGCAGGAG
TTTTGCCTGGAAACTCGGAGTCGGAAGGACCAGACGGTGAAATGGCGTATATGAGAGCTT
ACTTTGAGAGAGTTGTTGGGTCTAAAGATTCAGAGACTTTTTATATGTTGAGTCCTGAAG
GTAATAATGGACCTGAGCTTAGTTTTTTCTTTGTAAGAGTTTGATTAATTTTGTTAATTT
AACGTGCATGTAAAGGCCGGAGACGGTGGTTGACGTTATAT**ATATAGTATTATTTTAG
TATGATTAAATTATATTCTTCTCCCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM32TF U 1
AF RR2FB72TF U 1
AF RR2AA38TF U 3
AF RR2FM32JQ C 93
AF RR2FB72JQ C 271
AF RR2AA38JQ C 130
BS 1 317 RR2FB72TF
BS 318 318 RR2FM32TF
BS 319 645 RR2FB72TF
BS 646 646 RR2FM32TF
BS 647 717 RR2FB72TF
BS 718 718 RR2FM32JQ
BS 719 727 RR2FB72TF
BS 728 745 RR2AA38TF
BS 746 830 RR2FM32JQ
BS 831 831 RR2FB72JQ
BS 832 961 RR2FM32JQ
BS 962 986 RR2AA38JQ

RD RR2FM32TF 713 0 0
GGAC
AAGGACGTTGGTTGATTAGTCGTCGGTCGTTGAAGGAAGAAGAAGTCTTTTCTCCTTCTT
TCTTCACCGTACGATCGTTGTCTATACAATGAGAGAAACATCAAAGCCAATGGCTACAAG
CTCTTCTTCCTCCTCCATCTCCTCAATTCCTCCTTCGTCTCCATCATCTTCTCCAGCCAC
CACGACCACGCCGCCACGTCAGAACAATCTCGTCAAGCCACCATCTTCAAAAAAGAAGAA
AAACAAATCAAACGTGTTCGGAGTCTTACGCACCGTGTTTCGCTCTTTCCCTATCTTCAC
AACATCATCCCTAGCATGCAAAATCCCGGTTATCAATCCCGGTTTAGGCGTAGCAGAACC
TCATCACAACACGTCAAGAGTCACCGGCACGTTGTTCGGATACCGCAAAGGCCGAGTAAG
TCTCTCCATTCAAGAAACCCCTAAATATCTACCTTCTTTAGTCGTAGAGCTCGCCATGCA
AACCACAACGTTTCAAAAAGAGCTTAGCATGGGGATGGTTAGAATCGCTCTCGAGACCGA
GAAACAACCTAACAATAATAACA***AGACAGAAAAGAGCACAAATATTTTGGATGAACC
GTTGTGGACAATGTTTTGTAAAGGAGAGAAAACTGGTTACGGTGTGAGACGTGAAGCGAA
CGATGAAGACTTAAGCGTGATGGA*CTGTTACGACCGGTGTCTATGGGC

QA 5 713 5 713
DS 

RD RR2FB72TF 727 0 0
GGACAAGGACGTTGGTTGATTAGTCGTCGGTCGTTGAAGGAAGAAGAAGTCTTTTCTCCT
TCTTTCTTCACCGTACGATCGTTGTCTATACAATGAGAGAAACATCAAAGCCAATGGCTA
CAAGCTCTTCTTCCTCCTCCATCTCCTCAATTCCTCCTTCGTCTCCATCATCTTCTCCAG
CCACCACGACCACGCCGCCACGTCAGAACAATCTCGTCAAGCCACCATCTTCAAAAAAGA
AGAAAAACAAATCAAACGTGTTCGGAGTCTTACGCACCGTGTTTCGCTCTTTCCCTATCT
TCACAACATCATCCCTAACATGCAAAATCCCGGTTATCAATCCCGGTTTAGGCGTAGCAG
AACCTCATCACAACACGTCAAGAGTCACCGGCACGTTGTTCGGATACCGCAAAGGCCGAG
TAAGTCTCTCCATTCAAGAAACCCCTAAATGTCTACCTTCTTTAGTCGTAGAGCTCGCCA
TGCAAACCACAACGTTTCAAAAAGAGCTTAGCATGGGGATGGTTAGAATCGCTCTCGAGA
CCGAGAAACAACCTAACAATAATAACA***AGACAGAAAAGAGCACAAATATTTTGGATG
AACCGTTGTGGACAATGTTTTGTAAAGGAGAGAAAACTGGTTACG*TGTGAGACGTGAAG
CGAACGATGAAGACTTAAGCGTGATGGAACTGTTACGACCGGTGTCTATGGGCGCAG*AG
TTTTGCC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2AA38TF 750 0 0
GG
AAGGACGTTGGTTGATTAGTCGTCGGTCGTTGAAGGAAGAAGAAGTCTTTTCTCCTTCTT
TCTTCACCGTACGATCGTTGTCTATACAATGAGAGAAACATCAAAGCCAATTGCTACAAG
CTCTTCTTCCTCCTCCATCTCCTCAATTCCTCCTTCGTCTCCATCATCTTCTCCAGCCAC
CACGACCACGCCGCCACGTCAGAACAATCTCCTCAAGCCACCATCTTCAAAAAAGAAGAA
AAACAAATCAAACGTGTTCGGAGTCTTACGCACCGTGTTTCGCTCTTTTCCTATCTTCAC
AACATCATCCCTAGCATGCAAAATCCCGGTTATCAATCCCGGTTCAGGCGTAGCAGAACC
TCATCACAACACGTCAAGAGTCACCGGCACATTGTTTGGATACCGTAAAGGCCGAGTAAG
TCTCTCCATTCAAGAAACCCCTAAATGTCTACCTTCTTTAGTCGTAGAGCTCGCCATGCA
AACCACAACGTTTCAAAAAGAACTTAGCATGGGGATGGTTAGAATCGCTCTCGAGACCGA
GAAACAACCTAACAATAATAACAACAAGACAGAAAAGAGCACAAATATTTTGGATGAACC
GTTGTGGACGATGTTTTGTAAAGGAGAGAAAACTGGTTACGGTGTGAGACGTGAAGCGAA
CGATGAAGACTTAAGCGTGATGGAACTGTTACGCCCGGTGTCTATGGGCGCAG*AGTTTT
GCCTGGAAACTCGGAGTCGGA
GGACCAG

QA 3 743 3 743
DS 

RD RR2FM32JQ 872 0 0
ATGAGAGAAACATCAAAGCCAATGGCTACAAGCTCTTCTTCCTCCTCCATCTCCTCAATT
CT**CTTCGTCTCCATCATCTTCTCCAGCCACCACGACCACGCCGCCACGTCAGAACAAT
CTCGTCAAGCCACCATCTTCAAAAAAGAAGAAAAACAAATCAAACGTGTTCGGAGTCTTA
CGCACCGTGTTTCGCTCTTTCCCTATCTTCACAACATCATCCCTAGCATGCAAAATCCCG
GTTATCAATCCCGGTTTAGGCGTAGCAGAACCTCATCACAACACGTCAAGAGTCACCGGC
ACGTTGTTCGGATACCGCAAAGGCCGAGTAAGTCTCTCCATTCAAGAAACCCCTAAATAT
CTACCTTCTTTAGTCGTAGAGCTCGCCATGCAAACCACAACGTTTCAAAAAGAGCTTAGC
ATGGGGATGGTTAGAATCGCTCTCGAGACCGAGAAACAACCTAACAATAATAACA***AG
ACAGAAAAGAGCACAAATATTTTGGATGAACCGTTGTGGACAATGTTTTGTAAAGGAGAG
AAAACTGGTTACGGTGTGAGACGTGAAGCGAACGATGAAGACTTAAGCGTGATGGAACTG
TTACGACCGGTGTCTATGGGCGCAGGAGTTTTGCCTGGAAACTCGGAGTCGGAAGGACCA
GACGGTGAAATGGCGTATATGAGAGCTTACTTTGAGAGAGTTGTTGGGTCTAAAGATTCA
GAGACTTTTTATATGTTGGGTCCTGAAGGTAATAATGGACCTGAGCTTAGTTTTTTCTTT
GTAAGAGTTTGATTAATTTTGTTAATTTAACGTGCATGTAAAGGCCGGAGACGGTGGTTG
ACGTTATAT**ATATAGTATTATTTTAGT
ATG

QA 1 869 1 869
DS 

RD RR2FB72JQ 691 0 0
TACGCACCGTGTTTCGCTCTTTCCCTATCTTCACAACATCATCCCTAACATGCAAAATCC
CGGTTATCAATCCCGGTTTAGGCGTAGCAGAACCTCATCACAACACGTCAAGAGTCACCG
GCACGTTGTTCGGATACCGCAAAGGCCGAGTAAGTCTCTCCATTCAAGAAACCCCTAAAT
GTCTACCTTCTTTAGTCGTAGAGCTCGCCATGCAAACCACAACGTTTCAAAAAGAGCTTA
GCATGGGGATGGTTAGAATCGCTCTCGAGACCGAGAAACAACCTAACAATAATAACA***
AGACAGAAAAGAGCACAAATATTTTGGATGAACCGTTGTGGACAATGTTTTGTAAAGGAG
AGAAAACTGGTTACGGTGTGAGACGTGAAGCGAACGATGAAGACTTAAGCGTGATGGAAC
TGTTACGACCGGTGTCTATGGGCGCAGGAGTTTTGCCTGGAAACTCGGAGTCGGAAGGAC
CAGACGGTGAAATGGCGTATATGAGAGCTTACTTTGAGAGAGTTGTTGGGTCTAAAGATT
CAGAGACTTTTTATATGTTGAGTCCTGAAGGTAATAATGGACCTGAGCTTAGTTTTTTCT
TTGTAAGAGTTTGATTAATTTTGTTAATTTAACGTGCATGTAAAGGCCGGAGACGGTGGT
TGACGTTATAT**ATATAGTATTATTTTAGT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2AA38JQ 857 0 0
CTTCCTCCTCCATCTCCTCAATTCCT*CTTCGTCTCCATCATCTTCTCCAGCCACCACGA
CCACGCCGCCACGTCAGAACAATCTCCTCAAGCCACCATCTTCAAAAAAGAAGAAAAACA
AATCAAACGTGTTCGGAGTCTTACGCACCGTGTTTCGCTCTTTTCCTATCTTCACAACAT
CATCCCTAGCATGCAAAATCCCGGTTATCAATCCCGGTTCAGGCGTAGCAGAACCTCATC
ACAACACGTCAAGAGTCACCGGCACATTGTTTGGATACCGTAAAGGCCGAGTAAGTCTCT
CCATTCAAGAAACCCCTAAATGTCTACCTTCTTTAGTCGTAGAGCTCGCCATGCAAACCA
CAACGTTTCAAAAAGAACTTAGCATGGGGATGGTTAGAATCGCTCTCGAGACCGAGAAAC
AACCTAACAATAATAACAACAAGACAGAAAAGAGCACAAATATTTTGGATGAACCGTTGT
GGACGATGTTTTGTAAAGGAGAGAAAACTGGTTACGGTGTGAGACGTGAAGCGAACGATG
AAGACTTAAGCGTGATGGAACTGTTACGCCCGGTGTCTATGGGCGCAGGAGTTTTGCCTG
GAAACTCGGAGTCGGAAGGACCAGACGGTGAAATGGCGTATATGAGAGCTTACTTTGAGA
GAGTTGTTGGGTCTAAAGATTCAGAGACTTTTTATATGTTGAGTCCTGAAGGTAATAATG
GACCTGAGCTTAGTTTTTTCTTTGTAAGAGTTTGATTAATTTTGTTAATTTAACGTGCAT
GTAAAGGCCGGAGACGGCGGTTGACGTTATATACATATAGTATCATTTTAGTATGATTAA
ATTATATTCTTCTCCCC

QA 1 857 1 857
DS 



AS 1 6

CO CL1504Contig1 753 6 6 U
GATAGTAACACTTCAGTTTAACTTACAAATTAAAAATGACATAAAGAACATTAGAAGGAC
CAGCATTTCAGTTTTTCCTTCGTTTTTTTTTACCTTAAAAAAACATTACATGAACATCTT
ATTTCTTTGTCTGAGGAGCAAAACAACACCGAGTCAATAACCAACCATAAGAGAAAGATG
AAGGACATTCTGGTGGTCTGAGTAACATTTAAAAAAAAAAAGAAAGTAAAACGATTTCTT
TCTTATCATTCAGCGAGATAAGCCTAAGATATCGTCTTCATCGTCAGTAGAAGACTCATC
GTAAATGCTCCTACTAGCAACTCTGTTAAACTCGTCCTGACGGTCTTCGATTTCGGAAGG
ACCAATCTTGACGTCGCGGTGTTTAACAAGGAGCCAGCGGAGGAGTTTGTCTTCCTTGTT
GAGGTAATGAAGCTCCTTGTTCATGTTTGGAGTTGCCATCATTGTTATCTGCATCAGTTG
TCCCTGATAGTGTCTACCGTCGAGCTTCTTGATACCGTAACCCAATTCGACCTTGCCGAA
GGATTTGACCTCCGTGAGGACACCATTTCTGCTGTAAACGTGTTTACCGATGCGAGCAAC
GAGATCGATCAGGCCTTCCTTCCTGATTACTGGCTTGAACAGAAGCATACAGTCGTACAG
CGGCATCTCCAGATCCTCTTCTTCTTCCTTCCTTCCGACGAGAGAGTGATTACTACAGCA
TATATTTAGATCTCGACCGTCTGTCCGGTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB80JQ U 86
AF RR2FC81JQ U 1
AF RR2BM23JQ U 92
AF RR2BM23TF C 92
AF RR2FC81TF C 85
AF RR2FB80TF C 89
BS 1 284 RR2FC81JQ
BS 285 285 RR2FB80JQ
BS 286 621 RR2FC81JQ
BS 622 696 RR2BM23JQ
BS 697 734 RR2FC81TF
BS 735 753 RR2FB80TF

RD RR2FB80JQ 515 0 0
TTTTTT
ACCTTAAAAAAACATTACATGAACATCTTATTTCTTTGTCTGAGGAGCAAAACAACACCG
AGTCAATAACCAACCATAAGAAAAAGATGAAGGACATTCTGGTGGTCTGAGTAACATTTA
AAAAAAAAA*GAAAGTAAAACGATTTCTTTCTTATCATTCAGCGAGATAAGCCTAAAATA
TCGTCTTCATCGTCAGTAAAAAACTCATCGTAAATGCTCCTACTAGCAACTCTGTTAAAC
TCGTCCTGACGGTCTTCGATTTCGGAAGGACCAATCTTGACGTCCCGGTGTTTAACAAGG
AGCCAGCGGAGGAGTTTGTCTTCCTTGTTGAGGTAATGAAGCTCCTTGTTCATGTTTGGA
GTTGCCATCATTGTTATCTGCATCAGTTGTCCCTGATAGTGTCTACCGTCGAGCTTCTTG
ATACCGTAACCCAATTCGACCTTGCCGAAGGATTTGACCTCCGTGAGGACACCATTTCTG
CTGTAAACGTGTTTACCGATGCGAGCAAC

QA 7 515 7 515
DS 

RD RR2FC81JQ 621 0 0
GATAGTAACACTTCAGTTTAACTTACAAATTAAAAATGACATAAAGAACATTAGAAGGAC
CAGCATTTCAGTTTTTCCTTCGTTTTTTTTTACCTTAAAAAAACATTACATGAACATCTT
ATTTCTTTGTCTGAGGAGCAAAACAACACCGAGTCAATAACCAACCATAAGAGAAAGATG
AAGGACATTCTGGTGGTCTGAGTAACATTTAAAAAAAAAAAGAAAGTAAAACGATTTCTT
TCTTATCATTCAGCGAGATAAGCCTAAGATATCGTCTTCATCGTAAGTAGAAGACTCATC
GTAAATGCTCCTACTAGCAACTCTGTTAAACTCGTCCTGACGGTCTTCGATTTCGGAAGG
ACCAATCTTGACGTCGCGGTGTTTAACAAGGAGCCAGCGGAGGAGTTTGTCTTCCTTGTT
GAGGTAATGAAGCTCCTTGTTCATGTTTGGAGTTGCCATCATTGTTATCTGCATCAGTTG
TCCCTGATAGTGTCTACCGTCGAGCTTCTTGATACCGTAACCCAATTCGACCTTGCCGAA
GGATTTGACCTCCGTGAGGACACCATTTCTGCTGTAAACGTGTTTACCGATGCGAGCAAC
GAGATCGATCAGGCCTTCCTT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2BM23JQ 607 0 0
ACCTTAAAAAAACATTACATGAACATCTTATTTCTTTGTCTGAGGAGCAAAACAACACCG
AGTCAATAACCAACCATAAGAGAAAGATGAAGGACATTCTGGTGGTCTGAGTAACATTTA
AAAAAAAAAAGAAAGTAAAACGATTTCTTTCTTATCATTCAGCGAGATAAGCCTAAGATA
TCGTCTTCATCGTCAGTAGAAGACTCATCGTAAATGCTCCTACTAGCAACTCTGTTAAAC
TCGTCCTGACGGTCTTCGATTTTGGAAGGACCAATCTTGACGTCGCGGTGTTTAACAAGG
AGCCAGCGGAGGAGTTTGTCTTCCTTGTTGAGGTAATGAAGCTCCTTGTTCATGTTTGGA
GTTGCCATCATTGTTATCTGCATCAGTTGTCCCTGATAGTGTCTACCGTCGAGCTTCTTG
ATACCGTAACCCAATTCGACCTTGCCGAAGGATTTGACCTCCGTGAGGACACCATTTCTG
CTGTAAACGTGTTTACCGATGCGAGCAACGAGATCGATCAGGCCTTCCTTCCTGATTACT
GGCTTGAACAGAAGCATACAGTCGTACAGCGGCATCTCCAGATCCTCTTCTTCTTCCTTC
CTTCC
CC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2BM23TF 607 0 0
ACCTTAAAAAAACATTACATGAACATCTTATTTCTTTGTCTGAGGAGCAAAACAACACCG
AGTCAATAACCAACCATAAGAGAAAGATGAAGGACATTCTGGTGGTCTGAGTAACATTTA
AAAAAAAAAAGAAAGTAAAACGATTTCTTTCTTATCATTCAGCGAGATAAGCCTAAGATA
TCGTCTTCATCGTCAGTAGAAGACTCATCGTAAATGCTCCTACTAGCAACTCTGTTAAAC
TCGTCCTGACGGTCTTCGATTTTGGAAGGACCAATCTTGACGTCGCGGTGTTTAACAAGG
AGCCAGCGGAGGAGTTTGTCTTCCTTGTTGAGGTAATGAAGCTCCTTGTTCATGTTTGGA
GTTGCCATCATTGTTATCTGCATCAGTTGTCCCTGATAGTGTCTACCGTCGAGCTTCTTG
ATACCGTAACCCAATTCGACCTTGCCGAAGGATTTGACCTCCGTGAGGACACCATTTCTG
CTGTAAACGTGTTTACCGATGCGAGCAACGAGATCGATCAGGCCTTCCTTCCTGATTACT
GGCTTGAACAGAAGCATACAGTCGTACAGCGGCATCTCCAGATCCTCTTCTTCTTCCTTC
CTTCC
CC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2FC81TF 652 0 0
TTTTTTT
ACCTTAAAAAAACATTACATGAACATCTTATTTCTTTGTCTGAGGAGCAAAACAACACCG
AGTCAATAACCAACCATAAGAGAAAGATGAAGGACATTCTGGTGGTCTGAGTAACATTTA
AAAAAAAAAAGAAAGTAAAACGATTTCTTTCTTATCATTCAGCGAGATAAGCCTAAGATA
TCGTCTTCATCGTAAGTAGAAGACTCATCGTAAATGCTCCTACTAGCAACTCTGTTAAAC
TCGTCCTGACGGTCTTCGATTTCGGAAGGACCAATCTTGACGTCGCGGTGTTTAACAAGG
AGCCAGCGGAGGAGTTTGTCTTCCTTGTTGAGGTAATGAAGCTCCTTGTTCATGTTTGGA
GTTGCCATCATTGTTATCTGCATCAGTTGTCCCTGATAGTGTCTACCGTCGAGCTTCTTG
ATACCGTAACCCAATTCGACCTTGCCGAAGGATTTGACCTCCGTGAGGACACCATTTCTG
CTGTAAACGTGTTTACCGATGCGAGCAACGAGATCGATCAGGCCTTCCTTCCTGATTACT
GGCTTGAACAGAAGCATACAGTCGTACAGCGGCATCTCCAGATCCTCTTCTTCTTCCTTC
CTTCCGACGAGAGAGTGATTACTACAGCATATATTTAGATCTC
CC

QA 8 650 8 650
DS 

RD RR2FB80TF 665 0 0
TTTTAT
TTAAAAAAACATTACATGAACATCTTATTTCTTTGTCTGAGGAGCAAAACAACACCGAGT
CAATAACCAACCATAAGAGAAAGATGAAGGACATTCTGGTGGTCTGAGTAACATTTAAAA
AAAAAA*GAAAGTAAAACGATTTCTTTCTTATCATTCAGCGAGATAAGCCTAAGATATCG
TCTTCATCGTCAGTAGAAGACTCATCGTAAATGCTCCTACTAGCAACTCTGTTAAACTCG
TCCTGACGGTCTTCGATTTCGGAAGGACCAATCTTGACGTCGCGGTGTTTAACAAGGAGC
CAGCGGAGGAGTTTGTCTTCCTTGTTGAGGTAATGAAGCTCCTTGTTCATGTTTGGAGTT
GCCATCATTGTTATCTGCATCAGTTGTCCCTGATAGTGTCTACCGTCGAGCTTCTTGATA
CCGTAACCCAATTCGACCTTGCCGAAGGATTTGACCTCCGTGAGGACACCATTTCTGCTG
TAAACGTGTTTACCGATGCGAGCAACGAGATCGATCAGGCCTTCCTTCCTGATTACTGGC
TTGAACAGAAGCATACAGTCGTACAGCGGCATCTCCAGATCCTCTTCTTCTTCCTTCCTT
CCGACGAGAGAGTGATTACTACAGCATATATTTAGATCTCGACCGTCTGTCCGGTCCCC

QA 7 665 7 665
DS 



AS 2 4

CO CL1505Contig1 715 2 9 U
GAGAACAAGTCACGTATAATTCTAGTGCACACAAACTCTGGATATAGACATAGTCTGGGA
GAGGTTCTTAACGCTCCCAACGTTATGAATATGATCAAAGATACTAAAGCAGCAAAAGAG
GTCAAAGCTCTCAACGATTTCTTCACCATGCTTTCAAATGATCCAGCTCGAGCATGCTAT
GGACCAAAACATGTAGAAGTTGCTCATGAGCGAATGGCAGTCCAAACACTTCTCATCACT
GATGAGCTTTTCAGGAACTCCGACGTGAAAACAAGGAAGAAGCATGTGGATTTGGTTGAG
CCGGTTAAAGATTCAGGAGGAGAGGCTTTTATATTCTCGTCCATGCATGTTTCAGGGGAA
CAGTTGGCAACACTCACAGGGATTGCAGCTCTTCTCAGGTTCCCATTACCAGACCTCGAA
GACATTGAGATGTAATATATATCCTTCGGCTACAGAAAACAATACAAAAGAATCATACAG
GTCTCTCTCTCATTATAATCTTTAGTCTTTGCTCTATAGCTTAAAGTGAGATTTTGTATT
GTGGTCTAAGAAAGCAACTCTTACATTTAGTCGTTCCTGTTTTCTTTCAGCGTTTTTGTG
TTTCATTCAGTCAATAGGAAACATTATACCTTGTTGAATCATCTTCAGCTTTGTAATCTA
TAAAATATATTTTTGGAGCAGATAACGTTTAACATATAATATACAGTGATTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2GE71JQ C 1
AF RR2BJ62TF U 81
BS 1 84 RR2GE71JQ
BS 85 282 RR2BJ62TF
BS 283 283 RR2GE71JQ
BS 284 300 RR2BJ62TF
BS 301 301 RR2GE71JQ
BS 302 315 RR2BJ62TF
BS 316 316 RR2GE71JQ
BS 317 714 RR2BJ62TF
BS 715 715 RR2GE71JQ

RD RR2GE71JQ 715 0 0
GAGAACAAGTCACGTATAATTCTAGTGCACACAAACTCTGGATATAGACATAGTCTGGGA
GAGGTTCTTAACGCTCCCAACGTTATGAATATGATCAAAGATACTAAAGCAGCAAAAGAG
GTCAAAGCTCTCAACGATTTCTTCACCATGCTTTCAAATGATCCAGCTCGAGCATGCTAT
GGACCAAAACATGTAGAAGTTGCTCATGAGCGAATGGCAGTCCAAACACTTCTCATCACT
GATGAGCTTTTCAGGAACTCCGACGTGAAAACAAGGAAGAAGCATGTGGATTTGGTTGAG
CCGGTTAAAGATTCAGGAGGAGAGGCTTTTATATTCTCGTCCATGCATGTTTCAGGGGAA
CAGTTGGCAACACTCACAGGGATTGCTGCTCTTCTCAGGTTCCCATTACCAGACCTCGAA
GACATTGAGATGTAATATATATCCTTCGGCTATAGAAAACAATACAAAAGAATCATACAG
GTCTCTCTCTCATTATAATCTTTAGTCTTTGCTCTATAGCTTAAAGTGAGATTTTGTATT
GTGGTCTAAGAAAGCAACTCTTACATTTAGTCGTTCCTGTTTTCTTTCAGCGTTTTTTTG
TTTCATTCAGTCAATAGGAAACATTATACCTTGTTGAATCATCTTCAGCTTTGTAATCTA
TAAAATATATTTTTGGAGCAGATAACGTTTAACATATAATATACAGTGATTTATT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2BJ62TF 634 0 0
GGTT
ATGAATATGATCAAAGATACTAAAGCAGCAAAAGAGGTCAAAGCTCTCAACGATTTCTTC
ACCATGCTTTCAAATGATCCAGCTCGAGCATGCTATGGACCAAAACATGTAGAAGTTGCT
CATGAGCGAATGGCAGTCCAAACACTTCTCATCACTGATGAGCTTTTCAGGAACTCCGAC
GTGAAAACAAGGAAGAAGTATGTGGATTTGGTTGAGTCGGTTAAAGATTCATGAGGAGAG
GCTTTTATATTCTCGTCCATGCATGTTTCAGGGGAACAGTTGGCAACACTCACAGGGATT
GCAGCTCTTCTCAGGTTCCCATTACCAGACCTCGAAGACATTGAGATGTAATATATATCC
TTCGGCTACAGAAAACAATACAAAAGAATCATACAGGTCTCTCTCTCATTATAATCTTTA
GTCTTTGCTCTATAGCTTAAAGTGAGATTTTGTATTGTGGTCTAAGAAAGCAACTCTTAC
ATTTAGTCGTTCCTGTTTTCTTTCAGCGTTTTTGTGTTTCATTCAGTCAATAGGAAACAT
TATACCTTGTTGAATCATCTTCAGCTTTGTAATCTATAAAATATATTTTTGGAGCAGATA
ACGTTTAACATATAATATACAGTGATTTAT

QA 5 634 5 634
DS 



CO CL1505Contig2 1301 2 4 U
GAAAAAACAGGAACGACTAAATGTAAGAGTTGCTTTCTTAGACCACAGTACAAAATCTCA
CTTTTAAGCTATAGAGCAAAGACTAAAGATTTATAATGAGAGAGACCTATATGATTTTTT
GTATTGTTTTCTATAGCCAAAGGATATATATCACATCTCAATGTCTTCGAGGTCTGGTAA
TGGGAACCTGAGAAGAGCTGCAATCCCTGTGAGTGTTGCCAACTGTTCCCCTGAGACATG
CATCGATGAAAATATAAAAGCCTCTCCTCCTGAATCTTTAACCGACTCAACCAAATCCAC
ATACTTCTTCCTTGTTTTCACGTCAGAGTTCCTGAAAAGCTCATCAGTGATGAGAAGTGT
TTGGACTGCCATTCGCTCATGAGCAACTTATACATGTTTTGGTCCATAGCATGCTCGAGC
TGGATCATTTGAAAGCATGGTGAAGAAATCGTTTAGAGCTTTGACCTCTTTTGCTGCTTT
AGTATATTTGATCATATTCATCACGTTGGGAGCATTAAGAACCTCTCCCAGGCTATGTCT
ATATCCAGAGTTTGTGTGCACCAGAATTATACGTGACTTGTTCTCAATTATAGGTCTCAA
CTGTCTTCTTTCAGCTTCCAATAACAAGTGACGATGAAACTGATCCTTTGTAAAGCCGGG
ACTGGCGATCACTGCACAACGAACGACACTGAAGTCAACATGTTTCACAAAGGCCTGCAG
AACATTCTCAAAGAATTTCTTCAAAGCAGACTCGTAACCAGCAATTGCAGGCCCATGCTT
CCTAGGAATTGATGTTTCTATTTTTGCACGGCTACTTGTGATACTTCTGCCGACAAGGAA
GATTTGTCCAAGTCCTTCTTGCATTAGAACTACAGCGAGATCGGCACTAGCAGCGGGATC
GGAGGCCTGCTTGATTGTATCAAGAGCCAGTGAGTCCCAAATTCCCTTTCTCAAAACAAA
AGGTCGTTTCAGCTCAATCTCCAAAGTATGGAATGCACCAATCTTGACGTGATCATTCTC
CAGGATATTCTTCCCACGTATGCGCAGAACAGCCGCGTCTTTGTCGTAGTCCACCTCCTC
AACTTGTACTTCGAGCTTCAGTCTAACCCGCTCAGAGTCTCTTCCCCCACCAGGTACCTC
TCTCTGAACCTTTCTAAAAGTGACAGCCATGACACTGTCACCAGTGGCAATGAGGTTATA
TGCATACCAGAGATCATCAGAGTCCTCAGCCACCATCTTAACGCTTCCGGGTCCATTACG
AACGAAATCCCTGCGAACGATCTTCATCTTGTCCGGCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV54JQB U 1
AF RR2GE71TF C 548
BS 1 576 RR2GV54JQB
BS 577 577 RR2GE71TF
BS 578 732 RR2GV54JQB
BS 733 1301 RR2GE71TF

RD RR2GV54JQB 732 0 0
GAAAAAACAGGAACGACTAAATGTAAGAGTTGCTTTCTTAGACCACAGTACAAAATCTCA
CTTTTAAGCTATAGAGCAAAGACTAAAGATTTATAATGAGAGAGACCTATATGATTTTTT
GTATTGTTTTCTATAGCCAAAGGATATATATCACATCTCAATGTCTTCGAGGTCTGGTAA
TGGGAACCTGAGAAGAGCTGCAATCCCTGTGAGTGTTGCCAACTGTTCCCCTGAGACATG
CATCGATGAAAATATAAAAGCCTCTCCTCCTGAATCTTTAACCGACTCAACCAAATCCAC
ATACTTCTTCCTTGTTTTCACGTCAGAGTTCCTGAAAAGCTCATCAGTGATGAGAAGTGT
TTGGACTGCCATTCGCTCATGAGCAACTTATACATGTTTTGGTCCATAGCATGCTCGAGC
TGGATCATTTGAAAGCATGGTGAAGAAATCGTTTAGAGCTTTGACCTCTTTTGCTGCTTT
AGTATATTTGATCATATTCATCACGTTGGGAGCATTAAGAACCTCTCCCAGGCTATGTCT
ATATCCAGAGTTTGTGTGCACCAGAATTATACGTGATTTGTTCTCAATTATAGGTCTCAA
CTGTCTTCTTTCAGCTTCCAATAACAAGTGACGATGAAACTGATCCTTTGTAAAGCCGGG
ACTGGCGATCACTGCACAACGAACGACACTGAAGTCAACATGTTTCACAAAGGCCTGCAG
AACATTCTCAAA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2GE71TF 754 0 0
GAGTTTGTGTGCACTAGAATTATACGTGACTTGTTCTCAATTATAGGTCTCAACTGTCTT
CTTTCAGCTTCCAATAACAAGTGACGATGAAACTGATC*TTTGTAAAGCCGGGACTGGCG
ATCACTGCACAACGAACGACACTGAAGTCAACATGTTTCACAAATGCCTGCAGAACATTC
TCAAAGAATTTCTTCAAAGCAGACTCGTAACCAGCAATTGCAGGCCCATGCTTCCTAGGA
ATTGATGTTTCTATTTTTGCACGGCTACTTGTGATACTTCTGCCGACAAGGAAGATTTGT
CCAAGTCCTTCTTGCATTAGAACTACAGCGAGATCGGCACTAGCAGCGGGATCGGAGGCC
TGCTTGATTGTATCAAGAGCCAGTGAGTCCCAAATTCCCTTTCTCAAAACAAAAGGTCGT
TTCAGCTCAATCTCCAAAGTATGGAATGCACCAATCTTGACGTGATCATTCTCCAGGATA
TTCTTCCCACGTATGCGCAGAACAGCCGCGTCTTTGTCGTAGTCCACCTCCTCAACTTGT
ACTTCGAGCTTCAGTCTAACCCGCTCAGAGTCTCTTCCCCCACCAGGTACCTCTCTCTGA
ACCTTTCTAAAAGTGACAGCCATGACACTGTCACCAGTGGCAATGAGGTTATATGCATAC
CAGAGATCATCAGAGTCCTCAGCCACCATCTTAACGCTTCCGGGTCCATTACGAACGAAA
TCCCTGCGAACGATCTTCATCTTGTCCGGCTTTC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 2 6

CO CL1506Contig1 752 2 5 U
GCATTCTTGGTTGAGAAAGAAAAAGAACAACTGAGAATCCAAATCATTCTTGTTTTTTTT
CAAAAGAAAGAATAATAACATGGAAGAACAGATATAATACTTAGGGCCAAAAGCCTTTCT
TCTATACAAACTCTTTCTCTCTTCAAGTTTTCCTTGAACTCATCATACTTGGAAGTACTA
AAGCTCTGGTTTCAATGGACCATTATTAGGTGAGAAACTAGACATAGTCGATGGATTTGA
AACGAACCCCATTTGGTAGAGGCTTTGTAATTCACTCTCTAGTGTTGTTGTCTGAGTTAA
TGAGTTGTATTGTGGAGTTGTGGTGGTAGAAATGTTCTGCATCGTCCCTTGAAAACCGGT
GAAAGGATTCAGCCCCAGAGTAGGAGTGTTTCTGTCTCTTGGTTGCAGAAAATCTTTAGC
AAGAATCCTGTCTATATCAACGTTGAGTTCTGGATTCACCGTGGCGAGTTTCATAAACAA
AAACTCAACCTGCTGTTGCAATGACTGAACATAGTTGATGATTTCATCAAGCATAACCGC
TTTGCCAGTGATCTTGTTGCATCCAGGAACAAGCTCTTGAAGCAGTCTCATCCTTTCACT
GATCTTTTCTCTTCTAACCCTTTCTGCAAGACTGTGACTATTAGTGGCTTGACCTCTTCT
TGCCCTCATATGAATGTAGTTTTCTTTAGGTGCTTCTTCGCTCTGTGAGCTCTCTTTGTT
CATCATCTTCTCTTTACTCTGTTCATTTTTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY50JQ U 1
AF RR2CU17JQ U 1
BS 1 180 RR2CU17JQ
BS 181 181 RR2FY50JQ
BS 182 240 RR2CU17JQ
BS 241 241 RR2FY50JQ
BS 242 752 RR2CU17JQ

RD RR2FY50JQ 524 0 0
GCATTCTTGGTTGAGAAAGAAAAAGAACAACTGAGAATCCAAATCATTCTTGTTTTTTTT
CAAAAGAAAGAATAATAACATGGAAGAACAGATATAATACTTAGGGCCAAAAGCCTTTCT
TCTATACAAACTCTTTCTCTCTTCAAGTTTTCCTTGAACTCATCATACTTGGAAGTACTA
AAGCTCTGGTTTCAATGGACCATTATTAGGTGAGAAACTAGACATAGTCGATGGATTTGA
AACGAACCCCATTTGGTAGAGGCTTTGTAATTCACTCTCTAGTGTTGTTGTCTGAGTTAA
TGAGTTGTATTGTGGAGTTGTGGTGGTAGAAATGTTCTGCATCGTCCCTTGAAAACCGGT
GAAAGGATTCAGCCCCAGAGTAGGAGTGTTTCTGTCTCTTGGTTGCAGAAGATCTTTAGC
AAGAATCCTGTCTATATCAACGTTGAGTTCTGGATTCACCGTGGCGAGTTTCATAGACAA
AAACTCAACCTGCTGTTGCAATGACTGAACATAGTTGATGATTT

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2CU17JQ 752 0 0
GCATTCTTGGTTGAGAAAGAAAAAGAACAACTGAGAATCCAAATCATTCTTGTTTTTTTT
CAAAAGAAAGAATAATAACATGGAAGAACAGATATAATACTTAGGGCCAAAAGCCTTTCT
TCTATACAAACTCTTTCTCTCTTCAAGTTTTCCTTGAACTCATCATACTTGGAAGTACTA
GAGCTCTGGTTTCAATGGACCATTATTAGGTGAGAAACTAGACATAGTCGATGGATTTGA
GACGAACCCCATTTGGTAGAGGCTTTGTAATTCACTCTCTAGTGTTGTTGTCTGAGTTAA
TGAGTTGTATTGTGGAGTTGTGGTGGTAGAAATGTTCTGCATCGTCCCTTGAAAACCGGT
GAAAGGATTCAGCCCCAGAGTAGGAGTGTTTCTGTCTCTTGGTTGCAGAAAATCTTTAGC
AAGAATCCTGTCTATATCAACGTTGAGTTCTGGATTCACCGTGGCGAGTTTCATAAACAA
AAACTCAACCTGCTGTTGCAATGACTGAACATAGTTGATGATTTCATCAAGCATAACCGC
TTTGCCAGTGATCTTGTTGCATCCAGGAACAAGCTCTTGAAGCAGTCTCATCCTTTCACT
GATCTTTTCTCTTCTAACCCTTTCTGCAAGACTGTGACTATTAGTGGCTTGACCTCTTCT
TGCCCTCATATGAATGTAGTTTTCTTTAGGTGCTTCTTCGCTCTGTGAGCTCTCTTTGTT
CATCATCTTCTCTTTACTCTGTTCATTTTTGT

QA 1 752 1 752
DS 



CO CL1506Contig2 1522 4 8 U
GGCGACGAATAAGCATTTATCCTCAGAGAGTTCTCTTTCTCTTCCCTTCCCTTAAAGAAA
ACTGTGAGTGACTTGCTTCTGCTGCATCGTTGCAAAGAAGCAAACCAAGTTGAAGTTTGT
TTTTGAGGGTTTGAATCAGAAGGAAATGGGTGGAGAGACTAATGAAGGTGAGATGGGGCT
AAACCATGGAGATGATCAAAATGGGATCTCAAGAGTTGGGATGCCTTTGTATGCAAAGGT
AGATCCTTTCTTCTCTTCTGCAGATTGGGATCCAGTTGTCAGTGTTGGTGTTGGTGGTGG
TGGCTTCTCTAGCTCTCATTACCCTTCAATGGTGGCTATGGATAATCCAGGGATGAGTTG
CTTCCCTCATTACCAAACCGGTTCTGGTTCTGGTTACCATGACATGCCTGCTAGTCTTGG
TCCGTTTGGTGATTGTGGAGGTGG*TGGT**GGTGGTCAGTTTCTTGGTTCAGACAAGGG
AGATGAAAGTGTTGGGAGATTGATCAGAGCTGGAGATGGTCGCCAGGTTTCAGATGATGT
TGTTGTTGGTGGTGGTGGTGGTTCCTCAAACAGAAAAAGAAGGCAACCAGTAGCCGAATC
ACAATGGAACAAGAAAGCTGTGGAGGAATTTCAAGAAGACCCTCAGAGTCAGAAGAAACA
CAAAAATGAACAGAGTAAAGAGAAGATGATGAACAAAGAGAGCTCACAGAGCGAAGAAGC
ACCTAAAGAAAACTACATTCATATGAGGGCAAGAAGAGGTCAAGCCACTAATAGTCACAG
TCTTGCAGAAAGGGTTAGAAGAGAAAAGATCAGTGAAAGGATGAGACTGCTTCAAGAGCT
TGTTCCTGGATGCAACAAGATCACTGGCAAAGCGGTTATGCTTGATGAAATCATCAACTA
TGTTCAGTCATTGCAACAGCAGGTTGAGCTTCTGCAACCAAGAGACAGAAACACTCCTAC
TCTGGGGCTGAATCCTTTCACCGGTTTTCAAGGGACGATGCAGAACATTTCTACCACCAC
AACTCCACAATACAACTCATTAACTCAGACAACAACACTAGAGAGTGAATTACAAGGCCT
CTACCAAATGGGAGGTATCCTGACCCCACAGAAGTGGTCCAGACTAGTCATGTGTTGCCA
CATGTCGGTCCTCTGTCCCTGGCGATGCCGAAATGTTAATTCCCCAGTGGCCGGGATTCG
AACCCAGATGGCGGAACTCACAGCTGTGAACCCTTTACCAACTGAGCTAGAAGCCCCGGT
TTCATCTCTCTTTCTTTATTGATAGTTTCTTCTTTTCTTAGGTCCATTGAAACCAGAGCT
CTAGTACTTCCAAGTATGATGAGTTCAAGGAAAACTTGAAGAGAGAAAGAGTTTGTATAG
AAGAAAGGCTTTTGGCCCTAAGTATTATATCTGTTCTTCCATGTTATTATTCTTTCTTTT
GAAAAAAAACAAGAATGATTTGGATTCTCAGTTGTTTTTTTTCTTTCTCAACCAAGAATG
CATTTTATTAAAATATGGAATC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU17TF U 1
AF RR2FY50TF U 1
AF RR2B634TF U 3
AF RR2B634JQ C 634
BS 1 444 RR2CU17TF
BS 445 445 RR2FY50TF
BS 446 448 RR2CU17TF
BS 449 451 RR2FY50TF
BS 452 551 RR2CU17TF
BS 552 624 RR2FY50TF
BS 625 821 RR2B634TF
BS 822 1522 RR2B634JQ

RD RR2CU17TF 551 0 0
GGCGACGAATAAGCATTTATCCTCAGAGAGTTCTCTTTCTCTTCCCTTCCCTTAAAGAAA
ACTGTGAGTGACTTGCTTCTGCTGCATCGTTGCAAAGAAGCAAACCAAGTTGAAGTTTGT
TTTTGAGGGTTTGAATCAGAAGGAAATGGGTGGAGAGACTAATGAAGGTGAGATGGGGCT
AAACCATGGAGATGATCAAAATGGGATCTCAAGAGTTGGGATGCCTTTGTATGCAAAGGT
AGATCCTTTCTTCTCTTCTGCAGATTGGGATCCAGTTGTCAGTGTTGGTGTTGGTGGTGG
TGGCTTCTCTAGCTCTCATTACCCTTCAATGGTGGCTATGGATAATCCAGGGATGAGTTG
CTTCCCTCATTACCAAACCGGTTCTGGTTCTGGTTACCATGACATGCCTGCTAGTCTTGG
TCCGTTTGGTGATTGTGGAGGTGGGTGGGTGGGTGGTCAGTTTCTTGGTTCAGACAAGGG
AGATGAAAGTGTTGGGAGATTGATCAGAGCTGGAGATGGTCGCCAGGTTTCAGATGATGT
TGTTGTTGGTG

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2FY50TF 624 0 0
GGC
GACGAATAAGCATTTATCCTCAGAGAGTTCTCTTTCTCTTCCCTTCCCTTAAAGAAAACT
GTGAGTGACTTGCTTCTGCTGCATCGTTGCAAAGAAGCAAACCAAGTTGAAGTTTGTTTT
TGAGGGTTTGAATCAGAAGGAAATGGGTGGAGAGACTAATGAAGGTGAGATGGGGCTAAA
CCATGGAGATGATCAAAATGGGATCTCAAGAGTTGGGATGCCTTTGTATGCAAAGGTAGA
TCCTTTCTTCTCTTCTGCAGATTGGGATCCAGTTGTCAGTGTTGGTGTTGGTGGTGGTGG
CTTCTCTAGCTCTCATTACCCTTCAATGGTGGCTATGGATAATCCAGGGATGAGTTGCTT
CCCTCATTACCAAACCGGTTCTGGTTCTGGTTACCATGACATGCCTGCTAGCCTTGGTCC
GTTTGGTGATTGTGGAGGTGG*TGGT**GGTGGTCAGTTTCTTGGTTCAGACAAGGGAGA
TGAAAGTGTTGGGAGATTGATCAGAGCTGGAGATGGTCGCCAGGTTTCAGATGATGTTGT
TGTTGGTGGTGGTGGTGGTTCCTCAAACAGAAAAAGAAGGCAACCAGTAGCCGAATCACA
ATGGAACAAGAAAGCTGTGGA

QA 4 624 4 624
DS 

RD RR2B634TF 819 0 0
G
GACGAATAAGCATTTATCCTCAGAGAGTTCTCTTTCTCTTCCCTTCCCTTAAAGAAAACT
GTGAGTGACTTGCTTCTGCTGCATCTTTGCAAAGAAGCAAACCAAGTTGAAGTTTGTTTT
TGAGGGTTTGAATCAGAAGGAAATGGGTGGAGAGACTAATGAAGGTGAGATGGGGCTAAA
CCATGGAGATGATCAAAATGGGATCTCAAGAGTTGGGATGCCTTTGTATGCAAAGGTAGA
TCCTTTCTTCTCTTCTGCAGATTGGGATCCAGTTGTCAGTGTTGGTGTTGGTGGTGGTGG
CTTCTCTAGCTCTCATTACCCTTCAATGGTGGCTATGGATAATCCAGGGATGAGTTGCTT
CCCTCATTACCAAACCGGTTCTGGTTCTGGTTACCATGACATGCCTGCTAGTCTTGGTCC
GTTTGGTGATTGTGGAGGTGG*TGGT**GGTGGTCAGTTTCTTGGTTCAGACAAGGGAGA
TGAAAGTGTTGGGAGATTGATCAGAGCTGGAGATGGTCACCAGGTTTCAGATGATGTTGT
TGTTGGTGGTGGTGGTGGTTCCTCAAACAGAAAAAGAAGGCAACCAGTAGCCGAATCACA
ATGGAACAAGAAAGCTGTGGAGGAATTTCAAGAAGACCCTCAGAGTCAGAAGAAACACAA
AAATGAACAGAGTAAAGAGAAGATGATGAACAAAGAGAGCTCACAGAGCGAAGAAGCACC
TAAAGAAAACTACATTCATATGAGGGCAAGAAGAGGTCAAGCCACTAATAGTCACAGTCT
TGCAGAAAGGGTTAGAAGAGAAAAGATCAGTGAAAGGA

QA 2 819 2 819
DS 

RD RR2B634JQ 889 0 0
AGAAGACCCTCAGAGTCAGAAGAAACACAAAAATGAACAGAGTAAAGAGAAGATGATGAA
CAAAGAGAGCTCACAGAGCGAAGAAGCACCTAAAGAAAACTACATTCATATGAGGGCAAG
AAGAGGTCAAGCCACTAATAGTCACAGTCTTGCAGAAAGGGTTAGAAGAGAAAAGATCAG
TGAAAGGATGAGACTGCTTCAAGAGCTTGTTCCTGGATGCAACAAGATCACTGGCAAAGC
GGTTATGCTTGATGAAATCATCAACTATGTTCAGTCATTGCAACAGCAGGTTGAGCTTCT
GCAACCAAGAGACAGAAACACTCCTACTCTGGGGCTGAATCCTTTCACCGGTTTTCAAGG
GACGATGCAGAACATTTCTACCACCACAACTCCACAATACAACTCATTAACTCAGACAAC
AACACTAGAGAGTGAATTACAAGGCCTCTACCAAATGGGAGGTATCCTGACCCCACAGAA
GTGGTCCAGACTAGTCATGTGTTGCCACATGTCGGTCCTCTGTCCCTGGCGATGCCGAAA
TGTTAATTCCCCAGTGGCCGGGATTCGAACCCAGATGGCGGAACTCACAGCTGTGAACCC
TTTACCAACTGAGCTAGAAGCCCCGGTTTCATCTCTCTTTCTTTATTGATAGTTTCTTCT
TTTCTTAGGTCCATTGAAACCAGAGCTCTAGTACTTCCAAGTATGATGAGTTCAAGGAAA
ACTTGAAGAGAGAAAGAGTTTGTATAGAAGAAAGGCTTTTGGCCCTAAGTATTATATCTG
TTCTTCCATGTTATTATTCTTTCTTTTGAAAAAAAACAAGAATGATTTGGATTCTCAGTT
GTTTTTTTTCTTTCTCAACCAAGAATGCATTTTATTAAAATATGGAATC

QA 1 889 1 889
DS 



AS 1 6

CO CL1507Contig1 491 6 6 U
GGACAAACATAATCATCTCAACTTTAGAAAATGGGCCAAACACACGAAGGCAAATGCTTT
GGGTTTATTGTTCTCTTGCTATGCCTCACTTCGACCTTTGCACGCACCCTCCTTAAGGAT
CAACTCCCTATGATGAAGCTGCACCATGAGGGTATGCTGGAGTTAGAACCTGACAACACA
GTAGTGGTTAAACTTGATGGTCAAAATTTTGGAAGCGGCACAAGCCTCGGATATGATTTT
GGAAGTGGTCTAGTTACAACTAACTTAGGCGGTGGTGACTATCCAGACCCTGACGACCAT
AAATTAGACAAAGAGACTGTAAACATGATGAGAGAAGCTGATGAATCTTCTGCCTTGCCA
TAAAAAGCTTTTAACTCGTATCGCCTCTCTTTAAGCTGCAAACTTTGATATCATCATAAG
ACATCGATCTAATAAATCTCCTTTTATAAATGATAAAACTGGTTATAAGAGCAATAAAAT
TTGTGAGGGAT


BQ
30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN40JQ C 4
AF RR2GI03JQB C 1
AF RR2GU41JQB C 1
AF RR2GU41TF U 1
AF RR2GI03TF U 1
AF RR2BN40TF U 4
BS 1 327 RR2GU41TF
BS 328 328 RR2GI03TF
BS 329 391 RR2GU41TF
BS 392 392 RR2GI03TF
BS 393 472 RR2GU41TF
BS 473 491 RR2BN40TF

RD RR2BN40JQ 113 0 0
G
AAACATAATCATCTCAACTTTAGAAAATGGGCCAAACACACGAAGGCAAATGCTTTGGGT
TTATTGTTCTCTTGCTATGCCTCACTTCGACCTTTGCACGCACCCTCCTTAA

QA 2 113 2 113
DS 

RD RR2GI03JQB 477 0 0
GGACAAACATAATCATCTCAACTTTAGAAAATGGGCCAAACACACGAAGGCAAATGCTTT
GGGTTTATTGTTCTCTTGCTATGCCTCACTTCGACCTTTGCACGCACCCTCCTTAAGGAT
CAACTCCCTATGATGAAGCTGCACCATGAGGGTATGCTGGAGTTAGAACCTGACAACACA
GTAGTGGTTAAACTTGATGGTCAAAATTTTGGAAGCGGCACAAGCCTCGGATATGATTTT
GGAAGTGGTCTAGTTACAACTAACTTAGGCGGTGGTGACTATCCAGACCCTGACGACCAT
AAATTAGACAAAGAGACTGTAAACATGATGAGAGAAGCTGATGAATCTTCTGCCTTGCCA
TAAAAAGCTTTTAACTCGTATCGCCTCTCTTTAAGCTGCAAACTTTGATATCATCATAAG
ACATCGATCTAATAAATCTCCTTTTATAAATGATAAAACTGGTTATAAGAGC
AATAA

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2GU41JQB 472 0 0
GGACAAACATAATCATCTCAACTTTAGAAAATGGGCCAAACACACGAAGGCAAATGCTTT
GGGTTTATTGTTCTCTTGCTATGCCTCACTTCGACCTTTGCACGCCCCCTCCTTAAGGAT
CAACTCCCTATGATGAAGCTGCACCATGAGGGTATGCTGGAGTTAGAACCTGACAACACA
GTAGTGGTTAAACTTGATGGTCAAAATTTTGGAAGCGGCACAAGCCTCGGATATGATTTT
GGAAGTGGTCTAGTTACAACTAACTTAGGCGGTGGTGACTATCCAGACCCTGACGACCAT
AAATTAGACAAAGAGACTGTAAACATGGTGAGAGAAGCTGATGAATCTTCTGCCTTGCCA
TAAAAAGCTTTTAACTCGTATCGCCTCTCTTCAAGCTGCAAACTTTGATATCATCATAAG
ACATCGATTTAATAAATCTCCTTTTATAAATGATAAAACTGGTTATAAGAGC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2GU41TF 472 0 0
GGACAAACATAATCATCTCAACTTTAGAAAATGGGCCAAACACACGAAGGCAAATGCTTT
GGGTTTATTGTTCTCTTGCTATGCCTCACTTCGACCTTTGCACGCACCCTCCTTAAGGAT
CAACTCCCTATGATGAAGCTGCACCATGAGGGTATGCTGGAGTTAGAACCTGACAACACA
GTAGTGGTTAAACTTGATGGTCAAAATTTTGGAAGCGGCACAAGCCTCGGATATGATTTT
GGAAGTGGTCTAGTTACAACTAACTTAGGCGGTGGTGACTATCCAGACCCTGACGACCAT
AAATTAGACAAAGAGACTGTAAACATGGTGAGAGAAGCTGATGAATCTTCTGCCTTGCCA
TAAAAAGCTTTTAACTCGTATCGCCTCTCTTCAAGCTGCAAACTTTGATATCATCATAAG
ACATCGATCTAATAAATCTCCTTTTATAAATGATAAAACTGGTTATAAGAGC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2GI03TF 477 0 0
GGACAAACATAATCATCTCAACTTTAGAAAATGGGCCAAACACACGAAGGCAAATGCTTT
GGGTTTATTGTTCTCTTGCTATGCCTCACTTCGACCTTTGCACGCACCCTCCTTAAGGAT
CAACTCCCTATGATGAAGCTGCACCATGAGGGTATGCTGGAGTTAGAACCTGACAACACA
GTAGTGGTTAAACTTGATGGTCAAAATTTTGGAAGCGGCACAAGCCTCGGATATGATTTT
GGAAGTGGTCTAGTTACAACTAACTTAGGCGGTGGTGACTATCCAGACCCTGACGACCAT
AAATTAGACAAAGAGACTGTAAACATGATGAGAGAAGCTGATGAATCTTCTGCCTTGCCA
TAAAAAGCTTTTAACTCGTATCGCCTCTCTTTAAGCTGCAAACTTTGATATCATCATAAG
ACATCGATCTAATAAATCTCCTTTTATAAATGATAAAACTGGTTATAAGAGC
AATAA

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2BN40TF 488 0 0
G
AAACATAATCATCTCAACTTTAGAAAATGGGCCAAACACACGAAGGCAAATGCTTTGGGT
TTATTGTTCTCTTGCTATGCCTCACTTCGACCTTTGCACGCACCCTCCTTAAGGATCAAC
TCCCTATGATGAAGCTGCACCATGAGGGTATGCTGGAGTTAGAACCTGACAACACAGTAG
TGGTT*****TGATGGTCAAAATTTTGGAAGCGGCACAAGCCTCGGATATGATTTTGGAA
GTGGTCTAGTTACAACTAACTTAGGCGGTGGTGACTATCCAGACCCTGACGACCATAAAT
TAGACAAAGAGACTGTAAACATGATGAGAGAAGCTGA**AATCTTCTGCCTTGCCATAAA
AAGCTTTTAACTCGTATCGCCTCTCTTTAAGCTGCAAACTTTGATATCATCATAAGACAT
CGATCTAATAAATCTCCTTTTATAAATGATAAAACTGGTTATAAGAGCAATAAAATTTGT
GAGGGAT

QA 2 488 2 488
DS 



AS 1 3

CO CL1508Contig1 705 3 3 U
GTGAAGGAAATAGATTATTATTACACAACAAAAAAAAAGAAGACATGATTCACCAGTTTG
TAAGGCTTATAAATAGCGTTTTCGTGCGTAGTTTCCCAACCACACAAACCTTTATTACAC
AGATGAAACAAACAAACGAATAAACCAAATTCCACAATTCTCTGAGTTTTTGTGTTTCGT
TTTCACGCAAATATTTTTCTTCTCTCAACATAATTCAAGTTCCAAATAAGGGGAGGATAG
AGCAATATAGAGGCTGTTTAAAAGGCTTAGCTTGTGGCGTCGCGGCTGTAGAATTGATCG
AGTGTTTTGGCAGGAATACGGTGAAGAAGCTCACGCGGGAAGATACGGAGCAGTGTCCAT
GCCAAATCAAGTGACTGGAAGATGTTTCTTGTATCGTATGCGCCTTGCATCACAAACTTC
CTCTCAAATTTGTCCAGGAACTCTAGGTACAGCAGATCCTCAGAAGAAAGAGCTTCTTCT
CCAACGACAGCTTTCATGGCTTGAACATCCTTCCCGATTGCATAGTTTGCGTAGAGCTGG
TTGGACACATCAGAATGGTCACGGCGAGTCATTCCCTCACCAATAGCACTCTTCATCAAT
CGAGAAAGTGATGGAAGCACGTTAATGGGTGGATAAATCTGTCTGTTGTGAAGTTGCCTG
TCAATGTATATCTGACCCTCGGTAATGTAACCAGTAAGATCCGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G979JQ U 83
AF RR2G979TF C 83
AF RR2GV58JQB U 1
BS 1 442 RR2GV58JQB
BS 443 444 RR2G979JQ
BS 445 705 RR2GV58JQB

RD RR2G979JQ 391 0 0
CGTGCGTAGTTTCCCAACCACACAAACCTTTATTACACAGATGAAACAAACAAACGAATA
AACCAAATTCCACAATTCTCTGAGTTTTTGTGTTTCGTTTTCACGCAAATATTTTTCTTC
TCTCAACATAATTCAAGTTCCAAATAAGGGGAGGATAGAGCAATATAGAGGCTGTTTAAA
AGGCTTAGCTTGTGGCGTCGCGGCTGTAGAATTGATCGAGTGTTTTGGCAGGAATACGGT
GAAGAAGCTCACGCGGGAAGATACGGAGCAGTGTCCATGCCAAATCAAGTGACTGGAAGA
TGTTTCTTGTATCGTATGCGCCTTGCATCACAAACTTCCTCTCAAATTTGTCCAGGAACT
CTAGGTACAGCAGATCCTCAGAAGAAA
AAAA

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR2G979TF 391 0 0
CGTGCGTAGTTTCCCAACCACACAAACCTTTATTACACAGATGAAACAAACAAACGAATA
AACCAAATTCCACAATTCTCTGAGTTTTTGTGTTTCGTTTTCACGCAAATATTTTTCTTC
TCTCAACATAATTCAAGTTCCAAATAAGGGGAGGATAGAGCAATATAGAGGCTGTTTAAA
AGGCTTAGCTTGTGGCGTCGCGGCTGTAGAATTGATCGAGTGTTTTGGCAGGAATACGGT
GAAGAAGCTCACGCGGGAAGATACGGAGCAGTGTCCATGCCAAATCAAGTGACTGGAAGA
TGTTTCTTGTATCGTATGCGCCTTGCATCACAAACTTCCTCTCAAATTTGTCCAGGAACT
CTAGGTACAGCAGATCCTCAGAAGAAA
AAAA

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR2GV58JQB 705 0 0
GTGAAGGAAATAGATTATTATTACACAACAAAAAAAAAGAAGACATGATTCACCAGTTTG
TAAGGCTTATAAATAGCGTTTTCGTGCGTAGTTTCCCAACCACACAAACCTTTATTACAC
AGATGAAACAAACAAACGAATAAACCAAATTCCACAATTCTCTGAGTTTTTGTGTTTCGT
TTTCACGCAAATATTTTTCTTCTCTCAACATAATTCAAGTTCCAAATAAGGGGAGGATAG
AGCAATATAGAGGCTGTTTAAAAGGCTTAGCTTGTGGCGTCGCGGCTGTAGAATTGATCG
AGTGTTTTGGCAGGAATACGGTGAAGAAGCTCACGCGGGAAGATACGGAGCAGTGTCCAT
GCCAAATCAAGTGACTGGAAGATGTTTCTTGTATCGTATGCGCCTTGCATCACAAACTTC
CTCTCAAATTTGTCCAGGAACT**AGGTACAGCAGATCCTCAGAAGAAAGAGCTTCTTCT
CCAACGACAGCTTTCATGGCTTGAACATCCTTCCCGATTGCATAGTTTGCGTAGAGCTGG
TTGGACACATCAGAATGGTCACGGCGAGTCATTCCCTCACCAATAGCACTCTTCATCAAT
CGAGAAAGTGATGGAAGCACGTTAATGGGTGGATAAATCTGTCTGTTGTGAAGTTGCCTG
TCAATGTATATCTGACCCTCGGTAATGTAACCAGTAAGATCCGGA

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 4

CO CL1509Contig1 1594 4 10 U
GGGGCTCACTCTCAAACTGTTAAAAAAATGTCTCTCTTCTTAACACTTCTCTACGTTTTC
CTCTGCAACTCAATTACTCTCTCATCATCTCTCTCTCTCCACTTCCCTCTCACATCTCTC
CGTCTCACCACAAACACTAGTAGCCCATCCTCCTCTTCTTCTCTCCAAACCTCCCTAGCC
TCTCGCCGGAATCCATCTCAGTCGTCATCATCTCCTCCGTACAATTTCCGATCAAACTTC
AAATACTCGATGGCTCTGATTCTCTCTCTTCCGATTGGGACACCTGCTCAGACTCAAGAG
CTTGTCCTCGACACAGGGAGCCAACTCTCGTGGATCCAGTGCCATCGCAAGAAGAAGAAA
CCACCAACGACGTCGTTTGATCCGTCGCTGTCTTCATCCTTCTCCAACTTGCCTTGCTCT
CATCCTTTCTGCAAACCAAGAATTCCCGATTTTACCCTTCCCACAACTTGCGACTCGAAC
CGTCTCTGTCACTACTCCTACTTCTACGCAGACGGAACCTACGCCGAAGGCAATCTCGTC
AAAGAAAAATTCACCTTCTCAAGTACCCAAACTACCCCTCCTTTGATTCTAGGCTGTGCT
GCCGAGTCTACAGACGACAGGGGTATTTTGGGGATGAATCTTGGTCGCCTTTCTTTCATC
TCGCAAGCTAAAATATCCAAGTTCTCTTATTGCATTCCAACCAGGTCTAACCGGCCCGGT
TTTACCCCGACAGGGTCTTTCTACCTCGGGGAAAATCCCATCTCTCGAGGATTTAAATAC
GTCCCTCTTTTGACTTTTCCTCAGAGTCAACGCATGCCGAATCTAGACCCTCTGGCTTAT
ACAGTACCTTTGCAAGGTATCCGAATAGGACAAAAGAGGCTAGATATCCCAGCCTCTGTC
TTTAGACCCGATGCTGGCGGGTCGGGTCAAACCATGGTCGATTCGGATTCTGAATTCACT
CACCTGGTCGACGTGGCGTATGATAAAGTGAGGGAAGAAATAGTGAAGCGTGTAGGGCCC
AGAATGAAAAAAGGTTACGTCTACGGCGAAACGGCTGACATGTGTTTTGATGGAAACAAT
CCTATGGAGATCGGACGGTTGGTAGGAGATCTTGCGTTTGAGTTCGGGAGAGGAGTGGAG
ATTCTCGTTGAAAAACAAAGGCTTCTTATTAACGTAGGAGATGGGGTCCACTGTGTTGGC
ATCGGACGGTCAAGCATGCTCGGTGCAGCTAGTAATATAATCGGGAACGTTCATCAGCAG
AATCTATGGGTTGAGTTTGATGTAATCAATAAGAGAGTGGGTTTCAGTAAAGCTGACTGC
AGCAGATCATTACCTTAATGAGAAGGCTCCAGTATTTATCTACGGTCCTGCGTATTATTC
GAAAATGTTCCCCGATTATGATCATCTTTGGGTGATTGTTCGATCGGACAGTGTATATTA
TTAGATCAGTTTTATTCTGGGACTGTGTGGTCCCGTTAGAAGGACACCTGTCTGAAGCAA
ATTTGTTGTCTTATTAAGTTCTGTAACTATAATAATTAAATAGCTCATGTATGTGTTAAT
TACTGTCACGTGTATTATATTGTTTCCGTTCAAC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ40TFB U 1
AF RR2AF28TF U 2
AF RR2AF28JQ C 653
AF RR2AZ40JQ C 835
BS 1 431 RR2AZ40TFB
BS 432 432 RR2AF28TF
BS 433 707 RR2AZ40TFB
BS 708 708 RR2AF28TF
BS 709 785 RR2AZ40TFB
BS 786 868 RR2AF28TF
BS 869 1040 RR2AF28JQ
BS 1041 1041 RR2AZ40JQ
BS 1042 1496 RR2AF28JQ
BS 1497 1594 RR2AZ40JQ

RD RR2AZ40TFB 785 0 0
GGGGCTCACTCTCAAACTGTTAAAAAAATGTCTCTCTTCTTAACACTTCTCTACGTTTTC
CTCTGCAACTCAATTACTCTCTCATCATCTCTCTCTCTCCACTTCCCTCTCACATCTCTC
CGTCTCACCACAAACACTAGTAGCCCATCCTCCTCTTCTTCTCTCCAAACCTCCCTAGCC
TCTCGCCGGAATCCATCTCAGTCGTCATCATCTCCTCCGTACAATTTCCGATCAAACTTC
AAATACTCGATGGCTCTGATTCTCTCTCTTCCGATTGGGACACCTGCTCAGACTCAAGAG
CTTGTCCTCGACACAGGGAGCCAACTCTCGTGGATCCAGTGCCATCGCAAGAAGAAGAAA
CCACCAACGACGTCGTTTGATCCGTCGCTGTCTTCATCCTTCTCCAACTTGCCTTGCTCT
CATCCTTTCTGTAAACCAAGAATTCCCGATTTTACCCTTCCCACAACTTGCGACTCGAAC
CGTCTCTGTCACTACTCCTACTTCTACGCAGACGGAACCTACGCCGAAGGCAATCTCGTC
AAAGAAAAATTCACCTTCTCAAGTACCCAAACTACCCCTCCTTTGATTCTAGGCTGTGCT
GCCGAGTCTACAGACGACAGGGGTATTTTGGGGATGAATCTTGGTCGCCTTTCTTTCATC
TCGCAAGCTAAAATATCCAAGTTCTCTTATTGCATTCCAACCAGGTCGAACCGGCCCGGT
TTTACCCCGACAGGGTCTTTCTACCTCGGGGAAAATCCCATCTCTCGAGGATTTAAATAC
GTCCC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2AF28TF 871 0 0
GGGCTCACTCTCAAACTGTTAAAAAAATGTCTCTCTTCTTAACACTTCTCTACGTTTTCC
TCTGCAACTCAATTACTCTCTCATCATCTCTCTCTCTCCACTTCCCTCTCACATCTCTCC
GTCTCACCACAAACACTAGTAGCCCATCCTCCTCTTCTTCTCTCCAAACCTCCCTAGCCT
CTCGCCGGAATCCATCTCAGTCGTCATCATCTCCTCCGTACAATTTCCGATCAAACTTCA
AATACTCGATGGCTCTGATTCTCTCTCTTCCGATTGGGACACCTGCTCAGACTCAAGAGC
TTGTCCTCGACACAGGGAGCCAACTCTCGTGGATCCAGTGCCATCGCAAGAAGAAGAAAC
CACCAACGACGTCGTTTGATCCGTCGCTGTCTTCATCCTTCTCCAACTTGCCTTGCTCTC
ATCCTTTCTGCAAACCAAGAATTCCCGATTTTACCCTTCCCACAACTTGCGACTCGAACC
GTCTCTGTCACTACTCCTACTTCTACGCAGACGGAACCTACGCCGAAGGCAATCTCGTCA
AAGAAAAATTCACCTTCTCAAGTACCCAAACTACCCCTCCTTTGATTCTAGGCTGTGCTG
CCGAGTCTACAGACGACAGGGGTATTTTGGGGATGAATCTTGGTCGCCTTTCTTTCATCT
CGCAAGCTAAAATATCCAAGTTCTCTTATTGCATTCCAACCAGGTCTAACCGGCCCGGTT
TTACCCCGACAGGGTCTTTCTACCTCGGGGAAAATCCCATCTCTCGAGGATTTAAATACG
TCCCTCTTTTGACTTTTCCTCAGAGTCAACGCATGCCGAATCTAGACCCTCTGGCTTATA
CAGTACCTTTGCAAGGTATCCGAATAG
ACAA

QA 1 867 1 867
DS 

RD RR2AF28JQ 846 0 0
CTTTCATCTCGCAAGCTAAAATATCCAAGTTCTCTTATTGCATTCCAACCAGGTCTAACC
GGCCCGGTTTTACCCCGACAGGGTCTTTCTACCTCGGGGAAAATCCCATCTCTCGAGGAT
TTAAATACGTCCCTCTTTTGACTTTTCCTCAGAGTCAACGCATGCCGAATCTAGACCCTC
TGGCTTATACAGTACCTTTGCAAGGTATCCGAATAGGACAAAAGAGGCTAGATATCCCAG
CCTCTGTCTTTAGACCCGATGCTGGCGGGTCGGGTCAAACCATGGTCGATTCGGATTCTG
AATTCACTCACCTGGTCGACGTGGCGTATGATAAAGTGAGGGAAGAAATAGTGAAGCGTG
TAGGGCCCAGAATGAAAAAAGGTTACGTTTACGGCGAAACGGCTGACATGTGTTTTGATG
GAAACAATCCTATGGAGATCGGACGGTTGGTAGGAGATCTTGCGTTTGAGTTCGGGAGAG
GAGTGGAGATTCTCGTTGAAAAACAAAGGCTTCTTATTAACGTAGGAGATGGGGTCCACT
GTGTTGGCATCGGACGGTCAAGCATGCTCGGTGCAGCTAGTAATATAATCGGGAACGTTC
ATCAGCAGAATCTATGGGTTGAGTTTGATGTAATCAATAAGAGAGTGGGTTTCAGTAAAG
CTGACTGCAGCAGATCATTACCTTAATGAGAAGGCTCCAGTATTTATCTACGGTCCTGCG
TATTATTCGAAAATGTTCCCCGATTATGATCATCTTTGGGTGATTGTTCGATCGGACAGT
GTATATTATTAGATCAGTTTTATTCTGGGACTGTGTGGTCCCGTTAGAAGGACACCTGTC
TGAA
AT

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR2AZ40JQ 760 0 0
GCTTATACAGTACCTTTGCAAGGTATCCGAATAGGACAAAAGAGGCTAGATATCCCAGCC
TCTGTCTTTAGACCCGATGCTGGCGGGTCGGGTCAAACCATGGTCGATTCGGGTTCTGAA
TTCACTCACTTGGTCGACGTGGCGTATGATAAAGTGAGGGAAGAAATAGTGAAGCGTGTA
GGGCCCAGAATGAAAAAAGGTTACGTCTACGGCGAAACGGCTGACATGTGTTTTGATGGA
AACAATCCTATGGAGATCGGACGGTTGGTAGGAGATCTTGCGTTTGAGTTCGGGAGAGGA
GTGGAGATTCTCGTTGAAAAACAAAGGCTTCTTATTAACGTAGGAGATGGGGTCCACTGT
GTTGGCATCGGACGGTCAAGCATGCTCGGTGCAGCTAGTAATATAATCGGGAACGTTCAT
CAGCAGAATCTATGGGTTGAGTTTGATGTAATCAATAAGAGAGTGGGTTTCAGTAAAGCT
GACTGCAGCAGATCATTACCTTAATGAGAAGGCTCCAGTATTTATCTACGGTCCTGCGTA
TTATTCGAAAATGTTCCCCGATTATGATCATCTTTGGGTGATTGTTCGATCGGACAGTGT
ATATTATTAGATCAGTTTTATTCTGGGACTGTGTGGTCCCGTTAGAAGGACACCTGTCTG
AAGCAAATTTGTTGTCTTATTAAGTTCTGTAACTATAATAATTAAATAGCTCATGTATGT
GTTAATTACTGTCACGTGTATTATATTGTTTCCGTTCAAC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 2 6

CO CL1510Contig1 826 4 7 U
ATACTCTCAGAAGAATTTAATCAAAAAAAAAAACTCACAGAAAAAAAGAAAAAGCTTTGA
AAATGCCACATCAAAAGTAGATATTCAGCAACGTACAACACATGCATTGCAATAGTATAG
TAGGTTGTCATAGATGAGTGAAACCATCAGCTGACAACATACATCATTTAAAAGTATGAA
AACAAATACAGAGGCGAAATTCTGGATCCATTGTCTAGAAGCTTATTGTACATCATATAT
GATCAATTACGGAAACAACACATCATTTGAAAGTAGGGAATCAAGGGTATTTGAAGTGAT
GCGGAAGTAGCAAAGGCTGGAAGCCGTGGCTGAAACAAGCTTCCCATACTTGGTCCAAAT
CTGAGAGAAGAATGGATGTGCCGCACTCATGCATTTCCCATCCTTCTAAGGCGTGCAATA
TGCCAGCCACTCTAGTTGCACTCATAGCCTTTCTCGGTAACCAGTTCTCACATGAGTGGA
TATTCACTAGAGATTTTGGAATTATTAAAGCCGGTGGTGTATGATAGGTACAATCTCTAC
GAAACTGCTTGAGGGGGAACTGTGAGATTGGGATAAATAACGTTCCTTTTGTGGCCATTT
CCTGCTCCTATCTAGTTGTTCCTTCTCCCATCAGCCATATCTTGTTTGATGCGAGTGCTT
CAGAGGTTAAAAGGACCAAACGGTCTCTGCATTCTTGTGGAACAAATGATCTTAGGTTCT
CATACTTTTCTGGTAATAGAGTCGATACCTGAACTCCTCTCTGGCAAAGAGCAGAGGCGA
TGGTGTATGCCACCTTTGTGAGATTGCCTGACATCACTACTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA93JQ U 1
AF RR2AX47JQ U 59
AF RR2GI17JQB U 369
AF RR2AX47TFB C 333
BS 1 194 RR2GA93JQ
BS 195 195 RR2AX47JQ
BS 196 609 RR2GA93JQ
BS 610 610 RR2AX47JQ
BS 611 656 RR2GA93JQ
BS 657 769 RR2AX47JQ
BS 770 826 RR2AX47TFB

RD RR2GA93JQ 660 0 0
ATACTCTCAGAAGAATTTAATCAAAAAAAAAAACTCACAGAAAAAAAGAAAAAGCTTTGA
AAATGCCACATCAAAAGTAGATATTCAGCAACGTACAACACATGCATTGCAATAGTATAG
TAGGTTGTCATAGATGAGTGAAACCATCAGCTGACAACATACATCATTTAAAAGTATGAA
AACAAATACAGAGGTGAAATTCTGGATCCATTGTCTAGAAGCTTATTGTACATCATATAT
GATCAATTACGGAAACAACACATCATTTGAAAGTAGGGAATCAAGGGTATTTGAAGTGAT
GCGGAAGTAGCAAAGGCTGGAAGCCGTGGCTGAAACAAGCTTCCCATACTTGGTCCAAAT
CTGAGAGAAGAATGGATGTGCCGCACTCATGCATTTCCCATCCTTCTAAGGCGTGCAATA
TGCCAGCCACTCTAGTTGCACTCATAGCCTTTCTCGGTAACCAGTTCTCACATGAGTGGA
TATTCACTAGAGATTTTGGAATTATTAAAGCCGGTGGTGTATGATAGGTACAATCTCTAC
GAAACTGCTTGAGGGGGAACTGTGAGATTGGGATAAATAACGTTCCTTTTGTGGCCATTT
CCTGCTCCTCTCTAGTTGTTCCTTCTCCCATCAGCCATATCTTGTTTGATGCGAGT
GCTT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2AX47JQ 711 0 0
GAAAATGCCACATCAGAAGTAGATATTCAGCAACGTACAACACATGCATTGCAATAGTAT
AGTAGGTTGTCATAGATGAGTGAAACCATCAGCTGACAACATACATCATTTAAAAGTATG
AAAACAAATACAGAGGCGAAATTCTGGATCCATTGTCTAGAAGCTTATTGTACATCGTAT
ATGATCAATTACGGAAACAACACATCATTTGAAAGTAGGGAATCAAGGGTATTTGAAGTG
ATGCGGAAGTAGCAGAGGCTGGAAGCCGTGGCTGAAACAAGCTTCCCATACTTGGTCCAA
ATCTGAAAGAAAAATGGATGTGCCGCACTCATGCATTTCCCATCCTTCTAAGGCGTGCAA
TATGCCAGCCACTCTAGTTGCACTCATAGCCTTTCTCGGTAACCAGTTCTCACATGAGTG
GATATTCACTAGAGATTTTGGAATTATTAAAGCCGGTGGTGTATGATAGGTACAATCTCT
ACGAAACTGCTTGAGGGGGAACTGTGAGATTGGGATAAATAACGTTCCTTTTGTGGCCAT
TTCCTGCTCCTATCTAGTTGTTCCTTCTCCCATCAGCCATATCTTGTTTGATGCGAGTGC
TTCAGAGGTTAAAAGGACCAAACGGTCTCTGCATTCTTGTGGAACAAATGATCTTAGGTT
CTCATACTTTTCTGGTAATAGAGTCGATACCTGAACTCCTCTCTGGCAAAG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2GI17JQB 402 0 0
AA
AATGGATGTGCCGCACTCATGCATTTCCCATCCTTCTAAGGCGTGCAATATGCCAGCCAC
TCTAGTTGCACTCATAGCCTTTCTCGGTAACCAGTTCTCACATGAGTGGATATTCACTAA
AGATTTTGGAATTATTAAAGCCGGTGGTGTATGATAGGTACAATCTCTACGAAACTGCTT
GAGGGGGAACTGTGAGATTGGGATAAATAACGTTCCTTTTGTGGCCATTTCCTGCTCCTC
TCTAGTTGTTCCTTCTCCCATCAGCCATATCTTGTTTGATGCGAGTACTTCAGAGGTTAA
AAGGACCAAACGGTCTCTGCATTCTTGTGGAACAAATGATCTTAGGTTCTCATACTTTTC
TGGTAATAGAGTCGATACCTGAACTCCTCTCTGGCAAAG
A

QA 3 401 3 401
DS 

RD RR2AX47TFB 494 0 0
AG
ACAAGCTTCCCATACTTGGTCCAAATCTGAGAGAAGAATGGATGTGCCGCACTCATGCAT
TTCCCATCCTTCTAAGGCGTGCAATATGCCAGCCACTCTAGTTGCACTCATAGCCTTTCT
CGGTAACCAGTTCTCACATGAGTGGATATTCACTAGAGATTTTGGAATTATTAAAGCCGG
TGGTGTATGATAGGTACAATCTCTACGAAACTGCTTGAGGGGGAACTGTGAGATTGGGAT
AAATAACGTTCCTTTTGTGGCCATTTCCTGCTCCTATCTAGTTGTTCCTTCTCCCATCAG
CCATATCTTGTTTGATGCGAGTGCTTCAGAGGTTAAAAGGACCAAACGGTCTCTGCATTC
TTGTGGAACAAATGATCTTAGGTTCTCATACTTTTCTGGTAATAGAGTCGATACCTGAAC
TCCTCTCTGGCAAAGAGCAGAGGCGATGGTGTATGCCACCTTTGTGAGATTGCCTGACAT
CACTACTTTTGT

QA 3 494 3 494
DS 



CO CL1510Contig2 858 2 4 U
GGAATCAACCAAATAACCAAATTGAATCGAATCCAAATCGAACTGAGAAAATAACCGAAG
TGTCCACCGCCAGTTATTAACAAATCCTTTTGTTTTCCTACGTATTGGTAGCGAGTGCAA
TGTGATAAAACACTCTTATTGTCATAATATCATTCTTTTGGATTATAAAATTATCATGAT
GAGAGTTGCAGATTCCACTCGCTGCACCACACCCAATTCCGGACCAACTACTCCCTCTTC
ATGCCCTTGTATGACTACATCTACGGCACAATGGATAAATCCTCGGATACATTGTATGAG
AAATCTCTAGAAAGAGGAGAAGATAAAGTGGACGTCGTGCACTTAACTCACCTGACGACG
CCCGAGTCCATATACCATTTGCGGATTGGCTTGGCTTCATTTGCCTCCTATCCCTTCTCT
TACAGATGGTTCATGCGCCTTTTGTGGCCTTTCACATCTCTCTCCATGCTCTTCACTCTC
TTCTACGCCAGCAGCCCTTTTGTCGCTGAGAGAAACTCTTTTGAGAAGCTCAACTTGCAG
TCTTGGATCATACCCAGATATAATCTGCAGTACTTGTTAAAATGGAGGAAAGACGCGATC
AACAATACTAGAGGCAAATAAAAAAGGAGTGAAGGTGCTTAGCCTGGGTCTCATGAACCA
AGGGGAGGAGCTAAACAGGAATGGAGAGGTGTATATTGACAAGCATCCAGAAATGAAAGT
AAGATTGGTGGATGGCAGTAGATTGTCAGCAGCAGTCGTGATCAATAATCTACCCAAATC
AACGACAAAAGTAGTGATGACAGGCAATCTCACAAAGGTGGCATACACCATCGCCTCTGC
TCTTTGCCAGAGAGGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI17TF U 1
AF RR2GA93TF U 509
BS 1 595 RR2GI17TF
BS 596 596 RR2GA93TF
BS 597 607 RR2GI17TF
BS 608 858 RR2GA93TF

RD RR2GI17TF 626 0 0
GGAATCAACCAAATAACCAAATTGAATCGAATCCAAATCGAACTGAGAAAATAACCGAAG
TGTCCACCGCCAGTTATTAACAAATCCTTTTGTTTTCCTACGTATTGGTAGCGAGTGCAA
TGTGATAAAACACTCTTATTGTCATAATATCATTCTTTTGGATTATAAAATTATCATGAT
GAGAGTTGCAGATTCCACTCGCTGCACCACACCCAATTCCGGACCAACTACTCCCTCTTC
ATGCCCTTGTATGACTACATCTACGGCACAATGGATAAATCCTCGGATACATTGTATGAG
AAATCTCTAGAAAGAGGAGAAGATAAAGTGGACGTCGTGCACTTAACTCACCTGACGACG
CCCGAGTCCATATACCATTTGCGGATTGGCTTGGCTTCATTTGCCTCCTATCCCTTCTCT
TACAGATGGTTCATGCGCCTTTTGTGGCCTTTCACATCTCTCTCCATGCTCTTCACTCTC
TTCTACGCCAGCAGCCCTTTTGTCGCTGAGAGAAACTCTTTTGAGAAGCTCAACTTGCAG
TCTTGGATCATACCCAGATATAATCTGCAGTACTTGTTAAAATGGAGGAAAGACGTGATC
AACAATA
TGATTGAGAAAGCAATACT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2GA93TF 350 0 0
G
GAGAAACTCTTTTGAGAAGCTCAACTTGCAGTCTTGGATCATACCCAGATATAATCTGCA
GTACTTGTTAAAATGGAGGAAAGACGCGATCAACAATACTAGAGGCAAATAAAAAAGGAG
TGAAGGTGCTTAGCCTGGGTCTCATGAACCAAGGGGAGGAGCTAAACAGGAATGGAGAGG
TGTATATTGACAAGCATCCAGAAATGAAAGTAAGATTGGTGGATGGCAGTAGATTGTCAG
CAGCAGTCGTGATCAATAATCTACCCAAATCAACGACAAAAGTAGTGATGACAGGCAATC
TCACAAAGGTGGCATACACCATCGCCTCTGCTCTTTGCCAGAGAGGAGT

QA 2 350 2 350
DS 



AS 1 5

CO CL1511Contig1 679 5 2 U
GGACTTGTGTTTTGTCATTCCTCCTTCACTTATTTCTCGGTCTCTCCTCTCCTTCACCAT
TCTTAGATCATCGATCTGTCTTCTTAGACCCCTTTGGCATCTCTC*****AGGCGGATTT
GGGTAGATAGAAATGGCAACAGCATCAAGGTTCCAAGCATTCTTGAATAGCCCCGTTGGA
CCTAAAACAACCCATTTCTGGGGTCCGATCGCTAACTGGGGCTTTGTTGCTGCTGGTTTG
GTGGATATGCAAAAGCCTCCTGAGATGATCTCCGGAAACATGACCTCAGCCATGTGCATT
TACTCTGCTTTGTTCATGAGGTTTGCCTGGATGGTCCAACCACGCAACTATTTACTACTT
GCCTGCCATGCTTCCAACGAGACTGTTCAGCTCTATCAGCTCTCCCGCTGGGCTAGAGCT
CAGGGGTATCTATCCTCAACGAAACAAGAGGAGAAACCGGCTCAGTAAAACTGTCACAAG
GAAAGGTTTCTTCAACGCTTCTGCTTGCTTCTGATGATCAACGAAACGGATCATCTGCAT
ATCTCTTCTTGGGAATTAATAAATTCTGTTTGCTTTTACTTTGAAACATATTTGTGTTGT
GTCCCCAAGCTATATGCTTTACTTGTTGGATCCTTCATTAACATCTCTCCTTTTTAATAA
AATTGGGGATCCAAAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B818JQ C 69
AF RR2B818TF U 17
AF RR2E859TF U 1
AF RR2FB78JQ C 40
AF RR2FB78TF U 40
BS 1 669 RR2E859TF
BS 670 679 RR2FB78TF

RD RR2B818JQ 590 0 0
CATCGATCTGTCTTCTTAGACCCCTTTGGCATCTCTC*****AGGCGGATTTGGGTAGAT
AGAAATGGCAACAGCATCAAGGTTCCAAGCATTCTTGAATAGCCCCGTTGGACCTAAAAC
AACCCATTTCTGGGGTCCGATCGCTAACTGGGGCTTTGTTGCTGCTGGTTTGGTGGATAT
GCAAAAGCCTCCTGAGATGATCTCCGGAAACATGACCTCAGCCATGTGCATTTACTCTGC
TTTGTTCATGAGGTTTGCCTGGATGGTCCAACCACGCAACTATTTACTACTTGCCTGCCA
TGCTTCCAACGAGACTGTTCAGCTCTATCAGCTCTCCCGCTGGGCTAGAGCTCAGGGGTA
TCTATCCTCAACGAAACAAGAGGAGAAACCGGCTCAGTAAAACTGTCACAAGGAAAGGTT
TCTTCAACGCTTCTGCTTGCTTCTGATGATCAACGAAACGGATCATCTGCATATCTCTTC
TTGGGAATTAATAAATTCTGTTTGCTTTTACTTTGAAACATATTTGTGTTGTGTCCCCAA
GCTATATGCTTTACTTGTTGGATCCTTCATTAACATCTCTCCTTTTTAAT

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2B818TF 639 0 0
GG
TCCTCCTTCACTTATTTCTCGGTCTCTCCTCTCCTTCACCATTCTTAGATCATCGATCTG
TCTTCTTAGACCCCTTTGGCATCTCTC*****AGGCGGATTTGGGTAGATAGAAATGGCA
ACAGCATCAAGGTTCCAAGCATTCTTGAATAGCCCCGTTGGACCTAAAACAACCCATTTC
TGGGGTCCGATCGCTAACTGGGGCTTTGTTGCTGCTGGTTTGGTGGATATGCAAAAGCCT
CCTGAGATGATCTCCGGAAACATGACCTCAGCCATGTGCATTTACTCTGCTTTGTTCATG
AGGTTTGCCTGGATGGTCCAACCACGCAACTATTTACTACTTGCCTGCCATGCTTCCAAC
GAGACTGTTCAGCTCTATCAGCTCTCCCGCTGGGCTAGAGCTCAGGGGTATCTATCCTCA
ACGAAACAAGAGGAGAAACCGGCTCAGTAAAACTGTCACAAGGAAAGGTTTCTTCAACGC
TTCTGCTTGCTTCTGATGATCAACGAAACGGATCATCTGCATATCTCTTCTTGGGAATTA
ATAAATTCTGTTTGCTTTTACTTTGAAACATATTTGTGTTGTGTCCCCAAGCTATATGCT
TTACTTGTTGGATCCTTCATTAACATCTCTCCTTTTT

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR2E859TF 669 0 0
GGACTTGTGTTTTGTCATTCCTCCTTCACTTATTTCTCGGTCTCTCCTCTCCTTCACCAT
TCTTAGATCATCGATCTGTCTTCTTAGACCCCTTTGGCATCTCTC*****AGGCGGATTT
GGGTAGATAGAAATGGCAACAGCATCAAGGTTCCAAGCATTCTTGAATAGCCCCGTTGGA
CCTAAAACAACCCATTTCTGGGGTCCGATCGCTAACTGGGGCTTTGTTGCTGCTGGTTTG
GTGGATATGCAAAAGCCTCCTGAGATGATCTCCGGAAACATGACCTCAGCCATGTGCATT
TACTCTGCTTTGTTCATGAGGTTTGCCTGGATGGTCCAACCACGCAACTATTTACTACTT
GCCTGCCATGCTTCCAACGAGACTGTTCAGCTCTATCAGCTCTCCCGCTGGGCTAGAGCT
CAGGGGTATCTATCCTCAACGAAACAAGAGGAGAAACCGGCTCAGTAAAACTGTCACAAG
GAAAGGTTTCTTCAACGCTTCTGCTTGCTTCTGATGATCAACGAAACGGATCATCTGCAT
ATCTCTTCTTGGGAATTAATAAATTCTGTTTGCTTTTACTTTGAAACATATTTGTGTTGT
GTCCCCAAGCTATATGCTTTACTTGTTGGATCCTTCATTAACATCTCTCCTTTTTAATAA
AATTGGGGA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2FB78JQ 640 0 0
GG
CTCTCCTCTCCTTCACCATTCTTAGATCATCGATCTGTCTTCTTAGACCCCTTTGGCATC
TCTCAGTGCAGGCGGATTTGGGTAGATAGAAATGGCAACAGTATCAAGGTTCCAAGCATT
CTTGAATAGCCCCGTTGGACCTAAAACAACCCATTTCTGGGGTCCGATCGCTAACTGGGG
CTTTGTTGCTGCTGGTTTGGTGGATATGCAAAATCCTCCTGAGATGATCTCCGGAAACAT
GACCTCAGCCATGTGCATTTACTTTGCTTTGTTCATGAGGTTTGCCTGGATGGTCCAACC
ACGCAACTATTTACTACTTGCCTGCCATGCTTCCAACGAGACTGTTCAGCTCTATCAGCT
CTCCCGCTGGGCTAGAGCTCAGGGGTATCTATCCTCAACGAAACAAGAGGAGAAACCGGC
TCAGTAAAACTGTCACAAGGAAAGGTTTCTTCAACGCTTCTGCTTGCTTCTGATGATCAA
CGAAACGGATCATCTGCATATCTCTTCTTGGGAATTAATAAATTCTGTTTGCTTTTACTT
TGAAACATAGTTGTGTTGTGTCCCCAAGCTATATGCTTTACTTGTTGGATCCTTCATTAA
CATCTCTCCTTTTTAATAAAATTGGGGATCCAAAATGG

QA 3 640 3 640
DS 

RD RR2FB78TF 640 0 0
GG
CTCTCCTCTCCTTCACCATTCTTAGATCATCGATCTGTCTTCTTAGACCCCTTTGGCATC
TCTCAGTGCAGGCGGATTTGGGTAGATAGAAATGGCAACAGTATCAAGGTTCCAAGCATT
CTTGAATAGCCCCGTTGGACCTAAAACAACCCATTTCTGGGGTCCGATCGCTAACTGGGG
CTTTGTTGCTGCTGGTTTGGTGGATATGCAAAATCCTCCTGAGATGATCTCCGGAAACAT
GACCTCAGCCATGTGCATTTACTCTGCTTTGTTCATGAGGTTTGCCTGGATGGTCCAACC
ACGCAACTATTTACTACTTGCCTGCCATGCTTCCAACGAGACTGTTCAGCTCTATCAGCT
CTCCCGCTGGGCTAGAGCTCAGGGGTATCTATCCTCAACGAAACAAGAGGAGAAACCGGC
TCAGTAAAACTGTCACAAGGAAAGGTTTCTTCAACGCTTCTGCTTGCTTCTGATGATCAA
CGAAACGGATCATCTGCATATCTCTTCTTGGGAATTAATAAATTCTGTTTGCTTTTACTT
TGAAACATAGTTGTGTTGTGTCCCCAAGCTATATGCTTTACTTGTTGGATCCTTCATTAA
CATCTCTCCTTTTTAATAAAATTGGGGATCCAAAATGG

QA 3 640 3 640
DS 



AS 2 6

CO CL1512Contig1 1665 3 13 U
GGGCTGAGAGGAAAGAATTAGGGTTTCAACAGAAGACTGTTGTTAGTTTGAAAGAGCAGT
TAGCGAGGACCACTCTGAGGAACTTGAGAGCGCAGGGTCATACCTACGTTGAGCTGCGCG
AGGATGGGAAGAGATTCGTGTTCTTCTGCACTCTGTGTCTCGCTCCTTGCTACAGTGACG
CGATCTTGCCTGGACACTTGAACGGGAGCCTTCACAAGGAGAGGTTGTCGTGTGCTAAGA
TAACGCTTCTCCACGGTGAACATCCCTGGCCTTTCAATGATGGTGTGCTCTTCTTCGATA
CGGAGGAAGAAGAAGAAGAGGAGGAGAAGAGTTTGATCTCTTCTGGTGGTTGTGTTGAAG
CTGAAGCTGGTCCTTTGCAGCTTTGCTGCAGTGATGATGGTGATGAGAGATTTGCTATTG
TTGCTTATGATGAGAACAGAATGAGTCGAGACGATGATCAACCTCCTGCTGCTGCTGCGG
ATGATCTGTTGATATCTGGTTTGCTGATCAAGGAGAGAACACTTGATGTGGAAGCGAAGT
TTATCGGCTTTGGCCGGATAGCTGCTAGGTTGTTTGAGAAGAAAGGACGGTCGACTTGGA
TTGATAAGTTATGGTGCGAGTGGTTAGGAAAAGACGGTCCTTCCGATGAGGAGAAGGCTG
TTGTCCCAGAGCATGACTTTGCTGTTGTCACGTTCTCCTACTTCTACAACTTGGGTAGGC
TTGGTCTGCTCGACCATCCGAGCCGTCTTCTCACATCGGAATCAGGTGAAGACAGTGGCA
GGAAGAGAAAGAAGTCGTTTTCGGATCTGGAGGATACCAGTGAGTCTCTGTGTAGTCAGG
ATGACTCTTCAGAGGAGGTTTCTTCGAGAGCTTTACTAGCTGACTACGATGACCATCTCG
TGAGCAGGAGAGTCATCAAGAACAGAACGGTGAGAAGGGAGCTCAGGAAGCAGCAGAGGA
TATTTTCCGAAAGGATATGCGAAGTCTGTAAGCAAAAGATGCTCCCTGGGAAAGACGCTG
CAGCAATACTAAACACGAAGACGGGGAAGCTCGTGTGCGGCAGCAGAAACCTCCTTGGAG
CGTTCCACCTGTTCCACGTGTCTTGTGTCGTGCACTGGTTTCTCTTCTGTGAGAGTGAAA
TACTTGGGAACAAGATGGTGAGTGGGAAAGGCAAAAAGAGATGCGCGAAGAAGCATCAGA
GTGGTGTGAAGTTGAATAGGTTGGTAAGCGATGTGAGCTGGCAAATATTCTCAGTGTTCT
GTCCTGAATGCCAAGGCACTGGGATAAACATTGAAGGAGATGTGATTGAGAGAGACACGT
TTCCCCTTTTTCAGACATGGAGATTTGGGGTGAAAGTGAGTGAAGGTAGAAAAGCATGGG
TGAAGAATCCGGAGAAGTTGGAGAATTGCTCAACAGGTTTTCATTTTCCGCAACAGAATG
AAGAATCAGTCAAGGATCAGGAGGAGAGAGTGCAGAACATGAAGCTAGTTCGTTTCTACC
GGGTGGAGTTGTAATGTAGGAAACACTAGCTAAGACACTCTGAATTTGATGTGTGTGTTT
GTGTGTAAATAAGGCCTTGGTCTCGCATTTTACAGGTCTCTCTGTAAATCCTATTACTTT
TGATACTATGATCACTTTTGAGGCCCAATTAACTTTTCATATTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D641TF U 1
AF RR2E970TF U 527
AF RR2D641JQ C 826
BS 1 537 RR2D641TF
BS 538 538 RR2E970TF
BS 539 632 RR2D641TF
BS 633 850 RR2E970TF
BS 851 851 RR2D641JQ
BS 852 935 RR2E970TF
BS 936 936 RR2D641JQ
BS 937 943 RR2E970TF
BS 944 944 RR2D641JQ
BS 945 1138 RR2E970TF
BS 1139 1139 RR2D641JQ
BS 1140 1170 RR2E970TF
BS 1171 1665 RR2D641JQ

RD RR2D641TF 632 0 0
GGGCTGAGAGGAAAGAATTAGGGTTTCAACAGAAGACTGTTGTTAGTTTGAAAGAGCAGT
TAGCGAGGACCACTCTGAGGAACTTGAGAGCGCAGGGTCATACCTACGTTGAGCTGCGCG
AGGATGGGAAGAGATTCGTGTTCTTCTGCACTCTGTGTCTCGCTCCTTGCTACAGTGACG
CGATCTTGCCTGGACACTTGAACGGGAGCCTTCACAAGGAGAGGTTGTCGTGTGCTAAGA
TAACGCTTCTCCACGGTGAACATCCCTGGCCTTTCAATGATGGTGTGCTCTTCTTCGATA
CGGAGGAAGAAGAAGAAGAGGAGGAGAAGAGTTTGATCTCTTCTGGTGGTTGTGTTGAAG
CTGAAGCTGGTCCTTTGCAGCTTTGCTGCAGTGATGATGGTGATGAGAGATTTGCTATTG
TTGCTTATGATGAGAACAGAATGAGTCGAGACGATGATCAACCTCCTGCTGCTGCTGCGG
ATGATCTGTTGATATCTGGTTTGCTGATCAAGGAGAGAACACTTGATGTGGAAGCGAGGT
TTATCGGCTTTGGCCGGATAGCTGCTAGGTTGTTTGAGAAGAAAGGACGGTCGACTTGGA
TTGATAAGTTATGGTGCGAGTGGTTAGGAAAA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2E970TF 647 0 0
G
GTGGAAGCGAAGTTTATCGGCTTTGGCCGGATAGCTGCTAGGTTGTTTGAGAAGAAAGGA
CGGTCGACTTGGGTTGATAAGTTATGGTGCGAGTGGTTAGGAAAAGACGGTCCTTCCGAT
GAGGAGAAGGCTGTTGTCCCAGAGCATGACTTTGCTGTTGTCACGTTCTCCTACTTCTAC
AACTTGGGTAGGCTTGGTCTGCTCGACCATCCGAGCCGTCTTCTCACATCGGAATCAGGT
GAAGACAGTGGCAGGAAGAGAAAGAAGTCGTTTTCGGATCTGGAGGATACCAGTGAGTCT
CTGTGTAGTCAGGATGACTCTTCCGAGGAGGTTTCTTCGAGAGCTTTACTAGCTGACTAC
GATGACCATCTCGTGAGCAGGAGAGTCATCAAGAACAGAACGGTGAGACGGGAGCTTAGG
AAGCAGCAGAGGATATTTTCCGAAAGGATATGCGAAGTCTGTAAGCAAAAGATGCTCCCT
GGGAAAGACGCTGCAGCAATACTAAACACGAAGACGGGGAAGCTCGTGTGCGGCAGCAGA
AACCTCCTTGGAGCGTTCCACCTGTTCCACGTGTCTTGTGTCGTGCACTGGTTTCTCTTC
TGTGAGAGTGAGATACTTGGGAACAAGATGGTGAGTGGGAAAG
CAA

QA 2 644 2 644
DS 

RD RR2D641JQ 840 0 0
CTCTGTGTAGTCAGGATGACTCTTCAGAGGAGGTTTCTTCGAGAGCTTTACTAGCTGACT
ACGATGACCATCTCGTGAGCAGGAGAGTCATCAAGAACAGAACGGTGAGAAGGGAGCTCA
GGAAGCAGCAGAGGATATTTTCCGAAAGGATATGCGAAGTCTGTAAGCAAAAGATGCTTC
CTGGGAAAGACGCTGCAGCAATACTAAACACGAAGACGGGGAAGCTTGTGTGCGGCAGCA
GAAACCTCCTTGGAGCGTTCCACCTGTTCCACGTGTCTTGTGTCGTGCACTGGTTTCTCT
TCTGTGAGAGTGAAATACTTGGGAACAAGATGGTGAGTGGGAAAGGCAAAAAGAGATGCG
CGAAGAAGCATCAGAGTGGTGTGAAGTTGAATAGGTTGGTAAGCGATGTGAGCTGGCAAA
TATTCTCAGTGTTCTGTCCTGAATGCCAAGGCACTGGGATAAACATTGAAGGAGATGTGA
TTGAGAGAGACACGTTTCCCCTTTTTCAGACATGGAGATTTGGGGTGAAAGTGAGTGAAG
GTAGAAAAGCATGGGTGAAGAATCCGGAGAAGTTGGAGAATTGCTCAACAGGTTTTCATT
TTCCGCAACAGAATGAAGAATCAGTCAAGGATCAGGAGGAGAGAGTGCAGAACATGAAGC
TAGTTCGTTTCTACCGGGTGGAGTTGTAATGTAGGAAACACTAGCTAAGACACTCTGAAT
TTGATGTGTGTGTTTGTGTGTAAATAAGGCCTTGGTCTCGCATTTTACAGGTCTCTCTGT
AAATCCTATTACTTTTGATACTATGATCACTTTTGAGGCCCAATTAACTTTTCATATTGA

QA 1 840 1 840
DS 



CO CL1512Contig2 845 3 17 U
CGATATGAAAAGTTAATTGGGCCTCAAAAGTGATCATAGTATCAAAAGTGATAAGATTTA
CAGAGAGACCTGTAAAATGCGAGACCAAGGCCTTATTTACACACACAAACACACATCAAA
TTCAGAGTATCTCAAGCTAGTTGTTTTCC*TACATTACAACTCAACCCGGTAGAAACGAA
CTAGCTTCATGTTCTGCACTCTCTCCTCCTGATCCTTGACTGATTCTTCATTCTGTTGCG
GAAAATGAAAACCTGTTGAGCAATTCTCCAACTTCTCCGGATTCTTCACCCATGCTTTTC
TACCTTCACTCACTTTCACCCCAAACCTCCATGTCTGAAAAAGGGGGAACGTGTCTCTCT
CAATCACATCTCCTTCAATGTTTATCCCAGTACCTTGGCACTCAGGACAGAACACTGAGA
ATATTTGCCAGCTCACATCGCTTACCAACCTATTCAACTTCACACCACTCTGATGCTTCT
TCGCGCATCTCTTTTTGCCTTTCCCACTCACCATCTTGTTCCCAAGTATCTCACTCTCAC
AGAAGAGAAACCAGTGCACGACACAAGACACGTGGAACAGGTGGAACGCTCCAAGGAGGT
TTCTGCTGCCGCACACGAGCTTCCCCGTCTTCGTGTTTAGTATTGCTGCAGCGTCTTTCC
CAGGGAGCATCTTTTGCTTACAGACTTCGCATATCCTTTCGGAAAATATCCTCTGCTGCT
TCCTAAGCTCCCGTCTCACCGTTCTGTTCTTGATGACTCTCCTGCTCACGAGATGGTCAT
CGTAGTCAGCTAGTAAAGCTCTCGAGAACCTCCTCGGAGAGTCATCCTGACTACACAGAG
ACTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2BV93JQ U 21
AF RR2BV93TF C 21
AF RR2E970JQ U 1
BS 1 149 RR2E970JQ
BS 150 150 RR2BV93JQ
BS 151 163 RR2E970JQ
BS 164 164 RR2BV93JQ
BS 165 346 RR2E970JQ
BS 347 347 RR2BV93JQ
BS 348 391 RR2E970JQ
BS 392 392 RR2BV93JQ
BS 393 400 RR2E970JQ
BS 401 401 RR2BV93JQ
BS 402 409 RR2E970JQ
BS 410 410 RR2BV93JQ
BS 411 413 RR2E970JQ
BS 414 414 RR2BV93JQ
BS 415 430 RR2E970JQ
BS 431 431 RR2BV93JQ
BS 432 845 RR2E970JQ

RD RR2BV93JQ 428 0 0
GCCTCAAAAGTGATCATAGTATCAAAAGTGATAAGATTTACAGAGAGACCTGTAAAATGC
GAGACCAAGGCCTTATTTACACACACAAACACACATCAAATTCAGAGTATCTCAAGCTAG
TTGTTTTCC*TACATTACAACTCAACCCGGTAGAAACGAACTAGCTTCATGTTCTGCACT
CTCTCCTCCTGATCCTTGACTGATTCTTCATTCTGTTGCGGAAAATGAAAACCTGTTGAG
CAATTCTCCAACTTCTCCGGATTCTTCACCCATGCTTTTCTACCTTCACTCACTTTCACC
CCAAACCTCCATGTCTGAAAAAGGGGGAACGTGTCTCTCTCAATCACATCTCCTTCAATG
TTTATCCCAGTACCTTGGCACTCAGGACAGAACACTGAGAATATTTGCCAGCTCACATCG
CTTACCA
C

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR2BV93TF 428 0 0
GCCTCAAAAGTGATCATAGTATCAAAAGTGATAAGATTTACAGAGAGACCTGTAAAATGC
GAGACCAAGGCCTTATTTACACACACAAACACACATCAAATTCAGAGTATCTCAAGCTAG
TTGTTTTCC*TACATTACAACTCAACCCGGTAGAAACGAACTAGCTTCATGTTCTGCACT
CTCTCCTCCTGATCCTTGACTGATTCTTCATTCTGTTGCGGAAAATGAAAACCTGTTGAG
CAATTCTCCAACTTCTCCGGATTCTTCACCCATGCTTTTCTACCTTCACTCACTTTCACC
CCAAACCTCCATGTCTGAGAAAGGGGGAACGTGTCTCTCTCAATCACATCTCCTTCAATG
TTTATCCCAGTACCTTGGCACTCAGGACAGAACACTGAGAATATTTGCCAGCTCACATCG
CTTACCA
C

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR2E970JQ 845 0 0
CGATATGAAAAGTTAATTGGGCCTCAAAAGTGATCATAGTATCAAAAGTGATAAGATTTA
CAGAGAGACCTGTAAAATGCGAGACCAAGGCCTTATTTACACACACAAACACACATCAAA
TTCAGAGTATCTCAAGCTAGTTGTTTTCCCTACATTACAACTCCACCCGGTAGAAACGAA
CTAGCTTCATGTTCTGCACTCTCTCCTCCTGATCCTTGACTGATTCTTCATTCTGTTGCG
GAAAATGAAAACCTGTTGAGCAATTCTCCAACTTCTCCGGATTCTTCACCCATGCTTTTC
TACCTTCACTCACTTTCACCCCAAACCTCCATGTCTGAAAAAGGGGAAACGTGTCTCTCT
CAATCACATCTCCTTCAATGTTTATCCCAGTGCCTTGGCATTCAGGACAAAACGCTGAGA
ATATTTGCCAACTCACATCGCTTACCAACCTATTCAACTTCACACCACTCTGATGCTTCT
TCGCGCATCTCTTTTTGCCTTTCCCACTCACCATCTTGTTCCCAAGTATCTCACTCTCAC
AGAAGAGAAACCAGTGCACGACACAAGACACGTGGAACAGGTGGAACGCTCCAAGGAGGT
TTCTGCTGCCGCACACGAGCTTCCCCGTCTTCGTGTTTAGTATTGCTGCAGCGTCTTTCC
CAGGGAGCATCTTTTGCTTACAGACTTCGCATATCCTTTCGGAAAATATCCTCTGCTGCT
TCCTAAGCTCCCGTCTCACCGTTCTGTTCTTGATGACTCTCCTGCTCACGAGATGGTCAT
CGTAGTCAGCTAGTAAAGCTCTCGAGAACCTCCTCGGAGAGTCATCCTGACTACACAGAG
ACTCA

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 6

CO CL1513Contig1 778 6 5 U
AAATAAATAATGAACTTTCCAAAGGAAATGTACATATTTGTAGAATTGTGACAAATAGAG
AGAGCATGTCAAAAGATAGAATGAATAATACAACGAAGCGTGATATAGTGAATGTTACTC
TACAAAGAGGAAAATACATATAACAAGGCATAGGAGGGAAAACATCCTGGTCATTAGGTT
GCGAGTATTGGGTTCCTTTCTTCATCGATATCTATCGCAAGGACACGCTCTGGTTCCGAG
CCGCTCGGTCCTTCCTCGTACAGTGTCGGCAGATAAGCCTTATATGCAGGCAAATACCTT
GACACAAAGTCATTCACCTCATCATCAGACATCCCGGCTTTGCCAGCCTGCCTCATTGCT
ATTTCCGCCTGAAGACGCCATCGGTATACATAACTTGGGTCCTTAATTTTGATGACCACC
CATGCATCTATGTACTTGTCCCATGCCTCGTAATAAGCTTCAAGGTTCTTGTTCACTGTC
TCCAACTGAGGATCCACTGCTTTAACGGCTTCAGCAGGAAGAGGTTTAAAACCAAGCATC
CATCCCTCAAAGAGAATCACCTTTAGAGGTCCTTCAACTTCAGGCCATGTTTCTGCGTCG
GCTCTGTCACCCCTCCCGCTATAAGCAGACTTATCGTAGCGAGGAACTTTCATCTTCATG
CCTTCCTTGGTAAGTTTAGTCAGGGCTTCTATTGTTTCGACAGAGAATGGAAGATCATGG
CTTCCTGCATTCCCACGATACTCAAGGAGTGCATTTCCTGGATTCTCTTCCCTCAATC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN38JQ U 1
AF RR2F537JQ U 12
AF RR2FH22JQ U 4
AF RR2DJ36JQ U 19
AF RR2C860JQ U 22
AF RR2FH22TF C 176
BS 1 679 RR2DN38JQ
BS 680 697 RR2FH22JQ
BS 698 731 RR2DJ36JQ
BS 732 765 RR2C860JQ
BS 766 778 RR2FH22TF

RD RR2DN38JQ 679 0 0
AAATAAATAATGAACTTTCCAAAGGAAATGTACATATTTGTAGAATTGTGACAAATAGAG
AGAGCATGTCAAAAGATAGAATGAATAATACAACGAAGCGTGATATAGTGAATGTTACTC
TACAAAGAGGAAAATACATATAACAAGGCATAGGAGGGAAAACATCCTGGTCATTAGGTT
GCGAGTATTGGGTTCCTTTCTTCATCGATATCTATCGCAAGGACACGCTCTGGTTCCGAG
CCGCTCGGTCCTTCCTCGTACAGTGTCGGCAGATAAGCCTTATATGCAGGCAAATACCTT
GACACAAAGTCATTCACCTCATCATCAGACATCCCGGCTTTGCCAGCCTGCCTCATTGCT
ATTTCCGCCTGAAGACGCCATCGGTATACATAACTTGGGTCCTTAATTTTGATGACCACC
CATGCATCTATGTACTTGTCCCATGCCTCGTAATAAGCTTCAAGGTTCTTGTTCACTGTC
TCCAACTGAGGATCCACTGCTTTAACGGCTTCAGCAGGAAGAGGTTTAAAACCAAGCATC
CATCCCTCAAAGAGAATCACCTTTAGAGGTCCTTCAACTTCAGGCCATGTTTCTGCGTCG
GCTCTGTCACCCCTCCCGCTATAAGCAGACTTATCGTAGCGAGGAACTTTCATCTTCATG
CCTTCCTTGGTAAGTTTAG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2F537JQ 666 0 0
GAACTTT
CCAAAGGAAATGTACATATTTGTAGAATTGTGACAAATAGAGAGAGCATGTCAAAAGATA
GAATGAATAATACAACGAAGCGTGATATAGTGAATGTTACTCTACAAAGAGGAAAATACA
TATAACAAGGCATAGGAGGGAAA*CATCCTGGTCATTAGGTTGCGAGTATTGGGTTCCTT
TCTTCATCGATATCTATCGCAAGGACACGCTCTGGTTCCGAGCCGCTCGGTCCTTCCTCG
TACAGTGTCGGCAGATAAGCCTTATATGCAGGCAAATACCTTGACACAAAGTCATTCACC
TCATCATCAGACATCCCGGCTTTGCCAGCCTGCCTCATTGCTATTTCCGCCTGAAGACGC
CATCGGTATACATAACTTGGGTCCTTAATTTTGATGACCACCCATGCATCTATGTACTTG
TCCCATGCCTCGTAATAAGCTTCAAGGTTCTTGTTCACTGTCTCCAACTGAGGATCCACT
GCTTTAACGGCTTCAGCAGGAAGAGGTTTAAAACCAAGCATCCATCCCTCAAAGAGAATC
ACCTTTAGAGGTCCTTCAACTTCAGGCCATGTTTCTGCGTCGGCTCTGTCACCCCTCCCG
CTATAAGCAGACTTATCGTAGCGAGGAACTTTCATCTTCATGCCTTCCTTGGTAAGTTT

QA 8 666 8 666
DS 

RD RR2FH22JQ 694 0 0
TAAATAATGAACTTTCCAAAGGAAATGTACATATTTGTAGAATTGTGACAAATAGAGAGA
GCATGTCAAAAGATAGAATGAATAATACAACGAAGCGTGATATAGTGAATGTTACTCTAC
AAAGAGGAAAATACATATAACAAGGCATAGGAGGGAAAACATCCTGGTCATTAGGTTGCG
AGTATTGGGTTCATTTCTTCATCGATATCTATCGCAAGGACACGCTCTGGTTCCGAGCCG
CTCGGTCCTTCCTCGTACAGTGTCGGCAGATAAGCCTTATATGCAGGCAAATACCTTGAC
ACAAAGTCATTCACCTCATCATCAGACATCCCGGCTTTGCCAGCCTGCCTCATTGCTATT
TCCGCCTGAAGACGCCATCGGTATACATAACTTGGGTCCTTAATTTTGATGACCACCCAT
GCATCTATGTACTTGTCCCATGCCTCGTAATAAGCTTCAAGGTTCTTGTTCACTGTCTCC
AACTGAGGATCCACTGCTTTAACGGCTTCAGCAGGAAGAGGTTTAAAACCAAGCATCCAT
CCCTCAAAGAGAATCACCTTTAGAGGTCCTTCAACTTGAGGCCATGTTTCTGCGTCGGCT
CTGTCACCCCTCCCGCTATAAGCAGACTTATCGTAGCGAGGAACTTTCATCTTCATGCCT
TCCTTGGTAAGTTTAGTCAGGGCTTCTATTGTTT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2DJ36JQ 713 0 0
CCAAAGGAAATGTACATATTTGTAGAATTGTGACAAATAGAGAGAGCATGTCAAAAGATA
GAATGAATAATACAACGAAGCGTGATATAGTGAATGTTACTCTACAAAGAGGAAAATACA
TATAACAAGGCATAGGAGGGAAAACATCCTGGTCATTAGGTTGCGAGTATTGGGTTCCTT
TCTTCATCGATATCTATCGCAAGGACACGCTCTGGTTCCGAGCCGCTCGGTCCTTCCTCG
TACAGTGTCGGCAGATAAGCCTTATATGCAGGCAAATACCTTGACACAAAGTCATTCACC
TCATCATCAGACATCCCGGCTTTGCCAGCCTGCCTCATTGCTATTTCCGCCTGAAGACGC
CATCGGTATACATAACTTGGGTCCTTAATTTTGATGACCACCCATGCATCTATGTACTTG
TCCCATGCCTCGTAATAAGCTTCAAGGTTCTTGTTCACTGTCTCCAACTGAGGATCCACT
GCTTTAGCGGCTTCAGCAGGAAGAGGTTTAAAACCAAGCATCCATCCCTCAAAGAGAATC
ACCTTTAGAGGTCCTTCAACTTCAGGCCATGTTTCTGCGTCGGCTCTGTCACCCCTCCCG
CTATAAGCAGACTTATCGTAGCGAGGAACTTTCATCTTCATGCCTTCCTTGGTAAGTTTA
GTCAGGGCTTCTATTGTTTCGACAGAGAATGGAAGATCATGGCTTCCTGCATT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2C860JQ 744 0 0
AAGGAAATGTACATATTTGTAGAGTTGAGACAAATAGAGAGAGCATGTCAAAAGATAGAA
TGAATAATACAACGAAGCGTGATATAGTGAATGTTACTCTACAAAGAGGAAAATACATAT
AACAAGGCGTAGGAGGGAAAACATCCTGGTCATTAGGTTGCGAGTATTGGGTTCCTTTCT
TCATCGATATCTATCGCAAGGACACGCTCTGGTTCCGAGCCGCTCGGTCCTTCCTCGTAC
AGTGTCGGCAGATAAGCCTTATATGCAGGCAAATACCTTGACACAAAGTCATTCACCTCA
TCATCAGACATCCCGGCTTTGCCAGCCTGCCTCATTGCTATTTCCGCCTGAAGACGCCAT
CGGTATACATAACTTGGGTCCTTAATTTTGATGACCACCCATGCATCTATGTACTTGTCC
CATGCCTCGTAATAAGCTTCAAGGTTCTTGTTCACTGTCTCCAACTGAGGATCCACTGCT
TTAACGGCTTCAGCAGGAAGAGGTTTAAAACCAAGCATCCATCCCTCAAAGAGAATCACC
TTTAGAGGTCCTTCAACTTCAGGCCATGTTTCTGCGTCGGCTCTGTCACCCCTCCCGCTA
TAAGCAGACTTATCGTAGCGAGGAACTTTCATCTTCATGCCTTCCTTGGTAAGTTTAGTC
AGGGCTTCTATTGTTTCGACAGAGAATGGAAGATCATGGCTTCCTGCATTCCCACGATAC
TCAAGGAGTGCATTTCCTGGATTC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2FH22TF 603 0 0
AGGTTGCGAGTATTGGGTTCATTTCTTCATCGATATCTATCGCAAGGACACGCTCTGGTT
CCGAGCCGCTCGGTCCTTCCTCGTACAGTGTCGGCAGATAAGCCTTATATGCAGGCAAAT
ACCTTGACACAAAGTCATTCACCTCATCATCAGACATCCCGGCTTTGCCAGCCTGCCTCA
TTGCTATTTCCGCCTGAAGACGCCATCGGTATACATAACTTGGGTCCTTAATTTTGATGA
CCACCCATGCATCTATGTACTTGTCCCATGCCTCGTAATAAGCTTCAAGGTTCTTGTTCA
CTGTCTCCAACTGAGGATCCACTGCTTTAACGGCTTCAGCAGGAAGAGGTTTAAAACCAA
GCATCCATCCCTCAAAGAGAATCACCTTTAGAGGTCCTTCAACTTGAGGCCATGTTTCTG
CGTCGGCTCTGTCACCCCTCCCGCTATAAGCAGACTTATCGTAGCGAGGAACTTTCATCT
TCATGCCTTCCTTGGTAAGTTTAGTCAGGGCTTCTATTGTTTCGACAGAGAATGGAAGAT
CATGGCTTCCTGCATTCCCACGATACTCAAGGAGTGCATTTCCTGGATTCTCTTCCCTCA
ATC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 3

CO CL1514Contig1 1104 3 26 U
GTCCTTCCACCAAGTGCAAGCTGAGGCTGCTGAAGATGGAGCGGATCAAGGACTACCTCC
TGATGGAGGAGGAGTTCGTGGCGAATCAGGAGAGGCTGAAGCCTCAGGAGGAGAAGGCGG
AGGAAGATAGATCTAAGGTCGATGATCTCCGTGGGACGCCGATGAGCGTCGGGAACCTCG
AGGAGCTGATCGATGAGAATCACGCCATCGTGTCGTCCTCCGTGGGGCCTGAGTACTACG
TTGGGATCTTGTCCTTCGTTGATAAAGACCAGCTCGAGCCTGGTTGCTCGATCTTGATGC
ATAATAAGGTTCTGTCTGTTGTTGGGATACCGCAAGATGAAGTGGATCCGATGGTGTCTG
TGATGAAAGTTGAGAAGGCGCCTTTGGAGTCGTATGCTGACATTGGAGGTTTGGAAGCTC
AGATCCAGGAGATTAAGGAAGCTGTTGAGTTGCCTTTGACTCATCCTGAGTTGTATGAGG
ATATTGGTATCAAGCCCCCCAAGGGTGTGATTCTGTATGGTGAGCCTGGAACTGGGAAGA
CTCTGCTTGCTAAGGCGGTGGCGAACTCTACATCAGCTACTTTCTTGAGAGTTGTTGGTA
GTGAACTGATTCAGAAGTATCTGGGAGATGGTCCCAAGCTTGTGAGGGAGCTTTTCAGAG
TTGCTGATGACCTTTCACCATCAATCGTCTTCATAGACGAGATTGATGCTGTTGGTACCA
AGCGGTATGATGCTAACTCAGGAGGTGAGCGTGAGATCCAAAGAACTATGCTGGAACTTC
TGAACCAGCTTGATGGGTTTGACTCAAGAGGAGACGTAAAGGTCATCCTTGCAACAAACA
GAATCGAGACTCTTGACCCGGCACTTCTTCGACCTGGACGTATTGATAGGAAGATCGAGT
TCCCACTTCCAGATATCAAAACGAGAAGACGCATCTTCCAGATACACACATCAAAGATGA
CTCTGTCGGAAGATGTGAACTTGGAAGAGTTTGTGATGACGAAAGATGAGTTCTCAGAGC
TGATATAAAGGCTATTTGCACTGAGGCTGGTCTGCTTGCTCTCAGGAGCGTCGTATGAAG
TGACGCACCCGGATTTCAAGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F985TF U 1
AF RR2AJ29TF U 395
AF RR2AS10TF U 299
BS 1 330 RR2F985TF
BS 331 331 RR2AS10TF
BS 332 401 RR2F985TF
BS 402 402 RR2AS10TF
BS 403 571 RR2F985TF
BS 572 630 RR2AS10TF
BS 631 631 RR2AJ29TF
BS 632 694 RR2AS10TF
BS 695 695 RR2AJ29TF
BS 696 744 RR2AS10TF
BS 745 745 RR2AJ29TF
BS 746 814 RR2AS10TF
BS 815 815 RR2AJ29TF
BS 816 848 RR2AS10TF
BS 849 849 RR2AJ29TF
BS 850 859 RR2AS10TF
BS 860 860 RR2AJ29TF
BS 861 861 RR2AS10TF
BS 862 862 RR2AJ29TF
BS 863 1026 RR2AS10TF
BS 1027 1027 RR2AJ29TF
BS 1028 1030 RR2AS10TF
BS 1031 1031 RR2AJ29TF
BS 1032 1045 RR2AS10TF
BS 1046 1046 RR2AJ29TF
BS 1047 1104 RR2AS10TF

RD RR2F985TF 571 0 0
GTCCTTCCACCAAGTGCAAGCTGAGGCTGCTGAAGATGGAGCGGATCAAGGACTACCTCC
TGATGGAGGAGGAGTTCGTGGCGAATCAGGAGAGGCTGAAGCCTCAGGAGGAGAAGGCGG
AGGAAGATAGATCTAAGGTCGATGATCTCCGTGGGACGCCGATGAGCGTCGGGAACCTCG
AGGAGCTGATCGATGAGAATCACGCCATCGTGTCGTCCTCCGTGGGGCCTGAGTACTACG
TTGGGATCTTGTCCTTCGTTGATAAAGACCAGCTCGAGCCTGGTTGCTCGATCTTGATGC
ATAATAAGGTTCTGTCTGTTGTTGGGATACTGCAAGATGAAGTGGATCCGATGGTGTCTG
TGATGAAAGTTGAGAAGGCGCCTTTGGAGTCGTATGCTGACGTTGGAGGTTTGGAAGCTC
AGATCCAGGAGATTAAGGAAGCTGTTGAGTTGCCTTTGACTCATCCTGAGTTGTATGAGG
ATATTGGTATCAAGCCCCCCAAGGGTGTGATTCTGTATGGTGAGCCTGGAACTGGGAAGA
CTCTGCTTGCTAAGGCGGTGGCGAACTCTAC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2AJ29TF 684 0 0
G
GCTGACATTGGAGGTTTGGAAGCTCAGATCCAGGAGATTAAGGAAGCTGTTGAGTTGCCT
TTGACTCATCCTGAGTTGTATGAGGATATTGGTATCAAGCCCCCCAAGGGTGTGATTCTG
TATGGTGAGCCTGGAACTGGGAAGACTCTGCTCGCTAAGGCGGTGGCGAACTCTACATCA
GCTACTTTCTTGAGAGTTGTTGGTAGTGAACTGATTCAGAAGTATCTGGGAGATGGTCCC
AAGCTTGTGAGGGAGCTTTTCAGAGTTGCTGATGACCTTTCACCTTCAATCGTCTTCATA
GACGAGATTGATGCTGTTGGTACCAAGCGGTATGATGCTAACTCAGGAGGTGAGCGTGAG
ATCCAAAGAACTATGTTGGAACTTCTGAACCAGCTTGATGGGTTTGACTCAAGAGGAGAC
GTAAAGGTCATCCTTGCAACAAACAGAATCGAGAGTCTTGACCCGGCACTTCTTCGACCT
GGACGTATTGATAGGAAGATCGAGTTCCCACTTCCAGATATCAAAACGAGAAGACGCATC
TTCCAGATACACACATCAAAGATGACTCTGTCGGAAGATGTGAACTTGGAAGAGTTTGTG
ATGACGAA*GATGAGTTCTCAGAGCTGATATAAAGGCTATTTGCACTGAGGCTGGTCTGC
TTGCTCTCAGGAGCGTCGTATGA

QA 2 684 2 684
DS 

RD RR2AS10TF 806 0 0
GCATAATAAGGTTCTGTCTGTTGTTGGGATACCGCAAGATGAAGTGGATCCGATGGTGTC
TGTGATGAAAGTTGAGAAGGCGCCTTTGGAGTCGTATGCTGACATTGGAGGTTTAGAAGC
TCAGATTCAGGAGATTAAGGAAGCTGTTGAGTTGCCTTTGACACATCCTGAGTTGTATGA
GGATATTGGTATCAAGCCCCCCAAGGGTGTGATTTTGTATGGTGAGCCTGGAACTGGGAA
GACTCTGCTTGCTAAGGCGGTGGCGAACTCTACATCAGCTACTTTCTTGAGAGTTGTTGG
TAGTGAACTGATTCAGAAGTATCTGGGAGATGTTCCCAAGCTTGTGAGGGAGCTTTTCAG
AGTTGCTGATGACCTTTCACCATCAATCGTCTTCATTGACGAGATTGATGCTGTTGGTAC
CAAGCGGTATGATGCTAACTCAGGAGTTGAGCGTGAGATCCAAAGAACTATGCTGGAACT
TCTGAACCAGCTTGATGGGTTTGACTCAAGAGGAGATGTAAAGGTCATCCTTGCAACAAA
CAGAATCGAGTCTCTTGACCCTGTACTTCTTCGACCTGGACGTATTGATAGGAAGATCGA
GTTCCCACTTCCAGATATCAAAACGAGAAGACGCATCTTCCAGATACACACATCAAAGAT
GACTCTGTCGGAAGATGTGAACTTGGAAGAGTTTGTGATGACGAAAGATGAGTTCTCAGA
GCTGATATCAAG*CTATTTGCACTGAG*CTGGTCTGCTTGCTCTCAGGAGCGTCGTATGA
AGTGACGCACCCGGATTTCAAGAAGC

QA 1 806 1 806
DS 



AS 2 6

CO CL1515Contig1 475 4 19 U
TTTTTCATATTCGGCGGTGGTGCTCGTATCGAAATGGCGAAGAGAACGAAGAAGGTTGGA
ATCGTCGGCAAGTACGGTACTCGATATGGAGCGAGTATCAGGAAGCAGATCAAGAAGATG
GAGGTGAGCCAGCACAGCAAGTACTTCTGTGAGTTCTGCGGCAAGTACGGAGTGAAGCGA
AAGGCAGTTGGTATCTGGGGATGCAAGGATTGTGGCAAGGTCAAGGCTGGTGGTGCCTGC
ACCATGAACACCGCCAGTGCCGTCACCGTTAGAAGCACCATCAGGAGGTTGAGGGAGCAG
ATCGAGGGTTAAAAAATCTTCATATGATTTGTCATCATTCAATTGGCTTCTTCGCTTTTT
TTT*GACAATCATGCTATGCCTATCTTTGTTATTCAAGACGCTGTTACATTTAGCCATGA
ATCGATGTTTTATTGGATTTTTTGGAGTTCCTTAATGAGTTATCGTTTACATATC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E140JQ C 1
AF RR2D115TF U 100
AF RR2GW15TF U 1
AF RR2E140TF U 1
BS 1 27 RR2GW15TF
BS 28 28 RR2E140TF
BS 29 42 RR2GW15TF
BS 43 43 RR2E140TF
BS 44 100 RR2GW15TF
BS 101 110 RR2D115TF
BS 111 111 RR2E140TF
BS 112 212 RR2D115TF
BS 213 213 RR2GW15TF
BS 214 238 RR2D115TF
BS 239 239 RR2E140TF
BS 240 333 RR2D115TF
BS 334 334 RR2E140TF
BS 335 363 RR2D115TF
BS 364 364 RR2GW15TF
BS 365 421 RR2D115TF
BS 422 422 RR2GW15TF
BS 423 439 RR2D115TF
BS 440 475 RR2E140TF

RD RR2E140JQ 475 0 0
TTTTTCATATTCGGCGGTGGTGCTCGTATCGAAATGGCGAAGAGAACGAAGAAGGTTGGA
ATCGTCGGCAAGTACGGTACTCGATATGGAGCGAGTATCAGGAAGCAGATCAAGAAGATG
GAGGTGAGCCAGCACAGCAAGTACTTCTGTGAGTTCTGCGGCAAGTACGGAGTGAAGCGA
AAGGCAGTTGGTATCTGGGGATGCAAGGATTGTGGCAAGGTCAAGGCTGGTGGTGCCTGC
ACCATGAACACCGCCAGTGCCGTCACCGTTAGAAGCACCATCAGGAGGTTGAGGGAGCAG
ATCGAGGGTTAAAAAATCTTCATATGATTTGTCATCATTCAATTGGCTTCTTCGCTTTTT
TTT*GACAATCATGCTATGCCTATCTTTGTTATTCAAGACGCTGTTACATTTAGCCATGA
ATCGATGTTTTATTGGATTTTTTGGAGTTCCTTAATGAGTTATCGTTTACATATC

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2D115TF 340 0 0
G
GGAAGCAGATTAAGAAGATGGAGGTGAGCCAGCACAGCAAGTACTTCTGTGAGTTCTGCG
GCAAGTACGGAGTGAAGCGAAAGGCAGTTGGTATCTGGGGATGCAAGGATTGGGGCAAGG
TCAAGGCTGGTGGTGCCTACACCATGAACACCGCCAGTGCCGTCACCGTTAGAAGCACCA
TCAGGAGGTTGAGGGAGCAGATCGAGGGTTAAAAAATCTTCATATGATTTGTCGTCATTC
AATTGGCTTCTTCGCTTTTTTTTTGACAATCATGCTATGCCTATCTTTGTTATTCAAGAC
GCTGTTACATTTAGCCATGAACCGATGTTTTATTGGATT

QA 2 340 2 340
DS 

RD RR2GW15TF 436 0 0
TTTTTCATATTCGGCGGTGGTGCTCGTTTCGAAATGGCGAAGGGAACGAAGAAGGTTGGA
ATCGTCGGCAAGTACGGTACTCGATATGGAGCGAGTATCAGGAAGCAGATTAAGAAGATG
GAGGTGAGCCAGCACAGCAAGTACTTCTGTGAGTTCTGCGGCAAGTACGGAGTGAAGCGA
AAGGCAGTTGGTATCTGGGGATGCAAGGATTGTGGCAAGGTCAAGGCTGGTGGTGCCTAC
ACCATGAACACCGCCAGTGCCGTCACCGTTAGAAGCACCATCAGGAGGTTGAGGGAGCAG
ATCGAGGGTTAAAAAATCTTCATATGATTTGTCGTCATTCAATTGGCTTCTTCGCTTTTT
TTT*GACAATCATGCTATGCCTATCTTTGTTATTCAAGACGCTGTTACATTTAGCCATGA
ATCGATGTTTTATTGG

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR2E140TF 475 0 0
TTTTTCATATTCGGCGGTGGTGCTCGTATCGAAATGGCGAAGAGAACGAAGAAGGTTGGA
ATCGTCGGCAAGTACGGTACTCGATATGGAGCGAGTATCAGGAAGCAGATCAAGAAGATG
GAGGTGAGCCAGCACAGCAAGTACTTCTGTGAGTTCTGCGGCAAGTACGGAGTGAAGCGA
AAGGCAGTTGGTATCTGGGGATGCAAGGATTGTGGCAAGGTCAAGGCTGGTGGTGCCTGC
ACCATGAACACCGCCAGTGCCGTCACCGTTAGAAGCACCATCAGGAGGTTGAGGGAGCAG
ATCGAGGGTTAAAAAATCTTCATATGATTTGTCATCATTCAATTGGCTTCTTCGCTTTTT
TTT*GACAATCATGCTATGCCTATCTTTGTTATTCAAGACGCTGTTACATTTAGCCATGA
ATCGATGTTTTATTGGATTTTTTGGAGTTCCTTAATGAGTTATCGTTTACATATC

QA 1 475 1 475
DS 



CO CL1515Contig2 454 2 1 U
TTTTTCATATTCGGCGGTGGTGCTCGTTTCGAAATGGCGAAGAGAACGAAGAAGGTTGGA
ATCGTCGGCAAGTACGGTACTCGATATGGAGCGAGTATCAGGAAGCAGATCAAGAAGATG
GAGGTGAGCCAGCACAGCAAGTACTTCTGTGAGTTCTGCGGCAAGTACGGAGTGAAGCGA
AAGGCTGTTGGAATCTGGGGATGCAAGGATTGTGGCAAGGTCAAGGCTGGTGGTGCTTAC
ACCATGAACACCGCCAGTGCCGTCACCGTTAGAAGCACCATCAGGAGGTTGAGGGAGCAG
ATCGAGGGTTAAATAAATCTTCATATGATTTGTCGTCATCCAATTGGCTTCTTCGCTTTT
TTTGACAATCATATGCTATGCTTATCTTTCTTATTCAAGACGCTGTTACATTTAGCCATG
AATCTATGTTTTGTTGGATTTTTTGGAGTTCCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2HA47JQ C 1
AF RR2HA47TF U 1
BS 1 454 RR2HA47TF

RD RR2HA47JQ 454 0 0
TTTTTCATATTCGGCGGTGGTGCTCGTTTCGAAATGGCGAAGAGAACGAAGAAGGTTGGA
ATCGTCGGCAAGTACGGTACTCGATATGGAGCGAGTATCAGGAAGCAGATCAAGAAGATG
GAGGTGAGCCAGCACAGCAAGTACTTCTGTGAGTTCTGCGGCAAGTACGGAGTGAAGCGA
AAGGCTGTTGGAATCTGGGGATGCAAGGATTGTGGCAAGGTCAAGGCTGGTGGTGCTTAC
ACCATGAACACCGCCAGTGCCGTCACCGTTAGAAGCACCATCAGGAGGTTGAGGGAGCAG
ATCGAGGGTTAAATAAATCTTCATATGATTTGTCGTCATCCAATTGGCTTCTTCGCTTTT
TTTGACAATCATATGCTATGCTTATCTTTCTTATTCAAGACGCTGTTACATTTAGCCATG
AATCTATGTTTTGTTGGATTTTTTGGAGTTCCTT

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR2HA47TF 454 0 0
TTTTTCATATTCGGCGGTGGTGCTCGTTTCGAAATGGCGAAGAGAACGAAGAAGGTTGGA
ATCGTCGGCAAGTACGGTACTCGATATGGAGCGAGTATCAGGAAGCAGATCAAGAAGATG
GAGGTGAGCCAGCACAGCAAGTACTTCTGTGAGTTCTGCGGCAAGTACGGAGTGAAGCGA
AAGGCTGTTGGAATCTGGGGATGCAAGGATTGTGGCAAGGTCAAGGCTGGTGGTGCTTAC
ACCATGAACACCGCCAGTGCCGTCACCGTTAGAAGCACCATCAGGAGGTTGAGGGAGCAG
ATCGAGGGTTAAATAAATCTTCATATGATTTGTCGTCATCCAATTGGCTTCTTCGCTTTT
TTTGACAATCATATGCTATGCTTATCTTTCTTATTCAAGACGCTGTTACATTTAGCCATG
AATCTATGTTTTGTTGGATTTTTTGGAGTTCCTT

QA 1 454 1 454
DS 



AS 0 0

AS 1 6

CO CL1517Contig1 801 6 6 U
CCAATTCATTCTCTCTCTCTCTTTTGTGGGGATTATTATTGTTCAATTGGGATCTTGAAG
ATGATAGATATCAGCCGAGTCCAGAAAGAGCTCCAAGATTGCGAGAAAGACAGAGACTCC
TCGGGCATCCGGGTCTGCCCGAAATCCGACAACCTTACCCGACTCACCGGAACCATCCCC
GGTCCAATCGGTACTCCTTACGAAGGCGGAACCTTTCAGATCGATATCACCATTCCAGAA
GGGTATCCCTTTGAGCCTCCAAAGATGCAATTTT*CAACCAAAGTTTGGCACCCGAATAT
CAGTAGCCAAAGCGGGGCAATATGCTTGGATGTCTTGAAAGACCAGTGGAGTCCAGCTCT
TACTTTGAAGACAGCTCTGGTTTCAGTCCAGGCATTACTCTCTGCACCAGAGCCTAAAGA
CCCTCAAGATGCTGTT*GTTGCTGAGCAGTACATGAAGAACTACCAAGTGTTCGTATCAA
CGGCTCGTTACTGGACACAAACATTCGCCAAGAACTCTTCTCTTGAGGACAAAGTGAAGA
GACTTGTGGAGATGGG**TTTTGGAGATGCTCAGGTCAGGAGTGCAATTGAATCAAGTGG
TGGAGATGAGAATCTGGCGCTTGAAAAGCTCTGCTCTGGTTAGAATCTATCAAAGCAGAG
GCCTCTTTTGGCGCTAGATATGATATTAATTGGGTTTATTATAACTTTATGTGTTGCGTT
TCTGTTCTTGTCTGATGATAAGAGTGAACTACTTTTAAAACTAAATGCAATGCTATATAT
CCATAAAAGGAGATTTTATCG


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2BL09TF U 1
AF RR2AT45TF U 1
AF RR2AK43TF U 1
AF RR2BD33TF U 223
AF RR2AT45JQ C 1
AF RR2BL09JQ C 12
BS 1 306 RR2AK43TF
BS 307 307 RR2BD33TF
BS 308 390 RR2AK43TF
BS 391 391 RR2BD33TF
BS 392 781 RR2AK43TF
BS 782 801 RR2AT45JQ

RD RR2BL09TF 741 0 0
GG
AATTCATTCTCTCTCTCTCTTTTGTGGGGATTATTATTGTTCAATTGGGATCTTGAAGAT
GATAGATATCAGCCGAGTCCAGAAAGAGCTCCAAGATTGCGAGAAAGACAGAGACTCCTC
GGGCATCCGGGTCTGCCCGAAATCCGACAACCTTACCCGACTCACCGGAACCATCCCCGG
TCCAATCGGTACTCCTTACGAAGGCGGAACCTTTCAGATCGATATCACCATTCCAGAAGG
GTATCCCTTTGAGCCTCCAAAGATGCAATTTT*CAACCAAAGTTTGGCACCCGAATATCA
GTAGCCAAAGCGGGGCAATATGCTTGGATGTCTTGAAAGACCAGTGGAGTCCAGCTCTTA
CTTTGAAGACAGCTCTGGTTTCAGTCCAGGCATTACTCTCTGCACCAGAGCCTAAAGACC
CTCAAGATGCTGTT*GCTGCTGAGCAGTACATGAAGAACTACCAAGTGTTCGTATCAACG
GCTCGTTACTGGACACAAACATTCGCCAAGAACTCTTCTCTTGAGGACAAAGTGAAGAGA
CTTGTGGAGATGGG**TTTTGGAGATGCTCAGGTCAGGAGTGCAATTGAATCAAGTGGTG
GAGATGAGAATCTGGCGCTTGAAA*GCTCTGCTCTGGTTAGAATCTATCAAAGCAGAG*C
CTCTTTTGGCGCTAGATATGATATTATTTGGGTTTAT*ATAACTTTATGTGTTGCGTTTC
TGTTCTTGTCTGATGATAA

QA 3 741 3 741
DS 

RD RR2AT45TF 778 0 0
GG
AATTCATTCTCTCTCTCTCTTTTGTGGGGATTATTATTGTTCAATTGGGATCTTGAAGAT
GATAGATATCAGCCGAGTCCAGAAAGAGCTCCAAGATTGCGAGAAAGACAGAGACTCCTC
GGGCATCCGGGTCTGCCCGAAATCCGACAACCTTACCCGACTCACCGGAACCATCCCCGG
TCCAATCGGTACTCCTTACGAAGGCGGAACCTTTCAGATCGATATCACCATTCCAGAAGG
GTATCCCTTTGAGCCTCCAAAGATGCAATTTT*CAACCAAAGTTTGGCACCCGAATATCA
GTAGCCAAAGCGGGGCAATATGCTTGGATGTCTTGAAAGACCAGTGGAGTCCAGCTCTTA
CTTTGAAGACAGCTCTGGTTTCAGTCCAGGCATTACTCTCTGCACCAGAGCCTAAAGACC
CTCAAGATGCTGTT*GTTGCTGAGCAGTACATGAAGAACTACCAAGTGTTCGTATCAACG
GCTCGTTACTGGACACAAACATTCGCCAAGAACTCTTCTCTTGAGGACAAAGTGAAGAGA
CTTGTGGAGATGGG**TTTTGGAGATGCTCAGGTCAGGAGTGCAATTGAATCAAGCGGTG
GAGATGAGAATCTGGCGCTTGAAAAGCTCTGCTCTGGTTAGAATCTATCAAAGCAGAGGC
CTCTTTTGGCGCTAGATATGATATTAATTGGGTTTATTATAACTTTATGTGTTGCGTTTC
TGTTCTTGTCTGATGATAAGAGTGAACTACTTTTAAAACTAAATGCAATGCTATAT

QA 3 778 3 778
DS 

RD RR2AK43TF 785 0 0
CCAATTCATTCTCTCTCTCTCTTTTGTGGGGATTATTATTGTTCAATTGGGATCTTGAAG
ATGATAGATATCAGCCGAGTCCAGAAAGAGCTCCAAGATTGCGAGAAAGACAGAGACTCC
TCGGGCATCCGGGTCTGCCCGAAATCCGACAACCTTACCCGACTCACCGGAACCATCCCC
GGTCCAATCGGTACTCCTTACGAAGGCGGAACCTTTCAGATCGATATCACCATTCCAGAA
GGGTATCCCTTTGAGCCTCCAAAGATGCAATTTT*CAACCAAAGTTTGGCACCCGAATAT
CAGTAGTCAAAGCGGGGCAATATGCTTGGATGTCTTGAAAGACCAGTGGAGTCCAGCTCT
TACTTTGAAGACAGCTCTGGTTTCAGTCCATGCATTACTCTCTGCACCAGAGCCTAAAGA
CCCTCAAGATGCTGTT*GTTGCTGAGCAGTACATGAAGAACTACCAAGTGTTCGTATCAA
CGGCTCGTTACTGGACACAAACATTCGCCAAGAACTCTTCTCTTGAGGACAAAGTGAAGA
GACTTGTGGAGATGGG**TTTTGGAGATGCTCAGGTCAGGAGTGCAATTGAATCAAGTGG
TGGAGATGAGAATCTGGCGCTTGAAAAGCTCTGCTCTGGTTAGAATCTATCAAAGCAGAG
GCCTCTTTTGGCGCTAGATATGATATTAATTGGGTTTATTATAACTTTATGTGTTGCGTT
TCTGTTCTTGTCTGATGATAAGAGTGAACTACTTTTAAAACTAAATGCAATGCTATATAT
C
CATA

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2BD33TF 559 0 0
GATATCACCATTCCAGAAGGGTATCCCTTTGAGCCTCCAAAGATGCAATTTTTCAACCAA
AGTTTGGCACCCGAATATCAGTAGCCAAAGCGGGGCAATATGCTTGGATGTCTTGAAAGA
CCAGTGGAGTCCAGCTCTTACTTTGAAGACAGCTCTGGTTTCAGTCCAGGCATTACTCTC
TGCACCAGAGCCTAAAGACCCTCAAGATGCTGTTTGTTGCTGAGCAGTACATGAAGAACC
ACCAAGTGTTCGTATCAACGGCTCGTTACTGGACACAAACATTCGCCAAGAACTCTTCTC
TTGAGGACAAAGTGAAGAGACTTGTGGAGATGGGGTTTTTGGAGATGCTCAG*TCAG*AG
TGCAATTGAATCAAGTGGTGGAGATGAGAATCTGGTGCTTGAAAAGCTCTGCTCTGGTTA
GAATCTATCAAAGCAGAG*CCTCTTTTGGCGCTAGATATGATATTAATTGGGTTTAT*AT
AACTTTATGTGTTGCGTTTCTGTTCTTGTCTGATGATA*GAGTGA*CTACTTTTAAA*CT
AAATGCA*TGCTATATATC

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2AT45JQ 801 0 0
GG
AATTCATTCTCTCTCTCTCTTTTGTGGGGATTATTATTGTTCAATTGGGATCTTGAAGAT
GATAGATATCAGCCGAGTCCAGAAAGAGCTCCAAGATTGCGAGAAAGACAGAGACTCCTC
GGGCATCCGGGTCTGCCCGAAATCCGACAACCTTACCCGACTCACCGGAACCATCCCCGG
TCCAATCGGTACTCCTTACGAAGGCGGAACCTTTCAGATCGATATCACCATTCCAGAAGG
GTATCCCTTTGAGCCTCCAAAGATGCAATTTT*CAACCAAAGTTTGGCACCCGAATATCA
GTAGCCAAAGCGGGGCAATATGCTTGGATGTCTTGAAAGACCAGTGGAGTCCAGCTCTTA
CTTTGAAGACAGCTCTGGTTTCAGTCCAGGCATTACTCTTTGCACCAGAGCCTAAAGACC
CTCAAGATGCTGTT*GTTGCTGAGCAGTACATGAAGAACTACCAAGTGTTCGTATCAACG
GCTCGTTACTGGACACAAACATTCGCCAAGAACTCTTCTCTTGAGGACAAAGTGAAGAGA
CTTGTGGAGATGGG**TTTTGGAGATGCTCAGGTCAGGAGTGCAATTGAATCAAGCGGTG
GAGATGAGAATCTGGCGCTTGAAAAGCTCTGCTCTGGTTAGAATCTATCAAAGCAGAGGC
CTCTTTTGGCGCTAGATATGATATTAATTGGGTTTATTATAACTTTATGTGTTGCGTTTC
TGTTCTTGTCTGATGATAAGAGTGAACTACTTTTAAAACTAAATGCAATGCTATATATCC
ATAAAAGGAGATTTTATCG

QA 3 801 3 801
DS 

RD RR2BL09JQ 789 0 0
TCTCTCTCTCTTTTGTGGGGATTATTATTGTTCAATTGGGATCTTGAAGATGATAGATAT
CAGCCGAGTCCAGAAAGAGCTCCAAGATTGCGAGAAAGACAGAGACTCCTCGGGCATCCG
GGTCTGCCCGAAATCCGACAACCTTACCCGACTCACCGGAACCATCCCCGGTCCAATCGG
TACTCCTTACGAAGGCGGAACCTTTCAGATCGATATCACCATTCCAGAAGGGTATCCCTT
TGAGCCTCCAAAGATGCAATTTT*CAACCAAAGTTTGGCACCCGAATATCAGTAGCCAAA
GCGGGGCAATATGCTTGGATGTCTTGAAAGACCAGTGGAGTCCAGCTCTTACTTTGAAGA
CAGCTCTGGTTTCAGTCCAGGCATTACTCTCTGCACCAGAGCCTAAAGACCCTCAAGATG
CTGTT*GCTGCTGAGCAGTACATGAAGAACTACCAAGTGTTCGTATCAACGGCTCGTTAC
TGGACACAAACATTCGCCAAGAACTCTTCTCTTGAGGACAAAGTGAAGAGACTTGTGGAG
ATGGG**TTTTGGAGATGCTCAGGTCAGGAGTGCAATTGAATCAAGTGGTGGAGATGAGA
ATCTGGCGCTTGAAAAGCTCTGCTCTGGTTAGAATCTATCAAAGCAGAGGCCTCTTTTGG
CGCTAGATATGATATTATTTGGGTTTATTATAACTTTATGTGTTGCGTTTCTGTTCTTGT
CTGATGATAAGAGTGAACTACTTTTAAAACTAAATGCAATGCTATATATCCATAAAAGGA
GATTTTATC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 6

CO CL1518Contig1 614 6 10 U
AGGGGAAGACAAGAGGAGGCAATGATGGTCTTATCCAGCAGCATCTTCTCCATGAGCAGA
GCTTCAACGGCTATGGCGTCTCTAACCAATGACTCTCCAACTCCCCTTCCATCGAAACCT
ACAAGGAAACCGACAAGAATCATCCAAAAGAACGGGAATGAAAATCAGCAACTATCACGG
AAGCAACGGCGTGAGAAGAAGCCATCAATAGCTCAGATCGAGCGAGCATTTGGCGCTGGA
TCATATCGTGATTCTGAAGGGGAAATGGATATGAATACAGTATTCGATGAGCTTCTTCTA
GGTCATGCTAACAAATTCGAAGGAAAGCTGGAGAAGACGCTACGAGAGGTTGGCGAAATG
TTTGTAGACCGAACAGAGTCTAAGCTTCGTTCCTCCGGGAAACCAGTTTTGATGTTTACA
CTTCAATGGATACTTCCTATATGGATTGTGTCTCTGCTTTTCGCTTGTGGAATCATCAAA
CTTCCCTTTAGCCTCCCATTACTTGATGACTTGATCATGTGATTGTACCTTAGGCACCAC
ATGTTTACCATGATCACAATCACTTTTGTGTGTTAGCCCCATAATAATCTCAAAAGAAAG
CGATTTCTGTGAGC


BQ
10 10 10 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 

AF RR2DP31TF U 4
AF RR2BV42TF U 1
AF RR2DP31JQ C 4
AF RR2F340JQ C 4
AF RR2F340TF U 4
AF RR2AS26TF U 0
BS 1 62 RR2BV42TF
BS 63 63 RR2DP31TF
BS 64 90 RR2BV42TF
BS 91 91 RR2DP31TF
BS 92 301 RR2BV42TF
BS 302 302 RR2DP31TF
BS 303 594 RR2BV42TF
BS 595 595 RR2F340TF
BS 596 611 RR2BV42TF
BS 612 614 RR2AS26TF

RD RR2DP31TF 551 0 0
GGAAGACAAGAGGAGGCAATGATGGTCTTATCCAGCAGCATCTTCTCCATGAGCAGAGCT
TCAACGGCTATGGCGTCTCTAACCAATGACTCTCCAACTCCCCTTCCATCGAAACCTACA
AGGAAACCGACAAGAATCATCCAAAAGAACGGGAATGAAAATCAGCAACTATCACGGAAG
CAACGGCGTGAGAAGAAGCCATCAATAGCTCAGATCGAGCGAGCATTTGGCGCTGGATCA
TATCGTGATTCTGAAGGGGAAATGGATATGAATACAGTATTCGATGAGCTTCTTCTAGGT
CATGCTAACAAATTCGAAGGAAAGCTGGAGAAGACGCTACGAGAGGTTGGCGAAATGTTT
GTAGACCGAACAGAGTCTAAGCTTCGTTCCTCCGGGAAACCAGTTTTGATGTTTACACTT
CAATGGATACTTCCTATATGGATTGTGTCTCTGCTTTTCGCTTGTGGAATCATCAAACTT
CCCTTTAGCCTCCCATTACTTGATGACTTGATCATGTGATTGTACCTTAGGCACCACATG
TTTACCATGAT

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2BV42TF 611 0 0
AGGGGAAGACAAGAGGAGGCAATGATGGTCTTATCCAGCAGCATCTTCTCCATGAGCAGA
GCATCAACGGCTATGGCGTCTCTAACCAATTACTCTCCAACTCCCCTTCCATCGAAACCT
ACAAGGAAACCGACAAGAATCATCCAAAAGAACGGGAATGAAAATCAGCAACTATCACGG
AAGCAACGGCGTGAGAAGAAGCCATCAATAGCTCAGATCGAGCGAGCATTTGGCGCTGGA
TCATATCGTGATTCTGAAGGGGAAATGGATATGAATACAGTATTCGATGAGCTTCTTCTA
GTTCATGCTAACAAATTCGAAGGAAAGCTGGAGAAGACGCTACGAGAGGTTGGCGAAATG
TTTGTAGACCGAACAGAGTCTAAGCTTCGTTCCTCCGGGAAACCAGTTTTGATGTTTACA
CTTCAATGGATACTTCCTATATGGATTGTGTCTCTGCTTTTCGCTTGTGGAATCATCAAA
CTTCCCTTTAGCCTCCCATTACTTGATGACTTGATCATGTGATTGTACCTTAGGCACCAC
ATGTTTACCATGATCACAATCACTTTTGTGTGTTAGCCCCATAATAATCTCAAA*GAAAG
CGATTTCTGTG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2DP31JQ 608 0 0
GGAAGACAAGAGGAGGCAATGATGGTCTTATCCAGCAGCATCTTCTCCATGAGCAGAGCT
TCAACGGCTATGGCGTCTCTAACCAATGACTCTCCAACTCCCCTTCCATCGAAACCTACA
AGGAAACCGACAAGAATCATCCAAAAGAACGGGAATGAAAATCAGCAACTATCACGGAAG
CAACGGCGTGAGAAGAAGCCATCAATAGCTCAGATCGAGCGAGCATTTGGCGCTGGATCA
TATCGTGATTCTGAAGGGGAAATGGATATGAATACAGTATTCGATGAGCTTCTTCTAGGT
CATGCTAACAAATTCGAAGGAAAGCTGGAGAAGACGCTACGAGAGGTTGGCGAAATGTTT
GTAGACCGAACAGAGTCTAAGCTTCGTTCCTCCGGGAAACCAGTTTTGATGTTTACACTT
CAATGGATACTTCCTATATGGATTGTGTCTCTGCTTTTCGCTTGTGGAATCATCAAACTT
CCCTTTAGCCTCCCATTACTTGATGACTTGATCATGTGATTGTACCTTAGGCACCACATG
TTTACCATGATCACAATCACTTTTGTGTGTTAGCCCCATAATAATCTCAAAAGAAAGCGA
TTTCTGTG

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2F340JQ 608 0 0
GGAAGACAAGAGGAGGCAATGATGGTCTTATCCAGCAGCATCTTCTCCATGAGCAGAGCT
TCAACGGCTATGGCGTCTCTAACCAATGACTCTCCAACTCCCCTTCCATCGAAACCTACA
AGGAAACCGACAAGAATCATCCAAAAGAACGGGAATGAAAATCAGCAACTATCACGGAAG
CAACGGCGTGAGAAGAAGCCATCAATAGCTCAGATCGAGCGAGCATTTGGCGCTGGATCA
TATCGTGATTCTGAAGGGGAAATGGATATGAATACAGTATTCGATGAGCTTCCTCTAGGT
CATGCTAACAAATTCGAAGGAAAGCTGGAGAAGACGCTACGAGAGGTTGGCGAAATGTTT
GTAGACCGAACAGAGTCTAAGCTTCGTTCCTCCGGGAAACCAGTTTTGATGTTTACACTT
CAATGGATACTTCCTATATGGATTGTGTCTCTGCTTTTCGCTTGTGGAATCATCAAACTT
CCCTTTAGCCTCCCATTACTTGATGACTTGATCATGTGATTGTACCTTAGGCACCACATG
TTTACCATGATCACAATCACTTTTGTGTGTTAGCCCCATAATAATCTCAAAAGAAAGCGA
TTTCTGTG

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2F340TF 608 0 0
GGAAGACAAGAGGAGGCAATGATGGTCTTATCCAGCAGCATCTTCTCCATGAGCAGAGCT
TCAACGGCTATGGCGTCTCTAACCAATGACTCTCCAACTCCCCTTCCATCGAAACCTACA
AGGAAACCGACAAGAATCATCCAAAAGAACGGGAATGAAAATCAGCAACTATCACGGAAG
CAACGGCGTGAGAAGAAGCCATCAATAGCTCAGATCGAGCGAGCATTTGGCGCTGGATCA
TATCGTGATTCTGAAGGGGAAATGGATATGAATACAGTATTCGATGAGCTTCCTCTAGGT
CATGCTAACAAATTCGAAGGAAAGCTGGAGAAGACGCTACGAGAGGTTGGCGAAATGTTT
GTAGACCGAACAGAGTCTAAGCTTCGTTCCTCCGGGAAACCAGTTTTGATGTTTACACTT
CAATGGATACTTCCTATATGGATTGTGTCTCTGCTTTTCGCTTGTGGAATCATCAAACTT
CCCTTTAGCCTCCCATTACTTGATGACTTGATCATGTGATTGTACCTTAGGCACCACATG
TTTACCATGATCACAATCACTTTTGTGTGTTAGCCCCATAATAATCTCAAAAGAAAGCGA
TTTCTGTG

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2AS26TF 615 0 0
GGACAC
AAGACAAGAGGAGGCAATGATGGTCTTATCCAGCAGCATCTTCTCCATGAGCAGAGCTTC
AACGGCTATGGCGTCTCTAACCAATGACTCTCCAACTCCCCTTCCATCGAAACCTACAAG
GAAACCGACAAGAATCATCCAAAAGAACGGGAATGAAAATCAGCAACTACCACGGAAGCA
ACGGCGTGAGAAGAAGCCATCAATAGCTCAGATCGAGCGAGCATTTGGCGCTGGATCATA
TCGTGATTCTGAAGGGGAAATGGATACGAATACAGTATTCGATGAGCTTCTTCTAGGTCA
TGCTAACAAATTCGAAGGAAAGCTGGAGAAGACGCTACGAGAGATTGGCGAAATGTTTGT
AGACCGAACAGAGTCTAAGCTTCGTTCCTCCGGGAAACCAGTTTTGATGTTTACACTTCA
ATGGATACTTCCTATATGGATTGTGTCTCTGCTTTTCGCTTGTGGAATCATCAAACTTCC
CTTTAGCCTCCCATTACTTGATGACTTGATCATGTGATTGTACCTTAGGCACCACATGTT
TACCATGATCACAATCACTTTTGTGTGTTAGCCCCATAATAATCTCAAAAGAAAGCGATT
TCTGTGAGC

QA 7 615 7 615
DS 



AS 1 4

CO CL1519Contig1 581 4 10 U
AGTGCAAAACTTGTTACCAATACCAATATTACTTCTCAGTGCCACTACACACACAAAACG
CATGTATATGTTTTTACTTAAAACAAACACCAGTAGTCTTTGGGCTCCTTTTTTGTTCTT
TGTTTTTCCAACTACCGACATACATATATACTTATTACATAATAATAGATGTGATATTTG
ATAAAAGTGGTGAAGTGTTCTTACAAGATCCACCCCCAATTTTTT*AAAAAGTTGTTTCA
GTTGCAGTTGGTGTCGTAGCTTGCAAGACCGAGTAGTTCCGGTCCCTCCAATCGCGAGTT
GTTCTCAAAGTTCTCCAAAGGGATGTGTTCAAAAGGTCCTTCTATTGGGATAGTTCCACA
CAAATTATTGTTCGACACATCAAAGACTTTAAGGCTTGGGATTTTCGTTAGTTCTCTAGG
GATTGAACCGGTCAATCGGTTGTCATTGAGCCGGAGAAAGACCAGAGACTTCAATTTCCC
CAAGGAAGTAGGGATCTTCCCGGTAAGATTGTTGTTGTAAAGATCCAAGCTGATGAGACT
TTTCAATTTTCCAAGTTCAGATGGTATAGTTCCTTGGATGC


BQ
10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2EX33JQ U 102
AF RR2EJ88JQ U 1
AF RR2A235TF C 1
AF RR2A235JQ U 125
BS 1 2 RR2A235TF
BS 3 101 RR2EJ88JQ
BS 102 225 RR2EX33JQ
BS 226 226 RR2EJ88JQ
BS 227 264 RR2EX33JQ
BS 265 265 RR2EJ88JQ
BS 266 321 RR2EX33JQ
BS 322 322 RR2A235JQ
BS 323 533 RR2EX33JQ
BS 534 581 RR2A235JQ

RD RR2EX33JQ 432 0 0
GGGCTCCTTTTTTGTTCTTTGTTTTTCCAACTACCGACATACATATATACTTATTACATA
ATAATAGATGTGATATTTGATAAAAGTGGTGAAGTGTTCTTACAAGATCCACCCCCAATT
TTTTTAAAAAGTTGTTTCAGTTGCAGTTGGTGTCGTAGCTTGCGAGACCGAGTAGTTCCG
GTCCCTCCAATCGCGAGTTGTTCTCAAAGTTCTCCAAAGGAATGTGTTCAAAAGGTCCTT
CTATTGGGATAGTTCCACACAAATTATTGTTCGACACATCAAAGACTTTAAGGCTTGGGA
TTTTCGTTAGTTCTCTAGGGATTGAACCGGTCAATCGGTTGTCATTGAGCCGGAGAAAGA
CCAGAGACTTCAATTTCCCCAAGGAAGTAGGGATCTTCCCGGTAAGATTGTTGTTGTAAA
GATCCAAGCTGA

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR2EJ88JQ 531 0 0
AA
TGCAAAACTTGTTACCAATACCAATATTACTTCTCAGTGCCACTACACACACAAAACGCA
TGTATATGTTTTTACTTAAAACAAACACCAGTAGTCTTTGGGCTCCTTTTTTGTTCTTTG
TTTTTCCAACTACCGACATACATATATACTTATTACATAATAATAAATGTGATATTTGAT
AAAAGTGGTGAAGTGTTCTTACAAAATCCACCCCCAATTTTTT*AAAAAGTTGTTTCAGT
TGCAGTTGGTGTCGTAGCTTGCAAGACCGAGTAGTTCCGGTCCCTCCAATCGCGAGTTGT
TCTCAAAGTTCTCCAAAGGAATGTGTTCAAAAGGGCCTTCTATTGGGATAGTTCCACACA
AATTATTGTTCGACACATCAAAAACTTTAAGGCTTGGGATTTTCGTTAGTTCTCTAGGGA
TTGAACCGGTCAATCGGTTGTCATTGAGCCGGAAAAAGACCAAAAACTTCAATTTCCCCA
AGGAAGTAGGGATCTTCCCGGTAAGATTGTTGTTGTAAAGATCCAAGCT

QA 3 531 3 531
DS 

RD RR2A235TF 581 0 0
AGTGCAGAACTTGTTACCAATACCAATATTACTTCTCAGTGCCACTACACACACAAAACG
CATGTATATGTTTTTACTTAAA*CAGACACCAGTAGTCTTTGGGCTCTTTTTTTGTTCTT
TGTTTTTCCAACTACCGACATACATATATACTTATTACATAATAATAGATGTGATATTTG
ATAAAAGTGGTGAAGTGTTCTTACAAGATCCACCCCCAATTTTTT*AAAAAGTTGTTTCA
GTTGCAGTTGGTGTCGTAGCTTGCAAGACCGAGTAGTTCCGGTCCCTCCAATCGCGAGTT
GTTCTCAAAGTTCTCCAAAGGGATGTGTTCAAAAGGTCCTTCTATTGGGATAGTTCCACA
CAAATTATTGTTCGACACATCAAAGACTTTAAGGCTTGGGATTTTCGTTAGTTCTCTAGG
GATTGAACCGGTCAATCGGTTGTCATTGAGCCGGAGAAAGACCAGAGACTTCAATTTCCC
CAAGGAAGTAGGGATCTTCCCGGTAAGATTGTTGTTGTAAAGATCCAAGCTGATGAGACT
TTTCAATTTTCCAAGTTCAGATGGTATAGTTCCTTGGATG
C

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2A235JQ 457 0 0
TTTCCAACTACCGACATACATATATACTTATTACATAATAATAGATGTGATATTTGATAA
AAGTGGTGAAGTGTTCTTACAAGATCCACCCCCAATTTTTT*AAAAAGTTGTTTCAGTTG
CAGTTGGTGTCGTAGCTTGCAAGACCGAGTAGTTCCGGTCCCTCCAATCGCGAGTTGTTC
TCAAAGTTCTCCAAAGGGATGTGTTCAAAAGGTCCTTCTATTGGGATAGTTCCACACAAA
TTATTGTTCGACACATCAAAGACTTTAAGGCTTGGGATTTTCGTTAGTTCTCTAGGGATT
GAACCGGTCAATCGGTTGTCATTGAGCCGGAAAAAGACCAGAGACTTCAATTTCCCCAAG
GAAGTAGGGATCTTCCCGGTAAGATTGTTGTTGTAAAGATCCAAGCTGATGAGACTTTTC
AATTTTCCAAGTTCAGATGGTATAGTTCCTTGGATGC

QA 1 457 1 457
DS 



AS 2 5

CO CL1520Contig1 1124 3 7 U
ATTTTAAATTCAAACATAAAAAAAACAAATTTTTTGATTTATCAGTTTCACTTTCTTATG
AAGTAACAAAAAAAAAACTAAAACACAAGCCTGAGGAGTTTGATCTCTCTCTCTTTCTCT
CTATCTATATTCCCTCTCTCATGTTATACATCTACCAAAACACCCGAGCAAAACTTTAAA
GTTTTTGAGCATATAACAAACATATGTTGGTAACTTCTATCTATGCATGTCGTCAAAGCT
CAAGATCCAACGCTGGTCTCTTCTTATCTGACACACTTTTCCAGCTACTACGTCCATCAA
ATTTCTCTTCATCCTCTGAGCTATGACCATTATTACTGAACAAACAACCTCTATCAACAA
CAAGCGGGCTCTGTGGTGAGTCAGACCTCGTCAAGCTTATTAAGCCTGTGTTTCCCTATC
TAACAAAACAGGCTGATCCGAGGATGGCAGAATCTTTGCTGGATGCAGCGGATGCTTACG
GATATGCATTCTATATTTTTGTAAATGACTCTTGACTTCATCATTGGTTAAACCATCAAC
TCTCATCATTTCTCTAATCTGCTTTGGTGTTGCCACTTGTGGCCCTCCAAGGATGTGAAG
AGCATCAACGAAATTACGGTGGAGTTCCTGTGACCATCTCCTTCTCTGATCTTTCTTCGG
AACGTAATGGCTCTGTATAATAGGTTTGCTGAACTGAGGATGATTCTGCTCAATTCTCCT
ATAATCCATCAGTATTTCTGATGTTGGAGTCCTGAGAGTCAGAGGAGCCGGAGGAGGCGG
TGGTGGTGGGTTGTATAGTGGAAATGCTCCTCCCTGATTATTACATGTCTGAATAGGCTT
CAAAGTCACACATCCATCTTCCTCTTCGTTTGTCGATTGCAATTGAGAGTTAGGATTGGA
GATCCATAACTGGGCAGAGCTCATCCAGTTCTTCTTATTATTATCACTTTCCAATCTTAC
CCCTTCACCCACATCGAATTTACCATTTGATGCCATCATCATCACTGATGAAGCCTCTTC
CTTTAACCTCTCAATCGCTTCGTTCAATAGGAGCATGCATAGAGGTAGTTCCCGTTTAAA
AACATCGATCTTTCTCCTCTCTTCCTCTAATTTTCCGACATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM64JQ U 1
AF RR2FA21JQ U 34
AF RR2FA21TF C 353
BS 1 199 RR2BM64JQ
BS 200 200 RR2FA21JQ
BS 201 220 RR2BM64JQ
BS 221 221 RR2FA21JQ
BS 222 379 RR2BM64JQ
BS 380 630 RR2FA21JQ
BS 631 1124 RR2FA21TF

RD RR2BM64JQ 387 0 0
ATTTTAAATTCAAACATAAAAAAAACAAATTTTTTGATTTATCAGTTTCACTTTCTTATG
AAGTAACAAAAAAAAAACTAAAACACAAGCCTGAGGAGTTTGATCTCTCTCTCTTTCTCT
CTATCTATATTCCCTCTCTCATGTTATACATCTACCAAAACACCCGAGCAAAACTTTAAA
GTTTTTGAGCATATAACAA*CATATGTTGGTAACTTCTATGTATGCATGTCGTCAAAGCT
CAAGATCCAACGCTGGTCTCTTCTTATCTGACACACTTTTCCAGCTACTACGTCCATCAA
ATTTCTCTTCATCCTCTGAGCTATGACCATTATTACTGAACAAACAACCTCTATCAACAA
CAAGCGGGCTCTGTGGTGA
ATCCAACC

QA 1 379 1 379
DS 

RD RR2FA21JQ 597 0 0
TTGATTTATCAGTTTCACTTTCTTATGAAGTAACAAAAAAA***CTAAAACACAAGCCTG
AGGAGTTTGATCTCTCTCTCTTTCTCTCTATCTATATTCCCTCTCTCATGTTATACATCT
ACCAAAACACCGGAGCAAAACTTTAAAGTTTTTGAGCATATAACAAACATATGTTGGTAA
CTTTTATCTATGCATGTCTTCAAAGCTCAAGATCCAACGCTGGTCTCTTTTTATCTGACA
CACTTTTCCAGCTACTACGTCCATCAGATTTCTCTTCATCCTCTGAGCTATGACCATTAT
TACTGAACAAACAGCCTCTATCAACAACAAGCGGGCTCTGTGGTGAGTCAGACCTCGTCA
AGCTTATTAAGCCTGTGTTTCCCTATCTAACAAAACAGGCTGATCCGAGGATGGCAGAAT
CTTTGCTGGATGCAGCGGATGCTTACGGATATGCATTCTATATTTTTGTAAATGACTCTT
GACTTCATCATTGGTTAAACCATCAACTCTCATCATTTCTCTAATCTGCTTTGGTGTTGC
CACTTGTGGCCCTCCAAGGATGTGAAGAGCATCAACGAAATTACGGTGGAGTTCCTG

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2FA21TF 772 0 0
ATCAACAACAAGCGGGCTCTGTGGTGAGTCAGACCTCGTCAAGCTTATTAAGC*TGTGTT
TCCCTATCTAACAAAACAGGCTGATCCGAGGATGGCAGAGTCTTTGCTGGATGCAGCGGA
TGCTTACGGATATGCATTCTATATTTTTGTAAATGACTCTTGACTTCATCATTGGTTAAA
CCATCAACTCTCATCATTTCTCTAATCTGCTTTGGTGTTGCCACTTGTGGCCCTCCAAGG
ATGTGAAGAGCATCAACGAAATTACGGTGGAGTTCCTGTGACCATCTCCTTCTCTGATCT
TTCTTCGGAACGTAATGGCTCTGTATAATAGGTTTGCTGAACTGAGGATGATTCTGCTCA
ATTCTCCTATAATCCATCAGTATTTCTGATGTTGGAGTCCTGAGAGTCAGAGGAGCCGGA
GGAGGCGGTGGTGGTGGGTTGTATAGTGGAAATGCTCCTCCCTGATTATTACATGTCTGA
ATAGGCTTCAAAGTCACACATCCATCTTCCTCTTCGTTTGTCGATTGCAATTGAGAGTTA
GGATTGGAGATCCATAACTGGGCAGAGCTCATCCAGTTCTTCTTATTATTATCACTTTCC
AATCTTACCCCTTCACCCACATCGAATTTACCATTTGATGCCATCATCATCACTGATGAA
GCCTCTTCCTTTAACCTCTCAATCGCTTCGTTCAATAGGAGCATGCATAGAGGTAGTTCC
CGTTTAAAAACATCGATCTTTCTCCTCTCTTCCTCTAATTTTCCGACATACC

QA 1 772 1 772
DS 



CO CL1520Contig2 1189 2 4 U
GGATCTTTATTGTTTCTTTTCGTTCTTATTCGATGGTTCAGACAGATACAGATAAGATGG
GTCTTAATTTGAATCTGTCCATGTACTCCTTAGCAAAACCCTTGTCTCAATTTCTCGACC
AAGTGTCGAGGATCAAAGACGATGAGTCGAAACTGTCTGAAATCGATGATTATGTCGGAA
AATTAGAGGAAGAGAGGAGAAAGATCGATGTTTTTAAACGGGAGCTACCTCTATGCATGC
TCCTATTGAACGAAGCGATTGAGAGGTTAAAGGAAGAGGCTTCAACAGTGATGATGATGG
CATCAAATGGTAAATTAGATGTGGGTGAAGGGGTAAGATTGGAAAGTGATAATAATAAGA
AGAACTGGATGAGCTCTGCCCAGTTATGGATCTCCAATCCTAACTCTCAATTTCAATCGA
CATACGAAGAAGAAGAAGGTCGGTGTGTGACTCAGAAGCCTATTCAGACATGTAATAATC
AGTTTCCACCACCATATAACCCTCCACCACCGCCTCCTCCGGCTCCTCTGACTCTCAGTA
CACCAACGTCTGAAATACTGATGGATTATAGGAGAATGGAGCAGAATCATCCGCAGTTCA
GCAAGCCTATTATACAGAGCCATCACGTTCCGAAGAAAGATCAGAGAAGGAGATGGTCAC
AGGAACTTCACCGTAAGTTCGTTGATGCTCTTCACATCCTTGGAGGGCCACAAGTGGCAA
CACCAAAGCAGATAAGAGAAATGATGAGAGTTGATGGTTTAACCAATGATGAAGTCAAGA
GCCATTTACAAAAATACAGAATGCATATCCGTAAGCATCCACTGCATCCAGCAAAGATTC
TGCCATCCTCGGATCAGCCTGTTTTGTTAGATAGGGAAACACAGAGCTTAATAAGTTTGA
CGAGGTCGGATTCACCACAGAGCCCGCTTGTTGTTGATAGAGGTTGTTTGTTCAGTAATA
ATGGTCATAGCTCAGAGGATGAAGAGAAATCTGATGGACGTAGTAGCTGGAAAAGTGTGT
CAGATAAGAAGAGACCAGCTTTGGATCTTGAGCTTTGACGACATGCATATATAAAAGTTA
CCAACATATGTTGTTATATGCTCAAAAACTTTAAAGTTTTGCTCGGGAGTTTTTGTAGAT
GTAAAACATGAGAGAGGGAATATAGATTAGAGAGAAAGAGATCAAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F037TF U 1
AF RR2F037JQ C 553
BS 1 649 RR2F037TF
BS 650 650 RR2F037JQ
BS 651 777 RR2F037TF
BS 778 1189 RR2F037JQ

RD RR2F037TF 777 0 0
GGATCTTTATTGTTTCTTTTCGTTCTTATTCGATGGTTCAGACAGATACAGATAAGATGG
GTCTTAATTTGAATCTGTCCATGTACTCCTTAGCAAAACCCTTGTCTCAATTTCTCGACC
AAGTGTCGAGGATCAAAGACGATGAGTCGAAACTGTCTGAAATCGATGATTATGTCGGAA
AATTAGAGGAAGAGAGGAGAAAGATCGATGTTTTTAAACGGGAGCTACCTCTATGCATGC
TCCTATTGAACGAAGCGATTGAGAGGTTAAAGGAAGAGGCTTCAACAGTGATGATGATGG
CATCAAATGGTAAATTAGATGTGGGTGAAGGGGTAAGATTGGAAAGTGATAATAATAAGA
AGAACTGGATGAGCTCTGCCCAGTTATGGATCTCCAATCCTAACTCTCAATTTCAATCGA
CATACGAAGAAGAAGAAGGTCGGTGTGTGACTCAGAAGCCTATTCAGACATGTAATAATC
AGTTTCCACCACCATATAACCCTCCACCACCGCCTCCTCCGGCTCCTCTGACTCTCAGTA
CACCAACGTCTGAAATACTGATGGATTATAGGAGAATGGAGCAGAATCATCCGCAGTTCA
GCAAGCCTATTATACAGAGCCATCACGTTCCGAAGAAAGATCAGAGAAG*AGATGGTCAC
AGGAACTTCACCGTAAGTTCGTTGATGCTCTTCACATCCTTGGAGGGCCACAAGTGGCAA
CACCAAAGCAGATAAGAGAAATGATGAGAGTTGATGGTTTAACCAATGATGAAGTCA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2F037JQ 637 0 0
AAATACTGATGGATTATAGGAGAATGGAGCAGAATCATCCGCAGTTCAGCAAGCCTATTA
TACAGAGCCATCACGTTCCGAAGAAAGATCAGAGAAGGAGATGGTCACAGGAACTTCACC
GTAAGTTCGTTGATGCTCTTCACATCCTTGGAGGGCCACAAGTGGCAACACCAAAGCAGA
TAAGAGAAATGATGAGAGTTGATGGTTTAACCAATGATGAAGTCAAGAGCCATTTACAAA
AATACAGAATGCATATCCGTAAGCATCCACTGCATCCAGCAAAGATTCTGCCATCCTCGG
ATCAGCCTGTTTTGTTAGATAGGGAAACACAGAGCTTAATAAGTTTGACGAGGTCGGATT
CACCACAGAGCCCGCTTGTTGTTGATAGAGGTTGTTTGTTCAGTAATAATGGTCATAGCT
CAGAGGATGAAGAGAAATCTGATGGACGTAGTAGCTGGAAAAGTGTGTCAGATAAGAAGA
GACCAGCTTTGGATCTTGAGCTTTGACGACATGCATATATAAAAGTTACCAACATATGTT
GTTATATGCTCAAAAACTTTAAAGTTTTGCTCGGGAGTTTTTGTAGATGTAAAACATGAG
AGAGGGAATATAGATTAGAGAGAAAGAGATCAAACTC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 5

CO CL1521Contig1 1159 5 30 U
GGAATTACAAATAGACAAAAACAAAAATGACGAATCAAAGCAAAGTCTATATCCTCTTCT
CGAGACACAGTTCGAATTTGATTAATCAAAGCAAAGTCGTGTCTGGTTTTTAGATTTGCT
TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGATATACTTATCGGAGAGACAGACAATTACGATGGCG
TAACGGTGACCATGAATGAACCAATGGATGCTGAAGTTTTCACCCATAGGCTCAGGGCTT
CTCTTTCCCATTGGAGACAAGAGGGGAAGAAGGGGATTTGGATAAAGCTACCTCTTGGTT
TAGCTAACCTTGTTGAATCTGCAGTTAGTGAAGGGTTTAGATATCATCACGCAGAGCCAG
AGTACTTGATGCTTGTGTCTTGGATCTCTAACACCCCTGACACGATCCCTGCCAATGCTT
CTCACATTGTTGGTGTTGGTGCTCTTGTCCTCAACAAAGCTACTCGTGAGGTCCTCGTTG
TCCAGGAAAAGAGCGGTTATTTCAGAGACAAAAATGTCTGGAAGCTCCCTACTGGTGTTA
TCCACGAGGGTGAGGATATTTGCGATGGAGTAGCTAGGGAAGTGGAAGAAGAAACTGGTA
TTATCGCAGATTTTGTTGAAGTGTTGTCCTTCAGGCAAAGCCACAAAGCATTCTTGAAAC
AGAAAACGGATCTGTTTTTCCTCTGTGTCTTGGCTCCACGCTCCTACGAAATCACTGAAC
AAAAATCTGAGATCTTGGAAGCTAAGTGGATGCCGATCAAAGAATACGTAGATCAGCCAT
GGAACCAGAAGAAGGAGATGTTCAAGATCATGGCTGAAATATGCGAGAAGAAGTGTGATG
AACAATACGTTGGATTCTCCGCTGTGGAAACTGTCACCGGAACTGGTAAAAAGAGCTTTG
TCTACTGCAATGCTGATCACGCCAAGAACCTTATAGCAGCGCGTGACCAAGCATCATCCT
CTTCTCTCTGAATAACATTCTCATGGAATCTCTGCATTTGTCATTATTGTGTTGTGTCCT
TTGTATTTGTATCTCAAATAAAAAACAAAACCATCTTTCTGAGACAATTGCTTTCCTTTG
GCATTGTCTCAACCGGTTTCAAATTCTCAGCTTTATATTTTTCATGGTTATTTCTGGTTT
AATCCACTTTCGTTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA60TF U 1
AF RR2G245TF U 113
AF RR2B583TF U 131
AF RR2EZ06JQ C 452
AF RR2G245JQ C 414
BS 1 157 RR2BA60TF
BS 158 158 RR2G245TF
BS 159 276 RR2BA60TF
BS 277 277 RR2G245TF
BS 278 346 RR2BA60TF
BS 347 347 RR2G245TF
BS 348 369 RR2BA60TF
BS 370 370 RR2G245TF
BS 371 525 RR2BA60TF
BS 526 526 RR2G245TF
BS 527 539 RR2BA60TF
BS 540 540 RR2G245TF
BS 541 604 RR2BA60TF
BS 605 605 RR2G245TF
BS 606 628 RR2BA60TF
BS 629 629 RR2G245TF
BS 630 665 RR2BA60TF
BS 666 666 RR2G245TF
BS 667 692 RR2BA60TF
BS 693 693 RR2G245TF
BS 694 707 RR2BA60TF
BS 708 708 RR2G245TF
BS 709 709 RR2BA60TF
BS 710 710 RR2G245TF
BS 711 724 RR2BA60TF
BS 725 725 RR2G245TF
BS 726 789 RR2BA60TF
BS 790 794 RR2G245TF
BS 795 887 RR2B583TF
BS 888 1159 RR2G245JQ

RD RR2BA60TF 789 0 0
GGAATTACAAATAGACAAAAACAAAAATGACGAATCAAAGCAAAGTCTATATCCTCTTCT
CGAGACACAGTTCGAATTTGATTAATCAAAGCAAAGTCGTGTCTGGTTTTTAGATTTGCT
TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGATATACTTATCGGGGAGACAGACAATTACGATGGCG
TAACGGTGACCATGAATGAACCAATGGATGCTGAAGTTTTCACCCATAGGCTCAGGGCTT
CTCTTTCCCATTGGAGACAAGAGGGGAAGAAGGGGACTTGGATAAAGCTACCTCTTGGTT
TAGCTAACCTTGTTGAATCTGCAGTTAGTGAAGGGTTTAGATATCACCACGCAGAGCCAG
AGTACTTGACGCTTGTGTCTTGGATCTCTAACACCCCTGACACGATCCCTGCCAATGCTT
CTCACATTGTTGGTGTTGGTGCTCTTGTCCTCAACAAAGCTACTCGTGAGGTCCTCGTTG
TCCAGGAAAAGAGCGGTTATTTCAGAGACAAAAATGTCTGGAAGCCCCCTACTGGTGTTG
TCCACGAGGGTGAGGATATTTGCGATGGAGTAGCTAGGGAAGTGGAAGAAGAAACTGGTA
TTATTGCAGATTTTGTTGAAGTGTTGTCTTTCAGGCAAAGCCACAAAGCATTCTTGAAAC
AGAAATCGGATCTGTTTTTCCTCTGTGTCTTGACTCCACGCTCCTACAATATCACTGAAC
AAAAGTCTGAGATCTTGGAAGCTAAGTGGATGCCGATCAAAGAATACGTAGATCAGCCAT
GGAACCAGA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2G245TF 682 0 0
TTTTTAGATCTGCTT
GAGAGAGAGAGAGATGGATATACTTATCGGAGAGACAGACAATTATGATGGCGTAACGGT
GACCATGAATGAACCAATGGATGCTGAAGTTTTCACCCATAGGCTCAGGGCTTCTCTTTC
CCATTGGAGACAAGAGGGGAAGAAGGGGATTTGGATAAAGCTACCTCTTGGTTTAGCTAA
CCTTGTTGAATCTGCAGTTAGTGAAGGGTTTAGATATCATCACGCAGAGCCAGAGTACTT
GATGCTTGTGTCTTGGATCTCTGACACCCCTGACACGATCCCTGCCAATGCTTCTCACAT
TGTTGGTGTTGGTGCTCTTGTCCTCAACAAAGCTACTCGTGAGGTCCTCGTTGTCCAGGA
AAAGAGCGGTTATTTCAGAGACAAAAATGTCTGGAAGCTCCCTACTGGTGTTATCCACGA
GGGTGAGGATATTTGCGATGGAGTAGCTAGGGAAGTGGAAGAAGAAACTGGTATTATCGC
AGATTTTGTTGAAGTGTTGTCCTTCAGGCAAAGCCACAAAGCATTCTTGAAACAGAAAAC
GGATCTGTTTTTCCTCTGTGTCTTGGCTCCACGCTCCTACGAAATCACTGAACAAAAATC
TGAGATCTTGGAAGCTAAGTGGATGCCGATCAAAGAATACGTAGATCAGCCATGGAACCA
GAAGAAG

QA 16 682 16 682
DS 

RD RR2B583TF 757 0 0
G
GAGAGAGAGATGGATATACTTATCGGAGAGACAGACAATTACGATGGCGTAACGGTGACC
ATGAATGAACCAATGGATGCTGAAGTTTTCACCCATAGGCTCAGGGCTTCTCTTTCCCAT
TGGAGACAAGAGGGGAAGAAGGGGATTTGGATAAAGCTACCTCTTGGTTTAGCTAACCTT
GTTGAATCTGCAGTTAGTGAAGGGTTTAGATATCATCACGCAGAGCCAGAGTACTTGATG
CTTGTGTCTTGGATCTCTAACACCCCTGACACGATCCCTGCCAATGCTTCTCACATTGTT
GGTGTTGGTGCTCTTGTCCTCAACAAAGCTACTCGTGAGGTCCTCGTTGTCCAGGAAAAG
AGCGGTTATTTCAGAGACAAAAATGTCTGGAAGCTCCCTACTGGTGTTATCCACGAGGGT
GAGGATATTCGCGATGGAGTAGCTAGGGAAGTGGAAGAAGAAACTGGTATTATCGCAGAT
TTTGTTGAAGTGTTGTCCTTCAGGCAAAGCCACAAAGCATTCTTGAAACAGAAAACGGAT
CTGTTTTTCCTCTGTGTCTTGGCTCCACGCTCCTACGAAATCACTGAACAAAAATCTGAG
ATCTTGGAAGCTAAGTG*ATGCCGATCAAAGAATACGTAGATCAGCCATGGAACCAGAAG
AAGGAGATGTTCAAGATCATGGCTGAAATATGCGAGAAGAAGTGTGATGAACAATACGTT
GGATTCTCCGCTGTGGAAACTGTCACCGGAACTGGT

QA 2 757 2 757
DS 

RD RR2EZ06JQ 689 0 0
CAACAAAGCTACTCGTGAGGTCCTCGTTGTCCAGGAAAAGAGCGGTTATTTCAGAGACAA
AAATGTCTGGAAGCTCCCTACTGGTGTTATCCACGAGGGTGAGGATATTTGCGATGGAGT
AGCTAGGGAAGTGGAAGAAGAAACTGGTATTATCGCAGATTTTGTTGAAGTGTTGTCCTT
CAGGCAAAGCCACAAAGCATTCTTGAAACAGAAAACGGATCTGTTTTTCCTCTGTGTCTT
GGCTCCACGCTCCTACGAAATCACTGAACAAAAATCTGAGATCTTGGAAGCTAAGTGGAT
GCCGATCAAAGAATACGTAGATCAGCCATGGAACCAGAAGAAGGAGATGTTCAAGATCAT
GGCTGAAATATGCGAGAAGAAGTGTGATGAACAATACGTTGGATTCTCCGCTGTGGAAAC
TGTCACCTGAACTGGTAAAAAGAGCTTTGTCTACTGCAATGCTGATCACGCCAAGAACCT
TATAGCAGCGCGTGACCAAGCATCATCCTCTTCTCTCTGAATAACATTCTCATGGAATCT
CTGCATTTGTCATTATTGTGTTGTGTCCTTTGTATTTGTATCTCAAATAAAAAACAAAAC
CATCTTTCTGAGACAATTGCTTTCCTTTGGCATTGTCTCAACCGGTTTCAAATTCTCAGC
TTTATATTTTTCATGGTTATTTCTGGTTT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2G245JQ 746 0 0
AATGCTTCTCACATTGTTGGTGTTGGTGCTCTTGTCCTCAACAAAGCTACTCGTGAGGTC
CTCGTTGTCCAGGAAAAGAGCGGTTATTTCAGAGACAAAAATGTCTGGAAGCTCCCTACT
GGTGTTATCCACGAGGGTGAGGATATTTGCGATGGAGTAGCTAGGGAAGTGGAAGAAGAA
ACTGGTATTATCGCAGATTTTGTTGAAGTGTTGTCCTTCAGGCAAAGCCACAAAGCATTC
TTGAAACAGAAAACGGATCTGTTTTTCCTCTGTGTCTTGGCTCCACGCTCCTACGAAATC
ACTGAACAAAAATCTGAGATCTTGGAAGCTAAGTGGATGCCGATCAAAGAATACGTAGAT
CAGCCATGGAACCAGAAGAAGGAGATGTTCAAGATCATGGCTGAAATATGCGAGAAGAAG
TGTGATGAACAATACGTTGGATTCTCCGCTGTGGAAACTGTCACCGGAACTGGTAAAAAG
AGCTTTGTCTACTGCAATGCTGATCACGCCAAGAACCTTATAGCAGCGCGTGACCAAGCA
TCATCCTCTTCTCTCTGAATAACATTCTCATGGAATCTCTGCATTTGTCATTATTGTGTT
GTGTCCTTTGTATTTGTATCTCAAATAAAAAACAAAACCATCTTTCTGAGACAATTGCTT
TCCTTTGGCATTGTCTCAACCGGTTTCAAATTCTCAGCTTTATATTTTTCATGGTTATTT
CTGGTTTAATCCACTTTCGTTTGATT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 2 6

CO CL1522Contig1 630 2 1 U
GTGTTCGAGGAAATCCTCCAGCGAAACCCGCTTTCGTTCGAGGCTTTGTTCGAGAACGCG
TTGCTCATGGACAGGTCCGGGGAAGGAGATGCGGTCTGCAGAGGCTGGAAGACGCTTTGG
CTGTGGCTGAAGCCGAGAATATGGTCAAGGAGATAAGGGACGTGAGGCTGATCATTGCGC
AGATACAGTTCTTGCAGAAGAATGTGGATGAGGCGTTGAAGAGTTATGAGCAGCTGACGA
GAGAGGATCCTAAGGATTTCAGACCGTATTTCTGTAGGAGTATGATTTATAGCTTGCTCG
ACAAGAATGTTGAAGCCAAGGAGCAGTTTGCTAAGTACAGAGAGCTTTCTCCCAAGAAGT
TTGAAGTTGAAGGGTATTTGAGGACGCCACTGTCTAAGATGAAGCTCTTTGGTAGCGATG
GAGACAACTGAGTTCAGAATAATAGTTCATATCTGAAGAATAATACACAGAAGACTAAGA
TTGTTTTCCTTGAGAGATTACGTTGGAGTTACTTATAAAGCAAAACGCTCTTTTATGTCG
ATTTTAAACTTATGATTTGTGGTTTACTTTTTTTATTTATCCTATGATTCGTATTTGATA
TAACGCAGAGGAAAAAGAGACTTATTTGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EK68JQ C 1
AF RR2EK68TF U 1
BS 1 630 RR2EK68TF

RD RR2EK68JQ 630 0 0
GTGTTCGAGGAAATCCTCCAGCGAAACCCGCTTTCGTTCGAGGCTTTGTTCGAGAACGCG
TTGCTCATGGACAGGTCCGGGGAAGGAGATGCGGTCTGCAGAGGCTGGAAGACGCTTTGG
CTGTGGCTGAAGCCGAGAATATGGTCAAGGAGATAAGGGACGTGAGGCTGATCATTGCGC
AGATACAGTTCTTGCAGAAGAATGTGGATGAGGCGTTGAAGAGTTATGAGCAGCTGACGA
GAGAGGATCCTAAGGATTTCAGACCGTATTTCTGTAGGAGTATGATTTATAGCTTGCTCG
ACAAGAATGTTGAAGCCAAGGAGCAGTTTGCTAAGTACAGAGAGCTTTCTCCCAAGAAGT
TTGAAGTTGAAGGGTATTTGAGGACGCCACTGTCTAAGATGAAGCTCTTTGGTAGCGATG
GAGACAACTGAGTTCAGAATAATAGTTCATATCTGAAGAATAATACACAGAAGACTAAGA
TTGTTTTCCTTGAGAGATTACGTTGGAGTTACTTATAAAGCAAAACGCTCTTTTATGTCG
ATTTTAAACTTATGATTTGTGGTTTACTTTTTTTATTTATCCTATGATTCGTATTTGATA
TAACGCAGAGGAAAAAGAGACTTATTTGAT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2EK68TF 630 0 0
GTGTTCGAGGAAATCCTCCAGCGAAACCCGCTTTCGTTCGAGGCTTTGTTCGAGAACGCG
TTGCTCATGGACAGGTCCGGGGAAGGAGATGCGGTCTGCAGAGGCTGGAAGACGCTTTGG
CTGTGGCTGAAGCCGAGAATATGGTCAAGGAGATAAGGGACGTGAGGCTGATCATTGCGC
AGATACAGTTCTTGCAGAAGAATGTGGATGAGGCGTTGAAGAGTTATGAGCAGCTGACGA
GAGAGGATCCTAAGGATTTCAGACCGTATTTCTGTAGGAGTATGATTTATAGCTTGCTCG
ACAAGAATGTTGAAGCCAAGGAGCAGTTTGCTAAGTACAGAGAGCTTTCTCCCAAGAAGT
TTGAAGTTGAAGGGTATTTGAGGACGCCACTGTCTAAGATGAAGCTCTTTGGTAGCGATG
GAGACAACTGAGTTCAGAATAATAGTTCATATCTGAAGAATAATACACAGAAGACTAAGA
TTGTTTTCCTTGAGAGATTACGTTGGAGTTACTTATAAAGCAAAACGCTCTTTTATGTCG
ATTTTAAACTTATGATTTGTGGTTTACTTTTTTTATTTATCCTATGATTCGTATTTGATA
TAACGCAGAGGAAAAAGAGACTTATTTGAT

QA 1 630 1 630
DS 



CO CL1522Contig2 1318 4 11 U
CGTTAACAAATAAGTTTTCTTTTCCCCTGCGTTATTATGATACTAAATACGAATCATAGG
ATAAACAAAAAAAATAAACCACAAATTCATAAGTTTTAACTCAACATAAAAGAACATTTT
GCTTTATAAATAACTCCAACGTAATCTCTCAGGAAAACAATCTAGTCTTCCGTATCTTAT
TCTTCAGATATAAGAACTATTATCCTAACTTCACTCAGTTATCCCCACCACTACCAAAGA
GCTTCATCTTAAACAGCGGCGTCCTCAAATACCCTTCAACTTCAAACTTCTTTGGAGAAA
GCTCTCTGTACTCAGCAAACTGCTCCTTGGCTTCAACATTCTTGTCAAGCAAACTATAAA
TCATACCTCTACAGAAATATGGTCTGAAATCCTTCGGATCCTCTCTCGTCAGCTGCTCAT
AGCTCTTCAACGCTTCATCCACATTCTTCTGCAAGAACTGTATCTGCGCAATGATCAGCC
TCACGTCTCTGATCTCCTTCACCATATTCTCAGCTTCAGCTACAGCCAACGCATCTTCCA
GCCTCTGCAGCACCGCGTCTCCTTCCCCGGACCTGTCCATGAGCAATGCGTTCTCGAACA
AAGCCTCGAAAGAAAGCGGGTTTCGCTGGAGAATTTCCTCGAACACTTGGCGTGCGTTCT
CGGTACGACCCATCTCTCCCAATAGCCTCGCCATCAAGAACTTCCACTCAGTTTCATCTG
GTTGTGCGGTTACGAGTCTCTCTAAGATCTTGAGAGCTTCTTCGTCTTCTCCGTTCTCTA
GCTTCTGCTGAAGAAACGATCTCAGCGTTTTGACCGCCTATGGGGTGGATTCTAGAAGCT
CGGACAACGGCGAAGTGGGTTCAATCTCAGACGAAGTGTTCTCTTCTGTCACTTCCTCGG
TGGTCGTCGCGACCGGAGATTCCGCTATCGCCGGTAAAGTTGCGAACTTTCCGGTCATGG
AAACAGCAGCGCCGATTAGAATCGTTGATTTGGCGAAAGATTTGAGCTTTTCGTGAAAAC
AGTGATCCGAAGAACCATTCTTGCTAGCCCTGATGCGCAGAGAGACGAGATCACGACGGG
GAATGATATGCCCGGCGGCGACCGGAGGAGTTTTAACGGCGAGTAAAGAGAAAGACAATG
AAGAAGGAGGTGAGAGAGACGTGAACATGGTTTCCAGCGTACTGTATGAGTTCGCTGGAG
AGTGGAGAAGCGAACTCACAAATCCAACAGAGGTAGGTAGGCGGCAGCGATTTTCCGGAT
GAGACAAGGGTTGTGTTAATTTAAGTCCCACCACTCCACATTCTCATGTCGAAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF20JQ U 5
AF RR2H046JQ U 1
AF RR2H046TF C 576
AF RR2DF20TF C 686
BS 1 251 RR2H046JQ
BS 252 252 RR2DF20JQ
BS 253 802 RR2H046JQ
BS 803 930 RR2H046TF
BS 931 933 RR2DF20TF
BS 934 1036 RR2H046TF
BS 1037 1037 RR2DF20TF
BS 1038 1181 RR2H046TF
BS 1182 1182 RR2DF20TF
BS 1183 1221 RR2H046TF
BS 1222 1318 RR2DF20TF

RD RR2DF20JQ 592 0 0
CG
CAAATAAGTTTTCTTTTCCTCTGCGTTATTATGATACTAAATACGAATCATAGGATAAAC
AAAAAAAATAAACCACAAATTCATAAGTTTTAACTCAACATAAAAGAACATTTTGCTTTA
TAAATAACTCCAACGTAATCTCTCAGGAAAACAATCTAGTCTTCCGTATCTTATTCTTCA
GATATAAGAACTATTATCCTAACTTCACTCAGTTATCTCCACCACTACCAAAGAGCTTCA
TCTTAAACAGCGGCGTCCTCAAATACCCTTCAACTTCAAACTTCTTTGGAGAAAGCTCTC
TGTACTTAGCAAACTGCTCCTTGGCTTCAACATTCTTGTCAAGCAAACTATAAATCATAC
CTCTACAGAAATATGGTCTGAAATCCTTCGGATCCTCTCTCGTCAGCTGCTCATAGCTCT
TCAACGCTTCATCCACATTCTTCTGCAAGAACTGTATCTGCGCAATGATCAGCCTCACGT
CTCTGATCTCCTTCACCATATTCTCAGCTTCAGCTACAGCCAACGCATCTTCCAGCCTCT
GCAGCACCGCGTCTCCTTCCCCGGACCTGTCCATGAGCAATGCGTTCTCG

QA 3 592 3 592
DS 

RD RR2H046JQ 802 0 0
CGTTAACAAATAAGTTTTCTTTTCCCCTGCGTTATTATGATACTAAATACGAATCATAGG
ATAAACAAAAAAAATAAACCACAAATTCATAAGTTTTAACTCAACATAAAAGAACATTTT
GCTTTATAAATAACTCCAACGTAATCTCTCAGGAAAACAATCTAGTCTTCCGTATCTTAT
TCTTCAGATATAAGAACTATTATCCTAACTTCACTCAGTTATCCCCACCACTACCAAAGA
GCTTCATCTTAGACAGCGGCGTCCTCAAATACCCTTCAACTTCAAACTTCTTTGGAGAAA
GCTCTCTGTACTCAGCAAACTGCTCCTTGGCTTCAACATTCTTGTCAAGCAAACTATAAA
TCATACCTCTACAGAAATATGGTCTGAAATCCTTCGGATCCTCTCTCGTCAGCTGCTCAT
AGCTCTTCAACGCTTCATCCACATTCTTCTGCAAGAACTGTATCTGCGCAATGATCAGCC
TCACGTCTCTGATCTCCTTCACCATATTCTCAGCTTCAGCTACAGCCAACGCATCTTCCA
GCCTCTGCAGCACCGCGTCTCCTTCCCCGGACCTGTCCATGAGCAATGCGTTCTCGAACA
AAGCCTCGAAAGAAAGCGGGTTTCGCTGGAGAATTTCCTCGAACACTTGGCGTGCGTTCT
CGGTACGACCCATCTCTCCCAATAGCCTCGCCATCAAGAACTTCCACTCAGTTTCATCTG
GTTGTGCGGTTACGAGTCTCTCTAAGATCTTGAGAGCTTCTTCGTCTTCTCCGTTCTCTA
GCTTCTGCTGAAGAAACGATCT

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2H046TF 646 0 0
TCCATGAGCAATGCGTTCTCGAACAAAGCCTCGAAAGAAAGCGGGTTTCGCTGGAGAATT
TCCTCGAACACTTGGCGTGCGTTCTCGGTACGACCCATCTCTCCCAATAGCCTCGCCATC
AAGAACTTCCACTCAGTTTCATCTGGTTGTGCGGTTACGAGTCTCTCTAAGATCTTGAGA
GCTTCTTCGTCTTCTCCGTTCTCTAGCTTCTGCTGAAGAAACGATCTCAGCGTTTTGACC
GCCTATGGGGTGGATTCTAGAAGCTCGGACAACGGCGAAGTGGGTTCAATCTCAGACGAA
GTGTTCTCTTCTGTCACTTCCTCGGTGGTCGTCGCGACCGGAGATTCCGCTATCG***GT
AAAGTTGCGAACTTTCCGGTCATGGAAACAGCAGCGCCGATTAGAATCGTTGATTTGGCG
AAAGATTTGAGCTTTTCGTGAAAACAGTGATCCGAAGAACCGTTCTTGCTAGCCCTGATG
CGCAGAGAGACGAGATCACGACGGGGAATGATATGCCCGGCGGCGACCGGAGGAGTTTTA
ACGGCGAGTAAAGAGAAAGACAATGAAGAAGGAGGTGAGAGAGACGTGAACATGGTTTCC
AGCGTATTGTATGAGTTCGCTGGAGAGTGGAGAAGCGAACTCACAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2DF20TF 633 0 0
CCTCGCCATCAAGAACT*CCACTCAGTTTCATCTGGCTGTGCGGTTAAGAGTCTCT**AA
GATCTTGAGAGCTTCT*CGTCTTCTCCGTTCTCTAGCTCCTGCTGAAGAAACGATCTCAG
CGTTTTGACCGCCTCTGGGGTGGATTCTAGAAGCTCGGACAACGGCGAAGTGGGTTCAAT
CTCAGACGAAGTGTTCTCTTCTGTCACTTCCTCGGTGGTCGTCGCGACCGGAGATTCCGC
TATCGCCGGTAAAGTTGCGAACTTTCCGGTCATGGAAACAGCAGCGCCGATTAGAATCGT
TGATTTGGCGAAAGATTTGAGCTTTTCGTGAAAACAGTGATCCGAAGAACCATTCTTGCT
AGCCCTGATGCGCAGAGAGACGAGATCACGACGGGGAATGATATGCCCGGCGGCGACCGG
AGGAGTTTTAACGGCGAGTAAAGAGAAAGACAATGAAGAAGGAGGTGAGAGAGACGTGAA
CATGGTTTCCAGCGTACTGTATGAGTTCGCTGGAGAGTGGAGAAGCGAACTCACAAATCC
AACAGAGGTAGGTAGGCGGCAGCGATTTTCCGGATGAGACAAGGGTTGTGTTAATTTAAG
TCCCACCACTCCACATTCTCATGTCGAAAATCC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 6

CO CL1523Contig1 629 6 8 U
GGCTCCTCAGCTAAACTGAACATATTTAAATAAATAAATATATACATAAATGGCGGGCCG
CGACACCTTGCAGCTACATGTTGTGGCTGTCGTGGTATCCGTCATCATATTAACCTTCTT
TGTGTTCGGTCAAGTTGCGGAGGCATCACGTACGATGAACTTGTGTTCTCATACCGCATA
TCCTTCTCTATGCCAACCTATGGTGAGACGTATCACGAACCCAAGACGAGCCACACACCG
AACCATCCAGGCCCTGGAGGCTAAGACCAAACTGGCTCTGGCTGAGGCGGCTAGGTACAA
GAATGGTAACCAAGCGATCACCACGTGTTACGCGACGCTTGGTGACGCGATTTACAATCT
GGCGAACGCGAGGAAAAGCATAAGGAAACGTGATGTGATGGCGTTGAATACGTTTTTGAC
TGCGGCAGTGTCTGATTACGGTGTGTGTGTCGAAGGGTTTATTGATGCGAACCAAGTTAA
TACGGTCCAGAATGTAGCGGTTGATTTGAGGAAAATTAGTAGTAATTGCTTGTCGTTGTC
TACGTTGATTTAGATGATTGATTACAAATAACATTTATTCATTTTTTTCTCCGAGCAATA
AAAGAAAAACTAATCATTCAATTGATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 25 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX72JQ C 1
AF RR2BX72TF U 233
AF RR2B184TF U 1
AF RR2B184JQ C 1
AF RR2DA77JQ C 7
AF RR2DA77TF U 7
BS 1 8 RR2B184JQ
BS 9 232 RR2B184TF
BS 233 451 RR2BX72TF
BS 452 452 RR2B184TF
BS 453 492 RR2BX72TF
BS 493 588 RR2B184TF
BS 589 619 RR2DA77TF
BS 620 629 RR2B184JQ

RD RR2BX72JQ 403 0 0
GGCTCCTC
AGCTAAACTGAACATATTTAAATAAATAAATATATACATAAATGGCGGGCCGCGACACCT
TGCAGCTACATGTTGTGGCTGTCGTGGTATCCGTCATCATATTAACCTTCTTTGTGTTCG
GTCAAGTTGCGGAGGCATCACGTACGATGAACTTGTGTTCTCATACCGCATATCCTTCTC
TATGCCAACCTATGGTGAGACGTATCACGAACCCAAGACGAGCCACACACCGAACCATCC
AGGCCCTGGAGGCTAAGACCAAACTGGCTCTGGGTGAGGCGGCTAGGTACAAGAATGGTA
ACCAAGCGATCACCACGTGTTACGCGACGCTTGGTGACGCGATTTACAATCTGGCGAACG
CGAGGAAAAGCATAAGGAAACGTGATGTGATGGCG

QA 9 403 9 403
DS 

RD RR2BX72TF 260 0 0
ACACACCGAACCATCCAGGCCCTGGAGGCTAAGACCAAACTGGCTCTGGCTGAGGCGGCT
AGGTACAAGAATGGTAACCAAGCGATCACCACGTGTTACGCGACGCTTGGTGACGCGATT
TACAATCTGGCGAACGCGAGGAAAAGCATAAGGAAACGTGATGTGATGGCGTTGAATACG
TTTTTGACTGCGGCAGTGTCTGATTACGGTGTGTGTGTCAAAGGGTTTATTGATGCGAAC
CAAGTTAATACGGTCCAGAA

QA 1 260 1 260
DS 

RD RR2B184TF 588 0 0
GGCTCCTC
AGCTAAACTGAACATATTTAAATAAATAAATATATACATAAATGGCGGGCCGCGACACCT
TGCAGCTACATGTTGTGGCTGTCGTGGTATCCGTCATCATATTAACCTTCTTTGTGTTCG
GTCAAGTTGCGGAGGCATCACGTACGATGAACTTGTGTTCTCATACCGCATATCCTTCTC
TATGCCAACCTATGGTGAGACGTATCACGAACCCAAGACGAGCCACACACCGAACCATCC
AGGCCCTGGAGGCTAAGACCAAACTGGCTCTGGCTGAGGCGGCTAGGTACAAGAATGGTA
ACCAAGCGATCACCACGTGTTACGCGACGCTTGGTGACGCGATTTACAATCTGGCGAACG
CGAGGAAAAGCATAAGGAAACGTGATGTGATGGCGTTGAATACGTTTTTGACTGCGGCAG
TGTCTGATTACGGTGTGTGTGTCGAAGGGTTTATTGATGCGAACCAAGTTAATACGGTCC
AGAATGTAGCGGTTGATTTGAGGAAAATTAGTAGTAATTGCTTGTCGTTGTCTACGTTGA
TTTAGATGATTGATTACAAATAACATTTATTCATTTTTTT

QA 9 588 9 588
DS 

RD RR2B184JQ 629 0 0
GGCTCCTCAGCTAAACTGAACATATTTAAATAAATAAATATATACATAAATGGCGGGCCG
CGACACCTTGCAGCTACATGTTGTGGCTGTCGTGGTATCCGTCATCATATTAACCTTCTT
TGTGTTCGGTCAAGTTGCGGAGGCATCACGTACGATGAACTTGTGTTTTCATACCGCATA
TCCTTCTCTATGCCAACCTATGGTGAGACGTATCACGAACCCAAGACGAGCCACACACCG
AACCATCCAGGCCCTGGAGGCTAAGACCAAACTGGCTCTGGCTGAGGCGGCTAGGTACAA
GAATGGTAACCAAGCGATCACCACGTGTTACGCGACGCTTGGTGACGCGATTTACAATCT
GGCGAACGCGAGGAAAAGCATAAGGAAACGTGATGTGATGGCGTTGAATACGTTTTTGAC
TGCGGCAGTGTCTGATTACGGTGTGTGTGTCGAAGGGTTTATTGATGCGAACCAAGTTAA
TACGGTCCAGAATGTAGCGGTTGATTTGAGGAAAATTAGTAGTAATTGCTTGTCGTTGTC
TACGTTGATTTAGATGATTGATTACAAATAACATTTATTCATTTTTTTCTCCGAGCAACA
AAAGAAAAACTAATCATTCAATTGATGTG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2DA77JQ 613 0 0
GG
AGCTAAACTGAACATATTTAAATAAATAAATATATACATAAATGGCGGGCCGCGACACCT
TGCAGCTACATGTTGTGGCTGTCGTGGTATCCGTCATCATATTAACCTTCTTTGTGTTCG
GTCAAGTTGCGGAGGCATCACGTACGATGAACTTGTGTTCTCATACCGCATATCCTTCTC
TATGCCAACCTATGGTGAGACGTATCACGAACCCAAGACGAGCCACATTCCGAACCATCC
AGGCCCTGGAGGCTAAGACCAAACTGGCTCTGGCTGAGGCGGCTAGGTACAAGAATGGTA
ACCAAGCGATCACCACGTGTTACGCGACGCTTGGTGACGCGATTTACAATCTGGCGAACG
CGAGGAAAAGCATAAGGAAACGTGATGTGATGGCGTTAAATACGTTTTTGACTGCGGCAA
TGTCTGATTACGGTGTGTGTGTCGAAGGGTTTATTGATGCGAACCAAGTTAATACGGTCC
AGAATGTAGCGGTTGATTTGAGGAAAATTAGTAGTAATTGCTTGTCGTTGTCTACGTTGA
TTTAGATGATTGATTACAAATAACATTTATTCATTTTTTTCTCCGAGCAATAAAAGAAAA
ACTAATCATTC

QA 3 613 3 613
DS 

RD RR2DA77TF 613 0 0
GG
AGCTAAACTGAACATATTTAAATAAATAAATATATACATAAATGGCGGGCCGCGACACCT
TGCAGCTACATGTTGTGGCTGTCGTGGTATCCGTCATCATATTAACCTTCTTTGTGTTCG
GTCAAGTTGCGGAGGCATCACGTACGATGAACTTGTGTTCTCATACCGCATATCCTTCTC
TATGCCAACCTATGGTGAGACGTATCACGAACCCAAGACGAGCCACACTCCGAACCATCC
AGGCCCTGGAGGCTAAGACCAAACTGGCTCTGGCTGAGGCGGCTAGGTACAAGAATGGTA
ACCAAGCGATCACCACGTGTTACGCGACGCTTGGTGACGCGATTTACAATCTGGCGAACG
CGAGGAAAAGCATAAGGAAACGTGATGTGATGGCGTTAAATACGTTTTTGACTGCGGCAA
TGTCTGATTACGGTGTGTGTGTCGAAGGGTTTATTGATGCGAACCAAGTTAATACGGTCC
AGAATGTAGCGGTTGATTTGAGGAAAATTAGTAGTAATTGCTTGTCGTTGTCTACGTTGA
TTTAGATGATTGATTACAAATAACATTTATTCATTTTTTTCTCCGAGCAATAAAAGAAAA
ACTAATCATTC

QA 3 613 3 613
DS 



AS 1 6

CO CL1524Contig1 1391 6 15 U
GGAAAGCACACAAGCAATATTCTCTCTTACTTTCCTCCTCTCTCACTCACTATACAATGG
CAGGCAAGTGCATTTTAGCGAGTGTTCTAGGGGTAGTTTTGGTATTGACGCTGCTACACA
ACCCGCTCACCGTCTCCGGTCAAAATATCCCGGCGGTGGCTTTGTTCACGTTCGGTGACT
CCGACTTCGACGCCGGAAACAAACAGACTCTCACCACAGCAAACGTTGCCCAGGGTTTCT
GGCCGTACGGTAAATCCAGAGATGATCCTAACGGGAAATTCTCCGACGGTTTCATCGCTC
CTGACTTCGTCGCAAAATTCATGGGGATACCAATCCCAATCCCGGCGGCCCTTAAACCAA
ACGTTAATGTCTCACGTGGAGCTAGTTTCGCCGTTGCTGATGCTACTCTTCTCGGAGCTC
CGGTTGAATCTTTGACTCTAAGTCAACAAGTGCGGAAATTTAATCAAATGAAAGCAGCAA
ACTGGAATGATGACTTTATCAAGAAGTCAGTGTTTATGATATACGTTGGTGCTAACGACT
ACTTGAATTTCACCAAGAACAACCCTAACGCCGATGCTTCTGCTCAACAAGCTTTCGTCA
CTTCGGTGACCAACAAGTTAAAGAATGATATCAGCTTGTTGTATTCATCAGGAGCTAGTA
AATTTGTGATCCAAACCCTAGCACCATTAGGTTGCTTACCTATAGTCAGACAAGATTACA
ACACAGGAATGGATCAATGCCACGAAGGTCTCAATAATTTGGCTAAACAACACAACGAAA
AAATCGGACCGATGTTGAACGAAATGGCCCGAACAACTTCTGGTTTCCAATTTACCGTCT
TCGATTTCTACAGTGTCATTCTTCGTAGGACGCAGAGAGGCTTCAACTACAGGTTTTTCG
TGACAAATGCATCGTGCTGCGGTGTTGGGACACACAATGCTTACGGTTGCGGTTTACCTA
ACGTGCACTCCAAGCTATGTGAGT*ACC*AACGATCTTACTTATTCTTCGATGGGCGTCA
CAATACCGAGAAGGCACAAGAGAGTTTTGGTCATCTTCTTTTCGGAGCCGATCCAAATGT
GATCCAACCAATGAATGTCCGCGAGCTCGTTGTTTACCCAGTCGATGAACCTATGAGGGA
AGTTTGGGTACCTACAACGTCAGCCACCGTCCAAGCCAGCGACTCTAGCTCGTCAACAAG
CCGCGGTTACGAGTTCTATTGAGTCCCTATAAATTACATCTAAGAAATTGAATTTGTGAT
GTTTTCGTTTTCAACTTGTTTTTTCATCTTGCTCGAGTGAGTTTCCCTCTATAATAAAAG
ATCGATCATTGTAACTCTTACCACGTAGTGGACTGTTTAGGAAGTGAATCAATATGTCGA
TCATTTTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW86TF U 6
AF RR2CC69TF U 6
AF RR2DA19TF U 1
AF RR2FY63TF U 474
AF RR2DA19JQ C 853
AF RR2DW86JQ C 733
BS 1 651 RR2DA19TF
BS 652 652 RR2FY63TF
BS 653 690 RR2DA19TF
BS 691 691 RR2FY63TF
BS 692 703 RR2DA19TF
BS 704 981 RR2FY63TF
BS 982 982 RR2DW86JQ
BS 983 984 RR2FY63TF
BS 985 985 RR2DW86JQ
BS 986 988 RR2FY63TF
BS 989 989 RR2DW86JQ
BS 990 1032 RR2FY63TF
BS 1033 1033 RR2DW86JQ
BS 1034 1139 RR2FY63TF
BS 1140 1391 RR2DW86JQ

RD RR2DW86TF 282 0 0
GG
ACACAAGCAATATTCTCTCTTACTTTCCTCCTCTCTCACTCACTATACAATGGCAGGCAA
GTGCATTTTAGCGAGTGTTCTAGGGGTAGTTTTGGTATTGACGCTGCTACACAACCCGCT
CACCGTCTCCGGTCAAAATATCCCGGCGGTGGCTTTGTTCACGTTCGGTGACTCCGACTT
CGACGCCGGAAACAAACAGACTCTCACCACAGCAAACGTTGCCCAGGGTTTCTGGCCGTA
CGGTAAATCCAGAGATGATCCTAACGGGAAATTCTCCGAC

QA 3 282 3 282
DS 

RD RR2CC69TF 642 0 0
GG
ACACAAGCAATATTCTCTCTTACTTTCCTCCTCTCTCACTCACTATACAATGGCAGGCAA
GTGCATTTTAGCGAGTGTTCTAGGGGTAGTTTTGGTATTGACGCTGCTACACAACCCGCT
CACCGTCTCCGGTCAAAATATCCCGGCGGTGGCTTTGTTCACGTTCGGTGACTCCGACTT
CGACGCCGGAAACAAACAGACTCTCACCACAGCAAACGTTGCCCAGGGTTTCTGGCCGTA
CGGTAAGTCCAGAGATGATCCTAACGGGAAATTCTCCGACGGTTTCATCGCTCCTGACTT
CGTCGCAAAATTCATGGGGATACCAATCCCAATCCCGGCGGCCCTTAAACCAAACGTTAA
TGTCTCACGTGGAGCTAGTTTCGCCGTTGCTGATGCTACTCTTCTCGGAGCTCCGGTTGA
ATCTTTGACTCTAAGTCAACAAGTGCGGAAATTTAATCAAATGAAAGCAGCAAACTGGAA
TGATGACTTTATCAAGAAGTCAGTTTTTATGATATACGTTGGTGCTAACGACTACTTGAA
TTTCACCAAGAACAACCCTAACGCCGATGCTTCTGCTCAACAAGCTTTCGTCACTTCGGT
GACCAACAAGTTAAAGAATGATATCAGCTTGTTGTATTCA

QA 3 642 3 642
DS 

RD RR2DA19TF 703 0 0
GGAAAGCACACAAGCAATATTCTCTCTTACTTTCCTCCTCTCTCACTCACTATACAATGG
CAGGCAAGTGCATTTTAGCGAGTGTTCTAGGGGTAGTTTTGGTATTGACGCTGCTACACA
ACCCGCTCACCGTCTCCGGTCAAAATATCCCGGCGGTGGCTTTGTTCACGTTCGGTGACT
CCGACTTCGACGCCGGAAACAAACAGACTCTCACCACAGCAAACGTTGCCCAGGGTTTCT
GGCCGTACGGTAAATCCAGAGATGATCCTAACGGGAAATTCTCCGACGGTTTCATCGCTC
CTGACTTCGTCGCAAAATTCATGGGGATACCAATCCCAATCCCGGCGGCCCTTAAACCAA
ACGTTAATGTCTCACGTGGAGCTAGTTTCGCCGTTGCTGATGCTACTCTTCTCGGAGCTC
CGGTTGAATCTTTGACTCTAAGTCAACAAGTGCGGAAATTTAATCAAATGAAAGCAGCAA
ACTGGAATGATGACTTTATCAAGAAGTCAGTGTTTATGATATACGTTGGTGCTAACGACT
ACTTGAATTTCACCAAGAACAACCCTAACGCCGATGCTTCTGCTCAACAAGCTTTCGTCA
CTTCGGTGACCAACAAGTTAAAGAATGATATCAGCTTGTTGTATTCATCAG*AGCTAGTA
AATTTGTGATCCAAACCCTAGCACCATTAG*TTGCTTACCTAT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2FY63TF 666 0 0
GCAGCAAACTGGAATGATGACTTTATCAAGAAGTCAGTGTTTATGATATACGTTGGTGCT
AACGACTACTTGAATTTCACCAAGAACAACCCTAACGCCGATGCTTCTGCTCAACAAGCT
TTCGTCACTTCGGTGACCAACAAGTTAAAGAGTGATATCAGCTTGTTGTATTCATCAGGA
GCTAGTAAATTTGTGATCCAAACCCTAGCACCATTAGGTTGCTTACCTATAGTCAGACAA
GATTACAACACAGGAATGGATCAATGCCACGAAGGTCTCAATAATTTGGCTAAACAACAC
AACGAAAAAATCGGACCGATGTTGAACGAAATGGCCCGAACAACTTCTGGTTTCCAATTT
ACCGTCTTCGATTTCTACAGTGTCATTCTTCGTAGGACGCAGAGAGGCTTCAACTACAGG
TTTTTCGTGACAAATGCATCGTGCTGCGGTGTTGGGACACACAATGCTTACGGTTGCGGT
TTACCTAACGTGCACTCCAAGCTATGTGTGTTACCTAACGATCTTACTTATTCTTCGATG
GGCGTCACAATACCGAGAAAGCACAAGAGAGTTTTGGTCATCTTCTTTTCGGAGCCGATC
CAAATGTGATCCAACCAATGAATGTCCGCGAGCTCGTTGTTTACCCAGTCGATGAACCTA
TGAGGG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2DA19JQ 490 0 0
GTGTCATTCTTCGTAGGACGCAGAGAGGCTTCAACTACAGGTTTTTCGTGACAAATGCAT
CGTGCTGCGGTGTTGGGACACACAATGCTTACGGTTGCGGTTTACCTAACGTGCACTCCA
AGCTATGTGAGT*ACC*AACGATCTTACTTATTTTTCGATGGGCGTCACAATACCGAGAA
GGCACAAGAGAGTTTTGGTCATTTTCTTTTCGGAGCCGATCCAAATGTGATCCAACCAAT
GAATGTCCGCGAGCTCGTTGTTTACCCAGTCGATGAACCTATGAGGGAAGTTTGGGTACC
TACAACGTCAGCCACCGTCCAAGCCAGCGACTCTAGCTCGTCAACAAGCCGCGGTTACGA
GTTCTATTGAGTCCCTATAAATTACATCTAAGAAATTGAATTTGTGATGTTTTCGTTTTC
AACTTGTTTTTTCATCTTGCTCGAGTGAGTTTCCCTCTATAATAAAAGATCGATCATTGT
AACTCTTACC

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR2DW86JQ 659 0 0
ATCAATGCCACGAAGGTCTCAATAATTTGGCTAAACAACACAACGAAAAAATCGGACCGA
TGTTGAACGAAATGGCCCGAACAACTTCTGGTTTCCAATTTACCGTCTTCGATTTCTACA
GTGTCATTCTTCGTAGGACGCAGAGAGGCTTCAACTACAGGTTTTTCGTGACAAATGCAT
CGTGCTGCGGTGTTGGGACACACAATGCTTACGGTTGCGGTTTACCTAACGTGCACTCCA
AGCTATGTGAGT*ACC*AACGATCTTACTTATTCTTCGATGGGCGTCACAATACCGAGAA
GGCACAAGAGAGTTTTGGTCATCTTCTTTTCGGAGCCGATCCAAATGTGATCCAACCAAT
GAATGTCCGCGAGCTCGTTGTTTACCCAGTCGATGAACCTATGAGGGAAGTTTGGGTACC
TACAACGTCAGCCACCGTCCAAGCCAGCGACTCTAGCTCGTCAACAAGCCGCGGTTACGA
GTTCTATTGAGTCCCTATAAATTACATCTAAGAAATTGAATTTGTGATGTTTTCGTTTTC
AACTTGTTTTTTCATCTTGCTCGAGTGAGTTTCCCTCTATAATAAAAGATCGATCATTGT
AACTCTTACCACGTAGTGGACTGTTTAGGAAGTGAATCAATATGTCGATCATTTTACCC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 6

CO CL1525Contig1 1017 6 18 U
GGAAAACTAGGAATTAAACACAGATGGGGAGCGTAAGAATACAACCACCGACTTCTTCAT
CGACACATCTTATCCACAACCTTCTCCGACATCCCGAACCACCGTCTTCCTTCTGTCTCT
TCATCAGACCCTTTCGCTTCTCCGCTGTAACATGTCAATCCAGCCGCTGTAACAAGCCTC
GGTTTCAATCAATCTCTTCAAAGCCTCCGCTTCCTTTTCACTCTACTTCTTCTTCTTCT*
**TCACTCGTAGCGAAATCCTTCTCTGCCATCGATGAGCCGGACCTCCTCGGAGAAGAAG
ATGAGAGCGAGGAAGACGATTACAACGAAGAAGAAGACGAAGAAGAAGAGCTGGACAGTG
GAATGGTATCCGCGAGAGGAAGTGAGGAGGACTACGAGGAAGGTTTAGGAGACAAGGAGG
AGGATAAGATAGAGAAGATGAAGAAGAAGGCTCGGGGCTCGGGTTTGAAGTTGACGATAA
AGGAGAAGAAGGAACTTGCTTCATACGCCCATAGTCTTGGTGACAAATTAAAATGTCAAC
TCGTCGGGAAATCTGGCGTTACTGATTCAGTCGTTTTCTCCTTCCTGGAGACTCTCGAGA
AGAACGAGCTCTTAAAGGTGAAGATACGGAAGACATCTCCAGAGGAGATGGAGGACGCTG
TTATGCATTTGGAGGAAGCCACTGGTTCTGTTGCTGTTGGCCAAATCGGGAGGACGGTTA
TATTGTACCGCCCTAGTCCCACCAAAATGAAAGCTGAGGAGAAGAAGAAAGAAGTTGAGA
GATTGTTGATTAGAAGGAGACAGAAGTTCTCAAACTCCCGACCCACGAGACCTTTTAGGA
GAGAGTATTCAGAGAGACCTGATGGACGTGGACGCAGAGGAGGAAGTAGAGTTGCAACCC
CTTGATTTTTTTGTTATTGTTAATTTGCTCGGTTTGTTTTTTTTTATTATCACCTAAGTA
GACCAGTTCTTTGCTTTTGTATGCATTCTTCAAAAAAATACAATCTCGTTGATCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2EK56TF U 1
AF RR2D489TF U 7
AF RR2E325TF U 7
AF RR2B861TF U 13
AF RR2E325JQ C 303
AF RR2B861JQ C 518
BS 1 175 RR2EK56TF
BS 176 176 RR2D489TF
BS 177 188 RR2EK56TF
BS 189 189 RR2D489TF
BS 190 639 RR2EK56TF
BS 640 679 RR2D489TF
BS 680 680 RR2E325TF
BS 681 704 RR2D489TF
BS 705 705 RR2E325TF
BS 706 718 RR2D489TF
BS 719 758 RR2B861TF
BS 759 759 RR2E325JQ
BS 760 794 RR2B861TF
BS 795 826 RR2E325JQ
BS 827 827 RR2B861JQ
BS 828 898 RR2E325JQ
BS 899 899 RR2B861JQ
BS 900 1017 RR2E325JQ

RD RR2EK56TF 639 0 0
GGAAAACTAGGAATTAAACACAGATGGGGAGCGTAAGAATACAACCACCGACTTCTTCAT
CGACACATCTTATCCACAACCTTCTCCGACATCCCGAACCACCGTCTTCCTTCTGTCTCT
TCATCAGACCCTTTCGCTTCTCCGCTGTAACATGTCAATCCAGCCGCTGTAACAATCCTC
GGTTTCAACCAATCTCTTCAAAGCCTCCGCTTCCTTTTCACTCTACTTCTTCTTCTTCT*
**TCACTCGTAGCGAAATCCTTCTCTGCCATCGATGAGCCGGACCTCCTCGGAGAAGAAG
ATGAGAGCGAGGAAGACGATTACAACGAAGAAGAAGACGAAGAAGAAGAGCTGGACAGTG
GAATGGTATCCGCGAGAGGAAGTGAGGAGGACTACGAGGAAGGTTTAGGAGACAAGGAGG
AGGATAAGATAGAGAAGATGAAGAAGAAGGCTCGGGGCTCGGGTTTGAAGTTGACGATAA
AGGAGAAGAAGGAACTTGCTTCATACGCCCATAGTCTTGGTGACAAATTAAAATGTCAAC
TCGTCGGGAAATCTGGCGTTACTGATTCAGTCGTTTTCTCCTTCCTGGAGACTCTCGAGA
AGAACGAGCTCTTAAAGGTGAAGATACGGAAGACATCTC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2D489TF 727 0 0
GGAGGAATT
AAACACAGATGGGGAGCGTAAGAATACAACCACCGACTTCTTCATCGACACATCTTATCC
ACAACCTTCTCCGACATCCCGAACCACCGTCTTCCTTCTGTCTCTTCATCAGACCCTTTC
GCTTCTCCGCTGTAACATGTCAATCCAGCCGCCGTAACAAGCCTCGGTTTCAATCAATCT
CTTCAAAGCCTCCGCTTCCTTTTCACTCTACTTCTTCTTCTTCT***TCACTCGTAGCGA
AATCCTTCTCTGCCATCGATGAGCCGGACCTCCTCGGAGAAGAAGATGAGAGCGAGGAAG
ACGATTACAACGAAGAAGAAGACGAAGAAGAAGAGCTGGACAGTGGAATGGTATCCGCGA
GAGGAAGTGAGGAGGACTACGAGGAAGGTTTAGGAGACAAGGAGGAGGATAAGATAGAGA
AGATGAAGAAGAAGGCTCGGGGCTCGGGTTTGAAGTTGACGATAAAGGAGAAGAAGGAAC
TTGCTTCATACGCCCATAGTCTTGGTGACAAATTAAAATGTCAACTCGTCGGGAAATCTG
GCGTTACTGATTCAGTCGTTTTCTCCTTCCTGGAGACTCTCGAGAAGAACGAGCTCTTAA
AGGTGAAGATACGGAAGACATCTCCAGAGGAGATGGAGGACGCTGTTATGCATTTGGAGG
AAGC*ACTGGTTCTGTTGCTGTTGGCCAA*TCGGGAGGACGGT
ATATCGTACCGCCCT

QA 10 712 10 712
DS 

RD RR2E325TF 703 0 0
GGAGGAATT
AAACACAGATGGGGAGCGTAAGAATACAACCACCGACTTCTTCATCGACACATCTTATCC
ACAACCTTCTCCGACATCCCGAACCACCGTCTTCCTTCTGTCTCTTCATCAGACCCTTTC
GCTTCTCCGCTGTAACATGTCAATCCAGCCGCTGTAACAAGCCTCGGTTTCAATCAATCT
CTTCAAAGCCTCCGCTTCCTTTTCACTCTACTTCTTCTTCTTCTTCTTCACTCGTAGCGA
AATCCTTCTCTGCCATCGATGAGCCGGACCTCCTCGGAGAAGAAGATGAGAGCGAGGAAG
ACGATTACAACGAAGAAGAAGACGAAGAAGAAGAGCTGGACAGTGGAATGGTATCCGCGA
GAGGAAGTGAGGAGGACTACGAGGAAGGTTTAGGAGACAAGGAGGAGGATAAGATAGAGA
AGATGAAGAAGAAGGCTCGGGGCTCGGGTTTGAAGTTGACGATAAAGGAGAAGAAGGAAC
TTGCTTCATACGCCCATAGTCTCGGTGACAAATTAAAATGTCAACTCGTCGGGAAATCTG
GCGTTACTGATTCAGTCGTTTTCTCCTTCCTGGAGACTCTCGAGAAGAACGAGCTCTTAA
AGGTGAAGATACGGAAGACATCTCCAGAGGAGATGGAGGACGCTGTTATGCATTTGGAGG
AAGCCACTGGTTCTGTTGCTGTTGGCCAAATCGG

QA 10 703 10 703
DS 

RD RR2B861TF 787 0 0
GGA
AAACACAGATGGGGAGCGTAAGAATACAACCACCGACTTCTTCATCGACACATCTTATCC
ACAACCTTCTCCGACATCCCGAACCACCGTCTTCCTTCTGTCTCTTCATCAGACCCTTTC
GCTTCTCCGCTGTAACATGTCAATCCAGCCGCTGTAACAAGCCTCGGTTTCAATCAATCT
CTTCAAAGCCTCCGCTTCCTTTTCACTCTACTTCTTCTTCTTCT***TCACTCGTAGCGA
AATCCTTCTCTGCCATCGATGAGCCGGACCTCCTCGGAGAAGAAGATGAGAGCGAGGAAG
ACGATTACAACGAAGAAGAAGACGAAGAAGAAGAGCTGGACAGTGGAATGGTATCCGCGA
GAGGAAGTGAGGAGGACTACGAGGAAGGTTTAGGAGACAAGGAGGAGGATAAGATAGAGA
AGATGAAGAAGAAGGCTCGGGGCTCGGGTTTGAAGTTGACGATAAAGGAGAAGAAGGAAC
TTGCTTCATACGCCCATAGTCTTGGTGACAAATTAAAATGTCAACTCGTCGGGAAATCTG
GCGTTACTGATTCAGTCGTTTTCTCCTTCCTGGAGACTCTCGAGAAGAACGAGCTCTTAA
AGGTGAAGATACGGAAGACATCTCCAGAGGAGATGGAGGACGCTGTTATGCATTTGGAGG
AAGCCACTGGTTCTGTTGCTGTTGGCCAAATCGGGAGGACGGTTATATTGTACCGCCCTA
GTCCCACCAAAATGAAAGCTGAG*AGAAGAAGAAAGAAGTTGAGAGATTGTTGATTAGA
GAGAC

QA 4 782 4 782
DS 

RD RR2E325JQ 715 0 0
GAGAGCGAGGAAGACGATTACAACGAAGAAGAAGACGAAGAAGAAGAGCTGGACAGTGGA
ATGGTATCCGCGAGAGGAAGTGAGGAGGACTACGAGGAAGGTTTAGGAGACAAGGAGGAG
GATAAGATAGAGAAGATGAAGAAGAAGGCTCGGGGCTCGGGTTTGAAGTTGACGATAAAG
GAGAAGAAGGAACTTGCTTCATACGCCCATAGTCTCGGTGACAAATTAAAATGTCAACTC
GTCGGGAAATCTGGCGTTACTGATTCAGTCGTTTTCTCCTTCCTGGAGACTCTCGAGAAG
AACGAGCTCTTAAAGGTGAAGATACGGAAGACATCTCCAGAGGAGATGGAGGACGCTGTT
ATGCATTTGGAGGAAGCCACTGGTTCTGTTGCTGTTGGCCAAATCGGGAGGACGGTTATA
TTGTACCGCCCTAGTCCCACCAAAATGAAAGCTGAGGAGAAGAAGAAGGAAGTTGAGAGA
TTGTTGATTAGAAGGAGACAGAAGTTCTCAAACTCCCGACCCACTAGACCTTTTAGGAGA
GAGTATTCAGAGAGACCTGATGGACGTGGACGCAGAGGAGGAAGTAGAGTTGCAACGCCT
TGATTTTTTTGTTATTGTTAATTTGCTCGGTTTGTTTTTTTTTATTATCACCTAAGTAGA
CCAGTTCTTTGCTTTTGTATGCATTCTTCAAAAAAATACAATCTCGTTGATCTGT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2B861JQ 500 0 0
TGGTGACAAATTAAAATGTCAACTCGTCGGGAAATCTGGCGTTACTGATTCAGTCGTTTT
TTCCTTCCTGGAGACTCTCGAGAAGAACGAGCTTTTAAAGGGGAAGATACGGAAGACATC
TCCAGAGGAGATGGAGGACGCTGTTATGCATTTGGAGGAAGCCACTGGTTTTGTTGCTGT
TGGCCAAATCGGGAGGACGGTTATATTGTCCCCCCCTAGTCCCCCCAAAATGAAAGCTGA
GGAGAAGAAGAAAGAAGTTGAGAGATTGTTGATTAGAAGGAGACAGAAGTTTTCAAACTC
CCGACCCCCGAGACCTTTTAGGAGAGAGTATTCAGAGAGACCTGATGGACGTGGACGCAG
AGGAGGAAGTAGAGTTGCAACCCCTTGATTTTTTTGTTATTGTTAATTTGCTCGGTTTGT
TTTTTTT*ATTATCCCCTAAGTAGACCAGTTTTTTGCTTTTGTATGCATTTTTCAAAAAA
ATACAATCTCGTTGATCTGT

QA 1 500 1 500
DS 



AS 2 4

CO CL1526Contig1 953 2 16 U
GGATATCCGAGTGAGTGGTGACTTGTTACGTCAAGTGACGTTACATCGCACCGTCTAAAA
TAAAAAAGCAAAGCCACCTTTTGCTCTCACCAACCACAAACCTCCTTTTACAGAGGCAGT
GTCCTCCGCACACACACATCACAGAGAGATAGGGAGAGAGACAGAGAAACAATGGCGTTG
GCTCTTCGCAGACTCTCCTATTCCCTCAAGAAGCCCATCTTCTCAAATGGCGGTTCCCTC
CGTTCTATGTCGTCTACGTCAGCCTCTGAGAGATCTCATTCCAGTTGGATAAGGCAACTC
AATGCACCTCTTGAAGAAATCGATCCCGAAATCGCAGATATCATCGAGCTCGAGAAGGCT
AGGCAATGGAAGGGATTTGAACTTATACCGTCAGAGAACTTCACCTCTGCCTCAGTTATG
GAAGCTGTTGGCTCTGTTATGACTAACAAGTATAGTGAAGGTTACCCTGGTGCTAGATAC
TACGGAGGCAATGAGTACATTGACATGGCAGAATCATTATGTCAAAAACGAGCACTTGAA
GCTTTTCAGTTAGATCCTTCCAAATGGGGAGTCAATGTGCAGTCTTTATCAGGATCACCA
GCTAACTTTCAAGTTTACACTGCATTGCTGAAACCTCATGAAAGAATCATGGCACTTGAC
TTGCCTCACGGTGGCCATCTTTCTCATGGTTATCAGACTGACACGAAGAAAATCTCTGCT
GTATCCATTTTTTTTGAGACAATGCCATACAGATTGGATGAGAACACTGGTTACATTGAT
TATGATCAGCTAGAGAAGAGTGCCGTGCTTTTCAGACCCAAACTTATTGTTGCGGGTGCA
AGTGCTTATGCTCGTCTATATGACTATGCACGCATTCGTAAGTCTGCGACAGCAAGAGCG
GTTATGCTGGCTGACATGGCTCATATTAGTGGGTGGTTGCTGCTGGTGTGATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX89TF U 1
AF RR2GS03TF U 149
BS 1 251 RR2EX89TF
BS 252 252 RR2GS03TF
BS 253 256 RR2EX89TF
BS 257 257 RR2GS03TF
BS 258 482 RR2EX89TF
BS 483 483 RR2GS03TF
BS 484 509 RR2EX89TF
BS 510 510 RR2GS03TF
BS 511 515 RR2EX89TF
BS 516 516 RR2GS03TF
BS 517 592 RR2EX89TF
BS 593 593 RR2GS03TF
BS 594 711 RR2EX89TF
BS 712 712 RR2GS03TF
BS 713 728 RR2EX89TF
BS 729 953 RR2GS03TF

RD RR2EX89TF 731 0 0
GGATATCCGAGTGAGTGGTGACTTGTTACGTCAAGTGACGTTACATCGCACCGTCTAAAA
TAAAAAAGCAAAGCCACCTTTTGCTCTCACCAACCACAAACCTCCTTTTACAGAGGCAGT
GTCCTCCGCACACACACATCACAGAGAGATAGGGAGAGAGACAGAGAAACAATGGCGTTG
GCTCTTCGCAGACTCTCCTATTCCCTCAAGAAGCCCATCTTCTCAAATGGCGGTTCCCTC
CGTTCTATGTCTTCTATGTCAGCCTCTGAGAGATCTCATTCCAGTTGGATAAGGCAACTC
AATGCACCTCTTGAAGAAATCGATCCCGAAATCGCAGATATCATCGAGCTCGAGAAGGCT
AGGCAATGGAAGGGATTTGAACTTATACCGTCAGAGAACTTCACCTCTGCCTCAGTTATG
GAAGCTGTTGGCTCTGTTATGACTAACAAGTATAGTGAAGGTTACCCTGGTGCTAGATAC
TATGGAGGCAATGAGTACATTGACATGGCTGAATCTTTATGTCAAAAACGAGCACTTGAA
GCTTTTCAGTTAGATCCTTCCAAATGGGGAGTCAATGTGCAGTCTTTATCAG*ATCACCA
GCTAACTTTCAAGTTTACACTGCATTGCTGAAACCTCATGAAAGAATCATGGCACTTGAC
TTGCCTCACGGTGGCCATCTTTCTCATGGTTATCAGACTGACACGAAGAAA*TCTCTGCT
GTATCCAT
TTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2GS03TF 805 0 0
GG
AGGGAGAGAGACAGAGAAACAATGGCGTTGGCTCTTCGCAGACTCTCCTATTCCCTCAAG
AAGCCCATCTTCTCAAATGGCGGTTCCCTCCGTTCTATGTCGTCTACGTCAGCCTCTGAG
AGATCTCATTCCAGTTGGATAAGGCAACTCAATGCACCTCTTGAAGAAATCGATCCCGAA
ATCGCAGATATCATCGAGCTCGAGAAGGCTAGGCAATGGAAGGGATTTGAACTTATACCG
TCAGAGAACTTCACCTCTGCCTCAGTTATGGAAGCTGTTGGCTCTGTTATGACTAACAAG
TATAGTGAAGGTTACCCTGGTGCTAGATACTACGGAGGCAATGAGTACATTGACATGGCA
GAGTCATTATGTCAGAAACGCGCACTTGAAGCTTTTCAGTTAGATCCTTCCAAGTGGGGA
GTCAATGTGCAGTCTTTATCAGGATCACCAGCTAACTTTCAAGTTTACACTGCATTGCTG
AAACCTCATGAAAGAATCATGGCACTTGACTTGCCTCACGGTGGCCATCTTTCTCATGGT
TATCAGACTGACACGAAGAAAATCTCTGCTGTATCCATTTTTTTTGAGACAATGCCATAC
AGATTGGATGAGAACACTGGTTACATTGATTATGATCAGCTAGAGAAGAGTGCCGTGCTT
TTCAGACCCAAACTTATTGTTGCGGGTGCAAGTGCTTATGCTCGTCTATATGACTATGCA
CGCATTCGTAAGTCTGCGACAGCAAGAGCGGTTATGCTGGCTGACATGGCTCATATTAGT
GGGTGGTTGCTGCTGGTGTGATA

QA 3 805 3 805
DS 



CO CL1526Contig2 702 2 11 U
AATCTGAATCTGAAGTTTATATAGACCAAAATAAGTCTTTTCTGAAACTTCTTATTGGTT
AAATGTGTTTATCATACAAGAATGCATGAGTTTTGTGAACCGTTTTAGAACTGCTCTAAG
TTCATCTTTATACCTTTTATTCTCAACACAATGAAAAAAAAAAAAAAGAGAACAGAAGAT
AGCAAATGAAAAAGGTCACTTCTGTGTTTTATCAAAACGTGAAATCTCTTCTTATGGAAC
ACTTACTACCTATGCGGAAACGTGTAGATTCACCTGACGAATGGAACTACTCTTTGTATC
TCATTGTCTCTTTCTCGAACCCAATCGTTGGGAACTGTTTAGCATATTCTTCAACCATCT
CACGCAGCTTTGTCATCGCTGACTGTAACTTCTCATTTGATTGCATTGTTGCTACAAAGT
CCTTCAGCTTTGTTCCTTGAAACTCTGCCTTGATCTTCAAGGCTATCTTGACGGCTAAAT
CAAAGTATTCCGCCACTTTTGCAAAATCTTACTCAATGAATCCTCTTGATGTGAGAGCTG
GTGTACCCATACGGATGCCACCAGGAACCATAGCGGAAACGTCACCAGGAACAGTGTTCT
TGTTTGCTGCAATATGTACTGATTCTAATACTTTCTCCACTCTTGATCCATCTATTCCCT
TATTTTTCAAATTCACCAAGACTAAGTGATTCTCAGTGCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH81JQ U 1
AF RR2GS03JQB U 177
BS 1 191 RR2FH81JQ
BS 192 192 RR2GS03JQB
BS 193 241 RR2FH81JQ
BS 242 242 RR2GS03JQB
BS 243 377 RR2FH81JQ
BS 378 378 RR2GS03JQB
BS 379 440 RR2FH81JQ
BS 441 441 RR2GS03JQB
BS 442 510 RR2FH81JQ
BS 511 511 RR2GS03JQB
BS 512 702 RR2FH81JQ

RD RR2FH81JQ 702 0 0
AATCTGAATCTGAAGTTTATATAGACCAAAATAAGTCTTTTCTGAAACTTCTTATTGGTT
AAATGTGTTTATCATACAAGAATGCATGAGTTTTGTGAACCGTTTTAGAACTGCTCTAAG
TTCATCTTTATACCTTTTATTCTCAACACAATGAAAAAAAAAAAAAAGAGAACAGAAGAT
AGCAAATGAAAGAGGTCACTTCTGTGTTTTATCAAAACGTGAAATCTCTTCTTATGGAAC
ATTTACTACCTATGCGGAAACGTGTAGATTCACCTGACGAATGGAACTACTCTTTGTATC
TCATTGTCTCTTTCTCGAACCCAATCGTTGGGAACTGTTTAGCATATTCTTCAACCATCT
CACGCAGCTTTGTCATCTCTGACTGTAACTTCTCATTTGATTGCATTGTTGCTACAAAGT
CCTTCAGCTTTGTTCCTTGAGACTCTGCCTTGATCTTCAAGGCTATCTTGACGGCTAAAT
CAAAGTATTCCGCCACTTTTGCAAAATCTTCCTCAATGAATCCTCTTGATGTGAGAGCTG
GTGTACCCATACGGATGCCACCAGGAACCATAGCGGAAACGTCACCAGGAACAGTGTTCT
TGTTTGCTGCAATATGTACTGATTCTAATACTTTCTCCACTCTTGATCCATCTATTCCCT
TATTTTTCAAATTCACCAAGACTAAGTGATTCTCAGTGCCAC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2GS03JQB 508 0 0
AA
ATAGCAAATGGAAAAGGTCACTTCTGTGTTTTATCAAAACGTGAAATCTCTTCTTATGGA
ACACTTACTACCTATGCGGAAACGTGTAGATTCACCTGACGAATGGAACTACTCTTTGTA
TCTCATTGTCTCTTTCTCGAACCCAATCGTTGGGAACTGTTTAGCATATTCTTCAACCAT
CTCACGCAGCTTTGTCATCGCTGACTGTAACTTCTCATTTGATTGCATTGTTGCTACAAA
GTCCTTCAGCTTTGTTCCTTGAAACTCTGCCTTGATCTTCAAGGCTATCTTGACGGCTAA
ATCAAAGTATTCCGCCACTTTTGCAAAATCTTACTCAATGAATCCTCTTGATGTGAGAGC
TGGTGTTCCCATACGGATGCCACCAGGAACCATAGCGGAAACGTCACCAGGAACAGTGTT
CTTGTTTGCTGCAATATGTACTGATTCTAATACTTTCTCCACTCTTGATCCATCTATTCC
CTTATTTTTCAAATTCACCAAGACTA

QA 3 508 3 508
DS 



AS 2 4

CO CL1527Contig1 599 2 2 U
GATCACATATCATCTCTCTCCTTGCTACTCGCCACAACAAACCTGATCTCGCTCTTTGGA
AAAGAAAAATACCATTTCTCATCTGTATCTTTCTTCTTCTCTCTGTTCTTTGTTCTCATC
TAGATTCATAAGAATAGAATAAGTCATGATGATGAGAAAAGAAGATCTGGGTTTGAGCCT
AAGCTTAGGACTTTCACAAGATCACACACCTCTTCAGCTGCGTCAGAATCCTAACTCGTC
CATATCCAACAATCTCCCTAGATTTCCATGGAACCAAACATTCGCTTCCTCATCAGATCT
TGGCAAAATAGACGTGAACAGTATTCCAACAACGGTGGATCACGAGGAGGAAGCAGGAGT
GTCGTCTCCCAACAGTACGATCTCGAGCACCATAAGCGGCGGGAAGAGGAGTGAGAGAGA
AGGAATCTCCGACCACCACGATGATATCACTCCGGATAGAGGTTACTCGCGTGTAACCTC
GGACGAAGAAGAAGACGGCGGTGAAACGTCGAGGAAGAAGCTCCGATTATCTAAAGATCA
GTCTGCTTTTCTTGAAGAGACTTTCAAAGAACACAACACTCTCAATCCCAAACAGAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT29TF U 1
AF RR2D155TF U 22
BS 1 133 RR2AT29TF
BS 134 599 RR2D155TF

RD RR2AT29TF 133 0 0
GATCACATATCATCTCTCTCCTTGCTACTCGCCACAACAAACCTGATCTCGCTCTTTGGA
AAAGAAAAATACCATTTCTCATCTGTATCTTTCTTCTTCTCTCTGTTCTTTGTTCTCATC
TAGATTCATAAGA

QA 1 133 1 133
DS 

RD RR2D155TF 578 0 0
GG
GCTACTCGCCACAACAAACCTGATCTCTCTCTTTGGAAAGGAAAAATACCATTTCTCATC
TGTATCTTTCTTCTTCTCTCTGTTCTTTGTTCTCATCTAGATTCATAAGAATAGAATAAG
TCATGATGATGAGAAAAGAAGATCTGGGTTTGAGCCTAAGCTTAGGACTTTCACAAGATC
ACACACCTCTTCAGCTGCGTCAGAATCCTAACTCGTCCATATCCAACAATCTCCCTAGAT
TTCCATGGAACCAAACATTCGCTTCCTCATCAGATCTTGGCAAAATAGACGTGAACAGTA
TTCCAACAACGGTGGATCACGAGGAGGAAGCAGGAGTGTCGTCTCCCAACAGTACGATCT
CGAGCACCATAAGCGGCGGGAAGAGGAGTGAGAGAGAAGGAATCTCCGACCACCACGATG
ATATCACTCCGGATAGAGGTTACTCGCGTGTAACCTCGGACGAAGAAGAAGACGGCGGTG
AAACGTCGAGGAAGAAGCTCCGATTATCTAAAGATCAGTCTGCTTTTCTTGAAGAGACTT
TCAAAGAACACAACACTCTCAATCCCAAACAGAAGT

QA 3 578 3 578
DS 



CO CL1527Contig2 822 2 4 U
GGATCACACATCATCTCTCTCCTTTACTACTCGCCACAACAAACCTGATCTCTCTCTTTA
GAAAAGAAAAATACCATTTCTCATCTGTATCTTTCTTCTTGATTTCTTTCTCTCCACATA
AAGATCAAACCCCCTCTGTTCTCATCTAGATTCATAAGAACAGAATATGTCATGATGATG
AGAAAAGAAGATCTGGGTTTGAGCCTGAGCCTAGGACTTTCACAAGATCACACACCTCTT
CAGCTGAGTCAGAATCCTAACTCGTCCATATCCAACAATCTCCCTAGATTTCCATGGAAC
CAAACATTCGCTTCTTCATCGGATCTTGGCAAAATAGACGTGAACAGTATTCCAACAACG
GTGGATTGCGAGGAGGAAGCAGGAGTGTCATCTCCTAAAAGTACGATCTCGAGCACCATA
AGCGGCGGGAAAAGGAGTGAGAGAGAAGGAATCTCCGACCACCACGATGATATCACTCCG
GATAGAGGTTACTCGCGTGGAACCTCCGATGAAGAAGAAGACGGCGGTGAAACCTCGAGG
AAGAAGCTCCGATTATCAAAAGATCAGTCTGCTTTTCTTGAAGAGACTTTCAAAGAACAC
AACACTCTCAATCCCAAACAGAAGTTAGCTTTGGCCAAGAAGTTGAACTTGACAGCAAGA
CAAGTGGAAGTCTGGTTTCAGAACAGAAGAGCTAGAACCAAATTAAAGCAAACGGAGGTG
GATTGTGAATACTTGAAACGATGGGTAGAGAAACTAACGGAGGAGAATAGGCGGCTTCAG
AAAGAGGCTATGGAGCTTCGAACTCTCAAGCTGTCTCCACGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK86TF U 1
AF RR2AT29JQ C 562
BS 1 646 RR2EK86TF
BS 647 647 RR2AT29JQ
BS 648 712 RR2EK86TF
BS 713 822 RR2AT29JQ

RD RR2EK86TF 712 0 0
GGATCACACATCATCTCTCTCCTTTACTACTCGCCACAACAAACCTGATCTCTCTCTTTA
GAAAAGAAAAATACCATTTCTCATCTGTATCTTTCTTCTTGATTTCTTTCTCTCCACATA
AAGATCAAACCCCCTCTGTTCTCATCTAGATTCATAAGAACAGAATATGTCATGATGATG
AGAAAAGAAGATCTGGGTTTGAGCCTGAGCCTAGGACTTTCACAAGATCACACACCTCTT
CAGCTGAGTCAGAATCCTAACTCGTCCATATCCAACAATCTCCCTAGATTTCCATGGAAC
CAAACATTCGCTTCTTCATCGGATCTTGGCAAAATAGACGTGAACAGTATTCCAACAACG
GTGGATTGCGAGGAGGAAGCAGGAGTGTCATCTCCTAAAAGTACGATCTCGAGCACCATA
AGCGGCGGGAAAAGGAGTGAGAGAGAAGGAATCTCCGACCACCACGATGATATCACTCCG
GATAGAGGTTACTCGCGTGGAACCTCCGATGAAGAAGAAGACGGCGGTGAAACCTCGAGG
AAGAAGCTCCGATTATCAAAAGATCAGTCTGCTTTTCTTGAAGAGACTTTCAAAGAACAC
AACACTCTCAATCCCAAACAGAAGTTAGCTTTGGCCAAGAAGTTGAGCTTGACAGCAAGA
CAAGTGGAAGTCTGGTTTCAGAACAGAAGAGCTAGAACCAAATTAAAGCAAA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2AT29JQ 261 0 0
GATCATTT
TGCTTTTCTTGAAGAGACTTTCAAAGAACACAACACTCTCAATCCCAAACAGAAGTTAGT
TTTGGCCAAGAAGTTGAACTTGACAGCAAGACAAGTGGAAGTCTGGTTTCAGAACAGAAG
AGCTAGAACCAAATTAAAGCAAACGGAGGTGGATTGTGAATACTTGAAACGATGGGTAGA
GAAACTAACGGAGGAGAATAGGCGGCTTCAGAAAGAGGCTATGGAGCTTCGAACTCTCAA
GCTGTCTCCACGA

QA 9 261 9 261
DS 



AS 1 6

CO CL1528Contig1 663 6 12 U
TTTTCGAACAAAAACACCTTTATTATTTCATCAATAAAACATGTAACGGATTACAAACAG
TAGATAATAATTTCTTTCTCAAAAGAAAAACAATAGATGGTAGTAGAATAAAACAAGAAA
TTTTGAAATTACACGAAATTTTGAAACAAGAATCGTATTTTAGTGATAATTTAGAACATC
GATCCAAAAACGTGCTATCTCTAAGCACATTGGAAACCAGATGGAACCTTCGTACCACAC
TGGTTAAAGAGAACACTCAGTGAAATAGGAACACGAAGATTAATGCCAAGGACATTAGCC
TTCAAAGCGGTACAGAGACAGACCCCGGCATCGAGATTAACTAGACCTTTGATAAGGGCG
CAACATTCGGCCTTTTCTGGTAGAGAAACCTTAACCAAATTCAAGACGTTGGCACATACC
TTGAGTTTAAGAATATCTTTGCAAGTTGGTTTGGTGTAAGGAGACGACGGTGCGGGTTTC
TTGTTATGGCTTTTGGGCGGTGGTGGTGAACAAGGGGCCGTAGAGCTAACCAAAGTGAAG
AAGATGACATTCAAAACAAGGAGAAGAGCAATCTTAGAGTAAGCCATTGATGAAAGAGTA
AAGTTTTAAGAGTTTTCTCTTAGAAAGTTATCTCTCTTTATCAAGCTTGTGATGTTGTGT
CCC


BQ
10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 30 10 

AF RR2ET37JQ U 6
AF RR2ET37TF C 12
AF RR2BG35TF C 1
AF RR2BG35JQ U 5
AF RR2B471JQ U 6
AF RR2B471TF C 6
BS 1 5 RR2BG35TF
BS 6 266 RR2BG35JQ
BS 267 267 RR2ET37JQ
BS 268 381 RR2BG35JQ
BS 382 382 RR2ET37JQ
BS 383 433 RR2BG35JQ
BS 434 434 RR2ET37JQ
BS 435 485 RR2BG35JQ
BS 486 486 RR2ET37JQ
BS 487 515 RR2BG35JQ
BS 516 516 RR2ET37JQ
BS 517 663 RR2BG35JQ

RD RR2ET37JQ 615 0 0
GAACAAAAACACCTTTATTATTTCATCAATAAAACATGTAACGGATTACAAACAGTAGAT
AATAATTTCTTTCTCAAAAGAAAAACAATAGATGGTAGTAGAATAAAACAAGAAATTTTG
AAATTACACGAAATTTTGAAACAAGAATCGTATTTTAGTGATAATTTAGAACATCGATCC
AAAAACGTGCTATCTCTAAGCACATTGGAAACCAGATGGAACCTTCGTACCACACTGGTT
AAAGAGAACACTCAGTGAAATAGGAACACGAAGATTAATGCCAAGGACATTAGCCTTCAA
AGCGGTACAGAGACAGACCCCGGCATCGAGATTAACTAGACCTTTGATAAGGGCGCAACA
TTCGGCCTTTTCTGGTAGAGAAACCTTAACCAAATTCAAGACGTTGGCACATACCTTGAG
TTTAAGAATATCTTTGCAAGTTGGTTTGGTGTAAGGAGACGACGGTGCGGGTTTCTTGTT
ATGGCTTTTGGGCGGTGGTGGTGAACAAGGGGCCGTAGAGCTAACCAAAGTGAAGAAGAT
GACATTCAAAACAAGGAGAAGAGCAATCTTAGAGTAAGCCATTGATGAAAGAGTAAAGTT
TTAAGAGTTTTCTCT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2ET37TF 652 0 0
AAACACCTTTATTATTTCATCAATAAAACATGTAACGGATTACAAACAGTAGATAATAAT
TTCTTTCTCAAAAGAAAAACAATAGATGGTAGTAGAATAAAACAAGAAATTTTGAAATTA
CACGAAATTTTGAAACAAGAATCGTATTTTAGTGATAATTTAGAACATCGATCCAAAAAC
GTGCTATCTCTAAGCACATTGGAAACCAGATGGAACCTTCGTACCACACTGGTTAAAGAG
AACACTCAGTGAAATAGGAACACGAAGATTAATGCCAAGGACATTAGCCTTCAAAGCGGT
ACAGAGACAGACCCCGGCATCGAGATTAACTAGACCTTTGATAAGGGCGCAACATTCGGC
CTTTTCTGGTAGAGAAACCTTAACCAAATTCAAGACGTTGGCACATACCTTGAGTTTAAG
AATATCTTTGCAAGTTGGTTTGGTGTAAGGAGACGACGGTGCGGGTTTCTTGTTATGGCT
TTTGGGCGGTGGTGGTGAACAAGGGGCCGTAGAGCTAACCAAAGTGAAGAAGATGACATT
CAAAACAAGGAGAAGAGCAATCTTAGAGTAAGCCATTGATGAAAGAGTAAAGTTTTAAGA
GTTTTCTCTTAGAAAGTTATCTCTCTTTATCAAGCTTGTGATGTTGTGT
GGC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2BG35TF 663 0 0
TTTTCGAACAAAAACACCTTTATTATTTCATCAATAAAACATGTAACGGATTACAAACAG
TAGATAATAATTTCTTTCTCAAAAGAAAAACAATAGATGGTAGTAGAATAAAACAAGAAA
TTTTGAAATTACACGAAATTTTGAAACAAGAATCGTATTTTAGTGATAATTTAGAACATC
GATCCAAAAACGTGCTATCTCTAAGCACATTGGAAACCAGATGGAACCTTCGTACCACAC
TGGTTAAAGAGAACACTCAGTGAAATGGGAACACGAAGATTAATGCCAAGGACATTAGCC
TTCAAAGCGGTACAGAGACAGACCCCGGCATCGAGATTAACTAGACCTTTGATAAGGGCG
CAACATTCGGCCTTTTCTGGTGGAGAAACCTTAACCAAATTCAAGACGTTGGCACATACC
TTGAGTTTAAGAACATCTTTGCAAGTTGGTTTGGTGTAAGGAGACGACGGTGCGGGTTTC
TTGTTGTGGCTTTTGGGCGGTGGTGGTGAACAAGGAGCCGTAGAGCTAACCAAAGTGAAG
AAGATGACATTCAAAACAAGGAGAAGAGCAATCTTAGAGTAAGCCATTGATGAAAGAGTA
AAGTTTTAAGAGTTTTCTCTTAGAAAGTTATCTCTCTTTATCAAGCTTGTGATGTTGTGT
CC
C

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2BG35JQ 659 0 0
C
GAACAAAAACACCTTTATTATTTCATCAATAAAACATGTAACGGATTACAAACAGTAGAT
AATAATTTCTTTCTCAAAAGAAAAACAATAGATGGTAGTAGAATAAAACAAGAAATTTTG
AAATTACACGAAATTTTGAAACAAGAATCGTATTTTAGTGATAATTTAGAACATCGATCC
AAAAACGTGCTATCTCTAAGCACATTGGAAACCAGATGGAACCTTCGTACCACACTGGTT
AAAGAGAACACTCAGTGAAATGGGAACACGAAGATTAATGCCAAGGACATTAGCCTTCAA
AGCGGTACAGAGACAGACCCCGGCATCGAGATTAACTAGACCTTTGATAAGGGCGCAACA
TTCGGCCTTTTCTGGTGGAGAAACCTTAACCAAATTCAAGACGTTGGCACATACCTTGAG
TTTAAGAACATCTTTGCAAGTTGGTTTGGTGTAAGGAGACGACGGTGCGGGTTTCTTGTT
GTGGCTTTTGGGCGGTGGTGGTGAACAAGGAGCCGTAGAGCTAACCAAAGTGAAGAAGAT
GACATTCAAAACAAGGAGAAGAGCAATCTTAGAGTAAGCCATTGATGAAAGAGTAAAGTT
TTAAGAGTTTTCTCTTAGAAAGTTATCTCTCTTTATCAAGCTTGTGATGTTGTGTCCC

QA 2 659 2 659
DS 

RD RR2B471JQ 657 0 0
GAACAAAAACACCTTTATTATTTCATCAATAAAACATGTAACGGATTACAAACAGTAGAT
AATAATTTCTTTCTCAAAAGAAAAACAATAGATGGTAGTAGAATAAAACAAGAAATTTTG
AAATTACACGAAATTTTGAAACAAGAACCGTATTTTAGTGATAATTTAGAACATCGATCC
AAAAACGTGCTATCTCTAAGCACATTGGAAACCAGATGGAACCTTCGTGCCACACTGGTT
AAAGAGAACACTCAGTGAAATAGGAGCACGAAGATTAATGCCAAGGACATTAGCCTTCAA
AGCGGTACAGAGACAGACCCCGGCATCGAGATTAACTAGACCTTTGATAAGGGCGCAACA
TTCGGCCTTTTCTGGTAGAGAAACCTTAACCAAATTCAAGACGTTGGCACATACCTTGAG
TTTAAGAATATCTTTGCAAGTTGGTTTGGTGTAAGGAGACGACGGTGCGGGTTTCTTGTT
ATGGCTTTTGGGCGGTGGTGGTGAACAAGGGGCCGTAGAGCTAACCAAAGTGAAGAAGAT
GACATTCAAAACAAGGAGAAGAGCAATCTTAGAGTAAGCCATTGATGAAAGAGTAAAGTT
TTAAGAGTTTTCTCTTAGAAAGTTATCTCTCTTTATCAAGCTTGTGATGTTGTGTCC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2B471TF 657 0 0
GAACAAAAACACCTTTATTATTTCATCAATAAAACATGTAACGGATTACAAACAGTAGAT
AATAATTTCTTTCTCAAAAGAAAAACAATAGATGGTAGTAGAATAAAACAAGAAATTTTG
AAATTACACGAAATTTTGAAACAAGAACCGTATTTTAGTGATAATTTAGAACATCGATCC
AAAAACGTGCTATCTCTAAGCACATTGGAAACCAGATGGAACCTTCGTGCCACACTGGTT
AAAGAGAACACTCAGTGAAATAGGAGCACGAAGATTAATGCCAAGGACATTAGCCTTCAA
AGCGGTACAGAGACAGACCCCGGCATCGAGATTAACTAGACCTTTGATAAGGGCGCAACA
TTCGGCCTTTTCTGGTAGAGAAACCTTAACCAAATTCAAGACGTTGGCACATACCTTGAG
TTTAAGAATATCTTTGCAAGTTGGTTTGGTGTAAGGAGACGACGGTGCGGGTTTCTTGTT
ATGGCTTTTGGGCGGTGGTGGTGAACAAGGGGCCGTAGAGCTAACCAAAGTGAAGAAGAT
GACATTCAAAACAAGGAGAAGAGCAATCTTAGAGTAAGCCATTGATGAAAGAGTAAAGTT
TTAAGAGTTTTCTCTTAGAAAGTTATCTCTCTTTATCAAGCTTGTGATGTTGTGTCC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 6

CO CL1529Contig1 1227 6 14 U
TTTTTTCTCTCTCCCCCCTCTTCCATTCACTTCTCTCTCCCTCCTCTTCTATTCTTCATG
GCCATTATCAAGCTTCCTAACCTCCCACCAGATCTGCTCGTTGTGCTCTGTCTCTCTGAA
AGTGAGCCTCCTCGACTGTTCCCTTCATCGATCGCTTAGGATGAAAAATCTCTTGCCGCC
CTAATTGATACTCTAAAGGACTTCTCCGCTCCACCCTCTTCAGCTCCTCTGAAAAAATCG
AACAGGCAGAATGTTCAATATGCAAAAGCTCCAAACAACGCTCCACAGGCTTTGCTTGTT
TTGTGGTCAAATCGACCAAGATCCTCTCTCCCTAATTGTTTCTTCATGTTCTTGATTTTT
TTCCTTAACTTTCTAAACCTTTTCTGGTGCTCTTGCTAGTGTGATTGTTGAGGCTATGAA
AGTTGTCAGCTTGCAGAGGCTCTGCTCCTCTCTGAAACCTATTCACCGTCGAGTTCTAGA
GAGCGAGAAACTTTGAAATTATTAGCCGTCTACGACGAAGAAGATGACCGGAGGAGGCAG
ATACGGCGGCGCATCAGGTAAACTCGTACGCTCATCAATGAAGAGAGAAGAGCGTCAAGG
CAGATCTGGGATACCACCGGTTAATAAAGTTCTATGCGAGGTGCAGAGGCTAAAGCTGCT
TGCCCTGAGATGCAGTTGGTTCAAGTTCCTGTGTCTCGTGCAGGGAAGCTACGCAAAGAA
TGGATGTCATGGGAACAATCAAAGTAGAAGAGCAAACTGTTAAAAGGTCCTTCTCAGATA
CAGAGCAACACATTGGCTGCTTTGGAAGCCATTGATGTTCCCGTTGCTGAAGAAGTAATG
GACGCTGGCTGTATCACCGGTGATCGGATTAACGGTCTTGTCGACGGTGTCTCTGGTGCT
TGATTTATCAAGTTTGATACTTTCACTCCTGCGGTGTCACGAGGACTTCCTGTGACTCGG
GTGATATTGTTTTTGGTGTATAGGTTAGGACTAACTTGTTTGGTAGAAGTGAAGCTACTT
ACTCAGGCTACACTTGTTATAGTGGCATTGCAGATTTTGTCGGCTGTTATTGAGTCTGTT
GGGTATGTTGTATTCAAAGCAAAACTCCAATAGAATGACGTTTTTTTCTTAAAAGAGGGG
ACTTAGTGTTTTTGTCTTGTATAGTCAACTGCTAACGTTTATTCTGATTGATTCTTTTAA
ATAATTTTAATAAAATCTCTATTTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ67TF U 11
AF RR2EJ94TF U 39
AF RR2FS41TF U 1
AF RR2CY23TF U 27
AF RR2FS41JQ C 455
AF RR2CY23JQ C 471
BS 1 481 RR2FS41TF
BS 482 482 RR2CY23TF
BS 483 704 RR2FS41TF
BS 705 705 RR2FS41JQ
BS 706 731 RR2FS41TF
BS 732 737 RR2CY23TF
BS 738 738 RR2FS41JQ
BS 739 762 RR2CY23TF
BS 763 772 RR2FS41JQ
BS 773 773 RR2CY23JQ
BS 774 836 RR2FS41JQ
BS 837 837 RR2CY23JQ
BS 838 1186 RR2FS41JQ
BS 1187 1227 RR2CY23JQ

RD RR2AJ67TF 207 0 0
GGCCCTCCTTTTCT
ATTCACTTCTCTCTCCCTCCTCTTCTATTCTTCATGGCCATTATCAAGCTTCCTAACCTC
CCACCAGATCTGCTCGTTGTGCTCTGTCTCTCTGAAAGTGAGCCTCCTCTACTGTTCCCT
TCATCGATCGCTTAGGATGAAAAATCTCTTGCCGCCCTAATTGATACTCTAAAGGACTCC
TCCGCTCCACCCT

QA 15 207 15 207
DS 

RD RR2EJ94TF 394 0 0
CCCTCTTCTTCTATTCTTCATGGCCATTATCAAGCTTCCTAACCTCCCACCAGATCTGCT
CGTTGTGCTCTGTCTCTCTGAAAGTGAGCCTCCTCGACTGTTCCCTTCATCGATCGCTTA
GGATGAAAAATCTCTTGCCGCCCTAATTGATACTCTAAAGGACTTCTCCGCTCCACCCTC
TTCAGCTCCTCTGAAAAAATCGGACAGGCAGAATGTTCAATATGCAAAAGCTCCAAACAA
CGCTCCACAGGCTTTGCTTGTTTTGTGGTCAAATCGACCAAGATCCTCTCTCCCTAATTG
TTTCTTCATGTTCTTGATTTTTTTCCTTAACTTTCTAAACCTTTTCTGGTGCTCTTGCTA
GTGTGATTGTTGAGGCTATGAAAGTTGTCAGCTT

QA 1 394 1 394
DS 

RD RR2FS41TF 731 0 0
TTTTTTCTCTCTCCCCCCTCTTCCATTCACTTCTCTCTCCCTCCTCTTCTATTCTTCATG
GCCATTATCAAGCTTCCTAACCTCCCACCAGATCTGCTCGTTGTGCTCTGTCTCTCTGAA
AGTGAGCCTCCTCGACTGTTCCCTTCATCGATCGCTTAGGATGAAAAATCTCTTGCCGCC
CTAATTGATACTCTAAAGGACTTCTCCGCTCCACCCTCTTCAGCTCCTCTGAAAAAATCG
AACAGGCAGAATGTTCAATATGCAAAAGCTCCAAACAACGCTCCACAGGCTTTGCTTGTT
TTGTGGTCAAATCGACCAAGATCCTCTCTCCCTAATTGTTTCTTCATGTTCTTGATTTTT
TTCCTTAACTTTCTAAACCTTTTCTGGTGCTCTTGCTAGTGTGATTGTTGAGGCTATGAA
AGTTGTCAGCTTGCAGAGGCTCTGCTCCTCTCTGAAACCTATTCACCGTCGAGTTCTAGA
GGGCGAGAAACTTTGAAATTATTAGCCGTCTACGACGAAGAAGATGACCGGAGGAGGCAG
ATACGGCGGCGCATCAGGTAAACTCGTACGCTCATCAATGAAGAGAGAAGAGCGTCAAGG
CAGATCTGGGATACCACCGGTTAATAAAGTTCTATGCGAGGTGCAGAGGCTAAAGCTGCT
TGCCCTGAGATGCAGTTGGTTCAAGTTCCTGTGTCTCGTGCAGG*AAGCTACGCAAAGAA
TGGATGTCATG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2CY23TF 736 0 0
GG
ACTTCTCTCTCCCTCCTCTTCTATTCTTCATGGCCATTATCAAGCTTCCTAACCTCCCAC
CAGATCTGCTCGTTGTGCTCTGTCTCTCTGAAAGTGAGCCTCCTCGACTGTTCCCTTCAT
CGATCGCTTAGGATGAAAAATCTCTTGCCGCCCTAATTGATACTCTAAAGGACTTCTCCG
CTCCACCCTCTTCAGCTCCTCTGAAAAAATCGAACAGGCAGAATGTTCAATATGCAAAAG
CTCCAAACAACGCTCCACAGGCTTTGCTTGTTTTGTGGTCAAATCGACCAAGATCCTCTC
TCCCTAATTGTTTCTTCATGTTCTTGATTTTTTTCCTTAACTTTCTAAACCTTTTCTGGT
GCTCTTGCTAGTGTGATTGTTGAGGCTATGAAAGTTGTCAGCTTGCAGAGGCTCTGCTCC
TCTCTGAAACCTATTCACCGTCGAGTTCTAGAGAGCGAGAAACTTTGAAATTATTAGCCG
TCTACGACGAAGAAGATGACCGGAGGAGGCAGATACGGCGGCGCATCAGGTAAACTCGTA
CGCTCATCAATGAAGAGAGAAGAGCGTCAAGGCAGATCTGGGATACCACCGGTTAATAAA
GTTCTATGCGGGGTGCAGAGGCTAAAGCTGCTTGCCCTGAGATGCAGTTGGTTCAAGTTC
CTGTGTCTCGTGCAGG*AAGCTACGCAAAGAATGGATGTCATGGGAACA*TCAAAGTAGA
AGAGCAAACTGTTA

QA 3 736 3 736
DS 

RD RR2FS41JQ 733 0 0
AAACCTATTCACCGTCGAGTTCTAGAGGGCGAGAAACTTTGAAATTATTAGCCGTCTACG
ACGAAGAAGATGACCGGAGGAGGCAGATACGGCGGCGCATCAGGTAAACTCGTACGCTCA
TCAATGAAGAGAGAAGAGCGTCAAGGCAGATCTGGGATACCACCGGTTAATAAAGTTCTA
TGCGAGGTGCAGAGGCTAAAGCTGCTTGCCCTGAGATGCAGTTGGTTCAAGTTCCTGTGT
CTCGTGCAGGGAAGCTACGCAAAGAATGGATGTCATGGGAACAATCAAAGTAGAAGAGCA
AACTGTTAAAAGGTCCTTTTCAGATACAGAGCAACACATTGGCTGCTTTGGAAGCCATTG
ATGTTCCCGTTGCTGAAGAAGTTATGGACGCTGGCTGTATCACCGGTGATCGGATTAACG
GTCTTGTCGACGGTGTCTCTGGTGCTTGATTTATCAAGTTTGATACTTTCACTCCTGCGG
TGTCACGAGGACTTCCTGTGACTCGGGTGATATTGTTTTTGGTGTATAGGTTAGGACTAA
CTTGTTTGGTAGAAGTGAAGCTACTTACTCAGGCTACACTTGTTATAGTGGCATTGCAGA
TTTTGTCGGCTGTTATTGAGTCTGTTGGGTATGTTGTATTCAAAGCAAAACTCCAATAGA
ATGACGTTTTTTTCTTAAAAGAGGGGACTTAGTGTTTTTGTCTTGTATAGTCAACTGCTA
ACGTTTATTCTG
C

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2CY23JQ 757 0 0
GAGTTCTAGAGAGCGAGAAACTTTGAAATTATTAGCCGTCTACGACGAAGAAGATGACCG
GAGGAGGCAGATACGGCGGCGCATCAGGTAAACTCGTACGCTCATCAATGAAGAGAGAAG
AGCGTCAAGGCAGATCTGGGATACCACCGGTTAATAAAGTTCTATGCGGGGTGCAGAGGC
TAAAGCTGCTTGCCCTGAGATGCAGTTGGTTCAAGTTCCTGTGTCTCGTGCAGGGAAGCT
ACGCAAAGAATGGATGTCATGGGAACAATCAAAGTAGAAGAGCAAACTGTTAAAAGGTCC
TTCTCAGATACAGAGCAACACATTGGCTGCTTTGGAAGCCATTGATGTTCCCGTTGCTGA
AGAAGTAATGGACGCTGGCTGTATCACCGGTGATCGGATTAACGGTCTTGTCGACGGTGT
CTCTGGTGCTTGATTTATCAAGTTTGATACTTTCACTCCTGCGGTGTCACGAGGACTTCC
TGTGACTCGGGTGATATTGTTTTTGGTGTATAGGTTAGGACTAACTTGTTTGGTAGAATT
GAAGCTACTTACTCAGGCTACACTTGTTATAGTGGCATTGCAGATTTTGTCGGCTGTTAT
TGAGTCTGTTGGGTATGTTGTATTCAAAGCAAAACTTCAATAGAATGACGTTTTTTTCTT
AAAAGAGGGGACTTAGTGTTTTTGTCTTGTATAGTCAACTGCTAACGTTTATTCTGATTG
ATTCTTTTAAATAATTTTAATAAAATCTCTATTTAGG

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 5

CO CL1530Contig1 1327 5 7 U
GAGTCTGTCCTCTTTTGTTTGAATTATTGATCTCTCTCTCTCGATTCCGATCGCGAAAAT
ATAATTTGATTGATTATTCAAACGAGGTGAAGATATTATGATGAAGATGCAAATCGGTAT
CCTCGCGCTTCTGGTGACTCTCTCTGCGATTGAAATCGGATTGGCTTCTTCTCCCAACAC
CGTCCCTGCTTTCCTCTGGTCTCCGCATCTCCAGGATGGGAATGAGGGTGTGAATTATCA
GGTCATGTCTGCGAAGGATCTAGTTGACTCTGTTTTCGCTCAAGGAGGATGGTCTAACAT
TCTTTGCTCTGAGAAGAAAGCCGAGCATCCTGTTGTTGATGTTGCATTTGTCTTCATAGG
CAGAGAGTTACTGTCTTCTGATGTTTCTTCCAAACGTAGTTCCCTTGTCAACACATTGAG
TGGTCTCTTTACATCTTCCAACTTCTCATTGGCATTCCCATACATTGCTGCCCCAGAGGA
AGAGAGGATGGAGAGTTTGTTGCTTTCAGGGTTTAAGCAAGCTTGTCCTCACAATGCAGG
AGTCGGCAATATTGTGTTCTCTGATTCTTGCTTTGTTGAGGATGGAACGATTCAGAAACT
ATCAGACCTTCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAAAGAAACAAGGAAAGAAG*
AGAAACTGATTTGGTTGTGCTCTGCTCCGAGGGTTCTGAATCAAAGGGTCAATCACACTC
AGCGCATGAAAGCATCTCCGAGCTTGTTAGTTCTGTAGAACAATCTGGCAGTAAATATAC
AGCTCTTTATGTCTCTGATCCTTATTGGTACACATCCTACAAAACTCTCCAAAGGTTTCT
AGCTGAAAGTGGTACAGGAAACAGCACCGTTGGTGTTGCTACAACCTGTGACGAACTCTG
CAAATTTAAGTCATCACTTTTGGAGGGCATACTAGTGGGAATCGTTTTCCTTCTCATCTT
GATCAGTGGACTTTGTTGTATGGCGGGTATCGATACACCAACCAGATTCGAGACTCCTCA
AGATTCTTGAGCTTGTTGTTGACCCCTTAAAAGAGTCATCCCCACCTTTTGCTTTGCTTT
GCCTTTTTGATTGTGACGGGTCTTTTCTTCTGCATAGTACGTATGGTGAAAAAGGTACTT
ATTACACTACTTTTAAAAACAAAAATTTGCATATGCGATTACAAAGTCCCCCTGTAACAT
TTTATTCATCTTGTTTGTGTCTTTCTTAAACGTTAATAAGTCGATAATGGAGAACGAGTG
AAAACCAGAGACACTGGAACTACTACGTACATTCTTTTATATATAAATGTATGATTTTAT
AGTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB40TF U 19
AF RR2EC14TF U 60
AF RR2FB43TF U 1
AF RR2EC14JQ C 599
AF RR2FB43JQ C 1170
BS 1 144 RR2FB43TF
BS 145 145 RR2EB40TF
BS 146 651 RR2FB43TF
BS 652 652 RR2EC14TF
BS 653 759 RR2FB43TF
BS 760 1242 RR2EC14JQ
BS 1243 1327 RR2FB43JQ

RD RR2EB40TF 194 0 0
GG
GAATTATTGATCTCTCTCTCTCGATTCCGATCGCGAAAATATAATTTGATTGATTATTCA
AACGAGGTGAAGATATTATGATGAAGATGCAAATCGGTATCCTCGCGCTTCTGGTGACTC
TCTCTGCGATTGAAATCGGATTGGCTTCTTCTCCCAACACCGTCCCTGCTTTCCTCTGGT
CTCCGCATCTCC

QA 3 194 3 194
DS 

RD RR2EC14TF 627 0 0
G
ATAATTTGATTGATTATTCAAACGAGGTGAAGATATTATGATGAAGATGCAAATCGGTAT
CCTCGCGCTTCTGGTGACTCTCTCTGCGATTGAAATCGGATTGGCTTCTTCTCCCAACAC
CGTCCCTGCTTTCCTCTGGTCTCCGCATCTCCAGGATGGGAATGAGGGTGTGAATTATCA
GGTCATGTCTGCGAAGGATCTAGTTGACTCTGTTTTCGCTCAAGGAGGATGGTCTAACAT
TCTTTGCTCTGAGAAGAAAGCCGAGCATCCTGTTGTTGATGTTGCATTTGTCTTCATAGG
CAGAGAGTTACTGTCTTCTGATGTTTCTTCCAAACGTAGTTCCCTTGTCAACACATTGAG
TGGTCTCTTTACATCTTCCAACTTCTCATTGGCATTCCCATACATTGCTGCCCCAGAGGA
AGAGAGGATGGAGAGTTTGTTGCTTTCAGGGTTTAAGCAAGCTTGTCCTCACAATGCAGG
AGTCGGCAATATTGTGTTCTCTGATTCTTGCTTTGTTGAGGATGGAACGAT**AGAAACT
ATCAGACCTTCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAAAGAAACAAGGAAAGAAG*
AGAAACTGATTTGGTTGTGCTCTGCT

QA 2 627 2 627
DS 

RD RR2FB43TF 768 0 0
GAGTCTGTCCTCTTTTGTTTGAATTATTGATCTCTCTCTCTCGATTCCGATCGCGAAAAT
ATAATTTGATTGATTATTCAAACGAGGTGAAGATATTATGATGAAGATGCAAATCGGTAT
CCTCGCGCTTCTGGTGACTCTCTCCGCGATTGAAATCGGATTGGCTTCTTCTCCCAACAC
CGTCCCTGCTTTCCTCTGGTCTCCGCATCTCCAGGATGGGAATGAGGGTGTGAATTATCA
GGTCATGTCTGCGAAGGATCTAGTTGACTCTGTTTTCGCTCAAGGAGGATGGTCTAACAT
TCTTTGCTCTGAGAAGAAAGCCGAGCATCCTGTTGTTGATGTTGCATTTGTCTTCATAGG
CAGAGAGTTACTGTCTTCTGATGTTTCTTCCAAACGTAGTTCCCTTGTCAACACATTGAG
TGGTCTCTTTACATCTTCCAACTTCTCATTGGCATTCCCATACATTGCTGCCCCAGAGGA
AGAGAGGATGGAGAGTTTGTTGCTTTCAGGGTTTAAGCAAGCTTGTCCTCACAATGCAGG
AGTCGGCAATATTGTGTTCTCTGATTCTTGCTTTGTTGAGGATGGAACGATTCAGAAACT
ATCAGACCTTCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAAAGAAACAAG*AAAGAAG*
AGAAACTGATTTGGTTGTGCTCTGCTCCGAGGGTTCTGAATCAAAGGGTCAATCACACTC
AGCGCATGAAAGCATCTCCGAGCTTGTTAGTTCTGTAGA
CATCTGGCA

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2EC14JQ 644 0 0
CTATCAGACCTTCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAAAGAAACAAGGAAAGAA
GGAGAAACTGATTTGGTTGTGCTCTGCTCCGAGGGTTCTGAATCAAAGGGTCAATCACAC
TCAGCGCATGAAAGCATCTCCGAGCTTGTTAGTTCTGTAGAACAATCTGGCAGTAAATAT
ACAGCTCTTTATGTCTCTGATCCTTATTGGTACACATCCTACAAAACTCTCCAAAGGTTT
CTAGCTGAAAGTGGTACAGGAAACAGCACCGTTGGTGTTGCTACAACCTGTGACGAACTC
TGCAAATTTAAGTCATCACTTTTGGAGGGCATACTAGTGGGAATCGTTTTCCTTCTCATC
TTGATCAGTGGACTTTGTTGTATGGCGGGTATCGATACACCAACCAGATTCGAGACTCCT
CAAGATTCTTGAGCTTGTTGTTGACCCCTTAAAAGAGTCATCCCCACCTTTTGCTTTGCT
TTGCCTTTTTGATTGTGACGGGTCTTTTCTTCTGCATAGTACGTATGGTGAAAAAGGTAC
TTATTACACTACTTTTAAAAACAAAAATTTGCATATGCGATTACAAAGTCCCCCTGTAAC
ATTTTATTCATCTTGTTTGTGTCTTTCTTAAACGTTAATAAGTC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2FB43JQ 158 0 0
CATATGCGATTACAAAGTCCCCTTGTAACATTTTATTCATCTTGTTTGTGTCTTTCTTAA
ACGTTAATAAGTCGATAATGGAGAACGAGTGAAAACCAGAGACACTGGAACTACTACGTA
CATTCTTTTATATATAAATGTATGATTTTATAGTTTAT

QA 1 158 1 158
DS 



AS 1 5

CO CL1531Contig1 823 5 13 U
GGATAGCACGAGATACTTTTCGCAGAAACCTAGAGATTGTGTATTCTCTGGATCCGATCT
GTTCGCCATGGAAGATAAGAAGGCAGAATCAACCAACAAGAACGTTAAGAAGGCAAATCT
GCTTGAGCACAACTCGATCAAGCACATCCTCGACGAGTCCGTCTCTGACATCGTGAAGAG
CCGTGGATACAAGGAGGATGTGAGGCTGAGCAACCTGAAACTGATCTTAGGGACGGTTAT
CATCGTGGTTGCTCTCGTTGCGCAGTTCTACAACAAGAAGTTTCCGGAGAACAGAGACTT
TTTGATCGGATGCATCGCATCGTATGTGGTGCTGAATGGGGTGTTGCAGCTGATTCTGTA
CACTAAGGAGAAGAATGCCATTTTGTTCACCTATCCTCCTGAGGGATCATTCACCAGCAC
TGGATTAGTTGTGTCTTCAAAGCTGCCGAGATTCTCTGATGAGTACACTCTCACCATTGA
CAGTGCTGATCCAAAATCGATCTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAACTCACCAAAAGTGTCAC
TCAATGGTTCACGAAAGATGGAGTTCTTGTTGAGGGTTTGTTTTGG*AAAGACGTGGAAG
CATTGATCAAGGACTATTCAAAAGAAGAAGAACCAAAGAAGAAGAAATGATGATTATGTT
ATGGAGAAAATAATGTTCTTTAAAACTCCTAAATGTTTCGTTTTAGACTACTAAAATTCA
ATGGCGACATTTGGTTAGAGATGACATCAATATTCCCGATAAGAATATTCCAGTTTTTTT
CTGTTATAACAAAACGAATCGAATTTTATCTGAGATTGTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2GP07TF U 1
AF RR2F177TF U 53
AF RR2F177JQ C 53
AF RR2F012JQ C 99
AF RR2F012TF U 99
BS 1 164 RR2GP07TF
BS 165 166 RR2F177TF
BS 167 586 RR2GP07TF
BS 587 587 RR2F177TF
BS 588 684 RR2GP07TF
BS 685 685 RR2F177TF
BS 686 707 RR2GP07TF
BS 708 708 RR2F012TF
BS 709 710 RR2GP07TF
BS 711 711 RR2F012TF
BS 712 716 RR2GP07TF
BS 717 821 RR2F012TF
BS 822 823 RR2F012JQ

RD RR2GP07TF 717 0 0
GGATAGCACGAGATACTTTTCGCAGAAACCTAGAGATTGTGTATTCTCTGGATCCGATCT
GTTCGCCATGGAAGATAAGAAGGCAGAATCAACCAACAAGAACGTTAAGAAGGCAAATCT
GCTTGAGCACAACTCGATCAAGCACATCCTCGACGAGTCCGTCT**GACATCGTGAAGAG
CCGTGGATACAAGGAGGATGTGAGGCTGAGCAACCTGAAACTGATCTTAGGGACGGTTAT
CATCGTGGTTGCTCTCGTTGCGCAGTTCTACAACAAGAAGTTTCCGGAGAACAGAGACTT
TTTGATCGGATGCATCGCATCGTATGTGGTGCTGAATGGGGTGTTGCAGCTGATTCTGTA
CACTAAGGAGAAGAATGCCATTTTGTTCACCTATCCTCCTGAGGGATCATTCACCAGCAC
TGGATTAGTTGTGTCTTCAAAGCTGCCGAGATTCTCTGATGAGTACACTCTCACCATTGA
CAGTGCTGATCCAAAATCGATCTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAACTCACCAAAAGTGTCAC
TCAATGGTTCACGAAAGATGGAGTTCTTGTTGAGGGTTTGTTTTGGGAAAGACGTGGAAG
CATTGATCAAGGACTATTCAAAAGAAGAAGAACCAAAGAAGAAGAAATGATGATTATGTT
ATGGAGAAAATAATGTTCTTTAAA*CTCCTAAATGTTTCGTTTTAGATTATTAAAA
A

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2F177TF 665 0 0
G
CCGATCTGTTCGCCATGGAAGATAAGAAGGCAGAATCAACCAACAAGAACGTTAAGAAGG
CAAATCTGCTTGAGCACAACTCGATCAAGCACATCCTCGACGAGTCCGTCTCTGACATCG
TGAAGAGCCGTGGATACAAGGAGGATGTGAGGCTGAGCAACCTGAAACTGATCTTAGGGA
CGGTTACCATCGTGGTTGCTCTCGTTGCGCAGTTCTACAACAAGAAGTTTCCGGAGAACA
GAGACTTTTTGATCGGATGCATCGCATCGTATGTGGTGCTGAATGGGGTGTTGCAGCTGA
TTCTGTACACTAAGGAGAAGAATGCCATTTTGTTCACCTATCCTCCTGAGGGATCATTCA
CCAGCACTGGATTAGTTGTGTCTTCAAAGCTGCCGAGATTCTCTGATGAGTACACTCTCA
CCATTGACAGTGCTGATCCAAAATCGATCTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAACTCACCAAAA
GTGTCACTCAATGGTTCGCGAAAGATGGAGTTCTTGTTGAGGGTTTGTTTTGG*AAAGAC
GTGGAAGCATTGATCAAGGACTATTCAAAAGAAGAAGAACCAAAGAAGAAGAAATGATGA
TTATGTTATGGAGAAAATAATGTTCTTTAAAACTCCTAAATGTTTCGTTTTA
GATTATTAAAAA

QA 2 653 2 653
DS 

RD RR2F177JQ 704 0 0
G
CCGATCTGTTCGCCATGGAAGATAAGAAGGCAGAATCAACCAACAAGAACGTTAAGAAGG
CAAATCTGCTTGAGCACAACTCGATCAAGCACATCCTCGACGAGTCCGTCTCTGACATCG
TGAAGAGCCGTGGATACAAGGAGGATGTGAGGCTGAGCAACCTGAAACTGATCTTAGGGA
CGGTTACCATCGTGGTTGCTCTCGTTGCGCAGTTCTACAACAAGAAGTTTCCGGAGAACA
GAGACTTTTTGATCGGATGCATCGCATCGTATGTGGTGCTGAATGGGGTGTTGCAGCTGA
TTCTGTACACTAAGGAGAAGAATGCCATTTTGTTCACCTATCCTCCTGAGGGATCATTCA
CCAGCACTGGATTAGTTGTGTCTTCAAAGCTGCCGAGATTTTCTGATGAGTACACTCTCA
CCATTGACAGTGCTGATCCAAAATCGATTTCAGCTGGGAAGTCAGTCCAACTCACCAAAA
GTGTCACTCAATGGTTCGCGAAAGATGGAGTTCTTGTTGAGGGTTTGTTTTGG*AAAGAC
GTGGAAGCATTGATCAAGGACTATTCAAAAGAAGAAGAACCAAAGAAGAAGAAATGATGA
TTATGTTATGGAGAAAATAATGTTCTTTAAAACTCCTAAATGTTTCGTTTTAGATTATTA
AAAATCAACGGCGACATTTGGTTAGAGATGACATTAATATTCC

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR2F012JQ 725 0 0
G
GAACGTTAAGAAGGCAAATCTGCTTGAGCACAACTCGATCAAGCACATCCTCGACGAGTC
CGTCTCTGACATCGTGAAGAGCCGTGGATACAAGGAGGATGTGAGGCTGAGCAACCTGAA
ACTGATCTTAGGGACGGTTATCATCGTGGTTGCTCTCGTTGCGCAGTTCTACAACAAGAA
GTTTCCGGAGAACAGAGACTTTTTGATCGGATGCATCGCATCGTATGTGGTGCTGAATGG
GGTGTTGCAGCTGATTCTGTACACTAAGGAGAAGAATGCCATTTTGTTCACCTATCCTCC
TGAGGGATCATTCACCAGCACTGGATTAGTTGTGTCTTCAAAGCTGCCGAGATTCTCTGA
TGAGTACACTCTCACCATTGACAGTGCTGATCCAAAATCGATCTCAGCTGGGAAGTCAGT
CCAACTCACCAAAAGTGTCACTCAATGGTTCACGAAAGATGGAGTTCTTGTTGAGGGTTT
GTTTTGG*AAAGACGTGGAAGCATTGATCAAGGACTATGCAAAAGAAGAAGAACCAAAGA
AGAAGAAATGATGATTATATTATGGAGAAAATAATGTTCTTTAAAACTTCTAAATGTTTC
GTTTTATACTACTAAAATTCAATGGCGACATTTGGTTAGAGATGACATCAATATTCCCGA
TAAGAATATTCCAGTTTTTTTCTGTTATAACAAAACGAATCGAATTTTATCTGAGATTGT
GGAC

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR2F012TF 723 0 0
G
GAACGTTAAGAAGGCAAATCTGCTTGAGCACAACTCGATCAAGCACATCCTCGACGAGTC
CGTCTCTGACATCGTGAAGAGCCGTGGATACAAGGAGGATGTGAGGCTGAGCAACCTGAA
ACTGATCTTAGGGACGGTTATCATCGTGGTTGCTCTCGTTGCGCAGTTCTACAACAAGAA
GTTTCCGGAGAACAGAGACTTTTTGATCGGATGCATCGCATCGTATGTGGTGCTGAATGG
GGTGTTGCAGCTGATTCTGTACACTAAGGAGAAGAATGCCATTTTGTTCACCTATCCTCC
TGAGGGATCATTCACCAGCACTGGATTAGTTGTGTCTTCAAAGCTGCCGAGATTCTCTGA
TGAGTACACTCTCACCATTGACAGTGCTGATCCAAAATCGATCTCAGCTGGGAAGTCAGT
CCAACTCACCAAAAGTGTCACTCAATGGTTCACGAAAGATGGAGTTCTTGTTGAGGGTTT
GTTTTGG*AAAGACGTGGAAGCATTGATCAAGGACTATGCAAAAGAAGAAGAACCAAAGA
AGAAGAAATGATGATTATATTATGGAGAAAATAATGTTCTTTAAAACTTCTAAATGTTTC
GTTTTATACTACTAAAATTCAATGGCGACATTTGGTTAGAGATGACATCAATATTCCCGA
TAAGAATATTCCAGTTTTTTTCTGTTATAACAAAACGAATCGAATTTTATCTGAGATTGT
GG

QA 2 723 2 723
DS 



AS 1 3

CO CL1532Contig1 1589 3 15 U
TTCAAAGATGATGCTAGCGAAGAGAAAGGAGAACGCGCCAGGATGGCATCATTCATTGGT
GCAATGGCTGCAGAGTGTGCTCGTGATGCTTTGCTGAAAAGGAGTAATTGATAATAAGGA
GAATGCAGAGAAGTTTAGGTCAGACTTGATGAAGATTGCAATGACTACGTTATGCTCCAA
AATTCTCTCGCAAGACAAGGAACACTTTGCAGAAATGGCTGTGGATGCTGTTTTCAGGCT
GAAGGGAAGCACAAATTTGGAAGCTATTCAAATCATCAAAAAACCTGTAGGGTCACTGAG
GGATTCCTTTCTGGATGAAGGATTTATTCTTGACAAGAAGATCGGAATTGGGCAGCCAAA
GCGAATCGAAAACGCAAAGATCTTGGTAGCAAACACTGCAATGGACACTGATAAAGTGAA
AATTTATGGTGCACGTGTCCGTGTGGATTCTATGACCAAGGTTGCCCAGATCGAAGGGGC
GGAGAAGGAAAAGATGAAAGACAAGGTGAACAAGATACTAGCCCACGGTGTCAACTGCTT
TGTTAACAGGCAGCTGATCTACAATTTCCCCGAGGAACTCTTCGCAGACGCTGGTGTACT
TGCTATTGAGCATGCTGACTTCGAAGGAATAGAGCGTCTTGGTTTGGTCACAGGCGGTGA
AATCGCTTCGACCTTTGACAACCCAGAATCTGTCAAGCTTGGACATTGCAAGCTCATCGA
AGAGATCATGATTGGTGAAGACAAGCTGATCCATTTCTCCGGTGTTGAGATGGGCCAGGC
TTGTTCAATTGTCCTAAGGGGTGCTAGTCACCATGTTCTAGACGAGGCTGAAAGATCACT
CCACGATGCACTGTGTGTTCTCTCCCAAACAGTGAATGACAGTAGAGTCTTGCTCGGAGG
TGGATGGCCAGAGATGGTGATGGCGAAAGAAGTAGATGAGCTTGCGAGGAAAACTGCTGG
CAAAAAGTCTCACGCCATTGAAGCTTTCTCACGGGCTCTAGTGGCTATACCGACAACAAT
CGCAGACAATGCTGGTTTAGACAGTGCAGAGTTGGTGGCTCAGCTTCGTGCAGAATACCA
CACTGAAGGGTGTAACGCCGGGATCGACGTCATCTCGGGAGCTGTAGGAGATATGGAGGA
AAGAGGAATCTATGAAGCATTCAAAGTGAAGCAAGCGGTTCTGCTTTCAGCGACAGAAGC
AGCTGAGATGATACTGCGAGTGGATGAGATCATTACATGTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGA
CAGGATGTGAAAACACATCACGTGCACATGGTGGGAGATAGATTTCATGATTAGACCACC
ATACCCTCCTCCCCAGCGATCATGTTCGACGCATTGGATTGTGTTTTCGATTTGGATCAG
AAAACAGCTTTAAATGTTTTAATGTTTTGCTTCTTAAACTTTGTTTGTTTTCTAAATCCG
AATATTGTTTTGATTATGTTTTCAGAGGTGTTTCGACAAAATGTGTTTCTAGGAGTTAAA
CTTGTCCTCTAGTAACTTCACCTATTTCATATTCTCGACCATTATGGCCACATGCATACA
AGATACTAAATTTCCACTAATATTAATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A073TF U 1
AF RR2G371TF U 285
AF RR2G371JQ C 797
BS 1 366 RR2A073TF
BS 367 367 RR2G371TF
BS 368 405 RR2A073TF
BS 406 406 RR2G371TF
BS 407 438 RR2A073TF
BS 439 439 RR2G371TF
BS 440 458 RR2A073TF
BS 459 899 RR2G371TF
BS 900 900 RR2G371JQ
BS 901 965 RR2G371TF
BS 966 966 RR2G371JQ
BS 967 1015 RR2G371TF
BS 1016 1016 RR2G371JQ
BS 1017 1062 RR2G371TF
BS 1063 1589 RR2G371JQ

RD RR2A073TF 458 0 0
TTCAAAGATGATGCTAGCGAAGAGAAAGGAGAACGCGCCAGGATGGCATCATTCATTGGT
GCAATGGCTGCAGAGTGTGCTCGTGATGCTTTGCTGAAAAGGAGTAATTGATAATAAGGA
GAATGCAGAGAAGTTTAGGTCAGACTTGATGAAGATTGCAATGACTACGTTATGCTCCAA
AATTCTCTCGCAAGACAAGGAACACTTTGCAGAAATGGCTGTGGATGCTGTTTTCAGGCT
GAAGGGAAGCACAAATTTGGAAGCTATTCAAATCATCAAAAAACCTGTAGGGTCACTGAG
GGATTCCTTTCTGGATGAAGGATTTATTCTTGACAAGAAGATCGGAATTGGGCAGCCAAA
GCGAATTGAAAACGCAAAGATCTTGGTAGCAAACACTGCAATGGATACTGATAAAGTGAA
AATTTATGGTGCACGTGTGCGTGTGGATTCTATGACCA

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2G371TF 778 0 0
GTGGAGGTTCT
CTGAGGGATTCCTTTCTGGATGAAGGATTTATTCTTGACAAGAAGATCGGAATTGGGCAG
CCAAAGCGCATCGAAAACGCAAAGATCTTGGTAGCAAACACTGCAATGGACACTGATAAA
GTGAAAATTTATGGTGCACGTGTCCGTGTGGATTCTATGACCAAGGTTGCCCAGATCGAA
GGGGCGGAGAAGGAAAAGATGAAAGACAAGGTGAACAAGATACTAGCCCACGGTGTCAAC
TGCTTTGTTAACAGGCAGCTGATCTACAATTTCCCCGAGGAACTCTTCGCAGACGCTGGT
GTACTTGCTATTGAGCATGCTGACTTCGAAGGAATAGAGCGTCTTGGTTTGGTCACAGGC
GGTGAAATCGCTTCGACCTTTGACAACCCAGAATCTGTCAAGCTTGGACATTGCAAGCTC
ATCGAAGAGATCATGATTGGTGAAGACAAGCTGATCCATTTCTCCGGTGTTGAGATGGGC
CAGGCTTGTTCAATTGTCCTAAGGGGTGCTAGTCACCATGTTCTAGACGAGGCTGAAAGA
TCACTCCACGATGCACTGTGTGTTCTCTCCCAAACAGTGAATGACAGTAGAGTCTTGCTC
GGAG*TGGATGGCCAGAGATGGTGATGGCGAAAGAAGTAGATGAGCTTGCGAGGAAAACT
GCTGGCAAAA*GTCTCACGCCATTGAAGCTTTCTCACGGGCTCTAGTGGCTATACCGACA
*CAATCGCAGACAATGCTGGTTTAGACAGTGCAGAGTTGGTGGCTCA

QA 12 778 12 778
DS 

RD RR2G371JQ 793 0 0
AGGGGTGCT
AGTCACCATGTTCTAGACGAGGCTGAAAGATCACTCCACGATGCACTGTGTGTTCTCTCC
CAAACAGTGAATGACAGTAGAGTCTTGCTCGGAGGTGGATGGCCAGAGATGGTGATGGCG
AAGGAAGTAGATGAGCTTGCGAGGAAAACTGCTGGCAAAAAGTCTCACGCCATTGAAGCT
TTCTCACGGGCTTTAGTGGCTATACCGACAACAATCGCAGACAATGCTGGTTTAGACAGT
GCAGAGTTGGTGGCTCAGCTTCGTGCAGAATACCACACTGAAGGGTGTAACGCCGGGATC
GACGTCATCTCGGGAGCTGTAGGAGATATGGAGGAAAGAGGAATCTATGAAGCATTCAAA
GTGAAGCAAGCGGTTCTGCTTTCAGCGACAGAAGCAGCTGAGATGATACTGCGAGTGGAT
GAGATCATTACATGTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGACAGGATGTGAAAACACATCACGTGC
ACATGGTGGGAGATAGATTTCATGATTAGACCACCATACCCTCCTCCCCAGCGATCATGT
TCGACGCATTGGATTGTGTTTTCGATTTGGATCAGAAAACAGCTTTAAATGTTTTAATGT
TTTGCTTCTTAAACTTTGTTTGTTTTCTAAATCCGAATATTGTTTTGATTATGTTTTCAG
AGGTGTTTCGACAAAATGTGTTTCTAGGAGTTAAACTTGTCCTCTAGTAACTTCACCTAT
TTCATATTCTCGACCATTATGGCCACATGCATACAAGATACTAAATTTCCACTAATATTA
ATTG

QA 10 793 10 793
DS 



AS 1 6

CO CL1533Contig1 657 6 9 U
GGAGGTTTTGGTGGGAGGTAAAGAAGCAAAAAAATCAATGGGGCAGGAGGAAGCAAAGAT
CTTCACTCTTTCAGAAGTTTCAGAGCACAATCACGCTCATGACTGCTGGATCGTCATCAA
TGCAAAGGTGTACAATGTAACCAAGTTCCTTGAAGACCATCCAGGTGGAGATGAAGTTCT
CCTGTCTTCAACAGGTAAGGATGCAACGGATGATTTTGAGGACGTGGGGCATAGCGAGAG
CGCGAGAGAGATGATGGAACAATACTACGTAGGAGAGATCGATCCGACAACAATCCCGAA
GAAAACCAAGTACACACCTCCTAAACAGCCTCACTACAACCAAGACAAGACCTCTGAGTT
CATTATCAAGATCCTCCAGTTCCTCGTTCCCATTGCCATTCTCGGTTTGGCAGTTGGGAT
TCGTATCTACACCAAGTCAGGATAGTAGTCTTCTTTTTCATATCTTCTATATAT**AAAA
AGAGAGAGATTTAAGTCTTCTGAGAAGACAAATCTCGAAGTCTCTGTTCCTATCTTTTGT
TGTGTGAACGTGTTTTGTATTAATGTTTCTTACGTGTTGTGATGAAGTTGCATCTAAACA
AGCAGTCTTGCAGAAATGCAGCTGATATTGATCTAATATAGTTCATATTATGAAACC


BQ
10 10 10 10 10 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RR2A230JQ C 1
AF RR2A230TF U 1
AF RR2F394TF U 1
AF RR2G983JQ C 6
AF RR2FL46TF U 77
AF RR2G983TF U 6
BS 1 5 RR2A230JQ
BS 6 57 RR2A230TF
BS 58 58 RR2F394TF
BS 59 195 RR2A230TF
BS 196 196 RR2F394TF
BS 197 425 RR2A230TF
BS 426 426 RR2F394TF
BS 427 656 RR2A230TF
BS 657 657 RR2G983JQ

RD RR2A230JQ 474 0 0
GGAGGTTTTGGTGGGAGGTAAAGAAGCAAAAAAATCAATGGGGCAGGAGGAAGCAAATAT
CTTCACTCTTTCAGAAGTTTCAGAGCACAATCACGCTCATGACTGCTGGATCGTCATCAA
TGCAAAGGTGTACAATGTAACCAAGTTCCTTGAAGACCATCCAGGTGGAGATGAAGTTCT
CCTGTCTTCAACAGGCAAGGATGCAACGGATGATTTTGAGGACGTGGGGCATAGCGAGAG
CGCGAGAGAGATGATGGAACAATACTACGTAGGAGAGATCGATCCGACAACAATCCCGAA
GAAAACCAAGTACACACCTCCTAAACAGCCTCACTACAACCAAGACAAGACCTCTGAGTT
CATTATCAAGTTCCTCCAGTTCCTCGTTCCCATTGCCATTCTCGGTTTGGCAGTTGGGAT
TCGTACCTACACCAAGTCAGGATAGTATTCTTCTTTTTCATTTCTTCTATATAT

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2A230TF 656 0 0
GGAGG
TTTTGGTGGGAGGTAAAGAAGCAAAAAAATCAATGGGGCAGGAGGAAGCAAATATCTTCA
CTCTTTCAGAAGTTTCAGAGCACAATCACGCTCATGACTGCTGGATCGTCATCAATGCAA
AGGTGTACAATGTAACCAAGTTCCTTGAAGACCATCCAGGTGGAGATGAAGTTCTCCTGT
CTTCAACAGGCAAGGATGCAACGGATGATTTTGAGGACGTGGGGCATAGCGAGAGCGCGA
GAGAGATGATGGAACAATACTACGTAGGAGAGATCGATCCGACAACAATCCCGAAGAAAA
CCAAGTACACACCTCCTAAACAGCCTCACTACAACCAAGACAAGACCTCTGAGTTCATTA
TCAAGATCCTCCAGTTCCTCGTTCCCATTGCCATTCTCGGTTTGGCAGTTGGGATTCGTA
CCTACACCAAGTCAGGATAGTAGTCTTCTTTTTCATATCTTCTATATAT**AAAAAGAGA
GAGATTTAAGTCTTCTGAGAAGACAAATCTCGAAGTCTCTGTTCCTATCTTTTGTTGTGT
GAACGTGTTTTGTATTAATGTTTCTTACGTGTTGTGATGAAGTTGCATCTAAACAAGCAG
TCTTGCAGAAATGCAGCTGATATTGATCTAATATAGTTCATATTATGAAAC

QA 6 656 6 656
DS 

RD RR2F394TF 635 0 0
GGAGG
TTTTGGTGGGAGGTAAAGAAGCAAAAAA*TCAATGGGGTAGGAGGAAGCAAAGATCTTCA
CTCTTTCAGAAGTTTCAGAGCACAATCACGCTCATGACTGCTGGATCGTCATCAATGCAA
AGGTGTACAATGTAACCAAGTTCCTTGAAGACCATCCAGGTGGAGATGAAGTTCTCCTGT
CTTCAACAGGTAAGGATGCAACGGATGATTTTGAGGACGTGGGGCATAGCGAGAGCGCGA
GAGAGATGATGGAACAATACTACGTAGGAGAGATCGATCCGACAACAATCCCGAAGAAAA
CCAAGTACACACCTCCTAAACAGCCTCACTACAACCAAGACAAGACCTCTGAGTTCATTA
TCAAGATCCTCCAGTTCCTCGTTCCCATTGCCATTCTCGGTTTGGCAGTTGGGATTCGTA
TCTACACCAAGTCAGGATAGTAGTCTTCTTTTTCATATCTTCTATATAT**AAAAAGAGA
GAGATTTAAGTCTTCTGAGAAGACAAATCTCGAAGTCTCTGTTCCTATCTTTTGTTGTGT
GAACGTGTTTTGTATTAATGTTTCTTACGTGTTGTGATGAAGTTGCATCTAAACAAGCT*
TCTTGCAGAAATGCAGCTGATATTGATCTA

QA 6 635 6 635
DS 

RD RR2G983JQ 652 0 0
TTTTTGTGGGAGGTAAAGAAGCAAAAAAATCAATGGGGCAGGAGGAAGCAAAGATCTTCA
CTCTTTCAGAAGTTTCAGAGCACAATCACGCTCATGACTGCTGGATCGTCATCAATGCAA
AGGTGTACAATGTAACCAAGTTCCTTGAAGACCATCCAGGTGGAGATGAAGTTCTCCTGT
CTTCAACAGGTAAGGATGCAACGGATGATTTTGAGGACGTGGGGCATAGCGAGAGCGCGA
GAGAGATGATGGAACAATACTACGTAGGAGAGATCGATCCGACAACAATCCCGAAGAAAA
CCAAGTACACACCTCCTAAACAGCCTCACTACAACCAAGACAAGACCTCTGAGTTCATTA
TCAAGATCCTCCAGTTCCTCGTTCCCATTGCCATTCTCGGTTTGGCGGTTGGGATTCGTA
TCTACACCAAGTCAGGATAGTAGTCTTCTTTTTCATATCTTCTATACAT**AAAAAGAGA
GAGATTTAAGTCTTCTGAGAAGACAAATCTCGAAGTCTCTGTTCCTATCTTTTGTTGTGT
GAACGTGTTTTGTATTAATGTTTCTTACGTGTTGTGATGAAGTTGCATCTAAACAAGCAG
TCTTGCAGAAATGCAGCTGATATTGATCTAATATAGTTCATATTATGAAACC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2FL46TF 580 0 0
GTTTCAGAGCACAATCACGCTCATGACTGCTGGATCGTCATCAATGCAAAGGTGTACAAT
GTAACCAAGTTCCTTGAAGACCATCCAGGTGGAGATGAAGTTCTCCTGTCTTCAACAGGT
AAGGATGCAACGGATGATTTTGAGGACGTGGGGCATAGCGAGAGTGCGAGAGAGATGATG
GAACAATACTACGTAGGAGAGATCGATCCGACAACAATCCCGAAGAAAACCAAGTACACA
CCCCCTAAACAGCCTCACTACAACCAAGACAAGACCTCTGAGTTCATTATCAAGATCCTC
CAGTTCCTCGTTCCCATTGCCATTCTCGGTTTGGCAGTTGGGATTCGTATCTACACCAAG
TCAGGATAGTAGTCTTCTTTTTCATATCTTCTATATATATAAAAAGAGAGAGATTTAAGT
CTTCTGAGAAGACAAATCTCGAAGTCTCTGTTCCTATCTTTTGTTGTGTGAACGTGTTTT
GTATTAATGTTTCTTACGTGTTGTGATGAAGTTGCATCTAAACAAGCAGTCTTGCAGAAA
TGCAGCTGATATTGATCTAATATAGTTCATATTATGAAAC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2G983TF 651 0 0
TTTTTGTGGGAGGTAAAGAAGCAAAAAAATCAATGGGGCAGGAGGAAGCAAAGATCTTCA
CTCTTTCAGAAGTTTCAGAGCACAATCACGCTCATGACTGCTGGATCGTCATCAATGCAA
AGGTGTACAATGTAACCAAGTTCCTTGAAGACCATCCAGGTGGAGATGAAGTTCTCCTGT
CTTCAACAGGTAAGGATGCAACGGATGATTTTGAGGACGTGGGGCATAGCGAGAGCGCGA
GAGAGATGATGGAACAATACTACGTAGGAGAGATCGATCCGACAACAATCCCGAAGAAAA
CCAAGTACACACCTCCTAAACAGCCTCACTACAACCAAGACAAGACCTCTGAGTTCATTA
TCAAGATCCTCCAGTTCCTCGTTCCCATTGCCATTCTCGGTTTGGCGGTTGGGATTCGTA
TCTACACCAAGTCAGGATAGTAGTCTTCTTTTTCATATCTTCTATACAT**AAAAAGAGA
GAGATTTAAGTCTTCTGAGAAGACAAATCTCGAAGTCTCTGTTCCTATCTTTTGTTGTGT
GAACGTGTTTTGTATTAATGTTTCTTACGTGTTGTGATGAAGTTGCATCTAAACAAGCAG
TCTTGCAGAAATGCAGCTGATATTGATCTAATATAGTTCATATTATGAAAC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 6

CO CL1534Contig1 958 6 12 U
TTTTTTTCCTCTCCTCTCTAACCTCTCCTCTCAGCTTGTGCTGGATCTCTCCAGCAGAGA
CGAACCAATCCTTCTTCGGAGAGATTCGCACGGGACTGATTGATCGATCAAGGCTTCTCG
GGCTATCAGAAATGGACCACGACAAGACAGGATGCCAAAGCCCACCTGAAGGTCCCAAGC
TTTGCATCAACAACTGCGGCTTCTTCGGAAGCGCTGCCACAATGAACATGTGTTCCAAGT
GTCACAAGACTATCCTCTTTCAACAGGAACAGGGGGCTAAGTTTGCATCTGCAGTGTCTG
GTTCATCATCATCATCCAGCAACATCTTAAAGGAAACCTTTGCCGCTGCGCTGGTT*GAT
CCTGAAACCAAATCTGTTGAGCCGGTGGTT*GTATCTGTGCAGCCATCC*TCTGTTCAAG
TTGCCGCAGAGGTAGTAGCTCCTGAAGCAGAAGCTGCAGCGAAACCGAAGCAAGGACCAA
GCCGATGTACTACTTGCAATAAACGGGTTGGTCTGACTGGATTCAAATGTCGCTGTGGTG
ACCTCTTCTGCGGGACGCACCGCTATGCAGACATACATAACTGCTCCTTCAATTACCATG
CCGCTGCGCAAGAAGCTATCGCTAAAGCAAACCCGGTTGTGAAGGCAGAGAAGCTTGACA
AAATCTGAAACTCAAACACCAAAGTTTCCGTCGTCCTGTCTGCGTCTGGTTCAAGGTGTG
TCGCATGTTAAAAAGGCTTTTTATATATATATATATGGTCGAAGAACCAAAGCGTGTGTT
TATCTTTAGTTTCTCTCTGCAATATTTGTGGTGTGGAACATTCTATTATCTGTGGTTTGA
AGCAGAGAAGTGTGCTCTTAAAGAATATGCTTTGATGTGTTTCTCTTTCTTATGATTTAT
GAGCACTATGTTTGTTTATGTTTCATCATTTGGGTCTGTATCATATTGAGATTGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK64TF U 54
AF RR2EP90TF U 1
AF RR2AK64JQ C 81
AF RR2AE30TF U 8
AF RR2AE30JQ C 187
AF RR2EP90JQ C 240
BS 1 198 RR2EP90TF
BS 199 199 RR2AK64TF
BS 200 574 RR2EP90TF
BS 575 714 RR2AE30TF
BS 715 715 RR2AE30JQ
BS 716 735 RR2AE30TF
BS 736 736 RR2AE30JQ
BS 737 801 RR2AE30TF
BS 802 804 RR2AE30JQ
BS 805 817 RR2AE30TF
BS 818 922 RR2AE30JQ
BS 923 958 RR2EP90JQ

RD RR2AK64TF 375 0 0
GCAGAGACGAACCAATCCTTCTTCGGAGAGATTCGCACGGGACTGATTGATCGATCAAGG
CTTCTCGGGCTATCAGAAATGGACCACGACAAGACAGGATGCCAAAGCCCACCTGAAGGT
CCCAAGCTTTGCATCAACAACTGCGGCTTCTTCGGTAGCGCTGCCACAATGAACATGTGT
TCCAAGTGTCACAAGACTATCCTCTTTCAACAGGAACAGGGGGCTAAGTTTGCATCTGCA
GTGTCTGGTTCATCATCATCATCCAGCAACATCTTAAAGGAAACCTTTGCCGCTGCGCTG
GTTTGATCCTGAAACCAAATCTGTTGAGCCGGTGGTTTGTATCTGTGCAGCCATCCCTCT
GTTCAAGTT
TGCCGC

QA 1 369 1 369
DS 

RD RR2EP90TF 574 0 0
TTTTTTTCCTCTCCTCTCTAACCTCTCCTCTCAGCTTGTGCTGGATCTCTCCAGCAGAGA
CGAACCAATCCTTCTTCGGAGAGATTCGCACGGGACTGATTGATCGATCAAGGCTTCTCG
GGCTATCAGAAATGGACCACGACAAGACAGGATGCCAAAGCCCACCTGAAGGTCCCAAGC
TTTGCATCAACAACTGCGACTTCTTCGGAAGCGCTGCCACAATGAACATGTGTTCCAAGT
GTCACAAGACTATCCTCTTTCAACAGGAACAGGGGGCTAAGTTTGCATCTGCAGTGTCTG
GTTCATCATCATCATCCAGCAACATCTTAAAGGAAACCTTTGCCGCTGCGCTGGTT*GAT
CCTGAAACCAAATCTGTTGAGCCGGTGGTT*GTATCTGTGCAGCCATCC*TCTGTTCAAG
TTGCCGCAGAGGTAGTAGCTCCTGAAGCAGAAGCTGCAGCGAAACCGAAGCAAGGACCAA
GCCGATGTACTACTTGCAATAAACGGGTTGGTCTGACTGGATTCAAATGTCGCTGTGGTG
ACCTCTTCTGCGGGACGCACCGCTATGCAGACAT

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2AK64JQ 581 0 0
AGAGA
TCGCACGGGACTGATTGATCGATCAAGGCTTCTCGGGCTATCAGAAATGGACCACGACAA
GACAGGATGCCAAAGCCCAC*TGAAGGTCCCAAGCTTTGCATCAACAACTGCGGCTTCTT
CGGTAGCGCTGCCACAATGAACATGTGTTCCAAGTGTCACAAGACTATCCTCTTTCAACA
GGAACAGGGGGCTAAGTTTGCATCTGCAGTGTCTGGTTCATCATCATCATCCAGCAACAT
CTTAAAGGAAACCTTTGCCGCTGCGCTGGTT*GATCCTGAAACCAAATCTGTTGAGCCGG
TGGTT*GTATCTGTGCAGCCATCC*TCTGTTCAAGTTGCCGCAGAGGTAGTAGCTCCTGA
AGCAGAAGCTGCAGCGAAACCGAAGCAAGGACCAAGCCGATGTACTACTTGCAATAAACG
GGTTGGTCTGACTGGATTCAAATGTCGCTGTGGTGACCTCTTCTGCGGGACGCACCGCTA
TACAGACATACATAACTGCTCCTTCAATTACCATGCCGCTGCGCAAGAAGCTATCGCTAA
AGCAAACCCGGTTGTGAAGGCAGAGAAGCTTGACAA

QA 6 581 6 581
DS 

RD RR2AE30TF 814 0 0
CCTCTCCTCTCTAACCTCTCCTCTCAGCTTGTGCTGGATCTCTCCAGCAGAGACGAACCA
ATCCTTCTTCGGAGAGATTCGCACGGGACTGATTGATCGATCAAGGCTTCTCGGGCTATC
AGAAATGGACCACGACAAGACAGGATGCCAAAGCC*ACCTGAAGGTCCCAAGCTTTGCAT
CAACGACTGCGGCTTCTTCGGAAGCGCTGCCACAATGAACATGTGTTCCAAGTGTCACAA
GACTATCCTCTTTCAACAGGAACAGGGGGCTAAGTTTGCATCTGCAGTGTCTGGTTCATC
ATCATCATCCAGCAACATCTTAAAGGAAACCTTTGCCGCTGCGCTGGTT*GATCCTGAAA
CCAAATCTGTTGAGCCGGTGGTT*GTATCTGTGCAGCCATCC*TCTGTTCAATTTGCCGC
AGAGGTAGTAGCTCCTGAAGCAGAAGCTGCAGCGAAACCGAAGCAAGGACCAAGCCGATG
TACTACTTGCAATAAACGGGTTGGTCTGACTGGATTCAAATGTCGCTGTGGTGACCTCTT
CTGCGGGACGCACCGCTATGCAGACATACATAACTGCTCCTTCAATTACCATGCCGCTGC
GCAAGAAGCTATCGCTAAAGCAAACCCGGTTGTGAAGGCAGAGAAGCTTGACAAAATCTG
AAACTCAAACACCAAAGTTTCCGTCGTCCTGTCTGCGTCTGGTTCAAAGTGTGTCGCATG
TTAAAAAG*CTTTTTATATATATATATATGGTCGAAGAACCAAAGCGTGTGTTTATCTTT
AGTTTCTCTCTGCATATTTTGTGGTGTGGA
CATT

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR2AE30JQ 738 0 0
TCAACGACTGCGGCTTCTTCGGAAGCGCTGCCACAATGAACATGTGTTCCAAGTGTCACA
AGACTATCCTCTTTCAACAGGAACAGGGGGCTAAGTTTGCATCTGCAGTGTCTGGTTCAT
CATCATCATCCAGCAACATCTTAAAGGAAACCTTTGCCGCTGCGCTGGTT*GATCCTGAA
ACCAAATCTGTTGAGCCGGTGGTT*GTATCTGTGCAGCCATCC*TCTGTTCAATTTGCCG
CAGAGGTAGTAGCTCCTGAAGCAGAAGCTGCAGCGAAACCGAAGCAAGGACCAAGCCGAT
GTACTACTTGCAATAAACGGGTTGGTCTGACTGGATTCAAATGTCGCTGTGGTGACCTCT
TCTGCGGGACGCACCGCTATGCAGACATACATAACTGCTCCTTCAATTACCATGCCGCTG
CGCAAGAAGCTATCGCTAAAGCAAACCCGGTTGTGAAGGCAGAGAAGCTTGACAAAATCT
GAAACTCAAACACCAAAGTTTCCGTCGTCCTGTCTGCGTCTGGTTCAAGGTGTGTCGCAT
GTTAAAAAGGCTTTTTATATATATATATATGGTCGAAGAACCAAAGCGTGTGTTTATCTT
TAGTTTCTCTCTGCAATATTTGTGGTGTGGAACATTCTATTATCTGTGGTTTGAAGCAGA
GAAGTGTGCTCTTAAAGAATATGCTTTGATGTGTTTCTCTTTCTTATGATTTATGAGCAC
TATGTTTGTTTATGTT
CC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2EP90JQ 719 0 0
TGTCACAAGACTTTCCTCTTTCAACAGGAACAGGGGGCTAAGTTTGCATCTGCAGTGTCT
GGTTCATCATCATCATCCAGCAACATCTTAAAGGAAACCTTTGCCGCTGCGCTGGTT*GA
TCCTGAAACCAAATCTGTTGAGCCGGTGGTT*GTATCTGTGCAGCCATCC*TCTGTTCAA
GTTGCCGCAGAGGTAGTAGCTCCTGAAGCAGAAGCTGCAGCGAAACCGAAGCAAGGACCA
AGCCGATGTACTACTTGCAATAAACGGGTTGGTCTGACTGGATTCAAATGTCGCTGTGGT
GACCTCTTCTGCGGGACGCACCGCTATGCAGACATACATAACTGCTCCTTCAATTACCAT
GCCGCTGCGCAAGAAGCTATCGCTAAAGCAAACCCGGTTGTGAAGGCAGAGAAGCTTGAC
AAAATCTGAAACTCAAACACCAAAGTTTCCGTCGTCCTGTCTGCGTCTGGTTCGAGGTGT
GTCGCATGTTAAAAAGGCTTTTTATATATATATATATGGTCGAAGAACCAAAGCGTGTGT
TTATCTTTAGTTTCTCTCTGCAATATTTGTGGTGTGGAACATTCTATTATCTGTGGTTTG
AAGCAGAGAAGTGTGCTCTTAAAGAATATGCTTTGATGTGTTTCTCTTTCTTATGATTTA
TGAGCACTATGTTTGTTTATGTTTCATCATTTGGGTCTGTATCATATTGAGATTGTATC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 5

CO CL1535Contig1 1410 5 12 U
GAAGAACTTCGGTAGTAAGGAAGTTGCTGTAGTGGATGGCCAGCGGAACCTCGGCACTAA
ACAGTTGTGGAAGTTTCGTTACACTCACCCAACTCTTCCAGCTGCTATCCGTAACCAGAG
TGCCGGTTGGGAAATGCTGGAGTACGTGCCTTCCTCTCTACCAAATGCTCCACAGGCGTT
CAAGAGCAGGGTGGCCGTAAAGCTGTCCTACACTTATGAGAAGGACAGTATCAGGATCGC
CGGGAACGGACATCTGATTCCGGGAGGAAACAACAACGGAGCCAACGGAGCCAACAACAA
CGGAGCCAACGGAGCCAACAACAACGGTGGTGGAGCCAACAACAACAACGGTGGTGGAGC
CAACAACAACAACGGTGGTGGAGCCAACAACAACAACGGTGGTGGAGCCAACAACAACAA
CGGTGGTGGAGCCAACAACAACAACGGTGGTGGAGCCAACAACAACAACGGTGGTGGAGC
CAACCAAGGAGGCAACGCCCAAGGAGGCAACGCCCAAGGAGGCAACGCCCAAGGAGGCAA
CGCCCAAGCCGACAACGCTCAGAACTACAATGCCGGACCAGGGAACTTTTTTAACTATGC
AGGAAATTATTACAACGGCGGACACTATGGCGACCACTACGACGGAGGTTTTTTCGGCAA
CATGTTCGACGAGTAAGAATGATGAACCTCTGAGTGAGAAAATAATTCTGCAGCTACTAT
ATAGGTACTGTTTCTGCCACGTTATCTTACTGTTTCTGCCACGTTATCTTACTCCCATCT
CCCTTAAAATGCTGCTGCTATCTCCGATCAACGCCTCTTTACCACCGTCGTTTCACAGGG
GAACACTGATCCGGCAACCAATTAAAACGCCATGCAGGATCATGGCAAAGGCCAAGGACG
ATACCGAGTCTGGCGGGTTTCTTGAGAATGCAGCTATAGCCGGTGGTTTAGTATCGACGC
CGGTGATTGGATGGTCACTCTACACTCTGAAGACCACTGGTTGTGGTTTACCTCCAGGCC
CGGCCGGTTCAATCGGTGCGTTGGAAGGTGTGAGCTACTTGGTGGTGTTGGGCATCGTGG
GCTGGTCTCTGTACACCAAGACCAAAACCGGCTCGGGTCTGCCAAATGGACCGTTTGGTT
TGTTGGGTGCGGTCGAAGGCTTATCTTACCTGTCGCTTCTAGCCATTCTTGTGGTGTTCG
GTTTACAGTTCTTGGGTAACGGGTCGGTTCCTGGTCCACTTCCAAGTGACCAGTGTTTTG
GTTAACCAATCAGTTTCGCTCCTTCTCCAAATGCAATGTCGTATAATACCGAACATATTT
TATTTCAATTTGTGACTGGTCATTTGATGTAATCGCTTTTGTAGAAATAAAAAAACTTGG
TTTAAAAAGATTTGAATAAAGTTTTATTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2CA30TF U 1
AF RR2GG83TF U 388
AF RR2C823TF U 769
AF RR2BB55TF U 770
AF RR2GG83JQB C 983
BS 1 593 RR2CA30TF
BS 594 927 RR2GG83TF
BS 928 928 RR2C823TF
BS 929 1047 RR2GG83TF
BS 1048 1048 RR2C823TF
BS 1049 1096 RR2GG83TF
BS 1097 1252 RR2C823TF
BS 1253 1253 RR2BB55TF
BS 1254 1383 RR2C823TF
BS 1384 1387 RR2BB55TF
BS 1388 1388 RR2GG83JQB
BS 1389 1410 RR2BB55TF

RD RR2CA30TF 597 0 0
GAAGAACTTCGGTAGTAAGGAAGTTGCTGTAGTGGATGGCCAGCGGAACCTCGGCACTAA
ACAGTTGTGGAAGTTTCGTTACACTCACCCAACTCTTCCAGCTGCTATCCGTAACCAGAG
TGCCGGTTGGGAAATGCTGGAGTACGTGCCTTCCTCTCTACCAAATGCTCCACAGGCGTT
CAAGAGCAGGGTGGCCGTAAAGCTGTCCTACACTTATGAGAAGGACAGTATCAGGATCGC
CGGGAACGGACATCTGATTCCGGGAGGAAACAACAACGGAGCCAACGGAGCCAACAACAA
CGGAGCCAACGGAGCCAACAACAACGGTGGTGGAGCCAACAACAACAACGGTGGTGGAGC
CAACAACAACAACGGTGGTGGAGCCAACAACAACAACGGTGGTGGAGCCAACAACAACAA
CGGTGGTGGAGCCAACAACAACAACGGTGGTGGAGCCAACAACAACAACGGTGGTGGAGC
CAACCAAGGAGGCAACGCCCAAGGAGGCAACGCCCAAGGAGGCAACGCCCAAGGAGGCAA
CGCCCAAGCCGACAACGCTCAGAACTACAATGCCGGACCAGGGAACTTTTTTA
CTAT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2GG83TF 709 0 0
G
AACAACAACGGTGGTGGAGCCAACAACAACAACGGTGGTGGAGCCAACAACAACAACGGT
GGTGGAGCCAACAACAACAACGGTGGTGGAGCCAACCAAGGAGGCAACGCCCAAGGAGGC
AACGCCCAAGGAGGCAACGCCCAAGGAGGCAACGCCCAAGCCGACAACGCTCAGAACTAC
AATGCCGGACCAGGGAACTTTTTTAACTATGCAGGAAATTATTACAACGGCGGACACTAT
GGCGACCACTACGACGGAGGTTTTTTCGGCAACATGTTCGACGAGTAAGAATGATGAACC
TCTGAGTGAGAAAATAATTCTGCAGCTACTATATAGGTACTGTTTCTGCCACGTTATCTT
ACTGTTTCTGCCACGTTATCTTACTCCCATCTCCCTTAAAATGCTGCTGCTATCTCCGAT
CAACGCCTCTTTACCACCGTCGTTTCACAGGGGAACACTGATCCGGCAACCAATTAAAAC
GCCATGCAGGATCATGGCAAAGGCCAAGGACGATACCGAGTCTGGCGGGTTTCTTGAGA*
TGCAGCTATAGCCGGTGGTTTAGTATCGACGCCGGTGATTGGATGGTCACTCTACACTCT
GAAGACCACTGGTTGTGGTTTACCTCCAGGCCCGGCCGGTTCAATCGGTGCGTTGGAAG*
TGTGAGCTACTTGGTGGTGTTGGGCATCGTGGGCTGGTCTCTGTACAC

QA 2 709 2 709
DS 

RD RR2C823TF 615 0 0
GG
ACTCCCATCTCCCTTAAAATGCTGCTGCTATCTCCGATCAACGCCTCTTTACCACCGTCG
TTTCACAGGGGAACACTGATCCGGCAACCAATTAAAACGCCATGCAGGATCATGGCAAAG
GCCAAGGACGATACCGAGTCTGGCGGGTTTCTTGAGAATGCAGCTATAGCCGGTGGTTTA
GTATCGACGCCGGTGATTGGATGGTCACTCTACACTCTGAAGACCACTGGTTGTGGTTTA
CCTCCAGGCCCGGCCGGTTCAATCGGTGCGTTGGAAGGTGTGAGCTACTTGGTGGTGTTG
GGCATCGTGGGCTGGTCTCTGTACACCAAGACCAAAACCGGCTCGGGTCTGCCAAATGGA
CCGTTTGGTTTGTTGGGTGCGGTCGAAGGCTTATCTTACCTGTCGCTTCTAGCCATTCTT
GTGGTGTTCGGTTTACAGTTCTTGGGTAACGGGTCGGTTCCTGGTCCACTTCCAAGTGAC
CATTGTTTTGGTTAACCAATCAGTTTCGCTCCTTCTCCAAATGCAATGTCGTATAATACC
GAACATATTTTATTTCAATTTGTGACTGGTCATTTGATGTAATCGCTTTTGTAGAAATAA
AAAAACTTGGTTT

QA 3 615 3 615
DS 

RD RR2BB55TF 641 0 0
G
ACTCCCATCTCCCTTAAAATGCTGCTGCTATCTCCGATCAACGCCTCTTTACCACCGTCG
TTTCACAGGGGAACACTGATCCGGCAACCAATTAAAACGCCATGCAGGATCATGGCAAAG
GCCAAGGACGATACCGAGTCTGGCGGGTTTCTTGAGAATGCAGCTATAGCCGGTGGTTTA
GTATCGACGCCGGTGATTGGATGGTCACTCTACACTCTGAAGACCACTGGTTGTGGTTTA
CCTCCAGGCCCGGCCGGTTCAATCGGTGCGTTGGAAGGTGTGAGCTACTTGGTGGTGTTG
GGCATCGTGGGCTGGTCTCTGTACACCAAGACCAAAACCGGCTCGGGTCTGCCAAATGGA
CCGTTTGGTTTGTTGGGTGCGGTCGAAGGCTTATCTTACCTGTCGCTTCTAGCCATTCTT
GTGGTGTTCGGTTTACAGTTCTTGGGTAACGGGTCGGTTCCTGGTCCACTTCCAAGTGAC
CAGTGTTTTGGTTAACCAATCAGTTTCGCTCCTTCTCCAAATGCAATGTCGTATAATACC
GAACATATTTTATTTCAATTTGTGACTGGTCATTTGATGTAATCGCTTTTGTAGAAATAA
AAAAACTTGGTTTAAAA*GATTTGAATAAAGTTTTATTCA

QA 2 641 2 641
DS 

RD RR2GG83JQB 427 0 0
CACTCTGAAGACCACTGGTTGTGGTTTACCTCCAGGCCCGGCCGGTTCAATCGGTGCGTT
GGAAGGTGTGAGCTACTTGGTGGTGTTGGGCATCGTGGGCTGGTCTCTGTACACCAAGAC
CAAAACCGGCTCGGGTCTACCAAATGGACCGTTTGGTTTGTTGGGTGCGGTCGAAGGCTT
ATCTTACCTGTCGCTTCTAGCCATTCTTGTGGTGTTCGGTTTACAGTTCTTGGGTAACGG
GTCGGTTCCTGGTCCACTTCCAAGTGACCAGTGTTTTGGTTAACCAATCAGTTTCGCTCC
TTCTCCAAATGCAATGTCGTATAATACCGAACATATTTTATTTCAATTTGTGACTGGTCA
TTTGATGTAATCGCTTTTGTAGAAATAAAAAAACTTGGTTTAAAAAGATTTGAATAAAGT
TTTATTC

QA 1 427 1 427
DS 



AS 1 3

CO CL1536Contig1 896 3 14 U
GGATCAAGTGTATCTTAAGTTATAAAATATTCTACCGAGTATAACAACATGCGAGTGTAT
CCATAAATATGCGAACAAGGGTAAGTTGCTCTGCTCTTTTCTCTACAACTTGATAACTAA
ACATCACAGTCTCAAGACTCAAGTACAAGGATGTTAAAAACAACTCAAAATTGTATCAAT
CTCATAAGTCGTTCATGTTGTAGACACCATTATCAAAAGAAACTACGAGGGAAGCCAAAT
ATCATCTTGTATTCCAACTAGCCAACCTTGGCAACTTTTCTTGGCTCGGTTTGTCCCGAC
AAAGGGCATTGCATCTCTGTCCAGCTAATCGGAACCATGGTTTCACCAGCAGCACTCTCC
GCTGAGACCACACCAAGCTCGTTCTTAGCAGTTGACAAATAGTAAGCCCGTGAGTCACCA
AGGGACAGAAACATGGCTCTAACAATGTCACTGGGACGGAAAGACTGATGCATATCAACT
TTGTCAATCTCCGTTGCTCTTACATCTTGTTGCCTAATTATGCCAGCAAATTTTTCACGA
ACGGCCTTGGGACCAACACACAAGATATCAACAGAAGCCATTCTAGCCATAACTTTAGTC
ACCCTTGCTAAGACAACAGAACCAGGCTCAGGAATAAGCCCATGTGCCTTGTGACCCGTA
ACTTCCACAATAGCTCTCTGGTCAGGAGACTCGGGAAGAGAAGAAACAATCCGACGAGAT
CCAGTGAGGGAAGCGTAGATTGTTTTGTCGTTGACGTAAGCTCCTTTGCCGGCTTTAAAC
TCAGCCACATTCCCAAGTACATCTCCAGGCGTTACTATGTCCGTCATTTCAAGAGATTTC
GACTGTTGATTAACGAGGAAGAAGAGTACAAGGCAGAACACAAATTATTACTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA39JQ U 51
AF RR2B788JQ U 1
AF RR2CN92TF C 272
BS 1 371 RR2B788JQ
BS 372 372 RR2CN92TF
BS 373 430 RR2B788JQ
BS 431 431 RR2CN92TF
BS 432 515 RR2B788JQ
BS 516 516 RR2CN92TF
BS 517 669 RR2B788JQ
BS 670 670 RR2CN92TF
BS 671 671 RR2B788JQ
BS 672 672 RR2CN92TF
BS 673 689 RR2B788JQ
BS 690 690 RR2CN92TF
BS 691 839 RR2B788JQ
BS 840 896 RR2CN92TF

RD RR2FA39JQ 302 0 0
GCGAGTGTATCCATAAATATGCGAACAAGGGTAAGTTGCTCTGCTCTTTTCTCTACAACT
TGATAACTAAACATCACAGTCTCAAGACTCAAGTACAAGGATGTTAAAAACAACTCAAAA
TTGTATCAATCTCATAAGTCGTTCATGTTGTAGACACCATTATCAAAAGAAACTACGAGG
GAAGCCAAATATCATCTTGTATTCCAACTAGCCAACCTTGGCAACTTTTCTTGGCTCGGT
TTGTCCCGACAAAGGGCATTGCATCTCTGTCCAGCTAATCGGAACCATGGTTTCACCTGC
AG

QA 1 302 1 302
DS 

RD RR2B788JQ 839 0 0
GGATCAAGTGTATCTTAAGTTATAAAATATTCTACCGAGTATAACAACATGCGAGTGTAT
CCATAAATATGCGAACAAGGGTAAGTTGCTCTGCTCTTTTCTCTACAACTTGATAACTAA
ACATCACAGTCTCAAGACTCAAGTACAAGGATGTTAAAAACAACTCAAAATTGTATCAAT
CTCATAAGTCGTTCATGTTGTAGACACCATTATCAAAAGAAACTACGAGGGAAGCCAAAT
ATCATCTTGTATTCCAACTAGCCAACCTTGGCAACTTTTCTTGGCTCGGTTTGTCCCGAC
AAAGGGCATTGCATCTCTGTCCAGCTAATCGGAACCATGGTTTCACCAGCAGCACTCTCC
GCTGAGACCACGCCAAGCTCGTTCTTAGCAGTTGACAAATAGTAAGCCCGTGAGTCACCA
AGGGACAGAACCATGGCTCTAACAATGTCACTGGGACGGAAAGACTGATGCATATCAACT
TTGTCAATCTCCGTTGCTCTTACATCTTGTTGCCTGATTATGCCAGCAAATTTTTCACGA
ACGGCCTTGGGACCAACACACAAGATATCAACAGAAGCCATTCTAGCCATAACTTTAGTC
ACCCTTGCTAAGACAACAGAACCAGGCTCAGGAATAAGCCCATGTGCCTTGTGACCCGTA
ACTTCCACAGTGGCTCTCTGGTCAGGAGAGTCGGGAAGAGAAGAAACAATCCGACGAGAT
CCAGTGAGGGAAGCGTAGATTGTTTTGTCGTTGACGTAAGCTCCTTTGCCGGCTTTAAAC
TCAGCCACATTCCCAAGTACATCTCCAGGCGTTACTATGTCCGTCATTTCAAGAGATTT

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR2CN92TF 625 0 0
GCAAC
TTTCTTGGCTCGGTTTGTCCCGACAAAGGGCATTGCATCTCTGTCCAGCTAATCGGAACC
ATGGTTTCACCAGCAGCACTCTCCGCTGAGACCACACCAAGCTCGTTCTTAGCAGTTGAC
AAATAGTGAGCCCGTGAGTCACCAAGGGACAGAAACATGGCTCTAACAATGTCACTGGGA
CGGAAAGACTGATGCATATCAACTTTGTCAATCTCTGTTGCTCTTACATCTTGTTGCCTA
ATTATGCCAGCAAATTTTTCACGAACGGCCTTGGGACCAACACACAAGATATCAACAGAA
GCCATTCTAGCCATAACTTTAGTCACCCTTGCTAAGACAACAGAACCAGGTTCAGGAATA
AGCCCATGTGCCTTGTGACCCGTAACTTCCACAATAGCTCTCTGGTCAGGAGACTCGGGA
AGAGAAGAAACAATCCGACGAGATCCAGTGAGGGAAGCGTAGATTGTTTTGTCGTTGACG
TAAGCTCCTTTGCCGGCTTTAAACTCAGCCACATTCCCAAGTACATCTCCAGGCGTTACT
ATGTCCGTCATTTCAAGAGATTTCGACTGTTGATTAACGAGGAAGAAGAGTACAAGGCAG
AACACAAATTATTACTATCC

QA 6 625 6 625
DS 



AS 1 6

CO CL1537Contig1 579 6 5 U
GGGAAAAAAAACAAGTTAAGAAAAACAAAAGAAAACGCGGAGAGGTTATATTACTTGTGC
TCGCGAGATTCATCAATTCGATTCCTTGTTCGTTTCTCACCGGCGTAAATCATGACAACT
TCAAAGAGGCTTGCAGACAGGAAGATCGAGAGGTTTGACAAGAACATTACAAAAAGAGGT
TTTGTTCCTGAGACCACCACCAAGAAGGGCAAGGATTACCCTGTCGGACCCATCCTCCTC
GGCTTCTTTGTCTTCGTCGTCATCGGTTCTTCTCTCTTCCAGATCATCAGGACCGCAACA
AGCAAAGGCATGGCATAAACGGAATCACTGTTCAAGCTTAGAGGAAGCGATGTTTTCAAA
ATTAATCTCT*CTTCTTCTTCTGTCTTGACTGTTTTTCCCTTATACTGTAGAATGCGTTA
ACTTTCTGTTTACTTACATGTTATGAAGAATTTTGAGACTACTTTTTTCTATAAATTATC
CAATCTTTGAAATCTTGTCTTGAACTTAGTTGCCAATGCTGTTGTTGTTATGATGCTTTT
GTATAACTACTTGTTGACTTACCTCAACTTGGTTCGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E687JQ C 1
AF RR2E687TF U 1
AF RR2BE75JQ C 25
AF RR2BE75TF U 25
AF RR2CY25JQ C 7
AF RR2CY25TF U 7
BS 1 8 RR2E687JQ
BS 9 421 RR2E687TF
BS 422 422 RR2BE75TF
BS 423 472 RR2E687TF
BS 473 579 RR2CY25TF

RD RR2E687JQ 472 0 0
GGGAAAAAAAACAAGTTAAGAAAAACAAAAGAAAACGCGGAGAGGTTATATTACTTGTGC
TCGCGAGATTCATCAATTCGATTCCTTGTTCGTTTCTCACCGGCGTAAATCATGACAACT
TCAAAGAGGCTTGCAGACAGGAAGATCGAGAGGTTTGACAAGAACATTACAAAAAGAGGT
TTTGTTCCTGAGACCACCACCAAGAAGGGCAAGGATTACCCTGTCGGACCCATCCTCCTC
GGCTTCTTTGTTTTCGTCGTCATCGGTTCTTCTCTCTTCCAGATCATCAGGACCGCAACA
AGCAAAGGCATGGCATAAACGGAATCACTGTTCAAGCTTAGAGGAAGCGATGTTTTCAAA
ATTAATCTCT*CTTCTTCTTCTGTCTTGACTGTTTTTCCCTTATACTGTAGAATGCGTTA
ATTTTCTGTTTACTTACATGTTATGAAGAATTTTGAGACTACTTTTTTCTAT

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2E687TF 472 0 0
GGGAAAAA
AAACAAGTTAAGAAAAACAAAAGAAAACGCGGAGAGGTTATATTACTTGTGCTCGCGAGA
TTCATCAATTCGATTCCTTGTTCGTTTCTCACCGGCGTAAATCATGACAACTTCAAAGAG
GCTTGCAGACAGGAAGATCGAGAGGTTTGACAAGAACATTACAAAAAGAGGTTTTGTTCC
TGAGACCACCACCAAGAAGGGCAAGGATTACCCTGTCGGACCCATCCTCCTCGGCTTCTT
TGTCTTCGTCGTCATCGGTTCTTCTCTCTTCCAGATCATCAGGACCGCAACAAGCAAAGG
CATGGCATAAACGGAATCACTGTTCAAGCTTAGAGGAAGCGATGTTTTCAAAATTAATCT
CT*CTTCTTCTTCTGTCTTGACTGTTTTTCCCTTATACTGTAGAATGCGTTAATTTTCTG
TTTACTTACATGTTATGAAGAATTTTGAGACTACTTTTTTCTAT

QA 9 472 9 472
DS 

RD RR2BE75JQ 436 0 0
ACAAAAGAAAACGCGGAGAGGTTATATTACTTGTGCTCGCGAGATTCATCAATTCGATTC
CTTGTTCGTTTCTCACCGGCGTAAATCATGACAACTTCAAAGAGGCTTGCAGACAGGAAG
ATCGAGAGGTTTGACAAGAACATTACTAAAAGAGGTTTTGTTCCTGAGACCACCACCAAG
AAGGGCAAGGATTACCCTGTCGGACCCATCCTCCTCGGCTTCTTTGTCTTCGTCGTCATT
GGTTCATCTCTCTTCCAGATCATCAGGACCGCAACAAGCGAAGGCATGGCATAAACGGAA
TCACTGTTCAAGCTTAGAGGAAGCGATGTTTTCAAAATTAATGTCTTCTTCTTCTTCTGT
CTTGACTGTTTTTCCCTTATACTGTAGAATGCGTTAACTTTCTGTTTACTTACATGTTAT
GAAGAATTTTGAGAC
C

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR2BE75TF 436 0 0
ACAAAAGAAAACGCGGAGAGGTTATATTACTTGTGCTCGCGAGATTCATCAATTCGATTC
CTTGTTCGTTTCTCACCGGCGTAAATCATGACAACTTCAAAGAGGCTTGCAGACAGGAAG
ATCGAGAGGTTTGACAAGAACATTACTAAAAGAGGTTTTGTTCCTGAGACCACCACCAAG
AAGGGCAAGGATTACCCTGTCGGACCCATCCTCCTCGGCTTCTTTGTCTTCGTCGTCATT
GGTTCATCTCTCTTCCAGATCATCAGGACCGCAACAAGCGAAGGCATGGCATAAACGGAA
TCACTGTTCAAGCTTAGAGGAAGCGATGTTTTCAAAATTAATGTCTTCTTCTTCTTCTGT
CTTGACTGTTTTTCCCTTATACTGTAGAATGCGTTAACTTTCTGTTTACTTACATGTTAT
GAAGAATTTTGAGAC
C

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR2CY25JQ 573 0 0
GG
AAACAAGTTAAGAAAAACAAAAGAAAACGCGGAGAGGTTATATTACTTGTGCTCGCGAGA
TTCATCAATTCGATTCCTTGTTCGTTTCTCACCGGCGTAAATCATGACAACTTCAAAGAG
GCTTGCAGACAGGAAGATCGAGAGGTTTGACAAGAACATTACAAAAAGAGGTTTTGTTCC
TGAGACCACCACCAAGAAGGGCAAGGATTACCCTGTCGGACCCATCCTCCTCGGCTTCTT
TGTCTTCGTCGTCATCGGTTCTTCTCTCTTCCAGATCATCAGGACCGCAACAAGCAAAGG
CATGGCATAAACGGAATCACTGTTCAAGCTTAGAGGAAGCGATGTTTTCAAAATTAATCT
CT*CTTCTTCTTCTGTCTTGACTGTTTTTCCCTTATACTGTAGAATGCGTTAACTTTCTG
TTTACTTACATGTTATGAAGAATTTTGAGACTACTTTTTTCTATAAATTATCCAATCTTT
GAAATCTTGTCTTGAACTTAGTTGCCAATGCTGTTGTTGTTATGATGCTTTTGTATAACT
ACTTGTTGACTTACCTCAACTTGGTTCGCCC

QA 3 573 3 573
DS 

RD RR2CY25TF 573 0 0
GG
AAACAAGTTAAGAAAAACAAAAGAAAACGCGGAGAGGTTATATTACTTGTGCTCGCGAGA
TTCATCAATTCGATTCCTTGTTCGTTTCTCACCGGCGTAAATCATGACAACTTCAAAGAG
GCTTGCAGACAGGAAGATCGAGAGGTTTGACAAGAACATTACAAAAAGAGGTTTTGTTCC
TGAGACCACCACCAAGAAGGGCAAGGATTACCCTGTCGGACCCATCCTCCTCGGCTTCTT
TGTCTTCGTCGTCATCGGTTCTTCTCTCTTCCAGATCATCAGGACCGCAACAAGCAAAGG
CATGGCATAAACGGAATCACTGTTCAAGCTTAGAGGAAGCGATGTTTTCAAAATTAATCT
CT*CTTCTTCTTCTGTCTTGACTGTTTTTCCCTTATACTGTAGAATGCGTTAACTTTCTG
TTTACTTACATGTTATGAAGAATTTTGAGACTACTTTTTTCTATAAATTATCCAATCTTT
GAAATCTTGTCTTGAACTTAGTTGCCAATGCTGTTGTTGTTATGATGCTTTTGTATAACT
ACTTGTTGACTTACCTCAACTTGGTTCGCCC

QA 3 573 3 573
DS 



AS 1 5

CO CL1538Contig1 1120 5 45 U
ATCTACCCAATGCATGTCTCATAATCAAAGGTTTTCACATAAAAACATGAACAAAGATAT
AAGAGAAGAATAAGTTTGTTTAAGCTTTTGATAGTAACAAGCTTGGTGCTAAAGCAACAT
GTTTGTTTAAATTTGATAGTCGAAAGCGTCATAAGGGTTTGTAGTACCAGCCCTGTAGTG
ACAAGCTTGGCACTCAAACATAGGCTGAGCAGAATGATCAGCGGTCACAATATCATGCCT
TAAACTGCTGTGACTTGAGCAATAGGGTTTATTGCAGAACCTGCACTTCGGAAGCACAAG
CCAGCATTCAAGGCACAGACTGTCTCCACCGCACGCTGCTTCTTGAATCTCGGTGTCTGA
TCCTAGGCACACCGAACACTCCGTGCATCTAGGGACGCAGAACCAGCATCCCCTGCACTT
CCGTTCTTGCCTTCTCCCACGGTTGCATGACGCTCTTGAGCAAGAGGGAATCATCATGAC
TTGGTCGCATTTGGGACAGACCTCGACATCTACGGCTCCCTCGTGAGGAAGGTGAGTGGA
GAGTGCTGAGAGATGGTCTTTAGTGAAGCGGTGGACGCCGTTGATGTGAAGTGTCTCCAT
CTTTGTTAAGCTTTCAACGCATCCAATGATTCCTTCTGGAGTCAGTTCAGTGCATCCTGG
CACAATTATCTTTCTGATGAGAGGATTTGCGTCCACAACACGTCGAAGCCCCTTGTCGGT
GATCCTAAGACAGTGTCGGAGGATCAGAGTGTTTAATTTTCCGGCGGATTTGGAAGTGAT
CTCCCATAGAATATCATCGGTTAGACGAGGGCTCAGCGGTGGTTCGAGAACGATCTTTGT
CCATAACGCAGTTTCGTCTCTGATCGCGTCTCTTAAGGACCGTGAAACGCCGGTCATGGA
GAGAAGCTCGAAGAGAGAGTGGAGATAAGGAAGAACAATCAGTAAAACCTCGTGAGCTGA
TCTTGATGTTGGCCATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCTCCTCCGTCCTCATGTTTAT
CAGCTGCTGTCTGTTTCTAAATATCCTTAATTTCTCCTTTTTTTCCTTATCTTTTAAGCG
ATGAATCTTTTTTTTTGTTCAACAAGCGATGAATCATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 5 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 10 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ84JQ U 67
AF RR2FF30JQ U 62
AF RR2BA13JQ U 1
AF RR2FF30TF C 295
AF RR2DQ84TF C 585
BS 1 166 RR2BA13JQ
BS 167 167 RR2FF30JQ
BS 168 242 RR2BA13JQ
BS 243 243 RR2FF30JQ
BS 244 303 RR2BA13JQ
BS 304 304 RR2FF30JQ
BS 305 321 RR2BA13JQ
BS 322 322 RR2FF30JQ
BS 323 324 RR2BA13JQ
BS 325 325 RR2FF30JQ
BS 326 333 RR2BA13JQ
BS 334 334 RR2FF30JQ
BS 335 393 RR2BA13JQ
BS 394 394 RR2FF30JQ
BS 395 426 RR2BA13JQ
BS 427 427 RR2FF30JQ
BS 428 444 RR2BA13JQ
BS 445 445 RR2FF30JQ
BS 446 456 RR2BA13JQ
BS 457 457 RR2FF30JQ
BS 458 507 RR2BA13JQ
BS 508 508 RR2FF30JQ
BS 509 512 RR2BA13JQ
BS 513 513 RR2FF30JQ
BS 514 570 RR2BA13JQ
BS 571 571 RR2FF30JQ
BS 572 610 RR2BA13JQ
BS 611 611 RR2FF30JQ
BS 612 618 RR2BA13JQ
BS 619 619 RR2FF30JQ
BS 620 648 RR2BA13JQ
BS 649 649 RR2FF30JQ
BS 650 693 RR2BA13JQ
BS 694 694 RR2FF30JQ
BS 695 711 RR2BA13JQ
BS 712 712 RR2FF30JQ
BS 713 756 RR2BA13JQ
BS 757 757 RR2FF30JQ
BS 758 809 RR2BA13JQ
BS 810 810 RR2FF30TF
BS 811 873 RR2BA13JQ
BS 874 1063 RR2FF30TF
BS 1064 1064 RR2DQ84TF
BS 1065 1082 RR2FF30TF
BS 1083 1120 RR2DQ84TF

RD RR2DQ84JQ 629 0 0
AA
AATAAGTTTGTTTAAGCTTTTGATAGTAACGAGATTGGTGCTAAAGCAACATGTTTGTTT
AAATTTGATAGTCGAAAGCGTCATAAGGGTTTGTAGTACCAGCCCTGTAGTGACAAGCTT
GGCACTCAAACATAGGCTGAGCAGAATGATCAGCGGTCACAATATCATGCCTTAAACTGA
*GTGGCTTGAGCAATAGGGTTTATTGCAAAACCTGCACTTCGGAAGCACAAGCCAGCATT
CAAGACACAGACTGTCTCCACCGCACGCTGCTTCTTGAATCTCGGTGTCTGATCCTAGGC
ACACCGAACACTCCGTGCATCTAGGGACGCAAAACCAGCATCCCCTGCACTTCCGTTCTT
GCCTTCTCCCACGGTTGCATGACGCTCTTGAGCAAGAGGGAATCATCATGACTTGGTCGC
ATTTGGGACAGACCTCGACATCTACGGCTCCCTCGTGAGGAAGGTGAGTGGAGAGTGCTG
AGAGATGGTATTTAGTGAAGCGGTGGACGCCGTTGATGTGAAGTGTCTCCATCTTTGTTA
AGCTTTCAACGCATCCAATGATTCCTTCTGGAGTCAGTTCAGTGCATCCTGGCACAATTA
TCTTTCTGATGAGAGGATTTGCGTCCA

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR2FF30JQ 751 0 0
CGAGAAG
AATAAGTTTGTTTAAGCTTTTGATAGTAACAAGCTTGGTGCTAAAGCAACATGTTTGTTT
AAATTTGATAGTCGAAAGCGTCATAAGGGTTTGTAGTACCAGCCCTGTAGTGACAAGCTT
GGCACTCAAACATAGGCTGAGCAGAATGATCAGCGGTCACAATATCATGCCTTAAACTGC
TGTGACTTGAGCAATAGGGTTTATTGCAGAACCTGCACTTCGGAAGCACAAGCCAGCATT
CAAGGCACAGACTGTCTCCACCGCACGCTGCTTCTTGAATCTCGGTGTCTGATCCTAGGC
ACACCGAACACTCCGTGCATCTAGGGACGCAAAACCAGCATCCCCTGCACTTCCGTTCTT
GCCTTCTCCCACGGTTGCATGACGCTCTTGAGCAAGAGGGAATCATCATGACTTGGTCGC
ATTTGGGACAGACCTCGACATCTACGGCTCCCTCGTGAGGAAGGTGAGTGGAGAGTGCTG
AGAGATGGTCTTTAGTGAAGCGGTGGACGCCGTTGATGTGAAGTGTCTCCATCTTTGTTA
AGCTTTCAACGCATCCAATGATTCCTTCTGGAGTCAGTTCAGTGCATCCTGGCACAATTA
TCTTTCTGATGAGAGGATTTGCGTCCACAACACGTCGAAGCCCCTTGTCGGTGATCCTAA
GACAGTGTCGGAGGATCAGAGTGTTTAATTTTCCGGCGGATTTGGAAGTGATCTCCCATA
GAATATCATCGGTTAGACGAG
GGC

QA 8 748 8 748
DS 

RD RR2BA13JQ 873 0 0
ATCTACCCAATGCATGTCTCATAATCAAAGGTTTTCACATAAAAACATGAACAAAGATAT
AAGAGAAGAATAAGTTTGTTTAAGCTTTTGATAGTAACAAGCTTGGTGCTAAAGCAACAT
GTTTGTTTAAATTTGATAGTCGAAAGCGTCATAAGGGTTTGTAGTAGCAGCCCTGTAGTG
ACAAGCTTGGCACTCAAACATAGGCTGAGCAGAATGATCAGCGGTCACAATATCATGCCT
TAGACTGCTGTGACTTGAGCAATAGGGTTTATTGCAGAACCTGCACTTCGGAAGCACAAG
CCAACATTCAAGGCACAGACTATCGCCACCGCAAGCTGCTTCTTGAATCTCGGTGTCTGA
TCCTAGGCACACCGAACACTCCGTGCATCTAGGAACGCAGAACCAGCATCCCCTGCACTT
CCGTTCGTGCCTTCTCCCACGGTTACATGACGCTCTCGAGCAAGAGGGAATCATCATGAC
TTGGTCGCATTTGGGACAGACCTCGACGTCTAGGGCTCCCTCGTGAGGAAGGTGAGTGGA
GAGTGCTGAGAGATGGTCTTTAGTGAAGCGATGGACGCCGTTGATGTGAAGTGTCTCCAT
CTTTGTTAAGGTTTCAACACATCCAATGATTCCTTCTGGAGTCAGTTCTGTGCATCCTGG
CACAATTATCTTTCTGATGAGAGGATTTGCGTCAACAACACGTCGAAGCCCTTTGTCGGT
GATCCTAAGACAGTGTCGGAGGATCAGAGTGTTTAACTTTCCGGCGGATTTGGAAGTGAT
CTCCCATAGAATATCATCGGTTAGACGAGAGCTCAGCGGTGGTTCGAGAACGATCTTTGT
CCATAACGCAGTTTCGTCTCTGATCGCGTCTCT

QA 1 873 1 873
DS 

RD RR2FF30TF 790 0 0
GAGCACAGCCAGCATCAAG
CACAGACTGTCTCCAC*GCACGCTGCTTCTTGA*TCTCGGTGTCTGATCCTAGGCACAC*
GAACACTCCGTGCATCTAGGGACGCAGAACCAGCATCCCCTGCACTTCCGTTCTTGCCTT
CTCCCACGGTTGCATGACGCTCTTGAGCAAGAGGGAATCATCATGACTTGGTCGCATTTG
GGACAGACCTCGACATCTACGGCTCCCTCGTGAGGAAGGTGAGTGGAGAGTGCTGAGAGA
TGGTCTTTAGTGAAGCGGTGGACGCCGTTGATGTGAAGTGTCTCCATCTTTGTTAAGCTT
TCAACGCATCCAATGATTCCTTCTGGAGTCAGTTCAGTGCATCCTGGCACAATTATCTTT
CTGATGAGAGGATTTGCGTCCACAACACGTCGAAGCCCCTTGTCGGTGATCCTAAGACAG
TGTCGGAGGATCAGAGTGTTTAATTTTCCGGCGGATTTGGAAGTGATCTCCCATAGAATA
TCATCGGTTAGACGAGGGCTCAGCGGTGGTTCGAGAACGATCTTTGTCCATAACGCAGTT
TCGTCTCTGATCGCGTCTCTTAAGGACCGTGAAACGCCGGTCATGGAGAGAAGCTCGAAG
AGAGAGTGGAGATAAGGAAGAACAATCAGTAAAACCTCGTGAGCTGATCTTGATGTTGGC
CATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCTCCTCCGTCCTCATGTTTATCAGCTGCTGTCTG
TTTCTAAATATCCTTAATTTCTCCTTTTTT*CCTTATCTTTTAAGCGAT
CC

QA 20 788 20 788
DS 

RD RR2DQ84TF 536 0 0
TGTGAAGTGTCTCCATCTTTGTTAAGCTTTCAACGCATCCAATGATTCCTTCTGGAGTCA
GTTCAGTGCATCCTGGCACAATTATCTTTCTGATGAGAGGATTTGCGTCCACAACACGTC
GAAGCCCCTTGTCGGTGATCCTAAGACAGTGTCGGAGGATCAGAGTGTTTAATTTTCCGG
CGGATTTGGAAGTGATCTCCCATAGAATATCATCGGTTAGACGAGGGCTCAGCGGTGGTT
CGAGAACGATCTTTGTCCATAACGCAGTTTCGTCTCTGATCGCGTCTCTTAAGGACCGTG
AAACGCCGGTCATGGAGAGAAGCTCGAAGAGAGAGTGGAGATAAGGAAGAACAATCAGTA
AAACCTCGTGAGCTGATCTTGATGTTGGCCATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCTCCT
CCGTCCTCATGTTTATCAGCTGCTGTCTGTTTCTAAATATCCTTAATTTCTCCTTTTTTT
CCTTATCTTTTAAGCGATGAATCTTTTTTTTTGTTCAACAAGCGATGAATCATTCC

QA 1 536 1 536
DS 



AS 2 5

CO CL1539Contig1 733 3 3 U
GGTTGAATCATGATTCTGATAAAACAAAAAGAATTATGATTAAACACATTACACATAAAA
TGAAAAACTGGATTGCAAAATTCTCATATAAAATCACATTCTTAGTTCAAGTTGCTACAA
AAAAAAAGAAAAACATATGCAGAGTTGCCAAAAACACACAGCAAGAACAAGGAAGAAAAC
TAAGAACTAATAGCCTCCTTTGAGATCGTTGACGACGTCGTATGGAATTGGGGTGACTGA
CTCCAAGGTCATACCTTCAACCATGAATCCAGGTTTGGGTCCCTTAGGCTGCCTCTTGGT
GCTTATTGTCTCGCCTCTAGCTTTGGCTGCAGTTTTGAGCTCATCGTTCTTCTTCTTTCT
CAGTTTGAACTCCTCAGCACATCTAGACTGCTGCACATGCTCCACACGCACGTGAAGTCT
CTTCTTTATGATCCTGTTTCCGATCTGTTTGTTGACTTCGACACCAACGGCGCGTTTGGT
AACGTTCCAGACACGACCAGTACGACCATGGTAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGAT
CGCACCATTCACTTTAACATCGACGTAATCTCCGACCTTGAAGGTTCTGAGGTACGTGGA
CAATGGGATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCTCTAGCGAACAGATCCCTTGTTCTCGCACG
AACTCCATGTCCTGCCGGCATTTTTTTTTCCTCTTTGGTGGAAGTAACAAGTCTAAACCT
TAAAACAGCCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU58JQ U 57
AF RR2BU58TF C 57
AF RR2AV37JQ U 1
BS 1 591 RR2AV37JQ
BS 592 592 RR2BU58JQ
BS 593 733 RR2AV37JQ

RD RR2BU58JQ 640 0 0
AAAAT
GAAAAACTGGATTGCAAAATTCTCATATAAAATCACATTCTTAGTTCAAGTTGCTACAAA
AAAAAAGAAAAACATATGCAGAGTTGCCAAAAACACACAGCAAGAACAAGGAAGAAAACT
AAGAACTAATAGCCTCCTTTGAGATCGTTGACGACGTCGTATGGAATTGGGGTGACTGAC
TCCAAGGTCATACCTTCAACCATGAATCCAGGTTTGGGTCCCTTAGGCTGCCTCTTGGTG
CTTATTGTCTCGCCTCTAGCTTTGGCTGCAGTTTTGAGCTCATCGTTCTTCTTCTTTCTC
AGTTTGAACTCCTCAGCACATCTAGACTGCTGCACATGCTCCACACGCACGTGAAGTCTC
TTCTTTATGATCCTGTTTCCGATCTGTTTGTTGACTTCGACACCAACGGCGCGTTTGGTA
ACGTTCCAGACACGACCAGTACGACCATGGTAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGATC
GCACCATTCACTTTAACATCGACGTAATCTCCGACCTTGAAGGTTCTGAGGTACGTGGAC
AATGGGATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCTCTAGCGAACAGATCCCTTGTTCTCGCACGA
ACTCCATGTCCTGCCGGCATTTTT
TTTTCCTCTCC

QA 6 629 6 629
DS 

RD RR2BU58TF 640 0 0
AAAAT
GAAAAACTGGATTGCAAAATTCTCATATAAAATCACATTCTTAGTTCAAGTTGCTACAAA
AAAAAAGAAAAACATATGCAGAGTTGCCAAAAACACACAGCAAGAACAAGGAAGAAAACT
AAGAACTAATAGCCTCCTTTGAGATCGTTGACGACGTCGTATGGAATTGGGGTGACTGAC
TCCAAGGTCATACCTTCAACCATGAATCCAGGTTTGGGTCCCTTAGGCTGCCTCTTGGTG
CTTATTGTCTCGCCTCTAGCTTTGGCTGCAGTTTTGAGCTCATCGTTCTTCTTCTTTCTC
AGTTTGAACTCCTCAGCACATCTAGACTGCTGCACATGCTCCACACCCACGTGAAGTCTC
TTCTTTATGATCCTGTTTCCGATCTGTTTGTTGACTTCGACACCAACGGCGCGTTTGGTA
ACGTTCCAGACACGACCAGTACGACCATGGTAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGATC
GCACCATTCACTTTAACATCGACGTAATCTCCGACCTTGAAGGTTCTGAGGTACGTGGAC
AATGGGATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCTCTAGCGAACAGATCCCTTGTTCTCGCACGA
ACTCCATGTCCTGCCGGCATTTTT
TTTTCCTCTCC

QA 6 629 6 629
DS 

RD RR2AV37JQ 733 0 0
GGTTGAATCATGATTCTGATAAAACAAAAAGAATTATGATTAAACACATTACACATAAAA
TGAAAAACTGGATTGCAAAATTCTCATATAAAATCACATTCTTAGTTCAAGTTGCTACAA
AAAAAAAGAAAAACATATGCAGAGTTGCCAAAAACACACAGCAAGAACAAGGAAGAAAAC
TAAGAACTAATAGCCTCCTTTGAGATCGTTGACGACGTCGTATGGAATTGGGGTGACTGA
CTCCAAGGTCATACCTTCAACCATGAATCCAGGTTTGGGTCCCTTAGGCTGCCTCTTGGT
GCTTATTGTCTCGCCTCTAGCTTTGGCTGCAGTTTTGAGCTCATCGTTCTTCTTCTTTCT
CAGTTTGAACTCCTCAGCACATCTAGACTGCTGCACATGCTCCACACGCACGTGAAGTCT
CTTCTTTATGATCCTGTTTCCGATCTGTTTGTTGACTTCGACACCAACGGCGCGTTTGGT
AACGTTCCAGACACGACCAGTACGACCATGGTAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGAT
CGCACCATTCACTTTAACATCGACGTAATCTCCGACCTTGAAGGTTCTGAGATACGTGGA
CAATGGGATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCTCTAGCGAACAGATCCCTTGTTCTCGCACG
AACTCCATGTCCTGCCGGCATTTTTTTTTCCTCTTTGGTGGAAGTAACAAGTCTAAACCT
TAAAACAGCCGCC

QA 1 733 1 733
DS 



CO CL1539Contig2 657 2 1 U
GGAAGGTTTAGACTTGTCGCATCCACCAAAGAGAAGACAAAAATGCCGGCAGGACATGGA
GTTCGTGCTCGAACGAGGGATCTGTTCGCTAGAGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATCCCA
TTGTCCACTTACCTCAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGT
GCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACTGGTCGCGTCTGGAAC
GTCACCAAACGCGCCGTTGGTGTCGAAGTTAACAAACAGATCGGAAACAGGATCATAAAG
AAGAGACTTCATGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCTAGATGTGCTGAGGAGTTCAAA
CTAAGGAAGAAGAAGAACGATGAACTCAAAACTGCAGCCAAAGCTAGAGGAGAGACAATA
AGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGAAGGTATGACCTTG
GAGACCGTCACCCCAATTCCATACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTC
TTACTTTTCTTCCCTATTCTTGCTGTGTGTTTTTGGAACTCTGCATATGTTTTTCTTTTG
TAGCAACTTGAACTAAGAATGCGATTTTATATGAGGAATTTTTCAATCCAGTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E331TF U 1
AF RR2E331JQ C 538
BS 1 657 RR2E331TF

RD RR2E331TF 657 0 0
GGAAGGTTTAGACTTGTCGCATCCACCAAAGAGAAGACAAAAATGCCGGCAGGACATGGA
GTTCGTGCTCGAACGAGGGATCTGTTCGCTAGAGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATCCCA
TTGTCCACTTACCTCAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGT
GCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACTGGTCGCGTCTGGAAC
GTCACCAAACGCGCCGTTGGTGTCGAAGTTAACAAACAGATCGGAAACAGGATCATAAAG
AAGAGACTTCATGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCTAGATGTGCTGAGGAGTTCAAA
CTAAGGAAGAAGAAGAACGATGAACTCAAAACTGCAGCCAAAGCTAGAGGAGAGACAATA
AGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGAAGGTATGACCTTG
GAGACCGTCACCCCAATTCCATACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTC
TTACTTTTCTTCCCTATTCTTGCTGTGTGTTTTTGGAACTCTGCATATGTTTTTCTTTTG
TAGCAACTTGAACTAAGAATGCGATTTTATATGAGGAATTTTTCAATCCAGTTTTTC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2E331JQ 120 0 0
TTTTTACTTTTTTTCCCTA
TTCTTGCTGTGTGTTTTTGGAACTCTGCATATGTTTTTTTTTTGTAGCAACTTGAACTAA
GAATGCGATTTTATATGAGGAATTTTTCAATCCAGTTTTTC

QA 20 120 20 120
DS 



AS 1 5

CO CL1540Contig1 881 5 6 U
GGACATTGAGCTAGTTTCAGAAATATGCCCCAAAAGGGGAACTCTTGTTTGCATCGATGG
CACCTTTGCAACACCTCTGAATCAGAAAGCCCTTGCTTTTGGTGCTGATCTTGTTGTGCA
CTCTCTTACAAAGTACATCGGAGGTTACAACGATGTTCTTGGTGGATGCATCTGTGGCCC
ACTGAAGGTGGTTTCAGAAATTCGCAATCTGCATCATGTGTTGGGAGGCACACTTAATCC
GAACGCGGCGTACCTAATGATCCGAGGCATGAAGACAATGCATCTTCGTGTAAAGCAACA
GAATTCTACTGCCTCAAGGATGGCCGAAATTTTAGAGGCACATCCTAAGGTGAGTCATGT
GTACTATCCAGGCCTTGCAAGTCATCCCGAGCATCACATTGCCAAGCGACAAATGAGTGG
TTTTGGAGGTGTGGTCAGTTTCGAGATTGATGGAGACATTGAAAGAACGATAAAGTTTGT
GGATTCACTCAAGATTCCTTACATCGCACCATCTTTTGGTGGCTGCGAAAGCATCGTGGA
CCAACCGGCCATCATGTCGTACTGGGATCTGACACAGGAGGAGAGGCTAAAGTATGGAAT
CAAAGACAATTTGGTCCGTTTCAGCTTTGGAGTTGAAGACTTTGAAGATGTCAAAGCTGA
CATTCTTCAAGCTCTCGAAGCCATCTGAAATTCC*AATTATTTCACCCCCCAAAAACACA
ATGTCGTTTCTGTCATCTTTTGAATTATTGTCTGTTTCATTGTCTCTCTGCTCTCTATTT
CTATGGTCACTGTAATAATGCCGTCTTTGAACTATTGTTCGGCGACATTTACCGTTTCGT
AATAACGATGAACTATTTATGTTTGTTGGGTTAACAATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB76TF U 1
AF RR2EB76JQ C 61
AF RR2CP87TF U 283
AF RR2H352TF U 280
AF RR2CJ07JQ C 95
BS 1 715 RR2EB76TF
BS 716 748 RR2CP87TF
BS 749 749 RR2H352TF
BS 750 855 RR2CP87TF
BS 856 869 RR2H352TF
BS 870 881 RR2EB76JQ

RD RR2EB76TF 717 0 0
GGACATTGAGCTAGTTTCAGAAATATGCCCCAAAAGGGGAACTCTTGTTTGCATCGATGG
CACCTTTGCAACACCTCTGAATCAGAAAGCCCTTGCTTTTGGTGCTGATCTTGTTGTGCA
CTCTCTTACAAAGTACATCGGAGGTTACAACGATGTTCTTGGTGGATGCATCTGTGGCCC
ACTGAAGGTGGTTTCAGAAATTCGCAATCTGCATCATGTGTTGGGAGGCACACTTAATCC
GAACGCGGCGTACCTAATGATCCGAGGCATGAAGACAATGCATCTTCGTGTAAAGCAACA
GAATTCTACTGCCTCAAGGATGGCCGAAATTTTAGAGGCACATCCTAAGGTGAGTCATGT
GTACTATCCAGGCCTTGCAAGTCATCCCGAGCATCACATTGCCAAGCGACAAATGAGTGG
TTTTGGAGGTGTGGTCAGTTTCGAGATTGATGGAGACATTGAAAGAACGATAAAGTTTGT
GGATTCACTCAAGATTCCTTACATCGCACCATCTTTTGGTGGCTGCGAAAGCATCGTGGA
CCAACCGGCCATCATGTCGTACTGGGATCTGACACAGGAGGAGAGGCTAAAGTATGGAAT
CAAAGACAATTTGGTCCGTTTCAGCTTTGGAGTTGAAGACTTTGAAGATGTCAAAGCTGA
CATTCTTCAAGCTCTCGAAGCCATCTGAAATTCC*AATTATTTCACCCCCCAAAA
CA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2EB76JQ 821 0 0
GGCACTTTGCAACACT
CTGAATCAGAAAGCCCTTGCTTTTGGTGCTGATCTTGTTGTGCACTCTCTTACAAAGTAC
ATCGGAGGTTACAACGATGTTCTTGGTGGATGCATCTGTGGCCCACTGAAGGTGGTTTCA
GAAATTCGCAATCTGCATCATGTGTTGGGAGGCACACTTAATCCGAACGCGGCGTACCTA
ATGATCCGAGGCATGAAGACAATGCATCTTCGTGTAAAGCAACAGAATTCTACTGCCTCA
AGGATGGCCGAAATTTTAGAGGCACATCCTAAGGTGAGTCATGTGTACTATCCAGGCCTT
GCAAGTCATCCCGAGCATCACATTGCCAAGCGACAAATGAGTGGTTTTGGAGGTGTGGTC
AGTTTCGAGATTGATGGAGACATTGAAAGAACGATAAAGTTTGTGGATTCACTCAAGATT
CCTTACATCGCACCATCTTTTGGTGGCTGCGAAAGCATCGTGGACCAACCGGCCATCATG
TCGTACTGGGATCTGACACAGGAGGAGAGGCTAAAGTATGGAATCAAAGACAATTTGGTC
CGTTTCAGCTTTGGAGTTGAAGACTTTGAAGATGTCAAAGCTGACATTCTTCAAGCTCTC
GAAGCCATCTGAAATTCC*AATTATTTCACCCCCCAAAAACACAATGTCGTTTCTGTCAT
CTTTTGAATTATTGTCTGTTTCATTGTCTCTCTGCTCTCTATTTCTATGGTCACTGTAAT
AATGCCGTCTTTGAACTATTGTTCGGCGACATTTACCGTTTCGTAATAACGATGAACTAT
TTATGTTTGTTGGGTTAACAATACC

QA 17 821 17 821
DS 

RD RR2CP87TF 573 0 0
G
CTTCGTGTAAAGCAACAGAATTCTACTGCCTCAAGGATGGCCGAAATTTTAGAGGCACAT
CCTAAGGTGAGTCATGTGTACTATCCAGGCCTTGCAAGTCATCCCGAGCATCACATTGCC
AAGCGACAAATGAGTGGTTTTGGAGGTGTGGTCAGTTTCGAGATTGATGGAGACATTGAA
AGAACGATAAAGTTTGTGGATTCACTCAAGATTCCTTACATCGCACCATCTTTTGGTGGC
TGCGAAAGCATCGTGGACCAACCGGCCATCATGTCGTACTGGGATCTGACACAGGAGGAG
AGGCTAAAGTATGGAATCAAAGACAATTTGGTCCGTTTCAGCTTTGGAGTTGAAGACTTT
GAAGATGTCAAAGCTGACATTCTTCAAGCTCTCGAAGCCATCTGAAATTCC*AATTATTT
CACCCCCCAAAAACACAATGTCGTTTCTGTCATCTTTTGAATTAT*GTCTGTTTCATTGT
CTCTCTGCTCTCTATTTCTATGGTCACTGTAATAATGCCGTCTTTGAACTATTGTTCGGC
GACATTTACCGTTTCGTAATAACGATGAACTA

QA 2 573 2 573
DS 

RD RR2H352TF 590 0 0
GCATCTTCGTGTAAAGCAACAGAATTCTACTGCCTCAAGGATGGCCGAAATTTTAGAGGC
ACATCCTAAGGTGAGTCATGTGTACTATCCAGGCCTTGCAAGTCATCCCGAGCATCACAT
TGCCAAGCGACAAATGAGTGGTTTTGGAGGTGTGGTCAGTTTCGAGATTGATGGAGACAT
TGAAGGAACGATAAAGTTTGTGGATTCACTCAAGATTCCTTACATCGCACCATCTTTTGG
TGGCTGCGAAAGCATCGTGGACTAACCGGCCATCATGTCGTACTGGGATCTGACACAGGA
GGAGAGGCTAAAGTATGGAATCAAAGACAATTTGGTCCGTTTCAGCTTTGGAGTTGAAGA
CTTTGAAGATGTCAAAGCTGACATTCTTCAAGCTCTCGAAGCCATCTGAAATTCC*AATT
ATTTCACCCCCCAAAAACACAATGTCGTTTCTGTCATCTTTTGAATTATTGTCTGTTTCA
TTGTCTCTCTGCTCTCTATTTCTATGGCCACTGTAATAATGCCGTCTTTGAACTATTGTT
CGGCGACATTTACCGTTTCGTAATAACGATGAACTATTTATGTTTGTTGG

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2CJ07JQ 764 0 0
GCTTTTGGTGCTGATCTTGTTGTGCACTCTCTTACTAAGTACATCGGAGGACACAACGAT
GTTCTTGGTGGATGCATCTGTGGCCCACTGAAGGTGGTTTCAGAAATTCGCAATCTGCAT
CATGTGTTGGGAGGCACACTTAATCCGAACGCTGCGTACCTAATGATCCGAGGCATGAAG
ACAATGCATCTTCGTGTAAAGCAACAGAATTCTACTGCCTCAAGGATGGCCGAAATTTTA
GAGGCACATCCTAAGGTGAGTCATGTGTACTATCCAGGCCTTGCAAGTCATCCCGAGCAT
CACATTGCCAAGCGACAAATGACTGGTTTTGGAGGTGTGGTCAGTTTCGAGATTGATGGA
GACATTGAAAGAACGATAAAGTTTGTGGATTCACTTAAGATTCCTTACATCGCACCATCG
TTTGGTGGCTGCGAAAGCATCGTGGACCAACCGGCCATCATGTCTTACTGGGATCTGACG
CAGGAGGAGAGGCTAAAGTATGGAATCAAAGACAATTTGGTACGTTTCAGCTTTGGAGTT
GAAGACTTTGAAGATGTCAAAGCTGACATTCTTCAAGCTCTCGAAGCCATCTGAAATACC
CAATTGTTTCACCCCC*AAAAACACAATGTCGTTTCTGTCATCTTTTGAATTATTGTCTG
TTTCATTGTCTCTCTGCTCTCTATTTCTATGGTCACTGTAATAGTGCTGCCTTTGAACTA
TTGTTCGGCGACATTTACCGTTTCGTAATAACGATGAACTA
TTT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 6

CO CL1541Contig1 679 6 3 U
CACAGAGCAAACATTAATATAAAAAGCATCAACATAGATAACGGCTAAAGAGTCAAACTC
ATAATCCAAATTGAAATGAAACGTACTCATGTCCGACAAAACAAAATTTAAAACACAAAA
GTACTTGCTTATGATTTAAACTTAAAAGACAAAACACCTTACTCAAATCAACTCTTTGCT
TTAATCAACGTTCTGCATAACATCCTCAGCAGTGAACTTAGTACCCTTGTCCTTATCCGC
AGCAGCACGTCCCTTGGCCTTCCTCTCCAAAAGCGACTTCCTGTCCTTGTCGAGACGAAG
CTTGGTAATAACCACTTTCGACGGCTGAACTCCGACATTCACGGTGGTTCCGTTCACCTT
CTCCCTCGTGATCCTCTCGATGTGAATCACCCACTTGCGACGGTACACCTGGACTACCTT
TCCCTCACGTCCCTTGTAGGTACCGCGAACGATCTGAACCTCGTCGTCCTTGCGGATAGG
CATGGATCTGACGTTGTACTTGGCGCGAAGGTCGGTGGAGAGAGGTGAGCTCATGATGAC
GCGCCTCTCGCTCGATGAGGCTGTGAAATGAGCCTTACGGTTCTTCCTGCGAGAGGAGGT
GACTCTTGGGTTGTACTTCATCTTCGCCGCCGGGTTTGGGGAATGGAGAAGCTCTCTTTC
TAGGGTTTTATGGGGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 

AF RR2D254JQ U 40
AF RR2FL78JQ U 1
AF RR2FL78TF C 243
AF RR2D254TF C 40
AF RR2A828JQ U 50
AF RR2A828TF C 50
BS 1 184 RR2FL78JQ
BS 185 185 RR2D254JQ
BS 186 679 RR2FL78JQ

RD RR2D254JQ 579 0 0
AACGGCTAAAGAGTCAAACTCATAATCCAAATTGAAATGAAACGTACTCATGTCCGACAA
AACAAAATTTAAAACACAAAAGTACTTGCTTATGATTTAAACTTAAAAGACAAA*CACCT
TACTCAAATCAACTCTTTGCTTTAATCAACGTTCTGCATAACATCCTCAGCAGTGAACTT
AGTACCCTTGTCCTTATCCGCAGCAGCACGTCCCTTGGCCTTCCTCTCCAAAAGCGACTT
CCTGTCCTTGTCGAGACGAAGCTTGGTAATAACCACTTTCGACGGCTGAACTCCGACATT
CACGGTGGTTCCGTTCACCTTCTCCCTCGTGATCCTCTCGATGTGAATCACCCACTTGCG
ACGGTACACCTGGACTACCTTTCCCTCACGTCCCTTGTAGGTACCGCGAACGATCTGAAC
CTCGTCGTCCTTGCGGATAGGCATGGATCTGACGTTGTACTTGGCGCGAAGGTCGGTGGA
GAGAGGTGAGCTCATGATGACGCGCCTCTCGCTCGATGAGGCTGTGAAATGAGCCTTACG
GTTCTTCCTGCGAGAGGAGGTGACTCTTGGGTTGTACTT

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2FL78JQ 679 0 0
CACAGAGCAAACATTAATATAAAAAGCATCAACATAGATAACGGCTAAAGAGTCAAACTC
ATAATCCAAATTGAAATGAAACGTACTCATGTCCGACAAAACAAAATTTAAAACACAAAA
GTACTTGCTTATGATTTAAACTTAAAAGACAAAACACCTTACTCAAATCAACTCTTTGCT
TTAACCAACGTTCTGCATAACATCCTCAGCAGTGAACTTAGTACCCTTGTCCTTATCCGC
AGCAGCACGTCCCTTGGCCTTCCTCTCCAAAAGCGACTTCCTGTCCTTGTCGAGACGAAG
CTTGGTAATAACCACTTTCGACGGCTGAACTCCGACATTCACGGTGGTTCCGTTCACCTT
CTCCCTCGTGATCCTCTCGATGTGAATCACCCACTTGCGACGGTACACCTGGACTACCTT
TCCCTCACGTCCCTTGTAGGTACCGCGAACGATCTGAACCTCGTCGTCCTTGCGGATAGG
CATGGATCTGACGTTGTACTTGGCGCGAAGGTCGGTGGAGAGAGGTGAGCTCATGATGAC
GCGCCTCTCGCTCGATGAGGCTGTGAAATGAGCCTTACGGTTCTTCCTGCGAGAGGAGGT
GACTCTTGGGTTGTACTTCATCTTCGCCGCCGGGTTTGGGGAATGGAGAAGCTCTCTTTC
TAGGGTTTTATGGGGGCCC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2FL78TF 437 0 0
CAGCACGTCCCTTGGCCTTCCTCTCCAAAAGCGACTTCCTGTCCTTGTCGAGACGAAGCT
TGGTAATAACCACTTTCGACGGCTGAACTCCGACATTCACGGTGGTTCCGTTCACCTTCT
CCCTCGTGATCCTCTCGATGTGAATCACCCACTTGCGACGGTACACCTGGACTACCTTTC
CCTCACGTCCCTTGTAGGTACCGCGAACGATCTGAACCTCGTCGTCCTTGCGGATAGGCA
TGGATCTGACGTTGTACTTGGCGCGAAGGTCGGTGGAGAGAGGTGAGCTCATGATGACGC
GCCTCTCGCTCGATGAGGCTGTGAAATGAGCCTTACGGTTCTTCCTGCGAGAGGAGGTGA
CTCTTGGGTTGTACTTCATCTTCGCCGCCGGGTTTGGGGAAAGGAGAAGCTCTCTTTCTA
GGGTTTTATGGGGGCCC

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR2D254TF 643 0 0
AACGGCTAAAGAGTCAAACTCATAATCCAAATTGAAATGAAACGTACTCATGTCCGACAA
AACAAAATTTAAAACACAAAAGTACTTGCTTATGATTTAAACTTAAAAGACAAA*CACCT
TACTCAAATCAACTCTTTGCTTTAATCAACGTTCTGCATAACATCCTCAGCAGTGAACTT
AGTACCCTTGTCCTTATCCGCAGCAGCACGTCCCTTGGCCTTCCTCTCCAAAAGCGACTT
CCTGTCCTTGTCGAGACGAAGCTTGGTAATAACCACTTTCGACGGCTGAACTCCGACATT
CACGGTGGTTCCGTTCACCTTCTCCCTCGTGATCCTCTCGATGTGAATCACCCACTTGCG
ACGGTACACCTGGACTACCTTTCCCTCACGTCCCTTGTAGGTACCGCGAACGATCTGAAC
CTCGTCGTCCTTGCGGATAGGCATGGATCTGACGTTGTACTTGGCGCGAAGGTCGGTGGA
GAGAGGTGAGCTCATGATGACGCGCCTCTCGCTCGATGAGGCTGTGAAATGAGCCTTACG
GTTCTTCCTGCGAGAGGAGGTGACTCTTGGGTTGTACTTCATCTTCGCCGCCGGGTTTGG
GGAATGGAGAAGCTCTCTTTCTAGGGTTTTATGGGGGC
GAGCC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2A828JQ 630 0 0
GG
GTCAAACTCATAATCCAAATTGAAATGAAACGTACTCATGTCCGACAAAACAAAATTTAA
AACACAAAAGTACTTGCTTATGATTTAAACTTAAAAGACAAAACACCTTGCTCAAATCAA
CTCTTTGCTTTAATCAACGTTCTGCATAACATCCTCAGCAGTGAACTTAGTACCCTTGTC
CTTATCCGCAGCAGCACGTCCCTTGGCCTTCCTCTCCAAAAGCGACTTCCTGTCCTTGTC
GAGACGAAGCTTGGTAATAACCACTTTCGACGGCTGAACTCCGACATTCACGGTGGTTCC
GTTCACCTTCTCCCTCGTGATCCTCTCGATGTGAATCACCCACTTGCGACGGTACACCTG
GACTACCTTTCCCTCACGTCCCTTGTAGGTACCGCGAACGATCTGAACCTCGTCGTCCTT
GCGGATAGGCATGGATCTGACGTTGTACTTGGCGCGAAGGTCGGTGGAGAGAGGTGAGCT
CATGATGACGCGCCTCTCGCTCGAGGAGGCTGTGAAATGAGCCTTACGGTTCTTCCTGCG
AGAGG**GTGACTCTTGGGTTGTACTTCATCTTCGCCGCCGGGTTTGGGGAATGGAGAAG
CTCTCTTTCTAGGGTTTTATGGGGGCCC

QA 3 630 3 630
DS 

RD RR2A828TF 630 0 0
GG
GTCAAACTCATAATCCAAATTGAAATGAAACGTACTCATGTCCGACAAAACAAAATTTAA
AACACAAAAGTACTTGCTTATGATTTAAACTTAAAAGACAAAACACCTTGCTCAAATCAA
CTCTTTGCTTTAATCAACGTTCTGCATAACATCCTCAGCAGTGAACTTAGTACCCTTGTC
CTTATCCGCAGCAGCACGTCCCTTGGCCTTCCTCTCCAAAAGCGACTTCCTGTCCTTGTC
GAGACGAAGCTTGGTAATAACCACTTTCGACGGCTGAACTCCGACATTCACGGTGGTTCC
GTTCACCTTCTCCCTCGTGATCCTCTCGATGTGAATCACCCACTTGCGACGGTACACCTG
GACTACCTTTCCCTCACGTCCCTTGTAGGTACCGCGAACGATCTGAACCTCGTCGTCCTT
GCGGATAGGCATGGATCTGACGTTGTACTTGGCGCGAAGGTCGGTGGAGAGAGGTGAGCT
CATGATGACGCGCCTCTCGCTCGAGGAGGCTGTGAAATGAGCCTTACGGTTCTTCCTGCG
AGAGG**GTGACTCTTGGGTTGTACTTCATCTTCGCCGCCGGGTTTGGGGAATGGAGAAG
CTCTCTTTCTAGGGTTTTATGGGGGCCC

QA 3 630 3 630
DS 



AS 1 6

CO CL1542Contig1 593 6 27 U
GGGCTGTTCAGTGGAGAAGAAGATCCAAATCGATCCGTTGAAAAGTGCCAGGGATAATCT
AATTTGTGAGCTATGTCGAGTGCTGCGGTGGACGCGACGGGGAACCCGATCCCTACATCT
GCTGTGTTGACTGCCTCAGCGAAGCATATAGGTTTAAGATGTATGCCGGAGAACGTTGCG
TTTCTCAAATGCAAGAAGAATGATCCAAACCCTGAGAAATGTCTTGACAAGGGTCGTGAC
GTCACTCGCTGTGTCCTTGGCTTGCTGAAGGATCTTCACCAAAAGTGCCAAAAGGAGATG
GATGACTATGTTGGGTGTATGTATTACTACACAAACGAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAG
CAAGAAGCCTTCGAGAAAGTTTGTCCCCTGAAATGAAGTTACTCTCTCATGTTTTAATTT
GTAATCTCCTAATAAAGCAGCATGTTCATTTTTCAATGAGCTTTACTCTCTCTTCTTGTC
ATCACCATTTTTCCTTCCAATGTTGTCGAAGTGACTTCTAAAAGACAGCCACCTGACTCG
GTTTTCAATGCTTGATGGTTATTTTTAATCAGAACATAATGGATTTCACAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2B943JQ C 8
AF RR2B943TF U 8
AF RR2GB05TF U 1
AF RR2CN50JQ C 4
AF RR2GB05JQ C 170
AF RR2CN50TF U 26
BS 1 37 RR2GB05TF
BS 38 38 RR2B943TF
BS 39 86 RR2GB05TF
BS 87 87 RR2B943TF
BS 88 122 RR2GB05TF
BS 123 123 RR2B943TF
BS 124 167 RR2GB05TF
BS 168 168 RR2B943TF
BS 169 200 RR2GB05TF
BS 201 201 RR2B943TF
BS 202 224 RR2GB05TF
BS 225 225 RR2B943TF
BS 226 308 RR2GB05TF
BS 309 309 RR2B943TF
BS 310 338 RR2GB05TF
BS 339 339 RR2B943TF
BS 340 401 RR2GB05TF
BS 402 402 RR2B943TF
BS 403 403 RR2GB05TF
BS 404 404 RR2B943TF
BS 405 415 RR2GB05TF
BS 416 416 RR2B943TF
BS 417 453 RR2GB05TF
BS 454 454 RR2B943TF
BS 455 492 RR2GB05TF
BS 493 493 RR2CN50TF
BS 494 593 RR2GB05TF

RD RR2B943JQ 447 0 0
GG
AGTGGAGAAGAAGATCCAAATCGATCCGTTGAAAAGTGCCAGGGATAATTTAATTTGTGA
GCTATGTCGAGTGCTGCGGTGGACGCGACGGGGAACCCGATCCCTACATTTGCTGTGTTG
ACTGCCTCAGCGAAGCATATAGGTTTAAGATGCATGCCGGAGAACGTTGCGTTTTTCAAA
TGCAAGAAGAATGATCCAAACCCTGAGAAATGTCTTGACAAGGGTCGTGACGTCACTCGC
TGTGTCCTTGGCTTGCTGAAGGATTTTCACCAAAAGTGCCAAAAGGAGATGGATGACTAT
GTTGGGTGTATGTATTACTACACAAACGAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAGCAAGAAGCC
TTCGAGAAAGTTTGTCCCCTGAAATGAAGTTACTCTCTCATGTTTTAATTTGTAATCTCC
TAATAAAGCAGCATGTTCATTTTTC

QA 3 447 3 447
DS 

RD RR2B943TF 447 0 0
GG
AGTGGAGAAGAAGATCCAAATCGATCCGTTGAAAAGTGCCAGGGATAATCTAATTTGTGA
GCTATGTCGAGTGCTGCGGTGGACGCGACGGGGAACCCGATCCCTACATCTGCTGTGTTG
ACTGCCTCAGCGAAGCATATAGGTTTAAGATGCATGCCGGAGAACGTTGCGTTTCTCAAA
TGCAAGAAGAATGATCCAAACCCTGAGAAATGTCTTGACAAGGGTCGTGACGTCACTCGC
TGTGTCCTTGGCTTGCTGAAGGATCTTCACCAAAAGTGCCAAAAGGAGATGGATGACTAT
GTTGGGTGTATGTATTACTACACAAACGAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAGCAAGAAGCC
TTCGAGAAAGTTTGTCCCCTGAAATGAAGTTACTCTCTCATGTTTTAATTTGTAATCTCC
TAATAAAGCAGCATGTTCATTTTTC

QA 3 447 3 447
DS 

RD RR2GB05TF 593 0 0
GGGCTGTTCAGTGGAGAAGAAGATCCAAATCGATCCGGTGAAAAGTGCCAGGGATAATCT
AATTTGTGAGCTATGTCGAGTGCTGCTGTGGACGCGACGGGGAACCCGATCCCTACATCT
GCGGTGTTGACTGCCTCAGCGAAGCATATAGGTTTAAGATGTATGCCTGAGAACGTTGCG
TTTCTCAAATGCAAGAAGAACGATCCAAACCCTGAGAAATGTCTCGACAAGGGTCGTGAC
GTCACTCGCTGTGTCCTTGGCTTGCTGAAGGATCTTCACCAAAAGTGCCAAAAGGAGATG
GATGACTACGTTGGGTGTATGTATTACTACACAAACGAATTTGATCTGTGTAGGAAAGAG
CAAGAAGCCTTCGAGAAAGTTTGTCCCCTGAAATGAAGTTAGTGTCTCATGTTTTTATTT
GTAATCTCCTAATAAAGCAGCATGTTCATTTTTGAATGAGCTTTACTCTCTCTTCTTGTC
ATCACCATTTTTTCTTCCAATGTTGTCGAAGTGACTTCTAAAAGACAGCCACCTGACTCG
GTTTTCAATGCTTGATGGTTATTTTTAATCAGAACATAATGGATTTCACAAGG

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2CN50JQ 590 0 0
GGGTTC
AGTGGAGAAGAAGATCCAAATCGATCCGTTGAAAAGTGCCAGGGATAATTTAATTTGTGA
GCTATGTCGAGTGCTGCGGTGGACGCGACGGGGAACCCGATCCCTACATTTGCTGTGTTG
ACTGCCTCAGCGAAGCATATAGGTTTAAGATGTATGCCGGAGAACGTTGCGTTTCTCAAA
TGCAAGAAGAATGATCCAAACCCTGAGAAATGTCTTGACAAGGGTCGTGACGTCACTCGC
TGTGTCCTTGGCTTGCTGAAGGATCTTCACCAAAAGTGCCAAAAGGAGATGGATGACTAT
GTTGGGTGTATGTATTACTACACAAACGAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAGCAAGAAGCC
TTCGAGAAAGTTTGTCCCCTGAAATGAAGTTACTCTCTCATGTTTTAATTTGTAATCTCC
TAATAAAGCAGCATGTTCATTTTTCAATGAGCTTTACTCTCTCTTCTTGTCATCACCATT
TTTCCTTCCAATGTTGTCGAAGTGACTTTTAAAAGACAGCCACCTGACTCGGTTTTC***
GCTTGATGGTTATTTTTAATCAGAACATAATGGATTTCACAAGG

QA 7 590 7 590
DS 

RD RR2GB05JQ 424 0 0
AGAACGTTGCGTTTCTCAAATGCAAGAAGAACGATCCAAACCCTGAGAAATGTCTCGACA
AGGGTCGTGACGTCACTCGCTGTGTCCTTGGCTTGCTGAAGGATCTTCACCAAAAGTGCC
AAAAGGAGATGGATGACTACGTTGGGTGTATGTATTACTACACAAACGAATTTGATCTGT
GTAGGAAAGAGCAAGAAGCCTTCGAGAAAGTTTGTCCCCTGAAATGAAGTTAGTGTCTCA
TGTTTTTATTTGTAATCTCCTAATAAAGCAGCATGTTCATTTTTGAATGAGCTTTACTCT
TTCTTCTTGTCATCACCATTTTTTCTTCCAATGTTGTCGAAGTGACTTCTAAAAGACAGC
CACCTGACTCGGTTTTCAATGCTTGATGGTTATTTTTAATCAGAACATAATGGATTTCAC
AAGG

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR2CN50TF 568 0 0
CAAATCGATCCGTTGAAAAGTGCCAGGGATAATCTAATTTGTGAGCTATGTCGAGTGCTG
CGGTGGACGCGACGGGGAACCCGATCCCTACATCTGCTGTGTTGACTGCCTCAGCGAAGC
ATATAGGTTTAAGATGTATGCCGGAGAACGTTGCGTTTCTCAAATGCAAGAAGAATGATC
CAAACCCTGAGAAATGTCTTGACAAGGGTCGTGACGTCACTCGCTGTGTCCTTGGCTTGC
TGAAGGATCTTCACCAAAAGTGCCAAAAGGAGATGGATGACTATGTTGGGTGTATGTATT
ACTACACAAACGAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAGCAAGAAGCCTTCGAGAAAGTTTGTC
CCCTGAAATGAAGTTACTCTCTCATGTTTTAATTTGTAATCTCCTAATAAAGCAGCATGT
TCATTTTTCAATGAGCTTTACTCTCTCTTCTTGTCATCACCATTTTTCCTTCCAATGTTG
TCGAAGTGACTTCTAAAAGACAGCCACCTGACTCGGTTTTC***GCTTGATGGTTATTTT
TAATCAGAACATAATGGATTTCACAAGG

QA 1 568 1 568
DS 



AS 2 6

CO CL1543Contig1 662 2 6 U
GCAAAAGAAAATATATACGCAAATGGGTAATGGTCTAGTAGTATACATTAACAGCTAATG
GTATTTAAAAAGCAAATGTCAACTTTGGAATATATTGATAAAATCTAAAAAACATACAAC
TCAGCTTGGCCGTCAATAAAGAGACTCATGAACTCTTCTCCATCAACAGTTTCTTTCTCG
ATCAAAAGCTGCGCAAGCTTGTGCAAGATATCAATGTGAGTTGTTATGATGTCTGTGGCT
CTCTTGTACGCCTTCTCCACCAGCTCTCTCACCTCAGCATCTACGATATCAGCAGTTGCC
ATTGAGTAATCTTTCTGTGAAGACATTTGTTGACCCATGAAGGGATTTCCACCAGGGCCA
CCAACGGCTACTTGTCCAATCTTTTTGCTGAACCCGAACCTCTCGATCATTTGACGTGCC
ACACGAGGCACCTGCATGAAATCATTTGATGCTCCAGTCGTCACATTGTCATCTCCAAAG
ATCACCTCCTCTGCAACCCTTCCACCAAGAGCAACAGCCATTTGATTCTCGAGGTAGCTT
CTACTGTACAATCCAAACTCGAGTCTTTCTTCACTGGGAGCAAAGAAGGTAAGCCCACCA
GCTTGGCCACGAGGAATGATTGAAATCTTGGCAACAGGATCATACTCTGGCATAAGAGCA
CC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2DZ29JQ U 1
AF RR2EH92JQ U 1
BS 1 108 RR2DZ29JQ
BS 109 109 RR2EH92JQ
BS 110 185 RR2DZ29JQ
BS 186 186 RR2EH92JQ
BS 187 423 RR2DZ29JQ
BS 424 662 RR2EH92JQ

RD RR2DZ29JQ 423 0 0
GCAAAAGAAAATATATACGCAAATGGGTAATGGTCTAGTAGTATACATTAACAGCTAATG
GTATTTAAAAAGCAAATGTCAACTTTGGAATATATTGATAAAATCTAAGAAACATACAAC
TCAGCTTGGCCGTCAATAAAGAGACTCATGAACTCTTCTCCATCAACAGTTTCTTTCTCG
ATCAAGAGCTGCGCAAGCTTGTGCAAGATATCAATGTGAGTTGTTATGATGTCTGTGGCT
CTCTTGTACGCCTTCTCCACCAGCTCTCTCACCTCAGCATCTACGATATCAGCAGTTGCC
ATTGAGTAATCTTTCTGTGAAGACATTTGTTGACCCATGAAGGGATTTCCACCAGGGCCA
CCAACGGCTACTTGTCCAATCTTTTTGCTGAACCCGAACCTCTCGATCATTTGACGTGCC
ACA

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR2EH92JQ 662 0 0
A
CAAAAGAAAATATATACGCAAATGGGTAATGGTCTAGTAGTATACATTAACAGCTAATGG
TATTTAAAAAGCAAATGTCAACTTTGGAATATATTGATAAAATCTAAAAAACATACAACT
CAGCTTGGCTGTCAATAAAGAGACTCATGAACTCTTCTCCATCAACAGTTTCTTTCTCGA
TCAAAAGCTGCGCAAGCTTGTGCAAGATATCAATGTGAGTTGTTATGATGTCTGTGGCTC
TCTTGTACGCCTTCTCCACCAGCTCTCTCACCTCAGCATCTACGATATCAGCAGTTGCCA
TTGAGTAATCTTTCTGTGAAGACATTTGTTGACCCATGAAGGGATTTCCACCAGGGCCAC
CAACGGCTACTTGTCCAATCTTTTTGCTGAACCCGAACCTCTCGATCATTTGACGTGCCA
CACGAGGCACCTGCATGAAATCATTTGATGCTCCAGTCGTCACATTGTCATCTCCAAAGA
TCACCTCCTCTGCAACCCTTCCACCAAGAGCAACAGCCATTTGATTCTCGAGGTAGCTTC
TACTGTACAATCCAAACTCGAGTCTTTCTTCACTGGGAGCAAAGAAGGTAAGCCCACCAG
CTTGGCCACGAGGAATGATTGAAATCTTGGCAACAGGATCATACTCTGGCATAAGAGCAC
C

QA 2 662 2 662
DS 



CO CL1543Contig2 990 4 19 U
GAGGCAGGTGACGGTTGATAGGCCTGATGTTGCTGGGAGAGTCAAGATTCTTCAGGTTCA
TTCTAGAGGGAAGGCGATTGGTAAAGATGTGGACTTTGATAAGGTTGCGAGGAGGACTCC
GGGTTTCACCGGCGCTGACTTGCAGAACCTGATGAATGAAGCGGCGATTCTTGCGGCGAG
GCGGGAGCTTAAGGAGATAAGCAAGGATGAGATCTCTGATGCGCTTGAGAGGATCATTGC
TGGACCTGAGAAGAAGAATGCTGTTGTCTCTGATGAGAAGAAGAGACTTGTTGCTTACCA
TGAGGCTGGTCATGCTCTAGTGGGTGCTCTTATGCCAGAGTATGATCCTGTTGCCAAGAT
TTCAATCATTCCTCGTGGCCAAGCTGGTGGGCTTACCTTCTTTGCTCCCAGTGAAGAAAG
ACTCGAGTCTGGATTGTACAGTAGAAGCTACCTCGAGAATCAGATGGCTGTTGCACTTGG
TGGAAGGGTTGCAGAGGAGGTGATCTTTGGAGATGACAATGTGACGACTGGAGCATCAAA
TGATTTCATGCAGGTGTCTCGTGTGGCACGTCAAATGATCGAGAGGTTCGGGTTCAGCAA
AAAGATTGGACAAGTAGCCGTTGGTGGCCCTGGTGGAAATCCCTTCATGGGTCAACAAAT
GTCTTCACAGAAAGATTACTCAATGGCAACTGCTGATATCGTAGATGCTGAGGTGAGAGA
GCTGGTGGAGAAGGCGTACAAGAGAGCCACAGACATCATAACAACTCACATTGATATCTT
GCACAAGCTTGCGCAGCTCTTGATCGAGAAAGAAACTGTTGATGGGAGAAGAGTTCATGA
GTCTCTTTATTGACGGCCAAGCTGAGTTATATGTTTCTTAGATTTTATCAAAATATTCCA
AAGTTGACATTTGCTTTTTAAATACCATTAGCTGTTAATGTATACTAGACCATTGCGTAT
ATATCTTCTTTTGTAAAATACTCTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DZ29TF U 1
AF RR2EH92TF U 20
AF RR2B119TF U 191
AF RR2B119JQ C 428
BS 1 184 RR2DZ29TF
BS 185 185 RR2EH92TF
BS 186 228 RR2DZ29TF
BS 229 462 RR2EH92TF
BS 463 463 RR2B119TF
BS 464 474 RR2EH92TF
BS 475 475 RR2B119TF
BS 476 553 RR2EH92TF
BS 554 554 RR2B119TF
BS 555 556 RR2EH92TF
BS 557 557 RR2B119TF
BS 558 672 RR2EH92TF
BS 673 673 RR2B119TF
BS 674 688 RR2EH92TF
BS 689 689 RR2B119TF
BS 690 712 RR2EH92TF
BS 713 713 RR2B119TF
BS 714 727 RR2EH92TF
BS 728 990 RR2B119TF

RD RR2DZ29TF 228 0 0
GAGGCAGGTGACGGTTGATAGGCCTGATGTTGCTGGGAGAGTCAAGATTCTTCAGGTTCA
TTCTAGAGGGAAGGCGATTGGTAAAGATGTGGACTTTGATAAGGTTGCGAGGAGGACTCC
GGGTTTCACCGGCGCTGACTTGCAGAACCTGATGAATGAAGCGGCGATTCTTGCGGCGAG
GCGGTAGCTTAAGGAGATAAGCAAGGATGAGATCTCTGATGCGCTTGA

QA 1 228 1 228
DS 

RD RR2EH92TF 708 0 0
G
GGCCTGATGTTGCTGGGAGAGTCAAGATTCTTCAGGTTCATTCTAGAGGGAAGGCGATTG
GTAAAGATGTGGACTTTGATAAGGTTGCGAGGAGGACTCCGGGTTTCACCGGCGCTGACT
TGCAGAACCTGATGAATGAAGCGGCGATTCTTGCGGCGAGGCGGGAGCTTAAGGAGATAA
GCAAGGATGAGATCTCTGATGCGCTTGAGAGGATCATTGCTGGACCTGAGAAGAAGAATG
CTGTTGTCTCTGATGAGAAGAAGAGACTTGTTGCTTACCATGAGGCTGGTCATGCTCTAG
TGGGTGCTCTTATGCCAGAGTATGATCCTGTTGCCAAGATTTCAATCATTCCTCGTGGCC
AAGCTGGTGGGCTTACCTTCTTTGCTCCCAGTGAAGAAAGACTCGAGTCTGGATTGTACA
GTAGAAGCTACCTCGAGAATCAAATGGCTGTTGCTCTTGGTGGAAGGGTTGCAGAGGAGG
TGATCTTTGGAGATGACAATGTGACGACTGGAGCATCAAATGATTTCATGCAG*TGCCTC
GTGTGGCACGTCAAATGATCGAGAGGTTCGGGTTCAGCAAAAAGATTGGACAAGTAGCCG
TTGGTGGCCCTGGTGGAAATCCCTTCATGGGTCAACAAATGTCTTCACAGAA*GATTACT
CAATGGCA*CTGCTGATATCGTAGATGCTGAG*TGAGAGAGCTGGTG

QA 2 708 2 708
DS 

RD RR2B119TF 800 0 0
GG
GGAGATAAGCAAGGATGAGATCTCTGATGCACTTGAGAGGATCATTGCTGGACCTGAGAA
GAAGAATGCTGTTGTCTCTGATGAGAAGAAGAGACTTGTTGCTTACCATGAGGCTGGTCA
TGCTCTAGTGGGTGCTCTTATGCCAGAGTATGATCCTGTTGCCAAGATTTCCATCATTCC
TCGTGGCCAAGCTGGTGGGCTTACCTTTTTTGCTCCCAGTGAAGAAAGACTCGAGTCTGG
ATTGTACAGTAGAAGCTACCTCGAGAATCAGATGGCTGTTGCACTTGGTGGAAGGGTTGC
AGAGGAGGTGATCTTTGGAGATGACAATGTGACGACTGGAGCATCAAATGATTTCATGCA
GGTGTCTCGTGTGGCACGTCAAATGATCGAGAGGTTCGGGTTCAGCAAAAAGATTGGACA
AGTAGCCGTTGGTGGCCCTGGTGGAAATCCCTTCATGGGTCAACAAATGTCTTCACAGAA
AGATTACTCAATGGCAACTGCTGATATCGTAGATGCTGAGGTGAGAGAGCTGGTGGAGAA
GGCGTACAAGAGAGCCACAGACATCATAACAACTCACATTGATATCTTGCACAAGCTTGC
GCAGCTCTTGATCGAGAAAGAAACTGTTGATGGGAGAAGAGTTCATGAGTCTCTTTATTG
ACGGCCAAGCTGAGTTATATGTTTCTTAGATTTTATCAAAATATTCCAAAGTTGACATTT
GCTTTTTAAATACCATTAGCTGTTAATGTATACTAGACCATTGCGTATATATCTTCTTTT
GTAAAATACTCTGTTTCC

QA 3 800 3 800
DS 

RD RR2B119JQ 563 0 0
TC
TGGATTGTACAGTAGAAGCTACCTCGAGAATCAGATGGCTGTTGCACTTGGTGGAAGGGT
TGCAGAGGAGGTGATCTTTGGAGATGACAATGTGACGACTGGAGCATCAAATGATTTCAT
GCAGGTGTCTCGTGTGGCACGTCAAATGATCGAGAGGTTCGGGTTCAGCAAAAAGATTGG
ACAAGTAGCCGTTGGTGGCCCTGGTGGAAATCCCTTCATGGGTCAACAAATGTCTTCACA
GAAAGATTACTCAATGGCAACTGCTGATATCGTAGATGCTGAGGTGAGAGAGCTGGTGGA
GAAGGCGTACAAGAGAGCCACAGACATCATAACAACTCACATTGATATCTTGCACAAGCT
TGCGCAGCTCTTGATCGAGAAAGAAACTGTTGATGG*AGAAGAGTTCATGAGTCTCTTTA
TTGACGGCCAAGCTGAGTTATATGTTTTTTAGATTTTATCAAAATATTCCAAAGTTGACA
TTTGCTTTTTAAATACCATTAGCTGTTAATGTATACTAGACCATTGCGTATATATCTTCT
TTTGTAAAATACTCTGTTTCC

QA 3 563 3 563
DS 



AS 2 5

CO CL1544Contig1 1173 2 2 U
GGAAAGAGTTTAGACGCTGTTTCTGTTATAGAGAAAAAAAGAATGGGGAGGAAGAGAAAG
CATAGCGAGGCGGAAGCGGCGGCGCCGGTGAAGGACGATTCTGCTCCGGAGAGACCTAAA
TGAACTCTTCTGGGTTGGAAAGATAAGAAAGAAGATGTTGAGGAAGCTAAGGAAGCGCCA
GCGTCTGTGTCTGTGACTGGATTCAGGAATAAAGAGAAGGTTCTCGTTACTTGTTCCCGT
CGGATTAGTTTCAGGTACCGACATCTGATGTTGAACATAGTGTCACTTCTGCCTCACTGT
AAGAAGGATAGTAAGGTTGAAGCTAAGAGCAGTAAAGGCGCGACTCTTAATGAGCTTGTT
GAGCTTAAGGGTTCTTCTTCCTGCTTGTTCTTCGAGTGTAGGAAGCATAAAGATCGATAC
ATGTGGATGGTCAAGTCCCCTAGTGGACCCTCTGTTAAGTTCTTAGTTAATGCTGTTCAC
ACAATGGAGGAGCTGAAACTCACTGGAAATCATCTGAAAGGGTCACGCCCTCTCTTGACC
TTCTCATCTAACTTTGATAAAGATGTACACTGGAAACTCTTGAAAGAGATGTTAACACAG
GTATTTGGAATCCCCAAGGAGCACAGGAAGTCTAAACCTTACCATGACCATGTTTTTGCT
TTCTCTATTGTCGATGACCATATCTGGTTCCGTAATTACCAGATTTCAGTACCCCATAAT
GAGGCAGACAAGGTTGCTCGTGGTGGTCTTGATAAAATGACCCTTGTCGAGGTTGGTCCA
AGGTTTTGTTTAAACCCGATTAAGATCTTTGGAGGAAGCTTTGGAGGTCCAACCCTTTAC
GAGAACCCATTCTACGTATCTCCAAACCAGATCCGAGCCTTGGAGAAAAGAAATAAAGCT
GGGAAATTTGCAAAGAAGATCAAAGCAAAAACAAGGAGAAAGATGCATGAGCTTTCAAAC
CCGTTGGAGCCTGATGAATTTGCAGACATGTGGAAGGATGATGAATGATCAATTTCCATT
ATTAAGTTTTTCTTGTTGTAAACCCCCTTCCAAATTCACAGAACTCTCACATTTTTGTCT
TTGTACAACTGTTCTTCTTGACTCTTGTTTTTATCTATCTCTCCCTCTTATGGATCAAAA
GGTAATGTTTTTCTCGCAAATTGAAGACTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM26TF U 1
AF RR2CM26JQ C 408
BS 1 726 RR2CM26TF
BS 727 1173 RR2CM26JQ

RD RR2CM26TF 726 0 0
GGAAAGAGTTTAGACGCTGTTTCTGTTATAGAGAAAAAAAGAATGGGGAGGAAGAGAAAG
CATAGCGAGGCGGAAGCGGCGGCGCCGGTGAAGGACGATTCTGCTCCGGAGAGACCTAAA
TGAACTCTTCTGGGTTGGAAAGATAAGAAAGAAGATGTTGAGGAAGCTAAGGAAGCGCCA
GCGTCTGTGTCTGTGACTGGATTCAGGAATAAAGAGAAGGTTCTCGTTACTTGTTCCCGT
CGGATTAGTTTCAGGTACCGACATCTGATGTTGAACATAGTGTCACTTCTGCCTCACTGT
AAGAAGGATAGTAAGGTTGAAGCTAAGAGCAGTAAAGGCGCGACTCTTAATGAGCTTGTT
GAGCTTAAGGGTTCTTCTTCCTGCTTGTTCTTCGAGTGTAGGAAGCATAAAGATCGATAC
ATGTGGATGGTCAAGTCCCCTAGTGGACCCTCTGTTAAGTTCTTAGTTAATGCTGTTCAC
ACAATGGAGGAGCTGAAACTCACTGGAAATCATCTGAAAGGGTCACGCCCTCTCTTGACC
TTCTCATCTAACTTTGATAAAGATGTACACTGGAAACTCTTGAAAGAGATGTTAACACAG
GTATTTGGAATCCCCAAGGAGCACAGGAAGTCTAAACCTTACCATGACCATGTTTTTGCT
TTCTCTATTGTCGATGACCATATCTGGTTCCGTAATTACCAGATTTCAGTACCCCATAAT
GAGGCA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2CM26JQ 766 0 0
TAAAGATCGATACATGTGGATGGTCAAGTCCC*TAGTGGACC*TCTGTTAAGTTCTTAGT
TAATGCTGTTCACACAATGGAGGAGCTGAAACTCACTGGAAATCATCTGAAAGGGTCACG
CCCTCTCTTGACCTTCTCATCTAACTTTGATAAAGATGTACACTGGAAACTCTTGAAAGA
GATGTTAACACAGGTATTTGGAATCCCCAAGGAGCACAGGAAGTCTAAACCTTACCATGA
CCATGTTTTTGCTTTCTCTATTGTCGATGACCATATCTGGTTCCGTAATTACCAGATTTC
AGTACCCCATAATGAGGCAGACAAGGTTGCTCGTGGTGGTCTTGATAAAATGACCCTTGT
CGAGGTTGGTCCAAGGTTTTGTTTAAACCCGATTAAGATCTTTGGAGGAAGCTTTGGAGG
TCCAACCCTTTACGAGAACCCATTCTACGTATCTCCAAACCAGATCCGAGCCTTGGAGAA
AAGAAATAAAGCTGGGAAATTTGCAAAGAAGATCAAAGCAAAAACAAGGAGAAAGATGCA
TGAGCTTTCAAACCCGTTGGAGCCTGATGAATTTGCAGACATGTGGAAGGATGATGAATG
ATCAATTTCCATTATTAAGTTTTTCTTGTTGTAAACCCCCTTCCAAATTCACAGAACTCT
CACATTTTTGTCTTTGTACAACTGTTCTTCTTGACTCTTGTTTTTATCTATCTCTCCCTC
TTATGGATCAAAAGGTAATGTTTTTCTCGCAAATTGAAGACTTTTT

QA 1 766 1 766
DS 



CO CL1544Contig2 1156 3 5 U
GGGTCCTAAAACCCTAGAAAGAGTTTAGACGCTGTTTCTGTTATAGAGAAAAAAAAATGG
GGAGGAAGAGAAAGCATAGCGAGGCAGAAGCGGCGGCGGCGGTGAAGGACGATTCTGCTC
CGGAGAGACCTAAAAGAACTCTTTTGGGTTGGAAAGATAAGAAAGAAGATGTGGAGGAAG
CTAAGGAAGCGCCTGCGTCTGTGCCTGGATTCAGGAATAAAGAGAAGGTTCTCGTTACTT
GCTCCCGTCGGATTAGTTTCAGGTACCGACATCTGATGTTGAACATAGTGTCACTTTTGC
CTCACTGTAAGAAAGATAGTAAGGTGGAAGCTAAGAGCAGTAAAGGCGCGACCCTTAATG
AGCTTGTTGAGCTTAAGGGTTCTTCTTCCTGCTTGTTCTTCGAGTGTAGGAAGCATAAAG
ATCTTTACATGTGGATGGTGAAGTCTCCTAGTGGACCCTCTGTTAAGTTCTTGGTTAATG
CTGTTCACACAATGGAGGAGCTGAAACTCACTGGAAATCATCTGAAAGGGTCACGACCTC
TCTTGACTTTCTCATCTAACTTTGATAAAGATGTACACTGGAAACTCTTGAAAGAGATGT
TAACACAGGTTTTTGGAATCCCCAAGGAGCACAGAAAGTCTAAACCTTACCATGACTATG
TTTTTGCTTTCTCTATCGTCGATGACCATATATGGTTCCGTAATTACCAGATATCAGTAC
CTCATAATGAGGCAGACAAGGTTGCTCGTGGTGGTCTTGATAAAATGACCCTTGTCGAGG
TTGGTCCAAGGTTTTGTTTAAACCCGATTAAGATCTTTGGAAGAAGCTTTGGTGGTCCAA
CCCTTTACGAGAACCCATTCTACGTATCTCCAAACCAGATCCGAGCCTTGGAGAAGAGGA
ATAAAGCTGGGAAATTTGCAAAGAAGATCAAAGCTAAAACAAGGAGAAAGATGCATGAGC
TTTCCAACCCATTGGAGCCTGATGAATTTGCAGACATGTGGAAGGATGACGAATGATCAA
GTTCCATTCAAGTTTTTCTTGTTGTAAACCCCTTTCAAATTCACAGAAAGCTCTCACATT
TTTATATTTGTACTACGGTTCTTGACTCTGTTTTCATTTATCCCTCTTATGGATCAAAAT
GGTAATATTTTTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2GY66TF U 1
AF RR2GY66JQ C 400
AF RR2BG72TF U 573
BS 1 735 RR2GY66TF
BS 736 821 RR2BG72TF
BS 822 822 RR2GY66JQ
BS 823 1155 RR2BG72TF
BS 1156 1156 RR2GY66JQ

RD RR2GY66TF 735 0 0
GGGTCCTAAAACCCTAGAAAGAGTTTAGACGCTGTTTCTGTTATAGAGAAAAAAAAATGG
GGAGGAAGAGAAAGCATAGCGAGGCAGAAGCGGCGGCGGCGGTGAAGGACGATTCTGCTC
CGGAGAGACCTAAAAGAACTCTTTTGGGTTGGAAAGATAAGAAAGAAGATGTGGAGGAAG
CTAAGGAAGCGCCTGCGTCTGTGCCTGGATTCAGGAATAAAGAGAAGGTTCTCGTTACTT
GCTCCCGTCGGATTAGTTTCAGGTACCGACATCTGATGTTGAACATAGTGTCACTTTTGC
CTCACTGTAAGAAAGATAGTAAGGTGGAAGCTAAGAGCAGTAAAGGCGCGACCCTTAATG
AGCTTGTTGAGCTTAAGGGTTCTTCTTCCTGCTTGTTCTTCGAGTGTAGGAAGCATAAAG
ATCTTTACATGTGGATGGTGAAGTCTCCTAGTGGACCCTCTGTTAAGTTCTTGGTTAATG
CTGTTCACACAATGGAGGAGCTGAAACTCACTGGAAATCATCTGAAAGGGTCACGACCTC
TCTTGACTTTCTCATCTAACTTTGATAAAGATGTACACTGGAAACTCTTGAAAGAGATGT
TAACACAGGTTTTTGGAATCCCCAAGGAGCACAGAAAGTCTAAACCTTACCATGACTATG
TTTTTGCTTTCTCTATCGTCGATGACCATATATGGTTCCGTAATTACCAGATATCAGTAC
CTCATAATGAGGCAG

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2GY66JQ 757 0 0
TC
GAGTGTAGGAAGCATAAAGATCTTTACATGTGGATGGTGAAGTCTCCTAGTGGACCCTCT
GTTAAGTTCTTGGTTAATGCTGTTCACACAATGGAGGAGCTGAAACTCACTGGAAATCAT
CTGAAAGGGTCACGACCTCTCTTGACTTTCTCATCTAACTTTGATAAAGATGTACACTGG
AAACTCTTGAAAGAGATGTTAACACAGGTTTTTGGAATCCCCAAGGAGCACAGAAAGTCT
AAACCTTACCATGACTATGTTTTTGCTTTCTCTATCGTCGATGACCATATATGGTTCCGT
AATTACCAGATATCAGTACCTCATAATGAGGCAGACAAGGTTGCTCGTGGTGGTCTTGAT
AAAATGACCCTTGTCGAGGTTGGTCCAAGGTTTTGTTTAAACCCGATTAAGATCTTTGGA
AGAAGCTTTGGTGGTCCAACCCTTTACGAGAACCCATTTTACGTATCTCCAAACCAGATC
CGAGCCTTGGAGAAGAGGAATAAAGCTGGGAAATTTGCAAAGAAGATCAAAGCTAAAACA
AGGAGAAAGATGCATGAGCTTTCCAACCCATTGGAGCCTGATGAATTTGCAGACATGTGG
AAGGATGACGAATGATCAAGTTCCATTCAAGTTTTTCTTGTTGTAAACCCCTTTCAAATT
CACAGAAAGCTCTCACATTTTTATATTTGTACTACGGTTCTTGACTCTGTTTTCATTTAT
CCCTCTTATGGATCAAAATGGTAATATTTTTCTTG

QA 3 757 3 757
DS 

RD RR2BG72TF 583 0 0
GG
ACACTGGAAACTCTTGAAAGAGATGTTAACACAGGTTTTTGGAATCCCCAAGGAGCACAG
AAAGTCTAAACCTTACCATGACCATGTTTTTGCTTTCTCTACCGTCGATGACCATATATG
GTTCCGTAATTACCAGATATCAGTACCTCATAATGAGGCAGACAAGGTTGCTCGTGGTGG
TCTTGATAAAATGACCCTTGTCGAGGTTGGTCCAAGGTTTTGTTTAAACCCGATTAAGAT
CTTTGGAGGAAGCTTTGGTGGTCCAACCCTTTACGAGAACCCATTCTACGTATCTCCAAA
CCAGATCCGAGCCTTGGAGAAGAGGAATAAAGCTGGGAAATTTGCAAAGAAGATCAAAGC
TAAAACAAGGAGAAAGATGCATGAGCTTTCCAACCCATTGGAGCCTGATGAATTTGCAGA
CATGTGGAAGGATGACGAATGATCAAGTTCCATTCAAGTTTTTCTTGTTGTAAACCCCTT
TCAAATTCACAGAAAGCTCTCACATTTTTATATTTGTACTACGGTTCTTGACTCTGTTTT
CATTTATCCCTCTTATGGATCAAAATGGTAATATTTTTCTT

QA 3 583 3 583
DS 



AS 1 6

CO CL1545Contig1 788 6 16 U
GGGAGATGAGATTGAAATCGAAGCACTCACACAGACGAACGAAGATCAATAATGGCTCTC
GAGGCATGGTTAATGGATGATAGCAATGAAGATCAGAGACTTCCTCATCATCCTAACCCC
AAAGAGCTCCTCCCTATGGATTACTTGGCAGAACTGGGAGTATTGTACTGGAAGTTGAAC
CCTGAGAACTACGAGAATGATTCCGAGCTAGCCAAGATTAGAGATGAAAGGGGTTACGAT
TACATGGATTTGCTGGATCTGTGTCCCGAGAAAGTCAGCAACTACGAGGAGAAGCTGAAG
AACTTTTTCACAGAACACATTCACCAGGACGAAGAGATTCGCTACTGCCTTGCAGGAAGT
GGCTATTTTGATGTTAGGGACAAGGATGACCGTTGGATCCGAATTTGGATGAAACCGGGC
GATCTCATTGTCCTTCCTGCCGGGATCTACCACCGGTTCACACTCGACACCAGCAACTAC
ATCAAGCTAATGAGGCTGTTTGTGGGAGAACCGGTTTGGACACCATATAACCGGCCGCAG
GAAGAACACCCGGTTAGGAAGGAGTATATAAAGAGCTTGACCCACAAGTTTGGAGAAAGC
ATTCAAGCTCATTAAGAAGATGGCATTGTGGTGCATTTCTTTGTGTTGTTTACTCAGTTG
TTCTTGTCACATATTTGTGCTTTTGTTCAAATAAAAAAAAATATTTGTCACCTAAATAGT
GAAAGTTGTTAAACTTTGTTTAATTAATTTTACATTTGATATGTATTTTTAGCATGAGCA
TCTTTTAT


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU51TF U 1
AF RR2AS47JQ C 2
AF RR2FP18TF U 2
AF RR2AS47TF U 2
AF RR2FU51JQ C 449
AF RR2FP18JQ C 114
BS 1 42 RR2FU51TF
BS 43 43 RR2FP18TF
BS 44 49 RR2FU51TF
BS 50 50 RR2AS47TF
BS 51 209 RR2FU51TF
BS 210 210 RR2FP18TF
BS 211 273 RR2FU51TF
BS 274 274 RR2FP18TF
BS 275 326 RR2FU51TF
BS 327 451 RR2FP18TF
BS 452 452 RR2AS47TF
BS 453 664 RR2FP18TF
BS 665 665 RR2AS47TF
BS 666 683 RR2FP18TF
BS 684 688 RR2AS47TF
BS 689 788 RR2FP18JQ

RD RR2FU51TF 329 0 0
GGGAGATGAGATTGAAATCGAAGCACTCACACAGACGAACGAGGATCAAGAATGGCTCTC
GAGGCATGGTTAATGGATGATAGCAATGAAGATCAGAGACTTCCTCATCATCCTAACCCC
AAAGAGCTCCTCCCTATGGATTACTTGGCAGAACTGGGAGTATTGTACTGGAAGTTGAAC
CCTGAGAACTACGAGAATGATTCCGAGCTGGCCAAGATTAGAGATGAAAGGGGTTACGAT
TACATGGATTTGCTGGATCTGTGTCCCGAGAAATTCAGCAACTACGAGGAGAAGCTGAAG
AACTTTTTCACAGAACACATTCACCA
CGA

QA 1 326 1 326
DS 

RD RR2AS47JQ 687 0 0
GGAGATGAGATTGAAATCGAAGCACTCACACAGACGAACGAAGATCAATAATGGCTCTCG
AGGCATGGTTAATGGATGATAGCAATGAAGATCAGAGACTTCCTCATCATCCTAACCCCA
AAGAGCTCCTCCCTATGGATTACTTGGCAGAACTGGGAGTATTGTACTGGAAGTTGAACC
CTGAGAACTACGAGAATGATTCCGAGCTAGCCAAGATTAGAGATGAAAGGGGTTACGATT
ACATGGATTTGCTGGATCTGTGTCCCGAGAAAGTCAGCAACTACGAGGAGAAGCTGAAGA
ACTTTTTCACAGAACACATTCACCAGGACGAGGAGATTCGCTACTGCCTTGCAGGAAGTG
GCTATTTTGATGTTAGGGACAAGGATGACCGTTGGATCCGAATTTGGATGAAACCGGGCG
ATCTCATTGTCCTTCCTGCCGGGATCTACCACCGGTTCACACTCGACACCAGCAACTACA
TCAAGCTAATGAGGCTGTTTGTGGGAGAACCGGTTTGGACACCATATAACCGGCCGCAGG
AAGAACACCCGGTTAGGAAGGAGTATATAAAGAGCTTGACCCACAAGTTTGGAGAAAGCA
TTCAAGCTCATTAAGAAGATGGCATTGTGGTGCATTTCTTTGTGTTGTTTACTCAGTTGT
TCTTGTCACATATTTGTGCTTTTGTTC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2FP18TF 688 0 0
GGAGATGAGATTGAAATCGAAGCACTCACACAGACGAACGAAGATCAAGAATGGCTCTCG
AGGCATGGTTAATGGATGATAGCAATGAAGATCAGAGACTTCCTCATCATCCTAACCCCA
AAGAGCTCCTCCCTATGGATTACCTGGCAGAACTGGGAGTATTGTACTGGAAGTTGAACC
CTGAGAACTACGAGAATGATTCCGAGCTAGCCAAGATTAGAGATGAAAGGGGTTACGATT
ACATGGATTTGCTGGATCTGTGTCCCGAGAAAGTCAGCAACTACGAGGAGAAGCTGAAGA
ACTTTTTCACAGAACACATTCACCAGGACGAAGAGATTCGCTACTGCCTTGCAGGAAGTG
GCTATTTTGATGTTAGGGACAAGGATGACCGTTGGATCCGAATTTGGATGAAACCGGGCG
ATCTCATTGTCCTTCCTGCCGGGATCTACCGCCGGTTCACACTCGACACCAGCAACTACA
TCAAGCTAATGAGGCTGTTTGTGGGAGAACCGGTTTGGACACCATATAACCGGCCGCAGG
AAGAACACCCGGTTAGGAAGGAGTATATAAAGAGCTTGACCCACAAGTTTGGAGAAAGCA
TTCAAGCTCATTAAGAAGATGGCATTGTGGTGCATTTCTTTGTGTTGTTTACTCAGTTGT
TCT*GTCACATATTTGTGCTTT
GTTCAA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2AS47TF 687 0 0
GGAGATGAGATTGAAATCGAAGCACTCACACAGACGAACGAAGATCAATAATGGCTCTCG
AGGCATGGTTAATGGATGATAGCAATGAAGATCAGAGACTTCCTCATCATCCTAACCCCA
AAGAGCTCCTCCCTATGGATTACTTGGCAGAACTGGGAGTATTGTACTGGAAGTTGAACC
CTGAGAACTACGAGAATGATTCCGAGCTAGCCAAGATTAGAGATGAAAGGGGTTACGATT
ACATGGATTTGCTGGATCTGTGTCCCGAGAAAGTCAGCAACTACGAGGAGAAGCTGAAGA
ACTTTTTCACAGAACACATTCACCAGGACGAGGAGATTCGCTACTGCCTTGCAGGAAGTG
GCTATTTTGATGTTAGGGACAAGGATGACCGTTGGATCCGAATTTGGATGAAACCGGGCG
ATCTCATTGTCCTTCCTGCCGGGATCTACCACCGGTTCACACTCGACACCAGCAACTACA
TCAAGCTAATGAGGCTGTTTGTGGGAGAACCGGTTTGGACACCATATAACCGGCCGCAGG
AAGAACACCCGGTTAGGAAGGAGTATATAAAGAGCTTGACCCACAAGTTTGGAGAAAGCA
TTCAAGCTCATTAAGAAGATGGCATTGTGGTGCATTTCTTTGTGTTGTTTACTCAGTTGT
TCTTGTCACATATTTGTGCTTTTGTTC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2FU51JQ 252 0 0
ACCA
CCGGTTCACACTTGACACCAGCAACTACATCAAGATAATGAGGCTGTTTGTGGGAGAACC
GGTTTGGACACCATATAACCGGCCGCAGGAAGAACACCCGGTTAGGAAGGAGTATATAAA
GAGCTTGACCCACAAGTTTGGAGAAAGCATTCAAGCTCATTAAGAAGATGGCATTGTGGT
GCATTTTTATGTGTTGTTTACTCAGTTGTTCTTGTTACATATTTGTGCTTTTGTTCAAAT
AAAAAAAA

QA 5 252 5 252
DS 

RD RR2FP18JQ 675 0 0
TAACCCCAAAGAGCTCCTCCCTATGGATTACCTGGCAGAACTGGGAGTATTGTACTGGAA
GTTGAACCCTGAGAACTACGAGAATGATTCCGAGCTAGCCAAGATTAGAGATGAAAGGGG
TTACGATTACATGGATTTGCTGGATCTGTGTCCCGAGAAAGTCAGCAACTACGAGGAGAA
GCTGAAGAACTTTTTCACAGAACACATTCACCAGGACGAAGAGATTCGCTACTGCCTTGC
AGGAAGTGGCTATTTTGATGTTAGGGACAAGGATGACCGTTGGATCCGAATTTGGATGAA
ACCGGGCGATCTCATTGTCCTTCCTGCCGGGATCTACCGCCGGTTCACACTCGACACCAG
CAACTACATCAAGCTAATGAGGCTGTTTGTGGGAGAACCGGTTTGGACACCATATAACCG
GCCGCAGGAAGAACACCCGGTTAGGAAGGAGTATATAAAGAGCTTGACCCACAAGTTTGG
AGAAAGCATTCAAGCTCATTAAGAAGATGGCATTGTGGTGCATTTCTTTGTGTTGTTTAC
TCAGTTGTTCTTGTCACATATTTGTGCTTTTGTTCAAATAAAAAAAAATATTTGTCACCT
AAATAGTGAAAGTTGTTAAACTTTGTTTAATTAATTTTACATTTGATATGTATTTTTAGC
ATGAGCATCTTTTAT

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 6

CO CL1546Contig1 903 6 25 U
CAAATAACGTAAATCATCATCATTCATAGAAAA*GTTACAAGCCATGTAATAAAATACAG
TAAATATATAT**CATGGGCAAGAGACGACGTAATAATACAAACTTACAAAAGTATCAAC
CCACATAAGAAGAAAGAAACTCATTAGAAGAAGTTACCGAATTGGCTGCTTAGTGAATTC
TTGAGATTAGAGTATAAGCCATAAAGCGAGTACCGCTTCAGATTCGCAACCTCGTACCAC
GAGTTCATCGCGGTGTAGTGTTTATCCGTGCCGGAGAACGCCAACTGGATCCCCAAGCTG
CAATCTACTTGCCCTCCTTGGTTCTTGCAGCTTTGCCTTTTAATCGCGCATTGGTCTTTG
TTGAGGCACACGAATTTGGCATTTCCGGAACATTTGGAGCATCCGTCTTTCTTCCAGAAC
AAGTTCTCGAGCCTGCCTTTCTGGAACTCAAGAACAAGGGTGAAGCTTGTGACGACGTGA
TCGTTGTCAGCAACCATAATAGGAACTGATCTTGCTGCGTACTTCGCACCAGCGAATGCT
ACCATATATCCCTTTGAGGAATCCGGGCGGAAACTAGAGGAGTTCGAGGAGGTGTTGATG
GTAAGGAGTGTGATCTCATCGACTTTAGGTCTGAATACGGCGAGCTCGGAGTTACCGTTG
AGGGAGAGGCGGCGATGATCGCAGGGAGAGTACTGAACGGAACGATTGGTGCCGAAGAAA
GAATCTCTCGCCGCGAAGGCAATGCCGAAAGTGAATCCATCGCCGATCGCGACAGTTGAG
TCTGAGCAAGGCGAGTAAACTTTATTATCGTCGCCGGCTTTCGTTAGTGATGACGTCAGC
GCCGCCGCGAAGAGGAAACAGAGAAGAAGGAATCTAGCCATCTGTCAAAAGGACAAAAAA
AAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2HA13JQ U 1
AF RR2BN85JQ U 9
AF RR2FQ08JQ U 9
AF RR2HA13TF C 248
AF RR2BN85TF C 162
AF RR2FQ08TF C 235
BS 1 28 RR2HA13JQ
BS 29 29 RR2BN85JQ
BS 30 33 RR2HA13JQ
BS 34 34 RR2BN85JQ
BS 35 71 RR2HA13JQ
BS 72 73 RR2BN85JQ
BS 74 146 RR2HA13JQ
BS 147 147 RR2BN85JQ
BS 148 150 RR2HA13JQ
BS 151 151 RR2BN85JQ
BS 152 213 RR2HA13JQ
BS 214 214 RR2BN85JQ
BS 215 220 RR2HA13JQ
BS 221 221 RR2BN85JQ
BS 222 275 RR2HA13JQ
BS 276 276 RR2BN85JQ
BS 277 335 RR2HA13JQ
BS 336 336 RR2BN85JQ
BS 337 488 RR2HA13JQ
BS 489 489 RR2BN85JQ
BS 490 704 RR2HA13JQ
BS 705 727 RR2BN85JQ
BS 728 785 RR2FQ08JQ
BS 786 902 RR2BN85TF
BS 903 903 RR2FQ08TF

RD RR2HA13JQ 704 0 0
CAAATAACGTAAATCATCATCATTCATAAAAAAAGTTACAAGCCATGTAATAAAATACAG
TAAATATATATATCATGGGCAAGAGACGACGTAATAATACAAACTTACAAAAGTATCAAC
CCACATAAGAAGAAAGAAACTCATTAAAAGGAGTTACCGAATTGGCTGCTTAGTGAATTC
TTGAGATTAGAGTATAAGCCATAAAGCGAGTACTGCTTCAAATTCGCAACCTCGTACCAC
GAGTTCATCGCGGTGTAGTGTTTATCCGTGCCGGAAAACGCCAACTGGATCCCCAAGCTG
CAATCTACTTGCCCTCCTTGGTTCTTGCAGCTTTGTCTTTTAATCGCGCATTGGTCTTTG
TTGAGGCACACGAATTTGGCATTTCCGGAACATTTGGAGCATCCGTCTTTCTTCCAGAAC
AAGTTCTCGAGCCTGCCTTTCTGGAACTCAAGAACAAGGGTGAAGCTTGTGACGACGTGA
TCGTTGTCCGCAACCATAATAGGAACTGATCTTGCTGCGTACTTCGCACCAGCGAATGCT
ACCATATATCCCTTTGAGGAATCCGGGCGGAAACTAGAGGAGTTCGAGGAGGTGTTGATG
GTAAGGAGTGTGATCTCATCGACTTTAGGTCTGAATACGGCGAGCTCGGAGTTACCGTTG
AGGGAGAGGCGGCGATGATCGCAGGGAGAGTACTGAACGGAACG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2BN85JQ 719 0 0
GCGTAAA
ATCATCATTCATAGAAAA*GTTACAAGCCATGTAATAAAATACAGTAAATATATAT**CA
TGGGCAAGAGACGACGTAATAATACAAACTTACAAAAGTATCAACCCACATAAGAAGAAA
GAAACTCATTAGAAGAAGTTACCGAATTGGCTGCTTAGTGAATTCTTGAGATTAGAGTAT
AAGCCATAAAGCGAGTACCGCTTCAGATTCGCAACCTCGTACCGCGAGTTCATCGCGGTG
TAGTGTTTATCCGTGCCGGAGAACGCCAACTGGATCCCCAAGCTGCAATCTACTTGCCCT
CCTTGGTTCTTGCGGCTTTGCCTTTTAATCGCGCATTGGTCTTTGTTGAGGCACACGAAT
TTGTCATTTCCGGAACATTTGGAGCATCCGTCTTTCTTCCAGAACAAGTTCTCGAGCCTG
CCTTTCTGGAACTCAAGAACAAGGGTGAAGCTTGTGACGACGTGATCGTTGTCAGCAACC
ATAATAGGAACTGATCTTGCAGCGTACTTCGCACCAGCGAATGCTACCATATACCCCTTT
GAGGAATCCGGGCGGAAACTAGAGGAGTTCGAGGAGGTATTGATGGTAAGGAGTGTGATC
TCATCGACTTTAGGTCTGAATACGGCGAGCTCGGAGCTACCGTTGAGGGAGAGGCGGCGA
TGATCGCAGGGAGAGTACTGAACGGAACGATTGGTGCCGAAGAAAGAATCTC

QA 8 719 8 719
DS 

RD RR2FQ08JQ 777 0 0
AGCGTAA
ATCATCATTCATAGAAAA*GTCACAAGCCATGTAATAAAATACAGTAAATATATAT**CA
TGGGCAAGAGACGACGTAATAATACAAACTTACAAAAGTATCAACCCACATAAGAAGAAA
GAAACTCATTAGAAGAAGTTACCGAATTGGCTGCTTAGTGAATTCTTGAGATTAGAGTAT
AAGCCATAAAGCGAGTACTGCTTCAGATTCGCAACCTCGTACCACGAGTTCATCGCGGTG
TAGTGTTTATCCGTGCCGGAGAACGCCAACTGGATCCCCAAGCTGCAATCTACTTGCCCT
CCCTGGTTCTTGCAGCTTTGCCTTTTAATCGCGCATTGGTCTTTGTTGAGGCACACGAAT
TTGGCATTTCCGGAACATTTGGAGCATCCGTCTTTCTTCCAGAACAAGTTCTCGAGCCTG
CCTTTCTGGAACTCAAGAACAAGGGTGAAGCTTGTGACGACGTGATCGTTGTCTGCAACC
ATAATAGGAACTGATCTTGCTGCGTACTTCGCACCAGCGAATGCTACCATATATCCCTTT
GAGGAATCCGGGCGGAAACTAGAGGAGTTCGAGGAGGTGTTGATGGTAAGGAGTGTGATC
TCATCGACTTTAGGTCTGAATACGGCGAGCTCGGAGTTACCGTTGAGGGAGAGGCGGCGA
TGATCGCAGGGAGAGTACTGAACGGAACGATTGGTGCCGAAGAAAGAATCTCTCGCCGCG
AAGGCAATGCCGAAAGTGAATCCATCGCCGATCGCGACAGTTGAGTCTGA

QA 8 777 8 777
DS 

RD RR2HA13TF 640 0 0
TCGCGGTGTAGTGTTTATCCGTGCCGGAGAACGCCAACTGGATCCCCAAGCTGCAATCTA
CTTGCCCTCCTTGGTTCTTGCAGCTTTGTCTTTTAATCGCGCATTGGTCTTTGTTGAGGC
ACACGAATTTGGCATTTCCGGAACATTTGGAGCATCCGTCTTTCTTCCAGAACAAGTTCT
CGAGCCTGCCTTTCTGGAACTCAAGAACAAGGGTGAAGCTTGTGACGACGTGATCGTTGT
CCGCAACCATAATAGGAACTGATCTTGCTGCGTACTTCGCACCAGCGAATGCTACCATAT
ATCCCTTTGAGGAATCCGGGCGGAAACTAGAGGAGTTCGAGGAGGTGTTGATGGTAAGGA
GTGTGATCTCATCGACTTTAGGTCTGAATACGGCGAGCTCGGAGTTACCGTTGAGGGAGA
GGCGGCGATGATCGCAGGGAGAGTACTGAACGGAACGATTGGTGCCGAAGAAAGAATCTC
TCGCCGCGAAGGCAATGTCGAAAGTGAATCCATCGCCGATCGCGACAGTTGAGTCTGAGC
AAGGCGAGTAAACTTTATTATCGTCGCCGGCTTTCGTTAGTGATGACGTCAGCGCCGCCG
CGAAGAGGAAACAGAGAAGAAGGAATCTAGCCATCTGTC
C

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2BN85TF 741 0 0
TTGGCTGCTTAGTGAATTCT*GAGATTAGAGTATAAGCCATAAAGCGAGTACCGCTTCAG
ATTCGCAAC*TCGTACCGCGAGTTCATCGCGGTGTAGTGTTTATCCGTGCCGGAGAACGC
CAACTGGATCCCCAAGCTGCAATCTACTTGCCCTCTTTGGTTCTTGCGGCTTTGCCTTTT
AATCGCGCATTGGTCTTTGTTGAGGCACACGAATTTGTCATTTCCGGAACATTTGGAGCA
TCCGTCTTTCTTCCAGAACAAGTTCTCGAGCCTGCCTTTCTGGAACTCAAGAACAAGGGT
GAAGCTTGTGACGACGTGATCGTTGTCAGCAACCATAATAGGAACTGATCTTGCAGCGTA
CTTCGCACCAGCGAATGCTACCATATACCCCTTTGAGGAATCCGGGCGGAAACTAGAGGA
GTTCGAGGAGGTATTGATGGTAAGGAGTGTGATCTCATCGACTTTAGGTCTGAATACGGC
GAGCTCGGAGCTACCGTTGAGGGAGAGGCGGCGATGATCGCAGGGAGAGTACTGAACGGA
ACGATTGGTGCCGAAGAAAGAATCTCTCGCCGCGAAGGCAATGCCGAAAGTGAATCCATC
GCCGATCGCGACAGTTGAGTCTGAGCAAGGCGAGTAAACTTTATTATCGTCGCCGGCTTT
CGTTAGTGATGACGTCAGCGCCGCCGCGAAGAGGAAACAGAGAAGAAGGAATCTAGCCAT
CTGTCAAAAGGACAAAAAAAA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2FQ08TF 669 0 0
TACCACGAGTTCATCGCGGTGTAGTGTTTATCCGTGCCGGAGAACGCCAACTGGATCCCC
AAGCTGCAATCTACTTGCCCTCCCTGGTTCTTGCAGCTTTGCCTTTTAATCGCGCATTGG
TCTTTGTTGAGGCACACGAATTTGGCATTTCCGGAACATTTGGAGCATCCGTCTTTCTTC
CAGAACAAGTTCTCGAGCCTGCCTTTCTGGAACTCAAGAACAAGGGTGAAGCTTGTGACG
ACGTGATCGTTGTCTGCAACCATAATAGGAACTGATCTTGCTGCGTACTTCGCACCAGCG
AATGCTACCATATATCCCTTTGAGGAATCCGGGCGGAAACTAGAGGAGTTCGAGGAGGTG
TTGATGGTAAGGAGTGTGATCTCATCGACTTTAGGTCTGAATACGGCGAGCTCGGAGTTA
CCGTTGAGGGAGAGGCGGCGATGATCGCAGGGAGAGTACTGAACGGAACGATTGGTGCCG
AAGAAAGAATCTCTCGCCGCGAAGGCAATGCCGAAAGTGAATCCATCGCCGATCGCGACA
GTTGAGTCTGAGCAAGGCGAGTAAACTTTATTATCGTCGCCGGCTTTCGTTAGTGATGAC
GTCAGCGCCGCCGCGAAGAGGAAACAGAGAAGAAGGAATCTAGCCATCTGTCAAAAGGAC
AAAAAAAAA

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 6

CO CL1547Contig1 927 6 23 U
GGAAATCCCTCGGTGTCTCTCACACCATCAATCCCAACGAAAAACCATCCAAAACAATGT
ACTCAGCATCGTCTGTAATAAAACGCCTCATTTTGATCCACGTATTTGCCATACAACTAC
TTCTGACAAACAGCGACTTGTCCTTAAACACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCT
TGGTTAATCAAGGAAAATACAAGCCGGGAAGTGAGTACGAGGACCGTTTAAAAAGAACCA
TGAAAATGATCTATTCAGGCAGTAACAGAGGTTATGACGGGATCGGCGATCCCACTTTTT
CCGCTATCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCCTACGGGCCCAAGTGCCATGACTGCTTTGCCA
CTGCACTCTCTGCGCTTGGTAGGCGATGTCCTTGGTACAAGGGGAGGATAATATGGTATG
ATCACTGTCCTCTCGCGATTTCAACCTTCAATACTATTGGGAAGATAGATTACGACAATA
ACTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGGTGGGAGGAGATATAGGCTCGTTTATAATTGCTT
GGAATAATCTTATTCAAGATCTGACGACTTTTGCCACCAGTGGAGATAATTACACACTGT
ACTCTGTGGGAGAGACTCGGTACAAGGGTGATATGCTGTATGGAATGGTGCAGTGTACGA
AAGGCTTATCGCCAAAAGCTTGTGAGGAGTGTGTGTCGTTTACTAGCTTGCATTTTCAAG
ATTGCCTGAATACTAGACGAGGAGGGAGAGTTGTAGGTTTGAGCTGTAATTTTAGGCTTG
AGTTTTACCCGTTTATTGCCGAGCCCGTCCGGAATATTTAATGAGCTAAAGAAATATTTA
ACTTTTTGCTTTCTTTTTTTTCAATCAAAAGTTTATGTAAAATCAAGTGCTACTTTACTC
TTTTGTGACAAATAAAAGAATATTCCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 15 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D143TF U 1
AF RR2A505TF U 2
AF RR2H621TF U 1
AF RR2A716TF U 102
AF RR2A716JQ C 146
AF RR2A505JQ C 185
BS 1 331 RR2D143TF
BS 332 332 RR2A505TF
BS 333 424 RR2D143TF
BS 425 425 RR2A505TF
BS 426 429 RR2D143TF
BS 430 430 RR2A505TF
BS 431 502 RR2D143TF
BS 503 625 RR2H621TF
BS 626 626 RR2A505TF
BS 627 663 RR2H621TF
BS 664 664 RR2A716TF
BS 665 676 RR2H621TF
BS 677 677 RR2A716TF
BS 678 718 RR2H621TF
BS 719 719 RR2A716TF
BS 720 722 RR2H621TF
BS 723 723 RR2A716TF
BS 724 729 RR2H621TF
BS 730 730 RR2A716TF
BS 731 752 RR2H621TF
BS 753 771 RR2A716TF
BS 772 878 RR2A716JQ
BS 879 927 RR2A505JQ

RD RR2D143TF 502 0 0
GGAAATCCCTCGGTGTCTCTCACACCATCAATCCCAACGAAAAACCATCCAAAACAATGT
ACTCAGCATCGTCTGTAATAAAACGCCTCATTTTGATCCACGTATTTGCCATACAACTAC
TTCTGACAAACAGCGACTTGTCCTTAAACACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCT
TGGTTAATCAAGGAAAATACAAGCCGGGAAGTGAGTACGAGGACCGTTTAAAAAGAACCA
TGAAAATGATCTATTCAGGCAGTAACAGAGGTTATGACGGGATCGGCGATCCCACTTTTT
CCGCTATCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCCTATGGGCCCAAGTGCCATGACTGCTTTGCCA
CTGCACTCTCTGCGCTTGGTAGGCGATGTCCTTGGTACAAGGGGAGGATAATATGGTATG
ATCAGTGTCTTCTCGCGATTTCAACCTTCAATACTATTGGGAAGATAGATTACGACAATA
ACTTTTGTATGTCCAACGCGAA

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR2A505TF 658 0 0
GAAATCCCTCGGTGTCTCTCACACCATCAATCCCAACGAAAAACCATCCAAAACAATGTA
CTCAGCATCGTCTGTAATAAAACGCCTCATTTTGATCCACGTATTTGCCATACAACTACT
TCTGACAAACAGCGACTTGTCCTTAAACACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCTT
GGTTAATCAAGGAAAATACAAGCCGGGAAGTGAGTACGAGGACCGTTTAAAAAGAACCAT
GAAAATGATCTATTCAGGCAGTAACAGAGGTTATGACGGGATCGGCGATCCCACTTTTTC
CGCTATCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCCTACGGGCCCAAGTGCCATGACTGCTTTGCCAC
TGCACTCTCTGCGCTTGGTAGGCGATGTCCTTGGTACAAGGGGAGGATAATATGGTATGA
TCACTGTCCTCTCGCGATTTCAACCTTCAATACTATTGGGAAAATAGATTACGACAATAA
CTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGGTGGGAGGAGATATAGGCTCGTTTATAATTGCTTG
GAATAATCTTATTCAAGATCTGACGACTTTTGCCACCAGTGGAGATAATTACACACTGTA
CTCTGTGGGAGAGACTCGGTACAAGGGTGATATGCTGTATGGAATGGTGCAGTGTACG

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2H621TF 752 0 0
G
GAAATCCCTCGGTGTCTCTCACACCATCAATCCCAACGAAAAACCATCCAAAACAATGTA
CTCAGCATCGTCTGTAATAAAACGCCTCATTTTGATCCACGTATTTGCCATACAACTACT
TCTGACAAACAGCGACTTGTCCTTAAACACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCTT
GGTTAATCAAGGAAAATACAAGCCGGGAAGTGAGTACGAGGACCGTTTAAAAAGAACCAT
GAAAATGATCTATTCAGGCAGTAACAGAGGTTATGACGGGATCGGCGATCCCACTTTTTC
CGCTATCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCCTATGGGCCCAAGTGCCATGACTGCTTTGCCAC
TGCACTCTCTGCGCTTGGTAGGCGATGTCCTTGGTACAAGGGGAGGATAATATGGTGTGA
TCAGTGTCTTCTCGCGATTTCAACCTTCAATACTATTGGGAAGATAGATTACGACAATAA
CTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGGTGGGAGGAGATATAGGCTCGTTTATAATTGCTTG
GAATAATCTTATTCAAGATCTGACGACTTTTGCCACCAGTGGAGATAATTACACACTGTA
CTCTGTGGGAGAGACTCGGTACAAAGGTGATATGCTGTATGGAATGGTGCAGTGTACGAA
AG*CTTATCGCCAAA*GCTTGTGAGGAGTGTGTGTCGTTTACTAGCTTGCATTTTCA*GA
T*GCCTGA*TACTAGACGAGGAGGGAGAGTT

QA 2 752 2 752
DS 

RD RR2A716TF 670 0 0
GG
ATTTGCCATACAACTACTTCTGACAAACAGCGACTTGTCCTTAAACACGACCAATGCGTA
TCTCAACCACAAATGCTTGGTTAATCAAGGAAAATACAAGCCGGGAAGTGAGTACGAGGA
CCGTTTAAAAAGAACCATGAAAATGATCTATTCAGGCAGTAACAGAGGTTATGACGGGAT
CGGCGATCCCACTTTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCCTACGGGCCCAAGTG
CCATGACTGCTTTGCCACTGCACTCTCTGCGCTTGGTAGGCGATGTCCCTGGTACAAGGG
GAGGATAATATGGTATGATCACTGTCCTCTCGCGATTTCAACCTTCAATACTATTGGGAA
GATAGATTACGACAATAACTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGGTGGGAGGAGATATAGG
CTCGTTTATAATTGCTTGGAATAATCTTATTCAAGATCTGACGACTTTTGCCACCAGTGG
AGATAATTACACACTGTACTCTGTGGGAGAGACTCGGTACAAGGGTGATATGCTGTATGG
AATGGTGCAGTGTACGAAAGGCTTATCGCCAAAAGCTTGTGAGGAGTGTGTGTCGTTTAC
TAGCTTGCATTTTCAAGATTGCCTGAATACTAGACGAGGAGGGAGAGTTGTAGGTTTGAG
CTGTAATT

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR2A716JQ 733 0 0
AAACACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCTTGGTTAATCAAGGAAAATACAAGCC
GGGAAGTGAGTACGAGGACCGTTTAAAAAGAACCATGAAAATGATCTATTCAGGCAGTAA
CAGAGGTTATGACGGGATCGGCGATCCCACTTTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGCGGCGA
CTCCTACGGGCCCAAGTGCCATGACTGCTTTGCCACTGCACTCTCTGCGCTTGGTAGGCG
ATGTCCCTGGTACAAGGGGAGGATAATATGGTATGATCACTGTCCTCTCGCGATTTCAAC
CTTCAATACTATTGGGAAGATAGATTACGACAATAACTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAA
GGTGGGAGGAGATATAGGCTCGTTTATAATTGCTTGGAATAATCTTATTCAAGATCTGAC
GACTTTTGCCACCAGTGGAGATAATTACACACTGTACTCTGTGGGAGAGACTCGGTACAA
GGGTGATATGCTGTATGGAATGGTGCAGTGTACGAAAGGCTTATCGCCAAAAGCTTGTGA
GGAGTGTGTGTCGTTTACTAGCTTGCATTTTCAAGATTGCCTGAATACTAGACGAGGAGG
GAGAGTTGTAGGTTTGAGCTGTAATTTTAGGCTTGAGTTTTACCCGTTTATTGCCGAGCC
CGTCCGGAATATTTAATGAGCTAAAGAAATATTTAACTTTTTGCTTTCTTTTTTTTCAAT
CAAAAGTTTATGT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2A505JQ 743 0 0
TAATCAAGGAAAATACAAGCCGGGAAGTGAGTACGAGGACCGTTTAAAAAGAACCATGAA
AATGATCTATTCAGGCAGTAACAGAGGTTATGACGGGATCGGCGATCCCACTTTTTCCGC
TATCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCCTACGGGCCCAAGTGCCATGACTGCTTTGCCACTGC
ACTCTCTGCGCTTGGTAGGCGATGTCCTTGGTACAAGGGGAGGATAATATGGTATGATCA
CTGTCCTCTCGCGATTTCAACCTTCAATACTATTGGGAAAATAGATTACGACAATAACTT
TTGTATGTCCAACGCGAAGAAGGTGGGAGGAGATATAGGCTCGTTTATAATTGCTTGGAA
TAATCTTATTCAAGATCTGACGACTTTTGCCACCAGTGGAGATAATTACACACTGTACTC
TGTGGGAGAGACTCGGTACAAGGGTGATATGCTGTATGGAATGGTGCAGTGTACGAAAGG
CTTATCGCCAAAAGCTTGTGAGGAGTGTGTGTCGTTTACTAGCTTGCATTTTCAAGATTG
CCTGAATACTAGACGAGGAGGGAGAGTTGTAGGTTTGAGCTGTAATTTTAGGCTTGAGTT
TTACCCGTTTATTGCCGAGCCCGTCCGGAATATTTAATGAGCTAAAGAAATATTTAACTT
TTTGCTTTCTTTTTTTTCAATCAAAAGTTTATGTAAAATCAAGTGCTACTTTACTCTTTT
GTGACAAATAAAAGAATATTCCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 6

CO CL1548Contig1 1074 6 12 U
GTTTCAACATTAGTCAAAGCTAATTTTCCCCCCTATGGCATGAGTTTTCCACATGGATGT
CCCACCGGTAGATTTTGCAACGGCAAGATCCCTGCTGATTTTATAGCGGAATTTTTAGGA
GTAAAACCAACTTTACCGCCATACTTGAAGCCAGGGCTAACCCAAGAAGATCTCATCACT
GGTGTATCATTTGCTTCAGGTGGTTCTGGCTTCGATCCTTTGACACCTATCGTTGTAAGC
GCGATACCGATGTCAAACCAGTTGACATATTTTCAAGAATACATTGAGAAAGTGAAAGGC
TTTGTGGGAAAAGAGAAAGCGGAGCATATAATATCCAAAAGTCTAGCCATTGTGGTTGCG
GGCAGCGATGATCTAGCTAATACATACTATGGTACACATGCAGAAGAATTATTATATGAC
ATCGATGCATATACCTCCTATATGGCTAGCTCTGCTGCAAGTTTCGCTATGCAACTATAT
GAATCTGGAGCAAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACCAATAGGGTGTATACCGATA
CAAAGAACCGCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAGTGTGCTGATGAAGTAAACGTTGCAGCT
CAGCTTTTCAATACCAAACTCTCCAGAAGTTTGCATTCAGTGGCTGAGACCTTGGAAAAT
GGCACTTTGGTGTATATTGATGTCTACGCTCTCTTCGCTCAAATGATCCAAAACCCAAAA
GAATATGGATTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACGGGGCTGGTCGAATTAGGC
CCGCTTTGCAACCAATTTACATCACTTCTGTGCAGCAATGTATCTTCTTATATGTTTTGG
GACAGTTACCATCCAACGGAAAGAGCTTATAGAATTTTAACCAAAAAGTTTATAGAGACA
GACATGAGCCCTTTTTATGACAAATAGATTTAATATGTGTCTGTTGTGATAAAATTTGGC
TAAATAAAAGGTGTAACTCATTTGGTTTAATGTTTCTTTTGGTACTTATTTGGTATAATG
TATTATATTAACATGGAACTAGGAATTAATAAAAAGATGGAGGGATTCATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GU24TF U 1
AF RR2G363TF U 281
AF RR2GH83TF U 281
AF RR2GH83JQB C 454
AF RR2GU24JQB C 695
AF RR2G363JQ C 488
BS 1 435 RR2GU24TF
BS 436 436 RR2G363TF
BS 437 491 RR2GU24TF
BS 492 492 RR2G363TF
BS 493 590 RR2GU24TF
BS 591 777 RR2G363TF
BS 778 778 RR2GH83TF
BS 779 836 RR2G363TF
BS 837 914 RR2GH83TF
BS 915 915 RR2GH83JQB
BS 916 956 RR2GH83TF
BS 957 1074 RR2GH83JQB

RD RR2GU24TF 590 0 0
GTTTCAACATTAGTCAAAGCTAATTTTCCCCCCTATGGCATGAGTTTTCCACATGGATGT
CCCACCGGTAGATTTTGCAACGGCAAGATCCCTGCTGATTTTATAGCGGAATTTTTAGGA
GTAAAACCAACTTTACCGCCATACTTGAAGCCAGGGCTAACCCAAGAAGATCTCATCACT
GGTGTATCATTTGCTTCAGGTGGTTCTGGCTTCGATCCTTTGACACCTATCGTTGTAAGC
GCGATACCGATGTCAAACCAGTTGACATATTTTCAAGAATACATTGAGAAAGTGAAAGGC
TTTGTGGGAAAAGAGAAAGCGGAGCATATAATATCCAAAAGTCTAGCCATTGTGGTTGCG
GGCAGCGATGATCTAGCTAATACATACTATGGTACACATGCAGAAGAATTATTATATGAC
ATCGATGCATATACCCCCTATATGGCTAGCTCTGCTGCAAGTTTCGCTATGCAACTATAT
GAATCTGGAGCGAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACCAATAGGGTGTATACCGATA
CAAAGAACCGCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAGTGTGCTGATGAAGTAAA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2G363TF 556 0 0
GG
ATTGAGAAAGTGAAAGGCTTTGTGGGAAAAGAGAAAGCGGAGCATATAATATCCAAAAGT
CTAGCCATTGTGGTTGCGGGCAGCGATGATCTAGCTAATACATACTATGGTACACATGCA
GAAGAATTATTATATGACATCGATGCATATACCTCCTATATGGCTAGCTCTGCTGCAAGT
TTCGCTATGCAACTATATGAATCTGGAGCAAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACCA
ATAGGGTGTATACCGATACAAAGAACCGCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAGTGTGCTGAT
GAAGTAAACGTTGCAGCTCAGCTTTTCAATACCAAACTCTCCAGAAGTTTGCATTCAGTG
GCTGAGACCTTGGAAAATGGCACTTTGGTGTATATTGATGTCTACGCTCTCTTCGCTCAA
ATGATCCAAAACCCAAAAGAATATGGATTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACG
GGGCTGGTCGAATTATGCCCGCTTTGCAACCAATTTACATCACTTCTGTGCAGCAATGTA
TCTTCTTATATGTT

QA 3 556 3 556
DS 

RD RR2GH83TF 676 0 0
GG
ATTGAGAAAGTGAAAGGCTTTGTGGGAAAAGAGAAAGCGGAGCATATAATATCCAAAAGT
CTAGCCATTGTGGTTGCGGGCAGCGATGATCTAGCTAATACATACTATGGTACACATGCA
GAAGAATTATTATATGACATCGATGCATATACCTCCTATATGGCTAGCTCTGCTGCAAGT
TTCGCTATGCAACTATATGAATCTGGAGCAAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACCA
ATAGGGTGTATACCGATACAAAGAACCGCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAGTGTGCTGAT
GAAGTAAACGTTGCAGCTCAGCTTTTCAATACCAAACTCTCCAGAAGTTTGCATTCAGTG
GCTGAGACCTTGGAAAATGGCACTTTGGTGTATATTGATGTCTACGCTCTCTTCGCTCAA
ATGATCCAAAACCCAAAAGAATATGGATTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACG
GGGCTGGTCGAATTAGGCCCGCTTTGCAACCAATTTACATCACTTCTGTGCAGCAATGTA
TCTTCTTATATGTTTTGGGACAGTTACCATCCAACGGAAAGAGCTTATAGAATTTTAACC
AAAAAGTTTATAGAGACAGACATGAGCCCTTTCTATGACAAATAGATTTAATATGTGTCT
GTTGTGATAAAATT

QA 3 676 3 676
DS 

RD RR2GH83JQB 621 0 0
GCTGCAAGTTTCGCTATGCAACTATATGAATCTGGAGCAAGAAAGATAGGATTCATTGGT
ATATCACCAATAGGGTGTATACCGATACAAAGAACCGCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAG
TGTGCTGATGAAGTAAACGTTGCAGTTCAGCTTTTCAATACCAAACTCTCCAGAAGTTTG
CATTCAGTGGCTGAGACCTTGGAAAATGGCACTTTGGTGTATATTGATGTTTACGCTCTC
TTCGCTCAAATGATCCAAAACCCAAAAGAATATGGATTTGATGAGATTGATAGAGGATGT
TGCGGGACGGGGCTGGTCGAATTAGGCCCGCTTTGCAACCAATTTACATCACTTCTGTGC
AGCAATGTATCTTCTTATATGTTTTGGGACAGTTACCATCCAACGGAAAGAGCTTATAGA
ATTTTAACCAAAAAGTTTATAGAGACAGACATGAGCCCTTTTTATGACAAATAGATTTAA
TATGTGTCTGTTGTGATAAAATTTGGCTAAATAAAAGGTGTAACTCATTTGGTTTAATGT
TTCTTTTGGTACTTATTTGGTATAATGTATTATATTAACATGGAACTAGGAATTAATAAA
AAGATGGAGGGATTCATTTCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2GU24JQB 380 0 0
TCGCTCAAATGATCCAAAACCCAAAAGAATATGGATTTGATGAGATTGATAGAGGATGTT
GCGGGACGGGGCTGGTCGAATTAGGCCCGCTTTGCAACCAATTTACATCACTTCTGTGCA
GCAATGTATCTTCTTATATGTTTTGGGACAGTTACCATCCAACGGAAAGAGCTTATAGAA
TTTTAACCAAAAAGTTTATAGAGACAGACATGAGCCCTTTTTATGACAAATAGATTTAAG
ATGTGTCTGTTGTGATAAAATTTGGCTAAATAAAAGGTGTAACTCATTTGGTTTAATGTT
TCTTTTGGTACTTATTTGGTATAATGTATAATATTAACATGGAACTAGGAATTAATAAAA
AGATGGAGGGATTCATTTCC

QA 1 380 1 380
DS 

RD RR2G363JQ 587 0 0
GAGCAAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACCAATAGGGTGTATACCGATACAAAGAA
CCGCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAGTGTGCTGATGAAGTAAACGTTGCAGTTCAGCTTT
TCAATACCAAACTCTCCAGAAGTTTGCATTCAGTGGCTGAGACCTTGGAAAATGGCACTT
TGGTGTATATTGATGTTTACGCTCTTTTCGCTCAAATGATCCAAAACCCAAAAGAATATG
GATTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACGGGGCTGGTCGAATTAGGCCCGCTTT
GCAACCAATTTACATCACTTCTGTGCAGCAATGTATCTTTTTATATGTTTTGGGACAGTT
ACCATCCAACGGAAAGAGCTTATAGAATTTTAACCAAAAAGTTTATAGAGACAGACATGA
GCCCTTTTTATGACAAATAGATTTAATATGTGTCTGTTGTGATAAAATTTGGCTAAATAA
AAGGTGTAACTCATTTGGTTTAATGTTTCTTTTGGTACTTATTTGGTATAATGTATTATA
TTAACATGGAACTAGGAATTAATAAAAAGATGGAGGGATTCATTTCC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 4

CO CL1549Contig1 715 4 25 U
GAAGTGATCTAGGTTTCTGTAACGACTAGCTTGTAAATGTCAAGTTTTTCGGACATGAAA
TAAACAGAGCTTCTTGTTCTCAAAAAGTAAAACAAAGATGCAAGATGAATAAATACAAAC
AAGGTCTGTGCAAGGATGTTGTCGAGATAAATCATTGTCTTCTACCAGTTTCGAAACTAC
TCACAAGACGAGGTTATATTTATAACAGAAGAACCAGACTTGGGGGGAGACTACTACTCT
GCCTTGTAACTCTTCTCTAGCTCCTCCAAATGCTCAAGGTCTTTATTGTACTTGCAGATG
CGGAAAATACACCAGTAGAGAAGGATCCCAGCCGCACACAGAACAACATTTCGCTGAGCC
TTGTAGATTGATTTCTCGTAGCGATCCCGCTCGGTGGCAGTGCAAACCTCAGATGAGCAC
ATCAGTCTATGCTCATTCTTCCAGTAAAGATCGAGGAGTTGAAATCCAGCGAAGGCGACG
ATGGAGGCGGCAGGCTGGAGTATGAGCGAGACAAGTGACACGATGCGTTTCTTCACGAGC
ATCGGGTAAGGTAGAGTCAAAATGACTGCGATCGCTACCTCGGCAGCAACCACGTACGAT
AGAATCAGCCATTGCAATGCCATTTTTCTTCTCCCTCTAGCTCTCTCTCTCTCTTTCTCT
CTTTCGGTCCTCTTCTGTGCGCGATCGACGCGTTATCTACGCCGTGTGCGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 20 20 20 20 0 0 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C926JQ U 159
AF RR2AB61JQ U 159
AF RR2AB61TF C 159
AF RR2FV54TF C 1
BS 1 158 RR2FV54TF
BS 159 226 RR2C926JQ
BS 227 227 RR2AB61JQ
BS 228 344 RR2C926JQ
BS 345 345 RR2AB61JQ
BS 346 413 RR2C926JQ
BS 414 414 RR2AB61JQ
BS 415 422 RR2C926JQ
BS 423 423 RR2AB61JQ
BS 424 464 RR2C926JQ
BS 465 465 RR2AB61JQ
BS 466 518 RR2C926JQ
BS 519 519 RR2AB61JQ
BS 520 542 RR2C926JQ
BS 543 543 RR2AB61JQ
BS 544 545 RR2C926JQ
BS 546 546 RR2AB61JQ
BS 547 611 RR2C926JQ
BS 612 612 RR2AB61JQ
BS 613 633 RR2C926JQ
BS 634 634 RR2FV54TF
BS 635 638 RR2C926JQ
BS 639 640 RR2FV54TF
BS 641 642 RR2C926JQ
BS 643 715 RR2FV54TF

RD RR2C926JQ 501 0 0
CTTCTACCAGTTTCGAAACTACTCACAAGACGAGGTTATATTTATAACAGAAGAACCAGA
CTTGGGGG*AGACTACTACTCTGCCTTGTAACTCTTCTCTAGCTCCTCCAAATGCTCAAG
GTCTTTATTGTACTTGCAGATGCGGAAAATACACCAGTAGAGAAGGATCCCAGCCGCACA
CAGAACCACATTTCGCTGAGCCTTGTAGATTGATTTCTCGTAGCGATCCCGCTCGGTGGC
AGTGCAAACCTCAGAGGAGCACATTAGTCTATGCTCATTCTTCCAGTAAAGATCGAGGAG
TTGAAACCCAGCGAAGGCGACGATGGAGGCGGCAGGCTGGAGTATGAGCGAGACAAGTGA
TACGATGCGTTTCTTCACGAGCATAGGATAAGGTAGAGTCAAAATGACTGCGATCGCTAC
CTCGGCAGCAACCACGTACGATAGAATCAGCCACTGCAATGCCATTTTTCTTCTCTCTCT
CTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTC

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2AB61JQ 491 0 0
CTTCTACCAGTTTCGAAACTACTCACAAGACGAGGTTATATTTATAACAGAAGAACCAGA
CTTGGGGGGAGACTACTACTCTGCCTTGTAACTCTTCTCTAGCTCCTCCAAATGCTCAAG
GTCTTTATTGTACTTGCAGATGCGGAAAATACACCAGTAGAGAAGGATCCCAGCCGCACA
CAGAACAACATTTCGCTGAGCCTTGTAGATTGATTTCTCGTAGCGATCCCGCTCGGTGGC
AGTGCAA*CCTCAGATGAGCACATCAGTCTATGCTCATTCTTCCAGTAAAGATCGAGGAG
TTGAAATCCAGCGAAGGCGACGATGGAGGCGGCAGGCTGGAGTATGAGCGAGACAAGTGA
CACGATGCGTTTCTTCACGAGCATCGGGTAAGGTAGAGTCAAAATGACTGCGATCGCTAC
CTCGGCAGCAACCACGTACGATAGAATCAGCCATTGCAATGCCATTTTTCTTCT
TCCTCTAGCTCTCTCCC

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2AB61TF 491 0 0
CTTCTACCAGTTTCGAAACTACTCACAAGACGAGGTTATATTTATAACAGAAGAACCAGA
CTTGGGGGGAGACTACTACTCTGCCTTGTAACTCTTCTCTAGCTCCTCCAAATGCTCAAG
GTCTTTATTGTACTTGCAGATGCGGAAAATACACCAGTAGAGAAGGATCCCAGCCGCACA
CAGAACAACATTTCGCTGAGCCTTGTAGATTGATTTCTCGTAGCGATCCCGCTCGGTGGC
AGTGCAA*CCTCAGATGAGCACATCAGTCTATGCTCATTCTTCCAGTAAAGATCGAGGAG
TTGAAATCCAGCGAAGGCGACGATGGAGGCGGCAGGCTGGAGTATGAGCGAGACAAGTGA
CACGATGCGTTTCTTCACGAGCATCGGGTAAGGTAGAGTCAAAATGACTGCGATCGCTAC
CTCGGCAGCAACCACGTACGATAGAATCAGCCATTGCAATGCCATTTTTCTTCT
TCCTCTAGCTCTCTCCC

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2FV54TF 715 0 0
GAAGTGATCTAGGTTTCTGTAACGACTAGCTTGTAAATGTCAAGTTTTTCGGACATGAAA
TAAACAGAGCTTCTTGTTCTCAAAAAGTAAAACAAAGATGCAAGATGAATAAATACAAAC
AAGGTCTGTGCAAGGATGTTGTCGAGATAAATCATTGTCTTCTAACAGTTTCGAAACTAC
TCACAAGACGAGGTTATATTTATAACAGAAGAACCAGACTTGGGGGGAGACTACTACTCT
GCCTTGTAACTCTTCTCTAGCTCCTCCAAATGCTCAAGGTCTTTATTGTACTTGCAGATG
CGGAAAATACACCAGTAGAGAAGGATCCCAGCCGCACACTGAACAACATTTCGCTGAGCC
TTGTAGATTGATTTCTCGTAGCGATCCCGCTCGGTGGCAGTGCAAACCTCAGATGAGCAC
ATCAGTCTATGCTCATTCTTCCAGTAAAGATCGAGGAGTTGAAATCCAGCGAAGGCGACG
ATGGAGGCGGCAGGCTGGAGTATGAGCGAGACAAGTGACACGATGCGTTTCTTCACGAGC
ATCGGGTAAGGTAGAGTCAAAATGACTGCGATCGCTACCTCGGCAGCAACCACGTACGAT
AGAATCAGCCATTGCAATGCCATTTTTCTTCTTCCTCTAGCTCTCTCTCTCTCTTTCTCT
CTTTCGGTCCTCTTCTGTGCGCGATCGACGCGTTATCTACGCCGTGTGCGAGTCC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 6

CO CL1550Contig1 1083 6 13 U
ATACAAATGGTTGTATAGAAAGAAAGAAAAACATCCACCAATACTTTTTTTACAAATTCA
AATGAATACAAATAAACAACACATCAACGACTTCCAGAAACAGAGATTTATCCACACAAA
GACAAACCAAATAAAATAAAAAGAATGAAAATAGTTTGTTTTTTTTTGTTCCTTTCAGTT
TTTGTCACGTACAAAGATGTTTTCATACAAGATAAAGCAAACCGTACCATCTTGAAACGA
ATCAAGGCTTCGGTGGCTCAGCCACTGGCGCCGGCGTTGTCGTTTCAGCTGGTGCCGTAA
CCGGAGTTTCAACCACCGCTGGAGCTGGAGCTGGAGCTGGAGCAGCTTCTTCCTTTTTCA
CTTCTTCGACGACAGGCTTCTTCTCCTCCTCCTTTTCTACTTCAGGTTTCTTCTCCTCAA
CGACCGCGGTTGCGACGGTCTCTTCTTTCTTCTCTTCAACAATCTCCTTCTCGCCACTTG
TTTCTTCGGTTTTGACTGGCTCCTCGGTTTTGGCTGGCTCCTCGGTCTTGGCTGGTTCTT
CGGTTTTCACTTCCTCCACAGGTACTTCCCGTGTCTTAACCTCCTCGGGAAGGAACACAC
ATACCTTCTCGAATATGAACCCGACTGGTCCGGAGACATAGCCAGCTCCGAAGCTAGAGG
CAGCTTCTTTCACAGCCGTTGACCCGGGGAATTCTATACCGACAAGAGCCTCGAGATATT
TCAGCACAGCCGCAGAGTTTTTCTTCAAACCAGCCTCCTTAGGGTCTCTCACCAAAGCCT
TGACTTCAGCCGACGTGGCCTCATAGGTCTCCACGACCTTTGGTTGGAGTTCTGTCTTTT
TCTCCTCAATTTCCTTGTTGATTGTTTCCTTAGACTCATCAAAGGTCTTGCAAGCTTCAG
CAGCAGCAGCCTTCTTAGCACTATTCCTCTCGAATATCTTCTTGAACCTCGGAACAACCT
TCGAATTCCAGTAACCCATTTTGTAATTTAATTTAAATTCACCGTCTCAACGCGCTTGAG
ATGTTAAATCTCTTTGAAGATCTTCTTCTTTCTTCTCTGGAACACACAAAACTGATTAAT
TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2EM40JQ U 1
AF RR2C159JQ U 32
AF RR2CD75JQ U 32
AF RR2EM40TF C 227
AF RR2C159TF C 395
AF RR2CD75TF C 420
BS 1 406 RR2EM40JQ
BS 407 407 RR2C159JQ
BS 408 439 RR2EM40JQ
BS 440 440 RR2C159JQ
BS 441 720 RR2EM40JQ
BS 721 802 RR2C159JQ
BS 803 917 RR2EM40TF
BS 918 926 RR2C159TF
BS 927 927 RR2CD75TF
BS 928 949 RR2C159TF
BS 950 950 RR2CD75TF
BS 951 1024 RR2C159TF
BS 1025 1083 RR2CD75TF

RD RR2EM40JQ 720 0 0
ATACAAATGGTTGTATAGAAAGAAAGAAAAACATCCACCAATACTTTTTTTACAAATTCA
AATGAATACAAATAAACAACACATCAACGACTTCCAGAAACAGAGATTTATCCACACAAA
GACAAACCAAATAAAATAAAAAGAATGAAAATAGTTTGTTTTTTTTTGTTCCTTTCAGTT
TTTGTCACGTACAAAGATGTTTTCATACAAGATAAAGCAAACCGTACCATCTTGAAACGA
ATCAAGGCTTCGGTGGCTCAGCCACTGGCGCCGGCGTTGTCGTTTCAGCTGGTGCCGTAA
CCGGAGTTTCAACCACCGCTGGAGCTGGAGCTGGAGCTGGAGCAGCTTCTTCCTTTTTCA
CTTCTTCGACGACAGGCTTCTTCTCCTCCTCCTTTTCTACTTCAGGCTTCTTCTCCTCAA
CGACCGCGGTTGCGACGGT*TCTTCTTTCTTCTCTTCAACAATCTCCTTCTCGCCACTTG
TTTCTTCGGTTTTGACTGGCTCCTCGGTTTTGGCTGGCTCCTCGGTCTTGGCTGGTTCTT
CGGTTTTCACTTCCTCCACAGGTACTTCCCGTGTCTTAACCTCCTCGGGAAGGAACACAC
ATACCTTCTCGAATATGAACCCGACTGGTCCGGAGACATAGCCAGCTCCGAAGCTAGAGG
CAGCTTCTTTCACAGCCGTTGACCCGGGGAATTCTATACCGACAAGAGCCTCGAGATATT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2C159JQ 771 0 0
C
ATCCACCAATACTTTTTTTACAAATTCAAATGAATACAAATAAACAACACATCAACGACT
TCCAGAAACAGAGATTTATCCACACAAAGACAAACCAAATAAAATAAAAAGAATGAAAAT
AGTTTGTTTTTTTTTGTTCCTTTCAGTTTTTGTCACGTACAAAGATGTTTTCATACAAGA
TAAAGCAAACCGTACCATCTTGAAACGAATCAAGGCTTCGGTGGCTCAGCCACTGGCGCC
GGCGTTGTCGTTTCAGCTGGTGCCGTAACCGGAGTTTCAACCACCGCTGGAGCTGGAGCT
GGAGCTGGAGCAGCTTCTTCCTTTTTCACTTCTTCGACGACAGGCTTCTTCTCCTCCTCC
TTTTCTACTTCAGGTTTCTTCTCCTCAACGACCGCGGTTGCGACGGTCTCTTCTTTCTTC
TCTTCAACAATCTCCTTCTCGCCACTTGTTTCTTCGGTTTTGACTGGCTCCTCGGTTTTG
GCTGGCTCCCCGGTCTTGGCTGGTTCTTCGGTTTTCACTTCCTCCACAGGTACTTCCCGT
GTCTTAACCTCCTCGGGAAGGAACACACATACCTTCTCGAATATGAACCCGACTGGTCCG
GAGACATAGCCAGCTCCGAAGCTAGAGGCAGCTTCTTTCACAGCCGTTGACCCGGGGAAT
TCTATACCGACAAGAGCCTCGAGATATTTCAGCACAGCCGCAGAGTTTTTCTTCAAACCA
GCCTCCTTAGGGTCTCTCACCAAAGCCTTGACTTCAGCCGACGTGGCCTC

QA 2 771 2 771
DS 

RD RR2CD75JQ 750 0 0
G
ATCCACCAATACTTTTTT*ACAAATTCAAATGAATACAAATAAACAACACATCAACGACT
TCCAGAAACAGAGATTTATCCACACAAAGACAAACCAAATAAAATAAAAAGAATGAAAAT
AGTTTGTTTTTTTTTGTTCCTTTCAGTTTTTGTCACGTACAAAGATGTTTTCATACAAGA
TAAAGCAAACCGTACCATCTTGAAACGAATCAAGGCTTCGGTGGCTCAGCCACTGGCGCC
GGCGTTGTCGTTTCAGCTGGTGCCGTAACCGGAGTTTCAACCACCGCTGGAGCTGGAGCT
GGAGCTGGAGCAGCTTCTTCCTTTTTCACTTCTTCGACGACAGGCTTCTTCTCCTCCTCC
TTTTCTACTTCAGGTTTCTTCTCCTCAACGACCGCGGTTGCGACGGTCTCTTCTTTCTTC
TCTTCAACAATCTCCTTCTCGCCACTTGTTTCTTCGGTTTTGACTGGCTCCTCGGTTTTG
GCTGGCTCCTCGGTCTTGGCTGGTTCTTCGGTTTTCACTTCCTCCACAGGTACTTCCCGT
GTCTTAACCTCCTCGGGAAGGAACACACATACCTTCTCGAATATGAACCCGACTGGTCCG
GAGACATAGCCAGCTCCGAAGCTAGAGGCAGCTTCTTTCACAGCCGTTGACCCGGGGAAT
TCTATACCGACAAGAGCCTCGAGATATTTCAGCACAGCCGCAGAGTTTTTCTTCAAACCA
GCCTCCTTAGG*TCTCTCACCTAAGCCTT

QA 2 750 2 750
DS 

RD RR2EM40TF 692 0 0
CCATCTTGAAACGA*TCAAGGCTTCGGTGGCTCAGCCACTGGCGCCGGCGTTGTCGTTTC
AGCTGGTGCCGTAACCGGAGTTTCAACCACCGCTGGAGCTGGAGCTGGAGCTGGAGCAGC
TTCTTCCTTTTTCACTTCTTCGACGACAGGCTTCTTCTCCTCCTCCTTTTCTACTTCAGG
CTTCTTCTCCTCAACGACCGCGGTTGCGACGGT*TCTTCTTTCTTCTCTTCAACAATCTC
CTTCTCGCCACTTGTTTCTTCGGTTTTGACTGGCTCCTCGGTTTTGGCTGGCTCCTCGGT
CTTGGCTGGTTCTTCGGTTTTCACTTCCTCCACAGGTACTTCCCGTGTCTTAACCTCCTC
GGGAAGGAACACACATACCTTCTCGAATATGAACCCGACTGGTCCGGAGACATAGCCAGC
TCCGAAGCTAGAGGCAGCTTCTTTCACAGCCGTTGACCCGGGGAATTCTATACCGACAAG
AGCCTCGAGATATTTCAGCACAGCCGCAGAGTTTTTCTTCAAACCAGCCTCCTTAGGGTC
TCTCACCAAAGCCTTGACTTCAGCCGACGTGGCCTCATAGGTCTCCACGACCTTTGGTTG
GAGTTCTGTCTTTTTCTCCTCAATTTCCTTGTTGATTGTTTCCTTAGACTCATCAAAGGT
CTTGCAAGCTTCAGCAGCAGCAGCCTTCTTA
C

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2C159TF 630 0 0
TTCTACTTCAGGTTTCTTCTCCTCAACGACCGCGGTTGCGACGGTCTCTTCTTTCTTCTC
TTCAACAATCTCCTTCTCGCCACTTGTTTCTTCGGTTTTGACTGGCTCCTCGGTTTTGGC
TGGCTCCCCGGTCTTGGCTGGTTCTTCGGTTTTCACTTCCTCCACAGGTACTTCCCGTGT
CTTAACCTCCTCGGGAAGGAACACACATACCTTCTCGAATATGAACCCGACTGGTCCGGA
GACATAGCCAGCTCCGAAGCTAGAGGCAGCTTCTTTCACAGCCGTTGACCCGGGGAATTC
TATACCGACAAGAGCCTCGAGATATTTCAGCACAGCCGCAGAGTTTTTCTTCAAACCAGC
CTCCTTAGGGTCTCTCACCAAAGCCTTGACTTCAGCCGACGTGGCCTCATAGGTCTCCAC
GACCTTTGGTTGGAGTTCTGTCTTTTTCTCCTCAATTTCCTTGTTGATTGTTTCCTTAGA
CTCATCAAAGGTCTTGCAAGCTTCAGCAGCAGCAGCCTTCTTAGCACTATTCTTCTCGAA
TATCTTCTTGAACCTTGGAACAACCTTCGAATTCCAGTAACCCATTTTGTAATTTAATTT
AAATTCACCGTCTCAACGCGCTTGAGATGT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2CD75TF 664 0 0
ACGACCGCGGT*GCGACGGTCTCTTCTTTCTTCTCTTCAACAATCTCCTTCTCGCCACTT
GTTTCTTCGGTTTTGACTGGCTCCTCGGTTTTGGCTGGCTCCTCGGTCTTGGCTGGTTCT
TCGGTTTTCACTTCCTCCACAGGTACTTCCCGTGTCTTAACCTCCTCGGGAAGGAACACA
CATACCTTCTCGAATATGAACCCGACTGGTCCGGAGACATAGCCAGCTCCGAAGCTAGAG
GCAGCTTCTTTCACAGCCGTTGACCCGGGGAATTCTATACCGACAAGAGCCTCGAGATAT
TTCAGCACAGCCGCAGAGTTTTTCTTCAAACCAGCCTCCTTAGGGTCTCTCACCTAAGCC
TTGACTTCAGCCGACGTGGCCTCATAGGTCTCCACGACCTTTGGTTGGAGTTCTGTCTTT
TTCTCCTCAATTTCCTTGTTGATTGTTTCCTTAGACTCATCAAAGGTCTTGCAAGCTTCA
GCAGCAGCAGCCTTCTTAGCACTATTCCTCTCGAATATCTTCTTGAACCTCGGAACAACC
TTCGAATTCCAGTAACCCATTTTGTAATTTAATTTAAATTCACCGTCTCAACGCGCTTGA
GATGTTAAATCTCTTTGAAGATCTTCTTCTTTCTTCTCTGGAACACACAAAACTGATTAA
TTCC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 2 4

CO CL1551Contig1 935 2 2 U
GGGAGAATCATTGTAAAGTTGAAACATTTAGTGAAGATGGCAGCAGCTCGGTTAGTGTTT
TCGTTGAGCCTCCCATCAACTACTCATCATGGAATCAATCGAAATTATCAGCCTTTTCTC
CTGACCCAAACAGGAGCTCCTCCTGGATTTCGTGCTCTTCGTTGCCAAGCAAACCCTGAA
TCTCCCGAAGCAAGGAGAAACTGGTGGTGGATAATGAAATTTCACCTGCGTCCAAAGTAG
CTGAACCATCTTCTTCTTCTTCATCTGGGTTTCCTGAGTCTCCAAACAGTGATATTAACA
GAAGAGTCGCTGTTGGTTCTGTTGTTGCCGCTTTGGCCTTGTTTCTATCGACAAGGCTTG
ATTTTGGGATCTCCTTGAAGGATTTAACTGCTTCAGCCTTGCCTTACGAGGAGGCTTTGT
CGAATGGGAAGCCGACAGTGGTTGAGTTCTATGCTGATTGGTGTGAGGTTTGTCGAGAAC
TTGCCCCTGATGTTTACAAAATCGAGCAACAATACAAGGACAAAGTGAACTTTGTGATGC
TAAATGTGGACAACACGAAATGGGAGCAAGAGCTGGATGAGTTTGGTGTTGAAGGTATTC
CTCATTTCGCTTTCCTCGATCGACAAGGGAACGAGGAAGGTAACGTGGTAGGAAGGCTCC
CGAGACAGTATCTAGTTGAGAATGTCAATGCCCTTGCAGACGGAAAGCAATCAATTCCTC
ATGCTCGAGCCGTGGGACAGTACAGCAGCGCCGAAGCCCGCAAGGTGCATCAGGTTACTG
ATCCCTTAAGCCATGGATAGAAAGAGAGAGAGACATCACAAACTCTATAGTGCACAAAAG
ATAGACAGTAAGGGGAACAACTGAAAAGTAGCAATGTTTCATATTTGATCAAATTGTAAC
TAAATGTTTGGTTTCGTTTTATTACATAATAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A208TF U 1
AF RR2A208JQ C 156
BS 1 766 RR2A208TF
BS 767 935 RR2A208JQ

RD RR2A208TF 770 0 0
GGGAGAATCATTGTAAAGTTGAAACATTTAGTGAAGATGGCAGCAGCTCGGTTAGTGTTT
TCGTTGAGCCTCCCATCAACTACTCATCATGGAATCAATCGAAATTATCAGCCTTTTCTC
CTGACCCAAACAGGAGCTCCTCCTGGATTTCGTGCTCTTCGTTGCCAAGCAAACCCTGAA
TCTCCCGAAGCAAGGAGAAACTGGTGGTGGATAATGAAATTTCACCTGCGTCCAAAGTAG
CTGAACCATCTTCTTCTTCTTCATCTGGGTTTCCTGAGTCTCCAAACAGTGATATTAACA
GAAGAGTCGCTGTTGGTTCTGTTGTTGCCGCTTTGGCCTTGTTTCTATCGACAAGGCTTG
ATTTTGGGATCTCCTTGAAGGATTTAACTGCTTCAGCCTTGCCTTACGAGGAGGCTTTGT
CGAATGGGAAGCCGACAGTGGTTGAGTTCTATGCTGATTGGTGTGAGGTTTGTCGAGAAC
TTGCCCCTGATGTTTACAAAATCGAGCAACAATACAAGGACAAAGTGAACTTTGTGATGC
TAAATGTGGACAACACGAAATGGGAGCAAGAGCTGGATGAGTTTGGTGTTGAAGGTATTC
CTCATTTCGCTTTCCTCGATCGACAAGGGAACGAGGAAGGTAACGTGGTAGGAAGGCTCC
CGAGACAGTATCTAGTTGAGAATGTCAATGCCCTTGCAGACGGAAAGCAATCAATTCCTC
ATGCTCGAGCCGTGGGACAGTACAGCAGCGCCGAAGCCCGCAAGGT
GCAT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2A208JQ 780 0 0
TCTTCGTTGCCAAGCAAACCCTGAATCTCCCGAAGCAAGGAGAAACTGGTGGTGGATAAT
GAAATTTCACCTGCGTCCAAAGTAGCTGAACCATCTTCTTCTTCTTCATCTGGGTTTCCT
GAGTCTCCAAACAGTGATATTAACAGAAGAGTCGCTGTTGGTTCTGTTGTTGCCGCTTTG
GCCTTGTTTCTATCGACAAGGCTTGATTTTGGGATCTCCTTGAAGGATTTAACTGCTTCA
GCCTTGCCTTACGAGGAGGCTTTGTCGAATGGGAAGCCGACAGTGGTTGAGTTTTATGCT
GATTGGTGTGAGGTTTGTCGAGAACTTGCCCCTGATGTTTACAAAATCGAGCAACAATAC
AAGGACAAAGTGAACTTTGTGATGCTAAATGTGGACAACACGAAATGGGAGCAAGAGCTG
GATGAGTTTGGTGTTGAAGGTATTCCTCATTTCGCTTTCCTCGATCGACAAGGGAACGAG
GAAGGTAACGTGGTAGGAAGGCTCCCGAGACAGTATCTAGTTGAGAATGTCAATGCCCTT
GCAGACGGAAAGCAATCAATTCCTCATGCTCGAGCCGTGGGACAGTACAGCAGCGCCGAA
GCCCGCAAGGTGCATCAGGTTACTGATCCCTTAAGCCATGGATAGAAAGAGAGAGAGACA
TCACAAACTCTATAGTGCACAAAAGATAGACAGTAAGGGGAACAACTGAAAAGTAGCAAT
GTTTCATATTTGATCAAATTGTAACTAAATGTTTGGTTTCGTTTTATTACATAATAACTT

QA 1 780 1 780
DS 



CO CL1551Contig2 976 2 12 U
GGATTCTGAGAATCATTGTAAAGTTGAAACCTTTTAGTGAAGATGGCAGCTGGGTTAGTG
TTTTCGTTGAGCCTTCCATCAACTACTCATCATGGAATCAATCGAAATTATCAACCTTTT
CTCCTAACCCAAACCGGAGCTCCTCCTAGATTTCGTGCTCTTCGTTGCCAAGCAAACCCT
GAATCTTCCGAAACCAAGGAGAAATTGGTGGTGGATAATGGCTCTACTGATGAAATTTCA
CCTACGTCGAAGGTGGCGAACCATCACCTTCTTCTTCTGGGTTTCCTGAGTCTCCAAACA
GGGATATTAACAGAAGAGTCGCTGTTGGTTCGGTTGTTGCCGCTTTGGCCTTGTTTCTAT
CGACGAGGCTTGATTTTGGGATTTCTTTGAAGGATTTAACTGCTTCAGCCTTGCCTTACG
AGGAGGCTTTGTCGAATGGGAAGCCGACAGTGGTGGAGTTCTACGCTGATTGGTGTGAGG
TTTGTCGAGAACTAGCCCCTGATGTTTACAAAATCGAGCAGCAATACAAGGACAAAGTGA
ACTTTGTGATGCTAAATGTGGACAACACGAAATGGGAGCAAGAGCTGGATGAGTTTGGGT
GTTGAAGGTATTCCTCATTTCGCATTCCTCGATCGACAAAGGAACGAGGAAGGTAATGTG
GTCGGAAAGCTCCCGAGACAGTATCTAGTTGAGAATGTCAATGCCCTTGCAGACGGAAAG
CAATCAATTCCTCATGCTCGAGCCGTGGGACAGTACAGCAGCGCCGAGGCCCGCAAGGTT
CATCAGGTTACCGATCCCTTAAGCCATGGATAGATAGCCAGAGAGAGAGACATCACAACT
CTATAGTGCACAAAAGTAGAAATGTTTGATATTTGATCAATTGTAACTAAATGTTTGGTT
TCGTTTTATTACATAACTTATAAAACTCTAATCAGAAATTGAATCCGAAGACTGATGAGG
ACTCAGCACAGATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ09TF U 1
AF RR2EA24JQ C 290
BS 1 301 RR2GZ09TF
BS 302 302 RR2EA24JQ
BS 303 454 RR2GZ09TF
BS 455 455 RR2EA24JQ
BS 456 463 RR2GZ09TF
BS 464 464 RR2EA24JQ
BS 465 493 RR2GZ09TF
BS 494 494 RR2EA24JQ
BS 495 623 RR2GZ09TF
BS 624 624 RR2EA24JQ
BS 625 718 RR2GZ09TF
BS 719 976 RR2EA24JQ

RD RR2GZ09TF 718 0 0
GGATTCTGAGAATCATTGTAAAGTTGAAACCTTTTAGTGAAGATGGCAGCTGGGTTAGTG
TTTTCGTTGAGCCTTCCATCAACTACTCATCATGGAATCAATCGAAATTATCAACCTTTT
CTCCTAACCCAAACCGGAGCTCCTCCTAGATTTCGTGCTCTTCGTTGCCAAGCAAACCCT
GAATCTTCCGAAACCAAGGAGAAATTGGTGGTGGATAATGGCTCTACTGATGAAATTTCA
CCTACGTCGAAGGTGGCGAACCATCACCTTCTTCTTCTGGGTTTCCTGAGTCTCCAAACA
GTGATATTAACAGAAGAGTCGCTGTTGGTTCGGTTGTTGCCGCTTTGGCCTTGTTTCTAT
CGACGAGGCTTGATTTTGGGATTTCTTTGAAGGATTTAACTGCTTCAGCCTTGCCTTACG
AGGAGGCTTTGTCGAATGGGAAGCCGACAGTGGTTGAGTTCTATGCTGATTGGTGTGAGG
TTTGTCGAGAACTTGCCCCTGATGTTTACAAAATCGAGCAGCAATACAAGGACAAAGTGA
ACTTTGTGATGCTAAATGTGGACAACACGAAATGGGAGCAAGAGCTGGATGAGTTTGGGT
GTTGAAGGTATTCCTCATTTCGCTTTCCTCGATCGACAAAGGAACGAGGAAGGTAATGTG
GTCGGAAAGCTCCCGAGACAGTATCTAGTTGAGAATGTCAATGCCCTTGCAGACGGAA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2EA24JQ 687 0 0
A
TCTCCAAACAGGGATATTAACAGAAGAGTCGCTGTTGGTTCTGTTGTTGCCGCTTTGGCC
TTGTTTCTATCGACGAGGCTTGATTTTGGGATTTCTTTGAAGGATTTAACTGCTTCAGCC
TTGCCTTACGAGGAGGCTTTGTCGAATGGGAAGCCGACAGTGGTGGAGTTCTACGCTGAT
TGGTGTGAGGTTTGTCGAGAACTAGCCCCTGATGTTTACAAAATCGAGCAGCAATACAAG
GACAAAGTGAACTTTGTGATGCTAAATGTGGACAACACGAAATGGGAGCAAGAGCTGGAT
GAGTTTGG*TGTTGAAGGTATTCCTCATTTCGCATTCCTCGATCGACAAGGGAACGAGGA
AGGTAATGTGGTCGGAAGGCTCCCGAGACAGTATCTAGTTGAGAATGTCAATGCCCTTGC
AGCCGGAAAGCAATCAATTCCTCATGCTCGAGCCGTGGGACAGTACAGCAGCGCCGAGGC
CCGCAAGGTTCATCAGGTTACCGATCCCTTAAGCCATGGATAGATAGCCAGAGAGAGAGA
CATCACAACTCTATAGTGCACAAAAGTAGAAATGTTTGATATTTGATCAATTGTAACTAA
ATGTTTGGTTTCGTTTTATTACATAACTTATAAAACTCTAATCAGAAATTGAATCCGAAG
ACTGATGAGGACTCAGCACAGATACC

QA 2 687 2 687
DS 



AS 1 4

CO CL1552Contig1 1090 4 32 U
GGCAATAAAAAACAATTTAAGCAGGACTCTGAAACAAAAGACTGAAAATGGTACTCCTAG
AAGCAAAAGATTAAAATAGCTAAAAATGTATCTTTTTCTCACGAAGCATATGAAAAAGCT
AAGTCTTGTATGTTATTGTCATGAGCCATTTTGATTAAAATTAAAAACCCTTTCAACACA
CTCTGTTATAGAAGAAAGACATGTAAGCAAATGTGGTTTCCGGGGGTAAGCCTCTCCCAT
CATTCCTCACCATCTTCGCCTTCTCCTTCATCGTCTTCATCAGAATCACCTTCCCCCTCA
TCATCTTCATCATCAAAATCCTCTTCATCAGCCTCATTGTTGAAGTAGGTGAGAGGGTTG
GCCCATAAATCTTCCTTGATGATATCCGCAACCTCGTCGAGAATCTCAACTTCAACGTCT
TCGTCCTTGTGTTGACCATCGCTAAACCAGGTAAAGAAACTCTCTTCAGGCAATGCACGT
TTGTTCCCATTCTTCTCGTGGTCCACACCATTTGGCAAGCCCTTTCCCTCTTTCCACTTG
ATAGGCGTGGCTGTGATTTTGGTTGTCCCTTCGTCGAGGAAGGTAAAGGTCTTGGTTAGT
TTCCCATCCTCAAAATAAGGGTTGGCATTGAAGTTAAAAGTGATAGAGTATCCAGACTTC
ACATCTTTGGCATCCTCAACATCCAGAGAGCTTAGATATTTGAATATCTTTTGGTCTTCT
TCAGTTAAAAGATCACCAAGAGCAGGGTGGCTCAAGAAAGCAGTGAGCCAGAAATCAGGA
ATGGCTTTGATGATATCGGCACGCTTGTCATAGACAGGCTTCCTTATACCGTTGTACTTC
TGCTCCACTTCCAACACTTCATCGCTTGCCTTCTCGTTTATCTTCTCGAGGTCGTCTTGA
ATGGACTGAAGCTTTTCAATAGAAAGGAGAAGCTCTCCGTCGATTTGCTCGGCGTTCTAC
TCATCAGTCTTCGCCTTCTTGCTCTTGTTGTCCGCCACCATTCTCACTTTTTTCACCCTA
ATTTGCAAATCCACAGAAAGCTTCGACTCCTTTGCTCTCTTGGCTTTTAGTTCCGTCACA
CGAGCAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H208JQ U 1
AF RR2E784JQ U 73
AF RR2E784TF C 423
AF RR2GS13TF C 428
BS 1 91 RR2H208JQ
BS 92 92 RR2E784JQ
BS 93 101 RR2H208JQ
BS 102 102 RR2E784JQ
BS 103 109 RR2H208JQ
BS 110 111 RR2E784JQ
BS 112 160 RR2H208JQ
BS 161 163 RR2E784JQ
BS 164 166 RR2H208JQ
BS 167 169 RR2E784JQ
BS 170 278 RR2H208JQ
BS 279 280 RR2E784JQ
BS 281 485 RR2H208JQ
BS 486 486 RR2E784JQ
BS 487 500 RR2H208JQ
BS 501 501 RR2E784JQ
BS 502 725 RR2H208JQ
BS 726 726 RR2E784JQ
BS 727 730 RR2H208JQ
BS 731 751 RR2E784JQ
BS 752 754 RR2E784TF
BS 755 755 RR2GS13TF
BS 756 779 RR2E784TF
BS 780 780 RR2GS13TF
BS 781 917 RR2E784TF
BS 918 918 RR2GS13TF
BS 919 1005 RR2E784TF
BS 1006 1006 RR2GS13TF
BS 1007 1013 RR2E784TF
BS 1014 1014 RR2GS13TF
BS 1015 1064 RR2E784TF
BS 1065 1090 RR2GS13TF

RD RR2H208JQ 730 0 0
GGCAATAAAAAACAATTTAAGCAGGACTCTGAAACAAAAGACTGAAAATGGTACTCCTAG
AAGCAAAAGATTAAAATAGCTAAAAATGTATTTTTTTCTCA*GAAGCAT**GAAAAAGCT
AAGTCTTGTATGTTATTGTCATGAGCCATTTTGATTAAAA***AAA***CTTTCAACACA
CTCTGTTATAGAAGAAAGACATGTAAGCAAATGTGGTTTCCGGGGGTAAGCCTCTCCCAT
CATTCCTCACCATCTTCGCCTTCTCCTTCATCGTCTTC**CAGAATCACCTTCCCCCTCA
TCATCTTCATCATCAAAATCCTCTTCATCAGCCTCATTGTTGAAGTAGGTGAGAGGGTTG
GCCCATAAATCTTCCTTGATGATATCCGCAACCTCGTCGAGAATCTCAACTTCAACGTCT
TCGTCCTTGTGTTGACCATCGCTAAACCAGGTAAAGAAACTCTCTTCAGGCAATGCACGT
TTGTTTCCATTCTTCTCGTGTTCCACACCATTTGGCAAGCCCTTTCCCTCTTTCCACTTG
ATAGGCGTGGCTGTGATTTTGGTTGTCCCTTCGTCGAGGAAGGTAAAGGTCTTGGTTAGT
TTCCCATCCTCAAAATAAGGGTTGGCATTGAAGTTAAAAGTGATAGAGTATCCAGACTTC
ACATCTTTGGCATCCTCAACATCCAGAGAGCTTAGATATTTGAATATCTTTTGGTCTTCT
TCAGTCAAAA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2E784JQ 679 0 0
AAAATAGCTAAAAATGTATCTTTTTTTCTCGAAGCATATGAAAAAGCTAAGTCTTGTATG
TTATTGTCATGAGCCATTTTGATTAAAATTAAAAACCCTTTCAACACACTCTGTTATAGA
AGAAAGACATGTAAGCAAATGTGGTTTCCGGGGGTAAGCCTCTCCCATCATTCCTCACCA
TCTTCGCCTTCTCCTTCATCGTCTTCATCAGAATCACCTTCCCCCTCATCATCTTCATCA
TCAAAATTCTCTTCATCAGCCTCATTGTTGAAGTAGGTGAGAGGGTTGGCCCATAAATCT
TCCTTGATGATATCCGCAACCTCGTCGTGAATCTCAACTTCAACGTCTTCGTCCTTGTGT
TGACCATCGCTAAACCAGGTAAAGGAACTCTCTTCAGGCAATGCACGTTTGTTCCCATTC
TTCTCGTGGTCCACACCATTTGGCAAGCCCTTTCCCTCTTTCCACTTGATAGGCGTGGCT
GTGATTTTGGTTGTCCCTTCGTCGAGGAAGGTAAAGGTCTTGGTTAGTTTCCCATCCTCA
AAATAAGGGTTGGCATTGAAGTTAAAAGTGATAGAGTATCCAGACTTCACATCTTTGGCA
TCCTCAACATCCAGAGAGCTTAGATATTTGAATATCTTTTGGTCTTCTTCAGTTAAAAGA
TCACCAAGAGCAGGGTGGC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2E784TF 644 0 0
GTC
CTTGTGTTGACCATCGCTAAACCAGGTAAAGGAACTCTCTTCAGGCAATGCACGTTTGTT
CCCATTCTTCTCGTGGTCCACACCATTTGGCAAGCCCTTTCCCTCTTTCCACTTGATAGG
CGTGGCTGTGATTTTGGTTGTCCCTTCGTCGAGGAAGGTAAAGGTCTTGGTTAGTTTCCC
ATCCTCAAAATAAGGGTTGGCATTGAAGTTAAAAGTGATAGAGTATCCAGACTTCACATC
TTTGGCATCCTCAACATCCAGAGAGCTTAGATATTTGAATATCTTTTGGTCTTCTTCAGT
TAAAAGATCACCAAGAGCAGGGTGGCTCAGGAAAGCAGTGAGCCAGAAATCAGGGATGGC
TTTGATGATATCGGCACGCTTGTCATAGACAGGCTTCCTTATACCGTTGTACTTCTGCTC
CACTTCCAACACTTCATCGCTTGCCTTCTCGTTTATCTTCTCGAGGTCGTCTTGAATGGA
CTGAAGCTTTTCGATAGAAAGGAGAAGCTCTCCGTCGATTTGCTCGGCGTTCTACTCATC
AGTCTTCGCCTTCTTGCTCTTGTTGTCCGCCACCATTCTCGCTTTTTTTACCCTAATTTG
CAAATCCACAGAAAGCTTCGACTCCTTTGCTCTCTTGGC
CC

QA 4 642 4 642
DS 

RD RR2GS13TF 663 0 0
TGTGTTGACCACAGCTAAACCAGGTAAAGAAACTCTCTTCAGGCAATGCACGTTTGTTTC
CATTCTTCTCGTGTTCCACACCATTTGGCAAGCCCTTGCCCTCTTTCCACTTGATAGGCG
TGGCTGTGATTTTGGTTGTCCCTTCGTCGAGGAAGGTAAAGGTCTTGGTTAGTTTCCCAT
CCTCAAAATAAGGGTTGGCATTGAAGTTAAAAGTGATAGAGTATCCAGACTTCACATCTT
TGGCATCCTCAACATCCAGAGAGCTTAGATGTTTGAATATCTTTTGGTCTTCTTCAGTTA
AAAGATCACCAAGAGCAGGGTGGCTCAAGAAAGCGGTGAGCCAGAAATCAGGAATGGCTT
TGATGATATCGGCACGCTTGTCATAGACAGGCTTCCTTATACCGTTGTACTTCTGCTCCA
CTTCCAACACTTCATCGCTTGCCTTCTCGTTTATCTTCTCGAGGTCGTCTTGAATGGACT
GAAGCTTTTCAATAGAAAGGAGAAGCTCTCCGTCGATTTGCTCGGCGTTCTCCTCATCAG
TCTTCGCCTTCTTGCTCTTGTTGTCCGCCACCATTCTCACTTTTTTCACCCTAATTTGCA
AATCCACAGAGAGTTTCGACTCCTTTGCTCTCTTGGCTTTTAGTTCCGTCACACGAGCAA
CTC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 5

CO CL1553Contig1 724 5 9 U
GGCCCCTCCACCGAAACAGAAGTTGCATACTTTATCCGAATCTAGGGTTTCATTCTTCTC
TTCTCCCGATAAATCAGATCCTCGAAACGCTACTCCTCGAATCAGGTTTCAGTTTCTCTA
TAGTTTGCCCATCAGATCAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCTACTG
CCTTCGACCCGTTTGCTGATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACG
TCCACATACGTGTCCAGCAGCGGAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACAGTCCAGGGGCTGA
AGAAAGAGTATAGTTACAGCAAGATACTTAAGGACCTCAAGAAGGAGTTTTGTTGCAACG
GAACTGTGGTTCAAGACTCTGAACTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGCGACCAGAGGA
AGAACGTCTCCACGTTCCTAGTCCAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCC
ATGGTTTCTGAGCTGCTTGTGTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTCTA
GTGGATCATCACTGTTATCCTCCCGTTCCAAAACATTTCTTCAACTTTCATCTTTCATCT
TTGATCACTTGTTACTGTTTTTTTTCTTTTCTATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGACT
ACACGATCTTATGTACTTCGGGTTTGCCACTTCTTTAATATGAAAATTTTAAGAAATCTT
CATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 

AF RR2FK24TF U 1
AF RR2GP18TF U 19
AF RR2FK24JQ C 70
AF RR2E737TF U 8
AF RR2E737JQ C 79
BS 1 24 RR2FK24TF
BS 25 25 RR2E737TF
BS 26 168 RR2FK24TF
BS 169 169 RR2E737TF
BS 170 471 RR2FK24TF
BS 472 472 RR2E737TF
BS 473 633 RR2FK24TF
BS 634 723 RR2E737TF
BS 724 724 RR2E737JQ

RD RR2FK24TF 633 0 0
GGCCCCTCCACCGAAACAGAAGTTTCATACTTTATCCGAATCTAGGGTTTCATTCTTCTC
TTCTCCCGATAAATCAGATCCTCGAAACGCTACTCCTCGAATCAGGTTTCAGTTTCTCTA
TAGTTTGCCCATCAGATCAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCTGGTCCCTACTG
CCTTCGACCCGTTTGCTGATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACG
TCCACATACGTGTCCAGCAGCGGAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACAGTCCAGGGGCTGA
AGAAAGAGTATAGTTACAGCAAGATACTTAAGGACCTCAAGAAGGAGTTTTGTTGCAACG
GAACTGTGGTTCAAGACTCTGAACTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGCGACCAGAGGA
AGAACGTCTCCACGTTCCTAGTCCAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAACACCAAGATCC
ATGGTTTCTGAGCTGCTTGTGTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTCTA
GTGGATCATCACTGTTATCCTCCCGTTCCAAAACATTTCTTCAACTTTCATCTTTCATCT
TTGATCACTTGTTACTGTTTTTTTTCTTTTCTA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2GP18TF 683 0 0
GG
AGTTGCATACTTTATCCGAATCTAGGGTTTCATTCTTCTCTTCTCCCGATAAATCAGATC
CTCGAAACGCTACTCCTCGAATCAGGTTTCAGTTTCTCTATAGTTTGCCCATCAGATCAA
CAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCTACTGCCTTCGACCCGTTTGCTGAT
GTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGTCCACATACGTGTCCAGCAG
CGGAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACAGTCCAGGGGCTGAAGAAAGAGTATAGTTACAGC
AAGATACTTAAGGACCTCAAGAAGGAGTTTTGTTGCAACGGAACTGTGGTTCAAGACTCT
GAACTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGCGACCAGAGGAAGAACGTCTCCACGTTCCTA
GTCCAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTTTCTGAGCTGCTTGT
GTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTCTAGTGGATCATCACTGTTATCC
TCCCGTTCCAAAACATTTCTTCAACTTTCATCTTTCATCTTTGATCACTTGTTACTGTTT
TTTTTCTTTTCTATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGACTACACGATCTTATGTACTTTG
GGTTTGCCACTTCTTTA
TATG

QA 3 679 3 679
DS 

RD RR2FK24JQ 622 0 0
TAAATCAGATCCTCGAAACGCTACTCCTCGAATCAGGTTTCAGTTTCTCTATAGTTTGCC
CATCAGATCAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCTGGTCCCTACTGCCTTCGACC
CGTTTGCTGATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGTCCACATAC
GTGTCCAGCAGCGGAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACAGTCCAGGGGCTGAAGAAAGAGT
ATAGTTACAGCAAGATACTTAAGGACCTCAAGAAGGAGTTTTGTTGCAACGGAACTGTGG
TTCAAGACTCTGAACTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGCGACCAGAGGAAGAACGTCT
CCACGTTCCTAGTCCAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAACACCAAGATCCATGGTTTTT
GAGCTGCTTGTGTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTCTAGTGGATCAT
CACTGTTATCCTCCCGTTCCAAAACATTTCTTCAACTTTCATCTTTCATCTTTGATCACT
TGTTACTGTTTTTTTTCTTTTCTATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGACTACACGATCT
TATGTACTTTGGGTTTGCCACT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2E737TF 716 0 0
GG
ACCGAAACAGAAGTTGCATACTTTATCCGAATCTAGGGTTTCATTCTTCTCTTCTCCCGA
TAAATCAGATCCTCGAAACGCTACTCCTCGAATCAGGTTTCAGTTTCTCTATAGTTTGCC
CATCAGATCAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCTACTGCCTTCGACC
CGTTTGCTGATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGTCCACATAC
GTGTCCAGCAGCGGAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACAGTCCAGGGGCTGAAGAGAGAGT
ATAGTTACAGCAAGATACTTAAGGACCTCAAGAAGGAGTTTTGTTGCAACGGAACTGTGG
TTCAAGACTCTGAACTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGCGACCAGAGGAAGAACGTCT
CCACGTTCCTAGTCCAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTTTCT
GAGCTGCTTGTGTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTCTAGTGGATCAT
CACTGTTATCCTCCCGTTCCAAAACATTTCTTCAACTTTCATCTTTCATCTTTGATCACT
TGTTACTGTTTTTTTTCTTTTCTATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGACTACACGATCT
TATGTACTTCGGGTTTGCCACTTCTTTAATATGAAAATTTTAAGAAATCTTCAT

QA 3 716 3 716
DS 

RD RR2E737JQ 646 0 0
TCCTCGAAACGCTACTCCTCGAATCAGGTTTCAGTTTCTCTATAGTTTGCCCATCAGATC
AACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCTACTGCCTTCGACCCGTTTGCTG
ATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGTCCACATACGTGTCCAGC
AGCGGAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACAGTCCAGGGGCTGAAGAGAGAGTATAGTTACA
GCAAGATACTTAAGGACCTCAAGAAGGAGTTTTGTTGCAACGGAACTGTGGTTCAAGACT
CTGAACTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGCGACCAGAGGAAGAACGTCTCCACGTTCC
TAGTCCAGGCTGGCCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTTTTTGAGCTGCTT
GTGTTACATTTCCCCTAAAGCCGTTTGCTACATTCTGCTCTAGTGGATCATCACTGTTAT
CCTCCCGTTCCAAAACATTTTTTCAACTTTCATCTTTCATCTTTGATCACTTGTTACTGT
TTTTTTTTTTTTCTATTCGCATTGGTATGATACTAAGAGACTACACGATCTTATGTACTT
CGGGTTTGCCACTTCTTTAATATGAAAATTTTAAGAAATCTTCATT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 5

CO CL1554Contig1 729 5 43 U
TTTTTTATTTGACTATGGGAAGTGTACAGTTGAATGGTTCTGGCTTAGTAGCTTCTCTAT
CTCC*AACTCATATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAGTAACCCAAAGCCGGCCTTCTTA
CGCTCAAACCACAATGCCACCAGAGTCAAGACCATCCGAGCCATAAGCACTGCACCAGCA
AGCCAGCCTCCATCGGCAGATGAGCAGGATGACGAACCTCCTGCTGTTGATTTTGCATTC
GTCCATTCGGTGTTGTTACCGGACGGGGCACCAGACGTGCATTGGAG**GAGCGTGCGGT
GGACAGAAACTCAGAGACATAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCTTACAGT
AAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGGTCGAGATTGTA
AATGGAAAAGAGCTTCTAAATCCACGTACTGACATTGAGAAGGAGAAACTAAAAAGGAAA
CCAAAAAATTGGAGACTCGCTTGTCAAACCAACGTGGGCAACCCAGATTCAACTGGATTG
GTTGTCATACAACAATTGCCAGAGTGGAAAGCTCACGAATGGAACATCCCTAGGAATCTG
CCTATTGATGATCCCGAAGCTTCTACGTGAAATGATTAATTTGTATTATTGTTAATACTA
TATATTAGGCTACTATATATCATGAAAATGTAACGTTTTATTTGTTTTTATATATGTCGA
TAATTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF92TF U 1
AF RR2CI41TF U 8
AF RR2DF92JQ C 458
AF RR2H287TF U 11
AF RR2H287JQ C 8
BS 1 40 RR2DF92TF
BS 41 41 RR2H287TF
BS 42 43 RR2DF92TF
BS 44 44 RR2CI41TF
BS 45 48 RR2DF92TF
BS 49 49 RR2CI41TF
BS 50 50 RR2DF92TF
BS 51 51 RR2CI41TF
BS 52 58 RR2DF92TF
BS 59 59 RR2CI41TF
BS 60 111 RR2DF92TF
BS 112 112 RR2H287TF
BS 113 122 RR2DF92TF
BS 123 123 RR2CI41TF
BS 124 212 RR2DF92TF
BS 213 213 RR2H287TF
BS 214 227 RR2DF92TF
BS 228 228 RR2H287TF
BS 229 236 RR2DF92TF
BS 237 237 RR2H287TF
BS 238 251 RR2DF92TF
BS 252 252 RR2CI41TF
BS 253 267 RR2DF92TF
BS 268 268 RR2H287TF
BS 269 287 RR2DF92TF
BS 288 289 RR2H287TF
BS 290 311 RR2DF92TF
BS 312 312 RR2H287TF
BS 313 365 RR2DF92TF
BS 366 366 RR2CI41TF
BS 367 446 RR2DF92TF
BS 447 447 RR2H287TF
BS 448 554 RR2CI41TF
BS 555 555 RR2H287TF
BS 556 593 RR2CI41TF
BS 594 594 RR2H287TF
BS 595 631 RR2CI41TF
BS 632 632 RR2H287TF
BS 633 659 RR2CI41TF
BS 660 668 RR2H287TF
BS 669 669 RR2H287JQ
BS 670 694 RR2H287TF
BS 695 729 RR2H287JQ

RD RR2DF92TF 450 0 0
TTTTTTATTTGACTATGGGAAGTGTACAGTTGAATGGTTCAGGTTTAGCATCTTCTCTGT
CTCC*AACTCATATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAGTAACCCAAAGCCGTCCTTCTTA
CGTTCAAACCACAATGCCACCAGAGTCAAGACCATCCGAGCCATAAGCACTGCACCAGCA
AGCCAGCCTCCATCGGCAGATGAGCAGGATGATGAACCTCCTGCTGTCGATTTTGCGTTC
GTCCATTCGGTATTGTTACCGGACGGGACACCAGACGTGCATTGGAGAAGAGCGTGCGGT
GGACAGAAACTTAGAGACATAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCTTACAGT
AAGCCGTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGGTCGAGATTGTA
AATGGAAAAGAGCTTCTAAATCCACG
AACT

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR2CI41TF 652 0 0
TTT
GACTATGGGAAGTGTACAGTTGAATGGCTCAGGCTTAGTAGCTTCTCTATCTCC*AACTC
ATATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTATTAACCCAAAGCCGTCCTTCTTACGCTCAAACC
ACAATGCCACCAGAGTCAAGACCATTCGAGCCATAAGCACTGCACCAGCGAGCCAGCCTC
CATCGGCAGATGAGCAGGATGATGAACCTCCTGCTGTCGATTTTGCGTTCGTCCATTCGG
TGTTGTTACCGGACGGGACACCAGACGTGCATTGGAGAAGAGCGTGCGGTGGACAGAAAC
TTAGAGACATAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCTTACAGTAAGCCCTTAT
CAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGGTCGAGATTGTAAATGGAAAAG
AGCTTCTAAATCCACGAACTGACATTGAGAAGGAGAAACTAAAAAGGAAACCAAAAAATT
GGAGACTCGCTTGTCAAACCAACGTGGGCAACCCAGATTCAACTGGATTGGTTGTCATAC
AACA*TTGCCAGAGTGGAAAGCTCACGAATGGAACATCCCTAG*AATCTGCCTATTGATG
ATCCCGAAGCTTCTACGTGAA*TGATTAATTTGTATTATTGTTAATACT

QA 4 652 4 652
DS 

RD RR2DF92JQ 154 0 0
AGAAGGAGAAACTAAAAAGGAAACCAAAAAATTGGAGACTCGCTTGTCAAACCAACGTGG
GCAACCCAGATTCAACTGGATTGGTTGTCATACAACAATTGCCAGAGTGGAAAGCTCACG
AATGGAACATCCCTAGGAATCTGCCTATCGATGA

QA 1 154 1 154
DS 

RD RR2H287TF 684 0 0
GACTATGGGAAGTGTACAGTTGAATGGTTCTGGCTTAGTAGCTTCTCTATCTCC*AACTC
ATATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAGTAACCCAAAGCCGGCCTTCTTACGCTCAAACC
ACAATGCCACCAGAGTCAAGACCATCCGAGCCATAAGCACTGCACCAGCAAGCCAGCCTC
CATCGGCAGATGAGCAGGATGACGAACCTCCTGCTGTTGATTTTGCATTCGTCCATTCGG
TGTTGTTACCGGACGGGGCACCAGACGTGCATTGGAG**GAGCGTGCGGTGGACAGAAAC
TCAGAGACATAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCTTACAGTAAGCCCTTGT
CAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGGTCGAGATTGTAAATGGAAAAG
AGCTTCTAAATCCACGTACTGACATTGAGAAGGAGAAACTAAAAAGGAAACCAAAAAATT
GGAGACTCGCTTGTCAAACCAACGTGGGCAACCCAGATTCGACTGGATTGGTTGTCATAC
AACAATTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAGGAATCTGCCTATTGATG
ATCCCGAAGCTTCTACGTGAAATGATTAATTTGTATTATTGTTAATACTATATATTAG*C
TACTATATATCATGAAAATGTAAC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2H287JQ 722 0 0
TTT
GACTATGGGAAGTGTACAGTTGAATGGTTCTGGCTTAGTAGCTTCTCTATCTCCCAACTC
ATATCTTTAGCCACAAAACCAAACTTAGTAACCCAAAGCCGGCCTTCTTACGCTCAAACC
ACAATGCCACCAGAGTCAAGACCATCCGAGCCATAAGCACTGCACCAGCAAGCCAGCCTC
CATCGGCAGATGAGCAGGATGACGAACCTCCTGCTGTTGATTTTGCATTCGTCCATTCGG
TGTTGTTACCGGACGGGGCACCAGACGTGCATTGGAG**GAGCGTGCGGTGGACAGAAAC
TCAGAGACATAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCTTACAGTAAGCCCTTGT
CAAACTGCGCAGGAGTAGGAACTTGCGCTACCTGCATGGTCGAGATTGTAAATGGAAAAG
AGCTTCTAAATCCACGTACTGACATTGAGAAGGAGAAACTAAAAAGGAAACCAAAAAATT
GGAGACTCGCTTGTCAAACCAACGTGGGCAACCCAGATTCGACTGGATTGGTTGTCATAC
AACAATTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAGGAATCTGCCTATTGATG
ATCCCGAAGCTTCTACGTGAAATGATTAATTTGTATTATTGTTAATACTATATATTAGGC
TACTATATATCATGAAAATGTAACGTTTTATTTGTTTTTATATATGTCGATAATTAGCT

QA 4 722 4 722
DS 



AS 2 5

CO CL1555Contig1 609 3 15 U
GGACACTTGACATCCTTCACTACTAATCAACAAAAGAAAAACAAGATGTGGGATGAAACT
GTAGCTGGACCTAAGCCGGAGCATGGCCTTGGCCGCCTCCGCAACAAGATCAACGCCCAA
CCCATTGACATCAAAGGTGTAGGAGAAGGGAGCAGCAGCAAGGCTACGCCTGCAGTGGCC
GGGAGTCCTGGAACTCCAACGACGCCAGGATCGGCACGTAAAGAGAACGTGTGGAGGGGT
GTGTTTCATCCAGGAAGTAACATCGCCACCAGAGGAATGGGCACTAACCTTTTCGACAAG
CCCTCACACCCAAACGCTCCCACCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGACGATACTAGGAGC
CAGCACCGTTAAGCCGAGACCGAGAGGGACGAGTGACATGCCGGTGATGTAGTATATCCT
GTTTCCGTTAGCCACGTGTTTATTTTCAGTTTATGGCTGTATTCGCATCCTTTTTTTCTT
TGTTTGTTGTTGTTAGTGACCGTTTGATTTCCACCATCTGGGTTGGTTTTTAACGGTGGT
GATGCGTCCTCTTGTCTGTTTTAATATTTCTACTGTTTCGTAATAGATATATTTAACTTT
TAGCTTCGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 5 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS28JQ C 68
AF RR2FS28TF U 1
AF RR2CS42TF U 1
BS 1 24 RR2CS42TF
BS 25 25 RR2FS28TF
BS 26 237 RR2CS42TF
BS 238 238 RR2FS28TF
BS 239 280 RR2CS42TF
BS 281 281 RR2FS28TF
BS 282 351 RR2CS42TF
BS 352 352 RR2FS28TF
BS 353 360 RR2CS42TF
BS 361 361 RR2FS28TF
BS 362 377 RR2CS42TF
BS 378 378 RR2FS28TF
BS 379 380 RR2CS42TF
BS 381 381 RR2FS28TF
BS 382 609 RR2CS42TF

RD RR2FS28JQ 476 0 0
GACT
TAAGCCGGAGCATGGCCTTGGCCGCCTCCGCAACAAGATCAACGCCCAACCCATTGACAT
CAAAGGTGTAGGAGAAGGGAGCAGCAGCAAGGCTACGCCTGCAGTGGCCGGGAGTCCTGG
AACTCCAACGACGCCAGGATCGGCACGTAAAGAGAACGTGTGGAGGGGTGTGTTTCATCC
AGGAAGTAACATCGCCACCAGAGGAATGGGCACTAACCTTTTGGACAAGCCCTCACACCC
AAACGCTCCCACCGTTTACGACTGGTTGTACAGGGACGATATTAGGAGCCAGCACCGTTA
AGCCGAGACCGAGAGGGACGAGTGACATGCCGGTGATGTAGTATATCCTGTTTCCGTTAG
CCACGTGTTTATTTTCAGTTTATGGCTGTATTCGCATCCTTTTTTTCTTTGTTTGTTGTT
GTTAGTGACCGTTTGATTTCCCCCATCTGGGTTGGTTTTTAACGG
GGGTGAT

QA 5 469 5 469
DS 

RD RR2FS28TF 600 0 0
GGACACTTGACATCCTTCACTACTAATCAACAAAAGAAAAACAAGATGTGGGATGAAACT
GTAGCTGGACCTAAGCCGGAGCATGGCCTTGGCCGCCTCCGCAACAAGATCAACGCCCAA
CCCATTGACATCAAAGGTGTAGGAGAAGGGAGCAGCAGCAAGGCTACGCCTGCAGTGGCC
GGGAGTCCTGGAACTCCAACGACGCCAGGATCGGCACGTAAAGAGAACGTGTGGAGGGGT
GTGTTTCATCCAGGAAGTAACATCGCCACCAGAGGAATGGGCACTAACCTTTTCGACAAG
CCCTCACACCCAAACGCTCCCACCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGACGATACTAGGAGC
CAGCACCGTTAAGCCGAGACCGAGAGGGACGAGTGACATGCCGGTGATGTAGTATATCCT
GTTTCCGTTAGCCACGTGTTTATTTTCAGTTTATGGCTGTATTCGCATCCTTTTTTTCTT
TGTTTGTTGTTGTTAGTGACCGTTTGATTTCCACCATCTGGGTTGGTTTTTAACGGTGGT
GATGCGTCCTCTTGTCTGTTTTAATATTTCTACTGTTTCGTAATAGATATATTTAACTTT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2CS42TF 609 0 0
GGACACTTGACATCCTTCACTACTGATCAACAAAAGAAAAACAAGATGTGGGATGAAACT
GTAGCTGGACCTAAGCCGGAGCATGGCCTTGGCCGCCTCCGCAACAAGATCAACGCCCAA
CCCATTGACATCAAAGGTGTAGGAGAAGGGAGCAGCAGCAAGGCTACGCCTGCAGTGGCC
GGGAGTCCTGGAACTCCAACGACGCCAGGATCGGCACGTAAAGAGAACGTGTGGAGGAGT
GTGTTTCATCCAGGAAGTAACATCGCCACCAGAGGAATGGACACTAACCTTTTCGACAAG
CCCTCACACCCAAACGCTCCCACCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGACGATTCTAGGAGC
TAGCACCGTTAAGCCGAAACTGAGAGGGACGAGTGACATGCCGGTGATGTAGTATATCCT
GTTTCCGTTAGCCACGTGTTTATTTTCAGTTTATGGCTGTATTCGCATCCTTTTTTTCTT
TGTTTGTTGTTGTTAGTGACCGTTTGATTTCCACCATCTGGGTTGGTTTTTAACGGTGGT
GATGCGTCCTCTTGTCTGTTTTAATATTTCTACTGTTTCGTAATAGATATATTTAACTTT
TAGCTTCGA

QA 1 609 1 609
DS 



CO CL1555Contig2 606 2 2 U
GGACACTTGACATCCTTTACTACTAATCAACAAAAGAAAAACAAGATGTGGGATGAAACT
GTAGCTGGACCTAAGCCGGAGCATGGCCTTGGCCGCCTCCGCAACAAGATCAACGCCCAA
CCCATTGACATCAAAGGTGTAGGAGAAGGGAGCAGCAGCAAGTCTATGCCTGCGGTGGCT
GGGAGTCCTGGAACTCCAACGACGCCAGGATCGGCACGTAAAGAGAACGTGTGGAGGAGT
GTGTTTCATCCAGGAAGTAACATCGCCACCAGAGGGATGGGCACTAACCTTTTCGACAAG
CCCTCTCACCCAAACGCTCCCACCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGACGATACTAGGAGC
CAGCACCGTTGAGCCGAGACCGAGAGGGAGAAGTGCATGCCGGTGATGTAGTATATCCTG
TTTCCATTAGCCACGTGTTTAATTTCAGTTTATGGCTGTATTCGCAACCTTTTTTTCTTT
GTTTGTTGTTGTTAGTGACCGTTTGATTTCCACCATCTGGGTTGGTTTTTAACGGTGGTA
ATGCGTCCTCTTGTCTCTTTTAATGTTTCTACTGTTTCATAATAGATATATTTAACTTTT
AGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD62TF U 1
AF RR2GD62JQ C 27
BS 1 599 RR2GD62TF
BS 600 606 RR2GD62JQ

RD RR2GD62TF 606 0 0
GGACACTTGACATCCTTTACTACTAATCAACAAAAGAAAAACAAGATGTGGGATGAAACT
GTAGCTGGACCTAAGCCGGAGCATGGCCTTGGCCGCCTCCGCAACAAGATCAACGCCCAA
CCCATTGACATCAAAGGTGTAGGAGAAGGGAGCAGCAGCAAGTCTATGCCTGCGGTGGCT
GGGAGTCCTGGAACTCCAACGACGCCAGGATCGGCACGTAAAGAGAACGTGTGGAGGAGT
GTGTTTCATCCAGGAAGTAACATCGCCACCAGAGGGATGGGCACTAACCTTTTCGACAAG
CCCTCTCACCCAAACGCTCCCACCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGACGATACTAGGAGC
CAGCACCGTTGAGCCGAGACCGAGAGGGAGAAGTGCATGCCGGTGATGTAGTATATCCTG
TTTCCATTAGCCACGTGTTTAATTTCAGTTTATGGCTGTATTCGCAACCTTTTTTTCTTT
GTTTGTTGTTGTTAGTGACCGTTTGATTTCCACCATCTGGGTTGGTTTTTAACGGTGGTA
ATGCGTCCTCTTGTCTCTTTTAATGTTTCTACTGTTTCATAATAGATATATTTAACTTT
TAGCTTC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2GD62JQ 580 0 0
TCAACAAAAGAAAAACAAGATGTGGGATGAAACTGTAGCTGGACCTAAGCCGGAGCATGG
CCTTGGCCGCCTCCGCAACAAGATCAACGCCCAACCCATTGACATCAAAGGTGTAGGAGA
AGGGAGCAGCAGCAAGTCTATGCCTGCGGTGGCTGGGAGTCCTGGAACTCCAACGACGCC
AGGATCGGCACGTAAAGAGAACGTGTGGAGGAGTGTGTTTCATCCAGGAAGTAACATCGC
CACCAGAGGGATGGGCACTAACCTTTTCGACAAGCCCTCTCACCCAAACGCTCCCACCGT
TTACGACTGGTTGTACAGCGACGATACTAGGAGCCAGCACCGTTGAGCCGAGACCGAGAG
GGAGAAGTGCATGCCGGTGATGTAGTATATCCTGTTTCCATTAGCCACGTGTTTAATTTC
AGTTTATGGCTGTATTCGCAACCTTTTTTTCTTTGTTTGTTGTTGTTAGTGACCGTTTGA
TTTCCACCATCTGGGTTGGTTTTTAACGGTGGTAATGCGTCCTCTTGTCTCTTTTAATGT
TTCTACTGTTTCATAATAGATATATTTAACTTTTAGCTTC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 3

CO CL1556Contig1 638 3 2 U
TTTTTTGACAATTAAGTAATCAGAAAAAGTTCCACACATTTCAAATCCTTAAATGTAGCA
AGGTTTCCCAGAAGACACTCAAGTCCTGCAGATTCCTTAGGACAATATACATAGCCACTT
AATTATATAAATAAATCCAAGTCTTGTGTTCTATACTACTATTTATATTATTTAAAACGG
AGCTTTTGTTGGTGAGTTTTGATCACATTGACTGACTCTCAGAATGTGACACTCAGAGCA
TCCAGCCTGGGATGTAACCGTTCCCTGGCTGCGTCTGAGCTTGTGTTGTTGCAGTTATCT
GCTCCGAGCCTACTGGATTGTTGTACCCCATCTGCAGAGTAGGATTGCATTCAAGAGGCT
GGAATAGTCCTTGAGACTGAGCTTGATGATGCTCGTACGAGACATTCTGTTCATTGCCTT
CCCATCCTCCTCCTCCTCCTCCCATATGATGGCTTCTCACACCAATCATATCATCCAGCT
TCATTGCCAAAGCTCTATTGGTTTCAAGCAACATTTGCTCTTTGCTTTGAAGATCAGAGA
GCTGGTCAAGCATGTACTGTGTCTTGATGGAGCGAACTTGCTTGAGAGAGCCATATAGTT
GACGCTCAAGCTGCTCTAGTTCCTTTGAGTTGAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2GL36JQ U 21
AF RR2E479TF C 1
AF RR2E479JQ U 7
BS 1 6 RR2E479TF
BS 7 638 RR2E479JQ

RD RR2GL36JQ 518 0 0
CAGAAAAAGTTCCACACATTTCAAATCCTTAAATGTAGCAAGGTTTCCCAGAAGACACTC
AAGTCCTGCAGATTCCTTAGGACAATATACATAGCCACTTAATTATATAAATAAATCCAA
GTCTTGTGTTCTATACTACTATTTATATTATTTAAAACGGAGCTTTTGTTGGTGAGTTTT
GATCACATTGACTGACTCTCAAAATGTGACACTCAGAGCATCCAGCCTGGGATGTAACCG
TTCCCTGGCTGCGCCTGAGCTTGTGTTGTTGCAGTTATCTGCTCCGAGCCTACTGGATTG
TTGTACCCCATCTGCAGAGTAGGATTGCATTCAAGAGGCTGGAATAGTCCTTGAGACTGA
GCTTGATGATGCTCGTACGAGACATTCTGTTCATTGCCTTCCCATCCTCCTCCTCCTCCT
CCCATATGATGGCTTCTCACACCAATCATATCATCCAGCTTCATTGCCAAAGCTCTATTG
GTTTCAAGCAACATTTGCTCTTTGCTTTGAAGATCAGA

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2E479TF 638 0 0
TTTTTTGACAATTAAGTAATCAGAAAAAGTTCCACACATTTCAAATC*TTAAATGTAGCA
AGGTTTCCCAGAAGACACTCAAGTCCTGCAGATTCCTTAGGACAATATACATAGCCACTT
AATTATATAAATAAATCCAAGTCTTGTGTTCTATACTACTATTTATATTATTTAAAACGG
AGCTTTTGTTGGTGAGTTTTGATCACATTGACTGACTCTCAGAATGTGACACTCAGAGCA
TCCAGCCTGGGATGTAACCGTTCCCTGGCTGCGTCTGAGCTTGTGTTGTTGCAGTTATCT
GCTCCGAGCCTACTGGATTGTTGTACCCCATCTGCAGAGTAGGATTGCATTCAAGAGGCT
GGAATAGTCCTTGAGACTGAGCTTGATGATGCTCGTACGAGACATTCTGTTCATTGCCTT
CCCATCCTCCTCCTCCTCCTCCCATATGATGGCTTCTCACACCAATCATATCATCCAGCT
TCATTGCCAAAGCTCTATTGGTTTCAAGCAACATTTGCTCTTTGCTTTGAAGATCAGAGA
GCTGGTCAAGCATGTACTGTGTCTTGATGGAGCGAACTTGCTTGAGAGAGCCATATAGTT
GACGCTCAAGCTGCTCTAGTTCCTTTGAGTTGAGAG
CC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2E479JQ 632 0 0
GACAATTAAGTAATCAGAAAAAGTTCCACACATTTCAAATCCTTAAATGTAGCAAGGTTT
CCCAGAAGACACTCAAGTCCTGCAGATTCCTTAGGACAATATACATAGCCACTTAATTAT
ATAAATAAATCCAAGTCTTGTGTTCTATACTACTATTTATATTATTTAAAACGGAGCTTT
TGTTGGTGAGTTTTGATCACATTGACTGACTCTCAGAATGTGACACTCAGAGCATCCAGC
CTGGGATGTAACCGTTCCCTGGCTGCGTCTGAGCTTGTGTTGTTGCAGTTATCTGCTCCG
AGCCTACTGGATTGTTGTACCCCATCTGCAGAGTAGGATTGCATTCAAGAGGCTGGAATA
GTCCTTGAGACTGAGCTTGATGATGCTCGTACGAGACATTCTGTTCATTGCCTTCCCATC
CTCCTCCTCCTCCTCCCATATGATGGCTTCTCACACCAATCATATCATCCAGCTTCATTG
CCAAAGCTCTATTGGTTTCAAGCAACATTTGCTCTTTGCTTTGAAGATCAGAGAGCTGGT
CAAGCATGTACTGTGTCTTGATGGAGCGAACTTGCTTGAGAGAGCCATATAGTTGACGCT
CAAGCTGCTCTAGTTCCTTTGAGTTGAGAGCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 2 5

CO CL1557Contig1 794 3 8 U
GGAGGACTTTTGTATGTTTCTTTTATCTTTGTGTTTGCTTACAGATTGTAACAGCTACAT
ATTCAAGAGTGACTAGGCAAATTGAGATTCAAACTCTGTATTTTTTTTGATTGATCATCT
TAGTCCTGCTGGAGATGTTGGACTGCCTCCTCCAGGTCTTCCCATGGCTCTTTGGGCAAG
AGACCCATCATAATCCCGTTTCTCGAAGGAACTATCCTGCGAGTTAGCTATCTTGTCGGC
AATTCCATAGTCAATGGCTGCTTGTGCTTGGAGATATTTAGGTCGCTTGATGTCCTCGTT
GATCTGCTCTTTGGTTTTGCCTGCTCCCTTAGCTAACAGCTCGATGTAGTACTCAGTATT
TGCATCAAGCTCCTTGGCCTTTATCCACATGTCGATGGCAGCTCCGCTAGATCTGTTTAC
TTTTGGCAGATACAATTTTGTTGATGAATGTGGCTGAACTGCACGGTAACCCTTTTTACC
GAGAGAAAGAAGCATTGCTGCTTGACCAAAAGCCATGCCACAGTTGATAGTGTATACATC
TGATTTGCAATAAGAAATGGTGTCAGCTATGGCATAAGCCTCTGTTTCTGACCCAACAGT
CTCCATCTTCTCATTCTGAGTCCCGGGTGAATTTATGTACAGGTAGATGGGCTTGGCTGA
GTTGTCATAGTCTAACCACATAAACTGAGCAACGAGTAACTCAGTAACTGCAGGTACGAG
GCATGCCAAGGTAGCAAATCCGAGCATCCAATAGCAAAGAAGGCAAATCCGGAGGAGCAG
TTCTTGGTCTTGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H748JQB U 1
AF RR2FY43JQ U 1
AF RR2FI06TF C 115
BS 1 604 RR2FY43JQ
BS 605 605 RR2FI06TF
BS 606 624 RR2FY43JQ
BS 625 625 RR2FI06TF
BS 626 639 RR2FY43JQ
BS 640 640 RR2FI06TF
BS 641 668 RR2FY43JQ
BS 669 794 RR2FI06TF

RD RR2H748JQB 552 0 0
GGAGGACTTTTGTATGTTTCTTTTATCTTTGTGTTTGCTTACAGATTGTAACAGCTACAT
ATTCAAGAGTGACTAGGCAAATTGAGATTCAAACTCTGTATTTTTTTTGATTGATCATCT
TAGTCCTGCTGGAGATGTTGGACTGCCTCCTCCAGGTCTTCCCATGGCTCTTTGGGCAAG
AGACCCATCATAATCCCGTTTCTCGAAGGAACTATCCTGCGAGTTAGCTATCTTGTCGGC
AATTCCATAGTCAATGGCTGCTTGTGCTTGGAGATATTTAGGTCGCTTGATGTCCTCGTT
GATCTGCTCTTTGGTTTTGCCTGCTCCCTTAGCTAACAGCTCGATGTAGTACTCAGTATT
TGCATCAAGCTCCTTGGCCTTTATCCACATGTCGATGGCAGCTCCGCTAGATCTGTTTAC
TTTTGGCAGATACAATTTTGTTGATGAATGTGGCTGAACTGCACGGTAACCCTTTTTACC
GAGAGAAAGAAGCATTGCTGCTTGACCAAAAGCCATGCCACAGTTGATAGTGTATACATC
TGATTTGCAATA

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2FY43JQ 668 0 0
GGAGGACTTTTGTATGTTTCTTTTATCTTTGTGTTTGCTTACAGATTGTAACAGCTACAT
ATTCAAGAGTGACTAGGCAAATTGAGATTCAAACTCTGTATTTTTTTTGATTGATCATCT
TAGTCCTGCTGGAGATGTTGGACTGCCTCCTCCAGGTCTTCCCATGGCTCTTTGGGCAAG
AGACCCATCATAATCCCGTTTCTCGAAGGAACTATCCTGCGAGTTAGCTATCTTGTCGGC
AATTCCATAGTCAATGGCTGCTTGTGCTTGGAGATATTTAGGTCGCTTGATGTCCTCGTT
GATCTGCTCTTTGGTTTTGCCTGCTCCCTTAGCTAACAGCTCGATGTAGTACTCAGTATT
TGCATCAAGCTCCTTGGCCTTTATCCACATGTCGATGGCAGCTCCGCTAGATCTGTTTAC
TTTTGGCAGATACAATTTTGTTGATGAATGTGGCTGAACTGCACGGTAACCCTTTTTACC
GAGAGAAAGAAGCATTGCTGCTTGACCAAAAGCCATGCCACAGTTGATAGTGTATACATC
TGATTTGCAATAAGAAATGGTGTCAGCTATGGCATAAGCCTCTGTTTCTGACCCAACAGT
CTCCGTCTTCTCATTCTGAGTCCCTGGTGAATTTATGTATAGGTAGATGGGCTTGGCTGA
GTTGTCAT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2FI06TF 680 0 0
TCATCTTAGTCCGGCTGGAGATGTTGGACTGCCTCCTCCAGGTCTTCCCATGGCTCTTTG
GGCAAGAGACCCATCATAATCCCGTTTCTCAAAGGAACTATCCTGCGAGTTAGCTATCTT
GTCTGCGATTCCATAGTCAATGGCTGCTTGTGCTTGGAGATACTTAGGTCGCTTGATGTC
CTCGTTGATCTGCTCTTTGGTTTTGCCTGTTCCCTTAGCTAACAGCTCGATGTAGTACTC
AGTATTTGCATCAAGTTCCTTGGCCTTTATCCACATGTCAATGGCAGCTCCGCTCGATCT
GTTTACTTTTGGCAAATACAATTTTGTTGATGAATGTGGTTGAACTGCGCGATAACCCTT
TTTACCGAGAGAAAGAAGCATTGCTGCTTGACCAAAAGCCACGCCACAGTTGATAGTGTA
TACATCTGATTTGCAATAAGAAATGGTGTCAGCTATGGCATAAGCCTCTGTTTCTGACCC
AACAGTCTCCATCTTCTCATTCTGAGTCCCGGGTGAGTTTATGTACAGGTAGATGGGCTT
TGCTGGGTTGTCATAGTCTAACCACATAAACTGAGCAACGAGTAACTCAGTAACTGCAGG
TACGAGGCATGCCAAGGTAGCAAATCCGAGCATCCAATAGCAAAGAAGGCAAATCCGGAG
GAGCAGTTCTTGGTCTTGCC

QA 1 680 1 680
DS 



CO CL1557Contig2 702 2 1 U
GGAATCAGCTTCTTCTTCTTCTTCATCGGTTTTGCTCAATTGGAGATGGCGACTTCGATG
GTCTCTCCTCTTACTTCCCAGCTCAACCATGAATCTGTATTTTCCAAGTCCGTGCTTCCC
AAATCACCGTTCATGTCGGGATCTAAGCTCTTCTCCTCGAACATGCCTTGCTCTACTGTT
CCTCGACGCACAAGAAGATCGAACTGCTTCGCTTCTGCTAAAGATATGAGCTTTGACCAC
ATCCCCAAACAGTTCCGTGGAGACAATCTCAAAGATGGAGTGATGCAGAACTTCAAGAAT
GTACCACAATATTTCTACGGTCTTAATCCAGCTCAAATGGATATGTTCATGACTGAGGAC
AGCCCTGTCCGTAGGCAAGCAGAGAAAGTTACAGAGGAAAGCATCTCGTCTAGAAGTAAT
TATCTAGACAACGGAGGAGCATGGAGTATGTCTGGTATGAATGCAGCAGATCCTAGGAGA
TACAGCATGAGTGTCCAAATGTACAGAGGTGGTGGAGGCGGCGGAGGAGGATCTGCAAGA
CCAAGAACTGCTCCTCCAGATTTGCCTTCTTTGCTCTTGGATGCTCGGATTTGCTACCTT
GGCATGCCTATCGTACCTGCAGTAACTGAGTTACTCGTTGCTCAGTTTATGTGGTTAGAC
TATGACAACTCAGCCAAGCCCATCTACCTATACATAAATTCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2FY43TF U 1
AF RR2H748TF U 1
BS 1 702 RR2FY43TF

RD RR2FY43TF 702 0 0
GGAATCAGCTTCTTCTTCTTCTTCATCGGTTTTGCTCAATTGGAGATGGCGACTTCGATG
GTCTCTCCTCTTACTTCCCAGCTCAACCATGAATCTGTATTTTCCAAGTCCGTGCTTCCC
AAATCACCGTTCATGTCGGGATCTAAGCTCTTCTCCTCGAACATGCCTTGCTCTACTGTT
CCTCGACGCACAAGAAGATCGAACTGCTTCGCTTCTGCTAAAGATATGAGCTTTGACCAC
ATCCCCAAACAGTTCCGTGGAGACAATCTCAAAGATGGAGTGATGCAGAACTTCAAGAAT
GTACCACAATATTTCTACGGTCTTAATCCAGCTCAAATGGATATGTTCATGACTGAGGAC
AGCCCTGTCCGTAGGCAAGCAGAGAAAGTTACAGAGGAAAGCATCTCGTCTAGAAGTAAT
TATCTAGACAACGGAGGAGCATGGAGTATGTCTGGTATGAATGCAGCAGATCCTAGGAGA
TACAGCATGAGTGTCCAAATGTACAGAGGTGGTGGAGGCGGCGGAGGAGGATCTGCAAGA
CCAAGAACTGCTCCTCCAGATTTGCCTTCTTTGCTCTTGGATGCTCGGATTTGCTACCTT
GGCATGCCTATCGTACCTGCAGTAACTGAGTTACTCGTTGCTCAGTTTATGTGGTTAGAC
TATGACAACTCAGCCAAGCCCATCTACCTATACATAAATTCA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2H748TF 702 0 0
GGAATCAGCTTCTTCTTCTTCTTCATCGGTTTTGCTCAATTGGAGATGGCGACTTCGATG
GTCTCTCCTCTTACTTCCCAGCTCAACCATGAATCTGTATTTTCCAAGTCCGTGCTTCCC
AAATCACCGTTCATGTCGGGATCTAAGCTCTTCTCCTCGAACATGCCTTGCTCTACTGTT
CCTCGACGCACAAGAAGATCGAACTGCTTCGCTTCTGCTAAAGATATGAGCTTTGACCAC
ATCCCCAAACAGTTCCGTGGAGACAATCTCAAAGATGGAGTGATGCAGAACTTCAAGAAT
GTACCACAATATTTCTACGGTCTTAATCCAGCTCAAATGGATATGTTCATGACTGAGGAC
AGCCCTGTCCGTAGGCAAGCAGAGAAAGTTACAGAGGAAAGCATCTCGTCTAGAAGTAAT
TATCTAGACAACGGAGGAGCATGGAGTATGTCTGGTATGAATGCAGCAGATCCTAGGAGA
TACAGCATGAGTGTCCAAATGTACAGAGGTGGTGGAGGCGGCGGAGGAGGATCTGCAAGA
CCAAGAACTGCTCCTCCAGATTTGCCTTCTTTGCTCTTGGATGCTCGGATTTGCTACCTT
GGCATGCCTATCGTACCTGCAGTAACTGAGTTACTCGTTGCTCAGTTTATGTGGTTAGAC
TATGACAACTCAGCCAAGCCCATCTACCTATACATAAA
TTCA

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 4

CO CL1558Contig1 1005 4 15 U
GGGCGTGAGTGCGATGTTCAATGTGTTTCTCACACCCACTTTATGCTTTATTACTTACAA
ACGAAGAAGAACCCAATAAAATATAGTTGGAAGAAAAGAGAGAGAAAGAGAGGATCTCAG
AGTAGAAGAAGAAGTAGATGGAGATGGAGAAGAGAAAGATGGTGATGTGTGGTGTGCTAG
CACTTCTGGGTTTATTATCTGCTGTTACTGCCTTCGCTGCTGAAGCTACCAGAATCAAGA
AATCTCAGGTCGTGGTTACCACATTGGACTCGGTCAAACAATGCTCTTACAAGAGAAGTC
CAGCTTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGCCATCTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCCA
GCGTCGGTAGCGGTTGTTTCTGTTGTAGAAAAGGTCCTTCCGCTCCTACCAGATCCAAGT
GGATTCTCGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTCCTCG
TGCTGCTCACTGCAGCTGCCCTCAACGATGAACACATCCAGGAGACAGAGACTCCCGACA
GCTACTTCTGCTACATTGTGAAACCAGGCGTTTTCTTCATCGGCTCCATCCTCTCGCTTT
TCACTATAGGCCTTGGGATTGTCTACTATTTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTCG
CTGCTGCTGCCACAACGACACCGGTTAACCAAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGATTC
CAGTGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTTGTTCATGAGGATACTTACATGAGAAGACAGTTCA
CTTAAAAAAATACAGAACCAAGCTTGCTTGTGGATCACGCTAGTTATATAGGAGGATATT
TTAGGTTTTAAAAAAGGGCTTGGTGCTTGTTTTGTTTTTTTTTTTATTTTATCTTTTGTG
ATTCTCGTGTGAAAGCAAAAACTATGAGAGACTTGGTAGTAGTTGGATTAATGAATGATG
AATGATTACTGTTGTTGGAATGTTATAATCATAGATTACCAAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU24TF U 1
AF RR2AR07TF U 87
AF RR2AR07JQ C 120
AF RR2FU24JQ C 405
BS 1 251 RR2FU24TF
BS 252 252 RR2AR07TF
BS 253 338 RR2FU24TF
BS 339 339 RR2AR07TF
BS 340 343 RR2FU24TF
BS 344 344 RR2AR07TF
BS 345 400 RR2FU24TF
BS 401 401 RR2AR07TF
BS 402 660 RR2FU24TF
BS 661 661 RR2AR07TF
BS 662 704 RR2FU24TF
BS 705 827 RR2AR07TF
BS 828 882 RR2AR07JQ
BS 883 884 RR2FU24JQ
BS 885 1005 RR2AR07JQ

RD RR2FU24TF 704 0 0
GGGCGTGAGTGCGATGTTCAATGTGTTTCTCACACCCACTTTATGCTTTATTACTTACAA
ACGAAGAAGAACCCAATAAAATATAGTTGGAAGAAAAGAGAGAGAAAGAGAGGATCTCAG
AGTAGAAGAAGAAGTAGATGGAGATGGAGAAGAGAAAGATGGTGATGTGTGGTGTGCTAG
CACTTCTGGGTTTATTATCTGCTGTTACTGCCTTCGCTGCTGAAGCTACCAGAATCAAGA
AATCTCAGGTCATGGTTACCACATTGGACTCGGTCAAACAATGCTCTTACAAGAGAAGTC
CAGCTTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGCCATCTTTCTCGTGATAGCTCAGATCATCGCCA
GCGTCGGTAGCGGTTGTTTCTGTTGTAGAAAAGGTCCTTCTGCTCCTACCAGATCCAAGT
GGATTCTCGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTCCTCG
TGCTGCTCACTGCAGCTGCCCTCAACGATGAACACATCCAGGAGACAGAGACTCCCGACA
GCTACTTCTGCTACATTGTGAAACCAGGCGTTTTCTTCATCGGCTCCATCCTCTCGCTTT
TCACTATAGGCCTTGGGATTGTCTACTATTTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTCG
TTGCTGCTGCCACAACGACACCGGTTAACCAAGGAATAGCAATG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2AR07TF 741 0 0
GG
GGAAGAAAAGAGAGAGAAAGAGAGGATCTCAGAGTAGAAGAAGAAGTAGATGGAGATGGA
GAAGAGAAAGATGGTGATGTGTGGTGTGCTAGCACTTCTGGGTTTATTATCTGCTGTTAC
TGCCTTCGCTGCTGAAGCTACCAGAATCAAGAAATCTCAGGTCGTGGTTACCACATTGGA
CTCGGTCAAACAATGCTCTTACAAGAGAAGTCCAGCTTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGC
CATCTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCCAGCGTCGGTAGCGGTTGTTTCTGTTGTAG
AAAAGGTCCTTCCGCTCCTACCAGATCCAAGTGGATTCTCGCCTTAGTCTCCTTCATTGT
CTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTCCTCGTGCTGCTCACTGCAGCTGCCCTCAACGA
TGAACACATCCAGGAGACGGAGACTCCCGACAGCTACTTCTGCTACATTGTGAAACCAGG
CGTTTTCTTCATCGGCTCCATCCTCTCGCTTTTCACTATAGGCCTTGGGATTGTCTACTA
TTTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTTGCTGCTGCTGCCACAACGACACCGGTTAA
CCAAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGATTCCAGTGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTTGT
TCATGAGGATACTTACATGAGAAGACAGTTCACTTAAAAAAATACAGAACCAAGCTTGCT
TGTGGATCACGCTAGTTAT

QA 3 741 3 741
DS 

RD RR2AR07JQ 886 0 0
GAGT
AGAAGAAGAAGTAGATGGAGATGGAGAAGAGAAAGATGGTGATGTGTGGTGTGCTAGCAC
TTCTGGGTTTATTATCTGCTGTTACTGCCTTCGCTGCTGAAGCTACCAGAATCAAGAAAT
CTCAGGTCGTGGTTACCACATTGGACTCGGTCAAACAATGCTCTTACAAGAGAAGTCCAG
CTTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGCCATCTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCCAGCG
TCGGTAGCGGTTGTTTCTGTTGTAGAAAAGGTCCTTCCGCTCCTACCAGATCCAAGTGGA
TTCTCGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTCCTCGTGC
TGCTCACTGCAGCTGCCCTCAACGATGAACACATCCAGGAGACGGAGACTCCCGACAGCT
ACTTCTGCTACATTGTGAAACCAGGCGTTTTCTTCATCGGCTCCATCCTCTCGCTTTTCA
CTATAGGCCTTGGGATTGTCTACTATTTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTTGCTG
CTGCTGCCACAACGACACCGGTTAACCAAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGATTCCAG
TGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTTGTTCATGAGGATACTTACATGAGAAGACAGTTCACTT
AAAAAAATACAGAACCAAGCTTGCTTGTGGATCACGCTAGTTATATAGGAGGATATTTTA
GGTTTTAAAAAAGGGCTTGGTGCTTGTTTTGTTTTTTTT**TATTTTATCTTTTGTGATT
CTCGTGTGAAAGCAAAAACTATGAGAGACTTGGTAGTAGTTGGATTAATGAATGATGAAT
GATTACTGTTGTTGGAATGTTATAATCATAGATTACCAAAAC

QA 5 886 5 886
DS 

RD RR2FU24JQ 566 0 0
CCTACCAGATCCAAGTGGATTCTCGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCATGGTTCACTTTT
GTGCTAGCTTTCCTCGTGCTGCTCACTGCAGCTGCCCTCAACGATGAACACATCCAGGAG
ACAGAGACTCCCGACAGCTACTTCTGCTACATTGTGAAACCAGGCGTTTTTTTCATCGGC
TCCATCCTCTCGCTTTTCACTATAGGCCTTGGGATTGTTTACTATTTGTGTTTGAATTCG
GTTAAGCAAAACGTCGTTGCTGCTGCCACAACGACACCGGTTAACCAAGGAATAGCAATG
GGACAGCTTCAGATTCCAGTGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTTGTTCATGAGGATACTTAC
ATGAGAAGACAGTTCACTTAAAAAAATACAGAACCAAGCTTGCTTGTGGATCACGCTAGT
TATATAGGAGGATATTTTAGGTTTTAAAAAAGGGCTTGGTGCTTGTTTTGTTTTTTTTTT
TATTTTATCTTTTGTGATTCTCGTGTGAAAGCAAAAACTATGAGAGACTTGGTAGTAGTT
GGATTAATGAATGATGAATGATTAC
C

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 3

CO CL1559Contig1 604 3 5 U
GACAAAGAAAAAAAGTCTTAGAATAGAAGTGTCATTCGACATAAGAAAGCAAGTAGTTTC
AACAACTGAATCTAAATCATTACAAGCCTGTGTCTGAAGCACCATCGACTTTAAGCCTAG
ATAGTTAGCTGACTAGAGAGTACAAAGTACAAACAAACCCAATATCTCAAGGATAAGATT
ACACACTACTAGTACTACACACATTTTTCTACATGAGAGACTTGATATCATCATCTGAGT
TAATTGAATCATCTTCCCGCTCCTGCTGCTTTGAGGAAATTGTCAAAGGGACTAGCTGGA
GGCAGACTCATCATCGACCACGTATCCTGAAACACACCACATTCTCTCCCATAGATGCTC
CCATCTTCTGTTACCTTTTCAAGTGCAGAAGACTCCTCTGATGAGTTTCTGTAGAGACCA
TTCACCTGGCGGTTCTCAGTGGCCAACCACCTTGAGAGCCTCTGCCTTGTCCCAGTCCCA
AAGGTTTCGCAGCGGTTTGTCATTGTGTCGTAAGGAAGCGGAGAAGTGGAGACAGATGAC
ACAACTACTTGACCAGCCACCTCAAGCGCAGATTCCATAAGCTGGGCCAATGCTGATAAC
TTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 

AF RR2GV38JQB U 60
AF RR2H908JQ U 1
AF RR2GR19JQ U 21
BS 1 481 RR2H908JQ
BS 482 482 RR2GR19JQ
BS 483 585 RR2H908JQ
BS 586 586 RR2GR19JQ
BS 587 604 RR2H908JQ

RD RR2GV38JQB 352 0 0
CAACAACTGAATCTAAATCATTACAAGCCTGTGTCTGAAGCACCATCGACTTTAAGCCTA
GATAGTTAGCTGACTAGAGAGTACAAAGTACAAACAAACCCAATATCTCAAGGATAAGAT
TACACACTACTAGTACTACACACATTTTTCTACATGAGAGACTTGATATCATCATCTGAG
TTAATTGAATCATCTTCCCGCTCCTGCTGCTTTGAGGAAATTGTCAAAGGGACTAGCTGG
AGGCAGACTCATCATCGACCACGTATCCTGAAACACACCACATTCTCTCCCATAAATGCT
CCCATCTTCTGTTACCTTTTCAAGTGCAGAAAACTCCTCTGATGAGTTTCTG

QA 1 352 1 352
DS 

RD RR2H908JQ 604 0 0
GACAAAGAAAAAAAGTCTTAGAATAGAAGTGTCATTCGACATAAGAAAGCAAGTAGTTTC
AACAACTGAATCTAAATCATTACAAGCCTGTGTCTGAAGCACCATCGACTTTAAGCCTAG
ATAGTTAGCTGACTAGAGAGTACAAAGTACAAACAAACCCAATATCTCAAGGATAAGATT
ACACACTACTAGTACTACACACATTTTTCTACATGAGAGACTTGATATCATCATCTGAGT
TAATTGAATCATCTTCCCGCTCCTGCTGCTTTGAGGAAATTGTCAAAGGGACTAGCTGGA
GGCAGACTCATCATCGACCACGTATCCTGAAACACACCACATTCTCTCCCATAGATGCTC
CCATCTTCTGTTACCTTTTCAAGTGCAGAAGACTCCTCTGATGAGTTTCTGTAGAGACCA
TTCACCTGGCGGTTCTCAGTGGCCAACCACCTTGAGAGCCTCTGCCTTGTCCCAGTCCCA
AGGGTTTCGCAGCGGTTTGTCATTGTGTCGTAAGGAAGCGGAGAAGTGGAGACAGATGAC
ACAACTACTTGACCAGCCACCTCAAGCGCAGATTCCATAAGCTGG*CCAATGCTGATAAC
TTGA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2GR19JQ 584 0 0
GAATAGAAGTGTCATTCGACATAAGAAAGCAAGTAGTTTCAACAACTGAATCTAAATCAT
TACAAGCCTGTGTCTGAAGCACCATCGACTTTAAGCCTAGATAGTTAGCTGACTAGAGAG
TACAAAGTACAAACAAACCCAATATCTCAAGGATAAGATTACACACTACTAGTACTACAC
ACATTTTTCTACATGAGAGACTTGATATCATCATCTGAGTTAATTGAATCATCTTCCCGC
TCCTGCTGCTTTGAGGAAATTGTCAAAGGGACTAGCTGGAGGCAGACTCATCATCGACCA
CGTATCCTGAAACACACCACATTCTCTCCCATAGATGCTCCCATCTTCTGTTACCTTTTC
AAGTGCAGAAGACTCCTCTGATGAGTTTCTGTAGAGACCATTCACCTGGCGGTTCTCAGT
GGCCAACCACCTTGAGAGCCTCTGTCTTGTCCCAGTCCCAAAGGTTTCGCAGCGGTTTGT
CATTGTGTCGTAAGGAAGCGGAGAAGTGGAGACAGATGACACAACTACTTGACCAGCCAC
CTCAAGCGCAGATTCCATAAGCTGGGCCAATGCTGATAACTTGA

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 5

CO CL1560Contig1 781 5 10 U
AATTTATTGTCTGAAGCTAAGCTATTATAAAGAGATATCCAAAAGAAGAGAAGACCACCA
AACAAAAACAAAAAACAAAAATGACGTCCAAAACCTTTTTCTTCTCTTTCTTTGTCGTCT
CCTTCGTGTGTTTGTCCTCTCTGGCCGGATTTTCTGCCGCCGATGCTGATGATTTTGACA
GTTTCCAGATTCAAGGATCAGTTTATTGTGACACTTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTC
TCAGCAAATTCCTTGAAGGAGCGAAAGTGAAGTTGGAATGCAGGAGCAGAACAAACGGAA
CCCTAACATTGACCAAAGAAGCCGTTACCGACAAAACGGGAAGCTACAGGATGGAAGTAA
CCGGCGACCACGAAGAAGAAGTTTGCGAGCTCGTGTTGGTGCAATCCCCAGACAGTGGTT
GCAGTGACGTCAGCAAAGATGCATACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTCTAACGGCGA
ATGACGGTATCGTCTCTCACGAGACACGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTAAGA
CACCGTCAGCTGACTGTCCCGCTGCTTTCAAGGAGCTCGGTATTGTCCCTGACGTTACTT
TCTAAGCGAAGATAGAAAGTATTTATATATGACATGGGAGATTTGATTTTCTATTTGCTT
CATTTTGAAGGGGTTTCCGTCAAGTTTACCAATTATTATCATTATGAGTTTTAACATCAA
CAGTAAAAACACTCAAAATTATTATTTTTATCTTTTTGTTCACTAATGATAGGTTGTTAC
C


BQ
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2H461TF U 9
AF RR2BP22TF U 1
AF RR2CH60TF U 1
AF RR2BP22JQ C 99
AF RR2CH60JQ C 123
BS 1 5 RR2BP22TF
BS 6 6 RR2CH60TF
BS 7 10 RR2BP22TF
BS 11 11 RR2CH60TF
BS 12 666 RR2BP22TF
BS 667 672 RR2CH60TF
BS 673 673 RR2BP22JQ
BS 674 729 RR2CH60TF
BS 730 763 RR2BP22JQ
BS 764 781 RR2CH60JQ

RD RR2H461TF 545 0 0
GTT
TGAAGCTAAGCTATTATAAAGAGATATCCAAAAGAAGAGAAGACCACCAAACAAAAACAA
AAAACAAAAATGACGTCCAAAACCTTTTTCTTCTCTTTCTTTGTCGTCTCCTTCGTGTGT
TTGTCCTCTCTGGCCGGATTTTCTGCCGCCGATGCTGATGATTTTGACAGTTTCCAGATT
CAAGGATCAGTTTATTGTGACACTTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTC
CTTGAAGGAGCGAAAGTGAAGTTGGAATGCAGGAGCAGAACAAACGGAACCCTAACATTG
ACCAAAGAAGCCGTTACCGACAAAACGGGAAGCTACAGGATGGAAGTAACCGGCGACCAC
GAAGAAGAAGTTTGCGAGCTCGTGTTGGTGCAATCCCCAGACAGTGGTTGCAGTGACGTC
AGCAAAGATGCATACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTCTAACGGCGAATGACGGTATC
GTCTCTCACGAGACACGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTAAGACACCGTCAGCT
GA

QA 4 545 4 545
DS 

RD RR2BP22TF 666 0 0
AATTTCTTGTTTGAAGCTAAGCTATTATAAAGAGATATCCAAAAGAAGAGAAGACCACCA
AACAAAAACAAAAAACAAAAATGACGTCCAAAACCTTTTTCTTCTCTTTCTTTGTCGTCT
CCTTCGTGTGTTTGTCCTCTCTGGCCGGATTTTCTGCCGCCGATGCTGATGATTTTGACA
GTTTCCAGATTCAAGGATCAGTTTATTGTGACACTTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTC
TCAGCAAATTCCTTGAAGGAGCGAAAGTGAAGTTGGAATGCAGGAGCAGAACAAACGGAA
CCCTAACATTGACCAAAGAAGCCGTTACCGACAAAACGGGAAGCTACAGGATGGAAGTAA
CCGGCGACCACGAAGAAGAAGTTTGCGAGCTCGTGTTGGTGCAATCCCCAGACAGTGGTT
GCAGTGACGTCAGCAAAGATGCATACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTCTAACGGCGA
ATGACGGTATCGTCTCTCACGAGACACGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTAAGA
CACCGTCAGCTGACTGTCCCGCTGCTTTCAAGGAGCTCGGTATTGTCCCTGACGTTACTT
TCTAAGCGAAGATAGAAAGTATTTATATATGACATGGGAGATTTGATTTTCTATTTGCTT
CATTTT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2CH60TF 729 0 0
AATTTATTGTCTGAAGCTAAGCTATTATAAAGAGATATCCAAAAGAAGAGAAGATCATCA
AACAGAAA***AAAACAAAAATGACGTCCAAAGCCTTTTTCTTCTCTTTCTTTGTCGTCT
CCTTCGTGTGTTTGTCCTCTCTGGCCGGATTTTCCGCCGCCGATGCTGATGATTTTGACC
ATTTCCAGATTCAGGGATCAGTTTATTGTGACACTTGCCGTGTCCAATTCGTTACTCGTC
TCAGCAAATTCCTTGAAGGAGCGAAAGTGAAGTTGGAATGCAGGAGCAGAACAAACGGAA
CCCTAACATTGACCAAAGAAGCCGTTACCGACAAAACGGGAAGCTACAGGATGGAAGTAA
CCGGCGACCACGAAGAAGAAGTTTGCGAGCTCGTGTTGGTGCAATCCCCAGACAGCGGTT
GCAGTGACGTCAGCAAAGATGCATACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTCTAACGGCGA
ATGACGGTATCGTCTCTCACGAGACACGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTAAGA
CACCGTCAGCTGACTGTCCCGCTGCTTTCAAGGAGCTCGGTATTGTCCCTGACGTTACTT
TCTAAGCGAAGATAGAAAGTATTTATATATGACATGGGAGATTTGATTTTCTATTTGCTT
CATTTTGAAGGG*TTTCCGTCAAGTTTACCAATTATTATCATTATGAGTTTTAACATCAA
CAGTAAAAA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2BP22JQ 666 0 0
TTCTTCTCTTTCTTTGTCGTCTCCTTCGTGTGTTTGTCCTCTCTGGCCGGATTTTCTGCC
GCCGATGCTGATGATTTTGACAGTTTCCAGATTCAAGGATCAGTTTATTGTGACACTTGC
CGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTCCTTGAAGGAGCGAAAGTGAAGTTGGAA
TGCAGGAGCAGAACAAACGGAACCCTAACATTGACCAAAGAAGCCGTTACCGACAAAACG
GGAAGCTACAGGATGGAAGTAACCGGCGACCACGAAGAAGAAGTTTGCGAGCTCGTGTTG
GTGCAATCCCCAGACAGTGGTTGCAGTGACGTCAGCAAAGATGCATACTTACGTAACGCC
GCTAAGATCAGTCTAACGGCGAATGACGGTATCGTCTCTCACGAGACACGTATCGTTAAC
CCTCTCGGTTTCATGGTTAAGACACCGTCAGCTGACTGTCCCGCTGCTTTCAAGGAGCTC
GGTATTGTCCCTGACGTTACTTTTTAAGCGAAGATAGAAAGTATTTATATATGACATGGG
AGATTTGATTTTTTATTTGCTTCATTTTGAAGGGGTTTCCGTCAAGTTTACCAATTATTA
TCATTATGAGTTTTAACATCAACAGTAAAAACACTCAAAATTATTATTTTTATCTTTTTG
TTCAC
G

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2CH60JQ 659 0 0
TTCGTGTGTTTGTCCTCTCTGGCCGGATTTTCCGCCGCCGATGCTGATGATTTTGACCAT
TTCCAGATTCAGGGATCAGTTTATTGTGACACTTGCCGTGTCCAATTCGTTACTCGTCTC
AGCAAATTCCTTGAAGGAGCGAAAGTGAAGTTGGAATGCAGGAGCAGAACAAACGGAACC
CTAACATTGACCAAAGAAGCCGTTACCGACAAAACGGGAAGCTACAGGATGGAAGTAACC
GGCGACCACGAAGAAGAAGTTTGCGAGCTCGTGTTGGTGCAATCCCCAGACAGCGGTTGC
AGTGACGTCAGCAAAGATGCATACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTCTAACGGCGAAT
GACGGTATCGTCTCTCACGAGACACGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTAAGACA
CCGTCAGCTGACTGTCCCGCTGCTTTCAAGGAGCTCGGTATTGTCCCTGACGTTACTTTC
TAAGCGAAGATAGAAAGTATTTATATATGACATGGGAGATTTGATTTTCTATTTGCTTCA
TTTTGAAGGGGTTTCCGTCAAGTTTACCAATTATTATCATTATGAGTTTTAACATCAACA
GTAAAAACACTCAAAGTTATTATTTTTATCTTTTTGTTCACTAATGATAGGTTGTTACC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 3

CO CL1561Contig1 721 3 31 U
GGAGATCAAACTAGTTGTGTTCTGTCATAAAATAAAAGAACGAAATCGAAAGAATCTGTT
TCCACTTTCGTCTGAAGGAGATCGACTTGTCAAAGGGAAACAAACTCCCTAGATATGGCG
GAGAAGCTTGCGCCAGAGAAGCGACACGATTTCGTTCATAACGGGCAAAAGGTGTTCGAA
TGGGATCAAACACTTGAAGAAGTGAACCTGTACATAACTCTGCCGCCTAATGTTCACTCA
AAGGCTTTCCACTGCAAAATCCAGTCGAAACATCTCGAAGTTGGCATCAAAGGCAACCCT
CCTTATCTCAATCACGATCTTAGTGCTCCTGTGAAGACGGATTGCTCGTTCTGGACTCTA
GAGGATGATATAATGCACATAACCCTGCAGAAGAGGGAGAAAGGGCAGACATGGGCATCT
CCGATACTCGGACAGGGTCAGTTAGATCCTTACGCCACTGATCTAGAGCAGAAGCGTCTC
ATGCTCCAGAGGTTTCAAGAAGAGAACCCAGGATTCGACTTTTCACAAGCTCAGTTCACG
GGTAACTGTCCAGATCCGAGTAGCTTCATGGGTGGTATTCGTTCTGACTAGTCCTTCCTA
CTCTTGTTGTTTCCATTATAATAAAACTGCGAAAAGGAAAATGTCCCCATGGGTCTGTTA
ATCAATCAAATCATCTCTAAACTATATTTCATTCACTTACGAATAAATGCGTTTGTCTTG
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 5 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 

AF RR2G896TF U 1
AF RR2AA76TF U 41
AF RR2D345TF U 68
BS 1 60 RR2G896TF
BS 61 61 RR2AA76TF
BS 62 93 RR2G896TF
BS 94 94 RR2AA76TF
BS 95 96 RR2G896TF
BS 97 97 RR2AA76TF
BS 98 98 RR2G896TF
BS 99 99 RR2AA76TF
BS 100 105 RR2G896TF
BS 106 106 RR2AA76TF
BS 107 176 RR2G896TF
BS 177 177 RR2AA76TF
BS 178 208 RR2G896TF
BS 209 209 RR2AA76TF
BS 210 392 RR2G896TF
BS 393 393 RR2AA76TF
BS 394 425 RR2G896TF
BS 426 426 RR2AA76TF
BS 427 485 RR2G896TF
BS 486 486 RR2AA76TF
BS 487 512 RR2G896TF
BS 513 513 RR2AA76TF
BS 514 598 RR2G896TF
BS 599 599 RR2AA76TF
BS 600 605 RR2G896TF
BS 606 606 RR2AA76TF
BS 607 622 RR2G896TF
BS 623 640 RR2AA76TF
BS 641 641 RR2D345TF
BS 642 720 RR2AA76TF
BS 721 721 RR2D345TF

RD RR2G896TF 622 0 0
GGAGATCAAACTAGTTGTGTTCTGTCATAAAATAAAAGAACGAAATCGAAAGAATCTGTT
*CCACTTTCGTCTGAAGGAGATCGACTTGTCAAGGGAACACAAACCCCCTAGATATGGCG
GAGAAGCTTGCGCCAGAGAAGCGACACGATTTCGTTCATAACGGGCAAAAGGTGTTTGAA
TGGGATCAAACACTTGAAGAAGTGAACCCGTACATAACTCTGCCGCCTAATGTTCACTCA
AAGGCTTTCCACTGCAAAATCCAGTCGAAACATCTCGAAGTTGGCATCAAAGGCAACCCT
CCTTATCTCAATCACGATCTTAGTGCTCCTGTGAAGACGGATTGCTCGTTCTGGACTCTA
GAGGATGATATAATGCACATAACCCTGCAGAAAAGGGAGAAAGGGCAGACATGGGCATCT
CCGATTCTCGGACAGGGTCAGTTAGATCCTTACGCCACTGATCTAGAGCAGAAGCGTCTC
ATGCTGCAGAGGTTTCAAGAAGAGAACCCAGGGTTCGACTTTTCACAAGCTCAGTTCACG
GGTAACTGTCCAGATCCGAGTAGCTTCATGGGTGGTATTCGTTCTGACTAGTCCTTCCGA
CTCTT*TTGTTTCCATTATAAT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2AA76TF 680 0 0
G
GAAATCGAAAGCATCTGTTTCCACTTTCGTCTGAAGGAGATCGACTTGTCAAAGGGAAAC
AAACTCCCTAGATATGGCGGAGAAGCTTGCGCCAGAGAAGCGACACGATTTCGTTCATAA
CGGGCAAAAGGTGTTCGAATGGGATCAAACACTTGAAGAAGTGAACCTGTACATAACTCT
GCCGCCTAATGTTCACTCAAAGGCTTTCCACTGCAAAATCCAGTCGAAACATCTCGAAGT
TGGCATCAAAGGCAACCCTCCTTATCTCAATCACGATCTTAGTGCTCCTGTGAAGACGGA
TTGCTCGTTCTGGACTCTAGAGGATGATATAATGCACATAACCCTGCAGAAGAGGGAGAA
AGGGCAGACATGGGCATCTCCGATACTCGGACAGGGTCAGTTAGATCCTTACGCCACTGA
TCTAGAGCAGAAGCGTCTCATGCTCCAGAGGTTTCAAGAAGAGAACCCAGGATTCGACTT
TTCACAAGCTCAGTTCACGGGTAACTGTCCAGATCCGAGTAGCTTCATGGGTGGTATTCG
TTCTGACTAGTCCTTCCTACTCTTGTTGTTTCCATTATAATAAAACTGCGAAAAGGAAA*
TGTCCCCATGGGTCTGTTAATCAATCAAATCATCTCTAAACTATATTTCATTCACTTACG
AATAAATGCGTTTGTCTTG

QA 2 680 2 680
DS 

RD RR2D345TF 654 0 0
GGGTCT
GAAGGAGATCGACTTGTCAAAGGGAAACAAACTCCCTAGATATGGCGGAGAAGCTTGCGC
CAGAGAAGCGACACGATTTCGTTCATAACGGGCAAAAGGTGTTCGAATGGGATCAAACAC
TTGAAGAAGTGAACCTGTACATAACTCTGCCGCCTAATGTTCACTCAAAGGCTTTCCACT
GCAAAATCCAGTCGAAACATCTCGAAGTTGGCATCAAAGGCAACCCTCCTTATCTCAATC
ACGATCTTAGTGCTCCTGTGAAGACGGATTGCTCGTTCTGGACTCTAGAGGATGATATAA
TGCACATAACCCTGCAGAAGAGGGAGAAAGGGCAGACATGGGCATCTCCGATACTCGGAC
AGGGTCAGTTAGATCCTTACGCCACTGATCTAGAGCAGAAGCGTCTCATGCTCCAGAGGT
TTCAAGAAGAGAACCCAGGATTCGACTTTCCACAAGCTCAGTTCACGGGTAACTGTCCAG
ATCCGAGTAGCTTCATGGTTGGTATTCGTTCTGACTAGTCCTTCCTACTCTCTTTGTTTC
CATTATAATAAAACTGCGAAAAGGAAAATGTCCCCATGGGTCTGTTAATCAATCAAATCA
TCTCTAAACTATATTTCATTCACTTACGAATAAATGCGTTTGTCTTGT

QA 7 654 7 654
DS 



AS 1 5

CO CL1562Contig1 1197 5 14 U
GGAAGGAAAAAAGAAAACATTCAATAATTAAAAAAAAAAAAAAAGTATGTCTCTTGTTCT
TCCCCATCTCATCATCTACCTACTTCTCTTGACGGTAGCCACCGGTGAAATTCTCCGACC
AAGATTCTACAGCGAAACATGCCCTGAAGCTGAATCCATCGTGAGAAACGAAATGAAGAA
AGCCATGATCAGAGAAGCCAGAAGCGTCGCCTCCGTTATGCGTCTCCAGTTTCACGACTG
CTTCGTTAATGGATGTGACGGGTCCGTGTTGCTTGACGACACACCCAACATGCTCGGTGA
AAAACTATCACTTTCCAACATCGATTCACTGAGATCTTTCGAAGTTGTAGACGACATCAA
AGAAGCTCTAGAGAAAGCTTGTCCCGCTACTGTCTCCTGTGCCGACATCGTCATCATGGC
TTCCCGTGACGCCGTTGCTCTTACAGGAGGACCGGACTGGGAAGTGAAGCTAGGGAGGAA
AGACAGTTTAACAGCGAGTCAGAAAGATTCAGACGACATAATGCCGAGCCCAAGAGCAAA
CGCGACGTTCTTGGTCGATCTCTTCGAAAGATTCGATCTTTCGGTTAAAGACATGGTGGC
TTTGTCTGGATCACACTCGATTGGTAAAGGTCGGTGTTTTTCGATCATGTTCAGGCTTTA
TAACCAATCCGGTTCTGGTAAACCGGATCCCGGCTCTCGAACCGGTTTACAAGAGGAAGC
TTAACAAGCTTTGTCCTTTGGGTGGAGACGAGAACGTGACCGGGGATCTAGACGCGACGC
CTCGGGTTTTTGATAATCAGTACTTCAAAGACTTGGTTTCAGGGAGAGGGTTTCTTAACT
CTGATCAGACTCTGTACACGAGTAGAGAGACGAGAGGGTATGTGAAGTGGTTTAGCGAGG
ATCAAGGTGAGTTCTTTAGAGCTTTTGAAGAAGGGATGGTGAAGTTGGGTGATTTGCAAT
CTGGGAGACCTGGTGAGGTTAGGGTTAACTGTAGGGTTGTTAATACAGGGCATAATGATG
TATTATTGCGTGACTCTTGAAATTAGAGGAGAGATATTATGTATGACTTTTGAATACATC
TTTCAGACTCATGATGCTGCATTTGCAACTTTAGATCTGTAAAACTGGAGAAAATGTCTA
TATCAGCCAAAAGATATAAACATCCAAACCCAAAACATATAAACAAGCATATTATGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C644TF U 57
AF RR2DT75TF U 1
AF RR2C644JQ C 637
AF RR2BI06TF U 1
AF RR2DT75JQ C 737
BS 1 16 RR2BI06TF
BS 17 17 RR2DT75TF
BS 18 383 RR2BI06TF
BS 384 384 RR2DT75TF
BS 385 467 RR2BI06TF
BS 468 468 RR2DT75TF
BS 469 469 RR2BI06TF
BS 470 470 RR2DT75TF
BS 471 482 RR2BI06TF
BS 483 483 RR2DT75TF
BS 484 568 RR2BI06TF
BS 569 569 RR2DT75TF
BS 570 814 RR2BI06TF
BS 815 1197 RR2DT75JQ

RD RR2C644TF 569 0 0
TTCTTCCCCATCTCATCATCTACCTACTTCTCTTGACGGTAGCCACCGGTGAAATTCTCC
GACCAAGATTCTACAGCGAAACATGCCCTGAAGCTGAATCCATCGTGAGAAACGAAATGA
AGAAAGCCATGATCAGAGAAGCCAGAAGCGTCGCCTCCGTTATGCGTCTCCAGTTTCACG
ACTGCTTCGTTAATGGATGTGACGGGTCCGTGTTGCTTGACGACACACCCAACATGCTCG
GTGAAAAACTATCACTTTCCAACATCGATTCACTGAGAACTTTCGAAGTTGTAGACGACA
TCAAAGAAGCTCTAGAGAAAGCTTGTCCCGCTACTGTCTCCTGTGCCGACATCGTCATCA
TGGCTTCCCGTGACGCCGTTGCTCTTACAGGAGGACCGGACTGGGAAGTGAAGCTAGGGA
GGAAAGACAGTTTAACAGCGAGTCAGAAAGATTCAGACGACATAATGCCGAGCCCAAGAG
CAAACGCGACGTTCTTGGTCGATCTCTTCGAAAGATTCGATCTTTCGGTTAAAGACATGG
TGGCTTTGTCTGGATCACACTCGATTGGT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2DT75TF 684 0 0
GGAAGGAAAAAAGAAAACATTCAATAATTAAAAAAAAAAAAAA*GTATGTCTCTTGTTCT
TCCCCATCTCATCATCTACCTACTTCTCTTGACGGTAGCCACCGGTGAAATTCTCCGACC
AAGATTCTACAGCGAAACATGCCCTGAAGCTGAATCCATCGTGAGAAACGAAATGAAGAA
AGCCATGATCAGAGAAGCCAGAAGCGTCGCCTCCGTTATGCGTCTCCAGTTTCACGACTG
CTTCGTTAATGGATGTGACGGGTCCGTGTTGCTTGACGACACACCCAACATGCTCGGTGA
AAAACTATCACTTTCCAACATCGATTCACTGAGATCTTTCGAAGTTGTAGACGACATCAA
AGAAGCTCTAGAGAAAGCTTGTCCCGCTACTGTCTCCTGTGCCGACATCGTCATCATGGC
TTCCCGTGACGCCGTTGCTCTTACAGGAGGACCGGACTGGGAAGTGAAGCTAGGGAGGAA
AGACAGTTTAACAGCGAGTCAGAAAGATTCAGACGACATAATGCCGAGCCCAAGAGCAAA
CGCGACGTTCTTGGTCGATCTCTTCGAAAGATTCGATCTTTCGGTTAAAGACATGGTGGC
TTTGTCTGGATCACACTCGATTGGTAAGGGTCGGTGTTTTTCGATCATGTTCAG*CTTTA
TAACCAATCCCGTTCTGGTAAACC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2C644JQ 126 0 0
TTTTTCGATCATGTTCAGGCTTTATAACCAATCCGGTTCTGGTAAACCGGTTCC*GGCTC
TCGAACCGGTTTACAAGAGGAAGCTTAACAAGCTTTGTCCTTTGGGTGGAGACGAGAACG
TGACCG

QA 1 126 1 126
DS 

RD RR2BI06TF 814 0 0
GGAAGGAAAAAAGAAAGCATTCAATAATTAAAAAAAAAAAAAAAGTATGTCTCTTGTTCT
TCCCCATCTCATCATCTACCTACTTCTCTTGACGGTAGCCACCGGTGAAATTCTCCGACC
AAGATTCTACAGCGAAACATGCCCTGAAGCTGAATCCATCGTGAGAAACGAAATGAAGAA
AGCCATGATCAGAGAAGCCAGAAGCGTCGCCTCCGTTATGCGTCTCCAGTTTCACGACTG
CTTCGTTAATGGATGTGACGGGTCCGTGTTGCTTGACGACACACCCAACATGCTCGGTGA
AAAACTATCACTTTCCAACATCGATTCACTGAGATCTTTCGAAGTTGTAGACGACATCAA
AGAAGCTCTAGAGAAAGCTTGTCACGCTACTGTCTCCTGTGCCGACATCGTCATCATGGC
TTCCCGTGACGCCGTTGCTCTTACAGGAGGACCGGACTGGGAAGTGAGGTTAGGGAGGAA
AGGCAGTTTAACAGCGAGTCAGAAAGATTCAGACGACATAATGCCGAGCCCAAGAGCAAA
CGCGACGTTCTTGGTCGATCTCTTCGAAGGATTCGATCTTTCGGTTAAAGACATGGTGGC
TTTGTCTGGATCACACTCGATTGGTAAAGGTCGGTGTTTTTCGATCATGTTCAGGCTTTA
TAACCAATCCGGTTCTGGTAAACCGGATCCCGGCTCTCGAACCGGTTTACAAGAGGAAGC
TTAACAAGCTTTGTCCTTTGGGTGGAGACGAGAACGTGACCGGGGATCTAGACGCGACGC
CTCGGGTTTTTGATAATCAGTACTTCAAAGACTT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR2DT75JQ 461 0 0
TTTGGGTGGAGACGAGAACGTGACCGGGGATCTAGACGCGACGCCTCGGGTTTTTGATAA
TCAGTACTTCAAAGACTTGGTTTCAGGGAGAGGGTTTCTTAACTCTGATCAGACTCTGTA
CACGAGTAGAGAGACGAGAGGGTATGTGAAGTGGTTTAGCGAGGATCAAGGTGAGTTCTT
TAGAGCTTTTGAAGAAGGGATGGTGAAGTTGGGTGATTTGCAATCTGGGAGACCTGGTGA
GGTTAGGGTTAACTGTAGGGTTGTTAATACAGGGCATAATGATGTATTATTGCGTGACTC
TTGAAATTAGAGGAGAGATATTATGTATGACTTTTGAATACATCTTTCAGACTCATGATG
CTGCATTTGCAACTTTAGATCTGTAAAACTGGAGAAAATGTCTATATCAGCCAAAAGATA
TAAACATCCAAACCCAAAACATATAAACAAGCATATTATGC

QA 1 461 1 461
DS 



AS 1 5

CO CL1563Contig1 850 5 10 U
GGATTCAAACTTAATTCCTGATTGACGACAAAAAAAAAAAAACTTAAATCCTGATTGAAA
GATTCAGATTGGGTTTCGTCGGATTGAAAGGAAGGACCCATGACTCCGTCTCCGATTTTA
ACCGCCTCGTTTCTCTTCTTCCTCTTCTGCGTTGCTCCGCCGCTCACCACCGCCGCTACA
GATACCGATTCGCCGACGGCGTACACTCTCCTTCAAAGCTACAACTTCCCCGTCGGGATT
CTCCCCAAAGGAGTCGTGTCGTACGATCTGGACGAGTCCACAGGGAAGTTCCACGCGTAT
TTCGACAAGTCGTGTACTTTCGCCCTCCAGGATTCTTCTTACCAGTTGGATTACGCATCG
ACCATCTCCGGCTACATATCGGAGAACAAGATCACGAAGCTCACCGGCGTGAAGGTGAAA
GTTCTCTTCTTGTGGCTCAACATCGTGGAGGTTATCAGGAACGGAGACCAGCTCGAGTTC
TCCGTCGGGATCACGTCGGCGAACTTCGCGATCGAGGAGTTTTACGAGTCGCCTCAGTGT
GGATGCGGG*TTCGATTGCGACGGGTTGAAATCGGAATCGGATGATTTGGGAAGAAACCC
TTTTGTCTCTTCGGTCTGAAAGGTGCTTCCTTCTTCAATTGTAATTAAATAGGGGACTTT
TCTTACAGAACTTGAAACTCTTTGGGGGGGGGGGGGGTTTGTTCTTTATCCAATCATTAT
GGTTCTTTGTTTCAATAAATTGCTTTGCTTTGTATCTGTTCTTAAGATCGTTGGATTAAC
CAACCAATGTATTTACTTCCAAGCAATAAAACGATGGGTGGTTGATCAATGGTTATGAAT
GTTGCATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2C264TF U 1
AF RR2BZ43TF U 37
AF RR2GQ50TF U 243
AF RR2BZ43JQ C 120
AF RR2C264JQ C 609
BS 1 530 RR2C264TF
BS 531 531 RR2BZ43TF
BS 532 618 RR2C264TF
BS 619 676 RR2BZ43TF
BS 677 677 RR2BZ43JQ
BS 678 682 RR2BZ43TF
BS 683 683 RR2BZ43JQ
BS 684 696 RR2BZ43TF
BS 697 848 RR2BZ43JQ
BS 849 850 RR2C264JQ

RD RR2C264TF 618 0 0
GGATTCAAACTTAATTCCTGATTGACGACAAAAAAAAAAAAACTTAAATCCTGATTGAAA
GATTCAGATTGGGTTTCGTCGGATTGAAAGGAAGGACCCATGACTCCGTCTCCGATTTTA
ACCGCCTCGTTTCTCTTCTTCCTCTTCTGCGTTGCTCCGCCGCTCACCACCGCCGCTACA
GATACCGATTCGCCGACGGCGTACACTCTCCTTCAAAGCTACAACTTCCCCGTCGGGATT
CTCCCCAAAGGAGTCGTGTCGTACGATCTGGACGAGTCCACAGGGAAGTTCCACGCGTAT
TTCGACAAGTCGTGTACTTTCGCCCTCCAGGATTCTTCTTACCAGTTGGATTACGCATCG
ACCATCTCCGGCTACATATCGGAGAACAAGATCACGAAGCTCACCGGCGTGAAGGTGAAA
GTTCTCTTCTTGTGGCTCAACATCGTGGAGGTTATCAGGAACGGAGACCAGCTCGAGTTC
TCCGTCGGGATCACGTCGGCGAACTTCGCGATCGAGGAGTTTTACGAGTCACCTCAGTGT
GGATGCGGG*TTCGATTGCGACGGGTTGAAATCGGAATCGGATGATTTGGGAAGAAACCC
TTTTGTCTCTTCGGTCTG

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2BZ43TF 660 0 0
G
AAAAACTTAAATCCTGATTGAAAGATTCAGATTGGGTTTCGTCGGATTGAAAGGAAGGAC
CCATGACTCCGTCTCCGATTTTAACCGCCTCGTTTCTCTTCTTCCTCTTCTGCGTTGCTC
CGCCGCTCACCACCGCCGCTACAGATACCGATTCGCCGACGGCGTACACTCTCCTTCAAA
GCTACAACTTCCCCGTCGGGATTCTCCCCAAAGGAGTCGTGTCGTACGATCTGGACGAGT
CCACAGGGAAGTTCCACGCGTATTTCGACAAGTCGTGTACTTTCGCCCTCCAGGATTCTT
CTTACCAGTTGGATTACGCATCGACCATCTCCGGCTACATATCGGAGAACAAGATCACGA
AGCTCACCGGCGTGAAGGTGAAAGTTCTCTTCTTGTGGCTCAACATCGTGGAGGTTATCA
GGAACGGAGACCAGCTCGAGTTCTCCGTCGGGATCACGTCGGCGAACTTCGCGATCGAGG
AGTTTTACGAGTCGCCTCAGTGTGGATGCGGG*TTCGATTGCGACGGGTTGAAATCGGAA
TCGGATGATTTGGGAAGAAACCCTTTTGTCTCTTCGGTCTGAAAGGTGCTTCCTTCTTCA
ATTGTAATTAAATAGGGGACTTTTCTTACAGAACTTGAA*CTCTTGGGGGGGGGGGGGG

QA 2 660 2 660
DS 

RD RR2GQ50TF 429 0 0
CCCCAAAGGAGTCGTGTCGTACGATCTGGACGAATCCACAGGGAAGTTCCACGCGTATTT
CGACAAGTCGTGTACTTTCGCCCTCCAGGATTCTTCTTACCAGTTGGATTACAAATCGAC
GATCTCCGGCTACATATCGGAGAACAAGATCACGAAGCTCACCGGCGTGAAGGTGAAAGT
TCTCTTCTTGTGGCTCAACATCGTGGAGGTCATCAGGAACGGTGACGAGCTCGAGTTCTC
CGTCGGGATCACGTCGGCGAACTTCGCGATCGAGGAGTTTTACGAGTCGCCTCAGTGTGG
ATGCGGGGTTCGATTGCGACGGGTTGAAATCGGAATCGGATGATTTGGGAAGAAACCCTT
TTGTCTCTTCGGTCTGAAAGGTGCTTCCTTCTTCCATTGTAATTAAATAGGGGACTTTTC
TTACAGA
CT

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR2BZ43JQ 729 0 0
AACCGCCTCGTTTCTCTTCTTCCTCTTCTGCGTTGCTCCGCCGCTCACCACCGCCGCTAC
AGATACCGATTCGCCGACGGCGTACACTCTCCTTCAAAGCTACAACTTCCCCGTCGGGAT
TCTCCCCAAAGGAGTCGTGTCGTACGATCTGGACGAGTCCACAGGGAAGTTCCACGCGTA
TTTCGACAAGTCGTGTACTTTCGCCCTCCAGGATTTTTCTTACCAGTTGGATTACGCATC
GACCATCTCCGGCTACATATCGGAGAACAAGATCACGAAGCTCACCGGCGTGAAGGTGAA
AGTTCTCTTCTTGTGGCTCAACATCGTGGAGGTTATCAGGAACGGAGACCAGCTCGAGTT
CTCCGTCGGGATCACGTCGGCGAACTTCGCGATCGAGGAGTTTTACGAGTCGCCTCAGTG
TGGATGCGGG*TTCGATTGCGACGGGTTGAAATCGGAATCGGATGATTTGGGAAGAAACC
CTTTTGTCTCTTCGGTCTGAAAGGTGCTTCCTTCTTCAATTGTAATTAAATAGGGGACTT
TTCTTACAGAACTTGAAACTCTTTGGGGGGGGGGGGGGTTTGTTCTTTATCCAATCATTA
TGGTTCTTTGTTTCAATAAATTGCTTTGCTTTGTATCTGTTCTTAAGATCGTTGGATTAA
CCAACCAATGTATTTACTTCCAAGCAATAAAACGATGGGTGGTTGATCAATGGTTATGAA
TGTTGCATC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2C264JQ 242 0 0
T
TTCGGTTTGAAAGGTGCTTCCTTCTTCAATTGTAATTAAATAGGGGACTTTTCTTACAGA
ACTTGAAACTCTTTGGGGGGGGGGGGGGTTTGTTCTTTATCCAATCATTATGGTTCTTTT
TTTCAATAAATTGCTTTGCTTTGTATCTGTTCTTAAGATCGTTGGATTAATCAACCAATG
TATTTACTTCCAAGCAATAAAACGATGGGTGGTTGATCAATGGTTATGAATGTTGCATCC
C

QA 2 242 2 242
DS 



AS 1 4

CO CL1564Contig1 575 4 4 U
GGATAATCGGGAATCATGGCGATGGCACCGGCAATGCAGACCCAGACGACGTTCGTGTCA
TCGACGAACTTTCTGAAACAATCGAGACCTTCTTCATCACCTAGCAATGTGACTCTTCCC
AAAAACAAAAGATCGTCATCCGTAGTTGTTGCCGCTGTCGATGATGTCTCTTCTGACGGA
ACCGTATATTTGATAGCCGGAGCCGCTGCCGTTGCTCTTGTCGGAACAGCTTTTCCGATC
CTCTTCAAACGCACCGACACGTGTCCGGAATGTGACGGGGCAGGATTTGTGAGGAAGGGA
GGAGCCACTTTGAGGGCCAACGCGGCAAGGAAGGATCAAGCTCAGATCGTTTGCGCCAAC
TGCAATGGCCTCGGCAAGCTTAACCAGATTGATAAATAAAATAATTAACTCTCTTCTTCA
TTATTATTACAAACCGCTATTTCACATTCATCTTCTTCTCTGTGTAATATATACTCTGTA
AGTTTTTCTGAAACCGTAAGAGTGTGTTCGATTCGCGATAGCTTGTTTTGAGCTGTTCAA
CTTATATGCTCTGCATCTGCAAGAGAGTCTCTGTT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CK44TF U 3
AF RR2F094TF U 1
AF RR2DV92TF U 3
AF RR2DV92JQ C 81
BS 1 160 RR2F094TF
BS 161 161 RR2DV92TF
BS 162 517 RR2F094TF
BS 518 575 RR2DV92TF

RD RR2CK44TF 443 0 0
GG
AATCGGGAATCATGGCGACGGCACCGGCAATGCAGACCCAGACGACGTTCGTGTCATCGA
CGAACTTTCTGAAACAATCGAGACCTTCTTCATCACCTAGCAATGTGACTCTTCCCAAAA
ACAAAAGATCGTCATCCGTAGTTGTTGCCGCTGTCGGTGATGTCTCTTCTGACGGAACCG
TATATTTGATAGCCGGAGCCGCTGCCGTTGCTCTTGTCGGAACAGCTTTTCCGATCCTCT
TCAAACGCACCGACACGTGTCCGGAATGTGACGGGGCAGGATTTGTGAGGAAGGGAGGAG
CCACTTTGAGGGCCAACGCTGCAAGGAAGGATCAAGCTCAGATCGTTTGCGCCAACTGCA
ATGGCCTCGGCAAGCTTAACCAGATTGATAAATAAAATAATTAACTCTCTTCTTCATTAT
TATTACAAACCGCTATTTCAC

QA 3 443 3 443
DS 

RD RR2F094TF 517 0 0
GGATAATCGGGAATCATGGCGATGGCACCGGCAATGCAGACCCAGACGACGTTCGTGTCA
TCGACGAACTTTCTGAAACAATCGAGACCTTCTTCATCACCTAGCAATGTGACTCTTCCC
AAAAACAAAAGATCGTCATCCGTAGTTGTTGCCGCTGTCGGTGATGTCTCTTCTGACGGA
ACCGTATATTTGATAGCCGGAGCCGCTGCCGTTGCTCTTGTCGGAACAGCTTTTCCGATC
CTCTTCAAACGCACCGACACGTGTCCGGAATGTGACGGGGCAGGATTTGTGAGGAAGGGA
GGAGCCACTTTGAGGGCCAACGCGGCAAGGAAGGATCAAGCTCAGATCGTTTGCGCCAAC
TGCAATGGCCTCGGCAAGCTTAACCAGATTGATAAATAAAATAATTAACTCTCTTCTTCA
TTATTATTACAAACCGCTATTTCACATTCATCTTCTTCTCTGTGTAATATATACTCTGTA
AGTTTTTCTGAAACCGTAAGAGTGTGTTCGATTCGCG

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2DV92TF 573 0 0
GG
AATCGGGAATCATGGCGATGGCACCGGCAATGCAGACCCAGACGACGTTCGTGTCATCGA
CGAACTTTCTGAAACAATCGAGACCTTCTTCATCACCTAGCAATGTGACTCTTCCCAAAA
ACAAAAGATCGTCATCCGTAGTTGTTGCCGCTGTCGATGATGTCTCTTCTGACGGAACCG
TATATTTGATAGCCGGAGCCGCTGCCGTTGCTCTTGTCGGAACAGCTTTTCCGATCCTCT
TCAAACGCACCGACACGTGTCCGGAATGTGACGGGGCAGGATTTGTGAGGAAGGGAGGAG
CCACTTTGAGGGCCAACGCGGCAAGGAAGGATCAAGCTCAGATCGTTTGCGCCAACTGCA
ATGGCCTCGGCAAGCTTAACCAGATTGATAAATAAAATAATTAACTCTCTTCTTCATTAT
TATTACAAACCGCTATTTCACATTCATCTTCTTCTCTGTGTAATATATACTCTGTAAGTT
TTTCTGAAACCGTAAGAGTGTGTTCGATTCGCGATAGCTTGTTTTGAGCTGTTCAACTTA
TATGCTCTGCATCTGCAAGAGAGTCTCTGTT

QA 3 573 3 573
DS 

RD RR2DV92JQ 495 0 0
ATCGAGACCTTCTTCATCACCTAGCAATGTGACTCTTCCCAAAAACAAAAGATCGTCATC
CGTAGTTGTTGCCGCTGTCGATGATGTCTCTTCTGACGGAACCGTATATTTGATAGCCGG
AGCCGCTGCCGTTGCTCTTGTCGGAACAGCTTTTCCGATCCTCTTCAAACGCACCGACAC
GTGTCCGGAATGTGACGGGGCAGGATTTGTGAGGAAGGGAGGAGCCACTTTGAGGGCCAA
CGCGGCAAGGAAGGATCAAGCTCAGATCGTTTGCGCCAACTGCAATGGCCTCGGCAAGCT
TAACCAGATTGATAAATAAAATAATTAACTCTCTTCTTCATTATTATTACAAACCGCTAT
TTCACATTCATCTTCTTCTCTGTGTAATATATACTCTGTAAGTTTTTCTGAAACCGTAAG
AGTGTGTTCGATTCGCGATAGCTTGTTTTGAGCTGTTCAACTTATATGCTCTGCATCTGC
AAGAGAGTCTCTGTT

QA 1 495 1 495
DS 



AS 1 5

CO CL1565Contig1 580 5 5 U
GGAGGATACGTAAATCACAAATTTGTTTCAGAGAGAACGATTCTCCTGCGCCTCCTCTCG
CCGTCGTGTTCTCAGCTTTGTCGTCTGTGTGATTTAGATCGAGTTTCAGGGTTAACAAGT
AATAATGGCAAGAGGCAAATACATAGTCGGTGCCCTTGTGGGATCTGCTGTAGTAGCCTA
CGTCTGTGACAAAGTCATCTCTGATGATAAGATTTTCGGAGGTTCTACACCGGGAACTAT
TACTAACAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAGAGAGGCTCCAAGCATGGCCAAGAACTGC
TGGTCCTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACTTCATCGTCAAGTCCCGCCC
TGAATAACTGCGCAATCCTTCCTATCTCTCTCATTTGATTAAAAGATTTGATTTTATTTG
CTCTCTATGTTGGCCCCTTTTATCTTTTGATTTGAGGATCGGCTATTTTCTCAGTAATAA
TTTGTGGATTGGATGGATTGGATGGAATAAACATATTCATTCCAATCTTTTCTTTGTTGA
TTTTGACGATAATATTAAATTGAGCCAACAAGACTTGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN42TF U 1
AF RR2AO96JQ C 392
AF RR2A761JQ C 31
AF RR2A761TF U 31
AF RR2AO96TF U 24
BS 1 78 RR2DN42TF
BS 79 79 RR2A761TF
BS 80 205 RR2DN42TF
BS 206 206 RR2A761TF
BS 207 580 RR2DN42TF

RD RR2DN42TF 580 0 0
GGAGGATACGTAAATCACAAATTTGTTTCAGAGAGAACGATTCTCCTGCGCCTCCTCTCG
CCGTCGTGTTCTCAGCTTCGTCGTCTGTGTGATTTAGATCGAGTTTCAGGGTTAACAAGT
AATAATGGCAAGAGGCAAATACATAGTCGGTGCCCTTGTGGGATCTGCTGTAGTAGCCTA
CGTCTGTGACAAAGTCATCTCTGATAATAAGATTTTCGGAGGTTCTACACCGGGAACTAT
TACTAACAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAGAGAGGCTCCAAGCATGGCCAAGAACTGC
TGGTCCTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACTTCATCGTCAAGTCCCGCCC
TGAATAACTGCGCAATCCTTCCTATCTCTCTCATTTGATTAAAAGATTTGATTTTATTTG
CTCTCTATGTTGGCCCCTTTTATCTTTTGATTTGAGGATCGGCTATTTTCTCAGTAATAA
TTTGTGGATTGGATGGATTGGATGGAATAAACATATTCATTCCAATCTTTTCTTTGTTGA
TTTTGACGATAATATTAAATTGAGCCAACAAGACTTGAGA

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2AO96JQ 178 0 0
CATTTGATTAAAAGATTTGATTTTATTTGCTCTTTATGTTGGCCCCTTTTATTTTTTGAT
TTGAGGATCGGCTATTTTTTCAGTAATAATTTGTGGATTGGATGGATTGGATGGAATAAA
CATATTCATTCCAATTTTTTTTTTGTTGATTTTGACGATAATATTAAATTGAGCC
AAC

QA 1 175 1 175
DS 

RD RR2A761JQ 536 0 0
GG
GAGAACGATTCTCCTGCGCCTCCTCTCGCCGTCGTGTTTTCAGCTTTGTCGTCTGTGTGA
TTTAGATCGAGTTTCAGGGTTAACAAGTAATAATGGCAAGAGGCAAATACATAGTCGGTG
CCCTTGTGGGATCTGCTGTAGTAGCCTACGTCTGTGACAAAGTCATCTCTGATGATAAGA
TTTTCGGAGGTTCTACACCGGGAACTATTACTAACAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAG
AGAGGCTCCAAGCATGGCCAAGAACTGCTGGTCCTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTC
GCCAGAACTTCATCGTCAAGTCCCGCCCTGAATAACTGCGCAATCCTTCCTATCTCTCTC
ATTTGATTAAAAGATTTGATTTTATTTGCTCTCTATGTTGGCCCCTTTTATCTTTTGATT
TGAGGATCGGCTATTTTCTCAGTAATAATTTGTGGATTGGATGGATTGGATGGAATAAAC
ATATTCATTCCAATCTTTTCTTTGTTGATTTTGACGATAATATTAAATTGAGCC

QA 3 536 3 536
DS 

RD RR2A761TF 536 0 0
GG
GAGAACGATTCTCCTGCGCCTCCTCTCGCCGTCGTGTTCTCAGCTTTGTCGTCTGTGTGA
TTTAGATCGAGTTTCAGGGTTAACAAGTAATAATGGCAAGAGGCAAATACATAGTCGGTG
CCCTTGTGGGATCTGCTGTAGTAGCCTACGTCTGTGACAAAGTCATCTCTGATGATAAGA
TTTTCGGAGGTTCTACACCGGGAACTATTACTAACAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAG
AGAGGCTCCAAGCATGGCCAAGAACTGCTGGTCCTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTC
GCCAGAACTTCATCGTCAAGTCCCGCCCTGAATAACTGCGCAATCCTTCCTATCTCTCTC
ATTTGATTAAAAGATTTGATTTTATTTGCTCTCTATGTTGGCCCCTTTTATCTTTTGATT
TGAGGATCGGCTATTTTCTCAGTAATAATTTGTGGATTGGATGGATTGGATGGAATAAAC
ATATTCATTCCAATCTTTTCTTTGTTGATTTTGACGATAATATTAAATTGAGCC

QA 3 536 3 536
DS 

RD RR2AO96TF 546 0 0
TGTTTCAGA
GAGAACGATTCTCCTGCGCCTCCTCTCGCCGTCGTGTTCTCAGCTTCGTCGTCTGTGTGA
TTTAGATCGAGTTTCAGGGTTAACAAGTAATAATGGCAAGAGGCAAATACATAGTCGGTG
CCCTTGTGGGATCTGCTGTAGTAGCCTACGTCTGTGACAAAGTCATCTCTGATGATAAGA
TTTTCGGAGGTTCTACACCGGGAACTATTACTAACAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAG
AGAGGCTCCAAGCATGGCCAAGAACTGCTGGTCCTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTC
GCCAGAACTTCATCGTCAAATCCCGCCCTGAATAACTGCGCAATCCTTCCTATCTCTCTC
ATTTGATTAAAAGATTTGATTTTATTTGCTCTCTATGTTGGCCCCTTTTATCTTTTGATT
TGAGGATCGGCTATTTTCTCAGTAATAATTTGTGGATTGGATGGATTGGATGGAATAAAC
ATATTCATTCCAATCTTTTCTTTGTTGATTTTGACGATAATATTAAATTGAGCC
AAC

QA 10 543 10 543
DS 



AS 2 5

CO CL1566Contig1 725 3 5 U
GGACTCCACCTGACTTTGTTGGCATTCTCATTGGAATCTCAGAAAGACAGTCCTATAAAA
AAACTCTATATCATTTCTTCTTCACCCTCTTCTCTTTGCCTTCCCTGCCTCCCCCTTCTC
ATTCCGATATATCTCCCTCTCTCCTTAGTATCTATGGCTTCCATGGCTGCTGCCTCTACT
TCCCTGCAGGCTCGTCCTAACCAAATGGCAACTGCGGTTAGATGTTTTAGTCAGGGAAGC
AGAAACAATCTTTCTTTTACGCTTCGCCAGCTTCCTACCCGCTTGAGCGTTTCTTGCGCT
GCAAAACCTGAGACAGTGGACAAAGTGTGTGAAGTCGTCAAAAAGCAACTCTCACTTAAA
GCGGGCGATGAAGTTACGGCTGCCACCAAATTTGCTGCACTTGGTGCTGATTCTCTTGAT
ACGGTGGAGATTGTGATGGGCCTGGAGGAAGCGTTTGATATTGAAATGGCGGAGGAGAAA
GCACAGAATATTGCGACAGTCGAGGAAGCAGCTGAGCTCATTGAGGAGATCTTGAAGGGA
AAGGCTTAAGTCCGAAATCATTTATTACAGAACCAACAATGGAAACACTAAACCCTAAAC
CACTTATCTTGTTATTGTTTGGTTAGGTAGAGACCACATCTGTCTGTTGAGATTTATGTT
CGTTTGGGCAAAATTATTACAAGGCTTGTATTTGACATTTTTTCATCTTAAAACTTTTTA
CCTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2FF25TF U 96
AF RR2AF25TF U 1
AF RR2AF25JQ C 1
BS 1 97 RR2AF25TF
BS 98 199 RR2FF25TF
BS 200 200 RR2AF25TF
BS 201 687 RR2FF25TF
BS 688 725 RR2AF25JQ

RD RR2FF25TF 592 0 0
GG
GCCTTCCCTGCCTCCCCCTTCTCATTCCGATATATCTCCCTCTCTCCTTAGTATCTATGG
CTTCCATGGCTGCTGCCTCTACTTCCCTGCAGGCTCGTCCTAGCCAAATGGCAACTGCGG
TTAGATGTTTTAGTCAGGGAAGCAGAAACAATCTTTCTTTTACGCTTCGCCAGCTTCCTA
CCCGCTTGAGCGTTTCTTGCGCTGCAAAACCTGAGACAGTGGACAAAGTGTGTGAAGTCG
TCAAAAAGCAACTCTCACTTAAAGCGGGCGATGAAGTTACGGCTGCCACCAAATTTGCTG
CACTTGGTGCTGATTCTCTTGATACGGTGGAGATTGTGATGGGCCTGGAGGAAGCGTTTG
ATATTGAAATGGCGGAGGAGAAAGCACAGAATATTGCGACAGTCGAGGAAGCAGCTGAGC
TCATTGAGGAGATCTTGAAGGGAAAGGCTTAAGTCCGAAATCATTTATTACAGAACCAAC
AATGGAAACACTAAACCCTAAACCACTTATCTTGTTATTGTTTGGTTAGGTAGAGACCAC
ATCTGTCTGTTGAGATTTATGTTCGTTTGGGCAAAATTATTACAAGGCTT

QA 3 592 3 592
DS 

RD RR2AF25TF 677 0 0
GGACTCCACCTGACTTTGTTGGCATTCTCATTGGAATCTCAGAAAGACAGTCCTATAAAA
AAACTCTATATCATTTCTTCTTCACCCTCTTCTCTTTGCCTTCCCTGCCTCCCCCTTCTC
ATTCCGATATATCTCCCTCTCTCCTTAGTATCTATGGCTTCCATGGCTGCTGCCTCTACT
TCCCTGCAGGCTCGTCCTAACCAAATGGCAACTGCGGTTAGATGTTTTAGTCAGGGAAGC
AGAAACAATCTTTCTTTTACGCTTCGCCAGCTTCCTACCCGCTTGAGCGTTTCTTGCGCT
GCAAAACCTGAGACAGTGGACAAAGTGTGTGAAGTCGTCAAAAAGCAACTCTCACTTAAA
GCGGGCGATGAAGTTACGGCTGCCACCAAATTTGCTGCACTTGGTGCTGATTCTCTTGAT
ACGGTGGAGATTGTGATGGGCCTGGAGGAAGCGTTTGATATTGAAATGGCGGAGGAGAAA
GCACAGAATATTGCGACAGTCGAGGAAGCAGCTGAGCTCATTGAGGAGATCTTGAAGGGA
AAGGCTTAAGTCCGAAATCATTTATTACAGAACCAACAATGGAAACACTAAACCCTAAAC
CACTTATCTTGTTATTGTTTGGTTAGGTAGAGACCACATCTGTCTGTTGAGATTTATGTT
CGTTTGGGCAAAATTAT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2AF25JQ 725 0 0
GGACTCCACCTGACTTTGTTGGCATTCTCATTGGAATCTCAGAAAGACAGTCCTATAAAA
AAACTCTATATCATTTCTTCTTCACCCTCTTCTCTTTGCCTTCCCTGCCTCCCCCTTCTC
ATTCCGATATATCTCCCTCTCTCCTTAGTATCTATGGCTTCCATGGCTGCTGCCTCTACT
TCCCTGCAGGCTCGTCCTAACCAAATGGCAACTGCGGTTAGATGTTTTAGTCAGGGAAGC
AGAAACAATCTTTCTTTTACGCTTCGCCAGCTTCCTACCCGCTTGAGCGTTTCTTGCGCT
GCAAAACCTGAGACAGTGGACAAAGTGTGTGAAGTCGTCAAAAAGCAACTCTCACTTAAA
GCGGGCGATGAAGTTACGGCTGCCACCAAATTTGCTGCACTTGGTGCTGATTCTCTTGAT
ACGGTGGAGATTGTGATGGGCCTGGAGGAAGCGTTTGATATTGAAATGGCGGAGGAGAAA
GCACAGAATATTGCGACAGTCGAGGAAGCAGCTGAGCTCATTGAGGAGATCTTGAAGGGA
AAGGCTTAAGTCCGAAATCATTTATTACAGAACCAACAATGGAAACACTAAACCCTAAAC
CACTTATCTTGTTATTGTTTGGTTAGGTAGAGACCACATCTGTCTGTTGAGATTTATGTT
CGTTTGGGCAAAATTATTACAAGGCTTGTATTTGACATTTTTTCATCTTAAAACTTTTTA
CCTCC

QA 1 725 1 725
DS 



CO CL1566Contig2 931 2 10 U
GGCTCTTCGCTTTGCCTTCCCCGCCTCCTCCGTCTCACTCCGATATCTCTCTCTCCCTCC
TTTGTATTCATGGCTTCCATGGCTACTGCCTCTACTTCCCTGCAGGCTCGTCCTCGCCAA
ATGGTCTCTCTCTCGCTACTTCACTAGAAAATCTCGAATCTCCACCTTTTTTACATTTAA
ACTGGTTCTTGTCGCGTGTAGTCAGATCTGATTATTTTCTCACCGATCTCGATCTAGTAT
TTTTATCCTTTTCAACGGTAGATCTTATTGTTGAAACGTCTCTATGACTCAATCATTTGT
TTTTCTCGGATCTTAGGCAACTGCGGTTAGATGTTTTAGCCAGGGAAGCAGAAACAATCT
TTCTTTTACGCTTCGCCAGCTTCCTACCCGCTTGAGCGTTTCTTGCGCTGCAAAACCTGA
GACAGTGGACAAAGTGTGTGAAGTCGTCAAAAAGCAACTCTCACTTAAAGCCGGCGACGA
AGTTACGGCTGCCACCAAATTTGCTGCACTTGGTGCTGATTCTCTTGATACGGTGGAGAT
TGTGATGGGCCTGGAGGAAGCGTTTGATATTGAAATGGCGGAGGATAAAGCACAGAATAT
TGCGACAGTCGAGGAAGCAGCTGAGCTCATTGAGGAGATCTTGAAGGAAAAAGCTTAAGT
CCAATATCATTTATTACAGAACCAACAATGGAAACACTAAGCCCAAAACCACTTATCTTG
TTATTGTTTGGTTAGGTAGAGACCACATCTGTCTGTTGAGATTTATGTTCGTTTGGGCAA
AAATTATTACAAGGCTTGTATTTGACTTTTTTTCATCTTTTTTTTTTTTTAAACTTGGCT
TCTTTTTTTTTCATCTTAAAACCTTTTACTTCCATTCTCCAGAAGTCACCTTACGATTTA
CGAATCGTTTTAATATATGTTGTTGAAAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB02TF U 1
AF RR2GB02JQ C 480
BS 1 707 RR2GB02TF
BS 708 708 RR2GB02JQ
BS 709 736 RR2GB02TF
BS 737 737 RR2GB02JQ
BS 738 782 RR2GB02TF
BS 783 783 RR2GB02JQ
BS 784 812 RR2GB02TF
BS 813 813 RR2GB02JQ
BS 814 819 RR2GB02TF
BS 820 931 RR2GB02JQ

RD RR2GB02TF 825 0 0
GGCTCTTCGCTTTGCCTTCCCCGCCTCCTCCGTCTCACTCCGATATCTCTCTCTCCCTCC
TTTGTATTCATGGCTTCCATGGCTACTGCCTCTACTTCCCTGCAGGCTCGTCCTCGCCAA
ATGGTCTCTCTCTCGCTACTTCACTAGAAAATCTCGAATCTCCACCTTTTTTACATTTAA
ACTGGTTCTTGTCGCGTGTAGTCAGATCTGATTATTTTCTCACCGATCTCGATCTAGTAT
TTTTATCCTTTTCAACGGTAGATCTTATTGTTGAAACGTCTCTATGACTCAATCATTTGT
TTTTCTCGGATCTTAGGCAACTGCGGTTAGATGTTTTAGCCAGGGAAGCAGAAACAATCT
TTCTTTTACGCTTCGCCAGCTTCCTACCCGCTTGAGCGTTTCTTGCGCTGCAAAACCTGA
GACAGTGGACAAAGTGTGTGAAGTCGTCAAAAAGCAACTCTCACTTAAAGCCGGCGACGA
AGTTACGGCTGCCACCAAATTTGCTGCACTTGGTGCTGATTCTCTTGATACGGTGGAGAT
TGTGATGGGCCTGGAGGAAGCGTTTGATATTGAAATGGCGGAGGATAAAGCACAGAATAT
TGCGACAGTCGAGGAAGCAGCTGAGCTCATTGAGGAGATCTTGAAGGAAAAAGCTTAAGT
CCAATATCATTTATTACAGAACCAACAATGGAAACACTAAGCCCAAA*CCACTTATCTTG
TTATTGTTTGGTTAGG*AGAGACCACATCTGTCTGTTGAGATTTATGTTCGTTTGGGCAA
AA*TTATTACAAGGCTTGTATTTGACTTTTTT*CATCTT
TTTTTT

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2GB02JQ 452 0 0
AAGTTACGGCTGCCACCAAATTTGCTGCACTTGGTGCTGATTCTCTTGATACGGTGGAGA
TTGTGATGGGCCTGGAGGAAGCGTTTGATATTGAAATGGCGGAGGATAAAGCACAGAATA
TTGCGACAGTCGAGGAAGCAGCTGAGCTCATTGAGGAGATCTTGAAGGAAAAAGCTTAAG
TCCAATATCATTTATTACAGAACCAACAATGGAAACACTAAGCCCAAAACCACTTATCTT
GTTATTGTTTGGTTAGGTAGAGACCACATCTGTCTGTTGAGATTTATGTTCGTTTGGGCA
AAAATTATTACAAGGCTTGTATTTGACTTTTTTTCATCTTTTTTTTTTTTTAAACTTGGC
TTCTTTTTTTTTCATCTTAAAACCTTTTACTTCCATTCTCCAGAAGTCACCTTACGATTT
ACGAATCGTTTTAATATATGTTGTTGAAAGGG

QA 1 452 1 452
DS 



AS 1 4

CO CL1567Contig1 1281 4 15 U
GGATCAATGTGGGAGGGGAGGACAAACGTGGCGACTGTTCTGCTTGAAGCCGGTTTAGCG
AAAATGCAGACAAGCTTTGGTGCAGACAGGATCGTTGAAGCACATATTCTTGAACAGGCT
GAGAGAACTGCTAAGAATCAGAAACTGAAGATTTGGGAAAACTATGTTGAAGGACAAGAA
GTCTCAAATGGAAGTACAACCGTAGAGACCAGGCAAAAGGAGACTTTAAAGGTTGCTGTT
ACAGAAGTTCTTGGAGGTGGTCGGTTCTATGTTCAATCTGTTGGAGATCAGAGAATAGGT
TCTATTCAGAACCAGCTTGCATCCCTGAGTGTTAAAGATGCTCCAATCCTTGGATCTTTC
AACCCCAAGAGAGGTGACATCGTTCTTGCACAGTTTAGCCTTGACAACTCCTGGAACCGT
GCAATGATTGTGAGTGCACCCAGAGAAGCTATTCAGTCCCCAGATGAGAAGCTTGAAGTG
TTCTACATCGATTATGGAAACCAAGAGTTGGTCCCCTACAGCGCAATCCGACCAGTAGAT
CCTTCTGTGTCCTCAGCATCAGGGCTTGCTCAGCTATGCAGGCTTGCCTACATAAAGGTT
CCAAGCTTGGAGGAAGACTTTGGTCCTGAAGCTGGAGAGTATCTGCATACCGTGACGCTG
GGAAGTGGTAAAGAGTTCAAAGCAGTGATAGAAGAAAGAGACACATCTGGAGGTAAAGCC
AAAGGCCAAGGAACTGGAACTGAACTTGCTGTCACTCTCATTGCTGTTGATGAAGAGATC
TCTGTCAACGCTGCAATGCTTCAGGAAGGAATAGCGAGAATGGAGAAACGTAGGAGGTTT
GAGCACAAGGACAAGCAAGCAGTTCTTGATGCTTTAGAGAAGTACCAGGAGGAAGCTCGC
AAGGCTAGAACTGGAATCTGGCAGTACGGTGACGTGGAATCAGATGATGAGGATACTGCT
CCGGCCAGGAAGCCTGCCGGTGGTCGCAGGTAGATCATCGGGAATTAATATGCTGGTTTC
AAAGGTACCATGAGGTAGGGGAACAAGTGTTCTGTCTGGTCGGTTTCTATAAGAGGGTTT
AAAGACATGTCATCAGATTTTTCTGAAACTTTTTTTAGATTGTTCACTTTCTTTTTTTTT
TCTTTTTAATTTTATACTTTTTGAGTTTTAAAGAGAACTTTCTATGTAGGGCTTGAAATA
AGGGAAGTTTGAACTTTGAACTATGCTTCAACAGTTTTTTGTTACTTTTTCACAATCAGA
TTCTACTGAGAATCAAAGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS20TF U 1
AF RR2C775TF U 291
AF RR2DR07JQ C 572
AF RR2FS20JQ C 519
BS 1 515 RR2FS20TF
BS 516 516 RR2C775TF
BS 517 627 RR2FS20TF
BS 628 628 RR2C775TF
BS 629 712 RR2FS20TF
BS 713 738 RR2C775TF
BS 739 739 RR2FS20JQ
BS 740 928 RR2C775TF
BS 929 929 RR2FS20JQ
BS 930 951 RR2C775TF
BS 952 1140 RR2FS20JQ
BS 1141 1141 RR2DR07JQ
BS 1142 1217 RR2FS20JQ
BS 1218 1218 RR2DR07JQ
BS 1219 1281 RR2FS20JQ

RD RR2FS20TF 718 0 0
GGATCAATGTGGGAGGGGAGGACAAACGTGGCGACTGTTCTGCTTGAAGCCGGTTTAGCG
AAAATGCAGACAAGCTTTGGTGCAGACAGGATCGTTGAAGCACATATTCTTGAACAGGCT
GAGAGAACTGCTAAGAATCAGAAACTGAAGATTTGGGAAAACTATGTTGAAGGACAAGAA
GTCTCAAATGGAAGTACAACCGTAGAGACCAGGCAAAAGGAGACTTTAAAGGTTGCTGTT
ACAGAAGTTCTTGGAGGTGGTCGGTTCTATGTTCAATCTGTTGGAGATCAGAGAATAGGT
TCTATTCAGAACCAGCTTGCATCCCTGAGTGTTAAAGATGCTCCAATCCTTGGATCTTTC
AACCCCAAGAGAGGTGACATCGTTCTTGCACAGTTTAGCCTTGACAACTCCTGGAACCGT
GCAATGATTGTGAGTGCACCCAGAGAAGCTATTCAGTCCCCAGATGAGAAGCTTGAAGTG
TTCTACATCGATTATGGAAACCAAGAGTTGGTCCCTTACAGCGCAATCCGACCAGTAGAT
CCTTCTGTGTCCTCAGCATCAGGGCTTGCTCAGCTATGCAGGCTTGCCTACATAAAGGTT
CCAAGCTTGGAGGAAGACTTTGGTCCTTAAGCTGGAGAGTATCTGCATACCGTGACGCTG
GGAAGTGGTAAAGAGTTCAAAGCAGTGATAGAAGAAAGAGACACATCTGGAG
TAAAGC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2C775TF 668 0 0
GAGAATAGGTTCTATTCAGAACCAGCTTGCATCCCTGAGTGTTAAAGATGCTCCAATCCT
TGGATCTTTCAACCCCAAGAGAGGTGACATCGTTCTTGCACAGTTTAGCCTTGACAACTC
CTGGAACCGTGCAATGATTGTGAGTGCACCCAGAGAAGCTATTCAGTCCCCAGATGAGAA
GCTTGAAGTGTTCTACATCGATTATGGAAACCAAGAGTTGGTCCCCTACAGCGCAATCCG
ACCAGTAGATCCTTCTGTGTCCTCAGCACCAGGGCTTGCTCAGCTATGCAGGCTTGCCTA
CATAAAGGTTCCAAGCTTGGAGGAAGACTTTGGTCCTGAAGCTGGAGAGTATCTGCATAC
CGTGACGCTGGGAAGTGGTAAAGAGTTCAAAGCAGTGATAGAAGAAAGAGACACATCTGG
AGGTAAAGCCAAAGGCCAAGGAACTGGAGCTGAACTTGCTGTCACTCTCATTGCTGTTGA
TGAAGAGATCTCTGTCAACGCTGCAATGCTTCAGGAAGGAATAGCGAGAATGGAGAAACG
TAGGAGGTTTGAGCACAAGGACAAGCAAGCAGTTCTTGATGCTTTAGAGAAGTACCAGGA
GGAAGCTCGCAAGGCTAGAACTGGAATCTGGCAGTACG*TGACGTGGAATCAGATGATGA
G
ATACTGC

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2DR07JQ 682 0 0
AGCTATGCAGGCTTGCCTACATAAAGGTTCCAAGCTTGGAAGAAGACTTTGGTCCTGAAG
CTGGAGAGTATTTGCATACCGTGACGCTGTGAAGTGGTAAAGAGTTCAAAGCAGTGATTG
AAGAAAGAGACACATCTGGAGGTAAGGCCAAAGGACAAGGAACTGGGACTGAACTTGCTG
TCACTCTCATTGCTGTTGATGAAGAGATCTCTGTCAGCGCTGCAATGCTTCAGGAAGGAA
TAGCGAGAATGGAGAAACGTAGGAGGTTCGAGCACAAGGACAAGCAAGCAGTTCTTGATG
CTTTAGAGAAGTACCAGGAGGAAGCCCGCAAGGCTAGAACTGGAATCTGGCAGTACGGTG
ACGTGGAATCAGATGATGAGGATACTGCTCCGGCCAGGAAGCCTGCCGGTGGTCGCAGGT
AGATCATCGGGAATTAATATGCTGGTTTCAAAGGTACCATGAGGTAGGGGAACAAGTGTT
CTGTCTGGTCGGTTTCTATAAGAGGGTTTAAAGACATGTCATCAGATTTTTCTGAAACTT
TTTTTAGATTGTTCACTTTCTTTTTTTTTTCTTTTTAATTTTATACTTTTTGAGTTTTAA
AGAGAACTTTCTATGTAGGGCTTGAAATAAGGGAAGTTTGAACTTTGAACTATGCTTCAA
CAGTTTTTTGTTACTTTTTC
CC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2FS20JQ 763 0 0
CAGCGCAATCCGACCAGTAGATCTTTCTGTGTCCTCAGCATCAGGGCTTGCTCAGCTATG
CAGGCTTGCCTACATAAAGGTTCCAAGCTTGGAGGAAGACTTTGGTCCTTAAGCTGGAGA
GTATCTGCATACCGTGACGCTGGGAAGTGGTAAAGAGTTCAAAGCAGTGATAGAAGAAAG
AGACACATCTGGAGGTAAAGCCAAAGGCCAAGGAACTGGAACTGAACTTGCTGTCACTCT
CATTGCTGTTGATGAAGAGATCTCTGTCAACGCTGCAATGCTTCAGGAAGGAATAGCGAG
AATGGAGAAACGTAGGAGGTTTGAGCACAAGGACAAGCAAGCAGTTCTTGATGCTTTAGA
GAAGTACCAGGAGGAAGCTCGCAAGGCTAGAACTGGAATCTGGCAGTACGGTGACGTGGA
ATCAGATGATGAGGATACTGCTCCGGCCAGGAAGCCTGCCGGTGGTCGCAGGTAGATCAT
CGGGAATTAATATGCTGGTTTCAAAGGTACCATGAGGTAGGGGAACAAGTGTTCTGTCTG
GTCGGTTTCTATAAGAGGGTTTAAAGACATGTCATCAGATTTTTCTGAAACTTTTTTTAG
ATTGTTCACTTTCTTTTTTTTT*CTTTTTAATTTTATACTTTTTGAGTTTTAAAGAGAAC
TTTCTATGTAGGGCTTGAAATAAGGGAAGTTTGAACTTTTAACTATGCTTCAACAGTTTT
TTGTTACTTTTTCACAATCAGATTCTACTGAGAATCAAAGCAT

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 4

CO CL1568Contig1 1217 4 9 U
GATAGTCTTAGGGAGCCATTAGGTGTCTGTGCTGGCATTTGTCCTTTCAACTCCCCTGCA
ATGATTCCTTTATGGATGTTTCCCATTGCGGTGACATGTGGCAATACCTTTGTCTTAAAG
CCATCAGAGAAGGATCCTGGTGCTTCTGTAATGCTTGCGGAGCTCGCAATGGAAGCTGGA
TTACCTGACGGGGTTCTCAACATCGTTCGCGGTACCAATGATACTGTGAATGCTATCTGT
GATGATGATGATATCAGGGCTGTCTCTTTTGTTGGCTCAAACACTGCTGGAATGCATATA
TATGCAAGAGCAGCAGCGAAAGGAAAACGTATTCAGTCAAATATGGGGGCGAAAAACCAT
GGAGTTGTCCTGCCTGATGCCAACGTCGAAGCTACTTTGAATGCGCTACTTGCTGCTGGA
TTTGGTGCCGCTGGACAGAGATGCATGGCTCTGAGTACAGTGGTCTTTGTTGGCAGTTCA
AAATCATGGGAGGATAAACTTGTCGAGCGAGCTAAAGCCCTTAAAGTCACATGTGGAACA
GAGCCAGATGCAGACCTGGGTCCTGTGATTAGTAAACAGGCCAAAGAAAGGATATGTCGC
TTGATTCAGTCTGGTGTGGACGATGGTGCTAAACTGCTGCTTGACGGAAGAAATATTGTG
GTTCCTGGATACTAGAAAGGGAATTTTATCGGTCCTACCATTATATCTGGTGTTACCCCA
GACATGGAGTGTTACAAGGAAGAAATATTTGGCCCCGTTCTTGTATGCATGGAGGCAAGC
AGCTTTGATGAAGCCATAGACATACTGAACAAAAACAAGTATGGGAACGGTGCTGCAATT
TTCACTGCATCGGGCGCTGCGGCAAGAAAGTTCCAGATGGAAATAGAAGCAGGACAGATT
GGTATAAACGTTCCAATCCCGGTCCCGTTACCGTTCTTCTCCTTCACTGGGAACAAAGCT
TCATTTGCAGGAGACCTGAATTTTTATGGCAAAGCTGGAGTAGACTTTTTCACTCAGATC
AAGACTGTGACACAACAGTGGAAGGATATTCCAACTTCAGTATCTCTTGCCATGCCTACA
TCGCAAAAGCACTAAATAAAACCCAACCTCGCTATTTTCATTTTGGATTTCTCGAAATAA
TAAATGAATTGTATCCATTTCAGTTAATATCACTTCCGTTTACGTAGTCAAATGCGTAAA
ATAAACACTTCGTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS11TF U 1
AF RR2B052TF U 299
AF RR2B052JQ C 378
AF RR2FS11JQ C 859
BS 1 320 RR2FS11TF
BS 321 321 RR2B052TF
BS 322 390 RR2FS11TF
BS 391 392 RR2B052TF
BS 393 507 RR2FS11TF
BS 508 983 RR2B052TF
BS 984 984 RR2B052JQ
BS 985 1166 RR2B052TF
BS 1167 1217 RR2B052JQ

RD RR2FS11TF 507 0 0
GATAGTCTTAGGGAGCCATTAGGTGTCTGTGCTGGCATTTGTCCTTTCAACTCCCCTGCA
ATGATTCCTTTATGGATGTTTCCCATTGCGGTGACATGTGGCAATACCTTTGTCTTAAAG
CCATCAGAGAAGGATCCTGGTGCTTCTGTAATGCTTGCGGAGCTCGCAATGGAAGCTGGA
TTACCTGACGGGGTTCTCAACATCGTTCGCGGTACCAATGATACTGTGAATGCTATCTGT
GATGATGATGATATCAGGGCTGTCTCTTTTGTTGGCTCAAACACTGCTGGAATGCATATA
TATGCAAGAGCAGCAGCGAAGGGAAAACGTATTCAGTCAAATATGGGGGCGAAAAACCAT
GGAGTTGTCCTGCCTGATGCCAACGTCGAAT*TACTTTGAATGCGCTACTTGCTGCTGGA
TTTGGTGCCGCTGGACAGAGATGCATGGCTCTGAGTACAGTGGTCTTTGTTGGCAGTTCA
AAATCATGGGAGGATAAACTTGTCGAG

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2B052TF 868 0 0
GG
TATGCAAGAGCAGCAGCGAAAGGAAAACGTATTCAGTCAAATATGGGGGCGAAAAACCAT
GGAGTTGTCCTGCCTGATGCCAACGTCGAAGCTACTTTGAATGCGCTACTTGCTGCTGGA
TTTGGTGCCGCTGGACAGAGATGCATGGCTCTGAGTACAGTGGTCTTTGTTGGCAGTTCA
AAATCATGGGAGGATAAACTTGTCGAGCGAGCTAAAGCCCTTAAAGTCACATGTGGAACA
GAGCCAGATGCAGACCTGGGTCCTGTGATTAGTAAACAGGCCAAAGAAAGGATATGTCGC
TTGATTCAGTCTGGTGTGGACGATGGTGCTAAACTGCTGCTTGACGGAAGAAATATTGTG
GTTCCTGGATACTAGAAAGGGAATTTTATCGGTCCTACCATTATATCTGGTGTTACCCCA
GACATGGAGTGTTACAAGGAAGAAATATTTGGCCCCGTTCTTGTATGCATGGAGGCAAGC
AGCTTTGATGAAGCCATAGACATACTGAACAAAAACAAGTATGGGAACGGTGCTGCAATT
TTCACTGCATCGGGCGCTGCGGCAAGAAAGTTCCAGATGGAAATAGAAGCAGGACAGATT
GGTATAAACGTTCCAATCCCGGTCCCGTTACCGTTCTTCTCCTTCACTGGGAACAAAGCT
TCATTTGCAGGAGACCTGAATTTCTATGGCAAAGCTGGAGTAGACTTTTTCACTCAGATC
AAGACTGTGACACAACAGTGGAAGGATATTCCAACTTCAGTATCTCTTGCCATGCCTACA
TCGCAAAAGCACTAAATAAAACCCAACCTCGCTATTTTCATTTTGGATTTCTCGAAATAA
TAAATGAATTGTATCCATTTCAGTTA

QA 3 868 3 868
DS 

RD RR2B052JQ 840 0 0
TGCCAACGTCGAAGCTACTTTGAATGCGCTACTTGCTGCTGGATTTGGTGCCGCTGGACA
GAGATGCATGGCTCTGAGTACAGTGGTCTTTGTTGGCAGTTCAAAATCATGGGAGGATAA
ACTTGTCGAGCGAGCTAAAGCCCTTAAAGTCACATGTGGAACAGAGCCAGATGCAGACCT
GGGTCCTGTGATTAGTAAACAGGCCAAAGAAAGGATATGTCGCTTGATTCAGTCTGGTGT
GGACGATGGTGCTAAACTGCTGCTTGACGGAAGAAATATTGTGGTTCCTGGATACTAGAA
AGGGAATTTTATCGGTCCTACCATTATATCTGGTGTTACCCCAGACATGGAGTGTTACAA
GGAAGAAATATTTGGCCCCGTTCTTGTATGCATGGAGGCAAGCAGCTTTGATGAAGCCAT
AGACATACTGAACAAAAACAAGTATGGGAACGGTGCTGCAATTTTCACTGCATCGGGCGC
TGCGGCAAGAAAGTTCCAGATGGAAATAGAAGCAGGACAGATTGGTATAAACGTTCCAAT
CCCGGTCCCGTTACCGTTCTTCTCCTTCACTGGGAACAAAGCTTCATTTGCAGGAGACCT
GAATTTTTATGGCAAAGCTGGAGTAGACTTTTTCACTCAGATCAAGACTGTGACACAACA
GTGGAAGGATATTCCAACTTCAGTATCTCTTGCCATGCCTACATCGCAAAAGCACTAAAT
AAAACCCAACCTCGCTATTTTCATTTTGGATTTCTCGAAATAATAAATGAATTGTATCCA
TTTCAGTTAATATCACTTCCGTTTACGTAGTCAAATGCGTAAAATAAACACTTCGTTTCG

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2FS11JQ 346 0 0
GCGGCAAGAAAGTTCCAGATGGAAATAGAAGCAGGACAGATTGGCATAAACGTTCCAATC
CCGGTCCCGTTACCGTTTTTTTCCTTCACTGGGAACAAAGCTTCATTTGCAGGAGACCTG
AATTTTTATGGCAAAGCTGGAGTAGACTTTTTCACTCAGATCAAGACTGTGACACAACAG
TGGAAGGATATTCCAACTTCAGTATCTCTTGCCATGCCTACATGGCAAAAGCACTAAATA
AAACCCAACCTCGCTATTTTCATTT*GGATTTCTCGAAATAATAAATGAATTGTATCCAT
TTCAGTTAATATCACTTCCGTTTACGTAGTCAAATGCGTAAAATAA

QA 1 346 1 346
DS 



AS 1 4

CO CL1569Contig1 944 4 4 U
GGGTGGATCTGATTTGCTATAATCAACTCTTAAGGGCGGGAAAGACGGCGAACGAGAGGG
AGAGGGAGAAAAGATGGATTCTGAGAAATCGGTGGTGGACGAGCTGCCGCTAGCTATCGT
GCGGCGGGTGGTGAAAGAGAAGCTTTCGGAGTGTTCGCCGGATTATGACGTGAGCATTCA
CAAGGAAGCGCTGCTTGCTTTCTCCGAGAGTGCCCGGATCTTCATCCACTACCTCTCCGC
CACGGCAAATGATGTATGTAAGGATTCAAGAAGACAGACGATGAAAGCTGAGGATGTGTT
TAAGGCATTAGAAGACATGGAATTTTCAGAATTTTTGGAGCCGCTTAAAGCTTCTCTTGA
AGATTTTAAGAAGAAGAACGCTGGGAAAAAGGCTGCTAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGAGC
AGCAGCAGCAGCTTCGAAGCCCAAAGAGACGAAAAAGAGGAAACATGAAGAAGAAGCATC
AACGCAGAAGGGCGTGACAAAAAGCAAAAGAGATGAGGGAGATTTGGAGAAGAATGTTGA
GGATGACAACACAAAGGAGAATGAGGATGATAATACCGAAGAGAATGGGAATGATGATGA
GGAGGAGGAGGATGCTGCTGACGGGAATGAGGAAAACAGCATGGAAGAGAACGGGAATGA
GGACAATAGCATGGAAGAAGCTGGGAGTGAGAGTGGTGAAGATGATGAGAACGAAGGTAC
TGGCGAAGAGGAGGAGGATGAGTGAACTAAATTGGAGAGGCCGTTTCAGATTCTTTTCTG
CAAAGATGTTTTCAGGCTAATGTTCTCTCATTAAAATGCTAAAAATCGATTAGCTTGTTA
AGCTTGAGTAGCACTGTTGTAGTTGTTGGCATGTCCATGTCGTAGACTCGTATAATATTT
GCTCTTTAACTCTAGTTTTACCAGATATTTAAGTGAAAGGTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV33TF U 1
AF RR2AI12TF U 48
AF RR2GV33JQB C 242
AF RR2AI12JQ C 340
BS 1 556 RR2GV33TF
BS 557 712 RR2AI12TF
BS 713 910 RR2GV33JQB
BS 911 944 RR2AI12JQ

RD RR2GV33TF 560 0 0
GGGTGGATCTGATTTGCTATAATCAACTCTTAAGGGCGGGAAAGACGGCGAACGAGAGGG
AGAGGGAGAAAAGATGGATTCTGAGAAATCGGTGGTGGACGAGCTGCCGCTAGCTATCGT
GCGGCGGGTGGTGAAAGAGAAGCTTTCGGAGTGTTCGCCGGATTATGACGTGAGCATTCA
CAAGGAAGCGCTGCTTGCTTTCTCCGAGAGTGCCCGGATCTTCATCCACTACCTCTCCGC
CACGGCAAATGATGTATGTAAGGATTCAAGAAGACAGACGATGAAAGCTGAGGATGTGTT
TAAGGCATTAGAAGACATGGAATTTTCAGAATTTTTGGAGCCGCTTAAAGCTTCTCTTGA
AGATTTTAAGAAGAAGAACGCTGGGAAAAAGGCTGCTAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGAGC
AGCAGCAGCAGCTTCGAAGCCCAAAGAGACGAAAAAGAGGAAACATGAAGAAGAAGCATC
AACGCAGAAGGGCGTGACAAAAAGCAAAAGAGATGAGGGAGATTTGGAGAAGAATGTTGA
GGATGACAACACAAAG
AGAA

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2AI12TF 665 0 0
GGGAACGAGAGA
GAGAGGGAGAAAAGATGGATTCTGAGAAATCGGTGGTGGACGAGCTGCCGCTAGCTATCG
TGCGGCGGGTGGTGAAAGAGAAGCTTTCGGAGTGTTCGCCGGATTATGACGTGAGCATTC
ACAAGGAAGCGCTGCTTGCTTTCTCCGAGAGTGCCCGGATCTTCATCCACTACCTCTCCG
CCACGGCAAATGATGTATGTAAGGATTCAAGAAGACAGACGATGAAAGCTGAGGATGTGT
TTAAGGCATTAGAAGACATGGAATTTTCAGAATTTTTGGAGCCGCTTAAAGCTTCTCTTG
AAGATTTTAAGAAGAAGAACGCTGGGAAAAAGGCTGCTAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGAG
CAGCAGCAGCAGCTTCGAAGCCCAAAGAGACGAAAAAGAGGAAACATGAAGAAGAAGCAT
CAACGCAGAAGGTCGTGACAAAAAGCAAAAGAGATGAGGGAGATTTGGAGAAGAATGTTG
AGGATGACAACACAAAGGAGAATGAGGATGATAATACCGAAGAGAATGGGAATGATGATG
AGGAGGAGGAGGATGCTGCTGACGGGAATGAGGAAAACAGCATGGAAGAGAACGGGAATG
AGGACAATAGCATGGAAGAAGCTGGGAGTGAGAGTGGTGAAGATGATGAGAAC

QA 13 665 13 665
DS 

RD RR2GV33JQB 671 0 0
ACGGCAAATGATGTATGTAAGGATTCAAGAAGACAGACGATGAAAGCTGAGGATGTGTTT
AAGGCATTAGAAGACATGGAATTTTCAGAATTTTTGGAGCCGCTTAAAGCTTCTCTTGAA
GATTTTAAGAAGAAGAACGCTGGGAAAAAGGCTGCTAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGAGCA
GCAGCAGCAGCTTCGAAGCCCAAAGAGACGAAAAAGAGGAAACATGAAGAAGAAGCATCA
ACGCAGAAGGGCGTGACAAAAAGCAAAAGAGATGAGGGAGATTTGGAGAAGAATGTTGAG
GATGACAACACAAAGGAGAATGAGGATGATAATACCGAAGAGAATGGGAATGATGATGAG
GAGGAGGAGGATGCTGCTGACGGGAATGAGGAAAACAGCATGGAAGAGAACGGGAATGAG
GACAATAGCATGGAAGAAGCTGGGAGTGAGAGTGGTGAAGATGATGAGAACGAAGGTACT
GGCGAAGAGGAGGAGGATGAGTGAACTAAATTGGAGAGGCCGTTTCAGATTCTTTTCTGC
AAAGATGTTTTCAGGCTAATGTTCTCTCATTAAAATGCTAAAAATCGATTAGCTTGTTAA
GCTTGAGTAGCACTGTTGTAGTTGTTGGCATGTCCATGTCGTAGACTCGTATAATATTTG
CTCTTTAAC
GC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2AI12JQ 605 0 0
GCCGCTTAAAGCTTCTCTTGAAGATTTTAAGAAGAAGAACGCTGGGAAAAAGGCTGCTAG
TGGTGGTGGTGGTGGTGGAGCAGCAGCAGCAGCTTCGAAGCCCAAAGAGACGAAAAAGAG
GAAACATGAAGAAGAAGCATCAACGCAGAAGGTCGTGACAAAAAGCAAAAGAGATGAGGG
AGATTTGGAGAAGAATGTTGAGGATGACAACACAAAGGAGAATGAGGATGATAATACCGA
AGAGAATGGGAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGCTGCTGACGGGAATGAGGAAAACAG
CATGGAAGAGAACGGGAATGAGGACAATAGCATGGAAGAAGCTGGGAGTGAGAGTGGTGA
AGATGATGAGAACGAAGGTACTGGCGAAGAGGAGGAGGATGAGTGAACTAAATTGGAGAG
GCCGTTTCAGATTCTTTTCTGCAAAGATGTTTTCAGGCTAATGTTCTCTCATTAAAATGT
TAAAAATCGATTAGCTTGTTAAGCTTGAGTAGCACTGTTGTAGTTGTTGGCATGTCCATG
TCGTAGACTCGTATAATATTTGCTCTTTAACTCTAGTTTTACCAGATATTTAAGTGAAAG
GTAGC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 5

CO CL1570Contig1 1151 5 21 U
GACACATCGAAGAACTCAGAGAGAGAGAGAGAGATATGGAGCTCGATTCCATCACCGCTA
GGTGCAGACTCGCCACCGTCGCCGCTCACTTCCCGTTAGCCACCACCAACGATCCCGTCT
CCTCCGCATCGCTCCTCCCTTTGAACTGTAGCGGCAGTTTGAACTCTGCCATCATCAGAA
GATGTGATAACAAGATCTCTTTTGCTCGGCAAGCATCTTCTGAGCAGGGCTTTTTCATGA
GGCAGGCTCCCGCTGACCAGCAGACTAGCGGCGGCGGCATCACTTTGAAGAACTCTGTCA
TTAGAAGAGGTGACAACAGGCTGTATTTTGCTCGGCAAGCGTCCTCTGCACAGGGTCTTT
TCATGAGGCAGGCTTCAACTGATGATAGGACTATACCACAGGACGCTGCATCTACCAAGT
GCTCTGCGACCAAAACGAATGGCAACTCTTCTTCGCAACAACCATTGCTTTCCAGACCTG
AGTACGCCTCACCACAGTTTTCCAAAGCCGCCGCAAAAGATGAGTTCTTTGTTTCTTTTG
ATTCACCATGTCAGCTAAAGGAAGACTTGCAAAAGCCATACACGCCTGACCTTCCTAAGT
TAGCCAATCTAGGGACTGTTTGGTCTCCGAGATCACATGTTGAAGAGTATGAACATAACT
ATGTTGTGGCGGTAGAGCTACCAGGGGCCAGTATCAATGATATAAGAGTTGAGGTCGACA
ACCTAAACTTGACTGTGACAGGTAGACGCACATCCGTCTGTCAAAAAGTTGATGCATGCA
CCAACGGTTCAACCTTTGGATATCACAAGCACGAAATACTACAAGGTCCATTCAAAGTTT
CCTGGCCACTCCCTAGCAATGTGAACAAAGATAACGTTGGTGCTGAATTTATGGATGGGA
TTCTGAGAATAGTGATTCCAAAGCTCTGAGAGATCATCGTTCTGGAACCATATACAAAAC
GGTAAATAATGTTGTATAATATATGGTGTTTGCGTGGAAGAAGAGAAAGAAAAGCAATAA
TTGGTGAAAGATATGTAAAATAGTTTGGTCTTTATTTATCATAGATTGCAGACAGGCATG
CTCAGTTGATAGAGTAAGCCATGTAAACAATCCATTAATATAAGGAAAAAAAATAAAGTT
TGATTATAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FK45TF U 1
AF RR2H140TF U 231
AF RR2H831TF U 231
AF RR2H140JQ C 348
AF RR2H831JQ C 449
BS 1 243 RR2FK45TF
BS 244 244 RR2H140TF
BS 245 251 RR2FK45TF
BS 252 252 RR2H140TF
BS 253 260 RR2FK45TF
BS 261 263 RR2H140TF
BS 264 708 RR2FK45TF
BS 709 864 RR2H140TF
BS 865 865 RR2H831TF
BS 866 901 RR2H140TF
BS 902 902 RR2H831TF
BS 903 921 RR2H140TF
BS 922 922 RR2H140JQ
BS 923 948 RR2H140TF
BS 949 949 RR2H140JQ
BS 950 958 RR2H140TF
BS 959 959 RR2H140JQ
BS 960 960 RR2H831TF
BS 961 961 RR2H140JQ
BS 962 996 RR2H831TF
BS 997 1151 RR2H140JQ

RD RR2FK45TF 708 0 0
GACACATCGAAGAACTCAGAGAGAGAGAGAGAGATATGGAGCTCGATTCCATCACCGCTA
GGTGCAGACTCGCCACCGTCGCCGCTCACTTCCCGTTAGCCACCACCAACGATCCCGTCT
CCTCCGCATCGCTCCTCCCTTTGAACTGTAGCGGCAGTTTGAACTCTGCCATCATCAGAA
GATGTGATAACAAGATCTCTTTTGCTCGGCAAGCATCTTCTGAGCAGGGCTTTTTCATGA
GGCGGGCTCCCACTGACCAG***ACTAGCGGCGGCGGCATCACTTTGAAGAACTCTGTCA
TTAGAAGAGGTGACAACAGGCTGTATTTTGCTCGGCAAGCGTCCTCTGCACAGGGTCTTT
TCATGAGGCAGGCTTCAACTGATGATAGGACTATACCACAGGACGCTGCATCTACCAAGT
GCTCTGCGACCAAAACGAATGGCAACTCTTCTTCGCAACAACCATTGCTTTCCAGACCTG
AGTACGCCTCACCACAGTTTTCCAAAGCCGCCGCAAAAGATGAGTTCTTTGTTTCTTTTG
ATTCACCATGTCAGCTAAAGGAAGACTTGCAAAAGCCATACACGCCTGACCTTCCTAAGT
TAGCCAATCTAGGGACTGTTTGGTCTCCGAGATCACATGTTGAAGAGTATGAACATAACT
ATGTTGTGGCGGTAGAGCTACCAGGGGCCAGTATCAATGATATAAGAG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2H140TF 728 0 0
TTTTTCATGAGGCAGGCTCCCGCTGACCAGCAGACTAGCGGCGGCGGCATCACTTTGAAG
AACTCTGTCATTAGAAGAGGTGACAACAGGCTGTATTTTGCTCGGCAAGCGTCCTCTGCA
CAGGGTCTTTTCATGAGGCAGGCTTCAACTGATGATAGGACTATACCACAGGACGCTGCA
TCTACCAAGTGCTCTGCGACCAAAACGAATGGCAACTCTTCTTCGCAACAACCATTGCTT
TCCAGACCTGAGTACGCCTCACCACAGTTTTCCAAAGCCGCCGCAAAAGATGAGTTCTTT
GTTTCTTTTGATTCACCATGTCAGCTAAAGGAAGACTTGCAAAAGCCATACACGCCTGAC
CTTCCTAAGTTAGCCAATCTAGGGACTGTTTGGTCTCCGAGATCACATGTTGAAGAGTAT
GAACATAACTATGTTGTGGCGGTAGAGCTACCAGGGGCCAGTATCAATGATATAAGAGTT
GAGGTCGACAACCTAAACTTGACTGTGACAGGTAGACGCACATCCGTCTGTCAAAAAGTT
GATGCATGCACCAACGGTTCAACCTTTGGATATCACAAGCACGAAATACTACAAGGTCCA
TTCAAAGTTTCCTGGCCACTCCCTAGCAATGTGA*CAAAGATAACGTTGGTGCTGAATTT
ATGGATGGGAT*CTGAGAATAGTGATTCCAA*GCTCTGAGAGATCATCGTTCTGGAAC*A
TATACAAA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2H831TF 766 0 0
TTTTTCATGAGGCAGGCTCCCGCTGACCAGCAGACTAGCGGCGGCGGCATCACTTTGAAG
AACTCTGTCATTAGAAGAGGTGACAACAGGCTGTATTTTGCTCGGCAAGCGTCCTCTGCA
CAGGGTCTTTTCATGAGGCAGGCTTCAACTGATGATAGGACTATACCACAGGACGCTGCA
TCTACCAAGTGCTCTGCGACCAAAACGAATGGCAACTCTTCTTCGCAACAACCATTGCTT
TCCAGACCTGAGTACGCCTCACCACAGTTTTCCAAAGCCGCCGCAAAAGATGAGTTCTTT
GTTTCTTTTGATTCACCATGTCAGCTAAAGGAAGACTTGCAAAAGCCATACACGCCTGAC
CTTCCTAAGTTAGCCAATCTAGGGACTGTTTGGTCTCCGAGATCACATGTTGAAGAGTAT
GAACATAACTATGTTGTGGCGGTAGAGCTACCAGGGGCCAGTATCAATGATATAAGAGTT
GAGGTCGACAACCTAAACTTGACTGTGACAGGTAGACGCACATCCGTCTGTCAAAAAGTT
GATGCATGCACCAACGGTTCAACCTTTGGATATCACAAGCACGAAATACTACAAGGTCCA
TTCAAAGTTTCCTGGCCACTCCCTAGCAATGTGAACAAAGATAACGTTGGTGCTGAATTT
ATGGATGGGATTCTGAGAATAGTGATCCCAA*GCTCTGAGAGATCATCGTTCTGGAAC*A
TATACAAA*CAGTAAATAATGTTGTATAATATATGGTGTTTGCGTG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2H140JQ 804 0 0
GCACAGGGTCTTTTCATGAGGCAGGCTTCAACTGATGATAGGACTATACCACAGGACGCT
GCATCTACCAAGTGCTCTGCGACCAAAACGAATGGCAACTCTTCTTCGCAACAACCATTG
CTTTCCAGACCTGAGTACGCCTCACCACAGTTTTCCAAAGCCGCCGCAAAAGATGAGTTC
TTTGTTTCTTTTGATTCACCATGTCAGCTAAAGGAAGACTTGCAAAAGCCATACACGCCT
GACCTTCCTAAGTTAGCCAATCTAGGGACTGTTTGGTCTCCGAGATCACATGTTGAAGAG
TATGAACATAACTATGTTGTGGCGGTAGAGCTACCAGGGGCCAGTATCAATGATATAAGA
GTTGAGGTCGACAACCTAAACTTGACTGTGACAGGTAGACGCACATCCGTCTGTCAAAAA
GTTGATGCATGCACCAACGGTTCAACCTTTGGATATCACAAGCACGAAATACTACAAGGT
CCATTCAAAGTTTCCTGGCCACTCCCTAGCAATGTGAACAAGGATAACGTTGGTGCTGAA
TTTATGGATGGGATTCTGAGAATAGTGATTCCAAAGCTCTGAGAGATCATCGTTCTGGAA
CCATATACAAAACGGTAAATAATGTTGTATAATATATGGTGTTTGCGTGGAAGAAGAGAA
AGAAAAGCAATAATTGGTGAAAGATATGTAAAATAGTTTGGTCTTTATTTATCATAGATT
GCAGACAGGCATGCTCAGTTGATAGAGTAAGCCATGTAAACAATCCATTAATATAAGGAA
AAAAAATAAAGTTTGATTATAACT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2H831JQ 703 0 0
TTCTTCGCAACAACCATTGCTTTCCAGACCTGAGTACGCCTCACCACAGTTTTCCAAAGC
CGCCGCAAAAGATGAGTTCTTTGTTTCTTTTGATTCACCATGTCAGCTAAAGGAAGACTT
GCAAAAGCCATACACGCCTGACCTTCCTAAGTTAGCCAATCTAGGGACTGTTTGGTCTCC
GAGATCACATGTTGAAGAGTATGAACATAACTATGTTGTGGCGGTAGAGCTACCAGGGGC
CAGTATCAATGATATAAGAGTTGAGGTCGACAACCTAAACTTGACTGTGACAGGTAGACG
CACATCCGTCTGTCAAAAAGTTGATGCATGCACCAACGGTTCAACCTTTGGATATCACAA
GCACGAAATACTACAAGGTCCATTCAAAGTTTCCTGGCCACTCCCTAGCAATGTGAACAA
GGATAACGTTGGTGCTGAATTTATGGATGGGATTCTGAGAATAGTGATTCCAAAGCTTTG
AGAGATCATCGTTCTGGAACCATATACAAAACGGTAAATAATGTTGTATAATATATGGTG
TTTGCGTGGAAGAAGAGAAAGAAAAGCAATAATTGGTGAAAGATATGTAAAATAGTTTGG
TCTTTATTTATCATAGATTGCAGACAGGCATGCTCAGTTGATAGAGTAAGCCATGTAAAC
AATCCATTAATATAAGGAAAAAAAATAAAGTTTGATTATAACT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 5

CO CL1571Contig1 696 5 13 U
GGAAAAACAAAAAAGGAAAAGAGAAAAAAAGGTAACTGCAAGACGCGTTTTACTTAAATG
TAAAACACAGTAGTATCTTCGCTCCTTTAATATCCCGGATTCTCTCAAACAATCTCTATC
GCTTCTTCCCCCTATAACCTTCTCTCTCGATCTACTCTCCATCGCAAAACCTAACAA***
TGAGTCAGTACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGCTATCCACCGGAGG
GATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGTATCCGCCTCAGG
GATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCTCCTCCTTACGCCCCGCAGTATC
CTCCTCCGCCTCAGCATCAGCAGCAGCAGAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTCTGG
CTGCTCTCTGCTGTTGCTGTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTT
TGGAGCCGGTGATTTGATTGCAAGAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCATT
GTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTTTATTCTCTTTCTGGTTTATGTTCTTAGAT
TCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATTTGAGACTTTAAAATGGGAATGTAAA
TTTGCGTGGAGATACTAAGTTCTTTACCTCTCAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK81TF U 116
AF RR2DM94TF U 1
AF RR2DM94JQ C 44
AF RR2E091JQ C 116
AF RR2E091TF U 116
BS 1 162 RR2DM94TF
BS 163 163 RR2EK81TF
BS 164 177 RR2DM94TF
BS 178 180 RR2EK81TF
BS 181 226 RR2DM94TF
BS 227 227 RR2EK81TF
BS 228 386 RR2DM94TF
BS 387 389 RR2E091TF
BS 390 400 RR2DM94TF
BS 401 401 RR2E091TF
BS 402 461 RR2DM94TF
BS 462 690 RR2E091TF
BS 691 696 RR2E091JQ

RD RR2EK81TF 255 0 0
GG
ATCGCTTCTTCCCCCTATAACCTTCTCTCTCGATCTACTCTCCATCGCAAAACCTAACAA
***TGAGTCAGTACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGCTATCCACCGG
AGGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGTATCCGCCTC
AGGGATACCCTCAACAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCTCCTCCTTACGCCCCGCAGT
ATCCTCCTCCGCC

QA 3 255 3 255
DS 

RD RR2DM94TF 461 0 0
GGAAAAACAAAAAAGGAAAAGAGAAAAAAAGGTAACTGCAAGACGCGTTTTACTTAAATG
TAAAACACAGTAGTATCTTCGCTCCTTTAATATCCCGGATTCTCTCAAACAATCTCTATC
GCTTCTTCCCCCTATAACCTTCTCTCTCGATCTACTCTCCATTGCAAAACCTAACAACAA
TGAGTCAGTACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGTTATCCACCGGAGG
GATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGTATCCGCCTCAGG
GATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCTCCTCCTTACGCCCCGCAGTATC
CTCCTCCGCCTCAGCATCAGCAGCAG***AGCGGACCTGGTGTTCTAGAAGGATGTCTGG
CTGCTCTCTGCTGTTGCTGTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGA

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR2DM94JQ 649 0 0
CGCGTTTTACTTAAATGTAAAACACAGTAGTATCTTCGCTCCTTTAATATCCCGGATTCT
CTCAAACAATCTCTATCGCTTCTTCCCCCTATAACCTTCTCTCTCGATCTACTCTCCATT
GCAAAACCTAACAACAATGAGTCAGTACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCA
AGGTTATCCACCGGAGGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCA
GGGGTATCCGCCTCAGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCTCCTCC
TTACGCCCCGCAGTATCCTCCTCCGCCTCAGCATCAGCAGCAG***AGCGGACCTGGTGT
TCTAGAAGGATGTCTGGCTGCTCTCTGCTGTTGCTGTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATG
ATTGGAGTACCTGCTTTCGGAGCCGGTGATTTGATTGCAAGAGAGTGTTTCGCAACTTTA
ATTAAGTAATGGGCATTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTTTATGCTCTTTCT
GGTTTATGTTCTTAGATTCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATTTGAGACTT
TAAAATGGGAATGTAAATTTGCGTGGAGATACTAAGTTCTTTACCTC
GC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2E091JQ 581 0 0
GG
ATCGCTTCTTCCCCCTATAACCTTCTCTC**GATCTACTCTCCATCGCAAAACCTAACAA
***TGAGTCAGTACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCGAGGCTATCCACCGG
AGGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGTATCCGCCTC
AGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCTCCTCCTTACGCCCCGCAGT
ATCCTCCTCCGCCTCAGCATCAGCAGCAGCAGAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTC
TGGCTGCTCTCTGCTGTTGCTGTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGC
TTTTGGAGCCGGTGATTTGATTGCAAGAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGC
ATTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTTTATTCTCTTTCTGGTTTATGTTCTTA
GATTCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATTTGAGACTTTAAAATGGGAATGT
AAATTTGCGTGGAGATACTAAGTTCTTTACCTCTCAGTC

QA 3 581 3 581
DS 

RD RR2E091TF 581 0 0
GG
ATCGCTTCTTCCCCCTATAACCTTCTCTC**GATCTACTCTCCATCGCAAAACCTAACAA
***TGAGTCAGTACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCGAGGCTATCCACCGG
AGGGATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGTATCCGCCTC
AGGGATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCTCCTCCTTACGCCCCGCAGT
ATCCTCCTCCGCCTCAGCATCAGCAGCAGCAGAGCGGACCTGGGGTTCTAGAAGGATGTC
TGGCTGCTCTCTGCTGTTGCTGTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGC
TTTTGGAGCCGGTGATTTGATTGCAAGAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGC
ATTGTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTTTATTCTCTTTCTGGTTTATGTTCTTA
GATTCACAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATTTGAGACTTTAAAATGGGAATGT
AAATTTGCGTGGAGATACTAAGTTCTTTACCTC
TCAGTC

QA 3 575 3 575
DS 



AS 1 4

CO CL1572Contig1 949 4 5 U
GTCATAATATCATGTTTATTTAAACCAAAAAGAGTAGTAATTACAAGTAGCAGTGAAGTA
TATAACACACACTTCTTCTGCGGATACGGTTAGTAAAAAAAAAAA***GGAAAACAAAAG
CGTTTATGTCAAGTCATTAAAATTTTCTGATAAAACATCAACTATGCCCACATGATTTAC
AAGGTGAAAGGGCTTGGAGGAGGCTGAACGATAGGAAGTTTCGACATGGTTACATTTCCA
CTAATCACATTCTGCGCAACCGTATCCTCCAATGGTATAGGATCAACCCTCACCACATTC
TCTGGTACAACCTTGTCACCATCAACCTTAGCAAGAACCTCAAAATGCATTTTCATTGTT
TTGGGTTTCGTTCTCCACTCTGGCAAGTCTAACCCTTCAAGATCACTTTCCTTCAGCTTC
CTCTCTACACCAAAACCAATCTTCATAAACGTCTGAGCTGCGACGTCTGCTTTCAACACC
TTAAAAGAACCTTCTTCTTGAGCTTTGGGACCTAACACAGAGGTCAACAGCTTCTCAAAG
CCGAGTAAGTTAGCGTTGGAGCCGTTGATTGAAGTGGTCGGCCACATGGTTGTGAACTCC
CTCGGAGTAAGAACAGTAGTAGTAACACCCTCAATGGTTGAGACATCTCTACTACTACCT
TTGTCTTTAGACATGGAAGATAGCTCCACAAGTCCAGGCGCAAGGCGCTTAAGCTTGAGT
TTGCTCTCAGGAGATCGCGAGGTCGATGCAGGAGAACTAGGACCAACAATGCGGAGAGAT
AGAAGTGGAGTTTCGTGATCAGCTGATGAAGCACCACCACGTCGAAGCTGCTCAGCTAAA
GAGAGAAGACCAGAGGCGAACTCACTGGAGCTTTGGTTCAACGGAAGTGGCAAATCAATA
GGGTGACGCAGACTAACAGATCTAGCCCCCTTGACAGTCACAACAGCAC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 0 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA41JQ U 1
AF RR2EA41TF C 1
AF RR2FT09JQ U 1
AF RR2DD18TF C 264
BS 1 572 RR2EA41JQ
BS 573 573 RR2FT09JQ
BS 574 601 RR2EA41JQ
BS 602 711 RR2FT09JQ
BS 712 949 RR2DD18TF

RD RR2EA41JQ 601 0 0
GTCATAATATCATGTTTATTTAAACCAAAAAGAGTAGTAATTACAAGTAGCAGTGAAGTA
TATAACACACACTTCTTCTGCGGATACGGTTAGTAAAAAAAAAAA***GGAAAACAAAAG
CGTTTATGTCAAGTCATTAAAATTTTCTGATAAAACATCAACTATGCCCACATGATTTAC
AAGGTGAAAGGGCTTGGAGGAGGCTGAACGATAGGAAGTTTCGACATGGTTACATTTCCA
CTAATCACATTCTGCGCAACCGTATCCTCCAATGGTATAGGATCAACCCTCACCACATTC
TCTGGTACAACCTTGTCACCATCAACCTTAGCAAGAACCTCAAAATGCATTTTCATTGTT
TTGGGTTTCGTTCTCCACTCTGGCAAGTCTAACCCTTCAAGATCACTTTCCTTCAGCTTC
CTCTCTACACCAAAACCAATCTTCATAAACGTCTGAGCTGCGACGTCTGCTTTCAACACC
TTAAAAGAACCTTCTTCTTGAGCTTTGGGACCTAACACAGAGGTCAACAGCTTCTCAAAG
CCGAGTAAGTTAGCGTTGGAGCCGTTGATTGAGGTGGTCGGCCACATGGTTGTGAACTCC
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2EA41TF 601 0 0
G
TCATAATATCATGTTTATTTAAACCAAAAAGAGTAGTAATTACAAGTAGCAGTGAAGTAT
ATAACACACACTTCTTCTGCGGATACGGTTAGTAAAAAAAAAAA***GGAAAACAAAAGC
GTTTATGTCAAGTCATTAAAATTTTCTGATAAAACATCAACTATGCCCACATGATTTACA
AGGTGAAAGGGCTTGGAGGAGGCTGAACGATAGGAAGTTTCGACATGGTTACATTTCCAC
TAATCACATTCTGCGCAACCGTATCCTCCAATGGTATAGGATCAACCCTCACCACATTCT
CTGGTACAACCTTGTCACCATCAACCTTAGCAAGAACCTCAAAATGCATTTTCATTGTTT
TGGGTTTCGTTCTCCACTCTGGCAAGTCTAACCCTTCAAGATCACTTTCCTTCAGCTTCC
TCTCTACACCAAAACCAATCTTCATAAACGTCTGAGCTGCGACGTCTGCTTTCAACACCT
TAAAAGAACCTTCTTCTTGAGCTTTGGGACCTAACACAGAGGTCAACAGCTTCTCAAAGC
CGAGTAAGTTAGCGTTGGAGCCGTTGATTGAGGTGGTCGGCCACATGGTTGTGAACTCCC

QA 2 601 2 601
DS 

RD RR2FT09JQ 711 0 0
C
TCATAATATCATGTTTATTTAAACCAAAAAGAGTAGTAATTACAAGTAGCAGTGAAGTAT
ATAACACACACTTCTTCTGCGGATACGGTTAGTAAAAAAAAAAAAAAGGAAAACAAAAGC
GTTTATGTCAAGTCATTAAAATTTTCTGATAAAACATCAACTATGTCCACATGATTTACA
AGGTGAAAGGGCTTGGAGGAGGCTGAACGATAGGAAGTTTCGACATGGTTACATTTCCAC
TAATCACATTCTGCGCAACCGTATCCTCCAATGGTATAGGATCAACCCTCACCACATTCT
CTGGTACAACCTTGTCACCATCAACCTTAGCAAGAACCTCAAAATGCATTTTCATTGTTT
TGGGTTTCGTTCTCCACTCTGGCAAGTCTAACCCTTCAAGATCACTTTCCTTCAGCTTCC
TCTCTACACCAAAACCAATCTTCATAAACGTCTGAGCTGCGACGTCTGCTTTCAACACCT
TAAAAGAACCTTCTTCTTGAGCTTTGGGACCTAACACAGAGGTCAACAGCTTCTCAAAGC
CGAGTAAGTTAGCGTTGGAGCCGTTGATTGAAGTGGTCGGCCACATGGTTGTGAACTCCC
TCGGAGTAAGAACAGTAGTAGTAACACCCTCAATGGTTGAGACATCTCTACTACTACCTT
TGTCTTTAGACATGGAAGATAGCTCCACAAGTCCAGGCGCAAGGCGCTTA

QA 2 711 2 711
DS 

RD RR2DD18TF 686 0 0
ATCCTCCAATGGTATAGGATCAACCCTCACCACATTCTCTGGTATAACCTTGTCACCATC
AACCTTAGCAAGAACCTCAAAATGCATTCTCATTGTTTTGGGTTTCGTTCTCCACTCTGG
AAAGTCCAAGCCTTCAAGATCACTTTCCTTCAGCTTCCTCTCTACACCAAAACCAATCTT
CATAAAAGTCTGAGCTGCAACGTCTGCTTTCAACACCTTAAAAGAACCTTCTTCCTGAGC
TTTGGGACCTAACACAGAGGTCAACAGCTTCTCAAAGCCGAGCAAGTTAGCGTTGGAGCC
GTTGATTGAAGTGATCGGCCACATGGTTGTGAACTCCCTTGGTGTAAGAACAGTAGTAGT
AACACCCTCAATGGTTGAGACATCTCTACTACTACCTTTGTCTTTAGACATGGAAGATAG
CTCCACAAGTCCAGGCGCAAGGCGCTTAAGCTTGAGTTTGCTCTCAGGAGATCGCGAGGT
CGATGCAGGAGAACTAGGACCAACAATGCGGAGAGATAGAAGTGGAGTTTCGTGATCAGC
TGATGAAGCACCACCACGTCGAAGCTGCTCAGCTAAAGAGAGAAGACCAGAGGCGAACTC
ACTGGAGCTTTGGTTCAACGGAAGTGGCAAATCAATAGGGTGACGCAGACTAACAGATCT
AGCCCCCTTGACAGTCACAACAGCAC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 2 5

CO CL1573Contig1 740 2 2 U
GGATCAGATGCCCTGCCGTGCAAGAAAAAGCGCAGCAGGAGCTTGACGCCGTGGTCGGAT
CAGAAAGGCTAATGACAGAATCAGACATCCCAAAACTGCCGTATCTGCAATGCGTGGTCA
AAGAAGCTCTGAGACTTCACCCGTCAACACCAACAATGCTTCCACACAAAGCAAGTGAAA
CGGTGTGGTTAGGTGGGTATAAGGTTCCTAAAGGAACCACGGTCTATGTCCACGTGAAGG
AGATTGGACGGGATCCAGTGAACTGGATAAACCCTTTGGAGTTCAGACCGGAGCGGTTCC
TACTAGAGGACACTGATGTCAAGGGTCGAGACTTCAGGGTTCTTCCATTTGGATCGGGGA
GAAGGGTGTGTCCAGCTGCACAGCTAAGCATGAACTTGATGGCGTTGGTGATGGGGAACT
TGTTACAATGCTTCTCGTGGAGTTCTCCTATTCCTCCGGAGAGTATTGACATGAGCGAGA
TTCCTGGATTGCTTTGTGTTATGAAGACTCCAGTGGAAGCACTAGCTTCGCCGAGAGCTG
CCACAAGAGTTATACCTTTAAATATGGATTAAATAAATAAGATAATGGATCATGGAAATT
TAATAGACCATGATGACTCTCGTTAAGGAGAAGAAGATGTAGTCATGTGAAAAGCACTAG
ATGCATGGCACAATTTACTACATGGCTGAAACTGGGGTTTCATAAAATAAAAATGTAGCT
GATGTATATGGAAAATAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC74TF U 1
AF RR2EC74JQ C 22
BS 1 620 RR2EC74TF
BS 621 740 RR2EC74JQ

RD RR2EC74TF 620 0 0
GGATCAGATGCCCTGCCGTGCAAGAAAAAGCGCAGCAGGAGCTTGACGCCGTGGTCGGAT
CAGAAAGGCTAATGACAGAATCAGACATCCCAAAACTGCCGTATCTGCAATGCGTGGTCA
AAGAAGCTCTGAGACTTCACCCGTCAACACCAACAATGCTTCCACACAAAGCAAGTGAAA
CGGTGTGGTTAGGTGGGTATAAGGTTCCTAAAGGAACCACGGTCTATGTCCACGTGAAGG
AGATTGGACGGGATCCAGTGAACTGGATAAACCCTTTGGAGTTCAGACCGGAGCGGTTCC
TACTAGAGGACACTGATGTCAAGGGTCGAGACTTCAGGGTTCTTCCATTTGGATCGGGGA
GAAGGGTGTGTCCAGCTGCACAGCTAAGCATGAACTTGATGGCGTTGGTGATGGGGAACT
TGTTACAATGCTTCTCGTGGAGTTCTCCTATTCCTCCGGAGAGTATTGACATGAGCGAGA
TTCCTGGATTGCTTTGTGTTATGAAGACTCCAGTGGAAGCACTAGCTTCGCCGAGAGCTG
CCACAAGAGTTATACCTTTAAATATGGATTAAATAAATAAGATAATGGATCATGGAAATT
TAATAGACCATGATGACTCT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2EC74JQ 719 0 0
AAGAAAAAGCGCAGCAGGAGCTTGACGCCGTGGTCGGATCAGAAAGGCTAATGACAGAAT
CAGACATCCCAAAACTGCCGTATCTGCAATGCGTGGTCAAAGAAGCTCTGAGACTTCACC
CGTCAACACCAACAATGCTTCCACACAAAGCAAGTGAAACGGTGTGGTTAGGTGGGTATA
AGGTTCCTAAAGGAACCACGGTCTATGTCCACGTGAAGGAGATTGGACGGGATCCAGTGA
ACTGGATAAACCCTTTGGAGTTCAGACCGGAGCGGTTCCTACTAGAGGACACTGATGTCA
AGGGTCGAGACTTCAGGGTTCTTCCATTTGGATCGGGGAGAAGGGTGTGTCCAGCTGCAC
AGCTAAGCATGAACTTGATGGCGTTGGTGATGGGGAACTTGTTACAATGCTTCTCGTGGA
GTTCTCCTATTCCTCCGGAGAGTATTGACATGAGCGAGATTCCTGGATTGCTTTGTGTTA
TGAAGACTCCAGTGGAAGCACTAGCTTCGCCGAGAGCTGCCACAAGAGTTATACCTTTAA
ATATGGATTAAATAAATAAGATAATGGATCATGGAAATTTAATAGACCATGATGACTCTC
GTTAAGGAGAAGAAGATGTAGTCATGTGAAAAGCACTAGATGCATGGCACAATTTACTAC
ATGGCTGAAACTGGGGTTTCATAAAATAAAAATGTAGCTGATGTATATGGAAAATAAAA

QA 1 719 1 719
DS 



CO CL1573Contig2 1629 3 17 U
GATCACCACCAACATGCTTTATCAACGGTGGTGGGCATCCAACATACCTCCAGGACCAAA
GCCACGGTTTCTACTCGGAAACATTCATGAACTGAAACCACATTGGACTCATTCTTTTTC
TGAATGGTCACAGACATATGGTCCCATCATATCGGTATGGTTTGGAACAAACCTCTCTGT
CGTTGTCTCTAACGCTGATTTAGCCAGACAAGTGTTGAAAGACAACGACCATCAGTTGTG
TAACCGAGAAAGGGTCGCAAAGATGACACAGTCAGGTACCGATCTCGTTTGGTCTGACTA
CAGTCCACATTACGTGAAGCTGAGGAAACTATGCACGCCTGAGCTTTTCTCTTTGAAGAG
CATTGAGAGTTTCAGATCGTTGAGAGAGATGGAGGCAAGGTCCATGGTCGAGTCGCTTTA
CAAGGACGTGATGATAGATTCAACAGACGATCAGACTAGAAAACCAGTGGTCGTGAGGAA
GTATCTAGCTGCTGTTGTTTTGAACACAATCTCAAAGTTAATGATCGGGAAACAGTTCAG
CGCCGAGGAAGGTAAAGAGTTCAAAGAGATTGTCCACAAAGAACATTTTCTTAGCGGCTC
AGGGAGCTTGTTAGATGTCATCTGGTGGCTCAAATGGGTTTCGAAGTGGCTCGTTAACGA
CAAGGACTTCTTGGCGCACATGGATAGGAGAACAAAGTGGTTTAGAGGAGCTATAATGGT
GGAAGAAGATGTAGCTGTTGAGGATCACGAGGGGTTTGTCAGGAAACTGTTAGTGTTGAA
AGAGAAGAAAGAGCTGAGTGAAGAGACGGTTCACGGATTAATCTGGAACATGTTCACCGC
ACGCTCAGACACAACAGCTGTTGTCCTGGAATGGGCTATGGCAGAGATGATCAGATGCCC
TGCCGTGCAAGAAAAAGCGCAGCAGGAGCTTGACGCCGTGGTCGGATCAGAAAGGCTAAT
GACTGAAGCAGACATCCCAAAACTGCCGTATCTGCAATGCGTGGTCAAAGAAGCTCTGAG
ACTTCACCCGTCAACACCAACAATGCTTCCACACAAAGCAAGTGAAACGGTGTGGTTAGG
TGGGTATAAGGTTCCTAAAGGAACCACGGTTTATGTCCACGTGAAGGAGATAGGGGGATC
CAGTGAACTGGATAAACCCTTTGGAGTTCAGACCGGAGAGGTTCCTAGTAGAGGACACTG
ATGTCAAGGGTCGAGACTTCAGGGTTCTTCCGTTTGGCTCGGGGAGGAGAGTGTGTCCAG
CTGCACAGCTCAGCATGAACTTGATGGCGTTGGTGATGGGGAACTTGTTGCAATGCTTCT
CGTGGAGTTCTCCTATTCCTCCGGAGAGTATTGACATGAGCGAGATTCCTGGATTGCTTT
GTGTCATGAAGACTCCAGTGGAAGCACTAGCTTCGCCAAGAGCTGCCACAAGAGTTATAC
CTTTAAATATGGGTTGAATAAATAAAGATAATGGATCATGGAAACTAAATAGACCATGAT
GACTCTCATTAAGGAGAAGAAGATGTAGTAGTCATGTGAAAAGCACTAGATGCATGGCAC
AATTTACTACATATGGCTGAAACTGGTTTCATAAAATAAAAATGTAGCTGATGTATATGG
AAAATAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF18TF U 1
AF RR2B746TF U 140
AF RR2B746JQ C 835
BS 1 355 RR2FF18TF
BS 356 356 RR2B746TF
BS 357 447 RR2FF18TF
BS 448 448 RR2B746TF
BS 449 449 RR2FF18TF
BS 450 450 RR2B746TF
BS 451 600 RR2FF18TF
BS 601 601 RR2B746TF
BS 602 677 RR2FF18TF
BS 678 678 RR2B746TF
BS 679 723 RR2FF18TF
BS 724 724 RR2B746TF
BS 725 747 RR2FF18TF
BS 748 925 RR2B746TF
BS 926 926 RR2B746JQ
BS 927 1008 RR2B746TF
BS 1009 1629 RR2B746JQ

RD RR2FF18TF 747 0 0
GATCACCACCAACATGCTTTATCAACGGTGGTGGGCATCCAACATACCTCCAGGACCAAA
GCCACGGTTTCTACTCGGAAACATTCATGAACTGAAACCACATTGGACTCATTCTTTTTC
TGAATGGTCACAGACATATGGTCCCATCATATCGGTATGGTTTGGAACAAACCTCTCTGT
CGTTGTCTCTAACGCTGATTTAGCCAGACAAGTGTTGAAAGACAACGACCATCAGTTGTG
TAACCGAGAAAGGGTCGCAAAGATGACACAGTCAGGTACCGATCTCGTTTGGTCTGACTA
CAGTCCACATTACGTGAAGCTGAGGAAACTATGCACGCCTGAGCTTTTCTCTTTGGAGAG
CATTGAGAGTTTCAGATCGTTGAGAGAGATGGAGGCAAGGTCCATGGTCGAGTCGCTTTA
CAAGGACGTGATGATAGATTCAACAGATGGTCAGACTAGAAAACCAGTGGTCGTGAGGAA
GTATCTAGCTGCTGTTGTTTTGAACACAATCTCAAAGTTAATGATCGGGAAACAGTTCAG
CGCCGAGGAAGGTAAAGAGTTCAAAGAGATTGTCCACAAAGAACATTTTCTTAGCGGCTC
GGGGAGCTTGTTAGATGTCATCTGGTGGCTCAAATGGGTTTCGAAGTGGCTCGTTAACGA
CAAGGACTTCTTGGCGCGCATGGATAGGAGAACAAAGTGGTTTAGAGGAGCTATAATGGT
GGAGGAAGATGTAGCTGTTGAGGATCA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2B746TF 869 0 0
GGTCCCATCATATCGGTATGGTTTGGAACAAACCTCTCTGTCGTTGTCTCTAACGCTGAT
TTAGCCAGACAAGTGTTGAAAGACAACGACCATCAGTTGTGTAACCGAGAAAGGGTCGCA
AAGATGACACAGTCAGGTACTGATCTCGTTTGGTCTGACTACAGTCCACATTACGTGAAG
CTGAGGAAACTATGCACGCTTGAGCTTTTCTCTTTGAAGAGCATTGAGAGTTTCAGGTCG
TTGAGAGAGATGGAGGCAAGGTCCATGGTCGAGTCGGTTTACAAGGACGTGATGATAGAT
TCAACAGACGATCAGACTAGAAAGCCAGTGGTCGTGAGGAAGTATCTAGCTGCTGTTGTT
TTGAACACGATCTCGAAGTTAATGATCGGGAAACAGTTCAGCGCCGAGGAAGGTAAAGAG
TTCAAAGAGATTGTTCACAAAGAACATTTTCTTAGTGGCTCAGGGAGCTTGTTAGATGTC
ATCTGGTGGCTCAAATGGGTTTCGAAGTGGCTCGTTAACGACAAGGACTTCTTGGCGCAC
ATGGATAGTAGAACAAAGTGGTTTAGAGGAGCTATAATGGTGGAAGAAGATGTAGCTGTT
GAGGATCACGAGGGGTTTGTCAGGAAACTGTTAGTGTTGAAAGAGAAGAAAGAGCTGAGT
GAAGAGACGGTTCACGGATTAATCTGGAACATGTTCACCGCACGCTCAGACACAACAGCT
GTTGTCCTGGAATGGGCTATGGCAGAGATGATCAGATGCCCTGCCGTGCAAGAAAAAGCG
CAGCAG*AGCTTGACGCCGTGGTCGGATCAGAAAGGCTAATGACTGAAGCAGACATCCCA
AAACTGCCGTATCTGCAATGCGTGGTCAA

QA 1 869 1 869
DS 

RD RR2B746JQ 795 0 0
CACCGCAGGCTCAGACACAACAGCTGTTGTCCTGGAATGGGCTATGGCAGAGATGATCAG
ATGCCCTGCCGTGCAAGAAAAAGCGCAGCAGGAGCTTGACGCCGTGGTCGGATCAGAAAG
GCTAATGACTGAAGCAGACATCCCAAAACTGCCGTATTTGCAATGCGTGGTCAAAGAAGC
TCTGAGACTTCACCCGTCAACACCAACAATGCTTCCACACAAAGCAAGTGAAACGGTGTG
GTTAGGTGGGTATAAGGTTCCTAAAGGAACCACGGTTTATGTCCACGTGAAGGAGATAGG
GGGATCCAGTGAACTGGATAAACCCTTTGGAGTTCAGACCGGAGAGGTTCCTAGTAGAGG
ACACTGATGTCAAGGGTCGAGACTTCAGGGTTCTTCCGTTTGGCTCGGGGAGGAGAGTGT
GTCCAGCTGCACAGCTCAGCATGAACTTGATGGCGTTGGTGATGGGGAACTTGTTGCAAT
GCTTCTCGTGGAGTTCTCCTATTCCTCCGGAGAGTATTGACATGAGCGAGATTCCTGGAT
TGCTTTGTGTCATGAAGACTCCAGTGGAAGCACTAGCTTCGCCAAGAGCTGCCACAAGAG
TTATACCTTTAAATATGGGTTGAATAAATAAAGATAATGGATCATGGAAACTAAATAGAC
CATGATGACTCTCATTAAGGAGAAGAAGATGTAGTAGTCATGTGAAAAGCACTAGATGCA
TGGCACAATTTACTACATATGGCTGAAACTGGTTTCATAAAATAAAAATGTAGCTGATGT
ATATGGAAAATAAAA

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 4

CO CL1574Contig1 1422 4 10 U
TTTTTTGATCCTATCTCTCACACGAAGTGGTTGAGACTAGGCCTAGTTGAGACTGTTGCC
ATAAATAAACAAAAGCTCTCTCTTTCTTTCTGATTGATTGATTGTTTGGTAGGTTCGACG
AAAGCTTTGATCTTTTTGCATAAAATGGCGTCTCTTTTAAGCAGATTCTGCCGGAAACTG
GCAGTTCCGGGATCAGCTCACGGAGCACGGATGGTTTCTACAACGACGTCGTGTGGATCA
GAAACCGTGAAGTCGTTGAACCTGTACTCTGCTATCAATCAAGCTCTTCACATCGCCTTG
GAAACCGATCCTCGCTCCTATGTATTTGGGGAAGATGTTGGGTTTGGTGGAGTCTTCCGC
TGCACAACAGGATTAGCTGAACGGTTCGGCAAAAACCGTGTCTTCAACACTCCTCTTTGT
GAACAAGGCATTGTTGGATTTGGTATTGGCCTAGCAGCAATGGGGAATCGAGCAGTTGTA
GAAATTCAATTTGCAGACTATATTTATCCTGCTTTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCA
AAGTTCAGATACCGAAGTGGTAACCAGTTCAACTGTGGAGGACTTACAATAAGAGCACCG
TACGGGGCGGTTGGTCATGGTGGACATTACCATTCACAATCCCCTGAGGCTTTCTTCTGC
CATGTCCCCGGCATTAAGGTTGTTATCCCTCGGAGTCCACGAGAAGCTAAGGGACTGCTC
TTGTCCTCTATCCGTGATCCTAATCCTGTTGTCTTCTTCGAACCAAAGTGGCTATATCGT
CAAGCGGTAGAAGAAGTTCCAGAGCATGACTATATGATACCTTTATCAGAAGCTGAGGTT
ATTAGACAAGGCAATGACATAACACTTGTTGGATGGGGAGCTCAGCTTACCGTTATGGAA
CAAGCTTGTCTAGACGCGGAGAAGGTTTCAGCTTTATACTAAGATAATTGGTTTGTTTAA
CAGTTAGGAGTAACATGGGTCTTGAGTTAATAATGGCAGGAAGGAATATCATGTGAACTG
ATAGATCTCAAGACTCTACTACCTTGGGACAAAGAAACAGTGGAGGCCTCTGTTAAAAAG
ACTGGCAGGCTTCTTATAAGCCATGAAGCTCCTGTGACGGGAGGTTTTGGAGCAGAGATC
TCTGCAACAATCCTCGAACGTTGCTTCTTGAAGTTAGAAGCGCCAGTAAGCAGAGTTTGT
GGTCTAGACACTCCATTCCCTCTTGTGTTTGAGCCGTTCTACATGCCCACCAAGAACAAG
ATATTGGATGCAATCAAGTCCACTGTCAATTACTAGCCATCCAATATGCTTCTTTGGAAA
ACTTGAAGAACTATTGTTTGTTGTTTTACATTATGTATCATGTAGCTATTTATGCGGTAC
TGTTGTGTTTATATGAATAAGCAATGAATTGCCTTAAGACCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH81TF U 1
AF RR2G496TF U 1
AF RR2EY44TF U 193
AF RR2EY44JQ C 750
BS 1 136 RR2CH81TF
BS 137 137 RR2G496TF
BS 138 449 RR2CH81TF
BS 450 450 RR2G496TF
BS 451 493 RR2CH81TF
BS 494 494 RR2G496TF
BS 495 597 RR2CH81TF
BS 598 660 RR2G496TF
BS 661 920 RR2EY44TF
BS 921 1422 RR2EY44JQ

RD RR2CH81TF 597 0 0
TTTTTTGATCCTATCTCTCACACGAAGTGGTTGAGACTAGGCCTAGTTGAGACTGTTGCC
ATAAATAAACAAAAGCTCTCTCTTTCTTTCTGATTGATTGATTGTTTGGTAGGTTCGACG
AAAGCTTTGATCTTTT*GCATAAAATGGCGTCTCTTTTAAGCAGATTCTGCCGGAAACTG
GCAGTTCCGGGATCAGCTCACGGAGCACGGATGGTTTCTACAACGACGTCGTGTGGATCA
GAAACCGTGAAGTCGTTGAACCTGTACTCTGCTATCAATCAAGCTCTTCACATCGCCTTG
GAAACCGATCCTCGCTCCTATGTATTTGGGGAAGATGTTGGGTTTGGTGGAGTCTTCCGC
TGCACAACAGGATTAGCTGAACGGTTCGGCAAAAACCGTGTCTTCAACACTCCTCTTTGT
GAACAAGGCATTGTTGGATTTGGTATTGGTCTAGCAGCAATGGGGAATCGAGCAGTTGTA
GAAATTCAATTTGTAGACTATATTTATCCTGCTTTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCA
AAGTTCAGATACCGAAGTGGTAACCAGTTCAACTGTGGAGGACTTACAATAAGAGCA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2G496TF 660 0 0
TTTTTTGATCCTATCTCTCACACGAAGTGGTTGAGACTAGGCCTAGTTGAGACTGTTGCC
ATAAATAAACAAAAGCTCTCTCTTTCTTTCTGATTGATTGATTGTTTGGTAGGTTCGACG
AAAGCTTTGATCTTTTTGCATAAAATGGCGTCTCTTTTAAGCAGATTCTGCCGGAAACTG
GCAGTTCCGGGATCAGCTCACGGAGCACGGATGGTTTCTACAACGACGTCGTGTGGATCA
GAAACCGTGAAGTCGTTGAACCTGTACTCTGCTATCAATCAAGCTCTTCACATCGCCTTG
GAAACAGATCCTCGCTCCTATGTATTTGGGGAAGATGTTGGGTTTGGTGGAGTCTTCCGC
TGCACAACAGGATTAGCTGAACGGTTCGGCAAAAACCGTGTCTTCAACACTCCTCTTTGT
GGACAAGGCATTGTTGGATTTGGTATTGGCCTAGCAGCAATGGGGAATCGAGCAGTTGTA
GAAATTCAATTTGCAGACTATATTTATCCTGCTTTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCA
AAGTTCAGATACCGAAGTGGTAACCAGTTCAACTGTGGAGGACTTACAATAAGAGCACCG
TACGGGGCGGTTGGTCATGGTGGACATTACCATTCACAATCCCCTGAGGCTTTCTTCTGC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2EY44TF 730 0 0
G
CAGCTCACGGAGCACGGATGGTTTCTACAACGACGTCGTGTGGATCAGAAACCGTGAAGT
CGTTGAACCTGTACTCTGCTATCGATCAAGCTCTTCACATCGCCTTGGAAACCGATCCTC
GCTCCTATGTATTTGGGGAAGATGTTGGGTTTGGTGGAGTCTTCCGCTGCACAACAGGAT
TAGCTGAACGGTTCGGCAAAAACCGTGTCTTCAACACTCCTCTTTGTGAACAAGGCATTG
TTGGATTTGGTATTGGCCTAGCAGCAATGGGGAATCGAGCAGTTGTAGAAATTCAATTTG
CAGACTATATTTATCCTGCTTTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCAAAGTTCAGATACC
GAAGTGGTAACCAGTTCAACTGTGGAGGACTTACAATAAGAGCACCGTATGGGGCGGTTG
GTCATGGTGGACATTACCATTCACAATCCCCTGAGGCTTTCTTCTGCCATGTCCCCGGCA
TTAAGGTTGTTATCCCTCGGAGTCCACGAGAAGCTAAGGGACTGCTCTTGTCCTCTATCC
GTGATCCTAATCCTGTTGTCTTCTTCGAACCAAAGTGGCTATATCGTCAAGCGGTAGAAG
AAGTTCCAGAGCATGACTATATGATACCTTTATCAGAAGCTGAGGTTATTAGACAAGGCA
ATGACATAACACTTGTTGGATGGGGAGCTCAGCTTACCGTTATGGAACAAGCTTGTCTAG
ACGCGGA
GA

QA 2 728 2 728
DS 

RD RR2EY44JQ 673 0 0
TGTCTTCTTCGAACCAAAGTGGCTATATCGTCAAGCGGTAGAAGAAGTTCCAGAGCATGA
CTATATGATACCTTTATCAGAAGCTGAGGTTATTAGACAAGGCAATGACATAACACTTGT
TGGATGGGGAGCTCAGCTTACCGTTATGGAACAAGCTTGTCTAGACGCGGAGAAGGTTTC
AGCTTTATACTAAGATAATTGGTTTGTTTAACAGTTAGGAGTAACATGGGTCTTGAGTTA
ATAATGGCAGGAAGGAATATCATGTGAACTGATAGATCTCAAGACTCTACTACCTTGGGA
CAAAGAAACAGTGGAGGCCTCTGTTAAAAAGACTGGCAGGCTTCTTATAAGCCATGAAGC
TCCTGTGACGGGAGGTTTTGGAGCAGAGATCTCTGCAACAATCCTCGAACGTTGCTTCTT
GAAGTTAGAAGCGCCAGTAAGCAGAGTTTGTGGTCTAGACACTCCATTCCCTCTTGTGTT
TGAGCCGTTCTACATGCCCACCAAGAACAAGATATTGGATGCAATCAAGTCCACTGTCAA
TTACTAGCCATCCAATATGCTTCTTTGGAAAACTTGAAGAACTATTGTTTGTTGTTTTAC
ATTATGTATCATGTAGCTATTTATGCGGTACTGTTGTGTTTATATGAATAAGCAATGAAT
TGCCTTAAGACCG

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 3

CO CL1575Contig1 817 3 12 U
GGAAGACAGCAGCAAACAGCAGCAAACAGACATAGAACTTGGTGGAGAACTCCGGCGGCG
ACATGGGTGGTTCAATTTCTGTGTCCGAAAAATCCATCCATGAATTCACTGTCAAGAATA
GCTCCGGCAAGGAGGTTGACCTTAGCGTTTACCAAGGGAAGGTTCCTCTCGTCGTCAACG
TCGCGTCTAAATGTGGTTTCACGGAATCCAATTACACACAGCTTACTGAACTTTACCAGA
AATACAAAGATCAAGGGTTTGTGATATTGGCGCTTCCTTGCAACCAGTTTTTGAACCAGG
AGCCTGGTACAAGCCAAGATGCTCATGAATTTGCTTGTACCAGGTTTAAGGCCGAGTACC
CTGTCTTCCAAAAGGTGCGTGTAAATGGACAAAACACAGCACCAGTCTACAAATTCCTCA
AGTCTAAGAAACCGTCATTCCTTGGAAGCAGGATCAAATGGAACTTCACCAAGTTCTTGG
TCGGCAAAGATGGTCAAGTCATTGATCGTTATGGCCCCACTGTTCCACCTCTCTCCATCG
AGTTAACTCTTTTACTATTCTTTTTTCTTTTTTTACTATTCTCTTCTCATCTCTTGCAAT
ATATATATATAGCGGTTAGTTAATTCATTCATGTTTTCTGCCAAACAGAAAGACATCAAG
AAAGCCCTCGGAGACGCAGAAGCGTTTCCAAGTACTTAGCCCTTGAAGAAGAAGAAGATA
GAGGGAGAGGCGAGAGGCTCTTGAAGAATTCGTCTCTTTACTCTTTGATATCCACTCATT
TTGTAGTTTCTCTGGTGATGATGTACAAGTTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C023TF U 31
AF RR2D330TF U 1
AF RR2D330JQ C 231
BS 1 74 RR2D330TF
BS 75 75 RR2C023TF
BS 76 117 RR2D330TF
BS 118 118 RR2C023TF
BS 119 165 RR2D330TF
BS 166 166 RR2C023TF
BS 167 706 RR2D330TF
BS 707 707 RR2D330JQ
BS 708 709 RR2D330TF
BS 710 712 RR2D330JQ
BS 713 742 RR2D330TF
BS 743 817 RR2D330JQ

RD RR2C023TF 286 0 0
G
ATAGAACTTGGTGGAGAACTCCGGCGGCGACATGGGTGGTTCAATTTCTGTGTCCGAAAA
ATCCATCCATGAATTCACTGTCAAGAATAGCTCCGGCAAGGAGGTTGACCTTAGCGTTTA
CCAAGGGAAGGTTCCTCTCGTCGTCAACGTCGCGTCTAAATGTGGTTTCACGGAATCCAA
TTACACACAGCTTACTGAACTTTACCGGAAATACAAAGATCAAGGGTTTGTGATATTGGC
GTTTCCTTGCAACCAGTTTTTGAACCAAGAGCCTGGTACAAGCCA

QA 2 286 2 286
DS 

RD RR2D330TF 742 0 0
GGAAGACAGCAGCAAACAGCAGCAAACAGACATAGAACTTGGTGGAGAACTCCGGCGGCG
ACATGGGTGGTTCAGTTTCTGTGTCCGAAAAATCCATCCATGAATTCACTGTCAAGATTA
GCTCCGGCAAGGAGGTTGACCTTAGCGTTTACCAAGGGAAGGTTCTTCTCGTCGTCAACG
TCGCGTCTAAATGTGGTTTCACGGAATCCAATTACACACAGCTTACTGAACTTTACCAGA
AATACAAAGATCAAGGGTTTGTGATATTGGCGCTTCCTTGCAACCAGTTTTTGAACCAGG
AGCCTGGTACAAGCCAAGATGCTCATGAATTTGCTTGTACCAGGTTTAAGGCCGAGTACC
CTGTCTTCCAAAAGGTGCGTGTAAATGGACAAAACACAGCACCAGTCTACAAATTCCTCA
AGTCTAAGAAACCGTCATTCCTTGGAAGCAGGATCAAATGGAACTTCACCAAGTTCTTGG
TCGGCAAAGATGGTCAAGTCATTGATCGTTATGGCCCCACTGTTCCACCTCTCTCCATCG
AGTTAACTCTTTTACTATTCTTTTTTCTTTTTTTACTATTCTCTTCTCATCTCTTGCAAT
ATATATATATAGCGGTTAGTTAATTCATTCATGTTTTCTGCCAAACAGAAAGACATCAAG
AAAGCCCTCGGAGACGCAGAAGCGTTTCCAAGTACTTAGCCCTTGA*GAG**AGAAGATA
GAGGGAGAGGCGAGAGGCTCTT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2D330JQ 587 0 0
CTTTACCAGAAATACAAAGATCAAGGGTTTGTGATATTGGCGCTTCCTTGCAACCAGTTT
TTGAACCAGGAGCCTGGTACAAGCCAAGATGCTCATGAATTTGCTTGTACCAGGTTTAAG
GCCGAGTACCCTGTCTTCCAAAAGGTGCGTGTAAATGGACAAAACACAGCACCAGTCTAC
AAATTCCTCAAGTCTAAGAAACCGTCATTCCTTGGAAGCAGGATCAAATGGAACTTCACC
AAGTTCTTGGTCGGCAAAGATGGTCAAGTCATTGATCGTTATGGCCCCACTGTTCCACCT
CTCTCCATCGAGTTAACTCTTTTACTATTCTTTTTTCTTTTTTTACTATTCTCTTCTCAT
CTCTTGCAATATATATATATAGCGGTTAGTTAATTCATTCATGTTTTCTGCCAAACAGAA
AGACATCAAGAAAGCCCTCGGAGACGCAGAAGCGTTTCCAAGTACTTAGCCCTTGAAGAA
GAAGAAGATAGAGGGAGAGGCGAGAGGCTCTTGAAGAATTCGTCTCTTTACTCTTTGATA
TCCACTCATTTTGTAGTTTCTCTGGTGATGATGTACAAGTTTCTTCC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 5

CO CL1576Contig1 694 5 6 U
GGGGGCCCCTCTCACAACATCGCACGGATCCAAATCCAGATCATACCGAAGAAGAAGAAG
AAGACACGCACCATCCATCCATCCATCCATCTCCAGGAGGGAGCTTTGATTTGAATCTGA
ATTTTGATCAAAAAGATGGGTTTCCTGATAACAACCCTAATCTTCATGGTCGTGGGAATA
ATTGCTTCTCTGTGCGTTCGTATCTGCTTCGCTAGAGGTCCCTCCACAAATCTGCTTCAC
TTCACCTTGGTCATTACTGCCACGGTCTGCTGCTGGATGATGTGGGCGATTGTATACATT
GCACAGATGAATCCTCTGATTGTCCCAATCCTAAGCGAAACAGAGTAGCATCCTCTCACT
CAAACTCACTCAGGCTATGAACAAAGTGAGTAGTAATACCGGGTTGCTTACCTTCTTCTG
TTCTCGATTTCTTGTGTATCTTCAATCTTTTAAATGGTTTGTAATCTGTTTCCTAGTGCG
AACAAATCCATAAACTTTTTGCCTCTGTATTATTGAAAATGTTTTGTATTCCCAAAACAG
CTGAGATGCTCAAAACAATGTATTTGTTGATGAAATAATGTCTTTGACAGGG*ACGAGTT
TTATTCGCCCTTCTATCATACAGTAATGTTTTTTATGTTGTTGCTATTAATAGTTTGCTG
TATATACAAAGCATTGCAATTTTAACGCAGAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2AA81JQ C 15
AF RR2AA81TF U 15
AF RR2EL20TF U 26
AF RR2CC94JQ C 1
AF RR2CC94TF U 1
BS 1 16 RR2CC94TF
BS 17 458 RR2AA81TF
BS 459 459 RR2EL20TF
BS 460 588 RR2AA81TF
BS 589 614 RR2EL20TF
BS 615 694 RR2CC94TF

RD RR2AA81JQ 574 0 0
GG
ACATCGCACGGATCCAAATCCAGATCATACCGAAGAAGAAGAAGAAGACACGCACCATCC
ATCCATCCATCCATCTCCAGGAGGGAGCTTTGATTTGAATCTGAATTTTGATCAAAAAGA
TGGGTTTCCTGATAACAACCCTAATCTTCATGGTCGTGGGAATAATTGCTTCTCTGTGCG
TTCGTATCTGCTTCGCTAGAGGTCCCTCCACAAATCTGCTTCACTTCACCTTGGTCATTA
CTGCCACGGTCTGCTGCTGGATGATGTGGGCGATTGTATACATTGCACAGATGAATCCTC
TGATTGTCCCAATCCTAAGCGAAACAGAGTAGCATCCTCTCACTCAAACTCACTCAGGCT
ATGAACAAAGTGAGTAGTAATACCGGGTTGCTTACCTTCTTCTGTTCTCGATTTCTTGTG
TATCTTCAATCTTTTAAATGGTCTGTAATCTGTTTCCTAGTGCGAACAAATCCATAAACT
TTTTGCCTCTGTATTATTGAAAATGTTTTGTATTCCCAAAACAGCTGAGATGCTCAAAAC
AATGTATTTGTTGATGAAATAATGTCTTTGAC

QA 3 574 3 574
DS 

RD RR2AA81TF 574 0 0
GG
ACATCGCACGGATCCAAATCCAGATCATACCGAAGAAGAAGAAGAAGACACGCACCATCC
ATCCATCCATCCATCTCCAGGAGGGAGCTTTGATTTGAATCTGAATTTTGATCAAAAAGA
TGGGTTTCCTGATAACAACCCTAATCTTCATGGTCGTGGGAATAATTGCTTCTCTGTGCG
TTCGTATCTGCTTCGCTAGAGGTCCCTCCACAAATCTGCTTCACTTCACCTTGGTCATTA
CTGCCACGGTCTGCTGCTGGATGATGTGGGCGATTGTATACATTGCACAGATGAATCCTC
TGATTGTCCCAATCCTAAGCGAAACAGAGTAGCATCCTCTCACTCAAACTCACTCAGGCT
ATGAACAAAGTGAGTAGTAATACCGGGTTGCTTACCTTCTTCTGTTCTCGATTTCTTGTG
TATCTTCAATCTTTTAAATGGTCTGTAATCTGTTTCCTAGTGCGAACAAATCCATAAACT
TTTTGCCTCTGTATTATTGAAAATGTTTTGTATTCCCAAAACAGCTGAGATGCTCAAAAC
AATGTATTTGTTGATGAAATAATGTCTTTGAC

QA 3 574 3 574
DS 

RD RR2EL20TF 589 0 0
GGATCCAAATCCAGATCATACCGAAGAAGAAGAAGAAGACACGCACCATCCATCCATCCA
TCCATCTCCAGGAGGGAGCTTTGATTTGAATCTGAATTTTGATCAAAAAGATGGGTTTCC
TGATAACAACCCTAATCTTCATGGTCGTGGGAATAATTGCTTCTCTGTGCGTTCGTATCT
GCTTCGCTAGAGGTCCCTCCACAAATCTGCTTCACTTCACCTTGGTCATTACTGCCACGG
TCTGCTGCTGGATGATGTGGGCGATTGTATACATTGCACAGATGAATCCTCTGATTGTCC
CAATCCTAAGCGAAACAGAGTAGCATCCTCTCACTCAAACTCACTCAGGCTATGAACAAA
GTGAGTAGTAATACCGGGTTGCTTACCTTCTTCTGTTCTCGATTTCTTGTGTATCTTCAA
TCTTTTAAATGGTTTGTAATCTGTTTCCTAGTGCGAACAAATCCATAAACTTTTTGCCTC
TGTATTATTGAAAATGTTTTGTATTCCCAAAACAGCTGAGATGCTCAAAACAATGTATTT
GTTGATGAAATAATGTCTTTGACAGGG*ACGAGTTTTATTCGCCCTTCT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2CC94JQ 690 0 0
GGGGGCCCCTCTCACAACATCGCACGGATCCAAATCCAGATCATACCGAAGAAGAAGAAG
GAGACACGCACCATCCATCCATCCATCCATCTCCAGGAGGGAGCTTTGATTTGAATCTGA
ATTTTGATCAAAAAGATGGGTTTCCTGATAACAACCCTAATCTTCATGGTCGTGGGAATA
ATTGCTTCTCTGTGCGTTCGTATCTGCTTCGCTAGAGGTCCCTCCACAAATCTGCTTCAC
TTCACCTTGGTCATTACTGCCACGGTCTGCTGCTGGATGATGTGGGCGATTGTATACATT
GCACAGATGAATCCTCTGATTGTCCCAATCCTAAGCGAAACAGAGTAGCATCCTCTCACT
CAAACTCACTCAGGCTATGAACAAAGTGAGTAGTAATACCGGGTTGCTTACCTTCTTCTG
TTCTCGATTTCTTGTGTATCTTCAATCTTTTAAATGGTTTGTAATCTGTTTCCTAGTGCG
AACAAATCCATAAACTTTTTGCCTCTGTATTATTGAAAATGTTTTGTATTCCCAAAACAG
CTGAGATGCTCAAAACAATGTATTTGTTGATGAAATAATGTCTTTGACAGGG*ACGAGTT
TTATTCGCCCTTCTATCATACAGTAATGTTTTT*ATGTTGTTGCTATTAATAGTTTGCTG
TATATACAAAGCATTGCAATTTTAACGCAG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2CC94TF 694 0 0
GGGGGCCCCTCTCACAACATCGCACGGATCCAAATCCAGATCATACCGAAGAAGAAGAAG
GAGACACGCACCATCCATCCATCCATCCATCTCCAGGAGGGAGCTTTGATTTGAATCTGA
ATTTTGATCAAAAAGATGGGTTTCCTGATAACAACCCTAATCTTCATGGTCGTGGGAATA
ATTGCTTCTCTGTGCGTTCGTATCTGCTTCGCTAGAGGTCCCTCCACAAATCTGCTTCAC
TTCACCTTGGTCATTACTGCCACGGTCTGCTGCTGGATGATGTGGGCGATTGTATACATT
GCACAGATGAATCCTCTGATTGTCCCAATCCTAAGCGAAACAGAGTAGCATCCTCTCACT
CAAACTCACTCAGGCTATGAACAAAGTGAGTAGTAATACCGGGTTGCTTACCTTCTTCTG
TTCTCGATTTCTTGTGTATCTTCAATCTTTTAAATGGTTTGTAATCTGTTTCCTAGTGCG
AACAAATCCATAAACTTTTTGCCTCTGTATTATTGAAAATGTTTTGTATTCCCAAAACAG
CTGAGATGCTCAAAACAATGTATTTGTTGATGAAATAATGTCTTTGACAGGGGACGAGTT
TTATTCGCCCTTCTATCATACAGTAATGTTTTTTATGTTGTTGCTATTAATAGTTTGCTG
TATATACAAAGCATTGCAATTTTAACGCAGAAAA

QA 1 694 1 694
DS 



AS 2 5

CO CL1577Contig1 448 2 3 U
GGCAAGAGAAGCTTGAGAAGATAGCTAGACAGGGTCCGGGAGAACAAGCAGCAAGTGGAG
GAGCCAAGGCTAGTGGTGGTGGTGGAACATCATCAGCGGGATCAGCTGAATCAGGGCCAA
AAGTGTCAGAAGACAAGGACAGAAACTATGCGGTTGTGGCAGGTGTGGTGGCTGTTGTTG
GAGCCATTGGTTGGTACATGAAATCAGGTGGAAAGAAGCAGCAGCCAGAGGTTCAAGAGT
GAAAGAATGATAACGTAGCGGGTGAATAAAACAGAGAGTGGAATCTTTTCCTCTCTTATG
AGAAACTTTGGAATGGCTACTATATTTATTTTGGTTTTGGTTTCCAAATCTTTTCAACTT
TTTCGGTTTGTTGACATTTAGTTTTGGAACCTTAACTACATAAACTCTTCTGCTCTGATC
AAAATAAGTGAAAATTCTCAAGAGAACC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2B995JQ C 1
AF RR2B995TF U 1
BS 1 1 RR2B995JQ
BS 2 447 RR2B995TF
BS 448 448 RR2B995JQ

RD RR2B995JQ 448 0 0
GGCAAGAGAAGCTTGAGAAGATAGCTAGACAGGGTCCGGGAGAACAAGCAGCAAGTGGAG
GAGCCAAGGCTAGTGGTGGTGGTGGAACATCATCAGCGGGATCAGCTGAATCAGGGCCAA
AAGTGTCAGAAGACAAGGACAGAAACTATGCGGTTGTGGCAGGTGTGGTGGCTGTTGTTG
GAGCCATTGGTTGGTACATGAAATCAGGTGGAAAGAAGCAGCAGCCAGAGGTTCAAGAGT
GAAAGAATGATAACGTAGCGGGTGAATAAAACAGAGAGTGGAATCTTTTCCTCTCTTATG
AGAAACTTTGGAATGGCTACTATATTTATTTTGGTTTTGGTTTCCAAATCTTTTCAACTT
TTTCGGTTTGTTGACATTTAGTTTTGGAACCTTAACTACATAAACTCTTCTGCTCTGATC
AAAATAAGTGAAAATTCTCAAGAGAACC

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR2B995TF 448 0 0
G
GCAAGAGAAGCTTGAGAAGATAGCTAGACAGGGTCCGGGAGAACAAGCAGCAAGTGGAGG
AGCCAAGGCTAGTGGTGGTGGTGGAACATCATCAGCGGGATCAGCTGAATCAGGGCCAAA
AGTGTCAGAAGACAAGGACAGAAACTATGCGGTTGTGGCAGGTGTGGTGGCTGTTGTTGG
AGCCATTGGTTGGTACATGAAATCAGGTGGAAAGAAGCAGCAGCCAGAGGTTCAAGAGTG
AAAGAATGATAACGTAGCGGGTGAATAAAACAGAGAGTGGAATCTTTTCCTCTCTTATGA
GAAACTTTGGAATGGCTACTATATTTATTTTGGTTTTGGTTTCCAAATCTTTTCAACTTT
TTCGGTTTGTTGACATTTAGTTTTGGAACCTTAACTACATAAACTCTTCTGCTCTGATCA
AAATAAGTGAAAATTCTCAAGAGAAC
C

QA 2 447 2 447
DS 



CO CL1577Contig2 634 3 28 U
GGAAGCGGTTTTCATCAGCAGCAGCCAGACGCACTTTAACGATCTACC*ATCAACAAGGA
GGATACTTGTTCATTATTACCATGGCAACCAGAAGCGCTTTCAGATTAGTGTCTCGCATG
TTTTCTAACGGAAAAGTTCTTAGCGAAGAGGAGAAAGCTGCTGAGAATGTTTTCATCAAG
AAAATGGAGCAAGAGAAGCTTGAGAAGATAGCTAGACAGGGTCCGGGAGAACAAGCAGCA
AGTGGAGGAGCCAAGGCTAGCAGTGGTGGTGGGGGAACATCATCAGCTGAATCAGGGCCA
AAAGTGTCAGAAGACAAGGACAGAAACTATGCGGTTGTGGCAGGTGTGGTGGCTGTTGTT
GGAGCCATTTGTTGGTACATGAAATCAGGTGGAAAGAAGCAGCAGCCAGAGGTTCAAGAG
TGAAGAATGATAACGTAGCGGGTGAATAAAACAGAGAGTGGAATCTTTTCCTC**TTATG
AGAAACTTTGGAATGGCTACTATATTTTATTTTGGTTTTGGTTTCCAAATCTTTTCAACT
TTTTCGGTTTGTTGACATTTAGTTTTGGAACCTTAACTACATAAACTCTTCTGCTCTGAT
CAAAATAAGTGAAAATTCTCAAGAGAACACAACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN06TF U 25
AF RR2ED72JQ C 1
AF RR2ED72TF U 1
BS 1 26 RR2ED72TF
BS 27 48 RR2EN06TF
BS 49 49 RR2ED72TF
BS 50 55 RR2EN06TF
BS 56 56 RR2ED72TF
BS 57 118 RR2EN06TF
BS 119 119 RR2ED72TF
BS 120 194 RR2EN06TF
BS 195 195 RR2ED72TF
BS 196 260 RR2EN06TF
BS 261 261 RR2ED72TF
BS 262 272 RR2EN06TF
BS 273 273 RR2ED72TF
BS 274 350 RR2EN06TF
BS 351 351 RR2ED72TF
BS 352 369 RR2EN06TF
BS 370 370 RR2ED72TF
BS 371 459 RR2EN06TF
BS 460 460 RR2ED72TF
BS 461 473 RR2EN06TF
BS 474 475 RR2ED72TF
BS 476 507 RR2EN06TF
BS 508 508 RR2ED72TF
BS 509 543 RR2EN06TF
BS 544 544 RR2ED72TF
BS 545 578 RR2EN06TF
BS 579 628 RR2ED72TF
BS 629 634 RR2ED72JQ

RD RR2EN06TF 554 0 0
GG
AGACGCACTTTAACGATCTACCCATCAACGAGGAGGATACTTGTTCATTATTACCATGGC
AACCAGAAGCGCTTTCAGATTAGTGTCTCGCAGGTTTTCTAACGGAAAAGTTCTTAGCGA
AGAGGAGAAAGCTGCTGAGAATGTTTTCATCAAGAAAATGGAGCAAGAAAAGCTTGAGAA
GATAGCTAGACAGGGTCCGGGAGAACAAGCAGCAAGTGGAGGAGCCAAGGCTAGTAGTGG
TGGTGGTGGAACATCATCAGCTGAATCAGGGCCAAAAGTGTCAGAAGACAAGGACAGAAA
CTATGCGGTTGTGGCAGGTGTGGTCGCTGTTGTTGGAGCCATTGGTTGGTACATGAAATC
AGGTGGAAAGAAGCAGCAGCCAGAGGTTCAAGAGTGAAGAATGATAACGTAGCGGGTGAA
TAAAACAGAGAGTAGAATCTTTTCCTCTCTTATGAGAAACTTTGGAATGGCTACTATATT
T*ATTTTGGTTTTGGTTTCCAAATCTTTTCAACTTTTCCGGTTTGTTGACATTTAGTTTT
GGAACCTTAACT

QA 3 554 3 554
DS 

RD RR2ED72JQ 634 0 0
GGAAGCGGTTTTCATCAGCAGCAGCCAGACGCACTTTAACGATCTACC*ATCAACAAGGA
GGATACTTGTTCATTATTACCATGGCAACCAGAAGCGCTTTCAGATTAGTGTCTCGCATG
TTTTCTAACGGAAAAGTTCTTAGCGAAGAGGAGAAAGCTGCTGAGAATGTTTTCATCAAG
AAAATGGAGCAAGAGAAGCTTGAGAAGATAGCTAGACAGGGTCCGGGAGAACAAGCAGCA
AGTGGAGGAGCCAAGGCTAGCAGTGGTGGTGGGGGAACATCATCAGCTGAATCAGGGCCA
AAAGTGTCAGAAGACAAGGACAGAAACTATGCGGTTGTGGCAGGTGTGGTGGCTGTTGTT
GGAGCCATTTGTTGGTACATGAAATCAGGTGGAAAGAAGCAGCAGCCAGAGGTTCAAGAG
TGAAGAATGATAACGTAGCGGGTGAATAAAACAGAGAGTGGAATCTTTTCCTC**TTATG
AGAAACTTTGGAATGGCTACTATATTTTATTTTGGTTTTGGTTTCCAAATCTTTTCAACT
TTTTCGGTTTGTTGACATTTAGTTTTGGAACCTTAACTACATAAACTCTTCTGCTCTGAT
CAAAATAAGTGAAAATTCTCAAGAGAACACAACG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2ED72TF 634 0 0
GGAAGCGGTTTTCATCAGCAGCAGCCAGACGCACTTTAACGATCTACC*ATCAACAAGGA
GGATACTTGTTCATTATTACCATGGCAACCAGAAGCGCTTTCAGATTAGTGTCTCGCATG
TTTTCTAACGGAAAAGTTCTTAGCGAAGAGGAGAAAGCTGCTGAGAATGTTTTCATCAAG
AAAATGGAGCAAGAGAAGCTTGAGAAGATAGCTAGACAGGGTCCGGGAGAACAAGCAGCA
AGTGGAGGAGCCAAGGCTAGCAGTGGTGGTGGGGGAACATCATCAGCTGAATCAGGGCCA
AAAGTGTCAGAAGACAAGGACAGAAACTATGCGGTTGTGGCAGGTGTGGTGGCTGTTGTT
GGAGCCATTTGTTGGTACATGAAATCAGGTGGAAAGAAGCAGCAGCCAGAGGTTCAAGAG
TGAAGAATGATAACGTAGCGGGTGAATAAAACAGAGAGTGGAATCTTTTCCTC**TTATG
AGAAACTTTGGAATGGCTACTATATTTTATTTTGGTTTTGGTTTCCAAATCTTTTCAACT
TTTTCGGTTTGTTGACATTTAGTTTTGGAACCTTAACTACATAAACTCTTCTGCTCTGAT
CAAAATAAGTGAAAATTCTCAAGAGAAC
ACAACG

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 4

CO CL1578Contig1 1026 4 8 U
GGGAGCGACAACAAACTCACACTTAACCAAACAAAGACAAGACGATGGCTTCGTTTCACT
TCCCTTTCTCGTTTTCTCAGCCCTCTGTCCCTAAACCACCGCGTCCCACGTCATCATCAT
CATCATCCAGACTCTCCGTTTCCGCAGTCGCCGTGACCGTGACCGTTGGCGGAGTAGCTG
CGATCGCGGCGTCGCGGAATCCGTGGGTGTTGTTCTCATCTCAGCGTTCGTCTCTGTTAC
TACCATGGGGATCTATAGCTCTAGCCAGTTCTAGCTCCGAATCCAACGTTGTTGTTGAGC
CTAAGACCGGTTTCTCCTTCCCGGCTACAATCGGAGGTTCGAGGAGATTACTAGGCGTGG
GGTTGAGGAAGAAGAGCCTACTTGGATTGAAGAACATCGATGTCTACGCATTCGGCATGT
ATGCTGACTGTGATGATGTCAAGAAACTTGTTGGTGAGAAATACGCGAATCTTCCGGCTT
CTGAGCTCAGGGGAAACAAGGCATTCGTCGATGATCTCATGGATGCCGATGTAAAGATGA
CTATTAGGCTACAGATTGTTTACGGCAAACTCAACATCCGTTCCGTTCGCACTGCTTTCA
AAGATTCTGTCGGTAACAGACTCAAGAAGTTTGGTGGCTTATCAGACAACGATGACTTGC
TCCAAAGCTTCGTTAGCCTCTTCAAAGACGAGTATAAGATTCCAAGAAATTCCACTATTG
ATATGACACGAGAACCAGGGCATGTACTCAATGTAGCAATTGAGGGAAACCAAGTTGGGA
GTGTGAAGAGCAAACTCTTGTGTAGGTCAATCTTAGACCTGTACATTGGTGAAGAACCGT
TTGATAAGAATGCAAGAGAGGATTTTCTAGACAATGTGGCTTCTATAGCCGCTGTTGACG
ACAAGTAGTACCAGCTCATGAGATTCAGAAGAAAACATGATAAAACAAAACCAAGTGTGG
TTTTTGCTATCGTATTCTCTATAACATAATACTGTTGAGGTATTTTTAATGAAACAAATT
GCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 

AF RR2GI39TF U 23
AF RR2GV50TF U 1
AF RR2GV50JQB C 404
AF RR2GI39JQB C 520
BS 1 57 RR2GV50TF
BS 58 58 RR2GI39TF
BS 59 160 RR2GV50TF
BS 161 161 RR2GI39TF
BS 162 559 RR2GV50TF
BS 560 560 RR2GV50JQB
BS 561 765 RR2GV50TF
BS 766 1026 RR2GV50JQB

RD RR2GI39TF 521 0 0
GG
AACCAAACAAAGACAAGACGATGGCTTCGTTTCACTTCCCTTTCTCGTTTTCTCAGCCCT
CTGTCCCTAAACCACCGCGTCCCACGTCATCATCATCATCATCCAGACTCTCCGTTTCCG
CAGTCGCCGTGACCGTGACCGTTGGCGGAGTAGCTGCGATCGCGGCGTCGCGGAATCCGT
GGGTGTTGTTCTCATCTCAGCGTTCGTCTCTGTTACTACCATGGGGATCTATAGCTCTAG
CCAGTTCTAGCTCCGAATCCAACGTTGTTGTTGAGCCTAAGACCGGTTTCTCCTTCCCGG
CTACAATCGG*GGTTCGAGGAGATTACTAGGCGTGGGGTTGAGGAAGAAGAGCCTACTTG
GATTGAAGAACATCGATGTCTACGCATTCGGCATGTATGCTGACTGTGATGATGTCAAGA
AACTTGTTGGTGAGAAATACGCGAATCTTCCGGCTTCTGAGCTCAGGGGAAACAAAGCAT
TCGTCGATGATCTCATGGATGCCGATGTAAAGATGACTA

QA 3 521 3 521
DS 

RD RR2GV50TF 776 0 0
GGGAGCGACAACAAACTCACACTTAACCAAACAAAGACAAGACGATGGCTTCGTTTCGCT
TCCCTTTCTCGTTTTCTCAGCCCTCTGTCCCTAAACCACCGCGTCCCACGTCATCATCAT
CATCATCCAGACTCTCCGTTTCCGCAGTCGCCGTGACCGTTACCGTTGGCGGAGTAGCTG
CGATCGCGGCGTCGCGGAATCCGTGGGTGTTGTTCTCATCTCAGCGTTCGTCTCTGTTAC
TACCATGGGGATCTATAGCTCTAGCCAGTTCTAGCTCCGAATCCAACGTTGTTGTTGAGC
CTAAGACCGGTTTCTCCTTCCCGGCTACAATCGGAGGTTCGAGGAGATTACTAGGCGTGG
GGTTGAGGAAGAAGAGCCTACTTGGATTGAAGAACATCGATGTCTACGCATTCGGCATGT
ATGCTGACTGTGATGATGTCAAGAAACTTGTTGGTGAGAAATACGCGAATCTTCCGGCTT
CTGAGCTCAGGGGAAACAAGGCATTCGTCGATGATCTCATGGATGCCGATGTAAAGATGA
CTATTAGGCTACAGATTGTCTACGGCAAACTCAACATCCGTTCCGTTCGCACTGCTTTCA
AAGATTCTGTCGGTAACAGACTCAAGAAGTTTGGTGGCTTATCAGACAACGATGACTTGC
TCCAAAGCTTCGTTAGCCTCTTCAAAGACGAGTATAAGATTCCAAGAAATTCCACTATTG
ATATGACACGAGAACCAGGGCATGTACTCAATGTAGCAATTGAGG
AAACAAGTTGG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2GV50JQB 623 0 0
CTACGCATTCGGCATGTATGCTGACTGTGATGATGTCAAGAAACTTGTTGGTGAGAAATA
CGCGAATCTTCCGGCTTCTGAGCTCAGGGGAAACAAGGCATTCGTCGATGATCTCATGGA
TGCCGATGTAAAGATGACTATTAGGCTACAGATTGTTTACGGCAAACTCAACATCCGTTC
CGTTCGCACTGCTTTCAAAGATTCTGTCGGTAACAGACTCAAGAAGTTTGGTGGCTTATC
AGACAACGATGACTTGCTCCAAAGCTTCGTTAGCCTCTTCAAAGACGAGTATAAGATTCC
AAGAAATTCCACTATTGATATGACACGAGAACCAGGGCATGTACTCAATGTAGCAATTGA
GGGAAACCAAGTTGGGAGTGTGAAGAGCAAACTCTTGTGTAGGTCAATCTTAGACCTGTA
CATTGGTGAAGAACCGTTTGATAAGAATGCAAGAGAGGATTTTCTAGACAATGTGGCTTC
TATAGCCGCTGTTGACGACAAGTAGTACCAGCTCATGAGATTCAGAAGAAAACATGATAA
AACAAAACCAAGTGTGGTTTTTGCTATCGTATTCTCTATAACATAATACTGTTGAGGTAT
TTTTAATGAAACAAATTGCTACC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2GI39JQB 507 0 0
TGGATGCCGATGTAAAGATGACTATTAGGCTACAGATTGTTTACGGCAAACTCAACATCC
GTTCCGTTCGCACTGCTTTCAAAGATTCTGTCGGTAACAGACTCAAGAAGTTTGGTGGCT
TATCAGACAACGATGACTTGCTCCAAAGCTTCGTTAGCCTCTTCAAAGACGAGTATAAGA
TTCCAAGAAATTCCACTATTGATATGACACGAGAACCAGGGCATGTACTCAATGTAGCAA
TTGAGGGAAACCAAGTTGGGAGTGTGAAGAGCAAACTCTTGTGTAGGTCAATCTTAGACC
TGTACATTGGTGAAGAACCGTTTGATAAGAATGCAAGAGAGGATTTTCTAGACAATGTGG
CTTCTATAGCCGCTGTTGACGACAAGTAGTACCAGCTCATGAGATTCAGAAGAAAACATG
ATAAAACAAAACCGAGTGTGGTTTTTGCTATCGTATTCTCTATAATATAATACTGTTGAG
GTATTTTTAATGAAACAAATTGCTACC

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 5

CO CL1579Contig1 726 5 2 U
GGAAAAGATGGGATGTCTTGATCCGTGAATCACCTTTGCGTCCGCCAAATTTAAGTTCGA
TTCAGGACTTGCAAGAGGACCTGGTACGGATTAGAGAATATAGGGTTTTCTACGAGGTTC
TTGATGTCAAAACCTTTGCAGGGGACTTGTCTGACACACTTGACGAGCTGGAATCTTTTA
ACACCCTGATGCAAGGGATAATTGTTACAAGCTCTCTGAACCCCACGTACCTTAATGCTC
GCAACTTTAGAGAAATGTTAAACTCTGGTAGACAAAGGTATGACCAGCTTCTGCAAGCCA
TTACTCCTATGGGAATGCATAGTGAAGGTAATCTGCCTGACCCTCGTCGACTTCGGGCAT
CCACAGCTGATATGTGGAGGCAGTTAGTGAAGAGGTGTCAGAGTGCTAGAACCGTTATGA
ATTTGAAGATTAATAGCAAATATGTTCCCACAGCTGAAGAATACTGGATGCTAGTTGACC
TGTACAATGAAGTGCCGGACTGGAGGAAACAAGATAAATGACTCAGAATGTTCGTCTGTT
TTAACCAATGTTCTTTTCTAGCTCCCCTCTGTATTGCAAAAACTGCCTCTAGTTTTGCTT
CTTGTTTGGTTGGAATTGGACTTGTCTCCCTTTTTTGTTTGTTGAAGTCTTATCCTTAAA
TTACGATTATTACGATGATATCATTCATACTTGATCGGTTAACATAAAAATTGAACTGCG
TTTTAT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT51JQ C 1
AF RR2AZ58JQ C 1
AF RR2AT51TF U 1
AF RR2AZ58TFB U 1
AF RR2FF62TF U 342
BS 1 659 RR2AT51TF
BS 660 726 RR2FF62TF

RD RR2AT51JQ 659 0 0
GGAAAAGATGGGATGTCTTGATCCGTGAATCACCTTTGCGTCCGCCAAATTTAAGTTCGA
TTCAGGACTTGCAAGAGGACCTGGTACGGATTAGAGAATATAGGGTTTTCTACGAGGTTC
TTGATGTCAAAACCTTTGCAGGGGACTTGTCTGACACACTTGACGAGCTGGAATCTTTTA
ACACCCTGATGCAAGGGATAATTGTTACAAGCTCTCTGAACCCCACGTACCTTAATGCTC
GCAACTTTAGAGAAATGTTAAACTCTGGTAGACAAAGGTATGACCAGCTTCTGCAAGCCA
TTACTCCTATGGGAATGCATAGTGAAGGTAATCTGCCTGACCCTCGTCGACTTCGGGCAT
CCACAGCTGATATGTGGAGGCAGTTAGTGAAGAGGTGTCAGAGTGCTAGAACCGTTATGA
ATTTGAAGATTAATAGCAAATATGTTCCCACAGCTGAAGAATACTGGATGCTAGTTGACC
TGTACAATGAAGTGCCGGACTGGAGGAAACAAGATAAATGACTCAGAATGTTCGTCTGTT
TTAACCAATGTTCTTTTCTAGCTCCCCTCTGTATTGCAAAAACTGCCTCTAGTTTTGCTT
CTTGTTTGGTTGGAATTGGACTTGTCTCCCTTTTTTGTTTGTTGAAGTCTTATCCTTAA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2AZ58JQ 629 0 0
GGAAAAGATGGGATGTCTTGATCCGTGAATCACCTTTGCGTCCGCCAAATTTAAGTTCGA
TTCAGGACTTGCAAGAGGACCTGGTACGGATTAGAGAATATAGGGTTTTCTACGAGGTTC
TTGATGTCAAAACCTTTGCAGGGGACTTGTCTGACACACTTGACGAGCTGGAATCTTTTA
ACACCCTGATGCAAGGGATAATTGTTACAAGCTCTCTGAACCCCACGTACCTTAATGCTC
GCAACTTTAGAGAAATGTTAAACTCTGGTAGACAAAGGTATGACCAGCTTCTGCAAGCCA
TTACTCCTATGGGAATGCATAGTGAAGGTAATCTGCCTGACCCTCGTCGACTTCGGGCAT
CCACAGCTGATATGTGGAGGCAGTTAGTGAAGAGGTGTCAGAGTGCTAGAACCGTTATGA
ATTTGAAGATTAATAGCAAATATGTTCCCACAGCTGAAGAATACTGGATGCTAGTTGACC
TGTACAATGAAGTGCCGGACTGGAGGAAACAAGATAAATGACTCAGAATGTTCGTCTGTT
TTAACCAATGTTCTTTTCTAGCTCCCCTCTGTATTGCAAAAACTGCCTCTAGTTTTGCTT
CTTGTTTGGTTGGAATTGGACTTGTCTCC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2AT51TF 659 0 0
GGAAAAGATGGGATGTCTTGATCCGTGAATCACCTTTGCGTCCGCCAAATTTAAGTTCGA
TTCAGGACTTGCAAGAGGACCTGGTACGGATTAGAGAATATAGGGTTTTCTACGAGGTTC
TTGATGTCAAAACCTTTGCAGGGGACTTGTCTGACACACTTGACGAGCTGGAATCTTTTA
ACACCCTGATGCAAGGGATAATTGTTACAAGCTCTCTGAACCCCACGTACCTTAATGCTC
GCAACTTTAGAGAAATGTTAAACTCTGGTAGACAAAGGTATGACCAGCTTCTGCAAGCCA
TTACTCCTATGGGAATGCATAGTGAAGGTAATCTGCCTGACCCTCGTCGACTTCGGGCAT
CCACAGCTGATATGTGGAGGCAGTTAGTGAAGAGGTGTCAGAGTGCTAGAACCGTTATGA
ATTTGAAGATTAATAGCAAATATGTTCCCACAGCTGAAGAATACTGGATGCTAGTTGACC
TGTACAATGAAGTGCCGGACTGGAGGAAACAAGATAAATGACTCAGAATGTTCGTCTGTT
TTAACCAATGTTCTTTTCTAGCTCCCCTCTGTATTGCAAAAACTGCCTCTAGTTTTGCTT
CTTGTTTGGTTGGAATTGGACTTGTCTCCCTTTTTTGTTTGTTGAAGTCTTATCCTTAA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2AZ58TFB 659 0 0
GGAAAAGATGGGATGTCTTGATCCGTGAATCACCTTTGCGTCCGCCAAATTTAAGTTCGA
TTCAGGACTTGCAAGAGGACCTGGTACGGATTAGAGAATATAGGGTTTTCTACGAGGTTC
TTGATGTCAAAACCTTTGCAGGGGACTTGTCTGACACACTTGACGAGCTGGAATCTTTTA
ACACCCTGATGCAAGGGATAATTGTTACAAGCTCTCTGAACCCCACGTACCTTAATGCTC
GCAACTTTAGAGAAATGTTAAACTCTGGTAGACAAAGGTATGACCAGCTTCTGCAAGCCA
TTACTCCTATGGGAATGCATAGTGAAGGTAATCTGCCTGACCCTCGTCGACTTCGGGCAT
CCACAGCTGATATGTGGAGGCAGTTAGTGAAGAGGTGTCAGAGTGCTAGAACCGTTATGA
ATTTGAAGATTAATAGCAAATATGTTCCCACAGCTGAAGAATACTGGATGCTAGTTGACC
TGTACAATGAAGTGCCGGACTGGAGGAAACAAGATAAATGACTCAGAATGTTCGTCTGTT
TTAACCAATGTTCTTTTCTAGCTCCCCTCTGTATTGCAAAAACTGCCTCTAGTTTTGCTT
CTTGTTTGGTTGGAATTGGACTTGTCTCCCTTTTTTGTTTGTTGAAGTCTTATCCTTAA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2FF62TF 385 0 0
CCTCGTCGACTTCGGGCATCCACAGCTGATATGTGGAGGCAGTTAGTGAAGAGGTGTCAG
AGTGCTAGAACCGTTATGAATTTGAAGATTAATAGCAAATATGTTCCCACAGCTGAAGAA
TACTGGATGCTAGTTGACCTGTACAATGAAGTGCCGGACTGGAGGAAACAAGATAAATGA
CTCAGAATGTTCGTCTGTTTTAACCAATGTTCTTTTCTAGCTCCCCTCTGTATTGCAAAA
ACTGCCTCTAGTTTTGCTTCTTGTTTGGTTGGAATTGGACTTGTCTCCCTTTTTTGTTTG
TTGAAGTCTTATCCTTAAATTACGATTATTACGATGATATCATTCATACTTGATCGGTTA
ACATAAAAATTGAACTGCGTTTTAT

QA 1 385 1 385
DS 



AS 1 5

CO CL1580Contig1 643 5 28 U
GGAAAAACTAAAACCCTAGCTGCTTCCTCCTCTCACCTCTTCTCTTATAACTCTGCGGCG
AAAGATGACGGTTGAAGGAGTGAACCCTAAGGCGTACCCGTTGGCCGATTCTCAGCTAGC
CATAACAATCCTCGATCTTGTTCAACAAGCTACCAACTACAAACAGCTCAAGAAAGGAGC
TAATGAAGCTACCAAGACTTTGAACCGTGGTATCTCTGAGTTCGTGGTTATGGCTGCTGA
TGCTGAGCCTCTCGAGATCCTTCTTCATCTTCCTTTACTGGCTGAAGACAAGAATGTGCC
GTATGTGTTTGTGCCATCGAAGCAAGCCCTTGGAAGAGCATGTGGTGTGACAAGACCCGT
GATTGCTTGCTCTGTTACATCAAACGATGCTAGCCAGTTGAAATCTCAGATTCAGCAGCT
AAAGGATGCTATTGAGAAACTCCTCATCTAAGGATGTGTTAGGTGGAGTTATGAATGATG
GGTCTTTCTCCATTTAATGGAAAAGGCTTTGACTACTGAAGCGAGTTTGTGAGAGTTTTA
GCCGTATCTGTTTTTGAAGTTTGTAATGCTTTTTATTTCATGTTTGTGTTGGTGCAAATC
TAGTCTTGAACAAGAACAATTATTTATAAATCGGGTTTCTAGG


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ24TF U 1
AF RR2DQ24JQ C 1
AF RR2GD19TF U 2
AF RR2GM48JQ C 206
AF RR2GM48TF U 206
BS 1 3 RR2DQ24JQ
BS 4 212 RR2DQ24TF
BS 213 213 RR2GD19TF
BS 214 225 RR2DQ24TF
BS 226 226 RR2GD19TF
BS 227 240 RR2DQ24TF
BS 241 241 RR2GD19TF
BS 242 330 RR2DQ24TF
BS 331 331 RR2GD19TF
BS 332 387 RR2DQ24TF
BS 388 388 RR2GD19TF
BS 389 420 RR2DQ24TF
BS 421 421 RR2GD19TF
BS 422 438 RR2DQ24TF
BS 439 439 RR2GD19TF
BS 440 460 RR2DQ24TF
BS 461 461 RR2GD19TF
BS 462 463 RR2DQ24TF
BS 464 464 RR2GD19TF
BS 465 470 RR2DQ24TF
BS 471 471 RR2GD19TF
BS 472 490 RR2DQ24TF
BS 491 521 RR2GD19TF
BS 522 522 RR2GM48TF
BS 523 612 RR2GD19TF
BS 613 613 RR2GM48TF
BS 614 637 RR2GD19TF
BS 638 643 RR2GM48JQ

RD RR2DQ24TF 490 0 0
GGA
AAAACTAAAACCCTAGCTGCTTCCTCCTCTCACCTCTTCTCTTATAACTCTGCGGCGAAA
GATGACGGTTGAAGGAGTGAACCCTAAGGCGTACCCGTTGGCCGATTCTCAGCTAGCCAT
AACAATCCTCGATCTTGTTCAACAAGCTACCAACTACAAACAGCTCAAGAAAGGAGCTAA
TGAAGCTACCAAGACTTTGAACCGTGGTACCTCTGAGTTCGTTGTTATGGCTGCTGACGC
TGAGCCTCTCGAGATCCTTCTTCATCTTCCTTTACTGGCTGAAGACAAGAATGTGCCGTA
TGTGTTTGTGCCATCGAAGCAAGCCCTCGGAAGAGCATGTGGTGTGACAAGACCCGTGAT
TGCTTGCTCTGTTACATCAAACGACGCTAGCCAGTTGAAATCTCAGATTCAGCAGCTTAA
GGATGCTATTGAGAAGCTCCTCATCTAAGGATGTGTT*GGCGGAGTTCTGAATGATGGGT
CTTTCTC

QA 4 490 4 490
DS 

RD RR2DQ24JQ 640 0 0
GGAAAAACTAAAACCCTAGCTGCTTCCTCCTCTCACCTCTTCTCTTATAACTCTGCGGCG
AAAGATGACGGTTGAAGGAGTGAACCCTAAGGCGTACCCGTTGGCCGATTCTCAGCTAGC
CATAACAATCCTCGATCTTGTTCAACAAGCTACCAACTACAAACAGCTCAAGAAAGGAGC
TAATGAAGCTACCAAGACTTTGAACCGTGGTACCTCTGAGTTCGTTGTTATGGCTGCTGA
CGCTGAGCCTCTCGAGATCCTTCTTCATCTTCCTTTACTGGCTGAAGACAAGAATGTGCC
GTATGTGTTTGTGCCATCGAAGCAAGCCCTCGGAAGAGCATGTGGTGTGACAAGACCCGT
GATTGCTTGCTCTGTTACATCAAACGACGCTAGCCAGTTGAAATTTCAGATTCAGCAGCT
TAAGGATGCTATTGAGAAGCTCCTCATCTAAGGATGTGTT*GGCGGAGTTCTGAATGATG
GGTCTTTCTCCATTTAATGGAAAAGGCTTTGACTACTAAAGTGAGTTTGTGAGAGTTTTA
GCCGTATCTGTTTTTGAAGTTTGTAATGCTTTTTATTTCATGTTTGTGTTGGTGCAAATC
TAGTCTTGAACAAGAACAATTATTTATAAATCGGGTT
TCC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2GD19TF 636 0 0
GG
AAAACTAAAACCCTAGCTGCTTCCTCCTCTCAACTCTTCTCTTAGAACTCTGCGGCGAAA
GATGACGGTTGAAGGAGTGAACCCTAAGGCGTACCCATTGGCCGATTCTCAGCTAGCCAT
AACAATCCTCGATCTTGTTCAACAAGCTACCAACTACAAACAGCTCAAGAAAGGAGCTAA
TGAAGCTACCAAGACTTTGAACCGTGGTATCTCTGAGTTCGTGGTTATGGCTGCTGATGC
TGAGCCTCTCGAGATCCTTCTTCATCTTCCTTTACTGGCTGAAGACAAGAATGTGCCGTA
TGTGTTTGTGCCATCGAAGCAAGCCCTTGGAAGAGCATGTGGTGTGACAAGACCCGTGAT
TGCTTGCTCTGTTACATCAAACGATGCTAGCCAGTTGAAATCTCAGATTCAGCAGCTAAA
GGATGCTATTGAGAAACTCCTCATCTAAGGATGTGTTAGGTGGAGTTATGAATGATGGGT
CTTTCTCCATTTAATGGAAAAGGCTTTGACTACTGAAGTGAGTTTGTGAGAGTTTTAGCC
GTATCTGTTTTTGAAGTTTGTAATGCTTTTTATTTCATGTTTGTGTTGGTGCAAATCTAG
TCTTGAACATGAACAATTATTTATAAATCGGGTT

QA 3 636 3 636
DS 

RD RR2GM48JQ 438 0 0
G
GTGGTATCTCTGAGTTCGTGGTTATGGCTGCTGATGCTGAGCCTCTCGAGATCCTTCTTC
ATCTTCCTTTACTGGCTGAAGACAAGAATGTGCCGTATGTGTTTGTGCCATCGAAGCAAG
CCCTTGGAAGAGCATGTGGTGTGACAAGACCCGTGATTGCTTGCTCTGTTACATCAAACG
ATGCTAGCCAGTTGAAATTTCAGATTCATCAGCTAAAGGATGCTATTGAGAAACTCCTCA
TCTAAGGATGTGTTAGGTGGAGTTATGAATGATGGGTCTTTCTCCATTTAATGGAAAAGG
CTTTGACTACTGAAGCGAGTTTGTGAGAGTTTTAGCCGTATCTGTTTTTGAAGTTTGTAA
TGCTTTTTATTTCATGTTTGTGTTGGTGCAAATCTAGTCTTGAACAAGAACAATTATTTA
TAAATCGGGTTTCTAGG

QA 2 438 2 438
DS 

RD RR2GM48TF 438 0 0
G
GTGGTATCTCTGAGTTCGTGGTTATGGCTGCTGATGCTGAGCCTCTCGAGATCCTTCTTC
ATCTTCCTTTACTGGCTGAAGACAAGAATGTGCCGTATGTGTTTGTGCCATCGAAGCAAG
CCCTTGGAAGAGCATGTGGTGTGACAAGACCCGTGATTGCTTGCTCTGTTACATCAAACG
ATGCTAGCCAGTTGAAATCTCAGATTCATCAGCTAAAGGATGCTATTGAGAAACTCCTCA
TCTAAGGATGTGTTAGGTGGAGTTATGAATGATGGGTCTTTCTCCATTTAATGGAAAAGG
CTTTGACTACTGAAGCGAGTTTGTGAGAGTTTTAGCCGTATCTGTTTTTGAAGTTTGTAA
TGCTTTTTATTTCATGTTTGTGTTGGTGCAAATCTAGTCTTGAACAAGAACAATTATTTA
TAAATCGGGTT
TCTAGG

QA 2 432 2 432
DS 



AS 1 5

CO CL1581Contig1 1086 5 9 U
GGTCCAAAAGAGTTGAATCATTAGATAGACTCAAGAAAAAAAAAGAACTACAAGTCTTAA
AAGAAAAGAAAATCCAATGCAACTCAAAGTTGCAAACGAGAAGAAAAACTGGTTAAATAA
GTCCTAAAAATTTCAAAGCGCATAGTCTAATAAAAGGCAAAAGAAACATTGTCTTTTTCT
TTGGGTAATAACTCATTTCACTCCGTTGAGGAGGGAGCAAACTGATCATCAACGGAAGAA
ACAGCTGTCGGATTAGCAGAGAGCCTGAGTACATCCAGAGCCATAGCCACTTTAGCCTTG
AGCGCTTCAGGTGACTCAAGAAGGTGCAAGATCTCAGCTTGGTCCATCTCCAGCAACATC
CCTGTAACTTTGGCCACATGAACTGGCTCCTGCTTTTCCACAAGTGGGTAAAGCTGCTCT
CCAAGAATCTGCGAGTGATTGGCAGGGCTAGCCAATGCCAAGGCAGAAGTGAGCTTAGAA
ATGGGGAGGAGAGCTGGCCTCTGTTGGTTTTGAGAACCATTGTGAGAGATCGCAGATGCA
TCCAATGGTATGATGCCTTGTGGAGCAGATGCTCCTTCCACACGATTCATCATATTACCA
ACACCTCCCATGTATCTTCCATTGTGCTGCATAATTTGTTGCTGCTGCTGGAAGTGGTGC
TGCATGTTAGGAGCCCCACGCCTGAACCCAACACGGGGACCAGGATGGTTTTGTCTCTGA
AGAGGGTAAGGAATCATGTAGTTAGCCGGGCCAGAACCCGGACGCACACCAGGCATGAAC
TGAAGTTGGTACCCGTACCCCATAGGCTGTGAAGGCACCATACCTTGACCGTTCTGGCCC
ATGTACATCTGACGGTGTGGCCCTCCAGCTGGCCCTCCTGTTGGGTGATGATGGAACCCA
CCCATTGGTACATTTGGTCTCATAGAAAACACAGTCTGAAGATGAGTCCTCCTCTCTTCC
TTGCGTTGAGCAAACGCAATGTAAAGAGGTTTCCTTCCTATCATCTTCCCATTCATTTCA
TTCAAAGCTCTTAAAGCTTCTCCAGGAGTGGAGTAAGCAACAAAACCAAACCCTCTGCTC
AAACCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 5 15 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 5 
35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM67JQ U 1
AF RR2B312JQ U 1
AF RR2B312TF C 1
AF RR2FE88JQ U 1
AF RR2FE88TF C 258
BS 1 299 RR2B312JQ
BS 300 300 RR2DM67JQ
BS 301 302 RR2B312JQ
BS 303 303 RR2DM67JQ
BS 304 572 RR2B312JQ
BS 573 575 RR2FE88JQ
BS 576 645 RR2B312JQ
BS 646 726 RR2FE88JQ
BS 727 1086 RR2FE88TF

RD RR2DM67JQ 533 0 0
GGTCCAAAAGAGTTGAATCATTAGATAGACTCAAGAAAAAAAGA*AACTACAAGTCTTAA
AA***AAGAACATCCAATGCAACTAAAAGTTGCAAACGAGAAGAAAAACTGGTTAAATAA
GTCCTAAAAATTTCAAAGCGCATAGTCTAATAAAAGGCAAAAGAAACATTGTCTTTTTCT
TTGGGTAATAACTCATTTCACTCCGTTGAGGAGGGAGCAAACTGATCATCAACGGAAGAA
ACAGCTGTCGGATTAGCAGAGAGCCTGAGTACATCCAGAGCCATAGCCACTTTAGCCTTG
AGCGCTTCAGGTGACTCAAGAAGGTGCAAGATCTCAGCTTGGTCCATCTCCAGCAACATC
CCTGTAACTTTGGCCACATGAACTGGCTCCTGCTTTTCCACAAGTGGGTAAAGCTGCTCT
CCAAGAATCTGCGAGTGATTGGCAGGGCTAGCCAATGCCAAGGCAGAAGTGAGCTTAGAA
ATGGGGAGGAGAGCTGGCCTCTGTTGGTTTTGAGAACCATTGTGAGAGATCGC

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2B312JQ 646 0 0
GGTCCAAAAGAGTTGAATCATTAGATAGACTCAAGAAAAAAAAAGAACTACAAGTCTTAA
AAGAAAAGAAAATCCAATGCAACTCAAAGTTGCAAACGAGAAGAAAAACTGGTTAAATAA
GTCCTAAAAATTTCAAAGCGCATAGTCTAATAAAAGGCAAAAGAAACATTGTCTTTTTCT
TTGGGTAATAACTCATTTCACTCCGTTGAGGAGGGAGCAAACTGATCATCAACGGAAGAA
ACAGCTGTCGGATTAGCAGAGAGCCTGAGTACATCCAGAGCCATAGCCACTTTAGCCTTA
AGAGCTTCAGGTGACTCAAGAAGGTGCAAGATCTCAGCTTGGTCCATCTCCAGCAACATC
CCTGTAACTTTGGCCACATGAACTGGCTCCTGCTTTTCCACAAGTGGGTAAAGCTGCTCT
CCAAGAATCTGCGAGTGATTGGCAGGGCTAGCCAATGCCAAGGCAGAAGTGAGCTTAGAA
ATGGGGAGGAGAGCTGGCCTCTGTTGGTTTTGAGAACCATTGTGAGAGATCGCAGATGCA
TCCAATGGTATGATGCCTTGTGGAGCAGATGC***TTCCACACGATTCATCATATTACCA
ACACCTCCCATGTATCTTCCATTGTGCTGCATAATTTGTTGCTGC
C

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2B312TF 646 0 0
GGTCCAAAAGAGTTGAATCATTAGATAGACTCAAGAAAAAAAAAGAACTACAAGTCTTAA
AAGAAAAGAAAATCCAATGCAACTCAAAGTTGCAAACGAGAAGAAAAACTGGTTAAATAA
GTCCTAAAAATTTCAAAGCGCATAGTCTAATAAAAGGCAAAAGAAACATTGTCTTTTTCT
TTGGGTAATAACTCATTTCACTCCGTTGAGGAGGGAGCAAACTGATCATCAACGGAAGAA
ACAGCTGTCGGATTAGCAGAGAGCCTGAGTACATCCAGAGCCATAGCCACTTTAGCCTTA
AGAGCTTCAGGTGACTCAAGAAGGTGCAAGATCTCAGCTTGGTCCATCTCCAGCAACATC
CCTGTAACTTTGGCCACATGAACTGGCTCCTGCTTTTCCACAAGTGGGTAAAGCTGCTCT
CCAAGAATCTGCGAGTGATTGGCAGGGCTAGCCAATGCCAAGGCAGAAGTGAGCTTAGAA
ATGGGGAGGAGAGCTGGCCTCTGTTGGTTTTGAGAACCATTGTGAGAGATCGCAGATGCA
TCCAATGGTATGATGCCTTGTGGAGCAGATGC***TTCCACACGATTCATCATATTACCA
ACACCTCCCATGTATCTTCCATTGTGCTGCATAATTTGTTGCTGC
C

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2FE88JQ 726 0 0
GGTCCAAAAGAGTTGAATCATTAGATAGACTCAAGAAAAAAAGA*AACTACAAGTCTTAA
AA**AAAGAACATCCAATGCAACTAAAAGTTGCAAACGAGAAGAAAAACTGGTTAAATAA
GTCCTAAAAATTTCAAAGCGCATAGTCTAATAAAAGGCAAAAGAAAAATTGTCTTTTTCT
TTGGGTAATAACTCATTTCACTCCGTTGAGGAGGGAGCAAACTGATCATCAACGGAAGAA
ACAGCTGTCGGATTAGCAGAGAGCCTGAGTACATCCAGAGCCATAGCCACTTTAGCCTTG
AGCGCTTCAGGTGACTCAAGAAGGTGCAAGATCTCAGCTTGGTCCATCTCCAGCAACATC
CCTGTAACTTTGGCCACATGAACTGGCTCCTGCTTTTCCACAAGTGGGTAAAGCTGCTCT
CCAAGAATCTGCGAGTGATTGGCAGGGCTAGCCAATGCCAAGGCAGAAGTGAGCTTAGAA
ATGGGGAGGAGAGCTGGCCTCTGTTGGTTTTGAGAACCATTGTGAGAGATCGCAGATGCA
TCCAATGGTATGATGCCTTGTGGAGCAGATGCTCCTTCCACACGATTCATCATATTACCA
ACACCTCCCATGTATCTTCCATTGTGCTGCATAATTTGTTGCTGCTGCTGGAAGTGGTGC
TGCATGTTAGGAGCCCCACGCCTGAACCCAACACGGGGACCAGGATGGTTTTGTCTCTGA
AGAGGG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2FE88TF 829 0 0
CAGAGAG
CTGAGTACATCCAGAGCCATAGCCACTT*AGC*TTGAGCGCT*CAGGTGACTCAAGAAGG
TGCAAGATCTCAGCTTG*TCCATCTCCAGCAACATCC*TGTAACTT*GGCCACATGAACT
GGCTC*TGCTTTTCCACAAGTGGGTAAAGCTGCTCTCCAAGAATCTGCGAGTGATTGGCA
GGGCTAGCCAATGCCAAGGCAGAAGTGAGCTTAGAAATGGGGAGGAGAGCTGGCCTCTGT
TGGTTTTGAGAACCATTGTGAGAGATCGCAGATGCATCCAATGGTATGATGCCTTGTGGA
GCAGATGCTCCTTCCACACGATTCATCATATTACCAACACCTCCCATGTATCTTCCATTG
TGCTGCATAATTTGTTGCTGCTGCTGGAAGTGGTGCTGCATGTTAGGAGCCCCACGCCTG
AACCCAACACGGGGACCAGGATGGTTTTGTCTCTGAAGAGGGTAAGGAATCATGTAGTTA
GCCGGGCCAGAACCCGGACGCACACCAGGCATGAACTGAAGTTGGTACCCGTACCCCATA
GGCTGTGAAGGCACCATACCTTGACCGTTCTGGCCCATGTACATCTGACGGTGTGGCCCT
CCAGCTGGCCCTCCTGTTGGGTGATGATGGAACCCACCCATTGGTACATTTGGTCTCATA
GAAAACACAGTCTGAAGATGAGTCCTCCTCTCTTCCTTGCGTTGAGCAAACGCAATGTAA
AGAGGTTTCCTTCCTATCATCTTCCCATTCATTTCATTCAAAGCTCTTAAAGCTTCTCCA
GGAGTGGAGTAAGCAACAAAACCAAACCCTCTGCTCAAACCC

QA 8 829 8 829
DS 



AS 1 4

CO CL1582Contig1 1031 4 14 U
GGGCCGCCAGTGAGGAAGAAGAAGGAGAGTCGTCGTCTGCTCCGAAACAA*CAGCTGCAA
ACATGGCAAGGGGATTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCCCCCCATCATTGGGGTC
TTGACAAACTTGGTGGTGCCTTCGCTCCCAAGCCGTCATCTGGACCTCACAAGTCTAGGG
AGTGTCTTCCTCTTGTCCTGATCATCAGGAACAGGTTGAAGTATGCTTTGACATACCGTG
AAGTCATCTCCATCCTCATGCAGAGGCATATTCAAGTCGATGGTAAAGTCAGGACTGACA
AAACATACCCTGCTGGCTTCATGGATGTTGTCTCCATCCCCAAGACCAATGAGAGCTTCC
GTCTTCTTTACGACACCAAGGGACGTTTCCGTCTCCACTCCATCAGGGACGAGGAAGCAA
AGTTCAAGCTTTGCAAGGTGAGGACTATCCAGCTCGGACAAAAGGGAATCCCTTACCTCA
ACACTTACGACGGTCGCACCATCCGCTACCCCGACCCGCTCATCAAACCCAACGACACCA
TCAAGCTCGACCTCGAGGAGAACAAGATTGTCGAGTTCATCAAGTTTGACGTCGGCAACG
TTGTGATGGTGACTGGTGGAAGGAACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGA
AGCATAAGGGAAGCTTTGAGACGATTCACATCCAAGACTCGACGGGGCATGAGTTCGCCA
CGAGGTTGGGTAATGTGTTCACTCTGGGGAAAGGGACTAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCAA
AGGGCAAAGGTATTAAGCTGACCATCATTGAGGAAGCTAGGAAGAGGCTTTCTGCTCAGC
AAGCTGCTTAGATGTTGAATCGTTCAAGACCGTTTGTTCGCTCCTTGCTTCAGTTTTGAG
TTTGTTTTTTTCTTTCTATTACATGTTTCTTGCTTGCAAAACCCCATAAGAAAAGAAAAA
AGACAGCTGAGCGTTTTAGAGTGTTTTGTAATATTTGTATGGATATTTTTTTTATAGTAA
CCTACTCTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ33TF U 7
AF RR2AF82TF U 24
AF RR2DA71TF U 1
AF RR2DA71JQ C 314
BS 1 45 RR2DA71TF
BS 46 46 RR2EZ33TF
BS 47 49 RR2DA71TF
BS 50 50 RR2EZ33TF
BS 51 157 RR2DA71TF
BS 158 158 RR2EZ33TF
BS 159 196 RR2DA71TF
BS 197 197 RR2EZ33TF
BS 198 223 RR2DA71TF
BS 224 224 RR2EZ33TF
BS 225 706 RR2DA71TF
BS 707 707 RR2DA71JQ
BS 708 721 RR2DA71TF
BS 722 1031 RR2DA71JQ

RD RR2EZ33TF 657 0 0
GGAC
TGAGGAAGAAGAAGGAGAGTCGTCGTCTGCTCCGAAACAA*CAGCTGCAAACATGGCAAG
GGGATTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCCCCCCATCATTTGGGTCTTGACAAACT
TGGTGGTGCCTTCGCTCCCAAGCCGTCATCTGGACCTCACAAGTCTAGAGAGTGTCTTCC
TCTTGTCCTGATCATCAGGAACAGGTTGAAGTATGCTTTGACTTACCGTGAAGTCATCTC
CATCCTCATGCATAGGCATATTCAAGTCGATGGTAAAGTCAGGACTGACAAAACATACCC
TGCTGGCTTCATGGATGTTGTCTCCATCCCCAAGACCAATGAGAGCTTCCGTCTTCTTTA
CGACACCAAGGGACGTTTCCGTCTCCACTCCATCAGGGACGAGGAAGCAAAGTTCAAGCT
TTGCAAGGTGAGGACTATCCAGCTCGGACAAAAGGGAATCCCTTACCTCAACACTTACGA
CGGTCGCACCATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAAACCCAACGACACCATCAAGCTCGA
CCTCGAGGAGAACAAGATCGTCGAGTTCATCAAGTTTGACGTCGGCAACGTTGTGATGGT
GACTGGTGGAAAGAACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGAAGC

QA 5 657 5 657
DS 

RD RR2AF82TF 677 0 0
GGAGAGTCGTCGTCTGCTCCGAAACAAACAGCTGCAAACATGGCAAGGGGATTGAAGAAG
CATCTGAAGAGGCTCAATGCCCCCCATCATTGGGGTCTTGACAAACTTGGTGGTGCCTTC
GCTCCCAAACCGTCGTCTGGACCTCACAAGTCTAGGGAGTGTCTTCCTCTTGTCCTGATC
ATCAGGAACAGGTTGAAGTATGCTTTGACATACCGTGAAGTCATCTCCATCCTCATGCAG
AGGCATATCCAAGTCGATGGTAAAGTCAGGACTGACAAAACATACCCTGCTGGCTTCATG
GATGTTGTCTCCATCCCCAAGACCAATGAGAGCTTCCGTCTTCTTTACGACACCAAGGGA
CGTTTCCGTCTCCACTCCATCAGGGACGAGGAAGCAAAGTTCAAGCTTTGCAAGGTGAGG
ACTATCCAGCTCGGACAAAAGGGAATCCCTTACCTCAACACTTACGACGGTCGCACCATC
CGCTACCCCGACCCGCTCATCAAACCCAACGACACCATCAAGCTCGACCTCGAGGAGAAC
AAGATCGTCGAGTTCATCAAGTTCGACGTCGGCAACGTTGTGATGGTGACTGGGGGGAGA
AACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGAAGCATAAGGGAAGCTTTGAGACG
ATTCACATCCAAGACTC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2DA71TF 721 0 0
GGGCCGCCAGTGAGGAAGAAGAAGGAGAGTCGTCGTCTGCTCCGAGACAT*CAGCTGCAA
ACATGGCAAGGGGATTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCCCCCCATCATTGGGGTC
TTGACAAACTTGGTGGTGCCTTCGCTCCCAAGCCGTCTTCTGGACCTCACAAGTCTAGGG
AGTGTCTTCCTCTTGTTCTGATCATCAGGAACAGGTTGAAGTACGCTTTGACATACCGTG
AAGTCATCTCCATCCTCATGCAGAGGCATATTCAAGTCGATGGTAAAGTCAGGACTGACA
AAACATACCCTGCTGGCTTCATGGATGTTGTCTCCATCCCCAAGACCAATGAGAGCTTCC
GTCTTCTTTACGACACCAAGGGACGTTTCCGTCTCCACTCCATCAGGGACGAGGAAGCAA
AGTTCAAGCTTTGCAAGGTGAGGACTATCCAGCTCGGACAAAAGGGAATCCCTTACCTCA
ACACTTACGACGGTCGCACCATCCGCTACCCCGACCCGCTCATCAAACCCAACGACACCA
TCAAGCTCGACCTCGAGGAGAACAAGATTGTCGAGTTCATCAAGTTTGACGTCGGCAACG
TTGTGATGGTGACTGGTGGAAGGAACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGA
AGCATAAGGGAAGCTTTGAGACGATTCACATCCAAGACTCGACGGG*CATGAGTTCGCCA
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2DA71JQ 718 0 0
TGGCTTCATGGATGTTGTCTCCATCCCCAAGACCAATGAGAGCTTCCGTCTTCTTTACGA
CACCAAGGGACGTTTCCGTCTCCACTCCATCAGGGACGAGGAAGCAAAGTTCAAGCTTTG
CAAGGTGAGGACTATCCAGCTCGGACAAAAGGGAATCCCTTACCTCAACACTTACGACGG
TCGCACCATCCGCTACCCCGACCCGCTCATCAAACCCAACGACACCATCAAGCTCGACCT
CGAGGAGAACAAGATTGTCGAGTTCATCAAGTTTGACGTCGGCAACGTTGTGATGGTGAC
TGGTGGAAGGAACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGAAGCATAAGGGAAG
CTTTGAGACGATTCACATCCAAGACTCGACGGGGCATGAGTTCGCCACGAGGTTGGGTAA
TGTGTTCACTCTGGGGAAAGGGACTAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCAAAGGGCAAAGGTAT
TAAGCTGACCATCATTGAGGAAGCTAGGAAGAGGCTTTCTGCTCAGCAAGCTGCTTAGAT
GTTGAATCGTTCAAGACCGTTTGTTCGCTCCTTGCTTCAGTTTTGAGTTTGTTTTTTTCT
TTCTATTACATGTTTCTTGCTTGCAAAACCCCATAAGAAAAGAAAAAAGACAGCTGAGCG
TTTTAGAGTGTTTTGTAATATTTGTATGGATATTTTTTTTATAGTAACCTACTCTTCG

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 5

CO CL1583Contig1 686 5 29 U
CTCCGAACGAAAAATCGCAAAATCTTTCGTGAACCAAAAAATGTCACGTCTCCCGATCCT
AATCGCCGCCTTCCTCTTCCTCTCCGTCGCCACCGCCGAATCAGACTCTCCGACGGCGTA
CTCCCTCCTCCAAAGCTACAACTTCCCCGTCGGAATCCTCCCAAAAGGAGTCGTCGCCTA
CGATCTCGACACGTCGACAGGCAAATTCCACGCCTACTTCAACGGCTCCTGCAGCTTCTC
CCTCGTGGGATCTTACCAGCTGAACTACAAATCGACGATCAGCGGCTACATCTCCGAGAA
CAAGCTCACGAAGCTGAGTGGTATCAAGGTCAAAGTCCTCTTCCTGTGGCTCAACATCGT
CGAGGTCGTTAGGAAAGGAGACGAGATGGCGTTTTCCGTCGGGATCACGTCGGCGAATTT
CGAGATCGAGGAGTTCTTGGAGTCTCCTCAGTGTGGGTGTGGGTTTGAGTGCGAGAAATC
GAGTTCCGACAAGTTTGACAGAAGCTTCCCTTTTGTCTCTTCGTCGTGAAATGATTGAAT
CTTTGTCTAATAATAATATGTTATCGTCATTGGCTGAGAAACCCTTTTAAGTTTATGTTA
TTGTTTCAATCAAACTGGTTATGGTTAGGATTTGTTATGTTTATGTTATTGTTTCAATCG
ATCTGGTGGAAAGATGATTTGCTTGT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GG64TF U 3
AF RR2FI85JQ C 12
AF RR2FI85TF U 12
AF RR2HA46TF U 1
AF RR2HA46JQ C 66
BS 1 41 RR2HA46TF
BS 42 42 RR2GG64TF
BS 43 132 RR2HA46TF
BS 133 133 RR2GG64TF
BS 134 198 RR2HA46TF
BS 199 199 RR2GG64TF
BS 200 249 RR2HA46TF
BS 250 250 RR2GG64TF
BS 251 259 RR2HA46TF
BS 260 260 RR2GG64TF
BS 261 369 RR2HA46TF
BS 370 370 RR2GG64TF
BS 371 399 RR2HA46TF
BS 400 400 RR2GG64TF
BS 401 405 RR2HA46TF
BS 406 406 RR2GG64TF
BS 407 435 RR2HA46TF
BS 436 437 RR2GG64TF
BS 438 465 RR2HA46TF
BS 466 466 RR2GG64TF
BS 467 489 RR2HA46TF
BS 490 490 RR2GG64TF
BS 491 515 RR2HA46TF
BS 516 516 RR2GG64TF
BS 517 564 RR2HA46TF
BS 565 565 RR2FI85TF
BS 566 587 RR2HA46TF
BS 588 588 RR2FI85TF
BS 589 686 RR2HA46TF

RD RR2GG64TF 567 0 0
GG
GAACGAAAAATCGCAAAATCTTTCGTGAACCAAAAAATGTCACGTCTCCCGATCCTAATC
GCCGCCTTCCTCTTCCTCTCCGTCGCCACCGCCGAATCAGACTCTCCGACGGCGTACTCC
CTCCTCCAAAGCTACAACTTCCCCGTCGGAATCCTCCCAAAAGGAGTCGTCGCCTACGAT
CTCGACACGTCGACAGGCAAATTCCACGCCTACTTCAACGGCTCCTGCAGCTTCTCCCTC
GTGGGATCTTACCAGCTGAACTACAAATCGACGATCAGCGGCTACATCTCCGAGAACAAG
CTCACGAAGCTGAGTGGTATCAAGGTCAAAGTCCTCTTCCTGTGGCTCAACATCGTCGAG
GTCGTTAGGAAAGGAGACGAGATGGCGTTTTCCGTCGGGATCACGTCGGCGAATTTCGAG
ATCGAGGAGTTCTTGGAGTCTCCTCAGTGTGGGTGTGGGTTTGAGTGCGAGAAATCGAGT
TCCGACAAGTTTGACAGAAGCTTCCCTTTTGTCTCTTCGTCGTGAAATGATTGAATCTTT
GTCTAATAATAATATGTT
CTCGTCC

QA 3 560 3 560
DS 

RD RR2FI85JQ 644 0 0
GG
ATCGCAAAATCTTTCGTGAACCAAAAAATGTCACGTCTCCCGATCCTAATCGCCGCCTTC
CTCTTCCTCTCCGTCGCCACCGCCGAATCAGACTCTCCGACGGCGTACTCCCTCCTCCAA
AGCTACAACTTCCCCGTCGGAATCCTCCCAAAAGGAGTCGTCGCCTACGATCTCGACACG
TCGACAGGCAAATTCCACGCCTACTTCAACGGCTCCTGCAGCTTCTCCCTCGTGGGATCT
TACCAGCTGAACTACAAATCGACGATCAGCGGCTACATCTCCGAGAACAAGCTCACGAAG
CTGAGTGGTATCAAGGTCAAAGTCCTCTTCCTGTGGCTCAACATCGTCGAGGTCGTTAGG
AAAGGAGACGAGATGGCGTTTTCCGTCGGGATCACGTCGGCGAATTTCGAGATCGAGGAG
TTCTTGGAGTCTCCTCAGTGTGGGTGTGGGTTTGAGTGCGAGAAATCGAGTTCCGACAAG
TTTGACAGAAGCTTCCCTTTTGTCTCTTCGTCGTGAAATGATTGAATCTTTGTCTAATAA
TAGTATGTTCTCGTCATTGGCTGAGGAACCCTTTTAAGTTTATGTTATTGTTTTAATCAA
ACTGGTTATGGTTAGGATTTGTTATGTTTATGTTATTGTT
GC

QA 3 642 3 642
DS 

RD RR2FI85TF 644 0 0
GG
ATCGCAAAATCTTTCGTGAACCAAAAAATGTCACGTCTCCCGATCCTAATCGCCGCCTTC
CTCTTCCTCTCCGTCGCCACCGCCGAATCAGACTCTCCGACGGCGTACTCCCTCCTCCAA
AGCTACAACTTCCCCGTCGGAATCCTCCCAAAAGGAGTCGTCGCCTACGATCTCGACACG
TCGACAGGCAAATTCCACGCCTACTTCAACGGCTCCTGCAGCTTCTCCCTCGTGGGATCT
TACCAGCTGAACTACAAATCGACGATCAGCGGCTACATCTCCGAGAACAAGCTCACGAAG
CTGAGTGGTATCAAGGTCAAAGTCCTCTTCCTGTGGCTCAACATCGTCGAGGTCGTTAGG
AAAGGAGACGAGATGGCGTTTTCCGTCGGGATCACGTCGGCGAATTTCGAGATCGAGGAG
TTCTTGGAGTCTCCTCAGTGTGGGTGTGGGTTTGAGTGCGAGAAATCGAGTTCCGACAAG
TTTGACAGAAGCTTCCCTTTTGTCTCTTCGTCGTGAAATGATTGAATCTTTGTCTAATAA
TAGTATGTTCTCGTCATTGGCTGAGGAACCCTTTTAAGTTTATGTTATTGTTTTAATCAA
ACTGGTTATGGTTAGGATTTGTTATGTTTATGTTATTGTT
GC

QA 3 642 3 642
DS 

RD RR2HA46TF 686 0 0
CTCCGAACGAAAAATCGCAAAATCTTTCGTGAACCAAAAAACGTCACGTCTCCCGATCCT
AATCGCCGCCTTCCTCTTCCTCTCCGTCGCCACCGCCGAATCAGACTCTCCGACGGCGTA
CTCCCTCCTCCAGAGCTACAACTTCCCCGTCGGAATCCTCCCAAAAGGAGTCGTCGCCTA
CGATCTCGACACGTCGACGGGCAAATTCCACGCCTACTTCAACGGCTCCTGCAGCTTCTC
CCTCGTGGGGTCTTACCAGTTGAACTACAAATCGACGATCAGCGGCTACATCTCCGAGAA
CAAGCTCACGAAGCTGAGTGGTATCAAGGTCAAAGTCCTCTTCCTGTGGCTCAACATCGT
CGAGGTCGTCAGGAAAGGAGACGAGATGGCGTTTTCCGTTGGGATTACGTCGGCGAATTT
CGAGATCGAGGAGTTTCTGGAGTCTCCTCAGTGTGGGTGTGGGTTCGAGTGCGAGAAATC
GAGTTCCGATAAGTTTGACAGAAGCTTCCCTTTTGCCTCTTCGTCGTGAAATGATTGAAT
CTTTGTCTAATAATAATATGTTATTGTCATTGGCTGAGAAACCCTTT*AAGTTTATGTTA
TTGTTTCAATCAAACTGGTTATGGTTAGGATTTGTTATGTTTATGTTATTGTTTCAATCG
ATCTGGTGGAAAGATGATTTGCTTGT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2HA46JQ 621 0 0
CCGCCTTCCTCTTCCTCTCCGTCGCCACCGCCGAATCAGACTTTCCGACGGCGTACTCCC
TCCTCCAGAGCTACAACTTCCCCGTCGGAATCCTCCCAAAAGGAGTCGTCGCCTACGATC
TCGACACGTCGACGGGCAAATTCCACGCCTACTTCAACGGCTCCTGCAGCTTTTCCCTCG
TGGGGTCTTACCAGTTGAACTACAAATCGACGATCAGCGGCTACATTTCCGAGAACAAGC
TCACGAAGCTGAGTGGTATCAAGGTCAAAGTCCTCTTCCTGTGGCTCAACATCGTCGAGG
TCGTCAGGAAAGGAGACGAGATGGCGTTTTCCGTTGGGATTACGTCGGCGAATTTCGAGA
TCGAGGAGTTTCTGGAGTCTCCTCAGTGTGGGTGTGGGTTCGAGTGCGAGAAATCGAGTT
CCGATAAGTTTGACAGAAGCTTCCCTTTTGCCTTTTCGTCGTGAAATGATTGAATCTTTG
TCTAATAATAATATGTTATTGTCATTGGCTGAGAAACCCTTT*AAGTTTATGTTATTGTT
TCAATCAAACTGGTTATGGTTAGGATTTGTTATGTTTATGTTATTGTTTCAATCGATCTG
GTGGAAAGATGATTTGCTTGT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 4

CO CL1584Contig1 1248 4 7 U
GGGGCTCTTGCAAGCAAGGAAAGCCAACAAGAGAGGATTGTTCCTGGGATTGAAGAAGAC
ATACAGAGAGAGAAGCAATGGGCAGCACAAGCACGGCTTCTGCTGCTCTATTTCCCCATT
TACAGCTCACCAGTCGTAACCGTGATTCCCCTAGAAAGCCTCCGTACACCGTGAGTTTCA
GCAATTCGTGGAAGGAAAGTGGACTCCGACACGGTGTGACGCGACGCCGTAGCCAAAGGT
TCGACCAAGTGGTCCGCTTTTCCGCTTTCGGTGAAAATTCCGGAGACTCACCTACGGAAA
CCACTCCAGGCGTTGGCTCTGCTCTTGAAGACAGACCAGTTGTGGAAGATGCGTCCTTTG
AGCAAGAAGACAAAACAAGTTCCATCTATGGATTTCTTTATCCAGATAAAGAGGAGCTCC
CTGATGATAAAGAGATGACTATATTCGATCATCTTGAGGAGCTCCGGGAGAGAATATTCG
TCTCGGTTTTGGCTGTGGGAGCTGCAATCTTGGGATGCTTCGCCTACTCCAAAGATCTAA
TCGTGTTTCTTGAAGCTCCCGTCAAAACACAGGG*AGTACGGTTTCTTCAGCTAGCTCCA
GGCGAGTTTTTCTTCACAACTTTAAAGGTCTCGGGTTATTGTGGGCTTCTACTAGGGAGT
CCAGTGATACTGTATGAGATTATAGCTTTTGTACTTCCTGGTTTGACAAGAGCTGAGAGA
AGGTTTCTGGGGCCAATTGTGTTTGGTTCCTCCTTGTTGTTCTATGCTGGACTTGCCTTC
TCCTACTGGGTTTTAACCCCTGCTGCCTTGAATTTCTTTGTCAACTATGCAGAAGGGGTG
GTTGAATCTCTTTGGTCTATCGACCAGTACTTTGAGTTTGTGCTAGTGCTTATGTTCAGC
ACCGGGCTGTCTTTCCAGGTTCCAGTAATTCAGTTACTCCTGGGACAAGTAGGGGTGGTG
TCAGGAGATCAAATGCTTTCAATATGGAGATATGTTGTGGTGGGTGCGGTGGTTGTAGCA
GCTGTGGTCACGCCCTCGACAGACCCTGTTACTCAGATGCTCCTAGCGACACCGCTTCTG
GGCCTCTACTTGGGTGGTGCTTGGATGGTCAAGCTCACAGGTCGGTGAGAAATTTGGTTG
TTCAAAGACTGGATAAAATCATGTGTATCTTGTAGTGTATATCACCTCTCCGTTCAAGAA
ACCACAGTTTGGTATCTAAAGCGTTTATCTGAAACATAATCTTCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB31TF U 53
AF RR2EP89TF U 1
AF RR2EP89JQ C 455
AF RR2EB31JQ C 528
BS 1 708 RR2EP89TF
BS 709 709 RR2EP89JQ
BS 710 763 RR2EP89TF
BS 764 1187 RR2EP89JQ
BS 1188 1188 RR2EB31JQ
BS 1189 1231 RR2EP89JQ
BS 1232 1248 RR2EB31JQ

RD RR2EB31TF 663 0 0
AAGAAGACAT
ACAGAGAGAGAAGCAATGGGCAGCACAAGCACGGCTTCTGCTGCTCTATTTCCCCATTTA
CAGCTCACCAGTCGTAACCGTGATTCCCCTAGAAAGCCTCCGTACACCGTGAGTTTCAGC
AATTCGTGGAAGGAAAGTGGACTCCGACACGGTGTGACGCGACGCCGTAGCCAAAGGTTC
GACCAAGTGGTCCGCTTTTCCGCTTTCGGTGAAAATTCCGGAGACTCACCTACGGAAACC
ACTCCAGGCGTTGGCTCTGCTCTTGAAGACAGACCAGTTGTGGAAGATGCGTCCTTTGAG
CAAGAAGACAAAACAAGTTCCATCTATGGATTTCTTTATCCAGATAAAGAGGAGCTCCCT
GATGATAAAGAGATGACTATATTCGATCATCTTGAGGAGCTCCGGGAGAGAATATTCGTC
TCGGTTTTGGCTGTGGGAGCTGCAATCTTGGGATGCTTCGCCTACTCCAAAGATCTAATC
GTGTTTCTTGAAGCTCCCGTCAAAACACAGGGGAGTACGGTTTCTTCAGCTAGCTCCAGG
CGAGTTTTTCTTCACAACTTTAAAGGTCTCGGGTTATTGTGGGCTTCTACTAGGGAGTCC
AGTGATACTGTATGAGATTATAGCTTTTGTACTTCCTGGTTTGACA
GAGCTGA

QA 11 656 11 656
DS 

RD RR2EP89TF 763 0 0
GGGGCTCTTGCAAGCAAGGAAAGCCAACAAGAGAGGATTGTTCCTGGGATTGAAGAAGAC
ATACAGAGAGAGAAGCAATGGGCAGCACAAGCACGGCTTCTGCTGCTCTATTTCCCCATT
TACAGCTCACCAGTCGTAACCGTGATTCCCCTAGAAAGCCTCCGTACACCGTGAGTTTCA
GCAATTCGTGGAAGGAAAGTGGACTCCGACACGGTGTGACGCGACGCCGTAGCCAAAGGT
TCGACCAAGTGGTCCGCTTTTCCGCTTTCGGTGAAAATTCCGGAGACTCACCTACGGAAA
CCACTCCAGGCGTTGGCTCTGCTCTTGAAGACAGACCAGTTGTGGAAGATGCGTCCTTTG
AGCAAGAAGACAAAACAAGTTCCATCTATGGATTTCTTTATCCAGATAAAGAGGAGCTCC
CTGATGATAAAGAGATGACTATATTCGATCATCTTGAGGAGCTCCGGGAGAGAATATTCG
TCTCGGTTTTGGCTGTGGGAGCTGCAATCTTGGGATGCTTCGCCTACTCCAAAGATCTAA
TCGTGTTTCTTGAAGCTCCCGTCAAAACACAGGG*AGTACGGTTTCTTCAGCTAGCTCCA
GGCGAGTTTTTCTTCACAACTTTAAAGGTCTCGGGTTATTGTGGGCTTCTACTAGGGAGT
CCAGTGATACTGTATGAGATTATAGCTTTTGTACTTCCTGGTTTGACA*GAGCTGAGAGA
AGGTTTCTGGGGCCAATTGTGTTTGGTTCCTCCTTGTTGTTCT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2EP89JQ 777 0 0
TTGA
GAGCTCCGGGAGAGAATATTCGTCTCGGTTTTGGCTGTGGGAGCTGCAATCTTGGGATGC
TTCGCCTACTCCAAAGATCTAATCGTGTTTCTTGAAGCTCCCGTCAAAACACAGGG*AGT
ACGGTTTCTTCAGCTAGCTCCAGGCGAGTTTTTCTTCACAACTTTAAAGGTCTCGGGTTA
TTGTGGGCTTCTACTAGGGAGTCCAGTGATACTGTATGAGATTATAGCTTTTGTACTTCC
TGGTTTGACAAGAGCTGAGAGAAGGTTTCTGGGGCCAATTGTGTTTGGTTCCTCCTTGTT
GTTCTATGCTGGACTTGCCTTCTCCTACTGGGTTTTAACCCCTGCTGCCTTGAATTTCTT
TGTCAACTATGCAGAAGGGGTGGTTGAATCTCTTTGGTCTATCGACCAGTACTTTGAGTT
TGTGCTAGTGCTTATGTTCAGCACCGGGCTGTCTTTCCAGGTTCCAGTAATTCAGTTACT
CCTGGGACAAGTAGGGGTGGTGTCAGGAGATCAAATGCTTTCAATATGGAGATATGTTGT
GGTGGGTGCGGTGGTTGTAGCAGCTGTGGTCACGCCCTCGACAGACCCTGTTACTCAGAT
GCTCCTAGCGACACCGCTTCTGGGCCTCTACTTGGGTGGTGCTTGGATGGTCAAGCTCAC
AGGTCGGTGAGAAATTTGGTTGTTCAAAGACTGGATAAAATCATGTGTATCTTGTAGTGT
ATATCACCTTTCCGTTCAAGAAACCACAGTTTGGTATCTAAAGCGTTTATCTG

QA 5 777 5 777
DS 

RD RR2EB31JQ 721 0 0
TCCAAAGATCTAATCGTGTTTCTTGAAGCTCCCGTCAAAACACAGGG*AGTACGGTTTCT
TCAGCTAGCTCCAGGCGAGTTTTTCTTCACAACTTTAAAGGTCTCGGGTTATTGTGGGCT
TCTACTAGGGAGTCCAGTGATACTGTATGAGATTATAGCTTTTGTACTTCCTGGTTTGAC
AAGAGCTGAGAGAAGGTTTCTGGGGCCAATTGTGTTTGGTTCCTCCTTGTTGTTCTATGC
TGGACTTGCCTTCTCCTACTGGGTTTTAACCCCTGCTGCCTTGAATTTCTTTGTCAACTA
TGCAGAAGGGGTGGTTGAATCTCTTTGGTCTATCGACCAGTACTTTGAGTTTGTGCTAGT
GCTTATGTTCAGCACCGGGCTGTCTTTCCAGGTTCCAGTAATTCAGTTACTCCTGGGACA
AGTAGGGGTGGTGTCAGGAGATCAAATGCTTTCAATATGGAGATATGTTGTGGTGGGTGC
GGTGGTTGTAGCAGCTGTGGTCACGCCCTCGACAGACCCTGTTACTCAGATGCTCCTAGC
GACACCGCTTCTGGGCCTCTACTTGGGTGGTGCTTGGATGGTCAAGCTCACAGGTCGGTG
AGAAATTTGGTTGTTCAAAGACTGGATAAAATCATGTGTATCTTGTAGTGTATATCACCT
CTCCGTTCAAGAAACCACAGTTTGGTATCTAAAGCGTTTATCTGAAACATAATCTTCTTT
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 3

CO CL1585Contig1 1467 3 16 U
AAAATTTAACCAGGAAAAGTCGTACCAAGAAGACAATCATCACCTTTTTGGGGTCCAATA
AAGAATTTATTTTCCATTTTGGTATTTAAACCGACAGAAATGGTTTACTAATATTAAACC
GATACGGTTTTAGAAAACAATACAACAGTTCTGGTTCGCTCTTCTGAATCGAATATATAA
TTAACGGCCAGGATTCATAAAATCCCGGGAACGGCAGCAATCTTCATCCCCGTCCCGCGA
AGAACACCGTCAATGGCCTTTGACGGCGAGGGAATTAGGCTCCGCCGGTTGCTGCTGCGT
AATGCAATGTATGTTTCCTCCAGCTAGAACGATCTCTCTTGCATTCTCGATCCCCACAAC
CGAGTGATGAGGATACGTCTCTGAGAGAACGCGAATCGCTTCTTCATCGCGTTTCGCGTC
ACCGAACTGGGGCACGATTATTCCTCCGTTAGCGATGTAGAAGTCCACATACGATGCTGC
CAGTCTTGTCCCTGCAAGCCTTGCTTTAGCTTCACCTTCCTGAATGATCCCAGAGGATTC
TTCTTCGGTCATATAAAGCGGTCCAGGGACGTGGAGCTTGATGACTTGAATCTTCCTGCC
ACGAGCATCAACAGAGTTTGAGAAAACCGAAAGAGCTTCTACCGATCTTTCGTATTGAGG
ATCAGCTTCATCGTCTGTCCAAGACAGTAACACAACTCCCGGTTTAGCAAAGCAGCACAT
GTTATCAATGTGGCCGTTTGTGTCATCATCACCGTATAGACCACGAGGAAGCCAGATGAA
TGTTTGCACTCCGAGATATCTCTTGAGCTCTTCTTCTATCTGCTCTTTGCTCATGTGAGG
GTTCCTGTTTTTGTTCAAGAGACACTCTTCAGTCACAAGACAGGTACCTTCGCCGTCGAC
ATGGATGCTGCCTCCTTCAAGAATCATCGAGTGCTGAAATCTTGGAATCCGCTCAACAGC
GAGAATCTTTTTTTGGAACTAGGAGGTCATGACTCCAATCATTGTAGCAGCCATCATCAG
CTCCTCCCCAGGCATTGAAATTCCAGTCGACTCCAGTGACGTTTCGGGTTAGGGAACTGA
GCTTTAATGGCATTTTCCGCACAACAAAAGTTGGTCCAGAGTCGCGGAACCAAGAATCAT
TCATGCTCATCTCAACAACTCTGATCTCCTCTGGAAGTTGTTTCCTTGCATTTTCCCACT
GAGCGGAGCTTGCACAGACTGTAACAGGCTCGAACACTGAGATTGCCTTTGCAACATCTA
CAAACACTCGTTGTGCAGGCAAAGCGTTGTGACGCCAGTTATCTTGCCTTTCAGGCCAAC
CGATCCAGGTTTGAGCATGAGGTTCCCACTCCGCCGGCATGTAGAAGCCGTGTTCCGCCG
GAGATTCTCGTGACTCCTCCATTCTCTCTGCGTGATAGGTGGGAGAGCTGACAAGTCAGA
TATTTTTTAAGTACTGTTGTGTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E010JQ U 88
AF RR2EO19JQ U 1
AF RR2D651TF C 757
BS 1 109 RR2EO19JQ
BS 110 110 RR2E010JQ
BS 111 227 RR2EO19JQ
BS 228 228 RR2E010JQ
BS 229 420 RR2EO19JQ
BS 421 421 RR2E010JQ
BS 422 464 RR2EO19JQ
BS 465 465 RR2E010JQ
BS 466 814 RR2EO19JQ
BS 815 815 RR2D651TF
BS 816 840 RR2EO19JQ
BS 841 841 RR2D651TF
BS 842 857 RR2EO19JQ
BS 858 858 RR2D651TF
BS 859 881 RR2EO19JQ
BS 882 1467 RR2D651TF

RD RR2E010JQ 648 0 0
AAACCGACAGAAATGGTTTACTAATATTAAACCGATACGGTTTTAGAAAACAATACAACA
GTTCTGGTTCGCTCTTCTGAATCGAATATATAATTAACGGCCAGGATTCATAAAATCCCG
GGAACGGCAGTAATCTTCATCCCCGTCCCGCGAAGAACACCGTCAATGGCCTTTGACGGC
GAGGGAATTAGGCTCCGCCGGTTGCTGCTGCGTAATGCAATGTATGTTTCCTCCAGCTAG
AACGATCTCTCTTGCATTCTCGATCCCCACAACCGAGTGATGAGGATACGTCTCTGAGAG
AACGCGAATCGCTTCTTCATCGCGTTTCGCGTCACCGAACTGGGGCACGATTATTCCTCC
GTTAGCGATGTAGAAGTCCACATACGATGTTGCCAGTCTTGTCCCTGCAAGCCTTGCTTT
AGCTTCACCTTCCTGAATGATCCCAGAGGATTCTTCTTCGGTCATATAAAGCGGTCCAGG
GACGTGGAGCTTGATGACTTGAATCTTCCTGCCACGAGCATCAACAGAGTTTGAGAAAAC
CGAAAGAGCTTCTACCGATCTTTCGTATTGAGGATCAGCTTCATCGTCTGTCCAAGACAG
TAACACAACTCCCGGTTTAGCAAAGCAGCACATGTTATCAATGTGGCC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2EO19JQ 881 0 0
AAAATTTAACCAGGAAAAGTCGTACCAAGAAGACAATCATCACCTTTTTGGGGTCCAATA
AAGAATTTATTTTCCATTTTGGTATTTAAACCGACAGAAATGGTTTACTGATATTAAACC
GATACGGTTTTAGAAAACAATACAACAGTTCTGGTTCGCTCTTCTGAATCGAATATATAA
TTAACGGCCAGGATTCATAAAATCCCGGGAACGGCAGCAATCTTCATTCCCGTCCCGCGA
AGAACACCGTCAATGGCCTTTGACGGCGAGGGAATTAGGCTCCGCCGGTTGCTGCTGCGT
AATGCAATGTATGTTTCCTCCAGCTAGAACGATCTCTCTTGCATTCTCGATCCCCACAAC
CGAGTGATGAGGATACGTCTCTGAGAGAACGCGAATCGCTTCTTCATCGCGTTTCGCGTC
GCCGAACTGGGGCACGATTATTCCTCCGTTAGCGATGTAGAAGTTCACATACGATGCTGC
CAGTCTTGTCCCTGCAAGCCTTGCTTTAGCTTCACCTTCCTGAATGATCCCAGAGGATTC
TTCTTCGGTCATATAAAGCGGTCCAGGGACGTGGAGCTTGATGACTTGAATCTTCCTGCC
ACGAGCATCAACAGAGTTTGAGAAAACCGAAAGAGCTTCTACCGATCTTTCGTATTGAGG
ATCAGCTTCATCGTCTGTCCAAGACAGTAACACAACTCCCGGTTTAGCAAAGCAGCACAT
GTTATCAATGTGGCCGTTTGTGTCATCATCACCGTATAGACCACGAGGAAGCCAGATGAA
TGTTTGCACTCCGAGATATCTCTTGAGCTCTTCT*CTATCTGCTCTTTGCTCATGTGAGG
*TTCCTGTTTTTGTTCA*GAGACACTCTTCAGTCACAAGAC

QA 1 881 1 881
DS 

RD RR2D651TF 711 0 0
TAGACCACGAGGAAGCCAGATGAATGTTTGCACTCCGAGATATCTCTTGAGCTCTTCTTC
TATCTGCTCTTTGCTCATGTGAGGGTTCCTGTTTTTGTTCAAGAGACACTCTTCAGTCAC
AAGACAGGTACCTTCGCCGTCGACATGGATGCTGCCTCCTTCAAGAATCATCGAGTGCTG
AAATCTTGGAATCCGCTCAACAGCGAGAATCTTTTTTTGGAACTAGGAGGTCATGACTCC
AATCATTGTAGCAGCCATCATCAGCTCCTCCCCAGGCATTGAAATTCCAGTCGACTCCAG
TGACGTTTCGGGTTAGGGAACTGAGCTTTAATGGCATTTTCCGCACAACAAAAGTTGGTC
CAGAGTCGCGGAACCAAGAATCATTCATGCTCATCTCAACAACTCTGATCTCCTCTGGAA
GTTGTTTCCTTGCATTTTCCCACTGAGCGGAGCTTGCACAGACTGTAACAGGCTCGAACA
CTGAGATTGCCTTTGCAACATCTACAAACACTCGTTGTGCAGGCAAAGCGTTGTGACGCC
AGTTATCTTGCCTTTCAGGCCAACCGATCCAGGTTTGAGCATGAGGTTCCCACTCCGCCG
GCATGTAGAAGCCGTGTTCCGCCGGAGATTCTCGTGACTCCTCCATTCTCTCTGCGTGAT
AGGTGGGAGAGCTGACAAGTCAGATATTTTTTAAGTACTGTTGTGTGATCC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 5

CO CL1586Contig1 1346 5 11 U
GGGGCGTTGGAGGAGGAGATCGAGGACATTGGTGGTCATCTGAATGCGTATACCTCGAGG
GAGCAGACTACTTACTATGCGAAAGTGACGGGTTCCGATGTGAACCAGGCGCTGGATGTC
TTGGCTGATATCTTGCAGAATTCTAAGTTCGAGGAGCAGAGGATCAACAGGGAGCGTGAT
GTCATCCTCAGGGAAATGCAAGAGGTGGAAGGGCAAACCGATGAAGTTGTTCTTGACCAT
TTACATGCTACTGCGTTCCAATACACACCTCTTGGAAGAACTATTCTGGGATCTGCTCAG
AATGTCAAGTCTATCACCAGAGATGATCTGCAGAATTACATTAAGACTCACTACACAGCT
TCCAGGATGGTGATTGCTGCGGCAGGAGCTGTCAAGCATGAGGAAGTTGTTGAGCAAGTG
AAGAAGCTATTTACCAAGTTGTCATCTGATCCAACTTCTACTACTCAACTGGTTGCCAAA
GAACCTGCTAGTTTTACTGGTTCTGAGGTTCGAATGATTGATGATGACCTGCCCCTTGCA
CAATTTGCTGTTGCCTTTGAAAGAGCATCTTGGACAGATCCAGATTCTGTTGCTCTTATG
GTTATGCAAACCATGTTGGGTTCATGGAACAAAAATGTTGGTGGTGGCAAACACATGGGT
TCTGCCCTGGTCCAGAGGGTTGCCATTAACGAAATAGCAGAAAGTATAATGGCATTCAAC
ACCAACTACAAGGATACTGGATTGTTTGGCGTGTACGCAGTTGCTAAGGCCGATTGCTTA
GATGATTTATCATATGCCATTATGCATGAGGTAACCAGGTTGGCCTTCCGAGTTTCTGAC
GATGACGTGACACGTGCACGGAATCAGCTCAAATCATCGCTTTTGCTTCACATGGATGGA
ACTAGCCCAATTGCCGAAGATATTGGTCGTCAGCTGCTGACATATGGGAGAAGAATCCCA
ACCGCTGAACTATTTGCTAGGATCGATGCTGTTGATGCCAGCACCGTTAAACGTGTTGCC
AACAAGTATCTCTATGACAAGGACATTGCAATCTCAGCCATTGGTCCGATCCAAGATTTG
CCAGACTATAACAAGTTCAGACGCAGAACCTACTTTAACCGTTACTAAGCCTCTGAAATA
ACGGTCATAGAACCCCCGCATGTTCGCCCACGGGAGAGAGAGAGCAGAACCTTGGTGGCG
ATGGATTCATTTTTTGAGTTTTGTTTTACTGGTATAATAAATGTACCGCATACTTTTTAT
CCTTCTATTTGGAATAAAATAAATGTACCGCATATTTGGAATGATTGTATCCTTTCTTCA
GCATTTATTCATATAATTATGGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2FW43TF U 1
AF RR2FV89TF U 419
AF RR2FW43JQ C 627
AF RR2FV89JQ C 625
AF RR2CZ31TF U 941
BS 1 634 RR2FW43TF
BS 635 635 RR2FV89TF
BS 636 678 RR2FW43TF
BS 679 679 RR2FV89TF
BS 680 688 RR2FW43TF
BS 689 1096 RR2FV89TF
BS 1097 1098 RR2CZ31TF
BS 1099 1099 RR2FV89JQ
BS 1100 1242 RR2CZ31TF
BS 1243 1243 RR2FV89JQ
BS 1244 1346 RR2CZ31TF

RD RR2FW43TF 704 0 0
GGGGCGTTGGAGGAGGAGATCGAGGACATTGGTGGTCATCTGAATGCGTATACCTCGAGG
GAGCAGACTACTTACTATGCGAAAGTGACGGGTTCCGATGTGAACCAGGCGCTGGATGTC
TTGGCTGATATCTTGCAGAATTCTAAGTTCGAGGAGCAGAGGATCAACAGGGAGCGTGAT
GTCATCCTCAGGGAAATGCAAGAGGTGGAAGGGCAAACCGATGAAGTTGTTCTTGACCAT
TTACATGCTACTGCGTTCCAATACACACCTCTTGGAAGAACTATTCTGGGATCTGCTCAG
AATGTCAAGTCTATCACCAGAGATGATCTGCAGAATTACATTAAGACTCACTACACAGCT
TCCAGGATGGTGATTGCTGCGGCAGGAGCTGTCAAGCATGAGGAAGTTGTTGAGCAAGTG
AAGAAGCTATTTACCAAGTTGTCATCTGATCCAACTTCTACTACTCAACTGGTTGCCAAA
GAACCTGCTAGTTTTACTGGTTCTGAGGTTCGAATGATTGATGATGACCTGCCCCTTGCA
CAATTTGCTGTTGCCTTTGAAAGAGCATCTTGGACAGATCCAGATTCTGTTGCTCTTATG
GTTATGCAAACCATGTTGGGTTCATGGAACAAAA*TGTTGGTGGTGGCAAACACATGGGT
TCTGCCCTGGTCCAGAGG*TTGCCATTA
CGAATAGCAGAAGTAT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2FV89TF 678 0 0
G
GAAGAAGCTATTTACCAAGTTGTCATCTGATCCAACTTCTACTACTCAACTGGTTGCCAA
AGAACCTGCTAGTTTTACTGGTTCTGAGGTTCGAATGATTGATGATGACCTGCCCCTTGC
ACAATTTGCTGTTGCCTTTGAAGGAGCATCTTGGACAGATCCAGATTCTGTTGCTCTTAT
GGTTATGCAAACCATGTTGGGTTCATGGAACAAAAATGTTGGTGGTGGCAAACACATGGG
TTCTGCCCTGGTCCAGAGGGTTGCCATTAACGAAATAGCAGAAAGTATAATGGCATTCAA
CACCAACTACAAGGATACTGGATTGTTTGGCGTGTACGCAGTTGCTAAGGCCGATTGCTT
AGATGATTTATCATATGCCATTATGCATGAGGTAACCAGGTTGGCCTTCCGAGTTTCTGA
CGATGACGTGACACGTGCACGGAATCAGCTCAAATCATCGCTTTTGCTTCACATGGATGG
AACTAGCCCAATTGCCGAAGATATTGGTCGTCAGCTGCTGACATATGGGAGAAGAATCCC
AACCGCTGAACTATTTGCTAGGATCGATGCTGTTGATGCCAGCACCGTTAAACGTGTTGC
CAACAAGTATCTCTATGACAAGGACATTGCAATCTCAGCCATTGGTCCGATCCAAGATTT
GCCAGACTATAACAAGT

QA 2 678 2 678
DS 

RD RR2FW43JQ 665 0 0
GAACA
AAAATGTTGGTGGTGGCAAACACATGGGTTCTGCCCTGGTCCAGAGGGTTGCCATTAACG
AAATAGCAGAAAGTATAATGGCATTCAACACCAACTACAAGGATACTGGATTGTTTGGCG
TGTACGCAGTTGCTAAGGCCGATTGCTTAGATGATTTATCATATGCCATTATGCATGAGG
TAACCAGGTTGGCCTTCCGAGTTTCTGACGATGACGTGACACGTGCACGGAATCAGCTCA
AATCATCGCTTTTGCTTCACATGGATGGAACTAGCCCAATTGCCGAAGATATTGGTCGTC
AGCTGCTGACATATGGGAGAAGAATCCCAACCGCTGAACTATTTGCTAGGATCGATGCTG
TTGATGCCAGCACCGTTAAACGTGTTGCCAACAAGTATCTTTATGACAAGGACATTGCAA
TTTCAGCCATTGGTCCGATCCAAGATTTGCCAGACTATAACAAGTTCAGACGCAGAACCT
ACTTTAACCTTTACTAAGCCTCTGAAATAACGGTCATAGAACCCCCGCATGTTCGCCCAC
GGGAGAGAGAG**CAGAACCTTGGTGGCGATGGATTCATTTTTTGAGTTTTGTTTTACTG
GTATAATAAATGTACCGCATACTTTTTATCCTTCTATTTGGAATAAAATAAATGTACCGC

QA 6 665 6 665
DS 

RD RR2FV89JQ 717 0 0
TGGAACA
AAAATGTTGGTGGTGGCAAACACATGGGTTCTGCCCTGGTCCAGAGGGTTGCCATTAACG
AAATAGCAGAAAGTATAATGGCATTCAACACCAACTACAAGGATACTGGATTGTTTGGCG
TGTACGCAGTTGCTAAGGCCGATTGCTTAGATGATTTATCATATGCCATTATGCATGAGG
TAACCAGGTTGGCCTTCCGAGTTTCTGACGATGACGTGACACGTGCACGGAATCAGCTCA
AATCATCGCTTTTGCTTCACATGGATGGAACTAGCCCAATTGCCGAAGATATTGGTCGTC
AGCTGCTGACATATGGGAGAAGAATCCCAACCGCTGAACTATTTGCTAGGATCGATGCTG
TTGATGCCAGCACCGTTAAACGTGTTGCCAACAAGTATCTCTATGACAAGGACATTGCAA
TTTCAGCCATTGGTCCGATCCAAGATTTGCCAGACTATAACAAGTTCAGGCGCAGAACCT
ACTTTAACCGTTACTAAGCCTCTGAAATAACGGTCATAGAACCCCCGCATGTTCGCCCAC
GGGAGAGAGAGAGCAGAACCTTGGTGGCGATGGATTCATTTTTTGAGTTTTGTTTTACTG
GTATAATAAATGTACCGCATACTTTTTATCCTTCTATTTGGAATAAAATAAATGTACCGC
ATATTTGGAATGATTGTATCCTTTCTTCAGCATTTATTCATATAATTATG

QA 8 717 8 717
DS 

RD RR2CZ31TF 406 0 0
G
ATATGGGAGAAGAATCCCAACCGCTGAACTATTTGCTAGGATCGATGCTGTTGATGCCAG
CACCGTTAAACGTGTTGCCAACAAGTATATCTATGACAAGGACATTGCAATCTCAGCCAT
TGGTCCGATCCAAGATTTGCCAGACTATAACAAGTTCGGACGCAGAACCTACTTTAACCG
TTACTAAGCCTCTGAAATAACGGTCATAGAACCCCCGCATGTTCGCCCACGGGAGAGAGA
GAGCAGAACCTTGGTGGCGATGGATTCATTTTTTGAGTTTTGTTTTACTGGTATAATAAA
TTTACCGCATACTTTTTATCCTTCTATTTGGAATAAAATAAATGTACCGCATATTTGGAA
TGATTGTATCCTTTCTTCAGCATTTATTCATATAATTATGGATCT

QA 2 406 2 406
DS 



AS 1 4

CO CL1587Contig1 720 4 1 U
GGATCTCCAGTTCATTTAAAAACACAGACACACTAACACTTTTGTGGTGCTAACTAAATT
CAGAAGTATTTGTAACCTCTATGGCTTCTTCTTCTCTTCTAGTCACCATCTTCCTCTGCA
TTTCCTTCTTCTCCTTCTTGTCTGTAAATGCAAATGAGGTAACCGTCGGTGGAAAATCCG
GTGTGTGGAAGATCCCTCCTTCATCTTCTTACTCTTTCAACGAATGGGCTCAAAAGGCTC
GCTTCAAAGTTGGAGACTTTCTAGTTTTCAGCTACGAAGCTGGTAAAGACTCGGTGCTGC
AAGTGACAAGAGAGGCTTACGAGAAATGCAACACCACGAGACCGATAGCCAGCTACACCG
ATGGGAACACCAAGGTGAAGCTAGAACAACACGGTCCGGTCTACTTCATAAGCGGAACAG
AGGGTCACTGTCAAAAGGGTCAGAAGCTACGCCTTGTGGTAGTCACTCCTCGTAGCTATG
CTTTCTCTCCGGCTCCTTCTCCATCTGACGGTCCTGCCGTTGCTCCTTCTACTGGCGCTG
CTACTAAGCTCACGGGGGTCTTCAGTGTCGTGGGCCTTGTTCTTGGATTATGGGCCTTCG
TCTGAGAAGCTTTTTTTTTTTTTACTTTTACTTAGTCCTGAATTCTATTCTTTTTGTCTT
TTGGAACATGTAACAGTGATCTGTGTTATGTTCTCCCTAGTCCCTAGTCTTGTTGTTACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DQ22JQ C 189
AF RR2G950TF U 1
AF RR2D941TF U 1
AF RR2D941JQ C 206
BS 1 720 RR2D941TF

RD RR2DQ22JQ 409 0 0
AAGATCCCTCCTTCACCTTCTGACTCTTTCAACGAATGGGCTCAAAAAGCTCGCTTCAAA
GTCGGAGACTTTCTAGTTTTCAGCTACGAAGCGGGTAAAGACTCGGTGCTGCAAGTGACA
AGAGAGGCTTACGAGAAATGCAACACCACGAGCCCGAAAGCCAGCTACACCGGTGGGAAC
ACCAAGGTGAAGCTAGAACAACACGGTCCGGTCTACTTTATCAGTGGAACAGAGGGTCAC
TGTCAAAAGGGTCAGAAGCTACGCGTTGTGGTAGTCACTCCTCGTAGCTCTGCTTTCTCT
CCGGCTCCTTCTCCATCTGACGGTCCCGCCGTTGCTCCTTCTACGGGCGCTGCTACTAAG
CTCACGGGCGTCTTCAGTGTTGTGGGCCTTGTTCTTGGACTCTGGGCCT

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR2G950TF 656 0 0
GGATCTCCAGTTCATTTAAAAACACAGACACACTAACACTTTTGTGGTGCTAACTAAATT
CAGAAGTATTTGTAACCTCTATGGCTTCTTCTTCTCTTCTAGTCACCATCTTCCTCTGCA
TTTCCTTCTTCTCCTTCTTGTCTGTAAATGCAAATGAGGTAACCGTCGGTGGAAAATCCG
GTGTGTGGAAGATCCCTCCTTCATCTTCTTACTCTTTCAACGAATGGGCTCAAAAGGCTC
GCTTCAAAGTTGGAGACTTTCTAGTTTTCAGCTACGAAGCTGGTAAAGACTCGGTGCTGC
AAGTGACAAGAGAGGCTTACGAGAAATGCAACACCACGAGACCGATAGCCAGCTACACCG
ATGGGAACACCAAGGTGAAGCTAGAACAACACGGTCCGGTCTACTTCATAAGCGGAACAG
AGGGTCACTGTCAAAAGGGTCAGAAGCTACGCCTTGTGGTAGTCACTCCTCGTAGCTATG
CTTTCTCTCCGGCTCCTTCTCCATCTGACGGTCCTGCCGTTGCTCCTTCTACTGGCGCTG
CTACT**GCTCACGGGGGTCTTCAGTGTCGTGGGCCTTGTTCTTGGATTATGGGCCTTCG
TCTGAGAAGCTTTTTTTTTTTTTACTTTTACTTAGTCCTGAATTCTATTCTTTT
GT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2D941TF 720 0 0
GGATCTCCAGTTCATTTAAAAACACAGACACACTAACACTTTTGTGGTGCTAACTAAATT
CAGAAGTATTTGTAACCTCTATGGCTTCTTCTTCTCTTCTAGTCACCATCTTCCTCTGCA
TTTCCTTCTTCTCCTTCTTGTCTGTAAATGCAAATGAGGTAACCGTCGGTGGAAAATCCG
GTGTGTGGAAGATCCCTCCTTCATCTTCTTACTCTTTCAACGAATGGGCTCAAAAGGCTC
GCTTCAAAGTTGGAGACTTTCTAGTTTTCAGCTACGAAGCTGGTAAAGACTCGGTGCTGC
AAGTGACAAGAGAGGCTTACGAGAAATGCAACACCACGAGACCGATAGCCAGCTACACCG
ATGGGAACACCAAGGTGAAGCTAGAACAACACGGTCCGGTCTACTTCATAAGCGGAACAG
AGGGTCACTGTCAAAAGGGTCAGAAGCTACGCCTTGTGGTAGTCACTCCTCGTAGCTATG
CTTTCTCTCCGGCTCCTTCTCCATCTGACGGTCCTGCCGTTGCTCCTTCTACTGGCGCTG
CTACTAAGCTCACGGGGGTCTTCAGTGTCGTGGGCCTTGTTCTTGGATTATGGGCCTTCG
TCTGAGAAGCTTTTTTTTTTTTTACTTTTACTTAGTCCTGAATTCTATTCTTTTTGTCTT
TTGGAACATGTAACAGTGATCTGTGTTATGTTCTCCCTAGTCCCTAGTCTTGTTGTTACT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2D941JQ 515 0 0
TTCTTACTCTTTCAACGAATGGGCTCAAAAGGCTCGCTTCAAAGTTGGAGACTTTCTAGT
TTTCAGCTACGAAGCTGGTAAAGACTCGGTGCTGCAAGTGACAAGAGAGGCTTACGAGAA
ATGCAACACCACGAGACCGATAGCCAGCTACACCGATGGGAACACCAAGGTGAAGCTAGA
ACAACACGGTCCGGTTTACTTCATAAGCGGAACAGAGGGTCACTGTCAAAAGGGTCAGAA
GCTACGCCTTGTGGTAGTCACTCCTCGTAGCTATGCTTTCTTTCCGGCTCCTTCTCCATC
TGACGGTCCTGCCGTTGCTCCTTCTACTGGCGCTGCTACTAAGCTCACGGGGGTTTTCAG
TGTCGTGGGCCTTGTTCTTGGATTATGGGCCTTCGTTTGAGAAGCTTTTTTTTTTTTTAC
TTTTACTTAGTCCTGAATTCTATTCTTTTTGTCTTTTGGAACATGTAACAGTGATCTGTG
TTATGTTCTCCCTAGTCCCTAGTCTTGTTGTTACT

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 5

CO CL1588Contig1 622 5 8 U
GGAACGTTTAGAACCAGAAGAAGGAAAAAAAGGATTGGAAGAGAGAAGTAATGGCGACAT
CGGTTGCGACTCTATCTTCTCCGCCACCAGTCACTCTGCCTCTCTCTTCATCTCGCTCTT
CCTTATTCTCCAACTGTTTCATAGCGACCACCCAACGAAGACCAAAGACCCGTTCTTTGG
TGGCGATTCGACCGGAGCAGAGGAGAAAGGCACTGACTTGTAACGCCCTGTTTGGTCTCG
GTGTCCCTGAGCTTGCCGTGATCGCTGGCGTCGCAGCGTTGCTTTTCGGACCTAAGAAGC
TTCCTGAGATTGGCAAGAGTATTGGCAAGACCGTCAAAAGCTTTCAACAGGCTGCAAAAG
AGTTTGAGTCTGAGCTTAAGACAGAACCTGAAGATTCTGTTGCTGGCTCGTCGTCTCCAG
TAGCAATGAGCAACAAGGAAGAGGAAAAAACTGAGGTTTCGACAAGCTCAAAGGATAATG
CATGAATGAAGAATGATGCGGCCTTCTTTGTGTTTTCCCTGTAGCTAGAACAGTTTATGA
AATGAGTTTAGATCAAATACTCTTTGTTGATGGAAGCAGACTTGTCTTCCTATGATATAT
GGTTTCATGGTGTTTGAATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR2DC07JQ C 78
AF RR2AZ95TFB U 63
AF RR2DC07TF U 1
AF RR2GU82TF U 36
AF RR2AZ95JQ C 77
BS 1 108 RR2DC07TF
BS 109 109 RR2AZ95TFB
BS 110 461 RR2DC07TF
BS 462 462 RR2AZ95TFB
BS 463 502 RR2DC07TF
BS 503 503 RR2AZ95TFB
BS 504 617 RR2DC07TF
BS 618 622 RR2AZ95JQ

RD RR2DC07JQ 314 0 0
TT
TCCGCCACCAGTCACTCTGCCTCTCTCTTTATCTCGCTCTTCCTTATTCTCCAACTGTTT
CATAGCGACCACCCAACGAAGACCAAAGACCCGTTCTTTGGTGGCGATTCGACCGGAGCA
GAGGAGAAAGGCACTGACTTGTAACGCCCTGTTTGGTCTCGGTGTCCCTGAGCTTGCCGT
GATCGCTGGCGTCGCAGCGTTGCTTTTCGGACCTAAGAAGCTTCCTGAGATTGGCAAGAG
TATTGGCAAGACCGTCAAAAGCTTTCAACAGGCTGCAAAAGAGTTTGAGTCTGAGCTTAA
GACAGAACCTGA

QA 3 314 3 314
DS 

RD RR2AZ95TFB 452 0 0
GTTGGGACTCTATCTTCTCCGCCACCAGTCACTCTGCCTCTCTCTTCATCTCGCTCTTCC
TTATTCTCCAACTGTTTCATAGCGACCACCCAACGAAGGGCAAAGACC*GTTCTTTGGTG
GCGATTCGACCGGAGCAGAGGAGAAAGGCACTGACTTGTAACGCCCTGTTTGGTCTCGGT
GTCCCTGAGCTTGCCGTGATCGCTGGCGTCGCAGCGTTGCTTTTCGGACCTAAGAAGCTT
CCTGAGATTGGCAAGAGTATTGGCAAGACCGTCAAAAGCTTTCAACAGGCTGCAAAAGAG
TTTGAGTCTGAGCTTAAGACAGAACCTGAAGATTCTGTTGCTGGCTCGTCGTCTCCAGTA
GCAATGAGCAACAAGGAAGAGGAAAAAACTGAGGTTTCGACAAGCTCAAAGGATAATGCA
TGAATGAAGAATGATGCGGCCTTCTTTGTGTT

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2DC07TF 622 0 0
GGAACGTTTAGAACCAGAAGAAGGAAAAAAAGGATTGGAAGAGAGAAGTAATGGCGACAT
CGGTTGCGACTCTATCTTCTCCGCCACCAGTCACTCTGCCTCTCTCTTTATCTCGCTCTT
CCTTATTCTCCAACTGTTTCATAGCGACCACCCAACGAAGACCAAAGACCCGTTCTTTGG
TGGCGATTCGACCGGAGCAGAGGAGAAAGGCACTGACTTGTAACGCCCTGTTTGGTCTCG
GTGTCCCTGAGCTTGCCGTGATCGCTGGCGTCGCAGCGTTGCTTTTCGGACCTAAGAAGC
TTCCTGAGATTGGCAAGAGTATTGGCAAGACCGTCAAAAGCTTTCAACAGGCTGCAAAAG
AGTTTGAGTCTGAGCTTAAGACAGAACCTGAAGATTCTGTTGCTGGCTCGTCGTCTCCAG
TAGCAATGAGCAACAAGGAAGAGGAAAAAACTGAGGTTTCGTCAAGCTCAAAGGATAATG
CATGAATGAAGAATGATGCGGCTTTCTTTGTGTTTTCCCTGTAGCTAGAACAGTTTATGA
AATGAGTTTAGATCAAATACTCTTTGTTGATGGAAGCAGACTTGTCTTCCTATGATATAT
GGTTTCATGGTGTTTGA
ATCCC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2GU82TF 582 0 0
G
GGAAGAGAGAAGTAATGGCGACATCGGTTGCGACTCTATCTTCTCCGCCACCAGTCACTC
TGCCTCTCTCTTCATCTCGCTCTTCCTTATTCTCCAACTGTTTCATAGCGACCACCCAAC
GAAGACCAAAGACCCGTTCTTTGGTGGCGATTCGACCGGAGCAGAGGAGAAAGGCACTGA
CTTGTAACGCCCTGTTTGGTCTCGGTGTCCCTGAGCTTGCCGTGATCGCTGGCGTCGCAG
CGTTGCTTTTCGGACCTAAGAAGCTTCCTGAGATTGGCAAGAGTATTGGCAAGACCGTCA
AAAGCTTTCAACAGGCTGCAAAAGAGTTTGAGTCTGAGCTTAAGACAGAACCTGAAGATT
CTGTTGCTGGCTCGTCGTCTCCAGTAGCAATGAGCAACAAGGTAGAGGAAAAAACTGAGG
TTTCGTCAAGCTCAAAGGATAATGCATGAATGAAGAATGATGCGGCTTTCTTTGTGTTTT
CCCTGTAGCTAGAACAGTTTATGAAATGAGTTTAGATCAAATACTCTTTGTTGATGGAAG
CAGACTTGTCTTCCTATGATATATGGTTTCATGGTGTTTGA

QA 2 582 2 582
DS 

RD RR2AZ95JQ 546 0 0
TTCTCCGCCACCAGTCACTCTGCCTCTCTCTTCATCTCGCTCTTCCTTATTCTCCAACTG
TTTCATAGCGACCACCCAACGAAGGCCAAAGACC*GTTCTTTGGTGGCGATTCGACCGGA
GCAGAGGAGAAAGGCACTGACTTGTAACGCCCTGTTTGGTCTCGGTGTCCCTGAGCTTGC
CGTGATCGCTGGCGTCGCAGCGTTGCTTTTCGGACCTAAGAAGCTTCCTGAGATTGGCAA
GAGTATTGGCAAGACCGTCAAAAGCTTTCAACAGGCTGCAAAAGAGTTTGAGTCTGAGCT
TAAGACAGAACCTGAAGATTCTGTTGCTGGCTCGTCGTCTCCAGTAGCAATGAGCAACAA
GGAAGAGGAAAAAACTGAGGTTTCGACAAGCTCAAAGGATAATGCATGAATGAAGAATGA
TGCGGCCTTCTTTGTGTTTTCCCTGTAGCTAGAACAGTTTATGAAATGAGTTTAGATCAA
ATACTCTTTGTTGATGGAAGCAGACTTGTCTTCCTATGATATATGGTTTCATGGTGTTTG
AATCTC

QA 1 546 1 546
DS 



AS 2 5

CO CL1589Contig1 522 2 7 U
GAGCACAAGTGGAAGATATGCCCATATACAAAACCAAAAACACAGTTTAAATCTCATGAA
TATAATCACATATTCAGTTTATCTGTTCTTTTTTTATTAGAGTAAGAAAAAGGAAAAAAA
GTTCATTTCTTCTGATCACTCATAAGATCTCAAAAAGCAAAACAAAACAAAAAAAAGAAC
ATTTTTATCTCTACTTCCCTTCAAAACTCATTTGCTGTCCAAACCGGCGAGCACATTCCT
GGAATCTCATGACCAGACCGCTACAACTTAAGGGGTTCTCGACGTTCTCCTTGTAACATT
TCTTCCACCCTTCGTGATCCGAAAAACAAGGCATTGGTTTCGGTTCCGGGATCTTAAACT
CTTTCTCCCTCAAATCCTTGGCTCTCTCTGTCACCTCATGGACAATGTTCTTTTCTTGTC
TCTCCACCGTCTCAAGAACCTTCTCACTCTCTTTCAAAACAGATTTAATCGATTCCAGCT
CTGTGATTGTTGCTGTTTGTTGTGGAATTGGGAAGAAGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP92JQ U 148
AF RR2BN42TF C 1
BS 1 147 RR2BN42TF
BS 148 176 RR2DP92JQ
BS 177 177 RR2BN42TF
BS 178 227 RR2DP92JQ
BS 228 228 RR2BN42TF
BS 229 422 RR2DP92JQ
BS 423 522 RR2BN42TF

RD RR2DP92JQ 275 0 0
TCTCAAAAAGCAAAACAAAACAAAAAAAATAACATTTTTATCTCTACTTCCCTTCAAAAC
TCATTTGCTGTCCAAACCGGGGAGCACATTCCTGGAATCTCATGACCAGACCGCTACAAC
TTAAGGGGTTCTCGACGTTCTCCTTGTAACATTTCTTCCACCCTTCGTGATCCGAAAAAC
AAGGCATTGGTTTCGGTTCCGGGATCTTAAACTCTTTCTCCCTCAAATCCTTGGCTCTCT
CTGTCACCTCATGGACAATGTTCTTTTCTTGTCTC

QA 1 275 1 275
DS 

RD RR2BN42TF 522 0 0
GAGCACAAGTGGAAGATATGCCCATATACAAAACCAAAAACACAGTTTAAATCTCATGAA
TATAATCACATATTCAGTTTATCTGTTCTTTTTTTATTAGAGTAAGAAAAAGGAAAAAAA
GTTCATTTCTTCTGATCACTCATAAGATCTCAGAAAGCAAAACAAAACAAAAGAAAGAAC
ATTTTTATCTCTACTTCCCTTCAGAACTCATTTGCTGTCCAAACCGGCGAGCACATTCCT
GGAATCTCATGACCAGACCGCTACAACTTAAGGGGTTCTCGACGTTCTCCTTGTAACATT
TCTTCCACGCTTCGTGATCCGAAGAGCAAGGCATTGGTTTCGGTTCCGGGATCTTAAACT
CTTTCTCCCTCAGATCCTTGGCTCTCTCTGTTACCTCATGGACAATGTTCTTTTCTTGTC
TCTCCACCGTCTCAAGAACCTTCTCACTCTCTTTCAAAACAGATTTAATCGATTCCAGCT
CTGTGATTGTTGCTGTTTGTTGTGGAATTGGGAAGAAGAATC

QA 1 522 1 522
DS 



CO CL1589Contig2 717 3 2 U
GGGGGCCGTTGGCCGATCTCTTTTCATACCAGGTTGTTGAAACTCTGGTAATATGGGCGA
TTACACAATTCAGATCACTCCGAAGCTGATCAATCAGTTAGCTCAAGGCAATGAAAAACC
GAAGAGAAAGGTAAAGAGAACCAAACCCAAAGCCTCAGCACCACAGAACAATGCAGATCA
AGCGAGAACACACCGTGATGCAGAGAAACCTAAGCCAATGGGAGAGTTACCGACTCAGCA
GCCACCATTCTTCTTCCCAATTCCACAACAAACAGTAGCAAGCACGGAGCTGGAATCGAT
TAAATCTGTTTTGAAAGAGAGTGAGAAGGTTCTTGAGACGGTGGAGAGACAAGAAAAGAA
CATTGTCCATGAGGTGACAGAGAGAGCCAAGGATCTAAGGGAGAAAGAGTTTAAGATCCC
GGAACCGAAACCAATGCCTTGCTCTTCGGATCACGAAGCGTGGAAGAAATGTTACAAGGA
GAACGTCGAGAACCCCTTAAGTTGTAGCGGTCTGGTCATGAGATTCCAGGAATGTGCTCG
CCGGTTTGGACAGCAAATGAGTTCGGAAGGAAAGTAGAGATAAAAATGTTATTTCTTTTG
TTTTGTTTTGCTTTTTGAGATCTTATGACTGATCAGAAGAAATGAGTTTTTTTCCTTTTT
CTTACTCTAATAAAAAAAGAACAGATAAACTGAATATGTGATTATATTCATGAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP92TF U 10
AF RR2BN50TF U 1
AF RR2BN50JQ C 40
BS 1 677 RR2BN50TF
BS 678 717 RR2BN50JQ

RD RR2DP92TF 556 0 0
G
GGCCGATCTCTTTTCCTACCAGGTTGTTGAAACCCTGGTAATATGGGCGATTACACAATT
CAGATCACTCCGAAGCTGATCAATCAGTTAGCTCAAGGCAATGAAAAACCGAAGAGAAAG
GTAAAGAGAACCAAACCCAAAGCCTCACCACCACAGAACAATGCAGATCAAGCGAGAACA
CACCGTGATGCAGAGAAACCGAAGCCAATGGGAGAGTTACCGACTCAGCAGCCACCATTC
TTCTTCCCAATTCCACAACAAACCGCAGCAAGCACGGAGCTGGAATCGATTAAATCTGTT
TTGAAAGAGAGTGAGAAGGTTCTTGAGACGGTGGAGAGACAAGAAAAGAACATTGTCCAT
GAGGTGACAGAGAGAGCCAAGGATCTGAGGGAGAAAGAGTTTAAGATCCCGGAACCGAAA
CCAATGCCTTGCTCTTCGGATCACGAAGCGTGGAAGAAATGTTACAAGGAGAACGTCGAG
AACCCCTTAAGTTGTAGCGGTCTGGTCATGAGATTCCAGGAATGTGCTCGCCGGTTTGGA
CAGCAAATGAGTTC
T

QA 2 555 2 555
DS 

RD RR2BN50TF 677 0 0
GGGGGCCGTTGGCCGATCTCTTTTCATACCAGGTTGTTGAAACTCTGGTAATATGGGCGA
TTACACAATTCAGATCACTCCGAAGCTGATCAATCAGTTAGCTCAAGGCAATGAAAAACC
GAAGAGAAAGGTAAAGAGAACCAAACCCAAAGCCTCAGCACCACAGAACAATGCAGATCA
AGCGAGAACACACCGTGATGCAGAGAAACCTAAGCCAATGGGAGAGTTACCGACTCAGCA
GCCACCATTCTTCTTCCCAATTCCACAACAAACAGTAGCAAGCACGGAGCTGGAATCGAT
TAAATCTGTTTTGAAAGAGAGTGAGAAGGTTCTTGAGACGGTGGAGAGACAAGAAAAGAA
CATTGTCCATGAGGTGACAGAGAGAGCCAAGGATCTAAGGGAGAAAGAGTTTAAGATCCC
GGAACCGAAACCAATGCCTTGCTCTTCGGATCACGAAGCGTGGAAGAAATGTTACAAGGA
GAACGTCGAGAACCCCTTAAGTTGTAGCGGTCTGGTCATGAGATTCCAGGAATGTGCTCG
CCGGTTTGGACAGCAAATGAGTTCGGAAGGAAAGTAGAGATAAAAATGTTATTTCTTTTG
TTTTGTTTTGCTTTTTGAGATCTTATGACTGATCAGAAGAAATGAGTTTTTTTCCTTTTT
CTTACTCTAATAAAAAA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2BN50JQ 678 0 0
AAACTCTGGTAATATGGGCGATTACACAATTCAGATCACTCCGAAGCTGATCAATCAGTT
AGCTCAAGGCAATGAAAAACCGAAGAGAAAGGTAAAGAGAACCAAACCCAAAGCCTCAGC
ACCACAGAACAATGCAGATCAAGCGAGAACACACCGTGATGCAGAGAAACCTAAGCCAAT
GGGAGAGTTACCGACTCAGCAGCCACCATTCTTCTTCCCAATTCCACAACAAACAGTAGC
AAGCACGGAGCTGGAATCGATTAAATCTGTTTTGAAAGAGAGTGAGAAGGTTCTTGAGAC
GGTGGAGAGACAAGAAAAGAACATTGTCCATGAGGTGACAGAGAGAGCCAAGGATCTAAG
GGAGAAAGAGTTTAAGATCCCGGAACCGAAACCAATGCCTTGCTCTTCGGATCACGAAGC
GTGGAAGAAATGTTACAAGGAGAACGTCGAGAACCCCTTAAGTTGTAGCGGTCTGGTCAT
GAGATTCCAGGAATGTGCTCGCCGGTTTGGACAGCAAATGAGTTCGGAAGGAAAGTAGAG
ATAAAAATGTTATTTCTTTTGTTTTGTTTTGCTTTTTGAGATCTTATGACTGATCAGAAG
AAATGAGTTTTTTTCCTTTTTCTTACTTTAATAAAAAAAGAACAGATAAACTGAATATGT
GATTATATTCATGAGATT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 5

CO CL1590Contig1 1266 5 16 U
GGGTGCCATCAGCTTTTACATTACGAGAAAACACTTACAAATCTAAGTGAGATATCTCTC
CTTCTTCCTCCAAAAAACCCTAAGCAGTTTATTTAAACCAAAAGAAAACCATGCCTCTCT
TTGACACTCACAACACATGGGCCTTTGTCTTTGGTTTGATGGGGAATGTAATCTCCTTCG
CCGTGTTCCTCTCTCCTGTGCCAACGTTCTATAGGGTGTGGAAGAAGAAGACAACGGAGG
GGTTTCAGTCTCTTCCTTACGTCGTGGCGCTCTTCAGTGCAACACTTTGGCTTTACTACG
CAACACAGAAGAAAGATGTCTTCCTCCTTGTTACCATCAACTCCTTTGGATGCTTCATAG
AAACCATCTACATCTCTATCTTCCTTGCCTTCGCACCCAAGAAAGCCAGGATGCTGACAG
TGAAGTTGCTACTTCTTATGAACTTTGGAGGATTCTGCTTGATTCTCCTT*CTATGTCAA
TTCTTGGCAAAAGGAACCACACGTGCTAAGATCATCGGAGGAATATGTGTCGGATTCTCT
GTTTGTGTTTTTGCTGCTCCTCTAAGCATAATCAGGACGGTAATAAAGACCAGAAGTGTG
GAGTACATGCCCTTTAGCTTATCCTTAACCCTTACAATCAGTGCTGTCGTATGGCTCCTT
TATGGTCTTGCTCTCAAGGACATCTATGTTGCTTTCCCTAATGTGATTGGTTTTGCCCTC
GGTGCACTTCAAATGATACTCTACGTGGTTTACAAATACTGTAAAACGCCGCCACATTTG
GGAGAGAAAGAAGTGGAAGCTGCTAAGTTACCGGAGGTGACCCTCGATATGCTGAAGCTA
GGCACCGTGTCGTCCCCTGATCCAATCGCAGCCGTTCGTCAAACGAACAAGTGTACCTGC
GGAAATGATCGGAGGGCTGAGATTGAAGATGGACAAAATGCTAAAAACGGCAAGCAGTCC
TCTTCGGCAACAGCCACATGAACAATCTCGTTGACGACTATGCAATGTTGACTTTACCCC
CAACTTGATATACCAACCACCACGTGTTCCCGTTATGCTGTCGTATTTTTCTGAGTTAAT
CAAGTGTGCGAAGTAGAGAAATAATTTCCGAGGATAAATATATGCATTTTCGAATGTTAT
ATATATGTTTCTGGAATTAATTTCTCCACTTCTTTTTAAAACTTTTATGTAATTACCTAT
TGGG*ATATGTATATTTCCTATTTTCAGGTGTAACGAAAACTATCAAAGTTATCTATTGG
CTGATT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2DK79TF U 1
AF RR2B959TF U 2
AF RR2B959JQ C 394
AF RR2AE07TF U 553
AF RR2DK79JQ C 807
BS 1 732 RR2DK79TF
BS 733 733 RR2B959TF
BS 734 765 RR2DK79TF
BS 766 766 RR2B959TF
BS 767 789 RR2DK79TF
BS 790 814 RR2B959TF
BS 815 816 RR2AE07TF
BS 817 835 RR2B959TF
BS 836 836 RR2AE07TF
BS 837 840 RR2B959TF
BS 841 841 RR2AE07TF
BS 842 901 RR2B959TF
BS 902 912 RR2AE07TF
BS 913 913 RR2B959JQ
BS 914 1226 RR2AE07TF
BS 1227 1266 RR2DK79JQ

RD RR2DK79TF 791 0 0
GGGTGCCATCAGCTTTTACATTACGAGAAAACACTTACAAATCTAAGTGAGATATCTCTC
CTTCTTCCTCCAAAAAACCCTAAGCAGTTTATTTAAACCAAAAGAAAACCATGCCTCTCT
TTGACACTCACAACACATGGGCCTTTGTCTTTGGTTTGATGGGGAATGTAATCTCCTTCG
CCGTGTTCCTCTCTCCTGTGCCAACGTTCTATAGGGTGTGGAAGAAGAAGACAACGGAGG
GGTTTCAGTCTCTTCCTTACGTCGTGGCGCTCTTCAGTGCAACACTTTGGCTTTACTACG
CAACACAGAAGAAAGATGTCTTCCTCCTTGTTACCATCAACTCCTTTGGATGCTTCATAG
AAACCATCTACATCTCTATCTTCCTTGCCTTCGCACCCAAGAAAGCCAGGATGCTGACAG
TGAAGTTGCTACTTCTTATGAACTTTGGAGGATTCTGCTTGATTCTCCTT*CTATGTCAA
TTCTTGGCAAAAGGAACCACACGTGCTAAGATCATCGGAGGAATATGTGTCGGATTCTCT
GTTTGTGTTTTTGCTGCTCCTCTAAGCATAATCAGGACGGTAATAAAGACCAGAAGTGTG
GAGTACATGCCCTTTAGCTTATCCTTAACCCTTACAATCAGTGCTGTCGTATGGCTCCTT
TATGGTCTTGCTCTCAAGGACATCTATGTTGCTTTCCCTAATGTGATTGGTTTTGCCCTC
GGTGCACTTCAA*TGATACTCTACGTGGTTTACAAATACTGTAAA*CGCCGCCACATTTG
GGAGAGAAA
AA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2B959TF 900 0 0
GGTGCCATCAGCTTTTACATTACGAGAAAACACTTACAAATCTAAGTGAGATATCTCTCC
TTCTTCCTCCAAAAAACCCTAAGCAGTTTATTTAAACCAAAAGAAAACCATGCCTCTCTT
TGACACTCACAACACATGGGCCTTTGTCTTTGGTTTGATGGGGAATGTAATCTCCTTCGC
CGTGTTCCTCTCTCCTGTGCCAACGTTCTATAGGGTGTGGAAGAAGAAGACAACGGAGGG
GTTTCAGTCTCTTCCTTACGTCGTGGCGCTCTTCAGTGCAACACTTTGGCTTTACTACGC
AACACAGAAGAAAGATGTCTTCCTCCTTGTTACCATCAACTCCTTTGGATGCTTCATAGA
AACCATCTACATCTCTATCTTCCTTGCCTTCGCACCCAAGAAAGCCAGGATGCTGACAGT
GAAGTTGCTACTTCTTATGAACTTTGGAGGATTCTGCTTGATTCTCCTT*CTATGTCAAT
TCTTGGCAAAAGGAACCACACGTGCTAAGATCATCGGAGGAATATGTGTCGGATTCTCTG
TTTGTGTTTTTGCTGCTCCTCTAAGCATAATCAGGACGGTAATAAAGACCAGAAGTGTGG
AGTACATGCCCTTTAGCTTATCCTTAACCCTTACAATCAGTGCTGTCGTATGGCTCCTTT
ATGGTCTTGCTCTCAAGGACATCTATGTTGCTTTCCCTAATGTGATTGGTTTTGCCCTCG
GTGCACTTCAAATGATACTCTACGTGGTTTACAAATACTGTAAAACGCCGCCACATTTGG
GAGAGAAAGAAGTGGAAGCTGCTAAGTTACCGGGAGTGACCCTCGATATGCTGA*GCTAT
GCACCGTGTCGTCCCCTGATCCAATCGCAGCCGTTCGTCAAACGAACAAGTGTACCTGCG

QA 1 900 1 900
DS 

RD RR2B959JQ 838 0 0
CACCCAAGAAAGCCAGGATGCTGACAGTGAAGTTGCTACTTCTTATGAACTTTGGAGGAT
TCTGCTTGATTCTCCTTTCTATGTCAATTCTTGGCAAAAGGAACCACACGTGCTAAGATC
ATCGGAGGAATATGTGTCGGATTCTCTGTTTGTGTTTTTGCTGCTCCTCTAAGCATAATC
AGGACGGTAATAAAGACCAGAAGTGTGGAGTACATGCCCTTTAGCTTATCCTTAACCCTT
ACAATCAGTGCTGTCGTATGGCTCCTTTATGGTCTTGCTCTCAAGGACATCTATGTTGCT
TTCCCTAATGTGATTGGTTTTGCCCTCGGTGCACTTCAAATGATACTCTACGTGGTTTAC
AAATACTGTAAAACGCCGCCACATTTGGGAGAGAAAGAAGTGGAAGCTGCTAAGTTACCG
GAGGTGACCCTCGATATGCTGAAGCTATGCACCGTGTCGTCCCCTGATCCAATCGCAGCC
GTTCGTCAAACGAACAAGTGTACCTGCGGAAATGATCGGAGGGCTGAGATTGAAGATGGA
CAAAATGCTAAAAACGGCAAGCAGTCCTCTTCGGCAACAGCCACATGAACAATCTCGTTG
ACGACTATGCAATGTTGACTTTACCCCCAACTTGATATACCAACCACCACGTGTTCCCGT
TATGCTGTCGTATTTTTCTGAGTTAATCAAGTGTGCGAAGTAGAGAAATAATTTCCGAGG
ATAAATATATGCATTTTCGAATGTTATATATATGTTTCTGGAATTAATTTCTCCACTTCT
TTTTAAAACTTTTATGTAATTACCTATTGGG*ATATGTATATTTCCTATTTTC
AGGTG

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2AE07TF 674 0 0
GCTGCTCCTCTAAGCATAATCAGGACGGTAATAAAGACCAGAAGTGTGGAGTACATGCCC
TTTAGCTTATCCTTAACCCTTACAATCGGTGCTGTCGTATGGCTCCTTTATGGTCTTGCT
CTCAAGGACATCTATGTTGCTTTCCCTAATGTGATTGGTTTTGCCCTCGGTGCACTTCAA
ATGATACTCTACGTGGTTTACAAATACTGTAAAACGCCGCCACATTTGGGAGAGAAAGAA
GTGGAAGCTGCTAAGTTACCGGAGGTGACCCTCGATATGCTGAAGCTAGGCACCGTGTCG
CCCCCTGATCCAATCGCAGCCGTTCGTCAAACGAACAAGTGTACCTGCGGAAATGATCGG
*GGGCTGAGATTGAAGATGGACAAAATGCTAAAAACGGCAAGCAGTCCTCTTCGGCAACA
GCCACATGAACAATCTCGTTGACGACTATGCAATGTTGACTTTACCCCCAACTTGATATA
CCAACCACCACGTGTTCCCGTTATGCTGTCGTATTTTTCTGAGTTAATCAAGTGTGCGAA
GTAGAGAAATAATTTCCGAGGATAAATATATGCATTTTCGAATGTTATATATATGTTTCT
GGAATTAATTTCTCCACTTCTTTTTAAAACTTTTATGTAATTACCTATTGGG*ATATGTA
TATTTCCTATTTTC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2DK79JQ 460 0 0
GTTACCGGAGGTGACCCTCGATATGCTGAAGCTAGGCACCGTGTCGTCCCCTGATCCAAT
CGCAGCCGTTCGTCAAACGAACAAGTGTACCTGCGGAAATGATCGGAGGGCTGAGATTGA
AGATGGACAAAATGCTAAAAACGGCAATCAGTCCTTTTCGGCAACAGCCACATGAACAAT
TTCGTTGACGACTATGCAATGTTGACTTTACCCCCAACTTGATATACCAAC*ACCACGTG
TTCCCGTTATGCTGTCGTATTTTT*TGAGTTAATCAAGTGTGCGAAGTAGAGAAATAATT
TCCGAGGATAAATATATGCATTTTCGAATGTTATATATATGTTTTTGGAATTAATTTTTC
CACTTCTTTTTAAAACTTTTATGTAATTACCTATTGGGGATATGTATATTTCCTATTTTC
AGGTGTAACGAAAACTATCAAAGTTATCTATTGGCTGATT

QA 1 460 1 460
DS 



AS 1 5

CO CL1591Contig1 860 5 15 U
GGAGGAGCCGGTGCGTAATCTCTTCCCCTTATCTTCATCTTCTTCGTGCGGATTGGATTC
TCCAGCAACACAACAATGGCGTTATCGGTTTCGAACCTCGCCTCTTCTCTCTCGTCTCTC
TCTTTCTCCTCCCAAGTTTCTCAAGGACCAAACGCCATCTCCTTCTCCCGGACGAACTCG
GCGTTCTCACTACCGGCGAAATCCGCTCGTCGCGCTTCTCTATCAGTTACCGCCACGGTG
GCTGCTCCCGATGAAGTATCGGAGGATAATGATACAATGGAGCTGAAGAAGTACGTGAAA
TCTCGGCTTCCGGGAGGTTTCGCAGCACAGAAGATCATAGGCACGGGGCGGCGTAAGTGC
GCAATCGCTAGAGTTGTGCTCCAAGAAGGCACCGGCAAAGTTATCATAAACTATCGCGAT
GCCAAGGAGTACCTTCAGGGCAACCCACTGTGGCTTCAATACGTTAAAGCGCCGTTAGTG
ACACTTGGTTACGAGAACAGCTATGACGTGTTTGTGAAAGCTCATGGAGGCGGTCTCTCT
GGTCAAGCTCAGGCCATTACTCTCGGAGTTGCTCGTGCCCTCTTGAAGGTAAGTGCTGAC
CATAGATCGCCTTTGAAGAAGGAAGGTTTGCTCACCAGAGACGCGAGAGTCGTTGAAAGA
AAGAAGGTTGGGCTCAAGAAGGCCCGTAAAGCACCACAATTCTCCAAGCGTTAAAAAGAA
CCCTTTTGTTTTTTGTATTATTTGTTGGATCATCCTTTGCCTCCACTTTCTTTTTCT**A
TGTTCATGTGTTGATGAACCAATCTCTGTTTTGATTGAATATAATGCAAATCCAGAGAGT
GAGAATTCATTGTTTACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK64TF U 64
AF RR2BH70TF U 1
AF RR2EK64JQ C 354
AF RR2BH70JQ C 42
AF RR2GU77TF U 255
BS 1 613 RR2BH70TF
BS 614 635 RR2GU77TF
BS 636 636 RR2BH70JQ
BS 637 641 RR2GU77TF
BS 642 642 RR2BH70JQ
BS 643 644 RR2GU77TF
BS 645 645 RR2BH70JQ
BS 646 722 RR2GU77TF
BS 723 723 RR2BH70JQ
BS 724 733 RR2GU77TF
BS 734 734 RR2BH70JQ
BS 735 777 RR2GU77TF
BS 778 779 RR2BH70JQ
BS 780 844 RR2GU77TF
BS 845 860 RR2BH70JQ

RD RR2EK64TF 114 0 0
GGG
AACACAACAATGGCGTTATCGGTTTCGAACCTCGCCTCTTCTCTCTCGTCTCTCTCTTTC
TCCTCCCAAGTTTCTCAAGGACCAAACGCCATCTCCTTCTCCCGGACGAAC

QA 4 114 4 114
DS 

RD RR2BH70TF 613 0 0
GGAGGAGCCGGTGCGTAATCTCTTCCCCTTATCTTCATCTTCTTCGTGCGGATTGGATTC
TCCAGCAACACAACAATGGCGTTATCGGTTTCGAACCTCGCCTCTTCTCTCTCGTCTCTC
TCTTTCTCCTCCCAAGTTTCTCAAGGACCAAACGCCATCTCCTTCTCCCGGACGAACTCG
GCGTTCTCACTACCGGCGAAATCCGCTCGTCGCGCTTCTCTATCAGTTACCGCCACGGTG
GCTGCTCCCGATGAAGTATCGGAGGATAATGATACAATGGAGCTGAAGAAGTACGTGAAA
TCTCGGCTTCCGGGAGGTTTCGCAGCACAGAAGATCATAGGCACGGGGCGGCGTAAGTGC
GCAATCGCTAGAGTTGTGCTCCAAGAAGGCACCGGCAAAGTTATCATAAACTATCGCGAT
GCCAAGGAGTACCTTCAGGGCAACCCACTGTGGCTTCAATACGTTAAAGCGCCGTTAGTG
ACACTTGGTTACGAGAACAGCTATGACGTGTTTGTGAAAGCTCATGGAGGCGGTCTCTCT
GGTCAAGCTCAGGCCATTACTCTCGGAGTTGCTCGTGCCCTCTTGAAGGTAAGTGCTGAC
CATAGATCGCCTT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2EK64JQ 467 0 0
TAAGTGCGCAATCGCTAGAGTTGTGCTCCAAGAAGGCACCGGCAAAGTTATCATAAACTA
TCGGGATGCCAAGGAGTACCTTCAGGGCAACCCACTGTGGCTTCAATACGTTAAAGTCCC
GTTAGTGACACTTGGTTACGAGAACAGATATGACGTGTTTGTGAAAGCTCATGGAGGCGG
TCTTTCTGGTCAAGCTCAGGCCATTACTCTCGGAGTTGCTCGTGCCCTCTTGAAGGTAAG
TGCTGACCATAGATCGCCTTTGAAGAAGGAAGGTTTGCTCAC*AGAGACGCGAGAGTCGT
TGAAAGAAAGAAGGTTGGGCTCAAGAAGGCCCGTAAAGCACCACAATTCTCCAAGCGTTA
AAAAGAACCCTTTTGTTTTTTGTATTATTTGTTGGATCATCCTTTGCCTCCACTTTCTTT
TTCT**ATGTTCATGTGTTGATGAACCAATCTCTGTTTTGATTGAAT

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2BH70JQ 819 0 0
CTTCGTGCGGATTGGATTCTCCAGCAACACAACAATGGCGTTATCGGTTTCGAACCTCGC
CTCTTCTCTCTCGTCTCTCTCTTTCTCCTCCCAAGTTTCTCAAGGACCAAACGCCATCTC
CTTCTCCCGGACGAACTCGGCGTTCTCACTACCGGCGAAATCCGCTCGTCGCGCTTCTCT
ATCAGTTACCGCCACGGTGGCTGCTCCCGATGAAGTATCGGAGGATAATGATACAATGGA
GCTGAAGAAGTACGTGAAATCTCGGCTTCCGGGAGGTTTCGCAGCACAGAAGATCATAGG
CACGGGGCGGCGTAAGTGCGCAATCGCTAGAGTTGTGCTCCAAGAAGGCACCGGCAAAGT
TATCATAAACTATCGCGATGCCAAGGAGTACCTTCAGGGCAACCCACTGTGGCTTCAATA
CGTTAAAGCGCCGTTAGTGACACTTGGTTACGAGAACAGCTATGACGTGTTTGTGAAAGC
TCATGGAGGCGGTCTCTCTGGTCAAGCTCAGGCCATTACTCTCGGAGTTGCTCGTGCCCT
CTTGAAGGTAAGTGCTGACCATAGATCGCCTTTGAAGAAGGAAGGTTTGCTCACCAGAGA
CGCGAGAGTCGTTGAAAGAAAGAAGGTTGGGCTCAAGAAGGCCCGTAAAGCACCACAATT
CTCCAAGCGTTAAAAAGAACCCTTTTGTTTTTTGTATTATTTGTTGGATCATCCTTTGCC
TCCACTTTCTTTTTCT**ATGTTCATGTGTTGATGAACCAATCTCTGTTTTGATTGAATA
TAATGCAAATCCAGAGAGTGAGAATTCATTGTTTACACC

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2GU77TF 590 0 0
G
GTATCGGAGGATAATGATACAATGGAGCTGAAGAAGTACGTGAAATCTCGGCTTCCGGGA
GGTTTCGCAGCACAGAAGATCATAGGCACGGGGCGGCGTAAGTGCGCCATCGCTAGAGTT
GTGCTCCAAGAAGGCACCGGCAAAGTTATTATTAACTATCGCGATGCCAAGGAGTACCTT
CAGGGCAACCCACTGTGACTTCAATACGTTAAAGTGCCGTTAGTGACACTTGGTTACGAG
AACAGCTACGACGTGTTTGTGAAAGCCCATGGTGGCGGTCTCTCTGGTCAAGCTCAGGCC
ATTACTCTCGGAGTTGCTCGTGCCCTCTTGAAGGTAAGTGCTGACCATAGATCGCCTTTG
AAGAAGGAAGGTTTGCTCACTAGAGATGCAAGAGTCGTTGAAAGAAAGAAGGTTGGGCTC
AAGAAGGCCCGTAAAGCACCACAATTCTCCAAGCGTTAAAAAGAACCGTTTTGTTTTT*G
TATTATTTGTTGGATCATCCTTTGCCTCCACTTTCTTTTTCTTTATGTTCATGTGTTGAT
GAACCAATCTCTGTTTTGATTGAATATAATGCAAATCCAGAGAGTGAGA

QA 2 590 2 590
DS 



AS 1 5

CO CL1592Contig1 1501 5 7 U
GTAAACACATTAGCAGAAAAGGCATGAATCTGACTGAACATGCAACTCTCATCTGCATTA
CACTCTGTAACACTCACATCAGTCATACAACAAGCAGTCCCGAGATTGCTCTCTGTAACA
ATAGCATTCCTCGAGGCCTTTTTATTGAATAAATAAATACAAAAAGGAAAAACAATGCAG
ATATATTTATTTAAGCGTATAATAGCACTTTCTTTAGGACAAAATAATAAAGAACCAGGG
GGTTTGGGGGAGGTTTTAACAACAAATCCACAGGAAGAAAAGGAAACACTGTGTCTGTGT
TTTGGTTGCTTTCCATTATATGGAAAGAGACATGCAAAGTCCCATCAAGCTTGCAAGAAG
CTGGCGTACTTAGCACCAAGGAGAAGCCTCTGAATACACAAGAGAGCGTTCTTGGTTACC
TCAGCGTTCTCATGGTTCATCAGTTTCATCACTCTTTCTTTCGCCTTGAGGTCTGTCACG
ATCGCTCTCCCCGCTGGGTGGTACTGTATGAACTGAGAGATATCAAAGCACGCCACCGCC
AATGATCTTGGATCACTTGACGTATCCAGGATTGTGAGGAGAACCCTGAGTATCTGGAAG
TCATTCTCCTCAAAGCAAGTGACATTCTCACGCCAGAAATTGGCTTCTTTGTGCATTGGG
TTCCAGTCAAGATGGCCAAGAAGAACCTCTTGCTTGTATTTGTCAAAGGAACTCAACTTC
TTGATCTTGTCTTTTAGCCCTTCTTCTAGTTGGTTCAGTGCATCCAGCAAGTCCTCGTCA
CTCCATGCTTGTGTTTTCAGACTGTGGATGATATGTGGGAGTCCAAGATCAACCATCTGG
GCACCAAATGTACCTTTTGGGAGCAAGTTCCTGAATGTCAATATGACAACTCTGACAACC
TTTTCCTTAGTCGAGCTCTTAACCACTTCCGTGAGCCTTTGCATTGTCCTAGATGTTGCC
AAGTACTCTATAGCGGGTTCATAATATGACAGAAGCCAGATGCAGACACAGGTTTCGTAG
AGAAGCTGGATAGACTGCTGAGTGGATGCTGGTGAGATTAAAGGGACAAGTAACTTCACA
CCATCCGCCTGAACAAACGATGATCTGACAACAGATTCCTTAAGCAGTGTTGACAGGCAA
TTGATTGCAACTGGAGCACCACGAGTAGGGTGAGAAGGTTGCCTCAACTGGGCACAAAGC
CACTCCACCAACCCATTGAGTACATCATCAATTGTAGTAATAGGTTTCTTAGAAGCAGAG
GCTTCTCCATTACCAGCTTTTGGCCTAGCACTTATTATCCAGGCAAGGATCTTGCAGCTT
TTTTCTTGAATGAACCAATTTCCCTTCGACAGCAACCTCAAGAAAGGCTCGTAAGTATCC
TCATGTGCCAAAGATTCATCATGGAATAACCGAGCTCGGGTCGGGTTTGCTGAGGGCATC
TCATAAATCAAAGCCAAAACATATTCGACTGTTTCCTCCTTGAATATATCACGTAAGATG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2AQ37JQ U 32
AF RR2G629JQ U 1
AF RR2AQ37TF C 72
AF RR2AB19JQ U 165
AF RR2FV36TF C 910
BS 1 483 RR2G629JQ
BS 484 484 RR2AQ37JQ
BS 485 521 RR2G629JQ
BS 522 522 RR2AQ37JQ
BS 523 675 RR2G629JQ
BS 676 983 RR2AB19JQ
BS 984 1501 RR2FV36TF

RD RR2AQ37JQ 548 0 0
GACTGAACATGCAACTCTCATCTGCATTACACTCTGTAACACTCACATCAGTCATACAAC
AAGCAGTCCCGAAATTGCTCTCTGTAACAATAGCATTCCTCGAGGCCTTTTTATTGAATA
AATAAATACAAAAAGGAAAAACAATGCAAAAATATTTATTTAAGCGTATAATAGCACTTT
CTTTAGGACAAAATAATAAAAAACCAGGGGGTTTGGGGGAGGTTTTAACAACAAATCCAC
AGGAAAAAAAGGAAACACTGTGTCTGTGTTTTGGTTGCTTTCCATTATATGGAAAGAAAC
ATGCAAAGTCCCATCAAGCTTGCAAGAAGCTGGCGTACTTAGCACCAAGGAAAAGCCTCT
GAATACACAAAAAAGCGTTCTTGGTTACCTCAGCGTTCTCATGGTTCATCAGTTTCATCA
CTCTTTCTTTCGCCTTGAGGTCTGTCACGATCGCTCTCCCCGCTGGGTGGTACTGTATGA
ACTGAGAGATATCAAAGCACGCCACCGCCAATGATCTTGGATCACTTGACGTATCCAGGA
TTGTGAGG

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2G629JQ 675 0 0
GTAAACACATTAGCAGAAAAGGCATGAATCTGACTGAACATGCAACTCTCATCTGCATTA
CACTCTGTAACACTCACATCAGTCATACAACAAGCAGTCCCGAGATTGCTCTCTGTAACA
ATAGCATTCCTCGAGGCCTTTTTATTGAATAAATAAATACAAAAAGGAAAAACAATGCAG
ATATATTTATTTAAGCGTATAATAGCACTTTCTTTAGGACAAAATAATAAAGAACCAGGG
GGTTTGGGGGAGGTTTTAACAACAAATCCACAGGAAGAAAAGGAAACACTGTGTCTGTGT
TTTGGTTGCTTTCCATTATATGGAAAGAGACATGCAAAGTCCCATCAAGCTTGCAAGAAG
CTGGCGTACTTAGCACCAAGGAGAAGCCTCTGAATACACAAGAGAGCGTTCTTGGTTACC
TCAGCGTTCTCATGGTTCATCAGTTTCATCACTCTTTCTTTCGCCTTGAGGTCTGTCACG
ATCACTCTCCCCGCTGGGTGGTACTGTATGAACTGAGAGATGTCAAAGCACGCCACCGCC
AATGATCTTGGATCACTTGACGTATCCAGGATTGTGAGGAGAACCCTGAGTATCTGGAAG
TCATTCTCCTCAAAGCAAGTGACATTCTCACGCCAGAAATTGGCTTCTTTGTGCATTGGG
TTCCAGTCAAGATGG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2AQ37TF 735 0 0
ACTCACATCAGTCATACAACAAGCAGTCCCGAGATTGCTCTCTGTAACAATAGCATTCCT
CGAGGCCTTTTTATTGAATAAATAAATACAAAAAGGAAAAACAATGCAGATATATTTATT
TAAGCGTATAATAGCACTTTCTTTAGGACAAAATAATAAAGAACCAGGGGGTTTGGGGGA
GGTTTTAACAACAAATCCACAGGAAGAAAAGGAAACACTGTGTCTGTGTTTTGGTTGCTT
TCCATTATATGGAAAGAGACATGCAAAGTCCCATCAAGCTTGCAAGAAGCTGGCGTACTT
AGCACCAAGGAGAAGCCTCTGAATACACAAGAGAGCGTTCTTGGTTACCTCAGCGTTCTC
ATGGTTCATCAGTTTCATCACTCTTTCTTTCGCCTTGAGGTCTGTCACGATCGCTCTCCC
CGCTGGGTGGTACTGTATGAACTGAGAGATATCAAAGCACGCCACCGCCAATGATCTTGG
ATCACTTGACGTATCCAGGATTGTGAGGAGAACCCTGAGTATCTGGAAGTCATTCTCCTC
AAAGCAAGTGACATTCTCACGCCAGAAATTGGCTTCTTTGTGCATTGGGTTCCAGTCAAG
ATGGCCAAGAAGAACCTCTTGCTTGTATTTGTCAAAGGAACTCAACTTCTTGATCTTGTC
TTTTAGCCCTTCTTCTAGTTGGTTCAGTGCATCCAGCAAGTCCTCGTCACTCCATGCTTG
TGTTTTCAGACTGT
C

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2AB19JQ 820 0 0
AGGAAAAACAATGCAGATATATTTATTTAAGCGTATAATAGCACTTTCTTTAGGACAAAA
TAATAAAGAACCAGCGGGTTTGGGGGAGGTTTTAACAACAAATCCACAGGAAGAAAAGGA
AACACTGTGTCTGTGTTTTGGTTGCTTTCCATTACATGGAAAGAGACATGCAAAGTCCCA
TCAAGCTTGCAAGAAGCTGGCGTACTTAGCACCAAGGAGAAGCCTCTGAATACACAAGAG
AGCGTTCTTGGTTACCTCAGCGTTCTCATGGTTCATCAGTTTCATCACTCTTTCTTTCGC
CTTGAGGTCTGTCACGATCACTCTCCCCGCTGGGTGGTACTGTATGAACTGAGAGATATC
AAGGCACGCCACCGCCAATGATCTTGGATCACTTGACGTATCCAGGATTGTGAGGAGAAC
CCTGAGTATCTGGAAGTCATTCTCCTCAAAGCAAGTGACATTCTCACGCCAGAAATTGGC
TTCTTTGTGCATTGGGTTCCAGTCAAGATGGCCAAGAAGAACCTCTTGCTTGTATTTGTC
AAAGGAACTCAACTTCTTGATCTTGTCTTTTAGCCCTTCTTCTAGTTGGTTCAGTGCATC
CAGCAAGTCCTCGTCACTCCATGCTTGTGTTTTCAGACTGTGGATGATATGTGGGAGTCC
AAGATCAACCATCTGGGCACCAAATGTACCTTTTGGGAGCAAGTTCCTGAATGTCAATAT
GACAACTCTGACAACCTTTTCCTTAGTCGAGCTCTTAACCACTTCCGTGAGCCTTTGCAT
TGTCCTAGATGTTGCCAAGTACTCTATAGCGGGTTCATA
G

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2FV36TF 592 0 0
GTCGAGCTCTTAACCACTTCCGTGAGCCTTTGCATTGTCCTCGATGTTGCCAAGTACTCT
ATTGCTGGTTCATAATATGACAGAAGCCAGATGCAGACACAGGTTTCGTAGAGAAGCTGG
ATAGACTGCTGAGTGGATGCTGGTGAGATTAAAGGGACAAGTAACTTCACACCATCCGCC
TGAACAAACGATGATCTGACAACAGATTCCTTAAGCAGTGTTGACAGGCAATTGATTGCA
ACTGGAGCACCACGAGTAGGGTGAGAAGGTTGCCTCAACTGGGCACAAAGCCACTCCACC
AACCCATTGAGTACATCATCAATTGTAGTAATAGGTTTCTTAGAAGCAGAGGCTTCTCCA
TTACCAGCTTTTGGCCTAGCACTTATTATCCAGGCAAGGATCTTGCAGCTTTTTTCTTGA
ATGAACCAATTTCCCTTCGACAGCAACCTCAAGAAAGGCTCGTAAGTATCCTCATGTGCC
AAAGATTCATCATGGAATAACCGAGCTCGGGTCGGGTTTGCTGAGGGCATCTCATAAATC
AAAGCCAAAACATATTCGACTGTTTCCTCCTTGAATATATCACGTAAGATGC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL1593Contig1 713 2 2 U
GGAATCTCAAAAAAAAAACGTTCACTCTCATCTCATTCAACAGGTTCCATCTTCACTGAT
CATCTTCTCTCTGTTTCTTCTGTCTTAGGGAGAAATGGCCGTAATCAACAGCCTCCGACG
GGTGGCCCGTTCCTCTCAGGTTACTTTGCAGAGAAGGTATGCTGCTTCACAATACACGTC
TGGTTCGAGGATCTTTACTACAGAGGCTTCACCTCAGAAGCAAACCATAGTTGGGTCTAA
GGGGCATGATATGCTGGCACCTTTTACAGCTGGGTGGCAGAGTGCTGATTTACATCCCTT
GATCATTGCTAAATCCGAGGGAAGTTATGTGTATGATGACCATGGCAAAAAGTATCTTGA
TTCTCTCGCTGGTCTTTGGTGTACTGCCTTGGGAGGAAATGAGCCACGGCTTGTTTCTGC
TGCCGTGGAGCAGTTGAAAACCTTGCCCTTTTATCACTTCTTCTGGAACCGTACTACTAA
GCCTTCTCTGGATCTTGCCAAGGATCTTCTAGAAATGTTCACGGCTAATAAAATGGCTAA
AGCTTTTTTTACAAACAGTGGATCAGAGGCCAATGATACCCAGGTCAAGCTTGTTTGGTA
CTGCAATAACGCACTTGGGAGGCCTGAGAAGAAAAAGTTTATCGCAAGAAAGAAATCGTA
CCATGGCTCCACTCTAATATCAGCAAGTTTGTCCGGCCTTCCAGCACTTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA82TF U 1
AF RR2GA82JQ C 43
BS 1 618 RR2GA82TF
BS 619 713 RR2GA82JQ

RD RR2GA82TF 618 0 0
GGAATCTCAAAAAAAAAACGTTCACTCTCATCTCATTCAACAGGTTCCATCTTCACTGAT
CATCTTCTCTCTGTTTCTTCTGTCTTAGGGAGAAATGGCCGTAATCAACAGCCTCCGACG
GGTGGCCCGTTCCTCTCAGGTTACTTTGCAGAGAAGGTATGCTGCTTCACAATACACGTC
TGGTTCGAGGATCTTTACTACAGAGGCTTCACCTCAGAAGCAAACCATAGTTGGGTCTAA
GGGGCATGATATGCTGGCACCTTTTACAGCTGGGTGGCAGAGTGCTGATTTACATCCCTT
GATCATTGCTAAATCCGAGGGAAGTTATGTGTATGATGACCATGGCAAAAAGTATCTTGA
TTCTCTCGCTGGTCTTTGGTGTACTGCCTTGGGAGGAAATGAGCCACGGCTTGTTTCTGC
TGCCGTGGAGCAGTTGAAAACCTTGCCCTTTTATCACTTCTTCTGGAACCGTACTACTAA
GCCTTCTCTGGATCTTGCCAAGGATCTTCTAGAAATGTTCACGGCTAATAAAATGGCTAA
AGCTTTTTTTACAAACAGTGGATCAGAGGCCAATGATACCCAGGTCAAGCTTGTTTGGTA
CTGCAATAACGCACTTGG

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2GA82JQ 671 0 0
GGTTCCATCTTCACTGATCATCTTCTCTCTGTTTCTTCTGTCTTAGGGAGAAATGGCCGT
AATCAACAGCCTCCGACGGGTGGCCCGTTCCTCTCAGGTTACTTTGCAGAGAAGGTATGC
TGCTTCACAATACACGTCTGGTTCGAGGATCTTTACTACAGAGGCTTCACCTCAGAAGCA
AACCATAGTTGGGTCTAAGGGGCATGATATGCTGGCACCTTTTACAGCTGGGTGGCAGAG
TGCTGATTTACATCCCTTGATCATTGCTAAATCCGAGGGAAGTTATGTGTATGATGACCA
TGGCAAAAAGTATCTTGATTCTCTCGCTGGTCTTTGGTGTACTGCCTTGGGAGGAAATGA
GCCACGGCTTGTTTCTGCTGCCGTGGAGCAGTTGAAAACCTTGCCCTTTTATCACTTCTT
CTGGAACCGTACTACTAAGCCTTTTCTGGATCTTGCCAAGGATCTTCTAGAAATGTTCAC
GGCTAATAAAATGGCTAAAGCTTTTTTTACAAACAGTGGATCAGAGGCCAATGATACCCA
GGTCAAGCTTGTTTGGTACTGCAATAACGCACTTGGGAGGCCTGAGAAGAAAAAGTTTAT
CGCAAGAAAGAAATCGTACCATGGCTCCACTCTAATATCAGCAAGTTTGTCCGGCCTTCC
AGCACTTCACC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 5

CO CL1594Contig1 966 5 15 U
GGGGTCTTGTTGTCGGAGTGAAAATGGCGTCGTCGTACACGCTTTCCTTTATCCCTTTGA
CGGTCGTCGTTCCCCGGCGGAGTGCATCATCATCATCTCCCTCTTCATTGATTCCTCCTC
CTTCTCTGATAGGTAAGAAGCTTCTGGTGAAACAACCGTCGCGCCGCCGCTTCTTCGTCT
CCAAGCACCGGTTCTTGACATCAGCCAGCACCGTCTTTAGCGTCCCAACTGCGCAACCGG
AGAATGGTTCTTCGGACAAGATCCCAAAATGGTCGGCGAGAGCGATAAAATCACTGGCAA
TGGGGGAATTGGAGGCTAGGAAGCTCAAGTATCCAACTACAGGGACCGAGGCCATTCTCA
TGGGTATTTTGGTCGAAGGTACAAGCACAGCTGCTAAGTTCCTGAGGGGGAACGGAATCA
CACTTTTCAAGGTGAGGGATGAGATTATAAAGCTGCTAGGGAAATCAGATATGTACTTCT
TCAGCCCGGAGCATCCTCCTCTTACTGAACCCGCTCGCAGGGCCGTTGACTGGGCTGTTG
ACCAGAAGAAGAAATCTGGTGTGGATGGGGAACTAACAGCAGCCTACTTGCTTCTTGGGG
CTTGGTCTCAGAAGGACTCAGCACGCCGCCAGATTTTGGAGTCGCTCGGGTTCAACGAAG
ATAAAGCCAAACAAGTTGCTGATTCGATGAATGAAGATGTAGATTTGAGCTTCAAGAAAC
AAG*TCAATAGTGATGAGTTCTTATCTCAGTCTGTCACTGTATATGG*AGTAGCAAAAGC
AACTCCTTATTCAAGACAAACCTGTCTCACTCTTATCAAATACGAGACACAGGCCATCAT
CGTTAGCATTTTCTGTCTGTACACTTGGTTGCTGTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGCATT
AGACACCTATTCTGCATCTTATTATACAATTTACAACTTCAAAATATAATTCAGTTGCTA
TTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2G668TF U 1
AF RR2G528TF U 7
AF RR2GQ71TF U 7
AF RR2BV67TF U 15
AF RR2BV67JQ C 275
BS 1 496 RR2G668TF
BS 497 497 RR2G528TF
BS 498 600 RR2G668TF
BS 601 601 RR2BV67TF
BS 602 714 RR2G668TF
BS 715 721 RR2GQ71TF
BS 722 722 RR2BV67TF
BS 723 740 RR2GQ71TF
BS 741 741 RR2BV67TF
BS 742 755 RR2GQ71TF
BS 756 756 RR2BV67TF
BS 757 767 RR2GQ71TF
BS 768 768 RR2BV67TF
BS 769 777 RR2GQ71TF
BS 778 966 RR2BV67JQ

RD RR2G668TF 718 0 0
GGGGTCTTGTTGTCGGAGTGAAAATGGCGTCGTCGTACACGCTTTCCTTTATCCCTTTGA
CGGTCGTCGTTCCCCGGCGGAGTGCATCATCATCATCTCCCTCTTCATTGATTCCTCCTC
CTTCTCTGATAGGTAAGAAGCTTCTGGTGAAACAACCGTCGCGCCGCCGCTTCTTCGTCT
CCAAGCACCGGTTCTTGACATCAGCCAGCACCGTCTTTAGCGTCCCAACTGCGCAACCGG
AGAATGGTTCTTCGGACAAGATCCCAAAATGGTCGGCGAGAGCGATAAAATCACTGGCAA
TGGGGGAATTGGAGGCTAGGAAGCTCAAGTATCCAACTACAGGGACCGAGGCCATTCTCA
TGGGTATTTTGGTCGAAGGTACAAGCACAGCTGCTAAGTTCCTGAGGGGGAACGGAATCA
CACTTTTCAAGGTGAGGGATGAGATTATAAAGCTGCTAGGGAAATCAGATATGTACTTCT
TCAGCCCGGAGCATCCCCCTCTTACTGAACCCGCTCGCAGGGCCGTTGACTGGGCTGTTG
ACCAGAAGAAGAAATCTGGTGTGGATGGGGAACTAACAGCAGCCTACTTGCTTCTTGGGG
TTTGGTCTCAGAAGGACTCAGCACGCCGCCAGATTTTGGAGTCGCTCGGGTTCAACGAAG
ATAAAGCCAAACAAGTTGCTGATTCGATGAATGAAGATGTAGATTTGAGCTTCA
GAAC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2G528TF 706 0 0
GG
GTTGTCGGAGTGAAAATGGCGTCGTCGTACACGCTTTCCTTTATCCCTTTGACGGTCGTC
GTTCCCCGGCGGAGTGCATCATCATCATCTCCCTCTTCATTGATTCCTCCTCCTTCTCTG
ATAGGTAAGAAGCTTCTGGTGAAACAACCGTCGCGCCGCCGCTTCTTCGTCTCCAAGCAC
CGGTTCTTGACATCAGCCAGCACCGTCTTTAGCGTCCCAACTGCGCAACCGGAGAATGGT
TCTTCGGACAAGATCCCAAAATGGTCGGCGAGAGCGATAAAATCACTGGCAATGGGGGAA
TTGGAGGCTAGGAAGCTCAAGTATCCAACTACAGGGACCGAGGCCATTCTCATAGGTATT
TTGGTCGAAGGTACAAGCACAGCTGCTAAGTTCCTGAGGGGGAACGGAATCACACTTTTC
AAGGTGAGGGATGAGATTATAAAGCTGCTAGGGAAATCAGATATGTACTTCTTCAGCCCG
GAGCATCCTCCTCTTACTGAACCCGCTCGCAGGGCCGTTGACTGGGCTGTTGACCAGAAG
AAGAAATCTGGTGTGGATGGGGAACTAACAGCAGCCTACTTGCTTCTTGGGGTTTGGTCT
CAGAAG*ACTCAGCA*GCCGCCAGATTTTGGAGTCGCTCGGGTTCAACGAAGATAAAGCC
AAACAAGTTGCTGATTCGATGAATGAGGATGTAGATTGGAGCTT

QA 3 706 3 706
DS 

RD RR2GQ71TF 771 0 0
GG
GTTGTCGGAGTGAAAATGGCGTCGTCGTACACGCTTTCCTTTATCCCTTTGACGGTCGTC
GTTCCCCGGCGGAGTGCATCATCATCATCTCCCTCTTCATTGATTCCTCCTCCTTCTCTG
ATAGGTAAGAAGCTTCTGGTGAAACAACCGTCGCGCCGCCGCTTCTTCGTCTCCAAGCAC
CGGTTCTTGACATCAGCCAGCACCGTCTTTAGCGTCCCAACTGCGCAACCGGAGAATGGT
TCTTCGGACAAGATCCCAAAATGGTCGGCGAGAGCGATAAAATCACTGGCAATGGGGGAA
TTGGAGGCTAGGAAGCTCAAGTATCCAACTACAGGGACCGAGGCCATTCTCATGGGTATT
TTGGTCGAAGGTACAAGCACAGCTGCTAAGTTCCTGAGGGGGAACGGAATCACACTTTTC
AAGGTGAGGGATGAGATTATAAAGCTGCTAGGGAAATCAGATATGTACTTCTTCAGCCCG
GAGCATCCTCCTCTTACTGAACCCGCTCGCAGGGCCGTTGACTGGGCTGTCGACCAGAAG
AAGAAATCTGGTGTGGATGGGGAACTAACAGCAGCCTACTTGCTTCTTGGGGTTTGGTCT
CAGAAGGACTCAGCACGCCGCCAGATTTTGGAGTCGCTCGGGTTCAACGAAGATAAAGCC
AAACAAGTTGCTGATTCGATGAATGAAGATGTAGATTTGAGCTTCAAGAAACAGG*TCAA
TAGTGATGAGTTTTTATCTCAGTCTGTAACTGTATATGGGAGTAGCAAA

QA 3 771 3 771
DS 

RD RR2BV67TF 771 0 0
AGGGG
GAAAATGGCGTCGTCGTACACGCTTTCCTTTATCCCTTTGACGGTCGTCGTTCCCCGGCG
GAGTGCATCATCATCATCTCCCTCTTCATTGATTCCTCCTCCTTCTCTGATAGGTAAGAA
GCTTCTGGTGAAACAACCGTCGCGCCGCCGCTTCTTCGTCTCCAAGCACCGGTTCTTGAC
ATCAGCCAGCACCGTCTTTAGCGTCCCAACTGCGCAACCGGAGAATGGTTCTTCGGACAA
GATCCCAAAATGGTCGGCGAGAGCGATAAAATCACTGGCAATGGGGGAATTGGAGGCTAG
GAAGCTCAAGTATCCAACTACAGGGACCGAGGCCATTCTCATGGGTATTTTGGTCGAAGG
TACAAGCACAGCTGCTAAGTTCCTGAGGGGGAACGGAATCACACTTTTCAAGGTGAGGGA
TGAGATTATAAAGCTGCTAGGGAAATCAGATATGTACTTCTTCAGCCCGGAGCATCCTCC
TCTTACTGAACCCGCTCGCAGGGCCGTTGACTGGGCTGTTGACCAGAAGAAGAAATCTGG
TGTGGATGGGGAACTAACAGCAGTCTACTTGCTTCTTGGGGCTTGGTCTCAGAAGGACTC
AGCA*GCCGCCAGATTTTGGAGTCGCTCGGGTTCAACGAAGATAAAGCCAAACAAGTTGC
TGATTCGATGAATGAAGATGTAGATTTGAGCTTCAAGAAACAAG*TCAATAGTGATGAGT
TCTTATCTCAGTCTGTCACTGTATATGG*AGTAGCAAA
GCACTCCT

QA 6 763 6 763
DS 

RD RR2BV67JQ 692 0 0
GGCGAGAGCGATAAAATCACTGGCAATGGGGGAATTGGAGGCTAGGAAGCTCAAGTATCC
AACTACAGGGACCGAGGCCATTCTCATGGGTATTTTGGTCGAAGGTACAAGCACAGCTGC
TAAGTTCCTGAGGGGGAACGGAATCACACTTTTCAAGGTGAGGGATGAGATTATAAAGCT
GCTAGGGAAATCAGATATGTACTTCTTCAGCCCGGAGCATCCTCCTCTTACTGAACCCGC
TCGCAGGGCCGTTGACTGGGCTGTTGACCAGAAGAAGAAATCTGGTGTGGATGGGGAACT
AACAGCAGTCTACTTGCTTCTTGGGGCTTGGTCTCAGAAGGACTCAGCAGGCCGCCAGAT
TTTGGAGTCGCTCGGGTTCAACGAAGATAAAGCCAAACAAGTTGCTGATTCGATGAATGA
AGATGTAGATTTGAGCTTCAAGAAACAAGGTCAATAGTGATGAGTTCTTATCTCAGTCTG
TCACTGTATATGG*AGTAGCAAAAGCAACTCCTTATTCAAGACAAACCTGTCTCACTCTT
ATCAAATACGAGACACAGGCCATCATCGTTAGCATTTTCTGTCTGTACACTTGGTTGCTG
TTAAAGTTTTATTTTATTTTTGCATTAGACACCTATTCTGCATCTTATTATACAATTTAC
AACTTCAAAATATAATTCAGTTGCTATTGCTT

QA 1 692 1 692
DS 



AS 2 4

CO CL1595Contig1 517 2 2 U
GCGGGGGAATAACGGGGAACAAAGGGAGATGTTACGATTTCTGGATGGATTTCAGCGAGT
GTATGTCACACTGCAGAGAGCCCAAGGATTGTTCTCTTCTTCGTGAAGACTACCTCGAGT
GCCTCCACCATTCCAAAGAGTTCCAACGAAGAAACAGGATATACAAAGAGGAACATCGTA
AACTAAGAGCAGCTTCTAGGAAAGGTGAAGAATCTGGCGATGCTTCTCATACTCCTCGCT
AATCAAATTATCTTTCTCCTCCAAGTTTGCATCAAGAAAGAATAAGGAAAAGTTTCGTCA
AGTTTCTGTATGTTGTGTGTCGAACTCCCTTTTGATTGTTTCCAGTTTGCTTCTGCAATG
AATGTTTTGTCTTTTTTTTTCTCTTCTCTATTTTTACATTTGGATTGAGTTGTAATATGG
GCCTTTAGCCTGTTCATCTCACACAAACTTGTTTCTTCATGGCAATAATTTTAAAACAGA
CAGAAGTGGATGAAATAATGAAATGATACATTGACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2D803TF U 1
AF RR2D803JQ C 124
BS 1 515 RR2D803TF
BS 516 517 RR2D803JQ

RD RR2D803TF 517 0 0
GCGGGGGAATAACGGGGAACAAAGGGAGATGTTACGATTTCTGGATGGATTTCAGCGAGT
GTATGTCACACTGCAGAGAGCCCAAGGATTGTTCTCTTCTTCGTGAAGACTACCTCGAGT
GCCTCCACCATTCCAAAGAGTTCCAACGAAGAAACAGGATATACAAAGAGGAACATCGTA
AACTAAGAGCAGCTTCTAGGAAAGGTGAAGAATCTGGCGATGCTTCTCATACTCCTCGCT
AATCAAATTATCTTTCTCCTCCAAGTTTGCATCAAGAAAGAATAAGGAAAAGTTTCGTCA
AGTTTCTGTATGTTGTGTGTCGAACTCCCTTTTGATTGTTTCCAGTTTGCTTCTGCAATG
AATGTTTTGTCTTTTTTTTTCTCTTCTCTATTTTTACATTTGGATTGAGTTGTAATATGG
GCCTTTAGCCTGTTCATCTCACACAAACTTGTTTCTTCATGGCAATAATTTTAAAACAGA
CAGAAGTGGATGAAATAATGAAATGATACATTGAC
TT

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2D803JQ 394 0 0
TCCACCATTCCAAAGAGTTCCAACGAAGAAACAGGATATACAAAGAGGAACATCGTAAAC
TAAGAGCAGCTTTTAGGAAAGGTGAAGAATCTGGGGATGCTTTTCATACTCCTCGCTAAT
CAAATTATCTTTTTCCTCCAAGTTTGCATCAAGAAAGAATAAGGAAAAGTTTCGTCAAGT
TTCTGTATGTTGTGTGTCGAACTCCCTTTTGATTGTTTCCAGTTTGCTTTTGCAATGAAT
GTTTTGTCTTTTTTTTTCTCTTCTCTATTTTTACATTTGGATTGAGTTGTAATATGGGCC
TTTAGCCTGTTCATCTCACACAAACTTGTTTCTTCATGGCAATAATTTTAAAACAGACAG
AAGTGGATGAAATAATGAAATGATACATTGACTT

QA 1 394 1 394
DS 



CO CL1595Contig2 624 2 2 U
GGGGGTCGTTGGTAAGAAAGATATCAGGTAGGTCTTCGTTGAAGAGAGGATCAAATCGGA
ATCAGGAGAGAGAGATGGCGTCGGGGTGGGGAATAACGGGGAACAAAGGGAGATGTTACG
ATTTCTGGATGGATTTCAGCGAGTGTATGTCACACTGCAGAGAGCCCAAGGATTGTTCTC
TTCTTCGTGAAGACTACCTCGAGTGCCTCCACCATTCCAAAGAGTTCCAACGAAGAAACA
GGATATACAAAGAGGAACAGCGTAAACTAAGAGCAGCTTCAAGGAAAGGTGAAGAAACTG
GCGATGCTTCTCATCCTCATCACTAATCCACATATTTTTCTTCTTCCAAGTTTGCTTCTC
TCGCATTTGGAGAAGAAAGGATAGGGAAAAGTTTCGTCAAGTTTCTGTATCTTGTGTGTT
AAAAACTCCCTTTTGATTGTTTCCAGGTTGCTTCTGCAATGAATGTTTTGTCTTTTTCAT
CTTCTCCTCTATTTTTACCTTTGGATTGAGTTGTAATATGGGCCTTTAGCCTGTTCATCT
CACACAAACTTGTTTCTTCATGGCAATAATTTTAAAACAGACAGAAGTGGATGAAATAAT
GAAATGATACATTGACATTCTCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF74JQ C 1
AF RR2FF74TF U 1
BS 1 616 RR2FF74TF
BS 617 624 RR2FF74JQ

RD RR2FF74JQ 624 0 0
GGGGGTCGTTGGTAAGAAAGATATCAGGTAGGTCTTCGTTGAAGAGAGGATCAAATCGGA
ATCAGGAGAGAGAGATGGCGTCGGGGTGGGGAATAACGGGGAACAAAGGGAGATGTTACG
ATTTCTGGATGGATTTCAGCGAGTGTATGTCACACTGCAGAGAGCCCAAGGATTGTTCTC
TTCTTCGTGAAGACTACCTCGAGTGCCTCCACCATTCCAAAGAGTTCCAACGAAGAAACA
GGATATACAAAGAGGAACAGCGTAAACTAAGAGCAGCTTCAAGGAAAGGTGAAGAAACTG
GCGATGCTTCTCATCCTCATCACTAATCCACATATTTTTCTTCTTCCAAGTTTGCTTCTC
TCGCATTTGGAGAAGAAAGGATAGGGAAAAGTTTCGTCAAGTTTCTGTATCTTGTGTGTT
AAAAACTCCCTTTTGATTGTTTCCAGGTTGCTTCTGCAATGAATGTTTTGTCTTTTTCAT
CTTCTCCTCTATTTTTACCTTTGGATTGAGTTGTAATATGGGCCTTTAGCCTGTTCATCT
CACACAAACTTGTTTCTTCATGGCAATAATTTTAAAACAGACAGAAGTGGATGAAATAAT
GAAATGATACATTGACATTCTCTT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2FF74TF 624 0 0
GGGGGTCGTTGGTAAGAAAGATATCAGGTAGGTCTTCGTTGAAGAGAGGATCAAATCGGA
ATCAGGAGAGAGAGATGGCGTCGGGGTGGGGAATAACGGGGAACAAAGGGAGATGTTACG
ATTTCTGGATGGATTTCAGCGAGTGTATGTCACACTGCAGAGAGCCCAAGGATTGTTCTC
TTCTTCGTGAAGACTACCTCGAGTGCCTCCACCATTCCAAAGAGTTCCAACGAAGAAACA
GGATATACAAAGAGGAACAGCGTAAACTAAGAGCAGCTTCAAGGAAAGGTGAAGAAACTG
GCGATGCTTCTCATCCTCATCACTAATCCACATATTTTTCTTCTTCCAAGTTTGCTTCTC
TCGCATTTGGAGAAGAAAGGATAGGGAAAAGTTTCGTCAAGTTTCTGTATCTTGTGTGTT
AAAAACTCCCTTTTGATTGTTTCCAGGTTGCTTCTGCAATGAATGTTTTGTCTTTTTCAT
CTTCTCCTCTATTTTTACCTTTGGATTGAGTTGTAATATGGGCCTTTAGCCTGTTCATCT
CACACAAACTTGTTTCTTCATGGCAATAATTTTAAAACAGACAGAAGTGGATGAAATAAT
GAAATGATACATTGAC
ATTCTCTT

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 4

CO CL1596Contig1 629 4 4 U
GAACTCATCCATGGCGATTTCTCAAGCTCAGTCTCTGCTTCTTCTCCTCTTCCTTTTACC
TTCTTTGCACGCCACTTCTTTCCACAACTGTGATAAGAGGCTCGATCCCGTTAAGGTCGA
GGGTGTGGAGATCTCTCCTGACCCTGCTGTGAGTGGCGAAGCCGCTACATTTAAGATCAC
TGCTTCTACTGATGAAGACATCTCTGGAGGAAAAGTAGTGATCAGTGTTTCATTATTTGG
AGTTCATATCCATAGCGAAACACATGATCTTTGCGATGAGTCTTCCTGCCCGATCGCACC
TGGCACCTTTGTCCTTTCTCATTCCCAAACACTGCCTTCTATTACACCCCCCGGTACTTA
TACGCTTAAGATGACGATAAACGACAAGGATGGCGGGCGACTGGCCTGCATCAGCTTCAA
ATTCAAGATCACATTGTTTTCCACGGTTTCTGCTAGTTAAGTTCTCCTGTGAAAATATGT
TTGCCTCTTTTGTGAACCTCCTCTCTCTGTCTCGTAGACTTTTGTGTGTTGTCCAAATAA
AAATGCTCCTTT*GAGGCTTGTGAACCTCTCTCTCGTAGACTCTGTGTGGTGTCCAAATA
ACGTACCAATCTCAATGTTTTGTTTCTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2AZ78JQ C 1
AF RR2A064JQ C 223
AF RR2AZ78TFB U 1
AF RR2A064TF U 439
BS 1 270 RR2AZ78TFB
BS 271 271 RR2AZ78JQ
BS 272 628 RR2AZ78TFB
BS 629 629 RR2A064TF

RD RR2AZ78JQ 629 0 0
GAACTCATCCATGGCGATTTCTCAAGCTCAGTCTCTGCTTCTTCTCCTCTTCCTTTTACC
TTCTTTGCACGCCACTTCTTTCCACAACTGTGATAAGAGGCTCGATCCCGTTAAGGTCGA
GGGTGTGGAGATCTCTCCTGACCCTGCTGTGAGTGGCGAAGCCGCTACATTTAAGATCAC
TGCTTCTACTGATGAAGACATCTCTGGAGGAAAAGTAGTGATCAGTGTTTCATTATTTGG
AGTTCATATCCATAGCGAAACACATGATCTTTGCGATGAGTCTTCCTGCCCGATCGCACC
TGGCACCTTTGTCCTTTCTCATTCCCAAACACTGCCTTCTATTACACCCCCCGGTACTTA
TACGCTTAAGATGACGATAAACGACAAGGATGGCGGGCGACTGGCCTGCATCAGCTTCAA
ATTCAAGATCACATTGTTTTCCACGGTTTCTGCTAGTTAAGTTCTCCTGTGAAAATATGT
TTGCCTCTTTTGTGAACCTCCTCTCTCTGTCTCGTAGACTTTTGTGTGTTGTCCAAATAA
AAATGCTCCTTT*GAGGCTTGTGAACCTCTCTCTCGTAGACTCTGTGTGGTGTCCAAATA
ACGTACCAATCTCAATGTTTTGTTTCTC
G

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2A064JQ 381 0 0
CG
GTGTTTCATTATTTGGAGTTCATATCCATAGGGAAACACATGATTTTTGCGATGAGTTTT
CCTGCCCGATCGCACCTGGCACCTTTGTCCTTTTTCATTCCCAAACACTGCCTTTTATTA
CACCCCCCGGTACTTATACGCTTAAGATGACGATAAACGACAAGGATGGCGGGCGACTGG
CCTGCATCAGCTTCAAATTCAAGATCACATTGTTTTCCACGGTTTTTGCTAGTTAAGTTC
TCCTGTGAAAATATGTTTGCCTCTTTTGTGAACCTCCTCTCTCTGTCTCGTAGACTTTTG
TGTGTTGTCCAAATAAAAATGCTCCTTT*GAGGCTTGTGAACCTCTCTCTCGTAGACTCT
GTGTGGTGTCCAAATAACG

QA 3 381 3 381
DS 

RD RR2AZ78TFB 629 0 0
GAACTCATCCATGGCGATTTCTCAAGCTCAGTCTCTGCTTCTTCTCCTCTTCCTTTTACC
TTCTTTGCACGCCACTTCTTTCCACAACTGTGATAAGAGGCTCGATCCCGTTAAGGTCGA
GGGTGTGGAGATCTCTCCTGACCCTGCTGTGAGTGGCGAAGCCGCTACATTTAAGATCAC
TGCTTCTACTGATGAAGACATCTCTGGAGGAAAAGTAGTGATCAGTGTTTCATTATTTGG
AGTTCATATCCATAGCGAAACACATGATCTCTGCGATGAGTCTTCCTGCCCGATCGCACC
TGGCACCTTTGTCCTTTCTCATTCCCAAACACTGCCTTCTATTACACCCCCCGGTACTTA
TACGCTTAAGATGACGATAAACGACAAGGATGGCGGGCGACTGGCCTGCATCAGCTTCAA
ATTCAAGATCACATTGTTTTCCACGGTTTCTGCTAGTTAAGTTCTCCTGTGAAAATATGT
TTGCCTCTTTTGTGAACCTCCTCTCTCTGTCTCGTAGACTTTTGTGTGTTGTCCAAATAA
AAATGCTCCTTT*GAGGCTTGTGAACCTCTCTCTCGTAGACTCTGTGTGGTGTCCAAATA
ACGTACCAATCTCAATGTTTTGTTTCTC
G

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2A064TF 191 0 0
TTCCACGGTTTCTGCTAGTTAAGTTCTCCTGTGAAAATATGTTTGCCTCTTTTGTGAACC
TCCTCTCTCTGTCTCGTAGACTTTTGTGTGTTGTCCAAATAAAAATGCTCCTTTTGAGGC
TTGTGAACCTCTCTCTCGTAGACTCTGTGTGGTGTCCAAATAACGTACCAATCTCAATGT
TTTGTTTCTCT

QA 1 191 1 191
DS 



AS 2 5

CO CL1597Contig1 737 3 5 U
GGGATCGCATTGACTTGTCCGTAGCTGATTGTTTAATGGCGAATCAAGGAGCAAAGAAGC
GGAAGGATGAGAACGCTCGGCACATGACCAAGCTCCGTCGTATCATCATCGCTTGCAACG
TTGTGTACATGATAGTGAGGATGCTGATTTTCTATTCGAGCTTTACATGGAAGCACTGGA
TTGGTCTTGTGGTGACGTCGATAGGTTACGGTTTTCCTTACAAGTTTCTAGATGGGATGG
TGAGGCCTAGTGTTAGTGACGATGGTGAGCTTATTGATGGTGGGTTCGACATGAGCACTG
GTGGTATTTGTGGATACTTGCACGATGTGCTCTACATCACTTGCTTCGTGCAGCTTGCAT
CTATCATCTCTGGAAAGTTTTGGTACACTTATCTAGTGATTCCTGCATTTGGAGCGTACA
AAGCTTCTGGGTTTATTAAAGGATTCATGTCACAAGGTTCAGAGGGAGGTGTAGAGGATG
AGAAAACTCGCAAAAAGAGGGAGAAGATGGAGAGAAAAGCTTCTAGAGGGCAAGCCGTCA
GGACAAGATCACGATGAATGTGTTTATCATCATCTTTAGCAGCAACTTAACTTTGGG*AA
AATCTGTCCTCAAAAACTTACAAAATGCAAATCAACGGGCAACAACACACTCACTTTTGG
CTTTTCCAAAATCATTTTGTTGTACCGATGTAGCTGTCTTTACACTGTTTGAATTGAATG
GATGTTGTTGATGTTAA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2CE77TF U 1
AF RR2AP53TF U 1
AF RR2AP53JQ C 17
BS 1 597 RR2AP53TF
BS 598 598 RR2CE77TF
BS 599 712 RR2AP53TF
BS 713 713 RR2AP53JQ
BS 714 737 RR2AP53TF

RD RR2CE77TF 668 0 0
GG
GATCGCATTGACTTGTCCGTAGCTGATTGTTTAATGGTGAATCAAGGAGCAAAGAAGCGG
AAGGATGAGAACGCTCGGCACATGGCCAAGCTCCGTCGTATCATCATCGCTTGCAACGTT
GTGTACGTGATAGTGAGGATGCTGGTTTTCTATTCGAGCTCTACATGGAAGCACTGGATT
GGTCTTGTGGTGACGTCGATAGGTTACGGTGTTCCTTACAAGTTTCTAGATGGGATGGCG
AGGCCTAGTGTTAGTGACGATGGTGAGCTTATTGATGGTGGGTTCGACATGAGCACTGGT
GGTATTTGTGGATACTTGCACGATGTGCTCTACATCACTTGCTTCGTGCAGCTTGCATCT
ATCATCTCTGGAAAGTTTTGGTACACTTATCTAGTGATTCCTGCATTTGGAGCGTACAAA
GCTTCTGGGTTTATTAAAGGATTCATGTCACAAGGTTCAGAGGGAGGTGTAGAGGATGAG
AAAACTCGCAAAAAGAGGGAGAAGATGGAGAGAAAAGCTTCTAGAGGGCAAGCCGTCAGG
ACAAGATCACGATGAATGTGTTTATCATCATCTTTAGCAGCAACTTAACTTTGGG*AAAA
TCTGTCCTCAAAA*CTTACAAAATGCAAATCAACGGGCAACAACACACTCACTCTTGGCT
TT
CCAA

QA 3 664 3 664
DS 

RD RR2AP53TF 737 0 0
GGGATCGCATTGACTTGTCCGTAGCTGATTGTTTAATGGCGAATCAAGGAGCAAAGAAGC
GGAAGGATGAGAACGCTCGGCACATGACCAAGCTCCGTCGTATCATCATCGCTTGCAACG
TTGTGTACATGATAGTGAGGATGCTGATTTTCTATTCGAGCTTTACATGGAAGCACTGGA
TTGGTCTTGTGGTGACGTCGATAGGTTACGGTTTTCCTTACAAGTTTCTAGATGGGATGG
TGAGGCCTAGTGTTAGTGACGATGGTGAGCTTATTGATGGTGGGTTCGACATGAGCACTG
GTGGTATTTGTGGATACTTGCACGATGTGCTCTACATCACTTGCTTCGTGCAGCTTGCAT
CTATCATCTCTGGAAAGTTTTGGTACACTTATCTAGTGATTCCTGCATTTGGAGCGTACA
AAGCTTCTGGGTTTATTAAAGGATTCATGTCACAAGGTTCAGAGGGAGGTGTAGAGGATG
AGAAAACTCGCAAAAAGAGGGAGAAGATGGAGAGAAAAGCTTCTAGAGGGCAAGCCGTCA
GGACAAGATCACGATGAATGTGTTTATCATCATCTTTAGCAGCAACTTAACTTTGGGGAA
AATCTGTCCTCAAAAACTTACAAAATGCAAATCAACGGGCAACAACACACTCACTTTTGG
CTTTTCCAAAATCATTTTGTTGTACCGATGTAGCTGTCTTTACACTGTTTGA*TTGAATG
GATGTTGTTGATGTTAA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2AP53JQ 719 0 0
GTCCG
TAGCTGATTGTTTAATGGCGAATCAAGGAGCAAAGAAGCGGAAGGATGAGAACGCTCGGC
ACATGACCAAGCTCCGTCGTATCATCATCGCTTGCAACGTTGTGTACATGATAGTGAGGA
TGCTGATTTTCTATTCGAGCTTTACATGGAAGCACTGGATTGGTCTTGTGGTGACGTCGA
TAGGTTACGGTTTTCCTTACAAGTTTCTAGATGGGATGGTGAGGCCTAGTGTTAGTGACG
ATGGTGAGCTTATTGATGGTGGGTTCGACATGAGCACTGGTGGTATTTGTGGATACTTGC
ACGATGTGCTTTACATCACTTGCTTCGTGCAGCTTGCATCTATCATTTTTGGAAAGTTTT
GGTACACTTATTTAGTGATTCCTGCATTTGGAGCGTACAAAGCTTTTGGGTTTATTAAAG
GATTCATGTCACAAGGTTCAGAGGGAGGTGTAGAGGATGAGAAAACTCGCAAAAAGAGGG
AGAAGATGGAGAGAAAAGCTTTTAGAGGGCAAGCCGTCAGGACAAGATCACGATGAATGT
GTTTATCATCATCTTTAGCAGCAACTTAACTTTGGG*AAAATCTGTCCTCAAAAACTTAC
AAAATGCAAATCAACGGGCAACAACACACTCACTTTTGGCTTTTCCAAAATCATTTTGTT
GTACCGATGTAGCTGTCTTTACACTGTTTGAATTGAATGGATGTTGTTGATGTT

QA 6 719 6 719
DS 



CO CL1597Contig2 753 2 6 U
GGCTTCTTCGATCGCATTGACTTGTCCGTATAGCTGATTGTTTAATGGCGAATCAAGGAG
CAAAGAAGCGGAAGGATGAGAACGCTCGGCACATGGCCAAGCTCCGTCGTATCATCATCG
CTTGCAACGTTGTGTACGTGATAGTGAGGATGCTGATTTTCTATTCGAGCTTTACATGGA
AGCATTGGATTGTTCTTGTGGTGACGTCGATAGGTTACTGCGTTCCTTATAAGTTTCTCG
ATGGGATGGCGAGGCCTAGTGTTAGTGACGATGGTGAGCTTATTGATGGTGGGTTTGACA
TGAGCACTGGTGGTATTTGTGGATACTTGCACGATGTGCTCTACATCACTTGCTTTGTGC
AGCTTGCATCTATCATCTCTGGAAAGTTTTGGTACACTTATCTAGTGATTCCTGCATTTG
GAGCGTACAAAGCTTCTGGGTTTATTAAAGGGTTCATGTCACAAGGTTCAGAGGGAGGTG
TAGAGGATGAGAAAACTCGCAAAAAGAGGGAGAAGATGGAGAGGAAGGCTTCTAGAGGGC
AAGCCGTCAGGACAAGATCACGATGAATGTGTTTTTCATCATCTTTAGCAGCAACTTAAC
TTTGGGAAAATCTGTCCTCAAAAACATACAAAATGCAAATCAACGGGCAACAACACACTC
ACTCTTGTCTTTGCAAAATCATTTTGTTGTACCGATGTAGCTGTCTTTTACACTGTTTGA
ATTGAATGGATGTTGTTGATGTTAATCCTGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM27TF U 1
AF RR2FM27JQ C 31
BS 1 623 RR2FM27TF
BS 624 624 RR2FM27JQ
BS 625 677 RR2FM27TF
BS 678 678 RR2FM27JQ
BS 679 708 RR2FM27TF
BS 709 753 RR2FM27JQ

RD RR2FM27TF 712 0 0
GGCTTCTTCGATCGCATTGACTTGTCCGTATAGCTGATTGTTTAATGGCGAATCAAGGAG
CAAAGAAGCGGAAGGATGAGAACGCTCGGCACATGGCCAAGCTCCGTCGTATCATCATCG
CTTGCAACGTTGTGTACGTGATAGTGAGGATGCTGATTTTCTATTCGAGCTTTACATGGA
AGCATTGGATTGTTCTTGTGGTGACGTCGATAGGTTACTGCGTTCCTTATAAGTTTCTCG
ATGGGATGGCGAGGCCTAGTGTTAGTGACGATGGTGAGCTTATTGATGGTGGGTTTGACA
TGAGCACTGGTGGTATTTGTGGATACTTGCACGATGTGCTCTACATCACTTGCTTTGTGC
AGCTTGCATCTATCATCTCTGGAAAGTTTTGGTACACTTATCTAGTGATTCCTGCATTTG
GAGCGTACAAAGCTTCTGGGTTTATTAAAGGGTTCATGTCACAAGGTTCAGAGGGAGGTG
TAGAGGATGAGAAAACTCGCAAAAAGAGGGAGAAGATGGAGAGGAAGGCTTCTAGAGGGC
AAGCCGTCAGGACAAGATCACGATGAATGTGTTTTTCATCATCTTTAGCAGCAACTTAAC
TTTGGGAAAATCTGTCCTCAAAA*CATACAAAATGCAAATCAACGGGCAACAACACACTC
ACTCTTGTCTTTGCAAA*TCATTTTGTTGTACCGATGTAGCTGTCTTT
ACAC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2FM27JQ 723 0 0
TAGCTGATTGTTTAATGGCGAATCAAGGAGCAAAGAAGCGGAAGGATGAGAACGCTCGGC
ACATGGCCAAGCTCCGTCGTATCATCATCGCTTGCAACGTTGTGTACGTGATAGTGAGGA
TGCTGATTTTCTATTCGAGCTTTACATGGAAGCATTGGATTGTTCTTGTGGTGACGTCGA
TAGGTTACTGCGTTCCTTATAAGTTTCTCGATGGGATGGCGAGGCCTAGTGTTAGTGACG
ATGGTGAGCTTATTGATGGTGGGTTTGACATGAGCACTGGTGGTATTTGTGGATACTTGC
ACGATGTGCTCTACATCACTTGCTTTGTGCAGCTTGCATCTATCATCTCTGGAAAGTTTT
GGTACACTTATCTAGTGATTCCTGCATTTGGAGCGTACAAAGCTTCTGGGTTTATTAAAG
GGTTCATGTCACAAGGTTCAGAGGGAGGTGTAGAGGATGAGAAAACTCGCAAAAAGAGGG
AGAAGATGGAGAGGAAGGCTTCTAGAGGGCAAGCCGTCAGGACAAGATCACGATGAATGT
GTTTTTCATCATCTTTAGCAGCAACTTAACTTTGGGAAAATCTGTCCTCAAAAACATACA
AAATGCAAATCAACGGGCAACAACACACTCACTCTTGTCTTTGCAAAATCATTTTGTTGT
ACCGATGTAGCTGTCTTTTACACTGTTTGAATTGAATGGATGTTGTTGATGTTAATCCTG
AGG

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 5

CO CL1598Contig1 878 5 10 U
GGGACCGAGAGAAAAGATCGGCCACGACCAGTATACACGGATCGATGAATACAATGAGAA
ATTTTGTAAGCTCAATGAAAACGTCTGCTAAGAAGATGCAATACGGCCTCTTCACGGCGC
TCCTTCTGTTCATTCTGGTTCCGCTCGGTGAGGCGGTTTGGCTAGACGTGCCTGCCACGG
GAATGAAGTGTGTGTCTGAAGAAATCCAGAGCAATGTGGTTGTCTTGGCCGATTACATCA
TCATCTCCGAGGATGATTCCTTATTACCCACTATATCCGTCAAGGTGACGTCCCCGTACG
GCAAAAATCTGCACCACATGGAAG**GTGACGGTTGGGGAATTTGCATTTACAACGCAAG
AATCAGGGAACTACATGGCGTGCTTTACGGCAGATGCAAAGAGTCACGGAAACAAAAACG
TTAGCATAAGCGTTGACTGGAAAACTGGAATCGCTGCTAAGGATTGGAAAAATATTGCTA
AGAAAGAGAAGATCGAGGGAGTGGAGCTTGAGATACGGAAACTTGAAGCCGCAGTGGAAT
CCATCCATGAAAATTTAGTTTACATAAGAAACAAGGAAGCAGATATGAGGACAGTGAGTG
AGAAAACGAACTCTCGAGTAGCTTGGTACAGTACAATGTCGATGGGTATTTGCATTGCTG
TCTCTGGTGTACAAGTAGTCTACTTGAAGCAATACTTTCAGAAGAAGAAGCTTATCTAAG
CTTTAGCTTTTTCACTCATCCACATCCTTTCTAAGAGCTTTTTTGTTGGGTTCAAAGTAA
TAATAAGGACTTAGTTTGCAGTTTTTGTTACTTCAGGGCTATAAGCCAATAAACAGATTT
TCAATTTGATCAAAAAAAAACAGAATTTCAATTCTGCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E429TF U 1
AF RR2FO32TF U 1
AF RR2D985JQ C 204
AF RR2D985TF U 204
AF RR2E429JQ C 528
BS 1 323 RR2E429TF
BS 324 326 RR2D985TF
BS 327 555 RR2E429TF
BS 556 556 RR2FO32TF
BS 557 558 RR2E429TF
BS 559 559 RR2FO32TF
BS 560 570 RR2E429TF
BS 571 718 RR2FO32TF
BS 719 860 RR2D985TF
BS 861 878 RR2E429JQ

RD RR2E429TF 570 0 0
GGGACCGAGAGAAAAGATCGGCCACGACCAGTATACACGGATCGATGAATACAATGAGAA
ATTTTGTAAGCTCAATGAAAACGTCTGCTAAGAAGATGCAATACGGCCTCTTCACGGCGC
TCCTTCTGTTCATTCTGGTTCCGCTCGGTGAGGCGGTTTGGCTAGACGTGCCTGCCACGG
GAATGAAGTGTGTGTCTGAAGAAATCCAGAGCAATGTGGTTGTCTTGGCCGATTACATCA
TCATCTCCGAGGATGATTCCTTATTACCCACTATATCCGTCAAGGTGACGTCCCCGTACG
GCAAAAATCTGCACCACATGGAAAACGTGACGGTTGGGGAATTTGCATTTACAACGCAAG
AATCAGGGAACTACATGGCGTGCTTTACGGCAGATGCAAAGAGTCACGGAAACAAAAACG
TTAGCATAAGCGTTGACTGGAAAACTGGAATCGCTGCTAAGGATTGGAAAAATATTGCTA
AGAAAGAGAAGATCGAGGGAGTGGAGCTTGAGATACGGAAACTTGAAGCCGCAGTGGAAT
CCATCCATGAAAATT*AGCTTACATAAGAA

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2FO32TF 718 0 0
GGGACCGAGAGAAAAGATCGGCCACGACCAGTATACACGGATCGATGAATACAATGAGAA
ATTTTGTAAGCTCAATGAAGACGTCTGCTAAGAAGATGCAATACGGCCTCTTCACGGCGC
TCCTTCTGTTCATTCTGGTTCCGGTCGGTGAGGCGGTTTGGCTAGACGTGCCTGCCACGG
GAATGAAGTGTGTGTCTGAAGAAATCCAGAGCAATGTGGTTGTCTTGGCCGATTACATCG
TCATCTCCGAGGATGATTCCTTATTACCCACTATATCCGTCAAGGTGACGTCCCCGTACG
GCAAAAATCTGCACCACATGGAAAACGTGACGGTTGGGGAATTTGCATTTACAACGCAAG
AATCAGGGAACTACATGGCGTGCTTTACGGCAGATGCAAAGAGTCACGGAAACAAAAACG
TTAGCATAAGCGTTGACTGGAAAACTGGAATCGCTGCTAAGGATTGGAAAAATATTGCTA
AGAAAGAGAAGATCGAGGGAGTGGAGCTTGAGATACGGAAACTTGAAGCCGCAGTGGAAT
CCATCCATGAAAATTTAGTTTACATAAGAAACAAGGAAGCAGATATGAGGACAGTGAGTG
AGAAAACGAACTCTCGAGTAGCTTGGTACAGTACAATGTCGATGGGTATTTGCATTGCTG
TCTCTGGTGTACAAGTAGTCTACTTGAAGCAATACTTTCAGAAGAAGAAGCTTATCTA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2D985JQ 648 0 0
G
TCCAGAGCAATGTGGTTGTCTTGGCCGATTACATCATCATCTCCGAGGATGATTCCTTAT
TACCCACTATATCCGTCAAGGTGACGTCCCCGTACGGCAAAAATCTGCACCACATGGAAG
**GTGACGGTTGGGGAATTTGCATTTACAACGCAAGAATCAGGGAACTACATGGCGTGCT
TTACGGCAGATGCAAAGAGTCACGGAAACAAAAACGTTAGCATAAGCGTTGACTGGAAAA
CTGGAATCGCTGCTAAGGATTGGAAAAATATTGCTAAGAAAGAGAAGATCGAGGGAGTGG
AGCTTGAGATACGGAAACTTGAAGCCGCAGTGGAATCCATCCATGAAAATTTAGTTTACA
TAAGAAACAAGGAAGCAGATATGAGGACAGTGAGTGAGAAAACGAACTCTCGAGTAGCTT
GGTACAGTACAATGTCGATGGGTATTTGCATTGCTGTCTCTGGTGTACAAGTAGTCTACT
TGAAGCAATACTTTCAGAAGAAGAAGCTTATCTAAGCTTTAGCTTTTTCACTCATCCACA
TCCTTTCTAAGAGCTTTTTTGTTGGGTTCAAAGTAATAATAAGGACTTAGTTTGCAGTTT
TTGTTACTTCAGGGCTATAAGCCAATAAACAGATTTTCAATTTGATC

QA 2 648 2 648
DS 

RD RR2D985TF 657 0 0
G
TCCAGAGCAATGTGGTTGTCTTGGCCGATTACATCATCATCTCCGAGGATGATTCCTTAT
TACCCACTATATCCGTCAAGGTGACGTCCCCGTACGGCAAAAATCTGCACCACATGGAAG
**GTGACGGTTGGGGAATTTGCATTTACAACGCAAGAATCAGGGAACTACATGGCGTGCT
TTACGGCAGATGCAAAGAGTCACGGAAACAAAAACGTTAGCATAAGCGTTGACTGGAAAA
CTGGAATCGCTGCTAAGGATTGGAAAAATATTGCTAAGAAAGAGAAGATCGAGGGAGTGG
AGCTTGAGATACGGAAACTTGAAGCCGCAGTGGAATCCATCCATGAAAATTTAGTTTACA
TAAGAAACAAGGAAGCAGATATGAGGACAGTGAGTGAGAAAACGAACTCTCGAGTAGCTT
GGTACAGTACAATGTCGATGGGTATTTGCATTGCTGTCTCTGGTGTACAAGTAGTCTACT
TGAAGCAATACTTTCAGAAGAAGAAGCTTATCTAAGCTTTAGCTTTTTCACTCATCCACA
TCCTTTCTAAGAGCTTTTTTGTTGGGTTCAAAGTAATAATAAGGACTTAGTTTGCAGTTT
TTGTTACTTCAGGGCTATAAGCCAATAAACAGATTTTCAATTTGATCAAAAAAAAA

QA 2 657 2 657
DS 

RD RR2E429JQ 351 0 0
GCCGCAGTGGAATCCATCCATGAAAATT*AGCTTACATAAGAAACAAGGAAGCAGATATG
AGGACAGTGAGTGAGAAAACGAACTCTCGAGTAGCTTGGTACAGTACAATGTCGATGGGT
ATTTGCATTGCTGTTTCTGGTGTACAAGTAGTCTACTTGAAGCAATACTTTTAGAAGAAG
AAGCTTATCTAAGCTTTAGCTTTTTCACTCATCCACATCCTTTTTAAGAGCTTTTTTGTT
GGGTTCAAAGTAATAATAAGGATTTAGTTTGCAGTTTTTGTTACTTCAGGGCTATATGCC
AATAAACAGATTTTCAATTTGATCAAAAAAAAACAGAATTTCAATTCTGCG

QA 1 351 1 351
DS 



AS 1 4

CO CL1599Contig1 845 4 27 U
GGTGGAACCTTTTCTAAAAAATCTTCTATATATCAAAAGATGTTCTTCAACACTCTGAAA
CAAAAAAACGACCAACTATTTATTTTTTTCCTAAGAACAGTTCAGTGGGAAGGGAAACAT
GTTTTTTCTTTTTTCCATTCTACACACGCAACAAAAAAAAAAA*GAGACACCAACTACTC
AATCACTATCAGAGCCAAGAACTTGCTTCTTGATGTCACTAATCTTCATCTTGAGTTCTT
CTCTATTACTCTTAAAGAGTAAATAACGTGTAGTGAACCAGAGTGTGTACCCGAGACCAA
CCACTTCCATCAGCTTAGGTAACAGGGGAACTGATTCGAGAGAACCAACGATTGCAGAAG
TCAAGTAGACAGCGAGTATCGCACCAAACCCGTAGAGCAGGATCGAATACGTGTTGTCTG
AGTCCAGCTTGATATCGTTGAAGAACTCTAAGGAGGCTTGAGTTTGCTCGTCTTCAGATT
GAGCTTCACTAGTAAAGATTCTCTCTTCGACTGCATCTTGCGCTTCACTAGTAAAGTTAT
GCTCTTTGTCTGCAACTACTTCAGGCTTCTTCTCAAGACCAAACTCATTGACTCCCGATG
ACGTGTCTTCTTCAGACACTGTTTCTCCTGGAAACTTTCTCGTACATCGCAACGTGCGGG
ATTGAAGACGGAGAGATGCAGCGTTGCCCTGTCGAGGGAGTGAGACTCTACGCACATCGT
TTCCGGCGAGATATGCGTGGCGGTTGGTGCTAGAAGAAGGGAGGTGAGTGATGGTACTGA
CTGTGGAGAGCTCCATTTCCGTACTGACGAGTTAACCAAAGTCTCTTTCGCTTCTGAGAT
AGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2EL59JQ U 1
AF RR2BA03JQ U 14
AF RR2BY19TF C 138
AF RR2BA03TF C 135
BS 1 20 RR2EL59JQ
BS 21 21 RR2BA03JQ
BS 22 59 RR2EL59JQ
BS 60 60 RR2BA03JQ
BS 61 81 RR2EL59JQ
BS 82 83 RR2BA03JQ
BS 84 126 RR2EL59JQ
BS 127 127 RR2BA03JQ
BS 128 166 RR2EL59JQ
BS 167 167 RR2BA03JQ
BS 168 289 RR2EL59JQ
BS 290 290 RR2BA03JQ
BS 291 294 RR2EL59JQ
BS 295 295 RR2BA03JQ
BS 296 337 RR2EL59JQ
BS 338 338 RR2BA03JQ
BS 339 373 RR2EL59JQ
BS 374 374 RR2BA03JQ
BS 375 378 RR2EL59JQ
BS 379 379 RR2BA03JQ
BS 380 391 RR2EL59JQ
BS 392 392 RR2BA03JQ
BS 393 446 RR2EL59JQ
BS 447 447 RR2BA03JQ
BS 448 493 RR2EL59JQ
BS 494 747 RR2BA03JQ
BS 748 845 RR2BA03TF

RD RR2EL59JQ 494 0 0
GGTGGAACCTTTTCTAAAAATTCTTCTATATATCAAAAGATGTTCTTCAACACTCTGAAC
CAAAAAAACGACCAACTATTT**TTTTTTCCTAAGAACAGTTCAGTGGGAAGGGAAACAT
GTTTTT*CTTTTTTCCATTCTACACACGCAACAAAAAAAAAAA*GAAACACCAACTACTC
AATCACTATCAGAGCCAAGAACTTGCTTCTTGATGTCACTAATCTTCATCTTGAGTTCTT
CTCTATTACTCTTAAAGAGTAAATAACGTGTAGTGAACCAGAGTGTGTATCCGAAACCAA
CCACTTCCATCAGCTTAGGTAACAGGGGAACTGATTCAAGAGAACCAACGATTGCAGAAG
TCAAGTAGACAGCAAGTACCGCACCAAACCCATAGAGCAGGATCGAATACGTGTTGTCTG
AGTCCAGCTTGATATCGTTGAAGAACCCTAAGGAGGCTTGAGTTTGCTCGTCTTCAGATT
GAGCTTCACTAGT
G

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR2BA03JQ 740 0 0
CTAAAAAATCTTCTATATATCAAAAGATGTTCTTCAACACTCTGAAACAAAAAAACGACC
AACTATTTATTTTTTTCCTAAGAACAGTTCAGTGGGAAGGGAAACATGTTTTTTCTTTTT
TCCATTCTACACACGCAACAAAAAAAAAAA*GAGACAGCAACTACTCAATCACTATCAGA
GCCAAGAACTTGCTTCTTGATGTCACTAATCTTCATCTTGAGTTCTTCTCTATTACTCTT
AAAGAGTAAATAACGTGTAGTGAACCAGAGTGTGTACCCGAGACCAACCACTTCCATCAG
CTTAGGTAACAGGGGAACTGATTCGAGAGAACCAACGATTGCAGAAGTCAAGTAGACAGC
GAGTATCGCACCAAACCCGTAGAGCAGGATCGAATACGTGTTGTCTGAGTCCAGCTTGAT
ATCGTTGAAGAACTCTAAGGAGGCTTGAGTTTGCTCGTCTTCAGATTGAGCTTCACTAGT
AAAGATTCTCTCTTCGACTGCATCTTGCGCTTCACTAGTAAAGTTATGCTCTTTGTCTGC
AACTACTTCAGGCTTCTTCTCAAGACCAAACTCATTGACTCCCGATGACGTGTCTTCTTC
AGACACTGTTTCTCCTGGAAACTTTCTCGTACATCGCAACGTGCGGGATTGAAGACGGAG
AGATGCAGCGTTGCCCTGTCGAGGGAGTGAGACTCTACGCACATCGTTTCCGGCGAGATA
TGCGTGGCGGTTGG
TGCTAG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2BY19TF 699 0 0
TTCTACACACGCAACAAAAAAAAAA**GAGACACCAACTACTCAATCACTATCAGAGCCA
AGAACTTGCTTCTTGATGTCACTAATCTTCATCTTGAGTTCTTCTCTATTACTCTTAAAG
AGTAAATAACGTGTAGTGAACCAGAGTGTGTACCCGAGACCAACCACTTCCATCAGCTTA
GGTAACAGGGGAACTGATTCGAGAGAACCAACGATTGCAGAAGTCAAGTAGACAGCGAGT
ATCGCACCAAACCCGTAGAGCAGGATCGAATACGTGTTGTCTGAGTCCAGCTTGATATCG
TTGAAGAACTCTAAGGAGGCTTGAGTTTGCTCGTCTTCAGATTGAGCTTCACTAGTAAAG
ATTCTCTCTTCGACTGCATCTTGCGCTTCACTAGTAAAGTTATGCTCTTTGTCTGCAACA
ACTTCAGGCTTCTTCTCAAGACCAAACTCATTGACTCCCGATGACGTGTCTTCTTCAGAC
ACTGTTTCTCCTGGAAACTTTCTCGTACATCGCAACGTGCGGGATTGAAGACGGAGAGAT
GCAGCGTTGCCCTGTCGAGGGAGTGAGACTCTACGCACATCGTTTCCGGCGAGATATGCG
TGGCGGTTGGTGCTAGAAGAAGGGAGGTGAGTGATGGTACTGACTGTGGAGGGCTCCATT
TCCGTACTGACGAGTTAACCAAAGTCTCTTTCG
CCTCCC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2BA03TF 711 0 0
CCA
TTCTACACACGCAACAAAAAAAAAAAAGAGACAGCAACTACTCAATCACTATCAGAGCCA
AGAACTTGCTTCTTGATGTCACTAATCTTCATCTTGAGTTCTTCTCTATTACTCTTAAAG
AGTAAATAACGTGTAGTGAACCAGAGTGTGTACCCGAGACCAACCACTTCCATCAGCTTA
GGTAACAGGGGAACTGATTCGAGAGAACCAACGATTGCAGAAGTCAAGTAGACAGCGAGT
ATCGCACCAAACCCGTAGAGCAGGATCGAATACGTGTTGTCTGAGTCCAGCTTGATATCG
TTGAAGAACTCTAAGGAGGCTTGAGTTTGCTCGTCTTCAGATTGAGCTTCACTAGTAAAG
ATTCTCTCTTCGACTGCATCTTGCGCTTCACTAGTAAAGTTATGCTCTTTGTCTGCAACT
ACTTCAGGCTTCTTCTCAAGACCAAACTCATTGACTCCCGATGACGTGTCTTCTTCAGAC
ACTGTTTCTCCTGGAAACTTTCTCGTACATCGCAACGTGCGGGATTGAAGACGGAGAGAT
GCAGCGTTGCCCTGTCGAGGGAGTGAGACTCTACGCACATCGTTTCCGGCGAGATATGCG
TGGCGGTTGGTGCTAGAAGAAGGGAGGTGAGTGATGGTACTGACTGTGGAGAGCTCCATT
TCCGTACTGACGAGTTAACCAAAGTCTCTTTCGCTTCTGAGATAGGTC

QA 4 711 4 711
DS 



AS 1 5

CO CL1600Contig1 1073 5 9 U
GGTAACACTCTTGACTACTAAACTCCGACCATTTCTGCATTCTCCCTGAAGACTTGTACT
TGCGTGTTTCTATGTAAGAAAATTGAAAGAAAATCTGTAAAGAACGAGTCAAGAGATCCA
GACGTGTGTATAAAAGGAATCAAATCGGAAAAAAAAATGGAGAAGAAGAAGGTGCCAAAA
AGACTCCAAGGTAAAGTAGCGATCGTGACGGCATCGACGCAAGGGATAGGCTTCGGTATC
GTTGAGCGGCTTGGCCTCGAAGGCGCTTCTGTCGTCGTCTCCTCTCGCAAACAGAGAAAT
GTGGATGAGGCGGTAGAGAAGCTTAAAGCTCAGGGGATTGATGCATTTGGAATCGTTTGT
CATGTCTCTAATGCTCAACATCGCCAGATTCTTGTCCAAAAGACAATTCAAAGATATGGG
AAGATAAATATTGTTGTGTGCAATGCAGCTGTGAATCCATCTACTGAACCAATCTTATCC
ACCAAAGAACCTGCTCTTGACAAGCTTTGGGAAGTCAATGTCAAATCATCTATCCTTCTC
CTCCAGGATATGGCTCCTCACTTAGAGAAGGGTTCTTCTGTAATCTTCATAACCTCCATT
GCTGCGTTTCAACCGCAAGTACCAACGGCAATGTATGGAGTTACTAAAACAGCTCTTCTC
GGCCTAACCAAGGCACTTGCTGCTGAGATGGGACCGGACACTAGAGTGAACGCAGTAGCA
CCTGGTGTTGTGCCAACACACTTTGCTTCTTTCATCACCCGGAACTCTGAAGTGAGAAGA
GCCAGTGAGGAGAAAACTCTGCTCAACAGGCTGGGAACAACGGATGACATGGCCGCTGCA
ACCGCTTTCTTGGCTTCTGATGATGCTTCTTACATCACCAGTGAAACCTTAGTGGTCGCC
GGAGGAATGCCCTCCAGGCTCTGAATCAAAATCCCCAACTAGTAATAATTATTCATATAT
CAATAAAAACTTTTTGATGATGTACAAGAAAAAAACCATACATTTGTTACTGTTGTATGA
TAATGTGATGTGGGATACTTTAATTTCTCATTTTGAATAGCAGTAAATGGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM12TF U 47
AF RR2AS01TF U 1
AF RR2C706TF U 46
AF RR2C706JQ C 685
AF RR2AS01JQ C 286
BS 1 156 RR2AS01TF
BS 157 157 RR2C706TF
BS 158 671 RR2AS01TF
BS 672 672 RR2C706TF
BS 673 774 RR2AS01TF
BS 775 795 RR2C706TF
BS 796 796 RR2AS01JQ
BS 797 809 RR2C706TF
BS 810 1073 RR2AS01JQ

RD RR2FM12TF 621 0 0
G
GAAGACTTGTACTTGCGTGTTTCTATGTAAGAAAATTGAAAGAAAATCTGTAAAGAACGA
GTCAAGAGATCCAGACGTGTGTATAAAAGGAATCAAATCGGAAAAAAAAATGGAGAAGAA
GAAGGTGCCAAAAAGACTCCAAGGTAAAGTAGCGATCGTGACGGCATCGACGCAAGGGAT
AGGCTTCGGTATCGTTGAGCGGCTTGGCCTCGAAGGCGCTTCTGTCGTCGTCTCCTCTCG
CAAACAGAGAAATGTGGATGAGGCGGTAGAGAAGCTTAAAGCTCAGGGGATTGATGCATT
TGGAATCGTTTGTCATGTCTCTAATGCTCAACATCGCCAGATTCTTGTCCAAAAGACAAT
TCAAAGATATGGGAAGATAAATATTGTTGTGTGCAATGCAGCTGTGAATCCATCTACTGA
ACCAATCTTATCCACCAAAGAACCTGCTCTTGACAAGCTTTGGGAAGTCAATGTCAAATC
ATCTATCCTTCTCCTCCAGGATATGGCTCCTCACTTAGAGAAGGGTTCTTCTGTAATCTT
CATAACCTCCATTGCTGCGTTTCAACCGCAAGTACCAACGGCAATGTATGGAGTTACTAA
AACAGCTCTTCTCGGCCTAA

QA 2 621 2 621
DS 

RD RR2AS01TF 774 0 0
GGTAACACTCTTGACTACTAAACTCCGACCATTTCTGCATTCTCCCTGAAGACTTGTACT
TGCGTGTTTCTATGTAAGAAAATTGAAAGAAAATCTGTAAAGAACGAGTCAAGAGATCCA
GACGTGTGTATAAAAGGAATCAAATCGGAAAAAAAA*TGGAGAAGAAGAAGGTGCCAAAA
AGACTCCAAGGTAAAGTAGCGATCGTGACGGCATCGACGCAAGGGATAGGCTTCGGTATC
GTTGAGCGGCTTGGCCTCGAAGGCGCTTCTGTCGTCGTCTCCTCTCGCAAACAGAGAAAT
GTGGATGAGGCGGTAGAGAAGCTTAAAGCTCAGGGGATTGATGCATTTGGAATCGTTTGT
CATGTCTCTAATGCTCAACATCGCCAGATTCTTGTCCAAAAGACAATTCAAAGATATGGG
AAGATAAATATTGTTGTGTGCAATGCAGCTGTGAATCCATCTACTGAACCAATCTTATCC
ACCAAAGAACCTGCTCTTGACAAGCTTTGGGAAGTCAATGTCAAATCATCTATCCTTCTC
CTCCAGGATATGGCTCCTCACTTAGAGAAGGGTTCTTCTGTAATCTTCATAACCTCCATT
GCTGCGTTTCAACCGCAAGTACCAACGGCAATGTATGGAGTTACTAAAACAGCTCTTCTC
GGCCTAACCAAAGCACTTGCTGCTGAGATGGGACCGGACACTAGAGTGAACGCAGTAGCA
CCTGGTGTTGTGCCAACACACTTTGCTTCTTTCATCACCCGGAACTCTGAAGTG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2C706TF 770 0 0
GG
GAAGACTTGTACTTGCGTGTTTCTATGTAAGAAAATTGAAAGAAAATCTGTAAAGAACGA
GTCAAGAGATCCAGACGTGTGTATAAAAGGAATCAAATCGGAAAAAAAAATGGAGAAGAA
GAAGGTGCCAAAAAGACTCCAAGGTAAAGTAGCGATCGTGACGGCATCGACGCAAGGGAT
AGGCTTCGGTATCGTTGAGCGGCTTGGCCTCGAAGGCGCTTCTGTCGTCGTCTCCTCTCG
CAAACAGAGAAATGTGGATGAGGCGGTAGAGAAGCTTAAAGCTCAGGGGATTGATGCATT
TGGAATCGTTTGTCATGTCTCTAATGCTCAACATCGCCAGATTCTTGTCCAAAAGACAAT
TCAAAGATATGGGAAGATAAATATTGTTGTGTGCAATGCAGCTGTGAATCCATCTACTGA
GCCAATCTTATCCACCAAAGAACCTGCTCTTGACAAGCTTTGGGAAGTCAATGTCAAATC
ATCTATCCTTCTCCTCCAGGATATGGCTCCTCACTTAGAGAAGGGTTCTTCTGTAATCTT
CATAACCTCCATTGCTGCGTTTCAACCGCAAGTACCAACGGCAATGTATGGAGTTACTAA
AACAGCTCTTCTCGGCCTAACCAAGGCACTTGCTGCTGAGATGGGACCGGACACTAGAGT
GAACGCAGTAGCACCTGGTGTTGTGCCAACACACTTTGCTTCTTTCATCACCCGGAACTC
TGAAGTGAGAAGAGCCAGTGAGGAGAAA*CTCTGCTCAACAG
CTGGGA

QA 3 764 3 764
DS 

RD RR2C706JQ 222 0 0
GAGATGGGACCGGACACTAGAGTGAACGCAGTAGCACCTGGTGTTGTGCCAACACACTTT
GCTTCTTTCATCACCCGGAACTCTGAAGTGAGAAGAGCCAGTGAGGAGAAAACTCTGCTC
AACAGGCTGGGAACAACGGATGACATGGCCGCTGCAACCGCTTTCTTGGCTTCTGATGAT
GCTTCTTACTTCACCAGTGAACCCTTAGTGGTCGCCGGAGGA

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR2AS01JQ 788 0 0
CGCAAACAGAGAAATGTGGATGAGGCGGTAGAGAAGCTTAAAGCTCAGGGGATTGATGCA
TTTGGAATCGTTTGTCATGTCTCTAATGCTCAACATCGCCAGATTCTTGTCCAAAAGACA
ATTCAAAGATATGGGAAGATAAATATTGTTGTGTGCAATGCAGCTGTGAATCCATCTACT
GAACCAATCTTATCCACCAAAGAACCTGCTCTTGACAAGCTTTGGGAAGTCAATGTCAAA
TCATCTATCCTTCTCCTCCAGGATATGGCTCCTCACTTAGAGAAGGGTTCTTCTGTAATC
TTCATAACCTCCATTGCTGCGTTTCAACCGCAAGTACCAACGGCAATGTATGGAGTTACT
AAAACAGCTCTTCTCGGCCTAACCAAGGCACTTGCTGCTGAGATGGGACCGGACACTAGA
GTGAACGCAGTAGCACCTGGTGTTGTGCCAACACACTTTGCTTCTTTCATCACCCGGAAC
TCTGAAGTGAGAAGAGCCAGTGAGGAGAAAACTCTGCTCAACAGGCTGGGAACAACGGAT
GACATGGCCGCTGCAACCGCTTTCTTGGCTTCTGATGATGCTTCTTACATCACCAGTGAA
ACCTTAGTGGTCGCCGGAGGAATGCCCTCCAGGCTCTGAATCAAAATCCCCAACTAGTAA
TAATTATTCATATATCAATAAAAACTTTTTGATGATGTACAAGAAAAAAACCATACATTT
GTTACTGTTGTATGATAATGTGATGTGGGATACTTTAATTTCTCATTTTGAATAGCAGTA
AATGGAAC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 4

CO CL1601Contig1 616 4 5 U
TTTTTTTGGGTAAAATCGCTTCTGCTAAAATTCATATATGTTTTTGATTCAAAGGGCGTT
TAACAAGCACCACAATTCAAAGCTAGACAATGAGATGAAGAAAGAAGAGCAAGAAATCAA
AAAGCACAAAAACACAAGCCTAATGGAAACTATAGGAAATCTCTAAGCACGCTCTCCACG
AATGCGCCTAGCCAATTGAATGTCCTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTGGCGTGAATGGC
ACACAGATTCGTGTCTTCGAACAACCCCACCAAATACGCCTCTGCCGCTTCCTGAAGAGC
CAACACCGCGTGGCTCTGGAATCTCAGATCCGTCTTGAAATCCTGGGCGATTTCACGAAC
AAGACGCTGGAAGGGAAGTTTACGGATAAGTAACTCAGTGCTCTTCTGGTACTTACGAAT
CTCACGGAGAGCGACGGTTCCGGGACGGTAACGGTGAGGCTTCTTGACACCTCCGGTAGT
TGGTGCAGATTTCCTCGCAGCCTTGGTGGCGAGTTGCTTCCTGGGAGCTTTTCCTCCGGT
AGAGTTCCTAGCGGTCTGCTTCGTACGAGCCATGGCTTTGAATAGGAGATGGTTGGATCG
AATGTTTGTTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B395JQ U 9
AF RR2EE71TF C 1
AF RR2EE71JQ U 8
AF RR2B395TF C 9
BS 1 8 RR2EE71TF
BS 9 543 RR2EE71JQ
BS 544 544 RR2B395JQ
BS 545 607 RR2EE71JQ
BS 608 616 RR2B395TF

RD RR2B395JQ 574 0 0
GGTAAAATCGCTTCTGCTAAAATTCATATATGTTTTTGATTCAAAGGGCGTTTAACAAGC
ACCACAATTCAAAGCTAGACAATGAGATGAAGAAAGAAGAGCAAGAAATCAAAAAGCACA
AAAACACAAGCCTAATGGAAACTATAGGAAATCTCTAAGCACGCTCTCCACGAATGCGCC
TAGCCAATTGAATGTCCTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTGGCGTGAATGGCACACAGAT
TCGTGTCTTCGAACAACCCCACCAAATACGCCTCTGCCGCTTCCTGAAGAGCCAACACCG
CGTGGCTCTGGAATCTCAGATCCGTCTTGAAATCCTGGGCGATTTCACGAACAAGACGCT
GGAAGGGAAGTTTACGGATAAGTAACTCAGTGCTCTTCTGGTACTTACGAATCTCACGGA
GAGCGACGGTTCCGGGACGGTAACGGTGAGGCTTCTTGACACCTCCGGTAGTTGGTGCAA
ATTTCCTCGCAGCCTTGGTGGCGAGTTGCTTCCTGGGAGCTTTTCCTCCGGTGGAGTTCC
TAGCGGTCTGCTTCGTACGAGCCATGGCTTTGAA

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2EE71TF 613 0 0
TTTTTTTGGGTAAAATCGCTTCTGCTAAAATTCATATATGTTTTTGATTCAAAGGGCGTT
TAACAAGCACCACAATTCAAAGCTAGACAATGAGATGAAGAAAGAAGAGCAAGAAATCAA
AAAGCACAAAAACACAAGCCTAATGGAAACTATAGGAAATCTCTAAGCACGCTCTCCACG
AATGCGCCTAGCCAATTGAATGTCCTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTGGCGTGAATGGC
ACACAGATTCGTGTCTTCGAACAACCCCACCAAATACGCCTCTGCCGCTTCCTGAAGAGC
CAACACCGCGTGGCTCTGGAATCTCAGATCCGTCTTGAAATCCTGGGCGATTTCACGAAC
AAGACGCTGGAAGGGAAGTTTACGGATAAGTAACTCAGTGCTCTTCTGGTACTTACGAAT
CTCACGGAGAGCGACGGTTCCGGGACGGTAACGGTGAGGCTTCTTGACACCTCCGGTAGT
TGGTGCAGATTTCCTCGCAGCCTTGGTGGCGAGTTGCTTCCTGGGAGCTTTTCCTCCGGT
AGATTTCCTAGCGGTCTGCTTCGTACGAGCCATGGCTTTGAATAGGAGATGGTTGGATCG
AATGTTT
ATTTCC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2EE71JQ 606 0 0
G
GGTAAAATCGCTTCTGCTAAAATTCATATATGTTTTTGATTCAAAGGGCGTTTAACAAGC
ACCACAATTCAAAGCTAGACAATGAGATGAAGAAAGAAGAGCAAGAAATCAAAAAGCACA
AAAACACAAGCCTAATGGAAACTATAGGAAATCTCTAAGCACGCTCTCCACGAATGCGCC
TAGCCAATTGAATGTCCTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTGGCGTGAATGGCACACAGAT
TCGTGTCTTCGAACAACCCCACCAAATACGCCTCTGCCGCTTCCTGAAGAGCCAACACCG
CGTGGCTCTGGAATCTCAGATCCGTCTTGAAATCCTGGGCGATTTCACGAACAAGACGCT
GGAAGGGAAGTTTACGGATAAGTAACTCAGTGCTCTTCTGGTACTTACGAATCTCACGGA
GAGCGACGGTTCCGGGACGGTAACGGTGAGGCTTCTTGACACCTCCGGTAGTTGGTGCAG
ATTTCCTCGCAGCCTTGGTGGCGAGTTGCTTCCTGGGAGCTTTTCCTCCGGTAGATTTCC
TAGCGGTCTGCTTCGTACGAGCCATGGCTTTGAATAGGAGATGGTTGGATCGAATGTTT
ATTTCC

QA 2 600 2 600
DS 

RD RR2B395TF 608 0 0
GGTAAAATCGCTTCTGCTAAAATTCATATATGTTTTTGATTCAAAGGGCGTTTAACAAGC
ACCACAATTCAAAGCTAGACAATGAGATGAAGAAAGAAGAGCAAGAAATCAAAAAGCACA
AAAACACAAGCCTAATGGAAACTATAGGAAATCTCTAAGCACGCTCTCCACGAATGCGCC
TAGCCAATTGAATGTCCTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTGGCGTGAATGGCACACAGAT
TCGTGTCTTCGAACAACCCCACCAAATACGCCTCTGCCGCTTCCTGAAGAGCCAACACCG
CGTGGCTCTGGAATCTCAGATCCGTCTTGAAATCCTGGGCGATTTCACGAACAAGACGCT
GGAAGGGAAGTTTACGGATAAGTAACTCAGTGCTCTTCTGGTACTTACGAATCTCACGGA
GAGCGACGGTTCCGGGACGGTAACGGTGAGGCTTCTTGACACCTCCGGTAGTTGGTGCAG
ATTTCCTCGCAGCCTTGGTGGCGAGTTGCTTCCTGGGAGCTTTTCCTCCGGTGGAGTTCC
TAGCGGTCTGCTTCGTACGAGCCATGGCTTTGAATAGGAGATGGTTGGATCGAATGTTTG
TTTGTTCC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 3

CO CL1602Contig1 1023 3 11 U
GGGATCTTAATCTTCTGTGAACACAAACACGGAAGAACATAACCAAACCAAACCAGCCAA
GTCCTAAGATCTCCACCACCCCCAGGGAAGAAGAGATCGAAGTGTGGTTTTCTTCATAGC
CGGTGAATTAAAGCAAGATCCTCTAAGTAACCATGATGAATCGTCTGTTCGGGAAACCAA
AGGTGGAGAACAATGCTCTCCAGACATTAGACAAGCTTAACGAGACACTAGAGATGCTAG
AGAAGAAGGAGAAGGTACTCTTGAAGAAGGCTGGTCAAGAGGTTGAGAAGGCTAAAGAAT
ACACTCGTGCTAAGAACAAACGCGCGGCTATACAGTGTTTGAAAAGAAAGAGGTTATATG
AGCAACAAGTCGAACAGCTTGGCAATTTCCAGCTCCGTATTCATGATCAAATGATTATGT
TGGAAGGCGCAAAAGCAACAACTGAAACTGTTGATGCATTGAGGAGTGGAGCTTCTGCAA
TGAAAGCAATGCAGAAAGCTACAAATATCGATGACGTGGACAAGACCATGGATGAGATCA
ATGAGCAGACAGAGAACATGAAACAGATCCAAGAAGCATTGTCTACTCCTCTCGGGGCAG
CAGCCGACTTCGATGAGGATGAGCTAGAAGCAGAGTTGGAAGAACTAGAAAGTGCAGAGC
TTGAAGAGCAGCTTCTTCAGCCAACCACAGTATTGCCTTCAGTTCCGGTGCCTGCAGGGC
GTCAAGCAGCACGTCCTACTCCTAAGCGGACCGCAGAGGAGGAAGAACTTGCTGCATTAC
AGGCTGAGATGGCCCTCTAAGAGGTTTATTCACGAACCGGAGCAGACCTGTATGCATTGA
TAAACCAAGAACAGGCGATGTATATAAGGATCTCAATGTCAAAATTTAAAATTGGAGCGA
AACTTATAATAAATAATCCTCGTCGTGCAATGTTATTTTTATCAAACTTTTGACTGTTTC
TTCTTCACATGTACTATTGTCTTTTGTATTTGATTTGGTAATCTGATGGGTTACTTACTA
CGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2FK26TF U 1
AF RR2ER22TF U 17
AF RR2ER22JQ C 346
BS 1 59 RR2FK26TF
BS 60 60 RR2ER22TF
BS 61 240 RR2FK26TF
BS 241 241 RR2ER22TF
BS 242 625 RR2FK26TF
BS 626 626 RR2ER22TF
BS 627 650 RR2FK26TF
BS 651 651 RR2ER22TF
BS 652 678 RR2FK26TF
BS 679 707 RR2ER22TF
BS 708 1023 RR2ER22JQ

RD RR2FK26TF 678 0 0
GGGATCTTAATCTTCTGTGAACACAAACACGGAAGAACATAACCAAACCAAACCAGCCAG
GTCCTAAGATCTCCACCACCCCCAGGGAAGAAGAGATCGAAGTGTGGTTTTCTTCATAGC
CGGTGAATTAAAGCAAGATCCTCTAAGTAACCATGATGAATCGTCTGTTCGGGAAACCAA
AGGTGGAGAACAATGCTCTCCAGACATTAGACAAGCTTAACGAGACACTAGAGATGCTAG
CGAAGAAGGAGAAGGTACTCTTGAAGAAGGCTGGTCAAGAGGTTGAGAAGGCTAAAGAAT
ACACTCGTGCTAAGAACAAACGCGCGGCTATACAGTGTTTGAAAAGAAAGAGGTTATATG
AGCAACAAGTCGAACAGCTTGGCAATTTCCAGCTCCGTATTCATGATCAAATGATTATGT
TGGAAGGCGCAAAAGCAACAACTGAAACTGTTGATGCATTGAGGAGTGGAGCTTCTGCAA
TGAAAGCAATGCAGAAAGCTACAAATATCGATGACGTGGACAAGACCATGGATGAGATCA
ATGAGCAGACAGAGAACATGAAACAGATCCAAGAAGCATTGTCTACTCCTCTCGGGGCAG
CAGCCGACTTCGATGAGGATGAGCTGGAAGCAGAGTTGGAAGAACTAGAA*GTGCAGAGC
TTGAAGAGCAGCTTCTTC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2ER22TF 696 0 0
GG
GAACACAAACACGGAAGAACATAACCAAACCAAACCAGCCAAGTCCTAAGATCTCCACCA
CCCCCAGGGAAGAAGAGATCGAAGTGTGGTTTTCTTCATAGCCGGTGAATTAAAGCAAGA
TCCTCTAAGTAACCATGATGAATCGTCTGTTCGGGAAACCAAAGGTGGAGAACAATGCTC
TCCAGACATTAGACAAGCTTAACGAGACACTAGAGATGCTAGAGAAGAAGGAGAAGGTAC
TCTTGAAGAAGGCTGGTCAAGAGGTTGAGAAGGCTAAAGAATACACTCGTGCTAAGAACA
AACGCGCGGCTATACAGTGTTTGAAAAGAAAGAGGTTATATGAGCAACAAGTCGAACAGC
TTGGCAATTTCCAGCTCCGTATTCATGATCAAATGATTATGTTGGAAGGCGCAAAAGCAA
CAACTGAAACTGTTGATGCATTGAGGAGTGGAGCTTCTGCAATGAAAGCAATGCAGAAAG
CTACAAATATCGATGACGTGGACAAGACCATGGATGAGATCAATGAGCAGACAGAGAACA
TGAAACAGATCCAAGAAGCATTGTCTACTCCTCTCGGGGCAGCAGCCGACTTCGATGAGG
ATGAGCTAGAAGCAGAGTTGGAAGAACTAGAAAGTGCAGAGCTTGAAGAGCAGCTTCTTC
AGCCAACCACAGTATTGCCTTCAGTTCCG
TGCCT

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR2ER22JQ 678 0 0
GAAAGAGGTTATATGAGCAACAAGTCGAACAGCTTGGCAATTTCCAGCTCCGTATTCATG
ATCAAATGATTATGTTGGAAGGCGCAAAAGCAACAACTGAAACTGTTGATGCATTGAGGA
GTGGAGCTTCTGCAATGAAAGCAATGCAGAAAGCTACAAATATCGATGACGTGGACAAGA
CCATGGATGAGATCAATGAGCAGACAGAGAACATGAAACAGATCCAAGAAGCATTGTCTA
CTCCTCTCGGGGCAGCAGCCGACTTCGATGAGGATGAGCTAGAAGCAGAGTTGGAAGAAC
TAGAAGGTGCAGAGCTTGAAGAGCAGCTTCTTCAGCCAACCACAGTATTGCCTTCAGTTC
CGGTGCCTGCAGGGCGTCAAGCAGCACGTCCTACTCCTAAGCGGACCGCAGAGGAGGAAG
AACTTGCTGCATTACAGGCTGAGATGGCCCTCTAAGAGGTTTATTCACGAACCGGAGCAG
ACCTGTATGCATTGATAAACCAAGAACAGGCGATGTATATAAGGATCTCAATGTCAAAAT
TTAAAATTGGAGCGAAACTTATAATAAATAATCCTCGTCGTGCAATGTTATTTTTATCAA
ACTTTTGACTGTTTCTTCTTCACATGTACTATTGTCTTTTGTATTTGATTTGGTAATCTG
ATGGGTTACTTACTACGT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 2 5

CO CL1603Contig1 796 3 19 U
CGGTACGTAAAACAATTGTGAGGAAGTAAAGCAAGTTTAATAGTTTTGACAAGCAAATAA
AGAGAAAACGTTCTGTATAATTATCATTTGTTTCAGACTATATACATTGCAATGCAAGGA
ATATATAAACTTCCCTTTTTCTGTGACAATTACTACACAAATTATCTGCCAAACTGATTC
TTTTTATCTTAAAATTTCATCGTCGGTTTACTTAAGTATCAAGCAGCCTGAAGCAATTTA
CCGTCACTCTTCTCATCCCTTCTCGTCAATTTCGGAGTTGTCCTGATCACCTTGACCCTA
AATGCCGCCTTCTTATCCGAACCAAACTCGATGATATCGGACGATCTAAACCGGGTTGGG
AAGTTTGGTGTCACTCTGTATTTTCCTCCTTCGTTATCGGTGAGATAGGTCCCGTGTTCG
CTTCGAAGATCCATCAAGAAGAAAGCTCCATCTTTGTAGATTACACGCGCATGCATCTTC
GATACCTGAGGGGAAGGGATCACAATGTGCGTTCCAGGAAAATCTTGGTCTGGTTCACTT
CCGACAATGCAAGGCTGTTCCTCATCTTTGGTTAGACGTAATGTTTCAGAAACGCTACAC
TCGTTGTCATGTGGAATAAGATACCATTCTCCGTTAATAGTACGTTCAAGAGCTTCGTCG
TCCTCAAACCACTCACGAAGGCGGTCATCAGCTTTGTCAGTGAGTCTGCAACTAGGTGGC
TTCCTTCGAGTTTCTCACTGTTACCCCAAGGACCCAGTTAAGCATGGGAGGCATAGCAAT
GTCAATGAAGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E744TF C 41
AF RR2E744JQ U 48
AF RR2CV44JQ U 1
BS 1 134 RR2CV44JQ
BS 135 135 RR2E744JQ
BS 136 167 RR2CV44JQ
BS 168 168 RR2E744JQ
BS 169 185 RR2CV44JQ
BS 186 186 RR2E744JQ
BS 187 212 RR2CV44JQ
BS 213 213 RR2E744JQ
BS 214 533 RR2CV44JQ
BS 534 534 RR2E744JQ
BS 535 560 RR2CV44JQ
BS 561 561 RR2E744JQ
BS 562 587 RR2CV44JQ
BS 588 588 RR2E744JQ
BS 589 606 RR2CV44JQ
BS 607 607 RR2E744JQ
BS 608 662 RR2CV44JQ
BS 663 663 RR2E744JQ
BS 664 796 RR2CV44JQ

RD RR2E744TF 689 0 0
TTAGTTT
GACAAGCAAATAAAGAGAAAACGT*CTGTATAATTATCATTTGTTTCAGACTATATACAT
TGCAATGCAAGGAATATATAAACTTCCCTTTTTCTGTGACAATTACTACACAAATTATCT
GCCAAACTGATTCTTTTTATCTTAAAATTTCATCGTCGGTTTACTTAAGTATCAAGCAGC
CTGAAGCAATTTACCGTCACTCTTCTCATCCCTTCTCGTCAATTTCGGAGTTGTCCTGAT
CACCTTGACCCTAAATGCCGCCTTCTTATCCGAACCAAACTCGATGATATCGGACGATCT
AAACCGGGTTGGGAAGTTTGGTGTCACTCTGTATTTTCCTCCTTCGTTATCGGTGAGATA
GGTCCCGTGTTCGCTTCGAAGATCCATCAAGAAGAAAGCTCCATCTTTGTAGATTACACG
CGCATGCATCTTCGATACCTGAGGGGAAGGGATCACAATGTGCGTTCCAGGAAAATCTTG
GTCTGGTTCACTTCCGACAATGCAAGGCTGTTCCTCATCTTTGGTTAGACGTAATGTTTC
AGAAACGCTACACTCGTTGTCATGTGGAATAAGATACCATTCTCCGTTAATAGTACGTTC
AAGAGCTTCGTCGTCCTCAAACCACTCACGAAGGCGGTCATCAGCTTTGTCAGTGAGTCT
GCAACTAGGTGGC
CTTCCTTCC

QA 8 680 8 680
DS 

RD RR2E744JQ 664 0 0
GACAAGCAAATAAAGAGAAAACGTTCTGTATAATTATCATTTGTTTCAGACTATATACAT
TGCAATGCAAGGAATATATAAACTTCCCTTTTTCTGTGACAATTACTACACAAATTATCT
GCCAAACTGATTCTTTTTATCTTAAAATTTCATCGTCGGTTTACTTAAGTATCAAGCAGC
CTGAAGCAATTTACCGTCACTCTTCTCATCCCTTCTCGTCAATTTCGGAGTTGTCCTGAT
CACCTTGACCCTAAATGCCGCCTTCTTATCCGAACCAAACTCGATGATATCGGACGATCT
AAACCGGGTTGGGAAGTTTGGTGTCACTCTGTATTTTCCTCCTTCGTTATCGGTGAGATA
GGTCCCGTGTTCGCTTCGAAGATCCATCAAGAAGAAAGCTCCATCTTTGTAGATTACACG
CGCATGCATCTTCGATACCTGAGGGGAAGGGATCACAATGTGCGTTCCAGGAAAATCTTG
GTCTGGTTCACTTCCGACAATGCAAGGCTGTTCCTCATCTTTGGTTAGACGTAATGTTTC
AGAAACGCTACACTCGTTGTCATGTGGAATAAGATACCATTCTCCGTTAATAGTACGTTC
AAGAGCTTCGTCGTCCTCAAACCACTCACGAAGGCGGTCATCAGCTTTGTCAGTGAGTCT
GCAA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2CV44JQ 796 0 0
CGGTACGTAAAACAATTGTGAGGAAGTAAAGCAAGTTTAATAGTTTTGACAAGCAAATAA
AGAGAAAACGTTCTGTATAATTATCATTTGTTTCAGACTATATACATTGCAATGCAAGGA
ATATATAAACTTCCTTTTTTCTGTGACAATTACTACACAAATTATCTTCCAAACTGATTC
TTTTTTTCTTAAAATTTCATCGTCGGTTTACTCAAGTATCAAGCAGCCTGAAGCAATTTA
CCGTCACTCTTCTCATCCCTTCTCGTCAATTTCGGAGTTGTCCTGATCACCTTGACCCTA
AATGCCGCCTTCTTATCCGAACCAAACTCGATGATATCGGACGATCTAAACCGGGTTGGG
AAGTTTGGTGTCACTCTGTATTTTCCTCCTTCGTTATCGGTGAGATAGGTCCCGTGTTCG
CTTCGAAGATCCATCAAGAAGAAAGCTCCATCTTTGTAGATTACACGCGCATGCATCTTC
GATACCTGAGGGGAAGGGATCACAATGTGCGTTCCAGGAAAATCTTGGTCTGGCTCACTT
CCGACAATGCAAGGCTGTTCTTCATCTTTGGTTAGACGTAATGTTTCCGAAACGCTACAC
TCGTTGCCATGTGGAATAAGATACCATTCTCCGTTAATAGTACGTTCAAGAGCTTCGTCG
TCTTCAAACCACTCACGAAGGCGGTCATCAGCTTTGTCAGTGAGTCTGCAACTAGGTGGC
TTCCTTCGAGTTTCTCACTGTTACCCCAAGGACCCAGTTAAGCATGGGAGGCATAGCAAT
GTCAATGAAGATCTCC

QA 1 796 1 796
DS 



CO CL1603Contig2 686 2 2 U
GAACAGTGAGAAGCTCGAAGGAAGGCCACCTAGTTGCAGACTCACTGACAAAGCTGATGA
CCGCCTTCGTGAGTGGTTTGAAGACGACGAGGCTCTTGAACGTACTATTAACGGAGAATG
GTATCTTATCCCACATGGCAACGAGTGTAGCGTTTCTGAAACATTACGTCTAACCAAAGA
TGAGGAACAGCCTTGCATTGTCGGAAGTGAACCAGACCAAGATTTTCCTGGAACGCACAT
TGTGATCCCTTCCCCTCAGGTATCGAAGATGCATGCGCGTGTAATCTACAAAGATGGAGC
TTTCTTCTTGATGGATCTTCGAAGCGAACACGGGACCTATCTCACCGATAACGAAGGAGG
AAAATACAGAGTGACACCAAACTTCCCAACCCGGTTTAGATCGTCCGATATCATCGAGTT
TGGTTCGGATAAGAAGGCCGCATTTAGGGTCAAGGTGATCAGGACAACTCCGAAATTGAC
GAGAAGGGATGAGAAGAGTGACGGTAAATTGCTTCAGGCTGCTTGATACTTAAGTAAACC
GACGCTGAAATTTAAGAAAAAAAGAATCAGTTTGGCAGATAATTTGTGTAGTAATTGAAG
ATGCAGAAAAAAGAAGTTCAAATATTCCTTGCATTGCAGTGTATATAGTCTGAAACAAAT
GATAATTATACAGAACGTTTTCTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G023JQ C 1
AF RR2G023TF U 61
BS 1 60 RR2G023JQ
BS 61 686 RR2G023TF

RD RR2G023JQ 686 0 0
GAACAGTGAGAAGCTCGAAGGAAGGCCACCTAGTTGCAGACTCACTGACAAAGCTGATGA
CCGCCTTCGTGAGTGGTTTGAAGACGACGAGGCTCTTGAACGTACTATTAACGGAGAATG
GTATCTTATCCCACATGGCAACGAGTGTAGCGTTTCTGAAACATTACGTCTAACCAAAGA
TGAGGAACAGCCTTGCATTGTCGGAAGTGAACCAGACCAAGATTTTCCTGGAACGCACAT
TGTGATCCCTTCCCCTCAGGTATCGAAGATGCATGCGCGTGTAATCTACAAAGATGGAGC
TTTCTTCTTGATGGATCTTCGAAGCGAACACGGGACCTATCTCACCGATAACGAAGGAGG
AAAATACAGAGTGACACCAAACTTCCCAACCCGGTTTAGATCGTCCGATATCATCGAGTT
TGGTTCGGATAAGAAGGCCGCATTTAGGGTCAAGGTGATCAGGACAACTCCGAAATTGAC
GAGAAGGGATGAGAAGAGTGACGGTAAATTGCTTCAGGCTGCTTGATACTTAAGTAAACC
GACGCTGAAATTTAAGAAAAAAAGAATCAGTTTGGCAGATAATTTGTGTAGTAATTGAAG
ATGCAGAAAAAAGAAGTTCAAATATTCCTTGCATTGCAGTGTATATAGTCTGAAACAAAT
GATAATTATACAGAACGTTTTCTCTT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2G023TF 626 0 0
CCGCCTTCGTGAGTGGTTTGAAGACGACGAGGCTCTTGAACGTACTATTAACGGAGAATG
GTATCTTATCCCACATGGCAACGAGTGTAGCGTTTCTGAAACATTACGTCTAACCAAAGA
TGAGGAACAGCCTTGCATTGTCGGAAGTGAACCAGACCAAGATTTTCCTGGAACGCACAT
TGTGATCCCTTCCCCTCAGGTATCGAAGATGCATGCGCGTGTAATCTACAAAGATGGAGC
TTTCTTCTTGATGGATCTTCGAAGCGAACACGGGACCTATCTCACCGATAACGAAGGAGG
AAAATACAGAGTGACACCAAACTTCCCAACCCGGTTTAGATCGTCCGATATCATCGAGTT
TGGTTCGGATAAGAAGGCCGCATTTAGGGTCAAGGTGATCAGGACAACTCCGAAATTGAC
GAGAAGGGATGAGAAGAGTGACGGTAAATTGCTTCAGGCTGCTTGATACTTAAGTAAACC
GACGCTGAAATTTAAGAAAAAAAGAATCAGTTTGGCAGATAATTTGTGTAGTAATTGAAG
ATGCAGAAAAAAGAAGTTCAAATATTCCTTGCATTGCAGTGTATATAGTCTGAAACAAAT
GATAATTATACAGAACGTTTTCTCTT

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL1604Contig1 816 2 2 U
GAAGATGACTCCTCACGACAAACAAGTTATGATGTTCTCAGCAACTCTCAGCAAAGAGAT
ACGCCCAGTCTGCAAGAAGTTTATGCAAGATCCAATGGAAATTTATGTTGATGATGAAGC
CAAATTGACCTGCATGGGCTTGTCCAGCACTACATCAAACTGAGCGAGATGGAGAAAAAC
CGTAAGCTGAATGACCTTCTTGACGCATTGGACTTCAATCAAGTTGTCATATTTGTGAAG
AGCGTCAGCAGAGCTGGGGAGCTGAACAAGCTGCTTATCGAATGTAACTTCCCCTCAATA
TGCATTCACTCTGGCATGTCTCAGGAAGAGAGGCTGACTCACTACAAAAGCTTCAAGGAA
GGGCACAAGAGAATTCTGGTGGCGACAGACTTGGTAGGGAGAGGAATTGACATTGAGCGA
GTAAACATTGTCATCAACTATGACATGCCAGATTCTGCTGATACATACCTTCACAGGGTT
GGAAGAGCTGGTAGGTTTGGAACAAAGGGTCTTGCAATCACATTTGTGGCATCAGCTTCA
GACTCGGAAGTTCTTAACCAGGTACAAGCTAGGTTCGAGGTTGATATCAAGCAACTTCCT
GAGAATATTGATACTTCTACATACATGCCGTCTTAAAGCAGCATCGTCTCTCAGGAAGAA
CCTCTCCAGATTACAACTATCATCTTCCCCTCTATATTTTAGCTTTTTTTCTCTGTGGAC
AAGCTTCTGTTTAGACCGTTTGTAACTCTTCAGTTAAAGAGATCGAGTGACTCTACAATC
ACATTTTGTTAAAGTTTGTCCTGTTTTGTAAAGATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA51TF U 1
AF RR2C152TF U 140
BS 1 638 RR2DA51TF
BS 639 816 RR2C152TF

RD RR2DA51TF 649 0 0
GAAGATGACTCCTCACGACAAACAAGTTATGATGTTCTCAGCAACTCTCAGCAAAGAGAT
ACGCCCAGTCTGCAAGAAGTTTATGCAAGATCCAATGGAAATTTATGTTGATGATGAAGC
CAAATTGACCTGCATGGGCTTGTCCAGCACTACATCAAACTGAGCGAGATGGAGAAAAAC
CGTAAGCTGAATGACCTTCTTGACGCATTGGACTTCAATCAAGTTGTCATATTTGTGAAG
AGCGTCAGCAGAGCTGGGGAGCTGAACAAGCTGCTTATCGAATGTAACTTCCCCTCAATA
TGCATTCACTCTGGCATGTCTCAGGAAGAGAGGCTGACTCACTACAAAAGCTTCAAGGAA
GGGCACAAGAGAATTCTGGTGGCGACAGACTTGGTAGGGAGAGGAATTGACATTGAGCGA
GTAAACATTGTCATCAACTATGACATGCCAGATTCTGCTGATACATACCTTCACAGGGTT
GGAAGAGCTGGTAGGTTTGGAACAAAGGGTCTTGCAATCACATTTGTGGCATCAGCTTCA
GACTCGGAAGTTCTTAACCAGGTACAAGCTAGGTTCGAGGTTGATATCAAGCAACTTCCT
GAGAATATTGATACTTCTACATACATGCCGTCTTAAAG
CAGCATCGTCT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2C152TF 677 0 0
G
TGTCCAGCACTACATCAAACTGAGCGAGATGGAGAAAAACCGTAAGCTGAATGACCTTCT
TGACGCATTGGACTTCAATCAAGTTGTCATATTTGTGAAGAGCGTCAGCAGAGCTGGGGA
GCTGAACAAGCTGCTTATCGAATGTAACTTCCCCTCAATATGCATTCACTCTGGCATGTC
TCAGGAAG*GAGGCTGACTCACTACAAAAGCTTCAAGGAAGGGCACAAGAGAATTCTGGT
GGCGACAGACTTGGTAGGGAGAGGAATTGACATTGAGCGAGTAAACATTGTCATCAACTA
TGACATGCCAGATTCTGCTGATACATACCTTCACAGGGTTGGAAGAGCTGGTAGGTTTGG
AACAAAGGGTCTTGCAATCACATTTGTGGCATCAGCTTCAGACTCGGAAGTTCTTAACCA
GGTACAAGCTAGGTTCGAGGTTGATATCAAGCAACTTCCTGAGAATATTGGTACTTCTAC
ATACATGCCGTCTTAAAGCAGCATCGTCTCTCAGGAAGAACCTCTCCAGATTACAACTAT
CATCTTCCCCTCTATATTTTAGCTTTTTTTCTCTGTGGACAAGCTTCTGTTTAGACCGTT
TGTAACTCTTCAGTTAAAGAGATCGAGTGACTCTACAATCACATTTTGTTAAAGTTTGTC
CTGTTTTGTAAAGATA

QA 2 677 2 677
DS 



AS 1 3

CO CL1605Contig1 1090 3 10 U
GGGGATCCACACACACACACATAGAGGGTTAGAGATTCATCAATGGCGGTTTCTCGCAGC
TACTCATCGATTCTCTTCCCCCGATCCACCGCGGGTACCTCCCCCATTGGCTTCAACCGC
TTCCCTTGTCTCCAAACGCTGCGTTTCAAATCAAGAAACGCTTATCCAAAATCTCGTGCT
TCTTCAGTCTCGGCATCATCAGCTTCACGGTCTCTCGAAGCTCTGATCTTCGACTGCGAC
GGTGTGATACTCGAATCGGAGAACTTACACCGTCAAGCTTACAACGACGCATTCTCGCAT
TTCGATGTTCGATGTCCTCCTTCCTCACCCGAGTCTCTCAACTGGAGCCTCGAGTTCTAC
GACAAGTTTCAGAATCTTGTCGGAGGTGGAAAGCCTAAAATGAGATGGTACTTTAGAGAA
AATGGATGGCCGACTTCGACCCTTTTCGACACACCTCCAGAGAGTGACGATGATCGAGCC
AAGTTGATCGATACTCTTCAGGATTGGAAGACAGAGAGGTACAAAGAGATCATTAAATCA
GGAAGTGTAGAAGCAAGACCTGGTGTAATAAGACTAATGGATGAAGCAAGAGCTGCTGGG
AAGAAACTAGCTGTGTGTTCTGCAGCTACAAAGAGTTCAGTTGTCTTATGTCTTGAGAAT
CTAATCCAAATCGAGCGATTCCAAGGACTTGATTGCTTCCTTGCAGGAGATGATGTTAAG
GAGAAGAAACCTGATCCTTCTATATATATAACAGCTGCCGAGAAGCTAGGTGTTTCTGTG
AATGACTGTTTGGTTATAGAGGACAGTGTGATTGGCTTGCAGGCTGCTACAAAAGCAGGC
ATGTCATGTGTGATTACATACACTTCTTCAACATCTGATCAGGATTTCAAAGAGGCGATT
GCTGTATACCCTGATCTCAGCAATGTGAGCTTAAAAGACCTGGAAACTCTACTTCAAACC
ATTGTCACTGCAGCTTAATACATACATTTGCCTGTTTTTTTTTGTGCAACACATTTGCCT
TCTTTTCATTTTTGTTTTATTCTTCTGCAACTGTACATCTGTTTTTGTTCAATATTTTTT
TTCATTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH58TF U 1
AF RR2GK95TF U 3
AF RR2EO25JQ C 400
BS 1 476 RR2DH58TF
BS 477 477 RR2GK95TF
BS 478 541 RR2DH58TF
BS 542 542 RR2GK95TF
BS 543 573 RR2DH58TF
BS 574 574 RR2EO25JQ
BS 575 583 RR2GK95TF
BS 584 584 RR2EO25JQ
BS 585 683 RR2GK95TF
BS 684 1090 RR2EO25JQ

RD RR2DH58TF 580 0 0
GGGGATCCACACACACACACATAGAGGGTTAGAGATTCATCAATGGCGGTTTCTCGCAGC
TACTCATCGATTCTCTTCCCCCGATCCACCGCGGGTACCTCCCCCATTGGCTTCAACCGC
TTCCCTTGTCTCCAAACGCTGCGTTTCAAATCAAGAAACGCTTATCCAAAATCTCGTGCT
TCTTCAGTCTCGGCATCATCAGCTTCACGGTCTCTCGAAGCTCTGATCTTCGACTGCGAC
GGTGTGATACTCGAATCGGAGAACTTACACCGTCAAGCTTACAACGACGCATTCTCGCAT
TTCGATGTTCGATGTCCTCCTTCCTCACCCGAGTCTCTCAACTGGAGCCTCGAGTTCTAC
GACAAGTTTCAGAATCTTGTCGGAGGTGGAAAGCCTAAAATGAGATGGTACTTTAGAGAA
AATGGATGGCCGACTTCGACCCTTTTCGACACACCTCCAGAGAGTGACGATGATCGCGCC
AAGTTGATCGATACTCTTCAGGATTGGAAGACAGAGAGGTACAAAGAGATCATTAAATCA
G*AAGTGTAGAAGCAAGACCTGGTGTAATAAGA
GTAATGG

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2GK95TF 681 0 0
GGGGATC
CACACACACACATAGAGGGTTAGAGATTCATCAATGGCGGTTTCTTGCAGCTACTCATCG
ATTCTCTTCCCCCGATCCACCGCGGGTACCTCCTCCATTGGCTTCAACCGCTTCCCTTGT
CTCCAAACGCTGCGTTTCAAATCAAGAAACGCTTATCCAAAATCTCGTGCTTCTTCAGTC
TCGGCATCATCAGCTTCACGGTCTCTCGAAGCTCTGATCTTCGACTGCGACGGTGTGATA
CTCGAATCGGAGAACTTACACCGTCAAGCTTACAACGACGCATTCTCGCATTTCGATGTT
CGATGTCCTCCTTCCTCACCCGAGTCTCTCAACTGGAGCCTCGAGTTCTACGACAAGTTT
CAGAATCTTGTCGGAGGTGGAAAGCCTAAAATGAGATGGTACTTTAGAGAAAATGGATGG
CCGACTTCGACCCTTTTCGACACACCTCCAGAGAGTGACGATGATCGAGCCAAGTTGATC
GATACTCTTCAGGATTGGAAGACAGAGAGGTACAAAGAGATCATTAAATCAGGAAGTGTA
GAAGCAAGACCTGGTGTAATAAGAGTAATGGATGGAGCAAGAGCTGCTGGGAAGAAACTA
GCTGTGTGTTCTGCAGCTACAAAGAGTTCAGTTGTCTTATGTCTTGAGAATCTAATCCAA
ATCGAGCGATTCCA

QA 8 681 8 681
DS 

RD RR2EO25JQ 691 0 0
ATGAGATGGTACTTTAGAGAGAATGGATGGCCGACTTCGACCCTTTTCGACACACCTCCA
GAGAGTGACAATGATCGAGCCAAGTTGATCGATACTCTTCAGGATTGGAAGACAGAGAGG
TACAAAGAGACCATTAAATCAGGAAGTGTAGAAGCAAGACCTGGTGTAATAAGACTCATG
GATGAAGCAAGAGCTGCTGGGAAGAAACTAGCTGTGTGTTCTGCAGCTACAAAGAGTTCA
GTTGTCTTATGTCTTGAGAATCTAATCCAAATCGAGCGATTCCAAGGACTTGATTGCTTC
CTTGCAGGAGATGATGTTAAGGAGAAGAAACCTGATCCTTCTATATATATAACAGCTGCC
GAGAAGCTAGGTGTTTCTGTGAATGACTGTTTGGTTATAGAGGACAGTGTGATTGGCTTG
CAGGCTGCTACAAAAGCAGGCATGTCATGTGTGATTACATACACTTCTTCAACATCTGAT
CAGGATTTCAAAGAGGCGATTGCTGTATACCCTGATCTCAGCAATGTGAGCTTAAAAGAC
CTGGAAACTCTACTTCAAACCATTGTCACTGCAGCTTAATACATACATTTGCCTGTTTTT
TTTTGTGCAACACATTTGCCTTCTTTTCATTTTTGTTTTATTCTTCTGCAACTGTACATC
TGTTTTTGTTCAATATTTTTTTTCATTAATC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 4

CO CL1606Contig1 868 4 3 U
GGAGGTTACTACTGATCATCGGCCAATTCCTCTTCTTCCCTCCCTCGCGTCGGTGCCCTG
TTCATCTTCCGTCCCGTGGACTCTGTAATCTCACGGTTGAAGCACCTTACTGCCTCGGAG
GAAACCCTAATTCATCCGAACAGTCGCTACCCCTCTCTCTCCGTCTTTTCGCCAAACCCC
TTCTCTGATACATCTGTGATGGATCCAGCACAGAACACAAGCGCTGCAGGGATTGGCGGA
AGCAATGGTACAACGACGATGGGATATGATGGAACTGCAACTGCGTCTGAAGATTCGAAA
GAGAATCTGAACCAAGTCACAAACTCTATTCAGAAGACTTTGGGACTCCTTCATCAGTTA
CACCTTACTGTCTCTTCTTTCACTCCCGCTTCTCAGCTTCATCTCCTCCAGCGCCTCAAC
TCTCTCGTGTCGGAGCTGAATAGCATGGCTAAGTTGTCAGAGAAATGCAACATTCAAGTC
CCCATGGAGGTTCTTAGCTTGATTGATGATGGAAAGAACCCGGATGAGTTTACAAGGGAT
GTTATTAATAGCTGCGTCGCCAGGAATCAAGTTACAAAGGGCAAGACTGATGCTTTTAAG
GATTTGAGAAAACATATTCTGGAGGAGCTTGAAGAGACTTTCCCTGATGAAGTTGATAAG
TACAGAGAGATCCGTGCTGCTTCTGCCGCTGAAGCGAAACGGCAGGCGCAATCGCAAAGT
GTGTCGTTACCCAATGGGGATGCCAAGGTCAAGAACGAGCTATAAGTTTCTCCTCTGGAT
CTTCTTAAACTTGTAGAAATCAAGTTTCTGTGTAGAAACCGAATAAGACCCACTTTGCAA
TTTCTACAATAAATATCTGTTTGTTTGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GT77TF U 1
AF RR2H460TF U 1
AF RR2GT77JQB C 217
AF RR2H460JQB C 329
BS 1 574 RR2GT77TF
BS 575 647 RR2H460TF
BS 648 868 RR2GT77JQB

RD RR2GT77TF 574 0 0
GGAGGTTACTACTGATCATCGGCCAATTCCTCTTCTTCCCTCCCTCGCGTCGGTGCCCTG
TTCATCTTCCGTCCCGTGGACTCTGTAATCTCACGGTTGAAGCACCTTACTGCCTCGGAG
GAAACCCTAATTCATCCGAACAGTCGCTACCCCTCTCTCTCCGTCTTTTCGCCAAACCCC
TTCTCTGATACATCTGTGATGGATCCAGCACAGAACACAAGCGCTGCAGGGATTGGCGGA
AGCAATGGTACAACGACGATGGGATATGATGGAACTGCAACTGCGTCTGAAGATTCGAAA
GAGAATCTGAACCAAGTCACAAACTCTATTCAGAAGACTTTGGGACTCCTTCATCAGTTA
CACCTTACTGTCTCTTCTTTCACTCCCGCTTCTCAGCTTCATCTCCTCCAGCGCCTCAAC
TCTCTCGTGTCGGAGCTGAATAGCATGGCTAAGTTGTCAGAGAAATGCAACATTCAAGTC
CCCATGGAGGTTCTTAGCTTGATTGATGATGGAAAGAACCCGGATGAGTTTACAAGGGAT
GTTATTAATAGCTGCGTCGCCAGGAATCAAGTTA

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2H460TF 647 0 0
GGAGGTTACTACTGATCATCGGCCAATTCCTCTTCTTCCCTCCCTCGCGTCGGTGCCCTG
TTCATCTTCCGTCCCGTGGACTCTGTAATCTCACGGTTGAAGCACCTTACTGCCTCGGAG
GAAACCCTAATTCATCCGAACAGTCGCTACCCCTCTCTCTCCGTCTTTTCGCCAAACCCC
TTCTCTGATACATCTGTGATGGATCCAGCACAGAACACAAGCGCTGCAGGGATTGGCGGA
AGCAATGGTACAACGACGATGGGATATGATGGAACTGCAACTGCGTCTGAAGATTCGAAA
GAGAATCTGAACCAAGTCACAAACTCTATTCAGAAGACTTTGGGACTCCTTCATCAGTTA
CACCTTACTGTCTCTTCTTTCACTCCCGCTTCTCAGCTTCATCTCCTCCAGCGCCTCAAC
TCTCTCGTGTCGGAGCTGAATAGCATGGCTAAGTTGTCAGAGAAATGCAACATTCAAGTC
CCCATGGAGGTTCTTAGCTTGATTGATGATGGAAAGAACCCGGATGAGTTTACAAGGGAT
GTTATTAATAGCTGCGTCGCCAGGAATCAAGTTACAAAGGGCAAGACTGATGCTTTTAAG
GATTTGAGAAAACATATTCTGGAGGAGCTTGAAGAGACTTTCCCTGA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2GT77JQB 652 0 0
ACAAGCGCTGCAGGGATTGGCGGAAGCAATGGTACAACGACGATGGGATATGATGGAACT
GCAACTGCGTCTGAAGATTCGAAAGAGAATCTGAACCAAGTCACAAACTCTATTCAGAAG
ACTTTGGGACTCCTTCATCAGTTACACCTTACTGTCTCTTCTTTCACTCCCGCTTTTCAG
CTTCATCTCCTCCAGCGCCTCAACTCTCTCGTGTCGGAGCTGAATAGCATGGCTAAGTTG
TCAGAGAAATGCAACATTCAAGTCCCCATGGAGGTTCTTAGCTTGATTGATGATGGAAAG
AACCCGGATGAGTTTACAAGGGATGTTATTAATAGCTGCGTCGCCAGGAATCAAGTTACA
AAGGGCAAGACTGATGCTTTTAAGGATTTGAGAAAACATATTCTGGAGGAGCTTGAAGAG
ACTTTCCCTGATGAAGTTGATAAGTACAGAGAGATCCGTGCTGCTTCTGCCGCTGAAGCG
AAACGGCAGGCGCAATCGCAAAGTGTGTCGTTACCCAATGGGGATGCCAAGGTCAAGAAC
GAGCTATAAGTTTCTCCTCTGGATCTTCTTAAACTTGTAGAAATCAAGTTTCTGTGTAGA
AACCGAATAAGACCCACTTTGCAATTTCTACAATAAATATCTGTTTGTTTGC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2H460JQB 540 0 0
TTCAGAAGACTTTGGGACTCCTTCATCAGTTACACCTTACTGTCTCTTCTTTCACTCCCG
CTTTTCAGCTTCATCTCCTCCAGCGCCTCAACTCTCTCGTGTCGGAGCTGAATAGCATGG
CTAAGTTGTCAGAGAAATGCAACATTCAAGTCCCCATGGAGGTTCTTAGCTTGATTGATG
ATGGAAAGAACCCGGATGAGTTTACAAGGGATGTTATTAATAGCTGCGTCGCCAGGAATC
AAGTTACAAAGGGCAAGACTGATGCTTTTAAGGATTTGAGAAAACATATTCTGGAGGAGC
TTGAAGAGACTTTCCCTGATGAAGTTGATAAGTACAGAGAGATCCGTGCTGCTTCTGCCG
CTGAAGCGAAACGGCAGGCGCAATCGCAAAGTGTGTCGTTACCCAATGGGGATGCCAAGG
TCAAGAACGAGCTATAAGTTTCTCCTCTGGATCTTCTTAAACTTGTAGAAATCAAGTTTC
TGTGTAGAAACCGAATAAGACCCACTTTGCAATTTCTACAATAAATATCTGTTTGTTTGC

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 3

CO CL1607Contig1 1235 3 11 U
GGGGAAAGAGATTTTATTTTGTAGACATGTATTACAACACTTAGCGTCATATATAGCTAT
ATGCCACTTTTAATATATATATTTGTACAGCTTCTGAGCGTTTACAAATGCTATAAGCAA
GTCTTTAAGAAATCAGAAATACTCAACAGGGAAACCAACGACGGGGTCAATCTCAGAAGC
CAGAGAGCGTAGCTCAGCCACTTCATCGTCTGTCAGACTCCAACCTATAGCTCCAGCAAA
CTCTTTGGCTTGTTCTGCATTCTTGGCTCCTGGGATCGGTATCACGTTCCCTTGTGCCAC
CAACCAGTTCAATGCTACCTGTGTGGGAGTTTTGGTGTAGACTTCGCCTATTTGTTTGAT
TCTATTAAGCAGGGGTTGAAGCTTTGTTAGAAATTCACGAGTATAAATACGACCCCGAGG
ACCTGAAGGTGGGTTCTCTGGGGTGTATTTACCAGTTAGAGCACCTTGAGCAATGGGGGA
ATATGCAATCAAACTGACACCAAGCTCATCACAGGCAGCCTTTACACCAGTCTGCTCTGG
AGCTCTGTATATCAAACTGTAGTTGACTTGATTTGAGGCCAGAGGGATTCCTCTCTTTTT
GAGTCTCTCATAAGCATCACGTAGCCGCTTCTCACTGTAGTTAGAAACACCAACAGCCTT
CACAAGTCCTTGCTCAACGGCATCCCCAAGACCATCCAGATATCCTTCATTTCCCCATAA
TCCCGGCCAATGGAGTTGATAGAGATCCACAGAAGAAAACTCAAGCCGGGAAAGGGAATC
TTCCTAGAAGAGTTTCAGAGCTTATAGCACCCAAGGAAAACTTGGAACCGTAAACTTCAG
CAGTATCGAAAAAATCTATACCGTTGTCAAGACTGACATCGAAAGCACCTTTGGCAGCCT
TCAGTTTCCTGTCATCCCACTGGAAATCATTCCAGTAACTGTTATCACCCCATGACCAGA
CTCCGATGCCAAGCTTCGTCACCTTCAGATCCGAGCCACCTAGTTTCACTTTTGACTCTT
CCGTAATCGCCGGAGCTACGGAAGAATATCCTGAGGCTACTGCTGCTCTGACCAGCTTCC
GATCGAACCTTCCTCTTCCTCGAGAGGCTTCCGAGATAACGTAGTTTACAGGGAAGCTGA
AATGCGTAGCCATGGCCATTGGGGTGTGTGTGATGTAATTTTTGAAACTGGAAGAAGAGA
AGAAGAAGAGGTGAGCGACGGTTAAACTGACACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX93JQ U 1
AF RR2EA85JQ U 48
AF RR2GX93TF C 542
BS 1 167 RR2GX93JQ
BS 168 168 RR2EA85JQ
BS 169 498 RR2GX93JQ
BS 499 499 RR2EA85JQ
BS 500 512 RR2GX93JQ
BS 513 513 RR2EA85JQ
BS 514 756 RR2GX93JQ
BS 757 758 RR2EA85JQ
BS 759 759 RR2GX93TF
BS 760 778 RR2EA85JQ
BS 779 1235 RR2GX93TF

RD RR2GX93JQ 756 0 0
GGGGAAAGAGATTTTATTTTGTAGACATGTATTACAACACTTAGCGTCATATATAGCTAT
ATGCCACTTTTAATATATATATTTGTACAGCTTCTGAGCGTTTACAAATGCTATAAGCAA
GTCTTTAAGAAATCAGAAATACTCAACAGGGAAACCAACGACGGGGTTAATCTCAGAAGC
CAGAGAGCGTAGCTCAGCCACTTCATCGTCTGTCAGACTCCAACCTATAGCTCCAGCAAA
CTCTTTGGCTTGTTCTGCATTCTTGGCTCCTGGGATCGGTATCACGTTCCCTTGTGCCAC
CAACCAGTTCAATGCTACCTGTGTGGGAGTTTTGGTGTAGACTTCGCCTATTTGTTTGAT
TCTATTAAGCAGGGGTTGAAGCTTTGTTAGAAATTCACGAGTATAAATACGACCCCGAGG
ACCTGAAGGTGGGTTCTCTGGGGTGTATTTACCAGTTAGAGCACCTTGAGCAATGGGGGA
ATATGCAATCAAACTGACGCCAAGCTCATCACGGGCAGCCTTTACACCAGTCTGCTCTGG
AGCTCTGTATATCAAACTGTAGTTGACTTGATTTGAGGCCAGAGGGATTCCTCTCTTTTT
GAGTCTCTCATAAGCATCACGTAGCCGCTTCTCACTGTAGTTAGAAACACCAACAGCCTT
CACAAGTCCTTGCTCAACGGCATCCCCAAGACCATCCAGATATCCTTCATTTCCCCATAA
TCCCGGCCAATGGAGTTGATAGAGATCCACAGAAGA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2EA85JQ 731 0 0
CATC
TATAGCTATATGCCACTTTTAATATATATATTTGTACAGCTTCTGAGCGTTTACAAATGC
TATAAGCAAGTCTTTAAGAAATCAGAGATACTCAACAGGGAAACCAACGACGGGGTCAAT
CTCAGAAGCCAGAGAGCGTAGCTCAGCCACTTCATCGTCTGTCAGACTCCAACCTATAGC
TCCAGCAAACTCTTTGGCTTGTTCTGCATTCTTGGCTCCTGGGATCGGTATCACGTTCCC
TTGTGCCACCAACCAGTTCAATGCTACCTGTGTGGGAGTTTTGGTGTAGACTTCGCCTAT
TTGTTTGATTCTATTAAGCAGGGGTTGAAGCTTTGTTAGAAATTCACGAGTATAAATACG
ACCCCGAGGACCTGAAGGTGGGTTCTCTGGGGTGTATTTACCAGTTAGAGCACCTTGAGC
AATGGGGGAATATGCAATCAAACTGACACCAAGCTCATCACAGGCAGCCTTTACACCAGT
CTGCTCTGGAGCTCTGTATATCAAACTGTAGTTGACTTGATTTGAGGCCAGAGGGATTCC
TCTCTTTTTGAGTCTCTCATAAGCATCACGTAGCCGCTTCTCACTGTAGTTAGAAACACC
AACAGCCTTCACAAGTCCTTGCTCAACAGCATCCCCAAGACCATCCAGATATCCTTCATT
TCCCCATAATCCCGGCCAATGGAGTTGATAGAGATCCACAGAAGAAAGCTCAAGCCGGGA
AAGGGAA

QA 5 731 5 731
DS 

RD RR2GX93TF 694 0 0
GCTCTGTATATCAAACTGTAGTTGACTTGATTTGAGGCCAGAGGGATTCCTCTCTTTTTG
AGTCTCTCATAAGCATCACGTAGCCGCTTCTCACTGTAGTTAGAAACACCAACAGCCTTC
ACAAGTCCTTGCTCAACGGCATCCCCAAGACCATCCAGATATCCTTCATTTCCCCATAAT
CCCGGCCAATGGAGTTGATAGAGATCCACAGAAGAAAACTCAAGCCGGGAAAGGGAATCT
TCCTAGAAGAGTTTCAGAGCTTATAGCACCCAAGGAAAACTTGGAACCGTAAACTTCAGC
AGTATCGAAAAAATCTATACCGTTGTCAAGACTGACATCGAAAGCACCTTTGGCAGCCTT
CAGTTTCCTGTCATCCCACTGGAAATCATTCCAGTAACTGTTATCACCCCATGACCAGAC
TCCGATGCCAAGCTTCGTCACCTTCAGATCCGAGCCACCTAGTTTCACTTTTGACTCTTC
CGTAATCGCCGGAGCTACGGAAGAATATCCTGAGGCTACTGCTGCTCTGACCAGCTTCCG
ATCGAACCTTCCTCTTCCTCGAGAGGCTTCCGAGATAACGTAGTTTACAGGGAAGCTGAA
ATGCGTAGCCATGGCCATTGGGGTGTGTGTGATGTAATTTTTGAAACTGGAAGAAGAGAA
GAAGAAGAGGTGAGCGACGGTTAAACTGACACCC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 4

CO CL1608Contig1 1403 4 22 U
TATCTTCCTAGCAGCAAGTCTTTGAAGCCATTCTCAGATTCACGACAGCAGTTCGGTAAT
AAAACCTCCCTCGAGCCTAGGTCGTAAAAATTGGAACTTAGTTTTTTTCTGGAAGATGAT
TGGGAATCCTGTAATTCAAGTTCCCTCATCACTAATGCCATCGTCTTCAATGATGTCTCG
CCCTCGAGTTTCTCCCAATGGGCTTCCTTATCTCCCACCCAAACCTAGGACTAGGCATTT
AGTGGTCAGAGCTGCATCCAATTCACATGGTCAACCATCCTCTGATGAAGAAGGGAAGAG
TCCTCTCACGGTTGTTTTGGATGTCCCGAGGAATATCTGGAGACAGACTCTGAAACCTCT
GAGTGATTTTGGGTTT*GGTAAGAGAAGTGTTTGGGAAGGTGGGGTCGGTTTGTTTATCG
TCTCTGGAGCTACGCTTCTCGCGCTTAGCTGGGCTTGGATGCGAGGGTTTCAAATGCGGT
CCAAGTTCAGGAAGTATCAGACCGTCTTTGAGCTTAGCCAAGCCTCTGGTATTTGCACGG
GGACACCGGTTAGGATCCGTGGTGTGACTGTTGGTACGGTTATTCGTGTGAATCCTTCCT
TGAAGAACATTGAAGCTGTTGCTGAGATTGAAGATGATAAGATTATCATCCCTAAGAATT
CACTGGTTGAGGTGAATCAGTCTGGTCTTCTGATGGAAACCATGATCGATATCACGCCGA
GGAATCCTATACCGGAACCTTCTGTTGGGCCTTTGGATCCGGAATGTGGTAGAGAAAGTC
TGATTGTTTGTGATAGACAGAAGATAAAGGGAGAGCAAGGGGTGAGTTTAGATGCACTGG
TTGGGATATTCACTCGTATTGGACGTGAAGTAGAGGCGATTGGTGTTGTCAATGCGTATA
CGCTTGCTGAGAGAGCAGCGTCTGTTACTGAAGAAGCGAAACCATTGCTCAGAAAGATTC
AAGCCATGGCCGAAGATGCTCAACCTTTGCTCTCTGAGTTTCGTGACAGCGGCTTGCTCA
AGGAAGTTGAGTCTCTTACTCGAAGCCTTACCCAAGCTTCTGACGATATGAGAAAGGTTC
ATTCGTCGATTATGACACCTGAGAATACAGAACTAATCCAGAAGTCAATCTACACTCTGG
TTTACACTTTGAAGAACGTCGAGAGCATAAGCTCAGATATTCTGGGATTCACAGGGGATG
AAGCCACAAGAAAAAACCTTAAACTACTCATCAAATCCCTCAGTAGGCTATTATGAAACC
AAGTTTTTAAAAAGGTGAGCAAGCAATGTTGATTCTTTTTCTTTGAATGTGTTTTTTTAT
AAAAAAATTGGGTTCAAACGAGAGAGTTTATTCGGTGTATACGAACAGCAAATCTGTGCG
TTCTGCATTAATGCATTTTCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL42TF U 1
AF RR2E378TF U 24
AF RR2A220TF U 29
AF RR2E378JQ C 758
BS 1 129 RR2CL42TF
BS 130 130 RR2E378TF
BS 131 606 RR2CL42TF
BS 607 607 RR2E378TF
BS 608 631 RR2CL42TF
BS 632 632 RR2E378TF
BS 633 639 RR2CL42TF
BS 640 640 RR2E378TF
BS 641 657 RR2CL42TF
BS 658 658 RR2E378TF
BS 659 675 RR2CL42TF
BS 676 676 RR2E378TF
BS 677 713 RR2CL42TF
BS 714 745 RR2E378TF
BS 746 830 RR2A220TF
BS 831 831 RR2E378JQ
BS 832 859 RR2A220TF
BS 860 860 RR2E378JQ
BS 861 891 RR2A220TF
BS 892 892 RR2E378JQ
BS 893 909 RR2A220TF
BS 910 1403 RR2E378JQ

RD RR2CL42TF 713 0 0
TATCTTCCTAGCAGCAAGTCTTTGAAGCCATTCTCAGATTCACGACAGCAGTTCGGTAAT
AAAACCTCCCTCGAGCCTAGGTCGTAAAAATTGGAACTTAGTTTTTTTCTGGAAGATGAT
TGGGAATCCCGTAATTCAAGTTCCCTCATCACTAATGCCATCGTCTTCAATGATGTCTCG
CCCTCGAGTTTCTCCCAATGGGCTTCCTTATCTCCCACCCAAACCTAGGACTAGGCATTT
AGTGGTCAGAGCTGCATCCAATTCACATGGTCAACCATCCTCTGATGAAGAAGGGAAGAG
TCCTCTCACGGTTGTTTTGGATGTCCCGAGGAATATCTGGAGACAGACTCTGAAACCTCT
GAGTGATTTTGGGTTT*GGTAAGAGAAGTGTTTGGGAAGGTGGGGTCGGTTTGTTTATCG
TCTCTGGAGCTACGCTTCTCGCGCTTAGCTGGGCTTGGATGCGAGGGTTTCAAATGCGGT
CCAAGTTCAGGAAGTATCAGACCGTCTTTGAGCTTAGCCAAGCCTCTGGTATTTGCACGG
GGACACCGGTTAGGATCCGTGGTGTGACTGTTGGTACGGTTATTCGTGTGAATCCTTCCT
TGAAGA*CATTGAAGCTGTTGCTGAGATTGA*GATGATA*GATTATCATCCCTAAGA*TT
CACTGGTTGAGGTGA*TCAGTCTGGTCTTCTGATGGAAACCATGATCGATATC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2E378TF 739 0 0
GGAGCC
ATTCTCAGATTCACGACAGCAGTTCGGTAATAAAACCTCCCTCGAGCCTAGGTCGTAAAA
ATTGGAACTTAGTTTTTTTCTGGAAGATGATTGGGAATCCTGTAATTCAAGTTCCCTCAT
CACTAATGCCATCGTCTTCAATGATGTCTCGCCCTCGAGTTTCTCCCAATGGGCTTCCTT
ATCTCCCACCCAAACCTAGGACTAGGCATTTAGTGGTCAGAGCTGCATCCAATTCACATG
GTCAACCATCCTCTGATGAAGAAGGGAAGAGTCCTCTCACGGTTGTTTTGGATGTCCCGA
GGAATATCTGGAGATAGACTCTGGAACCTCTGAGTGATTTTGGGTTTAGGTAAGAGAAGT
GTTTGGGAAGGTGGGGTCGGTTTGTTTATCGTCTCTGGAGCTACGCTTCTCGCGCTTAGC
TGGGCTTGGATGCGAGGGTTTCAAATGCGGTCCAAGTTCAGGAAGTATCAGACCGTCTTT
GAGCTTAGCCAAGCCTCTGGTATTTGCACGGGGACACCGGTTAGGATCCGTGGTGTGACT
GTTGGTACGGTTATTCGTGTGAATCCTTCCTTGAAGAACATTGAAGCTGTTGCTGAGATT
GAAGATGATAAGATTATCATCCCTAAGAATTCACTGGTTGAGGTGAATCAGTCTGGTCTT
CTGATGGAAACCATGATCGATATCACGCCGAGGAATCCTATACCGGAACCTTCTGT
GGGCCTTGGATCCGGAT

QA 7 722 7 722
DS 

RD RR2A220TF 881 0 0
G
ATTCTCAGATTCACGACAGCAGTTCGGTAATAAAACCTCCCTCGAGCCTAGGTCGTAAAA
ATTGGAACTTAGTTTTTTTCTGGAAGATGATTGGGAATCCTGTAATTCAAGTTCCCTCAT
CACTAATGCCATCGTCTTCAATGATGTCTCGCCCTCGAGTTTCTCCCAATGGGCTTCCTT
ATCTCCCACCCAAACCTAGGACTAGGCATTTAGTGGTCAGAGCTGCATCCAATTCACATG
GTCAACCATCCTCTGATGAAGAAGGGAAGAGTCCTCTCACGGTTGTTTTGGATGTCCCGA
GGAATATCTGGAGACAGACTCTGAAACCTCTGAGTGATTTTGGGTTT*GGTAAGAGAAGT
GTTTGGGAAGGTGGGGTCGGTTTGTTTATCGTCTCTGGAGCTACGCTTCTCGCGCTTAGC
TGGGCTTGGATGCGAGGGTTTCAAATGCGGTCCAAGTTCAGGAAGTATCAGACCGTCTTT
GAGCTTAGCCAAGCCTCTGGTATTTGCACGGGGACACCGGTTAGGATCCGTGGTGTGACT
GTTGGTACGGTTATTCGTGTGAATCCTTCCTTGAAGAACATTGAAGCTGTTGCTGAGATT
GAAGATGATAAGATTATCATCCCTAAGAATTCACTGGTTGAGGTGAATCAGTCTGGTCTT
CTGATGGAAACCATGATCGATATCACGCCGAGGAATCCTATACCGGAACCTTCTGTTGGG
CCTTTGGATCCGGAATGTGGTAGAGAAAGTCTGATTGTTTGTGATAGACAGAAGATAAAG
GGAGAGCAAGGGGTGAGTTTATATGCACTGGTTGGGATATTCACTCGTAT*GGACGTGAA
GTAGAGGCGATTGGTGTTGTCA*TGCGTATACGCTTGCTG

QA 2 881 2 881
DS 

RD RR2E378JQ 646 0 0
TCCGGAATGTGGTAGAGAAGGTCTGATTGTTTGTGATAGACAGAAGATAAAGGGAGAGCA
AGGGGTGAGTTTAGATGCACTGGTTGGGATATTCACTCGTATTGGACGTGAAGTAGAGGC
GATTGGTGTTGTCAATGCGTATACGCTTGCTGAGAGAGCAGCGTCTGTTACTGAAGAAGC
GAAACCATTGCTCAGAAAGATTCAAGCCATGGCCGAAGATGCTCAACCTTTGCTCTCTGA
GTTTCGTGACAGCGGCTTGCTCAAGGAAGTTGAGTCTCTTACTCGAAGCCTTACCCAAGC
TTCTGACGATATGAGAAAGGTTCATTCGTCGATTATGACACCTGAGAATACAGAACTAAT
CCAGAAGTCAATCTACACTCTGGTTTACACTTTGAAGAACGTCGAGAGCATAAGCTCAGA
TATTCTGGGATTCACAGGGGATGAAGCCACAAGAAAAAACCTTAAACTACTCATCAAATC
CCTCAGTAGGCTATTATGAAACCAAGTTTTTAAAAAGGTGAGCAAGCAATGTTGATTCTT
TTTCTTTGAATGTGTTTTTTTATAAAAAAATTGGGTTCAAACGAGAGAGTTTATTCGGTG
TATACGAACAGCAAATCTGTGCGTTCTGCATTAATGCATTTTCCGC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 2 5

CO CL1609Contig1 691 3 12 U
GGAGGGAGAGAAGAAATCAACGCAGGCATGGTAGGCGCAGCAGCATCAGCGAACCTCGCG
AGCCTGAGATCGACAACGACGTCTCTGTTTACAAATCGGCCATTCTCTTTGTCCATGTTA
AGCGGAATCAGAAGCTCTCTCGTATTAAGGACATGTCTGAAGCCCACACCTCTCCGATTC
GTGACGTCCTGGCCAACACCTTCACACCACGTTTCTTCCGTTAGGGCCATGTCATCGTCA
TCATCGTCTCCATCTCCCTCGCTAGAGGAGACGGTTAGAAGGACAGTAGCAGAAAACCCT
GTGGTTGTCTACTCCAAATCCTGGTGCTCATACTCGTCGGAAGTGAAGTCGTTGTTCAAT
GGGCTTCAAGTTAAGCCACTCGTTATTGAACTTGATCAACTTGGTGCACAAGGGTCGCAG
CTGCAGAATGTCTTGGAGAAACTCACTGGACAATACACTGTTCCTAATGTTTTCATCGGA
GGCAAGCACATTGGTGGCTGCTCAGATACGTTGCAGCTGTACAACAAAGGAGAGCTGGGG
CCAATGTTAGCTGAGGCCAATGCCAAAACCGGTCAGACCTAGAGATGAGAACTGGTTGGA
GATTTGTTTACGTTTCCGTTTTTGTTTAATCAGAACCTCTGAATTAAAATTCTTCAAGTC
GAGATGATTTGCTGTCTACGTAGAGATTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI49TF U 201
AF RR2C718JQ C 1
AF RR2C718TF U 1
BS 1 7 RR2C718JQ
BS 8 202 RR2C718TF
BS 203 277 RR2BI49TF
BS 278 278 RR2C718TF
BS 279 280 RR2BI49TF
BS 281 281 RR2C718TF
BS 282 286 RR2BI49TF
BS 287 287 RR2C718TF
BS 288 291 RR2BI49TF
BS 292 292 RR2C718TF
BS 293 392 RR2BI49TF
BS 393 691 RR2C718TF

RD RR2BI49TF 192 0 0
TT
CACACCACGTTTCTTCCGTTAGGGCCATGTCATCGTCATCATCGTCTCCATCTCCCTCGC
TAGAGGAGACGGTTAAAATGACAGCAGCATAAAACCCTGTGGTTGTCTACTCCAAATCCT
GGTGCTCATACTCGTCGGAAGTGAAGTCGTTGTTCAATGGGCTTCAAGTTAAGCCACTCG
TTATTGAACT

QA 3 192 3 192
DS 

RD RR2C718JQ 625 0 0
GGAGGGAGAGAAGAAATCAACGCAGGCATGGTAGGCGCAGCAGCATCAGCGAACCTCGCG
AGCCTGAGATCGACAACGACGTCTCTGTTTACAAATCGGCCATTCTCTTTGTCCATGTTA
AGCGGAATCAGAAGCTCTCTCGTATTAAGGACATGTCTGAAGCCCACACCTCTCCGATTC
GTGACGTCCTGGCCAACACCTTCACACCACGTTTCTTCCGTTAGGGCCATGTCATCGTCA
TCATCGTCTCCATCTCCCTCGCTAGAGGAGACGGTTAGAAGGACAGTAGCAGAAAACCCT
GTGGTTGTCTACTCCAAATCCTGGTGCTCATACTCGTCGGAAGTGAAGTCGTTGTTCAAT
GGGCTTCAAGTTAAGCCACTCGTTATTGAACTTGATCAACTTGGTGCACAAGGGTCGCAG
CTGCAGAATGTCTTGGAGAAACTCACTGGACAATACACTGTTCCTAATGTTTTCATCGGA
GGCAAGCACATTGGTGGCTGCTCAGATACGTTGCAGCTGTACAACAAAGGAGAGCTGGGG
CCAATGTTAGCTGAGGCCAATGCCAAAACCGGTCAGACCTAGAGATGAGAACTGGTTGGA
GATTTGTTTACGTTTCCGTTT
TTGT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2C718TF 691 0 0
GGAGGGA
GAGAAGAAATCAACGCAGGCATGGTAGGCGCAGCAGCATCAGCGAACCTCGCGAGCCTGA
GATCGACAACGACGTCTCTGTTTACAAATCGGCCATTCTCTTTGTCCATGTTAAGCGGAA
TCAGAAGCTCTCTCGTATTAAGGACATGTCTGAAGCCCACACCTCTCCGATTCGTGACGT
CCTGGCCAACACCTTCACACCACGTTTCTTCCGTTAGGGCCATGTCATCGTCATCATCGT
CTCCATCTCCCTCGCTAGAGGAGACGGTTAGAAGGACAGTAGCAGAAAACCCTGTGGTTG
TCTACTCCAAATCCTGGTGCTCATACTCGTCGGAAGTGAAGTCGTTGTTCAATGGGCTTC
AAGTTAAGCCACTCGTTATTGAACTTGATCAACTTGGTGCACAAGGGTCGCAGCTGCAGA
ATGTCTTGGAGAAACTCACTGGACAATACACTGTTCCTAATGTTTTCATCGGAGGCAAGC
ACATTGGTGGCTGCTCAGATACGTTGCAGCTGTACAACAAAGGAGAGCTGGGGCCAATGT
TAGCTGAGGCCAATGCCAAAACCGGTCAGACCTAGAGATGAGAACTGGTTGGAGATTTGT
TTACGTTTCCGTTTTTGTTTAATCAGAACCTCTGAATTAAAATTCTTCAAGTCGAGATGA
TTTGCTGTCTACGTAGAGATTCAT

QA 8 691 8 691
DS 



CO CL1609Contig2 705 2 6 U
GGCCGGGGGGGCTGAGAGAGAAAGATAGAGGAGAAAAAATCAACGCAGGCATGGTAGGCG
CAGCAGCATCAGCGAACCTCGCGAGCCTGAGATTGACGACGACGTCTCTGTTTACAAATC
GGCCATTCTCTTTGTCCATGTTAAGCGGAATCAGAAGCTCTCTCGCATTAAGGACATGTC
TAAAGCCCACACCTCTCCGATTCGCGACGTCGTGGCCAACACCTCCACACCACGTTTCTT
CCGTTAGGGCCACGTCATCGTCATCGTCATCGTCTCAATCTCCATCGCTAGAGGAGACGG
TCAAAACGACAGTAGCAGAAAACCCTGTGGTTGTCTACTCCAAATCCTGGTGCTCATACT
CGTCGGAAGTGAAGTCGTTGTTCAATGGGCTTCAAGTTAAGCCACTCGTTATTGAACTCG
ATCAACTTGGTGCAGGGGGGTCACAGCTGCAGAATGTCTTGGAGAAACTCACTGGACAAT
ACACTGTTCCTAATGTTTTCATCGGAGGGAAGCACATTGGTGGCTGCTCCGATACGTTGC
AGCTGTACAACAAAGGAGAGCTGGAGCCAATGTTAGCTGAGGCAAATGCCAAAACCGGTC
AGACCTAGAGATGAAAACTGGTTGGAGATTTGTTTCCGTTTTCGTTTAATCAGAACCTCT
GAATTAAAATTCTTCAAGTCGAGACGATTTGCTGTCTGCGTAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB49TF U 1
AF RR2CE93TF U 12
BS 1 294 RR2GB49TF
BS 295 295 RR2CE93TF
BS 296 398 RR2GB49TF
BS 399 399 RR2CE93TF
BS 400 417 RR2GB49TF
BS 418 705 RR2CE93TF

RD RR2GB49TF 417 0 0
GGCCGGGGGGGCTGAGAGAGAAAGATAGAGGAGAAAAAATCAACGCAGGCATGGTAGGCG
CAGCAGCATCAGCGAACCTCGCGAGCCTGAGATTGACGACGACGTCTCTGTTTACAAATC
GGCCATTCTCTTTGTCCATGTTAAGCGGAATCAGAAGCTCTCTCGCATTAAGGACATGTC
TAAAGCCCACACCTCTCCGATTCGCGACGTCGTGGCCAACACCTCCACACCACGTTTCTT
CCGTTAGGGCCACGTCATCGTCATCGTCATCGTCTCAATCTCCATCGCTAGAGGTGACGG
TCAAAACGACAGTAGCAGAAAACCCTGTGGTTGTCTACTCCAAATCCTGGTGCTCATACT
CGTCGGAAGTGAAGTCGTTGTTCAATGGGCTTCAAGTTGAGCCACTCGTTATTGAAC

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR2CE93TF 694 0 0
GG
GAGAGAGAAAGATAGAGGAGAAGAAATCAACGCAGGCATGGTAGGCGCAGCAGCATCAGC
GAACCTCGCGAGCCTGAGATTGACGACGACGTCTCTGTTTACAAATCGGCCATTCTCTTT
GTCCATGTTAAGCGGAATCAGAAGCTCTCTCGCATTAAGGACATGTCTAAAGCCCACACC
TCTCCGATTCGCGACGTCGTGGCCAACACCTCCACACCACGTTTCTTCCGTTAGGGCCAC
GTCATCGTCATCGTCATCGTCTCAATCTCCATCGCTAGAGGAGACGGTCAAAACGACAGT
AGCAGAAAACCCTGTGGTTGTCTACTCCAAATCCTGGTGCTCATACTCGTCGGAAGTGAA
GTCGTTGTTCAATGGGCTTCAAGTTAAGCCACTCGTTATTGAACTCGATCAACTTGGTGC
AGGGGGGTCACAGCTGCAGAATGTCTTGGAGAAACTCACTGGACAATACACTGTTCCTAA
TGTTTTCATCGGAGGGAAGCACATTGGTGGCTGCTCCGATACGTTGCAGCTGTACAACAA
AGGAGAGCTGGAGCCAATGTTAGCTGAGGCAAATGCCAAAACCGGTCAGACCTAGAGATG
AAAACTGGTTGGAGATTTGTTTCCGTTTTCGTTTAATCAGAACCTCTGAATTAAAATTCT
TCAAGTCGAGACGATTTGCTGTCTGCGTAGAG

QA 3 694 3 694
DS 



AS 1 2

CO CL1610Contig1 779 2 1 U
GGATAGATACAGAGAGAGACTCAAACAATGGCGACTCTGAAATTCTCTCCATTAACACCA
CCTTCTTCAACTCAGGCTAGGCTATCAACCGCATCATCTTTCATCGCTAACGCGGCGCGT
GCCTTCAACGCGACACTTTCTCCCTCTAAGTCGCGGTTCTTGGGTAATAATAATTGCCTC
AAAGCAAAACAGAGAATAATAATAATACAGAGAGCGTCTCGCTCCGGCGGAATCACTTGC
TCTGCTTCATCTTCACCGGGGACTCTTCCTTCCGCTCTTCTCTTCGACTGCGATGGAGTG
CTTGTCGATACCGAGAAAGATGGTCACAGGATCTCCTTCAACGACACGTTCAAAGAGAGA
GACTTGGGTGTTACATGGGATGTTGATCTGTACGGAGAGCTACTGAAAATCGGTGGTGGG
AAAGAAAGGATGACGGCGTATTTTAACAAGGTGGGTTGGCCTGAGAAAGCCCCCAAAGAT
GAAGCAGAGAGGAAAGCGTTCATAGCTGGCCTTCACAAGCAGAAGACTGAGCTTTTCATG
GTTCTCATCGAGAAGAAGCTTCTTCCTCTTCGACCCGGTGTTGCCAAACTGGTTGATCAA
GCTCTAACGAATGGAGTAAAAGTCGCCGTGTGCAGCACTTCAAACGAAAAGGCGGTGTCT
GCTATAGTTTCATGCTTGCTTGGACAGAAAGAGCAGAGAAGATCAAGATATTTGCAGAGA
TGTAGTCCCCAAAAGAAGCCTGACCCGGCATCTACACTTGGCAGCTGAAACCCTTGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G721TF U 1
AF RR2G052TF U 124
BS 1 779 RR2G721TF

RD RR2G721TF 779 0 0
GGATAGATACAGAGAGAGACTCAAACAATGGCGACTCTGAAATTCTCTCCATTAACACCA
CCTTCTTCAACTCAGGCTAGGCTATCAACCGCATCATCTTTCATCGCTAACGCGGCGCGT
GCCTTCAACGCGACACTTTCTCCCTCTAAGTCGCGGTTCTTGGGTAATAATAATTGCCTC
AAAGCAAAACAGAGAATAATAATAATACAGAGAGCGTCTCGCTCCGGCGGAATCACTTGC
TCTGCTTCATCTTCACCGGGGACTCTTCCTTCCGCTCTTCTCTTCGACTGCGATGGAGTG
CTTGTCGATACCGAGAAAGATGGTCACAGGATCTCCTTCAACGACACGTTCAAAGAGAGA
GACTTGGGTGTTACATGGGATGTTGATCTGTACGGAGAGCTACTGAAAATCGGTGGTGGG
AAAGAAAGGATGACGGCGTATTTTAACAAGGTGGGTTGGCCTGAGAAAGCCCCCAAAGAT
GAAGCAGAGAGGAAAGCGTTCATAGCTGGCCTTCACAAGCAGAAGACTGAGCTTTTCATG
GTTCTCATCGAGAAGAAGCTTCTTCCTCTTCGACCCGGTGTTGCCAAACTGGTTGATCAA
GCTCTAACGAATGGAGTAAAAGTCGCCGTGTGCAGCACTTCAAACGAAAAGGCGGTGTCT
GCTATAGTTTCATGCTTGCTTGGACAGAAAGAGCAGAGAAGATCAAGATATTTGCAGAGA
TGTAGTCCCCAAAAGAAGCCTGACCCGGCATCTACACTTGGCAGCTGAAACCCTTGGAG

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2G052TF 648 0 0
TTCAACGCGACACTTTCTCTCTCTAAGTCGCGGTTCTTGGGTAATAATAATTGCCTCAAA
GCAAAACAGAGAATAATAATAATACAGAGAGCGTCTCGCTCCGGCGGAATCACTTGCTCT
GCTTCATCTTCACCGGGGACTCTTCCTTCCGCTCTTCTCTTCGACTGCGATGGAGTGCTT
GTCGATACCGAGAAGGATGGTCACAGGATCTCCTTCAACGACCCGTTCAAAGAGAGAGAC
TTGGGTGTTACATGGGATGTTGGTCTGTACGGAGAGCTACTGAAAATCGGTGGTGGGAAA
GAAAGGATGACGGCGTATTTTAACAAGGTGGGTTGGCCTGAGAAAGCCCCCAAAGATGAA
GCAGAGAGGAAAGCGTTCATAGCTGGCCTTCACAAGCAGAAGACTGAGCTTTTCATGGTT
CTCATCGAGAAGAAGCTTCTTCCTCTTCGACCCGGTGTTGTCAAACTGGTTGATCAAGCT
CTAACGAATGGAGTAAAAGTCGCCGTGTGCAGCACTTCAAACGAAAAG*CGGTGTCTGCT
ATAGTTTCATGCTTGCTTGGACAGAAAGAGCAGAGA*GATCA*GATATTTGCAGAGATGT
AGTCCC*AAAAGAAGCCTGACC*GGCATCTACACT*GGCAGCTGAAAC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 5

CO CL1611Contig1 1107 5 11 U
GGATCTCACACTTAACACATAAATCTCTCATCATCTTCTCAACTTACTTTCAAATCTTAC
TAAATCTCATTTCTATCATCTAAACCCAAATGGGACGAAGCTCGAGCCTCACCATCACCA
TCGTGGCAGCTGTTCTGCTGGTAATGATGTTCGGTTCAGCCTACTCAGGCAACTTCTTCG
ACGAGTTCGACCTCACGTGGGGTGACCACAGGGGTAAAATCTTCAACGGAGGAAACATGC
TGTCTCTATCTCTGGACCGTGTTTCCGGGTCGGGGTTCAAATCCAAGAAAGAGTATCTAT
TCGGACGGATCGATATGCAGCTTAAACTCGTCGCCGGAAACTCAGCCGGCACCGTCACTG
CTTACTACTTGTCGTCGCAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTTTCTTGGAA
ACGAGACAGGTAAGCCTTATGTTCTCCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGCAACA
GAGAACAACAGTTTTATCTCTGGTTCGACCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCTATTG
TCTGGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAACTTGCCTATAAGAGTGTTCAACA
ATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTACTCGAGCC
TGTGGAATGCAGATGATTGGGCTACGAGAGGTGGTCTTGTAAAGACTGACTGGTCCAAAG
CTCCTTTCACAGCTTACTACAGAGGATTCAACGCTGCGGCTTGCACTGTCTCTTCAGGCT
GTGACCCCAAATTCAAGACTTCTCTAAGTGATAGTGAGTTGCAAACGGCAAATGAGCTCA
ATGCATATGGCAGGAGGAGGCTGAGATGGGTGCAGAAGTACTTCATGATCTATAATTATT
GCTCTGATCTCAAAAGGTTCCCTAGAGGATTCCCTCCTGAGTGCAGGAGGTCAAGAGTCT
AAGGGAAAAACACTAAACATCCAATATGATTGTGTGTATGCTTGTTGCATTTCCTCTCTT
TAAGTTATAAGATTTGTTTTGTTCTCTGTTATTCTTCCGTTGTACATTCTCAAGGTCAAT
AAAAGCTCCTTCCTGTGTTTAAAGTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC51TF U 1
AF RR2CI37TF U 1
AF RR2GP13TF U 1
AF RR2CI37JQ C 362
AF RR2GP13JQ C 435
BS 1 77 RR2CI37TF
BS 78 78 RR2DC51TF
BS 79 691 RR2CI37TF
BS 692 692 RR2GP13TF
BS 693 744 RR2CI37TF
BS 745 747 RR2GP13TF
BS 748 748 RR2CI37JQ
BS 749 777 RR2GP13TF
BS 778 778 RR2CI37JQ
BS 779 787 RR2GP13TF
BS 788 1107 RR2CI37JQ

RD RR2DC51TF 684 0 0
GGATCTCACACTAAA*ACATATATCTCTCATCATCTTCTCAACTTACTTTCAAATCTTAC
TAAATCTCATTTCTATCATCTAAACCCAAATGGGACGAAGCTGGAGCCTCACCATCACCA
TCGTG*CAGCTGTTCTGCTGGTAATGATGTTCGGTTCAGCCTACTCAGGCAACTTCTTCG
ACGAGTTCGACCTCACGTGGGGTGACCACAGGGGTAAAATCTTCAACGGAGGAAACATGT
TGTCCCTGTCTCTAGACCGGGTTTCCGGATCGGGGTTCAAATCCAAGAAAGAGTATCTAT
TCGGACGGATCGATATGCAGCTCAAACTCGTCGCAGGAAACTCAGCCGGCACCGTCACTG
CTTACTACTTGTCGTCGCAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTTTCTAGGCA
ACGAGACAGGTAAGCCTTATGTTCTCCACACCAATGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGCGACA
GAGAACAACAGTTTTATCTCTGGTTCGATCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCTATTG
TCTGGAGACCTCAGCACATCATATTCTTGGTGGACAATTTGCCTATAAGAGTGTTCAACA
ATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAG*ATCTACTCGAGCC
TGTGGAATGCAGATGATTGGGCTA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2CI37TF 754 0 0
GGATCTCACACTTAACACATAAATCTCTCATCATCTTCTCAACTTACTTTCAAATCTTAC
TAAATCTCATTTCTATCGTCTAAACCCAAATGGGACGAAGCTCGAGCCTCACCATCACCA
TCGTGGCAGCTGTTCTGCTGGTAATGATGTTCGGTTCAGCCTACTCAGGCAACTTCTTCG
ACGAGTTCGACCTCACGTGGGGTGACCACAGGGGTAAAATCTTCAACGGAGGAAACATGC
TGTCTCTATCTCTGGACCGTGTTTCCGGGTCGGGGTTCAAATCCAAGAAAGAGTATCTAT
TCGGACGGATCGATATGCAGCTTAAACTCGTCGCCGGAAACTCAGCCGGCACCGTCACTG
CTTACTACTTGTCGTCGCAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTTTCTTGGAA
ACGAGACAGGTAAGCCTTATGTTCTCCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGCAACA
GAGAACAACAGTTTTATCTCTGGTTCGACCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCTATTG
TCTGGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAACTTGCCTATAAGAGTGTTCAACA
ATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTACTCGAGCC
TGTGGAATGCAGATGATTGGGCTACGAGAGG*GGTCTTGTAAAGACTGACTGGTCCAAAG
CTCCTTTCACAGCTTACTACAGAG
ATTCACGCTG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2GP13TF 796 0 0
GGATCTCACACTTAACACATAAATCTCTCATCATCTTCTCAACTTACTTTCAAATCTTAC
TAAATCTCATTTCTATCATCTAAACCCAAATGGGACGAAGCTCGAGCCTCACCATCACCA
TCGTGGCAGCTGTTCTGCTGGTAATGATGTTCGGTTCAGCCTACTCAGGCAACTTCTTCG
ACGAGTTCGACCTCACGTGGGGTGACCACAGGGGTAAAATCTTCAACGGAGGAAACATGC
TGTCTCTATCTCTGGACCGTGTTTCCGGGTCGGGGTTCAAATCCAAGAAAGAGTATCTAT
TCGGACGGATCGATATGCAGCTTAAACTCGTCGCCGGAAACTCAGCCGGCACCGTCACTG
CTTACTACTTGTCGTCGCAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTTTCTTGGAA
ACGAGACAGGTAAGCCTTATGTTCTCCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGCAACA
GAGAACAACAGTTTTATCTCTGGTTCGACCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCTATTG
TCTGGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAACTTGCCTATAAGAGTGTTCAACA
ATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTACTCGAGCC
TGTGGAATGCAGATGATTGGGCTACGAGAGGTGGTCTTGTAAAGACTGACTGGTCCAAAG
CTCCTTTCACAGCTTACTACAGAGGAT*CAACGCTGCGGCTTGCACTGTCTCTTCAG*CT
GTGACCC
AAATCAAGA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2CI37JQ 746 0 0
TTACTACTTGTCGTCGCAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTTTCTTGGAAA
CGAGACAGGTAAGCCTTATGTTCTCCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGCAACAG
AGAACAACAGTTTTATCTCTGGTTCGACCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCTATTGT
CTGGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAACTTGCCTATAAGAGTGTTCAACAA
TGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTACTCGAGCCT
GTGGAATGCAGATGATTGGGCTACGAGAGGTGGTCTTGTAAAGACTGACTGGTCCAAAGC
TCCTTTCACAGCTTACTACAGAGGATTCAACGCTGCGGCTTGCACTGTCTCTTCAGGCTG
TGACCCCAAATTCAAGACTTCTCTAAGTGATAGTGAGTTGCAAACGGCAAATGAGCTCAA
TGCATATGGCAGGAGGAGGCTGAGATGGGTGCAGAAGTACTTCATGATCTATAATTATTG
CTCTGATCTCAAAAGGTTCCCTAGAGGATTCCCTCCTGAGTGCAGGAGGTCAAGAGTCTA
AGGGAAAAACACTAAACATCCAATATGATTGTGTGTATGCTTGTTGCATTTCCTCTCTTT
AAGTTATAAGATTTGTTTTGTTCTCTGTTATTCTTCCGTTGTACATTCTCAAGGTCAATA
AAAGCTCCTTCCTGTGTTTAAAGTAT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2GP13JQ 666 0 0
CCTTATGTTCTCCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGCAACAGAGAACAACAGTTT
TATCTCTGGTTCGACCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCTATTGTCTGGAGACCTCAA
CACATCATATTCTTGGTGGACAACTTGCCTATAAGAGTGTTCAACAATGCAGAGAAGCTT
GGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTACTCGAGCCTGTGGAATGCAGAT
GATTGGGCTACGAGAGGTGGTCTTGTAAAGACTGACTGGTCCAAAGCTCCTTTCACAGCT
TACTACAGAGGATTCAACGCTGCGGCTTGCACTGTCTCTTCAGGCTGTGACCCCAAATTC
AAGACTTCTCTAAGTGATAGTGAGTTGCAAACGGCAAATGAGCTCAATGCATATGGCAGG
AGGAGGCTGAGATGTGTGCAGAAGTACTTCATGATCTATAATTATTGCTCTGATCTCAAA
AGGTTCCCTAGAGGATTCCCTCCTGAGTGCAGGAGGTCAAGAGTCTAAGGGAAAAACACT
AAACATCCAATATGATTGTGTGTATGCTTGTTGCATTTCCTCTCTTTAAGTTATAAGATT
TGTTTTGTTCTCTGTTATTCTTCCGTTGTACATTCTCAAGGTCAATAAAAGCTCCTTCCT
GTGTTT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 2 5

CO CL1612Contig1 1074 3 6 U
GAAGTTGAAAAGCCCATAACAGGACAATAAAGAGTCACCAAAGCACAGCTTCTTGAAAAC
GCATCACAACATTTAAACCACTGACCAGTCTACGACAAAGAAAGACACATTATAGCATCA
AACGACTTGTTAAAACTACATTAAAAAAGCTCCACATCATTTGTCGGAAAAGAAAAAAAA
ACTTCACTTCCACCCGGAATTTCAAACCTTCTAGGCCTTGTCTATATGTAGTTGAATCTT
ATAAATAAGGGAAACTCAAAAGTCGCACACATAACATTTTGGTGGTAGAGGCAGAATGAG
AAGACTTTTTGGATTGTAGCTGTCCTGCCATGGCTAGATAAGACAACTTTCTACCCATTG
CTTCAACCAACCACTTATTACTGAGAAACCTAACAGCAGACCAAGGGAAACCCTTAGTTA
TTGGCAATAAATTGCCTGATCGATATGCGGAGGAATTTGCTTAATCTCCGTTCCAAGCTC
TTGCTCAATCCGGTAAAGGTTAAAGCGGTCCTCATAGGTGATGAGATTCACAGCTAAACC
AAGATGGCCAAACCTTCCTGATCGACCAACCCTATGTAGATAAGTTTCTGCAGTCTTTGG
GAAATCAAAGTTTATCACCACATTGACTGCTTGAATGTCAATACCACGTGTGAACAGGTC
AGTACACACAAGATTGCGGCATGCACCATTGCGGAAGTCATGGAACACTCTGTTTCGGTG
GTCTTGAAGCATCTTTGCATGGATGTAGAAGCACGAATACCCAAGTTCTGTAATTTTCTT
AGCTAAGAGCTCCACACGGTTCACAGAGTTACAGAAAATGATCGATTGGTTAATTTGCAG
CTTAGAGAATAGCGTATTCAAGCAATGAATTTTCTGCCGTTCTTCAACGAAAGCATAGAA
CTGCGTAATACCCTTGAGCGTAAGCTCATCCATGAGATTGATGATGTAAGGATTCGTCAG
AAATCTATCCTTAAAATCCTTGACAGTGACAGGAAACGTGGCTGAGAACATCAGTATCTG
ACGGTTCTGCGGTAGAAAGCTGATCAGATGCTCCACTGAAGGTTGGAACTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL37JQ U 42
AF RR2C153JQ U 1
AF RR2C153TF C 440
BS 1 785 RR2C153JQ
BS 786 786 RR2C153TF
BS 787 792 RR2C153JQ
BS 793 793 RR2C153TF
BS 794 807 RR2C153JQ
BS 808 1074 RR2C153TF

RD RR2FL37JQ 625 0 0
AGCACAGCTTCTTGAAAACGCATCACAACATTTAAACCACTGACCAGTCTACGACAAAGA
AAGACACATTATAGCATCAAACGACTTGTTAAAACTACATTAAAAAAGCTCCACATCATT
TGTCGGAAAAGAAAAAAAAACTTCACTTCCACCCGGAATTTCAAACCTTCTAGGCCTTGT
CTATATGTAGTTGAATCTTATAAATAAGGGAAACTCAAAAGTCGCACACATAACATTTTG
GTGGTAGAGGCAGAATGAGAAGACTTTTTGGATTGTAGCTGTCCTGCCATGGCTAGATAA
GACAACTTTCTACCCATTGCTTCAACCAACCACTTATTACTGAGAAACCTAACAGCAGAC
CAAGGGAAACCCTTAGTTATTGGCAATAAATTGCCTGATCGATATGCGGAGGAATTTGCT
TAATCTCCGTTCCAAGCTCTTGCTCAATCCGGTAAAGGTTAAAGCGGTCCTCATAGGTGA
TGAGATTCACAGCTAAACCAAGATGGCCAAACCTTCCTGATCGACCAACCCTATGTAGAT
AAGTTTCTGCAGTCTTTGGGAAATCAAAGTTTATCACCACATTGACTGCTTGAATGTCAA
TACCACGTGTGAACAGGTCAGTACA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2C153JQ 807 0 0
GAAGTTGAAAAGCCCATAACAGGACAATAAAGAGTCACCAAAGCACAGCTTCTTGAAAAC
GCATCACAACATTTAAACCACTGACCAGTCTACGACAAAGAAAGACACATTATAGCATCA
AACGACTTGTTAAAACTACATTAAAAAAGCTCCACATCATTTGTCGGAAAAGAAAAAAAA
ACTTCACTTCCACCCGGAATTTCAAACCTTCTAGGCCTTGTCTATATGTAGTTGAATCTT
ATAAATAAGGGAAACTCAAAAGTCGCACACATAACATTTTGGTGGTAGAGGCAGAATGAG
AAGACTTTTTGGATTGTAGCTGTCCTGCCATGGCTAGATAAGACAACTTTCTACCCATTG
CTTCAACCAACCACTTATTACTGAGAAACCTAACAGCAGACCAAGGGAAACCCTTAGTTA
TTGGCAATAAATTGCCTGATCGATATGCGGAGGAATTTGCTTAATCTCCGTTCCAAGCTC
TTGCTCAATCCGGTAAAGGTTAAAGCGGTCCTCATAGGTGATGAGATTCACAGCTAAACC
AAGATGGCCAAACCTTCCTGATCGACCAACCCTATGTAGATAAGTTTCTGCAGTCTTTGG
GAAATCAAAGTTTATCACCACATTGACTGCTTGAATGTCAATACCACGTGTGAACAGGTC
AGTACACACAAGATTGCGGCATGCACCATTGCGGAAGTCATGGAACACTCTGTTTCGGTG
GTCTTGAAGCATCTTTGCATGGATGTAGAAGCACGAATACCCAAGTTCTGTAATTTTCTT
AGCTA*GAGCTC*ACACGGTTCACAGA

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2C153TF 635 0 0
TCGATATGCGGAGGAATTTGCTTAATCTCCGTTCCAAGCTCTTGCTCAATCCGGTAAAGG
TTAAAGCGGTCCTCATAGGTGATGAGATTCACAGCTAAACCAAGATGGCCAAACCTTCCT
GATCGACCAACCCTATGTAGATAAGTTTCTGCAGTCTTTGGGAAATCAAAGTTTATCACC
ACATTGACTGCTTGAATGTCAATACCACGTGTGAACAGGTCAGTACACACAAGATTGCGG
CATGCACCATTGCGGAAGTCATGGAACACTCTGTTTCGGTGGTCTTGAAGCATCTTTGCA
TGGATGTAGAAGCACGAATACCCAAGTTCTGTAATTTTCTTAGCTAAGAGCTCCACACGG
TTCACAGAGTTACAGAAAATGATCGATTGGTTAATTTGCAGCTTAGAGAATAGCGTATTC
AAGCAATGAATTTTCTGCCGTTCTTCAACGAAAGCATAGAACTGCGTAATACCCTTGAGC
GTAAGCTCATCCATGAGATTGATGATGTAAGGATTCGTCAGAAATCTATCCTTAAAATCC
TTGACAGTGACAGGAAACGTGGCTGAGAACATCAGTATCTGACGGTTCTGCGGTAGAAAG
CTGATCAGATGCTCCACTGAAGGTTGGAACTCTTC

QA 1 635 1 635
DS 



CO CL1612Contig2 982 2 2 U
GGGACCGCTTTAACCTTTACCGGATTGAGCAAGAGCTTGGAACGGAGATCAAGCAAATTC
CTCCGCATATCGATCAGGCAATTTATTGCCAATAACCAAGGGTTTGACCCCCCTTGGTCT
GCTGTTAGGTGTCTCAGTAATAAGTGGTTGGTTGAAGCAATGGGTAGAAAGTTGTCTTAT
CTAGCCATGGAAGGACAACGACAATCCAAAAAGTCTTCTCATTCTGCCTCTTACCACCAA
AATGTTATGTGTGCGTCTTTTGGGTTTCCCTTATTTATAAGATTCGACTACATATAGACA
AGGCCTAGAAGGTTTAAAATTCCGGGTAGTAGTGGAAGTGAAGTTTTTTTTTTCTTTTTG
GACAAATGAAGTGGAGTTTTTTTAATGTAGTTTTAACAAGTCGTTTGATGCTATTATGTG
TCTTTCTTTGTCGTAGACTGGTCAGTGGTTTAAATGTTGTGATGCGTTTTCAAGAAGCTG
TGCTCTGGTGACTCTTTAGTGTCCTGTTTTGGGCTTTTTAACTTCGATGTTAAGTCTTTG
CAACCTGAAGATGTTACTTTTCATATTTGATTCGAGCATCGTTTCCTTTTGTCAGTAGGT
TGACCAGTTTTGGTTTTGTGTGGACAATTATTTCAGCACACCATGATAAACATAAGCAAA
CACACACACACGTAAAATGTTTTTAAGTAGGAGAGGGGGAGATGGGTGATAATATGTTAC
GGTTGATATCAGAAGCAGCTGCAAGATGCCTTGTTGGGAATCTGTCCAGTGGCTTGAAAC
CTGGCAGCTTCTTTTTCGGCATGGAGAATCTCTTGAGCGCGTCTAGTTTGAACCTTTGCT
TTCTTCTCTTGTGCTTTTGCATGAACTGCTGCTTTCTTGCTCCTTAGTTTCTCTGCTTCC
TCCATTTTCTTACTGTCCATCTTCCGCTGCAAAAAAAACAATGTCTTTAGTAAATAGTAG
CTGACTTGCTTCTTGTTTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E751TF U 1
AF RR2E751JQ C 228
BS 1 685 RR2E751TF
BS 686 982 RR2E751JQ

RD RR2E751TF 685 0 0
GGGACCGCTTTAACCTTTACCGGATTGAGCAAGAGCTTGGAACGGAGATCAAGCAAATTC
CTCCGCATATCGATCAGGCAATTTATTGCCAATAACCAAGGGTTTGACCCCCCTTGGTCT
GCTGTTAGGTGTCTCAGTAATAAGTGGTTGGTTGAAGCAATGGGTAGAAAGTTGTCTTAT
CTAGCCATGGAAGGACAACGACAATCCAAAAAGTCTTCTCATTCTGCCTCTTACCACCAA
AATGTTATGTGTGCGTCTTTTGGGTTTCCCTTATTTATAAGATTCGACTACATATAGACA
AGGCCTAGAAGGTTTAAAATTCCGGGTAGTAGTGGAAGTGAAGTTTTTTTTTTCTTTTTG
GACAAATGAAGTGGAGTTTTTTTAATGTAGTTTTAACAAGTCGTTTGATGCTATTATGTG
TCTTTCTTTGTCGTAGACTGGTCAGTGGTTTAAATGTTGTGATGCGTTTTCAAGAAGCTG
TGCTCTGGTGACTCTTTAGTGTCCTGTTTTGGGCTTTTTAACTTCGATGTTAAGTCTTTG
CAACCTGAAGATGTTACTTTTCATATTTGATTCGAGCATCGTTTCCTTTTGTCAGTAGGT
TGACCAGTTTTGGTTTTGTGTGGACAATTATTTCAGCACACCATGATAAACATAAGCAAA
CACACACACACGTAAAATGTTTTTA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2E751JQ 755 0 0
CTCT
TACCACCAAAATGTTATGTGTGCGTCTTTTGGGTTTCCCTTATTTATAAGATTCGACTAC
ATATAGACAAGGCCTAGAAGGTTTAAAATTCCGGGTAGTAGTGGAAGTGAAGTTTTTTTT
TTCTTTTTGGACAAATGAAGTGGAGTTTTTTTAATGTAGTTTTAACAAGTCGTTTGATGC
TATTATGTGTCTTTCTTTGTCGTAGACTGGTCAGTGGTTTAAATGTTGTGATGCGTTTTC
AAGAAGCTGTGCTCTGGTGACTCTTTAGTGTCCTGTTTTGGGCTTTTTAACTTCGATGTT
AAGTCTTTGCAACCTGAAGATGTTACTTTTCATATTTGATTCGAGCATCGTTTCCTTTTG
TCAGTAGGTTGACCAGTTTTGGTTTTGTGTGGACAATTATTTCAGCACACCATGATAAAC
ATAAGCAAACACACACACACGTAAAATGTTTTTAAGTAGGAGAGGGGGAGATGGGTGATA
ATATGTTACGGTTGATATCAGAAGCAGCTGCAAGATGCCTTGTTGGGAATCTGTCCAGTG
GCTTGAAACCTGGCAGCTTCTTTTTCGGCATGGAGAATCTCTTGAGCGCGTCTAGTTTGA
ACCTTTGCTTTCTTCTCTTGTGCTTTTGCATGAACTGCTGCTTTCTTGCTCCTTAGTTTC
TCTGCTTCCTCCATTTTCTTACTGTCCATCTTCCGCTGCAAAAAAAACAATGTCTTTAGT
AAATAGTAGCTGACTTGCTTCTTGTTTTGAT

QA 5 755 5 755
DS 



AS 1 5

CO CL1613Contig1 766 5 13 U
GGAGTTGGGAAAAGACCACCATTTATTATTCCTCTCTCTCTCTTTACACGAAGTGAGACG
CAATGGAGCACGAGCGCAAGAACAATCTGAATGGGATGGAGATGGAAAAGGGAAAGAAGG
AGAGCGGTTCGAGAAAAGGGCTTGAGTTAACGATGAGAGTGTTGGCTTGGGTTCTAACAC
TGGCGGCTGCAACAGTACTTGGTGTCGCAAAACAGACAAAGGTTGTGTCTATAACGCTTA
TTCCAACTTTGCCTCCTCTTGATGTGCCCGCAACAGCCAAAGCCTCTTACTTGTCTGCCT
TTGTGTTCAACATTTCGGCAAACGCTATAGCTTGCGGTTACACAGCGATCTCAATAGTCA
TTCTGATGATCAGCAAAGAAAGAAGAAGCAAAGGCTTGATAATGGCGGTGTTGGTAGGTG
ATCTAGTGATGATGGCTTTGCTATTTTCCGGCACCGGAGCTGCTGGAGCAATAGGGTTGA
TGGGTGTACAAGGGAACAAGCATGTGATGTGGAAGAAAGTGTGTAATGTTTTTGGAAAAT
TCTGTCACCAAACTGCTGCTTCGGTTGCCATCACTCTTCTTGCTGCAATCGTGTTTATGG
TTCTTGTTGTTCTTGATGCTATGAAGCTTCCTTAATGCAATTGATATCTTCCTTAATGCA
ATTGATATGTCTGTTTCTTCTTACAGCTCTTCTGCTTCTTGTCGTGTTGTGTAAAGTCAT
TATCAACAATCATGTAATTGTCTATTTGCTTTTAATGCTTTTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK28TF U 53
AF RR2HA80TF U 1
AF RR2FJ96TF U 6
AF RR2HA80JQ C 33
AF RR2FJ96JQ C 37
BS 1 51 RR2HA80TF
BS 52 52 RR2FJ96TF
BS 53 136 RR2HA80TF
BS 137 137 RR2FJ96TF
BS 138 455 RR2HA80TF
BS 456 456 RR2FJ96TF
BS 457 664 RR2HA80TF
BS 665 665 RR2FJ96TF
BS 666 668 RR2HA80TF
BS 669 669 RR2FJ96TF
BS 670 732 RR2HA80TF
BS 733 748 RR2FJ96TF
BS 749 766 RR2HA80JQ

RD RR2BK28TF 423 0 0
GTGAGACGCAATGGAGCACGAGCGCAAGAACAATCTGAATGGGATGGAGATGGAAAAGGG
AAAGAAGGAGAGCGGTTCGAGAAAAGGGCTTGAGTTAACGATGAGAGTGTTGGCTTGGGT
TCTAACACTGGCGGCTGCAACAGTACTTGGTGTCGCAAAACAGACAAAGGTTGTGTCTAT
AGCGCTTATTCCAACTTTGCCTCCTCTTGATGTGCCCGCAACAGCCAAAGCCTCTTACTT
GTCTGCCTTTGTGTTCAACATTTCTGCAAACGCTATAGCTTGCGGTTACACAGCGATCTC
AATAGTCATTCTGATGATCAGCAAAAAAAGAAGAGGCAAAGGCTTGATAATGGCGGTGTT
GGTAGGTGATCTAGTGATGATGGCTTTGCTATTTTCCGGCACCGGAGCTGCTGGAGCAAT
A
TG

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR2HA80TF 732 0 0
GGAGTTGGGAAAAGACCACCATTTATTATTCCTCTCTCTCTCTTTACACGAGGTGAGACG
CAATGGAGCACGAGCGCAAGAACAATCTGAATGGGATGGAGATGGAAAAGGGAAAGAAGG
AGAGCGGTTCGAGAAA*GGGCTTGAGTTAACGATGAGAGTGTTGGCTTGGGTTCTAACAC
TGGCGGCTGCAACAGTACTTGGTGTCGCAAAACAGACAAAGGTTGTGTCTATAACGCTTA
TTCCAACTTTGCCTCCTCTTGATGTGCCCGCAACAGCCAAAGCCTCTTACTTGTCTGCCT
TTGTGTTCAACATTTCGGCAAACGCTATAGCTTGCGGTTACACAGCGATCTCAATAGTCA
TTCTGATGATCAGCAAAGAAAGAAGAAGCAAAGGCTTGATAATGGCGGTGTTGGTAGGTG
ATCTAGTGATGATGGCTTTGCTATTTTCCGGCACCAGAGCTGCTGGAGCAATAGGGTTGA
TGGGTGTACAAGGGAACAAGCATGTGATGTGGAAGAAAGTGTGTAATGTTTTTGGAAAAT
TCTGTCACCAAACTGCTGCTTCGGTTGCCATCACTCTTCTTGCTGCAATCGTGTTTATGG
TTCTTGTTGTTCTTGATGCTATGAAGCTTCCTTAATGCAATTGATATCTTCCTTAATGCA
ATTGGTATTTCTGTTTCTTCTTACAGCTCTTCTGCTTCTTGTCGTGTTGTGTAAAGTCAT
TATCAACAATCA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2FJ96TF 743 0 0
G
GGGAAAAGACCACCATTTATTATTCCTCTCTCTCTCTTTACACGAAGTGAGACGCAATGG
AGCACGAGCGCAAGAACAATCTGAATGGGATGGAGATGGAAAAGGGAAAGAAGGAGAGCG
GTTCGAGAAAAGGGCTTGAGTTAACGATGAGAGTGTTGGCTTGGGTTCTAACACTGGCGG
CTGCAACAGTACTTGGTGTCGCAAAACAGACAAAGGTTGTGTCTATAACGCTTATTCCAA
CTTTGCCTCCTCTTGATGTGCCCGCAACAGCCAAAGCCTCTTACTTGTCTGCCTTTGTGT
TCAACATTTCGGCAAACGCTATAGCTTGCGGTTACACAGCGATCTCAATAGTCATTCTGA
TGATCAGCAAAGAAAGAAGAAGCAAAGGCTTGATAATGGCGGTGTTGGTAGGTGATCTAG
TGATGATGGCTTTGCTATTTTCCGGCACCGGAGCTGCTGGAGCAATAGGGTTGATGGGTG
TACAAGGGAACAAGCATGTGATGTGGAAGAAAGTGTGTAATGTTTTTGGAAAATTCTGTC
ACCAAACTGCTGCTTCGGTTGCCATCACTCTTCTTGCTGCAATCGTGTTTATGGTTCTTG
TTGTTCTTGATGCTATGAAGCTTCCTTAATGCAATTGATATCTTCCTTAATGCAATTGAT
ATGTCTGTTTCTTCTTACAGCTCTTCTGCTTCTTGTCGTGTTGTGTAAAGTCATTATCAA
CAATCATGTAATTGTCTATTTG

QA 2 743 2 743
DS 

RD RR2HA80JQ 734 0 0
TCTC
TCTCTCTTTACACGAGGTGAGACGCAATGGAGCACGAGCGCAAGAACAATCTGAATGGGA
TGGAGATGGAAAAGGGAAAGAAGGAGAGCGGTTCGAGAAA*GGGCTTGAGTTAACGATGA
GAGTGTTGGCTTGGGTTCTAACACTGGCGGCTGCAACAGTACTTGGTGTCGCAAAACAGA
CAAAGGTTGTGTCTATAACGCTTATTCCAACTTTGCCTCCTCTTGATGTGCCCGCAACAG
CCAAAGCCTCTTACTTGTCTGCCTTTGTGTTCAACATTTCGGCAAACGCTATAGCTTGCG
GTTACACAGCGATCTCAATAGTCATTTTGATGATCAGCAAAGAAAGAAGAAGCAAAGGCT
TGATAATGGCGGTGTTGGTAGGTGATCTAGTGATGATGGCTTTGCTATTTTCCGGCACCA
GAGCTGCTGGAGCAATAGGGTTGATGGGTGTACAAGGGAACAAGCATGTGATGTGGAAGA
AAGTGTGTAATGTTTTTGGAAAATTCTGTCACCAAACTGCTGCTTCGGTTGCCATCACTC
TTCTTGCTGCAATCGTGTTTATGGTTCTTGTTGTTCTTGATGCTATGAAGCTTCCTTAAT
GCAATTGATATCTTCCTTAATGCAATTGGTATTTCTGTTTCTTCTTACAGCTCTTCTGCT
TCTTGTCGTGTTGTGTAAAGTCATTATCAACAATCATGTAATTGTCTATTTGCTTTTAAT
GCTTTTCACG

QA 5 734 5 734
DS 

RD RR2FJ96JQ 723 0 0
TCTCTCTTTACACGAAGTGAGACGCAATGGAGCACGAGCGCAAGAACAATCTGAATGGGA
TGGAGATGGAAAAGGGAAAGAAGGAGAGCGGTTCGAGAAAAGGGCTTGAGTTAACGATGA
GAGTGTTGGCTTGGGTTCTAACACTGGCGGCTGCAACAGTACTTGGTGTCGCAAAACAGA
CAAAGGTTGTGTCTATAACGCTTATTCCAACTTTGCCTCCTCTTGATGTGCCCGCAACAG
CCAAAGCCTCTTACTTGTCTGCCTTTGTGTTCAACATTTCGGCAAACGCTATAGCTTGCG
GTTACACAGCGATCTCAATAGTCATTCTGATGATCAGCAAAGAAAGAAGAAGCAAAGGCT
TGATAATGGCGGTGTTGGTAGGTGATCTAGTGATGATGGCTTTGCTATTTTCCGGCACCG
GAGCTGCTGGAGCAATAGGGTTGATGGGTGTACAAGGGAACAAGCATGTGATGTGGAAGA
AAGTGTGTAATGTTTTTGGAAAATTCTGTCACCAAACTGCTGCTTCGGTTGCCATCACTC
TTCTTGCTGCAATCGTGTTTATGGTTCTTGTTGTTCTTGATGCTATGAAGCTTCCTTAAT
GCAATTGATATCTTCCTTAATGCAATTGATATGTCTGTTTCTTCTTACAGCTCTTCTGCT
TCTTGTCGTGTTGTGTAAAGTCATTATCAACAATCATGTAATTGTCTATTTGCTTTTAAT
GC
G

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 4

CO CL1614Contig1 1021 4 3 U
GCTCTCACTTAGTCCTCGATTCTCTTTCTCTCTACGCGTTTCAGCGCTAGTCTTCTTCTT
CTCTAGATCTCTGCCTTCCTCCTCCACGCCGTTATAATAAATCTCCAATCCATTAGGAAA
AACAAAGAAGAAATGGCGCAACAACAATCGTCGTTGATCTACAGTTTCGTGGCACGGGGC
ACAGTGATCCTCGTGGAGTTCACCGATTTCAAAGGAAACTTCACATCAATCGCTGCACAG
TGCCTCCAAAAGCTCCCTTCCTCGAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGATGGTCATATC
TTCAATTACCTCGTCGAGAATGGATTCACTTATTGTGTTGTTGCAGTCGATTCTGCTGGG
AGGCAGATTCCTATGGCTTTCTTGGAACGGGTGAAGGAGGATTTCAACAAGAGATACGGT
GGTGGAAAGGCTGCTACTGCTCAAGCTAACAGCTTGAATAAAGAGTTTGGGTCGAAACTG
AAAGAGCACATGCAGCATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTG
AAGGCTCAGGTGTCTGAAGTTAAAGGTGTCATGATGGAAAACATTGAAAAGGTTCTTGAC
CGTGGTGAGAAAATTGAACTTTTGGTGGACAAAACTGAAAACCTTCGCTCACAGGCGCAA
GATTTCAGAACACAAGGAACACAGATTAGAAGAAAGATGTGGTTTCAGAACATGAAGATA
AAACTCATTGTTCTTGCAATTATCATCGCCTTGATCCTCATCATCGTCCTCTCAGTCTGC
GGTGGTTTCAACTGTGGCAAATGAGTCTGCATCATTTATGATTTCCGTCAACATCCTCCT
CATTCACTTCGTCGTGCCGCTTCTTCGTTTTTGTGGTTTCTAAATTCTCATGCTCTATGT
TTCTCTGCTTAGATTGTATTTCTTGAAGTTGGTTTTGTATAGGCCATAATATATATGTAT
GAATGTTCGACATTTTGCCAACATTTGCTATTGGTGGTTTCGACACTGATTCTTGCGAAC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2GA70TF U 231
AF RR2A469TF U 1
AF RR2BT21TF U 191
AF RR2A469JQ C 283
BS 1 781 RR2A469TF
BS 782 938 RR2BT21TF
BS 939 1021 RR2A469JQ

RD RR2GA70TF 332 0 0
CGCTGCACAGTGCCTCCAAAAGCTCCCTTCATCGAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGA
TGGTCATACCTCCAATTACCTCGTCGAGAATGGATTCACTTATTGTGTTGTTGCAGTCGA
TTCTGCTGGGAGGCAGATTCCTATGGCTTTCTTGGAACGGGTGAAGGAGGATTTCAACAA
GAGATACGGTGGTGGAAAGGCTGCTACTGCTCAAGCTAACAGCTTGAATAAAGAGTTTGG
GTCGAAACTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCT
TGCTAAGGTGAAAGCTCACGTGTCTGAAGTTA

QA 1 332 1 332
DS 

RD RR2A469TF 781 0 0
GCTCTCACTTAGTCCTCGATTCTCTTTCTCTCTACGCGTTTCAGCGCTAGTCTTCTTCTT
CTCTAGATCTCTGCCTTCCTCCTCCACGCCGTTATAATAAATCTCCAATCCATTAGGAAA
AACAAAGAAGAAATGGCGCAACAACAATCGTCGTTGATCTACAGTTTCGTGGCACGGGGC
ACAGTGATCCTCGTGGAGTTCACCGATTTCAAAGGAAACTTCACATCAATCGCTGCACAG
TGCCTCCAAAAGCTCCCTTCCTCGAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGATGGTCATATC
TTCAATTACCTCGTCGAGAATGGATTCACTTATTGTGTTGTTGCAGTCGATTCTGCTGGG
AGGCAGATTCCTATGGCTTTCTTGGAACGGGTGAAGGAGGATTTCAACAAGAGATACGGT
GGTGGAAAGGCTGCTACTGCTCAAGCTAACAGCTTGAATAAAGAGTTTGGGTCGAAACTG
AAAGAGCACATGCAGCATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTG
AAGGCTCAGGTGTCTGAAGTTAAAGGTGTCATGATGGAAAACATTGAAAAGGTTCTTGAC
CGTGGTGAGAAAATTGAACTTTTGGTGGACAAAACTGAAAACCTTCGCTCACAGGCGCAA
GATTTCAGAACACAAGGAACACAGATTAGAAGAAAGATGTGGTTTCAGAACATGAAGATA
AAACTCATTGTTCTTGCAATTATCATCGCCTTGATCCTCATCATCGTCCTCTCAGTCTGC
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2BT21TF 748 0 0
G
CGTGGAGTTCACCGATTTCAAAGGAAACTTCACATCAATCGCTGCACAGTGCCTCCAAAA
GCTCCCTTCCTCGAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGATGGTCATACCTTCAATTACCT
CGTCGAGAATGGATTCACTTATTGTGTTGTTGCAGTCGATTCTGCTGGGAGGCAGATTCC
TATGGCTTTCTTGGAATGGGTGAAGGAGGATTTCAACAAGAGATACGGTGGTGGAAAGGC
TGCTACTGCTCAAGCTAACAGCTTGAATAAAGAGTTTGGGTCGAAACTGAAAGAGCACAT
GCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGTTGAAGGCTCAGGT
GTCTGAAGTTAAAGGTGTCATGATGGAAAACATTGAAAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAA
AATTGAACTTTTGGTGGACAAAACTGAAAACCTTCGCTCACAGGCGCAAGATTTCAGAAC
ACAAGGAACACAGATGAGAAGAAAGATGTGGTTTCAGAACATGAAGATAAAACTCATTGT
TCTTGCAATTATCATCGCCTTGATCCTCATCATCGTCCTCTCAGTCTGCGGTGGTTTCAA
CTGTGGCAAATGAGTCTGCATCATTTATGATTTCCGTCAACATCCTCCTCATTCACTTCG
TCGTGCCGCTTCTTCGTTTTTGTGGTTTCTAAATTCTCATGCTCTATGTTTCTCTGCTTA
GATTGTATTTCTTGAAGTTGGTTTTGT

QA 2 748 2 748
DS 

RD RR2A469JQ 739 0 0
AACTGCGATGGTCATATCTTCAATTACCTCGTCGAGAATGGATTCACTTATTGTGTTGTT
GCAGTCGATTCTGCTGGGAGGCAGATTCCTATGGCTTTCTTGGAACGGGTGAAGGAGGAT
TTCAACAAGAGATACGGTGGTGGAAAGGCTGCTACTGCTCAAGCTAACAGCTTGAATAAA
GAGTTTGGGTCGAAACTGAAAGAGCACATGCAGCATTGTATGGATCATCCTGATGAGATT
AGCAAGCTTGCTAAGGTGAAGGCTCAGGTGTCTGAAGTTAAAGGTGTCATGATGGAAAAC
ATTGAAAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTGAACTTTTGGTGGACAAAACTGAAAAC
CTTCGCTCACAGGCGCAAGATTTCAGAACACAAGGAACACAGATTAGAAGAAAGATGTGG
TTTCAGAACATGAAGATAAAACTCATTGTTCTTGCAATTATCATCGCCTTGATCCTCATC
ATCGTCCTCTCAGTCTGCGGTGGTTTCAACTGTGGCAAATGAGTCTGCATCATTTATGAT
TTCCGTCAACATCCTCCTCATTCACTTCGTCGTGCTGCTTCTTCGTTTTTGTGGTTTCTA
AATTCTCATGCTCTATGTTTCTCTGCTTAGATTGTATTTCTTGAAGTTGGTTTTGTATAG
GCCATAATATATATGTATGAATGTTCGACATTTTGCCAACATTTGCTATTGGTGGTTTCG
ACACTGATTCTTGCGAACC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 5

CO CL1615Contig1 1019 5 17 U
GGTCCTGATTACGAAGAAGAGACTGATTTTGAAGCTGGAGTGAAAGACTTTAGAGACCGT
TTGGCCAATTATGAGAGGGTTTATGAGCCTGTTGAAGAAGGTTCTTACATCAAAATGATT
GATATGGTCAGCGGTAATGGTGGTCAGATACAAGTGAACAATATAAGTGGTTACCTTCCT
GGAAGAATTGTGTTTTTCTTGGTGAATTCGCATCTGACTCCACGACCAATACTACTCACT
CGGCATGGAGAAAGTATGGATAATGTTAGAGGCCGAACTGGAGGAGACAGTGTTATAAGT
GAATCTGGAAAAATTTATGCAAAGAAGCTTGCCAACTTTGTCGAAAAGCGACTAAAAAAC
GAAAAGGCTGCTTCGATTTGGACCAGTACACTTCAGAGAACTGTCTTAACAGCAGGTCCC
ATCGTTGGATTCCCTAAGGTGCAATGGCGTGCCTTGGACGAGATCAATTCTGGAGTATGC
GATGGAATGACATATGAAGAGATAAAGAAGAACATGCCGGAAGAGTACGAATCTCGGTTA
AAGGACAAACTGCGATACAGATACCCTCGTGGAGAGTCCTACCTTGATGTAATCCAACGG
CTTGAACCTGTGATCATTGAGTTAGAACGACAAAGAGCTCCTGTCGTCGTGATATCTCAC
CAGGCCGTTCTGAGAGCACTGTATGCATATTTTGCGGATCGTCCCCTCAAAGAGATACCC
CAGATCGAGATGCCACTTCACACAATCATAGAGATACAGATGGGAGTTTCTGGCGTGCAA
GAGAAGCGTTACAAACTCATGGACTGAACAACAACTGTTCTGTCGATTCTCAACCAAGTC
TCGTCCCCAAAGATTTTTATTTTTACTCTGCGAATAAGAAGATTTGCAGATATCATTGGT
TGCATTTTGGCTTCCACAGTTCTTATTTTATCCATCAAATTTTTTTT*CTGTATACTCCC
CCAACAGTCTTGTGATCTCAACATTTTATATTCTTCATAATAATCAGCTTTTATACTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2E556TF U 244
AF RR2E171TF U 1
AF RR2A640TF U 299
AF RR2E556JQ C 372
AF RR2E171JQ C 377
BS 1 705 RR2E171TF
BS 706 706 RR2A640TF
BS 707 779 RR2E171TF
BS 780 780 RR2A640TF
BS 781 810 RR2E171TF
BS 811 811 RR2A640TF
BS 812 826 RR2E171TF
BS 827 831 RR2A640TF
BS 832 832 RR2E556JQ
BS 833 947 RR2A640TF
BS 948 948 RR2E556JQ
BS 949 966 RR2A640TF
BS 967 967 RR2E556JQ
BS 968 999 RR2A640TF
BS 1000 1000 RR2E556JQ
BS 1001 1017 RR2A640TF
BS 1018 1019 RR2E171JQ

RD RR2E556TF 178 0 0
G
ATGGAGAAAGTATGGATAATGTTAGAGGCCGAACTGGAGGAGACAGTGTTATAAGTGAAT
CTGGAAAAATTTATGCAAAGAAGCTTGCCAACTTTGTCGAAAAGCGACTAAAAAACGAAA
AGGCTGCTTCGATTTGGACCAGTACACTTCAGAGAACTGTCTTAACAGCAGGTCCCA

QA 2 178 2 178
DS 

RD RR2E171TF 826 0 0
GGTCCTGATTACGAAGAAGAGACTGATTTTGAAGCTGGAGTGAAAGACTTTAGAGACCGT
TTGGCCAATTATGAGAGGGTTTATGAGCCTGTTGAAGAAGGTTCTTACATCAAAATGATT
GATATGGTCAGCGGTAATGGTGGTCAGATACAAGTGAACAATATAAGTGGTTACCTTCCT
GGAAGAATTGTGTTTTTCTTGGTGAATTCGCATCTGACTCCACGACCAATACTACTCACT
CGGCATGGAGAAAGTATGGATAATGTTAGAGGCCGAACTGGAGGAGACAGTGTTATAAGT
GAATCTGGAAAAATTTATGCAAAGAAGCTTGCCAACTTTGTCGAAAAGCGACTAAAAAAC
GAAAAGGCTGCTTCGATTTGGACCAGTACACTTCAGAGAACTGTCTTAACAGCAGGTCCC
ATCGTTGGATTCCCTAAGGTGCAATGGCGTGCCTTGGACGAGATCAATTCTGGAGTATGC
GATGGAATGACATATGAAGAGATAAAGAAGAACATGCCGGAAGAGTACGAATCTCGGTTA
AAGGACAAACTGCGATACAGATACCCTCGTGGAGAGTCCTACCTTGATGTAATCCAACGG
CTTGAACCTGTGATCATTGAGTTAGAACGACAAAGAGCTCCTGTCGTCGTGATATCTCAC
CAGGCCGTTCTGAGAGCACTGTATGCATATTTTGCGGATCGTCCC*TCAAAGAGATACCC
CAGATCGAGATGCCACTTCACACAATCATAGAGATACAGATGGGAGTTTCTGGCGTGCA*
GAGAAGCGTTACAAACTCATGGACTGAACA*CAACTGTTCTGTCGA

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2A640TF 719 0 0
GTGAATCTGGAAAAATTTATGCAAAGAAGCTTGCCAACTTTGTCGAAAAGCGACTAAAAA
ACGAAAAGGCTGCTTCGATTTGGACCAGTACACTTCAGAGAACTGTCTTAACAGCAGGTC
CCATCGTCGGATTCCCTAAGGTGCAATGGCGTGCCTTGGACGATATCAATTCTGGAGTAT
GCGATGGAATGACATATGAAGAGATAAAGAAGAACATGCCGGAAGAGTACGAATCTCGGT
TAAAGGACAAACTGCGATACAGGTACCCTCGTGGAGAGTCCTACCTTGATGTAATCCAAC
GGCTTGAACCTGTGATCATTGAGTTAGAACGACAAAGAGCTCCTGTCGTCGTGATATCTC
ACCAGGCCGTTCTGAGAGCACTGTATGCATATTTTGCGGATCGTCCCCTCAAAGAGATAC
CCCAGATCGAGATGCCACTTCACACAATCATAGAGATACAGATGGGAGTTTCTGGCGTGC
AAGAGAAGCGCTACAAACTCATGGACTGAACAACAACTGTTCTGTCGATTCTCTACCAAG
TCTCGTCCCCAAAGATTTTTATTTTTACTCTGCGAATAAGAAGATTTGCAGATATCATTG
GTTGCATTTTGGCTTCCACAGTTCTTATTTTATCCATCAAATTTTTTTTTCTGTATACTC
CCCCAACATTCTTGTGATCTCAACATTTTATATTCTTCATA*TAATCAGCTTTTATACT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2E556JQ 646 0 0
TTCGA
TTTGGACCAGTACACTTCAGAGAACTGTCTTAACAGCAGGTCCCATCGTTGGATTCCCTA
AGGTGCAATGGCGTGCCCTGGACGAGATCAATTCTGGAGTTTGCGATGGAATGACATATG
AAGAGATAAAGAAGAACATGCCGGAAGAGTACGAATCTCGGTTAAAGGACAAACTGCGAT
ACAGATACCCTCGTGGAGAGTCCTACCTTGATGTAATCCAACGGCTTGAACCTGTGATCA
TTGAGTTAGAACGACAAAGAGCTCCTGTCGTCGTGATATCTCACCAGGCCGTTCTGAGAG
CACTGTATGCATATTTTGCGGATCGTCCCCTCAAAGAGATACCCCAGATCGAGATGCCAC
TTCACACAATCATAGAGATACAGATGGGAGTTTCTGGCGTGCAAGAGAAGCGTTACAAAC
TCATGGACTGAACAACAACTGTTCTGTCGATTCTCAACCAAGTCTCGTCCCCAAAGATTT
TTATTTTTACTCTGCGAATAAGAAGATTTGCAGATATCATTGGTTGCATTTTGGCTTCCA
CAGTTCTTATTTTATCCATCAAATTTTTTTT*CTGTATACTCCCCCAACAGTCTTGTGAT
CTCAACATTTTATATTCTTCATAATAATCAGCTTTTATACT

QA 6 646 6 646
DS 

RD RR2E171JQ 643 0 0
TTTGGACCAGTACACTTCAGAGAACTGTCTTAACAGCAGGTCCCATCGTTGGATTCCCTA
AGGTGCAATGGCGTGCCTTGGACGAGATCAATTCTGGAGTATGCGATGGAATGACATATG
AAGAGATAAAGAAGAACATGCCGGAAGAGTACGAATCTCGGTTAAAGGACAAACTGCGAT
ACAGATACCCTCGTGGAGAGTCCTACCTTGATGTAATCCAACGGCTTGAACCTGTGATCA
TTGAGTTAGAACGACAAAGAGCTCCTGTCGTCGTGATATCTCACCAGGCCGTTCTGAGAG
CACTGTATGCATATTTTGCGGATCGTCCCCTCAAAGAGATACCCCAGATCGAGATGCCAC
TTCACACAATCATAGAGATACAGATGGGAGTTTCTGGCGTGCAAGAGAAGCGTTACAAAC
TCATGGACTGAACAACAACTGTTCTGTCGATTCTCAACCAAGTCTCGTCCCCAAAGATTT
TTATTTTTACTCTGCGAATAAGAAGATTTGCAGATATCATTGGTTGCATTTTGGCTTCCA
CAGTTCTTATTTTATCCATCAAATTTTTTT**CTGTATACTCCCCCAACAGTCCTGTGAT
CTCAACATTTTATATTCTTCATAATAATCAGCTTTTATACTAG

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 4

CO CL1616Contig1 681 4 16 U
GGGCGAGAGAGAGAGAGATGGCTGAAACAGCGAGAAGACAAGGTGGTGGTGGGAGGCCGT
TTCCACCGCCTCCTCCGAGAGGCGTTAATCAACTCCCTCGCCCTAAAGCCGAACCTGTCG
ATCGCGAGAAGACGTGTCCTTTGCTTCTTCGTGTGTTCACCAAGAGTGGTGGTCATCATA
CTAAGGAAGATTATGCTGTGAGGGGCAAAGAGCCAAAGGACGAAGTTCAGATTTACACTT
GGAAAGATGCCAATCTTCGCGAGCTAACGGATTTGGTCAAAGAGGTTTCTGTGGCAGCTA
GGAGAAGAGATGCGAGATTATCGTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAATGGCCGCTTTA
TTGTGAGACAGGTTGGTCAGACGATGTCTTATCCAAACCGAAAACAACCAGACGACAGTA
AAACACTCGCCGACCTTCATTTCGAGATTGGAGATTATCTGGATGTGGCAATCTACTAGG
AGGAGGAGGTT*CTGTTTTTTCCTCGAGTAACATTTAGGGGTGTGTGCACAAAGGAAAAT
AACAAATTCATAGTTGTTCCCATTCCTTTTTTGTTTTTGTTTTTTAACAACAGTTGTTCC
CATTTCAAAACTTTGTTTAGACACATATTATGTATCCTTGGATCTGGTCTGTGCACAACT
GGTTTAGCCATAACTTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C311TF U 4
AF RR2AM58JQ C 1
AF RR2AM58TF U 1
AF RR2A312TF U 120
BS 1 6 RR2AM58JQ
BS 7 37 RR2C311TF
BS 38 38 RR2AM58TF
BS 39 64 RR2C311TF
BS 65 65 RR2AM58TF
BS 66 93 RR2C311TF
BS 94 94 RR2AM58TF
BS 95 98 RR2C311TF
BS 99 99 RR2AM58TF
BS 100 139 RR2C311TF
BS 140 141 RR2AM58TF
BS 142 268 RR2C311TF
BS 269 269 RR2AM58TF
BS 270 294 RR2C311TF
BS 295 664 RR2AM58TF
BS 665 681 RR2A312TF

RD RR2C311TF 291 0 0
GGG
GAGAGAGAGAGATGGCTGAAACAGCGAGAAGTCAAGGTGGTGGTGGGAGGCCGTTTCCGC
CGCCTCCTCCGAGAGGCGTTAATCAACCCCCTTGCCCTAAAGCCGAACCTGTCGATCGCG
AGAAGACGTGTCCCCTGCTTCTTCGTGTGTTCACCAAGAGTGGTGGTCATCATACTAAGG
AAGATTATGCTGTGAGGGGCAAAGAGCCAAAGGACGAAGTTCAGATTTACACTTGGAAAG
ATGCCAATCTTCGCGAGCTAACAGATTTGGTCAAAGAGGTTTCTGTGG

QA 4 291 4 291
DS 

RD RR2AM58JQ 681 0 0
GGGCGAGAGAGAGAGAGATGGCTGAAACAGCGAGAAGACAAGGTGGTGGTGGGAGGCCGT
TTCCACCGCCTCCTCCGAGAGGCGTTAATCAACTCCCTCGCCCTAAAGCCGAACCTGTCG
ATCGCGAGAAGACGTGTCCTTTGCTTCTTCGTGTGTTCACCAAGAGTGGTGGTCATCATA
CTAAGGAAGATTATGCTGTGAGGGGCAAAGAGCCAAAGGACGAAGTTCAGATTTACACTT
GGAAAGATGCCAATCTTCGCGAGCTAACGGATTTGGTCAAAGAGGTTTCTGTGGCAGCTA
GGAGAAGAGATGCGAGATTATCGTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAATGGCCGCTTTA
TTGTGAGACAGGTTGGTCAGACGATGTCTTATCCAAACCGAAAACAACCAGACGACAGTA
AAACACTCGCCGACCTTCATTTCGAGATTGGAGATTATCTGGATGTGGCAATCTACTAGG
AGGAGGAGGTT*CTGTTTTTTCCTCGAGTAACATTTAGGGGTGTGTGCACAAAGGAAAAT
AACAAATTCATAGTTGTTCCCATTCCTTTTTTGTTTTTGTTTTTTAACAACAGTTGTTCC
CATTTCAAAACTTTGTTTAGACACATATTATGTATCCTTGGATCTGGTCTGTGCACAACT
GGTT
TAGCCATAACTTTTTTC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2AM58TF 681 0 0
GGGCGA
GAGAGAGAGAGATGGCTGAAACAGCGAGAAGACAAGGTGGTGGTGGGAGGCCGTTTCCAC
CGCCTCCTCCGAGAGGCGTTAATCAACTCCCTCGCCCTAAAGCCGAACCTGTCGATCGCG
AGAAGACGTGTCCTTTGCTTCTTCGTGTGTTCACCAAGAGTGGTGGTCATCATACTAAGG
AAGATTATGCTGTGAGGGGCAAAGAGCCAAAGGACGAAGTTCAGATTTACACTTGGAAAG
ATGCCAATCTTCGCGAGCTAACGGATTTGGTCAAAGAGGTTTCTGTGGCAGCTAGGAGAA
GAGATGCGAGATTATCGTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAATGGCCGCTTTATTGTGA
GACAGGTTGGTCAGACGATGTCTTATCCAAACCGAAAACAACCAGACGACAGTAAAACAC
TCGCCGACCTTCATTTCGAGATTGGAGATTATCTGGATGTGGCAATCTACTAGGAGGAGG
AGGTT*CTGTTTTTTCCTCGAGTAACATTTAGGGGTGTGTGCACAAAGGAAAATAACAAA
TTCATAGTTGTTCCCATTCCTTTTTTGTTTTTGTTTTTTAACAACAGTTGTTCCCATTTC
AAAACTTTGTTTAGACACATATTATGTATCCTTGGATCTGGTCTGTGCACAACTGGTT
TAGCCATAACTTTTTTC

QA 7 664 7 664
DS 

RD RR2A312TF 562 0 0
GATCGCGAGAAGACGTGTCCTTTGCTTCTTCGTGTGTTCACCAAGAGTGGTGGTCATCAT
ACTAAGGAAGATTATGCTGTGAGGGGCAAAGAGCCAAAGGACGAAGTTCAGATTTACACT
TGGAAAGATGCCAATCTTCGCGAGCTAACGGATTTGGTCAAAGAGGTTTCTGTGGCAGCT
AGGAGAAGAGATGCGAGATTATCGTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAATGGCCGCTTT
ATTGTGAGACAGGTTGGTCAGACGATGTCTTATCCAAACCGAAAACAACCAGACGACAGT
AAAACACTCGCCGACCTTCATTTCGAGATTGGAGATTATCTGGATGTGGCAATCTACTAG
GAGGAGGAGGTTTCTGTTTTTTCCTCGAGTAACATTTAGGGGTGTGTGCACAAAGGAAAA
GAACAAATTCATAGTTGTTCCCATTCCTTTTTTGTTTTTGTTTTTTAACAACAGTTGTTC
CCATTTCAAAACTTTGTTTAGACACATATTATGTATCCTTGGATCTGGTCTGTGCACAAC
TGGTTTAGCCATAACTTTTCTC

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 5

CO CL1617Contig1 687 5 4 U
GGGAGCTGCTGACTCTGCAACCATGTCGAAGCGAGGAAGAGGAGGAACCTCTGGTAACAA
GTTCAGGATGTCACTTGGTCTTCCAGTGGCAGCCACAGTGAACTGTGCTGACAACACTGG
AGCCAAGAACCTTTACATCATCTCCGTAAAGGGTATCAAGGGTCGTCTTAACCGTTTGCC
ATCTGCATGTGTTGGTGACATGGTTATGGCTACAGTCAAGAAAGGTAAACCTGATCTCCG
TAAGAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCTTGGCGCCGAAAGGATGG
TGTCTTCATGTACTTCGAGGACAATGCTGGTGTCATTGTCAATCCCAAGGGTGAAATGAA
AGGATCTGCTATTACTGGACCAATCGGGAAGGAGTGTGCTGACCTGTGGCCGAGGATCGC
AAGTGCTGCAAACGCCATCGTTTAAGATATCTCTTGAACGTTTAATCTCTCCTCTGTTGA
GGGATACACCTTGTTTTCTTTTGTGTTAAGACATTGATCTTGATTCTAGTTCCTATAAGA
ACTCTGTTTCTTAGCACCGGTTTGTTTGTTATTATAGTTTTGTTTAACCTTTAATTTTCC
AACTGTGACGTTAATCTCGATACCTGGACTAGTTATTCCTCTAGTATAGTTCGGTTAAAC
CGAAAAATTGAGGCTTCAATTCTAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D162JQ C 1
AF RR2D162TF U 1
AF RR2AX71TFB U 89
AF RR2AC24JQ C 5
AF RR2AC24TF U 5
BS 1 7 RR2D162JQ
BS 8 592 RR2D162TF
BS 593 662 RR2AC24TF
BS 663 687 RR2AC24JQ

RD RR2D162JQ 592 0 0
GGGAGCTGCTGACTCTGCAACCATGTCGAAGCGAGGAAGAGGAGGAACCTCTGGTAACAA
GTTCAGGATGTCACTTGGTCTTCCAGTGGCAGCCACAGTGAACTGTGCTGACAACACTGG
AGCCAAGAACCTTTACATCATCTCCGTAAAGGGTATCAAGGGTCGTTTTAACCGTTTGCC
ATCTGCATGTGTTGGTGACATGGTTATGGCTACAGTCAAGAAAGGTAAACCTGATCTCCG
TAAGAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCTTGGCGCCGAAAGGATGG
TGTCTTCATGTACTTCGAGGACAATGCTGGTGTCATTGTCAATCCCAAGGGTGAAATGAA
AGGATCTGCTATTACTGGACCAATCGGGAAGGAGTGTGCTGACCTGTGGCCGAGGATCGC
AAGTGCTGCAAACGCCATCGTTTAAGATATCTCTTGAACGTTTAATCTCTCCTCTGTTGA
GGGATACACCTTGTTTTCTTTTGTGTTAAGACATTGATCTTGATTCTAGTTCCTATAAGA
ACTCTGTTTCTTAGCACCGGTTTGTTTGTTATTATAGTTTTGTTTAACCTTT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2D162TF 592 0 0
GGGAGCT
GCTGACTCTGCAACCATGTCGAAGCGAGGAAGAGGAGGAACCTCTGGTAACAAGTTCAGG
ATGTCACTTGGTCTTCCAGTGGCAGCCACAGTGAACTGTGCTGACAACACTGGAGCCAAG
AACCTTTACATCATCTCCGTAAAGGGTATCAAGGGTCGTCTTAACCGTTTGCCATCTGCA
TGTGTTGGTGACATGGTTATGGCTACAGTCAAGAAAGGTAAACCTGATCTCCGTAAGAAG
GTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCTTGGCGCCGAAAGGATGGTGTCTTC
ATGTACTTCGAGGACAATGCTGGTGTCATTGTCAATCCCAAGGGTGAAATGAAAGGATCT
GCTATTACTGGACCAATCGGGAAGGAGTGTGCTGACCTGTGGCCGAGGATCGCAAGTGCT
GCAAACGCCATCGTTTAAGATATCTCTTGAACGTTTAATCTCTCCTCTGTTGAGGGATAC
ACCTTGTTTTCTTTTGTGTTAAGACATTGATCTTGATTCTAGTTCCTATAAGAACTCTGT
TTCTTAGCACCGGTTTGTTTGTTATTATAGTTTTGTTTAACCTTT

QA 8 592 8 592
DS 

RD RR2AX71TFB 499 0 0
GCAGCCACAGTGAGCTGTGCTGACAACACTGGAGCCAAGAACCTTTACATCATCTCCGTA
AAGGGTATCAAGGGTCGTCTTAACCGTTTGCCATCTGCATGTGTTGGTGACATGGTTATG
GCTACAGTCAAGAAAGGTAAACCTGATCTCCGTAAGAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTT
AGGCAGAGGAAGCCTTGGCGCCGAAAGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGAGGACAATGCT
GGTGTCATTGTCAATCCCAAGGGTGAAATGAAAGGATCTGCTATTACTGGACCAATCGGG
AAGGAGTGTGCTGACCTGTGGCCGAGGATCGCAAGTGCTGCAAACGCCATCGTTTAAGAT
ATCTCTTGAACGTTTAATCTCTCCTCTGTTGAGGGATACACCTTGTTTTCTTTTGTGTTA
AGACATTGATCTTGATTCTAGTTCCTATAAGAACTCTGTTTCTTAGCACCGGTTTGTTTG
TTATTATAGTTTTGTTTAA

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR2AC24JQ 683 0 0
GGG
GCTGACTCTGCAACCATGTCGAAGCGAGGAAGAGGAGGAACCTCTGGTAACAAGTTCAGG
ATGTCACTTGGTCTTCCAGTGGCAGCCACAGTGAACTGTGCTGACAACACTGGAGCCAAG
AACCTTTACATCATCTCCGTAAAGGGTATCAAGGGTCGTCTTAACCGTTTGCCATCTGCA
TGTGTTGGTGACATGGTTATGGCTACAGTCAAGAAAGGTAAACCTGATCTCCGTAAGAAG
GTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCTTGGCGCCGAAAGGATGGTGTCTTC
ATGTACTTCGAGGACAATGCTGGTGTCATTGTCAATCCCAAGGGTGAAATGAAAGGATCT
GCTATTACTGGACCAATCGGGAAGGAGTGTGCTGACCTGTGGCCGAGGATCGCAAGTGCT
GCAAACGCCATCGTTTAAGATATCTCTTGAACGTTTAATCTCTCCTCTGTTGAGGGATAC
ACCTTGTTTTCTTTTGTGTTAAGACATTGATCTTGATTCTAGTTCCTATAAGAACTCTGT
TTCTTAGCACCGGTTTGTTTGTTATTATAGTTTTGTTTAACCTTTAATTTTCCAACTGTG
ACGTTAATCTCGATACCTGGACTAGTTATTCCTCTAGTATAGTTCGGTTAAACCGAAAAA
TTGAGGCTTCAATTCTAACT

QA 4 683 4 683
DS 

RD RR2AC24TF 658 0 0
GGG
GCTGACTCTGCAACCATGTCGAAGCGAGGAAGAGGAGGAACCTCTGGTAACAAGTTCAGG
ATGTCACTTGGTCTTCCAGTGGCAGCCACAGTGAACTGTGCTGACAACACTGGAGCCAAG
AACCTTTACATCATCTCCGTAAAGGGTATCAAGGGTCGTCTTAACCGTTTGCCATCTGCA
TGTGTTGGTGACATGGTTATGGCTACAGTCAAGAAAGGTAAACCTGATCTCCGTAAGAAG
GTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCTTGGCGCCGAAAGGATGGTGTCTTC
ATGTACTTCGAGGACAATGCTGGTGTCATTGTCAATCCCAAGGGTGAAATGAAAGGATCT
GCTATTACTGGACCAATCGGGAAGGAGTGTGCTGACCTGTGGCCGAGGATCGCAAGTGCT
GCAAACGCCATCGTTTAAGATATCTCTTGAACGTTTAATCTCTCCTCTGTTGAGGGATAC
ACCTTGTTTTCTTTTGTGTTAAGACATTGATCTTGATTCTAGTTCCTATAAGAACTCTGT
TTCTTAGCACCGGTTTGTTTGTTATTATAGTTTTGTTTAACCTTTAATTTTCCAACTGTG
ACGTTAATCTCGATACCTGGACTAGTTATTCCTCTAGTATAGTTCGGTTAAACCG

QA 4 658 4 658
DS 



AS 2 4

CO CL1618Contig1 601 2 5 U
GCGAACTTGAAACTTCATTAATCAGAGATGCAACTTAGTTCATACATTAAACTGCAGATC
TATGCAGATATATTAAAAAAAAAAGAAAGAAAACTGAAGTTTTAACAACACGCATAATCT
GCTTCCCATCTCTGCTTTCTCCTCACTTGTAAAACTCAAAGTCCGTGTCTGGCTTCTTCA
CATTTGAGCGGTAACCCTTCTCGAAGTCCTTAGGCAGTATCACATATCTGTTCTTACGCA
CCGCATGCATTCCAGCTTCCTGGCAGATTGCCGCTATCTCAGCAGCGCTAATTTTATCAG
GACGTGAAACATAGTCTTCCAAGTCAACCTCATCGCTGAGGTTCATTTTGGCAGTGCATA
CCTGGAAAACAAGCCTCTTTTGACGTCTATCAGGAAGGGGGAACTCAATCTTACGATCAA
GTCTACCAGGACGTAAGAAAGCAGGATCAAGAGTGTCTGCCCTGTTGGTCGCCATTATGA
CCTTGACATTCACGGTCTGGTCAAATCCATCCATCTGATTAAGTAGTTCCATGAGAATAC
GCTGAACTTCCCTATCAGCTCCTGTTTGAGCATCGAACCTAGCAGTAGCGATGGCATCCA
C


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2F983JQ U 1
AF RR2D801JQ U 1
BS 1 96 RR2D801JQ
BS 97 97 RR2F983JQ
BS 98 151 RR2D801JQ
BS 152 152 RR2F983JQ
BS 153 601 RR2D801JQ

RD RR2F983JQ 580 0 0
GT
GAACTTGAAACTTCATTAATCAGAGATGCAACTTAGTTCATACATTAAACTGCAGATCTA
TGCAGATATATTAAAAAAAAAA*AAAGAAAACTGAAGTTTTAACAACACGCATAATCTGC
TTCCCATCTCTGCTTTCTCCTCACTTGTAAAACTCAAAGTCCGTGTCTGGCTTCTTCACA
TTTGAGCGGTAACCCTTCTCGAAGTCCTTAGGCAGTATCACATATCTGTTCTTACGCACC
GCATGCATTCCAGCTTCCTGGCAGATTGCCGCTATCTCAGCAGCGCTAATTTTATCAGGA
CGTGAAACATAGTCTTCCAAGTCAACCTCATCGCTGAGGTTCATTTTGGCAGTGCATACC
TGGAAAACAAGCCTCTTTTGACGTCTATCAGGAAGGGGGAACTCAATCTTACGATCAAGT
CTACCAGGACGTAAGAAAGCAGGATCAAGAGTGTCTGCCCTGTTGGTCGCCATTATGACC
TTGACATTCACGGTCTGGTCAAATCCATCCATCTGATTAAGTAGTTCCATGAGAATACGC
TGAACTTCCCTATCAGCTCCTGTTTGAGCATCGAACCT

QA 3 580 3 580
DS 

RD RR2D801JQ 601 0 0
GCGAACTTGAAACTTCATTAATCAGAGATGCAACTTAGTTCATACATTAAACTGCAGATC
TATGCAGATATATTAAAAAAAAAAGAAAGAAAACTGGAGTTTTAACAACACGCATAATCT
GCTTCCCATCTCTGCTTTCTCCTCACTTGTAGAACTCAAAGTCCGTGTCTGGCTTCTTCA
CATTTGAGCGGTAACCCTTCTCGAAGTCCTTAGGCAGTATCACATATCTGTTCTTACGCA
CCGCATGCATTCCAGCTTCCTGGCAGATTGCCGCTATCTCAGCAGCGCTAATTTTATCAG
GACGTGAAACATAGTCTTCCAAGTCAACCTCATCGCTGAGGTTCATTTTGGCAGTGCATA
CCTGGAAAACAAGCCTCTTTTGACGTCTATCAGGAAGGGGGAACTCAATCTTACGATCAA
GTCTACCAGGACGTAAGAAAGCAGGATCAAGAGTGTCTGCCCTGTTGGTCGCCATTATGA
CCTTGACATTCACGGTCTGGTCAAATCCATCCATCTGATTAAGTAGTTCCATGAGAATAC
GCTGAACTTCCCTATCAGCTCCTGTTTGAGCATCGAACCTAGCAGTAGCGATGGCATCCA
C

QA 1 601 1 601
DS 



CO CL1618Contig2 785 2 15 U
GGATTTTATTTGTTAGCAACCGATCTTTTCTTTCTCTCTACTCCAAGAACTCATCCCACA
GATCTCTCTCCGACAATGGCCGCAGCGATGGTTCTCGACCCCAAATCATCATCTCCCCCA
CTGATGGATCTCTCCACGTCCCCCGACGAGGAAGATCCCTACTCCCGTCTCAAATCGCTC
GAGCGGCAGCTAGAGTTCACCGACATCCAAGAGGAATACGTGAAAGACGAGCAGAAGAAT
CTCAAACGCGAGCTCTTGCGCGCTCAAGAAGAGGTCAAACGAATCCAATCCGTGCCCTTA
GTGATTGGCCAGTTCATGGAGATGGTCGATCAGAACAACGGCATCGTTGGATCCACCACG
GGCTCCAATTACTATGTCAGGATTCTCAGCACCATCAACAGAGAAGACCTAAAGCCTTCT
GCTTCCGTGGCCCTTCACCGTCACTCTAATGCCCTTGTTGATGTCTTGCCGCCTGAGGCT
GATTCGAGCATCTCCCTTCTCAGCCAATCTGAGAAGCCTGACGTCTCCTACAATGATATT
GGAGGATGTGATATTCAGAAACAGGAGATTCGAGAGGCTGTTGAGTTGCCACTTACCCAC
CACGAGCTTTACAAACAGATTGGTATTGACCCTCCACGAGGTGTCTTGCTCTATGGACCT
CCTGGTACCGGGAAGACTATGTTGGCTAAGCTGTTGCTAACCACACAACCGCTGCTTTCA
TTAGGGTGTTGGCTCTGAGTTCGTGCAGAAGTACCTCGGCGAGGGACCTCGTATGGTTCG
TGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2D801TF U 38
AF RR2F983TF U 1
BS 1 176 RR2F983TF
BS 177 177 RR2D801TF
BS 178 191 RR2F983TF
BS 192 192 RR2D801TF
BS 193 359 RR2F983TF
BS 360 360 RR2D801TF
BS 361 362 RR2F983TF
BS 363 363 RR2D801TF
BS 364 410 RR2F983TF
BS 411 411 RR2D801TF
BS 412 485 RR2F983TF
BS 486 486 RR2D801TF
BS 487 506 RR2F983TF
BS 507 507 RR2D801TF
BS 508 785 RR2F983TF

RD RR2D801TF 649 0 0
GG
ACTCCAAGAACTCATCCCACAGATCTCTCTCCGACAATGGCCGCAGCGATGGTTCTCGAC
CCCAAATCATCATCTCCCCCACTGATGGATCTTTCCACGTCCCCCGACGAGGAAGATCCC
TACTCCCGTCTCAAATCGCTCGAGCGGCAGCTAGAGTTCACCGACATCCAAGAGGAATAC
GTGAAAGACGAGCAGAAGAATCTCAAGCGCGAGCTCTTGCGCGCTCAAGAAGAGGTCAAA
CGAATCCAATCCGTGCCCTTAGTGATTGGCCAGTTCATGGAGATGGTCGATCAGAACAAC
GGCATCGTTGGATCCACCACGGGCTCCAATTACTATGTCAGGATTCTCAGCACCATCAAC
AGAGAAGACTTAAAGCCTTCTGCTTCCGTGGCCCTTCACCGTCACTCTAATGCCCTTGTT
GATGTCTTGCCGCCTGAGGCTGATTCGAGCATCTCCCTTCTTAGCCAATCTGAGAAGCCT
GACGTCTCCTACAATGATATTGGAGGATGTGATATTCAGAAACAGGAGATTCGAGAGGCT
GTTGAGTTGCCACTTACCCACCACGGGCTTTACAAACAGATTGGTATTGACCCTCCACGA
GGTGTCTTGCTCTATGGACCTCCTGGTACCGGGAAGACTATGTTGGC

QA 3 649 3 649
DS 

RD RR2F983TF 785 0 0
GGATTTTATTTGTTAGCAACCGATCTTTTCTTTCTCTCTACTCCAAGAACTCATCCCACA
GATCTCTCTCCGACAATGGCCGCAGCGATGGTTCTCGACCCCAAATCATCATCTCCCCCA
CTGATGGATCTCTCCACGTCCCCCGACGAGGAAGATCCCTACTCCCGTCTCAAATCTCTC
GAGCGGCAGCTGGAGTTCACCGACATCCAAGAGGAATACGTGAAAGACGAGCAGAAGAAT
CTCAAACGCGAGCTCTTGCGCGCTCAAGAAGAGGTCAAACGAATCCAATCCGTGCCCTTA
GTGATTGGCCAGTTCATGGAGATGGTCGATCAGAACAACGGCATCGTTGGATCCACCACT
GGGTCCAATTACTATGTCAGGATTCTCAGCACCATCAACAGAGAAGACCTGAAGCCTTCT
GCTTCCGTGGCCCTTCACCGTCACTCTAATGCCCTTGTTGATGTCTTGCCGCCTGAGGCT
GATTCTAGCATCTCCCTTCTCAGCCAGTCTGAGAAGCCTGACGTCTCCTACAATGATATT
GGAGGATGTGATATTCAGAAACAGGAGATTCGAGAGGCTGTTGAGTTGCCACTTACCCAC
CACGAGCTTTACAAACAGATTGGTATTGACCCTCCACGAGGTGTCTTGCTCTATGGACCT
CCTGGTACCGGGAAGACTATGTTGGCTAAGCTGTTGCTAACCACACAACCGCTGCTTTCA
TTAGGGTGTTGGCTCTGAGTTCGTGCAGAAGTACCTCGGCGAGGGACCTCGTATGGTTCG
TGATG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 4

CO CL1619Contig1 910 4 3 U
CTTAAACCAAAAAGAAGCATCCGTTATTTCAAACATGAAAAGGTTTTGTTTGGTTGTGTT
CCCAAACAAACAAACATTGAAGAAAGTAGAGTAATCAAAAGAACAAATATAGCTCTTTCT
AATACAACTTGAATAAAGTTTAACATTTAACCATTTAACACAAATACATTACCTTCTTTC
TCCTTCTGAAGTAGCTTTGCAATCCCAAAACTCTAATATCGTTCTTCAGGTTTTATTTCC
ATGGAGAATAATAGCAAACTCCCTGTGGTTAGCAAGGACTTCTAAGCAGCAGCCTGTAGC
AACTCCCTTTCAGCGCGTTCCTTGATCCTTCTCTCAAGCTCCGGCCTAAAGTGCCTAATC
AGACCTTGCACGGGCCACGCAGCTGCATCACCCAAGGCACAGATTGTGTGTCCTTCGATC
TGTTTGGTTACCTCGTGAAGCATATCAATCTCTTCCAGCTTTGCATTGCCAACTTTCATC
CTCTCCATGATCATCCAAAGCAAACCTGTCCCTTCTCTGCAAGGAGTACACTGCCCACAG
CTTTCATGCTTGTAGAAGTACGAGAGCCTCGCAATTGCATCCACGACATCGGTTGACTTA
TCCATCACGATCACCGCCGCAGTTCCTAGCCCTGATTGGACAGCTTTGAGCGCATCGAAA
TCCATCAGCACATCCTCGCATATGTTCTTAGGAATCAAAGGGACAGATGAACCTCCAGGA
ATAATAGCAAGCAGGTTGTCCCATCCACCCCTAACGCCTCCGCAATGCCTCTCAATCAGT
TCCTTGAGAGGTATACAGCGGAGACTTAGTTTTTGTTCCTCAAAGCTAGAAGGCCACGGG
AATGGAAGTAGAGGAGGAAGAAGGTGATGCGCACCTGAGACAGACGAACTCGAGATAACT
GCTTGGTTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FI65JQ U 163
AF RR2BF35JQ U 1
AF RR2BV61JQ U 4
AF RR2BF35TF C 189
BS 1 703 RR2BF35JQ
BS 704 729 RR2BV61JQ
BS 730 910 RR2BF35TF

RD RR2FI65JQ 164 0 0
AATACATTACCTTCTTTCTCCTTCTGAATTAGCTTTGCAATCCCAAAACTCTAATATCGC
TCTTCAGGTTTTATTTCCATGGAGAATAATAGCAAACTCCCTGTGGTTAGCAAGGACTTC
TAAACAGCAGCCTGTAGCAACTCCCTTTCAGCGCGTTCCTTGAT

QA 1 164 1 164
DS 

RD RR2BF35JQ 703 0 0
CTTAAACCAAAAAGAAGCATCCGTTATTTCAAACATGAAAAGGTTTTGTTTGGTTGTGTT
CCCAAACAAACAAACATTGAAGAAAGTAGAGTAATCAAAAGAACAAATATAGCTCTTTCT
AATACAACTTGAATAAAGTTTAACATTTAACCATTTAACACAAATACATTACCTTCTTTC
TCCTTCTGAAGTAGCTTTGCAATCCCAAAACTCTAATATCGTTCTTCAGGTTTTATTTCC
ATGGAGAATAATAGCAAACTCCCTGTGGTTAGCAAGGACTTCTAAGCAGCAGCCTGTAGC
AACTCCCTTTCAGCGCGTTCCTTGATCCTTCTCTCAAGCTCCGGCCTAAAGTGCCTAATC
AGACCTTGCACGGGCCACGCAGCTGCATCACCCAAGGCACAGATTGTGTGTCCTTCGATC
TGTTTGGTTACCTCGTGAAGCATATCAATCTCTTCCAGCTTTGCATTGCCAACTTTCATC
CTCTCCATGATCATCCAAAGCAAACCTGTCCCTTCTCTGCAAGGAGTACACTGCCCACAG
CTTTCATGCTTGTAGAAGTACGAGAGCCTCGCAATTGCATCCACGACATCGGTTGACTTA
TCCATCACGATCACCGCCGCAGTTCCTAGCCCTGATTGGACAGCTTTGAGCGCATCGAAA
TCCATCAGCACATCCTCGCATATGTTCTTAGGAATCAAAGGGA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2BV61JQ 726 0 0
AAACCAAAAAGAAGCATCCTTTATTTCAAACATGAAAAGGTTTTGTTTGGTTGTGTTCCC
AAACAAACAAACATTGAAGAAAGTAGAGTAATCAAGAGAACAAATATAGCTCTTTCTAAT
ACAACTTGAATAAAGTTTAACATTTACCCATTTAACACAAATACATTACCTTCTTTCTCC
TTCTGAAGTAGCTTTGCAATCCCAAAACTCTAATATCGTTCTTCAGGTTTTATTTCCATG
GAGAATAATAGCAAACTCCCTGTGGTTAGCAAGGACTTCTAAGCAGCAGCCTGTAGCAAC
TCCCTTTCAGCGCGTTCCTTGATCCTTCTCTCAAGCTCCGGCCTAAAGTGCCTAATCAGA
CCTTGCACGGGCCACGCAGCTGCATCACCCAAGGCACAGATTGTGTGTCCTTCGATCTGT
TTGGTTACCTCGTGAAGCATATCAATCTCTTCCAGCTTTGCATTGCCAACTTTCATCCTC
TCCATGATCATCCAAAGCCAACCTGTCCCTTCTCTGCAAGGAGTACACTGCCCACAGCTT
TCATGCTTGTAGAAGTACGAGAGCCTCGCAATTGCATCCACGACATCGGTTGACTTATCC
ATCACGATCACCGCCGCAGTTCCTAGCCCTGATTGGACAGCTTTGAGCGCATCGAAATCC
ATCAGCACATCCTCGCATATGTTCTTAGGAATCAAAGGGACAGATGAACCTCCAGGAATA
ATAGCA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2BF35TF 722 0 0
AAGTAGCTTTGCAATCCCAAAACTCTAATATCGTTCTTCAGGTTTTATTTCCATGGAGAA
TAATAGCAAACTCCCTGTGGTTAGCAAGGACTTCTAAGCAGCAGCCTGTAGCAACTCCCT
TTCAGCGCGTTCCTTGATCCTTCTCTCAAGCTCCGGCCTAAAGTGCCTAATCAGACCTTG
CACGGGCCACGCAGCTGCATCACCCAAGGCACAGATTGTGTGTCCTTCGATCTGTTTGGT
TACCTCGTGAAGCATATCAATCTCTTCCAGCTTTGCATTGCCAACTTTCATCCTCTCCAT
GATCATCCAAAGCAAACCTGTCCCTTCTCTGCAAGGAGTACACTGCCCACAGCTTTCATG
CTTGTAGAAGTACGAGAGCCTCGCAATTGCATCCACGACATCGGTTGACTTATCCATCAC
GATCACCGCCGCAGTTCCTAGCCCTGATTGGACAGCTTTGAGCGCATCGAAATCCATCAG
CACATCCTCGCATATGTTCTTAGGAATCAAAGGGACAGATGAACCTCCAGGAATAATAGC
AAGCAGGTTGTCCCATCCACCCCTAACGCCTCCGCAATGCCTCTCAATCAGTTCCTTGAG
AGGTATACAGCGGAGACTTAGTTTTTGTTCCTCAAAGCTAGAAGGCCACGGGAATGGAAG
TAGAGGAGGAAGAAGGTGATGCGCACCTGAGACAGACGAACTCGAGATAACTGCTTGGTT
CC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 5

CO CL1620Contig1 881 5 18 U
GGATACAATTTCTGAGATATCTCCGCTTTGTCCTCTGCTTCGTGTCATTTTTTTCGCAGA
TCTCGAAGAGAGCCCAGTAAAAAAGGTTCGTTTTTCTCGATGGGTTCTTCGTCGGGGCAA
CCCGAGTTTGATTACTTGTTCAAAGTTTTATTGATCGGAGATTCTGGTGTTGGCAAAAGC
TCTCTTTTGCTTAGTTTCACATCCAATACGTTTGATGATCTTTCTCCC*ACAATCGGGGT
TGATTTCAAGGTCAAATATCTTACCATTGGAGAGAAGAAACTGAAGCTTGCGATTTGGGA
CACAGCTGGGCAAGAGAGATTTAGGACGTTAACAAGTTCGTATTACAGAGGAGCTCAGGG
CATCATAATGGTATATGATGTGACACGACGAGATACATTCACCAATCTATCAGATATATG
GGCTAAGGAAATCGACCTGTACTCGACTAATCAGGATTGCATCAAGATGCTTGTTGGGAA
TAAAGTCGACAAGGAGAGTGAACGAGCTGTATCTAAAAAGGAAGGCATTGACTTTGCTCG
GGAGTATGGATGTTTGTTTTTGGAGTGCAGTGCAAAGACCCGAGTCAATGTTGAGCAATG
TTTTGAAGAGCTTGTTCTTAAGATTTTGGAAACGCCGAGTCTTACTGCTGAAGGTTCGTC
TGGAGGGAAGAAGAACATCTTCAAACAAAACCCAGCACAGACCAGCAATGCTTCATCGAG
TTACTGCTGCGCGTCTTAGACGTGGCTTTACGGTTTATGACACAACATCCACTCTTGTTT
GTCTTCTTGCTCTTGATTGTCTATCTGTTTCCCAGAAAAACTGCAGCATCTTGGATGTAA
ATCTTAACCCTACTTTCAAAGTTGTGTTCACTGGTTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2DC78TF U 12
AF RR2DP77TF U 72
AF RR2DA16TF U 1
AF RR2DC78JQ C 124
AF RR2DP77JQ C 137
BS 1 63 RR2DA16TF
BS 64 64 RR2DC78TF
BS 65 280 RR2DA16TF
BS 281 281 RR2DC78TF
BS 282 509 RR2DA16TF
BS 510 510 RR2DC78JQ
BS 511 652 RR2DA16TF
BS 653 653 RR2DC78JQ
BS 654 674 RR2DA16TF
BS 675 675 RR2DC78JQ
BS 676 689 RR2DA16TF
BS 690 690 RR2DC78JQ
BS 691 707 RR2DA16TF
BS 708 708 RR2DC78JQ
BS 709 721 RR2DA16TF
BS 722 722 RR2DC78JQ
BS 723 734 RR2DA16TF
BS 735 881 RR2DC78JQ

RD RR2DC78TF 321 0 0
GG
GAGATATCTCCGCTTTGTCCTCTGCTTCGTGTCATTTTTTTCGCAGATCTCGAAGAGAGC
CCAGTAAAAAAGGTTCGTTTTTCTCGATGGGTTCTTCGTCGGGGCAACCCGAGTTTGATT
ACTTGTTCAAAGTTTTATTGATCGGAGATTCTGGTGTTGGCAAAAGCTCTCTTTTGCTTA
GTTTCACATCCAATACGTTTGATGATCTTTCTCCC*ACAATCGGGGTTGATTTCAAGGTC
AAATATCTTACCATTGGAGAGAAGAAACTGAAGCTTGCGATTTGGGACACAGCTGGGCAA
GAGAGATTTAGGACGTTAA

QA 3 321 3 321
DS 

RD RR2DP77TF 401 0 0
GGCA
AGTAAAAAAGGTTCGTTTTTCTCGATGGGTTCTTCGTCGGGGCAACCCGAGTTTGATTAC
TTGTTCAAAGTTTTATTGATCGGAGATTCTGGTGTTGGCAAAAGCTCTCCTTTGCTTA*T
CTCACATCCAATACGTTTGATGATCTTTCTCCC*ACAATCGGGGTTGATTTCAAGGTCAA
ATATCTTACCATTGGAGAGAA*AAACTGAAGCTTGCGATTTGGGACACAGCTGGGCAAGA
GGGATTTAGGACGTTAACAAGTTCGTATTACAGAGGAGCTCAGGGCGTCATAATGG*ATA
TGATGTGACACGACGAGATACATTCACCAATCTATCA*ATATATGGGCTAAGGAAATCGA
CCTGTACTCGACTAATCAGGAT*GCATCAAGATGCTT

QA 5 401 5 401
DS 

RD RR2DA16TF 744 0 0
GGATACAATTTCTGAGATATCTCCGCTTTGTCCTCTGCTTCGTGTCATTTTTTTCGCAGA
TCTTGAAGAGAGCCCAGTAAAAAAGGTTCGTTTTTCTCGATGGGTTCTTCGTCGGGGCAA
CCCGAGTTTGATTACTTGTTCAAAGTTTTATTGATCGGAGATTCTGGTGTTGGCAAAAGC
TCTCTTTTGCTTAGTTTCACATCCAATACGTTTGATGATCTTTCTCCC*ACAATCGGGGT
TGATTTCAAGGTCAAATATCTTACCATTGGAGAGAAGAAATTGAAGCTTGCGATTTGGGA
CACAGCTGGGCAAGAGAGATTTAGGACGTTAACAAGTTCGTATTACAGAGGAGCTCAGGG
CATCATAATGGTATATGATGTGACACGACGAGATACATTCACCAATCTATCAGATATATG
GGCTAAGGAAATCGACCTGTACTCGACTAATCAGGATTGCATCAAGATGCTTGTTGGGAA
TAAAGTCGACAAGGAGAGTGAACGAGCTGCATCTAAAAAGGAAGGCATTGACTTTGCTCG
GGAGTATGGATGTTTGTTTTTGGAGTGCAGTGCAAAGACCCGAGTCAATGTTGAGCAATG
TTTTGAAGAGCTTGTTCTTAAGATTTTGGAAACGCCGAGTCTTACTGCTGAAAGTTCGTC
TGGAGGGAAGAAGA*CATCTTCAAACAAA*CCCAGCACAGACCAGCA*TGCTTCATCGAG
T*ACTGCTGCGCGT
CTAGACGTGG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2DC78JQ 758 0 0
GAGTTTGATTACTTGTTCAAAGTTTTATTGATCGGAGATTCTGGTGTTGGCAAAAGCTCT
CTTTTGCTTAGTTTCACATCCAATACGTTTGATGATCTTTCTCCCCACAATCGGGGTTGA
TTTCAAGGTCAAATATCTTACCATTGGAGAGAAGAAACTGAAGCTTGCGATTTGGGACAC
AGCTGGGCAAGAGAGATTTAGGACGTTAACAAGTTCGTATTACAGAGGAGCTCAGGGCAT
CATAATGGTATATGATGTGACACGACGAGATACATTCACCAATCTATCAGATATATGGGC
TAAGGAAATCGACCTGTACTCGACTAATCAGGATTGCATCAAGATGCTTGTTGGGAATAA
AGTCGACAAGGAGAGTGAACGAGCTGTATCTAAAAAGGAAGGCATTGACTTTGCTCGGGA
GTATGGATGTTTGTTTTTGGAGTGCAGTGCAAAGACCCGAGTCAATGTTGAGCAATGTTT
TGAAGAGCTTGTTCTTAAGATTTTGGAAACGCCGAGTCTTACTGCTGAAGGTTCGTCTGG
AGGGAAGAAGAACATCTTCAAACAAAACCCAGCACAGACCAGCAATGCTTCATCGAGTTA
CTGCTGCGCGTCTTAGACGTGGCTTTACGGTTTATGACACAACATCCACTCTTGTTTGTC
TTCTTGCTCTTGATTGTCTATCTGTTTCCCAGAAAAACTGCAGCATCTTGGATGTAAATC
TTAACCCTACTTTCAAAGTTGTGTTCACTGGTTTTCTT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2DP77JQ 744 0 0
TGTTCAAAGTTTTATTGATCGGAGATTCTGGTGTTGGCAAAAGCTCTCCTTTGCTTAGTC
TCACATCCAATACGTTTGATGATCTTTCTCCC*ACAATCGGGGTTGATTTCAAGGTCAAA
TATCTTACCATTGGAGAGAAGAAACTGAAGCTTGCGATTTGGGACACAGCTGGGCAAGAG
GGATTTAGGACGTTAACAAGTTCGTATTACAGAGGAGCTCAGGGCGTCATAATGGTATAT
GATGTGACACGACGAGATACATTCACCAATCTATCAGATATATGGGCTAAGGAAATCGAC
CTGTACTCGACTAATCAGGATTGCATCAAGATGCTTGTTGGGAATAAAGTCGACAAGGAG
AGTGAACGAGCTGTATCTAAAAAGGAAGGCATTGACTTTGCTCGGGAGTATGGATGTTTG
TTTTTGGAGTGCAGTGCAAAGACCCGAGTCAATGTTGAGCAATGTTTTGAAGAGCTTGTT
CTTAAGATTTTGGAAACGCCGAGTCTTACTGCTGAAGGTTCTTCTGGAGGGAAGAAGAAC
ATCTTCAAACAAAACCCAGCACAGACCAGCAATGCTTCATCGAGTTACTGCTGCGCGTTT
TAGACGTGGCTTTACGGTTTATGACACAACATCCACTCTTGTTTGTCTTCTTGCTCTTGA
TTGTCTATCTGTTTCCCAGAAAAACTGCAGCATCTTGGATGTAAATCTTAACCCTACTTT
CAAAGTTGTGTTCACTGGTTTTCT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 2 5

CO CL1621Contig1 378 2 5 U
AAAATATTAACCCCCACTTCATATAGTGTATGTTTCGTTTTACAACAAAACAAAGTCAAA
CCTGACATGGATATTAGTATTTGACACCAAGTCTTTGTTGATTTAATATGGTATTAAGTT
TTAAATATGGGAAAGTGGGCAATGGGGTAAGTGACTTGGAAAAATAAAAGGAACATAAAA
CATTGAAGTTGTCAAACCAAAAAGGGTTTAAGTCGGGGATCAGTACGGGGAGGAAAACCA
AAGCGAGCTCCCAAAGCTCGGCAGTTGCAAGCAGCCCCTTGGGTAGCGAATGGTAGCATT
TTCTCTGGGGGCATGCCGGCCCATAAGGCATAAAAAACTGCTCCTATGAATGCCTCCCCT
GCCCCGGTGGTGTCAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY21JQ U 19
AF RR2FZ58JQ U 1
BS 1 49 RR2FZ58JQ
BS 50 50 RR2GY21JQ
BS 51 76 RR2FZ58JQ
BS 77 77 RR2GY21JQ
BS 78 378 RR2FZ58JQ

RD RR2GY21JQ 319 0 0
TCATATAGTGTATGTTTCGTTTTACAACAAAACAAAGTCAAACCTGACATGGATATTAGT
ATTTGACCCCAAGTCTTTGTTGATTTAATATGGTATTAAGTTTTAAATATGGGAAAGTGG
GCAATGGGGTAAGTGACTTGGAAAAATAAAAGGAACATAAAACATTGAAGTTGTCAAACC
AAAAAGGGTTTAAGTCGGGGATCAGTACGGGGAGGAAAACCAAAGCGAGCTCCCAAAGCT
CGGCAGTTGCAAGCAGCCCCTTGGGTAGCGAATGGTAGCATTTTCTCTGGGGGCATGCCG
GCCCATAAGGCATAAA
AAA

QA 1 316 1 316
DS 

RD RR2FZ58JQ 378 0 0
AAAATATTAACCCCCACTTCATATAGTGTATGTTTCGTTTTACAACAAAGCAAAGTCAAA
CCTGACATGGATATTATTATTTGACACCAAGTCTTTGTTGATTTAATATGGTATTAAGTT
TTAAATATGGGAAAGTGGGCAATGGGGTAAGTGACTTGGAAAAATAAAAGGAACATAAAA
CATTGAAGTTGTCAAACCAAAAAGGGTTTAAGTCGGGGATCAGTACGGGGAGGAAAACCA
AAGCGAGCTCCCAAAGCTCGGCAGTTGCAAGCAGCCCCTTGGGTAGCGAATGGTAGCATT
TTCTCTGGGGGCATGCCGGCCCATAAGGCATAAAAAACTGCTCCTATGAATGCCTCCCCT
GCCCCGGTGGTGTCAACA

QA 1 378 1 378
DS 



CO CL1621Contig2 1358 3 7 U
GGACCTCACTCAATCTCTCTCTCACAGATTAGATACAAAGAAAAAAAAATGATGATGTGT
TTCACTCATCTCACACCTCTTCCTCTCTTCTCCGGCGTCTATCTCCCGTCCTCCCGTCGT
CAGTTCACGAGTTTCAGGACGAGAATGTCTTCCTCGTCGTCAATCGATTCTGCTCCTCCT
CCTCCGACGGATGACGGCATTGTCCTTGGTTGCGGCGGAACCACTGTGGATTTCCTGGCG
ACGGTGGATTCTTATCCTAAACCTGATGACAAGATCCGAAGCACTAGCCTCAAGGTACAA
GGAGGGGGGAATGCTGGAAACGCTTTAACTTGTGCAGCTCGTCTGGGATTGACTTCTAGG
CTTATTAGTAAGGTAGCAAATGACTCTCAAGGGAAGGGTATATTGGAGGAGCTTGAATCC
GATGGTGTCGATACCTCTTTTCTTGTGGTCTCTAAAGAGGGCAATACTCCATTTACCTAC
GTCATTGTTGATAAACAAACGAAAACGCGTACTTATATTCATACACCTGGATATCCACCC
ATGGTACCAACTGATCTTCCTCACTCGACCATGTTATCTGCTCTAGACAGAGCAAGCATT
GCATACTTTGATGTAAGATTACACGAAACCGCATTGGTGATTGCAAAAGAGGCAAGTCGG
AAGAAGATACCTATTTTAGTTGATGCAGAGAAGAAAAGAGATGGATTAGACGATCTCTTG
CAACTCGCCGATTACGTTGTCTGCACAGCAAAATTCCCTCAGGCATGGACAGAAGCGTCT
TCAATTCCATGTGCGCTTGTGTCCATGATGTTGAGATTGCCAAAACTGAAGTTTGTGATC
GTAACCTTAGGTGAAGAAGGATGCTTAATGATCCAGAGAGATTCAACAGAAACATCAGAA
TCCAAAGAGACAGACATTGAGAGTTTGGTGGAGTCTCTGAAGCAAAGATCAGACTCGACC
GCAACATTTCCAACATGCGTTTCATCGGAGACAGCCAAGCTAAAGGCCAACGGGATAGGA
ACACTGAGCGGAAGACTGTTTCTCGGAACAGCAGAGAAAATTCCTCCAGAAGAGCTTGTT
GACACCACCGGTGCAGGCGACGCAGTCATAGGAGCAGTTCTTTATGCCTTATGCGCCGGC
ATGCCCCCAGAGAAAATGCTACCATTCGCTACCCAAGTGGCTGCTTGCAACTGCCGAGCT
TTGGGAGCTCGCTCTGGTCTTCCTCACCGTACTGATCCCCGACTTAAACCCTTTCTGGTT
TGACAACTTCAATGTTCTATGTTCCTTTTATCTTTCCAAGTCACTTACCCCATTGCCCAC
TTTCCCATATTTAAAACTTAATACCATATTAAATCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ58TF U 1
AF RR2AO54TF U 36
AF RR2AO54JQ C 565
BS 1 645 RR2FZ58TF
BS 646 850 RR2AO54TF
BS 851 851 RR2AO54JQ
BS 852 859 RR2AO54TF
BS 860 860 RR2AO54JQ
BS 861 902 RR2AO54TF
BS 903 1358 RR2AO54JQ

RD RR2FZ58TF 645 0 0
GGACCTCACTCAATCTCTCTCTCACAGATTAGATACAAAGAAAAAAAAATGATGATGTGT
TTCACTCATCTCACACCTCTTCCTCTCTTCTCCGGCGTCTATCTCCCGTCCTCCCGTCGT
CAGTTCACGAGTTTCAGGACGAGAATGTCTTCCTCGTCGTCAATCGATTCTGCTCCTCCT
CCTCCGACGGATGACGGCATTGTCCTTGGTTGCGGCGGAACCACTGTGGATTTCCTGGCG
ACGGTGGATTCTTATCCTAAACCTGATGACAAGATCCGAAGCACTAGCCTCAAGGTACAA
GGAGGGGGGAATGCTGGAAACGCTTTAACTTGTGCAGCTCGTCTGGGATTGACTTCTAGG
CTTATTAGTAAGGTAGCAAATGACTCTCAAGGGAAGGGTATATTGGAGGAGCTTGAATCC
GATGGTGTCGATACCTCTTTTCTTGTGGTCTCTAAAGAGGGCAATACTCCATTTACCTAC
GTCATTGTTGATAAACAAACGAAAACGCGTACTTATATTCATACACCTGGATATCCACCC
ATGGTACCAACTGATCTTCCTCACTCGACCATGTTATCTGCTCTAGACAGAGCAAGCATT
GCATACTTTGATGTAAGATTACACGAAACCGCATTGGTGATTGCA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2AO54TF 867 0 0
CAAAGAAAAAAAAATGATGATGTGTTTCACTCATCTCACACCTCTTCCTCTCTTCTCCGG
CGTCTATCTCCCGTCCTCCCGTCGTCAGTTCACGAGTTTCAGGACGAGAATGTCTTCTTC
GTCGTCAATCGATTCTGCTCCTCCTCCTCCGACGGATGACGGCATTGTCCTTGGTTGCGG
CGGAACCACTGTGGATTTCCTGGCGACGGTGGATTCTTATCCTAAACCTGATGACAAGAT
CCGAAGCACTAGCCTCAAGGTACAAGGAGGGGGGAATGCTGGAAACGCTTTAACTTGTGC
AGCTCGTCTGGGATTGACTTCTAGGCTTATTAGTAAGGTAGCAAATGACTCTCAAGGGAA
GGGTATATTGGAGGAGCTTGAATCCGATGGTGTCGATACCTCTTTTCTTGTGGTCTCTAA
AGAGGGCAATACTCCATTTACCTACGTCATTGTTGATAAACAAACGAAAACGCGTACTTG
TATTCATACACCTGGATATCCACCCATGGTACCAACTGATCTTCCTCACTCGACCATGTT
ATCTGCTCTAGACAGAGCAAGCATTGCATACTTTGATGTAAGATTACACGAAACCGCATT
GGTGATTGCAAAAGAGGCAAGTCGGAAGAAGATACCTATTTTAGTTGATGCAGAGAAGAA
AAGAGATGGATTAGACGATCTCTTGCAACTCGCCGATTACGTTGTCTGCACAGCAAAATT
CCCTCAGGCATGGACAGAAGCGTCTTCAATTCCATGTGCGCTTGTGTCCATGATGTTGAG
ATTGCCAAAACTGAAGTTTGTGATCGTAACCTTAG*TGAAGAAG*ATGCTTAATGATCCA
GAGAGATTCAACAGAAACATCAGAATC

QA 1 867 1 867
DS 

RD RR2AO54JQ 794 0 0
TCGACCATGTTATCTGCTCTAGACAGAGCAAGCATTGCATACTTTGATGTAAGATTACAC
GAAACCGCATTGGTGATTGCAAAAGAGGCAAGTCGGAAGAAGATACCTATTTTAGTTGAT
GCAGAGAAGAAAAGAGATGGATTAGACGATCTCTTGCAACTCGCCGATTACGTTGTCTGC
ACAGCAAAATTCCCTCAGGCATGGACAGAAGCGTCTTCAATTCCATGTGCGCTTGTGTCC
ATGATGTTGAGATTGCCAAAACTGAAGTTTGTGATCGTAACCTTAGGTGAAGAAGGATGC
TTAATGATCCAGAGAGATTCAACAGAAACATCAGAATCCAAAGAGACAGACATTGAGAGT
TTGGTGGAGTCTCTGAAGCAAAGATCAGACTCGACCGCAACATTTCCAACATGCGTTTCA
TCGGAGACAGCCAAGCTAAAGGCCAACGGGATAGGAACACTGAGCGGAAGACTGTTTCTC
GGAACAGCAGAGAAAATTCCTCCAGAAGAGCTTGTTGACACCACCGGTGCAGGCGACGCA
GTCATAGGAGCAGTTCTTTATGCCTTATGCGCCGGCATGCCCCCAGAGAAAATGCTACCA
TTCGCTACCCAAGTGGCTGCTTGCAACTGCCGAGCTTTGGGAGCTCGCTCTGGTCTTCCT
CACCGTACTGATCCCCGACTTAAACCCTTTCTGGTTTGACAACTTCAATGTTCTATGTTC
CTTTTATCTTTCCAAGTCACTTACCCCATTGCCCACTTTCCCATATTTAAAACTTAATAC
CATATTAAATCAGC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 2 5

CO CL1622Contig1 613 3 3 U
GGACTGCGTCCTGTCGCTTTGCCTAGCTTTTCGTTCAATTTCTCTTTTCCTTCATTTTCT
TCTCTTTCTTGTTCTTCCCTCTCCAAATCATTACCCAAAACTGAGGGAGGGAAGAACGTA
CGAATCTTTTTAAAACTGAATATATAATTGGTTTTATATCAAACTAAGCAGTTAATAAAG
AGAAGAGTGAAAGGGAGAAAATCTCAGCACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTCG
GAGCTCTTACAATCGTATGGATAGTTTTCTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAGT
CCGCAGCTCCAGCTCCCACTCCCGCTCCGTCAAGCGATGGAACAATAATAGACCAAGGCA
TAGCATATGTCCTTATGTTGGTGGCTTTGGTCCTCACTTATTACATCCATTAATCCTTTT
GTCATTTTAATTTTGGTCTCTGTTTAGTTTAATTATATTTTCCCCTTTTGATTATAATTA
AACAGAGACCAGAAAAGTTTATGTCGTAGAGAAATTGATGAGATTTTCTAATATCTGGAG
TGATACAATTTTGAAGTTCATTTGTATAACGTCGATGTGCGTCAACTGTTGGAAATATAT
CTTATCACTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR40JQ C 1
AF RR2CR40TF U 8
AF RR2CC65TF U 1
BS 1 345 RR2CC65TF
BS 346 346 RR2CR40TF
BS 347 613 RR2CC65TF

RD RR2CR40JQ 592 0 0
GGACTGC
GTCCTGTCGCTTTGCCTAGCTTTTCGTTCAATTTCTCTTTTCCTTCATTTTCTTCTCTTT
CTTGTTCTTCCCTCTCCAAATCATTACCCAAAACTGAGGGAGGGAAGAACGTACGAATCT
TTTTAAAACTGAATATATAATTGGTTTTATATCAAACTAAGCAGTTAATAAAGAGAAGAG
TGAAAGGGAGAAAATCTCAGCACTGAAAATGTCGGCGTTTAAACTTTTTTTCGGAGTTCT
TACAATCGTATGGATAGTTTTCTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAGTCCGCAGC
TCCAGCTCCCACTCCCGCTCCGTCAAGCGATGGAACAATAATAGACCAAGGCATAGCATA
TGTCCTTATGTTGGTGGCTTTGGTCCTCACTTATTACATCCATTAATCCTTTTGTCATTT
TAATTTTGGTCTCTGTTTAGTTTAATTATATTTTCCCCTTTTGATTATAATTAAACAGAG
ACCAGAAAAGTTTATGTCGTAGAGAAATTGATGAGATTTTCTAATATCTGGAGTGATACA
ATTTTGAAGTTCATTTGTATAACGTCGATGTGCGTCAACTGTTGG

QA 8 592 8 592
DS 

RD RR2CR40TF 585 0 0
GTCCTGTCGCTTTGCCTAGCTTTTCGTTCAATTTCTCTTTTCCTTCATTTTCTTCTCTTT
CTTGTTCTTCCCTCTCCAAATCATTACCCAAAACTGAGGGAGGGAAGAACGTACGAATCT
TTTTAAAACTGAATATATAATTGGTTTTATATCAAACTAAGCAGTTAATAAAGAGAAGAG
TGAAAGGGAGAAAATCTCAGCACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTCGGAGCTCT
TACAATCGTATGGATAGTTTTCTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAGTCCGCAGC
TCCAGCTCCCACTCCCGCTCCGTCAAGCGATGGAACAATAATAGACCAAGGCATAGCATA
TGTCCTTATGTTGGTGGCTTTGGTCCTCACTTATTACATCCATTAATCCTTTTGTCATTT
TAATTTTGGTCTCTGTTTAGTTTAATTATATTTTCCCCTTTTGATTATAATTAAACAGAG
ACCAGAAAAGTTTATGTCGTAGAGAAATTGATGAGATTTTCTAATATCTGGAGTGATACA
ATTTTGAAGTTCATTTGTATAACGTCGATGTGCGTCAACTGTTGG

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2CC65TF 613 0 0
GGACTGCGTCCTGTCGCTTTGCCTAGCTTTTCGTTCAATTTCTCTTTTCCTTCATTTTCT
TCTCTTTCTTGTTCTTCCCTCTCCAAATCATTACCCAAAACTGAGGGAGGGAAGAACGTA
CGAATCTTTTTAAAACTGAATATATAATTGGTTTTATATCAAACTAAGCAGTTAATAAAG
AGAAGAGTGAAAGGGAGAAAATCTCAGCACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTCG
GAGCTCTTACAATCGTATGGATAGTTTTCTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAGT
CCGCAGCTCCAGCTCCCACTCCCGCTCCGTCAAGCGATGGAACAACAATAGACCAAGGCA
TAGCATATGTCCTTATGTTGGTGGCTTTGGTCCTCACTTATTACATCCATTAATCCTTTT
GTCATTTTAATTTTGGTCTCTGTTTAGTTTAATTATATTTTCCCCTTTTGATTATAATTA
AACAGAGACCAGAAAAGTTTATGTCGTAGAGAAATTGATGAGATTTTCTAATATCTGGAG
TGATACAATTTTGAAGTTCATTTGTATAACGTCGATGTGCGTCAACTGTTGGAAATATAT
CTTATCACTTTAC

QA 1 613 1 613
DS 



CO CL1622Contig2 499 2 2 U
GGGACGAATCTTTTCAAAACTGAATATATAATTGGTTATATATCAAACTAAGCAGTTAAA
GAGAAGAGTGGAAGGGAAAAAATCTCAGCACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTC
GGAGCTCTTACAATCGTATGGATAGTTTTTTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAG
TCCGCAGCTCCAGCTCCCGCTCCGTCAAGCGATGGAACAACAATAGACCAAGGCATAGCA
TATGTCCTTATGTTGGTGGCTTTGGTCCTCACTTATTACATCCATTAATCCTTTTGTCAT
TTTAATTTTGGTCTCTGTTTAGTTTAATTATATTTTCCCCTTTTGATTATAATTAAACAG
AGACCAGAAAAGTTTATGTCGTAGAGAAATTGATGAGATTTTCTAATATCTGGAGTGATA
CAATTTTGAAGTTCATTTGTATAACGTCGATGTGCGTCAACTGTTGGAAATATATCTTAT
CACTTTACATCTTTCTCCG


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GB52JQ C 1
AF RR2GB52TF U 1
BS 1 3 RR2GB52JQ
BS 4 499 RR2GB52TF

RD RR2GB52JQ 499 0 0
GGGACGAATCTTTTCAAAACTGAATATATAATTGGTTATATATCAAACTAAGCAGTTAAA
GAGAAGAGTGGAAGGGAAAAAATCTCAGCACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTC
GGAGCTCTTACAATCGTATGGATAGTTTTTTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAG
TCCGCAGCTCCAGCTCCCGCTCCGTCAAGCGATGGAACAACAATAGACCAAGGCATAGCA
TATGTCCTTATGTTGGTGGCTTTGGTCCTCACTTATTACATCCATTAATCCTTTTGTCAT
TTTAATTTTGGTCTCTGTTTAGTTTAATTATATTTTCCCCTTTTGATTATAATTAAACAG
AGACCAGAAAAGTTTATGTCGTAGAGAAATTGATGAGATTTTCTAATATCTGGAGTGATA
CAATTTTGAAGTTCATTTGTATAACGTCGATGTGCGTCAACTGTTGGAAATATATCTTAT
CACTTTACATCTTTCTCCG

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR2GB52TF 499 0 0
GGG
ACGAATCTTTTCAAAACTGAATATATAATTGGTTATATATCAAACTAAGCAGTTAAAGAG
AAGAGTGGAAGGGAAAAAATCTCAGCACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTCGGA
GCTCTTACAATCGTATGGATAGTTTTTTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAGTCC
GCAGCTCCAGCTCCCGCTCCGTCAAGCGATGGAACAACAATAGACCAAGGCATAGCATAT
GTCCTTATGTTGGTGGCTTTGGTCCTCACTTATTACATCCATTAATCCTTTTGTCATTTT
AATTTTGGTCTCTGTTTAGTTTAATTATATTTTCCCCTTTTGATTATAATTAAACAGAGA
CCAGAAAAGTTTATGTCGTAGAGAAATTGATGAGATTTTCTAATATCTGGAGTGATACAA
TTTTGAAGTTCATTTGTATAACGTCGATGTGCGTCAACTGTTGGAAATATATCTTATCAC
TTTACATCTTTCTCCG

QA 4 499 4 499
DS 



AS 1 3

CO CL1623Contig1 801 3 32 U
CCTGCAAATCAAAATGTTCGTGTGTCGTATAAACCAAGTAACACTAAGGTCATTTTTGGT
TGTATCCATGATGCAGCACAACGTGCAATAATAACACAGTTAATCAAGTCGAAA*CAATC
TTAAAATATTGTCTGAAAACAGGCAAACACAAA**********TTCTATAACAAAAGTCG
AGAAGCAAGTTAAAAAGACAATGACAATGGTCCTTAAACCTTGAATCCACGGCTCTTCCT
CTTTCCTCTGGCCTTCTCGAACTTCCTTCCCTTGGACCGAACATATGGCTTGGAGTGACT
GTGTGGTACACCAGGAGCAGGACCAAAATGCTTCACAGCCTCAAGTGAGTTCTTAGGTCC
TCTAAGAAGAACAGTGTTCTGCCCCAAAGGAGCTCTGAGAGCAAGCTGGTCAAAGGTTAA
GCATTCACCACCAGCTTTCTCAATGCGAGCTCTGGCTCTCTCAGTGAACCTCAAGGCAGT
AACCTTGATAGCTGGGATCTCGTGTACCCTCAAATCATCGGTTATGGTTCCAACCAAAAC
AGCAATCTTGTCTTCCTTGCCGGTCATGAATTCGACGAGCCTGGAAAGAGAGAGAGGAGC
TTTGTTGATTTTGCTCATGAAAAGCCTCTTCAAGATCACTGCATTGAACTTGCTCTGTGT
TCTCCTTACCAGAAACCTGTAAAGCTTGACGGTAAGCTTGAGGTAGACATCGTCGGACTT
GGGAGCTGTCCTTTTGGTCTTCTTGCTCTTCCCTCCTGCGATCAAATCAATTCCCATCGT
GCCGCCGCGGTGCTTCTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G247JQ U 1
AF RR2AR81JQ U 65
AF RR2AR81TF C 65
BS 1 96 RR2G247JQ
BS 97 97 RR2AR81JQ
BS 98 114 RR2G247JQ
BS 115 115 RR2AR81JQ
BS 116 129 RR2G247JQ
BS 130 130 RR2AR81JQ
BS 131 136 RR2G247JQ
BS 137 137 RR2AR81JQ
BS 138 153 RR2G247JQ
BS 154 163 RR2AR81JQ
BS 164 199 RR2G247JQ
BS 200 200 RR2AR81JQ
BS 201 261 RR2G247JQ
BS 262 262 RR2AR81JQ
BS 263 285 RR2G247JQ
BS 286 286 RR2AR81JQ
BS 287 306 RR2G247JQ
BS 307 307 RR2AR81JQ
BS 308 315 RR2G247JQ
BS 316 316 RR2AR81JQ
BS 317 318 RR2G247JQ
BS 319 319 RR2AR81JQ
BS 320 327 RR2G247JQ
BS 328 328 RR2AR81JQ
BS 329 343 RR2G247JQ
BS 344 344 RR2AR81JQ
BS 345 467 RR2G247JQ
BS 468 468 RR2AR81JQ
BS 469 545 RR2G247JQ
BS 546 546 RR2AR81JQ
BS 547 576 RR2G247JQ
BS 577 801 RR2AR81JQ

RD RR2G247JQ 576 0 0
CCTGCAAATCAAAATGTTCGTGTGTCGTATAAACCAAGTAACACTAAGGTCATTTTTGGT
TGTATCCATGATGCAGCACAACGTGCAATAATAACAAAGTTAATCAAGTCGAAAACAATC
TTAAAATATAGTCTGAGAACAGGCAAACACAAAAAAAACACGATTCTATAACAAAAGTCG
AGAAGCAAGTTAAAAAGACGATGACAATGGTCCTTAAACCTTGAATCCACGGCTCTTCCT
CTTTCCTCTGGCCTTCTCGAATTTCCTTCCCTTGGACCGAACATACGGCTTGGAGTGACT
GTGTGGCACACCAGGGGCTGGACCAAAGTGCTTCACAGCCTCACGTGAGTTCTTAGGTCC
TCTAAGAAGAACAGTGTTCTGCCCCAAAGGAGCTCTGAGAGCAAGCTGGTCAAAGGTTAA
GCATTCACCACCAGCTTTCTCAATGCGAGCTCTGGCTCTCTCAGTGAGCCTCAAGGCAGT
AACCTTGATAGCTGGGATCTCGTGTACCCTCAAATCATCGGTTATGGTTCCAACCAAAAC
AGCAACCTTGTCTTCCTTGCCGGTCATGAATTCGAC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2AR81JQ 737 0 0
GGTTGTG
TGCAGCACAACGTGCAATAATAACACAGTTAATCAAGTCGAAA*CAATCTTAAAATATTG
TCTGAAAACAGGCAAACACAAA**********TTCTATAACAAAAGTCGAGAAGCAAGTT
AAAAAGACAATGACAATGGTCCTTAAACCTTGAATCCACGGCTCTTCCTCTTTCCTCTGG
CCTTCTCGAACTTCCTTCCCTTGGACCGAACATATGGCTTGGAGTGACTGTGTGGTACAC
CAGGAGCAGGACCAAAATGCTTCACAGCCTCAAGTGAGTTCTTAGGTCCTCTAAGAAGAA
CAGTGTTCTGCCCCAAAGGAGCTCTGAGAGCAAGCTGGTCAAAGGTTAAGCATTCACCAC
CAGCTTTCTCAATGCGAGCTCTGGCTCTCTCAGTGAACCTCAAGGCAGTAACCTTGATAG
CTGGGATCTCGTGTACCCTCAAATCATCGGTTATGGTTCCAACCAAAACAGCAATCTTGT
CTTCCTTGCCGGTCATGAATTCGACGAGCCTGGAAAGAGAGAGAGGAGCTTTGTTGATTT
TGCTCATGAAAAGCCTCTTCAAGATCACTGCATTGAACTTGCTCTGTGTTCTCCTTACCA
GAAACCTGTAAAGCTTGACGGTAAGCTTGAGGTAGACATCGTCGGACTTGGGAGCTGTCC
TTTTGGTCTTCTTGCTCTTCCCTCCTGCGATCAAATCAATTCCCATCGTGCCGCCGCGGT
GCTTCTGCCC

QA 8 737 8 737
DS 

RD RR2AR81TF 737 0 0
GGTTGTG
TGCAGCACAACGTGCAATAATAACACAGTTAATCAAGTCGAAA*CAATCTTAAAATATTG
TCTGAAAACAGGCAAACACAAA**********TTCTATAACAAAAGTCGAGAAGCAAGTT
AAAAAGACAATGACAATGGTCCTTAAACCTTGAATCCACGGCTCTTCCTCTTTCCTCTGG
CCTTCTCGAACTTCCTTCCCTTGGACCGAACATATGGCTTGGAGTGACTGTGTGGTACAC
CAGGAGCAGGACCAAAATGCTTCACAGCCTCAAGTGAGTTCTTAGGTCCTCTAAGAAGAA
CAGTGTTCTGCCCCAAAGGAGCTCTGAGAGCAAGCTGGTCAAAGGTTAAGCATTCACCAC
CAGCTTTCTCAATGCGAGCTCTGGCTCTCTCAGTGAACCTCAAGGCAGTAACCTTGATAG
CTGGGATCTCGTGTACCCTCAAATCATCGGTTATGGTTCCAACCAAAACAGCAATCTTGT
CTTCCTTGCCGGTCATGAATTCGACGAGCCTGGAAAGAGAGAGAGGAGCTTTGTTGATTT
TGCTCATGAAAAGCCTCTTCAAGATCACTGCATTGAACTTGCTCTGTGTTCTCCTTACCA
GAAACCTGTAAAGCTTGACGGTAAGCTTGAGGTAGACATCGTCGGACTTGGGAGCTGTCC
TTTTGGTCTTCTTGCTCTTCCCTCCTGCGATCAAATCAATTCCCATCGTGCCG
CCGCGGTGCTTCTGCCC

QA 8 720 8 720
DS 



AS 1 5

CO CL1624Contig1 813 5 20 U
GGGCTGCTCGGGAACAGAATAAGCTTCGCCAATGGCTTCTTCCGCTTTGTCACTCTCGTG
GAGCTCCTCGCTTTGTTCGCCTCACACCTTCAATGTCGTCGGAAATGAAACCCTAAAAGT
ATCCCAGCGAAGGTCTACTTTGGAGGTTGTTGCCCAGAAGAAAGCCAAGAAACTCCGCAA
GGTAATCTTGAAAGAGGATGTGTCGGACTTGGGCAAGCAAGGGCAATTACTTGACGTGAA
AGCTGGATTCTTCAGAAACTTCCTCTTGCCCACTGGAAAGGCTCAGCTCATGACTCCGCT
TCTGCTCAAGGAAATGAAAATGGAAAACGAAAGGATAGAGGCAGAAAAGCAAAGGGTGAA
AGAAGAGGCGCTACAATTGGCTACAGTATTCGAAACCGTTGGGGCTTTCAAGGTTAAACG
CAAGGGTGGTAAAGGCAAACAAATATTTGGATCTGTCACAGCACAAGACCTTGTTGACAT
CATCAAGGCGCAGCTCCAAAGGGATATAGACAAGCGCCTTGTCTCTCTTCCGGAGATCCG
TGAAACCGGAGAATACATAGCCGAACTCAAACTTCACCCTGATGTCACTGCTCGTGTTAG
GCTCAACGTTTTCGCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTACTGCTGCATCCCAAGGA
ACATAGAGAAAGGGCGAAGAGAGTGGCCAGGATCCAAGTTTGTGAAGTTTTTTTTTGATT
ATCTTTTGCTGCATTCGTTTTTTTGCTATTTTAAAAAGAATATTTTGGAATCTTGAAAAT
GTTATATTTTCATCAAGTTATCAAGTTATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS14TF U 1
AF RR2D754TF U 10
AF RR2D754JQ C 614
AF RR2AO29JQ C 5
AF RR2AO29TF U 5
BS 1 29 RR2AS14TF
BS 30 30 RR2AO29TF
BS 31 79 RR2AS14TF
BS 80 80 RR2AO29TF
BS 81 127 RR2AS14TF
BS 128 270 RR2D754TF
BS 271 271 RR2AO29TF
BS 272 297 RR2D754TF
BS 298 298 RR2AO29TF
BS 299 318 RR2D754TF
BS 319 319 RR2AO29TF
BS 320 378 RR2D754TF
BS 379 379 RR2AO29TF
BS 380 471 RR2D754TF
BS 472 472 RR2AO29TF
BS 473 658 RR2D754TF
BS 659 659 RR2AO29TF
BS 660 668 RR2D754TF
BS 669 800 RR2AO29TF
BS 801 813 RR2AO29JQ

RD RR2AS14TF 127 0 0
GGGCTGCTCGGGAACAGAATAAGCTTCGCTAATGGCTTCTTCCGCTTTGTCACTCTCGTG
GAGCTCCTCGCTTTGTTCGTCTCACACCTTCAATGTCGTCGGAAATGAAACCCTAAAAGT
ATCCCAG

QA 1 127 1 127
DS 

RD RR2D754TF 659 0 0
GGGAACAGAATAAGCTTCGCTAATGGCTTCTTCCGCTTTGTCACTCTCGTGGAGCTCCTC
GCTTTGTTCGTCTCACACCTTCAATGTCGTCGGAAATGAAACCCTAAAAGTATCCCAGCG
AAGGTCTACTTTGGAGGTTGTTGCCCAGAAGAAAGCCAAGAAACTCCGCAAGGTAATCTT
GAAAGAGGATGTGTCGGACTTGGGCAAGCAAGGGCAATTACTTGACGTGAAAGCTGGATT
CTTCAGAAACTTCCTCTTGCCAACTGGAAAGGCTCAGCTCATGACTCCACTTCTGCTCAA
GGAAATGAAGATGGAAAACGAAAGGATAGAGGCAGAAAAGCAAAGGGTGAAAGAAGAGGC
GCTACAATTAGCTACAGTATTCGAAACCGTTGGGGCTTTCAAGGTTAAACGCAAGGGTGG
TAAAGGCAAACAAATATTTGGATCTGTCACAGCACAAGACCTCGTTGACATCATCAAGGC
GCAGCTCCAAAGGGATATAGACAAGCGCCTTGTCTCTCTTCCGGAGATCCGTGAAACCGG
AGAATACATAGCCGAACTCAAACTTCACCCTGATGTCACTGCTCGTGTTAGGCTCAACGT
TTTCGCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTACTGCTGCATCCCAAG*AACATAGAG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2D754JQ 143 0 0
GCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTACTGCTGCATCCCAAGGAACATAGAGAAAGG
GAGAAGAGAGTTGCCAGGATCCAAGTTTGTGAAGTTTTTTCTTGATTATCTTTTGCTGCA
TTCGTCTTTTTGCTATTTAAAAA

QA 1 143 1 143
DS 

RD RR2AO29JQ 809 0 0
GGCTC
GGGAACAGAATAAGCTTCGCCAATGGCTTCTTCCGCTTTGTCACTCTCGTGGAGCTCCTC
GCTTTGTTCGCCTCACACCTTCAATGTCGTCGGAAATGAAACCCTAAAAGTATCCCAGCG
AAGGTCTACTTTGGAGGTTGTTGCCCAGAAGAAAGCCAAGAAACTCCGCAAGGTAATCTT
GAAAGAGGATGTGTCGGACTTGGGCAAGCAAGGGCAATTACTTGACGTGAAAGCTGGATT
CTTCAGAAACTTCCTCTTGCCCACTGGAAAGGCTCAGCTCATGACTCCGCTTCTGCTCAA
GGAAATGAAAATGGAAAACGAAAGGATAGAGGCAGAAAAGCAAAGGGTGAAAGAAGAGGC
GCTACAATTGGCTACAGTATTCGAAACCGTTGGGGCTTTCAAGGTTAAACGCAAGGGTGG
TAAAGGCAAACAAATATTTGGATCTGTCACAGCACAAGACCTTGTTGACATCATCAAGGC
GCAGCTCCAAAGGGATATAGACAAGCGCCTTGTCTCTCTTCCGGAGATCCGTGAAACCGG
AGAATACATAGCCGAACTCAAACTTCACCCTGATGTCACTGCTCGTGTTAGGCTCAACGT
TTTCGCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTACTGCTGCATCCCAAGGAACATAGAGA
AAGGGCGAAGAGAGTGGCCAGGATCCAAGTTTGTGAAGTTTTTTTTTGATTATCTTTTGC
TGCATTCGTTTTTTTGCTATTTTAAAAAGAATATTTTGGAATCTTGAAAATGTTATATTT
TCATCAAGTTATCAAGTTATTATT

QA 6 809 6 809
DS 

RD RR2AO29TF 796 0 0
GGCTC
GGGAACAGAATAAGCTTCGCCAATGGCTTCTTCCGCTTTGTCACTCTCGTGGAGCTCCTC
GCTTTGTTCGCCTCACACCTTCAATGTCGTCGGAAATGAAACCCTAAAAGTATCCCAGCG
AAGGTCTACTTTGGAGGTTGTTGCCCAGAAGAAAGCCAAGAAACTCCGCAAGGTAATCTT
GAAAGAGGATGTGTCGGACTTGGGCAAGCAAGGGCAATTACTTGACGTGAAAGCTGGATT
CTTCAGAAACTTCCTCTTGCCCACTGGAAAGGCTCAGCTCATGACTCCGCTTCTGCTCAA
GGAAATGAAAATGGAAAACGAAAGGATAGAGGCAGAAAAGCAAAGGGTGAAAGAAGAGGC
GCTACAATTGGCTACAGTATTCGAAACCGTTGGGGCTTTCAAGGTTAAACGCAAGGGTGG
TAAAGGCAAACAAATATTTGGATCTGTCACAGCACAAGACCTTGTTGACATCATCAAGGC
GCAGCTCCAAAGGGATATAGACAAGCGCCTTGTCTCTCTTCCGGAGATCCGTGAAACCGG
AGAATACATAGCCGAACTCAAACTTCACCCTGATGTCACTGCTCGTGTTAGGCTCAACGT
TTTCGCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTACTGCTGCATCCCAAGGAACATAGAGA
AAGGGCGAAGAGAGTGGCCAGGATCCAAGTTTGTGAAGTTTTTTTTTGATTATCTTTTGC
TGCATTCGTTTTTTTGCTATTTTAAAAAGAATATTTTGGAATCTTGAAAATGTTATATTT
TCATCAAGTTA

QA 6 796 6 796
DS 



AS 1 5

CO CL1625Contig1 936 5 9 U
GGAAGTTAAAATTTGTTGTTGTGCAAAATCAGAAAGAAAGAAAGAAAGACGATCACGAAA
GATGGCGACGGAGAGTTCTTCTGCTAAGAGATGGCTTCCACTTGAAGCTAACCCAGAGGT
CATGAATCAGTTTCTTTGGGGGCTTGGGCTTGAACCAGATGCGGCGGAGTGCAATGACGT
GTTTGGATTAGACGACGAACTTCTTGAGATGGTTCCAAAGCCTGTTCTTGCTGTTCTCTT
CCTTTACCCTATCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGGATCGAGCAGGACAAGGAAATCAA
GGAGAAGGTGCATAGTGATAAGGTTTACTTCATGAAACAAACTGTGGGTAATGCTTGCGG
AACCATTGGTCTTCTCCATGCTATTGGCAACATTACCTCTGAAATCAATCTTTCTGAGGG
ATCCTTCTTGGATAAATTCTTCAAATCCACAGCCAATATGACGCCCATGGAGCGTGCAAG
GTTTCTTGAGAATGACAGTCAAATAGAAGATGCGCATTCTGTGGCGGTTACCGCTGGTGA
AACACCGGCTACAGACGACGCAGACACACATTTCATCTGTTTAGCTTGTGTAGATAGTGA
GCTCTATGAACTCGATGGAAGGAAAGCTGGACCAATTTCACATGGTGCTTCCTCGCCAGC
TACCCTCTTGAAGGATGCGACGAAGGTGATGAAGAAGTTTATTGATAAGAATCCGGACAC
GCTCAACTTCAATGTAATGGCCATCTCTAAGAGAACCTGAGATTTTTCTTCAAGAAGCAG
AGATCAGTAGTCTTGTTTATGCATTTATTACTTAACTATCCACGCAGATTTTATATCTTT
GTGGATTCTGATTTACTGTATTCTGAATCTTTTTCTTCTTTCTTTTTGTTTCTGAAAATC
TTATAAAAGAGTTTATGATCATGGTTTTAAGAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV37TF U 6
AF RR2DV07TF U 1
AF RR2HA18TF U 12
AF RR2HA18JQ C 226
AF RR2DV07JQ C 305
BS 1 595 RR2DV07TF
BS 596 596 RR2HA18TF
BS 597 621 RR2DV07TF
BS 622 622 RR2HA18TF
BS 623 653 RR2DV07TF
BS 654 673 RR2HA18TF
BS 674 761 RR2HA18JQ
BS 762 762 RR2DV07JQ
BS 763 936 RR2HA18JQ

RD RR2DV37TF 575 0 0
GG
AAAATTTGTTGTTGTGCAAAATCAGAAAGAAAGAAAGA****CGATCAGGAA*GATGGCG
ACGGAGAGTTCTTCTGCTAAGAGATGGCTTCCACTTGAAGCTAACCCAGAGGTTATGAAT
CAGTTTCTTTGGGGGCTTGGGCTTGAACCTGATGCAGCGGAGTGCAATGACGTGTTTCGA
TTAGACGACGAACTTCTTGAGATGGTTCCAAAGCCTGTCCTTGCTGTTCTCTTCCTTTAC
CCTATCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGGATCGAGCAAGACAAGGAAATCAAAGAGAAG
GTGCATAGTGATAAGGTTTACTTCATGAAACAAACTGTGGGTAATGCTTGTGGAACCATT
GGTCTTCTCCATGCTATTGGCAACATTACCTCTGAAATCAAGCTTTCTGAGGGATCCTTC
TTGGATAAATTCTTCAAATCCACAGCCAATATGACTCCCATGGAGCGTGCAAGGTTTCTT
GAGAATGACAGTCAAATAGAAGATGCGCATTCTGTGGCGGTTACCGCTGGTGAAACACCG
GCTACAGATGACGCGGACACACATTTCATCTGT

QA 3 575 3 575
DS 

RD RR2DV07TF 653 0 0
GGAAGTTAAAATTTGTTGTTGTGCAAAATCAGAAAGAAAGAAAGAAAGACGATCACGAAA
GATGGCGACGGAGAGTTCTTCTGCTAAGAGATGGCTTCCACTTGAAGCTAACCCAGAGGT
CATGAATCAGTTTCTTTGGGGGCTTGGGCTTGAACCAGATGCGGCGGAGTGCAATGACGT
GTTTGGATTAGACGACGAACTTCTTGAGATGGTTCCAAAGCCTGTTCTTGCTGTTCTCTT
CCTTTACCCTATCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGGATCGAGCAGGACAAGGAAATCAA
GGAGAAGGTGCATAGTGATAAGGTTTACTTCATGAAACAAACTGTGGGTAATGCTTGCGG
AACCATTGGTCTTCTCCATGCTATTGGCAACATTACCTCTGAAATCAATCTTTCTGAGGG
ATCCTTCTTGGATAAATTCTTCAAATCCACAGCCAATATGACGCCCATGGAGCGTGCAAG
GTTTCTTGAGAATGACAGTCAAATAGAAGATGCGCATTCTGTGGCGGTTACCGCTGGTGA
AACACCGGCTACAGACGACGCAGACACACATTTCATCTGTTTAGCTTGTGTAGATGGTGA
GCTCTATGAACTCGATGGAAG*AAAGCTGGACCAATTTCACATGGTGCTTCCT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2HA18TF 669 0 0
TTTGTTGTTGTGCAAAATCAGAAAGAAAGAAAGAAAGACGATCACGAAAGATGGCGACGG
AGAGTTCTTCTGCTAAGAGATGGCTTCCACTTGAAGCTAACCCAGAGGTCATGAATCAGT
TTCTTTGGGGGCTTGGGCTTGATCCAGATGCGGCGGAGTGCAATGACGTGTTTGGATTAG
ACGACGAACTTCTTGAGATGGTTCCAAAGCCTGTTCTTGCTGTTCTCTTCCTTTACCCTA
TCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGGATCGAGCAGGACAAGGAAATCAAGGAGAAGGTGC
ATAGTGATAAGGTTTACTTCATGAAACAAACTGTGGGTAATGCTTGCGGAACCATTGGTC
TTCTCCATGCTATTGGCAACATTACCTCTGAAATCAATCTTTCTGAGGGATCCTTCTTGG
ATAAATTCTTCAAATCCACAGCCAATATGACGCCCATGGAGCGTGCAAGGTTTCTTGAGA
ATGACAGTCAAATAGAAGATGCGCATTCTGTGGCGGTTACCGCTGGTGAAACACCGGCTA
CAGACGACGCAGACACACATTTCATCTGTTTAGCTTGTGTAGATAGTGAGCTCTATGAAC
TCGATGGAAGGAAAGCTGGACCAATTTCACATGGTGCTTCCTCGCCAGCTACCCTCTTGA
AG
ATGCGAC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2HA18JQ 711 0 0
T
CTTGCTGTTCTCTTCCTTTACCCTATCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGGATCGAGCAG
GACAAGGAAATCAAGGAGAAGGTGCATAGTGATAAGGTTTACTCCATGAAACAAACTGTG
GGTAATGCTTGCGGAACCATTGGTCTTCTCCATGCTATTGGCAACATTACCTCTGAAATC
AATCTTTCTGAGGGATCCTTCTTGGATAAATTCTTCAAATCCACAGCCAATATGACGCCC
ATGGAGCGTGCAAGGTTTCTTGAGAATGACAGTCAAATAGAAGATGCGCATTCTGTGGCG
GTTACCGCTGGTGAAACACCGGCTACAGACGACGCAGACACACATTTCATCTGTTTAGCT
TGTGTAGATAGTGAGCTCTATGAACTCGATGGAAGGAAAGCTGGACCAATTTCACATGGT
GCTTCCTCGCCAGCTACCCTCTTGAAGGATGCGACGAAGGTGATGAAGAAGTTTATTGAT
AAGAATCCGGACACGCTCAACTTCAATGTAATGGCCATCTCTAAGAGAACCTGAGGTTTT
TCTTCAAGAAGCAGAGATCAGTAGTCTTGTTTATGCATTTATTACTTAACTATCCACGCA
GATTTTATATCTTTGTGGATTCTGATTTACTGTATTCTGAATCTTTTTCTTCTTTCTTTT
TGTTTCTGAAAATCTTATAAAAGAGTTTATGATCATGGTTTTAAGAGTGC

QA 2 711 2 711
DS 

RD RR2DV07JQ 616 0 0
AAGGTGCATAGTGATAAGGTTTACTTCATGAAACAAACTGTGGGTAATGCTTGCGGAACC
ATTGGTCTTCTCCATGCTATTGGCAACATTACCTCTGAAATCAATCTTTCTGAGGGATCC
TTCTTGGATAAATTCTTCAAATCCACAGCCAATATGACGCCCATGGAGCGTGCAAGGTTT
CTTGAGAATGACAGTCAAATAGAAGATGCGCATTCTGTGGCGGTTACCGCTGGTGAAACA
CCGGCTACAGACGACGCAGACACACATTTCATCTGTTTAGCTTGTGTAGATGGTGAGCTC
TATGAACTCGATGGAAGGAAAGCTGGACCAATTTCACATGGTGCTTCCTCGCCAGCTACC
CTCTTGAAGGATGCGACGAAGGTGATGAAGAAGTTTATTGATAAGAATCCGGACACGCTC
AACTTCAATGTAATGGCCATCTCTAAGAGAACCTGAGATTTTTCTTCAAGAAGCAGAGAT
CAGTAGTCTTGTTTATGCATTTATTACTTAACTATCCACGCAGATTTTATATCTTTGTGG
ATTCTGATTTACTGTATTCTGAATCTTTTTCTTCTTTCTTTTTGTTTCTGAAAATCTTAT
AAAAGAGTTTATGATC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 4

CO CL1626Contig1 1430 4 9 U
ATCATAAAAGAACTTGAAAGGATAACCTTCACTTATGAAGTCGAATTTGTCAGAAGCGAG
ACAAGATGGCCATCAAGATGGGATGCCTATTTAAAAATGGAAGGTGCTTGTGTCCATTGG
TTCTCTATACTGAACTCGCTTATGGTGATCGTCTTTCTCGCCGGTATAGTCTTTGTCATA
TTCCTGAGGACAGTGAGAAGGGATCTGACAAAGTACGAGGAACTGGACAAGGAAGCGCAG
GCACAGATGAACGAGGAGTTCTCTGGATGGAAACTTGTTGTCGGAGATGTGTTCAGAGAA
CCAGAACTTTCAAAGCTTCTATGCATTATGGTGGGAGACGGTGTTCGGATTACAGGAATG
GCTGTTGTCACTATTGTTTTCGCAGCACTAGGATTCATGTCGCCTGCATCGAGAGGAATG
TTACTAACCGGGATGATTATTCTCTATCTTTTCTTGGGTATTGCTGCTGGGTACGCTGGT
GTCCGGCTCTGGAGAACCGTCAAAGGAACTTCAGAAGGATGGAGATCACTATCCTGGTCC
ATCGCATGCTTCTTCCCGGGTATTGCTTTTGTCATACTGACAGTGTTGAACTTCCTTCTC
TGGAGCAGCAACAGCACTGGCGCCATCCCAATATCACTCTACTTTGAGCTCTTGGCTCTA
TGGTTCTGCATCTCGGTTCCACTCACCTTGTTTGGAGGATTCTTAGGCACGCGAGCAGAA
GCAATTCAATTTCCAGTGAGAACCAACCAGATTCCAAGGGAGATCCCAGAACGTAAATAC
CCGTCATGGCTTCTCGTCCTTGGAGCAGGAACACTTCCTTTCGGAACTCTATTCATTGAA
CTCTTCTTCATATTCTCCAGCATATGGTTAGGCAGATTCTACTACGTATTTGGGTTCTTA
CTCATAGTACTGCTTCTTTTAGTAGTTGTGTGTGCAGAGGTATCAGTGGTGTTGACCTAT
ATGCACCTCTGCGTGGAAGATTGGAGATGGTGGTGGAAAGCCTTCTTCGCATCTGGTTCA
GTCGCCTTGTATGTCTTTGCTTACTCCATCAACTATTTGGTGTTCGATCTCCAAAGTCTG
AGCGGACCGGTCTCGGCTATGCTTTACATTGGCTACTCTCTGCTTATGGCCATTGCAATA
ATGCTCTCTACAGGAACCATTGGCTTCCTTACTTCCTTCTACTTCGTCCACTATCTGTTT
TCCTCTGTCAAAATCGATTGAAAATTTGACGAGAAATCTCAACCGTTGAATGTTTGCTTT
TTCTGAAGCAATTTTTTCAGGTGTTGTTATTTTCTTTTGTCAGTAATAGACTTGTTAGAG
TCCTGCGTTTTTTTTTCTCTCTGAATTTTCGGACTTATTTTTCCGTTATATGTTATTTTC
GTTTTTTTTTTCTGAACTTTGGGTAGAAATAAATGATTCCGTTTTTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH92TF U 1
AF RR2AJ25TF U 309
AF RR2F519JQ C 614
AF RR2FH92JQ C 631
BS 1 706 RR2FH92TF
BS 707 707 RR2AJ25TF
BS 708 727 RR2FH92TF
BS 728 1093 RR2AJ25TF
BS 1094 1178 RR2F519JQ
BS 1179 1179 RR2FH92JQ
BS 1180 1325 RR2F519JQ
BS 1326 1326 RR2FH92JQ
BS 1327 1430 RR2F519JQ

RD RR2FH92TF 727 0 0
ATCATAAAAGAACTTGAAAGGATAACCTTCACTTATGAAGTCGAATTTGTCAGAAGCGAG
ACAAGATGGCCATCAAGATGGGATGCCTATTTAAAAATGGAAGGTGCTTGTGTCCATTGG
TTCTCTATACTGAACTCGCTTATGGTGATCGTCTTTCTCGCCGGTATAGTCTTTGTCATA
TTCCTGAGGACAGTGAGAAGGGATCTGACAAAGTACGAGGAACTGGACAAGGAAGCGCAG
GCACAGATGAACGAGGAGTTCTCTGGATGGAAACTTGTTGTCGGAGATGTGTTCAGAGAA
CCAGAACTTTCAAAGCTTCTATGCATTATGGTGGGAGACGGTGTTCGGATTACAGGAATG
GCTGTTGTCACTATTGTTTTCGCAGCACTAGGATTCATGTCGCCTGCATCGAGAGGAATG
TTACTAACCGGGATGATTATTCTCTATCTTTTCTTGGGTATTGCTGCTGGGTACGCTGGT
GTCCGGCTCTGGAGAACCGTCAAAGGAACTTCAGAAGGATGGAGATCACTATCCTGGTCC
ATCGCATGCTTCTTCCCGGGTATTGCTTTTGTCATACTGACAGTGTTGAACTTCCTTCTC
TGGAGCAGCAACAGCACTGGCGCCATCCCAATATCACTCTACTTTGAGCTCTTGGCTCTA
TGGTTCTGCATCTCGGTTCCACTCACCTTGTTTGGAGGATTCTTAG*CACGCGAGCAGAA
GCAATTC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2AJ25TF 785 0 0
TTCAAAGCTTCTATGCATTATGGTGGGAGACGGTGTTCGGATTACAGGAATGGCTGTTGT
CACTATTGTTTTCGCAGCACTAGGATTCATGTCGCCTGCATCGAGAGGAATGTTACTAAC
CGGGATGATTATTCTCTATCTTTTCTTGGGTATTGCTGCTGGGTACGCTGGTGTCCGGCT
CTGGAGAACCGTCAAAGGAACTTCAGAAGGATGGAGATCACTATCCTGGTCCATCGCATG
CTTCTTCCCGGGTATTGCTTTTGTCATACTGACAGTGTTGAACTTCCTTCTCTGGAGCAG
CAACAGCACTGGCGCCATCCCAATATCACTCTACTTTGAGCTCTTGGCTCTATGGTTCTG
CATCTCGGTTCCACTCACCTTGTTTGGAGGATTCTTAGGCACGCGAGCAGAAGCAATTCA
ATTTCCAGTGAGAACCAACCAGATTCCAAGGGAGATCCCAGAACGTAAATACCCGTCATG
GCTTCTCGTCCTTGGAGCAGGAACACTTCCTTTCGGAACTCTATTCATTGAACTCTTCTT
CATATTCTCCAGCATATGGTTAGGCAGATTCTACTACGTATTTGGGTTCTTACTCATAGT
ACTGCTTCTTTTAGTAGTTGTGTGTGCAGAGGTATCAGTGGTGTTGACCTATATGCACCT
CTGCGTGGAAGATTGGAGATGGTGGTGGAAAGCCTTCTTCGCATCTGGTTCAGTCGCCTT
GTATGTCTTTGCTTACTCCATCAACTATTTGGTGTTCGATCTCCAAAGTCTGAGCGGACC
GGTCT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2F519JQ 817 0 0
GCACTGGCGCCATCCCAACATCACTCTACTTTGAGCTCTTGGCTCTATGGTTCTGCATCT
CGGTTCCACTCACCTTGTTTGGAGGATTCTTAGGCACGCGAGCAGAAGCAATTCAATTTC
CAGTGAGAACCAACCAGATTCCAAGGGAGATCCCAGAACGTAAATACCCGTCATGGCTTC
TCGTCCTTGGAGCAGGAACACTTCCTTTCGGAACTCTATTCATTGAACTCTTCTTCATAT
TCTCCAGCATATGGTTAGGCAGATTCTACTACGTATTTGGGTTCTTACTCATAGTACTGC
TTCTTTTAGTAGTTGTGTGTGCAGAGGTATCAGTGGTGTTGACCTATATGCACCTCTGCG
TGGAAGATTGGAGATGGTGGTGGAAAGCCTTCTTCGCATCTGGTTCAGTCGCCTTGTATG
TCTTTGCTTACTCCATCAACTATTTGGTGTTCGATCTCCAAAGTCTGAGCGGACCGGTCT
CGGCTATGCTTTACATTGGCTACTCTCTGCTTATGGCCATTGCAATAATGCTCTCTACAG
GAACCATTGGCTTCCTTACTTCCTTTTACTTCGTCCACTATCTGTTTTCCTCTGTCAAAA
TCGATTGAAAATTTGACGAGAAATCTCAACCGTTGAATGTTTGCTTTTTCTGAAGCAATT
TTTTCAGGTGTTGTTATTTTCTTTTGTCAGTAATAGACTTGTTAGAGTCCTGTGTTTTTT
TTTCTCTCTGAATTTTCGGACTTATTTTTCCGTTATATGTTATTTTCGTTTTTTTTTTCT
GAACTTTGGGTAGAAATAAATGATTCCGTTTTTCTGC

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2FH92JQ 763 0 0
AT
ATCACTCTACTTTGAGCTCT*GGCTCTATGGTTCTGCATCTCGGTTCCACTCACCTTGTT
TGGAGGATTCTTAGGCACGCGAGCAGAAGCAATTCAATTTCCAGTGAGAACCAACCAGAT
TCCAAGGGAGATCCCAGAACGTAAATACCCGTCATGGCTTCTCGTCCTTGGAGCAGGAAC
ACTTCCTTTCGGAACTCTATTCATTGAACTCTTCTTCATATTCTCCAGCATATGGTTAGG
CAGATTCTACTACGTATTTGGGTTCTTACTCATAGTACTGCTTCTTTTAGTAGTTGTGTG
TGCAGAGGTATCAGTGGTGTTGACCTATATACACCTCTGCGTGGAAGATTGGAGATGGTG
GTGGAAAGCCTTCTTCGTATCTGGTTCAGTCGCCTTGTATGTCTTTGCTTACTCCATCAA
CTATTTGGTGTTCGATCTCCAAAGTCTGAGCGGACCGGTCTCGGCTATGCTTTACATTGG
CTACTCTCTGCTTATGGCCATTGCAATAATGCTCTCTACAGGAACCATTGGCTTCCTTAC
TTCCTTCTACTTCGTCCACTATCTGTTTTCCTCTGTCAAGATCGATTGAAAATTTGACGA
GAAATCTCAGCCGTTGAATGTTTGCTTTTTCTGAAGCAATTTTTTCAGGTGTTGTTATTT
TCTTTTGTCAGTAATAGACTTGTTAGAGTCCTGCGTTTTTTTTTCTCTCTGAATTTTCGG
GCTTATTTTTCCGTTATATGTTATTTTCGTTTTTTTTT
CTG

QA 3 760 3 760
DS 



AS 2 4

CO CL1627Contig1 506 2 2 U
GGCTCATCTCTGGAAATTAGGGTTCTTGCTTCTTCGCTTGCCGCCGCTAAACACTCACCT
TCGTCTACAGAATGGATTCTCAGATTAAGCATGCTGTGGTGGTGAAAGTGATGGGACGCA
CGGGGTCAAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCTAGTGAAGTTCACAGACTCTGATCGTTTCA
TTATGCGCAATGTTAAAGGACCGGTGAGGGAAGGTGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCAG
AGAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATCCCCCTTCCTCCTCCACAGGTGGAAGCAAGAAC
ACAGAACCAAATGTCTGCTTAGTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTCTTGTTACT
GGATTAATGATTATGCACTCAGGTTCTGTTTGGTTGTTGCTATAAGACAATTCCTGGATT
GATATTTGTTCTGTCTTTTTTTCTGGTCTTCGGAGTTTATTGTGTGAAACTCATTACTCG
AGTAAGCCATGGTTAGTGTTATTACG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DV30JQ C 1
AF RR2DV30TF U 1
BS 1 5 RR2DV30JQ
BS 6 506 RR2DV30TF

RD RR2DV30JQ 506 0 0
GGCTCATCTCTGGAAATTAGGGTTCTTGCTTCTTCGCTTGCCGCCGCTAAACACTCACCT
TCGTCTACAGAATGGATTCTCAGATTAAGCATGCTGTGGTGGTGAAAGTGATGGGACGCA
CGGGGTCAAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCTAGTGAAGTTCACAGACTCTGATCGTTTCA
TTATGCGCAATGTTAAAGGACCGGTGAGGGAAGGTGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCAG
AGAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATCCCCCTTCCTCCTCCACAGGTGGAAGCAAGAAC
ACAGAACCAAATGTCTGCTTAGTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTCTTGTTACT
GGATTAGTGATTATGCACTCAGGTTCTGTTTGGTTGTTGCTATAAGACAATTCCTGGATT
GATATTTGTTCTGTCTTTTTTTCTGGTCTTCGGAGTTTATTGTGTGAAACTCATTACTCG
AGTAAGCCATGGTTAGTGTTATTACG

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2DV30TF 506 0 0
GGCTC
ATCTCTGGAAATTAGGGTTCTTGCTTCTTCGCTTGCCGCCGCTAAACACTCACCTTCGTC
TACAGAATGGATTCTCAGATTAAGCATGCTGTGGTGGTGAAAGTGATGGGACGCACGGGG
TCAAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCTAGTGAAGTTCACAGACTCTGATCGTTTCATTATG
CGCAATGTTAAAGGACCGGTGAGGGAAGGTGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCAGAGAGA
GAAGCCAGGAGACTTCGTTGATCCCCCTTCCTCCTCCACAGGTGGAAGCAAGAACACAGA
ACCAAATGTCTGCTTAGTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTCTTGTTACTGGATT
AATGATTATGCACTCAGGTTCTGTTTGGTTGTTGCTATAAGACAATTCCTGGATTGATAT
TTGTTCTGTCTTTTTTTCTGGTCTTCGGAGTTTATTGTGTGAAACTCATTACTCGAGTAA
GCCATGGTTAGTGTTATTACG

QA 6 506 6 506
DS 



CO CL1627Contig2 534 2 1 U
GGATCTCTGGAAATTAGGGTTGTTGCTTCTCCGCTTGCCGCCGCTAAGCTCTTCACCTTC
GTTCTACAGAATGGATTCTCAGATTAAGCATGCTGTGGTGGTGAACGTGATGGGACGTAC
GGGGTCAAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTGAAGTTCACAGACTCTGATCGTTTCAT
TATGCGCAATGTTAAAGGACCAGTGAGGGAAGGAGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCAGA
GAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGAGATCCCCCTTCCTCCTCCTCCACTGGTGGAAGCAA
GAACACAGAACCAAATGTCTGCTTAGTTCTCTTTTTGTTTTTTTTTTTTGCTTCTTGTTA
CTGGATTAGTGATTATGCACTCAGGTTCTGTTTGGTTGTTGCTATAAGACAATTCCTGGA
TTGATATTTGTTCTGTCTTTTTTTCTGGTCTTCGGAGTTTATTGTGTGAAACTCATATCA
TCTTCACATCGAGAATTCATTACTCGAGTAAGCCATGGTCAGTGTTATTACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ED39TF U 1
AF RR2ED39JQ C 53
BS 1 534 RR2ED39TF

RD RR2ED39TF 534 0 0
GGATCTCTGGAAATTAGGGTTGTTGCTTCTCCGCTTGCCGCCGCTAAGCTCTTCACCTTC
GTTCTACAGAATGGATTCTCAGATTAAGCATGCTGTGGTGGTGAACGTGATGGGACGTAC
GGGGTCAAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTGAAGTTCACAGACTCTGATCGTTTCAT
TATGCGCAATGTTAAAGGACCAGTGAGGGAAGGAGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCAGA
GAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGAGATCCCCCTTCCTCCTCCTCCACTGGTGGAAGCAA
GAACACAGAACCAAATGTCTGCTTAGTTCTCTTTTTGTTTTTTTTTTTTGCTTCTTGTTA
CTGGATTAGTGATTATGCACTCAGGTTCTGTTTGGTTGTTGCTATAAGACAATTCCTGGA
TTGATATTTGTTCTGTCTTTTTTTCTGGTCTTCGGAGTTTATTGTGTGAAACTCATATCA
TCTTCACATCGAGAATTCATTACTCGAGTAAGCCATGGTCAGTGTTATTACATG

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2ED39JQ 482 0 0
TCACCTTCGTTCTACAGAATGGATTCTCAGATTAAGCATGCTGTGGTGGTGAACGTGATG
GGACGTACGGGGTCAAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTGAAGTTCACAGACTCTGAT
CGTTTCATTATGCGCAATGTTAAAGGACCAGTGAGGGAAGGAGACATCCTCACCTTGCTC
GAGTCAGAGAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGAGATCCCCCTTCCTCCTCCTCCACTGGT
GGAAGCAAGAACACAGAACCAAATGTCTGCTTAGTTCTCTTTTTGTTTTTTTTTTTTGCT
TCTTGTTACTGGATTAGTGATTATGCACTCAGGTTCTGTTTGGTTGTTGCTATAAGACAA
TTCCTGGATTGATATTTGTTCTGTCTTTTTTTCTGGTCTTCGGAGTTTATTGTGTGAAAC
TCATATCATCTTCACATCGAGAATTCATTACTCGAGTAAGCCATGGTCAGTGTTATTACA
TG

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 4

CO CL1628Contig1 721 4 3 U
GCGCCACCTTCTTCAAGATTCAGAACCTTGACAACACCATCCTCCGCCAGAATCGCGTAC
CTCCTCGACCTAACTCCGAGTCCCACAGGCTTATCCCTCAAATCCAACTCCACGCCAAGC
TTCCCCGTGAACTCTCCGTTCCCGTCGGACAACAGCATCACCTCGTCGTCGATCCCGAGG
TCCTTCCTCCACGCTTCCATCACGAACGCGTCGTTCACGGAGACGCACGCGATGACGTCG
ACGCCTTTGGATCTGAGCTCTCCGGCTTTGGAGACGAACCCGGGGACGTGTTTCTGCGAG
CAGGTCGGAGTGAAGGCTCCCGGGACGGCGAAGAGGATGGTTTTCTTCCCGGCGGTTAGG
GAGGAGACGGTGACTGTTTTGACGTCGTTGGTGGCGGGGTCGAGGTAGGAGAGAGTGGAG
TCTGGGAGTTTGTCTCCGACGGAAATGGCGGAGGTGATGGTTGTTGAGAAGGATCTGGTG
GCGGAGAGGGTGATGCTGCGGCGGGTGTTGGATTTGAGGGAGAGGCTAGGAGCGAGAGAG
CGCGTGAAAGAGAGAGGCGCCGTAAAGGTTGGGGAGAGTAACGGTTTAGCGATGGAGATG
GCGGTGGCGGAGGAGGAGGAGGAGAGGAGTCTGGAGACAGAGAGAGAAGTTGCCATGGAT
GATAGTGTTGAGCGGTTCAAATGAAATGTTTGGTGAGTGACTCAAGATTGTGTCTTCTCC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 

AF RR2EQ72JQ U 1
AF RR2A067JQ U 9
AF RR2EQ72TF C 31
AF RR2A067TF C 12
BS 1 168 RR2EQ72JQ
BS 169 720 RR2A067JQ
BS 721 721 RR2A067TF

RD RR2EQ72JQ 168 0 0
GCGCCACCTTCTTCAAGATTCAGAACCTTGACAACACCATCCTCCGCCAGAATCGCGTAC
CTCCTCGACCTAACTCCGAGTCCCACAGGCTTATCCCTCAAATCCAACTCCACGCCAAGC
TTCCCCGTGAACTCTCCGTTCCCGTCGGACAACAGCATCACCTCGTCG

QA 1 168 1 168
DS 

RD RR2A067JQ 712 0 0
TTC
TTCAAGATTCAGAACCTTGACAACACCATCCTCCGCCAGAATCGCGTACCTCCTCGACCT
AACTCCGAGTCCCACAGGCTTATCCCTCAAATCCAACTCCACGCCAAGCTTCCCCGTGAA
CTCTCCGTTCCCGTCGGACAACAGCATCACCTCGTCGTCGATCCCGAGGTCCTTCCTCCA
CGCTTCCATCACGAACGCGTCGTTCACGGAGACGCACGCGATGACGTCGACGCCTTTGGA
TCTGAGCTCTCCGGCTTTGGAGACGAACCCGGGGACGTGTTTCTGCGAGCAGGTCGGAGT
GAAGGCTCCCGGGACGGCGAAGAGGATGGTTTTCTTCCCGGCGGTTAGGGAGGAGACGGT
GACTGTTTTGACGTCGTTGGTGGCGGGGTCGAGGTAGGAGAGAGTGGAGTCTGGGAGTTT
GTCTCCGACGGAAATGGCGGAGGTGATGGTTGTTGAGAAGGATCTGGTGGCGGAGAGGGT
GATGCTGCGGCGGGTGTTGGATTTGAGGGAGAGGCTAGGAGCGAGAGAGCGCGTGAAAGA
GAGAGGCGCCGTAAAGGTTGGGGAGAGTAACGGTTTAGCGATGGAGATGGCGGTGGCGGA
GGAGGAGGAGGAGAGGAGTCTGGAGACAGAGAGAGAAGTTGCCATGGATGATAGTGTTGA
GCGGTTCAAATGAAATGTTTGGTGAGTGACTCAAGATTGTGTCTTCTCC

QA 4 712 4 712
DS 

RD RR2EQ72TF 675 0 0
ACAACACCATCCTCCGCCAGAATCGCGTACCTCCTCGACCTAACTCCGAGTCCCACAGGC
TTATCCCTCAAATCCAACTCCACGCCAAGCTTCCCCGTGAACTCTCCGTTCCCGTCGGAC
AACAGCATCACCTCGTCGTCGATCCCGAGGTCCTTCCTCCACGCTTCCATCACGAACGCG
TCGTTCACGGAGACGCACGCGATGACGTCGACGCCTTTGGATCTGAGCTCTCCGGCTTTG
GAGACGAACCCGGGGACGTGTTTCTGCGAGCAGGTCGGAGTGAAGGCTCCCGGGACGGCG
AAGAGGATGGTTTTCTTCCCGGCGGTTAGGGAGGAGACGGTGACTGTTTTGACGTCGTTG
GTGGCGGGGTCGAGGTAGGAGAGAGTGGAGTCTGGGAGTTTGTCTCCGACGGAAATGGCG
GAGGTGATGGTTGTTGAGAAGGATCTGGTGGCGGAGAGGGTGATGCTGCGGCGGGTGTTG
GATTTGAGGGAGAGGTTAGGAGCGAGAGAGCGCGTGAAAGAGAGAGGCGCCGTAAAGGTT
GGGGAGAGTAACGGTTTAGCGATGGAGATGGCGGTGGCGGAGGAGGAGGAGGAGAGGAGT
CTGGAGACAGAGAGAGAAGTTGCCATGGATGATAGTGTTGAGCGATTCAAATGAAATGTT
TGGTGAGTGACTC
CC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2A067TF 710 0 0
TTCAAGATTCAGAACCTTGACAACACCATCCTCCGCCAGAATCGCGTACCTCCTCGACCT
AACTCCGAGTCCCACAGGCTTATCCCTCAAATCCAACTCCACGCCAAGCTTCCCCGTGAA
CTCTCCGTTCCCGTCGGACAACAGCATCACCTCGTCGTCGATCCCGAGGTCCTTCCTCCA
CGCTTCCATCACGAACGCGTCGTTCACGGAGACGCACGCGATGACGTCGACGCCTTTGGA
TCTGAGCTCTCCGGCTTTGGAGACGAACCCGGGGACGTGTTTCTGCGAGCAGGTCGGAGT
GAAGGCTCCCGGGACGGCGAAGAGGATGGTTTTCTTCCCGGCGGTTAGGGAGGAGACGGT
GACTGTTTTGACGTCGTTGGTGGCGGGGTCGAGGTAGGAGAGAGTGGAGTCTGGGAGTTT
GTCTCCGACGGAAATGGCGGAGGTGATGGTTGTTGAGAAGGATCTGGTGGCGGAGAGGGT
GATGCTGCGGCGGGTGTTGGATTTGAGGGAGAGGCTAGGAGCGAGAGAGCGCGTGAAAGA
GAGAGGCGCCGTAAAGGTTGGGGAGAGTAACGGTTTAGCGATGGAGATGGCGGTGGCGGA
GGAGGAGGAGGAGAGGAGTCTGGAGACAGAGAGAGAAGTTGCCATGGATGATAGTGTTGA
GCGGTTCAAATGAAATGTTTGGTGAGTGACTCAAGATTGTGTCTTCTCCC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL1629Contig1 1315 2 8 U
GGAGAAATAAAATACCAATGTGATTTATGATAACAACGTAGCAACACAACTTCGTTTTCA
TTGAGAAATTGCTGAGTTCTGCAAATTGCTCAAGGAATGGACCAAGAGTTGCAATCATCA
CATCTTCCATTAGTAGATCACTTGAATCCACATGGTTCGTTTAATATTCCCAAATTACAA
TTTCCTCGTTGAGCATGCATTCAAATAAACTTCTAAAACCGCTAAGTAAACCAACCAATG
AAACAACGCAAAGAACTGCCATATGTTATATTTGACCTTATTAGTGTCAAACACTTCATT
TGGTTAGGAGAATTCGATTGATGACATCAACAGGTAAAGCGTAGGCTGGATCAATTGGTT
TGACTCCAGGATACTCAAGGAGGGATAGCCCTGCAACTCCAAAGTAGGTGTGGAAAATAT
CAACAGCATCGTCAGGTCTGTCTGAAATACCTCCGTTCTCCAAATCCTGACAATCCAAGA
TGAATTTGACAAGCTTTGCTTTGTTGATCCAGTGAACTCTATCTATCATGATTAGGCTCG
ATAGGACCCACCAAGAATAGCAAACATCAGGGAGTTTCTCGGGTCGTCCATTTAAACCCC
CGGACTTGACTTGTCTTTCACATAACCACCACCCCAAGTAAGTCCTTATCGACATGATGG
AGACTCCCGGTGATAGCAAGAGCACCCACGCAGCAAAAAATCTGTCCTGCATGTGATTCT
GCTCCGGGTGTGCAACCGAAACCACCATCAAGGTTTTTGCAGCTAACAATGTAATCGACT
GCCTTCTCAACATTGATTTTGTCAAGACATTTCAATATCGAGAGACTGCAGATAGCTATG
TACGAAAACCTCGTATCTACTTCTCCCCACATATCTCCTGAGAAGGATCCATCTTCATTC
TGCAAACCAGCAATATAGCTTGATACTTTTGCAACGTCAAGAATGTCTAGTTTGTCAAAG
AGGGCCAAGATTTGCACAGCACTCAGTGTATATAAAACATGTGGATCATGTCCAGTATTT
CCGGCAAAGCCACCAGATTCGTGCTGGCAGGTGAAGAGCCATGAAACGACTTCATCAACG
GAAACAGAGGGAAGCTTGTCGAGTAAGTCTAGAGTGGTGAGTCCCCAGTAGGCACCATTC
ATTCTGAGATGATCCATCACCACCGACTCAAAACTCTCTTTCTTCTTTTCTGACATGAGA
ATGTAACGTACATGCTTGTCAGCTACAAGCTGACCCATCTGGGAGGACGACGAAGACGAA
GAGCTCATCAGCTTGATTGGAGACAGAAGACGACTCGCACGATTGGAGGCGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU03JQ U 1
AF RR2B016TF C 497
BS 1 568 RR2CU03JQ
BS 569 569 RR2B016TF
BS 570 601 RR2CU03JQ
BS 602 602 RR2B016TF
BS 603 634 RR2CU03JQ
BS 635 635 RR2B016TF
BS 636 692 RR2CU03JQ
BS 693 1315 RR2B016TF

RD RR2CU03JQ 694 0 0
GGAGAAATAAAATACCAATGTGATTTATGATAACAACGTAGCAACACAACTTCGTTTTCA
TTGAGAAATTGCTGAGTTCTGCAAATTGCTCAAGGAATGGACCAAGAGTTGCAATCATCA
CATCTTCCATTAGTAGATCACTTGAATCCACATGGTTCGTTTAATATTCCCAAATTACAA
TTTCCTCGTTGAGCATGCATTCAAATAAACTTCTAAAACCGCTAAGTAAACCAACCAATG
AAACAACGCAAAGAACTGCCATATGTTATATTTGACCTTATTAGTGTCAAACACTTCATT
TGGTTAGGAGAATTCGATTGATGACATCAACAGGTAAAGCGTAGGCTGGATCAATTGGTT
TGACTCCAGGATACTCAAGGAGGGATAGCCCTGCAACTCCAAAGTAGGTGTGGAAAATAT
CAACAGCATCGTCAGGTCTGTCTGAAATACCTCCGTTCTCCAAATCCTGACAATCCAAGA
TGAATTTGACAAGCTTTGCTTTGTTGATCCAGTGAACTCTATCTATCATGATTAGGCTCG
ATAGGACCCACCAAGAATAGCAAACATCTGGGAGTTTCTCGGGTCGTCCATTTAAACCCC
CTGACTTGACTTGTCTTTCACATAACCACCACCC*AAGTAAGTCCTTATCGACATGATGG
AGACTCCCGGTGATAGCAAGAGCACCCACGCA
AC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2B016TF 819 0 0
TTGC
TTGTTGATCCAGTGAACTCTATCTATCATGATTAGGCTCGATAGGACCCACCAAGAATAG
CAAACATCAGGGAGTTTCTCTGGTCGTCCATTTAAACCCCCGGACTTGACTTGTCTTTCA
CATAACCACCACCCCAAGTAAGTCCTTATCGACATGATGGAGACTCCCGGTGATAGCAAG
AGCACCCACGCAGCAAAAAATCTGTCCTGCATGTGATTCTGCTCCGGGTGTGCAACCGAA
ACCACCATCAAGGTTTTTGCAGCTAACAATGTAATCGACTGCCTTCTCAACATTGATTTT
GTCAAGACATTTCAATATCGAGAGACTGCAGATAGCTATGTACGAAAACCTCGTATCTAC
TTCTCCCCACATATCTCCTGAGAAGGATCCATCTTCATTCTGCAAACCAGCAATATAGCT
TGATACTTTTGCAACGTCAAGAATGTCTAGTTTGTCAAAGAGGGCCAAGATTTGCACAGC
ACTCAGTGTATATAAAACATGTGGATCATGTCCAGTATTTCCGGCAAAGCCACCAGATTC
GTGCTGGCAGGTGAAGAGCCATGAAACGACTTCATCAACGGAAACAGAGGGAAGCTTGTC
GAGTAAGTCTAGAGTGGTGAGTCCCCAGTAGGCACCATTCATTCTGAGATGATCCATCAC
CACCGACTCAAAACTCTCTTTCTTCTTTTCTGACATGAGAATGTAACGTACATGCTTGTC
AGCTACAAGCTGACCCATCTGGGAGGACGACGAAGACGAAGAGCTCATCAGCTTGATTGG
AGACAGAAGACGACTCGCACGATTGGAGGCGGGCC

QA 5 819 5 819
DS 



AS 1 2

CO CL1630Contig1 782 2 1 U
GGAGAGAGCTAGAAGAGAAAAAAAAAGAAAGGGATCTTCCCATGGACGATCTCTGAGAAA
CCAAATCCATCTGGTATTCTAATTTCAATCCTAATCCGGGAAGATCGATTATTTTTGTTG
AAATGGTGTTGGTATTGGCATTGGGGGATATACATGTACCCCAAAGAGCGGCTGATCTAC
CCCCAAAGTTCAAATCCATGCTTGTTCCTGGCAAGATTCAACACATCCTCTGCACTGGCA
ACCTCTCCATCAAAGAAATACATGACTACTTGAAGACAATCTGCCCTGATTTGCATATAG
TTAGAGGCGAGTTTGACGAAGATGCACGTTACCCTGACACTAAAACCTTGTCTATTGGCC
AATTCAAGCTCGGCCTCTGCCACGGCCACCAGGTGATCCCATGGGGTGATTTAGACTCAC
TGGCCATGCTTCAGAGACAGCTCGACGTGGACATACTTGTGACTGGACATACCCACCAGT
TCACTGCCTACAAGCACGAGGGAGGTGTCGTCATCAACCCGGGCTCTGCTACTGGAGCTT
ACAGCACCATTAACCAAGATGTTAACCCCAGCTTTGTTCTTATGGATATCGATGGCCTTC
GTGTTGTCGTCCATGTCTACGAGCTCATCGATGGTGAGGTTAAAGTCGACAAGATCGATT
TCAAGAAAGCCTCCTCCACTTCTGCTCCTTAACAAACTGAACCTTTCTTTAGCTTCAAAT
AATCTTTTTAAATACTTTGAACCCACTGAGAACAATGTTTTGCAAGTCATTTGAAGTTTA
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2A513TF U 1
AF RR2A513JQ C 117
BS 1 782 RR2A513TF

RD RR2A513TF 782 0 0
GGAGAGAGCTAGAAGAGAAAAAAAAAGAAAGGGATCTTCCCATGGACGATCTCTGAGAAA
CCAAATCCATCTGGTATTCTAATTTCAATCCTAATCCGGGAAGATCGATTATTTTTGTTG
AAATGGTGTTGGTATTGGCATTGGGGGATATACATGTACCCCAAAGAGCGGCTGATCTAC
CCCCAAAGTTCAAATCCATGCTTGTTCCTGGCAAGATTCAACACATCCTCTGCACTGGCA
ACCTCTCCATCAAAGAAATACATGACTACTTGAAGACAATCTGCCCTGATTTGCATATAG
TTAGAGGCGAGTTTGACGAAGATGCACGTTACCCTGACACTAAAACCTTGTCTATTGGCC
AATTCAAGCTCGGCCTCTGCCACGGCCACCAGGTGATCCCATGGGGTGATTTAGACTCAC
TGGCCATGCTTCAGAGACAGCTCGACGTGGACATACTTGTGACTGGACATACCCACCAGT
TCACTGCCTACAAGCACGAGGGAGGTGTCGTCATCAACCCGGGCTCTGCTACTGGAGCTT
ACAGCACCATTAACCAAGATGTTAACCCCAGCTTTGTTCTTATGGATATCGATGGCCTTC
GTGTTGTCGTCCATGTCTACGAGCTCATCGATGGTGAGGTTAAAGTCGACAAGATCGATT
TCAAGAAAGCCTCCTCCACTTCTGCTCCTTAACAAACTGAACCTTTCTTTAGCTTCAAAT
AATCTTTTTAAATACTTTGAACCCACTGAGAACAATGTTTTGCAAGTCATTTGAAGTTTA
AG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2A513JQ 666 0 0
GTT
GAAATGGTGTTGGTATTGGCATTGGGGGATATACATGTACCCCAAAGAGCGGCTGATCTA
CCCCCAAAGTTCAAATCCATGCTTGTTCCTGGCAAGATTCAACACATCCTTTGCACTGGC
AACCTCTCCATCAAAGAAATACATGACTACTTGAAGACAATTTGCCCTGATTTGCATATA
GTTAGAGGCGAGTTTGACGAAGATGCACGTTACCCTGACACTAAAACCTTGTTTATTGGC
CAATTCAAGCTCGGCCTTTGCCACGGCCACCAGGTGATCCCATGGGGTGATTTAGACTCA
CTGGCCATGCTTCAGAGACAGCTCGACGTGGACATACTTGTGACTGGACATACCCACCAG
TTCACTGCCTACAAGCACGAGGGAGGTGTTGTCATCAACCCGGGCTTTGCTACTGGAGCT
TACAGCACCATTAACCAAGATGTTAACCCCAGCTTTGTTCTTATGGATATCGATGGCCTT
CGTGTTGTCGTCCATGTTTACGAGCTCATCGATGGTGAGGTTAAAGTCGACAAGATCGAT
TTCAAGAAGGCCTCCTCCACTTTTGCTCCTTAACAAACTGAACCTTTCTTTAGCTTCAAA
TAATCTTTTTAAATACTTTGAACCCACTGAGAACAATGTTTTGCAAGTCATTTGAAGTTT
AAG

QA 4 666 4 666
DS 



AS 1 5

CO CL1631Contig1 1259 5 29 U
GGATCATCGAGTGTCTCGCCCAAGTGCTTCACCACAAAAACTAAAAAACAAAAAAGACAT
CTTCTCTCCTCGCAAATCCCCCAAAAATGTTCAGATCCATGCTTGTCCGATCCTCCGCCT
CGGCGAAGCAGTCGCTTCTCCGCCGCAACTTCTCATCCGGATCCGTCCCCGAGAGAAAAG
TCGCAATCTTGGGAGCCGCCGGTGGAATCGGTCAGCCTCTCGCTCTCCTCATGAAACTCA
ACCCTCTCGTCTCCAGCCTCTCCCTCTTCGATATCGCCAACACTCCTGGAGTCGCCGCTG
ATGTCGGTCACATCAACACCAGATCTCAGGTTGTTGGATACATGGGAGATGATGAGTTGG
CGAAAGCTCTTGAAGGAGCTGACCTAGTTATCATTCCAGCTGGTGTCCCCAGGAAGCCTG
GTATGACCCGTGATGATCTTTTCAACATCAATGCTGGCATTGTCAAGAACCTTGCCTCTG
CCATCGCCAAGTACTGCCCTCATGCGCTTGTTAATATGATCAGCAACCCAGTGAACTCCA
CTGTTCCAATTGCAGCTGAGATATTCAAGAAGGCTGGTATGTACGATGAAAAGAAGTTGT
TTGGTGTTACCACTCTTGACGTTGTTAGGGCCAGGACTTTCTATGCTGGAAAGGCTAATG
TCCCTGTTGCAGAAGTGAATGTTCCGGTGATTGGTGGTCATGCTGGGGTTACAATTCTCC
CACTCTTCTCTCAGGCCACTCCTCAAGCTAACTTGTCAGGTGACGTGCTCACCGCTCTCA
CCAAGCGTACCCAAGATGGAGGTACAGAAGTCGTAGAGGCTAAAGCGGGAAAAGGTTCAG
CTACATTGTCAATGGCCTATGCTGGAGCTCTATTCGCTGATGCATGCTTGAAGGGACTCA
ATGGTGTTCCAGATGTTGTTGAATGCTCATACGTGCAATCCACAATCACCGAACTTCCTT
TCTTTGCCTCAAAGGTGAGGTTGGGAAAGAACGGCGTGGAGGAGGTTCTTGATTTGGGCC
CACTCTCTGACTTTGAGAAGGAAGGCTTGGAGGCATTGAAGCCTGAACTCAAGTCTTCCA
TTGAGAAGGGAATTAAGTTTGCCAACCAATGATCAAACCGGTTTGACTCGGTTGTTGTTT
TTTCCAAATTTTCCGGCTAGAGTTTGCCTTCCATAAGATACTACATGATTTGAGTCTTAC
TTTTGTTTTCAAACAATCTGTTTTGCTGGTAATAAATGTCACACACACCATCACAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB03TF U 1
AF RR2DS59TF U 32
AF RR2AG51TF U 322
AF RR2AG51JQ C 475
AF RR2DS59JQ C 564
BS 1 70 RR2EB03TF
BS 71 71 RR2DS59TF
BS 72 145 RR2EB03TF
BS 146 146 RR2DS59TF
BS 147 355 RR2EB03TF
BS 356 356 RR2DS59TF
BS 357 385 RR2EB03TF
BS 386 386 RR2DS59TF
BS 387 394 RR2EB03TF
BS 395 395 RR2DS59TF
BS 396 397 RR2EB03TF
BS 398 398 RR2DS59TF
BS 399 505 RR2EB03TF
BS 506 506 RR2DS59TF
BS 507 633 RR2EB03TF
BS 634 634 RR2DS59TF
BS 635 637 RR2EB03TF
BS 638 638 RR2DS59TF
BS 639 653 RR2EB03TF
BS 654 654 RR2DS59TF
BS 655 698 RR2EB03TF
BS 699 734 RR2DS59TF
BS 735 735 RR2AG51TF
BS 736 759 RR2DS59TF
BS 760 760 RR2AG51TF
BS 761 814 RR2DS59TF
BS 815 970 RR2AG51TF
BS 971 1246 RR2AG51JQ
BS 1247 1259 RR2DS59JQ

RD RR2EB03TF 698 0 0
GGATCATCGAGTGTCTCGCCCAAGTGCTTCACCACAAAAACTAAAAAACAAAAAAGACAT
CTTCTCTCCTTGCAAATCCCCCAAAAATGTTCAGATCCATGCTTGTCCGATCCTCCGCCT
CGGCGAAGCAGTCGCTTCTCCGCCGTAACTTCTCATCCGGATCCGTCCCCGAGAGAAAAG
TCGCAATCTTGGGAGCCGCCGGTGGAATCGGTCAGCCTCTCGCTCTCCTCATGAAACTCA
ACCCTCTCGTCTCCAGCCTCTCCCTCTTCGATATCGCCAACACTCCTGGAGTCGCCGCTG
ATGTCGGTCACATCAACACCAGATCTCAGGTTGTTGGATACATGGGAGATGATGAATTGG
CGAAAGCTCTTGAAGGAGCTGACCTCGTTATCATCCCTGCTGGTGTCCCCAGGAAGCCTG
GTATGACCCGTGATGATCTTTTCAACATCAATGCTGGCATTGTCAAGAACCTTGCCTCTG
CCATCGCCAAGTACTGCCCTCATGCACTTGTTAATATGATCAGCAACCCAGTGAACTCCA
CTGTTCCAATTGCAGCTGAGATATTCAAGAAGGCTGGTATGTACGATGAAAAGAAGTTGT
TTGGTGTTACCACTCTTGACGTTGTTAGGGCCAAGACCTTCTATGCTGGAAAG*CTAATG
TCCCTGTTGCAGAAGTGAATGTTCCGGTGATTGGTGGT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2DS59TF 783 0 0
GG
ACAAAAACTAAAAAACAAAAAAGACATCTTCTCTCCTCGCAAATCCCCCAAAAATGTTCA
GATCCATGCTTGTCCGATCCTCCGCCTCGGCGAAGCAGTCGCTTGTCCGCCGCAGCTTCT
CATCCGGATCCGTCCCCGAGCGAAAAGTCGCAATCTTGGGCGCCGCCGGTGGAATCGGTC
AGCCTCTCGCTCTCCTCATGAAACTCAACCCTCTCGTCTCCAGCCTCTCCCTCTTCGATA
TCGCCAACACTCCTGGAGTCGCCGCTGATGTCGGTCACATCAACACCAGATCTCAGGTTG
TTGGATACATGGGAGATGATGAGTTGGCGAAAGCTCTTGAAGGAGCTGACCTAGTTATCA
TTCCAGCTGGTGCCCCCAGGAAGCCTGGTATGACCCGTGATGATCTTTTCAACATCAATG
CTGGCATTGTCAAGAACCTTGCCTCTGCCATCGCCAAGTACTGCCCTCATGCGCTTGTTA
ATATGATCAGCAACCCAGTGAACTCCACTGTTCCAATTGCAGCTGAGATATTCAAGAAGG
CTGGTATGTACGATGAAAAGAAGTTGTTTGGTGTTACCACTCTTGACGTTGTTAGGGCCA
GGACTTTCTATGCTGGAAAGGCTAATGTCCCTGTTGCAGAAGTGAATGTTCCGGTGATTG
GTGGTCATGCTGGGGTTACAATTCTCCCACTCTTCTCTCAG*CCACTCCTCAAGCTAACT
TGTCAG*TGACGTGCTCACCGCTCTCACCAAGCGTACCCAAGATGGAGGTACAGAAGTCG
T

QA 3 783 3 783
DS 

RD RR2AG51TF 649 0 0
GATCTCAGGTTGTTGGATACATGGGAGATGATGAGTTGGCGAAAGCTCTTGAAGGAGCTG
ACCTAGTTATCATTCCAGCTGGTGTCCCCAGGAAGCCTGGTATGACCCGTGATGATCTTT
TCAACATCAATGCTGGCATTGTCAAGAACCTTGCCTCTGCCATCGCCAAGTACTGCCCTC
ATGCGCTTGTTAATATGATCAGCAACCCAGTGAACTCCACTGTTCCAATTGCAGCTGAGA
TATTCAAGAAGGCTGGTATGTACGATGAAAAGAAGTTGTTTGGTGTTACCACTCTTGACG
TTGTTAGGGCCAGGACTTTCTATGCTGGAAAGGCTAATGTCCCTGTTGCAGAAGTGAATG
TTCCGGTGATTGGTGGTCATGCTGGGGTTACAATTCTCCCACTCTTCTCTCAGGCCACTC
CTCAAGCTAACTTGTCAGGTGACGTGCTCACCGCTCTCACCAAGCGTACCCAAGATGGAG
GTACAGAAGTCGTAGAGGCTAAAGCGGGAAAAGGTTCAGCTACATTGTCAATGGCCTATG
CTGGAGCTCTATTCGCTGATGCATGCTTGAAGGGACTCAATGGTGTTCCAGATGTTGTTG
AATGCTCATACGTGCAATCCACAATCACCGAACTTCCTTTCTTTGCCTC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2AG51JQ 772 0 0
CCTCTGCCATCGCCAAGTACTGCCCTCATGCGCTTGTTAATATGATCAGCAACCCAGTGA
ACTCCACTGTTCCAATTGCAGCTGAGATATTCAAGAAGGCTGGTATGTACGATGAAAAGA
AGTTGTTTGGTGTTACCACTCTTGACGTTGTTAGGGCCAGGACTTTCTATGCTGGAAAGG
CTAATGTCCCTGTTGCAGAAGTGAATGTTCCGGTGATTGGTGGTCATGCTGGGGTTACAA
TTCTCCCACTCTTCTCTCAGGCCACTCCTCAAGCTAACTTGTCAGGTGACGTGCTCACCG
CTCTCACCAAGCGTACCCAAGATGGAGGTACAGAAGTCGTAGAGGCTAAAGCGGGAAAAG
GTTCAGCTACATTGTCAATGGCCTATGCTGGAGCTCTATTCGCTGATGCATGCTTGAAGG
GACTCAATGGTGTTCCAGATGTTGTTGAATGCTCATACGTGCAATCCACAATCACCGAAC
TTCCTTTCTTTGCCTCAAAGGTGAGGTTGGGAAAGAACGGCGTGGAGGAGGTTCTTGATT
TGGGCCCACTCTCTGACTTTGAGAAGGAAGGCTTGGAGGCATTGAAGCCTGAACTCAAGT
CTTCCATTGAGAAGGGAATTAAGTTTGCCAACCAATGATCAAACCGGTTTGACTCGGTTG
TTGTTTTTTCCAAATTTTCCGGCTAGAGTTTGCCTTCCATAAGATACTACATGATTTGAG
TCTTACTTTTGTTTTCAAACAATCTGTTTTGCTGGTAATAAATGTCACACAC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2DS59JQ 696 0 0
TTCAAGAAGGCTGGTATGTACGATGAAAAGAAGTTGTTTGGTGTTACCACTCTTGACGTT
GTTAGGGCCAGGACTTTCTATGCTGGAAAGGCTAATGTCCCTGTTGCAGAAGTGAATGTT
CCGGTGATTGGTGGTCATGCTGGGGTTACAATTCTCCCACTCTTCTCTCAGGCCACTCCT
CAAGCTAACTTGTCAGGTGACGTGCTCACCGCTCTCACCAAGCGTACCCAAGATGGAGGT
ACAGAAGTCGTAGAGGCTAAAGCAGGAAAAGGTTCAGCTACATTGCCAATGGCCTATGCT
GGAGCTCTATTCGCTGATGCATGCTTGAAGGGACTCAATGGTGTTCCAGATGTTGTTGAA
TGCTCATACGTGCAATCCACAATCACCGAACTTCCTTTCTTTGCCTCAAAGGTGAGGTTG
GGAAAGAACGGCGTGGAGGAGGTTCTTGATTTGGGCCCACTCTCTGACTTTGAGAAGGAA
GGCTTGGAGGCATTGAAGCCTGAACTCAAGTCTTCCATTGAGAAGGGAATTAAGTTTGCC
AACCAATGATCAAACCGGTTTGACTCGGTTGTTGTTTTTTCCAAATTTTCCGGCTAGAGT
TTGCCTTCCATAAGATACTACATGATTTGAGTCTTACTTTTGTTTTCAAACAATCTGTTT
TGCTGGTAATAAATGTCACACACACCATCACAAACT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 2 5

CO CL1632Contig1 1029 3 27 U
CGCATAACAGATGCATTCCAACACTAAGAGAAAGCTTTAGCATAAAGAACCAAAGCAAAG
GTATAATGGTTTTTTGGTATATTATTATAACTTTTGTTTTTCTTAAAATCTTATTTCGTG
AAAACTGAAAATAAAATGACTTTCATTATAATTAGTTTTTTCTTAAACTATTACTTGGTT
TAGAGTCTTGAGGGCATTCCTCCAGCGACGACCAAAGTTTCACCGGTGATGTAAGAAGAA
TCATCAAATGCTAAGAAAGCCGCAGCAGCAGCCATGTCTCCTGTTGTTCCCAACCTGTTA
AGCAGAGTCTTCTCTTCGATGCTCTCCCTCACTTGGGAGTTCCCGGTGATGAAAGAAGCA
AAATGTGTGGGCACAAAAACGGGAGCAACCGCGTTCACACGTGTGTCCGGACCCATCTCA
GCAGCAAGAGCCTTGGTTAGTCCGAGAAGAGCAGTCTTAGTGACACCATACATAGCCATG
GATCCTTGTGGTTGAAATACAGCGATGGAAGTAATGAAGATAACAGAAGAACCCTTCTCT
AAGTGAGGAGCCATATCCTGAAGGAGAAGTATAGATGATTCGACATTGATTTCCCAAAGC
TTGTCGAGGACAGCTTCTTTGGTGGACAAGATTGGGTCTGTAGATGGATTAGCAGCGGCG
TTACAGACAACGATATCTATCTTTCCATATTTCTGAACAGTTTTTTCGACAAGATCTCGG
CGATGTTGAGCATTGGAAACGTGACGGCGATTCCATAAGCATCAATCCCTTTTGATTTGA
GTTTTTCTACTGCTTCCTCAACATTTGCCTGCTTGCGGGAAGAAACGACGACGGAAGCGC
CTTCGAGACCGAAACGCTCGATGATACCGAAGCCGATCCCTTGCGTCGAGGCCGTTACTA
TCGCCACCTTTCCTTCCAATCTCCTCCCTATCTTCTTCCCCTCCATTTCTCTCTCTCTTG
TCTTTTTTTTTTTTTGCTTCTTTCTCTCTCTTAGCCGATGATGATTGATGAATGATGAGT
GTGATGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E194JQ U 1
AF RR2AQ50JQ U 63
AF RR2AQ50TF C 289
BS 1 304 RR2E194JQ
BS 305 305 RR2AQ50JQ
BS 306 323 RR2E194JQ
BS 324 324 RR2AQ50JQ
BS 325 341 RR2E194JQ
BS 342 342 RR2AQ50JQ
BS 343 344 RR2E194JQ
BS 345 345 RR2AQ50JQ
BS 346 362 RR2E194JQ
BS 363 363 RR2AQ50JQ
BS 364 378 RR2E194JQ
BS 379 379 RR2AQ50JQ
BS 380 498 RR2E194JQ
BS 499 499 RR2AQ50JQ
BS 500 503 RR2E194JQ
BS 504 504 RR2AQ50JQ
BS 505 512 RR2E194JQ
BS 513 513 RR2AQ50JQ
BS 514 527 RR2E194JQ
BS 528 528 RR2AQ50JQ
BS 529 575 RR2E194JQ
BS 576 576 RR2AQ50JQ
BS 577 580 RR2E194JQ
BS 581 582 RR2AQ50JQ
BS 583 638 RR2E194JQ
BS 639 801 RR2AQ50JQ
BS 802 1029 RR2AQ50TF

RD RR2E194JQ 647 0 0
CGCATAACAGATGCATTCCAACACTAAGAGAAAGCTTTAGCATAAAGAACCAAAGCAAAG
GTATAATGGTTTTTTGGTATATTATTATAACTTTTGTTTTTCTTAAAATCTTATTTCGTG
AAAACTGAAAATAAAATGACTTTCATTATAATTAGTTTTTTCTTAAACTATTACTTGGTT
TAGAGTCTTGAGGGCATTCCTCCAGCGACGACCAAAGTTTCACCGGTGATGTAAGAAGAA
TCATCAAATGCTAAGAAAGCCGCAGCAGCAGCCATGTCTCCTGTTGTTCCCAACCTGTTA
AGCAAAGTCTTCTCTTCGATGCTTTCCCTCACTTGGGAGTTTCCAGTGATGAAAGAAGCA
AAGTGTGTGGGCACAAAACCGGGAGCAACCGCGTTCACACGTGTGTCCGGACCCATCTCA
GCAGCAAGAGCCTTGGTTAGTCCGAGAAGAGCAGTCTTAGTGACACCATACATAGCCATG
GATCCTTGTGGTTGAAATCCAGCAATGGAAGTTATGAAGATAACAGAGGAACCCTTCTCT
AAGTGAGGAGCCATATCCTGAAGGAGAAGTATAGAGGATTTAACATTGATTTCCCAAAGC
TTGTCGAGGACAGCTTCTTTGGTGGACAAGATTGGGTC
CGTTGATGG

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2AQ50JQ 739 0 0
ATAATGGTTTTTTGGTATATTATTATAACTTTTGTTTTTCTTAAAATCTTATTTCGTGAA
AACTGAAAATAAAATGACTTTCATTATAATTAGTTTTTTCTTAGACTATTACTTGGTTTA
GAGTCTTGAGGGCATTCCTCCAGCGACGACCAAAGTTTCACCGGTGATGTAAGAAGAATC
ATCAGATGCTAAGAAAGCCGCAGCAGCAGCCATGTCTCCTGTTGTTCCCAACCTGTTAAG
CAGAGTCTTCTCTTCGATGCTCTCCCTCACTTGGGAGTTCCCGGTGATGAAAGAAGCAAA
ATGTGTGGGCACAAAAACGGGAGCAACCGCGTTCACACGTGTGTCCGGACCCATCTCAGC
AGCAAGAGCCTTGGTTAGTCCGAGAAGAGCAGTCTTAGTGACACCATACATAGCCATGGA
TCCTTGTGGTTGAAATACAGCGATGGAAGTAATGAAGATAACAGAAGAACCCTTCTCTAA
GTGAGGAGCCATATCCTGAAGGAGAAGTATAGATGATTCGACATTGATTTCCCAAAGCTT
GTCGAGGACAGCTTCTTTGGTGGACAAGATTGGGTCTGTAGATGGATTAGCAGCGGCGTT
ACAGACAACGATATCTATCTTTCCATATTTCTGAACAGTTTTTTCGACAAGATCTCGGCG
ATGTTGAGCATTGGAAACGTGACGGCGATTCCATAAGCATCAATCCCTTTTGATTTGAGT
TTTTCTACTGCTTCCTCAA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2AQ50TF 741 0 0
CCCAACCTGTTAAGCAGAGTCTTCTCTTCGATGCTCTCCCTCACTTGGGAGTTCCCGGTG
ATGAAAGAAGCAAAATGTGTGGGCACAAAAACGGGAGCAACCGCGTTCACACGTGTGTCC
GGACCCATCTCAGCAGCAAGAGCCTTGGTTAGTCCGAGAAGAGCAGTCTTAGTGACACCA
TACATAGCCATGGATCCTTGTGGTTGAAATACAGCGATGGAAGTAATGAAGATAACAGAA
GAACCCTTCTCTAAGTGAGGAGCCATATCCTGAAGGAGAAGTATAGATGATTCGACATTG
ATTTCCCAAAGCTTGTCGAGGACAGCTTCTTTGGTGGACAAGATTGGGTCTGTAGATGGA
TTAGCAGCGGCGTTACAGACAACGATATCTATCTTTCCATATTTCTGAACAGTTTTTTCG
ACAAGATCTCGGCGATGTTGAGCATTGGAAACGTGACGGCGATTCCATAAGCATCAATCC
CTTTTGATTTGAGTTTTTCTACTGCTTCCTCAACATTTGCCTGCTTGCGGGAAGAAACGA
CGACGGAAGCGCCTTCGAGACCGAAACGCTCGATGATACCGAAGCCGATCCCTTGCGTCG
AGGCCGTTACTATCGCCACCTTTCCTTCCAATCTCCTCCCTATCTTCTTCCCCTCCATTT
CTCTCTCTCTTGTCTTTTTTTTTTTTTGCTTCTTTCTCTCTCTTAGCCGATGATGATTGA
TGAATGATGAGTGTGATGCCC

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL1632Contig2 728 2 1 U
GGATCACACTCATCATTCATCAATCATCATCGGCTAAGAGAGAGAGAAAGAAGCAAAAGA
AAAGAGATAGAGAGAGAGAAATGGAGGGGAAGAAGATAGCTAGGAGGCTGGAAGGAAAGG
TTGCGATAGTAACAGCTTCGACGCAAGGGATTGGCTTCGGTATCATCGAGCGTTTCGGTC
TCGAAGGCGCTTCCGTCGTCGTTTCTTCCCGCAAGCAGGCAAATGTTGAGGAAGCAGTAG
AAAAACTCAAATCCAAAGGGATTGATGCTTATGGAATCGTCTGTCACGTTTCCAATGCTC
AACATCGCCGAGATCTTGTCGAAAAAACTGTTCAGAAATATGGAAAGATAGATATCATTG
TCTGTAACGCCGCTGCTAATCCATCAACGGACCCAATCTTGTCCACCAAAGAAGCTGTCC
TCGACAAGCTTTGGGAAATCAATGTTAAATCCTCTATACTTCTCCTTCAGGATATGGCTC
CTCACTTAGAGAAGGGTTCCTCTGTTATCTTCATAACTTCCATTGCTGGATTTCAACCAC
AAGGATCCATGGCTATGTATGGTGTCACTAAGACTGCTCTTCTCGGACTAACCAAGGCTC
TTGCTGCTGAGATGGGTCCGGACACACGTGTGAACGCGGTTGCTCCCGGTTTTGTGCCCA
CACACTTTGCTTCTTTCATCACTGGAAACTCCCAAGTGAGGGAAAGCATCGAAGAGAGAC
TCTGCTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP46TF U 117
AF RR2E194TF U 1
BS 1 728 RR2E194TF

RD RR2GP46TF 477 0 0
AAGGTTGCGATAGTAACAGCTTCGACGCAAGGGATTGGCTTCGGTATCATCGAGCGTTTC
GGTCTCGAAGGCGCTTCCGTCGTCGTTTCTTCCCGCAAGCAGGCAAATGTTGAGGAAGCA
GTAGAAAAACTCAAATCCAAAGGGATTGATGCTTATGGAATCGTCTGTCACGTTTCCAAT
GCTCAACATCGCCGAGATCTTGTCGAAAAAACTGTTCAGAAATATGGAAAGATAGATATC
ATTGTCTGTAACGCCGCTGCTAATCCATCAACGGACCCAATCTTGTCCACCAAAGAAGCT
GTCCTCGACAAGCTTTGGGAAATCAATGTTAAATCCTCTATACTTCTCCTTCAGGATATG
GCTCCTCACTTAGAGAAGGGTTCCTCTGTTATCTTCATAACTTCCATTGCTGGATTTCAA
CCACAAGGATCCATGGCTATGTATGGTGTCACTAAGACTGCTCTTCTCGGACTAACC

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2E194TF 728 0 0
GGATCACACTCATCATTCATCAATCATCATCGGCTAAGAGAGAGAGAAAGAAGCAAAAGA
AAAGAGATAGAGAGAGAGAAATGGAGGGGAAGAAGATAGCTAGGAGGCTGGAAGGAAAGG
TTGCGATAGTAACAGCTTCGACGCAAGGGATTGGCTTCGGTATCATCGAGCGTTTCGGTC
TCGAAGGCGCTTCCGTCGTCGTTTCTTCCCGCAAGCAGGCAAATGTTGAGGAAGCAGTAG
AAAAACTCAAATCCAAAGGGATTGATGCTTATGGAATCGTCTGTCACGTTTCCAATGCTC
AACATCGCCGAGATCTTGTCGAAAAAACTGTTCAGAAATATGGAAAGATAGATATCATTG
TCTGTAACGCCGCTGCTAATCCATCAACGGACCCAATCTTGTCCACCAAAGAAGCTGTCC
TCGACAAGCTTTGGGAAATCAATGTTAAATCCTCTATACTTCTCCTTCAGGATATGGCTC
CTCACTTAGAGAAGGGTTCCTCTGTTATCTTCATAACTTCCATTGCTGGATTTCAACCAC
AAGGATCCATGGCTATGTATGGTGTCACTAAGACTGCTCTTCTCGGACTAACCAAGGCTC
TTGCTGCTGAGATGGGTCCGGACACACGTGTGAACGCGGTTGCTCCCGGTTTTGTGCCCA
CACACTTTGCTTCTTTCATCACTGGAAACTCCCAAGTGAGGGAAAGCATCGAAGAGAGAC
TCTGCTTA

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

CO CL1633Contig1 841 3 14 U
GAACATAGCAACTCTTAATGGCGGTATAAAAGGGGGACACCATAGTACACATTAAACTTA
ACCCAGATTCGAAAGAAGGTAGCATCTAAGTCCTCGAAGATAAAAAAAAAGTTCACAAAG
ATTCGATAGATATTTGCTCATATGTTTGAAGGAGGAAAGACTGCTTTATTACGGGCTCTT
CAGGGCTGCGATGGTGTAGGAGATGTTGGAGGCTTCAAGTCAGGGTACGCTGCATATGGT
GAGAGTGGTCTTGAATAAGATTTTGGTTTGTCTTCTGTCTTGGTTGGTTCTGTGATTACT
TGTGCAGTGGCCGCTTCAGCCGTTGGCTCCGAGATTGCTTGTGCAGTGGCGGCTGTCTCT
GAGTTTACCTGTGCAGTGGCGGCTTTGATTACTGGCTCAGGTTCTGGTTTCTCGACCGTG
GTTGTAGGTGCTTCTGCTGCTACTGCTGCAGGTGAGGGAAGAGCTTTGCTGCTTGTTGAT
GGAGGAAGAAGAGCCTTACCTATGTCCTTTAACTCATCAACAAGTTCTTTAGGTGCAATC
TTTGTGTTCAAGAACTCATCCACTTGTTTTAGAGTTTGCTTTCGGTCCTCAGCAAATAGA
AGTTTCTTGCCTGCAAGCTGAACAAGTGCAGCTGAACCTAATAGTTGAAGTATGGTTTCA
ATCTCTGTAAATGCTAAAGCACTTAATCCAGCAGCAGCAGCTACTCCAATTGCAACAGAG
ACACCATCAGAACTCTCGCCAAATACACCGCTGATACTATCAGTCAAACTGCTCAAATCA
AGACTGAGAGTCTTCTTTGGCTCTATCCAAGGCAATCCGCTATTCAACCAGCCCCTAGGT
C


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2CX24JQ U 2
AF RR2G790JQ U 1
AF RR2EG41TF C 115
BS 1 464 RR2G790JQ
BS 465 465 RR2CX24JQ
BS 466 687 RR2G790JQ
BS 688 688 RR2EG41TF
BS 689 724 RR2G790JQ
BS 725 725 RR2EG41TF
BS 726 767 RR2G790JQ
BS 768 768 RR2EG41TF
BS 769 776 RR2G790JQ
BS 777 777 RR2EG41TF
BS 778 780 RR2G790JQ
BS 781 781 RR2EG41TF
BS 782 797 RR2G790JQ
BS 798 841 RR2EG41TF

RD RR2CX24JQ 626 0 0
AACATAGCAACTCTTAATGGCGGTATAAAAGGGGGACACCATAGTACACATTAAACTTAA
CCCAGATTCGAAAGAAGGTAGCATCTAAGTCCTCGAAGATAAAAAAAAAGTTCACAAAGA
TTCGATAGATATTTGCTCATATGTTTGAAGGAGGAAAGACTGCTTTATTACGGGCTCTTC
AGGGCTGCGATGGTGTAGGAGATGTTGGAGGCTTCAAGTCAGGGTACGCTGCATATGGTG
AGAGTGGTCTTGAATAAGATTTTGGTTTGTCTTCTGTCTTGGTTGGTTCTGTGATTACTT
GTGCAGTGGCCGCTTCAGCCGTTGGCTCCGAGATTGCTTGTGCAGTGGCGGCTGTCTCTG
AGTTTACCTGTGCAGTGGCGGCTTTGATTACTGGCTCAGGTTCTGGTTTCTCGACCGTGG
TTGTAGGTGCTTCTGCTGCTACTGCTGCAGGTGCGGGAAGAGCTTTGCTGCTTGTTGATG
GAGGAAGAAGAGCCTTACCTATGTCCTTTAACTCATCAACAAGTTCTTTAGGTGCAATCT
TTGTGTTCAAGAACTCATCCACTTGTTTTAGAGTTTGCTTTCGGTCCTCAGCAAATAGAA
GTTTCTTGCCTGCAAGCTGAACAAGT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2G790JQ 805 0 0
GAACATAGCAACTCTTAATGGCGGTATAAAAGGGGGACACCATAGTACACATTAAACTTA
ACCCAGATTCGAAAGAAGGTAGCATCTAAGTCCTCGAAGATAAAAAAAAAGTTCACAAAG
ATTCGATAGATATTTGCTCATATGTTTGAAGGAGGAAAGACTGCTTTATTACGGGCTCTT
CAGGGCTGCGATGGTGTAGGAGATGTTGGAGGCTTCAAGTCAGGGTACGCTGCATATGGT
GAGAGTGGTCTTGAATAAGATTTTGGTTTGTCTTCTGTCTTGGTTGGTTCTGTGATTACT
TGTGCAGTGGCCGCTTCAGCCGTTGGCTCCGAGATTGCTTGTGCAGTGGCGGCTGTCTCT
GAGTTTACCTGTGCAGTGGCGGCTTTGATTACTGGCTCAGGTTCTGGTTTCTCGACCGTG
GTTGTAGGTGCTTCTGCTGCTACTGCTGCAGGTGAGGGAAGAGCATTGCTGCTTGTTGAT
GGAGGAAGAAGAGCCTTACCTATGTCCTTTAACTCATCAACAAGTTCTTTAGGTGCAATC
TTTGTGTTCAAGAACTCATCCACTTGTTTTAGAGTTTGCTTTCGGTCCTCAGCAAATAGA
AGTTTCTTGCCTGCAAGCTGAACAAGTGCAGCTGAACCTAATAGTTGAAGTATGGTTTCA
ATCTCTGTAAATGCTAAAGCACTTAATTCAGCAGCAGCAGCTACTCCAATTGCAACAGAG
ACAC*ATCAGAACTCTCGCCAAATACACCGCTGATACTATCAGTCAA*CTGCTCAA*TCA
*GACTGAGAGTCTTCTT
GGCTCTAT

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2EG41TF 727 0 0
TCACAAAGATCGATAGATA
TTGCTCATATGTT*GAAGGAGGAAAGACTGCTTTATTACGGGCTCTTCAGGGCTGCGATG
GTGTAGGAGATGTTGGAGGCTTCAAGTCAGGGTACGCTGCATATGGTGAGAGTGGTCTTG
AATAAGATTTTGGTTTGTCTTCTGTCTTGGTTGGTTCTGTGATTACTTGTGCAGTGGCCG
CTTCAGCCGTTGGCTCCGAGATTGCTTGTGCAGTGGCGGCTGTCTCTGAGTTTACCTGTG
CAGTGGCGGCTTTGATTACTGGCTCAGATTCTGGTTTCTCGACCGTGGTTGTAGGTGCTT
CTGCTGCTACTGCTGCAGGTGTGGGAAGAGCTTTGCTGCTTGTTGATGGAGGAAGAAGAG
CCTTACCTATGTCCTTTAACTCATCAACAAGTTCTTTAGGTGCAATCTTTGTGTTCAAGA
ACTCATCCACTTGTTTTAGAGTTTGCTTTCGGTCCTCAGCAAATAGAAGTTTCTTGCCTG
CAAGCTGAACAAGTGCAGCTGAACCTAATAGTTGAAGTATGGTTTCAATCTCTGTAAATG
CTAAAGCACTTAATCCAGCAGCAGCAGCTACTCCAATTGCAACAGAGACACCATCAGCAC
TCTCGCCAAATACACCGCTGATACTATCAGTCAAACTGCTCAAATCAAGACTGAGAGTCT
TCTTTGGCTCTATCCAAGGCAATCCGCTATTCAACCAGCCCCTAGGTC

QA 20 727 20 727
DS 



AS 2 5

CO CL1634Contig1 998 2 4 U
GGGTTTCAGAGAATGGAGTTCCAAAACCGGTACGGACTTACAACGACGCAGAAGTACGAC
TGTCTCTTATTCGATTTGGACGATACTCTTTATCCTCTTAGCACCGGAATCGCAAGAGAG
TGTGGGCAGAACATCAAAGATTATATGGTCGAGGAACTCGGTATTCCGAAGGACAAAATC
GTTGAATTGTCTAATCTTCTCTACAAGAACTATGGAACAACAATGGCCGGTCTTAGAGCG
ATCGGATATGACTTTGACTACGATGAATATCATAGCTTCGTCCACGGTCGTTTACCGTAC
GACAACATAAAACCTGACCCTGTTCTTCGAAGCCTTTTGCTTAGCCTTCCTCTCCGCAAA
GTCATATTCACGAACGCGGATAGAGTTCACGCGGTCAAGGCGTTGAAGAGGCTGGGATTA
GAGGATTGTTTCGAAGGGATCATATGTTTCGAAACACTTAACCCGACGCACACAAACGCA
GTGTCTGGAAATACCGATATTTTTGATATCTTTGGACATTTCTACCGGTCTGAACCGGTT
AGTTTGCTTCCGAAAACGCCTATTGTGTGTAAACCGTCAGAAGCCGCTATTGAGAAAGCT
CTCGAAATCGCCAATATTGACCCTAACCGAACGCTGTTCTTTGAGGACAGTGTCCGAAAT
GTACAAGCTGGAAAACGCGTTGGTCTCGACACGGTTCTGGTTGGTGCATCAAACAAAGTC
AAAGGAGCAGATTACGCCTTCGAAAACATTCACAACATGAAGGAGGCGTTACCAGAGTTA
TGGAAATCGGACAGAAAATCAGCTGATGTTGGATATTCGGGCAAGGTCGCCGTTGAGACA
CCTGTCACAGCGTAGGACTGTTTCACCGTTGTACCTAATTTTCATCCACTGTCATTTTCA
ATCTTTTTTTCAAATGACGTTATGTCATTTTTGTTTTTCGAGTCGTGTTTATAAATTTAA
ATAAAAGCAGGAAATAATCTTCATCTAGTTTGCAACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK18TF U 1
AF RR2EK18JQ C 210
BS 1 674 RR2EK18TF
BS 675 675 RR2EK18JQ
BS 676 697 RR2EK18TF
BS 698 998 RR2EK18JQ

RD RR2EK18TF 697 0 0
GGGTTTCAGAGAATGGAGTTCCAAAACCGGTACGGACTTACAACGACGCAGAAGTACGAC
TGTCTCTTATTCGATTTGGACGATACTCTTTATCCTCTTAGCACCGGAATCGCAAGAGAG
TGTGGGCAGAACATCAAAGATTATATGGTCGAGGAACTCGGTATTCCGAAGGACAAAATC
GTTGAATTGTCTAATCTTCTCTACAAGAACTATGGAACAACAATGGCCGGTCTTAGAGCG
ATCGGATATGACTTTGACTACGATGAATATCATAGCTTCGTCCACGGTCGTTTACCGTAC
GACAACATAAAACCTGACCCTGTTCTTCGAAGCCTTTTGCTTAGCCTTCCTCTCCGCAAA
GTCATATTCACGAACGCGGATAGAGTTCACGCGGTCAAGGCGTTGAAGAGGCTGGGATTA
GAGGATTGTTTCGAAGGGATCATATGTTTCGAAACACTTAACCCGACGCACACAAACGCA
GTGTCTGGAAATACCGATATTTTTGATATCTTTGGACATTTCTACCGGTCTGAACCGGTT
AGTTTGCTTCCGAAAACGCCTATTGTGTGTAAACCGTCAGAAGCCGCTATTGAGAAAGCT
CTCGAAATCGCCAATATTGACCCTAACCGAACGCTGTTCTTTGAGGACAGTGTCCGAAAT
GTACAAGCTGGAAA*CGCGTTGGTCTCGACACGGTTC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2EK18JQ 789 0 0
CTATGGAACA*CAATGGCCGGTCT*AGAGCGATCGGATATGACTT*GACTACGATGAATA
TCATAGCTTCGTCCACGGTCGTTTACCGTACGACAACATAAAACCTGACCCTGTTCTTCG
AAGCCTTTTGCTTAGCCTTCCTCTCCGCAAAGTCATATTCACGAACGCGGATAGAGTTCA
CGCGGTCAAGGCGTTGAAGAGGCTGGGATTAGAGGATTGTTTCGAAGGGATCATATGTTT
CGAAACACTTAACCCGACGCACACAAACGCAGTGTCTGGAAATACCGATATTTTTGATAT
CTTTGGACATTTCTACCGGTCTGAACCGGTTAGTTTGCTTCCGAAAACGCCTATTGTGTG
TAAACCGTCAGAAGCCGCTATTGAGAAAGCTCTCGAAATCGCCAATATTGACCCTAACCG
AACGCTGTTCTTTGAGGACAGTGTCCGAAATGTACAAGCTGGAAAACGCGTTGGTCTCGA
CACGGTTCTGGTTGGTGCATCAAACAAAGTCAAAGGAGCAGATTACGCCTTCGAAAACAT
TCACAACATGAAGGAGGCGTTACCAGAGTTATGGAAATCGGACAGAAAATCAGCTGATGT
TGGATATTCGGGCAAGGTCGCCGTTGAGACACCTGTCACAGCGTAGGACTGTTTCACCGT
TGTACCTAATTTTCATCCACTGTCATTTTCAATCTTTTTTTCAAATGACGTTATGTCATT
TTTGTTTTTCGAGTCGTGTTTATAAATTTAAATAAAAGCAGGAAATAATCTTCATCTAGT
TTGCAACAG

QA 1 789 1 789
DS 



CO CL1634Contig2 1022 3 4 U
AAATTTATAAACACGACTCGAAAAACAAAAATGACATAACGTCATTTGAAAAAAAAGATT
GAAAATGACAGTGGATGAAAATTAGGTACAACGGTGAAACAGTCCTACCCTGTAACAGGT
GTCTCAACGGCGACCTTGCCTGAATATCCAACATCAGCTGATTTTCTGTCCGATTTCCAT
AACTCTGGTAATGCCTCCTTCATGTTGTGAATGTTTTCGAAGACGTAATCTGCTCCTTTG
ACTTTGTTTGATGCACCAACCAGAACCGTGTCGAGACCAACGCGTTTTCCAGCTTGTACA
TTTCGGACACTGTCCTCAAAGAACAGCGTTCGGTTAGGGTCAATATTGGCGATTTCGAGA
GCTTTCTCAATAGCGGCTTCGGACGGTTTACACACGATAGGCGTTTTCGGAAGTAAGCTA
ACCGGTTCAGACCGGTCGAAATGTCCAACGATATCAAAAATCTCGGTATTTCCAGACGCA
GCGTTTGTGTGCGTCGGGTTAAGCGTTTCGAAACATATGATTCCTTCGAAACAATCCTCT
AATCCCAGCCTCTTCAGCGCCTTGACCGCGTGAACTCTATCCGCATTTGTGAATATGACT
TTGCGGAGAGGAAGGCTAAGCAAGAGGCTTCGAAGAACAGGGTCAGGTTTTATGTTGTCG
TACGGTAAACGACCGTGGACGAAGCTATGATATTCATCGTAGTCAAAATATATCCGATCG
CTCTAAGACCGGCCATTGTTGTTCCATAGTTCTTGTAGAGAAGATTAGACAATTCAACGA
TTTTGTCCTTCGGTATACCGAGTTCCTCGACCATATAGTCTTTGATGTTCTGCCCACACT
CCCTTGCGATTCCGGTGCTAAGAGGATAAAGAGTATCGTCCAAATCAAACAAGAGACAGT
CGTACTTCTGCGTCGTTGTAAGTCCGTACCGGTTTTCGAACTCCATTCTCTTAAGCTTAG
AACAGAAGCTGGCGGATGTAGAGAGAGAAAGAGCAGAATATGTTAAGAAAGAGAAGGTGT
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2GC96JQ U 32
AF RR2ES05JQ U 1
AF RR2ES05TF C 387
BS 1 108 RR2ES05JQ
BS 109 109 RR2GC96JQ
BS 110 613 RR2ES05JQ
BS 614 1022 RR2ES05TF

RD RR2GC96JQ 115 0 0
TGACATAACGTCATTTGAAAAAAAAGATTGGAAATGACAGTGGATGAAAATTAGGTACAA
CGGTGAAACAGTCCTACCCTGTAACAGGTGTCTCAACGGCGACCTTGCCTGAATA

QA 1 115 1 115
DS 

RD RR2ES05JQ 613 0 0
AAATTTATAAACACGACTCGAAAAACAAAAATGACATAACGTCATTTGAAAAAAAAGATT
GAAAATGACAGTGGATGAAAATTAGGTACAACGGTGAAACAGTCCTACGCTGTAACAGGT
GTCTCAACGGCGACCTTGCCTGAATATCCAACATCAGCTGATTTTCTGTCCGATTTCCAT
AACTCTGGTAATGCCTCCTTCATGTTGTGAATGTTTTCGAAGACGTAATCTGCTCCTTTG
ACTTTGTTTGATGCACCAACCAGAACCGTGTCGAGACCAACGCGTTTTCCAGCTTGTACA
TTTCGGACACTGTCCTCAAAGAACAGCGTTCGGTTAGGGTCAATATTGGCGATTTCGAGA
GCTTTCTCAATAGCGGCTTCGGACGGTTTACACACGATAGGCGTTTTCGGAAGTAAGCTA
ACCGGTTCAGACCGGTCGAAATGTCCAACGATATCAAAAATCTCGGTATTTCCAGACGCA
GCGTTTGTGTGCGTCGGGTTAAGCGTTTCGAAACATATGATTCCTTCGAAACAATCCTCT
AATCCCAGCCTCTTCAGCGCCTTGACCGCGTGAACTCTATCCGCATTTGTGAATATGACT
TTGCGGAGAGGAA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2ES05TF 636 0 0
TTTACACACGATAGGCGTTTTCGGAAGTAAGCTAACCGGTTCAGACCGGTCGAAATGTCC
AACGATATCAAAAATCTCGGTATTTCCAGACGCAGCGTTTGTGTGCGTCGGGTTAAGCGT
TTCGAAACATATGATTCCTTCGAAACAATCCTCTAATCCCAGCCTCTTCAGCGCCTTGAC
CGCGTGAACTCTATCCGCATTTGTGAATATGACTTTGCGGAGAGGAAGGCTAAGCAAGAG
GCTTCGAAGAACAGGGTCAGGTTTTATGTTGTCGTACGGTAAACGACCGTGGACGAAGCT
ATGATATTCATCGTAGTCAAAATATATCCGATCGCTCTAAGACCGGCCATTGTTGTTCCA
TAGTTCTTGTAGAGAAGATTAGACAATTCAACGATTTTGTCCTTCGGTATACCGAGTTCC
TCGACCATATAGTCTTTGATGTTCTGCCCACACTCCCTTGCGATTCCGGTGCTAAGAGGA
TAAAGAGTATCGTCCAAATCAAACAAGAGACAGTCGTACTTCTGCGTCGTTGTAAGTCCG
TACCGGTTTTCGAACTCCATTCTCTTAAGCTTAGAACAGAAGCTGGCGGATGTAGAGAGA
GAAAGAGCAGAATATGTTAAGAAAGAGAAGGTGTCC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 5

CO CL1635Contig1 648 5 3 U
GGAAAAGAGTCGTACATTGATAAGTAGAGTTTGGTCTCTCGATTCTTTTTCTTTTTCGAA
GAAACAAAATGGCTTGGGATTTGTTCTTATGGATCCTCTCCTTCTTCGTCAGCTTAGCTC
TCGTCGCTTCCGTCTTCTATCAGGTTATATGTTTAACGGATTTAGAAGCTGATTACTTGA
ACCCTTTTGAAACATCATCTCGTATCAACCGATTGATACTACCTGAGTTTATCCTCCAAG
CCTCACTCTGCATTCTCTTCCTCATCACATGGCATTGGGTGTTTTTTCTAGTCGCTCTCC
CTGTAACATGCTATCACGCTATGCTATACAAAGAGCGAAGACATCTCATAGATGTCACTG
AAGTGTTCCGTGGTATTAGCTTTGAAAAGAAGCTCCGGTTTACCAAGCTCGGTTTCTACA
TCTTTCTCTTCATCATGGTTGTCTTTAGGCTTACTCTTTCAGCGGTCTATAGCTTCACTG
AGGATGATGATCTACTTCATTTGTTTTGATGTACTCTTATTTGTTTTCTCAGTGTGTGTG
TTGTGTTATAGACATTTCTTAGGGATTTACTCAAAACTTCACAGGACATCAGATTGCTCT
CACAAGCTAAATCGCAAACTAATTAGAGAAAAAAAGGAAGATTTCCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF27TF U 1
AF RR2BF27JQ C 96
AF RR2CH38TF U 1
AF RR2AE78TF U 72
AF RR2CH38JQ C 282
BS 1 587 RR2BF27TF
BS 588 627 RR2CH38TF
BS 628 648 RR2CH38JQ

RD RR2BF27TF 587 0 0
GGAAAAGAGTCGTACATTGATAAGTAGAGTTTGGTCTCTCGATTCTTTTTCTTTTTCGAA
GAAACAAAATGGCTTGGGATTTGTTCTTATGGATCCTCTCCTTCTTCGTCAGCTTAGCTC
TCGTCGCTTCCGTCTTCTATCAGGTTATATGTTTAACGGATTTAGAAGCTGATTACTTGA
ACCCTTTTGAAACATCATCTCGTATCAACCGATTGATACTACCTGAGTTTATCCTCCAAG
CCTCACTCTGCATTCTCTTCCTCATCACATGGCATTGGGTGTTTTTTCTAGTCGCTCTCC
CTGTAACATGCTATCACGCTATGCTATACAAAGAGCGAAGACATCTCATAGATGTCACTG
AAGTGTTCCGTGGTATTAGCTTTGAAAAGAAGCTCCGGTTTACCAAGCTCGGTTTCTACA
TCTTTCTCTTCATCATGGTTGTCTTTAGGCTTACTCTTTCAGCGGTCTATAGCTTCACTG
AGGATGATGATCTACTTCATTTGTTTTGATGTACTCTTATTTGTTTTCTCAGTGTGTGTG
TTGTGTTATAGACATTTCTTAGGGATTTACTCAAAACTTCACAGGAC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2BF27JQ 492 0 0
CTCTCCTTCTTCGTCAGCTTAGCTCTCGTCGCTTCCGTCTTCTATCAGGTTATATGTTTA
ACGGATTTAGAAGCTGATTACTTGAACCCTTTTGAAACATCATCTCGTATCAACCGATTG
ATACTACCTGAGTTTATCCTCCAAGCCTCACTCTGCATTCTCTTCCTCATCACATGGCAT
TGGGTGTTTTTTCTAGTCGCTCTCCCTGTAACATGCTATCACGCTATGCTATACAAAGAG
CGAAGACATCTCATAGATGTCACTGAAGTGTTCCGTGGTATTAGCTTTGAAAAGAAGCTC
CGGTTTACCAAGCTCGGTTTCTACATCTTTCTCTTCATCATGGTTGTCTTTAGGCTTACT
CTTTCAGCGGTCTATAGCTTCACTGAGGATGATGATCTACTTCATTTGTTTTGATGTACT
CTTATTTGTTTTCTCAGTGTGTGTGTTGTGTTATAGACATTTCTTAGGGATTTACTCAAA
ACTTCACAGGAC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR2CH38TF 634 0 0
GGAAAAGAGTCGTACATTGATAAGTAGAGTTTGGTCTCTCGATTCTTTTTCTTTTTCGAA
GAAACAAAATGGCTTGGGATTTGTTCTTATGGATCCTCTCCTTCTTCGTCAGCTTAGCTC
TCGTCGCTTCCGTCTTCTATCAGGTTATATGTTTAACGGATTTAGAAGCTGATTACTTGA
ACCCTTTTGAAACATCATCTCGTATCAACCGATTGATACTACCTGAGTTTATCCTCCAAG
CCTCACTCTGCATTCTCTTCCTCATCACATGGCATTGGGTGTTTTTTCTAGTCGCTCTCC
CTGTAACATGCTATCACGCTATGCTATACAAAGAGCGAAGACATCTCATAGATGTCACTG
AAGTGTTCCGTGGTATTAGCTTTGAAAAGAAGCTCCGGTTTACCAAGCTCGGTTTCTACA
TCTTTCTCTTCATCATGGTTGTCTTTAGGCTTACTCTTTCAGCGGTCTATAGCTTCACTG
AGGATGATGATCTACTTCATTTGTTTTGATGTACTCTTATTTGTTTTCTCAGTGTGTGTG
TTGTGTTATAGACATTTCTTAGGGATTTACTCAAAACTTCACAGGACATCAGATTGCTCT
CACAAGCTAAATCGCAAACTAATTAGA
GAAAAAA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2AE78TF 557 0 0
GCTTGGGATTTGTTCTTATGGATCCTCTCCTTCTTCGTCAGCTTAGCTCTCGTCGCTTCC
GTCTTCTATCAGGTTATATGTTTAACGGATTTAGAAGCTGATTACTTGAACCCTTTTGAA
ACATCATCTCGTATCAACCGATTGATACTACCTGAGTTTATCCTCCAAGCCTCACTCTGC
ATTCTCTTCCTCATCACATGGCATTGGGTGTTTTTTCTAGTCGCTCTCCCTGTAACATGC
TATCACGCTATGCTATACAAAGAGCGAAGACATCTCATAGATGTCACTGAAGTGTTCCGT
GGTATTAGCTTTGAAAAGAAGCTCCGGTTTACCAAGCTCGGTTTCTACATCTTTCTCTTC
ATCATGGTTGTCTTTAGGCTTACTCTTTCAGCGGTCTATAGCTTCACTGAGGATGATGAT
CTACTTCATTTGTTTTGATGTACTCTTATTTGTTTTCTCAGTGTGTGTGTTGTGTTATAG
ACATTTCTTAGGGATTTACTCAAAACTTCACAGGACATCAGATTGCTCTCACAAGCTAAA
TCGCAAACTAATTAGA
C

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2CH38JQ 367 0 0
TTTTTTCTAGTCGCTCTCCCTGTAACATGCTATCACGCTATGCTATACAAAGAGCGAAGA
CATTTCATAGATGTCACTGAAGTGTTCCGTGGTATTAGCTTTGAAAAGAAGCTCCGGTTT
ACCAAGCTCGGTTTCTACATCTTTCTCTTCATCATGGTTGTCTTTAGGCTTACTCTTTCA
GCGGTCTATAGCTTCACTGAGGATGATGATCTACTTCATTTGTTTTGATGTACTCTTATT
TGTTTTCTCAGTGTGTGTGTTGTGTTATAGACATTTCTTAGGGATTTACTCAAAACTTCA
CAGGACATCAGATTGCTCTCACAAGCTAAATCGCAAACTAATTAGAGAAAAAAAGGAAGA
TTTCCAT

QA 1 367 1 367
DS 



AS 1 5

CO CL1636Contig1 645 5 2 U
GGAACCCAAACAAAAAAACATGTTCACAAAACCGATCCTTTTAGCTTCCTTTCTCCTCAT
CATCTTCGTCTCTGCAACTCACTCAGCTCGTCACAACAGCGGTAACGATGGTTCAGGATT
CGGAGGTGTACCCGGATTTGACGGAATACCCGGATTCGGAAACGGGTTCCCGGGAACCGG
AGTGGGCGGTGCCTACGGTGGAGGATACGGTGGTCCAAGCGGTGGGTTTGGAAAGGGAGG
TGTGGTGAGACCGACGGTGACTTGTAGAGTGAAAGGTCCTTGTAACGGTAAGAAGCTGAG
GTGTCCGGCCAAGTGTTTCAGCTCTTTTAGCCGCTCAGGGAAAGGATACGGCGGTGGAGG
AGGAGGTGGTGGATGCACTATGGATTGTAAGAAGAAGTGTATTGCTTATTGTTAGAGATA
AGAAAATCGCATCTTTTTAGAATATATAGTCATTACAATGATTATATATTGCTGCCGTAT
GCTATGTTGTTGTAGCCTATAGTTGATGATCATAAGGATCCTTTTGTCTGGATTCGGATG
TAGTAGTTTTTTATATGCATAATATATGGTTTGTGATGAATAAATGAGGAAACTTAGCGG
TTTTCTCAATTTGCGTTTGTTGTGTGAGAGGTTACGAGTTTTCTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H180TF U 1
AF RR2FZ42TF U 1
AF RR2FZ54TF U 1
AF RR2H061TF U 1
AF RR2H061JQ C 74
BS 1 621 RR2FZ42TF
BS 622 645 RR2H061TF

RD RR2H180TF 597 0 0
GGAACCCAAACAAAAAAACATGTTCACAAAACCGATCCTTTTAGCTTCCTTTCTCCTCAT
CATCTTCGTCTCTGCAACTCACTCAGCTCGTCACAACAGCGGTAACGATGGTTCAGGATT
CGGAGGTGTACCCGGATTTGACGGAATACCCGGATTCGGAAACGGGTTCCCGGGAACCGG
AGTGGGCGGTGCCTACGGTGGAGGATACGGTGGTCCAAGCGGTGGGTTTGGAAAGGGAGG
TGTGGTGAGACCGACGGTGACTTGTAGAGTGAAAGGTCCTTGTAACGGTAAGAAGCTGAG
GTGTCCGGCCAAGTGTTTCAGCTCTTTTAGCCGCTCAGGGAAAGGATACGGCGGTGGAGG
AGGAGGTGGTGGATGCACTATGGATTGTAAGAAGAAGTGTATTGCTTATTGTTAGAGATA
AGAAAATCGCATCTTTTTAGAATATATAGTCATTACAATGATTATATATTGCTGCCGTAT
GCTATGTTGTTGTAGCCTATAGTTGATGATCATAAGGATCCTTTTGTCTGGATTCGGATG
TAGTAGTTTTTTATATGCATAATATATGGTTTGTGATGAATAAATGAGGAAACTTAG

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2FZ42TF 624 0 0
GGAACCCAAACAAAAAAACATGTTCACAAAACCGATCCTTTTAGCTTCCTTTCTCCTCAT
CATCTTCGTCTCTGCAACTCACTCAGCTCGTCACAACAGCGGTAACGATGGTTCAGGATT
CGGAGGTGTACCCGGATTTGACGGAATACCCGGATTCGGAAACGGGTTCCCGGGAACCGG
AGTGGGCGGTGCCTACGGTGGAGGATACGGTGGTCCAAGCGGTGGGTTTGGAAAGGGAGG
TGTGGTGAGACCGACGGTGACTTGTAGAGTGAAAGGTCCTTGTAACGGTAAGAAGCTGAG
GTGTCCGGCCAAGTGTTTCAGCTCTTTTAGCCGCTCAGGGAAAGGATACGGCGGTGGAGG
AGGAGGTGGTGGATGCACTATGGATTGTAAGAAGAAGTGTATTGCTTATTGTTAGAGATA
AGAAAATCGCATCTTTTTAGAATATATAGTCATTACAATGATTATATATTGCTGCCGTAT
GCTATGTTGTTGTAGCCTATAGTTGATGATCATAAGGATCCTTTTGTCTGGATTCGGATG
TAGTAGTTTTTTATATGCATAATATATGGTTTGTGATGAATAAATGAGGAAACTTAGCGG
TTTTCTCAATTTGCGTTTGTT
GTC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2FZ54TF 621 0 0
GGAACCCAAACAAAAAAACATGTTCACAAAACCGATCCTTTTAGCTTCCTTTCTCCTCAT
CATCTTCGTCTCTGCAACTCACTCAGCTCGTCACAACAGCGGTAACGATGGTTCAGGATT
CGGAGGTGTACCCGGATTTGACGGAATACCCGGATTCGGAAACGGGTTCCCGGGAACCGG
AGTGGGCGGTGCCTACGGTGGAGGATACGGTGGTCCAAGCGGTGGGTTTGGAAAGGGAGG
TGTGGTGAGACCGACGGTGACTTGTAGAGTGAAAGGTCCTTGTAACGGTAAGAAGCTGAG
GTGTCCGGCCAAGTGTTTCAGCTCTTTTAGCCGCTCAGGGAAAGGATACGGCGGTGGAGG
AGGAGGTGGTGGATGCACTATGGATTGTAAGAAGAAGTGTATTGCTTATTGTTAGAGATA
AGAAAATCGCATCTTTTTAGAATATATAGTCATTACAATGATTATATATTGCTGCCGTAT
GCTATGTTGTTGTAGCCTATAGTTGATGATCATAAGGATCCTTTTGTCTGGATTCGGATG
TAGTAGTTTTTTATATGCATAATATATGGTTTGTGATGAATAAATGAGGAAACTTAGCGG
TTTTCTCA*TTTGCGTTTGTT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2H061TF 645 0 0
GGAACCCAAACAAAAAA*CATGTTCACAAAACCGATCCTTTTAGCTTCCTTTCTCCTCAT
CATCTTCGTCTCTGCAACTCACTCAGCTCGTCACAACAGCGGTAACGATGGTTCAGGATT
CGGAGGTGTACCCGGATTTGACGGAATACCCGGATTCGGAAACGGGTTCCCGGGAACCGG
AGTGGGCGGTGCCTATGGTGGAGGATACGGTGGTCCAAGCGGTGGGTTTGGAAAGGGAGG
TGTGGTGAGACCGACGGTGACTTGTAGAGTGAAAGGTCCTTGTAACGGTAAGAAGCTGAG
GTGTCCGGCCAAGTGTTTCAGCTCTTTTAGCCGCTCAGGGAAAGGATACGGCGGTGGAGG
AGGAGGTGGTGGATGCACTATGGATTGTAAGAAGAAGTGTATTGCTTATTGTTAGAGATA
AGAAAATCGCATCTTTTTAGAATATATAGTCATTACAATGATTATATATTGCTGCCGTAT
GCTATGTTGTTGTAGCCTATAGTTGATGATCATAAGGATCCTTTTGTCTGGATTCGGATG
TAGTAGTTTTTTATATGCATAATATATGGTTTGTGGTGAATAAATGAGGAAACTTAGCGG
TTTTCTCAATTTGCGTTTGTTGTGTGAGAGGTTACGAGTTTTCTT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2H061JQ 572 0 0
GCAACTCACTCAGCTCGTCACAACAGCGGTAACGATGGTTCAGGATTCGGAGGTGTACCC
GGATTTGACGGAATACCCGGATTCGGAAACGGGTTCCCGGGAACCGGAGTGGGCGGTGCC
TATGGTGGAGGATACGGTGGTCCAAGCGGTGGGTTTGGAAAGGGAGGTGTGGTGAGACCG
ACGGTGACTTGTAGAGTGAAAGGTCCTTGTAACGGTAAGAAGCTGAGGTGTCCGGCCAAG
TGTTTCAGCTCTTTTAGCCGCTCAGGGAAAGGATACGGCGGTGGAGGAGGAGGTGGTGGA
TGCACTATGGATTGTAAGAAGAAGTGTATTGCTTATTGTTAGAGATAAGAAAATCGCATC
TTTTTAGAATATATAGTCATTACAATGATTATATATTGCTGCCGTATGCTATGTTGTTGT
AGCCTATAGTTGATGATCATAAGGATCCTTTTGTTTGGATTCGGATGTAGTAGTTTTTTA
TATGCATAATATATGGTTTGTGGTGAATAAATGAGGAAACTTAGCGGTTTTCTCAATTTG
CGTTTGTTGTGTGAGAGGTTACGAGTTTTCTT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 5

CO CL1637Contig1 731 5 11 U
GGATATATTTCTTCTCTTTCTACAAAACTAAAAATAAAACTCAGAAAGAGATAGAGGGGC
CAAAAAATGGCGGACGAATCTCCACAGTCTATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATCTCA
GGTAACGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAAAGGCAAAACTCTTCTGATTGTAAACGTTGCC
TCCAAATGTGGACTGACGGATGCGAACTACAAGGAACTCAATGTTTTGTACGAAAAATAC
AAGGAACAAGGGTTGGAGATATTAGCATTTCCATGCAATCAGTTTTTGGGACAAGAACCA
GGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCTGCACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCCATC
TTTGACAAGGTAGATGTGAACGGGAAGAACACGGCCCCGTTATACAAATACTTGAAAGCA
GAGAAAGGAGGATTGCTCATTGACGCAATCAAATGGAACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCT
CCTGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATATTCTCCCAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAA
GACATTCAAGCTCTGCTGGGACAGGCTTCTTCTTGAATCATCATCTGAAGTTTCAAGAAC
GGGTTTATCTATTTATTAAACGTTTCTACATTTGGTCCAAATGTTTGTTCTTAAGAATCC
GCAACTTTGCGAACTTGTTTTTCTCTTAATCCTTTTGACCGTATCTTTAAATAAAAATGT
TCATTGATAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E011TF U 1
AF RR2H837TF U 16
AF RR2B172TF U 112
AF RR2H837JQ C 161
AF RR2E011JQ C 283
BS 1 21 RR2E011TF
BS 22 22 RR2H837TF
BS 23 74 RR2E011TF
BS 75 75 RR2H837TF
BS 76 269 RR2E011TF
BS 270 270 RR2H837TF
BS 271 644 RR2E011TF
BS 645 650 RR2H837TF
BS 651 712 RR2B172TF
BS 713 723 RR2H837JQ
BS 724 731 RR2E011JQ

RD RR2E011TF 644 0 0
GGATATATTTCTTCTCTTTCTTCAAAACTAAAAATAAAACTCAGAAAGAGATAGAGGGGC
CAAAAAATGGCGGATGAATCTCCACAGTCTATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATCTCA
GGTAACGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAAAGGCAAAACTCTTCTGATTGTAAACGTTGCC
TCCAAATGTGGACTGACGGATGCGAACTACAAGGAACTCAATGTTTTGTACGAAAAATAC
AAGGAACAAGGGTTGGAGATATTAGCATTCCCATGCAATCAGTTTTTGGGACAAGAACCA
GGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCTGCACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCCATC
TTTGACAAGGTAGATGTGAACGGGAAGAACACGGCCCCGTTATACAAATACTTGAAAGCA
GAGAAAGGAGGATTGCTCATTGACGCAATCAAATGGAACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCT
CCTGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATATTCTCCCAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAA
GACATTCAAGCTCTGCTGGGACAGGCTTCTTCTTGAATCATCATCTGAAGTTTCAAGAAC
GGGTTTATCTATTTATTAAACGTTTCTACATTTGGTCCAAATGT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2H837TF 635 0 0
CTTTCTACAAAACTAAAAATAAAACTCAGAAAGAGATAGAGGGGCCAAAAAATGGCGGAC
GAATCTCCACAGTCTATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATCTCAGGTAACGATGTGAGT
TTGAGCCAATTCAAAGGCAAAACTCTTCTGATTGTAAACGTTGCCTCCAAATGTGGACTG
ACGGATGCGAACTACAAGGAACTCAATGTTTTGTACGAAAAATACAAGGAACAAGGGTTG
GAGATATTAGCATTTCCATGCAATCAGTTTTTGGGACAAGAACCAGGAAACAATGAAGAG
ATTCAGCAAACTGTCTGCACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCCATCTTTGACAAGGTAGAT
GTGAACGGGAAGAACACGGCCCCGTTATACAAATACTTGAAAGCAGAGAAAGGAGGATTG
CTCATTGACGCAATCAAATGGAACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCCTGACGGTAAAGTC
TCCCAGAGATATTCTCCCAGAACCTCCCCTCTTCAATTCGAGAAAGACATTCAAGCTCTG
CTGGGACAGGCTTCTTCTTGAATCATCATCTGAAGTTTCAAGAACGGGTTTATCTATTTA
TTAAACGTTTCTACATTTGGTCCAAATGTTTGTTC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2B172TF 601 0 0
GATATCTCAGGTAACGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAAAGGCAAAACTCTTCTGATTGTA
AACGTTGCCTCCAAATGTGGACTGACGGATGCGAACTACAAGGAACTCAATGTTTTGTAC
GAAAAATACAAGGAACAAGGGTTGGAGATATTAGCATTCCCATGCAATCAGTTTTTGGGA
CAAGAACCAGGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCTGCACAAGGTTCAAAGCTGAG
TTCCCCATCTTTGACAAGGTAGATGTGAACGGGAAGAACACGGCCCCGTTATACAAATAC
TTGAAAGCAGAGAAAGGAGGATTGCTCATTGACGCAATCAAATGGAACTTCACAAAGTTC
TTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATATTCTCCCAGAACCTCTCCTCTTCAA
TTCGAGAAAGACATTCAAGCTCTGCTGGGACAGGCTTCTTCTTGAATCATCATCTGAAGT
TTCAAGAACGGGTTTATCTATTTATTAAACGTTTCTACATTTGGTCCAAATGTTTGTTCT
TAAGAATCCGCAACTTTGCGAACTTGTTTTTCTCTTAATCCTTTTGACCGTATCTTTAAA
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2H837JQ 563 0 0
TTCTGATTGTAAACGTTGCCTCCAAATGTGGACTGACGGATGCGAACTACAAGGAACTCA
ATGTTTTGTACGAAAAATACAAGGAACAAGGGTTGGAGATATTAGCATTTCCATGCAATC
AGTTTTTGGGACAAGAACCAGGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCTGCACAAGGT
TCAAAGCTGAGTTCCCCATCTTTGACAAGGTAGATGTGAACGGGAAGAACACGGCCCCGT
TATACAAATACTTGAAAGCAGAGAAAGGAGGATTGCTCATTGACGCAATCAAATGGAACT
TCACAAAGTTCTTGGTTTCTCCTGACGGTAAAGTCTCCCAGAGATATTCTCCCAGAACCT
CCCCTCTTCAATTCGAGAAAGACATTCAAGTTCTGCTGGGACAGGCTTTTTCTTGAATCA
TCATCTGAAGTTTCAAGAACGGGTTTATCTATTTATTAAACGTTTCTACATTTGGTCCAA
ATGTTTGTTCTTAAAAATCCGCAACTTTGCGAACTTGTTTTTTTCTTAATCCTTTTGACC
GTATCTTTAAATAAAAATGTTCA

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2E011JQ 449 0 0
TTTTTGGGACAAGAACCAGGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCTGCACAAGGTTC
AAAGCTGAGTTCCCCATCTTTGACAAGGTAGATGTGAACGGGAAGAACACGGCCCCGTTA
TACAAATACTTGAAAGCAGAGAAAGGAGGATTGCTCATTGACGCAATCAAATGGAACTTC
ACAAAGTTCTTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATATTCTCCCAGAACCTCT
CCTCTTCAATTCGAGAAAGACATTCAAGCTCTGCTGGGACAGGCTTCTTCTTGAATCATC
ATCTGAAGTTTCAAGAACGGGTTTATCTATTTATTAAACGTTTCTACATTTGGTCCAAAT
GTTTGTTCTTAAGAATCCGCAACTTTGCGAACTTGTTTTTCTCTTAATCCTTTTGACCGT
ATCTTTAAATAAAAATGTTCATTGATAGG

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 5

CO CL1638Contig1 1058 5 6 U
GGACAACACAATTACACAAAACATGGCTCTCACAAAATTATCCTTAGTCCTTTTCCTCTG
CCTCTTAGGTTTATACTCTGAAACCGTCAAGTCTCAAAACTGCGGTTGCGCCCCAAACCT
GTGTTGCAGTCAGTTCGGTTACTGCGGTTCCACCGACGCTTATTGTGGTACTGGGTGCCG
ATCAGGCCCTTGCAGAAGCCCTGGTGGAACCA***CTCCCGCTGGTGGTGGATCCGTTGG
TAGCATTGTGACACAAGCTTTCTTTAACGGTATTATCAATCAAGCCGGTGGTGGTTGCGC
CGGAAAGAATTTCTACACCCGTGATTCTTTCGTTAACGCCGCAAATACTTTCCCCAACTT
TGCCAATTCCGTTACAAGACGTGAAATTGCAACCATGTTTGCTCATTTCACCCACGAGAC
TGGACATTTCTGCTACATAGAAGAAATAAACGGAGCTTCACGTGACTACTGCGACGAAAA
CAACAGGCAGTACCCATGTGCACCGGGCAAAGGCTACTTCGGTCGTGGTCCAATTCAACT
ATCATGGAACTACAACTACGGAGCTTGTGGCCAGAGTCTTAACCTCAACCTCTTAGGCCA
GCCCGAGCTAGTGAGTAGCAACCCAACTGTCGCTTTCAGGACGGGTCTGTGGTTTTGGAT
GAATAGCGTGAGACCAGTACTAAACCAAGGGTTTGGAGCCACCATTAGAGCCATCAATGG
AATGGAATGTAACGGAGGGAACTCAGGTGCGGTCAATGCAAGGATTAGGTACTATAGAGA
CTATTGTGGACAGCTTGGTGTGGACCCTGGTCCTAACCTTAGCTGCTAAAAATCTATTCG
AAACAAGCACGCACACATGACGTGGGTAGTGATGGAGAAAGTTGAAGTTATGAAATAATA
AATGAGATAATAAAGTTAGATCTCATCTATGCTCTTGGGTTGGGTCTTAGTGTTTCCTGC
GTCACAAGCAATAAGTAGTTGTAATAATCTTGTGAAAATGATTTTCTTATAAATGTACTA
TGAAGTGAATGCAACATTAATAAATGCCTAAGAAAGGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC41TF U 1
AF RR2BQ89TF U 1
AF RR2EZ12TF U 4
AF RR2BQ89JQ C 297
AF RR2DC41JQ C 492
BS 1 639 RR2BQ89TF
BS 640 640 RR2BQ89JQ
BS 641 693 RR2BQ89TF
BS 694 766 RR2BQ89JQ
BS 767 767 RR2DC41JQ
BS 768 1058 RR2BQ89JQ

RD RR2DC41TF 382 0 0
GGACAACACAATTACACAAAACATGGCTCTCACAAAATTATCCTTAGTCCTTTTCCTCTG
CCTCTTAGGTTTATGCTCTGAAACCGTCAAGTCA*AAAACTGCGGTTGCGCCCCAAACCT
GTGTTGCAGTCAGTTCGGTTACTGCGGTTCCACCGACGCTTATTGTGGTACCGGGTGCCG
ATCAGGCCCTTGCAGAAGCCCTGGTGGAACCA***CTCCCGCTGGTGGTGGATCCGTTGG
TAGCATTGTGACACAAGCTTTCTTTAACGGTATTATCAATCAAGCCGGTGGTGGT*GCGC
CGGAAAGAATTTCTACACCCGTGATTCTTTCGT*AACGCCGCAAATACTTTCCCCAACTT
TGCCAATTCCGT*ACAAGACGT

QA 1 382 1 382
DS 

RD RR2BQ89TF 694 0 0
GGACAACACAATTACACAAAACATGGCTCTCACAAAATTATCCTTAGTCCTTTTCCTCTG
CCTCTTAGGTTTATACTCTGAAACCGTCAAGTCTCAAAACTGCGGTTGCGCCCCAAACCT
GTGTTGCAGTCAGTTCGGTTACTGCGGTTCCACCGACGCTTATTGTGGTACTGGGTGCCG
ATCAGGCCCTTGCAGAAGCCCTGGTGGAACCA***CTCCCGCTGGTGGTGGATCCGTTGG
TAGCATTGTGACACAAGCTTTCTTTAACGGTATTATCAATCAAGCCGGTGGTGGTTGCGC
CGGAAAGAATTTCTACACCCGTGATTCTTTCGTTAACGCCGCAAATACTTTCCCCAACTT
TGCCAATTCCGTTACAAGACGTGAAATTGCAACCATGTTTGCTCATTTCACCCACGAGAC
TGGACATTTCTGCTACATAGAAGAAATAAACGGAGCTTCACGTGACTACTGCGACGAAAA
CAACAGGCAGTACCCATGTGCACCGGGCAAAGGCTACTTCGGTCGTGGTCCAATTCAACT
ATCATGGAACTACAACTACGGAGCTTGTGGCCAGAGTCTTAACCTCAACCTCTTAGGCCA
GCCCGAGCTAGTGAGTAGCAACCCAACTGTCGCTTTCAG*ACGGGTCTGTGGTTTTGGAT
GAATAGCGTGAGACCAGTACTAAACCAAGGGTT
G

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2EZ12TF 676 0 0
GACAGCACAACTACACAAA
ATGGCTCTCACAAAATTATCCTTAGTCCTTTTCCTCTGCTTCTTAGGTTTATACTCTGAA
ACCGTCAAGTCTCAAAACTGCGGTTGCGCCCCAAACCTGTGTTGCAGTCAGTTCGGTTAC
TGCGGTTCCACCGACGCTTATTGTGGTACTGGGTGCCGATCAGGCCCTTGCAGAAGCCCT
GGTGGAACCCCTTCTCCCGCTGGTGGTGGATCAGTTGGTAGCATTGTGACACAAGCTTTC
TTTAACGGTATTATCAACCAAGCCGGTGGTGGTTGCGCCGGAAAGAATTTCTACACCCGT
GATTCTTTCGTTAACGCCGCAAATACTTTCCCCAACTTTGCCAATTCCGTTACAAGACGT
GAAATTGCAACCATGTTTGCTCATTTCACCCACGAGACTGGACATTTCTGCTATATAGAA
GAAATAAACGGAGCTTCACGTGACTACTGCGACGAAAACAACAGGCAGTACCCATGTGCA
CCGGGCAAAGGCTACTTCGGTCGTGGTCCAATTCAACTATCATGGAACTACAACTACGGA
GCTTGTGGCCAGAGTCTTAACCTCAACCTCTTAGGCCAGCCCGAGCTAGTGAGTAGCGAC
CCAACTGTCGCTTTCAG*ACGGGTCTGTGGTTTTGGATGAATAGCGTAAGACC
GGTA

QA 20 672 20 672
DS 

RD RR2BQ89JQ 762 0 0
TGCG
CGGAAAGAATTTCTACACCCGTGATTCTTTCGTTAACGCCGCAAATACTTTCCCCAACTT
TGCCAATTCCGTTACAAGACGTGAAATTGCAACCATGTTTGCTCATTTCACCCACGAGAC
TGGACATTTCTGCTACATAGAAGAAATAAACGGAGCTTCACGTGACTACTGCGACGAAAA
CAACAGGCAGTACCCATGTGCACCGGGCAAAGGCTACTTCGGTCGTGGTCCAATTCAACT
ATCATGGAACTACAACTACGGAGCTTGTGGCCAGAGTCTTAACCTCAACCTCTTAGGCCA
GCCCGAGCTAGTGAGTAGCAACCCAACTGTCGCTTTCAGGACGGGTCTGTGGTTTTGGAT
GAATAGCGTGAGACCAGTACTAAACCAAGGGTTTGGAGCCACCATTAGAGCCATCAATGG
AATGGAATGTAACGGAGGGAACTCAGGTGCGGTCAATGCAAGGATT*GGTACTATAGAGA
CTATTGTGGACAGCTTGGTGTGGACCCTGGTCCTAACCTTAGCTGCTAAAAATCTATTCG
AAACAAGCACGCACACATGACGTGGGTAGTGATGGAGAAAGTTGAAGTTATGAAATAATA
AATGAGATAATAAAGTTAGATCTCATCTATGCTCTTGGGTTGGGTCTTAGTGTTTCCTGC
GTCACAAGCAATAAGTAGTTGTAATAATCTTGTGAAAATGATTTTCTTATAAATGTACTA
TGAAGTGAATGCAACATTAATAAATGCCTAAGAAAGGT

QA 5 762 5 762
DS 

RD RR2DC41JQ 558 0 0
AT
CCATGTGCACCGGGCAAAGGCTACTTCGGTCGTGGTCCAATTCAACTATCATGGAACTAC
AACTACGGAGCTTGTGGCCAGAGTTTTAACCTCAACCTTTTAGGCCAGCCCGAGCTAGTG
AGTAGCAACCCAACTGTCGCTTTCAGGACGGGTCTGTGGTTTTGGATGAATAGCGTGAGA
CCAGTACTAAACCAAGGGTTTGGAGCCACCATTAGAGCCATCAATGGAATGGAATGTAAC
GGTGGGAACTCAGGTGCGGTCAATGCAAGGATTAGGTACTATAGAGACTATTGTGGACAG
CTTGGTGTGGACCCTGGTCCTAACCTTAGCTGCTAAAAATCTATTCGAAACAAGCACGCA
CACATGACGTGGGTAGTGATGGAGAAAGTTGAAGTTATGAAATAATAAATGAGATAATAA
AGTTAGATTTCATCTATGCTCTTGGGTTGGGTCTTAGTGTTTCCTGCGTCACAAGCAATA
AGTAGTTGTAATAATCTTGTGAAAATGATTTTCTTATAAATGTACTATGAAGTGAATGCA
ACATTAATAAATGCCT

QA 3 558 3 558
DS 



AS 1 5

CO CL1639Contig1 774 5 5 U
TTTGAGAGAAAGCACTCTTCGTTATTAGTAAACAATGGGTGAAGAAAGCTATGGGTCTTT
CAAAGTTTTACACATCATCTCAAAGAACTGTGATACTGTCTTTGATTTTACATAACGAGC
AAGAAATGTAATTCTGTAAAGAGAAAAAAA*CATTAAAAAAAGATAAAAAGTCTTTAACT
AGGTGTACCGTTGGCTTTGCTCCTGTACACCTCTTCAAGACATTCTTTGGCTCGATGAAC
TTTCGATTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCTTTGGCGTTGTTCTCAAACAGCTTGTCGTATTT
CTGTACTATCTCTTCCCAAGAGGTCTGCTCGGTAACACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTG
CTCAGTAATGGATTTTCCTGCTTTACGTACTGCGTTCTGCATTGCTTCCTGCGCTACGCC
AGTTTTAGAAGCATTAGCAAGAGCCTGACGATAGGCTTGAAAGAAAGCACGACCCAATAT
CCCAGAACCCATCACAATCAGTTGCGCAATGATTCTCCCTGCCATTGAAGCTGTTTAATT
GATCGATTGAGAGATTCGGAAAGATGCTTCTTTCGTTTACGAGATTCGGATTCGTTTTTC
GCGGGCGGGGGGAGAGAGAGAGAGAGATAAACCTGGACAG*AAGTCGATAGAACAATCTA
GGGTTCTCTTTTCTTTTTTCTTCTTTTGGTTCGTGTTCGTGTAATAAACAAGATTAGATG
TTAGGACAAACACGGCCAAGACCAACGACCAGCACGAAGAAGCACAAGAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2FW61JQ U 4
AF RR2GF58JQ U 4
AF RR2FW61TF C 1
AF RR2G928JQ U 3
AF RR2G928TF C 12
BS 1 5 RR2FW61TF
BS 6 549 RR2FW61JQ
BS 550 585 RR2GF58JQ
BS 586 770 RR2G928JQ
BS 771 774 RR2G928TF

RD RR2FW61JQ 546 0 0
GA
GAGAAAGCACTCTTCGTTATTAGTAAACAATGGGTGAAGAAAGCTATGGGTCTTTCAAAG
TTTTACACATCATCTCAAAGAACTGTGATACTGTCTTTGATTTTACATAACGAGCAAGAA
ATGTAATTCTGTAAAGAGAAAAAAA*CATTAAAAAAAGATAAAAAGTCTTTAACTAGGTG
TACCGTTGGCTTTGCTCCTGTACACCTCTTCAAGACATTCTTTGGCTCGATGAACTTTCG
ATTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCTTTGGCGTTGTTCTCAAACAGCTTGTCGTATTTCTGTA
CTATCTCTTCCCAAGAGGTCTGCTCGGTAACACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTGCTCAG
TAATGGATTTTCCTGCTTTACGTACTGCGTTCTGCATTGCTTCCTGCGCTACGCCAGTTT
TAGAAGCATTAGCAAGAGCCTGACGATAGGCTTGAAAGAAAGCACGACCCAATATCCCAG
AACCCATCACAATCAGTTGCGCAATGATTCTCCCTGCCATTGAAGCTGTTTAATTGATCG
ATTG

QA 3 546 3 546
DS 

RD RR2GF58JQ 582 0 0
GA
GAGAAAGCACTCTTCGTTATTAGTAAACAATGGGTGAAGAAAGCTATGGGTCTTTCAAAG
TTTTACACATCATCTCAAAGAACTGTGATACTGTCTTTGATTTTACATAACGAGCAAGAA
ATGTAATTCTGTAAAGAGAAAAAAA*CATTAAAAAAAGATAAAAAGTCTTTAACTAGGTG
TACCGTTGGCTTTGCTCCTGTACACCTCTTCAAGACATTCTTTGGCTCGATGAACTTTCG
ATTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCTTTGGCGTTGTTCTCAAACAGCTTGTCGTATTTCTGTA
CTATCTCTTCCCAAGAGGTCTGCTCGGTAACACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTGCTCAG
TAATGGATTTTCCTGCTTTACGTACTGCGTTCTGCATTGCTTCCTGCGCTACGCCAGTTT
TAGAAGCATTAGCAAGAGCCTGACGATAGGCTTGAAAGAAAGCACGACCCAATATCCCAG
AACCCATCACAATCAGTTGCGCAATGATTCTCCCTGCCATTGAAGCTGTTTAATTGATCG
ATTGAGAGATTCGGAAAGATGCTTCTTTCGTTTACGAGAT

QA 3 582 3 582
DS 

RD RR2FW61TF 689 0 0
TTTGAGAGAAAGCACTCTTCGTTATTAGTAAACAATGGGTGAAGAAAGCTATGGGTCTTT
CAAAGTTTTACACATCATCTCAAAGAACTGTGATACTGTCTTTGATTTTACATAACGAGC
AAGAAATGTAATTCTGTAAAGAGAAAAAAA*CATTAAAAAAAGATAAAAAGTCTTTAACT
AGGTGTACCGTTGGCTTTGCTCCTGTACACCTCTTCAAGACATTCTTTGGCTCGATGAAC
TTTCGATTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCTTTGGCGTTGTTCTCAAACAGCTTGTCGTATTT
CTGTACTATCTCTTCCCAAGAGGTCTGCTCGGTAACACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTG
CTCAGTAATGGATTTTCCTGCTTTACGTACTGCGTTCTGCATTGCTTCCTGCGCTACGCC
AGTTTTAGAAGCATTAGCAAGAGCCTGACGATAGGCTTGAAAGAAAGCACGACCCAATAT
CCCAGAACCCATCACAATCAGTTGCGCAATGATTCTCCCTGCCATTGAAGCTGTTTAATT
GATCGATTGAGAGATTCGGAAAGATGCTTCTTTCGTTTACGAGATTCGGATTCGTTTTTC
GCGGGCGGGGGGAGAGAGAGAGAGA**TAAACCTGGACAGGAAGTCGATAGAACAATCTA
GGGTTCTCTTTTCTTTTTTCTTCTTTT
CC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2G928JQ 768 0 0
AGG
GAGAAAGCACTCTTCGTTATTAGTAAACAATGGGTGAAGAAAGCTATGGGTCTTTCAAAG
TTTTACACATCATCTCAAAGAACTGTGATACTGTCTTTGATTTTACATAACGAGCAAGAA
ATGTAATTCTGTAAAGAGAAAAAAAACATTAAAAAAAGATAAAAAGTCTTTAACTAGGTG
TACCGTTGGCTTTGCTCCTGTACACCTCTTCAAGACATTCTTTGGCTCGATGAACTTTCG
ATTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCTTTGGCGTTGTTCTCAA*CAGCTTGTCGTATTTCTGTA
CTATCTCTTCCCAAGAGGTCTGCTCGGTAACACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTGCTCAG
TAATGGATTTTCCTGCTTTACGTACTGCGTTCTGCATTGCTTCCTGCGCTACGCCAGTTT
TAGAAGCATTAGCAAGAGCCTGACGATAGGCTTGAAAGAAAGCACGACCCAATATCCCAG
AACCCATCAAAATCAGTTGCGCAATGATTCTCCCTGCCATTGAAGCTGTTTAATTGATCG
ATTGAGAGATTCGGAAAGATGCTTCTTTCGTTTACGAGATTCGGATTCGTTTTTCGCGGG
CGGGGGGAGAGAGAGAGAGAGATAAACCTGGACAG*AAGTCGATAGAACAATCTAGGGTT
CTCTTTTCTTTTTTCTTCTTTTGGTTCGTGTTCGTGTAATAAACAAGATTAGATGTTAGG
ACAAACACGGCCAAGACCAACGACCAGCACGAAGAAGCACAAGAA

QA 4 768 4 768
DS 

RD RR2G928TF 763 0 0
GCACTCTTCGTTATTAGTAAACAATGGGTGAAGAAAGCTATGG*TCTTTCAAAGTTTTAC
ACATCATCTCAAAGAACTGTGATACTGTCTTTGATTTTACATAACGAGCAAGAAATGTAA
TTCTGTAAAGAGAAAAAAAACATTAAAAAAAGATAAAAAGTCTTTAACTAGGTGTACCGT
TGGCTTTGCTCCTGTACACCTCTTCAAGACATTCTTTGGCTCGATGAACTTTCGATTGAA
GGTAAAAGCTCCCAGCTTTGGCGTTGTTCTCAA*CAGCTTGTCGTATTTCTGTACTATCT
CTTCCCAAGAGGTCTGCTCGGTAACACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTGCTCAGTAATGG
ATTTTCCTGCTTTACGTACTGCGTTCTGCATTGCTTCCTGCGCTACGCCAGTTTTAGAAG
CATTAGCAAGAGCCTGACGATAGGCTTGAAAGAAAGCACGACCCAATATCCCAGAACCCA
TCAAAATCAGTTGCGCAATGATTCTCCCTGCCATTGAAGCTGTTTAATTGATCGATTGAG
AGATTCGGAAAGATGCTTCTTTCGTTTACGAGATTCGGATTCGTTTTTCGCGGGCGGGGG
GAGAGAGAGAGAGAGATAAACCTGGACAG*AAGTCGATAGAACAATCTAGGGTTCTCTTT
TCTTTTTTCTTCTTTTGGTTCGTGTTCGTGTAATAAACAAGATTAGATGTTAGGACAAAC
ACGGCCAAGACCAACGACCAGCACGAAGAAGCACAAGAAAAAA

QA 1 763 1 763
DS 



AS 2 5

CO CL1640Contig1 832 2 10 U
GCGACCATTTCCATGTGCAAACAAAGAGAGAGCATGCTCTGTTGGGAGACAATGAGAATG
GAGAAAATGATGAGGAGTCAGGGGAGGTTGCAGACCCAAAATGGATCACCATCAAAGCAG
CTCTACTGCTACTGTTGGGAGCAGCCATTGCAGCTGCGTTTGCTGATCCTTTGGTTGACA
CAGTTAACAACTTCTCTGCAGCCACAGGGATCCCATCTTTCTTCATTTCTTTCATCGCTT
TGCCTTTAGCAACCAACTCAAGTGAAGCAGTCTCTGCCATCATCTTCGCTTCCCGCAAAA
AGATCAGAACAGCTTCCTTACTTTCTCCGAGCTATGTGGGGGAGTGACAATGAACAACAT
TCTGTGTCTCTCGGTGTTCTTAGCAATCGTTTACCTTAGAGGATTAACATGGAACTTCTC
ATCAGAAGTGTTGGTGATTCTCATAGTTTGTCTGGTGATGGGAGGTTTCACTAGCTTCCG
CACAACGTATCCGCTTTGGACATGTTTCATAGCATACTTGCTTTACCCATTCTCTTTGGG
TCTGGTCTATATTCTCGACTACTGGTTTGGCTGGTCGTAGGTCAAATGGTTTGTTCACAT
GAGTGAGCTTGTTCTTTGCGTGTTTCCTTTTCTTTATCTCTTTTATGTTGTGTATGTAAG
AGTGTATAAACTTGAAGTAAAAGTTCTGAGATTGTGAGTGATGATTGTTTGAAACACTCT
TGTCAAAGCTAATAAATACGTGTCTTGTTTCTTTGGTATGTATTCTTTTCTACTACTATT
GGTTGTTACGATTTTACTATTGCAATAAACTAAAGAATGCACTTGTAATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ93TF U 1
AF RR2BZ93JQ C 277
BS 1 339 RR2BZ93TF
BS 340 340 RR2BZ93JQ
BS 341 681 RR2BZ93TF
BS 682 682 RR2BZ93JQ
BS 683 692 RR2BZ93TF
BS 693 693 RR2BZ93JQ
BS 694 768 RR2BZ93TF
BS 769 769 RR2BZ93JQ
BS 770 786 RR2BZ93TF
BS 787 832 RR2BZ93JQ

RD RR2BZ93TF 801 0 0
GCGACCATTTCCATGTGCAAACAAAGAGAGAGCATGCTCTGTTGGGAGACAATGAGAATG
GAGAAAATGATGAGGAGTCAGGGGAGGTTGCAGACCCAAAATGGATCACCATCAAAGCAG
CTCTACTGCTACTGTTGGGAGCAGCCATTGCAGCTGCGTTTGCTGATCCTTTGGTTGACA
CAGTTAACAACTTCTCTGCAGCCACAGGGATCCCATCTTTCTTCATTTCTTTCATCGCTT
TGCCTTTAGCAACCAACTCAAGTGAAGCAGTCTCTGCCATCATCTTCGCTTCCCGCAAAA
AGATCAGAACAGCTTCCTTACTTTCTCCGAGCTATGTGGTGGAGTGACAATGAACAACAT
TCTGTGTCTCTCGGTGTTCTTAGCAATCGTTTACCTTAGAGGATTAACATGGAACTTCTC
ATCAGAAGTGTTGGTGATTCTCATAGTTTGTCTGGTGATGGGAGGTTTCACTAGCTTCCG
CACAACGTATCCGCTTTGGACATGTTTCATAGCATACTTGCTTTACCCATTCTCTTTGGG
TCTGGTCTATATTCTCGACTACTGGTTTGGCTGGTCGTAGGTCAAATGGTTTGTTCACAT
GAGTGAGCTTGTTCTTTGCGTGTTTCCTTTTCTTTATCTCTTTTATGTTGTGTATGTAAG
AGTGTATAAACTTGAAGTAAA*GTTCTGAGAT*GTGAGTGATGATTGTTTGAAACACTCT
TGTCAAAGCTAATAAATACGTGTCTTGTTTCTTTGGTATGTATTCTTT*CTACTACTATT
GGTTGT
ACGATTTACTATTGC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2BZ93JQ 556 0 0
CCATCATCTTCGCTTCCCGCAAAAAGATCAGAACAGCTTCCTTACTTTTTCCGAGCTATG
TGGGGGAGTGACAATGAACAACATTCTGTGTCTCTCGGTGTTCTTAGCAATCGTTTCCCT
TAGAGGATTAACATGGAACTTCTCATCAGAAGTGTTGGTGATTCTCATAGTTTGTCTGGT
GATGGGAGGTTTCACTAGCTTCCGCACAACGTATCCGCTTTGGACATGTTTCATAGCATA
CTTGCTTTACCCATTCTCTTTGGGTCTGGTCTATATTCTCGACTACTGGTTTGGCTGGTC
GTAGGTCAAATGGTTTGTTCACATGAGTGAGCTTGTTCTTTGCGTGTTTCCTTTTCTTTA
TCTCTTTTATGTTGTGTATGTAAGAGTGTATAAACTTGAAGTAAAAGTTCTGAGATTGTG
AGTGATGATTGTTTGAAACACTCTTGTCAAAGCTAATAAATACGTGTCTTGTTTCTTTGG
TATGTATTCTTTTCTACTACTATTGGTTGTTACGATTTTACTATTGCAATAAACTAAAGA
ATGCACTTGTAATCTC

QA 1 556 1 556
DS 



CO CL1640Contig2 774 3 16 U
AAACAAAAAGAGATTTATTAGCTTTAACGAGAATGTTTCAAACACATCATCACTCACAAT
CTCAAAACTTTTACTTCAAGTTTATACACTCTTACATACACAACATAAAGAAAAGGAAAC
ACGCAAAGAGCAAGCTCACTCATGTGAACAAACCCTTTGAACTACGACCAGCCAAACCAG
TAGTCGAGAATATATACCAAACCCAAAGAGAACGGATAAAGCAAGTACGCTATGAAACAT
GTCCAAAGAGGATACGTTGTGCGGAAGCTAGCGAAACCTCCCATCACCAAACAAACTATG
AGAATCACCAACACTTCTGATGAGAAGTTCCATGTTAATCCTCTAAGGTAAACGATTGCT
AAGAACACCGAGAGACACAGAATGTTGTTCATTGTCACTCCACCACATAGCTCGGAAAAA
GTTAAGGAAGCTGTTCTGATCTTTTTGCGAGAGGCGAAAATGATGGCAGAAACTGCTTCA
CTTGAGTTGGTGGCTAAAGGCAAAGAGATGAAAGAAATGAAGAAAGATGGGATCCCTGTG
GCTGAGAGAAGTTGTTAACTGTGTCAACCAAAGGATCAGCAAACGCAGCTGCAATGGCTG
CTCCCAACAGTAGCAGTAAAGCTGCTTTAATGGTGATCCATTTCGGGTCTGCAACCTCCC
CTGACTCCTCATCATTCTCACCATTCTCATTGTCTCCCAACAGAGCATGCTCTCTCTTTG
TTTGCACATGGAAATGGTCGAGGAATTTCATTGTGCGAGGACCGGCGTCTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DH88JQ U 1
AF RR2FO33JQ U 2
AF RR2FO33TF C 159
BS 1 51 RR2DH88JQ
BS 52 52 RR2FO33JQ
BS 53 99 RR2DH88JQ
BS 100 100 RR2FO33JQ
BS 101 195 RR2DH88JQ
BS 196 196 RR2FO33JQ
BS 197 209 RR2DH88JQ
BS 210 210 RR2FO33JQ
BS 211 228 RR2DH88JQ
BS 229 229 RR2FO33JQ
BS 230 278 RR2DH88JQ
BS 279 279 RR2FO33JQ
BS 280 301 RR2DH88JQ
BS 302 302 RR2FO33JQ
BS 303 358 RR2DH88JQ
BS 359 774 RR2FO33JQ

RD RR2DH88JQ 358 0 0
AAACAAAAAGAGATTTATTAGCTTTAACGAGAATGTTTCAAACACATCATCCCTCACAAT
CTCAAAACTTTTACTTCAAGTTTATACACTCTTACATACCCAACATAAAGAAAAGGAAAC
ACGCAAAGAGCAAGCTCACTCATGTGAACAAACCCTTTGAACTACGACCAGCCAAACCAG
TAGTCGAGAATATATGCCAAACCCAAAGAAAACGGATAAAGCAAGTACCCTATGAAACAT
GTCCAAAGAGGATACGTTGTGCGGAAGCTAGCGAAACCCCCCATCACCAAACAAACTATG
AAAATCACCAACACTTCTGATGAGAAGTTCCATGTTAATCCTCTAAGGTAAACGATTG

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR2FO33JQ 773 0 0
AACAAAAAGAG
ATTTATTAGCTTTAACGAGAATGTTTCAAACACATCATCACTCACAATCTCAGAACTTTT
ACTTCAAGTTTATACACTCTTACATACACAGCATAAAGAAAAGGAAACACGCAAAGAGCA
AGCTCACTCATGTGAACAAACCCTTTGAACTACGACCAGCCAAACCAGTAGTCGAGAATA
TATACCAAACCCAAAGAGAACGGATAAAGCAAGTACGCTATGAAACATGTCCAAAGAGGA
TACGTTGTGCGGAAGCTAGCGAAACCTCCCATCACCAAACAAACTATGAGAATCACCAAC
ACTTCTGATGAGAAGTTCCATGTTAATCCTCTAAGGTAAACGATTGCTAAGAACACCGAG
AGACACAGAATGTTGTTCATTGTCACTCCACCACATAGCTCGGAAAAAGTTAAGGAAGCT
GTTCTGATCTTTTTGCGAGAGGCGAAAATGATGGCAGAAACTGCTTCACTTGAGTTGGTG
GCTAAAGGCAAAGAGATGAAAGAAATGAAGAAAGATGGGATCCCTGTGGCTGAGAGAAGT
TGTTAACTGTGTCAACCAAAGGATCAGCAAACGCAGCTGCAATGGCTGCTCCCAACAGTA
GCAGTAAAGCTGCTTTAATGGTGATCCATTTCGGGTCTGCAACCTCCCCTGACTCCTCAT
CATTCTCACCATTCTCATTGTCTCCCAACAGAGCATGCTCTCTCTTTGTTTGCACATGGA
AATGGTCGAGGAATTTCATTGTGCGAGGACCGGCGTCTGGAC

QA 12 773 12 773
DS 

RD RR2FO33TF 616 0 0
GAA
CTACGACCAGCCAAACCAGTAGTCGAGAATATATACCAAACCCAAAGAGAACGGATAAAG
CAAGTACGCTATGAAACATGTCCAAAGAGGATACGTTGTGCGGAAGCTAGCGAAACCTCC
CATCACCAAACAAACTATGAGAATCACCAACACTTCTGATGAGAAGTTCCATGTTAATCC
TCTAAGGTAAACGATTGCTAAGAACACCGAGAGACACAGAATGTTGTTCATTGTCACTCC
ACCACATAGCTCGGAGAAAGTTAAGGAAGCTGTTCTGATCTTTTTGCGAGAGGCGAAGAT
GATGGCAGAGACTGCTTCACTTGAGTTGGTGGCTAAAGGCAAAGAGATGAAAGAAATGAA
GAAAGATGGGATCCCTGTGGCTGAGAGAAGTTGTTAACTGTGTCAACCAAAGGATCAGCA
AACGCAGCTGCAATGGCTGCTCCCAACAGTAGCAGTAAAGCTGCTTTAATGGTGATCCAT
TTCGGGTCTGCAACCTCCCCTGACTCCTCATCATTCTCACCATTCTCATTGTCTCCCAAC
AGAGCATGCTCTCTCTTTGTTTGCACATGGAAATGGTCGAGGAATTTCATTGTGCGAGGA
CCGGCGTCTGGAC

QA 4 616 4 616
DS 



AS 1 3

CO CL1641Contig1 946 3 5 U
GGGTTTCTCTCACAACAACAAAAATTGTTTTATTTGCGTTGGGATCCGTGAGAAACAGAG
AGGATAAGCTATCATCATGGGTTCGATCTCTCTATCCAATTCTCTGCCCATACCGCGACT
TCCACTACATACATCATCACTCAATCCATGTCTTGTTCCCACTTCTTCTTCGCTTCCTCC
TCTCTCTAATCCTCCTCGTCGTCGCTCCGCTTTTTCACCGTTAGTCACCGCCTCTGCAGT
CTTCGCTGCTCCTTCCGGCGTTAATAACTCTGTTCCTGGTAAAAATGGGAGTTACACGGT
TGGTGACTTCATGACAGGGAAAGAGTATCTTCATGTTGTTAAGCCCACAACATCGGTTGA
TGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGCCACGGGCTTGCCTGTAATTGATGATGA
CTGGAATCTGGTTGGGGTTGTTTCTGATTATGACTTGCTTGCACTCGACTCCATTTCTGG
GCGCAGCAGCGAAAATGATACAAACATGTTCCCTAACGTCGACAGTTCATGGAAAACGTT
TAACGAACTCCAGAAGCTGATGAGCAAGACACATGGAAAAGTGGTTGGAGATTTGATGAC
TCCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCCACCAATTTAGAAGATGCTGCCAGGTTGCTACT
GGAAACGAAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTGAATTCAGATGGAAAACTGATTGGGATCCT
AACAAGGGGGAACGTTGTAAGGGCTGCGTTGCAGATCAAGCGGGAAACCGAGAACTCAAC
CTATCCAGCAGCAGTTGTAGAGCAGAGCCCTTCATTTTCTGCCATATAGTTAAATAGCAA
ATCTGTTGATTCCATTTGATATAAAGTATATATAAAAAATGTGTAACTATGCCCTCTCAT
CTTTCCACCTCCACAAGCAATTTTTTACTTAAAAAAACATTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H965TF U 1
AF RR2BE90TF U 10
AF RR2H965JQ C 205
BS 1 53 RR2H965TF
BS 54 54 RR2BE90TF
BS 55 635 RR2H965TF
BS 636 738 RR2BE90TF
BS 739 946 RR2H965JQ

RD RR2H965TF 635 0 0
GGGTTTCTCTCACAACAACAAAAATTGTTTTATTTGCGTTGGGATCCGTGAGATACAGAG
AGGATAAGCTATCATCATGGGTTCGATCTCTCTATCCAATTCTCTGCCCATACCGCGACT
TCCACTACATACATCATCACTCAATCCATGTCTTGTTCCCACTTCTTCTTCGCTTCCTCC
TCTCTCTAATCCTCCTCGTCGTCGCTCCGCTTTTTCACCGTTAGTCACCGCCTCTGCAGT
CTTCGCTGCTCCTTCCGGCGTTAATAACTCTGTTCCTGGTAAAAATGGGAGTTACACGGT
TGGTGACTTCATGACAGGGAAAGAGTATCTTCATGTTGTTAAGCCCACAACATCGGTTGA
TGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGCCACGGGCTTGCCTGTAATTGATGATGA
CTGGAATCTGGTTGGGGTTGTTTCTGATTATGACTTGCTTGCACTCGACTCCATTTCTGG
GCGCAGCAGCGAAAATGATACAAACATGTTCCCTAACGTCGACAGTTCATGGAAAACGTT
TAACGAACTCCAGAAGCTGATGAGCAAGACACATGGAAAAGTGGTTGGAGATTTGATGAC
TCCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCCACCAATT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2BE90TF 729 0 0
GG
ACAACAACAAAAATTGTTTTATTTGCGTTGGGATCCGTGAGAAACAGAGAGGATAAGCTA
TCATCATGGGTTCGATCTCTCTATCCAATTCTCTGCCCATACCGCGACTTCCACTACATA
CATCATCACTCAATCCATGTCTTGTTCCCACTTCTTCTTCGCTTCCTCCTCTCTCTAATC
CTCCTCGTCGTCGCTCCGCTTTTTCACCGTTAGTCACCGCCTCTGCAGTCTTCGCTGCTC
CTTCCGGCGTTAATAACTCTGTTCCTGGTAAAAACGGGAGTTACACGGTTGGTGACTTCA
TGACAGGGAAAGAGCATCTTCATGTTGTTAAGCCCACAACATCGGTTGATGATGCATTGG
AACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCACGGGCTTGCCTGTAATTGATGATGACTGGAATCTGG
TTGGGGTTGTTTCTGATTATGACTTGCTTGCACTCGACTCCATTTCTGGGCGCAGCAGCG
AAAATGATACAAACATGTTCCCTAACGTCGACAGTTCATGGAAAACGTTTAACGAACTCC
AGAAGCTGATAAGCAAGACACATGGAAAAGTGGTTGGAGATTTGATGACTCCTTCTCCTC
TGGTTGTCCGTGGTTCCACCAATTTAGAAGATGCTGCCAGGTTGCTACTGGAAACGAAGT
TCCGAAGATTACCAGTCGTGAATTCAGATGGAAAACTGATTGGGATCCTAACAAGGGGGA
ACGTTGT

QA 3 729 3 729
DS 

RD RR2H965JQ 742 0 0
GCTCCGC
TTTTCACCGTTAGTCACCGCCTCTGCAGTCTTCGCTGCTCCTTCCGGCGTTAATAACTCT
GTTCCTGGTAAAAATGGGAGTTACACGGTTGGTGACTTCATGACAGGGAAAGAGTATCTT
CATGTTGTTAAGCCCACAACATCGGTTGATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAA
GCCACGGGCTTGCCTGTAATTGATGATGACTGGAATCTGGTTGGGGTTGTTTCTGATTAT
GACTTGCTTGCACTCGACTCCATTTCTGGGCGCAGCAGCGAAAATGATACAAACATGTTC
CCTAACGTCGACAGTTCATGGAAAACGTTTAACGAACTCCAGAAGCTGATGAGCAAGACA
CATGGAAAAGTGGTTGGAGATTTGATGACTCCTTCTCCTCTGGTTGTCCGTGGTTCCACC
AATTTAGAAGATGCTGCCAGGTTGCTACTGGAAACGAAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTG
AATTCAGATGGAAAACTGATTGGGATCCTAACAAGGGGGAACGTTGTAAGGGCTGCGTTG
CAGATCAAGCGGGAAACCGAGAACTCAACCTATCCAGCAGCAGTTGTAGAGCAGAGCCCT
TCATTTTCTGCCATATAGTTAAATAGCAAATCTGTTGATTCCATTTGATATAAAGTATAT
ATAAAAAATGTGTAACTATGCCCTCTCATCTTTCCACCTCCACAAGCAATTTTTTACTTA
AAAAAACATTTTCTC

QA 8 742 8 742
DS 



AS 1 5

CO CL1642Contig1 878 5 14 U
GGAGGTGCCTTTAGGGTTTTCGTCTCGTTGTGCTGTGTGTGACCGTTCTCCTCCACCAAT
TTTTGAAACAAAAGCAAGACCCAAATTCTTATTCGCTTTTGAATAGTCTCTTGCGTCAGG
AATCAGATTCTCTGTTTCCTTTTTTTTACCAGTTTTTGATCTCTTCTCTTGCGGAATTTG
AGTTTTTGTGGGGGGAGACGATGGGAAGAGGCAAGTTCAAGGGCAAACCTACAGGCCAAC
GCCGATTCTCTAGCGCTGCTGAAATACTTGCGGGCACTTCTGCTGCACGTCCTCGGTCAT
TCAAGCAGAAAGAAGCAGAGTACGAAGAAGATATCGAAGAGGAGTCTGAAGAGGACGAAT
CTGAAGAAGAATCCGAAGATGAATCTGATGTGAAGAAGAAAGGGCATGAAGCTCTAATCG
AAGTTGATAACCCTAACAGAGCTAAGCCAAAGACCTTGAAAGCTAGAGACCTTGATGCAA
GTAAAACCACTGAACTCTCAAGGCGTGAAAGGGAGGAGCTAGAGAAGCAGCGAGCTCATG
AGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCAAGGCAAAACCGAGCAAGCAAGAAAGGATTTGGATC
GTTTGGCTCTGATTCGTCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAGAAGCGAGAAGAAGAAAAAG
CAGCGAGAGACGCGAAGAAAGTCGATGCACGCAAATGAGCTAAGTGTTCAAGCTCATCAG
AGAACTACCCTACTTTATAACTATATATATATAACAAAACAAGACTCAGCGACTAAGATG
CTTTTTTTTTTACTTTTGTTCAATTGGTAAACAAATACAGCCTTTACCTATTTACTCAGT
TCCGTGTGGATCCTAATACATTTGAAAGTTATTGAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FU58TF U 187
AF RR2GS05TF U 101
AF RR2BP06TF U 1
AF RR2B969JQ C 99
AF RR2B969TF U 99
BS 1 139 RR2BP06TF
BS 140 140 RR2B969TF
BS 141 173 RR2BP06TF
BS 174 174 RR2GS05TF
BS 175 658 RR2BP06TF
BS 659 659 RR2B969TF
BS 660 661 RR2BP06TF
BS 662 662 RR2B969TF
BS 663 694 RR2BP06TF
BS 695 695 RR2B969TF
BS 696 710 RR2BP06TF
BS 711 711 RR2B969TF
BS 712 738 RR2BP06TF
BS 739 878 RR2B969TF

RD RR2FU58TF 107 0 0
TTTTTGT
GGAGACGATGGGAAGAGGCAAGTTCAAGGGGAAACCTACAGGCCAACGCCGATTCTCTAG
CGCTGCTGAAATACTTGCGGGCACTTCTGCTGTACGTCCT

QA 8 107 8 107
DS 

RD RR2GS05TF 199 0 0
GG
ATAGTCTCTTGCGTCAGGAATCAGATTCTCTGTTTCCCTTTTTTTACCAGTTTTTGATCT
CTTCTCTTGCGGAATTTGAGTTTTTGTGGGGGGAGACGATGGGAAGAGGCAAGTTCAAGG
GCAAACCTACAGGCCAACGCCGATTCTCTAGCGCTGCTGAAATACTTGCGGGCACTTCTG
CTGCACGTCCTCGGTCA

QA 3 199 3 199
DS 

RD RR2BP06TF 738 0 0
GGAGGTGCCTTTAGGGTTTTCGTCTCGTTGTGCTGTGTGTGACCGTTCTCCTCCACCAAT
TTTTGAAACAAAAGCAAGACCCAAATTCTTATTCGCTTTTGAATAGTCTCTTGCGTCAGG
AATCAGATTCTCTGTTTCCCTTTTTTTACCAGTTTTTGATCTCTTCTCTTGCGAAATTTG
AGTTTTTGTGGGGGGAGACGATGGGAAGAGGCAAGTTCAAGGGCAAACCTACAGGCCAAC
GCCGATTCTCTAGCGCTGCTGAAATACTTGCGGGCACTTCTGCTGCACGTCCTCGGTCAT
TCAAGCAGAAAGAAGCAGAGTACGAAGAAGATATCGAAGAGGAGTCTGAAGAGGACGAAT
CTGAAGAAGAATCCGAAGATGAATCTGATGTGAAGAAGAAAGGGCATGAAGCTCTAATCG
AAGTTGATAACCCTAACAGAGCTAAGCCAAAGACCTTGAAAGCTAGAGACCTTGATGCAA
GTAAAACCACTGAACTCTCAAGGCGTGAAAGGGAGGAGCTAGAGAAGCAGCGAGCTCATG
AGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCAAGGCAAAACCGAGCAAGCAAGAAAGGATTTGGATC
GTTTGGCTCTGATTCGTCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAGAAGCGAGAAGAAGAAAA*G
CGGCGAGAGACGCGAAGAAAGTCGATGCACGCAA*TGAGCTAAGTGTTCA*GCTCATCAG
AGAACTACCCTACTTTAT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2B969JQ 780 0 0
GGGA
ATAGTCTCTTGCGTCAGGAATCAGATTCTCTGTTTCCTTTTTTTTACCAGTTTTTGATCT
CTTCTCTTGCGGAATTTGAGTTTTTGTGGGGGGAGACGATGGGAAGAGGCAAGTTCAAGG
GCAAACCTACAGGCCAACGCCGATTCTCTAGCGCTGCTGAAATACTTGCGGGCACTTCTG
CTGCACGTCCTCGGTCATTCAAGCAGAAAGAAGCAGAGTACGAAGAAGATATCGAAGAGG
AGTCTGAAGAGGACGAATCTGAAGAAGAATCCGAAGATGAATCTGATGTGAAGAAGAAAG
GGCATGAAGCTCTAATCGAAGTTGATAACCCTAACAGAGCTAAGCCAAAGACCTTGAAAG
CTAGAGACCTTGATGCAAGTAAAACCACTGAACTCTCAAGGCGTGAAAGGGAGGAGCTAG
AGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCAAGGCAAAACCGAGCAAG
CAAGAAAGGATTTGGATCGTTTGGCTCTGATTCGTCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAGA
AGCGAGAAGAAGAAAAAGCAGCGAGAGACGCGAAGAAAGTCGATGCACGCAAATGAGCTA
AGTGTTCAAGCTCATCAGAGAACTACCCTACTTTATAACTATATATATATAACAAAACAA
GACTCAGCGACTAAGATGCTTTTTTTTTTACTTTTGTTCAATTGGTAAACAAATACAGCC
TTTACCTATTTACTCAGTTCCGTGTGGATCCTAATACATTTGAAAGTTATTGAGTC

QA 5 780 5 780
DS 

RD RR2B969TF 780 0 0
GGGA
ATAGTCTCTTGCGTCAGGAATCAGATTCTCTGTTTCCTTTTTTTTACCAGTTTTTGATCT
CTTCTCTTGCGGAATTTGAGTTTTTGTGGGGGGAGACGATGGGAAGAGGCAAGTTCAAGG
GCAAACCTACAGGCCAACGCCGATTCTCTAGCGCTGCTGAAATACTTGCGGGCACTTCTG
CTGCACGTCCTCGGTCATTCAAGCAGAAAGAAGCAGAGTACGAAGAAGATATCGAAGAGG
AGTCTGAAGAGGACGAATCTGAAGAAGAATCCGAAGATGAATCTGATGTGAAGAAGAAAG
GGCATGAAGCTCTAATCGAAGTTGATAACCCTAACAGAGCTAAGCCAAAGACCTTGAAAG
CTAGAGACCTTGATGCAAGTAAAACCACTGAACTCTCAAGGCGTGAAAGGGAGGAGCTAG
AGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAAGTTGCAGGAGCAAGGCAAAACCGAGCAAG
CAAGAAAGGATTTGGATCGTTTGGCTCTGATTCGTCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAGA
AGCGAGAAGAAGAAAAAGCAGCGAGAGACGCGAAGAAAGTCGATGCACGCAAATGAGCTA
AGTGTTCAAGCTCATCAGAGAACTACCCTACTTTATAACTATATATATATAACAAAACAA
GACTCAGCGACTAAGATGCTTTTTTTTTTACTTTTGTTCAATTGGTAAACAAATACAGCC
TTTACCTATTTACTCAGTTCCGTGTGGATCCTAATACATTTGAAAGTTATTGAGTC

QA 5 780 5 780
DS 



AS 1 3

CO CL1643Contig1 835 3 11 U
GGAGACGGAGGCCCTCAAGAGATCGCTGGTGGATTCCTTGTACGGCACAGACCGAGGTTT
GAGCGCATCGAGCGAGACGAGAGCCGAGATCGGAGATCTAATCACACAGCTCGAGTCCAA
GAACCCTACCCCCAGCTCCCACCGAAGCTCTCTTCCTTCTCAACGGCAAATGGATCCTCG
CGTACACATCGTTCGTTGGTTTGTTCCCGTTACTTTCACGAGGGATCGTGCCGTTAGTTA
AAGTCGACGAGATCTCACAGACCATCGATTCAGACTTCTTCACGGTCGAGAACTCTGTCC
TGTTCGCTGGTCCGTTGGCTACGACCTCGATCAGCACCAACGCCAAATTCGAAATCAGGA
GCCCTAAACGCGTCCAGATTAAGTTCGAGGAAGGTGTGATCGGGACTCCTCAGCTAACGG
ATTCGATCGAGATCCCTGAGTACGTCGAGTTTCTTGGACAGAAGATTGATCTTACTCCGA
TCAGAGGGCTGCTTACTTCGGTACAAGACACGGCTTCGTCGGTGGCGAGAACCATATCGA
GCCAGCCACCGTTGAAGTTCGCTTTGCCAGGGGACAATGCGCAGTCGTGGCTGCTCACGA
CTTATCTGGACAAGGAGATTCGGATCTCTAGAGGAGATGGTGGAAGCGTCTTTGTGCTTA
TCAAAGAAGGAAGCCCTCTCTTGAATCCTTGAGTTAATAGCTCCTCATAATCTATATCAC
TACCTTTCATGCCAAGTGTTGTCGTAGGTTTTTACTTAATGTTTGTATTAACTTGGGTGA
TATGGTAATTAAGAAATAATGTTTGTAAACTGCTATAAAAGTACAAATGCTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN31TF U 1
AF RR2G436TF U 145
AF RR2C930JQ C 9
BS 1 132 RR2FN31TF
BS 133 133 RR2C930JQ
BS 134 411 RR2FN31TF
BS 412 413 RR2G436TF
BS 414 614 RR2FN31TF
BS 615 671 RR2G436TF
BS 672 672 RR2C930JQ
BS 673 703 RR2G436TF
BS 704 704 RR2C930JQ
BS 705 742 RR2G436TF
BS 743 835 RR2C930JQ

RD RR2FN31TF 618 0 0
GGAGACGGAGGCCCTCAAGAGATCGCTGGTGGATTCCTTGTACGGCACAGACCGAGGTTT
GAGCGCATCGAGCGAGACGAGAGCCGAGATCGGAGATCTAATCACACAGCTCGAGTCCAA
GAACCCTACCCC*AGCTCCCACCGAAGCTCTCTTCCTTCTCAACGGCAAATGGATCCTCG
CGTACACATCGTTCGTTGGTTTGTTCCCGTTACTTTCACGAGGGATCGTGCCGTTAGTTA
AAGTCGACGAGATCTCACAGACCATCGATTCAGACTTCTTCACGGTCGAGAACTCTGTCC
TGTTCGCTGGTCCGTTGGCTACGACCTCGATCAGCACCAACGCCAAATTCGAAATCAGGA
GCCCTAAACGCGTCCAGATTAAGTTCGAGGAAGGTGTGATCGGGACTCCTC**CTAACGG
ATTCGATCGAGATCCCTGAGTACGTCGAGTTTCTTGGACAGAAGATTGATCTTACTCCGA
TCAGAGGGCTGCTTACTTCGGTACAAGACACGGCTTCGTCGGTGGCGAGAACCATATCGA
GCCAGCCACCGTTGAAGTTCGCTTTGCCAGGGGACAATGCGCAGTCGTGGCTGCTCACGA
CTTATCTGGACAAG
AGAT

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2G436TF 598 0 0
G
AGCTCTCTTCCTTCTCAACGGCAAATGGATCCTCGCGTACACATCGTTCGTTGGTTTGTT
CCCGTTACTTTCACGAGGGATCGTGCCGTTAGTTAAAGTCGACGAGATCTCACAGACCAT
CGATTCAGACTTCTTCACGGTCGAGAACTCTGTCCTGTTCGCTGGTCCGTTGGCTACGAC
CTCGATCAGCACCAACGCCAAATTCGAAATCAGGAGCCCTAAACGCGTCCAGATTAAGTT
CGAGGAAGGTGTGATCGGGACTCCTCAGCTAACGGATTCGATCGAGATCTCTGAGTACGT
CGAGTTTCTTGGACAGAAGATTGATCTTACTCCGATCAGAGGGCTGCTTACTTCGGTACA
AGACACGGCTTCGTCGGTGGCGAGAACCATATCGAGCCAGCCACCGTTGAAGTTCGCTTT
GCCAGGGGACAATGCGCAGTCGTGGCTGCTCACGACTTATCTGGACAAGGAGATTCGGAT
CTCTAGAGGAGATGGTGGAAGCGTCTTTGTGCTTATCAAAGAAGGAGGCCCTCTCTTGAA
TCCTTGAGTTAATAGCTCGTCATAATCTATATCACTACCTTTCATGCCAAGTGTTGT

QA 2 598 2 598
DS 

RD RR2C930JQ 827 0 0
AGGCTCTCAAGAGATCGCTGGTGGAT*CCTTGTACGGCACAGACCGAGGTTTGAGCGCAT
CGAGCGAGACTCGAGCCGAGATCGGAGATTTAATCACACAGCTCGAGTCCAAGAACCCTA
CCCCCAGCTCCCACCGAAGCTCTCTTCCTTCTCAACGGCAAATGGATCCTCGCGTACACA
TCGTTCGTTGGTTTGTTCCTGCTGCTCTCACGAGGGATCGTGCCGTTAGTTAAAGTCGAC
GAGATCTCACAGACCATCGATTCAGACTTCTTCACGGTCGAGAACTCTGTTCTGTTCGCT
GGTCCGCTGGCTACGACCTCGATCAGCACCAACGCGAAATTCGAAATCCGGAGTCCTAAA
CGCGTCCAGATTAAGTTCGAGGAAGGTGTGATCGGGACTCCTCAGCTTACGGATTCGATC
GAGATCCCTGAGTACGTTGAGTTTCTTGGACAGAAGATTGATCTTGCTCCGATCAGAGGG
CTGCTTACTTCGGTACAAGACACGGCTTCGTCTGTGGCGAGAACCATATCGAGCCAGCCA
CCGTTGAAGTTCGCTTTGCCAGGGGACAATGCACAGTCGTGGCTGCTCACGACTTATCTG
GACAAGGAGATTCGGATCTCTAGAGGAGATGGTGGAAGCGTCTTTGTGCTTATCAAAGAA
GGAAGCCCTCTCTTGAATCCTTGAGTTAATAGCTCCTCATAATCTATATCACTACCTTTC
ATGCCAAGTGTTGTCGTAGGTTTTTACTTAATGTTTGTATTAACTTGGGTGATATGGTAA
TTAAGAAATAATGTTTGTAAACTGCTATAAAAGTACAAATGCTTACG

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 4

CO CL1644Contig1 1056 4 17 U
AGCTTAAACTACTCATAAGCAGGCTAATAGTTAAATTGTGAGTGTACAAGAAAGGGGGGC
CAATTTCAACTATTGTGTAAGACAAATAAAAGAAAAAAACAATCGTGTAATCCATTCTCC
TTTTGAACAAATATATTGACTTAACAAGATGATGATGAAGATGAGCTAAATCGGATGAAT
TGACAAGATTGTGTATATGAGAAAAGGGGGTTGTTAGTCGGTTGAAAGGCGAAGAAGCAA
ACCAGAAGTGGTTTGGAAAGTTTTGAGGTGACGGGAGCCAATGAGATCTCGAATGTGAAA
TCTCATATCAAGAGGAGAGTAGCGGAGTCGTTTCTTTTCAAGCTGGGCCAAGAACATCTC
TTTGTGACGCTTGCGCTTTAGCAACGAGAGTAGCTCCTTCCTTCCCTGCCGCAGAGCCTT
CAAAAGTTTGCCAATACTGGGAATGGTAAACCAGTACATGTCTGGATCGATAAGTTGGCG
TGTGAGAAGGCCAGCGTTGATTAAGAGAGTGATGTGCGCATCCTTCACCTTTCCCCCC*A
ATGACAAGAGCGTACA******AAGCTCATGATGTGAAATATTGGGATCAATTTTAGAAT
CAAGGATATGTTCTTTGAACCACTTGAAAATAGTTGCAGTATCACTCTGATTCTTGTCTT
CCATCCTCTTTGCTATTCGATCAACCTGGTTAAGATAGTCATCGAGAAAGATGATTGCAT
GATCATCTTGTCCAGTGTTGAGTTTGAAAACACGAACAACTTTATCCCTTCGTAGAAGCT
CAAGTTCACTATCGACCTGGGTTCTATCGTTGACGCTACTGTACAACTGCGACTGTAATA
TGAATGGCGGGACCGAAGCCTGGTCAATGCGAGGAAACTGAGACCGCATCATCCGAAGCG
CCACAGAAGTATCGGTAAAGGTAAGTTCATCCTGGAGAGAAAAACATTGATCTCCATTCG
CAACTTGACTGCAACCAACTTCATCCTCCTCTCGCCGACGCTTCTTTCCTCCGGCGGAGG
TTTCCGAATTTGTGACTTTCTTCATTTGATTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY68TF C 51
AF RR2FM05JQ U 1
AF RR2C925JQ U 46
AF RR2C925TF C 422
BS 1 200 RR2FM05JQ
BS 201 201 RR2C925JQ
BS 202 233 RR2FM05JQ
BS 234 234 RR2C925JQ
BS 235 244 RR2FM05JQ
BS 245 245 RR2C925JQ
BS 246 406 RR2FM05JQ
BS 407 410 RR2C925JQ
BS 411 448 RR2FM05JQ
BS 449 449 RR2C925JQ
BS 450 556 RR2FM05JQ
BS 557 562 RR2C925JQ
BS 563 681 RR2FM05JQ
BS 682 866 RR2C925JQ
BS 867 867 RR2C925TF
BS 868 898 RR2C925JQ
BS 899 1056 RR2C925TF

RD RR2FY68TF 221 0 0
AAAGGGGGGCCAATTTCAACTATTGTGTAAGACAAATAAAAGAAAAAAACAATCGTGTAA
TCCATTCTCCTTTTGAACAAATATATTGACTTAACAAGATGATGATGAAGATGAGCTAAA
TCGGATGAATTGACAAGATTGTGTATATGAGAAAAGGGGGTTGTTAGTCGGTTGAAAGGC
GAAGAAGCAAACCAGAAGTGGTTTGGAAAGTTTTGAGGTG
C

QA 1 220 1 220
DS 

RD RR2FM05JQ 681 0 0
AGCTTAAACTACTCATAAGCAGGCTAATAGTTAAATTGTGAGTGTACAAGAAAGGGGGGC
CAATTTCAACTATTGTGTAAGACAAATAAAAGAAAAAAACAATCGTGTAATCCATTCTCC
TTTTGAACAAATATATTGACTTAACAAGATGATGATGAAGATGAGCTAAATCGGATGAAT
TGACAAGATTGTGTATATGAAAAAAGGGGGTTGTTAGTCGGTTGAAAGGCGAAAAAGCAA
ACCAAAAGTGGTTTGGAAAGTTTTGAGGTGACGGGAGCCAATGAGATCTCGAATGTGAAA
TCTCATATCAAGAGGAGAGTAGCGGAGTCGTTTCTTTTCAAGCTGGGCCAAGAACATCTC
TTTGTGACGCTTGCGCTTTAGCAACGAGAGTAGCTCCTTCCTTCCC****GCAGAGCCTT
CAAAAGTTTGCCAATACTGGGAATGGTAGACCAGTACATGTCTGGATCGATAAGTTGGCG
TGTGAGAAGGCCAGCGTTGATTAAGAGAGTGATGTGCGCATCCTTCACCTTTCCCCCC*A
ATGACAAGAGCGTACATGTCACAAGCTCATGATGTGAAATATTGGGATCAATTTTAGAAT
CAAGGATATGTTCTTTGAACCACTTGAAAATAGTTGCAGTATCACTCTGATTCTTGTCTT
CCATCCTCTTTGCTATTCGAT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2C925JQ 853 0 0
ACAAG
AAAGGGGGGCCAATTTCAACTATTGTGTAAGACAAATAAAAGAAAAAAACAATCGTGTAA
TCCATTCTCCTTTTGAACAAATATATTGACTTAACAAGATGATGATGAAGATGAGCTAAA
TCGGATGAATTGACAAGATTGTGTATATAAGAAGAGGGGGTTGTTAGTCGGTTGAAAGGC
GAAGAAGCAAACCAGAAGTGGTTTGGAAAGTTTTGAGGTGACGGGAGCCAATGAGATCTC
GAATGTGAAATCTCATATCAAGAGGAGAGTAGCGGAGTCGTTTCTTTTCAAGCTGGGCCA
AGAACATCTCTTTGTGACGCTTGCGCTTTAGCAACGAGAGTAGCTCCTTCCTTCCCTGCC
GCAGAGCCTTCAAAAGTTTGCCAATACTGGGAATGGTAAACCAGTACATGTCTGGATCGA
TAAGTTGGCGTGTGAGAAGGCCAGCGTTGATTAAGAGAGTGATGTGCGCATCCTTCACCT
TTCCCCCC*AATGACAAGAGCGTACA******AAGCTCATGATGTGAAATATTGGGATCA
ATTTTAGAATCAAGGATATGTTCTTTGAACCACTTGAAAATAGTTGCAGTATCACTCTGA
TTCTTGTCTTCCATCCTCTTTGCTATTCGATCAACCTGGTTAAGATAGTCATCGAGAAAG
ATGATTGCATGATCATCTTGTCCAGTGTTGAGTTTGAAAACACGAACAACTTTATCCCTT
CGTAGAAGCTCAAGTTCACTATCGACCTGGGTTCTATCGTTGACGCTACTGTACAACTGC
GACTGTAATATGAATGGCGGGACCGAAGCCTGGTCA*TGCGAGGAAACTGAGACCGCATC
ATCCGAAG

QA 6 853 6 853
DS 

RD RR2C925TF 635 0 0
AAAAGTTTGCCAATACTGGGAATGGTAAACCAGTACATGTCTGGATCGATAAGTTGGCGT
GTGAGAAGGCCAGCGTTGATTAAGAGAGTGATGTGCGCATCCTTCACCTTTCCCCCCCAA
TGACAAGAGCGTACA******AAGCTCATGATGTGAAATATTGGGATCAATTTTAGAATC
AAGGATATGTTCTTTGAACCACTTGAAAATAGTTGCAGTATCACTCTGATTCTTGTCTTC
CATCCTCTTTGCTATTCGATCAACCTGGTTAAGATAGTCATCGAGAAAGATGATTGCATG
ATCATCTTGTCCAGTGTTGAGTTTGAAAACACGAACAACTTTATCCCTTCGTAGAAGCTC
AAGTTCACTATCGACCTGGGTTCTATCGTTGACGCTACTGTACAACTGCGACTGTAATAT
GAATGGCGGGACCGAAGCCTGGTCAATGCGAGGAAACTGAGACCGCATCATCCGAAGCGC
CACAGAAGTATCGGTAAAGGTAAGTTCATCCTGGAGAGAAAAACATTGATCTCCATTCGC
AACTTGACTGCAACCAACTTCATCCTCCTCTCGCCGACGCTTCTTTCCTCCGGCGGAGGT
TTCCGAATTTGTGACTTTCTTCATTTGATTTCTCC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 5

CO CL1645Contig1 1359 5 25 U
CGATTGAAATATTTGTATGTGATTAAGAGACATATCTTTACAAGTGGAAGGAAACGAGCC
AAGTTTATAACTAAAAGTTTGAAGTTCACCAAAACACAAGAAAATGTTAGAGAAACCAAA
ACACACACAAAACAAGATTTCTTTCTGATTCAAACAGAAGCAGCAGCTTCGAGTTTGGGA
AGAAGAGCTCTCCAGGCGTCAGCAATACCGTTTGCTAAGCGAGCTTGTCCTTTGGCGAAC
TGATGGAACGCTACTCCCATCTCTTCCGTCTTCTGTTCTTGGAACCTCACTATCTCCTCG
TTCATTCTCTTCACTATCCTCTCAAATCTTATCGTTGCTTCCTCGCTCTCTGCTTTTATC
TCTCTGTATTCGATCTCAGCTTCTCCTACTTTGTCAGAACGTGTGAGCATGAGTTTGTCA
AGGTTTATTTCCTTTAGCTTTGTTGTTTCGGCCATTTCACAATGTTGCTTGAATGCAGTG
GCTCGTTCTCCTATGGTTGCCTTAATCGATTGCACATAACGAACATAGTCCTTCAAGGGT
TCCTCGAAGTTCATCAGGACTTGTTGAGCCTCTTTCTGGAGCTTGATAGATACCAGTTCT
GATTTAGTTCCAAGATCGGAAAATAGTTTTCCTGTAGGTTCACCCTCACAAGCCCCAAGA
AGCTTTACAGCCTTGCCAAAATCCAACAGTGACTGGCCCAACTCTCTATGCCTCTTGACG
AGGCGATACGCATGCTTTTGAGCCTCGGCTAAGTGGTTCTCAAGCTCGAAAACGTAGTGT
TTAAGCTTCTCATATTCAGGAGTGGTTTCTTCGACAGGTTTTTCTTTTCCTAGGACAGCA
TCGCTAACCTTTGATTGCACATCCCTGAACATTTGCATAAAATCTGCAGGCTTCTTATTG
AATATGCCAGTTTCCTGAAACCTGAATCTTTCCATTGTCTCTTCATCCGCTTGCAAAAAG
GTTCTAAGATCCTCACTCTGCTGGAGCTCAGGGTGTGATGCTATCCGATTAACAAATATG
TCCAATGCTGCTCGCCTCATTTCAATAAATTCAGCACTAAACCGGAACTTCTCAACAGCA
CTCTTCTCAGGGAGAGGAGGAATGAAAACACCCTTGTATTTCTCAAACAGCCGATCCCTC
AACCACACGAAATCACTGTACCGTCTGATTACAATCTTCTCCGGTCCTTGATACTCCGGC
AAGTTCGTCTTGGTGATGACTCGGTAAGAGATGTAAGATTGGACGCCATTGCCTAATTTG
ACAGGATCGGTGACGGAGGCTGACAGAAAAGGATGAGAAGACGGAGATCTAGGGCTCTGC
ATCACGTTCCTCGTCTGACTCTGATCTATGCTGCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM86JQ U 1
AF RR2H106JQ U 15
AF RR2GL77JQ U 15
AF RR2DM86TF C 639
AF RR2H106TF C 923
BS 1 73 RR2DM86JQ
BS 74 74 RR2GL77JQ
BS 75 79 RR2DM86JQ
BS 80 80 RR2GL77JQ
BS 81 140 RR2DM86JQ
BS 141 142 RR2GL77JQ
BS 143 144 RR2DM86JQ
BS 145 145 RR2GL77JQ
BS 146 160 RR2DM86JQ
BS 161 161 RR2GL77JQ
BS 162 197 RR2DM86JQ
BS 198 198 RR2GL77JQ
BS 199 203 RR2DM86JQ
BS 204 204 RR2GL77JQ
BS 205 305 RR2DM86JQ
BS 306 306 RR2GL77JQ
BS 307 329 RR2DM86JQ
BS 330 330 RR2GL77JQ
BS 331 454 RR2DM86JQ
BS 455 455 RR2GL77JQ
BS 456 764 RR2DM86JQ
BS 765 800 RR2GL77JQ
BS 801 1237 RR2DM86TF
BS 1238 1238 RR2H106TF
BS 1239 1359 RR2DM86TF

RD RR2DM86JQ 767 0 0
CGATTGAAATATTTGTATGTGATTAAGAGACATATCTTTACAAGTGGAAGGAAACGAGCC
AAGTTTATAACTAGAAGTT*GAAGTTCACCAAAACACAAGAAAATGTTAGAGAAACCAAA
ACACACACAAAACAAGATTT**TTTTGATTCAAACAGAAGAAGCAGCTTCGAGTTTGGGA
AGAAGAGCTCTCCAGGCATCAGCGATACCGTTTGCTAAGCGAGCTTGTCCTTTGGCGAAC
TGATGGAACGCTACTCCCATCTCTTCCGTCTTCTGTTCTTGGAACCTCACTATCTCCTCG
TTCATCCTCTTCACTATCCTCTCAAATCTCATCGTTGCTTCCTCGCTCTCTGCTTTTATC
TCTCTGTATTCGATCTCAGCTTCTCCTACTTTGTCAGAACGTGTGAGCATGAGTTTGTCA
AGGTTTATTTCCTTTAGCTTTGTTGTTTCGGCCAATTCACAATGTTGCTTGAATGCAGTG
GCTCGTTCTCCTATGGTTGCCTTAATCGATTGCACATAACGAACATAGTCCTTCAAGGGT
TCCTCGAAGTTCATCAGGACTTGTTGAGCCTCTTTCTGGAGCTTGATAGATACCAGTTCT
GATTTAGTTCCAAGATCGGAAAATAGTTTTCCTGTAGGTTCACCCTCACAAGCCCCAAGA
AGCTTTACAGCCTTGCCAAAATCCAACAGTGACTGGCCCAACTCTCTATGCCTCTTGACG
AGGCGATACGCATGCTTTTGAGCCTCGGCTAAGTGGTTCTCAAG
TTC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2H106JQ 752 0 0
GTATGTGATTAAGAGACATATCTTTACAAGTGGAAGGAAACGAGCCAAGTTTATAACTAA
AAGTTTGAAGTTCACCAAAACACAAGAAAATGTTAGAGAAACCAAAACACACACAAAACA
AGATTTCTTTCTGATTCAAACAGAAGCAGCAGCTTCGAGTTTGGGAAGAAGAGCTCTCCA
GGCGTCAGCAATACCGTTTGCTAAGCGAGCTTGTCCTTTGGCGAACTGATGGAACGCTAC
TCCCATCTCTTCCGTCTTCTGTTCTTGGAACCTCACTATCTCCTCGTTCATTCTCTTCAC
TATCCTCTCAAATCTTATCGTTGCTTCCTCGCTCTCTGCTTTTATCTCTCTGTATTCGAT
CTCAGCTTCTCCTACTTTGTCAGAACGTGTGAGCATGAGTTTGTCAAGGTTTATTTCCTT
TAGCTTTGTTGTTTCGGCCATTTCACAATGTTGCTTGAATGCAGTGGCTCGTTCTCCTAT
GGTTGCCTTAATCGATTGCACATAACGAACATAGTCCTTCAAGGGTTCCTCGAAGTTCAT
CAGGACTTGTTGAGCCTCTTTCTGGAGCTTGATAGATACCAGTTCTGATTTAGTTCCAAG
ATCGGAAAATAGTTTTCCTGTAGGTTCACCCTCACAAGCCCCAAGAAGCTTTACAGCCTT
GCCAAAATCCAACAGCGACTGGCCCAACTCTCTATGCCTCTTGACGAGGCGATACGCATG
CTTTTGAGCCTCGGTTAAGTGGTTCTCAAG
CT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2GL77JQ 786 0 0
GTATGTGATTAAGAGACATATCTTTACAAGTGGAAGGAAACGAGCCAAGTTTATAACTAA
AAGTTTGAAGTTCACCAAAACACAAGAAAATGTTAGAGAAACCAAAACACACACAAAACA
AGATTTCTTTCTGATTCAAACAGAAGCAGCAGCTTCGAGTTTGGGAAGAAGAGCTCTCCA
GGCGTCAGCAATACCGTTTGCTAAGCGAGCTTGTCCTTTGGCGAACTGATGGAACGCTAC
TCCCATCTCTTCCGTCTTCTGTTCTTGGAACCTCACTATCTCCTCGTTCATTCTCTTCAC
TATCCTCTCAAATCTTATCGTTGCTTCCTCGCTCTCTGCTTTTATCTCTCTGTATTCGAT
CTCAGCTTCTCCTACTTTGTCAGAACGTGTGAGCATGAGTTTGTCAAGGTTTATTTCCTT
TAGCTTTGTTGTTTCGGCCATTTCACAATGTTGCTTGAATGCAGTGGCTCGTTCTCCTAT
GGTTGCCTTAATCGATTGCACATAACGAACATAGTCCTTCAAGGGTTCCTCGAAGTTCAT
CAGGACTTGTTGAGCCTCTTTCTGGAGCTTGATAGATACCAGTTCTGATTTAGTTCCAAG
ATCGGAAAATAGTTTTCCTGTAGGTTCACCCTCACAAGCCCCAAGAAGCTTTACAGCCTT
GCCAAAATCCAACAGCGACTGGCCCAACTCTCTATGCCTCTTGACGAGGCGATACGCATG
CTTTTGAGCCTCGGTTAAGTGGTTCTCAAGCTCGAAAACGTAGTGTTTAAGCTTCTCATA
TTCAGG

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2DM86TF 721 0 0
TTCACCCTCACAAGCCCCAAGAAGCTTTACAGC*TTGCCAAAATCCAACAGTGACTGGCC
CAACTCTCTATGCCTCTTGACGAGGCGATACGCATGCTTTTGAGCCTCGGCTAAGTGGTT
CTCAAGTTCGAAAACGTAGTGTTTAAGCTTCTCGTATTCAGGAGTGGTTTCTTCGACAGG
TTTTTCTTTTCCTAGGACAGCATCGCTAACCTTTGATTGCACATCCCTGAACATTTGCAT
AAAATCTGCAGGCTTCTTATTGAATATGCCAGTTTCCTGAAACCTGAATCTTTCCATTGT
CTCTTCATCCGCTTGCAAAAAGGTTCTAAGATCCTCACTCTGCTGGAGCTCAGGGTGTGA
TGCTATCCGATTAACAAATATGTCCAATGCTGCTCGCCTCATTTCAATAAATTCAGCACT
AAACCGGAACTTCTCAACAGCACTCTTCTCAGGGAGAGGAGGAATGAAAACACCCTTGTA
TTTCTCAAACAGCCGATCCCTCAACCACACGAAATCACTGTACCGTCTGATTACAATCTT
CTCCGGTCCTTGATACTCCGGCAAGTTCGTCTTGGTGATGACTCGGTAAGAGATGTAAGC
TTGGACGCCATTGCCTAATTTGACAGGATCGGTGACGGAGGCTGACAGAAAAGGATGAGA
AGACGGAGATCTAGGGCTCTGCATCACGTTCCTCGTCTGACTCTGATCTATGCTGCTCTC
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2H106TF 427 0 0
TGAATCTTTCCATTGTCTCTTCATCTGCTTGCAAAAAGGTTCTAAGATCCTCACTCTGCT
GGAGCTCAGGGTGTGATGCTATCCGATTAACAAATATGTCCAATGCTGCTCGCCTCATTT
CAATAAATTCAGCACTAAACCGGAACTTCTCAACAGCACTCTTCTCAGGGAGAGGAGGAA
TGAAAACACCCTTGTATTTCTCAAACAGCCGATCCCTTAGCCACACGAAATCACTGTACC
GTCTGATTACAATCTTCTCCGGTCCTTGATACTCCGGCAAGTTCGTCTTGGTGATGACTC
GGTAAGAGATGTAAGATTGGACGCCATTGCCTAATTTTACGGGATCGGTGACGGAGGCTG
ACAGGAAGGGATGAGAAGACGGAGATCTAGGGCTCTGCATCACGTTCCTCGTCTGACTCT
GATCT
CC

QA 1 425 1 425
DS 



AS 1 5

CO CL1646Contig1 776 5 13 U
GGATACATATATATAGAGAGAAAAGATCAAAAACATCGAACCATGGAGAAATCAACGAGA
ACCCTAATGATCATAACCATCGTGATTACATCCATGTTGGTAGGGTTTGGAAGCTCAGAT
CTGGATCAAGACAGAGAAGAGTGTACGGACCAGTTGATAGCACTCTCACCGTGTCTCCCA
TACGTGGGAGGAAACGCAAAGGCTCCAACAAAAGATTGTTGTGGAGGTTTTGATCAGGTG
ATAACAAAGAGTGAGAAGTGTGTTTGCATTTTGGTCAAAGACAAAGATGATCCTAATCTC
GGCCTAAAGTTTAACGCAACACTAGCCGCTTATATTCCCACCCTTTGTCATATTACGGCT
CCTAACATCACCAAGTGTATTTCGCTTCTGCATTTATCTCCAAACTCGACATTGGCTAAA
GAGTTCGAGAGTTTGGGAAGGATTGAATATGAAGGAAAGACCAACTCCACATCTCCTTCC
CCACATGTTAAAGATGGGACAGGAGGAGGAAAAGCTGAACAAGTAAAGAGTACTGGAGAG
AAGAAGAGTTGGTTGGCTGTTGAGCTTTTAATATTGGCTCTGTTCTCTCATCTTCTTTTC
ATTATCTCTTCTCCAGTATCTTCCTCCTTTATTTAATGTTCTTTTGCTTTGAATATGCTA
AATAGTTTTATAATGTTCTCAGTTACATCTAAATTTATATATGCATGTGCATGCATATGA
TTATGTATGCATGAGAGTGCAAACTTGTAATATTTAATCGGTATTGAAATTTTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2FX02TF U 33
AF RR2GT28TF U 1
AF RR2FX02JQ C 124
AF RR2B607JQ C 415
AF RR2B607TF U 415
BS 1 293 RR2GT28TF
BS 294 294 RR2FX02TF
BS 295 299 RR2GT28TF
BS 300 300 RR2FX02TF
BS 301 330 RR2GT28TF
BS 331 331 RR2FX02TF
BS 332 660 RR2GT28TF
BS 661 662 RR2B607TF
BS 663 749 RR2GT28TF
BS 750 750 RR2B607TF
BS 751 763 RR2GT28TF
BS 764 773 RR2B607TF
BS 774 776 RR2B607JQ

RD RR2FX02TF 596 0 0
GG
ATCGAACCATGGAGAAATCAACGAGAACCCTAATGATCATAACCATCGTGATTACATCCA
TGTTGGTAGGGTTTGGAAGCTCAGATCTGGATCAAGACAGAGAAGAGTGTACGGACCAGT
TGATAGCACTCTCACCGTGTCTCCCATACGTGGGAGGAAACGCAAAGGCTCCAACAAAAG
ATTGTTGTGGAGGTTTTGATCAGGTGATAACAAAGAGTGAGAAGTGTGTTTGCATTTTGG
TCAAAGACAAAGATGATCCTAATCTCGGCCTAAAGTTTAACGCAACACTAGCCGCTTATA
TTCCCACCCTTTGTCATATTACGGCTCCTAACATCACCAAGTGTATTTCGCTTCTGCATT
TATCTCCAAACTCGACATTGGCTAAAGAGTTCGAGAGTTTGGGAAGGATTGAATATGAAG
GAAAGACCAACTCCACATCTCCTTCCCCACATGTTAAAGATGGGACAGGAGGAGGAAAAG
CTGAACAAGTAAAGAGTACTGGAGAGAAGAAGAGTTGGTTGGCTGTTGAGCTTTTAATAT
TGGCTCTGTTCTCTCATCTTCTTTTCATTATCTCTTCTCCAGTATCTTCCTCCT

QA 3 596 3 596
DS 

RD RR2GT28TF 763 0 0
GGATACATATATATAGAGAGAAAAGATCAAAAACATCGAACCATGGAGAAATCAACGAGA
ACCCTAATGATCATAACCATCGTGATTACATCCATGTTGGTAGGGTTTGGAAGCTCAGAT
CTGGATCAAGACAGAGAAGAGTGTACGGACCAGTTGATAGCACTCTCACCGTGTCTCCCA
TACGTGGGAGGAAACGCAAAGGCTCCAACAAAAGATTGTTGTGGAGGTTTTGATCAGGTG
ATAACAAAGAGTGAGAAGTGTGTTTGCATTTTGGTCAAAGACAAAGATGATCCAAATCTT
GGCCTAAAGTTTAACGCAACACTAGCCGCTCATATTCCCACCCTTTGTCATATTACGGCT
CCTAACATCACCAAGTGTATTTCGCTTCTGCATTTATCTCCAAACTCGACATTGGCTAAA
GAGTTCGAGAGTTTGGGAAGGATTGAATATGAAGGAAAGACCAACTCCACATCTCCTTCC
CCACATGTTAAAGATGGGACAGGAGGAGGAAAAGCTGAACAAGTAAAGAGTACTGGAGAG
AAGAAGAGTTGGTTGGCTGTTGAGCTTTTAATATTGGCTCTGTTCTCTCATCTTCTTTTC
ATTATCTCTTCTCCAGTATCTTCCTCCTTTATTTAATGTTCTTTTGCTTTGAATATGCTA
TGTAGTTTTATAATGTTCTCAGTTACATCTAAATTTATATATGCATGTGCATGCATATGA
TTATGTATGCATGAGAGTGCAAACTTGTA*TATTTAATCGGTA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2FX02JQ 650 0 0
GATCAAGACAGAGAAGAGTGTACGGACCAGTTGATAGCACTCTCACCGTGTCTCCCATAC
GTGGGAGGAAACGCAAAGGCTCCAACAAAAGATTGTTGTGGAGGTTTTGATCAGGTGATA
ACAAAGAGTGAGAAGTGTGTTTGCATTTTGGTCAAAGACAAAGATGATCCTAATCTCGGC
CTAAAGTTTAACGCAACACTAGCCGCTTATATTCCCACCCTTTGTCATATTACGGCTCCT
AACATCACCAAGTGTATTTCGCTTCTGCATTTATCTCCAAACTCGACATTGGCTAAAGAG
TTCGAGAGTTTGGGAAGGATTGAATATGAAGGAAAGACCAACTCCACATCTCCTTCCCCA
CATGTTAAAGATGGGACAGGAGGAGGAAAAGCTGAACAAGTAAAGAGTACTGGAGAGAAG
AAGAGTTGGTTGGCTGTTGAGCTTTTAATATTGGCTCTGTTCTCTCATCTTCTTTTCATT
ATCTCTTCTCCAGTATCTTCCTCCTTTATTTAATGTTCTTTTGCTTTGAATATGCTAAAT
AGTTTTATAATGTTTTCAGTTACATCTAAATTTATATATGCATGTGCATGCATATGATTA
TGTATGCATGAGAGTGCAAACTTGTAATATTTAATCGGTATTGAAATTTT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2B607JQ 362 0 0
GCTAAAGAGTTCGAGAGTTTGGGAAGGATTGAATATGAAGGAAAGACCAACTCCACATCT
CCTTCCCCACATGTTAAAGATGGGACAGGAGGAGGAAAAGCTGAACAAGTAAAGAGTACT
GGAGAGAAGAAGAGTTGGTTGGCTGTTGAGCTTTTAATATTGGCTCTGTTCTCTCATCTT
CTTTTCATTATCTCTTCTCCAGTATCTTCCTCCTTTATTTAATGTTCTTTTGCTTTGAAT
ATGCTAAATAGTTTTATAATGTTCTCAGTTACATCTAAATTTATATATGCATGTGCATGC
ATATGATTATGTATGCATGAGAGTGCAAACTTGTAATATTTAATCGGTATTGAAATTTTA
AG

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR2B607TF 362 0 0
GCTAAAGAGTTCGAGAGTTTGGGAAGGATTGAATATGAAGGAAAGACCAACTCCACATCT
CCTTCCCCACATGTTAAAGATGGGACAGGAGGAGGAAAAGCTGAACAAGTAAAGAGTACT
GGAGAGAAGAAGAGTTGGTTGGCTGTTGAGCTTTTAATATTGGCTCTGTTCTCTCATCTT
CTTTTCATTATCTCTTCTCCAGTATCTTCCTCCTTTATTTAATGTTCTTTTGCTTTGAAT
ATGCTAAATAGTTTTATAATGTTCTCAGTTACATCTAAATTTATATATGCATGTGCATGC
ATATGATTATGTATGCATGAGAGTGCAAACTTGTAATATTTAATCGGTATTGAAATTTT
AAG

QA 1 359 1 359
DS 



AS 1 5

CO CL1647Contig1 1037 5 36 U
GGAACAGTGATGGGCCTGCTAATGAAAACGGATATGTTGGAGGCTACAGACGCTCTGAAG
AAGGAGATGGAGCGAGACGTGGTGGGTCTTCTGTTGGTGGATACCGCGGTCGTGGTGGTG
GTCGCCGTGGAGGCTACAACAGTGGGGAGTCGGGTGACTTCGAACGCCCCCGTAGGAACT
TCGACCGCCAGAGTGGAACAGGTCACGGAAATGGGTTTAAACGTGATGGAGCTGGCCGTG
GCAACTGGGGAACCAATGAGGATGAGATTCCTCCAGTGACCGAAGAATCCGCAGCAGTTG
TGGTGGAGAAGAGTTTGGGTGTTGAGAAGGAAGGTGGTGAAGCAACTGAAGCAAACAAAG
AGACGACACCTGTTGAAGAGAAAGAGCCTGAGGACAAGGAGATGACTCTGGAAGAGTATG
AGAAGGTTTTGGAGGAGAAGAGGAAAGCTCTGCAGGCAACAAAGATTGAGGAGAGGAAGG
TTGACACAAAAGCGTTTGAGACCATGCAACAGCTCTCAAACAAAAAGAGCAACAACGACG
AGGTCTTCATCAAACTGGGAACAGAGAAGGACAAGCGCCCAGTTGAGAAAGAGGAGAAGA
CCAAGAAGTCGTTGAGCATAAATGAGTTTCTGAAACCTGCGAATGGAGAGAGGTACAGAG
GAGCTGGTTACCGTGGTGGAAGGGAAGGAGGACGTGGAGGTCGTGGACCAAGAGAAGGAG
CTGAAGGAAGAGGTCGTGGACCAAGAGGAGGAGCCGATGGAGGAGAAAACCAGAGAGCTG
CTGCTGCTGCTCCTAAAAGGGTCGCTCCTGCACCAAAAATTGAAGACGCCGCACAGTTCC
CAACTCTGGGAAAGTAAAGGCTCTCTCTTCTGTCTTGGTCCTTGAGCCTCTGTGTCTGGA
ACTCTTTTGGTTTTTGTAATCTCTCTCACCTGGTTTTGGATTTTGTTCTTCTGATTCGAT
TGCTATTGTTACCCTTCGCGTTTTGTTCTACGAACCCAATTTTGGGAGTTTTTATTGAAG
TTAAATGAGTCAGAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 10 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ42TF U 1
AF RR2H967TF U 116
AF RR2AW42TFB U 174
AF RR2H967JQ C 550
AF RR2AW42JQ C 196
BS 1 135 RR2DJ42TF
BS 136 136 RR2H967TF
BS 137 181 RR2DJ42TF
BS 182 182 RR2H967TF
BS 183 222 RR2DJ42TF
BS 223 223 RR2H967TF
BS 224 238 RR2DJ42TF
BS 239 239 RR2H967TF
BS 240 241 RR2DJ42TF
BS 242 242 RR2H967TF
BS 243 280 RR2DJ42TF
BS 281 281 RR2H967TF
BS 282 298 RR2DJ42TF
BS 299 299 RR2H967TF
BS 300 349 RR2DJ42TF
BS 350 350 RR2H967TF
BS 351 364 RR2DJ42TF
BS 365 367 RR2H967TF
BS 368 407 RR2DJ42TF
BS 408 408 RR2H967TF
BS 409 487 RR2DJ42TF
BS 488 488 RR2H967TF
BS 489 502 RR2DJ42TF
BS 503 503 RR2H967TF
BS 504 566 RR2DJ42TF
BS 567 567 RR2H967TF
BS 568 568 RR2DJ42TF
BS 569 569 RR2H967TF
BS 570 634 RR2DJ42TF
BS 635 635 RR2AW42TFB
BS 636 652 RR2DJ42TF
BS 653 725 RR2H967TF
BS 726 726 RR2AW42TFB
BS 727 766 RR2H967TF
BS 767 811 RR2AW42TFB
BS 812 1037 RR2AW42JQ

RD RR2DJ42TF 655 0 0
GGAACAGTGATGGGCCTGCTAATGAAAACGGATATGTTGGAGGCTACAGACGCTCTGAAG
AAGGAGATGGAGCGAGACGTGGTGGGTCTTCTGTTGGTGGATACCGCGGTCGTGGTGGTG
GTCGCCGTGGAGGCTTCAACAGTGGGGAGTCGGGTGACTTCGAACGCCCCCGTAGGAACT
TTGACCGCCAGAGTGGAACAGGTCACGGAAATGGGTTTAAACTTGATGGAGCTGGCCGGG
GTAACTGGGGAACCAATGAGGATGAGATTCCTCCAGTGACTGAAGAATCCGCAGCAGTGG
TGGTGGAGAAGAGTTTGGGTGTTGAGAAGGAAGGTGGTGAAGCAACTGATGCAAACAAAG
AGAC***ACCTGTTGAAGAGAAAGAGCCTGAGGACAAGGAGATGACTTTGGAAGAGTATG
AGAAGGTTTTGGAGGAGAAGAGGAAAGCTCTGCAGGCAACAAAGATTGAGGAGAGGAAGG
TTGACACCAAAGCGTTTGAGACAATGCAACAGCTCTCAAACAAAAAGAGCAACAACGACG
AGGTCTTCATCAAACTGGGAACAGAGGACGACAAGCGCCCAGTTGAGAAAGAGGAGAAGA
CCAAGAAGTCGTTGAGCATAAATGAGTTTCTGAA*CCTGCGAATGGAGAGAG
TAC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2H967TF 651 0 0
G
GGTGGTCGCCGTGGGGGCTACAACAGTGGGGAGTCGGGTGACTTTGAACGCCCGCGTAGG
AACTTCGACCGCCAGAGTGGAACAGGTCACGGAAATGGGTTTAAACGTGATGGAGCTGGC
CGTGGCAACTGGGGAACCAATGAGGATGAGATTCCTCCAGTGACCGAAGAATCCGCAGCA
GTTGTGGTGGAGAAGAGTTTGGGTGTTGAGAAGGAAGGTGGTGAAGCAACTGAAGCAAAC
AAAGAGACGACACCTGTTGAAGAGAAAGAGCCTGAGGACAAGGAGATGGCTCTGGAAGAG
TATGAGAAGGTTTTGGAGGAGAAGAGGAAAGCTCTGCAGGCAACAAAGATTGAGGAGAGG
AAGGTTGACACAAAAGCGTTTGAGACCATGCAACAGCTCTCAAACAAAAAGAGCAACAAC
GACGAGGTCTTCATCAAACTGGGAACAAAGAAGGACAAGCGCCCAGTTGAGAAAGAGGAG
AAGACCAAGAAGTCGTTGAGCATAAATGAGTTTCTGAA*CCTGCGAATGGAGAGAGGTAC
AGAGGAGCTGGTTACCGTGGTGGAAGGGAAGGAGGACGTGGAGGTCGTGGACCAAGAGAA
GGAGCTGAAAGAAGAGGTCGTGGACCAAGAGGAGGAGCCGATGGAGGAGA

QA 2 651 2 651
DS 

RD RR2AW42TFB 641 0 0
G
GGAACTTCGACCGCCAGAGTGGAACAGGTCACGGAAATGGGTTTAAACGTGATGGAGCTG
GGCGTGGCAACTGGGGAACCAATGAGGATGAGATTCCTCCAGTGACCGAAGAATCCGCAG
CAGTTGTGGTGGAGAAGAGTTTGGGTGTTGAGAAGGAAGGTGGTGAAGCAACTGAAGCAA
ACAAAGAGACGACACCTGTTGAAGAGAAAGAGCCTGAGGACAAGGAGATGACTCTGGAAG
AGTATGAGAAGGTTTTGGAGGAGAAGAGGAAAGCTCTGCAGGCAACAAAGATTGAGGAGA
GGAAGGTTGACACAAAAGCGTTTGAGACCATGCAACAGCTCTCAAACAAAAAGAGCAACA
ACGACGAGGTCTTCATCAAACTGGGAACAGAGAAGGACAAGCGCCCAGTTGAGAAAGAGG
AGAAGACCAAGAAGTCGTTGAGCATAAATGAGTTTCTGAAACCTGCGAATGGAGAGAGGT
ACAGAGGAGCTGGTTACCGTGGTGGAAGGGAAGGAGGACGTGGAGGTCGTGGACCAAGAG
AAGGAGCTGAAGGAAGAGGTCGTGGACCAAGAGGAGGAGCCGATGGAGGAGAAAACCAGA
GAGCTGCTGCTGCTGCTCCTAAAAGGGTCGCTCCTGC
ACC

QA 2 638 2 638
DS 

RD RR2H967JQ 327 0 0
TCAAACTGGGAACAAAGAAGGACAAGCGCCCAGTTGAGAAAGAGGAGAAGACCAAGAAGT
CGTTGAGCATAAATGAGTTTTTGAAACCTGGGAATGGAGAGAGGTACAGAGGAGCTGGTT
ACCGTGGTGGAAGGGAAGGAGGACGTGGAGGTCGTGGACCAAGAGAAGGAGCTGAAGGAA
GAGGTCGTGGACCAAGAGGAGGAGCCGATGGAGGAGAAAACCAGAGAGCTGCTGCTGCTG
CTCCTAAAAGGGTCGCTCCTGCCCCAAAAATTGAAGACGCCGCACAGTTCCCAATTTTGG
GAAAGTAAAGGCT
TTTTTTTTTGTTTT

QA 1 313 1 313
DS 

RD RR2AW42JQ 842 0 0
GAACAGGTCACGGAAATGGGTTTAAACGTGATGGAGCTGGCCGTGGCAACTGGGGAACCA
ATGAGGATGAGATTCCTCCAGTGACCGAAGAATCCGCAGCAGTTGTGGTGGAGAAGAGTT
TGGGTGTTGAGAAGGAAGGTGGTGAAGCAACTGAAGCAAACAAAGAGACGACACCTGTTG
AAGAGAAAGAGCCTGAGGACAAGGAGATGACTCTGGAAGAGTATGAGAAGGTTTTGGAGG
AGAAGAGGAAAGCTCTGCAGGCAACAAAGATTGAGGAGAGGAAGGTTGACACAAAAGCGT
TTGAGACCATGCAACAGCTCTCAAACAAAAAGAGCAACAACGACGAGGTCTTCATCAAAC
TGGGAACAGAGAAGGACAAGCGCCCAGTTGAGAAAGAGGAGAAGACCAAGAAGTCGTTGA
GCATAAATGAGTTTTTGAAACCTGCGAATGGAGAGAGGTACAGAGGAGCTGGTTACCGTG
GTGGAAGGGAAGGAGGACGTGGAGGTCGTGGACCAAGAGAAGGAGCTGAAGGAAGAGGTC
GTGGACCAAGAGGAGGAGCCGATGGAGGAGAAAACCAGAGAGCTGCTGCTGCTGCTCCTA
AAAGGGTCGCTCCTGCACCAAAAATTGAAGACGCCGCACAGTTCCCAACTCTGGGAAAGT
AAAGGCTCTCTCTTCTGTCTTGGTCCTTGAGCCTCTGTGTCTGGAACTCTTTTGGTTTTT
GTAATCTCTCTCACCTGGTTTTGGATTTTGTTCTTCTGATTCGATTGCTATTGTTACCCT
TCGCGTTTTGTTCTACGAACCCAATTTTGGGAGTTTTTATTGAAGTTAAATGAGTCAGAA
AG

QA 1 842 1 842
DS 



AS 2 5

CO CL1648Contig1 924 2 2 U
GGAATAACCAATCCACGTTCTTTATCTTCTTCCCCCAAATAAATAATAGTACTACTCTTT
ACGTTTTACTAATTTCTCTCGCGATCCATTACAATGGCTACAATCATCTCCTGCTCCGCT
CTCCCTTCGATCCGTGCATCTTCCGGATCCATCAGAAAACCCGATCCGACCGGAAAGAAA
CCCGGTTCATGGTGGGCTCCTCTATTTGGCTGGTCATCGGAACCTGATTACGTCGTGGAT
AACAGCAACAGCAGCAGCTCCTCCGCGAATCGGGAATCAGATCTGGATCAGAGGACTACG
CGGAGGTGTCTCACGGAGGAGAAGGCTAAGCAACTGCGAATGAAAATCGCCCAAGTCTCC
ACGTTCCACGAAGTCATGTATCATTCCGCCATCGCGTCACGACTCGCGTCTGACGTGTCC
GTTCGGGTCAACGAATAACAACCCGGATCGGGTCACGGGTTCTCTAACCGTATACATAAA
TAATTAAATAATAATAGTCCCATCCAACTAAAATGTTGTTTTTCGATCGATGATACTCGA
AATCCGTTGGATTGTGTATCGTCGTTTGTGTTTGTACGGTCTCGATCGTGCTTGATGTTG
TTTCTTGTCAACCGTTGGATTCTCAATTAGTTTAGCTTTATTTCAACAATTATAGTATTA
TACATTGCTAATATATGTTGACAGAAAAAATCAAATATATAACGAGACACTTTCTTCTCT
ATTAGATTTTAATAAATATTTGTGGGATCCATCTTTATAATTTTGTTTTAGAATAGTATG
TATTCATATAAATATCACTAAATATCACTTAATGCAGTGGTTTATGTATCATTAAAGAAG
TTCACAATCCGGGTTTGAATAGAGAACATGTGCGTTTTGCATTTTTTATGATAAAATTTA
ATAAAAGGTAATTATGATTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C474TF U 1
AF RR2C474JQ C 265
BS 1 689 RR2C474TF
BS 690 924 RR2C474JQ

RD RR2C474TF 689 0 0
GGAATAACCAATCCACGTTCTTTATCTTCTTCCCCCAAATAAATAATAGTACTACTCTTT
ACGTTTTACTAATTTCTCTCGCGATCCATTACAATGGCTACAATCATCTCCTGCTCCGCT
CTCCCTTCGATCCGTGCATCTTCCGGATCCATCAGAAAACCCGATCCGACCGGAAAGAAA
CCCGGTTCATGGTGGGCTCCTCTATTTGGCTGGTCATCGGAACCTGATTACGTCGTGGAT
AACAGCAACAGCAGCAGCTCCTCCGCGAATCGGGAATCAGATCTGGATCAGAGGACTACG
CGGAGGTGTCTCACGGAGGAGAAGGCTAAGCAACTGCGAATGAAAATCGCCCAAGTCTCC
ACGTTCCACGAAGTCATGTATCATTCCGCCATCGCGTCACGACTCGCGTCTGACGTGTCC
GTTCGGGTCAACGAATAACAACCCGGATCGGGTCACGGGTTCTCTAACCGTATACATAAA
TAATTAAATAATAATAGTCCCATCCAACTAAAATGTTGTTTTTCGATCGATGATACTCGA
AATCCGTTGGATTGTGTATCGTCGTTTGTGTTTGTACGGTCTCGATCGTGCTTGATGTTG
TTTCTTGTCAACCGTTGGATTCTCAATTAGTTTAGCTTTATTTCAACAATTATAGTATTA
TACATTGCTAATATATGTTGACAGAAAAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2C474JQ 660 0 0
GCGAATCGGGAATCAGATCTGGATCAGAGGACTACGCGGAGGTGTCTCACGGAGGAGAAG
GCTAAGCAACTGCGAATGAAAATCGCCCAAGTCTCCACGTTCCACGAAGTCATGTATCAT
TCCGCCATCGCGTCACGACTCGCGTCTGACGTGTCCGTTCGGGTCAACGAATAACAACCC
GGATCGGGTCACGGGTTCTCTAACCGTATACATAAATAATTAAATAATAATAGTCCCATC
CAACTAAAATGTTGTTTTTCGATCGATGATACTCGAAATCCGTTGGATTGTGTATCGTCG
TTTGTGTTTGTACGGTCTCGATCGTGCTTGATGTTGTTTCTTGTCAACCGTTGGATTCTC
AATTAGTTTAGCTTTATTTCAACAATTATAGTATTATACATTGCTAATATATGTTGACAG
AAAAAATCAAATATATAACGAGACACTTTCTTCTCTATTAGATTTTAATAAATATTTGTG
GGATCCATCTTTATAATTTTGTTTTAGAATAGTATGTATTCATATAAATATCACTAAATA
TCACTTAATGCAGTGGTTTATGTATCATTAAAGAAGTTCACAATCCGGGTTTGAATAGAG
AACATGTGCGTTTTGCATTTTTTATGATAAAATTTAATAAAAGGTAATTATGATTTTTGC

QA 1 660 1 660
DS 



CO CL1648Contig2 704 3 3 U
GGAACCAATCCACGTTCTTTATCTTCTTCCCCAAATAAATAAACACTCTTTTACGTTTTG
CTAATTTTTCTCACGATCCATTACAATGGCTACAATCATCTCCTGCTCCGCTCTCCCTTC
CATCCGTGCATCTTCCGGATCCATCAGAAAACCCGATCCGACCGGAAAGAAACCCGGTTC
ATGGTGGGCTCCTCTTTTCGGCTGGTCATCGGAACCTGATTACGTCGTGGATAATAACAG
CAGCAGCAGCTCCTCCGCGAATCGGGAATCAGATCTGGATCAGAGGACTACGCGGAGGTG
TCTCACGGAGGAGAAGGCGAAGCAACTGCGAATGAAAATCGCCCAAGTCTCCACGTTCCA
CGAAGTCATGTATCATTCCGCCATCGCGTCACGACTCGCGTCTGACGTGTCCGTTCGGGT
CAACGAATAACAGCCCGGATCGGGTCACGGGTTCTCTAACCGTATACATAAATAAATAAA
TAATAATAGTCCCATCCAACTAAAATGTTGTTTTTCGATCGATGATACTCGAAATCCGTT
GGATTGTGTATCGTCGTTTGTGTTTGTACGGTCTCGATCGTGCTTGATGTTGTTTCTTGT
CAACCGTTGGATTCTCAATTAGTTTAGCTTTATTTCAACAATTATACATTGCTAATATAT
GTTGACAGAAAAAATCAAATATATAACAAGACACTTTCTTCTCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D934TF U 1
AF RR2GU79TF U 1
AF RR2D934JQ C 4
BS 1 462 RR2D934TF
BS 463 622 RR2GU79TF
BS 623 704 RR2D934JQ

RD RR2D934TF 462 0 0
GGAACCAATCCACGTTCTTTATCTTCTTCCCCAAATAAATAAACACTCTTTTACGTTTTG
CTAATTTTTCTCACGATCCATTACAATGGCTACAATCATCTCCTGCTCCGCTCTCCCTTC
CATCCGTGCATCTTCCGGATCCATCAGAAAACCCGATCCGACCGGAAAGAAACCCGGTTC
ATGGTGGGCTCCTCTTTTCGGCTGGTCATCGGAACCTGATTACGTCGTGGATAATAACAG
CAGCAGCAGCTCCTCCGCGAATCGGGAATCAGATCTGGATCAGAGGACTACGCGGAGGTG
TCTCACGGAGGAGAAGGCGAAGCAACTGCGAATGAAAATCGCCCAAGTCTCCACGTTCCA
CGAAGTCATGTATCATTCCGCCATCGCGTCACGACTCGCGTCTGACGTGTCCGTTCGGGT
CAACGAATAACAGCCCGGATCGGGTCACGGGTTCTCTAACCG

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2GU79TF 622 0 0
GGA
ACCAATCCACGTTCTTTATCTTCTTCCCCAAATAAATAAACACTCTTTTACGTTTTGCTA
ATTTTTCTCACGATCCATTACAATGGCTACAATCATCTCCTGCTCCGCTCTCCCTTCCAT
CCGTGCATCTTCCGGATCCATCAGAAAACCCGATCCGACCGGAAAGAAACCCGGTTCATG
GTGGGCTCCTCTTTTCGGCTGGTCATCGGAACCTGATTACGTCGTGGATAATAACAGCAG
CAGCAGCTCCTCCGCGAATCGGGAATCAGATCTGGATCAGAGGACTACGCGGAGGTGTCT
CACGGAGGAGAAGGCGAAGCAACTGCGAATGAAAATCGCCCAAGTCTCCACGTTCCACGA
AGTCATGTATCATTCCGCCATCGCGTCACGACTCGCGTCTGACGTGTCCGTTCGGGTCAA
CGAATAACAACCCGGATCGGGTCACGGGTTCTCTAACCGTATACATAAATAAATAAATAA
TAATAGTCCCATCCAACTAAAATGTTGTTTTTCGATCGATGATACTCGAAATCCGTTGGA
TTGTGTATCGTCGTTTGTGTTTGTACGGTCTCGATCGTGCTTGATGTTGTTTCTTGTCAA
CCGTTGGATTCTCAATTAG

QA 4 622 4 622
DS 

RD RR2D934JQ 701 0 0
ACCAATCCACGTTCTTTATCTTCTTCCCCAAATAAATAAACACTCTTTTACGTTTTGCTA
ATTTTTCTCACGATCCATTACAATGGCTACAATCATCTC*TGCTCCGCTCTCCCTTCCAT
CCGTGCATCTTCCGGATCCATCAGAAAACCCGATCCGACCGGAAAGAAACCCGGTTCATG
GTGGGCTCCTCTTTTCGGCTGGTCATCGGAACCTGATTACGTCGTGGATAATAACAGCAG
CAGCAGCTCCTCCGCGAATCGGGAATCAGATCTGGATCAGAGGACTACGCGGAGGTGTCT
CACGGAGGAGAAGGCGAAGCAACTGCGAATGAAAATCGCCCAAGTCTCCACGTTCCACGA
AGTCATGTATCATTCCGCCATCGCGTCACGACTCGCGTCTGACGTGTCCGTTCGGGTCAA
CGAATAACAGCCCGGATCGGGTCACGGGTTCTCTAACCGTATACATAAATAAATAA****
TAATAGTCCCATCCAACTAAAATGTTGTTTTTCGATCGATGATACTCGAAATCCGTTGGA
TTGTGTATCGTCGTTTGTGTTTGTACGGTCTCGATCGTGCTTGATGTTGTTTCTTGTCAA
CCGTTGGATTCTCAATTAGTTTAGCTTTATTTCAACAATTATACATTGCTAATATATGTT
GACAGAAAAAATCAAATATATAACAAGACACTTTCTTCTCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 4

CO CL1649Contig1 1146 4 22 U
CGATCTCTGGGTTGGGGGAAGATGAAGTGAGCTCTTTTTTTGAATCGTCACCACCGCTGA
AGAAAAAGGAAGGTATACAGGAGAAGCTTAAGGGCTTCATCGAGCACAATTCTTCAGGAG
GGAGGAGGATCGTATGTGTGACTTCAGGCGGAACTACGGTTCCACTGGAGCAACGCTGCG
TTAGATACATCGATAACTTCAGCTCTGGAAACAGAGGTGCTGCTTCCACTGAGAATTTCG
TCAAGGCTGGATATGCTGTAGTGTTTCTGTATAGAAGTGGAACTTGCCAGCCGTATTGCC
GGTCTCTTCCTGATGATCCATTCCTTGAATGTTTTGAGTTTCCAGATAAGACCAACATTC
AAGTTCATCCATCACATGTGGAAGCTGTGAGAATGGCTGTTATGGACCAGCAAGCTGCAG
TAGCTGAATCTCGCTTACTGAAGCTCCCATTCACAACCATATATGAGTATCTTCAGATGT
TGCGGTTGATTGCAACGGCATTAAAAGACGTCGGTCCATGTTCAATGTTTTATCTTGCTG
CTGCTGTCTCTGACTTTTATGTGCCCTGGAATAGCATGACAGAGCACAAAATAGAATCAG
GATCTGGTCCTTTGGACATAAGACTTGCTCAAGTCCCTAAAATGCTTTCAATCTTGAGAA
TAACTTGGGCTCCAAAGGCTTTCTGCATATCATTCAAGCTTGAGACAGACTCAAAGATTC
TGATAGAGAAGGCTACAAAGGCTCTAGGAAAGTATAAAGTGCACGCTGTTGTAGCCAATG
AGCTGTCAACACGTAAGGAAGAAGTTGTGGTTGTTTCAAGCAGCGGTAATGTTGTGGTTA
GGCGTGATAGCGATAAGCCTGAATCTATCGTAGAAGACAATCTTATTCGCCTCATTGTAG
GTCGGCACTCAACATACATCAAAGAATCTCACACTTGATTTCTTAAATGCTTCCAAGTCA
AAAACATGTATGAATATTTCATCCACTCAACAAAAACAATCTATATAGGTTCCTCCTCTC
TCTCCTCTTTATTTGTGTACGGTATGTGAACAAATGATGATTGGGGTTTTGACCATTGAT
CAGTAATTTCAGATTTTATTAAAACGAGTGAGAATTTTCTTGAATATTGAATAGTTTGGT
TGTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2C666TF U 1
AF RR2HA73TF U 200
AF RR2B386TF U 246
AF RR2B386JQ C 316
BS 1 266 RR2C666TF
BS 267 267 RR2HA73TF
BS 268 274 RR2C666TF
BS 275 275 RR2HA73TF
BS 276 335 RR2C666TF
BS 336 336 RR2HA73TF
BS 337 350 RR2C666TF
BS 351 351 RR2HA73TF
BS 352 368 RR2C666TF
BS 369 369 RR2HA73TF
BS 370 390 RR2C666TF
BS 391 391 RR2HA73TF
BS 392 393 RR2C666TF
BS 394 394 RR2HA73TF
BS 395 502 RR2C666TF
BS 503 503 RR2HA73TF
BS 504 509 RR2C666TF
BS 510 797 RR2HA73TF
BS 798 798 RR2B386TF
BS 799 836 RR2HA73TF
BS 837 1038 RR2B386TF
BS 1039 1146 RR2B386JQ

RD RR2C666TF 509 0 0
CGATCTCTGGGTTGGGGGAAGATGAAGTGAGCTCTTTTTTTGAATCGTCACCACCGCTGA
AGAAAAAGGAAGGTATACAGGAGAAGCTTAAGGGCTTCATCGAGCACAATTCTTCAGGAG
GGAGGAGGATCGTATGTGTGACTTCAGGCGGAACTACGGTTCCACTGGAGCAACGCTGCG
TTAGATACATCGATAACTTCAGCTCTGGAAACAGAGGTGCTGCTTCCACTGAGAATTTCG
TCAAGGCTGGATATGCTGTAGTGTTTTTGTATAGGAGTGGAACTTGCCAGCCGTATTGCC
GGTCTCTTCCTGATGATCCATTCCTTGAATGTTTTCAGTTTCCAGATAAGCCCAACATTC
AAGTTCATGCATCACATGTGGAAGCTGTGAAAACGGCTGTTATGGACCAGCAAGCTGCAG
TAGCTGAATCTCGCTTACTGAAGCTCCCATTCACAACCATATATGAGTATCTTCAGATGT
TGCGGTTGATTGCAACGGCATTGAAAGAC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2HA73TF 637 0 0
G
AGCTCTGGAAGCAGAGGTGCTGCTTCCACTGAGAATTTCGTCAAGGCTGGATATGCTGTA
GTGTTTCTGTATAGAAGTGGAACTTGCCAGCCGTATTGCCGGTCTCTTCCTGATGATCCA
TTCCTTGAATGTTTTGAGTTTCCAGATAAGACCAACATTCAAGTTCATCCATCACATGTG
GAAGCTGTGAGAATGGCTGTTATGGACCAGCAAGCTGCAGTAGCTGAATCTCGCTTACTG
AAGCTCCCATTCACAACCATATATGAGTATCTTCAGATGTTGCGGTTGATTGCAACGGCA
TTAAAAGACGTCGGTCCATGTTCAATGTTTTATCTTGCTGCTGCTGTCTCTGACTTTTAT
GTGCCCTGGAATAGCATGACAGAGCACAAAATAGAATCAGGATCTGGTCCTTTGGACATA
AGACTTGCTCAAGTCCCTAAAATGCTTTCAATCTTGAGAATAACTTGGGCTCCAAAGGCT
TTCTGCATATCATTCAAGCTTGAGACAGACTCAAAGATTCTGATAGAGAAGGCTACAAAG
GCTCTAGGAAAGTATAAAGTGCACGCTGTTGTAGCCAATGAGCTGTCAACACGTAAG*AA
GAAGTTGTGGTTGTTTCAAGCAGCGGTAATGTTGTG

QA 2 637 2 637
DS 

RD RR2B386TF 793 0 0
GCTGGATATGCTGTAGTGTTTCTGTATAGAAGTGGAACTTGCCAGCCGTATTGCCGGTCT
CTTCCTGATGATCCATTCCTTGAATGTTTTGAGTTTCCAGATAAGACCAACATTCAAGTT
CATCCATCACATGTGGAAGCTGTGAGAATGGCTGTTATGGACCAGCAAGCTGCAGTAGCT
GAATCTCGCTTACTGAAGCTCCCATTCACAACCATATATGAGTATCTTCAGATGTTGCGG
TTGATTGCAACGGCATTAAAAGACGTCGGTCCATGTTCAATGTTTTATCTTGCTGCTGCT
GTCTCTGACTTTTATGTGCCCTGGAATAGCATGACAGAGCACAAAATAGAATCAGGATCT
GGTCCTTTGGACATAAGACTTGCTCAAGTCCCTAAAATGCTTTCAATCTTGAGAATAACT
TGGGCTCCAAAGGCTTTCTGCATATCATTCAAGCTTGAGACAGACTCAAAGATTCTGATA
GAGAAGGCTACAAAGGCTCTAGGAAAGTATAAAGTGCACGCTGTTGTAGCCAATGAGCTG
TCAACACGTAAGGAAGAAGTTGTGGTTGTTTCAAGCAGCGGTAATGTTGTGGTTAGGCGT
GATAGCGATAAGCCTGAATCTATCGTAGAAGACAATCTTATTCGCCTCATTGTAGGTCGG
CACTCAACATACATCAAAGAATCTCACACTTGATTTCTTAAATGCTTCCAAGTCAAAAAC
ATGTATGAATATTTCATCCACTCAACAAAAACAATCTATATAGGTTCCTCCTCTCTCTCC
TCTTTATTTGTGT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2B386JQ 831 0 0
ATCCATTCCTTGAATGTTTTGAGTTTCCAGATAAGACCAACATTCAAGTTCATCCATCAC
ATGTGGAAGCTGTGAGAATGGCTGTTATGGACCAGCAAGCTGCAGTAGCTGAATCTCGCT
TACTGAAGCTCCCATTCACAACCATATATGAGTATCTTCAGATGTTGCGGTTGATTGCAA
CGGCATTAAAAGACGTCGGTCCATGTTCAATGTTTTATCTTGCTGCTGCTGTCTCTGACT
TTTATGTGCCCTGGAATAGCATGACAGAGCACAAAATAGAATCAGGATCTGGTCCTTTGG
ACATAAGACTTGCTCAAGTCCCTAAAATGCTTTCAATCTTGAGAATAACTTGGGCTCCAA
AGGCTTTTTGCATATCATTCAAGCTTGAGACAGACTCAAAGATTTTGATAGAGAAGGCTA
CAAAGGCTCTAGGAAAGTATAAAGTGCACGCTGTTGTAGCCAATGAGCTGTCAACACGTA
AGGAAGAAGTTGTGGTTGTTTCAAGCAGCGGTAATGTTGTGGTTAGGCGTGATAGCGATA
AGCCTGAATCTATCGTAGAAGACAATTTTATTCGCCTCATTGTAGGTCGGCACTCAACAT
ACATCAAAGAATCTCACACTTGATTTTTTAAATGCTTCCAAGTCAAAAACATGTATGAAT
ATTTCATCCACTCAACAAAAACAATCTATATAGGTTCCTCCTCTCTCTCCTCTTTATTTG
TGTACGGTATGTGAACAAATGATGATTGGGGTTTTGACCATTGATCAGTAATTTCAGATT
TTATTAAAACGAGTGAGAATTTTCTTGAATATTGAATAGTTTGGTTGTATG

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 4

CO CL1650Contig1 864 4 7 U
GGGCCAACTCTAAAAGAAACCTTAAGCTCAATCTCCTCCACACTCGTCTCCAACTCCAGA
GGAAACCAATGTCGCTCACGATCCCAACGAACCTCGTCCTCAACCCGAGATCCAAAAACA
AGACTCTCACTCAATCCGTACCTAAATCCACCGGGAGATTCGTCTGCTCCACCGATGACA
ACAACAAGTCCATGAAGGCATTCTCCGCGGCGGTGGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCAT
CCCCGATGCCAGCCGCCGCTGATATCTCGGGCCTAACCCCTTGCAAGGAGTCTAAACAGT
TCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAAGAAGCTCCAATCATCTCTCAAGCTCTACGCTC
CTGAGAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTCAACGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCG
ACAACTACGGCAAGTACGGACTTCTGTGCGGTGCAGACGGGCTACCACACTTGATAGTGA
ACGGAGACCAGAGGCATTGGGGAGAGTTCATAACTCCAGGACTTTTGTTTCTCTACATTG
CGGGATGGATCGGGTGGGTGGGGAGAAGCTACTTGATAGCGATTGGTGATGAGAAGAAAC
CAGCGATGAAGGAGATCATTATTGATGTACCATTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTT
TCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAGCGTTGCTCAATGGCGATCTCATTGCCAAGGATG
TTTAAGAAACAAACAAAAAATCTATATATTTGACCCTTTGTTTGCTTCGTATGTGTTTAA
ACTCCTCCCTGTCAAATAATGTTTTTGCAATATGGGGAACTTATTATTTGGATTAAATGT
TGAAAATCCTAAGAAGCCAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A031JQ C 254
AF RR2FH19TF U 1
AF RR2E160TF U 22
AF RR2FH19JQ C 420
BS 1 542 RR2FH19TF
BS 543 543 RR2E160TF
BS 544 619 RR2FH19TF
BS 620 620 RR2E160TF
BS 621 621 RR2FH19JQ
BS 622 706 RR2E160TF
BS 707 864 RR2FH19JQ

RD RR2A031JQ 305 0 0
CGT
CGCTGATATCTCGGGCCTAACCCCTTGCAAGGAGTCTAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAA
GCAACAGATCAAGAGGCTCCAATCATCTCTCAAGCTTTACGCTCCTGAGAGTGCTCCTGC
TCTTGCTCTCAACGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCGACAATTACGGCAAGTA
CGGACTTCTGTGCGGTGCAGACGGGCTACCACACTTGATAGTGAACGGAGACCAGAGGCA
TTGGGGAGAGTTCATAACTCCAGGGCTTCTCTTTCTTTACATTGCGGGATGGTTCGGGTG
GG

QA 4 305 4 305
DS 

RD RR2FH19TF 619 0 0
GGGCCAACTCTAAAAGAAACCTTAAGCTCAATCTCCTCCACACTCGTCTCCAACTCCAGA
GGAAACCAATGTCGCTCACGATCCCAACGAACCTCGTCCTCAACCCGAGATCCAAAAACA
AGACTCTCACTCAATCCGTACCTAAATCCACCGGGAGATTCGTCTGCTCCACCGATGACA
ACAACAAGTCCATGAAGGCATTCTCCGCGGCGGTGGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCAT
CCCCGATGCCAGCCGCCGCTGATATCTCGGGCCTAACCCCTTGCAAGGAGTCTAAACAGT
TCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAAGAAGCTCCAATCATCTCTCAAGCTCTACGCTC
CTGAGAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTCAACGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCG
ACAACTACGGCAAGTACGGACTTCTGTGCGGTGCAGACGGGCTACCACACTTGATAGTGA
ACGGAGACCAGAGGCATTGGGGAGAGTTCATAACTCCAGGACTTTTGTTTCTCTACATTG
CGTGATGGATCGGGTGGGTGGGGAGAAGCTACTTGATAGCGATTGGTGATGAGAAGAAAC
CAGCGATGAAGGAGATCAT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2E160TF 686 0 0
GG
AAGCTCAATCTCCTCCACACTCGTCTCCAACTCCAGAGGAAACCAATGTCGCTCACGATC
CCAACGAACCTCGTCCTCAACCCGAGATCCAAAAACAAGACTCTCACTCAATCCGTACCT
AAATCCACCGGGAGATTCGTCTGCTCCACCGATGACAACAACAAGTCCATGAAGGCATTC
TCCGCGGCGGTGGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCATCCCCGATGCCAGCCGCCGCTGAT
ATCTCGGGCCTAACCCCTTGCAAGGAGTCTAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAG
ATCAAGAAGCTCCAATCATCTCTCAAGCTCTACGCTCCTGAGAGTGCTCCTGCTCTTGCT
CTCAACGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCTGGTTCGACAACTACGGCAAGTACGGACTT
CTGTGCGGTGCAGACGGGCTACCACACTTGATAGTGAACGGAGACCAGAGGCATTGGGGA
GAGTTCATAACTCCAGGACTTTTGTTTCTCTACATTGCGGGATGGATCGGGTGGGTGGGG
AGAAGCTACTTGATAGCGATTGGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAGGAGATCATTTTT
GATGTACCATTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTAC
AGAGCGTTGCTCAATGGCGATCT
C

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR2FH19JQ 445 0 0
GACAACTACGGCAAGTACGGACTTCTGTGGGGTGCAGACGGGCTACCACACTTGATAGTG
AACGGAGACCAGAGGCATTGGGGAGAGTTCATAACTCCAGGACTTTTGTTTCTTTACATT
GCGTGATGGATCGGGTGGGTGGGGAGAAGCTACTTGATAGCGATTGGTGATGAGAAGAAA
CCAGCGATGAAGGAGATCATTATTGATGTACCATTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGT
TTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAGCGTTGCTCAATGGCGATCTCATTGCCAAGGAT
GTTTAAGAAACAAACAAAAAATCTATATATTTGACCCTTTGTTTGCTTCGTATGTGTTTA
AACTCCTCCCTGTCAAATAATGTTTTTGCAATATGGGGAACTTATTATTTGGATTAAATG
TTGAAAATCCTAAGAAGCCAAAAAA

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 5

CO CL1651Contig1 914 5 11 U
AAGCTGAACACGCAAAGGCGAAGGCTGAACACGCGACAGCTAAAATACAGGTTTGGTGGG
ACATGTTTGACTGTCCGATACCCCAAGGTTATGATGCTCGTCAGGTCCGTCCGAGTATAG
AAGCGGCATTCAAGGAACTAGGTTACACTGGTACTGTCTCCATCACTGCCTATGGCGACC
ATAAACATACTCCCCTACAAGCTCTCTCTTCCACTGGTGTCGAAGTTGCACATGTCGTTC
CGGGTGTTGAATACAAGCGCATGTGTAGAGATGTGTGGAAATGGCATTATGATAATCCTC
CTCAAACAGCTGCTATAATGATGCTCATATCGGATAGTTTAGAGAACATTTCAATTAGTC
TTGTCAAGCTACTACAAGAGAATAAGTACAACTTTTTTCTGGCTTATTCGTTTAGGCCTT
ACAGAATGTCATACCTGCTCACTTCTGCGGAGTGGCTCTGGGAAAGCATGCTTGCAAAGC
ACTGTCTTCTCAGTGAAAGTGAAAACAGTGAATCTATCGCAATTTTCCATTGCAAATTGT
GCCGGTTTGATACTGTAAGCATTGATAAGTTCAGGGCACATCTCATAAGTGATGAAATAC
ATGCACAAAAAGAGATAAGAATTCCCGCGCTTCGTAAATATTGCTTTCAGAACATGAGGC
TATCTCGACTAGCTGAGTACGATAGACATTATTGGCCAGACCGCCAGAGGTAAAAGAATT
ATCGAACAGCAAACGTATGAAGAAAGCAATACGTACGGGTTCTAGACGTCTTTACTAATC
TCAGCAAATGTTGTCTTATATTGTTGTGAATGTATTTTTTTTTTATAGTTTTATAAATTG
TGATATGTATAATCATCTATCTGTTAAAAAAACAAGTTAACCTTATTATTAATGGTATTA
GTAATTTCAAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV86TF U 1
AF RR2BZ76TF U 16
AF RR2GU87TF U 123
AF RR2CV86JQ C 174
AF RR2BZ76JQ C 182
BS 1 531 RR2CV86TF
BS 532 654 RR2BZ76TF
BS 655 672 RR2GU87TF
BS 673 673 RR2CV86JQ
BS 674 758 RR2GU87TF
BS 759 759 RR2CV86JQ
BS 760 821 RR2GU87TF
BS 822 823 RR2CV86JQ
BS 824 870 RR2GU87TF
BS 871 879 RR2CV86JQ
BS 880 914 RR2BZ76JQ

RD RR2CV86TF 531 0 0
AAGCTGAACACGCAAAGGCGAAGGCTGAACACGCGACAGCTAAAATACAGGTTTGGTGGG
ACATGTTTGACTGTCCGATACCCCAAGGTTATGATGCTCGTCAGGTCCGTCCGAGTATAG
AAGCGGCATTCAAGGAACTAGGTTACACTGGTACTGTCTCCATCACTGCCTATGGCGACC
ATAAACATACTCCCCTACAAGCTCTCTCTTCCACTGGTGTCGAAGTTGCACATGTCGTTC
CGGGTGTTGAATACAAGCGCATGTGTAGAGATGTGTGGAAATGGCATTATGATAATCCTC
CTCAAACAGCTGCTATAATGATGCTCATATCGGATAGTTTAGAGAACATTTCAATTAGTC
TTGTCAAGCTACTACAAGAGAATAAGTACAACTTTTTTCTGGCTTATTCGTTTAGGCCTT
ACAGAATGTCATACCTGCTCACTTCTGCGGAGTGGCTCTGGGAAAGCATGCTTGCAAAGC
ACTGTCTTCTCAGTGAAAGTGAAAACAGTGAATCTATCGCAATTTTCCATT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2BZ76TF 639 0 0
GGGCGACGCCTGAATTT
GCGACAGCTAAAATACAGGTTTGGTGGGACATGTTTGACTGTCCGATACCCCAAGGTTAT
GATGCTCGTCAGGTCCGTCCGAGTATAGAAGCGGCATTCAAGGAACTAGGTTACACTGGT
ACTGTCTCCATCACTGCCTATGGCGACCATAAACATACTCCCCTACAAGCTCTCTCTTCC
ACTGGTGTCGAAGTTGCACATGTCGTTCCGGGTGTTGAATACAAGCGCATGTGTAGAGAT
GTGTGGAAATGGCATTATGATAATCCTCCTCAAACAGCTGCTATAATGATGCTCATATCG
GATAGTTTAGAGAACATTTCAATTAGTCTTGTCAAGCTACTACAAGAGAATAAGTACAAC
TTTTTTCTGGCTTATTCGTTTAGGCCTTACAGAATGTCATACCTGCTCACTTCTGCGGAG
TGGCTCTGGGAAAGCATGCTTGCAAAGCACTGTCTTCTCAGTGAAAGTGAAAACAGTGAA
TCTATCGCAATTTTCCATTGCAAATTGTGCCGGTTTGATACTGTAAGCATTGATAAGTTC
AGGGCACATCTCATAAGTGATGAAATACATGCACAAAAAGAGATAAGAATTCCCGCGCTT
CGTAAATATTGCTTTCAGAACA

QA 18 639 18 639
DS 

RD RR2GU87TF 748 0 0
GCGGCATTCAAGGAACTAGGTTACACTGGTACTGTCTCCATCACTGCCTATGGCGACCAT
AAACATACTCCCCTACAAGCTCTCTCTTCCACTGGTGTCGAAGTTGCACATGTCGTTCCG
GGTGTTGAATACAAGCGCATGTGTAGAGATGTGTGGAAATGGCATTATGATAATCCTCCT
CAAACAGCTGCTATAATGATGCTCATATCGGATAGTTTAGAGAACATTTCAATTAGTCTT
GTCAAGCTACTACAAGAGAATAAGTACAACTTTTTTCTGGCTTATTCGTTTAGGCCTTAC
AGAATGTCATACCTGCTCACTTCTGCGGAGTGGCTCTGGGAAAGCATGCTTGCAAAGCAC
TGTCTTCTCAGTGAAAGTGAAAACAGTGAATCTATCGCAATTTTCCATTGCAAATTGTGC
CGGTTTGATACTGTAAGCATTGATAAGTTCAGGGCACATCTCATAAGTGATGAAATACAT
GCACAAAAAGAGATAAGAATTCCCGCGCTTCGTAAATATTGCTTTCAGAACATGAGGCTA
TCTCGACTAGTTGAGTACGATAGACATTATTGGCCAGACCGCCAGAGGTAAAAGAATTAT
CGAACAGCAAACGTATGAAGAAAGCAATACGTACGG*TTCTAGACGTCTTTACTAATCTC
AGCAAATGTTGTCTTATATTGTTGTGAATGTATTTTTTT**TATAGTTTTATAAATTGTG
ATATGTATAATCATCTATCTGTTAAAAA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2CV86JQ 711 0 0
GGCGACCATAAACATACTCCCCTACAAGCTCTCTCTTCCACTGGTGTCGAAGTTGCACAT
GTCGTTCCGGGTGTTGAATACAAGCGCATGTGTAGAGATGTGTGGAAATGGCATTATGAT
AATCCTCCTCAAACAGCTGCTATAATGATGCTCATATCGGATAGTTTAGAGAACATTTCA
ATTAGTCTTGTCAAGCTACTACAAGAGAATAAGTACAACTTTTTTCTGGCTTATTCGTTT
AGGCCTTACAGAATGTCATACCTGCTCACTTCTGCGGAGTGGCTCTGGGAAAGCATGCTT
GCAAAGCACTGTCTTCTCAGTGAAAGTGAAAACAGTGAATCTATCGCAATTTTCCATTGC
AAATTGTGCCGGTTTGATACTGTAAGCATTGATAAGTTCAGGGCACATCTCATAAGTGAT
GAAATACATGCACAAAAAGAGATAAGAATTCCCGCGCTTCGTAAATGTTGCTTTCAGAAC
ATGAGGCTATCTCGACTAGCTGAGTACGATAGACATTATTGGCCAGACCGCCAGAGGTAA
AAGAATTATCGAACAGCAAACGTATGAAGAAAGCAATACGTACGGGTTCTAGACGTCTTT
ACTAATCTCAGCAAATGTTGTCTTATATTGTTGTGAATGTATTTTTTTTTTATAGTTTTA
TAAATTGTGATATGTATAATCATCTATCTGTTAAAAAAACAAGTTA
CCCTC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2BZ76JQ 733 0 0
TAAACATACTCCCCTACAAGCTCTCTCTTCCACTGGTGTCGAAGTTGCACATGTCGTTCC
GGGTGTTGAATACAAGCGCATGTGTAGAGATGTGTGGAAATGGCATTATGATAATCCTCC
TCAAACAGCTGCTATAATGATGCTCATATCGGATAGTTTAGAGAACATTTCAATTAGTCT
TGTCAAGCTACTACAAGAGAATAAGTACAACTTTTTTCTGGCTTATTCGTTTAGGCCTTA
CAGAATGTCATACCTGCTCACTTTTGCGGAGTGGCTCTGGGAAAGCATGCTTGCAAAGCA
CTGTCTTCTCAGTGAAAGTGAAAACAGTGAATCTATCGCAATTTTCCATTGCAAATTGTG
CCGGTTTGATACTGTAAGCATTGATAAGTTCAGGGCACATCTCATAAGTGATGAAATACA
TGCACAAAAAGAGATAAGAATTCCCGCGCTTCGTAAATATTGCTTTCAGAACATGAGGCT
ATCTCGACTAGCTGAGTACGATAGACATTATTGGCCAGACCGCCAGAGGTAAAAGAATTA
TCGAACAGCAAACGTATGAAGAAAGCAATACGTACGGGTTCTAGACGTCTTTACTAATCT
CAGCAAATGTTGTCTTATATTGTTGTGAATGTATTTTTTTTTTATAGTTTTATAAATTGT
GATATGTATAATCATCTATCTGTTAAAAAAACAAGTTAACCTTATTATTAATGGTATTAG
TAATTTCAAATTC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 5

CO CL1652Contig1 590 5 15 U
GGGAAAAACAATTAATTCAAAACAATAAAAACAATATGGTGTTCCCTTCAAAGATCATCA
CATGCCTCCTCGTCCTAACCGTCTGCATGGCAGCCCCATCAGAGTCAGCCATAACGTGTG
GGACAGTGACAAGCACACTGGCACGGTGTGTGGGCTACTTGACCAACAGTGGTCCATTGC
CATCAGACTGCTGCGTGGGAGTCAAATCATTGAACCAAATGACGCAGACCACACCGGACC
GCCGACAAGTCTGTGAGTGCCTTAAATCTGCGGCTAAGGATATCACTGGCCTCAACACCG
ACCTTGTGGCCACACTCCCTACGACTTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCCATTCGTTTTA
GCACCAACTGTGACACTATATCGGCTACCGTGTGAAGGAGGCTGGAGATGTACGACTAAT
CAAAGTTGCAAGCTTTTAACCTAAATAATAATATTATGCTGTTATTTCCCATGTTATGAG
TTCATTCTCTTATTATGTAATCCATTATATGAGATTCAAAAAAAAAAATGTAATCATCCA
TTACATATGGCAATTGGCAATAACGACAAAGGAACTCTTTCTCGCTCGAA


BQ
10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2DX41TF U 2
AF RR2GZ72TF U -4
AF RR2H021JQ C 1
AF RR2AA68TF U 2
AF RR2H021TF U 1
BS 1 1 RR2H021JQ
BS 2 51 RR2DX41TF
BS 52 52 RR2GZ72TF
BS 53 221 RR2DX41TF
BS 222 223 RR2GZ72TF
BS 224 224 RR2AA68TF
BS 225 276 RR2GZ72TF
BS 277 277 RR2AA68TF
BS 278 322 RR2GZ72TF
BS 323 323 RR2AA68TF
BS 324 436 RR2GZ72TF
BS 437 526 RR2AA68TF
BS 527 528 RR2H021TF
BS 529 586 RR2AA68TF
BS 587 590 RR2H021TF

RD RR2DX41TF 220 0 0
GGAAAAACAATTAATTCAAAACAATAAAAACAATATGGTGTTCCCTTCAAGGATCATCAC
ATGCCTCCTCGTCCTAACCGTCTGCATGGCAGCCCCATCAGAGTCAGCCATAACGTGTGG
GACAGTGACAAGCACACTGGCACGGTGTGTGGGCTACTTGACCAACAGTGGTCCATTGCC
ATCAGACTGCTGCGTGGGAGTCAAATCATTGAACCAAATG

QA 1 220 1 220
DS 

RD RR2GZ72TF 441 0 0
GGTGAAGT
AAAAACAATTAATTCAAAACAATAAAAACAATATGGTGTTCCCTTCAAAGATCATCACAT
GCCTCCTCGTCCTAACCGTCTGCATGGCAGCCCCATCAGAGTCAGCCATAACGTGTGGGA
CAGTGACAAGCACACTGGCACGCTGTGTGGGTTACTTGACCAACAGTGGTCCATTGCCAT
CAGACTGCTGCGTGGGAGTCAAATCATTGAACCAAATGACTCAGACCACACCGGACCGCC
GACAAGTCTGTGAGTGCCTTAAATCTGCGGCTAGGGATATCACTGGCCTCAACACCGACC
TTGTGGCCACACTCCCTACAACTTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCCATTCGTTTTAGCA
CCAACTGTGACACTATATCGGCTACCGTGTGAAGGAGGCTGGAGATGTACGACTAATCAA
AGTTGCAAGCTTT

QA 9 441 9 441
DS 

RD RR2H021JQ 588 0 0
GGGAAAAACAATTAATTCAAAACAATAAAAACAATATGGTGTTCCCTTCAAAGATCATCA
CATGCCTCCTCGTCCTAACCGTCTGCATGGCAGCCCCATCAGAGTCAGCCATAACGTGTG
GGACAGTGACAAGCACACTGGCACGGTGTGTGGGCTACTTGACCAACAGTGGTCCATTGC
CATCAGACTGCTGCGTGGGAGTCAAATCATTGAACCAAATGACGCAGACCACACCGGACC
GCCGACAAGTCTGTGAGTGCCTTAAATCTGCGGCTAAGGATATCACTGGCCTCAACACCG
ACCTTGTGGCCACACTCCCTACGACTTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCCATTCGTTTTA
GCACCAACTGTGACACTATATCGGCTACCGTGTGAAGGAGGCTGGAGATGTACGACTAAT
CAAAGTTGCAAGCTTTTAACCTAAATAATAATATTATGCTGTTATTTCCCATGTTATGAG
TTCATTCTCTTATTATGTAATCCATTATATGAGATTCAAAAAAAAAAATGTAATCATCCA
TTACATATGGCAATTGGCAATAACGACAAAGGAACTCTTTCTCGCT
CG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2AA68TF 585 0 0
GGAAAAACAATTAATTCAAAACAATAAAAACAATATGGTGTTCCCTTCAAAGATCATCAC
ATGCCTCCTCGTCCTAACCGTCTGCATGGCAGCCCCATCAGAGTCAGCCATAACGTGTGG
GACAGTGACAAGCACACTGGCACGGTGTGTGGGCTACTTTACCAACAGTGGTCCATTGCC
ATCAGACTGCTGCGTGGGAGTCAAATCATTGAACCAAATGACGCAGACCACACCGGACCG
CCGACAAGTCTGTGAGTGCCTTAAATCTGCGGCTAAGGATATCACTGGCCTCGACACCGA
CCTTGTGGCCACACTCCCTACGACTTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCCATTCGTTTTAG
CACCAACTGTGACGCTATATCGGCTACCGTGTGAAGGAGGCTGGAGATGTACGACTAATC
AAAGTTGCAAGCTTTTAACCTAAATAATAATATTATGCTGTTATTTCCCATGTTATGAGT
TCATTCTCTTATTATGTAATCCATTATATGAGATTCAAAAAAAAA**TGTAATCATCCAT
TACATATGGCAATTGGCAATAACGACAAAGGAACTCTTTCTCGCT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2H021TF 590 0 0
G
GGAAAAACAATTAATTCAAAACAATAAAAACAATATGGTGTTCCCTTCAAAGATCATCAC
ATGCCTCCTCGTCCTAACCGTCTGCATGGCAGCCCCATCAGAGTCAGCCATAACGTGTGG
GACAGTGACAAGCACACTGGCACGGTGTGTGGGCTACTTGACCAACAGTGGTCCATTGCC
ATCAGACTGCTGCGTGGGAGTCAAATCATTGAACCAAATGACGCAGACCACACCGGACCG
CCGACAAGTCTGTGAGTGCCTTAAATCTGCGGCTAAGGATATCACTGGCCTCAACACCGA
CCTTGTGGCCACACTCCCTACGACTTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCCATTCGTTTTAG
CACCAACTGTGACACTATATCGGCTACCGTGTGAAGGAGGCTGGAGATGTACGACTAATC
AAAGTTGCAAGCTTTTAACCTAAATAATAATATTATGCTGTTATTTCCCATGTTATGAGT
TCATTCTCTTATTATGTAATCCATTATATGAGATTCAAAAAAAAAAATGTAATCATCCAT
TACATATGGCAATTGGCAATAACGACAAAGGAACTCTTTCTCGCTCGAA

QA 2 590 2 590
DS 



AS 1 4

CO CL1653Contig1 785 4 6 U
AATGCAGTTCTAGCGTCTTTCATGGAAACACAATACAAACACACACCCAACGTGAATTCG
AAAACACTTACACTGATGCAAAAACATGAAGTGAATTAAGGGAACAATGCAGAATATAAT
GAACACTAAAAAGAATAGGAATATGCTATATTTATCACACAAAATTTGTTCACACAAGGC
CATCATATAATAGCTCTTAGGAGCTACTCATTGATCCTCACTTCAACGCTTTTTACTCCC
TTCCGACTTCTTATTATACAGCAATCGGTGTATCCTTGGAAGCTATATTGGAGACGGCTA
GATTGAACTTCTCTTTGGTTTTCGAGCCAGCAAGCTGACCTGCTCTCGCAACTTTGCTGA
AAGCGCCACTAAACCAAGCAGCTCCAGCAGTCACATACCTGCTTGATTTGACAGCTGAAC
CAGTGTCGTTTAACTTCTTCTCAGCTGCAAATATAGCCGCCATGGTTTTATCTGAAACCT
GAAGCCTCTGGTCAACGGATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATACCCACGTTGAACT
TCTCGCTAAGCCTGACTCTCTTGTCAAAAGAAGAAACTTTGGCGGAAGCATTAGCTCTCA
GCTGGTGCAACTCATCAAAAGCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGTCCAAGAGCAGAGC
CTTTAGCCAAAACAGTAGCCATCACATCTTGCGCTTTGCCAACGTACGCTCTACCACCAT
TGCCGTCCGTGTTCTGGCGTGTTGGTGTTGGTGGCATCGCGTTCTCTACCACTTGCTGGA
TGTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2DT47JQ U 116
AF RR2GS20JQB U 1
AF RR2DT47TF C 483
AF RR2H373JQ U 35
BS 1 382 RR2GS20JQB
BS 383 383 RR2H373JQ
BS 384 656 RR2GS20JQB
BS 657 699 RR2H373JQ
BS 700 700 RR2DT47TF
BS 701 785 RR2H373JQ

RD RR2DT47JQ 303 0 0
ATAATGAACACTAAAAAGAATAGGAATATGCTAT**TTATCACACAAAATTTGTTCACAC
AAGGCCATCATATAATAGCTCTTAAGAGCTACTCATTGATCCTCACTTCAACGCTTTTTA
CTCCCTTCCGACTTCTTATTATACAGCAATCGGTGTATCCTTGGAAGCTATATTGGAGAC
GGCTAGATTGAACTTCTCTTTGGTTTTCGAGTCAGCAAGCTGACCTGCTCTCGCAACTTT
GCTGAAAGCGCCACTAAACCAAGCAGCTCCAGCAGTCACATACCTGCTTGATTTGACAGC
TGA

QA 1 303 1 303
DS 

RD RR2GS20JQB 656 0 0
AATGCAGTTCTAGCGTCTTTCATGGAAACACAATACAAACACACACCCAACGTGAATTCG
AAAACACTTACACTGATGCAAAAACATGAAGTGAATTAAGGGAACAATGCAGAATATAAT
GAACACTAAAAAGAATAGGAATATGCTATATTTATCACACAAAATTTGTTCACACAAGGC
CATCATATAATAGCTCTTAGGAGCTACTCATTGATCCTCACTTCAACGCTTTTTACTCCC
TTCCGACTTCTTATTATACAGCAATCGGTGTATCCTTGGAAGCTATATTGGAGACGGCTA
GATTGAACTTCTCTTTGGTTTTCGAGCCAGCAAGCTGACCTGCTCTCGCAACTTTGCTGA
AAGCGCCACTAAACCAAGCAGCCCCAGCAGTCACATACCTGCTTGATTTGACAGCTGAAC
CAGTGTCGTTTAACTTCTTCTCAGCTGCAAATATAGCCGCCATGGTTTTATCTGAAACCT
GAAGCCTCTGGTCAACGGATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATACCCACGTTGAACT
TCTCGCTAAGCCTGACTCTCTTGTCAAAAGAAGAAACTTTGGCGGAAGCATTAGCTCTCA
GCTGGTGCAACTCATCAAAAGCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGTCCAAGAGCA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2DT47TF 257 0 0
AGCCTCTGGTCAACGGATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATACCCACGTTGAACTTC
TCGCTAAGCCTGACTCTCTTGTCAAAAGAAGAAACTTTGGCGGAAGCATTGGCTCTTAGC
TGGTGCAACTCATCAAAAGCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGTCCAAGAGCAGAGCCT
TTAGCCAAAACAGTAGCCATCACATCTTGCGCTTTGCCAACGTACGCTCTACCACCATTG
CCGTCCGTGTTCTGGCG

QA 1 257 1 257
DS 

RD RR2H373JQ 751 0 0
G
CAAACACACACCCAACGTGAATTCGAAAACACTTACACTGATGCAAAAACATGAAGTGAA
TTAAGGGAACAATGCAGAATATAATGAACACTAAAAAGAATAGGAATATGCTATATTTAT
CACACAAAATTTGTTCACACAAGGCCATCATATAATAGCTCTTAGGAGCTACTCATTGAT
CCTCACTTCAACGCTTTTTACTCCCTTCCGACTTCTTATTATACAGCAATCGGTGTATCC
TTGGAAGCTATATTGGAGACGGCTAGATTGAACTTCTCTTTGGTTTTCGAGCCAGCAAGC
TGACCTGCTCTCGCAACTTTGCTGAAAGCGCCACTAAACCAAGCAGCTCCAGCAGTCACA
TACCTGCTTGATTTGACAGCTGAACCAGTGTCGTTTAACTTCTTCTCAGCTGCAAATATA
GCCGCCATGGTTTTATCTGAAACCTGAAGCCTCTGGTCAACGGATTTTACTTTCTCGTTA
ACCACAGAGATACCCACGTTGAACTTCTCGCTAAGCCTGACTCTCTTGTCAAAAGAAGAA
ACTTTGGCAGAAGCATTAGCTCTCAGCTGGTGCAACTCATCAAAAGCCTTGGCTTTGTTC
ACAGCATCTTGTCCAAGAGCAGAGCCTTTAGCCAAAACAGTAGCCATCACATCTTGCGCT
TTGCTAACGTACGCTCTACCACCATTGCCGTCCGTGTTCTGGCGTGTTGGTGTTGGTGGC
ATCGCGTTCTCTACCACTTGCTGGATGTCA

QA 2 751 2 751
DS 



AS 1 5

CO CL1654Contig1 972 5 11 U
GGGAAAAGCAAACTAACTAACAATGACAGTTCCTCCACTATTCCTCCTCCTCCTCCTCAC
ACTCCTCTCCCTCCCTTCTCTCCTCATCAACGCCGCCGTCTCCGATGCTTACCCTACCAT
TCCCGGAACCACTCCCATCGACGGAGGTTTCTCCGATGATCTCAAACCCATCCGCCGCGA
GGTATACGGCGAAGGCAAAATCTTCGACATCAGTCACCGATACACGCCGGAGATGCCGGC
GTGGGACTCGAAGGAAGGAATCGGAAGGTTTCTGTGGCTAGCTGCGAGCATGAAGAACGG
ATCGCCCGCTAACAACTCCCAGATGAAGATTCCGACTCACACCGGCACACACGTCGATTC
GCCTGGACACGTGTACGACGAGTATTACGACGCTGGTTTTGACGTAGACTCGCTTGATCT
CCAAGTCCTAAACGGTCCTGCGTTGTTGGTTGATGTTCCGAGGAACAAGAACATAACTGC
CGAAGTGATGAAGTCTCTTAACATACCAAGAGGAGTTCGACGTGTGCTTTTCAGAACATT
GAACACTGACAGACGTCTTATGTTCAAGAAGGAGTTTGATACAAGCTATGTCGGATTCAT
GAAGGACGGCGCACAATGGTTGGTAGACAACACAGACATCAAACTTGTTGGGGTTGATTA
TTTATCAGTAGCTGCGTATGATGATCTGATTCCCTCCCACCTAGCATTCCTAAAAGGCCG
GGAGACTATACTTGTGGAAGGATTGAAGCTGGATGATGTGAAGGCAGGAGTCTACTCTGT
CCATTGCTTACCTCTAAGACTTGTTGGAGCAGAAGGTTCTCCAATTCGCTGCATCCTCAT
CAGTTGATTTTCCTCTTCCTTAAACACCATCAAACATGAAGTTTATCTATAAGCAAGTCT
ACTTAGCGCTATGAACTTCGCTGACTATGTAGCAATAAGAGAGGTGAAGAGAAGAAGAGA
AGGAAGCCACTT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2GY16TF U 1
AF RR2FT36TF U 2
AF RR2GH84JQB C 385
AF RR2GY16JQ C 442
AF RR2GH84TF U 385
BS 1 53 RR2GY16TF
BS 54 56 RR2FT36TF
BS 57 299 RR2GY16TF
BS 300 300 RR2FT36TF
BS 301 305 RR2GY16TF
BS 306 306 RR2FT36TF
BS 307 478 RR2GY16TF
BS 479 479 RR2FT36TF
BS 480 568 RR2GY16TF
BS 569 970 RR2GH84TF
BS 971 972 RR2GH84JQB

RD RR2GY16TF 568 0 0
GGGAAAAGCAAACTAACTAACAATGACAGTTCCTCCACTATTCCTCCTCCTCC***TCAC
ACTCCTCTCCCTCCCTTCTCTCCTCATCAACGCCGCCGTCTCCGATGCTTACCCTACCAT
TCCCGGAACCACTCCCATCGACGGAGGTTTCTCCGATGATCTCAAACCCATCCGCCGCGA
GGTATACGGCGAAGGCAAAATCTTCGACATCAGTCACCGATACACGCCGGAGATGCCGGC
GTGGGACTCGAAGGAAGGAATCGGAAGGTTTCTGTGGCTAGCTGCGAGCATGAAGAACGT
ATCGCTCGCTAACAACTCCCAGATGAAGATTCCGACTCACACCGGCACACACGTCGATTC
GCCTGGACACGTGTACGACGAGTATTACGACGCTGGTTTTGACGTAGACTCGCTTGATCT
CCAAGTCCTAAACGGTCCTGCGTTGTTGGTTGATGTTCCGAGGAACAAGAACATAACTAC
CGAAGTGATGAAGTCTCTTAACATACCAAGAGGAGTTCGACGTGTGCTTTTCAGAACATT
GAACACTGACAGACGTCTTATGTTCAAG

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2FT36TF 565 0 0
GGG
AAAGCAAACTAACTAACAATGATAGTTCCTCCACTATTCCTCCTCCTCCTCCTCACACTC
CTCTCCCTCCCTTCTCTCCTCATCAACGCCGCCGTCTCCGATGCTTACCCTACCATTCCC
GGAACCACTCCCATCGACGGAGGTTTCTCCGATGATCTCAAACCCATCCGCCGCGAGGTA
TACGGCGAAGGCAAAATCTTCGACATCAGTCACCGATACACGCCGGAGATGCCGGCGTGG
GACTCGAAGGAAGGAATCGGAAGGTTTCTGTGGCTAGCTGCGAGCATGAAGAACGGATCG
CCCGCTAACAACTCCCAGATGAAGATTCCGACTCACACCGGCACACACGTCGATTCGCCT
GGACACGTGTACGACGAGTATTACGACGCTGGTTTTGACGTAGACTCGCTTGATCTCCAA
GTCCTAAACGGTCCTGCGTTGTTGGTTGATGTTCCGAGGAACAAGAACATAACTGCCGAA
GTGATGAAGTCTCTTAACATACCAAGAGGAGTTCGACGTGTGCTTTTCAGAACATTGAAC
ACTGACAGACGTCTTATGTTCA

QA 4 565 4 565
DS 

RD RR2GH84JQB 588 0 0
G
TACGACGCTGGTTTTGACGTAGACTCGCTTGATCTCCAAGTCCTAAACGGTCCTGCGTTG
TTGGTTGATGTTCCGAGGAACAAGAACATAACTGCCTAAGTGATGAAGTCTCTTAACATA
CCAAGAGGAGTTCGACGTGTGCTTTTCAGAACATTGAACACTGACAGACGTCTTATGTTC
AAGAAGGAGTTTGATACAAGCTATGTCGGATTCATGAAGGACGGCGCACAATGGTTGGTA
GACAACACAGACATCAAACTTGTTGGGGTTGATTATTTATCAGTAGCTGCGTATGATGAT
CTGATTCCCTCCCACCTAGCATTCCTAAAAGGCCGGGAGACTATACTTGTGGAAGGATTG
AAGCTGGATGATGTGAAGGCAGGAGTCTACTCTGTCCATTGCTTACCTCTAAGACTTGTT
GGAGCAGAAGGTTCTCCAATTCGCTGCATCCTCATCAGTTGATTTTCCTCTTCCTTAAAC
ACCATCAAACATGAAGTTTATCTATAAGCAAGTCTACTTAGCGCTATGAACTTCGCTGAC
TATGTAGCAATAAGAGAGGTGAAGAGAAGAAGAGAAGGAAGCCACTT

QA 2 588 2 588
DS 

RD RR2GY16JQ 529 0 0
GTTGTTGGTTGATGTTCCGAGGAACAAGAACATAACTACCGAAGTGATGAAGTCTCTTAA
CATACCAAGAGGAGTTCGACGTGTGCTTTTCAGAACATTGAACACTGACAGACGTCTTAT
GTTCAAGAAGGAGTTTGATACAAGCTATGTCGGATTCATGAAGGACGGCGCACAATGGTT
GGTAGACAACACAGACATCAAACTTGTTGGGGTTGATTATTTATCAGTACCTGCGTATGA
TGATCTGATTCCCTCCCACCTAGCATTCCTAAAAGGCCGGGAGACTATACTTGTGGAAGG
ATTGAAGCTGGATGATGTGAAGGCAGGAGTCTACTCTGTCCATTGCTTACCTTTAAGACT
TGTTGGAGCAGAAGGTTCTCCAATTCGCTGCATCCTCATCAGTTGATTTTCCTCTTCCTT
AAACACCATCAAACATGAAGTTTATCTATAAGCAAGTCTACTTAGCGCTATGAACTTCGC
TGACTATGTAGCAATAAGAGAGGTGAAGAGAAGAAGAGAAGGAAGCCAC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2GH84TF 588 0 0
G
TACGACGCTGGTTTTGACGTAGACTCGCTTGATCTCCAAGTCCTAAACGGTCCTGCGTTG
TTGGTTGATGTTCCGAGGAACAAGAACATAACTGCCTAAGTGATGAAGTCTCTTAACATA
CCAAGAGGAGTTCGACGTGTGCTTTTCAGAACATTGAACACTGACAGACGTCTTATGTTC
AAGAAGGAGTTTGATACAAGCTATGTCGGATTCATGAAGGACGGCGCACAATGGTTGGTA
GACAACACAGACATCAAACTTGTTGGGGTTGATTATTTATCAGTAGCTGCGTATGATGAT
CTGATTCCCTCCCACCTAGCATTCCTAAAAGGCCGGGAGACTATACTTGTGGAAGGATTG
AAGCTGGATGATGTGAAGGCAGGAGTCTACTCTGTCCATTGCTTACCTCTAAGACTTGTT
GGAGCAGAAGGTTCTCCAATTCGCTGCATCCTCATCAGTTGATTTTCCTCTTCCTTAAAC
ACCATCAAACATGAAGTTTATCTATAAGCAAGTCTACTTAGCGCTATGAACTTCGCTGAC
TATGTAGCAATAAGAGAGGTGAAGAGAAGAAGAGAAGGAAGCCAC
TT

QA 2 586 2 586
DS 



AS 1 5

CO CL1655Contig1 730 5 3 U
CATTCCAATGTTTCTTTAGATTAGAATACTAATTACGTATGAACCATTAAAGAATATGTA
TCCGGTACTAAAAAAATGAAGCTCGCCGTGTAAAAGCATATTGATCAGGAAGAACAACAT
ATCAGAATTGGATGATCCTCAAAACTTGAGTTGATCATAAAAATGAAAATAAAAATAAAA
ATAAAATTTGAGATAAATAAAAAAATTGTTGAATTCTCACATTTTATTAAAACTCTGCAG
ACAGCAAAAGAGGACGATGGGATGGGCTTTATTCATCAAGCGGGAGTTGTCTTAAAGAGG
ACCAGGGAAAGTTCCATTCTCTCTTTGCTCGTTCCACCTATCAACCCATTCGCTGGGGCA
AAGAGATCGATAAAATTTTGCAAACTTATCGCATTCTGGAGCATCGTCACCCTTAGCAGC
TACACATCTGTGATACTCAATGTAACGTGTGAAACAATGCCTCGTTTGGTTTGTGGTCGG
GAAACGGAAATCAGCAGGAGCTGTCTTAAGCGTGATCTCATCAGGAGTCTCCTCACTAGT
GTTTTCGTCACTAGGATCCTCTTTAACTTGCTTCACTTCATTCTCCAAATGATATTGCTC
GGAGAGAGACGGAGTTTTAGCAGACACAGCTTCCGCCATTTGGACCAGAGAGCGACGAGG
ATCGGAGGAGAATACAGAGAATCTTCAGGTGGTGATAAACACAACACTCGAGAGCTAATA
ATTGTTATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2E917JQ U 162
AF RR2CF65JQ U 1
AF RR2CF65TF C 1
AF RR2C257JQ U 90
AF RR2C257TF C 90
BS 1 124 RR2CF65JQ
BS 125 125 RR2C257JQ
BS 126 730 RR2CF65JQ

RD RR2E917JQ 485 0 0
AATGAAAATAAAAATAAAAATAAAATTTGAGATAAATAAAAAAATTGTTGAATTCTCACA
TTTTATTAAAACTCTGCAGACAGCAAAAGAGGACGATGGGATGGGCTTTATTCATCAAGC
GGGAGTTGTCTTAAAGAGGACCAGGGAAAGTTCCATTCTCTCTTTGCTCGTTCCACCTAT
CAACCCATTCGCTGGGGCAAAGAGATCGATAAAATTTTGCAAACTTATCGCATTCTGGAG
CATCGTCACCCTTAGCAGCTACACATCTGTGATACTCAATGTAACGTGTGAAACAATGCC
TCGTTTGGTTTGTGGTCGGGAGACGGAAATCAGCAGGAGCTGTCTTAAGCGTGATCTCAT
CAGGAGTCTCCTCACTAGTGTTTTCGTCACTAGGATCCTCTTTAACTTGCTTCACTTCAT
TCTCCAAATGATATTGCTCGGAGAGAGACGGAGTTTTAGCAGACACAGCTTCCGCCATTT
GGACC

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2CF65JQ 730 0 0
CATTCCAATGTTTCTTTAGATTAGAATACTAATTACGTATGAACCATTAAAGAATATGTA
TCCGGTACTAAAAAAATGAAGCTCGCCGTGTAAAAGCATATTGATCAGGAAGAACAACAT
ATCAAAATTGGATGATCCTCAAAACTTGAGTTGATCATAAAAATGAAAATAAAAATAAAA
ATAAAATTTGAGATAAATAAAAAAATTGTTGAATTCTCACATTTTATTAAAACTCTGCAG
ACAGCAAAAGAGGACGATGGGATGGGCTTTATTCATCAAGCGGGAGTTGTCTTAAAGAGG
ACCAGGGAAAGTTCCATTCTCTCTTTGCTCGTTCCACCTATCAACCCATTCGCTGGGGCA
AAGAGATCGATAAAATTTTGCAAACTTATCGCATTCTGGAGCATCGTCACCCTTAGCAGC
TACACATCTGTGATACTCAATGTAACGTGTGAAACAATGCCTCGTTTGGTTTGTGGTCGG
GAAACGGAAATCAGCAGGAGCTGTCTTAAGCGTGATCTCATCAGGAGTCTCCTCACTAGT
GTTTTCGTCACTAGGATCCTCTTTAACTTGCTTCACTTCATTCTCCAAATGATATTGCTC
GGAGAGAGACGGAGTTTTAGCAGACACAGCTTCCGCCATTTGGACCAGAGAGCGACGAGG
ATCGGAGGAGAATACAGAGAATCTTCAGGTGGTGATAAACACAACACTCGAGAGCTAATA
ATTGTTATCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2CF65TF 730 0 0
CATTCCAATGTTTCTTTAGATTAGAATACTAATTACGTATGAACCATTAAAGAATATGTA
TCCGGTACTAAAAAAATGAAGCTCGCCGTGTAAAAGCATATTGATCAGGAAGAACAACAT
ATCAGAATTGGATGATCCTCAAAACTTGAGTTGATCATAAAAATGAAAATAAAAATAAAA
ATAAAATTTGAGATAAATAAAAAAATTGTTGAATTCTCACATTTTATTAAAACTCTGCAG
ACAGCAAAAGAGGACGATGGGATGGGCTTTATTCATCAAGCGGGAGTTGTCTTAAAGAGG
ACCAGGGAAAGTTCCATTCTCTCTTTGCTCGTTCCACCTATCAACCCATTCGCTGGGGCA
AAGAGATCGATAAAATTTTGCAAACTTATCGCATTCTGGAGCATCGTCACCCTTAGCAGC
TACACATCTGTGATACTCAATGTAACGTGTGAAACAATGCCTCGTTTGGTTTGTGGTCGG
GAAACGGAAATCAGCAGGAGCTGTCTTAAGCGTGATCTCATCAGGAGTCTCCTCACTAGT
GTTTTCGTCACTAGGATCCTCTTTAACTTGCTTCACTTCATTCTCCAAATGATATTGCTC
GGAGAGAGACGGAGTTTTAGCAGACACAGCTTCCGCCATTTGGACCAGAGAGCGACGAGG
ATCGGAGGAGAATACAGAGAATCTTCAGGTGGTGATAAACACAACACTCGAGAGCTAATA
ATTGTTATCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2C257JQ 641 0 0
AC
AAAAGCATATTGATCAGGAAGAACAACATATCAGAATTGGATGATCCTCAAAACTTGAGT
TGATCATAAAAATGAAAATAAAAATAAAAATAAAATTTGAGATAAATAAAAAAATTGTTG
AATTCTCACATTTTATTAAAACTCTGCAGACAGCAAAAGAGGACGATGGGATGGGCTTTA
TTCATCAAGCGGGAGTTGTCTTAAAGAGGACCAGGGAAAGTTCCATTCTCTCTTTGCTCG
TTCCACCTATCAACCCATTCGCTGGGGCAAAGAGATCGATAAAATTTTGCAAACTTATCG
CATTCTGGAGCATCGTCACCCTTAGCAGCTACACATCTGTGATACTCAATGTAACGTGTG
AAACAATGCCTCGTTTGGTTTGTGGTCGGGAAACGGAAATCAGCAGGAGCTGTCTTAAGC
GGGATCTCATCAGGAGTCTCCTCACTAGTGTTTTCGTCACTAGGATCCTCTTTAACTTGC
TTCACTTCATTCTCCAAATGATATTGCTCGGAGAGAGACGGAGTTTTAGCAGACACAGCT
TCCGCCATTTGGACCAGAGAGCGACGAGGATCGGAGGAGAATACAGAGAATCTTCAGGTG
GTGATAAACACAACACTCGAGAGCTAATAATTGTTATCC

QA 3 641 3 641
DS 

RD RR2C257TF 641 0 0
AC
AAAAGCATATTGATCAGGAAGAACAACATATCAGAATTGGATGATCCTCAAAACTTGAGT
TGATCATAAAAATGAAAATAAAAATAAAAATAAAATTTGAGATAAATAAAAAAATTGTTG
AATTCTCACATTTTATTAAAACTCTGCAGACAGCAAAAGAGGACGATGGGATGGGCTTTA
TTCATCAAGCGGGAGTTGTCTTAAAGAGGACCAGGGAAAGTTCCATTCTCTCTTTGCTCG
TTCCACCTATCAACCCATTCGCTGGGGCAAAGAGATCGATAAAATTTTGCAAACTTATCG
CATTCTGGAGCATCGTCACCCTTAGCAGCTACACATCTGTGATACTCAATGTAACGTGTG
AAACAATGCCTCGTTTGGTTTGTGGTCGGGAAACGGAAATCAGCAGGAGCTGTCTTAAGC
GGGATCTCATCAGGAGTCTCCTCACTAGTGTTTTCGTCACTAGGATCCTCTTTAACTTGC
TTCACTTCATTCTCCAAATGATATTGCTCGGAGAGAGACGGAGTTTTAGCAGACACAGCT
TCCGCCATTTGGACCAGAGAGCGACGAGGATCGGAGGAGAATACAGAGAATCTTCAGGTG
GTGATAAACACAACACTCGAGAGCTAATAATTGTTATCC

QA 3 641 3 641
DS 



AS 1 5

CO CL1656Contig1 747 5 5 U
GAAGTGTGTTGCCGTCACTGAGCGTGTCCTTGCTGCTTGCTACAAGGCTCTTAGTGACCA
CCGCGTCTTGCTCGAGGGAACTTTGTTGAAGCCTAACATGGTCACTCCTGGTTCCGACAG
TGCCAAGGTTGCGCCAGAGGTTATCGCCGAGCACACCGTCCGTGCTCTTCAGAGAACCGT
CCCACCAGCTGTTCCATCTATTGTGTTCTTGTCTGGAGGACAGAGTGAGGAAGAGGCGAC
CAAGAACTTGAACGCGATGAACCAGTTGAAGACCAAGAAGCCGTGGTCATTGTCTTTCTC
TTTCGGACGTGCGTTGCAGCAGAGTACTTTGAAGACATGGGCAGGTAAAGAGGAGAACGT
TAAGGCCGCTCAAGAGGCTTTGTATGTGAGGTGTAAGGCTAACTCTGAAGCCACTCTCGG
AACATACAAGGGTGATGCTAAGCTTGGTGATGGAGCCGCAGAGAGCCTTCACGTGAAGGA
CTACAAGTACTGAGAGTCGTCGTCAATGGTTTCTGTTGTGACGTACTTATCACCCTCGAT
ATAATTCTAAGGGTTTTTCTACTTTTTTTGCTTGACAAAATCGGATTAACAATGTTTTTT
TCGATTTTTCTTTTCGATTTGTGTTTTGATTTTCGTTTGGTGTGTTCTTTATTTAGAAAA
TGGTGAGTGTTTGAGAAAACGCACAAATAAAAGGCCATCAGAGGTTATATCTGTTTTTCT
TATATGATCAAGAAGTAATTTGGGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES67TF U 1
AF RR2FD76JQ C 231
AF RR2FD76TF U 231
AF RR2EB35TF U 78
AF RR2EB35JQ C 78
BS 1 196 RR2ES67TF
BS 197 197 RR2EB35TF
BS 198 581 RR2ES67TF
BS 582 719 RR2FD76TF
BS 720 747 RR2EB35JQ

RD RR2ES67TF 581 0 0
GAAGTGTGTTGCCGTCACTGAGCGTGTCCTTGCTGCTTGCTACAAGGCTCTTAGTGACCA
CCGCGTCTTGCTCGAGGGAACTTTGTTGAAGCCTAACATGGTCACTCCTGGTTCCGACAG
TGCCAAGGTTGCGCCAGAGGTTATCGCCGAGCACACCGTCCGTGCTCTTCAGAGAACCGT
CCCACCAGCTGTTCCAGCTATTGTGTTCTTGTCTGGAGGACAGAGTGAGGAAGAGGCGAC
CAAGAACTTGAACGCGATGAACCAGTTGAAGACCAAGAAGCCGTGGTCATTGTCTTTCTC
TTTCGGACGTGCGTTGCAGCAGAGTACTTTGAAGACATGGGCAGGTAAAGAGGAGAACGT
TAAGGCCGCTCAAGAGGCTTTGTATGTGAGGTGTAAGGCTAACTCTGAAGCCACTCTCGG
AACATACAAGGGTGATGCTAAGCTTGGTGATGGAGCCGCAGAGAGCCTTCACGTGAAGGA
CTACAAGTACTGAGAGTCGTCGTCAATGGTTTCTGTTGTGACGTACTTATCACCCTCGAT
ATAATTCTAAGGGTTTTTCTACTTTTTTTGCTTGACAAAAT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2FD76JQ 490 0 0
G
AGAGGCGACCAAGAACTTGAACGCGATGAACCAGTTGAAGACCAAGAAGCCGTGGTCATT
GTCTTTTTCTTTCGGACGTGCGTTGCAGCAGAGTACTTTGAAGACATGGGCAGGTAAAGA
GGAGAACGTTAAGGCCGCTCAAGAGGCTTTGTATGTGAGGTGTAAGGCTAACTCTGAAGC
CACTCTCGGAACATACAAGGGTGATGCTAAGCTTGGTGATGGAGCCGCAGAGAGCCTTCA
CGTGGAGGACTACAAGTACTGAGAGTCGTCGTCAATGGTTTCTGTTGTGACGTACTTATC
ACCCTCGATATAATTTTAAGGGTTTTTTTACTTTTTTTGCTTGACAAAATCGGATTAACA
ATGTTTTTTTCGATTTTTCTTTTCGATTTGTGTTTTGATTTTCGTTTGGTGTGTTCTTTA
TTTAGAAAATGGTGAGTGTTTGAGAAAACGCACAAATAAAAGGCCATCAGAGGTTATATC
TGTTTTTC
C

QA 2 489 2 489
DS 

RD RR2FD76TF 490 0 0
G
AGAGGCGACCAAGAACTTGAACGCGATGAACCAGTTGAAGACCAAGAAGCCGTGGTCATT
GTCTTTCTCTTTCGGACGTGCGTTGCAGCAGAGTACTTTGAAGACATGGGCAGGTAAAGA
GGAGAACGTTAAGGCCGCTCAAGAGGCTTTGTATGTGAGGTGTAAGGCTAACTCTGAAGC
CACTCTCGGAACATACAAGGGTGATGCTAAGCTTGGTGATGGAGCCGCAGAGAGCCTTCA
CGTGGAGGACTACAAGTACTGAGAGTCGTCGTCAATGGTTTCTGTTGTGACGTACTTATC
ACCCTCGATATAATTCTAAGGGTTTTTCTACTTTTTTTGCTTGACAAAATCGGATTAACA
ATGTTTTTTTCGATTTTTCTTTTCGATTTGTGTTTTGATTTTCGTTTGGTGTGTTCTTTA
TTTAGAAAATGGTGAGTGTTTGAGAAAACGCACAAATAAAAGGCCATCAGAGGTTATATC
TGTTTTTC
C

QA 2 489 2 489
DS 

RD RR2EB35TF 612 0 0
GAACTTTGTTGAAGCCTAACATGGTCACTCCTGGTTCCGACAGTGCCAAGGTTGCGCCAG
AGGTTATCGCCGAGCACACCGTCCGTGCTCTTCAGAGAACCGTCCCACCAGCTGTTCCAT
CTATTGTGTTCTTGTCTGGAGGACAGAGTGAGGAAGAGGCGACCAAGAACTTGAACGCGA
TGAACCAGTTGAAGACCAAGAAGCCGTGGTCATTGTCTTTCTCTTTCGGACGTGCGTTGC
AGCAGAGTACTTTGAAGACATGGGCAGGTAAAGAGGAGAACGTTAAGGCCGCTCAAGAGG
CTTTGTATGTGAGGTGTAAGGCTAACTCTGAAGCCACTCTCGGAACATACAAGGGTGATG
CTAAGCTTGGTGATGGAGCCGCAGAGAGCCTTCACGTGAAGGACTACAAGTACTGAGAGT
CGTCGTCAATGGTTTCTGTTGTGACGTACTTATCACCCTCGATATAATTCTAAGGGTTTT
TCTACTTTTTTTGCTTGACAAAATCGGATTAACAATGTTTTTTTCGATTTTTCTTTTCGA
TTTGTGTTTTGATTTTCGTTTGGTGTGTTCTTTATTTAGAAAATGGTGAGTGTTTGAGAA
AACGCACAAATA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2EB35JQ 670 0 0
GAACTTTGTTGAAGCCTAACATGGTCACTCCTGGTTCCGACAGTGCCAAGGTTGCGCCAG
AGGTTATCGCCGAGCACACCGTCCGTGCTCTTCAGAGAACCGTCCCACCAGCTGTTCCAT
CTATTGTGTTCTTGTCTGGAGGACAGAGTGAGGAAGAGGCGACCAAGAACTTGAACGCGA
TGAACCAGTTGAAGACCAAGAAGCCGTGGTCATTGTCTTTCTCTTTCGGACGTGCGTTGC
AGCAGAGTACTTTGAAGACATGGGCAGGTAAAGAGGAGAACGTTAAGGCCGCTCAAGAGG
CTTTGTATGTGAGGTGTAAGGCTAACTCTGAAGCCACTCTCGGAACATACAAGGGTGATG
CTAAGCTTGGTGATGGAGCCGCAGAGAGCCTTCACGTGAAGGACTACAAGTACTGAGAGT
CGTCGTCAATGGTTTCTGTTGTGACGTACTTATCACCCTCGATATAATTCTAAGGGTTTT
TCTACTTTTTTTGCTTGACAAAATCGGATTAACAATGTTTTTTTCGATTTTTCTTTTCGA
TTTGTGTTTTGATTTTCGTTTGGTGTGTTCTTTATTTAGAAAATGGTGAGTGTTTGAGAA
AACGCACAAATAAAAGGCCATCAGAGGTTATATCTGTTTTTCTTATATGATCAAGAAGTA
ATTTGGGCCT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 5

CO CL1657Contig1 823 5 6 U
TTTTTTTTCCACCCCAAAAAATAAATTTACAAATAAAGCTCCCAAAATAAATCTAAGAGA
GGGGAAGACACAAGAGTTAAAGGATAACGACATTAACAATGGCCAAATTCTTCATCCTGT
TCCTTGCCTCTGCCATATGTTTCACCACCCTCCTTCACTTCGCGGCCGCTGATGCCGATG
ACTTCGACCGCTTCAACATCACGGGCTCCGTCTATTGCGACACATGCCGCGTCCAATTCG
TTACCCGCCTCAGTAAATTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTTGAGTGTAAGAGTCGTG
TGAACCAGACCGTGACAGTGACCAAGGAAGCTATGACCGACAAAGACGGAAAGTACCAGA
TGGAAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATCATCCTCGTCCAATCACCGG
ACGCAGAGTGTGGCGAAGTAAACAACGAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCAAGGATCAGTC
TCACGGCTAACGATGGCATTGTCTCTAACGAGGTTCGAACCATTAACCCACTTGGGTTCA
TGAGGAAGACTCCTCTCGCTGATTGTCCTCAAGTTTTCAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTG
ATGTCATCTTCTAAGCTTAATACCGATATACATCCATTTTAATTTTTCTTTTGTAACTTT
ATATTTCGTATATAAAACATTTATATATGATTTTTACATGTTGTCGGTCTGAGATACTTA
ACTAGCGCTGTTTTCTTTTGTTTCATATCTTGTGTTTGTGTTCCAACAACCTTTTCAAAA
ATGATTTGATTAACTTCTAAATTTTTAATTTTTGGGAGTTTTT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2EG01TF U 1
AF RR2CT12TF U 2
AF RR2EG01JQ C 130
AF RR2B791TF U 54
AF RR2B791JQ C 185
BS 1 619 RR2EG01TF
BS 620 620 RR2CT12TF
BS 621 635 RR2EG01TF
BS 636 671 RR2CT12TF
BS 672 820 RR2B791TF
BS 821 823 RR2B791JQ

RD RR2EG01TF 635 0 0
TTTTTTTTCCACCCCAAAAAATAAATTTACAAATAAAGCTCCCAAAATAAATCTAAGAGA
GGGGAAGACACAAGAGTTAAAGGATAACGACATTAACAATGGCCAAATTCTTCATCCTGT
TCCTTGCCTCTGCCATATGTTTCACCACCCTCCTTCACTTCGCGGCCGCTGATGCCGATG
ACTTCGACCGCTTCAACATCACGGGCTCCGTCTATTGCGACACATGCCGCGTCCAATTCG
TTACCCGCCTCAGTAAATTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTTGAGTGTAAGAGTCGTG
TGAACCAGACCGTGACAGTGACCAAGGAAGCTATGACCGACAAAGACGGAAAGTACCAGA
TGGAAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATCATCCTCGTCCAATCACCGG
ACGCAGAGTGTGGCGAAGTAAACAACGAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCAAGGATCAGTC
TCACGGCTAACGATGGCATTGTCTCTAACGAGGTTCGAACCATTAACCCACTTGGGTTCA
TGAGGAAGACTCCTCTCGCTGATTGTCCTCAAGTTTTCAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTG
ATGTCATCTTCTAAGCTTA*TACCGATATACATCC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2CT12TF 670 0 0
TTTTTTTCCACCCCAAAAAATAAATTTACAAATAAAGCTCCCAAAATAAATCTAAGAGAG
GGGAAGACACAAGAGTTAAAGGATAACGACATTAACAATGGCCAAATTCTTCATCCTGTT
CCTTGCCTCTGCCATATGTTTCACCACCCTCCTTCACTTCGCGGCCGCTGATGCCGATGA
CTTCGACCGCTTCAACATCACGGGCTCCGTCTATTGCGACACATGCCGCGTCCAATTCGT
TACCCGCCTCAGTAAATTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTTGAGTGTAAGAGTCGTGT
GAACCAGACCGTGACAGTGACCAAGGAAGCTATGACCGACAAAGACGGAAAGTACCAGAT
GGAAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATCATCCTCGTCCAATCACCGGA
CGCAGAGTGTGGCGAAGTAAACAACGAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCAAGGATCAGTCT
CACGGCTAACGATGGCATTGTCTCTAACGAGGTTCGAACCATTAACCCACTTGGGTTCAT
GAGGAAGACTCCTCTCGCTGATTGTCCTCAAGTTTTCAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTGA
TGTCATCTTCTAAGCTTAATACCGATATACATCCATTTTAATTTTTCTTTTGTAACTTTA
TATTTCGTAT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2EG01JQ 651 0 0
CTGCCATATGTTTCACCACCCTCCTTCACTTCGCGGCCGCTGATGCCGATGACTTCGACC
GCTTCAACATCACGGGCTCCGTCTATTGCGACACATGCCGCGTCCAATTCGTTACCCGCC
TCAGTAAATTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTTGAGTGTAAGAGTCGTGTGAACCAGA
CCGTGACAGTGACCAAGGAAGCTATGACCGACAAAGACGGAAAGTACCAGATGGAAGTTA
TGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATCATCCTCGTCCAATCACCGGACGCAGAGT
GTGGCGAAGTAAACAACGAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCAAGGATCAGTCTCACGGCTA
ACGATGGCATTGTCTCTAACGAGGTTCGAACCATTAACCCACTTGGGTTCATGAGGAAGA
CTCCTCTCGCTGATTGTCCTCAAGTTTTCAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTGATGTCATCT
TCTAAGCTTAATACCGATATACATCCATTTTAATTTTTCTTTTGTAACTTTATATTTCGT
ATATAAAACATTTATATATGATTTTTACATGTTGTCGGTCTGAGATACTTAACTAGTGCT
GTTTTTTTTTGTTTCATATCTTGTGTTTGTGTTCCAACAACCTTTTCAAAA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2B791TF 768 0 0
G
AAGAGAGGGGAAGACACAAGAGTTAAAGGATAACGACATTAACAATGGCCAAATTCTTCA
TCCTGTTCCTTGCCTCTGCCATATGTTCCACCACCCTCCTTCACTTCGCGGCCGCTGATG
CCGATGACTTCGACCGCTTCAACATCACCGGCTCCGTCTATTGCGACACATGCCGCGTTC
AATTCGTTACCCACCTCAGTAAATTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTTGAGTGTAAGA
GTCGTGTGAACCAGACCGTGACAGTGACCAAGGAAGCTATGACCGACAAAGACGGAAAGT
ACCAGATGGAAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATCATCCTCGTCCAAT
CACCGGACGCAGAGTGTGGCGAAGTAAACAACGAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCAAGGA
TCAGTCTCACGGCTAACGATGGCATTGTCTCTAACGAGGTTCGAACCATTAACCCACTTG
GGTTCATGAGGAAGACTCCTCTCGCTGATTGTCCTCAAGTTTTCAAGGAGCTTGGAATCG
TCCCTGATGTCATCTTCTAAGCTTAATACCGATATACATCCATTTTAATTTTTCTTTTGT
AACTTTATATTTCGTATATAAAACATTTATATATGATTTTTACATGTTGTCGGTCTGAGA
TACTTAACTAGCGCTGTTTTCTTTTGTTTCATATCTTGTGTTTGTGTTCCAACAACCTTT
TCAAAAATGATTTGATTAACTTCTAAATTTTTAATTTTTGGGAGTT
C

QA 2 767 2 767
DS 

RD RR2B791JQ 639 0 0
CGACCGCTTCAACATCACCGGCTCCGTCTATTGCGACACATGCCGCGTTCAATTCGTTAC
CCACCTCAGTAAATTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTTGAGTGTAAGAGTCGTGTGAA
CCAGACCGTGACAGTGACCAAGGAAGCTATGACCGACAAAGACGGAAAGTACCAGATGGA
AGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATCATCCTCGTCCAATCCCCGGACGC
AGAGTGTGGGGAAGTAAACAACGAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCAAGGATCAGTCTCAC
GGCTAACGATGGCATTGTTTCTAACGAGGTTCGAACCATTAACCCACTTGGGTTCATGAG
GAAGACTCCTCTCGCTGATTGTCCTCAAGTTTTCAAGGAGCTTGGAATCGTCCCTGATGT
CATTTTTTAAGCTTAATACCGATATACATCCATTTTAATTTTTTTTTTGTAACTTTATAT
TTTGTATATAAAACATTTATATATGATTTTTACATGTTGTCGGTTTGAGATACTTAACTA
GCGCTGTTTTCTTTTGTTTCATATTTTGTGTTTGTGTTCCAACAACCTTTTCAAAAATGA
TTTGATTAACTTTTAAATTTTTAATTTTTGGGAGTTTTT

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 5

CO CL1658Contig1 623 5 4 U
GGCCGCTCCGGCATCATCACCATTTAAACCCGAGTCTCTCTCTCACTCACACGGTTTTGC
AAATGGCGACAGTACCAGGACAATTGGTTTGGGAGATCGTTAAGAGAAACAACTGTTTCT
TGGTCAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAAGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAACAATC
TCTGCAACCTCAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGACCATCC
AGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACA
AACCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTTAAGAAGGAATTCCCCAGAATGTCTAAGG
CTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTTGCTCTTG
CCAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAA
ACCGTCAAGCTTAAGCTTTTATCTTCAGAAAGTGTTCTTTTTTTTT*AAGTAAAAGATTT
TATCAAGTTGTTTGTGTTGAGGTTGAACCATAACACTATGCTATGCACCTTTCGTTTTTC
TTTTCAAAGGAACTTTTTCTTTC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A167JQ C 4
AF RR2GC29TF U 1
AF RR2GC29JQ C 44
AF RR2GB65TF U 3
AF RR2A167TF U 12
BS 1 105 RR2GC29TF
BS 106 107 RR2GB65TF
BS 108 601 RR2GC29TF
BS 602 623 RR2A167TF

RD RR2A167JQ 465 0 0
G
GCTCCGGCATCATCACCATTTAAACCCGAGTCTCTCTCTCACTCACACGGTTTTGCAAAT
GGCGACAGTACCAGGACAATTGGTTTGGGAGAT*GTTAAGAGAAACAACTGTTTCTTGGT
CAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAAGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAACAATCTCTG
CAACCTCAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGACCATCCAGCC
AGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAACC
TAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTTAAGAAGGAATTCCCCAGAATGTCTAAGGCTGT
TGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTTGCTCTTGCCAG
ACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTG

QA 2 465 2 465
DS 

RD RR2GC29TF 608 0 0
GGCCGCTCCGGCATCATCACCATTTAAACCCGAGTCTCTCTCTCACTCACACGGTTTTGC
AAATGGCGACAGTACCAGGACAATTGGTTTGGGAGATCGTTAAGA**AACAACTGTTTCT
TGGTCAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAAGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAACAATC
TCTGCAACCTCAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGACCATCC
AGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACA
AACCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTTAAGAAGGAATTCCCCAGAATGTCTAAGG
CTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTTGCTCTTG
CCAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAA
ACCGTCAAGCTTAAGCTTTTATCTTCAGAAAGTGTTCTTTTTTTTT*AAGTAAAAGATTT
TATCAAGTTGTTTGTGTTGAGGTTGAACCATAACACTATGCTATGCACCTTTCGTTTTTC
T
AAAAAAA

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2GC29JQ 558 0 0
CACTCACACGGTTTTGCAAATGGCGACAGTACCAGGACAATTGGTTTGGGAGATCGTTAA
GA**AACAACTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAAGTTCAGTTCAG
CAAAGAGAAGAACAATTTTTGCAACCTCAACTCCTACAAGCACTTTGGTCTTGCAAACAA
GAAGACAGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAA
GACCAAGAAGCAGAACAAACCTAAGGTTTCTGTCAACAAGTCTATCCTTAAGAAGGAATT
CCCCAGAATGTTTAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTT
GAAGAAATTTGCTCTTGCCAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTC
CGGTGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTATCTTCAGAAAGTGTTCTTTTTT
TTT*AAGTAAAAGATTTTATCAAGTTGTTTGTGTTGAGGTTGAACCATAACACTATGCTA
TGCACCTTTCGTTTTTCT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2GB65TF 603 0 0
GG
GCTCCGGCATCATCACCATTTAAACCCGAGTCTCTCTCTCACTCACACGGTTTTGCAAAT
GGCGACAGTACCAGGACAATTGGTTTGGGAGATCGTTAAGAGAAACAACTGTTTCTTGGT
CAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAAGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAACAATCTCTG
CAACCTCAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGACCATCCAGCC
AGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAACC
TAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTTAAGAAGGAATTCCCCAGAATGTCTAAGGCTGT
TGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTTGCTCTTGCCAG
ACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCG
TCAAGCTTAAGCTTTTATCTTCAGAAAGTGTTCTTTTTTTTTTAAGTAAAAGATTTTATC
AAGTTGTTTGTGTTGAGGTTGAACCATAACACTATGCTATGCACCTTTCGTTTTTCT
TTTC

QA 3 599 3 599
DS 

RD RR2A167TF 612 0 0
CATCATCACCATTTAAACCCGAGTCTCTCTCTCACTCACACGGTTTTGCAAATGGCGACA
GTACCAGGACAATTGGTTTGGGAGAT*GTTAAGAGAAACAACTGTTTCTTGGTCAAACAG
TTCGGTAGAGGCAATGCCAAAGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAACAATCTCTGCAACCTC
AACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGACCATCCAGCCAGCTGAC
AAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAACCTAAGGTC
TCTGTCAACAAGTCTATCCTTAAGAAGGAATTCCCCAGAATGTCTAAGGCTGTTGCTAAC
CAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTTGCTCTTGCCAGACTCAGT
GTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAGCT
TAAGCTTTTATCTTCAGAAAGTGTTCTTTTTTTTTTAAGTAAAAGATTTTATCAAGTTGT
TTGTGTTGAGGTTGAACCATAACACTATGCTATGCACCTTTCGTTTTTCTTTTCAAAGGA
ACTTTTTCTTTC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 5

CO CL1659Contig1 762 5 16 U
GGACCGAATCAGAAGTTGCAGACTTTATATCCAAATTTAGGGTTTCCTCTCTTCTCTTGA
TTATCA***GATCCTCGAAACCCTACTTGTCGAATCAGGTCTCAGCTTCTCTGTCCTTTT
TTTTCTGCCCAACAGTTCAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCAACTG
CCTTCGACCCGTTTGCTGATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACG
TCCACATTCGTGTGCAGCAGCGTAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACCGTCCAGGGGCTGA
AGAAAGAGTACAGCTACACCAAGATTCTTAAGGATCTCAAGAAAGAGTTTTGTTGCAACG
GAACTGTCGTTCAAGACTCCGAACTGGGTCAGGTTATTCAGCTTCAAGGAGACCAGAGGA
AGAACGTCTCCACGTTCCTAGTCCAGGCTGGGCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCC
ATGGTTTCTGAGCT***TGCTTTATTCTACTCTACTGTTATCACTACTGTTTTCAAAACA
TACCCAAGTTCCTCTTGTTTCTGGTTTATTTCGAACGACTATAGTATGTTCTTTGTGTTA
CAACATCCTGCTACTTGTGTGATATGAGATCGTTAAGAACTCTTCGTTGACTTCATCTCC
TCTTTCTATATCTTTCTTGTGCCAAGTTTGATACTATTGTTGTAAATTACGATATTAACA
CATCAATGAGTGTTATCTCTCTCGAGCAAGGGGAGGTTCTGG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G819JQ C 16
AF RR2G819TF U 16
AF RR2EL57TF U 2
AF RR2D604TF U 1
AF RR2D604JQ C 127
BS 1 66 RR2D604TF
BS 67 69 RR2G819TF
BS 70 90 RR2D604TF
BS 91 91 RR2G819TF
BS 92 123 RR2D604TF
BS 124 124 RR2G819TF
BS 125 164 RR2D604TF
BS 165 165 RR2G819TF
BS 166 705 RR2D604TF
BS 706 706 RR2D604JQ
BS 707 715 RR2D604TF
BS 716 716 RR2D604JQ
BS 717 733 RR2D604TF
BS 734 734 RR2D604JQ
BS 735 746 RR2D604TF
BS 747 762 RR2D604JQ

RD RR2G819JQ 638 0 0
GG
GCAGACTTTATATCCAAATTTAGGGTTTCCTCTCTTCTCTTGATTATCA***GATCCTCG
AAACCCTACTTGTCGAATCAGGTCTCAGCTTCTCTGTCCTTTTTTTTCTGCCCATCAGTT
CAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCAACTGCCTTCGATCCGTTTGCT
GATGTGGATGCTGAAGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGTCCACATTCGTGTGCAG
CAGCGTAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACCGTCCAGGGGCTGAAGAAAGAGTACAGCTAC
ACCAAGATACTTAAGGATCTCAAGAAAGAGTTTTGTTGCAACGGAACTGTCGTTCAAGAC
TCCGAACTGGGTCAGGTTATTCAGCTTCAAGGAGACCAGAGGAAGAACGTCTCCACGTTC
CTAGTCCAGGCTGGGCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTTTTTGAGCTGTT
TGCTTTATTCTACTCTACTGTTATCACTACTGTTTTCAAAACACACCCAAGTTCCTCTTG
TTTCTGGTTTATTTCGAACGACTATAGTATGTTCTTTGTGTTACAACATCCTGCTACTTG
TGTGATATGAGATCGTTAAGAACTCTTCGTTGACTT

QA 3 638 3 638
DS 

RD RR2G819TF 638 0 0
GG
GCAGACTTTATATCCAAATTTAGGGTTTCCTCTCTTCTCTTGATTATCA***GATCCTCG
AAACCCTACTTGTCGAATCAGGTCTCAGCTTCTCTGTCCTTTTTTTTCTGCCCATCAGTT
CAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCAACTGCCTTCGATCCGTTTGCT
GATGTGGATGCTGAAGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGTCCACATTCGTGTGCAG
CAGCGTAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACCGTCCAGGGGCTGAAGAAAGAGTACAGCTAC
ACCAAGATACTTAAGGATCTCAAGAAAGAGTTTTGTTGCAACGGAACTGTCGTTCAAGAC
TCCGAACTGGGTCAGGTTATTCAGCTTCAAGGAGACCAGAGGAAGAACGTCTCCACGTTC
CTAGTCCAGGCTGGGCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTTTCTGAGCTGTT
TGCTTTATTCTACTCTACTGTTATCACTACTGTTTTCAAAACACACCCAAGTTCCTCTTG
TTTCTGGTTTATTTCGAACGACTATAGTATGTTCTTTGTGTTACAACATCCTGCTACTTG
TGTGATATGAGATCGTTAAGAACTCTTCGTTGACTT

QA 3 638 3 638
DS 

RD RR2EL57TF 629 0 0
GACCGAATCAGAAGTTGCAGACTTTATATCCAAATTTAGGGTTTCCTCTCTTCTCTTGAT
TATCACCAGATCCTCGAAACCCTACTTGTTGAATCAGGTCTCAGCTTCTCTGTCCTTTTT
TT*CTGCCCAACAGTTCAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATTCCCAGGTCCCAACTGC
CTTCGACCCGTTTGCTGATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGT
CCACATTCGTGTGCAGCAGCGTAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACCGTCCAGGGGCTGAA
GAAAGAGTACAGCTACACCAAGATTCTTAAGGATCTCAAGAAAGAGTTTTGTTGCAACGG
AACTGTCGTTCAAGACTCCGAACTGGGTCAGGTTATTCAGCTTCAAGGAGACCATAGGAA
GAACGTCTCCACGTTCCTAGTCCAGGCTGGGCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCA
TGGTTTCTGGGCT***TGCTTTATTCTACTCTACTGTTATCACTACTGTTTTCAAAACAT
ACCCAAGTTCCTCTTGTTTCTGGTTTATTTCGAACGACTATAGTATGTTCTTTGTGTTAC
AACATCCTGCTACTTGTGTGATATGAGAT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2D604TF 746 0 0
GGACCGAATCAGAAGTTGCAGACTTTATATCCAAATTTAGGGTTTCCTCTCTTCTCTTGA
TTATCACCAGATCCTCGAAACCCTACTTGTTGAATCAGGTCTCAGCTTCTCTGTCCTTTT
TTT*CTGCCCAACAGTTCAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATCCCCAGGTCCCAACTG
CCTTCGACCCGTTTGCTGATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACG
TCCACATTCGTGTGCAGCAGCGTAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACCGTCCAGGGGCTGA
AGAAAGAGTACAGCTACACCAAGATTCTTAAGGATCTCAAGAAAGAGTTTTGTTGCAACG
GAACTGTCGTTCAAGACTCCGAACTGGGTCAGGTTATTCAGCTTCAAGGAGACCAGAGGA
AGAACGTCTCCACGTTCCTAGTCCAGGCTGGGCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCC
ATGGTTTCTGAGCT***TGCTTTATTCTACTCTACTGTTATCACTACTGTTTTCAAAACA
TACCCAAGTTCCTCTTGTTTCTGGTTTATTTCGAACGACTATAGTATGTTCTTTGTGTTA
CAACATCCTGCTACTTGTGTGATATGAGATCGTTAAGAACTCTTCGTTGACTTCATCTCC
TCTTTCTATATCTTTCTTGTGCCAAGTTTGATACTATTGTTGTAA*TTACGATAT*AACA
CATCAATGAGTGT*ATCTCTCTCGAG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2D604JQ 636 0 0
GCCCAACAGTTCAACAAAGTTTCATGTCTGAACTTGATCCCCAGGTCCCAACTGCCTTCG
ACCCGTTTGCTGATGTGGATGCTGAGGACTCAGGTGCGGGAACAAAGGAGTACGTCCACA
TTCGTGTGCAGCAGCGTAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACCGTCCAGGGGCTGAAGAAAG
AGTACAGCTACACCAAGATTCTTAAGGATCTCAAGAAAGAGTTTTGTTGCAACGGAACTG
TCGTTCAAGACTCCGAACTGGGTCAGGTTATTCAGCTTCAAGGAGACCAGAGGAAGAACG
TCTCCACGTTCCTAGTCCAGGCTGGGCTTGTGAAGAAGGACAACATCAAGATCCATGGTT
TCTGAGCT***TGCTTTATTCTACTCTACTGTTATCACTACTGTTTTCAAAACATACCCA
AGTTCCTCTTGTTTCTGGTTTATTTCGAACGACTATAGTATGTTCTTTGTGTTACAACAT
CCTGCTACTTGTGTGATATGAGATCGTTAAGAACTCTTCGTTGACTTCATCTCCTCTTTC
TATATCTTTCTTGTGCCAAGTTTGATACTATTGTTGTAAATTACGATATTAACACATCAA
TGAGTGTTATCTCTCTCGAGCAAGGGGAGGTTCTGG

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 4

CO CL1660Contig1 1043 4 14 U
GGGAGAAGAAAGAAAACCCCCATTCTCCGATCCTTCTTAAATCGCGAGAGAGAGACAGAG
AGAGGGGAAGAGTGAACAACAATTGAAGAAGAAGATGAGTAGCATTGGAACTGGATACGA
TCTCTCAGTCACGACCTTCTCTCCCGATGGCCGTGTTTTCCAGATCGAGTACGCCGCCAA
AGCTGTCGACAACAGTGGAACTGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTAATGGG
TGTGGAGAAGCTCATTGCATCTAAGATGATGCTACCGGGTTCCAACCGGAGGATCCATTC
TGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATGGGAGGCAAATTGT
TGCACGTGCTAAATCTGAAGCCAGAAGCTATGAGAGTGTTTATGGCGACGCTGTACCTGT
GAAGGAACTTTCGGAGCGTGTTGCAAGTTATGTTCATTTATGCACTCTCTATTGGTGGCT
TAGGCCTTTTGGTTGTGGAGTCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGACCCCAGTTGTA
CATGATTGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGCAAAGGAAA
ACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTAACTGAGATGACATGCAAAGAAAG
CGTTATCGAAGTTGCAAAAATCATTTACAAGCTACACGATGAAGCCAAAGACAAGGCTTT
TGAATTGGAGATGGGCTGGATTTGCGAGGAGTCAAAAAGAGAGCACCAGAAGGTCCCTGA
TGATCTTCTAGAAGAAGCAAAGACGGCAGCCAAAACTGCGCTTGAGGAGATGGATGCTGA
CTAAACTGATAAAAATGGGTCAAAATTAGATATTGTGTAATGGCATCGTTTGGTGTTTCT
GTTGTAAAACTTTAAAATTTGCCTCTGAGGGGCAAATCGCTGCATTTTCTCATGAACCTT
TTGGACTCCTTGTTTCTATCGACGGTTTCTTTGAACTCCGGAGTTACTGTTGCAGTTTTT
CTCAAAAACGTTTAGTTTCCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D153TF U 11
AF RR2AZ08TFB U 135
AF RR2FF17TF U 1
AF RR2GY56JQ C 220
BS 1 333 RR2FF17TF
BS 334 334 RR2AZ08TFB
BS 335 534 RR2FF17TF
BS 535 535 RR2AZ08TFB
BS 536 552 RR2FF17TF
BS 553 553 RR2AZ08TFB
BS 554 637 RR2FF17TF
BS 638 638 RR2GY56JQ
BS 639 666 RR2FF17TF
BS 667 667 RR2GY56JQ
BS 668 679 RR2FF17TF
BS 680 680 RR2GY56JQ
BS 681 705 RR2FF17TF
BS 706 1043 RR2GY56JQ

RD RR2D153TF 582 0 0
GGAAAACCC
CCATTCTCCGATCCTTCTTAAATCGCGAGAGAGAGACAGAGAGAGGGGAAGAGTGAACAA
CAATTGAAGAAGAAGATGAGTAGCATTGGAACTGGATACGATCTCTCAGTCACGACCTTC
TCTCCCGATGGCCGTGTTTTCCAGATCGAGTACGCCGCCAAAGCTGTCGACAACAGTGGA
ACTGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTAATGGGTGTGGAGAAGCTCATTGCA
TCTAAGATGATGCTACCGGGTTCCAACCGGAGGATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGTC
ATGGCTGTTGCTGGACTTGCTGCTGATGGGAGGCAAATCGTTGCACGTGCTAAATCTGAA
GCCAGAAGCTATGAGAGTGTTTATGGCGACGCTGTACCTGTGAAGGAACTTTCGGAGCGT
GTTGCAAGTTATGTTCATTTATGCACTCTCTATTGGTGGCTTAGGCCTTTTGGTTGTGGA
GTCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGACCCCAATTGTACATGATTGAGCCTTCCGGT
ATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGC

QA 10 582 10 582
DS 

RD RR2AZ08TFB 473 0 0
CCTTCTCTCCCGATGGCCGTGTTTTCCAGATCGAGTACGCCGCCAAAGCTGTCGACAACA
GTGGAACTGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTAATGGGTGTGGAGAAGCTCA
TTGCATCTAAGATGATGCTACCGGGTTCCAACCGGAGGATCCATTCTGTTCATCGTCATG
CTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGATGGGAGGCAAATTGTTGCACGTGCTAAAT
CTGAAGCCAGAAGCTATGAGAGTGTTTATGGCGACGCTGTACCTGTGAAGGAACTTTCGG
AGCGTGTTGCAAGTTACGTTCATTTATGTACTCTCTATTGGTGGCTTAGGCCTTTTGGTT
GTGGAGTCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGACCCCAGTTGTACATGATTGAGCCAT
CCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGCAAAGGAAAACAAGCT

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2FF17TF 705 0 0
GGGAGAAGAAAGAAAACCCCCATTCTCCGATCCTTCTTAAATCGCGAGAGAGAGACAGAG
AGAGGGGAAGAGTGAACAACAATTGAAGAAGAAGATGAGTAGCATTGGAACTGGATACGA
TCTCTCAGTCACGACCTTCTCTCCCGATGGCCGTGTTTTCCAGATCGAGTACGCCGCCAA
AGCTGTCGACAACAGTGGAACTGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTAATGGG
TGTGGAGAAGCTCATTGCATCTAAGATGATGCTACCGGGTTCCAACCGGAGGATCCATTC
TGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGACTTGCTGCTGATGGGAGGCAAATTGT
TGCACGTGCTAAATCTGAAGCCAGAAGCTATGAGAGTGTTTATGGCGACGCTGTACCTGT
GAAGGAACTTTCGGAGCGTGTTGCAAGTTATGTTCATTTATGCACTCTCTATTGGTGGCT
TAGGCCTTTTGGTTGTGGAGTCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGACCCCAATTGTA
CATGATTGAGCCTTCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGCAAAGGAAA
ACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGAGATGACATGCAAAGAAAG
CGTTATTGAAGTTGCAAAA*TCATTTACAAGCTACACGATGAAGC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2GY56JQ 824 0 0
CAAGGACGGGATTGTAATGGGTGTGGAGAAGCTCATTGCATCTAAGATGATGCTACCGGG
TTCCAACCGGAGGATCCACTCTGTTCATCGTCATTCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGC
TGCTGATGGGAGGCAAATTGCTGCACGTGCTAAATCTGAAGCCAGAAGCTATGAGAGTGT
TTATGGTGACGCTGTACCTGTGAAGGAACTTTCGGAGCGTGTTGCAAGTTATGTTCATTT
ATGCACTCTCTATTGGTGGCTTAGGCCTTTTGGTTGTGGAGTCATTCTTGGAGGTTACGA
TAAAGATGGACCTCAGTTGTACATGATTGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGA
CGCTGCAATTGGCAAAGGAAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTAAC
TGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTTATCGAAGTTGCAAAAATCATTTACAAGCTACACGA
TGAAGCCAAAGACAAGGCTTTTGAATTGGAGATGGGCTGGATTTGCGAGGAGTCAAAAAG
AGAGCACCAGAAGGTCCCTGATGATCTTCTAGAAGAAGCAAAGACGGCAGCCAAAACTGC
GCTTGAGGAGATGGATGCTGACTAAACTGATAAAAATGGGTCAAAATTAGATATTGTGTA
ATGGCATCGTTTGGTGTTTCTGTTGTAAAACTTTAAAATTTGCCTCTGAGGGGCAAATCG
CTGCATTTTCTCATGAACCTTTTGGACTCCTTGTTTCTATCGACGGTTTCTTTGAACTCC
GGAGTTACTGTTGCAGTTTTTCTCAAAAACGTTTAGTTTCCACT

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 5

CO CL1661Contig1 1770 5 14 U
ACACACACAGTAGGTGATCTGAAGATATTAAAACCATAAAGGCAAAAGTCCACTAGGCAA
GACATAAAAGACATATCTTACAACATCAAGCTTACACCATAAGCACATAAGCAATCCAAG
TATACAAAAGATAAAACACCATTAACCAAAGAAACATTTCAACCAAATTTCACTTTGATT
GCTTCTCCTAAGCGTTAACTTCCGGCGGCACAGGAAAGAGTCGTTTAAACAACCAATTTA
TTGGTCCCAAAACCTCAGCTTTCTTCTTCCTCCAGAACCATATCGCTGCTCCGTACTGTT
CATTGCGTATCTTCGTCGTTGCTGCTCTCCAGTCATACTTCTCCGTCTCTTCTCTTGCCG
CCTTTCCAATGATTTCTCTTGTTTCACTGTCGTGCAATAGAGTTCTCAGCTTCGTCACAC
AGTCCTCCACATCCCCAGGGCTGAACAAAAACCCTGTCTTTCCCTCCTGTTCTTCAGGGA
TGATATCAGGGATTCCACCAGCTCTAGCGACAACAACAGGAAGTCCTGAAGCCATTGCCT
CAAGAACCACAAGACCAAGCGTCTCTGACTCTGATGGCATCACAAACACATCTCCGCTTG
CGTAAGCTTGCGAGAGTTCCTCCCCTTGTAGCATTCCAGTGAAAACCGCTGGCATTCCGG
CGAACAGCTTCTCAAGATCCTCTCTGTATGGTCCATCTCCAATGAAAGCAATCCGAGCTT
CAGGCAATTTGTCCATTACACTTTTTAGAAGCTCCAAACTCTTTTCTACGCCAATACGGC
CTACATGGATCACTAGAGGCTTTTCTGGCTCACCATTACTTAGTCTTATACGCATTTCTT
GAGAACGGAAACGGGGATTGAAGCTTTCTGAATCCACACCCTTGTTCCAGAGTCGAAGTT
GATTAGCTGCAGTTGCACCAGCTGCTATAAGATCTTTCCCAATGGCAGCGGAAGGAACTA
ATGTAAGATCAGCCGCTCGGTGAAGAAATCTGATTATCGACCACATTGGTTGGACCAACC
AACTAAAAGTGTATCTTGGGATGTATACAGGAACGTGGGTGTGGTAAGACATTACTATTG
GTACAGATAGCATCTTTGCTATTGCCAGAGCACCAAAAACCATAATCCCAGGAGAAGAAG
CGTGTATAATGTCAGGCTTAAAACGAGCGATTTCGGAGATAATTCTTGGACTAAGGGCAA
GCGAGAGGGGAACCTTTTGGTAGTAAGGGCAAGGGAAGCTTCTTGATCCAATGACTTTGG
CTCCATAGAACTCTTCAGGAACACCTTCATGTGTCGTCACGACAATAACCTCGTCACCCA
TTTCACGTAGATACCTAATGAAGTTCTGGAATCTGTTTTTGTATCCCGACACATATGCAA
AGGGAGAAGGCTCGACAAAGAGAGCAATTCTCCTGGGCTTGGAGTAGGATTCGGGATCGA
GAAGTGGAGCCTCAAGCTCCGATTCCTCACCTTCCCCTCTAGCTTCAGTAATAGTCATAT
CGTTGGACCCAGAAGAAGCAGAAACCACCCCAAGTCCGGAACTTTTCTTGCGAATCAAGC
TAATGGATGATCTCCGAGGAGAAGAAACAACGAGGGAAACAGGGGAGCTAGCAAAAGAAC
AACACCTGGGGGAACAAGTGGAAGAAGAACAAGTAGTTGTGGTGGTCGTGCTAGGAAGAA
TAGTAGGAGCAGTTGGAGAGAGATTTATAGAGAGAGAAGAAGAAAGGTTCATTTTTCTTA
TTCCTCTCTCTACAGAAGCTCTTAAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR62JQ U 1
AF RR2AL43JQ U 29
AF RR2EI87JQ U 21
AF RR2AL43TF C 476
AF RR2EI87TF C 998
BS 1 35 RR2GR62JQ
BS 36 36 RR2EI87JQ
BS 37 69 RR2GR62JQ
BS 70 70 RR2EI87JQ
BS 71 94 RR2GR62JQ
BS 95 96 RR2EI87JQ
BS 97 209 RR2GR62JQ
BS 210 210 RR2EI87JQ
BS 211 216 RR2GR62JQ
BS 217 509 RR2EI87JQ
BS 510 510 RR2AL43TF
BS 511 652 RR2EI87JQ
BS 653 1181 RR2AL43TF
BS 1182 1770 RR2EI87TF

RD RR2GR62JQ 216 0 0
ACACACACAGTAGGTGATCTGAAGATATTAAAACCCTAAAGGCAAAAGTCCACTAGGCAA
GACATAAAAAACATATCTTACAACATCAAGCTTA**CCATAAGCACATAAGCAATCCAAG
TATACAAAAGATAAAACACCATTAACCAAAGAAACATTTCAACCAAATTTCACTTTGATT
GCTTCTCCTAAGCGTTAACTTCCGGCGGCCCAGGAA

QA 1 216 1 216
DS 

RD RR2AL43JQ 272 0 0
TAAAACCATAAAGGCAAAAGTCCACTAGGCAAGACATAAAAGACATATCTTACAACATCA
AGCTTACACCATAAGCACATAAGCAATCCAAGTATACAAAAGATAAAACACCATTAACCA
AAGAAACATTTCAACCAAATTTCACTTTGATTGCTTCTCCTAAGCGTTAACTTCCGGCGG
CACAGGAAAGAGTCGTTTAAA**ACCAATTTATTGGTCCCAAAACCTCAGCTTTCTTCTT
CCTCCAGAACCATATCGCTGCTCCGTACTGTT

QA 1 272 1 272
DS 

RD RR2EI87JQ 632 0 0
GAAGATATTAAAACCATAAAGGCAAAAGTCCACTAGGCAAGACATAAAAGACATATCTTA
CAACATCAAGCTTACACCATAAGCACATAAGCAATCCAAGTATACAAAAGATAAAACACC
ATTAACCAAAGAAACATTTCAACCAAATTTCACTTTGATTGCTTCTCCTAAGCGTTAACT
TCCGGCGGCACAGGAAAGAGTCGTTTAAACAACCAATTTATTGGTCCCAAAACCTCAGCT
TTCTTCTTCCTCCAGAACCATATCGCTGCTCCGTACTGTTCATTGCGTATCTTCGTCGTT
GCTGCTCTCCAGTCATACTTCTCCGTCTCTTCTCTTGCCGCCTTTCCAATGATTTCTCTT
GTTTCACTGTCGTGCAATAGAGTTCTCAGCTTCGTCACACAGTCCTCCACATCCCCAGGG
CTGAACAAAAACCCTGTCTTTCCCTCCTGTTCTTCAGGGATGATATCAGGGATTCCACCA
GCTCTAGCGGCAACAACAGGAAGTCCTGAAGCCATTGCCTCAAGAACCACAAGACCAAGC
GTCTCTGACTCTGATGGCATCACAAACACATCTCCGCTTGCGTAAGCTTGCGAGAGTTCC
TCCCCTTGTAGCATTCCAGTGAAAACCGCTGG

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2AL43TF 707 0 0
AGGGATGATATCAGGGATTCCACCAGCTCTAGCGACAACAACAGGAAGTCCTGAAGCCAT
TGCCTCAAGAACCACAAGACCAAGCGTCTCTGACTCTGATGGCATCACAAACACATCTCC
GCTTGCGTAAGCTTGCGAGAGTTCCTCCCCTTGTAGCATTC*AGTGAAAACCGCTGGCAT
TCCGGCGAACAGCTTCTCAAGATCCTCTCTGTATGGTCCATCTCCAATGAAAGCAATCCG
AGCTTCAGGCAATTTGTCCATTACACTTTTTAGAAGCTCCAAACTCTTTTCTACGCCAAT
ACGGCCTACATGGATCACTAGAGGCTTTTCTGGCTCACCATTACTTAGTCTTATACGCAT
TTCTTGAGAACGGAAACGGGGATTGAAGCTTTCTGAATCCACACCCTTGTTCCAGAGTCG
AAGTTGATTAGCTGCAGTTGCACCAGCTGCTATAAGATCTTTCCCAATGGCAGCGGAAGG
AACTAATGTAAGATCAGCCGCTCGGTGAAGAAATCTGATTATCGACCACATTGGTTGGAC
CAACCAACTAAAAGTGTATCTTGGGATGTATACAGGAACGTGGGTGTGGTAAGACATTAC
TATTGGTACAGATAGCATCTTTGCTATTGCCAGAGCACCAAAAACCATAATCCCAGGAGA
AGAAGCGTGTATAATGTCAGGCTTAAAACGAGCGATTTCGGAGATA
C

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2EI87TF 773 0 0
T
GACCACATTGGTTGGACCAACCAACTAAAAGTGTATCT*GGGATGTATACAGGAACGTGG
GTGTGGTAAGACATTACTATTGGTACAGATAGCATCTTTGCTATTGCCAGAGCACCAAAA
ACCATAATCCCAGGAGAAGAAGCGTGTATAATGTCAGGCTTAAAACGAGCGATTTCGGAG
ATAATTCTTGGACTAAGGGCAAGCGAGAGGGGAACCTTTTGGTAGTAAGGGCAAGGGAAG
CTTCTTGATCCAATGACTTTGGCTCCATAGAACTCTTCAGGAACACCTTCATGTGTCGTC
ACGACAATAACCTCGTCACCCATTTCACGTAGATACCTAATGAAGTTCTGGAATCTGTTT
TTGTATCCCGACACATATGCAAAGGGAGAAGGCTCGACAAAGAGAGCAATTCTCCTGGGC
TTGGAGTAGGATTCGGGATCGAGAAGTGGAGCCTCAAGCTCCGATTCCTCACCTTCCCCT
CTAGCTTCAGTAATAGTCATATCGTTGGACCCAGAAGAAGCAGAAACCACCCCAAGTCCG
GAACTTTTCTTGCGAATCAAGCTAATGGATGATCTCCGAGGAGAAGAAACAACGAGGGAA
ACAGGGGAGCTAGCAAAAGAACAACACCTGGGGGAACAAGTGGAAGAAGAACAAGTAGTT
GTGGTGGTCGTGCTAGGAAGAATAGTAGGAGCAGTTGGAGAGAGATTTATAGAGAGAGAA
GAAGAAAGGTTCATTTTTCTTATTCCTCTCTCTACAGAAGCTCTTAAATTCC

QA 2 773 2 773
DS 



AS 1 5

CO CL1662Contig1 1741 5 12 U
GGGTTCTCTGTCCCACCGCTTCTCCACCAATCACTTCTTTCTCTCTCTCTCAGATCTGCA
TCTACCAGAGATTCTCCTCCTTTTCCTTTTCTGCATCTTTTAAAAGCACCATGGTTGGAC
CTCTGGAATCTGATCAATCAATCTTCGCCATCATGTCTGAAAAAATCGAAATATTGTCTG
ATGACTTCGATCCGACCGCTGTAGTCACCGAACCGTCACCATCCCCGGTAACAAACGGAG
GAGGAGGAGAAAGAGAAATGGTTATGGGGAGGAATGTGCACACGACGTCTCTAGCCGTGA
CAGAACCGGAGTCAAACGACGAGTTCACGGGAGACAAGGAAGCTTACATGGCTAGCGTCC
TCGCTCGTTACCGCAAAACTTTGGTTGAACGAACCAAATATCATCTAGGTTATCCATATA
ACTTGGACTTCGACTACGGTGCGCTTGGGCAGTTACAGCATTTCTCAATTAACAACCTCG
GAGATCCGTTTATCGAAAGCAACTATGGAGTGCACTCTAGGCCTTTCGAAGTTGGCGTCT
TGGATTGGTTTGCTCGTCTCTGGGAGATTGAGAGAGATGACTATTGGGGTTACATCACCA
ACTGTGGTACTGAAGGAAACCTTCACGGCATCTTAGTTGGGAGAGAGATGTTACCTGATG
GGATTCTGTATGCTTCGACTGAATCTCATTACTCTGTGTTTAAAGCTGCTCGTATGTATC
GAATGGAATGTGAGAAGGTTGATACGCTTATCTCTGGGGAGATTGACTGTGATGATCTCA
GACGAAAGCTGTTGGCTAACAAAGATAAACCCGCCATTCTTAATGTTAACATAGGTACAA
CGGTTAAAGGAGCCGTTGATGATCTCGACCTTGTTATCAAAACGCTTGAAGAGTGTGGGT
TCTCACATGACAGGTTCTATATTCACTGCGATGGAGCTCTCTTTGGACTTATGATGCCTT
TTGTCAAACGTGCACCAAAAGTCACGTTCAATAAACCGATAGGGAGTGTGAGTGTGTCGG
GCCACAAATTTGTCGGGTGTCCAATGCCTTGTGGTGTTCAGATAACAAGGATGAAACACA
TCAAAGTCCTATCCAGCAACGTTGAGTACCTGGTGTCAAGGGATGCAACAATCATGGGAA
GCAGAAACGGGCATGCTCCTTTGTTCCTTTGGTACACTCTTAACCGCAAAGGCTACAAAG
GATTCCAGAAAGAAGTTCAGAAATGCCTGAGGAATGCCCATTACCTTAAAGACAAACTCC
GTGAATCTGGGATCAGCGCCATGCTCAACGAGCTTAGCAGCACTGTTGTCTTTGAAAGGC
CCAAGGATGAAGAGTTCGTTAGGAGGTGGCAGCTCGCTTGCCAAGGCGATATAGCTCATG
TGGTGGTGATGCCTAGTGTTACGATCGAGAAGCTCGATCATTTTGTGAAAGACCTGGTCG
AACACAGATCGGTCTGGTGTAAGGACGGGTCTCAAACACCATGCCTTGCAAAGGATGTAG
GAACCAACAACTGCGTCTGTCCAGCTCACAAGTGAAGTGACCGTGCTGTTTCACCATATG
TTTTTGATTTCTTTATTTCTGGTTTAAATTTCTATCCGTTGCAGTCATGAATTTTTCGTA
AAATTTTCCAGTTTCACTTAAGTTATTAATAAAAGTCATGATTCTAAAACCATTGTGTGA
TGTGATATTGTGATCTATGCATTTTAGATGTTTGGTGCTAAACTTTGTGTAAATATGTTT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 
15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2G771TF U 1
AF RR2EO30TF U 133
AF RR2BL04TF U 584
AF RR2BL04JQ C 883
AF RR2G771JQ C 1053
BS 1 302 RR2G771TF
BS 303 303 RR2EO30TF
BS 304 415 RR2G771TF
BS 416 416 RR2EO30TF
BS 417 529 RR2G771TF
BS 530 530 RR2EO30TF
BS 531 720 RR2G771TF
BS 721 1318 RR2BL04TF
BS 1319 1320 RR2BL04JQ
BS 1321 1335 RR2BL04TF
BS 1336 1665 RR2BL04JQ
BS 1666 1741 RR2G771JQ

RD RR2G771TF 720 0 0
GGGTTCTCTGTCCCACCGCTTCTCCACCAATCACTTCTTTCTCTCTCTCTCAGATCTGCA
TCTACCAGAGATTCTCCTCCTTTTCCTTTTCTGCATCTTTTAAAAGCACCATGGTTGGAC
CTCTGGAATCTGATCAATCAATCTTCGCCATCATGTCTGAAAAAATCGAAATATTGTCTG
ATGACTTCGATCCGACCGCTGTAGTCACCGAACCGTCACCATCCCCGGTAACAAACGGAG
GAGGAGGAGAAAGAGAAATGGTTATGGGGAGGAATGTGCACACGACGTCTCTAGCCGTGA
CATAACCGGAGTCAAACGACGAGTTCACGGGAGACAAGGAAGCTTACATGGCTAGCGTCC
TCGCTCGTTACCGCAAAACTTTGGTTGAACGAACCAAATATCATCTAGGTTATCCGTATA
ACTTGGACTTCGACTACGGTGCGCTTGGGCAGTTACAGCATTTCTCAATTAACAACCTCG
GAGATCCGTTTATCGAAAGCAACTATGGAGTGCACTCTAGGCCTTTCGAGGTTGGCGTCT
TGGATTGGTTTGCTCGTCTCTGGGAGATTGAGAGAGATGACTATTGGGGTTACATCACCA
ACTGTGGTACTGAAGGAAACCTTCACGGCATCTTAGTTGGGAGAGAGATGTTACCTGATG
GGATTCTGTATGCTTCGACTGAATCTCATTACTCTGTGTTTAAAGCTGCTCGTATGTATC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2EO30TF 540 0 0
GGGATCAATCAATCTTCGA
CATGTCTGGAAAAATCGAAATATTGTCTGATGACTTCGATCCGACCGCTGTAGTCACCGA
ACCGTTACCATCCCCGGTAACAAACGGAGGAGGAGGAGAAAGAGAAATGGTTATGGGGAG
GAATGTTCACACGACGTCTCTTGCTGTGACGGAACCGGAGTCAAACGACGAGTTCACGGG
AGACAAGGAGGCTTACATGGCTAGCGTTCTCGCTCGTTACCGTAAAACTTTGGTTGAACG
AACCAAATTTCATCTAGGTTATCCATATAACTTGGATTTCGACTACGGTGCGCTTGGGCA
GTTACAGCATTTCTCAATTAACAACCTGGGAGATCCGTTTATCGAAAGCAACTATGGAGT
GCACTCTAG*CCTTTTGAAGTTGGCGTCTTGGATTGGTTTGCTCGTCTCTGGGAGATTGA
GAGAGATGACTATTGGGGTTACATCACCAACTGTGGTACTGAAGGAAACCTTCACGGCAT
CTTAGTTGGGAGAGAGATGTTACCTGATGGGATCCTGTATG

QA 20 540 20 540
DS 

RD RR2BL04TF 752 0 0
GG
GGGGTTACATCACCAACTGTGGTACTGAAGGAAACCTTCACGGCATCTTAGTTGGGAGAG
AGATGTTACCTGATGGGATTCTGTATGCTTCGACTGAATCTCATTACTCTGTGTTTAAAG
CTGCTCGTATGTATCGAATGGAATGTGAGAAGGTTGATACGCTTATCTCTGGGGAGATTG
ACTGTGATGATCTCAGACGAAAGCTGTTGGCTAACAAAGATAAACCCGCCATTCTTAATG
TTAACATAGGTACAACGGTTAAAGGAGCCGTTGATGATCTCGACCTTGTTATCAAAACGC
TTGAAGAGTGTGGGTTCTCACATGACAGGTTCTATATTCACTGCGATGGAGCTCTCTTTG
GACTTATGATGCCTTTTGTCAAACGTGCACCAAAAGTCACGTTCAATAAACCGATAGGGA
GTGTGAGTGTGTCGGGCCACAAATTTGTCGGGTGTCCAATGCCTTGTGGTGTTCAGATAA
CAAGGATGAAACACATCAAAGTCCTATCCAGCAACGTTGAGTACCTGGTGTCAAGGGATG
CAACAATCATGGGAAGCAGAAACGGGCATGCTCCTTTGTTCCTTTGGTACACTCTTAACC
GCAAAGGCTACAAAGGATTCCAGAAAGAAGTTCAGAAATGCCTGAGGAATGCCCATTACC
TTAAAGACAAACTCCGTGAATCTGGGATCAGCGCCATGCTCAACGAGCTTAGCAGCACTG
TTGTCTTTGAAAG**CCAAGGATGAAGAGT

QA 3 752 3 752
DS 

RD RR2BL04JQ 783 0 0
CGCTTGAAGAGTGTGGGTTCTCACATGACAGGTTCTATATTCACTGCGATGGAGCTCTCT
TTGGACTTATGATGCCTTTTGTCAAACGTGCACCAAAAGTCACGTTCAATAAACCGATAG
GGAGTGTGAGTGTGTCGGGCCACAAATTTGTCGGGTGTCCAATGCCTTGTGGTGTTCAGA
TAACAAGGATGAAACACATCAAAGTCCTATCCAGCAACGTTGAGTACCTGGTGTCAAGGG
ATGCAACAATCATGGGAAGCAGAAACGGGCATGCTCCTTTGTTCCTTTGGTACACTTTTA
ACCGCAAAGGCTACAAAGGATTCCAGAAAGAAGTTCAGAAATGCCTGAGGAATGCCCATT
ACCTTAAAGACAAACTCCGTGAATCTGGGATCAGCGCCATGCTCAACGAGCTTAGCAGCA
CTGTTGTCTTTGAAAGGCCCAAGGATGAAGAGTTCGTTAGGAGGTGGCAGCTCGCTTGCC
AAGGCGATATAGCTCATGTGGTGGTGATGCCTAGTGTTACGATCGAGAAGCTCGATCATT
TTGTGAAAGACCTGGTCGAACACAGATCGGTCTGGTGTAAGGACGGGTCTCAAACACCAT
GCCTTGCAAAGGATGTAGGAACCAACAACTGCGTCTGTCCAGCTCACAAGTGAAGTGACC
GTGCTGTTTCACCATATGTTTTTGATTTCTTTATTTCTGGTTTAAATTTCTATCCGTTGC
AGTCATGAATTTTTCGTAAAATTTTCCAGTTTCACTTAAGTTATTAATAAAAGTCATGAT
TCT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2G771JQ 689 0 0
GGTGTTCAGATAACAAGGATGAAACACATCAAAGTCCTATCCAGCAACGTTGAGTACCTG
GCGTCAAGGGATGCAACAATCATGGGAAGCAGAAACGGGCATGCTCCTTTGTTCCTTTGG
TACACTCTTAACCGCAAAGGCTACAAAGGATTCCAGAAAGAAGTTCAGAAATGCCTGAGG
AATGCCCATTACCTTAAAGACAGACTCCGTGAATCTGGGATCAGCGCCATGCTCAACGAG
CTTAGCAGCACTGCTGTCTTTGAAAGGCCCAAGGATGAAGAGTTCGTTAGGAGGTGGCAG
CTCGCTTGCCAAGGCGATATAGCTCATGTGGTGGTGATGCCTAGTGTTACGATCGAGAAG
CTCGATCATTTTGTGAAAGACCTGGTCGAACACAGATCGGTCTGGTGTAAGGACGGGTCT
CAAACACCATGCCTTGCAAAGGATGTAGGAACCAACAACTGCGTCTGTCCAGCTCACAAG
TGAAGTGACCGTGCTGTTTCACCATATGTTTTTGATTTCTTTATTTCTGGTTTAAATTTC
TATCCGTTGCAGTCATGAATTTTTCGTAAAATTTTCCAGTTTCACTTAAGTTATTAATAA
AAGTCATGATTCTAAAACCATTGTGTGATGTGATATTGTGATCTATGCATTTTAGATGTT
TGGTGCTAAACTTTGTGTAAATATGTTTG

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 3

CO CL1663Contig1 754 3 8 U
ATAACCCTAATTAATTAAACTTTTGACGAAAATTCCTAAAATTAAAAAGAATACATATCA
ATCTCACCTCGTTATTAATAAAATCTGATAGCCACAAAAAAA*GGAAGAAGAATACATAT
CATTCCATATTTTACTAGACTGAAGATTTTTCTTGTTCTTGTTGACTCGTCGTGGTTGGA
GTATCTTCATCATTATCTTCAGACTTGCGCAAAGCTTGTCTGAGACCCAACACGATGAAC
AAATTGGTGAGAGCAAGAAGTGATTCAGCTCCTCCATGTAACCAATCAACGTTTGACAAT
GATGTTCCATAATGCACCTTAGCATATATCCCAGCAGGTATTGTAGCTCCAACGAAGGCA
AGCAAGAAGTAGAATCCGAAAAGTGTGAGCTTCGGAGCAGTTTTGGACTTAGTGATGAAG
TAGAGGAAACCTATGTACGGAAACAGAGACACCGCGAAGAGCTGAGATGCTATGCTCTGT
GAATCAATGGTTGGAGCCCAGGGGTCCACCGGAAACATCCCTCCTGCGTCACACACGATC
GAAACTCTGCCATCTTCTCCTCTTCTTCTTATTCTTTTCTCTTTCGTCTCTGTCAAGTGT
AAGAAGAAGCTTTTGTTCCTAGAGATCGAGATACTATGCTGAGAAAGTCGTCGAGTGTTG
AACGGAGACGAGCTCAGATATTTAACGGCTGAGATTATCGCCGGAGAGTAAGAGAGCATC
AGAATCATCTTCTCTTTTTCTCTTTTACTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DX11JQ U 1
AF RR2H909JQ U 42
AF RR2H909TF C 83
BS 1 102 RR2DX11JQ
BS 103 103 RR2H909JQ
BS 104 170 RR2DX11JQ
BS 171 171 RR2H909JQ
BS 172 350 RR2DX11JQ
BS 351 351 RR2H909JQ
BS 352 356 RR2DX11JQ
BS 357 754 RR2H909JQ

RD RR2DX11JQ 356 0 0
ATAACCCTAATTAATTAAACTTTTGACGAAAATTCCTAAAATTAAAAAGAATACATATCA
ATCTCACCTCGTTATTAATAAAATCTGATAGCCACAAAAAAAAGGAAGAAGAATACATAT
CATTCCATATTTTACTAGACTGAAGATTTTTCTTGTTCTTGTTGACTCGTTGTGGTTGGA
GTATCTTCATCATTATCTTCAGACTTGCGCAAAGCTTGTCTGAGACCCAACACGATGAAC
AAATTGGTGAGAGCAAGAAGTGATTCAGCTCCTCCATGTAACCAATCAACGTTTGACAAT
GATGTTCCATAATGCACCTTAGCATATATCCCAGCAGGTATTGTAGCTCCGACGAA

QA 1 356 1 356
DS 

RD RR2H909JQ 713 0 0
TTAAAAAGAATACATATCAATCTCACCTCGTTATTAATAAAATCTGATAGCCACAAAAAA
A*GGAAGAAGAATACATATCATTCCATATTTTACTAGACTGAAGATTTTTCTTGTTCTTG
TTGACTCGTCGTGGTTGGAGTATCTTCATCATTATCTTCAGACTTGCGCAAAGCTTGTCT
GAAACCCAACACGATGAACAAATTGGTGAGAGCAAGAAGTGATTCAGCTCCTCCATGTAA
CCAATCAACGTTTGACAATGATGTTCCATAATGCACCTTAGCATATATCCCAGCAGGTAT
TGTAGCTCCAACGAAGGCAAGCAAGAAGTAGAATCCGAAAAGTGTGAGCTTCGGAGCAGT
TTTGGACTTAGTGATGAAGTAGAGGAAACCTATGTACGGAAACAGAGACACCGCGAAGAG
CTGAGATGCTATGCTCTGTGAATCAATGGTTGGAGCCCAGGGGTCCACCGGAAACATCCC
TCCTGCGTCACACACGATCGAAACTCTGCCATCTTCTCCTCTTCTTCTTATTCTTTTCTC
TTTCGTCTCTGTCAAGTGTAAGAAGAAGCTTTTGTTCCTAGAGATCGAGATACTATGCTG
AGAAAGTCGTCGAGTGTTGAACGGAGACGAGCTCAGATATTTAACGGCTGAGATTATCGC
CGGAGAGTAAGAGAGCATCAGAATCATCTTCTCTTTTTCTCTTTTACTCTCCC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2H909TF 672 0 0
ATCTGATAGCCACAAAAAA**GGAAGAAGAATACATATCATTCCATATTTTACTAGACTG
AAGATTTTTCTTGTTCTTGTTGACTCGTCGTGGTTGGAGTATCTTCATCATTATCTTCAG
ACTTGCGCAAAGCTTGTCTGAGACCCAACACGATGAACAAATTGGTGAGAGCAAGAAGTG
ATTCAGCTCCTCCATGTAACCAATCAACGTTTGACAATGATGTTCCATAATGCACCTTAG
CATATATCCCAGCAGGTATTGTAGCTCCAACGAAGGCAAGCAAGAAGTAGAATCCGAAAA
GTGTGAGCTTCGGAGCAGTTTTGGACTTAGTGATGAAGTAGAGGAAACCTATGTACGGAA
ACAGAGACACCGCGAAGAGCTGAGATGCTATGCTCTGTGAATCAATGGTTGGAGCCCAGG
GGTCCACCGGAAACATCCCTCCTGCGTCACACACGATCGAAACTCTGCCATCTTCTCCTC
TTCTTCTTATTCTTTTCTCTTTCGTCTCTGTCAAGTGTAAGAAGAAGCTTTTGTTCCTAG
AGATCGAGATACTATGCTGAGAAAGTCGTCGAGTGTTGAACGGAGACGAGCTCAGATATT
TAACGGCTGAGATTATCGCCGGAGAGTAAGAGAGCATCAGAATCATCTTCTCTTTTTCTC
TTTTACTCTCCC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 4

CO CL1664Contig1 1171 4 27 U
GGAACATACAAAAAATGATTAACACCATTCTCAATATTTTTCTTCCTCCTCTTACCACCA
TCTTTCTCTTCCTCTTGTACCCATCTTACCTTTTGGGCAAACTTGTGATTCGTCTCTATA
AGCACCTGAGCTTTGAAAATGTGGCCAGAAAAGTAGTTCTAATCACTGGAGCTTCATCCG
GCATTGGAGAGCATGTAGCCTACGAGTATGCAAAGAAAGGAGCGTGTTTGGTTCTCGTTG
CTCGAAGAAGGGACCGTCTAGATATAGTAGCCCAAAAATTACATCAATTAGGATCTGGTG
ATGTCCTCGTCATACCTGGTGATGTTGCTAATATTAATGACTGCAAGAAGTTAATCGATG
ATACGATTCATCATTTCGGTAAACTAGACCACTTGATTAACAATGCTGGTGTATTTCAAA
CTATTCTTTTCGAAGATTTCACTCAAATTCAAGACGCTAATCCTATTATGGATATTAACT
TTTGGGGTTCAACATACATCACTTATTTTGCCATTCCTCATCTTCGAAAGAGCAAAGGAA
AGATCATTGTGATTACTTCTGGTGCAGCAAATATACCCTTGCCATTGGCGAGCGTCTATT
CAGCAAGCAAAGCAGCCTTGGTAAGATTCTTTGAGACACTAAGAGTTGAGCTCAGTCCGG
ATATCAAAATAACAATCGTTTTCCCCGGAGTTATATCTACAGATATGACCACTCCTCACT
TTGTAGAAAAGTATGGTTCAGATTTTTTCCTCTCGGAATCAGTGACTAAATGTGCAAAAG
CAATCTTCAGAGGAATCGCTAGAGGAGAGACATACATAGAAGAGCCACCTTGGTTAAAAT
GGATGTTTTTGATAAACAGTGTGACTCCTGAAATGTTTGACTACTTAGTCAACTATTTAT
TTTTTCGTTATCTCAAACCTTATTTCAAGCGTGATTGATCGTATTCGTATCAGCCCATTG
CTATAATACTCTTCAAAATGGTTGTATTTCAACGGGAAATGAAACTGAACGATACTTTGT
TTTTCGTTAGCTAATTATTATTATTTTTTTTTTTTTTTTTAAGATCATTCATTAGCTAAT
TATTGCAACCAAGTCTATTAGTTATTACTCTTTTATATTTGTTCCAGTTTTCTTCTAGCT
AGAGTTTAAGGTATTACACATGACACGATCG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC12TF U 1
AF RR2AG14TF U 5
AF RR2AG14JQ C 224
AF RR2EC12JQ C 464
BS 1 57 RR2EC12TF
BS 58 58 RR2AG14TF
BS 59 61 RR2EC12TF
BS 62 62 RR2AG14TF
BS 63 175 RR2EC12TF
BS 176 176 RR2AG14TF
BS 177 253 RR2EC12TF
BS 254 254 RR2AG14TF
BS 255 262 RR2EC12TF
BS 263 263 RR2AG14TF
BS 264 279 RR2EC12TF
BS 280 280 RR2AG14TF
BS 281 322 RR2EC12TF
BS 323 323 RR2AG14TF
BS 324 379 RR2EC12TF
BS 380 380 RR2AG14TF
BS 381 397 RR2EC12TF
BS 398 398 RR2AG14TF
BS 399 444 RR2EC12TF
BS 445 445 RR2AG14TF
BS 446 652 RR2EC12TF
BS 653 653 RR2AG14TF
BS 654 742 RR2EC12TF
BS 743 973 RR2AG14JQ
BS 974 974 RR2EC12JQ
BS 975 1026 RR2AG14JQ
BS 1027 1171 RR2EC12JQ

RD RR2EC12TF 744 0 0
GGAACATACAAAAAATGATTAACACCATTCTCAATATTTTTCTTCCTCCTCTTACCATCA
TTTTTCTCTTCCTCTTGTACCCATCTTACCTTTTGGGCAAACTTGTGATTCGTCTCTATA
AGCACCTGAGCTTTGAAAATGTGGCCAGAAAAGTAGTTCTAATCACTGGAGCTTCCTCCG
GCATTGGAGAGCATGTAGCCTACGAGTATGCAAAGAAAGGAGCGTGTTTGGTTCTCGTTG
CTCGAAGAAGGGATCGTCTAGAGATAGTAGCCCAAAAATCACATCAATTAGGATCTGGTG
ATGTCCTCGTCATACCTGGTGACGTTGCTAATATTAATGACTGCAAGAAGTTAATCGATG
ATACGATTCATCATTTCGGCAAACTAGACCACTTGATCAACAATGCTGGTGTATTTCAAA
CTATTCTTTTCGAAGATTTCACTCGAATTCAAGACGCTAATCCTATTATGGATATTAACT
TTTGGGGTTCAACATACATCACTTATTTTGCCATTCCTCATCTTCGAAAGAGCAAAGGAA
AGATCATTGTGATTACTTCTGGTGCAGCAAATATACCCTTGCCATTGGCGAGCGTCTATT
CAGCAAGCAAAGCAGCCTTGGTAAGATTCTTTGAGACACTAAGAGTTGAGCTTAGTCCGG
ATATCAAAATAACAATCGTTTTCCCCGGAGTTATATCTACAGATATGACCACTCCTCACT
TTGTAGAAAAGTATGGTTCAGA
TT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2AG14TF 738 0 0
G
ATACAAAAAATGATTAACACCATTCTCAATATTTTTCTTCCTCCTCTTACCACCATCTTT
CTCTTCCTCTTGTACTCATCTTACCTTTTGGGCAAACTTGTGATTCGTCTCTATAAGCAC
CTGAGCTTTGAAAATGTGGCCAGAAAAGTAGTTCTAGTCACTGGAGCTTCATCCGGCATT
GGAGAGCATGTAGCCTACGAGTATGCAAAGAAAGGAGCGTGTTTGGTTCTCGTTGCTCGA
AGAAGGGACCGTCTAGATATAGTAGCCCAAAAATTACATCAATTAGGATCTGGTGATGTC
CTCGTCATACCTGGTGATGTTGCTAATATTAATGACTGCAAGAAGTTAATCGATGATACG
ATTCATCATTTCGGTAAACTAGACCACTTGATTAACAATGCTGGTGTATTTCAAACTATT
CTTTTCGAAGATTTCACTCAAATTCAAGACGCTAATCCTATTATGGATATTAACTTTTGG
GGTTCAACATACATCACTTATTTTGCCATTCCTCATCTTCGAAAGAGCAAAGGAAAGATC
ATTGTGATTACTTCTGGTGCAGCAAATATACCCTTGCCATTGGCGAGCGTCTATTCAGCA
AGCAAAGCAGCTTTGGTAAGATTCTTTGAGACACTAAGAGTTGAGCTCAGTCCGGATATC
AAAATAACAATCGTTTTCCCCGGAGTTATATCTACAGATATGACCACTCCTCACTTTGTA
GAAAAGTATGGTTCAGA

QA 2 738 2 738
DS 

RD RR2AG14JQ 803 0 0
GTGTTTGGTTCTCGTTGCTCGAAGAAGGGACCGTCTAGATATAGTAGCCCAAAAATTACA
TCAATTAGGATCTGGTGATGTCCTCGTCATACCTGGTGATGTTGCTAATATTAATGACTG
CAAGAAGTTAATCGATGATACGATTCATCATTTCGGTAAACTAGACCACTTGATTAACAA
TGCTGGTGTATTTCAAACTATTCTTTTCGAAGATTTCACTCAAATTCAAGACGCTAATCC
TATTATGGATATTAACTTTTGGGGTTCAACATACATCACTTATTTTGCCATTCCTCATCT
TCGAAAGAGCAAAGGAAAGATCATTGTGATTACTTCTGGTGCAGCAAATATACCCTTGCC
ATTGGCGAGCGTCTATTCAGCAAGCAAAGCAGCTTTGGTAAGATTCTTTGAGACACTAAG
AGTTGAGCTCAGTCCGGATATCAAAATAACAATCGTTTTCCCCGGAGTTATATCTACAGA
TATGACCACTCCTCACTTTGTAGAAAAGTATGGTTCAGATTTTTTCCTCTCGGAATCAGT
GACTAAATGTGCAAAAGCAATCTTCAGAGGAATCGCTAGAGGAGAGACATACATAGAAGA
GCCACCTTGGTTAAAATGGATGTTTTTGATAAACAGTGTGACTCCTGAAATGTTTGACTA
CTTAGTCAACTATTTATTTTTTCGTTATCTCAAACCTTATTTCAAGCGTGATTGATCGTA
TTCGTATCAGCCCATTGCTATAATACTCTTGAAAATGGTTGTATTTCAACGGGAAATGAA
ACTGAACGATACTTTGTTTTTCG

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2EC12JQ 708 0 0
TATTATGGATATTAACTTTTGGGGTTCAACATACATCACTTATTTTGCCATTCCTCATCT
TCGAAAGAGCAAAGGAAAGATCATTGTGATTACTTCTGGTGCAGCAAATATACCCTTGCC
ATTGGCGAGCGTCTATTCAGCAAGCAAAGCAGCCTTGGTAAGATTCTTTGAGACACTAAG
AGTTGAGCTTAGTCCGGATATCAAAATAACAATCGTTTTCCCCGGAGTTATATCTACAGA
TATGACCACTCCTCACTTTGTAGAAAAGTATGGTTCAGATTTTTTCCTCTCGGAATCAGT
GACTAAATGTGCAAAAGCAATCTTCAGAGGAATCGCTAGAGGAGAGACATACATAGAAGA
GCCATCTTGGTTAAAATGGATGTTTTTGATAAACAGTGTGACTCCTGAAATGTTTGACTA
CTTAGTCAACTATTTATTTTTTCGTTATCTCAAACCTTATTTCAAGCGTGATTGATCGTA
TTCGTATCAGCCCATTGCTATAATACTCTTCAAAATGGTTGTATTTCAACGGGAAATGAA
ACTGAACGATACTTTGTTTTTCGTTAGCTAATTATTATTATTTTTTTTTTTTTTTTTAAG
ATCATTCATTAGCTAATTATTGCAACCAAGTCTATTAGTTATTACTCTTTTATATTTGTT
CCAGTTTTCTTCTAGCTAGAGTTTAAGGTATTACACATGACACGATCG

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 4

CO CL1665Contig1 1036 4 14 U
GGATAGGAAAAAAAGAAGAAAGAGGAAAACAACAAGTATCGTGCTTGATTGGGAATTAGG
GATTCAGGGAGGCGAGAGAGAGAGAGAGATTCATTTCGATTTCTCCTCGAAAAATTAAAT
TAATCCAGAGGGGTTGGAGGTGGAGAGATGGTGAGGATGGTGAGAAGCTGCTTACAGTCG
ATGATGAAGCTTGTGAATTCCCTTCTTGGAATGGTTGGTGTCGCCATGATCCTCTACGCT
GTTTGGCTCGTCAGGCAATGGCAACAACAAACCGGATCTCTCCCCTTCCCTTACCCTCAT
GATGATCACCCCCTTCCTTGGTTCATTTATGCTTTTCTTTGTCTCGGGGCTCTTCTCTGT
CTTGTCACTTGCGCTGGCCACATCGCTGCTGAAACCGTTAATTCTTGTTGTCTTTACTTT
TATATGGGATTCATCCTCTTGCTTATTATGATTCAAGGTGGTGTCGTTGCCGATACCTTT
CTTAACCCTGACTGGAAACAGGACTTTCCAGATGATCCAAGTGGTGCCTTCATCCGTTTC
TCTAAGTTCGTCGAGTCAAACTTCAAGATTTGCAGATGGATTGGTCTCTCCATTTTCTTT
GTCCAGGGTGCATCAGTTCTATTGGCCATGTTGCTCAAAGCTCTTGGACCTCACCCGCAT
TATGACAGTGACGATGAATATGATTTGAGCACGGTTGCACTCCTACGTGATGCTCGCCAG
CCTCATCGTCCATACGTTGTTGGAGAACCCATTTATGGACCCAAACCGGATTCCTGGACT
GTTAGGATTAATGAAAGAGCCAACCGGTAAGAGAGATGGAGCCCAAGAGAAAGCTGTGAG
AAGCAAAGTAGCCAATAGTCACCTCTTTTATTTAGTATATATTACTTACTTTGCTTCTTT
GTTGCATCTATCTTATCTATCTCTCCCTCCAAAGTCCAACCAAACCACTATCCCTTGTAA
AAAAAATATTGCATACACATATGGGGATGTACTTATGCATTTTAAAAACTACAATATGTG
ATCACTTCAGACCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2BK34TF U 1
AF RR2HB07TF U 49
AF RR2BK34JQ C 294
AF RR2A508JQ C 321
BS 1 85 RR2BK34TF
BS 86 89 RR2HB07TF
BS 90 105 RR2BK34TF
BS 106 106 RR2HB07TF
BS 107 730 RR2BK34TF
BS 731 731 RR2HB07TF
BS 732 746 RR2BK34TF
BS 747 747 RR2HB07TF
BS 748 758 RR2BK34TF
BS 759 773 RR2HB07TF
BS 774 886 RR2BK34JQ
BS 887 890 RR2A508JQ
BS 891 1035 RR2BK34JQ
BS 1036 1036 RR2A508JQ

RD RR2BK34TF 758 0 0
GGATAGGAAAAAAAGAAGAAAGAGGAAAACAACAAGTATCGTGCTTGATTGGGAATTAGG
GATTCAGGGAGGCGAGAGAGAGAGA****TTCATTTCGATTTCTCTTCGAAAAATTAAAT
TAATCCAGAGGGGTTGGAGGTGGAGAGATGGTGAGGATGGTGAGAAGCTGCTTACAGTCG
ATGATGAAGCTTGTGAATTCCCTTCTTGGAATGGTTGGTGTCGCCATGATCCTCTACGCT
GTTTGGCTCGTCAGGCAATGGCAACAACAAACCGGATCTCTCCCCTTCCCTTACCCTCAT
GATGATCACCCCCTTCCTTGGTTCATTTATGCTTTTCTTTGTCTCGGGGCTCTTCTCTGT
CTTGTCACTTGCGCTGGCCACATCGCTGCTGAAACCGTTAATTCTTGTTGTCTTTACTTT
TATATGGGATTCATCCTCTTGCTTATTATGATTCAAGGTGGTGTCGTTGCCGATACCTTT
CTTAACCCTGACTGGAAACAGGACTTTCCAGATGATCCAAGTGGTGCCTTCATCCGTTTC
TCTAAGTTCGTCGAGTCAAACTTCAAGATTTGCAGATGGATTGGTCTCTCCATTTTCTTT
GTCCAGGGTGCATCAGTTCTATTGGCCATGTTGCTCAAAGCTCTTGGACCTCACCCGCAT
TATGACAGTGACGATGAATATGATTTGAGCACGGTTGCACTCCTACGTGATGCTCGCCAG
CCTCATCGTC*ATACGTTGTTGGAGA*CCCATTTATGG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2HB07TF 725 0 0
GG
GGGAATTAGGGATTCAGGGAGGCGAGAGAGAGAGAGAGATTCATTTCGATTTCTCCTCGA
AAAATTAAATTAATCCAGAGGGGTTGGAGGTGGAGAGATGGTGAGGATGGTGAGAAGCTG
CTTACAGTCGATGATGAAGCTTGTGAATTCCCTTCTTGGAATGGTTGGTGTCGCCATGAT
CCTCTACGCTGTTTGGCTCGTCAGGCAATGGCAACAACAAACCGGATCTCTCCCCTTCCC
TTACCCTCATGATGATCACCCCCTTCCTTGGTTCATTTATGCTTTTCTTTGTCTCGGGGC
TCTTCTCTGTCTTGTCACTTGCGCTGGCCACATCGCTGCTGAAACCGTTAATTCTTGTTG
TCTTTACTTTTATATGGGATTCATCCTCTTGCTTATTATGATTCAAGGTGGTGTCGTTGC
CGATACCTTTCTTAACCCTGACTGGAAACAGGACTTTCCAGATGATCCAAGTGGTGCCTT
CATCCGTTTCTCTAAGTTCGTCGAGTCAAACTTCAAGGTTTGCAGATGGATTGGTCTCTC
CATTTTCTTTGTCCAGGGTGCATCAGTTCTATTGGCCATGTTGCTCAAAGCTCTTGGACC
TCACCCGCATTATGACAGTGACGATGAATATGATTTGAGCACGGTTGCACTCCTACGTGA
TGCTCGCCAGCCTCATCGTCCATACGTTGTTGGAGAACCCATTTATGGACCCAAACCGGA
TTC

QA 3 725 3 725
DS 

RD RR2BK34JQ 743 0 0
CCCTCATGATGATCACCCCCTTCCTTGGTTCATTTATGCTTTTCTTTGTCTCGGGGCTCT
TCTCTGTCTTGTCACTTGCGCTGGCCACATCGCTGCTGAAACCGTTAATTCTTGTTGTCT
TTACTTTTATATGGGATTCATCCTCTTGCTTATTATGATTCAAGGTGGTGTCGTTGCCGA
TACCTTTCTTAACCCTGACTGGAAACAGGACTTTCCAGATGATCCAAGTGGTGCCTTCAT
CCGTTTCTCTAAGTTCGTCGAGTCAAACTTCAAGATTTGCAGATGGATTGGTCTCTCCAT
TTTCTTTGTCCAGGGTGCATCAGTTCTATTGGCCATGTTGCTCAAAGCTCTTGGACCTCA
CCCGCATTATGACAGTGACGATGAATATGATTTGAGCACGGTTGCACTCCTACGTGATGC
TCGCCAGCCTCATCGTCCATACGTTGTTGGAGAACCCATTTATGGACCCAAACCGGATTC
CTGGACTGTTAGGATTAATGAAAGAGCCAACCGGTAAGAGAGATGGAGCCCAAGAGAAAG
CTGTGAGAAGCAAAGTAGCCAATAGTCACCTCTTTTATTTAGTATATATTACT****TTG
CTTCTTTGTTGCATCTATCTTATCTATCTCTCCCTCCAAAGTCCAACCAAACCACTATCC
CTTGTAAAAAAAATATTGCATACACATATGGGGATGTACTTATGCATTTTAAAAACTACA
ATATGTGATCACTTCAGACCCC
T

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2A508JQ 716 0 0
GTTCATTTATGCTTTTCTTTGTCTCGGGGCTCTTCTCTGTCTTGTCACTTGCGCTGGCCA
CATCGCTGCTGAAACCGTTAATTCTTGTTGTCTTTACTTTTATATGGGATTCATCCTCTT
GCTTATTATGATTCAAGGTGGTGTCGTTGCCGATACCTTTCTTAACCCTGACTGGAAACA
GGACTTTCCAGATGATCCAAGTGGTGCCTTCATCCGTTTCTCTAAGTTCGTTGAGTCGAA
CTTCAAGATTTGCAGATGGATTGGTCTCTCCATTTTCTTTGTCCAGGGTGCATCAGTTCT
ATTGGCCATGTTGCTCAAAGCTCTTGGACCTCACCCGCATTATGACAGTGACGATGAATA
TGATTTGAGCACGGTTGCACTCCTTCGTGATGCTCGCCAGCCTCATCGTCCATACGTTGT
TGGAGAACCCATTTATGGACCCAAACCGGATTCCTGGACTGTTAGGATTAATGAAAGAGC
CAACCGGTAAGAGAGATGGAGCCCAAGAGAAAGCTGTGAGAAGCAAAGTAGCCAATAGTC
ACCTCTTTTATTTAGTATATATTACTTACTTTGCTTCTTTGTTGCATCTATCTTATCTAT
CTCTCCCTTCAAAGTCCAACCAAACCACTATCCCTTGTAAAAAAAATATTGCATACACAT
ATGGGGATGTACTTATGCATTTTAAAAACTACAATATGTGATCACTTCAGACCCCC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 5

CO CL1666Contig1 492 5 3 U
GGAGAGACAGCTTATCTTAGCTTAGCTGTATTTATTTGTGGGCACAAGCCAAACTTTAAT
TCTACAGAATTTCTATCTCTGGTTGTTAGAAAGAGAAGAAAGAGAAGAGAGAAAAGGTAT
CCAAAGTAGGAAGGAAGAAGATGGGAGCATTTGAGGATCAGGTGAAGATGAGGGCGACAG
AGCTGAAGCATCTATTCAAGAAAAGTATCAAAGTCGTTGGCAAATCTTGCAAGAAGGGTT
GGTCCAAAGTCAAGAACCTTCGTCGCTAATCCCTCTTCTACTCCTCCTCCATCTTTGCGT
CTTGTGTTTTCTTTTTACTTCTTACATTAAAAAGTTTTGTCGTCTTCATACTTTTGTGGG
TTTTGCATTAATCCAAGTCTTCTCATCATTTTGTAATTTGTGTTTCCTCTTCGTTCTTTT
CTTCTTCGCCTTAATTACTTATTTTGGTTGGATGTGAACACCTTTTCCATCAGTGGATAA
GATCTACTTCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F574JQ C 1
AF RR2F574TF U 1
AF RR2DV94TF U 62
AF RR2CC64JQ C 191
AF RR2CC64TF U 191
BS 1 380 RR2F574TF
BS 381 398 RR2DV94TF
BS 399 492 RR2CC64TF

RD RR2F574JQ 380 0 0
GGAGAGACAGCTTATCTTAGCTTAGCTGTATTTATTTGTGGGCACAAGCCAAACTTTAAT
TCTACAGAATTTCTATCTCTGGTTGTTAGAAAGAGAAGAAAGAGAAGAGAGAAAAGGTAT
CCAAAGTAGGAAGGAAGAAGATGGGAGCATTTGAGGATCAGGTGAAGATGAGGGCGACAG
AGCTGAAGCATCTATTCAAGAAAAGTATCAAAGTCGTTGGCAAATCTTGCAAGAAGGGTT
GGTCCAAAGTCAAGAACCTTCGTCGCTAATCCCTCTTCTACTCCTCCTCCATCTTTGCGT
CTTGTGTTTTCTTTTTACTTCTTACATTAAAAAGTTTTGTCGTCTTCATACTTTTGTGGG
TTTTGCATTAATCCAAGTCT

QA 1 380 1 380
DS 

RD RR2F574TF 380 0 0
GGAGAGACAGCTTATCTTAGCTTAGCTGTATTTATTTGTGGGCACAAGCCAAACTTTAAT
TCTACAGAATTTCTATCTCTGGTTGTTAGAAAGAGAAGAAAGAGAAGAGAGAAAAGGTAT
CCAAAGTAGGAAGGAAGAAGATGGGAGCATTTGAGGATCAGGTGAAGATGAGGGCGACAG
AGCTGAAGCATCTATTCAAGAAAAGTATCAAAGTCGTTGGCAAATCTTGCAAGAAGGGTT
GGTCCAAAGTCAAGAACCTTCGTCGCTAATCCCTCTTCTACTCCTCCTCCATCTTTGCGT
CTTGTGTTTTCTTTTTACTTCTTACATTAAAAAGTTTTGTCGTCTTCATACTTTTGTGGG
TTTTGCATTAATCCAAGTCT

QA 1 380 1 380
DS 

RD RR2DV94TF 337 0 0
GG
ACAGAATTTCTATCTCTGGTTGTTAGAAAGAGAAGAAAGAGAAGAGAGAAAAGGTATCCA
AAGTAGGAAGGAAGAAGATGGGAGCATTTGAGGATCAGGTGAAGATGAGGGCGACAGAGC
TGAAGCATCTATTCAAGAAAAGTATCAAAGTCGTTGGCAAATCTTGCAAGAAGGGTTGGT
CCAAAGTCAAGAACCTTCGTCGCTAATCCCTCTTCTACTCCTCCTCCATCTTTGCGTCTT
GTGTTTTCTTTTTACTTCTTACATTAAAAAGTTTTGTCGTCTTCATACTTTTGTGGGTTT
TGCATTAATCCAAGTCTTCTCATCATTTTGTAATT

QA 3 337 3 337
DS 

RD RR2CC64JQ 218 0 0
G
CTATTCAAGAAAAGTATCAAAGTCGTTGGCAAATCTTGCAAGAAGGGTTGGTCCAAAGTC
AAGAACCTTCGTCGCTAATCCCTCTTCTACTCCTCCTCCATCTTTGCGTCTTGTGTTTTC
TTTTTACTTCTTACATTAAAAAGTTTTGTCGTCTTCATACTTTTGTGGGTTTTGCATTAA
TCCAAGTCTTCTCATCATTTTGTAATTTGTGTTTCCT

QA 2 218 2 218
DS 

RD RR2CC64TF 302 0 0
G
CTATTCAAGAAAAGTATCAAAGTCGTTGGCAAATCTTGCAAGAAGGGTTGGTCCAAAGTC
AAGAACCTTCGTCGCTAATCCCTCTTCTACTCCTCCTCCATCTTTGCGTCTTGTGTTTTC
TTTTTACTTCTTACATTAAAAAGTTTTGTCGTCTTCATACTTTTGTGGGTTTTGCATTAA
TCCAAGTCTTCTCATCATTTTGTAATTTGTGTTTCCTCTTCGTTCTTTTCTTCTTCGCCT
TAATTACTTATTTTGGTTGGATGTGAACACCTTTTCCATCAGTGGATAAGATCTACTTCT
T

QA 2 302 2 302
DS 



AS 1 5

CO CL1667Contig1 827 5 5 U
GGATAGCTCTCAACTCAATCAAACAAACAATCACAATCATGTCATCATTCCCATTGGTCT
CTTTTCTCGTCACTCTCCTGTTGGCTACAGCCGTCTGCACCCACGGACAAGAACTGGTGA
CAGACACCAACGGAAACATAGTTCGACTCAATGATCAATACTTCATCCAACCAGTCAATA
CCGGGAATAACGGAGGTGGTATTGTCCCACTTGCTTCTAAAATTTCCCTTTGTCTACTTG
GCATCACCCAAGCACTTCCGGACGAACCGGGCGTGCGGGTTAGCTTCTCCTTTCCACAGA
CGTTGATCCCTCCCATACCATTCACCCCTGTACTTACAAATGTCGATATAACCATCGAGT
TCAAGTCCAACATATGCAAGGAGTTCTCCAAGCTCTGGGAAGTCGATGCATCCGCACTGG
TTTCCGAAGAGCCTGCAATTCAAATCAATGGTAACCCGCGGCGAAGAAACAGCCGGTTTA
AGATAGAGAAAGTGGGAAAAGAAGGAAGAACAAACATTTACAGATTTACTACTTCTGATG
GAACCGTGGGAGCTGTCCCAGGGGCCTTGGAGAGTACACAGCTAGTTCTCACCAATGATG
TGGCTAAGACCATATTTGTCAAATTCATCAAATTTAATGCTGTTACTACCGATGTTGCTT
CTACTTCTCGTGTTGAGAAGTTAGGACTAAGGATGATTTTGTAATGTAAAAGCCAAAGAC
TCCGTCCATGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGATTAATACCCGCACGTACCCATGCACGTAA
ACTTTTTTTCTACTGTCAGGATAAGTAAAATATAAGCTATGTTTTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A027TF U 84
AF RR2GF64TF U 1
AF RR2F020TF U 1
AF RR2F020JQ C 97
AF RR2A027JQ C 238
BS 1 638 RR2F020TF
BS 639 639 RR2A027TF
BS 640 734 RR2F020TF
BS 735 762 RR2F020JQ
BS 763 827 RR2A027JQ

RD RR2A027TF 605 0 0
GCTG
CAGCCGTCTGCACCCACGGACAAGAACTGGTGACAGACACCAACGGAAACATAGTTCGAC
TCAATGATCAATACTTCATCCAACCAGTCAATACCGGGAATAACGGAGGTGGTATTGTCC
CACTTGCTTCTAAAATTTCCCTTTGTCTACTTGGCATCACCCAAGCACTTCCGGACGAAC
CGGGCGTGCGGGTTAGCTTCTCCTTTCCACAGACGTTGATCCCTCCCATACCATTCACCC
CTGTACTTACAAATGTCGATATAACCATCGAGTTCAAGTCCAACATATGCAAGGAGTTCT
CCAAGCTCTGGGAAGTCGATGCATCCGCACTGGTTTCCGAAGAGCCTGCAATTCAAATCA
ATGGTAACCCGCGGCGAAGAAACAGCCGGTTTAAGATAGAGAAAGTGGGAAAAGAAGGAA
GAACAAACATTTACAGATTTACTACTTCTGATGGAACCGTGGGAGCTGTCCCAGGGGCCT
TGGAGAGTACACAGCTAGTTCTCACCAATGATGTGGCTAAGACCATATTTGTCAAATTCA
TCAAATTTAATGCTGTTACTACCGATGTTGCTTCTACTTCTCGTGTTGAGAAGTTATGAC
T

QA 5 605 5 605
DS 

RD RR2GF64TF 686 0 0
GGATAGCTCTCAACTCAATCAAACAAACAATCACAATCATGTCATCATTCCCATTGGTCT
CTTTTCTCGTCACTCTCCTGTTGGCTGCAGCCGTCTGCACCCACGGACAAGAACTGGTGA
CAGACACCAACGGAAACATAGTTCGACTCAATGATCAATACTTCATCCAACCAGTCAATA
CCGGGAATAACGGAGGTGGTATTGTCCCACTTGCTTCTAAAATTTCCCTTTGTCTACTTG
GCATCACCCAAGCACTTCCGGACGAACCGGGCGTGCGGGTTAGCTTCTCCTTTCCACAGA
CGTTGATCCCTCCCATACCATTCACCCCTGTACTTACAAATGTCGATATAACCATCGAGT
TCAAGTCCAACATATGCAAGGAGTTCTCCAAGCTCTGGGAAGTCGATGCATCCGCACTGG
TTTCCGAAGAGCCTGCAATTCAAATCAATGGTAACCCGCGGCGAAGAAACAGCCGGTTTA
AGATAGAGAAAGTGGGAAAAGAAGGAAGAACAAACATTTACAGATTTACTACTTCTGATG
GAACCGTGGGAGCTGTCCCAGGGGCCTTGGAGAGTACACAGCTAGTTCTCACCAATGATG
TGGCTAAGACCATATTTGTCAAATTCATCAAATTTAATGCTGTTACTACCGATGTTGCTT
CTACTTCTCGTGTTGAGAAGT
AGGAC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2F020TF 734 0 0
GGATAGCTCTCAACTCAATCAAACAAACAATCACAATCATGTCATCATTCCCATTGGTCT
CTTTTCTCGTCACTCTCCTGTTGGCTACAGCCGTCTGCACCCACGGACAAGAACTGGTGA
CAGACACCAACGGAAACATAGTTCGACTCAATGATCAATACTTCATCCAACCAGTCAATA
CCGGGAATAACGGAGGTGGTATTGTCCCACTTGCTTCTAAAATTTCCCTTTGTCTACTTG
GCATCACCCAAGCACTTCCGGACGAACCGGGCGTGCGGGTTAGCTTCTCCTTTCCACAGA
CGTTGATCCCTCCCATACCATTCACCCCTGTACTTACAAATGTCGATATAACCATCGAGT
TCAAGTCCAACATATGCAAGGAGTTCTCCAAGCTCTGGGAAGTCGATGCATCCGCACTGG
TTTCCGAAGAGCCTGCAATTCAAATCAATGGTAACCCGCGGCGAAGAAACAGCCGGTTTA
AGATAGAGAAAGTGGGAAAAGAAGGAAGAACAAACATTTACAGATTTACTACTTCTGATG
GAACCGTGGGAGCTGTCCCAGGGGCCTTGGAGAGTACACAGCTAGTTCTCACCAATGATG
TGGCTAAGACCATATTTGTCAAATTCATCAAATTTAATTCTGTTACTACCGATGTTGCTT
CTACTTCTCGTGTTGAGAAGTTAGGACTAAGGATGATTTTGTAATGTAAAAGCCAAAGAC
TCCGTCCATGGCCA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2F020JQ 666 0 0
GCACCCACGGACAAGAACTGGTGACAGACACCAACGGAAACATAGTTCGACTCAATGATC
AATACTTCATCCAACCAGTCAATACCGGGAATAACGGAGGTGGTATTGTCCCACTTGCTT
CTAAAATTTCCCTTTGTCTACTTGGCATCACCCAAGCACTTCCGGACGAACCGGGCGTGC
GGGTTAGCTTCTCCTTTCCACAGACGTTGATCCCTCCCATACCATTCACCCCTGTACTTA
CAAATGTCGATATAACCATCGAGTTCAAGTCCAACATATGCAAGGAGTTCTCCAAGCTCT
GGGAAGTCGATGCATCCGCACTGGTTTCCGAAGAGCCTGCAATTCAAATCAATGGTAACC
CGCGGCGAAGAAACAGCCGGTTTAAGATAGAGAAAGTGGGAAAAGAAGGAAGAACAAACA
TTTACAGATTTACTACTTCTGATGGAACCGTGGGAGCTGTCCCAGGGGCCTTGGAGAGTA
CACAGCTAGTTCTCACCAATGATGTGGCTAAGACCATATTTGTCAAATTCATCAAATTTA
ATTCTGTTACTACCGATGTTGCTTCTACTTCTCGTGTTGAGAAGTTAGGACTAAGGATGA
TTTTGTAATGTAAAAGCCAAAGACTCCGTCCATGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGATTAAT
ACCCGC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2A027JQ 590 0 0
TTGGCATCACCCAAGCACTTCCGGACGAACCGGGCGTGCGGGTTAGCTTCTCCTTTCCAC
AGACGTTGATCCCTCCCATACCATTCACCCCTGTACTTACAAATGTCGATATAACCATCG
AGTTCAAGTCCAACATATGCAAGGAGTTTTCCAAGTTCTGGGAAGTCGATGCATCCGCAC
TGGTTTCCGAAGAGCCTGCAATTCAAATCAATGGTAACCCGCGGGGAAGAAACAGCCGGT
TTAAGATAGAGAAAGTGGGAAAAGAAGGAAGAACAAACATTTACAGATTTACTACTTCTG
ATGGAACCGTGGGAGCTGTCCCAGGGGCCTTGGAGAGTACACAGCTAGTTCTCACCAATG
ATGTGGCTAAGACCATATTTGTCAAATTCATCAAATTTAATGCTGTTACTACCGATGTTG
CTTCTACTTCTCGTGTTGAGAAGTTAGGACTAAGGATGATTTTGTAATGTAAAAGCCAAA
GACTCCGTCCATGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGATTAATACCCGCACGTACCCATGCACG
TAAACTTTTTTTCTACTGTCAGGATAAGTAAAATATAAGCTATGTTTTGA

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 4

CO CL1668Contig1 1284 4 24 U
GGAGACCTACTCCCATCTCATTTCTTATCTCCCTCTCTTCTTTTACGGCCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCCTTCTATTCTCTCGTTTTATTTGGTAGTGAGGATGGATATGTACAAAGATGA
TAGCTCACCATACTGTTATTTCCACCCGAAGGAAGAATATGTGGGAGTGTGTCCACTCTG
TTTGAACGAGAGGCTTCTGGTTTTAGCTTCAAAGCAGAGATCGTCAAGAACCAAACATTC
TTCATCTCCATCAATCATTAACCTCCCTAAGATCTTTGCCTTTAGCGCTCTCCTCAGTCG
CCTCGATCTCAGGCACCACCGGAAATTCAGTCCACCCTCCGATCTTGACGTCTCCACGAG
CCAAGAAGATTCTTTTATATCAATAAAATTTGAAAATGATGGAAACGCGTCGTGGGAAAA
GAAAACAGAGTGTGTAGACAACATCAACTCAACATGTAAGGAGCAGCAGTCCCTAATAAC
GAGCAGTACTAGTATCGTAGAGCGTAAAAGTGTCAAGTCATCTCTAAGGTGGCGCAAACG
TATTGGCCATCTTTTTCACGTCATTAAACTAAGATCAGGATTGTCCACCTCTTCTCGTCA
TGTAGCATCATCATCCAAGGTCGAAGGAACCAA*GTGAGGAAACAGGGTTGGATGGTGAG
GACCTTAACCAGAACAAAAGCCAGGAAAAGTAAAAATTGAATTTTTCATATATTTATTTA
CTACACCTAAAACAAATAATTTTTTGGTGTTTAAAAAAACAAATATTTTATATCGCTTTT
TTTTTAGTTTAATATTTGGTTTGGTCGTTTTGTCAATGATTGACGCTTCTGTTTAAAGAA
AAAAATATTTTGAAGTTTTTCTGTTGTAAGTAATGATAATGCTGGAAAATCCATAAATTA
AATTGTTGAATTGAATAGATTTTTGTAAAACTAGGTGTATTACATATAACCTTTTAGTTT
TTAACCAAATAATTTACATATAATTTCTAAAGCATATGTAAAAGGCACAAGAGGCTTGCC
ATGTACCATACTTGTTTGTTGGCTTGTGGTCTGTATCCGATAAAGCTTATTAAAAGATGG
GAGAAGGGTCAAAATAGCCTTTTATCATTATTTTAAAAATAATAGTATTTCACTTTTTCT
TGTTTAGTTTTAATGGTTTTCCTCGATTGGAGACTTCGTCTTTTCTAATGAGGGTTTTAT
CTCAGGAGGTTTGTAATCTGCCAGCAATGTATCTCGCCAATATCTTTCACATTTGTAATT
TGCCAGTGTTAATGAAATTTCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM17TF U 1
AF RR2CD02TF U 7
AF RR2AG40JQ C 664
AF RR2CD02JQ C 545
BS 1 73 RR2EM17TF
BS 74 74 RR2CD02TF
BS 75 225 RR2EM17TF
BS 226 226 RR2CD02TF
BS 227 260 RR2EM17TF
BS 261 261 RR2CD02TF
BS 262 355 RR2EM17TF
BS 356 356 RR2CD02TF
BS 357 673 RR2EM17TF
BS 674 674 RR2CD02JQ
BS 675 675 RR2AG40JQ
BS 676 679 RR2CD02JQ
BS 680 680 RR2AG40JQ
BS 681 704 RR2CD02JQ
BS 705 706 RR2AG40JQ
BS 707 844 RR2CD02JQ
BS 845 845 RR2AG40JQ
BS 846 909 RR2CD02JQ
BS 910 910 RR2AG40JQ
BS 911 1082 RR2CD02JQ
BS 1083 1083 RR2AG40JQ
BS 1084 1165 RR2CD02JQ
BS 1166 1166 RR2AG40JQ
BS 1167 1284 RR2CD02JQ

RD RR2EM17TF 673 0 0
GGAGACCTACTCCCATCTCATTTCTTATCTCCCTCTCTTCTTTTACGGCCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCCTTCTCTTCTCTCGTTTTATTTGGTAGTGAGGATGGATATGTACAAAGATGA
TAGCTCACCATACTGTTATTTCCACCCGAAGGAAGAATATGTGGGAGTGTGTCCACTCTG
TTTGAACGAGAGGCTTCTGGTTTTAGCTTCAAAGCAGAGATCGTCGAGAACCAAACATTC
TTCATCTCCATCAATCATTAGCCTCCCTAAGATCTTTGCCTTTAGCGCTCTCCTCAGTCG
CCTCGATCTCAGGCACCACCGGAAATTCAGTCCACCCTCCGATCTTGACGTCTCCGCGAG
CCAAGAAGATTCTTTTATATCAATAAAATTTGAAAATGATGGAAACGCGTCGTGGGAAAA
GAAAACAGAGTGTGTAGACAACATCAACTCAACATGTAAGGAGCAGCAGTCCCTAATAAC
GAGCAGTACTAGTATCGTAGAGCGTAAAAGTGTCAAGTCATCTCTAAGGTGGCGCAAACG
TATTGGCCATCTTTTTCACGTCATTAAACTAAGATCAGGATTGTCCACCTCTTCTCGTCA
TGTAGCATCATCATCCAAGGTCGAAGGAACCAA*GTGAGGAAACAGGGTTGGATGGTGAG
GACCTTAACCAGA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2CD02TF 668 0 0
GG
ACTCCCATCTCATTTCTTATCTCCCTCTCTTCTTTTACGGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
CTTCTATTCTCTCGTTTTATTTGGTAGTGAGGATGGATATGTACAAAGATGATAGCTCAC
CATACTGTTATTTCCACCCGAAGGAAGAATATGTGGGAGTGTGTCCACTCTGTTTGAACG
AGAGGCTTCTGGTTTTAGCTTCAAAGCAGAGATCGTCAAGAACCAAACATTCTTCATCTC
CATCAATCATTAACCTCCCTAAGATCTTTGCCTTTAGCGCTCTCCTCAGTCGCCTCGATC
TCAGGCACCACCGGAAATTCAGTCCACCCTCCGATCTTGACGTCTCCACGAGCCAAGAAG
ATTCTTTTATATCAATAAAATTTGAAAATGATGGAAACGCGTCGTGGGAAAAGAAAACAG
AGTGTGTAGACAACATCAACTCAACATGTAAGGAGCAGCAGTCCCTAATAACGAGCAGTA
CTAGTATCGTAGAGCGTAAAAGTGTCAAGTCATCTCTAAGGTGGCGCAAACGTATTGGCC
ATCTTTTTCACGTCATTAAACTAAGATCAGGATTGTCCACCTCTTCTCGTCATGTAGCAT
CATCATCCAAGGTCGAAGAACCAAA*GTGAGGAAACAGGGTTGGATGGTGAGGACCTTAA
CCAGA
A

QA 3 667 3 667
DS 

RD RR2AG40JQ 512 0 0
CTTAACCAGAACAAAAGCCAGGAAAAGTAAAAATTGAATTTTTCATATATTTATTTACTA
CACCTAAAACAAATAATTTTTTGGTGTTTAAAAAAACAAATATTT*ATATTGCTTTTTTT
TTAGTTTAATATTTGGTTTGGTCGTTTTGTCAATGATTGACGCTTCTGTTTAAAGAAAAA
AATATTTTGAAGTTTTTCTGTTGTAAGTAATGATAATGCTGGAAAATCCATAAATTAAAT
TGTTGAATTGAATAGATTTTTGTAAAACTAGGTGTATTACATATAATCTTTTAGTTTTTA
ACCAAATAATTTACATATAATTTTTAAAGCATATGTAAAAGGCACAAGAGGCTTGCCATG
TACCATACTTTTTTGTTGGCTTGTGGTCTGTATTTGATAAAGCTTATTAAAAGATGGGAG
AAGGGTCAAAATAGCCTTTTTTCATTATTTTAAAAATAATAGTATTTCACTTTTTCTTGT
TTAGTTTTAATGGTTTTCCTCGATTGGAGACT

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2CD02JQ 740 0 0
TGGCCATC
TTTTCACGTCATTAAACTAAGATCAGGATTGTCCACCTCTTCTCGTCATGTAGCATCATC
ATCCAAGGTCGAAGGAACCAAAGTGAGGAAACAGGGTTGGATGGTGAGGACCTTAACCAG
AAGAAAATCCAGGAAAAGTAAAAATTGAATTT**CATATATTTATTTACTACACCTAAAA
CAAATAATTTTTTGGTGTTTAAAAAAACAAATATTTTATATCGCTTTTTTTTTAGTTTAA
TATTTGGTTTGGTCGTTTTGTCAATGATTGACGCTTCTGTTTAAAGAAAAAA*TATTTTG
AAGTTTTTCTGTTGTAAGTAATGATAATGCTGGAAAATCCATAAATTAAATTGTTGAGTT
GAATAGATTTTTGTAAAACTAGGTGTATTACATATAACCTTTTAGTTTTTAACCAAATAA
TTTACATATAATTTCTAAAGCATATGTAAAAGGCACAAGAGGCTTGCCATGTACCATACT
TGTTTGTTGGCTTGTGGTCTGTATCCGATAAAGCTTATTAAAAGATGGGA*AAGGGTCAA
AATAGCCTTTTATCATTATTTTAAAAATAATAGTATTTCACTTTTTCTTGTTTAGTTTTA
ATGGTTTTCCTCGGTTGGAGACTTCGTCTTTTCTAATGAGGGTTTTATCTCAGGAGGTTT
GTAATCTGCCAGCAATGTATCTCGCCAATATCTTTCACATTTGTAATTTGCCAGTGTTAA
TGAAATTTCAGT

QA 9 740 9 740
DS 



AS 2 5

CO CL1669Contig1 682 3 3 U
GAAGTTCTTGTTGCTGAGAATAAGAAAACACCTGATACCTCTCCTACAAGAAGATCTACT
AGCTCCAACCCAGCAGATGACTTCTCTCTAAATGAAGCGAAAGATGATCAAGCAGATGCT
TCAGAAGAAGAGGAGCCTGAAGTGAAACAGGAGGAAACAGAAGAGCAAGATGAATCTGTG
ATAGATCCAAGTGGAGCAACTTTCACTTACGAACAGCTGAAAGCCAATTCTGAGAACCCA
GTGACTGGAATAGATTACAAGCGCAGAGAGGCTTATCTATCTGAGGAAGAGTTCCCAAGT
GTGTTTGGGATGGAGAAAGAAGCATTCAACAACTTACCTCGCTGGAAGCAAGATCTGCTT
AAGAAGAAGTTTGACTTGTTCTAGAACACTCAAACACCAATGGGGAAAACAACATATCAC
ACATCATTCGTGCACCGTCCTGCAAATTCATTTTATACTAAAGTCACTGAATGTGGTCAG
TCAGTTTGTCGTTGGTTTGAAGAGTGATCTTCTTTTTTTTTTGGTTTTATCTTCTTCAAT
TTTTGTTTACTTTTTGTCTCATGGTTTGGTTTGGGTTTGGTTATTAATATTTTTTTACAG
CACAATCATATATCTTGTAATGATGATCATAGTTTGTAATGATTGTTTTACCCCAGACAG
ATTTGTGGTTGTGGGTTAAAAA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF41JQ C 1
AF RR2AF41TF U 1
AF RR2EP36TF U 54
BS 1 1 RR2AF41JQ
BS 2 596 RR2AF41TF
BS 597 682 RR2EP36TF

RD RR2AF41JQ 601 0 0
GAAGTTCTTGTTGCTGAGAATAAGAAAACACCTGATACCTTTCCTACAAGAAGATCTACT
AGCTCCAACCCAGCAGATGACTTCTCTCTAAATGAAGCGAAAGATGATCAAGCAGATGCT
TCAGAAGAAGAGGAGCCTGAAGTGAAACAGGAGGAAACAGAAGAGCAAGATGAATCTGTG
ATAGATCCAAGTGGAGCAACTTTCACTTACGAACAGCTGAAAGCCAATTCTGAGAACCCA
GTGACTGGAATAGATTACAAGCGCAGAGAGGCTTATCTATCTGAGGAAGAGTTCCCAAGT
GTGTTTGGGATGGAGAAAGAAGCATTCAACAACTTACCTCGCTGGAAGCAAGATCTGCTT
AAGAAGAAGTTTGACTTGTTCTAGAACACTCAAACACCAATGGGGAAAACAACATATCAC
ACATCATTCGTGCACCGTCCTGCAAATTCATTTTATACTAAAGTCACTGAATGTGGTCAG
TCAGTTTGTCGTTGGTTTGAAGAGTGATCTTCTTTTTTTTTTGGTTTTATCTTCTTCAAT
TTTTGTTTACTTTTTGTCTCATGGTTTGGTTTGGGTTTGGTTATTAATATTTTTTT
ACAGC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2AF41TF 602 0 0
G
AAGTTCTTGTTGCTGAGAATAAGAAAACACCTGATACCTCTCCTACAAGAAGATCTACTA
GCTCCAACCCAGCAGATGACTTCTCTCTAAATGAAGCGAAAGATGATCAAGCAGATGCTT
CAGAAGAAGAGGAGCCTGAAGTGAAACAGGAGGAAACAGAAGAGCAAGATGAATCTGTGA
TAGATCCAAGTGGAGCAACTTTCACTTACGAACAGCTGAAAGCCAATTCTGAGAACCCAG
TGACTGGAATAGATTACAAGCGCAGAGAGGCTTATCTATCTGAGGAAGAGTTCCCAAGTG
TGTTTGGGATGGAGAAAGAAGCATTCAACAACTTACCTCGCTGGAAGCAAGATCTGCTTA
AGAAGAAGTTTGACTTGTTCTAGAACACTCAAACACCAATGGGGAAAACAACATATCACA
CATCATTCGTGCACCGTCCTGCAAATTCATTTTATACTAAAGTCACTGAATGTGGTCAGT
CAGTTTGTCGTTGGTTTGAAGAGTGATCTTCTTTTTTTTTTGGTTTTATCTTCTTCAATT
TTTGTTTACTTTTTGTCTCATGGTTTGGTTTGGGTTTGGTTATTAATATTTTTTT
TACAGC

QA 2 596 2 596
DS 

RD RR2EP36TF 629 0 0
G
TCTACTAGCTCCAACCCAGCAGATGACTTCTCTCTAAATGAAGCGAAAGATGATCAAGCA
GATGCTTCAGAAGAAGAGGAGCCTGAAGTGAAACAGGAGGAAACAGAAGAGCAAGATGAA
TCTGTGATAGATCCAAGTGGAGCAACTTTCACTTACGAACAGCTGAAAGCCAATTCTGAG
AACCCAGTGACTGGAATAGATTACAAGCGCAGAGAGGCTTATCTATCTGAGGAAGAGTTC
CCAAGTGTGTTTGGGATGGAGAAAGAAGCATTCAACAACTTACCTCGTTGGAAGCAAGAT
CTGCTTAAGAAGAAGTTTGACTTGTTCTAGAACACTCAAACACCAATGGGGAAAACAACA
TATCACACATCATTCGTGCACCGTCCTGCAAATTCATTTTATACTAAAGTCACTGAATGT
GGTCAGTCAGTTTGTCGTTGGTTTGAAGAGTGATCTTCTTTTTTTTTTGGTTTTATCTTC
TTCAATTTTTGTTTACTTTTTGTCTCATGGTTTGGTTTGGGTTTGGTTATTAATATTTTT
TTACAGCACAATCATATATCTTGTAATGATGATCATAGTTTGTAATGATTGTTTTACCCC
AGACAGATTTGTGGTTGTGGGTTAAAAA

QA 2 629 2 629
DS 



CO CL1669Contig2 1003 2 6 U
GGAAAAAAGCAGCCTTGTTATTTGGCACTCACCACGTTGTAGAGGACAAGTCTAGCGGTG
GTGGACCAAGGCAAAGAGCTGAGGCACTAGCTGCCTTAAATTCTGCCTTTAATTCTTCTT
CTAGCAGACCTGCCTATTCGAGTCAGGACAGATCAAGCGAAAGTCAAGAGGGTCCACGAC
AAAGAGCTGAAGCTTTAGCAGCCTTGACATCTGCTTTTAGTTCGTCATCGACCAAAGCGC
CTCCACCACCAAGGTCAGTGTGGACGAGTCAGGCTTCACAGAGAGCAGCAGCAGTGGCTG
CTCTCTCTCAAGTTCTCGTTGCTGAGAATAAGAAAACACCTGATACCTCTCCTACAAGAA
GATCTACTAGCTCCAACCCAGCAGATGACTCCTCTCTAACTGAGGCCAAAGATGATCAAG
CAGATGCTTCAGAAGGAGAGGAGCCTGAAGTGAAACAGGAGGAAACAGAAGAGCAAGATG
AATCTGTGATAGATCCAAGTGGAGCAACTTTCACTTACGAGCAGCTGAAAGCTAATTCTG
AGGACCCTGTGACTGGAATAGATAACAAGCGCAGAGAGGCTTATCTATCTGAGGAAGAGT
TCCAAAGTGTGTTTGGGATGGAGAAAGAAGCATTCAACAACTTACCACGTTGGAAGCAAG
ATCTGCTTAAGAAGAAGTTTGACTTGTTCTAGAACACTCAAACGCCAATGGAAAAACAAC
ATCTCACACATCTTTCTTGGCACCGTCCTGCAAATTCATTTTATACCAAAGTCACTGAAT
GTGGTCAGTCAGTTTGTTGTTGGTTTGAAGAGTGTTTTCATATTTTTTTTGGTTTATTTT
CAATTTTATTTACTTTTCTCTCATGGGTTGGTTTGAGTTTGATTTTTAATATTTTTTTTT
TAAAGCACAATCATATATCTTTGTAATGATGATCATTGTTTGTAATGATTGCTTTACCCG
AGACAAATTTGTGGTTGTGGGTTAAAAAAATTCTTTGATTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ07TF U 1
AF RR2GJ07JQB C 395
BS 1 715 RR2GJ07TF
BS 716 716 RR2GJ07JQB
BS 717 766 RR2GJ07TF
BS 767 767 RR2GJ07JQB
BS 768 794 RR2GJ07TF
BS 795 1003 RR2GJ07JQB

RD RR2GJ07TF 794 0 0
GGAAAAAAGCAGCCTTGTTATTTGGCACTCACCACGTTGTAGAGGACAAGTCTAGCGGTG
GTGGACCAAGGCAAAGAGCTGAGGCACTAGCTGCCTTAAATTCTGCCTTTAATTCTTCTT
CTAGCAGACCTGCCTATTCGAGTCAGGACAGATCAAGCGAAAGTCAAGAGGGTCCACGAC
AAAGAGCTGAAGCTTTAGCAGCCTTGACATCTGCTTTTAGTTCGTCATCGACCAAAGCGC
CTCCACCACCAAGGTCAGTGTGGACGAGTCAGGCTTCACAGAGAGCAGCAGCAGTGGCTG
CTCTCTCTCAAGTTCTCGTTGCTGAGAATAAGAAAACACCTGATACCTCTCCTACAAGAA
GATCTACTAGCTCCAACCCAGCAGATGACTCCTCTCTAACTGAGGCCAAAGATGATCAAG
CAGATGCTTCAGAAGGAGAGGAGCCTGAAGTGAAACAGGAGGAAACAGAAGAGCAAGATG
AATCTGTGATAGATCCAAGTGGAGCAACTTTCACTTACGAGCAGCTGAAAGCTAATTCTG
AGGACCCTGTGACTGGAATAGATAACAAGCGCAGAGAGGCTTATCTATCTGAGGAAGAGT
TCCAAAGTGTGTTTGGGATGGAGAAAGAAGCATTCAACAACTTACCACGTTGGAAGCAAG
ATCTGCTTAAGAAGAAGTTTGACTTGTTCTAGAACACTCAAACGCCAATGGAAAA*CAAC
ATCTCACACATCTTTCTTGGCACCGTCCTGCAAATTCATTTTATAC*AAAGTCACTGAAT
GTGGTCAGTCAGTT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2GJ07JQB 609 0 0
TCTAACTGAGGCC
AAAGATGATCAAGCAGATGCTTCAGAAGGAGAGGAGCCTGAAGTGAAACAGGAGGAAACA
GAAGAGCAAGATGAATCTGTGATAGATCCAAGTGGAGCAACTTTCACTTACGAGCAGCTG
AAAGCTAATTTTGAGGACCCTGTGACTGGAATAGATAACAAGCGCAGAGAGGCTTATCTA
TTTGAGGAAGAGTTCCAAAGTGTGTTTGGGATGGAGAAAGAAGCATTCAACAACTTACCA
CGTTGGAAGCAAGATTTGCTTAAGAAGAAGTTTGACTTGTTTTAGAACACTCAAACGCCA
ATGGAAAAACAACATTTCACACATCTTTCTTGGCACCGTCCTGCAAATTCATTTTATACC
AAAGTCACTGAATGTGGTCAGTCAGTTTGTTGTTGGTTTGAAGAGTGTTTTCATATTTTT
TTTGGTTTATTTTCAATTTTATTTACTTTTCTCTCATGGGTTGGTTTGAGTTTGATTTTT
AATATTTTTTTTTTAAAGCACAATCATATATCTTTGTAATGATGATCATTGTTTGTAATG
ATTGCTTTACCCGAGACAAATTTGTGGTTGTGGGTTAAAAAAATTCTTTGATTTGG

QA 14 609 14 609
DS 



AS 2 5

CO CL1670Contig1 759 2 12 U
AACTAAATGATAATGTAGTTCCTTGGCTGAAATGCTTAAAGATCCAGTCACCGAACAAAC
TCTCTAAGGCACTAACACGATTTCAATATCCAAAATCCTCCAACAATATTATCACAAATC
ATAAATTCATGTACATAAAAGACTTAAGTGTATGCTTAATGCTCACACATCATTTCAGCT
CTTCATGGCTTAACATATTCTCTGATGAACTCTCGCACTTGCTCTGTTTCTCCTGTTAGT
CCAGATGCTTCAGCGACAGTGACTTTGTTCAAGCAGTGCGAAAAGGAAAACACTTCTCCT
TCAATCCCAAGAGTAAAGTCATTGGCTATGTCAGCTGTTGAAACCGCACTCCTCGAAACC
CTAAGTTTCTCTATTTCTTTCTCCATCTGCTTGCGGATGAACTCTTTTGTGTGTGCAGTT
ATTTTATCTGTCTTGCTGCAGCATAGCAGGACTGGGATCTTATTCTTAACCACGCTTACA
TTGGTAAGAATGTCGTAAAGGTACTCTGAAGCTGCACGACAATTTGGGAGGAACTCAAGT
GCATCTACTACAAACACAATAGCGGCTGCTCGTGGCAAGTACTCTTCTAGATTAGATCTA
AGCCGAGAGTGCCCAGGAACATCAACTAGATGAACGGGCTTCGTTTTATTAGTGTTTTCA
GTGTGGAGCACGAAGGTGCCTTCGTTAGGTTCCATTGACGTCACAGAACCCTGATGAGAA
GATCCATCTCGGAGTTGATAGAAGAGAACGGTTTTGCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB56JQ U 1
AF RR2H063JQ U 68
BS 1 114 RR2FB56JQ
BS 115 115 RR2H063JQ
BS 116 435 RR2FB56JQ
BS 436 436 RR2H063JQ
BS 437 477 RR2FB56JQ
BS 478 478 RR2H063JQ
BS 479 590 RR2FB56JQ
BS 591 591 RR2H063JQ
BS 592 602 RR2FB56JQ
BS 603 603 RR2H063JQ
BS 604 735 RR2FB56JQ
BS 736 759 RR2H063JQ

RD RR2FB56JQ 735 0 0
AACTAAATGATAATGTAGTTCCTTGGCTGAAATGCTTAAAGATCCAGTCACCGAACAAAC
TCTCTAAGGCACTAACACGATTTCAATATCCAAAATCCTCCAACAATATTATCAGAAATC
ATAAATTCATGTACATAAAAGACTTAAGTGTATGCTTAATGCTCACACATCATTTCAGCT
CTTCATGGCTTAACATATTCTCTGATGAACTCTCGCACTTGCTCTGTTTCTCCTGTTAGT
CCAGATGCTTCAGCGACAGTGACTTTGTTCAAGCAGTGCGAAAAGGAAAACACTTCTCCT
TCAATCCCAAGAGTAAAGTCATTGGCTATGTCAGCTGTTGAAACCGCACTCCTCGAAACC
CTAAGTTTCTCTATTTCTTTCTCCATCTGCTTGCGGATGAACTCTTTTGTGTGTGCAGTT
ATTTTATCTGTCTTGTTGCAGCATAGCAGGACTGGGATCTTATTCTTAACCACGCTTGCA
TTGGTAAGAATGTCGTAAAGGTACTCTGAAGCTGCACGACAATTTGGGAGGAACTCAAGT
GCATCTACTACAAACACAATAGCGGCTGCTCGTGGCAAGTACTCTTCTAGCTTAGATCTA
AGTCGAGAGTGCCCAGGAACATCAACTAGATGAACGGGCTTCGTTTTATTAGTGTTTTCA
GTGTGGAGCACGAAGGTGCCTTCGTTAGGTTCCATTGACGTCACAGAACCCTGATGAGAA
GATCCATCTCGGAGT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2H063JQ 692 0 0
GGCACTAACACGATTTCAATATCCAAAATCCTCCAACAATATTATCACAAATCATAAATT
CATGTACATAAAAGACTTAAGTGTATGCTTAATGCTCACACATCATTTCAGCTCTTCATG
GCTTAACATATTCTCTGATGAACTCTTGCACTTGCTCTGTTTCTCCTGTTAGTCCAGATG
CTTCAGCGTCAGTGACTTTGTTCAAGCAGTGCGAAAAGGAAAACACTTCTCCTTCAATCC
CAAGAGTAAAGTCATTGGCTATGTCAGCTGTTGAAACCGCACTCCTCGAAACCCTAAGTT
TCTCTATTTCTTTCTCCATCTGCTTGCGGATGAACTCTTTTGTGTGTGCAGTTATTTTAT
CTGTCTTGCTGCAGCATAGCAGGACTGGGATCTTATTCTTAACCACGCTTACATTGGTAA
GAATGTCGTAAAGGTACTCTGAAGCTGCACGACAATTTGGGAGGAACTCAAGTGCGTCTA
CTACAAACACAATAGCGGCTGCTCGTGGCAAGTACTCTTCTAGATTAGATCTAAGCCGAG
AGTGCCCAGGAACATCAACTAGATGAACGGGCTTCGTTTTATTAGTGTTTTCAGTGTGGA
GCACGAAGGTGCCTTCGTTAGGTTCCATTGACGTCACAGAACCCTGATGAGAAGATCCAT
CTCGGAGTTGATAGAAGAGAACGGTTTTGCCA

QA 1 692 1 692
DS 



CO CL1670Contig2 729 3 2 U
GGGATTCACATCTTCAGAACGAATCTCTCATCGTCACGTAGGACAGACAGACAGTCTCCA
TCTCTTCGACTCCTGCCGAGCTTCTCATCAGTG****AACAAAAAAAGCGGAAACGAAAA
TGGAGAAGAACTTGGAGGATTTGAGAATTGTGGGGGAGCAATGGTTGAATCAAGGAACTG
AATTTGTTCAACAGATACCACAGGACCAGCTTTATGCTGCTATTGGTGTTCTCTTATTAA
CTACCATCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTCTATTCGCTTGTTCAGACGTACCAAGGCCAATA
CTGTACTCCTCTCTGGCCTAAGCGGAAGTGGCAAAACCGTTCTCTTCTATCAACTCCGAG
ATGGATCTTCTCATCAGGGTTCTGTGACGTCAATGGAACCTAACGAAGGCACCTTCGTGC
TCCACACTGAAAACACTAATAAAACGAAGCCCGTTCATCTAGTTGATGTTCCTGGGCACT
CTCGGCTTAGATCTAAGCTAGAAGAGTACTTGCCACGAGCAGCCGCTATTGTGTTTGTAG
TAGATGCACTTGAGTTCCTCCCAAATTGTCGTGCAGCTTCAGAGTACCTCTACGACATTC
TTACCAATGCAAGCGTGGTTAAGAATAAGATCCCAGTCCTGCTATGCTGCAACAAGACAG
ATAAAATAACTGCACACACAAAAGAGT*CATCCGCAAGCAGATGGAGAAGAAATAGAGAA
ACTTAGGTG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 0 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 

AF RR2H063TF U 28
AF RR2G089TF U 1
AF RR2FB56TF U 3
BS 1 725 RR2G089TF
BS 726 729 RR2FB56TF

RD RR2H063TF 694 0 0
GG
ATCGTCACGTAGGACAGACAGACAGTGTCCATCTCTTCGACTCCTGCCGAGCTTCTCATC
AGTGAGTGAACAAAAAAAGCGGAAACGAAAATGGAGAAGAACTTGGAGGATTTGAGAATT
GTGGGGGAGCAATGGTTGAATCAAGGAACTGAATTTGTTCAACAGATACCACAGGACCAG
CTTTATGCTGCTATTGGTGTTCTCTTATTAACTACCATCTTCTTGCTCTTCTTCTTCTCT
ATTCGCTTGTTCAGACGTACCAAGGCCAATACTGTACTCCTCTCTGGCCTAAGCGGAAGT
GGCAAAACCGTTCTCTTCTATCAACTCCGAGATGGATCTTCTCATCAGGGTTCTGTGACG
TCAATGGAACCTAACGAAGGCACCTTCGTGCTCCACACTGAAAACACTAATAAAACGAAG
CCCGTTCATCTAGTTGATGTTCCTGGGCACTCTCGGCTTAGATCTAATCTAGAAGAGTAC
TTGCCACGAGCAGCCGCTATTGTGTTTGTAGTAGACGCACTTGAGTTCCTCCCAAATTGT
CGTGCAGCTTCAGAGTACCTCTACGACATTCTTACCAATGTAAGCGTGGTTAAGAATAAG
ATCCCAGTCCTGCTATGCTGCAGCAAGACAGATAAAATAACTGCACACACAAAAGAGTTC
ATCCGCAAGCAGATGGAGAAAGAA
TAGAGAAC

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR2G089TF 725 0 0
GGGATTCACATCTTCAGAACGAATCTCTCATCGTCACGTAGGACAGACAGACAGTCTCCA
TCTCTTCGACTCCTGCCGAGCTTCTCATCAGTG****AACAAAAAAAGCGGAAACGAAAA
TGGAGAAGAACTTGGAGGATTTGAGAATTGTGGGGGAGCAATGGTTGAATCAAGGAACTG
AATTTGTTCAACAGATACCACAGGACCAGCTTTATGCTGCTATTGGTGTTCTCTTATTAA
CTACCATCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTCTATTCGCTTGTTCAGACGTACCAAGGCCAATA
CTGTACTCCTCTCTGGCCTAAGCGGAAGTGGCAAAACCGTTCTCTTCTATCAACTCCGAG
ATGGATCTTCTCATCAGGGTTCTGTGACGTCAATGGAACCTAACGAAGGCACCTTCGTGC
TCCACACTGAAAACACTAATAAAACGAAGCCCGTTCATCTAGTTGATGTTCCTGGGCACT
CTCGGCTTAGATCTAAGCTAGAAGAGTACTTGCCACGAGCAGCCGCTATTGTGTTTGTAG
TAGATGCACTTGAGTTCCTCCCAAATTGTCGTGCAGCTTCAGAGTACCTCTACGACATTC
TTACCAATGCAAGCGTGGTTAAGAATAAGATCCCAGTCCTGCTATGCTGCAACAAGACAG
ATAAAATAACTGCACACACAAAAGAGT*CATCCGCAAGCAGATGGAGAAGAAATAGAGAA
ACTTA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2FB56TF 727 0 0
GATTCACATCTTCAGAACGAATCTCTCATCGTCACGTAGGACAGACAGACAGTCTCCATC
TCTTCGACTCCTGCCGAGCTTCTCATCAGTG****AACAAAAAAAGCGGAAACGAAAATG
GAGAAGAACTTGGAGGATTTGAGAATTGTGGGGGAGCAATGGTTGAATCAAGGAACTGAA
TTTGTTCAACAGATACCACAGGACCAGCTTTATGCTGCTATTGGTGTTCTCTTATTAACT
ACCATCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTCTATTCGCTTGTTCAGACGTACCAAGGCCAATACT
GTACTCCTCTCTGGCCTAAGCGGAAGTGGCAAAACCGTTCTCTTCTATCAACTCCGAGAT
GGATCTTCTCATCAGGGTTCTGTGACGTCAATGGAACCTAACGAAGGCACCTTCGTGCTC
CACACTGAAAACACTAATAAAACGAAGCCCGTTCATCTAGTTGATGTTCCTGGGCACTCT
CGACTTAGATCTAAGCTAGAAGAGTACTTGCCACGAGCAGCCGCTATTGTGTTTGTAGTA
GATGCACTTGAGTTCCTCCCAAATTGTCGTGCAGCTTCAGAGTACCTCTACGACATTCTT
ACCAATGCAAGCGTGGTTAAGAATAAGATCCCAGTCCTGCTATGCTGCAACAAGACAGAT
AAA*TAACTGCACACACAAAAGAGT*CATCCGCAAGCAGATGGAGAAG*AATAGAGAAAC
TTAGGTG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 5

CO CL1671Contig1 835 5 37 U
GGAAAGCAGCGTTTCTTTAATGCATTGTTAGGTTGACACCTTTGAAGGTGCCGCGGCGAC
CCAATCAATCCTAACTCTCTTATATTTAAAAGCTATAATCTTTCCGACAATCTTTGTCTC
CCCTCTCTTTCTGAGATTTACGATGTCAACACCAGCGAGGAAGAGGCTTATGAGGGATTT
CAGGAGGTTGCAGCAAGATCCTCCTGCCGGTATCAGCGGTGCTCCTCATGACAACAACAT
CTTGCTCTGGAACGCTGTTATCTTCGGTCCAGATGATACACCTTGGGATGGAGGTACTTT
TAAGTTGACTCTTCAATTCACAGAGGATTATCCAAACAAACCACCAACTGTTCGTTTTGT
TTCTCGCATGTTTCACCCAAACATCTATGCAGATGGGAGTATCTGTCTTGATATCTTACA
GAACCAGTGGAGTCCTATCTATGATGTGGCAGCGATTCTTACATCTATACAGTCACTCCT
CTGTGATCCCAACCCAAACTCGCCTGCAAACTCAGAAGCTGCTCGATTGTTCAGCGAGAG
CAAGCGAGAGTACAACAGACGTGTTAAGGAGATTGTCGAACAGAGCTGGACCGCTGATTA
ATAAGTCACACCCCAGTTTGTAATATTTGAAGTGGAGGAGGCCTATCAAATTGGTTAAAA
ACAGTTTGTTTGTTACATGCCTCCAGTTCAAATATATGTAATTTAATTGCTGTATGAACC
TATATATCACATTTTCCTGATAAGACAATCTTGCTTGCTTCTAAGTTGTGTGTATGTAAA
CTTTTTTAAGAATCTTGTCCATGTTCATCAATAGCACCACCATTCCTTTTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 10 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD20TF U 1
AF RR2D732TF U 22
AF RR2GE77TF U 39
AF RR2AJ36TF U 116
AF RR2D732JQ C 251
BS 1 129 RR2CD20TF
BS 130 130 RR2D732TF
BS 131 168 RR2CD20TF
BS 169 169 RR2D732TF
BS 170 193 RR2CD20TF
BS 194 194 RR2D732TF
BS 195 216 RR2CD20TF
BS 217 217 RR2D732TF
BS 218 279 RR2CD20TF
BS 280 280 RR2D732TF
BS 281 315 RR2CD20TF
BS 316 316 RR2D732TF
BS 317 447 RR2CD20TF
BS 448 448 RR2D732TF
BS 449 450 RR2CD20TF
BS 451 451 RR2D732TF
BS 452 453 RR2CD20TF
BS 454 454 RR2D732TF
BS 455 468 RR2CD20TF
BS 469 469 RR2D732TF
BS 470 474 RR2CD20TF
BS 475 475 RR2D732TF
BS 476 507 RR2CD20TF
BS 508 508 RR2D732TF
BS 509 660 RR2CD20TF
BS 661 661 RR2D732TF
BS 662 727 RR2CD20TF
BS 728 729 RR2D732TF
BS 730 734 RR2CD20TF
BS 735 735 RR2D732TF
BS 736 742 RR2CD20TF
BS 743 743 RR2D732TF
BS 744 747 RR2CD20TF
BS 748 748 RR2AJ36TF
BS 749 777 RR2D732TF
BS 778 824 RR2AJ36TF
BS 825 835 RR2D732JQ

RD RR2CD20TF 754 0 0
GGAAAGCAGCGTTTCTTTAATGCATTGTTAGGTTGACACCTTTGAAGGTGCCGCGGCGAC
CCAATCAATCCTAACTCTCTTATATTTAAAAGCTATAATCTTTCCGACAATCTTTGTCTC
CCCTCTCTT*CTGAGATTTACGATGTCAACACCAGCGAGGAAGAGGCTCATGAGGGATTT
CAGGAGGTTGCAGTAAGATCCTCCTGCCGGTATCAGTGGTGCTCCTCATGACAACAACAT
CTTGCTCTGGAACGCTGTTATCTTCGGTCCAGATGATACGCCTTGGGATGGAGGTACTTT
TAAGTTGACTCTTCAGTTCACAGAGGATTATCCAAACAAACCACCAACTGTTCGTTTTGT
TTCTCGCATGTTTCACCCAAACATCTATGCAGATGGGAGTATCTGTCTTGATATCTTACA
GAACCAGTGGAGTCCTATCTATGATGTCGCTGCCATTCTTACATCTATCCAGTCGCTCCT
CTGTGATCCCAACCCAAACTCGCCTGCGAACTCAGAAGCTGCTCGATTGTTCAGCGAGAG
CAAGCGAGAGTACAACAGACGTGTTAAGGAGATTGTCGAACAGAGCTGGACCGCTGATTA
ATAAGTCACACCCCAGTTTGTAATATTTGAAGTGGAGGAGGCCTATCAAATTGGTTAAAA
*CAGTTTGTTTGTTACATGCCTCCAGTTCAAATATATGTAATTTAATTGCTGTATGAACC
TATATATTGCATTT*CCTGATA*GACA
TCTTGCT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2D732TF 756 0 0
GGATA
GTTAGGTTGACACCTTTGAAGGTGCCGCGGCGACCCAATCAATCCTAACTCTCTTTTATT
TAAAAGCTATAATCTTTCCGACAATCTTTGTCTCCCCTCTCTTTCTGAGATTTACGATGT
CAACACCAGCGAGGAAGAGGCTTATGAGGGATTTCAGGAGGTTGCAGCAAGATCCTCCTG
CCGGTATCAGCGGTGCTCCTCATGACAACAACATCTTGCTCTGGAACGCTGTTATCTTCG
GTCCAGATGATACACCTTGGGATGGAGGTACTTTTAAGTTGACTCTTCAATTCACAGAGG
ATTATCCAAACAAACCACCAACTGTTCGTTTTGTTTCTCGCATGTTTCACCCAAACATCT
ATGCAGATGGGAGTATCTGTCTTGATATCTTACAGAACCAGTGGAGTCCTATCTATGATG
TGGCAGCGATTCTTACATCTATACAGTCACTCCTCTGTGATCCCAACCCAAACTCGCCTG
CAAACTCAGAAGCTGCTCGATTGTTCAGCGAGAGCAAGCGAGAGTACAACAGACGTGTTA
AGGAGATTGTCGAACAGAGCTGGACCGCTGATTAATAAGTCACACCCCAGTTTGTAATAT
TTGAAGTGGAGGAGGCCTATCAAATTGGTTAAAAACAGTTTGTTTGTTACATGCCTCCAG
TTCAAATATATGTAATTTAATTGCTGTATGAACCTATATATCACATTTTCCTGATAAGAC
A*TCTTGCTTGCTTCTAAGTTGTGTGTATGT

QA 6 756 6 756
DS 

RD RR2GE77TF 717 0 0
G
CTTTGAAGGTGCCGCGGCGACCCAATCAATCCTAACTCTCTTATATTTAAAAGCTATAAT
CTTTCCGACAATCTTTGTCTCCCCTCTCTT*CTGAGATTTACGATGTCAACACCAGCGAG
GAAGAGGCTTATGAGGGATTTCAGGAGGTTGCAGCAAGATCCTCCTGCCGGTATCAGTGG
TGCTCCTCATGACAACAACATCTTGCTCTGGATCGCTGTTATCTTCGGTCCAGATGATAC
GCCTTGGGATGGAGGTACTTTTAAGTTGACTCTTCAGTTCACAGAGGATTATCCAAACAA
ACCACCAACTGTTCGTTTTGTTTCTCGCATGTTTCACCCAAACATCTATGCAGATGGGAG
TATCTGTCTTGATATCTTACAGAACCAGTGGAGTCCTATCTATGATGTCGCTGCCATTCT
TACATCTATCCAGTCACTCCTCTGTGATCCCAACCCAAACTCGCCTGCGAACTCAGAAGC
TGCTCGATTGTTCAGCGAGAGCAAGCGAGAGTACAACAGACGTGTTAAGGAGATTGTCGA
ACAGAGCTGGACCGCTGATTAATAAGTCACACCCCAGTTTGTAATATTTGAAGTGGAGGA
GGCCTATCAAATTGGTTAAAA*CAGTTTGTTTGTTACATGCCTCCAGTTCAA*TATATGT
A*TTTAATTGCTGTATGA*CCTATATATTGCATTTTCCTGATA*GACA
ATCTTGCT

QA 2 709 2 709
DS 

RD RR2AJ36TF 709 0 0
GG
CTCCCCTCTCTTTCTGAGATTTACGATGTCAACACCAGCGAGGAAGAGGCTTATGAGGGA
TTTCAGGAGGTTGCAGCAAGATCCTCCTGCCGGTATCAGCGGTGCTCCTCATGACAACAA
CATCTTGCTCTGGAACGCTGTTATCTTCGGTCCAGATGATACACCTTGGGATGGAGGTAC
TTTTAAGTTGACTCTTCAATTCACAGAGGATTATCCAAACAAACCACCAACTGTTCGTTT
TGTTTCTCGCATGTTTCACCCAAACATCTATGCAGATGGGAGTATCTGTCTTGATATCTT
ACAGAACCAGCGGAGTCCTATCTATGATGTGGCAGCGATTCTTACATCTATACAGTCACT
CCTCTGTGATCCCAACCCAAACTCGCCTGCAAACTCAGAAGCTGCTCGATTGTTCAGCGA
GAGCAAGCGAGAGTACAACAGACGTGTTAAGGAGATTGTCGAACAGAGCTGGACCGCTGA
TTAATAAGTCACACCCCAGTTTGTAATATTTGAAGTGGAGGAGGCCTATCAAATTGGTTA
AAAACAGTTTGTTTGTTACATGCCTCCAGTTCAA*TATATGTAATTTAATTGCTGTATGA
ACCTATATATCACATTTTCCTGATAAGACAATCTTGCTTGCTTCTAAGTTGTGTGTATGT
AAACTTTTTTAAGAATCTTGTCCATGTTCATCAATAGCACCACCATT

QA 3 709 3 709
DS 

RD RR2D732JQ 585 0 0
AACGCTGTTATCTTCGGTCCAGATGATACACCTTGGGATGGAGGTACTTTTAAGTTGACT
CTTCAATTCACAGAGGATTATCCAAACAAACCACCAACTGTTCGTTTTGTTTCTCGCATG
TTTCACCCAAACATCTATGCAGATGGGAGTATCTGTCTTGATATCTTACAGAACCAGTGG
AGTCCTATCTATGATGTGGCAGCGATTCTTACATCTATACAGTCACTCCTCTGTGATCCC
AACCCAAACTCGCCTGCAAACTCAGAAGCTGCTCGATTGTTCAGCGAGAGCAAGCGAGAG
TACAACAGACGTGTTAAGGAGATTGTCGAACAGAGCTGGACCGCTGATTAATAAGTCACA
CCCCAGTTTGTAATATTTGAAGTGGAGGAGGCCTATCAAATTGGTTAAAAACAGTTTGTT
TGTTACATGCCTCCAGTTCAAATATATGTAATTTAATTGCTGTATGAACCTATATATCAC
ATTTTCCTGATAAGACAATCTTGCTTGCTTCTAAGTTGTGTGTATGTAAACTTTTTTAAG
AATCTTGTCCATGTTCATCAATAGCACCACCATTCCTTTTTGTTC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 4

CO CL1672Contig1 984 4 6 U
GATGGAAGTAAAGAATACATTTCATTGCGGGCTAAATATAAGTTGTTCTTGAAGGATGAA
AGTAAAGAATACATTTCATTGCAACTGATTGCAAGTTGCAAATGGTCCTGGTGCGTAGCT
AAAAAAAGAACAACTTTTAATCATACAACATCCAAAGTAAATATCATTTTGTCCCTCTCC
CTCAGTCTACCCCCCCTCGTCAAAGGCTCTCTAACAACACGTTCTGAAGTTGTCTTCAAT
CAGTGCAGTTAAAACCGCGACAAACCGAAAGCCAGATAACGAGAACAAGTAGTAGCAAGA
TCCCGAGAACCACAAGTTTCATCTTCATGTTCTGGTACCACAGTTTCCTCCTCACTTGTG
TCCCTTGTTTCTTGTACTCTTGCGCCTGGGAGCGTAGATTCTCGGTCTTGTCAGTAAGAA
CCGTCAGATTTTCTCCTCTGTCGATTGCCTTGTCAATATTCTCCAACATTATACTTTTGA
CTTCCGAAACTTGAGCCTTGACTTTGATAAGCTTTTCAATCTCCTCTGCACGGTCTACAA
TATACTTCATGTGTTCTTTCATCACCGGCCCGAACTCCTTGTTGAGACTTTTGGGGATAG
CTGTACTTGCTTTTCCGCCCCCATACCGTTTATTGAAATCAGCTTTCACCCTCTCCAGAA
ATGCGATCGAGATTTGCTTGCTTAGAGCATCTTTCGCCACAACACAATATGCGAAGCCAT
CTTCGACGAGGAAGTTGAAGGTGTGGTGATCGCAGTTGTAAGTGAACTTGCTGTTGCTGG
AGGAAGGAAGCTTCTGGAGACACTGTGCTGCTATCGACGGGAAGTTGCCCGTGAACTCCG
TGTACTCCGCCAGGATCATAGTGCCTCTTGCCACGAAGCTGTAGATGAACGATTCCTGAC
CCATTGAGTCCGCCACCGACTCCGCTCAAAGAGAGAGAGAGAGTTTTGGGATCTTCTTTA
TTAGTTTATTTACCTTTGCTACCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR05JQ U 4
AF RR2GP04JQ U 1
AF RR2GP04TF C 303
AF RR2CR05TF C 232
BS 1 245 RR2GP04JQ
BS 246 246 RR2CR05JQ
BS 247 319 RR2GP04JQ
BS 320 320 RR2CR05JQ
BS 321 784 RR2GP04JQ
BS 785 984 RR2CR05TF

RD RR2CR05JQ 706 0 0
A
GAAGTAAAGAATACATTTCATTGCGGGCTAAATATAAGTTGTTCTTGAAGGATGAAAGTA
AAGAATACATTTCATTGCAACTGATTGCAAGTTGCAAATGGTCCTGGTGCGTAGCTAAAA
AAAGAACAACTTTTAATCATACAACATCCAAAGTAAATATCATTTTGTCCCTCTCCCTCA
GTCTACCCCTCCTCGTCAAAGGTTCTCTAACAACACGTTCTGAAGTTGTCTTCAATCAGT
GCAGTTAAAACCGCGACAAACCGAAAGCCAGATAACGAGAACAAGTAGTAGCAAGATCCC
GAGAACCACAAGTTTCATCTTCATGTTCTGGTACCACAGTTTCCTCCTCACTTGTGTCCC
TTGTTTCTTGTACTCTTGCGCCTGGGAGCGTAAATTCTCGGTCTTGTCAGTAAGAACCGT
CAGATTTTCTCCTCTGTCGATTGCCTTGTCAATATTCTCCAACATTATACTTTTGACTTC
CGAAACTTGAGCCTTGACTTTGATAAGCTTTTCAATCTCCTCTGCATGGTCTACAATATA
CTTCATGTGTTCTTTCATCACCGGCCCGAACTCCTTGTTGAGACTTTTGGGGATAGCTGT
ACTTGCTTTTCCGCCCCCATACCGTTTATTGAAATCAGCTTTCACCCTCTCCAGAAATGC
GATCGAGATTTGCTTGCTTAGAGCATCTTTCGCCACAACACAATA

QA 2 706 2 706
DS 

RD RR2GP04JQ 784 0 0
GATGGAAGTAAAGAATACATTTCATTGCGGGCTAAATATAAGTTGTTCTTGAAGGATGAA
AGTAAAGAATACATTTCATTGCAACTGATTGCAAGTTGCAAATGGTCCTGGTGCGTAGCT
AAAAAAAGAACAACTTTTAATCATACAACATCCAAAGTAAATATCATTTTGTCCCTCTCC
CTCAGTCTACCCCCCCTCGTCAAAGGCTCTCTAACAACACGTTCTGAAGTTGTCTTCAAT
CAGTGTAGTTAAAACCGCGACAAACCGAAAGCCAGATAACGAGAACAAGTAGTAGCAAGA
TCCCGAGAACCACAAGTTTTATCTTCATGTTCTGGTACCACAGTTTCCTCCTCACTTGTG
TCCCTTGTTTCTTGTACTCTTGCGCCTGGGAGCGTAGATTCTCGGTCTTGTCAGTAAGAA
CCGTCAGATTTTCTCCTCTGTCGATTGCCTTGTCAATATTCTCCAACATTATACTTTTGA
CTTCCGAAACTTGAGCCTTGACTTTGATAAGCTTTTCAATCTCCTCTGCACGGTCTACAA
TATACTTCATGTGTTCTTTCATCACCGGCCCGAACTCCTTGTTGAGACTTTTGGGGATAG
CTGTACTTGCTTTTCCGCCCCCATACCGTTTATTGAAATCAGCTTTCACCCTCTCCAGAA
ATGCGATCGAGATTTGCTTGCTTAGAGCATCTTTCGCCACAACACAATATGCGAAGCCAT
CTTCGACGAGGAAGTTGAAGGTGTGGTGATCGCAGTTGTAAGTGAACTTGCTGTTGCTGG
AGGA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2GP04TF 647 0 0
CCGAGAACCACAAGTTTTATCTTCATGTTCTGGTACCACAGTTTCCTCCTCACTTGTGTC
C*TTGTTTCTTGTACTCTTGCGCCTGGGAGCGTAGATTCTCGGTCTTGTCAGTAAGAACC
GTCAGATTTTCTCCTCTGTCGATTGCCTTGTCAATATTCTCCAACATTATACTTTTGACT
TCCGAAACTTGAGCCTTGACTTTGATAAGCTTTTCAATCTCCTCTGCACGGTCTACAATA
TACTTCATGTGTTCTTTCATCACCGGCCCGAACTCCTTGTTGAGACTTTTGGGGATAGCT
GTACTTGCTTTTCCGCCCCCATACCGTTTATTGAAATCAGCTTTCACCCTCTCCAGAAAT
GCGATCGAGATTTGCTTGCTTAGAGCATCTTTCGCCACAACACAATATGCGAAGCCATCT
TCGACGAGGAAGTTGAAGGTGTGGTGATCGCAGTTGTAAGTGAACTTGCTGTTGCTGGAG
GAAGGAAGCTTCTGGAGACACTGTGCTGCTATCGACGGGAAGTTGCCCGTGAACTCCGTG
TACTCCGCCAGGATCATAGTGCCTCTTGCCACGAAGCTGTAGATGAACGATTCCTGACCC
ATTGAGTCCGCCACCGACTCCGCTCAAAGAGAGAGAGAGAGTTTTGG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2CR05TF 753 0 0
TGTC
TCAATCAGTGCAGTTAAA*CCGCGACAAACCGAAAGCCAGATA*CGAGA*CAAGTAGTAG
CAAGATCCCGAGAACCACAAGTTTCATCTTCATGTTCTGGTACCACAGTTTCCTCCTCAC
TTGTGTCC*TTGTTTCTTGTACTCTTGCGCCTGGGAGCGTAGATTCTCGGTCTTGTCAGT
AAGAACCGTCAGATTTTCTCCTCTGTCGATTGCCTTGTCAATATTCTCCAACATTATACT
TTTGACTTCCGAAACTTGAGCCTTGACTTTGATAAGCTTTTCAATCTCCTCTGCATGGTC
TACAATATACTTCATGTGTTCTTTCATCACCGGCCCGAACTCCTTGTTGAGACTTTTGGG
GATAGCTGTACTTGCTTTTCCGCCCCCATACCGTTTATTGAAATCAGCTTTCACCCTCTC
CAGAAATGCGATCGAGATTTGCTTGCTTAGAGCATCTTTCGCCACAACACAATATGCGAA
GCCATCTTCGACGAGGAAGTTGAAGGTGTGGTGATCGCAGTTGTAAGTGAACTTGCTGTT
GCTGGAGGAAGGAAGCTTCTGGAGACACTGTGCTGCTATCGACGGGAAGTTGCCCGTGAA
CTCCGTGTACTCCGCCAGGATCATAGTGCCTCTTGCCACGAAGCTGTAGATGAACGATTC
CTGACCCATTGAGTCCGCCACCGACTCCGCTCAAAGAGAGAGAGAGAGTTTTGGGATCTT
CTTTATTAGTTTATTTACCTTTGCTACCT

QA 5 753 5 753
DS 



AS 2 5

CO CL1673Contig1 654 2 1 U
GGCTTGTTTGCGCAGACACTATTTCGAGGCTCACTTGATTTTTAGGGTTTCAACAATCTG
AACAAATGGCGGATGAGGCTGCTAAGGCTGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAAT
TCGCCTTCAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTCTCGACATGTCTACTGATGATCTTGTCA
AGCTCTTCAGTTCCCGTATTCGTAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACCAGGAAGCCTATGG
CTTTGATCAAGAAATTGCGAAAAGCGAAAAGGGATGCGCCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAG
CAGTGAGAACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGCATCATTG
GTGTATACAACGGAAAGACATTTAATCAAGTCGAGATCAAACCAGAGATGATTGGTCATT
ACTTGGCTGAGTTTTCAATCTCATATAAGCCTGTTAAGCATGGTAGGCCTGGTGTTGGTG
CCACCAATTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAGTGAATGATCTACTCTTATTATAGCCATG
TGTTAATGCTCCAAAATAAGACTTTCGTTGTTTTTTTCTTTATAACGTTTTGTCTCTGTT
TCTCTCTCTCCTTTAGATTATATTTTAAACAATTCTTCATGCGTTTCAATAATA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AP92JQ C 1
AF RR2AP92TF U 1
BS 1 654 RR2AP92TF

RD RR2AP92JQ 654 0 0
GGCTTGTTTGCGCAGACACTATTTCGAGGCTCACTTGATTTTTAGGGTTTCAACAATCTG
AACAAATGGCGGATGAGGCTGCTAAGGCTGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAAT
TCGCCTTCAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTCTCGACATGTCTACTGATGATCTTGTCA
AGCTCTTCAGTTCCCGTATTCGTAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACCAGGAAGCCTATGG
CTTTGATCAAGAAATTGCGAAAAGCGAAAAGGGATGCGCCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAG
CAGTGAGAACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGCATCATTG
GTGTATACAACGGAAAGACATTTAATCAAGTCGAGATCAAACCAGAGATGATTGGTCATT
ACTTGGCTGAGTTTTCAATCTCATATAAGCCTGTTAAGCATGGTAGGCCTGGTGTTGGTG
CCACCAATTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAGTGAATGATCTACTCTTATTATAGCCATG
TGTTAATGCTCCAAAATAAGACTTTCGTTGTTTTTTTCTTTATAACGTTTTGTCTCTGTT
TCTCTCTCTCCTTTAGATTATATTTTAAACAATTCTTCATGCGTTTCAATAATA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2AP92TF 654 0 0
GGCTTGTTTGCGCAGACACTATTTCGAGGCTCACTTGATTTTTAGGGTTTCAACAATCTG
AACAAATGGCGGATGAGGCTGCTAAGGCTGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAAT
TCGCCTTCAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTCTCGACATGTCTACTGATGATCTTGTCA
AGCTCTTCAGTTCCCGTATTCGTAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACCAGGAAGCCTATGG
CTTTGATCAAGAAATTGCGAAAAGCGAAAAGGGATGCGCCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAG
CAGTGAGAACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGCATCATTG
GTGTATACAACGGAAAGACATTTAATCAAGTCGAGATCAAACCAGAGATGATTGGTCATT
ACTTGGCTGAGTTTTCAATCTCATATAAGCCTGTTAAGCATGGTAGGCCTGGTGTTGGTG
CCACCAATTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAGTGAATGATCTACTCTTATTATAGCCATG
TGTTAATGCTCCAAAATAAGACTTTCGTTGTTTTTTTCTTTATAACGTTTTGTCTCTGTT
TCTCTCTCTCCTTTAGATTATATTTTAAACAATTCTTCATGCGTTTCAATAATA

QA 1 654 1 654
DS 



CO CL1673Contig2 710 3 4 U
GGAGCTTGCTTGCGCAGACACTGTTTTAAAGTTCACTCGATTTCTAGGGTTTTCAACAGT
GAACAAATGGCGGATGAGGCTGCTAAAACTGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAA
TTCGCCTTCAAAGGAGTT*ATCTCGATGCTCTTCTGGACATGTCTACTGATGATCTTGTC
AAGCTCTTCAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACGAGGAAGCCTATG
GCTTTGATCAAGAAATTGCGAAAAGCTAAAAGGGATGCGCCAGCTGGTGAGAAGCCAGAA
GCAGTGAGAACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGCATCATT
GGTGTATACAACGGAAAGACATTTAACCAAGTCGAGATCAAACCAGAGATGATTGGTCAT
TACTTGGCTGAGTTTTCAATCTCATATAAGCCTGTTAAGCATGGTAGGCCTGGTGTTGGT
GCCACCAATTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAGTGAATGATCTACTCTTATTATAGACAT
GTGTTAATGCTCCAAAATAAGACTTTCGTTGGTCTTTTCTTTATAATGTTTTGTCTTTGT
TTCTCTGCTCTCCTTTAGATTTTGTTTAAAACATTTTTTCATGCGTTTCAATAATACTTA
GCATTTTTGAGTATCCATACTTGTTTATCAATAGTAACAGTTTATATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER17TF U 1
AF RR2CY10TF U 6
AF RR2ER17JQ C 1
BS 1 7 RR2ER17JQ
BS 8 606 RR2ER17TF
BS 607 647 RR2CY10TF
BS 648 710 RR2ER17JQ

RD RR2ER17TF 611 0 0
GGAGCTT
GCTTGCGCAGACACTGTTTTAAAGTTCACTCGATTTCTAGGGTTTTCAACAGTGAACAAA
TGGCGGATGAGGCTGCTAAAACTGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAATTCGCCT
TCAAAGGAGTT*ATCTCGATGCTCTTCTGGACATGTCTACTGATGATCTTGTCAAGCTCT
TCAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACGAGGAAGCCTATGGCTTTGA
TCAAGAAATTGCGAAAAGCTAAAAGGGATGCGCCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAGCAGTGA
GAACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGCATCATTGGTGTAT
ACAACGGAAAGACATTTAACCAAGTCGAGATCAAACCAGAGATGATTGGTCATTACTTGG
CTGAGTTTTCAATCTCATATAAGCCTGTTAAGCATGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCCACCA
ATTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAGTGAATGATCTACTCTTATTATAGACATGTGTTAA
TGCTCCAAAATAAGACTTTCGTTGGTCTTTTCTTTATAATGTTTTGTCTTTGTTTCTCT
GCTCT

QA 8 606 8 606
DS 

RD RR2CY10TF 642 0 0
GG
GCTTGCGCGGACACTGTTTTAAAGTTCACTCGATTTCTAGGGTTTTCAACAGTGAACAAA
TGGCGGATGAGGCTGCTAAAACTGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAATTCGCCT
TCAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTCTGGACATGTCTACTGATGATCTTGTCAAGCTCT
TCAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACGAGGAAGCCTATGGCTTTGA
TCAAGAAATTGCGAAAAGCTAAAAGGGATGCGCCAGCTGGTGAGAAGCCGGAAGCAGTGA
GAACCCACCTAAGTAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGCATCATTGGTGTAT
ACAACGGAAAGACATTTAACCAAGTCGAGATCAAACCAGAGATGATTGGTCATTACTTGG
CTGAGTTTTCAATCTCATATAAGCCTGTTAAGCATGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCCACCA
ATTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAGTGAATGATCTACTCTTATTATAGACATGTGTTAA
TGCTCCAAAATAAGACTTTCGTTGGTCTTTTCTTTATAATGTTTTGTCTTTGTTTCTCTG
CTCTCCTTTAGATTTTGTTTAAAACATTTTTTCATGCGTT

QA 3 642 3 642
DS 

RD RR2ER17JQ 710 0 0
GGAGCTTGCTTGCGCAGACACTGTTTTAAAGTTCACTCGATTTCTAGGGTTTTCAACAGT
GAACAAATGGCGGATGAGGCTGCTAAAACTGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAA
TTCGCCTTCAAAGGAGTT*ATCTCGATGCTCTTCTGGACATGTCTACTGATGATCTTGTC
AAGCTCTTCAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACGAGGAAGCCTATG
GCTTTGATCAAGAAATTGCGAAAAGCTAAAAGGGATGCGCCAGCTGGTGAGAAGCCAGAA
GCAGTGAGAACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGCATCATT
GGTGTATACAACGGAAAGACATTTAACCAAGTCGAGATCAAACCAGAGATGATTGGTCAT
TACTTGGCTGAGTTTTCAATCTCATATAAGCCTGTTAAGCATGGTAGGCCTGGTGTTGGT
GCCACCAATTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAGTGAATGATCTACTCTTATTATAGACAT
GTGTTAATGCTCCAAAATAAGACTTTCGTTGGTCTTTTCTTTATAATGTTTTGTCTTTGT
TTCTCTGCTCTCCTTTAGATTTTGTTTAAAACATTTTTTCATGCGTTTCAATAATACTTA
GCATTTTTGAGTATCCATACTTGTTTATCAATAGTAACAGTTTATATTGC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 5

CO CL1674Contig1 632 5 4 U
GGCTCACAGAAACCTAACCCTAAGAGAAGCGAGTTCCGTCTATTGTTGGCTATCTCCAAG
CGAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGGAACCCCAAGGCCGGTGAGAAGATCT
TCAGGACCAAGTGCGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCCGGTCACAAACAAGGAC
CAAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGGCAGTCTGGGACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTG
CTGCTAACAAAAACAAAGCTGTAGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCA
ACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACTAAGATGGTCTTCCCTGGGCTTAAGAAGCCACAAG
AACGCGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGAAATCAACCAACAA
ACCAACCAATGGTGGTGTGGGACATCATGAATTATTATTCTTTTGACAAATAAAATCTCC
AAACTTTTTTTTTGTTTTGCTTTTGGAAATTTTCTCATCTTATTTATATACGTTTTGTTT
CGAGTACCAAATGTACTCCGAATACTTTCTTTTTCTGAGGTTCACTTATATAAGTGCGTC
TACAATATCTAGAATAAACACATTTCTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2FO74JQ C 1
AF RR2FO74TF U 1
AF RR2F951TF U 4
AF RR2FO80JQ C 4
AF RR2FO80TF U 4
BS 1 5 RR2FO74JQ
BS 6 492 RR2FO74TF
BS 493 493 RR2F951TF
BS 494 632 RR2FO74TF

RD RR2FO74JQ 632 0 0
GGCTCACAGAAACCTAACCCTAAGAGAAGCGAGTTCCGTCTATTGTTGGCTATCTCCAAG
CGAAAATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGGAACCCCAAGGCCGGTGAGAAGATCT
TCAGGACCAAGTGCGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCCGGTCACAAACAAGGAC
CAAACCTAAACGGTCTGTTTGGAAGGCAGTCTGGGACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTG
CTGCTAACAAAAACAAAGCTGTAGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCA
ACCCCAAGAAGTACATTCCTGGAACTAAGATGGTCTTCCCTGGGCTTAAGAAGCCACAAG
AACGCGCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGAAATCAACCAACAA
ACCAACCAATGGTGGTGTGGGACATCATGAATTATTATTCTTTTGACAAATAAAATCTCC
AAACTTTTTTTT*GTTTTGCTTTTGGAAATTTTTTCATCTTATTTATATACGTTTTGTTT
CGAGTACCAAATGTACTCCGAATACTTTCTTTTTCTGAGGTTCACTTATATAAGTGCGTC
TACAATATCTAGAATAAACACATTTCTTTTCT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2FO74TF 632 0 0
GGCTC
ACAGAAACCTAACCCTAAGAGAAGCGAGTTCCGTCTATTGTTGGCTATCTCCAAGCGAAA
ATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGGAACCCCAAGGCCGGTGAGAAGATCTTCAGG
ACCAAGTGCGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCCGGTCACAAACAAGGACCAAAC
CTAAACGGTCTGTTTGGAAGGCAGTCTGGGACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTGCTGCT
AACAAAAACAAAGCTGTAGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCAACCCC
AAGAAGTACATTCCTGGAACTAAGATGGTCTTCCCTGGGCTTAAGAAGCCACAAGAACGC
GCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGAAATCAACCAACAAACCAA
CCAATGGTGGTGTGGGACATCATGAATTATTATTCTTTTGACAAATAAAATCTCCAAACT
TTTTTTT*GTTTTGCTTTTGGAAATTTTCTCATCTTATTTATATACGTTTTGTTTCGAGT
ACCAAATGTACTCCGAATACTTTCTTTTTCTGAGGTTCACTTATATAAGTGCGTCTACAA
TATCTAGAATAAACACATTTCTTTTCT

QA 6 632 6 632
DS 

RD RR2F951TF 629 0 0
GG
ACAGAAACCTAACCCTAAGAGAAGCGAGTTCCGTCTATTGTTGGCTATCTCCAAGCGAAA
ATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCACCAGGGAACCCCAAGGCCGGTGAGAAGATCTTCAGG
ACCAAGTGCGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCCGGTCACAAACAAGGACCAAAC
CTAAACGGTCTGTTTGGAAGGCAGTCTGGGACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTGTTGCT
AACAAAAACAAAGCTGTAGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCAACCCC
AAGAAGTACATTCCTGGAACTAAGATGGTCTTCCCTGGGCTTAAGAAGCCACAAGAACGC
GCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGAAATCAACCAACAAACCAA
CCAATGGTGGTGTGGGACATCATGAATTATTATTCTTTTGACAAATAAAATCTCCAAACT
TTTTTTTTGTTTTGCTTTTGGAAATTTTCTCATCTTATTTATATACGTTTTGTTTCGAGT
ACCAAATGTACTCCGAATACTTTCTTTTTCTGAGGTTCACTTATATAAGTGCGTCTACAA
TATCTAGAATAAACACATTTCTTTTCT

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR2FO80JQ 609 0 0
GG
ACAGAAACCTAACCCTAAGAGAAGCGAGTTCCGTCTATTGTTGGCTATCTCCAAGCGAAA
ATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCAC*AGGGAACCCCAAGGCCGGTGAGAAGATCTTCAGG
ACCAAGTGCGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCCGGTCACAAACAAGGACCAAAC
CTAAACGGTCTGTTTGGAAGGCAGTCTGGGACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTGCTGCT
AACAAAAACAAAGCTGTAGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCAACCCC
AAGAAGTACATTCCTGGAACTAAGATGGTCTTCCCTGGGCTTAAGAAGCCACAAGAACGC
GCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGAAATCAACCAACAAACCAA
CCAATGGTGGTGTGGGACATCATGAATTATTATTCTTTTGACAAATAAAATCTCCAAACT
TTTTTTTTGTTTTGCTTTTGGAAATTTTCTCATCTTATTTATATACGTTTTGTTTCGAGT
ACCAAATGTACTCCGAATACTTTCTTTTTCTGAGGTTCACTTATATAAGCGCGTCTACAA
TATCTAG

QA 3 609 3 609
DS 

RD RR2FO80TF 609 0 0
GG
ACAGAAACCTAACCCTAAGAGAAGCGAGTTCCGTCTATTGTTGGCTATCTCCAAGCGAAA
ATGGCGTCGTTTGATGAAGCACCAC*AGGGAACCCCAAGGCCGGTGAGAAGATCTTCAGG
ACCAAGTGCGCTCAGTGTCACACCGTCGACAAAGGCGCCGGTCACAAACAAGGACCAAAC
CTAAACGGTCTGTTTGGAAGGCAGTCTGGGACAACAGCTGGTTACTCTTACTCTGCTGCT
AACAAAAACAAAGCTGTAGAATGGGAAGAGAAGACCTTGTACGATTACTTGCTCAACCCC
AAGAAGTACATTCCTGGAACTAAGATGGTCTTCCCTGGGCTTAAGAAGCCACAAGAACGC
GCTGATCTCATTGCCTACTTGAAGGAAGCTACTGCTTAGTGAAATCAACCAACAAACCAA
CCAATGGTGGTGTGGGACATCATGAATTATTATTCTTTTGACAAATAAAATCTCCAAACT
TTTTTTTTGTTTTGCTTTTGGAAATTTTCTCATCTTATTTATATACGTTTTGTTTCGAGT
ACCAAATGTACTCCGAATACTTTCTTTTTCTGAGGTTCACTTATATAAGCGCGTCTACAA
TATCTAG

QA 3 609 3 609
DS 



AS 1 5

CO CL1675Contig1 476 5 2 U
GGAACTGCGCTGCGATCTCTCTCTCTCTTTCTCTCCCCCGCAGATTCCCTTATCTTGTCG
ATTACTTTCTCTGAGATAAATAATGTTGACGGAAACACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCT
TCTGGAGAAGCAGAGGTTGTTCCAGAGCATCCAGAGGCACACTTACTTGAAAGGACCAAT
GGACAAGGTCACCTCCGTTGTGATTCCTCTTGCCCTGGCTGCATCTGCTCTCTACATGAT
TGGAACAGGAATCTACAACATGTCCAACGGAATCGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGCTT
CTTTTTTTCTTTTTTTTTAATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCAT
ATCAGACTGAAGTTTGCACTGGTCTTTGTGATTCCGTTTTGCCGAATAATAATTTGCTTA
GTCGCAAGACAATGTCGAAAGCTGAAAGATGTTTGATGTGAAAAAGTTTCAATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2DD37TF U 5
AF RR2A974JQ C 1
AF RR2D943JQ C 26
AF RR2A974TF U 1
AF RR2D943TF U 1
BS 1 6 RR2A974JQ
BS 7 476 RR2A974TF

RD RR2DD37TF 284 0 0
GG
GCGCTGCGATCTCTCCCTCTCTTTCTCTCCCCCGCAGATTCCCTTATCTTGTCGATTACT
TTCTCTGAGATAAATAATGTTGACGGAAACACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCTTCTGGA
GAAGCAGAGGTTGTTCCAGAGCATCCAGAGGCACACTTACTTGAAAGGACCAATGGACAA
GGTCACCTCCGTTGCGATTCCTCTTGCCCTGGCTGCATCTGCTCTCTACATGATTGGAAC
AGGAATCTACAACATGTCCAACGGAATCGGGAAGAAGGAATA

QA 3 284 3 284
DS 

RD RR2A974JQ 476 0 0
GGAACTGCGCTGCGATCTCTCTCTCTCTTTCTCTCCCCCGCAGATTCCCTTATCTTGTCG
ATTACTTTCTTTGAGATAAATAATGTTGACGGAAACACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCT
TCTGGAGAAGCAGAGGTTGTTCCAGAGCATCCAGAGGCACACTTACTTGAAAGGACCAAT
GGACAAGGTCACCTCCGTTGTGATTCCTCTTGCCCTGGCTGCATTTGCTCTCTACATGAT
TGGAACAGGAATCTACAACATGTCCAACGGAATCGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGCTT
CTTTTTTTCTTTTTTTTTAATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCAT
ATCAGACTGAAGTTTGCACTGGTCTTTGTGATTCCGTTTTGCCGAATAATAATTTGCTTA
GTCGCAAGACAATGTCGAAAGCTGAAAGATGTTTGATGTGAAAAAGTTTCAATGTG

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR2D943JQ 451 0 0
TCTTTCTCTCCCCCGCAGATTCCCTTATCTTGTCGATTACTTTCTTTGAGATAAATAATG
TTGACGGAAACACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCTTTTGGAGAAGCAGAGGTTGTTCCAG
AGCATCCAGAGGCACACTTACTTGAAAGGACCAATGGACAAGGTCACCTCCGTTGTGATT
CCTCTTGCCCTGGCTGCATTTGCTCTCTACATGATTGGAACAGGAATTTACAACATGTCC
AACGGAATCGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGCTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTAATTGCT
TTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCATATCAGACTGAAGTTTGCACTGGTCT
TTGTGATTCCGTTTTGCCGAATAATAATTTGCTTAGTCGCAAGACAATGTCGAAAGCTGA
AAGATGTTTGATGTGAAAAAGTTTCAATGTG

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR2A974TF 476 0 0
GGAACT
GCGCTGCGATCTCTCTCTCTCTTTCTCTCCCCCGCAGATTCCCTTATCTTGTCGATTACT
TTCTCTGAGATAAATAATGTTGACGGAAACACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCTTCTGGA
GAAGCAGAGGTTGTTCCAGAGCATCCAGAGGCACACTTACTTGAAAGGACCAATGGACAA
GGTCACCTCCGTTGTGATTCCTCTTGCCCTGGCTGCATCTGCTCTCTACATGATTGGAAC
AGGAATCTACAACATGTCCAACGGAATCGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGCTTCTTTTT
TTCTTTTTTTTTAATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCATATCAGA
CTGAAGTTTGCACTGGTCTTTGTGATTCCGTTTTGCCGAATAATAATTTGCTTAGTCGCA
AGACAATGTCGAAAGCTGAAAGATGTTTGATGTGAAAAAGTTTCAATGTG

QA 7 476 7 476
DS 

RD RR2D943TF 476 0 0
GGAACT
GCGCTGCGATCTCTCTCTCTCTTTCTCTCCCCCGCAGATTCCCTTATCTTGTCGATTACT
TTCTCTGAGATAAATAATGTTGACGGAAACACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCTTCTGGA
GAAGCAGAGGTTGTTCCAGAGCATCCAGAGGCACACTTACTTGAAAGGACCAATGGACAA
GGTCACCTCCGTTGTGATTCCTCTTGCCCTGGCTGCATCTGCTCTCTACATGATTGGAAC
AGGAATCTACAACATGTCCAACGGAATCGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGCTTCTTTTT
TTCTTTTTTTTTAATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCATATCAGA
CTGAAGTTTGCACTGGTCTTTGTGATTCCGTTTTGCCGAATAATAATTTGCTTAGTCGCA
AGACAATGTCGAAAGCTGAAAGATGTTTGATGTGAAAAAGTTTCAATGTG

QA 7 476 7 476
DS 



AS 1 4

CO CL1676Contig1 790 4 10 U
GGCTTCCGGGTTTTACCAGTGTCCAGAAGGGAGAAGCAAAAATGGTGTCGCTGAAGCCCC
AGAAGCGGCTCGCAGCCTCAGTGATGAAGTGCGGAAAGGGCAAAGTATGGCTCGATCCTA
ACGAAACCAGTGACATCTCCATGGCTAATTCGCGTCAAAACATCAGGAAGCTTGTGAACG
ATGGATTCATCATCAGGAAGCCAACGAAGATTCACTCGCGTTCCAGAGCTCGCCGCATGA
AGATTGCCAAGATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCAGGGAGG
CGAGGCTGCCAACAAAGGTACTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTTCTCAGGCGTCTTCTCA
AGAAGTACCGTGAGTCCAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCACGACATGTACATGAAAG
TCAAGGGTAACGTTTTCAAGAACAAGCGTGTTCTGATGGAGAGCATCCACAAATCCAAGG
CTGAGAAGGCTAGGGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTCGAGGCTAAGAGGGCTAAGAACA
AGGCTAGCCGTGAAAGGAAACATGCTCGTAGAGAGGAACGACTTGCCAAGGGTCCTGGAG
GAGATGTACCTGCCGCCGCACCGCATGCCCAAACCGCATAGTAAGGTCCCGGCGAAGAGG
TCTAAGAAGTGAGGAGAATAAGCTTTTTTGCTTGATAGTAATTTTTTTTAGCAGTGATTT
TTGCATGGATTTTGTGATTCAGTTTTGTCAAAACACCTACTCTGCGCCGAATCTGAAAAC
CTTTATCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2GC43TF U 6
AF RR2H377TF U 1
AF RR2GC43JQ C 12
AF RR2H377JQ C 355
BS 1 211 RR2H377TF
BS 212 212 RR2GC43TF
BS 213 688 RR2H377TF
BS 689 689 RR2GC43JQ
BS 690 708 RR2H377TF
BS 709 709 RR2GC43JQ
BS 710 721 RR2H377TF
BS 722 722 RR2GC43JQ
BS 723 752 RR2H377TF
BS 753 790 RR2GC43JQ

RD RR2GC43TF 657 0 0
GGGGGT
TTTACCAGTGTCCAGAAGGGAGAAGCAAAAATGGTGTCGCTGAAGCCCCAGAAGCGGCTC
GCAGCCTCAGTGATGAAGTGCGGAAAGGGCAAAGTATGGCTCGATCCTAACGAAACCAGT
GACATCTCCATGGCTAATTCGCGTCAAAACATCAGGAAGCTTGTGAACGATGGATTCATC
ATCAGGAAGCCAACGAAGATTCACTCGCGTTCCAGAGCTCGCCGCATGAAGATTGCCAAG
ATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCAGGGAGGCGAGGCTGCCA
ACAAAGGTACTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTTCTCAGGCGTCTTCTCAAGAAGTACCGT
GAGTCCAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCACGACATGTACATGAAAGTCAAGGGTAAC
GTTTTCAAGAACAAGCGTGTTCTGATGGAGAGCATCCACAAATCCAAGGCTGAGAAGGCT
AGGGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTCGAGGCTAAGAGGGCTAAGAACAAGGCTAGCCGT
GAAA**AAACATGCTCGTAGAGAGGAACGACTTGCCAAGGGTCCTGGAGGAGATGTACCT
GCCGCCGCACCGCATGCCCAAACCGCATAGTA*GGTCCCGGCGAAGAGGT
C

QA 7 656 7 656
DS 

RD RR2H377TF 766 0 0
GGCTTCCGGGTTTTACCAGTGTCCAGAAGGGAGAAGCAAAAATGGTGTCGCTGAAGCCCC
AGAAGCGGCTCGCAGCCTCAGTGATGAAGTGCGGAAAGGGCAAAGTATGGCTCGATCCTA
ACGAAACCAGTGACATCTCCATGGCTAATTCGCGTCAAAACATCAGGAAGCTTGTGAACG
ATGGATTCATCATCAGGAAGCCAACGAAGATCCACTCGCGTTCCAGAGCTCGCCGCATGA
AGATTGCCAAGATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCAGGGAGG
CGAGGCTGCCAACAAAGGTACTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTTCTCAGGCGTCTTCTCA
AGAAGTACCGTGAGTCCAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCACGACATGTACATGAAAG
TCAAGGGTAACGTTTTCAAGAACAAGCGTGTTCTGATGGAGAGCATCCACAAATCCAAGG
CTGAGAAGGCTAGGGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTCGAGGCTAAGAGGGCTAAGAACA
AGGCTAGCCGTGAAAGGAAACATGCTCGTAGAGAGGAACGACTTGCCAAGGGTCCTGGAG
GAGATGTACCTGCCGCCGCACCGCATGCCCAAACCGCATAGTAAGGTCCCGGCGAAGAGG
TCTAAGAAGTGAGGAGAATAAGCTTTTT*GCTTGATAGTAATTTTTTT*AGCAGTGATTT
T*GCATGGATTTTGTGATTCAGTTTTGTCAAA
CACCTACTCTGCGC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2GC43JQ 779 0 0
TTTACCAGTGTCCAGAAGGGAGAAGCAAAAATGGTGTCGCTGAAGCCCCAGAAGCGGCTC
GCAGCCTCAGTGATGAAGTGCGGAAAGGGCAAAGTATGGCTCGATCCTAACGAAACCAGT
GACATCTCCATGGCTAATTCGCGTCAAAACATCAGGAAGCTTGTGAACGATGGATTCATC
ATCAGGAAGCCAACGAAGATTCACTCGCGTTCCAGAGCTCGCCGCATGAAGATTGCCAAG
ATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCAGGGAGGCGAGGCTGCCA
ACAAAGGTACTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTTTTCAGGCGTCTTCTCAAGAAGTACCGT
GAGTCCAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCACGACATGTACATGAAAGTCAAGGGTAAC
GTTTTCAAGAACAAGCGTGTTCTGATGGAGAGCATCCACAAATCCAAGGCTGAGAAGGCT
AGGGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTCGAGGCTAAGAGGGCTAAGAACAAGGCTAGCCGT
GAAA**AAACATGCTCGTAGAGAGGAACGACTTGCCAAGGGTCCTGGAGGAGATGTACCT
GCCGCCGCACCGCATGCCCAAACCGCATAGTAAGGTCCCGGCGAAGAGGTCTAAGAAGTG
AGGAGAATAAGCTTTTTTGCTTGATAGTAATTTTTTTTAGCAGTGATTTTTGCATGGATT
TTGTGATTCAGTTTTGTCAAAACACCTACTCTGCGCCGAATCTGAAAACCTTTATCATC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2H377JQ 436 0 0
TTT
TCAAGAAGTACCGTGAGTCCAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCACGACATGTACATGA
AAGTCAAGGGTAACGTTTTCAAGAACAAGGGTGTTTTGATGGAGAGCATCCACAAATCCA
AGGCTGAGAAGGCTAGGGAGAAGACTTTGTTTGATCAGTTCGAGGCTAAGAGGGCTAAGA
ACAAGGCTAGCCGTGAAAGGAAACATGCTCGTAGAGAGGAACGACTTGCCAAGGGTCCTG
GAGGAGATGTACCTGCCGCCGCACCGCATGCCCAAACCGCATAGTAAGGTCCCGGGGAAG
AGGTTTAAGAAGTGAGGAGAATAAGCTTTTTTGCTTGATAGTAATTTTTTTTAGCAGTGA
TTTTTGCATGGATTTTGTGATTCAGTTTTGTCAAAACACCTATTTTGCGCCGAATTTGAA
AACCTTTATCAT
T

QA 4 435 4 435
DS 



AS 1 4

CO CL1677Contig1 716 4 36 U
GGCCCACACTCATCAACAAGAGCCGAAACCACAAAACTCTTAACAACCATTCCGCCGAAG
TTGGATCCGAGCGCGATCGTCGACGTCTACGTCCGCGTGACCGGAGGAGAAGTCGGAGCC
GCCAGTTCCCTCGCCCCCAAGATCGGTCCTCTCGGTCTCGCACCAAAGAAGATCGGAGAA
GACATCGCCAAAGAGACAGCCAAAGAGTGGAAAGGACTCCGCGTCACCGTCAAGCTAACC
GTTCAGAACCGTCAGGCGAAGGTCACGGTGGTTCCGTCCGCCGCCGCTCTCGTCATCAAG
GCCTTGAAGGAGCCGGAGAGAGACAGGAAGAAGGTGAAGAACATCAAGCACAATGGGAAC
ATTTCGTTTGATGATGTGATTGAGATCGCTAGGATCATGAGGCCTAGATCTATTGCTAAG
GAGCTGAGTGGGACCGTGAGGGAGATTCTTGGAACGTGTGTGTCTGTTGGGTGCACTGTT
GATGGGAAGGATCCCAAGGATCTTCAGCAGGAGATTCAAGAGGGTGAGATTGAGATTCCT
GAGAACTAAGGAAAAGGAAAAGAAAAAGATTTTAATCTTTAGTTTTGGGTTGTTGTTGCG
TTTTGTTATCTCTGTTTAAGGATCTTTCTATGTTTTTATTATGAGAATTTGAATTTGCAT
TTGATGTTCATGTCCTATCTATGCCATTGCTTTCTATGAAGTTTGGAGCTTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DZ93TF U 2
AF RR2GN13TF U 1
AF RR2CR07JQ C 12
AF RR2CR07TF U 12
BS 1 35 RR2GN13TF
BS 36 36 RR2CR07TF
BS 37 40 RR2GN13TF
BS 41 41 RR2DZ93TF
BS 42 42 RR2GN13TF
BS 43 43 RR2CR07TF
BS 44 50 RR2GN13TF
BS 51 51 RR2CR07TF
BS 52 65 RR2GN13TF
BS 66 66 RR2CR07TF
BS 67 92 RR2GN13TF
BS 93 93 RR2DZ93TF
BS 94 188 RR2GN13TF
BS 189 189 RR2CR07TF
BS 190 233 RR2GN13TF
BS 234 234 RR2DZ93TF
BS 235 239 RR2GN13TF
BS 240 240 RR2CR07TF
BS 241 320 RR2GN13TF
BS 321 321 RR2CR07TF
BS 322 452 RR2GN13TF
BS 453 453 RR2CR07TF
BS 454 455 RR2GN13TF
BS 456 456 RR2CR07TF
BS 457 554 RR2GN13TF
BS 555 555 RR2CR07TF
BS 556 566 RR2GN13TF
BS 567 567 RR2CR07TF
BS 568 620 RR2GN13TF
BS 621 621 RR2CR07TF
BS 622 629 RR2GN13TF
BS 630 630 RR2CR07TF
BS 631 644 RR2GN13TF
BS 645 645 RR2CR07TF
BS 646 669 RR2GN13TF
BS 670 716 RR2CR07TF

RD RR2DZ93TF 288 0 0
GGCTCCCACTCTCAG
CAAGAGCAGAAACCACAAA*CTCTTAGCAACCATGCCGCCGAAGTTGGACCCGAGCGCGA
TCGTCGACGTCTACGTCCGCGTGACCGGAGGAGAAGTCGGAGCCGCGAGTTCCCTCGCCC
CCAAGATCGGTCCTCTCGGTCTCGCACCAAAGAAGATCGGAGAAGACATCGCGAAAGAGA
CAGCCAAAGAGTGGAAAGGACTCCGCGTCACCGTCAAGCTAACGGTTCAGAACCGTCAGG
CGAAAGTCACGGTGGTTCCGTCCGCCGCCGCTC

QA 16 288 16 288
DS 

RD RR2GN13TF 669 0 0
GGCCCACACTCATCAACAAGAGCCGAAACCACAAA*CTCTAA*CAACCATGCCGCCGAAG
TTGGACCCGAGCGCGATCGTCGACGTCTACGTTCGCGTGACCGGAGGAGAAGTCGGAGCC
GCCAGTTCCCTCGCCCCCAAGATCGGTCCTCTCGGTCTCGCACCAAAGAAGATCGGAGAA
GACATCGCTAAAGAGACAGCCAAAGAGTGGAAAGGACTCCGCGTCACCGTCAATCTAACG
GTTCAGAACCGTCAGGCGAAGGTCACGGTGGTTCCGTCCGCCGCCGCTCTCGTCATCAAG
GCCTTGAAGGAGCCGGAGAGGGACAGGAAGAAGGTGAAGAACATCAAGCACAATGGGAAC
ATTTCGTTTGATGATGTGATTGAGATCGCTAGGATCATGAGGCCTAGATCTATTGCTAAG
GAGCTGAGTGGGACCGTGAGGGAGATTCTTGGGACTTGTGTGTCTGTTGGGTGCACTGTT
GATGGGAAGGATCCCAAGGATCTTCAGCAGGAGATTCAAGAGGGTGAGATTGAGATTCCT
GAGAACTAAGGAAAGGGAAAAGAAAA*GATTTTAATCTTTAGTTTTGGGTTGTTGTTGCG
TTTTGTTATCTCTGTTTAAG*ATCTTTCTTTGTTTTTATTATGATAATTTGAATTTGCAT
TTGATGTTC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2CR07JQ 705 0 0
GGAAA
CAAGAGCCGAAACCACAAAACTCTTAACAACCATTCCGCCGAAGTTGGATCCGAGCGCGA
TCGTCGACGTCTACGTCCGCGTGACCGGAGGAGAAGTCGGAGCCGCCAGTTCCCTCGCCC
CCAAGATCGGTCCTCTCGGTCTCGCACCAAAGAAGATCGGAGAAGACATCGCCAAAGAGA
CAGCCAAAGAGTGGAAAGGACTCCGCGTCACCGTCAAGCTAACCGTTCAGAACCGTCAGG
CGAAGGTCACGGTGGTTCCGTCCGCCGCCGCTCTCGTCATCAAGGCCTTGAAGGAGCCGG
AGAGAGACAGGAAGAAGGTGAAGAACATCAAGCACAATGGGAACATTTCGTTTGATGATG
TGATTGAGATCGCTAGGATCATGAGGCCTAGATCTATTGCTAAGGAGCTGAGTGGGACCG
TGAGGGAGATTCTTGGAACGTGTGTGTCTGTTGGGTGCACTGTTGATGGGAAGGATCCCA
AGGATCTTCAGCAGGAGATTCAAGAGGGTGAGATTGAGATTCCTGAGAACTAAGGAAAAG
GAAAAGAAAAAGATTTTAATCTTTAGTTTTGGGTTGTTGTTGCGTTTTGTTATCTCTGTT
TAAGGATCTTTCTATGTTTTTATTATGAGAATTTGAATTTGCATTTGATGTTCATGTCCT
ATCTATGCCATTGCTTTCTATGAAGTTTGGAGCTTTGATC

QA 6 705 6 705
DS 

RD RR2CR07TF 705 0 0
GGAAA
CAAGAGCCGAAACCACAAAACTCTTAACAACCATTCCGCCGAAGTTGGATCCGAGCGCGA
TCGTCGACGTCTACGTCCGCGTGACCGGAGGAGAAGTCGGAGCCGCCAGTTCCCTCGCCC
CCAAGATCGGTCCTCTCGGTCTCGCACCAAAGAAGATCGGAGAAGACATCGCCAAAGAGA
CAGCCAAAGAGTGGAAAGGACTCCGCGTCACCGTCAAGCTAACCGTTCAGAACCGTCAGG
CGAAGGTCACGGTGGTTCCGTCCGCCGCCGCTCTCGTCATCAAGGCCTTGAAGGAGCCGG
AGAGAGACAGGAAGAAGGTGAAGAACATCAAGCACAATGGGAACATTTCGTTTGATGATG
TGATTGAGATCGCTAGGATCATGAGGCCTAGATCTATTGCTAAGGAGCTGAGTGGGACCG
TGAGGGAGATTCTTGGAACGTGTGTGTCTGTTGGGTGCACTGTTGATGGGAAGGATCCCA
AGGATCTTCAGCAGGAGATTCAAGAGGGTGAGATTGAGATTCCTGAGAACTAAGGAAAAG
GAAAAGAAAAAGATTTTAATCTTTAGTTTTGGGTTGTTGTTGCGTTTTGTTATCTCTGTT
TAAGGATCTTTCTATGTTTTTATTATGAGAATTTGAATTTGCATTTGATGTTCATGTCCT
ATCTATGCCATTGCTTTCTATGAAGTTTGGAGCTTTGATC

QA 6 705 6 705
DS 



AS 1 4

CO CL1678Contig1 1120 4 11 U
AACAGCCACGAGTCTTTTCTTATCAAAACATAATAAAGCCTTGGCCTCTCCATCCCTTTT
CCTTTATAACAATCTTCCAAAACGATGATGCAGGCAACAATGGGACAAAAACAAGGCGTT
GAATCTAGAGGAGATATCATCACCACGGGGCCGTCGCCGTTTGATTTCTTGCCGGAGGAT
TGCATCTCCAAAATAATCTCCTTCACAAGTCCACGTGACGCGTGCGTCGCCGCTTCGGTT
GCTAAAACCTTTGAATCTGCGGTTAAGTCAGATACCGTGTGGGAGAAGTTTCTTCCCCCG
GAATATTCCTCTTTGATCCCACGATCGAGAGCTTTCTCGTCCAAGAAGGAGCTCTATCTC
ACCCTATGCGATGATCCTGTTCTTATCGAAGATGGTAAAAAGAGCTTCTGGTTAGAGAAA
TCGAGTGGGAAAAGATGTATTATGTTATCTTCCAAGGAAGTGTGGATCACATGGGGAAGT
AGTCCACAATATTGGCGATGGGTTTCAATTCCTGAATCTAGGTTTGAGAAAATAGCAGAG
CTTCTCAACGTGTGTTGGTTTGAGATTCGTGCGGGGATGCATACCCGCTACCTATCTCCA
GGAACTCGGTACTCGGTTTACATTGTGTTCAAGACAGAGGACGGATGTCCTGGATTGGGT
GATATCCCGGTAGAAGCTGGAGTTGGGTTGGTTGGACAAGAATCTTCTCAAAAGTTGATA
TACTTTGTTGGGCCTAGTGGTCGAAGGAGAGAGAGAGAAAGGAGAGATGTTACAAGACCA
AAGGAGAGGGAAGATGGGTGGATGGAAGCTGAGCTTGGTGAGTTGTACAATGGATCATGC
TGCGATGATATCTCGGTTAGTGTTGTTGAGATTAAATCTCCATATTGGAAACGTGGTTTG
ATAATTCAAGGATTTGAATTCCGCCCCTCAAAAACTCAGTAACACTATCTATATGCAGTT
TCTGGTTTATGGTTGTTTGCTTCAGTTCCATGTCTAAGCAAAGTGAAACTATTTGTTGTA
TTGTAATGTTTTCGAAATTTCAAGTCTTTTTGGATTGAATGTTTGCATGGTTTGATTTTG
ATCACATGAAGAAGTCAATAAAAAAATTGTGTGTTACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C146TF U 1
AF RR2C421JQ C 281
AF RR2C421TF U 261
AF RR2C146JQ C 400
BS 1 587 RR2C146TF
BS 588 588 RR2C421TF
BS 589 681 RR2C146TF
BS 682 933 RR2C421TF
BS 934 934 RR2C421JQ
BS 935 1025 RR2C421TF
BS 1026 1026 RR2C146JQ
BS 1027 1031 RR2C421TF
BS 1032 1032 RR2C146JQ
BS 1033 1052 RR2C421TF
BS 1053 1120 RR2C146JQ

RD RR2C146TF 681 0 0
AACAGCCACGAGTCTTTTCTTATCAAAACATAATAAAGCCTTGGCCTCTCCATCCCTTTT
CCTTTATAACAATCTTCCAAAACGATGATGCAGGCAACAATGGGACAAAAACAAGGCGTT
GAATCTAGAGGAGATATCATCACCACGGGGCCGTCGCCGTTTGATTTCTTGCCGGAGGAT
TGCATCTCCAAAATAATCTCCTTCACAAGTCCACGTGACGCGTGCGTCGCCGCTTCGGTT
GCTAAAACCTTTGAATCTGCGGTTAAGTCAGATACCGTGTGGGAGAAGTTTCTTCCCCCG
GAATATTCCTCTTTGATCCCACGATCGAGAGCTTTCTCGTCCAAGAAGGAGCTCTATCTC
ACCCTATGCGATGATCCTGTTCTTATCGAAGATGGTAAAAAGAGCTTCTGGTTAGAGAAA
TCGAGTGGGAAAAGATGTATTATGTTATCTTCCAAGGAAGTGTGGATCACATGGGGAAGT
AGTCCACAATATTGGCGATGGGTTTCAATTCCTGAATCTAGGTTTGAGAAAATAGCAGAG
CTTCTCAACGTGTGTTGGTTTGAGATTCGTGCGGGGATGCATACCCGTTACCTATCTCCA
GGAACTCGGTACTCGGTTTACATTGTGTTCAAGACAGAGGACGGATGTCCTGGATTGGGT
GATATCCCGGTAGAAGCTGGA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2C421JQ 716 0 0
GGGAGAAGTTTCTTCCCCCGGAATATTCCTCTTTGATCCCACGATCGAGAGCTTTCTCGT
CCAAGAAGGAGCTCTATCTCACCCTATGCGATGATCCTGTTCTTATCGAAGATGGTAAAA
AGAGCTTCTGGTTAGAGAAATCGAGTGGGAAAAGATGTATTATGTTATCTTCCAAGGAAG
TGTGGATCACATGGGGAAGTAGTCCACAATATTGGCGATGGGTTTCAATTCCTGAATCTA
GGTTTGAGAAAATAGCAGAGCTTCTCAACGTGTGTTGGTTTGAGATTCGTGCGGGGATGC
ATACCCGCTACCTATCTCCAGGAACTCGGTACTCGGTTTACATTGTGTTCAAGACAGAGG
ACGGATGTCCTGGATTGGGTGATATCCCGGTAGAAGCTGGAGTTGGGTTGGTTGGACAAG
AATCTTCTCAAAAGTTGATATACTTTGTTGGGCCTAGTGGTCGAAGGAGAGAGAGAGAAA
GGAGAGATGTTACAAGACCAAAGGAGAGGGAAGATGGGTGGATGGAAGCTGAGCTTGGTG
AGTTGTACAATGGATCATGCTGCGATGATATCTCGGTTAGTGTTGTTGAGATTAAATCTC
CATATTGGAAACGTGGTTTGATAATTCAAGGATTTGAATTCCGCCCCTCAAAAACTCAGT
AACACTATCTATATGCAGTTTCTGGTTTATGGTTGTTTGCTTCAGTTCCATGTCTA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2C421TF 796 0 0
GGTTAAGTCAGATACCGTGTGGGAGAAGTTTCTTCCCCCGGAATATTCCTCTTTGATCCC
ACGATCGAGAGCTTTCTCGTCCAAGAAGGAGCTCTATCTCACCCTATGCGATGATCCTGT
TCTTATCGAAGATGGTAAAAAGAGCTTCTGGTTAGAGAAATCGAGTGGGAAAAGATGTAT
TATGTTATCTTCCAAGGAAGTGTGGATCACATGGGGAAGTAGTCCACAATATTGGCGATG
GGTTTCAATTCCTGAATCTAGGTTTGAGAAAATAGCAGAGCTTCTCAACGTGTGTTGGTT
TGAGATTCGTGCGGGGATGCATACCCGCTACCTATCTCCAGGAACTCGGTACTCGGTTTA
CATTGTGTTCAAGACAGAGGACGGATGTCCTGGATTGGGTGATATCCCGGTAGAAGCTGG
AGTTGGGTTGGTTGGACAAGAATCTTCTCAAAAGTTGATATACTTTGTTGGGCCTAGTGG
TCGAAGGAGAGAGAGAGAAAGGAGAGATGTTACAAGACCAAAGGAGAGGGAAGATGGGTG
GATGGAAGCTGAGCTTGGTGAGTTGTACAATGGATCATGCTGCGATGATATCTCGGTTAG
TGTTGTTGAGATTAAATCTCCATATTGGAAACGTGGTTTGATAATTCAAGGATTTGAATT
CCGCCCCTCAAAA*CTCAGTAACACTATCTATATGCAGTTTCTGGTTTATGGTTGTTTGC
TTCAGTTCCATGTCTAAGCAAAGTGAAACTATTTGTTGTATTGTA*TGTTT*CGAAATTT
CAAGTCTTTTTG
CAAA

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2C146JQ 721 0 0
AAGAGCTTCTGGTTAGAGAAATCGAGTGGGAAAAGATGTATTATGTTATCTTCCAAGGAA
GTGTGGATCACATGGGGAAGTAGTCCACAATATTGGCGATGGGTTTCAATTCCTGAATCT
AGGTTTGAGAAAATAGCAGAGCTTCTCAACGTGTGTTGGTTTGAGATTCGTGCGGGGATG
CATACCCGTTACCTATCTCCAGGAACTCGGTACTCGGTTTACATTGTGTTCAAGACAGAG
GACGGATGTCCTGGATTGGGTGATATCCCGGTAGAAGCTGGAGTTGGGTTGGTTGGACAA
GAATCTTCTCAAAAGTTGATATACTTTGTTGGGCCTAGTGGTCGAAGGAGAGAGAGAGAA
AGGAGAGATGTTACGAGACCAAAGGAGAGGGAAGATGGGTGGATGGAAGCTGAGCTTCGT
GAGTTGTACAATGGATCATGCTGTGATGATATCTCGGTTAGTGTTGTTGAGATTAAATCT
CCATATTGGAAACGTGGTTTGATAATTCAAGGATTTGAATTCCGCCCCTCAAAAACTCAG
TAACACTATCTATATGCAGTTTCTGGTTTATGGTTGTTTGCTTCAGTTCCATGTCTAAGC
AAAGTGAAACTATTTGTTGTATTGTAATGTTTTCGAAATTTCAAGTCTTTTTGGATTGAA
TGTTTGCATGGTTTGATTTTGATCACATGAAGAAGTCAATAAAAAAATTGTGTGTTACTC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 2 5

CO CL1679Contig1 766 2 2 U
GGACCAAATCCCTCTCGTAGTCTCCGCCTTCTCCACCCTTCCTCCTTTGTTCTCGTTGTG
CAGACACAGGTGCATACACAAAATGGCGACTTTTCGGGTCTCTTCCACTAGCATGACGAC
CACCAAGGCGGTTCTTAGAAGCCAGCCGACGAACAAGCTCGTCGCTAACAAGAGCCACCA
GCAAGTCTCCGTCGGATCGGTCAAGAAAGTCGCGAGATCCTTTGGCTTGAAATGCTCAAC
CAACTCAGGTGCCACCACGATGATGTCAGCGGTATACAAGGTCAAGCTCATAGGACCAGA
AGGGGAAGAGAACGAGTTCGAGGTTCTGGAGGACCAGTTCATATTGGACGCAGCCGAAGA
GGCGGGGGTTGACTTTCCTTACTCTTGCAGAGCAGGTGCGTGTTCCACCTGCGCCGGTCA
GATCGTGAAAGGCCAAGTTGATCAGTCCGAGGGTTCGTTTCTTGAGGATGATCACTTTGA
GAAAGGTTTCGTCTTGACTTGTGTGGCTTACCCGCAGTCGGACTGTGTTATCCATACCCA
CAAGGAAACTGAACTCTTCTAAAAGACCCGTTCTCGTTTGGTGGTAGTGTGATGCTAAAT
TGTTATTTGGGTTATTGTTATTATTATTATCCGTTTCCTTTCTACGAATTTGTGTGTGTT
TAAAAGGTTAATGCTTTTTTGTATGAACACGTCTCAGGATATGCCTTTTTTAGTTTTCAT
CAATCTGTTACCGGGTTACAACTGGTTAATAAAGTGGTTAAAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS67TF U 1
AF RR2DS67JQ C 188
BS 1 643 RR2DS67TF
BS 644 766 RR2DS67JQ

RD RR2DS67TF 643 0 0
GGACCAAATCCCTCTCGTAGTCTCCGCCTTCTCCACCCTTCCTCCTTTGTTCTCGTTGTG
CAGACACAGGTGCATACACAAAATGGCGACTTTTCGGGTCTCTTCCACTAGCATGACGAC
CACCAAGGCGGTTCTTAGAAGCCAGCCGACGAACAAGCTCGTCGCTAACAAGAGCCACCA
GCAAGTCTCCGTCGGATCGGTCAAGAAAGTCGCGAGATCCTTTGGCTTGAAATGCTCAAC
CAACTCAGGTGCCACCACGATGATGTCAGCGGTATACAAGGTCAAGCTCATAGGACCAGA
AGGGGAAGAGAACGAGTTCGAGGTTCTGGAGGACCAGTTCATATTGGACGCAGCCGAAGA
GGCGGGGGTTGACTTTCCTTACTCTTGCAGAGCAGGTGCGTGTTCCACCTGCGCCGGTCA
GATCGTGAAAGGCCAAGTTGATCAGTCCGAGGGTTCGTTTCTTGAGGATGATCACTTTGA
GAAAGGTTTCGTCTTGACTTGTGTGGCTTACCCGCAGTCGGACTGTGTTATCCATACCCA
CAAGGAAACTGAACTCTTCTAAAAGACCCGTTCTCGTTTGGTGGTAGTGTGATGCTAAAT
TGTTATTTGGGTTATTGTTATTATTATTATCCGTTTCCTTTCT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2DS67JQ 579 0 0
TCCGTCGGATCGGTCAAGAAAGTCGCGAGATCCTTTGGCTTGAAATGCTCAACCAACTCA
GGTGCCACCACGATGATGTCAGCGGTATACAAGGTCAAGCTCATAGGACCAGAAGGGGAA
GAGAACGAGTTCGAGGTTCTGGAGGACCAGTTCATATTGGACGCAGCCGAAGAGGCGGGG
GTTGACTTTCCTTACTCTTGCAGAGCAGGTGCGTGTTCCACCTGCGCCGGTCAGATCGTG
AAAGGCCAAGTTGATCAGTCCGAGGGTTCGTTTCTTGAGGATGATCACTTTGAGAAAGGT
TTCGTCTTGACTTGTGTGGCTTACCCGCAGTCGGACTGTGTTATCCATACCCACAAGGAA
ACTGAACTCTTCTAAAAGACCCGTTCTCGTTTGGTGGTAGTGTGATGCTAAATTGTTATT
TGGGTTATTGTTATTATTATTATCCGTTTCCTTTCTACGAATTTGTGTGTGTTTAAAAGG
TTAATGCTTTTTTGTATGAACACGTCTCAGGATATGCCTTTTTTAGTTTTCATCAATCTG
TTACCGGGTTACAACTGGTTAATAAAGTGGTTAAAAGCC

QA 1 579 1 579
DS 



CO CL1679Contig2 874 3 7 U
AGGTGTAAAAAAAATAAGTAGCCGACGAAGGTGGGAAGCAAGTTGGGCCGTCACGCCCTT
CCAAAAGCCACCCTCCCCTCCCCTCTCCCTCTTTTTATAAATCATTCTCCCCTCAACTAA
ACCACCAAACCCCTCTCGTAGTCTCCGCCTTCTCCACCCTTCCTCCTTTGTTCTCGACAC
AGGTTCATAAACAAATGGCGACTTTTCGAATCTCTTCCACTAGCATGACCACCACCACGG
CCGTTCTCAGAAGCCAGCCGACGAACAAGCTCATCGCTAACAAGAGCCAGCAAGTCTCCG
TTGGATCGGTCAAGAAAGTCGCTAGATCCTTCGGCTTGAAATGCTCAACCAACTCGGGTG
CCACCACCATGATGTCAGCCGTATACAAGGTCAAGCTCATAGGACCAGAAGGGGAAGAGA
ACGAGTTCGAGGTTCTGGAAGACCAGTTCATATTGGACGCAGCCGAAGAGGCGGGAGTTG
ACTTGCCTTACTCTTGCAGAGCCGGTGCGTGTCCCACCTGCGCCGGTCAGATCGTGAAAG
GCCAAGTTGATCAGTCCGAGGGTTCGTTTCTTGAGGATGATCACTTGGAGAAAGGTTTTG
TGTTGACTTGTGTGGCTTACCCGCAGTCGGACTGTGTGATCCATACCCACAAGGAAACTG
AACTCTTCTAAAAGACCCGTTCTCGTTTGGTGGTGGTAGTGTGATGCTAAATTGTTATTT
GGGTTTGTTATTATTATTATCAGTTTCCTTTCTACGAATTTGTGTGTGTTTAAAAGGTTA
ATGCTTTTTTGTATGAACACGTCTCAGGATATGCCTTTTTAGTTTTCATCAATCGTCACC
GGGTTACAACTGGTTAATAAAGTGGTTAAATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD62TF U 1
AF RR2F474TF U 125
AF RR2F474JQ C 170
BS 1 338 RR2FD62TF
BS 339 339 RR2F474TF
BS 340 512 RR2FD62TF
BS 513 513 RR2F474TF
BS 514 647 RR2FD62TF
BS 648 649 RR2F474TF
BS 650 874 RR2F474JQ

RD RR2FD62TF 647 0 0
AGGTGTAAAAAAAATAAGTAGCCGACGAAGGTGGGAAGCAAGTTGGGCCGTCACGCCCTT
CCAAAAGCCACCCTCCCCTCCCCTCTCCCTCTTTTTATAAATCATTCTCCCCTCAACTAA
ACCACCAAACCCCTCTCGTAGTCTCCGCCTTCTCCACCCTTCCTCCTTTGTTCTCGACAC
AGGTTCATAAACAAATGGCGACTTTTCGAATCTCTTCCACTAGCATGACCACCACCACGG
CCGTTCTCAGAAGCCAGCCGACGAACAAGCTCATCGCTAACAAGAGCCAGCAAGTCTCCG
TTGGATCGGTCAAGAAAGTCGCTAGATCCTTCGGCTTGGAATGCTCAACCAACTCGGGTG
CCACCACCATGATGTCAGCCGTATACAAGGTCAAGCTCATAGGACCAGAAGGGGAAGAGA
ACGAGTTCGAGGTTCTGGAAGACCAGTTCATATTGGACGCAGCCGAAGAGGCGGGAGTTG
ACTTGCCTTACTCTTGCAGAGCCGGTGCGTGTTCCACCTGCGCCGGTCAGATCGTGAAAG
GCCAAGTTGATCAGTCCGAGGGTTCGTTTCTTGAGGATGATCACTTGGAGAAAGGTTTTG
TGTTGACTTGTGTGGCTTACCCGCAGTCGGACTGTGTGATCCATACC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2F474TF 525 0 0
GGAAAC
CCCTCTCGTAGTCTCCGCCTTCTCCACCCTTCCTCCTTTGTTCTCGACACAGGTTCATAA
ACAAATGGCGACTTTTCGAATCTCTTCCACTAGCATGACCACCACCACGGCCGTTCTCAG
AAGCCAGCCGACGAACAAGCTCATCGCTAACAAGAGCCAGCAAGTCTCCGTTGGATCGGT
CAAGAAAGTCGCTAGATCCTTCGGCTTGAAATGCTCAACCAACTCGGGTGCCACCACCAT
GATGTCAGCCGTATACAAGGTCAAGCTCATAGGACCAGAAGGGGAAGAGAACGAGTTCGA
GGTTCTGGAAGACCAGTTCATATTGGACGCAGCCGAAGAGGCGGGAGTTGACTTGCCTTA
CTCTTGCAGAGCCGGTGCGTGTCCCACCTGCGCCGGTCAGATCGTGAAAGGCCAAGTTGA
TCAGTCCGAGGGTTCGTTTCTTGAGGATGATCACTTGGAGAAAGGTTTTGTGTTGACTTG
TGTGGCTTACCCGCAGTCGGACTGTGTGATCCATACCCA

QA 7 525 7 525
DS 

RD RR2F474JQ 705 0 0
GTTCTCGACACAGGTTCATAAACAAATGGCGACTTTTCGAATCTCTTCCACTAGCATGAC
CACCACCACGGCCGTTCTCAGAAGCCAGCCGACGAACAAGCTCATCGCTAACAAGAGCCA
GCAAGTCTCCGTTGGATCGGTCAAGAAAGTCGCTAGATCCTTCGGCTTGAAATGCTCAAC
CAACTCGGGTGCCACCACCATGATGTCAGCCGTATACAAGGTCAAGCTCATAGGACCAGA
AGGGGAAGAGAACGAGTTCGAGGTTCTGGAAGACCAGTTCATATTGGACGCAGCCGAAGA
GGCGGGAGTTGACTTGCCTTACTCTTGCAGAGCCGGTGCGTGTCCCACCTGCGCCGGTCA
GATCGTGAAAGGCCAAGTTGATCAGTCCGAGGGTTCGTTTCTTGAGGATGATCACTTGGA
GAAAGGTTTTGTGTTGACTTGTGTGGCTTACCCGCAGTCGGACTGTGTGATCCATACCCA
CAAGGAAACTGAACTCTTCTAAAAGACCCGTTCTCGTTTGGTGGTGGTAGTGTGATGCTA
AATTGTTATTTGGGTTTGTTATTATTATTATCAGTTTCCTTTCTACGAATTTGTGTGTGT
TTAAAAGGTTAATGCTTTTTTGTATGAACACGTCTCAGGATATGCCTTTTTAGTTTTCAT
CAATCGTCACCGGGTTACAACTGGTTAATAAAGTGGTTAAATTTC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 2 5

CO CL1680Contig1 722 2 6 U
GGAGTATACGTTGGTAACGTGTCACCATGGTCCTAGTGGATCTTGTAGTACAAGGGTTTA
TGACAGAGATGGGTTTGAGTGCTTGGCAAGTGAGATCAACGAGGATCGTCGTGAGAGACT
TTTCATGGTCGATGTCGGTAACGAATCTCCTGAGAACTCGCCGGAGTTTAAGGGTTTGGG
TTTCCTCAGTTCTTGTTACTTATGCAGGAAGAAACTCCATGGTCACGACATATTTATTTA
TAGAGGAGAAAAAGCATTTTGCAGCACAGAGTGTCGATCGAGTCATATAGCAAATGTTGA
AAGGAAAGAGAGATGTAGATCAAAACTCTCAGCCTCTCCTTACACCGCCGGACAAATTAT
CTCCGCCGGAGTTCTAGTGACTTAGCCGGAATTCTACCGAGTATACATTATATATGGGGG
GGGGATCAGGGGTGAATAAAATAAGTACGCATACAACATATAGCGGACGAAATAAATTAG
CATATATATAAATTGTGACATGTATGTCTATATAAATGGTATATGGTGGAGGTGAAACAA
CATGAAAATTTTGGTGAGGGGGGTTAATGATAGTAGAGAGAGCTAGTTTTTGATCGTTAA
CATGGCGAGAAATGGACTAAAATGCTCTTGTTTGTTTTTCAAAAAAAAAAAAGAAATGGA
CTAATGCTCTTGTTTGTTTTTTATTGTTATTTTTGGTATTTTGTGGTAATTACATATTAA
AT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2C673JQ C 1
AF RR2B850TF U 46
BS 1 45 RR2C673JQ
BS 46 208 RR2B850TF
BS 209 209 RR2C673JQ
BS 210 418 RR2B850TF
BS 419 419 RR2C673JQ
BS 420 722 RR2B850TF

RD RR2C673JQ 707 0 0
GGAGTATACGTTGGTAACGTGTCACCATGGTCCTAGTGGATCTTGTAGTACAAGGGTTTA
TGACAGAGATGGGTTTGAGTGCTTGGCAAGTGAGATCAACGAGGATCGTCGTGAGAGACT
TTTCATGGTCGATGTCGTTAACGAATCTCCTGAGAACTCGCCGGAGTTTAAGGGTTTGGG
TTTCCTCAGTTCTTGTTACTTATGCAGGAAGAAACTCCATGGTCACGACATATTTATTTA
TAGAGGAGAAAAAGCATTTTGCAGCACAGAGTGTCGATCGAGTCATATAGCAAATGTTGA
AAGGAAAGAGAGATGTAGATCAAAACTCTCAGCCTCTCCTTACACCGCCGGACAAATTAT
CTCCGCCGGAGTTCTAGTGACTTAGCCGGAATTCTACCGAGTATACATTATATATGGGGG
GGGGATCAGGGGTGAATAAAATAAGTACGCATACAACATATAGCGGACGAAATAAATTAG
CATATATATAAATTGTGACATGTATGTCTATATAAATGGTATATGGTGGAGGTGAAACAA
CATGAAAATTTTGGTGAGGGGGGTTAATGATAGTAGAGAGAGCTAGTTTTTGATCGTTAA
CATGGCGAGAAATGGACTAAAATGCTCTTGTTTGTTTTTCAAAAAAAAA***GAAATGGA
CTAATGCTCTTGTTTGTTTTTTATTGTTATTTTTGGTATTTTGTG
AT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2B850TF 677 0 0
TAGTACAAGGGTTTATGACAGAGATGGGTTTGAGTGCTTGGCAAGTGAGATCAACGAGGA
TCGTCGTGAGAGACTTTTCATGGTCGATGTCGGTAACGAATCTCCTGAGAACTCGCCGGA
GTTTAAGGGTTTGGGTTTCCTCAGTTCTTGTTACTTATGCAGGGAGAAACTCCATGGTCA
CGACATATTTATTTATAGAGGAGAAAAAGCATTTTGCAGCACAGAGTGTCGATCGAGTCA
TATAGCAAATGTTGAAAGGAAAGAGAGATGTAGATCAAAACTCTCAGCCTCTCCTTACAC
CGCCGGACAAATTATCTCCGCCGGAGTTCTAGTGACTTAGCCGGAATTCTACCGAGTATA
CATTATATATGGGTGGGGGATCAGGGGTGAATAAAATAAGTACGCATACAACATATAGCG
GACGAAATAAATTAGCATATATATAAATTGTGACATGTATGTCTATATAAATGGTATATG
GTGGAGGTGAAACAACATGAAAATTTTGGTGAGGGGGGTTAATGATAGTAGAGAGAGCTA
GTTTTTGATCGTTAACATGGCGAGAAATGGACTAAAATGCTCTTGTTTGTTTTTCAAAAA
AAAAAAAGAAATGGACTAATGCTCTTGTTTGTTTTTTATTGTTATTTTTGGTATTTTGTG
GTAATTACATATTAAAT

QA 1 677 1 677
DS 



CO CL1680Contig2 999 3 9 U
GGGTGGAAACACCACCAGTCTTCCTCCTCTTCTTCTCTCATCTCCTTTTTTTAAGTTTTA
AGGTTGATCTGATCAAAACCCTTCTCTCCACCAAGTATCATGCTTAGCAAAAGAACCCAT
CCCATGATCGGAAAGATATCTGAGCTCCTCGTCGGCGTGAACCGATCTGCGGCCGCGGCG
GCTCCGTTCTTTGACGTCTTGATGACAAGCCCTAAAAGCCCACTTGACTTCAAGATTCTC
CCTCAGATATCTCAAAGAAACAGCTCAAAGAGATTCTACGACGACAACCTTGGTGGGTCC
GTTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGTCTAATCACTAGATCA
GAACCGAACCAATCAAACCGGTCTGATCCGGTCCAGTTCATGAGCCAAGAAGGAAGCACG
GACGAAGAAGAAGACGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGAGGAGTATACGTTGGTAACG
TGTCACCATGGTCCTAGTGGATCTTGTAGTACAAGGGTTTATGACAAAGATGGGTTTGAG
TGCTTGGCAAGT*AGATCAACGAGGATCGTCGTGAGAGACTTTTCATGGTCGATGTCGGT
AACGAATCTCCTGAGAACTCGCCGGAGTTTAAGGGTTTGGGTTTCCTCAGTTCTTGTTAC
TTATGCAGGAAGAAACTTCACGGTCACGACATATTTATTTATAGAGGAGAAAAAGCATTT
TGCAGCACAGAGTGTCGATCGAGTCATATAGCAAATGTTGAAAGGAAAGAGAGATGCAGA
TCAAAACTCTCAGCCTCTCCTTACACCGCCGGTCAAATTTTCTCCGCCGGAGTTCTAGTG
ACTTAGCCGGAGTTCTAGTGAGAATACATTATATATGGGGTGGGGGGGGGATCAGGGGTG
AATAAAATAAGTACGCATAAAACATATGCAGACGAAATAAATTAGCATATATATAAATTA
TGACATGTATGTCTACATAAATGGTATATGGTGGAGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN31TF U 1
AF RR2C673TF U 216
AF RR2EN31JQ C 377
BS 1 281 RR2EN31TF
BS 282 282 RR2C673TF
BS 283 359 RR2EN31TF
BS 360 360 RR2C673TF
BS 361 589 RR2EN31TF
BS 590 598 RR2C673TF
BS 599 599 RR2EN31JQ
BS 600 636 RR2C673TF
BS 637 999 RR2EN31JQ

RD RR2EN31TF 589 0 0
GGGTGGAAACACCACCAGTCTTCCTCCTCTTCTTCTCTCATCTCCTTTTTTTAAGTTTTA
AGGTTGATCTGATCAAAACCCTTCTCTCCACCAAGTATCATGCTTAGCAAAAGAACCCAT
CCCATGATCGGAAAGATATCTGAGCTCCTCGTCGGCGTGAACCGATCTGCGGCCGCGGCG
GCTCCGTTCTTTGACGTCTTGATGACAAGCCCTAAAAGCCCACTTGACTTCAAGATTCTC
CCTCAGATATCTCAAAGAAACAGCTCAAAGAGATTCTACGATGACAACCTTGGTGGGTCC
GTTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGTCTAATCACTAGATCG
GAACCGAACCAATCAAACCGGTCTGATCCGGTCCAGTTCATGAGCCAAGAAGGAAGCACG
GACGAAGAAGAAGACGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGAGGAGTATACGTTGGTAACG
TGTCACCATGGTCCTAGTGGATCTTGTAGTACAAGGGTTTATGACAAAGATGGGTTTGAG
TGCTTGGCAAGT*AGATCAACGAGGATCGTCGTGAGAGACTTTTCATGG

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2C673TF 421 0 0
AAGCCCACTTGACTTCAAGATTCTCCCTCAGATATCTCAAAGAAACAGCTCAAAGAGATT
CTACGACGACAACCTTGGTGGGTCCGTTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTC
AACCACTCGTCTAATCACTAGATCAGAACCGAACCAGTCAAACCGGTCTGATCCGGTCCA
GTTCATGAGCCAGGAAGGAAGCACGGACGAAGAAGAAGACGAGGAGATGTTCATAATGGA
CGAGGAGGAGTATACGTTGGTAACGTGTCACCATGGTCCTAGTGGATCTTGTAGTACAAG
GGTTTATGACAGAGATGGGTTTGAGTGCTTGGCAAGTGAGATCAACGAGGATCGTCGTGA
GAGACTTTTCATGGTCGATGTCGTTAACGAATCTCCTGAGAACTCGCCGGAGTTTAAGGG
T

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR2EN31JQ 623 0 0
ACCGGTCTGATCCGGTCCAGTTCATGAGCCAAGAAGGAAGCACGGACGAAGAAGAAGACG
AGGAGATGTTCATAATGGACGAGGAGGAGTATACGTTGGTAACGTGTCACCATGGTCCTA
GTGGATCTTGTAGTACAAGGGTTTATGACAAAGATGGGTTTGAGTGCTTGGCAAGT*AGA
TCAACGAGGATCGTCGTGAGAGACTTTTCATGGTCGATGTCGGTAACGAATCTCCTGAGA
ACTCGCCGGAGTTTAAGGGTTTGGGTTTCCTCAGTTCTTGTTACTTATGCAGGAAGAAAC
TTCACGGTCACGACATATTTATTTATAGAGGAGAAAAAGCATTTTGCAGCACAGAGTGTC
GATCGAGTCATATAGCAAATGTTGAAAGGAAAGAGAGATGCAGATCAAAACTCTCAGCCT
CTCCTTACACCGCCGGTCAAATTTTCTCCGCCGGAGTTCTAGTGACTTAGCCGGAGTTCT
AGTGAGAATACATTATATATGGGGTGGGGGGGGGATCAGGGGTGAATAAAATAAGTACGC
ATAAAACATATGCAGACGAAATAAATTAGCATATATATAAATTATGACATGTATGTCTAC
ATAAATGGTATATGGTGGAGGTG

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 3

CO CL1681Contig1 1329 3 19 U
GAAAAAGCATTAAGATCACCCCCCTTTTGTCCGTATCCTCTCTCTTCTCTCTCTCTATGG
GCAACGTGAACGCGAGAGACGAAGCGAACAGTAGCCACCACCACCACCACAACAGCAACA
ACAACAACGCATCTCAACTCGAAGACAACAACGACGGTGAGATTCATCAACCCATGTCTT
CTTCCGACACCACCGCACCTCCTCCTCCTGAGCTCATGGGTCAATCTCCTCCTCAATCAC
CTCGCGCCACTCAATCTCCTCTCATGTTTGCTCCTCAGGTTCCGGTGCTTCCTCTACAAA
GACCAGATGAAATCCACATCCCTAACCCTTCCTGGATGCAATCTCCTTCCTACGAAGAGG
CTTGTAACGAGCAAGGTATCCCCACCATGATCACTTGGTGCCATGGTGGTAAGGAGATTG
CTGTCGAAGGTTCTTGGGATAATTGGAAGACAAGAAGTCGGCTACAGAGATCTGGGAAAG
ACTTCACTATAATGAAAGTCTTGCCTTCAGGTGTCTACGAGTACAGGTTCATCGTTGATG
GACAGTGGAGGCATGCCCCTGAGCTCCCTCTCGCTCGTGATGACGCTGGCAACACTTTCA
ACCTCTTGGACCTCCAGGACTATGTACCAGAAGACATTGAAAGCATATCTGGTTTTGAGC
CACCGCAATCACCAGAAGCTAGTTACAGCAGCTTGCTTCTAGGAGCTGAGGACTACTCCA
AAGAACCGCCTCTGGTTCCGCCGCACCTGCAGATGACACTGCTGAACTTGCCTCCAGCAA
GCCCTGACATTCCATCACCGCTGCCGAGACCTCAGCACGTCATTCTCAACCATCTCTACA
TGCAGAAAGGCAAAAGCGGTCCGTCTGTGGTTGCCCTTGGTTCCACTCACCGCTTTCTGG
CCAAGTACGTCACTGTGGTGCTCTACAAGTCCCTCCAGAGGTGAGAAAAGATGATAGTGC
TCAGTTCTCGTAAAGCATGTGGGGAAACTCAGACATGCTTAGTATCTAATTTCATGGAGA
AGAATGAATGTGAGGCTATAATAGGATATATGCGAAGAAGAGGAAGAAGAGTTTATCATC
ATCATCACAGGCAAAAAAGTATTTTCCCTCTCAATAAGCTCGAATTTTGTTGTCTTGTCA
ATAAGGTTTTAGCAACATAATGAAAGATGCATTGTTCAGTCATGTGTAATCTTTTGATTT
CAAGACTTTTTTTATTTATCTCTTCTCTTTTCTTAGAATAATTTAGAAAAAAAAAGAGAA
CTGAGACTTCACTTGTAAAACCAGCAATTCTCTTTTTCTGTTTTGTTTTGTGGCTTTCAA
GTTTTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD59TF U 1
AF RR2BD89TF U 33
AF RR2BD59JQ C 563
BS 1 105 RR2BD59TF
BS 106 106 RR2BD89TF
BS 107 453 RR2BD59TF
BS 454 456 RR2BD89TF
BS 457 519 RR2BD59TF
BS 520 520 RR2BD89TF
BS 521 828 RR2BD59TF
BS 829 829 RR2BD89TF
BS 830 843 RR2BD59TF
BS 844 854 RR2BD89TF
BS 855 855 RR2BD59JQ
BS 856 883 RR2BD89TF
BS 884 884 RR2BD59JQ
BS 885 890 RR2BD89TF
BS 891 891 RR2BD59JQ
BS 892 901 RR2BD89TF
BS 902 903 RR2BD59JQ
BS 904 925 RR2BD89TF
BS 926 1329 RR2BD59JQ

RD RR2BD59TF 843 0 0
GAAAAAGCATTAAGATCACCCCCCTTTTGTCCGTATCCTCTCTCTTCTCTCTCTCTATGG
GCAACGTGAACGCGAGAGACGAAGCGAACAGTAGCCACCACCACCGCCACAACAGCAACA
ACAACAACGCATCTCAACTCGAAGACAACAACGACGGTGAGATTCATCAACCCATGTCTT
CTTCCGACACCACCGCACCTCCTCCTCCTGAGCTCATGGGTCAATCTCCTCCTCAATCAC
CTCGCGCCACTCAATCTCCTCTCATGTTTGCTCCTCAGGTTCCGGTGCTTCCTCTACAAA
GACCAGATGAAATCCACATCCCTAACCCTTCCTGGATGCAATCTCCTTCCTACGAAGAGG
CTTGTAACGAGCAAGGTATCCCCACCATGATCACTTGGTGCCATGGTGGTAAGGAGATTG
CTGTCGAAGGTTCTTGGGATAATTGGAAGACAA***GTCGGCTACAGAGATCTGGGAAAG
ACTTCACTATAATGAAAGTCTTGCCTTCAGGTGTCTACGGGTACAGGTTCATCGTTGATG
GACAGTGGAGGCATGCCCCTGAGCTCCCTCTCGCTCGTGATGACGCTGGCAACACTTTCA
ACCTCTTGGACCTCCAGGACTATGTACCAGAAGACATTGAAAGCATATCTGGTTTTGAGC
CACCGCAATCACCAGAAGCTAGTTACAGCAGCTTGCTTCTAGGAGCTGAGGACTACTCCA
AAGAACCGCCTCTGGTTCCGCCGCACCTGCAGATGACACTGCTGAACTTGCCTCCAGCAA
GCCCTGACATTCCATCACCGCTGCCGAGACCTCAGCACGTCATTCTCA*CCATCTCTACA
TGC

QA 1 843 1 843
DS 

RD RR2BD89TF 893 0 0
GG
ATCCTCTCTCTTCTCTCTCTCTATGGGCAACGTGAACGCGAGAGACGAAGCGAACAGTAG
CCACCACCACCACCACAACAGCAACAACAACAACGCATCTCAACTCGAAGACAACAACGA
CGGTGAGATTCATCAACCCATGTCTTCTTCCGACACCACCGCACCTCCTCCTCCTGAGCT
CATGGGTCAATCTCCTCCTCAATCACCTCGCGCCACTCAATCTCCTCTCATGTTTGCTCC
TCAGGTTCCGGTGCTTCCTCTACAAAGACCAGATGACATCCACATCCCTAACCCTTCCTG
GATGCAATCTCCTTCCTACGAAGAGGCTTGTAACGAGCAAGGTATCCCCACCATGATCAC
TTGGTGCCATGGTGGTAAGGAGATTGCTGTCGAAGGTTCTTGGGATAATTGGAAGACAAG
AAGTCGGCTACAGAGATCTGGGAAAGACTTCACTATAATGAAAGTCTTGCCTTCAGGTGT
CTACGAGTACAGGTTCATCTTTGATGGACAGTGGAGGCATGCCCCTGAGCTCCCTCTCGC
TCGTGATGACGCTGGCAACACTTTCAACCTCTTGGACCTCCAGGACTATGTACCAGAAGA
CATTGAAAGCATATCTGGTTTTGAGCCACCGCAATCACCAGAAGCTAGTTACAGCAGCTT
GCTTCTAGGAGCTGAGGACTACTCCAAAGAACCGCCTCTGGTTCCGCCGCACCTGCAGAT
GACACTGCTGAACTTGCCTCCAGCAAGCCCTGACATTCCATCACCGCTGCCGAGACCTCA
GCACGTCATTCTCAACCATCTCTACATGCAGAAAGGCAAA*GCGGTCCGTCTGTGGTTGC
CCTTGGTTC*ACTCAC*GCTTTCTGGC**AGTACGTCACTGTGGTGCTCTA

QA 3 893 3 893
DS 

RD RR2BD59JQ 767 0 0
GCTCCCTCTCGCTCGTGATGACGCTGGCAACACTTTCAACCTCTTGGACCTCCAGGACTA
TGTACCAGAAGACATTGAAAGCATATCTGGTTTTGAGCCACCGCAATCACCAGAAGCTAG
TTACAGCAGCTTGCTTCTAGGAGCTGAGGACTACTCCAAAGAACCGCCTCTGGTTCCGCC
GCACCTGCAGATGACACTGCTGAACTTGCCTCCAGCAAGCCCTGACATTCCATCACCGCT
GCCGAGACCTCAGCACGTCATTTTCAACCATCTCTACATGCAGAAAGGCAAAAGCGGTCC
GTCTGTGGTTGCCCTTGGTTCCACTCACCGCTTTCTGGCCAAGTACGTCACTGTGGTGCT
CTACAAGTCCCTCCAGAGGTGAGAAAAGATGATAGTGCTCAGTTCTCGTAAAGCATGTGG
GGAAACTCAGACATGCTTAGTATCTAATTTCATGGAGAAGAATGAATGTGAGGCTATAAT
AGGATATATGCGAAGAAGAGGAAGAAGAGTTTATCATCATCATCACAGGCAAAAAAGTAT
TTTCCCTCTCAATAAGCTCGAATTTTGTTGTCTTGTCAATAAGGTTTTAGCAACATAATG
AAAGATGCATTGTTCAGTCATGTGTAATCTTTTGATTTCAAGACTTTTTTTATTTATCTC
TTCTCTTTTCTTAGAATAATTTAGAAAAAAAAAGAGAACTGAGACTTCACTTGTAAAACC
AGCAATTCTCTTTTTCTGTTTTGTTTTGTGGCTTTCAAGTTTTCACG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 5

CO CL1682Contig1 755 5 5 U
GGGTCCACAGAGAAAAACCCTAAAGAGAGAGAGTTTCTCCACAACCCGGCGGCGAAGATG
AAGTACAACCCAAGAGTCACCTCCTCTCGCAGGAAGAACCGTAAGGCTCATTTCACAGCC
TCATCGAGCGAGAGACGCGTCATCATGAGCTCGCCTCTCTCCACCGACCTTCGCGCGAAG
TACAACGTCAGGTCCATGCCCATCCGCAAGGACGACGAGGTTCAGATCGTTCGCGGGACC
TACAAGGGACGCGAAGGAAAGGTCGTCCAGGTGTACCGTCGCAAGTGGGTGATTCACATC
GAGAGGATCACGAGGGAGAAGGTGAACGGAACCACCGTGAACGTCGGCGTGCAGCCGTCT
AAAGTGGTGATCACGAAGCTTCGTCTTGATAAGGACAGGAAGTCGTTGCTGGAGAGGAAG
GCGAAGGGGCGTGCTGCTGCGGATAAGGACAAGGGGACCAAGTTCACTGCTGAGGATGTT
ATGCAGAACGTTGATTAAGCGAGAGATTTGTCGTAAGGTTTTTTTATCGTTGTTTCAAAT
TTTGTTATATCGAATGTTTTATTTGTGTTTCGGAAATGAACATCTGTCTTTTGGTTTCAG
TTTCGGTAATGAGTTCGACTTTTTAGCTTTTATCTATAGTTTAATTGATGCTTTTAATAT
TGAATGTTTGCTTGCGCTGATTATGGTTGAGACTGATTCATTTTATGAGTATTATGCTAG
TGATATTTTGGGTCGTTAATTTGGTTATTAATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D660JQ C 5
AF RR2D660TF U 5
AF RR2DA96JQ C 1
AF RR2DA96TF U 1
AF RR2AD10TF U 596
BS 1 6 RR2DA96JQ
BS 7 208 RR2DA96TF
BS 209 209 RR2D660TF
BS 210 679 RR2DA96TF
BS 680 755 RR2AD10TF

RD RR2D660JQ 625 0 0
GG
ACAGAGAAAAACCCTAAAGAGAGAGAGTTTCTCCACAACCCGGCGGCGAAGATGAAGTAC
AACCCAAGAGTCACCTCCTCTCGCAGGAAGAACCGTAAGGCTCATTTCACAGCCTCATCG
AGCGAGAGACGCGTCATCATGAGCTCGCCTCTCTCCACCGACCTTCGCGCGAAGTACAAC
GTCAGGTCCATGCCCATCCGCAAGGACGACGAGGTTCAGATCGTTCGCGGGACCTACAAG
GGACGCGAAGGAAAGGTCGTCCAGGTGTACCGTCGCAAGTGGGTGATTCACATCGAGAGG
ATCACGAGGGAGAAGGTGAACGGAACCACCGTGAACGTCGGCGTGCAGCCGTCTAAAGTG
GTGATCACGAAGCTTCGTCTTGATAAGGACAGGAAGTCGTTGCTGGAGAGGAAGGCGAAG
GGGCGTGCTGCTGCGGATAAGGACAAGGGGACCAAGTTCACTGCTGAGGATGTTATGCAG
AACGTTGATTAAGCGAGAGATTTGTCGTAAGGTTTTTTTATCGTTGTTTCAAATTTTGTT
ATATCGAATGTTTTATTTGTGTTTCGGAAATGAACATCTGTCTTTTGGTTTCAGTTTCGG
TAATGAGTTCGACTTTTTAGCT
G

QA 3 624 3 624
DS 

RD RR2D660TF 625 0 0
GG
ACAGAGAAAAACCCTAAAGAGAGAGAGTTTCTCCACAACCCGGCGGCGAAGATGAAGTAC
AACCCAAGAGTCACCTCCTCTCGCAGGAAGAACCGTAAGGCTCATTTCACAGCCTCATCG
AGCGAGAGACGCGTCATCATGAGCTCGCCTCTCTCCACCGACCTTCGCGCGAAGTACAAC
GTCAGGTCCATGCCCATCCGCAAGGACGACGAGGTTCAGATCGTTCGCGGGACCTACAAG
GGACGCGAAGGAAAGGTCGTCCAGGTGTACCGTCGCAAGTGGGTGATTCACATCGAGAGG
ATCACGAGGGAGAAGGTGAACGGAACCACCGTGAACGTCGGCGTGCAGCCGTCTAAAGTG
GTGATCACGAAGCTTCGTCTTGATAAGGACAGGAAGTCGTTGCTGGAGAGGAAGGCGAAG
GGGCGTGCTGCTGCGGATAAGGACAAGGGGACCAAGTTCACTGCTGAGGATGTTATGCAG
AACGTTGATTAAGCGAGAGATTTGTCGTAAGGTTTTTTTATCGTTGTTTCAAATTTTGTT
ATATCGAATGTTTTATTTGTGTTTCGGAA*TGAACATCTGTCTTTTGGTTTCAGTTTCGG
TAATGAGTTCGACTTTTTAGCT
G

QA 3 624 3 624
DS 

RD RR2DA96JQ 679 0 0
GGGTCCACAGAGAAAAACCCTAAAGAGAGAGAGTTTCTCCACAACCCGGCGGCGAAGATG
AAGTACAACCCAAGAGTCACCTCCTCTCGCAGGAAGAACCGTAAGGCTCATTTCACAGCC
TCATCGAGCGAGAGACGCGTCATCATGAGCTCGCCTCTCTCCACCGACCTTCGCGCGAAG
TACAACGTCAGGTCCATGCCCATCCGCATGGACGACGAGGTTCAGATCGTTCGCGGGACC
TACAAGGGACGCGAAGGAAAGGTCGTCCAGGTGTACCGTCGCAAGTGGGTGATTCACATC
GAGAGGATCACGAGGGAGAAGGTGAACGGAACCACCGTGAACGTCGGCGTGCAGCCGTCT
AAAGTGGTGATCACGAAGCTTCGTCTTGATAAGGACAGGAAGTCGTTGCTGGAGAGGAAG
GCGAAGGGGCGTGCTGCTGCGGATAAGGACAAGGGGACCAAGTTCACTGCTGAGGATGTT
ATGCAGAACGTTGATTAAGCGAGAGATTTGTCGTAAGGTTTTTTTATCGTTGTTTCAAAT
TTTGTTATATCGAATGTTTTATTTGTGTTTCGGAAATGAACATCTGTCTTTTGGTTTCAG
TTTCGGTAATGAGTTCGACTTTTTAGCTTTTATCTATAGTTTAATTGATGCTTTTAATAT
TGAATGTTTGCTTGCGCTG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2DA96TF 679 0 0
GGGTCC
ACAGAGAAAAACCCTAAAGAGAGAGAGTTTCTCCACAACCCGGCGGCGAAGATGAAGTAC
AACCCAAGAGTCACCTCCTCTCGCAGGAAGAACCGTAAGGCTCATTTCACAGCCTCATCG
AGCGAGAGACGCGTCATCATGAGCTCGCCTCTCTCCACCGACCTTCGCGCGAAGTACAAC
GTCAGGTCCATGCCCATCCGCATGGACGACGAGGTTCAGATCGTTCGCGGGACCTACAAG
GGACGCGAAGGAAAGGTCGTCCAGGTGTACCGTCGCAAGTGGGTGATTCACATCGAGAGG
ATCACGAGGGAGAAGGTGAACGGAACCACCGTGAACGTCGGCGTGCAGCCGTCTAAAGTG
GTGATCACGAAGCTTCGTCTTGATAAGGACAGGAAGTCGTTGCTGGAGAGGAAGGCGAAG
GGGCGTGCTGCTGCGGATAAGGACAAGGGGACCAAGTTCACTGCTGAGGATGTTATGCAG
AACGTTGATTAAGCGAGAGATTTGTCGTAAGGTTTTTTTATCGTTGTTTCAAATTTTGTT
ATATCGAATGTTTTATTTGTGTTTCGGAAATGAACATCTGTCTTTTGGTTTCAGTTTCGG
TAATGAGTTCGACTTTTTAGCTTTTATCTATAGTTTAATTGATGCTTTTAATATTGAATG
TTTGCTTGCGCTG

QA 7 679 7 679
DS 

RD RR2AD10TF 160 0 0
TTCAGTTTCGGTAATGAGTTCGACTTTT*AGCTTTTATCTATAGTTTAATTGATGCTTTT
AATATTGAATGTTTGCTTGCGCTGATTATGGTTGAGACTGATTCATTTTATGAGTATTAT
GCTAGTGATATTTTGGGTCGTTAATTTGGTTATTAATTGT

QA 1 160 1 160
DS 



AS 1 5

CO CL1683Contig1 1070 5 18 U
ACTGAGAGAACAAAAGAGGTTCTTAGAAACTCGGTCCCAAGGCTTGCCTCAAACTACTCA
TAACATCAAAAGAGAACTGAGTTCAAAAAGGAAAAATTGACCCAAAAGAAAAACAAAAGA
AAAGAGGCAGAGCCATTATTGTTTAGCCAGCGTGCATGTAAAAACTCTAACGAATAGACA
CAAACACCTCTCTCTACTGTGTATTTTCCTCAAAACTACCAAACTAGGCTAGCAGCTAAG
AGATACAACACACTTCTCCTTTTCAGAGCTCGTCCTTAACGGCCTCAGCTGTCGTTTCCT
CCTTCTTAGGCTCTCCAGCTGTGTCCTTGTTCTTGTCGATGAAGCTTATGATGTCTTCCT
TTGTCCTGTCTCCTTCGTAAACCACAATGTTTCCGCTCGCTGATCTCAAGTATATTGTCG
GAAAGCCCTTCACACCGAAGGTATCATTTGGGAAGTCGTTTGCGGTTGCGTCTAGCTTAG
CAATGACAACACTTGGGTCGCTTTGGTATGACACAGCGACTTCGTCCAAGATTGGAACAA
GCTTTTGGCAGTGTCCACACCATGGTGCATAGAATTCAAGCAAGACGTTCTTTCCAGAGT
TGAAGACCATCTCGTCAAGGTTCTCAGCAACAACAACCTTCACTGGCTCGTTGTTTTCGG
TTGGGATAGGTTGAGATTTTTTGTGTGGGGCAACTTTTCCATCTTTGAAGTCCTTGACCC
ACGATTCAATCTGGTCAATCTCCACATTTGTTTTCAGATATTTCTTGTCGTCAGTAGTCT
GGATGATGATGAGAGGAACTTGGCTCTCTTCTAGTCCAAAGTACTGGAATGCGCCTTGGC
TGCTCTCAGCATCTCCGAGAAGGAAGCTAAGACCTTGTCCCTTGAAGGATGCAGCAACTT
CACGGTACTTTGATTTAAGAGCCTCAGCTCCTTCACCGGTGAAGTTAATGAACAACATCG
CCTTAGTGTTAGGGCTGTCAAAGAATTTGATAACATATGGGTGGTTGTTAGGATCCTTGT
CAAAGCCTCTCCATCAAAATCCTTGGAATCAACAAACAACTCATCGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB73JQ U 1
AF RR2DP09JQ U 32
AF RR2CY78JQ U 152
AF RR2BU92JQ U 113
AF RR2DP09TF C 377
BS 1 66 RR2GB73JQ
BS 67 67 RR2DP09JQ
BS 68 266 RR2GB73JQ
BS 267 267 RR2DP09JQ
BS 268 309 RR2GB73JQ
BS 310 310 RR2DP09JQ
BS 311 421 RR2GB73JQ
BS 422 422 RR2DP09JQ
BS 423 434 RR2GB73JQ
BS 435 435 RR2DP09JQ
BS 436 601 RR2GB73JQ
BS 602 734 RR2DP09JQ
BS 735 864 RR2BU92JQ
BS 865 865 RR2DP09TF
BS 866 887 RR2BU92JQ
BS 888 888 RR2DP09TF
BS 889 898 RR2BU92JQ
BS 899 1070 RR2DP09TF

RD RR2GB73JQ 601 0 0
ACTGAGAGAACAAAAGAGGTTCTTAGAAACTCGGTCCCAAGGCTTGCCTCAAACTACTCA
TAACATTAAAAGAGAACTGAGTTCAAAAAGGAAAAATTGACCCAAAAGAAAAACAAAAGA
AAAGAGGCAGAGCCATTATTGTTTAGCCAGCGTGCATGTAAAAACTCTAACGAATAGACA
CAAACACCTCTCTCTACTGTGTATTTTCCTCAAAACTACCAAACTAGGCTAGCAGCTAAG
AGATACAACACACTTCTCCTTTTCAGGGCTCGTCCTTAACGGCCTCAGCTGTCGTTTCCT
CCTTCTTAGACTCTCCAGCTGTGTCCTTGTTCTTGTCGATGAAGCTTATGATGTCTTCCT
TTGTCCTGTCTCCTTCGTAAACCACAATGTTTCCGCTCGCTGATCTCAAGTATATTGTCG
GGAAGCCCTTCACATCGAAGGTATCATTTGGGAAGTCGTTTGCGGTTGCGTCTAGCTTAG
CAATGACAACACTTGGGTCGCTTTGGTATGACACAGCGACTTCGTCCAAGATTGGAACAA
GCTTTTGGCAGTGTCCACACCATGGTGCATAGAATTCAAGCAAGACGTTCTTTCCAGAGT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2DP09JQ 703 0 0
CGGTCCCAAGGCTTGCCTCAAACTACTCATAACATCGAAAGAGAACTGAGTTCAAAAAGG
AAAACTTGACCCAAAAGAAAAACAAAAGAAAAGAGGCAAAGCCATTATTGTTTAGCCAGC
GTGCATGTAAAAACTCTAACGAATAGACACAAACACCTCTCTCTACTGTGTATTTTCCTC
AAAACTACCAAACTAGGCTAGCAGCTAAGAGATACAACACACTTCTCCTTTTCAGAGCTC
GTCCTTAACGGCCTCACCTGTCGTTTCCTCCTTCTTAGGCTCTCCAGCTGTGTCCTTGTT
CTTGTCGATGAAGCTTATGATGTCTTCCTTTGTCCTGTCTCCTTCGTAAACCACAATGTT
TCCGCTCGCTGATCTCAAGTATATTGTCGGAAAGCCCTTCACACCGAAGGTATCATTTGG
GAAGTCGTTTGCGGTTGCGTCTAGCTTAGCAATGACAACACTTGGGTCGCTTTGGTATGA
CACAGCGACTTCGTCCAAGATTGGAACAAGCTTTTGGCAGTGTCCACACCGTGGTGCATA
GAATTCAAGTAAGACGTTCTTTCCAGAGTTGAAGACCATCTCGTCAAGGTTCTCAGCAAC
AACAACCTTCACTGGCTCGTTGTTTTCGGTTGGGATAGGTTGAGATTTTTTGTGTGGGGC
AACTTTTCCATCTTTGAAGTCCTTGACCCACGATTCAATCTGG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2CY78JQ 621 0 0
GTGCATGTAAAAACTCTAACGAATAGACACAAACACCTCTCTCTACTGTGTATTTTCCTC
AAAACTACCAAACTAGGCTAGCAGCTAAGAGATACAACACACTTCTCCTTTTCAGAGCTC
GTCCTTAACGGCCTCAGCTGTCGTTTCCTCCTTCTTAGGCTCTCCAGCTGTGTCCTTGTT
CTTGTCGATGAAGCTTATGATGTCTTCCTTTGTCCTGTCTCCTTCGTAAACCACAATGTT
TCCGCTCGCTGATCTCAAGTATATTGTCGGGAAGCCCTTCACATCGAAGGTATCATTTGG
GAAGTCGTTTGCGGTTGCGTCTAGCTTAGCAATGACAACACTTGGGTCGCTTTGGTATGA
CACAGCGACTTCGTCCAAGATTGGAACAAGCTTTTGGAAGTGTCCACACCATGGTGCATA
GAATTCAAGCAAGACGTTCTTTCCAGAGTTGAAGACCATCTCGTCAAGGTTCTCAGCAAC
AACAACCTTCACTGGCTCGTTGTTTTCGGTTGGGATAGGTTGAGATTTTTTGTGTGGGGC
AACTTTTCCATCTTTGAAGTCCTTGACCCACGATCCAATCTGGTCAATCTCCACATTTGT
TTTCAGATATTTCTTGTCGTC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2BU92JQ 786 0 0
ACAAAAGAAAAGAGGCAGAGCCATTATTGTTTAGCCAGCGTGCATGTAAAAACTCTAACG
AATAGACACAAACACCTCTCTCTACTGTGTATTTTCCTCAAAACTACCAAACTAGGCTAG
CAGCTAAGAGATACAACACACTTCTCCTTTTCAGAGCTCGTCCTTAACGGCCTCAGCTGT
CGTTTCCTCCTTCTTAGGCTCTCCAGCTGTGTCCTTGTTCTTGTCGATGAAGCTTATGAT
GTCTTCCTTTGTCCTGTCTCCTTCGTAAACCACAATGTTTCCGCTCGCTGATCTCAAGTA
TATTGTCGGGAAGCCCTTCACATCGAAGGTATCATTTGGGAAGTCGTTTGCGGTTGCGTC
TAGCTTAGCAATGACAACACTTGGGTCGCTTTGGTATGACACAGCGACTTCGTCCAAGAT
TGGAACAAGCTTTTGGCAGTGTCCACACCATGGTGCATAGAATTCAAGCAAGACGTTCTT
TCCAGAGTTGAAGACCATCTCGTCAAGGTTCTCAGCAACAACAACCTTCACTGGCTCGTT
GTTTTCGGTTGGGATAGGTTGAGATTTTTTGTGTGGGGCAACTTTTCCATCTTTGAAGTC
CTTGACCCACGATCCAATCTGGTCAATCTCCACATTTGTTTTCAGATATTTCTTGTCGTC
AGTAGTCTGGATGATGATGAGAGGAACTTGGCTCTCTTCTAGTCCAAAGTACTGGAATGC
GCCTTGGCTGCTCTCAGCATCTCCGAGAAGGA*GCTAAGACCTTGTCCCTTGAAG*ATGC
AGCAAC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2DP09TF 694 0 0
GTAAACCACAATGTTTCCGCTCGCTGATCTCAAGTATATTGTCGGAAAGCCCTTCACACC
GAAGGTATCATTTGGGAAGTCGTTTGCGGTTGCGTCTAGCTTAGCAATGACAACACTTGG
GTCGCTTTGGTATGACACAGCGACTTCGTCCAAGATTGGAACAAGCTTTTGGCAGTGTCC
ACACCGTGGTGCATAGAATTCAAGTAAGACGTTCTTTCCAGAGTTGAAGACCATCTCGTC
AAGGTTCTCAGCAACAACAACCTTCACTGGCTCGTTGTTTTCGGTTGGGATAGGTTGAGA
TTTTTTGTGTGGGGCAACTTTTCCATCTTTGAAGTCCTTGACCCACGATTCAATCTGGTC
AATCTCCACATTTGTTTTCAGATATTTCTTGTCGTCGGTAGTCTGGATGATGATGAGAGG
AACTTGGCTCTCTTCTAGTCCAAAGTACTGGAATGCGCCTTGGCTGTTCTCAGCATCTCC
GAGAAGGAAGCTAAGACCTTGTCCCTTGAAGGATGCAGCAACTTCACGGTACTTTGATTT
AAGAGCCTCAGCTCCTTCACCGGTGAAGTTAATGAACAACATCGCCTTAGTGTTAGGGCT
GTCAAAGAATTTGATAACATATGGGTGGTTGTTAGGATCCTTGTCAAAGCCTCTCCATCA
AAATCCTTGGAATCAACAAACAACTCATCGAATC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 5

CO CL1684Contig1 1324 5 29 U
CCGTCAATAGATTTGATATTCATTCCAAACTGAAATACCAGAGTTCATACATAAGCTGGC
GGTCTAACAGGATAGCCCCAGAAACAAGAGCCCATAGAAAGCGGCAACTAGAACCCACAC
CGGGGCAACTTACTGAAACACAACATAAAGACTAAAACCGCAACAAAACCCTAGACAACA
AATTACTACTACATTCGAAACTGGAACATATCAACTCAGCAGACATAAGAAATAAACACA
TGCCAATGATCGGGAAATACCGTTGCTGCACATAGCCCCGCCACACGATAACTTCCACTT
CTTACACCCACACCACGACTTATTGCTGCTGCCTACGCACGCCAACAATAACGCCCAAGA
ACCTGAGACTTCATAACCCGACAAGAAGGATCAAAACTCGATCAACTTAACCTTCGGATA
CGGATGCGACGCAATCATAATCGTCCATTTAGTCCTAGATAGAAGCTCAACCAAAACCCC
ACGAAGACAAAGCCTTACTAACCGAAACTTACCGGACGCATTCACGGAAAAAGAAACGGA
CAGCAAGCAATCACTGCACCCACCACCATTGGAAGAAAGTCTGCTAAATCAATGCCGAAC
TCCAAACGTAGAGATAAATCGATACCCAGATTTGAGCGAAAACAAAGGACAACCGAGCAC
AGAGCATAGTAATAAACGGGTTTCAACTCCTTACCAACACCCAAGACATCTCGCAGACAC
ACGACCGCCAAAAGGACTGGGCGCGTACCGACAACCACAACTGCCACCTCCCTTGAACAG
TAGCAAACCCCATTCCCGAGACAAGACACCAAGTCTCAAGTCAAAAGAAAGCCAACCGTA
CCACTCCCGGCGCACACCGCCACTTAGAAACGACCACCGCCGCTTTGTAACCTTGAAGAA
CATGAGAGAGAGTCGTCCCTTACCTCACGCGCTGCCACCACGGATGACCCCGAGCAGATC
TACAAAAGTGAAAACGAGATCTGTCGGGATCAAACCTAAAAAGCCGACTCGTCTACCTCC
AAACCCATGGACGCCTCGATGATATTCCAGATCAGAGCTTCATACGGCCGGATCTAGCTT
TCCCCGAAGCAGATCTAGGGTTCCGCCGCGAAGTTACACCACCAGAACACCAATCATATC
GATGTCTATGAAGAGAGGAAGGAGAAGAGCAAAACAAAACAAAGAAAAAGGGGAAAGGGA
GCTTCCGGTGATGGCAGGAAGCCAAACACCAGAGCCCTGAAGGAGTCGCTCTTTTGTCGC
TTTTTTCTCTATTCAAAGCCGCTGGTTTTATCTTTTATTCTCTTGTGTCCAAAAGCAGGT
TCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 5 
20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 

AF RR2EC35JQ U 2
AF RR2EH91JQ U 1
AF RR2F062JQ U 1
AF RR2F062TF C 576
AF RR2EC35TF C 1010
BS 1 38 RR2EH91JQ
BS 39 39 RR2F062JQ
BS 40 97 RR2EH91JQ
BS 98 98 RR2F062JQ
BS 99 102 RR2EH91JQ
BS 103 103 RR2F062JQ
BS 104 172 RR2EH91JQ
BS 173 173 RR2F062JQ
BS 174 175 RR2EH91JQ
BS 176 176 RR2F062JQ
BS 177 179 RR2EH91JQ
BS 180 180 RR2F062JQ
BS 181 181 RR2EH91JQ
BS 182 182 RR2F062JQ
BS 183 183 RR2EH91JQ
BS 184 184 RR2F062JQ
BS 185 218 RR2EH91JQ
BS 219 219 RR2F062JQ
BS 220 520 RR2EH91JQ
BS 521 522 RR2F062JQ
BS 523 531 RR2EH91JQ
BS 532 532 RR2F062JQ
BS 533 559 RR2EH91JQ
BS 560 560 RR2F062JQ
BS 561 605 RR2EH91JQ
BS 606 606 RR2F062JQ
BS 607 645 RR2EH91JQ
BS 646 681 RR2F062JQ
BS 682 1324 RR2F062TF

RD RR2EC35JQ 327 0 0
G
GTCAATAGATTTGATATTCATTCCAAACTGAAATACCAGAGTTCATACATAAGCTGGCGG
TCTAACAGGATAGCCCCAGAAACAAGAGCCCATAGAAAGCGGCAACTAGAACCCACACCG
GGGCAACTTACTGAAACACAACATAAAGACTAAAACCGCAACAAAACCCTAGACAACAAA
TTACTACTACATTCTAAACTGGAACATATCAACTCAGCAGACATAAAAAATAAACACATG
CCAATGATCGGGAAATACCGTTGCTGCACATAGCCCCGCCACACGATAACTTCCACTTCT
TACACCCACACCACGACTTATTGCTG

QA 2 327 2 327
DS 

RD RR2EH91JQ 645 0 0
CCGTCAATAGATTTGATATTCATTCCAAACTGAAATACAAGAGTTCATACATAAGCTGGC
GGTCTAACAGGATAGCCCCAGAAACAAGAGCCCATAGGAAGCAGCAACTAGAACCCACAC
CGGGGCAACTTACTGAAACACAACATAAAGACTAAAACCGCAACAAAACCCTGGAGAACG
ATTAACTACTACATTCGAAACTGGAACATATCAACTCATCAGACATAAGAAATAAACACA
TGCCAATGATCGGGAAATACCGTTGCTGCACATAGCCCCGCCACACGATAACTTCCACTT
CTTACACCCACACCACGACTTATTGCTGCTGCCTACGCACGCCAACAATAACGCCCAAGA
ACCTGAGACTTCATAACCCGACAAGAAGGATCAAAACTCGATCAACTTAACCTTCGGATA
CGGATGCGACGCAATCATAATCGTCCATTTAGTCCTAGATAGAAGCTCAACCAAAACCCC
ACGAAGACAAAGCCTTACTAACCGAAACTTACCGGACGCA**CACGGAAAAGGAAACGGA
CAGCAAGCAATCACTGCACTCACCACCATTGGAAGAAAGTCTGCTAAATCAATGCCGAAC
TCCAAGCGTAGAGATAAATCGATACCCAGATTTGAGCGAAAACAA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2F062JQ 681 0 0
CC
GTCAATAGATTTGATATTCATTCCAAACTGAAATACCAGAGTTCATACATAAGCTGGCGG
TCTAACAGGATAGCCCCAGAAACAAGAGCCCATAGAAAGCGGCAACTAGAACCCACACCG
GGGCAACTTACTGAAACACAACATAAAGACTAAAACCGCAACAAAACCCTAGACAACAAA
TTACTACTACATTCGAAACTGGAACATATCAACTCAGCAGACATAAGAAATAAACACATG
CCAATGATCGGGAAATACCGTTGCTGCACATAGCCCCGCCACACGATAACTTCCACTTCT
TACACCCACACCACGACTTATTGCTGCTGCCTACGCACGCCAACAATAACGCCCAAGAAC
CTGAGACTTCATAACCCGACAAGAAGGATCGAAACTCGATCAACTTAACCTTCGGATACG
GATGCGACGCAATCATAATCGTCCATTTAGTCCTAGATAGAAGCTCAACCAAAACCCCAC
GAAGACAAAGCCTTACTAACCGAAACTTACCGGACGCATTCACGGAAAAAGAAACGGACA
GCAAGCAATCACTGCACCCACCACCATTGGAAGAAAGTCTGCTAAATCAATGCCGAACTC
CAAACGTAGAGATAAATCGATACCCAGATTTGAGCGAAAACAAAGGACAACCGAGCACAG
AGCATAGTAATAAACGGGT

QA 3 681 3 681
DS 

RD RR2F062TF 749 0 0
AAAGTCTGCTAAATCAATGCCGAACTCCAAACGTAGAGATAA*TCGATACCCAGATTTGA
GCGAAAACAAAGGACAACCGAGCACAGAGCATAGTAATAAACGGGTTTCAACTCCTTACC
AACACCCAAGACATCTCGCAGACACACGACCGCCAAAAGGACTGGGCGCGTACCGACAAC
CACAACTGCCACCTCCCTTGAACAGTAGCAAACCCCATTCCCGAGACAAGACACCAAGTC
TCAAGTCAAAAGAAAGCCAACCGTACCACTCCCGGCGCACACCGCCACTTAGAAACGACC
ACCGCCGCTTTGTAACCTTGAAGAACATGAGAGAGAGTCGTCCCTTACCTCACGCGCTGC
CACCACGGATGACCCCGAGCAGATCTACAAAAGTGAAAACGAGATCTGTCGGGATCAAAC
CTAAAAAGCCGACTCGTCTACCTCCAAACCCATGGACGCCTCGATGATATTCCAGATCAG
AGCTTCATACGGCCGGATCTAGCTTTCCCCGAAGCAGATCTAGGGTTCCGCCGCGAAGTT
ACACCACCAGAACACCAATCATATCGATGTCTATGAAGAGAGGAAGGAGAAGAGCAAAAC
AAAACAAAGAAAAAGGGGAAAGGGAGCTTCCGGTGATGGCAGGAAGCCAAACACCAGAGC
CCTGAAGGAGTCGCTCTTTTGTCGCTTTTTTCTCTATTCAAAGCCGCTGGTTTTATCTTT
TATTCTCTTGTGTCCAAAAGCAGGTTCCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2EC35TF 314 0 0
CGTCTACCTCCAAACCCATGGACGCCTCGATGATATTCCAGATCAGAGCTTCATACGGCC
GGATCTAGCTTTCCCCGAAGCAGATCTAGGGTTCCGCCGTGAAGTTACACCACCAGAACA
CCAATCATATCGATGTCTATGAAGAGAGGAAGGAGAAGAGCAAAACAAAACAAAGAAAAA
GGGGAAAGGGAGCTTCCGGTGATGGCAGGAAGCCAAACACCAGAGCCCTGAAGGAGTCGC
TCTTTTGTCGCTTTTTTCTTTATTCAAAGCCGCTGGTTTTATCTTTTATTCTCTTGTGTC
CAAAAGCAGGTTCC

QA 1 314 1 314
DS 



AS 1 5

CO CL1685Contig1 1233 5 10 U
CTATGGACTTCTATTTACGTAATGTGTCTAGTTTGAATCGTCAAAGGCAGAGCCAACACA
CCAAAAAGTTCATTATGAGTTTATGAATTGATTTTTATATAAACTTGGAAGGATAAAATA
TAAATTTGGAATTGATATTTAACCCTGAAGTAATTTCATAACATCATTTGCTCTGGACTC
CATCCCTTTAAGATACTCGATCAAGATTCGCTGCTCGTATGAACCTCCTTCAGTTCGAAT
CAGCGTGCGCTCAACTCGTTTCTTTATAACAGCAGATAGCTCATCAGGTGTTACTTCACC
TTTCCCGAGTGTTAACCCTTCTAAGAAAAGCTTGTTCCACTGTTCCTCAGGAGCTTTGAT
CAGAGTTTCCAGAAACTGCTCCGCCTTTACAACTTCGTTCCCTTTCTTTGCGTAGCTACG
CTTGGAGAGGACCGTAGCAGCATAGAGTTGTAGAACTTTCTGGAGCATGGCCGCAAGCCC
TGGTTTGTCTTTATCTTCTTTTGCCTGCCGTAGCTGAGCACTAACTTGTGAAAGAAACCC
TTCGTCTAGTTGCCCTTCTTTTTCCCTTTGTATCATTTCCTTTTCCATTTGATTGATGGC
TTGAGGATCTCTGGGAGGCCATGAGATTTCTTCAACTCCTTCCACAACGGGTCTTAATAT
CGCTTTCAGAACATCAGTAGACGACTCTATCTTCTCCTGAGTCATATTAACAACGCAGTC
AACTATGGTCATCACAGTTGCAGCTAACTCCTCATAATCCTTCTTGTCATCATCTGATAT
GCAAGTATCAGACCTGGCAGCTAGTCTAAGCCAAAAAACTTCATCAAAGGCCAAGATGTT
TTCAACAACAAGCTTCTCAAGTTCTCTAGGGTTAGCATCTTTAAGAGCATCTATCATCAT
ATCGAGTTCAACAGTCTTCTTAAACGCTCCTTCTGCACCTACTCCCTTGACTGCACACAT
CAAAGGTCTCCTTCGCTTCAAATCAACTCCAGAAAGCAGAGAAATGTTACACAGACTCGA
AGATACTAAAACCCTAGAACCCAATCTCCAACGCGACCCACTCTGCTTGAAAAAAGAAAA
CGGAGGAATCAAGTCGAAATTTCTCTAATAATTCGCTGAAATGATAACAGAGAGATCACC
TGCGGGCGCTGATGATAATGATGATGATGAGAATCGTAAGAGGATAAGCATTGAACAGAG
GATATTGCCGCCATTGAAGTAAGTGAAAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY64JQ U 1
AF RR2E436JQ U 46
AF RR2GD37JQ U 83
AF RR2E436TF C 249
AF RR2DY64TF C 701
BS 1 274 RR2DY64JQ
BS 275 275 RR2E436JQ
BS 276 324 RR2DY64JQ
BS 325 325 RR2E436JQ
BS 326 430 RR2DY64JQ
BS 431 517 RR2E436JQ
BS 518 518 RR2GD37JQ
BS 519 769 RR2E436JQ
BS 770 867 RR2E436TF
BS 868 1233 RR2DY64TF

RD RR2DY64JQ 430 0 0
CTATGGACTTCTATTTACGTAATGTGTCTAGTTTGAATCGTCAAAGGCAGAGCCAACACA
CCAAAAAGTTCATTATGAGTTTATGAATTGATTTTTATATAAACTTGGAAGGATAAAATA
TAAATTTGGAATTGATATTTAACCCTGAAGTAATTTCATAACATCATTTGCTCTGGACTC
CATCCCTTTAAGATACTCGATCAAGATTCGCTGCTCGTATGAACCTCCTTCAGTTCGAAT
CAGCGTGCGCTCAACTCGTTTCTTTATAACAGCAAATAGCTCATCAGGTGTTACTTCACC
TTTCCCGAGTGTTAACCCTTCTAAAAAAAGCTTGTTCCACTGTTCCTCAGGAGCTTTGAT
CAGAGTTTCCAGAAACTGCTCCGCCTTTACAACTTCGTTCCCTTTCTTTGCGTAGCTACG
CTTGGAGAGG

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2E436JQ 724 0 0
GGCAGAGCCAACACACCAAAAAGTTCATTATGAGTTTATGAATTGATTTTTATATAAACT
TGGAAGGATAAAATATAAATTTGGAATTGATATTTAACCCTGAAGTAATTTCATAACATC
ATTTGCTCTGGACTCCATCCCTTTAAGATACTCGATCAAGATTCGCTGCTCGTATGAACC
TCCTTCAGTTCGAATCAGCGTGCGCTCAACTCGTTTCTTTATAACAGCAGATAGCTCATC
AGGTGTTACTTCACCTTTCCCGAGTGTTAACCCTTCTAAGAAAAGCTTGTTCCACTGTTC
CTCAGGAGCTTTGATCAGAGTTTCCAGAAACTGCTCCGCCTTTACAACTTCGTTCCCTTT
CTTTGCGTAGCTACGCTTGGAGAGGACCGTAGCAGCATAGAGTTGTAGAACTTTCTGGAG
CATGGCCGCAAGCCCTGGTTTGTCTTTATCTTCTTTTGCCTGCCGTAGCTGAACACTAAC
TTGTGAAAGAAACCCTTCGTCTAGTTGCCCTTCTTTTTCCCTTTGTATCATTTCCTTTTC
CATTTGATTGATGGCTTGAGGATCTCTGGGAGGCCATGAGATTTCTTCAACTCCTTCCAC
AACGGGTCTTAATATCGCTTTCAGAACATCAGTAGACGACTCTATCTTCTCCTGAGTCAT
ATTAACAACGCAGTCAACTATGGTCATCACAGTTGCAGCTAACTCCTCATAATCCTTCTT
GTCA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2GD37JQ 674 0 0
ATGAATTGATTTTTATATAAACTTGGAAGGATAAAATATACATTTGGAATTGATATTTAA
CCCTGAAGTAATTTCATAACATCATTTGCTCTGGACTCCATCCCTTTGAGATACTCGATC
AAGATTCTCTGCTCGTATGAACCTCCTTCAGTTCGAATCAGCGTGCGCTCAACTCGTTTC
TTTATAACAGCAGATAGCTCATCAGGTGTTACTTCACCTTTCCCGACTGTTAACCCTTCT
AAGAAAAGCTTGTTCCACTGTTCCTCAGGAGCTTTGATCAGAGTTTCCAGAAACTGCTCC
GCCTTTACAACTTCGTTCCCTTTCTTTGCGTAGCTACGCTTGGAGAGGACCGTAGCAGCA
TAGAGTTTTAGAACTTTCTGGAGCATGGCCGCAAGCCCTGGTTTGTCTTTATCTTCTTTT
GCCTGCCGTAGCTGAGCACTAACTTGTGAAAGAAACGCTTCGTCTAATTGCCCTTCTTTT
TCCCGTTGTATCATTTCCTTTTCCATTTGATTGATGGCTTGAGGTTCTCTGGGAGGCCAT
GAGATTTCTTCAACTCCTTCCACAACGGGTCTTAATATCGCTTTCAGAACATCAGTAGAC
GACTCTATCTTCTCCTGAGTCATATTAACAACGCAGTCAACTATGGTCATCACAGTTGCA
GCTAACTCCTCATA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2E436TF 620 0 0
GCTCAACTCGTTTCTTTATAACAGCAGATAGCTCATCAGGTGTTACTTCACCTTTCCCGA
GTGTTAACCCTTCTAAGAAAAGCTTGTTCCACTGTTCCTCAGGAGCTTTGATCAGAGTTT
CCAGAAACTGCTCCGCCTTTACAACTTCGTTCCCTTTCTTTGCGTAGCTACGCTTGGAGA
GGACCGTAGCAGCATAGAGTTGTAGAACTTTCTGGAGCATGGCCGCAAGCCCTGGTTTGT
CTTTATCTTCTTTTGCCTGCCGTAGCTGAGCACTAACTTGTGAAAGAAACCCTTCGTCTA
GTTGCCCTTCTTTTTCCCTTTGTATCATTTCCTTTTCCATTTGATTGATGGCTTGAGGAT
CTCTGGGAGGCCATGAGATTTCTTCAACTCCTTCCACAACGGGTCTTAATATCGCTTTCA
GAACATCAGTAGACGACTCTATCTTCTCCTGAGTCATATTAACAACGCAGTCAACTATGG
TCATCACAGTTGCAGCTAACTCCTCATAATCCTTCTTGTCATCATCTGATATGCAAGTAT
CAGACCTGGCAGCTAGTCTAAGCCAAAAAACTTCATCAAAGGCCAAGATGTTTTCAACAA
CAAGCTTCTCAAGTTCTCT
C

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2DY64TF 533 0 0
GTCATATTAACAACGCAGTCAACTATGGTCATCACAGTTGCAGCTAACTCCTCATAATCC
TTCTTGTCATCATCTGATATGCAAGTATCAGACCTGGCAGCTAGTCTAAGCCAAAAAACT
TCATCAAAGGCCAAGATGTTTTCAACAACAAGCTTCTCAAGTTCTCTAGGGTTAGCATCT
TTAAGAGCATCTATCATCATATCGAGTTCAACAGTCTTCTTAAACGCTCCTTCTGCACCT
ACTCCCTTGACTGCACACATCAAAGGTCTCCTTCGCTTCAAATCAACTCCAGAAAGCAGA
GAAATGTTACACAGACTCGAAGATACTAAAACCCTAGAACCCAATCTCCAACGCGACCCA
CTCTGCTTGAAAAAAGAAAACGGAGGAATCAAGTCGAAATTTCTCTAATAATTCGCTGAA
ATGATAACAGAGAGATCACCTGCGGGCGCTGATGATAATGATGATGATGAGAATCGTAAG
AGGATAAGCATTGAACAGAGGATATTGCCGCCATTGAAGTAAGTGAAAGCTCC

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 3

CO CL1686Contig1 628 3 1 U
AAGGGATAAACCAACTTTATTTCATTATTGTGGGCTATTCGCCAAACAGAGCTACACTCA
ACATGCACTAATGAAAAATTCGCAGTTACAATATCAGACAGTCTAAAAATCCCGAACACC
CTCTAGGACTCACCAGTTGGTAGGTGGTAACAGAGTGGTCTTATCAAGAGAAAGAGACTT
TGAACTCCGTCTTAGATCAAGCCAACGAGCTTCTCACTTATCTCCCAAACTTTACGAGCC
TTCTCAACGTCACTCGCTTCTTCTGACAACTGGTTCTCAAAAGACGCCGAAGCCTTGTTC
CAGCTCCAGTACACTCCTGATTTCGTCAAGCTCGGATCACTCACCACCTGAGCAAGTCTT
TTGCCAGACTCTGTCTCGGAGACGTATCCTTTGGTGATGTACTTCTGAAACGGAGGGAAG
AGTGTTCGGAAAAGCGGGATGTGCTCTCTGAATAAACCGGTGGAGGCGATGCAACCAGGG
TACAGCGAGGCGAACGTGATTCCTGTTTCTTCATGGTAACGCCTGTGAAACTCTTGCATC
GTCAACATGTTGCACACTTTGCTGTCTTTGTAAGCCTTTGCACCGTCGAATTCTCCTCCA
TCAATCATCGCCGAGCTGTTTAAATCGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH30JQ U 314
AF RR2AR37JQ U 1
AF RR2AR37TF C 1
BS 1 628 RR2AR37JQ

RD RR2EH30JQ 196 0 0
CTCCAGATTTCGTCAAACTCGGATCACTCACCACCTGAGCAAGTCTTTTGCCAGACTCTG
TCTCGGAAACCTATCCTTTGGTGATGTACTTCTGAAACGGAGGGAAGAGGGTACGGAAAA
GCGGGATGTGCTCTCTGAATAAACCTGTGGAGGCGATGCAACCAGGGTACAGCGAGGCGA
ATGTGAT
TCCAGTTTC

QA 1 187 1 187
DS 

RD RR2AR37JQ 628 0 0
AAGGGATAAACCAACTTTATTTCATTATTGTGGGCTATTCGCCAAACAGAGCTACACTCA
ACATGCACTAATGAAAAATTCGCAGTTACAATATCAGACAGTCTAAAAATCCCGAACACC
CTCTAGGACTCACCAGTTGGTAGGTGGTAACAGAGTGGTCTTATCAAGAGAAAGAGACTT
TGAACTCCGTCTTAGATCAAGCCAACGAGCTTCTCACTTATCTCCCAAACTTTACGAGCC
TTCTCAACGTCACTCGCTTCTTCTGACAACTGGTTCTCAAAAGACGCCGAAGCCTTGTTC
CAGCTCCAGTACACTCCTGATTTCGTCAAGCTCGGATCACTCACCACCTGAGCAAGTCTT
TTGCCAGACTCTGTCTCGGAGACGTATCCTTTGGTGATGTACTTCTGAAACGGAGGGAAG
AGTGTTCGGAAAAGCGGGATGTGCTCTCTGAATAAACCGGTGGAGGCGATGCAACCAGGG
TACAGCGAGGCGAACGTGATTCCTGTTTCTTCATGGTAACGCCTGTGAAACTCTTGCATC
GTCAACATGTTGCACACTTTGCTGTCTTTGTAAGCCTTTGCACCGTCGAATTCTCCTCCA
TCAATCATCGCCGAGCTGTTTAAATCGC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2AR37TF 628 0 0
AAGGGATAAACCAACTTTATTTCATTATTGTGGGCTATTCGCCAAACAGAGCTACACTCA
ACATGCACTAATGAAAAATTCGCAGTTACAATATCAGACAGTCTAAAAATCCCGAACACC
CTCTAGGACTCACCAGTTGGTAGGTGGTAACAGAGTGGTCTTATCAAGAGAAAGAGACTT
TGAACTCCGTCTTAGATCAAGCCAACGAGCTTCTCACTTATCTCCCAAACTTTACGAGCC
TTCTCAACGTCACTCGCTTCTTCTGACAACTGGTTCTCAAAAGACGCCGAAGCCTTGTTC
CAGCTCCAGTACACTCCTGATTTCGTCAAGCTCGGATCACTCACCACCTGAGCAAGTCTT
TTGCCAGACTCTGTCTCGGAGACGTATCCTTTGGTGATGTACTTCTGAAACGGAGGGAAG
AGTGTTCGGAAAAGCGGGATGTGCTCTCTGAATAAACCGGTGGAGGCGATGCAACCAGGG
TACAGCGAGGCGAACGTGATTCCTGTTTCTTCATGGTAACGCCTGTGAAACTCTTGCATC
GTCAACATGTTGCACACTTTGCTGTCTTTGTAAGCCTTTGCACCGTCGAATTCTCCTCCA
TCAATCATCGCCGAGCTGTT
TAAATCGC

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 5

CO CL1687Contig1 1682 5 11 U
GGACTCAGATCTTGTCTTAAAAATACCTCGATTTAGATCTTTATCACAACAGAGAGGATC
TGCTACTAAGAAGATTGGAGAGGGATGATGGAGAGGTGTTTGGGAGCTCAACGGTGCCGG
AGAATCCAGAGAGCATTACGTCACTTGAAGGTAACGGTTCTATGTCTCGTTCTCACCGTA
GTCGTCCTACGTGGCACAATCGGCGCCGGGAAGTTCGGAACTCCGGAGCAAGATCTCGAC
GAGATCCGTCAGCATATCTACGCATCTCGTAAACGAGCCGAGCCTCACCGTGTGCTCGAA
GAGATACAGACCGATGGCGATTCCTCTTCCTCTTCTTCCTCCTCCGGCGGCGGGAGCAAT
AACTACGAGACGTTTGACATCAACAAGATATTCGTTGACGAAGGAGAAGAAGAGAAACCC
GACCCGAATAAACCGTACACTCTCGGACCCAAGATATCCGATTGGGACGAACAGAGATCC
GGCTGGTTAGCTAAGAACCCGACCTTCCCCAACTTCATCGGACCGAGCAAGCCACGTGTC
CTCTTGGTGACTGGTTCTGCTCCGAAGCCGTGTGAGAATCCCGTCGGAGACCATTACCTG
TTGAAGTCGATCAAGAACAAGATCGATTACTGTAGGCTTCACGGGATCGAGATCTTCTAC
AACATGGCTTTACTAGATGCCGAGATGGCTGGTTTCTGGGCGAAGTTGCCGTTGATCAGG
AAGCTGTTGCTATCTCACCCCGAGATTGAGTTTCTGTGGTGGACGGATAGTGATGCGATG
TTTACGGACATGGCGTTTGAGCTTCCGTGGGAGAGGTATAAAGATTACAACTTGGTGATG
CACGGGTGGAATGAGATGGTTTACGATGAGAAGAATTGGATTGGGTTGAACACTGGGAGT
TTCTTGCTTAGGAACAATCAATGGGCGCTTGATTTGCTTGATACTTGGGCTCCTATGGGT
CCTAAAGGGAAGATCCGTGAGGAAGCCGGCAAGGTTTTGACCCGTGAGCTCAAGGGTAGG
CCTGTTTTCGAAGCTGATGATCAGTCTGCTATGGTTTATCTCTTGGCTACTCAGCGTGAC
ACTTGGGGTAATAAGGTATTCCTAGAAAATGGATACTATCTTCACGGCTACTGGGGAATA
CTTGTCGACAAATACGAAGAAATGATAGAGAACTACCACCCGGGTCTAGGCGATCACAGA
TGGCCCTTGGTGACTCACTTTGTGGGTTGCAAACCATGCGGGAAGTTTGGGGATTACCCC
GTGGAACGGTGTCTAAAGCAAATGGACAGAGCCTTTAACTTTGGGGATAACCAGATTCTG
CAAATATATGGTTTCACTCACAAATCTTTGGCTAGTCGCAAAGTCAAGAGAGTGAGGAAC
GAGACTAACAATCCACTTGAGATGAAAGACGAGCTTGGATTGCTTCATCCAGCGTTCAAG
GCTGTTAAGGTACAAACAAACCAAGTTTGAATCTAGATTCTTGCTATATTTATTGTCTTT
GCTTGTTGTTGTACTAAGATGGATGAAAAAAAAATGTATTCTGCGGAGACATAAGTTTAT
TTTTTGTTTTTGTTTCGTCTCTACGTCTACTATTTTATAAAGAGTTCAGATTGTTGCGTC
TTCTTTCTTATAGAACATGAGATTTTGTAGCTTCACAAATCAATAATCAATGTTAATTCA
GT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2H570TF U 1
AF RR2AH64TF U 519
AF RR2G331TF U 562
AF RR2AH64JQ C 801
AF RR2G331JQ C 887
BS 1 715 RR2H570TF
BS 716 763 RR2AH64TF
BS 764 764 RR2G331TF
BS 765 1187 RR2AH64TF
BS 1188 1232 RR2G331TF
BS 1233 1233 RR2AH64JQ
BS 1234 1254 RR2G331TF
BS 1255 1387 RR2AH64JQ
BS 1388 1388 RR2G331JQ
BS 1389 1623 RR2AH64JQ
BS 1624 1682 RR2G331JQ

RD RR2H570TF 715 0 0
GGACTCAGATCTTGTCTTAAAAATACCTCGATTTAGATCTTTATCACAACAGAGAGGATC
TGCTACTAAGAAGATTGGAGAGGGATGATGGAGAGGTGTTTGGGAGCTCAACGGTGCCGG
AGAATCCAGAGAGCATTACGTCACTTGAAGGTAACGGTTCTATGTCTCGTTCTCACCGTA
GTCGTCCTACGTGGCACAATCGGCGCCGGGAAGTTCGGAACTCCGGAGCAAGATCTCGAC
GAGATCCGTCAGCATATCTACGCATCTCGTAAACGAGCCGAGCCTCACCGTGTGCTCGAA
GAGATACAGACCGATGGCGATTCCTCTTCCTCTTCTTCCTCCTCCGGCGGCGGGAGCAAT
AACTACGAGACGTTTGACATCAACAAGATATTCGTTGACGAAGGAGAAGAAGAGAAACCC
GACCCGAATAAACCGTACACTCTCGGACCCAAGATATCCGATTGGGACGAACAGAGATCC
GGCTGGTTAGCTAAGAACCCGACCTTCCCCAACTTCATCGGACCGAGCAAGCCACGTGTC
CTCTTGGTGACTGGTTCTGCTCCGAAGCCGTGTGAGAATCCCGTCGGAGACCATTACCTG
TTGAAGTCGATCAAGAACAAGATCGATTACTGTAGGCTTCACGGGATCGAGATCTTCTAC
AACATGGCTTTACTAGATGCCGAGATGGCTGGTTTCTGGGCGAAGTTGCCGTTGA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2AH64TF 669 0 0
G
GGACCGAGCAAGCCACGTGTCCTCTTGGTGACTGGTTCTGCTCCGAAGCCGTGTGAGAAT
CCCGTCGGAGACCATTACCTGTTGAAGTCGATCAAGAACAAGATCGATTACTGTAGGCTT
CACGGGATCGAGATCTTCTACAACATGGCTTTACTAGATGCCGAGATGGCTGGTTTCTGG
GCGAAGTTGCCGTTGATCAGGAAGCTGTTGCTATCTCACCCCGAGATTGAGTTTCTGTGG
TGGATGGATAGTGATGCGATGTTTACGGACATGGCGTTTGAGCTTCCGTGGGAGAGGTAT
AAAGATTACAACTTGGTGATGCACGGGTGGAATGAGATGGTTTACGATGAGAAGAATTGG
ATTGGGTTGAACACTGGGAGTTTCTTGCTTAGGAACAATCAATGGGCGCTTGATTTGCTT
GATACTTGGGCTCCTATGGGTCCTAAAGGGAAGATCCGTGAGGAAGCCGGCAAGGTTTTG
ACCCGTGAGCTCAAGGGTAGGCCTGTTTTCGAAGCTGATGATCAGTCTGCTATGGTTTAT
CTCTTGGCTACTCAGCGTGACACTTGGGGTAATAAGGTATTCCTAGAAAATGGATACTAT
CTTCACGGCTACTGGGGAATACTTGTCGACAAATACGAAGAAATGATAGAGAACTACCAC
CCGGGTCT

QA 2 669 2 669
DS 

RD RR2G331TF 701 0 0
G
CGAAGCCGTGTGAGAATCCCGTCGGAGACCATTACCTGTTGAAGTCGATCAAGAACAAGA
TCGATTACTGTAGGCTTCACGGGATCGAGATCTTCTACAACATGGCTTTACTAGATGCCG
AGATGGCTGGTTTCTGGGCGAAGTTGCCGTTGATCAGGAAGCTGTTGCTATCTCACCCCG
AGATTGAGTTTCTGTGGTGGACGGATAGTGATGCGATGTTTACGGACATGGCGTTTGAGC
TTCCGTGGGAGAGGTATAAAGATTACAACTTGGTGATGCACGGGTGGAATGAGATGGTTT
ACGATGAGAAGAATTGGATTGGGTTGAACACTGGGAGTTTCTTGCTTAGGAACAATCAAT
GGGCGCTTGATTTGCTTGATACTTGGGCTCCTATGGGTCCTAAAGGGAAGATCCGTGAGG
AAGCCGGCAAGGTTTTGACCCGTGAGCTCAAGGGTAGGCCTGTTTTCGAAGCTGATGATC
AGTCTGCTATGGTTTATCTCTTGGCTACTC***GTGACACTTGGGGTAATAAGGTATTCC
TAGAAAATGGATACTATCTTCACGGCTACTGGGGAATACTTGTCGACAAATACGAAGAAA
TGATAGAGAACTACCACCCGGGTCTAGGCGATCACAGATGGCCCTTGGTGACTCACTTTG
TGGGTTGCAA*CCATGCGGGAAGTTTGGGGAT
ACCCCGTG

QA 2 693 2 693
DS 

RD RR2AH64JQ 823 0 0
GCTTCCGTGGGAGAGGTATAAAGATTACAACTTGGTGATGCACGGGTGGAATGAGATGGT
TTACGATGAGAAGAATTGGATTGGGTTGAACACTGGGAGTTTCTTGCTTAGGAACAATCA
ATGGGCGCTTGATTTGCTTGATACTTGGGCTCCTATGGGTCCTAAAGGGAAGATCCGTGA
GGAAGCCGGCAAGGTTTTGACCCGTGAGCTCAAGGGTAGGCCTGTTTTCGAAGCTGATGA
TCAGTCTGCTATGGTTTATCTCTTGGCTACTCAGCGTGACACTTGGGGTAATAAGGTATT
CCTAGAAAATGGATACTATCTTCACGGCTACTGGGGAATACTTGTCGACAAATACGAAGA
AATGATAGAGAACTACCACCCGGGTCTAGGCGATCACAGACGGCCCTTGGTGACTCACTT
TGTGGGTTGCAAACCATGCGGGAAGTTTGGGGATTACCCCGTGGAACGGTGTCTAAAGCA
AATGGACAGAGCCTTTAACTTTGGGGATAACCAGATTCTGCAAATATATGGTTTCACTCA
CAAATCTTTGGCTAGTCGCAAAGTCAAGAGAGTGAGGAACGAGACTAGCAATCCACTTGA
GATGAAAGACGAGCTTGGATTGCTTCATCCAGCGTTCAAGGCTGTTAAGGTACAAACAAA
CCAAGTTTGAATCTAGATTCTTGCTATATTTATTGTCTTTGCTTGTTGTTGTACTAAGAT
GGATGAAAAAAAAATGTATTCTGCGGAGACATAAGTTTATTTTTTGTTTTTGTTTCGTCT
CTACGTCTACTATTTTATAAAGAGTTCAGATTGTTGCGTCTTC

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR2G331JQ 796 0 0
TGAACACTGGGAGTTTCTTGCTTAGGAACAATCAATGGGCGCTTGATTTGCTTGATACTT
GGGCTCCTATGGGTCCTAAAGGGAAGATCCGTGAGGAAGCCGGCAAGGTTTTGACCCGTG
AGCTCAAGGGTAGGCCTGTTTTCGAAGCTGATGATCAGTCTGCTATGGTTTATCTCTTGG
CTACTC***GTGACACTTGGGGTAATAAGGTATTCCTAGAAAATGGATACTATCTTCACG
GCTACTGGGGAATACTTGTCGACAAATACGAAGAAATGATAGAGAACTACCACCCGGGTC
TAGGCGATCACAGATGGCCCTTGGTGACTCACTTTGTGGGTTGCAAACCATGCGGGAAGT
TTGGGGATTACCCCGTGGAACGGTGTCTAAAGCAAATGGACAGAGCCTTTAACTTTGGGG
ATAACCAGATTCTGCAAATATATGGTTTCACTCACAAATCTTTGGCTAGTCGCAAAGTCA
AGAGAGTGAGGAACGAGACTAACAATCCACTTGAGATGAAAGACGAGCTTGGATTGCTTC
ATCCAGCGTTCAAGGCTGTTAAGGTACAAACAAACCAAGTTTGAATCTAGATTCTTGCTA
TATTTATTGTCTTTGCTTGTTGTTGTACTAAGATGGATGAAAAAAAA*TGTATTCTGCGG
AGACATAAGTTTATTTTTTGTTTTTGTTTCGTCTCTACGTCTACTATTTTATAAAGAGTT
CAGATTGTTGCGTCTTCTTTCTTATAGAACATGAGATTTTGTAGCTTCACAAATCAATAA
TCAATGTTAATTCAGT

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 5

CO CL1688Contig1 708 5 4 U
TGGGGAGATAAAAGAGGAGACGAAGATTTGTTAACACTCAGGGGCAAAAAGAGAGAGAAA
GATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTCACCGGAAAAACGATAACCCTAGAAGTGGAGAGCAG
CGACACCATCGACAATGTCAAAGCCAAAATCCAGGACAAAGAAGGTATACCACCAGACCA
ACAAAGGCTCATCTTTGCCGGTAAGCAGCTTGAAGACGGCCGAACCCTAGCCGATTACAA
CATCCAGAAAGAGTCTACTCTCCACCTCGTCTTGAGGCTCAGAGGTGGCACCATGATCAA
GGTCAAGACCCTCACCGGCAAAGAAATCGAGATTGATATCGAACCAACCGACACTATTGA
CCGTATCAAGGAACGTGTCGAAGAGAAAGAAGGCATCCCTCCCGTCCAACAAAGGCTTAT
CTATGCAGGGAAGCAGCTTGCTGATGACAAAACGGCCAAAGATTACAACATAGAGGGTGG
CTCTGTTCTTCATTTGGTTCTTGCTCTTAGGGGTGGTGGTTGTGTTTGAAATCAGAACAT
GCATCTTTCTTTTCTTATCTATATTTGAAATCTTTATCATGTTTTCTCTGATTGTGTTTT
GGACTTCATATGAACCCCCTGATTTGATATGATGATATTGGCATGTTGGTTATATTGTCT
CGTGGATAATGCATCTATCATTGAATAAATTACACACTTCTATTAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2B701JQ C 1
AF RR2DG55TF U 13
AF RR2B701TF U 1
AF RR2DI96TF U 15
AF RR2DI96JQ C 75
BS 1 605 RR2B701TF
BS 606 606 RR2DI96TF
BS 607 649 RR2B701TF
BS 650 708 RR2DI96TF

RD RR2B701JQ 482 0 0
TGGGGAGATAAAAGAGGAGACGAAGATTTGTTAACACTCAGGGGCAAAAAGAGAGAGAAA
GATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTCACCGGAAAAACGATAACCCTAGAAGTGGAGAGCAG
CGACACCATCGACAATGTCAAAGCCAAAATCCAGGACAAAGAAGGTATACCACCAGACCA
ACAAAGGCTCATCTTTGCCGGTAAGCAGCTTGAAGACGGCCGAACCCTAGCCGATTACAA
CATCCAGAAAGAGTTTACTCTCCACCTCGTCTTGAGGCTCAGAGGTGGCACCATGATCAA
GGTCAAGACCCTCACCGGCAAAGAAATCGAGATTGATATCGAACCAACCGACACTATTGA
CCGTATCAAGGAACGTGTCGAAGAGAAAGAAGGCATCCCTCCCGTCCAACAAAGGCTTAT
CTATGCAGGGAAGCAGCTTGCTGATGACAAAACGGCCAAAGATTACAACATAGAGGGGGG
CT

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR2DG55TF 539 0 0
GGA
GGAGACGAAGATTTGTTAACACTCAGGGGAAAAAAGAGAGAGAAAGATGCAGATCTTCGT
GAAAACCCTCACCGGAAAAACGATAACCCTAGAGGTGGAGAGCAGCGACACCATCGACAA
TGTCAAAGCCAAAATCCAGGACAAAGAAGGTATACCACCGGACCAACAAAGGCTCATCTT
CGCCGGTAAGCAGCTTGAAGACGGCAGAACCTTAGCCGATTACAACATCCAGAAAGAGTC
TACTCTCCATCTCGTCTTGAGGCTCAGAGGTGGCACCATGATCAAGGTCAAGACCCTCAC
CGGCAAAGAAATCGAGATTGATATCGAACCAACCGACACTATTGACCGTATCAAGGAACT
TGTCGAAGAGAAAGAAGGCATCCCTCCCGTCCAACAAAGGCTTATCTATGCAGGGAAGCA
GCTTGCTGATGACAAAACGGCCAAAGATTACAACATAGAGGGTGGCTCTGTTCTTCATTT
GGTTCTTGCTCTTAGGGGTGGTGGTTGTGTTTGAAATCAGAACATGCATCTTTC
CT

QA 4 537 4 537
DS 

RD RR2B701TF 651 0 0
TGGGGAGATAAAAGAGGAGACGAAGATTTGTTAACACTCAGGGGCAAAAAGAGAGAGAAA
GATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTCACCGGAAAAACGATAACCCTAGAAGTGGAGAGCAG
CGACACCATCGACAATGTCAAAGCCAAAATCCAGGACAAAGAAGGTATACCACCAGACCA
ACAAAGGCTCATCTTTGCCGGTAAGCAGCTTGAAGACGGCCGAACCCTAGCCGATTACAA
CATCCAGAAAGAGTCTACTCTCCACCTCGTCTTGAGGCTCAGAGGTGGCACCATGATCAA
GGTCAAGACCCTCACCGGCAAAGAAATCGAGATTGATATCGAACCAACCGACACTATTGA
CCGTATCAAGGAACGTGTCGAAGAGAAAGAAGGCATCCCTCCCGTCCAACAAAGGCTTAT
CTATGCAGGGAAGCAGCTTGCTGATGACAAAACGGCCAAAGATTACAACATAGAGGGTGG
CTCTGTTCTTCATTTGGTTCTTGCTCTTAGGGGTGGTGGTTGTGTTTGAAATCAGAACAT
GCATCTTTCTTTTCTTATCTATATTTGAAATCTTTATCATGTTTTCTCTGATTGTGTTTT
GGACTCCATATGAACCCCCTGATTTGATATGATGATATTGGCATGTTGG
GC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2DI96TF 694 0 0
G
GGAGACGAAGATTTGTTAACACTCAGGGGCAAAAAGAGAGAGAAAGATGCAGATCTTCGT
GAAAACCCTCACCGGAAAAACGATAACCCTAGAAGTGGAGAGCAGCGACACCATCGACAA
TGTCAAAGCCAAAATCCAGGACAAAGAAGGTATACCACCAGACCAACAAAGGCTCATCTT
TGCCGGTAAGCAGCTTGAAGACGGCCGAACCCTAGCCGATTACAACATCCAGAAAGAGTC
TACTCTCCACCTCGTCTTGAGGCTCAGAGGTGGCACCATGATCAAGGTCAAGACCCTCAC
CGGCAAAGAAATCGAGATTGATATCGAACCAACCGACACTATTGACCGTATCAAGGAACG
TGTCGAAGAGAAAGAAGGCATCCCTCCCGTCCAACAAAGGCTTATCTATGCAGGGAAGCA
GCTTGCTGATGACAAAACGGCCAAAGATTACAACATAGAGGGTGGCTCTGTTCTTCATTT
GGTTCTTGCTCTTAGGGGTGGTGGTTGTGTTTGAAATCAGAACATGCATCTTTCTTTTCT
TATCTATATTTGAAATCTTTATCATGTTTTCTCTGATTGTGTTTTGGACTTCATATGAAC
CCCCTGATTTGATATGATGATATTGGCATGTTGGTTATATTGTCTCGTGGATAATGCATC
TATCATTGAATAAATTACACACTTCTATTAAAA

QA 2 694 2 694
DS 

RD RR2DI96JQ 630 0 0
TGAAAACCCTCACCGGAAAAACGATAACCCTAGAAGTGGAGAGCAGCGACACCATCGACA
ATGTCAAAGCCAAAATCCAGGACAAAGAAGGTATACCACCAGACCAACAAAGGCTCATCT
TTGCCGGTAAGCAGCTTGAAGACGGCCGAACCCTAGCCGATTACAACATCCAGAAAGAGT
CTACTCTCCACCTCGTCTTGAGGCTCAGAGGTGGCACCATGATCAAGGTCAAGACCCTCA
CCGGCAAAGAAATCGAGATTGATATCGAACCAACCGACACTATTGACCGTATCAAGGAAC
GTGTCGAAGAGAAAGAAGGCATCCCTCCCGTCCAACAAAGGCTTATCTATGCAGGGAAGC
AGCTTGCTGATGACAAAACGGCCAAAGATTACAACATAGAGGGTGGCTCTGTTCTTCATT
TGGTTCTTGCTCTTAGGGGTGGTGGTTGTGTTTGAAATCAGAACATGCATCTTTCTTTTT
TTATCTATATTTGAAATCTTTATCATGTTTTCTCTGATTGTGTTTTGGACTTCATATGAA
CCCCCTGATTTGATATGATGATATTGGCATGTTGGTTATATTGTCTCGTGGATAATGCAT
CTATCATTGAATAAATTACACACTTCTATT

QA 1 630 1 630
DS 



AS 2 4

CO CL1689Contig1 805 2 13 U
CATAAAAACATAAAAGTCTCCCATATATTATAAAAACCAAATTCATACAAAGCACGATAA
AACACAACACACTTGCTTGACAAGGAGAGTACCTCAACTTCTCAAGACATTATTCATTAT
TAAGAAGCATAAAAAAAAAGAAGCTCAAAAGTAGTTTTAGATATTATAGTTCTGCTAGAT
TCCCTCGTCCTTCTCGTCCTCGCTGCTGCAGCTACTACTGTTGCTGCTCCACTGACACTT
CAATGTAAATCTAGGCGACCCACAGTACTTGCCTAGCTTCTCAAACGTCTGATACATCAC
CGTACCACTCTCTTCTCCCAAAGACTCAAATGTCCTCTCTCTGCATCCATAATCTTCCAA
GTCCACACTGATCTCAGGCTTGTAAGCGTTAACCCCAACGCTCGAATGCACTGCCACAGA
GAATTGCTTCGGCTCAAAGCAAGACAGGACTCTAGTCACCAGCTGGCTCAGGTCCATGGT
GTTGAAGTCATAACCAACAGCTTCGAAGCTAGCGTAGCTAAACCCATCCTCAGGGGTAAC
ATGGATAGTGGAGATCGCATCTCCTTCGATGGAGTTCATAGAGTAGCCACAGGGCTCGAA
CTCAAAGTCGCAGATCTGGGAGTTTGGGAGGATCTTTCTGATTCCAGAGTTGTCAGTCAT
TGATCCTGTATCCCCATTCTTGAAGAAGACAGATGCTTTCTCCCTGTCTAGACCAGTCAT
GCACATCTCAAGCGTGTAGACATTGTTGTTGCTTGAGGACTGGGCAGAGGAGGCAGCATA
GACATGCCATTTCTTAGTCTCGTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV96JQ U 51
AF RR2BO53JQ U 1
BS 1 303 RR2BO53JQ
BS 304 304 RR2EV96JQ
BS 305 384 RR2BO53JQ
BS 385 385 RR2EV96JQ
BS 386 414 RR2BO53JQ
BS 415 415 RR2EV96JQ
BS 416 437 RR2BO53JQ
BS 438 438 RR2EV96JQ
BS 439 537 RR2BO53JQ
BS 538 538 RR2EV96JQ
BS 539 729 RR2BO53JQ
BS 730 730 RR2EV96JQ
BS 731 805 RR2BO53JQ

RD RR2EV96JQ 716 0 0
AGCACGATAAAACACAACACACTTGCTTGACAAGGAGAGTACCTCAACTTCTCAAGACAT
TATTCATTATTAAGAAGCATAAAAAAAAA*AAGCTCAAAAGTAGTTTTAGATATTATAGT
TCTGCTAGATTCCTTCGTCCTTCTCGTCCTCGCTGCTGCAGCTACTACTGTTGCTGCTCC
ACTGACACTTCAATGTAGATCTAGGCGACCCACAGTACTTGCCTAGCTTCTCAAACGTCT
GGTACATCACCGTACCACTCTCTTCTCCCAAAGACTCAAATGTCCTCTCTCTGCATCCAT
AATCTTCCAAGTCCACACTGATCTCAGGCTTGTAAGCGTTCACTCCAACGCTCGAGTGCA
CTGCCACAGAGAATTGCTTCGGCTCGAAGCAAGACAGGGCTCTAGTCACCAGCTGGCTCA
GGTCCATGGTGTTGAAGTCATAACCAACAGCTTCGAAGCTAGCGTAGCTAAACCCATCCT
CAGGGGTAACATGGATAGTGGAGATCGCATCTCCTTCGATGGAGTTCATAGAGTAGCCAC
AGGGCTCGAACTCAAAGTCGCAGATCTGGGAGTTTGGGAGGATCTTTCTGATTCCAGAGT
TGTCAGTCATTGATCCTGTCTCGCCATTCTTGAAGAAGACAGATGCTTTCTCCCTGTCTA
GACCAGTCATGCACATCTCAAGCGTGTAGACATTGTTGTTGCTTGAGGACTGGGC
A

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2BO53JQ 805 0 0
CATAAAAACATAAAAGTCTCCCATATATTATAAAAACCAAATTCATACAAAGCACGATAA
AACACAACACACTTGCTTGACAAGGAGAGTACCTCAACTTCTCAAGACATTATTCATTAT
TAAGAAGCATAAAAAAAAAGAAGCTCAAAAGTAGTTTTAGATATTATAGTTCTGCTAGAT
TCCCTCGTCCTTCTCGTCCTCGCTGCTGCAGCTACTACTGTTGCTGCTCCACTGACACTT
CAATGTAAATCTAGGCGACCCACAGTACTTGCCTAGCTTCTCAAACGTCTGATACATCAC
CGTTCCACTCTCTTCTCCCAAAGACTCAAATGTCCTCTCTCTGCATCCATAATCTTCCAA
GTCCACACTGATCTCAGGCTTGTACGCGTTAACCCCAACGCTCGAATGCACTGCTACAGA
GAATTGCTTCGGCTCAAGGCAAGACAGGACTCTAGTCACCAGCTGGCTCAGGTCCATGGT
GTTGAAGTCATAACCAACAGCTTCGAAGCTAGCGTAGCTAAACCCATCCTCAGGGGTCAC
ATGGATAGTGGAGATCGCATCTCCTTCGATGGAGTTCATAGAGTAGCCACAGGGCTCGAA
CTCAAAGTCGCAGATCTGGGAGTTTGGGAGGATCTTTCTGATTCCAGAGTTGTCAGTCAT
TGATCCTGTATCCCCATTCTTGAAGAAGACAGATGCTTTCTCCCTGTCTAGACCAGTCAT
GCACATCTCGAGCGTGTAGACATTGTTGTTGCTTGAGGACTGGGCAGAGGAGGCAGCATA
GACATGCCATTTCTTAGTCTCGTCA

QA 1 805 1 805
DS 



CO CL1689Contig2 1122 2 4 U
GGAGAAAACGCTTCTTCATTTGCCTCATTATTACCAAATCATTCATAAGCGTTTCTCTCA
AATTTAGGGTTTTCTTTTATCTCTTCGAAATCGTCTCAAGAGTTCTATCATTCAAAAGTC
TTTCGTTTTCCTGAATCATCTTTTATCTGGTTTGAAGGTTTTCGTTTTGATATCTGGAAA
GGAGGGATTTTTTCAGTCTGTGGTCTACATCTAAATTCATATATTATATAACGCGTGAAT
GAGATTGTGATGGAATCGAAAGGTGGTAAAAAGAAGTCCAGCAGTAGTAGTAGTTCCTTA
TTTTACGAAGCTCCCCTCGGTTACAGCATTGAAGACGTTCGCCCAAACGGTGGAATCAAG
AAATTCAAATCTTCTGTCTACTCCAACTGCGCTAAGAGGCCATCCTGAGTTGTAGCGTGC
ACCGAGAGTCTCCTAATATAGTTATCGCTTTCTTTACTTTCAAGTTCATCATTTACTTCC
TTATAAGCTCCGTTTCTGCTTGGTTCCCCCAATCCAATCGTTCTCTCCTCCTCCTACAAC
AAACAAGGCGAACATGGCCTTATCTGCAATCGGTTTCGAAGGCTACGAGAAGCGCCTCGA
GGTCACTTTCTTCGAGCCAAGCTTCTTCCAAGACTCCAAGGGCCTGGGTCTCCGTGCTCT
GACCAGGTCCCAGCTTGACGAAATACTCACTCCTGCTGCCTGCGAGATCGTTTCTTCTCT
CTCCAACGATCACCTGGACTCCTACGTCCTCTCTGAGTCCAGCTTCTTTGTCTACCCTTA
CAAAGTCATCATCAAGACTTGCGGCACCACCAAGCTCCTCCTCTCCATCCCGCCGCTTCT
TAAGCTGGCCGGTGAGCTCTCTCTGAATGTAAAGTCTGTTAAATACACTCGTGGCTCCTT
CCTCTGCCCTGGGGGTCAGCCTTTTCCTCACCGCAGCTTCTCTGAGGAAGTCTCTGTTCT
TGATGGTCACTTTTCTAAGCTGGGTTTGAACAGCGTTGCCTACTTGATGGGTAATGATGA
CGAGACTAAGAAATGGCACGTCTATGCTGCCTCCTCCGCCCAGTCCCCAAGCAACAACAA
TGTCTACACGCTTGAGATGTGCATGACTGGTCTAGACAGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV96TF U 1
AF RR2GF32TF U 408
BS 1 545 RR2EV96TF
BS 546 546 RR2GF32TF
BS 547 694 RR2EV96TF
BS 695 1122 RR2GF32TF

RD RR2EV96TF 694 0 0
GGAGAAAACGCTTCTTCATTTGCCTCATTATTACCAAATCATTCATAAGCGTTTCTCTCA
AATTTAGGGTTTTCTTTTATCTCTTCGAAATCGTCTCAAGAGTTCTATCATTCAAAAGTC
TTTCGTTTTCCTGAATCATCTTTTATCTGGTTTGAAGGTTTTCGTTTTGATATCTGGAAA
GGAGGGATTTTTTCAGTCTGTGGTCTACATCTAAATTCATATATTATATAACGCGTGAAT
GAGATTGTGATGGAATCGAAAGGTGGTAAAAAGAAGTCCAGCAGTAGTAGTAGTTCCTTA
TTTTACGAAGCTCCCCTCGGTTACAGCATTGAAGACGTTCGCCCAAACGGTGGAATCAAG
AAATTCAAATCTTCTGTCTACTCCAACTGCGCTAAGAGGCCATCCTGAGTTGTAGCGTGC
ACCGAGAGTCTCCTAATATAGTTATCGCTTTCTTTACTTTCAAGTTCATCATTTACTTCC
TTATAAGCTCCGTTTCTGCTTGGTTCCCCCAATCCAATCGTTCTCTCCTCCTCCTACAAC
AAACATGGCGAACATGGCCTTATCTGCAATCGGTTTCGAAGGCTACGAGAAGCGCCTCGA
GGTCACTTTCTTCGAGCCAAGCTTCTTCCAAGACTCCAAGGGCCTGGGTCTCCGTGCTCT
GACCAGGTCCCAGCTTGACGAAATACTCACTCCT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2GF32TF 715 0 0
G
GTTGTAGCGTGCACCGAGAGTCTCCTAATATAGTTATCGCTTTCTTTACTTTCAAGTTCA
TCATTTACTTCCTTATAAGCTCCGTTTCTGCTTGGTTCCCCCAATCCAATCGTTCTCTCC
TCCTCCTACAACAAACAAGGCGAACATGGCCTTATCTGCAATCGGTTTCGAAGGCTACGA
GAAGCGCCTCGAGGTCTCTTTCTTCGAGCCAAGCTTCTTCCAAGACTCCAAGGGCCTGGG
TCTCTGTGCTCTGACCAGGTCCCAGCTTGACGAAATACTCACTCCTGCTGCCTGCGAGAT
CGTTTCTTCTCTCTCCAACGATCACCTGGACTCCTACGTCCTCTCTGAGTCCAGCTTCTT
TGTCTACCCTTACAAAGTCATCATCAAGACTTGCGGCACCACCAAGCTCCTCCTCTCCAT
CCCGCCGCTTCTTAAGCTGGCCGGTGAGCTCTCTCTGAATGTAAAGTCTGTTAAATACAC
TCGTGGCTCCTTCCTCTGCCCTGGGGGTCAGCCTTTTCCTCACCGCAGCTTCTCTGAGGA
AGTCTCTGTTCTTGATGGTCACTTTTCTAAGCTGGGTTTGAACAGCGTTGCCTACTTGAT
GGGTAATGATGACGAGACTAAGAAATGGCACGTCTATGCTGCCTCCTCCGCCCAGTCCCC
AAGCAACAACAATGTCTACACGCTTGAGATGTGCATGACTGGTCTAGACAGGAG

QA 2 715 2 715
DS 



AS 1 5

CO CL1690Contig1 1534 5 30 U
GCGTCAAATTGTTTCGGATTGGTAAAAACTTTATCATTTCACCTGTTATGGTGGTTATTG
ACAGCTGAAATTATTTATTTTTACGAGGATCGGGCAGAACAGAAACACCTCAAGAATTGT
AAAACCAAAACCCATTTTTGGTAGTCGGTAACCAAATGGAAAAAAAAACCGAAACAAGTG
ACTCAGAGCTTTATCCTGAAGACCAACAGTTATGGTTCTGGATGTGCACGTCGATCCGAG
GTTTATTATGTGGTAATCATCCAAGGTTTCATTTCATCAATAGCTGAATCTTTCTCTCAC
AGAAGAAGTCTTCGAACATCCTCAAAGTTTGAACGCAGTTCAGACAGAAACGAAGCTCCA
ACTTGTCCATCAAAGATCCGATGATCAGCGGATAACGTCACATTCATTTTTGTTACTAGA
GAAGGCTTCTCGGTTCCATCTATTCCAAGAACTGCCTCCACAACTTTATTTCCTCTACCA
ACTGCTAGAATTCCAGCCTGAGGGGGGTTAATGATTGCGCAGAATTGGTCCACAGGATAC
ATTCCTAGATTTGAAATGCTGAATGTCCCTCCTTGAAACTCATGAGGAGCAAGCTTTCCA
GATCGCGCCTTTTGTGCCAGCTCCTTAACCTCTGAGGATATAGCAGAAATAGATTTCTGG
TCAGCATTTCTAATAATTGGAGTCATTAAGCCCTTATCAGTTGCAACTGCAATTGATATG
TCAACATCCTCACACAAAACAATTTCTCCTTTCTCAGCATCCCAGAAAGCATTAGCTTGT
CGTACATTCCTCAGTGCGACTGCCACTGCTTTAATAACTATGTCATTGACCGACACTTTA
ACACCATGGTTTTCTTGAAGTTCTTTTCTAAATGCAAGAAGAGGATCCAATACAACATCT
GATGATAAATACAAATGGGGTATCTTCTGTTTTGATTCCAACAAACGTTTGGCTATAATC
TTGCGAATTTGACTATTGGGAAAATCTTCATAATCATTTGACGGTGTCACAGAAGACTTT
GATTCAGGCCGCGATACGGAAGAGGATTTAGATAGGTTCTCCTTTGATGGCTGTTTCTTC
TCCGTAGAGAGTGATTTTTTAGATGTTTTTCCAGAAGCAATTGCGGCAACAACGTCCGAT
TTTAGTAATGTACCGTAGGGACCCGAGGCCTCAATTGATGATGCCTCCATGTTCTAAAAT
CAAAAGCTTTGCTGCAGGACTGATCTTTGTGAAGCCTGCTTTCTTCCCCCCGGATTTATC
TACAACACTTTGAGGGGCTAGTTTTTCAGTAACAGCCTCAGAACCACCTGCGGAAGAAGA
CTTGATGGTTTCAATGCTTTCAGCATCTTCAACTATAAGTGCAATCGGCTTTCCGACAGC
CACATCCTTGGAACCTTCAGGAATTAGAATCTTAGCCAGGTACCCTTCTTCAAGGCTTTC
AAATTCCAGAGTGGCTTTGTCAGTCTCGATTTCACCTATGACATCACCTACTTCAATCTT
GTCACCCTCTTTTTTCCACCATTTGGCAATGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 5 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA53JQ U 89
AF RR2EG65JQ U 1
AF RR2FA53TF C 78
AF RR2D551JQ U 60
AF RR2EG65TF C 822
BS 1 96 RR2EG65JQ
BS 97 97 RR2FA53JQ
BS 98 101 RR2EG65JQ
BS 102 102 RR2D551JQ
BS 103 132 RR2EG65JQ
BS 133 133 RR2D551JQ
BS 134 166 RR2EG65JQ
BS 167 167 RR2D551JQ
BS 168 168 RR2FA53JQ
BS 169 173 RR2EG65JQ
BS 174 174 RR2D551JQ
BS 175 181 RR2EG65JQ
BS 182 182 RR2FA53JQ
BS 183 215 RR2EG65JQ
BS 216 216 RR2D551JQ
BS 217 237 RR2EG65JQ
BS 238 238 RR2FA53JQ
BS 239 274 RR2EG65JQ
BS 275 275 RR2D551JQ
BS 276 280 RR2EG65JQ
BS 281 281 RR2D551JQ
BS 282 353 RR2EG65JQ
BS 354 354 RR2D551JQ
BS 355 365 RR2EG65JQ
BS 366 366 RR2D551JQ
BS 367 384 RR2EG65JQ
BS 385 695 RR2D551JQ
BS 696 696 RR2FA53TF
BS 697 880 RR2D551JQ
BS 881 1534 RR2EG65TF

RD RR2FA53JQ 219 0 0
ATCGGGCAGAACAAAAACACCTCAAGAATTGTAAAACCAAAACCCATTTTTGGTAGTCGG
TAACCAAATGGAAAAAAAAACCGAAACAAGTGACTCACAGCTTTATCCTGAAGACCAACA
GTTATGGTTCTGGATGTGCACGTCCATCCGAGGTTTATTATGTGGTAATCATCCAAGGTT
TCATTTCCTCAATAGCTGAATCTTTCTCTCACAGAA
AAA

QA 1 216 1 216
DS 

RD RR2EG65JQ 384 0 0
GCGTCAAATTGTTTCGGATTGGTAAAAACTTTATCATTTCACCTGTTATGGTGGTTATTG
ACAGCTGAAATTATTTATTTTTACGAGGATCGGGCAAAACAAAAACACCTCAAGAATTGT
AAAACCAAAACCAATTTTTGGTAGTCGGTAACCAAATGGAAAAAAA**CCGAAGCAAGTG
ATTCAGAGCTTTATCCTGAAGACCAACAGTTATGGCTCTGGATGTGCACGTCGATCCAAG
GTTTATTATGTGGTAATCATCCAAGGTTTCATTTGATCAACAGCTGAATCTTTCTCTCAC
AGAAGAAGTCTTCGAACATCCTCAAAGTTTGAACGCAGTTCAGACAGAAACGAGGCTCCA
ACTTGGCCATCAAAGATCCGATGA

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR2FA53TF 643 0 0
TTTTTACGAGGATCGGGCAGAACAGAAACACCTCAAGAATTGTAAAACCAAAACCCATTT
TTGGTAGTCGGTAACCAAATGGAAAAAAAAACCGAAACAAGTGACTCAGAGCTTTATCCT
GAAGACCAACAGTTATGGTTCTGGATGTGCACGTCGATCCGAGGTTTATTATGTGGTAAT
CATCCAAGGTTTCATTTCATCAATAGCTGAATCTTTCTCTCACAGAAGAAGTCTTCGAAC
ATCCTCAAAGTTTGAACGCAGTTCAGACAGAAACGAAGCTCCAACTTGTCCATCAAAGAT
CCGATGATCAGCGGATAACGTCACATTCATTTTTGTTACTAGAGAAGGCTTCTCGGTTCC
ATCTATTCCAAGAACTGCCTCCACAACTTTATTTCCTCTACCAACTGCTAGAATTCCAGC
CTGAGGGGGGTTAATGATTGCGCAGAATTGGTCCACAGGATACATTCCTAGATTTGAAAT
GCTGAATGTCCCTCCTTGAAACTCATGAGGAGCAAGCTTTCCAGATCGCGCCTTTTGTGC
CAGCTCCTTAACCTCTGAGGATATAGCAGAAATAGATTTCTGGTCAGCATTTCTAATAAT
TGGAGTCATTAAGCCCTTATCAGTTGCAACTGCAATTGATAT
C

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2D551JQ 821 0 0
GG
CAGCTGAAATTATTTATTTTTACGAGGATCGGGCAAAACAGAGACACCTCAAGAATTGTA
AAACCAAAACCCATTTTTGGTAGTCGGTAACCAAATGGAAAAAAAA*CCGAAACAAGTGA
TTCAGAGCTTTATCCTGAAGACCAACAGTTATGGTTCTGGATGTGCACGTCGATCCAAGG
TTTATTATGTGGTAATCATCCAAGGTTTCATTTCATCAATAGCTGAATCTTTCTCTCACA
GAAGAAGTCTTCGAACATCCTCAAAGTTTGAACGCAGTTCAGACAGAAACGAAGCTCCAA
CTTGTCCATCAAAGATCCGATGATCAGCGGATAACGTCACATTCATTTTTGTTACTAGAG
AAGGCTTCTCGGTTCCATCTATTCCAAGAACTGCCTCCACAACTTTATTTCCTCTACCAA
CTGCTAGAATTCCAGCCTGAGGGGGGTTAATGATTGCGCAGAATTGGTCCACAGGATACA
TTCCTAGATTTGAAATGCTGAATGTCCCTCCTTGAAACTCATGAGGAGCAAGCTTTCCAG
ATCGCGCCTTTTGTGCCAGCTCCTTAACCTCTGAGGATATAGCAGAAATAGATTTCTGGT
CAGCATTTCTAATAATTGGAGTCATTAAGCCCTTCTCAGTTGCAACTGCAATTGATATGT
CAACATCCTCACACAAAACAATTTCTCCTTTCTCAGCATCCCAGAAAGCATTAGCTTGTC
GTACATTCCTCAGTGCGACTGCCACTGCTTTAATAACTATGTCATTGACCGACACTTTAA
CACCATGGTTTTCTTGAAGTTCTTTTCTAAATGCAAGAA

QA 3 821 3 821
DS 

RD RR2EG65TF 713 0 0
GTCATTGACCGACACTTTAACACCATGGTTTTCTTGAAGT*CTTTTCTAAATGCAAGAAG
AGGATCCAATACAACATCTGATGATAAATACAAATGGGGTATCTTCTGTTTTGATTCCAA
CAAACGTTTGGCTATAATCTTGCGAATTTGACTATTGGGAAAATCTTCATAATCATTTGA
CGGTGTCACAGAAGACTTTGATTCAGGCCGCGATACGGAAGAGGATTTAGATAGGTTCTC
CTTTGATGGCTGTTTCTTCTCCGTAGAGAGTGATTTTTTAGATGTTTTTCCAGAAGCAAT
TGCGGCAACAACGTCCGATTTTAGTAATGTACCGTAGGGACCCGAGGCCTCAATTGATGA
TGCCTCCATGTTCTAAAATCAAAAGCTTTGCTGCAGGACTGATCTTTGTGAAGCCTGCTT
TCTTCCCCCCGGATTTATCTACAACACTTTGAGGGGCTAGTTTTTCAGTAACAGCCTCAG
AACCACCTGCGGAAGAAGACTTGATGGTTTCAATGCTTTCAGCATCTTCAACTATAAGTG
CAATCGGCTTTCCGACAGCCACATCCTTGGAACCTTCAGGAATTAGAATCTTAGCCAGGT
ACCCTTCTTCAAGGCTTTCAAATTCCAGAGTGGCTTTGTCAGTCTCGATTTCACCTATGA
CATCACCTACTTCAATCTTGTCACCCTCTTTTTTCCACCATTTGGCAATGTTC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 5

CO CL1691Contig1 1144 5 9 U
AGGGCCTCACATTCTCGTTAAAATCGCGCAACACCTTACCCATCTCCGGACGGCGAACAT
CTCCAAATCCTCGACGACGGCAAACCCAATTTCTCAAAATCCGAAAGTTTCAAACTTTTG
ATTTTGATTTGGTGGTGGAGCGATATGGACGATTACACTAGAGAGATGATGGATCTCAAG
ACCTTAGTCACTCGAACCCTCGAGAAGAAGGGTGTTCTCGCTAAGATCCGGGCTGAGCTA
CGAGCGAGTGTGTTTGAGGCAATTGAAGAAGAGGATCGAGTGATTGAGAACAACGAAGGG
CTGCCACCAGCTTTGTTGGGAAGCTGTAATGATCGTGCAAGGCAGCTTCATGCTCTTCCC
TCAGGTAGGTTGCTGTGTGCGTTAGTTTGTGAGTACTTGGAATGGGCGCAACTCGATCAC
ACGCTCAAAGTGTATCAACCCGAATGCAATTTGCAAAAGGACTCTTGGAAGTCTGAATTA
AGCGACTTTAGCAGCAACCATGGTTATGAGCTCAACAGAAATGGAGATAGCGCACCTCTC
CTTCTCGATGTTCTTGAAGGATTCTTGAAGTTCGAGAGCATGACACAGATTACTAATTCA
AGGAGAGACTCTGAAACTGAGTCTTCATCAAGCCTTGACTCTAGGAATCCTCCTCGCAGA
TCATCTGCATCTGACAATTTGCCTCCTCTAAGAAGGACGGGTTCTGGATCCCAAGGAGCA
GATAGAAGAGGTGGGAGTAATTACAGAAAAGATGAAATCAACTGGAGACACGGTAATCAA
GATGCGCATGAAGAGGTGATGAGAGCTTCAGCGGCACTTGAGAATCTTCAGCTTGATAGG
AAAACTCGGAACATGACATCCTCTTGGAGGAATGTGAGGGATGGAGCAAATGAAGATGAA
GGGAGGGATTGAGTTAGGAGGTGGCTAATTAAAAAATGCAGCTTCTGAGAATTGAGTGTT
GGTTTGTGTACGTGTGATATGTATGTATGCTCTTTATTTGCAAACTGTGTGTTTCGCGGG
AACCCCTTCTGTCTCTTTTAAGGTTATTCATGAGATCATATTGAACTGTTTAATGTTTAT
TTCTGAATTTTTTACGCATAGAAACACTTTTCCACATTCCAATGAGTTGATTACTTTCTA
GGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2AV25TF U 1
AF RR2DI87TF U 9
AF RR2B392TF U 12
AF RR2DI87JQ C 691
AF RR2AV25JQ C 369
BS 1 172 RR2AV25TF
BS 173 173 RR2DI87TF
BS 174 694 RR2AV25TF
BS 695 695 RR2B392TF
BS 696 711 RR2AV25TF
BS 712 727 RR2B392TF
BS 728 754 RR2AV25JQ
BS 755 755 RR2DI87JQ
BS 756 1144 RR2AV25JQ

RD RR2AV25TF 711 0 0
AGGGCCTCACATTCTCGTTAAAATCGCGCAACACCTTACCCATCTCCGGACGGCGAACAT
CTCCAAATCCTCGACGACGGCAAACCCAATTTCTCAAAATCCGAAAGTTTCAAACTTTTG
ATTTTGATTTGGTGGTGGAGCGATATGGACGATTACACTAGAGAGATGATGGGTCTCAAG
ACCTTAGTCACTCGAACCCTCGAGAAGAAGGGTGTTCTCGCTAAGATCCGGGCTGAGCTA
CGAGCGAGTGTGTTTGAGGCAATTGAAGAAGAGGATCGAGTGATTGAGAACAACGAAGGG
CTGCCACCAGCTTTGTTGGGAAGCTGTAATGATCGTGCAAGGCAGCTTCATGCTCTTCCC
TCAGGTAGGTTGCTGTGTGCGTTAGTTTGTGAGTACTTGGAATGGGCGCAACTCGATCAC
ACGCTCAAAGTGTATCAACCCGAATGCAATTTGCAAAAGGACTCTTGGAAGTCTGAATTA
AGCGACTTTAGCAGCAACCATGGTTATGAGCTCAACAGAAATGGAGATAGCGCACCTCTC
CTTCTCGATGTTCTTGAAGGATTCTTGAAGTTCGAGAGCATGACACAGATTACTAATTCA
AGGAGAGACTCTGAAACTGAGTCTTCATCAAGCCTTGACTCTAGGAATCCTCCTCGCAGA
TCATCTGCATCTGACAATTTGCCTCCTCTAAGAAAGACGGGTTCTGGATCC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2DI87TF 682 0 0
GGATT
CTCGTTAAAATCGCGCAACACCTTACCCATCTCCGGACGGCGAACATCTCCAAATCCTCG
ACGACGGCAAACCCAATTTCTCAAAATCTGAAAGTTTCAAACTTTTGATTTTGATTTGGT
GGTGGAGCGATATGGACGATTACACTAGAGAGATGATGGATCTCAAGACCTTAGTCACTC
GAACCCTCGAGAAGAAGGGTGTTCTCGCTAAGATCCGGGCTGAGCTACGAGCGAGTGTGT
TTGAGGCAATTGAAGAAGAGGATCGAGTGATTGAGAACAACGAAGGGCTGCCACCAGCTT
TGTTGGGAAGCTGTAATGATCGTGCAAGGCAGCTTCATGCTCTTCCCTCAGGTAGGTTGC
TGTGTGCGTTAGTTTGTGAGTACTTGGAATGGGCGCAACTCGATCACACGCTCAAAGTGT
ATCAACCCGAATGCAATTTGCAAAAGGACTCTTGGAAGTCTGAATTAAGCGACTTTAGCA
GCAACCATGGTTATGAGCTCAACAGAAATGGAGATAGCGCACCTCTCCTTCTCGATGTTC
TTGAAGGATTCTTGAAGTTCGAGAGCATGACACAGATTACTAATTCAAGGAGAGACTCTG
AAACTGAGTCTTCATCAAGCCTTGACTCTAGGAATCCTCCTCGCAGATCATCTGCATCCG
ACAATTTGCCTCCTCTA

QA 6 682 6 682
DS 

RD RR2B392TF 716 0 0
GG
CTCGTTAAAATCGCGCAACACCTTACCCATCTCCGGACGGCGAACATCTCCAAATCCTCG
ACGACGGCAAACCCAATTTCTCAAAATCCGAAAGGTTCAAACTTTTGATTTTGATTTGGT
GGTGGAGCGATATGGACGATTACACTAGAGAGATGATGGATCTCAAGACCTTAGTCACTC
GAACCCTCGAGAAGAAGGGTGTTCTCGCTAAGATCCGGGCTGAGCTACGAGCGAGTGTGT
TTGAGGCAATTGAAGAAGAGGATCGAGTGATTGAGAACAACGAAGGGCTGCCACCAGCTT
TGTTGGGAAGCTGTAATGATCGTGCAAGGCAGCTTCATACTCTTCCCTCAGGTAGGTTGC
TGTGTGCGTTAGTTTGTGAGTACTTGGAATGGGCGCAACTCGATCACACGCTCAAAGTGT
ATCAACCCGAATGCAATTTGCAAAAGGACTCTTGGAAGTCTGAATTAAGCGACTTTAGCA
GCAACCATGGTTATGAGCTCAACAGAAATGGAGATAGCGCACCTCTCCTTCTCGATGTTC
TTGAAGGATTCTTGAAGTTCGAGAGCATGACACAGATTACTAATTCAAGGAGAGACTCTG
AAACTGAGTCTTCATCAAGCCTTGACTCTAGGAATCCTCCTCGCAGATCATCTGCATCTG
ACAATTTGCCTCCTCTAAGAAGGACGGGTTCTGGATCCCAAGGAGCAGATAGAA

QA 3 716 3 716
DS 

RD RR2DI87JQ 407 0 0
AGAAGGACGGGTTCTGGATCCCAAGGAGCAGAT*GAAGAGGTGGGAGTAATTACAGAAAA
GATGAAATCAACTGGAGACACGGTAATCAAGATGCGCATGAAGAGGTGATGAGAGCTTCA
GCGGCACTTGAGAATCTTCAGCTTGATAGGAAAACTCGGAACATGACATCCTCTTGGAGG
AATGTGAGGGATGGAGCAAATGAAGATGAAGGGAGGGATTGGGTTAGGAGGTTGCTAATT
AAAAAATGCAGCTTCTGAGAATTGAGTGTTGGTTTGTGTACGTGTGATATGTATGTATGC
TCTTTATTTGCAAACTGTGTGTTTCGCGGGAACCCCTTCTGTCTCTTTTAAGGTTATTCA
TGAGATCATATTGAACTGTTTAATGTTTATTTCTGAATTTTTTACGC

QA 1 407 1 407
DS 

RD RR2AV25JQ 776 0 0
GTTGCTGTGTGCGTTAGTTTGTGAGTACTTGGAATGGGCGCAACTCGATCACACGCTCAA
AGTGTATCAACCCGAATGCAATTTGCAAAAGGACTCTTGGAAGTCTGAATTAAGCGACTT
TAGCAGCAACCATGGTTATGAGCTCAACAGAAATGGAGATAGCGCACCTCTCCTTCTCGA
TGTTCTTGAAGGATTCTTGAAGTTCGAGAGCATGACACAGATTACTAATTCAAGGAGAGA
CTCTGAAACTGAGTCTTCATCAAGCCTTGACTCTAGGAATCCTCCTCGCAGATCATCTGC
ATCTGACAATTTGCCTCCTCTAAGAAGGACGGGTTCTGGATCCCAAGGAGCAGATAGAAG
AGGTGGGAGTAATTACAGAAAAGATGGAATCAACTGGAGACACGGTAATCAAGATGCGCA
TGAAGAGGTGATGAGAGCTTCAGCGGCACTTGAGAATCTTCAGCTTGATAGGAAAACTCG
GAACATGACATCCTCTTGGAGGAATGTGAGGGATGGAGCAAATGAAGATGAAGGGAGGGA
TTGAGTTAGGAGGTGGCTAATTAAAAAATGCAGCTTCTGAGAATTGAGTGTTGGTTTGTG
TACGTGTGATATGTATGTATGCTCTTTATTTGCAAACTGTGTGTTTCGCGGGAACCCCTT
CTGTCTCTTTTAAGGTTATTCATGAGATCATATTGAACTGTTTAATGTTTATTTCTGAAT
TTTTTACGCATAGAAACACTTTTCCACATTCCAATGAGTTGATTACTTTCTAGGAT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 2 5

CO CL1692Contig1 648 2 2 U
GACTTGCAACATATCCAAGTATTATTGACTTTAAAACTAATCTCGAAACATACAATCAAT
TTGCAAAATTCAGATGTAACATGAGTTGCAACACACACACACAGACAAACACAAGTATAT
TATTGACTTTAAAGTTGAAATACAAAGAGACATGTTTTTTGAAAGCTTTTTTTATTTCTA
GGACAGGTGATAAACATTATTGACCTTTGAGGTTTGGTCTTTTCAGGAGGAGTATCTGTC
GCGGTCATGAGGCAAAGAGTAATCGATGTTTGGTCCATGAGGGATGATCCCAAACGGGTT
TAACGTAGGGTGGCTTCCGTAGTAATGTTGCTTGATGTGATCCATTTTCACAGTACTGCT
CATTCCATTGATTTGGTATACATCTTTTATGTAGTTGAAGATATTCGGATACTCTCTTAA
GAGTCTATTATTGCATTTGAAGTGAACCGCGTAAACCTCATCAAATCTTATGAGGGTGAC
GAATAACCGAACATCTGCTTCAGTAAACGTGTCTCCACAGATGTATCGTTGTTTTTCGAG
TATTGTCTCACATCTCTCTACTGCTTCAAACACTTGGTTCACTGCCTCATTGTAAGGTTC
TTGTTTCCTAGCAAACCCACATCTATAAACACCATTGTTTATCCCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH24JQ U 1
AF RR2H412JQB U 102
BS 1 641 RR2DH24JQ
BS 642 648 RR2H412JQB

RD RR2DH24JQ 641 0 0
GACTTGCAACATATCCAAGTATTATTGACTTTAAAACTAATCTCGAAACATACAATCAAT
TTGCAAAATTCAGATGTAACATGAGTTGCAACACACACACACAGACAAACACAAGTATAT
TATTGACTTTAAAGTTGAAATACAAAGAGACATGTTTTTTGAAAGCTTTTTTTATTTCTA
GGACAGGTGATAAACATTATTGACCTTTGAGGTTTGGTCTTTTCAGGAGGAGTATCTGTC
GCGGTCATGAGGCAAAGAGTAATCGATGTTTGGTCCATGAGGGATGATCCCAAACGGGTT
TAACGTAGGGTGGCTTCCGTAGTAATGTTGCTTGATGTGATCCATTTTCACAGTACTGCT
CATTCCATTGATTTGGTATACATCTTTTATGTAGTTGAAGATATTCGGATACTCTCTTAA
GAGTCTATTATTGCATTTGAAGTGAACCGCGTAAACCTCATCAAATCTTATGAGGGTGAC
GAATAACCGAACATCTGCTTCAGTAAACGTGTCTCCACAGATGTATCGTTGTTTTTCGAG
TATTGTCTCACATCTCTCTACTGCTTCAAACACTTGGTTCACTGCCTCATTGTAAGGTTC
TTGTTTCCTAGCAAACCCACATCTATAAACACCATTGTTTA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2H412JQB 547 0 0
CG
GACAAACACAAGTATATTATTGACTTTAAAGTTGAAATACAAAGAGACATGTTTTTTGAA
AGCTTTTTTTATTTCTAGGACAGGTGATAAACATTATTGACCTTTGAGGTTTGGTCTTTT
CAGGAGGAGTATCTGTCGCGGTCATGAGGCAAAGAGTAATCGATGTTTGGTCCATGAGGG
ATGATCCCAAACGGGTTTAACGTAGGGTGGCTTCCGTAGTAATGTTGCTTGATGTGATCC
ATTTTCACAGTACTGCTCATTCCATTGATTTGGTATACATCTTTTATGTAGTTGAAGATA
TTCGGATACTCTCTTAAGAGTCTCTTATTGCATTTGAAGTGAACCGCGTAAACCTCGTCA
AATCTTATGAGGGTGACGAATAACCGAACATCTGCTTCAGTAAACGTGTCTCCACAGATG
TATCGTTGTTTTTCGAGTATTGTCTCACATCTCTCTACTGCTTCAAACACTTGGTTCACT
GCCTCATTGTAAGGTTCTTGTTT**TAGCAAACCCACATCTATAAACACCATTGTTTATC
CCATT

QA 3 547 3 547
DS 



CO CL1692Contig2 838 3 2 U
GGACACACAAACATCCTTTTCTAACCTTATCGCCACAAAAAAAGTCATCGTTCAACAACA
GCAACATTCACTGTCTATCTTTGGTAGATCTTGTCTTCAAACACACACCACCATCATCAG
ATATTCATGGCTAGGTCTGGGGTTGATGAGACATCAGAATCTGGAGCTTTTGTAAGAACA
GCATCTACATTCCGAAGCTTTGTCTCACAAGATCCTGCTTCTCAGTTCCCACCCGAATCC
GGAAGATACCATCTTTACATTTCCTATGCTTGTCCATGGGCTTGTAGATGTCTCTCTTTC
TTGATCCTCAAAGGTCTTGACGAAGCTATCACCTTCTCGTCGTGTCACACAATTTGGGGA
AGAACTAAAGAAACTGATGACCATAGAGGATGGGTTTTCCCTGATTCAGACACTGAGCTC
CCTGGAGCTGAGCCTGATTATCTTAATGGTGCCAAGACTGTGAGAGACCTCTATGAGATT
GCTAGTCCCAACTATGTGGGAAAGTACACTGTTCCTATTCTATGGGATAAGAAGCTTAAG
ACTGTGGTTAACAACGAGAGTTCAGAGATAATCAGGATGCTCAACACTGAGTTCAACGGT
GTTGCGAAAAACCCGTCGCTCGACCTTTATCCTTCTCATCTTAGAGAAGCAATCGACGAG
ACTAATGAATGGGTTTTCAATGGGATAAACAATGGTGTTTATAGATGTGGGTTTGCTAGA
AACAAGAGCCTTACAATGAGCAGTGAACAAGTGTTTGAAGCAGTAGAGAGATGTGAGACA
TACTCGAAAACAACGATACATCTGTGGAGACACGTTACTGAGCAGATGTTCGGTATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH24TF U 1
AF RR2H412TF U 27
AF RR2DN26TF U 27
BS 1 716 RR2DH24TF
BS 717 838 RR2DN26TF

RD RR2DH24TF 716 0 0
GGACACACAAACATCCTTTTCTAACCTTATCGCCACAAAAAAAGTCATCGTTCAACAACA
GCAACATTCACTGTCTATCTTTGGTAGATCTTGTCTTCAAACACACACCACCATCATCAG
ATATTCATGGCTAGGTCTGGGGTTGATGAGACATCAGAATCTGGAGCTTTTGTAAGAACA
GCATCTACATTCCGAAGCTTTGTCTCACAAGATCCTGCTTCTCAGTTCCCACCCGAATCC
GGAAGATACCATCTTTACATTTCCTATGCTTGTCCATGGGCTTGTAGATGTCTCTCTTTC
TTGATCCTCAAAGGTCTTGACGAAGCTATCACCTTCTCGTCGTGTCACACAATTTGGGGA
AGAACTAAAGAAACTGATGACCATAGAGGATGGGTTTTCCCTGATTCAGACACTGAGCTC
CCTGGAGCTGAGCCTGATTATCTTAATGGTGCCAAGACTGTGAGAGACCTCTATGAGATT
GCTAGTCCCAACTATGTGGGAAAGTACACTGTTCCTATTCTATGGGATAAGAAGCTTAAG
ACTGTGGTTAACAACGAGAGTTCAGAGATAATCAGGATGCTCAACACTGAGTTCAACGGT
GTTGCGAAAAACCCGTCGCTCGACCTTTATCCTTCTCATCTTAGAGAAGCAATCGACGAG
ACTAATGAATGGGTTTTCAATGGGATAAACAATGGTGTTTATAGATGTGGGTTTGC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2H412TF 649 0 0
GG
ATCGCCACAAAAAAAGTCATCGTTCAACAACAGCAACACTCACTGTCTATCTTTGGTAGA
TCTTGTCTTCAAACACACACCACCATCATCAGATATTCATGGCTAGGTCTGGGGTTGATG
AGACATCAGAATCTGGAGCTTTTGTAAGAACAGCATCTACATTCCGAAGCTTTGTCTCAC
AAGATCCTGCTTCTCAGTTCCCACCCGAATCCGGAAGATACCATCTTTACATTTCCTATG
CTTGTCCATGGGCTTGTAGATGTCTCTCTTTCTTGATCCTCAAAGGTCTTGACGAAGCTA
TCACCTTCTCGTCGTGTCACACAATTTGGGGAAGAACTAAAGAAACTGATGACCATAGAG
GATGGGTTTTCCCTGATTCAGACACTGAGCTCCCTGGAGCTGAGCCTGATTATCTTAATG
GTGCCAAGACTGTGAGAGACCTCTATGAGATTGCTAGTCCCAACTATGTGGGAAAGTACA
CTGTTCCTATTCTATGGGATAAGAAGCTTAAGACTGTGGTTAACAACGAGAGTTCAGAGA
TAATCAGGATGCTCAACACTGAGTTCAACGGTGTTGCGAAAAACCCGTCGCTCGACCTTT
ATCCTTCTCATCTTAGAGAAGCAATCGACGAGACTAATGAATGGGTT

QA 3 649 3 649
DS 

RD RR2DN26TF 812 0 0
GG
ATCGCCACAAAAAAAGTCATCGTTCAACAACAGCAACATTCACTGTCTATCTTTGGTAGA
TCTTGTCTTCAAACACACACCACCATCATCAGATATTCATGGCTAGGTCTGGGGTTGATG
AGACATCAGAATCTGGAGCTTTTGTAAGAACAGCATCTACATTCCGAAGCTTTGTCTCAC
AAGATCCTGCTTCTCAGTTCCCACCCGAATCCGAAAGATACCATCTTTACATTTCCTATG
CTTGTCCATGGGCTTGTAGATGTCTCTCTTTCTTGATCCTCAAAGGTCTTGACGAAGCTA
TCACCTTCTCGTCGTGTCACACAATTTGGGGAAGAACTAAAGAAACTGATGACCATAGAG
GATGGGTTTTCCCTGATTCAGACACTGAGCTCCCTGGAGCTGAGCCTGATTATCTTAATG
GTGCCAAGACTGTGAGAGACCTCTATGAGATTGCTAGTCCCAACTATGTGGGAAAGTACA
CTGTTCCTATTCTATGGGATAAGAAGCTTAAGACTGTGGTTAACAACGAGAGTTCAGAGA
TAATCAGGATGCTCAACACTGAGTTCAACGGTGTTGCGAAAAACCCGTCGCTCGACCTTT
ATCCTTCTCATCTTAGAGAAGCAATCGACGAGACTAATGAATGGGTTTTCAATGGGATAA
ACAATGGTGTTTATAGATGTGGGTTTGCTAGAAACAAGAGCCTTACAATGAGCAGTGAAC
AAGTGTTTGAAGCAGTAGAGAGATGTGAGACATACTCGAAAACAACGATACATCTGTGGA
GACACGTTACTGAGCAGATGTTCGGTATCG

QA 3 812 3 812
DS 



AS 1 5

CO CL1693Contig1 668 5 5 U
GGAAAACTATTCTCCTCTTCGTAGCTGCGCTTGTTGCCGCAAGTACCTCTTTGCTGTTGA
TTCTCTCCCTCTCCTTCCATCGACAAACATGGGTAAGACAAGAGGAATGGGAGCTGGGCG
CAAGCTCAAAAGGCTCAGGATTAATCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCTCA
TCAGGGTAATGAGTGGAAGAAGCCTTTCGCTGGTTCTTCTCACGCCAAGGGCATCGTTCT
TGAGAAAATCGGTATTGAGGCTAAGCAGCCTAACTCTGCTATCCGTAAGTGTGCTAGAGT
CCAACTTATCAAGAACGGAAAGAAGATTGCCGCTTTTGTCCCCAACGATGGTTGTTTGAA
CTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATCGCTGGATTTGGTCGTAAGGGTCACGCTGT
GGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCAAGGTTGTCAAGGTTTCTGGTGTTTCACTCTTGGC
CCTCTTCAAAGAGAAGAAGGAGAAGCCAAGATCTTAAACAATGCGCCAAGCTTTTGAAAT
TATTTTGATGTTATAATCACTTTTTGCTAGTTCAGTTTTAAAGAATACTCTCTTCTTTTC
TACTTTAAGCAAGAACATGGTGTGTTGAAACCTATTTTTCTTAATGAATCTTTGAGTTTA
GCTTGATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP35TF U 1
AF RR2DP35JQ C 1
AF RR2D493TF U 31
AF RR2D930JQ C 31
AF RR2D930TF U 39
BS 1 59 RR2DP35TF
BS 60 60 RR2D493TF
BS 61 636 RR2DP35TF
BS 637 661 RR2D493TF
BS 662 668 RR2D930JQ

RD RR2DP35TF 636 0 0
GGAAAACTATTCTCCTCTTCGTAGCTGCGCTTGTTGCCGCAAGTACCTCTTTGCTGTTGG
TTCTCTCCCTCTCCTTCCATCGACAAACATGGGTAAGACAAGAGGAATGGGAGCTGGGCG
CAAGCTCAAAAGGCTCAGGATTAATCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCTCA
TCAGGGTAATGAGTGGAAGAAGCCTTTCGCTGGTTCTTCTCACGCCAAGGGCATCGTTCT
TGAGAAAATCGGTATTGAGGCTAAGCAGCCTAACTCTGCTATCCGTAAGTGTGCTAGAGT
CCAACTTATCAAGAACGGAAAGAAGATTGCCGCTTTTGTCCCCAACGATGGTTGTTTGAA
CTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATCGCTGGATTTGGTCGTAAGGGTCACGCTGT
GGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCAAGGTTGTCAAGGTTTCTGGTGTTTCACTCTTGGC
CCTCTTCAAAGAGAAGAAGGAGAAGCCAAGATCTTAAACAATGCGCCAAGCTTTTGAAAT
TATTTTGATGTTATAATCACTTTTTGCTAGTTCAGTTTTAAAGAATACTCTCTTCTTTTC
TACTTTAAGCAAGAACATGGTGTGTTGAAACCTATT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2DP35JQ 661 0 0
GGAAAACTATTCTCCTCTTCGTAGCTGCGCTTGTTGCCGCAAGTACCTCTTTGCTGTTGG
TTCTCTCCCTCTCCTTCCATCGACAAACATGGGTAAGACAAGAGGAATGGGAGCTGGGCG
CAAGCTCAAAAGGCTCAGGATTAATCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCTCA
TCAGGGTAATGAGTGGAAGAAGCCTTTCGCTGGTTCTTCTCACGCCAAGGGCATCGTTCT
TGAGAAAATCGGTATTGAGGCTAAGCAGCCTAACTTTGCTATCCGTAAGTGTGCTAGAGT
CCAACTTATCAAGAACGGAAAGAAGATTGCCGCTTTTGTCCCCAACGATGGTTGTTTGAA
CTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATCGCTGGATTTGGTCGTAAGGGTCACGCTGT
GGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCAAGGTTGTCAAGGTTTCTGGTGTTTCACTCTTGGC
CCTCTTCAAAGAGAAGAAGGAGAAGCCAAGATCTTAAACAATGCGCCAAGCTTTTGAAAT
TATTTTGATGTTATAATCACTTTTTGCTAGTTCAGTTTTAAAGAATACTCTCTTCTTTTT
TACTTTAAGCAAGAACATGGTGTGTTGAAACCTATTTTTCTTAATGAATCTTTGAGTTTA
G

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2D493TF 636 0 0
GG
GTTGCCGCAAGTACCTCTTTGCTGTTGATTCTCTCCCTCTCCTTCCATCGACAAACATGG
GTAAGACAAGAGGAATGGGAGCTGGGCGCAAGCTCAAAAGGCTCAGGATTAATCAGAGGT
GGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCTCATCAGGGTAATGAGTGGAAGAAGCCTTTCGCTG
GTTCTTCTCACGCCAAGGGCATCGTTCTTGAGAAAATCGGTATTGAGGCTAAGCAGCCTA
ACTCTGCTATCCGTAAGTGTGCTAGAGTCCAACTTATCAAGAACGGAAAGAAGATTGCCG
CTTTTGTCCCCAACGATGGTTGTTTGAACTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATCG
CTGGATTTGGTCGTAAGGGTCACGCTGTGGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCAAGGTTG
TCGAGGTTTCTGGTGTTTCACTCTTGGCCCTCTTCAAAGAGAAGAAGGAGAAGCCAAGAT
CTTAAACAATGCGCCAAGCTTTTGAAATTATTTTGATGTTATAATCACTTTTTGCTAGTT
CAGTTTTAAAGAATACTCTCTTCTTTTCTACTTTAAGCAAGAACATGGTGTGTTGAAACC
TATTTTTCTTAATGAATCTTTGAGTTTAG
CTTGA

QA 3 631 3 631
DS 

RD RR2D930JQ 638 0 0
GG
GTTGCCGCAAGTACCTCTTTGCTGTTGATTCTCTCCCTCTCCTTCCATCGACAAACATGG
GTAAGACAAGAGGAATGGGAGCTGGGCGCAAGCTCAAAAGGCTCAGGATTAATCAGAGGT
GGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCTCATCAGGGTAATGAGTGGAAGAAGCCTTTCGCTG
GTTCTTCTCACGCCAAGGGCATCGTTCTTGAGAAAATCGGTATTGAGGCTAAGCAGCCTA
ACTCTGCTATCCGTAAGTGTGCTAGAGTCCAACTTATCAAGAACGGAAAGAAGATTGCCG
CTTTTGTCCCCAACGATGGTTGTTTGAACTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATCG
CTGGATTTGGTCGTAAGGGTCACGCTGTGGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCAAGGTTG
TCAAGGTTTCTGGTGTTTCACTCTTGGCCCTCTTCAAAGAGAAGAAGGAGAAGCCAAGAT
CTTAAACAATGCGCCAAGCTTTTGAAATTATTTTGATGTTATAATCACTTTTTGCTAGTT
CAGTTTTAAAGAATACTTTCTTCTTTTCTACTTTAAGCAAGAACATGGTGTGTTGAAACC
TATTTTTCTTAATGAATCTTTGAGTTTAGCTTGATC

QA 3 638 3 638
DS 

RD RR2D930TF 630 0 0
GCAAGTACCTCTTTGCTGTTGATTCTCTCCCTCTCCTTCCATCGACAAACATGGGTAAGA
CAAGAGGAATGGGAGCTGGGCGCAAGCTCAAAAGGCTCAGGATTAATCAGAGGTGGGCTG
ACAAGCAGTACAAGAAGTCTCATCAGGGTAATGAGTGGAAGAAGCCTTTCGCTGGTTCTT
CTCACGCCAAGGGCATCGTTCTTGAGAAAATCGGTATTGAGGCTAAGCAGCCTAACTCTG
CTATCCGTAAGTGTGCTAGAGTCCAACTTATCAAGAACGGAAAGAAGATTGCCGCTTTTG
TCCCCAACGATGGTTGTTTGAACTACATTGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATCGCTGGAT
TTGGTCGTAAGGGTCACGCTGTGGGAGATATTCCCGGAGTTAGGTTCAAGGTTGTCAAGG
TTTCTGGTGTTTCACTCTTGGCCCTCTTCAAAGAGAAGAAGGAGAAGCCAAGATCTTAAA
CAATGCGCCAAGCTTTTGAAATTATTTTGATGTTATAATCACTTTTTGCTAGTTCAGTTT
TAAAGAATACTCTCTTCTTTTCTACTTTAAGCAAGAACATGGTGTGTTGAAACCTATTTT
TCTTAATGAATCTTTGAGTTTAG
CTTGATC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 3

CO CL1694Contig1 859 3 5 U
GGATATTAAAAAAAACCTTGCATGTTTTATTTTCTTCATTGCTTCCAATTGAAATCTTTC
ACAGCTTAGTAAGGATCATATCTAAGCTTCCAAATAAATAAAGAACTTTTGAGTTTTATA
ACTTTCTCCATCCTTATTGTATCATCAACCACTTTATTTCTTCTTTAAATTTTGTTGCCT
TCTTCCATAAAACTTGTGAAACTTGAACTCCCTTTTGTGTTTTGAGTGAAAAAGCTTAAA
ATCTTTTTGCTGCCAATCTCCACTTTTTTTTTCTGGCTTTCACTGATTTGGTTTATTTAA
TTATTGCACTCTGTTATTCATCACCAGACCGTAATGAAAAACCAAAAGGATGAAATCACA
AACGCAAACGCCAAGTTATGAGTATTAATCGCTGAAACTCCACTTGTTGTTGAGTTGGCT
TTTGCAGTAGCAGCAGCAACAACAGGCTTAGTAGTAGAGGACGGTGGGGATGGTGGCTCG
TCATATGTATAATCATCATCACCGGGAGGTTGTGGAGGAAGTGGTGAAGAAGATGAACCA
TGATCTGAAGGACCTTCAGGATTCATGATATGTGTAACTGCTAATATGAAGCACGGAGAT
GTTATACGGATGTGTCGCAACAGAGTCTATAAGCTTAGCGTCAAGGATAGATCTGGGAAC
CGCGGATCCGAACATAACGTCGCCGTTGCTCATAACGGTTGCGTTTACGAACCCTTGCTG
GCCTTTGGCCTGACCGCTTGATTGGAAGAGAGTGGTGAGTATTACTGATTTTTTGTTGAG
GTTCTTGAGTTTCTTGATGTCGTAGTAATCTAGAATGACGTGGAGGCTGAGGATTTTCTT
GTTGTCTTCAGTTGATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD80JQ U 1
AF RR2BK91JQ U 92
AF RR2BK91TF C 271
BS 1 429 RR2AD80JQ
BS 430 430 RR2BK91JQ
BS 431 449 RR2AD80JQ
BS 450 454 RR2BK91JQ
BS 455 859 RR2BK91TF

RD RR2AD80JQ 449 0 0
GGATATTAAAAAAAACCTTGCATGTTTTATTTTCTTCATTGCTTCCAATTGAAATCTTTC
ACAGCTTAGTAAGGATCATATCTAAGCTTCCAAATAAATAAAGAACTTTTGAGTTTTATA
ACTTTCTCCATCCTTATTGTATCATCAACCACTTTATTTCTTCTTTAAATTTTGTTGCCT
TCTTCCATAAAACTTGTGAAACTTGAACTCCCTTTTGTGTTTTGAGTGAAAAAGCTTAAA
ATCTTTTTGCTGCCAATCTCCACTTTTTTTTTCTGGCTTTCACTGATTTGGTTTATTTAA
TTATTGCACTCTGTTATTCATCACCAGACCGTAATGAAAAACCAAAAGGATGAAATCACA
AACGCAAACGCCAAGTTATGAGTATTAATCGCTGAAACTCCACTTGTTGTTGAGTTGGCT
TTTGCAGTAACAGCAGCAACAACAGGCTT

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2BK91JQ 363 0 0
AAATAAATAAAGAACTTTTGAGTTTTATAACTTTCTCCATCCTTATTGTATCATCAACCA
CTTTATTTCTTCTTTAGATTTTGTTGCCTTCTTCCATAAAACTTGTGAAACTTGAACTCC
CTTTTGTGTTTTGAGTGAAAAAGCTTAAAATCTTTTTGCTGCCAATCTCCACTTTTTTTT
TCTGGCTTTCACTGATTTGGTTTATTTAATTATTGCACTCTGTTATTCATCACCAGACCG
TAATGAAAAACCAAAAGGATGAAATCACAAACGCAAACGCCAAGTTATGAGTATTAATCG
CTGAAACTCCACTTGTTGTTGAGTTGGCTTTTGCAGTAGCAGCAGCAACAACAGGCTTAG
TAG

QA 1 363 1 363
DS 

RD RR2BK91TF 589 0 0
TTCTGGCTTTCACTGATTTGGTTTATTTAATTATTGCACTCTGTTATTCATCACCAGACC
GTAATGAAGAACCAAAAGGATGAGATCACAAACGCAAACGCCAAGTTATGAGTATTAATC
GCTGAAACTCCACTTGTTGTTGAGTTGGCTTTTGCAGTAGCAGCAGCAACAACAGGCTTA
GTAGTAGAGGACGGTGGGGATGGTGGCTCGTCATATGTATAATCATCATCACCGGGAGGT
TGTGGAGGAAGTGGTGAAGAAGATGAACCATGATCTGAAGGACCTTCAGGATTCATGATA
TGTGTAACTGCTAATATGAAGCACGGAGATGTTATACGGATGTGTCGCAACAGAGTCTAT
AAGCTTAGCGTCAAGGATAGATCTGGGAACCGCGGATCCGAACATAACGTCGCCGTTGCT
CATAACGGTTGCGTTTACGAACCCTTGCTGGCCTTTGGCCTGACCGCTTGATTGGAAGAG
AGTGGTGAGTATTACTGATTTTTTGTTGAGGTTCTTGAGTTTCTTGATGTCGTAGTAATC
TAGAATGACGTGGAGGCTGAGGATTTTCTTGTTGTCTTCAGTTGATTGC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 2 4

CO CL1695Contig1 770 2 7 U
GGGGCTCAAGCACATCCACTCGGCTAAAGTTATCCACAGAGATCTAAAACCGAGCAATCT
TCTCCTGAACGCCAACTGCGATTTAAAGATCTGTGACTTCGGTCTTGCTCGACCGACTTC
GGAGAACGAGTTTATGACCGAGTATGTTGTTACCAGATGGTATAGAGCACCTGAGCTTCT
GTTGAACTCATCCGACTACACAGCTGCTATAGATGTTTGGTCTGTTGGTTGTATCTTTAT
GGAGCTCATGAACAGAAAGCCTTTGTTCCCTGGTAAAGACCATGTCCATCAGATGCGCTT
ATTGACAGAGTTGCTTGGCACGCCGACAGAATCAGATCTCGGGTTTACACACAACGAGGA
TGCGAAAAGATACATCCGGCAACTCCCCACCTTCCCTCGCCAGCCGTTAGCTAAACTTTT
CTCTCATGTTAACCCATTGGCCATTGATCTAGTTGACAGAATGTTGACTTTTGACCCCAA
CAAAAGAATCACTGTTGAAGAAGCTCTGAATCACCCGTACCTTGCCAAGTTGCACGACCC
AAATGATGAGCCAATCTGTCTAAAGCCATTCTCTTTCGACTTTGAACAACAACCTCTAGA
TGAGGAACAGATAAAAGAGATGATCTACAGGGAAGCCATTGCACTCAATCCAACATATGC
TTAGAAGAGCTGCAACCGAATGAATGGCATTTATTTTACCCAAACTTTCCATCCGAATCG
CTGCCCCCCTAGTATCTTTACCTGTTTCTTTTATTCATGTACTTTTTTAC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG54TF U 1
AF RR2B410TF U 1
BS 1 133 RR2B410TF
BS 134 134 RR2EG54TF
BS 135 180 RR2B410TF
BS 181 181 RR2EG54TF
BS 182 195 RR2B410TF
BS 196 196 RR2EG54TF
BS 197 770 RR2B410TF

RD RR2EG54TF 272 0 0
G
GGGCTCAAGTACATCCACTCGGCTAAAGTTATCCACAGGGATCTAAAACCGAGCAATCTT
CTCCTGAACGCCAACTGCGATTTAAAGATCTGTGACTTCGGTCTTGCTCGACCGACTTCG
GAGAACGAGTTTATGACCGAGTATGTTGTTACCAGATGGTATAGAGCACCTGAGCTTCTG
TTGAACTCATCGGACTACACAGCTGCTATAGATGTTTGGTCTGTTGGTTGTATCTTTATG
GAGCTCATGAACAGAAAGCCTTTGTTCCCTG

QA 2 272 2 272
DS 

RD RR2B410TF 770 0 0
GGGGCTCAAGCACATCCACTCGGCTAAAGTTATCCACAGAGATCTAAAACCGAGCAATCT
TCTCCTGAACGCCAACTGCGATTTAAAGATCTGTGACTTCGGTCTTGCTCGACCGACTTC
GGAGAACGAGTTTGTGACCGAGTATGTTGTTACCAGATGGTATAGAGCACCTGAGCTTCT
TTTGAACTCATCCGATTACACAGCTGCTATAGATGTTTGGTCTGTTGGTTGTATCTTTAT
GGAGCTCATGAACAGAAAGCCTTTGTTCCCTGGTAAAGACCATGTCCATCAGATGCGCTT
ATTGACAGAGTTGCTTGGCACGCCGACAGAATCAGATCTCGGGTTTACACACAACGAGGA
TGCGAAAAGATACATCCGGCAACTCCCCACCTTCCCTCGCCAGCCGTTAGCTAAACTTTT
CTCTCATGTTAACCCATTGGCCATTGATCTAGTTGACAGAATGTTGACTTTTGACCCCAA
CAAAAGAATCACTGTTGAAGAAGCTCTGAATCACCCGTACCTTGCCAAGTTGCACGACCC
AAATGATGAGCCAATCTGTCTAAAGCCATTCTCTTTCGACTTTGAACAACAACCTCTAGA
TGAGGAACAGATAAAAGAGATGATCTACAGGGAAGCCATTGCACTCAATCCAACATATGC
TTAGAAGAGCTGCAACCGAATGAATGGCATTTATTTTACCCAAACTTTCCATCCGAATCG
CTGCCCCCCTAGTATCTTTACCTGTTTCTTTTATTCATGTACTTTTTTAC

QA 1 770 1 770
DS 



CO CL1695Contig2 780 2 13 U
GGAGTCAGAAAATGTGAAGAAATTATTTCATAGCTGGAGTTCTTTACATTAGAGCTACAT
GCAACTCACTCACTAGCAGTAGTAATACAGCATTTAAACAAACAAATAGGATTACAAGAG
TACACATGTAAAAAGTACATGAATAAAAGAACAGGTAAAGATACTAGGCGGGGGGCAGCG
ATTCGGATGGATAGTTTGGGTAAAACAAAAGCCACTCATTCGGTTGCAGCTCTACTAAGC
ATATGTTGGATTGAGTGCAATGGCTTCCCTGTAGATCATCTCTTTTATCTGTTCCTCATC
TAGAGGTTGTTGTTCAAAGTCGAAAGAAAATGGCTTTAGACAGATTGGCTCATCATTTGG
ATCGTGCAACTTGGCAAGGTACGGGTGATTCAGAGCTTCTTCAACAGTGATTCTTTTGTT
GAGGTCAAAAGTCAACATTCTGTCAACTAGATCAATGGCCAATGGGTTAACATGAGAGAA
AAGTTTAGCTAACGGCTGGCGAGGGAAGGTGGGGAGTTGCCGGATGTATCTTTTCGCATC
CTCGTTGTGTGTAAACCCGAGATCTGATTCTGTCGGCGTGCCAAGCAACTCTGTCAATAA
GCGCATCTGATGGACATGGTCTTTACCAGGGAACAAAGGCTTTCTGTTCATGAGCTCCAT
AAAGATACAACCAACAGACCAAACATCTATAGCAGCTGTGTAGTCCGATGAGTTCAACAG
AAGCTCAGTGCTCTATACCATCTGGTAACAACATACTCGGTCATAAACTCGTTCTCCGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG56JQ U 14
AF RR2EG54JQ U 1
BS 1 180 RR2EG54JQ
BS 181 181 RR2DG56JQ
BS 182 214 RR2EG54JQ
BS 215 215 RR2DG56JQ
BS 216 327 RR2EG54JQ
BS 328 328 RR2DG56JQ
BS 329 405 RR2EG54JQ
BS 406 406 RR2DG56JQ
BS 407 421 RR2EG54JQ
BS 422 422 RR2DG56JQ
BS 423 624 RR2EG54JQ
BS 625 625 RR2DG56JQ
BS 626 780 RR2EG54JQ

RD RR2DG56JQ 621 0 0
GTGAAGAAATTATTTCATAGCTGGAGTTCTTTACATTAGAGCTACATGCAACTCACTCAC
TAGCAGTAGTAATACAGCATTTAAACAAACAAATAGGATTACAAGAGTACACATGTAAAA
AGTACGTGAATAAAAGAACAGGTAAAGATACTAGG***GGGGCAGCGATTCGGATGGATA
TTTTGGGTAAAATACATGCCACTCATTCGGTTGCAGCTCTTCTAAGCATATGTTGGATTG
AGTGCAATGGCTTCCCTGTAGATCATCTCTTTTATCTGTTCCTCATCTAGAGGTTGTTGT
TCAAAGTCGAAAGAAAATGGCTTTAGACAGATTGGCTCATCATTTGGGTCGTGCAACTTG
GCAAGGTACGGGTGATTCAGAGCTTCTTCAACAGTGATTCTTTTGTTGAGGTCAAAAGTC
AACATTCTGTCAACTAGATCAATGGCCAATGGGTTAACATGAGAGAAAAGTTTAGCTAAC
GGCTGGCGAGGGAAGGTGGGGAGTTGCCGGATGTATCTTTTCGCATCCTCGTTGTGTGTA
AACCCGAGATCTGATTCTGTCGGCGTGCCAAGCAACTCTGTCAATAAGCGCATCTGATGG
ACATGGTCTTTACCAGGGAAC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2EG54JQ 780 0 0
GGAGTCAGAAAATGTGAAGAAATTATTTCATAGCTGGAGTTCTTTACATTAGAGCTACAT
GCAACTCACTCACTAGCAGTAGTAATACAGCATTTAAACAAACAAATAGGATTACAAGAG
TACACATGTAAAAAGTACATGAATAAAAGAACAGGTAAAGATACTAGGCGGGGGGCAGCG
GTTCGGATGGATAGTTTGGGTAAAACAAAAGCCATTCATTCGGTTGCAGCTCTACTAAGC
ATATGTTGGATTGAGTGCAATGGCTTCCCTGTAGATCATCTCTTTTATCTGTTCCTCATC
TAGAGGTTGTTGTTCAAAGTCGAAAGAGAATGGCTTTAGACAGATTGGCTCATCATTTGG
ATCGTGCAACTTGGCAAGGTACGGGTGATTCAGAGCTTCTTCAACGGTGATTCTTTTGTT
GGGGTCAAAAGTCAACATTCTGTCAACTAGATCAATGGCCAATGGGTTAACATGAGAGAA
AAGTTTAGCTAACGGCTGGCGAGGGAAGGTGGGGAGTTGCCGGATGTATCTTTTCGCATC
CTCGTTGTGTGTAAACCCGAGATCTGATTCTGTCGGCGTGCCAAGCAACTCTGTCAATAA
GCGCATCTGATGGACATGGTCTTTGCCAGGGAACAAAGGCTTTCTGTTCATGAGCTCCAT
AAAGATACAACCAACAGACCAAACATCTATAGCAGCTGTGTAGTCCGATGAGTTCAACAG
AAGCTCAGTGCTCTATACCATCTGGTAACAACATACTCGGTCATAAACTCGTTCTCCGAA

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 5

CO CL1696Contig1 785 5 46 U
GGGGTCGTCTTCTTGCAGAGAAAAAAAAAA*TTAAAAGAGCCTCGAAAAA*TTCACAGAC
TTGTCTCCCTCTCTCTTT*CAGATTTTAGTAGCTTCTGAAAAATTTCTCTAAAAGAAAAA
AA*TGAGCAAGTTCTGGACTTTCCTCACTGCTCTTCACTCAGGCGCTGGCCCACTGGTTA
TGTTGGTGTATCCATTGTACGCATCGGTTGTGGCAATGGAGAGCACAACGAAAGTAGACG
ACGAGCAGTGGCTTGCGTACTGGATCATTTACTCCTTCCTCACCCTCACGGAGCTGATTC
TGCAATCCCTTCTCGAGTGGATCCCGATTTGGTATTCTGTGAAACTGGTGTTCGTGGCTT
GGTTGGTCCTGCCTCAGTTCCATGGCGCAGCTTTCATCTACAACCGCGTGGTGAGAGAAC
AGTTCAAGAAACACGGCGTCTTCGGCTCCTCCTCCTCCTCTCACACCAAACACTCCAAGC
ACTCCAAACCCAACATCATCCACTCCATTTTCCACCGGGAGGGACAAGAGGCTCACTCTC
ACTGACGCCAAAGCGGACGAGAAGCTCGAATAGCATTGTAATGGGAGTTGGTGGTGGCCC
CTTCTTGTCTTCATGTCTAATCTTACTTTTGCTTTAGTTTTTCATTTAATAATTTGAGAA
ATATGATAATGACTGAGGAGGTGTGTGATCGTTTTAAATTAGAAATGGCTTCTTGTTGTT
GTATTGCTTTGATTCCACGACGACGTATTTTCCATTTGGAACACAAGTGTTAACGCTATT
GTCCC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BB11TF U 14
AF RR2H881TF U 2
AF RR2EH25JQ C 1
AF RR2EH25TF U 1
AF RR2H881JQ C 162
BS 1 1 RR2EH25JQ
BS 2 21 RR2H881TF
BS 22 69 RR2BB11TF
BS 70 70 RR2H881TF
BS 71 78 RR2BB11TF
BS 79 79 RR2H881TF
BS 80 107 RR2BB11TF
BS 108 108 RR2H881TF
BS 109 112 RR2BB11TF
BS 113 113 RR2H881TF
BS 114 114 RR2BB11TF
BS 115 115 RR2H881TF
BS 116 154 RR2BB11TF
BS 155 155 RR2H881TF
BS 156 169 RR2BB11TF
BS 170 170 RR2H881TF
BS 171 178 RR2BB11TF
BS 179 179 RR2H881TF
BS 180 208 RR2BB11TF
BS 209 209 RR2H881TF
BS 210 235 RR2BB11TF
BS 236 236 RR2H881TF
BS 237 241 RR2BB11TF
BS 242 242 RR2H881TF
BS 243 307 RR2BB11TF
BS 308 308 RR2H881TF
BS 309 313 RR2BB11TF
BS 314 314 RR2H881TF
BS 315 457 RR2BB11TF
BS 458 460 RR2H881TF
BS 461 484 RR2BB11TF
BS 485 485 RR2H881TF
BS 486 499 RR2BB11TF
BS 500 500 RR2H881TF
BS 501 526 RR2BB11TF
BS 527 527 RR2H881TF
BS 528 532 RR2BB11TF
BS 533 533 RR2H881TF
BS 534 595 RR2BB11TF
BS 596 596 RR2H881TF
BS 597 641 RR2BB11TF
BS 642 643 RR2H881TF
BS 644 695 RR2BB11TF
BS 696 708 RR2H881TF
BS 709 721 RR2EH25TF
BS 722 785 RR2H881JQ

RD RR2BB11TF 682 0 0
GGGCAGAG
AAAAAAAAA*TTAAAAGAGCCTCGAAAAA*TTCACAGACTTGTCTCCCCCTCTCTTTTCA
GATTTTAGTAGCTTCTGAAAAATTTCACTAAGAAAAAAAAA*TGAGCAAGTTCTGGACTT
TCCTCACTGCTCTCCACTCAGGCGCTGGTCCACTGGTGATGTTGGTGTATCCATTGTACG
CATCGGTGGTGGCAATGGAGAGCACAACGAAAGTGGACGATGAGCAGTGGCTTGCGTACT
GGATCATTTACTCCTTCCTCACCCTCACGGAGCTGATTCTGCAATCGCTTCTTGAGTGGA
TCCCGATTTGGTATTCTGTGAAACTGGTGTTCGTGGCTTGGTTGGTCCTGCCTCAGTTCC
ATGGCGCAGCTTTCATCTACAACCGCGTGGTGAGAGAACAGTTCAAGAAACACGGCGTCT
TCGGCTCCTCCTCCTC***TCACACCAAACACTCCAAGCACTCTAAACCCAACATCATAC
ACTCCATTTTCCACCGGGAGGGACACGAGGCCCACTCTCACTGACGCCAAAGCGGACGAG
AAGCTCGAATAGCATTGTAATGGGAGTTGGTGGTAGCCCCTTCTTGTCTTCATGTCTAAT
CTTACTTTTGCTTTAGTTTT**ATTTAATAATTTGAGAAATATGATAATGACTGAGGAGG
TGTGTGATCGTTTT

QA 9 682 9 682
DS 

RD RR2H881TF 707 0 0
GGGTCGTCTTCTTGCAGAGAAAAAAAAAAATTAAAAGAGCCTCGAAAAA*TTCACAGACT
TGTCTCCCTCTCTCTTT*CAGATTTTAGTAGCTTCTGAAAAATTTCTCTAAAAGAAAAAA
AATGAGCAAGTTCTGGACTTTCCTCACTGCTCTTCACTCAGGCGCTGGCCCACTGGTTAT
GTTGGTGTATCCATTGTACGCATCGGTTGTGGCAATGGAGAGCACAACGAAAGTAGACGA
CGAGCAGTGGCTTGCGTACTGGATCATTTACTCCTTCCTCACCCTCACGGAGCTGATTCT
GCAATCCCTTCTCGAGTGGATCCCGATTTGGTATTCTGTGAAACTGGTGTTCGTGGCTTG
GTTGGTCCTGCCTCAGTTCCATGGCGCAGCTTTCATCTACAACCGCGTGGTGAGAGAACA
GTTCAAGAAACACGGCGTCTTCGGCTCCTCCTCCTCCTCTCACACCAAACACTCCAAGCA
CTCCAAACCCAACATCATCCACTCCATTTTCCACCGGGAGGGACAAGAGGCTCACTCTCA
CTGACGCCAAAGCGGACGAGAAGCTCGAATAGCATTGTAATGGGAGTTGGTGGTGGCCCC
TTCTTGTCTTCATGTCTAATCTTACTTTTGCTTTAGTTTTTCATTTAATAATTTGAGAA*
TATGATAATGACTGAGGAGGTGTGTGATCGTTTTAAATTAGAAATGG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2EH25JQ 722 0 0
GGGGTCGTCTTCTTGCAGAGAAAAAAAAAA*TTAAAAGAGCCTCGAAAAAATTCACAGAC
TTGTCTCCCTCTCTCTTT*CAGATTTTAGTAGCTTCTGAAAAATTTCTCTAAAAGAAAAA
AA*TGAGCAAGTTCTGGACTTTCCTCACTGCTCTTCACTCAGGCGCTGGCCCACTGGTTA
TGTTGGTGTATCCATTGTACGCATCGGTTGTGGCAATGGAGAGCACAACGAAAGTAGACG
ACGAGCAGTGGCTTGCGTACTGGATCATTTACTCCTTCCTCACCCTCACGGAGCTGATTC
TGCAATCCCTTCTCGAGTGGATCCCGATTTGGTATTCTGTGAAACTGGTGTTCGTGGCTT
GGTTGGTCCTGCCTCAGTTCCATGGCGCAGCTTTCATCTACAACCGCGTGGTGAGAGAAC
AGTTCAAGAAACACGGCGTCTTCGGCTCCTCCTCCTCCTCTCACACCAAACACTCCAAGC
ACTCCAAACCCAACATCATCCACTCCATTTTCCACCGGGAGGGACAAGAGGCTCACTCTC
ACTGACGCCAAAGCGGACGAGAAGCTCGAATAGCATTGTAATGGGAGTTGGTGGTGGCCC
CTTCTTGTCTTCATGTCTAATCTTACTTTTGCTTTAGTTTTTCATTTAATAATTTGAGAA
ATATGATAATGACTGAGGAGGTGTGTGATCGTTTTAAATTAGAAATGGCTTCTTGTTGTT
G
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2EH25TF 722 0 0
G
GGGTCGTCTTCTTGCAGAGAAAAAAAAAA*TTAAAAGAGCCTCGAAAAA*TTCACAGACT
TGTCTCCCTCTCTCTTT*CAGATTTTAGTAGCTTCTGAAAAATTTCTCTAAAAGAAAAAA
A*TGAGCAAGTTCTGGACTTTCCTCACTGCTCTTCACTCAGGCGCTGGCCCACTGGTTAT
GTTGGTGTATCCATTGTACGCATCGGTTGTGGCAATGGAGAGCACAACGAAAGTAGACGA
CGAGCAGTGGCTTGCGTACTGGATCATTTACTCCTTCCTCACCCTCACGGAGCTGATTCT
GCAATCCCTTCTCGAGTGGATCCCGATTTGGTATTCTGTGAAACTGGTGTTCGTGGCTTG
GTTGGTCCTGCCTCAGTTCCATGGCGCAGCTTTCATCTACAACCGCGTGGTGAGAGAACA
GTTCAAGAAACACGGCGTCTTCGGCTCCTCCTCCTCCTCTCACACCAAACACTCCAAGCA
CTCCAAACCCAACATCATCCACTCCATTTTCCACCGGGAGGGACAAGAGGCTCACTCTCA
CTGACGCCAAAGCGGACGAGAAGCTCGAATAGCATTGTAATGGGAGTTGGTGGTGGCCCC
TTCTTGTCTTCATGTCTAATCTTACTTTTGCTTTAGTTTTTCATTTAATAATTTGAGAAA
TATGATAATGACTGAG*AGGTGTGTGATCGTTTTAA*TTAGAAATGGCTTCTTGTTGTTG
C

QA 2 721 2 721
DS 

RD RR2H881JQ 624 0 0
GGCGCTGGCCCACTGGTTATGTTGGTGTATCCATTGTACGCATCGGTTGTGGCAATGGAG
AGCACAACGAAAGTAGACGACGAGCAGTGGCTTGCGTACTGGATCATTTACTCCTTCCTC
ACCCTCACGGAGCTGATTCTGCAATCCCTTCTCGAGTGGATCCCGATTTGGTATTCTGTG
AAACTGGTGTTCGTGGCTTGGTTGGTCCTGCCTCAGTTCCATGGCGCAGCTTTCATCTAC
AACCGCGTGGTGAGAGAACAGTTCAAGAAACACGGCGTCTTCGGCTCCTCCTCCTCCTCT
CACACCAAACACTCCAAGCACTCCAAACCCAACATCATCCACTCCATTTTCCACCGGGAG
GGACAAGAGGCTCACTCTCACTGACGCCAAAGCGGACGAGAAGCTCGAATAGCATTGTAA
TGGGAGTTGGTGGTGGCCCCTTCTTGTCTTCATGTCTAATCTTACTTTTGCTTTAGTTTT
TCATTTAATAATTTGAGAAATATGATAATGACTGAGGAGGTGTGTGATCGTTTTAAATTA
GAAATGGCTTCTTGTTGTTGTATTGCTTTGATTCCACGACGACGTATTTTCCATTTGGAA
CACAAGTGTTAACGCTATTGTCCC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 3

CO CL1697Contig1 1377 3 11 U
GGAATGGCGTTGCTCAGTTGCATAGTGACATCTTAAAGGATGAGTTATTCGCCGACTATG
TCTCTATTTGGCCAAACAAGTTTCAAAACAAGACTAATGGCATCACACCTCGAAGGTGGC
TTCGTTTCTGCAGCCCTGAGCTTAGTGATATAATCACAAAGTGGTTGAAGACTGACAAAT
GGATCACCGATCTTGACCTACTAACTGGTCTTCGACAGTTTGCGGACAATGAAGAACTCC
AATCTGAGTGGGCTTCTGCAAAGGCGGCCAATAAGCAACGTTTGGCTCAGTATATAGAGC
GTGTGACTGGTGTGAGTATTGATCCAAACAGCTTGTTTGACATACAAGTTAAGCGTATCC
ACGAATACAAGAGGCAGCTTATGAACATTCTCGGAGTAATATACAGGTTCAAGAAACTAA
AGGAGATGAAGCCTGAGGAAAGGAAGAAAACAACTCCTCGTACTATCATGATTGGGGGTA
AAGCCTTTGCAACCTATACAAATGCAAAACGGATTGTGAAGCTAGTGAATGATGTGGGCG
ACGTTGTTAACAGCGATCCAGAGGTCAACGAATATCTGAAGGTTGTATTTGTTCCAAACT
ACAATGTGACTGTAGCAGAGATGCTTATACCCGGAAGTGAGCTTTCTCAGCACATCAGCA
CAGCAGACATGGAGGCAAGTGGTACAAGCAATATGAAATTCGCTCTCAACGGTTGCCTTA
TCATAGGAACCCTTGATGGGGCTAATGTGGAGATAAGAGAGGAGATTGGCGAAGAAAATT
TCTTTCTTTTTGGTGCAACAGCCGATCAGGTCCCTCGACTGCGTAAAGAAAGAGAAGACG
GACTCTTCAAACCAGATCCTCGATTTGAAGAGGCGAAGCAGTTTGCCAAAAGTGGAGTGT
TTGGAACCTATGACTACGGTCCGCTCCTTGATTCTCTTGAGGGAAACACTGGTTATGGGC
GTGGTGATTACTTCCTGGTTGGGTATGACTTCGCGAGCTACATGGATGCTCAGGCCAAAG
TTGATGAAGCTTACAAGGACCGGAAGAGGTGGCTGAAGATGTCGATAATGAGCACAGCCG
GGTCAGGAAAGTTCAGCAGCGACCGGACAATAGCTCAGTATGCCAAAGAGATTTGGAACA
TTGAGGCATGCCCCGTTCCTTAATTCCTTATATCGTTGCCACAGACTCTGCCTTTTACCA
TGGCCTCTCTACATCCACACAGCTCCAAAGTCAATATATATATCTTATATAAATCTCATA
ACTGAATAAGTAATAAACCTTTTCGCATTTATATGTTCATTATGTTTGCATAAGTTAAAT
GTTTGTTCATGTAAAACTTTTCTGCAAGTATATGAATGACATTCTGGATTATTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA33TF U 1
AF RR2FM34JQ C 528
AF RR2BL86TF U 824
BS 1 553 RR2CA33TF
BS 554 554 RR2FM34JQ
BS 555 666 RR2CA33TF
BS 667 667 RR2FM34JQ
BS 668 726 RR2CA33TF
BS 727 727 RR2FM34JQ
BS 728 755 RR2CA33TF
BS 756 824 RR2FM34JQ
BS 825 1142 RR2BL86TF
BS 1143 1143 RR2FM34JQ
BS 1144 1377 RR2BL86TF

RD RR2CA33TF 755 0 0
GGAATGGCGTTGCTCAGTTGCATAGTGACATCTTAAAGGATGAGTTATTCGCCGACTATG
TCTCTATTTGGCCAAACAAGTTTCAAAACAAGACTAATGGCATCACACCTCGAAGGTGGC
TTCGTTTCTGCAGCCCTGAGCTTAGTGATATAATCACAAAGTGGTTGAAGACTGACAAAT
GGATCACCGATCTTGACCTACTAACTGGTCTTCGACAGTTTGCGGACAATGAAGAACTCC
AATCTGAGTGGGCTTCTGCAAAGGCGGCCAATAAGCAACGTTTGGCTCAGTATATAGAGC
GTGTGACTGGTGTGAGTATTGATCCAAACAGCTTGTTTGACATACAAGTTAAGCGTATCC
ACGAATACAAGAGGCAGCTTATGAACATTCTCGGAGTAATATACAGGTTCAAGAAACTAA
AGGAGATGAAGCCTGAGGAAAGGAAGAAAACAACTCCTCGTACTATCATGATTGGGGGTA
AAGCCTTTGCAACCTATACAAATGCAAAACGGATTGTGAAGCTAGTGAATGATGTGGGCG
ACGTTGTTAACAGTGATCCAGAGGTCAACGAATATCTGAAGGTTGTATTTGTTCCAAACT
ACAATGTGACTGTAGCAGAGATGCTTATACCCGGAAGTGAGCTTTCTCAGCACATCAGCA
CAGCAGGCATGGAGGCAAGTGGTACAAGCAATATGAAATTCGCTCTCAACGGTTGCCTTA
TCATAG*AACCCTTGATGGGGCTAATGTGGAGATA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2FM34JQ 842 0 0
AATGATGTGGGCGACGTTGTTAACAGCGATCCAGAGGTCGACGAATATCTGAAGGTTGTA
TT*GTTCCAAACTACAATGTGACTGTAGCAGAGATGCTTATACCCGGAAGTGAGCTTTCT
CAGCATATCAGCACAGCAGACATGGAGGCAAGTGGTACAAGCAATATGAAATTCGCTCTC
AACGGTTGCCTTATCATAGGAACCCTTGATGGGGCTAATGTGGAGATAAGAGAGGAGATT
GGCGAAGAAAATTTCTTTCTTTTTGGTGCAACAGCCGATCAGGTCCCTCGACTGCGTAAA
GAAAGAGAAGACGGACTCTTCAAACCAGATCCTCGATTTGAAGAGGCGAAGCAGTTTGCC
AAAAGTGGAGTGTTTGGAACCTATGACTACGGTCCGCTCCTTGATTCTCTTGAGGGAAAC
ACTGGTTATGGGCGTGGTGATTACTTCCTGGTTGGGTATGACTTCGCGAGCTACATGGAT
GCTCAGGCCAAAGTTGATGAAGCTTACAAGGACCGGAAGAGGTGGCTGAAGATGTCGATA
ATGAGCACAGCCGGGTCAGGAAAGTTCAGCAGCGACCGGACAATAGCTCAGTATGCCAAA
GAGATTTGGAACATTGAGGCATGCCCCGTTCCTTAATTCCTTATATCGTTGCCACAGACT
CTGCCTTTTACCATGGCCTCTCTACATCCGCACAGCTCCAAAGTCAATATATATATCTTA
TATAAATCTCATAACTGAATAAGTAATAAACCTTTTCGCATTTATATGTTCATTATGTTT
GCATAAGTTAAATGTTTGTTCATGTAAAACTTTTCTGCAAGTATATGAATGACAT
TCTGGAT

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR2BL86TF 554 0 0
G
AAAGAAAGAGAAGACGGACTCTTCAAACCAGATCCTCGATTTGAAGAGGCGAAGCAGTTT
GCCAAAAGTGGAGTGTTTGGAACCTATGACTACGGTCCGCTCCTTGATTCTCTTGAGGGA
AACACTGGTTATGGGCGTGGTGATTACTTCCTGGTTGGGTATGACTTCGCGAGCTACATG
GATGCTCAGGCCAAAGTTGATGAAGCTTACAAGGACCGGAAGAGGTGGCTGAAGATGTCG
ATAATGAGCACAGCCGGGTCAGGAAAGTTCAGCAGCGACCGGACAATAGCTCAGTATGCC
AAAGAGATTTGGAACATT*AGGCATGCCCCGTTCCTTAATTCCTTATATCGTTGCCACAG
ACTCTGCCTTTTACCATGGCCTCTCTACATCCACACAGCTCCAAAGTCAATATATATATC
TTATATAAATCTCATAACTGAATAAGTAATAAACCTTTTCGCATTTATATGTTCATTATG
TTTGCATAAGTTAAATGTTTGTTCATGTAAAACTTTTCTGCAAGTATATGAATGACATTC
TGGATTATTTTGT

QA 2 554 2 554
DS 



AS 2 5

CO CL1698Contig1 629 2 2 U
GGCGGATGGAAACGAGACGGCCGGTGCGTACAAGATCGCTGTCACCAAGCGTAAGACGCC
GTCTATCTTGGCTTTGTCTAGACAGAAGCTTCCTCAGCTTCCAGGGACGTCCATCGAGGG
AGTTGAGAAGGGTGGATACACAATCTCTGACAACTCCTCGGGGAACAAACCTGATGTGAT
CTTGATTGGAACCGGTTCAGAGCTGGAGATTGCTGCACAGGCTGGAGAGGTGCTTAGGAA
AGAAGGCAAGACGGTTAGAGTTGTGTCGTTTGTCTGCTGGGAGCTGTTTGACGAGCAGAC
GGATGAGTACAAGGAGAGTGTTTTGCCGTCTGATGTGTCGGCTAGAGTGAGTATCGAAGC
GGCTTCGACTTTTGGTTGGGGGAAGATTGTTGGAGGGAGAGGGAAGTCTATTGGTATTAA
CTCGTTTGGGGCTAGTGCACCTGCTCCCTTGCTCTACAAGGAGTTTGGTATCACTGTTGA
AGCTGTTGTTGATGCGGCTAAGTCATTATTCTAAGAGAGTTAAAAGATCAGACCATCCTC
GCTATAAGGGGGTTTGATTTGGAAGCAAAGCTATTCATAACATTGTCTCATTATCTCATA
ATAAAGTGCAACAAGACTTTCTTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AS64JQ C 1
AF RR2AS64TF U 1
BS 1 4 RR2AS64JQ
BS 5 629 RR2AS64TF

RD RR2AS64JQ 629 0 0
GGCGGATGGAAACGAGACGGCCGGTGCGTACAAGATCGCTGTCACCAAGCGTAAGACGCC
GTCTATCTTGGCTTTGTCTAGACAGAAGCTTCCTCAGCTTCCAGGGACGTCCATCGAGGG
AGTTGAGAAGGGTGGATACACAATTTCTGACAACTCCTCGGGGAACAAACCTGATGTGAT
CTTGATTGGAACCGGTTCAGAGCTGGAGATTGCTGCACAGGCTGGAGAGGTGCTTAGGAA
AGAAGGCAAGACGGTTAGAGTTGTGTCGTTTGTCTGCTGGGAGCTGTTTGACGAGCAGAC
GGATGAGTACAAGGAGAGTGTTTTGCCGTCTGATGTGTCGGCTAGAGTGAGTATCGAAGC
GGCTTCGACTTTTGGTTGGGGGAAGATTGTTGGAGGGAGAGGGAAGTCTATTGGTATTAA
CTCGTTTGGGGCTAGTGCACCTGCTCCCTTGCTCTACAAGGAGTTTGGTATCACTGTTGA
AGCTGTTGTTGATGCGGCTAAGTCATTATTCTAAGAGAGTTAAAAGATCAGACCATCCTC
GCTATAAGGGGGTTTGATTTGGAAGCAAAGCTATTCATAACATTGTCTCATTATCTCATA
ATAAAGTGCAACAAGACTTTCTTTCTTCC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2AS64TF 629 0 0
GGCG
GATGGAAACGAGACGGCCGGTGCGTACAAGATCGCTGTCACCAAGCGTAAGACGCCGTCT
ATCTTGGCTTTGTCTAGACAGAAGCTTCCTCAGCTTCCAGGGACGTCCATCGAGGGAGTT
GAGAAGGGTGGATACACAATCTCTGACAACTCCTCGGGGAACAAACCTGATGTGATCTTG
ATTGGAACCGGTTCAGAGCTGGAGATTGCTGCACAGGCTGGAGAGGTGCTTAGGAAAGAA
GGCAAGACGGTTAGAGTTGTGTCGTTTGTCTGCTGGGAGCTGTTTGACGAGCAGACGGAT
GAGTACAAGGAGAGTGTTTTGCCGTCTGATGTGTCGGCTAGAGTGAGTATCGAAGCGGCT
TCGACTTTTGGTTGGGGGAAGATTGTTGGAGGGAGAGGGAAGTCTATTGGTATTAACTCG
TTTGGGGCTAGTGCACCTGCTCCCTTGCTCTACAAGGAGTTTGGTATCACTGTTGAAGCT
GTTGTTGATGCGGCTAAGTCATTATTCTAAGAGAGTTAAAAGATCAGACCATCCTCGCTA
TAAGGGGGTTTGATTTGGAAGCAAAGCTATTCATAACATTGTCTCATTATCTCATAATAA
AGTGCAACAAGACTTTCTTTCTTCC

QA 5 629 5 629
DS 



CO CL1698Contig2 1216 3 11 U
GAGAGTTGAAATCAATCATCACTGGTGAACTACCTGCTGGCTGGGAGAAGGCACTACCAA
CATACACACCTGAGTCTCCAGGAGACGCCACTAGAAACCTGTCACAGCAATGTCTTAACG
CCATTGCCAAAGTTGTACCCGGTTTCCTCGGTGGAAGTGCTGACCTTGCATCTTCCAACA
TGACACTGTTCAAAGCCTCTGGTGACTTCCAGGAGGCCACACCGGAAGAGAGGAACCTTA
GGTTTGGTGTGAGGGAGCACGGAATGGGAGCCATCTGCAACGGCATTGCCCTTCACAGCC
CTGGTCTCATCCCTTACTGTGCAACGTTCTTTGTCTTCACTGACTACATGAGAGGTGCGA
TGAGAATCTCAGCCTTGTCCGAAGCTGGAGTTATCTATGTGATGACTCATGACTCCATTG
GTCTTGGAGAAGATGGGCCAACACATCAGCCCATTGAACACATCGCTAGCTTCCGTGCCA
TGCCCAACACTCTCATGTTCCGTCCCGCCGATGGAAACGAGACGGCCGGTGCGTACAAGA
TCGCTGTCACCAAGCGCAAGACGCCGTCTATCTTGGCTTTGTCTAGACAAAAGCTTCCTC
AGCTTCCAGGGACATCGATCGAGGGGGTTGAGAAGGGTGGATACACGATCTCTGACAACT
CCTCGGGGAACAAACCTGATGTGATCTTGATTGGAACCGGTTCAGAGCTGGAGATTGCTG
CACAGGCTGGAGAGGCGCTTAGGCAAGAAGGCAAGACCGTTAGAGTTGTGTCGTTTGTCT
GCTGGGAGCTGTTTGACGAGCAGAGTGATGAGTACAAGGAGAGTGTCTTGCCGTCTGATG
TGTCGGCTAGAGTGAGTATCGAAGCGGCTTCGACTTTTGGTTGGGGGAAGATTGTTGGAG
GGAGAGGGAAGTCTATTGGTATTAACTCGTTTGGGGCAAGTGCACCTGCTCCCTTGCTCT
ACAAGGAGTTTGGTATCACCGTTGAAGCTGTTGTTGATGCGGCCAAGTCACTCTTCTAAG
AGACTTAGAGATCGGACCATTCTCTCTATAATATTTCATAACATTGTCTCATTATCTCAA
AATAAATTGAAACAAGACGCAAAGACTTTTCTTTCTTTTCTTTTTGTAATTCGGGTCAAC
ATAGGTTTTGAGTTTTGGAAGAGGACATAGTGCAAGACAATGTAAAACACTCATGATCAT
TCGTGTGTTTATTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ46TF U 1
AF RR2EQ87TF U 302
AF RR2GZ46JQ C 425
BS 1 721 RR2GZ46TF
BS 722 780 RR2EQ87TF
BS 781 781 RR2GZ46JQ
BS 782 785 RR2EQ87TF
BS 786 786 RR2GZ46JQ
BS 787 830 RR2EQ87TF
BS 831 831 RR2GZ46JQ
BS 832 1018 RR2EQ87TF
BS 1019 1019 RR2GZ46JQ
BS 1020 1035 RR2EQ87TF
BS 1036 1216 RR2GZ46JQ

RD RR2GZ46TF 721 0 0
GAGAGTTGAAATCAATCATCACTGGTGAACTACCTGCTGGCTGGGAGAAGGCACTACCAA
CATACACACCTGAGTCTCCAGGAGACGCCACTAGAAACCTGTCACAGCAATGTCTTAACG
CCATTGCCAAAGTTGTACCCGGTTTCCTCGGTGGAAGTGCTGACCTTGCATCTTCCAACA
TGACACTGTTCAAAGCCTCTGGTGACTTCCAGGAGGCCACACCGGAAGAGAGGAACCTTA
GGTTTGGTGTGAGGGAGCACGGAATGGGAGCCATCTGCAACGGCATTGCCCTTCACAGCC
CTGGTCTCATCCCTTACTGTGCAACGTTCTTTGTCTTCACTGACTACATGAGAGGTGCGA
TGAGAATCTCAGCCTTGTCCGAAGCTGGAGTTATCTATGTGATGACTCATGACTCCATTG
GTCTTGGAGAAGATGGGCCAACACATCAGCCCATTGAACACATCGCTAGCTTCCGTGCCA
TGCCCAACACTCTCATGTTCCGTCCCGCCGATGGAAACGAGACGGCCGGTGCGTACAAGA
TCGCTGTCACCAAGCGCAAGACGCCGTCTATCTTGGCTTTGTCTAGACAAAAGCTTCCTC
AGCTTCCAGGGACATCGATCGAGGGGGTTGAGAAGGGTGGATACACGATCTCTGACAACT
CCTCGGGGAACAAACCTGATGTGATCTTGATTGGAACCGGTTCAGAGCTGGAGATTGCTG
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2EQ87TF 734 0 0
G
GGTCTCATCCCTTACTGTGCAACGTTCTTTGTCTTCACTGACTACATGAGAGGTGCGATG
AGAATCTCAGCCTTGTCCGAAGCTGGAGTTATCTATGTGATGACTCATGACTCCATTGGT
CTTGGAGAAGATGGGCCAACACATCAGCCCATTGAACACATCGCTAGCTTCCGTGCCATG
CCCAACACTCTCATGTTCCGTCCCGCCGATGGAAACGAGACGGCCGGTGCGTACAAGATC
GCTGTCACCAAGCGCAAGACGCCGTCTATCTTGGCTTTGTCTAGACAAAAGCTTCCTCAG
CTTCCAGGGACATCGATCGAGGGGGTTGAGAAGGGTGGATACACGATCTCTGACAACTCC
TCGGGGAACAAACCTGATGTGATCTTGATTGGAACCGGTTCAGAGCTGGAGATTGCTGCA
CAGGCTGGAGAGGCGCTTAGGCAAGAAGGCAAGACCGTTAGAGTTGTGTCGTTTGTCTTC
TGGTAGCTGTTTGACGAGCAGAGTGATGAGTACAAGGAGAGTGTCTTGTCGTCTGATGTG
TCGGCTAGAGTGAGTATCGAAGCGGCTTCGACTTTTGGTTGGGGGAAGATTGTTGGAGGG
AGAGGGAAGTCTATTGGTATTAACTCGTTTGGGGCAAGTGCACCTGCTCCCTTGCTCTAC
AAGGAGTTTGGTATCACCGTTGAAGCTGTTGTTGATGCGGCCAAGTCACTCTTCTA*GAG
ACTTAGAGATCGG

QA 2 734 2 734
DS 

RD RR2GZ46JQ 792 0 0
TGGAGAAGATGGGCCAACACATCAGCCCATTGAACACATCGCTAGCTTCCGTGCCATGCC
CAACACTCTCATGTTCCGTCCCGCCGATGGAAACGAGACGGCCGGTGCGTACAAGATCGC
TGTCACCAAGCGCAAGACGCCGTCTATCTTGGCTTTGTCTAGACAAAAGCTTCCTCAGCT
TCCAGGGACATCGATCGAGGGGGTTGAGAAGGGTGGATACACGATCTCTGACAACTCCTC
GGGGAACAAACCTGATGTGATCTTGATTGGAACCGGTTCAGAGCTGGAGATTGCTGCACA
GGCTGGAGAGGTGCTTAGGCAAGAAGGCAAGACCGTTAGAGTTGTGTCGTTTGTCTGCTG
GGAGCTGTTTGGCGAGCAGAGTGATGAGTACAAGGAGAGTGTCTTGCCGTCTGATGTGTC
GGCTAGAGTGAGTATCGAAGCGGCTTCGACTTTTGGTTGGGGGAAGATTGTTGGAGGGAG
AGGGAAGTCTATTGGTATTAACTCGTTTGGGGCAAGTGCACCTGCTCCCTTGCTCTACAA
GGAGTTTGGTATCACCGTTGAAGCTGTTGTTGATGCGGCCAAGTCACTCTTTTAAGAGAC
TTAGAGATCGGACCATTCTCTCTATAATATTTCATAACATTGTCTCATTATCTCAAAATA
AATTGAAACAAGACGCAAAGACTTTTCTTTCTTTTCTTTTTGTAATTCGGGTCAACATAG
GTTTTGAGTTTTGGAAGAGGACATAGTGCAAGACAATGTAAAACACTCATGATCATTCGT
GTGTTTATTGCT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 3

CO CL1699Contig1 892 3 9 U
AGAAAAGGAAAGTTATAAGATCAAATCCCAAATTACAATCTAATAAAAGGAAGTTATACA
AGTTCTATGCAGAGAAAAAAATCACAAGGTCTATAGGGATCATGACCCTTTACATCAATC
GCTAGGAGACATAGGCTGAGTAAATAGTAGTGGTTAAGGTAGCTGAACAAAACGGAAGTG
ATGATATCATGGGTTTCACTTGGGGTTTGTTTTTTATAACAAAACTGACACGCTTCTTGT
CGTGGTGTTTGGTCTGTTAGATCCATCTTTTACTTCTGCTTCTCCTCCACTTCTGTTTGG
GAGGATGATCCTGACTGGTGATTGTCGTCCTTTGGCCTGGCTGGAGAGACTTTGGCAGGT
GTTGAACGCTCCGACTGAGAAGAGCGGATCAGGATCTGCATACAGAGGGTGATGATACCT
AGACCAAGCGCCGACAACGCAATGCCTTTCCATGAGGAAAAGAGATTTGACCAGTGTAAG
AACTTCATTGCTCCAAGAGTTAGTAGGCATGCCCATGATACAACCACAGCAAGAGACTTT
ATGGGACGGCCAATGTTCTGTTCTTTCTGGCCAGGGAAAGTGTCAGCAGCTATGTGTTTG
TCTAACAGTGCATCCTTAGCCACAAACTGATCTCTGCACCACTGCGCAATTTCGTCTTCT
GATTCAGGCAAGTCTTTCATGGAGTGACACTTGATGTGAACATGCACCACAGAAGGTTGT
CCTTTGAATAGTCTTAGCATCGTTGGGGGAGGAGAAGTTTTTGGAATAGCCACGGTCATA
TCATATATGGCTGGCACAAATGATCGCATGTTACTAACTGCTGACACAAAACCTTTGGTG
CGAGGAATCAACACATTTCGAGGGATAGGCAACTCAGAGGAGGCTGCGTACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV46JQB U 1
AF RR2H391JQ U 1
AF RR2H391TF C 73
BS 1 247 RR2GV46JQB
BS 248 248 RR2H391JQ
BS 249 258 RR2GV46JQB
BS 259 260 RR2H391JQ
BS 261 644 RR2GV46JQB
BS 645 645 RR2H391JQ
BS 646 659 RR2GV46JQB
BS 660 697 RR2H391JQ
BS 698 892 RR2H391TF

RD RR2GV46JQB 659 0 0
AGAAAAGGAAAGTTATAAGATCAAATCCCAAATTACAATCTAATAAAAGGAAGTTATACA
AGTTCTATGCAGAGAAAAAAATCACAAGGTCTATAGGGATCATGACCCTTTACATCAATC
GCTAGGAGACATAGGCTGAGTAAATAGTAGTGGTTAAGGTAGCTGAACAAAACGGAAGTG
ATGATATCATGGGTTTCACTTGGGGTTTGTTTTTTATAACAAAACTGACACGCTTCTTGT
CGTGGTGCTTGGTCTGTTGCATCCATCTTTTACTTCTGCTTCTCCTCCACTTCTGTTTGG
GAGGATGATCCTGACTGGTGATTGTCGTCCTTTGGCCTGGCTGGAGAGACTTTGGCAGGT
GTTGAACGCTCCGACTGAGAAGAGCGGATCAGGATCTGCATACAGAGGGTGATGATACCT
AGACCAAGCGCCGACAACGCAATGCCTTTCCATGAGGAAAAGAGATTTGACCAGTGTAAG
AACTTCATTGCTCCAAGAGTTAGTAGGCATGCCCATGATACAACCACAGCAAGAGACTTT
ATGGGACGGCCAATGTTCTGTTCTTTCTGGCCAGGGAAAGTGTCAGCAGCTATGTGTTTG
TCTAACAGTGCATCCTTAGCCACAAACTGATCTCTGCACCACTGAGCAATTTCGTCTTC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2H391JQ 697 0 0
AGAAAAGGAAAGTTATAAGATCAAATCCCAAATTACAATCTAATAAAAGGAAGTTATACA
AGTTCTATGCAGAGAAAAAAATCACAAGGTCTATAGGGATCATGACCCTTTACATCAATC
GCTAGGAGACATAGGCTGAGTAAATAGTAGTGGTTGAGGTAGCTGAACAAAACGGAAGTG
ATGATATCATGGGTTTCACTTGGGGTTTGTTTTTTATAACAAAACTGACACGCTTCTTGT
CGTGGTGTTTGGTCTGTTAGATCCATCTTTTACTTCTGCTTCTCCTCCACTTCTGTTTGG
GAGGATGATCCTGACTGGTGATTGTCGTCCTTTGGCCTGGCTGGAGAGACTTTGGCAGGT
GTTGAACGCTCCGACTGAGAAGAGCGGATCAGGATCTGCATACAGAGGGTGATGATACCT
AGACCAAGCGCCGACAACGCAATGCCTTTCCATGAGGAAAAGAGATTTGACCAGTGTAAG
AACTTCATTGCTCCAAGAGTTAGTAGGCATGCCCATGATACAACCACAGCAAGAGACTTT
ATGGGACGGCCAATGTTCTGTTCTTTCTGGCCAGGGAAAGTGTCAGCAGCTATGTGTTTG
TCTAACAGTGCATCCTTAGCCACAAACTGATCTCTGCACCACTGCGCAATTTCGTCTTCT
GATTCAGGCAAGTCTTTCATGGAGTGACACTTGATGT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2H391TF 820 0 0
GAG
AAAAAATCACAAGGTCTATAGGGATCATGACC*TTTACATCAATCGCTAGGAGACATAGG
CTGAGTAAATAGTAGTGGTGA**GTAGCTGAACAAA*CGGAAGTGATGATATCATGGGTT
TCACTTGGGGTTTGTTTTT*ATA*CAAAACTGACACGCTTCTTGTCGTGGTGTTTGGTCT
GTTAGATCCATCTTTTACTTCTGCTTCTCCTCCACTTCTGTTTGGGAGGATGATCCTGAC
TGGTGATTGTCGTCCTTTGGCCTGGCTGGAGAGACTTTGGCAGGTGTTGAACGCTCCGAC
TGAGAAGAGCGGATCAGGATCTGCATACAGAGGGTGATGATACCTAGACCAAGCGCCGAC
AACGCAATGCCTTTCCATGAGGAAAAGAGATTTGACCAGTGTAAGAACTTCATTGCTCCA
AGAGTTAGTAGGCATGCCCATGATACAACCACAGCAAGAGACTTTATGGGACGGCCAATG
TTCTGTTCTTTCTGGCCAGGGAAAGTGTCAGCAGCTATGTGTTTGTCTAACAGTGCATCC
TTAGCCACAAACTGATCTCTGCACCACTGCGCAATTTCGTCTTCTGATTCAGGCAAGTCT
TTCATGGAGTGACACTTGATGTGAACATGCACCACAGAAGGTTGTCCTTTGAATAGTCTT
AGCATCGTTGGGGGAGGAGAAGTTTTTGGAATAGCCACGGTCATATCATATATGGCTGGC
ACAAATGATCGCATGTTACTAACTGCTGACACAAAACCTTTGGTGCGAGGAATCAACACA
TTTCGAGGGATAGGCAACTCAGAGGAGGCTGCGTACC

QA 4 820 4 820
DS 



AS 1 4

CO CL1700Contig1 863 4 14 U
GGATAAACATCCATCTCCACGCATACACAAATACTTCGCCCGATTCTCTCGATCCCGACA
ACATGGCTCTACCTAACCAGCAAACCGTAGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATCGTCG
GTGACGGAGGCACAGGAAAAACAACTTTTGTCAAGAGACATCTTACCGGAGAGTTTGAGA
AGAAGTATGAACCTACAATCGGTGTGGAGGTTCACCCTCTAGATTTCTTCACAAACTGTG
GCAAGATCCGTTTCTACTGCTGGGATACCGCCGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGAG
ATGGTTACTACATCCACGGTCAATGCGCGGTAATCATGTTCGACGTGACGGCGCGTCTCA
CGTACAAGAACGTCCCCACGTGGCACCGCGACCTCTGCCGTGTCTGTGAGAACATCCCCA
TCGTTCTGTGCGGGAACAAGGTGGACGTGAAGAACAGGCAGGTGAAGGCCAAGCAGGTGA
CGTTCCACAGGAAGAAGAATCTTCAGTACTACGAGATATCCGCCAAGAGCAACTACAACT
TCGAGAAGCCCTTCTTGTACTTAGCTAGGAAGCTCGCTGGTGACCAGAACCTTCACTTTG
TCGAGTCCCCCGCTCTCGCTCCCCCAGAGGTTCACATTGACTTTGCTGAGCAGCAGAAGA
ACGAGGCTGACCTCATCGCCGCCGCGGCTCAGCCTCTTCCCGATGATGATGATGACGCTT
TTGAGTAAAAAAGAAGCTTCCCACTGTGGGAGGAGAGCTGTTTGCTTTTGTCTCTGATTC
TCTCTCTTTTGTTTTTGGTTTCTTCTATGTGTTGTTGCATTGATGTTTAACATTATAAAA
TGATTCAAGTCTGGTAGAGAACT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2EU67TF U 4
AF RR2EO77TF U 1
AF RR2EU67JQ C 197
AF RR2EO77JQ C 221
BS 1 129 RR2EO77TF
BS 130 130 RR2EU67TF
BS 131 495 RR2EO77TF
BS 496 496 RR2EU67TF
BS 497 594 RR2EO77TF
BS 595 595 RR2EU67JQ
BS 596 610 RR2EO77TF
BS 611 611 RR2EU67JQ
BS 612 649 RR2EO77TF
BS 650 670 RR2EU67JQ
BS 671 672 RR2EO77JQ
BS 673 708 RR2EU67JQ
BS 709 709 RR2EO77JQ
BS 710 863 RR2EU67JQ

RD RR2EU67TF 586 0 0
G
AAACATCCGTCTCCACGCATACACAAATACTTCGCCCGATTCTCTCGATCCCGACAACAT
GGCTCTACCTAACCAGCAAACCGTAGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATCGTCGGTGA
CGGAGGCACAGGAAAAACAACTTTTGTCAAGAGACATCTTACCGGAGAGTTTGAGAAGAA
GTATGAACCTACAATCGGTGTGGAGGTTCACCCTCTAGATTTCTTCACAAACTGTGGCAA
GATCCGTTTCTACTGCTTGGATACCGCCGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGAGATGG
TTACTACATCCACGGTCAATGCGCGGTAATCATGTTCGACGTGACGGCGCGTCTCACGTA
CAAGAACGTCCCCACGTGGCACCGCGACCTCTGCCGTGTCTGTGAGAACATCCCCATCGT
TCTGTGCGGGAACAAGGTGGACGTGAAGAACAGGCAGGTGAAGGCCAAGCAGGTGACGTT
CCACAGGAAGAAGAATCTTCAGTACTACGAGATATCCGCCAAGAGCAACTACAACTTCGA
GAAGCCCTTCTTGTACTTAGCTAGGAAGCTCGCTGGTGACCAGAA

QA 2 586 2 586
DS 

RD RR2EO77TF 649 0 0
GGATAAACATCCATCTCCACGCATACACAAATACTTCGCCCGATTCTCTCGATCCCGACA
ACATGGCTCTACCTAACCAGCAAACCGTAGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATCGTCG
GTGACGGAGTCACAGGAAAAACAACTTTTGTCAAGAGACATCTTACCGGAGAGTTTGAGA
AGAAGTATGAACCTACAATCGGTGTGGAGGTTCACCCTCTAGATTTCTTCACAAACTGTG
GCAAGATCCGTTTCTACTGCTGGGATACCGCCGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGAG
ATGGTTACTACATCCACGGTCAATGCGCGGTAATCATGTTCGACGTGACGGCGCGTCTCA
CGTACAAGAACGTCCCCACGTGGCACCGCGACCTCTGCCGTGTCTGTGAGAACATCCCCA
TCGTTCTGTGCGGGAACAAGGTGGACGTGAAGAACAGGCAGGTGAAGGCCAAGCAGGTGA
CGTTCCACAGGAAGAGGAATCTTCAGTACTACGAGATATCCGCCAAGAGCAACTACAACT
TCGAGAAGCCCTTCTTGTACTTAGCTAGGAAGCTCGCTGGTGACCAGAACCTTCCCTTTG
TCGAGTCCCC*GCTCTCGCTCCCCCAGAGGTTCACATTGACTTTGCTGA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2EU67JQ 667 0 0
AATCGGTGTGGAGGTTCACCCTCTAGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTTCTA
CTGCTTGGATACCGCCGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGAGATGGTTACTACATCCA
CGGTCAATGCGCGGTAATCATGTTCGACGTGACGGCGCGTCTCACGTACAAGAACGTCCC
CACGTGGCACCGCGACCTCTGCCGTGTCTGTGAGAACATCCCCATCGTTCTGTGCGGGAA
CAAGGTGGACGTGAAGAACAGGCAGGTGAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAA
GAATTTTCAGTACTACGAGATATCCGCCAAGAGCAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTT
GTACTTAGCTAGGAAGCTCGCTGGTGACCAGAACCTTCACTTTGTCGAGTCCCCCGCTCT
CGCTCCCCCAGAGGTTCACATTGACTTTGCTGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATTTCAT
CGCCGCCGCGGCTCAGCCTCTTCCCGATGATGGTGATGACGCTTTTGAGTAAAAAAGAAG
CTTCCCACTGTGGGAGGAGAGCTGTTTGCTTTTGTCTCTGATTCTCTCTCTTTTGTTTTT
GGTTTCTTCTATGTGTTGTTGCATTGATGTTTAACATTATAAAATGATTCAAGTCTGGTA
GAGAACT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2EO77JQ 643 0 0
AGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTTCTACTGCTGGGATACCGCCGGTCAAGA
GAAGTTCGGTGGCCTTAGAGATGGTTACTACATCCACGGTCAATGCGCGGTAATCATGTT
CGACGTGACGGCGCGTCTCACGTACAAGAACGTCCCCACGTGGCACCGCGACTTTTGCCG
TGTCTGTGAGAACATCCCCATCGTTCTGTGCGGGAACAAGGTGGACGTGAAGAACAGGCA
GGTGAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAGGAATTTTCAGTATTACGAGATATC
CGCCAAGAGCAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTTTTGTACTTAGCTAGGAAGCTCGCTGG
TGACCAGAACCTTCACTTTGTCGAGTCCCCCGCTCTCGCTCCCCCAGAGGTTCACATTGA
CTTTGCTGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGACCTCATCGCCGCCGCGGCTCAGCCTTTTCC
CGATGATGATGATGACGCTTTTGAGTAAAAAAGAAGCTTCCCACTGTGGGAGGAGAGCTG
TTTGCTTTTGTTTCTGATTCTCTCTCTTTTGTTTTTGGTTTCTTCTATGTGTTGTTGCAT
TGATGTTTAACATTATAAAATGATTCAAGTCTGGTAGAGAACT

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 4

CO CL1701Contig1 1419 4 7 U
CACAAAAAAAAAAACTCGTATAAGAGTTATTCATAGTACATGTCTCATATTGTTTTTCTT
TGGAAAAAAGTATATGTTTTATCATTAAATTTAAACCTTGGAAGGATACAATACATGTTA
CAAACAAAAAAAATAGAAACTCTTATCTGATTTCAGTTTATGTATACCACCGTTTACTGT
TGAAATAAGAATCTTATGAACCATGCGAGTTTTTGATTTAGTCGTTGTATGACTGCAACT
CCTTGAACAAACCACAAGAAGTTTCCCAAAGTTCTTTACCAAGTTTGGGATCTCTAGAAG
CTTTTGACGATTTAATGGTCCTTCCTTTTCCTCCAAAATAGTAAACGCCTGATGTTTCTG
GTGGAGCTAAAGCTGCATCGACAGAAGATTCAGCTCCATCATCAGGGGTTTGGAGGAGGC
CAATAAGTTTGAAAAAGAGAAACGCAGAAGCAGATGAGTATTTAGGAAACTCGCGCAGTA
GATTTGTTTTCACAAATCCAGGATCTGCAGCTATAACAGAGACATGGTGTGAATCATCTT
TGAGGCGAAGCTGTCTGTGCAATTCATAGGAGAAAAGTAGAAGACATAATTTAGAGTACT
CGTAGACATGAGCATGAGGATATTCGTCAAATGTCGTGAAATGTTGTCCAGTTACATAAT
CCTTGTCAAGCTTCCCAATAGAAGCATAACGATGTGAGAAAGATGCAACGTTCACGACCC
GTGATGGCACAGAGCTGTTTTTCAGAAGTGGTAAAAGAAGTTTGGTCATAGTGAATGGAC
CAATATAGTTTGTAGTCATCATCCTGTCATAGCCATTAGCGAGTGGTCGACTGTACACTG
CCATGATCCCAGCATTGTTCACTAAAAGCTGAATTGAAGGATGTAACTCTTCGTCCGAGA
GCCATTGCTGTAGAGAATCTTTAAAATTGAAAATTGATGAAAAACAAGACATGTCAACTA
CGAAAGATTTGAGTAGTGCATCTTCGTGCTTGCTCTTGATTTCTTCCAAAGTCTCTGAAA
GAAGCTGAGGAGACCTTCCAACAAGAACAACGTGGAAGCCCTTCTCTGCAAGAGAAAATG
CAGTGGCCTTACCAATTCCAGAAGTAGGACCAGTGATAACACAAATAGGTCTTGGAGATC
CAAACTTTGGACCGATGGAACTAGAATTGGGAGTAGACTTCGATCCAAATATACTTGCTT
TAAGTAATTTCCAGTAGGAAGAATAGAGAGCGATACCCCAGAGAAACATGTTCCAAGAAC
TAGGTGACCATGCAAAACGTATAGCCTCCATCACGTCTTTAATCATTTTTATAGATCCAA
AATGATTCAGGTAACCTCAAATACTTGAAACAAAACCCTATACAAACGTTGAAGGAAGGA
GGGATTAGGAGTGAAGGTTGCTGCATGCATTTGATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E316JQ U 62
AF RR2H857JQ U 1
AF RR2E846TF C 175
AF RR2E316TF C 786
BS 1 354 RR2H857JQ
BS 355 355 RR2E316JQ
BS 356 741 RR2H857JQ
BS 742 840 RR2E846TF
BS 841 841 RR2E316TF
BS 842 850 RR2E846TF
BS 851 1419 RR2E316TF

RD RR2E316JQ 520 0 0
GGAAAAAAGTATATGTTTTATCATTAAATTTAAACCTTGGAAGGATACAATACATGTTAC
AAACAAAAAAAATAGAAACTCTTATCTGATTTCAGTTTATGTATACCACCGTTTACTGTT
GAAATAAGAATCTTATGAACCATGCGAGTTTTTGATTTAGTCGTTGTATGACTGCAACTC
CTTGAACAAACCACAAGAAGTTTCCCAAAGTTCTTTACCAAGTTTGGGATCTCTAGAAGC
TTTTGACGATTTAATGGTCCTTCCTTTTCCTCCAAAATAGTAAACGCCTGATGTTTCTGG
TGGAGCTAAAGCTGCATCGACAGAAGATTCAGCTCCATCATCAGGGGTTTGGAGGAGGCC
AATAAGTTTGAAAAAGAGAAACGCAGAAGCAGATGAGTATTTAGGAAACTCGCGCAGTAG
ATTTGTTTTCACAAATCCAGGATCTGCAGCTATAACAGAGACATGGTGTGAATCATCTTT
GAGGCGAAGCTGTCTGTGCAATTCATAGGAGAAAAGTAGA

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2H857JQ 741 0 0
CACAAAAAAAAAAACTCGTATAAGAGTTATTCATAGTACATGTCTCATATTGTTTTTCTT
TGGAAAAAAGTATATGTTTTATCATTAAATTTAAACCTTGGAAGGATACAATACATGTTA
CAAACAAAAAAAATAGAAACTCTTATCTGATTTCAGTTTATGTATACCACCGTTTACTGT
TGAAATAAGAATCTTATGAACCATGCGAGTTTTTGATTTAGTCGTTGTATGACTGCAACT
CCTTGAACAAACCACAAGAAGTTTCCCAAAGTTCTTTACCAAGTTTGGGATCTCTAGAAG
CTTTTGACGATTTAATGGTCCTTCCTTTTCCTCCAAAATAGTAAACGCCTGATGCTTCTG
GTGGAGCTAAAGCTGCATCGACAGAAGATTCAGCTCCATCATCAGGGGTTTGGAGGAGGC
CAATAAGTTTGAAAAAGAGAAACGCAGAAGCAGATGAGTATTTAGGAAACTCGCGCAGTA
GATTTGTTTTCACAAATCCAGGATCTGCAGCTATAACAGAGACATGGTGTGAATCATCTT
TGAGGCGAAGCTGTCTGTGCAATTCATAGGAGAAAAGTAGAAGACATAATTTAGAGTACT
CGTAGACATGAGCATGAGGATATTCGTCAAATGTCGTGAAATGTTGTCCAGTTACATAAT
CCTTGTCAAGCTTCCCAATAGAAGCATAACGATGTGAGAAAGATGCAACGTTCACGACCC
GTGATGGCACAGAGCTGTTTT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2E846TF 676 0 0
TACTGTTGAAATAAGAATCTTATGAACCATGCGAGTTTTTGATTTAGTCGTTGTATGACT
GCAACTCCTTGAACAAACCACAAGAAGTTTCCCAAAGTTCTTTACCAAGTTTGGGATCTC
TAGAAGCTTTTGACGATTTAATGGTCCTTCCTTTTCCTCCAAAATAGTAAACGCCTGATG
TTTCTGGTGGAGCTAAAGCTGCATCGACAGAAGATTCAGCTCCATCATCAGGGGTTTGGA
GGAGGCCAATAAGTTTGAAAAAGAGAAACGCAGAAGCAGATGAGTATTTAGGAAACTCGC
GCAGTAGATTTGTTTTCACAAATCCAGGATCTGCAGCTATAACAGAGACATGGTGTGAAT
CATCTTTGAGGCGGAGCTGTCTGTGCAATTCATAGGAGAAAAGTAGAAGACATAATTTAG
AGTACTCGTAGGCATGAGCATGAGGATATTCGTCAAATGTCGTGAAATGTTGTCCAGTTA
CATAATCCTTGTCAAGCTTCCCAATAGAAGCATAACGATGTGAGAAAGATGCAACGTTCA
CGACCCGTGATGGCACAGAGCTGTTTTTCAGAAGTGGTAAAAGAAGTTTGGTCATAGTGA
ATGGACCAATATAGTTTGTAGTCATCATCCTGTCATAGCCATTAGCGAGTGGTCGACTGT
ACACTGGCATGATCCC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2E316TF 634 0 0
TAGTTTGTAGTCATCATCCTGTCATAGCCATTAGCGAGTGGTCGACTGTACACTGCCATG
ATCCCAGCATTGTTCACTAAAAGCTGAATTGAAGGATGTAACTCTTCGTCCGAGAGCCAT
TGCTGTAGAGAATCTTTAAAATTGAAAATTGATGAAAAACAAGACATGTCAACTACGAAA
GATTTGAGTAGTGCATCTTCGTGCTTGCTCTTGATTTCTTCCAAAGTCTCTGAAAGAAGC
TGAGGAGACCTTCCAACAAGAACAACGTGGAAGCCCTTCTCTGCAAGAGAAAATGCAGTG
GCCTTACCAATTCCAGAAGTAGGACCAGTGATAACACAAATAGGTCTTGGAGATCCAAAC
TTTGGACCGATGGAACTAGAATTGGGAGTAGACTTCGATCCAAATATACTTGCTTTAAGT
AATTTCCAGTAGGAAGAATAGAGAGCGATACCCCAGAGAAACATGTTCCAAGAACTAGGT
GACCATGCAAAACGTATAGCCTCCATCACGTCTTTAATCATTTTTATAGATCCAAAATGA
TTCAGGTAACCTCAAATACTTGAAACAAAACCCTATACAAACGTTGAAGGAAGGAGGGAT
TAGGAGTGAAGGTTGCTGCATGCATTTGATTTCC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 5

CO CL1702Contig1 677 5 10 U
GGAGAGCTTTGAGCAATCTATCAATGGCGGATGGTAAACCGGACGAGCAGCTCTTCCAGC
TTCTTTCAGGTCTTCTCCAACAGGTTGAATCGTTGACGAATACAGAGGAAGTAGAATTAC
GTTCGAAGATCGAAGCACTTGGCTTAGAAGTCACCAAAGTGCCATCAAAATCTTCTCAAC
CCCTCACTGAGGTGGAGATTGCTAATGAATTGGACAAGTTATCAGCCAAGCTTGACGATG
TTGATGAGATGATCTCGTCTGCTATTGCTTCTGACCCGCAAGTTCAGACTCTTCTTAGTG
GTACTGCTGATGTTTGGATGCCTGTTATCACTGCCAACACCCAAGAGAGGCTCAACTTCA
CTGCCTCAATTGGTGACGATGATGTTGAGGATAAGGATGCTACTACCGATAAGGACAAGA
ACAACAGCTCGTAATCTTTCTTGCAGAACCTGGTTCTTATTGATAAGTATTGTTCTGTCT
TTTTTTTTTTATTTATGCAGTCTTGTTACTTTCTCAATTCAATAGGTCATCTCTCACATA
TTTGATGGTGGAGATTTGTGTGAATTGAATACATCTGTTTATTTTATACTACCATGAGTT
TACATCGAGTAAAAAAAAGTTGTAATTCAGTATCTTATATTTGATGAAAAATTGAATAAA
GTGTTTATTTATTATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2GN37TF U 256
AF RR2G628JQ C 13
AF RR2G628TF U 13
AF RR2C324JQ C 1
AF RR2C324TF U 1
BS 1 12 RR2C324TF
BS 13 13 RR2G628TF
BS 14 14 RR2C324TF
BS 15 505 RR2G628TF
BS 506 506 RR2GN37TF
BS 507 616 RR2G628TF
BS 617 618 RR2C324TF
BS 619 650 RR2G628TF
BS 651 651 RR2C324TF
BS 652 677 RR2G628TF

RD RR2GN37TF 355 0 0
G
GTCTGCTATTGCTTCTGACCCGCAAGTTCAGACTCTTCTTAGTGGTACTGCTGATGTTTG
GATGCCTGTTATCACTGCCAACACCCAAGAGAGGCTCAACTTCACTGCCTCAATTGGTGA
CGATGATGTTGAGGATAAGGATGCTACTACCGATAAGGACAAGAACAACAGCTCGTAATC
TTTCTTGCAGAACCTGGTTCTTATTGATAAGTATTGTTCTGTCTTTTTTTTT**ATTTAT
GCAGTCTTGTTACTTTCTCAATTCAATAGGTCATCTCTCACATATTTGATGGTGGAGATT
TGTGTGAATTGAATACATCTGTTTATTTTATACTACCATGAGTTTACATCGAGT

QA 2 355 2 355
DS 

RD RR2G628JQ 665 0 0
GGAATCTATCAATGGCGGATGGTAAACCGGACGAGCAGCTCTTCCAGCTTCTTTCAGGTC
TTCTCCAACAGGTTGAATCGTTGACGAATACAGAGGAAGTAGAATTACGTTCGAAGATCG
AAGCACTTGGCTTAGAAGTCACCAAAGTGCCATCAAAATCTTCTCAACCCCTCACTGAGG
TGGAGATTGCTAATGAATTGGACAAGTTATCAGCCAAGCTTGACGATGTTGATGAGATGA
TCTCGTCTGCTATTGCTTCTGACCCGCAAGTTCAGACTCTTCTTAGTGGTACTGCTGATG
TTTGGATGCCTGTTATCACTGCCAACACCCAAGAGAGGCTCAACTTCACTGCCTCAATTG
GTGACGATGATGTTGAGGATAAGGATGCTACTACCGATAAGGACAAGAACAACAGCTCGT
AATCTTTCTTGCAGAACCTGGTTCTTATTGATAAGTATTGTTCTGTCTTTTTTTTTTTAT
TTATGCAGTCTTGCTACTTTCTCAATTCAATAGGTCATCTCTCACATATTTGATGGTGGA
GATTTGTGTGAATTGAATACATCTGTTTATTTTATACTACCATGAGTTTACATCGAGTAA
AAAA**GTTGTAATTCAGTATCTTATATTTGATGAAAAATTGAATAAAGTGTTTATTTAT
TATCC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2G628TF 665 0 0
GGAATCTATCAATGGCGGATGGTAAACCGGACGAGCAGCTCTTCCAGCTTCTTTCAGGTC
TTCTCCAACAGGTTGAATCGTTGACGAATACAGAGGAAGTAGAATTACGTTCGAAGATCG
AAGCACTTGGCTTAGAAGTCACCAAAGTGCCATCAAAATCTTCTCAACCCCTCACTGAGG
TGGAGATTGCTAATGAATTGGACAAGTTATCAGCCAAGCTTGACGATGTTGATGAGATGA
TCTCGTCTGCTATTGCTTCTGACCCGCAAGTTCAGACTCTTCTTAGTGGTACTGCTGATG
TTTGGATGCCTGTTATCACTGCCAACACCCAAGAGAGGCTCAACTTCACTGCCTCAATTG
GTGACGATGATGTTGAGGATAAGGATGCTACTACCGATAAGGACAAGAACAACAGCTCGT
AATCTTTCTTGCAGAACCTGGTTCTTATTGATAAGTATTGTTCTGTCTTTTTTTTTTTAT
TTATGCAGTCTTGCTACTTTCTCAATTCAATAGGTCATCTCTCACATATTTGATGGTGGA
GATTTGTGTGAATTGAATACATCTGTTTATTTTATACTACCATGAGTTTACATCGAGTAA
AAAA**GTTGTAATTCAGTATCTTATATTTGATGAAAA*TTGAATAAAGTGTTTATTTAT
TATCC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2C324JQ 677 0 0
GGAGAGCTTTGATCAATCTATCAATGGCGGATGGTAAACCGGACGAGCAGCTCTTCCAGC
TTCTTTCAGGT**************TGAATCGTTGACGAATACAGAGGAAGTAGAATTAC
GTTCGAAGATCGAAGCACTTGGCTTAGAAGTCACCAAAGTGCCATCAAAATCTTCTCAAC
CCCTCACTGAGGTGGAGATTGCTAATGAATTGGACAAGTTATCAGCCAAGCTTGACGATG
TTGATGAGATGATCTCGTCTGCTATTGCTTCTGACCCGCAAGTTCAGACTCTTCTTAGTG
GTACTGCTGATGTTTGGATGCCTGTTATCACTGCCAACACCCAAGAGAGGCTCAACTTCA
CTGCCTCAATTGGTGACGATGATGTTGAGGATAAGGATGCTACTACCGATAAGGACAAGA
ACAACAGCTCGTAATCTTTCTTGCAGAACCTGGTTCTTATTGATAAGTATTGTTCTGTCT
TTTTTTTTTTATTTATGCAGTCTTGTTACTTTCTCAATTCAATAGGTCATCTCTCACATA
TTTGATGGTGGAGATTTGTGTGAATTGAATACATCTGTTTATTTTATACTACCATGAGTT
TACATCGAGTAAAAAAAAGTTGTAATTCAGTATCTTATATTTGATGAAAAATTGAATAAA
GTGTTTATTTATTATCC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2C324TF 677 0 0
GGAGAGCTTTGATCAATCTATCAATGGCGGATGGTAAACCGGACGAGCAGCTCTTCCAGC
TTCTTTCAGGT**************TGAATCGTTGACGAATACAGAGGAAGTAGAATTAC
GTTCGAAGATCGAAGCACTTGGCTTAGAAGTCACCAAAGTGCCATCAAAATCTTCTCAAC
CCCTCACTGAGGTGGAGATTGCTAATGAATTGGACAAGTTATCAGCCAAGCTTGACGATG
TTGATGAGATGATCTCGTCTGCTATTGCTTCTGACCCGCAAGTTCAGACTCTTCTTAGTG
GTACTGCTGATGTTTGGATGCCTGTTATCACTGCCAACACCCAAGAGAGGCTCAACTTCA
CTGCCTCAATTGGTGACGATGATGTTGAGGATAAGGATGCTACTACCGATAAGGACAAGA
ACAACAGCTCGTAATCTTTCTTGCAGAACCTGGTTCTTATTGATAAGTATTGTTCTGTCT
TTTTTTTTTTATTTATGCAGTCTTGTTACTTTCTCAATTCAATAGGTCATCTCTCACATA
TTTGATGGTGGAGATTTGTGTGAATTGAATACATCTGTTTATTTTATACTACCATGAGTT
TACATCGAGTAAAAAAAAGTTGTAATTCAGTATCTTATATTTGATGAAAAATTGAATAAA
GTGTTTATTTATTATCC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 4

CO CL1703Contig1 872 4 5 U
GGACGCCACGCCACTGAGAGTTCATCGCAGAGAACACAGAGAACAACAGAGAAAATGCCG
GCGGCTAAGCAGAGGACCCCCAAAGTAAGCCGGAACCCTGATCTGATCAGAGGCGTCGGC
AAATACTCTCGCTCTCAAATGTACCACAAGAGGGGTTTGTGGGCAATCAAGGCTAAAAAC
GGCGGCGTTTTCCCCCGTCACGACGTTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCCGGTTGAGAAGCCG
GCCAAGTTTTACCCGGCGGAAGACGTCAAGAAGCCTCTCGCCAACAGACGCAAGCCTAAG
CCCACCAAGCTTAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTAGA
TTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTTCTCAAGCAACTCACTTCTGGTTTGCTTTTGGTAACT
GGTCCATTCAAGATCAACGGTGTTCCGTTGAGACGTGTTAACCAGTCGTACGTGATTGGA
ACCTCCACGAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAACACTGAGAAATTCGATGACAAGTACTTC
GGAAAGGTTGCCGAGAAGAAGACGAAGAAAGGAGAGGGAGAGTTCTTTGAAGCTGACAAA
GAGGTGAAGAAAGAGATCTCTCAAGAGAAGAAGGAAGACCAGAAAACCGTAGACGCAGCT
CTTATCAAATCCATTGAAGCAGTCCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCT
CTGTCACAAGGAATGAAACCACATGAGCTTGTCTTCTAGATTTCATCATCTTGTCGTTTT
GTTTCCCTTCATGTTTCAACAACATCTGTTTTCCCCTGAGAGTTTTTGTCCCTGGATCTT
AAGAAATACACTATTTTCTCTGATTTATATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E655TF U 1
AF RR2AD86JQ C 338
AF RR2AD86TF U 19
AF RR2E655JQ C 276
BS 1 264 RR2E655TF
BS 265 265 RR2AD86TF
BS 266 287 RR2E655TF
BS 288 796 RR2AD86TF
BS 797 872 RR2E655JQ

RD RR2E655TF 287 0 0
GGACGCCACGCCACTGAGAGTTCATCGCAGAGAACACAGAGAACAACAGAGAAAATGCCG
GCGGCTAAGCAGAGGACCCCCAAAGTAAGCCGGAACCCTGATCTGATCAGAGGCGTCGGC
AAATACTCTCGCTCTCAAATGTACCACAAGAGGGGTTTGTGGGCAATCAAGGCTAAAAAC
GGCGGCGTTTTCCCCCGTCACGACGTTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCCGGTTGAGAAGCCG
GCCAAGTTTTACCCGGCGGAAGAC*TCAAGAAGCCTCTCGCCAACAG

QA 1 287 1 287
DS 

RD RR2AD86JQ 369 0 0
TGTTGATCATCCTTGCTGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTTGTTTTTTTCAAGCAACTCA
CTTTTGGTTTGCTTTTGGTAACTGGTCCATTCAAGATCAACGGTGTTCCGTTGAGACGTG
TTAACCAGTCGTACGTGATTGGAACCTCCACGAAGGTTGACATTTTTGGAGTCAACACTG
AGAAATTGGATGACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCCGAGAAGAAGAAGAAAAAAGGAGAGG
GAGAGTTTTTTGAAGCTGACAAAGAGGTGAAGAAAGAGATTTTTCAAGAGAAGAAGGAAG
ACCAGAAAACCGTAGACGCAGCTTTTATCAAATCCATTGAAGCAGTCCCAGAGCTCAAGA
CTTACCT
TG

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR2AD86TF 778 0 0
AGTTCATCGCAGAGAACACAGAGAACAACAGAGAAAATGCCGGCGGCTAAGCAGAGGACC
CCCAAAGTAAGCCGGAACCCTGATCTGATCAGAGGCGTCGGCAAATACTCTCGCTCTCAA
ATGTACCACAAGAGGGGTTTGTGGGCAATCAAGGCTAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCCGT
CACGACGTTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCCGGTTGAGAAGCCGGCCAAGTTTTACCCGGCG
GAAGACGTCAAGAAGCCTCTCGCCAACAGACGCAAGCCTAAGCCCACCAAGCTTAAAGCA
AGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTT
GTCTTTCTCAAGCAACTCACTTCTGGTTTGCTTTTGGTAACTGGTCCATTCAAGATCAAC
GGTGTTCCGTTGAGACGTGTTAACCAGTCGTACGTGATTGGAACCTCCACGAAGGTTGAC
ATTTCTGGAGTCAACACTGAGAAATTCGATGACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCCGAGAAG
AAGACGAAGAAAGGAGAGGGAGAGTTCTTTGAAGCTGACAAAGAGGTGAAGAAAGAGATC
TCTCAAGAGAAGAAGGAAGACCAGAAAACCGTAGACGCAGCTCTTATCAAATCCATTGAA
GCAGTCCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCTCTGTCACAAGGAATGAAA
CCACATGAGCTTGTCTTCTAGATTTCATCATCTTGTCGTTTTGTTTCCCTTCATGTTT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2E655JQ 597 0 0
TCTCGCCAACAGACGCAAGCCTAAGCCCACCAAGCTTAAAGCAAGCATTACTCCAGGAAC
TGTGTTGATCATCCTTGCTGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTTCTCAAGCAACT
CACTTCTGGTTTGCTTTTGGTAACTGGTCCATTCAAGATCAACGGTGTTCCGTTGAGACG
TGTTAACCAGTCGTACGTGATTGGAACCTCCACGAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAACAC
TGAGAAATTCGATGACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCCGAGAAGAAGACGAAGAAAGGAGA
GGGAGAGTTCTTTGAAGCTGACAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCTCTCAAGAGAAGAAGGA
AGACCAGAAAACCGTAGACGCAGCTCTTATCAAATCCATTGAAGCAGTCCCAGAGCTCAA
GACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTTTCTGTCACGAGGAATGAAACCACATGAGCTTGTCTT
CTAGATTTCATCATCTTGTCGTTTTGTTTCCCTTCATGTTTCAACAACATCTGTTTTCCC
CTGAGAGTTTTTGTCCCTGGATCTTAAGAAATACACTATTTTCTCTGATTTATATAC

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 3

CO CL1704Contig1 930 3 5 U
GGAACATGTTTTCTTCTTGCCTTTAGATTTCTTATTCATTACATAAAACAACAACAACAA
CGTGGAAGAGAACATATAACTCTCAACACACATAATATAAAATATGAAGATAGTTAAGCT
ACTGATGGAGAAGGAATCATTCCCACTTTCCTCGCATAAGCAAAGATACCACCAGCATCA
ATAACCGGTCCGGCATCACCGATCGCCTTCAGCTTATACTGCTTACCGGTTGTATGATTA
GTCAGTAAACCACCACTATCCCTCAGCTCGATCGTCACCGTGTCTCCTGTCGTGCACGCG
TCGCAGACTCTAACCTCTGATTCGAGGGGAAACACCTCTCCCGTAGCCACCGAGTTACGG
AAAAAGATCCTTGCGTAAGTCTGAGCAACAACGGCTTTAGCTCCGGCTGCTCCTAGACAG
ACAGGAGCGTGTTCACGTGACGACCCGCAACAAAAGTTCTCACCGGCGACTATGATCGAG
TATTTAGATTTGATCTCTCCTGGCTCAACGAAGCGGGGTTTGTGGGAGTCCGGTAGACCG
GAGAGGGCGTTAGAGCCGATCTCGTCACGCTCTTGCTGGTTGGAAGGGAAGATGCATGCT
TTGTCTGCTGGGATGAT*TGGTCGGTGTCTATGTTGTCTTTCAAGACGAAGCATAGACCG
TGGAAGGTGGTTTTGGCTAGCGAGTCGGATCCCTCGGAAGAGGAGGGAGTGGCACGTGGG
ATGATGAAAGATGCGCGACGTGAAGAGAGGGAGATAGATGATGGGGAGGAAGTAAGCGGA
ACTGGTAATCTTGAGGGAAGGAGATCGGAAGGGAAGGAAGGAGGGAGAAGTTTTACTTGA
TGAGGAAGGTAAGACTCTGGAGAATGTAGGTAGAGAAGACGCCATTTGTGTGTTTGGCTC
TACTATCGAAGTCGTTGTCTGAGTGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI60JQB U 1
AF RR2CN38JQ U 25
AF RR2GI60TF C 346
BS 1 88 RR2GI60JQB
BS 89 89 RR2CN38JQ
BS 90 694 RR2GI60JQB
BS 695 786 RR2CN38JQ
BS 787 930 RR2GI60TF

RD RR2GI60JQB 694 0 0
GGAACATGTTTTCTTCTTGCCTTTAGATTTCTTATTCATTACATAAAACAACAACAACAA
CGTGGAAGAGAACATATAACTCTCAACATACATAATATAAAATATGAAGATAGTTAAGCT
ACTGATGGAGAAGGAATCATTCCCACTTTCCTCGCATAAGCAAAGATACCACCAGCATCA
ATAACCGGTCCGGCATCACCGATCGCCTTCAGCTTATACTGCTTACCGGTTGTATGATTA
GTCAGTAAACCACCACTATCCCTCAGCTCGATCGTCACCGTGTCTCCTGTCGTGCACGCG
TCGCAGACTCTAACCTCTGATTCGAGGGGAAACACCTCTCCCGTAGCCACCGAGTTACGG
AAAAAGATCCTTGCGTAAGTCTGAGCAACAACGGCTTTAGCTCCGGCTGCTCCTAGACAG
ACAGGAGCGTGTTCACGTGACGACCCGCAACAAAAGTTCTCACCGGCGACTATGATCGAG
TATTTAGATTTGATCTCTCCTGGCTCAACGAAGCGGGGTTTGTGGGAGTCCGGTAGACCG
GAGAGGGCGTTAGAGCCGATCTCGTCACGCTCTTGCTGGTTGGAAGGGAAGATGCATGCT
TTGTCTGCTGGGATGAT*TGGTCGGTGTCTATGTTGTCTTTCAAGACGAAGCATAGACCG
TGGAAGGTGGTTTTGGCTAGCGAGTCGGATCCCT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2CN38JQ 777 0 0
AGATTTCTTATTCATTACATAAAACAACAACAACAACGTGGAAGAGAACATATAACTCTC
AACACACATAATATAAAATATGAAGATAGTTAAGCTACTGATGGAGAAGGAATCATTCCC
ACTTTCCTCGCATAAGCAAAGATACCACCAGCATCAATAACCGGTCCGGTATCACCGATC
GCCTTCAGCTTATACTGCTTACCGGTTGTATGATTAGTCAGTAAACCACCACTATCCCTC
AGCTCGATCGTCACCGTGTCTCCTGTCGTGCACGCGTCGCAGACTCTAACCTCTGATTCG
AGGGGAAACACCTCTCCCGTAGCCACCGAGTTACGGAAAAAGATCCTTGCGTAAGTCTGA
GCAACAACGGCTTTAGCTCCGGCTGCTCCTAGACAGACAGGAGCGTGTTCACGTGACGAC
CCGCAACCAAAGTTCTCACCGGCGACTATGATCGAGTATTTAGATTTGATCTCTCCTGGC
TCAACGAAGCGGGGTTTGTGGGAGTCCGGTAGACCGGAGAGGGCGTTAGAGCCGATCTCG
TCACGCTCTTGCTGGTTGGAAGGGAAGATGCATGCTTTGTCTGCTGGGATGATCTGGTCG
GTGTCTATGTTGTCTTTCAAGACGAAGCATAGACCGTGGAAGGTGGTTTTGGCTAGCGAG
TCGGATCCCTCGGAAGAGGAGGGAGTGGCACGTGGGATGATGAAAGATGCGCGACGTGAA
GAGAGGGAGATAGATGATGGGGAGGAAGTAAGCGGAACTGGT
ATCTTGAGGGAAGAG

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2GI60TF 585 0 0
GCCACCGAGTTACGGAAAAAGATCCTTGCGTAAGTCTGAGCAACAACGGCTTTAGCTCCG
GCTGCTCCTAGACAGACAGGAGCGTGTTCACGTGACGACCCGCAACAAAAGTTCTCACCG
GCGACTATGATCGAGTATTTAGATTTGATCTCTCCTGGCTCAACGAAGCGGGGTTTGTGG
GAGTCCGGTAGACCGGAGAGGGCGTTAGAGCCGATCTCGTCACGCTCTTGCTGGTTGGAA
GGGAAGATGCATGCTTTGTCTGCTGGGATGAT*TGGTCGGTGTCTATGTTGTCTTTCAAG
ACGAAGCATAGACCGTGGAAGGTGGTTTTGGCTAGCGAGTCGGATCCCTCGGAAGAGGAG
GGAGTGGCACGTGGGATGATGAAGGATGCGCGACGTGAAGAGAGGGAGATAGATGATGGG
*AGGAAGTAAGCGGAACTGGTAATCTTGAGGGAAGGAGATCGGAAGGGAAGGAAGGAGGG
AGAAGTTTTACTTGATGAGGAAGGTAAGACTCTGGAGAATGTAGGTAGAGAAGACGCCAT
TTGTGTGTTTGGCTCTACTATCGAAGTCGTTGTCTGAGTGAGTCC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 5

CO CL1705Contig1 639 5 10 U
GGGAGCAGCCGCATTTTAGAGGTGATTTCTCTTCGTCTAGGGTTTCATCAAGCCGTCGTC
TTTCGTCGCATTTCCTCAACGCAACAATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTGCTCAACC
CTCCAGCTGAGCTCGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTGCAATCTCCTAACT
CCTTCTTCATGGACGTCAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACAGTGTTTAGCCACT
CTCAAACAGTTGTAGTGTGTGGCAACTGTCAGACGGTTCTGTGTCAGCCCACTGGTGGTA
AAGCCAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGATTTGATATTTCTCAC
ATTAAATCTCATCTTTTCACAAATGTTGCTGTGAGAAAGAAGTCGGATCTTTTTT*CAGT
TTGCTTTAGTACTTCTTATTGTGTTTATGACAGTCTTTCTTTTTTTTGAATTATGAGAAG
ATTTTGAAACCATCATCACAAACTACTAGTTGGGTTCCTCTACTTTCGTTTAGTCATAAA
TCGAATCGCATCAACTGTCTTGTTTATTGTCTACATATCTGTATTTTGTCAATCGTTGAA
TAAAACACTAAGCGGCCATTCTTTAATCCTAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H238TF U 1
AF RR2AM69JQ C 1
AF RR2AM69TF U 1
AF RR2DK89JQ C 6
AF RR2DK89TF U 6
BS 1 6 RR2AM69JQ
BS 7 415 RR2H238TF
BS 416 416 RR2AM69TF
BS 417 467 RR2H238TF
BS 468 469 RR2AM69TF
BS 470 470 RR2DK89TF
BS 471 474 RR2AM69TF
BS 475 475 RR2DK89TF
BS 476 552 RR2AM69TF
BS 553 639 RR2DK89TF

RD RR2H238TF 479 0 0
GGGAGC
AGCCGCATTTTAGAGGTGATTTCTCTTCGTCTAGGGTTTCATCAAGCCGTCGTCTTTCGT
CGCATTTCCTCAACGCAACAATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTGCTCAACCCTCCAG
CTGAGCTCGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTGCAATCTCCTAACTCCTTCT
TCATGGACGTCAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACAGTGTTTAGCCACTCTCAAA
CAGTTGTAGTGTGTGGCAACTGTCAGACGGTTCTGTGTCAGCCCACTGGTGGTAAAGCCA
GGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGATTTGATATTTCTCACATTAAA
TCTCATCTTTTCACAAATGTTGCTGTGAGAAAGAAGTCGGATCTTTTTTTCAGTTTGCTT
TAGTACTTCTTATTGTGTTTATGACAGTCTTTCTTTTTTTT
TGATTATGAGAA

QA 7 467 7 467
DS 

RD RR2AM69JQ 553 0 0
GGGAGCAGCCGCATTTTAGAGGTGATTTCTCTTCGTCTAGGGTTTCATCAAGCCGTCGTC
TTTCGTCGCATTTCCTCAACGCAACAATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTGCTCAACC
CTCCAGCTGAGCTCGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTGCAATCTCCTAACT
CCTTCTTCATGGACGTCAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACAGTGTTTAGCCACT
CTCAAACAGTTGTAGTGTGTGGCAACTGTCAGACGGTTCTGTGTCAGCCCACTGGTGGTA
AAGCCAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGATTTGATATTTCTCAC
ATTAAATCTCATCTTTTCACAAGTGTTGCTGTGAGAAAGAAGTCGGATCTTTTTT*CAGT
TTGCTTTAGTACTTCTTATTGTGTTTATGACAGTCTTTCTTTTTTTTGATTTAT*AGAAG
ATTTTGAAACCATCATCACAAACTACTAGTTGGGTTCCTCTACTTTCGTTTAGTCATAAA
TCGAATCGCATC
G

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2AM69TF 553 0 0
GGGAGC
AGCCGCATTTTAGAGGTGATTTCTCTTCGTCTAGGGTTTCATCAAGCCGTCGTCTTTCGT
CGCATTTCCTCAACGCAACAATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTGCTCAACCCTCCAG
CTGAGCTCGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTGCAATCTCCTAACTCCTTCT
TCATGGACGTCAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACAGTGTTTAGCCACTCTCAAA
CAGTTGTAGTGTGTGGCAACTGTCAGACGGTTCTGTGTCAGCCCACTGGTGGTAAAGCCA
GGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGATTTGATATTTCTCACATTAAA
TCTCATCTTTTCACAAGTGTTGCTGTGAGAAAGAAGTCGGATCTTTTTT*CAGTTTGCTT
TAGTACTTCTTATTGTGTTTATGACAGTCTTTCTTTTTTTTGATTTAT*AGAAGATTTTG
AAACCATCATCACAAACTACTAGTTGGGTTCCTCTACTTTCGTTTAGTCATAAATCGAAT
CGCATC
G

QA 7 552 7 552
DS 

RD RR2DK89JQ 625 0 0
G
AGCCACATTTTAGAGGTGATTTCTCTTCGTCTAGGGTTTCATCAAGCCGTCGTCTTTCGT
CGCATTTCCTCAACGCAACAATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTGCTCAACCCTCCAG
CTGAGCTCGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTACAATCTCCTAACTCCTTCT
TCATGGACGTCAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACAGTGTTTAGCCACTCTCAAA
CAGTTGTAGTGTGTGGCAACTGTCAGACGGTTCTGTGTCAGCCCACTGGTGGTAAAGCCA
GGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGATTTGATATTTCTCACATTAAA
TCTCATCTTTTCACAAATGTTGCTGTGAGAAAGAAGTCGGATCTTTTTT*CAGTTTGCTT
TAGTACTTCTTATTGTGTTTATGACAGTCTTTCTTTTTTTTTGATTATGAGAAGATTTTG
AAACCATCATCACAAACTACTAGTTGGGTTCCTCTACTTTCGTTTAGTCATAAATCGAAT
CGCATCAACTGTCTTGTTTATTGTCTACATATCTGTATTTTGTCAATCGTTGAATAAAAC
ACTAAGCGGCCATTCTTTAATCCT

QA 2 625 2 625
DS 

RD RR2DK89TF 634 0 0
G
AGCCACATTTTAGAGGTGATTTCTCTTCGTCTAGGGTTTCATCAAGCCGTCGTCTTTCGT
CGCATTTCCTCAACGCAACAATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTGCTCAACCCTCCAG
CTGAGCTCGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTACAATCTCCTAACTCCTTCT
TCATGGACGTCAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACAGTGTTTAGCCACTCTCAAA
CAGTTGTAGTGTGTGGCAACTGTCAGACGGTTCTGTGTCAGCCCACTGGTGGTAAAGCCA
GGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGATTTGATATTTCTCACATTAAA
TCTCATCTTTTCACAAATGTTGCTGTGAGAAAGAAGTCGGATCTTTTTT*CAGTTTGCTT
TAGTACTTCTTATTGTGTTTATGACAGTCTTTCTTTTTTTTTGATTATGAGAAGATTTTG
AAACCATCATCACAAACTACTAGTTGGGTTCCTCTACTTTCGTTTAGTCATAAATCGAAT
CGCATCAACTGTCTTGTTTATTGTCTACATATCTGTATTTTGTCAATCGTTGAATAAAAC
ACTAAGCGGCCATTCTTTAATCCTAAAAAAAAA

QA 2 634 2 634
DS 



AS 1 5

CO CL1706Contig1 1259 5 22 U
CAATAAATTTTTGGTAAATTAACGCGTACTACCTTTATACACATATATAAACATATATTT
ATAATTTTATACAGTTGACTTCTTACCGAATGGTAAAAGAGTATAAAAAAAGTAAGTCTT
CCGGTACATAGAGGACTAACCATATTCACAGACCAATCAACCTGTTCTTGTCAAATCAAA
AATCGATCTTAACCGGATATCTATGGATACAATGTTCCCAAGGATTCTTAACCGATGGTT
CAACGTCACGAAGTGCCACCCAAACCGCGCTGTTACACTTAAACCCACTTCCAAAAGCAA
TCTGCCAAACCCGGTTCCCATTCTTCATTCTTCCTTTAGCTTCCGTATAAGCCAACTCAT
ACCATATAGAGCTCGAAGAAGTGTTACCAAATCTATGCAACGTCATCCTCGACGCTTCCA
CATGTTTAGGCAAAAGCCTTAAACTCTTCTCTAGCTCGTCGATCACGGCTCTACCTCCCG
CGTGTATACAGAAATGATCAAACGCAAGCTTGAAATCCGGTTGGTAAGGCCTCATCTTTT
TCTTAGCATTAAACAGTTTATTAGCAACAAAAGTCGCAAAGAAGAGAATCTGCTCGCTCA
TGGGGAGAACAAGAGGACCCAAAGTGGTGATGTTCGTCTTAAGAGCTTCTCCAGCTATAG
CCATCAGGTCCTTAGACAAAGAAACACCCGTTGTCAAAGCCTCGTCTTGTTCTTGGTACA
CACAGTTAAATGCTTTCTCATCTGCTCCTTTATGAGTCCTCACCGTGTGAACAAGCTTAT
ACTTGGAACGTTTACGATCACTAGCCTTGTTAGAGAGCAGAACCGCGGATCCACCAACCA
TAAACAAGCAGTTAGGTATCAACATGGCTTTGTTACTACCAAAGTACCAGTTCTGAGTTA
TGTTCTCTGTGCTAACCACAAGAGCATAAGTGTTTCTATATAACTGCAACATGTCATTAG
CTAGATCAACAGCGATCACACCAGCACTGCATCATCGGCTTGGTCAGCCTTTACCTAACC
AACTACCTAATACTACGCAGGCTCATCAAACAGCGCTTTCTAGCTTTCTTCGGGATTTAG
CCCGAACTGTTCGGCAGATTCCCGCGCCTTACGCACCCGTTCGCCACTTTGTTCACAACT
CTTCCCACCTCTTGGGTGAGACAAGCTACCTTGAGCTAGGAGCCTCCATTCCTTCTGACT
AGCTTGACGTTCTTACGGATCTGAACGTTGTCGTCCATGGGAGATTTCTACTAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D460JQ U 1
AF RR2GS83JQB U 1
AF RR2CF63JQ U 31
AF RR2GS83TF C 173
AF RR2D460TF C 497
BS 1 96 RR2D460JQ
BS 97 97 RR2GS83JQB
BS 98 146 RR2D460JQ
BS 147 147 RR2GS83JQB
BS 148 238 RR2D460JQ
BS 239 239 RR2GS83JQB
BS 240 244 RR2D460JQ
BS 245 245 RR2GS83JQB
BS 246 343 RR2D460JQ
BS 344 344 RR2GS83JQB
BS 345 376 RR2D460JQ
BS 377 377 RR2CF63JQ
BS 378 409 RR2D460JQ
BS 410 585 RR2CF63JQ
BS 586 586 RR2GS83TF
BS 587 829 RR2CF63JQ
BS 830 875 RR2GS83TF
BS 876 876 RR2D460TF
BS 877 946 RR2GS83TF
BS 947 947 RR2D460TF
BS 948 952 RR2GS83TF
BS 953 1259 RR2D460TF

RD RR2D460JQ 409 0 0
CAATAAATTTTTGGTAAATTAACGCGTACTACCTTTATACACATATATAAACATATATTT
ATAATTTTATACAGTTGACTTCTTACCGAATGGTAAGAGAGTATAAAAAAAGTAAGTCTT
CCGGTACATAGAGGACTAACCATATTTACAGACCAATCAACCTGTTCTTGTCAAATCAAA
AATCGATCTTAACCGGATATCTATGGATACAATGTTCCCAAGGATTCTTAACCGATGGCT
CAACATCACGAAGTGCCACCCAAACCGCGCTGTTACACTTAAACCCACTTCCAAAAGCAA
TCTGCCAAACCCGGTTCCCATTCTTCATTCTTCCTTTAGCTTCTGTATAAGCCAACTCAT
ACCATATAGAGCTCGATGAAGTGTTACCAAATCTATGCAACGTCATCCT

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR2GS83JQB 371 0 0
CAAG
AAATTTTTGGTAAATTAACGCGTACTACCTTTATACACATATATAAACATATATTTATAA
TTTTATACAGTTGACTTCTTACCGAATGGTAAAAGAGTATAAAAAAAGTAAGTCTTCCGG
TACATAGAGGACTAACCATATTCACAGACCAATCAACCTGTTCTTGTCAAATCAAAAATC
GATCTTAACCGGATATCTATGGATACAATGTTCCCAAGGATTCTTAACCGATGGTTCAAC
GTCACGAAGTGCCACCCAAACCGCGCTGTTACACTTAAACCCACTTCCAAAAGCAATCTG
CCAAACCCGGTTCCCATTCTTCATTCTTCCTTTAGCTTCCGTATAAGCCAACTCATACCA
TATAGAG

QA 5 371 5 371
DS 

RD RR2CF63JQ 799 0 0
G
CCTTTATACACATATATAAACATATATTTATAATTTTATACAGTTGACTTCTTACCGAAT
GGTAAAAGAGTATAAGAAGAGTAAGTCTTCCGGTACATAGAGGACTAACCATATTCACAG
ACCAATCAACCTGTTCTTGTCAAATCAGAGATCGATCTTAACCGGATATCTATGGATACA
ATGTTCCCAAGGATTCTTAACCGATGGTTCAACGTCACGAAGTGCCACCCAAACCGCGCT
GTTACACTTAAACCCACTTCCAAAAGCAATCTGCCAAACCCGGTTCCCATTCTTCATTCT
TCCTTTAGCTTCCGTATAAGCCAACTCATACCATATAGAGCTCGAAGAAGTGTTGCCAAA
TCTATGCAACGTCATCCTCGACGCTTCCACATGTTTAGGCAAAAGCCTTAAACTCTTCTC
TAGCTCGTCGATCACGGCTCTACCTCCCGCGTGTATACAGAAATGATCAAACGCAAGCTT
GAAATCCGGTTGGTAAGGCCTCATCTTTTTCTTAGCATTAAACAGTTTATTAGCAACAAA
AGTCGCAAAGAAGAAAATCTGCTCGCTCATGGGGAGAACAAGAGGACCCAAAGTGGTGAT
GTTCGTCTTAAGAGCTTCTCCAGCTATAGCCATCAGGTCCTTAGACAAAGAAACACCCGT
TGTCAAAGCCTCGTCTTGTTCTTGGTACACACAGTTAAATGCTTTCTCATCTGCTCCTTT
ATGAGTCCTCACCGTGTGAACAAGCTTATACTTGGAACGTTTACGATCACTAGCCTTGTT
AGAGAGCAGAACCGCGGA

QA 2 799 2 799
DS 

RD RR2GS83TF 781 0 0
AAATCAGAG
ATCGATCTTAACCGGATATCTATGGATACAATGTTCCCAAGGATC**TAACCGATGGTTC
AACGTCACGAAGTGCCACCCAAACCGCGCTGTTACACTTAAACCCACTTCCAAAAGCAAT
CTGCCAAACCCGGTTCCCATTCTTCATTCTTCCTTTAGCTTCCGTATAAGCCAACTCATA
CCATATAGAGCTCGAAGAAGTGTTACCAAATCTATGCAACGTCATCCTCGACGCTTCCAC
ATGTTTAGGCAAAAGCCTTAAACTCTTCTCTAGCTCGTCGATCACGGCTCTACCTCCCGC
GTGTATACAGAAATGATCAAACGCAAGCTTGAAATCCGGTTGGTAAGGCCTCATCTTTTT
CTTAGCATTAAACAGTTTATTAGCAACAAAAGTCGCAAAGAAGAGAATCTGCTCGCTCAT
GGGGAGAACAAGAGGACCCAAAGTGGTGATGTTCGTCTTAAGAGCTTCTCCAGCTATAGC
CATCAGGTCCTTAGACAAAGAAACACCCGTTGTCAAAGCCTCGTCTTGTTCTTGGTACAC
ACAGTTAAATGCTTTCTCATCTGCTCCTTTATGAGTCCTCACCGTGTGAACAAGCTTATG
CTTGGAACGTTTACGATCACTAGCCTTGTTAGAGAGCAGAACCGCGGATCCACCAACCAT
AAACAAGCAGTTAGGTATCAACATGGCTTTGTTATTACCAAAGTACCAGTTCTGAGTTAT
GTTCTCTGTGCTAACCACAAGAGCATAAGTGTTTCTATATAACTGTAACAT
C

QA 10 780 10 780
DS 

RD RR2D460TF 763 0 0
ATCAAACGCAAGCT*GAAATCCGGTTGGTAAGGC*TCATCTTTT*CTTAGCATTAAACAG
TTTATTAGCAACGAAAGTCGCAAAGAAGAGAATCTGCTCGCTCATGGGGAGAACAAGAGG
ACCCAAAGTGGTGATGTTCGTCTTAAGAGCTTCTCCAGCTATAGCCATCAGGTC*TTAGA
CAAAGAAACGCCCGTTGTCAAAGCCTCGTCTTGTTCTTGGTACACGCAGTTAAATGCTTT
CTCATCTGCTCCTTTATGAGTCCTCACCGTGTGAACAAGCTTATACTTGGAACGTTTACG
ATCACTAGCCTTGTTAGAGAGCAGAACCGCGGATCCACCAACCCTAAACAAGCAGTTAGG
TATCAACATGGCTTTGTTACTACCAAAGTACCAGTTCTGAGTTATGTTCTCTGTGCTAAC
CACAAGAGCATAAGTGTTTCTATATAACTGCAACATGTCATTAGCTAGATCAACAGCGAT
CACACCAGCACTGCATCATCGGCTTGGTCAGCCTTTACCTAACCAACTACCTAATACTAC
GCAGGCTCATCAAACAGCGCTTTCTAGCTTTCTTCGGGATTTAGCCCGAACTGTTCGGCA
GATTCCCGCGCCTTACGCACCCGTTCGCCACTTTGTTCACAACTCTTCCCACCTCTTGGG
TGAGACAAGCTACCTTGAGCTAGGAGCCTCCATTCCTTCTGACTAGCTTGACGTTCTTAC
GGATCTGAACGTTGTCGTCCATGGGAGATTTCTACTAAAAAAA

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 5

CO CL1707Contig1 681 5 14 U
GGAATAATAACAAGAAAGAATTATGAGTATCAAGAACTCAGGAGCTGCTGCTGCTGCTGC
AGTCAACAACACCAACGGTAAGCTTCCAATGGAGGAGAAGGACGGAGAAGAAGAGATATG
GAAAGTGGCGGTGTCGAGGTTTCAAGCACGAGAAGAAGAGATAGAGAGGAAGAAGATGAC
TGTTAAGGAGAAAGTCCAACAGAGGCTTGGTTTTGCTGAGGAAGCTACAAGATGCTTGAC
TCAAACTTTGGAAGAGCTGGAGATTATGGGAGATCCAATGAGAAAAGAAGTTGGAATGGT
GAGGAAGAAAATCGACATGGCGAACCGAGATATCAAATCTTTAGCTCAAAGCTGTCAGAA
GAAGGAGAAGGAATACAAAGAGACATTAGAAGCTTTCAACGAAAAGAACAAAGAGAAAAC
TCACCTTGTTTCCATGTTAATGGAGCTACTTGCTGAAAGCGAAAGAGTAAGGATGAAGAA
ACTGGAGGAGATCAACAAGACTGTTGGAGCCTTGCAATGAGAAAGAAACAAAAGAATTGG
ATGTTACATTTTAAAAAGAGTTTTAAATTTGTTTTGAGG*TTTTTTGTTGTATTAGACTC
TTTTCAAGTCATCTCTATTAAAAGTGAACTACCATGTAACATATTATGTACCTCAATGAA
AATGCAACCATATTAAAAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT34TF U 1
AF RR2CU69TF U 113
AF RR2CU69JQ C 176
AF RR2GS80JQB C 252
AF RR2GS80TF U 252
BS 1 147 RR2BT34TF
BS 148 148 RR2CU69TF
BS 149 155 RR2BT34TF
BS 156 156 RR2CU69TF
BS 157 162 RR2BT34TF
BS 163 163 RR2CU69TF
BS 164 264 RR2BT34TF
BS 265 266 RR2CU69TF
BS 267 321 RR2BT34TF
BS 322 322 RR2CU69TF
BS 323 556 RR2BT34TF
BS 557 557 RR2CU69TF
BS 558 674 RR2BT34TF
BS 675 681 RR2CU69JQ

RD RR2BT34TF 675 0 0
GGAATAATAACAAGAAAGAATTATGAGTATCAAGAACTCAGGAGCTGCTGCTGCTGCTGC
AGTCAACAACACCAACGGTAAGCTTCCAATGGAGGAGAAGGACGGAGAAGAAGAGATATG
GAAAGTGGCGGTGTCGAGGTTTCAAGCGCGAGAAGGAGAGATCGAGAGGAAGAAGATGAC
TGTTAAGGAGAAAGTCCAACAGAGGCTTGGTTTTGCTGAGGAAGCTACAAGATGCTTGAC
TCAAACTTTGGAAGAGCTGGAGATAGTGGGAGATCCAATGAGAAAAGAAGTTGGAATGGT
GAGGAAGAAAATCGACATGGCTAACCGAGATATCAAATCTTTAGCTCAAAGCTGTCAGAA
GAAGGAGAAGGAATACAAAGAGACATTAGAAGCTTTCAACGAAAAGAACAAAGAGAAAAC
TCACCTTGTTTCCATGTTAATGGAGCTACTTGCTGAAAGCGAAAGAGTAAGGATGAAGAA
ACTGGAGGAGATCAACAAGACTGTTGGAGCCTTGCAATGAGAAAGAAACAAAAGAATTGG
ATGTTACATTTTAAAA*GAGTTTTAAATTTGTTTTGAGG*TTTTTTGTTGTATTAGACTC
TTTTCAAGTCATCTCTATTAAAAGTGAACTACCATGTAACATATTATGTACCTCAATGAA
AATGCAACCATATT
A

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2CU69TF 569 0 0
GAGATATGGAAAGTGGCGGTGTCGAGGTTTCAAGCACGAGAAGAAGAGATAGAGAGGAAG
AAGATGACTGTTAAGGAGAAAGTCCAACAGAGGCTTGGTTTTGCTGAGGAAGCTACAAGA
TGCTTGACTCAAACTTTGGAAGAGCTGGAGATTATGGGAGATCCAATGAGAAAAGAAGTT
GGAATGGTGAGGAAGAAAATCGACATGGCGAACCGAGATATCAAATCTTTAGCTCAAAGC
TGTCAGAAGAAGGAGAAGGAATACAAAGAGACATTAGAAGCTTTCAACGAAAAGAACAAA
GAGAAAACTCACCTTGTTTCCATGTTAATGGAGCTACTTGCTGAAAGCGAAAGAGTAAGG
ATGAAGAAACTGGAGGAGACCAACAAGACTGTTGGAGCCATGCAATGAGAAAGAAACAAA
AGAATTGGATGTTACATTTTAAAAAGAGTTTTAAATTTGTTTTGAGGGTTTTTTGTTGTA
TTAGACTCTTTTCAAGTCATCTCTATTAAAAGTGAACTACCATGTAACATATTATGTACC
TCAATGAAAATGCAACCATATT
AAAAGGT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2CU69JQ 506 0 0
ATGACTGTTAAGGAGAAAGTCCAACAGAGGCTTGGTTTTGCTGAGGAAGCTACAAGATGC
TTGACTCAAACTTTGGAAGAGCTGGAGATTATGGGAGATCCAATGAGAAAAGAAGTTGGA
ATGGTGAGGAAGAAAATCGACATGGCGAACCGAGATATCAAATCTTTAGCTCAAAGCTGT
CAGAAGAAGGAGAAGGAATACAAAGAGACATTAGAAGCTTTCAACGAAAAGAACAAAGAG
AAAACTCACCTTGTTTCCATGTTAATGGAGCTACTTGCTGAAAGCGAAAGAGTAAGGATG
AAGAAACTGGAGGAGATCAACAAGACTGTTGGAGCCATGCAATGAGAAAGAAACAAAAGA
ATTGGATGTTACATTTTAAAAAGAGTTTTAAATTTGTTTTGAGGGTTTTTTGTTGTATTA
GACTCTTTTCAAGTCATCTCTATTAAAAGTGAACTACCATGTAACATATTATGTACCTCA
ATGAAAATGCAACCATATTAAAAGGT

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2GS80JQB 423 0 0
G
AGAGCTGGAGATTATGGGAGATCCTATGAGAAAAGAAGTTGGAATGGTGAGGAAGAAAAT
CGACATGGCGAACCGAGATATCAAATCTTTAGCTCAAAGCTGTCAGAAGAAGGAGAAGGA
ATACAAAGAGACATTAGAAGCTTTCAACGAAAAGAACAAAGAGAAAACTCACCTTGTTTC
CATGTTAATGGAGCTACTTGCTGAAAGCGAAAGAGTAAGGATGAAGAAACTGGAGGAGAT
CAACAAGACTGTTGGAGCCTTGCAATGAGAAAGAAACAAAAGAATTGGATGTTACATTTT
AAAAAGAGTTTTAAATTTGTTTTGAGG*TTTTTTGTTGTATTAGACTCTTTTCAAGTCAT
CTCTATTAAAAGTGAACTACCATGTAACATATTATGTACCTCAATGAAAATGCAACCATA
TT

QA 2 423 2 423
DS 

RD RR2GS80TF 423 0 0
G
AGAGCTGGAGATTATGGGAGATCCTATGAGAAAAGAAGTTGGAATGGTGAGGAAGAAAAT
CGACATGGCGAACCGAGATATCAAATCTTTAGCTCAAAGCTGTCAGAAGAAGGAGAAGGA
ATACAAAGAGACATTAGAAGCTTTCAACGAAAAGAACAAAGAGAAAACTCACCTTGTTTC
CATGTTAATGGAGCTACTTGCTGAAAGCGAAAGAGTAAGGATGAAGAAACTGGAGGAGAT
CAACAAGACTGTTGGAGCCTTGCAATGAGAAAGAAACAAAAGAATTGGATGTTACATTTT
AAAAAGAGTTTTAAATTTGTTTTGAGG*TTTTTTGTTGTATTAGACTCTTTTCAAGTCAT
CTCTATTAAAAGTGAACTACCATGTAACATATTATGTACCTCAATGAAAATGCAACCATA
TT

QA 2 423 2 423
DS 



AS 1 5

CO CL1708Contig1 1434 5 13 U
GGACCTTGCGTTTCCTTTGAAATGAAGAAAATTTTATGGAGTCTCACTCTTTTTGGTGTC
ATCTTAATCCTCCCTGTTAATGGGGTGATGGAGAGGCTCCCAGATTCTAATGGGACAAAT
GTATATCAGACAGAAAATGATGTCTATTCCAAAGCAAAGCCTACAATGGTAGAACTCACT
TTCGTTAAGAATGCTAATGAGAGATCAGCATTGTGTCTAGATGGAAGTCCTTCCGGATAT
CATTTTCATCCCGGGTCCGGTTCAGGAGCAAAGAATTGGATCATTCAGTTTGAGGGAGGT
GGATGGTGTGGTACCATTGAAGATTGTATAAATATGAAAAAAACTCGTCATGGGTCGTCC
AAATATATGGAGAAACAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGACAAAGCCGCGGAAAAT
CCAGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTCCTGTGATGGTGGATCCTTTATG
GGAAAAAACGAAAATATGGATGCAAAACTTCAGTTTAGAGGAAAGCAAATATGGGGATGT
ATTATGGTAGACTTGATGGAAAACAACAGATTTCGTGAAGCAAAGCAGGTTCTGCTTTCT
GGATGTTCTTCTGGAGGCCTTGCAGCGATACTTCACTGTGACCAGTTAAAATGGCATTTC
CCTAAAGCCAGACTAAAATGTCTGAGTGATGCTGGCCTTTTCCTTGATGCCCCCGATGTC
TCTGGAGATCGACCTCTTAGAAATTTATACAGAGATTTAATAGTATTACAGAGTATTACA
ACACAGCTCTCTAACGAATGTTTAAGACGTCTTAATCCAACTTCGTGTTTTTTCGGGCAA
AACCTAATAAACCAAGTCAACACTTCATTGTTTATTCTAAATGCTGCATACGATCCGTGG
CAGATCCAAGAGAGTTTAACTCCTAAATCTGCAGATCCAAATGGAAGTTGGTCTGACTGT
AGACTTAACATCGCAAAGTGCAATGCATCTCAGATCAAGTTCTTGCAAGGTTTCAGAACT
CGTATGGTGAATTTGATCAGTAGTTTTACAAAGCCAAGTAAGAACGGAGTATTTATTAAC
TCGTGCTTTACTCATTGCCAAACAGAGAATCATGACACTTGGTATTCCAAAAACTCTCCT
GCTATTAAGAACAAGAGGATTGCAGTAGCTGTGGGAGATTGGTTTTTCGAAAGAAGAGGA
GCGAAACTCATAGACTGTGCTTATCCCTGTGACAAGACTTGCCGTAATGAAGTTTCCAAA
TGATAATTTGTTTCTATATATATTTTGGCATTCAAATCCTTTTTGTCATTTTTATTTGCA
ACAAATAACCAAAATAAAGGACAATTGCCTAGAACAGTTTAGCTAACTAAATTGGTAGTG
TAAAATTAGTATGAACTACTGCTATTTATTGGCGATAAATACAAAAATGTTGTG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D755TF U 1
AF RR2CD70TF U 1
AF RR2CD70JQ C 546
AF RR2BJ40JQ C 992
AF RR2BJ40TF U 992
BS 1 122 RR2CD70TF
BS 123 123 RR2D755TF
BS 124 131 RR2CD70TF
BS 132 132 RR2D755TF
BS 133 485 RR2CD70TF
BS 486 486 RR2D755TF
BS 487 523 RR2CD70TF
BS 524 524 RR2D755TF
BS 525 583 RR2CD70TF
BS 584 584 RR2D755TF
BS 585 695 RR2CD70TF
BS 696 992 RR2CD70JQ
BS 993 1434 RR2BJ40TF

RD RR2D755TF 605 0 0
A
GACCTTGCGTTTCCTTTGAAATGAAGAAAATTTTATGGAGTCTCACTCTTTTTGGTGTCA
TCTTAATCCTCCCTGTTAATGGGGTGATGGAGAGGCTCCCAGATTCTAATGGGACAAATG
TATATCAGACAGAAAATGATGTCTATTCCAAAGCAAAGCCTACAATGGTAGAACTCACTT
TCGTTAAGAATGCTAATGAGAGATCAGCATTGTGTCTAGATGGAGGTCCTTCCGGATATC
ATTTTCATCCCGGGTCCGGTTCAGGAGCAAAGAATTGGATCATTTAGTTTGAGGGAGGTG
GATGGTGTGGTACCATTGAAGATTGTATAAATATGAAAAAAACTCGTCATGGGTCGTCCA
AATATATGGAGAAACAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGACAAAGCCGCGGAAAATC
CAGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTCCTGTGATGGTGGATCCTTTATGG
GAAGAAACGAAAATATGGATGCAAAACTTCAGTTTAGAGGAAAGCAAATATGGGGATGTG
TTATGGTAGACTTGATGGAAAACAACAGATTTCGTGAAGCAAAGCAGGTTCTGCTTTCTG
GATG

QA 2 605 2 605
DS 

RD RR2CD70TF 695 0 0
GGACCTTGCGTTTCCTTTGAAATGAAGAAAATTTTATGGAGTCTCACTCTTTTTGGTGTC
ATCTTAATCCTCCCTGTTAATGGGGTGATGGAGAGGCTCCCAGATTCTAATGGGACAAAT
GTGTATCAGACCGAAAATGATGTCTATTCCAAAGCAAAGCCTACAATGGTAGAACTCACT
TTCGTTAAGAATGCTAATGAGAGATCAGCATTGTGTCTAGATGGAAGTCCTTCCGGATAT
CATTTTCATCCCGGGTCCGGTTCAGGAGCAAAGAATTGGATCATTCAGTTTGAGGGAGGT
GGATGGTGTGGTACCATTGAAGATTGTATAAATATGAAAAAAACTCGTCATGGGTCGTCC
AAATATATGGAGAAACAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGACAAAGCCGCGGAAAAT
CCAGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTCCTGTGATGGTGGATCCTTTATG
GGAAACAACGAAAATATGGATGCAAAACTTCAGTTTAGAGGAAGGCAAATATGGGGATGT
ATTATGGTAGACTTGATGGAAAACAACAGATTTCGTGAAGCAA*GCAGGTTCTGCTTTCT
GGATGTTCTTCTGGAGGCCTTGCAGCGATACTTCACTGTGACCAGTTAAAATGGCATTTC
CCTAAAGCCAGACTAAAATGTCTGAGTGATGCTGG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2CD70JQ 805 0 0
GGTAGACTTGATGGAAAACAACAGATTTCGTGAAGCAAAGCAGGTTCTGCTTTCTGGATG
TTCTTCTGGAGGCCTTGCAGCGATACTTCACTGTGACCAGTTAAAATGGCATTTCCCTAA
GGCCAGACTAAAATGTCTGAGTGATGCTGGCCTTTTCCTTGATGCCCCCGATGTCTCTGG
AGATCGACCTCTTAGAAATTTATACAGAGATTTAATAGTATTACAGAGTATTACAACACA
GCTCTCTAACGAATGTTTAAGACGTCTTAATCCAACTTCGTGTTTTTTCGGGCAAAACCT
AATAAACCAAGTCAACACTTCATTGTTTATTCTAAATGCTGCATACGATCCGTGGCAGAT
CCAAGAGAGTTTAACTCCTAAATCTGCAGATCCAAATGGAAGTTGGTCTGACTGTAGACT
TAACATCGCAAAGTGCAATGCATCTCAGATCAAGTTCTTGCAAGGTTTCAGGACTCGTAT
GGTGAATTTGATCAGTGGTTTTACAAAGCCAAGTAAGAACGGAGTATTTATTAACCCGTG
CTTTACTCATTGCCAAACAGAGAATCATGACACATGGTATTCCAAAAACTCTCCTGCTAT
TAAGAACAAGAGGATTGCAGTAGCTGTGGGAGATTGGTTTTTCGAAAGAAGAGGAGCGAA
ACTCATAGACTGTGATTATCCCTGTGACAAGACTTGCCGTAATGAAGTTTCCAAATGATA
ACTTGTTTCTATATATATTTTGGCATTCAAATCCTTTTTGTCATTCTTATTTGCAACAAA
TAACCAAAATAAAGGAAAATTGCCT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2BJ40JQ 443 0 0
G
GATCAAGTTCTTGCAAGGTTTCAGAACTCGTATGGTGAATTTGATCAGTAGTTTTACAAA
GCCAAGTAAGAACGGAGTATTTATTAACTCGTGCTTTACTCATTGCCAAACAGAGAATCA
TGACACTTGGTATTCCAAAAACTCTCCTGCTATTAAGAACAAGAGGATTGCAGTAGCTGT
GGGAGATTGGTTTTTCGAAAGAAGAGGAGCGAAACTCATAGACTGTGCTTATCCCTGTGA
CAAGACTTGCCGTAATGAAGTTTCCAAATGATAATTTGTTTCTATATATATTTTGGCATT
CAAATCCTTTTTGTCATTTTTATTTGCAACAAATAACCAAAATAAAGGACAATTGCCTAG
AACAGTTTAGCTAACTAAATTGGTAGTGTAAAATTAGTATGAACTACTGCTATTTATTGG
CGATAAATACAAAAATGTTGTG

QA 2 443 2 443
DS 

RD RR2BJ40TF 443 0 0
G
GATCAAGTTCTTGCAAGGTTTCAGAACTCGTATGGTGAATTTGATCAGTAGTTTTACAAA
GCCAAGTAAGAACGGAGTATTTATTAACTCGTGCTTTACTCATTGCCAAACAGAGAATCA
TGACACTTGGTATTCCAAAAACTCTCCTGCTATTAAGAACAAGAGGATTGCAGTAGCTGT
GGGAGATTGGTTTTTCGAAAGAAGAGGAGCGAAACTCATAGACTGTGCTTATCCCTGTGA
CAAGACTTGCCGTAATGAAGTTTCCAAATGATAATTTGTTTCTATATATATTTTGGCATT
CAAATCCTTTTTGTCATTTTTATTTGCAACAAATAACCAAAATAAAGGACAATTGCCTAG
AACAGTTTAGCTAACTAAATTGGTAGTGTAAAATTAGTATGAACTACTGCTATTTATTGG
CGATAAATACAAAAATGTTGTG

QA 2 443 2 443
DS 



AS 1 5

CO CL1709Contig1 962 5 20 U
GGGCAGAAGTCACATTTGTTTTATTGTCCCTTGTAAAGATCCAAAGATGAGCGAAGAAAC
ATATGAAGAAACGATGGAATCAAACGGGTCTCCTCGTCCTGCTCCAAAACTCAACGAAAG
GATTCTCTCAACTCTGTCCAAGAGATCTGTAGCTGCACGTCCATGGCACGACCTTGAGAT
CGGTCCTGAAGCTCCATTGGTCTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGAAGCAAAGT
GAAGTATGAACTTGACAAAAAGACCGGTCTTATCAAGGTTGACCGGATCTTGTACTCATC
GGTTGTTTATCCTCACAACTATGGATTCATCCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCC
TCTCGATGTTCTTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTCCGCGCTAG
AGCCATTGGATTAATGCCCATGATCGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCGGT
GTGTGCTGATGATCCTGAGTACAGACATTTCACTGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCG
TCTCTCAGAGATTCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGC
TGTAAACGATTTCTTGCCATCGGAAAAGGCACATGAAGCAATCCAGTACTCCATGGACCT
ATACGCTGAGTACATTCTCCATAGCTTGAGGAGATGAACGTACGCACAAGCTGCATATTT
ATATTCCCATACGGCGAAAGGGATCATTCTTGGCAGCAGAATATTGTTTTAAATAATTAT
ATCTGAATATTACAGTTTTCTCTTGTTATTTTTGTTGTTGTTCTTTCTTGAGATGTTGCA
ATTTTGTTATATTGTATAATTTGAAAACTGATACAAGGACGAATGTATTTTTCATTCTTT
CCTTGTCATGTTAACTTGTATACTAATGGGCTTTATAAGCTCATATGGCCCAAATAAACT
GG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2GJ34TF U 1
AF RR2CM76TF U 3
AF RR2CM76JQ C 219
AF RR2C637TF U 381
AF RR2GJ34JQB C 102
BS 1 467 RR2GJ34TF
BS 468 468 RR2CM76TF
BS 469 479 RR2GJ34TF
BS 480 480 RR2CM76TF
BS 481 618 RR2GJ34TF
BS 619 628 RR2CM76TF
BS 629 629 RR2C637TF
BS 630 675 RR2CM76TF
BS 676 676 RR2C637TF
BS 677 679 RR2CM76TF
BS 680 680 RR2C637TF
BS 681 697 RR2CM76TF
BS 698 698 RR2C637TF
BS 699 724 RR2CM76TF
BS 725 800 RR2C637TF
BS 801 801 RR2GJ34JQB
BS 802 842 RR2C637TF
BS 843 866 RR2GJ34JQB
BS 867 867 RR2CM76JQ
BS 868 962 RR2GJ34JQB

RD RR2GJ34TF 618 0 0
GGGCAGAAGTCACATTTGTTTTATTGTCCCTTGTAAAGATCCAAAGATGAGCGAAGAAAC
ATATGAAGAAACGATGGAATCAAACGGGTCTCCTCGTCCTGCTCCAAAACTCAACGAAAG
GATTCTCTCAACTCTGTCCAAGAGATCTGTAGCTGCACGTCCATGGCACGACCTTGAGAT
CGGTCCTGAAGCTCCATTGGTCTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGAAGCAAAGT
GAAGTATGAACTTGACAAAAAGACCGGTCTTATCAAGGTTGACCGGATCTTGTACTCATC
GGTTGTTTATCCTCACAACTATGGATTCATCCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCC
TCTCGATGTTCTTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTCCGCGCTAG
AGCCATTGGATTAATGCCCATGATCGATCAGGGAGAGATGGACGACAGGATCATAGCGGC
GTGTGCTGATGATCCTGAGTACAGACATTTCACTGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCG
TCTCTCAGAGATTCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGC
TGTAAACGATTTCTTGCC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2CM76TF 726 0 0
GG
AGAAGTCACATTTGTTTTATTGTCCCTTGTAAAGATCTAAAGATGAGCGAAGAAACATAT
GAAGAAACGATGGAATCAAACGGTTCTCCTCGTCCTGCTCCAAAACTCAACGAGAGGATT
CTCTCAACTCTGTCCAAGAGATCTGTAGCTGCACATCCATGGCACGACCTTGAGATCGGT
CCTGAAGCTCCATTGGTCTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGAAGCAAAGTGAAG
TATGAACTTGACAAAAAGACCGGTCTTATCAAGGTTGACCGGATCTTGTACTCATCGGTT
GTTTATCCTCACAACTATGGATTCATCCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCCTCTC
GATGTTCTTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTCCGCGCTAGAGCC
ATTGGATTAATGTCCATGATCGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCGGTGTGT
GCTGATGATCCTGAGTACAGACATTTCACTGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCGTCTC
TCAGAGATTCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGCTGTA
AACGATTTCTTGCCATCGGAAAAG*CACATGAAGCAATCCAGTACTCCATGGACCTATAC
GCTGAGTACAT*CTC*ATAGCTTGAGGAGATGA*CGTACGCACAAGCTGCATATTTATAT
CCCA

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR2CM76JQ 661 0 0
AGATCACAAAGGGAAGCAAAGTGAAGTATGAACTTGACAAAAAGACCGGTCTTATCAAGG
TTGACCGGATCTTGTACTCATCGGTTGTTTATCCTCACAACTATGGATTCATCCCAAGGA
CATTGTGTGAAGACAACGATCCTCTCGATGTTCTTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTC
CAGGATGTTTTCTCCGCGCTAGAGCCATTGGATTAATGTCCATGATCGATCAGGGAGAGA
TGGACGACAAGATCATAGCGGTGTGTGCTGATGATCCTGAGTACAGACATTTCACTGACA
TCAAACAACTCGCTCCTCACCGTCTTTCAGAGATTCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGA
AGAACGAGCACAAGGAGGTGGCTGTAAACGATTTCTTGCCATCGGAAAAGGCACATGAAG
CAATCCAGTACTCCATGGACCTATACGCTGAGTACATTCTCCATAGCTTGAGGAGATGAA
CGTACGCACAAGCTGCATATTTATATTCCCATACGGCGAAAGGGATCATTCTTGGCAGCA
GAATATTGTTTTAAATAATTATATCTGAATATTACAGTTTTCTCTTGTTATTTTTGTTGT
TGTTCTTTCTTGAGATGTTGCAATTTTGTTATATTGTATAATTTGAAAACTGATACAAGG
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2C637TF 462 0 0
G
GCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTCCGCGCTAGAGCCATTGGATTAATGCCCAT
GATCGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCGGTGTGTGCTGATGATCCTGAGTA
CAAACATTTCACTGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCGTCTCTCAGAGATTCGTCGTTT
CTTTGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGCTGTAAACGATTTCTTGCCATC
GGAAAAGGCACATGAAGCAATCCAGTACTCCATGGACCTATACGCTGAGTACATTCTCCA
TAGCTTGAGGAGATGAACGTACGCACAAGCTGCATATTTATATTCCCATACGGCGAAAGG
GATCATTCTTGGCAGCAGAATATTGTTTTAAATAATTATATCTGAATATTACAGTTTTCG
CTTGTTATTTTTGTTGTTGTTCTTTCTTGAGATGTTGCAAT

QA 2 462 2 462
DS 

RD RR2GJ34JQB 861 0 0
GCTCC
AAACTCAACGAAAGGAT*CTCTCAACTCTGTCCAAGAGATCTGTAGCTGCACGTCCATGG
CACGACCT*GAGATCGGTC*TGAAGCTCCATTGGTCTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACA
AAGGGAAGCAAAGTGAAGTATGAACTTGACAAAAAGACCGGTCTTATCAAGGTTGACCGG
ATCTTGTACTCATCGGTTGTTTATCCTCACAACTATGGATTCATCCCAAGGACATTGTGT
GAAGACAACGATCCTCTCGATGTTCTTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGT
TTTCTCCGCGCTAGAGCCATTGGATTAATGCCCATGATCGATCAGGGAGAGATGGACGAC
AGGATCATAGCGGCGTGTGCTGATGATCCTGAGTACAGACATTTCACTGACATCAAACAA
CTCGCTCCTCACCGTCTCTCAGAGATTCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAACGAG
CACAAGGAGGTGGCTGTAAACGATTTCTTGCCATCGGAAAAGGCACATGAAGCAATCCAG
TACTCCATGGACCTATACGCTGAGTACATTCTCCATAGCTTGAGGAGATGAACGTACGCA
CAAGCTGCATATTTATATTCCCATACGGCGAAAGGGATCATTCTTGGCAGTAGAATATTG
TTTTAAATAATTATATCTGAATATTACAGTTTTCTCTTGTTATTTTTGTTGTTGTTCTTT
CTTGAGATGTTGCAATTTTGTTATATTGTATAATTTGAAA*CTGATACAAGGACGAATGT
ATTTTTCATTCTTTCCTTGTCATGTTAACTTGTATACTAATGGGCTTTATAAGCTCATAT
GGCCCAAATAAACTGG

QA 6 861 6 861
DS 



AS 2 4

CO CL1710Contig1 928 2 4 U
GCTGAACTTTGACGGCTTCATGATTTAATCAATCCAGCAATAACCGAATCTTAACCGAAC
AAAACAAAGAAGAGATGAAAAGAATGGTGGTCTTACATACAGAACATATGTATAACAACG
TCTAGAGTCAGAGATCAAAGTTTAAAAAAAACTACATAAAAACCACTAGAATTGCTAAAG
TGACGATCAATCCCACAAGAAAATGTGTCTGTTTCCAAAAGAAGGCGTAAAAACAATGGA
AGTGTAAGCACAACATCAGAAGATATACCTTGCAAGAACATAAGCCAACGGTAATGGCGC
TCACTTCGTCAGAACAATATGAGACTAATAACGTAGGACCATCACTATCCATTACAGGAA
GTAAGGAACACCTGTTCTTGGCCCTCTCATTTGATTGTTCTCTTCTGTCTCCGTGAAGAA
CTTCACATCCCTTTCCATGTTGTCATTGAAGCTCAACATAGAAGCTACATTCCCACAGCG
GTAGCAGTAGTTAGGTGCAGACCACACAGTTACAAGGCCTTTGTCTTGGAACATGTACTT
GAGACCTTCTTGTACAAGCTGATGTGCGCGGCAAACTAGTTCAAGATTGTTTATATGGTT
AAACTCAGTGGTAACCCTGGACCCGAAAAGCCAACCAGCCCCACGTGGACTTACAGCCCA
TGTTTCAATGTCTTCAGGATCACTCCACATAAGATCACAGAATGGTCCTTCATGCGGGAT
TTCGCAATTTCGATCAATCAGTCTTATCTGGTCGATTGTTCGTACATCATGTGAAAGGCC
ACCATGAACACGTAGAACGGTGCCATCGATAATAGCTGAGAGAGTGAGATAGTCAAACAC
ATCCGTGCAGTATCTCCAAGCATTAGCATTATCATACTTCCTTTGGCATCGTCATAGAAC
CGTACACCTGAGTAAGCTGTCTGCTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH43JQ U 1
AF RR2G554JQ U 77
BS 1 153 RR2AH43JQ
BS 154 154 RR2G554JQ
BS 155 766 RR2AH43JQ
BS 767 928 RR2G554JQ

RD RR2AH43JQ 766 0 0
GCTGAACTTTGACGGCTTCATGATTTAATCAATCCAGCAATAACCGAATCTTAACCGAAC
AAAACAAAGAAGAGATGAAAAGAATGGTGGTCTTACATACAGAACATATGTATAACAACG
TCTAGAGTCAGAGATCAAAGTTTAAAAAAAACTGCATAAAAACCACTAGAATTGCTAAAG
TGACGATCAATCCCACAAGAAAATGTGTCTGTTTCCAAAAGAAGGCGTAAAAACAATGGA
AGTGTAAGCACAACATCAGAAGATATACCTTGCAAGAACATAAGCCAACGGTAATGGCGC
TCACTTCGTCAGAACAATATGAGACTAATAACGTAGGACCATCACTATCCATTACAGGAA
GTAAGGAACACCTGTTCTTGGCCCTCTCATTTGATTGTTCTCTTCTGTCTCCGTGAAGAA
CTTCACATCCCTTTCCATGTTGTCATTGAAGCTCAACATAGAAGCTACATTCCCACAGCG
GTAGCAGTAGTTAGGTGCAGACCACACAGTTACAAGGCCTTTGTCTTGGAACATGTACTT
GAGACCTTCTTGTACAAGCTGATGTGCGCGGCAAACTAGTTCAAGATTGTTTATATGGTT
AAACTCAGTGGTAACCCTGGACCCGAAAAGCCAACCAGCCCCACGTGGACTTACAGCCCA
TGTTTCAATGTCTTCAGGATCACTCCACATAAGATCACAGAATGGTCCTTCATGCGGGAT
TTCGCAATTTCGATCAATCAGTCTTATCTGGTCGATTGTTCGTACA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2G554JQ 852 0 0
GAAAAGAATGGTGGTCTTACATACAGAACATATGTATAACAACGTCTAGAGTCAGAGATC
AAAGTTTAAAAAAAACTACATAAAAACCACTAGAATTGCTAAAGTGACGATCAATCCCAC
AAGAAAATGTGTCTGTTTCCAAAAGAAGGCGTAAAAACAATGGAAGTGTAAGCACAACAT
CAGAAGATATACCTTGCAAGAACATAAGCCAACGGTAATGGCGCTCACTTCGTCAGAACA
ATATGAGACTAATAACGTAGGACCATCACTATCCATTACAGGAAGTAAGGAACACCTGTT
CTTGGCCCTCTCATTTGATTGTTCTCTTCTGTCTCCGTGAAGAACTTCACATCCCTTTCC
ATGTTGTCATTGAAGCTCAACATAGAAGCTACATTCCCACAGCGGTAGCAGTAGTTAGGT
GCAGACCACACAGTTACAAGGCCTTTGTCTTGGAACATGTACTTGAGACCTTCTTGTACA
AGCTGATGTGCGCGGCAAACTAGTTCAAGATTGTTTATATGGTTAAACTCAGTGGTAACC
CTGGACCCGAAAAGCCAACCAGCCCCACGTGGACTTACAGCCCATGTTTCAATGTCTTCA
GGATCACTCCACATAAGATCACAGAATGGTCCTTCATGCGGGATTTCGCAATTTCGATCA
ATCAGTCTTATCTGGTCGATTGTTCGTACATCATGTGAAAGGCCACCATGAACACGTAGA
ACGGTGCCATCGATAATAGCTGAGAGAGTGAGATAGTCAAACACATCCGTGCAGTATCTC
CAAGCATTAGCATTATCATACTTCCTTTGGCATCGTCATAGAACCGTACACCTGAGTAAG
CTGTCTGCTTCA

QA 1 852 1 852
DS 



CO CL1710Contig2 711 2 8 U
GGAAACGAAGCGGAGAGAGCAATGGTGTGGTAGAATAATAGATAGAGAGATCTAAATCCG
AAGAGACCAGACGCCCAAAATAAATCAATGGATTTAGATCAATGGATATCCAAGGTCAAA
GACGCCCAACATCTCTCCGAAGACGAGCTTCACCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATT
CTGATTGAGGAGTCGAATGTGCAACCTGTCAACAGTCCTGTCACTGTCTGTGGTGATATC
CATGGCCAGTTTCATGACCTAATGAAGCTTTTCCAGACCGGTGGTCATGTTCCAGACACT
AATTACATTTTTATGGGAGATTTCGTTGACAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTTTTCACT
ATTCTTTTGCTTCTCAAAGCAAGATATCCAGCCCATATCACTCTCTTGCGTGGAAATCAT
GAAAGCAGACAGCTTACTCAGGTGTACGGTTTCTATGACGAATGCCAAAGGAAGTATGAT
AATGCTAATGCTTGGAGATACTGCACGGATGTGTTTGACTATCTCACTCTCTCAGCTATT
ATCGATGGCACCGTTCTACGTGTTCATGGTGGCCTTTCACCTGATGTACGAACAATCGAC
CAGATAAGACTGATTGATCGAAATTGCGAAATCCCGCATGAAAGACCATTCTGTGATCTT
ATGTGGAGTGATCCTGAGACATGAAACATGGGCTGTAAGTCACGTGGGGCT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH43TF U 1
AF RR2G554TF U 1
BS 1 344 RR2AH43TF
BS 345 345 RR2G554TF
BS 346 478 RR2AH43TF
BS 479 479 RR2G554TF
BS 480 558 RR2AH43TF
BS 559 559 RR2G554TF
BS 560 674 RR2AH43TF
BS 675 711 RR2G554TF

RD RR2AH43TF 674 0 0
GGAAACGAAGCGGAGAGAGCAATGGTGTGGTAGAATAATAGATAGAGAGATCTAAATCCG
AAGAGACCAGACGCCCAAAATAAATCAATGGATTTAGATCAATGGATATCCAAGGTCAAA
GACGCCCAACATCTCTCCGAAGACGAGCTTCACCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATT
CTGATTGAGGAGTCGAATGTGCAACCTGTCAACAGTCCTGTCACTGTCTGTGGTGATATC
CATGGCCAGTTTCATGACCTAATGAAGCTTTTCCAGACCGGTGGTCATGTTCCAGACACT
AATTACATTTTTATGGGAGATTTCGTTGACAGAGGTTACAACAGTCTTGAAGTTTTCACT
ATTCTTTTGCTTCTCAAAGCAAGATATCCAGCCCATATCACTCTCTTGCGTGGAAATCAT
GAAAGCAGACAGCTTACTCAGGTGTACGGTTTCTATGACGAATGCCAAAGGAAGTATGGT
AATGCTAATGCTTGGAGATACTGCACGGATGTGTTTGACTATCTCACTCTCTCAGCTATT
ATCGATGGCACCGTTCTATGTGTTCATGGTGGCCTTTCACCTGATGTACGAACAATCGAC
CAGATAAGACTGATTGATCGAAATTGCGAAATCCCGCATGAAAGACCATTCTGTGATCTT
ATGTGGAGTGATCC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2G554TF 711 0 0
GG
AAACGAAGCGGAGAGAGCAATGGTGTGGTAGAATAATAGATAGAGAGATCTAAATCCGAA
GAGACCAGACGCCCAAAATAAATCAATGGATTTAGATCAATGGATATCCAAGGTCAAAGA
CGCCCAACATCTCTCCGAAGACGAGCTTCACCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATTCT
GATTGAGGAGTCGAATGTGCAACCTGTCAACAGTCCTGTCACTGTCTGTGGTGATATCCA
TGGCCAGTTTCATGACCTAATGAAGCTTTTCCAGACCGGTGGTCATGTTCCAGACACTAA
TTACATTTTTATGGGAGATTTCGTTGACAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTTTTCACTAT
TCTTTTGCTTCTCAAAGCAAGATATCCAGCCCATATCACTCTCTTGCGTGGAAATCATGA
AAGCAGACAGCTTACTCAGGTGTACGGTTTCTATGACGAATGCCAAAGGAAGTATGATAA
TGCTAATGCTTGGAGATACTGCACGGATGTGTTTGACTATCTCACTCTCTCAGCTATTAT
CGATGGCACCGTTCTACGTGTTCATGGTGGCCTTTCACCTGATGTACGAACAATCGACCA
GATAAGACTGATTGATCGAAATTGCGAAATCCCGCATGAA*GAC*ATTCTGTGATCTTAT
GTGGAGTGATCCTGAGACATGAAACATGGGCTGTAAGTCACGTGGGGCT

QA 3 711 3 711
DS 



AS 1 5

CO CL1711Contig1 1207 5 10 U
GGACTCATTATCTTCTTCCTCTTCTAGCTTCTTCTTTTTCAGTCTCCCAATGGCTTCTTT
AAAATACAAACCTATGAACTTCATATTTCATGTTTTTTATTTGATTTTTATTTTCTCCGC
CCATAGTTCAACGGCGGAGCTCAAGAGGCTACTGCAGCCAGCGAAACCCGATGGTATAGT
AAGATTTCTCGTCATCGGAGACTGGGGAAGGCGAGGCTCCTATAATCAGTCCAACGTATC
TCTTCAGATGGGAGAAATTGGAGAAAAGCTAAATATAGATTTTGTAATCTCAACCGGAGA
TAATTTTTACGACAATGGGTTACTTGGCTTGGACGATTCTGCATTTCAAGATTCTTTCAC
CAACATTTATAACGCGTCGAGCTTACAAAAGCCTTGGTATACTGTTTTAGGAAACCATGA
CTATAGAGGTGATGTCGAGGCACAACTTAGCCCTATGCTAAGGGCTTTGGACAACAGATG
GGTCTGCATGAGATCTTTCGTTGTTAATGCTGAGATCGTCGAGTTTTTGTTTGTCGACAC
AACTCCATTCGTCGATAAATACTTTGTCCAACCAAATAAGCATGTCTATGACTGGAGAGG
CGTATTACCCAGACAGAGATATCTGAACAATCTCTTAAAGGAAGTGGATGTGGCATTGAA
AGAGTCAACTGCAAAGTGGAAAATAGCGATTGGTCACCACCCGATCAAAAGCGCAGGCCA
CCACAGGAACACCATTGAATTGGAGAGGCAGCTTTTGCCTATTCTTCACGCGAATGAAGT
GGATCTCTACGTAAACGGACATGATCATTGCTTAGAACACATAAGCAGCGTGGAGAGTAA
AATACAGTTTATGACGAGTGGAGGTGGATCAAAGGCTTGGAAAGGTGACGTGAACCACTT
GGATCCAGAAGAGCTGAAGTTTTACTACGACGGACAAGGATTCATGTCGGTTGACATTTC
GGAGGCCGAACTTCGTGTCGTGTTTTATGATGTTTCTGGAAACGTTTTGCATCATTGGGA
GACTTACAAGGAGGCGCTTTATTTCGCATCCTAAAACATAATGAAATCCCAAACATAATT
GAATCGTGACCACATTGTTTATAAATTATGATGCAATGTCTTAATTTCATATTTCGTTGA
ATTTTCATATCAGGTCATAACGTATCTATCAACCCGAAATAAAAGTCAATAAAATTCTTT
ATTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN43TF U 1
AF RR2GO06TF U 93
AF RR2F533TF U 384
AF RR2GN43JQ C 1053
AF RR2GO06JQ C 695
BS 1 384 RR2GN43TF
BS 385 385 RR2GO06TF
BS 386 623 RR2GN43TF
BS 624 715 RR2GO06TF
BS 716 716 RR2F533TF
BS 717 816 RR2GO06TF
BS 817 936 RR2F533TF
BS 937 937 RR2GO06JQ
BS 938 1006 RR2F533TF
BS 1007 1207 RR2GO06JQ

RD RR2GN43TF 623 0 0
GGACTCATTATCTTCTTCCTCTTCTAGCTTCTTCTTTTTCAGTCTCCCAATGGCTTCTTT
AAAATACAAACCTATGAACTTCATATTTCATGTTTTTTATTTGATTTTTATTTTCTCCGC
CCATAGTTCAACGGCGGAGCTCAAGAGGCTACTGCAGCCAGCGAAACCCGATGGTATAGT
AAGATTTCTCGTCATCGGAGACTGGGGAAGGCGAGGCTCCTATAATCAGTCCAACGTATC
TCTTCAGATGGGAGAAATTGGAGAAAAGCTAAATATAGATTTTGTAATCTCAACCGGAGA
TAATTTTTACGACAATGGGTTACTTGGCTTGGACGATTCTGCATTTCAAGATTCTTTCAC
CAACATTTATAACGCGTCGAGCTTGCAAAAGCCTTGGTATACTGTTTTAGGAAACCATGA
CTATAGAGGTGATGTCGAGGCACAACTTAGCCCTATGCTAAGGGCTTTGGACAACAGATG
GGTCTGCATGAGATCTTTCGTTGTTAATGCTGAGATCGTCGAGTTTTTGTTTGTCGACAC
AACTCCATTCGTCGATAAATACTTTGTCCAACCAAATAAGCATGTCTATGACTGGAGAGG
CGTATTACCCAGACAGAGATATC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2GO06TF 725 0 0
TTTTTTATTTGATTTTTATTTTCTCCGCCCTTAGTTCAACGGCGGAGCTCAAGAGGCTAC
TGCAGCCAGCGAAACCCGATGGTATAGTAAGATTTCTCGTCATCGGAGACTGGGGAAGGC
GAGGCTCCTATAATCAGTCCAACGTATCTCTTCAGATGGGAGAAATTGGAGAAAAGCTAA
ATATAGATTTTGTAATCTCAACCGGAGATAATTTTTACGACAATGGGTTACTTGGCTTGG
ACGATTCTGCATTTCAAGATTCTTTCACCAACATTTATAACGCGTCGAGCTTACAAAAGC
CTTGGTATACTGTTTTAGGAAGCCATGACTATAGAGGTGATGTCGAGGCACAACTTAGCC
CTATGCTAAGGGCTTTGGACAACAGATGGGTCTGCATGAGATCTTTCGTTGTTAATGCTG
AGATCGTCGAGTTTTTGTTTGTCGACACAACTCCATTCGTCGATAAATACTTTGTCCAAC
CAAATAAGCATGTCTATGACTGGAGAGGCGTATTACCCAGACAGAGATATCTGAACAATC
TCTTAAAGGAAGTGGATGTGGCATTGAAAGAGTCAACTGCAAAGTGGAAAATAGCGATTG
GTCACCACCCGATCAAAAGCGCACGCCACCACAGGAACACCATTGAATTGGAGAGGCAGC
TTTTGCCTATTCTTCACGCGAATGAAGTGGATCTCTACGTAAACGGACATGATCATTGCT
TAGA
C

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2F533TF 623 0 0
GG
CAAAAGCCTTGGTATACTGTTTTAGGAAACCATGACTATAGAGGTGATGTCGAGGCACAA
CTTAGCCCTATGCTAAGGGCTTTGGACAACAGATGGGTCTGCATGAGATCTTTCGTTGTT
AATGCTGAGATCGTCGAGTTTTTGTTTGTCGACACAACTCCATTCGTCGATAAATACTTT
GTCCAACCAAATAAGCATGTCTATGACTGGAGAGGCGTATTACCCAGACAGAGATATCTG
AACAATCTCTTAAAGGAAGTGGATGTGGCATTGAAAGAGTCAACTGCAAAGTGGAAGATA
GTGATTGGTCACCACCCGATCAAAAGCGCAGGCCACCACAGTA*CACCATTGAATTGGAG
AGGCAGCTTTTGCCTATTCTTCACGCGAATGAAGTGGATCTCTACGTAAACGGACATGAT
CATTGCTTAGAACACATAAGCAGCGTGGAGAGTAAAATACAGTTTATGACGAGTGGAGGT
GGATCAAAGGCTTGGAAAGGTGACGTGAACCACTTGGATCCAGAAGAGCTGAAGTTTTAC
TACGACGGACAGGGATTCATGTCGGTTGACATTTCGGAGGCCGAACTTCGTGTCGTGTTT
TATGATGTTTCTGGAAACGTT

QA 3 623 3 623
DS 

RD RR2GN43JQ 107 0 0
AAAACATAATGAAATCCCAAACATAATTGAATCGTGACCACATTGTTTATAAATTATGAT
GCAATGTTTTAATTTCATATTTCGTTGAATTTTCATATCAGGTCATA

QA 1 107 1 107
DS 

RD RR2GO06JQ 513 0 0
CACCACCCGATCAAAAGCGCAGGCCACCACAGGAACACCATTGAATTGGAGAGGCAGCTT
TTGCCTATTCTTCACGCGAATGAAGTGGATCTCTACGTAAACGGACATGATCATTGCTTA
GAACACATAAGCAGCGTGGAGAGTAAAATACAGTTTATGACTAGTGGAGGTGGATCAAAG
GCTTGGAAAGGTGACGTGAACCACTTGGATCCAGAAGAGCTGAAGTTTTACTACGACGGA
CAAGGATTCATGTCGGTTGACATTTCGGAGGCGGAACTTCGTGTCGTGTTTTATGATGTT
TCTGGAAACGTTTTGCATCATTGGGAGACTTACAAGGAGGCGCTTTATTTCGCATCCTAA
AACATAATGAAATCCCAAACATAATTGAATCGTGACCACATTGTTTATAAATTATGATGC
AATGTCTTAATTTCATATTTCGTTGAATTTTCATATCAGGTCATAACGTATCTATCAACC
CGAAATAAAAGTCAATAAAATTCTTTATTACAT

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 5

CO CL1712Contig1 699 5 11 U
GGAGAGGAGACTCGAAAGCAATCGGAAAA*TCAGAAAAAAAA*TGAGCGGAGTGTCAACG
GCGGCGTATTTCGCGCGGAGAGCGGCGCAAAAGGAAAGGGTTCGAATCCTCTATCGCCGT
GCCCTTAAGGATACTCTGAACTGGGCTGTTCATCGCCACATTTTCTACCGCGACGCTTCT
GATCTGCGCGAGAAGTTCAATGCCAACCAGGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAAA
CTGATTGCTCACGGTGAAGCAGAGTACGACAAGTGGCGGCACCCTGATCCTTATATCGTT
CCATGGGCTCCTGGTGGCTCAAAGTTCTGTAGAAACCCTACTCCGCCTGCTGGGATTGAG
ATTGTGTACAACTACGGTCAAGAAGACAACCCATAAAAATTTAATTTTCATACCCTTCAA
TAAAATTTGAAGCATCTTGTGGCTATGGTTCAGAGGATAA*CTAAAGGCTTTCAAGGTTG
AAACTTTGAGGGACCAATTGTAGTTTTCTAAGATGTTTCGTTTGAGTTAA*GACACCTAT
TGTTTCAACTTGGTATACTTCTTCCATCTAAAAACATTCTCGGCTGCTCTTTAGCTGCCA
AGCATCTCATCAT**GATGCATGGATAAAAACAAG***TTGTGTGTGTTTTGTCTACTTT
GACCACATTATCTATCAGTGTTTTATACCGGTTTAAACC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ62TF U 1
AF RR2FU95TF U 12
AF RR2FU95JQ C 12
AF RR2B364TF U 2
AF RR2B364JQ C 186
BS 1 29 RR2FZ62TF
BS 30 30 RR2FU95TF
BS 31 42 RR2FZ62TF
BS 43 43 RR2FU95TF
BS 44 53 RR2FZ62TF
BS 54 54 RR2FU95TF
BS 55 657 RR2FZ62TF
BS 658 658 RR2FU95TF
BS 659 677 RR2FZ62TF
BS 678 678 RR2FU95TF
BS 679 699 RR2FZ62TF

RD RR2FZ62TF 699 0 0
GGAGAGGAGACTCGAAAGCAATCGGAAAAATCAGAAAAAAAAATGAGCGGAGTTTCAACG
GCGGCGTATTTCGCGCGGAGAGCGGCGCAAAAGGAAAGGGTTCGAATCCTCTATCGCCGT
GCCCTTAAGGATACTCTGAACTGGGCTGTTCATCGCCACATTTTCTACCGCGACGCTTCT
GATCTGCGCGAGAAGTTCAATGCCAACCAGGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAAA
CTGATTGCTCACGGTGAAGCAGAGTACGACAAGTGGCGGCACCCTGATCCTTATATCGTT
CCATGGGCTCCTGGTGGCTCAAAGTTCTGTAGAAACCCTACTCCGCCTGCTGGGATTGAG
ATTGTGTACAACTACGGTCAAGAAGACAACCCATAAAAATTTAATTTTCATACCCTTCAA
TAAAATTTGAAGCATCTTGTGGCTATGGTTCAGAGGATAA*CTAAAGGCTTTCAAGGTTG
AAACTTTGAGGGACCAATTGTAGTTTTCTAAGATGTTTCGTTTGAGTTAA*GACACCTAT
TGTTTCAACTTGGTATACTTCTTCCATCTAAAAACATTCTCGGCTGCTCTTTAGCTGCCA
AGCATCTCATCAT**GATGCATGGATAAAAACAAG***TTGTGTGTGTTTTGTCTACCTT
GACCACATTATCTATCAATGTTTTATACCGGTTTAAACC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2FU95TF 684 0 0
GG
GAAAGCAATCGGAAAA*TCAGAAAAAAAA*TGAGCGGAGTGTCAACGGCGGCGTATTTCG
CGCGGAGAGCGGCGCAAAAGGAAAGGGTTCGAATCCTCTATCGCCGTGCCCTTAAGGATA
CTCTGAACTGGGCTGTTCATCGCCACATTTTCTACCGCGACGCTTCTGATCTGCGCGAGA
AGTTCAATGCAAACCAGGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACGAACTGATTGCTCATG
GTGAAGTAGAGTACGACAAGTGGCGGCACCCTGATCCTTACATCGTTCCATGGGCTCCTG
GTGGCTCAAAGTTCTGTAGAAACCCTACTCCGCCTGCTGGGATTGAGATTGTGTACAACT
ATGGTCAAGAAGACAACCCATAAAAATTTAATCTCCATACCCTTCAATAAAATTTGAAGC
ATCTTGTGGCTATGGTTCAGAGGATAAACTAAAGGCTTTCAAGGTTGAAACTTTGAGGGA
CCTATTGTAGTTTTCTAAGATGTTTCGTTTGAGTTAAAGACACCTATTGTTTCAACTTGG
TATACTTCTTCCATCTAAAAACATTCTCGGCTGCTCTTTAGCTGCCAAGCATCTCATCAT
ATGATGCATGGATAAAAACAAGAAGTGGTGTGTGTTTTGTCTACTTTGACCACATTATCT
ATCAGTGTTTTATA
AAAAAAAA

QA 3 676 3 676
DS 

RD RR2FU95JQ 675 0 0
GG
GAAAGCAATCGGAAAA*TCAGAAAAAAAA*TGAGCGGAGTGTCAACGGCGGCGTATTTCG
CGCGGAGAGCGGCGCAAAAGGAAAGGGTTCGAATCCTCTATCGCCGTGCCCTTAAGGATA
CTCTGAACTGGGCTGTTCATCGCCACATTTTCTACCGCGACGCTTCTGATCTGCGCGAGA
AGTTCAATGCAAACCAGGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACGAACTGATTGCTCATG
GTGAAGTAGAGTACGACAAGTGGCGGCACCCTGATCCTTACATCGTTCCATGGGCTCCTG
GTGGCTCAAAGTTCTGTAGAAACCCTACTCCGCCTGCTGGGATTGAGATTGTGTACAACT
ATGGTCAAGAAGACAACCCATAAAAATTTAATCTCCATACCCTTCAATAAAATTTGAAGC
ATCTTGTGGCTATGGTTCAGAGGATAAACTAAAGGCTTTCAAGGTTGAAACTTTGAGGGA
CCTATTGTAGTTTTTTAAGATGTTTCGTTTGAGTTAAAGACACCTATTGTTTCAACTTGG
TATACTTCTTCCATCTAAAAACATTCTCGGCTGCTCTTTAGCTGCCAAGCATCTCATCAT
ATGATGCATGGATAAAAACAAGAAGTGGTGTGTGTTTTGTCTACTTTGACCACATTATCT
ATCAGTGTTTTAT

QA 3 675 3 675
DS 

RD RR2B364TF 677 0 0
GG
GAGGAGACTCGAAAGCAATCGGAAAAATCAGAAAAAAAAATGAGCGGAGTTTCAACGGCG
GCGTATTTCGCGCGGAGAGCGGCGCAAAAGGAAAGGGTTCGAATCCTCTATCGCCGTGCC
CTTAAGGATACTCTGAACTGGGCTGTTCATCGCCACATTTTCTACCGCGACGCTTCTGAT
CTGCGCGAGAAGTTCAATGCCAACCAGGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAAACTG
ATTGCTCACGGTGAAGCAGAGTACGACAAGTGGCGGCACCCTGATCCTTATATCGTTCCA
TGGGCTCCTGGTGGCTCAAAGTTCTGTAGAAACCCTACTCCGCCTGCTGGGATTGAGATT
GTGTACAACTACGGTCAAGAAGACAACCCATAAAAATTTAATTTTCATACCCTTCAATAA
AATTTGAAGCATCTTGTGGCTATGGTTCAGAGGATAA*CTAAAGGCTTTCAAGGTTGAAA
CTTTGAGGGACCAATTGTAGTTTTCTAAGATGTTTCGTTTGAGTCAA*GACACCTATTGT
TTCAACTTGGTATACTTCTTCCATCTAAAAACATTCTCGGCCGCTCTTTAGCTGCCAAGC
ATCTCATCAT**GATGCATGGATAAAAACAAG***TTGTGTGTGTTTTGTCTACTTTGAC
CACATTATCTA
CCAA

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR2B364JQ 491 0 0
GCGCGAGAAGTTCAATGCCAACCAGGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAAACTGAT
TGCTCACGGTGAAGCAGAGTACGACAAGTGGCGGCACCCTGATCCTTATATCGTTCCATG
GGCTCCTGGTGGCTCAAAGTTCTGTAGAAACCCTACTCCGCCTGCTGGGATTGAGATTGT
GTACAACTACGGTCAAGAAGACAACCCATAAAAATTTAATTTTCATACCCTTCAATAAAA
TTTGAAGCATCTTGTGGCTATGGTTCAGAGGATAA*CTAAAGGCTTTCAAGGTTGAAACT
TTGAGGGACCAATTGTAGTTTTTTAAGATGTTTCGTTTGAGTCAA*GACACCTATTGTTT
CAACTTGGTATACTTCTTCCATCTAAAAACATTTTCGGCCGCTCTTTAGCTGCCAAGCAT
CTCATCAT**GATGCATGGATAAAAACAAG***TTGTGTGTGTTTTGTCTACTTTGACCA
CATTATCTA
CC

QA 1 489 1 489
DS 



AS 1 5

CO CL1713Contig1 659 5 5 U
GGAGAGAAATTAAACAAAAACGAAAAAAAAAATAGAGGGGTATTACCAGTGAAGCGAGAT
GGGCTGCATCGGTCTTATCGATTCAGCCAGTACCAATATTTACCGGCCGGTGCTTACAAG
AACATCAAACAAACCCTACACGAGAAGAGGACTATCGATGGCTGCGAGTCGAGCTGAGTC
AATGGCTACTGAAAAATTAGGGATCTTTATCGAGAAGAATCCTCCCGAGTCCAAACTCAC
CCAACTAGGCGTTCGTAATTGGCCCAAGTGGGGTTGTCCTCCAAGCAAGTTTCCATGGAC
TTACGATGCAAAGGAGACTTGTTTTCTGCTAGAGGGGAAAGTGAAAGTTTACCCTGATGG
TTCCGATGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGCGACTTTGTTGTTTTCCCTAAAGGAATGAG
TTGCACTTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAAGCACTACCAATTCGAGTGAATGGCTAT
TTACTTCTACGTACTCCGCATGTTGGTGATATGTTTGATATAGCTTCACTGTCTTTGTAT
GTTGTGGATACTTGATATAGAAGTTCTTTTGCGTTATTTAAGACCTTTTAAAGACTTTGT
GCATGACAAGTCCCAGGATAAAGTAGATAAAGAAAATCAGAGTTCAGATTTGTTCAAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AW96TFB U 300
AF RR2AW96JQ C 13
AF RR2BF58JQ C 1
AF RR2BF58TF U 1
AF RR2BQ63TF U 10
BS 1 363 RR2BF58TF
BS 364 364 RR2BQ63TF
BS 365 398 RR2BF58TF
BS 399 399 RR2BQ63TF
BS 400 659 RR2BF58TF

RD RR2AW96TFB 275 0 0
CTTACGATGCAAAGGAGACATGTTTTCTGCTAGAGGGGAAAGTGAAAGTGTACCCTGATG
GTTCCGATGAGGGCGTGGAGATCGAAGCAGGCGACTTTGTTGTTTTCCCTAAAGGAATGA
GTTGCACTTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAAGCACTACCAATTCGAGTGAATGGCTA
TTTACTTCTACGTACTCCTCATATTGGTGATATGTTTGATATAGCTTCACTGTCTTTGTA
TGTTGTGGATACTTAATATAGAAGTTCTTTTGCGT

QA 1 275 1 275
DS 

RD RR2AW96JQ 561 0 0
GAAACAAAAACG
AAAAAAAATAGAGAGGTATTACGAGAGAAGCAAGATGGGCTGCATTGGTCTTATCGATTC
AGCCAGTATCAATATTTACCGGCCGGTGCTTACAAGAACATCAAACAAACCCTACACGAG
AAGAGGACTATCGATGTCTGCGATTCGAGCTGAGTCAATGGCTACTGAAAAGTTAGGGAT
CTTTATCGAGAAGAATCCTCCCGAGTCCAAACTCACCCAACTAGGCGTTCGTAATTGGCC
CAAGTGGGGTTGTCCTCCAAGCAATTTTCCATGGACTTACGATGCAAAGGAGACATGTTT
TCTGCTAGAGGGGAAAGTGAAAGTGTACCCTGATGGTTCCGATGAGGGCGTGGAGATCGA
AGCAGGCGACTTTGTTGTTTTCCCTAAAGGAATGAGTTGCACTTGGGACGTCTCTGTTGC
AGTTGATAAGCACTACCAATTCGAGTGAATGGCTATTTACTTCTACGTACTCCTCATATT
GGTGATATGTTTGATATAGCTTCACTGTCTTTGTATGTTGTGGATACTTAATATAGAAGT
TCTTTTGCG

QA 13 561 13 561
DS 

RD RR2BF58JQ 659 0 0
GGAGAGAAATTAAACAAAAACGAAAAAAAAAATAGAGGGGTATTACCAGTGAAGCGAGAT
GGGCTGCATCGGTCTTATCGATTCAGCCAGTACCAATATTTACCGGCCGGTGCTTACAAG
AACATCAAACAAACCCTACACGAGAAGAGGACTATCGATGGCTGCGAGTCGAGCTGAGTC
AATGGCTACTGAAAAATTAGGGATCTTTATCGAGAAGAATCCTCCCGAGTCCAAACTCAC
CCAACTAGGCGTTCGTAATTGGCCCAAGTGGGGTTGTCCTCCAAGCAAGTTTCCATGGAC
TTACGATGCAAAGGAGACTTGTTTTTTGCTAGAGGGGAAAGTGAAAGTTTACCCTGATGG
TTCTGATGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGCGACTTTGCTGTTTTCCCTAAAGGAATGAG
TTGCACTTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAAGCACTACCAATTCGAGTGAATGGCTAT
TTACTTCTACGTACTCCGCATGTTGGTGATATGTTTGATATAGCTTCACTGTCTTTGTAT
GTTGTGGATACTTGATATAGAAGTTCTTTTGCGTTATTTAAGACCTTTTAAAGACTTTGT
GCATGACAAGTCCCAGGATAAAGTAGATAAAGAAAATCAGAGTTCAGATTTGTTCAAAG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2BF58TF 659 0 0
GGAGAGAAATTAAACAAAAACGAAAAAAAAAATAGAGGGGTATTACCAGTGAAGCGAGAT
GGGCTGCATCGGTCTTATCGATTCAGCCAGTACCAATATTTACCGGCCGGTGCTTACAAG
AACATCAAACAAACCCTACACGAGAAGAGGACTATCGATGGCTGCGAGTCGAGCTGAGTC
AATGGCTACTGAAAAATTAGGGATCTTTATCGAGAAGAATCCTCCCGAGTCCAAACTCAC
CCAACTAGGCGTTCGTAATTGGCCCAAGTGGGGTTGTCCTCCAAGCAAGTTTCCATGGAC
TTACGATGCAAAGGAGACTTGTTTTCTGCTAGAGGGGAAAGTGAAAGTTTACCCTGATGG
TTCTGATGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGCGACTTTGCTGTTTTCCCTAAAGGAATGAG
TTGCACTTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAAGCACTACCAATTCGAGTGAATGGCTAT
TTACTTCTACGTACTCCGCATGTTGGTGATATGTTTGATATAGCTTCACTGTCTTTGTAT
GTTGTGGATACTTGATATAGAAGTTCTTTTGCGTTATTTAAGACCTTTTAAAGACTTTGT
GCATGACAAGTCCCAGGATAAAGTAGATAAAGAAAATCAGAGTTCAGATTTGTTCAAAG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2BQ63TF 636 0 0
GG
AAACAAAAACGAAAAAAAAA*TAGAGGGGTATTACCAGTGAAGCGAGATGGGCTGCATCG
GTCTTATCGATTCAGCCAGTATCAATATTTACCGGCCGGTGCTTACAAGAACATCAAACA
AACCCTACACGAGAAGAGGACTATCGATGGCTGCGAGTCGAGCTGAGTCAATGGCTACTG
AAAAATTAGGGATCTTTATCGAGAAGAATCCTCCCGAGTCCAAACTCACCCAACTAGGCG
TTCGTAATTGGCCCAAGTGGGGTTGTCCTCCAAGCAAGTTTCCATGGACTTACGATGCAA
AGGAGACTTGTTTTCTGCTAGAGGGGAAAGTGAAAGTTTACCCTGATGGTTCCGATGAAG
GCGTGGAGATCGAAGCAGGCGACTTTGTTGTTTTCCCTAAAGGAATGAGTTGCACTTGGG
ACGTCTCTGTTGCAGTTGATAAGCACTACCAATTCGAGTGAATGGCTATTTACTTCTACG
TACTCCGCATGTTGGTGATATGTTTGATATAGCTTCACTGTCTTTGTATGTTGTGGATAC
TTGATATAGAAGTTCTTTTGCGTTATTTAAGACTTTTTAAGGACTTTGTGCATGACAAGT
CCCAGGATAAAGTAGATAAAGAAAATCAGAGTTC

QA 3 636 3 636
DS 



AS 1 4

CO CL1714Contig1 596 4 8 U
GGCTCCCCCTCCTCCTCCTTCTCCTTCCTTCTTCTTCCTCTCTGAACTGAATCTCAAATC
TCTGCTTCTGCAGTCTATTCCCTTCCTCAATTCCAAACCTTTCGTCTTTCTTTTTTCAAG
ATTAGCATAAGCAAATGGCGTCGCATTACAATAGCTTCTTCGGCAGCAGCGAAGAGCCAC
ACTTTCTGGAATCTTGCTCTCTTTGCCGTAAACACCTTTCTCTAAACTCCGACATCTTCA
TGTACAGAGGAGACAAGGCGTTTTGTAGCAAAGAGTGTAGAGAAGAACAGATCGAGCACG
ATGAAGCCAAGGAGAAAAGCTGGAGACTTTCCGCTAGATCTCTCCGCAAAAAATCTTCCG
AAGCAGCTAAAGATTCCGCCGCCGGAAAATCCGTACGGACAGGAACTCTCGTGGTGGCCT
AGTTGTGTTTTTATTACATAAGCAGATAGTTTTTTTCTATATATATTACCCTCTTTAAGA
AAAAAGAAAAAAAAACATGCAAAGTTTTGCTCTGTTTCTATCTTTATCTTGTTTCCGATG
TCGGAATCTGAGAAAGTGTTAGATCTGGTTTTTATGTAAATGAATGTGTTGATAGC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2DQ51JQ C 1
AF RR2DQ51TF U 1
AF RR2BS36JQ C 4
AF RR2BS36TF U 4
BS 1 5 RR2DQ51JQ
BS 6 45 RR2DQ51TF
BS 46 46 RR2BS36TF
BS 47 223 RR2DQ51TF
BS 224 224 RR2BS36TF
BS 225 440 RR2DQ51TF
BS 441 595 RR2BS36TF
BS 596 596 RR2BS36JQ

RD RR2DQ51JQ 476 0 0
GGCTCCCCCTCCTCCTCCTTCTCCTTCCTTCTTCTTCCTCTCTGAGCTGAATCTCAAATC
TCTGCTTCTGCAGTCTATTCCCTTCCTCAATTCCAAACCTTTCGTCTTTCTTTTTTCAAG
ATTAGCATAAGCAAATGGCGTCGCATTACAATAGCTTCTTCGGCAGCAGCGAAGAGCCAC
ACTTTCTGGAATCTTGCTCTCTTTGCCGTAAACACCTTTCTTTGAACTCCGACATCTTCA
TGTACAGAGGAGACAAGGCGTTTTGTAGCAAAGAGTGTAGAGAAGAACAGATCGAGCACG
ATGAAGCCAAGGAGAAAAGCTGGAGACTTTCCGCTAGATCTCTCCGCAAAAAATCTTCCG
AAGCAGCTAAAGATTCCGCCGCCGGAAAATCCGTACGGACAGGAACTCTCGTGGTGGCCT
AGTTGTGTTTTTATTACATAAGCAGATAGTTTTTTTCTATATATATTACCCTCTTT

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR2DQ51TF 440 0 0
GGCTC
CCCCTCCTCCTCCTTCTCCTTCCTTCTTCTTCCTCTCTGAGCTGAATCTCAAATCTCTGC
TTCTGCAGTCTATTCCCTTCCTCAATTCCAAACCTTTCGTCTTTCTTTTTTCAAGATTAG
CATAAGCAAATGGCGTCGCATTACAATAGCTTCTTCGGCAGCAGCGAAGAGCCACACTTT
CTGGAATCTTGCTCTCTTTGCCGTAAACACCTTTCTCTGAACTCCGACATCTTCATGTAC
AGAGGAGACAAGGCGTTTTGTAGCAAAGAGTGTAGAGAAGAACAGATCGAGCACGATGAA
GCCAAGGAGAAAAGCTGGAGACTTTCCGCTAGATCTCTCCGCAAAAAATCTTCCGAAGCA
GCTAAAGATTCCGCCGCCGGAAAATCCGTACGGACAGGAACTCTCGTGGTGGCCTAGTTG
TGTTTTTATTACATA

QA 6 440 6 440
DS 

RD RR2BS36JQ 593 0 0
GG
CCCCTCCTCCTCCTTCTCCTTCCTTCTTCTTCCTCTCTGAACTGAATCTCAAATCTCTGC
TTCTGCAGTCTATTCCCTTCCTCAATTCCAAACCTTTCGTCTTTCTTTTTTCAAGATTAG
CATAAGCAAATGGCGTCGCATTACAATAGCTTCTTCGGCAGCAGCGAAGAGCCACACTTT
CTGGAATCTTGCTCTCTTTGCCGTAAACACCTTTCTCTAAACTCCGACATCTTCATGTAC
AGAGGAGACAAGGCGTTTTGTAGCAAAGAGTGTAGAGAAGAACAGATCGAGCACGATGAG
GCCAAGGAGAAAAGCTGGAGACTTTCCGCTAGATCTCTCCGCAAAAAATCTTCCGAAGCA
GCTAAAGATTCCGCCGCCGGAAAATCCGTACGGACAGGAACTCTCGTGGTGGCCTAGTTG
TGTTTTTATTACATAAGCAGATAGTTTTTTTCTATATATATTACCCTCTTTAAGAAAAAA
GAAAAAAAAACATGCAAAGTTTTGCTCTGTTTCTATCTTTATCTTGTTTCCGATGTCGGA
ATCTGAGAAAGTGTTAGATCTGGTTTTTATGTAAATGAATGTGTTGATAGC

QA 3 593 3 593
DS 

RD RR2BS36TF 593 0 0
GG
CCCCTCCTCCTCCTTCTCCTTCCTTCTTCTTCCTCTCTGAACTGAATCTCAAATCTCTGC
TTCTGCAGTCTATTCCCTTCCTCAATTCCAAACCTTTCGTCTTTCTTTTTTCAAGATTAG
CATAAGCAAATGGCGTCGCATTACAATAGCTTCTTCGGCAGCAGCGAAGAGCCACACTTT
CTGGAATCTTGCTCTCTTTGCCGTAAACACCTTTCTCTAAACTCCGACATCTTCATGTAC
AGAGGAGACAAGGCGTTTTGTAGCAAAGAGTGTAGAGAAGAACAGATCGAGCACGATGAG
GCCAAGGAGAAAAGCTGGAGACTTTCCGCTAGATCTCTCCGCAAAAAATCTTCCGAAGCA
GCTAAAGATTCCGCCGCCGGAAAATCCGTACGGACAGGAACTCTCGTGGTGGCCTAGTTG
TGTTTTTATTACATAAGCAGATAGTTTTTTTCTATATATATTACCCTCTTTAAGAAAAAA
GAAAAAAAAACATGCAAAGTTTTGCTCTGTTTCTATCTTTATCTTGTTTCCGATGTCGGA
ATCTGAGAAAGTGTTAGATCTGGTTTTTATGTAAATGAATGTGTTGATAG
C

QA 3 592 3 592
DS 



AS 2 4

CO CL1715Contig1 815 2 6 U
TGATGAGGACGAGTCCGTGTTTGCAGTCGTCTCTGCTCTCAACTTGGGAAGATACAAGGA
GCACAAGTGCTTTAAAGAGGTGAAAGAGTTTCTTCTCCAAGTCTGTTCAGAGAAGAGTGT
AGCTGGTGATCTCAAATTGTTACTGGAGAAGAAGGCGCACGATGTTGGTATCTTGGTGTC
TCAAAGAGTGATGAACCTTCCTCCGCAGCTTCTTCCTCCACTGTACGATGGGTTGTTTGA
TGAAGTCGAATGGGCTACGGAAGACGAGCCTACGGAGGAGCTTCGTGGCTCGTTCCGGTT
CAAGTGGTATCTACTTGTCACCAAGATTTACAAACTGAAGAATCCTAAGCAGAGGAAACC
TCGTCGTGGTGAAGAAGAGGAAGAGGAAACAGTGTTCCTTAAGCCTGAAGATGAACTCTT
TCTGCAGCTGAGTTCTTGGTCTTTTACGTACCCTATGCGCTCACAGCTAGTGACTTCTGG
AGAAATGAAGAATTATCAGCTGATGGGACTAGTGATGGCTGTGGAAGCAAAAAGGATTCC
TGAGTTCAGGCAGATGTTGAATTCTCTCATTGATTGAATGAACAATTGATGTGAACATCT
TTGTCTACTTCTTGGAGAGTGTTCTAAGTTGGTCGTTTGTTTATTTGATTCACCGCCAGT
TTTGATAGTAGTTTTTCCAGCATAGTTCTAATGTCCTGTTGTTTTATCCAGCAACCTTTT
TTTTACATGTCATTGGGAACTCTAGTTTCGTGTGTCTGAAGCGATGTCTTGTTAAACTCT
CTATTAATGTTTTATAGCATTTCCAATTCACTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY44TF U 1
AF RR2FY44JQ C 28
BS 1 675 RR2FY44TF
BS 676 676 RR2FY44JQ
BS 677 723 RR2FY44TF
BS 724 724 RR2FY44JQ
BS 725 737 RR2FY44TF
BS 738 815 RR2FY44JQ

RD RR2FY44TF 737 0 0
TGATGAGGACGAGTCCGTGTTTGCAGTCGTCTCTGCTCTCAACTTGGGAAGATACAAGGA
GCACAAGTGCTTTAAAGAGGTGAAAGAGTTTCTTCTCCAAGTCTGTTCAGAGAAGAGTGT
AGCTGGTGATCTCAAATTGTTACTGGAGAAGAAGGCGCACGATGTTGGTATCTTGGTGTC
TCAAAGAGTGATGAACCTTCCTCCGCAGCTTCTTCCTCCACTGTACGATGGGTTGTTTGA
TGAAGTCGAATGGGCTACGGAAGACGAGCCTACGGAGGAGCTTCGTGGCTCGTTCCGGTT
CAAGTGGTATCTACTTGTCACCAAGATTTACAAACTGAAGAATCCTAAGCAGAGGAAACC
TCGTCGTGGTGAAGAAGAGGAAGAGGAAACAGTGTTCCTTAAGCCTGAAGATGAACTCTT
TCTGCAGCTGAGTTCTTGGTCTTTTACGTACCCTATGCGCTCACAGCTAGTGACTTCTGG
AGAAATGAAGAATTATCAGCTGATGGGACTAGTGATGGCTGTGGAAGCAAAAAGGATTCC
TGAGTTCAGGCAGATGTTGAATTCTCTCATTGATTGAATGAACAATTGATGTGAACATCT
TTGTCTACTTCTTGGAGAGTGTTCTAAGTTGGTCGTTTGTTTATTTGATTCACCGCCAGT
TTTGATAGTAGTTTT*CCAGCATAGTTCTAATGTCCTGTTGTTTTATCCAGCAACCTTTT
TTT*ACATGTCATTGGG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2FY44JQ 788 0 0
CGTCTCTGCTCTCAACTTGGGAAGATACAAGGAGCACAAGTGCTTTAAAGAGGTGAAAGA
GTTTCTTCTCCAAGTCTGTTCAGAGAAGAGTGTAGCTGGTGATCTCAAATTGTTACTGGA
GAAGAAGGCGCACGATGTTGGTATCTTGGTGTCTCAAAGAGTGATGAACCTTCCTCCGCA
GCTTCTTCCTCCACTGTACGATGGGTTGTTTGATGAAGTCGAATGGGCTACGGAAGACGA
GCCTACGGAGGAGCTTCGTGGCTCGTTCCGGTTCAAGTGGTATCTACTTGTCACCAAGAT
TTACAAACTGAAGAATCCTAAGCAGAGGAAACCTCGTCGTGGTGAAGAAGAGGAAGAGGA
AACAGTGTTCCTTAAGCCTGAAGATGAACTCTTTCTGCAGCTGAGTTCTTGGTCTTTTAC
GTACCCTATGCGCTCACAGCTAGTGACTTCTGGAGAAATGAAGAATTATCAGCTGATGGG
ACTAGTGATGGCTGTGGAAGCAAAAAGGATTCCTGAGTTCAGGCAGATGTTGAATTCTCT
CATTGATTGAATGAACAATTGATGTGAACATCTTTGTCTACTTCTTGGAGAGTGTTCTAA
GTTGGTCGTTTGTTTATTTGATTCACCGCCAGTTTTGATAGTAGTTTTTCCAGCATAGTT
CTAATGTCCTGTTGTTTTATCCAGCAACCTTTTTTTTACATGTCATTGGGAACTCTAGTT
TCGTGTGTCTGAAGCGATGTCTTGTTAAACTCTCTATTAATGTTTTATAGCATTTCCAAT
TCACTTCT

QA 1 788 1 788
DS 



CO CL1715Contig2 773 2 18 U
GGGTTGTGTTCGTGTTTGGTCAGAAGGTCAAAACTTGAAGGCTTTTTCTAGCTTCCGCTC
AACTGCTTATATCAGCAAAAGCGTTTCCAGATGCCTCGGAGACCATCGGGAGGAAGAAGA
AGATTCACAAAGCATCAACCTTTAGCATTTTCACCGTTTATGCGGTCGCTTGCTTTAGCT
TCAAGGCGTAGTAAACAAGAGGAAGACTCTCAACGCTCTGAAGAGCTAATGTCTTTTGAT
CAAAAGCTCCCAACTTTGTCTAAAAAGGAGAAAAAGGAACAGCTATCAGACTCCTCTGAT
GATGAAGACTCTCAGGGAGATGTACAAGCAGACTTTGAGTTCTTTGATCCTAAGACAACA
GACTTCAACGGAGTCAAGATTCTTCTCAAAAACTATCTAGACGACAAGGAGTGGGACTTG
AGCAGCTTTGTTGATTTGGTATTGGAACAGACGACGGTAGGAACCGTCGTGAAAGTAGCA
GATGATGAGGACGAGTCCGTGTTTGCAGTCGTCTCTGCTCTCAACATGGGAAGATACAAG
GAGCACAAGTGCTTTAAAGAGGTGAAAGAGTTTCTTCTCCAAGTCTGTTCAGAGAAGAGT
GTAGCTACTGATCTCAAACTGTTACTGGAGAAGAAGGCGCACGATGTTGGTATCTTGGTG
TCTCAAAGAGTGATGAACCTTCCTCCGCAGCTTCTTCCTCCACTGTACGATGGGTTGTTT
GATGAAGTCGAATGGGCCACGGAAGACGAGCCTACAGAGGAGCTTCGTGGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK36TF U 1
AF RR2AF07TF U 48
BS 1 127 RR2GK36TF
BS 128 128 RR2AF07TF
BS 129 284 RR2GK36TF
BS 285 285 RR2AF07TF
BS 286 323 RR2GK36TF
BS 324 324 RR2AF07TF
BS 325 354 RR2GK36TF
BS 355 355 RR2AF07TF
BS 356 525 RR2GK36TF
BS 526 526 RR2AF07TF
BS 527 606 RR2GK36TF
BS 607 608 RR2AF07TF
BS 609 618 RR2GK36TF
BS 619 619 RR2AF07TF
BS 620 636 RR2GK36TF
BS 637 637 RR2AF07TF
BS 638 721 RR2GK36TF
BS 722 773 RR2AF07TF

RD RR2GK36TF 721 0 0
GGGTTGTGTTCGTGTTTGGTCAGAAGGTCAAAACTTGAAGGCTTTTTCTAGCTTCCGCTC
AACTGCTTATATCAGCAAAAGCGTTTCCAGATGCCTCGGAGACCATCGGGAGGAAGAAGA
AGATTCATAAAGCATCAACCTTTAGCATTTTCACCGTTTATGCGGTCGCTTGCTTTAGCT
TCAAGGCGTAGTAAACAAGAGGAAGACTCTCAACGCTCTGAAGAGCTAATGTCTTTTGAT
CAAAAGCTCCCAACTTTGTCTAAAAAGGAGAAAAAGGAACAGCTTTCAGACTCCTCTGAT
GATGAAGACTCTCAGGGAGATGTTCAAGCAGACTTTGAGTTCTTTGATCCTAAGCCAACA
GACTTCAACGGAGTCAAGATTCTTCTCAAAAACTATCTAGACGACAAGGAGTGGGACTTG
AGCAGCTTTGTTGATTTGGTATTGGAACAGACGACGGTAGGAACCGTCGTGAAAGTAGCA
GATGATGAGGACGAGTCCGTGTTTGCAGTCGTCTCTGCTCTCAACTTGGGAAGATACAAG
GAGCACAAGTGCTTTAAAGAGGTGAAAGAGTTTCTTCTCCAAGTCTGTTCAGAGAAGAGT
GTAGCTGGTGATCTCAAATTGTTACTGGAGAAGAAG*CGCACGATGTTGGTATCTTGGTG
TCTCAAAGAGTGATGAACCTTCCTCCGCAGCTTCTTCCTCCACTGTACGATGGGTTGTTT
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2AF07TF 726 0 0
CTAGCTTCCGCTCAACTGCTTATATCAGCAAAAGCGTTTCCAGATGCCTCGGAGACCATC
GGGAGGAAGAAGAAGATTCACAAAGCATCAACCTTTAGCATTTTCACCGTTTATGCGGTC
GCTTGCTTTAGCTTCAAGGCGTAGTAAACAAGAGGAAGACTCTCAACGCTCTGAAGAGCT
GATGTCTTTTGATCAAAAGCTCCCAACTTTGTCTAAAAAGGATAAAAAGGAACAGCTATC
AGACTCCTCTGATGATGAAGACTCTCAGGGAGATGTACAAGCAGACTTTGAGTTCTTTGA
TCCTAAGACAACAGACTTCAACGGAGTCAAGATTCTTCTCAAAAACTATCTAGATGACAA
GGAGTGGGACTTGAGCAGCTTTGTTGATTTGGTATTGGAACAGACGACGGTAGGAACCGT
CGTGAAAGTAGCAGATGATGAGGACGAGTCCGTGTTTGCAGTCGTCTCTGCTCTCAACAT
GGGAAGATACAAGGAGCACAAGTGCTTTAGAGAGGTTAAAGAGTTTCTTCTCCAAGTCTG
TTCGGAGAAGAGTGTAGCTACTGATCTCAAACTGTTACTGGAGAAGAAGGCGCACGATGT
TGGTATCTTGGTGTCTCAGAGAGTGATGAACCTTCCTCCGCAGCTTCTTCCTCCACTGTA
CGATGGGTTGTTTGATGAAGTCGAATGGGCCACGGAAGACGAGCCTACAGAGGAGCTTCG
TGGCTC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 2 5

CO CL1716Contig1 1285 3 13 U
TACTGCCAGGTTCTTGAGCTCTTCTCCCGTATTATTGACCGTCTATCGTTCCGTGACAAA
ACAACTGAAAACGTTCTCTTGTCGAGTATGCCCCGAGACGAGTTCAACACTAATGACTTG
GGGGAATTCCAAAGGACAGATTCTAGAGTGTACGAGATGCCACCGTCAAGTGGAACTCCT
CCTAAGTTCGAAGGTGTACAGCCTCTTGTCCTTAAAGGGCTGATGTCTACTGTTAGCCAC
GAGTTCTCCATCGAGGTCCTATCAAGAATCACAGTGCCTTCATGTGATTCTATATTTGGC
GACACCGAGACAAGACTCTTGATGCACATCACAGGTCTACTTCCTTGGCTTTGCTTGCAG
CTTAGCCAAGACCAAGTCATGGTATCGGCGTTACCACTCCAGCAGCAGTACCAAAAGGCA
TGTTCTGTAGCAGCTAACATTGCTATCTGGTGCCGGGCGAAATCACTAGACGAATTGGCT
ACGGTTTTTGTTGCTTATTCTCGAGGCGAGATTAAACGAGTTGATAATCTCCTCGCGCGC
GTTTCTCCCCTGCTGTGCAACAAATGGTTCCCGAAACACTCGGCTTTAGCTTTCGGTCAC
TTGTTAAGACTGCTAAAGAAAGGACCAGTGGACTACCAACGAGTCATTCTACTTATGCTC
AAGGCATTGCTCCAACACACTCCTATGGATGCTTCACAGAGTCCCCACATGTACACTATC
GTCTCGCAGCTAGTAGAAAGCACTCTCTGCTGGGAAGCATTAAGTGTTCTCGAAGCTCTT
CTTCAAAGCTGTAGCCCGGTACAAGGCGGCAGCCATCCTCAGGATTCCGGTTACTTTGAG
AACGGGAGTGATGAGAAAACGCTTGTACCTCAGACCTCATTCAAAGCTCGAAGCGGACCT
CTCCAGTACACAATGATGGCTGCAACAATGTCGCAAGCTTTCCCTCTCGGAGCGGCTGCA
GGAGAATCAGGGATACCTCCGAGAGATGTGGCTTTGCAGAACACAAGGCTGATATTGGGT
CGTGTTCTTGATAGCTGCGCTCTAGGAAGAAGAGATTACAGAAGATTGGTGCCTTTTGTC
ACAACGATCGCAAACATGTAAGGTTTTTTTTTGTTGTTTTGCAGTAAATTTCCGCAATGG
TGGTCATGTTTGTATGTTCTTTTCAGAAGTTTTATTAAGAAGCAAAATGTTTTTGTTTGT
GAGTAGTTTGGTGTTATGGAGACTAAAGTGTATTCCAGACATATAACCACGAGAGTTTTA
TGTTACTACTTTATATGCTGGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS36TF U 1
AF RR2EZ37TF U 362
AF RR2CS36JQ C 552
BS 1 470 RR2CS36TF
BS 471 471 RR2EZ37TF
BS 472 537 RR2CS36TF
BS 538 538 RR2EZ37TF
BS 539 548 RR2CS36TF
BS 549 549 RR2EZ37TF
BS 550 663 RR2CS36TF
BS 664 664 RR2EZ37TF
BS 665 691 RR2CS36TF
BS 692 800 RR2EZ37TF
BS 801 801 RR2CS36JQ
BS 802 819 RR2EZ37TF
BS 820 1285 RR2CS36JQ

RD RR2CS36TF 691 0 0
TACTGCCAGGTTCTTGAGCTCTTCTCCCGTATTATTGACCGTCTATCGTTCCGTGACAAA
ACAACTGAAAACGTTCTCTTGTCGAGTATGCCCCGAGACGAGTTCAACACTAATGACTTG
GGGGAATTCCAAAGGACAGATTCTAGAGTGTACGAGATGCCACCGTCAAGTGGAACTCCT
CCTAAGTTCGAAGGTGTACAGCCTCTTGTCCTTAAAGGGCTGATGTCTACTGTTAGCCAC
GAGTTCTCCATCGAGGTCCTATCAAGAATCACAGTGCCTTCATGTGATTCTATATTTGGC
GACACCGAGACAAGACTCTTGATGCACATCACAGGTCTACTTCCTTGGCTTTGCTTGCAG
CTTAGCCAAGACCAAGTCATGGTATCGGCGTTACCACTCCAGCAGCAGTACCAAAAGGCA
TGTTCTGTAGCAGCTAACATTGCTATCTGGTGCCGGGCGAAATCACTAGATGAATTGGCT
ACGGTTTTTGTTGCTTATTCTCGAGGCGAGATTAAACGAGTTGATAATCTCCTCGCGTGC
GTTTCTCCTCTGCTGTGCAACAAATGGTTCCCGAAACACTCGGCTTTAGCTTTCGGTCAC
TTGTTAAGACTGCTAAAGAAAGGACCAGTGGACTACCAACGAGTCATTCTACTTATGCTC
AAG*CATTGCTCCAACACACTCCTATGGATG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2EZ37TF 458 0 0
TTAT
CCAAGACCAAGTCATGGTATCGGCGTTACCACTCCAGCAGCAGTACCAAAAGGCATGTTC
TGTAGCAGCTAACATTGCTATCTGGTGCCGGGCGAAATCACTAGACGAATTGGCTACGGT
TTTTGTTGCTTATTCTCGAGGCGAGATTAAACGAGTTGATAATCTCCTCGCGCGCGTTTC
TCCCCTGCTGTGCAACAAATGGTTCCCGAAACACTCGGCTTTAGCTTTCGGTCACTTGCT
AAGACTGCTAAAGAAAGGACCAGTGGACTACCAACGAGTCATTCTACTTATGCTCAAGGC
ATTGCTCCAACACACTCCCATGGATGCTTCACAGAGTCCCCACATGTACACTATCGTCTC
GCAGCTAGTAGAAAGCACTCTCTGCTGGGAAGCATTAAGTGTTCTCGAAGCTCTTCTTCA
AAGCTGTAGCCCGGTGCAAGGCGGCAGCCATCCT

QA 5 458 5 458
DS 

RD RR2CS36JQ 734 0 0
GCTGTGCAACAAATGGTTCCCGAAACACTCGGCTTTAGCTTTCGGTCACTTGTTAAGACT
GCTAAAGAAAGGACCAGTGGACTACCAACGAGTCATTCTACTTATGCTCAAGGCATTGCT
CCAACACACTCCTATGGATGCTTCACAGAGTCCCCACATGTACACTATCGTTTCGCAGCT
AGTCGAAAGCACTCTCTGCTGGGAAGCATTAAGTGTTCTCGAAGCTCTTCTTCAAAGCTG
TAGCCCTGTACAAGGCGGCAGCCATCCTCAGGATTCCGGTTACTTTGAGAACGGGAGTGA
TGAGAAAACGCTTGTACCTCAGACCTCATTCAAAGCTCGAAGCGGACCTCTCCAGTACAC
AATGATGGCTGCAACAATGTCGCAAGCTTTCCCTCTCGGAGCGGCTGCAGGAGAATCAGG
GATACCTCCGAGAGATGTGGCTTTGCAGAACACAAGGCTGATATTGGGTCGTGTTCTTGA
TAGCTGCGCTCTAGGAAGAAGAGATTACAGAAGATTGGTGCCTTTTGTCACAACGATCGC
AAACATGTAAGGTTTTTTTTTGTTGTTTTGCAGTAAATTTCCGCAATGGTGGTCATGTTT
GTATGTTCTTTTCAGAAGTTTTATTAAGAAGCAAAATGTTTTTGTTTGTGAGTAGTTTGG
TGTTATGGAGACTAAAGTGTATTCCAGACATATAACCACGAGAGTTTTATGTTACTACTT
TATATGCTGGGTTT

QA 1 734 1 734
DS 



CO CL1716Contig2 540 2 7 U
GACTAGAAAATAAATCTCAACATATAAAGTAGTAACATAAAACTCCCGTGGTTATATGTC
TGGAATACATTTAGTCTCCATAACACCAAACTATTCACAAACAAAAACATTTTGCTTCTT
AATAAAACTTCTGAAAAACATACAAACATAACCAAACAATTGCAGAAACTTACTGCAAAC
AAAAAAAAACTTACATGTTTGCGATCGTTGCGACAAAAGGCACCAATCTTCTGTAATCTC
TTCTTCCTAGAGCACAGCTATCAAGAACACGACCCAATATCAGCCTTGTGTTCTGCAAAG
CCACATCTCTCGGAGGTATCCCTGATTCTCCTGCACCCGCTCCGAGAGGGAAAGCTTGCG
ACATTGTTGCCGCCATCATTGTGTACTGGAGAGGCCCGCTTCCAGCTTTGAATGAAGTCT
GAGGAACAAGCGTTTTCTCATCACTCCCGTTCTCAAAGTAACCGGAATCCTGAGGATGGC
TGCCGCCTTGCACCGGGCTACAGCTTTGAAGAAGAGCTTCGAGAACACTTAATGCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ37JQ U 21
AF RR2GY33JQ U 1
BS 1 45 RR2GY33JQ
BS 46 46 RR2EZ37JQ
BS 47 134 RR2GY33JQ
BS 135 135 RR2EZ37JQ
BS 136 335 RR2GY33JQ
BS 336 336 RR2EZ37JQ
BS 337 540 RR2GY33JQ

RD RR2EZ37JQ 360 0 0
CATATAAAGTAGTAACATAAAACTCCCGTGGTTATATGTCTGGAATACATTTAGTCTCCA
TAACACCAAACTATTCACAAACAAAAACATTTTGCTTCTTAATAAAACTTCTGAAAAACA
TACAAACATAACCAAACAATTGCCGAAACTTACTGCAAACAAAAAAAAACTTACATGTTT
GCGATCGTTGTGACAAAAGGCACCAATCTTCTGTAATCTCTTCTTCCTAGAGCACAGCTA
TCAAGAACACGACCCAATATCAGCCTTGTGTTCTGCAAAGCCACATCTCTCGGAGGTATC
CCTGATTCTCCTGCCCCCGCTCCGAGAGGGAGAGCTTGCGACATTGTTGCCGCCATCATT

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR2GY33JQ 540 0 0
GACTAGAAAATAAATCTCAACATATAAAGTAGTAACATAAAACTCTCGTGGTTATATGTC
TGGAATACATTTAGTCTCCATAACACCAAACTATTCACAAACAAAAACATTTTGCTTCTT
AATAAAACTTCTGAGAAACATACAAACATAACCAAACAATTGCAGAAACTTACTGCAAAC
AAAAAAAAACTTACATGTTTGCGATCGTTGCGACAAAAGGCACCAATCTTCTGTAATCTC
TTCTTCCTAGAGCACAGCTATCAAGAACACGACCCAATATCAGCCTTGTGTTCTGCAAAG
CCACATCTCTCGGAGGTATCCCTGATTCTCCTGCAGCCGCTCCGAGAGGGAAAGCTTGCG
ACATTGTTGCCGCCATCATTGTGTACTGGAGAGGCCCGCTTCCAGCTTTGAATGAAGTCT
GAGGAACAAGCGTTTTCTCATCACTCCCGTTCTCAAAGTAACCGGAATCCTGAGGATGGC
TGCCGCCTTGCACCGGGCTACAGCTTTGAAGAAGAGCTTCGAGAACACTTAATGCTTCCC

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 4

CO CL1717Contig1 819 4 29 U
GGACAACTCAACTCACTCAAACCCCAAAACACACACAAAACAACCAAAATGAAGACTTCT
TTTCTCGTTACATTCCTGTTGGCTGCAGTTGTCTGCACCCACAGCCTTGAAGAGGTGAAG
GATTCTAACGGAAATCCAGTTAGGGTCGGTGCACAATACTTCATCCAGCCGGTTAAGACC
GAGAGTAACAACGGGGGAGGTCTTGTTCCAGCTGCCACTAACATACTTCCGTTTTGTCCA
CTTGGCATCACTCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTGCCGGTTAGCTTCGGATAT
CATCCAAACATTCTCGGCCGAGACACCATTGACACATCTGCCGATATAAACATCGAGTTC
AGGTCCCCTATATGGCCTGTCTGCACCGAGTTTTCTAAGTTGTGGGCAGTCGATTCCTCA
TCCGCATCCAATGAGCCTGCCGTTATCATCGGTGGTGAACCGAAGAGCCCAAATAGCGCG
TTTAAGATAGAAAAAGCTACAGGAGCACACACTTACAAGTTGACCACCTCATCTGGAACC
GTCGGAACCACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCACCACAGCTACTTGTCACCAATGATGTG
GCTAAGACCTTATTCGTCAAGTTTGTGAAGGTTGATAATGATGCTACTACGGCTACTACT
TCTACTTCTCGTGTTGAGAAGTTAGGTCTAAGAATGTTCCCATTCTACTAGTCAAGATCA
AGATCATGAAAAATAATGGTTGAGATAATACCCTCACGCATGTATGTGAACTCGTCCTTA
CTTTCATGAAAATCAAATAAATTTGTGTTTCCAGCGCTT


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A654JQ C 1
AF RR2AQ85TF U 1
AF RR2AQ85JQ C 260
AF RR2A654TF U 1
BS 1 2 RR2A654JQ
BS 3 33 RR2AQ85TF
BS 34 34 RR2A654TF
BS 35 43 RR2AQ85TF
BS 44 44 RR2A654TF
BS 45 71 RR2AQ85TF
BS 72 72 RR2A654TF
BS 73 78 RR2AQ85TF
BS 79 79 RR2A654TF
BS 80 88 RR2AQ85TF
BS 89 89 RR2A654TF
BS 90 102 RR2AQ85TF
BS 103 103 RR2A654TF
BS 104 122 RR2AQ85TF
BS 123 123 RR2A654TF
BS 124 125 RR2AQ85TF
BS 126 126 RR2A654TF
BS 127 152 RR2AQ85TF
BS 153 153 RR2A654TF
BS 154 176 RR2AQ85TF
BS 177 177 RR2A654TF
BS 178 455 RR2AQ85TF
BS 456 456 RR2A654TF
BS 457 498 RR2AQ85TF
BS 499 499 RR2A654TF
BS 500 776 RR2AQ85TF
BS 777 777 RR2A654TF
BS 778 806 RR2AQ85TF
BS 807 819 RR2A654TF

RD RR2A654JQ 819 0 0
GGACAACTCAACTCACTCAAACCCCAAAACACACACAAAACAACCAAAATGAAGACTTCT
TTTCTCGTTACATTCCTGTTGGCTGCAGTTGTCTGCACCCACAGCCTTGAAGAGGTGAAG
GATTCTAACGGAAATCCAGTTAGGGTCGGTGCACAATACTTCATCCAGCCGGTTAAGACC
GAGAGTAACAACGGGGGAGGTCTTGTTCCAGCTGCCACTAACATACTTCCGTTTTGTCCA
CTTGGCATCACTCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTGCCGGTTAGCTTCGGATAT
CATCCAAACATTCTCGGCCGAGACACCATTGACACATCTGCCGATATAAACATCGAGTTC
AGGTCCCCTATATGGCCTGTCTGCACCGAGTTTTCTAAGTTGTGGGCAGTCGATTCCTCA
TCCGCATCCAATGAGCCTGCCGTTATCATCGGTGGTGAACCGAAGGGCCCAAATAGCGCG
TTTAAGATAGAAAAAGCTACAGGAGCACACACTTACAAGTTGACCACCTCATCTGGAACC
GTCGGAACCACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCACCACAGCTACTTGTCACCAATGATGTG
GCTAAGACCTTATTCGTCAAGTTTGTGAAGGTTGATAATGATGCTACTACGGCTACTACT
TCTACTTCTCGTGTTGAGAAGTTAGGTCTAAGAATGTTCCCATTCTACTAGTCAAGATCA
AGATCATGAAAAATAATGGTTGAGATAATACCCTCACGCATGTATTTGAACTCGTCCTTA
CTTTCATGAAAATCAAATAAATTTGTGTTTCCAGCGCTT

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2AQ85TF 810 0 0
GG
ACAACTCAACTCACTCAAACCCCAAAACACATACAAAACAATCAAAATGAAGACTTCTTT
TCTCGTTACGTTCCTGCTGGCTGCAGCTGTCTGCACCCACGGCCTTGAAGAGGTGAAGGA
CTCCAACGGAAATCCAGTTAGGGTCGGTGCGCAATACTTCATCCAGCCGGTTAAAACCGA
GAGTAACAACGGGGGAGGTCTTGTTCCAGCTGCCACTAACATACTTCCGTTTTGTCCACT
TGGCATCACTCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTGCCGGTTAGCTTCGGATATCA
TCCAAACATTCTCGGCCGAGACACCATTGACACATCTGCCGATATAAACATCGAGTTCAG
GTCCCCTATATGGCCTGTCTGCACCGAGTTTTCTAAGTTGTGGGCAGTCGATTCCTCATC
CGCATCCAATGAGCCTGCCGTTATCATCGGTGGCGAACCGAAGAGCCCAAATAGCGCGTT
TAAGATAGAAAAAGCTGCAGGAGCACACACTTACAAGTTGACCACCTCATCTGGAACCGT
CGGAACCACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCACCACAGCTACTTGTCACCAATGATGTGGC
TAAGACCTTATTCGTCAAGTTTGTGAAGGTTGATAATGATGCTACTACGGCTACTACTTC
TACTTCTCGTGTTGAGAAGTTAGGTCTAAGAATGTTCCCATTCTACTAGTCAAGATCAAG
ATCATGAAAAATAATGGTTGAGATAATACCCTCACGCATGTATGTGAACTCGTCTTTACT
TTCATGAAAATCAAATAAATTTGT
ATTT

QA 3 806 3 806
DS 

RD RR2AQ85JQ 542 0 0
TTCTTCCCTACCAACCGGGCCTGCCGGTTAGCTTCGGATATCATCCAAACATTTTCGGCC
GAGACACCATTGACACATCTGCCGATATAAACATCGAGTTCAGGTCCCCTATATGGCCTG
TTTGCACCGAGTTTTTTAAGTTGTGGGCAGTCGATTCCTCATCCGCATCCAATGAGCCTG
CCGTTATCATCGGTGGGGAACCGAAGAGCCCAAATAGCGCGTTTAAGATAGAAAAAGCTG
CAGGAGCACACACTTACAAGTTGACCCCCTCATCTGGAACCGTCGGAACCCCCCCAGGGG
CTTGGTTGAGTGCACCACAGCTACTTGTCACCAATGATGTGGCTAAGACCTTATTCGTCA
AGTTTGTGAAGGTTGATAATGATGCTACTACGGCTACTACTTTTACTTCTCGTGTTGAGA
AGTTAGGTCTAAGAATGTTCCCATTTTACTAGTCAAAATCAAGATCATGAAAAATAATGG
TTGAGATAATACCCTCACGCATGTATGTGAACTCGTCTTTACTTTCATGAAAATCAAATA
AA

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2A654TF 819 0 0
GG
ACAACTCAACTCACTCAAACCCCAAAACACACACAAAACAACCAAAATGAAGACTTCTTT
TCTCGTTACATTCCTGTTGGCTGCAGTTGTCTGCACCCACAGCCTTGAAGAGGTGAAGGA
TTCTAACGGAAATCCAGTTAGGGTCGGTGCACAATACTTCATCCAGCCGGTTAAGACCGA
GAGTAACAACGGGGGAGGTCTTGTTCCAGCTGCCACTAACATACTTCCGTTTTGTCCACT
TGGCATCACTCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTGCCGGTTAGCTTCGGATATCA
TCCAAACATTCTCGGCCGAGACACCATTGACACATCTGCCGATATAAACATCGAGTTCAG
GTCCCCTATATGGCCTGTCTGCACCGAGTTTTCTAAGTTGTGGGCAGTCGATTCCTCATC
CGCATCCAATGAGCCTGCCGTTATCATCGGTGGTGAACCGAAGGGCCCAAATAGCGCGTT
TAAGATAGAAAAAGCTACAGGAGCACACACTTACAAGTTGACCACCTCATCTGGAACCGT
CGGAACCACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCACCACAGCTACTTGTCACCAATGATGTGGC
TAAGACCTTATTCGTCAAGTTTGTGAAGGTTGATAATGATGCTACTACGGCTACTACTTC
TACTTCTCGTGTTGAGAAGTTAGGTCTAAGAATGTTCCCATTCTACTAGTCAAGATCAAG
ATCATGAAAAATAATGGTTGAGATAATACCCTCACGCATGTATTTGAACTCGTCCTTACT
TTCATGAAAATCAAATAAATTTGTGTTTCCAGCGCTT

QA 3 819 3 819
DS 



AS 1 5

CO CL1718Contig1 562 5 8 U
GGAACAAAGAGTTTAGAAGATCGAAAAGAAAGAAGAAGATCGAAACGATGCCTCTGAGTG
CGACGATGGTGGGAGCTCTACTGGGACTCGGCACCCAGATGTACTCCAACGCTCTCCGCA
AGCTCCCTTACATGCGCCATCCGTGGGAGCATGTGGTGGGTATGGGACTCGGTGCTGTGT
TCGCGAACCAGCTTGTGAAATGGGATGTGAAGCTCAAGGAAGATCTCGAAGTTATGCTCA
ATAAGGCTAGAGCTGCCAACGAGCGCCGTTACTTTGATGAAGATCGGGATTAGTTATGGG
AGTCATCTTCGACGTCTTCAGAAAATAAATATATTTTCTCTGAAGTCATCTCAAGTGCTT
GATTTCTTTGATCTTCCATGTAAAAGCTTTTCTATTTTTTTCTTAGAGCTGGTTCTCCTT
TTGCTTCGGCATTGGAGCTCTTTCAGTTCAGTGTTTTTG*GTTAATGAACCTAAAGATGA
TTTGTGTTTTCATCTCACAGTCTGAATCTGTTTGTACCTGGCTCTAATAATTTCGAATGA
GAAACCTTTCAATGCTTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C268JQ C 1
AF RR2BK43TF U 16
AF RR2C268TF U 132
AF RR2G141JQ C 30
AF RR2G141TF U 30
BS 1 15 RR2C268JQ
BS 16 45 RR2BK43TF
BS 46 46 RR2G141TF
BS 47 79 RR2BK43TF
BS 80 80 RR2G141TF
BS 81 236 RR2BK43TF
BS 237 237 RR2C268TF
BS 238 562 RR2BK43TF

RD RR2C268JQ 554 0 0
GGAACAAAGAGTTTAGAAGATCGAAAAGAAAGAAGAAGATCGAAAGGATGCCTTTGAGTG
CGACGATGGTGGGAGCTTTGCTGGGACTCGGCACCCAGATGTACTCCAACGCTTTCCGCA
AGCTCCCTTACATGCGCCATCCGTGGGAGCATGTGGTGGGTATGGGACTCGGTGCTGTGT
TCGCGAACCAGCTTGTGAAATGGGATGTGAAGCTCAAGGAAGATCTCGAAGTTATGCTCA
ATAAGGCTAGAGCTGCCAACGAGCGCCGTTACTTTGATGAAGATCGGGATTAGTTATGGG
AGTCATTTTCGACGTCTTCAGAAAATAAATATATTTTCTCTGAAGTCATCTCAAGTGCTT
GATTTCTTTGATCTTCCATGTAAAAGCTTTTTTATTTTTTTTTTAGAGCTGGTTCTCCTT
TTGCTTCGGCATTGGAGCTCTTTCAGTTCAGTGTTTTTG*GTTAATGAACCTAAAGATGA
TTTGTGTTTTCATCTCACAGTCTGAATCTGTTTGTACCTGGCTCTAATAATTTCGAATGA
GAAACCTTTCAATG

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2BK43TF 547 0 0
GAAGATCGAAAAGAAAGAAGAAGATCGAAAGGATGCCTCTGAGTGCGACGATGGTGGGAG
CTCTGCTGGGACTCGGCACCCAGATGTACTCCAACGCTCTCCGCAAGCTCCCTTACATGC
GCCATCCGTGGGAGCATGTGGTGGGTATGGGACTCGGTGCTGTGTTCGCGAACCAGCTTG
TGAAATGGGATGTGAAGCTCAAGGAAGATCTCGAAGTTATGTTCAATAAGGCTAGAGCTG
CCAACGAGCGCCGTTACTTTGATGAAGATCGGGATTAGTTATGGGAGTCATCTTCGACGT
CTTCAGAAAATAAATATATTTTCTCTGAAGTCATCTCAAGTGCTTGATTTCTTTGATCTT
CCATGTAAAAGCTTTTCTATTTTTTTCTTAGAGCTGGTTCTCCTTTTGCTTCGGCATTGG
AGCTCTTTCAGTTCAGTGTTTTTG*GTTAATGAACCTAAAGATGATTTGTGTTTTCATCT
CACAGTCTGAATCTGTTTGTACCTGGCTCTAATAATTTCGAATGAGAAACCTTTCAATGC
TTAAAAA

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2C268TF 423 0 0
ATGCGCCATCCGTGGGAGCATGTGGTGGGTATGGGACTCGGTGCTGTGTTCGCGAACCAG
CTTGTGAAATGGGATGTGAAGCTCAAGGAAGAACTCGAAGTTATGCTCAATAAGGCTAGA
GCTGCCAACGAGCGCCGTTACTTTGATGAAGAACGGGATTAGTTATGGGAGTCATCTTCG
ACGTCTTCAGAAAATAAATATATTTTCTCTGAAGTCATCTCAAGTGCTTGATTTCTTTGA
TCTTCCATGTAAAAGCTTTTCTATTTTTTTCTTAGAGCTGGTTCTCCTTTTGCTTCGGCA
TTGGAGCTCTTTCAGTTCAGTGTTTTTG*GTTAATGAACCTAAAGATGATTTGTGTTTTC
ATCTCACAGTCTGAATCTGTTTGTACCTGGCTCTAATAATTTCGAATGAGAAACCTTTCA
ATG

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR2G141JQ 527 0 0
GG
GAAGAAGATCGAAACGATGCCTCTGAGTGCGA***TGGTGGGAGCTCTACTGGGACTCGG
CACCCAGATGTACTCCAACGCTCTCCGCAAGCTTCCTTACATGCGCCATCCGTGGGAGCA
TGTGGTGGGTATGGGACTCGGTGCTGTGTTCGCGAACCAGCTCGTGAAATGGGATGTGAA
GCTCAAGGAAGATCTCGAAGTTACGCTCAATAAGGCTAGAGCTGCCAACGAGCGCCGTTA
CTTTGATGAAGATCGGGATTAGTTATGA*AGTCATCTTAGACGTCTTCAGAAAAGAAATA
TATTTTCTCTGAAGTCATCTCAAGTGCTTGATTTCTTTGATCTTCCATGTAAAAGCTTTT
CTATTTTTTTCTTAGAGCTGGATCTCCTTTTGCTTCGGTATTGGAGCTCTTTCCGTTCAG
TGTTTTTTTGTTAATGAACCTAAAGATGATTTGTGTTTTCATCTCACACTCTGAATCTGT
TTGTACCTGGCTCTAGTAATTTCGAATGAGAAACCTTTCAATG
CC

QA 3 525 3 525
DS 

RD RR2G141TF 527 0 0
GG
GAAGAAGATCGAAACGATGCCTCTGAGTGCGA***TGGTGGGAGCTCTACTGGGACTCGG
CACCCAGATGTACTCCAACGCTCTCCGCAAGCTTCCTTACATGCGCCATCCGTGGGAGCA
TGTGGTGGGTATGGGACTCGGTGCTGTGTTCGCGAACCAGCTCGTGAAATGGGATGTGAA
GCTCAAGGAAGATCTCGAAGTTACGCTCAATAAGGCTAGAGCTGCCAACGAGCGCCGTTA
CTTTGATGAAGATCGGGATTAGTTATGA*AGTCATCTTAGACGTCTTCAGAAAAGAAATA
TATTTTCTCTGAAGTCATCTCAAGTGCTTGATTTCTTTGATCTTCCATGTAAAAGCTTTT
CTATTTTTTTCTTAGAGCTGGATCTCCTTTTGCTTCGGTATTGGAGCTCTTTCCGTTCAG
TGTTTTTTTGTTAATGAACCTAAAGATGATTTGTGTTTTCATCTCACACTCTGAATCTGT
TTGTACCTGGCTCTAGTAATTTCGAATGAGAAACCTTTCAATG
CC

QA 3 525 3 525
DS 



AS 1 4

CO CL1719Contig1 1049 4 19 U
GGACGCTAACAGCGTTACAGCGGAACATTCTAACCAACTAAATTGATTTAATTTTTTGTC
TTCTTGCTCACACCTTTGGACTCTCCGCTTTTCTTTGTCTGCAACAACATCTTCCCACTC
TCTTCCTCCCTCTTTACTTTGACAATAACAATGGCTACTGCATCCAACTCGGTACTCTTC
CCGAGCTCCGACTCACTGAGTCATCATCATCACAACCCGCCCAGAACCCATCTCCATCTT
TCCTCCTACAGATCCCATTCCGTTTCCCTCATATCCACCAAGCAATCCAGCTCACTCGCG
CTCCGTTGCTCCAACAATGGCGATAACAACGTCTCATCCCCAAAAGACACCCCAATCGAA
CTCAAGTTCCCAGCATTTCCAACGGTCATGGACATTAACCAGATCAGAGAGATACTGCCT
CACAGGTTCCCGTTTCTGCTGGTGGATAGAGTAATTGAGTATACACCTGGTGTTTCAGCT
GTAGCTATTAAGAACGTCACTATCAATGACAACTTCTTCCCTGGTCATTTCCCTGACCGA
CCCATCATGCCTGGTGTTCTCATGGTTGAGGCGATGGCACAAGTGGGAGGAATAGTAATG
CTGCAGCCAGAAGTAGGAGGATCTCAGGATAACTTCTTCTTTGCGGGTATTGATAAAGTG
AGATTCCGCAAACCAGTGATTGCAGGAGACACACTGGTCATGAGGATGACTCTTCTCAAG
TTCCAGAAACGCTTCGGTCTTGCTAAGATGGAAGGTAAAGCTTATGTGGGTGGGTCTTTG
GTCTGCGAGGGAGAGTTCATGATGGTTTCTGCTGGCAGTTCTCGATCTTCTCAACCATTT
TTTCACTCGCTTTATGTCTGTTTTTTTTCTTCTTATGCTTCTTCTGTGATTTGGATAACT
AGACAAGACCAAAGCTTAAAACAAAGTGACATTTGTACGAGTCTTCTTCAAGGTTTTCAT
GCCTTGTTATGTTCTTTATCGATGTCTCTGGTTGATGATTGATGAAGATTCACGGCACAT
GAAATAGTACTACAGAAACCCATTTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E084TF U 1
AF RR2CF86TF U 95
AF RR2E084JQ C 494
AF RR2CF86JQ C 335
BS 1 114 RR2E084TF
BS 115 115 RR2CF86TF
BS 116 180 RR2E084TF
BS 181 181 RR2CF86TF
BS 182 210 RR2E084TF
BS 211 211 RR2CF86TF
BS 212 627 RR2E084TF
BS 628 628 RR2CF86TF
BS 629 685 RR2E084TF
BS 686 686 RR2CF86TF
BS 687 704 RR2E084TF
BS 705 705 RR2CF86TF
BS 706 721 RR2E084TF
BS 722 753 RR2CF86TF
BS 754 754 RR2CF86JQ
BS 755 842 RR2CF86TF
BS 843 843 RR2CF86JQ
BS 844 861 RR2CF86TF
BS 862 1049 RR2CF86JQ

RD RR2E084TF 721 0 0
GGACGCTAACAGCGTTACAGCGGAACATTCTAACCAACTAAATTGATTTAATTTTTTGTC
TTCTTGCTCACACCTTTGGACTCTCCGCTTTTCTTTGTCTGCAACAACATCTTCTCACTC
TCTTCCTCCCTCTTTACTTTGACAATAACAATGGCTACTGCATCCAACTCGGTACTCTTC
TCGAGCTCCGACTCACTGAGTCATCATCATTACAACCCGCCCAGAACCCATCTCCATCTT
TCCTCCTACAGATCCCATTCCGTTTCCCTCATATCCACCAAGCAATCCAGCTCACTCGCG
CTCCGTTGCTCCAACAATGGCGATAACAACGTCTCATCCCCAAAAGACACCCCAATCGAA
CTCAAGTTCCCAGCATTTCCAACGGTCATGGACATTAACCAGATCAGAGAGATACTGCCT
CACAGGTTCCCGTTTCTGCTGGTGGATAGAGTAATTGAGTATACACCTGGTGTTTCAGCT
GTAGCTATTAAGAACGTCACTATCAATGACAACTTCTTCCCTGGTCATTTCCCTGACCGA
CCCATCATGCCTGGTGTTCTCATGGTTGAGGCGATGGCACAAGTGGGAGGAATAGTAATG
CTGCAGCCAGAAGTAGGAGGATCTCAG*ATAACTTCTTCTTTGCGGGTATTGATAAAGTG
AGATTCCGCAAACCAGTGATTGCAG*AGACACACTGGTCATGAG*ATGACTCTTCTCAAG
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2CF86TF 767 0 0
GG
GTCTGCAACAACATCTTCCCACTCTCTTCCTCCCTCTTTACTTTGACAATAACAATGGCT
ACTGCATCCAACTCGGTACTCTTCCCGAGCTCCGACTCACTGAGTCATCATCATCACAAC
CCGCCCAGAACCCATCTCCATCTTTCCTCCTACAGATCCCATTCCGTTTCCCTCATATCC
ACCAAGCAATCCAGCTCACTCGCGCTCCGTTGCTCCAACAATGGCGATAACAACGTCTCA
TCCCCAAAAGACACCCCAATCGAACTCAAGTTCCCAGCATTTCCAACGGTCATGGACATT
AACCAGATCAGAGAGATACTGCCTCACAGGTTCCCGTTTCTGCTGGTGGATAGAGTAATT
GAGTATACACCTGGTGTTTCAGCTGTAGCTATTAAGAACGTCACTATCAATGACAACTTC
TTCCCTGGTCATTTCCCTGACTGACCCATCATGCCTGGTGTTCTCATGGTTGAGGCGATG
GCACAAGTGGGAGGAATAGTAATGCTGCAGCCAGAAGTAGGAGGATCTCAGGATAACTTC
TTCTTTGCGGGTATTGATAAAGTGAGATTCCGCAAACCAGTGATTGCAGGAGACACACTG
GTCATGAGGATGACTCTTCTCAAGTTCCAGAAACGCTTCGGTCTTGCTAAGATGGAATGT
AAAGCTTATGTGGGTGGGTCTTTGGTCTGCGAGGGAGAGTTCATGATGGTTTCTGCTGGC
AGTTCTCGATCTTCTCAACCATTTTT*CACTCGCTTTATGTCTGT

QA 3 767 3 767
DS 

RD RR2E084JQ 491 0 0
ACGTCACTATCAATGACAACTTCTTCCCTGGTCATTTCCCTGACCGACCCATCATGCCTG
GTGTTCTCATGGTTGAGGCGATGGCACAAGTGGGAGGAATAGTAATGCTGCAGCCAGAAG
TAGGAGGATCTCAGGATAACTTCTTCTTTGCGGGTATTGATAAAGTGAGATTCCGCAAAC
CAGTGATTGCAGGAGACACACTGGTCATGAGGATGACTCTTCTCAAGTTCCAGAAACGCT
TCGGTCTTGCTAAGATGGAAGGTAAAGCTTATGTGGGTGGGTCTTTGGTCTGCGAGGGAG
AGTTCATGATGGTTTCTGCTGGCAGTTCTTGATATTCTCAACCATTTTTTCACTCGCTTT
ATGTCTGTTTTTTTTCTTCTTATGCTTCTTCTGTGATTTGGATAACTAGACAAGACCAAA
GCTTAAAACAAAGTGACATTTGTACGAGTCTTCTTCAAGGTTTTCATGCCTTGTTATGTT
CTTTATCGATG

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2CF86JQ 715 0 0
CATCCCCAAAAGACACCCCAATCGAACTCAAGTTCCCAGCATTTCCAACGGTCATGGACA
TTAACCAGATCAGAGAGATACTGCCTCACAGGTTCCCGTTTCTGCTGGTGGATAGAGTAA
TTGAGTATACACCTGGTGTTTCAGCTGTAGCTATTAAGAACGTCACTATCAATGACAACT
TCTTCCCTGGTCATTTCCCTGACTGACCCATCATGCCTGGTGTTCTCATGGTTGAGGCGA
TGGCACAAGTGGGAGGAATAGTAATGCTGCAGCCAGAAGTAGGAGGATCTCAGGATAACT
TCTTCTTTGCGGGTATTGATAAAGTGAGATTCCGCAAACCAGTGATTGCAGGAGACACAC
TGGTCATGAGGATGACTCTTCTCAAGTTCCAGAAACGCTTCGGTCTTGCTAAGATGGAAG
GTAAAGCTTATGTGGGTGGGTCTTTGGTCTGCGAGGGAGAGTTCATGATGGTTTCTGCTG
GCAGTTCTCGATCTTCTCAACCATTTTTTCACTCGCTTTATGTCTGTTTTTTTTCTTCTT
ATGCTTCTTCTGTGATTTGGATAACTAGACAAGACCAAAGCTTAAAACAAAGTGACATTT
GTACGAGTCTTCTTCAAGGTTTTCATGCCTTGTTATGTTCTTTATCGATGTCTCTGGTTG
ATGATTGATGAAGATTCACGGCACATGAAATAGTACTACAGAAACCCATTTTCAC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL1720Contig1 831 2 6 U
CATAGAATGTAAAGTCTCCAAACACAAAAACAACAATAAATTCATTACAAGTCTTATAGA
AATAAATGCAAGTTTGATCAAATTGTTTGAAGAGTTTCATCACTCTTTGTGAATAATAAT
ACATCTCAGGGACTGGGTTCGTCTCTAGGACTGTGGTCTTGTCCATTGGTCCCATTGCCG
TTTTCCTGACCCTTCTTCTCAGGCATTGGGCTCTTTTCATTGGGACTTGGGCTATGGTCT
CTGTCTTTGAGTGGATGTGAGTTAAGAACCGTTGGTTCAGGGCTCCTGCTTCTCGCAGCT
GGTTCAGGAGTTCGCTTCTTTTCAGTCCTAACAGGGGATCTTGAGCGACTGTAGCTTGGG
CTTCTGCTTCTGCTGCGGTTTCTTCTACTACGACGGGGAGGAGGTGATCGAGACCTAACT
GGTGATCTCGAGTAACTTTGGTCCCTCTTGAGCTTCTTGGGACTGTTCTTGCAGTTCCTC
TCTATATGACCTCTATCGCCACATCGATAACATTTGTTCTTCCAGTCACCAGCAGTGCAA
TCTCTAGCCCAGTGTCCATCAAGACCACAGTTGAAGCAGCGTCCACTTCCTGGAGGAGGA
GGTCCTCCTCTGCTTGAAGATATCTCTCGAGAACCATAACCAGAACCAGAACCACGCGGT
GTCTAGATATATATATATATACATGACGGACAACTTTTTAAGAAATTGTTTTATAATCAT
ATGAATAAAGTATATATTACCCCTTTAGCAAATTCAACAACGATGCGGCTTCCATCAACG
TCTCTTCCATCTAAGCGGTACCTTGCATCATCAGCATCTCGGGGGTCGCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX31JQ U 1
AF RR2AP25JQ U 24
BS 1 68 RR2EX31JQ
BS 69 69 RR2AP25JQ
BS 70 98 RR2EX31JQ
BS 99 99 RR2AP25JQ
BS 100 557 RR2EX31JQ
BS 558 831 RR2AP25JQ

RD RR2EX31JQ 557 0 0
CATAGAATGTAAAGTCTCCAAACACAAAAACAACAATAAATTCATTACAAGTCTTATAGA
AATAAATG*AAGTTTGATCAAATTGTTTGAAGAGTTTCCTCACTCTTTGTGAATAATAAT
ACATCTCAGGGACTGGGTTCGTCTCTAGGACTGTGGTCTTGTCCATTGGTCCCATTGCCG
TTTTCCTGACCCTTCTTCTCAGGCATTGGGCTCTTTTCATTGGGACTTGGGCTATGGTCT
CTGTCTTTGAGTGGATGTGAGTTAAGAACCGTTGGTTCAGGGCTCCTGCTTCTCGCAGCT
GGTTCAGGAGTTCGCTTCTTTTCAGTCCTAACAGGGGATCTTGAGCGACTGTAGCTTGGG
CTTCTGCTTCTGCTGCGGTTTCTTCTACTACGACGGGGAGGAGGTGATCGAGACCTAACT
GGTGATCTCGAGTAACTTTGGTCCCTCTTGAGCTTCTTGGGACTGTTCTTGCAGTTCCTC
TCTATATGACCTCTATCGCCACATCGATAACATTTGTTCTTCCAGTCACCAGCAGTGCAA
TCTCTAGCCCAGTGTCC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2AP25JQ 808 0 0
G
CAAAAACAACAATAAATTCATTACAAGTCTTATAGAAATAAATGCAAGTTTGATCAAATT
GTTTGAAGAGTTTCATCACTCTTTGTGAATAATAATACATCTCAGGGACTGGGTTCGTCT
CTAGGACTGTGGTCTTGTCCATTGGTCCCATTGCCGTTTTCCTGACCCTTCTTCTCAGGC
ATTGGGCTCTTTTCATTGGGACTTGGGCTATGGTCTCTGTCTTTGAGTGGATGTGAGTTA
AGAACCGTTGGTTCAGGGCTCCTGCTTCTCGCAGCTGGTTCAGGAGTTCGCTTCTTTTCA
GTCCTAACAGGGGATCTTGAGCGACTGTAGCTTGGGCTTCTGCTTCTGCTGCGGTTTCTT
CTACTACGACGGGGAGGAGGTGATCGAGACCTAACTGGTGATCTCGAGTAACTTTGGTCC
CTCTTGAGCTTCTTGGGACTGTTCTTGCAGTTCCTCTCTATATGACCTCTATCGCCACAT
CGATAACATTTGTTCTTCCAGTCACCAGCAGTGCAATCTCTAGCCCAGTGTCCATCAAGA
CCACAGTTGAAGCAGCGTCCACTTCCTGGAGGAGGAGGTCCTCCTCTGCTTGAAGATATC
TCTCGAGAACCATAACCAGAACCAGAACCACGCGGTGTCTAGATATATATATATATACAT
GACGGACAACTTTTTAAGAAATTGTTTTATAATCATATGAATAAAGTATATATTACCCCT
TTAGCAAATTCAACAACGATGCGGCTTCCATCAACGTCTCTTCCATCTAAGCGGTACCTT
GCATCATCAGCATCTCGGGGGTCGCTA

QA 2 808 2 808
DS 



AS 1 4

CO CL1721Contig1 1339 4 23 U
GGAAACATTTATTTCAAAAATGACAAAGCTGTTGCCATCGCCGTTTAGCTCATTACTCGC
CGTCGTTTTCATCTCCCTAGTCTCCATCGTCCACTGTTGCTCCCCTTCAGACCAAACGGC
TCTCAATGCTTTCAAGTCGTCACTGAGCGAACCAAACCTCGGAATCTTCAACACTTGGTC
CGAAAACACTGACTGCTGCAAGGCATGGTACGGTATCAGCTGCGATCCGGATTCGGGTCA
GGTCACGGATATCTCTCTCCGCGGCGAATCTGAAGATGCGATTTTCCAAAAGGCTGGCCG
GTCCGGTTACATGACCGGTTCGATAGACCCGGCGGTTTGCGATTTGACCGCACTGAGTTC
ACTCGTGCTCGCCGACTGGAAAGGAATCTCCGGCGAGATTCCGCCGTGCATAACCTCCTT
AGCCTCGCTCCGTGTCGTCGACCTCGCCGGAAACAGGATCACCGGAGAGATTCCGGCGGA
AATCGGTAAACTCACCAAACTCGCCGTTCTGAACCTCGCGGAGAATCGGATGTCCGGCGA
GATACCTCCGTCGCTGACGTCACTCGCCGAGCTGAAGCATCTCGAGCTGACGGAAAACGG
AATCTCCGGCGTGATTCCGGCGGATTTCGGATCGTTGAAGATGTTGAGCAGGGCGTTGCT
GGGACGTAACGAACTCACCGGGTCGATTCCCGGGTCGGTCTCCGGTATGAAACGGTTAGC
GGATCTGGATCTATCCAGGAACCATATCGAGGGTCCGATACCTGAGTGGATGGGTAAAAT
GAATGTACTCTCTGTTTTGAATCTCGATAGCAACTCGTTAACCGGTCCAATCCCCGGTTC
GATTCTTAGCAGTTCCGGTTTTGGAGTTTTGAATTTGAGTCGAAATGCGTTGGAAGGAAC
CATACCGGATGTTTTCGGATCCACAACCTATTTCATGTCGCTTGATTTGTCACACAATAA
TCTATCGGGTCGGATACCTGATTCGCTCTCGTCCACTAAGTTTGTGGGCCATCTCGATAT
CAGCCATAACAGGCTCTGTGGGCCTATTCCAATGGGCTCTCCTTTTGATCACCTTGAGGC
GTCTTCGTTTAGTGACAACGAGTGTTTGTGCGGTGGCCCTTTGATGAAGGCATGTTAAAG
TAATAAATAAGGAAGTCTCGTGTCGCTCTTGTTCGTCGTATCCAGTTTGTTTATATTCTT
CGCTTGCTTTCCTTTTCTTGAGATTATAAGCTCTATACAGCTAAGCTCTATACACCGATC
CAAATCTGTTCCCGGTGTATGGGTATGGTAGAGCATGTATAATGTATAAGCAATGTTATA
GATCTTAAATGTTTTAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2F692TF U 1
AF RR2GS19TF U 263
AF RR2F692JQ C 553
AF RR2GS19JQB C 690
BS 1 618 RR2F692TF
BS 619 619 RR2GS19TF
BS 620 704 RR2F692TF
BS 705 705 RR2GS19TF
BS 706 740 RR2F692TF
BS 741 741 RR2GS19TF
BS 742 755 RR2F692TF
BS 756 756 RR2GS19TF
BS 757 761 RR2F692TF
BS 762 762 RR2GS19TF
BS 763 778 RR2F692TF
BS 779 779 RR2GS19TF
BS 780 782 RR2F692TF
BS 783 783 RR2GS19TF
BS 784 800 RR2F692TF
BS 801 801 RR2GS19TF
BS 802 812 RR2F692TF
BS 813 854 RR2GS19TF
BS 855 855 RR2F692JQ
BS 856 892 RR2GS19TF
BS 893 1272 RR2F692JQ
BS 1273 1273 RR2GS19JQB
BS 1274 1339 RR2F692JQ

RD RR2F692TF 816 0 0
GGAAACATTTATTTCAAAAATGACAAAGCTGTTGCCATCGCCGTTTAGCTCATTACTCGC
CGTCGTTTTCATCTCCCTAGTCTCCATCGTCCACTGTTGCTCCCCTTCAGACCAAACGGC
TCTCAATGCTTTCAAGTCGTCACTGAGCGAACCAAACCTCGGAATCTTCAACACTTGGTC
CGAAAACACTGACTGCTGCAAGGCATGGTACGGTATCAGCTGCGATCCGGATTCGGGTCA
GGTCACGGATATCTCTCTCCGCGGCGAATCTGAAGATGCGATTTTCCAAAAGGCTGGCCG
GTCCGGTTACATGACCGGTTCGATAGACCCGGCGGTTTGCGATTTGACCGCACTGAGTTC
ACTCGTGCTCGCCGACTGGAAAGGAATCTCCGGCGAGATTCCGCCGTGCATAACCTCCTT
AGCCTCGCTCCGTGTCGTCGACCTCGCCGGAAACAGGATCACCGGAGAGATTCCGGCGGA
AATCGGTAAACTCACCAAACTCGCCGTTCTGAACCTCGCGGAGAATCGGATGTCCGGCGA
GATACCTCCGTCGCTGACGTCACTCGCCGAGCTGAAGCATCTCGAGCTGACGGAAAACGG
AATCTCCGGCGTGATTCCCGCGGATTTCGGATCGTTGAAGATGTTGAGCAGGGCGTTGCT
GGGACGTAACGAACTCACCGGGTCGATTCCCGGGTCGGTCTCCG*TATGAAACGGTTAGC
GGATCTGGATCTATCCAGGA*CCATATCGAGGGTC*GATAC*TGAGTGGATGGGTAAA*T
GA*TGTACTCTCTGTTTTGA*TCTCGATAGCA
CTCG

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR2GS19TF 630 0 0
GGCGAATCTGAAGATGCGATTTTCCAAAAGGCTGGCCGGTCCGGTTACATGACCGGTTCG
ATAGACCCGGCGGTTTGCGATTTGACCGCACTGAGTTCACTCGTGCTCGCCGACTGGAAA
GGAATCTCCGGCGAGATTCCGCCGTGCATAACCTCCTTAGCCTCGCTCCGTGTCGTCGAC
CTCGCCGGAAACAGGATCACCGGAGAGATTCCGGCGGAAATCGGTAAACTCACCAAACTC
GCCGTTCTGAACCTCGCGGAGAATCGGATGTCCGGCGAGATACCTCCGTCGCTGACGTCA
CTCGCCGAGCTGAAGCATCTCGAGCTGACGGAAAACGGAATCTCCGGCGTGATTCCGGCG
GATTTCGGATCGTTGAAGATGTTGAGCAGGGCGTTGCTGGGACGTAACGAACTCACCGGG
TCGATTCCCGGGTCGGTCTCCGGTATGAAACGGTTAGCGGATCTGGATCTATCCAGGAAC
CATATCGAGGGTCCGATACCTGAGTGGATGGGTAAAATGAATGTACTCTCTGTTTTGAAT
CTCGATAGCAACTCGTTAACCGGTCCAATCCCCGGTTCGATTCTTAGCAGTTTCGGTTTT
GGAGTTTTGAATTTGAGTCGAAATGCGTTG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2F692JQ 787 0 0
GCTGACGTCACTCGCCGAGCTGAAGCATCTCGAGCTGACGGAAAACGGAATCTCCGGCGT
GATTCCGGCGGATTTCGGATCGTTGAAGATGTTGAGCAGGGCGTTGCTGGGACGTAACGA
ACTCACCGGGTCGATTCCCGGGTCGGTCTCCGGTATGAAACGGTTAGCGGATCTGGATCT
ATCCAGGAACCATATCGAGGGTCCGATACCTGAGTGGATGGGTAAAATGAATGTACTCTC
TGTTTTGAATCTCGATAGCAACTCGTTAACCGGTCCAATCCCCGGTTCGATTCTTAGCAG
TTCCGGTTTTGGAGTTTTGAATTTGAGTCGAAATGCGTTGGAAGGAACCATACCGGATGT
TTTCGGATCCACAACCTATTTCATGTCGCTTGATTTGTCACACAATAATCTATCGGGTCG
GATACCTGATTCGCTCTCGTCCACTAAGTTTGTGGGCCATCTCGATATCAGCCATAACAG
GCTCTGTGGGCCTATTCCAATGGGCTCTCCTTTTGATCACCTTGAGGCGTCTTCGTTTAG
TGACAACGAGTGTTTGTGCGGTGGCCCTTTGATGAAGGCATGTTAAAGTAATAAATAAGG
AAGTCTCGTGTCGCTCTTGTTCGTCGTATCCAGTTTGTTTATATTCTTCGCTTGCTTTCC
TTTTCTTGAGATTATAAGCTCTATACAGCTAAGCTCTATACACCGATCCAAATCTGTTCC
TGGTGTATGGGTATGGTAGAGCATGTATAATGTATAAGCAATGTTATAGATCTTAAATGT
TTTAGAA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2GS19JQB 648 0 0
CCGGGTCGGTCTCCGGTATGAAACGGTTAGCGGATCTGGATCTATCCAGGAACCATATCG
AGGGTCCGATACCTGAGTGGATGGGTAAAATGAATGTACTCTCTGTTTTGAATCTCGATA
GCAACTCGTTAACCGGTCCAATCCCCGGTTCGATTCTTAGCAGTTCCGGTTTTGGAGTTT
TGAATTTGAGTCGAAATGCGTTGGAAGGAACCATACCGGATGTTTTCGGATCCACAACCT
ATTTCATGTCGCTTGATTTGTCACACAATAATCTATCGGGTCGGATACCTGATTCGCTCT
CGTCCGCTAAGTTTGTGGGCCATCTCGATATCAGCCATAACAGGCTCTGTGGGCCTATTT
CAATGGGCTCTCCTTTTGATCACCTTGAGGCGTCTTCGTTTAGTGACAACGAGTGTTTGT
GCGGTGGCCCTTTGATGAAGGCATGTTAAAGTAATAAATAAGGAAGTCTCGTGTCGCTCT
TGTTCGTCGTATCCAGTTTGTTTATATTCTTCGCTTGCTTTCCTTTTCTTGAGATTATAA
GCTCTATACAGCTAAGCTCTATACACCGATCCAAATCTGTTCCCGGTGTATGGGTATGGT
AGAGCATGTATAATGTATAAGCAATGTTATAGATCTTAAATGTTTTAG

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 5

CO CL1722Contig1 384 5 5 U
GGGAGGAAAAGAAAACACAAATTAGAAAAGAAAAAAAAA*GAGAGTCAAAGAAATCGCCA
TGGATGCCATCGATTCAGTCGTAGATCCTCTAAGAGACTTTGCCAAGGACAGCATTCGTC
TCGTTAAGCGTTGTCACAAACCAGATCGCAAAGAATTCACGAAAGTGGCGGTCCGTACAG
CTATTGGTTTTGTAGTGATGGGATTTGTCGGTTTCTTTGTGAAGCTCATCTTTATTCCCA
TCAACAACATCATCGTCGGTGCTACTTAAAAGATAACCACGGACGATGAAGAAGGGTAGT
AGTTACAGCTTTTGTTGTTTCAAGACACTTTTTTTTAATGCTCGAGAGAGTAAAACTTTT
GTTACAAATTGCAGAATTCGTCTA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2AU15TF U 1
AF RR2DL86TF U 46
AF RR2EU91JQ C 1
AF RR2EU91TF U 1
AF RR2AH03TF U 22
BS 1 39 RR2AU15TF
BS 40 40 RR2EU91TF
BS 41 103 RR2AU15TF
BS 104 104 RR2DL86TF
BS 105 384 RR2AU15TF

RD RR2AU15TF 384 0 0
GGGAGGAAAAGAAAACACAAATTAGAAAAGAAAAAAAAAAGAGAGTCAAAGAAATCGCCA
TGGATGCCATCGATTCAGTCGTAGATCCTCTAAGAGACTTTGCTAAGGACAGCATTCGTC
TCGTTAAGCGTTGTCACAAACCAGATCGCAAAGAATTCACGAAAGTGGCGGTCCGTACAG
CTATTGGTTTTGTAGTGATGGGATTTGTCGGTTTCTTTGTGAAGCTCATCTTTATTCCCA
TCAACAACATCATCGTCGGTGCTACTTAAAAGATAACCACGGACGATGAAGAAGGGTAGT
AGTTACAGCTTTTGTTGTTTCAAGACACTTTTTTTTAATGCTCGAGAGAGTAAAACTTTT
GTTACAAATTGCAGAATTCGTCTA

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR2DL86TF 339 0 0
G
CAAAGAAATCGCCATGGATGCCATCGATTCAGTCGTAGATCCTCTAAGAGACTTTGCCAA
GGACAGCATTCGTCTCGTTAAGCGTTGTCACAAACCAGATCGCAAAGAATTCACGAAAGT
GGCGGTCCGTACAGCTATTGGTTTTGTAGTGATGGGATTTGTCGGTTTCTTTGTGAAGCT
CATCTTTATTCCCATCAACAACATCATCGTCGGTGCTACTTAAAAGATAACCACGGACGA
TGAAGAAGGGTAGTAGTTACAGCTTTTGTTGTTTCAAGACACTTTTTTTTAATGCTCGAG
AGAGTAAAACTTTTGTTACAAATTGCAGAATTCGTCTA

QA 2 339 2 339
DS 

RD RR2EU91JQ 367 0 0
GGGAGGAAAAGAAAACACAAATTAGAAAAGAAAAAAAAA*GAGAGTCAAAGAAATCGCCA
TGGATGCCATCGATTCAGTCGTAGATCCTCTAAGAGACTTTGCCAAGGACAGCATTCGTC
TCGTTAAGCGTTGTCACAAACCAGATCGCAAAGAATTCACGAAAGTGGCGGTCCGTACAG
CTATTGGTTTTGTAGTGATGGGATTTGTCGGTTTCTTTGTGAAGCTCATCTTTATTCCCA
TCAACAACATCATCGTCGGTGCTACTTAAAAGATAACCACGGACGATGAAGAAGGGTAGT
AGTTACAGCTTTTGTTGTTTCAAGACACTTTTTTTTAATGCTCGAGAGAGTAAAACTTTT
GTTACAA

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR2EU91TF 384 0 0
GGGAGGAAAAGAAAACACAAATTAGAAAAGAAAAAAAAA*GAGAGTCAAAGAAATCGCCA
TGGATGCCATCGATTCAGTCGTAGATCCTCTAAGAGACTTTGCCAAGGACAGCATTCGTC
TCGTTAAGCGTTGTCACAAACCAGATCGCAAAGAATTCACGAAAGTGGCGGTCCGTACAG
CTATTGGTTTTGTAGTGATGGGATTTGTCGGTTTCTTTGTGAAGCTCATCTTTATTCCCA
TCAACAACATCATCGTCGGTGCTACTTAAAAGATAACCACGGACGATGAAGAAGGGTAGT
AGTTACAGCTTTTGTTGTTTCAAGACACTTTTTTTTAATGCTCGAGAGAGTAAAACTTTT
GTTACAAATTGCAGAATTCGTCTA

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR2AH03TF 363 0 0
GGAGAAAAGA
AAAAAAAAAGAGAGTCAAAGAAATCGCCATGGATGCCATCGATTCAGTCGTAGATCCTCT
AAGAGACTTTGCCAAGGACAGCATTCGTCTCGTTAAGCGTTGTCACAAACCAGATCGCAA
AGAATTCACGAAAGTGGCGGTCCGTACAGCTATTGGTTTTGTAGTGATGGGATTTGTCGG
TTTCTTTGTGAAGCTCATCTTTATTCCCATCAACAACATCATCGTCGGTGCTACTTAAAA
GATAACCACGGACGATGAAGAAGGGCAGTAGTTACAGCTTTTGTTGTTTCAAGACACTTT
TTTTTAATGCTCGAGAGAGTAAAACTTTTGTTACAAATTGCAGAATTCGTCTA

QA 11 363 11 363
DS 



AS 1 2

CO CL1723Contig1 601 2 4 U
GATCGCTGCCGTCTTTGCGGTGTGTTTAATCATCACATGCAGTTTTTGGAGCTCTGCTAT
TATCCTGCTGGTGATTGCAATGCTCATCATTGATCTCCTGGGAGTAATGGCAGTCTTTCA
TATTCAGCTAAACGCACTATCTGTTGTAAATCTAATCATGTCAGTGGGCATAGCGGTTGA
GTTTTGTGTACACATAACACATGCTTTCTCGACAAGCTCTGGGAACAGGAACCAAAGGAT
GAAAGAGGCGCTTGGTGGGATGGGAGCTTCAGTTTTCAGTGGAATTACATTGACAAAGCT
AGTTGGAGTGATTGTGCTTGGCTTCTCAAAATCGGAAGTGTTTGTGGTTTACTACTTCAA
GATGTATTTGGCACTAGTCCTCCTCGGTTTCTTGCACGGCCTTGTATTCTTACCGGTGTT
CTTGAGCATGTTTGGCCCAGCTCCAAGACATGTAGAAGGGGATAATAAGCAAGATCCTCA
ACCTTCGGTTTCATCGCTGCCGTAGAGGCTCAATTAGGGGTTTTTGATTCTTTATTTTAC
AAAGGTTTTGTTTTGGATACATCTTCTTACTTCTATTTGTAAATGGTTAAAAATTTGTTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2CD18JQ C 1
AF RR2CD18TF U 1
BS 1 9 RR2CD18JQ
BS 10 591 RR2CD18TF
BS 592 592 RR2CD18JQ
BS 593 601 RR2CD18TF

RD RR2CD18JQ 601 0 0
GATCGCTGCCGTCTTTGCGGTGTGTTTAATCATCACATGCAGTTTTTGGAGCTCTGCTAT
TATCCTGCTGGTGATTGCAATGCTCATCATTGATCTCCTGGGAGTAATGGCAGTCTTTCA
TATTCAGCTAAACGCACTATCTGTTGTAAATCTAATCATGTCAGTGGGCATAGCGGTTGA
GTTTTGTGTACACATAACACATGCTTTCTCGACAAGCTCTGGGAACAGGAACCAAAGGAT
GAAAGAGGCGCTTGGTGGGATGGGAGCTTCAGTTTTCAGTGGAATTACATTGACAAAGCT
AGTTGGAGTGATTGTGCTTGGCTTCTCAAAATCGGAAGTGTTTGTGGTTTACTACTTCAA
GATGTATTTGGCACTAGTCCTCCTCGGTTTCTTGCACGGCCTTGTATTCTTACCGGTGTT
CTTGAGCATGTTTGGCCCAGCTCCAAGACATGTAGAAGGGGATAATAAGCAAGATCCTCA
ACCTTCGGTTTCATCGCTGCCGTAGAGGCTCAATTAGGGGTTTTTGATTCTTTATTTTAC
AAAGGTTTTGTTTTGGATACATCTTCTTACTTCTATTTGTAAATGGTTAAAAATTTGTTC
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2CD18TF 601 0 0
GATCGCTGC
CGTCTTTGCGGTGTGTTTAATCATCACATGCAGTTTTTGGAGCTCTGCTATTATCCTGCT
GGTGATTGCAATGCTCATCATTGATCTCCTGGGAGTAATGGCAGTCTTTCATATTCAGCT
AAACGCACTATCTGTTGTAAATCTAATCATGTCAGTGGGCATAGCGGTTGAGTTTTGTGT
ACACATAACACATGCTTTCTCGACAAGCTCTGGGAACAGGAACCAAAGGATGAAAGAGGC
GCTTGGTGGGATGGGAGCTTCAGTTTTCAGTGGAATTACATTGACAAAGCTAGTTGGAGT
GATTGTGCTTGGCTTCTCAAAATCGGAAGTGTTTGTGGTTTACTACTTCAAGATGTATTT
GGCACTAGTCCTCCTCGGTTTCTTGCACGGCCTTGTATTCTTACCGGTGTTCTTGAGCAT
GTTTGGCCCAGCTCCAAGACATGTAGAAGGGGATAATAAGCAAGATCCTCAACCTTCGGT
TTCATCGCTGCCGTAGAGGCTCAATTAGGGGTTTTTGATTCTTTATTTTACAAAGGTTTT
GTTTTGGATACATCTTCTTACTTCTATTTGTAAATGGTTAAAGATTTGTTCC

QA 10 601 10 601
DS 



AS 1 5

CO CL1724Contig1 1164 5 23 U
GTGGTGAGGAGAGAGGTTCTTGACCAGTACCTGAGAGAGAGAGCGGAGAAGAGCGGAGCC
ACTGTGATCAACGGTCTCTTCTTGAAAATGGATCTACCGGAGAATTGGGACACCCCGTAC
GTGCTGCATTACACGGAGTACGACGGGAAGACGGGAGCTACGGGACAGAAGAAGACGATG
GAGGTTGACGCCGTCATCGGAGCTGACGGGGCTAACTCTAGAGTTGCGAAGTCCATCGGC
GCCGGAGATTACGACTACGCCATCGCTTTTCAGGAGAGAATCAGAATCCCAGATGATAAG
ATGACATACTACGAGGATCTAGCTGAGATGTACGTCGGAGATGACGTGTCACCCGATTTC
TACGGATGGGTTTTCCCGAAATGCGACCACGTAGCTGTCGGAACAGGCACTGTGACTCAC
AAAGGTGACATCAAGAAGTTCCAGCTCGCGACAAGAAACAGAGCCAAGGACAAGATTCTA
GGAGGAAAGATCATTCGCGTCGAGGCTCACCCTATCCCGGAACACCCGCGGCCACGTAGG
CTATCCAAGCGTGTGGCTCTTGTGGGAGATGCTGCAGGGTACGTGACTAAGTGCTCCGGT
GAAGGGATCTATTTC*CTGCAAAGAGTGGAAGAATGTGTGCTGAAGCCATCGTTGAAGGC
TCACAGAATGGTAAGAAGATGATTGATGAGAGTGACTTGAGGAAGTATTTGG*AGAAATG
GGACAAGACATACTTGCCTACGTACAGAGTTCTTGATGTGTTGCAGAAAGTGTTTTACAG
ATCGAATCCGGCTAGAGAAGCGTTTGTGGAGATGTGTAGCGATGAGTATGTTCAGAAGAT
GACATTCGATAGCTATCTGTACAAGAAGGTAGCTCCGGGTAATCCTTTGGAGGATTTGAA
GTTGGCTGTGAACACCATTGGGAGCGTGTTTAGGGCTAATGCTTTGAGGAGAGAGATTGA
GAAGCTAAATGTTTAAGACACAAAGAAGAGGAGATTGTTTCTTGTCTTTTCTTTTTTTTT
*AATTTTAAAAGTATGTTTATGTTATCTGTGTATTAGTCAAAAAGCATTTGGCTTTACAA
TCCAATTTCTCACTGAAACATATTTCATTAACCACTAAAACTCACTAAAGTGATCAGACT
TGATGAGACTTGCCTTCTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F043TF U 1
AF RR2A089TF U 108
AF RR2GU37JQB C 647
AF RR2F043JQ C 363
AF RR2GD54TF U 605
BS 1 658 RR2F043TF
BS 659 659 RR2A089TF
BS 660 717 RR2F043TF
BS 718 718 RR2A089TF
BS 719 745 RR2F043TF
BS 746 746 RR2A089TF
BS 747 768 RR2F043TF
BS 769 769 RR2A089TF
BS 770 784 RR2F043TF
BS 785 789 RR2A089TF
BS 790 790 RR2GD54TF
BS 791 804 RR2A089TF
BS 805 805 RR2GD54TF
BS 806 836 RR2A089TF
BS 837 837 RR2GD54TF
BS 838 845 RR2A089TF
BS 846 846 RR2GD54TF
BS 847 860 RR2A089TF
BS 861 1020 RR2GD54TF
BS 1021 1021 RR2F043JQ
BS 1022 1060 RR2GD54TF
BS 1061 1061 RR2F043JQ
BS 1062 1164 RR2GD54TF

RD RR2F043TF 784 0 0
GTGGTGAGGAGAGAGGTTCTTGACCAGTACCTGAGAGAGAGAGCGGAGAAGAGCGGAGCC
ACTGTGATCAACGGTCTCTTCTTGAAAATGGATCTACCGGAGAATTGGGACACCCCGTAC
GTGCTGCATTACACGGAGTACGACGGGAAGACGGGAGCTACGGGACAGAAGAAGACGATG
GAGGTTGACGCCGTCATCGGAGCTGACGGGGCTAACTCTAGAGTTGCGAAGTCCATCGGC
GCCGGAGATTACGACTACGCCATCGCTTTTCAGGAGAGAATCAGAATCCCAGATGATAAG
ATGACATACTACGAGGATCTAGCTGAGATGTACGTCGGAGATGACGTGTCACCCGATTTC
TACGGATGGGTTTTCCCGAAATGCGACCACGTAGCTGTCGGAACAGGCACTGTGACTCAC
AAAGGTGACATCAAGAAGTTCCAGCTCGCGACAAGAAACAGAGCCAAGGACAAGATTCTA
GGAGGAAAGATCATTCGCGTCGAGGCTCACCCTATCCCGGAACACCCGCGGCCACGTAGG
CTATCCAAGCGTGTGGCTCTTGTGGGAGATGCTGCAGGGTACGTGACTAAGTGCTCCGGT
GAAGGGATCTATTTC*CTGCAAAGAGTGGAAGAATGTGTGCTGAAGCCATCGTTGAAG*C
TCACAGAATGGTAAGAAGATGATTGATGAGAGTGACTTGAGGAAGTATTTGG*AGAA*TG
GGACAAGACATACTTGCCTACGTACGGAGTTCTTGATGTGTTGCAGAA*GTGTTTTACAG
ATCG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2A089TF 753 0 0
GGACACCCCGTACGTGCTGCATTACACGGAGTACGACGGGAAGACGGGAGCTACGGGACA
GAAGAAGACGATGGAGGTTGACGCCGTCATCGGAGCTGTCGGGGCTAACTCTAGAGTTGC
GAAGTCCATCGGCGCCGGAGATTACGACTACGCCATCGCTTTTCAGGAGAGAATCAGAAT
CCCAGATGATAAGATGACATACTACGAGGATCTAGCTGAGATGTACGTCGGAGATGACGT
GTCACCCGATTTCTATGGATGGGTTTTCCCGAAATGCGACCACGTAGCTGTCGGATCAGG
CACTGTGACTCACAAAGGTGACATCAAGAAGTTCCAGCTCGCGACAAGAAACAGAGCCAA
GGACAAGATTCTAGGAGGAAAGATCATTCGCGTCGAGGCTCACCCTATCCCGGAACACCC
GCGGCCACGTAGGCTATCCAAGCGTGTGGCTCTTGTGGGAGATGCTGCAGGGTACGTGAC
TAAGTGCTCCGGTGAAGGGATCTATTTCGCTGCAAAGAGTGGAAGAATGTGTGCTGAAGC
CATCGTTGAAGGCTCACAGAATGGTAAGAAGATGATTGATGAGAGTGACTTGAGGAAGTA
TTTGGGAGAAATGGGACAAGACATACTTGCCTACGTACAGAGTTCTTGATGTGTTGCAGA
AAGTGTTTTACAGATCGAATCCCGCTAGAGAAGCGTT*GTGGAGATGTGTAGCGATGAGT
ATGTTCAGA*GATGACAT*CGATAGCTATCTGT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2GU37JQB 467 0 0
CCATCGTTGAAGGCTCACAGAATGGTAAGAAGATGATTGATGAGAGTGACTTGAGGAAGT
ATTTGG*AGAAATGGGACAAGACATACTTGCCTACGTACAGAGTTCTTGATGTGTTGCAG
AAAGTGTTTTACAGATCGAATCCGGCTAGAGAAGCGTTTGTGGAGATGTGTAGCGATGAG
TATGTTCAGAAGATGACATTCGATAGCTATCTGTACAAGAAGGTAGCTCCGGGTAATCCT
TTGGAGGATTTGAAGTTGGCTGTGAACACCATTGGGAGCGTGTTTAGGGCTAATGCTTTG
AGGAGAGAGATTGAGAAGCTAAATGTTTAAGACACAAAGAAGAGGAGATTGTTTCTTGTC
TTTTCTTTTTTTTT*AATTTTAAAAGTATGTTTATGTTATCTGTGTATTAGTCAAAAAGC
ATTTGGCTTTACAATCCAATTTCTCACTGAAACATATTTCATTAACC

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2F043JQ 792 0 0
ACGGATGGG
TTTCCCGAAATGCGACCACGTAGCTGTCGGAACAGGCACTGTGACTCACAAAGGTGACAT
CAAGAAGTTCCAGCTCGCGACAAGAAACAGAGCCAAGGACAAGATTCTAGGAGGAAAGAT
CATTCGCGTCGAGGCTCACCCTATCCCGGAACACCCGCGGCCACGTAGGCTATCCAAGCG
TGTGGCTCTTGTGGGAGATGCTGCAGGGTACGTGACTAAGTGCTCCGGTGAAGGGATCTA
TTTC*CTGCAAAGAGTGGAAGAATGTGTGCTGAAGCCATCGTTGAAGGCTCACAGAATGG
TAAGAAGATGATTGATGAGAGTGACTTGAGGAAGTATTTGG*AGAAATGGGACAAGACAT
ACTTGCCTACGTACGGAGTTCTTGATGTGTTGCAGAAAGTGTTTTACAGATCGAATCCGG
CTAGAGAAGCGTTTGTGGAGATGTGTAGCGATGAGTATGTTCAGAAGATGACATTCGATA
GCTATCTGTACAAGAAGCTAGCTCCGGGTAATCCTTTGAAGGATTTGAAGTTGGCTGTGA
ACACCATTGGGAGCGTGTTTAGGGCTAATGCTTTGAGGAGAGAGATTGAGAAGCTAAATG
TTTAAGACACAAAGAAGAGGAGATTGTTTCTTGTCTTTTCTTTTTTTT**AATTTTAAAA
GTATGTTTATGTTATCTGTGTATTAGTCAAAAAGCATTTGGCTTTACAATCCAATTTCTC
ACTGAAACATATTTCATTAACCACTAAAACTCACTAAAGTGATCAGACTTGATGAGACTT
GC
T

QA 10 791 10 791
DS 

RD RR2GD54TF 560 0 0
GGATCTATTTCGCTGCAAAGAGTGGAAGAATGTGTGCTGAAGCCATCGTTGAAGGCTCAC
AGAATGGTGAGAAGATGATTGATGAGAGTGACTTGAGGAAGTATTTGG*AGAAATGGGAC
AAGACATACTTGCCTACGTACAGAGTTCTTGATGTGTTGCAGAAAGTGTTTTACAGATCG
AATCCGGCTAGAGAAGCGTTTGTGGAGATGTGTAGCGATGAGTATGTTCAGAAGATGACA
TTCGATAGCTATCTGTACAAGAAGGTAGCTCCGGGTAATCCTTTGGAGGATTTGAAGTTG
GCTGTGAACACCATTGGGAGCGTGTTTAGGGCTAATGCTTTGAGGAGAGAGATTGAGAAG
CTAAATGTTTAAGACACAAAGAAGAGGAGATTGTTTCTTGTCTTTTCTTTTTTTTTTAAT
TTTAAAAGTATGTTTATGTTATCTGTGTATTAGTCATAAAGCATTTGGCTTTACAATCCA
ATTTCTCACTGAAACATATTTCATTAACCACTAAAACTCACTAAAGTGATCAGACTTGAT
GAGACTTGCCTTCTTCTTCC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 5

CO CL1725Contig1 528 5 5 U
GGATTTGCGATAAAACTTTTGGTTAATTCTCTTTCGAGTTGGGATATTTCTTTAAACTTT
CTCGAGAAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGCCTGCACGTGCGT
CAACGGTTGTTGTGGAGGTTGCAAAAAGTACCCTGACTTAGGCTTTTCGGGCGAGACAAC
CACGAGTGAGACTTTTGTCTCTGGCGTTGCACCGGCTATGAAGAACCAGTACGAGGCTTC
CGGCGAGAGTAACGCCGAGAACGATGGATGTACATGCAAGTGTGGATCTGACTGCAAGTG
TGATCCTTGCACCTGTAAATGAGTAAAACCCTTTTTAAGAAAGGCAGAGATAATCAGTTT
GTCTTTTTAGTTAAGTAATAATACTACCGCAATAACCGTTTTATTAGGTTTTGCTTTTTA
TGTTTAATAATGGGCTGCAACGTTGTCTTTCTTTCGTTTATGTGTTTGGTCTGTCTCTGC
CAATTTGTGACCATTATATATGATGAGCCACTTTGAGATCTTCATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EG24JQ C 1
AF RR2EG24TF U 1
AF RR2EB83TF U 6
AF RR2E733JQ C 4
AF RR2E733TF U 4
BS 1 6 RR2EG24JQ
BS 7 189 RR2EG24TF
BS 190 190 RR2EB83TF
BS 191 517 RR2EG24TF
BS 518 528 RR2E733TF

RD RR2EG24JQ 517 0 0
GGATTTGCGATAAAACTTTTGGTTAATTCTCTTTCGAGTTGGGATATTTCTTTAAACTTT
CTCGAGAAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGCCTGCACGTGCGT
CAACGGTTGTTGTGGAGGTTGCAAAAAGTACCCTGACTTAGGCTTTTCGGGCGAGACAAC
CACGAGTGACACTTTTGTTTCTGGCGTTGCACCGGCTATGAAGAACCAGTACGAGGCTTC
CGGCGAGAGTAACGCCGAGAACGATGGATGTACATGCAAGTGTGGATCTGACTGCAAGTG
TGATCCTTGCACCTGTAAATGAGTAAAACCCTTTTTAAGAAAGGCAGAGATAATCAGTTT
GTCTTTTTAGTTAAGTAATAATACTACCGCAATAACCGTTTTATTAGGTTTTGCTTTTTA
TGTTTAATAATGGGCTGCAACGTTGTCTTTCTTTCGTTTATGTGTTTGGTCTGTCTCTGC
CAATTTGTGACCATTATATATGATGAGCCACTTTGAG

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2EG24TF 517 0 0
GGATTT
GCGATAAAACTTTTGGTTAATTCTCTTTCGAGTTGGGATATTTCTTTAAACTTTCTCGAG
AAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGCCTGCACGTGCGTCAACGG
TTGTTGTGGAGGTTGCAAAAAGTACCCTGACTTAGGCTTTTCGGGCGAGACAACCACGAG
TGACACTTTTGTCTCTGGCGTTGCACCGGCTATGAAGAACCAGTACGAGGCTTCCGGCGA
GAGTAACGCCGAGAACGATGGATGTACATGCAAGTGTGGATCTGACTGCAAGTGTGATCC
TTGCACCTGTAAATGAGTAAAACCCTTTTTAAGAAAGGCAGAGATAATCAGTTTGTCTTT
TTAGTTAAGTAATAATACTACCGCAATAACCGTTTTATTAGGTTTTGCTTTTTATGTTTA
ATAATGGGCTGCAACGTTGTCTTTCTTTCGTTTATGTGTTTGGTCTGTCTCTGCCAATTT
GTGACCATTATATATGATGAGCCACTTTGAG

QA 7 517 7 517
DS 

RD RR2EB83TF 511 0 0
G
GCGATAAAACTTTTGGTTAATTCTCTTTCGAGTTGGGATATTTCTTTAAACTTTCTCGAG
AAAAATCTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGCCTGCACGTGCGTCAACGG
TTGTTGTGGAGGTTGCAAAAAGTACCCTGACTTAGGCTTTTCGGGCGAGACAACCACGAG
TGAGACTTTTGTCTCTGGCGTTGCACCGGCTATGAAGAACCAGTACGAGGCTTCCGGCGA
GAGTAACGCCGAGAACGATGGATGTACATGCAAGTGTGGATCTGACTGCAAGTGTGATCC
TTGCACCTGTAAATGAGTAAAACCCTTTTTAAGAAAGGCAGAGATAATCAGTTTGTCTTT
TTAGTTAAGTAATAATACTACCGCAATAACCGTTTTATTAGGTTTTGCTTTTTATGTTTA
ATAATGGGCTGCAACGTTGTCTTTCTTTCGTTTATGTGTTTGGTCTGTCTCTGCCAATTT
GTGACCATTATATATGATGAGCCACTTTGA

QA 2 511 2 511
DS 

RD RR2E733JQ 525 0 0
GTG
GCGATGAAACTTTTGGTTAATTCTCTTTCGAGTTGGGATATTTCTTTAAACTTTCTCGAG
AAAAATGCCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGCCTGCACGTGCGTCAACGG
TTGTTGTGGAGGTTGCAAAAAGTACCCTGACTTAGGCTTTTCGGGCGAGACAACCACGAG
TGAGACTTTTGTTTCTGGCGTTGCACCGGCTATGAAGAACCAGTACGAGGCTTCCGGCGA
GAGTAACGCCGAGAACGATGGATGTACATGCAAGTGTGGATCTGACTGCAAGTGTGATCC
TTGCACCTGTAAATGAGTAAAACCCTTTTTAAGAAAGGCAGAGATAATCAGTTTGTCTTT
TTAGTTAAGTAATAATACTACCGCAATAACCGTTTTATTAGGTTTTGCTTTTTATGTTTA
ATAATGGGCTGCAACGTTGTCTTTCTTTCGTTTATGTGTTTGGTCTGTCTCTGCCAATTT
GTGACCATTATATATGATGAGCCACTTTGAGATCTTCATGTT

QA 4 525 4 525
DS 

RD RR2E733TF 525 0 0
GTG
GCGATGAAACTTTTGGTTAATTCTCTTTCGAGTTGGGATATTTCTTTAAACTTTCTCGAG
AAAAATGCCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGCCTGCACGTGCGTCAACGG
TTGTTGTGGAGGTTGCAAAAAGTACCCTGACTTAGGCTTTTCGGGCGAGACAACCACGAG
TGAGACTTTTGTCTCTGGCGTTGCACCGGCTATGAAGAACCAGTACGAGGCTTCCGGCGA
GAGTAACGCCGAGAACGATGGATGTACATGCAAGTGTGGATCTGACTGCAAGTGTGATCC
TTGCACCTGTAAATGAGTAAAACCCTTTTTAAGAAAGGCAGAGATAATCAGTTTGTCTTT
TTAGTTAAGTAATAATACTACCGCAATAACCGTTTTATTAGGTTTTGCTTTTTATGTTTA
ATAATGGGCTGCAACGTTGTCTTTCTTTCGTTTATGTGTTTGGTCTGTCTCTGCCAATTT
GTGACCATTATATATGATGAGCCACTTTGAGATCTTCATGTT

QA 4 525 4 525
DS 



AS 1 5

CO CL1726Contig1 642 5 4 U
TTTTTGTCTGAGAGAAACTCAGAAAAAGGAGGTGTCCCCTCGTTCTCTAATCGATTACCC
AATCATTCATTTACTCACCAGCTGAATTGAATCTGAAAAAAAACTGTGAGTTGTGTGATT
GATTGCGTCTTGTGGAAGAAGAGGGAAGTTAAGTAATGGCGAAAGCGGGAGGGATCACGA
ACGCAGTTAACGTAGGAATCGCTGTTCAAGCAGATTGGGAGAACCGTGAGTTCATCTCGC
ACATCTCTCTCAATGTTCGTCGTCTCTTCGAGTTCCTCGTCCAATTCGAATCGACGACAA
AGAGCAAATTGGCATCACTGAATGAGAAGTTGGATCTTCTGGAACGTCGCTTGGAGATGC
TCGAGGTACAAGTGAGTACCGCCACTGCTAATCCTTCTCTGTTTGCTACCTGAAACACAT
ATAGCCAGAGTCTGAGCCTTTGGCCTAATCAGAAGAAGGAGAACCATCTTTTCGTTTTTT
GAATGTGAACCGTTGAATCATTCTTTCTTTCTTCAATAGCTGTAGTAAACCATAAATATG
AATCCACGCATGAACTGTGTATCTTTGTCTATCCCAGTGTTGATGTAACTTGTAAGATGT
TTTGAATCCCAAATTATTTCACTATGTCACTTGGAGTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV93TF U 1
AF RR2E767TF U 8
AF RR2GE88JQ C 1
AF RR2GE88TF U 1
AF RR2DV93JQ C 260
BS 1 166 RR2DV93TF
BS 167 167 RR2GE88TF
BS 168 635 RR2DV93TF
BS 636 642 RR2GE88TF

RD RR2DV93TF 639 0 0
TTTTTGTCTGAGAGAAACTCAGAAAAAGGAGGTGTCCCCTCGTTCTCTAATCGATTACCC
AATCATTCATTTACTCACCAGCTGAATTGAATCTGAAAAAAAACTGTGAGTTGTGTGATT
GATTGCGTCTTGTGGAAGAAGAGGGAAGTTAAGTAATGGCGAAAGCAGGAGGGATCACGA
ACGCAGTTAACGTAGGAATCGCTGTTCAAGCAGATTGGGAGAACCGTGAGTTCATCTCGC
ACATCTCTCTCAATGTTCGTCGTCTCTTCGAGTTCCTCGTCCAATTCGAATCGACGACAA
AGAGCAAATTGGCATCACTGAATGAGAAGTTGGATCTTCTGGAACGTCGCTTGGAGATGC
TCGAGGTACAAGTGAGTACCGCCACTGCTAATCCTTCTCTGTTTGCTACCTGAAACACAT
ATAGCCAGAGTCTGAGCCTTTGGCCTAATCAGAAGAAGGAGAACCATCTTTTCGTTTTTT
GAATGTGAACCGTTGAATCATTCTTTCTTTCTTCAATAGCTGTAGTAAACCATAAATATG
AATCCACGCATGAACTGTGTATCTTTGTCTATCCCAGTGTTGATGTAACTTGTAAGATGT
TTTGAATCCCAAATTATTTCACTATGTCACTTGGA
GTTC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2E767TF 605 0 0
GG
GAGAGAAACTCAGAAAAAGGAGGTGTCCCCTCGTTCTCTAATCGATTACCCAATCATTCA
TTTACTCACCAGCTGAATTGAATCTGAAAAAAAACTGTGAGTTGTGTGATTGATTGCGTC
TTGTGGAAGAAGAGGGAAGTTAAGTAATGGCGAAAGCAGGAGGGATCACGAACGCAGTTA
CCGTAGGAATCGCTGTTCAAGCAGATTGGGAGAACCGTGAGTTCATCTCGCACATCTCTC
TCAATGTTCGTCGTCTCTTCGAGTTCCTCGTCCAATTCGAATCGACGACAAAGAGCAAAT
TGGCATCACTGAATGAGAAGTTGGATCTTCTGGAACGTCGCTTGGAGATGCTCGAGGTAC
AAGTGAGTACCGCCACTGCTAATCCTTCTCTGTTTGCTACCTGAAACACATATAGCCAGA
GTCTGAGCCTTTGGCCTAATCAGAAGAAGGAGAACCATCTTTTCGTTTTTTGAATGTGAA
CCGTTGAATCATTCTTTCTTTCTTCAATAGCTGTAGTAAACCATAAATATGAATCCACGC
ATGAACTGTGTATCTTTGTCTATCCCAGTGTTGATGTAACTTGTAAGATGTTTTGAATCC
CAA

QA 3 605 3 605
DS 

RD RR2GE88JQ 635 0 0
TTTTTGTCT
GAGAGAAACTCAGAAAAAGGAGGTGTCCCCTCGTTCTCTAATCGATTACCCAATCATTCA
TTTACTCACCAGCTGAATTGAATCTGAAAAAAAACTGTGAGTTGTGTGATTGATTGCGTC
TTGTGGAAGAAGAGGGAAGTTAAGTAATGGCGAAAGCGGGAGGGATCACGAACGCAGTTA
ACGTAGGAATCGCTGTTCAAGCAGATTGGGAGAACCGTGAGTTCATCTCGCACATCTCTC
TCAATGTTCGTCGTCTCTTCGAGTTCCTCGTCCAATTCGAATCGACGACAAAGAGCAAAT
TGGCATCACTGAATGAGAAGTTGGATCTTTTGGAACGTCGCTTGGAGATGCTCGAGGTAC
AAGTGAGTACCGCCACTGCTAATCCTTCTCTGTTTGCTACCTGAAACACACATAGCCAGA
GTTTGAGCCTTTGGCCTAATCAGAAGAAGGAGAACCATCTTTTCGTTTTTTGAATGTGAA
CCGTTGAATCATTCTTTCTTTCTTCAATAGCTGTAGTAAACCATAAATATGAATCCACGC
ATGAACTGTGTATCTTTGTCTATCCCAGTGTTGATGTAACTTGTAAGATGTTTTGAATCC
CAAATTATTTCACTATGTCACTTGGA

QA 10 635 10 635
DS 

RD RR2GE88TF 642 0 0
TTTTTGTCT
GAGAGAAACTCAGAAAAAGGAGGTGTCCCCTCGTTCTCTAATCGATTACCCAATCATTCA
TTTACTCACCAGCTGAATTGAATCTGAAAAAAAACTGTGAGTTGTGTGATTGATTGCGTC
TTGTGGAAGAAGAGGGAAGTTAAGTAATGGCGAAAGCGGGAGGGATCACGAACGCAGTTA
ACGTAGGAATCGCTGTTCAAGCAGATTGGGAGAACCGTGAGTTCATCTCGCACATCTCTC
TCAATGTTCGTCGTCTCTTCGAGTTCCTCGTCCAATTCGAATCGACGACAAAGAGCAAAT
TGGCATCACTGAATGAGAAGTTGGATCTTCTGGAACGTCGCTTGGAGATGCTCGAGGTAC
AAGTGAGTACCGCCACTGCTAATCCTTCTCTGTTTGCTACCTGAAACACACATAGCCAGA
GTCTGAGCCTTTGGCCTAATCAGAAGAAGGAGAACCATCTTTTCGTTTTTTGAATGTGAA
CCGTTGAATCATTCTTTCTTTCTTCAATAGCTGTAGTAAACCATAAATATGAATCCACGC
ATGAACTGTGTATCTTTGTCTATCCCAGTGTTGATGTAACTTGTAAGATGTTTTGAATCC
CAAATTATTTCACTATGTCACTTGGAGTTCTTC

QA 10 642 10 642
DS 

RD RR2DV93JQ 382 0 0
TCGTCTCTTCGAGTTCCTCGTCCAATTCGAATCGACGACAAAGAGCAAATTGGCATCACT
GAATGAGAAGTTGGATCTTCTGGAACGTCGCTTGGAGATGCTCGAGGTACAAGTGAGTAC
CGCCACTGCTAATCCTTCTCTGTTTGCTACCTGAAACACATATAGCCAGAGTCTGAGCCT
TTGGCCTAATCAGAAGAAGGAGAACCATCTTTTCGTTTTTTGAATGTGAACCGTTGAATC
ATTCTTTCTTTCTTCAATAGCTGTAGTAAACCATAAATATGAATCCACGCATGAACTGTG
TATCTTTGTCTATCCCAGTGTTGATGTAACTTGTAAGATGTTTTGAATCCCAAATTATTT
CACTATGTCACTTGGA
GTTCTT

QA 1 376 1 376
DS 



AS 1 5

CO CL1727Contig1 1139 5 29 U
GGACGCCATCGTCACTCTCCTCTGCTCTGCTCTCTGATTCGTATACTGCACACAGCTTTT
CCCCGAAGAAACAATCATCATGGTTAAAGGTCCAGGACTCTACACTGAAATCGGCAAAAA
GGCCAGAGATCTTCTGTACAAGGACTACCAAGGAGACCAGAAACTCAGCATCACCACTTA
CTCTTCCACCGGTGTTGCAATCACTACCACTGGAACAAACAAGGGAGATTTGTTTGTGGG
TGATGTATCTACCCAAGTCAAGAACAAGAACTTCACTGCCGATATCAAAGTCGCCACTGA
CTCTTCTCTGCTGACCACTTTCACTTATGATGAGGCCACCCCTGGTTTGAAGGCAATCGT
CAGCGCCAAGGTGCCTGATCAGAAATCTGGAAAGGTTGAGCTCCAGTATCTGCACGACTA
TGCTGGTATCTGCACCAGTGTTGGTTTGACAGCTAGCCCCATTGTCAATTTCTCCGGTGT
GGTTGGAAACAACGTCTTGGCTCTTGGTACTGATGTTTCCTTCAACACCCAGTCCGGCGA
TTTCAAGCATTTCAATGCTGGTTTCAGTTTCACCAAGGACGATTTGATTGCTTCTCTTAC
TCTGAATGACAAGGGTGACAAACTGAATGCGTCGTACTACCACACCGTGAACCCGTCGAG
CAACACAGTGGTTGGAGCTGAGGTTACACACAGCTTCACTACCCAAAAGAACGCCATAAC
CGTTGGTGCTCAGCATACTCTTGACCCATTGACCACAGTGAAAGCACGTGTGAACAATGC
TGGTGTAGCCAACGCTCTGATCCAACACCAGTGGCGTCCAAAGTCGTTCATTACCGTTTC
TGGAGAGGTTGACTCTAGGGCGATCGAGAAGAGTGCCAAGGTTGGGTTTGCTCTCGCTCT
CAAGCCTTGAGAGAAGAATCAAGAATCCAAATGAGGCCCTTGAGGAGGGGGTAGCTTAGT
TTTTTCATCTCCTTGGTTTTCTAATCTTTTGGACTAATCTCTCTGCCTGATTTTGCTTTA
AAAATCTTTCATTTGTTTTTTTGGTTTTCCTTGAATCGGTGTTGGGATTTGTATCAAATA
AGAAGAAAAAAACTATTAAAAGGGTCGTCTTGAAGATCAACAATGCGAATCTCTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW31TFB U 393
AF RR2EE57TF U 1
AF RR2DC53TF U 124
AF RR2G064TF U 205
AF RR2EE57JQ C 468
BS 1 324 RR2EE57TF
BS 325 325 RR2DC53TF
BS 326 336 RR2EE57TF
BS 337 337 RR2DC53TF
BS 338 345 RR2EE57TF
BS 346 346 RR2DC53TF
BS 347 390 RR2EE57TF
BS 391 391 RR2DC53TF
BS 392 682 RR2EE57TF
BS 683 683 RR2DC53TF
BS 684 707 RR2EE57TF
BS 708 710 RR2DC53TF
BS 711 746 RR2EE57TF
BS 747 747 RR2DC53TF
BS 748 753 RR2EE57TF
BS 754 754 RR2DC53TF
BS 755 762 RR2EE57TF
BS 763 763 RR2DC53TF
BS 764 782 RR2EE57TF
BS 783 783 RR2DC53TF
BS 784 791 RR2EE57TF
BS 792 792 RR2DC53TF
BS 793 801 RR2EE57TF
BS 802 804 RR2DC53TF
BS 805 805 RR2G064TF
BS 806 834 RR2DC53TF
BS 835 835 RR2G064TF
BS 836 854 RR2DC53TF
BS 855 1139 RR2EE57JQ

RD RR2AW31TFB 127 0 0
AGG
TTGAGCTCCAGTATCTGCACGACTATGCTGGTATCTGCACCAGTGTTGGTTTGACAGCTA
GCCCCATTGTCAATTTCTCCGGTGTGGTTGGAAACAACGTCTTGGCTCTTGGTACTGACG
TTTC

QA 4 127 4 127
DS 

RD RR2EE57TF 801 0 0
GGACGCCATCGTCACTCTCCTCTGCTCTGCTCTCTGATTCGTATACTGCACACAGCTTTT
CCCCGAAGAAACAATCATCATGGTTAAAGGTCCAGGACTCTACACTGAAATCGGCAAAAA
GGCCAGAGATCTTCTGTACAAGGACTACCAAGGAGACCAGAAACTCAGCATCACCACTTA
CTCTTCCACCGGTGTTGCAATCACTACCACTGGAACAAACAAGGGAGATTTGTTTGTGGG
TGATGTATCTACCCAAGTCAAGAACAAGAACTTCACTGCCGATATCAAAGTCGCCACTGA
CTCTTCTCTGCTGACCACTTTCACCTATGATGAGGCTACCCCTGGATTGAAGGCAATCGT
CAGCGCCAAGGTGCCTGATCAGAAATCTGGCAAGGTTGAGCTCCAGTATCTGCACGACTA
TGCTGGTATCTGCACCAGTGTTGGTTTGACAGCTAGCCCCATTGTCAATTTCTCCGGTGT
GGTTGGAAACAACGTCTTGGCTCTTGGTACTGATGTTTCCTTCAACACCCAGTCCGGCGA
TTTCAAGCATTTCAATGCTGGTTTCAGTTTCACCAAGGACGATTTGATTGCTTCTCTTAC
TCTGAATGACAAGGGTGACAAACTGAATGCGTCGTACTACCACACCGTGAACCCGTCGAG
CAACACAGTGGTTGGAGCTGAG*TTACACACAGCTTCACTACCCAAA**GACGCCATAAC
CGTTGGTGCTCAGCATACTCTTGACC*ATTGAC*ACAGTGAA*GCACGTGTGAACAATGC
TG*TGTAGCCA*CGCTCTGAT

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2DC53TF 731 0 0
G
AGAGATCTTCTGTACAAGGACTACCAAGGAGACCAGAAACTCAGCATCACCACTTTCTCT
TCCACCGGTGTTGCAATCACTACCACTGGAACAAACAAGGGAGATTTGTTTGTGGGTGAT
GTATCTACCCAAGTCAAGAACAAGAACTTCACTGCCGATATCAAAGTCGCCACTGACTCT
TCTCTGCTGACCACTTTCACTTATGATGAGGCCACCCCTGGTTTGAAGGCAATCGTCAGC
GCCAAGGTGCCTGGTCAGAAATCTGGAAAGTTTGAGCTCCAGTATCTGCACGACTATGCT
GGTATCTGCACCAGTGTTGGTTTGACAGCTAGCCCCATTGTCAATTTCTCCGGTGTGGTT
GGAAACAACGTCTTGGCTCTTGGTACTGATGTTTCCTTCAACACCCAGTCCGGCGATCTC
AAGCATTTCAATGCTGGTTTCAGTTTCACCAAGGACGATTTGATTGCTTCTCTTACTCTG
AATGACAAGGGTGACAAACTGAATGCGTCGTACTACCACACCGTGAACCCGTCGAGCAAC
ACAGTGGTTGGAGCTGAGGTTACACACAGCTTCACTACCCAAAAGAACGCCATAACCGTT
GGTGCTCAGCATGCTCTTGACCCATTGACCACAGTGAAAGCACGTGTGAACAATGCTGGT
GTAGCCAACGCTCTGATCCA*CACCAGTGGCGTCCAAAGTCGTTCATTAC*GTTTCTGGA
GAGGTTGACT

QA 2 731 2 731
DS 

RD RR2G064TF 640 0 0
G
ACCACTGGAACAAACAAGGGAGATTTGTTTGTGGGTGATGTATCTACCCAAGTCAAGAAC
AAGAACTTCACTGCCGATATCAAAGTCGCCACCGACTCTTCTCTGCTGACCACTTTCACT
TATGATGAGGCCACCCCTGGTTTGAGGGCAATCGTCAGCGCCAAGGTGCCTGATCAGAAA
TCTGGAAAGGTTGAGCTCCAGTATCTGCACGACTATGCTGGTATCTGCACCAGTGTTGGT
TTGACAGCTAGCCCCATTGTCAATTTCTCCGGTGTGGTTGGAAACAACGTCTTGGCTCTT
GGTACTGATGTTTCCTTCAACACCCAGTCCGGCGATTTCAAGCATTTCAATGCTGGTTTC
AGTTTCACCAAGGACGATTTGATTGCTTCTCTTACTCTGAATGACAAGGGTGACAAACTG
AATGCGTCGTACTACCACACCGTGAACCCGTCGAGCAACACAGTGGTTGGAGCTGAGGTT
ACACACAGCTTCACTACCCAAAAGAACGCCATAACCGTTGGTGCTCAGCATGCTCTTGAC
CCATTGACCACAGTGAATGCACGTGTGAACAATGCTGGTGTAGCCAACGCTCTGATCCAA
CACCAGTGGCGTCCAAAGTCGTCCATTACCGTTTCTGGA

QA 2 640 2 640
DS 

RD RR2EE57JQ 672 0 0
ATTTCTCCGGTGTGGTTGGAAACAACGTCTTGGCTCTTGGTACTGATGTTTCCTTCAACA
CCCAGTCCGGCGATTTCAAGCATTTCAATGCTGGTTTCAGTTTCACCAAGGACGATTTGA
TTGCTTCTCTTACTCTGAATGACAAGGGTGACAAACTGAATGCGTCGTACTACCACACCG
TGAACCCGTCGAGCAACACAGTGGTTGGAGCTGAGGTTACACACAGCTTCACTACCCAAA
AGAACGCCATAACCGTTGGTGCTCAGCATACTCTTGACCCATTGACCACAGTGAAGGCAC
GTGTGAACAATGCTGGTGTAGCCAACGCTCTGATCCAACACCAGTGGCGTCCAAAGTCGT
TCATTACCGTTTCTGGAGAGGTTGACTCTAGGGCGATCGAGAAGAGTGCCAAGGTTGGGT
TTGCTCTCGCTCTCAAGCCTTGAGAGAAGAATCAAGAATCCAAATGAGGCCCTTGAGGAG
GGGGTAGCTTAGTTTTTTCATCTCCTTGGTTTTCTAATCTTTTGGACTAATCTCTCTGCC
TGATTTTGCTTTAAAAATCTTTCATTTGTTTTTTTGGTTTTCCTTGAATCGGTGTTGGGA
TTTGTATCAAATAAGAAGAAAAAAACTATTAAAAGGGTCGTCTTGAAGATCAACAATGCG
AATCTCTTTCCC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 4

CO CL1728Contig1 948 4 6 U
GGCTCTTCCTCTGCCTCTGGACCTGACCATCTTCCTCCAAACACGATTCGATTAGCTTCT
TCTCGATCTCTGCCTTGTTTTTTTCTCTGTGCATTCCCTGATGTTTGTTTCGAGAATTCT
GTCGCGAGTTTCCCGCAGCGCGGGCTTACGCTCCTCTCTCTCCGCCGCCGCTCTTCCGGC
GAGGAACCGGACTCCTATATTCTCGAGCCGGTATCACAAATGAAAGATAAGGTTCTACGC
ACTTACGCAGAGATGGAGAATGTTATGGACAGAACAAGACGTGATGCTGAAAACACCAAG
AAGTATGCCATACAGAATTTTGCAAAGAGCCTTTTGGATGTGGCGGATAATCTTGGAAGA
GCTTCTTCGGTTGTCAAGGAAAGCTTCTCAAAGCTTGACACTACTGAAGATTCAGCTGGA
GCTACTCCACTCTTAAAGACCCTTTTAGAAGGTGTGGAGATGACTGAGAAACAGCTTGCT
GAGGTGTTTAAGAAAATTTGGTATGGAGAAGTACGATCC*TATCAACGAGCC*GTTTGAT
TCAAACAGACATAACGCAGTGTTTCAAGTCCCTGATGCCTCTAAGCCAGAAGGCACAGTT
GCTCATGTCCTGAAGTCTGGTTACACGTTGTTTGATCGAGTTATAAGACCGGCTGAGGTT
GGTGTTACTCAAGGAGGAGAGGCTGAAGAAGACAAGAAAGAGTTTGATGCTTAACAAGGA
GTCAGCTGGTTTTCATAAGTTTTTGCTACTGTTTTTTGTTTCGACCAACTCAATTAACAG
AAGTCATAGTTTTTTTCTTATCGTTTGGTTATTCATTGGATGAACATGATTTTCCCATAA
GTTGCTGGACATGGCAGCTTGCCTTTGTATTTGTTGCAGTACTTTTACACACACACACTT
TTTACCACGTTTTTTTTGAAAAATTAATCAGATACAAAAAAAAGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2H060TF U 108
AF RR2GY12TF U 1
AF RR2H060JQ C 499
AF RR2GY12JQ C 613
BS 1 495 RR2GY12TF
BS 496 496 RR2H060TF
BS 497 670 RR2GY12TF
BS 671 796 RR2H060JQ
BS 797 797 RR2GY12JQ
BS 798 948 RR2H060JQ

RD RR2H060TF 469 0 0
TTTCGAGAATTCTGTCGCGAGTTTCCCGCAGCGCGGGCTTACGCTCCTCTCTCTCCGCCG
C*GCTCTTCCGGCGAGGAACCGGACTCCTATATTCTCGAGCCGGTATCACAAATGAAAGA
TAAGGTTCTACGCACTTACGCAGAGATGGAGAATGTTATGGACAGAACAAGACGTGATGC
TGAAAACACCAAGAAGTATGCCATACAGAATTTTGCAAAGAGCCTTTTGGATGTGGCGGA
TAATCTTGGAAGAGCTTCTTCGGTTGTCAAGGAAAGCTTCTCAAAGCTTGACACTACTGA
AGATTCAGCTGGAGCTACTCCACTCTTAAAGACCCTTTTAGAAGGTGTGGAGATGACTGA
GAAACAGCTTGCTGAGGTGTTTAAGAAAATTTGGTATGGAGAAGTACGATCCCTATCAAC
GAGCCCGTTTGATTCAAACAGACATAACGCAGTGTTTCAAGTCCC
CTGA

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2GY12TF 670 0 0
GGCTCTTCCTCTGCCTCTGGACCTGACCATCTTCCTCCAAACACGATTCGATTAGCTTCT
TCTCGATCTCTGCCTTGTTTTTTTCTCTGTGCATTCCCTGATGTTTGTTTCGAGAATTCT
GTCGCGAGTTTCCCGCAGCGCGGGCTTACGCTCCTCTCTCTCCGCCGCCGCTCTTCCGGC
GAGGAACCGGACTCCTATATTCTCGAGCCGGTATCACAAATGAAAGATAAGGTTCTACGC
ACTTACGCAGAGATGGAGAATGTTATGGACAGAACAAGACGTGATGCTGAAAACACCAAG
AAGTATGCCATACAGAATTTTGCAAAGAGCCTTTTGGATGTGGCGGATAATCTTGGAAGA
GCTTCTTCGGTTGTCAAGGAAAGCTTCTCAAAGCTTGACACTACTGAAGATTCAGCTGGA
GCTACTCCACTCTTAAAGACCCTTTTAGAAGGTGTGGAGATGACTGAGAAACAGCTTGCT
GAGGTGTTTAAGAAA*TTTGGTATGGAGAAGTACGATCC*TATCAACGAGCC*GTTTGAT
TCAAACAGACATAACGCAGTGTTTCAAGTCCCTGATGCCTCTAAGCCAGAAGGCACAGTT
GCTCATGTCCTGAAGTCTGGTTACACGTTGTTTGATCGAGTTATAAGACCGGCTGAGGTT
GGTGTTACTC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2H060JQ 450 0 0
TGGTATGGAGAAGTACGATCC*TATCAACGAGCC*GTTTGATTCAAACAGACATAACGCA
GTGTTTCAAGTCCCTGATGCCTTTAAGCCAGAAGGCACAGTTGCTCATGTCCTGAAGTCT
GGTTACACGTTGTTTGATCGAGTTATAAGACCGGCTGAGGTTGGTGTTACTCAAGGAGGA
GAGGCTGAAGAAGACAAGAAAGAGTTTGATGCTTAACAAGGAGTCAGCTGGTTTTCATAA
GTTTTTGCTACTGTTTTTTGTTTCGACCAACTCAATTAACAGAAGTCATAGTTTTTTTTT
TATCGTTTGGTTATTCATTGGATGAACATGATTTTCCCATAAGTTGCTGGACATGGCAGC
TTGCCTTTGTATTTGTTGCAGTACTTTTACACACACACACTTTTTACCACGTTTTTTTTG
AAAAATTAATCAGATACAAAAAAAAGGTTT

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR2GY12JQ 336 0 0
AAGTTTGGTTACACGTTGTTTGATCGAGTTATAAGACCGGCTGAGGTTGGTGTTACTCAA
GGAGGAGAGGCTGAAGAAGACAAGAAAGAGTTTGATGCTTAACAAGGAGTCAGCTGGTTT
TCATAAGTTTTTGCTACTGTTTTTTGTTTCGACCAACTCAATTAACAGAAGTCATAGTTT
TTTTCTTATCGTTTGGTTATTCATTGGATGAACATGATTTTCCCATAAGTTGCTGGACAT
GGCAGCTTGCCTTTGTATTTGTTGCAGTACTTTTACACACACACACTTTTTACCACGTTT
TTTTTGATAAATTAATCAGATACAAAAAAAAGGTTT

QA 1 336 1 336
DS 



AS 1 4

CO CL1729Contig1 1482 4 13 U
GACCATTAGGCGAAACACGCTTTTGCCCATCACGGTATCAAGGTGGCTTCAGTTGAGATT
GATCTTCCTGCTATGTTGGCTCAGAAAGACAATGCGGTCAAGGGCCTCACTCGTGGCATT
GAGGGTTTGTTCAAGAAGAACAAGGTTACCTATGTCAAGGGGTATGGTAAGTTTCTTTCC
CCTAATGAAGTCTCTGTTGAGACTATCGATGGAGGAAACACCGTTGTCAAAGGCAAGCAC
ATCATTGTTGCTACCGGCTCTGACGTCAAGTCTTTGCCCGGTATTACAATCGATGAGAAG
AAGGTTGTTTCGTCGACTGGAGCTTTGTCTTTGTCTGAAGTCCCTAAGAAACTGATTGTG
ATTGGTGCTGGATATATTGGGCTGGAGATGGGTTCTGTTTGGGGAAGGCTTGGATCAGAG
GTCACGGTGGTTGAGTTTGCTGCTGATATCGTTCCTTCTATGGATGGTGAGATCCGTAAG
CAGTTTCAGCGTTCTCTTGAGAAGCAAAAGATGAAGTTCATGCTCAAGACTAAAGTTGTA
TCCGTGGATGCCTCTGGAGATGGTGTGAAGCTCACGGTGGAGCCAGCTGATGGTGGAGAG
CAGACCACACTCGAAGCCGATGTTGTCCTTGTCTCAGCGGGGAGAACACCCTTCACTTCT
GGACTTGATCTTGAGAAAATCGGAGTGGAAACTGACAAAGGTGGGAGAATTCTGGTGAAC
GAGAGGTTCTCGACCAATGTCTCGGGAGTGTATGCGATTGGAGATGTAATTCCAGGACCA
ATGCTTGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGGTGTTGCTTGTGTGGAGTTCATAGCAGGCAAA
CACGGCCATGTGGATTACGACAAGGTTCCTGGTGTTTGCTACACGCATCCAGAGGTTGCT
TCCGTCGGTAAAACCGAAGAACAGTTGAAGAAAGACGGTGTGAGCTATCGTGTTGGTAAG
TTCCCGTTTATGGCCAATAGTAGAGCTAAGGCCATAGATAATGCTGAAGGATTGGTTAAG
ATTTTGGCTGATAAGGAGACGGATAAGATCTTGGGCGTTCACATTATGTCTCCAAACGCT
GGAGAGCTGATCCATGAGGCGGTTCTTGCGATAAACTATGACGCATCAAGTGAAGATATT
GCTCGAGTCTGCCACGCTCATCCCACTATGAGTGAGGCTCTCAAGGAAGCTGCCATGGCC
ACCTATGACAAGCCGATTCACATCTAAATGCAAGCAGGAGGGACCGTAAAGGAGAGAGCC
AGCCACCGATGCAAAGACTATTCTATATCTTAACCTGGGTTGGATTTGGTTCGGTTTTCT
GTGGTTTATCCTTCACTTTTATCCTTTCATTTTCTGGTGGATTTTATTCTTTAGTTTTCT
TTACAAATGTTCAGATTCGGGCTTAGGCCTGATCCGTAATAATACTTCTACATTCACTCT
ACTCATTTTGGTTTATCGAGTAAACCAAGTTCGGTTCGAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU10TF U 1
AF RR2F843TF U 425
AF RR2GA07TF U 378
AF RR2BU10JQ C 776
BS 1 455 RR2BU10TF
BS 456 456 RR2GA07TF
BS 457 458 RR2BU10TF
BS 459 459 RR2GA07TF
BS 460 690 RR2BU10TF
BS 691 691 RR2GA07TF
BS 692 700 RR2BU10TF
BS 701 730 RR2GA07TF
BS 731 731 RR2F843TF
BS 732 767 RR2GA07TF
BS 768 768 RR2F843TF
BS 769 1035 RR2GA07TF
BS 1036 1482 RR2BU10JQ

RD RR2BU10TF 705 0 0
GACCATTAGGCGAAACACGCTTTTGCCCATCACGGTATCAAGGTGGCTTCAGTTGAGATT
GATCTTCCTGCTATGTTGGCTCAGAAAGACAATGCGGTCAAGGGCCTCACTCGTGGCATT
GAGGGTTTGTTCAAGAAGAACAAGGTTACCTATGTCAAGGGGTATGGTAAGTTTCTTTCC
CCTAATGAAGTCTCTGTTGAGACTATCGATGGAGGAAACACCGTTGTCAAAGGCAAGCAC
ATCATTGTTGCTACCGGCTCTGACGTCAAGTCTTTGCCCGGTATTACAATCGATGAGAAG
AAGGTTGTTTCGTCGACTGGAGCTTTGTCTTTGTCTGAAGTCCCTAAGAAACTGATTGTG
ATTGGTGCTGGATATATTGGGCTGGAGATGGGTTCTGTTTGGGGAAGGCTTGGATCAGAG
GTCACGGTGGTTGAGTTTGCTGCTGATATCGTTCCATCCATGGATGGTGAGATCCGTAAG
CAGTTTCAGCGTTCTCTTGAGAAGCAAAAGATGAAGTTCATGCTCAAGACTAAAGTTGTA
TCCGTGGATGCCTCTGGAGATGGTGTGAAGCTCACGGTGGAGCCAGCTGATGGTGGAGAG
CAGACCACACTCGAAGCCGATGTTGTCCTTGTCTCAGCGGGGAGAACACCCTTCACTTCT
GGACTTGATCTTGAGAAAATCGGAGTGGAAGCTGACAAAG
TGGGA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2F843TF 504 0 0
G
GGTGGTTGAGTTTGCTTCGGATATCGTTCCTTCTATGGATGGTGAAATCCGTAAGCAGTT
TCAGCGTTCT*TTGAGAAGCAAAAGATGAAGTTCATGCTCAAGACTAAAGTTGTATCTGT
GGATGCCTCTGGAGACGGTGTGAAGCTCACAGTGGAGCCAGCTGAAGGTGGAGACCAGAC
CACACTCGAAGCCGATGTTGTCCTTGTCTCAGCGGGGAGAACACCCTTCACTTCTGGACT
TGATCTTGAAAAAATCGGAGTGGAAACTGACAAAGGTGGGAGAATTCTGGTGAACGAGAG
GTTCTCGACCAATGTCTCGGGAGTGTATGCGATTGGAGATGTAATTCCAGGACCAATGCT
TGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGGTGTTGCTTGTGTGGAGTTCATAGCAGGCAAACACGG
CCATGTGGATTACGACAAGGTTCCTGGTGTTTGCTACACGCATCCAGAGGTTGCTTCGGT
CGGTAAAACCGAAGAACAGTTGA

QA 2 504 2 504
DS 

RD RR2GA07TF 661 0 0
G
GGGCTGGAGATGGGTTCTGTTTGGGGAAGGCTTGGATCAGAGGTCACGGTGGTTGAGTTT
GCTGCTGATATCGTTCCTTCTATGGATGGTGAGATCCGTAAGCAGTTTCAGCGTTCTCTT
GAGAAGCAAAAGATGAAGTTCATGCTCAAGACTAAAGTTGTATCCGTGGATGCCTCTGGA
GATGGTGTGAAGCTCACGGTGGAGCCAGCTGATGGTGGAGAGCAGACCACACTCGAAGCC
GATGTTGTCCTTGTCTCAGCGGGGAGAACACCCTTCACTTCTGGACTTGATCTTGAGAAA
ATCGGAGTGGAAACTGACAAAGGTGGGAGAATTCTGGTGAACGAGAGGTTCTTGACCAAT
GTCTCGGGAGTGTATGCGATTGGAGATGTGATTCCAGGACCAATGCTTGCTCACAAAGCT
GAAGAAGACGGTGTTGCTTGTGTGGAGTTCATAGCAGGCAAACACGGCCATGTGGATTAC
GACAAGGTTCCTGGTGTTTGCTACACGCATCCAGAGGTTGCTTCCGTCGGTAAAACCGAA
GAACAGTTGAAGAAAGACGGTGTGAGCTATCGTGTTGGTAAGTTCCCGTTTATGGCCAAT
AGTAGAGCTAAGGCCATAGATAATGCTGAAGGATTGGTTAAGATTTTGGCTGATAAG
AGA

QA 2 658 2 658
DS 

RD RR2BU10JQ 707 0 0
GACCAATGCTTGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGGTGTTGCTTGTGTGGAGTTCATAGCAG
GCAAACACGGCCATGTGGATTACGACAAGGTTCCTGGTGTTTGCTACACGCATCCAGAGG
TTGCTTCCGTCGGTAAAACCGAAGAACAGTTGAAGAAAGACGGTGTGAGTTATCGTTTTG
GTAAGTTCCCGTTTATGGCCAATAGTAGAGCTAAGGCCATAGATAATGCTGAAGGATTGG
TTAAGATTTTGGCTGATAAGGAGACGGATAAGATCTTGGGCGTTCACATTATGTCTCCAA
ACGCTGGAGAGCTGATCCATGAGGCGGTTCTTGCGATAAACTATGACGCATCAAGTGAAG
ATATTGCTCGAGTCTGCCACGCTCATCCCACTATGAGTGAGGCTCTCAAGGAAGCTGCCA
TGGCCACCTATGACAAGCCGATTCACATCTAAATGCAAGCAGGAGGGACCGTAAAGGAGA
GAGCCAGCCACCGATGCAAAGACTATTCTATATCTTAACCTGGGTTGGATTTGGTTCGGT
TTTCTGTGGTTTATCCTTCACTTTTATCCTTTCATTTTCTGGTGGATTTTATTCTTTAGT
TTTCTTTACAAATGTTCAGATTCGGGCTTAGGCCTGATCCGTAATAATACTTCTACATTC
ACTCTACTCATTTTGGTTTATCGAGTAAACCAAGTTCGGTTCGAGTT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 4

CO CL1730Contig1 815 4 11 U
GGGCATCAGATAAACGGCTCAAAAAGCAAAAAAAGAAAGAAAAAAAAAAGTTCTGTGGGA
AGATGCAGCCGACAGAGGCGACAAGGCCGGCGACGGCGGAACAGAGCCGGAGACTAAAGG
ATGAGCTATCGGAGAGCATGAGCTTCAGCAGCCAAATGAAGAAGGAAGACGAGGAGCTGT
CGGTGAAAGCTCTGTCGGCGTTCAAGGCGAAAGAAGATGAGATCGAGAAGAAGAAGATGG
AGATCAGAGAACGAGTTTTAGCTCAGCTCGGCCGTGTTGAAGACGAGACCAAGCGTCTCG
CTTTGATCCGCGAGGAACTTGAAGGATTTGCTGATCCCATGAGGAAGGAAGTCACTTTGA
TCCGGAAGAAGATTGATTCTCTCGATAAAGAGATTAAACCATTGGGGAATACTGTTCAGA
AAAAGGAAGTAGAGTACAAGGATGCACTTGAAGCATTTAATGAAAAGAACAAGGAGAAGG
TGGAGCTGATCACCAAGCTACAGGAGTTGGAGGGAGAGAGCGAAAAAATGAGATTAAAGA
AGCTGGAAGAGCTAAGCAAGAACATTGATCTAACCAAAGGTTAGTGTTGGACGAGCAGAC
TCACTTGGATTGGGCTAATATTATATGTGGTAAATCATGATTAGAGTATTTTCATTGTTC
TTTCTATCATTCTAGTCGTATATCATTTCAATATATAAAATAAAAAGTAATAGTGAATGG
TTTTGAACTCGAGTGTTTCAGAAAAA*GCATGTAACCAGTTTACAATGTCAAGACGTTAT
CGATGTGATTCCCAAATTTGTATTATAATAAATGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2GB85TF U 1
AF RR2DG61TF U 1
AF RR2EW49TF U 1
AF RR2DG61JQ C 269
BS 1 705 RR2DG61TF
BS 706 706 RR2EW49TF
BS 707 761 RR2DG61TF
BS 762 762 RR2EW49TF
BS 763 765 RR2DG61TF
BS 766 766 RR2EW49TF
BS 767 771 RR2DG61TF
BS 772 772 RR2EW49TF
BS 773 789 RR2DG61TF
BS 790 811 RR2EW49TF
BS 812 815 RR2DG61JQ

RD RR2GB85TF 498 0 0
GGGCATCAGATAAACGGCTCAAAAAGCAAAAAAGGAAA*****AAAAAAGTA*TCTGGGA
AGATGCAGCCGACAGAGGCGACAAGGCCGGCGACGGCGGAACAGAGCCGGCGACTAAAGG
ATGAGCTATCGGAGAGCAT*AGCTTCAGCAGCCAAATGAAGAAGGAAGACGAGGAGCTGT
CGGTGAAAGCTCTGTCGGCGTTCAAGGCGAAAGAAGATGAGATCGAGAAGAAGAAGATGG
AGATCAGAGAACGAGTTTTAGCTCAGCTCGGCCGTGTTGAAGACGAGACCAAGCGTCTCG
CTTTGATCCGCGAGGAACTTGAAGGATTTGCTGATCCCATGAGGAAGGAAGTCACTTTGA
TCCGGAAGAAGATTGATTCTCTCGATAAAGAGATTAAACCATTGGGGAATACTGTTCAGA
AAAAGGAAGTAGAGTACAAGGATGCACTTGAAGCATTTAACGAAAAGAACAAGGAGAAGG
TGGAGCTGATCACCAAGC

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2DG61TF 789 0 0
GGGCATCAGATAAACGGCTCAAAAAGCAAAAAAAGAAAGAAAAAAAAAAGTTCTGTGGGA
AGATGCAGCCGACAGAGGCGACAAGGCCGGCGACGGCGGAACAGAGCCGGAGACTAAAGG
ATGAGCTATCGGAGAGCATGAGCTTCAGCAGCCAAATGAAGAAGGAAGACGAGGAGCTGT
CGGTGAAAGCTCTGTCGGCGTTCAAGGCGAAAGAAGATGAGATCGAGAAGAAGAAGATGG
AGATCAGAGAACGAGTTTTAGCTCAGCTCGGCCGTGTTGAAGACGAGACCAAGCGTCTCG
CTTTGATCCGCGAGGAACTTGAAGGATTTGCTGATCCCATGAGGAAGGAAGTCACTTTGA
TCCGGAAGAAGATTGATTCTCTCGATAAAGAGATTAAACCATTGGGGAATACTGTTCAGA
AAAAGGAAGTAGAGTACAAGGATGCACTTGAAGCATTTAATGAAAAGAACAAGGAGAAGG
TGGAGCTGATCACCAAGCTACAGGAGTTGGAGGGAGAGAGCGAAAAAATGAGATTAAAGA
AGCTGGAAGAGCTAAGCAAGAACATTGATCTAACCAAAGGTTAGTGTTGGACGAGCAGAC
TCACTTGGATTGGGCTAATATTATATGTGGTAAATCATGATTAGAGTATTTTCATTGTTC
TTTCTATCATTCTAGTCGTATATCATTTCAATATATAAAATAAAA*GTAATAGTGAATGG
TTTTGAACTCGAGTGTTTCAGAAAAA*GCATGTAACCAGTT*ACA*TGTCA*GACGTTAT
CGATGTGAT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2EW49TF 811 0 0
GGGCATCAGATAAACGGCTCAAAAAGCAAAAAAAGAAAGAAAAAAAAAAGTTCTGTGGGA
AGATGCAGCCGACAGAGGCGACAAGGCCGGCGACGGCGGAACAGAGCCGGAGACTAAAGG
ATGAGCTATCGGAGAGCATGAGCTTCAGCAGCCAAATGAAGAAGGAAGACGAGGAGCTGT
CGGTGAAAGCTCTGTCGGCGTTCAAGGCGAAAGAAGATGAGATCGAGAAGAAGAAGATGG
AGATCAGAGAACGAGTTTTAGCTCAGCTCGGCCGTGTTGAAGACGAGACCAAGCGTCTCG
CTTTGATCCGCGAGGAACTTGAAGGATTTGCTGATCCCATGAGGAAGGAAGTCACTTTGA
TCCGGAAGAAGATTGATTCTCTCGATAAAGAGATTAAACCATTGGGGAATACTGTTCAGA
AAAAGGAAGTAGAGTACAAGGATGCACTTGAAGCATTTAATGAAAAGAACAAGGAGAAGG
TGGAGCTGATCACCAAGCTACAGGAGTTGGAGGGAGAGAGCGAAAAAATGAGATTAAAGA
AGCTGGAGGAGCTAAGCAAGAACATTGATCTAACCAAAGGTTAGTGTTGGACGAGCAGAC
TCACTTGGATTGGGCTAATATTATATGTGGTAAATCATGGTTAGAGTATTTTCATTGTTC
TTTCTATCATTCTAGTCGTATATCATTTCAATATATAAAATAAAAAGTAATAGTGAATGG
TTTTGAACTCGAGTGTTTCAGAAAAA*GCATGTAACCAGTTTACAATGTCAAGACGTTAT
CGATGTGATTCCCAAATTTGTATTATAATAA

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2DG61JQ 547 0 0
CGGCCGTGTTGAAGACGAGACCAAGCGTCTCGCTTTGATCCGCGAGGAACTTGAAGGATT
TGCTGATCCCATGAGGAAGGAAGTCACTTTGATCCGGAAGAAGATTGATTCTCTCGATAA
AGAGATTAAACCATTGGGGAATACTGTTCAGAAAAAGGAAGTAGAGTACAAGGATGCACT
TGAAGCATTTAATGAAAAGAACAAGGAGAAGGTGGAGCTGATCACCAAGCTACAGGAGTT
GGAGGGAGAGAGCGAAAAAATGAGATTAAAGAAGCTGGAAGAGCTAAGCAAGAACATTGA
TCTAACCAAAGGTTAGTGTTGGACGAGCAGACTCACTTGGATTGGGCTAATATTATATGT
GGTAAATCATGATTAGAGTATTTTCATTGTTCTTTCTATCATTCTAGTCGTATATCATTT
CAATATATAAAATAAAAAGTAATAGTGAATGGTTTTGAACTCGAGTGTTTCAGAAAAAAG
CATGTAACCAGTTTACAATGTCAAGACGTTATCGATGTGATTCCCAAATTTGTATTATAA
TAAATGT

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 5

CO CL1731Contig1 497 5 8 U
GGGTTCTTTACACACAACAAATTTTCTGTAAAAAAACATAATCAATTCATTCATATTACT
AAAGATGAAAAAATCACTTATATTTTCATTTAATGTTTTAACTCTCCTCATCATTCTTGT
ACTAGTGGCTGGAACGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAGGAGACATGTCCCATATA
TTTAGATAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAACAACAAGGCAGCTTGCCTAACTGCATGCAA
GACGAAGACAAAAGGGTTAGGCATGCAACAAGTAACCACTGGGTGCGTTTCAGGAAACAA
ATGCGCATGCTATGTCCCATGTCCAAAATGATCTTAATGTCTAGTTTATTGACAA*CCAA
ATTCATATATACTTATAATAAATTATGATATGATTCATAGTAATAATTAAATAATTTTTG
AAATTATGTTATTGTCAAATTATGATAACAATAAAATATGATCATTTGAAGATGTAATAA
ATGACAAAATAAGTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B481TF U 3
AF RR2DS65TF U 1
AF RR2EF29TF U 8
AF RR2H054JQ C 8
AF RR2H054TF U 340
BS 1 161 RR2DS65TF
BS 162 162 RR2B481TF
BS 163 417 RR2DS65TF
BS 418 418 RR2EF29TF
BS 419 468 RR2DS65TF
BS 469 469 RR2H054TF
BS 470 471 RR2EF29TF
BS 472 497 RR2H054TF

RD RR2B481TF 235 0 0
GTTCTTT
ACACACAGCAAATTTTCTGTAAAAAAACATAATCAATTCATTCATATTACTAAAGATGAA
AAAATCACTTATATTTTCATTTAATGTTTTAACTCTCCTCATCATTCTTGTACTAATGGC
TGGAACGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAGGAGACATGTCCCATATATTTAGATAA
CCAACAGCCTGGAAATTGTAACAACAAGGCAGCTTGCCTAACTGCATG

QA 8 235 8 235
DS 

RD RR2DS65TF 471 0 0
GGGTTCTTTACACACAACAAATTTTCTGTAAAAAAACATAATCAATTCATTCATATTACT
AAAGATGAAAAAATCACTTATATTTTCATTTAATGTTTTAACTCTCCTCATCATTCTTGT
ACTAGTGGCTGGAACGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAGGGAGACATGTCCCATATA
TTTAGATAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAACAACAAGGCAGCTTGCCTAACTGCATGCAA
GACGAAGACAAAAGGGTTAGGCATGCAACAAGTAACCACTGGGTGCGTTTCAGGAAACAA
ATGCGCATGCTATGTCCCATGTCCAAAATGATCTTAATGTCTAGTTTATTGACAA*CCAA
ATTCATATATACTTATAATAAATTATGATATGATTCATAGTAATAATTAAATAATTTGTG
AAATTATGTTATTGTCAAATTATGATAACAATAAAATATGATCATTTG
GAG

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR2EF29TF 468 0 0
GG
ACACACAACAAATTTTCTGTAAAAAAACATAATCAATTCATTCATATTACTAAAGATGAA
AAAATCACTTATATTTTCATTTAATGTTTTAACTCTCCTCATCATTCTTGTACTAGTGGC
TGGAACGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAGGAGACATGTCCCTTATATTTAGATAA
CCAACAGCCTGGAAGTTGTAACAACAAGGCAGCTTGCCTAACTGCATGCAAGACGAAGAC
AAAAGGGTTAGGCATGCAACAAGTAACCACTGGGTGCGTTTCAGGAAACAAATGTGCATG
CTATGTCCCATGTCCAAAATGATCTTAATGTCTAGTTTATTGACAAACCAAATTCATATA
TACTTATAATAAATTATGATATGATTCATAGTAATAATTAAATAATTTTTGAAATTATGT
TATTGTCAAATTATGATAACAATAAAATATGATCATTTGGAG
ATGT

QA 3 464 3 464
DS 

RD RR2H054JQ 490 0 0
GG
ACACACAACAAATTTTCTGTAAAAAAACATAATCAATTCATTCATATTACTAAAGATGAA
AAAATCATTTATATTTTCATTTAATGTTTTAACTCTCCTCATCATTCTTGTACTAGTGGC
TGGAACGATGGGGCAAGGAAATAAAAATAAAAAGGAGACATGTCCCATATATTTAGATAA
CCAACAGCCTGGAAGTTGTAACAACAAGGCAGCTTGCCTAACTGCATGCAAGACGAAGAC
AAAAGGGTTAGGCATGCAACAAGTAACCACTGGGTGCGTTTCAGGAAACAAATGCGCATG
CTATGTCCCATGTCCAAAATGATCTTAATGTCTAGTTTATTGACAA*CCAAATTCATATA
TACTTATAATAAATTATGATATGATTCATAGTAATAATTAAATAATTTTTGAAATTATGT
TATTGTCAAATTATGATAACAATAAAATATGATCATTTGAAGATGTAATAAATGACAAAA
TAAGTTGG

QA 3 490 3 490
DS 

RD RR2H054TF 158 0 0
TCTAGTTTATTGACAA*CCAAATTCATATATACTTATAATAAATTATGATATGATTCATA
GTAATAATTAAATAATTTTTGAAATTATGTTATTGTCAAATTATGATAACAATAAAATAT
GATCATTTGAAGATGTAATAAATGACAAAATAAGTTGG

QA 1 158 1 158
DS 



AS 1 4

CO CL1732Contig1 844 4 5 U
GGCCGCCCTCACCAAACCAAACCTCTCTTTCTCTCTCTCTCCACTCTTTCTCTCTCTAGG
GCGAGACGAAATGATGAAGGCTTCAGTCAAAGGCAAGTACGATGGCGACAAGAGCACCGG
AGTCGGTTCACTCGCCTTCAACGCTGGCGATCTTAAGCTACGCGCCACGATGACCGATGC
TACCTTCGTCGCTGGGCCTACCTTGAACGGCCTCTCTCTCGCCGTGGAGAAGCCTGGTTT
CTTCATCGTCGAGTATAACGTCCCTAAGAAAGATGTTAGGTTTCAGTTCATGGACACAGT
TAGAGTTGCTGAGAAGCCATTGAATCTGACTTACATTCATAGCAGAGCTGATAACAGAAC
AATCGTGGATGGGAGCCTTTTGATTGATCCTGCTAACAAACTCTCTGTTAATCACATGGT
GGGAACAAACAACTGTAAGCTTAAATATACTTATGCTCACCGGAAGATTGCTACCTTCGA
GCCGTGCTACGACTTTGCCAAAAACGCCTGGGATTTTGCTGTTTCTCGCAGAGTTTATGG
TGATGATGTTCTCAAGGCTACTTATCAGACGTCTAGTAAGTTGCTTGGTATGAAGTGGTC
AAGGACCTCCAAATTCACTGGATCTTTCAAGGTATGCGCGTCTGTGAATCTGGCGGAGGA
AGTGAAAACGCCCAAATTGACGGCAGAAACAACATGGAACCTTGAAATGTAATCTCATTT
TACTATTAACCAAGTTTCCCACTTAATTTTTTTGGTGTTACATACGATTAAACTAGCCCT
TGCGAATCATCTTCCCACATTTTATGGTACGTTTCGTGAAACATCATACATGCTTCTATT
AAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 

AF RR2E577TF U 4
AF RR2CH62TF U 8
AF RR2AF62JQ C 70
AF RR2AF62TF U 1
BS 1 38 RR2AF62TF
BS 39 40 RR2E577TF
BS 41 820 RR2AF62TF
BS 821 821 RR2AF62JQ
BS 822 844 RR2AF62TF

RD RR2E577TF 283 0 0
GGCCCT
CACCAAACCAAACCTCTCTTTCTCTCTCTCTCCACTCTTTCTCTCTCTAGGGCGAGACGA
AATGATGAAGGCTTCAGTCAAAGGCAAGTACGATGGCGACAAGAGCATCGGAGTCGGTTC
ACTCGCCTTCAACGCTGGCGATCTTAAGCTACGCGCCACGATGACCGATGCTACTTTCGT
CGCTGGGCCTACCTTGAACGGCCTCTCTCTCGCCGTGGAGAAGCCTGGTTTCTTCATCGT
CGAGTATAACGTCCCTAAGAAAGATGTTAGGTTTCAG

QA 7 283 7 283
DS 

RD RR2CH62TF 648 0 0
GG
CACCAAACCAAACCTCTCTTTCTCTCTCTCTCCACTCTTTCTCTCTCTAGGGCGAGACGA
AATGATGAAGGCTTCAGTCAAAGGCAAGTACGATGGCGACAAGAGCACCGGAGTCGGTTC
ACTCGCCTTCAACGCTGGCGATCTTAAGCTACGCGCCACGATGACCGATGCTACTTTCGT
CGCTGGGCCTACCTTGAACGGCCTCTCTCTCGCCGTGGAGAAGCCTGGTTTCTTCATCGT
CGAGTATAACGTCCCTAAGAAAGATGTTAGGTTTCAGTTCATGAACACAGTTAGAGTTGC
TGAGAAGCCATTGAATCTGACTTACATTCATAGCAGAGCTGATAACAGAACAATCGTGGA
TGGGAGCCTTTTGATTGATCCTGCTAACAAACTCTCTGTTAATCACATGGTGGGAACAAA
CAACTGTAAGCTTAAGTATACTTATGCTCACGGGAAGATTGCTACCTTCGAGCCGTGCTA
CGACTTTGCCAAAAACGCCTGGGATTTTGCCGTTTCTCGCAGAGTTTATGGTGATGATGT
TCTCAAGGCTACTTATCAGACGTCTAGTAAGTTGCTTGGCATGGAGTGGTCAAGGACCTC
CAAATCCACTGGATCTTTCAAGGTATGTGCGTCTGTGAATCTGGCG

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR2AF62JQ 771 0 0
AATGATGAAGGCTTCAGTCAAAGGCAAGTACGATGGCGACAAGAGCACCGGAGTCGGTTC
ACTCGCCTTCAACGCTGGCGATCTTAAGCTACGCGCCACGATGACCGATGCTACCTTCGT
CGCTGGGCCTACCTTGAACGGCCTCTCTCTCGCCGTGGAGAAGCCTGGTTTCTTCATCGT
CGAGTATAACGTCCCTAAGAAAGATGTTAGGTTTCAGTTCATGGACACAGTTAGAGTTGC
TGAGAAGCCATTGAATTTGACTTACATTCATAGCAGAGCTGATAACAGAACAATCGTGGA
TGGGAGCCTTTTGATTGATCCTGCTAACAAACTCTCTGTTAATCACATGGTGGGAACAAA
CAACTGTAAGCTTAAATATACTTATGCTCACCGGAAGATTGCTACCTTCGAGCCGTGCTA
CGACTTTGCCAAAAACGCCTGGGATTTTGCTGTTTCTCGCAGAGTTTATGGTGATGATGT
TCTCAAGGCTACTTATCAGACGTCTAGTAAGTTGCTTGGTATGAAGTGGTCAAGGACCTC
CAAATTCACTGGATCTTTCAAGGTATGCGCGTCTGTGAATCTGGCGGAGGAAGTGAAAAC
GCCCAAATTGACGGCAGAAACAACATGGAACCTTGAAATGTAATCTCATTTTACTATTAA
CCAAGTTTCCCACTTAATTTTTTTGGTGTTACATACGATTAAACTAGCCCTTGCGAATCA
TCTTCCCACATTTTATGGTACGTTTCGTGAAACATCATACATGCTTCTATT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2AF62TF 844 0 0
GGCCGCCCTCACCAAACCAAACCTCTCTTTCTCTCTCT**CCACTCTTTCTCTCTCTAGG
GCGAGACGAAATGATGAAGGCTTCAGTCAAAGGCAAGTACGATGGCGACAAGAGCACCGG
AGTCGGTTCACTCGCCTTCAACGCTGGCGATCTTAAGCTACGCGCCACGATGACCGATGC
TACCTTCGTCGCTGGGCCTACCTTGAACGGCCTCTCTCTCGCCGTGGAGAAGCCTGGTTT
CTTCATCGTCGAGTATAACGTCCCTAAGAAAGATGTTAGGTTTCAGTTCATGGACACAGT
TAGAGTTGCTGAGAAGCCATTGAATCTGACTTACATTCATAGCAGAGCTGATAACAGAAC
AATCGTGGATGGGAGCCTTTTGATTGATCCTGCTAACAAACTCTCTGTTAATCACATGGT
GGGAACAAACAACTGTAAGCTTAAATATACTTATGCTCACCGGAAGATTGCTACCTTCGA
GCCGTGCTACGACTTTGCCAAAAACGCCTGGGATTTTGCTGTTTCTCGCAGAGTTTATGG
TGATGATGTTCTCAAGGCTACTTATCAGACGTCTAGTAAGTTGCTTGGTATGAAGTGGTC
AAGGACCTCCAAATTCACTGGATCTTTCAAGGTATGCGCGTCTGTGAATCTGGCGGAGGA
AGTGAAAACGCCCAAATTGACGGCAGAAACAACATGGAACCTTGAAATGTAATCTCATTT
TACTATTAACCAAGTTTCCCACTTAATTTTTTTGGTGTTACATACGATTAAACTAGCCCT
TGCGAATCATCTTCCCACATTTTATGGTACGTTTCGTGAA*CATCATACATGCTTCTATT
AAAA

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 5

CO CL1733Contig1 614 5 4 U
GGGTAAGTGTGTTAAGAGGCGAAAAGAGTGATTTAATGGCGACTTCAGGGTTTAAGCATT
TGGTGGTTGTGAAGTTTAAGGAAGATGCAAAGGTTGATGAGATCTTGAAGGGCTTGGAGA
ATCTTGTTTCTCAAATTGATTCTGTCAAATCCTTTGAATGGGGAGAAGATAATGAGAGTC
ACGAGATGCTTAGACAAGGATTCACTCATGCATTCTCGATGACTTTTGAGAATAAAGATG
CTTACGTTTCTTTCACAAGCCATCCTCTTCACGTTGAGTTCTCTGCCGCTTTCACCGCTG
TCATCGACAAGATTGTGGTCATGGACTTCACCGTCGCCGCCGTCAAATCTCCCGTTGTAG
CCCCGTGAAACTCATCGTACTTGTTTCTTAATTAAATCTCGTTTTATAATTTAATCGAGG
TTTGTGAGTTGTTTCGGTTTATGTAATTCTGTTGGTTTAAGTATGTTTTGGTTTGATTCG
TTCAATTCCGGTTCGAAATAATAAAAAACTGGTTTGGTTGGTAGTTTGGTTATTGTTTAC
TTTGAAGTGAAAATCTATATATATCTCGTGTTTTTGCCCAAAAAAAACTTGTGTTAAATG
GAATTCAAGTGAGT


BQ
10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ79JQ C 1
AF RR2FZ79TF U 1
AF RR2DB26TF U 3
AF RR2C048TF U 3
AF RR2C048JQ C 3
BS 1 4 RR2FZ79JQ
BS 5 522 RR2FZ79TF
BS 523 587 RR2C048TF
BS 588 614 RR2C048JQ

RD RR2FZ79JQ 522 0 0
GGGTAAGTGTGTTAAGAGGCGAAAAGAGTGATTTAATGGCGACTTCAGGGTTTAAGCATT
TGGTGGTTGTGAAGTTTAAGGAAGATGCAAAGGTTGATGAGATCTTGAAGGGCTTGGAGA
ATCTTGTTTCTCAAATTGATTCTGTCAAATCCTTTGAATGGGGAGAAGATAATGAGAGTC
ACGAGATGCTTAGACAAGGATTCACTCATGCATTCTCGATGACTTTTGAGAATAAAGATG
CTTACGTTTCTTTCACAAGCCATCCTCTTCACGTTGAGTTTTCTGCCGCTTTCACCGCTG
TCATCGACAAGATTGTGGTCATGGACTTCACCGTCGCCGCCGTCAAATCTCCCGTTGTAG
CCCCGTGAAACTCATCGTACTTGTTTCTTAATTAAATCTCGTTTTATAATTTAATCGAGG
TTTGTGAGTTGTTTCGGTTTATGTAATTCTGTTGGTTTAAGTATGTTTTGGTTTGATTCG
TTCAATTCCGGTTCGAAATAATAAAAAACTGGTTTGGTTGGT

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2FZ79TF 522 0 0
GGGT
AAGTGTGTTAAGAGGCGAAAAGAGTGATTTAATGGCGACTTCAGGGTTTAAGCATTTGGT
GGTTGTGAAGTTTAAGGAAGATGCAAAGGTTGATGAGATCTTGAAGGGCTTGGAGAATCT
TGTTTCTCAAATTGATTCTGTCAAATCCTTTGAATGGGGAGAAGATAATGAGAGTCACGA
GATGCTTAGACAAGGATTCACTCATGCATTCTCGATGACTTTTGAGAATAAAGATGCTTA
CGTTTCTTTCACAAGCCATCCTCTTCACGTTGAGTTCTCTGCCGCTTTCACCGCTGTCAT
CGACAAGATTGTGGTCATGGACTTCACCGTCGCCGCCGTCAAATCTCCCGTTGTAGCCCC
GTGAAACTCATCGTACTTGTTTCTTAATTAAATCTCGTTTTATAATTTAATCGAGGTTTG
TGAGTTGTTTCGGTTTATGTAATTCTGTTGGTTTAAGTATGTTTTGGTTTGATTCGTTCA
ATTCCGGTTCGAAATAATAAAAAACTGGTTTGGTTGGT

QA 5 522 5 522
DS 

RD RR2DB26TF 506 0 0
GG
AAGTGTGTTAAGAGGCGAAAAGAGTGATTTAATGGCGACTTCAGGGTTTAAGCATTTGGT
GGTTGTGAAGTTTAAGGAAGATGCAAAGGTTGATGAGATCTTGAAGGGCTTGGAGAATCT
TGTTTCTCAAATTGATTCTGTCAAATCCTTTGAATGGGGAGAAGATAATGAGAGTCACGA
GATGCTTAGACAAGGATTCACTCATGCATTCTCGATGACTTTTGAGAATAAAGATGCTTA
CGTTTCTTTCACAAGCCATCCTCTTCACGTTGAGTTCTCTGCCGCTTTCACCGCTGTCAT
CGACAAGATTGTGGTCATGGACTTCACCGTCGCCGCCGTCAAATCTCCCGTTGTAGCCCC
GTGAAACTCATCGTACTTGTTTCTTAATTAAATCTCGTTTTATAATTTAATCGAGGTTTG
TGAGTTGTTTCGGTTTATGTAATTCTGTTGGTTTAAGTATGTTTTGGTTTGATTCGTTCA
ATTCCGGTTCGAAATAATAAAAAA

QA 3 506 3 506
DS 

RD RR2C048TF 585 0 0
GG
AAGTGTGTTAAGAGGCGAAAAGAGTGATTTAATGGCGACTTCAGGGTTTAAGCATTTGGT
GGTTGTGAAGTTTAAGGAAGATGCAAAGGTTGATGAGATCTTGAAGGGCTTGGAGAATCT
TGTTTCTCAAATTGATTCTGTCAAATCCTTTGAATGGGGAGAAGATAATGAGAGTCACGA
GATGCTTAGACAAGGATTCACTCATGCATTCTCGATGACTTTTGGGAATAAAGATGCTTA
CGTTTCTTTCACAAGCCATCCTCTTCACGTTGAGTTCTCTGCCGCTTTCACCGCTGTCAT
CGACAAGATTGTGGTCATGGACTTCACCGTCGCCGCCGTCAAATCTCCCGTTGTAGCCCC
GTGAAACTCATCGTACTTGTTTCTTAATTAAATCTCGTTTTATAATTTAATCGAGGTTTG
TGAGTTGTTTCGGTTTATGTAATTCTGTTGGTTTAAGTATGTTTTGGTTTGATTCGTTCA
ATTCCGGTTCGAAATAATAAAAAACTGGTTTGGTTGGTAGTTTGGTTATTGTTTACTTTG
AAGTGAAAATCTATATATATCTCGTGTTTTTGCCCAAAAAAAA

QA 3 585 3 585
DS 

RD RR2C048JQ 612 0 0
GG
AAGTGTGTTAAGAGGCGAAAAGAGTGATTTAATGGCGACTTCAGGGTTTAAGCATTTGGT
GGTTGTGAAGTTTAAGGAAGATGCAAAGGTTGATGAGATCTTGAAGGGCTTGGAGAATCT
TGTTTCTCAAATTGATTCTGTCAAATCCTTTGAATGGGGAGAAGATAATGAGAGTCACGA
GATGCTTAGACAAGGATTCACTCATGCATTCTCGATGACTTTTGGGAATAAAGATGCTTA
CGTTTCTTTCACAAGCCATCCTCTTCACGTTGAGTTTTCTGCCGCTTTCACCGCTGTCAT
CGACAAGATTGTGGTCATGGACTTCACCGTCGCCGCCGTCAAATCTCCCGTTGTAGCCCC
GTGAAACTCATCGTACTTGTTTCTTAATTAAATCTCGTTTTATAATTTAATCGAGGTTTG
TGAGTTGTTTCGGTTTATGTAATTCTGTTGGTTTAAGTATGTTTTGGTTTGATTCGTTCA
ATTCCGGTTCGAAATAATAAAAAACTGGTTTGGTTGGTAGTTTGGTTATTGTTTACTTTG
AAGTGAAAATCTATATATATCTCGTGTTTTTGCCCAAAAAAAACTTGTGTTAAATGGAAT
TCAAGTGAGT

QA 3 612 3 612
DS 



AS 2 4

CO CL1734Contig1 645 2 2 U
GGACTTAACACTTATTTCCTTTAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAAATG
AAGCTTTCTATGCGTTTGATCTCAGCTGTTTTCCCCTTGTTCATGATATTCGTTGCCACA
GGGATGGGTCCAGTCACAGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATAGGTTCAAG
GGTACATGTGTGAGCACAACAAACTGCGCAAACGTGTGCCACAACGAAGGCTTTCCTGGT
GGGATGGGTCCAGTCACAGTGGAGGCACGCACGTGTCAGTCGAAGAGCCATAGGTTCAAG
GGTACATGTGTGAGCACAACAAACTGCGCAAACGTGTGCCACAACGAAGGCTTTCCTGGT
GGTAATTGCCGTGGATTCCGTCGTCGTTGCCTTTGCACAAGACATTGCTAATCCATCAAT
CGATTCTCATAACTCAAAATCCTCGATCCATCGTCTCGTGTTGTTTCTTTCTATCTAATC
TTCCGCACAGCACTGAGTCGTACTTGTGTGTGTGATGTGTTTTCAAATAAGTCTTTGGTT
TGTGTGTTTTCTTTTTTTTTATGTAACGTAAGTGTGTTTTCGTTAGTCATGTAAGGTTAT
ATCAACTTGTGGTTCTCTAATCAAGAAGCCTCTACGAAGGTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ79TF U 1
AF RR2DZ79JQ C 89
BS 1 171 RR2DZ79TF
BS 172 645 RR2DZ79JQ

RD RR2DZ79TF 171 0 0
GGACTTAACACTTATTTCCTTTAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAAATG
AAGCTTTCTATGCGTTTGATCTCAGCTGTTTTCCCCTTGTTCATGATATTCGTTGCCACA
GGGATGGGTCCAGTCACAGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCAT

QA 1 171 1 171
DS 

RD RR2DZ79JQ 557 0 0
TTTTCCCCTTGTTCATGATATTCGTTGCCACAGGGATGGGTCCAGTCACAGTGGAGGCAC
GCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATAGGTTCAAGGGTACATGTGTGAGCACAACAAACTGCG
CAAACGTGTGCCACAACGAAGGCTTTCCTGGTGGGATGGGTCCAGTCACAGTGGAGGCAC
GCACGTGTCAGTCGAAGAGCCATAGGTTCAAGGGTACATGTGTGAGCACAACAAACTGCG
CAAACGTGTGCCACAACGAAGGCTTTCCTGGTGGTAATTGCCGTGGATTCCGTCGTCGTT
GCCTTTGCACAAGACATTGCTAATCCATCAATCGATTCTCATAACTCAAAATCCTCGATC
CATCGTCTCGTGTTGTTTCTTTCTATCTAATCTTCCGCACAGCACTGAGTCGTACTTGTG
TGTGTGATGTGTTTTCAAATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTTTCTTTTTTTTTATGTAACG
TAAGTGTGTTTTCGTTAGTCATGTAAGGTTATATCAACTTGTGGTTCTCTAATCAAGAAG
CCTCTACGAAGGTATTT

QA 1 557 1 557
DS 



CO CL1734Contig2 490 2 1 U
GGACACACTTAACACTTGTTTCCTTCCAACTCTGCTCTCCCTCTCTTTCTCTCTCTCAAA
ATGAAGCTCTCTATGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCTTGTTCATGATATTCGTTGCC
ACAGGGATGGGTCCAGTCAGAGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATAGATTC
AAGGGTACATGTGTGAGCACAACAAACTGCGCAAACGTGTGCCACAACGAAGGCTTTCCT
GGTGGTAATTGCCGTGGATTCCGTCGTCGTTGCTTTTGCACAAGACATTGCTAATCCATC
AATCGATTCTCATAACTCAAAATCGTCGATCCATCGTCTCGTGTTGTTTCTTTCTATCTA
ATCTTCCGCACAGCACCGAGTCGTACTTGTGTGTGTGTGATGTGTTTTCAAATAAGTCTT
TGGTTTGTGTGTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATGTAACGTAAGTGTGTTTTCGTTAGTCAT
GTAAGGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G542TF U 1
AF RR2G542JQ C 97
BS 1 490 RR2G542TF

RD RR2G542TF 490 0 0
GGACACACTTAACACTTGTTTCCTTCCAACTCTGCTCTCCCTCTCTTTCTCTCTCTCAAA
ATGAAGCTCTCTATGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCTTGTTCATGATATTCGTTGCC
ACAGGGATGGGTCCAGTCAGAGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATAGATTC
AAGGGTACATGTGTGAGCACAACAAACTGCGCAAACGTGTGCCACAACGAAGGCTTTCCT
GGTGGTAATTGCCGTGGATTCCGTCGTCGTTGCTTTTGCACAAGACATTGCTAATCCATC
AATCGATTCTCATAACTCAAAATCGTCGATCCATCGTCTCGTGTTGTTTCTTTCTATCTA
ATCTTCCGCACAGCACCGAGTCGTACTTGTGTGTGTGTGATGTGTTTTCAAATAAGTCTT
TGGTTTGTGTGTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATGTAACGTAAGTGTGTTTTCGTTAGTCAT
GTAAGGTTAT

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR2G542JQ 394 0 0
CT
CTTGTTCATGATATTCGTTGCCACAGGGATGGGTCCAGTCAGAGTGGAGGCACGCACGTG
TGAGTCGAAGAGCCATAGATTCAAGGGTACATGTGTGAGCACAACAAACTGCGCAAACGT
GTGCCACAACGAAGGCTTTCCTGGTGGTAATTGCCGTGGATTCCGTTGTCGTTGCTTTTG
CACAAGACATTGCTAATCCATCAATCGATTTTCATAACTCAAAATCGTCGATCCATCGTC
TCGTGTTGTTTCTTTCTATTTAATTTTCCGCACAGCACCGAGTCGTACTTGTGTGTGTGT
GATGTGTTTTCAAATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATGTAACG
TAAGTGTGTTTTCGTTAGTCATGTAAGGTTAT

QA 3 394 3 394
DS 



AS 1 3

CO CL1735Contig1 595 3 27 U
GGAGTCTGAAGAAAAACAGAAAAAGAAGAAGCGTTCAAGTGAGGAGGAAGAAGAAGCAAT
GGACAAAGCACCAGAAATTCATTTTCCAAAACTGGAGAAACCTTCAGGCAAGAAACAAAC
TACGACAGTTGTTGTCGGAGCTTTGGCTGTCGCATGGTTGGCGGTGGAGTTCGTGTTAAA
GCCATTGTTGAGCAAACTTAACTCATCAAAGGACAAATCAGTCTCCGAGGATGCAACAGC
TCCTCCCGCGGCCGACGCTGACACATCTCCTCCTGCGTCCGACGATGCCACAGCTCCTCC
CGCGACTGACGATGCCACATCTCCTTCCACGTCCGACGCCTAAAAGGTGAGAATAGCCTC
TGCGGGAGACATGTCTTATTATAATATTTATAAGCAATATGGTTTGTGTGTGTTATGTTG
TTGTTTTCTTCCGCGAAAAATATTGTTCGGTTTTTATTGCCTTGACGATGATTTTAAGTT
AAGGTAATCTTGTTTTTTCTTTTGTTTTGTAATAAATTTCCGAGATGGAATAATAAGTCA
ATGAGATACGATGTAATTGGGTTTTGCAGTTTCTTAGTTGCCTTGGGCTTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR92TF U 1
AF RR2BM91JQ C 54
AF RR2BM91TF U 54
BS 1 60 RR2FR92TF
BS 61 61 RR2BM91TF
BS 62 160 RR2FR92TF
BS 161 161 RR2BM91TF
BS 162 265 RR2FR92TF
BS 266 266 RR2BM91TF
BS 267 291 RR2FR92TF
BS 292 292 RR2BM91TF
BS 293 300 RR2FR92TF
BS 301 301 RR2BM91TF
BS 302 313 RR2FR92TF
BS 314 314 RR2BM91TF
BS 315 319 RR2FR92TF
BS 320 320 RR2BM91TF
BS 321 401 RR2FR92TF
BS 402 402 RR2BM91TF
BS 403 432 RR2FR92TF
BS 433 433 RR2BM91TF
BS 434 435 RR2FR92TF
BS 436 436 RR2BM91TF
BS 437 497 RR2FR92TF
BS 498 500 RR2BM91TF
BS 501 516 RR2FR92TF
BS 517 517 RR2BM91TF
BS 518 561 RR2FR92TF
BS 562 562 RR2BM91TF
BS 563 595 RR2FR92TF

RD RR2FR92TF 595 0 0
GGAGTCTGAAGAAAAACAGAAAAAGAAGAAGCGTTCAAGTGAGGAGGAAGAAGAAGCAAT
AGACAAAGCACCAGAAATTCATTTTCCAAAACTGGAGAAACCTTCAGGCAAGAAACAAAC
TACGACAGTTGTTGTCGGAGCTTTGGCTGTCGCATGGTTGTCGGTGGAGTTCGTGTTAAA
GCCATTGTTGAGCAAACTTAACTCATCAAAGGACAAATCAGTCTCCGAGGATGCAACAGC
TCCTCCCGCGGCCGACGCTGACACAGCTCCTCCTGCGTCCGACGATGCCACTGCTCCTCC
TGCGACTGACGATACCACAGCTCCTTCCACGTCCGACGCCTAAAAGGTGAGAATAGCCTC
TGCGGGAGACATGTCTTATTATAATATTTATAAGCAATATGTTTTGTGTGTGTTATGTTG
TTGTTTTCTTCCACGTAAAATATTGTTCGGTTTTTATTGCCTTGACGATGATTTTAAGTT
AAGGTAATCTTGTTTTTC**TTTGTTTTGTAATAAAATTCCGAGATGGAATAATAAGTCA
ATGAGATACGATGTAATTGGGATTTGCAGTTTCTTAGTTGCCTTGGGCTTTGTTC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2BM91JQ 519 0 0
AAGCAATGGACAAAGCACCAGAAATTCATTTTCCAAAACTGGAGAAACCTTCAGGCAAGA
AACAAACTACGACAGTTGTTGTCGGAGCTTTGGCTGTCGCATGGTTGGCGGTGGAGTTCG
TGTTAAAGCCATTGTTGAGCAAACTTAACTCATCAAAGGACAAATCAGTCTCCGAGGATG
CAACAGCTCCTCCCGCGGCCGACGCTGACACATCTCCTCCTGCGTCCGACGATGCCACAG
CTCCTCCCGCGACTGACGATGCCACATCTCCTTCCACGTCCGACGCCTAAAAGGTGAGAA
TAGCCTCTGCGGGAGACATGTCTTATTATAATATTTATAAGCAATATGGTTTGTGTGTGT
TATGTTGTTGTTTTCTTCCGCGAAAAATATTGTTCGGTTTTTATTGCCTTGACGATGATT
TTAAGTTAAGGTAATCTTGTTTTTTCTTTTGTTTTGTAATAAATTTCCGAGATGGAATAA
TAAGTCAATGAGATACGATGTAATTGGGTTTTGCAGTTT

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2BM91TF 519 0 0
AAGCAATGGACAAAGCACCAGAAATTCATTTTCCAAAACTGGAGAAACCTTCAGGCAAGA
AACAAACTACGACAGTTGTTGTCGGAGCTTTGGCTGTCGCATGGTTGGCGGTGGAGTTCG
TGTTAAAGCCATTGTTGAGCAAACTTAACTCATCAAAGGACAAATCAGTCTCCGAGGATG
CAACAGCTCCTCCCGCGGCCGACGCTGACACATCTCCTCCTGCGTCCGACGATGCCACAG
CTCCTCCCGCGACTGACGATGCCACATCTCCTTCCACGTCCGACGCCTAAAAGGTGAGAA
TAGCCTCTGCGGGAGACATGTCTTATTATAATATTTATAAGCAATATGGTTTGTGTGTGT
TATGTTGTTGTTTTCTTCCGCGAAAAATATTGTTCGGTTTTTATTGCCTTGACGATGATT
TTAAGTTAAGGTAATCTTGTTTTTTCTTTTGTTTTGTAATAAATTTCCGAGATGGAATAA
TAAGTCAATGAGATACGATGTAATTGGGTTTTGCAGTTT

QA 1 519 1 519
DS 



AS 2 5

CO CL1736Contig1 1019 3 7 U
CAGAACAATCCGATTTCTTTTTTAAAATCGGTACAATTTTTATCAAAAAAAACTTACAAG
GCTTATTTGTTTGACACATTAAATACAGCATATTCCCAACAAATTAAACAATCACATATA
GAAGCAAACCACAACAAGAATCAAATTCGGCTAGAGATATATTTTCATTCTTTTATAATC
TCTTTAGTTAGGAACGCGACACATTTTACGGATCTCCCCGGCACGACCAGTAAGAACCCC
GATCCGACCCATTTTCACCATTGAGACACCAAAGTCATGAAAGAAGGTTGACCCCCGTGC
CTGCTGCAAGACATAAGCCCTAGTCTTTGAGTTGTCCAACAGAGCAGCATCCGACTGGAA
AAGCCCTCTTCTCTTTGCCACTAGCTTGAAGTAACTCACGTCGAATGTCTTGAAACTTCC
CGGATCCATCTCTAGAGCCGTCGTTGTATCGGTCGGCTTGCATTTCTTCCTGAGGTTAGC
TGCGTACTCTGAGTCCAAACTCGGG*TCGCTGTCTCCTCTTCCGGTGAAGTTGTAAAGAC
GGTTTGTCATCAGAGGACAATGTCCCATTCCAATAGTGTGTCCACCTGAAAGAACGACTA
GATCTTTCTCATTGAGTCCCTTTGTGCTAAAATCGGTGATAAGCTTGGCGATGTTATCAA
AAGGTGATGGCAAGTTGACCTCATTGATATTAGAAACCCTACCATCTCTTCTTCCCGTTT
CTACTTACCATGTTGGTCCTTCAAGTGCAACCATTGCGTCCCTAGCAATAAGGGCTAAGA
TATCAGAGCAAGAAACTACGCCAGGACACACTTTTTCTAGAGCCGCCTTGGAATCGTCTA
TGATGCCAAACCCTCGAAGGCTTAGGTTAGGAACCGCATTCTTCTCGGCTTGATTACTCG
ATGAATCTAACAAGATTGATCCGTCACATCCCCGAACGAAGCAGTCGTGGAAGAACATTC
TAAGCAAAGGAGCACCAAGCGTAGGAGCTTTCTTCATCGCAGCGAACACGACCTTTCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL53JQ U 1
AF RR2EQ46JQ U 1
AF RR2CL53TF C 325
BS 1 165 RR2CL53JQ
BS 166 166 RR2EQ46JQ
BS 167 505 RR2CL53JQ
BS 506 506 RR2EQ46JQ
BS 507 663 RR2CL53JQ
BS 664 844 RR2EQ46JQ
BS 845 1019 RR2CL53TF

RD RR2CL53JQ 663 0 0
CAGAACAATCCGATTTCTTTTTTAAAATCGGTACAATTTTTATCAAAAAAAACTTACAAG
GCTTATTTGTTTGACACATTAAATACAGCATATTCCCAACAAATTAAACAATCACATATA
GAAGCAAACCACAACAAGAATCAAATTCGGCTAGAGATATATTTTTATTCTTTTATAATC
TCTTTAGTTAGGAACGCGACACATTTTACGGATCTCCCCGGCACGACCAGTAAGAACCCC
GATCCGACCCATTTTCACCATTGAGACACCAAAGTCATGAAAGAAGGTTGACCCCCGTGC
CTGCTGCAAGACATAAGCCCTAGTCTTTGAGTTGTCCAACAGAGCAGCATCCGACTGGAA
AAGCCCTCTTCTCTTTGCCACTAGCTTGAAGTAACTCACGTCGAATGTCTTGAAACTTCC
CGGATCCATCTCTAGAGCCGTCGTTGTATCGGTCGGCTTGCATTTCTTCCTGAGGTTAGC
TGCGTACTCTGAGTCCAAACTCGGGGTCGCTGTCTCCTCTTCCGGTGAAGTTGTAAAGAC
GGTTTGTCATCAGAGGACAATGTCCCATTCCAATAGTGTGTCCACCTGAAAGAACGACTA
GATCTTTCTCATTGAGTCCCTTTGTGCTAAAATCGGTGATAAGCTTGGCGATGTTATCAA
AAG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2EQ46JQ 844 0 0
CAGAACAATCCGATTTCTTTTTTAAAATCGGTACAATTTTTATCAAAAAAAACTTACAAG
GCTTATTTGTTTGACACATTAAATACAGCATATTCCCAACAAATTAAACAATCACATATA
GAAGCAAACCACAACAAGAATCAAATTCGGCTAGAGATATATTTTCATTCTTTTATAATC
TCTTTAGTTAGGAACGCGACACATTTTACGGATCTCCCCGGCACGACCAGTAAGAACCCC
GATCCGACCCATTTTCACCATTGAGACACCAAAGTCATGAAAGAAGGTTGACCCCCGTGC
CTGCTGCAAGACATAAGCCCTAGTCTTTGAGTTGTCCAACAGAGCAGCATCCGACTGGAA
AAGCCCTCTTCTCTTTGCCACTAGCTTGAAGTAGCTCACGTCGAATGTCTTGAAACTTCC
CGGATCCATCTCTAGAGCCGTCGTTGTATCGGTCGGCTTGCATTTCTTCCTGAGGTTAGC
TGCGTACTCTGAGTCCAAACTCGGG*TCGCTGTCTCCTCTTCCGGTGAAGTTGTAAAGAC
GGTTTGTCATCAGAGGACAATGTCCCATTCCAATAGTGTGTCCACCTGAAAGAACGACTA
GATCTTTCTCGTTAAGTCCCTTTGTGCTAAAATCGGTGATAAGCTTGGCGATGTTATCAA
AAGGTGATGGCAAGTTGACCTCATTGATATTAGAAACCCTACCATCTCTTCTTCCCGTTT
CTACTTACCATGTTGGTCCTTCAAGTGCAACCATTGCGTCCCTAGCAATAAGGGCTAAGA
TATCAGAGCAAGAAACTACGCCAGGACACACTTTTTCTAGAGCCGCCTTGGAATCGTCTA
TGAT

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR2CL53TF 695 0 0
TCTTTGAG
TGTCCAACAGAGCAGCATC*GACTG*AAAAGCC*TCTTCTCTTTGCCACTAGCTTGAAGT
AACTCACGTCGAATGTCTTGAAACTTCCCGGATCCATCTCTAGAGCCGTCGTTGTATCGG
TCGGCTTGCATTTCTTCCTGAGGTTAGCTGCGTACTCTGAGTCCAAACTCGGG*TCGCTG
TCTCCTCTTCCGGTGAAGTTGTAAAGACGGTTTGTCATCAGAGGACAATGTCCCATTCCA
ATAGTGTGTCCACCTGAAAGAACGACTAGATCTTTCTCATTGAGTCCCTTTGTGCTAAAA
TCGGTGATAAGCTTGGCGATGTTATCAAAAGGTGATGGCAAGTTGACCTCGTTGATATTA
GAAACCCTACCGTCTCTTCTTCCCGTTTCTACTTCCCATGTTGGTCCTTCAAGTGCAACC
ATTGCGTCCCTAGCAATAAGGGCTAAGATATCAGAGCATGAAACTATGCCAGGACACACT
TTTTCTAGAGCCGCCTTGGAATCGTCTATGATGCCAAACCCTCGAAGGCTTAGGTTAGGA
ACCGCATTCTTCTCGGCTTGATTACTCGATGAATCTAACAAGATTGATCCGTCACATCCC
CGAACGAAGCAGTCGTGGAAGAACATTCTAAGCAAAGGAGCACCAAGCGTAGGAGCTTTC
TTCATCGCAGCGAACACGACCTTTCTC

QA 9 695 9 695
DS 



CO CL1736Contig2 770 2 11 U
GGATCACCAATCGAGCCAAAAACAAAAAAAAAAGCTAATAGCTAGAAGCTAAATAGAATC
TCAAAAAATGGTTGCATCGAAGCGACTAGTGGTCTCTTGCTTCCTTTTAGTGTTGTTGCT
AGCAGAAGCCAGTGCACAAGGCTTGAAAGTAGGCTTCTACAGCAAAACATGCCCACATGC
CGAGGGTATTGTTAGAAAGGTCGTGTTCGCTGCGATGAAGAAAGCTCCTACACTTGGTGC
TCCTTTGCTTAGAATGTTCTTCCACGACTGCTTTGTTCGGGGATGTGATGGATCAGTTTT
GTTAGATTCACCGAACAATCAAGCCGAGAAGAATGCGGTTCCTAACCTAAGCCTTCGAGG
GTTTGGCATCATAGACGATTCCAAGGCGGCTCTAGAAAAAGTGTGTCCTGGCGTAGTTTC
TTGCTCTGATATCTTAGCCCTTATTGCTAGGGACGCAATGGTTGCACTTGAAGGACCAAC
ATGGGAAGTAGAAACGGGAAGAAGAGATGGTAGGGTTTCTAATATCAATGAGGTCAACTT
GCCATCACCTTTTGATAACATCGCCAAGCTTATCACCGATTTTAGCACAAAGGGACTTAA
CGAGAAAGATCTAGTCGTTCTTTCAGGTGGACACACTATTGGAATGGGACATTGTCCTCT
GATGACAAACCGTCTTTACAACTTCACCGGAAGAGGAGACAGCGACCCGAGTTTGGACTC
AGAGTACGCAGCTAACCTCAGAAGAAATGCAAGCCGACCGATAAACGACG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ46TF U 1
AF RR2GC44TF U 2
BS 1 39 RR2EQ46TF
BS 40 40 RR2GC44TF
BS 41 59 RR2EQ46TF
BS 60 60 RR2GC44TF
BS 61 349 RR2EQ46TF
BS 350 350 RR2GC44TF
BS 351 484 RR2EQ46TF
BS 485 485 RR2GC44TF
BS 486 736 RR2EQ46TF
BS 737 737 RR2GC44TF
BS 738 770 RR2EQ46TF

RD RR2EQ46TF 770 0 0
GGATCACCAATCGAGCCAAAAACAAAAAAAAAAGCTAAT*GCTAGAAGCTAAATAGAATT
TCAAAAAATGGTTGCATCGAAGCGACTAGTGGTCTCTTGCTTCCTTTTAGTGTTGTTGCT
AGCAGAAGCCAGTGCACAAGGCTTGAAAGTAGGCTTCTACAGCAAAACATGCCCACATGC
CGAGGGTATTGTTAGAAAGGTCGTGTTCGCTGCGATGAAGAAAGCTCCTACACTTGGTGC
TCCTTTGCTTAGAATGTTCTTCCACGACTGCTTTGTTCGGGGATGTGATGGATCAGTTTT
GTTAGATTCACCGAACAATCAAGCCGAGAAGAATGCGGTTCCTAACCTAGGCCTTCGAGG
GTTTGGCATCATAGACGATTCCAAGGCGGCTCTAGAAAAAGTGTGTCCTGGCGTAGTTTC
TTGCTCTGATATCTTAGCCCTTATTGCTAGGGACGCAATGGTTGCACTTGAAGGACCAAC
ATGGTAAGTAGAAACGGGAAGAAGAGATGGTAGGGTTTCTAATATCAATGAGGTCAACTT
GCCATCACCTTTTGATAACATCGCCAAGCTTATCACCGATTTTAGCACAAAGGGACTTAA
CGAGAAAGATCTAGTCGTTCTTTCAGGTGGACACACTATTGGAATGGGACATTGTCCTCT
GATGACAAACCGTCTTTACAACTTCACCGGAAGAGGAGACAGCGACCCGAGTTTGGACTC
AGAGTACGCAGCTAAC*TCAGAAGAAATGCAAGCCGACCGATAAACGACG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2GC44TF 764 0 0
GATCACCAATCGAGCCAAAAACAAAAAAAA**GCTAATAGCTAGAAGCTAAATAGAATCT
CAAAAAATGGTTGCATCGAAGCGACTAGTGGTCTCTTGCTTTCTTTTAGTGTTGTTGCTA
GCAGAAGCCAGTGCACAAGGCTTGAAAGTAGGCTTCTACAGCAAAACATGCCCACATGCC
GAGGGTATTGTTAGAAAGGTCGTGTTCGCTGCGATGAAGAAAGCTCCTACACTTGGTGCT
CCTTTGCTTAGAATGTTCTTCCACGACTGCTTTGTTCGGGGATGTGATGGATCAGTTTTG
TTAGATTCATCGAACAATCAAGCCGAGAAGAATGCGGTTCCTAACCTAAGCCTTCGAGGG
TTTGGCATCATAGACGATTCCAAGGCGGCTCTAGAAAAAGTGTGTCCTGGCGTAGTTTCT
TGCTCTGATATCTTAGCCCTTATTGCTAGGGACGCAATGGTTGCACTTGAAGGACCAACA
TGGGAAGTAGAAACGGGAAGAAGAGATGGTAGGGTTTCTAATATCAATGAGGTCAACTTG
CCATCACCTTTTGATAACATCGCCAAGCTTATCACCGATTTTAGCACAAAGGGACTTAAC
GAGAAAGATCTAGTCGTTCTTTCAGGTGGACACACTATTGGAATGGGACATTGTCCTCTG
ATGACAAACCGTCTTTACAACTTCACCGGAAGAGGAGACAGCGACCCGAGTTTGGACTCA
GAGTACGCAGCTAACCTCAGAAGAAATGCAAGCCGAC
GATACAC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 2 4

CO CL1737Contig1 714 2 8 U
GGGCACGAATATTCGTACAAACGGTAGTACACGGAGGAGGAGGAGGAGTGAAGAGAAGAG
CGATAATGGCGTCTAACGGTTTCGCGATGTTATCGATCCTCGTGTTGTCTCTCCTCTTCG
CTTCGTCTATTAGAAGCGAAGAAGAGACGACGAAGGAGTTCGTCTTGACGTTGGATCACT
CTAACTTCACCGATACCATCAACAAGCACGACTTCATCGTCGTCGAGTTCTACGCCCCTT
GGTGTGGCCACTGCAAGAGTCTTGCTCCTGAGTATGAGAAGGCTGCAGCGGAGCTGAGCA
GTCAAAGCCCTCCCATCTTCCTCGCCAAGATTGATGCGAGCGAGGAGTCTAACAAAGGGA
TTGCGAACGAGTACAAGATTCAGGGATTCCCAACGATCAAGATTCTGAGGAACGGTGGGA
AGTCGGTTCAAGATTACAACAGACCTCGTGAAGCTCCGGGTATTGTGACTTATGTGAAGA
AGCAGAGTGGACCTGCTTCTGCTGAGATTGAGTCGGCTGATGTTGCTGGTGAGGTTATTG
GTGAGAAGAATGTTGTTGCCGTTGGTGTGTTCCCTAAGTTCTACGGTGAGGAGTTTGATT
CTTTCATGGCCCTTGCTGAGAAATTGCGCGCTGACTATGATTTCGCACATACTTTGGACG
CCAAGCTTCTTCCTCGTGGAGACTCATCTGTGGCGGGACCTGTCGTGAGGCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ01TF U 1
AF RR2AQ84TF U 14
BS 1 286 RR2BJ01TF
BS 287 287 RR2AQ84TF
BS 288 440 RR2BJ01TF
BS 441 441 RR2AQ84TF
BS 442 559 RR2BJ01TF
BS 560 560 RR2AQ84TF
BS 561 579 RR2BJ01TF
BS 580 714 RR2AQ84TF

RD RR2BJ01TF 579 0 0
GGGCACGAATATTCGTACAAACGGTAGTACACGGAGGAGGAGGAGGAGTGAAGAGAAGAG
CGATAATGGCGTCTAACGGTTTCGCGATGTTATCGATCCTCGTGTTGTCTCTCCTCTTCG
CTTCGTCTATTAGAAGCGAAGAAGAGACGACGAAGGAGTTCGTCTTGACGTTGGATCACT
CTAACTTCACCGATACCATCAACAAGCACGACTTCATCGTCGTCGAGTTCTACGCCCCTT
GGTGTGGCCACTGCAAGAGTCTTGCTCCTGAGTATGAGAAGGCTGCGGCGGAGCTGAGCA
GTCAAAGCCCTCCCATCTTCCTCGCCAAGATTGATGCGAGCGAGGAGTCTAACAAAGGGA
TTGCGAACGAGTACAAGATTCAGGGATTCCCAACGATCAAGATTCTGAGGAACGGTGGGA
AGTCGGTTCAAGATTACAACGGACCTCGTGAAGCTCCGGGTATTGTGACTTATGTGAAGA
AGCAGAGTGGACCTGCTTCTGCTGAGATTGAGTCGGCTGATGTTGCTGGTGAGGTTATTG
GTGAGAAGAATGTTGTTGCTGTTGGTGTGTTCCCTAAGT

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2AQ84TF 701 0 0
CGTACAAACGGTAGTACAC
GGAGGAGGAGGAGGAGTGAAGAGAAGAGCGATAATG*CGTCTAACGGTTTCGCGATGTTA
TCGATCCTCGTGTTGTCTCTCCTCTTCGCTTCGTCTATTAGAAGCGAAGAAGAGACGACG
AAGGAGTTCGTCTTGACGTTGGATCACTCTAACTTCACCGATACCATCAACAAGCACGAC
TTCATCGTCGTCGAGTTCTACGCCCCTTGGTGTGGCCACTGCAAGAGTCTTGCTCCTGAG
TATGAGAAGGCTGCAGCGGAGCTGAGCAGTCAAAGCCCTCCCATCTTCCTCGCCAAGATT
GATGCGAGCGAGGAGTCTAACAAAGGGATTGCGAACGAGTACAAGATTCAGGGATTCCCA
ACGATCAAGATTCTGAGGAACGGTGGGAAGTCGGTTCAAGATTACAACAGACCTCGTGAA
GCTCCGGGTATTGTGACTTATGTGAAGAAGCAGAGTGGACCTGCTTCTGCTGAGATTGAG
TCGGCTGATGTTGCTGGTGAGGTTATTGGTGAGAAGAATGTTGTTGCCGTTGGTGTGTTC
CCTAAGTTCTACGGTGAGGAGTTTGATTCTTTCATGGCCCTTGCTGAGAAATTGCGCGCT
GACTATGATTTCGCACATACTTTGGACGCCAAGCTTCTTCCTCGTGGAGACTCATCTGTG
GCGGGACCTGTCGTGAGGCTAT

QA 20 701 20 701
DS 



CO CL1737Contig2 648 2 1 U
GGACACACGAATATTCGTACAAACGGTAGTACACGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGTGAA
GAGAAGAGCGATAATGGCGTCTAACGGTTTCGCGATGTTATCGATCCTTGTGTTATCATC
TCTCCTCGCTTCGTCTATTAGAAGCGAAGAAGCGACGAAGGAGTTCGTCTTGACGTTGGA
TCACTCTAACTTCACCGATACCATCAACAAGCACGACTTCATCGTCGTCGAGTTCTACGC
CCCTTGGTGTGGCCACTGCAAGAGTCTTGCTCCTGAGTATGAGAAGGCTGCAGCGGAGCT
GAGCAGCCAAAGCCCTCCCATCTTCCTCGCCAAGATTGACGCTAGCGAGGAGTCTAACAA
AGGGATTGCGAACGAGTACAAGATTCAGGGATTCCCAACGATCAAGATTCTGAGGAACGG
TGGGAAGTCGGTTCAAGATTACAACGGACCTCGTGAAGCTCCGGGTATTGTGACTTATGT
GAAGAAGCAGAGTGGACCTGCTTCTGCTGAGATTGAGTCGGCTGATGTTGCTGGTGAGGT
TATTGGTGAGAAGAATGTTGTTGCTGTTGGTGTGTTCCCTAAGTTATACGGTGAGGAGTT
TGATTCTTTCATGGCCCTTGCTGAGAAACTGCGCGCTGACTATGATTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E501TF U 1
AF RR2DK17TF U 1
BS 1 648 RR2DK17TF

RD RR2E501TF 137 0 0
GGACA
CACGAATATTCGTACAAACGGTAGTACACGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGTGAAGAGAA
GAGCGATAATGGCGTCTAACGGTTTCGCGATGTTATCGATCCTTGTGTTATCATCTCTCC
TCGCTTCGTCTA

QA 6 137 6 137
DS 

RD RR2DK17TF 648 0 0
GGACACACGAATATTCGTACAAACGGTAGTACACGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGTGAA
GAGAAGAGCGATAATGGCGTCTAACGGTTTCGCGATGTTATCGATCCTTGTGTTATCATC
TCTCCTCGCTTCGTCTATTAGAAGCGAAGAAGCGACGAAGGAGTTCGTCTTGACGTTGGA
TCACTCTAACTTCACCGATACCATCAACAAGCACGACTTCATCGTCGTCGAGTTCTACGC
CCCTTGGTGTGGCCACTGCAAGAGTCTTGCTCCTGAGTATGAGAAGGCTGCAGCGGAGCT
GAGCAGCCAAAGCCCTCCCATCTTCCTCGCCAAGATTGACGCTAGCGAGGAGTCTAACAA
AGGGATTGCGAACGAGTACAAGATTCAGGGATTCCCAACGATCAAGATTCTGAGGAACGG
TGGGAAGTCGGTTCAAGATTACAACGGACCTCGTGAAGCTCCGGGTATTGTGACTTATGT
GAAGAAGCAGAGTGGACCTGCTTCTGCTGAGATTGAGTCGGCTGATGTTGCTGGTGAGGT
TATTGGTGAGAAGAATGTTGTTGCTGTTGGTGTGTTCCCTAAGTTATACGGTGAGGAGTT
TGATTCTTTCATGGCCCTTGCTGAGAAACTGCGCGCTGACTATGATTT

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL1738Contig1 784 2 9 U
TATATAGGAGAATACTGAACATGGTAAAAAAGATACACAAGAAAATGATCTCAAAAGCTT
AGAAGAACAAAACAACGCACACTCGAAATATTCCCATTTCGAACTAAAATAAGAACTAAA
GGAAAAGAATAAACAAAAACCATTTAATGTATTTTGCTTCGCCTTCTTGGGATTAACAAA
AGATTGAAAGATAATTATAAAGTGGATGAAGGAGATTACTGGTTCAGTAGCCTTTTCTAA
GGCATAACGCCAATATCCTTGAAGTAATCATGCTCCAAGGCAGCTCTTGCGTTGATTCTT
TTGGTTGGATCCATTAACAGCATTTTATAGAGGAGATCTATTCCATTGGGATCAAGACTC
GGAACAAAAGACTCTAAGCCCGTTTGTTTCCATTTAGGGAAAGCGGATTTGTAATCCGGC
AGCGAAGTTACCCCAGGCCATGTATCCTCGTATGGAGTTCCCATGATTCTGAAAATCTTG
AAGAGTTGATCAATCTCGGAGCCTCCAGGAAATAAGGGCTTTTGGGTGATCATCTCCGCA
AATATGCATCCCACAGACCAAATATCAACGGGTGTAGAGTAATGATGAGATCCTAGGAGT
ATCTCTGGAGCTCGGTACCAGAGAGTAACCACCTCATGAGTAAATGTCCTGACAGGGATA
CCGAACGCTCTGGCCAGTCCAAAATCTGCAAGCTTGAGTGAGTTTGTGCGGCGATCAATC
AACAAATTCTGTGGCTTCAGATCACGGTGGAGAACCCTGTGAGAGTGGCAATACGCAATC
CCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2CI12JQ U 7
AF RR2AV91JQ U 1
BS 1 359 RR2AV91JQ
BS 360 360 RR2CI12JQ
BS 361 422 RR2AV91JQ
BS 423 423 RR2CI12JQ
BS 424 536 RR2AV91JQ
BS 537 537 RR2CI12JQ
BS 538 665 RR2AV91JQ
BS 666 666 RR2CI12JQ
BS 667 784 RR2AV91JQ

RD RR2CI12JQ 726 0 0
GGAGAATACTGAACATGGTAAAAAAGATACACAAGAAAATGATCTCAAAAGCTTAGAAGA
ACAAAACAACGCACACTCGAAA*ATTCCCATTTCGAACTAAAATAAGAACTAAAGGAAAA
GAATAAACAAAAACCATTTAATGTATTTTGCTTCGCCTTCTTGGGATTAACAAAAGATTG
AAAGATAATTATAAAGTGGATGAAGGAGATTACTGGTTCTGTAGCCTTTTCTAAGGCATA
ACGCCAATATCCTTGAAGTAATCATGCTCCAAGGCAGCTCTTGCGTTGATTCTTTTGGTT
GGATCCATTAACAGCATTTTATAGAGGAGATCTATTCCATTGGGATCCAGACTCGGAACA
AAAGATTCTAAGCCCGTTTGTTTCCATTTAGGGAAAGCGGATTTGTAATCCGGCAGCGAA
GTTACCCCAGGCCATGTATCCTCGTATGGAGTTCCCATGATTCTGAAAATCTTGAAGAGT
TGATCAATCTCGGAGTCTCCAGGAAATAAGGGCTTTTGGGTGATCATCTCCGCAAATATG
CATCCCACAGACCAAATATCAACGGGTGTAGAGTAATGATGAGATCCTAGGAGTATCTCT
GGAGCTCGGTACCAGAGAGTAACCACCTCATGAGTAAATGTCCTGACAGGGATACCGAAC
GCTCTGGCCAGTCCAAAATCTGCAAGCTTGAGTGAGTTTGTGCGGCGATCAATCAACAAA
TTCTGT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2AV91JQ 784 0 0
TATATAGGAGAATACTGAACATGGTAAAAAAGATACACAAGAAAATGATCTCAAAAGCTT
AGAAGAACAAAACAACGCACACTCGAAATATTCCCATTTCGAACTAAAATAAGAACTAAA
GGAAAAGAATAAACAAAAACCATTTAATGTATTTTGCTTCGCCTTCTTGGGATTAACAAA
AGATTGAAAGATAATTATAAAGTGGATGAAGGAGATTACTGGTTCAGTAGCCTTTTCTAA
GGCATAACGCCAATATCCTTGAAGTAATCATGCTCCAAGGCAGCTCTTGCGTTGATTCTT
TTGGTTGGATCCATTAACAGCATTTTATAGAGGAGATCTATTCCATTGGGATCAAGACTT
GGAACAAAAGACTCTAAGCCCGTTTGTTTCCATTTAGGGAAAGCGGATTTGTAATCCGGC
AGGGAAGTTACCCCAGGCCATGTATCCTCGTATGGAGTTCCCATGATTCTGAAAATCTTG
AAGAGTTGATCAATCTCGGAGCCTCCAGGAAATAAGGGCTTTTGGGTGATCATCTCGGCA
AATATGCATCCCACAGACCAAATATCAACGGGTGTAGAGTAATGATGAGATCCTAGGAGT
ATCTCTGGAGCTCGGTACCAGAGAGTAACCACCTCATGAGTAAATGTCCTGACAGGGATA
CCGAATGCTCTGGCCAGTCCAAAATCTGCAAGCTTGAGTGAGTTTGTGCGGCGATCAATC
AACAAATTCTGTGGCTTCAGATCACGGTGGAGAACCCTGTGAGAGTGGCAATACGCAATC
CCGC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 2 4

CO CL1739Contig1 429 2 1 U
GGAGGGTTTGTGACTCTTCGCTTATCGCCGCTAAGCTCTGTCGCCTCCGTGAAACCGTCG
TTTCTTCAGAATGGATTCTCAGATTAAGCACGCCGTGGTGGTGAAAGTGATGGGCCGTAC
TGGGTCCAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTCAAGTTCACAGACTCTGATCGTTACAT
TATGAGAAACGTCAAGGGGCCCGTGAGAGAAGGCGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCTGA
GAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATTGGCCTTTTTTCTACCGCTAAGTGGAAACAAGAA
AACAGAACAATGTCTTGTTTCTCTTTTTTGGTTTCTGTGACCGGTTTAGTTTGGTTTGTT
GCTTTAAGACAGTTGCTGGATTGATATTGTTATTTGGTATTCAAAGCCTCTTCTTTATCT
GTTTGTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AB33JQ C 1
AF RR2AB33TF U 1
BS 1 429 RR2AB33TF

RD RR2AB33JQ 429 0 0
GGAGGGTTTGTGACTCTTCGCTTATCGCCGCTAAGCTCTGTCGCCTCCGTGAAACCGTCG
TTTCTTCAGAATGGATTCTCAGATTAAGCACGCCGTGGTGGTGAAAGTGATGGGCCGTAC
TGGGTCCAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTCAAGTTCACAGACTCTGATCGTTACAT
TATGAGAAACGTCAAGGGGCCCGTGAGAGAAGGCGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCTGA
GAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATTGGCCTTTTTTCTACCGCTAAGTGGAAACAAGAA
AACAGAACAATGTCTTGTTTCTCTTTTTTGGTTTCTGTGACCGGTTTAGTTTGGTTTGTT
GCTTTAAGACAGTTGCTGGATTGATATTGTTATTTGGTATTCAAAGCCTCTTCTTTATCT
GTTTGTTTC

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR2AB33TF 429 0 0
GGAGGGTTTGTGACTCTTCGCTTATCGCCGCTAAGCTCTGTCGCCTCCGTGAAACCGTCG
TTTCTTCAGAATGGATTCTCAGATTAAGCACGCCGTGGTGGTGAAAGTGATGGGCCGTAC
TGGGTCCAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTCAAGTTCACAGACTCTGATCGTTACAT
TATGAGAAACGTCAAGGGGCCCGTGAGAGAAGGCGACATCCTCACCTTGCTCGAGTCTGA
GAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATTGGCCTTTTTTCTACCGCTAAGTGGAAACAAGAA
AACAGAACAATGTCTTGTTTCTCTTTTTTGGTTTCTGTGACCGGTTTAGTTTGGTTTGTT
GCTTTAAGACAGTTGCTGGATTGATATTGTTATTTGGTATTCAAAGCCTCTTCTTTATCT
GTTTGTTTC

QA 1 429 1 429
DS 



CO CL1739Contig2 404 2 1 U
GGAGGGTTTGTGACTCTTCGCTTATCGCCGCTAAGCTCTGTCGCCTCCGTGAAACCGTCG
TTTCTTCAGGTTTGTTCCTCAATGGATTCTCAGATTAAGCACACCGAGGTGGTGAAAGTG
ATGGGCCGTACTGGGTCCAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTCAAGTTCACAGACTCT
GATCGTTACATTATGAGAAACGTCAAGGGGCCCGTGAGAGAAGGCGACATCCTCACCTTG
CTCGAGTCTGAGAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATTGGCCTTTTTTCTACCGCTAAGT
GGAAACAAGAAAACAGAACAATGTCTTGTTTCTCTTTTTTGGTTTCTGTGACCGGTTTAG
TTTGGTTTGTTGCTTTAAGACAGTTGCTGGATTGATATTGTTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F187JQ C 1
AF RR2F187TF U 1
BS 1 404 RR2F187TF

RD RR2F187JQ 404 0 0
GGAGGGTTTGTGACTCTTCGCTTATCGCCGCTAAGCTCTGTCGCCTCCGTGAAACCGTCG
TTTCTTCAGGTTTGTTCCTCAATGGATTCTCAGATTAAGCACACCGAGGTGGTGAAAGTG
ATGGGCCGTACTGGGTCCAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTCAAGTTCACAGACTCT
GATCGTTACATTATGAGAAACGTCAAGGGGCCCGTGAGAGAAGGCGACATCCTCACCTTG
CTCGAGTCTGAGAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATTGGCCTTTTTTCTACCGCTAAGT
GGAAACAAGAAAACAGAACAATGTCTTGTTTCTCTTTTTTGGTTTCTGTGACCGGTTTAG
TTTGGTTTGTTGCTTTAAGACAGTTGCTGGATTGATATTGTTAT

QA 1 404 1 404
DS 

RD RR2F187TF 404 0 0
GGAGGGTTTGTGACTCTTCGCTTATCGCCGCTAAGCTCTGTCGCCTCCGTGAAACCGTCG
TTTCTTCAGGTTTGTTCCTCAATGGATTCTCAGATTAAGCACACCGAGGTGGTGAAAGTG
ATGGGCCGTACTGGGTCCAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTCAAGTTCACAGACTCT
GATCGTTACATTATGAGAAACGTCAAGGGGCCCGTGAGAGAAGGCGACATCCTCACCTTG
CTCGAGTCTGAGAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATTGGCCTTTTTTCTACCGCTAAGT
GGAAACAAGAAAACAGAACAATGTCTTGTTTCTCTTTTTTGGTTTCTGTGACCGGTTTAG
TTTGGTTTGTTGCTTTAAGACAGTTGCTGGATTGATATTGTTAT

QA 1 404 1 404
DS 



AS 1 5

CO CL1740Contig1 1218 5 11 U
AGGGACCAATAGAAAACACACAGAAAATAATTCAGATAATACAAAAAAA*GAAAAAAATG
ATAATATAATCACATGAATCAGGCCATGTGCTTGCTTACACACTCCATGCAAATAGAGAT
CCTTTAATTCTTCCGCAAACTTCTCTTACACTAACAAAGCATCGTTGTTCCAAAAATAGA
TGCGCCTTTGTCTCTCTTTCATATCTCCAAGAAGCTTCGTCGTCTTTGGATCTCGCATTT
CCATTTTCTTTCCATTTTTGTAGTTCACTTTCTGATAAAATCTGACTCAAGACATTTTTT
TTTGGTAAAATCTTACTCAAGACATATCCAAAGAGAAGGTGTTTTGCTAGGTCACGACGA
GCGTCGAACATCTTACAATATTGACAATGTCAGAAAGATCCTCGAAGGTGGTCGTAAAGG
ATAACTCGCAGGTCAACACATCGTCGAGAATCTATTACTACGGCGGAGCTTCCGTGCCGT
TTTTATGGGAGACAAGGCCAGGGACACCAAAGCATCCCCTCTTCTCTGAATCCTTTCGTC
TTCCGCCGTTAACGCCACCTCCATCATATTACTCCTCCTCCTCCT***CTTCCTCCGGGA
ACAATCTCAGTAAAGTTAGAACGAAACAAACTCGGTTCGTGAAGACCTTGTTCAACGGGA
AGCATCACGTATCGCGTCCTTCGTTTTCTTGGTCATCTACAACATCTTCATCTTCTTCTT
CCTCTTCCTTCTCTTCCTCGTCTTCTCCTAGGTCTAAAACAGTGCATCGTGCCAACAAGT
GTTACCTTTCTTGCTCCAGATCGTACGTTAAGGAAGATGACGAGGACGAGATTGGTTCGT
ACTCGCCGACGTCAACGTTGTGTTATAAAAGAGGATTTAGTATGAAAAGAGTTTTGTGTT
CTATTCTAAGCCATAAATCTAGTCGTAATGATCTTAGCTTGGTGTAATGGCGTGTTGTCT
TGTTATGGTTGTTGTTATAAACATAGGATCTTGATTTTAAAGATCCGTTTGTTTTGTTTC
TTTATTTTTGTGCGAATGTCAAATTTTATGTTCCTGTGTGTGTGTTTGGCTTTTGCAGCT
TCGAACACGCATATTAGTGTTTGAATTGTGTTCATGTTCACATGTTTTTATGATATATTC
AGTTGCTCGTTGTTGTGATTTTGCAAATTATATTGTTTTTGAGTTTCTGTAATTTGAGTG
AATCATTTTGGTACGCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS92TF U 1
AF RR2A565TF U 24
AF RR2EY91TF U 3
AF RR2CS92JQ C 231
AF RR2EY91JQ C 692
BS 1 49 RR2CS92TF
BS 50 50 RR2A565TF
BS 51 751 RR2CS92TF
BS 752 752 RR2CS92JQ
BS 753 774 RR2CS92TF
BS 775 777 RR2CS92JQ
BS 778 795 RR2EY91TF
BS 796 881 RR2CS92JQ
BS 882 882 RR2EY91JQ
BS 883 998 RR2CS92JQ
BS 999 1218 RR2EY91JQ

RD RR2CS92TF 783 0 0
AGGGACCAATAGAAAACACACAGAAAATAATTCAGATAATACAAAAAAAAGAAAAAAATG
ATAATATAATCACATGAATCAGGCCATGTGCTTGCTTACACACTCCATGCAAATAGAGAT
CCTTTAATTCTTCCGCAAACTTCTCTTACACTAACAAAGCATCGTTGTTCCAAAAATAGA
TGCGCCTTTGTCTCTCTTTCATATCTCCAAGAAGCTTCGTCGTCTTTGGATCTCGCATTT
CCATTTTCTTTCCATTTTTGTAGTTCACTTTCTGATAAAATCTGACTCAAGACATTTTTT
TTTGGTAAAATCTTACTCAAGACATATCCAAAGAGAAGGTGTTTTGCTAGGTCACGACGA
GCGTCGAACATCTTACAATATTGACAATGTCAGAAAGATCCTCGAAGGTGGTCGTAAAGG
ATAACTCGCAGGTCAACACATCGTCGAGAATCTATTACTACGGCGGAGCTTCCGTGCCGT
TTTTATGGGAGACAAGGCCAGGGACACCAAAGCATCCCCTCTTCTCTGAATCCTTTCGTC
TTCCGCCGTTAACGCCACCTCCATCATATTACTCCTCCTCCTCCT***CTTCCTCCGGGA
ACAATCTCAGTAAAGTTAGAACGAAACAAACTCGGTTCGTGAAGACCTTGTTCAACGGGA
AGCATCACGTATCGCGTCCTTCGTTTTCTTGGTCATCTACAACATCTTCATCTTCTTCTT
CCTCTTCCTTCTCTTCCTCGTCTTCTCCTAG*TCTAAAACAGTGCATCGTGCCA
ACAAGTGTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2A565TF 724 0 0
AAAATAATTCAGATAATACAAAAAAA*GAAAAAAATGATAATATAATCACATGAATCAGG
CCATGTGCTTGCTTACACACTCCATGCAAATAGAGATCCTTTAATTCTTCCGCAAACTTC
TCTTACACTAACAAAGCATCGTTGTTCCAAAAATAGATGCGCCTTTGTCTCTCTTTCATA
TCTCCAAGAAGCTTCGTCGTCTTTGGATCTCGCATTTCCATTTTCTTTCCATTTTTGTAG
TTCACTTTCTGATAAAATCTGACTCAAGACATTTTTTTTTGGTAAAATCTGACTCAAGAC
ATATCCAAAGAGAAGGTGTTTTGCTAGGTCACGACGAGCGTCGAACATCTTACAACATTG
ACAATGTCAGAAAGATCCTCGAAGGTGGTCGTAAAGGATAACTCGCAGGTCAACACATCG
TCGAGAATCTATTACTACGGCGGAGCTTCCGTGCCGTTTTTATGGGAGACAAGGCCAGGG
ACACCAAAGCATCCCCTCTTCTCTGAATCCTTTCGTCTTCCGCCGTTAACGCCACCTCCA
TCATATTACTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCGGGAACAATCTCAGTAAAGTTAGAACG
AAACAAACTCGGTTCGTGAAGACCTTGTTCAACGGGAAGCATCACGTATCGCGTCCTTCG
TTTTCTTGGTCATCTACAACATCTTCATCTTCTTCTTCCTCTTCCTTCTCTTCCTCGTCT
TCTC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2EY91TF 793 0 0
GGACCAATAGAAAACACACAGAAAATAATTCAGATAATACAAAAAAA*GAAAAAAATGAT
AATATAATCACATGAATCAGGCCATGTGCTTGCTTACACACTCCATGCAAATAGAGATCC
TTTAATTCTTCCGCAAACTTCTCTTACACTAACAAAGCATCGTTGTTCCAAAA*TAGATG
CGCCTTTGTCTCTCTTTCATATCTCCAGGAAGCTTCGTCGTCTTTGGATCTCGCATTTCC
ATTTTCTTTCCATTTTTGTAGTTCACTTTCTGATAAAATCTGACTCAAGACATTTTTTTT
TGGTAAAATCTGACTCAAGACATATCCAAAGAGAAGGTGTTTTGCTAGGTCACGACGAGC
GTCGAACATCTTACAATATTGACAATGTCAGAAAGATCCTCGAAGGTGGTCGTAAAGGAT
AACTCGCAGGTCAACACATCGTCGAGAATCTATTACTACGGCGGAGCTTCCGTGCCGTTT
TTATGGGAGACAAGGCCAGGGACACCAAAGCATCCCCTCTTCTCTGAATCCTTTCGTCTT
CCGCCGTTAACGCCACCTCCATCATATTACTCCTCCTCCTCCT***CTTCCTCCGGGAAC
AATCTCAGTAAAGTTAGAACGAAACAAACTCGGTTCGTGAAGACCTTGTTCAACGGGAAG
CATCACGTATCGCGTCCTTCGTTTTCTTGGTCATCTACA*CATCTTCATCTTCTTCTTCC
TCTTCCTT*TCTTCCTCGTCTTCTC*TAG*TCTAAA*CAGTGCATCGTGCCAC**AGTGT
TACCTTTCTTGCT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2CS92JQ 768 0 0
TCTCGCATTTCCATTTTCTTTCCATTTT*GTAGTTCACTTTCTGATAAAATCTGACTCAA
GACATTTTTTTT*GGTAAAATCTTACTCAAGACATATCCAAAGAGAAGGTGTTTTGCTAG
GTCACGACGAGCGTCGAACATCTTACAATATTGACAATGTCAGAAAGATCCTCGAAGGTG
GTCGTAAAGGATAACTCGCAGGTCAACACATCGTCGAGAATCTATTACTACGGCGGAGCT
TCCGTGCCGTTTTTATGGGAGACAAGGCCAGGGACACCAAAGCATCCCCTCTTCTCTGAA
TCCTTTCGTCTTCCGCCGTTAACGCCACCTCCATCATATTACTCCTCCTCCTCCT***CT
TCCTCCGGGAACAATCTCAGTAAAGTTAGAACGAAACAAACTCGGTTCGTGAAGACCTTG
TTCAACGGGAAGCATCACGTATCGCGTCCTTCGTTTTCTTGGTCATCTACAACATCTTCA
TCTTCTTCTTCCTCTTCCTTCTCTTCCTCGTCTTCTCCTAGGTCTAAAACAGTGCATCGT
GCCAACAAGTGTTACCTTTCTTGCTCCAGATCGTACGTTAAGGAAGATGACGAGGACGAG
ATTGGTTCGTACTCGCCGACGTCAACGTTGTGTTATAAAAGAGGATTTAGTGTGAAAAGA
GTTTTGTGTTCTATTCTAAGCCATAAATCTAGTCGTAATGATCTTAGCTTGGTGTAATGG
CGTGTTGTCTTGTTATGGTTGTTGTTATAAACATAGGATCTTGATTTT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2EY91JQ 527 0 0
GTCATCTACAACATCTTCATCTTCTTCTTCCTCTTCCTTCTCTTCCTCGTCTTCTCCTAG
GTCTAAACCAGTGCATCGTGCCAACAAGTGTTACCTTTCTTGCTCCAGATCGTACGTTAA
GGAAGATGACGAGGACGAGATTGGTTCGTACTCGCCGACGTCAACGTTGTGTTATAAAAG
AGGATTTAGTATGGAAAGAGTTTTGTGTTCTATTCTAAGCCATAAATCTAGTCGTAATGA
TCTTAGCTTGGTGTAATGGCGTGTTGTCTTGTTATGGTTGTTGTTATAAACATAGGATCT
TGATTTTAAAGATCCGTTTGTTTTGTTTCTTTATTTTTGTGCGAATGTCAAATTTTATGT
TCCTGTGTGTGTGTTTGGCTTTTGCAGCTTCGAACACGCATATTAGTGTTTGAATTGTGT
TCATGTTCACATGTTTTTATGATATATTCAGTTGCTCGTTGTTGTGATTTTGCAAATTAT
ATTGTTTTTGAGTTTCTGTAATTTGAGTGAATCATTTTGGTACGCCC

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 5

CO CL1741Contig1 848 5 23 U
GGATCTCTCTATAATCTATCCCCCTCTGTTTCGACTAATCAACAGTGAACATTTGTGTAT
CTGCATTCCCTTCATGGCTGTTCTGTTTCTCTATCTTCTCAGTCTCCTCATGGCTGGCCA
TTGTAGCGCCACATGGTGTGTGTGCAAAACAGGGCTGAGTGACTCAGTGCTCCAAAGGAC
ACTAGACTATGCTTGTGGAAATGGAGCTGACTGTAACCCAACTCACCCAAAAGGGTCTTG
CTTCAACCCTGACAATGTTAGAGCTCATTGTAACTATGCTGTCAATAGCTTCTTTCAGGA
GAAAGGTCAAGCTTCTGAGTCTTGCAACTTCACTGGTACTGCCACTCCTACCACCACTGA
ACCCAGCTATTCAGGATGTCCATTCCCTTCTAGTGTTAGTGGCACTGGAGGTGGTAGCAG
CAGCACCGTGACGCCAGGTAAAAGCAGTCCAAAGGGAAACAACTCTATCACGACATTTCC
CGGTGGAAACAGTCCATACACTGGCAGTCCATTCACTGGCACACCAACCACCGGACTGCT
AGGAGGCAATATCACTGATGCTACCGGAACCGGGTTAAACCCGGATTACTCAAACGAAAG
CACCGGTTTCGTGCTGCGTAATTCCAACACTTTGTTCCTCTGCTTGTTTTCTGTCTTGAT
GATGCTCTGAAGACGATGGATGGTCTGGTCTATCTTTTGTTCACTATCTAAATATGTTAT
GTTCTAGTTCGTTTGGGTTCATGCTTATCTATTTTAAGGAAAACAATTAACAATGTAAAA
CTGAATCGTTTTGGGACGAATTTGGTTTCTATTTAATATATTTAAATCTTAAGAAACATA
TTAAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 0 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
10 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU69JQ C 172
AF RR2GN22TF U 1
AF RR2EU69TF U 15
AF RR2H807TF U 688
AF RR2GN22JQ C 330
BS 1 22 RR2GN22TF
BS 23 23 RR2EU69TF
BS 24 43 RR2GN22TF
BS 44 44 RR2EU69TF
BS 45 117 RR2GN22TF
BS 118 118 RR2EU69TF
BS 119 264 RR2GN22TF
BS 265 265 RR2EU69TF
BS 266 298 RR2GN22TF
BS 299 299 RR2EU69TF
BS 300 300 RR2GN22TF
BS 301 301 RR2EU69TF
BS 302 304 RR2GN22TF
BS 305 305 RR2EU69TF
BS 306 306 RR2GN22TF
BS 307 307 RR2EU69TF
BS 308 324 RR2GN22TF
BS 325 325 RR2EU69TF
BS 326 594 RR2GN22TF
BS 595 680 RR2EU69TF
BS 681 687 RR2GN22JQ
BS 688 830 RR2H807TF
BS 831 848 RR2GN22JQ

RD RR2EU69JQ 316 0 0
CCAAAGGGCATTG
GACTATGCTTGTGGAAATGGAGCTGACTGTAACCCAACTCACCCAAAAGGGTCTTGCTTC
AACCCTGACAATGTTAGAGCTCATTGTAACTATGCTGTCAATAGCTTCTTTCAGGAGAAA
GGTCAAGCTTCTGAGTCTTGCAACTTCACTGGTACTGCCACTCCTACCACCACTGATCCC
AGCTATTCAGGATGTCCATTCCCTTCTAGTGTTAGTGGCACTGGAGGTGGTAGCAGCAGC
ACCGTGACGCCAGGTAAAAGCAGTCCAAAGGGAAACAACTCTATCACGACATTTCCCGGT
AGA

QA 14 313 14 313
DS 

RD RR2GN22TF 594 0 0
GGATCTCTCTATAATCTATCCCTCTCTGTTTCGACTAATCAACTGTGAACATTTGTGTAT
CTGCATTCCCTTCATGGCTGTTCTGTTTCTCTATCTTCTCAGTCTCCTCATGGCTGGTCA
TTGTAGCGCCACATGGTGTGTGTGCAAAACAGGGCTGAGTGACTCAGTGCTCCAAAGGAC
ACTAGACTATGCTTGTGGAAATGGAGCTGACTGTAACCCAACTCACCCAAAAGGGTCTTG
CTTCAACCCTGACAATGTTAGAGCGCATTGTAACTATGCTGTCAATAGCTTCTTTCAGAA
AAAAAGGCAAGCTTCTGAGTCTTGTAACTTCACTGGTACTGCCACTCCTACCACCACTGA
ACCCAGCTATTCAGGATGTCCATTCCCTTCTAGTGTTAGTGGCACTGGAGGTGGTAGCAG
CAGCACCGTGACGCCAGGTAAAAGCAGTCCAAAGGGAAACAACTCTATCACGACATTTCC
CGGTGGAAACAGTCCATACACTGGCAGTCCATTCACTGGCACACCAACCACCGGACTGCT
AGGAGGCAATATCACTGATGCTACCGGAACCGGGTTAAACCCGGATTACTCAAA

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2EU69TF 666 0 0
GGG
ATCCCCCTCTGTTTCGACTAATCAACAGTGAACATTTGTGTATCTGCATTCCCTTCATGG
CTGTTCTGTTTCTCTATCTTCTCAGTCTCCTCATGGCTGGCCATTGTAGCGCCACATGGT
GTGTGTGCAAAACAGGGCTGAGTGACTCAGTGCTCCAAAGGGCATTGGACTATGCTTGTG
GAAATGGAGCTGACTGTAACCCAACTCACCCAAAAGGGTCTTGCTTCAACCCTGACAATG
TTAGAGCTCATTGTAACTATGCTGTCAATAGCTTCTTTCAGGAGAAAGGTCAAGCTTCTG
AGTCTTGCAACTTCACTGGTACTGCCACTCCTACCACCACTGATCCCAGCTATTCAGGAT
GTCCATTCCCTTCTAGTGTTAGTGGCACTGGAGGTGGTAGCAGCAGCACCGTGACGCCAG
GTAAAAGCAGTCCAAAGGGAAACAACTCTATCACGACATTTCCCGGTGGAAACAGTCCAT
ACACTGGCAGTCCATTCACTGGCACACCAACCACCGGACTGCTAGGAGGCAATATCACTG
ATGCTACCGGAACCGGGTTAAACCCGGATTACTCAAACGAAAGCACCGGTTTCGTGCTGC
GTAATTCCAACACTTTGTTCCTCTGCTTGTTTTCTGTCTTGATGATGCTCTGAAGACGAT
GGA

QA 4 666 4 666
DS 

RD RR2H807TF 143 0 0
GTCTATCTTTTGTTCACTATCTAAATATGTTATGTTCTAGTTCGTTTGGGTTCATGCTTA
TCTATTTTAAGGAAAACAATTAACAATGTAAAACTGAATCGTTTTGGGACGAATTTGGTT
TCTATTTAATATATTTAAATCTT

QA 1 143 1 143
DS 

RD RR2GN22JQ 519 0 0
TCACTGGTACTGCCACTCCTACCACCACTGAACCCAGCTATTCAGGATGTCCATTCCCTT
CTAGTGTTAGTGGCACTGGAGGTGGTAGCAGCAGCACCGTGACGCCAGGTAAAAGCAGTC
CAAAGGGAAACAACTCTATCACGACATTTCCCGGTGGAAACAGTCCATACACTGGCAGTC
CATTCACTGGCACACCAACCACCGGACTGCTAGGAGGCAATATCACTGATGCTACCGGAA
CCGGGTTAAACCCGGATTACTCAAACGAAAGCACCGGTTTCGTGCTGCGTAATTCCAACA
CTTTGTTCCTCTGCTTGTTTTCTGTCTTGATGATGCTCTGAAGACGATGGATGGTCTGGT
CTATCTTTTGTTCACTATCTAAATATGTTATGTTCTAGTTCGTTTGGGTTCATGCTTATC
TATTTTAAGGAAAACAATTAACAATGTAAAACTGAATCGTTTTGGGACGAATTTGGTTTC
TATTTAATATCTTTAAATCTTAAGAAACATATTAAATTT

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 4

CO CL1742Contig1 1677 4 18 U
GGAACATATTTCTTGGTGGAGTGAATTAATGGCGTTACTCTAAGATCGATTCGAACTCTT
TCTCTGTTTTATCATTTTTCTCCTTCACACTCTACACACAAGGGGCGGCTTTTTTTCTCA
TAGTTAGTAGAACCAGAGCAATGGGAATCTCTGGACGACCTCTGATCTCTGTCTTCGTAT
TCTTTTTGCTCTCCGCTCACCACCAAATCATCTCCCTCGGAGATCCCATCACTTGCTCCG
GTATAGTTCCGAAGAAACACAAGAGCCAGATGCTGTCCATTTCTGACTTTGGCGCTGTCG
GTGACGGCACCACCTTGAACACCAATGCTTTTAACGCCGCCATTGATACCATACGCAACT
CCAAAAACAACGCTAGCGAGGGAAGTCTTCTGTACGTGCCTCGTGGTGTGTATTTAACTC
AGACCTTCAACCTTACCAGTCACATGACTCTTTACCTCGCCCATGGTGCTGTCATCAAAG
CCCTTCAGGATACGGAGAAATGGCCTTTGATCGACCCTTTGCCTTCTTATGGCAGAGGAA
GGGAGCGCCCTGGTCCAAGGTATATTAGCCTCATCCATGGAGACGGACTCACCGACGTTG
TTATCACAGGCAAAAATGGGACCATTGACGGTGCAGGAGAACCTTGGTGGAACATGTGGA
GACATGGAACTCTAAAGTTCACCAGACCTGGTCTCGTCGAATTCAAGAATTCAAGTGACA
TCCTCATTTCTCATGTTGTTCTTCAGAACTCCCCTTTCTGGACTCTCCATCCTGTTTACT
GCAGTGGTGTTGTTGTTCATCACGTTACCATCCTCGCTCCAACTGATTCTCCAAACACCG
ATGGGATTGATCCAGATTCGAGCTCTAACGTATGTATAGAAGACTCCTACATATCCACTG
GCGACGACCTTGTAGCAGTGAAGAGCGGTTGGGACGAGTATGGCATTGCCTACAACCGTC
CCAGCCGTGACATCACCATCCGACGCATCACCGGATCTACCTCATTTGCTGGAATAGCTA
TCGGAAGCGAAACCTCCGGCGGTATCCAGAATGTCACCGTGGAAAACATCACTTTGTTCA
ATTCCGGAATAGGCATCCGCATCAAGACAAACACTGGCCGAGGAGGAAGCATCCAGGGGA
TCACAGTCTCGGGAGTTCACATGGAAAAAGTCCGGACCGGCATTAAGATCTCCGGCGACA
CCGGAGACCACCCGGATGATCAGTTCAACACATCGGCTCTCCCTGTCGTAAGAGGCATAA
CGATCAGGAACGTCTGGGGAATCGAGGTCGAGCGAGCTGGCATGGTTCAGGGATTGAAAG
ATGCTCCTTTCACCAACCTATGCTTCTCCAATGTTACATTCACCGGAACAAAAGGCCCTC
CGATATGGAAATGCTCAGATGTCGTTGGAGCCGCTGATAAAGTCAACCCCACGGCATGCC
CTGAGTTGACCACAACGGCCCAACAAGGCGGTTCCTGCGGAAACCAAGCATAATATGTAC
TACTCCAAAAGCGTAATGTAATTTATGAATTTAATTTAATTTAAACTAATAGGATTAAAG
TCTTACAGAATCACATGTTATATAGACAAAATCAGCTTCATATCATATGGAAGCTATTTG
TTTGCTTTATTGTTATCTTTACTAGATTTAAAAGACAAACTAGAGTCTTCTTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK44TF U 1
AF RR2BX63TF U 234
AF RR2FC41TF U 721
AF RR2FC41JQ C 1035
BS 1 747 RR2BK44TF
BS 748 748 RR2BX63TF
BS 749 759 RR2BK44TF
BS 760 815 RR2BX63TF
BS 816 816 RR2FC41TF
BS 817 871 RR2BX63TF
BS 872 872 RR2FC41TF
BS 873 917 RR2BX63TF
BS 918 918 RR2FC41TF
BS 919 954 RR2BX63TF
BS 955 955 RR2FC41TF
BS 956 961 RR2BX63TF
BS 962 962 RR2FC41TF
BS 963 1013 RR2BX63TF
BS 1014 1374 RR2FC41TF
BS 1375 1375 RR2FC41JQ
BS 1376 1428 RR2FC41TF
BS 1429 1677 RR2FC41JQ

RD RR2BK44TF 759 0 0
GGAACATATTTCTTGGTGGAGTGAATTAATGGCGTTACTCTAAGATCGATTCGAACTCTT
TCTCTGTTTTATCATTTTTCTCCTTCACACTCTACACACAAGGGGCGGCTTTTTTTCTCA
TAGTTAGTAGAACCAGAGCAATGGGAATCTCTGGACGACCTCTGATCTCTGTCTTCGTAT
TCTTTTTGCTCTCCGCTCACCACCAAATCATCTCCCTCGGAGATCCCATCACTTGCTCCG
GTATAGTTCCGAAGAAACACAAGAGCCAGATGCTGTCCATTTCTGACTTTGGCGCTGTCG
GTGACGGCACCACCTTGAACACCAATGCTTTTAACGCCGCCATTGATACCATACGCAACT
CCAAAAACAACGCTAGCGAGGGAAGTCTTCTGTACGTGCCTCGTGGTGTGTATTTAACTC
AGACCTTCAACCTTACCAGTCACATGACTCTTTACCTCGCCCATGGTGCTGTCATCAAAG
CCCTTCAGGATACGGAGAAATGGCCTTTGATCGACCCTTTGCCTTCTTATGGCAGAGGAA
GGGAGCGCCCTGGTCCAAGGTATATTAGCCTCATCCATGGAGACGGACTCACCGACGTTG
TTATCACAGGCAAAAATGGGACCATTGACGGTGCAGGAGAACCTTGGTGGAACATGTGGA
GACATGGAACTCTAAAGTTCACCAGACCTGGTCTCGTCGAATTCAAGAATTCAAGTGACA
TCCTCATTTCTCATGTTGTTCTTCAGA*CTCCCCTTTCT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2BX63TF 787 0 0
G
GCTCCGGTATAGTTCCGAAGAAACACAGGAGCCAGATGCTGTCCATTTCTGACTTTGGCG
CTGTCGGTGACGGCACCACCTTGAACACCAATGCTTTTAACGCCGCCATTGATACCATAC
GCAACTCCAAAAACAACGCTAGCGAGGGAAGTCTTCTGTACGTGCCTCGTGGTGTGTATT
TAACTCAGACCTTCAACCTTACCAGTCACATGACTCTTTACCTCGCCCATGGTGCTGTCA
TCAAAGCCCTTCAGGATACGGAGAAATGGCCTTTGATCGACCCTTTGCCTTCTTATGGCA
GAGGAAGGGAGCGCCCTGGTCCAAGGTATATTAGCTTCATCCATGGAGACGGACTCACCG
ACGTTGTTATCACAGGCAAAAATGGGACCATTGACGGTGCAGGAGAACCTTGGTGGAACA
TGTGGAGACATGGAACTCTAAAGTTCACCAGACCTGGTCTCGTCGAATTCAAGAATTCAA
GTGACATCCTCATTTCTCATGTTGTTCTTCAGAACTCCCCTTTCTGGACTCTCCATCCTG
TTTACTGCAGTGGTGTTGTTGTTCATCACGTTACCATCCTCTCTCCAACTGATTCTCCAA
ACACCGATGGGATTGATCCAGATTCGAGCTCTAACGTTTGTATAGAAGACTCCTACATAT
CCACTGGCGACGACCTTGTAGCA*TGAAGAGCGGTTGGGACGAGTATGGCATTGCCTACA
*CCGTCC*AGCCGTGACATCACCATCCGACGCATCACCGGATCTACCTCATTTGCTGGA
TAGCTAT

QA 2 780 2 780
DS 

RD RR2FC41TF 708 0 0
G
CCTCATCTCTCATGTTGTTCTTCAGAACTCCCCTTTCTGGACTCTCCATCCTGTTTACTG
CAGTGGTGTTGTTGTTCATCACGTTACCATCCTCGCTCCAACTGATTCTCCAAACACGGA
TGGGATTGATCCAGATTCGATCTCTAACGTATGTATAGAAGACTCCTACATATCCACTGG
CGACGACCTTGTAGCCGTGAAGAGCGGTTGGGACGAGTATGGCATTGCCTACAACCGTCC
CAGCCGTGACATCACCATCCGACGCATCACCGGATCTACCTCATTTGCTGGAATAGCTAT
CGGAAGCGAAACCTCCGGCGGTATCCAGAATGTCACCGTGGAAAACATCACTTTGTTCAA
TTCCGGAATAGGCATCCGCATCAAGACAAACACTGGCCGAGGAGGAAGCATCCAGGGGAT
CACAGTCTCGGGAGTTCACATGGAAAAAGTCCGGACCGGCATTAAGATCTCCGGCGACAC
CGGAGACCACCCGGATGATCAGTTCAACACATCGGCTCTCCCTGTCGTAAGAGGCATAAC
GATCAGGAACGTCTGGGGAATCGAGGTCGAGCGAGCTGGCATGGTTCAGGGATTGAAAGA
TGCTCCTTTCACCAACCTATGCTTCTCCAATGTTACATTCACCGGAACAAAAG*CCCTCC
GATATGGAAATGCTCAGATGTCGTTGGAGCCGCTGATAAAGTCAACC

QA 2 708 2 708
DS 

RD RR2FC41JQ 643 0 0
TCC
GGCGGTATCCAGAATGTCACCGTGGAAAACATCACTTTGTTCAATTCCGGAATAGGCATC
CGCATCAAGACAAACACTGGCCGAGGAGGAAGCATCCAGGGGATCACAGTCTCGGGAGTT
CACATGGAAAAAGTCCGGACCGGCATTAAGATCTCCGGCGACACCGGAGACCACCCGGAT
GATCAGTTCAACACATCGGCTCTCCCTGTCGTAAGAGGCATAACGATCAGGAACGTCTGG
GGAATCGAGGTCGAGCGAGCTGGCATGGTTCAGGGATTGAAAGATGCTCCTTTCACCAAC
CTATGCTTCTCCAATGTTACATTCACCGGAACAAAAGGCCCTCCGATATGGAAATGCTCA
GATGTCGTTGGAGCCGCTGATAAAGTCAACCCCACGGCATGCCCTGAGTTGACCACAACG
GCCCAACAAGGCGGTTCCTGCGGAAACCAAGCATAATATGTACTACTCCAAAAGCGTAAT
GTAATTTATGAATTTAATTTAATTTAAACTAATAGGATTAAAGTCTTACAGAATCACATG
TTATATAGACAAAATCAGCTTCATATCATATGGAAGCTATTTGTTTGCTTTATTGTTATC
TTTACTAGATTTAAAAGACAAACTAGAGTCTTCTTTGTCC

QA 4 643 4 643
DS 



AS 1 5

CO CL1743Contig1 1177 5 62 U
GAAAGTTGTGTCTATCTGTCTCCACGATTCACGCCTTGAGTCTTGACCCCTCCTCCTCAT
CATCATCCCCCCT*TCTCAACAAAAGCAATTCGTTCATCGCTGCGTTGGAGAAATCAACG
AAAGAGAGAGAGAAGATGAGTTTTCAAGATTTAGAAGCAGGGAGAGGAGGAAGATCGAGG
AAGATGAATGGAGGTGGTCGCCAAGATTCCACGCAAGCCGTCGCTTCGGGTATCTTCCAG
ATCAATACCGGAGTCTCCACCTTTCAGCGGCTCGTTAACACGCTCGGTACTCCCAAAGAT
ACCCCCGAGCTCCGTGACAAGCTGCACAAGACACGGTTGCATATTGGCCAGCTTGTGAAG
GACACTTCTGCTAAGCTTAAAGAAGCTAGTGAAACTGATCATCGAACCCGTGTCAATGCA
AGTAAGAAGATTGCAGATGCTAAGCTAGCAAAGGACTTTCAAGCTGTGTTGAAAGAGTTT
CAGAAAGCTCAACAGACTGCTGCTGAAAGAGAAACCGCTTATGCTCCTCTCCTCCCTCCT
TCTTCTCTTCCCTCTAGCTATACAGCGAGTGAAGTAGACAATATTCCTGAACAGAGGG*C
ACAAGTTATGGAATCAAAAAGGCAGGAACTTGTATTGTTAGACAACGAGATTGCTTTCAA
CGAAGCTGTGATCGAAGAAAGAGAACAAGTGATACAAGAAATCCACACTCAAATCGG*AG
AGGTTAACGAAATTTTCAAAGATCTCGCGGTTCTTGTTAACGACCAAGGAGTCATGATTG
ATGATATTGGTACTCACATTGACAACTCTCGAGCTGCAACTGCTCAAGGAAAATCTCAGC
TCGCTCAAGCCTCCAAAACCCAAAGATCAAACTCATCTCTGACATGCTTGCTCTTGGTGA
TATTTGGCATTGTACTCCTGATTGTTATCATCGTACTCGCAGCTTGATTTTGGAAAAGCA
AGAACCAAGTCTTTCAATGTGTTCAACGAGTGAGTGCGACTACTTTGGTATATATAAGAT
AAATTTGCGGACAAAAAGCGTAGAAGTTGGGTTTTGTATTGGTTCGGTTTGAGGATTTAT
TGGTGAATGTAACAGAGTGCGTGTGTGTGTGTTGGTTTTCTTTGTGGTGCAAAACTATTT
GTTGCGAGATATTGGTTTAATTTTTTTTCAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA75TF U 63
AF RR2B980TF U 1
AF RR2A313TF U 36
AF RR2FE15JQ C 565
AF RR2FE15TF U 565
BS 1 66 RR2B980TF
BS 67 68 RR2A313TF
BS 69 73 RR2B980TF
BS 74 74 RR2A313TF
BS 75 82 RR2B980TF
BS 83 83 RR2A313TF
BS 84 84 RR2B980TF
BS 85 85 RR2A313TF
BS 86 100 RR2B980TF
BS 101 101 RR2A313TF
BS 102 131 RR2B980TF
BS 132 133 RR2A313TF
BS 134 163 RR2B980TF
BS 164 164 RR2A313TF
BS 165 227 RR2B980TF
BS 228 228 RR2A313TF
BS 229 248 RR2B980TF
BS 249 249 RR2A313TF
BS 250 251 RR2B980TF
BS 252 252 RR2A313TF
BS 253 317 RR2B980TF
BS 318 318 RR2A313TF
BS 319 319 RR2B980TF
BS 320 320 RR2A313TF
BS 321 338 RR2B980TF
BS 339 339 RR2A313TF
BS 340 347 RR2B980TF
BS 348 348 RR2A313TF
BS 349 353 RR2B980TF
BS 354 354 RR2A313TF
BS 355 401 RR2B980TF
BS 402 402 RR2A313TF
BS 403 417 RR2B980TF
BS 418 418 RR2A313TF
BS 419 491 RR2B980TF
BS 492 492 RR2A313TF
BS 493 494 RR2B980TF
BS 495 495 RR2A313TF
BS 496 505 RR2B980TF
BS 506 506 RR2A313TF
BS 507 575 RR2B980TF
BS 576 576 RR2A313TF
BS 577 598 RR2B980TF
BS 599 599 RR2A313TF
BS 600 612 RR2B980TF
BS 613 613 RR2A313TF
BS 614 654 RR2B980TF
BS 655 655 RR2A313TF
BS 656 684 RR2B980TF
BS 685 685 RR2A313TF
BS 686 689 RR2B980TF
BS 690 690 RR2FE15TF
BS 691 714 RR2B980TF
BS 715 715 RR2A313TF
BS 716 717 RR2B980TF
BS 718 718 RR2A313TF
BS 719 763 RR2B980TF
BS 764 764 RR2A313TF
BS 765 767 RR2B980TF
BS 768 768 RR2FE15TF
BS 769 824 RR2B980TF
BS 825 1177 RR2FE15TF

RD RR2DA75TF 556 0 0
GG
ATCCCCCCT*TCTCAACAAAAGCAATTCGTTCATCGCTGCGTTGGAGAAATCAACGAAAG
AGAGAGAGAAGATGAGTTTTCAAGATTTAGAAGCAGGGAGAGGAGGAAGATCGAGGAAGA
TGAATGGAGGTGGTCGCCAAGATTCCACGCAAGCCGTCGCTTCGGGTATCTTC*AGATCA
ATACCGGAGTCTCCACCTTTCAGCGGCTCGTTAACACGCTCGGTACTCCCAAAGATACCC
CCGAGCTCCGTGACAAGCTGCACAAGACACGGTTGCATATTGGCCAGCTTGTGAAGGACA
CTTCTGCTAAGCTTAAAGAAGCTAGTGAAACTGATCATCGAACCCGTGTCAATGCAAGTA
AGAAGATTGCAGATGCTAAGCTAGCAAAGGACTTTCAAGCTGTGTTGAAAGAGTTTCAGA
AAGCTCAACAGACTGCTGCTGAAAGAGAAACCTCTTATGCTCCTCTCCTCCCTCCTTCTT
CTCTTCCCTCTAGCTATACAGCGAGTGAAGTAGACAATATTCCTGAACAGAGGG*CACAA
GTTATGGAATCAAA

QA 3 556 3 556
DS 

RD RR2B980TF 824 0 0
GAAAGTTGTGTCTATCTGTCTCCACGATTCACGCCTTGAGTCTTGACCCCTCCTCCTCAT
CATCATTTCCCCTCTCTCAACAGA*GCAATTCGTTCATCGTTGCGTTGGAGAAATCAACG
AAAGAGAGAGA**AGATGAGTTTTCAAGATTTAGAAGCAGGGAAAGGAGGAAGATCGAGG
AAGATGAATGGAGGTGGTCGCCAAGATTCCACGCAAGCCGTCGCTTCCGGTATCTTCCAG
ATCAATACGGGTGTCTCCACCTTTCAGCGGCTCGTTAACACGCTCGGTACTCCCAAAGAT
ACCCCCGAGCTCCGTGATATGCTGCACAAGACACGGTTACATATTGGTCAGCTGGTGAAG
GACACTTCTGCTAAGCTTAAAGAAGCTAGTGAAACTGATCACCGAACCCGTGTCAATCCA
AGTAAGAAGATTGCAGATGCTAAGCTAGCAAAGGACTTTCAAGCTGTGTTGAAAGAGTTT
CAGAAAGCTCAGCAAACTGCTGCTGGAAGAGAAACCGCTTATGCTCCTCTCCTCCCTCCT
TCTTCTCTTCCCTCTAGCTATACAGCGAGTGAAGTGGACAATATTCCTGAACAGAGGGGC
ACAAGTTATGGAGTCAAAAAGGCAGGAACTTGTATTGTTAGACAACGAGATTGCATTCAA
CGAAGCTGTGATCGAAGAAAGAGAGCAAGGGATACAAGAAATCCACACTCAAATTGGGAG
AGGTTAACGAAATTTTCAAAGATCTCGCGGTTCTTGTTAACGATCAAAGAGTCATGATTG
ATGATATTGGTACTCACATTGACAACTCTCGAGCTGCAACTGCT

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2A313TF 789 0 0
GG
GAGTCTTGACCCCTCCTCCTCCTCATCATCCCCCCT*TCTCAACAAAAGCAATTCGTTCA
TCGCTGCGTTGGAGAAATCAACGAAAGAGAGAGAGAAGATGAGTTTTCAAGATTTAGAAG
CAGGGAGAGGAGGAAGATCGAGGAAGATGAATGGAGGTGGTCGCCAAGATTCCACGCAAG
CCGTCGCTTCGGGTATCTTCCAGATCAATACCGGAGTCTCCACCTTTCAGCGGCTCGTTA
ACACGCTCGGTACTCCCAAAGATACCCCCGAGCTCCGTGACAAGCTGCACAAGACACGGT
TGCATATTGGCCAGCTTGTGAAGGACACTTCTGCTAAGCTTAAATAAGCTAGTGAAACTG
ATCATCGAACCCGTGTCAATGCAAGTAAGAAGATTGCAGATGCTAAGCTAGCAAAGGACT
TTCAAGCTGTGTTGAAAGAGTTTCAGAAAGCTCAACAGACTGCTGCTGAAAGAGAAACCG
CTTATGCTCCTCTCCTCCCTCCTTCTTCTCTTCCCTCTAGCTATACAGCGAGTGAAGTAG
ACAATATTCCTGAACAGAGGG*CACAAGTTATGGAATCAAAAAGGCAGGAACTTGTATTG
TTAGACAACGAGATTGCTTTCAACGAAGCTGTGATCGAAGAAAGAGAACAAGGGATACAA
GAAATCCACACTCAAATCGG*AGAGGTTAACGAAATTTTCAA*GATCTCGCGGTTCTTGT
TAACGACCAAAGAGTCATGATTGATGATATTGGTACTCACATTGACAACTCTCGAGCTGC
AACTGCT

QA 3 789 3 789
DS 

RD RR2FE15JQ 605 0 0
GCGAGTGAAGTAGACAATATTCCTGAACAGAGGG*CACAAGTTATGGAATCAAAAAGGCA
GGAACTTGTATTGTTAGACAACGAGATTGCTTTCAACGAAGCTGTGATCGAAGAAAGAGA
ACAAGTGATACAAGAAATCCACACTCAAATCGG*AGAGGTTAACGAAATTTTCAAAGATC
TCGCGGTTCTTGTTAACGACCAAGGAGTCATGATTGATGATATTGGTACTCACATTGACA
ACTCTCGAGCTGCAACTGCTCAAGGAAAATTTCAGCTCGCTCAAGCCTCCAAAACCCAAA
GATCAAACTCATTTTTGACATGCTTGCTCTTGGTGATATTTGGCATTGTACTCCTGATTG
TTATCATCGTACTCGCAGCTTGATTTTGGAAAAGCAAGAACCAAGTCTTTCAATGTGTTC
AACGAGTGAGTGCGACTACTTTGGTATATATAAGATAAATTTGCGGACAAAAAGCGTAGA
AGTTGGGTTTTGTATTGGTTCGGTTTGAGGATTTATTGGTGAATGTAACAGAGTGCGTGT
GTGTGTGTTGGTTTTTTTTGTGGTGCAAAACTATTTGTTGCGAGATATTGGTTTAATTTT
TTTTC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2FE15TF 613 0 0
GCGAGTGAAGTAGACAATATTCCTGAACAGAGGG*CACAAGTTATGGAATCAAAAAGGCA
GGAACTTGTATTGTTAGACAACGAGATTGCTTTCAACGAAGCTGTGATCGAAGAAAGAGA
ACAAGTGATACAAGAAATCCACACTCAAATCGG*AGAGGTTAACGAAATTTTCAAAGATC
TCGCGGTTCTTGTTAACGACCAAGGAGTCATGATTGATGATATTGGTACTCACATTGACA
ACTCTCGAGCTGCAACTGCTCAAGGAAAATCTCAGCTCGCTCAAGCCTCCAAAACCCAAA
GATCAAACTCATCTCTGACATGCTTGCTCTTGGTGATATTTGGCATTGTACTCCTGATTG
TTATCATCGTACTCGCAGCTTGATTTTGGAAAAGCAAGAACCAAGTCTTTCAATGTGTTC
AACGAGTGAGTGCGACTACTTTGGTATATATAAGATAAATTTGCGGACAAAAAGCGTAGA
AGTTGGGTTTTGTATTGGTTCGGTTTGAGGATTTATTGGTGAATGTAACAGAGTGCGTGT
GTGTGTGTTGGTTTTCTTTGTGGTGCAAAACTATTTGTTGCGAGATATTGGTTTAATTTT
TTTTCAAAAAAAA

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 4

CO CL1744Contig1 771 4 41 U
GGGTCTTTCTTGTTACCACTGCCTAGGTGCTTTCCAGAGACGCGCATCCACAAGCCCTAA
GCAAATCGTCTCCTGTCTCTCATCCATTGGTGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGC
CCAAGGAGGAAACTGTCACTCTCGGACCGGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTG
TTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACACTTTCATCCATGTGACTGATCTGTCCGGAA
GAGAAACTCTCGTCCGTATCACCGGTGGGATGAAGGTTAAGGCTGATCGTGATGAGTCTT
CTCCTTATGCTGCTATGCTTGCAGCTCAAGATGTTACTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCA
TCACAGCAATGCACGTGAAGCCCCGTGCCACTGGAGGAAACAAGACCAAGACTCCAGGCC
CTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTG
AGGATGTGACTCCAATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGCAGAGGAAGAA
GACTTTGATTTCCCACCAATGAGATTCATCATCGTTCAGTTGTGCCCTCGACTCTTGTGG
GGG*TACACACTTGGAAGTTGGTTTTTGTCTCTCGCTCTCCAGTTTATCTTTCAAGTTGC
TTCGTAAAAACATTATAAGCTACGTCTTTCTTCAACGTTGTAAACTTAACTCTTGCATTT
TGGAGTTTTGGGAACGAGAAAAATTGTTAGTGAACAATGACTTTTTGCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G519TF U 1
AF RR2H867TF U 27
AF RR2AD56TF U 34
AF RR2H867JQ C 28
BS 1 133 RR2G519TF
BS 134 134 RR2H867TF
BS 135 148 RR2G519TF
BS 149 149 RR2H867TF
BS 150 205 RR2G519TF
BS 206 206 RR2H867TF
BS 207 217 RR2G519TF
BS 218 218 RR2H867TF
BS 219 236 RR2G519TF
BS 237 237 RR2H867TF
BS 238 335 RR2G519TF
BS 336 336 RR2H867TF
BS 337 367 RR2G519TF
BS 368 368 RR2H867TF
BS 369 381 RR2G519TF
BS 382 382 RR2H867TF
BS 383 403 RR2G519TF
BS 404 404 RR2H867TF
BS 405 460 RR2G519TF
BS 461 461 RR2H867TF
BS 462 471 RR2G519TF
BS 472 472 RR2H867TF
BS 473 480 RR2G519TF
BS 481 481 RR2H867TF
BS 482 525 RR2G519TF
BS 526 526 RR2H867TF
BS 527 588 RR2G519TF
BS 589 589 RR2H867TF
BS 590 651 RR2G519TF
BS 652 652 RR2H867TF
BS 653 669 RR2G519TF
BS 670 670 RR2H867TF
BS 671 694 RR2G519TF
BS 695 695 RR2H867TF
BS 696 703 RR2G519TF
BS 704 704 RR2AD56TF
BS 705 728 RR2G519TF
BS 729 742 RR2H867TF
BS 743 743 RR2H867JQ
BS 744 753 RR2H867TF
BS 754 771 RR2H867JQ

RD RR2G519TF 736 0 0
GGGTCTTTCTTGTTACCACTGCCTAGGTGCTTTCCAGAGACGCGCATCCACAAGCCCTAA
GCAAATCGTCTCCTGTCTCTCATCCATTGGTGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGC
CCAAGGAGGAAACCGTCACTCTCGGACCTGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTG
TTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAATGACACTTTCATTCATGTGACTGATCTGTCCAGAA
GAGAAACTCTCGTCCGTATCACCGGTGGGATGAAGGTTAAGGCTGATCGTGATGAGTCTT
CTCCTTATGCTGCTATGCTTGCAGCTCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCA
TCACAGCCATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCC
CTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGTATGAAGATTGATCGTATTG
TGGATGTGACTCCAATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGAACGCAGAGGAAGAA
GACTTTGATTTCCCACCAATGAGATTCATCATCGTTCAGTTGTGCCCTTGACTCTTGTGG
GGG*TACACACTTGGAAGTTGGTTTTTGTCTCTCGCTCTCCAGTTTATCTTCCAAGTTGC
TTCGTAAAA*CATTATAAGCTACGTCTTTCTTCA*CGTTGTAA*CTTAACTCTTGCATTT
TGGAGTTT
GGGAACGA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2H867TF 727 0 0
TTTT
TTTCCAGAGACGCGCATCCACAAGCCCTAAGCAAATCGTCTCCTGTCTCTCATCCATTGG
TGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACTGTCACTCTCGGACCGG
CTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACA
CTTTCATCCATGTGACTGATCTGTCCGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTATCACCGGTGGGA
TGAAGGTTAAGGCTGATCGTGATGAGTCTTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCAGCTCAAG
ATGTTACTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCAATGCACGTGAAGCCCCGTGCCA
CTGGAGGAAACAAGACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTG
CTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGATGTGACTCCAATTCCCACCGACAGTA
CACGTAGAAAGGGTGGACGCAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCCACCAATGAGATTCATC
ATCGTTCAGTTGTGCCCTCGACTCTTGTGGGGG*TACACACTTGGAAGTTGGTTTTTGTC
TCTCGCTCTCCAGTTTATCTTTCAAGTTGCTTCGTAAAAACATTATAAGCTACGTCTTTC
TTCAACGTTGTAA*CTTAACTCTTGCATTTTGGAGTTTTGGGAACGAGAAAA*TTGTTAG
TGA

QA 5 727 5 727
DS 

RD RR2AD56TF 706 0 0
CCAGAGACGCGCATCCACAAGCCCTAAGCAAATCGTCTCCTGTCTCTCATCCATTGGTGA
ACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACCGTCACTCTCGGACCTGCTG
TTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAATGACACTT
TCATTCATGTGACTGATCTGTCCGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTATCACCGGTGGGATGA
AGGTTAAGGCTGATCGTGATGAGTCTTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCAGCTCAAGATG
TTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTG
GAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGCTC
GTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGATGTGACTCCAATTCCCACCGACAGTACGC
GTAGAAAGGGTGGACGCAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCCACCAATGAGATTCATCATC
GTTCAGTTGTGCCCTTGACTCTTGTGGGGGGTACACACTTGGAAGTTGGTTTTTGTCTCT
CGCTCTCCAGTTTATCTTTCAAGTTGCTTCGTAAAA*CATTATAAGCTACGTCTTTCTTC
A*CGTTGTAAACTTAACTCTTGCATTTTGGAGTTT
TGGGAACGAGA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2H867JQ 744 0 0
TTT
TTTCCAGAGACGCGCATCCACAAGCCCTAAGCAAATCGTCTCCTGTCTCTCATCCATTGG
TGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACTGTCACTCTCGGACCGG
CTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTGTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACA
CTTTCATCCATGTGACTGATCTGTCCGGAAGAGAAACTTTCGTCCGTATCACCGGTGGGA
TGAAGGTTAAGGCTGATCGTGATGAGTCTTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCAGCTCAAG
ATGTTACTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCAATGCACGTGAAGCCCCGTGCCA
CTGGAGGAAACAAGACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTG
CTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGATGTGACTCCAATTCCCACCGACAGTA
CACGTAGAAAGGGTGGACGCAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCCACCAATGAGATTCATC
ATCGTTCAGTTGTGCCCTCGACTCTTGTGGGGG*TACACACTTGGAAGTTGGTTTTTGTC
TCTCGCTCTCCAGTTTATCTTTCAAGTTGCTTCGTAAAAACATTATAAGCTACGTCTTTC
TTCAACGTTGTAAACTTAACTCTTGCATTTTGGAGTTTTGGGAACGAGAAAAATTGTTAG
TGAACAATGACTTTTTGCATT

QA 4 744 4 744
DS 



AS 1 4

CO CL1745Contig1 602 4 4 U
GGACCTGATCTCTTCCTTCCTCCCAATCTCTCCTGAAACCCTAAATCAGAAGTCGAGAAC
GATGGCGTCGTTCGCTCGCCGAGCCATGAGCCTAGCTCAGATTCAATCTGCACGTATCCC
CGCCTCTGTTTGTCAGCGTCGTGGTCTCGCCGGCGCCGCTGATCACCATGGATCTACCAA
GGTTGACTTCTGGAAACAGCCCACGAACCCTGGAAACTGGAAAGAGGAGCATTTTGTGCT
TATTTCGCTAGCTGGCTGGGGCACGCTTTTCTACAGTGGATACAAGCTCTTCACCGGTGG
CAAAGGGGAGAAGCCTGTCGAGGCTGGACAATGATTTTTATCACTGGGGAAATGACAAGG
GAGGAGGTCTTCTTCCTCGTTCATTTTACTTTCATTTTCAGCACCTTGTGACTGGCCTTT
GTTATCAAAGCCAGCAATTACTTGTTTGTTTTCTTTGAGCAATAATAATATGCATCATTA
ATCTCACCTTTTGAAATCCTAATCATTTTGACTCCAGTGGATGATTCTGTTTCATTATTT
CCCTATGCTTTGGAAACATATCAAGGTTTTAGCAATTCTACTTGTTTGGTTTGGATGATA
TT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2AV55JQ C 1
AF RR2AV55TF U 1
AF RR2A506JQ C 1
AF RR2A506TF U 1
BS 1 115 RR2AV55TF
BS 116 116 RR2A506TF
BS 117 534 RR2AV55TF
BS 535 602 RR2A506TF

RD RR2AV55JQ 536 0 0
GGACCTGATCTCTTCCTTCCTCCCAATCTCTCCTGAAACCCTAAATCAGAAGTCGAGAAC
GATGGCGTCGTTCGCTCGCCGAGCCATGAGCCTAGCTCAGATTCAATCTGCACGTGTCCC
CGCCTCTGTTTGTCAGCGTCGTGGTCTCGCCGGCGCCGCTGATCACCATGGATCTACCAA
GGTTGACTTCTGGAAACAGCCCACGAACCCTGGAAACTGGAAAGAGGAGCATTTTGTGCT
TATTTCGCTAGCTGGCTGGGGCACGCTTTTCTACAGTGGATACAAGCTCTTCACCGGTGG
CAAAGGGGAGAAGCCTGTCGAGGCTGGACAATGATTTTTATCACTGGGGAAATGACAAGG
GAGGAGGTCTTCTTCCTCGTTCATTTTACTTTCATTTTCAGCACCTTGTGACTGGCCTTT
GTTATCAAAGCCAGCAATTACTTGTTTGTTTTCTTTGAGCAATAATAATATGCATCATTA
ATCTCACCTTTTGAAATCCTAATCATTTTGACTCCAGTGGATGATTCTGTTTCA
CT

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2AV55TF 536 0 0
GGACCTGATCTCTTCCTTCCTCCCAATCTCTCCTGAAACCCTAAATCAGAAGTCGAGAAC
GATGGCGTCGTTCGCTCGCCGAGCCATGAGCCTAGCTCAGATTCAATCTGCACGTGTCCC
CGCCTCTGTTTGTCAGCGTCGTGGTCTCGCCGGCGCCGCTGATCACCATGGATCTACCAA
GGTTGACTTCTGGAAACAGCCCACGAACCCTGGAAACTGGAAAGAGGAGCATTTTGTGCT
TATTTCGCTAGCTGGCTGGGGCACGCTTTTCTACAGTGGATACAAGCTCTTCACCGGTGG
CAAAGGGGAGAAGCCTGTCGAGGCTGGACAATGATTTTTATCACTGGGGAAATGACAAGG
GAGGAGGTCTTCTTCCTCGTTCATTTTACTTTCATTTTCAGCACCTTGTGACTGGCCTTT
GTTATCAAAGCCAGCAATTACTTGTTTGTTTTCTTTGAGCAATAATAATATGCATCATTA
ATCTCACCTTTTGAAATCCTAATCATTTTGACTCCAGTGGATGATTCTGTTTCA
CT

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2A506JQ 602 0 0
GGACCTGATCTCTTCCTTCCTCCCAATCTCTCCTGAAACCCTAAATCAGAAGTCGAGAAC
GATGGCGTCGTTCGCTCGCCGAGCCATGAGCCTAGCTCAGATTCAATCTGCACGTATCCC
CGCCTCTGTTTGTCAGCGTCGTGGTCTCGCCGGCGCCGCTGATCACCATGGATCTACCAA
GGTTGACTTCTGGAAACAGCCCACGAACCTTGGAAACTGGAAAGAGGAGCATTTTGTGCT
TATTTCGCTAGCTGGCTGGGGCACGCTTTTCTACAGTGGATACAAGCTCTTCACCGGTGG
CAAAGGGGAGAAGCCTGTCGAGGCTGGACAATGATTTTTATCACTGGGGAAATGACAAGG
GAGGAGGTCTTCTTCCTCGTTCATTTTACTTTCATTTTCAGCACCTTGTGACTGGCCTTT
GTTATCAAAGCCAGCAATTACTTGTTTGTTTTCTTTGAGCAATAATAATATGCATCATTA
ATCTCACCTTTTGAGATCCTAATCATTTTGACTCCAGTGGATGATTCTGTTTCATTATTT
CCCTATGCTTTGGAAACATATCAAGGTTTTAGCAATTCTACTTGTTTGGTTTGGATGATA
TT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2A506TF 602 0 0
GGACCTGATCTCTTCCTTCCTCCCAATCTCTCCTGAAACCCTAAATCAGAAGTCGAGAAC
GATGGCGTCGTTCGCTCGCCGAGCCATGAGCCTAGCTCAGATTCAATCTGCACGTATCCC
CGCCTCTGTTTGTCAGCGTCGTGGTCTCGCCGGCGCCGCTGATCACCATGGATCTACCAA
GGTTGACTTCTGGAAACAGCCCACGAACCTTGGAAACTGGAAAGAGGAGCATTTTGTGCT
TATTTCGCTAGCTGGCTGGGGCACGCTTTTCTACAGTGGATACAAGCTCTTCACCGGTGG
CAAAGGGGAGAAGCCTGTCGAGGCTGGACAATGATTTTTATCACTGGGGAAATGACAAGG
GAGGAGGTCTTCTTCCTCGTTCATTTTACTTTCATTTTCAGCACCTTGTGACTGGCCTTT
GTTATCAAAGCCAGCAATTACTTGTTTGTTTTCTTTGAGCAATAATAATATGCATCATTA
ATCTCACCTTTTGAGATCCTAATCATTTTGACTCCAGTGGATGATTCTGTTTCATTATTT
CCCTATGCTTTGGAAACATATCAAGGTTTTAGCAATTCTACTTGTTTGGTTTGGATGATA
TT

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL1746Contig1 1579 2 4 U
GGGAGAAGAAGCCTTTCACGATCGTAAACCCTAGGAGAGAGAAAAGTTAGTCAGAGAGCA
ATGGCGGAAGCGAATCCTAGCCGTGGAGGGGGAAGAAGAGGCGGTGGACCAATGGACGAC
GACAAATTAGTCTTCGAAACAACCGAAGGGATCGAGCCAATCACCAATTTCAACGACATG
GGGATCAAGGAAGACGTGCTCCGCGGCGTCTACGAGTACGGTTTCGAGAAACCCTCCGCG
ATCCAGCAGAGAGCCGTCATGCCGATTCTCCAAGGCCGCGACGTCATCGCCCAGGCTCAG
TCCGGTACCGGAAAAACCTCCATGATTGCTCTCTCCGTCTGCCAAATCGTCGACACTTCG
TCTAGAGAAGTTCAGGCGTTGATATTGTCTCCAACGAGAGAGCTGGCTTCGCAGACGGAG
AAGACTATTCAAGCGATTGGGTTGCACGCGAATATCCAGGCGCATGCGTGTGTTGGTGGG
AAGAGCGTTGGGGAAGATATTAGGAAGCCGGAGAATGGTGTCCATGTTGTGTCTGGGACG
CCTGGGCGTGTGTGTGATATGATTAAGAGGAGAAGTTTACGTACCAGGGGTATTAAGCTT
TTGATTCTTGATGAATCCGATGAGATGCTGAGCAGAGGGTTCGAAGACCAGATTTATGAT
GTTTACAGATATCTTCCACCTGATCTTCAGTTTGCTTGGTTTCTGCAACTCTACCTCACG
AGATTTTGGAGATGACATCAAAGTTTATGACGGAGCCAGTGAAGATACTTGTGAAGCGTG
ATGAGTTGACTCTTGAAGGCATTAAACAATTTTTCGTTGCTGTTGAGAAAGAGGAGTGGA
AATTTGATACGCTCTGTGATCTTTATGACACACTTACTATCACTCAAGCTGTTATCTTCT
GCAACACAAAACGAAAGGTGGATTGGCTAAGTGAGAAAATGAGGACTAACAACTTCACAG
TCTCGTCAATGCACGGTGACATGCCTCAGAAGGAAAGAGACGAGATTATGAATCAGTTTC
GTTCAGGCGACAGTCGTGTTTTGATCACAACAGATGTATGGGCACGTGGTATTGATGTGC
AGCAAGTTTCTCTTGTCATCAATTATGATCTTCCCAACAACCGTGAGCTCTACATCCATC
GTATTGGAAGATCTGGTCGTTTTGGGCGTAAGGGTGTTGCGATAAACTTTGTTAAAAGTG
ACGACATTAAGATCCTCCGGGACATTGAGCAGTACTACAGTACTCAGATTGACGAGATGC
CGATGAATGTAGCTGATCTTATCTAAATGACCGTGTCTGAAATTTTCTGTGATGGTTTCT
GTGCTTTCGGTGGAAGTGTATAAATGAGAAGGTTTTGTTCAGAGCTTGTGGTCTGGTTGT
TGCACTATCTTATGATGCTTCCCCTCAATACCTACCCCCTTTGATGTTTCTCTATAGTTT
TTGTGGGTTATTTTGACACTTGTGGTAAATGTTTTATGAATTGAGAAGAGATTTTAGGTT
TAGGGTTTATTTTTCTTTTCCTCGTTATTGATTATGGTGTTTAACACTCAAAATGGTTCA
GTGTCTTCATAAGTTGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ92TF U 1
AF RR2AD24JQ C 762
BS 1 798 RR2AQ92TF
BS 799 799 RR2AD24JQ
BS 800 823 RR2AQ92TF
BS 824 1579 RR2AD24JQ

RD RR2AQ92TF 824 0 0
GGGAGAAGAAGCCTTTCACGATCGTAAACCCTAGGAGAGAGAAAAGTTAGTCAGAGAGCA
ATGGCGGAAGCGAATCCTAGCCGTGGAGGGGGAAGAAGAGGCGGTGGACCAATGGACGAC
GACAAATTAGTCTTCGAAACAACCGAAGGGATCGAGCCAATCACCAATTTCAACGACATG
GGGATCAAGGAAGACGTGCTCCGCGGCGTCTACGAGTACGGTTTCGAGAAACCCTCCGCG
ATCCAGCAGAGAGCCGTCATGCCGATTCTCCAAGGCCGCGACGTCATCGCCCAGGCTCAG
TCCGGTACCGGAAAAACCTCCATGATTGCTCTCTCCGTCTGCCAAATCGTCGACACTTCG
TCTAGAGAAGTTCAGGCGTTGATATTGTCTCCAACGAGAGAGCTGGCTTCGCAGACGGAG
AAGACTATTCAAGCGATTGGGTTGCACGCGAATATCCAGGCGCATGCGTGTGTTGGTGGG
AAGAGCGTTGGGGAAGATATTAGGAAGCCGGAGAATGGTGTCCATGTTGTGTCTGGGACG
CCTGGGCGTGTGTGTGATATGATTAAGAGGAGAAGTTTACGTACCAGGGGTATTAAGCTT
TTGATTCTTGATGAATCCGATGAGATGCTGAGCAGAGGGTTCGAAGACCAGATTTATGAT
GTTTACAGATATCTTCCACCTGATCTTCAGTTTGCTTGGTTTCTGCAACTCTACCTCACG
AGATTTTGGAGATGACATCAAAGTTTATGACGGAGCCAGTGAAGATACTTGTGAAGCGTG
ATGAGTTGACTCTTGAAG*CATTAAACAATTTTTCGTTGCTGT
T

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR2AD24JQ 818 0 0
AAGATACTTGTGAAGCGTGATGAGTTGACTCTTGAAGGCATTAAACAATTTTTCGTTGCT
GTTGAGAAAGAGGAGTGGAAATTTGATACGCTCTGTGATCTTTATGACACACTTACTATC
ACTCAAGCTGTTATCTTCTGCAACACAAAACGAAAGGTGGATTGGCTAAGTGAGAAAATG
AGGACTAACAACTTCACAGTCTCGTCAATGCACGGTGACATGCCTCAGAAGGAAAGAGAC
GAGATTATGAATCAGTTTCGTTCAGGCGACAGTCGTGTTTTGATCACAACAGATGTATGG
GCACGTGGTATTGATGTGCAGCAAGTTTCTCTTGTCATCAATTATGATCTTCCCAACAAC
CGTGAGCTCTACATCCATCGTATTGGAAGATCTGGTCGTTTTGGGCGTAAGGGTGTTGCG
ATAAACTTTGTTAAAAGTGACGACATTAAGATCCTCCGGGACATTGAGCAGTACTACAGT
ACTCAGATTGACGAGATGCCGATGAATGTAGCTGATCTTATCTAAATGACCGTGTCTGAA
ATTTTCTGTGATGGTTTCTGTGCTTTCGGTGGAAGTGTATAAATGAGAAGGTTTTGTTCA
GAGCTTGTGGTCTGGTTGTTGCACTATCTTATGATGCTTCCCCTCAATACCTACCCCCTT
TGATGTTTCTCTATAGTTTTTGTGGGTTATTTTGACACTTGTGGTAAATGTTTTATGAAT
TGAGAAGAGATTTTAGGTTTAGGGTTTATTTTTCTTTTCCTCGTTATTGATTATGGTGTT
TAACACTCAAAATGGTTCAGTGTCTTCATAAGTTGTAT

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 3

CO CL1747Contig1 681 3 32 U
GGAGGGTTTTCAGTATTATCATCCTCTTGCTTGCCGCATCAACCTCTTTGCTGTTGATCT
TCTCCTCCTTCGACAAACAAACATGGGTAAGACAAGGGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCT
CAAAAGGCTTCGTATCAATCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCCCATCAGGG
AAACGAATGGAAGAAGCCTTTTGCCGGTTCTTCTCACGCCAAAGGAATCGTTCTTGAGAA
AATTGGTATTGAGGCTAAGCAGCCTAACTCTGCTATCCGTAAGTGTGCTAGAGTGCAGCT
TATTAAGAACGGAAAGAAGATTGCCGCTTTTGTTCCCAACGATGGTTGCTTGAACTACAT
TGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATTGCTGGGTTTGGTCGTAAGGGTCATGCCGTGGGAGA
TATTCCCGGAGTCAGGTTCAAGGTCGTCAAGGTTTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTT
CAAGGAGAAGAAGGAGAAGCCAAGATCTTAGACAACCCTTCAAGCTTTTAAGTTGTTTTG
ATGCTATAATCCCACCTTTTGTTAGTTCAGTTTTCTTTTATTAAAAAACTCGTATCTTCT
GTTCTATTCTACTCTTTAAGGTTCCTGAACTAATGTGTTAAATCACTTCTTCAATGAATC
TTTATTTTATTTTAATTTACC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC17TF U 1
AF RR2FN39JQ C 129
AF RR2FN39TF U 2
BS 1 180 RR2DC17TF
BS 181 181 RR2FN39TF
BS 182 183 RR2DC17TF
BS 184 184 RR2FN39TF
BS 185 198 RR2DC17TF
BS 199 199 RR2FN39TF
BS 200 204 RR2DC17TF
BS 205 205 RR2FN39TF
BS 206 207 RR2DC17TF
BS 208 208 RR2FN39TF
BS 209 213 RR2DC17TF
BS 214 214 RR2FN39TF
BS 215 222 RR2DC17TF
BS 223 223 RR2FN39TF
BS 224 225 RR2DC17TF
BS 226 226 RR2FN39TF
BS 227 288 RR2DC17TF
BS 289 289 RR2FN39TF
BS 290 294 RR2DC17TF
BS 295 295 RR2FN39TF
BS 296 303 RR2DC17TF
BS 304 304 RR2FN39TF
BS 305 333 RR2DC17TF
BS 334 334 RR2FN39TF
BS 335 351 RR2DC17TF
BS 352 352 RR2FN39TF
BS 353 411 RR2DC17TF
BS 412 412 RR2FN39TF
BS 413 483 RR2DC17TF
BS 484 484 RR2FN39TF
BS 485 488 RR2DC17TF
BS 489 681 RR2FN39TF

RD RR2DC17TF 488 0 0
GGAGGGTTTTCAGTATTATCATCCTCTTGCTTGCCGCATCAACCTCTTTGCTGTTGATCT
TCTCCTCCTTCGACAAACAAACATGGGTAAGACAAGGGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCT
CAAAAGGCTTCGTATCAATCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCCCATCAGGG
TAATGAATGGAAGAAGCCCTTTGCTGGATCTTCCCACGCCAAGGGTATCGTTCTTGAGAA
AATTGGTATTGAGGCTAAGCAGCCTAACTCTGCTATCCGTAAGTGTGCGAGAGTACAGCT
TATCAAGAACGGAAAGAAGATTGCCGCTTTTGTCCCCAACGATGGTTGCTTAAACTACAT
TGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATTGCTGGGTTTGGTCGTAAGGGTCATGCTGTGGGAGA
TATTCCCGGAGTCAGGTTCAAGGTCGTCAAGGTTTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTT
CAAAGAGA

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2FN39JQ 460 0 0
TTCGT
ATCAATCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCCCATCAGGGAAACGAATGGAAG
AAGCCTTTTGCCGGTTCTTCTCACGCCAAAGGAATCGTTCTTGAGAAAATTGGTATTGAG
GCTAAGCAGCCTAATTCTGCTATCCGTAAGTGTGCTAGAGTGCAGCTTATTAAGAACGGA
AAGAAGATTGCCGCTTTTGTTCCCAACGATGGTTGCTTGAACTACATTGAGGAAAATGAC
GAGGTGTTGATTGCTGGGTTTGGTCGTAAGGGTCATGCCGTGGGAGATATTCCCGGAGTC
AGGTTCAAGGTCGTCAAGGTTTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTTCAAGGAGAAGAAG
GAGAAGCCAAGATTTTAGACAACCCTTCAAGCTTTTAAGTTGTTTTGATGCTATAATCCC
CCCTTTTGTTAGTTCAGTTTTCTTTT
ATTAAAAAA

QA 6 451 6 451
DS 

RD RR2FN39TF 680 0 0
GAGGGTTTTCGGTATTATCATCCTCTTGCTTGCCGCATCAACCTCTTTGCTGTTGATCTT
CTCCTCCTTCGACAAACAAACATGGGTAAGACAAGGGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTC
AAAAGGCTTCGTATCAATCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGTCCCATCAGGGA
AACGAATGGAAGAAGCCTTTTGCCGGTTCTTCTCACGCCAAAGGAATCGTTCTTGAGAAA
ATTGGTATTGAGGCTAAGCAGCCTAACTCTGCTATCCGTAAGTGTGCTAGAGTGCAGCTT
ATTAAGAACGGAAAGAAGATTGCCGCTTTTGTTCCCAACGATGGTTGCTTGAACTACATT
GAGGAAAATGACGAGGTGTTGATTGCTGGGTTTGGTCGTAAGGGTCATGCCGTGGGAGAT
ATTCCCGGAGTCAGGTTCAAGGTCGTCAAGGTTTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTTC
AAGGAGAAGAAGGAGAAGCCAAGATCTTAGACAACCCTTCAAGCTTTTAAGTTGTTTTGA
TGCTATAATCCCACCTTTTGTTAGTTCAGTTTTCTTTTATTAAAAAACTCGTATCTTCTG
TTCTATTCTACTCTTTAAGGTTCCTGAACTAATGTGTTAAATCACTTCTTCAATGAATCT
TTATTTTATTTTAATTTACC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 5

CO CL1748Contig1 658 5 7 U
GGAGCAACAGATTAGGTGAGATCAAGAAAATTAACTATGCCGATTAGGCTTTCGATGAAG
AGACTCACGACGCTGACCATTTCAAAAACTCATGGCGGAGATATCTCCGGTTATGTCCTC
CGACACGCTACCACCCGGTTCGACCGCCTCTTCGCCGCATTTAGGCAAACAGAGAGCATG
AGAGACCGTCACGACGATAGGTCCACAGCGAGTTACGTGACAGATAAGGCAAAGGAAGGG
GTGAAGAAAGCGACCGATGCAGCTGTGAACGCAGGAGATAACATGAAGGATGCGATGGAC
GGGGCCTGGAAAGCGGCTAAGGAAACGGGTCAGAACATCAGCGAAGCCGTTACGGGAGAT
GATGACAACGGCGACAGGATTCAAGAGGACAAGGTCGCGGTCGAGCTGAAGGATGTGAGG
CAGCCTGTTGACACCACGGAGTATAGAGGTGTGGAGGATCTACATCATCAGCAAACCGAC
GGCGAGAATAAATCACCGTGAGAGAATGCGTGAGGG*TGTCTGTTGTCTTCTTTTTTTT*
*CTTTTCTTATCGTTGTTGTTT*GTTTCAATTATGAAGGAACCCGTTACTAGATTTGATT
ACATTTTGTTCTTATCAGTTAAAACGGGAAAATAACAAATCGTTTTGAAGTTTTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR2H007JQ C 1
AF RR2H007TF U 1
AF RR2G095TF U 6
AF RR2B243JQ C 2
AF RR2B243TF U 2
BS 1 5 RR2H007JQ
BS 6 38 RR2H007TF
BS 39 39 RR2G095TF
BS 40 617 RR2H007TF
BS 618 618 RR2G095TF
BS 619 656 RR2H007TF
BS 657 658 RR2B243JQ

RD RR2H007JQ 658 0 0
GGAGCAACAGATTAGGTGAGATCAAGAAAATTAACTATTCCGATTAGGCTTTCGATGAAG
AGACTCACGACGCTGACCATTTCAAAAACTCATGGCGGAGATATCTCCGGTTATGTCCTC
CGACACGCTACCACCCGGTTCGACCGCCTTTTCGCCGCATTTAGGCAAACAGAGAGCATG
AGAGACCGTCACGACGATAGGTCCACAGCGAGTTACGTGACAGATAAGGCAAAGGAAGGG
GTGAAGAAAGCGACCGATGCAGCTGTGAACGCAGGAGATAACATGAAGGATGCGATGGAC
GGGGCCTGGAAAGCGGCTAAGGAAACGGGTCAGAACATCAGCGAAGCCGTTACGGGAGAT
GATGACAACGGCGACAGGATTCAAGAGGACAAGGTCGCGGTCGAGCTGAAGGATGTGAGG
CAGCCTGTTGACACCACGGAGTATAGAGGTGTGGAGGATCTACATCATCAGCAAACCGAC
GGCGAGAATAAATCACCGTGAGAGAATGCGTGAGGG*TGTCTGTTGTCTTCTTTTTTTT*
*CTTTTCTTATCGTTGTTGTTT*GTTTCAATTATGAAGGAACCCGTTACTAGATTTGATT
ACATTTTGTTCTTATCATTTAAAACGGGAAAATAACAAATCGTTTTGAAGTTTTGG
GC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2H007TF 658 0 0
GGAGC
AACAGATTAGGTGAGATCAAGAAAATTAACTATTCCGATTAGGCTTTCGATGAAGAGACT
CACGACGCTGACCATTTCAAAAACTCATGGCGGAGATATCTCCGGTTATGTCCTCCGACA
CGCTACCACCCGGTTCGACCGCCTCTTCGCCGCATTTAGGCAAACAGAGAGCATGAGAGA
CCGTCACGACGATAGGTCCACAGCGAGTTACGTGACAGATAAGGCAAAGGAAGGGGTGAA
GAAAGCGACCGATGCAGCTGTGAACGCAGGAGATAACATGAAGGATGCGATGGACGGGGC
CTGGAAAGCGGCTAAGGAAACGGGTCAGAACATCAGCGAAGCCGTTACGGGAGATGATGA
CAACGGCGACAGGATTCAAGAGGACAAGGTCGCGGTCGAGCTGAAGGATGTGAGGCAGCC
TGTTGACACCACGGAGTATAGAGGTGTGGAGGATCTACATCATCAGCAAACCGACGGCGA
GAATAAATCACCGTGAGAGAATGCGTGAGGG*TGTCTGTTGTCTTCTTTTTTTT**CTTT
TCTTATCGTTGTTGTTT*GTTTCAATTATGAAGGAACCCGTTACTAGATTTGATTACATT
TTGTTCTTATCATTTAAAACGGGAAAATAACAAATCGTTTTGAAGTTTTGG
GC

QA 6 656 6 656
DS 

RD RR2G095TF 622 0 0
GTG
AGATTAGGTGAGATCAAGAAAATTAACTATGCCGATTAGGCTTTCGATTAAGAGACTCAC
GACGGTGACCATTTCAAAAACTCATGGTGGAGATATCTCCGGTTATGTCCTACGACACGC
TACCACCCGGTTCGACCGCCTCTTCACCGCATTTAGGCAAACAGAGAGCATGATAGACCG
TCACGACGATAGGTCCGCAGCGAGTTACGTGACAGATAAGGCAAAGGAAGGGGTGAAGAA
AGCGACCGATGCAGCTGTGAACGCAGGAGATAACATGAAGGATGCGATGGACGGGGCCTG
GAAAGCGGCTAAGGAAACGGGTCAGAACATCAGTGAAGCCGTTACGGGGGATGATGAAAA
CGGCGACAGGATTCAAGAGGACAAGGTCGCGGTCGAGCTGAAGGATGTGAGGCAGCCTGT
TGACACCACGGAGTATAGAGGTGTGGAGGATCTACATCATCAGCAAACCGACGCCGAGAA
TAAATCACCGTGAGAGAATGCGTGAGGG*TGTCTATTGTCTTCTTTTTTT***CTTTTCT
TATCGTTGTTGTTT*GTTTCAATTATGAAGGAACCCGTTACTAGGTTTGATTACATTTTG
TTCTTATCAGTTAAA
CGGG

QA 4 618 4 618
DS 

RD RR2B243JQ 657 0 0
GGGG
AACAGATTAGGTGAGATCAAGAAAATTAACTATGCCGATTAGGCTTTCGATGAAGAGACT
CACGACGCTGACCATTTCAAAAACTCATGGCGGAGATATCTCCGGTTATGTCCTCCGACA
CGCTACCACCCGGTTCGACCGCCTTTTCGCCGCATTTAGGCAAACAGAGAGCATGAGAGA
CCGTCACGACGATAGGTCCACAGCGAGTTACGTGACAGATAAGGCAAAGGAAGGGGTGAA
GAAAGCGACCGATGT**CTGTGAACGCAGGAGATAACATGAAGGATGCGATGGACGGGGC
CTGGAAAGCGGCTAAGGAAACGGGTCAGAACATCAGCGAAGCCGTTACGGGAGATGATGA
CAACGGCGACAGGATTCAAGAGGACAAGGTCGCGGTCGAGCTGAAGGATGTGAGGCAGCC
TGTTGACACCACGGAGTATAGAGGTGTGGAGGATCTACATCATCAGCAAACCGACGGCGA
GAATAAATCACCGTGAGAGAATGCGTGAGGG*TGTCTGTTGTCTTCTTTTTTTTTTCTTT
TCTTATCGTTGTTGTTT*GTTTCAATTATGAAGGAACCCGTTACTAGATTTGATTACATT
TTGTTCTTATCAGTTAAAACGGGAAAATAACAAATCGTTTTGAAGTTTTGGCC

QA 5 657 5 657
DS 

RD RR2B243TF 657 0 0
GGGG
AACAGATTAGGTGAGATCAAGAAAATTAACTATGCCGATTAGGCTTTCGATGAAGAGACT
CACGACGCTGACCATTTCAAAAACTCATGGCGGAGATATCTCCGGTTATGTCCTCCGACA
CGCTACCACCCGGTTCGACCGCCTCTTCGCCGCATTTAGGCAAACAGAGAGCATGAGAGA
CCGTCACGACGATAGGTCCACAGCGAGTTACGTGACAGATAAGGCAAAGGAAGGGGTGAA
GAAAGCGACCGATGT**CTGTGAACGCAGGAGATAACATGAAGGATGCGATGGACGGGGC
CTGGAAAGCGGCTAAGGAAACGGGTCAGAACATCAGCGAAGCCGTTACGGGAGATGATGA
CAACGGCGACAGGATTCAAGAGGACAAGGTCGCGGTCGAGCTGAAGGATGTGAGGCAGCC
TGTTGACACCACGGAGTATAGAGGTGTGGAGGATCTACATCATCAGCAAACCGACGGCGA
GAATAAATCACCGTGAGAGAATGCGTGAGGGGTGTCTGTTGTCTTCTTTTTTTTTTCTTT
TCTTATCGTTGTTGTTTTGTTTCAATTATGAAGGAACCCGTTACTAGATTTGATTACATT
TTGTTCTTATCAGTTAAAACGGGAAAATAACAAATCGTTTTGAAGTTTTGG
CC

QA 5 655 5 655
DS 



AS 1 5

CO CL1749Contig1 735 5 3 U
GGGCTTTTCCAGTTGTAAACCAAAGTGCAAAAAGACAGAGAAGGCGACGATGAGTTCGAC
GAAGCCAAGCAGGAGCGACGATATACCCGACCTGGATCAACAGATCAAGAACACCAACCA
GATCAGAGCTGGTTTTGACTCCTTGGCCCCTAAACGACCCACTAAACCCACCCGGAGCGA
GCCAGGCCCTTTCGGATGTTTCTCTACTCCCGACCCAACCACTGACCATCCGGAGGCTGA
CAAGTTCCAAACTCTCCAGTCACAAACTCATGGTAACATTCTGCATGAAGGAGGTTCAGC
TGCTGTTCAAGATGAGTTCCTGGAGACAGAGTATTACACGAATCTCACCGCCATTGATAA
GCAACATCACACGACCGGAAGTGGGTTTATCAATGTGGGGAAGGAAGATGGCGGTGAAGA
AGCTGTGGTAGCCGCCGCTGCAATGGGAGACGGAGGTGAAAAGGCTGTTTACAGAAGCAA
CCCGGCGACGAACGAGTGGATTCCTGCGGTGGAGGAGGACATTGCTTCAGAATCTTCGTC
TAAACCGAACCGGAGCGAGAGTTCTTGAATGGGATCTTTGGATGTGTGTACTTTATCTTC
TTCCTGATGTTATGTTTCTTGATATTATTGTCATAAAATATTAAAATAAACTAATTAAAT
AAGTTTCTGTCATTAATATGAAATAATTATTTAATAGTTGATTAGAGGAAGTTTCAAACT
TCCAAAATATCTCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A358JQ C 93
AF RR2C973TF U 1
AF RR2DW22TF U 1
AF RR2A358TF U 147
AF RR2DW22JQ C 147
BS 1 651 RR2C973TF
BS 652 669 RR2A358TF
BS 670 735 RR2DW22JQ

RD RR2A358JQ 501 0 0
G
GGATCAACAGATCAAGAACACCAACCAGATCAGAGCTGGTTTTGACTCCTTGGCCCCTAA
ACGACCCACTAAACCCACCCGGAGCGAGCCAGGCCCTTTCGGATGTTTCTCTACTCCCGA
CCCAACCACTGACCATCCGGAGGCTGACAAGTTCCAAACTCTCCAGTCACAAACTCATGG
TAACATTCTGCATGAAGGAGGTTCAGCTGCTGTTCAAGATGAGTTCCTGGAGACAGAGTA
TTACACGAATCTCACCGCCATTGATAAGCAACATCACACGACCGGAAGTGGGTTTATCAA
TGTGGGGAAGGAAGATGGCGGTGAAGAAGCTGTGGTAGCCGCCGCTGCAATGGGAGACGG
AGGTGAAAAGGCTGTTTACAGAAGCAACCCGGCGACGAACGAGTGGATTCCTGCGGTGGA
GGAGGACATTGCTTCAGAATCTTCGTCTAAACCGAACCGGAGCGAGAGTTCTTGAATGGG
TTCTTTGGATGTGTGTACTT

QA 2 501 2 501
DS 

RD RR2C973TF 651 0 0
GGGCTTTTCCAGTTGTAAACCAAAGTGCAAAAAGACAGAGAAGGCGACGATGAGTTCGAC
GAAGCCAAGCAGGAGCGACGATATACCCGACCTGGATCAACAGATCAAGAACACCAACCA
GATCAGAGCTGGTTTTGACTCCTTGGCCCCTAAACGACCCACTAAACCCACCCGGAGCGA
GCCAGGCCCTTTCGGATGTTTCTCTACTCCCGACCCAACCACTGACCATCCGGAGGCTGA
CAAGTTCCAAACTCTCCAGTCACAAACTCATGGTAACATTCTGCATGAAGGAGGTTCAGC
TGCTGTTCAAGATGAGTTCCTGGAGACAGAGTATTACACGAATCTCACCGCCATTGATAA
GCAACATCACACGACCGGAAGTGGGTTTATCAATGTGGGGAAGGAAGATGGCGGTGAAGA
AGCTGTGGTAGCCGCCGCTGCAATGGGAGACGGAGGTGAAAAGGCTGTTTACAGAAGCAA
CCCGGCGACGAACGAGTGGATTCCTGCGGTGGAGGAGGACATTGCTTCAGAATCTTCGTC
TAAACCGAACCGGAGCGAGAGTTCTTGAATGGGATCTTTGGATGTGTGTACTTTATCTTC
TTCCTGATGTTATGTTTCTTGATATTATTGTCATAAAATATTAAAATAAAC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2DW22TF 631 0 0
GGGCTTTTCCATTTGTAAACCAAAGTGCAAAAAGACAGAGAAGGCGACGATGAGTTCGAT
GAAGCCAAGCAGGAGCGACGATATACCCGACCTGGATCAACAGATCAAGAACACCAACCA
GATCAGAGCTGGTTTTGACTCCTTGGCCCCTAAACGACCCACTAAACCCACCCGGAGCGA
GCCAGGCCCTTTCGGATGTTTCTCTACTCCCGACCCAACCACTGACCATCCGGAGGCTGA
CAAGTTCCAAACTCTCCAGTCACAAACTCATGGTAACATTCTGCATGAAGGAGGTTCAGC
TGCTGTTCAAGATGAGTTCCTGGAGACAGAGTATTACACGAATCTCACCGCCATTGATAA
GCAACATCACACGACCGGAAGTGGGTTTATCAATGTGGGGAAGGAAGATGGCGGTGAAGA
AGCTGTGGTAGCCGCCGCTGCAATGGGAGACGGAGGTGAAAAGGCTGTTTACAGAAGCAA
CCCGGCGACGAACGAGTGGATTCCTGCGGTGGAGGAGGACATTGCTTCAGAATCTTCGTC
TAAACCGAACCGGAGCGAGAGTTCTTGAATGGGATCTTTGGATGTGTGTACTTTATCTTC
TTCCTGATGTTATGTTTCTTGATATTATTGT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2A358TF 525 0 0
CCCCTAAACGACCCACTAAACCCACCCGGAGCGAGCCAGGCCCTTTCGGATGTTTCTCTA
CTCCCGACCCAACCACTGACCATCCGGAGGCTGACAAGTTCCAAACTCTCCAGTCACAAA
CTCATGGTAACATTCTGCATGAAGGAGGTTCAGCTGCTGTTCAAGATGAGTTCCTGGAGA
CAGAGTATTACACGAATCTCACCGCCATTGATAAGCAACATCACACGACCGGAAGTGGGT
TTATCAATGTGGGGAAGGAAGATGGCGGTGAAGAAGCTGTGGTAGCCGCCGCTGCAATGG
GAGACGGAGGTGAAAAGGCTGTTTACAGAAGCAACCCGGCGACGAACGAGTGGATTCCTG
CGGTGGAGGAGGACATTGCTTCAGAATCTTCGTCTAAACCGAACCGGAGCGAGAGTTCTT
GAATGGGATCTTTGGATGTGTGTACTTTATCTTCTTCCTGATGTTATGTTTCTTGATATT
ATTGTCATAAAATATTAAAATAAACTAATTAAATAAGTTTCTG
CC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2DW22JQ 589 0 0
CCCCTAAACGACCCACTAAACCCACCCGGAGCGAGCCAGGCCCTTTCGGATGTTTCTCTA
CTCCCGACCCAACCACTGACCATCCGGAGGCTGACAAGTTCCAAACTCTCCAGTCACAAA
CTCATGGTAACATTCTGCATGAAGGAGGTTCAGCTGCTGTTCAAGATGAGTTCCTGGAGA
CAGAGTATTACACGAATCTCACCGCCATTGATAAGCAACATCACACGACCGGAAGTGGGT
TTATCAATGTGGGGAAGGAAGATGGCGGTGAAGAAGCTGTGGTAGCCGCCGCTGCAATGG
GAGACGGAGGTGAAAAGGCTGTTTACAGAAGCAACCCGGCGACGAACGAGTGGATTCCTG
CGGTGGAGGAGGACATTGCTTCAGAATCTTCGTTTAAACCGAACCGGAGCGAGAGTTCTT
GAATGGGATCTTTGGATGTGTGTACTTTATCTTCTTCCTGATGTTATGTTTCTTGATATT
ATTGTCATAAAATATTAAAATAAACTAATTAAATAAGTTTCTGTCATTAATATGAAATAA
TTATTTAATAGTTGATTAGAGGAAGTTTCAAACTTCCAAAATATCTCTC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 4

CO CL1750Contig1 894 4 32 U
GGACAATTTCCTCAATCATCTTCAGATCACAAGGCCCTGAATAATTTCTCCTCCTCCTAC
CTACACAGAGAGACAGATCGTATCCATTGCCAATAAGCGAGCGAGCGAGAGAAAGAGAGA
AAGAGATAGAATGTCTGGAATGGTAGATGCGAGCTCGTGGGGAGCAGCGTTGGTAAGGAT
CTCGCCGTACACTTTCTCGGCAATCGGAATCGCCATCTCGATCGGCGTCTCTGTCCTCGG
CGCCGCCTGGGGGATTTACATCACCGGAAGTAGTTTGATCGGTGCTGCCATTGAAGCTCC
TCGTATCACTTCCAAGAATCTCATCAGTGTAATCTTTTGCGAAGCTGTAGCTATATATGG
CGTTATTGTTGCAATCATTCTGCAAACGAAGTTGGAGAGTGTCCCATCTTCAAAGATGTA
TGACGCTGAGTCTCTTAGAGCTGGATATGCAATCTTCGCTTCTGGAATCATTGTTGGATT
CGCCAATCTTGTATGCGGGTTATGTGTAGGAATCATTGGAAGCAGTTGCGCATTGCCAGA
TGCTCAGAACTCAACTCTGTTTGTGAAGATTCTTGTGATTGAGATCTTCGGAAGCGCTCT
CGGTTTGTTTGGAGTTATTGTGGGG*ATCATTATGTCCGCACAAGCTACATGGCCGACCA
AATAGAGAGCATACAACCGTGTCTGAAACTCTGGAAAGAAGATGGTTTCTTGATTATCTT
CATTGTTATATGGATACTTTCATGTCTAGAGAAAAAAA*CCAGTGTAAGAACTGAGAACT
TCTTTGTATCCCTGATTTTTTTTTTCCAATATTGTTTTAATACTTTGTAATAAGTCTCTT
TGGAGAACATCTTCTTGTTTGTATTCTCTTTTAATCAAAGACAAGAGTTTGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 5 5 5 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK84TF U 46
AF RR2FG54TF U 65
AF RR2B361TF U 1
AF RR2CK84JQ C 185
BS 1 60 RR2B361TF
BS 61 62 RR2CK84TF
BS 63 65 RR2B361TF
BS 66 66 RR2CK84TF
BS 67 105 RR2B361TF
BS 106 113 RR2CK84TF
BS 114 116 RR2B361TF
BS 117 117 RR2CK84TF
BS 118 174 RR2B361TF
BS 175 175 RR2CK84TF
BS 176 177 RR2B361TF
BS 178 178 RR2CK84TF
BS 179 198 RR2B361TF
BS 199 199 RR2CK84TF
BS 200 426 RR2B361TF
BS 427 427 RR2CK84TF
BS 428 447 RR2B361TF
BS 448 448 RR2CK84TF
BS 449 486 RR2B361TF
BS 487 487 RR2CK84TF
BS 488 535 RR2B361TF
BS 536 536 RR2CK84TF
BS 537 566 RR2B361TF
BS 567 567 RR2CK84TF
BS 568 603 RR2B361TF
BS 604 604 RR2CK84TF
BS 605 678 RR2B361TF
BS 679 679 RR2CK84TF
BS 680 758 RR2B361TF
BS 759 759 RR2CK84TF
BS 760 843 RR2B361TF
BS 844 894 RR2CK84JQ

RD RR2CK84TF 760 0 0
GG
CTCCTCCTCCTACCTACACAGAGAGACAGATCGTATCCATTGCCAATAAGCGAGCGAGCG
AGAGAAAGAGAGAAAGAGATAGAATGTCTGGAATGGTAGATGCGAGCTCGTGGGGAGCAG
CGTTGGTAAGGATCTCGCCGTACACTTTCTCGGCAATCGGAATCGCCATCTCGATCGGCG
TCTCTGTCCTCGGCGCCGCCTGGGGGATTTACATCACCGGAAGTAGTTTGATCGGTGCTG
CCATTGAAGCTCCTCGTATCACTTCCAAGAATCTCATCAGTGTAATCTTTTGCGAAGCTG
TAGCTATATATGGCGTTATTGTTGCAATCATTCTGCAAACGAAGTTGGAGAGTGTCCCAT
CTTCAAAGATGTATGACGCTGAGTCTCTTAGAGCTGGATATGCAATCTTCGCTTCTGGAA
TCATTGTTGGATTCGCCAATCTTGTATGCGGGTTATGTGTAGGAATCATTGGAAGCAGTT
GCGCATTGCCAGATGCTCAGAACTCAACTCTGTTTGTGAAGATTCTTGTGATTGAGATCT
TCGGAAGCGCTCTCGGTTTGTTTGGAGTTATTGTGGGGGATCATTATGTCCGCACAAGCT
ACATGGCCGACCAAATAGAGAGCATACAACCGTGTCTGAAACTCTGGAAAGAAGATGGTT
TCTTGATTATCTTCATTGTTATATGGATACTTTCATGTCTAGAGAAAAAA**CCAGTGTA
*GAACTGAGAACTTCTTTGTATCCCTGATTTTTTTTT
C

QA 3 759 3 759
DS 

RD RR2FG54TF 726 0 0
GG
AGAGAGACAGATCGTATCCATTGCCAATAAGCGAGCGAGCGAGAGAAAGAGAGAAAGAGA
TAGAATGTCTGGAATGGTAGATGCGAGCTCGTGGGGAGCAGCGTTGGTAAGGATCTCGCC
GTACACTTTCTCGGCAATCGGAATCGCCATCTCGATCGGCGTCTCTGTCCTCGGCGCCGC
CTGGGGGATTTACATCACCGGAAGTAGTTTGATCGGTGCTGCCATTGAAGCTCCTCGTAT
CACTTCCAAGAATCTCATCAGTGTAATCTTTTGCGAAGCTGTAGCTATATATGGCGTTAT
TGTTGCAATCATTCTGCAAACGAAGTTGGAGAGTGTCCCATCTTCAAAGATGTATGACGC
TGAGTCTCTTAGAGCTGGATATGCAATCTTCGCTTCTGGAATCATTGTTGGATTCGCCAA
TCTTGTATGCGGGTTATGTGTAGGAATCATTGGAAGCAGTTGCGCACTGTCAGATGCTCA
GAACTCAACTCTGTTTGTGAAGGTTCTTGTGATTGAGATCTTCGGAAGCGCTCTCGGTTT
GTTTGGAGTTATTGTGGGG*ATCATTATGTCCGCACAAGCTACATGGCCGACCAAATAGA
GAGCATACAACCGTGTCTGAAACTCTGGAAAGAAGATGGTTTCTTGATTATCTTCATTGT
TATATGGATACTTTCATGTCTAGAGAAAAAA**CCAGTGTAAGAACTGAGAACTTCTTTG
TATC

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR2B361TF 843 0 0
GGACAATTTCCTCAATCATCTTCAGATCACAAGGCCCTGAATAATTTCTCCTCCTCCTAC
**ACAGAGAGAGACAGATCGTATCCATTGCCAATAAGCGAGCGAG********AGAAAGA
AAGAGATAGAATGTCTGGAATGGTAGATGCGAGCTCGTGGGGAGCAGCGTTGGTTAGTAT
CTCGCCGTACACTTTCTCCGCAATCGGAATCGCCATCTCGATCGGCGTCTCTGTCCTCGG
CGCCGCCTGGGGGATTTACATCACCGGAAGTAGTTTGATCGGTGCTGCCATTGAAGCTCC
TCGTATCACTTCCAAGAATCTCATCAGTGTAATCTTTTGCGAAGCTGTAGCTATATATGG
CGTTATTGTTGCAATCATTCTGCAAACGAAGTTGGAGAGTGTCCCATCTTCAAAGATGTA
TGACGCCGAGTCTCTTAGAGCTGGATACGCAATCTTCGCTTCTGGAATCATTGTTGGATT
CGCCAACCTTGTATGCGGGTTATGTGTAGGAATCATTGGAAGCAGTTGCGCATTGTCAGA
TGCTCAGAACTCAACTCTGTTTGTGAGGATTCTTGTGATTGAGATCTTCGGAAGCGCTCT
CGGGTTGTTTGGAGTTATTGTGGGG*ATCATTATGTCCGCACAAGCTACATGGCCGACCA
AATAGAGAGCATACAACCTTGTCTGAAACTCTGGAAAGAAGATGGTTTCTTGATTATCTT
CATTGTTATATGGATACTTTCATGTCTAGAGAAAAAAAACCAGTGTAAGAACTGAGAACT
TCTTTGTATCCCTGATTTTTTTTTTCCAATATTGTTTTAATACTTTGTAATAAGTCTCTT
TGG

QA 1 843 1 843
DS 

RD RR2CK84JQ 710 0 0
CCGTACACTTTCTCGGCAATCGGAATCGCCATCTCGATCGGCGTCTCTGTCCTCGGCGCC
GCCTGGGGGATTTACATCACCGGAAGTAGTTTGATCGGTGCTGCCATTGAAGCTCCTCGT
ATCACTTCCAAGAATCTCATCAGTGTAATCTTTTGCGAAGCTGTAGCTATATATGGCGTT
ATTGTTGCAATCATTCTGCAAACGAAGTTGGAGAGTGTCCCATCTTCAAAGATGTATGAC
GCTGAGTCTCTTAGAGCTGGATATGCAATCTTCGCTTCTGGAATCATTGTTGGATTCGCC
AATCTTGTATGCGGGTTATGTGTAGGAATCATTGGAAGCAGTTGCGCATTGCCAGATGCT
CAGAACTCAACTCTGTTTGTGAAGATTCTTGTGATTGAGATCTTCGGAAGCGCTCTCGGT
TTGTTTGGAGTTATTGTGGGG*ATCATTATGTCCGCACAAGCTACATGGCCGACCAAATA
GAGAGCATACAACCGTGTCTGAAACTCTGGAAAGAAGATGGTTTCTTGATTATCTTCATT
GTTATATGGATACTTTCATGTCTAGAGAAAAAAA*CCAGTGTAAGAACTGAGAACTTCTT
TGTATCCCTGATTTTTTTTTTCCAATATTGTTTTAATACTTTGTAATAAGTCTCTTTGGA
GAACATCTTCTTGTTTGTATTCTCTTTTAATCAAAGACAAGAGTTTGTAT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 4

CO CL1751Contig1 891 4 19 U
GCAAGAATGTGGTGTTGGACTTGCTTAGAGACCAGTTCCCTAGAGCTAATGACTTTGGGA
GTGAAGTTATCCCTGGTGCTACTGATCTTGGACTGAGAGTGCAAGCTTATCTGTATGATG
GGTATTGGGAAGACATTGGTACCATTGAAGCGTTTTACAATGCTAATCTTGGGATCACCA
AGAAACCAGTACCAGATTTCAGCTTCTACGACCGTTCAGCACCAATCTACACACAGCCTA
GGTACTTACCTCCATCCAAGATGCTTGATGCTGATGTTACCGACAGTGTGATCGGTGAAG
GTTGTGTCATCAAGAATTGCAAAATCCACCATTCCGTGATTGGTCTTCGGTCTTGCATAT
CGGAGGGTGCTATCATAGAAGACACCTTGTTGATGGGTGCAGACTACTACGAGACTGATG
CGGATAGGACACTCCTGGCTGCAAAAGGCAGCATTCCGATTGGCATTGGCCGAGACTCAC
ACATTAAAAGAGCTATCATTGACAAGAATGCTCGTATTGGTGACAACGTCAAGATCATCA
ACACGGACAATGTGCAAGAAGCTGCCAGAGAGACGGATGGATACTTCATCAAGAGCGGCA
TTGTTACAGTGATCAAGGATGCTCTCATTCCTAGTGGAACTGTTATCTAAGAGACACCAC
CCACCCCCTTTGACAATCTTCTTACATATCTCATGGTTTTGACCTCGTGTTAACTTCCAC
TGATGCTATCTGTAATGTTATCCGCGGTCAGGGCCTATTCATCCTCTTCCCTTATCCCGA
AATAATAATCTCTCTACTTTGTATTCTAGATCTTTGGCGATATACATGCATAGAAATGCA
GAACTTGCCCTCTATGTAACAAAACTATGAACCAGAAATCGTTAAAAGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H035TF U 1
AF RR2E766TF U 142
AF RR2EH56JQ C 114
AF RR2E766JQ C 142
BS 1 229 RR2H035TF
BS 230 230 RR2E766TF
BS 231 328 RR2H035TF
BS 329 329 RR2E766TF
BS 330 526 RR2H035TF
BS 527 527 RR2E766TF
BS 528 616 RR2H035TF
BS 617 617 RR2E766TF
BS 618 712 RR2H035TF
BS 713 713 RR2E766TF
BS 714 726 RR2H035TF
BS 727 727 RR2E766TF
BS 728 734 RR2H035TF
BS 735 735 RR2E766TF
BS 736 749 RR2H035TF
BS 750 752 RR2E766TF
BS 753 753 RR2EH56JQ
BS 754 835 RR2E766TF
BS 836 891 RR2EH56JQ

RD RR2H035TF 749 0 0
GCAAGAATGTGGTGTTGGACTTGCTTAGAGACCAGTTCCCTAGAGCTAATGACTTTGGGA
GTGAAGTTATCCCTGGTGCTACTGATCTTGGACTGAGAGTGCAAGCTTATCTGTATGATG
GGTATTGGGAAGACATTGGTACCATTGAAGCGTTTTACAATGCTAATCTTGGGATCACCA
AGAAACCAGTACCAGATTTCAGCTTCTACGACCGTTCAGCACCAATCTATACACAGCCTA
GGTACTTACCTCCATCCAAGATGCTTGATGCTGATGTTACCGACAGTGTGATCGGTGAAG
GTTGTGTCATCAAGAATTGCAAAATCCATCATTCCGTGATTGGTCTTCGGTCTTGCATAT
CGGAGGGTGCTATCATAGAAGACACCTTGTTGATGGGTGCAGACTACTACGAGACTGATG
CGGATAGGACACTCCTGGCTGCAAAAGGCAGCATTCCGATTGGCATTGGCCGAGACTCAC
ACATTAAAAGAGCTATCATTGACAAGAATGCTCGTATTGGTGACAATGTCAAGATCATCA
ACACGGACAATGTGCAAGAAGCTGCCAGAGAGACGGATGGATACTTCATCAAGAGCGGCA
TTGTTACAGTGATCAAAGATGCTCTCATTCCTAGTGGAACTGTTATCTAAGAGACACCAC
CCACCCCCTTTGACAATCTTCTTACATATCTCATGGTTTTGACCTCGTGTTAGCTTCCAC
TGATGCCATCTGTA*TGTTATCCGCGGTC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2E766TF 697 0 0
G
CATTGAAGCGTTTTACAATGCTAATCTTGGGATCACCAAGAAACCAGTACCAGATTTCAG
CTTCTACGACCGTTCAGCACCAATCTACACACAGCCTCGGTACTTACCTCCATCCAAGAT
GCTTGATGCTGATGTTACCGACAGTGTGATCGGTGAAGGTTGTGTCATCAAGAATTGCAA
AATCCACCATTCCGTGATTGGTCTTCGGTCTTGCATATCGGAGGGTGCTATCATAGAAGA
CACCTTGTTGATGGGTGCAGACTACTACGAGACTGATGCGGATAGGACACTCCTGGCTGC
AAAAGGCAGCATTCCGATTGGCATTGGCCGAGACTCACACATTAAAAGAGCTATCATTGA
CAAGAATGCTCGTATTGGTGACAACGTCAAGATCATCAACACGGACAATGTGCAAGAAGC
TGCCAGAGAGACGGATGGATACTTCATCAAGAGCGGCATTGTTACAGTGATCAAGGATGC
TCTTATTCCTAGTGGAACTGTTATCTAAGAGACACCACTCACCCCCTTTGACACTCTTCT
TACATATCTCATGGTTTTGACCTCGTGTTAACTTCCACTGATGCTATCTGTAATGTTATC
CGCGGTCAGG*CCTATTCATCCTCTTCCCTTATCCCGAAATAATAATCTCTCTACTTTGT
ATTCTAGATCTTTGGCGATATACATGCATAGAA
TGC

QA 2 694 2 694
DS 

RD RR2EH56JQ 778 0 0
TATGATGGGTATTGGGAAGACATTGGTACCATTGAAGCGTTTTACAATGCTAATCTTGGG
ATCACCAAGAAACCAGTACCAGATTTCAGCTTCTACGACCGTTCAGCACCAATCTATACA
CAGCCTAGGTACTTACCTCCATCCAAGATGCTTGATGCTGATGTTACCGACAGTGTGATC
GGTGAAGGTCGTGTCATCAAGAATTGCAAAATCCATCATTCCGTGATTGGTCTTCGGTCT
TGCATATCGGAGGGTGCTATCATAGAAGACACCTTGTTGATGGGTGCAGACTACTACGAG
ACTGATGCGGATAGGACACTCCTGGCTGCAAAAGGCAGCATTCCGATTGGCATTGGCCGA
GACTCACACATTAAAAGAGCTATCATTGACAAGAATGCTCGTATTGGTGACAATGTCAAG
ATCATCAACACGGACAATGTGCAAGAAGCTGCCAGAGAGGCGGATGAATACTTCATCAAG
AGCGGCATTGTTACAGTGATCAAGGATGCTCTCATTCCTAGTGGAACTGTTATCTAAGAG
ACACCACCCACCCCCTTTGACAATCTTCTTACATATCTCATGGTTTTGACCTCGTGTTAG
CTTCCACTGATGCTATCTGTAATGTTATCCGCGGTCAGGGCCTATTCATCCTCTTCCCTT
ATCCCGAAATAATAATCTCTCTACTTTGTATTCTAGATCTTTGGCGATATACATGCATAG
AAATGCAGAACTTGCCCTCTATGTAACAAAACTATGAACCAGAAATCGTTAAAAGGCG

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2E766JQ 716 0 0
G
CATTGAAGCGTTTTACAATGCTAATCTTGGGATCACCAAGAAACCAGTACCAGATTTCAG
CTTCTACGACCGTTCAGCACCAATCTACACACAGCCTCGGTACTTACCTCCATCCAAGAT
GCTTGATGCTGATGTTACCGACAGTGTGATCGGTGAAGGTTGTGTCATCAAGAATTGCAA
AATCCACCATTCCGTGATTGGTCTTCGGTCTTGCATATCGGAGGGTGCTATCATAGAAGA
CACCTTGTTGATGGGTGCAGACTACTACGAGACTGATGCGGATAGGACACTCCTGGCTGC
AAAAGGCAGCATTCCGATTGGCATTGGCCGAGACTCACACATTAAAAGAGCTATCATTGA
CAAGAATGCTCGTATTGGTGACAACGTCAAGATCATCAACACGGACAATGTGCAAGAAGC
TGCCAGAGAGACGGATGGATACTTCATCAAGAGCGGCATTGTTACAGTGATCAAGGATGC
TCTTATTCCTAGTGGAACTGTTATCTAAGAGACACCACTCACCCCCTTTGACACTCTTCT
TACATATCTCATGGTTTTGACCTCGTGTTAACTTCCACTGATGCTATCTGTAATGTTATC
CGCGGTCAGGGCCTATTCATCCTCTTCCCTTATCCCGAAATAATAATCTCTCTACTTTGT
ATTCTAGATCTTTGGCGATATACATGCATAGAAATGCAGAACTTGCCCTCTATGT

QA 2 716 2 716
DS 



AS 1 5

CO CL1752Contig1 1189 5 33 U
GGATTGTCTCCGTCATTTGTTCCTCAGTTTCTATCGATCCTCACGGTTCCTCAGGCACTG
TAACATCATCGAAGACTCAAAGAGAAAGGAATCAGTGAATCTCGAACGATCGTGACAGTG
TTTATCTTGAGAGAGAATGGCTTCAACACCTTGTGCAGCATGCAAGCTCTTGAGAAGAAA
GTGCACTCAAGAATGTGTTTTTGCGCCCTATTTTCCACCAACTCAGCCTCAGAAGTTTAT
ATACGTTCACAAAGTCTTTGGAGCAAGCAATGTAACCAAGATCCTCAACGATCTCCCACC
TCCAAACCGAGAAGACGCTGTTAATTCCCTCTACTATGAAGCCGAGGCCCGTATCCGTGA
CCCAATCTACGGATGCGTTGGTCTCATCTCCTTCTTACAACAATGTCTCAAGAAAATCCA
ACAAGATCTTGTCACTGCTAAAGAAGAGCTTGCTGGTTACATTGGACCCGATGCTGTGAA
TCCGCAACAGCCTTATCTTCCTCCTCTAGCCAACAATCCTCCACCAAATTTCATGATGGC
TATGGAAGGAATGCCACATGGAGTGGTCCCTCAAGGAGAACCGTTGATCATACGCGAACC
AAACATGCCTCAGCATCAACATCAACCGCAAGATGAGCAGATGCAA*CTCATGGGTACTG
ATGCACAGAGAATGGCTGCAATGATTTTGGAGAGAGGAGATCACCAACAAGAGATGTTCA
GTGGTTACGGGATAGACAACAATGGGTCGGTTACAGCCACAGGGTATAACCAGATGGATG
TGAACGATCACACGGCTGGTGGGTCGTTGTCTGGACCATCTCTTGCTTTAGGAAGCTTTG
GTGATGCTTATCAAATGGGTCACGAGACAGAGCATCACATCAGTCATGATCAGCTTCAGA
CACAGCTTATGCTTCAGCCTCCATTACAGGAAGGTCAAGAGCAAAATGAAGGACAGTTTC
TGATGCAGCCAATGGGACAAGAGAATCTCCATGAAGAAGAGGATGAGGAAGAGCTTGAGC
CGCCGGTTAAGTGGAGGAAATCTGACAACAAGGAAGCTAGTTATTGATTAAAACCAAGAA
AATAAGACATTTTCATTTGATGGATAGTTACTCTTGAGGGTCTAAGTTGCTTTTTAAAAA
TGTAATAAATGGCATTATTCATTGATTAATGTTTAGCATCGACAGATTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2BY90TF U 2
AF RR2GD75TF U 1
AF RR2C456TF U 276
AF RR2GD75JQ C 397
AF RR2C456JQ C 428
BS 1 39 RR2GD75TF
BS 40 40 RR2BY90TF
BS 41 55 RR2GD75TF
BS 56 60 RR2BY90TF
BS 61 105 RR2GD75TF
BS 106 106 RR2BY90TF
BS 107 261 RR2GD75TF
BS 262 262 RR2BY90TF
BS 263 472 RR2GD75TF
BS 473 473 RR2BY90TF
BS 474 485 RR2GD75TF
BS 486 486 RR2BY90TF
BS 487 709 RR2GD75TF
BS 710 710 RR2BY90TF
BS 711 730 RR2GD75TF
BS 731 731 RR2C456TF
BS 732 738 RR2GD75TF
BS 739 739 RR2C456TF
BS 740 751 RR2GD75TF
BS 752 752 RR2C456TF
BS 753 757 RR2GD75TF
BS 758 758 RR2C456TF
BS 759 763 RR2GD75TF
BS 764 764 RR2C456TF
BS 765 768 RR2GD75TF
BS 769 769 RR2C456TF
BS 770 783 RR2GD75TF
BS 784 784 RR2C456TF
BS 785 806 RR2GD75TF
BS 807 933 RR2C456TF
BS 934 934 RR2GD75JQ
BS 935 944 RR2C456TF
BS 945 1189 RR2GD75JQ

RD RR2BY90TF 767 0 0
GATTGTCTCCGTCATTTGTTCCTCAGTTTCTATCGATCCTCACGGTTCCTCAGGCACTGT
AACATCATCGAAGACTCAAAGAGAAAGGAATCAGTGAATCTCGAACGATCGTGACAGTGT
TTATCTTGAGAGAGAATGGCTTCAACACCTTGTGCAGCATGCAAGCTCTTGAGAAGAAAG
TGCACTCAAGAATGTGTTTTTGCGCCCTATTTTCCACCAACTCAGCCTCAGAAGTTTATA
TACGTTCACAAAGTCTTTGGAGCAAGCAATGTAACCAAGATCCTCAACGATCTCCCACCT
CCAAACCG*GAAGACGCTGTTAATCCCCTCTACTATGAAGCCGAGGCCCGTATCCGTGAC
C*AATCTACGGATGCGTTGGTCTCATCTCCTTCTTACAACAATGTCTCAAGAAAATCCAA
CAAGATCTTGTCACTGCTAAAGAAGAGCTTGCTGGTTACATTGGACCCGATGCTGTGAAT
CCGCAACAGCCTTATCTTCCTCCTCTAGCCAACAATCCTCCACCAAATTTCATGATGGCT
ATGGAAGGAATGCCACATGGAGTGGTCCCTCAAGGAGAACCGTTGATCATACGCGAACCA
AACATGCCTCAGCATCAACATCAACCGCAAGATGAGCAGATGCAA*CTCATGGGTACTGA
TGCACAGAGAATGGCTGCAATGATTTTGGAGAGAGGAGATCACCAACAAGAGATGTTCAG
TGGTTACGG*ATAGACA*CAATGGGTCGGT
ACAGCACAGGTATACCA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2GD75TF 806 0 0
GGATTGTCTCCGTCATTTGTTCCTCAGTTTCTATCGATC*TCACGGTTCCTCAGG*****
TAACATCATCGAAGACTCAAAGAGAAAGGAATCAGTGAATCTCGAGCGATCGTGACAGTG
TTTATCTTGAGAGAGAATGGCTTCAACACCTTGTGCAGCATGCAAGCTCTTGAGAAGAAA
GTGCACTCAAGAATGTGTTTTTGCGCCCTATTTTCCACCAACTCAGCCTCAGAAGTTTAT
ATACGTTCACAAAGTCTTTGGGGCAAGCAATGTAACCAAGATCCTCAACGATCTCCCACC
TCCAAACCGAGAAGACGCTGTTAATTCCCTCTACTATGAAGCCGAGGCCCGTATCCGTGA
CCCAATCTACGGATGCGTTGGTCTCATCTCCTTCTTACAACAATGTCTCAAGAAAATCCA
ACAAGATCTTGTCACTGCTAAAGAAGAGCTTGCTGGTTACATTGGACCCGATTCTGTGAA
TCCGCCACAGCCTTATCTTCCTCCTCTAGCCAACAATCCTCCACCAAATTTCATGATGGC
TATGGAAGGAATGCCACATGGAGTGGTCCCTCAAGGAGAACCGTTGATCATACGCGAACC
AAACATGCCTCAGCATCAACATCAACCGCAAGATGAGCAGATGCAA*CTCATGGGTACTG
ATGCACAGAGAATGGCTGCAATGATTTTGGAGAGAGGAGATCACCAACA*GAGATGTTCA
GTGGTTACGG*ATAGACA*CAATGGGTCGGT*ACAGC*ACAGG*TATA*CCAGATGGATG
TGA*CGATCACACGGCTGGTGGGTCG

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2C456TF 669 0 0
CCAAGATCCTCAACGATCTCCCACCTCCAAACCGAGAAGACGCTGTTAATTCCCTCTACT
ATGAAGCCGAGGCCCGTATCCGTGACCCAATCTACGGATGCGTTGGTCTCATCTCCTTCT
TACAACAATGTCTCAAGAAAATCCAACAAGATCTTGTCACTGCTAAAGAAGAGCTTGCTG
GTTACATTGGACCCGATGCTGTGAATCCGCAACAGCCTTATCTTCCTCCTCTAGCCAACA
ATCCTCCACCAAATTTCATGATGGCTATGGAAGGAATGCCACATGGAGTGGTCCCTCAAG
GAGAACCGTTGATCATACGCGAACCAAACATGCCTCAGCATCAACATCAACCGCAAGATG
AGCAGATGCAA*CTCATGGGTACTGATGCACAGAGAATGGCTGCAATGATTTTGGAGAGA
GGAGATCACCAACAAGAGATGTTCAGTGGTTACGGGATAGACAACAATGGGTCGGTTACA
GCCACAGGGTATAACCAGATGGATGTGAACGATCACACGGCTGGTGGGTCGTTGTCTGGA
CCATCTCTTGCTTTAGGAAGCTTTGGTGATGCTTATCAAATGGGTCACGAGACAGAGCAT
CACATCAGTCATGATCAGCTTCAGACACAGCTTATGCTTCAGCCTCCATTACAGGAAG*T
CAAGAGCAA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2GD75JQ 793 0 0
ACAACAATGTCTCAAGAAAATCCAACAAGATCTTGTCACTGCTAAAGAAGAGCTTGCTGG
TTACATTGGACCCGATTCTGTGAATCCGCCACAGCCTTATCTTCCTCCTCTAGCCAACAA
TCCTCCACCAAATTTCATGATGGCTATGGAAGGAATGCCACATGGAGTGGTCCCTCAAGG
AGAACCGTTGATCATACGCGAACCAAACATGCCTCAGCATCAACATCAACCGCAAGATGA
GCAGATGCAA*CTCATGGGTACTGATGCACAGAGAATGGCTGCAATGATTTTGGAGAGAG
GAGATCACCAACAAGAGATGTTCAGTGGTTACGGGATAGACAACAATGGGTCGGTTACAG
CCACAGGGTATAACCAGATGGATGTGAACGATCACACGGCTGGTGGGTCGTTGTCTGGAC
CATTTCTTGCTTTAGGAAGCTTTGGTGATGCTTATCAAATGGGTCACGAGACAGAGCATC
ACATCAGTCATGATCAGCTTCAGACACAGCTTATGCTTCAGCCTCCATTACAGGAAGGTC
AAGAGCAAAATGAAGGACAGTTTCTGATGCAGCCAATGGGACAAGAGAATCTCCATGAAG
AAGAGGATGAGGAAGAGCTTGAGCCGCCGGTTAAGTGGAGGAAATCTGACAACAAGGAAG
CTAGTTATTGATTAAAACCAAGAAAATAAGACATTTTCATTTGATGGATAGTTACTCTTG
AGGGTCTAAGTTGCTTTTTAAAAATGTAATAAATGGCATTATTCATTGATTAATGTTTAG
CATCGACAGATTC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2C456JQ 758 0 0
CTTGTCACTGCTAAAGAAGAGCTTGCTGGTTACATTGGACCCGATGCTGTGAATCCGCAA
CAGCCTTATCTTCCTCCTCTAGCCAACAATCCTCCACCAAATTTCATGATGGCTATGGAA
GGAATGCCACATGGAGTGGTCCCTCAAGGAGAACCGTTGATCATACGCGAACCAAACATG
CCTCAGCATCAACATCAACCGCAAGATGAGCAGATGCAAACTCATGGGTACTGATGCACA
GAGAATGGCTGCAATGATTTTGGAGAGAGGAGATCACCAACAAGAGATGTTCAGTGGTTA
CGGGATAGACAACAATGGGTCGGTTACAGCCACAGGGTATAACCAGATGGATGTGAACGA
TCACACGGCTGGTGGGTCGTTGTCTGGACCATCTCTTGCTTTAGGAAGCTTTGGTGATGC
TTATCAAATGGGTCACGAGACAGAGCATCACATCAGTCATGATCAGCTTCAGACACAGCT
TATGCTTCAGCCTCCATTACAGGAAGGTCAAGAGCAAAATGAAGGACAGTTTCTGATGCA
GCCAATGGGACAAGAGAATCTCCATGAAGAAGAGGATGAGGAAGAGCTTGAGCCGCCGGT
TAAGTGGAGGAAATCTGACAACAAGGAAGCTAGTTATTGATTAAAACCAAGAAAATAAGA
CATTTTCATTTGATGGATAGTTACTCTTGAGGGTCTAAGTTGCTTTTTAAAAATGTAATA
AATGGCATTATTCATTGATTAATGTTTAGCATCGACA
A

QA 1 757 1 757
DS 



AS 2 5

CO CL1753Contig1 842 2 2 U
TTTTTCTCTTTCCGTGGATCGATGGCAGCTTCGGTTGATCCTTTGGTGGTTGGAAGAGTG
ATCGGAGATGTGTTGGACATGTACATCCCCACCGCCAACATGTCTGTCTACGTTGGCCCC
AAACACATCACTAACGGCTGCCAGATCAAACCCTCAGCCGCAGTCAACCCTCCTAGAGTC
ACTATCTCCGGCAACTCCGATGAGCTTTACACCCTTGTGATGACTGACCCGGACGCACCT
AGCCCGAGCGAGCCGAACATGAGAGAATGGGTCCATTGGATTGTCGTAGATATCCCCAGA
GGCACCAATCCATCAAAAGGCAAGGAGATACTGCCATATACGGAACCGAGACCCCCTGTG
GGGATTCACCGTTACATATTGGTACTTTTTCGGCAGAGGTCACCGGTGGGTCTGATGGTG
CAGCTGCCGCCTTCTCGAGCCAATTTCAGCACCCGAATGTTCGCCGGACATCTAGATCTT
GGTTTACCTGTGGCGACAGTTTACTTCAATGCCCAAAAAGAGCCAGCTTCACGCAGACGT
TGATTCCACTAAGTATACTAAAGAATAACAACGAGCATATTCAGGGTTTTATCTGAAAAC
CGGACTGGAAAGAAATGTGGCTTTTATATGAACCATATTTTATAATTCCCGTGCTCGCAA
TAATATCTGTATATGTAGTATAGTTTACATAGTCATACAAATATGTTTGTGTGCTTGTGT
TACATGAAGTTGTTTGCGTATAATATATGGTTTTCGTTTGTGTGATCTTTGAAAATTAAA
ATTGTAAATGAACATATACATACTAGAATGTTAACAATGAGGCAGACAAGAGATTACACA
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2D329TF U 1
AF RR2D329JQ C 35
BS 1 752 RR2D329TF
BS 753 842 RR2D329JQ

RD RR2D329TF 752 0 0
TTTTTCTCTTTCCGTGGATCGATGGCAGCTTCGGTTGATCCTTTGGTGGTTGGAAGAGTG
ATCGGAGATGTGTTGGACATGTACATCCCCACCGCCAACATGTCTGTCTACGTTGGCCCC
AAACACATCACTAACGGCTGCCAGATCAAACCCTCAGCCGCAGTCAACCCTCCTAGAGTC
ACTATCTCCGGCAACTCCGATGAGCTTTACACCCTTGTGATGACTGACCCGGACGCACCT
AGCCCGAGCGAGCCGAACATGAGAGAATGGGTCCATTGGATTGTCGTAGATATCCCCAGA
GGCACCAATCCATCAAAAGGCAAGGAGATACTGCCATATACGGAACCGAGACCCCCTGTG
GGGATTCACCGTTACATATTGGTACTTTTTCGGCAGAGGTCACCGGTGGGTCTGATGGTG
CAGCTGCCGCCTTCTCGAGCCAATTTCAGCACCCGAATGTTCGCCGGACATCTAGATCTT
GGTTTACCTGTGGCGACAGTTTACTTCAATGCCCAAAAAGAGCCAGCTTCACGCAGACGT
TGATTCCACTAAGTATACTAAAGAATAACAACGAGCATATTCAGGGTTTTATCTGAAAAC
CGGACTGGAAAGAAATGTGGCTTTTATATGAACCATATTTTATAATTCCCGTGCTCGCAA
TAATATCTGTATATGTAGTATAGTTTACATAGTCATACAAATATGTTTGTGTGCTTGTGT
TACATGAAGTTGTTTGCGTATAATATATGGTT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2D329JQ 808 0 0
G
TGATCCTTTGGTGGTTGGAAGAGTGATCGGAGATGTGT*GGACATGTACATCCCCAC*GC
CAACATGTCTGTCTACGTTGGCCCCAAACACATCACTAACGGCTGCCAGATCAAACCTTC
AGCCGCAGTCAACCCTCCTAGAGTCACTATCTCCGGCAACTCCGATGAGCTTTACACCCT
TGTGATGACTGACCCGGACGCACCTAGCCCGAGCGAGCCGAACATGAGAGAATGGGTCCA
TTGGATTGTCGTAGATATCCCCAGAGGCACCAATCCATCAAAAGGCAAGGAGATACTGCC
ATATACGGAACCGAGACCCCCTGTGGGGATTCACCGTTACATATTGGTACTTTTTCGGCA
GAGGTCACCGGTGGGTCTGATGGTGCAGCTGCCGCCTTCTCGAGCCAATTTCAGCACCCG
AATGTTCGCCGGACATCTAGATCTTGGTTTACCTGTGGCGACAGTTTACTTCAATGCCCA
AAAAGAGCCAGCTTCACGCAGACGTTGATTCCACTAAGTATACTAAAGAATAACAACGAG
CATATTCAGGGTTTTATCTGAAAACCGGACTGGAAAGAAATGTGGCTTTTATATGAACCA
TATTTTATAATTCCGGTGCTCGCAATAATATCTGTATATGTAGTATAGTTTACATAGTCA
TACAAATATGTTTGTGTGCTTGTGTTACATGAAGTTGTTTGCGTATAATATATGGTTTTC
GTTTGTGTGATCTTTGAAAATTAAAATTGTAAATGAACATATACATACTAGAATGTTAAC
AATGAGGCAGACAAGAGATTACACATC

QA 2 808 2 808
DS 



CO CL1753Contig2 849 3 11 U
GGATGCGCTCAACGATTCTTCTTCTATAAATAAAAGAATCTCTACTTCTCTCTCTTTCTC
TATCTCTATCCCTCTCTTTCTTTTTCTCTTTCCGTGGATCGATGGCAGCTTCGGTTGATC
CTTTGGTGGTTGGAAGAGTGATCGGAGATGTGTTGGACATGTACATCCCCACCGCCAACA
TGTCTGTCTACGTTGGCCCCAAACACATCACTAACGGCTGCCAGATCAAACCATCGGCCG
CAGTCAACCCTCCTAGAGTCACCATCTCCGGCAACTCCGATGAGCTTTACACCCTTGTGA
TGACTGACCCGGACGCACCTAGCCCGAGCGAGCCGAACATGAGAGAATGGGTCCATTGGA
TTGTCGTAGATATCCCCGGAGGCACCAATCCATCAAAAGGCAAGGAGATACTGCCATATA
CGGAACCGAGACCCCCTGTGGGGATTCACCGTTACATATTGGTACTTTTTCGGCAGAGGT
CACCGGTGGGTCTGATGGTGCAGCTGCCGCCTTCTCGAGCCAATTTCAGCACCCGAATGT
TCGCCGGACATCTAGATCTTGGTTTACCTGTGGCGACAGTTTACTTCAATGCCCAAAAAG
AGCCAGCTTCACGCAGACGTTGATTCCACTAAGTATACTAAAGAATAACAACGAGAGCAT
TTTCAGGGTTTTATCTGAAAACCGGACTGGAAAGAAATGTGGCTTTTATATGTCGAACCA
TATTTTATAATTCCCGTGCTCGCA*TATATATATCTGTATATGTAGTATAGTTTATATAG
TCATACAAATATGTTTGTGTGCTTGTGTTACATGAAGTTGTTTGCGTATAATATATGGTT
TTCGTTTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D521TF U 1
AF RR2GK38TF U 1
AF RR2GK38JQ C 195
BS 1 70 RR2D521TF
BS 71 71 RR2GK38TF
BS 72 479 RR2D521TF
BS 480 480 RR2GK38TF
BS 481 718 RR2D521TF
BS 719 719 RR2GK38TF
BS 720 734 RR2D521TF
BS 735 735 RR2GK38TF
BS 736 792 RR2D521TF
BS 793 801 RR2GK38TF
BS 802 849 RR2GK38JQ

RD RR2D521TF 792 0 0
GGATGCGCTCAACGATTCTTCTTCTATAAATAAAAGAATCTCTACTTCTCTCTCTTTCTC
TATCTCTATCTCTCTCTTTCTTTTTCTCTTTCCGTGGATCGATGGCAGCTTCGGTTGATC
CTTTGGTGGTTGGAAGAGTGATCGGAGATGTGTTGGACATGTACATCCCCACCGCCAACA
TGTCTGTCTACGTTGGCCCCAAACACATCACTAACGGCTGCCAGATCAAACCATCGGCCG
CAGTCAACCCTCCTAGAGTCACCATCTCCGGCAACTCCGATGAGCTTTACACCCTTGTGA
TGACTGACCCGGACGCACCTAGCCCGAGCGAGCCGAACATGAGAGAATGGGTCCATTGGA
TTGTCGTAGATATCCCCGGAGGCACCAATCCATCAAAAGGCAAGGAGATACTGCCATATA
CGGAACCGAGACCCCCTGTGGGGATTCACCGTTACATATTGGTACTTTTTCGGCAGAGGC
CACCGGTGGGTCTGATGGTGCAGCTGCCGCCTTCTCGAGCCAATTTCAGCACCCGAATGT
TCGCCGGACATCTAGATCTTGGTTTACCTGTGGCGACAGTTTACTTCAATGCCCAAAAAG
AGCCAGCTTCACGCAGACGTTGATTCCACTAAGTATACTAAAGAATAACAACGAGAGCAT
TTTCAGGGTTTTATCTGAAAACCGGACTGGAAAGAAATGTGGCTTTTATATGTCGAAC*A
TATTTTATAATTCC*GTGCTCGCA*TATATATATCTGTATATGTAGTATAGTTTATATAG
TCATACAAATAT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2GK38TF 801 0 0
GGATGCGCTCAACGATTCTTCTTCTATAAATAAAAGAATCTCTACTTCTCTCTCTTTCTC
TATCTCTATCCCTCTCTTTCTTTTTCTCTTTCCGTGGATCGATGGCAGCTTCGGTTGATC
CTTTGGTGGTTGGAAGAGTGATCGGAGATGTGTTGGACATGTACATCCCCACCGCCAACA
TGTCTGTCTACGTTGGCCCCAAACACATCACTAACGGCTGCCAGATCAAACCATCGGCCG
CAGTCAACCCTCCTAGAGTCACCATCTCCGGCAACTCCGATGAGCTTTACACCCTTGTGA
TGACTGACCCGGACGCACCTAGCCCGAGCGAGCCGAACATGAGAGAATGGGTCCATTGGA
TTGTCGTAGATATCCCCGGAGGCACCAATCCATCAAAAGGCAAGGAGATACTGCCATATA
CGGAACCGAGACCCCCTGTGGGGATTCACCGTTACATATTGGTACTTTTTCGGCAGAGGT
CACCGGTGGGTCTGATGGTGCAGCTGCCGCCTTCTCGAGCCAATTTCAGCACCCGAATGT
TCGCCGGACATCTAGATCTTGGTTTACCTGTGGCGACAGTTTACTTCAATGCCCAAAAAG
AGCCAGCTTCACGCAGACGTTGATTCCACTAAGTATACTAAAGAATAACAACGAGAGCAT
TTTCAGGGTTTTATCTGAAAACCGGACTGGAAAGAAATGTGGCTTTTATATGTCGAACCA
TATTTTATAATTCCCGTGCTCGCA*TATATATATCTGTATATGTAGTATAGTTT*TATAG
TCATACAA*TATGTTTGTGTG

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2GK38JQ 655 0 0
GGCCCCAAACACATCACTAACGGCTGCCAGATCAAACCATCGGCCGCAGTCAACCCTCCT
AGAGTCACCATCTCCGGCAACTCCGATGAGCTTTACACCCTTGTGATGACTGACCCGGAC
GCACCTAGCCCGAGCGAGCCGAACATGAGAGAATGGGTCCATTGGATTGTCGTAGATATC
CCCGGAGGCACCAATCCATCAAAAGGCAAGGAGATACTGCCATATACGGAACCGAGACCC
CCTGTGGGGATTCACCGTTACATATTGGTACTTTTTCGGCAGAGGTCACCGGTGGGTCTG
ATGGTGCAGCTGCCGCCTTCTCGAGCCAATTTCAGCACCCGAATGTTCGCCGGACATCTA
GATCTTGGTTTACCTGTGGCGACAGTTTACTTCAATGCCCAAAAAGAGCCAGCTTCACGC
AGACGTTGATTCCACTAAGTATACTAAAGAATAACAACGAGAGCATTTTCAGGGTTTTAT
TTGAAAACCGGACTGGAAAGAAATGTGGCTTTTATATGTCGAACCATATTTTATAATTCC
GGTGCTCGCAATATATATATCTGTATATGTAGTATAGTTTATATAGTCATACAAATATGT
TTGTGTGCTTGTGTTACATGAAGTTGTTTGCGTATAATATATGGTTTTCGTTTGG

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 4

CO CL1754Contig1 1079 4 41 U
GTCTTGTTTGAACTTGATCTCAGCAATAACCGGTTCGCTGGTAAATTCCCGGAAGTGGTT
ATCGGTTTACCGAAGCTAAAGTACCTTGATCTCCGGTACAACGAGTTCGAAGGGGGGTTA
CCAGAGTCTTTATTCGAAAAAGACCTAGACGCTTTGTTTCTGAATAGTAACCGGTTCACT
AGCAAAATCCCGGTTAACATGGGGAACTCCCCGGTATCGGTTCTAGTTCTGGCGTCAAAC
CGGTTTGATGGATGTATACCGACGAGTTTCAGCAAGATGGCCAAGACCCTGAACGAGATC
ATCTTGATGGATAACGGTTTACAGTCCTGTCTACCCAATGACATGGGGCTGCTTCAAAAC
GTCACCGTTTTGGATATTAGTTACAACTCGCTGGTGGGAGAGTTGCCGGAGTCAATGGGC
CAGATGGAGAGTCTGGAGGTGTTAAACGTGGAGCGTAACATGTTCTCCGGTGTAATACCG
GAGGAGATCTGTTTACTTAAGAATCTTAGAGAGTTCAGATACGGGTCTAATTACTTCACT
GGAGAACCACCAACGTGTCGTTACCTAGAGGACTATAATAGTAAGATGAACTGTCTCAAG
GATGCCAAAGAGCAGAGGTCGACGATGGAGTGTAAGGTGTTTTTGTCGAAGCCTGTGGAT
TGCGACTCCTACAAGTGTAGTCCTGTCACTTCTTCGTGTGTTTGTCCAGGTCATCTTTCT
CCTCATCCACCTCAGATATCACCGTTTTCTCCACCATCGGGGCCGTCTCTTCTTCCACCA
GCGCCGCAGCCGTCTCCGAGTGCTTAACAAAGAGGCTCTTTCTCGCAGCCACCGATGAAC
TGATCGATCTATGTGTAGAGAGAAACTAGAAATGGGCACGTGTTGAAACGAGATTGTTTA
GAGCCAGAGGGAATTTATCTGAGACAGCAAGCTGCAAATCTATAGGACAACGTGTAGGAC
TTGTCGATTTAATAGATTTTGCATGTGTGTGTTTATTTACATAAATTTTTTTTATTATAT
GATTCTTGTTTGTTAAGCCTTTTTCAGATTCATTAATAAAGAACGAACGGTGACAATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F725TF U 130
AF RR2GO37TF U 1
AF RR2DP64JQ C 237
AF RR2F725JQ C 372
BS 1 224 RR2GO37TF
BS 225 225 RR2F725TF
BS 226 236 RR2GO37TF
BS 237 237 RR2F725TF
BS 238 287 RR2GO37TF
BS 288 288 RR2F725TF
BS 289 335 RR2GO37TF
BS 336 336 RR2F725TF
BS 337 431 RR2GO37TF
BS 432 432 RR2F725TF
BS 433 434 RR2GO37TF
BS 435 435 RR2F725TF
BS 436 464 RR2GO37TF
BS 465 465 RR2F725TF
BS 466 515 RR2GO37TF
BS 516 516 RR2DP64JQ
BS 517 530 RR2GO37TF
BS 531 531 RR2DP64JQ
BS 532 542 RR2GO37TF
BS 543 543 RR2DP64JQ
BS 544 563 RR2GO37TF
BS 564 564 RR2DP64JQ
BS 565 577 RR2GO37TF
BS 578 578 RR2DP64JQ
BS 579 581 RR2GO37TF
BS 582 582 RR2DP64JQ
BS 583 662 RR2GO37TF
BS 663 663 RR2DP64JQ
BS 664 710 RR2GO37TF
BS 711 711 RR2DP64JQ
BS 712 750 RR2GO37TF
BS 751 751 RR2DP64JQ
BS 752 760 RR2GO37TF
BS 761 761 RR2DP64JQ
BS 762 771 RR2GO37TF
BS 772 774 RR2DP64JQ
BS 775 796 RR2GO37TF
BS 797 797 RR2DP64JQ
BS 798 804 RR2GO37TF
BS 805 1046 RR2DP64JQ
BS 1047 1079 RR2F725JQ

RD RR2F725TF 369 0 0
C
TATTCGAAAAAGACCTAGACGCTTTGTTTCTGAATAGTAACCGGTTCACTAGCAAAATCC
CGGTTAACATGGGGAGCTCCCCGGTATCGGTTCTAGTTCTGGCGTCAAACCGGTTTGATG
GATGTATACCGACGAGTTTCAGCAAGATGGCCAAGACCCTGAACGAGATCATCTTGATGG
ATAACGGTTTACAGTCCTGTCTACCCAATGACATGGGGCTGCTTCAAAACGTCACCGTTT
TGGATATTAGTTACAACTCGCTGGTGGGAGAGTTGCCGGAGTCAATGGGCCAGATGGAGA
GTCTGGAGGTGTTAAACGTGGAGCGTAACATGTTCTCCGGTGTAATACCGGAGGAGATCT
GTTTACTT

QA 2 369 2 369
DS 

RD RR2GO37TF 804 0 0
GTCTTGTTTGAACTTGATCTCAGCAATAACCGGTTCGCTGGTAAATTCCCGGAAGTGGTT
ATCGGTTTACCGAAGCTAAAGTACCTTGATCTCCGGTACAACGAGTTCGAAGGGGGGTTA
CCAGAGTCTTTATTCGAAAAAGACCTAGACGCTTTGTTTCTGAATAGTAACCGGTTCACT
AGCAAAATCCCGGTTAACATGGGGAACTCCCCGGTATCGGTTCTGGTTCTGGCGTCGAAC
CGGTTTGATGGATGTATACCGACGAGTTTCAGCAAGATGGCCAAGACTCTGAACGAGATC
ATCTTGATGGATAACGGTTTACAGTCCTGTCTACCTAATGACATGGGGCTGCTTCAAAAC
GTCACCGTTTTGGATATTAGTTACAACTCGCTGGTGGGAGAGTTGCCGGAGTCAATGGGC
CAGATGGAGAGCCTAGAGGTGTTAAACGTGGAGCGTAACATGTTTTCCGGTGTAATACCG
GAGGAGATCTGTTTACTTAAGAATCTTAGAGAGTTTAGATACGGGTCTAACTACTTCACT
GGTGAACCACCAACGTGTCGTTATCTAGAGGACTATAGTAGCAAGATGAACTGTCTCAAG
GATGCCAAAGAGCAGAGGTCGACGATGGAGTGTAAGGTGTTTTTGTCGAAGCCTGTGGAT
TGTGACTCCTACAAGTGTAGTCCTGTCACTTCTTCGTGTGTTTGTCCAGGCCATCTTTCT
CCTCATCCACCTCAGATATCACCGTTTTCTTCACCATCGGCGCCGTCTCTT***CCACCA
GCGCCGCAGCCGTCTCGGAGTGCT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2DP64JQ 810 0 0
TCGACCGG
TTGATGGATGTATGC*GACGAGTTTCAGCAAGATGGCCAAGAC*CTGAACGAGATCATCT
TGATGGATAACGGTTTACAGTCCTGTCTACCCAATGACATGGGGCTGCTTCAAAACGTCA
CCGTTTTGGATATTAGTTACAACTCGCTGGTGGGAGAGTTGCCGGAGTCAATGGGCCAGA
TGGAGAGTCTGGAGGTGTTAAACGTGGAGCGTAACATGTTCTTCGGTGTAATACCGGAGG
AGATCTGTTTACTTAAGAATCTTAGAGAGTTCGGATACGGGTCTAATTACTTCACTGGAG
AACCACCAACGTGTCGATACCTAGAGGACTATAATAGTAAGATGAACTGTCTCAAGGATG
CCAAAGAGCAGAGGTCGACGATGGAGTGTAAGGTGTTTTTGTCGAAGCCTGTGGATTGCG
ACTCCTACAAGTGTAGTCCTGTCACTTCTTCGTGTGTTTGTCCAGGTCATCTTTCTCCTC
ATCCACCTCAGATATCACCGTTTTCTCCACCATCGGGGCCGTCTCTTCTTCCACCAGCGC
CGCAGCCGTCTCCGAGTGCTTAACAAAGAGGCTCTTTCTCGCAGCCACCGATGAACTGAT
CGATCTATGTGTAGAGAGAAACTAGAAATGGGCACGTGTTGAAACGAGATTGTTTAGAGC
CAGAGGGAATTTATCTGAGACAGCAAGCTGCAAATCTATAGGACAACGTGTAGGACTTGT
CGATTTAATAGATTTTGCATGTGTGTGTTTATTTACATAAATTTTTTTTATTATATGATT
CTTGTTTGTTAAGCCTTTTTCA

QA 9 810 9 810
DS 

RD RR2F725JQ 708 0 0
GGATATTAGTTACAACTCGCTGGTGGGAGAGTTGCCGGAGTCAATGGGCCAGATGGAGAG
TCTGGAGGTGTTAAACGTGGAGCGTAACATGTTCTCCGGTGTAATACCGGAGGAGATCTG
TTTACTTAAGAATCTTAGAGAGTTCAGATACGGGTCTAATTACTTCACTGGAGAACCACC
AACGTGTCGTTACCTAGAGGACTATAATAGTAAGATGAACTGTCTCAAGGATGCCAAAGA
GCAGAGGTCGACGATGGAGTGTAAGGTGTTTTTGTCGAAGCCTGTGGATTGCGACTCCTA
CAAGTGTAGTCCTGTCACTTCTTCGTGTGTTCGTCCAGGTCATCTTTCTCCTCATCCACC
TCAGATATCACCGTTTTCTGCACCATCGGGGCCGTCTCTTCTTCCACCAGCGCCGCAGCC
GTCTCCGAGTGCTTAACAAAGAGGCTCTTTCTCGCAGCCACCGATGAACTGATCGATCTA
TGTTTAGAGAGAAACTAGAAATGGGCACGTGTTGAAACGAGATTGTTTAGAGCCAGAGGG
AATTTATCTGAGACAGCAAGCTGCAAATCTATAGGACAACGTGTAGGACTTGTCGATTTA
ATAGATTTTGCATGTGTGTGTTTATTTACATAAATTTTTTTTATTATATGATTCTTGTTT
GTTAAGCCTTTTTCAGATTCATTAATAAAGAACGAACGGTGACAATCG

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 5

CO CL1755Contig1 767 5 7 U
GGATCGCTTGAGGTTTCATCCGCACTGCCAACCCCTCTCGAGACGAAAATGGTTGCTTTC
AGGTTTCACCAGTACCAGGTTGTCGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTGCAGCCC
AAGATTTACAGGATGAAGCTCTGGGCCACCAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGG
TATTTTTTGAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAAC
GAGATCTTTGAGAAGAACCCAACGACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAG
AGCAGAACTGGATACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCT
GTTGAGCAGATGTACACTGAGATGGCATCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAG
ATCATTAAGACAGCAACTGTTCCGGCCAAACTCTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTT
CACAACAGTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGTAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAG
CTCAAGACCACTTACAAGGCATCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAAGTCTCTTATTGA
CTTTCACATCTTTTTTGGTTGGGGGCTAGTATCGTTATGATGTCTATGTTATCTGCTCTT
TTGGCTTTTGTTTTTTCTTGGATATTTTTGCTTATCAATATTTTAGGTGTTGTGTCCATC
AAACTAAAGTACTCTCTCTTTCTTATGAAAAAACTTTTACCTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G722TF U 1
AF RR2FL68TF U 5
AF RR2G722JQ C 1
AF RR2EU50JQ C 183
AF RR2EU50TF U 183
BS 1 5 RR2G722JQ
BS 6 303 RR2G722TF
BS 304 304 RR2FL68TF
BS 305 675 RR2G722TF
BS 676 676 RR2EU50TF
BS 677 702 RR2G722TF
BS 703 767 RR2EU50TF

RD RR2G722TF 702 0 0
GGATC
GCTTGAGGTTTCATCCGCACTGCCAACCCCTCTCGAGACGAAAATGGTTGCTTTCAGGTT
TCACCAGTACCAGGTTGTCGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTGCAGCCCAAGAT
TTACAGGATGAAGCTCTGGGCCACCAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTATTT
TTTGAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAACGAGAT
CTTTGAGAAGAACCCAACGACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCGG
AACTGGATACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCTGTTGA
GCAGATGTACACTGAGATGGCATCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCAT
TAAGACAGCAACTGTTCCGGCCAAACTCTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTTCACAA
CAGTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGTAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAGCTCAA
GACCACTTACAAGGCATCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAAGTCTCTTATTGACTTTC
ACATCTTTTTTGGTTGGGGGCTAGTATCGTTATGATGTCTATGTTATCTGCTCTTTTGGC
TTTTGTTTTT*CTTGGATATTTTTGCTTATCAATATT

QA 6 702 6 702
DS 

RD RR2FL68TF 693 0 0
G
GCTTGAGGTTTCATCCGCACTGCCAACCCCTCTCGAGACGAAAATGGTTGCTTTCAGGTT
TCACCAGTACCAGGTTGTCGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTGCAGCCCAAGAT
TTACAGGATGAAGCTCTGGGCCACCAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTATTT
TTTGAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAACGAGAT
CTTTGAGAAGAACCCAACGACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAG
AACTGGATACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCTGTTGA
GCAGATGTACACTGAGATGGCATCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGAT*AT
TAAGACAGCAACTGTTCTGGCCAAACTCTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTTCACAA
CAGTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGTAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAGCTCAA
GACCACTTACAAGGCATCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAAGTCTCTTATTGACTTTC
ACATCTTTTTTGGTTGGGGGCTAGTATCGTTATGATGTCTATGTTATCTGTTCTTTTGGC
TTTTGTTTTT*CTTGGATATTTT
GCTTATCAT

QA 2 684 2 684
DS 

RD RR2G722JQ 767 0 0
GGATCGCTTGAGGTTTCATCCGCACTGCCAACCCCTCTCGAGACGAAAATGGTTGCTTTC
AGGTTTCACCAGTACCAGGTTGTCGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTGCAGCCC
AAGATTTACAGGATGAAGCTCTGGGCCACCAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGG
TATTTTTTGAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAAC
GAGATCTTTGAGAAGAACCCAACGACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAG
AGCGGAACTGGATACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCT
GTTGAGCAGATGTACACTGAGATGGCATCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAG
ATCATTAAGACAGCAACTGTTCCGGCCAAACTCTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTT
CACAACAGTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGTAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAG
CTCAAGACCACTTACAAGGCATCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAAGTCTCTTATTGA
CTTTCACATCTTTTTTGGTTGGGGGCTAGTATCGTTATGATGTCTATGTTATCTGCTCTT
TTGGCTTTTGTTTTTTCTTGGATATTTTTGCTTATCAATATTTTAGGTGTTGTGTCCATC
AAACTAAAGTACTCTCTCTTTCTTATGAAAAAACTTTTACCTTGTTT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2EU50JQ 571 0 0
TTTTTTGAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAACGA
GATCTTTGAGAAGAACCCGACGACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAG
CAGAACTGGGTACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCTGT
TGAGCAAATGTACACTGAGATGGCATCTCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGTATCCAGAT
CATTAGGACAGCAACTGTTCCCGCCAAACTCTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTTCA
CAACAGTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGTAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAGCT
CAAGACCACTTACAAGGCATCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAAGTCTCTTATTGACT
TTCACATCTTTTTTGGTTGGGGGCTAGTATCGTTATGATGTCTATGTTATCTGCTCTTTT
GGCTTTTGTTTTTTCTTGGATATTTTTGCTTATCAATATTTTAGGTGTTGTGTCCATCAA
ACTAAAGTACTCTCTCTTTCTTATGAAAAAA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2EU50TF 585 0 0
TTTTTTGAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAACGA
GATCTTTGAGAAGAACCCGACGACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAG
CAGAACTGGGTACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCTGT
TGAGCAAATGTACACTGAGATGGCATCTCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGTATCCAGAT
CATTAGGACAGCAACTGTTCCCGCCAAACTCTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTTCA
CAACAGTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGTAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAGCT
CAAGACCACTTACAAGGCATCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAAGTCTCTTATTGACT
TTCACATCTTTTTTGGTTGGGGGCTAGTATCGTTATGATGTCTATGTTATCTGCTCTTTT
GGCTTTTGTTTTTTCTTGGATATTTTTGCTTATCAATATTTTAGGTGTTGTGTCCATCAA
ACTAAAGTACTCTCTCTTTCTTATGAAAAAACTTTTACCTTGTTT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 4

CO CL1756Contig1 668 4 6 U
TTTTTGACAGGAAAAAACAATGAGATCTTTGAAAAATTATAACTGGACTCCAAGATTCAA
CAACACATCAAAACATGGATCTCAATACATCCGAGTTATTTATGAAATCGAAGTTTCAGA
ATTTTCTAGCCTGAAAGGACACAAGAAGAGGGGACTTAACCCGCCTATTTGATAACCGGA
GATTCTAGGCCGTGACTCTGTGACGCCCTTTAGATATTCTCCGAGCAATGACTCTCCGTC
CACCTTTGGTTGCTTTGCGAGCAAAGAATCCATGGTTACGTTTGCGCCTGATAGTGCTAG
GTTGGAATGTCCTCTTGGGGAATAAAAGCAATGGCTCAGTTGAAGGATCAACTTCTGGCA
AGAAGAACTCGAGGGAAGGAAGACCAGATGGGTGGAGAAACCCACGCTCGGTGAGCTCAC
GAAGCGTAACAGTGTCGTTAGGGGGCGAAGGGAGGGAGGAGCTCTGTAGATTCGAAAACG
AAGGTGGGAAATACGGCGGGAGCTCTGGTCCCTGAGGAGGAGCTATCTGCTGAAACGATC
TGAGGTCGTTCCTCACGAGATTCGCCGTCGGCTTCGAGAGGAACCGATTCATCAGCGAAG
CTCCCGACCTGATTAGGGTTTTGGCCGCCATTTCTTCTACCTTTTTGCCGAGATTGCGAT
TGCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FT82JQ U 22
AF RR2FT82TF C 22
AF RR2DQ80TF C 1
AF RR2DQ80JQ U 5
BS 1 11 RR2DQ80TF
BS 12 417 RR2DQ80JQ
BS 418 418 RR2FT82JQ
BS 419 546 RR2DQ80JQ
BS 547 547 RR2FT82JQ
BS 548 668 RR2DQ80JQ

RD RR2FT82JQ 636 0 0
GAGATCTTTGAAAAATTATAACTGGACTCCAAGATTCAACAACACATCAAAACATGGATC
TCAATACATCCGAGTTATTTATGAAATCGAAGTTTCAGAATTTTCTAGCCTGAAAGGACA
CAAGAAGAGGGGACTTAACCCGCCTATTTGATAACCGGAGATTCTAGGCCGTGACTCTGT
GACGCCCTTTAGCTATTCTCCGAGCAATGACTCTCCGTCCACCTTTGGTTGCTTTGCGAG
CAAAGAATCCATGGTTACGTTTGCGCCTGATAGTGCTAGGTTGGAATGTCCTCTTGGGGA
ATAAAAGCAATGGCTCAGTTGAAGGATCAACTTCTGGCAAGAAGAACTCGAGGGAAGGAA
GACCAGATGGGTGGAGAAACCCACGCTCGGTGAGCTCACGAAGCGTAACAGTGTCGTTAG
GGGGCGAAGGGAGGGAGGAGCTCTGTAGATTCGAAAACGAAGGTGGGAAATACGGCGGGA
GCTCTGGTCCCTGAGGAGGAGCTATCTGCTGAAACGATCTGAGGTCGTTCCTCACGAGAT
TCGCCGTCGGCTTCGAGAGGAACCGATTCATCAGCGAAGCTCCCGACCTGATTAGGGTTT
TGGCCGCCATTTCTTCTACCTTTTTGCCGAGATT
CC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2FT82TF 636 0 0
GAGATCTTTGAAAAATTATAACTGGACTCCAAGATTCAACAACACATCAAAACATGGATC
TCAATACATCCGAGTTATTTATGAAATCGAAGTTTCAGAATTTTCTAGCCTGAAAGGACA
CAAGAAGAGGGGACTTAACCCGCCTATTTGATAACCGGAGATTCTAGGCCGTGACTCTGT
GACGCCCTTTAGCTATTCTCCGAGCAATGACTCTCCGTCCACCTTTGGTTGCTTTGCGAG
CAAAGAATCCATGGTTACGTTTGCGCCTGATAGTGCTAGGTTGGAATGTCCTCTTGGGGA
ATAAAAGCAATGGCTCAGTTGAAGGATCAACTTCTGGCAAGAAGAACTCGAGGGAAGGAA
GACCAGATGGGTGGAGAAACCCACGCTCGGTGAGCTCACGAAGCGTAACAGTGTCGTTAG
GGGGCGAAGGGAGGGAGGAGCTCTGTAGATTCGAAAACGAAGGTGGGAAATACGGCGGGA
GCTCTGGTCCCTGAGGAGGAGCTATCTGCTGAAACGATCTGAGGTCGTTCCTCACGAGAT
TCGCCGTCGGCTTCGAGAGGAACCGATTCATCAGCGAAGCTCCCGACCTGATTAGGGTTT
TGGCCGCCATTTCTTCTACCTTTTTGCCGAGATT
CC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2DQ80TF 668 0 0
TTTTTGACAGGAAAAAACAATGAGATCTTTGAAAAATTATAACTGGACTCCAAGATTCAA
CAACACATCAAAACATGGATCTCAATACATCCGAGTTATTTATGAAATCGAAGTTTCAGA
ATTTTCTAGCGTGAAAGGACACAAGAAGAGGGGACTTAACCCGCCTATTTGATAACCGGA
GATTCTAGGCCGTGACTCTGTGACGCCCTTTAGATATTCTCCGAGCAATGACTCTCCGTC
CACCTTTGGTTGCTTTGCGAGCAAAGAATCCATGGTTACGTTTGCGCCTGATAGTGCTAG
GTTGGAATGTCCTCTTGGGGAATAAAAGCAATGGCTCAGTTGAAGGATCAACTTCTGGCA
AGAAGAACTCGAGGGAAGGAAGACCAGATGGGTGGAGAAACCCACGCTCGGTGAGCT*AC
GAAGCGTAACAGTGTCGTTAGGGGGCGAAGGGAGGGAGGAGCTCTGTAGATTCGAAAACG
AAGGTGGGAAATACGGCGGGAGCTCTGGTCCCTGAGGAGGAGCTATCTGCTGAAACGATC
TGAGGTTGTTCCTCACGAGATTCGCCGTCGGCTTCGAGAGGAACCGATTCATCAGCGAAG
CTCCCGACCTGATTAGGGTTTTGGCCGCCATTTCTTCTACCTTTTTGCCGAGATTGCGAT
TGCTTCCC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2DQ80JQ 664 0 0
GACAGGA
AAAAAACAATGAGATCTTTGAAAAATTATAACTGGACTCCAAGATTCAACAACACATCAA
AACATGGATCTCAATACATCCGAGTTATTTATGAAATCGAAGTTTCAGAATTTTCTAGCC
TGAAAGGACACAAGAAGAGGGGACTTAACCCGCCTATTTGATAACCGGAGATTCTAGGCC
GTGACTCTGTGACGCCCTTTAGATATTCTCCGAGCAATGACTCTCCGTCCACCTTTGGTT
GCTTTGCGAGCAAAGAATCCATGGTTACGTTTGCGCCTGATAGTGCTAGGTTGGAATGTC
CTCTTGGGGAATAAAAGCAATGGCTCAGTTGAAGGATCAACTTCTGGCAAGAAGAACTCG
AGGGAAGGAAGACCAGATGGGTGGAGAAACCCACGCTCGGTGAGCT*ACGAAGCGTAACA
GTGTCGTTAGGGGGCGAAGGGAGGGAGGAGCTCTGTAGATTCGAAAACGAAGGTGGGAAA
TACGGCGGGAGCTCTGGTCCCTGAGGAGGAGCTATCTGCTGAAACGATCTGAGGTTGTTC
CTCACGAGATTCGCCGTCGGCTTCGAGAGGAACCGATTCATCAGCGAAGCTCCCGACCTG
ATTAGGGTTTTGGCCGCCATTTCTTCTACCTTTTTGCCGAGATTGCGATTGCTTCCC

QA 8 664 8 664
DS 



AS 1 5

CO CL1757Contig1 1236 5 8 U
GGAGCACCTGCTCTTTCCCTCCCCTCTTCACCGTCCACCACTCTCACTCGCTTCTCCGCC
GTATCACTCCCTTCTCCGGCGACCTTCTCCTCCCTCCGCCTTCGTGTCTCCTGCCAAGCC
TCCTCCGTCACTTCCCCCACAACTTCCGATGTGAAAGGAAGTTGTGACCTGAAAGACTTT
CTGGCCATAGATGATTTTGACACAGAGACCATCAAAAAGATTCTAGACAAGGCTTCAGAG
GTCAAGGCCCTGTTGAAGTCAGGAGAGAGGAACTATCTGCCTTTCAAAGGCAAATCTATG
TCTATGATCTTCGCAAAGCCCTCCATGAGGACTCGTGTTTCCTTCGAGACTGGCTTCTTC
TTGCTCGGTGGACATGCCTTGTACCTCGGTCCCAATGACATCCAGATGGGCAAGAGGGAG
GAGACTCGCGACGTTGCTCGTGTTCTGTCGAGATATAATGACATCATTATGGCCCGTGTC
TTTGCTCATCAGGACATTCTTGATTTGGCTAACTACTCGAGTGCGCCAATTGTCAATGGT
CTGACAGATCATAACCATCCTTGTCAGATTATGGCTGATGCCCTCACAATCATTGAGCAC
ATTGGTCAAGTCGAAGGGACTAAGGTTGTTTATGTTGGAGATGGGAACAATATGGTTCAC
TCATGGTTAGAATTGGCATCAGTTATTCCATTTCATTTTGTCTGCGCTTGCCCGAAAGGG
TTTGAGCCGGACAAAGAGAGAGTTCTAAAGGCAGAACAAGCTGGATTAAGTAAGATAGAG
ATCGTACATGATGCTAAAGAAGCTGTACTAGGAGCTGATGTTGTGTACTCAGACGTATGG
GCCAGTATGGGCCAAAAAGATGAAGCTGAATACCGCCGAAAAGAATTCCAAGGATTCCAG
GTGGATGAAGCTCTTATGAAGTTGGCTGGACCAAAGGCCTATTTCATGCATTGTTTGCCT
GCAGAAAGAGGAGTTGAGGTGACCAATGGAGTCGTGGAAGCTCCCTATTCCATTGTCTTC
CCACAGGCTGAGAATCGTATGCATGCTCAAAATGCTATAATGCTTCATTTGCTTGGCTTT
TAAACCCCTGTTTGTTATCTTTGCTCTCCTCTCTCTCTCTCACGTGTTTACTGGTATGCC
ATTGACTTTGTGTTGTTGTTAACCTTTGTTTGAGGAACCTTGATGAATAATTATGTGGAT
GGTGTAGCTGGGAATAAGAATGAGCTTCTTTTTATC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB50TF U 36
AF RR2C548TF U 1
AF RR2BQ10TF U 1
AF RR2C548JQ C 520
AF RR2BQ10JQ C 421
BS 1 271 RR2BQ10TF
BS 272 272 RR2C548TF
BS 273 623 RR2BQ10TF
BS 624 624 RR2BQ10JQ
BS 625 692 RR2BQ10TF
BS 693 1135 RR2BQ10JQ
BS 1136 1136 RR2C548JQ
BS 1137 1236 RR2BQ10JQ

RD RR2CB50TF 124 0 0
CACCACTCTCACTCGCTTATCCGCCGTATCACTCCCTTCTCCGGCGACCTTCTCCTCCCT
CCGCCTTCGTGTCTCCTGCCAAGCCTCCTCCGTCACTTCCCCCACAACTTCCGATGTGAA
AGGA

QA 1 124 1 124
DS 

RD RR2C548TF 612 0 0
GGAT
CACCTGCTCTTTCCCTCTCCTCTTCACCGTCCACCACTCTCACTCGCTTCTCCGCCGTAT
CACTCCCTTCTCCGGCGACCTTCTCCTCCCTCCGCCTTCGTGTCTCCTGCCAAGCCTCCT
CCGTCACTTCCCCCACAACTTCCGATGTGAAAGGAAGTTGTGACCTGAAAGACTTTCTGG
CCATAGATGATTTTGACACAGAGACCATCAAAAAGATTCTAGACAAGGCTTCAGAGGTCA
AGGCCCTGTTGAAGTCAGGAGAGAGGAACTATCTGCCTTTCAAAGGCAAATCTATGTCTA
TGATCTTCGCAAAGCCCTCCATGAGGACTCGTGTTTCCTTCGAGACTGGCTTCTTCTTGC
TCGGTGGACATGCCTTGTACCTCGGTCCCAATGACATCCAGATGGGCAAGAGGGAGGAGA
CTCGCGACGTTGCTCGTGTTCTGTCGAGATATAATGACATCATTATGGCCCGTGTCTTTG
CTCATCAGGACATTCTTGATTTGGCTAACTACTCGAGTGCGCCAATTGTCAATGGTCTGA
CAGATCATAACCATCCTTGTCAGATTATGGCTGATGCCCTCACAATCATTGAGCACATTG
GTCAAGTC

QA 5 612 5 612
DS 

RD RR2BQ10TF 692 0 0
GGAGCACCTGCTCTTTCCCTCCCCTCTTCACCGTCCACCACTCTCACTCGCTTCTCCGCC
GTATCACTCCCTTCTCCGGCGACCTTCTCCTCCCTCCGCCTTCGTGTCTCCTGCCAAGCC
TCCTCCGTCACTTCCCCCACAACTTCCGATGTGAAAGGAAGTTGTGACCTGAAAGACTTT
CTGGCCATAGATGATTTTGACACAGAGACCATCAAAAAGATTCTAGACAAGGCTTCAGAG
GTCAAGGCCCTGTTGAAGTCAGGAGAGAGGAGCTATCTGCCTTTCAAAGGCAAATCTATG
TCTATGATCTTCGCAAAGCCCTCCATGAGGACTCGTGTTTCCTTCGAGACTGGCTTCTTC
TTGCTCGGTGGACATGCCTTGTACCTCGGTCCCAATGACATCCAGATGGGCAAGAGGGAG
GAGACTCGCGACGTTGCTCGTGTTCTGTCGAGATATAATGACATCATTATGGCCCGTGTC
TTTGCTCATCAGGACATTCTTGATTTGGCTAACTACTCGAGTGCGCCAATTGTCAATGGT
CTGACAGATCATAACCATCCTTGTCAGATTATGGCTGATGCCCTCACAATCATTGAGCAC
ATTGGTCAAGTCGAAGGGACTAAAGTTGTTTATGTTGGAGATGGGAACAATATGGTTCAC
TCATGGTTAGAATTGGCATCAGTTATTCCATT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2C548JQ 654 0 0
AGTGCGCCAATTGTCAATGGTCTGACAGATCATAACCATCCTTGTCAGATTATGGCTGAT
GCCCTCACAATCATTGAGCACATTGGTCAAGTCGAAGGGACTAAGGTTGTTTATGTTGGA
GATGGGAACAATATGGTTCACTCATGGTTAGAATTGGCATCAGTTATTCCATTTCATTTT
GTCTGCGCTTGCCCGAAAGGGTTTGAGCCGGACAAAGAGAGAGTTCTAAAGGCAGAACAA
GCTGGATTAAGTAAGATAGAGATCGTACATGATGCTAAAGAAGCTGTACTAGGAGCTGAT
GTTGTGTATTCAGACGTATGGGCCAGTATGGGCCAAAAAGATGAAGCTGAATACCGCCGA
AAAGAATTCCAAGGATTCCAGGTGGATGAAGCTCTTATGAAGTTGGCTGGACCAAAGGCC
TATTTCATGCATTGTTTGCCTGCAGAAAGAGGAGTTGAGGTGACCAATGGAGTCGTGGAA
GCTCCCTATTCCATTGTCTTCCCACAGGCTGAGAATCGTATGCATGCTCAAAATGCTATA
ATGCTTCATTTGCTTGGCTTTTAAACCCCTGTTTGTTATCTTTGCTCTCCTCTCTCTCTC
TCACGTGTTTACTGGTATGCCATTGACTTTGTGTTGTTGTTAACCTTTGTTTGA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2BQ10JQ 816 0 0
GAGACTCGCGACGTTGCTCGTGTTCTGTCGAGATATAATGACATCATTATGGCCCGTGTC
TTTGCTCATCAGGACATTCTTGATTTGGCTAACTACTCGAGTGCGCCAATTGTCAATGGT
CTGACAGATCATAACCATCCTTGTCAGATTATGGCTGATGCCCTCACAATCATTGAGCAC
ATTGGTCAAGTCGAAGGGACTAAGGTTGTTTATGTTGGAGATGGGAACAATATGGTTCAC
TCATGGTTAGAATTGGCATCAGTTATTCCATTTCATTTTGTCTGCGCTTGCCCGAAAGGG
TTTGAGCCGGACAAAGAGAGAGTTCTAAAGGCAGAACAAGCTGGATTAAGTAAGATAGAG
ATCGTACATGATGCTAAAGAAGCTGTACTAGGAGCTGATGTTGTGTACTCAGACGTATGG
GCCAGTATGGGCCAAAAAGATGAAGCTGAATACCGCCGAAAAGAATTCCAAGGATTCCAG
GTGGATGAAGCTCTTATGAAGTTGGCTGGACCAAAGGCCTATTTCATGCATTGTTTGCCT
GCAGAAAGAGGAGTTGAGGTGACCAATGGAGTCGTGGAAGCTCCCTATTCCATTGTCTTC
CCACAGGCTGAGAATCGTATGCATGCTCAAAATGCTATAATGCTTCATTTGCTTGGCTTT
TAAACCCCTGTTTGTTATCTTTGCTCTCCTCTCTCTCTCTCACGTGTTTACTGGTGTGCC
ATTGACTTTGTGTTGTTGTTAACCTTTGTTTGAGGAACCTTGATGAATAATTATGTGGAT
GGTGTAGCTGGGAATAAGAATGAGCTTCTTTTTATC

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 5

CO CL1758Contig1 575 5 7 U
GGGGGCGTTCACCCCGAAAGGCCTCT**CAACCTATTAACCCCGGCGAGATCTGCAACTC
TTCCCGGCGATCGAGAAAAAATGGTAGCGGCGAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAGGGAA
TCAACAGCAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTG
TTCTCAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTC
CGTTGAGGAGATCAGAGATAGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATT
ACAATGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCTTGCC
TCAGCATCGTTGATCCTGGTGATTCCGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGAT
TTTTGATTTTTTATCATGTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCAATGTGTTCTTGAGAGA
CATAATGTTTGGTTTCTTCTAGACTCTTTACTTATGTTTAATTACATTTTCGTCTCTATT
GATCAATCCAATTGCATGAAAGAATTATTTATCTG


BQ
10 10 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H694JQB C 1
AF RR2H694TF U 1
AF RR2A308JQ C 3
AF RR2A308TF U 3
AF RR2EL49TF U 3
BS 1 2 RR2H694JQB
BS 3 8 RR2H694TF
BS 9 9 RR2A308TF
BS 10 516 RR2H694TF
BS 517 517 RR2A308TF
BS 518 538 RR2H694TF
BS 539 575 RR2EL49TF

RD RR2H694JQB 506 0 0
GGGGGCGTCCACCCCGAAAGGCCTCT**CAACCTATTAACCCCGGCGAGATCTGCAACTC
TTCCCGGCGATCGAGAAAAAATGGTAGCGGCGAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAGGGAA
TCAACAGCAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTG
TTCTCAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTC
CGTTGAGGAGATCAGAGATAGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATT
ACAATGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCTTGCC
TCAGCATCGTTGATCCTGGTGATTCCGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGAT
TTTTGATTTTTTATCATGTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCAATGTGTTCTTGAGAGA
CATAATGTTTGGTTTCTTCTAGACTC

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2H694TF 540 0 0
GG
GGGCGTCCACCCCGAAAGGCCTCT**CAACCTATTAACCCCGGCGAGATCTGCAACTCTT
CCCGGCGATCGAGAAAAAATGGTAGCGGCGAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAGGGAATC
AACAGCAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTT
CTCAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCG
TTGAGGAGATCAGAGATAGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTAC
AATGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCTTGCCTC
AGCATCGTTGATCCTGGTGATTCCGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTT
TTGATTTTTTATCATGTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCAATGTGTTCTTGAGAGACA
TAATGTTTGGTTTCTTCTAGACTCTTTACTTATGGTTAATTACATTTTCGTCTCTA
TT

QA 3 538 3 538
DS 

RD RR2A308JQ 538 0 0
GGGCGTTCACCCCGAAAGGCCTCTCTCAACCTATTTAACCCGGCGAGATTTGCAGCTCTT
CCCGGCGGTCGAGAAAAA*TGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAGGGAATC
AACAGCAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTT
CTCAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCG
TTGAGGAGATCAGAGATTGAGTACTACGCCATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTAC
AATGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTATTTCCGTGTCTCCTGCCTC
AGCATTGTTGATCCTGGTGATTCCGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTT
TTGATTTTTTAT***GTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCAATGTGTTCTTGAGAGACA
TAATGTTTGGTTTCTTCTAGACTCTTTACTTATGTTTAATTACATTTTCGTCTCTA
GG

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2A308TF 538 0 0
GGGCGTTCACCCCGAAAGGCCTCTCTCAACCTATTTAACCCGGCGAGATCTGCAGCTCTT
CCCGGCGGTCGAGAAAAA*TGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAGGGAATC
AACAGCAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTT
CTCAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCG
TTGAGGAGATCAGAGATTGAGTACTACGCCATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTAC
AATGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTATTTCCGTGTCTCCTGCCTC
AGCATTGTTGATCCTGGTGATTCCGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTT
TTGATTTTTTAT***GTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCAATGTGTTCTTGAGAGACA
TAATGTTTGGTTTCTTCTAGACTCTTTACTTATGTTTAATTACATTTTCGTCTCTA
GG

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2EL49TF 573 0 0
GGGCGTTCACCCCGAAAGGCCTCT**CAACCTATTAACCCCGGCGAGATCTGCAACTCTT
CCCGGCGATCGAGAAAAAATGGTAGCGGCGAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAGGGAATC
AACAGCGGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTT
CTCAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCG
TTGAGGAGATCAGAGATAGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTAC
AATGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCTTGCCTC
AGCATCGTTGATCCTGGTGATTCCGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTT
TTGATTTTTTATCATGTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTATGCAATGTGTTCTTGAGAGACA
TAATGTTTGGTTTCTTCTAGACTCTTTACTTATGGTTAATTACATTTTCGTCTCTATTGA
TCAATCCAATTGCATGAAAGAATTATTTATCTG

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL1759Contig1 914 2 14 U
GATAAGTAACTTTTTGTTCTTTTCTTTTACTTCTAAGCAGAGACTCTCTGAAACCCCAAA
CATACAAATAAAGAAGTACCTCAAAGTTCCAAAAAATCTTTAAAAGAAAACAAAGAGACG
GACATCTGCTTCTCATTCTTGAGCATTGCTGCTTGTTTCCATTGGCTCAGCCTCCGTTGA
GGTCTCCCCTCCTTTCTCTCCAGCCTTCTTGGCTTTCTTCTTCTTTCCACCACCCTTCTT
CTTCTTGATAGCCAAGGCTAACCACCCTTTGATCTCAGGCTGGTCATCAATGGTCTTCGT
AGGTCGAAGCTCCTGAAGTGTATGTGAAGTGATCCTATCCGAACCATTTGGCATCAGCAA
AACTGTGAACTTGATTTGAGCAACAAAATCCCCAGGCTTCTCGTAAAGTACAGGATACGG
TAGCAAATGACCATGGTTCACACACTCCACAAGTCCAAGACGTGCCCTTTTCTCCTCCAG
TGACCTTGCAGTGAATGGCATGTGGGGAAAGTTTTCTTTAATCTCGCTGAATATGAATCT
GGAGGCCTTCATCTTCAACTGATATTTAACATCAGCATCCTTCTTGTAAACAGTTGTTTG
CTTCTCGTCTAAAAGCTTCGGCTTGCCATCACCAGTGCTGGCCACAATATCTACGGAATA
GACTTCATTCTCTTCAAACTCAGCATCATCAACCCTTGTTTCTGGGAGTGGATACACTTA
GGAAACACTTGCTTCCATCTATCACATTCTGTTTCATCTGGTGGGAAATAACCCCTTCCA
CAATTTTGCAGTCATAAGCTTCAGCCACCTTCTGAATAGCTTCAGTGACAGCATGGTTCT
TCTTCCCAGGGCGAACAAGCCTCAAAGCAACTTCAGCAGCAGTATTGGCAGCAGCAATGA
CATCAGCTTTGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG28JQ U 1
AF RR2AL30JQ U 196
BS 1 265 RR2FG28JQ
BS 266 266 RR2AL30JQ
BS 267 477 RR2FG28JQ
BS 478 478 RR2AL30JQ
BS 479 507 RR2FG28JQ
BS 508 508 RR2AL30JQ
BS 509 702 RR2FG28JQ
BS 703 703 RR2AL30JQ
BS 704 721 RR2FG28JQ
BS 722 722 RR2AL30JQ
BS 723 745 RR2FG28JQ
BS 746 746 RR2AL30JQ
BS 747 815 RR2FG28JQ
BS 816 914 RR2AL30JQ

RD RR2FG28JQ 815 0 0
GATAAGTAACTTTTTGTTCTTTTCTTTTACTTCTAAGCAGAGACTCTCTGAAACCCCAAA
CATACAAATAAAGAAGTACCTCAAAGTTCCAAAAAATCTTTAAAAGAAAACAAAGAGACG
GACATCTGCTTCTCATTCTTGAGCATTGCTGCTTGTTTCCATTGGCTCAGCCTCCGTTGA
GGTCTCCCCTCCTTTCTCTCCAGCCTTCTTGGCTTTCTTCTTCTTTCCACCACCCTTCTT
CTTCTTGATAGCCAAGGCTAACCACTCTTTGATCTCAGGCTGGTCATCAATGGTCTTCGT
AGGTCGAAGCTCCTGAAGTGTATGTGAAGTGATCCTATCCGAACCATTTGGCATCAGCAA
AACTGTGAACTTGATTTGAGCAACAAAATCCCCAGGCTTCTCGTAAAGTACAGGATACGG
TAGCAAATGACCATGGTTCACACACTCCACAAGTCCAAGACGTGCCCTTTTCTCCTCTAG
TGACCTTGCAGTGAATGGCATGTGGGGGAAGTTTTCTTTAATCTCGCTGAATATGAATCT
GGAGGCCTTCATCTTCAACTGATATTTAACATCAGCATCCTTCTTGTAAACAGTTGTTTG
CTTCTCGTCTAAAAGCTTCGGCTTGCCATCACCAGTGCTGGCCACAATATCTACGGAATA
GACTTCATTCTCTTCAAACTCAGCATCATCAACCCTTGTTTC*GGGAGTGGATACACTTA
G*AAACACTTGCTTCCATCTATCACGTTCTGTTTCATCTGGTGGGAAATAACCCCTTCCA
CAATTTTGCAGTCATAAGCTTCAGCCACCTTCTGA

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR2AL30JQ 719 0 0
CTCTCCAGCCTTCTTGGCTTTCTTCTTCTTTCCACCACCCTTCTTCTTCTTGGTAGCCAA
GGCTAACCACCCTTTGATCTCAGGGTGGTCATCAATGGTCTTCGTAGGTTGAAGCTCCTG
AAGTGTATGTGAAGTGGTCCTATCCGATCCATTTGGCATCAGCAAAACTGTGAACTTGAT
TTGAGCAACAAAATCCCCAGGCTTCTCGTAAAGTACAGGATACGGTAGCAAATGACCATG
GTTCACACACTCCACAAGTCCAAGACGTGCCCTTTTCTCCTCCAGTGACCTTGCAGTGAA
TGGCATGTGGGGAAAGTTTTCTTTAATCTCGCTGAATATGAATCTGGAGGCCTTCATCTT
CAACTGATATTTAACATCCGCATCCTTCTTGTAAACAGTTGTTTGCTTCTCGTCTAAAAG
CTTCGGCTTGCCATCACCAGTGCTGGCCACAATATCTACGGAATAGACTTCATTCTCTTC
AAACTCAGCATCATCAACCCTTGTTTCTGGGAGTGGATACACTTAGGAAACACTTGCTTC
CATCTATCACATTCTGTTTCATCTGGTGGGAAATAACCCCTTCCACAATTTTGCAGTCAT
AAGCTTCAGCCACCTTCTGAATAGCTTCAGTGACAGCATGGTTCTTCTTCCCAGGGCGAA
CAAGCCTCAAAGCAACTTCAGCAGCAGTATTGGCAGCAGCAATGACATCAGCTTTGCGT

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 5

CO CL1760Contig1 1304 5 8 U
GGATCCACTCACTAGCTATCTTAGCCATGACTTCAACCACTGACGTGAGGGAGTTCGTGG
TGAACAAAAGAAACGGAGTAAAAGGGTTCGTCGACTCTATGAAACCAACCACACTTCCTT
CTCAATACATTCAACCTCCTCAAGAACGCCTCACTTCCGACAAGATCCTCTCATCATCGT
CACAAGTTCCAGTCATCGACGTGTCCAACTGGGATGACCCGCACGTGGCTAGTGAGATAT
GCAATGCAGCGGCTAAGCTCGGGTTCTTTCAGATAGTGAACCACGGGATAGCTCCAGCGG
AGTTGAAGGCTTTGATTGCGGCAGCGCGTGGTTTCTTCGAGTTGCCAGCAGAGGAGAGGA
GTAGGTATTGGAGAGGAAGTTCGGTGTCGGAGACGGCGTGGATGACCACTAGTTTCAATC
CTTACAAAGAGAGTGTGTTGGAGTGGAGAGATTTTATCAAGTTTGAGTTTCTTCCTCAAC
AACATGGCTTCGATGCCACGTGGCCTCCTGTCTGCAAGGAACAAGTGACGGACCATTTCA
AGAGGATGAAACCAATCGCCAATAAGATTTTAAACATACTCATCAACAATCTAAACTCAA
CCATTAACGAGTCTAGTCAACAAACCCTAATGGGGACATTGAGAATGAATTTCAACTACT
ATCCGGAATGTCCTGACCCAAGCCTCACAATAGGAGCTGGTCGCCACTCAGACATCAACA
CCCTCACTCTCCTCCTACAAGAGGACGGTGTCTTGAGCAGCCTCTACGCTCGAGCTACCG
AGGACGGGGAGAAATGGATTTATGTCCCTCCAATTCCTGGAGCAGTTGTGATTAATATTG
GAGATGTGTTACAGATAATGAGCAATGGTAGGTATAGGAGCGTGGAGCATTGTGTGCTGG
TTAATAAATTCTGTAGCCGGGTTTCCATCCCGGTTTACTGCGGACCGCTTCCTGATTCTG
TTGTCGAGCCGTTACAAGAGGTGTTAGAGAACAATGTGATGGCTCAGTACAGAAAGGTTG
TGTACTCGGACTACTTGAAGTTTTTTTTTGAGAAACCCCATGATGGAAAGGCGACCATTG
AGTCGGTTAAATTGTAAGGCTCTGGCTTACAAAAGGGAATATTATCTTTGTCAACATCAA
TTAAGAATAAGCATGGCATATATTAGCCAAGAGAGTCAACATCAACTATATGTAGTACGT
ATGCAATGCAAGATATTATTTGTGTGGTATGTTATGTAAGATATTAAATATCTAAAAAAT
ATTTGTACAATAAATAAGGGAGCTTGAAATATGTTGAGTTAACT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G348TF U 1
AF RR2GW22TF U 2
AF RR2AS06TF U 1
AF RR2G348JQ C 518
AF RR2GW22JQ C 737
BS 1 743 RR2AS06TF
BS 744 744 RR2G348JQ
BS 745 747 RR2AS06TF
BS 748 748 RR2G348JQ
BS 749 757 RR2AS06TF
BS 758 758 RR2G348JQ
BS 759 782 RR2AS06TF
BS 783 1304 RR2G348JQ

RD RR2G348TF 580 0 0
G
GATCCACTCACTAGCTATCTTAGCCATGACTTCAACCACTGACGTGAGGGAGTTCGTGGT
GAACAAAAGGGACGGAGTAAAAGGGTTCGTCGACTCTATGAAACCAACCACACTTCCTTC
TCAATACATTCAACCTCCTCAAGAACGCCTCACTTCCGACAAGATCCTCTCATCATCGTC
ACAAGTTCCAGTCATCGACGTGTCCAACTGGGATGACCCGCACGTGGCTAGTGAGATATG
CAATGCAGCGGCTAAACTCGGGTTCTTTCAGATAGTGAACCACGGGATAGCTCCAGCGGA
GTTGAAGGCTTTGATTGCGGCAGCGCGTGGTTTCTTCGAGTTGCCAGCAGAGGAGAGGAG
TAGGTATTGGAGAGGAAGTTCGGTGTCGGAGACGGCGTGGATGACCACTAGTTTCAATCC
TTACAAAGAGAGTGTGTTGGAGTGGAGAGATTTTATCAAGTTTGAGTTTCTTCCTCAACA
ACATGGCTTCGATGCCACGTGGCCTCCTGTCTGCAAGGAACAAGTGACGGACCATTTCAA
GAGGATGAAACCAATCGCCAATAAGATTTTAAACATACT

QA 2 580 2 580
DS 

RD RR2GW22TF 699 0 0
GATCCACTCACTAGCTATCTTAGCCATGACTTCAACCACTGACGTGAGGGAGTTCGTGGT
GAACAAAAGAAACGGAGTAAAAGGGTTCGTCGACTCTATGAAACCAACCACACTTCCTTC
TCAATACATTCAACCTCCTCAAGAACGCCTCACTTCCGACAAGATCCTCTCATCATCGTC
ACAAGTTCCAGTCATCGACGTGTCCAACTGGGATGACCCGCACGTGGCTAGTGAGATATG
CAATGCAGCGGCTAAGCTCGGGTTCTTTCAGATAGTGAACCACGGGATAGCTCCAGCGGA
GTTGAAGGCTTTGATTGCGGCAGCGCGTGGTTTCTTCGAGTTGCCAGCAGAGGAGAGGAG
TAGGTATTGGAGAGGAAGTTCGGTGTCGGAGACGGCGTGGATGACCACTAGTTTCAATCC
TTACAAAGAGAGTGTGTTGGAGTGGAGAGATTTTATCAAGTTTGAGTTTCTTCCTCAACA
ACATGGCTTCGATGCCACGTGGCCTCCTGTCTGCAAGGAACAAGTGACGGACCATTTCAA
GAGGATGAAACCAATCGCCG*TAAGATTTTAAACATACTCATCAACAATCTAAACTCAAC
CATTAACGAGTCTAGTCAACAAACCCTAATGGGGACATTGAGAATGAATTTCAACTACTA
TCCGGAATGTCCTGACCCAAGCCTCACAATAGGAGCTGG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2AS06TF 782 0 0
GGATCCACTCACTAGCTATCTTAGCCATGACTTCAACCACTGACGTGAGGGAGTTCGTGG
TGAACAAAAGAAACGGAGTAAAAGGGTTCGTCGACTCTATGAAACCAACCACACTTCCTT
CTCAATACATTCAACCTCCTCAAGAACGCCTCACTTCCGACAAGATCCTCTCATCATCGT
CACAAGTTCCAGTCATCGACGTGTCCAACTGGGATGACCCGCACGTGGCTAGTGAGATAT
GCAATGCAGCGGCTAAGCTCGGGTTCTTTCAGATAGTGAACCACGGGATAGCTCCAGCGG
AGTTGAAGGCTTTGATTGCGGCAGCGCGTGGTTTCTTCGAGTTGCCAGCAGAGGAGAGGA
GTAGGTATTGGAGAGGAAGTTCGGTGTCGGAGACGGCGTGGATGACCACTAGTTTCAATC
CTTACAAAGAGAGTGTGTTGGAGTGGAGAGATTTTATCAAGTTTGAGTTTCTTCCTCAAC
AACATGGCTTCGATGCCACGTGGCCTCCTGTCTGCAAGGAACAAGTGACGGACCATTTCA
AGAGGATGAAACCAATCGCCAATAAGATTTTAAACATACTCATCAACAATCTAAACTCAA
CCATTAACGAGTCTAGTCAACAAACCCTAATGGGGACATTGAGAATGAATTTCAACTACT
ATCCGGAATGTCCTGACCCAAGCCTCACAATAGGAGCTGGTCGCCACTCAGACATCAACA
CCCTCACTCTCCTCCTACAAGAG*ACG*TGTCTTGAGTAGCCTCTACGCTCGAGCTACCG
AG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2G348JQ 787 0 0
GGAACAAGTGACGGACCATTTCAAGAGGATGAAACCAATCGCCAATAAGATTTTAAACAT
ACTCATCAACAATCTAAACTCAACCATTAACGAGTCTAGTCAACAAACCCTAATGGGGAC
ATTGAGAATGAATTTCAACTACTATCCGGAATGTCCTGACCCAAGCCTCACAATAGGAGC
TGGTCGCCACTCAGACATCAACACCCTCACTCTCCTCCTACAAGAGGACGGTGTCTTGAG
CAGCCTCTACGCTCGAGCTACCGAGGACGGGGAGAAATGGATTTATGTCCCTCCAATTCC
TGGAGCAGTTGTGATTAATATTGGAGATGTGTTACAGATAATGAGCAATGGTAGGTATAG
GAGCGTGGAGCATTGTGTGCTGGTTAATAAATTCTGTAGCCGGGTTTCCATCCCGGTTTA
CTGCGGACCGCTTCCTGATTCTGTTGTCGAGCCGTTACAAGAGGTGTTAGAGAACAATGT
GATGGCTCAGTACAGAAAGGTTGTGTACTCGGACTACTTGAAGTTTTTTTTTGAGAAACC
CCATGATGGAAAGGCGACCATTGAGTCGGTTAAATTGTAAGGCTCTGGCTTACAAAAGGG
AATATTATCTTTGTCAACATCAATTAAGAATAAGCATGGCATATATTAGCCAAGAGAGTC
AACATCAACTATATGTAGTACGTATGCAATGCAAGATATTATTTGTGTGGTATGTTATGT
AAGATATTAAATATCTAAAAAATATTTGTACAATAAATAAGGGAGCTTGAAATATGTTGA
GTTAACT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2GW22JQ 532 0 0
ACAAGAGGACGGTGTCTTGAGCAGCCTTTACGCTCGAGCTACCGAGGACGGGGAGAAATG
GATTTATGTCCCTCCAATTCCTGGAGCAGTTGTGATTAATATTGGAGATGTGTTACAGAT
AATGAGCAATGGTAGGTATAGGAGCGTGGAGCATTGTGTGCTGGTTAATAAATTCTGTAG
CCGGGTTTCCATCCCGGTTTACTGCGGACCGCTTCCTGATTCTGTTGTCGAGCCGTTACA
AGAGGTGTTAGAGAACAATGTGATGGCTCAGTACAGAAAGGTTGTGTACTCGGACTACTT
GAAGTTTTTTTTTGAGAAACCCCATGATGGAAAGGCGACCATTGAGTCGGTTAAATTGTA
AGGTTCTGGCTTACAAAAGGGAATATTATCTTTGTCAACATCAATTAAGAATAAGCATGG
CATATATTAGCCAAGAGAGTCAACATCAACTATATGTAGTACGTATGCAATGTAAGATAT
TATTTGTGTGGTATGTTATGTAAGATATTAAATATCTAAAAAATATTTGTAC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 5

CO CL1761Contig1 912 5 8 U
GGATAATTTGTCTGGGAAATAAATCTAAGAAAGAGCATAACTCATGAGAGGAATCATTAT
CGTAACCTTCTTGATATTACAGAGTCTTGTCGTGTCTTCGTCTCCATCACCACCGGATTT
TAATTTCTTCTACTGGGTCACCTACTGGCCAGGAGCAATATGCGACAGCCAAAAAGGATG
TTGCCCTCCACCGAACGGCAATACGGCGTCCGATTTTATGATCCATAGACTCTGGCCACA
GTTCAACAATGGCACCTGGCCAGCGTTTTGTGATCAAACCAATCTCTTCGATATCTCCAA
GGTTTCAGATCTAGTAAAGCAAATGGAGAAGAAGTGGACAGAGTGGGGTGTTTGGACATG
TCCAAGCAACGAGACTAATCTATGGGAACACGAGTGGAACAAGCACGGCACGTGTGTGCA
ATCTATCTTCGACCAACACTCTTACTTCCTTGCCAATCTCAGATTCAGACAAAAAGTCAA
ACTCCTCAACATCCTTAAACAAAAAGGAATTAAACCGGATGGTGGATTATACGGTTTAGA
TGAGATCAAGAATGCGATCAAGCGCAAGATCGGATTTGCACCAGGTATTGAATGCAATGA
AGATGTAAAGGGAACAAAGCAGCTTTTCCAGATCTACATATGTCTTGATAACTACGCAAA
AGAGTTTGTGCAGTGCCCGTATGTTCCGGATAAATCATGTGCTTCCAAGATCAAGTTTCC
AAAGTTCCCAAAGAAAGATTCTCCTGGTGAGACTCTAAGTGTGATCTCTTCTGTTTAAAC
TACCTAGTAAACGAAGAGAGAGTGAAGATTGTATTGTGTTTTCAATAAGAGAGTGAATGT
AAGAAGCTCCGCTATAAACTACAATGAATTAAGAGCTAAGAACCCTACTATTATGGTAAG
AATCCGTGTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV11TF U 9
AF RR2AN23TF U 1
AF RR2AN23JQ C 70
AF RR2CV11JQ C 286
AF RR2G002TF U 189
BS 1 347 RR2AN23TF
BS 348 348 RR2CV11TF
BS 349 363 RR2AN23TF
BS 364 364 RR2CV11TF
BS 365 822 RR2AN23TF
BS 823 849 RR2G002TF
BS 850 850 RR2AN23JQ
BS 851 912 RR2G002TF

RD RR2CV11TF 467 0 0
GGGTC
GGGAAATAAATCTAAGAAAGAGCATAACTCATGAGAGGAATCATTATCGTAACCTTCTTG
ATATTACAGAGTCTTGTCGTGTCTTCGTCTCCATCACCACCGGATTTTAATTTCTTCTAC
TGGGTCACCTACTGGCCAGGAGCAATATGCGACAGCCAAAAAGGATGTTGCCCTCCACCG
AACGGCAATACGGCGTCCGATTTTATGATCCATGGACTCTGGCCACAGTTCAACAATGGC
ACCTGGCCAGCGTTTTGTGATCAAACCAATCTCTTCGATATCTCCAAGGTTTCAGATCTA
GTAAAGCAAATGGAGAAGAAGTGGACAGAGTGGGGTGTTTGGACATGTCCAAGCAACGAG
GCTAATCTATGGGAACACGAGTGGAACAAGCACGGCACGTGTGTGCAATCTATCTTCGAC
CAACACTCTTACTTCCTTGCCAATCTCAGATTCAGACAAAAA

QA 6 467 6 467
DS 

RD RR2AN23TF 822 0 0
GGATAATTTGTCTGGGAAATAAATCTAAGAAAGAGCATAACTCATGAGAGGAATCATTAT
CGTAACCTTCTTGATATTACAGAGTCTTGTCGTGTCTTCGTCTCCATCACCACCGGATTT
TAATTTCTTCTACTGGGTCACCTACTGGCCAGGAGCAATATGCGACAGCCAAAAAGGATG
TTGCCCTCCACCGAACGGCAATACGGCGTCCGATTTTATGATCCATAGACTCTGGCCACA
GTTCAACAATGGCACCTGGCCAGCGTTTTGTGATCAAACCAATCTCTTCGATATCTCCAA
GGTTTCAGATCTAGTAAAGCAAATGGAGAAGAAGTGGACAGAGTGGG*TGTTTGGACATG
TCCGAGCAACGAGACTAATCTATGGGAACACGAGTGGAACAAGCACGGCACGTGTGTGCA
ATCTATCTTCGACCAACACTCTTACTTCCTTGCCAATCTCAGATTCAGACAAAAAGTCAA
ACTCCTCAACATCCTTAAACAAAAAGGAATTAAACCGGATGGTGGATTATACGGTTTAGA
TGAGATCAAGAATGCGATCAAGCGCAAGATCGGATTTGCACCAGGTATTGAATGCAATGA
AGATGTAAAGGGAACAAAGCAGCTTTTCCAGATCTACATATGTCTTGATAACTACGCAAA
AGAGTTTGTGCAGTGCCCGTATGTTCCGGATAAATCATGTGCTTCCAAGATCAAGTTTCC
AAAGTTCCCAAAGAAAGATTCTCCTGGTGAGACTCTAAGTGTGATCTCTTCTGTTTAAAC
TACCTAGTAAACGAAGAGAGAGTGAAGATTGTATTGTGTTTT

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR2AN23JQ 828 0 0
CTTGATATTACAGAGTCTTGTCGTGTCTTCGTCTCCATCACCACCGGATTTTAATTTCTT
CTACTGGGTCAC*TACTGGCCAGGAGCAATATGCGACAGCCAAAAAGGATGTTGCCCTCC
ACCGAACGGCAATACGGCGTCCGATTTTATGATCCATAGACTCTGGCCACAGTTCAACAA
TGGCACCTGGCCAGCGTTTTGTGATCAAACCAATCTCTTCGATATCTCCAAGGTTTCAGA
TCTAGTAAAGCAAATGGAGAAGAAGTGGACAGAGTGGG*TGTTTGGACATGTCCGAGCAA
CGAGACTAATCTATGGGAACACGAGTGGAACAAGCACGGCACGTGTGTGCAATCTATTTT
CGACCAACACTCTTACTTCCTTGCCAATCTCAGATTCAGACAAAAAGTCAAACTCCTCAA
CATCCTTAAACAAAAAGGAATTAAACCGGATGGTGGATTATACGGTTTAGATGAGATCAA
GAATGCGATCAAGCGCAAGATCGGATTTGCACCAGGTATTGAATGCAATGAAGATGTAAA
GGGAACAAAGCAGCTTTTCCAGATCTACATATGTCTTGATAACTACGCAAAAGAGTTTGT
GCAGTGCCCGTATGTTCCGGATAAATCATGTGCTTCCAAGATCAAGTTTCCAAAGTTCCC
AAAGAAAGATTCTCCTGGTGAGACTCTAAGTGTGATCTCTTCTGTTTAAACTACCTAGTA
AACGAAGAGAGAGTGAAGATTGTATTGTGTTTTCAATAAGAGAGTGAATGTAAGAAGCTC
CGCTATAAACTACAATGAATTAAGAGCTAAGAACCCTACTATTATG
GT

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2CV11JQ 612 0 0
CTTCGATATCTCCAAGGTTTCAGATCTAGTAAAGCAAATGGAGAAGAAGTGGACAGAGTG
GGGTGTTTGGACATGTCCAAGCAACGAGGCTAATCTATGGGAACACGAGTGGAACAAGCA
CGGCACGTGTGTGCAATCTATCTTCGACCAACACTCTTACTTCCTTGCCAATCTCAGATT
CAGACAAAAAGTCAAACTCCTCAACATCCTTAAACAAAAAGGAATTAAACCGGATGGTGG
ATTATACGGTTTAGATGAGATCAAGAATGCGATCAAGCGCAAGATCGGATTTGCACCAGG
TATTGAATGCAATGAAGATGTAAAGGGAACAAAGTAGCTTTTCCAGATCTACATATGTCT
TGATAACTACGCAAAAGAGTTTGTGCAGTGCCCGTATGTTCCGGATAAATCATGTGCTTC
CAAGATCAAGTTTCCAAAGTTCCCAAAGAAAGATTCTCCTGGTGAGACTCTAAGTGTGAT
CTCTTCTGTTTAAACTACCTAGTAAACGAAGAGAGAGTGAAGATTGTATTGTGTTTTCAA
TAAGAGAGTGAATGTAAGAAGCTCCGCTATAAACTACAATGGATTAAGAGCTAAGAACCC
TACTATTATG
AC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2G002TF 724 0 0
CACCGAACGGCAATACGGCGTCCGATTTTATGATCCATGGACTCTGGCCACAGTTCAACA
ATGGCACCTGGCCAGCGTTTTGTGATCAAACCAATCTCTTCGATATCTCCAAGGTTTCAG
ATCTAGTAAAGCAAATGGAGAAGAAGTGGACAGAGTGGGGTGTTTGGACATGTCCAAGCA
ACGAGACTAATCTATGGGAACACGAGTGGAACAAGCACGGCACGTGTGTGCAATCTATCT
TCGACCAACACTCTTACTTCCTTGCCAATCTCAGATTCAGACAAAAAGTCAAACTCCTCA
ACATCCTTAAACAAAAAGGAATTAAACCGGATGGTGGATTATACGGTTTAGATGAGATCA
AGAATGCGATCAAGCGCAAGATCGGATTTGCACCAGGTATTGAATGCAATGAAGATGTAA
AGGGAACAAAGCAGCTTTTCCAGATCTACATGTGTCTTGATAACTACGCAAAAGAGTTTG
TGCAGTGCCCGTATGTTCCGGATAAATCATGTGCTTCCAAGATCAAGTTTCCAAAGTTCC
CAAAGAAAGATTCTCCTGGTGAGACTCTAAGTGTGATCTCTTCTGTTTAAACTACCTAGT
AAACGAAGAGAGAGTGAAGATTGTATTGTGTTTTCAATAAGAGAGTGAATGTAAGAAGCT
C*GCTATAAACTACAATGAATTAAGAGCTAAGAACCCTACTATTATGGTAAGAATCCGTG
TTGA

QA 1 724 1 724
DS 



AS 2 5

CO CL1762Contig1 762 2 3 U
TCTCTCTCGCTGTTCCTCATACGAGGCAGACGTTGATTCGGACTCCGACATCTCTACCTC
CAGCTCATGCTCCTCGTACAATGGCTGTGGTGGTGAGTTGAGAGTGACGAAGAGACTGGA
GAAGAAGAAGAGCAATGTGTTGCTTGAAGGTTACGTTGTTGATGATGCAGCGGTTAGCGA
TGATTTGAAGAGGACCAAGAGCTTAACAGACGATGATCTCGAGGAGCTTAAAGGCTGTGT
AGATCTAGGTTTTGGGTTCAACTACGAGGAGATTCCTGAGCTTTGTAATACTTTACCAGC
TCTTGAGCTTTGTTACTCTATGAGTCAGAAGTTTATGGATCAAGATCATTCGCCTGAGAA
GAAACAACCAATGATGCTTGAGTCTCAAGTTAGTCCTATGGCTAGCTGGAAGATCTCTAG
TCCTGGGGACAATCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAAGTTCTGGGCACAAGCTGTGGC
ATGTACCGTGAGATTATGCACTTGAGAAAGAACTTTCATCTTGATTTTGAAGCAATCAAA
GCTTTGATGGATCAAAGAAGATGATGAACAAGACACTTTTGCTGCAGGAGTGATATCTCT
TTTATATGCTGTTCTGTTTCCAGCTTTTATGAGACTGACCTGCTTGAAACCCCCCATTTG
TTGTATGAGTTATGTAATGCTCAATGCTTAATGATCAAGGAAAGATTTTGTTAGGAAAAT
TTGTTGTAATGCATTTATTAATAAAACATTGTTCTTTTGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU19TF U 220
AF RR2CU19JQ C 1
BS 1 219 RR2CU19JQ
BS 220 639 RR2CU19TF
BS 640 762 RR2CU19JQ

RD RR2CU19TF 420 0 0
CGAGGAGCTTAAAGGCTGTGTAGATCTAGGTTTTGGGTTCAACTACGAGGAGATTCCTGA
GCTTTGTAATACTTTACCAGCTCTTGAGCTTTGTTACTCTATGAGTCAGAAGTTTATGGA
TCAAGATCATTCGCCTGAGAAGAAACAACCAATGATGCTTGAGTCTCAAGTTAGTCCTAT
GGCTAGCTGGAAGATCTCTAGTCCTGGGGACAATCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAA
GTTCTGGGCACAAGCTGTGGCATGTACCGTGAGATTATGCACTTGAGAAAGAACTTTCAT
CTTGATTTTGAAGCAATCAAAGCTTTGATGGATCAAAGAAGATGATGAACAAGACACTTT
TGCTGCAGGAGTGATATCTCTTTTATATGCTGTTCTGTTTCCAGCTTTTATGAGACTGAC

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR2CU19JQ 762 0 0
TCTCTCTCGCTGTTCCTCATACGAGGCAGACGTTGATTCGGACTCCGACATCTCTACCTC
CAGCTCATGCTCCTCGTACAATGGCTGTGGTGGTGAGTTGAGAGTGACGAAGAGACTGGA
GAAGAAGAAGAGCAATGTGTTGCTTGAAGGTTACGTTGTTGATGATGCAGCGGTTAGCGA
TGATTTGAAGAGGACCAAGAGCTTAACAGACGATGATCTCGAGGAGCTTAAAGGCTGTGT
AGATCTAGGTTTTGGGTTCAACTACGAGGAGATTCCTGAGCTTTGTAATACTTTACCAGC
TCTTGAGCTTTGTTACTCTATGAGTCAGAAGTTTATGGATCAAGATCATTCGCCTGAGAA
GAAACAACCAATGATGCTTGAGTCTCAAGTTAGTCCTATGGCTAGCTGGAAGATCTCTAG
TCCTGGGGACAATCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAAGTTCTGGGCACAAGCTGTGGC
ATGTACCGTGAGATTATGCACTTGAGAAAGAACTTTCATCTTGATTTTGAAGCAATCAAA
GCTTTGATGGATCAAAGAAGATGATGAACAAGACACTTTTGCTGCAGGAGTGATATCTCT
TTTATATGCTGTTCTGTTTCCAGCTTTTATGAGACTGACCTGCTTGAAACCCCCCATTTG
TTGTATGAGTTATGTAATGCTCAATGCTTAATGATCAAGGAAAGATTTTGTTAGGAAAAT
TTGTTGTAATGCATTTATTAATAAAACATTGTTCTTTTGACG

QA 1 762 1 762
DS 



CO CL1762Contig2 846 3 6 U
GGACTTTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCCAGCAAAATAAAAAAACAGGAGTTTCACAAT
GTGTGACTCAAATTATCTCTCTCGCTGTTCCTCATACGAGGCAGACGTTGATTCAGACTC
CAACATCTCTACCTCCAGCTCATGCTCCTCGTACAATGGCTGTGGTGGTGAGTTGAGAGT
GACGAAGAGACTGGAGAAGAAGAAGAGCAATGTGTTGCTTGAAGGTTACGTTGTTGATGA
TGCAGCGGTTAACGATGATTTGAAGAGGACCAAGAGCTTAACAGACGATGATCTCGAGGA
GCTTAAAGGTTGTGTAGATCTAGGTTTTGGGTTCAACTACGAGGAGATTCCTGAGCTTTG
TAATACTTTACCAGCTCTTGAGCTTTGTTACTCTATGAGTCAGAAGTTTATTGATCAAGA
TCATTCGCCTGAGAAGAAACAACCAATGATGCTTGAGTCTCAAGTTAGTCCTATAGCTAG
CTGGAAGATCTCTAGTCCTGGGGACAATCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAAGTTCTG
GGCACAAGCTGTGGCATGTACCGTGAGATTATGCACTTGAGAAAGAACTTTCATCTTGAT
TTTGAAGCAATCAAAGCATTGATGGATCAAAGAAGATGATGAACACAAGCCACTATTGCT
GCAGCCTGCAGGAGTGATATCTCTTTTATATGCTGTTCTGTTTCCAGCTTTTATGAGACT
GACCTGCTTGAAACACCCCATTTGTTGTATGAGTTATGTAATGCTCAATGCTTAATGATC
AAGGAAAGATTTTGTTAGGAAAATTTGTTGTAATGCATTTATTAATAAAACATTGTTCTT
TTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2C174TF U 100
AF RR2ED63TF U 1
AF RR2ED63JQ C 125
BS 1 121 RR2ED63TF
BS 122 122 RR2C174TF
BS 123 671 RR2ED63TF
BS 672 672 RR2ED63JQ
BS 673 767 RR2ED63TF
BS 768 846 RR2ED63JQ

RD RR2C174TF 222 0 0
GGCAGACGTTGATTCAGACTCCAACATCTCTACCTCCAGCTCATGCTCCTCGTACAATGG
CTGTGGTGGTGAGTTGAGAGTGACGAACAGACTGGAGAAGAAGAAGAGCAATGTGTTGCT
TGAAGGTTACATTGTTGATGATGCAGCGGTTAACGATGATTTGAAGAGGACCAAGAGCTT
AACAGACGATGATCTCGAGGAGCTTAAAGGTTGTGTAGATCT

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR2ED63TF 782 0 0
GGACTTTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCCAGCAAAATAAAAAAACAGGAGTTTCACAAT
GTGTGACTCAAATTATCTCTCTCGCTGTTCCTCATACGAGGCAGACGTTGATTCAGACTC
CGACATCTCTACCTCCAGCTCATGCTCCTCGTACAATGGCTGTGGTGGTGAGTTGAGAGT
GACGAAGAGACTGGAGAAGAAGAAGAGCAATGTGTTGCTTGAAGGTTACGTTGTTGATGA
TGCAGCGGTTAACGATGATTTGAAGAGGACCAAGAGCTTAACAGACGATGATCTCGAGGA
GCTTAAAGGTTGTGTAGATCTAGGTTTTGGGTTCAACTACGAGGAGATTCCTGAGCTTTG
TAATACTTTACCAGCTCTTGAGCTTTGTTACTCTATGAGTCAGAAGTTTATTGATCAAGA
TCATTCGCCTGAGAAGAAACAACCAATGATGCTTGAGTCTCAAGTTAGTCCTATAGCTAG
CTGGAAGATCTCTAGTCCTGGGGACAATCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAAGTTCTG
GGCACAAGCTGTGGCATGTACCGTGAGATTATGCACTTGAGAAAGAACTTTCATCTTGAT
TTTGAAGCAATCAAAGCATTGATGGATCAAAGAAGATGATGAACACAAGCCACTATTGCT
GCAGCCTGCAG*AGTGATATCTCTTTTATATGCTGTTCTGTTTCCAGCTTTTATGAGACT
GACCTGCTTGAAACACCCCATTTGTTGTATGAGTTATGTAATGCTCA
TGCTTATGATCAAGA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2ED63JQ 722 0 0
ATCTCTACCTCCAGCTCATGCTCCTCGTACAATGGCTGTGGTGGTGAGTTGAGAGTGACG
AAGAGACTGGAGAAGAAGAAGAGCAATGTGTTGCTTGAAGGTTACGTTGTTGATGATGCA
GCGGTTAACGATGATTTGAAGAGGACCAAGAGCTTAACAGACGATGATCTCGAGGAGCTT
AAAGGTTGTGTAGATCTAGGTTTTGGGTTCAACTACGAGGAGATTCCTGAGCTTTGTAAT
ACTTTACCAGCTCTTGAGCTTTGTTACTCTATGAGTCAGAAGTTTATTGATCAAGATCAT
TCGCCTGAGAAGAAACAACCAATGATGCTTGAGTCTCAAGTTAGTCCTATAGCTAGCTGG
AAGATCTCTAGTCCTGGGGACAATCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAAGTTCTGGGCA
CAAGCTGTGGCATGTACCGTGAGATTATGCACTTGAGAAAGAACTTTCATCTTGATTTTG
AAGCAATCAAAGCATTGATGGATCAAAGAAGATGATGAACACAAGCCACTATTGCTGCAG
CCTGCAGGAGTGATATCTCTTTTATATGCTGTTCTGTTTCCAGCTTTTATGAGACTGACC
TGCTTGAAACACCCCATTTGTTGTATGAGTTATGTAATGCTCAATGCTTAATGATCAAGG
AAAGATTTTGTTAGGAAAATTTGTTGTAATGCATTTATTAATAAAACATTGTTCTTTTGA
TG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL1763Contig1 936 2 2 U
GGAAGGAGAGGGAGGAGCTGAGAGAGAAAGAGATGGCGAGTGAGTACAGATGCGTGGGAT
GTGGGTTTAGGGTCAAGTCATTGTTCATTCAATACTCTCCGGGCAACATTCGCCTGATGA
AATGCGGAAACTGCAAGGAAGTCGCAGACGAATACATCGAGTGTGAACGCATGATTATTT
TCATCGATTTAGTTCTCCACAGACCCAAGGTATATAGGCACGTCCTCTTCAATGAAATCA
ATCAAGAAACCGTTAATATTCAGCATCTGTTGTGGAAGTTGGTCTTCGCTTATCTTCTTC
TAGACTCATATAGAAGCTTGCTACTGGGAAGAACTAATGAGCAAACGAGCTTGGTTCTGA
TAACTGTGAAGGTTCTAATCGACGTCCTGTCTACAAATTTTGCATTTCTCTGCTCTTTTG
CCCTTGCTGCTAAGAGTTTGCTAAATGAAGTTTCCAGAAAAAGGGAGATTCTTTTGGGGA
TATTAATTTCAAGTTACTTCAAGATCTTTCTGCTAGCGATGCTGGTATGGGAGTTCCCAG
TGTCAGTGATCTTTATTATAGATATACTTGTCCTAACATCCAACTCCATGGCTCTTAAAG
TGATGACCGAGTCAACCACGAGCACATGCATAGCTGTATGCTTAATCGCGCACACAGTTA
GATTCTTGGTAGCTCAGGTCTTTGAGCCAACAACATTCTTCACACAGTTTGGGTCTCTTG
TATATCTGTCTTCTTTGTTCAGAATCCTATGATTCCACCAATCATCTTCCACTACTGTAA
TCTTTTTCTTTAGAAGAAAAGAGAACCTTTGCAGTTAGCAATTTTTTTTTTTTCGATCAA
TCTTTGCAGTTAGCAATTTATCACTTCAAATGTATTGGATCACTATGTACTCAGATATTA
CTTAGTCCACTTAAAGAGTTAAATCAGGCCTTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F624TF U 1
AF RR2F624JQ C 187
BS 1 607 RR2F624TF
BS 608 936 RR2F624JQ

RD RR2F624TF 608 0 0
GGAAGGAGAGGGAGGAGCTGAGAGAGAAAGAGATGGCGAGTGAGTACAGATGCGTGGGAT
GTGGGTTTAGGGTCAAGTCATTGTTCATTCAATACTCTCCGGGCAACATTCGCCTGATGA
AATGCGGAAACTGCAAGGAAGTCGCAGACGAATACATCGAGTGTGAACGCATGATTATTT
TCATCGATTTAGTTCTCCACAGACCCAAGGTATATAGGCACGTCCTCTTCAATGAAATCA
ATCAAGAAACCGTTAATATTCAGCATCTGTTGTGGAAGTTGGTCTTCGCTTATCTTCTTC
TAGACTCATATAGAAGCTTGCTACTGGGAAGAACTAATGAGCAAACGAGCTTGGTTCTGA
TAACTGTGAAGGTTCTAATCGACGTCCTGTCTACAAATTTTGCATTTCTCTGCTCTTTTG
CCCTTGCTGCTAAGAGTTTGCTAAATGAAGTTTCCAGAAAAAGGGAGATTCTTTTGGGGA
TATTAATTTCAAGTTACTTCAAGATCTTTCTGCTAGCGATGCTGGTATGGGAGTTCCCAG
TGTCAGTGATCTTTATTATAGATATACTTGTCCTAACATCCAACTCCATGGCTCTTAAAG
TGATGAC
C

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2F624JQ 750 0 0
ATTTAGTTCTCCACAGACCCAAGGTATATAGGCACGTCCTCTTCAATGAAATCAATCAAG
AAACCGTTAATATTCAGCATCTGTTGTGGAAGTTGGTCTTCGCTTATCTTCTTCTAGACT
CATATAGAAGCTTGCTACTGGGAAGAACTAATGAGCAAACGAGCTTGGTTCTGATAACTG
TGAAGGTTCTAATCGACGTCCTGTCTACAAATTTTGCATTTCTTTGCTCTTTTGCCCTTG
CTGCTAAGAGTTTGCTAAATGAAGTTTCCAGAAAAAGGGAGATTCTTTTGGGGATATTAA
TTTCAAGTTACTTCAAGATCTTTCTGCTAGCGATGCTGGTATGGGAGTTCCCAGTGTCAG
TGATCTTTATTATAGATATACTTGTCCTAACATCCAACTCCATGGCTCTTAAAGTGATGA
CCGAGTCAACCACGAGCACATGCATAGCTGTATGCTTAATCGCGCACACAGTTAGATTCT
TGGTAGCTCAGGTCTTTGAGCCAACAACATTCTTCACACAGTTTGGGTCTCTTGTATATC
TGTCTTCTTTGTTCAGAATCCTATGATTCCACCAATCATCTTCCACTACTGTAATCTTTT
TCTTTAGAAGAAAAGAGAACCTTTGCAGTTAGCAATTTTTTTTTTTTCGATCAATCTTTG
CAGTTAGCAATTTATCACTTCAAATGTATTGGATCACTATGTACTCAGATATTACTTAGT
CCACTTAAAGAGTTAAATCAGGCCTTTACG

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 5

CO CL1764Contig1 607 5 13 U
GGAAAACCAAATCCTTTCTCACACCACAAAAACATATAAAAAAAAAGAAATAGTTGACGA
AATGAAGTCAATAGTCTTGCTCCTCCTGCTTCTTGCCGTTTCAACATCAGGGAACCAGAT
GTATAGTTGGCAAAATCTCACCGGCGTTCATGAAGATGAAGGGATTTTGGATTCTCTTGC
GCCGTATAAGGGAAATTACATATTCCCTGTAACCTTTCAACCTCAGAAGACATGTGGTGG
CCCGGCTGGTTCATGTACCGGAAATGTTAATGATGTGAAATATAACGCTTGTCCAATATA
CAGCAGATGCAAACGCATGGTAGCGATGTAACGTAATTCAAGTTTCCTCTATGGCTCCGA
CTCCGAATGGTTACGCTATGCGGGACATAGAAGAGGAAGCATACGCAAAGTCGACTATGC
ATATTTACAACTTTCTTTTGTTCCGTCCCCGTACGCTCTGTGAGATCTATTCGATAAATA
CAGTGCATCTATTAGAAATCCCATGTATCCTCTACGGTGTGGACTTATTGTGTCGCTCAG
ATTTATATTATACTACCTCTGTTTTATTTTATTTGTCGTTTATGCACATGAATTAAGAAA
ACATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI88JQ C 89
AF RR2DQ90JQ C 19
AF RR2DQ90TF U 19
AF RR2EI88TF U 26
AF RR2FA23TF U 1
BS 1 78 RR2FA23TF
BS 79 79 RR2DQ90TF
BS 80 215 RR2FA23TF
BS 216 216 RR2DQ90TF
BS 217 514 RR2FA23TF
BS 515 515 RR2DQ90TF
BS 516 541 RR2FA23TF
BS 542 542 RR2DQ90TF
BS 543 554 RR2FA23TF
BS 555 555 RR2DQ90TF
BS 556 556 RR2FA23TF
BS 557 557 RR2DQ90TF
BS 558 607 RR2FA23TF

RD RR2EI88JQ 377 0 0
TTTT
TTGCCGTTTCAACATCAGGGAACCAGATGTATAGTTGGCAAAATTTCACCGGGGTTCATG
AAGATGAAGGGATTTTGGATTTTCTTGCGCCGTATAAGGGAAATTACATATTCCCTGTAA
CCTTTCAACCTCAGAAGACATGTGGTGGCCCGGCTGGTTCATGTACCGGAAATGTTAATG
ATGTGAAATATAACGCTTGTCCAATATACAGCAGAGGCAAACGCATGGTAGCGATGTAAC
GTAATTCAAGTTTCCTCTATGGCTCCGACTCCGAATGGTTACGCTATGCGGGACATAGAA
GAGGAAGGGTACGCAAAGTCGACTATGCATATTTACAACTTTTTTTTGTTCCGTCCCCGT
ACGCTCTGTGAGA

QA 5 377 5 377
DS 

RD RR2DQ90JQ 552 0 0
GGACACC
ACAAAAACATATAAAAAAAAAGAAATAGTTGACGAAATGAAGTCAATAGTCTTGCTCCTC
CTGCTTCTTGCCGTTTCAACATCAGGGAACCAGATGTATAGTTGGCAAAATCTCACCGGC
GTTCATGAAGATGAAGGGATTTTGGATTCTCTTGCGCCGTATAAGGGAAAGTACATATTC
CCTGTAACCTTTCAACCTCAGAAGACATGTGGTGGCCCGGCTGGTTCATGTACCGGAAAT
GTTAATGGTATGAAATATAACGCTTGTCCAATATATAGCAGATGCAAACGCATGGTAT*G
ATGTAACGTAATTCAAGTTTCCTCTATGGCTCCGACTCCGAATGGTTACGCTATGCGGGG
CATAGAAGAGGGAGCATACGCAAAGTCGACTATGCATATTTACAACTTTCTTTTGTTCCG
TCCCTGTACGCTCTGTGAGATCTATTCGATAAATACAGTGCATCTATTAGAAATCCCATG
TATCCTCTACGGTGTGGACTTATTGTGTCGCTCAGATTTATATTATACTACCTCTGTTTT
GTTTT

QA 8 547 8 547
DS 

RD RR2DQ90TF 552 0 0
GGACACC
ACAAAAACATATAAAAAAAAAGAAATAGTTGACGAAATGAAGTCAATAGTCTTGCTCCTC
CTGCTTCTTGCCGTTTCAACATCAGGGAACCAGATGTATAGTTGGCAAAATCTCACCGGC
GTTCATGAAGATGAAGGGATTTTGGATTCTCTTGCGCCGTATAAGGGAAAGTACATATTC
CCTGTAACCTTTCAACCTCAGAAGACATGTGGTGGCCCGGCTGGTTCATGTACCGGAAAT
GTTAATGGTATGAAATATAACGCTTGTCCAATATATAGCAGATGCAAACGCATGGTAT*G
ATGTAACGTAATTCAAGTTTCCTCTATGGCTCCGACTCCGAATGGTTACGCTATGCGGGG
CATAGAAGAGGGAGCATACGCAAAGTCGACTATGCATATTTACAACTTTCTTTTGTTCCG
TCCCTGTACGCTCTGTGAGATCTATTCGATAAATACAGTGCATCTATTAGAAATCCCATG
TATCCTCTACGGTGTGGACTTATTGTGTCGCTCAGATTTATATTATACTACCTCTGTTTT
GTTTT

QA 8 547 8 547
DS 

RD RR2EI88TF 540 0 0
ACAAAAACATATAAAAAAAA*GAAATAGTTGACGAAATGAAGTCAATAGTCTTACTCCTC
CTGCTTCTTGCCGTTTCAACATCAGGGAACCAGATGTATAGTTGGCAAAATCTCACCGGC
GTTCATGAAGATGAAGGGATTTTGGATTCTCTTGCGCCGTATAAGGGAAATTACATATTC
CCTGTAACCTCTCAACCTCAGAAGACATGTGGTGGCCCGGCTGGTTCATGTACCGGAAAT
GTTAATGATGTGAAATATAACGCTTGTCCAATATACAGCAGATGCAAACGCATGGTAGCG
ATGTAACGTAATTCAAGTTTCCTCTATGGCTCCGACTCCGAATGGTTACGCTATGCGGGA
CATAGAAGAGGAAGCGTACGCAAAGTCGACTATGCATATTTACAACTTTCTTTTGTTCCG
TCCCCGTACGCTCTGTGAGATCTATTCGATAAATACAGTGCATCTATTAGAAATCCCATG
TATCCTCTATGGTGTGGACTTATTGTGTCGCTCAGAGTTATATTATACTCCTTCTGTTTT

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2FA23TF 607 0 0
GGAAAACCAAATCCTTTCTCACACCACAAAAACATATAAAAAAAAAGAAATAGTTGACGA
AATGAAGTCAATAGTCTTACTCCTCCTGCTTCTTGCCGTTTCAACATCAGGGAACCAGAT
GTATAGTTGGCAAAATCTCACCGGCGTTCATGAAGATGAAGGGATTTTGGATTCTCTTGC
GCCGTATAAGGGAAATTACATATTCCCTGTAACCTCTCAACCTCAGAAGACATGTGGTGG
CCCGGCTGGTTCATGTACCGGAAATGTTAATGATGTGAAATATAACGCTTGTCCAATATA
CAGCAGATGCAAACGCATGGTAGCGATGTAACGTAATTCAAGTTTCCTCTATGGCTCCGA
CTCCGAATGGTTACGCTATGCGGGACATAGAAGAGGAAGCATACGCAAAGTCGACTATGC
ATATTTACAACTTTCTTTTGTTCCGTCCCCGTACGCTCTGTGAGATCTATTCGATAAATA
CAGTGCATCTATTAGAAATCCCATGTATCCTCTATGGTGTGGACTTATTGTGTCGCTCAG
AGTTATATTATACTCCTTCTGTTTTATTTTATTTGTCGTTTATGCACATGAATTAAGAAA
ACATATG

QA 1 607 1 607
DS 



AS 2 5

CO CL1765Contig1 1059 2 2 U
GGGAACGAATCGGAGAAGAGAAGAGATGGCTGAGGAACACAAACACGACGAATCTGTGAC
GGCGCCGGAGCCAGCTGTGGAGATCGTGGAGAGGGAATCGTTGATGGATAAGATAACGGA
GAAGATCCACCACGGTGGCGATTTCTCTTCGTCGTCTTCATCGTCTGATGATGAGGACGA
TAAGAAGAAGAAGAAGCCGGAGTCTCCGTCTTCTGTGAAATCGAAAGTCTACCGCTTGTT
CGGAAGGGAGAAGCCCGTTCATAAGGTTCTCGGCGGTGGAAAGCCGGCGGATATATTCAT
GTGGAAGGATAAGAAGATGTCTGGTGGTGTGCTTGGTGGTGCTACAGCGGCGTGGGTTCT
GTTTGAGTTGATGGAGTACCATCTTCTCACTTTGCTTTGCCACGTGATGATTGTTGTGCT
TGCTGTGTTGTTTCTTTGGTCTAATGCCACCGTGTTCATCAACAAGTCGCCACCAAAGAT
TCCTGAAGTTCACATCCCTGAGGAGCCTATCCTTCAGCTTGCATCTGGGCTTAGAATCGA
GATCAACCGTGGACTCTCCTCTCTTCGTGAGATCGCTTCTGGCAGGGATCTCAAGAAATT
CCTCTGTGCTATAGCCGGCTTGTGGGTTCTATCAATCATGGGCGGCTGGTTCAATTTCTT
GACATTGGCATACATAGCTCTTGTGCTACTCTTCACGGTTCCTCTTGTATACGACAAGTA
CGAAGACAAGGTCGACCCGTTAGGTGAGAAAGCAATGATCGAGATCAAGAAGCAGTATGC
AGTGTTGGACGAGAAGGTGTTGAGCAAGATCCCAATGGGCCCGTTGAAGAACAAGAAGAA
AGATTAGGGTTTACAAAATGGTGATCGTGTTCGTCAGATAGCAAGAAAAAAGGGTGTCGT
GAAATGGTGTTTGTTGAAGCTTTATGTTAGATCTTTTAATATGTTATGTGAATGAACGTG
GATTTTCCTCGTTTTGTTTTTTTCGTTTATGCCATTGTTGGTGAACGTGGAAGGGATACG
ATTAGTGTTGGGTTCTTTTTCTCTCTAAACCTACTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C907TF U 1
AF RR2C907JQ C 284
BS 1 687 RR2C907TF
BS 688 1059 RR2C907JQ

RD RR2C907TF 690 0 0
GGGAACGAATCGGAGAAGAGAAGAGATGGCTGAGGAACACAAACACGACGAATCTGTGAC
GGCGCCGGAGCCAGCTGTGGAGATCGTGGAGAGGGAATCGTTGATGGATAAGATAACGGA
GAAGATCCACCACGGTGGCGATTTCTCTTCGTCGTCTTCATCGTCTGATGATGAGGACGA
TAAGAAGAAGAAGAAGCCGGAGTCTCCGTCTTCTGTGAAATCGAAAGTCTACCGCTTGTT
CGGAAGGGAGAAGCCCGTTCATAAGGTTCTCGGCGGTGGAAAGCCGGCGGATATATTCAT
GTGGAAGGATAAGAAGATGTCTGGTGGTGTGCTTGGTGGTGCTACAGCGGCGTGGGTTCT
GTTTGAGTTGATGGAGTACCATCTTCTCACTTTGCTTTGCCACGTGATGATTGTTGTGCT
TGCTGTGTTGTTTCTTTGGTCTAATGCCACCGTGTTCATCAACAAGTCGCCACCAAAGAT
TCCTGAAGTTCACATCCCTGAGGAGCCTATCCTTCAGCTTGCATCTGGGCTTAGAATCGA
GATCAACCGTGGACTCTCCTCTCTTCGTGAGATCGCTTCTGGCAGGGATCTCAAGAAATT
CCTCTGTGCTATAGCCGGCTTGTGGGTTCTATCAATCATGGGCGGCTGGTTCAATTTCTT
GACATTGGCATACATAGCTCTTGTGCT
ACT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2C907JQ 776 0 0
CCGGCGGATATATTCATGTGGAAGGATAAGAAGATGTCTGGTGGTGTGCTTGGTGGTGCT
ACAGCGGCGTGGGTTCTGTTTGAGTTGATGGAGTACCATCTTCTCACTTTGCTTTGCCAC
GTGATGATTGTTGTGCTTGCTGTGTTGTTTCTTTGGTCTAATGCCACCGTGTTCATCAAC
AAGTCGCCACCAAAGATTCCTGAAGTTCACATCCCTGAGGAGCCTATCCTTCAGCTTGCA
TCTGGGCTTAGAATCGAGATCAACCGTGGACTCTCCTCTCTTCGTGAGATCGCTTCTGGC
AGGGATCTCAAGAAATTCCTCTGTGCTATAGCCGGCTTGTGGGTTCTATCAATCATGGGC
GGCTGGTTCAATTTCTTGACATTGGCATACATAGCTCTTGTGCTACTCTTCACGGTTCCT
CTTGTATACGACAAGTACGAAGACAAGGTCGACCCGTTAGGTGAGAAAGCAATGATCGAG
ATCAAGAAGCAGTATGCAGTGTTGGACGAGAAGGTGTTGAGCAAGATCCCAATGGGCCCG
TTGAAGAACAAGAAGAAAGATTAGGGTTTACAAAATGGTGATCGTGTTCGTCAGATAGCA
AGAAAAAAGGGTGTCGTGAAATGGTGTTTGTTGAAGCTTTATGTTAGATCTTTTAATATG
TTATGTGAATGAACGTGGATTTTCCTCGTTTTGTTTTTTTCGTTTATGCCATTGTTGGTG
AACGTGGAAGGGATACGATTAGTGTTGGGTTCTTTTTCTCTCTAAACCTACTATAT

QA 1 776 1 776
DS 



CO CL1765Contig2 1080 3 8 U
GGAAGATTCAAATGGTTATATAGTAGGTTTAGAGAGAAAAAGAACCAACACTAATTGTAT
CCCTTCCACGTTCACCAACAATGGCATAAACAAACAAAAAAACAAAACGAGGAAAATCCA
CGTTCATTCACATAACATATTAAAAGATCTAACATAAAGCTTCAACAAACACCATTTCAC
AACACCCTTTTTCTTACTATCTGACGAACTCCATCACCACCATTTTGTAAACCCTAATCT
TTCTTCTTGTTCTTCAACGGGCCCATTGGGATCTTGCTCAACACCTTCTCGTCCAACACT
GCATACTGCTTCTTGATCTCGATCATTGCCTTCTCACCTAACGGGTCGACCTTGTCTTCG
TACTTGTCGTATACAAGAGGAACCGTGAAAAGCAGCACAAGAGCTATGTATGCCAATGTC
AAGAAATTGAACCAGCCGCCCATGATGGATAGAACCCACAAGCCGGCTATAGCACAGAGG
AATTTCTTGAGATCCCTGCCAGAAGCAATCTCACGAAGAGAGGAGAGTCCACGGTTGATC
TCGATTCTGAGCCCAGATGCGAGCTGAAGGATAGGCTCCTCAGGGATGTGAACTTCAGGA
ATCTTTGGTGGCGACTTGTTGATGAACACGGTGGCATTAGACCAAAGAAACAACACAGCA
AGCACAACAATCATCACGTGGCAAAGCAAAGTGAGAAGATGGTACTCCATCAACTCAAAC
AGAACCCACGCGGCTGTAGCACCACCAAGCACACCACCAGACATCTTCTTATCCTTCCAC
ATGAATATATCCGCCGGCTTTCCACCGCCGAGAACCTTATGAACGGGCTTCTCCCTTCCG
AACAAGCGGTAGACTTTCGATTTCATAGAAGTCGGAGACTCCGGATTCTTCTCCTTCTTC
TTCTTCTTATCGTCCTCGTCGTCGGAGGATGAAGACGACGAAGAGGAATCGCCACCGTGG
TGGATCTTCTCCGTTATCTTATCCATCAACGATTCCCTCTCCACGATCTCCACAGCTGGC
TCCGGAGCCGTCACAGATTCATCGTGTTTGTGTTCCTCAGCCATCTCTTCTTCGATTCCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH82JQ U 2
AF RR2FF60JQ U 1
AF RR2CH82TF C 391
BS 1 73 RR2FF60JQ
BS 74 74 RR2CH82JQ
BS 75 389 RR2FF60JQ
BS 390 390 RR2CH82JQ
BS 391 443 RR2FF60JQ
BS 444 444 RR2CH82JQ
BS 445 638 RR2FF60JQ
BS 639 1080 RR2CH82TF

RD RR2CH82JQ 475 0 0
GAAA
ATTCAAATGGTTATATAGTAGGTTTAGAGAGAAAAAGAACCAACACTAATTGTATCCCTT
CCACGTTCACCAACAATGGCATAAACAAACAAAAAA*CAAAACGAGGAAAATCCACGTTC
ATTCACATAACATATTAAAAGATCTAACATAAAGCTTCAACAAACACCATTTCACAACAC
CCTTTTTCTTGCTATCTGACGAACTCCATCACCACCATTTTGTAAACCCTAATCTTTCTT
CTTGTTCTTCAACGGGCCCATTGGGATCTTGCTCAACACCTTCTCGTCCAACACTGCATA
CTGCTTCTTGATCTCGATCATTGCCTTCTCACCTAACGGGTCGACCTTGTCTTCGTACTT
GTCGTATACAAGAGGAACCGTGAAAAGCAGCACAAGAGCTATGTATGCCAATGTCAAGAA
ATTGAACCAGCCGCCCATGATGGATAGAACCCACAAGCCGGCTATAGCACA

QA 5 475 5 475
DS 

RD RR2FF60JQ 638 0 0
GGAAGATTCAAATGGTTATATAGTAGGTTTAGAGAGAAAAAGAACCAACACTAATTGTAT
CCCTTCCACGTTCGCCAACAATGGCATAAACAAACAAAAAAACAAAACGAGGAAAATCCA
CGTTCATTCACATAACATATTAAAAGATCTAACATAAAGCTTCAACAAACACCATTTCAC
AACACCCTTTTTCTTACTATCTGACGAACTCCATCACCACCATTTTGTAAACCCTAATCT
TTCTTCTTGTTCTTCAACGGGCCCATTGGGATCTTGCTCAACACCTTCTCGTCCAACACT
GCATACTGCTTCTTGATCTCGATCATTGCCTTCTCACCTAACGGGTCGACCTTGTCTTCG
TACTTGTCGTATACAAGAGGAACCGTGAAGAGCAGCACAAGAGCTATGTATGCCAATGTC
AAGAAATTGAACCAGCCGCCCATAATGGATAGAACCCACAAGCCGGCTATAGCACAGAGG
AATTTCTTGAGATCCCTGCCAGAAGCAATCTCACGAAGAGAGGAGAGTCCACGGTTGATC
TCGATTCTGAGCCCAGATGCGAGCTGAAGGATAGGCTCCTCAGGGATGTGAACTTCAGGA
ATCTTTGGTGGCGACTTGTTGATGAACACGGTGGCATT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2CH82TF 690 0 0
AGC
AGCACAAGAGCTATGTATGCCAATGTCAAGAAATTGAACCAGCCGCCCATGATGGATAGA
ACCCACAAGCCGGCTATAGCACAGAGGAATTTCTTGAGATCCCTGCCAGAAGCAATCTCA
CGAAGAGAGGAGAGTCCACGGTTGATCTCGATTCTGAGCCCAGATGCGAGCTGAAGGATA
GGCTCCTCAGGGATGTGAACTTCAGGAATCTTTGGTGGCGACTTGTTGATGAACACGGTG
GCATTAGACCAAAGAAACAACACAGCAAGCACAACAATCATCACGTGGCAAAGCAAAGTG
AGAAGATGGTACTCCATCAACTCAAACAGAACCCACGCGGCTGTAGCACCACCAAGCACA
CCACCAGACATCTTCTTATCCTTCCACATGAATATATCCGCCGGCTTTCCACCGCCGAGA
ACCTTATGAACGGGCTTCTCCCTTCCGAACAAGCGGTAGACTTTCGATTTCATAGAAGTC
GGAGACTCCGGATTCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTTATCGTCCTCGTCGTCGGAGGATGAA
GACGACGAAGAGGAATCGCCACCGTGGTGGATCTTCTCCGTTATCTTATCCATCAACGAT
TCCCTCTCCACGATCTCCACAGCTGGCTCCGGAGCCGTCACAGATTCATCGTGTTTGTGT
TCCTCAGCCATCTCTTCTTCGATTCCC

QA 4 690 4 690
DS 



AS 1 5

CO CL1766Contig1 1385 5 15 U
TTTTTTATTACACTCTGTTTCCATCTCTTCTACTTAGGCTGTTAGCAATGAAAGGAGGCA
CCGGCTCGTTTCTCTGCGTTCTTCTCATCTCCACCGTCACCTCCGTCGTCTGCTTCCGTG
ACGGGATGTTACCAAACGGTGATTTTGAGCTAGGACCAAAACCATCGGACATGAAAGGAA
CACAAGTGCTAAACAAGAACGCTATTCCAAGCTGGGAGCTTACAGGCTTCGTCGAATACA
TAAAATCCGGTCAGAAACAAGGAGACATGCTCCTAGTAGTCCCCGCCGGAAAATTCGCCA
TCCGGCTAGGAAACGAAGCAGCGATCAAACAGAGACTTAACGTGACAAAAGGAATATATT
ACTCGCTCACGTTCAGTGCCGCAAGGACTTGTGCTCAAGACGAACGGCTCAACATATCGG
TGGCACCTGACTCGGGCGTCATTCCTATACAGACGGTGTACAGTAGCAGTGGATGGGACC
TATATGCTTGGGCGTTTCAAGCTGAGAGTAATGTGGCAGAGATCGTGATTCATAATCCTG
GCGAGGAAGAAGATCCTGCTTGTGGACCACTTATTTGATGGTGTTGCAATCAAGGCCCTG
TACCCTCCAAGACCTACCAATAAGAACATATTGAAAAACGGAGGATTCGAAGAAGGTCCC
TATCTACTCCCAAACTCCACAACCGGCGTTTTGATTCCTCCCTTCATAGAAGATGATCAC
TCTCCTTTACCCGCTTGGATGGTCGAATCCCTCAAAGCCGTCAAATACGTTGACGTCGAA
CACTTCTCAGTCCCACAAGGCCGTCGTGCCGTCGAGCTAGTTGCGGGGAAAGAAAGCGCT
ATCGCTCAGGTGGCTAGGACCATCATAGGGAAGACTTACGTGCTTTCTTTTGCGGTTGGA
GATGCTAACAACGCGTGCGAAGGCTCGATGATAGTCGAGGCGTTTGCGGGAAGGGACACG
TTAAAGGTTCCTTACGAGTCGAAAGGAAAGGGAGGCTTCAAACGCGCTTCTTTGCGGTTT
GTGGCGGTCTCTACCCGCACGAGGGTTATGTTTTACAGCACGTTTTACGCGATGAGAAGC
GATGATTTCTCGTCTCTGTGTGGCCCCGTGATCGACGATGTTAAGCTCCTCAGCGTTCGC
AAGGCTTAAAATGGTCCTTGTTTTATTTTAAAGGTTTTTTCGTATAAGGAGTGTGGGCTT
TTTCTAAAAAGTAATTTTTATCTCTGGTGCTTTTTAAATGAGATGATTTATATACCGAGT
GAGTTGTTATGGCATAGAGTTATATATAAAACAGAAATGTCTTGCTTACATCTATTTTCT
TGTATGGGAAGGCTGAAGAAATGTTGTCGTTTAAAAAAATAAAATAATGAGAATAGTTAT
TTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2D078TF U 1
AF RR2C168TF U 8
AF RR2B126TF U 246
AF RR2C168JQ C 611
AF RR2D078JQ C 642
BS 1 274 RR2D078TF
BS 275 320 RR2C168TF
BS 321 321 RR2B126TF
BS 322 355 RR2C168TF
BS 356 356 RR2B126TF
BS 357 637 RR2C168TF
BS 638 638 RR2B126TF
BS 639 650 RR2C168TF
BS 651 1012 RR2B126TF
BS 1013 1028 RR2C168JQ
BS 1029 1029 RR2D078JQ
BS 1030 1203 RR2C168JQ
BS 1204 1204 RR2D078JQ
BS 1205 1210 RR2C168JQ
BS 1211 1385 RR2D078JQ

RD RR2D078TF 274 0 0
TTTTTTATTACACTCTGTTTCCATCTCTTCTACTTAGGCTGTTAGCAATGAAAGGAGGCA
CCGGCTCGTTTCTCTGCGTTCTTCTCATCTCCACCGTCACCTCCGTCGTCTGCTTCCGTG
ACGGGATGTTACCAAACGGTGATTTTGAGCTAGGACCAAAACCATCGGACATGAAAGGAA
CACAAGTGCTAAACAAGAACGCTATTCCAAGCTGGGAGCTTACAGGCTTCGTCGAATACA
TAAAATCCGGTCAGAAACAAGGAGACATGCTCCT

QA 1 274 1 274
DS 

RD RR2C168TF 643 0 0
TTAA
ACTCTGTTTCCATCTCTTCTACTTAGGCTGTTAGCAATGAAAGGAGGCACCGGCTCGTTT
CTCTGCGTTCTTCTCATCTCCACCGTCACCTCCGTCGTCTGCTTCCGTGACGGGATGTTA
CCAAACGGTGATTTTGAGCTAGGACCAAAACCATCGGACATGAAAGGAACACAAGTGCTA
AACAAGAACGCTATTCCAAGCTGGGAGCTTACAGGCTTCGTCGAATACATAAAATCCGGT
CAGAAACAAGGAGACATGCTCCTAGTAGTCCCCGCCGGAAAATTCGCCATCCGGCTAGGA
AACGAAGCATCGATCAAACAGAGACTTAACGTGACAAAAGGAATGTATTACTCGCTCACG
TTCAGTGCCGCAAGGACTTGTGCTCAAGACGAACGGCTCAACATATCGGTGGCACCTGAC
TCGGGCGTCATTCCTATACAGACGGTGTACAGTAGCAGTGGATGGGACCTATATGCTTGG
GCGTTTCAAGCTGAGAGTAATGTGGCAGAGATCGTGATTCATAATCCTGGCGAGGAAGAA
GATCCTGCTTGTGGACCACTTATTTGATGGTGTTGCAATCAAGGCCCTGTACCCTCCAAG
ACCTACCAATAAGAACATATTGAAAA*CGGAGGATTCGA

QA 5 643 5 643
DS 

RD RR2B126TF 767 0 0
GG
CGGTCAGAAACAAGGAGACATGCTCCTAGTAGTCCCCGCCGGAAAATTCGCCATCCGGCT
AGGAAACGAAGCAGCGATCAAACAGAGACTTAACGTGACAAAAGGAATATATTACTCGCT
CACGTTCAGTGCCGCAAGGACTTGTGCTCAAGACGAACGGCTCAACATATCGGTGGCACC
TGACTCGGGCGTCATTCCTATACAGACGGTGTACAGTAGCAGTGGATGGGACCTATATGC
TTGGGCGTTTCAAGCTGAGAGTAATGTGGCAGAGATCGTGATTCATAATCCTGGCGAGGA
AGAAGATCCTGCTTGTGGACCACTTATT*GATGGTGTTGCAATCAAGGCCCTGTACCCTC
CAAGACCTACCAATAAGAACATATTGAAAAACGGAGGATTCGAAGAAGGTCCCTATCTAC
TCCCAAACTCCACAACCGGCGTTTTGATTCCTCCCTTCATAGAAGATGATCACTCTCCTT
TACCCGCTTGGATGGTCGAATCCCTCAAAGCCGTCAAATACGTTGACGTCGAACACTTCT
CAGTCCCACAAGGCCGTCGTGCCGTCGAGCTAGTTGCGGGGAAAGAAAGCGCTATCGCTC
AGGTGGCTAGGACCATCATAGGGAAGACTTACGTGCTTTCTTTTGCGGTTGGAGATGCTA
ACAACGCGTGCGAAGGCTCGATGATAGTCGAGGCGTTTGCGGGAAGGGACACGTTAAAGG
TTCCTTACGAGTCGAAAGGAAAGGGAGGCTTCAAACGCGCTTCTT

QA 3 767 3 767
DS 

RD RR2C168JQ 600 0 0
GACCTACCAATAAGAACATATTGAAAAACGGAGGATTCGAAGAAGGTCCCTATCTACTCC
CAAACTCCACAACCGGCGTTTTGATTCCTCCCTTCATAGAAGATGATCACTCTCCTTTAC
CCGCTTGGATGGTCGAATCCCTCAAAGCCGTCAAATACGTTGACGTCGAACACTTTTCAG
TCCCACAAGGCCGTAGTGCCGTCGAGCTAGTTGCGGGGAAAGAAAGCGCTATCGCTCAGG
TGGCTAGGACCATCATAGGGAAGACTTACGTGCTTTCTTTTGCGGTTGGAGATGCTAACA
ACGCGTGCGAAGGCTCGATGATAGTTGAGGCGTTTGCGGGAAGGGACACGCTGAAGGTTC
CTTACGAGTCGAAAGGAAAAGGAGGCTTCAAACGCGCTTCTTTGCGGTTTGTGGCGGTTT
CTACCCGCACGAGGGTTATGTTTTACAGCACGTTTTACGCGATGAGAAGCGATGATTTCT
CGTCTCTGTGTGGCCCCGTGATCGACGATGTTAAGCTCCTCAGCGTTCGCAAGGCTTAAA
ATGGTCCTTGTTTTATTTTAAAGGTTTTTTCGTATAAGGAGTGTGGGCTTTTTTTAAAAA

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2D078JQ 744 0 0
AGGATTCGAAGAAGGTCCCTATCTACTCCCAAACTCCACAACCGGCGTTTTGATTCCTCC
CTTCATAGAAGATGATCACTCTCCTTTACCCGCTTGGATGGTCGAATCTCTCAAAGCCGT
CAAATACGTTGACGTCGAACACTTCTCAGTCCCACAAGGCCGTCGTGCCGTCGAGCTAGT
TGCGGGGAAAGAAAGCGCTATCGCTCAGGTGGCTAGGACCATCATAGGGAAGACTTACGT
GCTTTCTTTTGCGGTTGGAGATGCTAACAACGCGTGCGAAGGCTCGATGATAGTCGAGGC
GTTTGCGGGAAGGGACACGTTAAAGGTTCCTTACGAGTCGAAAGGAAAGGGAGGCTTCAA
ACGCGCTTCTTTGCGGTTTGTGGCGGTCTCTACCCGCACGAGGGTTATGTTTTACAGCAC
GTTTTACGCGATGAGAAGCGATGATTTCTCGTCTCTGTGTGGCCCCGTGATCGACGATGT
TAAGCTCCTCAGCGTTCGCAAGGCTTAAGATGGTCCTTGTTTTATTTTAAAGGTTTTTTC
GTATAAGGAGTGTGGGCTTTTTCTAAAAAGTAATTTTTATCTCTGGTGCTTTTTAAATGA
GATGATTTATATACCGAGTGAGTTGTTATGGCATAGAGTTATATATAAAACAGAAATGTC
TTGCTTACATCTATTTTCTTGTATGGGAAGGCTGAAGAAATGTTGTCGTTTAAAAAAATA
AAATAATGAGAATAGTTATTTGGG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 5

CO CL1767Contig1 559 5 5 U
GGATCATTTCTATTAATTCTCTTACACATATATCAAACCCTGTAAAAGAAAAAAAATTGT
TTCGTTTTTATTCGATATCGTGAAGATGGGATCAAGTCAAAGCATGGGAGGTTCAAAGAG
AAGGGCGTCGAGTAGGGGACTTGGAGCTGTTCTTAAAGAACAAAGAGCTAAGCTTTACAT
CATTCGAAGATGTGTCGTCATGCTTCTTTGTTGGAACGATTGATTTCTCTGCAGATATAC
TCTCGTATCATTTTGATGAAGATCGTTCTGTATAAAAGGGATTTGTTGGCTGGATATAGG
ACTCACCATGATGTTTGGAGCTTAAGCGGGTCGGTTCGGATCCTAGTCTGGTGCCAGATT
GTGGAGTAGTTAAATGATTTAAGGTTAGGTGTCTCTACTGGTTAGCAGAGTCGTGTTCTT
TTGGAGCAATATTGTAAATATTGACGGCATAATACAGAGAGTTGATAAAATTTTGTAATA
GCTTTTGGCTCTGTTCAATGACACTCGAAATATATAAAAATATACGGTTAATGTAAAAAT
GGTCGTTCCCATGTAAAGG


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL19TF U 1
AF RR2EH13TF U 4
AF RR2EM37JQ C 4
AF RR2EM37TF U 4
AF RR2EH13JQ C 416
BS 1 308 RR2AL19TF
BS 309 309 RR2EH13TF
BS 310 482 RR2AL19TF
BS 483 534 RR2EH13TF
BS 535 559 RR2EH13JQ

RD RR2AL19TF 482 0 0
GGATCATTTCTATTAATTCTCTTACACATATATCAAACCCTGTAAAAGAAAAAAAATTGT
TTCGTTTTTATTCGATATCGTGAAGATGGGATCAAGTCAAAGCATGGGAGGTTCAAAGAG
AAGGGCGTCGAGTAGGGGACTTGGAGCTGTTCTTAAAGAACAAAGAGCTAAGCTTTACAT
CATTCGAAGATGTGTCGTCATGCTTCTTTGTTGGAACGATTGATTTCTCTGCAGATATAC
TCTCGTATCATTTTGATGAAGATCGTTCTGTATAAAAGGGATTTGTTGGCTGGATATAGG
ACTCACCACGATGTTTGGAGCTTAAGCGGGTCGGTTCGGATCCTAGTCTGGTGCCAGATT
GTGGAGTAGTTAAATGATTTAAGGTTAGGTGTCTCTACTGGTTAGCAGAGTCGTGTTCTT
TTGGAGCAATATTGTAAATATTGACGGCATAATACAGAGAGTTGATAAAATTTTGTAATA
GC

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR2EH13TF 536 0 0
GG
ATTTCTATTAATTCTCTTACACATATATCAAACCCTGTAAAAGAAAAAAAATTGTTTCGT
TTTTATTCGATATCGTGAAGATGGGATCAAGTCAAAGCATGGGAGGTTCAAAGAGAAGGG
CGTCGAGTAGGGGACTTGGAGCTGTTCTTAAAGAACAAAGAGCTAAGCTTTACATCATTC
GAAGATGTGTCGTCATGCTTCTTTGTTGGAACGATTGATTTCTCTGCAGATATACTCTCG
TATCATTTTGATGAAGGTCGTTCTGTATAAAAGGGATTTGTTGGCTGGATATAGGACTCA
CCATGATGTTTGGAGCTTAAGCGGGTCGGTTCGGATCCTAGTCTGGTGCCAGATTGTGGA
GTAGTTAAATGATTTAAGGTTAGGTGTCTCTACTGGTTAGTAGAGTCGTGTTCTTTTGGA
GCAATATTGTAAATATTGACGGCATAATACAGAGAGTTGATAAAATTTTGTAATAGCTTT
TGGCTCTGTTCAATGACACTCGAAATATATAAAAATATACGGTTAATGT
AAAAA

QA 3 531 3 531
DS 

RD RR2EM37JQ 531 0 0
GG
ATTTCTATTAATTCTCTTACACATATATCAAACCCTGTAAAAGAAAAAAAATTGTTTCGT
TTTTATTCGATATCGTGAAGATGGGATCAAGTCAAAGCATGGGAGGTTCAAAGAGAAGGG
CGTCGAGTAGGGGACTTGGAGCTGTTCTTAAAGAACAAAGAGCTAAGCTTTACATCATTC
GAAGATGTGTCGTCATGCTTCTTTGTTGGAACGATTGATTTCTCTGCAGATATACTCTCG
TATCATTTTGATGAAGATCGTTCTGTATAAAAGGGATTTGTTGGCTGGATATAGGACTCA
CCATGATGTTTGGAGCTTAAGCGGGTCGGTTCGGATCCTAGTCTGGTGCCAGATTGTGGA
GTAGTTAAATGATTTAAGGTTAGGTGTCTCTACTGGTTAGCAGAGTCGTGTTCTTTTGGA
GCAATATTGTAAATATTGACGGCATAATACAGAGAGTTGATAAAATTTTGTAATAGCTTT
TGGCTCTGTTCAATGACACTCGAAATATATAAAAATATACGGTTAATGT

QA 3 531 3 531
DS 

RD RR2EM37TF 531 0 0
GG
ATTTCTATTAATTCTCTTACACATATATCAAACCCTGTAAAAGAAAAAAAATTGTTTCGT
TTTTATTCGATATCGTGAAGATGGGATCAAGTCAAAGCATGGGAGGTTCAAAGAGAAGGG
CGTCGAGTAGGGGACTTGGAGCTGTTCTTAAAGAACAAAGAGCTAAGCTTTACATCATTC
GAAGATGTGTCGTCATGCTTCTTTGTTGGAACGATTGATTTCTCTGCAGATATACTCTCG
TATCATTTTGATGAAGATCGTTCTGTATAAAAGGGATTTGTTGGCTGGATATAGGACTCA
CCATGATGTTTGGAGCTTAAGCGGGTCGGTTCGGATCCTAGTCTGGTGCCAGATTGTGGA
GTAGTTAAATGATTTAAGGTTAGGTGTCTCTACTGGTTAGCAGAGTCGTGTTCTTTTGGA
GCAATATTGTAAATATTGACGGCATAATACAGAGAGTTGATAAAATTTTGTAATAGCTTT
TGGCTCTGTTCAATGACACTCGAAATATATAAAAATATACGGTTAATGT

QA 3 531 3 531
DS 

RD RR2EH13JQ 144 0 0
TTT
TTTTGGAGCAATTTTGTAAATATTGACGGCATAATACAGAGAGTTGATAAAATTTTGTAA
TAGCTTTTGGCTCTGTTCAATGACACTCGAAATATATAAAAATATACGGTTAATGTAAAA
ATGGTCGTTCCCATGTAAAGG

QA 4 144 4 144
DS 



AS 1 2

CO CL1768Contig1 656 2 1 U
GGGACGCCTCTCTCTCTTTCTTCTCTCTTTCCTCTGAATCCGTAGCAGAGTGCGAGAAGA
AGCTGTGAAACCCTAAGTAGTAGAATAATGGTGAAGCTAACTGCTGATTTGATCTGGAAC
AGTCCTCACTTCTTCAATGCCATCAAGGAGCGAGAGTTGGAGCTACGAGGTAACAAGATT
CCTGTAATCGAGAACTTGGGTGCTACCGAGGACCAGTTCGATACGATAGATCTGTCTGAT
AATGAGATAGTTAAGCTGGAAAACTTCCCGCTTCTGAACCGGTTAGGGACTCTGATTGTA
AATAACAATCGGATCACTCGGATAAACCCTAACATTGGAGAGTTCCTACCGAAGTTGCAC
ACTTTGGTTCTTACGAATAACAGGCTTGTGAATTTGGTTGAGATTGACCCCCTAGCCTCC
ATTCCAAGGCTTCAGTACCTTAGTTTATTGGATAACAATATCACCAAAAAGCCGAATTAT
CGCCTTTATGTGATTCACAGGCTTAAATCGCTTCGTGTGCTGGATTTCATTAAAGTTAAA
GCCAAGGAGAGAGCTGAAGCTGCAGCTTTGTTTTCATCTAAGAAGCAGAAGAGGAAGTTA
AGAAGTATCTCAGCAGAGATTCAAAAGTGTCAGATACTATAGAAGATGCAGAGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA80TF U 139
AF RR2EF39TF U 1
BS 1 656 RR2EF39TF

RD RR2CA80TF 172 0 0
GCCATCAAGGAGCGAGAGTTGGAGCTACGAGGTAACAAGATTCCTGTAATCGAGAACTTG
GGTGCTACCGAGGACCAGTTCGATACGATAGATCTGTCTGATAATGAGATAGTTAAGCTG
GAAAACTTCCCGCTTCTGAACCGGTTAGGGACTCTGATTGTAAATAACAATC

QA 1 172 1 172
DS 

RD RR2EF39TF 656 0 0
GGGACGCCTCTCTCTCTTTCTTCTCTCTTTCCTCTGAATCCGTAGCAGAGTGCGAGAAGA
AGCTGTGAAACCCTAAGTAGTAGAATAATGGTGAAGCTAACTGCTGATTTGATCTGGAAC
AGTCCTCACTTCTTCAATGCCATCAAGGAGCGAGAGTTGGAGCTACGAGGTAACAAGATT
CCTGTAATCGAGAACTTGGGTGCTACCGAGGACCAGTTCGATACGATAGATCTGTCTGAT
AATGAGATAGTTAAGCTGGAAAACTTCCCGCTTCTGAACCGGTTAGGGACTCTGATTGTA
AATAACAATCGGATCACTCGGATAAACCCTAACATTGGAGAGTTCCTACCGAAGTTGCAC
ACTTTGGTTCTTACGAATAACAGGCTTGTGAATTTGGTTGAGATTGACCCCCTAGCCTCC
ATTCCAAGGCTTCAGTACCTTAGTTTATTGGATAACAATATCACCAAAAAGCCGAATTAT
CGCCTTTATGTGATTCACAGGCTTAAATCGCTTCGTGTGCTGGATTTCATTAAAGTTAAA
GCCAAGGAGAGAGCTGAAGCTGCAGCTTTGTTTTCATCTAAGAAGCAGAAGAGGAAGTTA
AGAAGTATCTCAGCAGAGATTCAAAAGTGTCAGATACTATAGAAGATGCAGAGGCT

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 5

CO CL1769Contig1 768 5 4 U
GGATCACAATCTTCTCGTTGTTCCTCTTTCTTTACTCTCGAGGGAGAGAAGAAAGATGAA
GGCACCGAACATGGAGATGATAACAAAATCTCTTGAGAAATCAATGCAGAATTTTTCTCT
GAGTGATCGGAGAAGAAGAGTCGGAGACAGGTTCGGAAGATCGTCAACGATGGCCGAAGA
GAGCAGCAACGAACATGTTCCTCCAATCTCAGACAGAACACTGGAGCTTAACTCTCACAT
ATCTCTTCCTTGTCATTGGGAACAGTGTCTTGATCTCAAGACAGGAGAGATTTACTACAT
AAACTGGAAAAATGGAATGAGAGTGAAAGAGGATCCAAGGAAAGTGATGATGAATGCAGA
TAATGACAGTGGAGAATCATGCGGAACATTTTGCTCAGAAGAAGATAGTTCATATTACGA
CAGTGAGGAGTCTTCTTCAGAGTCATCTCCATCATCAAGAGAGAATCAGAAAGAGGATGA
AGAAGAAGAAGCTGTGCTTGTTGTTGCTGGATGCAAAGCTTGTTTCATGTACTTCATGGT
TCCTAAGCTTGTCGAGGACTGTCCCAAATGTGCTGCGCAGCTTGTTCACTTTGATCGACC
TCATTCTGCTTCTCCTTGAAACGTCTCTCTTTGTTTTCACTTCTTTTTATTTTCCTTGTT
TTCCAGATGAGAACTTGCTTAGGTTTTCCTCTTGCGTTCTTTCTTTAATCTTATATTAAT
GTTGTAACTTAATGGTTAATTCTCTTGTGAGTGGGGCATTAACAACTG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM77TF U 1
AF RR2F194TF U 38
AF RR2A029TF U 1
AF RR2A029JQ C 1
AF RR2F194JQ C 38
BS 1 614 RR2GM77TF
BS 615 678 RR2A029TF
BS 679 750 RR2A029JQ
BS 751 768 RR2F194JQ

RD RR2GM77TF 614 0 0
GGATCACAATCTTCTCGTTGTTCCTCTTTCTTTACTCTCGAGGGAGAGAAGAAAGATGAA
GGCACCGAACATGGAGATGATAACAAAATCTCTTGAGAAATCAATGCAGAATTTTTCTCT
GAGTGATCGGAGAAGAAGAGTCGGAGACAGGTTCGGAAGATCGTCAACGATGGCCGAAGA
GAGCAGCAACGAACATGTTCCTCCAATCTCAGACAGAACACTGGAGCTTAACTCTCACAT
ATCTCTTCCTTGTCATTGGGAACAGTGTCTTGATCTCAAGACAGGAGAGATTTACTACAT
AAACTGGAAAAATGGAATGAGAGTGAAAGAGGATCCAAGGAAAGTGATGATGAATGCAGA
TAATGACAGTGGAGAATCATGCGGAACATTTTGCTCAGAAGAAGATAGTTCATATTACGA
CAGTGAGGAGTCTTCTTCAGAGTCATCTCCATCATCAAGAGAGAATCAGAAAGAGGATGA
AGAAGAAGAAGCTGTGCTTGTTGTTGCTGGATGCAAAGCTTGTTTCATGTACTTCATGGT
TCCTAAGCTTGTCGAGGACTGTCCCAAATGTGCTGCGCAGCTTGTTCACTTTGATCGACC
TCATTCTGCTTCTC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2F194TF 599 0 0
GG
GAGGGAGAGAAGAAAGATGAAGGCACCGAACATGGAGATGATAACAAAATCTCTTGAGAA
ATCAATGCAGAATTTTTCTCTGAGTGATCGGAGAAGAAGAGTCGGAGACAGGTTCGGAAG
ATCGTCAACGATGGCCGAAGAGAGCAGCAACGAACATGTTCCTCCAATCTCAGACAGAAC
ACTGGAGCTTAACTCTCACATATCTCTTCCTTGTCATTGGGAACAGTGTCTTGATCTCAA
GACAGGAGAGATTTACTACATAAACTGGAAAAATGGAATGAGAGTGAAAGAGGATCCAAG
GAAAGTGATGATGAATGCAGATAATGACAGTGGAGAATCATGCGGAACATTTTGCTCAGA
AGAAGATAGTTCATATTACGACAGTGAGGAGTCTTCTTCAGAGTCATCTCCATCATCAAG
AGAGAATCAGAAAGAGGATGAAGAAGAAGAAGCTGTGCTTGTTGTTGCTGGATGCAAAGC
TTGTTTCATGTACTTCATGGTTCCTAAGTTTGTCGAGGACTGTCCCAAATGTGCTGCGCA
GCTTGTTCACTTTGATCGACCTCATTCTGCTTCTCCTTGAAACGTCTCTCTTTGTTT

QA 3 599 3 599
DS 

RD RR2A029TF 678 0 0
GGATCACAATCTTCTCGTTGTTCCTCTTTCTTTACTCTCGAGGGAGAGAAGAAAGATGAA
GGCACCGAACATGGAGTCGATAACAAAATCTCTTGAGAAATCAATGCAGAATTTTTCTCT
GAGTGATCGGAGAAGAAGAGTCGGAGACAGGTTCGGAAGATCGTCAACGATGGCCGAAGA
GAGCAGCAACGAACATGTTCCTCCAATCTCAGACAGAACACTGGAGCTTAACTCTCACAT
ATCTCTTCCTTGTCATTGGGAACAGTGTCTTGATCTCAAGACAGGAGAGATTTACTACAT
AAACTGGAAAAATGGAATGAGAGTGAAAGAGGATCCAAGGAAAGTGATGATGAATGCAGA
TAATGACAGTGGAGAATCATGCGGAACATTTTGCTCAGAAGAAAATAGTTCATATTACGA
CAGTGAGGAGTCTTCTTCAGAGTCATCTCCATCATCAAGAGAGAATCAGAAAGAGGATGA
AGAAGAAGAAGCTGTGCTTGTTGTTGCTGGATGCAAAGCTTGTTTCATGTACTTCATGGT
TCCTAAGCTTGTCGAGGACTGTCCCAAATGTGCTGCGCAGCTTGTTCACTTTGATCGACC
TCATTCTGCTTCTCCTTGAAACGTCTCTCTTTGTTTTCACTTCTTTTTATTTTCCTTGTT
TTCCAGATGAGAACTTGC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2A029JQ 750 0 0
GGATCACAATCTTCTCGTTGTTCCTCTTTCTTTACTCTCGAGGGAGAGAAGAAAGATGAA
GGCACCGAACATGGAGTCGATAACAAAATCTCTTGAGAAATCAATGCAGAATTTTTCTCT
GAGTGATCGGAGAAGAAGAGTCGGAGACAGGTTCGGAAGATCGTCAACGATGGCCGAAGA
GAGCAGCAACGAACATGTTCCTCCAATCTCAGACAGAACACTGGAGCTTAACTCTCACAT
ATCTCTTCCTTGTCATTGGGAACAGTGTCTTGATCTCAAGACAGGAGAGATTTACTACAT
AAACTGGAAAAATGGAATGAGAGTGAAAGAGGATCCAAGGAAAGTGATGATGAATGCAGA
TAATGACAGTGGAGAATCATGCGGAACATTTTGCTCAGAAGAAAATAGTTCATATTACGA
CAGTGAGGAGTCTTCTTCAGAGTCATCTCCATCATCAAGAGAGAATCAGAAAGAGGATGA
AGAAGAAGAAGCTGTGCTTGTTGTTGCTGGATGCAAAGCTTGTTTCATGTACTTCATGGT
TCCTAAGCTTGTCGAGGACTGTCCCAAATGTGCTGCGCAGCTTGTTCACTTTGATCGACC
TCATTCTGCTTCTCCTTGAAACGTCTCTCTTTGTTTTCACTTCTTTTTATTTTCCTTGTT
TTCCAGATGAGAACTTGCTTAGGTTTTCCTCTTGCGTTCTTTCTTTAATCTTATATTAAT
GTTGTAACTTAATGGTTAATTCTCTTGTGA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2F194JQ 731 0 0
GG
GAGGGAGAGAAGAAAGATGAAGGCACCGAACATGGAGATGATAACAAAATCTCTTGAGAA
ATCAATGCAGAATTTTTCTCTGAGTGATCGGAGAAGAAGAGTCGGAGACAGGTTCGGAAG
ATCGTCAACGATGGCCGAAGAGAGCAGCAACGAACATGTTCCTCCAATCTCAGACAGAAC
ACTGGAGCTTAACTCTCACATATCTCTTCCTTGTCATTGGGAACAGTGTCTTGATCTCAA
GACAGGAGAGATTTACTACATAAACTGGAAAAATGGAATGAGAGTGAAAGAGGATCCAAG
GAAAGTGATGATGAATGCAGATAATGACAGTGGAGAATCATGCGGAACATTTTGCTCAGA
AGAAGATAGTTCATATTACGACAGTGAGGAGTCTTCTTCAGAGTCATCTCCATCATCAAG
AGAGAATCAGAAAGAGGATGAAGAAGAAGAAGCTGTGCTTGTTGTTGCTGGATGCAAAGC
TTGTTTCATGTACTTCATGGTTCCTAAGTTTGTCGAGGACTGTCCCAAATGTGCTGCGCA
GCTTGTTCACTTTGATCGACCTCATTCTGCTTCTCCTTGAAACGTCTCTCTTTGTTTTCA
CTTCTTTTTATTTTCCTTGTTTTCCAGATGAGAACTTGCTTAGGTTTTCCTCTTGCGTTC
TTTCTTTAATCTTATATTAATGTTGTAACTTAATGGTTAATTCTCTTGTGAGTGGGGCAT
TAACAACTG

QA 3 731 3 731
DS 



AS 1 5

CO CL1770Contig1 1081 5 12 U
GGATCTTGTTCAGTAACAACAATGGCGGATCTCAACCCCAGGATCGAGATTTCGTTTCTT
GAAACCTTCATTTGCAGCGCTTTCGCTGCTTGTTTCGCAGAGTTATGTACGGTACCATTG
GACACAGCTAAAGTAAGGCTACAGCTCCAAAGAAAGATCCCCACTGGGGACGGAGATAAT
CTGCCCAAGTACAGAGGCTCCTTGGGTACGCTCTCTACCATAGCAAGAGAAGAAGGCATC
TCAGGGCTTTGGAAAGGCGTTATTGCAGGGCTGCATCGTCAATGTATCTATGGTGGCTTA
AGGATTGGTTTATATGAGCCTGTCAAGACGCTTTTGGTTGGAAGTGACTTTATTGGGGAT
ATTCCATTATATCAAAAGATTCTTGCTGCTTTGTTAACCGGAGCTATAGCTATCATAGTA
GCGAATCCAACTGATCTTGTTAAAGTTCGGCTTCAGTCAGAAGGAAAACTACCAGCTGGG
GTTCCTAGGCGTTACGCAGGAGCTGTAGACGCTTATTTCACCATAGTGAAGATGGAAGGA
GTTAGTGCGTTGTGGACAGGGCTTGGTCCTAATATAGCAAGGAACGCTATTGTAAACGCT
GCAGAGCTAGCTAGTTATGATCAAATCAAAGAGACAATTATGAAAATTCCAGGATTTGGA
GACAGTGTTCTAACTCATCTGCTAGCTGGGCTAGCTGCTGGATTCTTTGCTGTTTGTATC
GGTTCTCCAGTTGATGTGGTGAAATCTAGAATGATGGGAGATTCTACTTACCGTAACACA
ATTGATTGCTTCATCAAAACCATGCAGACTGAGGGGATTATGGCTTTCTACAAAGGATTC
CTCCCGAATTTTACACGGCTAGGAACTTGGAACGTCGTTATGTTCCTCACACTAGAACAA
GTGAAGAAAGTGTTTCTAAGAGAAGTATTGTTAGATTGATTCCCGAGATCCCTCGTCTTA
AAGAACATATATACCTTATTACATTATTCGTTATTAAGACGTCGAA*TTGTTATATATAC
ACTTCTATGTTACGTGAACTTTCGTCAGTTAGATTAATAATGAAAACATTCTTATCCAAT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2FG45TF U 1
AF RR2B449TF U 69
AF RR2DF13TF U 472
AF RR2FG45JQ C 453
AF RR2B449JQ C 241
BS 1 274 RR2FG45TF
BS 275 275 RR2B449TF
BS 276 775 RR2FG45TF
BS 776 776 RR2B449TF
BS 777 795 RR2FG45TF
BS 796 921 RR2B449TF
BS 922 964 RR2DF13TF
BS 965 965 RR2B449JQ
BS 966 1006 RR2DF13TF
BS 1007 1007 RR2B449JQ
BS 1008 1028 RR2DF13TF
BS 1029 1081 RR2B449JQ

RD RR2FG45TF 795 0 0
GGATCTTGTTCAGTAACAACAATGGCGGATCTCAACCCCAGGATCGAGATTTCGTTTCTT
GAAACCTTCATTTGCAGCGCTTTCGCTGCTTGTTTCGCAGAGTTATGTACGGTACCATTG
GACACAGCTAAAGTAAGGCTACAGCTCCAAAGAAAGATCCCCACTGGGGACGGAGATAAT
CTGCCCAAGTACAGAGGCTCCTTGGGTACGCTCTCTACCATAGCAAGAGAAGAAGGCATC
TCAGGGCTTTGGAAAGGCGTTATTGCAGGGCTGCGTCGTCAATGTATCTATGGTGGCTTA
AGGATTGGTTTATATGAGCCTGTCAAGACGCTTTTGGTTGGAAGTGACTTTATTGGGGAT
ATTCCATTATATCAAAAGATTCTTGCTGCTTTGTTAACCGGAGCTATAGCTATCATAGTA
GCGAATCCAACTGATCTTGTTAAAGTTCGGCTTCAGTCAGAAGGAAAACTACCAGCTGGG
GTTCCTAGGCGTTACGCAGGAGCTGTAGACGCTTATTTCACCATAGTGAAGATGGAAGGA
GTTAGTGCGTTGTGGACAGGGCTTGGTCCTAATATAGCAAGGAACGCTATTGTAAACGCT
GCAGAGCTAGCTAGTTATGATCAAATCAAAGAGACAATTATGAAAATTCCAGGATTTGGA
GACAGTGTTCTAACTCATCTGCTAGCTGGGCTAGCTGCTGGATTCTTTGCTGTTTGTATC
GGTTCTCCAGTTGATGTGGTGAAATCTAGAATGATGGGAGATTCTACTTACCGTA*CACA
ATTGATTGCTTCATC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2B449TF 853 0 0
G
ATTTGCAGCGCTTTCGCTGCTTGTTTCGCAGAGTTATGTAC*****CATTGGACACAGCT
AAAGTAAGGCTACAGCTCCAAAGAAAGATCCCCACTGGGGACGGAGATAATCTGCCCAAG
TACAGAGGCTCCTTGGGTACGCTCTCTACCATAGCAAGAGAAGAAGGCATCTCAGGGCTT
TGGAAAGGCGTTATTGCAGGGCTGCATCGTCAATGTATCTATGGTGGCTTAAGGATTGGT
TTATATGAGCCTGTCAAGACGCTTTTGGTTGGAAGTGACTTTATTGGGGATATTCCATTA
TATCAAAAGATTCTTGCTGCTTTGTTAACCGGAGCTATAGCTATCATAGTAGCGAATCCA
ACTGATCTTGTTAAAGTTCGGCTTCAGTCAGAAGGAAAACTACCAGCTGGGGTTCCTAGG
CGTTACGCAGGAGCTGTAGACGCTTATTTCACCATAGTGAAGATGGAAGGAGTTAGTGCG
TTGTGGACAGGGCTTGGTCCTAATATAGCAAGGAACGCTATTGTAAACGCTGCAGAGCTA
GCTAGTTATGATCAAATCAAAGAGACAATTATGAAAATTCCAGGATTTGGAGACAGTGTT
CTAACTCATCTGCTAGCTGGGCTAGCTGCTGGATTCTTTGCTGTTTGTATCGGTTCTCCA
GTTGATGTGGTGAAATCTAGAATGATGGGAGATTCTACTTACCGTAACACAATTGATTGC
TTCATCAAAACCATGCAGACTGAGGGGATTATGGCTTTCTACAAAGGATTCCTCCCGAAT
TTTACACGGCTAGGAACTTGGAACGTCGTTATGTTCCTCACACTAGAACAAGTGAAGAAA
GTGTTTCTAAGA

QA 2 853 2 853
DS 

RD RR2DF13TF 558 0 0
CCAGCTGGGGTTCCTAGGCGTTACGCAGGAGCTGTAGACGCTTATTTCACCATAGTGAAG
ATGGAAGGAGTCCGTGCGTTGTGGACAGGGCTTGGTCCTAATATAGCAAGGAACGCTATT
GTAAACGCTGCAGAGCTAGCTAGTTATGATCAAATCAAGGAGACAATTATGAAAATTCCA
GGATTTGGAGACAGTGTTCTAACTCATCTGCTAGCTGGGCTATCTGCTGGATTCTTTGCT
GTTTGTATCGGTTCTCCAGTTGATGTGGTGAAATCTAGGATGATGGGAGATTCTACTTAC
CGTAACACAATTGATTGCTTCATCAAAACCATGCAGACTGAGGGGATTATGGCTTTCTAC
AAAGGATTCCTCCCGAATTTTACACGGCTAGGAACTTGGAACGTTGTTATGTTCCTCACA
CTAGAACAAGTGAAGAAAGTGTTTCTAAGAGAAGTATTGTTAGATTGATTCCCGAGATCC
CTCGTCTTAAAGAGCATATATACCTTATTACATTATTCGTTATTAAGACGTCGAAATTGT
TATATATACACTTCTAT
A

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2FG45JQ 624 0 0
TCAGTCAGAAGGAAAACTACCAGCTGGGGTTCCTAGGCGTTACGCAGGAGCTGTAGACGC
TTATTTCACCATAGTGAAGATGGAAGGAGTTAGTGCGTTGTGGACAGGGCTTGGTCCTAA
TATAGCAAGGAACGCTATTGTAAACGCTGCAGAGCTAGCTAGTTATGATCAAATCAAAGA
GACAATTATGAAAATTCCAGGATTTGGAGACAGTGTTCTAACTCATCTGCTAGCTGGGCT
AGCTGCTGGATTCTTTGCTGTTTGTATCGGTTCTCCAGTTGATGTGGTGAAATCTAGAAT
GATGGGAGATTCTACTTACCGTAACACAATTGATTGCTTCATCAAAACCATGCAGACTGA
GGGGATTATGGCTTTTTACAAAGGATTCCTCCCGAATTTTACACGGCTAGGAACTTGGAA
CGTCGTTATGTTCCTCACACTAGAACAAGTGAAGAAAGTGTTTTTAAGAGAAGTATTGTT
AGATTGATTCCCGAGATCCCTCGTCTTAAAGAACATATACACCTTATTACATTATTCGTT
ATTAAGACGTCGAA*TTGTTATATATACACTTCTATGTTACGTGAACTTTGGTCAGTTAG
ATTAATAATGAAAACATTCTTATC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2B449JQ 841 0 0
TCAGGGCTTTGGAAAGGCGTTATTGCAGGGCTGCATCGTCAATGTATCTATGGTGGCTTA
AGGATTGGTTTATATGAGCCTGTCAAGACGCTTTTGGTTGGAAGTGACTTTATTGGGGAT
ATTCCATTATATCAAAAGATTCTTGCTGCTTTGTTAACCGGAGCTATAGCTATCATAGTA
GCGAATCCAACTGATCTTGTTAAAGTTCGGCTTCAGTCAGAAGGAAAACTACCAGCTGGG
GTTCCTAGGCGTTACGCAGGAGCTGTAGACGCTTATTTCACCATAGTGAAGATGGAAGGA
GTTAGTGCGTTGTGGACAGGGCTTGGTCCTAATATAGCAAGGAACGCTATTGTAAACGCT
GCAGAGCTAGCTAGTTATGATCAAATCAAAGAGACAATTATGAAAATTCCAGGATTTGGA
GACAGTGTTCTAACTCATCTGCTAGCTGGGCTAGCTGCTGGATTCTTTGCTGTTTGTATC
GGTTCTCCAGTTGATGTGGTGAAATCTAGAATGATGGGAGATTCTACTTACCGTAACACA
ATTGATTGCTTCATCAAAACCATGCAGACTGAGGGGATTATGGCTTTCTACAAAGGATTC
CTCCCGAATTTTACACGGCTAGGAACTTGGAACGTCGTTATGTTCCTCACACTAGAACAA
GTGAAGAAAGTGTTTCTAAGAGAAGTATTGTTAGATTGATTCCCGAGATCCCTCGTCTTA
AAGAACATATATACCTTATTACATTATTCGTTATTAAGACGTCGAA*TTGTTATATATAC
ACTTCTATGTTACGTGAACTTTCGTCAGTTAGATTAATAATGAAAACATTCTTATCCAAT
T

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 3

CO CL1771Contig1 900 3 4 U
GGAACATCTCTTATCCAATTTACCCCCACCGTCTCCTCTTTGCTTTCTCTGACAAGCTCT
AACAATGTCCTCACTCTCTTCGCTATGCCTATCGAACTCTCCCGTTTGTCGTCACTCTCT
TCCTAACCTCTCCTCCCAGCCACTCCTCTCTTTCTCCCGTTCCCTCAGGCCATTCGTTTC
CAAGTCCAAACCTTTTGCCTCGCAGAAGAAGAAGAGAGAGAGCTCTGTGGTCGTGGGAGT
GAAATCACAGGCTCTTGATTTCTCAGGCACTTTCTTTGAAGGTGGATTCGGCTCCGACGA
TGACCCTACTTCCTCTTCCGTCTCTACTGCCCTTGAGGATAAACCCGAACCTCAGTGCCC
ACCTGGTCTCCGACAGTACGAAACTATGGCCGTCTTGAGACCCGACATGTCTGAAGATGA
GCGCCTTGGTCTCACCCAGAAGTACGAAGAGTTGCTTGTGGCTGGAGGTGGAATGTATGT
GGAAGTATTCAACAGAGGAGTGATTCCATTGGCTTACAGCATCAGAAAGAAGAACAAAGC
AGGAGAGACTAACACTTACCTGGATGGTATCTACCTTCTCTTCACTTACTTCACCAAACC
CGAATCCATCACTCCCCTCGAGTCAGTTCTCCCTGCTGATGACGACGTTATCCGATCTTC
TTCCTTCAAGATCAAGAAGAGGAAGTACAACTGAAAGATCTGATCACCATCAACAACATT
GTGTGTGGTGAATGCATGTGGCTAAAGTTGGATTCTTCTTGTATTATCTATTTGGTTCTG
TTGTCTATGTATCTTTTTGTGAAATGCTCTGTTTTCTTGTGTTACAAGTGTGACAAACTC
TTAACGCAAGCTTTGAGAAACCTCCATAGTATATGCTTTTTCAAAACAAATTATTAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK84TF U 40
AF RR2DE48TF U 1
AF RR2H315JQ C 373
BS 1 408 RR2DE48TF
BS 409 409 RR2H315JQ
BS 410 523 RR2DE48TF
BS 524 900 RR2H315JQ

RD RR2EK84TF 162 0 0
GG
GCTTTCTCTGACAAGCTCTAACAATGTCCTCACTCTCTTCGCTATGCCTATCGAACTCTC
CCGTTTGTCGTCACTCTCTTCCTAACCTCTCCTCCCAGCCACTCCTCTCTTTCTCCCGTT
CCCTCAGGCCATTCGTTTCCAAGTCCAAACCTTTTGCCTC

QA 3 162 3 162
DS 

RD RR2DE48TF 525 0 0
GGAACATCTCTTATCCAATTTACCCCCACCGTCTCCTCTTTGCTTTCTCTGACAAGCTCT
AACAATGTCCTCACTCTCTTCGCTATGCCTATCGAACTCTCCCGTTTGTCGTCACTCTCT
TCCTAACCTCTCCTCCCAGCCACTCCTCTCTTTCTCCCGTTCCCTCAGGCCATTCGTTTC
CAAGTCCAAACCTTTTGCCTCGCAGAAGAAGAAGAGAGAGAGCTCTGTGGTCGTGGGAGT
GAAATCACAGGCTCTTGATTTCTCAGGCACTTTCTTTGAAGGTGGATTCGGCTCCGACGA
TGACCCTACTTCCTCTTCCGTCTCTACTGCCCTTGAGGATAAACCCGAACCTCAGTGCCC
ACCTGGTCTCCGACAGTACGAAACTATGGCCGTCTTGAGACCCGACATTTCTGAAGATGA
GCGCCTTGGTCTCACCCAGAAGTACGAAGAGTTGCTTGTGGCTGGAGGTGGAATGTATGT
GGAAGTATTCAACAGAGGAGTGATTCCATTGGCTTACAGCATC
CG

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2H315JQ 528 0 0
ACAGTACGAAACTATTGCCGTCTTGAGACCCGACATGTCTGAAGATGAGCGCCTTGGTCT
CACCCAGAAGTACGAAGAGTTGCTTGTGGCTGGGGGTGGAATGTATGTGGAAGTATTCAA
CAGAGGAGTGATTCCATTGGCTTACAGCATCAGAAAGAAGAACAAAGCAGGAGAGACTAA
CACTTACCTGGATGGTATCTACCTTCTCTTCACTTACTTCACCAAACCCGAATCCATCAC
TCCCCTCGAGTCAGTTCTCCCTGCTGATGACGACGTTATCCGATCTTCTTCCTTCAAGAT
CAAGAAGAGGAAGTACAACTGAAAGATCTGATCACCATCAACAACATTGTGTGTGGTGAA
TGCATGTGGCTAAAGTTGGATTCTTCTTGTATTATCTATTTGGTTCTGTTGTCTATGTAT
CTTTTTGTGAAATGCTCTGTTTTCTTGTGTTACAAGTGTGACAAACTCTTAACGCAAGCT
TTGAGAAACCTCCATAGTATATGCTTTTTCAAAACAAATTATTAACTC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 5

CO CL1772Contig1 1408 5 11 U
TTGGCTGCAAAGTTTCATGGTTTTGCTGAATGCACACAAGGTGTTTGGTTAAATGCCAAA
AAGAAGATGCTGATTGTAGCATTGCAGTTATAGTTGGCTTCGCTACTGGAGAGGAATCAG
AGAGTGGATAGGAGTGTTTAGTCTGTACGGAAAGAGAGTTATTCTTCATGAGACAGTTTA
GGAGAATGATAGGGTAAGAGAAACCCATATTCTTAGTGAGACAAATAGACCATAAGTACC
TCTGAGAGAGATTGACTAAACTCGCCAAGTATCAAGAGAATACCTCTGAGTGAGTCATGC
AATACTCTCCATGTACAGACCTGAATAGATCTCACACTAAGTTTGTTCTCCATGGTGAAT
TCAACAATCTGCCTACATCTCAACCATCTTAAACAACTCTTGCTTCTGTCCAGTCATTTG
CCTACTTCACAAGACTTCACAAGCATCCCACTATTGCAGTTTCAAACATGGCGTAGCTGT
CCACCCACGCCAAGTTTGCGGGGGAGTATTAAAGCCCATCTCAAAGAGCCTCAAGAACAA
GTCCAGCCCAAGAGAGTGAAGGGTTTCTAGCAAGTAGACTTCATATAAATACTCTTGTTA
TGTTATCTTTGATGGAACTTTGGCTGTCTAAAGAACAGCCTCTTTCAAACTCATTTTATG
AATCAATTACAATCTTACTCATCTTGGTGACAAGCATAGAACTTCTTCCTTTCTTTAGTT
TCATTGCACAATAAAGCTCTTAAGAGCTATCTCTTTATCTATTTTATTTCTGTTTCAATA
AGTAAAGTCATTTGCTTTGGTCAATCCACATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGT
GTTCATACCTCTTCTAAAGCTTTCCTTCAACTTCAGCCTCCGGTCATCATCTTCAGCTTC
CTCAACCTAAAGTCAGAGTTATTGTGTCATGGGTTTGGTTTCTGAAGTCAAAAGAAAAGA
GGAGACTTTCTGCGATTTGGTTACAGATTTGTGAAACTGACGACATGAATCAAGAAGAAC
AAGAAGAAGCTTGGTTCATCTGAAGAAGAGTCAGAGTCTTCAAGCCGGTCGGAGACACGT
TTCTCTGTGCGTTTTATTACATCATATGACTTAAAGCTTGGAGCTTTATGACAGCTAAAG
TCAGAACCTTTGAGAGCTGGATGAAGTTGAAGAATCTGAGGTTTAAAGGGAAACGTTTCA
CGTCATGTGTCATGAGTTGGCCAGGATCAAGCTGTCTGGAGGCATCACCAACTCCATCAC
TGTCTCTACGGTAATGTCTTTGTCCTACATCAGAAACATTAAAAAAAAAAATGTATGGAG
GGTTGATAGTTGAGAAAATGTGATGGTTGCTTGTTCGGTGATGGTCATACTGGCTGGTTA
GATTATAGCTTGATCGTGATCTAGATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB60JQ C 476
AF RR2DC43JQ C 1
AF RR2BP54TF U 614
AF RR2CB60TF U 620
AF RR2DC43TF U 615
BS 1 558 RR2DC43JQ
BS 559 559 RR2CB60JQ
BS 560 621 RR2DC43JQ
BS 622 797 RR2BP54TF
BS 798 798 RR2CB60TF
BS 799 882 RR2BP54TF
BS 883 883 RR2CB60TF
BS 884 1119 RR2BP54TF
BS 1120 1120 RR2CB60TF
BS 1121 1295 RR2BP54TF
BS 1296 1408 RR2DC43TF

RD RR2CB60JQ 181 0 0
GCTGTCCCCCCACGCCAAGTTTGGGGGGGAGTATTAAAGCCCATCTCAAAGAGCCTCAAG
AACAAGTCCAGCCCAAGAGAGTGAAGGGTTTCTAGCAAGTAGACTTCATATAAATACTCT
TGTTATGTTTTCTTTGATGGAACTTTGGCTGTCTAAAGAACAGCCTCTTTCAAACTCATT
T

QA 1 181 1 181
DS 

RD RR2DC43JQ 695 0 0
TTGGCTGCAAAGTTTCATGGTTTTGCTGAATGCACACAAGGTGTTTGGTTAAATGCCAAA
AAGAAGATGCTGATTGTAGCATTGCAGTTATAGTTGGCTTCGCTACTGGAGAGGAATCAG
AGAGTGGATAGGAGTGTTTAGTCTGTACGGAAAGAGAGTTATTCTTCATGAGACAGTTTA
GGAGAATGATAGGGTAAGAGAAACCCATATTCTTAGTGAGACAAATAGACCATAAGTACC
TCTGAGAGAGATTGACTAAACTCGCCAAGTATCAAGAGAATACCTCTGAGTGAGTCATGC
AATACTCTCCATGTACAGACCTGAATAGATCTCACACTAAGTTTGTTCTCCATGGTGAAT
TCAACAATCTGCCTACATCTCAACCATCTTAAACAACTCTTGCTTCTGTCCAGTCATTTG
CCTACTTCACAAGACTTCACAAGCATCCCACTATTGCAGTTTCAAACATGGCGTAGCTGT
CCACCCACGCCAAGTTTGCGGGGGAGTATTAAAGCCCATCTCAAAGAGCCTCAAGAACAA
GTCCAGCCCAAGAGAGTGTAGGGTTTCTAGCAAGTAGACTTCATATAAATACTCTTGTTA
TGTTATCTTTGATGGAACTTTGGCTGTCTAAAGAACAGCCTCTTTCAAACTCATTTTATG
AATCAATTACAATCTTACTCATCTTGGTGACAAGC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2BP54TF 687 0 0
GGAACTTT
GGCTGTCTAAAGAACAGCCTCTTTCAAACTCATTTTATGAATCAATTACAATCTTACTCA
TCTTGGTGACAAGCATAGAACTTCTTCCTTTCTTTAGTTTCATTGCACAATAAAGCTCTT
AAGAGCTATCTCTTTATCTATTTTATTTCTGTTTCAATAAGTAAAGTCATTTGCTTCGGT
CAATCCACATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTGTTCATACCTCTTCTAAAGCT
TTCCTTCAACTTCAGCCTCCGTTCATCATCTTCAGCTTCCTCAACCTAAAGTCAGAGTTA
TTGTGTCATGGGTTTGGTTTCTGAAGTCAAAAGAAAAGAGGAGACTTTCTGCGATTTGGT
TACAGATTTGTGAAACTGACGACATGAATCAAGAAGAACAAGAAGAAGCTTGGTTCATCT
GAAGAAGAGTCAGAGTCTTCAAGCCGGTCGGAGACACGTTTCTCTGTGCGTTTTATTACA
TCATATGACTTAAAGCTTAGAGCTTTATGACAGCTAAAGTCAGAACCTTTGAGAGCTGGA
TGAAGTTGAAGAATCTGAGGTTTAAAGGGAAACGTTTCACGTCATGTGTCATGAGTTGGC
CAGGATCAAGCTGTCTGGAGGCATCACCAACTCCATCACTGTCTCTACGGTAATGTCTTT
GTCCTACATCAGAA
CATTA

QA 9 682 9 682
DS 

RD RR2CB60TF 672 0 0
GG
GGCTGTCTAAAGAACAGCCTCTTTCAAACTCATTTTATGAATCAATTACAATCTTACTCA
TCTTGGTGACAAGCATAGAACTTCTTCCTTTCTTTAGTTTCATTGCACAATAAAGCTCTT
AAGAGCTATCTCTTTATCTATTTTATTTCTGTTTCAATAAGTAAAGTCATTTGCTTTGGT
CAATCCACATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTGTTCATACCTCTTCTAAAGCT
TTCCTTCAACTTCAGCCTCCGGTCATCATCTTCAGCTTCCTCAACCTAAAGTCAGAGTTA
TTGTGTCATGGGTTTGGTTTCTGAAGTCAAAAGAAAAGAGGAGACTTTCTGCGATTTGGT
TACAGATTTGTGAAACTGACGACATGAATCAAGAAGAACAAGAAG***CTTGGTTCATCT
GAAGAAGAGTCAGAGTCTTCAAGCCGGTCGGAGACACGTTTCTCTGTGCGTTTTATTACA
TCATATGACTTAAAGCTTGGAGCTTTATGACAGCTAAAGTCAGAACCTTTGAGAGCTGGA
TGAAGTTGAAGAATCTGAGGTTTAAAGGGAAACGTTTCACGTCATGTGTCATGAGTTGGC
CAGGACCAAGCTGTCTGGAGGCATCACCAACTCCATCACTGTCTCTACGGTAATGTCTTT
GTCCTACATC

QA 3 672 3 672
DS 

RD RR2DC43TF 794 0 0
GGACTTT
GGCTGTCTAAAGAACAGCCTCTTTCAAACTCATTTTATGAATCAATTACAATCTTACTCA
TCTTGGTGACAAGCATAGAACTTCTTCCTTTCTTTAGTTTCATTGCACAATAAAGCTCTT
AAGAGCTATCTCTTTATCTATTTTATTTCTGTTTCAATAAGTAAAGTCATTTGCTTTGGT
CAATCCACATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTGTTCATACCTCTTCTAAAGCT
TTCCTTCAACTTCAGCCTCCGGTCATCATCTTCAGCTTCCTCAACCTAAAGTCAGAGTTA
TTGTGTCATGGGTTTGGTTTCTGAAGTCAAAAGAAAAGAGGAGACTCTCTGCGATTTGGT
TACAGATTTGTGAAACTGACGACATGAATCAAGAAGAACAAGAAGAAGCTTGGTTCATCT
GAAGAAGAGTCAGAGTCTTCAAGCCGGTCGGAGACACGTTTCTCTGTGCGTTTTATTACA
TCATATGACTTAAAGCTTGGAGCTTTATGACAGCTAAAGTCAGAACCTTTGAGAGCTGGA
TGAAGTTGAAGAATCTGAGTTTTAAAGGGAAACGTTTCACGTCATGTGTCATGAGTTGGC
CAGGATCAAGCTGTCTGGAGGCATCACCAACTCCATCACTGTCTCTACG*TAATGTCTTT
GTCCTACATCAGAAACATTAAAAAAAAAAATGTATGGAGGGTTGATAGTTGAGAAAATGT
GATGGTTGCTTGTTCGGTGATGGTCATACTGGCTGGTTAGATTATAGCTTGATCGTGATC
TAGATGT

QA 8 794 8 794
DS 



AS 1 3

CO CL1773Contig1 688 3 5 U
GGATTCTTCAAAACTAAAACACAAAGAGAGACCAAAAATGGCGGAAGAATCTCCAAAGTC
TATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTGAAGGTAAGGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAA
AGGCAAAACTCTTCTGATTGTAAATGTTGCCTCCAAATGTGGCTTGACAGATGCAAACTA
CAAGGAACTCAATGTTCTGTATGATAAATACAAGGAACAAGGGTTGGAGATATTAGCGTT
CCCATGCAATCAGTTCTTGGGAGAACCGGGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCTG
CACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCTATCTTTGACAAGGTGGATGTGAACGGGAAGAACAC
TGCGCCGTTATACAGATACTTGAAAGCTGAGAAAGGAGGGTTGCTTATTGATGCAATCAA
ATGGAACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATACTCTCC
CAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGACATTCAAACTCTGTTGGGACAGGCTTCTTC
TTGAATCATCATCAAAAGTTTTAAGAACCGCTTTATCTGAATATTTTGTTTTTTTCCTTA
AGAATCCCACAATGTTTGCAAACAAACTATTATTCACTGAAACTGCGTTTTGAATAAACA
TGTTGTCTTCTCGTTGGTGATATGTCGT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FI64TF U 1
AF RR2A942TF U 2
AF RR2AW52TFB U 2
BS 1 262 RR2FI64TF
BS 263 399 RR2A942TF
BS 400 400 RR2AW52TFB
BS 401 677 RR2A942TF
BS 678 688 RR2AW52TFB

RD RR2FI64TF 262 0 0
GGATTCTTCAAAACTAAAACACAAAGAGAGACCAAAAATGGCGGAAGAATCTCCAAAGTC
TATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTGAAGGTAAGGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAA
AGGCAAAACTCTTCTGATTGTAAATGTTGCCTCCAAATGTGGCTTGACAGATGCAAACTA
CAAGGAACTCAATGTTCTGTATGATAAATACAAGGAACAAGGGTTGGAGATATTAGCGTT
CCCATGCAATCAGTTCTTGGGA

QA 1 262 1 262
DS 

RD RR2A942TF 679 0 0
GATTCTTCAAAACTAAAACACAAAGAGAGACCAAAAATGGCGGAAGAATCTCCAAAGTCT
ATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTGAAGGTAAGGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAAA
GGCAAAACTCTTCTGATTGTAAATGTTGCCTCCAAATGTGGCTTGACAGATGCAAACTAC
AAGGAACTCAATGTTCTGTATGATAAATACAAGGAACAAGGGTTGGAGATATTAGCGTTC
CCATGCAATCAGTTCTTGGGAGAACCGGGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCTGC
ACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCTATCTTTGACAAGGTGGATGTGAACGGGAAGAACACT
GCGCCGTTATACAGATACTTGAAAGCTGAGAAAGGAGGTTTGCTTATTGATGCAATCAAA
TGGAACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATACTCTCCC
AGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGACATTCAAACTCTGTTGGGACAGGCTTCTTCT
TGAATCATCATCAAAAGTTTTAAGAACCGCTTTATCTGAATATTTTGTTTTTTTCCTTAA
GAATCCCACAATGTTTGCAAACAAACTATTATTCACTGAAACTGCGTTTTGAATAAACAT
GTTGTCTTCTCGTTGG
GTG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2AW52TFB 687 0 0
GATTCTTCAAAACTAAAACACAAAGAGAGACCAAAAATGGCGGAAGAATCTCCAAAGTCT
ATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTGAAGGTAAGGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAAA
GGCAAAACTCTTCTGATTGTAAATGTTGCCTCCAAATGTGGCTTGACAGATGCAAACTAC
AAGGAACTCAATGTTCTGTATGATAAATACAAGGAACAAGGGTTGGAGATATTAGCGTTC
CCATGCAATCAGTTCTTGGGAGAACCGGGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCTGC
ACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCTATCTTTGACAAGGTGGATGTGAACGGGAAGAACACT
GCGCCGTTATACAGATACTTGAAAGCTGAGAAAGGAGGGTTGCTTATTGATGCAATCAAA
TGGAACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATACTCTCCC
AGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGACATTCAAACTCTGTTGGGACAGGCTTCTTCT
TGAATCATCATCAAAAGTTTTAAGAACCGCTTTATCTGAATATTT*GTTTTTTTCCTTAA
GAATCCCACAATGTTTGCAAACAAACTATTATTCACTGAAACTGCGTTTTGAATAAACAT
GTTGTCTTCTCGTTGGTGATATGTCGT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 2 5

CO CL1774Contig1 892 2 4 U
GGAGTTTTGGTGGTTATTTGGCTCTCTTACTTTGCAGTTTATCTTCTTCGGGGAAACAAA
TACGGCGAGGGAATCATATCAATCGAGCCATGTGGAATCACTTACTGGCTCCTCTCATCA
ACTCAAATACCCCTCACTCTCTTCTTCACTCTTTGGATCTGCTTCAGTGAAAATGTTCAA
GGCAGCCAATGTTCTGATCACCAAGCGCCAGTAAAGGATGTAGAAGATTTGAGATCAAAC
GATGGAGGAAGATCAAACAAGTGCATGTTTCCAGTAATGGCTCTATTAGCCGGAGTTTTG
GGTGGTGTTTTTGGTATTGGAGGCGGAATGCTCATTAGCCCTCTCCTCCTACAAGTTGGT
ATCGCTCCTGAGGTAACTGCAGCAACTTGTTCTTTCATGGTATTGTTTTCATCGACAATG
TCTGCGATTCAATACTTGTTACTAGACATGGAACATACTGGAACTGCTTGTCTATTTGCG
ATTGTATGTTTTGTGGCATCACTCGTTGGACTAATGGTGGTCCAAAAGGTTATAACCCAG
TATGGAAGGGCTTCGATAATTGTGTTCTCGGTTGGTATCGTCATGGCACTGAGCATTGTG
TTGATGACCAGCTATGTAGCTCTTGATGTTTGGAATGATTTTATCTCTGGCAGTTACATG
GGTTTCAAATTACCTTGTTGAGACCAAACAAAAAGGTTTTGGTTTCTTTGGTTAATAGTT
CATAATATATGTGTATACCCATCGTGTTCAATCCTTGCATGTTTTTGTTGCTCGTTGTTC
CATTGTTCATTAGGATTTTTCTACATTTTTGTATGATTTTTAAATCCATATTCAGAATGC
GCATCTCGTGCCTTCTGAAATACATGGTCAAAATAAGATATGTTGTAAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ18TF U 1
AF RR2CJ18JQ C 137
BS 1 633 RR2CJ18TF
BS 634 634 RR2CJ18JQ
BS 635 647 RR2CJ18TF
BS 648 892 RR2CJ18JQ

RD RR2CJ18TF 647 0 0
GGAGTTTTGGTGGTTATTTGGCTCTCTTACTTTGCAGTTTATCTTCTTCGGGGAAACAAA
TACGGCGAGGGAATCATATCAATCGAGCCATGTGGAATCACTTACTGGCTCCTCTCATCA
ACTCAAATACCCCTCACTCTCTTCTTCACTCTTTGGATCTGCTTCAGTGAAAATGTTCAA
GGCAGCCAATGTTCTGATCACCAAGCGCCAGTAAAGGATGTAGAAGATTTGAGATCAAAC
GATGGAGGAAGATCAAACAAGTGCATGTTTCCAGTAATGGCTCTATTAGCCGGAGTTTTG
GGTGGTGTTTTTGGTATTGGAGGCGGAATGCTCATTAGCCCTCTCCTCCTACAAGTTGGT
ATCGCTCCTGAGGTAACTGCAGCAACTTGTTCTTTCATGGTATTGTTTTCATCGACAATG
TCTGCGATTCAATACTTGTTACTAGACATGGAACATACTGGAACTGCTTGTCTATTTGCG
ATTGTATGTTTTGTGGCATCACTCGTTGGACTAATGGTGGTCCAAAAGGTTATAACCCAG
TATGGAAGGGCTTCGATAATTGTGTTCTCGGTTGGTATCGTCATGGCACTGAGCATTGTG
TTGATGACCAGCTATGTAGCTCTTGATGTTTGGGATGATTTTATCTC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2CJ18JQ 756 0 0
CTCTCTTCTTCACTCTTTGGATCTGCTTCAGTGAAAATGTTCAAGGCAGCCAATGTTCTG
ATCACCAAGCGCCAGTAAAGGATGTAGAAGATTTGAGATCAAACGATGGAGGAAGATCAA
ACAAGTGCATGTTTCCAGTAATGGCTCTATTAGCCGGAGTTTTGGGTGGTGTTTTTGGTA
TTGGAGGCGGAATGCTCATTAGCCCTCTCCTCCTACAAGTTGGTATCGCTCCTGAGGTAA
CTGCAGCAACTTGTTCTTTCATGGTATTGTTTTCATCGACAATGTCTGCGATTCAATACT
TGTTACTAGACATGGAACATACTGGAACTGCTTGTCTATTTGCGATTGTATGTTTTGTGG
CATCACTCGTTGGACTAATGGTGGTCCAAAAGGTTATAACCCAGTATGGAAGGGCTTCGA
TAATTGTGTTCTCGGTTGGTATCGTCATGGCACTGAGCATTGTGTTGATGACCAGCTATG
TAGCTCTTGATGTTTGGAATGATTTTATCTCTGGCAGTTACATGGGTTTCAAATTACCTT
GTTGAGACCAAACAAAAAGGTTTTGGTTTCTTTGGTTAATAGTTCATAATATATGTGTAT
ACCCATCGTGTTCAATCCTTGCATGTTTTTGTTGCTCGTTGTTCCATTGTTCATTAGGAT
TTTTCTACATTTTTGTATGATTTTTAAATCCATATTCAGAATGCGCATCTCGTGCCTTCT
GAAATACATGGTCAAAATAAGATATGTTGTAAGACC

QA 1 756 1 756
DS 



CO CL1774Contig2 787 3 8 U
GATCCAAAAATGCACAATATGAACTTTGGTCTTACAACATATCTTATTTTGACCATGTAT
TTCAGAATGCACGAGATGTGCATTCTGAGTATGGATTTAAAAATCATACAAAAATGTACA
AAAATTCTAATGAACAATGGAACAACAAGCAACAAAAACATGCAAGGATTAAACATGATG
TGTATGTATACACATATATTATAAACTATTAACCAAAGAAACCAAAACCTTTTTGTTTGG
CCTCAACAAGGTAATTTGAAACCCATGTAACTGCCAGAGATAAAATCATTCCAAACATCA
AGAGCTCCATAGCTGGTCATCAACACAATGCTCAGTGCCATGACGATACCAACCGAGAAC
ACAATTATCGAAGCCCTTCCATACTGGGTTATAACCTTTTGGACCACCATTAGTCCAACG
AGTGATGCCACAAAACATACAATCGCAAATAGACAAGCAGTTCCAGTATGTTCCATGCCT
AGTAACAAGTATTGAATCGCAGACATTGTCGATGAAAACAATACCATGAAAGAACAAGTT
GCTGCAGTTACCTCAGGAGCGATACCAACTTGTAGGAGGAGAGGGCTAATGAGCATTCCG
CCTCCAATACCAAAAACACCACCCAAAACTCCGGCTAATAGAGCCATTACTGGAAACATG
CACTTGTTTGATCTTCCTCCATCGTTTGATCTCAAATCTTCTACATCCTTTACTGGCGCT
TGGTGATCAGAACATTGGCTGCCTTGAACATTTTCACTGAAGCAGATCCAAAGAGTGAAG
AAGAGAG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ90JQ U 281
AF RR2FY70JQ U 1
AF RR2C977JQ U 3
BS 1 14 RR2FY70JQ
BS 15 15 RR2C977JQ
BS 16 170 RR2FY70JQ
BS 171 171 RR2C977JQ
BS 172 517 RR2FY70JQ
BS 518 518 RR2C977JQ
BS 519 757 RR2FY70JQ
BS 758 787 RR2C977JQ

RD RR2EJ90JQ 218 0 0
TAAAATCATTCCAAACATCAAGAGCTCCATAGCTGGTCATCAACACAATGCTCAGTGCCG
TGACGATACCAACCGAGAACACAATTATCGAAGCCCTTCCATACTGGGTTATAACCTTTT
GGACCACCATTAGTCCAACGAGTGATGCCACAAAACATACAATCGCAAATAGACAAGCAG
TTCCAGTATGTTCCATGCTTAGTAACAAGTATTGAATC

QA 1 218 1 218
DS 

RD RR2FY70JQ 757 0 0
GATCCAAAAATGCATAATATGAACTTTGGTCTTACAACATATCTTATTTTGACCATGTAT
TTCAGAATGCACGAGATGTGCATTCTGAGTATGGATTTAAAAATCATACAAAAATGTACA
AAAATTCTAATGAACAATGGAACAACAAGCAACAAAAACATGCAAGGATTGAACATGATG
TGTATGTATACACATATATTATAAACTATTAACCAAAGAAACCAAAACCTTTTTGTTTGG
CCTCAACAAGGTAATTTGAAACCCATGTAACTGCCAGAGATAAAATCATTCCAAACATCA
AGAGCTCCATAGCTGGTCATCAACACAATGCTCAGTGCCATGACGATACCAACCGAGAAC
ACAATTATCGAAGCCCTTCCATACTGGGTTATAACCTTTTGGACCACCATTAGTCCAACG
AGTGATGCCACAAAACATACAATCGCAAATAGACAAGCAGTTCCAGTATGTTCCATGCCT
AGTAACAAGTATTGAATCGCAGACATTGTCGATGAAAGCAATACCATGAAAGAACAAGTT
GCTGCAGTTACCTCAGGAGCGATACCAACTTGTAGGAGGAGAGGGCTAATGAGCATTCCG
CCTCCAATACCAAAAACACCACCCAAAACTCCGGCTAATAGAGCCATTACTGGAAACATG
CACTTGTTTGATCTTCCTCCATCGTTTGATCTCAAATCTTCTACATCCTTTACTGGCGCT
TGGTGATCAGAACATTGGCTGCCTTGAACATTTTCAC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2C977JQ 785 0 0
TCCAAAAATGCACAATATGAGTTTTGGTCTTACAACATATCTTATTTTGACCATGTATTT
CAGAATGCACGAGTTGTGCATTCTGAGTATGGATTTAAAA*TCATACAAAAATGTACAAA
AATTCTAATGA*CAATGGAACAACAAGCAACAAAAACATGCAAGGATTAAACATGATGTG
TATGTATACACATATATTATGAACTATTAACCAAAGAAACCAAAACCTTTTTGTTTGGTC
TCAACAAGGTAATTTGAAACCCATGTAGCTGCCAGAGATAAAATCATTCCAGACATCAAG
AGTTCCATAGCTGGTCATCAACACAATGCTCAGTGCCATGACGATACCAACCGAGAACAC
AATTATCGAAGCCCTTCCATACTGGGTTATAACCTTTTGGACCACCATTAGTCCAACGAG
TGATGCCACGAAACATACAATCGCAAATAGACAAGCAGTTCCAGTATGTTCCATGCCTAG
TAACAAGTATTGAATCGCAGACATTGTCGATGAAAACAATACCATGAAAGAACAAGTTGC
TGCTGTTACCTCAGGAGCGATACCAACTTGTAGGAGGAGAGGGCTAATGAGCATTCCGCC
TCCAATACCAAAAACACCACCCAAAACTCCGGCTAATAGAGCCATTACTGGAAACATGCA
CTTGTTTGATCTTCCTCCATCGTTTGATCTCAAATCTTCTACATCCTTTACTGGCGCTTG
GTGATCAGAACATTGGCTGCCTTGAACATTTTCACTGAAGCAGATCCAAAGAGTGAAGAA
GAGAG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 4

CO CL1775Contig1 872 4 3 U
GTTTCTCTCTTTCCCACGCCATTATATAAAAGAAAGAAAGGAAAGCTCATCGGTTTCTCA
GATCCACTTCTTCTTTTGGTTGATCTCTAGGGTTTTTCTGATCGCTTGTTTGGTAGGTTT
TGTGTTTTTGAGACATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAAAAGG
ATCCTCCTTCTAACTGTAGCGCAGGTCCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAA
CTATCATGGGACCTCCTGACAGTCCTTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGGTCTCCATTCACT
TTCCTCCGGATTATCCTTTCAAGCCACCTAAGGTGTCTTTTAAGACGAGAGTGTACCATC
CCAACATCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGCCCTG
CTCTTACCGTATCCAAGGTATTGCTGTCGATTTGCTCATTGCTGACAGACCCGAACCCAG
ATGATCCTCTTGTGCCAGAGATTGCCCATATGTACAAGACGGATAAGACCAAGTACGAGT
CAACTGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGGTGATTGATGAAGACCCAAAAGT
GGTGGTCGAAGACGGATCAAATTATTAAAAATAAAAACTGCATTTGTTTTGTTTATTTAG
TAAAACGCTTTTTGTGTGATGATCATCATAATCGAGCAACTTTATATGCTTGATCTCTCT
TAATCTTGTCTGCTGATATCATTATCATCATTCACCTATTTTACGGTTTTTCTCTCGATA
TTACCTCTGCTCATTTGATTGTTGTTTGAGACTGCAATTGCGACAACCGTGTAAATAAGC
TAAATTTTTGGAAAAGTATTCTGTTTCATTCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG37TF U 1
AF RR2D089TF U 1
AF RR2D089JQ C 49
AF RR2A178JQ C 94
BS 1 611 RR2D089TF
BS 612 776 RR2D089JQ
BS 777 872 RR2A178JQ

RD RR2GG37TF 539 0 0
GTTTCTCTCTTTCCCACGCCATTATATAAAAGAAAGAAAGGAAAGCTCATCGGTTTCTCA
GATCCACTTCTTCTTTTGGTTGATCTCTAAGGTTTTTCTGATCGCTTGTTTGGTAGGTTT
TGTGTTTTTGAGACATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAAAAGG
ATCCTCCTTCTAACTGTAGCGCAGGTCCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAA
CTATCATGGGACCTCCTGACAGTCCTTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGGTCTCCATTCACT
TTCCTCCGGATTATCCTTTCAAGCCACCTAAGGTGTCTTTTAAGACGAGAGTGTACCATC
CCAACATCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCCTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTG
CTCTTACCGTATCCAAGGTATTGCTGTCGATTTGCTCATTGCTGACAGACCCGAACCCAG
ATGATCCTCTTGTGCCAGAGATTGCCCATATGTACAAGACGGATAAGACCAAGTACGAG

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2D089TF 611 0 0
GTTTCTCTCTTTCCCACGCCATTATATAAAAGAAAGAAAGGAAAGCTCATCGGTTTCTCA
GATCCACTTCTTCTTTTGGTTGATCTCTAGGGTTTTTCTGATCGCTTGTTTGGTAGGTTT
TGTGTTTTTGAGACATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAAAAGG
ATCCTCCTTCTAACTGTAGCGCAGGTCCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAA
CTATCATGGGACCTCCTGACAGTCCTTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGGTCTCCATTCACT
TTCCTCCGGATTATCCTTTCAAGCCACCTAAGGTGTCTTTTAAGACGAGAGTGTACCATC
CCAACATCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGCCCTG
CTCTTACCGTATCCAAGGTATTGCTGTCGATTTGCTCATTGCTGACAGACCCGAACCCAG
ATGATCCTCTTGTGCCAGAGATTGCCCATATGTACAAGACGGATAAGACCAAGTACGAGT
CAACTGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGGTGATTGATGAAGACCCAAAAGT
GGTGGTCGAAG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2D089JQ 729 0 0
ATCGGTTTCTCAGATCCACTTCTTCTTTTGGTTGATCTCTAGGGTTTTTCTGATCGCTTG
TTTGGTAGGTTTTGTGTTTTTGAGACATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGG
ATTTGCAAAAGGATCCTCCTTCTAACTGTAGCGCAGGTCCTGTGGCTGAGGACATGTTCC
ATTGGCAAGCAACTATCATGGGACCTCCTGACAGTCCTTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGG
TCTCCATTCACTTTCCTCCGGATTATCCTTTCAAGCCACCTAAGGTGTCTTTTAAGACGA
GAGTGTACCATCCCAACATCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAAC
AGTGGAGCCCTGCTCTTACCGTATCCAAGGTATTGCTGTCGATTTGCTCATTGCTGACAG
ACCCGAACCCAGATGATCCTCTTGTGCCAGAGATTGCCCATATGTACAAGACGGATAAGA
CCAAGTACGAGTCAACTGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGGTGATTGATGA
AGACCCAAAAGTGGTGGTCGAAGACGGATCAAATTATTAAAAATAAAAACTGCATTTGTT
TTGTTTATTTAGTAAAACGCTTTTTGTGTGATGATCATCATAATCGAGCAACTTTATATG
CTTGATCTCTCTTAATCTTGTCTGCTGATATCATTATCATCATTCACCTATTTTACGGTT
TTTCTCTC
C

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2A178JQ 779 0 0
TCTTGTTCCCCCTTGTGTA
GTAGGTTTTGTGTTTTTGAGACATGGCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTT
GCAAAAGGATCCTCCTTCTAACTGTAGCGCAGGTCCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTG
GCAAGCAACTATCATGGGACCTCCTGACAGTCCTTATGCCGGAGGAGTCTTTTTGGTCTC
CATTCACTTTCCTCCGGATTATCCTTTCAAGCCACCTAAGGTGTCTTTTAAGACGAGAGT
GTACCATCCCAACATCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTG
GAGTCCTGCTCTTACCGTATCCAAGGTATTGCTGTCGATTTGCTCATTGCTGACAGACCC
GAGCCCAGATGATCCTCTTGTGCCAGAGATTGCCCATATGTACAAGACGGATAAGACCAA
GTACGAGTCAACTGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGGTGATTGATGAAGAC
CCAAAAGTGGTGGTCGAAGACGGATCAAATTATTAAAAATAAAAACTGCATTTGTTTTGT
TTATTTAGTAAAACGCTTTTTGTGTGATGATCATCATAATCGAGCAACTTTATATGCTTG
ATCTCTCTTAATCTTGTCTGCTGATATCATTATCATCATTCACCTATTTTACGGTTTTTC
TCTCGATATTACCTCTGCTCATTTGATTGTTGTTTGAGACTGCAATTGCGACAACCGTGT
AAATAAGCTAAATTTTTGGAAAAGTATTCTGTTTCATTCG

QA 20 779 20 779
DS 



AS 1 5

CO CL1776Contig1 1050 5 7 U
CGAGAAAGAGATCGATCAATTCCGATTTTTTCTTTTTCTATTGATTCTTTTCGGATCGAG
ATGTATGGATCCACGGATCTATGTGTCTATATAGATCCTGTTCATGGATTAACGAAAATG
TGCAAACGCTCTATTTGCCTCTGCCATTCTATGAGTCTCTTCATTTT*GCGTATGGCATC
GCCACTCCCTTTGGCAGCATCCACTAATTCGGAACTTAATTTGAAAGCCATATTTCGACC
CGGACGTTTTCGGGATGCCCCTAATAACCAACGAATGGCAAGTGCTTTTCCTTGCGTGGA
TCCTATTTCAATGGGAACTTGATGAGTTGATCCGCCTACACGTCTTGCTTTTACTGCTAT
ATCGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAAACAGATAGTGGATTTGTTTCTGTCTT
TTGTTGAATCTTTTTCAAGGCTCGATAGATAATTTGATAAGCCAATGATTTTTTTCCGTG
TTTCAGAATACGGTTAACCAACATGTTAACTAATCGATTACGATAAATTGGATCGGATTT
TGCAGTTTTTTCTTCTGCAGTACCTCGACGTGACATGAGCGTGAAAGGGGTTCAAGAATC
TGTTTTCTTTTTATAAGGGCTCAAATCTTTTATTTTGGCTTTTTGACCCCATATTTAGAA
CGCCCTTGTTGACGATCCTTTACTCCGACAGCATCTAGGGTTCCTCGAACAATGTGATAT
CTCACACCGGGTAAATCCTTAACCCTTCCCCCTCTTACTAAGACTACAGAATGTTCTTGT
AAATTATGGCCAATACCAGGTATATAAGCAGTGATTTCAAATCCCGAGGTTAATCGTACT
CTGGCAACTTTACGTAAGGCAGAGTTTGGTTTTTTGGGGGTGATAGTATACACCCGAGTA
CATGTTCCTCGTCGCTGAGGGCATCCCCGAAGCGCTGGGGATTTCGTGACATTTCGGATT
GGCTGTCTTGTATTTCTAATAAGTTGTTTAATGGTTGGCATACGGAATCATATAAATAAT
GGGCTGGTTTAGATGGGTTCTAACCGGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ34JQ U 139
AF RR2CZ34TF C 43
AF RR2FK63JQ U 1
AF RR2CD85JQ U 183
AF RR2FK63TF C 338
BS 1 162 RR2FK63JQ
BS 163 163 RR2CZ34JQ
BS 164 167 RR2FK63JQ
BS 168 168 RR2CZ34JQ
BS 169 746 RR2FK63JQ
BS 747 763 RR2CD85JQ
BS 764 1050 RR2FK63TF

RD RR2CZ34JQ 539 0 0
CTCTGCCATTCTATGAGTCTCTTCATTTT*GCGTATGGCATCGCCACTCCCTTTGGCAGC
ATCCACTAATTCGGAACTTAATTTGAAAGCCATATTTCGACCCGGACGTTTTCGGGATGC
CCCTAATAACCAACGAATGGCAAGTGCTTTTCCTTGCGTGGATCCTATTTCAATGGGAAC
TTGATGAGTTGATCCGCCTACACGTCTTGCTTTTACTGCTATATCGGGAGTTACTCCACG
TATTGCTTGACGTAAAACAGATAGTGGATTTGTTTCTGTCTTTTGTTGAATCTTTTTCAA
GGCTCGATAGATAATTTGATAAGCCAATGATTTTTTTCCGTGTTTCAGAATACGGTTAAC
CAACATGTTAACTAATCGATTACGATAAATTGGATCGGATTTTGCAGTTTTTTCTTCTGC
AGTACCTCGACGTGACATGAGCGTGAAAGGGGTTCAAGAATCTGTTTTCTTTTTATAAGG
GCTCAAATCTTTTATTTTGGCTTTTTGACCCCATATTTAGAACGCCCTTGTTGACGATC

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2CZ34TF 635 0 0
GATTCTTTTCGGATCGAGATGTATGGATCCACGGATCTATGTGTCTATATAGATCCTGTT
CATGGATTAACGAAAATGTGCAAACGCTCTATTTGCCTCTGCCATTCTATGAGTCTCTTC
ATTTT*GCGTATGGCATCGCCACTCCCTTTGGCAGCATCCACTAATTCGGAACTTAATTT
GAAAGCCATATTTCGACCCGGACGTTTTCGGGATGCCCCTAATAACCAACGAATGGCAAG
TGCTTTTCCTTGCGTGGATCCTATTTCAATGGGAACTTGATGAGTTGATCCGCCTACACG
TCTTGCTTTTACTGCTATATCGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAAACAGATAG
TGGATTTGTTTCTGTCTTTTGTTGAATCTTTTTCAAGGCTCGATAGATAATTTGATAAGC
CAATGATTTTTTTCCGTGTTTCAGAATACGGTTAACCAACATGTTAACTAATCGATTACG
ATAAATTGGATCGGATTTTGCAGTTTTTTCTTCTGCAGTACCTCGACGTGACATGAGCGT
GAAAGGGGTTCAAGAATCTGTTTTCTTTTTATAAGGGCTCAAATCTTTTATTTTGGCTTT
TTGACCCCATATTTAGAACGCCCTTGTTGACGATC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2FK63JQ 746 0 0
CGAGAAAGAGATCGATCAATTCCGATTTTTTCTTTTTCTATTGATTCTTTTCGGATCGAG
ATGTATGGATCCACGGATCTATGTGTCTATATAGATCCTGTTCATGGATTAACGAAAATG
TGCAAACGCTCTATTTGCCTCTGCCATTCTATGAGTCTCTTCCTTTTTGCGTATGGCATC
GCCACTCCCTTTGGCAGCATCCACTAATTCGGAACTTAATTTGAAAGCCATATTTCGACC
CGGACGTTTTCGGGATGCCCCTAATAACCAACGAATGGCAAGTGCTTTTCCTTGCGTGGA
TCCTATTTCAATGGGAACTTGATGAGTTGATCCGCCTACACGTCTTGCTTTTACTGCTAT
ATCGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAAACAGATAGTGGATTTGTTTCTGTCTT
TTGTTGAATCTTTTTCAAGGCTCGATAGATAATTTGATAAGCCAATGATTTTTTTCCGTG
TTTCAGAATACGGTTAACCAACATGTTAACTAATCGATTACGATAAATTGGATCGGATTT
TGCAGTTTTTTCTTCTGCAGTACCTCGACGTGACATGAGCGTGAAAGGGGTTCAAGAATC
TGTTTTCTTTTTATAAGGGCTCAAATCTTTTATTTTGGCTTTTTGACCCCATATTTAGAA
CGCCCTTGTTGACGATCCTTTACTCCGACAGCATCTAGGGTTCCTCGAACAATGTGATAT
CTCACACCGGGTAAATCCTTAACCCT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2CD85JQ 581 0 0
CACTCCCTTTGGCAGCATCCACTAATTCGGAACTTAATTTGAAAGCCATATTTCGACCCG
GACGTTTTCGGGATGCCCCTAATAACCAACGAATGGCAAGTGCTTTTCCTTGCGTGGATC
CTATTTCAATGGGAACTTGATGAGTTGATCCGCCTACACGTCTTGCTTTTACTGCTATAT
CGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAAACAGATAGTGGATTTGTTTCTGTCTTTT
GCTGAATCTTTTTCAAGGCTCGATAGATAATTTGATAAGCCAATGATTTTTTTCCGTGTT
TCAAAATACGGTTAACCAACATGTTAACTAATCGATTACGATAAATTGGATCGGATTTTG
CAGTTTTTTCTTCTGCAGTACCTCGACGTGACATGAGCGTGAAAGGGGTTCAAGAATCTG
TTTTCTTTTTATAAGGGCTCAAATCTTTTATTTTGGCTTTTTGACCCCATATTTAGAACG
CCCTTGTTGACGATCCTTTACTCCGACAGCATCTAGGGTTCCTCGAACAATGTGATATCT
CACACCGGGTAAATCCTTAACCCTTCCCCCTCTTACTAAGA

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2FK63TF 713 0 0
ACACGTCTTGCTTTTACTGCTATATCGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAAACA
GATAGTGGATTTGTTTCTGTCTTTTGTTGAATCTTTTTCAAGGCTCGATAGATAATTTGA
TAAGCCAATGATTTTTTTCCGTGTTTCAGAATACGGTTAACCAACATGTTAACTAATCGA
TTACGATAAATTGGATCGGATTTTGCAGTTTTTTCTTCTGCAGTACCTCGACGTGACATG
AGCGTGAAAGGGGTTCAAGAATCTGTTTTCTTTTTATAAGGGCTCAAATCTTTTATTTTG
GCTTTTTGACCCCATATTTAGAACGCCCTTGTTGACGATCCTTTACTCCGACAGCATCTA
GGGTTCCTCGAACAATGTGATATCTCACACCGGGTAAATCCTTAACCCTTCCCCCTCTTA
CTAAGACTACAGAATGTTCTTGTAAATTATGGCCAATACCAGGTATATAAGCAGTGATTT
CAAATCCCGAGGTTAATCGTACTCTGGCAACTTTACGTAAGGCAGAGTTTGGTTTTTTGG
GGGTGATAGTATACACCCGAGTACATGTTCCTCGTCGCTGAGGGCATCCCCGAAGCGCTG
GGGATTTCGTGACATTTCGGATTGGCTGTCTTGTATTTCTAATAAGTTGTTTAATGGTTG
GCATACGGAATCATATAAATAATGGGCTGGTTTAGATGGGTTCTAACCGGCTC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 4

CO CL1777Contig1 1199 4 8 U
GGATCCAAAACTCTCTCAATTCGCCCCAATGGCTCTTCTTCGTCTCCCTCCCATTTCCCT
CCAATTTCTAGGTCACCAATCTGAACACAAAACCCCTAATCCCGGCGTTTCGCTCGCCAA
TTTCTCCCTCCCTTGGTCTACTCCTCCTTCACTATCTCGTCTCCATCTATCAAAACCCAG
AAATCTGACCTCTTGCTTCTCCGCTACTACCCAAGAGCCAATCCTCGAGTCTTCTTCTTC
TTCTGAAGAGATTTCGAAAACCAGATTGATTGCTCAAAACGTTCCTTGGACCTCTACACC
CGAAGACATAAGGTCGCTCTTCGAGAAATACGGCAATGTCGTCGACGTTGAGATGTCTAT
GCACAAGAAGGAAAGGAACCGAGGTTTGGTTTTCATTGAGATGGCTTCTCCTGAAGATGC
TGCATCAGCTCTTCAAGCTCTCGAATCCTATGAATATGAGGGTCGTCGTTTGAAGGTAGC
CTATGCAAAGGCCAAGAAGAAGAAAACTTATGCTCCTCGTGAGAAGCCTACGCCGGTGCC
TACGTTCAATTTGTTTGTTGCAAACTTGGCATTTGAAGCAAGGGCCAAGCATCTTAAGGA
GTTCTTTGATGCAGACACTGGTAACGTTGTCTCCACTGAAGCTATATTCCATGAAAATCC
TAGGAGGTCGAGTGGTTACGGCTTTGTCTCTTTCAAAACCAAGAAAATGGCCGATGCTGC
GCTCCTTGAGTTCCAAGGAAAGGATTTCATGGGAAGACCAATCCGATTAGCTCGTAGCAA
ACAGTTTGTGAAGTTGCAAGCAAAAGAAGGGTTGCAGCCACCAGATGAAGAGGAACTATC
TGAGTCTGAGACAATGACCCAAGAGGACGAAATTCCAGCTCCGGAAAACTGAGAAGGATT
AGTGGTGGTTGGGTATCGGAATTGAAGAGAAAGCTTTGAGATTTTGACAAACAAGAGAAG
CGGATACATTGCAATTACCAACCTTAAGTAAGTGGTGGAGAAGTAAGAAGTACAAGAACG
ATCTAGTTAGAACTGAAAACTACTAGCGACTGTCAAGAAACAAAACCCATGTGTCTCTAA
GAACTTGCTTTGTTAAGTTAACACAATGTTCTTATTTTTCTATTGGTTTTGATAGAAAAT
TTTGCATTTGTTACTATGTTGAATGTGTATTTATTTGGTTCCCAAAGAGCCCCACTTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW90TF U 1
AF RR2B678TF U 1
AF RR2B678JQ C 307
AF RR2EW90JQ C 532
BS 1 24 RR2B678TF
BS 25 25 RR2EW90TF
BS 26 641 RR2B678TF
BS 642 642 RR2EW90TF
BS 643 805 RR2B678TF
BS 806 1014 RR2B678JQ
BS 1015 1015 RR2EW90JQ
BS 1016 1199 RR2B678JQ

RD RR2EW90TF 732 0 0
GGATCCAAAACTCTCTCAATTCGCCCCAATGGCTCTTCTTCGTCTCCCTCCCATTTCCCT
CCAATTTCTAGGTCACCAATCTGAACACAAAACCCCTAATCCCGGCGTTTCGCTCGCCAA
TTTCTCCCTCCCTTGGTCTACTCCTCCTTCACTATCTCGTCTCCATCTATCAAAACCCAG
AAATCTTACCTCTTGCTTCTCCGCTACTACCCAAGAGCCAATCCTCGAGTCTTCTTCTTC
TTCTGAAGAGATTTCGAAAACCAGATTGATTGCTCAAAACGTTCCTTGGACCTCTACACC
CGAAGACATAAGGTCGCTCTTTGAGAAATACGGCAATGTCGTCGACGTTGAGATGTCTAT
GCACAAGAAGGAAAGGAACCGAGGTTTGGTTTTCATTGAGATGGCTTCTCCTGAAGATGC
TGCATCAGCTCTTCAAGCTCTCGAATCCTATGAATATGAGGGTCGTCGTTTGAAGGTAGC
CTATGCAAAGGCCAAAAAGAAGAAAACTTATGCTCCTCGTGAGAGGCCTACGCCGGTGCC
TACGTTCAATTTGTTTGTTGCAAACTTGGCATTTGAAGCAAGGGCCAAGCATCTTAAGGA
GTTCTTTGATGCAGACACTGGTAACGTTGTCTCCACTGAAGCTATATTCCATGAAAATCC
TAGGAGGTCGAGTGGTTACG*CTTTGTCTCTTTCAAA*CCAAGAAA*TGGCCGATGCTGC
GCTCCTTGAGT
C

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2B678TF 805 0 0
GGATCCAAAACTCTCTCAATTCGCTCCAATGGCTCTTCTTCGTCTCCCTCCCATTTCCCT
CCAATTTCTAGGTCACCAATCTGAACACAAAACCCCTAATCCCGGCGTTTCGCTCGCCAA
TTTCTCCCTCCCTTGGTCTACTCCTCCTTCACTATCTCGTCTCCATCTATCAAAACCCAG
AAATCTGACCTCTTGCTTCTCCGCTACTACCCAAGAGCCAATCCTCGAGTCTTCTTCTTC
TTCTGAAGAGATTTCGAAAACCAGATTGATTGCTCAAAACGTTCCTTGGACCTCTACACC
CGAAGACATAAGGTCGCTCTTCGAGAAATACGGCAATGTCGTCGACGTTGAGATGTCTAT
GCACAAGAAGGAAAGGAACCGAGGTTTGGTTTTCATTGAGATGGCTTCTCCTGAAGATGC
TGCATCAGCTCTTCAAGCTCTCGAATCCTATGAATATGAGGGTCGTCGTTTGAAGGTAGC
CTATGCAAAGGCCAAGAAGAAGAAAACTTATGCTCCTCGTGAGAAGCCTACGCCGGTGCC
TACGTTCAATTTGTTTGTTGCAAACTTGGCATTTGAAGCAAGGGCCAAGCATCTTAAGGA
GTTCTTTGATGCAGACACTGGTAACGTTGTCTCCACTGAAGTTATATTCCATGAAAATCC
TAGGAGGTCGAGTGGTTACGGCTTTGTCTCTTTCAAAACCAAGAAAATGGCCGATGCTGC
GCTCCTTGAGTTCCAAGGAAAGGATTTCATGGGAAGACCAATCCGATTAGCTCGTAGCAA
ACAGTTTGTGAAGTTGCAAGCAAAA

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2B678JQ 893 0 0
CATAAGGTCGCTCTTCGAGAAATACGGCAATGTCGTCGACGTTGAGATGTCTATGCACAA
GAAGGAAAGGAACCGAGGTTTGGTTTTCATTGAGATGGCTTCTCCTGAAGATGCTGCATC
AGCTCTTCAAGCTCTCGAATCCTATGAATATGAGGGTCGTCGTTTGAAGGTAGCCTATGC
AAAGGCCAAGAAGAAGAAAACTTATGCTCCTCGTGAGAAGCCTACGCCGGTGCCTACGTT
CAATTTGTTTGTTGCAAACTTGGCATTTGAAGCAAGGGCCAAGCATCTTAAGGAGTTCTT
TGATGCAGACACTGGTAACGTTGTCTCCACTGAAGTTATATTCCATGAAAATCCTAGGAG
GTCGAGTGGTTACGGCTTTGTCTCTTTCAAAACCAAGAAAATGGCCGATGCTGCGCTCCT
TGAGTTCCAAGGAAAGGATTTCATGGGAAGACCAATCCGATTAGCTCGTAGCAAACAGTT
TGTGAAGTTGCAAGCAAAAGAAGGGTTGCAGCCACCAGATGAAGAGGAACTATCTGAGTC
TGAGACAATGACCCAAGAGGACGAAATTCCAGCTCCGGAAAACTGAGAAGGATTAGTGGT
GGTTGGGTATCGGAATTGAAGAGAAAGCTTTGAGATTTTGACAAACAAGAGAAGCGGATA
CATTGCAATTACCAACCTTAAGTAAGTGGTGGAGAAGTAAGAAGTACAGGAACGATCTAG
TTAGAACTGAAAACTACTAGCGACTGTCAAGAAACAAAACCCATGTGTCTCTAAGAACTT
GCTTTGTTAAGTTAACACAATGTTCTTATTTTTCTATTGGTTTTGATAGAAAATTTTGCA
TTTGTTACTATGTTGAATGTGTATTTATTTGGTTCCCAAAGAGCCCCACTTAC

QA 1 893 1 893
DS 

RD RR2EW90JQ 652 0 0
GCCGGTGCCTACGTTCAATTTGTTTGTTGCAAACTTGGCATTTGAAGCAAGGGCCAAGCA
TCTTAAGGAGTTCTTTGATGCAGACACTGGTAACGTTGTCTCCACTGAAGCTATATTCCA
TGAAAATCCTAGGAGGTCGAGTGGTTACGGCTTTGTCTCTTTCAAAACCAAGAAAATGGC
CGATGCTGCGCTCCTTGAGTTCCAAGGAAAGGATTTCATGGGAAGACCAATCCGATTTGC
TCGTAGCAAACAGTTTGTGAAGTTGCAAGCAAAAGAAGGGTTGCAGCCACCTGATGAAGA
GGAACTATCTGAGTCTGAGACGATGACCCAAGAGGACGAAATTCCAGCTCCGGAAAACTG
AGAAGGATTAGTGGTGGTTGGGTATCGGAATTGAAGAGAAAGCTTTGAGATTTTGACAAA
CAAGAGAAGCGGATACATTGCAATTACCAACCTTAAGTAAGTGGTGGAGAAGTAAGAAGT
ACAAGAACGATCTAGTTAGAACTGAAAACTACTAGCGACTGTCAAGAAACAAAACCCATG
TGTCTCTAAGAACTTGCTTTGTTAAGTTAACACAATGTTCTTATTTTTCTATTGGTTTTG
ATAGAAAATTTTGCATTTGTTACTATGTTGAATGTGTATTTATTTGGTTCCC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 4

CO CL1778Contig1 1593 4 3 U
GGACAAAAAAAAAACAAAAAAAACAAAAAAAATAAATAAAGATCTAGTATTAAATAAGAC
AAAATAAAAGAGAATAAAAATGGTGGGTTTGCGCAGAGCAAAGACGGTACTTCTTGTACT
AGTAGTGGCTATTTTGAACACAATAGCAAACGGGGCACCCCTTGATCCAGGACCCAAAGG
AAGCGGCGCAGCTGCACCAACAGGACCCGCAGGAAGTGGTGGAGCACTTGACGTTAAAGC
AGCAGGAGCCAAAGGAGACGGAACAACCGATGACACTGCGGCATTTTTGGCTGTATGGAA
AACAGCGTGTGAAGCAGCAGGACCGAGCACGATTACAATGCCAAAGGGTGATTATTTGGT
GAACAACATAGAGTTCTTAGGTCCGTGCAAGGGTCCTGTCACTTTGGAAATGCACGGCAA
TATGAAGGCTCCGGCTACGGTCGGTGCCACTAAGCCTAACAGCGGATGGATTGATTTTAC
AAATCTTGCTGATTTCACTTTGAATGGAAACGGAGCCATTTTTGACGGTCAAGGCTCCCT
CGCATGGAAGGCCAATGACTGCGCAAAAACTGGAAAATGCAACTCTCTCCCCATCAACAT
ACGATTCACGGGTCTCACAAACTCCAAAATTATTGGCATAACATCAACGAACAGCAAACT
TTTCCACATGAACGTTCTCAACTGCAAGAACGTAACTCTTGAGAAAATTGGTATTGATGC
ACCACCGGAGAGTCTCAACACTGATGGTATCCACATTGGAAGGTCCATCGGCGTGAACTT
ACTAGGGGCAAAGATTAAAACAGGAGATGACTGCGTTTCCATAGGAGATGGTACTGAGAA
TCTCATTGTTGAGAATGTGGAATGTGGACCGGGACACGGCATTGCCGTAGGGAGTCTAGG
AAGGTACCCTAATGAGCAACCAGTCAAAGGAGTCACAGTGAGGAAATGCCTCATCAAGAA
CACCATGAATGGTGTTCGCATCAAGACATGGCCTGGATCTCCTCCTGGTATTGCCTCCAA
CATTATTTTTGAGGATATCACGATGGACAATGTTAGCACTCCCGTTCTCATCGACCAAGA
GTACTGTCCTTATGCCGACTGCAAAGTTGGGGTACCTTCTAAGGTGAAATTGTCGGACGT
GACCTTCAAGAACATTAAGGGCACATCAGCGACAAAGATTGCTGTGAAATTAATCTGCAG
CTCAGGCACGCCTTGCACTAATGTTGCTCTTGCTGACATCAACTTGGTCCACAAAGGTGC
AGAAGGACCAGCTGTAGGGGCCTGTGCTAACATGAAGCCTGTTCTCACCGGACAGATGAT
TCCACCTGCTTGCACTGAGATTGCTAAATCGGGTCCTTGAATTTTATAGTCGCTTGTCCA
CCAAGCATCCATCTAATTAAGACACTTTGATTAACTAGACTGCGATGGAAAAGTTCTGAT
ATATCACTCTTGTATTTATAATATCTTTTTGACATATCAGTGATGTGGATATCTCTAGAG
AGAGTGACACATGACTGAGTAGTAAATTTTGTATGATTCTCAATATGCAAGAGTGCTTTA
ATATATATAATAAAATTATTAAAATTTTGAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2DH20TF U 1
AF RR2D424TF U 578
AF RR2D424JQ C 833
AF RR2DH20JQ C 913
BS 1 758 RR2DH20TF
BS 759 1203 RR2D424TF
BS 1204 1593 RR2D424JQ

RD RR2DH20TF 758 0 0
GGACAAAAAAAAAACAAAAAAAACAAAAAAAATAAATAAAGATCTAGTATTAAATAAGAC
AAAATAAAAGAGAATAAAAATGGTGGGTTTGCGCAGAGCAAAGACGGTACTTCTTGTACT
AGTAGTGGCTATTTTGAACACAATAGCAAACGGGGCACCCCTTGATCCAGGACCCAAAGG
AAGCGGCGCAGCTGCACCAACAGGACCCGCAGGAAGTGGTGGAGCACTTGACGTTAAAGC
AGCAGGAGCCAAAGGAGACGGAACAACCGATGACACTGCGGCATTTTTGGCTGTATGGAA
AACAGCGTGTGAAGCAGCAGGACCGAGCACGATTACAATGCCAAAGGGTGATTATTTGGT
GAACAACATAGAGTTCTTAGGTCCGTGCAAGGGTCCTGTCACTTTGGAAATGCACGGCAA
TATGAAGGCTCCGGCTACGGTCGGTGCCACTAAGCCTAACAGCGGATGGATTGATTTTAC
AAATCTTGCTGATTTCACTTTGAATGGAAACGGAGCCATTTTTGACGGTCAAGGCTCCCT
CGCATGGAAGGCCAATGACTGCGCAAAAACTGGAAAATGCAACTCTCTCCCCATCAACAT
ACGATTCACGGGTCTCACAAACTCCAAAATTATTGGCATAACATCAACGAACAGCAAACT
TTTCCACATGAACGTTCTCAACTGCAAGAACGTAACTCTTGAGAAAATTGGTATTGATGC
ACCACCGGAGAGTCTCAACACTGATGGTATCCACATTG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2D424TF 626 0 0
G
GCAACTCTCTCCCCATCAACATACGATTCACGGGTCTCACAAACTCCAAAATTATTGGCA
TAACATCAACGAACAGCAAACTTTTCCACATGAACGTTCTCAACTGCAAGAACGTAACTC
TTGAGAAAATTGGTATTGATGCACCACCGGAGAGTCTCAACACTGATGGTATCCACATTG
GAAGGTCCATCGGCGTGAACTTACTAGGGGCAAAGATTAAAACAGGAGATGACTGCGTTT
CCATAGGAGATGGTACTGAGAATCTCATTGTTGAGAATGTGGAATGTGGACCGGGACACG
GCATTGCCGTAGGGAGTCTAGGAAGGTACCCTAATGAGCAACCAGTCAAAGGAGTCACAG
TGAGGAAATGCCTCATCAAGAACACCATGAATGGTGTTCGCATCAAGACATGGCCTGGAT
CTCCTCCTGGTATTGCCTCCAACATTATTTTTGAGGATATCACGATGGACAATGTTAGCA
CTCCCGTTCTCATCGACCAAGAGTACTGTCCTTATGCCGACTGCAAAGTTGGGGTACCTT
CTAAGGTGAAATTGTCGGACGTGACCTTCAAGAACATTAAGGGCACATCAGCGACAAAGA
TTGCTGTGAAATTAATCTGCAGCTC

QA 2 626 2 626
DS 

RD RR2D424JQ 761 0 0
ACTGAGAATCTCATTGTTGAGAATGTGGAATGTGGACCGGGACACGGCATTGCCGTAGGG
AGTCTAGGAAGGTACCCTAATGAGCAACCAGTCAAAGGAGTCACAGTGAGGAAATGCCTC
ATCAAGAACACCATGAATGGTGTTCGCATCAAGACATGGCCTGGATCTCCTCCTGGTATT
GCCTCCAACATTATTTTTGAGGATATCACGATGGACAATGTTAGCACTCCCGTTTTCATC
GACCAAGAGTACTGTCCTTATGCCGACTGCAAAGTTGGGGTACCTTTTAAGGTGAAATTG
TCGGACGTGACCTTCAAGAACATTAAGGGCACATCAGCGACAAAGATTGCTGTGAAATTA
ATTTGCAGCTCAGGCACGCCTTGCACTAATGTTGCTCTTGCTGACATCAACTTGGTCCAC
AAAGGTGCAGAAGGACCAGCTGTAGGGGCCTGTGCTAACATGAAGCCTGTTCTCACCGGA
CAGATGATTCCACCTGCTTGCACTGAGATTGCTAAATCGGGTCCTTGAATTTTATAGTCG
CTTGTCCACCAAGCATCCATCTAATTAAGACACTTTGATTAACTAGACTGCGATGGAAAA
GTTCTGATATATCACTCTTGTATTTATAATATCTTTTTGACATATCAGTGATGTGGATAT
CTCTAGAGAGAGTGACACATGACTGAGTAGTAAATTTTGTATGATTCTCAATATGCAAGA
GTGCTTTAATATATATAATAAAATTATTAAAATTTTGAAGT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2DH20JQ 681 0 0
TGAGCAACCAGTCAAAGGAGTCACAGTGAGGAAATGCCTCATCAAGAACACCATTAATGG
TGTTCGCATCAAGACATGGCCTG*ATCTCCTCCTGGTATTGCCTCCAACATTATTTTTGA
GGATATCACGATGGACAATGTTAGCACTCCCGTTCTCATCGACCAAGAGTACTGTCCTTA
TGCCGACTGCAAAGTTGGGGTACCTTCTAAGGTGAAATTGTCGGACGTGACCTTCAAGAA
CATTAAGGGCACATCAGCGACAAAGATTGCTGTGAAATTAATCTGCAGCTCAGGCACGCC
TTGCACTAATGTTGCTCTTGCTGACATCAACTTGGTCCACAAAGGTGCAGGAGGACCAGC
TGTAGGGGCCTGTGCTAACATGAAGCCTGTTCTCACCGGACAGATGATTCCACCTGCTTG
CACTGAGATTGCTAAATCGGGTCCTTGAATTTTATAGTCGCTTGTCCACCAAGCATCCAT
CTAATTAAGACACTTTGATTAACTAGACTGCGATGGAAAAGTTCTGATATATCACTCTTG
TATTTATAATATCTTTTTGACATATCAGTGATGTGGATATCTCTAGAGAGAGTGACACAT
GACTGAGTAGTAAATTTTGTATGATTCTCAATATGCAAGAGTGCTTTAATATATATAATA
AAATTATTAAAATTTTGAAG
C

QA 1 680 1 680
DS 



AS 2 5

CO CL1779Contig1 1017 3 12 U
GGACTGAAAATTAAAAATAAAAAACAAAAAGAGGGTTGAAAAAGCGCCGTCTATCTGGAG
AATTTGTATAGACCATGAGGAGGTGAGAGTCTTCCGGAGACTGCGAAAACCCTAATTTTC
GTCCGCGAAAAAGGGTTTTTTTGGGTTCTAATCTTAACGATGGTGCATCACTCAACCGAC
GATGATTCGGAGTTGGAAGTAAGACCTGATATGCTCCTCCAACAAAGCGTCGACGCTCCC
TCCTTCTCTGGCTCACGACCCCTCCAGGATCCCGACTCTTCTTCTACCCACACCATCACT
ATCACCGTTTCTCATGACTCCTCGGAGCACCTTCTTCATCTTCCTGACCACGCCACTTTC
GGGGATGTGAAGAAAGCCCTTGTCCAGAAAACTGGGTTGGAGGCTAGTGATATGAAGATC
TTGTTCGGGGGAGATGAGAAAGATGATGACGCTGAGCTGTTGCAAGCTGCTGGTGTTATT
GAGGGTTCTAATCTTGTCCTTGTGGAGGAACCTAATGTGAGAGAGGACCATGTTGAACCG
CCTCCTGTGATGATGATGACCGAAGAGATTGCCAAGGCTATTGCTGCTGTTCAAGCAGTC
ACTCGAGAGGTCGATGAGCTCTCCGATAGGGTTGCTGCTTTAGAGGCTGCTGTGGATGGA
GGGACGATAGTTGCGGTGAAAGAGTTTGACATGACTGCTGAGCTGCTCATGAGGCAGTTG
CTCAAATTGGATGGCATTAAGGCAGATGGAGAGGCAAGAGTACATCGAAAGGCGGAGGTA
CGTAGGGTCCAAAAGTTGCAGGAGGATGTGGATACGTTGAAGGCAAGATGTTACAGAGCA
AAGCCGCAGCTGTAAGCACTGAGTGGGAATCCTTTCGGAAACGGTCTTGGAAAGCTCGAA
CCCTCCTCCGCCAGCTTTCGCTTTTGTACCAATGTAAACCAAGATTGGGAGAAATTTGAC
TGACATTTTTATTATTCTGTTACGTTGCTTAAAAAATATATTGCTTCTTTTTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH38TF U 66
AF RR2AH73TF U 1
AF RR2EH38JQ C 247
BS 1 141 RR2AH73TF
BS 142 142 RR2EH38TF
BS 143 287 RR2AH73TF
BS 288 288 RR2EH38TF
BS 289 349 RR2AH73TF
BS 350 350 RR2EH38TF
BS 351 690 RR2AH73TF
BS 691 691 RR2EH38JQ
BS 692 725 RR2AH73TF
BS 726 726 RR2EH38JQ
BS 727 737 RR2AH73TF
BS 738 1017 RR2EH38JQ

RD RR2EH38TF 505 0 0
GGATA
GACCATGAGGAGGTGGGAGTCTTCCGGAGACTGCGAAAACCCTAATTTTCGTCCGCGAAA
AAGGGTTTTTTTGGGTTCTAATCTTAACGATGGTGCATCACTCAACCGACGATGATTCGG
AGTTGGAAGTAAGACCTGATATGCTCCTCCAACAAAGCGTCGACGCTCCCTCCTTCTCTG
GCTCACGACCCCTCCAGGATCCCGACTCTTCTTCTACCCACACCATCACTATCACCGTTT
CTCATGACTCCTCGGAGCACCTTCTTCATCTTCCTGACCACGCCACTTTCGGGGATGTGA
AGAAAGCCCTTGTCCAGAAAACTGGGTTGGAGGCTAGTGATATGAAGATCTTGTTCGGGG
GAGATGAGAAAGATGATGACGCTGAGCTGTTGCAAGCTGCTGGTGTTATTGAGGGTTCTA
ATCTTGTCCTTGTGGAGGAACCTAATGTGAGAGAGGACCATGTTGAACCGCCTCCTGTGA
TGATGATGACCGAAGAGATT

QA 6 505 6 505
DS 

RD RR2AH73TF 749 0 0
GGACTGAAAATTAAAAATAAAAAACAAAAAGAGGGTTGAAAAAGCGCCGTCTATCTGGAG
AATTTGTATAGACCATGAGGAGGTGAGAGTCTTCCGGAGACTGCGAAAACCCTAATTTTC
GTCCGCGAAAAAGGGTTTTTT*GGGTTCTAATCTTAACGATGGTGCATCACTCAACCGAC
GATGATTCGGAGTTGGAAGTAAGACCTGATATGCTCCTCCAACAAAGCGTCGACGCTCCC
TCCTTCTCTGGCTCACGACCCCTCCAGGATCCCGACTCTTCTTCTACTCACACCATCACT
ATCACCGTTTCTCATGACTCCTCGGAGCACCTTCTTCATCTTCCTGACCGCGCCACTTTC
GGGGATGTGAAGAAAGCCCTTGTCCAGAAAACTGGGTTGGAGGCTAGTGATATGAAGATC
TTGTTCGGGGGAGATGAGAAAGATGATGACGCTGAGCTGTTGCAAGCTGCTGGTGTTATT
GAGGGTTCTAATCTTGTCCTTGTGGAGGAACCTAATGTGAGAGAGGACCATGTTGAACCG
CCTCCTGTGATGATGATGACCGAAGAGATTGCCAAGGCTATTGCTGCTGTTCAAGCAGTC
ACTCGAGAGGTCGATGAGCTCTCCGATAGGGTTGCTGCTTTAGAGGCTGCTGTGGATGGA
GGGACGATAGTTGCGGTGAAAGAGTTTGACCTGACTGCTGAGCTGCTCATGAGGCAGTTG
CTCAA*TTGGATGGCAT
CAAGCAGATGGA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2EH38JQ 771 0 0
TCTGGCTCACGACCCCTCCAGGATCCCGACTCTTCTTCTACCCACACCATCACTATCACC
GTTTCTCATGACTCCTCGGAGCACCTTCTTCATCTTCCTGACCACGCCACTTTCGGGGAT
GTGAAGAAAGCCCTTGTCCAGAAAACTGGGTTGGAGGCTAGTGATATGAAGATCTTGTTC
GGGGGAGATGAGAAAGATGATGACGCTGAGCTGTTGCAAGCTGCTGGTGTTATTGAGGGT
TCTAATCTTGTCCTTGTGGAGGAACCTAATGTGAGAGAGGACCATGTTGAACCGCCTCCT
GTGATGATGATGACCGAAGAGATTGCCAAGGCTATTGCTGCTGTTCAAGCAGTCACTCGA
GAGGTCGATGAGCTCTCCGATAGGGTTGCTGCTTTAGAGGCTGCTGTGGATGGAGGGACG
ATAGTTGCGGTGAAGGAGTTTGACATGACTGCTGAGCTGCTCATGAGGCAGTTGCTCAAA
TTGGATGGCATTAAGGCAGATGGAGAGGCAAGAGTACATCGAAAGGCGGAGGTACGTAGG
GTCCAAAAGTTGCAGGAGGATGTGGATACGTTGAAGGCAAGATGTTACAGAGCAAAGCCG
CAGCTGTAAGCACTGAGTGGGAATCCTTTCGGAAACGGTCTTGGAAAGCTCGAACCCTCC
TCCGCCAGCTTTCGCTTTTGTACCAATGTAAACCAAGATTGGGAGAAATTTGACTGACAT
TTTTATTATTCTGTTACGTTGCTTAAAAAATATATTGCTTCTTTTTTTTCT

QA 1 771 1 771
DS 



CO CL1779Contig2 1047 2 2 U
GGTGACCATGAGGAGGTGAGAGTCTTCCGGAGACTGCGAAAACCCTAATTTCGTTCGCGA
AAAAGGGGTTTTTGGGTTCTAATCTTAACGATGGTGCATCACTCAACCGACGATGATTCG
GAGTTGGAAGTAGGACCTGATATGCCCGTCCAACAAAGCGTCGACGCTCCCTCCTTCTCT
GACTCACGACCTCTCCAGGATCCCGACTCTTCTTCTACTCACACCATCACTATCACCGTT
TCTCATGACTCCTCGGACCACCTTCTTCATCTTCCTGACCACGCCACTTTCGGGGATGTG
AAGAAAGCCCTTGTCCAGAAAACTGAGTTGGAGGCTAGTGATATGAAGATCTTGTTCAGG
GGAGATGAGAAAGATGATGACTCTGAGCTATTGCAAGCTGCTGGTGTTATTGACGGTTCT
AGTCTTGTCCTTGAGGTAACCTAATGAGAGAGAGGACCATGTTGAACCGCCTCCTGTTAT
GATGATGACCGAAGAGATTGCCAAGGCTATTGCTGCTGTTCAAGCAGTCACTCGAGAGAT
CGATGAGCTCTCGGATAGAGTTGCTGCTTTAGAGGCTGCTGTCGATGGAGGGACGATAGT
TGCGGTGAAGGAGTTTGACATGACTGCTGAGCTGCTCATGAGGCAGTTGCTCAAATTGGA
TGGCATCAAGGCAGATGGAGAAGCTAGAGTACAGCGAAAGGCAGAGGTACGTAGGGTCCA
AAAGTCCAGGAGGATGTGGATACGTTGAAAGGCAAGATGTTACAGAGCAAAGCCGCAGCT
GTAAGCACTTAGTAGGATTCGTTCTGAAACCGGTGTTGAATGCTTGAACCCTCCTCCGCC
AGCTTTCGCTTTGTACCAATGTAAACCCAAGATTGGGAGAAATTTTACTGACATTTTTAT
TATTCTGTTACGTTTCTTAAAAAATATATTGCTTCTTTCTGTTTTCTTTTTTTTGATTAC
ATGAGTGTGACCAGAAAAATATGGTTGTATCCTGGAATGTCTGAATTTTTTGGTATCTCA
AATCTAAAAATAGTAATACATTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B456TF U 1
AF RR2B456JQ C 134
BS 1 824 RR2B456TF
BS 825 1047 RR2B456JQ

RD RR2B456TF 824 0 0
GGTGACCATGAGGAGGTGAGAGTCTTCCGGAGACTGCGAAAACCCTAATTTCGTTCGCGA
AAAAGGGGTTTTTGGGTTCTAATCTTAACGATGGTGCATCACTCAACCGACGATGATTCG
GAGTTGGAAGTAGGACCTGATATGCCCGTCCAACAAAGCGTCGACGCTCCCTCCTTCTCT
GACTCACGACCTCTCCAGGATCCCGACTCTTCTTCTACTCACACCATCACTATCACCGTT
TCTCATGACTCCTCGGACCACCTTCTTCATCTTCCTGACCACGCCACTTTCGGGGATGTG
AAGAAAGCCCTTGTCCAGAAAACTGAGTTGGAGGCTAGTGATATGAAGATCTTGTTCAGG
GGAGATGAGAAAGATGATGACTCTGAGCTATTGCAAGCTGCTGGTGTTATTGACGGTTCT
AGTCTTGTCCTTGAGGTAACCTAATGAGAGAGAGGACCATGTTGAACCGCCTCCTGTTAT
GATGATGACCGAAGAGATTGCCAAGGCTATTGCTGCTGTTCAAGCAGTCACTCGAGAGAT
CGATGAGCTCTCGGATAGAGTTGCTGCTTTAGAGGCTGCTGTCGATGGAGGGACGATAGT
TGCGGTGAAGGAGTTTGACATGACTGCTGAGCTGCTCATGAGGCAGTTGCTCAAATTGGA
TGGCATCAAGGCAGATGGAGAAGCTAGAGTACAGCGAAAGGCAGAGGTACGTAGGGTCCA
AAAGTCCAGGAGGATGTGGATACGTTGAAAGGCAAGATGTTACAGAGCAAAGCCGCAGCT
GTAAGCACTTAGTAGGATTCGTTCTGAAACCGGTGTTGAATGCT

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2B456JQ 914 0 0
GGA
CTGATATGCCCGTCCAACAAAGCGTCGACGCTCCC*CCTTCTCTGACTCACGACCTCTCC
AGGATCCCGACTCTTCTTCTACTCACACCATCACTATCACCGTTTCTCATGACTCCTCGG
ACCACCTTCTTCATCTTCCTGACCACGCCACTTTCGGGGATGTGAAGAAAGCCCTTGTCC
AGAAAACTGAGTTGGAGGCTAGTGATATGAAGATCTTGTTCAGGGGAGATGAGAAAGATG
ATGACTCTGAGCTATTGCAAGCTGCTGGTGTTATTGACGGTTCTAGTCTTGTCCTTGAGG
TAACCTAATGAGAGAGAGGACCATGTTGAACCGCCTCCTGTTATGATGATGACCGAAGAG
ATTGCCAAGGCTATTGCTGCTGTTCAAGCAGTCACTCGAGAGATCGATGAGCTCTCGGAT
AGAGTTGCTGCTTTAGAGGCTGCTGTCGATGGAGGGACGATAGTTGCGGTGAAGGAGTTT
GACATGACTGCTGAGCTGCTCATGAGGCAGTTGCTCAAATTGGATGGCATCAAGGCAGAT
GGAGAAGCTAGAGTACAGCGAAAGGCAGAGGTACGTAGGGTCCAAAAGTCCAGGAGGATG
TGGATACGTTGAA*GGCAAGATGTTACAGAGCAAAGCCGCAGCTGTAAGCACTTAGTAGG
ATTCGTTCTGAAACCGGTGTTGAATGCTTGAACCCTCCTCCGCCAGCTTTCGCTTTGTAC
CAATGTAAACCCAAGATTGGGAGAAATTTTACTGACATTTTTATTATTCTGTTACGTTTC
TTAAAAAATATATTGCTTCTTTCTGTTTTCTTTTTTTTGATTACATGAGTGTGACCAGAA
AAATATGGTTGTATCCTGGAATGTCTGAATTTTTTGGTATCTCAAATCTAAAAATAGTAA
TACATTTTTTC

QA 4 914 4 914
DS 



AS 1 5

CO CL1780Contig1 829 5 10 U
GGATCGTGAAACGTTGAAAGGCCATCAGAGCTAAGATCTCCTGCGGCGTTGTTTCTTCGG
TTTGGAAAAAAAAAAAAGGATGGGGTTGTCATTTGGGAAACTGTTCAGCAAGCTGTTTGC
GAAGAAAGAGATGCGTATTCTGATGGTGGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACCATCCT
CTACAAGCTCAAACTTGGTGAGATCGTCACCACTATCCCTACCATTGGTTTCAATGTTGA
AACTGTGGAATACAAGAACATCAGCTTTACCGTCTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGAT
CCGTCCATTGTGGAGACACTATTTCCAGAACACACAGGGACTTATCTTTGTTGTGGACAG
CAACGATCGTGACCGTGTTGTTGAAGCTAGGGACGAGCTTCACAGGATGTTGAACGAGGA
TGAGTTGAGGGATGCAGTTCTGCTTGTCTTTGCTAACAAACAAGATCTTCCCAACGCAAT
GAACGCTGCTGAGATTACTGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTCCGCCAACGACACTGGTA
CATTCAGAGCACATGTGCCACCTCTGGAGAAGGACTCTACGAGGGACTTGACTGGCTCTC
CAACAACATCGCAAACAAGGCATAGAAACATGGTACCAGGATTCCTCTTCACTTGTTTTC
TCATACCTTCTTCTTCTTCTTCAATTCTCAGTCTCAAAACTGAAAACCATATCATACTTT
GTACTTTCATTTAACAACACTATGTTTCTTTGTTTTTGTTTTTTGTTCTTCCTTAGTTGT
AAAAAAAACCTTTTGTTCCTTCTTTTTAACCGGATATTTACTTTTGGGT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC15TF U 1
AF RR2GC13TF U 4
AF RR2FB18TF U 56
AF RR2FB18JQ C 71
AF RR2FC15JQ C 97
BS 1 194 RR2FC15TF
BS 195 427 RR2GC13TF
BS 428 428 RR2FB18TF
BS 429 483 RR2GC13TF
BS 484 752 RR2FB18TF
BS 753 787 RR2FB18JQ
BS 788 788 RR2FC15JQ
BS 789 797 RR2FB18JQ
BS 798 798 RR2FC15JQ
BS 799 829 RR2FB18JQ

RD RR2FC15TF 194 0 0
GGATCGTGAAACGTTGAAAGGCCATCAGAGCTAAGATCTCCTGCGGCGTTGTTTCTTCGG
TTTGGAAAAAAAAAAAAGGATGGGGTTGTCATTTGGGAAACTGTTCAGCAAGCTGTTTGC
GAAGAAAGAGATGCGTATTCTGATGGTGGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACCATCCT
CTACAAGCTCAAAC

QA 1 194 1 194
DS 

RD RR2GC13TF 480 0 0
GG
GTGAAACGTTGAAAGGCCATCAGAGCTAAGATCTCCTGCGGCGTTGTTTCTTCGGTTTGG
AAAAAAAAAAA*GGATGGGGTTGTCATTTGGGAAACTGTTCAGCAAGCTGTTTGCGAAGA
AAGAGATGCGTATTCTGATGGTGGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACCATCCTCTACA
AGCTCAAACTTGGTGAGATCGTCACCACTATCCCTACCATTGGTTTCAATGTTGAAACTG
TGGAATACAAGAACATCAGCTTTACCGTCTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTC
CATTGTGGAGACACTATTTCCAGAACACACAGGGACTTATCTTTGTTGTGGACAGCAACG
ATCGTGACCGTGTTGTTGAAGCTAGGGACGAGCTTCACAGGATGTTGAACGAGGATGAGT
TGGGGGATGCAGTTCTGCTTGTCTTTGCTAACAAACAAGATCTTCCCAACGCAATGAA

QA 3 480 3 480
DS 

RD RR2FB18TF 697 0 0
GGGGTTTGGAA
AAAAAAAAAAAGGATGGGGTTGTCATTTGGGAAACTGTTCAGCAAGCTGTTTGCGAAGAA
AGAGATGCGTATTCTGATGGTGGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACCATCCTCTACAA
GCTCAAACTTGGTGAGATCGTCACCACTATCCCTACCATTGGTTTCAATGTTGAAATTGT
GGAATACAAGAACATCAGCTTTACCGTCTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTCC
ATTGTGGAGACACTATTTCCAGAACACACAGGGACTTATCTTTGTTGTGGACAGCAACGA
TCGTGACCGTGTTGTTGAAGCTAGGGACGAGCTTCACAGGATGTTGAACGAGGATGAGTT
GAGGGATGCAGTTCTGCTTGTCTTTGCTAACAAACAAGATCTTCCCAACGCAATGAACGC
TGCTGAGATTACTGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTCCGCCAACGACACTGGTACATTCA
GAGCACATGTGCCACCTCTGGAGAAGGACTCTACGAGGGACTTGACTGGCTCTCCAACAA
CATCGCAAACAAGGCATAGAAACATGGTACCAGGATTCCTCTTCACTTGTTTTCTCATAC
CTTCTTCTTCTTCTTCAATTCTCAGTCTCAAAACTGAAAACCATATCATACTTTGTACTT
TCATTTAACAACACTATGTTTCTTTG

QA 12 697 12 697
DS 

RD RR2FB18JQ 759 0 0
AAAAAAAGGATGGGGTTGTCATTTGGGAAACTGTTCAGCAAGCTGTTTGCGAAGAAAGAG
ATGCGTATTCTGATGGTGGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACTACCATCCTCTACAAGCTC
AAACTTGGTGAGATCGTCACCACTATCCCTACCATTGGTTTCAATGTTGAAATTGTGGAA
TACAAGAACATCAGCTTTACCGTCTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTCCATTG
TGGAGACACTATTTCCAGAACACACAGGGACTTATCTTTGTTGTGGACAGCAACGATCGT
GACCGTGTTGTTGAAGCTAGGGACGAGCTTCACAGGATGTTGAACGAGGATGAGTTGAGG
GATGCAGTTCTGCTTGTCTTTGCTAACAAACAAGATCTTCCCAACGCAATGAACGCTGCT
GAGATTACTGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTCCGCCAACGACACTGGTACATTCAGAGC
ACATGTGCCACCTCTGGAGAAGGACTCTACGAGGGACTTGACTGGCTCTCCAACAACATC
GCAAACAAGGCATAGAAACATGGTACCAGGATTCCTCTTCACTTGTTTTCTCATACCTTC
TTCTTCTTCTTCAATTCTCAGTCTCAAAACTGAAAACCATATCATACTTTGTACTTTCAT
TTAACAACACTATGTTTCTTTGTTTTTGTTTTTTGTTCTTCCTTAGTTGTAAAAAAA*CC
TTTTGTTTCTTCTTTTTAACCGGATATTTACTTTTGGGT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2FC15JQ 720 0 0
GAAACTGTTCAGCAAGCTGTTTGCGAAGAAAGAGATGCGTATTCTGATGGTGGGTCTTGA
TGCTGCTGGTAAGACTACCATCCTCTACAAGCTCAAACTTGGTGAGATCGTCACCACTAT
CCCTACCATTGGTTTCAATGTTGAAACTGTGGAATACAAGAACATCAGCTTTACCGTCTG
GGATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTCCATTGTGGAGACACTATTTCCAGAACACACA
GGGACTTATCTTTGTTGTGGACAGCAACGATCGTGACCGTGTTGTTGAAGCTAGGGACGA
GCTTCACAGGATGTTGAACGATGATGAGTTTAGGGATGCAGTTCTGCTTGTCTTTGCTAA
CAAACAAGATCTTCCCAACGCAATGAACGCTGCTGAGATTACTGACAAGCTTGGCCTTCA
CTCTCTCCGCCAACGACACTGGTACATTCAGAGCACATGTGCCACCTCTGGAGAAGGACT
CTACGAGGGACTTGACTGGCTCTCCAACAACATCGCAAACAAGGCATAGAAACATGGTAC
CAGGATTCCTCTTCACTTGTTTTCTCATACCTTCTTCTTCTTCTTCAATTCTCAGTCTCA
AAACTGAAAACCATATCATACTTTGTACTTTCATTTAACAGCACTATGTTTCTTTGTTTT
TGTTTTTTGTTCTTCCTTAGTTGTAAAAAAAACCTTTTGTTCCTTCTTTTTAACCGGATA

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 5

CO CL1781Contig1 791 5 10 U
GGACACCAAGAAGAGAGACCCTCTCTGCTTCATCTCTTTCCTCTACTCCTCTGTCTCTAG
TTTCCTCGCGCACACCGATAAGCACGAACAATGGCTTGTGTTCGTTCGATAGGATCTTTA
ACTTCTGTCACTCATTCTCCTCGGCATGTTTCACGCACCTCAGGCATTGTCATGTCTTCA
TGCTCTGCTCATCCCATCACGCCCTCCTCCTTTACTGGCTCTCCCATTTCCCTCTCTCGA
CTCCATCCACCATCTCTAACAACTCTGAGACCAAGGACTCTCGTCCCAATCACGATGATG
GTCAAACCAGCGCTCCAATTCATCCAAGGGACGGACGAGCTGACGATCCCTGACGTCAAG
CTGACTCGGTCAAGAGACGGGTCTAACGGAATGGCACTCTTCTCTTTCGACCAGCCTTCC
GTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTCGGTGAGATAACGGGATTGTACATGATTGACGAGGAA
GGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAACGCGAGATTCGTGAACGGGAAGCCAGAAGGGATA
GTGGCGAAGCACGTGATGAGGACGCCGAAAGAATGGGACAGGTTCATGAGGTTTATGGAG
CGGTACTCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAGAAGCAATGAGGTTGGGGACTATTC
TATGAGCAAAATGTGTATGTTACATTTTCAAAAAAAA*GACTATTGGTTTATAATTTCTC
TCATAGTTTTGATCATTATTTGAGTTTTCAATTCTTCAATGGTACTTTTATTAGAATGGT
ATGCCTCGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E169TF U 1
AF RR2GV86TF U 57
AF RR2GV86JQB C 417
AF RR2E169JQ C 240
AF RR2G187TF U 15
BS 1 59 RR2E169TF
BS 60 60 RR2G187TF
BS 61 646 RR2E169TF
BS 647 647 RR2GV86TF
BS 648 692 RR2E169TF
BS 693 747 RR2G187TF
BS 748 748 RR2E169JQ
BS 749 758 RR2G187TF
BS 759 759 RR2E169JQ
BS 760 791 RR2G187TF

RD RR2E169TF 692 0 0
GGACACCAAGAAGAGAGACCCTCTCTGCTTCATCTCTTTCCTCTACTCCTCTGTCTCTAT
TTTCCTCGCGCACACCGATAAGCACGAACAATGGCTTGTGTTCGTTCGATAGGATCTTTA
ACTTCTGTCACTCATTCTCCTCGGCATGTTTCACGCACCTCAGGCATTGTCATGTCTTCA
TGCTCTGCTCATCCCATCACGCCCTCCTCCTTTACTGGCTCTCCCATTTCCCTCTCTCGA
CTCCATCCACCATCTCTAACAACTCTGAGACCAAGGACTCTCGTCCCAATCACGATGATG
GTCAAACCAGCGCTCCAATTCATCCAAGGGACGGACGAGCTGACGATCCCTGACGTCAAG
CTGACTCGGTCAAGAGACGGGTCTAACGGAATGGCACTCTTCTCTTTCGACCAGCCTTCC
GTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTCGGTGAGATAACGGGATTGTACATGATTGACGAGGAA
GGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAACGCGAGATTCGTGAACGGGAAGCCAGAAGGGATA
GTGGCGAAGCACGTGATGAGGACGCCGAAAGAATGGGACAGGTTCATGAGGTTTATGGAG
CGGTACTCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAGAAGCAATGAG*TTGGGGACTATTC
TATGAGCAAAATGTGTATGTTACATTTTCAAA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2GV86TF 625 0 0
GGAG
TTTCCTCGCGCACACCGATAAGCACGAACAATGGCTTGTGTTCGTTCGATAGGATCTTTA
ACTTCTGTCACTCATTCTCCTCGGCATGTTTCACGCACCTCAGGCATTGTCATGTCTTCA
TGCTCTGCTCATCCCATCACGCCCTCCTCCTTTACTGGCTCTCCCATTTCCCTCTCTCGA
CTCCATCCACCATCTCTAACAACTCTGAGACCAAGGACTCTCGTCCCAATCACGATGATG
GTCAAGCCAGCGCTCCAATTCATCCAAGGGACGGACGAGCTGACGATCCCTGACGTCAAG
CTGACTCGGTCAAGAGACGGGTCTAACGGAATGGCACTCTTCTCTTTCGACCAGCCTTCC
GTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTCGGTGAGATAACGGGATTGTACATGATTGACGAGGAA
GGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAACGCGAGATTCGTGAACGGGAAGCCAGAAGGGATA
GTGGCGAAGCACGTGATGAGGACGCCGAAAGAATGGGACAGGTTCATGAGGTTTATGGAG
CGGTACTCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAGAAGCAATGAGGTTGGGGACTATTC
TATGAGCAAAATGTGTATGTT

QA 5 625 5 625
DS 

RD RR2GV86JQB 294 0 0
TTCCGTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTCGGTGAGATAACGGGATTGTACATGATTGACGA
GGAAGGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAACGCGAGATTCGTGAACGGGAAGCCAGAAGG
GATAGTGGCGAAGCACGTGATGAGGACGCCGAAAGAATGGGACAGGTTCATGAGGTTTAT
GGAGCGGTACTTTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAGAAGCAATGAGGTTGGGGACT
ATTTTATGAGCAAAATGTGTATGTTACATTTTCAAAAAAAA*GACTATTGGTTT

QA 1 294 1 294
DS 

RD RR2E169JQ 535 0 0
ACTCCATCCACCATCTCTAACAACTCTGAGACCAAGGACTCTCGTCCCAATCACGATGAT
GGTCAAACCAGCGCTCCAATTCATCCAAGGGACGGACGAGCTGACGATCCCTGACGTCAA
GCTGACTCGGTCAAGAGACGGGTCTAACGGAATGGCACTCTTCTCTTTCGACCAGCCTTC
CGTTTTCGACTCGAGCGGTGAGGTCGGTGAGATAACGGGATTGTACATGATTGACGAGGA
AGGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAACGCGAGATTCGTGAACGGGAAGCCAGAAGGGAT
AGTGGCGAAGCACGTGATGAGGACGCCGAAAGAATGGGACAGGTTCATGAGGTTTATGGA
GCGGTACTCTGACCAGAACGGTTTACAGTTCGTTAAGAAGCAATGAGGTTGGGGACTATT
CTATGAGCAAAATGTGTATGTTACATTTTCAAAAAAAAAGACTATTGGTTTATAATTTCT
CTCATAGTTTTGATCATTATTTGAGTTTTCAATTCTTCAATGGTACTTTTATTAG

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2G187TF 777 0 0
GG
GACCCTCTCTGCTTCATCTCTTTCCTCTACTCCTCTGTCTCTAGTTTCCTCGCGCACACC
GATAAGCACGAACAATGGCTTGTGTTCGTTCGATAGGATCTTTAACTTCTGTCACTCATT
CTCCTCGGCATGTTTCACGCCCCTCAGGCATTGTCATGTCTTCATGCTCTGCTCATCCCA
TCACGCCCTCCTCCTTTACTGGCTCTCCCATTTCCCTCTCTCGACTCCATCCACCATCTC
TAACAACTCTGAGACCAAGGACTCTCGTCCCAATCACGATGATGGTCAAACCAGCGCTCC
AATTCATCCAAGGGACGGACGAGCTGACGATCTCTGACGTCAAGCTGACTCGGTCAAGAG
ACGGGTCTAACGGAATGGCACTCTTCTCTTTCGACCAGCCTTCCGTTTTCGACTCGAGCG
GTGAGGTCGGTGAGATAACGGGATTGTACATGATTGACGAGGAAGGTGTGATTCAGTCGA
CGGATGTGAACGCGAGATTCGTGAACGGGAAGCCAGAAGGGATAGTGGCGAAGCACGTGA
TGAGGACGCCGAAA*AATGGGACAGGTTCATGAGGTTTATGGAGCGGTACTCTGACCAGA
ACGGTTTACAGTTCGTTAAGAAGCAATGAGGTTGGGGACTATTCTATGAGCAAAATGTGT
ATGTTACATTTTCAAAAAAAA*GACTATTGGTTTATAATTTCTCTCATAGTTTTGATCAT
TATTTGAGTTT*CAATTCTTCA*TGGTACTTTTATTAGAATGGTATGCCTCGTGC

QA 3 777 3 777
DS 



AS 1 4

CO CL1782Contig1 1115 4 10 U
GTTTGTGTCTGCCAACAAGCTCCCATTGGTCTCTGTTTTCACCAGAGAGAGTGCACCGGA
GATTTTCGAGAGTGCAATCAAGAAGCAGGTGTTGTTGTTTGTAACACAAAATGGATCTGA
GAAGGTTCTTCCAGAGTTTGAAGAAGCAGCAAAATCATTTAAAGGAAAGCTCATCTTTGT
ATCTGTGGATCTGGATAACGAGGACTATGGGAAGCCAGTTGCTGAATACTTTGGTGTGTC
TGGGAATGGTCCTAAACTTATTGCCTACACAGGAAATGAAGATCCTAAAAAACACTTCTT
CGATGGTGAAATCAAGTCTGATAAAATCAAGGCATTCGGGGAAGAGTTCTTGAGCGACAA
GCTAAAGCCTTTCTATAAGTCAGACCCTATTCCTGAAAAGAATGATGAAGATGTGAAAAT
CGTGGTTGGAGATAACTTTGATGACATTGTCCTGGACGAGTCCAAGGATGTTCTTCTCGA
GGTCTACGCACCATGGTGTGGCCATTGCCAAGCCCTTGAGCCAATGTATAACAAGCTTGC
TAAACATTTACGAAGCATTGACTCTCTTGTGATAGCCAAGATGGATGGAACAACCAATGA
ACATCCCAAGGCAAAGGCCGAAGGATTCCCTACAATTCTCTTCTTCCCTGCAGGAAACAA
GACCGCAGAACCGATAACTGTAGATACAGACCGCACTGTGGTTGCATTCTACAAGTTTTT
GAGGAAACACGCAACCATCCCTTTCAAACTGG*AGAAACCTGCTGCATCAACTGAATCTA
CTAAACCTGTTGAGTCCACACCAAAAGTAGAAACTACTGAGACCAAAGGCAAACCTGATA
GCACCACAAAGACTACCGAAAGTGACTCCAAGGACGAGTTGTGATCCGAAGCTAAGAAGA
AGATATATGAGTTATAGAAAACACTCTCCATAAGTTATGTTTGTCTGATCAGAATTGTTT
AATCAATGATGGAGATTTTTGAGTTATTTTAGTGTTGAGAAAGACACTTGTACTCTTTTG
ATTTGTGTTTTTGAATACCAACTTGTAGAACTGTAACACAAGGAAATAAGTTAAGTAGCA
CAATAAGATTCAATAAAAATATTTCCGTGTGAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B218TF U 1
AF RR2A074TF U 156
AF RR2A074JQ C 233
AF RR2B218JQ C 641
BS 1 411 RR2B218TF
BS 412 412 RR2A074TF
BS 413 752 RR2B218TF
BS 753 753 RR2A074TF
BS 754 828 RR2B218TF
BS 829 829 RR2A074TF
BS 830 864 RR2B218TF
BS 865 884 RR2A074TF
BS 885 1053 RR2A074JQ
BS 1054 1115 RR2B218JQ

RD RR2B218TF 864 0 0
GTTTGTGTCTGCCAACAAGCTCCCATTGGTCTCTGTTTTCACCAGAGAGAGTGCACCGGA
GATTTTCGAGAGTGCAATCAAGAAGCAGGTGTTGTTGTTTGTAACACAAAATGGATCTGA
GAAGGTTCTTCCAGAGTTTGAAGAAGCAGCAAAATCATTTAAAGGAAAGCTCATCTTTGT
ATCTGTGGATCTGGATAACGAGGACTATGGGAAGCCAGTTGCTGAATACTTTGGTGTGTC
TGGGAATGGTCCTAAACTTATTGCCTACACAGGAAATGAAGATCCTAAAAAACACTTCTT
CGATGGTGAAATCAAGTCTGATAAAATCAAGGCATTCGGGGAAGAGTTCTTGAGCGACAA
GCTAAAGCCTTTCTATAAGTCAGACCCTATTCCTGAAAAGAATGATGAAGACGTGAAAAT
CGTGGTTGGAGATAACTTTGATGACATTGTCCTGGACGAGTCCAAGGATGTTCTTCTCGA
GGTCTACGCACCATGGTGTGGCCATTGCCAAGCCCTTGAGCCAATGTATAACAAGCTTGC
TAAACATTTACGAAGCATTGACTCTCTTGTGATAGCCAAGATGGATGGAACAACCAATGA
ACATCCCAAGGCAAAGGCCGAAGGATTCCCTACAATTCTCTTCTTCCCTGCAGGAAACAA
GACCGCAGAACCGATAACTGTAGATACAGACCGCACTGTGGTTGCATTCTACAAGTTTTT
GAGGAAACACGCAACCATCCCTTTCAAACTGGGAGAAACCTGCTGCATCAACTGAATCTA
CTAAACCTGTTGAGTCCACACCAAAAGTAGAAACTACTGAGACCAAAG*CAAACCTGATA
GCACCACAAAGACTACCGAAAGTG

QA 1 864 1 864
DS 

RD RR2A074TF 745 0 0
G
ATTTAAAGGAAAGCTCATCTTTGTATCTGTGGATCTGGATAACGAGGACTATGGGAAGCC
AGTTGCTGAATACTTTGGTGTGTCTGGGAATGGTCCTAAACTTATTGCCTACACAGGAAA
TGAAGATCCTAAAAAACACTTCTTCGATGGTGAAATCAAGTCTGATAAAATCAAGGCATT
CGGGGAAGAGTTCTTGAGCGACAAGCTAAAGCCTTTCTATAAGTCAGACCCTATTCCTGA
AAAGAATGATGAAGATGTGAAAATCGTGGTTGGAGATAACTTTGATGACATTGTCCTGGA
CGAGTCCAAGGATGTTCTTCTCGAGGTCTACGCACCATGGTGTGGCCATTGCCAAGCCCT
TGAGCCAATGTATAACAAGCTTGCTAAACATTTACGAAGCATTGACTCTCTTGTGATAGC
CAAGATGGATGGAACAACCAATGAACATCCCAAGGCAAAGGCCGAAGGATTCCCTACAAT
TCTCTTCTTCCCTGCAGGAAACAAGACCGCAGAACCGATAACTGTAGATACAGACCGCAC
TGTGGTTGCATTCTACAAGTTTTTGAGGAAACACGCAACCATCCCTTTCAAACTGG*AGA
AACCTGCTGCATCAACTGAATCTACTAAACCTGTTGAGTCCACACCAAAAGTAGAAACTA
CTGAGACCAAAGGCAAACCTGATAGCACCACAAAGACTACCGAAAGTGACTCCAAGGACG
AGTTGTGA
TCCGAAGCTAAGAAGA

QA 2 729 2 729
DS 

RD RR2A074JQ 822 0 0
GGTGTGTCTGGGAATGGTCCTAAACTTATTGCCTACACAGGAAATGAAGATCCTAAAAAA
CACTTCTTCGATGGTGAAATCAAGTCTGATAAAATCAAGGCATTCGGGGAAGAGTTCTTG
AGCGACAAGCTAAAGCCTTTCTATAAGTCAGACCCTATTCCTGAAAAGAATGATGAAGAT
GTGAAAATCGTGGTTGGAGATAACTTTGATGACATTGTCCTGGACGAGTCCAAGGATGTT
CTTCTCGAGGTCTACGCACCATGGTGTGGCCATTGCCAAGCCCTTGAGCCAATGTATAAC
AAGCTTGCTAAACATTTACGAAGCATTGACTCTCTTGTGATAGCCAAGATGGATGGAACA
ACCAATGAACATCCCAAGGCAAAGGCCGAAGGATTCCCTACAATTTTCTTCTTCCCTGCA
GGAAACAAGACCGCAGAACCGATAACTGTAGATACAGACCGCACTGTGGTTGCATTCTAC
AAGTTTTTGAGGAAACACGCAACCATCCCTTTCAAACTGG*AGAAACCTGCTGCATCAAC
TGAATCTACTAAACCTGTTGAGTCCACACCAAAAGTAGAAACTACTGAGACCAAAGGCAA
ACCTGATAGCACCACAAAGACTACCGAAAGTGACTCCAAGGACGAGTTGTGATCCGAAGC
TAAGAAGAAGATATATGAGTTATAGAAAACACTCTCCATAAGTTATGTTTGTCTGATCAG
AATTGTTTAATCAATGATGGAGATTTTTGAGTTATTTTAGTGTTGAGAAAGACACTTGTA
CTCTTTTGATTTGTGTTTTTGAATACCAACTTGTAGAACTG
C

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR2B218JQ 475 0 0
TTCTTCCCTGCAGGAAACAAGACCGCAGAACCGATAACTGTAGATACAGACCGCACTGTG
GTTGCATTTTACAAGTTTTTGAGGAAACACGCAACCATCCCTTTCAAACTGG*AGAAACC
TGCTGCATCAACTGAATTTACTAAACCTGTTGAGTCCACACCAAAAGTAGAAACTACTGA
GACCAAAGGCAAACCTGATAGCACCACAAAGACTACCGAAAGTGGCTCCAAGGACGAGTT
GTGATCCGAAGCTAAGAAGAAGATATATGAGTTATAGAAAACACTCTCCATAAGTTATGT
TTGTCTGATCAGAATTGTTTAATCAATGATGGAGATTTTTGAGTTATTTTAGTGTTGAGA
AAGACACTTGTACTCTTTTGATTTGTGTTTTTGAATACCAACTTGTAGAACTGTAACACA
AGGAAATAAGTTAAGTAGCACAATAAGATTCAATAAAAATATTTCCGTGTGAAAG

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 5

CO CL1783Contig1 1092 5 6 U
ATCAAAAACTTTATTGGAAAATCAATATGATAATGATAACAAGACAAAGAATCCAAAATA
TAGCAAAACATGAAAGCAGTAGGAAACAGGATAGCATTGTTAATGAGTTTTTTTAAAGAT
CAGCAAAGACTTTGAATATGTTACCATTGATGTAATCATTCTCTACCAAACTTACCAAAT
AGTAGCTGTTCTTCACCTCCTCAAGCAAGTTTCTAGAAGGGTCAGCTTCAGGGTACAAGT
TAGCCCAGTTTCTTGACCAAGTTTCAAACGCTTCATCTTCCCAGACGTTAAAGCTAGAAG
GATCAACAATGGTTGGTTGTATAATCTCCTTAGCAGGGAAAACACCCCAAGTGACAGCAT
TCACATCAGACTGTGAAGTGTTTGACACCCAGCTTTCACCTTTGTTCATAGCTATGTAAG
TTATAGATGGCAGAGCTTTGCATATCTCAACAACTTCATCTAACTTGCCCTTTGAGCAGA
AGAACTCTAGGTAAGCCTTTTGGTATACGTATCCACCTGGACCACCCCATCCAACAGTTG
AAGAATCAGATCTCTCTGCGTTGACAGACGGCTGGCTGTTGATTGTCAAGAAGCCTTTGG
TGTTGATTTTCGCCAGCTGCTCGTTTATGATCTTTGTCTCTGGATGGAGTCCATCCAGTT
CAGACCATGGACTGCTTTTTAAGTTTCCAAGACAGAGCTCCTTGAATTTCTCATGAATAT
CTTCAACGCTTTTTAATGGGACAACCCATTCTTGTTGAAGCTTCTTGTCACGTGCTCGTG
GACGTGAGAACTGATGATCAGTGAGTGCACCGTATGAGGCACTGCGTGAATCACCCCATC
GACCTTGTGGGAAGTCTTCCCAAGCCTTGGTTCTAGAAATGTAACTCTTTGGACGGTTTG
CCCAAAAAATGGGACGCACATCTTCCTTAATACGGAAAACATTAGCAGGACGTCTCCATG
GTAAAGAACGAGAAATTTTTGACTCTTCAATCATGCCAAGATTCATCAATATTGCAAGAG
CTGATTTCTCCATGTTCAATGTATAGAGATGGAGAGACTTTATCCCATGAGCCAAGATCT
TTTTACACATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FA82JQ U 1
AF RR2G912JQ U 1
AF RR2FA34JQ U 1
AF RR2FA34TF C 323
AF RR2FA82TF C 930
BS 1 279 RR2FA34JQ
BS 280 280 RR2G912JQ
BS 281 368 RR2FA34JQ
BS 369 369 RR2G912JQ
BS 370 739 RR2FA34JQ
BS 740 1092 RR2FA34TF

RD RR2FA82JQ 160 0 0
ATCAAAAACTTTATTGGAAAATCAATATGATAATGATAACAAGACAAAGAATCCAAAATA
TAGCAAAACATGAAAGCAGTAGGAAACAGGATAGCATTGTTAATGAGTTTTTTTAAAGAT
CAGCAAAGACTTTGAATATGTTACCATTGATGTAATCATT

QA 1 160 1 160
DS 

RD RR2G912JQ 477 0 0
ATCAAAAACTTTATTGGAAAATCAATATGATAATGATAACAAGACAAAGAATCCAAAATA
TAGCAAAACATGAAAGCAGTAGGAAACAGGATAGCATTGTTAATGAGTTTTTTTAAAGAT
CAGCAAAGACTTTGAATATGTTACCATTGATGTAATCATTCTCTACCAAACTTACCAAAT
AGTAGCTGTTCTTCACCTCCTCAAGCAAGTTTCTAGAAGGGTCAGCTTCAGGGTACAAGT
TAGCCCAGTTTCTTGACCAAGTTTCAAACGCTTCATCTTCCCAGACGTTAAAGCTAGAAG
GATCAACAATGGTTGGTTGTATAATCTCCTTAGCAGGGAAAACACCCCAAGTGACAGCAT
TCACATCAGACTGTGAAGTGTTTGACACCCAGCTTTCACCTTTGTTCATAGCTATGTAAG
TTATAGATGGCAGAGCTTTGCATATCTCAACAACTTCATCTAACTTGCCCTTTGAGC

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2FA34JQ 739 0 0
ATCAAAAACTTTATTGGAAAATCAATATGATAATGATAACAAGACAAAGAATCCAAAATA
TAGCAAAACATGAAAGCAGTAGGAAACAGGATAGCATTGTTAATGAGTTTTTTTAAAGAT
CAGCAAAGACTTTGAATATGTTACCATTGATGTAATCATTCTCTACCAAACTTACCAAAT
AGTAGCTGTTCTTCACCTCCTCAAGCAAGTTTCTAGAAGGGTCAGCTTCAGGGTACAAGT
TAGCCCAGTTTCTTGACCAAGTTTCAAACGCTTCATCTTTCCAGACGTTAAAGCTAGAAG
GATCAACAATGGTTGGTTGTATAATCTCCTTAGCAGGGAAAACACCCCAAGTGACAGCAT
TCACATCAAACTGTGAAGTGTTTGACACCCAGCTTTCACCTTTGTTCATAGCTATGTAAG
TTATAGATGGCAGAGCTTTGCATATCTCAACAACTTCATCTAACTTGCCCTTTGAGCAGA
AGAACTCTAGGTAAGCCTTTTGGTATACGTATCCACCTGGACCACCCCATCCAACAGTTG
AAGAATCAGATCTCTCTGCGTTGACAGACGGCTGGCTGTTGATTGTCAAGAAGCCTTTGG
TGTTGATTTTCGCCAGCTGCTCGTTTATGATCTTTGTCTCTGGATGGAGTCCATCCAGTT
CAGACCATGGACTGCTTTTTAAGTTTCCAAGACAGAGCTCCTTGAATTTCTCATGAATAT
CTTCAACGCTTTTTAATGG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2FA34TF 770 0 0
TAATCT
CTTAGCAGAGAAAACACCCCAAGTGACAGCAT*CACATCAGACTGTGAAGTGTTTGACAC
CCAGCTTTCAC*TTTGTTCATAGCTATGTAAGTTATAGATGGCAGAGCTTTGCATATCTC
AACAACTTCATCTAACTTGCCCTTTGAGCAGAAGAACTCTAGGTAAGCCTTTTGGTATAC
GTATCCACCTGGACCACCCCATCCAACAGTTGAAGAATCAGATCTCTCTGCGTTGACAGA
CGGCTGGCTGTTGATTGTCAAGAAGCCTTTGGTGTTGATTTTCGCCAGCTGCTCGTTTAT
GATCTTTGTCTCTGGATGGAGTCCATCCAGTTCAGACCATGGACTGCTTTTTAAGTTTCC
AAGACAGAGCTCCTTGAATTTCTCATGAATATCTTCAACGCTTTTTAATGGGACAACCCA
TTCTTGTTGAAGCTTCTTGTCACGTGCTCGTGGACGTGAGAACTGATGATCAGTGAGTGC
ACCGTATGAGGCACTGCGTGAATCACCCCATCGACCTTGTGGGAAGTCTTCCCAAGCCTT
GGTTCTAGAAATGTAACTCTTTGGACGGTTTGCCCAAAAAATGGGACGCACATCTTCCTT
AATACGGAAAACATTAGCAGGACGTCTCCATGGTAAAGAACGAGAAATTTTTGACTCTTC
AATCATGCCAAGATTCATCAATATTGCAAGAGCTGATTTCTCCATGTTCAATGTATAGAG
ATGGAGAGACTTTATCCCATGAGCCAAGATCTTTTTACACATCC

QA 7 770 7 770
DS 

RD RR2FA82TF 163 0 0
ATACGGAAAACATTAGCAGGACGTCTCCATGGTAAAGAACGAGAAATTTTTGACTCTTCA
ATCATGCCAAGATTCATCAATATTGCAAGAGCTGATTTCTCCATGTTCAATGTATAGAGA
TGGAGAGACTTTATCCCATGAGCCAAGATCTTTTTACACATCC

QA 1 163 1 163
DS 



AS 1 5

CO CL1784Contig1 589 5 5 U
GGATTATCATCATAGCACAAACACATACACACTAAAGAAGAACATAATCTTTCTTTCTTT
TAATTTTTTCTTGTTCTTCTTCGTACAATCAAAGAGAAGCAGTGGAGGCAATGAAGATGA
TGGTTGTTTTCATGATCGTTGCTGTGGCTTTCTCAGCCGTAGGACAAGTGGCGGCTGCCA
CAGTGGAAGCTCCAGCTCCAAGCCCAACTTCTGATGCTACTATGTTCGTACCAGCATTGT
TTGCATCTGTTGTTGCTTTGGCCTCTGGTCTTCTCTTTTGAGCCAAAAACAACCATTTAT
CATTCATTTTTTCTCCTCTATTAATTTTGTTGTTTTTGTTAATGATTTGTGCGTGTGGTT
TGATTCTAAAGCTATAGAGTGTTGTAGTATTCTTAATTTTACCATCCGTTTCTATGTGTG
CTTTGTATGTGTCATCATCATTTTTCATTGTTTATGGATTCGTTTTATCATACAAACTAT
CCACAAATCCATGAAAGGCATCACATAACTCAATGTACAAAATATCATATTGCATTGATT
TGGGTTCACACAGAAAGATTCAATAAGAGAGAGGGGATACATTGGAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE89JQ C 7
AF RR2CE89TF U 1
AF RR2FA51JQ C 1
AF RR2FA51TF U 1
AF RR2FD60TF U 7
BS 1 11 RR2CE89TF
BS 12 12 RR2FA51TF
BS 13 374 RR2CE89TF
BS 375 469 RR2FA51TF
BS 470 589 RR2FD60TF

RD RR2CE89JQ 259 0 0
TCATTG
TAGCACAAACACATACACAGTAAAGAAGAACATAATCTTTCTTTCTTTTAATTTTTTCTT
GTTCTTCTTCGTACAATCAAAGAGAAGCAGTGGAGGCAATGAAGATGATGGTTGTTTTCA
TGATCGTTGCTGTGGCTTTTTCAGCCGTAGGACAAGTGGCGGCTGCCACAGTGGAAGCTC
CAGCTCCAAGCCCAACTTCTGATGCTACTATGTTCGTACCAGCATTGTTTGCATCTGTTG
TTGCTTTGGCCTC

QA 7 259 7 259
DS 

RD RR2CE89TF 374 0 0
GGATTATCATCGTAGCACAAACACATACACACTAAAGAAGAACATAATCTTTCTTTCTTT
TAATTTTTTCTTGTTCTTCTTCGTACAATCAAAGAGAAGCAGTGGAGGCAATGAAGATGA
TGGTTGTTTTCATGATCGTTGCTGTGGCTTTCTCAGCCGTAGGACAAGTGGCGGCTGCCA
CAGTGGAAGCTCCAGCTCCAAGCCCAACTTCTGATGCTACTATGTTCGTACCAGCATTGT
TTGCATCTGTTGTTGCTTTGGCCTCTGGTCTTCTCTTTTGAGCCAAAAACAACCATTTAT
CATTCATTTTTTCTCCTCTATTAATTTTGTTGTTTTTGTTAATGATTTGTGCGTGTGGTT
TGATTCTAAAGCTA

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR2FA51JQ 471 0 0
GGATTATC
ATCATAGCACAAACACATACACACTAAAGAAGAACATAATCTTTCTTTCTTTTAATTTTT
TCTTGTTCTTCTTCGTACAATCAAAGAGAAGCAGTGGAGGCAATGAAGATGATGGTTGTT
TTCATGATCGTTGCTGTGGCTTTCTCAGCCGTAGGACAAGTGGCGGCTGCCACAGTGGAA
GCTCCAGCTCCAAGCCCAACTTCTGATGCTACTATGTTCGTACCAGCATTGTTTGCATCT
GTTGTTGCTTTGGCCTCTGGTCTTCTCTTTTGAGCCAAAAACAACCATTTATCATTCATT
TTTTCTCCTCTATTAATTTTGTTGTTTTTGTTAATGATTTGTGCGTGTGGTTTGATTCTA
AAGCTATAGAGTGTTGTAGTATTCTTAATTTTACCATCCGTTTCTATGTGTGCTTTGTAT
GTGTCATCATCATTTTTCATTGTTTATGGATTCGTTTTATC
TT

QA 9 469 9 469
DS 

RD RR2FA51TF 471 0 0
GGATTATC
ATCATAGCACAAACACATACACACTAAAGAAGAACATAATCTTTCTTTCTTTTAATTTTT
TCTTGTTCTTCTTCGTACAATCAAAGAGAAGCAGTGGAGGCAATGAAGATGATGGTTGTT
TTCATGATCGTTGCTGTGGCTTTCTCAGCCGTAGGACAAGTGGCGGCTGCCACAGTGGAA
GCTCCAGCTCCAAGCCCAACTTCTGATGCTACTATGTTCGTACCAGCATTGTTTGCATCT
GTTGTTGCTTTGGCCTCTGGTCTTCTCTTTTGAGCCAAAAACAACCATTTATCATTCATT
TTTTCTCCTCTATTAATTTTGTTGTTTTTGTTAATGATTTGTGCGTGTGGTTTGATTCTA
AAGCTATAGAGTGTTGTAGTATTCTTAATTTTACCATCCGTTTCTATGTGTGCTTTGTAT
GTGTCATCATCATTTTTCATTGTTTATGGATTCGTTTTATC
TT

QA 9 469 9 469
DS 

RD RR2FD60TF 583 0 0
GGATCA
TAGCACAAACACATACACACTAAAGAAGAACATAATCTTTCTTTCTTTTAATTTTTTCTT
GTTCTTCTTCGTACAATCAAAGAGAAGCAATGGAGGCAATGAAGATGATGGTTGTTTTCA
TGATCGTTGCTGTGGCTTTCTCAGCCGTAGGACAAGTGGCGACTGCCACAGTGGAAGCTC
CAGCTCCAAGCCCAACTTCTGATGCTACTATGTTCGTACCAGCATTGTTTGCATCTGTTG
TTGCTTTGGCATCTGGTCTTCTCTTTTGAGCCAAAATCAACCATTTATCATTCATTTTTT
CCCCTTTATTAATTCTGTTGTTTTTGTTAATGATTTGTGCGTGTGGTTTGATTCTAAAGC
TATAGAGTGTTGTAGTATTCTTAATTTTACCATCCGTTTCTATGTGTGCTTTGTATGTAT
CATCATCATTTTTCATTGTTTATGGATTCGTTTTATCATACAAACTATCCACAAATCCAT
GAAAGGCATCACATAACTCAATGTACAAAATATCATATTGCATTGATTTGGGTTCACACA
GAAAGATTCAATAAGAGAGAGGGGATACATTGGAATT

QA 7 583 7 583
DS 



AS 1 3

CO CL1785Contig1 1211 3 19 U
GCAAAGGGAAACATATCATTGTTGCGACTGGTTCCGATGTCAAGTCTTTGCCTGGCATCA
CCATCGATGAGAAGAAGGTTGTCTCATCGACAGGAGCACTGAGATACCGAAGAAACTGAT
CGTCATTGGCGCTGGCTACATTGGTCTTGAGATGGGTTCTGTGTGGGGAAGGCTTGGTTC
AGAGGTCACTGTCGTTGAGTTTGCTTCGGATATTGTGCCCTCGATGGATGGTGAAATCCG
CAAGCAGTTCCAACGTTCGCTAGAGAAGCAGAAGATGAAGTTCATGCTCAAGACTAAAGT
TGTGGGCGTGGATTCATCAGGAGATGGTGTGAAGCTCACAGTGGAACCTGCAGAAGGTGG
AGACCAGACCACTCTCGAAGCTGATGTTGTCCTCGTCTCAGCAGGAAGATCTCCCTTCAC
ATCTGGACTTGATCTCGACAAAATAGGAGTTGAAACGGACAAAGTCGGGAGGATTCTAGT
GAACGAGAGATTCTCAACCAATGTCTCAGGCGTTTATGCTATTGGAGATGTGATTCCAGG
ACCAATGCTGGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGGTGTGGCTTGTGTTGAGTTTATAGCAGG
CAAACACGGCCATGTGGATTACGACAAGGTCCCTGGTGTTGTCTACACATATCCCGAAGT
TGCCTCTGTGGGTAAAACCGAGGAGCAGCTGAAGAAAGACGGTGTGAGCTACCGAGTTGG
GAAGTTCCCGTTCATGGCCAATAGCAGAGCAAAGGCTATAGATACAGCAGAGGGAATGGT
CAAGATTTTGGCTGATAAAGAGACAGACAAGATCTTGGGAGTTCACATTATGTCACCAAA
CGCAGGAGAGTTGATCCACGAGGCGGTTCTAGCGATCAACTATGATGCTTCTAGTGAAGA
CATTGCTAGAGTCTGTCACGCTCATCCCACCATGAGTGAGGCTATCAAGGAAGCTGCAAT
GGCTACCTACGACAAGCCCATTCACATGTAAGAAGAATCTCCACAGGTAAAATCACGGTT
TAGTTTTGGTTTTGCTTAAGCCAAATCGAGAACTTAAACCGGAGTTGTTTTGGTTATATT
TGGTTTGGTTTTATATTTTTCGGTTTAAACCTTGATTTTCTTTTTACTTTCCCGTTGATA
TGGGATGAGCTCAAAGAATATAACTTTACTACTCCTTTGTAATAATTTGAAATGCTCAAG
TAACCATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ55TF U 1
AF RR2GN56TF U 153
AF RR2FQ55JQ C 453
BS 1 180 RR2FQ55TF
BS 181 181 RR2GN56TF
BS 182 192 RR2FQ55TF
BS 193 193 RR2GN56TF
BS 194 315 RR2FQ55TF
BS 316 316 RR2GN56TF
BS 317 331 RR2FQ55TF
BS 332 332 RR2GN56TF
BS 333 339 RR2FQ55TF
BS 340 340 RR2GN56TF
BS 341 444 RR2FQ55TF
BS 445 445 RR2GN56TF
BS 446 447 RR2FQ55TF
BS 448 448 RR2GN56TF
BS 449 692 RR2FQ55TF
BS 693 834 RR2GN56TF
BS 835 835 RR2FQ55JQ
BS 836 845 RR2GN56TF
BS 846 1211 RR2FQ55JQ

RD RR2FQ55TF 698 0 0
GCAAAGGGAAACATATCATTGTTGCGACTGGTTCCGATGTCAAGTCTTTGCCTGGCATCA
CCATCGATGAGAAGAAGGTTGTCTCATCGACAGGAGCACTGAGATACCGAAGAAACTGAT
CGTCATTGGCGCTGGCTACATTGGTCTTGAGATGGGTTCTGTGTGGGGAAGGCTTGGTTC
TGAGGTCACTGTTGTTGAGTTTGCTTCGGATATTGTGCCCTCGATGGATGGTGAAATCCG
CAAGCAGTTCCAACGTTCGCTAGAGAAGCAGAAGATGAAGTTCATGCTCAAGACTAAAGT
TGTGGGCGTGGATTCCTCAGGAGATGGTGTGGAGCTCACGGTGGAACCTGCAGAAGGTGG
AGACCAGACCACTCTCGAAGCTGATGTTGTCCTCGTCTCAGCAGGAAGATCTCCCTTCAC
ATCTGGACTTGATCTCGACAAAATCGGTGTTGAAACGGACAAAGTCGGGAGGATTCTAGT
GAACGAGAGATTCTCAACCAATGTCTCAGGCGTTTATGCTATTGGAGATGTGATTCCAGG
ACCAATGCTGGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGGTGTGGCTTGTGTTGAGTTTATAGCAGG
CAAACACGGCCATGTGGATTACGACAAGGTCCCTGGTGTTGTCTACACATATCCCGAAGT
TGCCTCTGTGGGTAAAACCGAGGAGCAGCTGA
GAAAGA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2GN56TF 704 0 0
G
GGGTTCTGTGTGGGGAAGGCTTGGTTCAGAGGTCACTGTCGTTGAGTTTGCTTCGGATAT
TGTGCCCTCGATGGATGGTGAAATCCGCAAGCAGTTCCAACGTTCGCTAGAGAAGCAGAA
GATGAAGTTCATGCTCAAGACTAAAGTTGTTGGCGTGGATTCATCAGGAGATGGTGTGAA
GCTCACAGTGGAACCTTCAGAAGGTGGAGACCAGACCACTCTCGAAGCTGATGTTGTCCT
CGTCTCAGCAGGAAGATCTCCCTTCACATCTGGACTTGATCTTGAGAAAATAGGAGTTGA
AACGGACAAAGTCGGGAGGATTCTAGTGAACGAGAGGTTCTCAACCAATGTTTCAGGCGT
TTATGCTATTGGAGATGTGATTCCAGGACCAATGCTGGCTCACAAAGCTGAAGAAGACGG
TGTGGCTTGTGTTGAGTTTATAGCAGGCAAACACGGCCACGTGGATTACGACAAGGTCCC
TGGTGTTGTCTACACCTATCCCGAAGTTGCCTCTGTTGGTAAAACCGAGGAGCAGCTGAA
GAAAGACGGTGTGAGCTACCGAGTTGGGAAGTTCCCGTTCATGGCCAATAGCAGAGCAAA
GGCTATAGATACAGCAGAGGGAATGGTCAAGATTTTGGCTGATAAAGAGACAGACAAGAT
CTTGGGAGTTCACATTATGTCCCCAAACGCAG
AGAGTGATCCA

QA 2 693 2 693
DS 

RD RR2FQ55JQ 759 0 0
AAACGGACAAAGTCGGGAGGATTCTAGTGAACGAGAGATTCTCAACCAATGTCTCAGGCG
TTTATGCTATTGGAGATGTGATTCCAGGACCAATGCTGGCTCACAAAGCTGAAGAAGACG
GTGTGGCTTGTGTTGAGTTTATAGCAGGCAAACACGGCCATGTGGATTACGACAAGGTCC
CTGGTGTTGTCTACACATATCCCGAAGTTGCCTCTGTGGGTAAAACCGAGGAGCAGCTGA
AGAAAGACGGTGTGAGCTACCGAGTTGGGAAGTTCCCGTTCATGGCCAATAGCAGAGCCA
AGGCTATAGATACAGCAGAGGGAATGGTCAAGATTTTGGCTGATAAAGAGACAGACAAGA
TCTTGGGAGTTCACATTATGTCACCAAACGCAGGAGAGTTGATCCACGAGGCGGTTCTAG
CGATCAACTATGATGCTTCTAGTGAAGACATTGCTAGAGTCTGTCACGCTCATCCCACCA
TGAGTGAGGCTATCAAGGAAGCTGCAATGGCTACCTACGACAAGCCCATTCACATGTAAG
AAGAATCTCCACAGGTAAAATCACGGTTTAGTTTTGGTTTTGCTTAAGCCAAATCGAGAA
CTTAAACCGGAGTTGTTTTGGTTATATTTGGTTTGGTTTTATATTTTTCGGTTTAAACCT
TGATTTTCTTTTTACTTTCCCGTTGATATGGGATGAGCTCAAAGAATATAACTTTACTAC
TCCTTTGTAATAATTTGAAATGCTCAAGTAACCATTTTT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 3

CO CL1786Contig1 808 3 22 U
GAGGAGAACAGTAGGAAGAGAAATAAAGATTGTCTAAGATGGTACAATGCATGAACAAAA
AACAAAGAGTAACGTAACCCCTAAACTTCCTCAAAGACAAACTTAAAACTCTTTAAAAAC
GCAAAAAGCTGAAGTCTATCAAAACAGAAAAGGAGCCAAAAAGGCTCTCTTTTAGTTCTT
CTTGCTCTTTGATTTCCCAGACAATGTCTTGGCCAAATGAGTTCCCTCGAGCCACTCGTC
CAGTGATGCGTCGACAGACCTTGTTCCTACTTCCACCTTTGACACCTTTTTGGTTTTCTT
AGTGAGACGCTGAACTTGGCTGTAAGCCCATAGACCGAGGAGGAGGAGGAGAGCAATCCC
AAGTGTGATAAGGAAGACAGACTCACCGCTGAGAAGACCTCCAGATTCAACCACCTCAAT
GGTTCCATTGTAGAAGACATTCTGGTATGCCTTGCCTTCCACGTCGTAGATGACATAACC
CACCAGATCAAATGCTCCAGGCTGCAGGTACTGGCTGACAGCAAAGACGTAGGAGAATGT
TGCTTGAACAGAAAATGGGATGGAGGCATTGTTGATTCTCAGGACGGTAAGATTCTGAAC
CAACATCTTATGATCATAAGGAAGATGGACGCTGGCCCTAATTCCCATCACACCAACTCT
AGATTTCCCATCATTTCTGAGAGCAACAACGAGCTCAGTATCTTCTCCAGCTATAACCAA
TCTGCCACTGTTTTGGGGGAAAACAGAGACAGTCTCAACTCCTGGAGCTGAGGTCAAGTT
GAGATCCAAGTCCTGGTCATCTTCCTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 0 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX61JQ U 1
AF RR2C045JQ U 38
AF RR2G334TF C 323
BS 1 62 RR2AX61JQ
BS 63 63 RR2C045JQ
BS 64 64 RR2AX61JQ
BS 65 68 RR2C045JQ
BS 69 80 RR2AX61JQ
BS 81 81 RR2C045JQ
BS 82 122 RR2AX61JQ
BS 123 123 RR2C045JQ
BS 124 139 RR2AX61JQ
BS 140 141 RR2C045JQ
BS 142 143 RR2AX61JQ
BS 144 144 RR2C045JQ
BS 145 145 RR2AX61JQ
BS 146 146 RR2C045JQ
BS 147 147 RR2AX61JQ
BS 148 148 RR2C045JQ
BS 149 425 RR2AX61JQ
BS 426 426 RR2C045JQ
BS 427 582 RR2AX61JQ
BS 583 583 RR2C045JQ
BS 584 768 RR2AX61JQ
BS 769 808 RR2G334TF

RD RR2AX61JQ 768 0 0
GAGGAGAACAGTAGGAAGAGAAATAAAGATTGTCTAAGATGGTACAATGCATGAACAAAA
AAGA***GGTAACGTAACCC*TAAACTTCCTCAAAGACAAACTTAAAACTCTTTAAAAAC
GCCAAAAGCTGAAGTCTAT**AAGCTGTAAAGGAGCCAAAAAGGCTCTCTTTTAGTTCTT
CTTGCTCTTTGATTTCCCAGACAATGTCTTGGCCAAATGAGTTCCCTCGAGCCACTCGTC
CAGTGATGCGTCGACAGACCTTGTTCCTACTTCCACCTTTGACACCTTTTTGGTTTTCTT
AGTGAGACGCTGAACTTGGCTGTAAGCCCATAGACCGAGGAGGAGGAGGAGAGCAATCCC
AAGTGTGATAAGGAAGACAGACTCACCGCTGAGAAGACCTCCAGATTCAACCACCTCAAT
GGTTCAATTGTAGAAGACATTCTGGTATGCCTTGCCTTCCACGTCGTAGATGACATAACC
CACCAGATCAAATGCTCCAGGCTGCAGGTACTGGCTGACAGCAAAGACGTAGGAGAATGT
TGCTTGAACAGAAAATGGGATGGAGGCATTGTTGATTCTCAGCACGGTAAGATTCTGAAC
CAACATCTTATGATCATAAGGAAGATGGACGCTGGCCCTAATTCCCATCACACCAACTCT
AGATTTCCCATCATTTCTGAGAGCAACAACGAGCTCAGTATCTTCTCCAGCTATAACCAA
TCTGCCACTGTTTTGGGGGAAAACAGAGACAGTCTCAACTCCTGGAGC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2C045JQ 717 0 0
GATGGTACAATGCATGAACAAAAAACAAAGAGTAACGTAACCCCTAAACTTCCTCGA*GC
TGAACTTAAAACTCTTTCAAAA*GCAAAAAGCTGAAGTCTATCAAAACAGAAAAGGAGCC
AAAAAGGCTCT*TTTTAGTTCTTCTTGCTCTTTGATTTCCCAGACAATGTCTTGGCCAAA
TGAGTTCCCTCGAGCCACTCGTCCAGTGATGCGTCGACAGACCTTGTTCCTACTTCCACC
TTTGACACCTTTTTGGTTTTCTTAGTGAGACGCTGAACTTGGCTGTATGCCCATAGACCG
AGGAGGAGGAGGAGAGCAATCCCAAGTGTGATAAGGAAGACAGACTCACCGCTGAAAAGA
CCTCCAGATTCAACCACCTCAATGGTTCCATTGTAAAAGACATTCTGGTATGCCTTGCCT
TCCACGTCGTAAATGACATAACCCACCAGATCAAATGCTCCAGGCTGCAGGTACTGGCTG
ACAGCAAAGACGTAGGAAAATGTTGCTTGAACAGAAAATGGGATGGAGGCATTGTTGATT
CTCAGGACGGTAAGATTCTGAACCAACATCTTATGATCATAAGGAAGATGGACGCTGGCC
CTAATTCCCATCACACCAACTCTAGATTTCCCATCATTTCTGAGAGCAACAACGAGCTCA
GTATCTTCTCCAGCTATAACCAATCTGCCACTGTTTTGGGGGAAAACAGAGACAGTC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2G334TF 486 0 0
GTATG
CCATAGACCGAGGAGGAGGAGGAGAGCAATCCCAAGTGTGATAAGGAAGACAGACTCACC
GCTGAGAAGACCTCCAGATTCAACCACCTCAATGGTTCCATTGTAGAAGACATTCTGGTA
TGCCTTGCCTTCCACGTCGTAGACGACATAACCCACCAGATCAAATGCTCCAGGCTGCAG
GTACTGGCTGACAGCAAAGACGTAGGAGAATGTTGCTTGAACAGAAAATGGGATGGAGGC
ATTGTTGATTCTCAGGACGGTAAGATTCTGAACCAACATCTTATGATCATAAGGAAGATG
GACGCTGGCCCTAATTCCCATCACACCAACTCTAGATTTCCCATCATTTCTGAGAGCAAC
AACGAGCTCAGTATCTTCTCCAGCTATAACCAATCTGCCACTGTTTTGGGGGAAAACAGA
GACAGTCTCAACTCCTGGAGCTGAGGTCAAGTTGAGATCCAAGTCCTGGTCATCTTCCTC
A

QA 6 486 6 486
DS 



AS 1 5

CO CL1787Contig1 705 5 3 U
GGATTTTCTTACATTCATATCACCAACTATGGCTGGCCGTGACGTTCTCCTCCTCTCCCT
CCCCGTCATCATCACCCTATCTGTCGTTGCATTCGCCGACCGTGAACCACACTGCGTCTA
CACATTCTACATCGAAACCGGACCGGTGGAAAATGCCGGCACAGATTCTATCATAAGCGT
TAAAATCTCCGACAATTCGGGACAGGACATTGATATCCCAGACATAGTGACATGGGGTGG
GTTAATGGGACCAAGTTACGACTACTTCGAGAGAGGCAATTTGGACATTTTCAGTGGTAA
GGCGCAGTGTCTTCCTAGCCTAGTCTGTTCACTGAGTCTGACCTCAGACGGCTCCGGCGA
TTACCCGGCCTGGTTTGTTAACTACGTGGACGTCACGACGGTCAGTGTTCATTTAAAGAG
TGAACATCAATACTTTGATGTGGAGCAATGGCTTGCGACCGATACGCCGCCGTATAATCT
CACTGCCGTGCGGAACAACTGCCAGGTTTCTCCTATCGGTAGGGTCGGGTCTGAGATCCG
GAAGAGTCTCTCCTAGGATCGTGTTGTAAATCAATGTGTGGGAGATTTGTGTTAATGTGT
GGCTGCGATGCCGATAATGTAAACGATCCGATCGAATAAAAGTGTCATCTCTGAACATTT
GATAGAGTAATGTAAAATGATCTGATCGAATAAATCATACATATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS77JQ C 1
AF RR2BS77TF U 8
AF RR2EC67JQ C 114
AF RR2EC67TF U 11
AF RR2D458TF U 9
BS 1 12 RR2BS77JQ
BS 13 688 RR2BS77TF
BS 689 705 RR2D458TF

RD RR2BS77JQ 688 0 0
GGATTTTCTTACATTCATATCACCAACTATGGCTGGCCGTGACGTTCTCCTCCTCTCCCT
CCCCGTCATCATCACCCTATCTGTCGTTGCATTCGCCGACCGTGAACCACACTGCGTCTA
CACATTTTACATCGAAACCGGACCGGTGGAAAATGCCGGCACAGATTTTATCATAAGCGT
TAAAATTTCCGACAATTCGGGACAGGACATTGATATCCCAGACATAGTGACATGGGGTGG
GTTAATGGGACCAAGTTACGACTACTTCGAGAGAGGCAATTTGGACATTTTCAGTGGTAA
GGCGCAGTGTCTTCCTAGCCTAGTCTGTTCACTGAGTTTGACCTCAGACGGCTCCGGCGA
TTACCCGGCCTGGTTTGTTAACTACGTGGACGTCACGACGGTCAGTGTTCATTTAAAGAG
TGAACATCAATACTTTGATGTGGAGCAATGGCTTGCGACCGATACGCCGCCGTATAATCT
CACTGCCGTGCGGAACAACTGCCAGGTTTCTCCTATCGGTAGGGTCGGGTTTGAGATCCG
GAAGAGTCTCTCCTAGGATCGTGTTGTAAATCAATGTGTGGGAGATTTGTGTTAATGTGT
GGCTGCGATGCCGATAATGTAAACGATCCGATCGAATAAAAGTGTCATCTCTGAACATTT
GATAGAGTAATGTAAAATGATCTGATCG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2BS77TF 687 0 0
CTTAC
ATTCATATCACCAACTATGGCTGGCCGTGACGTTCTCCTCCTCTCCCTCCCCGTCATCAT
CACCCTATCTGTCGTTGCATTCGCCGACCGTGAACCACACTGCGTCTACACATTCTACAT
CGAAACCGGACCGGTGGAAAATGCCGGCACAGATTCTATCATAAGCGTTAAAATCTCCGA
CAATTCGGGACAGGACATTGATATCCCAGACATAGTGACATGGGGTGGGTTAATGGGACC
AAGTTACGACTACTTCGAGAGAGGCAATTTGGACATTTTCAGTGGTAAGGCGCAGTGTCT
TCCTAGCCTAGTCTGTTCACTGAGTCTGACCTCAGACGGCTCCGGCGATTACCCGGCCTG
GTTTGTTAACTACGTGGACGTCACGACGGTCAGTGTTCATTTAAAGAGTGAACATCAATA
CTTTGATGTGGAGCAATGGCTTGCGACCGATACGCCGCCGTATAATCTCACTGCCGTGCG
GAACAACTGCCAGGTTTCTCCTATCGGTAGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGAGTCTCTC
CTAGGATCGTGTTGTAAATCAATGTGTGGGAGATTTGTGTTAATGTGTGGCTGCGATGCC
GATAATGTAAACGATCCGATCGAATAAAAGTGTCATCTCTGAACATTTGATAGAGTAATG
TAAAATGATCTGATCG
AAAAAA

QA 6 681 6 681
DS 

RD RR2EC67JQ 575 0 0
GCGTCTACACATTCTACATCGAAACCGGACCGGTGGAAAATGCCGGCACAGATTCTATCA
TAAGCGTTAAAATCTCCGACAATTCGGGACAGGACATTGATATCCCAGACATAGTGACAT
GGGGTGGGTCAATGGGACCAAGTTACGACTACTTCGAGAGAGGCAATTTGGACATTTTCA
GTGGTAAGGCGCAGTGTCTTCCTAGCCTAGTCTGTTCACTGAGTCTGACCTCAGACGGCT
CCGGCGATTACCCGGCCTGGTTTGTTAACTACGTGGACGTCACGACGGTCAGTGTTCATT
TAAAGAGTGAACATCAATACTTTGATGTGGAGCAATGGCTTGCGACCGATACGCCGCCGT
ATAATCTCACTGCCGTGCGGAACAACTGCCAGGTTTCTCCTATCGGTAGGGTCGGGTCTG
AGATCCGGAAGAGTCTCTCCTAGGATCGTGTTGTAAATCAATGTGTGGGAGATTTGTGTT
AATGTGTGGCTGCGATGCCGATAATGTAAACGATCCGATCGAATAAAGGTGTCATCTCTG
AACATTTGATAGAGTAATGTAAAATGATCTGATCG

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2EC67TF 678 0 0
GG
ATTCATATCACCAACTATGGCTGGCCGTGACGTTCTCCTCCTCTCCCTCCTCGTCATCAT
CACCCTATCTGTCGATGCATTCGCCGACCGTGAACCACACTGCGTCTACACATTCTACAT
CGAAACCGGACCGGTGGAAAATGCCGGCACAGATTCTATCATAAGCGTTAAAATCTCCGA
CAATTCGGGACAGGACATTGATATCCCAGACATAGTGACATGGGGTGGGTCAATGGGACC
AAGTTACGACTACTTCGAGAGAGGCAATTTGGACATTTTCAGTGGTAAGGCGCAGTGTCT
TCCTAGCCTAGTCTGTTCACTGAGTCTGACCTCAGACGGCTCCGGCGATTACCCGGCCTG
GTTTGTTAACTACGTGGACGTCACGACGGTCAGTGTTCATTTAAAGAGTGAACATCAATA
CTTTGATGTGGAGCAATGGCTTGCGACCGATACGCCGCCGTATAATCTCACTGCCGTGCG
GAACAACTGCCAGGTTTCTCCTATCGGTAGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGAGTCTCTC
CTAGGATCGTGTTGTAAATCAATGTGTGGGAGATTTGTGTTAATGTGTGGCTGCGATGCC
GATAATGTAAACGATCCGATCGAATAAAGGTGTCATCTCTGA*CATTTGATAGAGTAATG
TAAAATGATCTGATCG

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR2D458TF 697 0 0
GGAC
ATTCATATCACCAACTATGGCTGGCCGTGACGTTCTCCTCCTCTCCCTCCTCGTCATCAT
CACCCTATCTGTCGTTGCATTCGCCGACCGTGAACCACACTGCGTCTACACATTCTACAT
CGAAACCGGACCGGTGGAAAATGCCGGCACAGATTCTATCATAAGCGTTAAAATCTCCGA
CAATTCGGGACAGGACATTGATATCCCAGACATAGTGACATGGGGTGGGTTAATGGGACC
AAGTTACGACTACTTCGAGAGAGGCAATTTGGACATTTTCAGTGGTAAGGCGCAGTGTCT
TCCTAGCCTAGTCTGTTCACTGAGTCTGACCTCAGACGGCTCCGGCGATTACCCGGCCTG
GTTTGTTAACTACGTGGACGTCACGACGGTCAGTGTTCATTTAAAGAGTGAACATCAATA
CTTTGATGTGGAGCAATGGCTTGCGACCGATACGCCGCCGTATAATCTCACTGCCGTGCG
GAACAACTGCCAGGTTTCTCCTATCGGTAGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGAGTCTCTC
CTAGGATCGTGTTGTAAATCAATGTGTGGGAGATTTGTGTTAATGTGTGGCTGCGATGCC
GATAATGTAAACGATCCGATCGAATAAAAGTGTCATCTCTGAACATTTGATAGAGTAACG
TAAA*TGATCTGATCGAATAAATCATACATATA

QA 5 697 5 697
DS 



AS 1 4

CO CL1788Contig1 478 4 3 U
GGCATATCAAAGAAAAACACTCAAAAACTTATTCCAATTCTCTTATAAAAATGTGGACCA
ACAAGTTTTTCTTCCTTCTTGCAGTTGCATGCATGGCTGTGTTAAGTACAGCTCAAACGT
TGCCTTCGATACCTGGACAGGACCCAGCAGACTGTTTGTCATCGTTGGAAGTTATTCCCA
ACTGTATCTCAGAAATTTTCGGATCAATAATAAGTGGACATATCGGGACTGTTGGTCACT
CTTGCTGCCATGCCTTTTTGGTTCTTAATGCAGATTGTATTACGCAGACGTTTGCCTTTG
CTCCCCTCTTCCCTCCGAGTCTAAGGGATCATTGTTCCAAACAATCTTTACCATAATTAT
TCTACATGTTCTAGGTCATAATTATCAAATAGTGTTATTTTTCTGCTTAAATAACAACTC
TTAATTTCCACGTAAACCCATGTGACCATCGTTATCCATATTTCATGTTGATATAACC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2ER72JQ C 1
AF RR2ER72TF U 1
AF RR2FL54TF U 2
AF RR2FX81TF U 118
BS 1 3 RR2ER72JQ
BS 4 475 RR2ER72TF
BS 476 478 RR2FL54TF

RD RR2ER72JQ 476 0 0
GGCATATCAAAGAAAAACACTCAAAAACTTATTCCAATTCTCTTATAAAAATGTGGACCA
ACAAGTTTTTCTTCCTTCTTGCAGTTGCATGCATGGCTGTGTTAAGTACAGCTCAAACGT
TGCCTTCGATACCTGGACAGGACCCAGCAGACTGTTTGTCATCGTTGGAAGTTATTCCCA
ACTGTATCTCAGAAATTTTCGGATCAATAATAAGTGGACATATCGGGACTGTTGGTCACT
CTTGCTGCCATGCCTTTTTGGTTCTTAATGCAGATTGTATTACGCAGACGTTTGCCTTTG
CTCCCCTCTTCCCTCCGAGTCTAAGGGATCATTGTTCCAAACAATCTTTACCATAATTAT
TCTACATGTTCTAGGTCATAATTATCAAATAGTGTTATTTTTCTGCTTAAATAACAACTC
TTAATTTCCACGTAAACCCATGTGACCATCGTTATCCATATTTCATGTTGATATA
G

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2ER72TF 476 0 0
GGC
ATATCAAAGAAAAACACTCAAAAACTTATTCCAATTCTCTTATAAAAATGTGGACCAACA
AGTTTTTCTTCCTTCTTGCAGTTGCATGCATGGCTGTGTTAAGTACAGCTCAAACGTTGC
CTTCGATACCTGGACAGGACCCAGCAGACTGTTTGTCATCGTTGGAAGTTATTCCCAACT
GTATCTCAGAAATTTTCGGATCAATAATAAGTGGACATATCGGGACTGTTGGTCACTCTT
GCTGCCATGCCTTTTTGGTTCTTAATGCAGATTGTATTACGCAGACGTTTGCCTTTGCTC
CCCTCTTCCCTCCGAGTCTAAGGGATCATTGTTCCAAACAATCTTTACCATAATTATTCT
ACATGTTCTAGGTCATAATTATCAAATAGTGTTATTTTTCTGCTTAAATAACAACTCTTA
ATTTCCACGTAAACCCATGTGACCATCGTTATCCATATTTCATGTTGATATA
G

QA 4 475 4 475
DS 

RD RR2FL54TF 477 0 0
GG
ATATCAAAGAAAAACACTCAAAAACTTATTCCAATTCTCTTATAAAAATGTGGACCAACA
AGTTTTTCTTCCTTCTTGCAGTTGCATGCATGGCTGTGTTAAGTACAGCTCAAACGTTGC
CTTCGATACCTGGACAGGACCCAGCAGACTGTTTGTCATCGTTGGAAGTTATTCCCAACT
GTATCTCAGAAATTTTCGGATCAATAATAAGTGGACATATCGGGACTGTTGGTCACTCTT
GCTGCCATGCCTTTTTGGTTCTTAATGCAGATTGTATTACGCAGACGTTTGCCTTTGCTC
CCCTCTTCCCTCCGAGTCTAAGGGATCATTGTTCCAAACAATCTTTGCCATAATTATTCT
ACATGTTCTAGGTCATAATTATCAAATAGTGTTATGTTTCTGCTTAAATAACAACTCTTA
ATTTCCATGTAAACCCATGTGACCATCGTTATCCATATTTCATGTTGATATAACC

QA 3 477 3 477
DS 

RD RR2FX81TF 316 0 0
G
GTTGCCTTCGATACCTGGACAGGACCCAGCAGACTGTTTGTCATCGTTGGAAGTTATTCC
CAACTGTATCTCAGAAATTTTCGGATCAATAATAAGTGGACATATCGGGACTGTTGGTCA
CTCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGTTCTTAATGCAGATTGTATTACGCAGACGTTTGCCTT
TGCTCCCCTCTTCCCTCCGAGTCTAAGGGATCATTGTTCCAAACAATCTTTGCCATAATT
ATTCTACATGTTCTAGGTCATAATTATCAAATAGTGTTATGTTTCTGCTTAAATAACAAC
TCTTAATTTCCA
TGT

QA 2 313 2 313
DS 



AS 1 5

CO CL1789Contig1 793 5 3 U
GGGGGTCGAGAAAAAAATAAGAGGTTTGCAGATTCTATCTCTCGATCTCTCGTCCAAGTC
TCTTTTCTGCACATTTATATTTTCCAACAATGGCCGAGTTTGCGGAAGGAGAATTGGTCG
AAGTATGCCTCAAAGAAGATGGTTACTTCGGGTCATTCTTTGAGGCCAAGGTATTGTCCA
AGCTTCACGATGGAACTTTCTACGAGGTTGAGTACAAGAACCTTATCACTGAAGGCGAAA
ACCCTCAGCCGTTGGTTGAAACCATCTCCGTCGACGACATCCGTCCGATGCCACCTACAT
TGCCCCAGCCGTCCACGTTTAGCCTCCATGAGAAGGTTGATGCTTTTGACTTAGACGCGT
GGTGGTACGGAGAGATCTACGGTTATGACGGCGAGACGTACTACGTTCACTTCCCAACGA
CCAAACATTTGTGCGAGTACCCACTTCAAAGCCTCAGAAAGCATCTCGAATTTGTTGACG
GTGAATGGGTTCCTTCAGCAATGTCAACAAGGAGGCGTTGAGCTTCTTAGATTCTCCGAT
GTTTCTTGGTCACTAGCTATTGTTCTTAATAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAACACTTT
TTATATCGGTTTCCAGAAAACCGTTGCTCTGTTTTTAAGACGTCCAAATAAACTAGGGAA
ACGACTTCTAGAACAAATCGTTAGCCCTAGAAAGTTTGATCATTTTGTAATCAATGCACA
GCCACTTGTTTTGCTGTTGCTTTCACAATGAATGTTGTATTCAAACTATGTTATTCGATT
ACTCTGTTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK66TF U 3
AF RR2D210TF U 1
AF RR2CV58TF U 3
AF RR2CB30TF U 252
AF RR2CV58JQ C 5
BS 1 751 RR2D210TF
BS 752 764 RR2CB30TF
BS 765 793 RR2CV58JQ

RD RR2CK66TF 675 0 0
GGGTCGAGA
AAAAAATAAGAGGTTTGCAGATTCTATCTCTCGATCTCTCGCCCAAGTCTCTTTTCTGCA
CATTTATATTTTCCAACAATGGCCGAGTTTGCGGAAGGAGAATTGGTCGAAGTATGCCTC
AAAGAAGATGGTTACTTCGGGTCATTCTTTGAGGCCGAGGTATTGTCCAAGCTTCACGAT
GGAACTTTCTACGAGGTTGAGTACAAGAACCTTATCACTGAAGGCGAAAACCCTCAGCCG
TTGGTTGAAACCATCTCCGTCGACGACATCCGTCCGATGCCACCTACATTGCCCCAGCCG
TCCACGTTTAGCCTCCATGAGAAGGTTGATGCTTTTGACTTAGACGCGTGGTGGTACGGA
GAGATCTACGGCTATGACGGCGAGACGTACTACGTTCACTTCCCAACGACCAAACATTTG
TGCGAGTACCCACTTCAAAGCCTCAGAAAGCATCTCGAATTTGTTGACGGTGAATGGGTT
CCTTCAGCAATGTCAACAAGGAGGCGTTGAGCTTCTTAGATTCTCCGATGTTTCTTGGTC
ACTAGCTATTGTTCTTAATAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAACACTTTTTATATCGGTT
TCCAGAAAACCGTTGCTCTGTTTTTA*GACGTCCAAATAAACTAGG*AAACGACTTCTAG
AACAAA

QA 10 675 10 675
DS 

RD RR2D210TF 751 0 0
GGGGGTCGAGAAAAAAATAAGAGGTTTGCAGATTCTATCTCTCGATCTCTCGTCCAAGTC
TCTTTTCTGCACATTTATATTTTCCAACAATGGCCGAGTTTGCGGAAGGAGAATTGGTCG
AAGTATGCCTCAAAGAAGATGGTTACTTCGGGTCATTCTTTGAGGCCAAGGTATTGTCCA
AGCTTCACGATGGAACTTTCTACGAGGTTGAGTACAAGAACCTTATCACTGAAGGCGAAA
ACCCTCAGCCGTTGGTTGAAACCATCTCCGTCGACGACATCCGTCCGATGCCACCTACAT
TGCCCCAGCCGTCCACGTTTAGCCTCCATGAGAAGGTTGATGCTTTTGACTTAGACGCGT
GGTGGTACGGAGAGATCTACGGTTATGACGGCGAGACGTACTACGTTCACTTCCCAACGA
CCAAACATTTGTGCGAGTACCCACTTCAAAGCCTCAGAAAGCATCTCGAATTTGTTGACG
GTGAATGGGTTCCTTCAGCAATGTCAACAAGGAGGCGTTGAGCTTCTTAGATTCTCCGAT
GTTTCTTGGTCACTAGCTATTGTTCTTAATAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAACACTTT
TTATATCGGTTTCCAGAAAACCGTTGCTCTGTTTTTAAGACGTCCAAATAAACTAGGGAA
ACGACTTCTAGAACAAATCGTTAGCCCTAGAAAGTTTGATCATTTTGTAATCAATGCACA
GCCACTTGTTTTGCTGTTGCTTTCACAATGA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2CV58TF 725 0 0
GGGTCGAGA
AAAAAATAAGAGGTTTGCAGATTCTATCTCTCGATCTCTCGTCCAAGTCTCTTTTCTGCA
CATTTATATTTTCCAACAATGGCCGAGTTTGCGGAAGGAGAATTGGTCGAAGTATGCCTC
AAAGAAGATGGTTACTTCGGGTCATTCTTTGAGGCCAAGGTATTGTCCAAGCTTCACGAT
GGAACTTTCTACGAGGTTGAGTACAAGAACCTTATCACTGAAGGCGAAAACCCTCAGCCG
TTGGTTGAAACCATCTCCGTCGACGACATCCGTCCGATGCCACCTACATTGCCCCAGCCG
TCCACGTTTAGCCTCCATGAGAAGGTTGATGCTTTTGACTTAGACGCGTGGTGGTACGGA
GAGATCTACGGTTATGACGGCGAGACGTACTACGTTCACTTCCCAACGACCAAACATTTG
TGTGAGTACCCACTTCAAAGCCTCAGAAAGCATCTCGAATTTGTTGACGGTGAATGGGTT
CCTTCAGCAATGTCAACAAGGAGGCGTTGAGCTTCTTAGATTCTCCGATGTTTCTTGGTC
ACTAGCTATTGTTCTTAATAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAACACTTTTTATATCGGTT
TCCAGAAAACCGTTGCTCTGTTTTTAAGACGTCCAAATAAACTAGGGAAACGACTTCTAG
AACAAATCGTTAGCCCTAGAAAGTTTGATCATTTTGTAATCAATGCACAGCCACTT

QA 10 725 10 725
DS 

RD RR2CB30TF 513 0 0
TTGA
TTGAAACCATCTCCGCCGACGACATCCGTCCGATGCCACCTACATTGCCCCAGCCGTCGA
CGTTTATCCTCCATGAGAAGGTTGATGCTTTTGACTTAGACGCGTGGTGGTACGGAGAGA
TCTACGGTTATGACGGCGAGACGTACTACGTTCACTTTCCAACGACCAAACATTTGTGCG
AGTACCCACTTCAAAGCCTCAGAAAGCATCTCGAATTTGTTGACGGTGAATGGGTTCCTT
CAGCAATGTCAACAAGGAGGCGTTGAGCTTCTTAGAATCTCCGATGTTTCTTGGTCGCTA
GTTATTGTTCTTAATAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAATACTTTTTATATCGGCTTCCA
GAAAACCGTTGCTCTGTTTT*AAGACGTCCAAATAAAATAGGGAAACGACTTCTAGAACA
AATCGTTAGCCCTAGAAAGTTTGATCATTTTGTAATCAATGCACAGCCACTTGTTTTGCT
GTTGCTTTCACAATGAATGTTGTATTCAA

QA 5 513 5 513
DS 

RD RR2CV58JQ 789 0 0
GGTCGAG
AAAAAATAAGAGGTTTGCAGATTCTATCTCTCGATCTCTCGTCCAAGTCTCTTTTCTGCA
CATTTATATTTTCCAACAATGGCCGAGTTTGCGGAAGGAGAATTGGTCGAAGTATGCCTC
AAAGAAGATGGTTACTTCGGGTCATTCTTTGAGGCCAAGGTATTGTCCAAGCTTCACGAT
GGAACTTTCTACGAGGTTGAGTACAAGAACCTTATCACTGAAGGCGAAAACCCTCAGCCG
TTGGTTGAAACCATCTCCGTCGACGACATCCGTCCGATGCCACCTACATTGCCCCAGCCG
TCCACGTTTAGCCTCCATGAGAAGGTTGATGCTTTTGACTTAGACGCGTGGTGGTACGGA
GAGATCTACGGTTATGACGGCGAGACGTACTACGTTCACTTCCCAACGACCAAACATTTG
TGTGAGTACCCACTTCAAAGCCTCAGAAAGCATCTCGAATTTGTTGACGGTGAATGGGTT
CCTTCAGCAATGTCAACAAGGAGGCGTTGAGCTTCTTAGATTCTCCGATGTTTCTTGGTC
ACTAGCTATTGTTCTTAATAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAACACTTTTTATATCGGTT
TCCAGAAAACCGTTGCTCTGTTTTTAAGACGTCCAAATAAACTAGGGAAACGACTTCTAG
AACAAATCGTTAGCCCTAGAAAGTTTGATCATTTTGTAATCAATGCACAGCCACTTGTTT
TGCTGTTGCTTTCACAATGAATGTTGTATTCAAACTATGTTATTCGATTACTCTGTTTTG
GC

QA 8 789 8 789
DS 



AS 1 3

CO CL1790Contig1 1249 3 8 U
AGGTTAAAAAGAGATTATTCCTTTGAATTAAAAACAATTGTTTACAGATCCTATTGATTT
CACAGATACAAAGAGACTATACTTCAAAGACTGATTCATGTCTTTCAGGAGGAATTATTG
CACACATGACATTACTTAAACTTACTAGCTCATTGAGTCAGGCAAACTCAGCTCCAGAAA
GTAAAGACTTGCAGACATACAAGCCATGCCGACAAACACAGCCTTTACAGCTTGTTTCTG
TCCAGCATAATCAAATGCCAAAGGGAGCATTTCGTGCAAAGTTAGGAATGCCATGATTCC
ACCAACTGCTCCCAACAATCCTTCAAGGATTTCTGGACTCAAGCTGCTGGGGAATAGATA
AGCCACGATAATGACACCTAGAGGCTCAGCTAATCCAGAGAGTGTTGCCAATTTGAATGC
CTGCCATTTGCTCTCTGTTGCAAAATATATAGGAAGTGCAACCGCAACACCCTCGGGAAT
GTTATGTAAAGCGATTGCCAAAGCCAGATTAACACCAACTCGCATGCCCTTAATTGATCC
GAGAAATACAGCCATCCCTTCTGGAAAATTGTGCAAGCTTATTCCAATAGCTGTAACAAT
TCCACTGTATAAGACTTGGCGGCGATGCTTCTTCGCCATGTCCTTACCTCCCTCGTCTCC
ATTTTTCTTTCTTCTTTTCACGTCAGTAGAAGGAGCAAGTGTTGGTTCGGGTATGAATTT
GGCAATACACGCAAAGAATATCACACCACCGAAAAACCAGAGATTGCCTTTCAAGAAGCC
AATAGAGTTGATAGCATTATGAGCCAAATCAAGGAACGATATGCTCAACATCAGACCTGC
CGCAAAACCCTGAAGAAGTCCAAGCATCTTCATATTGGGAGTCTCACTAAGAACTACGAA
AAGCGCACCTAAGAGGTACTTAATCCACCCACAAGGGATAGACCAAGCGCCACGAGCATC
TGCGAATCCATCGATTTTTATCTGAACGGAAGACCTTCTTATCGCAGCTCCTCACAAGAT
AACAAACAAACACAAAGACGAAGAATGTGTATTGTGTGTTATATATAAAGACGGAGACGA
TGAGAATCTCTGAAGCCCAAGCAAGGAAGAGATTGAAATCGATGGAAACCCTAATCCATA
GGCAGATGGATAGATTCTTAGCCTAAGTGAGTGAGAGCATATTATTATTATGTCAGACCA
CCCCCTTGCGTGCTTCTCGTTTTCTACCTAACCTTTCCTCTTCATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM81JQ U 6
AF RR2AD27JQ U 1
AF RR2B127TF C 425
BS 1 86 RR2AD27JQ
BS 87 87 RR2BM81JQ
BS 88 128 RR2AD27JQ
BS 129 129 RR2BM81JQ
BS 130 816 RR2AD27JQ
BS 817 817 RR2B127TF
BS 818 851 RR2AD27JQ
BS 852 1249 RR2B127TF

RD RR2BM81JQ 684 0 0
AAAAAGAGATTATTCCTTTGAATTAAAAACAATTGTTTACAGATCCTATTGATTTCACAG
ATACAAAGAGACTATACTTCAAAGACTGATTCATGTCTTTCAGGAGGAATTATTGCACAC
ATGACATTACTTAAACTTACTAGCTCATTGAGTCAGGCAAACTCAGCTCCAGAAAGTAAA
GACTTGCAGACATACAAGCCATGCCGACAAACACAGCCTTTACAGCTTGTTTCTGTCCAG
CATAATCAAATGCCAAAGGGAGCATTTCGTGCAAAGTTAGGAATGCCATGATTCCACCAA
CTGCTCCCAACAATCCTTCAAGGATTTCTGGACTCAAGCTGCTGGGGAATAGATAAGCCA
CGATAATGACACCTAGAGGCTCAGCTAATCCAGAGAGTGTTGCCAATTTGAATGCCTGCC
ATTTGCTCTCTGTTGCAAAATATATAGGAAGTGCAACCGCAACACCCTCGGGAATGTTAT
GTAAAGCGATTGCCAAAGCCAGATTAACACCAACTCGCATGCCCTTAATTGATCCGAGAA
ATACAGCCATCCCTTCTGGAAAATTGTGCAAGTTTATTCCAATAGCTGTAACAATTCCAC
TGTATAAGACTTGGCGGCGATGCTTCTTCGCCATGTCCTTACCTCCCTCGTCTCCATTTT
TCTTTCTTCTTTTCACGTCAGTAG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2AD27JQ 851 0 0
AGGTTAAAAAGAGATTATTCCTTTGAATTAAAAACAATTGTTTACAGATCCTATTGATTT
CACAGATACAAAGAGACTATACTTCAGAGACTGATTCATGTCTTTCAGGAGGAATTATTG
CACACATGGCATTACTTAAACTTACTAGCTCATTGAGTCAGGCAAACTCAGCTCCAGAAA
GTAAAGACTTGCAGACATACAAGCCATGCCGACAAACACAGCCTTTACAGCTTGTTTCTG
TCCAGCATAATCAAATGCCAAAGGGAGCATTTCGTGCAAAGTTAGGAATGCCATGATTCC
ACCAACTGCTCCCAACAATCCTTCAAGGATTTCTGGACTCAAGCTGCTGGGGAATAGATA
AGCCACGATAATGACACCTAGAGGCTCAGCTAATCCAGAGAGTGTTGCCAATTTGAATGC
CTGCCATTTGCTCTCTGTTGCAAAATATATAGGAAGTGCAACCGCAACACCCTCGGGAAT
GTTATGTAAAGCGATTGCCAAAGCCAGATTAACACCAACTCGCATGCCCTTAATTGATCC
GAGAAATACAGCCATCCCTTCTGGAAAATTGTGCAAGCTTATTCCAATAGCTGTAACAAT
TCCACTGTATAAGACTTGGCGGCGATGCTTCTTCGCCATGTCCTTACCTCCCTCGTCTCC
ATTTTTCTTTCTTCTTTTCACGTCAGTAGAAGGAGCAAGTGTTGGTTCGGGTATGAATTT
GGCAATACACGCAAAGAATATCACACCACCGAAAAACCAGAGATTGCCTTTCAAGAAGCC
AATAGAGTTGATAGCATTATGAGCCAAATCAAGGAAGGATATGCTCAACATCAGACCTGC
CGCAAAACCCT

QA 1 851 1 851
DS 

RD RR2B127TF 825 0 0
CATTTGCTCTCTGTTGCAAAATATATAGGAAGTGCAACCGCAACACCCCTCGGGATGTTA
TGTAAAGCGATTGCCAAAGCCAGATTAACACCAACTCGCATGCCCTTAATTGATCCGAGA
AATACAGCCATCCCTTCTGGAAAATTATGCAAGCTTATTCCAATAGCTGTAACAATTCCA
CTGTATAAGACTTGGCGGCGATGCTTCTTCGCCATATCCTTACCTCCCTCGTCTCCATTT
TTCTTTCTTCTTTTCACGCCAGTAGAAGGAGCAAGTGTTGGTTCGGGTATGAATTTGGCA
ATACACGCAAAGAATATCACACCACCGAAAAACCAGAGATTGCCTTTTAAGAAGCCAATA
GAGTTGATAGCATTATGAGCCAAATCAAGGAACGATATGCTCAACATCAGACCTGCCGCA
AAACCCTGAAGAAGTCCAAGCATCTTCATATTGGGAGTCTCACTAAGAACTACGAAAAGC
GCACCTAAGAGGTACTTAATCCACCCACAAGGGATAGACCAAGCGCCACGAGCATCTGCG
AATCCATCGATTTTTATCTGAACGGAAGACCTTCTTATCGCAGCTCCTCACAAGATAACA
AACAAACACAAAGACGAAGAATGTGTATTGTGTGTTATATATAAAGACGGAGACGATGAG
AATCTCTGAAGCCCAAGCAAGGAAGAGATTGAAATCGATGGAAACCCTAATCCATAGGCA
GATGGATAGATTCTTAGCCTAAGTGAGTGAGAGCATATTATTATTATGTCAGACCACCCC
CTTGCGTGCTTCTCGTTTTCTACCTAACCTTTCCTCTTCATCTCC

QA 1 825 1 825
DS 



AS 2 4

CO CL1791Contig1 610 2 4 U
TCTTCCTTCACCTGCTCTTCGTTTTTGCGTATTGGTGATGCGAGAAGCGGGAACTCACGA
GCTTCAAGCTTCACATTCCATACTCAGGTTTCTTGCGGGATTCAAAGGGATGATAATGGA
CGCCGTATTTGGCGGAGGAGAACACTGACAAAGAAGGATGATATGCTGCGTTACAAACTG
CAAAGAGTTCCGTTTGTGGAAGAGCAAGTGAGGAAGATACAGGAAGTTGGGAAGGTAATG
ACAATGGACATCGAGCGTTTGCTTTTGAGCGAAGACAATCGCTTTGAGTTCGTCAACAGT
GTAGCAGCTGAAGCAACCGAGTACGTTGAGAAAAACAGAGACGAATACGGAGGTACCAAG
AAAGCCATCTTTCATGTTCTGAGCAACCGTGTCAACGATCTCGGCTTTGATCGCCCCGAA
GCTTATGCCGAGTCAGATCCTTACAAACCTGGTCCTGGCTACTTGAAAGAGTACTACACT
TGAAGAGATGCTACTATTAGCTTCCCTTTTGTTATTGCATCTTCTTATTGCAACTGTTGG
AAACGATATCTGTTTTGGGGAGAGGAAAAAAATGAATTAAAAGTTATAAAAGAAAGTTAC
TACTATTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BX77JQ C 1
AF RR2BX77TF U 1
BS 1 10 RR2BX77JQ
BS 11 571 RR2BX77TF
BS 572 572 RR2BX77JQ
BS 573 610 RR2BX77TF

RD RR2BX77JQ 610 0 0
TCTTCCTTCACCTGCTCTTCGTTTTTGCGTATTGGTGATGCGAGAAGCGGGAACTCACGA
GCTTCAAGCTTCACATTCCATACTCAGGTTTCTTGCGGGATTCAAAGGGATGATAATGGA
CGCCGTATTTGGCGGAGGAGAACACTGACAAAGAAGGATGATATGCTGCGTTACAAACTG
CAAAGAGTTCCGTTTGTGGAAGAGCAAGTGAGGAAGATACAGGAAGTTGGGAAGGTAATG
ACAATGGACATCGAGCGTTTGCTTTTGAGCGAAGACAATCGCTTTGAGTTCGTCAACAGT
GTAGCAGCTGAAGCAACCGAGTACGTTGAGAAAAACAGAGACGAATACGGAGGTACCAAG
AAAGCCATCTTTCATGTTCTGAGCAACCGTGTCAACGATCTCGGCTTTGATCGCCCCGAA
GCTTATGCCGAGTCAGATCCTTACAAACCTGGTCCTGGCTACTTGAAAGAGTACTACACT
TGAAGAGATGCTACTATTAGCTTCCCTTTTGTTATTGCATCTTCTTATTGCAACTGTTGG
AAACGATATCTGTTTTGGGGAGAGGAAAAAAATGAATTAAAAGTTATAAAAGAAAGTTAC
TACTATTAGC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2BX77TF 610 0 0
TCTTCCTTCA
CCTGCTCTTCGTTTTTGCGTATTGGTGATGCGAGAAGCGGGAACTCACGAGCTTCAAGCT
TCACATTCCATACTCAGGTTTCTTGCGGGATTCAAAGGGATGATAATGGACGCCGTATTT
GGCGGAGGAGAACACTGACAAAGAAGGATGATATGCTGCGTTACAAACTGCAAAGAGTTC
CGTTTGTGGAAGAGCAAGTGAGGAAGATACAGGAAGTTGGGAAGGTAATGACAATGGACA
TCGAGCGTTTGCTTTTGAGCGAAGACAATCGCTTTGAGTTCGTCAACAGTGTAGCAGCTG
AAGCAACCGAGTACGTTGAGAAAAACAGAGACGAATACGGAGGTACCAAGAAAGCCATCT
TTCATGTTCTGAGCAACCGTGTCAACGATCTCGGCTTTGATCGCCCCGAAGCTTATGCCG
AGTCAGATCCTTACAAACCTGGTCCTGGCTACTTGAAAGAGTACTACACTTGAAGAGATG
CTACTATTAGCTTCCCTTTTGTTATTGCATCTTCTTATTGCAACTGTTGGAAACGATATC
TGTTTTGGGGAGAGGAAAAAA*TGAATTAAAAGTTATAAAAGAAAGTTACTACTATTAGC

QA 11 610 11 610
DS 



CO CL1791Contig2 588 2 5 U
TTGGTTACTAGTACAAGGACAAGAAAAGCTGTTTTGAATTACAATTTTTAACTCTTGCTA
ACAGTAGTATCTCTCTTCAAGTGCAGTACTCTTTCAAGTAGCCAGGACCAGGTTTGTAAG
GATCTGACTCGGCATAAGCCTCGGGGCGATCAAACCCGAGATCGTTTACACGGTTGCTCA
GAACGTGAAAGATGGCTTTCTTGGTACCTCCGTATTCCTCTCTGTTCTTCTCAACGTACT
CGGTTGCTTCGGCTGCTACACTGTTGACCAACTCAAAGCGATTGTCTTCGCTCAAAAGCA
GACGCTCGATGTCCATCGTCATTACCTTCCCAACTTCCTGTATCTTCCTCACTTGCTCTT
CCACAAACGGAACTCTTTGCAGTTTGTAACGCAGCATATCATCCTTCTTTGTCAGTGTTC
TCCTCCGCCAAATACGGCGTCCATTATCATCCCTTTGAATCCCGCAAGAAACCTGAGGAT
GGAATGTGAAGCTTGAAGCTCGTGAGTTCCCTCTTCTCGTATCACCAATACGCAAAAACG
AAGAGCAGGAGGAGGAGGTGAAGGAAGAAGCCATGGCTTATACTCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU49JQ U 63
AF RR2EU49TF C 1
BS 1 71 RR2EU49TF
BS 72 285 RR2EU49JQ
BS 286 286 RR2EU49TF
BS 287 298 RR2EU49JQ
BS 299 588 RR2EU49TF

RD RR2EU49JQ 238 0 0
AGTAGTATC
TCTCTTCAAGTGCAGTACTCTTTCAAGTAGCCAGGACCAGGTTTGTAAGGATCTGACTCG
GCATAAGCCTCGGGGCGATCAAACCCGAGATCGTTTACACGGTTGCTCAGAACGTGAAAG
ATGGCTTTCTTGGTACCTCCGTATTCCTCTCTGTTCTTCTCAACGTACTCGGTTGCTTCG
GCTGCTACACTGTTGACCAACTCAAAGCGATTGTTTTCGCTCAAAAG
GA

QA 10 236 10 236
DS 

RD RR2EU49TF 588 0 0
TTGGTTACTAGTACAAGGACAAGAAAAGCTGTTTTGAATTACAATTTTTAACTCTTGCTA
ACAGTAGTATCTCTCTTCAAGTGCAGTACTCTTTCAAGTAGCCAGGACCAGGTTTGTAAG
GATCTGACTCGGCATAAGCCTCGGGGCGATCAAACCCGAGATCGTTTACACGGTTGCTCA
GAACGTGAAAGATGGCTTTCTTGGTACCTCCGTATTCGTCTCTGTTCTTCTCAACGTACT
CGGTTGCTTCGGCTGCTACACTGTTGACGAACTCAAAGCGATTGTCTTCGCTCAAAAGCA
GACGCTCGATGTCCATCGTCATTACCTTCCCAACTTCCTGTATCTTCCTCACTTGCTCTT
CCACAAACGGAACTCTTTGCAGTTTGTAACGCAGCATATCATCCTTCTTTGTCAGTGTTC
TCCTCCGCCAAATACGGCGTCCATTATCATCCCTTTGAATCCCGCAAGAAACCTGAGGAT
GGAATGTGAAGCTTGAAGCTCGTGAGTTCCCTCTTCTCGTATCACCAATACGCAAAAACG
AAGAGCAGGAGGAGGAGGTGAAGGAAGAAGCCATGGCTTATACTCGTC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 4

CO CL1792Contig1 1050 4 9 U
GGAAAAGGAATGGCATCTATTCTGCGGTCAGTGGCAACGACTACAGCCGCCGTAGCCGCC
GCGTCTGCGATTCCAATCGCGATCGCCTTCTCCTCCTCTTCTTCTTCCTCTACCAAATCT
CAATCTCCCAATCTCTCCTTCTCCTCCCGATCGTCTCCACGTCGATTGGGTCTCTCACGA
AGTTTCGCTAGCTCTCCGATGACGACCGTTCCCGTTTCCGATCGTAATCTCCCTCAGGAG
GATCGAGTCGTCATGCCTCAGCTTCTTGCTGAGTTCATGGTCGATATGAAGTGTGAGGGT
TGTGTTAACGCCGTGAAGAACAAGTTAGAAACTGTCGAAGGGATTGAGAAAGTGGAGGTG
GATCTGGCTAACCAAGTTGTGAGGATACTTGGTTCTTCTCCTGTTAAGGCTATGACTCAA
GCTTTGGAGCTAACCGGTCGTAAAGCTCGTTTGATTGGCCAAGGTGTTCCTCAAGATTTC
TTGGTCTCGGCTGCAGTGGCGGAGTTCAAAGGTCCAGACATCTTTGGGGTGGTAAGGTTT
GCTCAGGTCAGTATGGAGCTTGCGAGAATCGAAGCCAGCTTTACCGGTTTGTCTCCCGGG
AAACACAGCTGGTGTATCAACGAGTATGGTGATCTCACAAACGGAGCAGCTAGCACCGGG
AACTTGTACAACCCACTTCAAGATCATACCAACACAGAGCCATTGGGGGACCTGGGAACA
CTAGAGGCAGACCAGAGCGGAGAGGCGTTTTACACGGGAAAGAAAGAGAAGCTCAAGGTT
GCTGATCTAATAGGCCGAGCCGTGGTGGTCTACGAGACAGAGGATAAGAACTCAGGCCCG
GGATTGACAGCTGCAGTGATTGCTAGAAGCGCAGGAGTTGGAGAAAACTACAAGAAGCTT
TGTACTTGTGATGGTACTGTCATTTGGGAAGCTACAGACAGCGATTTCGTTAAGGTTTAA
TGACCAATAAAGATATTATTGACACTACAACTTTACGTGTTGTATCCACTTTAAGACTTT
GTTTTGGATCAAAATCAAGACCGTCTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2GS82TF U 1
AF RR2F903TF U 309
AF RR2GS82JQB C 330
AF RR2BU75JQ C 489
BS 1 542 RR2GS82TF
BS 543 825 RR2F903TF
BS 826 826 RR2GS82JQB
BS 827 957 RR2F903TF
BS 958 958 RR2GS82JQB
BS 959 988 RR2F903TF
BS 989 989 RR2BU75JQ
BS 990 1048 RR2GS82JQB
BS 1049 1050 RR2BU75JQ

RD RR2GS82TF 542 0 0
GGAAAAGGAATGGCATCTATTCTGCGGTCAGTGGCAACGACTACAGCCGCCGTAGCCGCC
GCGTCTGCGATTCCAATCGCGATCGCCTTCTCCTCCTCTTCTTCTTCCTCTACCAAATCT
CAATCTCCCAATCTCTCCTTCTCCTCCCGATCGTCTCCACGTCGATTGGGTCTCTCACGA
AGTTTCGCTAGCTCTCCGATGACGACCGTTCCCGTTTCCGATCGTAATCTCCCTCAGGAG
GATCGAGTCGTCATGCCTCAGCTTCTTGCTGAGTTCATGGTCGATATGAAGTGTGAGGGT
TGTGTTAACGCCGTGAAGAACAAGTTAGAAACTGTCGAAGGGATTGAGAAAGTGGAGGTG
GATCTGGCTAACCAAGTTGTGAGGATACTTGGTTCTTCTCCTGTTAAGGCTATGACTCAA
GCTTTGGAGCTAACCGGTCGTAAAGCTCGTTTGATTGGCCAAGGTGTTCCTCAAGATTTC
TTGGTCTCGGCTGCAGTGGCGGAGTTCAAAGGTCCAGACATCTTTGGGGTGGTAAGGTTT
GC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2F903TF 698 0 0
CGCCGTGAAGAACAAGTTAGAAACTGTTGAAGGGATTGAGAAAGTGGAGGTGGATCTGGC
TAACCAAGTTGTGAGGATACTTGGTTCTTCTCCTGTTAAGGCTATGACTCAAGCTTTGGA
GCTAACCGGTCGTAAAGCTCGTTTGATTGGCCAAGGTGTTCCTCAAGATTTCTTGGTCTC
GGCTGCAGTGGCGGAGTTCAAAGGTCCAGACATCTTTGGGGTGGTAAGGTTTGCTCAGGT
CAGTATGGAGCTTGCGAGAATCGAAGCCAGCTTTACCGGTTTGTCTCCCGGGAAACACAG
CTGGTGTATCAACGAGTATGGTGATCTCACAAACGGAGCAGCTAGCACCGGGAACTTGTA
CAACCCACTTCAAGATCATACCAACACAGAGCCATTGGGGGACCTGGGAACACTAGAGGC
AGACCAGAGCGGAGAGGCGTTTTACACGGGAAAGAAAGAGAAGCTCAAGGTTGCTGATCT
AATAGGCCGAGCCGTGGTGGTCTACGAGACAGAGGATTAGAACTCAGGCCCGGGATTGAC
AGCTGCAGTGATTGCTAGAAGCGCAGGAGTTGGAGAAAACTACAAGAAGCTTTGTACTTG
TGATGGTACTGTCATTTGGGAAGCTACAGACAGCGATTTCGTTAAGGTT*AATGACCAAT
AAAGATATTATTGACACTAC
TACTTTACGTGTTGTATC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2GS82JQB 719 0 0
AACTGTCGAAGGGATTGAGAAAGTGGAGGTGGATCTGGCTAACCAAGTTGTGAGGATACT
TGGTTCTTCTCCTGTTAAGGCTATGACTCAAGCTTTGGAGCTAACCGGTCGTAAAGCTCG
TTTGATTGGCCAAGGTGTTCCTCAAGATTTCTTGGTCTCGGCTGCAGTGGCGGAGTTCAA
AGGTCCAGACATCTTTGGGGTGGTAAGGTTTGCTCAGGTCAGTATGGAGCTTGCGAGAAT
CGAAGCCAGCTTTACCGGTTTGTCTCCCGGGAAACACAGCTGGTGTATCAACGAGTATGG
TGATCTCACAAACGGAGCAGCTAGCACCGGGAACTTGTACAACCCACTTCAAGATCATAC
CAACACAGAGCCATTGGGGGACCTGGGAACACTAGAGGCAGACCAGAGCGGAGAGGCGTT
TTACACGGGAAAGAAAGAGAAGCTCAAGGTTGCTGATCTAATAGGCCGAGCCGTGGTGGT
TTACGAGACAGAGGATAAGAACTCAGGCCCGGGATTGACAGCTGCAGTGATTGCTAGAAG
CGCAGGAGTTGGAGAAAACTACAAGAAGCTTTGTACTTGTGATGGTACTGTCATTTGGGA
AGCTACAGACAGCGATTTCGTTAAGGTTTAACGACCAATAAAGATATTATTGACACTACT
ACTTTACGTGTTGTATCCACTTTAAGACTTTGTTTTGGATCAAAATCAAGACCGTCTTG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2BU75JQ 562 0 0
GGCTGCAGTGGCGGAGTTCAAAGGTCCAGACATCTTTGGAGTGGTAAGGTTTGCTCAGGT
CAGTATGGAGCTTGCGAGAATCGAAGCCAACTTTACTGGTTTGTCTCCCGGGAAACACAG
CTGGTGTATCAACGAGTATGGTGATTTCACAAACGGAGCAGCTAGCACCGGGAACTTGTA
CAACCCACTTCAAGATCATACCAACACAGAGCCATTGGGGGACCTGGGAACACTAGAGGC
GGACCAGAGCGGAGAGGCGTTTTACACGGGAAAGAAAGAGAAGCTCAAGGTTGCTGATTT
AATAGGCCGAGCCGTGGTGGTCTACAAGACAGAGGATAAGAACTCAGGCCCCGGATTGAC
TGCTGCAGTGATTGCTAGAAGCGCAGGAGTTGGAGAAAACTACAAGAAGCTTTGTACTTG
TGATGGTACTGTCATTTGGGAAGCTACAGACAGCGATTTCGTTAAGGTTTAATAACCAAT
AAAGATATTGTTGACACTACA***TTACGTGTTGTATCCACTTTAAGACTTTGTTTTGGA
TCAAAATCAAGACCGTCTTGAC

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 4

CO CL1793Contig1 960 4 22 U
GGACCGCACGCTATCTCCTCCCCTGCAAACACTTCGCTCTAAAAGAAAAACAGAGCTAAG
AGGAGGAGAGAAAACAAAGAGGCGAAGAATAAAGAACAATTGAACTTTTCATCACGTGGA
AAGCTTGATAAAAGATCGTTGAGCAATATATAGAAAAGTAATCAAAAGGTAAATGAGCAC
GACGGGTCCGGCAAAGAAAAGCTCACTTATGGAAACTCTCTTGGGACTCCTTAGAATCCG
CATCAAACGTGGCGTCAATCTAGCCGTCCGTGACATTAATAGCAGTGATCCTTACGTCGT
CGTTAAAATGGGCAAACAGAAATTGAAAACTCGTGTCATCAACAAAGACGTAAATCCAGA
ATGGAACGAAGATCTGACCCTCTCCGTCACGGATCCCAGTCTTACCGTTCTCTTGACGGT
GTACGACCACGACATGTTTAGCAAGGACGACAAGATGGGTGATGCAGAGTTCGAGATAAA
GCCGTATATCGAGGCTTTAAAGATGCAACTTGACGGTCTTCCTAGTGGTACCATCGTCAC
CACGGTTCAGCCATGTCGTCGCAACTGTCTAGCTGAGGAGTCTAAAATAACTTGGGTCGA
CGGTAAGCTCGTCCAGGATCTCGTTCTCAGATTACGACATGTTGAATGTGGAGAGGTCGA
GGCTCAGCTTCAGTGGATTGACCTCCCTGGCTCCAAGGGTCTATAAAACGTCTCTTCTAT
TTATAATTACCGTTACTATTTGAGGGTTTTCTTTTGAATTTGAATTAAACCTCAAAAACA
AAACAAGAACCGAACCATGTTGAAGTACAAAACGCGTATTAATCCATGCACGAGAGTATG
ACGATTAAGAACGTTTGAGGGATGTTTTGTTTCCCATATGGTGATCGAGTCGTATATATT
ATTGTCCTTGTATATTTGGATTAGCTATGTGCCTTGAATAAAAGCTTTGATTACCCCGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2G975TF U 1
AF RR2AE22TF U 71
AF RR2DE34JQ C 327
AF RR2G975JQ C 430
BS 1 225 RR2G975TF
BS 226 226 RR2AE22TF
BS 227 577 RR2G975TF
BS 578 578 RR2AE22TF
BS 579 602 RR2G975TF
BS 603 603 RR2AE22TF
BS 604 628 RR2G975TF
BS 629 693 RR2AE22TF
BS 694 711 RR2DE34JQ
BS 712 712 RR2G975JQ
BS 713 722 RR2DE34JQ
BS 723 723 RR2G975JQ
BS 724 728 RR2DE34JQ
BS 729 729 RR2G975JQ
BS 730 790 RR2DE34JQ
BS 791 791 RR2G975JQ
BS 792 820 RR2DE34JQ
BS 821 821 RR2G975JQ
BS 822 926 RR2DE34JQ
BS 927 927 RR2G975JQ
BS 928 955 RR2DE34JQ
BS 956 960 RR2G975JQ

RD RR2G975TF 628 0 0
GGACCGCACGCTATCTCCTCCCCTGCAAACACTTCGCTCTAAAAGAAAAACAGAGCTAAG
AGGAGGAGAGAAAACAAAGAGGCGAAGAATAAAGAACAATTGAACTTTTCATCACGTGGA
AAGCTTGATAAAAGATCGTTGAGCAATATATAGAAAAGTAATCAAAAGGTAAATGAGCAC
GACGGGTCCGGCAAAGAAAAGCTCACTTATGGAAACTCTCTTGGGGCTCCTTAGAATCCG
CATCAAACGTGGCGTCAATCTAGCCGTCCGTGACATTAATAGCAGTGATCCTTACGTCGT
CGTTAAAATGGGCAAACAGAAATTGAAAACTCGTGTCATCAACAAAGACGTAAATCCAGA
ATGGAACGAAGATCTGACCCTCTCCGTCACGGATCCCAGTCTTACCGTTCTCTTGACGGT
GTACGACCACGACATGTTTAGCAAGGACGACAAGATGGGTGATGCAGAGTTCGAGATAAA
GCCGTATATCGAGGCTTTAAAGATGCAACTTGACGGTCTTCCTAGTGGTACCATCGTCAC
CACGGTTCAGCCATGTCGTCGCAACTGTCTAGCTGAG*AGTCTAAAATAACTTGGGTCGA
CG*TAAGCTCGTCCAGGATCTCGTTCTC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2AE22TF 623 0 0
AAAACAAAGAGGCGAAGAATAAAGAACAATTGAACTTTTCATCACGTGGAAAGCTTGATA
AAAGATCGTTGAGCAATATATAGAAAAGTAATCAAAAGGTAAATGAGCACGACGGGTCCG
GCAAAGAAAAGCTCACTTATGGAAACTCTCTTGGGACTCCTTAGAATCCGCATCAAACGT
GGCGTCAATCTAGCCGTCCGTGACATTAATAGCAGTGATCCTTACGTCGTCGTTAAAATG
GGCAAACAGAAATTGAAAACTCGTGTCATCAACAAAGACGTAAATCCAGAATGGAACGAA
GATCTGACCCTCTCCGTCACGGATCCCAGTCTTACCGTTCTCTTGACGGTGTACGACCAC
GACATGTTTAGCAAGGACGACAAGATGGGTGATGCAGAGTTCGAGATAAAGCCGTATATC
GAGGCTTTAAAGATGCAACTTGACGGTCTTCCTAGTGGTACCATCGTCACCACGGTTCAG
CCATGTCGTCGCAACTGTCTAGCTGAGGAGTCTAAAATAACTTGGGTCGACGGTAAGCTC
GTCCAGGATCTCGTTCTCAGATTACGACATGTTGAATGTGGAGAGGTCGAGGCTCAGCTT
CAGTGGATTGACCTCCCTGGCTC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2DE34JQ 632 0 0
AAACTCGTGTCATCAACAAGGACGTAAATCCAGAATGGAACGAAGATCTGACCCTCTCCG
TCACGGACCCCAGTCTTACCGTTCTCTTGACGGTGTACGACCACGACATGTTTAGCAAGG
ACGACAAGATGGGTGATGCAGAGTTCGAGATAAAGCCGTATATCGAGGTTTTAAAAATGC
AACTTGACGGTCTTCCTAGTGGTACCATCGTCACCACGGTTCAGCCATGTCGTCGCAACT
GTCTAGCTGAGGAGTCTAAAATAACTTGGGTCGACGGTAAGCTCGTCCAGGATCTCGTTC
TCAGATTACGACATGTTGAATGTGGAGAGGTCGAGGCTCAGCTTCAGTGGATTGACCTCC
CTGGCTCCAAGGGTCTATAAAACGTGTCTTCTATTTTTAATTGCCGTTACTATTTGAGGG
TTTTCTTTTGAATTTGAATTAAACCTCAAAAACAAAACAAGAACTGAACCATGTTGAAGT
ACAAAACGCGTATTGATCCATGCACGAGAGTATGACGATTAAGAACGTTTGAGGGATGTT
TTGTTTCCCATATGGTGATCGAGTCGTATATATTATTGTCCTTGTATATTTGGATTAGCT
GTGTGCCTTGAATAAAAGCTTTGATTACC
ACG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2G975JQ 531 0 0
CGACATGTTTAGCAAGGACGACAAGATGGGTGATGCAGAGTTCGAGATAAAGCCGTATAT
CGAGGCTTTAAAGATGCAACTTGACGGTCTTCCTAGTGGTACCATCGTCACCACGGTTCA
GCCATGTCGTCGCAACTGTCTAGCTGAGGAGTCTAAAATAACTTGGGTCGACGGTAAGCT
CGTCCAGGATCTCGTTCTCAGATTACGACATGTTGAATGTGGAGAGGTCGAGGCTCAGCT
TCAGTGGATTGACCTCCCTGGCTCCAAGGGTCTATAAAACGTCTCTTCTATTTATAATTA
CCGTTACTATTTGAGGGTTTTCTTTTGAATTTGAATTAAACCTCAAAAACAAAACAAGAA
CCGAACCATGTTGAAGTACAAAACGCGTATTAATCCATGCATGAGAGTATGAGGATTAAG
AACGTTTGAGGGATGTTTTGTTTCCCATATGGTGATCGAGTCGTATATATTATTGTCCTT
GTATATTTGGATTAGCTATGTGCCTTGAATAAAAGCTTTGATTACCCCGAA

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 5

CO CL1794Contig1 551 5 7 U
GGAAGGAGAGCTACTACTCTGCAACCATGTCGAAGCGAGGAAGAGGAGGAACCTCTGGAA
ACAAGTTCAGGATGTCACTTGGTCTTCCAGTGGCAGCCACCGTGAACTGTGCTGACAACA
CCGGAGCCAAGAACCTTTACATCATTTCCGTAAAGGGTATCAAGGGTCGTCTCAACCGTC
TGCCATCCGCCTGTGTTGGTGACATGGTCATGGCCACTGTGAAGAAAGGTAAACCTGATC
TCCGTAAGAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCTTGGCGCCGAAAGG
ATGGTGTCTTCATGTACTTCGAGGATAATGCTGGTGTCATTGTCAATCCCAAGGGTGAAA
TGAAGGGATCTGCCATCACTGGACCAATCGGAAAGGAGTGTGCTGACCTGTGGCCAAGGA
TCGCTAGTGCTGCAAACGCTATCGTTTAAAATCTATCTTTTTGTGTTCGTTGAACTTTGT
CACTGTTGAGGATGCCTTGTTTCTTAAATCTTCACTTGTGTTATTCCTTAAATCTTGATT
TTAGTTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 

AF RR2CZ07TF U 1
AF RR2GO38JQ C 41
AF RR2GO38TF U 115
AF RR2AO02JQ C 266
AF RR2AO02TF U 266
BS 1 351 RR2CZ07TF
BS 352 352 RR2GO38TF
BS 353 495 RR2CZ07TF
BS 496 496 RR2AO02TF
BS 497 499 RR2GO38TF
BS 500 550 RR2CZ07TF
BS 551 551 RR2GO38TF

RD RR2CZ07TF 550 0 0
GGAAGGAGAGCTACTACTCTGCAACCATGTCGAAGCGAGGAAGAGGAGGAACCTCTGGAA
ACAAGTTCAGGATGTCACTTGGTCTTCCAGTGGCAGCCACCGTGAACTGTGCTGACAACA
CCGGAGCCAAGAACCTTTACATCATTTCCGTAAAGGGTATCAAGGGTCGTCTCAACCGTC
TGCCATCCGCCTGTGTTGGTGACATGGTCATGGCCACTGTGAAGAAAGGTAAACCTGATC
TCCGTAAGAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCTTGGCGCCGAAAGG
ATGGTGTCTTCATGTACTTCGAGGATAATGCTGGTGTCATTGTCAATCCCAGGGGTGAAA
TGAAGGGATCTGCCATCACTGGACCAATCGGAAAGGAGTGTGCTGACCTGTGGCCAAGGA
TCGCTAGTGCTGCAAACGCTATCGTTTAAAATCTATCTTTTTGTGTTCGTTGAACTTTGT
CACTGTTGAGGATGC****TTTCTTAAATCTTCACTTGTGTTATTCCTTAAATCTTGATT
TTAGTTTCCC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2GO38JQ 511 0 0
AG
GAGGAGGAACCTCTGGAAACAAGTTCAGGATGTCACTTGGTCTTCCAGTGGCAGCCACCG
TGAACTGTGCTGACAACACCGGAGCCAAGAACCTTTACATCATTTCCGTAAAGGGTATCA
AGGGTGGTCTCAACCGTCTCCCATCCGCCTGTGTTGGTGACATGGTCATGGCCACTGTGA
AGAAAGGTAAACCTGATCTCCGTAAGAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGA
AGCCTTGGCGCCGAAAGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGAGGATAATGCTGGTGTCATAG
TCAATCCCAAGGGTGAAATGAAGGGATCTGCCATCACTGGACCAATCGGAAAGGAGTGTG
CTGACCTGTGGCCAAGGATCGCTAGTGCTGCAAACGCTATCGTTTAAAATCTATCTTTTT
GTGTTCGTTGAACTTTGTCACTGTTGAGGATGCTTTGTTTCTTAAATCTTCACTTGTGTT
ATTCCTTAAATCTTGATTTTAGTTTCCCC

QA 3 511 3 511
DS 

RD RR2GO38TF 437 0 0
ACAACACCGGAGCCAAGAACCTTTACATCATTTCCGTAAAGGGTATCAAGGGTCGTCTCA
ACCGTCTGCCATCCGCCTGTGTTGGTGACATGGTCATGGCCACTGTGAAGAAAGGTAAAC
CTGATCTCCGTAAGAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCTTGGCGCC
GAAAGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGAGGATAATGCTGGTGTCATAGTCAATCCCAAGG
GTGAAATGAAGGGATCTGCCATCACTGGACCAATCGGAAAGGAGTGTGCTGACCTGTGGC
CAAGGATCGCTAGTGCTGCAAACGCTATCGTTTAAAATCTATCTTTTTGTGTTCGTTGAA
CTTTGTCACTGTTGAGGATGCTTTGTTTCTTAAATCTTCACTTGTGTTATTCCTTAAATC
TTGATTTTAGTTTCCCC

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR2AO02JQ 286 0 0
G
ATCGTTAGGCAGAGGAAGCCTTGGCGCCGAAAGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGAGGAT
AATGCTGGTGTCATTGTCAATCCCAAGGGTGAAATGAAGGGATCTGCCATCACTGGACCA
ATCGGAAAGGAGTGTGCTGACCTGTGGCCAAGGATCGCTAGTGCTGCAAACGCTATCGTT
TAAAATCTATCTTTTTGTGTTCGTTGAACTTTGTCACTGTTGAGGATGCCTTGTTTCTTA
AATCTTCACTTGCGTTATTCCTTAAATCTTGATTTTAGTTTCCCC

QA 2 286 2 286
DS 

RD RR2AO02TF 286 0 0
G
ATCGTTAGGCAGAGGAAGCCTTGGCGCCGAAAGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGAGGAT
AATGCTGGTGTCATTGTCAATCCCAAGGGTGAAATGAAGGGATCTGCCATCACTGGACCA
ATCGGAAAGGAGTGTGCTGACCTGTGGCCAAGGATCGCTAGTGCTGCAAACGCTATCGTT
TAAAATCTATCTTTTTGTGTTCGTTGAACTTTGTCACTGTTGAGGATGCCTTGTTTCTTA
AATCTTCACTTGCGTTATTCCTTAAATCTTGATTTTAGTTTCCCC

QA 2 286 2 286
DS 



AS 2 4

CO CL1795Contig1 736 2 1 U
GGATAATCCAGAATTCGAGAACGAGGCTAAGAAGAAAATCATCAATCAATCAAACACAGG
ATGGCGGGTCACCACGCGATAGAGGTTACAAAGACGGTGCTGGAGGTTGCGGACGTAGCG
TGGACCGCCGTGGAAGTCTACCACCAACACCACCACCACGACCATCACAGCGACGAAGGC
GAGAACCACGACGAGTCAACAAATCCGATCACGGATCCACGAGATCGAGAATTAGAATCT
CTTCGCCAAGAGAATCTCCGTCTCAGGACCTTGCTTGAAGCGAATCTTAAGCTCTTTGAG
ACTCTCGCTGAATCCGCTGCTTTATCTCACGATTGCCCTAAAGACATCTATGCGAGGCTT
GTATCGATGGTTACTTCGAGAGATTTCTTGGCTCGATTAGAGAGTCTGAGGCAAGCGTTA
TCTAACGGAACTCAAAATCAGTTTCCCTTCAAAGAGCCTACAGAAGATGATGTGCAGACT
GTTGAAGTACTTATAGAGATTGATCACCAAGAACCAAGCTGGTGGGTTTTGGTGACGGAC
GACATGATCCCTAGCAATGTGGAGGAAAAAAGCGCTATCGATAACGACCATTACATTGTT
GTGAATGAGGAACATGTGGTTGATGCTGTTGCACACTTTTTAGCAAAATGCATCATGTCA
AACCCCAAAGCTAAGATTCTCAAACCTGAAGAGCTTCAGAAGATTTGGCACAAGAAGTTA
GTGCTCTGAGCAAGTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G466TF U 1
AF RR2CB73TF U 1
BS 1 736 RR2CB73TF

RD RR2G466TF 708 0 0
GGATAATCCAGAATTCGAGAACGAGGCTAAGAAGAAAATCATCAATCAATCAAACACAGG
ATGGCGGGTCACCACGCGATAGAGGTTACAAAGACGGTGCTGGAGGTTGCGGACGTAGCG
TGGACCGCCGTGGAAGTCTACCACCAACACCACCACCACGACCATCACAGCGACGAAGGC
GAGAACCACGACGAGTCAACAAATCCGATCACGGATCCACGAGATCGAGAATTAGAATCT
CTTCGCCAAGAGAATCTCCGTCTCAGGACCTTGCTTGAAGCGAATCTTAAGCTCTTTGAG
ACTCTCGCTGAATCCGCTGCTTTATCTCACGATTGCCCTAAAGACATCTATGCGAGGCTT
GTATCGATGGTTACTTCGAGAGATTTCTTGGCTCGATTAGAGAGTCTGAGGCAAGCGTTA
TCTAACGGAACTCAAAATCAGTTTCCCTTCAAAGAGCCTACAGA***TGATGTGCAGACT
GTTGAAGTACTTATAGAGATTGATCACCAAGAACCAAGCTGGTGGGTTTTGGTGACGGAC
GACATGATCCCTAGCAATGTGGAGGAAAAAAGCGCTATCGATAACGACCATTACATTGTT
GTGAATGAGGAACATGTGGTTGATGCTGTTGCACACTTTTTAGCAAAATGCATCATGTCA
AACCCCAAAGCTAAGATTCTCAAACCTGAAGAGCTTCAGAAGATT
TGG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2CB73TF 736 0 0
GGATAATCCAGAATTCGAGAACGAGGCTAAGAAGAAAATCATCAATCAATCAAACACAGG
ATGGCGGGTCACCACGCGATAGAGGTTACAAAGACGGTGCTGGAGGTTGCGGACGTAGCG
TGGACCGCCGTGGAAGTCTACCACCAACACCACCACCACGACCATCACAGCGACGAAGGC
GAGAACCACGACGAGTCAACAAATCCGATCACGGATCCACGAGATCGAGAATTAGAATCT
CTTCGCCAAGAGAATCTCCGTCTCAGGACCTTGCTTGAAGCGAATCTTAAGCTCTTTGAG
ACTCTCGCTGAATCCGCTGCTTTATCTCACGATTGCCCTAAAGACATCTATGCGAGGCTT
GTATCGATGGTTACTTCGAGAGATTTCTTGGCTCGATTAGAGAGTCTGAGGCAAGCGTTA
TCTAACGGAACTCAAAATCAGTTTCCCTTCAAAGAGCCTACAGAAGATGATGTGCAGACT
GTTGAAGTACTTATAGAGATTGATCACCAAGAACCAAGCTGGTGGGTTTTGGTGACGGAC
GACATGATCCCTAGCAATGTGGAGGAAAAAAGCGCTATCGATAACGACCATTACATTGTT
GTGAATGAGGAACATGTGGTTGATGCTGTTGCACACTTTTTAGCAAAATGCATCATGTCA
AACCCCAAAGCTAAGATTCTCAAACCTGAAGAGCTTCAGAAGATTTGGCACAAGAAGTTA
GTGCTCTGAGCAAGTG

QA 1 736 1 736
DS 



CO CL1795Contig2 1059 2 2 U
GAAGAAGAAAATCATCAATCAATCAAACACAAGATGGCTGGTCACCACGCGATCGAGGTT
ACAAAGACGGTGCTGGAGGTTGCGGACGTAGCGTGGACCGCCGTGGAAGTCTACCACCAA
CACCACCACCACGACCATCATCACAGCGACGAAGGCGAGAATCACGACGAGTCAACAGAT
CCGATCACCGACCCACGAGATCGAGAATTAGAATCTCTTCGCCAAGAGAATCGCCGTCTC
AGGACCTTACTTGAAGCGAATCTTAAGCTCTTTGAGACTCTCGCTGAATCCGCTGCGCTA
TCTCACGATTGCCCTAAAGACATCTATGCGAGGATTGTATCGATGGTTGCATCGAGAGAT
TTCTTGGTTCGATTAGAAAGTCTGAGGCAAGCGTTATCTAACGGAACTCAAAATCAGTTT
CCCTTCAAACAGCCTACAGAAGATGATGTGCAGACTGTTGAAGTTCTTATAGAGATTGAT
CACCAAGAACCAAGCTGGTGGGTTTTGGTGACAGACGACATGATCCCTAGCAATGTCGTG
GAAAAAAGCGCTGTCGATAACGACCATTACATTGTTGTGAATGAGGAACATGTGGTTGAT
GCTGTTGCACACTTTTTAGCAAAATGCATCATGTCTAACCCCAAAGCTAAGATTCTCAAA
CCTGAAGAGCTTCAGAAGATTCTGGCACAAGAAGTTAGTGCTCTGAGCAAGGTAGGGAGG
GTTGTGGATATATGGCATGCTGGGAAAATGTTCTACACGTTTTCCACATGGGGACTTGCT
TTTGGAGGGTTATATCAAGCTCGTGGTGCGTTGAAGATAGCTGCTAAGGGCGTTCATGCA
ACAAGCAAAGTTGTTCTGAGGGCTCTCTGAAAGTTGTAAAAGGGGTCTAATGCGATGAAA
GCAGAGATGATTCTCCACTTTCTCATGGTTTGTGTTTCTGTGTTGTGTTGGAATGACTTA
TTTTAGTTACTACTATCATTGGGTCATTGCTTGTGTAAATAGTGTAAAAAGTGTGTGGTC
GGAATTGTAATTTAATTTACTTGAATTCTTCGTTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G714TF U 1
AF RR2G714JQ C 385
BS 1 710 RR2G714TF
BS 711 1059 RR2G714JQ

RD RR2G714TF 710 0 0
GAAGAAGAAAATCATCAATCAATCAAACACAAGATGGCTGGTCACCACGCGATCGAGGTT
ACAAAGACGGTGCTGGAGGTTGCGGACGTAGCGTGGACCGCCGTGGAAGTCTACCACCAA
CACCACCACCACGACCATCATCACAGCGACGAAGGCGAGAATCACGACGAGTCAACAGAT
CCGATCACCGACCCACGAGATCGAGAATTAGAATCTCTTCGCCAAGAGAATCGCCGTCTC
AGGACCTTACTTGAAGCGAATCTTAAGCTCTTTGAGACTCTCGCTGAATCCGCTGCGCTA
TCTCACGATTGCCCTAAAGACATCTATGCGAGGATTGTATCGATGGTTGCATCGAGAGAT
TTCTTGGTTCGATTAGAAAGTCTGAGGCAAGCGTTATCTAACGGAACTCAAAATCAGTTT
CCCTTCAAACAGCCTACAGAAGATGATGTGCAGACTGTTGAAGTTCTTATAGAGATTGAT
CACCAAGAACCAAGCTGGTGGGTTTTGGTGACAGACGACATGATCCCTAGCAATGTCGTG
GAAAAAAGCGCTGTCGATAACGACCATTACATTGTTGTGAATGAGGAACATGTGGTTGAT
GCTGTTGCACACTTTTTAGCAAAATGCATCATGTCTAACCCCAAAGCTAAGATTCTCAAA
CCTGAAGAGCTTCAGAAGATTCTGGCACAAGAAGTTAGTGCTCTGAGCAA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2G714JQ 675 0 0
AGGCAAGCGTTATCTAACGGAACTCAAAATCAGTTTCCCTTCAAACAGCCTACAGAAGAT
GATGTGCAGACTGTTGAAGTTCTTATAGAGATTGATCACCAAGAACCAAGCTGGTGGGTT
TTGGTGACAGACGACATGATCCCTAGCAATGTCGTGGAAAAAAGCGCTGTCGATAACGAC
CATTACATTGTTGTGAATGAGGAACATGTGGTTGATGCTGTTGCACACTTTTTAGCAAAA
TGCATCATGTCTAACCCCAAAGCTAAGATTCTCAAACCTGAAGAGCTTCAGAAGATTCTG
GCACAAGAAGTTAGTGCTCTGAGCAAGGTAGGGAGGGTTGTGGATATATGGCATGCTGGG
AAAATGTTCTACACGTTTTCCACATGGGGACTTGCTTTTGGAGGGTTATATCAAGCTCGT
GGTGCGTTGAAGATAGCTGCTAAGGGCGTTCATGCAACAAGCAAAGTTGTTCTGAGGGCT
CTCTGAAAGTTGTAAAAGGGGTCTAATGCGATGAAAGCAGAGATGATTCTCCACTTTCTC
ATGGTTTGTGTTTCTGTGTTGTGTTGGAATGACTTATTTTAGTTACTACTATCATTGGGT
CATTGCTTGTGTAAATAGTGTAAAAAGTGTGTGGTCGGAATTGTAATTTAATTTACTTGA
ATTCTTCGTTTGTCC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 5

CO CL1796Contig1 781 5 12 U
TTGTTATTTATGCGGACTAATTTTAGAAGGTAACGCCACTAAACATATCTGCTTAAAATA
CATTTTAGAACACTGCAAATCACACACAAAGCATATATATATAATTTAACAAAGACATTA
CTATGGTTTGGAGACGAACATTTTTGGTAAGTAAACAAATGTCATGACTGTAAACCTTTG
TTTTCAAATCTTCATGTAAAAACACACATGTACAATCTTCTTTTGCAGCAACAGTATATC
AAACGCCCTAACCGGTCTCTACCGGATTAAGAGCAGTCACTTCTTCATTTTACTACCAGA
CCCCTGATCCTCTTGTGGCTCCAAGAACGATGATAATCGTAGCAATAACAGATGCAATTG
CGCAAGCTATGTATCCAGGCCTCTCACGCGGGTTTCTAGAGAACAGAAAAAGGAAAAAGC
CGATGTACCAAGGGATGGCACCGAAAAAGAAACCAAGGATGAATAAGAACCAACCAATGC
CTATGCCACAACAAGGAAGACGATCGTACTCTGTTACTCCATTAACAGCATAACCGGAGA
CGTAGGGCTGAGCTGGCTGTGGATAACCTGGGGGAGGTGGCTGCTGCTGCTGCTGCGGAG
GTGGATAGTTGGAGACACCTTGAAACGGCGGAGGATGAGGAGGCTGCTGGTGTTGATAAT
CAGTTGCAACTGATCTGTTTTTCTCGTCTTCTGCGCTGCCGCTAGTCATCTCTCTTTTCA
GATCAATAAACCAAAAATAATATTTCTCTGATATGAATTTGTTCTTTGATCTGTGAGACC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2G293JQ U 141
AF RR2C583JQ U 25
AF RR2CC52JQ U 1
AF RR2C583TF C 58
AF RR2G293TF C 308
BS 1 54 RR2CC52JQ
BS 55 55 RR2C583JQ
BS 56 67 RR2CC52JQ
BS 68 68 RR2C583JQ
BS 69 263 RR2CC52JQ
BS 264 264 RR2C583JQ
BS 265 298 RR2CC52JQ
BS 299 299 RR2C583JQ
BS 300 519 RR2CC52JQ
BS 520 520 RR2C583JQ
BS 521 774 RR2CC52JQ
BS 775 781 RR2G293TF

RD RR2G293JQ 263 0 0
TTTTTGGTAAGTAAACAAATGTCATGACTGCAAACCTTTGTTTTCAAATCTTCATGTAAA
AACACACATGTACAATCTTCTTTTGCAGCAACAGTATATCAAACGCCCTAACCGGTCTCT
ACCGGATTAAAAGCAGTCACTTCTTCATTTTACTACCAAACCCCTGATCCTCTTGTGGCT
CCAAAAACGATGATAATCGTAGCAATAACAGATGCAATTGCCCAAGCTATGTATCCAGGC
CTCTCACGCGGGTTTCTAGAGAA

QA 1 263 1 263
DS 

RD RR2C583JQ 605 0 0
AGAAGGTAACGCCACTAAACATATCTGCTTAAAATACATTTTAGAACACTGCAAATCACA
CACAAAGCATATATATATAATTTAACAAAGACATTACTATGGTTTGGAGACGAACATTTT
TGGTAAGTAAACAAATGTCATGACTGTAAACCTTTGTTTTCAAATCTTCATGTAAAAACA
CACATGTACAATCTTCTTTTGCAGCAACAGTATATCAAACGCCCTAACCGGTCTCTACCG
GATTAAGAGCAGTCACTTCTTCATTTTACTACCAGACCCCTGATCCTCTTGTGGCTCCAA
GAACGATGATAATCGTAGCAATAACAGATGCAATTGCGCAAGCTATGTATCCAGGCCTCT
CACGCGGGTTTCTAGAGAACAGAAAAAGGAAAAAGCCGATGTACCAAGGGATGGCACCGA
AAAAAAAACCAAGGATGAATAAGAACCAACCAATGCCTATGCCACAACAAGGAAGACGAT
CGTACTCTGTTACTCCATTAACAGCATAACCGGAGACGTAGGGCTGAGCTGGCTGTGGAT
AACCTGGGGGAGGTGGCTGCTGCTGCTGCTGCGGAGGTGGATAGTTGGAGACACCTTGAA
ACGGC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2CC52JQ 775 0 0
TTGTTATTTATGCGGACTAATTTTAGAAGGTAACGCCACTAAACATATCTGCTTCAAATA
CATTTTAAAACACTGCAAATCACACACAAAGCATATATATATAATTTAACAAAGACATTA
CTATGGTTTGGAGACGAACATTTTTGGTAAGTAAACAAATGTCATGACTGTAAACCTTTG
TTTTCAAATCTTCATGTAAAAACACACATGTACAATCTTCTTTTGCAGCAACAGTATATC
AAACGCCCTAACCGGTCTCTACCAGATTAAGAGCAGTCACTTCTTCATTTTACTACCAAA
CCCCTGATCCTCTTGTGGCTCCAAGAACGATGATAATCGTAGCAATAACAGATGCAATTG
CGCAAGCTATGTATCCAGGCCTCTCACGCGGGTTTCTAGAGAACAGAAAAAGGAAAAAGC
CGATGTACCAAGGGATGGCACCGAAAAAGAAACCAAGGATGAATAAGAACCAACCAATGC
CTATGCCACAACAAGGAAGACGATCGTACTCTGTTACTCAATTAACAGCATAACCGGAGA
CGTAGGGCTGAGCTGGCTGTGGATAACCTGGGGGAGGTGGCTGCTGCTGCTGCTGCGGAG
GTGGATAGTTGGAGACACCTTGAAACGGCGGAGGATGAGGAGGCTGCTGGTGTTGATAAT
CAGTTGCAACTGATCTGTTTTTCTCGTCTTCTGCGCTGCCGCTAGTCATCTCTCTTTTCA
GATCAATAAACCAAAAATAATATTTCTCTGATATGAATTTGTTCTTTGATCTGT
C

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2C583TF 719 0 0
ATACATTTTAGAACACTGCAAATCACACACAAAGCATATATATATAATTTAACAAAGACA
TTACTATGGTTTGGAGACGAACATTTTTGGTAAGTAAACAAATGTCATGACTGTAAACAT
TTGTTTTCAAATCTTCATGTAAAAACACACATGTACAATCTTCTTTTGCAGCAACAGTAT
ATCAAACGCCCTAACCGGTCTCTACCGGATTAAGAGCAGTCACTTCTTCATTTTACTACC
AGACCCCTGATCCTCTTGTGGCTCCAAGAACGATGATAATCGTAGCAATAACAGATGCAA
TTGCGCAAGCTATGTATCCAGGCCTCTCACGCGGGTTTCTAGAGAACAGAAAAAGGAAAA
AGCCGATGTACCAAGGGATGGCACCGAAGAAGAAACCAAGGATGAATAAGAACCAACCAA
TGCCTATGCCACAACAAGGAAGACGATCGTACTCTGTTACTCCATTAACAGCATAACCGG
AGACGTAGGGCTGAGCTGGCTGTGGATAACCTGGGGGAGGTGGCTGCTGCTGCTGCTGCG
GAGGTGGATAGTTGGAGACACCTTGAAACGGCGGAGGATGAGGAGGCTGCTGGTGTTGAT
AATCAGTTGCAACTGATCTGTTTTTCTCGTCTTCTGCGCTGCCGCTAGTCATCTCTCTTT
TCAGATCAATAAACCAAAAATAATATTTCTCTGATATGAATTTGTTCTTTGATCTGT
CC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2G293TF 474 0 0
TCCTCTTGTGGCTCCAAGAACGATGATAATCGTAGCAATAACAGATGCAATTGCGCAAGC
TATGTATCCAGGCCTCTCACGCGGGTTTCTAGAGAACAGAAAAAGGAAAAAGCCGATGTA
CCAAGGGATGGCACCGAAGAAGAAACCAAGGATGAATAAGAACCAACCAATGCCTATGCC
ACAACAAGGAAGACGATCGTACTCTGTTACTCCATTAACAGCATAACCGGAGACGTAGGG
CTGAGCTGGCTGTGGATAACCTGGGGGAGGTGGCTGCTGCTGCTGCTGCGGAGGTGGATA
GTTGGAGACACCTTGAAACGGCGGAGGATGAGGAGGCTGCTGGTGTTGATAATCAGTTGC
AACTGATCTGTTTTTCTCGTCTTCTGCGCTGCCGCTAGTCATCTCTCTTTTCAGATCAAT
AAACCAAAAATAATATTTCTCTGATATGAATTTGTTCTTTGATCTGTGAGACCC

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 3

CO CL1797Contig1 591 3 28 U
GGGAGAGATATCTCAAGCGCTAACCGATAGGTAACGATTCAGAGAGAGAGAGAGAGGCGA
ATAAAAGAGATCCGGAAGAATGGCGACGGCGATAGTACGTTCAGCACTTTCACGAGCAGC
GATGGGCGCAGCTCCGAGGACATCCGCTGCCCCCAAGCGCAGATTTTCATCTTCTGCCGG
CCATGACGATGCTTATGAAGCAGCAAAGTGGGAGAAGATAACATATCTGGGAATTGCTAG
TTGCACTGCTCTAGCTGCCTATGTTTTATCTAAGGGTCATCATCACGGCGAGGATCCTCC
TGCCTATCCGTATATGCACATCCGCAACAAGGAGTTTCCTTGGGGTCCAGACGGTCTGTT
TGAGGTGAAGCACAACGAAGGGCACTGAAATGTTTGCGTCTTTACAATAAATTTTCTTCT
TGTTCATTTGATAGGCTAAATTGCTTATCGTCTTTGTTTTAAACGTTGTCTACTATTTGC
TACACCACCTTTGTTGGGAAATAAGAATGATAACTTTGTTTTGTTATTATCAAATACTTG
TGGTTCCTCAAATCTCTTGCGATTTAATCTCAATAAAAATGGAAATTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 10 25 10 10 25 25 10 25 10 10 10 25 10 10 25 10 10 10 10 10 25 25 10 10 25 10 10 25 25 10 10 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BL56TF U 1
AF RR2CQ34JQ C 1
AF RR2CQ34TF U 8
BS 1 8 RR2BL56TF
BS 9 9 RR2CQ34TF
BS 10 10 RR2BL56TF
BS 11 12 RR2CQ34TF
BS 13 14 RR2BL56TF
BS 15 15 RR2CQ34TF
BS 16 16 RR2BL56TF
BS 17 19 RR2CQ34TF
BS 20 20 RR2BL56TF
BS 21 22 RR2CQ34TF
BS 23 23 RR2BL56TF
BS 24 28 RR2CQ34TF
BS 29 30 RR2BL56TF
BS 31 32 RR2CQ34TF
BS 33 33 RR2BL56TF
BS 34 35 RR2CQ34TF
BS 36 37 RR2BL56TF
BS 38 40 RR2CQ34TF
BS 41 82 RR2BL56TF
BS 83 83 RR2CQ34TF
BS 84 114 RR2BL56TF
BS 115 115 RR2CQ34TF
BS 116 167 RR2BL56TF
BS 168 168 RR2CQ34TF
BS 169 309 RR2BL56TF
BS 310 310 RR2CQ34TF
BS 311 546 RR2BL56TF
BS 547 591 RR2CQ34TF

RD RR2BL56TF 546 0 0
GGGAGAGAGACTTCCACAAC**ATTTTCAGACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCGA
ATAAAAGAGATCCGGAAGAATGTCGACGGCGATAGTACGTTCAGCACTTTCACGGGCAGC
GATGGGCGCAGCTCCGAGGACATCCGCTGCCCCCAAGCGCAGATTTTTATCTTCTGCCGG
CCATGACGATGCTTATGAAGCAGCAAAGTGGGAGAAGATAACATATCTGGGAATTGCTAG
TTGCACTGCTCTAGCTGCCTATGTTTTATCTAAGGGTCATCATCACGGCGAGGATCCTCC
TGCCTATCCATATATGCACATCCGCAACAAGGAGTTTCCTTGGGGTCCAGACGGTCTGTT
TGAGGTGAAGCACAACGAAGGGCACTGAAATGTTTGCGTCTTTACAATAAATTTTCTTCT
TGTTCATTTGATAGGCTAAATTGCTTATCGTCTTTGTTTTAAACGTTGTCTACTATTTGC
TACACCACCTTTGTTGGGAAATAAGAATGATAACTTTGTTTTGTTATTATCAAATACTTG
TGGTTC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2CQ34JQ 591 0 0
GGGAACC
ATATCTCAAGCGCTAACCGATAGGTAACGATTCAGAGAGAGAGAGAGAGGCGAATAAAAG
AGATCCGGAAGAATGGCGACGGCGATAGTACGTTCAGCACTTTCACGAGCAGCGATGGGC
GCAGCTCCGAGGACATCCGCTGCCCCCAAGCGCAGATTTTCATCTTCTGCCGGCCATGAC
GATGCTTATGAAGCAGCAAAGTGGGAGAAGATAACATATCTGGGAATTGCTAGTTGCACT
GCTCTAGCTGCCTATGTTTTATCTAAGGGTCATCATCACGGCGAGGATCCTCCTGCCTAT
CCGTATATGCACATCCGCAACAAGGAGTTTCCTTGGGGTCCAGACGGTCTGTTTGAGGTG
AAGCACAACGAAGGGCACTGAAATGTTTGCGTCTTTACAATAAATTTTCTTCTTGTTCAT
TTGATAGGCTAAATTGCTTATCGTCTTTGTTTTAAACGTTGTCTACTATTTGCTACACCA
CCTTTGTTGGGAAATAAGAATGATAACTTTGTTTTGTTATTATCAAATACTTGTGGTTCC
TCAAATCTCTTGCGATTTAATCTCAATAAAAATGGAAATTCTCC

QA 8 591 8 591
DS 

RD RR2CQ34TF 584 0 0
ATATCTCAAGCGCTAACCGATAGGTAACGATTCA*AGAGAGAGAGAGAGGCGAATAAAAG
AGATCCGGAAGAATGGCGACGGCGATAGTACGTTCAGCACTTTCACGAGCAGCGATGGGC
GCAGCTCCGAGGACATCCGCTGCCCCCAAGCGCAGATTTTCATCTTCTGCCGGCCATGAC
GATGCTTATGAAGCAGCAAAGTGGGAGAAGATAACATATCTGGGAATTGCTAGTTGCACT
GCTCTAGCTGCCTATGTTTTATCTAAGGGTCATCATCACGGCGAGGATCCTCCTGCCTAT
CCGTATATGCACATCCGCAACAAGGAGTTTCCTTGGGGTCCAGACGGTCTGTTTGAGGTG
AAGCACAACGAAGGGCACTGAAATGTTTGCGTCTTTACAATAAATTTTCTTCTTGTTCAT
TTGATAGGCTAAATTGCTTATCGTCTTTGTTTTAAACGTTGTCTACTATTTGCTACACCA
CCTTTGTTGGGAAATAAGAATGATAACTTTGTTTTGTTATTATCAAATACTTGTGGTTCC
TCAAATCTCTTGCGATTTAATCTCAATAAAAATGGAAATTCTCC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 4

CO CL1798Contig1 976 4 7 U
GGACAAAACAGAGAAACAAAAAAAAACAGAGCGGGTCTGATGCGTAACGAAGGATGCCGT
CGTCCGCATCAATCTCATCGCCTTCATCTCTAGCGCTTCTCTCAACCAAAACTCGATCTC
CACTCTCCTCCTTCTTCCTCGCTCCCAAAGCCACAACCAGAATCCCTGATCATCATCTTC
CTTCTTCTCTCTTTGCTTCCCGGCGACCCCGCGATTTCACCAACGGGAGGGATGACTTGA
GCTGGAACCGGAAGATCAGACCTGAGTACGAGTTCGATGATGAGGGTTACGAAGAGGAAG
ACGAGCGTGACGAGGAAGAAGAAGATAGAAGCTTGGATCTTTTGCTCAGGTTTGTGGAGA
ACGTCTTCAGAAAAGTCTCCAAGAGAGCTAGGAAAGCCGTCCGATCGATCTTGCCTGTTT
CCATCTCCACTAAGCTCGTGGGTTTCTCAGTGAATGGCGTACTTATACTTGCGTTTTTGT
GGATCTCGAAGGCCTTTCTCGAGGTAGCTTGCACACTTGGGACTATTGTATTTACGAGCA
TTCTACTTATACGGGGGCTTTGGGCTGGTGTAGCATACGTACAAGAAAGCCGCAACAACC
GGATCAACGAACTCGCTGATGACCCTCGTGCTTGGAACGGGGTGCAACCAGCGTCATGAT
TAAAAATGTTTTGAGAGAATCTCAAGTTTCTGACTTTCGAGGGAGCCAAAATCGGTTTAG
GTGGTTCTCCGACGGCAATAAAAACGACAGCGGAGTTCTGAATCACAAAGCAGTCACTGT
GGATGATGTTCTTATGCTGTGTGTGGTGATTTAGTAATTAAAAAGAACAAAATGTAATAC
TTTGTAGCATTTTACAAAGTCAGCTATGGAAGCTTGGCATGTAGCATTTCTTGTTTTTCT
AAATAAATAACAAATACAGAATCACACCATTTGAATGATCAGAATTTGAATAATCAGAAT
TTGAATGACTTGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD82TF U 1
AF RR2CJ75TF U 32
AF RR2DD82JQ C 217
AF RR2CJ75JQ C 230
BS 1 219 RR2DD82TF
BS 220 220 RR2CJ75TF
BS 221 571 RR2DD82TF
BS 572 572 RR2CJ75TF
BS 573 709 RR2DD82TF
BS 710 878 RR2DD82JQ
BS 879 976 RR2CJ75JQ

RD RR2DD82TF 709 0 0
GGACAAAACAGAGAAACAAAAAAAAACAGAGCGGGTCTGATGCGTAACGAAGGATGCCGT
CGTCCGCATCAATCTCATCGCCTTCATCTCTAGCGCTTCTCTCAACCAAAACTCGATCTC
CACTCTCCTCCTTCTTCCTCGCTCCCAAAGCCACAACCAGAATCCCTGATCATCATCTTC
CTTCTTCTCTCTTTGCTTCCCGGCGACCCCGCGATTTCATCAACGGGAGGGATGACTTGA
GCTGGAACCGGAAGATCAGACCTGAGTACGAGTTCGATGATGAGGGTTACGAAGAGGAAG
ACGAGCGTGACGAGGAAGAAGAAGATAGAAGCTTGGATCTTTTGCTCAGGTTTGTGGAGA
ACGTCTTCAGAAAAGTCTCCAAGAGAGCTAGGAAAGCCGTCCGATCGATCTTGCCTGTTT
CCATCTCCACTAAGCTCGTGGGTTTCTCAGTGAATGGCGTACTTATACTTGCGTTTTTGT
GGATCTCGAAGGCCTTTCTCGAGGTAGCTTGCACACTTGGGACTATTGTATTTACGAGCA
TTCTACTTATACGGGGGCTTTGGGCTGGTGTCGCATACGTACAAGAAAGCCGCAACAACC
GGATCAACGAACTCGCTGATGACCCTCGTGCTTGGAACGGGGTGCAACCAGCGTCATGAT
TAAAAATGTTTTGAGAGAATCTCAAGTTTCTGACTTTCGAGGGAGCCAA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2CJ75TF 673 0 0
G
GGGTCTGATGCGTAACGAAGGATGCCGTCGTCCGCATCAATCTCATCGCCTTCATCTCTA
GCGCTTCTCTCAACCAAAACTCGATCTCCACTCTCCTCCTTCTTCCTCGCTCCCAAAGCC
ACAACCAGAATCCCTGATCATCATCTTCCTTCTTCTCTCTTTGCTTCCCGGCGACCCCGC
GATTTCACCAACGGGAGGGATGACTTGAGCTGGAACCGGAAGATCAGACCTGAGTACGAG
TTCGATGATGAGGGTTACGAAGAGGAAGACGAGCGTGACGAGGAAGAAGAAGATAGAAGC
TTGGATCTTTTGCTTAGGTTTGTGGAGAACGTCTTCAGAAAAGTCTCCAAGAGAGCTAGG
AAAGCCGTCCGATCGATCTTGCCTGTTTCCATCTCCACTAAGCTCGTGGGTTTCTCAGTG
AATGGCGTACTTATACTTGCGTTTTTGTGGATCTCGAAGGCCTTTCTCGAGGTAGCTTGC
ACACTTGGGACTATTGTATTTACGAGCATTCTACTTATACGGGGGCTTTGGGCTGGTGTA
GCATACGTACAAGAAAGCCGCAACAACCGGATCAACGAACTCGCTGATGACCCTCGTGCT
TGGAACGGGGTGCAACCAGCGTCATGATTAAAAATGTTTTGAGAGAATCTCAAGTTTCTG
ACTTTCGAG
AGA

QA 2 670 2 670
DS 

RD RR2DD82JQ 662 0 0
TCAT
CAACGGGAGGGATGACTTGAGCTGGAACCGGAAGATCAGACCTGAGTACGAGTTCGATGA
TGAGGGTTACGAAGAGGAAGACGAGCGTGACGAGGAAGAAGAAGATAGAAGCTTGGATCT
TTTGCTCAGGTTTGTGGAGAACGTCTTCAGAAAAGTCTCCAAGAGAGCTAGGAAAGCCGT
CCGATCGATCTTGCCTGTTTCCATCTCCACTAAGCTCGTGGGTTTCTCAGTGAATGGCGT
ACTTATACTTGCGTTTTTGTGGATCTCGAAGGCCTTTCTCGAGGTAGCTTGCACACTTGG
GACTATTGTATTTACGAGCATTCTACTTATACGGGGGCTTTGGGCTGGTGTCGCATACGT
ACAAGAAAGCCGCAACAACCGGATCAACGAACTCGCTGATGACCCTCGTGCTTGGAACGG
GGTGCAACCAGCGTCATGATTAAAAATGTTTTGAGAGAATCTCAAGTTTCTGACTTTCGA
GGGAGCCAAAATCGGTTTAGGTGGTTCTCCGACGGCAATAAAAACGACAGCGGAGTTCTG
AATCACAAAGCAGTCACTGTGGATGATGTTCTTATGCTGTGTGTGGTGATTTAGTAATTA
AAAAGAACAAAATGTAATACTTTGTAGCATTTTACAAAGTCAGCTATGGAAGCTTGGC

QA 5 662 5 662
DS 

RD RR2CJ75JQ 747 0 0
GGATGACTTGAGCTGGAACCGGAAGATCAGACCTGAGTACGAGTTCGATGATGAGGGTTA
CGAAGAGGAAGACGAGCGTGACGAGGAAGAAGAAGATAGAAGCTTGGATCTTTTGCTTAG
GTTTGTGGAGAACGTCTTCAGAAAAGTCTCCAAGAGAGCTAGGAAAGCCGTCCGATCGAT
CTTGCCTGTTTCCATCTCCACTAAGCTCGTGGGTTTCTCAGTGAATGGCGTACTTATACT
TGCGTTTTTGTGGATCTCGAAGGCCTTTCTCGAGGTAGCTTGCACACTTGGGACTATTGT
ATTTACGAGCATTCTACTTATACGGGGGCTTTGGGCTGGTGTAGCATACGTACAAGAAAG
CCGCAACAACCGGATCAACGAACTCGCTGATGACCCTCGTGCTTGGAACGGGGTGCAACC
AGCGTCATGATTAAAAATGTTTTGAGAGAATCTCAAGTTTCTGACTTTCGAGAGAGCCAA
AATCGGTTTAGGTGGTTCTCCGACGGCAATAAAAACGACAGCGGAGTTCTGAATCACAAA
GCAGTCACTGTGGATGATGTTCTTATGCTGTGTGTGGTGATTTAGTAATTAAAAAGAACA
AAATGTAATACTTTGTAGCATTTTACAAAGTCAGCTATGGAAGCTTGGCATGTAGCATTT
CTTGTTTTTCTAAATAAATAACAAATACAGAATCACACCATTTGAATGATCAGAATTTGA
ATAATCAGAATTTGAATGACTTGAATC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 5

CO CL1799Contig1 1135 5 6 U
GAAAGAGAGGATTAAGGAGGCGGAGACGAAGCTGGAGGAGGGACCATGGCGTCGACGTCG
TTGGTGCTAACGTTAGCATCTCCTCTGTTTAGTCGTCGGTCTGTTTCCGCAAGGGTAGCC
TTGACGATGATTACAGAGCCCTCAGTAAAATTGGGAAGAAGAAGAAGAAGATGCTCGGGG
AAAGAAGAAGTGCTTCTAGAAGGAATGCCACCGGAGTATTATGATGATGAATGGCAAGCT
CGGCAGAGGGAGAAGACGAAAGAATTGAGGCGGATGCAGCGGGAGGAAGAAGAAGAAGAA
GAGAGAAAGATTGAAGAGTACCGTGAAATCGGCTTGAGGTTGAAGGAATTTCCTGAGCAA
GACTTGAGGAAAGCTAGAAAGCTCGTCTCCACCTTCATCACTGCTGCTGAGGAAGTCGAA
GAGAGAATTGAAGAAGCAGCTGAGAAAGGAGAACTGGACGAGCTTGTTCTCATGATCATA
TGGAACCGCCTTGACCTTGCTCGCCGTGATGACGAGAAGGACGCTATAAGAAGTCTTGAT
CTCTTGTATAGAAGAGTCGAGACAGAGATCTTAAAACGGCAAGCAAGTCCTGCCATGAAG
CTGCTGAATGATCTTCTAAACATGCATGATGGCTTTGGAGACGATGCTTGGCTGAAAGAC
TGCAGAAAACGAATGGCTGAGACATTCCCACGGGAAGACCCCTTCAGCATTCTAATGCCA
CCCGGTTTCGACATTGATATGCATCAAGGACCGTTACGGTCGCCTGTTGAGACAGACGAC
ACCCTTTTCAGAGTAGACTTTGTAAGAGAAGTGGATGCATTGCTGCATGAAGTGAGACTA
ATAGAGGAAGACGAGGAGGAAGCTGGTAAGAAAGGAGAGGTGCTGGACCCTGAAGCGATA
GCACGTAAGTTGAAGCAGCAAGAGAAGAAGCGAACCATCCGTCAAGTTGAAGCCCTTCTT
GATTTGGCCCTCAACTTGAAGTGGTAGGTTAGGTACCAAGATGTGTGTTTATGAGCAAAA
AGACAAATACTAATAGGATTGTGGGAGCTTGGAAGAATTCTGTTTAGCTCCACCACAACA
CTCTTTTCCTCCGTTTGGCCTTCCCACGATGCTTTCCCAGCTACGAATTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO61TF U 1
AF RR2E994TF U 7
AF RR2DJ11TF U 40
AF RR2DJ11JQ C 416
AF RR2E994JQ C 612
BS 1 622 RR2CO61TF
BS 623 623 RR2E994TF
BS 624 693 RR2CO61TF
BS 694 777 RR2DJ11TF
BS 778 879 RR2DJ11JQ
BS 880 1135 RR2E994JQ

RD RR2CO61TF 693 0 0
GAAAGAGAGGATTAAGGAGGCGGAGACGAAGCTGGAGGAGGGACCATGGCGTCGACGTCG
TTGGTGCTAACGTTAGCATCTCCTCTGTTTAGTCGTCGGTCTGTTTCCGCAAGGGTAGCC
TTGACGATGATTACAGAGCCCTCAGTAAAATTGGGAAGAAGAAGAAGAAGATGCTCGGGG
AAAGAAGAAGTGCTTCTAGAAGGAATGCCACCGGAGTATTATGATGATGAATGGCAAGCT
CGGCAGAGGGAGAAGACGAAAGAATTGAGGCGGATGCAGCGGGAGGAAGAAGAAGAAGAA
GAGAGAAAGATTGAAGAGTACCGTGAAATCGGCTTGAGGTTGAAGGAATTTCCTGAGCAA
GACTTGAGGAAAGCTAGAAAGCTCGTCTCCACCTTCATCACTGCTGCTGAGGAAGTCGAA
GAGAGAATTGAAGAAGCAGCTGAGAAAGGAGAACTGGACGAGCTTGTTCTCATGATCATA
TGGAACCGCCTTGACCTTGCTCGCCGTGATGACGAGAAGGACGCTATAAGAAGTCTTGAT
CTCTTGTATAGAAGAGTCGAGACAGAGATCTTAAAACGGCAAGCAAGTCCTGCCATGAAG
CTGCTGAATGATCTTCTAAACACGCATGATGGCTTTGGAGACGATGCTTGGCTGAAAGAC
TGCAGAAAACGAATGGCTGAGACATTCCCACGG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2E994TF 682 0 0
GAGGATTAAGGAGGCGGAGACGAAGCTGGAGGAGGGACCATGGCGTCGACGTCGTTGGTG
CTAACGTTAGCATCTCCTCTGTTTAGTCGTCGGTCTGTTTCCGCAAGGGTAGCCTTGACG
ATGATTACAGAGCCCTCAGTAAAATTGGGAAGAAGAAGAAGAAGATGCTCGGGGAAAGAA
GAAGTGCTTCTAGAAGGAATGCCACCGGAGTATTATGATGATGAATGGCAAGCTCGGCAG
AGGGAGAAGACGAAAGAATTGAGGCGGATGCAGCGGGAGGAAGAAGAAGAAGA***GAGA
AAGATTAAAGAGTACCGTGAAATCGGCTTGAGGTTGAAGGAATTTCCTGAGCAAGACTTG
AGGAAAGCTAGAAAGCTCGTCTCCACCTTCATCACTGCTGCTGAGGAAGTCGAAGAGAGA
ATTGAAGAAGCAGCTGAGAAAGGAGAACTGGACGAGCTTGTTCTCATGATCATATGGAAC
CGCCTTGACCTTGCTCGCCGTGATGACGAGAAGGACGCTATAAGAAGTCTTGATCTCTTG
TATAGAAGAGCCGAGACAGAGATCTTAAAACGGCAAGCAAGTCCTGCCATGAAGCTGCTG
AATGATCTTCTAAACATGCATGATGGCTTTGGAGACGATGCTTGGCTGAAAGACTGCAGA
AAACGAATGGCTGAGACATTCC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2DJ11TF 738 0 0
GGGACCATGGCGTCGACGTCGTTGGTGCTAACGTTAGCATCTCCTCTGTTTAGTCGTCGG
TCTGTTTCCGCAAGGGTAGCCTTGACGATGATTACAGAGCCCTCAGTAAAATTGGGAAGA
AGAAGAAGAAGATGCTCGGGGAAAGAAGAAGTGCTTCTAGAAGGAATGCCACCGGAGTAT
TATGATGATGAATGGCAAGCTCGGCAGAGGGAGAAGACGAAAGAATTGAGGCGGATGCAG
CGGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGAAAGATTGAAGAGTACCGTGAAATCGGCTTGAGG
TTGAAGGAATTTCCTGAGCAAGACTTGAGGAAAGCTAGAAAGCTCGTCTCCACCTTCATC
ACTGCTGCTGAGGAAGTCGAAGAGAGAATTGAAGAAGCAGCTGAGAAAGGAGAACTGGAC
GAGCTTGTTCTCATGATCATATGGAACCGCCTTGACCTTGCTCGCCGTGATGACGAGAAG
GACGCTATAAGAAGTCTTGATCTCTTGTATAGAAGAGTCGAGACAGAGATCTTAAAACGG
CAAGCAAGTCCTGCCATGAAGCTGCTGAATGATCTTCTAAACATGCATGATGGCTTTGGA
GACGATGCTTGGCTGAAAGACTGCAGAAAACGAATGGCTGACACATTCTCACGGGAAGAC
CCCTTCAGCATTCTAATGCCACCCGGTTTCGACATTGATATGCATCAAGGACCGTTACGG
TCGCCTGTTGAGACAGAC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2DJ11JQ 464 0 0
TCGAAGAGAGAATTGAAGAAGCAGCTGAGAAAGGAGAACTGGACGAGCTTGTTCTCATGA
TCATATGGAACCGCCTTGACCTTGCTCGCCGTGATGACGAGAAGGACGCTATAAGAAGTC
TTGATCTCTTGTATAGAAGAGTCGAGACAGAGATCTTAAAACGGCAAGCAAGTCCTGCCA
TGAAGCTGCTGAATGATCTTCTAAACATGCATGATGGCTTTGGAGACGATGCTTGGCTGA
AAGACTGCAGAAAACGAATGGCTGACACATTCCCACGGGAAGACCCCTTCAGCATTCTAA
TGCCACCCGGTTTCGACATTGATATGCATCAAGGACCGTTACGGTCGCCTGTTGAGACAG
ACGACACCCTTTTCAGAGTAGACTTTGTAAGAGAAGTGGATGCATTGCTGCATGAAGTGA
GACTAATAGAGGAAGACGAGGAGGAAGCTGGTAAGAAAGGAGAG

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2E994JQ 524 0 0
TCTTCTAAACATGCATGATGGCTTTGGAGACGATGCTTGGCTGAAAGACTGCAGAAAACG
AATGGCTGAGACATTCCCACGGGAAGACCCCTTCAGCATTTTAATGCCACCCGGTTTCGA
CATTGATATGCATCAAGGACCGTTACGGTCGCCTGTTGAGACAGACGACACCCTTTTCAG
AGTAGACTTTGTAAGAGAAGTGGATGCATTGCTGCATGAAGTGAGACTAATAGAGGAAGA
CGAGGAGGAAGCTGGTAAGAAAGGAGAGGTGCTGGACCCTGAAGCGATAGCACGTAAGTT
GAAGCAGCAAGAGAAGAAGCGAACCATCCGTCAAGTTGAAGCCCTTCTTGATTTGGCCCT
CAACTTGAAGTGGTAGGTTAGGTACCAAGATGTGTGTTTATGAGCAAAAAGACAAATACT
AATAGGATTGTGGGAGCTTGGAAGAATTCTGTTTAGCTCCACCACAACACTCTTTTCCTC
CGTTTGGCCTTCCCACGATGCTTTCCCAGCTACGAATTTTTTTT

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 4

CO CL1800Contig1 921 4 14 U
AAATTTCTAAAAGATTGTTCAGAGTAGTGTTAAATCGATCAGTTTTCAAAAAAAATCAAT
CAACACTGATAGAAGTACAAGATTTTCACATGCTAACAACACAATTCCTCTGTAATATTC
AAAATATTCATCAATTTCTCGTTTTTTAAATAAAACTCCTTTATATACTACAAGCCGCTA
ATTTTCAGCATTTATGATTATTCTGCATAAACTCTATCTACTTTAGTTTTTTTTTAATAT
TTCATCATACTTCAATTATTTTTCACTATAATACTATTCAACTGATATACATGTAAAATT
CAATCTATGACCACATGACAAACTTCTCTCTTCTGGAAACATGAAATAGCGTACATGAAA
TTCGCTATTTGTGTTGGATGGCGTGGATCGAAGAAGATATACATGTCCGGTTCCTTACAC
GCCTTTGAGAATGGAAAACAAGTCGTGGTTGAACCTCCATTATAAACTTTAGGACAACAT
GGGCTTGTAGTGTTCAATAGATTCGAACTAACTTGATTGCTCGAAGGTCCACGAAGTCCC
AACATGAAGTTGAAGTAGTCGGAATATAAGAAGGAAGTATTTGACAGTCTATGATGCATA
TGCGACAAGCTTTCTCTAAGCTGAACATTGAAAATGTCGATAGCAAGGTTTAAAGAGTCG
TTGCAGCTTCCATGAGGTACCGTCTTAGCAATGATATTTGGGTAACAACCTAAAGGTTTA
ATGTTGTTGACGAAGAAATTCCGTGCTCCTAAGTTATATAATCTCTCGAGCTGTTTCAAG
AACTCATTAAGAAGCATGCTTGCAAACTCATTTGCATCGGTTGCGTTCTTTTCATATGTG
AAAGCGTAATCATTGACCCCAATTGCGGTCATAAACAACGATTTACCCAAGTGGCTACTA
AGCTCCGGCTGTGTCTTGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2FT32JQ U 120
AF RR2FT32TF C 156
AF RR2B731JQ U 1
AF RR2D625JQ U 129
BS 1 238 RR2B731JQ
BS 239 239 RR2FT32JQ
BS 240 274 RR2B731JQ
BS 275 275 RR2FT32JQ
BS 276 378 RR2B731JQ
BS 379 379 RR2FT32JQ
BS 380 730 RR2B731JQ
BS 731 731 RR2FT32JQ
BS 732 768 RR2B731JQ
BS 769 770 RR2FT32JQ
BS 771 905 RR2B731JQ
BS 906 906 RR2D625JQ
BS 907 917 RR2B731JQ
BS 918 921 RR2D625JQ

RD RR2FT32JQ 706 0 0
CAAAATATTCATCAATTTCTCGTTTTTTAAATAAAACTCCTTTATATACTACAAGCCGCT
AATTTTCAGCATTTATGATTATTCTGCATAAACTCTATCTACTTTAGTTTTTTTTTAATA
TTTCATCATACTTCAATTATTTTTCACTATAATACTATTCAACTGATATACATGTAAAAT
TCAATCTATGACCACATGACAAACTTCTCTCTTCTGGAAACATGAAATAGCGTACATGAA
ATTCGCTATTTGTGTTGGATGGCGTGGATCGAAGAAGATATACATGTCCGGTTCCTTACA
CGCCTTTGAGAATGGAAAACAAGTCGTGGTTGAACCTCCATTATAAACTTTAGGACAACA
TGGGCTTGTAGTGTTCAATAGATTCGAACTAACTTGATTGCTCGAAGGTCCACGAAGTCC
CAACATGAAGTTGAAGTAGTCGGAATATAAGAAGGAAGTATTTGACAGTCTATGATGCAT
ATGCGACAAGCTTTCTCTAAGCTGAACATTGAAAATGTCGATAGCAAGGTTTAAAGAGTC
GTTGCAGCTTCCATGAGGTACCGTCTTAGCAATGATATTTGGGTAACAACCTAAAGGTTT
AATGTTGTTGACGAAGAAATTCCGTGCTCCTAAGTTATATAATCTCTCGAGCTGTTTCAA
GAACTCATTAAGAAGCATGCTTGCAAACTCATTTGCATCGGTTGC
C

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2FT32TF 670 0 0
CTCCTTTATATACTACAAGCCGCTAATTTTCAGCATTTATGATTATTCTGCATAAACTCT
ATCTACTTTAGTTTTTTTTTAATATTTCATCATACTTCAATTATTTTTCACTATAATACT
ATTCAACTGATATACATGTAAAATTCAATCTATGACCACATGACAAACTTCTCTCTTCTG
GAAACATGAAATAGCGTACATGAAATTCGCTATTTGTGTTGGATGGCGTGGATCGAAGAA
GATATACATGTCCGGTTCCTTACACGCCTTTGAGAATGGAAAACAAGTCGTGGTTGAACC
TCCATTATAAACTTTAGGACAACATGGGCTTGTAGTGTTCAATAGATTCGAACTAACTTG
ATTGCTCGAAGGTCCACGAAGTCCCAACATGAAGTTGAAGTAGTCGGAATATAAGAAGGA
AGTATTTGACAGTCTATGATGCATATGCGACAAGCTTTCTCTAAGCTGAACATTGAAAAT
GTCGATAGCAAGGTTTAAAGAGTCGTTGCAGCTTCCATGAGGTACCGTCTTAGCAATGAT
ATTTGGGTAACAACCTAAAGGTTTAATGTTGTTGACGAAGAAATTCCGTGCTCCTAAGTT
ATATAATCTCTCGAGCTGTTTCAAGAACTCATTAAGAAGCATGCTTGCAAACTCATTTGC
ATCGGTTGC
C

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2B731JQ 917 0 0
AAATTTCTAAAAGATTGTTCAGAGTAGTGTTAAATCGATCAGTTTTCAAAAAAAATCAAT
CAACACTGATAGAAGTACAAGATTTTCACATGCTAACAACACAATTCCTCTGTAATATTC
AAAATATTCATCAATTTCTCGTTTTTTAAATAAAACTCCTTTATATACTACAAGCCGCTA
ATTTTCAGCATTTATGATTATTCTGCATAAACTCTATCTACTTTAGTTTTTTTTTAATGT
TTCATCATACTTCAATTATTTTTCACTATAATACCATTCAACTGATATACATGTAAAATT
CAATCTATGACCACATGACAAACTTCTCTCTTCTGGAAACATGAAATAGCGTACATGAAA
TTCGCTATTTGTGTTGGACGGCGTGGATCGAAGAAGATATACATGTCCGGTTCCTTACAC
GCCTTTGAGAATGGAAAACAAGTCGTGGTTGAACCTCCATTATAAACTTTAGGACAACAT
GGGCTTGTAGTGTTCAATAGATTCGAACTAACTTGATTGCTCGAAGGTCCACGAAGTCCC
AACATGAAGTTGAAGTAGTCGGAATATAAGAAGGAAGTATTTGACAGTCTATGATGCATA
TGCGACAAGCTTTCTCTAAGCTGAACATTGAAAATGTCGATAGCAAGGTTTAAAGAGTCG
TTGCAGCTTCCATGAGGTACCGTCTTAGCAATGATATTTGGGTAACAACCTAAAGGTTTA
ATGTTGTTGAAGAAGAAATTCCGTGCTCCTAAGTTATATAATCTCTCG**CTGTTTCAAG
AACTCATTAAGAAGCATGCTTGCAAACTCATTTGCATCGGTTGCGTTCTTTTCATATGTG
AAAGCGTAATCATTGACCCCAATTGCGGTCATAAACAACGATTTACCCAAGTGGCTACTA
AGCTCTGGCTGTGTCTT

QA 1 917 1 917
DS 

RD RR2D625JQ 793 0 0
CG
TCAATTTCTCGTTTTTTAAATAAAACTCCTTTATATACTACAAGCCGCTAATTTTCAGCA
TTTATGATTATTCTGCATAAACTCTATCTACTTTAGTTTTTTTTTAATGTTTCATCATAC
TTCAATTATTTTTCACTATAATACTATTCAACTGATATACATGTAAAATTCAATCTATGA
CCACATGACAAACTTCTCTCTTCTGGAAACATGAAATAGCGTACATGAAATTCGCTATTT
GTGTTGGATGGCGTGGATCGAAGAAGATATACATGTCCGGTTCCTTACACGCCTTTGAAA
ATGGAAAGCAAGTCGTGGTTGAACCTCCATAA**AACTTTAGGACAACATGGGCTTGTAG
TGTTCAATAGATTCGAACTAACTTGATTGCTCGAAGGTCCACGAAGTCCCAACATGAAGT
TGAAGTAGTCGGAATATAAGAAGGAAGTATTTGACAGTCTATGATGCATATGCGACAAGC
TTTCTCTAAGCAGAACATTGAAAATGTCGATAGCAAGGTTTAAAGAGTCGTTGCAGCTTC
CATGAGGTACCGTCTTAGCAATGATATTTGGGTAACAACCTAAAGGTTTAATGTTGTTGA
CGAAGAAATTCCGTGCTCCTAAGTTATATAATCTCTCGAGCTGTTTCAAGAACTCATTAA
GAAGCATGCTTGCAAACTCATTTGCATCGGTTGCGTTCTTTTCATATGTGAAAGCGTAAT
CATTGACCCCAATTGCGGTCATAAACAACGATTTACCCAAGTGGCTACTAAGCTCCGGCT
GTGTCTTGAAC

QA 3 793 3 793
DS 



AS 1 5

CO CL1801Contig1 741 5 23 U
GGGAAACTGGGGTACCCCTGAAGATGATATTCCACCACCAACGGAGGAAGCCACAACAGA
GGTTGAGAAGAGCCCTGTTGCTGAGAAGGAAGGCGGTGAGGACAACACCACCGATGCAAA
GAATGAGGCTCCTGCTGATGAGGAAAAGGAGAAAGAACCTGAAGACAAGGAAATGACATT
GGAAGAGTATGAAAAAATTCTGGAGGAGAAGAAGAAAGCTCTGCAAGCCACAAAGGTTGA
GGAAAGGAAAGTTGATACCAAAGTGTTCGAGTCTATGCAGCAGCTCTCTAGCAAGAAGAC
CAACAACGAGGAAATCTTCATCAAGCTGGGATCCGACAAACGCAAAGATGCTTCTGAGAA
AGAAGAGAAGGCTAAGAAGTCTTTGAGCATTAACGAGTTTTTGAAGCCGGCTGCTGGAGA
GAGATACAACCCAAGAGGTGGTTACCGTGGAAGAGGAGGAGGCCGTGGACAGAGAGATGG
AGGAGGCCGCAATGGTGGTCGTGGACAGAGAGATGAAAAAGTGAACAGAGGAGCTCCTGC
TCCGGCCATTGGAGACAGTGCTCAGTTCCCATCGTTGGGCAAATGAAGACCCCTCCTTGG
TCCTTCAGCATCTATCTATCTCTCTACTGTCTTAGTTTTAATTTTGTTCTTAATTCTATC
ATTCTTGTTACACTTTTTCTACAGAACAAGTTTGAGTGCTTTTTAGTTATGGAAAAACAA
ATTATAAGCCCTCTGTTCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2DF51TF U 1
AF RR2D076TF U 472
AF RR2DF51JQ C 137
AF RR2CO93JQ C 76
AF RR2CO93TF U 76
BS 1 91 RR2DF51TF
BS 92 92 RR2CO93TF
BS 93 98 RR2DF51TF
BS 99 99 RR2CO93TF
BS 100 102 RR2DF51TF
BS 103 104 RR2CO93TF
BS 105 186 RR2DF51TF
BS 187 187 RR2CO93TF
BS 188 192 RR2DF51TF
BS 193 193 RR2CO93TF
BS 194 303 RR2DF51TF
BS 304 304 RR2CO93TF
BS 305 368 RR2DF51TF
BS 369 471 RR2CO93TF
BS 472 575 RR2D076TF
BS 576 576 RR2CO93TF
BS 577 663 RR2D076TF
BS 664 664 RR2CO93TF
BS 665 712 RR2D076TF
BS 713 716 RR2CO93TF
BS 717 717 RR2CO93JQ
BS 718 738 RR2CO93TF
BS 739 741 RR2CO93JQ

RD RR2DF51TF 368 0 0
GGGAAACTGGGGTACCCCTGAAGATGATATTCCACCACCAACGGAGGAAGCCACAACAGA
GGTTGAGAAGAGCCCTGTTGCTGAGAAGGAAAGCGGTGGGGATGACACCACCGATGCAAA
GAATGAGGCTCCTGCTGATGAGGAAAAGGAGAAAGAACCTGAAGACAAGGAAATGACATT
GGAAGA*TATGAGAAAATTCTGGAGGAGAAGAAGAAAGCTCTGCAAGCCACAAAGGTTGA
GGAAAGGAAAGTTGATACCAAAGTGTTCGAGTCTATGCAGCAGCTCTCTAGCAAGAAGAC
CAATAACGAGGAAATCTTCATCAAGCTGGGATCCGACAAACGCAAAGATGCTTCTGAGAA
AGAAGAGA

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR2D076TF 241 0 0
GAGAGATGGAGGAGGCCGCAATGGTGGTCGTGGACAGAGAGATGAAAAAGTGAACAGAGG
AGCTCCTGCTCCGGCCATTGGAGACAGTGCTCAGTTCCCATCGTCGGGCAAATGAAGACC
CCTCCTTGGTCCTTCAGCATCTATCTATCTCTCTACTGTCTTAGTTTTAATTTTGTTCTT
AATTCTATCATTTTTGTTACACTTTTTCTACAGAACAAGTTTGAGTGCTTTTTAGTTATG
G

QA 1 241 1 241
DS 

RD RR2DF51JQ 576 0 0
GATGAGGAAAAGGAGAAAGAACCTGAAGACAAGGAAATGACATTGGAAGAGTATGAGAAA
ATTCTGGAGGAGAAGAAGAAAGCTCTGCAAGCCACAAAGGTTGAGGAAAGGAAAGTTGAT
ACCAAAGTGTTCGAGTCTATGCAGCAGCTCTCTAGCAAGAAGACCAATAACGAGGAAATC
TTCATCAAGCTGGGATCCGACAAACGCAAAGATGCTTCTGAGAAAGAAGAGAAGGCTAAG
AAGTCTTTGAGCATTAACGAGTTTTTGAAGCCGGCTGATGGAGAGAGATACAACCCAAGA
GGTGGATACCGTGGAAGAGGAGG***CCGTGGACAGAGAGATGGAGGAGGCCGCAATGGT
GGTCGTGGACAGAGAGATGAAAAAGTGAACGGAGGAGCTCCTGCTCCGGCCATCGGAGAC
AGTGCTCAGTTCCCATCGTTGGGCAAATGAAGACCCCTCCTTGGTCCTTCAACATCTATC
TATCTCTCTACTGTCTTAGTTTTAATTTTGTTCTTAATTCTATCATTTTTGTTACACTTT
TTCTACAGAACAAGTTTGAGTGCTTTTTAGTTATGG

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2CO93JQ 666 0 0
G
GTTGCTGAGAAGGAAGGCGGTGAGGACAACACCACCGATGCAAAGAATGAGGCTCCTGCT
GATGAGGAAAAGGAGAAAGAACCTGAAGACAAGGAAATGACATTGGAAGAGTATGAAAAA
ATTCTGGAGGAGAAGAAGAAAGCTCTGCAAGCCACAAAGGTTGAGGAAAGGAAAGTTGAT
ACCAAAGTGTTTGAGTCTATGCAGCAGCTCTCTAGCAAGAAGGCCAACAACGAGGAAATC
TTCATCAAGCTGGGATCCGACAAACGCAAAGATGCTTCTGAGAAAGAAGAGAAGGCTAAG
AAGTCTTTGAGCATTAACGAGTTTTTGAAGCCGGCTGCTGGAGAGAGATACAACCCAAGA
GGTGGTTACCGTGGAAGAGGAGGAGGCCGTGGACAGAGAGATGGAGGAGGCCGCAATGGT
GGTCGTGGACAGAGAGATGAAAAAGTGAACAGAGGAGCTCCTGCTCCGGCCATTGGAGAC
AGTGCTCAGTTCCCATCGTTGGGCAAATGAAGACCCCTCCTTGGTCCTTCAGCATCTATC
TATCTCTCTACTGTCTTAGTTTTAATTTTGTTCTTAATTCTATCATTCTTGTTACACTTT
TTCTACAGAACAAGTTTGAGTGCTTTTTAGTTATGGAAAAACAAATTATAAGCCCTCTGT
TCCAC

QA 2 666 2 666
DS 

RD RR2CO93TF 666 0 0
G
GTTGCTGAGAAGGAAGGCGGTGAGGACAACACCACCGATGCAAAGAATGAGGCTCCTGCT
GATGAGGAAAAGGAGAAAGAACCTGAAGACAAGGAAATGACATTGGAAGAGTATGAAAAA
ATTCTGGAGGAGAAGAAGAAAGCTCTGCAAGCCACAAAGGTTGAGGAAAGGAAAGTTGAT
ACCAAAGTGTTTGAGTCTATGCAGCAGCTCTCTAGCAAGAAGGCCAACAACGAGGAAATC
TTCATCAAGCTGGGATCCGACAAACGCAAAGATGCTTCTGAGAAAGAAGAGAAGGCTAAG
AAGTCTTTGAGCATTAACGAGTTTTTGAAGCCGGCTGCTGGAGAGAGATACAACCCAAGA
GGTGGTTACCGTGGAAGAGGAGGAGGCCGTGGACAGAGAGATGGAGGAGGCCGCAATGGT
GGTCGTGGACAGAGAGATGAAAAAGTGAACAGAGGAGCTCCTGCTCCGGCCATTGGAGAC
AGTGCTCAGTTCCCATCGTTGGGCAAATGAAGACCCCTCCTTGGTCCTTCAGCATCTATC
TATCTCTCTACTGTCTTAGTTTTAATTTTGTTCTTAATTCTATCATTCTTGTTACACTTT
TTCTACAGAACAAGTTTGAGTGCTTTTTAGTTATGGAAAA*CAAATTATAAGCCCTCTGT
TC
ACA

QA 2 663 2 663
DS 



AS 1 5

CO CL1802Contig1 1006 5 31 U
TTTTTCTTTTGGCGATGGAGACACTTCCAATCTCCGCGGAGAGCTTCAAGGTAGGGTTCA
TCGGAGCTGGAAAGATGGCGGAGAGTATAGCCAGAGGGGTGGTTGCCTCCGGGATGCTTC
CACCGAATCGTATCTCCACCGCCGTTCACTCGAATCTGAATCGCCGTCAAGTCTTCGAGT
CCTTTGGCGTCAATGTCTTCTCCAGTAGCGAAGAAGTCGTTAAAGAAAGTGACGTTGTGA
TCTTCTCTGTGAAACCTCAAGTTGTTAAGAAGGCCATCACGGAAGTAAGGTCAACGCTCT
CCAAGGATAAGGTTCTTGTTTCGGTTGCAGCGGGGATCAAGTTGAAAGATCTTCAGGAAT
GGTCTGGTCAAGATAGATTCATAAGGGTGATGCCTAATACACCAGCTGCAGTTGGCGAGG
CAGCTTCAGTAATGAGCCTTGGAACAGCAGCTACAGAAGAAGACGGAGCACTTGTTGCTA
AGTTGTTTGGCTCGGTGGGGAAGATATTAAGGGCCGATGAGAAAATGTTTGATGCTGTCA
CTGGTCTCAGTGGAAGTGGACCAGCGTACATATTCTTAGCCATTGAAGCTTTAGCTGATG
GAGGAGTAGCTGCTGGTTTACCCCGAGAACTCGCATTGGGTTTAGCTTCACAGACGGTTC
TTGGAGCTGCAACAATGGTAAGCAAAACCGGGAAGCATCCTGGTGTCTTGAAAGATGATG
TTACTTCACCAGGCGGGACTACAATAGCTGGAGTTCATGAACTGGAGAAAGGTTCTTTCC
GTGCAACACTTATGAATGCTGTTGTTGCTGCAGCTAATCGAAGCCGCGAGCTCTCACAGA
GCTAAATGACATAAAAGAGAGATGCTACTATTATTTCACCTCACAGATTCTTTCATCACA
ATAAGGGGTTTACTTTGGTAGGTGTGAAAAACTATTTGTCTCGACTCTGTATTGGTTCAG
ATCTCAGCTACTTTGTTTTCATTCTTATATCTAATAAAAACTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AE32TF U 12
AF RR2FQ27TF U 1
AF RR2BB29TF U 12
AF RR2AE32JQ C 188
AF RR2BB29JQ C 403
BS 1 97 RR2FQ27TF
BS 98 98 RR2AE32TF
BS 99 277 RR2FQ27TF
BS 278 278 RR2AE32TF
BS 279 297 RR2FQ27TF
BS 298 298 RR2AE32TF
BS 299 304 RR2FQ27TF
BS 305 305 RR2AE32TF
BS 306 352 RR2FQ27TF
BS 353 353 RR2AE32TF
BS 354 374 RR2FQ27TF
BS 375 375 RR2AE32TF
BS 376 409 RR2FQ27TF
BS 410 410 RR2AE32TF
BS 411 418 RR2FQ27TF
BS 419 419 RR2AE32TF
BS 420 547 RR2FQ27TF
BS 548 548 RR2AE32TF
BS 549 550 RR2FQ27TF
BS 551 551 RR2AE32TF
BS 552 656 RR2FQ27TF
BS 657 657 RR2BB29TF
BS 658 686 RR2FQ27TF
BS 687 687 RR2BB29TF
BS 688 703 RR2FQ27TF
BS 704 704 RR2BB29TF
BS 705 721 RR2FQ27TF
BS 722 722 RR2BB29TF
BS 723 739 RR2FQ27TF
BS 740 887 RR2BB29TF
BS 888 1006 RR2AE32JQ

RD RR2AE32TF 641 0 0
GCGATGGAGACACTTCCAATCTCCGCGGAGAGCTTCAAGGTAGGGTTCATCGGAGCTGGA
AAGATGGCGGAGAGTATAGCCAGAGGGGTGGTTGCCTCCGGGATGCTTCCACCGAATCGT
ATCTCCACCGCCGTTCACTCGAATCTGAATCGCCGTCAAGTCTTCGAGTCCTTTGGCGTC
AATGTCTTCTCCAGTAGCGAAGAAGTCGTTAAAGAAAGTGACGTTGTGATCTTCTCTGTG
AAACCTCAAGTTGTTAAGAAGGCCATCACGGAAGTAAGGTCAACGCTCTCCAAGGATAAG
GTTCTTGTTTCGGTTGCAGCGGGGATCAAGTTGAAAGATCTTCAGGAATGGTCTGGTCAA
GATAGATTCATAAGGGTGATGCCTAATACACCAGCTGCAGTTGGCGAGGCAGCTTCAGTA
ATGAGCCTTGGAACAGCAGCTACAGAAGAAGACGGAGCACTTGTTGCTAAGTTGTTTGGC
TCGGTGGGGAAGATATTAAGGGCCGATGAGAAAATGTTTGATGCTGTCACTGGTCTCAGT
GGAAGTGGACCAGCGTACATATTCTTAGCCATTGAAGCTTTAGCTGATGGAGGAGTAGCT
GCTGGTTTACCCCGAGAACTCGCATTGGGTTTAGCTTCACA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2FQ27TF 757 0 0
TTTTTCTTTTGGCGATGGAGACACTTCCAATCTCCGCGGAGAGCTTCAAGGTAGGGTTCA
TCGGAGCTGGAAAGATGGCGGAGAGTATAGCCAGAGGCGTGGTTGCCTCCGGGATGCTTC
CACCGAATCGTATCTCCACCGCCGTTCACTCGAATCTGAATCGCCGTCAAGTCTTCGAGT
CCTTTGGCGTCAATGTCTTCTCCAGTAGCGAAGAAGTCGTTAAAGAAAGTGACGTTGTGA
TCTTCTCTGTGAAACCTCAAGTTGTTAAGAAGGCCATTACGGAAGTAAGGTCAACGCCCT
CCAAAGATAAGGTTCTTGTTTCGGTTGCAGCGGGGATCAAGTTGAAAGATCTACAGGAAT
GGTCTGGTCAAGATCGATTCATAAGGGTGATGCCTAATACACCAGCTGCTGTTGGCGAAG
CAGCTTCAGTAATGAGCCTTGGAACAGCAGCTACAGAAGAAGACGGAGCACTTGTTGCTA
AGTTGTTTGGCTCGGTGGGGAAGATATTAAGGGCCGATGAGAAAATGTTTGATGCTGTCA
CTGGTCTAAGCGGAAGTGGACCAGCGTACATATTCTTAGCCATTGAAGCTTTAGCTGATG
GAGGAGTAGCTGCTGGTTTACCCCGAGAACTCGCATTGGGTTTAGCTTCACAGACG*TTC
TTGGAGCTGCAACAATGGTAAGCAAA*CCGGGAAGCATCCTGGAGTCTTGAAAGATGATG
T*ACTTCACCAGGCGGGAC
ACATAGCTGGAGTCATGA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2BB29TF 876 0 0
GCGATGGAGACACTTCCAATCTCCGCGGAGAGCTTCAAGGTAGGGTTCATCGGAGCTGGA
AAGATGGCGGAGAGTATAGCCAGAGGGGTGGTTGCCTCCGGGATGCTTCCACCGAATCGT
ATCTCCACCGCCGTTCACTCGAATCTGAATCGCCGTCAAGTCTTCGAGTCCTTTGGCGTC
AATGTCTTCTCCAGTAGCGAAGAAGTCGTTAAAGAAAGTGACGTTGTGATCTTCTCTGTG
AAACCTCAAGTTGTTAAGAAGGCCATCACGGAAGTAAGGTCAACGCTCTCCAAGGATAAG
GTTCTTGTTTCGGTTGCAGCGGGGATCAAGTTGAAAGATCTTCAGGAATGGTCTGGTCAA
GATAGATTCATAAGGGTGATGCCTAATACACCAGCCGCAGTTGGCGAGGCAGCTTCAGTA
ATGAGCCTTGGAACAGCAGCTACAGAAGAAGACGGAGCACTTGTTGCTAAGTTGTTTGGC
TCGGTGGGGAAGATATTAAGGGCCGATGAGAAAATGTTTGATGCTGTCACTGGTCTCAGT
GGAAGTGGACCAGCGTACATATTCTTAGCCATTGAAGCTTTAGCTGATGGAGGAGTAGCT
GCTGGTTTACCCCGAGAACTCGCATTGGGTTTAGCTTCACAGACGGTTCTTGGAGCTGCA
ACAATGGTAAGCAAAACCGGGAAGCATCCTGGTGTCTTGAAAGATGATGTTACTTCACCA
GGCGGGACTACAATAGCTGGAGTTCATGAACTGGAGAAAGGTTCTTTCCGTGCAACACTT
ATGAATGCTGTTGTTGCTGCAGCTAATCGAAGCCGCGAGCTCTCACAGAGCTAAATGACA
TAAAAGAGAGATGCTACTATTATTTCACCTCACAGA

QA 1 876 1 876
DS 

RD RR2AE32JQ 819 0 0
CGTCAATGTCTTCTCCAGTAGCGAAGAAGTCGTTAAAGAAAGTGACGTTGTGATCTTCTC
TGTGAAACCTCAAGTTGTTAAGAAGGCCATCACGGAAGTAAGGTCAACGCTCTCCAAGGA
TAAGGTTCTTGTTTCGGTTGCAGCGGGGATCAAGTTGAAAGATCTTCAGGAATGGTCTGG
TCAAGATAGATTCATAAGGGTGATGCCTAATACACCAGCTGCAGTTGGCGAGGCAGCTTC
AGTAATGAGCCTTGGAACAGCAGCTACAGAAGAAGACGGAGCACTTGTTGCTAAGTTGTT
TGGCTCGGTGGGGAAGATATTAAGGGCCGATGAGAAAATGTTTGATGCTGTCACTGGTCT
CAGTGGAAGTGGACCAGCGTACATATTCTTAGCCATTGAAGCTTTAGCTGATGGAGGAGT
AGCTGCTGGTTTACCCCGAGAACTCGCATTGGGTTTAGCTTCACAGACGGTTCTTGGAGC
TGCAACAATGGTAAGCAAAACCGGGAAGCATCCTGGTGTCTTGAAAGATGATGTTACTTC
ACCAGGCGGGACTACAATAGCTGGAGTTCATGAACTGGAGAAAGGTTCTTTCCGTGCAAC
ACTTATGAATGCTGTTGTTGCTGCAGCTAATCGAAGCCGCGAGCTCTCACAGAGCTAAAT
GACATAAAAGAGAGATGCTACTATTATTTCACCTCACAGATTCTTTCATCACAATAAGGG
GTTTACTTTGGTAGGTGTGAAAAACTATTTGTCTCGACTCTGTATTGGTTCAGATCTCAG
CTACTTTGTTTTCATTCTTATATCTAATAAAAACTTCAC

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2BB29JQ 604 0 0
CAGCCGCAGTTGGCGAGGCAGCTTCAGTAATGAGCCTTGGAACAGCAGCTACAGAAGAAG
ACGGAGCACTTGTTGTTAAGTTGTTTGGCTCGGTGGGGAAGATATTAAGGGCCGATGAGA
AAATGTTTGATGCTGTCACTGGTCTCAGTGGAAGTGGACCAGCGTACATATTTTTAGCCA
TTGAAGCTTTAGCTGATGGAGGAGTAGCTGCTGGTTTACCCCGAGAACTCGCATTGGGTT
TAGCTTCACAGACGGTTCTTGGAGCTGCAACAATGGTAAGCAAAACCGGGAAGCATCCTG
GTGTCTTGAAAGATGATGTTACTTCACCAGGCGGGACTACAATAGCTGGAGTTCATGAAC
TGGAGAAAGGTTCTTTCCGTGCAACACTTATGAATGCTGTTGTTGCTGCAGCTAATCGAA
GCCGCGAGCTCTCACAGAGCTAAATGACATAAAAGAGAGATGCTACTATTATTTCACCTC
ACAGATTCTTTCATCACAATAAGGGGTTTACTTTGGTAGGTGTGAAAAACTATTTGTCTC
GACTCTGTATTGGTTCAGATTTCAGCTACTTTGTTTTCATTCTTATATCTAATAAAAACT
TCAC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 2 5

CO CL1803Contig1 488 3 5 U
GGATCGTAGAGTGACCAAAGCTGCATCCTCCGTCTAGGGTTTTCACCAAGTCGTCTTCCT
CGCATTTCCGCAAGCAATCATGGTTCTCCAAAATGACATCGACCTCCTCAACCCTCCAGC
TGAGCTGGAGAATAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTGCAATCTCCTAACTCTTTCTT
CATGGACGTCAAATGCCAGGGATGCTTCAACATAACAACTGTGTTCAGCCACTCTCAAAC
AGTTGTAGTGTGTGGAAACTGTCAGACTGTTCTGTGCCAGCCCACCGGTGGTAAAGCAAG
GCTCACTGAGGGTTGCTCTTTCAGGAAAAAGTGAAATCATCATCTTTTCAAAAATGTTGC
TGTGATGTTCAGTTTGGTTTTTCTAGTTATTGTTATTGTCTTGTGACGTTTCTCATGTTT
CTTATGAAAAGATTTTGAAGACATGAAAACTAGTTGAGTTATTAATCCTATGCTTTATTT
TAGTTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV47TF U 1
AF RR2DZ40TF U 6
AF RR2DX09TF U 6
BS 1 132 RR2AV47TF
BS 133 133 RR2DZ40TF
BS 134 413 RR2AV47TF
BS 414 414 RR2DZ40TF
BS 415 488 RR2AV47TF

RD RR2AV47TF 488 0 0
GGATCGTAGAGTGACCAAAGCTGCATCCTCCGTCTAGGGTTTTCACCAAGTCGTCTTCCT
CGCATTTCCGCAAGCAATCATGGTTCTCCAAAATGACATCGACCTCCTCAACCCTCCAGC
TGAGCTGGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTGCAATCTCCTAACTCTTTCTT
CATGGACGTCAAATGCCAGGGATGCTTCAACATAACAACTGTGTTCAGCCACTCTCAAAC
AGTTGTAGTGTGTGGAAACTGTCAGACTGTTCTGTGCCAGCCCACCGGTGGTAAAGCAAG
GCTCACTGAGGGTTGCTCTTTCAGGAAAAAGTGAAATCATCATCTTTTCAAAAATGTTGC
TGTGATGTTCAGTTTGGTTTTTCTAGTTATTGTTATTGTCTTGTGACGTTTCTTATGTTT
CTTATGAAAAGATTTTGAAGACATGAAAACTAGTTGAGTTATTAATCCTATGCTTTATTT
TAGTTTTA

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2DZ40TF 482 0 0
GG
AGAGTGACCAAAGCTGCATCCTCCGTCTAGGGTTTTCACCAAGTCGTCTTCCTCGCATTT
CCGCAAGCAATCATGGTTCTCCAAAATGACATCGACCTCCTCAACCCTCCAGCTGAGCTG
GAGAATAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTGCAATCTCCTAACTCTTTCTTCATGGAC
GTCAAATGCCAGGGATGCTTCAACATAACAACTGTGTTCAGCCACTCTCAAACAGTTGTA
GTGTGTGGAAACTGTCAGACTGTTCTGTGCCAGCCCACCGGTGGTAAAGCAAGGCTCACT
GAGGGTTGCTCTTTCAGGAAAAAGTGAAATCATCATCTTTTCAAAAATGTTGCTGTGATG
TTCAGTTTGGTTTTTCTAGTTATTGTTATTGTCTTGTGACGTTTCTCATGTTTCTTATGA
AAAGATTTTGAAGACATGAAAACTAGTTGAGTTATTAATCCTATGCTTTATTTTA
GTTTT

QA 3 477 3 477
DS 

RD RR2DX09TF 477 0 0
GG
AGAGTGACCAAAGCTGCATCCTCCGTCTAGGGTTTTCACCAAGTCGTCTTCCTCGCATTT
CCGCAAGCAATCATGGTTCTCCAAAATGACATCGACCTCCTCAACCCTCCAGCTGAGCTG
GAGAATAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTGCAATCTCCTAACTCTTTCTTCATGGAC
GTCAAATGCCAGGGATGCTTCAACATAACAACTGTGTTCAGCCACTCTCAAACAGTTGTA
GTGTGTGGAAACTGTCAGACTGTTCTGTGCCAGCCCACCGGTGGTAAAGCAAGGCTCACT
GAGGGTTGCTCTTTCAGGAAAAAGTGAAATCATCATCTTTTCAAAAATGTTGCTGTGATG
TTCAGTTTGGTTTTTCTAGTTATTGTTATTGTCTTGTGACGTTTCTCATGTTTCTTATGA
AAAGATTTTGAAGACATGAAAACTAGTTGAGTTATTAATCCTATGCTTTATTTTA

QA 3 477 3 477
DS 



CO CL1803Contig2 313 2 1 U
AAAACTAAAATAAAGCATAGGATTAATAACTCAACTAGTTTTCATGTCTTCAAAATCTTT
TCATAAAAAACATGAAAAACGTCCCAAGACAATAACAATAACTAAAAAAACCAAACTGAA
CATCACAGCAACATTTTTGAAAAAATGATGATTTCACTTTTTCCTGAAAGAGCAACCCTC
AGTGAGCCTTGCTTTACCACCGGGGGGCTGGCACAAAACAGTCTGACAGTTTCCACACAC
TACAACTGTTTGAGAGTGGCTGAACACAGTTGTTATGTTGAAGCATCCCTGGCATTTGAC
GTCCATGAAGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX09JQ U 9
AF RR2DZ40JQ U 1
BS 1 313 RR2DZ40JQ

RD RR2DX09JQ 102 0 0
AATAAAGCATAGGATTAATAACTCAACTAGTTTTCATGTCTTCAAAATCTTTTCATAAAA
AACATGAAAAACGTCCCAAGACAATAACAATAACTAAAAAAA

QA 1 102 1 102
DS 

RD RR2DZ40JQ 313 0 0
AAAACTAAAATAAAGCATAGGATTAATAACTCAACTAGTTTTCATGTCTTCAAAATCTTT
TCATAAAAAACATGAAAAACGTCCCAAGACAATAACAATAACTAAAAAAACCAAACTGAA
CATCACAGCAACATTTTTGAAAAAATGATGATTTCACTTTTTCCTGAAAGAGCAACCCTC
AGTGAGCCTTGCTTTACCACCGGGGGGCTGGCACAAAACAGTCTGACAGTTTCCACACAC
TACAACTGTTTGAGAGTGGCTGAACACAGTTGTTATGTTGAAGCATCCCTGGCATTTGAC
GTCCATGAAGAAA

QA 1 313 1 313
DS 



AS 1 5

CO CL1804Contig1 1101 5 9 U
GGAATCAGAGATAGAGAGATCAGATATGGAGCTCGATTCCATCACCGCTAGGCGCAGACT
CGCTACCGTCGCCGCTCACTTCCCCTCAGCAACCAACGATCCCATCTCTGCGGCGGCGTC
TCTCGTCCCCTTGAACTGTAGTAGCAGTTTGAACTCTGTCATCAGAAGTTGTGACAATAA
AATCGCTTTTGCTCGGCAAGCATCTTCTGAACAAGGCTTCTTTATGAGGCAGGCTTCCAC
TGACCAGTTTACACCTCAGACTGGCGCCATCACTTTGAAGAACTCTGTCGTTAGAAGAGG
TGACAGCAGGCTCTATTTTGCTCGTCAAGCTTCTTCTGCACAGGGTCTTTTCATGAGGCA
GGCTTCCACTGACGAGGGGACTATACCACAGGACGCTGCATCTACCGAGACGAATGGATT
CCCTTCTTCTACAGAACAACCTTTGGTTTCCAGACCTGAGTACGCCCCACCACAGTTTTC
CAAGCCCACCGCAAAAGAAGAGTTCTTTGTTTTGTCTGATTTGCTAAACCAGCCAAAGGA
AAACTTGGAAAATCCATACAACCCTGACCTTCCTAAGTTAGTCAATCCAGGGACTGTTTG
GTCTCCGAGTTCGAATGTTGCAGAATATGAGCATAACTATGTCGTGGCAGTAGAGCTACC
AGGGGCCAGTATCAAAGATATAAGAGTGGAGGTCGACAACATAAACTTGACTGTGACAGG
TAGACGCACAGCTGTCTGTCAAAAAGCTGATGCAGGCACCAAAGGTTCAATCTGTGCGTA
TCACAAGCAAGAAATACTACAAGGACCTTTCAAAGTTTCCTGGCCACTACCCAGCAACGT
GAACAAGGATAACGTTTCTGCTGAATTTATGGATGGGCTTCTGAGAATAGTGATTCCAAA
GCTTTGAGGGATCATTATACGTAAAACGTAAACAATATGTGTATAAAATAATGTTGTATG
TGTGGATGAAGAGAAAGAAAAGCAAAAACTGATGAGTGATATGTAAAATAGAATGGTGTT
TATATATACAGACTGCAGACAGGCATGCTCAGTTAGTGTAGTCAGCCATGTAAACAATCC
ATAAGTTTGTAAGAAAGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G652TF U 5
AF RR2A911TF U 1
AF RR2BE47TF U 5
AF RR2BE47JQ C 375
AF RR2G652JQ C 606
BS 1 61 RR2A911TF
BS 62 62 RR2BE47TF
BS 63 521 RR2A911TF
BS 522 522 RR2BE47TF
BS 523 744 RR2A911TF
BS 745 745 RR2BE47JQ
BS 746 755 RR2A911TF
BS 756 1040 RR2BE47JQ
BS 1041 1101 RR2G652JQ

RD RR2G652TF 655 0 0
GGA
GAGATAGAGAGATCAGATATGGAGCTCGATTCCATCACCGCTAGGCGCAGACTCGCTACC
GTCGCCGCTCACTTCCCCTCAGCAACCAACGATCCCATCTCTGCGGCGGCGTCTCTCGTC
CCCTTGAACTGTAGTAGCAGTTTGAACTCTGTCATCAGAAGTTGTGACAATAAAATCGCT
TTTGCTCGGCAAGCATCTTCTGAACAAGGCTTCTTTATGAGGCAGGCTTCCACTGACCAG
TTTACGCCTCAGACTGGCGCCATCACTTTGAAGAACTCTGTCGTTAGAAGAGGTGACAGC
AGGCTCTATTTTGCTCGTCAAGCTTCTTCTGCACAGGGTCTTTTCATGAGGCAGGCTTCC
ACTGACGAGGGGACTATACCACAGGACGCCGCATCTACCGAGACGAATGGATTCCCTTCT
TCTACAGAACAACCTTTGGTTTCCAGACCTGAGTACGCCCCACCACAGTTTTCCAAGTCC
ACCGCAAAAGAAGAGTTCTTTGTTTTGTCTGATTTGCTAAACCAGCCAAAGGAAAACTTG
GAAAATCCATACAACCCTGACCTTCCTAAGTTAGTCAATCCAGGGACTGTTTGGTCTCCG
AGTTCGAATGTTGCAGAATATGAGCATAACTATGTCGTGGCAGTAGAGCTAC

QA 4 655 4 655
DS 

RD RR2A911TF 758 0 0
GGAATCAGAGATAGAGAGATCAGATATGGAGCTCGATTCCATCACCGCTAGGCGCAGACT
CACTACCGTCGCCGCTCACTTCCCCTCAGCAACCAACGATCCCATCTCTGCGGCGGCGTC
TCTCGTCCCCTTGAACTGTAGTAGCAGTTTGAACTCTGTCATCAGAAGTTGTGACAATAA
AATCGCTTTTGCTCGGCAAGCATCTTCTGAACAAGGCTTCTTTATGAGGCAGGCTTCCAC
TGACCAGTTTACACCTCAGACTGGCGCCATCACTTTGAAGAACTCTGTCGTTAGAAGAGG
TGACAGCAGGCTCTATTTTGCTCGTCAAGCTTCTTCTGCACAGGGTCTTTTCATGAGGCA
GGCTTCCACTGACGAGGGGACTATACCACAGGACGCTGCATCTACCGAGACGAATGGATT
CCCTTCTTCTACAGAACAACCTTTGGTTTCCAGACCTGAGTACGCCCCACCACAGTTTTC
CAAGCCCACCGCAAAAGAAGAGTTCTTTGTTTTGTCTGATTCGCTAAACCAGCCAAAGGA
AAACTTGGAAAATCCATACAACCCTGACCTTCCTAAGTTAGTCAATCCAGGGACTGTTTG
GTCTCCGAGTTCGAATGTTGCAGAATATGAGCATAACTATGTCGTGGCAGTAGAGCTACC
AGGGGCCAGTATCAAAGATATAAGAGTGGAGGTCGACAACATAAACTTGACTGTGACAGG
TAGACGCACAGCTGTCTGTCAAAA*GCTGATGCAG
CAC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2BE47TF 757 0 0
GGG
GAGATAGAGAGATCAGATATGGAGCTCGATTCCATCACCGCTAGGCGCAGACTCGCTACC
GTCGCCGCTCACTTCCCCTCAGCAACCAACGATCCCATCTCTGCGGCGGCGTCTCTCGTC
CCCTTGAACTGTAGTAGCAGTTTGAACTCTGTCATCAGAAGTTGTGACAATAAAATCGCT
TTTGCTCGGCAAGCATCTTCTGAACAAGGCTTCTTTATGAGGCAGGCTTCCACTGACCAG
TTTACACCTCAGACTGGCGCCATCACTTTGAAGAACTCTGTCGTTAGAAGAGGTGACAGC
AGGCTCTATTTTGCTCGTCAAGCTTCTTCTGCACAGGGTCTTTTCATGAGGCAGGCTTCC
ACTGACGAGGGGACTATACCACAGGACGCTGCATCTACCGAGACGAATGGATTCCCTTCT
TCTACAGAACAACCTTTGGTTTCCAGACCTGAGTACGCCCCACCACAGTTTTCCAAGCCC
ACCGCAAAAGAAGAGTTCTTTGTTTTGTCTGATTTGCTAAACCAGCCAAAGGAAAACTTG
GAAAATCCATACAACCCTGACCTTCCTAAGTTAGTCAATCCAGGGACTGTTTGGTCTCCG
AGTTCGAATGTTGCAGAATATGAGCATAACTATGTCGTGGCAGTAGAGCTACCAGGGGCC
AGTATCAAAGATATAAGAGTGGAGGTCGACAACATAAACTTGACTGTGACAGGTAGACGC
ACAGCTGTCTGTCAAAA*GCTGATGCAG
CACCAA

QA 4 751 4 751
DS 

RD RR2BE47JQ 666 0 0
AGGGGACTATACCACAGGACGCTGCATCTACCGAGACGAATGGATTCCCTTCTTCTACAG
AACAACCTTTGGTTTCCAGACCTGAGTACGCCCCACCACAGTTTTCCAAGCCCACCGCAA
AAGAAGAGTTCTTTGTTTTGTCTGATTTGCTAAACCAGCCAAAGGAAAACTTGGAAAATC
CATACAACCCTGACCTTCCTAAGTTAGTCAATCCAGGGACTGTTTGGTCTCCGAGTTCGA
ATGTTGCAGAATATGAGCATAACTATGTCGTGGCAGTAGAGCTACCAGGGGCCAGTATCA
AAGATATAAGAGTGGAGGTCGACAACATAAACTTGACTGTGACAGGTAGACGCACAGCTG
TCTGTCAAAAAGCTGATGCAGGCACCAAAGGTTCAATCTGTGCGTATCACAAGCAAGAAA
TACTACAAGGACCTTTCAAAGTTTCCTGGCCACTACCCAGCAACGTGAACAAGGATAACG
TTTCTGCTGAATTTATGGATGGGCTTCTGAGAATAGTGATTCCAAAGCTTTGAGGGATCA
TTATACGTAAAACGTAAACAATATGTGTATAAAATAATGTTGTATGTGTGGATGAAGAGA
AAGAAAAGCAAAAACTGATGAGTGATATGTAAAATAGAATGGTGTTTATATATACAGACT
GCAGAC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2G652JQ 496 0 0
CGAGTTCGAATGTTGCAGAATATGAGCATAACTATGTCGTGGCAGTAGAGCTACCAGGGG
CCAGTATCAAAGATATAAGAGTGGAGGTCGACAACATAAACTTGACTGCGACAGGTAGAC
GCACAGCTGTTTGTCAAAAAGCTGATGCAGGCACCAAAGGTTCAATCTGTGGGTATCACA
AGCAAGAAATACTACAAGGACCTTTCAAAGTTTCCTGGCCACTACCCAGCAACGTGAACA
AGGATAACGTTTTTGCTGAATTTATGGATGGGCTTTTGAGAATAGTGATTCCAAAGCTTT
GAGGGATCATTATACGTAAAACGTAAACAATATGTGTATAAAATAATGTTGTATGTGTGG
ATGAAGAGAAAGAAAAGCAAAAACTGATGAGTGATATGTAAAATAGAATGGTGTTTATAT
ATACAGACTGCAGACAGGCATGCTCAGTTAGTGTAGTCAGCCATGTAAACAATCCATAAG
TTTGTAAGAAAGAAAA

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 2

CO CL1805Contig1 949 2 2 U
GCTTTTGTTATATCATTTTCCATGGATGGACCTTGACCTCTGCTTCCCTTCTCTCTCCTG
ATTTCGTTCGTGCACTTTCTCTCTCTCTCTCTTCGTTAGTTTGATCTTCTACTGTGTTCG
TCTTCTCTCTCCAGATAAAAAGACAAGTTGTGTAGCAAACTAAGAGATCTCATGACTTAT
CGATTGGAAAGTGTGGACAAGGAGGGTTTAGGCACTTCACCTGGTCTAAAGGAACGCAAC
TACTTTGGTTTGTCTGATTGCTCCTCTGTTGACAGCTCAACCCTTCCCAATGCTGACAAG
AAGAGCAGCAGCCTCAACTTCAAAGCTACAGAGCTAAGGCTAGGTCTTCCTGACTCTCAA
TCTCCTCAGAGAGAAGCTGATTTCGGTTTGCTGAGTCCAAGAACTCCTGATGAGAAACTT
CTCTTCCCGCTGCTCCCTTGCAAAGACCATGCTGCTTCAGGCAACAAAAGAGGATATCTT
GCTAAGAGTGGCTCCAACAATGCACCTGCTGCCAAGGCACAGGTTGTTGGTTGGCCTCCA
ATCAGATCCTACAGGAAGAACACAATGGCTTCTTCTACTTCAAAGAACACTAATGAGGTT
GATGGGAAACCTGGTCTTGGCGCTCTGTTTGTGAAGGTGAGCATGGATGGTGCTCCCTAT
CTGAGGAAACTGAAGATCATGAAGGGCTCTGATTCTATTGGTCAATGTGGACTTCATGGA
GCTCATGGGAAGGAAATCGAAGAACAAAGATTGGGGCTCAAAACAAAACGTTATGCACAG
TTCCTCCCATGTTTCAGTCTTCATAAACTGATGTGTGTTTGAAAACTCTTATCATCTAGT
CTTTTACTAATCTGTGTTTGTTAAGACTTCGGAATCTCTTTTGTGCTTGTTTAGAACAAA
TACACTTGCTCTGATGTGTGTTCAGTTTTAATTTTCAAGACTTATATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU41TF U 1
AF RR2CU41JQ C 178
BS 1 633 RR2CU41TF
BS 634 949 RR2CU41JQ

RD RR2CU41TF 633 0 0
GCTTTTGTTATATCATTTTCCATGGATGGACCTTGACCTCTGCTTCCCTTCTCTCTCCTG
ATTTCGTTCGTGCACTTTCTCTCTCTCTCTCTTCGTTAGTTTGATCTTCTACTGTGTTCG
TCTTCTCTCTCCAGATAAAAAGACAAGTTGTGTAGCAAACTAAGAGATCTCATGACTTAT
CGATTGGAAAGTGTGGACAAGGAGGGTTTAGGCACTTCACCTGGTCTAAAGGAACGCAAC
TACTTTGGTTTGTCTGATTGCTCCTCTGTTGACAGCTCAACCCTTCCCAATGCTGACAAG
AAGAGCAGCAGCCTCAACTTCAAAGCTACAGAGCTAAGGCTAGGTCTTCCTGACTCTCAA
TCTCCTCAGAGAGAAGCTGATTTCGGTTTGCTGAGTCCAAGAACTCCTGATGAGAAACTT
CTCTTCCCGCTGCTCCCTTGCAAAGACCATGCTGCTTCAGGCAACAAAAGAGGATATCTT
GCTAAGAGTGGCTCCAACAATGCACCTGCTGCCAAGGCACAGGTTGTTGGTTGGCCTCCA
ATCAGATCCTACAGGAAGAACACAATGGCTTCTTCTACTTCAAAGAACACTAATGAGGTT
GATGGGAAACCTGGTCTTGGCGCTCTGTTTGTG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2CU41JQ 772 0 0
TATCGATTGGAAAGTGTGGACAAGGAGGGTTTAGGCACTTCACCTGGTCTAAAGGAACGC
AACTACTTTGGTTTGTCTGATTGCTCCTCTGTTGACAGCTCAACCCTTCCCAATGCTGAC
AAGAAGAGCAGCAGCCTCAACTTCAAAGCTACAGAGCTAAGGCTAGGTCTTCCTGACTCT
CAATCTCCTCAGAGAGAAGCTGATTTCGGTTTGCTGAGTCCAAGAACTCCTGATGAGAAA
CTTCTCTTCCCGCTGCTCCCTTGCAAAGACCATGCTGCTTCAGGCAACAAAAGAGGATAT
CTTGCTAAGAGTGGCTCCAACAATGCACCTGCTGCCAAGGCACAGGTTGTTGGTTGGCCT
CCAATCAGATCCTACAGGAAGAACACAATGGCTTCTTCTACTTCAAAGAACACTAATGAG
GTTGATGGGAAACCTGGTCTTGGCGCTCTGTTTGTGAAGGTGAGCATGGATGGTGCTCCC
TATCTGAGGAAACTGAAGATCATGAAGGGCTCTGATTCTATTGGTCAATGTGGACTTCAT
GGAGCTCATGGGAAGGAAATCGAAGAACAAAGATTGGGGCTCAAAACAAAACGTTATGCA
CAGTTCCTCCCATGTTTCAGTCTTCATAAACTGATGTGTGTTTGAAAACTCTTATCATCT
AGTCTTTTACTAATCTGTGTTTGTTAAGACTTCGGAATCTCTTTTGTGCTTGTTTAGAAC
AAATACACTTGCTCTGATGTGTGTTCAGTTTTAATTTTCAAGACTTATATCT

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 5

CO CL1806Contig1 543 5 13 U
GGAAGAAGAAGCGATGGGTGGTCTCGTCCTAATTTCTTCTTGTCCCGCACCGTCCTCCCT
CGTCCTCGTCTCTCGGCTTCACCAGTTCTCCGCCGGAATAAAAAACAGTGAAATTTCGCT
CAATCATCAACTTTCTCCTACCCGTAAACCCTTAATTGCGAAACCATGTTGTTTCAATCT
TCCTCAAGAACCTATCCTCTCGGAGGCTCTCAAGGAGCCAATTGCATTTGTGGGCGGGGT
GTTTGCTGGACTACTTAGACTGGATCTAAACGATGAACCGCTCAAGGAATGGGTGACGCG
AACTGTTGAAGCTTCTGGTATTACAGACGAGGATGTTGGTGGATATGGGATGGCATCTAA
TGAAGAAGAATCTCCTCAACAGATTGAGATTGAATGAGGTCATTGTCCTTTAATATGGTT
GCCCTTGTGTATGTGTATGTTTATGTGCTAGAAACATAAACCCAAAGAAGATTGTGCTCT
TAGAAAAACCAAGGCTTACAATCTTGATTGACATCTTGCTCTATGTATCTTTAATAAAAT
GAT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 15 15 30 30 30 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2CF32JQ C 1
AF RR2E739JQ C 1
AF RR2E739TF U 1
AF RR2CF32TF U 1
AF RR2E984TF U 4
BS 1 26 RR2E739TF
BS 27 27 RR2CF32TF
BS 28 353 RR2E739TF
BS 354 354 RR2CF32TF
BS 355 438 RR2E739TF
BS 439 439 RR2CF32TF
BS 440 488 RR2E739TF
BS 489 493 RR2CF32TF
BS 494 494 RR2E984TF
BS 495 498 RR2CF32TF
BS 499 506 RR2E984TF
BS 507 521 RR2CF32TF
BS 522 543 RR2E984TF

RD RR2CF32JQ 513 0 0
GGAAGAAGAAGCGATGGGTGGTTTCGTCCTAATTTCTTCTTGTCCCGCACCGTCCTCCCT
CGTCCTCGTCTTTCGGCTTCACCAGTTCTCCGCCGGAATAAAAAACAGTGAAATTTCGCT
CAATCATCAACTTTCTCCTACCCGTAAACCCTTAATTGCGAAACCATGTTGTTTCAATCT
TCCTCAAGAACCTATCCTCTCGGAGGCTCTCAAGGAGCCAATTGCATTTGTGGGCGGGGT
GTTTGCTGGACTACTTAGACTGGATCTAAACGATGAACCGCTCAAGGAATGGGTGACGCG
AACTGTTGAAGCTTCTGGTATTACAGACGAGGATGTTGGTGGATATGGGATGGCATCTAA
TGAAGAAGAATCTCCTCAACAGATTGAGATTGAATGAGGTCATTGTCCTTTAATATGGTT
GCCCTTGTGTATGTGTATGTTTATGTGCTAGAAACATAAACCCAAAGAAGATTGTGCTCT
TAGAAAAACCAAGGCTT
AATTGACATCTTGCTC

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2E739JQ 504 0 0
GGAAGAAGAAGCGATGGGTGGTCTCGCCCTAATTTCTTCTTGTCCCGCACCGTCCTCCCT
CGTCCTCGTCTTTCGGCTTCACCAGTTTTCCGCCGGAATAAAAAACAGTGAAATTTCGCT
CAATCATCAACTTTCTCCTACCCGTAAACCCTTAATTGCGAAACCATGTTGTTTCAATCT
TCCTCAAGAACCTATCCTCTCGGAGGCTCTCAAGGAGCCAATTGCATTTGTGGGCGGGGT
GTTTGCTGGACTACTTAGACTGGATCTAAACGATGAACCGCTCAAGGAATGGGTGACGCG
AACTGTTGAAGCTTCTGGTATTACAGACGAGGATGTTGGTGGATATGGGATGGTATCTAA
TGAAGAAGAATCTCCTCAACAGATTGAGATTGAATGAGGTCATTGTCCTTTAATATGGTT
GCCCTTGTGTATGTGTATTTTTATGTGCTAGAAACATAAACCCAAAGAAGATTGTGCTCT
TAGAAAAACCAAGGCTT
AATTGAC

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2E739TF 488 0 0
GGAAGAAGAAGCGATGGGTGGTCTCGCCCTAATTTCTTCTTGTCCCGCACCGTCCTCCCT
CGTCCTCGTCTCTCGGCTTCACCAGTTCTCCGCCGGAATAAAAAACAGTGAAATTTCGCT
CAATCATCAACTTTCTCCTACCCGTAAACCCTTAATTGCGAAACCATGTTGTTTCAATCT
TCCTCAAGAACCTATCCTCTCGGAGGCTCTCAAGGAGCCAATTGCATTTGTGGGCGGGGT
GTTTGCTGGACTACTTAGACTGGATCTAAACGATGAACCGCTCAAGGAATGGGTGACGCG
AACTGTTGAAGCTTCTGGTATTACAGACGAGGATGTTGGTGGATATGGGATGGTATCTAA
TGAAGAAGAATCTCCTCAACAGATTGAGATTGAATGAGGTCATTGTCCTTTAATATGGTT
GCCCTTGTGTATGTGTATTTTTATGTGCTAGAAACATAAACCCAAAGAAGATTGTGCTCT
TAGAAAAA

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2CF32TF 521 0 0
GGAAGAAGAAGCGATGGGTGGTCTCGTCCTAATTTCTTCTTGTCCCGCACCGTCCTCCCT
CGTCCTCGTCTCTCGGCTTCACCAGTTCTCCGCCGGAATAAAAAACAGTGAAATTTCGCT
CAATCATCAACTTTCTCCTACCCGTAAACCCTTAATTGCGAAACCATGTTGTTTCAATCT
TCCTCAAGAACCTATCCTCTCGGAGGCTCTCAAGGAGCCAATTGCATTTGTGGGCGGGGT
GTTTGCTGGACTACTTAGACTGGATCTAAACGATGAACCGCTCAAGGAATGGGTGACGCG
AACTGTTGAAGCTTCTGGTATTACAGACGAGGATGTTGGTGGATATGGGATGGCATCTAA
TGAAGAAGAATCTCCTCAACAGATTGAGATTGAATGAGGTCATTGTCCTTTAATATGGTT
GCCCTTGTGTATGTGTATGTTTATGTGCTAGAAACATAAACCCAAAGAAGATTGTGCTCT
TAGAAAAACCAAG*CTTA********ATTGACATCTTGCTC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2E984TF 540 0 0
GGAAGAAGAAGCGATG
GGTCTCGTCCTAATTTCTTCTTGTCCCGCACCGTCCTCCCTCGTCCTCGTCTCTCGGCTT
CACCAGTTCTCCGCCGGAATAAAAAACAGTGAAATTTCGCTCAATCATCAAGTTTCTCCT
ACCCGTAAACCCTTAATTGCGAAACCATGTTGTTTCAATCTTCCTCAAGAACCTATCCTC
TCGGAGGCTCTCAAGGAGCCAATTGCATTTGTGGGTGGGGTGTTTGCTGGTCTACTTAGA
CTGGATCTAAACGATGAACCGCTCAAGGAATGGGTGACGCGAACTGTTGAAGCTTCTGGT
ATTACAGGCGAGGAGGTTGGTGGATATAGGATGGCATCCAATGAAGAAGAATCTCCTCAA
CAGATTGAGATTGAATGAGGTCATTGTCCTTTAACATGGTTGCCCTTGTGTATGTGTATG
TTTATGTGCAAGAAACATAAACCCAAAGGAGATTGTGCTCTTGGGAAAACCAAAGCTTTC
AATCTTGATTGACATCTTGCTCTATGTATCTTTAATAAAATGAT

QA 17 540 17 540
DS 



AS 1 5

CO CL1807Contig1 801 5 6 U
CGTTGCAGATGCCGATCTCAGGAGAGGGGGTTTCTACTTACCTTTCTCTGGGGATATTGT
CGAATCTAAGTGGCGACCTAAGACACGCCAAGTTTCCCCTGATCCTAGTGTTATACAGGC
AGCAGTGGATGAAATATTCCCACACCATCACAGTGTCGATGACAAGTTCTTTCAGGAGTG
GGTGGAAACCCACGATATTGAACTTGAAGTTTCTAAGTGTTCCCTTGACCTTTCAGTCTT
TAATGATTGGACGAAAGGTGCCGACACAAGAGTCAGTCCGGTTATGGATGTTGGAGGACT
TTCCCATAGAGTACCGACTCAACGTGAGGTGTTGCTGGCGGTAAAAAAACGCAACATGAA
CGTTCCTGAATTACAAAGTACCTTCGATGAAGATGCCGTTGTGAAACGATGTTATAAGCG
GTTCGTGTCTCATGTGATAGACAAGTCTAGGTTGTCAAAATTGGGACCTATTTGCGGAGA
AGAAGCTTATTATTTTGAGCAGTACCTTCGTAATAAGAACCCACCTTTATCAGAATATAA
AGGTCCAATTCCACTTGTCGCAGTAGATAAATACATGCATATGATAAAAACGACAGTGAA
GCCCGTTGAAGAAGATAGTCTCCATTTGGAGAGACCTATCCCTGCTACCATAACGTATCA
TAAGAAAGGAGTTGTCATGATGACTTCACCATATTTCTTGTGCGCTATGATGAGGTTGTT
ATATTGTCTGAAAAGAAAAATAACCATTCCAACGGGAAAATTCCACCAGATATTCCATAT
GGATCCAATTGTTTTGGAGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F962JQ C 1
AF RR2DA43JQ C 437
AF RR2DA43TF U 437
AF RR2AM51TF U 221
AF RR2DC49TF U 587
BS 1 221 RR2F962JQ
BS 222 438 RR2AM51TF
BS 439 633 RR2DA43TF
BS 634 634 RR2AM51TF
BS 635 728 RR2DA43TF
BS 729 801 RR2DC49TF

RD RR2F962JQ 730 0 0
CGTTGCAGATGCCGATCTCAGGAGAGGGGGTTTCTACTTACCTTTCTCTGGGGATATTGT
CGAATCTAAGTGGCGACCTAAGACACGCCAAGTTTCCCCTGATCCTAGTGTTATACAGGC
AGCAGTGGATGAAATATTCCCACACCATCACAGTGTCGATGACAAGTTCTTTCAGGAGTG
GGTGGAAACCCACGATATTGAACTTGAAGTTTCTAAGTGTTCCCTTGACCTTTCAGTCTT
TAATGATTGGACGAAAGGTGCCGACACAAGAGTCAGTCCGGTTATGGATGTTGGAGGACT
TTCCCATAGAGTACCGACTCAACGTGAGGTGTTGCTGGCGGTAAAGAAACGCAACATGAA
CGTTCCTGAATTACAAAGTACCTTCGATGAAGATGCCGTTGTGAAACGATGTTATAAGCG
GTTCGTGTCTCATGTGATAGACAAGTCTAGGTTGTCAAAATTGGGACCTATTTGCGGAGA
AGAAGCTTATTATTTTGAGCAGTACCTTCGTAATAAGAACCCACCTTTATCAGAATATAA
AGGTCCAATTCCACTTGTCGCAGTAGATAAATACATGCATATGATAAAAACGACAGTGAA
GCCCGTTGAAGAAGATAGTCTCCATTTGGAGAGACCTATCCCTGCTACCATAACGTATCA
TAAGAAAGGAGTTGTCATGATGACTTCACCATATTTCTTGTGCGCTATGATGAGGTTGTT
ATATTGTC
TG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2DA43JQ 293 0 0
GG
AGACAAGTCTAGGTTGTCAAAATTGGGACCTATTTGCGGAGAAGAAGCTTATTATTTTGA
GCAGTACCTTCGTAATAAGAACCCACCTTTATCAGAATATAAAGGTCCAATTCCACTTGT
CGCAGTAGATAAATACATGCATATGATAAAAACGACAGTGAAGCCCGTTGAAGAAGATAG
TCTCCATTTGGAGAGGCCTATCCCTGCTACCATAACGTATCATAAGAAAGGAGTTGTCAT
GATGACTTCACCATATTTCTTGTGCGCTATGATGAGGTTGTTATATTGTC
C

QA 3 292 3 292
DS 

RD RR2DA43TF 293 0 0
GG
AGACAAGTCTAGGTTGTCAAAATTGGGACCTATTTGCGGAGAAGAAGCTTATTATTTTGA
GCAGTACCTTCGTAATAAGAACCCACCTTTATCAGAATATAAAGGTCCAATTCCACTTGT
CGCAGTAGATAAATACATGCATATGATAAAAACGACAGTGAAGCCCGTTGAAGAAGATAG
TCTCCATTTGGAGAGGCCTATCCCTGCTACCATAACGTATCATAAGAAAGGAGTTGTCAT
GATGACTTCACCATATTTCTTGTGCGCTATGATGAGGTTGTTATATTGTC
C

QA 3 292 3 292
DS 

RD RR2AM51TF 510 0 0
G
CCCTTGACCTTTCAGTCTTTAATGATTGGACGAAAGGTGCCGACACAAGAGTCAGTCCGG
TTATGGATGTTGGAGGACTTTCCCATAGAGTACCGACTCAACGTGAGGTGTTGCTGGCGG
TAAAAAAACGCAACATGAACGTTCCTGAATTACAAAGTACCTTCGATGAAGATGCCGTTG
TGAAACGATGTTATAAGCGGTTCGTGTCTCATGTGATAGACAAGTCTAGGTTGTCAAAAT
TGGGACCTATTTGCGGAGAAGAAGCTTATTATTTTGAGCAGTACCTTCGTAATAAGAACC
CACCTTTATCAGAATATAAAGGTCCAATTCCACTTGTCGCAGTATATAAATACATGCATA
TGATAAAAACGACAGTGAAGCCCGTTGAAGAAGATAGTCTCCATTTGGAGAGACCTATCC
CTGCTACCATAACGTATCATAAGAAAGGAGTTGTCATGATGACTTCACCATATTTCTTGT
GCGCTATGATGAGGTTGTTATATTGTC
TG

QA 2 508 2 508
DS 

RD RR2DC49TF 215 0 0
AAAACGACAGTGAAGCCCGTTGAAGAAGATAGTCTCCATTTGGAGAGACCTATCCCTGCT
ATCATAACGTATCATAAGAAAGGAGTTGTCATGATGACTTCACCATATTTCTTGTGCGCT
ATGATGAGGTTGTTATATTGTCTGAAAAGAAAAATAACCATTCCAACGGGAAAATTCCAC
CAGATATTCCATATGGATCCAATTGTTTTGGAGGA

QA 1 215 1 215
DS 



AS 1 4

CO CL1808Contig1 895 4 7 U
TTTTTTTTTGGGATAAGGGGATTTTGCCCTTTTGTCTTTGTATTAAAGTTTGAAACAGCC
CAAATCATGGGATAAACAGTTAGTAAACACCAATGTGCTGACACTTTTAAAGACTAGCCA
TAAACTACAGAATGTTTACCTCAAACCAACACAAAGAAGGCAAAATTTGAAACAAGTAAT
AATGTCTTTGGCAAGAAGGAAATATAAGTATCCGTAATGAAAAGCCAACATGAGCTGGTC
ATGCCGTGTTCTTTGCATCGTTTTGAGCAGTTTTCTTGATCGATTCAAGAAGATGCTCAA
TTCTGTATTTCATAACAGGCTGACCATGCCGAGTCTTTCTCATCATTTTCCCTTTAGCTG
CCTTCCTCCGGGACTCGGCCTCTTCTTTGGCTAGTTTCTTGGCCTGAAACGCTTCCTCCC
TCTCCCTCCTCGCTTTCTCCATCTCTTCTCGTGTCTGTTTGTACACCTCCACAACACCGA
TTCTCTTGTGAGATTTTTTACTCTTGTTGTGCTGCTTATCATCATCATCATCATCAACCA
CTTTACTACTCTCATCCTTTTCATGAACATTCTGCTGCTGCTGCTGCTTCATCGACTTCC
TAAACTTGCTCACACACTCGGCATTCTTGTAGTATTCCTTCTGCTTTTTGATGAAAGCAG
GATTGTAGTGACTCTTCTTCGACTTCAAGTTAGCAAAGGTTTGGAGAGAAAGACCACCGC
CTCCTAACCTCTTCATGTTCTTCGACTTGTAGCTCTTCCTTTTATTAGTCTCATCTTCCT
CTCTTTGATGAAAGTTCTTCATGATTCTTCAAGCTACCAAACCAACTCCACAAATCTAAT
CCAAAGAGATTAGGAACCCTAAATTTGTTATCTGCGGCGAGTCTCCGGAGTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ35JQ U 4
AF RR2BM59JQ U 1
AF RR2BM59TF C 175
AF RR2BJ35TF C 217
BS 1 599 RR2BM59JQ
BS 600 600 RR2BJ35JQ
BS 601 618 RR2BM59JQ
BS 619 619 RR2BJ35JQ
BS 620 781 RR2BM59JQ
BS 782 866 RR2BM59TF
BS 867 895 RR2BJ35TF

RD RR2BJ35JQ 681 0 0
AAGCTTGA
GATAAGGGGATTTTGCCCTTTTGTCTTTGTATTAAAGTTTGAAACAGCCCAAATCATGGG
ATAAACAGTTAGTAAACACCAATGTGCTGACACTTTTAAAGACTAGCCATAAACTACAGA
ATGTTTACCTCAAACCAACACAAAGAAGGCAAAATTTGAAACAAGTAATAATGTCTTTGG
CAAGAAGGAAATATAAGTATCCGTAATGAAAAGCCAACATGAGCTGGTCATGCCGTGTTC
TTTGCATCGTTTTGAGCAGTTTTCTTGATCGATTCAAGAAGATGCTCAATTCTGTATTTC
ATAACAGGCTGACCATGCCGAGTCTTTCTCATCATTTTCCCTTTAGCTGCCTTCCTCCGG
GACTCGGCCTCTTCTTTGGCTAGTTTCTTGGCCTGAAACGCTTCCTCCCTCTCCCTCCTC
GCTTTCTCCATCTCTTCTCGTGTCTGTTTGTACACCTCCTCAACACCGATTCTCTTGTGA
GATTTTTTACTCTTGTTGTGCTGCTTATCATCATCATCATCATCAACCACTTTACTACTC
TCATCCTTTTCATGAACATTCTGCTGCTGCTGCTGCTTCATCGACTTCCTAAACTTGCTC
ACACACTCGGCATTCTTGTAGTATTCCTTCTGCTTTTTGATGAAAGCAGGGTTGTAGTGA
CTCTTCTTCGACT

QA 9 681 9 681
DS 

RD RR2BM59JQ 787 0 0
TTTTTTTTTGGGATAAGGGGATTTTGCCCTTTTGTCTTTGTATTAAAGTTTGAAACAGCC
CAAATCATGGGATAAACAGTTAGTAAACACCAATGTGCTGACACTTTTAAAGACTAGCCA
TAAACTACAGAATGTTTACCTCAAACCAACACAAAGAAGGCAAAATTTGAAACAAGTAAT
AATGTCTTTGGCAAGAAGGAAATATAAGTATCCGTAATGAAAAGCCAACATGAGCTGGTC
ATGCCGTGTTCTTTGCATCGTTTTGAGCAGTTTTCTTGATCGATTCAAGAAGATGCTCAA
TTCTGTATTTCATAACAGGCTGACCATGCCGAGTCTTTCTCATCATTTTCCCTTTAGCTG
CCTTCCTCCGGGACTCGGCCTCTTCTTTGGCTAGTTTCTTGGCCTGAAACGCTTCCTCCC
TCTCCCTCCTCGCTTTCTCCATCTCTTCTCGTGTCTGTTTGTACACCTCCACAACACCGA
TTCTCTTGTGAGATTTTTTACTCTTGTTGTGCTGCTTATCATCATCATCATCATCAACCA
CTTTACTACTCTCATCCTTTTCATGAACATTCTGCTGCTGCTGCTGCTTCATCGACTTCT
TAAACTTGCTCACACACTTGGCATTCTTGTAGTATTCCTTCTGCTTTTTGATGAAAGCAG
GATTGTAGTGACTCTTCTTCGACTTCAAGTTAGCAAAGGTTTGGAGAGAAAGACCACCGC
CTCCTAACCTCTTCATGTTCTTCGACTTGTAGCTCTTCCTTTTATTAGTCTCATCTTCCT
C
TCTTTG

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2BM59TF 694 0 0
AGTAATAATGTCTT*GGCAAGAAGGAAATATAAGTATC*GTAATGAAAAGCCAACATGAG
CTGGTCATGCCGTGTTCTT*GCATCGTTTTGAGCAGTTTTCTTGATCGATTCAAGAAGAT
GCTCAATTCTGTATTTCATAACAGGCTGACCATGCCGAGTCTTTCTCATCATTTTCCCTT
TAGCTGCCTTCCTCCGGGACTCGGCCTCTTCTTTGGCTAGTTTCTTGGCCTGAAACGCTT
CCTCCCTCTCCCTCCTCGCTTTCTCCATCTCTTCTCGTGTCTGTTTGTACACCTCCACAA
CACCGATTCTCTTGTGAGATTTTTTACTCTTGTTGTGCTGCTTATCATCATCATCATCAT
CAACCACTTTACTACTCTCATCCTTTTCATGAACATTCTGCTGCTGCTGCTGCTTCATCG
ACTTCTTAAACTTGCTCACACACTTGGCATTCTTGTAGTATTCCTTCTGCTTTTTGATGA
AAGCAGGATTGTAGTGACTCTTCTTCGACTTCAAGTTAGCAAAGGTTTGGAGAGAAAGAC
CACCGCCTCCTAACCTCTTCATGTTCTTCGACTTGTAGCTCTTCCTTTTATTAGTCTCAT
CTTCCTCTCTTTGATGAAAGTTCTTCATGATTCTTCAAGCTACCAAACCAACTCCACAAA
TCTAATCCAAAGAGATTAGGAACCCTAAATTT
CC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2BJ35TF 679 0 0
ATGAAAAGCCAACATGAGCTGGTCATGCCGTGTTCTTTGCATCGTTTTGAGCAGTTTTCT
TGATCGATTCAAGAAGATGCTCAATTCTGTATTTCATAACAGGCTGACCATGCCGAGTCT
TTCTCATCATTTTCCCTTTAGCTGCCTTCCTCCGGGACTCGGCCTCTTCTTTGGCTAGTT
TCTTGGCCTGAAACGCTTCCTCCCTCTCCCTCCTCGCTTTCTCCATCTCTTCTCGTGTCT
GTTTGTACACCTCCTCAACACCGATTCTCTTGTGAGATTTTTTACTCTTGTTGTGCTGCT
TATCATCATCATCATCATCAACCACTTTACTACTCTCATCCTTTTCATGAACATTCTGCT
GCTGCTGCTGCTTCATCGACTTCCTAAACTTGCTCACACACTCGGCATTCTTGTAGTATT
CCTTCTGCTTTTTGATGAAAGCAGGGTTGTAGTGACTCTTCTTCGACTTCAAGTTAGCAA
AGGTTTGGAGAGAAAGACCACCGCCTCCTAACCTCTTCATGTTCTTCGACTTGTAGCTCT
TCCTTTTATTAGTCTCATCTTCCTCTCTTTGATGAAAGTTCTTCATGATTCTTCAAGCTA
CCAAACCAACTCCACAAATCTAATCCAAAGAGATTAGGAACCCTAAATTTGTTATCTGCG
GCGAGTCTCCGGAGTTCTC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 5

CO CL1809Contig1 1250 5 14 U
TTTCAAGTGTAAAATTGCACACTTCTGTTTAGTGGTTATTACATATATAAATGGCAATGA
ATATATAACTAATTAGGCTCGGATTACAACTTAAAAAGAAGGTTCATAGGTCCATCTACT
GTACAAAGATTTATTCAGATTTCTTTCTTACACAATGCAACCGTGGATTAATAAAATCTC
TGGGCTCACTCGTATGAACCCAAGAGACGCGCAAAAACATTAGTCTTCGAGTTTCATCGG
TGAGTCCCAAAGAGAAACGTGTCTTCTTTCTTTTACGGAGAGGAACACTTCTTAGAATCG
CTCCATCCATCTGAGAAATACTGGTACAGTCCCTTGGCAATTGGCTGTGAGATATCCTTC
TCTCTTCTATGTAGAACCCTCAGAAACTCTTCAACACTCAAATTCCCATCTCTATTCGAA
TCAAACACATGAAACGCAATCTCTATAACATTGTCTGACAATGATACTCCACATACCTGA
GAGGCGGCTCTTTTGAAATCTTTCATTGTAAGTAAACCATTGGCTTTGCCATAAGCGAAA
AGCGCTAGAGAAAACGGCCCAAGTTTAGTGCGTAGCTCAGCAAACTGTTTGAATTCCTTT
AACGAGATACGCATGTCCCGGAGATGCGGGTGTTCGCTCAGATCCTCCACTCGATCAAGC
AGCTTGCCCAAATGGCTTGCATCAGCCGCAGCTACCATGGACAGTGCAAAATCCTTGGCT
GATATAGTTCCTCTTCGTTTATAGTCATAATGTGCAAACTCCAGCCTCAGCATTTCTTCA
GTTAGATCTTTCAAAAACTGAGTGAATTTATCGTGCCTAAGTTTGTCACTGCCATCTTTT
CCAAAGAAGTATTCAACCAAGCCTCCATCCTCGACAGAGCCAGACATATTTAACCCTGCG
CGAAGGCCATCTCTGTGGCCAATGCCTTGCCTATGCTGAGATCTCATCAGACTCATCACT
GTCTTAAACTCTTCCTTGTCAATCTCCCTAAAAATAAAAATCTTTAATCAGAAGCGTCTC
AACGAAAGAAAAGCTACAAAGGATAGGAAGCACTGACCAGAGTTGTTTAACATGACTCAG
AGCGTAAACTCATAAAGAGACTCCACAGATCCCCACAACAGGAAAAAAGGGAAAGTTACC
AAAAGCAGGATTGATCTATTTACAAATTTGAACGACTACTCACCCGTTGTTGTCGGTATC
AAACATTTTGAACGCCACGGCGAAGCTTGATTCAGGAATGCTGAGTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM78JQ U 53
AF RR2BM78TF C 53
AF RR2FW16JQ U 1
AF RR2FD21JQ U 53
AF RR2FW16TF C 594
BS 1 110 RR2FW16JQ
BS 111 111 RR2BM78JQ
BS 112 137 RR2FW16JQ
BS 138 138 RR2BM78JQ
BS 139 294 RR2FW16JQ
BS 295 295 RR2BM78JQ
BS 296 314 RR2FW16JQ
BS 315 315 RR2FD21JQ
BS 316 382 RR2FW16JQ
BS 383 383 RR2BM78JQ
BS 384 480 RR2FW16JQ
BS 481 481 RR2BM78JQ
BS 482 772 RR2FW16JQ
BS 773 1250 RR2FW16TF

RD RR2BM78JQ 545 0 0
GG
CAATGAATATATAACTAATTAGGCTCGGATTACAACTTAAAAAGAAGGTTCATAGGTCCA
TCTACTGTACAAAGATTTATTCAGATTTCTTTCTTACACAATGCAACCGTGGATTAATAA
AATCTCTGGGCTCACTCGTATGAACCCAAGAGACGCGCAAAAACATTAGTCTTCGAGTTT
CATCGGTGAGTCCCAAAGAGAAACGTGTCTTCTTTCTTTTACGGAGAGGAACACTTCTTA
GAATCGCTCCATCCATCTGAAAAATACTGGTACAGTCCCTTGGCAATTGGCTGTGAGATA
TCCTTCTCTCTTCTATGTAGAACCCTCAGAAACTCTTCAACACTCAAATTCCCATCTCTA
TTCGAATCAAACACATGAAACGCAATCTCTATAACATTGTCTGACAATGATACTCCACAT
ACCTGAGAGGCGGCTCTTTTGAAATCTTTCATTGTAAGTAAACCATTGGCTTTGCCATAA
GCGAAAAGCGCTAGAGAAAACGGCCCAAGTTTAGTGCGTAGCTCAGCAAACTGTTTGAAT
TCC

QA 3 545 3 545
DS 

RD RR2BM78TF 545 0 0
GG
CAATGAATATATAACTAATTAGGCTCGGATTACAACTTAAAAAGAAGGTTCATAGGTCCA
TCTACTGTACAAAGATTTATTCAGATTTCTTTCTTACACAATGCAACCGTGGATTAATAA
AATCTCTGGGCTCACTCGTATGAACCCAAGAGACGCGCAAAAACATTAGTCTTCGAGTTT
CATCGGTGAGTCCCAAAGAGAAACGTGTCTTCTTTCTTTTACGGAGAGGAACACTTCTTA
GAATCGCTCCATCCATCTGAGAAATACTGGTACAGTCCCTTGGCAATTGGCTGTGAGATA
TCCTTCTCTCTTCTATGTAGAACCCTCAGAAACTCTTCAACACTCAAATTCCCATCTCTA
TTCGAATCAAACACATGAAACGCAATCTCTATAACATTGTCTGACAATGATACTCCACAT
ACCTGAGAGGCGGCTCTTTTGAAATCTTTCATTGTAAGTAAACCATTGGCTTTGCCATAA
GCGAAAAGCGCTAGAGAAAACGGCCCAAGTTTAGTGCGTAGCTCAGCAAACTGTTTGAAT
TCC

QA 3 545 3 545
DS 

RD RR2FW16JQ 772 0 0
TTTCAAGTGTAAAATTGCACACTTCTGTTTAGTGGTTATTACATATATAAATGGCAATGA
ATATATAACTAATTAGGCTCGGATTACAACTTAAAAAGAAGGTTCATAGGCCCATCTACT
GTACAAAGATTTATTCAAATTTCTTTCTTACACAATGCAACCGTGGATTAATAAAATCTC
TGGGCTCACTCGTATGAACCCAAGAGACGCGCAAAAACATTAGTCTTCGAGTTTCATCGG
TGAGTCCCAAAGAGAAACGTGTCTTCTTTCTTTTACGGAGAGGAACACTTCTTAAAATCG
CTCCATCCATCTGAAAAATACTGGTACAGTCCCTTGGCAATTGGCTGTGAGATATCCTTC
TCTCTTCTATGTAGAACCCTCAAAAACTCTTCAACACTCAAATTCCCATCTCTATTCGAA
TCAAACACATGAAACGCAATCTCTATAACATTGTCTGACAATGATACTCCACATACCTGA
AAGGCGGCTCTTTTGAAATCTTTCATTGTAAGTAAACCATTGGCTTTGCCATAAGCGAAA
AGCGCTAGAGAAAACGGCCCAAGTTTAGTGCGTAGCTCAGCAAACTGTTTGAATTCCTTT
AACGAGATACGCATGTCCCGGAGATGCGGGTGTTCGCTCAGATCCTCCACTCGATCAAGC
AGCTTGCCCAAATGGCTTGCATCAGCCGCAGCTACCATGGACAGTGCAAAATCCTTGGCT
GATATAGTTCCTCTTCGTTTATAGTCATAATGTGCAAACTCCAGCCTCAGCA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2FD21JQ 707 0 0
GT
CAATGAATATATAACTAATTAGGCTCGGATTACAACTTAAAAAGAAGGTTCATAGGTCCA
TCTACTGTACAAAGATTTATTCAGATTTCTTTCTTACACAATGCAACCGTGGATTAATAA
AATCTCTGGGCTCACTCGTATGAACCCAAGAGACGCGCAAAAACATTAGTCTTCGAGTTT
CATCGGTGAGTCCCAAAGAGAAACGTGTCTTCTTTCTTTTA*GGAGAGGAACACTTCTTA
GAATCGCTCCATCCATCTGAGAAATACTGGTACAGTCCCTTGGCAATTGGATGTGAGATA
TCCTTCTCTCTTCTATGTAGAACCCTCAGAAACTCTTCAACACTCAAATTCCCATCTCTA
TTCGAATCAAACACATGAAACGCAATCTCTATAACATTGTCTGACAATGATACTCCACAT
ACCTGAGAGGCGGCTCTTTTGAAATCTTTCATTGTAAGTAAACCATTGGCTTTGCCATAA
GCGAAAAGCGCTAGAGAAAACGGCCCCAGTTTAGTGCGTAGCTCAGCAAACTGTTTGAAT
TCCTTTAACGAGATACGCATGTCCCGGAGATGCGGGTGTTCGCTCAGATCCTCCACTCGA
TCAAGCAGCTTGCCCAAATGGCTTGCATCAGCCGCAGCTACCATGGACAGTGCAAAATCC
TTGGCTGATATAGTTCCTCTTCGTTTATAGTCATAATGTGCAAAC

QA 3 707 3 707
DS 

RD RR2FW16TF 657 0 0
ATT
CTTTAACGAGATACGCATGTCCCGGAGATGCGGGTGT*CGCTCAGATCCTCCACTCGATC
AAGCAGCTTGCCCAAATGGCTTGCATCAGCCGCAGCTACCATGGACAGTGCAAAATC*TT
GGCTGATATAGTTCCTCTTCGTTTATAGTCATAATGTGCAAACTCCAGCCTCAGCATTTC
TTCAGTTAGATCTTTCAAAAACTGAGTGAATTTATCGTGCCTAAGTTTGTCACTGCCATC
TTTTCCAAAGAAGTATTCAACCAAGCCTCCATCCTCGACAGAGCCAGACATATTTAACCC
TGCGCGAAGGCCATCTCTGTGGCCAATGCCTTGCCTATGCTGAGATCTCATCAGACTCAT
CACTGTCTTAAACTCTTCCTTGTCAATCTCCCTAAAAATAAAAATCTTTAATCAGAAGCG
TCTCAACGAAAGAAAAGCTACAAAGGATAGGAAGCACTGACCAGAGTTGTTTAACATGAC
TCAGAGCGTAAACTCATAAAGAGACTCCACAGATCCCCACAACAGGAAAAAAGGGAAAGT
TACCAAAAGCAGGATTGATCTATTTACAAATTTGAACGACTACTCACCCGTTGTTGTCGG
TATCAAACATTTTGAACGCCACGGCGAAGCTTGATTCAGGAATGCTGAGTAATC

QA 4 657 4 657
DS 



AS 2 5

CO CL1810Contig1 786 2 2 U
GATCTCAAAGTGACGAAAGTGTCACAGCTGGTTCATCTGATGAAAACGCCAACCACCAGT
AACAAGGTTCAGTTAGGAAGCCAAGCTTCGGACAGATGCTGGCTGATGCAAGTTCTCAGA
GTAATACTACTGGTGAGATCCAAGGCTCCATGCCTATGAAGCCAGTGGCCCCGGTGACTA
ATCTGAACATGGGGATGGACTTATGGTCTTCCCAGGCTGGCGTAGCTGTGAAGGATGAAA
GAGAGCTCAAGAGGCAGAAAAGGAAACAATCTAACCGTGAATCCGCTAGGCGGTCCAGAT
TGCGCAAGCAGGCGGAATGCGAGCAGCTTCAACAGAGAGTAGAGAGTTTGACGAGTGAGA
ATCAAACCCTGAGAGATGAGTTACAGAGACTCTCCGGAGAATGCGAGAAGCTCAAGACTG
AGAACAACTCTATTCAGGATGAGTTGGTGAGAGTGCATGGGCCAGAGGCCGTAGCTAATC
TCGAGCACAATGCTACTGAGTCTAAAGATGCTGAATGAAGAACACATTAACACTTAGGGG
GAAACATGGAGCTTTATAACCGTATCGTTGGGATAAAAAAACTTATTTGAGATTTACGTG
ACCAATATACAATCGTTTTGACATTTTCATTGTAATAGTGATTCAAACATAAGTCTGTAA
AAGCTGCAAAGCTATGATGACTACACTTGTTGTTTTACTAGTCTTCATGATCAGATTCTG
AATCTTGGATTGTTGTCGTTGATAGTTCAAGTTCTGGTTCGGGACTACTGTCTGGGATTT
CTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI59TF U 1
AF RR2DI59JQ C 197
BS 1 772 RR2DI59TF
BS 773 786 RR2DI59JQ

RD RR2DI59TF 772 0 0
GATCTCAAAGTGACGAAAGTGTCACAGCTGGTTCATCTGATGAAAACGCCAACCACCAGT
AACAAGGTTCAGTTAGGAAGCCAAGCTTCGGACAGATGCTGGCTGATGCAAGTTCTCAGA
GTAATACTACTGGTGAGATCCAAGGCTCCATGCCTATGAAGCCAGTGGCCCCGGTGACTA
ATCTGAACATGGGGATGGACTTATGGTCTTCCCAGGCTGGCGTAGCTGTGAAGGATGAAA
GAGAGCTCAAGAGGCAGAAAAGGAAACAATCTAACCGTGAATCCGCTAGGCGGTCCAGAT
TGCGCAAGCAGGCGGAATGCGAGCAGCTTCAACAGAGAGTAGAGAGTTTGACGAGTGAGA
ATCAAACCCTGAGAGATGAGTTACAGAGACTCTCCGGAGAATGCGAGAAGCTCAAGACTG
AGAACAACTCTATTCAGGATGAGTTGGTGAGAGTGCATGGGCCAGAGGCCGTAGCTAATC
TCGAGCACAATGCTACTGAGTCTAAAGATGCTGAATGAAGAACACATTAACACTTAGGGG
GAAACATGGAGCTTTATAACCGTATCGTTGGGATAAAAAAACTTATTTGAGATTTACGTG
ACCAATATACAATCGTTTTGACATTTTCATTGTAATAGTGATTCAAACATAAGTCTGTAA
AAGCTGCAAAGCTATGATGACTACACTTGTTGTTTTACTAGTCTTCATGATCAGATTCTG
AATCTTGGATTGTTGTCGTTGATAGTTCAAGTTCTGGTTCGGGACTACTGTC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2DI59JQ 590 0 0
GGACTTATGGTCTTCCCAGGCTGGCGTAGCTGTGAAGGATGAAAGAGAGCTCAAGAGGCA
GAAAAGGAAACAATCTAACCGTGATTCCGCTAGGCGGTCCAGATTGCGCAAGCAGGCGGA
ATGCGAGCAGCTTCAACAGAGAGTAGAGAGTTTGACGAGTGAGAATCAAACCCTGAGAGA
TGAGTTACAGAGACTCTCCGGAGAATGCGAGAAGCTCAAGACTGAGAACAACTCTATTCA
GGATGAGTTGGTGAGAGTGCATGGGCCAGAGGCCGTAGCTAATCTCGAGCACAATGCTAC
TGAGTCTAAAGATGCTGAATGAAGAACACATTAACACTTAGGGGGAAACATGGAGCTTTA
TAACCGTATCGTTGGGATAAAAAAACTTATTTGAGATTTACGTGACCAATATACAATCGT
TTTGACATTTTCATTGTAATAGTGATTCAAACATAAGTCTGTAAAAGCTGCAAAGCTATG
ATGACTACACTTGTTGTTTTACTAGTCTTCATGATCAGATTCTGAATCTTGGATTGTTGT
CGTTGATAGTTCAAGTTCTGGTTCGGGACTACTGTCTGGGATTTCTTCTC

QA 1 590 1 590
DS 



CO CL1810Contig2 840 3 14 U
GGGGAAGTAACCTTTTACGAGTGTGTAAAAAGCCGAGTTCGTCGTTAATCCGATAATAAA
CCGTCGTACAAATCTCCGATGAACGGATTCGCTTCACAGATTCCATCAATGGCGCTTCTC
GGATCCGGCTTCACCAGCGAGGCTGGGTTACGTGTACTGCTTTCCCCACTTAGTCCCAAC
ATCGTACTTCGTACAGCATGCTGTTCCATTGGCATAGGATTGCCAGTGTACTCCACTTTC
AAGGCCATTGAGACTAGAGATCAGAATCAACAACAAAAATGGCTTATTTACTGGGCAGCT
TTTGGTTCTTTTAGTCTTGTTGAAGTGTTCACGGACAAGCTCATTTCTTGGTTTCCGCTG
TATTATCATGCAAAGTTTGCGTTCCTAGTCTGGCTTCAACTTCCCACCATTGATGGAGCA
AAACAAATATATAACAACCACCTTCGCCCTTTCCTGATACAGCACCAAGCTAGACTGGAT
CGAGTCGTGGATGGCGTCTACGGGGAGATGGTCAAGGTCGTTAGGTCACACCAAGGAGAA
ATACAGTTTGTGCGATCAATGATCGTCAGAATCCTGGGATCAGCCAGTGAAATTACACCA
CCAAGGCAACAAGAAGGAGAAGAGATCCCAGACAGTAGTCCCGAACCAGAACTTGAACTA
TCAACGGCAACAATCCAAGATTCAGAATCTGATCATGAATGACTAGTAAAACAACCAAAC
AAGTGTAGTCATCATAGCTTTTCAGCTTTTACAGCTTTATGTTTGAATCACTATTACAAT
GAAAATGTCAAAACGATTGTATTTTGGTCACGTAAAATCTCAAATAAGTTTTCTTATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB02TF U 18
AF RR2F824TF U 1
AF RR2HB02JQ C 341
BS 1 137 RR2F824TF
BS 138 138 RR2HB02TF
BS 139 252 RR2F824TF
BS 253 253 RR2HB02TF
BS 254 612 RR2F824TF
BS 613 613 RR2HB02TF
BS 614 652 RR2F824TF
BS 653 653 RR2HB02TF
BS 654 705 RR2F824TF
BS 706 706 RR2HB02TF
BS 707 764 RR2F824TF
BS 765 765 RR2HB02JQ
BS 766 787 RR2F824TF
BS 788 840 RR2HB02JQ

RD RR2HB02TF 710 0 0
G
GAGTGTGTAAAAAGCCGAGTTCGTCGTTAATCCGATAATAAACCGTCGTACAAATCTCCG
ATGAACGGATTCGCTTCACAGATTCCATCAATGGCGCTTCTCGGATCCGGCTTCACCAGC
GAGGCTGGGTTACGTGTCCTGCTTTCCCCACTTAGTTCCAACATCGTACTTCGTACAGCA
TGCTGTTCCATTGGCATAGGGTTGCCGGTGTACTCCACTTTCAAGGCCATTGAGACTAGA
GATCAGAATCAACAACAAAAATGGCTTATTTACTGGGCAGCTTTTGGTTCTTTTAGTCTT
GTTGAAGTGTTCACGGACAAGCTCATTTCTTGGTTTCCGCTGTATTATCATGCAAAGTTT
GCGTTCCTAGTCTGGCTTCAACTTCCCACCATTGATGGAGCAAAACAAATATATAACAAC
CACCTTCGCCCTTTCCTGATACAGCACCAAGCTAGACTGGATCGAGTCGTGGATGGCGTC
TACGGGGAGATGGTCAAGGTCGTTAGGTCACACCAAGGAGAAATACAGTTTGTGCGATCA
ATGATCGTCAGAATCCTGGGATCAGCCAGTGAAATTACACCACCAAGGCAACAAGAAGGA
GAAGAGATCCCAGACAGTAGTCTCGAACCAGAACTTGAACTATCAACGGCAACAATCCAA
GATTCAGAATCTGATCATGAATGACTAGTAAAACAAC
CAAACAAGTGTG

QA 2 698 2 698
DS 

RD RR2F824TF 787 0 0
GGGGAAGTAACCTTTTACGAGTGTGTAAAAAGCCGAGTTCGTCGTTAATCCGATAATAAA
CCGTCGTACAAATCTCCGATGAACGGATTCGCTTCACAGATTCCATCAATGGCGCTTCTC
GGATCCGGCTTCACCAGTGAGGCTGGGTTACGTGTACTGCTTTCCCCACTTAGTCCCAAC
ATCGTACTTCGTACAGCATGCTGTTCCATTGGCATAGGATTGCCAGTGTACTCCACTTTC
AAGGCCATTGAGGCTAGAGATCAGAATCAACAACAAAAATGGCTTATTTACTGGGCAGCT
TTTGGTTCTTTTAGTCTTGTTGAAGTGTTCACGGACAAGCTCATTTCTTGGTTTCCGCTG
TATTATCATGCAAAGTTTGCGTTCCTAGTCTGGCTTCAACTTCCCACCATTGATGGAGCA
AAACAAATATATAACAACCACCTTCGCCCTTTCCTGATACAGCACCAAGCTAGACTGGAT
CGAGTCGTGGATGGCGTCTACGGGGAGATGGTCAAGGTCGTTAGGTCACACCAAGGAGAA
ATACAGTTTGTGCGATCAATGATCGTCAGAATCCTGGGATCAGCCAGTGAAATTACACCA
CCAAGGCAACAATAAGGAGAAGAGATCCCAGACAGTAGTCCCGAACCAGAACATGAACTA
TCAACGGCAACAATCCAAGATTCAGAATCTGATCATGAATGACTATTAAAACAACCAAAC
AAGTGTAGTCATCATAGCTTTTCAGCTTTTACAGCTTTATGTTTTAATCACTATTACAAT
GAAAATG

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2HB02JQ 500 0 0
TCATTTCTTGGTTTCCGCTGTATTATCATGCAAAGTTTGCGTTCCTAGTCTGGCTTCAAC
TTCCCACCATTGATGGAGCAAAACAAATATATAACAACCACCTTCGCCCTTTCCTGATAC
AGCACCAAGCTAGACTGGATCGAGTCGTGGATGGCGTTTACGGGGAGATGGTCAAGGTCG
TTAGGTCACACCAAGGAGAAATACAGTTTGTGCGATCAATGATCGTCAGAATCCTGGGAT
CAGCCAGTGAAATTACACCACCAAGGCAACAAGAAGGAGAAGAGATCCCAGACAGTAGTC
CCGAACCAGAACTTGAACTATCAACGGCAACAATCCAAGATTCAGAATCTGATCATGAAT
GACTAGTAAAACAACCAAACAAGTGTGGTCATCATAGCTTTTCAGCTTTTACAGCTTTAT
GTTTGAATCACTATTACAATGAAAATGTCAAAACGATTGTATTTTGGTCACGTAAAATCT
CAAATAAGTTTTCTTATCCC

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 5

CO CL1811Contig1 727 5 5 U
GGATCCAATAACAATTACTTGGACGGTCTCTTCTTCCTCAGATTACGAGAAAAACTCTAA
AATGGCGTCAGTTTCTGCAAGTTTGCCTCCACCATTGCTGCTTACTCAGAGAAAACCTAA
CCTCACATCAGTTCACAAACTTCCGTTTTCTCTTATTCGAGATAGAAGAAGCCCTAGCAT
GGGTCTTATGGTGAAAGCCAATGGTAAAAGTTCCGAATCATCATCGACTGATCTTGACGT
CATTAGTTCCATTCAGAATGTTTGGGATAAGTCTGAAGATCGTTTAGGTCTTATTGGTTT
GAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCTTCACTTAACATAATTACGGCAATCGACAA
ATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTTGGTATCTTGTTCTCCACGTGGTTTAC
ATATCGGTATCTCTTGTTCAAACCCGACAGAGAGGAGCTATCCCAAATTGTCAAGAAATC
AGTGGCGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTCTCAAAAAAAAAAAA*TATACTTGGC
TAGTAAGGCAGCAAATGCATGTGGTATCCTGAGATGATTTGTGTTTGTGACTGTGACATG
ATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTGCTGAACCTGTAAATACTGTATTTGGG
TTTTGGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTCATATAAAGAATTAAGACATCAA
GATCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS87JQ C 232
AF RR2H289JQ C 38
AF RR2H289TF U 38
AF RR2DS87TF U 8
AF RR2A802TF U 1
BS 1 127 RR2A802TF
BS 128 128 RR2H289TF
BS 129 529 RR2A802TF
BS 530 530 RR2H289TF
BS 531 727 RR2A802TF

RD RR2DS87JQ 487 0 0
TCTTGACGTCATTAGTTCCATTCAGAATGTTTGGGATAAGTCTGAAGATCGTTTAGGTCT
TATTGGTTTGAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCTTCACTTAACATAATTACGGC
AATCGACAAATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTTGGTATCTTGTTCTCCAC
GTGGTTTACATATCGGTATCTCTTGTTCAAACCCGACAGAGAGGATCTATCCCAAATTGT
CAAGAAATCAGTGGCGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTCTCAAAAAAAAAAAA*T
ATACTTGGCTAGTAAGGCAGCAAATGCATGTGGTATCCTGAGATGATTTGTGTTTGTGAC
TGTGACATGATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTGCTGAACCTGTAAATACT
GTATTTGGGTTTTGGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTCATATAAAGAATTA
AGACATC

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR2H289JQ 681 0 0
GG
AGATTACGAGAAAAACTCTAAAATGGCGTCAGTTTCTGCAAGTTTGCCTCCACCATTGCT
GCTTACTCAGAGAAAACCTAACCTCACATCAGTTCACAAACTTCCGTTTTCTCTTATTCG
AGATAGAAGAAGCCCTAGCATGGGTCTTATGGTGAAAGCCAATGGTAAAAGTTCCGAATC
ATCATCGACTGATCTTGACGTCATTAGTTCCATTCAGAATGTTTGGGATAAGTCTGAAGA
TCGTTTAGGTCTTATTGGTTTGAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCTTCACTTAA
CATAATTACGGCAATCGACAAATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTTGGTAT
CTTGTTCTCCACGTGGTTTACATATCGGTATCTCTTGTTCAAACCCGACAGAGAGGAGCT
ATCCCAAATTGTCAAGAAATCAGTGGCGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTCTCAA
AAAAAAA****TATACTTGGCTAGTAAGGCAGCAAATGCATGTGGTATCCTGAGATGATT
TGTGTTTGTGACTGTGACATGATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTGCTGAA
CCTGTAAATACTGTATTTGGGTTTTGGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTCA
TATAAAGAATTAAGACATC

QA 3 681 3 681
DS 

RD RR2H289TF 681 0 0
GG
AGATTACGAGAAAAACTCTAAAATGGCGTCAGTTTCTGCAAGTTTGCCTCCACCATTGCT
GCTTACTCAGAGAAAACCTAACCTCACATCAGTTCACAAACTTCCGTTTTCTCTTATTCG
AGATAGAAGAAGCCCTAGCATGGGTCTTATGGTGAAAGCCAATGGTAAAAGTTCCGAATC
ATCATCGACTGATCTTGACGTCATTAGTTCCATTCAGAATGTTTGGGATAAGTCTGAAGA
TCGTTTAGGTCTTATTGGTTTGAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCTTCACTTAA
CATAATTACGGCAATCGACAAATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTTGGTAT
CTTGTTCTCCACGTGGTTTACATATCGGTATCTCTTGTTCAAACCCGACAGAGAGGAGCT
ATCCCAAATTGTCAAGAAATCAGTGGCGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTCTCAA
AAAAAAA****TATACTTGGCTAGTAAGGCAGCAAATGCATGTGGTATCCTGAGATGATT
TGTGTTTGTGACTGTGACATGATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTGCTGAA
CCTGTAAATACTGTATTTGGGTTTTGGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTCA
TATAAAGAATTAAGACATC

QA 3 681 3 681
DS 

RD RR2DS87TF 702 0 0
GG
AACAATTACTTGGACGGTCTCTTCTTCCTCAGATTACGAGAAAAACTCTAAAATGGCGTC
AGTTTCTGCAAGTTTGCCTCCACCATTGCTGCTTACTCAGAGAAAACCTAACCTCACATC
AGTTCACAAACTTCCGTTTTCTCTTATTCGAGATAGAAGAAGCCCTAGCATGGGTCTTAT
GGTGAAAGCCAATGGTAAAAGTTCCGAATCATCATCGACTGATCTTGACGTCATTAGTTC
CATTCAGAATGTTTGGGATAAGTCTGAAGATCGTTTAGGTCTTATTGGTTTGAGTTTTGC
TGCTATTGTAGCTCTTTGGGCTTCACTTAACATAATTACGGCAATCGACAAATTGCCTGT
TATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTTGGTATCTTGTTCTCCACGTGGTTTACATATCGGTA
TCTCTTGTTCAAACCCGACAGAGAGGATCTATCCCAAATTGTCAAGAAATCAGTGGCGAA
TATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTCTCAAAAAAAAAAAA*TATACTTGGCTAGTAAGGC
AGCAAATGCATGTGGTATCCTGAGATGATTTGTGTTTGTGACTGTGACATGATAGATGTT
GTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTGCTGAACCTGTAAATACTGTATTTGGGTTTTGGTTG
CTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTCATATAAAGAAT

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR2A802TF 727 0 0
GGATCCAATAACAATTACTTGGACGGTCTCTTCTTCCTCAGATTACGAGAAAAACTCTAA
AATGGCGTCAGTTTCTGCAAGTTTGCCTCCACCATTGCTGCTTACTCAGAGAAAACCTAA
CCTCACACCAGTTCACAAACTTCCGTTTTCTCTTATTCGAGATAGAAGAAGCCCTAGCAT
GGGTCTTATGGTGAAAGCCAATGGTAAAAGTTCCGAATCATCATCGACTGATCTTGACGT
CATTAGTTCCATTCAGAATGTTTGGGATAAGTCTGAAGATCGTTTAGGTCTTATTGGTTT
GAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCTTCACTTAACATAATTACGGCAATCGACAA
ATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTTGGTATCTTGTTCTCCACGTGGTTTAC
ATATCGGTATCTCTTGTTCAAACCCGACAGAGAGGAGCTATCCCAAATTGTCAAGAAATC
AGTGGCGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTCTCAAAAAAAAAAAAATATACTTGGC
TAGTAAGGCAGCAAATGCATGTGGTATCCTGAGATGATTTGTGTTTGTGACTGTGACATG
ATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTGCTGAACCTGTAAATACTGTATTTGGG
TTTTGGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTCATATAAAGAATTAAGACATCAA
GATCAGT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 2 5

CO CL1812Contig1 941 2 4 U
GAATAAAGGGAATAATGATTCAGAGCTAAAGAACAGAAGAATTCACTTAGGTCTGTTCTC
TGACAAAGCTTGAATCACAAATCTTGGACAAGAAGCCATGGAAGTCGAAACCGATGCTAC
GAAGGGACAAGAGTCGAAGCAACAGATCAGAGACGAAGAACTATTCAAAGCGGCGGAATC
AGGAGATTCTTCGGTGTTCATGTCTTTATCTCCTCAGCAGCTAGCGAAATCTCTAACTTT
CAGAAACGAAGACGGTCGCTCCCTCCTCCACGTCTCTGCTTCTTTCGGTCATTCCCAGAT
AGTGAAGTTGTTATCAAGTGTAGATGAATCGAAGACTGTAATTAATGGTAAAGATGATGA
AGGATGGGCTCCTCTACATTCTGCTGCTAGCATCGGCAAGGCTGAGCTCGTTGAAATCTT
ATTGACTGGAGGTGCTGATGTGAATGTCAAGAACAATGGTGGTCGCACTGCTCTTCACTA
TGCTGCTAGCAAAGGATGGTTGGAAATCGCTCAACTTTTACTAACACATGGCGCAAAGAT
AAACATCACCGACAAGGTAGGCTGCACTCCGCTTCACAGGGCAGCAAGCACTGGAAAGTC
TGAAGTTTGTGAGTTCCTCATCGAGGAAGGAGCAGAGATCGATGCTACGGATAAAATGGG
CCAAACTCCACTCATGCATTCGGTGATCTGCGATGACAGACAAGTTGCGTTTCTCCTTGT
AAGACATGGTGCAGATGTGGATGTAGAAGACAAGGAAGGCTACACTGTTCTAGGTCGAGC
TTCCACCGATTTCAGACCAGCACTTATCGATGCTGCCAAGGCTATGCTTGAATGAGAAAT
TTTCTCTTAAACGGATTGAACATAAAAAGGATTGTTCTTTTATTTTGTTCAAGTTTGCAA
GATGTTTCAGCTGTTTTGTTTCTGAAGATATGTTTATCAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F445TF U 1
AF RR2F445JQ C 219
BS 1 629 RR2F445TF
BS 630 630 RR2F445JQ
BS 631 649 RR2F445TF
BS 650 941 RR2F445JQ

RD RR2F445TF 666 0 0
GAATAAAGGGAATAATGATTCAGAGCTAAAGAACAGAAGAATTCACTTAGGTCTGTTCTC
TGACAAAGCTTGAATCACAAATCTTGGACAAGAAGCCATGGAAGTCGAAACCGATGCTAC
GAAGGGACAAGAGTCGAAGCAACAGATCAGAGACGAAGAACTATTCAAAGCGGCGGAATC
AGGAGATTCTTCGGTGTTCATGTCTTTATCTCCTCAGCAGCTAGCGAAATCTCTAACTTT
CAGAAACGAAGACGGTCGCTCCCTCCTCCACGTCTCTGCTTCTTTCGGTCATTCCCAGAT
AGTGAAGTTGTTATCAAGTGTAGATGAATCGAAGACTGTAATTAATGGTAAAGATGATGA
AGGATGGGCTCCTCTACATTCTGCTGCTAGCATCGGCAAGGCTGAGCTCGTTGAAATCTT
ATTGACTGGAGGTGCTGATGTGAATGTCAAGAACAATGGTGGTCGCACTGCTCTTCACTA
TGCTGCTAGCAAAGGATGGTTGGAAATCGCTCAACTTTTACTAACACATGGCGCAAAGAT
AAACATCACCGACAAGGTAGGCTGCACTCCGCTTCACAGGGCAGCAAGCACTGGAAAGTC
TGAAGTTTGTGAGTTCCTCATCGAGGAAG*AGCAGAGATCGATGCTACG
ATAAATGGGCCAACTCC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2F445JQ 723 0 0
AGCTAGCGAAATCTCTAACTTTCAGAAACGAAGACGGTCGCTCCCTCCTCCACGTCTCTG
CTTCTTTCGGTCATTCCCAGATAGTGAAGTTGTTATCAAGTGTAGATGAATCGAAGACTG
TAATTAATGGTAAAGATGATGAAGGATGGGCTCCTCTACATTCTGCTGCTAGCATCGGCA
AGGCTGAGCTCGTTGAAATCTTATTGACTGGAGGTGCTGATGTGAATGTCAAGAACAATG
GTGGTCGCACTGCTCTTCACTATGCTGCTAGCAAAGGATGGTTGGAAATCGCTCAACTTT
TACTAACACATGGCGCAAAGATAAACATCACCGACAAGGTAGGCTGCACTCCGCTTCACA
GGGCAGCAAGCACTGGAAAGTCTGAAGTTTGTGAGTTCCTCATCGAGGAAGGAGCAGAGA
TCGATGCTACGGATAAAATGGGCCAAACTCCACTCATGCATTCGGTGATCTGCGATGACA
GACAAGTTGCGTTTCTCCTTGTAAGACATGGTGCAGATGTGGATGTAGAAGACAAGGAAG
GCTACACTGTTCTAGGTCGAGCTTCCACCGATTTCAGACCAGCACTTATCGATGCTGCCA
AGGCTATGCTTGAATGAGAAATTTTCTCTTAAACGGATTGAACATAAAAAGGATTGTTCT
TTTATTTTGTTCAAGTTTGCAAGATGTTTCAGCTGTTTTGTTTCTGAAGATATGTTTATC
AAT

QA 1 723 1 723
DS 



CO CL1812Contig2 923 3 5 U
GGGAAGAATTCACTTAGGTCTGTTCTCTGACAAAGCTTGAATCACAAATCTTGGACAAGA
AGCCATGGAAGTCGAAACCGATGCTACGAAGGGACAAGAGTCGAAGCAACAGATCAGAGA
CGAAGAACTATTCAAAGCGGCGGAATCAGGAGATTCTTCGGTGTTCATGTCTTTATCTCC
TCAGCAGCTAGCGAAATCTCTCAGTTTCAGAAACGAAGACGGTCGCTCCCTCCTCCACGT
CTCTGCTTCTTTCGGTCATTCTCAGATAGTGAAGTTGTTATCAAGTGTAGATGAATCAAA
GACTGTAATCAACAGTAAGGATGATGAAGGATGGGCTCCTCTACATTCTGCTGCTAGCAT
CGGCAAGGCTGAGCTCGTTGAAATCTTATTGACTAGAGGTGCTGATGTGAATGTCAAGAA
CAATGGTGGTCGCACTGCTCTTCACTATGCTGCTAGCAGGGGATGGTTGGAGATCGCCCA
GCTTTTACTGACACATGGCGCAAAGATAAACATCACCGACAAGGTGGGTTGCACTCCGCT
TCACAGGGCAGCAAGCACCGGAAAGTCTGAAGTTTGTGAGTTCTTGATCGAGGAAGGGGC
AGAGATCGATGCTACGGATAAAATGGGCCAAACTCCACTCATGCATTCAGTGATCTGTGA
TGACAGACAGGTTGCGTTTCTCCTTGTAAGACATGGTGCAGATGTGGATGTAGAAGACAA
GGGAGGCTACACCGTTCTAGGCCGAGCTTCCAACGACTTCAGACCAGCACTTATTGATGC
TGCCAAGGCTATGGTGGAAGGATGAGTTTCTCTTAAAACAGTAGAACATAAAAAGGATTG
TTCTTTTATTTGTTCAAGTTTGCAAGATGCTTCAGCTGTTTTGTTTCTGAAGATAATGTT
TATCAATCCATTTTCTTCTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2G191TF U 1
AF RR2E979JQ C 284
AF RR2E979TF U 284
BS 1 458 RR2G191TF
BS 459 459 RR2E979TF
BS 460 583 RR2G191TF
BS 584 922 RR2E979TF
BS 923 923 RR2E979JQ

RD RR2G191TF 589 0 0
GGGAAGAATTCACTTAGGTCTGTTCTCTGACAAAGCTTGAATCACAAATCTTGGACAAGA
AGCCATGGAAGTCGAAACCGATGCTACGAAGGGACAAGAGTCGAAGCAACAGATCAGAGA
CGAAGAACTATTCAAAGCGGCGGAATCAGGAGATTCTTCGGTGTTCATGTCTTTATCTCC
TCAGCAGCTAGCGAAATCTCTCAGTTTCAGAAACGAAGACGGTCGCTCCCTCCTCCACGT
CTCTGCTTCTTTCGGTCATTCTCAGATAGTGAAGTTGTTATCAAGTGTAGATGAATCAAA
GACTGTAATCAACAGTAAGGATGATGAAGGATGGGCTCCTCTACATTCTGCTGCTAGCAT
CGGCAAGGCTGAGCTCGTTGAAATCTTATTGACTAGAGGTGCTGATGTGAATGTCAAGAA
CAATGGTGGTCGCACTGCTCTTCACTATGCTGCTAGCAAGGGATGGTTGGAGATCGCCCA
GCTTTTACTGACACATGGCGCAAAGATAAACATCACCGACAAGGTGGGTTGCACTCCGCT
TCACAGGGCAGCAAGCACCGGAAAGTCTGAAGTTTGTGAGTTC
TTGATC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2E979JQ 640 0 0
AGTGTAGATGAATCAAAGACTGTAATCAACAGTAAGGATGATGAAGGATGGGCTCCTCTA
CATTCTGCTGCTAGCATCGGCAAGGCTGAGCTCGTTGAAATCTTATTGACTAGAGGTGCT
GATGTGAATGTCAAGAACAATGGTGGTCGCACTGCTCTTCACTATGCTGCTAGCAGGGGA
TGGTTGGAGATCGCCCAGCTTTTACTGACACATGGCGCAAAGATAAACATCACCGACAAG
GTGGGTTGCACTCCGCTTCACAGGGCAGCAAGCACCGGAAAGTCTGAAGTTTGTGAGTTC
TTGATCGAGGAAGGGGCAGAGATCGATGCTACGGATAAAATGGGCCAAACTCCACTCATG
CATTCAGTGATCTGTGATGACAGACAGGTTGCGTTTCTCCTTGTAAGACATGGTGCAGAT
GTGGATGTAGAAGACAAGGGAGGCTACACCGTTTTAGGCCGAGCTTCCAACGACTTCAGA
CCAGCACTTATTGATGCTGCCAAGGCTATGGTGGAAGGATGAGTTTCTCTTAAAACAGTA
GAACATAAAAAGGATTGTTCTTTTATTTGTTCAAGTTTGCAAGATGCTTCAGCTGTTTTG
TTTCTGAAGATAATGTTTATCAATCCATTTTCTTCTCTAC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2E979TF 639 0 0
AGTGTAGATGAATCAAAGACTGTAATCAACAGTAAGGATGATGAAGGATGGGCTCCTCTA
CATTCTGCTGCTAGCATCGGCAAGGCTGAGCTCGTTGAAATCTTATTGACTAGAGGTGCT
GATGTGAATGTCAAGAACAATGGTGGTCGCACTGCTCTTCACTATGCTGCTAGCAGGGGA
TGGTTGGAGATCGCCCAGCTTTTACTGACACATGGCGCAAAGATAAACATCACCGACAAG
GTGGGTTGCACTCCGCTTCACAGGGCAGCAAGCACCGGAAAGTCTGAAGTTTGTGAGTTC
TTGATCGAGGAAGGGGCAGAGATCGATGCTACGGATAAAATGGGCCAAACTCCACTCATG
CATTCAGTGATCTGTGATGACAGACAGGTTGCGTTTCTCCTTGTAAGACATGGTGCAGAT
GTGGATGTAGAAGACAAGGGAGGCTACACCGTTCTAGGCCGAGCTTCCAACGACTTCAGA
CCAGCACTTATTGATGCTGCCAAGGCTATGGTGGAAGGATGAGTTTCTCTTAAAACAGTA
GAACATAAAAAGGATTGTTCTTTTATTTGTTCAAGTTTGCAAGATGCTTCAGCTGTTTTG
TTTCTGAAGATAATGTTTATCAATCCATTTTCTTCTCTA

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 5

CO CL1813Contig1 901 5 18 U
AGGGGATAAACAGAATATCACTCTTTACAACCATAATTTCCTAGAATGGCGGAGGTTGCT
ACCGAAATTGCAAAGAAGATGGAGGAAAAGGCGGAGACGCCAGTGACTGTGCGGGCGGAA
GAAGCTGAGACCAAGGTGACGGTGACACCTCCTAAAACGGTCGAGGATACAAACAAACCG
GCGGAACAGGAGGTGAAGCCAACAGAGACGTCTAGCTTAGTGGGGAAGCTTGAGACAGAC
GTGGAGATCAAAGCTTCTGCTGAGCAGTTCCATCACATGTTCACCGGCAAACCACACCAT
GTTTCCAAAGCATCTCCAGGCAACATTCAGGGCTGTGATCTGCACGAAGGCGATTGGGGC
AAACCTGGCTCTATCATTTTCTGGAACTACGTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTAGCAAAG
GAGAGGATCGAGGCGGTAGAGCCGGAGAAGAACTTGATCACGTTCAGGGTTATTGAAGGT
GATCTGATGAAAGAGTACAAAAGCTTCTTGCTCACAATCCAGGTGACCCCTAAGCACGGT
GGGGCAGGAAGTATTGTGCACTGGCACCTTGAGTACGAGAAGATTAGCGAAGAGGTTGCT
CATCCCGAGACTCTCCTCCAGTTCTGTGTCGAAGTCTCCAAAGAGATCGACGAACATCTC
TTGGCCGATGAATAAATCAAAGGAATATGTGTTGTGCCTTAAGTTACGTACTTTTACTAA
GACAAAACAAAGGACTATGG*AGCCCTGTCCGAGTTTGTGAGAGATAAATTATGAGTGTG
CCATGATTATGTGTGTGTATGGTAAGATCGTTTTACGTTGTGAGTTGTAACTGTGAGAAG
CGACGTGTACTAGCTATGATGAGCAGTGCCGTCCCAAAATTATTTATGAGAAACAGTATA
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2CT11TF U 1
AF RR2AC86TF U 4
AF RR2BA32TF U 11
AF RR2BA32JQ C 187
AF RR2CT11JQ C 240
BS 1 65 RR2CT11TF
BS 66 66 RR2AC86TF
BS 67 200 RR2CT11TF
BS 201 201 RR2AC86TF
BS 202 335 RR2CT11TF
BS 336 336 RR2AC86TF
BS 337 479 RR2CT11TF
BS 480 480 RR2AC86TF
BS 481 580 RR2CT11TF
BS 581 581 RR2AC86TF
BS 582 590 RR2CT11TF
BS 591 727 RR2AC86TF
BS 728 728 RR2BA32TF
BS 729 740 RR2AC86TF
BS 741 741 RR2BA32TF
BS 742 798 RR2AC86TF
BS 799 875 RR2BA32TF
BS 876 901 RR2BA32JQ

RD RR2CT11TF 590 0 0
AGGGGATAAACAGAATATCACTCTTTACAACCATAATTTCCTAGAATGGCGGAGGTTGCT
ACCGACATTGCAAAGAAGATGGAGGAAAAGGCGGAGACGCCAGTGACTGTGCGGGCGGAA
GAAGCTGAGACCAAGGTGACGGTGACACCTCCTAAAACGGTCGAGGATACAAACAAACCG
GCGGAACAGGAGGTGAAGCCGACAGAGACGTCTAGCTTAGTGGGGAAGCTTGAGACAGAC
GTGGAGATCAAAGCTTCTGCTGAGCAGTTCCATCACATGTTCACCGGCAAACCACACCAT
GTTTCCAAAGCATCTCCAGGCAACATTCAGGGCTGCGATCTGCACGAAGGCGATTGGGGC
AAACCTGGCTCTATCATTTTCTGGAACTACGTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTAGCAAAG
GAGAGGATCGAGGCGGTAGAGCCGGAGAAGAACTTGATCACGTTCAGGGTTATTGAAGGC
GATCTGATGAAAGAGTACAAAAGCTTCTTGCTCACAATCCAGGTGACCCCTAAGCACGGT
GGGGCAGGAAGTATTGTGCACTGGCACCTTGAGTACGAGA*GATTAGCGA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2AC86TF 795 0 0
GGATAAAC
AGAATATCACTCTTTACAACCATAATTTCCTAGAATGGCGGAGGTTGCTACCGAAATTGC
AAAGAAGATGGAGGAAAAGGCGGAGACGCCAGTGACTGTGCGGGCGGAAGAAGCTGAGAC
CAAGGTGACGGTGACACCTCCTAAAACGGTCGAGGATACAAACAAACCGGCGGAACAGGA
GGTGAAGCCAACAGAGACGTCTAGCTTAGTGGGGAAGCTTGAGACAGACGTGGAGATCAA
AGCTTCTGCGGAGCAGTTCCATCACATGTTCACCGGCAAACCACACCATGTTTCCAAAGC
ATCTCCAGGCAACATTCAGGGCTGTGATCTGCACGAAGGCGATTGGGGCAAACCTGGCTC
TATCATTTTCTGGAACTACGTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTAGCAAAGGAGAGGATCGA
GGCGGTAGAACCGGAGAAGAACTTGATCACGTTCAGGGTTATTGAAGGTGATCTGATGAA
AGAGTACAAAAGCTTCTTGCTCACAATCCAGGTGACCCCTAAGCACGGTGGGGCAGGAAG
TATTGTGCACTGGCACCTTGAGTACGAGAAGATTAGCGAAGAGGTTGCTCATCCCGAGAC
TCTCCTCCAGTTCTGTGTCGAAGTCTCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGGCCGATGA
ATAAATCAAAGGAATATGTGTTGTGCCTTAAGTTACGTACTTTTACTAAGACAAAATAAA
GGACTATGGGAGCCCTGTCCGAGTTTGTGAGAGATAAATTATGAGTGTGCCATGATTATG
TGTGTGT

QA 9 795 9 795
DS 

RD RR2BA32TF 865 0 0
G
AGAATATCACTCTTTACAACCATAATTTCCTAGAATGGCGGAGGTTGCTACCGAAATTGC
AAAGAAGATGGAGGAAAAGGCGGAGACGCCAGTGACTGTGCGGGCGGAAGAAGCTGAGAC
CAAGGTGACGGTGACACCTCCTAAAACGGTCGAGGATACAAACAAACCGGCGGAACAGGA
GGTGAAGCCAACAGAGACGTCTAGCTTAGTGGGGAAGCTTGAGACAGACGTGGAGATCAA
AGCTTCTGCTGAGCAGTTCCATCACATGTTCACCGGCAAACCACACCATGTTTCCAAAGC
ATCTCCAGGCAACATTCAGGGCTGTGATCTGCACGAAGGCGATTGGGGCAAACCTGGCTC
TATCATTTTCTGGAACTACGTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTAGCAAAGGAGAGGATCGA
GGCGGTAGAGCCGGAGAAGAACTTGATCACGTTCAGGGTTATTGAAGGTGATCTGATGAA
AGAGTACAAAAGCTTCTCGCTCACAATCCAGGTGACCCCTAAGCACGGTGGGGCAGGAAG
TATTGTGCACTGGCACCTTGAGTACGAGAAGATTAGCGAAGAGGTTGCTCATCCCGAGAC
TCTCCTCCAGTTCTGTGTCGAAGTCTCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGGCCGATGA
ATAAATCAAAGGAATATGTGTTGTGCCTTAAGTTACGTACTTTTACTAAGACAAAACAAA
GGACTATGG*AGCCCTGTCCGAGTTTGTGAGAGATAAATTATGAGTGTGCCATGATTATG
TGTGTGTATGGTAAGATCGTTTTACGTTGTGAGTTGTAACTGTGAGAAGCGACGTGTACT
AGCTATGATGAGCAGTGCCGTCCC

QA 2 865 2 865
DS 

RD RR2BA32JQ 715 0 0
CAGGAGGTGAAGCCAACAGAGACGTCTAGCTTAGTGGGGAAGCTTGAGACAGACGTGGAG
ATCAAAGCTTCTGCTGAGCAGTTCCATCACATGTTCACCGGCAAACCACACCATGTTTCC
AAAGCATCTCCAGGCAACATTCAGGGCTGTGATCTGCACGAAGGCGATTGGGGCAAACCT
GGCTCTATCATTTTCTGGAACTACGTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTAGCAAAGGAGAGG
ATCGAGGCGGTAGAGCCGGAGAAGAACTTGATCACGTTCAGGGTTATTGAAGGTGATCTG
ATGAAAGAGTACAAAAGCTTCTCGCTCACAATCCAGGTGACCCCTAAGCACGGTGGGGCA
GGAAGTATTGTGCACTGGCACCTTGAGTACGAGAAGATTAGCGAAGAGGTTGCTCATCCC
GAGACTTTCCTCCAGTTCTGTGTCGAAGTCTCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGGCC
GATGAATAAATCAAAGGAATATGTGTTGTGCCTTAAGTTACGTACTTTTACTAAGACAAA
ACAAAGGACTATGG*AGCCCTGTCCGAGTTTGTGAGAGATAAATTATGAGTGTGCCATGA
TTATGTGTGTGTATGGTAAGATCGTTTTACGTTGTGAGTTGTAACTGTGAGAAGCGACGT
GTACTAGCTATGATGAGCAGTGCCGTCCCAAAATTATTTATGAGAAACAGTATAC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2CT11JQ 662 0 0
CGTGGAGATCAAAGCTTCTGCTGAGCAGTTCCATCACATGTTCACCGGCAAACCACACCA
TGTTTCCAAAGCATCTCCAGGCAACATTCAGGGCTGCGATCTGCACGAAGGCGATTGGGG
CAAACCTGGCTCTATCATTTTCTGGAACTACGTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTAGCAAA
GGAGAGGATCGAGGCGGTAGAGCCGGAGAAGAACTTGATCACGTTCAGGGTTATTGAAGG
CGATCTGATGAAAGAGTACAAAAGCTTCTTGCTCACAATCCAGGTGACCCCTAAGCACGG
TGGGGCAGGAAGTATTGTGCACTGGCACCTTGAGTACGAGAAGATTAGCGAAGAGGTTGC
TCATCCCGAGACTCTCCTCCAGTTCTGTGTCGAAGTCTCCAAAGAGATCGACGAACATCT
CTTGGCCGATGAATAAATCAAAGGAATATGTGTTGTGCCTTAAGTTACGTACTTTTACTA
AGACAAAATAAAGGACTATGG*AGCCCTGTCCGAGTTTGTGAGAGATAAATTATGAGTGT
GCCATGATTATGTGTGTGTATGGTAAGATCGTTTTACGTTGTGAGTTGTAACTGTGAGAA
GCGACGTATACTAGCTATGATGAGCAGTGCCGTCCCAAAATTATTTATGAGAAACAGTAT
AC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 5

CO CL1814Contig1 1242 5 24 U
TCAAACTCCTCAACCAAAAAGAAAGAAGAACTCATCCTTTTTTTTTGGTTAGATTACACT
TTTTCCATCTTCTTTGCATTTTTCTCTCTGTCTCTCTTTTTGTTCCATCAGATCATTCAT
AAAGCTAATCCAGCCACTTGGTGACTGTCCTCAATCGATTCCCTGTTCACCATCTTGAGG
GAGAAGACAATGAGTGTTGAGGTACGGTCAAGAGTCTTTGACCAAGAAGCTGGCTCAACT
CTAGCTTCGTTGAGAGATGGTGATCCGTCGACACAAAGGGGTTTTCGATGTATCCCTTAT
GAATTAGATCTCAATCCCCTACGCATTGTAGTAGCGGAATTGGTGGGGACATTCATTCTA
ATGTTCAGCGTGTGTGGGGTCATAAGCAGTACTCAGTTGTCCGGCGGTCATGTCGGATTG
CTAGAGTACGCCGCGACGGCTGGTCTATCGGTGGTTGTCGTAGTTTACTCCATCGGTCAT
ATCTCCGGCGCCCATCTCAACCCTTCCATCACCATTGCTTTCGCCCTCTTTGGCGGATTC
CCATGGTCTCAGGTTCCGTTATATATAACGGCGCAGACGATGGGGGCAACGGCGGCAACG
TTAGCTGGGG*TGTCAGTCTACGGAGTAAACCCTGACCTAATGATAACAAAACCTGCGTT
AAGCTGCGTTTCTGCGTTTTTCGTTGAACTCGTTGCTACGAGCATCGTCGTCTTTCTAGC
CTCCGCGTTACATTGTGGTCCTCATCAAAATTTGAGTAATTTGACGGGGTTGGTGATTGG
AGCAGTCATATCCCTTGGAGTGCTTATTACCGGACCGATTTCGGGAGGATCGATGAACCC
AGCTCGATCACTAGGACCGGCGGTGGTGGCATGGGATTTTGAGTATATATGGGTTTACAT
GACTGCTCCGGTGATCGGAGCCATTATCGGTGTTTTGACATACAGAACTATTAGCCTCCA
GAGCAGGCCTTCTCCACATTCCCCTCCAGTCACTTCGCTTTTACGCTGACCGACCATTCA
GCTCAAATCCTAGTATGATATCTAATTAAGTTATAACCTTAATTACTCCCCAAATAAACC
TTATTACTCTACTCTTAATGTAGCCCGTTATGCCTATATGGAGCCTCGATTGATACTACT
AGTGAATTCTAATGTTTGCTTGGATATTCATATTTTACAAGAATCCATTTTAAGTTCTTA
TTAATATATGAAATGTCTATATTAATATGAAGCATTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA55TF U 1
AF RR2CI31TF U 145
AF RR2DS92TF U 289
AF RR2CA55JQ C 407
AF RR2CI31JQ C 378
BS 1 162 RR2CA55TF
BS 163 163 RR2CI31TF
BS 164 610 RR2CA55TF
BS 611 611 RR2CI31TF
BS 612 651 RR2CA55TF
BS 652 824 RR2CI31TF
BS 825 825 RR2DS92TF
BS 826 854 RR2CI31TF
BS 855 855 RR2DS92TF
BS 856 859 RR2CI31TF
BS 860 860 RR2DS92TF
BS 861 879 RR2CI31TF
BS 880 880 RR2DS92TF
BS 881 890 RR2CI31TF
BS 891 960 RR2DS92TF
BS 961 961 RR2CI31JQ
BS 962 966 RR2DS92TF
BS 967 967 RR2CI31JQ
BS 968 991 RR2DS92TF
BS 992 992 RR2CI31JQ
BS 993 1001 RR2DS92TF
BS 1002 1002 RR2CI31JQ
BS 1003 1023 RR2DS92TF
BS 1024 1242 RR2CI31JQ

RD RR2CA55TF 651 0 0
TCAAACTCCTCAACCAAAAAGAAAGAAGAACTCATCCTTTTTTTTTGGTTAGATTACACT
TTTTCCATCTTCTTTGCATTTTTCTCTCTGTCTCTCTTTTTGTTCCATCAGATCATTCAT
AAAGCTAATCCAGCCACTTGGTGACTGTCCTCAATCGATTCCTTGTTCACCATCTTGAGG
GAGAAGACAATGAGTGTTGAGGTACGGTCAAGAGTCTTTGACCAAGAAGCTGGCTCAACT
CTAGCTTCGTTGAGAGATGGTGATCCGTCGACACAAAGGGGTTTTCGATGTATCCCTTAT
GAATTAGATCTCAATCCCCTACGCATTGTAGTAGCGGAATTGGTGGGGACATTCATTCTA
ATGTTCAGCGTGTGTGGGGTCATAAGCAGTACTCAGTTGTCCGGCGGTCATGTCGGATTG
CTAGAGTACGCCGCGACGGCTGGTCTATCGGTGGTTGTCGTAGTTTACTCCATCGGTCAT
ATCTCCGGCGCCCATCTCAACCCTTCCATCACCATTGCTTTCGCCCTCTTTGGCGGATTC
CCATGGTCTCAGGTTCCGTTATATATAACGGCGCAGACGATGGGGGCAACGGCGGCAACG
TTAGCTGGGGGTGTCAGTCTACGGAGTAAACCCTGACCTAATGATAACAAA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2CI31TF 746 0 0
GG
GTCCTCAATCGATTCCCTGTTCACCATCTTGAGGGAGAAGACAATGAGTGTTGAGGTACG
GTCAAGAGTCTTTGACCAAGAAGCTGGCTCAACTCTAGCTTCGTTGAGAGATGGTGATCC
GTCGACACAAAGGGGTTTTCGATGTATCCCTTATGAATTAGATCTCAATCCCCTACGCAT
TGTAGTAGCGGAATTGGTGGGGACATTCATTCTAATGTTCAGCGTGTGTGGGGTCATAAG
CAGTACTCAGTTGTCCGGCGGTCATGTCGGATTGCTAGAGTACGCCGCGACGGCTGGTCT
ATCGGTGGTTGTCGTAGTTTACTCCATCGGTCATATCTCCGGCGCCCATCTCAACCCTTC
CATCACCATTGCTTTCGCCCTCTTTGGCGGATTCCCATGGTCTCAGGTTCCGTTATATAT
AACGGCGCAGACGATGGGGGCAACGGCGGCAACGTTAGCTGGGG*TGTCAGTCTACGGAG
TAAACCCTGACCTAATGATAACAAAACCTGCGTTAAGCTGCGTTTCTGCGTTTTTCGTTG
AACTCGTTGCTACGAGCATCGTCGTCTTTCTAGCCTCCGCGTTACATTGTGGTCCTCATC
AAAATTTGAGTAATTTGACGGGGTTGGTGATTGGAGCAGTCATATCCCTTGGAGTGCTTA
TTACCGGACCGATTTCGG*AGGATCGATGAACCCAGCTCGATCACTAG*ACCG*CGGTGG
TGGCATGGGATTT*GAGTATATAT

QA 3 746 3 746
DS 

RD RR2DS92TF 735 0 0
G
GTATCCCTTATGAACTAGATCTCAATCCCCTACGCATTGTAGTAGCGGAATTGGTGGGGA
CATTCATTCTAATGTTCAGCGTGTGTGGGGTCATAAGCAGTACTCAGTTGTCCGGCGGTC
ATGTCGGATTGCTAGAGTACGCCGCGACGGCGGGTCTATCGGTGGTTGTCGTAGTTTACT
CCATCGGACACATCTCCGGCGCCCATCTCAACCCTTCCATCACCATTGCTTTCGCCCTCT
TTGGCGGATTCCCATGGTCTCAGGTTCCGTTATATATAACGGCGCAGACGATGGGGGCAA
CGGCGGCAACATTAGCTGGGG*TGTCAGTCTACGGTGTAAACCCTGACCTAATGATAACA
AAACCTGCGTTAAGCTGCGTTTCTGCGTTTTTCGTTGAACTCGTTGCTACGAGCATCGTT
GTCTTTCTAGCCTCCGCGTTGCATTGTGGTCCTCATCCAAATTTGAGTAATTTGACGGGG
TTGGTGATTGGAGCAGTCATATCCCTTGGAGTGCTTATTACCGGACCGATTTCGGGAGGA
TCGATGAACCCAGCTCGATCACTAGGACCGGCGGTGGTGGCATGGGATTTTGAGTATATA
TGGGTTTACATGACTGCTCCGGTGATCGGAGCCATTATCGGTGTTTTGACATACAGAACT
ATTAGCCTCCAAAGCAG*CCTTCTCCACATTCCCCTCCAGTCTCTTCGCTTT*ACGCTGA
CCGACCATTCAGCT

QA 2 735 2 735
DS 

RD RR2CA55JQ 780 0 0
GTCATGTCGGATTGCTAGAGTACGCCGCGACGGCTGGTCTATCGGTGGTTGTCGTAGTTT
ACTCCATCGGTCATATCTCCGGCGCCCATCTCAACCCTTCCATCACCATTGCTTTCGCCC
TCTTTGGCGGATTCCCATGGTCTCAGGTTCCGTTATATATAACGGCGCAGACGATGGGGG
CAACGGCGGCAACGTTAGCTGGGG*TGTCAGTCTACGGAGTAAACCCTGACCTAATGATA
ACAAAACCTGCGTTAAGCTGCGTTTCTGCGTTTTTCGTTGAACTCGTTGCTACGAGCATC
GTCGTCTTTCTAGCCTCCGCGTTACATTGTGGTCCTCATCAAAATTTGAGTAATTTGACG
GGGTAGGTGATTGGAGCAGTCATATCCCTTGGAGTGCTTATTACCGGACCGATTTCGGGA
GGATCGATGAACCCAGCTCGATCACTAGGACCGGCGGTGGTGGCATGGGATTTTGAGTAT
ATATGGGTTTACATGACTGCTCCGGTGATCGGAGCCATTATCGGTGTTTTGACATACAGA
ACTATTAGCCTCCAGAGCAGGCCTTCTCCACATTCCCCTCCAGTCACTTCGCTTTTACGC
TGACCGACCATTCAGCTCAAATCCTAGTATGATATCTAATTAAGTTATAACCTTAATTAC
TCCCCAAATAAACCTTATTACTCTACTCTTAATGTAGCCCGTTATGCCTATATGGAGCCT
CGATTGATACTACTAGTGAATTCTAATGTTTGCTTGGATATTCATATTTTACAAGAATCC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2CI31JQ 865 0 0
GGTCATAAGCAGTACTCAGTTGTCCGGCGGTCATGTCGGATTGCTAGAGTACGCCGCGAC
GGCTG*TCTATCGGTGGTTGTCGTAGTT*ACTCCATCGGTCATATCTCCGGCGCCCATCT
CAACCTTTCCATCACCATTGCTTTCGCCCTCTTTGGCGGATTCCCATGGTCTCAGGTTCC
GTTATATATAACGGCGCAGACGATGGGGGCAACGGCGGCAACGTTAGCTGGGG*TGTCAG
TCTACGGAGTAAACCCTGACCTAATGATAACAAAACCTGCGTTAAGCTGCGTTTCTGCGT
TTTTCGTTGAACTCGTTGCTACGAGCATCGTCGTCTTTCTAGCCTCCGCGTTACATTGTG
GTCCTCATCAAAATTTGAGTAATTTGACGGGGTTGGTGATTGGAGCAGTCATATCCCTTG
GAGTGCTTATTACCGGACCGATTTCGGGAGGATCGATGAACCCAGCTCGATCACTAGGAC
CGGCGGTGGTGGCATGGGATTTTGAGTATATATGGGTTTACATGACTGCTCCGGTGATCG
GAGCCATTATCGGTGTTTTGACATACAGAACTATTAGCCTCCAGAGCAGGCCTTCTCCAC
ATTCCCCTCCAGTCACTTCGCTTTTACGCTGACCGACCATTCAGCTCAAATCCTAGTATG
ATATCTAATTAAGTTATAACCTTAATTACTCCCCAAATAAACCTTATTACTCTACTCTTA
ATGTAGCCCGTTATGCCTATATGGAGCCTCGATTGATACTACTAGTGAATTCTAATGTTT
GCTTGGATATTCATATTTTACAAGAATCCATTTTAAGTTCTTATTAATATATGAAATGTC
TATATTAATATGAAGCATTTTTATT

QA 1 865 1 865
DS 



AS 1 5

CO CL1815Contig1 1181 5 8 U
GCGAATGCAAACATACAATTTACGACCAAATGTTATTAAAACAACAGCTATTTATCGCAA
TTAGTCCCGCAACAGAAAAATGAACAACAACTTACAACTTGGGACATGCTAACAAACACA
ATGTTGTAAACATGTGAAAAACAATCTCATATTTTCATGAACCAAAAAAGTTTACAGCTT
TTT*GATTAAAAACTCTAATCAAAAGGGGTT*GAATACTGAAGATTTTGTCTACAAAACA
AAAGAGTAAGACTTTGCTTTAAACTCACGAACTCCCTTATATGTTTTTCCATCATCCTCA
GTTGTCTTCTCCAAGAGTAAACTTGACAAACCTCCTCACTTTGATGTTTTCACCAAGAGT
AGCCACCGTCTGCTTCACAAGATCCTTGACCAGAACGCTATCATCTTTAATGAAAGGCTG
CTCAAGCAATGCCATCTCTCCCAGCCTCTTTGAGATCCTTCCTTCAACAATCTTCTCCTT
TATGTTCTCTGGTTTCGACAAAAGATCCTCTCTCTGCATCTCCATCTCCTTTTCTTTCTG
CTTAATCTCCTCTGGAATGTCCTCGATGGATACATATTGCACCTGTGGATTAGCCACTGC
TTGCATTGCAAGATCATCAACCAGTTCCTTGAACTTTTCACTTCTTCCCACGAAATCAGT
CTCGCAGTTCACTTCTATGAGGACTCCAATGCGAGCATCGTGGATGTATGACCCGATTCT
CCCTTCAGCTGCAAGCCTGCTTGATTTCTTATCTGCTGTTGAAAGACCTTTCTTTCTCAG
GTACTCTTGTGCTTTCTCTAGATCTCCTCCTGTCTCCGCCAATGCCTTCTTGCAATCCAT
CATTCCTGCTCCTGTTTCTTCACGCAGCTGCTTCACAAGTCCAGCTGAAACCACTGCTGT
TGGTGGACTTGGAACAGCTTCCTTGGGCTCTTCAGCTTTTGGCTCTTCTTTCTCTGGTTC
GGCTTTTGGTTTAGCTGCGGTTTGAGCAGCAACCTCAGCAGCAAAGTCCTGACTTTTCTT
CTCAAGGCCTTCTCCCAGAGTGTACCTAATGAATCTCTTCACCTTGATGTTTTCTCCAAT
GGTTGCAATCCTCTGCTTCACAAGGTCCTTCACTATCACCTTATCGTCTTTAATGTATGG
TTGCTCCAGTAATGCAAGTGCGTCTACCCTCTTCTTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV79JQ U 1
AF RR2D068JQ U 151
AF RR2GC33JQ U 156
AF RR2D068TF C 483
AF RR2BV79TF C 499
BS 1 733 RR2BV79JQ
BS 734 734 RR2D068JQ
BS 735 834 RR2BV79JQ
BS 835 835 RR2D068JQ
BS 836 853 RR2BV79JQ
BS 854 945 RR2GC33JQ
BS 946 1174 RR2D068TF
BS 1175 1181 RR2BV79TF

RD RR2BV79JQ 853 0 0
GCGAATGCAAACATACAATTTACGACCAAATGTTATTAAAACAACAGCTATTTATCGCAA
TTAGTCCCGCAACAGAAAAATGAACAACAACTTACAACTTGGGACATGCTAACAAACACA
ATGTTGTAAACATGTGAAAAACAATCTCATATTTTCATGAACCAAAAAAGTTTACAGCTT
TTT*GATTAAAAACTCTAATCAAAAGGGGTT*GAATACTGAAGATTTTGTCTACAAAACA
AAAGAGTAAGACTTTGCTTTAAACTCACGAACTCCCTTATATGTTTTTCCATCATCCTCA
GTTGTCTTCTCCAAGAGTAAACTTGACAAACCTCCTCACTTTGATGTTTTCACCAAGAGT
AGCCACCGTCTGCTTCACAAGATCCTTGACCAGAACGCTATCATCTTTAATGAAAGGCTG
CTCAAGCAATGCCATCTCTCCCAGCCTCTTTGAGATCCTTCCTTCAACAATCTTCTCCTT
TATGTTCTCTGGTTTCGACAAAAGATCCTCTCTCTGCATCTCCATCTCCTTTTCTTTCTG
CTTAATCTCCTCTGGAATGTCCTCGATGGATACATATTGCACCTGTGGATTAGCCACTGC
TTGCATTGCAAGATCATCAACCAGTTCCTTGAACTTTTCACTTCTTCCCACGAAATCAGT
CTCGCAGTTCACTTCTATGAGGACTCCAATGCGAGCATCGTGGATGTATGACCCGATTCT
CCCTTCAGCTGCA*GCCTGCTTGATTTCTTATCTGCTGTTGAAAGACCTTTCTTTCTCAG
GTACTCTTGTGCTTTCTCTAGATCTCCTCCTGTCTCCGCCAATGCCTTCTTGCA*TCCAT
CATTCCTGCTCCT

QA 1 853 1 853
DS 

RD RR2D068JQ 693 0 0
ATTTT
CATGAACCAAAAAAGTTTACAGCTTTTT*GATTAAAAACTCTAATCAAAAGGGGTT*GAA
TACTGAAGATTTTGTCTACAAAACAAAAGAGTAAGACTTTGCTTTAAACTCACGAACTCC
CTTATATGTTTTTCCATCATCCTCAGTTGTCTTCTCCAAGAGTAAACTTGACAAACCTCC
TCACTTTGATGTTTTCACCAAGAGTAGCCACCGTCTGCTTCACAAGATCCTTGACCAGAA
CGCTATCATCTTTAATGAAAAGCTGCTCAAGCAATGCCATCTCTCCCAGCCTCTTTGAGA
TCCTTCCTTCAACAATCTTCTCCTTTATGTTCTCTGGTTTCGACAAAAGATCCTCTCTCT
GCATCTCCATCTCCTTTTCTTTCTGCTTAATCTCCTCTGGAATGTCCTCGATGGATACAT
ATTGCACCTGTGGATTAGCCACTGCTTGCATTGCAAGATCATCAACCAGTTCCTTGAACT
TTTCACTTCTTCCCACGAAATCAGTCTCGCAGTTCACTTCTATGAGGACTCCAATGCGAG
CATCGTGGATGTATGACCCGATTCTCCCTTCAGCTGCAAGCCTGCTTGATTTCTTATCTG
CTGTTGAAAGACCTTTCTTTCTCAGGTACTCTTGTGCTTTCTCTAGATCTCCTCCTGTCT
CCGCCAATGCCTTCTTGCAATCCATCAT

QA 6 693 6 693
DS 

RD RR2GC33JQ 790 0 0
CATGAACCAAAAAAGTTTACAGCTTTTTTGATTAAAAACTCTAATCAAAAGGGGTTTGAA
TACTGAAAATTTTGTCTACAAAACAAAAGAGTAAGACTTTGCTTTAAACTCACGAACTCC
CTTATATGTTTTTCCATC***CTCAGTTGTCTTCTCCAAGAGTGAACTTGACAAACCTCC
TGACTTTGATGTTTTCACCAAGAGTAGCCACTGTCTGCTTCACAAGATCCTTGACCAGAA
CGCTATCATCTTTAATGAAAGGCTGCTCAAGCAATGCCATTTCTCCAAGCCTCTTTGAAA
TCCTTCCTTCCACAATTTTCTCCTTTATGTTCTCTGGTTTCGACAAAAGATCCTCTCTCT
GCATCTCCATCTCCTTTCCTTTCTGCTTAATCTCCTCTGGAATGTCCTCGATGGATACAT
ATTGCACCTGTGGATTAGCCACTGCTTGCATTGCAAGATCATCAACCAGTTCCTTGAACT
TTTCACTTCTTCCCACGAAATCAGTCTCGCAGTTCACTTCTATGAGGACTCCAATGCGAG
CATCGTGGATGTATGACCCGATTCTCCCTTCAGCTGCAAGCCTGCTTGATTTCTTATCAG
CTGTTGAAAGACCTTTCTTTCTGAGGTACTCTTGTGCTTTCTCTAGATCTCCTCCTGTCT
CCGCCAATGCCTTCTTGCAATCCATCATTCCTGCTCCTGTTTCTTCACGCAGCTGCTTCA
CAAGTCCAGCTGAAACCACTGCTGTTGGTGGACTTGGAACAGCTTCCTTGGGCTCTTCAG
CTTTTGGCTC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2D068TF 693 0 0
ATG
TCTCTGGTTTCGACAAAAGATCCTCTCTCTGCATCTCCATCTC*TTTTCTTTCTGCTTAA
TCTCCTCTGGAATGTCCTCGATGGATACATATTGCACCTGTGGATTAGCCACTGCTTGCA
TTGCAAGATCATCAACCAGTTCCTTGAACTTTTCACTTCTTCCCACGAAATCAGTCTCGC
AGTTCACTTCTATGAGGACTCCAATGCGAGCATCGTGGATGTATGACCCGATTCTCCCTT
CAGCTGCAAGCCTGCTTGATTTCTTATCTGCTGTTGAAAGACCTTTCTTTCTCAGGTACT
CTTGTGCTTTCTCTAGATCTCCTCCTGTCTCCGCCAATGCCTTCTTGCAATCCATCATTC
CTGCTCCTGTTTCTTCACGCAGCTGCTTCACAAGTCCAGCTGAAACCACTGCTGTTGGTG
GACTTGGAACAGCTTCCTTGGGCTCTTCAGCTTTTGGCTCTTCTTTCTCTGGTTCGGCTT
TTGGTTTAGCTGCGGTTTGAGCAGCAACCTCAGCAGCAAAGTCCTGACTTTTCTTCTCAA
GGCCTTCTCCCAGAGTGTACCTAATGAATCTCTTCACCTTGATGTTTTCTCCAATGGTTG
CAATCCTCTGCTTCACAAGGTCCTTCACTATCACCTTATCGTCTTTAATGTATGGTTGCT
CCAGTAATGCAAGTGCGTCTACCCTCTTC
C

QA 4 692 4 692
DS 

RD RR2BV79TF 683 0 0
CAAAAGATCCTCTCTCTGCATCTCCATCTCCTTTTCTTTCTGCTTAATCTCCTCTGGAAT
GTCCTCGATGGATACATATTGCACCTGTGGATTAGCCACTGCTTGCATTGCAAGATCATC
AACCAGTTCCTTGAACTTTTCACTTCTTCCCACGAAATCAGTCTCGCAGTTCACTTCTAT
GAGGACTCCAATGCGAGCATCGTGGATGTATGACCCGATTCTCCCTTCAGCTGCA*GCCT
GCTTGATTTCTTATCTGCTGTTGAAAGACCTTTCTTTCTCAGGTACTCTTGTGCTTTCTC
TAGATCTCCTCCTGTCTCCGCCAATGCCTTCTTGCAATCCATCATTCCTGCTCCTGTTTC
TTCACGCAGCTGCTTCACAAGTCCAGCTGAAACCACTGCTGTTGGTGGACTTGGAACAGC
TTCCTTGGGCTCTTCAGCTTTTGGCTCTTCTTTCTCTGGTTCGGCTTTTGGTTTAGCTGC
GGTTTGAGCAGCAACCTCAGCAGCAAAGTCCTGACTTTTCTTCTCAAGGCCTTCTCCCAG
AGTGTACCTAATGAATCTCTTCACCTTGATGTTTTCTCCAATGGTTGCAATCCTCTGCTT
CACAAGGTCCTTCACTATCCCCTTATCGTCTTTAATGTATGGTTGCTCCAGTAATGCAAG
TGCGTCTACCCTCTTCTTTATCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 5

CO CL1816Contig1 747 5 10 U
GGGTGTCCGTGAAGCTCTCCATAGAAAGGGTGAAGAGTACAAGTTGTTCTGGCCAGTGCA
ACCTGAGTTTGTGAGAGTTGCATCTAAATTTGGAGCCACAATCGTACCTTTTGGCGTTGT
TGGAGAAGACGACATCTGCAAGATTGTTCTGGACTCCTATGATCAAAGGAGCATACCGAT
CCTGAATGATTTAATTGAAAGGGCAACAAAGGAAGCTGGCAACCTAAGGAAAGGCAACGA
GAGCGAATTGGGAAACCAAGATTTTTATATACCAGGACTTGTACCTAAGGTTCCAGGGAG
GTTCTATTATTACTTTGGAAAACCAATAGAAACCGCAGGTAAGGAACACGAGCTAAGAGA
CAAAGAAAAAGCCCAAGAGCTTTACTTGCAAGTCAAGTCTCAGGTAGAACAATGCATTGC
CTATTTGAAAATGAAAAGAGAGAGTGATCCCTACAGAAACTTGCTGCCAAGGATGTTGTA
TCAGGCTTCACATGGTTTTTCTTCTGAAATTCCAACGTTTGATCTCTGAAATGATCTTCC
TTTTGATCATTTACACGACTTTATATATTTTATTTTTTCAAATCGTGGATTAAACAGCTA
ATTGTTTTTAAAAGTAGCATAGATAAATATTAGCAGCAAAATAAAACTTTTTGTGTTAAA
TGGTAGTCTTTCCAATGATTATTCTCTTTTCATATGATGTAATTGGTGATTTTACTCGGT
GTTAAAAAATAATTATTTTCCCGTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX87TFB U 54
AF RR2BT36JQ C 373
AF RR2BT36TF U 373
AF RR2D707TF U 1
AF RR2AX87JQ C 139
BS 1 153 RR2D707TF
BS 154 154 RR2AX87TFB
BS 155 170 RR2D707TF
BS 171 171 RR2AX87TFB
BS 172 346 RR2D707TF
BS 347 347 RR2AX87JQ
BS 348 523 RR2D707TF
BS 524 524 RR2BT36TF
BS 525 724 RR2D707TF
BS 725 747 RR2AX87JQ

RD RR2AX87TFB 281 0 0
CAGA
GCAACCTGAGTTTGTGAGAGTTGCATCTAAATTTGGAGCCACAATCGTACCTTTTGGCGT
TTTTGGAGAAGACGACATCTGCAAGATTGTTCTGGACTCCTATGATCAAAGGAGCATACC
GATCCTGAATGATTTAATTGAAAGGGCAACAAAGGAAGCTGGCAACCTAAGGAAAGGCAA
CGAGAGCGAATTGGGAAACCAAGATTTTTATATACCAGGACTTGTACCTAAGGTTCCAGG
GAGGTTCTATTATTACTTTGGAAAACCAATAGAAACC

QA 5 281 5 281
DS 

RD RR2BT36JQ 285 0 0
CCAAGAGCTTTACTTGCAAGTCAAGTCTCAGGTAGAACAATGCATTGCCTATTTGAAAAT
GAAAAGAGAGAGTGATCCCTACAGAAACTTGCTGCCAAGGATGTTGTATCAGGCTTCACA
TGGTTTTTCTTCTGAAATTCCAACGTTTGATCTCTGAAATGATCTTCCTTTTGATCATTT
ACACGACTTTATATATTTTATTTTTTCAAATCGTGGATTAAACAGCTAATTGTTTTTAAA
AGTAGCATAGATAAATATTAGCAGCAAAATAAAACTTTTTGTGTT

QA 1 285 1 285
DS 

RD RR2BT36TF 285 0 0
CCAAGAGCTTTACTTGCAAGTCAAGTCTCAGGTAGAACAATGCATTGCCTATTTGAAAAT
GAAAAGAGAGAGTGATCCCTACAGAAACTTGCTGCCAAGGATGTTGTATCAGGCTTCACA
TGGTTTTTCTTCTGAAATTCCAACGTTTGATCTCTGAAATGATCTTCCTTTTGATCATTT
ACACGACTTTATATATTTTATTTTTTCAAATCGTGGATTAAACAGCTAATTGTTTTTAAA
AGTAGCATAGATAAATATTAGCAGCAAAATAAAACTTTTTGTGTT

QA 1 285 1 285
DS 

RD RR2D707TF 724 0 0
GGGTGTCCGTGAAGCTCTCCATAGAAAGGGTGAAGAGTACAAGTTGTTCTGGCCAGTGCA
ACCTGAGTTTGTGAGAGTTGCATCTAAATTTGGAGCCACAATCGTACCTTTTGGCGTTGT
TGGAGAAGACGACATCTGCAAGATTGTTCTGGATTCCTATGATCAAAGGAACATACCGAT
CCTGAATGATTTAATTGAAAGGGCAACAAAGGAAGCTGGCAACCTAAGGAAAGGCAACGA
GAGCGAATTGGGAAACCAAGATTTTTATATACCAGGACTTGTACCTAAGGTTCCAGGGAG
GTTCTATTATTACTTTGGAAAACCAATAGAAACCGCAGGTAAGGAATACGAGCTAAGAGA
CAAAGAAAAAGCCCAAGAGCTTTACTTGCAAGTCAAGTCTCAGGTAGAACAATGCATTGC
CTATTTGAAAATGAAAAGAGAGAGTGATCCCTACAGAAACTTGCTGCCAAGGATGTTGTA
TCAGGCTTCACATGGTTTTTCTTCTGAAATTCCAACGTTTGATATCTGAAATGATCTTCC
TTTTGATCATTTACACGACTTTATATATTTTATTTTTTCAAATCGTGGATTAAACAGCTA
ATTGTTTTTAAAAGTAGCATAGATAAATATTAGCAGCAAAATAAAACTTTTTGTGTTAAA
TGGTAGTCTTTCCAATGATTATTCTCTTTTCATATGATGTAATTGGTGATTTTACTCGGT
GTTA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2AX87JQ 609 0 0
CAAGATTGTTTTGGACTCCTATGATCAAAGGAGCATACCGATCCTGAATGATTTAATTGA
AAGGGCAACAAAGGAAGCTGGCAACCTAAGGAAAGGCAACGAGAGGGAATTGGGAAACCA
AGATTTTTATATACCAGGACTTGTACCTAAGGTTCCAGGGAGGTTTTATTATTACTTTGG
AAAACCAATAGAAACCGCAGGTAAGGAACACGAGTTAAGAGACAAAGAAAAAGCCCAAGA
GCTTTACTTGCAAGTCAAGTTTCAGGTAGAACAATGCATTGCCTATTTGAAAATGAAAAG
AGAGAGTGATCCCTACAGAAACTTGCTGCCAAGGATGTTGTATCAGGCTTCACATGGTTT
TTTTTTTGAAATTCCAACGTTTGATTTTTGGAATGATTTTCCTTTTGATCATTTACACGA
CTTTATATATTTTATTTTTTCAAATCGTGGATTAAACAGCTAATTGTTTTTAAAAGTAGC
ATAGATAAATATTAGCAGCAAAATAAAACTTTTTGTGTTAAGTGGTAGTCTTTTTAATGA
TTATTTTCTTTTCATATGATGTAATTGGTGATTT*ACTCGGTGTTAAAAAATAATTATTT
TCCCGTATT

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 5

CO CL1817Contig1 1043 5 11 U
GGGACATATCCCTCTCTTCTACACAAACATCAGTCTTATAACGCTTATTTTACTGAGAAA
C**AAGTATTAAAGAAGAGCAAAAAAGTATCCACAACAATGTATATGTCACCGTCTGTAT
CAAAACGCCTCCTTTTGGTCCCTATCTTGGCTGTGGTGGCCATACAACTTCTATTTGTAC
GCGCTGCTTCGTCAGTGAACATGACAAATACGTATCTACACCACAAATGCTTTGTCAGTC
AAGGGAAATACAAACCGGGAAGTCAGTATGAGAAAAACCTAAAACGTATCAGGAATGAAA
TCTCTCCTGAAAGTTTTAAAAGAGGTTACAACTCTACGCACCTTGGTGCAGGTCCCGATT
TCATAATCATGTTCCTTCAGTGCCGCGGAGACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCT
ATGCTAACGCCCAACCCGAGTTCTTTAAGAGATGTCCAAGATATAAAGGTGGAATAATAT
GGTACGACCAGTGTTCTTTATATTTTTCTACGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACG
ACAACAATTTCTGTATGTCCAATAAAAAGAAAGTAGACGACTATCTATATAACGATTTAA
AACCGCGGTACTTCATCGACGATTTGATACAAAATACCACTCGTGAAGCTAACCCGAAAG
CGCCGTACTACACGGTGGAGGAGAAGAAGGTGGCGAATGTAACTATATATGGAATGGCTG
AGTGCTCCTTCGACATGTCGCAAAGAAACTGTAGGAAGTGTTTAGAACGAAATAATTTCT
ATTTTAGAAGATGTTTTCATAATAAAATAGGAGCCAGAGTTTTGGGTAAAAGCTGTAGTT
TTAGGTATGAGCTTTATCCTTTCATTTCCCCTGAGGCCGGTCCTAAATATTTGAAGTCTT
AAAAAGCAATTTATAGAAAAAGTATGCGGATCTTTTCTTTTATGAAAGTTTTAAATTTTA
TATTGTATTGATATCTTTGTATTTATTATTTTATTTAAACAAAAGTGTATGATGTAGTTT
AAATAAATCTATACTCCTCGTAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK82TF U 1
AF RR2H613TF U 4
AF RR2B376TF U 26
AF RR2CK82JQ C 283
AF RR2B376JQ C 729
BS 1 252 RR2CK82TF
BS 253 253 RR2H613TF
BS 254 670 RR2CK82TF
BS 671 877 RR2CK82JQ
BS 878 878 RR2B376JQ
BS 879 961 RR2CK82JQ
BS 962 962 RR2B376JQ
BS 963 997 RR2CK82JQ
BS 998 998 RR2B376JQ
BS 999 1020 RR2CK82JQ
BS 1021 1043 RR2B376JQ

RD RR2CK82TF 673 0 0
GGGACATATCCCTCTCTTCTACACAAACATCAGTCTTATAACGCTTATTTTACTGAGAAA
C**AAGTATTAAAGAAGAGCAAAAAAGTATCCACAACAATGTATATGTCACCGTCTGTAT
CAAAACGCCTCCTTTTGGTCCCTATCTTGGCTGTGGTGGCCATACAACTTCTATTTGTAC
GCGCTGCTTCGTCAGTGAACATGACAAATACGTATCTACACCACAAATGCTTTGTCAGTC
AAGGGAAATACAGACCGGGAAGTCAGTATGAGAAAAACCTAAAACGTATCAGGAATGAAA
TCTCTCCTGAAAGTTTTAAAAGAGGTTACAACTCTACGCACCTTGGTGCAGGTCCCGATT
TCATAATCATGTTCCTTCAGTGCCGCGGAGACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCT
ATGCTAACGCCCAACCCGAGTTCTTTAAGAGATGTCCAAGATATAAAGGTGGAATAATAT
GGTACGACCAGTGTTCTTTATATTTTTCTACGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACG
ACAACAATTTCTGTATGTCCAATAAAAAGAAAGTAGACGACTATCTATATAACGATTTAA
AACCGCGGTACTTCATCGACGATTTGATACAAAATACCACTCGTGAAGCTAACCCGAAAG
CGCCGTACTA
CAC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2H613TF 667 0 0
GG
ATATCCCTCTCTTCTACACAAACATCAGTCTTATAACGCTTATTTTACTGAGAAAC**AA
GTATTAAAGAAGAGCAAAAAAGTATCCACAACAATGTATATGTCACCGTCTGTATCAAAA
CGCCTCCTTTTGGTCCCTATCTTGGCTGTGGTGGCCATACAACTTCTATTTGTACGCGCT
GCTTCGTCAGTGAACATGACAAATACGTATCTACACCACAAATGCTTTGTCAGTCAAGGG
AAATACAAACCGGGAAGTCAGTATGAGAAAAACCTAAAACGTATCAGGAATGAAATCTCT
CCTGAAAGTTTTAAAAGAGGTTACAACTCTATGCACCTTGGTGCAGGTCCCGATTTCATA
ATCATGTTCCTTCAGTGCCGCGGAGACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCTATGCT
AACGCCCAACCCGAGTTCTTTAAGAGATGTCCAAGATATAAAGGTGGAATAATATGGTAC
GACCAGTGTTCTTTATATTTTTCTACGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACGACAAC
AATTTCTGTATGTCCAATAAAAAGAAAGTAGACGACTATCTATATAACGATTTAAAACCG
CGGTACTTCATCGACGATTTGATACAAAATACCACTCGTGAAGCTAACCCGAAAGCGCCG
TACTA

QA 3 667 3 667
DS 

RD RR2B376TF 648 0 0
GATCA
CAGTCTTATAACGCTTATCTTACTGAGAAACTTAAGTATTAAAGAAGAGCAAAAAAGTAT
CCGCAACAATGTATATTTCACCGTCTGTATCAAAACGCCTCCTTTTGGTCCCTATCTTGG
CTGTGGTGGCCATACAACTTCTATTTGTACGCGCTACTTCGTCAGTGAACATGACAAATA
CGTATCTACACCACAAATGCTTTGTCAGTCAAGGGAAATACAAACCGGGAAGTCAGTATG
AGAAAAACCTAAAACGTATCAGGAATGAAATCTCTCCTGAAAGTTTTAAAAGTGGTTACA
ACTCTACGCACCTTGGTGCAGGTCCCGATTTCATAATCATGTTCCTTCAATGCCGCGGAG
ACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCTATGCTAACGCCCAACCCGAGTTTTTTAAGA
GATGTCCAT*ATATAAAGGTGGAATAATATGGTACGACCAGTGTTCTTTATATTTTTCTA
CGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACGACAACAATTTCTGTATGTCCAATAAAAAGA
AAGTAGACGACTATCTATATAACGATTTCAAACCGCGGTATTTCATCGACGATTTGATAC
AAAATACCACTCGTGAAGCTAAACCGAAAGCGCCGTACTA
CAC

QA 6 645 6 645
DS 

RD RR2CK82JQ 738 0 0
AACGTATCAGGAATGAAATCTCTCCTGAAAGTTTTAAAAGAGGTTACAACTCTACGCACC
TTGGTGCAGGTCCCGATTTCATAATCATGTTCCTTCAGTGCCGCGGAGACACCCACGGGC
CCAAATGCCGTTCTTGCTATGCTAACGCCCAACCCGAGTTCTTTAAGAGATGTCCAAGAT
ATAAAGGTGGAATAATATGGTACGACCAGTGTTCTTTATATTTTTCTACGATCGATTCTA
TAGGGATGATCGATTACGACAACAATTTCTGTATGTCCAATAAAAAGAAAGTAGACGACT
ATCTATATAACGATTTAAAACCGCGGTACTTCATCGACGATTTGATACAAAATACCACTC
GTGAAGCTAACCCGAAAGCGCCGTACTACACGGTGGAGGAGAAGAAGGTGGCGAATGTAA
CTATATATGGAATGGCTGAGTGCTCCTTCGACATGTCGCAAAGAAACTGTAGGAAGTGTT
TAGAACGAAATAATTTCTATTTTAGAAGATGTTTTCATAATAAAATAGGAGCCAGAGTTT
TGGGTAAAAGCTGTAGTTTTAGGTATGAGCTTTATCCTTTCATTTCCCCTGAGGCTGGTC
CTAAATATTTGAAGTCTTAAAAAGCAATTTATAGAAAAAGTATGCGGATCTTTTCTTTTA
TGAAAGTTTTAAATTTTATTTTGTATTGATATCTTTGTATTTATTATTTTATTTAGACAA
AAGTGTATGATGTAGTTT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2B376JQ 315 0 0
TTCGACATGTCGCAAAGAAACTGTAGGAAGTGTTTAGAACGAAATAATTTTTATTTTAGA
AGATGTTTTCATAATAAAATAGGAGCCAGAGTTTTGGGTAAAAGCTGTAGTTTTAGGTAT
GAGCTTTATCCTTTCATTTCCCCTGAGGCCGGTCCTAAATATTTGAAGTTTTAAAAAGCA
ATTTATAGAAAAAGTATGCGGATTTTTTTTTTTATGAAAGTTTTAAATTTTATATTGTAT
TGATATCTTTGTATTTATTATTTTATTTAAACAAAAGTGTATGATGTAGTTTAAATAAAT
CTATACTCCTCGTAC

QA 1 315 1 315
DS 



AS 1 3

CO CL1818Contig1 672 3 20 U
GGGCCACGGGGAGGGTGGAGAGAGGGACTGTGAAGGTTGGGGAGACTGTGGATTTAGTTG
GGTTGAGGGAGACTAGGAACTATACGGTTACAGGAGTTGAGATGTTTCAGAAGATTCTTG
ATGAGGCGTTAGCTGGGGATAATGTGGGGTTGTTGCTTAGGGGTATTCAGAAGGCTGATA
TTCAGAGGGGGATGGTGTTGGCTAAGCCTGGGAGTATCACTCCGCATACTAAGTTTGAGG
CGATTGTGTATGTGTTGAAGAAAGAGGAAGGTGGGAGGCATTCTCCGTTTTTCGCGGGGT
ACAGGCCTCAGTTCTACATGAGGACGACGGATGTTACGGGGAAAGTGACCAAGATTATGA
ATGATAAAGATGAGGAGTCGAAGATGGTTATGCCTGGTGATAGGGTGAAGATTGTGGTTG
AGCTTATTGTGCCTGTGGCTTGTGAGCAAGGGATGAGGTTTGCTATTAGAGAAGGTGGGA
AGACCGTTGGTGCTGGAGTAATCCAGTCTATCATTGAGTGATGATTAGAGAGTTTCATAT
AGTGAGCAATCTAAAATCTACTTGCTTTCTTTTTT*GTTTCCCTCTTGATTCACAGAACT
CTTTACTTCTCTTTTTGTGCCATTTTCTGTAAGAACTTGGAAGTCAAAATGTCATATATT
TCTTGATTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2HA96TF U 1
AF RR2B920JQ C 17
AF RR2B920TF U 17
BS 1 37 RR2HA96TF
BS 38 38 RR2B920TF
BS 39 40 RR2HA96TF
BS 41 42 RR2B920TF
BS 43 55 RR2HA96TF
BS 56 56 RR2B920TF
BS 57 121 RR2HA96TF
BS 122 122 RR2B920TF
BS 123 275 RR2HA96TF
BS 276 276 RR2B920TF
BS 277 307 RR2HA96TF
BS 308 308 RR2B920TF
BS 309 328 RR2HA96TF
BS 329 329 RR2B920TF
BS 330 334 RR2HA96TF
BS 335 335 RR2B920TF
BS 336 575 RR2HA96TF
BS 576 576 RR2B920TF
BS 577 616 RR2HA96TF
BS 617 672 RR2B920TF

RD RR2HA96TF 620 0 0
GGGCCACGGGGAGGGTGGAGAGAGGGACTGTGAAGGTGGGATAGACTGTGGATTTGGTTG
GGTTGAGGGAGACTAGGAACTATACGGTTACAGGAGTTGAGATGTTTCAGAAGATTCTTG
ACGAGGCGTTAGCTGGGGATAATGTGGGGTTGTTGCTTAGGGGTATTCAGAAGGCTGATA
TTCAGAGGGGGATGGTGTTGGCTAAGCCTGGGAGTATCACTCCGCATACTAAGTTTGAGG
CGATTGTGTATGTGTTGAAGAAAGAGGAAGGTGGGGGGCATTCTCCGTTTTTCGCGGGGT
ACAGGCCGCAGTTCTACATGAGGACGACTGATGTCACGGGGAAAGTGACCAAGATTATGA
ATGATAAAGATGAGGAGTCGAAGATGGTTATGCCTGGTGATAGGGTGAAGATTGTGGTTG
AGCTTATTGTGCCTGTGGCTTGTGAGCAAGGGATGAGGTTTGCTATTAGAGAAGGTGGGA
AGACCGTTGGTGCTGGAGTAATCCAGTCTATCATTGAGTGATGATTAGAGAGTTTCATAT
AGTGAGCAATCTAAAATCTACTTGCTTTCTTTTTTTGTTTCCCTCTTGATTCACAGAACT
CTTTACTTCTCTTTTT
TGTG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2B920JQ 656 0 0
GGAGAGAGGGACTGTGAAGGTTGGGGAGACTGTGGATTTAGTTGGGTTGAGGGAGACTAG
GAACTATACGGTTACAGGAGTTGAGATGTTTCAGAAGATTCTTGATGAGGCGTTAGCTGG
GGATAATGTGGGGTTGTTGCTTAGGGGTATTCAGAAGGCTGATATTCAGAGGGGGATGGT
GTTGGCTAAGCCTGGGAGTATCACTCCGCATACTAAGTTTGAGGCGATTGTGTATGTGTT
GAAGAAAGAGGAAGGTGGGAGGCATTCTCCGTTTTTCGCGGGGTACAGGCCTCAGTTCTA
CATGAGGACGACGGATGTTACGGGGAAAGTGACCAAGATTATGAATGATAAAGATGAGGA
GTCGAAGATGGTTATGCCTGGTGATAGGGTGAAGATTGTGGTTGAGCTTATTGTGCCTGT
GGCTTGTGAGCAAGGGATGAGGTTTGCTATTAGAGAAGGTGGGAAGACCGTTGGTGCTGG
AGTAATCCAGTCTATCATTGAGTGATGATTAGAGAGTTTCATATAGTGAGCAATCTAAAA
TCTACTTGCTTTCTTTTTT*GTTTCCCTCTTGATTCACAGAACTCTTTACTTCTCTTTTT
GTGCCATTTTCTGTAAGAACTTGGAAGTCAAAATGTCATATATTTCTTGATTGTCC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2B920TF 656 0 0
GGAGAGAGGGACTGTGAAGGTTGGGGAGACTGTGGATTTAGTTGGGTTGAGGGAGACTAG
GAACTATACGGTTACAGGAGTTGAGATGTTTCAGAAGATTCTTGATGAGGCGTTAGCTGG
GGATAATGTGGGGTTGTTGCTTAGGGGTATTCAGAAGGCTGATATTCAGAGGGGGATGGT
GTTGGCTAAGCCTGGGAGTATCACTCCGCATACTAAGTTTGAGGCGATTGTGTATGTGTT
GAAGAAAGAGGAAGGTGGGAGGCATTCTCCGTTTTTCGCGGGGTACAGGCCTCAGTTCTA
CATGAGGACGACGGATGTTACGGGGAAAGTGACCAAGATTATGAATGATAAAGATGAGGA
GTCGAAGATGGTTATGCCTGGTGATAGGGTGAAGATTGTGGTTGAGCTTATTGTGCCTGT
GGCTTGTGAGCAAGGGATGAGGTTTGCTATTAGAGAAGGTGGGAAGACCGTTGGTGCTGG
AGTAATCCAGTCTATCATTGAGTGATGATTAGAGAGTTTCATATAGTGAGCAATCTAAAA
TCTACTTGCTTTCTTTTTT*GTTTCCCTCTTGATTCACAGAACTCTTTACTTCTCTTTTT
GTGCCATTTTCTGTAAGAACTTGGAAGTCAAAATGTCATATATTTCTTGATTGTCC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 3

CO CL1819Contig1 923 3 6 U
GGGCCGATCAATCAACTGACATTTAAGGGGTTTTACAGATCGAAGTCGCGGAATAAGAAC
AAGAAGATGTTTCTCACAAGGACCGAGTATGACAGAGGAGTCAACACTTTCTCTCCTGAA
GGCAGGCTCTTTCAAGTTGAGTATGCCATTGAAGCTATCAAGCTTGGTTCTACTGCAATT
GGAGTCAAGACAAAGGAAGGAGTTGTGCTTGCTGTCGAGAAGCGTATCACCTCTCCTTTG
CTGGATCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTATGGAGATTGATGACCATATTGGTTGTGCCATG
AGCGGTTTAATTGCTGATGCGCGTACACTTGTTGAACATGCAAGAGTTGAAACTCAAAAC
CACAGATTCTCGTATGGTGAGCCAATGACTGTGGAGTCCACAACACAAGCGCTGTGTGAT
CTGGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATCAATGTCTCGCCCATTTGGAGTATCT
CTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAACGGACCAAGCTTGTACTACACGGACCCATCAGGA
ACATTCTGGCAGTGCAACGCAAAGGCCATTGGCTCAGGCTCAGAAGGAGCTGATAGTTCT
CTTCAAGAGCAATTCAACAAAGATCTGTCACTCAGTGAAGCTGAGACGATCGCGGTGTCT
ATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAGAAGGTGACTCCGAATAATGTGGACATTGCCAAGGTA
GCTCCAGCTTACCATCTCTACACTCCAGAAGAAGTTGAAGCAGTCATTAGTCGTCTTTGA
GGATGATGATGCTCAATACAAGTGATGTGTTTTTATCCGACTTGTTCTAGTTCGGATTTT
GAAACAAAGACTTTCTCTCTGTTAGATTTGATGTTTCATGTGACATTCTAAGCATTGTTA
TGTAAGAGAACCTTTTCTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2FN68TF U 1
AF RR2FN68JQ C 347
AF RR2D993TF U 714
BS 1 687 RR2FN68TF
BS 688 688 RR2FN68JQ
BS 689 717 RR2FN68TF
BS 718 718 RR2D993TF
BS 719 732 RR2FN68TF
BS 733 923 RR2D993TF

RD RR2FN68TF 739 0 0
GGGCCGATCAATCAACTGACATTTAAGGGGTTTTACAGATCGAAGTCGCGGAATAAGAAC
AAGAAGATGTTTCTCACAAGGACCGAGTATGACAGAGGAGTCAACACTTTCTCTCCTGAA
GGCAGGCTCTTTCAAGTTGAGTATGCCATTGAAGCTATCAAGCTTGGTTCTACTGCAATT
GGAGTCAAGACAAAGGAAGGAGTTGTGCTTGCTGTCGAGAAGCGTATCACCTCTCCTTTG
CTGGATCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTATGGAGATTGATGACCATATTGGTTGTGCCATG
AGCGGTTTAATTGCTGATGCGCGTACACTTGTTGAACATGCAAGAGTTGAAACTCAAAAC
CACAGATTCTCGTATGGTGAGCCAATGACTGTGGAGTCCACAACACAAGCGCTGTGTGAT
CTGGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATCAATGTCTCGCCCATTTGGAGTATCT
CTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAACGGACCAAGCTTGTACTACACGGACCCATCAGGA
ACATTCTGGCAGTGCAACGCAAAGGCCATTGGCTCAGGCTCAGAAGGAGCTGATAGTTCT
CTTCAAGAGCAATTCAACAAAGATCTGTCACTCAGTGAAGCTGAGACGATCGCGGTGTCT
ATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAGAAG*TGACTCCGAATAATGTGGACATTGCCAAG*TA
GCTCCAGCTTAC
ATCTCTA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2FN68JQ 576 0 0
TTGAAACTCAAAACCACAGATTCTCGTATGGTGAGCCAATGACTGTGGAGTCCACAACAC
AGGCGCTGTGTGATCTGGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATCAATGTCTCGCC
CATTTGGAGTATCTCTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAACGGACCAAGCTTGTACTACA
CGGACCCATCAGGAACATTCTGGCAGTGCAACGCAAAGGCCATTGGCTCAGGCTCAGAAG
GAGCTGATAGTTTTCTTCAAGAGCAATTCAACAAAGATCTGTCACTCAGTGAAGCTGAGA
CGATCGCGGTGTCTATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAGAAGGTGACTCCGAATAATGTGG
ACATTGCCAAGGTAGCTCCAGCTTACCATCTTTACACTCCGGAAGAAGTTGAAGCAGTCA
TTAGTCGTCTTTGAGGATGATGATGCTCAATACAAGTGATGTGTTTTTATCCGACTTGTT
TTAGTTCGGATTTTGAAACAAAGACTTTCTTTCTGTTAGATTTGATGTTTCATGTGACAT
TTTAAGCATTGTTATGTAAGAGAACCTTTTCTTTCC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2D993TF 210 0 0
G
AAGGTAGCTCCAGCTTACCATCTCTACACTCCAGAAGAAGTTGAAGCAGTCATTAGTCGT
CTTTGAGGATGATGATGCTCAATACAAGTGATGTGTTTTTATCCGACTTGTTCTAGTTCG
GATTTTGAAACAAAGACTTTCTCTCTGTTAGATTTGATGTTTCATGTGACATTCTAAGCA
TTGTTATGTAAGAGAACCTTTTCTTTCCC

QA 2 210 2 210
DS 



AS 1 5

CO CL1820Contig1 513 5 8 U
GGGTTGCTATAGTACATTTGGTGGAGGAAGAAGG*CGAAAATGGGAAAGCAGCCAGTGAA
ATTGAAGGCGGTGGTTTACGCGTTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGATCATGACCGGTCTATG
GAAGGATCTACCGGAGAAGATCCACCACAAGGTCTCAGAGAATTGGATCAGCACGATTCT
CCTCCTCGCTCCGGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACATAGAAAAGGAGAA
GCTGGAGCACAGGTTCTAATCATGGAGATTTTCTGACCACACAAGAATACCATTTCTTTC
TTTGTTTTTCAGTTTCCAAAAACGCTTTTGAATGCTTCCTTGCGTTTCTTGTTGAATAAA
TATGTTTTATTTGTAACAATGCCCTGAAGGTTTGATCTCCAGAATGCAATTGCCGAAGAG
CAATTTAGTTTGATGAATAAAGTTTCTGAAAGACATTGTCTAAATCTCATTTTATTAGTA
TGCATACAAACCGTACGATAATGGATTTACTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DM88JQ C 1
AF RR2DM88TF U 1
AF RR2B336TF U 7
AF RR2FJ65JQ C 5
AF RR2FJ65TF U 5
BS 1 17 RR2DM88JQ
BS 18 140 RR2DM88TF
BS 141 141 RR2B336TF
BS 142 365 RR2DM88TF
BS 366 366 RR2B336TF
BS 367 448 RR2DM88TF
BS 449 463 RR2B336TF
BS 464 513 RR2FJ65TF

RD RR2DM88JQ 448 0 0
GGGTTGCTATAGTACATTTGGTGGAGGAAGAAGG*CGAAAATGGGAAAGCAGCCAGTGAA
ATTGAAGGCGGTGGTTTACGCGTTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGATCATGACCGGTCTATG
GAAGGATCTACCGGAGAAGACCCACCACAAGGTCTCAGAGAATTGGATCAGCACGATTCT
CCTCCTCGCTCCGGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACATAGAAAAGGAGAA
GCTGGAGCACAGGTTCTAATCATGGAGATTTTCTGACCACACAAGAATACCATTTCTTTC
TTTGTTTTTCAGTTTCCAAAAACGCTTTTGAATGCTTCCTTGCGTTTCTTGTTGAATAAA
TATGTCTTATTTGTAACAATGCCCTGAAGGTTTGATCTCCAGAATGCAATTGCCGAAGAG
CAATTTAGTTTGATGAATAAAGTTTCTG

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR2DM88TF 448 0 0
GGGTTGCTATAGTACAT
TTGGTGGAGGAAGAAGG*CGAAAATGGGAAAGCAGCCAGTGAAATTGAAGGCGGTGGTTT
ACGCGTTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGATCATGACCGGTCTATGGAAGGATCTACCGGAGA
AGACCCACCACAAGGTCTCAGAGAATTGGATCAGCACGATTCTCCTCCTCGCTCCGGTCA
TCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACATAGAAAAGGAGAAGCTGGAGCACAGGTTCT
AATCATGGAGATTTTCTGACCACACAAGAATACCATTTCTTTCTTTGTTTTTCAGTTTCC
AAAAACGCTTTTGAATGCTTCCTTGCGTTTCTTGTTGAATAAATATGTCTTATTTGTAAC
AATGCCCTGAAGGTTTGATCTCCAGAATGCAATTGCCGAAGAGCAATTTAGTTTGATGAA
TAAAGTTTCTG

QA 18 448 18 448
DS 

RD RR2B336TF 458 0 0
GGATAGTACAT
TTGGTGGAGGAAGAAGG*CGAAAATGGGAAAGCAGCCAGTGAAATTGAAGGCGGTGGTTT
ACGCGTTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGATCATGACCGGTCTATGGAAGGATCTACCGGAGA
AGATCCACCACAAGGTCTCAGAGAATTGGATCAGCACGATTCTCCTCCTCGCTCCGGTCA
TCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACATAGAAAAGGAGAAGCTGGAGCACAGGTTCT
AATCATGGAGATTTTCTGACCACACAAGAATACCATTTCTTTCTTTGTTTTTCAGTTTCC
AAAAACGCTTTTGAATGCTTCCTTGCGTTTCTTGTTGAATAAATATGTTTTATTTGTAAC
AATGCCCTGAAGGTTTGATCTCCAGAATGCAATTGCCGAAGAGCAATTTAGTTTGATGAA
TAAAGTTTCTGAAAGACATTGTCTAA
G

QA 12 457 12 457
DS 

RD RR2FJ65JQ 509 0 0
GGGCTATAGAACA
TTGGTGGAGGAAGAAGGTCGAAGATGGGAAAGCAGCCGGTGAAATTGAAGGCGGTGGTTT
ACGCGTTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGATCATGACCGGTCTATGGAAGGATCTACCTGAGA
AGATCCACCACAAGGTCTCGGAGAATTGGATCAGCACTATTCTCCTCCTCGCTCCGGTCA
TCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACATAGAAAAGGAGAAGCTGGAGCACAGGTTCT
AATCATGGAGATGTTCTGACCACACAAGAATACCATTTCTTTCTTTATTTTTCAGTTTCC
AAAAACACTTTTGAATGCTTCCTTGCGTTTCTTGTTGAATAAATATGTTTTATTTGTAAC
AATGCCCTGAAGGTTTGATCTCCAGAATGCAATTGCCGAAGAGCAATTTAGTTTGATGAA
TAAAGTTTTTGAAAGACATTGTCTAAATCTCATTTTATTAGTATGCATACAAACCGTACG
ATAATGGATTTACTGG

QA 14 509 14 509
DS 

RD RR2FJ65TF 509 0 0
GGGCTATAGAACA
TTGGTGGAGGAAGAAGGTCGAAGATGGGAAAGCAGCCGGTGAAATTGAAGGCGGTGGTTT
ACGCGTTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGATCATGACCGGTCTATGGAAGGATCTACCTGAGA
AGATCCACCACAAGGTCTCGGAGAATTGGATCAGCACTATTCTCCTCCTCGCTCCGGTCA
TCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACATAGAAAAGGAGAAGCTGGAGCACAGGTTCT
AATCATGGAGATGTTCTGACCACACAAGAATACCATTTCTTTCTTTATTTTTCAGTTTCC
AAAAACACTTTTGAATGCTTCCTTGCGTTTCTTGTTGAATAAATATGTTTTATTTGTAAC
AATGCCCTGAAGGTTTGATCTCCAGAATGCAATTGCCGAAGAGCAATTTAGTTTGATGAA
TAAAGTTTCTGAAAGACATTGTCTAAATCTCATTTTATTAGTATGCATACAAACCGTACG
ATAATGGATTTACTGG

QA 14 509 14 509
DS 



AS 1 4

CO CL1821Contig1 1284 4 7 U
GGAGGCTCGGTTTTGGTTCATAAAATTCCAGCCGTGTGGGATGAATGACAATTGTGTGCA
TTTCAATTTGATTGACTCTTCAATCCGGAACAGACTATCCAGTCGGCGAGCTCAAAATCC
TAGGAACTCTTCTCGCATGATGCAGCAATGGTTCTCAACAGATCACTAATCAACCTACAA
CTCCTACTTGGCGACCCACTGACTTCAATCTTGGAAATGGAGCTTCCATGCTGCTCTATA
CCGCTCCAATATTAACATTTTCAAGGGTGTTTAAGAAGAAAAGCACAGAGGAATTCTCAT
GTTTTCCTTACGTTATGACACTCTTAAACTGTTTGATTTACACTTGGTATGGCTTACCGA
TTGTGAGTCATCTTTGGGAGAATCTTCCTCTCGTCACCATCAATGGAGTAGGCATCCTTC
TCGAATTACTCTTCATTTTCATATATTTCTGCTACGCGTCGCCCAAAGAAAAGGTTAAGG
TTGGTGTTATATTTGTTCCGGTGGTGATCGTTTTGTTCGGGGTAACGGCTGTAATCTCAG
CCGTAGTGTTTGACGATCACCGTCACCGGAAATCATTTGTCGGAAGTGTCGGCCTCGTGG
CTTCTATCTCCATGTATGGTTCTCCTCTCGTCGTTATGAAAAAAGTGATAGAGACAAAAA
GTGTGGAGTACATGCCATTTTACTTGTCATTCTTTTCATTTCTGGCAAGCTCCCTTTGGC
TGGCCTATGGTTTACTCAGCCATGATCTCTTTCTTGCGTCACCTAATATGGTGGGGACTC
CACTGGGGATTCTCCAACTTATCCTCTACTTTAAGTACAAGAACAAGGAGGCACTGATTA
CAAAAACAGTGATGAGCAAATCGGATGATGAGAAGAACAAGAGATCACTCGAGCTTGTAG
TTGATGTTGATCATGACGGTGATGCCAATGAGAAGAAGTTTAACAACGCATGTTAGTTTC
TCCCTCCCCAAAAACTCCATGTGAATCTAGAGATTTAGTGTAAACTTGAAGGTCTCGGGG
GATTCTGCTTTCATTACATGATGTTTTATCTCTATTGTGTATCATGTGAATAAAGCACTC
GACGACAAAATATCCAATGTGTTTACCAAAAGGAGCAAAAGTAAAGAAAAACAAACGATC
AATCGATAGTTTATGATTGATACGATCCAGAACTATTAGCTATTTGTTTATGTAAAATAT
TATCCAAAGAGTACGTGGAATCAAAGTTTAATCCACAGAAAACAGGATCCCCTTATACTT
TATAAGATTTTTTTAATTATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX60TFB U 374
AF RR2B705TF U 1
AF RR2D033JQ C 349
AF RR2B705JQ C 723
BS 1 819 RR2B705TF
BS 820 826 RR2D033JQ
BS 827 827 RR2B705JQ
BS 828 1017 RR2D033JQ
BS 1018 1018 RR2B705JQ
BS 1019 1086 RR2D033JQ
BS 1087 1284 RR2B705JQ

RD RR2AX60TFB 282 0 0
TTGGGAGAATCTTCCTCTCGTCACCATCAATGGAGTAGGCATCCTTCTCGAATTACTCTT
CATTTTCATATATTTCTGCTACGCGTCGCCCAAAGAAAAGGTTAAGGTTGGTGTTATATT
TGTTCCGGTGGTGATCGTTTTGTTCGGGGTAACGGCTGTAATCTCAGCCGTATTGTTTGA
CGATCACCGTCACCGGAAATCATTTGTCGGAAGTGTCGGCCTCGTGGCTTCTATCTCCAT
GTATGGTTCTCCTCTCGTCGTTATGAAAAAAGTGATAGAGAC

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR2B705TF 822 0 0
GGAGGCTCGGTTTTGGTTCATAAAATTCCAGCCGTGTGGGATGAATGACAATTGTGTGCA
TTTCAATTTGATTGACTCTTCAATCCGGAACAGACTATCCAGTCGGCGAGCTCAAAATCC
TAGGAACTCTTCTCGCATGATGCAGCAATGGTTCTCAACAGATCACTAATCAACCTACAA
CTCCTACTTGGCGACCCACTGACTTCAATCTTGGAAATGGAGCTTCCATGCTGCTCTATA
CCGCTCCAATATTAACATTTTCAAGGGTGTTTAAGAAGAAAAGCACAGAGGAATTCTCAT
GTTTTCCTTACGTTATGACACTCTTAAACTGTTTGATTTACACTTGGTATGGCTTACCGA
TTGTGAGTCATCTTTGGGAGAATCTTCCTCTCGTCACCATCAATGGAGTAGGCATCCTTC
TCGAATTACTCTTCATTTTCATATATTTCTGCTACGCGTCGCCCAAAGAAAAGGTTAAGG
TTGGTGTTATATTTGTTCCGGTGGTGATCGTTTTGTTCGGGGTAACGGCTGTAATCTCAG
CCGTAGTGTTTGACGATCACCGTCACCGGAAATCATTTGTCGGAAGTGTCGGCCTCGTGG
CTTCTATCTCCATGTATGGTTCTCCTCTCGTCGTTATGAAAAAAGTGATAGAGACAAAAA
GTGTGGAGTACATGCCATTTTACTTGTCATTCTTTTCATTTCTGGCAAGCTCCCTTTGGC
TGGCCTATGGTTTACTCAGCCATGATCTCTTTCTTGCGTCACCTAATATGGTGGGGACTC
CACTGGGGATTCTCCAACTTATCCTCTACTTTAAGTACA
GAA

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2D033JQ 739 0 0
ATGGCTTACCGATTGTGAGTCATCTTTGGGAGAATCTTCCTCTCGTCACCATCAATGGAG
TAGGCATCCTTCTCGAATTACTCTTCATTTTCATATATTTCTGCTACGCGTCGCCCAAAG
AAAAGGTTAAGGTTGGTGTTATATTTGTTCCGGTGGTGATCGTTTTGTTCGGGGTAACGG
CTGTAATCTCAGCCGTAGTGTTTGACGATCACCGTCACCGGAAATCATTTGTCGGAAGTG
TCGGCCTCGTGGCTTCTATCTCCATGTATGGTTCTCCTCTCGTCGTTATGAAAAAAGTGA
TAGAGACAAGAAGTGTGGAGTACATGCCATTTTACTTGTCATTCTTTTCATTTCTGGCAA
GCTCCCTTTGGCTGGCCTATGGTTTACTCAGCCATGATCTCTTTCTTGCGTCACCTAATA
TGGTGGGGACTCCACTGGGGATTCTCCAACTTATCCTCTACTTTAAGTACAAGAACAATG
AGGCACTGATTACAAAAACAGTGATGAGCAAATCGGATGATGAGAAGAACAAGAGATCAC
TCGAGCTTGTAGTTGATGTTGATCATGACGGTGATGCCAATGAGAAGAAGTTTAACAACG
CATGTTAGTTTCTCCCTCCCCAAAAACTCCATGTGAATCTAGAGATTTAGTGTAAACTTG
AAGGTCTCGTGGGATTCTGCTTTCATTACATGATGTTTTATCTCTATTGTGTATCATGTG
AATAAAGCACTCGACGAC
T

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2B705JQ 562 0 0
GCCTATGGTTTACTCAGCCATGATCTCTTTCTTGCGTCACCTAATATGGTGGGGACTCCA
CTGGGGATTTTCCAACTTATCCTTTACTTTAAGTACAAGAACAAGGAGGCACTGATTACA
AAAACAGTGATGAGCAAATCGGATGATGAGAAGAACAAGAGATCACTCGAGCTTGTAGTT
GATGTTGATCATGACGGTGATGCCAATGAGAAGAAGTTTAACAACGCATGTTAGTTTCTC
CCTCCCCAAAAACTCCATGTGAATCTAGAGATTTAGTGTAAACTTGAAGGTCTCGGGGGA
TTTTGCTTTCATTACATGATGTTTTATCTTTATTGTGTATCATGTGAATAAAGCACTCGA
CGACAAAATATCCAATGTGTTTACCAAAAGGAGCAAAAGTAAAGAAAAACAAACGATCAA
TCGATAGTTTATGATTGATACGATCCAGAACTATTAGCTATTTGTTTATGTAAAATATTA
TCCAAAGAGTACGTGGAATCAAAGTTTAATCCACAGAAAACAGGATCCCCTTATACTTTA
TAAGATTTTTTTAATTATTATT

QA 1 562 1 562
DS 



AS 2 5

CO CL1822Contig1 801 2 1 U
GGGAATTGGACCTAAAAGGGAGCTTCAGAGACTGAAGATTCCGTTGGTTCTTGAGAATGA
ACATGTGGGGAAAGGAATGGCTGATAATCCGATGAACACCATCTTGGTGCCTTCTAAACA
GCCTATAGAGCAGTCACTTATACAGACTGTTGGGATCACAAAGATGGGTGTGTATGTTGA
AGCCAGCACTGGCTTTGGTCAGTCCCCTGAGAGCATTCATACTCACTATGGGGTTATGTC
TGATAAGAATGAATTATTTTCCACCATACCTGCAAAGCAGAGAAGACCAGAGGCAACACA
AGCTTACATCAGAAGAAACAAGTACCAACTTCATGAAGCATTCAATGGAAGTTTCATCTT
GGAGAAACTAGCTTACCCAATCTCTAGAGGGCACTTGAGCTTGCTCAACACAAATGTAGA
TGACAACCCTTCAGTCACCTTCAACTACTTCAAACACCCGGTGGATCTCCAACGCTGCGT
TGAAGCCATTCGTCTGGTTTCAAAAGTTGTGACGTCTAAACGTTTCCTAAACTACACGCA
GTGCGACAAGCAAAACGTACACGAGATGCTTAGCTTAAGTGTCAAGGCAAACATCAATCT
AAGACCAAAGCAAGTGAATGATACCAAATCCGTGGCTCAGTTCTGTAAAGACACTGTTGT
CACAATCTGGCACTATCATGGTGGTTGTCTTGTGGGTAAAGTAGTGAGCCCTGACCGCAA
AGTTCTCGTGTTACAGCTCAGAGTTATTGATGGTTCCACATTTGATGAGTCTCCTGGACC
AACCCTCAGCCACGGTCATGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G525TF U 1
AF RR2FZ66TF U 1
BS 1 801 RR2FZ66TF

RD RR2G525TF 447 0 0
GGGAATTGGACCTAAAAGGGAGCTTCAGAGACTGAAGATTCCGTTGGTTCTTGAGAATGA
ACATGTGGGGAAAGGAATGGCTGATAATCCGATGAACACCATCTTGGTGCCTTCTAAACA
GCCTATAGAGCAGTCACTTATACAGACTGTTGGGATCACAAAGATGGGTGTGTATGTTGA
AGCCAGCACTGGCTTTGGTCAGTCCCCTGAGAGCATTCCTACTCACTATGGGGTTATGTC
TGATAAGAATGAATTATTTTCCACCATACCTGCAAAGCAGAGAAGACCAGAGGCAACACA
AGCTTACATCAGAAGAAACAAGTACCAACTTCATGAAGCATTCAATGGAAGTTTCATCTT
GGAGAAACTAGCTTACCCAATCTCTAGAGGGCACTTGAGCTTGCTCAACACAAATGTAGA
TGACAACCCTTCAGTCACCTTCAACTA

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR2FZ66TF 801 0 0
GGGAATTGGACCTAAAAGGGAGCTTCAGAGACTGAAGATTCCGTTGGTTCTTGAGAATGA
ACATGTGGGGAAAGGAATGGCTGATAATCCGATGAACACCATCTTGGTGCCTTCTAAACA
GCCTATAGAGCAGTCACTTATACAGACTGTTGGGATCACAAAGATGGGTGTGTATGTTGA
AGCCAGCACTGGCTTTGGTCAGTCCCCTGAGAGCATTCATACTCACTATGGGGTTATGTC
TGATAAGAATGAATTATTTTCCACCATACCTGCAAAGCAGAGAAGACCAGAGGCAACACA
AGCTTACATCAGAAGAAACAAGTACCAACTTCATGAAGCATTCAATGGAAGTTTCATCTT
GGAGAAACTAGCTTACCCAATCTCTAGAGGGCACTTGAGCTTGCTCAACACAAATGTAGA
TGACAACCCTTCAGTCACCTTCAACTACTTCAAACACCCGGTGGATCTCCAACGCTGCGT
TGAAGCCATTCGTCTGGTTTCAAAAGTTGTGACGTCTAAACGTTTCCTAAACTACACGCA
GTGCGACAAGCAAAACGTACACGAGATGCTTAGCTTAAGTGTCAAGGCAAACATCAATCT
AAGACCAAAGCAAGTGAATGATACCAAATCCGTGGCTCAGTTCTGTAAAGACACTGTTGT
CACAATCTGGCACTATCATGGTGGTTGTCTTGTGGGTAAAGTAGTGAGCCCTGACCGCAA
AGTTCTCGTGTTACAGCTCAGAGTTATTGATGGTTCCACATTTGATGAGTCTCCTGGACC
AACCCTCAGCCACGGTCATGA

QA 1 801 1 801
DS 



CO CL1822Contig2 707 3 4 U
CAGGCAAGGCAAGGCATGATAACATTCAAACAGAAACCATAAACTTCTCACACAAGCAAA
CAAATTCGATTGCCCTAAATAGGGTTACACACAGTTTATAACACAATCTGATCCTATATT
TCAATGAATAGAATATCAAAATAACCAGAAATGGAAAAATTATCCAACGAGTTACGTTGT
ATGATAACAGCTCACTTTGTAAATTAAACACCTGCCTTGTTTCCAAGTCTCTCTCGAAAA
ATCTTGACTCCCATGTATCTTCCCATAATCATGACCGTGGCTTGAGGGTTGGTTCCAGGA
AACTCATCAAATGTGGAACCATCAATAACTCTGAGCCTGTTAACACCGAAAACTTTGCGG
TCAGGGCTCACTACTTTACCCACAAAACAACCACCATGATAGTGCCAGATTGTGACAACA
GTGTCTTTACAGAACTGAGCCACGGATTTGGTATCATTCACTTGCTTTGGTCTTAGATTG
ATGTTTGCCTTGACACTTAAGCTAAGCATCTCGTGTACGTTTTGCTTGTCGCACTGCGTG
TAGTTTAGGAAACGTTTAGACGTCACAACTCTTGAAACCAGACGAATGGCTTCAACGCAG
CGTTGGAGATCCACCGGGTGTTTGAAGTAGTTGAAGGTGACTGAAGGGTTGTCATCTACA
TTTGTGTTGAGCAAGCTCAAGTGCCCTCTAGAGATTGGGTAAGCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ66JQ U 33
AF RR2G525JQ U 1
AF RR2DH61JQ U 27
BS 1 130 RR2G525JQ
BS 131 131 RR2FZ66JQ
BS 132 557 RR2G525JQ
BS 558 707 RR2DH61JQ

RD RR2FZ66JQ 467 0 0
GAAACCATAAACTTCTCACACAAGCAAACAAATTCGATTGCCCTAAATAGGGTTACACAC
AGTTTATAACACAATCTGATCCTATATTTCAATGAATAGAATATCAAAATAACCAGAAAT
GGAAAAATTATCCAACGAGTTACGTTGTATGATAACAGCTCACTTTGTAAATTAAACACC
TGCCTTGTTTCCAAGTCTCTCTCGAAAAATCTTGACTCCCATGTATCTTCCCATAATCAT
GACCGTGGCTTGAGGGTTGGTTCCAGGAAACTCATCAAATGTGGAACCATCAATAACTCT
GAACCTGTTAACACCGAAAACTTTGCGGTCAGGGCTCACTACTTTACCCACAAAACAACC
ACCATGATAGTGCCAAATTGTGACAACAGTGTCTTTACAGAACTGAGCCACGGATTTGGT
ATCATTCACTTGCTTTGGTCTTAAATTGATGTTTGCCTTGACACTTA

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2G525JQ 557 0 0
CAGGCAAGGCAAGGCATGATAACATTCAAACAGAAACCATAAACTTCTCACACAAGCAAA
CAAATTCGATTGCCCTAAATAGGGTTACACACAGTTTATAACACAATCTGATCCTATATT
TCAATGAATAAAATATCAAAATAACCAGAAATGGAAAAATTATCCAACGAGTTACGTTGT
ATGATAACAGCTCACTTTGTAAATTAAACACCTGCCTTGTTTCCAAGTCTCTCTCGAAAA
ATCTTGACTCCCATGTATCTTCCCATAATCATGACCGTGGCTTGAGGGTTGGTTCCAGGA
AACTCATCAAATGTGGAACCATCAATAACTCTGAGCCTGTTAACACCGAAAACTTTGCGG
TCAGGGCTCACTACTTTACCCACAAAACAACCACCATGATAGTGCCAGATTGTGACAACA
GTGTCTTTACAGAACTGAGCCACGGATTTGGTATCATTCACTTGCTTTGGTCTTAGATTG
ATGTTTGCCTTGACACTTAAGCTAAGCATCTCGTGTACGTTTTGCTTGTCGCACTGCGTG
TAGTTTAGGAAACGTTT

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2DH61JQ 681 0 0
CGGACA
GAAACCATAAACTTCTCACACAAGCAAACAAATTCGATTGCCCTAAATAGGGTTACACAC
AGTTTATAACACAATCTGATCCTATATTTCAATGAATAGAATATCAAAATAACCAGAGAT
GGAGAAATTATCCAACGAGTTACGTTGTATGATAACAGCTCACTTTGTAAATTAAACACC
TGCCCTGTTTCCAAGTCTCTCTCGAAGAATCTTGACTCCCATGTATCTTCCCATCATCAT
GACCGTGGCTTGAGGGTTGGTTCCAGGAGACTCATCAAATGTGGAACCATCAATAACTCT
GAGCCTGTTAACACCGAGAACTTTGCGGTCAGGGCTCACTACTTTACCCACAAGACAACC
ACCATGATAGTGCCAGATTGTGACAACAGTGTCTTTACAGAACTGAGCCACGGATTTGGT
ATCATTCACTTGCTTTGGTCTTAGATTGATGTTTGCCTTGACACTTAAGCTAAGCATCTC
GTGTACGTTTTGCTTGTCGCACTGCGTGTAGTTTAGGAAACGTTTAGACGTCACAACTCT
TGAAACCAGACGAATGGCTTCAACGCAGCGTTGGAGATCCACCGGGTGTTTGAAGTAGTT
GAAGGTGACTGAAGGGTTGTCATCTACATTTGTGTTGAGCAAGCTCAAGTGCCCTCTAGA
GATTGGGTAAGCTAG

QA 7 681 7 681
DS 



AS 1 5

CO CL1823Contig1 1018 5 9 U
GGGAGAGTAAACCAGAGAGACAGAGAAAGACTTGTGACACCTTACACCCATGGCTGCCAA
ACACATGTTTATGATTTTCCTCTTTATATACACAGAAGAAAGATCAAAACATATCACTTG
CAGAGTCTTCTTAAAGAAAATAAACATAACATGACAACTTTTGAGGAAAGCTCTGATTCG
GAGGTTATACACAAGCATCTCTTTGAGGACTTGATGATCCCTGATGGTTTCATGGAAGAT
TTTCTCTTTGATGATTCCGCTTTTGTGTCAGGACTCTTGTCTCTAGAACCCTTTAACCCA
GTTCCTAAACTAGAGCCTAGTTCACCGGTTCTTGATCCAGGTTCCTATGTCCGAGAGTTT
CTTCAAATGGAAGCATCATCATCATCATCATCATCACCAACAACAACAGTAACTACAACA
TCACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGAAAAGACCAAAGAGGGTCGAAGAGACTAGA
CACTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCGGCAGAGATTCGAGATCCG
GCCAAGAAAGGATCTAGGCTTTGGCTAGGGACATTTGAGAGTGATATTGATGCTGCAAGA
GCTTATGACTACGCAGCTTTTAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTCCCTTTG
GATGCAGGTAAGTATGATGCTCCGATCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAAACGATGTA
CCGGAGCCTCAAGGAACAACTATGAGTACTAATTCATCATCTTCATCAAACTAATGGGAC
TAGTCATGCTTAAGTTTGACTAATGTAGATAAATATCTAAGTATGTGAAGCATCATGTAT
AGAGCCAAGAAAAATATTAGATTAGTGTAGTGAATAAGTGTTGCAAAATATGTACTAAAG
AGTCCTTGTAACACAATGGACTTTATGGTTAGATTGGGAGGGTAACACCGGATTGTGGAT
TAATCAGTTGAGATGTACAAAAAGTATGAATCAAATAATTGAGTAGATGAACAAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC60TF U 1
AF RR2GB39TF U 54
AF RR2B251JQ C 418
AF RR2B251TF U 418
AF RR2GB39JQ C 476
BS 1 286 RR2CC60TF
BS 287 287 RR2GB39TF
BS 288 396 RR2CC60TF
BS 397 397 RR2GB39TF
BS 398 631 RR2CC60TF
BS 632 632 RR2B251TF
BS 633 652 RR2CC60TF
BS 653 912 RR2B251TF
BS 913 1018 RR2GB39JQ

RD RR2CC60TF 652 0 0
GGGAGAGTAAACCAGAGAGACAGAGAAAGACTTGTGACACCTTACACCCATGGCTGCCAA
ACACATGTTTATGATTTTCCTCTTTATATACACAGAAGAAAGATCAAAACATATCACTTG
CAGAGTCTTCTTAAAGAAAATAAACATAACATGACAACTTTTGAGGAAAGCTCTGATTCG
GAGGTTATACACAAGCATCTCTTTGAGGACTTGATGATCCCTGATGGTTTCATGGAAGAT
TTTCTCTTTGATGATTCCGCTTTTGTGTCAGGACTCTTGTCTCTAGGACCCTTTAACCCA
GTTCCTAAACTAGAGCCTAGTTCACCGGTTCTTGATCCAGGTTCCTATGTCCGAGAGTTT
CTTCAAATGGAAGCATCATCATCATCATCATCATCATCAACAACAACAGTAACTACAACA
TCACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGAAAAGACCAAAGAGGGTCGAAGAGACTAGA
CACTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCGGCAGAGATTCGAGATCCG
GCCAAGAAAGGATCTAGGCTTTGGCTAGGGACATTTGAGAGTGATATTGATGCTGCAAGA
GCTTATGACTACGCAGCTTTTAAGCTCAGGG*AAGAAAAGCTGTGCTCAACT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2GB39TF 572 0 0
GG
GCCAAACACATGTTTATGATTTTCCTCTTTATATACACAGAAGAAAGATCAAAACATATC
ACTTGCAGAGTCTTCTTAAAGAAAATAAACATAACATGACAACTTTTGAGGAAAGCTCTG
ATTCGGAGGTTATACACAAGCATCTCTTTGAGGACTTGATTATCCCTGATGGTTTCATGG
AAGATTTTCTCTTTGATGATTCCGCTTTTGTGTCAGGACTCTTGTCTCTAGAACCCTTTA
ACCCAGTTCCTAAACTAGAGCCTAGTTCACCGGTTCTTGATCCAGGTTCCTATGTCCGAG
AGTTTCTTCAAATGGAAGCATCATCATCATCATCATCATCACCAACAACAACAGTAACTA
CAACATCACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGAAAAGACCAAAGAGGGTCGAAGAGA
CTAGACACTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCGGCAGAGATTCGAG
ATCCGGCCAAGAAAGGATCTAGGCTTTGGCTAGGGACATTTGAGAGTGATATTGATGCTG
CAAGAGCTTATGACTACGCAGCTTTTAAGC

QA 3 572 3 572
DS 

RD RR2B251JQ 495 0 0
G
CATCACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGAAAAGACCAAAGAGGGTCGAAGAGACTA
GACACTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCGGCAGAGATTCGAGATC
CGGCCAAGAAAGGATCTAGGCTTTGGCTAGGGACATTTGAGAGTGATATTGATGCTGCAA
GAGCTTATGACTACGCAGCTTTTAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTCCCTT
TGGATGCAGGTAAGTATGATGCTCCGATCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAAACGATG
TACCGGAGCCTCAAGGAACAACTATGAGTACTAATTCATCATCTTCATCAAACTAATGGG
ACTAGTCATGCTTAAGTTTGACTAATGTAGATAAATATCTAAGTATGTGAAGCATCATGT
ATAGAGCCAAGAAAAATATTAGATTAGTGTAGTGAATAAGTGTTGCAAAATATGTACTAA
AGAGTCCTTGTAAC

QA 2 495 2 495
DS 

RD RR2B251TF 495 0 0
G
CATCACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGAAAAGACCAAAGAGGGTCGAAGAGACTA
GACACTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCGGCAGAGATTCGAGATC
CGGCCAAGAAAGGATCTAGGCTTTGGCTAGGGACATTTGAGAGTGATATTGATGCTGCAA
GAGCTTATGACTACGCAGCTTTTAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTCCCTT
TGGATGCAGGTAAGTATGATGCTCCGATCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAAACGATG
TACCGGAGCCTCAAGGAACAACTATGAGTACTAATTCATCATCTTCATCAAACTAATGGG
ACTAGTCATGCTTAAGTTTGACTAATGTAGATAAATATCTAAGTATGTGAAGCATCATGT
ATAGAGCCAAGAAAAATATTAGATTAGTGTAGTGAATAAGTGTTGCAAAATATGTACTAA
AGAGTCCTTGTAAC

QA 2 495 2 495
DS 

RD RR2GB39JQ 543 0 0
CTAGACACTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCGGCAGAGATTCGAG
ATCCGGCCAAGAAAGGATCTAGGCTTTGGCTAGGGACATTTGAGAGTGATATTGATGCTG
CAAGAGCTTATGACTACGCAGCTTTTAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTCC
CTTTGGATGCAGGTAAGTATGATGCTCCGATCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAAACG
ATGTACCGGAGCCTCAAGGAACAACTATGAGTACTAATTCATCATTTTCATCAAACTAAT
GGGACTAGTCATGCTTAAGTTTGACTAATGTAGATAAATATCTAAGTATGTGAAGCATCA
TGTATAGAGCCAAGAAAAATATTAGATTAGTGTAGTGAATAAGTGTTGCAAAATATGTAC
TAAAGAGTCCTTGTAACACAATGGACTTTATGGTTAGATTGGGAGGGTAACACCGGATTG
TGGATTAATCAGTTGAGATGTACAAAAAGTATGAATCAAATAATTGAGTAGATGAACAAG
TTT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 5

CO CL1824Contig1 757 5 3 U
GGCATCATTTCAGACAAACAAAACAAAACCATTCTCCAAAACAGAGCATGAGAAACGGAG
GACAAAGCCAGAACAAGTTCTTGAGGATCATCTCAACACCTTTCAGAGCTTTAGGCAAAG
CTTACGTGAGAAGCATCACCGGCTGTGCCTCTCGGACTCAGTATCCCTCCTCCTCCTCTT
CCGTCTCCACTGCTTTTCCTAGAAGCAAGAGCTCTTCCTCCGCCGCCTTCTCCTCATCCG
CATCTACACGCAGAACCACTGATTTTGGGATTGATGATGACTACAGCGAGCTAGTGAGAG
CAGCGTCGGTTAGGAGTTTAGGACACAAGAATGAGATAGACATGTTTATACATGAGAAGG
TGAAACAAGAGAAGCTGCAGCAGGAGATGCAGAAGAAGATGAAGTATGGAGGGTTGCCGA
AGAGCACGAGCGTAGGGATGGCGAGGATAGATGAAGATGAAGAAGGAGAGGAAGGATCTG
TGAAACCGAAGACGACTAAGAAAGTCTCTGAGCTTTTGTATCCTCGTAGCAAATCATATG
CTGTTACTGGTAGCCCTAAGTTTTAGCTTTTGTTTATCTTTCTCATTTTAATAGTAATCT
GTGGATTGATTTTTGATATTTTTAGTTTTGATTTTTCTGCAACAAAGAAATAATGATAAA
TTTCGATAAACTACTCTCGATCAACCCAAGTTTGGTGATATTTGAGTTCAGTACGTGTAT
ATACGACCCTGTGTGTTCATCATCTGATCTGCATGTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW17TF U 1
AF RR2A387JQ C 250
AF RR2A387TF U 400
AF RR2GW17JQ C 1
AF RR2C315TF U 1
BS 1 12 RR2C315TF
BS 13 13 RR2GW17TF
BS 14 757 RR2C315TF

RD RR2GW17TF 626 0 0
GGCATCATTTCAGACAAACAAAACAAAACCATTCTCCAAAACAGAGCATGAGAAACGGAG
GACAAAGCCAGAACAAGTTCTTGAGGATCATCTCAACACCTTTCAGAGCTTTAGGCAAAG
CTTACGTGAGAAGCATCACCGGCTGTGCCTCTCGGACTCAGTATCCCTCCTCCTCCTCTT
CCGTCTCCACTGCTTTTCCTAGAAGCAAGAGCTCTTCCTCCGCCGCCTTCTCCTCATCCG
CATCTACACGCAGAACCACTGATTTTGGGATTGATGATGACTACAGCGAGCTAGTGAGAG
CAGCGTCGGTTAGGAGTTTAGGACACAAGAATGAGATAGACATGTTTATACATGAGAAGG
TGAAACAAGAGAAGCTGCAGCAGGAGATGCAGAAGAAGATGAAGTATGGAGGGTTGCCGA
AGAGCACGAGCGTAGGGATGGCGAGGATAGATGAAGATGAAGAAGGAGAGGAAGGATCTG
TGAAACCGAAGACGACTAAGAAAGTCTCTGAGCTTTTGTATCCTCGTAGCAAATCATATG
CTGTTACTGGTAGCCCTAAGTTTTAGCTTTTGTTTATCTTTCTCATTTTAATAGTAATCT
GTGGATTGATTTTTGATATTTTTAGT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2A387JQ 418 0 0
GCAGAACCACTGATTTTGGGATTGATGATGACTACAGCGAGCTAGTGAGAGCAGCGTCGG
TTAGGAGTTTAGGACACAAGAATGAGATAGACATGTTTATACATGAGAAGGTGAAACAAG
AGAAGCTGCAGCAGGAGATGCAGAAGAAGATGAAGTATGGAGGGTTGCCGAAGAGCACGA
GCGTAGGGATGGCGAGGATAGATGAAGATGAAGAAGGAGAGGAAGGATCTGTGAAACCGA
AGACGACTAAGAAAGTCTGTGAGCTTTTGTATCCTCGTAACAAATCATATGCTGTTACTG
GTAGCCCTAAGTTTTAGCTTTTGTTTATCTTTCTCATTTTAATAGTAATCTGTGGATTGA
TTTTTGATATTTTTAGTTTTGATTTTTCTGCAACAAAGAAATAATGATAAATTTCG
AC

QA 1 416 1 416
DS 

RD RR2A387TF 268 0 0
TGAAGTATGGAGGGTTGCCGAAAAGCACGAGCGTAGGGATGGCGAGGATAGATGAAGATG
AAGAAGGAGAGGAAGGATCTGTGAAACCGAAGACGACTAAGAAAGTCTCTGAGCTTTTGT
ATCCTCGTAACAAATCATATGCTGTTACTGGTAGCCCTAAGTTTTAGCTTTTGTTTATCT
TTCTCATTTTAATAGTAATCTGTGGATTGATTTTTGATATTTTTAGTTTTGATTTTTCTG
CAACAAAGAAATAATGATAAATTTCG
AC

QA 1 266 1 266
DS 

RD RR2GW17JQ 665 0 0
GGCATCATTTCAGACAAACAAAACAAAACCATTCTCCAAAACAGAGCATGAGAAACGGAG
GACAAAGCCAGAACAAGTTCTTGAGGATCATCTCAACACCTTTCAGAGCTTTAGGCAAAG
CTTACGTGAGAAGCATCACCGGCTGTGCCTCTCGGACTCAGTATCCCTCCTCCTCCTCTT
CCGTCTCCACTGCTTTTCCTAGAAGCAAGAGCTCTTCCTCCGCCGCCTTCTCCTCATCCG
CATCTACACGCAGAACCACTGATTTTGGGATTGATGATGACTACAGCGAGCTAGTGAGAG
CAGCGTCGGTTAGGAGTTTAGGACACAAGAATGAGATAGACATGTTTATACATGAGAAGG
TGAAACAAGAGAAGCTGCAGCAGGAGATGCAGAAGAAGATGAAGTATGGAGGGTTGCCGA
AGAGCACGAGCGTAGGGATGGCGAGGATAGATGAAGATGAAGAAGGAGAGGAAGGATCTG
TGAAACCGAAGACGACTAAGAAAGTCTCTGAGCTTTTGTATCCTCGTAGCAAATCATATG
CTGTTACTGGTAGCCCTAAGTTTTAGCTTTTGTTTATCTTTCTCATTTTAATAGTAATCT
GTGGATTGATTTTTGATATTTTTAGTTTTGATTTTTCTGCAACAAAGAAATAACGATAAA
TTTCG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2C315TF 757 0 0
GGCATCATTTCAAACAAACAAAACAAAACCATTCTCCAAAACAGAGCATGAGAAACGGAG
GACAAAGCCAGAACAAGTTCTTGAGGATCATCTCAACACCTTTCAGAGCTTTAGGCAAAG
CTTACGTGAGAAGCATCACCGGCTGTGCCTCTCGGACTCAGTATCCCTCCTCCTCCTCTT
CCGTCTCCACTGCTTTTCCTAGAAGCAAGAGCTCTTCCTCCGCCGCCTTCTCCTCATCCG
CATCTACACGCAGAACCACTGATTTTGGGATTGATGATGACTACAGCGAGCTAGTGAGAG
CAGCGTCGGTTAGGAGTTTAGGACACAAGAATGAGATAGACATGTTTATACATGAGAAGG
TGAAACAAGAGAAGCTGCAGCAGGAGATGCAGAAGAAGATGAAGTATGGAGGGTTGCCGA
AGAGCACGAGCGTAGGGATGGCGAGGATAGATGAAGATGAAGAAGGAGAGGAAGGATCTG
TGAAACCGAAGACGACTAAGAAAGTCTCTGAGCTTTTGTATCCTCGTAGCAAATCATATG
CTGTTACTGGTAGCCCTAAGTTTTAGCTTTTGTTTATCTTTCTCATTTTAATAGTAATCT
GTGGATTGATTTTTGATATTTTTAGTTTTGATTTTTCTGCAACAAAGAAATAATGATAAA
TTTCGATAAACTACTCTCGATCAACCCAAGTTTGGTGATATTTGAGTTCAGTACGTGTAT
ATACGACCCTGTGTGTTCATCATCTGATCTGCATGTT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 4

CO CL1825Contig1 756 4 8 U
GACATTAGCAATGAGGTCAAATTCGCTTGGAAGATTCAGAGGGACATGGCTGAAAGAGGT
CACAGCTTAGAGAGCATCAAGGCGAGTATTGAAGCACGAAAGCCTGACTTCGATGCATTC
ATTGACCCACAAAAGCAGTACGCGGATGCGGTGATAGAAGTGCTTCCAACACAGCTGATT
CCAGATGACAATGAAGGCAAAGTGTTGAGAGTGAGATTGATAATGAAGGAAGGTGTCAAG
TACTTCAGCCCCGTTTACCTATTTGATGAAGGCTCAACCATCTCGTGGATCCCTTGCGGT
CGCAAACTCACCTGCTCCTACCCTGGCATCAAGTTCGACTATGCACCTGATTCCTACTTC
GACCATGAGGTTTCGGTTGTGGAGATGGATGGGCAATTCGATAGACTGGATGAGCTGATT
TACGTGGAGAGCCATTTGAGCAACCTATCGACCAAATTTTACGGTGAAGTTACTCAACAG
ATGCTCAAACATGCTGATTTCCCTGGTAGCAACAATGGAACTGGTCCTTTCCAGACCATT
GTTGGATTGAAGATCAGAGATCTTTATGAGCAGCTCATTGCCAACAAAGCCACTGCTCCT
GCAGAAGCTGCTAAAGCCTAAAACAAAAGGCAAAATAGAACCCGTCTATAAAGTATAAAC
CCCTTTGCAGTTTCTTCTTCTCTCTCTTTCTTTTTATGGATTTTTCATGGCGAAAAGGAC
TATTTTGCTTTGGTTTGTAATTTATGTGGAGATGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GB72TF U 17
AF RR2BG02JQ C 1
AF RR2AV60TF U 569
AF RR2FR31TF U 569
BS 1 17 RR2BG02JQ
BS 18 187 RR2GB72TF
BS 188 188 RR2BG02JQ
BS 189 245 RR2GB72TF
BS 246 246 RR2BG02JQ
BS 247 323 RR2GB72TF
BS 324 569 RR2BG02JQ
BS 570 756 RR2AV60TF

RD RR2GB72TF 307 0 0
G
CAAATTCGCTTGGAAGATTCAGAGGGACATGGCTGAAAGAGGTCACAGCTTAGAGAGCAT
CAAGGCGAGTATTGAAGCACGAAAGCCTGACTTCGATGCATTCATTGACCCACAAAAGCA
GTACGCGGATGCGGTGATAGAAGTGCTTCCAACACAGCTGATTCCAGATGGCAATGAAGG
CAAAGTGTTGAGAGTGAGATTGATAATGAAGGAAGGTGTCAAGTACTTTAGCCCCGTTTA
CCTATTTGATGAAGGCTCAACCATCTCGTGGATCCCTTGCGGTCGCAAACTCACCTGCTC
CTACCC

QA 2 307 2 307
DS 

RD RR2BG02JQ 738 0 0
GACATTAGCAATGAGGTCAAATTCGCTTGGAAGATTCAGAGGGACATGGCTGAAAGAGGT
CACAGCTTAGAGAGCATCAAGGCGAGTATTGAAGCACGAAAGCCTGACTTCGATGCATTC
ATTGACCCACAAAAGCAGTACGCGGATGCGGTGATAGAAGTGCTTCCAACACAGCTGATT
CCAGATGACAATGAAGGCAAAGTGTTGAGAGTGAGATTGATAATGAAGGAAGGTGTCAAG
TACTTCAGCCCCGTTTACCTATTTGATGAAGGCTCAACCATTTCGTGGATCCCTTGCGGT
CGCAAACTCACCTGCTCCTACCCTGGCATCAAGTTCGACTATGCACCTGATTCCTACTTC
GACCATGAGGTTTCGGTTGTGGAGATGGATGGGCAATTCGATAGACTGGATGAGCTGATT
TACGTGGAGAGCCATTTGAGCAACCTATCGACCAAATTTTACGGTGAAGTTACTCAACAG
ATGCTCAAACATGCTGATTTCCCTGGTAGCAACAATGGAACTGGTCCTTTCCAGACCATT
GTTGGATTGAAGATCAGAGATCTTTATGAGCAGCTCATTGCCAACAAAGCCACTGCTCCT
GCAGAAGCTGCTAAAGCCTAAAACAAAAGGCAAAATAGAACCCGTCTATAAAGTATAAAC
CCCTTTGCAGTTTCTTCTTCTCTCTCTTTCTTTTTATGGATTTTTCATGGCGAAAAGGAC
TATTTTGCTTTGGTTTGT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2AV60TF 188 0 0
G
GCAGCTCATTGCCAACAAAGCCACTGCTCCTGCAGAAGCTGCTAAAGCCTAAAACAAAAG
GCAAAATAGAACCCGTCTATAAAGTATAAACCCCTTTGCAGTTTCTTCTTCTCTCTCTTT
CTTTTTATGGATTTTTCATGGCGAAAAGGACTATTTTGCTTTGGTTTGTAATTTATGTGG
AGATGGT

QA 2 188 2 188
DS 

RD RR2FR31TF 188 0 0
G
GCAGCTCATTGCCAACAAAGCCACTGCTCCTGCAGAAGCTGCTAAAGCCTAAAACAAAAG
GCAAAATAGAACCCGTCTATAAAGTATAAACCCCTTTGCAGTTTCTTCTTCTCTCTCTTT
CTTTTTATGGATTTTTCATGGCGAAAAGGACTATTTTGCTTTGGTTTGTAATTTATGTGG
AGATGGT

QA 2 188 2 188
DS 



AS 1 4

CO CL1826Contig1 826 4 9 U
GATCCACCATTGGGATGGGGTGACACCGCCGCGTATCTTGTCTTGCCTGTTCTCCTTATT
GTCTCACAGTATGTGTCAATGGAGATTATGAAGCCTCCTCAAACAGACGATCCTGCGCAG
AAGAACACACTTCTCGTTTTCAAGTTTCTTCCACTCATGATTGGCTACTTTGCATTGTCT
GTCCCATCAGGATTATCTATATACTGGTTCACAAACAATGTGCTTAGCACCGCCCAACAA
GTTTGGCTGCGTAAACTAGGTGGCGCAGCGCCTGCAGTCAATGAAAACGCAAGCGGAATA
ATAACTGCGGGACGGGCAAAGAGATCTATTGCTCAGCCTGATGATGCAGGCGAAAGATTT
AGACAATTAAAAGAGCAAGAGAAGCGCAGCAAGAAGAACAAGGCCGTTGCGAAAGATACA
GTTGAACTCCTGGAATCTCAGTCTGAATCAGAAGAAGGGTCCGACGATGAGGAAGAAGAG
GTTCGTGAAGGAGCGTTAGCTTCGAGCACAAGCAAGCCATTGCCTGACGTTGGCCAAAGG
AGAA**AAAAGATCGAAGCGAAAACGTACTGTATAGAAAACTTAAAACAAAACAAAGACA
ATTGTGAGGGAGGTTTGGAGTCTGTCCTTTAGTTTGATCTTTGATATATTTTTGCATATA
CCAATTAAGTCCTGCAATACCTAAACGTTTGTAAAATTAAGGCAAAGAGGTCATTCTAAA
GTTAAATGCTTTTGTTGATCAAAAGTAAATTGATTGTATTCCTTATGTGATTCACCTTGT
CTGTATTAACAACCTAGATGTTTGTACTATGACTTTCATGATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CK71TF U 1
AF RR2GG96TF U 553
AF RR2F377JQ C 123
AF RR2F377TF U 123
BS 1 292 RR2CK71TF
BS 293 293 RR2F377TF
BS 294 544 RR2CK71TF
BS 545 546 RR2F377TF
BS 547 676 RR2CK71TF
BS 677 677 RR2GG96TF
BS 678 695 RR2CK71TF
BS 696 723 RR2GG96TF
BS 724 826 RR2F377TF

RD RR2CK71TF 696 0 0
GATCCACCATTGGGATGGGGTGACACCGCCGCGTATCTTGTCTTGCCTGTTCTCCTTATT
GTCTCACAGTATGTGTCAATGGAGATTATGAAGCCTCCTCAAACAGACGATCCTGCGCAG
AAGAACACACTTCTCGTTTTCAAGTTTCTTCCACTCATGATTGGCTACTTTGCATTGTCT
GTCCCATCAGGATTATCTATATACTGGTTCACAAACAATGTGCTTAGCACCGCCCAACAA
GTTTGGCTGCGTAAACTAGGTGGCGCAGCGCCTGCAGTCAATGAAAACGCAATCGGAATA
ATAACTGCGGGACGGGCAAAGAGATCTATTGCTCAGCCTGATGATGCAGGCGAAAGATTT
AGACAATTAAAAGAGCAAGAGAAGCGCAGCAAGAAGAACAAGGCCGTTGCGAAAGATACA
GTTGAACTCCTGGAATCTCAGTCTGAATCAGAAGAAGGGTCCGACGATGAGGAAGAAGAG
GTTCGTGAAGGAGCGTTAGCTTCGAGCACAAGCAAGCCATTGCCTGACGTTGGCCAAAGG
AGAAGCAAAAGATCGAAGCGAAAACGTACTGTATAGAAAACTTAAAACAAAACAAAGACA
ATTGTGAGGGAGGTTTGGAGTCTGTCCTTTAGTTTGATCTTTGATATATTTTTGCATATA
CCAATTAAGTCCTGCA*TACCTAAACGTTTGTAAA
T

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2GG96TF 171 0 0
GG
GAAGCGAAAACGTACTGTATAGAAA*CTTAAAACAAAACAAAGACAATTGTGAGGGAGGT
TTGGAGTCTGTCCTTTAGTTTGATCTTTGATATATTTTTGCATATACCAATTAAGTCCTG
CAATACCTAAACGTTTGTAAAATTAAGGCAAAGAGGTCATTCTAAAGTT

QA 3 171 3 171
DS 

RD RR2F377JQ 704 0 0
GAACACACTTCTCGTTTTCAAGTTTCTTCCACTCATGATTGGCTACTTTGCATTGTCTGT
CCCATCAGGATTATCTATATACTGGTTCACAAACAATGTGCTTAGCACCGCCCAACAAGT
TTGGCTGCGTAAACTAGGTGGCGCAGCGCCTGCAGTCAATGAAAACGCAAGCGGAATAAT
AACTGCGGGACGGGCAAAGAGATCTATTGCTCAGCCTGATGATGCAGGCGAAAGATTTAG
ACAATTAAAAGAGCAAGAGAAGCGCAGCAAGAAGAACAAGGCCGTTGCGAAAGATACAGT
TGAACTCCTGGAATCTCAGTCTGAATCAGAAGAAGGGTCCGACGATGAGGAAGAAGAGGT
TCGTGAAGGAGCGTTAGCTTCGAGCACAAGCAAGCCATTGCCTGACGTTGGCCAAAGGAG
AA**AAAAGATCGAAGCGAAAACGTACTGTATAGAAAACTTAAAACAAAACAAAGACAAT
TGTGAGGGAGGTTTGGAGTCTGTCCTTTAGTTTGATCTTTGATATATTTTTGCATATACC
AATTAAGTCCTGCAATACCTAAACGTTTGTAAAATTAAGGCAAAGAGGTCATTCTAAAGT
TAAATGCTTTTGTTGATCAAAAGTAAATTGATTGTATTCCTTATGTGATTCACCTTGTCT
GTATTAACAACCTAGATGTTTGTACTATGACTTTCATGATGTCC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2F377TF 704 0 0
GAACACACTTCTCGTTTTCAAGTTTCTTCCACTCATGATTGGCTACTTTGCATTGTCTGT
CCCATCAGGATTATCTATATACTGGTTCACAAACAATGTGCTTAGCACCGCCCAACAAGT
TTGGCTGCGTAAACTAGGTGGCGCAGCGCCTGCAGTCAATGAAAACGCAAGCGGAATAAT
AACTGCGGGACGGGCAAAGAGATCTATTGCTCAGCCTGATGATGCAGGCGAAAGATTTAG
ACAATTAAAAGAGCAAGAGAAGCGCAGCAAGAAGAACAAGGCCGTTGCGAAAGATACAGT
TGAACTCCTGGAATCTCAGTCTGAATCAGAAGAAGGGTCCGACGATGAGGAAGAAGAGGT
TCGTGAAGGAGCGTTAGCTTCGAGCACAAGCAAGCCATTGCCTGACGTTGGCCAAAGGAG
AA**AAAAGATCGAAGCGAAAACGTACTGTATAGAAAACTTAAAACAAAACAAAGACAAT
TGTGAGGGAGGTTTGGAGTCTGTCCTTTAGTTTGATCTTTGATATATTTTTGCATATACC
AATTAAGTCCTGCAATACCTAAACGTTTGTAAAATTAAGGCAAAGAGGTCATTCTAAAGT
TAAATGCTTTTGTTGATCAAAAGTAAATTGATTGTATTCCTTATGTGATTCACCTTGTCT
GTATTAACAACCTAGATGTTTGTACTATGACTTTCATGATGTCC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 4

CO CL1827Contig1 470 4 3 U
TGGCGGATCAACAAGGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGCTCCAAATGCAA
ACGATCTTCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAGGAGA
ACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAGGTGGTGGCAGGAACGA
TGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGAAGAAGAAGGTGTACGAGGCCAAGG
TTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATCTCAAGAAGTTGGAGGCCTTCAACCACCTTCACGATG
TTTAGTTTCCATAACCTCAGCTTTAAACACATCGCATTCTATACGTGATAATGAAGAGTC
CCGGTTTAACCAATGGGTTAACTCCTTAAAATAATAAGTGAATGTGAACTCTACTCTTAT
GTGTTTGATTTGATGGGTGTGTGTGAAATGGAACTCGTGTTATTATTATC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2DY75TF U 1
AF RR2C088JQ C 1
AF RR2C088TF U 10
AF RR2DY75JQ C 1
BS 1 261 RR2DY75TF
BS 262 466 RR2C088TF
BS 467 470 RR2C088JQ

RD RR2DY75TF 261 0 0
TGGCGGATCAACAAGGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGCTCCAAATGCAA
ACGATCTTCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAGGAGA
ACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAGGTGGTGGCAGGAACGA
TGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGAAGAAGAAGGTGTACGAGGCCAAGG
TTTTGGAGAAGGCCTGGGAGA

QA 1 261 1 261
DS 

RD RR2C088JQ 470 0 0
TGGCGGATCAACAAGGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGCTCCAAATGCAA
ACGATCTTCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAGGAGA
ACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAGGTGGTGGCAGGAACGA
TGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGAAGAAGAAGGTGTACGAGGCCAAGG
TTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATCTCAAGAAGTTGGAGGCCTTCAACCACCTTCACGATG
TTTAGTTTCCATAACCTCAGCTTTAAACACATCGCATTCTATACGTGATAATGAAGAGTC
CCGGTTTAACCAATGGGTTAACTCCTTAAAATAATAAGTGAATGTGAACTCTACTCTTAT
GTGTTTGATTTGATGGGTGTGTGTGAAATGGAACTCGTGTTATTATTATC

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR2C088TF 461 0 0
AACAAGGAGGAGCAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGCTCCAAATGCAAACGATCTTC
AAGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAGGAGAACGTGAGTC
TGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAGGTGGTGGCAGGAACGATGCACCATC
TGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGAAGAAGAAGGTGTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGA
AGGCCTGGGAGAATCTCAAGAAGTTGGAGGCCTTCAACCACCTTCACGATGTTTAGTTTC
CATAACCTCAGCTTTAAACACATCGCATTCTATACGTGATAATGAAGAGTCCCGGTTTAA
CCAATGGGTTAACTCCTTAAAATAATAAGTGAATGTGAACTCTACTCTTATGTGTTTGAT
TTGATGGGTGTGTGTGAAATGGAACTCGTGTTATTAT
TATC

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR2DY75JQ 467 0 0
TGGCGGATCAACAAGGAGGAACAGTTTTGGGAGGAGTTCGCGATGTCGCTCCAAATGCAA
ACGATCTTCAAGTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCATAACAAGAAGGAGA
ACGTGAGTCTGGAGTACAAGAGGCTCATCGGTGCGAAAACGCAGGTGGTGGCAGGAACGA
TGCACCATCTGACTGTGGAGGTGGCTGATGGTGAGAAGAAGAAGGTGTACGAGGCCAAGG
TTTTGGAGAAGGCCTGGGAGAATCTCAAGAAGTTGGAGGCCTTCAACCACCTTCACGATG
TTTAGTTTCCATAACCTCAGCTTTAAACACATCGCATTCTATACGTGATAATGAAGAGTC
CCGGTTTAACCAATGGGTTAACTCCTTAAAATAATAGGTGAATGTGAACTCTACTCTTAT
GTGTTTGATTTGATGGGTGTGTGTGAAATGGAACTCGTGTTATTAT
C

QA 1 466 1 466
DS 



AS 2 4

CO CL1828Contig1 547 2 7 U
ATTTCTTTGGTGCATTGAGGGCTAGAGTGTACGATGATGAAGTGAGGAAGTTCGTTGAGG
GACTTGGAGTGGAGAAGATAAGCAAGAGGCTGGTGAACTCAAGGGAAGCTCCTCCAGTGT
TCGAGCAACCAGAGATGACTCTTGCCAAGCTTATGGAGTACGGTAACATGCTTGTGATGG
AGCAAGAGAACGTCAAGAGAGTCCAACTTGCTGACCAATACCTTAACGAGGCCGCCTTGG
GAGACGCAAACGCCGACGCTATTGGACGTGGAACTTTCTTCGGTTCCACATGAGGGAAAA
GAGCACAGTAAGTGAATTCGCGGGTTCCTGAAGGGTGTTAATGATCCTGCGGTCAAGAAC
TTTGATCCAACGGCTAGAAGTGACTGAAGGAACTTGTGTCTACAACTTTTGAGCTTTCTC
CTACTTATAATTAAATCTGCTGTTTTTTTTTCTTTCTACTCCTGTGTAATTGTGAATTGG
TGGCTCTTGTCATCTTTTGTTTTTATGATTATGTGCAAACGTTCATATATTACAGTTGCC
CTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B069TF U 96
AF RR2E112JQ C 1
BS 1 95 RR2E112JQ
BS 96 193 RR2B069TF
BS 194 194 RR2E112JQ
BS 195 410 RR2B069TF
BS 411 411 RR2E112JQ
BS 412 526 RR2B069TF
BS 527 547 RR2E112JQ

RD RR2B069TF 431 0 0
AACTCAAGGGAAGCTCCTCCAGTGTTCGAGCAACCAGAGATGACTCTTGCCAAGCTTATG
GAGTACGGTAACATGCTTGTGATGGAGCAAGAGAACGTTAAGAGAGTCCAACTTGCTGAC
CAATACCTTAACGAGGCCGCCTTGGGAGACGCAAACGCCGACGCTATTGGACGTGGAACT
TTCTTCGGTTCCACATGAGGGAAAAGAGCACAGTAAGTGAATTCGCGGGTTCCTGAAGGG
TGTTAATGATCCTGCGGTCAAGAACTTTGATCCAACGGCTAGAAGTGACTGAAGGAACTT
GTGTCTACAACTTTTTAGCTTTCTCCTACTTATAATTAAATCTGCTGTTTTTTTTTCTTT
CTACTCCTGTGTAATTGTGAATTGGTGGCTCTTGTCATCTTTTGTTTTTATGATTATGTG
CAAACGTTCAT

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR2E112JQ 547 0 0
ATTTCTTTGGTGCATTGAGGGCTAGAGTGTACGATGATGAAGTGAGGAAGTTCGTTGAGG
GACTTGGAGTGGAGAAGATAAGCAAGAGGCTGGTGAACTCAAGGGAAGCTCCTCCAGTGT
TCGAGCAACCAGAGATGACTCTTGCCAAGCTTATGGAGTACGGTAACATGCTTGTGATGG
AGCAAGAGAACGTCAAGAGAGTCCAACTTGCTGACCAATACCTTAACGAGGCCGCCTTGG
GAGACGCAAACGCCGACGCTATTGGACGTGGAACTTTCTTCGGTTCCACATGAGGGAAAA
GAGCACAGTAAGTGAATTCGCGGGTTCCTGAAGGGTGTTAATGATCCTGCGGTCAAGAAC
TTTGATCCAACGGCTAGAAGTGACTGAAGGAACTTGTGTCTACAACTTTTGAGCTTTCTC
CTACTTATAATTAAATCTGCTGTTTTTTTT*CTTTCTACTTCTGTGTAATTGTGAATTGG
TGGCTCTTGTCATCTTTTGTTTTTATGATTATGTGCAAACGTTCATATATTACAGTTGCC
CTTTATC

QA 1 547 1 547
DS 



CO CL1828Contig2 942 2 4 U
ATTCAAAATTTATCTCCTCAGCTTCTACTAGGAAGCACACTCGTGAGACATGGCCGCCGC
AGTTTCCACCGTTGGTGCCATCAACAGAGCTCCGTTGAGCTTGAACGGGTCAGGAGCAGG
AGCTGCTTCAGTCCCAGCAACGACCTTCTTGGGAAAGAAAGTTGTAACCGCGTCGAGATT
CGCACAGAGCAACAAGAAGAGCAACGGATCATTCAAGGTGGTTGCCGTGAAAGAAGACAA
ACAAACCGATGGAGACAGATGGAGGGGACTTGCGTACGACGTGTCTGATGATCAACAAGA
CATCACCAGAGGCAAAGGTATGGTTGATGCAGTCTTCAGGACTGACGGTGTCAAGGATGA
AGACATTGTCACGCTTGTTGACCAGTTCCCTGGCCAATCCATCGATTTCTTTGGTGCATT
GAGGGCTAGAGTGTACGATGATGAAGTGAGGAAGTTCGTTGAGGGACTTGGAGTGGAGAA
GATAAGCAAGAGGCTGGTGAACTCAAGGGAAGCTCCTCCAGTGTTCGAGCAACCAGAGAT
GACTCTTGCCAAGCTTATGGAGTACGGTAACATGCTTGTGATGGAGCAAGAGAACGTCAA
GAGAGTCCAACTTGCTGACCAATACCTTAACGAGGCTGCCTTGGGAGACGCAAACGCCGA
TGCTATTGGCCGTGGAACTTTCTTCGGTTCCACATGAGGGAAAACTGCACAGTAAAGTGA
AGTTGCATGTTCCTGAAGGGTGTTAATGATCCTGCGGTCAAGAACTTTGATCCAACGGCT
AGAAGTGACTGATGGAACTTGTGTCTACAACTTTTGAGCTTTCTCCTACTTATAATTAAA
TCTCCTGTTTTTTTTTCTTTGTAATTGTGAATTGGTGGCTCTTGTCATCTTTGTTTTTAT
GATTATGTGCAAACGTTCATATATTACAGTTGCCCTTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN95TF U 1
AF RR2EN95JQ C 264
BS 1 703 RR2EN95TF
BS 704 704 RR2EN95JQ
BS 705 730 RR2EN95TF
BS 731 942 RR2EN95JQ

RD RR2EN95TF 730 0 0
ATTCAAAATTTATCTCCTCAGCTTCTACTAGGAAGCACACTCGTGAGACATGGCCGCCGC
AGTTTCCACCGTTGGTGCCATCAACAGAGCTCCGTTGAGCTTGAACGGGTCAGGAGCAGG
AGCTGCTTCAGTCCCAGCAACGACCTTCTTGGGAAAGAAAGTTGTAACCGCGTCGAGATT
CGCACAGAGCAACAAGAAGAGCAACGGATCATTCAAGGTGGTTGCCGTGAAAGAAGACAA
ACAAACCGATGGAGACAGATGGAGGGGACTTGCGTACGACGTGTCTGATGATCAACAAGA
CATCACCAGAGGCAAAGGTATGGTTGATGCAGTCTTCAGGACTGACGGTGTCAAGGATGA
AGACATTGTCACGCTTGTTGACCAGTTCCCTGGCCAATCCATCGATTTCTTTGGTGCATT
GAGGGCTAGAGTGTACGATGATGAAGTGAGGAAGTTCGTTGAGGGACTTGGAGTGGAGAA
GATAAGCAAGAGGCTGGTGAACTCAAGGGAAGCTCCTCCAGTGTTCGAGCAACCAGAGAT
GACTCTTGCCAAGCTTATGGAGTACGGTAACATGCTTGTGATGGAGCAAGAGAACGTCAA
GAGAGTCCAACTTGCTGACCAATACCTTAACGAGGCTGCCTTGGGAGACGCAAACGCCGA
TGCTATTGGCCGTGGAACTTTCTTCGGTTCCACATGAGGGAAA*CTGCACAGTAAAGTGA
AGTTGCATGT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2EN95JQ 679 0 0
GGGGACTTGCGTACGACGTGTCTGATGATCAACAAGACATCACCAGAGGCAAAGGTATGG
TTGATGCAGTCTTCAGGACTGACGGTGTCAAGGATGAAGACATTGTCACGCTTGTTGACC
AGTTCCCTGGCCAATCCATCGATTTCTTTGGTGCATTGAGGGCTAGAGTGTACGATGATG
AAGTGAGGAAGTTCGTTGAGGGACTTGGAGTGGAGAAGATAAGCAAGAGGCTGGTGAACT
CAAGGGAAGCTCCTCCAGTGTTCGAGCAACCAGAGATGACTCTTGCCAAGCTTATGGAGT
ACGGTAACATGCTTGTGATGGAGCAAGAGAACGTCAAGAGAGTCCAACTTGCTGACCAAT
ACCTTAACGAGGCTGCCTTGGGAGACGCAAACGCCGATGCTATTGGCCGTGGAACTTTCT
TCGGTTCCACATGAGGGAAAACTGCACAGTAAAGTGAAGTTGCATGTTCCTGAAGGGTGT
TAATGATCCTGCGGTCAAGAACTTTGATCCAACGGCTAGAAGTGACTGATGGAACTTGTG
TCTACAACTTTTGAGCTTTCTCCTACTTATAATTAAATCTCCTGTTTTTTTTTCTTTGTA
ATTGTGAATTGGTGGCTCTTGTCATCTTTGTTTTTATGATTATGTGCAAACGTTCATATA
TTACAGTTGCCCTTTTACC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 2 5

CO CL1829Contig1 729 3 6 U
GGATTCATCGCTTCTCTAAAAAAAAAAACAAATCTCTCTCAAAAATCAAAAAAGATGTCG
ACGAAGAAGATCGTGTTGAAGAGCTCCGACGGCGAGTCCTTCGAGGTTGACGAGGCCGTG
GCTCGCGAGTCTCAGACCCTAGCTCACATGGTCGAAGACGACTGCATCGAGAACGGTATC
CCTCTCCCCAACGACACGAGCAAGATCCTCGCCAAGGTGATCGAGTACTGCAAGAAGCAC
GTCGACGCCGCTGCTGCCAAGACCGAGGCCGTCGATGGCGGTGCTTCCTCTGACGATGAC
CTCAAGGCGTGGGACGTTGAGTTCATGAAGATCGATCAAGCTACCCTCTTCGAACTCATC
CTGGCTGCTAATTATCTGAACATCAAGAACCTTCTTGACCTAACGTGCCAGACGGTGGCT
GATATGATCAAAGGCAAGACTCCAGAGGAGATTCGCGCGACCTTCAACATCAAGAACGAC
TTCACACCCGAGGAGGAAGAGGAGGTGCGCAGGGAGAACCAATGGGCTTTTGAATGAAGA
CAAAGAGAGCCTTGTTGAAGCAAACCCACCAAGCTTCTTTCTTTTTTTT*ATCTTATTTT
CGGTTTTTATGTTCTTAGGAAAAATTAATGACTTGTGTTGGTCCTACTAGTGCTTTTCTA
TTTGCGATTAAGAACCAATGATTTGAATAATTTGTGCTTATAATCAGTCTTGGTATCTTG
TTTCTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B948TF U 1
AF RR2C081JQ C 1
AF RR2C081TF U 339
BS 1 436 RR2B948TF
BS 437 437 RR2C081TF
BS 438 685 RR2B948TF
BS 686 702 RR2C081TF
BS 703 703 RR2C081JQ
BS 704 729 RR2C081TF

RD RR2B948TF 685 0 0
GGATTCATCGCTTCTCTAAAAAAAAAAACAAATCTCTCTCAAAAATCAAAAAAGATGTCG
ACGAAGAAGATCGTGTTGAAGAGCTCCGACGGCGAGTCCTTCGAGGTTGACGAGGCCGTG
GCTCGCGAGTCTCAGACCCTAGCTCACATGGTCGAAGACGACTGCATCGAGAACGGTATC
CCTCTCCCCAACGACACGAGCAAGATCCTCGCCAAGGTGATCGAGTACTGCAAGAAGCAC
GTCGACGCCGCTGCTGCCAAGACCGAGGCCGTCGATGGCGGTGCTTCCTCTGACGATGAC
CTCAAGGCGTGGGACGTTGAGTTCATGAAGATCGATCAAGCTACCCTCTTCGAACTCATC
CTGGCTGCTAATTATCTGAACATCAAGAACCTTCTTGACCTAACGTGCCAGACGGTGGCT
GATATGATCAAAGGCAGGACTCCAGAGGAGATTCGCGCGACCTTCAACATCAAGAACGAC
TTCACACCCGAGGAGGAAGAGGAGGTGCGCAGGGAGAACCAATGGGCTTTTGAATGAAGA
CAAAGAGAGCCTTGTTGAAGCAAACCCACCAAGCTTCTTTCTTTTTTTT*ATCTTATTTT
CGGTTTTTATGTTCTTAGGAAAAATTAATGACTTGTGTTGGTCCTACTAGTGCTTTTCTA
TTTGCGATTAAGAACCAATGATTTG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2C081JQ 729 0 0
GGATTCATC
GCTTCTCTAAAAAAAAAA*CAAATCTCTCTCAAAAATCAAAAAAGATGTCGACGAAGAAG
ATCGTGTTGAAGAGCTCCGACGGCGAGTCCTTCGAGGTTGACGAGGCCGTGGCTCGCGAG
TCTCAGACCCTAGCTCACATGGTCGAAGACGACTGCATCGAGAACGGTATCCCTCTCCCC
AACGTCACGAGCAAGATCCTCGCCAAGGTGATCGAGTACTGCAAGAAGCACGTCGACGCC
GCTGCTGCCAAGACCGAGGCCGTCGATGGCGGTGCTTCCTCTGACGATGACCTCAAGGCG
TGGGACGTTGAGTTCATGAAGATCGATCAAGCTACCCTCTTCGAACTCATCCTGGCTGCT
AATTATCTGAACATCAAGAACCTTCTTGACCTAACGTGCCAGACGGTGGCTGATATGATC
AAAGGCAAGACTCCAGAGGAGATTCGCGCGACCTTCAACATCAAGAACGACTTCACACCC
GAGGAGGAAGAGGAGGTGCGCAGGGAGAACCAATGGGCTTTTGAATGAAGACAAAGAGAG
CCTTGTTGAAGCAAACCCACCAAGCTTCTTTCTTTTTTTTTATCTTATTTTCGGTTTTTA
TGTTCTTAGGAAAAATTAATGACTTGTGTTGGTCCTACTAGTGCTTTTCTATTTGCGATT
AAGAACCAATGATTTGAATAATTTGTGCTTATAATCAGTCTTGGTATCTTGTTTCTCTTC

QA 10 729 10 729
DS 

RD RR2C081TF 391 0 0
AGCTACCCTCTTCGAACTCATCCTGGCTGCTAATTATCTGAACATCAAGAACCTTCTTGA
CCTAACGTGCCAGACGGTGGCTGATATGATCAAAGGCAAGACTCCAGAGGAGATTCGCGC
GACCTTCAACATCAAGAACGACTTCACACCCGAGGAGGAAGAGGAGGTGCGCAGGGAGAA
CCAATGGGCTTTTGAATGAAGACAAAGAGAGCCTTGTTGAAGCAAACCCACCAAGCTTCT
TTCTTTTTTTT*ATCTTATTTTCGGTTTTTATGTTCTTAG**AAAATTAATGACTTGTGT
TGGTCCTACTAGTGCTTTTCTATTTGCGAT*AAGAACCAATGATTTGAATAATTTGTGCT
TATA*TCAGTCTTGGTATCTTGTTTCTCTTC

QA 1 391 1 391
DS 



CO CL1829Contig2 751 2 3 U
TTTTGAATGCATAACTTGTAGATTAGATAGAAGAGAAACAAGATACCAAGACTGATTATA
AGCACAAATTATTCAAATCATTGGTTCTTAATCGCAAATAAGAAAAGCACTAGTAGGACC
AACACAAGTCATTAATTTTTTTTCCTAAGAACATAAAACGAAAATAAGAAAAAAAAAAGG
AAGAAGCTTGGTGGATTTGCTTCAACAAGGCTCTCTTTGTCTTCATTCAAAAGCCCATTG
GTTCTCCCTGCGCACCTCCTCTTCCTCCTCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAAGGT
CGCGCGAATCTCTTCTGGAGTCTTGCCTTTGATCATATCAGCCACCGTCTGGCACGTTAG
GTCAAGAAGGTTCTTGATGTTCAGGTAATTAGCAGCCAGGATGAGTTCGAAGAGGGTAGC
TTGATCGATCTTCATGAACTCAACGTCCCACGCCTTGAGGTCATCGTCAGAGGAAGCACC
GCCATCGACGGCCTCGGTCTTAGCAGCAGCGGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTCGAT
CACCTTGGCGAGGATCTTGCTCGTGACGTTGGGGAGAGGGATTCCGTTTTCGATGCAGTC
GTCTTCGACCATGTGAGCTAGGGTCTGAGACTCGCGAGCCACGGCCTCGTCAACCTCGAA
GGACTCGCCGTCGGAGCTCTTCAACACGATCTTCTTCGTCGACATCTTTTTTGATTTTTG
AGAGAGATTTGTTTTTTTTTTAGAGAAGCCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO03JQ U 5
AF RR2GO03TF C 1
BS 1 4 RR2GO03TF
BS 5 577 RR2GO03JQ
BS 578 751 RR2GO03TF

RD RR2GO03JQ 573 0 0
GAATGCATAACTTGTAGATTAGATAGAAGAGAAACAAGATACCAAGACTGATTATAAGCA
CAAATTATTCAAATCATTGGTTCTTAATCGCAAATAAGAAAAGCACTAGTAGGACCAACA
CAAGTCATTAATTTTTTTTCCTAAGAACATAAAACGAAAATAAGAAAAAAAAAAGGAAGA
AGCTTGGTGGATTTGCTTCAACAAGGCTCTCTTTGTCTTCATTCAAAAGCCCATTGGTTC
TCCCTGCGCACCTCCTCTTCCTCCTCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAAGGTCGCG
CGAATCTCTTCTGGAGTCTTGCCTTTGATCATATCAGCCACCGTCTGGCACGTTAGGTCA
AGAAGGTTCTTGATGTTCAGGTAATTAGCAGCCAGGATGAGTTCGAAGAGGGTAGCTTGA
TCGATCTTCATGAACTCAACGTCCCACGCCTTGAGGTCATCGTCAGAGGAAGCACCGCCA
TCGACGGCCTCGGTCTTAGCAGCAGCGGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTCGATCACC
TTGGCGAGGATCTTGCTCGTGACGTTGGGGAGA

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2GO03TF 751 0 0
TTTTGAATGCATAACTTGTAGATTAGATAGAAGAGAAACAAGATACCAAGACTGAT*ATA
AGCACAAATTATTCAAATCATTGGTTCTTAATCGCAAATAAGAAAAGCACTAGTAGGACC
AACACAAGTCATTAATTTTTTTTCCTAAGAACATAAAACGAAAATAAGAAAAAAAAAAGG
AAGAAGCTTGGTGGATTTGCTTCAACAAGGCTCTCTTTGTCTTCATTCAAAAGCCCATTG
GTTCTCCCTGCGCACCTCCTCTTCCTCCTCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAAGGT
CGCGCGAATCTCTTCTGGAGTCTTGCCTTTGATCATATCAGCCACCGTCTGGCACGTTAG
GTCAAGAAGGTTCTTGATGTTCAGGTAATTAGCAGCCAGGATGAGTTCGAAGAGGGTAGC
TTGATCGATCTTCATGAACTCAACGTCCCACGCCTTGAGGTCATCGTCAGAGGAAGCACC
GCCATCGACGGCCTCGGTCTTAGCAGCAGCGGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTCGAT
CACCTTGGCGAGGATCTTGCTCGTGACGTTGGGGAGAGGGATTCCGTTTTCGATGCAGTC
GTCTTCGACCATGTGAGCTAGGGTCTGAGACTCGCGAGCCACGGCCTCGTCAACCTCGAA
GGACTCGCCGTCGGAGCTCTTCAACACGATCTTCTTCGTCGACATCTTTTTTGATTTTTG
AGAGAGATTTGTTTTTTTTTTAGAGAAGCCC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 5

CO CL1830Contig1 821 5 19 U
ATAAGAAACATGAATAATATACATTTGACCAAAGATCATGGTTCATTTACAAAAGCAAAC
CTTCCATTAGGAAAAGTTCCATACTACTATTATATTATAGACATGTTCAAATGGTGCATT
TCACGGTCACACTATAGCTAAGTAACCAAAAACCCGGTTTTGGTTTGGTTCAATTTCCGG
TAAACCACCAAAATCTCTGACCAAGTCAAAACACCCCACTAGACCTTCTAGACCACACAA
TCACACCTACTACGCCTTTTACAGTACATTTTATCCACACAACGTAATTCGATTGATATG
ACTTACCTTTTCCCTCAAGGCAACAACTTCTCCAGCAAATTCCCAAAGAAGAAACTGGTT
TTAGCCCATCCTCTTCCTGTTCCGGCTTGACCTTCTTCTTTCCATCTCTTGCTTGGAACC
TTGTTCTTGACGTTAATCATCATACTGTGACCGATCTCTCCTCGTAACGCCTCGATTGTC
TTCACGTCCACTGGATTCCCTGAAGCATCTCTCACATAGAAAACGTTAACCGCTTGTTCT
CCTACTGTCGTGACACCAGCTCTCGTCACTGAAAGCCCGTGCTCTCTCAGAATCCTAGTC
ACTTCGGACAGTAATCCAACTCTGTCCTTTGCGCAGAGCTCCAGACTCCAACCCTCGCTG
ACTCTTCTATGGATTGCAGCTTCTAGACATTTGATAACTCTCTCTTTCTCTCCTTCTGAG
TCAAGAGTGCAACCATCTTTGTGCCTGATGAAATACTCCTGAGAGGCATGAGGACCGTTC
GATGTAATCGTTGCGTGAAACACAATGTACTGCATATCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS19JQ U 1
AF RR2A916JQ U 54
AF RR2A916TF C 64
AF RR2A144JQ U 604
AF RR2DS19TF C 262
BS 1 165 RR2DS19JQ
BS 166 166 RR2A916JQ
BS 167 227 RR2DS19JQ
BS 228 228 RR2A916JQ
BS 229 253 RR2DS19JQ
BS 254 254 RR2A916JQ
BS 255 289 RR2DS19JQ
BS 290 290 RR2A916JQ
BS 291 515 RR2DS19JQ
BS 516 525 RR2A916JQ
BS 526 548 RR2A916TF
BS 549 549 RR2DS19TF
BS 550 603 RR2A916TF
BS 604 743 RR2A144JQ
BS 744 744 RR2DS19TF
BS 745 750 RR2A144JQ
BS 751 751 RR2DS19TF
BS 752 770 RR2A144JQ
BS 771 821 RR2DS19TF

RD RR2DS19JQ 515 0 0
ATAAGAAACATGAATAATATACATTTGACCAAAGATCATGGTTCATTTACAAAAGCAAAC
CTTCCATTAGGAAAAGTTCCATACTACTATTATATTATAGACATGTTCAAATGGTGCATT
TCACGGTCACACTATAGCTAAGTAACCAAAAACCCGGTTTTGGTTCGGTTCAATTTCCGG
TAAACCACCAAAATCTCTGACCAAGTCAAAACACCCCACTAGACCTTATAGACCACACAA
TCACACCTACTACACCTTTTACAGTACATTTTATCCACACAACGTAATTTGATTGATATG
ACTTACCTTTTCCCTCAAGGCAACAACTTCTCCAGCAAATTCCCAAAGAAGAAACTGGTT
TTAGCCCATCCTCTTCCTGTTCCGGCTTGACCTTCTTCTTTCCATCTCTTGCTTGGAACC
TTGTTCTTGACGTTAATCATCATACTGTGACCGATCTCTCCTCGTAACGCCTCGATTGTC
TTCACGTCCACTGGATTCCCTGAAGCATCTCTCAC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2A916JQ 472 0 0
AGCAAACCTTCCATTAGGAAAAGTTCCATACTACTATTATATTATAGACATGTTCAAATG
GTGCATTTCACGGTCACACTATAGCTAAGTAACCAAAAACCCGGTTTTGGTTTGGTTCAA
TTTCCGGTAAACCACCAAAATCTCTGACCAAGTCAAAACACCCCACTAGACCTTCTAGAC
CACACAATCACACCTACTACGCCTTTTACAGTACATTTTATCCACACAATGTAATTCGAT
TGATATGACTTACCTTTTCCCTCAAGGCAACAACTTCTCCAGCAAATTCCCAAAGAAGAA
ACTGGTTTTAGCCCATCCTCTTCCTGTTCCGGCTTGACCTTCTTCTTTCCATCTCTTGCT
TGGAACCTTGTTCTTGACGTTAATCATCATACTGTGACCGATCTCTCCTCGTAACGCCTC
GATTGTCTTCACGTCCACTGGATTCCCTGAAGCATCTCTCACATAGAAAACG

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2A916TF 685 0 0
CCATTAGGAAAAGTTCCATACTACTATTATATTATAGACATGTTCAAATGGTGCATTTCA
CGGTCACACTATAGCTAAGTAACCAAAAACCCGGTTTTGGTTTGGTTCAATTTCCGGTAA
ACCACCAAAATCTCTGACCAAGTCAAAACACCCCACTAGACCTTCTAGACCACACAATCA
CACCTACTACGCCTTTTACAGTACATTTTATCCACACAATGTAATTCGATTGATATGACT
TACCTTTTCCCTCAAGGCAACAACTTCTCCAGCAAATTCCCAAAGAAGAAACTGGTTTTA
GCCCATCCTCTTCCTGTTCCGGCTTGACCTTCTTCTTTCCATCTCTTGCTTGGAACCTTG
TTCTTGACGTTAATCATCATACTGTGACCGATCTCTCCTCGTAACGCCTCGATTGTCTTC
ACGTCCACTGGATTCCCTGAAGCATCTCTCACATAGAAAACGTTAACCGCTTGTTCTCCT
ACTGTTGTGACACCAGCTCTCGTCACTGAAAGCCCGTGCTCTCTCAGAATCCTAGTCACT
TCGGACAGTAATCCAACTCTGTCCTTTGCGCAGAGCTCCAGACTCCAACCCTCGCTGACT
CTTCTATGGATTGCAGCTTCTAGACATTTGATAACTCTCTCTTTCTCTCCTTCTGAGTCA
AGAGTGCAACCATCTTTGTG
TCTGC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2A144JQ 167 0 0
TCGGACAGTAATCCAACTCTGTCCTTTGCGCAGAGCTCCAGACTCCAACCCTCGCTGACT
CTTCTATGGATTGCAGCTTCTAGACATTTGATAACTCTCTCTTTCTCTCCTTCTGAGTCA
AGAGTGCAACCATCTTTGTGTCTGATGGAATACTCCTGAGAGGCATG

QA 1 167 1 167
DS 

RD RR2DS19TF 560 0 0
CAGTACATTTTATCCACACAACGTAATTTGATTGATATGACTTACCTTTTCCCTCAAGGC
AACAACTTCTCCAGCAAATTCCCAAAGAAGAAACTGGTTTTAGCCCATCCTCTTCCTGTT
CCGGCTTGACCTTCTTCTTTCCATCTCTTGCTTGGAACCTTGTTCTTGACGTTAATCATC
ATACTGTGACCGATCTCTCCTCGTAACGCCTCGATTGTCTTCACGTCCACTGGATTCCCT
GAAGCATCTCTCACATAGAAAACGTTAACCGCTTGTTCTCCTACTGTCGTGACACCAGCT
CTCGTCACTGAAAGCCCGTGCTCTCTCAGAATCCTAGTCACTTCGGACAGTAATCCAACT
CTGTCCTTTGCGCACAGCTCCAGACTCCAACCCTCGCTGACTCTTCTATGGATTGCAGCT
TCTAGACATTTGATAACTCTCTCTTTCTCTCCTTCTGAGTCAAGAGTGCAACCATCTTTG
TGCCTGATGAAATACTCCTGAGAGGCATGAGGACCGTTCGATGTAATCGTTGCGTGAAAC
ACAATGTACTGCATATCCGC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 4

CO CL1831Contig1 858 4 8 U
TTTTGTTGTAAGATAAAGGAATTTTAGATGTTTGCAATGTAATGCTTATTACTTATTACA
ATTCAAACTAATGAGACAAGTAGCAACACAAGAACACACAACC*ATTCGAATAAACATGG
GAGTGCTAGAAGAACTTGAATAAAAGAACTCATAAACACACACAAAAATTTAGAAAAGAA
TCAGAAAGAGAAGCTTAATTAGTTCCTCCAAGCACACCCTTGAGCTTCTTAACCTCTTCA
TCGCTAAGGAACGTCGTGGCTTCAACGAGTTCTGAAGGCAAATCATTTGCAAACAGAGCA
AATGGTAGAATCTGAAGCCCTGGAGAAGAGCTTCCAAAGGCAACAAAGGCCAACGCAGGT
CCTTTCCCAGAGTTAAGCTGAAAATGAAGAAGCCCTTGGGGAAACACCATGGAGTCTCCT
CGATAGAGAGTCTTCGAGTAAACCTTGTTGGCAGAGGAGATAAATCCTGCGCGTATGGTT
CCTTGTATGACTACAAGGACCTCGGATGCACCAGGGTGAGTATGAAGAGGGATGACACCT
CCACCGGCTAAGTCAAGACGAGCCAATGAGACATCAAGGCCATTGAGACCTGCGAAGGCA
GGTGCAAAGGCTGGAGTCACAGCGGCTTTAATGATGCTGGAAGTGTTTCCGGCTATGGCG
AGACCGGAGAACGCGAAGTCATTCTCGGTGACTTGGTCAGGGTTCTTGCAAGAGTATCCT
GATGGG*TTTTGAGGACCCTTTGTATCGGCTACACAAAAGTCTAAAACAGAGGCCAAAGA
GATGGGTGAAACCAAGGAGAGGATGAAGAAGATATGGATTATCATTTTCATTTTATTATA
AGTCTTTGAAGTTATCCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2EQ17JQ U 34
AF RR2AM27TF C 1
AF RR2EQ17TF C 337
AF RR2AM27JQ U 5
BS 1 4 RR2AM27TF
BS 5 636 RR2AM27JQ
BS 637 637 RR2EQ17JQ
BS 638 654 RR2AM27JQ
BS 655 655 RR2EQ17JQ
BS 656 726 RR2AM27JQ
BS 727 727 RR2AM27TF
BS 728 858 RR2AM27JQ

RD RR2EQ17JQ 682 0 0
GCA
ATGTAATGCTTATTACTTATTACAATTCAAACTAATGAGACAAGTAGCAACACAAGAACA
CACAACC*ATTCGAATAAACATGGGAGTGCTAGAAGAACTTGAATAAAAGAACTCATAAA
CACACACAAAAATTTAGAAAAGAATCAGAAAGAGAAGCTTAATTAGTTCCTCCAAGCACA
CCCCTGAGCTTCTTAACCTCTTCATCGCTAAGGAACGTCGTGGCTTCAACGAGTTCTGAA
GGCAAATCATTTGCAAACAGAGCAAATGGTAGAATCTGAAGCCCTGGAGAAGAGCTTACA
AAGGCAACAAAGGCCAACGCAGGTCCTTTCCCAGAGTTAAGCTGAAAATGAAGAAGCCCT
TGGGGAAACACCATGGAGTCTCCTCGATAGAGAGTCTTCGAGTAAACCTTGTTGGCAGAG
GAGATAAATCCTGCGCGTATGGTTCCTTGTATGACTACAAGGACCTCGGATGCACCAGGG
TGAGTATGAAGAGGGATGACACCTCCACCGGCTAAGTCAAGACGAGCCAATGAGACATCA
AGGCCATTGAGACCTGCGAAGGCAGGTGCAAAGGCTGGAGTCACAGCGGCTTTAATGATG
CTGGAAGTGTTTCCGGCTATGGCGAGACCGGAGAACGCGAAGTCATTCTCGGTGACTTGG
TCAGGGTTCTTGCAAGAGT

QA 4 682 4 682
DS 

RD RR2AM27TF 858 0 0
TTTTGTTGTAAGATAAAGGAATTTTAGATGTTTGCAATGTAATGCTTATTACTTATTACA
ATTCAAACTAATGAGACAAGTAGCAACACAAGAACACACAACCCATTCGAATAAACATGG
GAGTGCTAGAAGAACTTGAATAAAAGAACTCATAAACACACACAAAAATTTAGAAAAGAA
TCAGAAAGAGAAGCTTAATTAGTTCCTCCAAGCACACCCTTGAGCTTCTTAACCTCTTCA
TCGCTAAGGAACGTCGTGGCTTCAACGAGTTCTGAAGGCAAATCATTTGCAAACAGAGCA
AATGGTAGAATCTGAAGCCCTGGAGAAGAGCTTCCAAAGGCAACAAAGGCCAACGCAGGT
CCTTTCCCAGAGTTAAGCTGAAAATGAAGAAGCCCTTGGGGAAACACCATGGAGTCTCCT
CGATAGAGAGTCTTCGAGTAAACCTTGTTGGCAGAGGAGATAAATCCTGCGCGTATGGTT
CCTTGTATGACTACAAGGACCTCGGATGCACCAGGGTGAGTATGAAGAGGGATGACACCT
CCACCGGCTAAGTCAAGACGAGCCAATGAGACATCAAGGCCATTGAGACCTGCGAAGGCA
GGTGCAAAGGCTGGAGTCACAGCGGCTTTAATGATGTTGGAAGTGTTTCCGGCTTTGGCG
AGACCGGAGAACGCGAAGTCATTCTCGGTGACTTGGTCAGGGTTCTTGCAAGAGTATCCT
GATGGG*TTTTGAGGACCCTTTGTATCGGCTACACAAAAGTCTAAAACAGAGGCCAAAGA
GATGGGTGAAACCAAGGAGAGGATGAAGAAGATATGGATTATCATTTTCATTTTATTATA
AGTCTTTGAAGTTATCC
C

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR2EQ17TF 521 0 0
AAGGCAACAAAGGCCAACGCAGGTCCTTTCCCAGAGTTAAGCTGAAAATGAAGAAGCCCT
TGGGGAAACACCATGGAGTCTCCTCGATAGAGAGTCTTCGAGTAAACCTTGTTGGCAGAG
GAGATAAATCCTGCGCGTATGGTTCCTTGTATGACTACAAGGACCTCGGATGCACCAGGG
TGAGTATGAAGAGGGATGACACCTCCACCGGCTAAGTCAAGACGAGCCAATGAGACATCA
AGGCCATTGAGACCTGCGAAGGCAGGTGCAAAGGCTGGAGTCACAGCGGCTTTAATGATG
CTGGAAGTGTTTCCGGCTATGGCGAGACCGGAGAACGCGAAGTCATTCTCGGTGACTTGG
TCAGGGTTCTTGCAAGAGTATCCTGATGGG*TTTTGAGGACCCTTTGTATCGGCTACACA
AAAGTCTAAAACAGAGGCCAAAGAGATGGGTGAAACCAAGGAGAGGATGAAGAAGATATG
GATTATCGTTTTCATTTTATTATAAGTCTTTGAAGTTATCC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2AM27JQ 854 0 0
GTTGTAAGATAAAGGAATTTTAGATGTTTGCAATGTAATGCTTATTACTTATTACAATTC
AAACTAATGAGACAAGTAGCAACACAAGAACACACAACC*ATTCGAATAAACATGGGAGT
GCTAGAAGAACTTGAATAAAAGAACTCATAAACACACACAAAAATTTAGAAAAGAATCAG
AAAGAGAAGCTTAATTAGTTCCTCCAAGCACACCCTTGAGCTTCTTAACCTCTTCATCGC
TAAGGAACGTCGTGGCTTCAACGAGTTCTGAAGGCAAATCATTTGCAAACAGAGCAAATG
GTAGAATCTGAAGCCCTGGAGAAGAGCTTCCAAAGGCAACAAAGGCCAACGCAGGTCCTT
TCCCAGAGTTAAGCTGAAAATGAAGAAGCCCTTGGGGAAACACCATGGAGTCTCCTCGAT
AGAGAGTCTTCGAGTAAACCTTGTTGGCAGAGGAGATAAATCCTGCGCGTATGGTTCCTT
GTATGACTACAAGGACCTCGGATGCACCAGGGTGAGTATGAAGAGGGATGACACCTCCAC
CGGCTAAGTCAAGACGAGCCAATGAGACATCAAGGCCATTGAGACCTGCGAAGGCAGGTG
CAAAGGCTGGAGTCACAGCGGCTTTAATGATGTTGGAAGTGTTTCCGGCTTTGGCGAGAC
CGGAGAACGCGAAGTCATTCTCGGTGACTTGGTCAGGGTTCTTGCAAGAGTATCCTGATG
GGGTTTTGAGGACCCTTTGTATCGGCTACACAAAAGTCTAAAACAGAGGCCAAAGAGATG
GGTGAAACCAAGGAGAGGATGAAGAAGATATGGATTATCATTTTCATTTTATTATAAGTC
TTTGAAGTTATCCC

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 3

CO CL1832Contig1 1168 3 11 U
GGAGGGATGGACGGGATATTCTGATATTATGAAAGGTCCCAGTTATGCTCCTAAAAGGAA
GACTTTCGCTACTGACTTGACTCGAGAGAATCTGCAGAACTGGAAAGAGTTGGAATTCAA
GGAGTATAACTTCAATGCTATGGGACAACCTCTTGATGCAGGGCATCTTCATCCCCTTCT
TAAGGTTCGGAAGCAGTTCAAAGACATATTTTGTCAGATGGGATTTGAAGAGATGCCAAC
AAACAACTTCGTGGAGAGCAGCTTCTGGAATTTCGATGCACTGTTCCAACCTCAGCAGCA
CCCTGCTCGTGACTCTCATGACACCTTCTTTTTAAAAGCTCCTTCGACAACCAGGGAACT
ACCAGAAGACTATGTTGAAAGGGTGAAACAGGTTCACGAGTCTGGTGGATACGGATCGCG
AGGGTATAACTATGAATGGAAAAGAGAGGAAGCAAACAAGAATCTTCTCCGTACACACAC
AACTGCAGTCTCGTCTAGGATGCTTTATGCACTCGCAAAGGGACCTTTCACTCCCAAGAA
GTACTTTTCAATAGACCGTGTCTTCAGAAACGAGGATGTTGACCGAACACATCTGGCAGA
GTTCCATCAGATTGAAAGTTTGATCTGTGACCGTGGTCTGACATTGGGTGATCTCATTGG
TGTATTGGAAGCGTTCTTCGCTCGATTAGGGATGCCCAAGCTGCGTTTCAAGCCGGCATA
CAACCCATACACTGAACCAAGCATGGAGATTTTCAGCTATCATCCAGGACTAGAGAAATG
GGTAGAGATTGGAAACTCTGGCATGTTCAGACCCGAAATGCTGCAGCCAATGGGTCTGCC
AGAGGATGTTCGAGTCATTGCATGGGGTCTTTCTCTTGAAAGACCAACAATGATCTTATA
TGGCATTGACAACATCCGTGATCTGTTTGGACACAAGGTGGATCTCAAACTCATCGAACG
GAATCCCATCTGTCGCGTTGGAATCTAGTCGGCTTGATTTGGATTATGAATTTGCTACAG
TTTCTTTGATGCAGTTATGCTAAATGCTATACACAATTTATGATCCTTCCTTTTTTTGTC
AAGAATCTATGATCCTTCCAATTTTACTTTTTGACTTGTTTTATCATCATCATTTTAAAG
ATTATATATCAACTTTTTTTATAAGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR24TF U 1
AF RR2F313TF U 216
AF RR2FR24JQ C 656
BS 1 292 RR2FR24TF
BS 293 294 RR2F313TF
BS 295 314 RR2FR24TF
BS 315 315 RR2F313TF
BS 316 685 RR2FR24TF
BS 686 801 RR2F313TF
BS 802 802 RR2FR24JQ
BS 803 937 RR2F313TF
BS 938 938 RR2FR24JQ
BS 939 991 RR2F313TF
BS 992 1168 RR2FR24JQ

RD RR2FR24TF 685 0 0
GGAGGGATGGACGGGATATTCTGATATTATGAAAGGTCCCAGTTATGCTCCTAAAAGGAA
GACTTTCGCTACTGACTTGACTCGAGAGAATCTGCAGAACTGGAAAGAGTTGGAATTCAA
GGAGTATAACTTCAATGCTATGGGACAACCTCTTGATGCAGGGCATCTTCATCCCCTTCT
TAAGGTTCGGAAGCAGTTCAAAGACATATTTTGTCAGATGGGATTTGAAGAGATGCCAAC
AAACAACTTCGTGGAGAGCAGCTTCTGGAATTTCGATGCACTGTTCCAACCT**GCAGCA
CCCTGCTCGTGACTTTCATGACACCTTCTTTTTAAAAGCTCCTTCGACAACCAGGGAACT
ACCAGAAGACTATGTTGAAAGGGTGAAACAGGTTCACGAGTCTGGTGGATACGGATCGCG
AGGGTATAACTATGAATGGAAAAGAGAGGAAGCAAACAAGAATCTTCTCCGTACACACAC
AACTGCAGTCTCGTCTAGGATGCTTTATGCACTCGCAAAGGGACCTTTCACTCCCAAGAA
GTACTTTTCAATAGACCGTGTCTTCAGAAACGAGGATGTTGACCGAACACATCTGGCAGA
GTTCCATCAGATTGAAAGTTTGATCTGTGACCGTGGTCTGACATTGGGTGATCTCATTGG
TGTATTGGAAGCGTTCTTCGCTCGA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2F313TF 786 0 0
G
GATGGGATTTGAAGAGATGCCAACAAACAACTTCGTGGAGAGCAGCTTCTGGAATTTCGA
TGCACTGTTCCAACCTCAGCAGCACCCTGCTCGTGACTCTCATGACACCTTCTTTTTAAA
AGCTCCTTCGACAACCAGGGAACTACCAGAAGACTATGTTGAAAGGGTGAAACAGGTTCA
CGAGTCTGGTGGATACGGATCGCGAGGGTATAACTATGAATGGAAAAGAGAGGAAGCAAA
CAAGAATCTTCTCCGTACACACACAACTGCAGTCTCGTCTAGGATGCTTTATGCACTCGC
AAAGGGACCTTTCACTCCCAAGAAGTACTTTTCAATAGACCGTGTCTTCAGAAACGAGGC
TGTTGACCGAACACATCTGGCAGAGTTCCATCAGATTGAAGGTTTGATCTGTGACCGTGG
TCTGACATTGGGTGATCTCATTGGTGTATTGGAAGCGTTCTTCGCTCGATTAGGGATGCC
CAAGCTGCGTTTCAAGCCGGCATACAACCCATACACTGAACCAAGCATGGAGATTTTCAG
CTATCATCCAGGACTAGAGAAATGGGTAGAGATTGGAAACTCTGGTATGTTCAGACCCGA
AATGCTGCAGCCAATGGGTCTGCCAGAGGATGTTCGAGTCATTGCATGGGGTCTTTCTCT
TGAAAGACCAACAATGATCTTATATGGCATTGACAACATCCGTGATCTGTTTGGACACAA
G*TGGATCTCAAACTCATCGAACGGAATCCCATCTGTCGCGTTGGAATCTAGTCG
CTTGATTTGG

QA 2 776 2 776
DS 

RD RR2FR24JQ 513 0 0
ATTGGTGTATTGGAAGCGTTCTTCGCTCGATTAGGGATGCCCAAGCTGCGTTTCAAGCCG
GCATACAACCCATACACTGAACCAAGCATGGAGATTTTCAGCTATCATCCAGGACTAGAG
AAATGGGTAGAGATTGGAAATTCTGGCATGTTCAGACCCGAAATGCTGCAGCCAATGGGT
CTGCCAGAGGATGTTCGAGTCATTGCATGGGGTCTTTTTCTTGAAAGACCAACAATGATT
TTATATGGCATTGACAACATCCGTGATCTGTTTGGACACAAGGTGGATTTCAAACTCATC
GAACGGAATCCCATCTGTCGCGTTGGAATCTAGTCGGCTTGATTTGGATTATGAATTTGC
TACAGTTTCTTTGATGCAGTTATGCTAAATGCTATACACAATTTATGATCCTTCCTTTTT
TTGTCAAGAATCTATGATCCTTCCAATTTTACTTTTTGACTTGTTTTATCATCATCATTT
TAAAGATTATATATCAACTTTTTTTATAAGGCC

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 2

CO CL1833Contig1 802 2 13 U
GGATATGCGTATCTTCAGAATCGCCATCACCACTCAAACAAGGCCCTTATGAATCACATG
GTTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCCCTGTAACCAAAATCGTTACCGTCATCTGTCTGAAAG
AATGCTGTCTTCCATGACGGTTCCGATTAATGGGTTTTCTTTAAACCTTCAGAAACCAAA
CCTTATTGCTGTCTTGAGGAGCAGAGTTTTGTATGGTGCTGTAGAAAGCTTATCGGTCTC
TCGTCTCTTCAAGCCTTCTTCTTACAGTTTCAGGACTAGAGTAAGAAGCTTTCAGAAAGA
AAATGCAGGAAAGAAGGAATCTGAAGATGAGAAACCAAATGTCGATGAAATGCTTAACAG
CGAAAGCACAAGAGTTTCTGAAAAGAAGAGAGTCTCATTCATAGCAAAGTTAGGTATTGG
GCTAGGATTGGCTCTGACTATTACAGCAATATGTGTAACCTTGAAAAGCTCTGCTAGTGG
TGGTGCACCTTTTGAGGTTAAGAGTCTTGCCAAACCTTCATCATCTTCAGTTGGTTTTAC
CTTCAATGCGTTCGGAAACAGATTCGTAATTCCAGCAAACGCACCTGGATGGGTTTACTT
TTGGTTGCTAATGGCGGCTGGATTTGGGCTTTTTATCAGCGAAGAGGCGCTAAATATTTG
GGTTGGAATAACATTGGCTCGAATGTTAACTCTGGAGGGGACGTGGCAATCTTTTGCTGA
GTCTTTCTCTCGGAATGCTCCTTATATAATGTCTACTGTGTCTTGGTTTACTGGGGAGTT
TTATAAGCGATATGATACCGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA02TF U 85
AF RR2CR55TF U 1
BS 1 136 RR2CR55TF
BS 137 137 RR2CA02TF
BS 138 281 RR2CR55TF
BS 282 283 RR2CA02TF
BS 284 696 RR2CR55TF
BS 697 697 RR2CA02TF
BS 698 725 RR2CR55TF
BS 726 726 RR2CA02TF
BS 727 734 RR2CR55TF
BS 735 735 RR2CA02TF
BS 736 748 RR2CR55TF
BS 749 749 RR2CA02TF
BS 750 802 RR2CR55TF

RD RR2CA02TF 682 0 0
GG
GTAACCAAAATCGTTACCGTCATCTGTCTGAAAGAATGCTGTCTTCCATGACGGTTCCGA
TTAATGGGTTTTCTTTAAACCTTCAGAAACCAAACCTTATTGCTGTCTTGAGGAGCAGAG
TTTTGTATGGTGCTGTAGAAAGCTTATCGGTCTCTCGTCTCTTCAAGCCTTCTTCTTACA
GTTTCAGGACTAGAGTAAGAAGCTTTCAGAAAGAAAATGCAGGAAAGAAGGAATCTGAAG
ATGAGAAACCAAATGTCGATGAAATGCTTAACAGCGAAAGCACAAGAGTTTCTGAAAAGA
AGAGAGTCTCATTCATAGCAAAGTTAGGTATTGGGCTAGGATTGGCTCTGACTATTACAG
CAATATGTGTAACCTTGAAAAGCTCTGCTAGTGGTGGTGCACCTTTTGAGGTTAAGAGTC
TTGCCAAACCTTCATCATCTTCAGTTGGTTTTACCTTCAATGCGTTCGGAAACAG*TTCG
TAATTCCAGCAAACGCACCTGGATGGGTTTACTTTTGGTTGCTAATGGCGGCTGGATTTG
GGCTTTTTATCAGCGAAGAGGCGCTAAATATTTGGGTTGGAATAACATTGGCTCGAATGT
TAACTCTGGAGGGGACGTGGCAATCTTTTGCTGAGTCTTTCTCTCGGAATGCTCCTTATA
TAATGTCTACTGTGTCTTGG

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR2CR55TF 802 0 0
GGATATGCGTATCTTCAGAATCGCCATCACCACTCAAACAAGGCCCTTATGAATCACATG
GTTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCCCTGTAACCAAAATCGTTACCGTCATCTGTCTGAAAG
AATGCTGTCTTCCATGGCGGTTCCGATTAATGGGTTTTCTTTAAACCTTCAGAAACCAAA
CCTTATTGCTGTCTTGAGGAGCAGAGTTTTGTATGGTGCTGTAGAAAGCTTATCGGTCTC
TCGTCTCTTCAAGCCTTCTTCTTACAGTTTCAGGACTAGAG**AGAAGCTTTCAGAAAGA
AAATGCAGGAAAGAAGGAATCTGAAGATGAGAAACCAAATGTCGATGAAATGCTTAACAG
CGAAAGCACAAGAGTTTCTGAAAAGAAGAGAGTCTCATTCATAGCAAAGTTAGGTATTGG
GCTAGGATTGGCTCTGACTATTACAGCAATATGTGTAACCTTGAAAAGCTCTGCTAGTGG
TGGTGCACCTTTTGAGGTTAAGAGTCTTGCCAAACCTTCATCATCTTCAGTTGGTTTTAC
CTTCAATGCGTTCGGAAACAGATTCGTAATTCCAGCAAACGCACCTGGATGGGTTTACTT
TTGGTTGCTAATGGCGGCTGGATTTGGGCTTTTTATCAGCGAAGAGGCGCTAAATATTTG
GGTTGGAATAACATTGGCTCGAATGTTAACTCTGGATGGGACGTGGCAATCTTTTGCTGA
GTCTT*CTCTCGGA*TGCTCCTTATATA*TGTCTACTGTGTCTTGGTTTACTGGGGAGTT
TTATAAGCGATATGATACCGTT

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 5

CO CL1834Contig1 1392 5 3 U
CATGTTCGAATATAAAGTTTATTACTATTAGAATTGAAGAGCACAAATACATATAAACTC
AGGAACTACAATTATACATTCCGAATCATAATAATAACAGTAGAATAAAAAATGGAGCAG
AACAACATCAAACAGTTGAGACTTCTTCACTTCCAGTTATTGGCAACAATGTCAGCCAAA
TCAACGACTCTCTGCGAGTAACCCCATTCGTTATCATACCAAGCAATCACTTTAACCATA
TCATCTCCCATAACCATGGTCAGAGAAGAATCAATGGTGGACGACACGTCAGAGCACCTG
AAGTCAACAGAGACAAGAGGCTCGTCGCAAACATCGAGTATACCTTTAAGCTCTTTCTCA
GCCGCATCCCTGAAGGCAGCGTTGACTTCCTCAGCGAAAGTCTTCTTCGAGACCTGCACG
ACTAAGTCGACCACCGAGACGTTAGGAGTTGGCACACGCAGCGCGATTCCGTTGAGTTTT
CCTTTCAGGTTAGGGAGCACTAGCGCCACGGCTTTAGCTGCTCCTGTAGATGTTGGAACG
ATGTTCAAAGCAGCTGCTCTTGCTCTCCTTAGATCACGGTGGCTAGCATCCAACAGCCTC
TGGTCACCAGTGTAGGAGTGTGTGGTTGTCATTGTACCCTTTATGATACCGAACTTCTGG
TCAAGAACCTTGACGAATGGAGCGAGACAGTTGGTAGTACAAGAAGCATTGCTGATGATT
GTGTCTTCATGGCTGTAAAGTTCAGCATTGACACCAACCACATAAGTTGGAATATCACCT
TTACCAGGTGCAGTGATGAGAACCTTCGTGGCTCCAGCTTGAATGTGCTTACCAGCACCT
TCTCTGTCTACAAACACTCCGGTTCCTTCTATGACCAAGTCAATGCCTAGTTCCCCCCAG
GGGAGGTTGGATGGGTTGCGATCAGAGACAATCTTGATGATCTTTCCATCGACAGAGAGA
GCAGAGTCTCCTGAAGGCTTGACGTCAGCGTCGAAGATTCCAAGAGTCGAGTCGTATTTG
AGGAGATGCGTTGCTTGTTTGACACCACCAGTGTCGTTAATGGCAATGACATCAAGAGGA
GAGTCCTTGCGACCATGCCAACATCTCAAGAAGTTCCTGCCGATCCTACCGAATCCATTG
ATGGCTACCTTTAGCTTGGCCTCGGTCACTCCTTTCTTGTATCCTCCATTGCTTCCCATT
GCAGAAGTCTGGAAACTGACGAAGGAAACAAACTCATCAGAAGAAGTTTTCTTGCCCAAG
GGAAGAGCAGAGGAGTTTCTGAGTCCTGAGAAGTCAGAGAAACCCTGAAGAGATGGTTTG
GCCACAGAGAAAGTAGCCGAAGCCATGGCTACCAGAGAGAGAGAGAGAAGATGTGTATAA
TGTAAGCAGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL70JQ U 300
AF RR2FE02JQ U 1
AF RR2FE02TF C 112
AF RR2B549JQ U 334
AF RR2B549TF C 643
BS 1 777 RR2FE02JQ
BS 778 820 RR2B549JQ
BS 821 1392 RR2B549TF

RD RR2FL70JQ 125 0 0
GAAGTCAACAGAGACAAGAGGCCCGTCGCAAACATCGAGTATACCTTTAAGCTCTTTCTC
AGCCGCATCCCTGAAGGCAGCGTTGACTTCCTCAGCGAAAGTCTTCTTCGAGACCTGCAC
GACTA

QA 1 125 1 125
DS 

RD RR2FE02JQ 777 0 0
CATGTTCGAATATAAAGTTTATTACTATTAGAATTGAAGAGCACAAATACATATAAACTC
AGGAACTACAATTATACATTCCGAATCATAATAATAACAGTAGAATAAAAAATGGAGCAG
AACAACATCAAACAGTTGAGACTTCTTCACTTCCAGTTATTGGCAACAATGTCAGCCAAA
TCAACGACTCTCTGCGAGTAACCCCATTCGTTATCATACCAAGCAATCACTTTAACCATA
TCATCTCCCATAACCATGGTCAGAGAAGAATCAATGGTGGACGACACGTCAGAGCACCTG
AAGTCAACAGAGACAAGAGGCTCGTCGCAAACATCGAGTATACCTTTAAGCTCTTTCTCA
GCCGCATCCCTGAAGGCAGCGTTGACTTCCTCAGCGAAAGTCTTCTTCGAGACCTGCACG
ACTAAGTCGACCACCGAGACGTTAGGAGTTGGCACACGCAGCGCGATTCCGTTGAGTTTT
CCTTTCAGGTTAGGGAGCACTAGCGCCACGGCTTTAGCTGCTCCTGTAGATGTTGGAACG
ATGTTCAAAGCAGCTGCTCTTGCTCTCCTTAGATCACGGTGGCTAGCATCCAACAGCCTC
TGGTCACCAGTGTAGGAGTGTGTGGTTGTCATTGTACCCTTTATGATACCGAACTTCTGG
TCAAGAACCTTGACGAATGGAGCGAGACAGTTGGTAGTACAAGAAGCATTGCTGATGATT
GTGTCTTCATGGCTGTAAAGTTCAGCATTGACACCAACCACATAAGTTGGAATATCA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2FE02TF 700 0 0
ATGGAGCAGAACAACATCAAACAGTTGAGACTTCTTCACTTCCAGTTATTGGCAACAATG
TCAGCCAAATCAACGACTCTCTGCGAGTAACCCCATTCGTTATCATACCAAGCAATCACT
TTAACCATATCATCTCCCATAACCATGGTCAGAGAAGAATCAATGGTGGACGACACGTCA
GAGCACCTGAAGTCAACAGAGACAAGAGGCTCGTCGCAGACATCGAGTATACCTTTAAGC
TCTTTCTCAGCCGCATCCCTGAAGGCAGCGTTGACTTCCTCAGCGAAAGTCTTCTTCGAG
ACCTGCACGACTAAGTCGACCACCGAGACGTTAGGAGTTGGCACACGCAGCGCGATTCCG
TTGAGTTTTCCTTTCAGGTTAGGGAGCACTAGCGCCACGGCTTTAGCTGCTCCTGTAGAT
GTTGGAACGATGTTCAAAGCAGCTGCTCTTGCTCTCCTTAGATCACGGTGGCTAGCATCC
AACAGCCTCTGGTCACCAGTGTAGGAGTGTGTGGTTGTCATTGTACCCTTTATGATACCG
AACTTCTGGTCAAGAACCTTGACGAATGGAGCGAGACAGTTGGTAGTACAAGAAGCATTG
CTGATGATTGTGTCTTCATGGCTGTAAAGTTCAGCATTGACACCAACCACATAAGTTGGA
ATATCACCTTTACCAGGTGCAGTGATGAGAACCTTC
TTGC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2B549JQ 487 0 0
TCGAGTATACCTTTAAGCTCTTTCTCAGCCGCATCCCTGAAGGCAGCGTTGACTTCCTCA
GCGAAAGTCTTCTTCGAGACCTGCACGACTAAGTCGACCACCGAGACGTTAGGAGTTGGC
ACACGCAGCGCGATTCCGTTGAGTTTTCCTTTCAGGTTAGGGAGCACTAGCGCCACGGCT
TTAGCTGCTCCTGTAGATGTTGGAACGATGTTCAAAGCAGCTGCTCTTGCTCTCCTTAGA
TCACGGTGGCTAGCATCCAACAGCCTCTGGTCACCAGTGTAGGAGTGTGTGGTTGTCATT
GTACCCTTTATGATACCGAACTTCTGGTCAAGAGCCTTGACGAATGGAGCGAGACAGTTG
GTAGTACAAGAAGCATTGCTGATGATTGTGTCTTCATGGCTGTAAAGTTCAGCATTGACA
CCAACCACATAAGTTGGAATATCACCTTTACCAGGTGCAGTGATGAGAACCTTCGTGGCT
CCAGCTT

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR2B549TF 750 0 0
ATGATACCGAACTTCTGGTCAAGAGCCTTGACGAATGGAGCGAGACAGTTGGTAGTACAA
GAAGCATTGCTGATGATTGTGTCTTCATGGCTGTAAAGTTCAGCATTGACACCAACCACA
TAAGTTGGAATATCACCTTTACCAGGTGCAGTGATGAGAACCTTCGTGGCTCCAGCTTGA
ATGTGCTTACCAGCACCTTCTCTGTCTACAAACACTCCGGTTCCTTCTATGACCAAGTCA
ATGCCTAGTTCCCCCCAGGGGAGGTTGGATGGGTTGCGATCAGAGACAATCTTGATGATC
TTTCCATCGACAGAGAGAGCAGAGTCTCCTGAAGGCTTGACGTCAGCGTCGAAGATTCCA
AGAGTCGAGTCGTATTTGAGGAGATGCGTTGCTTGTTTGACACCACCAGTGTCGTTAATG
GCAATGACATCAAGAGGAGAGTCCTTGCGACCATGCCAACATCTCAAGAAGTTCCTGCCG
ATCCTACCGAATCCATTGATGGCTACCTTTAGCTTGGCCTCGGTCACTCCTTTCTTGTAT
CCTCCATTGCTTCCCATTGCAGAAGTCTGGAAACTGACGAAGGAAACAAACTCATCAGAA
GAAGTTTTCTTGCCCAAGGGAAGAGCAGAGGAGTTTCTGAGTCCTGAGAAGTCAGAGAAA
CCCTGAAGAGATGGTTTGGCCACAGAGAAAGTAGCCGAAGCCATGGCTACCAGAGAGAGA
GAGAGAAGATGTGTATAATGTAAGCAGCAG

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 4

CO CL1835Contig1 687 4 3 U
GGACGCTCTTTGTACACTCCGCCATCTTTCCCATCTCTCTCTCTCTCGAGCAGATCCCTC
TCGTGAACAACTACAATGGCGACCACTTTCAGCGCCTCTGTCTCCATGCAAACCACTTCT
CTGGCAACACCATCAAGGATTAGTTTCCAGAAGCCAGCTTTGGTAAGGACTAATCTCTCC
TTCAACCTACGCCGTTCAATCCCCACTCGTCTCTCAGTCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAG
ACAGTAGCGAAAGTGTCTGAGATTGTCAAGAAGCAACTATCACTCAAAGACGATCAAAAA
GTCGTTGCGGAAACCAAGTTTGCTGATCTTGGAGCAGATTCTCTCGACACGGTTGAGATA
GTGATGGGTTTAGAGGAAGCGTTTGATATCGAAATGGCGGAAGAGAAAGCACAGAAGATT
GCAACTGTGGAGCAAGCTGCTGAACTCATTGAAGAGCTCGTGGGACTGAAGAAGTAATTT
AGTATAATAGCCACCTCTCAATGAAAGTTAAAACCATAAGGCTTTGTGTTTGTTGTCTTC
ATATTTTTTTCTGTCATTTTCTTTTAATGTCTCAAGAATCTTCTACTTTGTCCTTGTCCT
AGTTGTTTTACTAGTATCTGTATCCACGCATTGCTATTCTTCTCCTGAAACTTTTGGTGT
TTGGAAAATTCAGAATAACATTGAATG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FM08TF U 3
AF RR2FE12JQ C 262
AF RR2GV42TF U 1
AF RR2GV42JQB C 324
BS 1 56 RR2GV42TF
BS 57 57 RR2FM08TF
BS 58 687 RR2GV42TF

RD RR2FM08TF 642 0 0
GG
GCTCTTTGTACACTCCGCCATCTTTCCCATCTCTCTCTCTCTCGAGCAGATCCCTCTCGT
GAACAACTACAATGGCGACCACTTTCAGCGCCTCTGTCTCCATGCAAACCACTTCTCTGG
CAACACCATCAAGGATTAGTTTCCAGAAGCCAGCTTTGGTAAGGACTAATCTCTCCTTCA
ACCTACGCCGTTCAATCCCCACTCGTCTCTCAGTCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACAG
TAGCGAAAGTGTCTGAGATTGTCAAGAAGCAACTATCACTCAAAGACGATCAAAAAGTCG
TTGCGGAAACCAAGTTTGCTGATCTTGGAGCAGATTCTCTCGACACGGTTGAGATAGTGA
TGGGTTTAGAGGAAGCGTTTGATATCGAAATGGCGGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAA
CTGTGGAGCAAGCTGCTGAACTCATTGAAGAGCTCGTGGGACTGAAGAAGTAATTTAGTA
TAATAGCCACCTCTCAATGAAAGTTAAAACCATAAGGCTTTGTGTTTGTTGTCTTCATAT
TTTTTTCTGTCATTTTCTTTTAATGTCTCAAGAATCTTCTACTTTGTCCTTGTCCTAGTT
GTTTTACTAGTATCTGTATCCACGCATTGCTATTCTTCTC

QA 3 642 3 642
DS 

RD RR2FE12JQ 370 0 0
ATTGTCAAGAAGCAACTATCACTCAAAGACGATCAAAAAGTCGTTGCGGAAACCAAGTTT
GCTGATCTTGGAGCAGATTCTCTCGACACGGTTGAGATAGTGATGGGTTTAGAGGAAGCG
TTTGATATCGAAATGGCGGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACTGTGGAGCAAGCTGCT
GAACTCATTGAAGAGCTCGTGGGACTGAAGAAGTAATTTAGTATAATAGCCACCTCTCAA
TGAAAGTTAAAACCATAAGGCTTTGTGTTTGTTGTTTTCATATTTTTTTCTGTCATTTTC
TTTTAATGTCTCAAGAATCTTTTACTTTGTCCTTGTCCTAGTTGTTTTCCTAGTATCTGT
ATCCACGCAT

QA 1 370 1 370
DS 

RD RR2GV42TF 687 0 0
GGACGCTCTTTGTACACTCCGCCATCTTTCCCATCTCTCTCTCTCTCGAGCAGATCTCTC
TCGTGAACAACTACAATGGCGACCACTTTCAGCGCCTCTGTCTCCATGCAAACCACTTCT
CTGGCAACACCATCAAGGATTAGTTTCCAGAAGCCAGCTTTGGTAAGGACTAATCTCTCC
TTCAACCTACGCCGTTCAATCCCCACTCGTCTCTCAGTCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAG
ACAGTAGCGAAAGTGTCTGAGATTGTCAAGAAGCAACTATCACTCAAAGACGATCAAAAA
GTCGTTGCGGAAACCAAGTTTGCTGATCTTGGAGCAGATTCTCTCGACACGGTTGAGATA
GTGATGGGTTTAGAGGAAGCGTTTGATATCGAAATGGCGGAAGAGAAAGCACAGAAGATT
GCAACTGTGGAGCAAGCTGCTGAACTCATTGAAGAGCTCGTGGGACTGAAGAAGTAATTT
AGTATAATAGCCACCTCTCAATGAAAGTTAAAACCATAAGGCTTTGTGTTTGTTGTCTTC
ATATTTTTTTCTGTCATTTTCTTTTAATGTCTCAAGAATCTTCTACTTTGTCCTTGTCCT
AGTTGTTTTACTAGTATCTGTATCCACGCATTGCTATTCTTCTCCTGAAACTTTTGGTGT
TTGGAAAATTCAGAATAACATTGAATG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2GV42JQB 364 0 0
TGATCTTGGAGCAGATTCTCTCGACACGGTTGAGATAGTGATGGGTTTAGAGGAAGCGTT
TGATATCGAAATGGCGGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACTGTGGAGCAAGCTGCTGA
ACTCATTGAAGAGCTCGTGGGACTGAAGAAGTAATTTAGTATAATAGCCACCTCTCAATG
AAAGTTAAAACCATAAGGCTTTGTGTTTGTTGTCTTCATATTTTTTTCTGTCATTTTCTT
TTAATGTCTCAAGAATCTTCTACTTTGTCCTTGTCCTAGTTGTTTTACTAGTATCTGTAT
CCACGCATTGCTATTCTTCTCCTGAAACTTTTGGTGTTTGGAAAATTCAGAATAACATTG
AATG

QA 1 364 1 364
DS 



AS 1 5

CO CL1836Contig1 1983 5 13 U
CTGTTAAAATAGACACGTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCACAATTATGGATCTCAGCCA
CTCTACTTCGGATTAATTAAGAAGATATTTGTTTCCTGTTGTTGGGAGGAAGAAATTATT
TTTGGATCTGAAACGAAAAATCAATCAAACAAACAAGGAAGGGGAAGATGGGGTTCTTCA
GCACAGTGCTAGGGTTTTGCGGATTTGGGATAGGGATATCCATGGGGCTCGTCATCGGAT
ACTTCCTTTTCATCTACCTCCAGCCCAACGACGTCAAGGATCCAAAAATTGAACCGATAG
CAGAGCAAGATCCCAAATCCATGCTCCGTATGTTCCCTGAGATCCCTCTCTGGGTCAAGA
ACCCCGACTTCGACCGTGTTGACTGGATCAACAAGTTCCTCGAGTACATGTGGCCTTACC
TCGACAAAGCAATCTGCAAAACCGCACGGAACATAGCCAAGCCCATCATCGAGGAGCAGA
TCCCCAAGTACAAGATCGACTCCGTCGATTTCGAAACCCTAACCCTCGGCTCTCTCCCTC
CCACTCTCCAAGGGCATGAAAGTCTACCTCACTGACGAAAAGGAGCTGATCATGGAGCCT
TGCTTGAAATGGGCAGCTAATCCTAATGTCCTTGTCGCTATCAAAGCTTTCGGACTCGAG
GTTACTGTTCAGGTGGTTGATCTTCAAGTCTTTGCGCAGCCTCGTATCACTCTCAAACCC
TTGGTCCCGAGCTTCCCTTGTTTCGCCAGTATTTATGTCTCTCTTATGGACAAGCCACAC
GTTGATTTTGGGCTCAAGCTTGGTGGAGCTGATCTTATGTCTATCCCCGGCCTCTACAGA
TTTGTCCAGGAGCAAATCAAGGATCAAGTTGCAAACATGTATCTCTGGCCTAAGACCCTT
GTAGTTCCAATCCTTGACCCTGCCAAAGCGTTTAGAAGGCCGGTTGGAATCGTCCATGTG
AAGGTCGTGAGGGCTGTTGGGCTTAGGAAGAAAGATATGATGGGTGGGGCTGACCCCTAC
GTGAAGATCAAGCTCTCTGAAGACAAGATTCCCTCTAAGAAGACCACCGTCAAACACAAG
AATCTGAACCCTGAATGGAATGAGGAACATAAATTCTCTGTCAGAGATCCCCAGACTCAG
GTCCTAGAGTTCAGTGTCTATGACTGGGAACAGGTTGGGAAGCACGACAAGATGGGTATG
AATGTATTACCGCTGAAAGAAATGGTGCCTAACGAACACAAAAGCTTCACTTTGGAACTG
CGCAAGACTCTGGAGGGTGCTGAAGAAGGAGCGCAGCCTGACAAGGATAGAGGGAGGCTG
GAGGTTGAGCTCTTGTATAAGCCATTCACAGAAGAAGAAATGCCAAAGGGCTTCGAAGAA
TCGCAATCAGTGCAGAAGGCTCCTGAAGGCACACCGGCTGGTGGAGGAGTGCTTGCGGTG
ATAGTACATTCAGCTGAAGACGTCGAAGGTAAGCACCATACCGACCCTTACGTCCGCATC
TACTTCAAAGGAGAGGAGAGGAAAACCAAGCACGTCAAGAAGAACAGAGACCCGAGGTGG
GAGGAGGAGTTCACCTTCGTGCTCGAGGAGCCTCCAGTGCGCGAGAAGCTGCACGTGGAA
GTACTCAGCACCTCTCCAAGGATAGGTCTCTTGCATCCCAAGGAAACACTGGGGTACGTG
GACATTCCGGTGGTGGACGTGGTGAACAACAAAAGGATGAACCAAAAGTTTCACCTTATC
GATTCCAAGAACGGAAAGATCCAAATCGAGCTGGAGTGGCGAACCACCTCTTAGATTGCT
GCTATTCGAGAAGAGAGGAGAGAATTTGTTTGATGTTATAAACTCTTTGTGTTGTCGTTG
TTGTTGTACAATATGGGCCTTTTAACTCTTAAAACCAGACATCAGATTTGCAAAGCCCTT
TTCTTATTTATATGTTTATGTCTGCTATTCGGTAGTGCGACTTTACTGCTCATTATTTTC
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2A872TF U 1
AF RR2G459TF U 689
AF RR2AX53TFB U 814
AF RR2FI49TF U 964
AF RR2G459JQ C 1504
BS 1 746 RR2A872TF
BS 747 747 RR2G459TF
BS 748 767 RR2A872TF
BS 768 1287 RR2G459TF
BS 1288 1288 RR2AX53TFB
BS 1289 1344 RR2G459TF
BS 1345 1345 RR2AX53TFB
BS 1346 1354 RR2G459TF
BS 1355 1395 RR2AX53TFB
BS 1396 1553 RR2FI49TF
BS 1554 1554 RR2G459JQ
BS 1555 1635 RR2FI49TF
BS 1636 1983 RR2G459JQ

RD RR2A872TF 767 0 0
CTGTTAAAATAGACACGTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCACAATTATGGATCTCAGCCA
CTCTACTTCGGATTAATTAAGAAGATATTTGTTTCCTGTTGTTGGGAGGAAGAAATTATT
TTTGGATCTGAAACGAAAAATCAATCAAACAAACAAGGAAGGGGAAGATGGGGTTCTTCA
GCACAGTGCTAGGGTTTTGCGGATTTGGGATAGGGATATCCATGGGGCTCGTCATCGGAT
ACTTCCTTTTCATCTACCTCCAGCCCAACGACGTCAAGGATCCAAAAATTGAACCGATAG
CAGAGCAAGATCCCAAATCCATGCTCCGTATGTTCCCTGAGATCCCTCTCTGGGTCAAGA
ACCCCGACTTCGACCGTGTTGACTGGATCAACAAGTTCCTCGAGTACATGTGGCCTTACC
TCGACAAAGCAATCTGCAAAACCGCACGGAACATAGCCAAGCCCATCATCGAGGAGCAGA
TCCCCAAGTACAAGATCGACTCCGTCGATTTCGAAACCCTAACCCTCGGCTCTCTCCCTC
CCACTCTCCAAGGGCATGAAAGTCTACCTCACTGACGAAAAGGAGCTGATCATGGAGCCT
TGCTTGAAATGGGCAGCTAATCCTAATGTCCTTGTCGCTATCAAAGCTTTCGGACTCGAG
GTTACTGTTCAGGTGGTTGATCTTCAAGTCTTTGCGCAGCCTCGTATCACTCTCAAACCC
TTGGTCCCGAGCTTCCCTTGTTTCGC*AGTATTTATGTCTCTCTTAT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2G459TF 666 0 0
TT
TTTGCGCAGCCTCGTATCACTCTCAAACCTTTGGTCCCGAGCTTCCCTTGTTTCGCCAGT
ATTTATGTCTCTCTTATGGACAAGCCACACGTTGATTTTGGGCTCAAGCTTGGTGGAGCT
GATCTTATGTCTATCCCCGGCCTCTACAGATTTGTCCAGGAGCAAATCAAGGATCAAGTT
GCAAACATGTATCTCTGGCCTAAGACCCTTGTAGTTCCAATCCTTGACCCTGCCAAAGCG
TTTAGAAGGCCGGTTGGAATCGTCCATGTGAAGGTCGTGAGGGCTGTTGGGCTTAGGAAG
AAAGATATGATGGGTGGGGCTGACCCCTACGTGAAGATCAAGCTCTCTGAAGACAAGATT
CCCTCTAAGAAGACCACCGTCAAACACAAGAATCTGAACCCTGAATGGAATGAGGAACAT
AAATTCTCTGTCAGAGATCCCCAGACTCAGGTCCTAGAGTTCAGTGTCTATGACTGGGAA
CAGGTTGGGAAGCACGACAAGATGGGTATGAATGTATTACCGCTGAAAGAAATGGTGCCT
AACGAACACAAAAGCTTCACTTTGGAACTGCGCAAGACTCTGGAGGGTGCTGAAGAAAGA
GCGCAGCCTGACAAGGATAGAGGGAGGCTGGAGGTTGAGCTCTTGTATAAGCCACTCACA
GAAG

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR2AX53TFB 582 0 0
CTTATGTCTATCCCTGGCCTCTACAGATTTGTCCAGGAGCAAATCAAGGATCAAGTTGCA
AACATGTATCTCTGGCCTAGGACCCTTGTAGTTCCAATCCTTGACCCTGCCAAAGCGTTT
AGAAGGCCGGTTGGAATCGTCCATGTGAAGGTCGTGAGGGCTGTTGGGCTTAGGAAGAAA
GATATGATGGGTGGGGCTGACCCCTACGTGAAGATCAAGCTCTCTGAAGACAAGATTCCC
TCTAAGAAGACCACCGTCAAACACAAGAATCTGAACCCTGAATGGAATGAGGAACATAAA
TTCTCTGTCAGAGATCCCCAGACTCAGGTCCTAGAGTTCAGTGTCTATGACTGGGAACAG
GTTGGGAAGCACGACAAGATGGGTATGAATGTATTACCGCTGAAAGAAATGGTGCCTAAC
GAACACAAAAGCTTCACTTTGGAACTGCGCAAGACTCTGGAGGGTGCTGAAGAAGGAGCG
CAGCCTGACAAGGATAGAGGGAGGCTGGAGGTTGAGCTCTTGTATAAGCCATTCACAGAA
GAAGAAATGCCAAAGGGCTTCGAAGAATCGCAATCAGTGCAG

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2FI49TF 673 0 0
GTCGTGAGGGCTGTTGGGCTTAGGAAGAAAGATATGATGGGTGGGGCTGACCCCTACGTG
AAGATCAAGCTCTCTGAAGACAAGATTCCCTCTAAGAAGACCACCGTCAAACACAAGAAT
CTGAACCCTGAATGGAATGAGGAACATAAATTCTCTGTCAGAGATCCCCAGACTCAGGTC
CTAGAGTTCAGTGTCTATGACTGGGAACAGGTTGGGAAGCACGACAAGATGGGTATGAAT
GTATTACCGCTGAAAGAAATGGTGCCTAACGAACACAAAAGCTTCACTTTGGAACTGCGC
AAGACTCTGGAGGGTGCTGAAGAAGGAGCGCAGCCTGACAAGGATAGAGGGAGGCTGGAG
GTTGAGCTCTTGTATAAGCCATTCACAGAAGAAGAAATGCCAAAGGGCTTCGAAGAATCG
CAATCAGTGCAGAAGGCTCCTGAAGGCACACCGGCTGGTGGAGGAGTGCTTGCGGTGATA
GTACATTCAGCTGAAGACGTCGAAGGTAAGCACCATACCGACCCTTACGTCCGCATCTAC
TTCAAAGGAGAGGAGAGGAAAACCAAGCACGTCAAGAAGAACAGAGACCCTAGGTGGGAG
GAGGAGTTCACCTTCGTGCTCGAGGAGCCTCCAGTGCGCGAGAAGCTGCACGTGGAAGTA
CTCAGCACCTCT
T

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2G459JQ 480 0 0
TTCAAAGGAGAGGAGAGGAAAACCAAGCACGTCAAGAAGAACAGAGACCCGAGGTGGGAG
GAGGAGTTCACCTTCGTGCTCGAGGAGCCTCCAGTGCGCGAGAAGCTGCACGTGGAAGTA
CTCAGCACCTCTCCAAGGATAGGTCTCTTGCATCCCAAGGAAACACTGGGGTACGTGGAC
ATTCCGGTGGTGGACGTGGTGAACAACAAAAGGATGAACCAAAAGTTTCACCTTATCGAT
TCCAAGAACGGAAAGATCCAAATCGAGCTGGAGTGGCGAACCACCTCTTAGATTGCTGCT
ATTCGAGAAGAGAGGAGAGAATTTGTTTGATGTTATAAACTCTTTGTGTTGTCGTTGTTG
TTGTACAATATGGGCCTTTTAACTCTTAAAACCAGACATCAGATTTGCAAAGCCCTTTTC
TTATTTATATGTTTATGTCTGCTATTCGGTAGTGCGACTTTACTGCTCATTATTTTCCCC

QA 1 480 1 480
DS 



AS 1 4

CO CL1837Contig1 1102 4 9 U
GGACCCCAATCTGTAAACACACACTCGACGACGACCATGGCGGTCTCGTTTAATACAACC
CTTCACCAGTGTTCTCCGAGTCCCAGCTGTAGCATCAAACTTTATTCTGGGTTGAAGCCT
CAATCTGCAAGTTCGTTCCTTTTCTCCTTTACCTGTCTGAAAGTTTCGCTTTTTAGTCGA
ATTTGGGCTTTTAGTGCTCTGGGAATGAAATGATTAGTTTGTGTTACTCTTGTCGGAATC
TGTTGCAGGCTTTTTGACAAATGGGTATCAGAACCTGAACAAGGAGTTCTATGGCAGGAT
CCACAAGAGTTTGGAATCCGGGACTGGGAAAGCGAGTAGGTCACGGGTGAAGATGATGCC
AATAGGCACACCTAGAGTGCCTTACAGAAACCGAGAAGAAGGCACTTGGCAATGGGTCGA
CATTTGGAATGCCCTTTATCGAGAGCGTGTAATCTTCATTGGACAAAACATAGATGAAGA
GTTTGGCAACCAGATATTAGCAACCATGTTGTATCTTGATACTCTTGATGACTCGAGGAG
GATTTATATGTACCTTAATGGACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCTGGCTATCTATGA
TACGATGAAGAGCTTGAAAAGTCCTGTGGGGACACATTGTGTTGGGCTTGCTTATAACCT
TGCAGGTTTTCTTCTTGCTGCTGGTGAGAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAG
AATAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCCCGTGGACAGGCTGATGATATACAAAACGA
AGCAAAAGAGCTTTCAAGGATAAGAGATTACCTCTTCAATGAGCTAGCCAAGAATACAGG
GCAGCCTGCGGAAAGGATATTCAAAGACTTGAGCAGAGTGAAAAGGTTCAACGCAGAAGA
AGCCATGGAGTATGGGCTTATCGATAAGATTGTTAGACCACCTCGTATCAAAGCGGACGC
TCCTCGTCAAGATGAAACTGCAGGTCTCGGTTAATCCGTTTTTTTTTTTTTGTAATGTAA
TGTCTGGAAGTTTATACAATCTTGAAAAGTCATTGGTTCTTTCTTGTTTACCGTATGAAA
TCACATTTTTCCATGTTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR2C314TF U 1
AF RR2C314JQ C 319
AF RR2AW65JQ C 634
AF RR2AW65TFB U 702
BS 1 665 RR2C314TF
BS 666 666 RR2C314JQ
BS 667 702 RR2C314TF
BS 703 703 RR2AW65TFB
BS 704 721 RR2C314TF
BS 722 722 RR2AW65TFB
BS 723 755 RR2C314TF
BS 756 1097 RR2AW65TFB
BS 1098 1102 RR2AW65JQ

RD RR2C314TF 757 0 0
GGACCCCAATCTGTAAACACACACTCGACGACGACCATGGCGGTCTCGTTTAATACAACC
CTTCACCAGTGTTCTCCGAGTCCCAGCTGTAGCATCAAACTTTATTCTGGGTTGAAGCCT
CAATCTGCAAGTTCGTTCCTTTTCTCCTTTACCTGTCTGAAAGTTTCGCTTTTTAGTCGA
ATTTGGGCTTTTAGTGCTCTGGGAATGAAATGATTAGTTTGTGTTACTCTTGTCGGAATC
TGTTGCAGGCTTTTTGACAAATGGGTATCAGAACCTGAACAAGGAGTTCTATGGCAGGAT
CCACAAGAGTTTGGAATCCGGGACTGGGAAAGCGAGTAGGTCACGGGTGAAGATGATGCC
AATAGGCACACCTAGAGTGCCTTACAGAAACCGAGAAGAAGGCACTTGGCAATGGGTCGA
CATTTGGAATGCCCTTTATCGAGAGCGTGTAATCTTCATTGGACAAAACATAGATGAAGA
GTTTGGCAACCAGATATTAGCAACCATGTTGTATCTTGATACTCTTGATGACTCGAGGAG
GATTTATATGTACCTTAATGGACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCTGGCTATCTATGA
TACGATGAAGAGCTTGAAAAGTCCTGTGGGGACACATTGTGTTGGGCTTGCTTATAACCT
TGCAG*TTTTCTTCTTGCTGCTGGTGAGAAGGGTCAACGGTT*GCGATGCCATTGTCAAG
A*TAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCCCGTG
AC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2C314JQ 779 0 0
CCGGGACT
GGAAAGCGAGTAGGTCACGGGTGAAGATGATGCCAATAGGCACACCTAGAGTGCCTTACA
GAAACCGAGAAGAAGGCACTTGGCAATGGGTCGACATTTGGAATGCCCTTTATCGAGAGC
GTGTAATCTTCATTGGACAAAACATAGATGAAGAGTTTGGCAACCAGATATTAGCAACCA
TGTTGTATCTTGATACTCTTGATGACTCGAGGAGGATTTATATGTACCTTAATGGACCAG
GCGGGGATCTTACTCCAAGTCTGGCTATCTATGATACGATGAAGAGCTTGAAAAGTCCTG
TGGGGACACATTGTGTTGGGCTTGCTTATAACCTTGCAGGTTTTCTTCTTGCTGCTGGTG
AGAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAGAATAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTG
CAGCCCGTGGACAGGCTGATGATATACAAAACGAAGCAAAAGAGCTTTCAAGGATAAGAG
ATTACCTCTTCAATGAGCTAGCCAAGAATACAGGGCAGCCTACGGAAAGGATATTCAAAG
ACTTGAGCAGAGTGAAAAGGTTCAACGCAGAAGAAGCCATGGAGTATGGGCTTATCGATA
AGATTGTTGGACCACCTCGTATCAAAGCGGACGCTCCTCGTCAAGATGAAACTGCAGGTC
TCGGTTAATCCGTTTTTTTT****TGTAATGTAATGTCTGGAAGTTTATACAATCTTGAA
AAGTCATTGGTTCTTTCTTGTTTACCGTATGAAATCACATTTTTCCATGTT

QA 9 779 9 779
DS 

RD RR2AW65JQ 469 0 0
G
CATTGTGTTGGGCTTGCTTATAACCTTGCAGGTTTTTTTCTTGCTGCTGGTGAGAAGGGT
CAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAGAATAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCCCGT
GGACAGGCTGATGATATACAAAACGAAGCAAAAGAGCTTTCAAGGATAAGAGATTACCTC
TTCAATGAGCTAGCCAAGAATACAGGGCAGCCTGCGGAAAGGATATTCAAAGACTTGAGC
AGAGTGAAAAGGTTCAACGCAGAAGAAGCCATGGAGTATGGGCTTATCGATAAGATTGTT
AGACCACCTCGTATCAAAGCGGACGCTCCTCGTCAAGATGAAACTGCAGGTCTCGGTTAA
TCCGTTTTTTTTTTTTTGTAATGTAATGTCTGGAAGTTTATACAATCTTGAAAAGTCATT
GGTTCTTTCTTGTTTACCGTATGAAATCACATTTTTCCATGTTATTTT

QA 2 469 2 469
DS 

RD RR2AW65TFB 401 0 0
TTGCGATGCCATTGTCAAGAATAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCCCGTGGACAGG
CTGATGATATACAAAACGAAGCAAAAGAGCTTTCAAGGATAAGAGATTACCTCTTCAATG
AGCTAGCCAAGAATACAGGGCAGCCTGCGGAAAGGATATTCAAAGACTTGAGCAGAGTGA
AAAGGTTCAACGCAGAAGAAGCCATGGAGTATGGGCTTATCGATAAGATTGTTAGACCAC
CTCGTATCAAAGCGGACGCTCCTCGTCAAGATGAAACTGCAGGTCTCGGTTAATCCGTTT
TTTTTTTTTTGTAATGTAATGTCTGGAAGTTTATACAATCTTGAAAAGTCATTGGTTCTT
TCTTGTTTACCGTATGAAATCACATTTTTCCATGTT
ATTTT

QA 1 396 1 396
DS 



AS 1 3

CO CL1838Contig1 756 3 13 U
GGGAACTCTCTCACACTTGTTAATTGCTGCTTCTGCCTGTGCCCTAGTGGCTTTCGCGAT
ATCGTCTAAGTCTGGGTGCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTGCATCATGGCTTCCGCAGTT
TCCAACGCGTTTCGTTACCCTCCTCCGCAAATTGGTTATCGGAGCTCCAATTCCACTCTT
CGAGCTCCAAAGTCGCCGCCTTTTGTCAGGCTTCTTCCGCGAAGGGTGTTGCAGAGCAGG
ATTTTGATACGTGCTGCTTCGTCTTCTGCTTCTGCTGGAAATCCACTGTCTGATGGTGAC
TTTAACCCATATGAGGTTCTTGGTGTTAACCCTATAGAGGGATTTGACAAGATCAAGCAG
ACTTACGGAAGAAAACTTAAGGAAGCTCAGAGGAGTGGTGATGAAGCCACTGCTGCTCTA
CTTGAGAAAGCATATGATAAACTCATGTATTCCCAGTTAATGGATAGGAAAAAAGGTGTG
ACTTTCGGTTCGTTTAAGGTTTCCAAGGACATTAGATATGCTGATAAGCAGCCCATGATA
CCATGGGGTCCAAGGTATTCCAAGTCCCCCAAGAACGATATGTTGATCAACCTAGCAATA
TCAGCTGTGTTTAGTGCATGGATTGCCATAAAACGTAATGTTGAATACAAACCGCTGCAG
TTCATGTCCTTTGTGTTTGTCTGCAGAATTTTTGAGAAACTTAAATCCTTTGAAGGACCT
TCAACTCCAACATATAACGAGGAAGCGAGAGACGGA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD38TF U 1
AF RR2E237TF U 1
AF RR2CN58TF U 11
BS 1 228 RR2DD38TF
BS 229 229 RR2E237TF
BS 230 672 RR2DD38TF
BS 673 673 RR2E237TF
BS 674 692 RR2DD38TF
BS 693 698 RR2E237TF
BS 699 699 RR2CN58TF
BS 700 715 RR2E237TF
BS 716 716 RR2CN58TF
BS 717 723 RR2E237TF
BS 724 724 RR2CN58TF
BS 725 748 RR2E237TF
BS 749 756 RR2CN58TF

RD RR2DD38TF 708 0 0
GGGAACTCTCTCACACTTGTTAATTGCTGCTTCTGCCTGTGCCCTAGTGGCTTTCGCGAT
ATCGTCTAAGTCTGGGTGCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTGCATCATGGCTTCCGCAGTT
TCCAACGCGTTTCGTTACCCTCCTCCGCAAATTGGTTATCGGAGCTCCAATTCCACTCTT
CGAGCTCCAAAGTCGCCGCCTTTTGTCAGGCTTCTTCCGCGAAGGGTGCTGCAGAGCAGG
ATTTTGATACGTGCTGCTTCGTCTTCTGCTTCTGCTGGAAATCCACTGTCTGATGGTGAC
TTTAACCCATATGAGGTTCTTGGTGTTAACCCTATAGAGGGATTTGACAAGATCAAGCAG
ACTTACGGAAGAAAACTTAAGGAAGCTCAGAGGAGTGGTGATGAAGCCACTGCTGCTCTA
CTTGAGAAAGCATATGATAAACTCATGTATTCCCAGTTAATGGATAGGAAAAAAGGTGTG
ACTTTCGGTTCGTTTAAGGTTTCCAAGGACATTAGATATGCTGATAAGCAGCCCATGATA
CCATGGGGTCCAAGGTATTCCAAGTCCCCCAAGAACGATATGTTGATCAACCTAGCAATA
TCAGCTGTGTTTAGTGCATGGATTGCCATAAAACGTAATGTTGAATACAAACCGCTGCAG
TTCATGTCCTTTATGTTTGTCTGCAGAATTTT
GAGAACTTAAATCCTT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2E237TF 748 0 0
GG
GAACTCTCTCACACTTGTTAATTGCTGCTTCTGCCTGTGCCCTAGTGGCTTTCGCGATAT
CGTCTAAGTCTGGGTGCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTGCATCATGGCTTCCGCAGTTTC
CAACGCGTTTCGTTACCCTCCTCCGCAAATTGGTTATCGGAGCTCCAATTCCACTCTTCG
AGCTCCAAAGTCGCCGCCTTTTGTCAGGCTTCTTCCGCGAAGGGTGTTGCAGAGCAGGAT
TTTGATACGTGCTGCTTCGTCTTCTGCTTCTGCTGGAAATCCACTGTCTGATGGTGACTT
TAACCCATATGAGGTTCTTGGTGTTAACCCTATAGAGGGATTTGACAAGATCAAGCAGAC
TTACGGAAGAAAACTTAAGGAAGCTCAGAGGAGTGGTGATGAAGCCACTGCTGCTCTACT
TGAGAAAGCATATGATAAACTCATGTATTCCCAGTTAATGGATAGGAAAAAAGGTGTGAC
TTTCGGTTCGTTTAAGGTTTCCAAGGACATTAGATATGCTGATAAGCAGCCCATGATACC
ATGGGGTCCAAGGTATTCCAAGTCCCC*AAGAACGATATGTTGATCAACCTAGCAATATC
AGCTGTGTTTAGTGCATGGATTGCCATAAAACGTAATGTTGAATACAAACCGCTGCAGTT
CATGTCCTTTGTGTTTGTCTGCAGAATTTTTGAGAA*CTTAAATCCTTTGAAG*ACCTTC
A*CTCCAACATATAACGAGGAAGCGA

QA 3 748 3 748
DS 

RD RR2CN58TF 746 0 0
GGACT
CTTGTTAATTGCTGCTTCTGCCTGTGCCCTAGTGGCTCTCGCGATATCGTCTAAGTCTGG
*TGCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTGCATCATGGCTTCCGCAGTTTCCAACGCGTTTCGT
TACCCCCCTCCGCAAATTGGTTATCGGAGCTCCAATTCCACTCTTCGAGCTCCAAAGTCG
CCGTCTTTTGTCAGGCTTCTTCCTAGAAGGGTGTTGCAGAGCAGGATCGTGATACGTGCC
GCTTCGTCTTCTGCTTCTGCTGGAAATCCACAGTCTGATGGTGACTTTAACCCATATGAG
GTTCTTGGTGTTAACCCTATAGAGGGATTTGACAAGATCAGGCAAACTTATGGAAGAAAA
CTTAAAGAAGCTCAGAGGAGTGGTGATGAAGCCACTGCTGCTCTACTTGAGAAAGCATAT
GATAAACTCATGTATTCCCAGTTAATGGATAGGAAAAAAGGTGTGACTTTCGGTTCGTTT
AAGGTTTCCAAGGACATTAGATATGCTGATAAGCAGCCCATGATACCATGGGGTCCAAGG
TATTCCAAGTCCCCCAAGAACGATATGTTGATCAACCTAGCAATATCAGCTGTGTTTAGT
GCATGGATTGCCATAAAACGTAATGTTGAATACAAACCGCTGCAGTTCATGTCCTTTGTG
TTTGTCTACAGAATTTTTGAGAAACTTGAATCCTTTGAAGGACCTTCAACTCCAACATAT
AACGAGGAAGCGAGAGACGGA

QA 6 746 6 746
DS 



AS 1 4

CO CL1839Contig1 965 4 10 U
CCAAACAAAATCTTATTAATCCATTATTATTAAACACTTTATTCAACCACAATTACACAA
AATTACATAAGCTTTAATTCAAGCATAATTACACAAACTTTATCACCCGTTCACTTCACA
CAATACAAACCAAAACGGTTTCTTTATTCCGTAACCGAAAACATACGACAAATATAAGTT
TGTAGCCACCATATAACAGTTTTGCAGTAAAAGTTGCAAAAACCCTTTATTACCACTTCC
TTCTCTTATTTTGTTTGACGATAAGATGGTCAACCATCAACCTTCATGTCGGTTTCAGAG
TCCCACTTGAATGCTCCACTTGGCTGAGCCGCGTCTGCGATATCCTCCATCGTCAGATGC
GAGTTCGGTGTCTTCAACGGCACAATCTCATGCCCGTACTTCTCCGCATCTCCACAGTAA
TCTTGGTCAGCGTGCATTTTCCTCACAAACCTCTTGAAGAGTTCAAAGTTGTTTTCTTGA
AAGACCGTATCGGACAACCGAAGGTAAGTAAAGCCGTACATTCTCAGCTTCGGCTTACCG
TTATGGTTAACCCCGTTAGGCCTCGCATTAAGTAGAATCTGATTGTAACCTTTGGTTCCA
TAGGTCTCTAATGCGTTCTCACCAGCAACTTCTATGCCTTCTTTCCATGATTTGCTCAAT
ACCATTTGAACAAGTTCTTGTGGAGCACTCATGGCTTCAGCAGTATTGTCGGTATCTTTC
ATCTCAAGGCAAGTGAAGTTGAGAGTGCCGTAGTGTTTTGAGAGCATACGAGCGATCGGG
CGATAACCATCTCTCTCGTAGAGGTTATAATATCCGGCAGTAAGCTCCGCAGCGTGGCTG
TGGTGGTTGTACAACCAGTGAATTCCAGAAACCTTGGCAGCCAAGTTAACTTTAAGTCCA
GCGAAGATCTTGTTGGCTTCTCCTATGATCTGATCTCCATGAAAGATAAGTTTGGTCGAG
TACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2H573JQB U 12
AF RR2DL13JQ U 16
AF RR2A720JQ U 1
AF RR2H573TF C 270
BS 1 450 RR2A720JQ
BS 451 451 RR2H573JQB
BS 452 479 RR2A720JQ
BS 480 480 RR2H573JQB
BS 481 541 RR2A720JQ
BS 542 542 RR2H573JQB
BS 543 701 RR2A720JQ
BS 702 702 RR2DL13JQ
BS 703 834 RR2A720JQ
BS 835 965 RR2H573TF

RD RR2H573JQB 559 0 0
CCTA
TTAATCTATTATTATTAAAAACTTTATTCAACCACAATTACACAAAATTACATAAGCTTT
AATTCAAGCATAATTACACAAACTTAATCACC*GTTCACTTCACACAATACAAACCAAAA
CGGTTTCTTTATTCCGTAACCGAAAACATACGACAAATATAAGTTTGTAGCCACCATATA
ACAGTTTTGCAGTAAAAGTTGCAAAACCCCTTTATTACCACTTCCTTCTCTTATTTTGTT
TGACGATAAAATGGTCAACCATCAACCTTCATGTCGGTTTCAAAGTCCCACTTGAATGCT
CCACTTGGCTGAGCCGCGTCTGCGATATCCTCCATCGTCAAATGCGAGTTCGGTGTCTTC
AACGGCACAATCTCATGCCCGTACTTCTCCGCATCTCCACAGTAATCTTGGTCAGCGTGC
ATTTTCCTCACAAACCTCTTGAAGAGTTCAAAGTTGTTTTCTTGAAAGACCGTATCGGAC
AACCGAAGGTAAGTAAAGCCGTACATTCTCAGCTTCGGCTTACCGTTATGGTTAACCCCG
TTAGGCCTCGCATTA

QA 5 559 5 559
DS 

RD RR2DL13JQ 736 0 0
TTAATCCATTATTATTAAACACTTTATTCAACCACAATTACACAAAATTACATAAGCTTT
AATTCAAGCATAATTACACAAACTTTATCACCCGTTCACTTCACACAATACAAACCAAAA
CGGTTTCTTTATTCCATAACCGAAAACATACGACAAATATAAGTTTGTAGCCACCATATA
ACAGTTTTGCAGTAGAAGTTGCAAAAACCCTTTATTACCACTTCCTTCTCTTATTTTGTT
TGACGATAAGATGGTCAACCATCAACCTTCATGTCGGTTTCAGAGTCCCACTTGAATGCT
CCACTTGGCTGAGCCGCGTCTGCGATATCCTCCATCGTCAGATGCGAGTTCGGTGTCTTC
AACGGCACAATCTCATGCCCGTACTTCTCCGCATCTCCACAGTAATCTTGGTCAGCGTGC
ATTTTCCTCACAAACTTCTTGAAGAGTTGAAAGTTGTTTTCTTGAAAGACCGTATCAGAC
AACCGAAGGTAAGTAAAGCCGTACATTCTCAGCTTCGGCTTACCGTTATGGTTAACTCCG
TTAGGCCTCGCATTAAGTAGAATCTGATTGTAACCTTTGGTTCCATATGTCTCTAATGCG
TTCTCACCAGCAACTTCTATGCCTTCTTTCCATGATTTGCTCAATACCATTTGAACAAGT
TCTTGTGGAGCACTCATGGCTTCAGCAGTATTGTCGGTATCTTTCATCTCAAGGCAAGTG
AAGTTGAGAGTGCCGT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2A720JQ 834 0 0
CCAAACAAAATCTTATTAATCCATTATTATTAAACACTTTATTCAACCACAATTACACAA
AATTACATAAGCTTTAATTCAAGCATAATTACACAAACTTTATCACCCGTTCACTTCACA
CAATACAAACCAAAACGGTTTCTTTATTCCGTAACCGAAAACATACGACAAATATAAGTT
TGTAGCCACCATATAACAGTTTTGCAGTAAAAGTTGCAAAAACCCTTTATTACCACTTCC
TTCTCTTATTTTGTTTGACGATAAGATGGTCAACCATCAACCTTCATGTCGGTTTCAGAG
TCCCACTTGAATGCTCCACTTGGCTGAGCCGCGTCTGCGATATCCTCCATCGTCAGATGC
GAGTTCGGTGTCTTCAACGGCACAATCTCATGCCCGTACTTCTCCGCATCTCCACAGTAA
TCTTGGTCAGCGTGCATTTTCCTCACAAACTTCTTGAAGAGTTCAAAGTTGTTTTCTTGG
AAGACCGTATCGGACAACCGAAGGTAAGTAAAGCCGTACATTCTCAGCTTCGGCTTACCG
TCATGGTTAACCCCGTTAGGCCTCGCATTAAGTAGAATCTGATTGTAACCTTTGGTTCCA
TAGGTCTCTAATGCGTTCTCACCAGCAACTTCTATGCCTTCTTTCCATGATTTGCTCAAT
ACCATTTGAACAAGTTCTTGTGGAGCACTCATGGCTTCAGCTGTATTGTCGGTATCTTTC
ATCTCAAGGCAAGTGAAGTTGAGAGTGCCGTAGTGTTTTGAGAGCATACGAGCGATCGGG
CGATAACCATCTCTCTCGTAGAGGTTATAATATCCGGCAGTAAGCTCCGCAGCG

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR2H573TF 696 0 0
TCAACCATCAAC*TTCATGTCGGTTTCAGAGTCCCACTTGAATGCTCCACTTGGCTGAGC
CGCGTCTGCGATATCCTCCATCGTCAGATGCGAGTTCGGTGTCTTCAACGGCACAATCTC
ATGCCCGTACTTCTCCGCATCTCCACAGTAATCTTGGTCAGCGTGCATTTTCCTCACAAA
CCTCTTGAAGAGTTCAAAGTTGTTTTCTTGAAAGACCGTATCGGACAACCGAAGGTAAGT
AAAGCCGTACATTCTCAGCTTCGGCTTACCGTTATGGTTAACCCCGTTAGGCCTCGCATT
AAGTAGAATCTGATTGTAACCTTTGGTTCCATAGGTCTCTAATGCGTTCTCACCAGCAAC
TTCTATGCCTTCTTTCCATGATTTGCTCAATACCATTTGAACAAGTTCTTGTGGAGCACT
CATGGCTTCAGCAGTATTGTCGGTATCTCTCATCTCAAGGCAAGTGAAGTTGAGAGTGCC
GTAGTGTTTTGAGAGCATCCGAGCGATCGGGCGATAACCATCTCTCTCGTAGAGGTTATA
ATATCCGGCAGTAAGCTCCGCAGCGTGGCTGTGGTGGTTGTACAACCAGTGAATTCCAGA
AACCTTGGCAGCCAAGTTAACTTTAAGTCCAGCGAAGATCTTGTTGGCTTCTCCTATGAT
CTGATCTCCATGAAAGATAAGTTTGGTCGAGTACCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 5

CO CL1840Contig1 1413 5 14 U
GGTCACGAGCAAAGCATAACAAACAACATAATACAAGACATTTGGGCATCTTAATGCGTT
ACTAAGGTTTTGTTTCTATTATATAGTTACAACATAACATTGGCTTCACATACAAATTAT
TTCCCCTGGTGAGTTTATTTGAATCAGGTAGTGTGACATAAGAACAACTCACACCAAAAC
ATCATTTATTTGATCGTGATGTAGCGGTTTGTACCGTGCTTTGCCCAATGGTCCTTGAGA
TCAACCGGGTTCGAGAGATCATGGTGCCCTTCTGCAGCAAGCCGGCTTAAAAGCTTGTTG
AACGCGCTTCCACTCATCTTCCTTCCACCAACTCGAGCATGTCTTTTGTTGGGCAGTGCT
GGTAATGGATACATTGATATCGTGGTTGTGCAACAAGACGACTGCCAACCTCCGTTTCCC
CATTTGTAGCATTGCCTGAGATCTCCCGTGCATGAACACACAGGTGGTGGCATTGTCGCC
TCGTCGTAAACAACCTGGTTAAGCCCCACCATCTCTTGGCTTTTCCAGTCTGATTTGGAT
CCTGTTAAGACAAGCTTGCTTGTCTCTTCTTCCCCGTAGTCAAGGGACGTCTTCACAAAC
ATTATCTTGGTCAACTCGTCCTCGTTCTCCTTCTTAACCTTCCTCGGATTCTTTGGCCCT
CTCTTGTTAGCAGTGCTCTTCGTTGTTGTCGCCTTTGGATCTTTCACTCTTTTACCGCGT
TTCGGTTTGGCAGACTCCAAGGCGGTTCCTTGAAGTGGTGATACATCGTTTGGCTCCATT
TCTCTGGACTCATCATATGCATGATCACTCACCTGAAGCATGTGATGCTGCTGCTGATGA
TGCATTTGTGGATGATGAATGTGTTTTACACCACGTGGCATTTGACATCCCGGTGGGCAT
GCCGCCGCCATATTGGAAACTGCAGGAGTAGTAGTAGACATGGAGTTCTCACGGTATTGT
AGAGCTGAAAGAGCGCTGTCTCTCTCCATTATGGCGTTGTTGCGCTCGGCGATGGCAGTG
TCTCGCTGGAGGAACGCCATGTCCCTTTCAGCTACTGCTGATTTTCTCTCTGATATCGCT
AGGTTTCTCTCCTGGATCGCTGCATCACGCTCTGCTATTATTGACATGACTTGTTTCATC
GATGGTTGATGCTGCATCATCCACTGGCCCTGAGGTGCTTTATGCCGACCATTGTCACGA
TGTCCACCATCATCCATTTGAGATATTTAAACTTATATATAGAATCAACAAAAAGACTGA
GCAAGCTAATGGAAAATCAAAATAAAAGATCGATCCATCAGGAGGTAAGGTAGGTCCAAC
TAGAGATTGAAAGTAGGCATGGCGAAAGTGGAGGAGATACAAAGAACACAGAGATTCGGA
TTTGGGAAGAGAGTTGGTTGGGTGAGTTTAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G196JQ U 1
AF RR2EP26JQ U 18
AF RR2EP26TF C 11
AF RR2CT85JQ U 55
AF RR2CT85TF C 832
BS 1 56 RR2G196JQ
BS 57 57 RR2EP26JQ
BS 58 81 RR2G196JQ
BS 82 82 RR2EP26JQ
BS 83 254 RR2G196JQ
BS 255 255 RR2EP26JQ
BS 256 446 RR2G196JQ
BS 447 447 RR2EP26JQ
BS 448 478 RR2G196JQ
BS 479 479 RR2EP26JQ
BS 480 543 RR2G196JQ
BS 544 737 RR2EP26JQ
BS 738 890 RR2CT85JQ
BS 891 1413 RR2CT85TF

RD RR2G196JQ 545 0 0
GGTCACGAGCAAAGCATAACAAACAACATAATACAAGACATTTGGGCATCTTAATGTGTT
ACTAAGGTTTTGTTTCTATTACATAGTTACAACATAACATTGGCTTCACATACAAATTAT
TTCCCCTGGTGAGTTTATTTGAATCAGGTAGTGTGACATAAGAACAACTCACACCAAAAC
ATCATTTATTTGATCGTGATGTAGCGGTTTGTACCGTGCTTTGCCCAATGGTCCTTGAGA
TCAACCGGGTTCGAAAGATCATGGTGCCCTTCTGCAGCAAGCCGGCTTAAAAGCTTGTTG
AACGCGCTTCCACTCATCTTCCTTCCACCAACTCGAGCATGTCTTTTGTTGGGCAGTGCT
GGTAATGGATACATTGATATCGTGGTTGTGCAACAAGACGACTGCCAACCTCCGTTTCCC
CATTTGTAGCATTGCCTGAGATCTCCTGTGCATGAACACACAGGTGGTGGCATTGTCGTC
TCGTCGTAAACAACCTGGTTAAGCCCCACCATCTCTTGGCTTTTCCAGTCTGATTTGGAT
CCT
AT

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2EP26JQ 720 0 0
AG
CAAACAACATAATACAAGACATTTGGGCATCTTAATGCGTTACTAAGGTTTTGTTTCTAT
TATATAGTTACAACATAACATTGGCTTCACATACAAATTATTTCCCCTGGTGAGTTTATT
TGAATCAGGTAGTGTGACATAAGAACAACTCACACCAAAACATCATTTATTTGATCGTGA
TGTAGCGGTTTGTACCGTGCTTTGCCCAATGGTCCTTGAGATCAACCGGGTTCGAGAGAT
CATGGTGCCCTTCTGCAGCAAGCCGGCTTAAAAGCTTGTTGAACGCGCTTCCACTCATCT
TCCTTCCACCAACTCGAGCATGTCTTTTGTTGGGCAGTGCTGGTAATGGATACATTGATA
TCGTGGTTGTGCAACAAGACGACTGCCAACCTCCGTTTCCCCATTTGTAGCATTGCCTGA
GATCTCCCGTGCATGAACACACAGGTGGTGGCATTGTCGCCTCGTCGTAAACAACCTGGT
TAAGCCCCACCATCTCTTGGCTTTTCCAGTCTGATTTGGATCCTGTTAAGACAAGCTTGC
TTGTCTCTTCTTCCCCGTAGTCAAGGGACGTCTTCACAAACATTATCTTGGTCAACTCGT
CCTCGTTCTCCTTCTTAACCTTCCTCGGATTCTTTGGCCCTCTCTTGTTAGCAGTGCTCT
TCGTTGTTGTCGCCTTTGGATCTTTCACTCTTTTACCGCGTTTCGGTTTGGCAGACTC

QA 3 720 3 720
DS 

RD RR2EP26TF 773 0 0
TTTTTTTAG
CAAACAACATAATACAAGACATTTGGGCATCTTA*TGCGTTACTAAGGTTTTGTTTCTAT
TATATAGTTACAACATAACATTGGCTTCACATACAAATTATTTCCCCTGGTGAGTTTATT
TGAATCAGGTAGTGTGACATAAGAACAACTCACACCAAAACATCATTTATTTGATCGTGA
TGTAGCGGTTTGTACCGTGCTTTGCCCAATGGTCCTTGAGATCAACCGGGTTCGAGAGAT
CATGGTGCCCTTCTGCAGCAAGCCGGCTTAGAAGCTTGTTGAACGCGCTTCCACTCATCT
TCCTTCCACCAACTCGAGCATGTCTTTTGTTGGGCAGTGCTGGTAATGGATACATTGATA
TCGTGGTTGTGCAACAAGACGACTGCCAACCTCCGTTTCCCCATTTGTAGCATTGCCTGA
GATCTCCCGTGCATGAACACACAGGTGGTGGCATTGTCGCCTCGTCGTAAACAACCTGGT
TAAGCCCCACCATCTCTTGGCTTTTCCAGTCTGATTTGGATCCTGTTAAGACAAGCTTGC
TTGTCTCTTCTTCCCCGTAGTCAAGGGACGTCTTCACAAACATTATCTTGGTCAACTCGT
CCTCGTTCTCCTTCTTAACCTTCCTCGGATTCTTTGGCCCTCTCTTGTTAGCAGTGCTCT
TCGTTGTTGTCGCCTTTGGATCTTTCACTCTTTTACCGCGTTTCGGTTTGGCAGACTCCA
AGGCGGTTCCTTGAAGTGGTGATACATCGTTTGGCTCCATTTC
C

QA 10 772 10 772
DS 

RD RR2CT85JQ 836 0 0
CGC
GTTACTAAGGTTTTGTTTCTATTATATAGTTACAACATAACATTGGCTTCACATACAAAT
TATTTCCCCTGGTGAGTTTATTTGAATCAGGTAGTGTGACATAAGAACAACTCACACCAA
AACATCATTTATTTGATCGTGATGTAGCGGTTTGTACCGTGCTTTGCCCAATGGTCCTTG
AGATCAACCGGGTTCGAGAGATCATGGTGCCCTTCTGCAGCAAGCCGGCTTAAAAGCTTG
TTGAACGCGCTTCCACTCATCTTCCTTCCACCAACTCGAGCATGTCTTTTGTTGGGCAGT
GCTGGTAATGGATACATTGATATCGTGGTTGTGCAACAAGACGACTGCCAACCTCCGTTT
CCCCATTTGTAGCATTGCCTGAGATCTCCCGTGCATGAACACACAGGTGGTGGCATTGTC
GTCTCGTCGTAAACAACCTGGTTAAGCCCCACCATCTCTTGGCTTTTCCAGTCTGATTTG
GATCCTGTTAAGACAAGCTTGCCTGTCTCTTCTTCCCCGTAGTCAAGGGACGTCTTCACA
AACATTATCTTGGTCAACTCGTCCTCGTTCTCCTTCTTAACCTTCCTCGGATTCTTTGGC
CCTCTCTTGTTAGCAGTGCTCTTCGTTGTTGTCGCCTTTGGATCTTTCACTCTTTTACCG
CGTTTCGGTTTGGCAGACTCCAAGGCGGTTCCTTGAAGTGGTGATACATCGTTTGGCTCC
ATTTCTCTGGACTCATCATATGCATGATCACTCACCTGAAGCATGTGATGCTGCTGCTGA
TGATGCATTTGTGGATGATGAATGTGTTTTACACCACGTGGCATTTGACATCC

QA 4 836 4 836
DS 

RD RR2CT85TF 582 0 0
TGCTGATGATGCATTTGTGGATGATGAATGTGTTTTACACCACGTGGCATTTGACATCCC
GGTGGGCATGCCGCCGCCATATTGGAAACTGCAGGAGTAGTAGTAGACATGGAGTTCTCA
CGGTATTGTAGAGCTGAAAGAGCGCTGTCTCTCTCCATTATGGCGTTGTTGCGCTCGGCG
ATGGCAGTGTCTCGCTGGAGGAACGCCATGTCCCTTTCAGCTACTGCTGATTTTCTCTCT
GATATCGCTAGGTTTCTCTCCTGGATCGCTGCATCACGCTCTGCTATTATTGACATGACT
TGTTTCATCGATGGTTGATGCTGCATCATCCACTGGCCCTGAGGTGCTTTATGCCGACCA
TTGTCACGATGTCCACCATCATCCATTTGAGATATTTAAACTTATATATAGAATCAACAA
AAAGACTGAGCAAGCTAATGGAAAATCAAAATAAAAGATCGATCCATCAGGAGGTAAGGT
AGGTCCAACTAGAGATTGAAAGTAGGCATGGCGAAAGTGGAGGAGATACAAAGAACACAG
AGATTCGGATTTGGGAAGAGAGTTGGTTGGGTGAGTTTAGGT

QA 1 582 1 582
DS 



AS 2 5

CO CL1841Contig1 562 2 1 U
GGGATTCTCTTAGCCAAAAGAAGAGTAGCGGCGGCGTAACACGAGTGAAGATCACGATGG
CAAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTTCAGAACCAGCTTC
AGGATCTCAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCTCCCA
ACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCAGGAAATCCATAGCTCAGGTTTTGACCGTGACCT
CACAGAAGCAGAAATCTGCTCTAAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATCCCTCTTG
ATCTCCGTCCTAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGACGCCTCACCAAACATCAGCTCTCTT
TGAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAGGAGATGTACTTCCCAATCAGAAAGTACGCTATCA
AAGTTTAAATTCTAGCTGCTAGAAACTCTGTTTCAGCTTTGTGTTTTTGATGCAAACTTG
TTTTGTACTTCGCTTTTTGCTATTTTCTCAAACTGTTTCACCATCATGGATTTTGCTTCC
TATTTATATTTTGCATTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D851TF U 1
AF RR2D851JQ C 34
BS 1 562 RR2D851TF

RD RR2D851TF 562 0 0
GGGATTCTCTTAGCCAAAAGAAGAGTAGCGGCGGCGTAACACGAGTGAAGATCACGATGG
CAAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTTCAGAACCAGCTTC
AGGATCTCAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCTCCCA
ACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCAGGAAATCCATAGCTCAGGTTTTGACCGTGACCT
CACAGAAGCAGAAATCTGCTCTAAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATCCCTCTTG
ATCTCCGTCCTAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGACGCCTCACCAAACATCAGCTCTCTT
TGAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAGGAGATGTACTTCCCAATCAGAAAGTACGCTATCA
AAGTTTAAATTCTAGCTGCTAGAAACTCTGTTTCAGCTTTGTGTTTTTGATGCAAACTTG
TTTTGTACTTCGCTTTTTGCTATTTTCTCAAACTGTTTCACCATCATGGATTTTGCTTCC
TATTTATATTTTGCATTTTCTT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2D851JQ 529 0 0
GCGTAACACGAGTGAAGATCACGATGGCAAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGT
CGAAGAGCGATCTTCAGAACCAGCTTCAGGATCTCAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTG
TCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCTCCCAACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCAGGAAAT
CCATAGCTCAGGTTTTGACCGTGACCTCACAGAAGCAGAAATTTGCTTTAAGAGAAGCAT
ACAAGAACAAGAAGTTCATCCCTCTTGATTTCCGTCCTAAGAAGACCCGTGCTATCCGCA
GACGCCTCACCAAACATCAGCTTTCTTTGAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAGGAGATGT
ACTTCCCAATCAGAAAGTACGCTATCAAAGTTTAAATTCTAGCTGCTAGAAACTCTGTTT
CAGCTTTGTGTTTTTGATGCAAACTTGTTTTGTACTTCGCTTTTTGCTATTTTCTCAAAC
TGTTTCACCATCATGGATTTTGCTTCCTATTTATATTTTGCATTTTCTT

QA 1 529 1 529
DS 



CO CL1841Contig2 582 3 5 U
GGCTGATTCTCTTAGCCAAAAGAAGAGTAGCGGCGGCGTAACACGAGTGAAGATCACGAT
GGCAAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTTCAGAACCAGCT
TCAGGATCTCAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCCCC
*CAACAAGCTCTCTAAAATCAAGGTTGTCCGGAAATCAATAGCTCAGGTGTTGACCGTGA
CCTCACAGAAGCAGAAATCTGCTCTAAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATCCCTC
TTGATCTCCGTCCTAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGACGCCTCACCAAACATCAGCTCT
CTTTGAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAGGAGATGTACTTCCCAATCAGAAAGTACGCTA
TCAAAGTTTAAATTCTTGGCTACTAGAGACTTTGTTTCAGCTTTTTTTT*GTGTTTTTGA
TGCAAACTTGTTTTGTACTTCGCTTTGTGCTATTTTCTCAAACTGTTTCACCATCATGGA
TTTTGCTTCCTATTTATATTTTACATTTTCTTAATTCATGCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D867TF U 1
AF RR2FA22TF U 30
AF RR2FG85TF U 3
BS 1 58 RR2D867TF
BS 59 59 RR2FA22TF
BS 60 469 RR2D867TF
BS 470 470 RR2FA22TF
BS 471 582 RR2D867TF

RD RR2D867TF 582 0 0
GGCTGATTCTCTTAGCCAAAAGAAGAGTAGCGGCGGCGTAACACGAGTGAAGATCACGGT
GGCAAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTTCAGAACCAGCT
TCAGGATCTCAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCCCC
*CAACAAGCTCTCTAAAATCAAGGTTGTCCGGAAATCAATAGCTCAGGTGTTGACCGTGA
CCTCACAGAAGCAGAAATCTGCTCTAAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATCCCTC
TTGATCTCCGTCCTAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGACGCCTCACCAAACATCAGCTCT
CTTTGAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAGGAGATGTACTTCCCAATCAGAAAGTACGCTA
TCAAAGTTTAAATTCTTGGCTACTAGAGACTTTGTTTCAGCTTTTTTTTTGTGTTTTTGA
TGCAAACTTGTTTTGTACTTCGCTTTGTGCTATTTTCTCAAACTGTTTCACCATCATGGA
TTTTGCTTCCTATTTATATTTTACATTTTCTTAATTCATGCT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2FA22TF 547 0 0
GCGGCGGCGTAACACGAGTGAAGATCACGATGGCAAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGG
ACAAGTCGAAGAGCGATCTTCAGAACCAGCTTCAGGATCTCAAGGCTGAGCTCGCTCTCC
TCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCCCC*CAACAAGCTCTCTAAAATCAAGGTTGTC
CGGAAATCAATAGCTCAGGTGTTGACCGTGACCTCACAGAAGCAGAAATCTGCTCTAAGA
GAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATCCCTCTTGATCTCCGTCCTAAGAAGACCCGTGCT
ATCCGCAGACGCCTCACCAAACATCAGCTCTCTTTGAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAG
GAGATGTACTTCCCAATCAGAAAGTACGCTATCAAAGTTTAAATTCTTGGCTACTAGAGA
CTTTGTTTCAGCTTTTTTTT*GTGTTTTTGATGCAAACTTGTTTTGTACTTCGCTTTGTG
CTATTTTCTCAAACTGTTTCACCATCATGGATTTTGCTTCCTATTTATATTTTACATTTT
CTT
AATT

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2FG85TF 570 0 0
GG
GATTCTCTTAGCCAAAAGAAGAGTAGCGGCGGCGTAACACGAGTGAAGATCACGATGGCA
AGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTTCAGAACCAGCTTCAG
GATCTCAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCCCCTCAA
CAAGCTCTCTAAAATCAAGGTTGTCCGGAAATCAATAGCTCAGGTGTTGACCGTGACCTC
ACAGAAGCAGAAATCTGCTCTAAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATCCCTCTTGA
TCTCCGTCCTAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGACGCCTCACCAAACATCAGCTCTCTTT
GAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAGGAGATGTACTTCCCAATCAGAAAGTACGCTATCAA
AGTTTAAATTCTTGGCTACTAGAGACTTTGTTTCAGCTTTTTTTT*GTGTTTTTGATGCA
AACTTGTTTTGTACTTCGCTTTGTGCTATTTTCTCAAACTGTTTCACCATCATGGATTTT
GCTTCCTATTTATATTTTACATTTTCTT

QA 3 570 3 570
DS 



AS 1 5

CO CL1842Contig1 1176 5 43 U
GGGGCGACTGCGTTTATATAATAACAAGACTCTCTTCCTTACCTTCCTTCCTCAAAGCCC
AGTCGTATCATCCATTATCTTTTCTAAAAAAAA*CAAAATGGCGATTGCTTTCAAATCCG
GCGTCTGCTTCCTCAACTCCCCAAAACCCCAAATCGGAATCCGCCACTCTTCTCCCGACT
CCTCCCTCTCTTTCAAGAGATTAACTCCCATCGCCGCCCTCTCCACCTCTTCTCCCACCC
TCGGTCTCGCCGATACCTTCACCCAGCTCAAAAAACAAGGCAAAGTAGCATTCATACCGT
ACATCACAGCTGGGGACCCAGATCTCTCTACTACCGCAGAAGCATTGAAAGTTCTTGACG
CTTGTGGTTCCGACATTATCGAACTCGGTGTTCCTTACTCTGACCCTTTAGCGGATGGAC
CTGTTATTCAGGCTGCGGCGACAAGGTCTTTGGAGAAGGGGACCAACCTTAATAACATTC
TTGACATGTTGGATAAGGTTCTTCCGGAGTTATCGTGTCCAGTTTCGCTGTTTACTTATT
ACAACCCGATTCTTAAACGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTATAAGAGATGTTGGTG
TGCAAGGGCTTGTGGTTCCTGATGTTCCGCTTGAGGAAACTGAGTTGCTGAGAGAAGGAG
CACTTAGCAACGGCATTGAACTGGTCCTACTCACTACACCAACCACACCAACAGAGAGGA
TGAAGCGAATTGTTGAAGCATCAGAAGGGTTTATTTACCTTGTGAGCTCAATAGGAGTGA
CCGGTGCGCGTGCATCTGTCAGCGGAAAGGTTGAGTCGCTCTTGAAGGATATCAAAGAGG
CAACAGACAAGCCGGTGGCGGTTGGTTTTGGAATATCAAAGCCTGAGCATGTGAAACAGA
TAGCTGGTTGGGGAGCTGATGGAGTGATTGTAGGAAGTGCAATGGTGAGGCTTTTGGGAG
ATGGCAAGTCACCAACGGAAGGGCTCAAGGAGCTTGAGCGTCTCACAAAGTCTCTCAAAT
CTGCTCTTCTTTGAAAACACAAAGAAAAAAAAAATTTGCAGAACGCTTCATTGATTGTGT
TTTTGTTTTTACTAAATTACCAGTAATGTATGAAAATGATATTGATATTCCAAACTTTTG
AGACATTTCAAGTATGATGATCCAAACTGTTACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 0 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV63TF U 1
AF RR2GP02TF U 16
AF RR2GZ88TF U 58
AF RR2EO16TF U 63
AF RR2GZ88JQ C 431
BS 1 97 RR2EV63TF
BS 98 98 RR2GZ88TF
BS 99 164 RR2EV63TF
BS 165 165 RR2GP02TF
BS 166 178 RR2EV63TF
BS 179 179 RR2GZ88TF
BS 180 313 RR2EV63TF
BS 314 314 RR2GZ88TF
BS 315 316 RR2EV63TF
BS 317 317 RR2GZ88TF
BS 318 385 RR2EV63TF
BS 386 386 RR2GZ88TF
BS 387 412 RR2EV63TF
BS 413 413 RR2GZ88TF
BS 414 470 RR2EV63TF
BS 471 471 RR2GZ88TF
BS 472 478 RR2EV63TF
BS 479 479 RR2GZ88TF
BS 480 505 RR2EV63TF
BS 506 506 RR2GZ88TF
BS 507 520 RR2EV63TF
BS 521 521 RR2GZ88TF
BS 522 552 RR2EV63TF
BS 553 553 RR2GP02TF
BS 554 554 RR2GZ88TF
BS 555 619 RR2GP02TF
BS 620 620 RR2GZ88TF
BS 621 628 RR2GP02TF
BS 629 629 RR2GZ88TF
BS 630 697 RR2GP02TF
BS 698 698 RR2GZ88TF
BS 699 736 RR2GP02TF
BS 737 746 RR2GZ88TF
BS 747 747 RR2EO16TF
BS 748 774 RR2GZ88TF
BS 775 775 RR2EO16TF
BS 776 783 RR2GZ88TF
BS 784 784 RR2EO16TF
BS 785 805 RR2GZ88TF
BS 806 811 RR2EO16TF
BS 812 812 RR2GZ88JQ
BS 813 828 RR2EO16TF
BS 829 1176 RR2GZ88JQ

RD RR2EV63TF 552 0 0
GGGGCGACTGCGTTTATATAATAACAAGACTCTCTTCCTTACCTTCCTTCCTCAAAGCCC
AGTCGTATCATCCATTATCTTTTCTAAAAAAAA*CAATATGGCGATTGCTTTCAAATCCG
GCGTCTGCTTCCTCAACTCCCCAAAACCCCAAATCGGAATCCGCTACTCTTCTCCCGATT
CCTCCCTCTCTTTCAAGAGATTAACTCCCATCGCCGCCCTCTCCACCTCTTCTCCCACCC
TCGGTCTCGCCGATACCTTCACCCAGCTCAAAAAACAAGGCAAAGTAGCATTCATACCGT
ACATCACAGCTGGTGATCCAGATCTCTCTACTACCGCAGAAGCATTGAAAGTTCTTGACG
CTTGTGGTTCCGACATTATCGAACTGGGTGTTCCTTACTCTGACCCTTTAGCTGATGGAC
CTGTTATTCAGGCTGCGGCGACAAGGTCTTTGGAGAAGGGGACCAACCTTGATAACATAC
TTGACATGTTGGATAAGGTTCTTCCAGAGTTATCGTGTCCTGTTTCGCTGTTTACTTATT
ACAACCCGATTC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2GP02TF 727 0 0
GG
ATAATAACAAGACTCTCTTCCTTACCTTCCTTCCTCAAAGCCCAGTCGTATCATCCATTA
TCTTTTCTAAAAAAAAACAATATGGCGATTGCTTTCAAATCCGGCGTCTGCTTCCTCAAC
TCCCCAAAACCCCAAATCGGAATCCACCACTCTTCTCCCGATTCCTCCCTCTCTTTCAAG
AGATTAACTCCCATCGCCGCCCTCTCCACCTCTTCTCCCACCCTCGGTCTCGCCGATACC
TTCACCCAGCTCAAAAAACAAGGCAAAGTAGCATTCATACCGTACATCACAGCTGGTGAT
CCAGATCTCTCTACTACCGCAGAAGCATTGAAAGTTCTTGACGCTTGTGGTTCCGACATT
ATCGAACTGGGTGTTCCTTACTCTGACCCTTTAGCTGATGGACCTGTTATTCAGGCTGCG
GCGACAAGGTCTTTGGAGAAGGGGACCAACCTTGATAACATACTTGACATGTTGGATAAG
GTTCTTCCAGAGTTATCGTGTCCTGTTTCGCTGTTTACTTATTACAACCCGATTCTCAAA
CGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTATAAGAGATGTTGGTGTGCAAGGGCTTGTGGTT
CCAGATGTTCCTCTTGAGGAAACTGAGTTGCTGAGAGAAGGAGCACTTAGCAACGGCATT
GAACTGGTCCTACTCACTACGCCAACCACACCAACAGAGAGGATGAAGCGAATTGTTGA
GCATCA

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR2GZ88TF 748 0 0
GGCAGTC
GTATCATCCATTATCTTTTCTAAAAA****CACAATGGCGATTGCTTTCAAATCCGGCGT
CTGCTTCCTCAACTCCCCAAAACCCCAAATCGGAATCCGCCACTCTTCTCCCGACTCCTC
CCTCTCTTTCAAGAGATTAACTCCCATCGCCGCCCTCTCCACCTCTTCTCCCACCCTCGG
TCTCGCCGATACCTTCACCCAGCTCAAAAAACAAGGCAAAGTAGCATTCATACCGTACAT
CACAGCTGGGGACCCAGATCTCTCTACTACTGCTGAAGCATTGAAAGTTCTTGACGCTTG
TGGTTCCGACATTATCGAACTCGGTGTTCCTTACTCTGACCCTTTAGCGGATGGACCTGT
TATTCAGGCTGCGGCGACAAGGTCTTTGGAGAAGGGGACCAACCTTAATAACATTCTTGA
CATGTTGGATAAGGTTCTTCCGGAGTTATCGTGTCCAGTTTCGCTGTTTACTTATTACAA
CCCGATTCTTAAACGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTATAAGAGATGTTGGTGTGCA
AGGGCTTGTGGTTCCTGATGTTCCGCTTGAGGAAACTGAGTTGCTGAGAGAAGGAGCACT
TAGCAACGGCATTGAACTGGTCCTACTCACTACACCAACCACACCAACAGAGAGGATGAA
GCGAATTGTTGAAGCATCAGAAAGGTTTATTTACCTTGTGAGCTCAATAG*AGTGACCG*
TGCGCGTGCATCTGTCAGCGG

QA 8 748 8 748
DS 

RD RR2EO16TF 772 0 0
GG
GTATCATCCATTATCTTTTCTAAAAA****CACAATGGCGATTGCTTTCAAATCCGGCGT
CTGCTTCCTCAACTCCCCAAAACCCCAAATCGGAATCCGCCACTCTTCTCCCGACTCCTC
CCTCTCTTTCAAGAGATTAACTCCCATCGCCGCCCTCTCCACCTCTTCTCCCACCCTCGG
TCTCGCCGATACCTTCACCCAGCTCAAAAAACAAGGCAAAGTAGCATTCATACCGTACAT
CACAGCTGGGGACCCAGATCTCTCTACTACTGCTGAAGCATTGAAAGTTCTTGACGCTTG
TGGTTCCGACATTATCGAACTCGGTGTTCCTTACTCTGACCCTTTAGCGGATGGACCTGT
TATTCAGTCTGCGGCGACAAGGTCTTTGGAGAAGGGGACCAACCTTAATAACATTCTTGA
CATGTTGGATAAGGTTCTTCCGGAGTTATCGTGTCCAGTTTCGCTGTTTACTTATTACAA
CCCGATTCTTAAACGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTATAAGAGATGTTGGTGTGCA
AGGGCTTGTGGTTCCTGATGTTCCGCTTGAGGAAACTGAGTTGCTGAGAGAAGGAGCACT
TAGCAACGGCATTGAACTGGTCCTACTCACTACACCAACCACACCAACAGAGAGGATGAA
GCGAATTGTTGAAGCATCAGAAGGGTT*ATTTACCTTGTGAGCTCAATAGGAGTGACCGG
TGCGCGTGCATCTGTCAGCGGAAAGGT*GAGTCGCTCTTGAAGG
TATCAA

QA 3 766 3 766
DS 

RD RR2GZ88JQ 746 0 0
GGCTGCGGCGACAAGGTCTTTGGAGAAGGGGACCAACCTTAATAACATTCTTGACATGTT
GGATAAGGTTCTTCCGGAGTTATCGTGTCCAGTTTCGCTGTTTACTTATTACAACCCGAT
TCTTAAACGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTATAAGAGATGTTGGTGTGCAAGGGCT
TGTGGTTCCTGATGTTCCGCTTGAGGAAACTGAGTTGCTGAGAGAAGGAGCACTTAGCAA
CGGCATTGAACTGGTCCTACTCACTACACCAACCACACCAACAGAGAGGATGAAGCGAAT
TGTTGAAGCATCAGAAGGGTTTATTTACCTTGTGAGCTCAATAGGAGTGACCGGTGCGCG
TGCATCTGTCAGCGGAAAGGTTGAGTCGCTCTTGAAGGATATCAAAGAGGCAACAGACAA
GCCGGTGGCGGTTGGTTTTGGAATATCAAAGCCTGAGCATGTGAAACAGATAGCTGGTTG
GGGAGCTGATGGAGTGATTGTAGGAAGTGCAATGGTGAGGCTTTTGGGAGATGGCAAGTC
ACCAACGGAAGGGCTCAAGGAGCTTGAGCGTCTCACAAAGTCTCTCAAATCTGCTCTTCT
TTGAAAACACAAAGAAAAAAAAAATTTGCAGAACGCTTCATTGATTGTGTTTTTGTTTTT
ACTAAATTACCAGTAATGTATGAAAATGATATTGATATTCCAAACTTTTGAGACATTTCA
AGTATGATGATCCAAACTGTTACTTT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 2 5

CO CL1843Contig1 1258 3 9 U
GGATCAAACAAAAAGTGGTCCATAGTAATGAAATACAGTTTCTTATTTTTTTTAGAACTA
TAATGATGAGGAACCAAGAATGATGTATATACATATTTCGAGGCTTTCTTTTATTGGATA
CGTTTCAAAGTGAATAATAATAAACCTTTCTTTAAATGAAATCTGGTTGACCCGTTGATG
CCAAGCAACGATGCCACATTCGGCTATTGGGATCGACTGACTTTGGGTACGCAATTACTT
CAGGGATTGGCAAATACGCGTAATGAGTGTTGATTATGCCTACTGTGATTCCACTGTATC
CAGCAAATGCACCATGAACAGCGTTTTGTCCAAGAACGGTGCAGAGGATACCATCTGAGG
CATTTGCACGGACGGCTCGAATCATGTATGTTGGATCAATGTACTTGACATCTACTGCCA
TACTTTCTTCTTTAAAATACTTTTTCGTCTCTTGTTGAATGTGCACACCGAAATCACCAA
GTATTGTGCTACCAGATGCATCTTTTGCATTAGTTTTCTCTAAAAAATTCTGTCCAGCTC
CTTCTGCTACACAGATCACAGCGGAGCCTTTTGTTTCGATAAGGTACTTCAAGTGCTTCA
GTACACCATTAGGTCCATGAAGATTGAAAGGTACCTCAGGAATCAAACAGATGTCGACTT
GTCCGCTTGCTAAAGAGGCTTGCATGGCAATGAAACCACTGTTACGACCCATCAGTTTTA
CAATGCCAATGCCATGATAAGCACTATGTGCCTCAATGTAGGCAGAGTTTATAGCGCGTT
GTGCTTCTTCAACAGCAGTATCAAACCCAAACGTCTTATCCATGTGCAAAATATCATTGT
CAATGGTTTTAGGCACACCAACAACAGCTACCTTCATCTTTCTTTTGCGGCACTCATTGT
GTATAGCGTTGGCTCCAGCATGAGTTCCGTTTCCACCAAGCACGAAAAGCATGTTGATTC
CTCTCTCCTCCATGCTGTCAACAATTTCGCTGACACTAGGACCTCCACGTGAAACTCCAA
GCAAGCTTCCTCCAGATAGATGAATGTTCTGTACCACTTTCCTTGATAACGGCATTTCGG
TTAGATCTTTATCAGAGAAGCCTTTATAACCAAAAGGTATCCCAACAATGTTCTTAACAC
CATATATCTCAAGAGTGATAACAATATGTCTGATGACATCATTGAGACCAGGACAAAGCC
CACCACAAGTGATGATGGCAGCCTTCACTTGTTCCGGTCTGAAATATATCTTCTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI07JQ U 1
AF RR2BL42JQ U 30
AF RR2BL42TF C 591
BS 1 127 RR2EI07JQ
BS 128 128 RR2BL42JQ
BS 129 154 RR2EI07JQ
BS 155 155 RR2BL42JQ
BS 156 180 RR2EI07JQ
BS 181 181 RR2BL42JQ
BS 182 342 RR2EI07JQ
BS 343 753 RR2BL42JQ
BS 754 1258 RR2BL42TF

RD RR2EI07JQ 342 0 0
GGATCAAACAAAAAGTGGTCCATAGTAATGAAATACAGTTTCTTATTTTTTTTAGAACTA
TAATGATGAGGAACCAAGAATGATGTATATACATATTTCGAGGCTTTCTTTTATTGGATA
CGTTTCAGAGTGAATAATAATAAACCTTTCTTTAGATGAAATCTGGTTGACCCGTTGATG
TCAAGCAACGATGCCACATTCGGCTATTGGGATCGACTGACTTTGGGTACGCAATTACTT
CAGGGATTGGCAAATACGCGTAATGAGTGTTGATTATGCCTACTGTGATTCCACTGTATC
CAGCAAATGCACCATGAACAGCGTTTTGTCCAAGAACGGTGC

QA 1 342 1 342
DS 

RD RR2BL42JQ 724 0 0
A
AAATACAGTTTCTTATTTTTTT*AGAACTATAATGATGAGGAACCAAGAATGATGTATAT
ACATATTTCGAGGCTTTCTTTTATTGGATACGTTTCAAAGTGAATAATAATAAACCTTTC
TTTAAATGAAATCTGGTTGACCCGTTGATGCCAAGCAACGATGCCACATTCGGCTATTGG
GATCGACTGACTTTGGGTACGCAATTACTTCAGGGATTGGCAAATACGCGTAATGAGTGT
TGATTATGCCTACTGTGATTCCACTGTATCCAGCAAATGCACCATGAACAGCGTTTTGTC
CAAGAACGGTGCAGAGGATACCATCTGAGGCATTTGCACGGACGGCTCGAATCATGTATG
TTGGATCAATGTACTTGACATCTACTGCCATACTTTCTTCTTTAAAATACTTTTTCGTCT
CTTGTTGAATGTGCACACCGAAATCACCAAGTATTGTGCTACCAGATGCATCTTTTGCAT
TAGTTTTCTCTAAAAAATTCTGTCCAGCTCCTTCTGCTACACAGATCACAGCGGAGCCTT
TTGTTTCGATAAGGTACTTCAAGTGCTTCAGTACACCATTAGGTCCATGAAGATTGAAAG
GTACCTCAGGAATCAAACAGATGTCGACTTGTCCGCTTGCTAAAGAGGCTTGCATGGCAA
TGAAACCACTGTTACGACCCATCAGTTTTACAATGCCAATGCCATGATAAGCACTATGTG
CCT

QA 2 724 2 724
DS 

RD RR2BL42TF 668 0 0
AAGTGCTTCAGTACACCATTAGGTCCATGAAGATTGAAAGGTACCTCAGGAATCAAACAG
ATGTCGACTTGTCCGCTTGCTAAAGAGGCTTGCATGGCAATGAAACCACTGTTACGACCC
ATCAGTTTTACAATGCCAATGCCATGATAAGCACTATGTGCCTCAATGTAGGCAGAGTTT
ATAGCGCGTTGTGCTTCTTCAACAGCAGTATCAAACCCAAACGTCTTATCCATGTGCAAA
ATATCATTGTCAATGGTTTTAGGCACACCAACAACAGCTACCTTCATCTTTCTTTTGCGG
CACTCATTGTGTATAGCGTTGGCTCCAGCATGAGTTCCGTTTCCACCAAGCACGAAAAGC
ATGTTGATTCCTCTCTCCTCCATGCTGTCAACAATTTCGCTGACACTAGGACCTCCACGT
GAAACTCCAAGCAAGCTTCCTCCAGATAGATGAATGTTCTGTACCACTTTCCTTGATAAC
GGCATTTCGGTTAGATCTTTATCAGAGAAGCCTTTATAACCAAAAGGTATCCCAACAATG
TTCTTAACACCATATATCTCAAGAGTGATAACAATATGTCTGATGACATCATTGAGACCA
GGACAAAGCCCACCACAAGTGATGATGGCAGCCTTCACTTGTTCCGGTCTGAAATATATC
TTCTCCCT

QA 1 668 1 668
DS 



CO CL1843Contig2 769 2 1 U
TTTTTAGTCAAAAACTCCCTCTCCACTCATTAGTTGACTGAAGACAAAAGAAAAAAAAAA
GATCCGATCGATACGGTTACCTCAGTTTCTTCGCCGCCGCCATGGAAACTCTTTCTCAGG
CGATCACCTCCACCGTCTCGATTCCTCACAGTAACAACAGCTCCGCTCTCGTTAGGTCTC
ACGGTCTCAGCTCGTTACTCCTCCTCCGGAAACCGAGATCTCCGGCGAATCTCTCCCTGA
TCTCTTCTCGCAGCTCTTTGACTCGAGCTTCGGCTGTTGAACACAGCAGCAAAAGCTCGG
CTTCTTCGATCGATCTCAGCGATCCGGATTGGAAAACAAAGTACGAGAGAGAGTTCGAGG
AAAGATTCAGCATCCCTCACATCACTGACGTCTTCCCTGATGCTGAAGCCATCCGTTCAA
CGTTTTGTCTCAAGATGAGGTCTCCGACGGAAGATTTTGTGGGAGGGTACCCATCGGATG
AAGAATGGCATGGATACATTAATAACAATGATAGAGTCCTTCTCAAGGTTATTAGTTACT
CTTCCCCAACTTCTGCTGGAGCTGAGTGCATTGATTCTGACTGTTCTTGGGTTCAGCAAT
GGATTCACCGTGCTGGGCCGAGGGAGAAGATATATTTCAGACCGGAACAAGTGAAGCTGC
CATCATCACTTGTGGTGGGCTTTGTCCTGGTCTCGATGATGTCATCAGACATATTGTTAT
CACTCTTGAGATATATGGTGTTAGAACATTGTTGGGATACTTTTGGTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH83TF U 34
AF RR2EI07TF U 1
BS 1 769 RR2EI07TF

RD RR2EH83TF 401 0 0
G
TGACTGAAGACAAAAGAAAAAAAAA*GATCCGATCGATACGGTTACCTCAGTTTCTTCGC
CGCCGCCATGGAAACTCTTTCTCAGGCGATCACCTCCACCGTCTCGATTCCTCACAGTAA
CAACAGCTCCGCTCTCGTTAGGTCTCACGGTCTCAGCTCGTTACTCCTCCTCCGGAAACC
GAGATCTCCGGCGAATCTCTCCCTGATCTCTTCTCGCAGCTCTTTGACTCGAGCTTCGGC
TGTTGAACACAGCAGCAAAAGCTCGGCTTCTTCGATCGATCTCAGCGATCCGGATTGGAA
AACAAAGTACGAGAGAGAGTTCGAGGAAAGATTCAGCATCCCTCACATCACTGACGTCTT
CCCTGATGCTGAAGCCATCCGTTCAACGTTTTGTCTCAAG

QA 2 401 2 401
DS 

RD RR2EI07TF 769 0 0
TTTTTAGTCAAAAACTCCCTCTCCACTCATTAGTTGACTGAAGACAAAAGAAAAAAAAAA
GATCCGATCGATACGGTTACCTCAGTTTCTTCGCCGCCGCCATGGAAACTCTTTCTCAGG
CGATCACCTCCACCGTCTCGATTCCTCACAGTAACAACAGCTCCGCTCTCGTTAGGTCTC
ACGGTCTCAGCTCGTTACTCCTCCTCCGGAAACCGAGATCTCCGGCGAATCTCTCCCTGA
TCTCTTCTCGCAGCTCTTTGACTCGAGCTTCGGCTGTTGAACACAGCAGCAAAAGCTCGG
CTTCTTCGATCGATCTCAGCGATCCGGATTGGAAAACAAAGTACGAGAGAGAGTTCGAGG
AAAGATTCAGCATCCCTCACATCACTGACGTCTTCCCTGATGCTGAAGCCATCCGTTCAA
CGTTTTGTCTCAAGATGAGGTCTCCGACGGAAGATTTTGTGGGAGGGTACCCATCGGATG
AAGAATGGCATGGATACATTAATAACAATGATAGAGTCCTTCTCAAGGTTATTAGTTACT
CTTCCCCAACTTCTGCTGGAGCTGAGTGCATTGATTCTGACTGTTCTTGGGTTCAGCAAT
GGATTCACCGTGCTGGGCCGAGGGAGAAGATATATTTCAGACCGGAACAAGTGAAGCTGC
CATCATCACTTGTGGTGGGCTTTGTCCTGGTCTCGATGATGTCATCAGACATATTGTTAT
CACTCTTGAGATATATGGTGTTAGAACATTGTTGGGATACTTTTGGTTA

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 3

CO CL1844Contig1 922 3 11 U
GGTTGTAATTAAATTTGATAAATAATCGAACAGTTAAGAAGCAAATTCACTCTTGGACAG
AGCTTTATTTTTTACGTCTGGAAGTTTTACAGTTTGGGAAACAGATAAAATGCAGAAAGA
AAAAAGAAAGAGAGAGAGAGATCAGAGCTTAATGGCAGAGTGAATGGCGACAACGCCACC
AACAAGGTTCTCGTACTCCACCTTCTCAAATCCTGCGTCTGCTATCATCGTTGCAAATTT
CTCCTGAGGGGGAAACCGACGAACACTCTCAACCAAGTACTGGTAAGAGTCTCGGTCACC
GGCAATTAGTTCCCCTAAGTTTGGTATGACCTTGAATGAATACAAATCGTATACATCTTT
GAAGATCGGAATGTCAACATGGCTGAGCTCAAGGCACAGGAATCTTCCTCCCCGTTTTAG
TACCCTATAAGCCTCTGAGAGAGCCTTTTCTATGTGTGTGACATTCCTTATCCCAAATGC
AATAGTGTATCCATCCATTGAATTGTCATCGAAACTCAAGGCCTCTGCATCTCCTTCCAC
CCATACCAGTGACTTGTTATCTCTTATCCCTCTCTCGGTAGCACGTTGTTTCCCGACGTT
TAACATGTTGGGATTAATATCACATACGTATATCTGAGTTTCTTCAAGTGATTCCTCATC
AACTTTCCTCGATGCTCTTTGTTTCACACTGTTAACAGCATCAAAAATCCTAAACGCAAC
ATCACCCGTTCCACCGGCAACATCAAGATGCTTCATCCCAGCAAATGGACTCAGCTTCCC
AACGAGTCTTTCCTTCCAAAGCCTATGCAAGCCACCGCTCATGACATCATTCATGATATC
ATAACTGGAAGCAACATTGGTGAAAACGTTACCAACCAATTTGCTCTTCTCTCTTCCTTT
ACTTCTTGAAACCCGAAACTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE24JQ U 1
AF RR2BE64JQ U 35
AF RR2AW26JQ U 74
BS 1 74 RR2AE24JQ
BS 75 75 RR2BE64JQ
BS 76 164 RR2AE24JQ
BS 165 165 RR2BE64JQ
BS 166 317 RR2AE24JQ
BS 318 318 RR2BE64JQ
BS 319 756 RR2AE24JQ
BS 757 792 RR2BE64JQ
BS 793 793 RR2AW26JQ
BS 794 841 RR2BE64JQ
BS 842 922 RR2AW26JQ

RD RR2AE24JQ 756 0 0
GGTTGTAATTAAATTTGATAAATAATCGAACAGTTAAGAAGCAAATTCACTCTTGGACAG
AGCTTTATTTTTTAGGTCTGGAAGTTTTACAGTTTGGGAAACAGATAAAATGCAGAAAGA
AAAAAGAAAGAGAGAGAGAGATCAGAGCTTAATGGCAGAGTGAACGGCGACAACGCCACC
AACAAGGTTCTCGTACTCCACCTTCTCAAATCCTGCGTCTGCTATCATCGTTGCAAATTT
CTCCTGAGGGGGAAACCGACGAACACTCTCAACCAAGTACTGGTAAGAGTCTCGGTCACC
GGCAATTAGTTCCCCTATGTTTGGTATGACCTTGAATGAATACAAATCGTATACATCTTT
GAAGATCGGAATGTCAACATGGCTGAGCTCAAGGCACAGGAATCTTCCTCCCCGTTTTAG
TACCCTATAAGCCTCTGAGAGAGCCTTTTCTATGTGTGTGACATTCCTTATCCCAAATGC
AATAGTGTATCCATCCATTGAATTGTCATCGAAACTCAAGGCCTCTGCATCTCCTTCCAC
CCATACCAGTGACTTGTTATCTCTTATCCCTCTCTCGGTAGCACGTTGTTTCCCGACGTT
TAACATGTTGGGATTAATATCACATACGTATATCTGAGTTTCTTCAAGTGATTCCTCATC
AACTTTCCTCGATGCTCTTTGTTTCACACTGTTAACAGCATCAAAAATCCTAAACGCAAC
ATCACCCGTTCCACCGGCAACATCAAGATGCTTCAT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2BE64JQ 807 0 0
A
AAGAAGCAAATTCACTCTTGGACAGAGCTTTATTTTTTACTTGTGGAAGTTTTACAGTTT
GGGAAACAGATAAAATGCAGAAGGAAAAAAGAAAGAGAGAGAGAGATCAGAGCTTAATGG
CAGAGTGAATGGCGACAACGCCACCAACAAGGTTCTCGTACTCCACCTTCTCAAAACCTG
CGTCTGCTATCATCGTTGCAAATTTCTCCTGAGGGGGAAACCGACGAACACTCTCAACCA
AGTACTGGTAAGAGTCTCGGTCACCGGCAATTAGTTCCCCTAAGTTTGGAATGACCTTGA
ATGAATACAAATCGTATACATCTTTGAAGATCGGAATGTCAACATGGCTGAGCTCAAGGC
ACAAGAATCTTCCTCCCCGTTTTAGTACCCTATAAGCCTCCGCGAGAGCCTTTTCGATGT
GTGTGACATTCCTTATCCCAAATGCAATAGTGTATCCATCCATTGAGTTGTCATCGAAAC
TCAAGGCCTCTGCATCTCCTTCCACCCATACCAGTGACTTGTTATCGCTTAGCCCTCTCT
CGGCAGCACGTTGTTTCCCAACGTTTAACATGTTGGAATTAATATCACATACGTATATCT
GAGTTTCTTCAAGTGATTCCTCATCAACTTTCCTCGATGCTCTTTGTTTCACACTGTTAA
CAGCATCAAAAATCCTAAACGCAACATCACCGGTTCCACCGGCAACATCAAGATGCTTCA
TCCCAGCAAATGGACTCAGCTTCCCAACGAGTCTTTCTTTCCAAAGCCTATGCAAGCCAC
CGCTCATGACATCATTCATGATATCA

QA 2 807 2 807
DS 

RD RR2AW26JQ 849 0 0
AGGTC
TGGAAGTTTTACAGTTTGGGAAACAGATAAGATGCAGAAAGAAAAAAGAAAGAGAGAGAG
AGATCAGAGCTTAATGGCAGAGTGAATGGCGACAACGCCACCAACAAGGTTCTCGTACTC
CACCTTCTCAAATCCTGCGTCTGCTATCATCGTTGCAAATTTCTCCTGAGGGGGAAACCG
ACGAACACTCTCAACCAAGTACTGGTAAGAGTCTCGGTCACCGGCAATTAGTTCCCCTAA
GTTTGGTATGACCTTGAATGAATACAAATCGTATACATCTTTGAAGATCGGAATGTCAAC
ATGGCTGAGCTCAAGGCACAGGAATCTTCCTCCCCGTTTTAGTACCCTATAAGCCTCTGA
GAGAGCCTTTTCTATGTGTGTGACATTCCTTATCCCAAATGCAATAGTGTATCCATCCAT
TGAATTGTCATCGAAACTCAAGGCCTCTGCATCTCCTTCCACCCATACCAGTGACTTGTT
ATCTCTTATCCCTCTCTCGGTAGCACGTTGTTTCCCGACGTTTAACATGTTGGGATTAAT
ATCACATACGTATATCTGAGTTTCTTCAAGTGATTCCTCATCAACTTTCCTCGATGCTCT
TTGTTTCACACTGTTAACAGCATCAAAAATCCTAAACGCAACATCACCCGTTCCACCGGC
AACATCAAGATGCTTCATCCCAGCAAATGGACTCAGCTTCCCAACGAGTCTTTCCTTCCA
AAGCCTATGCAAGCCACCGCTCATGACATCATTCATGATATCATAACTGGAAGCAACATT
GGTGAAAACGTTACCAACCAATTTGCTCTTCTCTCTTCCTTTACTTCTTGAAACCCGAAA
CTTG

QA 6 849 6 849
DS 



AS 1 4

CO CL1845Contig1 805 4 7 U
GGGAGAATCGTCGAATCGAGGAAGAGATGGTGTCTGGTTCAGGGATATGCGCGAAGCGTG
TCGTGGTCGACGCGAGGCACCACATGTTGGGCCGTCTTGCTTCAATCATAGCTAAGGAGC
TGCTCAACGGACAGAAGGTTGTTGTGGTCCGATGCGAAGAGATATGTCTGTCAGGTGGAT
TGGTTCGACAGAAAATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAACGCATGAACACTAAACCTT
CTCACGGTCCTATTCACTTCAGGGCTCCCTCTAAGATCTTCTGGCGTACCGTTCGTGGGA
TGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGTGCTGCGGCTCTGGCCCGCTTGAAGGTTTTTGAAG
GAGTGCCACCTCCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTCATTCCTGATGCTCTCAAGGTTT
TGAGGCTCCAAGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGTCGTCTCTCTTCTGAGGTTGGCT
GGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAGAGAAAGGAGAAGTCACAGGCTG
TGTATGAGCGCAAGAAGCAACTCATCAAGCTTAGGACCAAGGCCGAGAAGGTTGCGGAGG
AGAAACTTGGATCCCAGCTTGATGTTCTTGCACCGATCAAGTACTAGAAAACCCGCATCT
ATCTTTTGGTTTAAACATTGCTTTGTTTTTACCTTTGAATTTTATTTTATTTTTGAATTT
GGTAACCTTGTAGACGTAAAGATTGGAAAGAGTACATTTTGGCTTGTTTTGTTTCCTATG
CAGTCAGTCAATCTGTTATGGTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DE46TF U 1
AF RR2F077TF U 1
AF RR2EI82JQ C 107
AF RR2DE46JQ C 270
BS 1 317 RR2DE46TF
BS 318 318 RR2F077TF
BS 319 685 RR2DE46TF
BS 686 689 RR2F077TF
BS 690 690 RR2EI82JQ
BS 691 702 RR2F077TF
BS 703 805 RR2EI82JQ

RD RR2DE46TF 685 0 0
GGGAGAATCGTCGAATCGAGGAAGAGATGGTGTCTGGTTCAGGGATATGCGCGAAGCGTG
TCGTGGTCGACGCGAGGCACCACATGTTGGGCCGTCTTGCTTCAATCATAGCTAAGGAGC
TGCTCAACGGACAGAAGGTTGTTGTGGTCCGATGCGAAGAGATATGTCTGTCAGGTGGAT
TGGTTCGACAGAAAATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAACGCATGAACACTAAACCTT
CTCACGGTCCTATTCACTTCAGGGCTCCCTCTAAGATCTTCTGGCGTACCGTTCGTGGGA
TGATTCCACACAAGACCCAGCGTGGTGCTGCGGCTCTGGCCCGCTTGAAGGTTTTTGAAG
GAGTGCCACCTCCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTCATTCCTGATGCTCTCAAGGTTT
TGAGGCTCCAAGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGTCGTCTCTCTTCTGAGGTTGGCT
GGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAGAGAAAGGAGAAGTCACAGGCTG
TGTATGAGCGCAAGAAGCAACTCATCAAGCTTAGGACCAAGGCCGAGAAGGTTGCGGAGG
AGAAACTTGGATCCCAGCTTGATGTTCTTGCACCGATCAAGTACTAGAAAACCCGCATCT
ATCTTTTGGTTTAAACATTGCTTTG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2F077TF 703 0 0
GGGAGAATCGTCGAATCGAGGAAGAGATGGTGTCTGGTTCAGGGATATGCGCGAAGCGTG
TCGTGGTCGACGCGAGGCACCACATGTTGGGCCGTCTTGCTTCAATCATAGCTAAGGAGC
TGCTCAACGGACAGAAGGTTGTTGTGGTCCGATGCGAAGAGATATGTCTGTCAGGTGGAT
TGGTTCGACAGAAAATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAACGCATGAACACTAAACCTT
CTCACGGTCCTATTCACTTCAGGGCTCCCTCTAAGATCTTCTGGCGTACCGTTCGTGGGA
TGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGTGCTGCGGCTCTGGCCCGCTTGAAGGTTTTTGAAG
GAGTGCCACCTCCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTCATTCCTGATGCTCTCAAGGTTT
TGAGGCTCCAAGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGTCGTCTCTCTTCTGAGGTTGGCT
GGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAGAGAAAGGAGAAGTCACAGGCTG
TGTATGAGCGCAAGAAGCAACTCATCAAGCTTAGGATCAAGGCCGAGAAGGTTGCGGAGG
AGAAACTTGGATCCCAGCTTGATGTTCTTGCACCGATCAAGTACTAGAAAACCCGCATCT
ATCTTCTGGTTTAAACATTGCTTTGTTTT*ACCTTTGAATTT
A

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2EI82JQ 699 0 0
CATAGCTAAGGAGCTGCTCAACGGGCAGAAGGTCGTGGTGGTACGATGCGAAGAGATATG
CCTTTCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAAATGAAGTACATGAGGTTTCTCAGGAAACGCAT
GAACACTAAACCTTCTCACGGTCCTATTCACTTCAGGGCTCCCTCTAAGATCTTCTGGCG
TACCGTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGTGCTGCAGCTCTTGCCCGCTT
GAAGGTTTTTGAAGGAGTCCCACCTCCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTCATTCCTGA
TGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAAGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGTCGTCTCTC
TTCTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAGAGAAAGGA
GAAGTCACAGGCTGTGTATGAGCGCAAGAAGCAACTCATCAAGCTTAGGACCAAGGCCGA
GAAGGTTGCGGAGGAGAAACTTGGATCCCAGCTTGATGTTCTTGCACCGATCAAGTACTA
GAAAACCCGCATCTATCTTTTGGTTTAAACATTGCTTTGTTTTTACCTTTGAATTTTATT
TTATTTTTGAATTTGGTAACCTTGTAGACGTAAAGATTGGAAAGAGTACATTTTGGCTTG
TTTTGTTTCCTATGCAGTCAGTCAATCTGTTATGGTTCC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2DE46JQ 536 0 0
TCTAAGATCTTCTGGCGTACCGTTCGTGGGATGATTCCACACAAGACCCAGCGTGGTGCT
GCGGTTCTGGCCCGCTTGAAGGTTTTTGAAGGAGTGCCACCTCCTTACGACAAGGTCAAG
AGAATGGTCATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAAGCTGGTCACAAGTACTGC
TTGTTGGGTCGTCTCTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTT
GAGGTCAAGAGAAAGGAGAAGTCACAGGCTGTGTATGAGCGCAAGAAGCAACTCATCAAG
CTTAGGACCAAGGCCGAGAAGGTTGCGGAGGAGAAACTTGGATCCCAGCTTGATGTTCTT
GCACCGATCAAGTACTAGAAAACCCGCATCTATCTTTTGGTTTAAACATTGCTTTGTTTT
TACCTTTGAATTTTATTTTATTTTTGAATTTGGTAACCTTGTAGACGTAAAGATTGGAAA
GAGTACATTTTGGCTTGTTTTGTTTCCTATGCAGTCAGTCAATCTGTTATGGTTCC

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 5

CO CL1846Contig1 723 5 14 U
GGAAAAAGACGAGAGAAAGAGAAGAAGGTTCTAGGGTTTATTTCTATTAGCAAGAAATGG
CGTCGAGAAATGCTCTAATTCGATACCTTAGAATCAGTGTCACGCCTCCTACTCTCCGAA
GCTCCAGCATCGCTTCTCATCGAGGCGTAGCTCCCTTGTACTTTATTCTTCGTCGTCGTT
TCTCTGAGGAAGTCAGAGGATCGTTCCTCGACAAATCCGAAGTCACAGATCGTGTTGTCT
CTGTTGTCAAAAATTTTCAGAAAGTAGAGCCTTCTAAGGTGACACCAAAGGCACACTTCC
AGAATGATCTAGGGTTGGACAGTTTGGACACAGTGGAGGTTGTTATGGCACTCGAAGAAG
AGTTTGGATTCGAGATACCTGATAACGAAGCAGATAAGATTCAGTCCATCGATCTTGCTG
TTGAGTTTATTGCTTCCCACCCCCAGGCAAAATGAGCCGCCTAGGAAAATCAAACATGTT
TCTTCGCTTGAGCGAGACATTTTCAGTTTCTTTCTTTTTCTCATGTTTGTTAATGCATCT
ATAATTAAGTTGGAGTCTATTGTATGGTAGTAGATCACAATATTGCATATGGAGCTTGTC
TTCGTTATTACTATCAAACAATACTCCATCCATTTCAATGTATAAGATGTTTCTGAATTT
TCTTCATTTTATTTGATGTTTCTATGCAAAAATTTTATATGATTGATACATATGACTAGT
TGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2EZ16JQ C 384
AF RR2BR54TF U 1
AF RR2BR54JQ C 175
AF RR2CD31TF U 6
AF RR2EP33TF U 5
BS 1 77 RR2BR54TF
BS 78 78 RR2EP33TF
BS 79 400 RR2BR54TF
BS 401 401 RR2EP33TF
BS 402 433 RR2BR54TF
BS 434 434 RR2EP33TF
BS 435 487 RR2BR54TF
BS 488 488 RR2EP33TF
BS 489 637 RR2BR54TF
BS 638 638 RR2EP33TF
BS 639 656 RR2BR54TF
BS 657 657 RR2EP33TF
BS 658 687 RR2BR54TF
BS 688 723 RR2EP33TF

RD RR2EZ16JQ 125 0 0
AACGAAGCAGATAAGATTCAGTCCATCGATCTTGCTGTTGAGTTTATTGCTTCCCACCCC
CAGGCAAAATGAGCCGCCTAGGAAAATCAAACATGTTTCTTCGCTTGAGCGAGACATTTT
CAGTT

QA 1 125 1 125
DS 

RD RR2BR54TF 692 0 0
GGAAAAAGACGAGAGAAAGAGAAGAAGGTTCTAGGGTTTATTTCTATTAGCAAGAAATGG
CGTCGAGAAATGCTCTACTTCGATACCTTAGAATCAGTGTCACGCCTCCTACTCTCCGAA
GCTCCAGCATCGCTTCTCATCGAGGCGTAGCTCCCTTGTACTTTATTCTTCGTCGTCGTT
TCTCTGAGGAAGTCAGAGGATCGTTCCTCGACAAATCCGAAGTCACAGATCGTGTTGTCT
CTGTTGTCAAAAATTTTCAGAAAGTAGAGCCTTCTAAGGTGACACCAAAGGCACACTTCC
AGAATGATCTAGGGTTGGACAGTTTGGACACAGTGGAGGTTGTTATGGCACTCGAAGAAG
AGTTTGGATTCGAGATACCTGATAACGAAGCAGATAAGATACAGTCCATCGATCTTGCTG
TTGAGTTTATTGCCTCCCACCCCCAGGCAAAATGAGCCGCCTAGGAAAATCAAACATGTT
TCTTCGCCTGAGCGAGACATTTTCAGTTTCTTTCTTTTTCTCATGTTTGTTAATGCATCT
ATAATTAAGTTGGAGTCTATTGTATGGTAGTAGATCACAATATTGCATATGGAGCTTGTC
TTCGTTATTACTATCAAACAATACTCCATCCATTTCA*TGTATAAGATGTTTCTGA*TTT
TCTTCATTTTATTTGATGTTTCTATGC
AAAAA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2BR54JQ 513 0 0
GTCGTTTCTCTGAGGAAGTCAGAGGATCGTTCCTCGACAAATCCGAAGTCACAGATCGTG
TTGTTTCTGTTGTCAAAAATTTTCAGAAAGTAGAGCCTTTTAAGGTGACACCAAAGGCAC
ACTTCCAGAATGATCTAGGGTTGGACAGTTTGGACACAGTGGAGGTTGTTATGGCACTCG
AAGAAGAGTTTGGATTCGAGATACCTGATAACGAAGCAGATAAGATACAGTCCATCGATC
TTGCTGTTGAGTTTATTGCCTCCCACCCCCAGGCAAAATGAGCCGCCTAGGAAAATCAAA
CATGTTTCTTCGCCTGAGCGAGACATTTTCAGTTTCTTTCTTTTTCTCATGTTTGTTAAT
GCATCTATAATTAAGTTGGAGTCTATTGTATGGTAGTAGATCACAATATTGCATATGGAG
CTTGTCTTCGTTATTACTATCAAACAATACTCCATCCATTTCAATGTATAAGATGTTTCT
GAATTTTCTTCATTTTATTTGATGTT
TCTATGC

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2CD31TF 679 0 0
GG
GACGAGAGAAAGAGAAGAAGGTTCTAGGGTTTATTTCTATTAGCAAGAAATGGCGTCGAG
AAATGCTCTAATTCGATACCTTAGAATCAGTGTCACGCCTCCTACTCTCCGAAGCTCCAG
CATCGCTTCTCATCGAGGCGTAGCTCCCTTGTACTTTATTCTTCGTCGTCGTTTCTCCGA
GGAAGTCAGAGGATCGTTCCTCGACAAATCCGAAGTCACAGATCGTGTTGTCTCTGTTGT
CAAAATTTTTCAGAAAGTAGAGCCTTCTAAGGTGACACCAAAGGCACACTTCCAGAATGA
TCTAGGGTTGGATAGTTTGGACACAGTGGAGGTTGTTATGGCACTCGAAGAAGAGTTTGG
ATTCGAGATACCTGATAACGAAGCAGATAAGATTCAGTCCATCGATCTTGCTGTTGAGTT
TATTGCTTCCCACCCCCAGGCAAAATGAGCCGCCTAGGAAAATCAAACATGTTTCTTCGC
TTGAGCGAGACATTTTCAGTTTCTTTCTTTTTCTCATGTTTGTTAATGCATCTATAATTA
AGTTGGAGTCTATTGTATGGTAGTAGATCACAATATTGCATATGGAGCTTGTCTTCGTTA
TTACTATCAAACAATACTCCATCCATTTCAATGTATAAGATGTTTCTGA*TTTTCTTCAT
TTTATTTGATGTT
CTAT

QA 3 675 3 675
DS 

RD RR2EP33TF 719 0 0
GGA
GACGAGAGAAAGAGAAGAAGGTTCTAGGGTTTATTTCTATTAGCAAGAAATGGCGTCGAG
AAATGCTCTAATTCGATACCTTAGAATCAGTGTCACGCCTCCTACTCTCCGAAGCTCCAG
CATCGCTTCTCATCGAGGCGTAGCTCCCTTGTACTTTATTCTTCGTCGTCGTTTCTCCGA
GGAAGTCAGAGGATCGTTCCTCGACAAATCCGAAGTCACAGATCGTGTTGTCTCTGTTGT
CAAAATTTTTCAGAAAGTAGAGCCTTCTAAGGTGACACCAAAGGCACACTTCCAGAATGA
TCTAGGGTTGGATAGTTTGGACACAGTGGAGGTTGTTATGACACTCGAAGAAGAGTTTGG
ATTCGAGATACCTGATAACGAAGCAGATAAGATTCAGTCCATCGATCTTGCTGTTGAGTT
TATTGCTTCCCACCCCCAGGCAAAATGAGCCGCCTAGGAAAATCAAACATGTTTCTTCGC
TTGAGCGAGACATTTTCAGTTTCTTTCTTTTTCTCATGTTTGTTAATGCATCTATAATTA
AGTTGGAGTCTATTGTATGGTAGTAGATCACAATATTGCATATGGAGCTTGTCTTCGTTA
TTACTATCAAACAATACTCCATCCATTTCAATGTATAAGATGTTTCTGAATTTTCTTCAT
TTTATTTGATGTTTCTATGCAAAAATTTTATATGATTGATACATATGACTAGTTGT

QA 4 719 4 719
DS 



AS 2 5

CO CL1847Contig1 645 2 2 U
GGAGAGAGAGAGAGCTTTTGAGAAAATTGATTCACTTCGACGATCGTCGTGATTAGCTTA
AAATTTGGTCCATCCATCCGTAGTTCGACACCATGCCGAAGAACGAGGGAAAAGGAGGAA
AGAACAGGAAGAGAGGAAAGAACGAAGCTGATGACGAGAAGCGTGAGCTTATCTTTAAAG
AAGATGGCCAAGAGTACGCTCAAGTCCTCCGCATGCTCGGCAATGGCCGATGCGAAGCCA
TGTGCATTGACGGAACCAAACGTCTCTGCCATATCCGTGGTAAGATGCACAAGAAGGTCT
GGATCGCAGCCGGTGACATCGTCCTTGTTGGCCTGAGGGACTACCAAGACGACAAAGCTG
ACGTCATCCTCAAGTACATGTCTGATGAAGCTAGGCTTCTCAAGGCCTATGGTGAGCTTC
CTGAGAATACCCGTCTAAATGAAGGCATTGTTGGTGATCTTGATGAAGATGACGATAATA
ATGTTGATGATTACGTTGAGTTTGAGGACGAGGATATTGATAGGATCTAAGTTTGTTTTG
CTTGGCCTTGTAATATCAAAAGTTGGATGATGCAACATCTTCTGAGAAAACCCAAGATAT
GGTGATATGTTAAAATAAAGAAAATTGTTATGTGTTGTATCAAAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2B342JQ C 1
AF RR2B342TF U 1
BS 1 641 RR2B342TF
BS 642 645 RR2B342JQ

RD RR2B342JQ 645 0 0
GGAGAGAGAGAGAGCTTTTGAGAAAATTGATTCACTTCGACGATCGTCGTGATTAGCTTA
AAATTTGGTCCATCCATCCGTAGTTCGACACCATGCCGAAGAACGAGGGAAAAGGAGGAA
AGAACAGGAAGAGAGGAAAGAACGAAGCTGATGACGAGAAGCGTGAGCTTATCTTTAAAG
AAGATGGCCAAGAGTACGCTCAAGTCCTCCGCATGCTCGGCAATGGCCGATGCGAAGCCA
TGTGCATTGACGGAACCAAACGTTTCTGCCATATCCGTGGTAAGATGCACAAGAAGGTCT
GGATCGCAGCCGGTGACATCGTCCTTGTTGGCCTGAGGGACTACCAAGACGACAAAGCTG
ACGTCATCCTCAAGTACATGTCTGATGAAGCTAGGCTTCTCAAGGCCTATGGTGAGCTTC
CTGAGAATACCCGTCTAAATGAAGGCATTGTTGGTGATCTTGATGAAGATGACGATAATA
ATGTTGATGATTACGTTGAGTTTGAGGACGAGGATATTGATAGGATCTAAGTTTGTTTTG
CTTGGCCTTGTAATATCAAAAGTTGGATGATGCAACATCTTCTGAGAAAACCCAAGATAT
GGTGATATGTTAAAATAAAGAAAATTGTTATGTGTTGTATCAAAC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2B342TF 645 0 0
GGAGAGAGAGAGAGCTTTTGAGAAAATTGATTCACTTCGACGATCGTCGTGATTAGCTTA
AAATTTGGTCCATCCATCCGTAGTTCGACACCATGCCGAAGAACGAGGGAAAAGGAGGAA
AGAACAGGAAGAGAGGAAAGAACGAAGCTGATGACGAGAAGCGTGAGCTTATCTTTAAAG
AAGATGGCCAAGAGTACGCTCAAGTCCTCCGCATGCTCGGCAATGGCCGATGCGAAGCCA
TGTGCATTGACGGAACCAAACGTCTCTGCCATATCCGTGGTAAGATGCACAAGAAGGTCT
GGATCGCAGCCGGTGACATCGTCCTTGTTGGCCTGAGGGACTACCAAGACGACAAAGCTG
ACGTCATCCTCAAGTACATGTCTGATGAAGCTAGGCTTCTCAAGGCCTATGGTGAGCTTC
CTGAGAATACCCGTCTAAATGAAGGCATTGTTGGTGATCTTGATGAAGATGACGATAATA
ATGTTGATGATTACGTTGAGTTTGAGGACGAGGATATTGATAGGATCTAAGTTTGTTTTG
CTTGGCCTTGTAATATCAAAAGTTGGATGATGCAACATCTTCTGAGAAAACCCAAGATAT
GGTGATATGTTAAAATAAAGAAAATTGTTATGTGTTGTATC
AAAC

QA 1 641 1 641
DS 



CO CL1847Contig2 631 3 8 U
GGAAGCATTTGAATTTAAAGATACAGACACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAAGGAGGAAA
GAACAGGAAGAGAGGAAAGAACGAAGCTGATGACGAGAAGCGTGAGCTTATCTTCAAAGA
AGATGGCCAAGAGTACGCTCAAGTCCTCCGCATGCTCGGCAATGGCCGATGCGAAGCCGT
GTGCATTGACGGCACCAAACGTCTCTGCCATATCCGTGGTAAGATGCACAAGAAGGTCTG
GATCGCAGCCGGTGACATCGTCCTTGTTGGCCTGAGGGACTACCAAGATGACAAAGCTGA
CGTCATCCTCAAGTACATGTCTGATGAAGCCAGGCTTCTCAAAGCCTATGGTGAGCTTCC
TGAGAATACCCGTCTTAATGAAGGCATTGTTGGTGATCTTGATGAAGATGACGATAATAA
TGTTGATGATTACGTTGAGTTTGAGGACGAGGATATTGATAGGATCTAAGTTTGTTTTGC
TTGGCCTTGTAATATCAAAAGTTGGATGATGCAACATCTTCTGAGAAAACCCAAGATATG
GTGATATGTTAAAATAAAGAAAATTGTTATGTGTTGTATCTCTATTACTGTCATTTGATT
CCCCCAAATAATTTACAGAATGTTCTTTATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW85JQ C 20
AF RR2C585TF U 1
AF RR2GW85TF U 1
BS 1 169 RR2C585TF
BS 170 170 RR2GW85TF
BS 171 178 RR2C585TF
BS 179 179 RR2GW85TF
BS 180 234 RR2C585TF
BS 235 235 RR2GW85TF
BS 236 576 RR2C585TF
BS 577 631 RR2GW85TF

RD RR2GW85JQ 481 0 0
GATACA
GACACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAAGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGAAAGAACGAA
GCTGATGACGAGAAGCGTGAGCTTATCTTCAAAGAAGATGGCCAAGAGTACGCTCAAGTC
CTCCGCATGCTCGGCAATGGCCGATGCGAAGCCGTGTGCATTGACGGCACCAAACGTTTC
TGCCATATCCGTGGTAAGATGCACAAGAAGGTCTGGATCGCAGCCGGTGACATCGTCCTT
GTTGGCCTGAGGGACTACCAAGATGACAAAGCTGACGTCATCCTCAAGTACATGTCTGAT
GAAGCCAGGCTTCTCAAAGCCTATGGTGAGCTTCCTGAGAATACCCGTCTTAATGAAGGC
ATTGTTGGTGATCTTGATGAAGATGACGATAATAATGTTGATGATTACGTTGAGTTTGAG
GACGAGGATATTGATAGGATCTAAGTTTGTTTTGCTTGGCCTTGTAATATCAAAA

QA 7 481 7 481
DS 

RD RR2C585TF 576 0 0
GGAAGCATTTGAATTTAAAGATACAGACACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAAGGAGGAAA
GAACAGGAAGAGAGGAAAGAACGAAGCTGATGACGAGAAGCGTGAGCTTATCTTCAAAGA
AGATGGCCAAGAGTACGCTCAAGTCCTCCGCATGCTCGGCAATGGCCGACGCGAAGCCAT
GTGCATTGACGGCACCAAACGTCTCTGCCATATCCGTGGTAAGATGCACAAGAATGTCTG
GATCGCAGCCGGTGACATCGTCCTTGTTGGCCTGAGGGACTACCAAGATGACAAAGCTGA
CGTCATCCTCAAGTACATGTCTGATGAAGCCAGGCTTCTCAAAGCCTATGGTGAGCTTCC
TGAGAATACCCGTCTTAATGAAGGCATTGTTGGTGATCTTGATGAAGATGACGATAATAA
TGTTGATGATTACGTTGAGTTTGAGGACGAGGATATTGATAGGATCTAAGTTTGTTTTGC
TTGGCCTTGTAATATCAAAAGTTGGATGATGCAACATCTTCTGAGAAAACCCAAGATATG
GTGATATGTTAAAATAAAGAAAATTGTTATGTGTTG

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2GW85TF 631 0 0
GGAAGCATTTGAATTTAAAGATACAGACACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAAGGAGGAAA
GAACAGGAAGAGAGGAAAGAACGAAGCTGATGACGAGAAGCGTGAGCTTATCTTCAAAGA
AGATGGCCAAGAGTACGCTCAAGTCCTCCGCATGCTCGGCAATGGCCGATGCGAAGCCGT
GTGCATTGACGGCACCAAACGTCTCTGCCATATCCGTGGTAAGATGCACAAGAAGGTCTG
GATCGCAGCCGGTGACATCGTCCTTGTTGGCCTGAGGGACTACCAAGATGACAAAGCTGA
CGTCATCCTCAAGTACATGTCTGATGAAGCCAGGCTTCTCAAAGCCTATGGTGAGCTTCC
TGAGAATACCCGTCTTAATGAAGGCATTGTTGGTGATCTTGATGAAGATGACGATAATAA
TGTTGATGATTACGTTGAGTTTGAGGACGAGGATATTGATAGGATCTAAGTTTGTTTTGC
TTGGCCTTGTAATATCAAAAGTTGGATGATGCAACATCTTCTGAGAAAACCCAAGATATG
GTGATATGTTAAAATAAAGAAAATTGTTATGTGTTGTATCTCTATTACTGTCATTTGATT
CCCCCAAATAATTTACAGAATGTTCTTTATT

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 5

CO CL1848Contig1 1455 5 18 U
GCTCTTCAATCACATTTGTAAACACAAAAAATTGCACCACACTGTTTAGGTCATTGTTTT
CCAACAAAATACATAGCCAAAATCAGGTCTTACTTCCCTACATTCCCTGTCTGAAATCAC
AAAAACCCAACGGAAAGAAACCAAAAAGAGTACAGAGATAATATGATTCGTAAAGCCACA
AATAGTAACAATGGCTCTCTCCAGACTGATTCATCGTAGAAGAATACCATCATCATCATC
ATC***TCATCTTCACCCCCAAGAATCCATTATAGCTATCCATGAGGCTTCTTATATGTA
CATCAATTCTTTGTT*GCTTCGTTTCCGGTTTACTCTTCTTTCCAGATTCGACCGGTCAC
CCTCAACTTGAGTTCTTGCCTATCACCTCCAGAGAAGTATAGTGCGAGGTTTCTAGGAAT
GATGAGACCGTCTTGACTGTCCCTAACTTTCCTGTGACTGTCACGGATGCTTCTAGGGAT
CCCTTGCCATGTTAGTTTACGTCCATGAGCTCCCACTTCCAAGCTGTAACTGAACTTCTT
TGCCTCGTTTTCATCTCCCATGAAACGAAGAAACGCCATGTAAACTGGAGCCATCCCCAG
CTGGAACACCTCAAAGTGTAAACAGAACTGTCTCCCGAAACAGTTGAACACCGTAAGCAT
CCATGTAGCATTCTCAACTTCATGTGGG*TTTGATTTCACATAACGGTGGTTGAAAGTGC
ACCCGTCATGCATATCGACTTTATGATCATCTTTGAGATGAACAACAAGCGTGGGGATGT
CACCTGTAACCGAACACTCAGAGCCAGCATAAGGGCAAGCGTAAGGCCTAAACCTGCAGT
GCTGCTCGTGCTTAAGCTTGCTGTAGTAAGGGAAAATGTCATGGCACCCCAAACTTTGGT
ACCGGCATGGAACTTCCAAGGACTCTGCAACTTTCTCAAGAGCTAAGCATCTTATGTTAC
CAAGCTCGTAGCGACATGTAGGGCAAGTGTTCTGCACTCTTGCTTTGCAGTTTGAACATA
AAGTGTGGCCATTTGGACACCGATGAATTGGAGGGTACATTAGATTAGTACAGACTGGAC
ACTCAAGAAGCTCGTAGACACCATTGTTTGAATGCATCCCATATTTTCCAACTCCTGCGC
TCCCTGACTTTGTAGGTTTGTTGTTAGTATTATTATTAACTTCGGCTTTCGCCATTTTAA
CCTCGTAATCCATCCCTGTTGAAGTAGATTCAAGGACTTCTTTCAAAGCACTGCCTCCAG
GAGCCATAGTGAGTCAAATGAGATGCCTTTGTATCTAACTTGTAGTAAGATGATTTGCTC
TTTTTGGATTTATTTTGTTATTCTGGAAACAAAAGTTTAGAGTTGGTGTTTATTTGTGTT
TTGTTTGATTCAGATTCAAATCTAAGACAAGAAATCGATGGGTTTTTAGAGGAAAACGAA
ATATTTGAGGATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 10 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA15JQ U 1
AF RR2GA65JQ U 20
AF RR2G480JQ U 18
AF RR2GA65TF C 487
AF RR2G480TF C 836
BS 1 240 RR2AA15JQ
BS 241 243 RR2G480JQ
BS 244 607 RR2AA15JQ
BS 608 608 RR2GA65JQ
BS 609 736 RR2AA15JQ
BS 737 737 RR2GA65JQ
BS 738 789 RR2AA15JQ
BS 790 790 RR2G480JQ
BS 791 805 RR2AA15JQ
BS 806 806 RR2G480JQ
BS 807 820 RR2AA15JQ
BS 821 825 RR2G480JQ
BS 826 826 RR2GA65TF
BS 827 871 RR2G480JQ
BS 872 873 RR2GA65TF
BS 874 890 RR2G480JQ
BS 891 1214 RR2GA65TF
BS 1215 1455 RR2G480TF

RD RR2AA15JQ 820 0 0
GCTCTTCAATCACATTTGTAAACACAAAAAATTGCACCACACTGTTTAGGTCATTGTTTT
CCAACAAAATACATAGCCAAAATCAGGTCTTACTTCCCTACATTCCCTGTCTGAAATCAC
AAAAACCCAACGGAAAGAAACCAAAAAGAGTACAGAGATAATATGATTCGTAAAGCCACA
AATAGTAACAATGGCTCTCTCCAGACTGATTCATCGTAGAAGAATACCATCATCATCATC
******TCATCTTCACCCCCAAGAATCCATTATAGCTATCCATGAGGCTTCTTATATGTA
CATCAATTCTTTGTT*GCTTCGTTTCCGGTTTACTCTTCTTTCCAGATTCGACCGGTCAC
CCTCAACTTGAGTTCTTGCCTATCACCTCCAGAGAAGTATAGTGCGAGGTTTCTAGGAAT
GATGAGACCGTCTTGACTGTCCCTAACTTTCCTGTGACTGTCACGGATGCTTCTAGGGAT
CCCTTGCCATGTTAGTTTACGTCCATGAGCTCCCACTTCCAAGCTGTAACTGAACTTCTT
TGCCTCGTTTTCATCTCCCATGAAACGAAGAAACGCCATGTAAACTGGAGCCATCCCCAG
CTGGAACGCCTCAAAGTGTAAACAGAACTGTCTCCCGAAACAGTTGAACACCGTAAGCAT
CCATGTAGCATTCTCAACTTCATGTGGG*TTTGATTTCACATAACGGTGGTTGAAAGTGC
ACCCGTCATGCATATCAACTTTATGATCATCTTTGAGATGAACAACAAGCGTGGGGATGT
CACCTGTAAACGAACACTCAGAGCCGGCATAAGGGCAAGC

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR2GA65JQ 764 0 0
AAACACAAAAAAGTGCACCACACTGTTTAGGTCATTGTTTTCCAACAAAGTACATAGCCA
AAATCAGGTCTTACTTCCCTACATTCCCTGTCTGAAATCACAAAAACCCAACGGAAAGAA
ACCAAAAAGAGTACAGAGATAATATGATTAGTAAAGCCACAAATAGTAACAATGGCTCTC
TCCAGACTGATTCATCGTAAAAGAATACCATCATCATCATCATCAACTCATCTTCACCCC
CAAGAATCCATTATAGCTATCCATGAGGCTTCTTAT**GTACATCAATTCTTTGTTTGCT
TCGTT*CCGGTTTACTCTTCTTTCCAGATTCGACCGGTCACCCTCAACTTGAGTTCTTGC
CTGTCACCTCCAGAAAAGTAAAGTGCAAGGTTTCTAGGGATGATGAGACCATCTTGACTG
TCCCTGACTTTCCTGTGACTGTCACGGATGCTTCTAGGGATCCCTTGCCATGTTAGTTTA
CGTCCATGAGCTCCCACTTCCAAGCTGTAACTGAACTTCTTTGCCTCGTTTTCATCTCCC
ATGAAACGAAGAAACGCCATGTAAACTGGAGCCATCCCCAGCTGGAACACCTCAAAGTGT
AAACAGAACTGTCTCCCGAAACAGTTGAACACCGTAAGCATCCATGTAGCATTCTCAACT
TCATGTGGGGTTTGATTTCACATAACGGTGGTTGAAAGTGCACCCGTCATGCATATCGAC
TTTATGATCATCTTTGAGATGAACAACAAGCGTGGGGATGTCAC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2G480JQ 873 0 0
GT
AAACACAAAAAATTGCACCACACTGTTTAGGTCATTGTTTTCCAACAAAATACATAGCCA
AAATCAGGTCTTACTTCCCTACATTCCCTGTCTGAAATCACAAAAACCCAACGGAAGGAA
ACCAAAAAGAGTACAGAGATAATATGATTCGTAAAGCCACAAATAGTAACAATGGCTCTC
TCCAGACTGATTCATCGTAGAAGAATACCATCATCATCATCATC***TCATCTTCACCCC
CAAGAATCCATTATAGCTATCCATGAGGCTTCTTATATGTACATCAATTCTTTGTT*GCT
TCGTTTCCGGTTTACTCTTCTTTCCAGATTCGACCGGTCACCCTCAACTTGAGTTCTTGC
CTATCACCTCCAGAGAAGTATAGTGCGAGGTTTCTAGGAATGATGAGACCGTCTTGACTG
TCCCTAACTTTCCTGTGACTGTCACGGATGCTTCTAGGGATCCCTTGCCATGTTAGTTTA
CGTCCATGAGCTCCCACTTCCAAGCTGTAACTGAACTTCTTTGCCTCGTTTTCATCTCCC
ATGAAACGAAGAAACGCCATGTAAACTGGAGCCATCCCCAGCTGGAACGCCTCAAAGTGT
AAACAGAACTGTCTCCCGAAACAGTTGAACACCGTAAGCATCCATGTAGCATTCTCAACT
TCATGTGGG*TTTGATTTCACATAACGGTGGTTGAAAGTGCATCCGTCATGCATATCAAC
TTTATGATCATCTTTGAGATGAACAACAAGCGAGGGGATGTCACCTGTAACCGAACACTC
AGAGCCAGCATAAGGGCAAGCGTAAG*CCTAAACCTGCAGTGCTGCTCGTGCTTAAGCTT
GCTGTAGTAAGG**AAATGTCATGGCACCCC

QA 3 873 3 873
DS 

RD RR2GA65TF 728 0 0
CCATGTTAGTTTACGTCCATGAGCTCCCACTTCCAAGCTGTAACTGAACTTCTTTGCCTC
GTTT*CATCTCCCATGAAACGAAGAAACGCCATGTAAACTGGAGCCATCCCCAGCTGGAA
CAC*TCAAAGTGTAAACAGAACTGTCTCCCGAAACAGTTGAACACTGTAAGCATCCATGT
AGCATTCTCAACTTCATGTGGG*TTTGATTTCACATAACGGTGGTTGAAAGTGCACCCGT
CATGCATATCGACTTTATGATCATCTTTGAGATGAACAACAAGCGTGGGGATGTCACCTG
TAACAGAACACTCGGAGCCAGCATAAGGGCAAGCGTAAGGCCTAAACCTGCAGTGCTGCT
CGTGCTTAAGCTTGCTGTAGTAAGGGAAAATGTCATGGCACCCCAAACTTTGGTACCGGC
ATGGAACTTCCAAGGACTCTGCAACTTTCTCAAGAGCTAAGCATCTTATGTTACCAAGCT
CGTAGCGACATGTAGGGCAAGTGTTCTGCACTCTTGCTTTGCAGTTTGAACATAAAGTGT
GGCCATTTGGACACCGATGAATTGGAGGGTACATTAGATTAGTACAGACTGGACACTCAA
GAAGCTCGTAGACACCATTGTTTGAATGCATCCCATATTTTCCAACTCCTGCGCTCCCTG
ACTTTGTAGGTTTGTTGTTAGTATTATTATTAACTTCGGCTTTCGCCATTTTAACCTCGT
AATCCATC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2G480TF 620 0 0
GCAGTGCTGCTCGTGCTTAAGCTTGCTGTAGTAAGGGAAAATGTCATGGCACCCCAAACT
TTGGTAGCGGCATGGAACTTCCAAGGACTCTGCAACTTTCTCGAGAGCTAAGCATCTTAT
GTTACCAAGCTCGTAGCGACATGTAGGGCAAGTGTTCTGCACTCTTGCTTTGCGGTTTGA
ACATAAAGTGTGGCCATTTGGACACTGATGAATTGGAGGGTACATTAGATTAGTACAGAC
TGGACACTCAAGAAGCTCGTAGACACCATTGTTTGAATGCATCCCATATTTTCCAACTCC
TGCGCTCCCTGACTTTGTAGGTTTGTTGTTAGTATTATTATTAACTTCGGCTTTCGCCAT
TTTAACCTCGTAATCCATCCCTGTTGAAGTAGATTCAAGGACTTCTTTCAAAGCACTGCC
TCCAGGAGCCATAGTGAGTCAAATGAGATGCCTTTGTATCTAACTTGTAGTAAGATGATT
TGCTCTTTTTGGATTTATTTTGTTATTCTGGAAACAAAAGTTTAGAGTTGGTGTTTATTT
GTGTTTTGTTTGATTCAGATTCAAATCTAAGACAAGAAATCGATGGGTTTTTAGAGGAAA
ACGAAATATTTGAGGATTAC

QA 1 620 1 620
DS 



AS 2 5

CO CL1849Contig1 790 3 1 U
GACAATTAGAAACGTTCAAATAAAAGTTCTATAGTGCAAAAATCTTCATACAAAAAAAAA
AAA*TCAAACAAATCAAAACCGTTCTGCTAATCTAGCAGAGGCTGCTCGGAGCTTGGAGT
AAACCTTGCCAGCTGGAGAACCCATGATGAGACTACACAAAGAATCCCTCGCGATTTTAA
TGTTAGAGAATGCTCCCAAGATGTGGATCCTCGTGTCAGCGATCACGATCCTTGTCCTTG
TAGAATTCTCAATCGCAAACTTGGTCTTCCCTCCTTTCCCCGACAATCTCCCTATAGCTC
TGGACAGATGCTCCCCTTTAAGAGTCTTGACATCCTTGATCTCAAAAGACTCAACGTAGA
GCTCGTCCATCCTCAGGAGGGAGATGGCATCAGGGACATCGAAACCGAGTATGAAAGCGT
GCACGAAATCAGCAGATTTTTGAAGGTTACTGACGTCGGGGGTGTCGGCTATGGTTTTGA
GCTCGACTCTGCGGGAGTTGTGGTTCATGCGGATGTCAACTTTCATCTGGTCGCAGACGG
TAGTGCTGATGTCTAACCAAGCTTTCTTGAGAGGAGAGTAGCGGTTTGGTGGGACGGATA
CCTTCCTGAGCTGGACCTTGCCATCAGACATTTCGTGAGCCTTGAGGGGCTTAAAGATTG
GCTTAGCAGGAAGTGTCTCCGGTTCAGTTGCTGATTGAATTTCCATATCAGTTGATTCTT
CTCGATTGCTAGAGGATGTCGCCGGCAAAGGAAGAAGAAACTAGGAGAAAGATAGACTTG
TAACTCGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EM87JQ U 1
AF RR2A906JQ U 1
AF RR2A906TF C 25
BS 1 790 RR2A906JQ

RD RR2EM87JQ 664 0 0
GACAATTAGAAACGTTCAAATAAAAGTTCTATAATGCAAAA*TCTTCATACAAAAAAAAA
AA**TCAAACAAATCAAAACCGTTCTGCTAATCTAGCAGAGGCTGCTCGGAGCTTGGAGT
AAACCTTGCCAGCTGGAGAACCCATGATGAGACTACACAAAGAATCCCTCGCGATTTTAA
TGTTAGAGAATGCTCCCAAGATGTGGATACTCGTGTCAGCGATCACGATCCTTGTCCTTG
TAGAATTCTCAATCGCAAACTTGGTCTTCCCTCCTTTCCCCGACAATCTCCCTATAGCTC
TGGACAGATGCTCCCCTTTAAGAGTCTTGACATCCTTGATCTCAAAAGACTCAACGTAGA
GCTCGTCCATCCTCAGGAGGGAGATGGCATCGGGGACATCGAAACCGAGTATGAAAGCGT
GCACGAAATCAGCAGATTTTTGAAGGTTACTGACGTCGGGGGTGTCAGCTATGGTTTTGA
GCTCGACTCTGCGGGAGTTGTGGTTCATGCGGATGTCAACTTTCATCTGGTCGCAGACGG
TAGTGCTGATGTCTAACCAAGCTTTCTTGAGAGGAGAGTAGCGGTTTGGTGGGACGGATA
CCTTCCTGAGCAGGACCTTGCCATCAGACATTTCGTGAGCCTTGAGGGGCTTAAAGATTG
GCTT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2A906JQ 790 0 0
GACAATTAGAAACGTTCAAATAAAAGTTCTATAGTGCAAAAATCTTCATACAAAAAAAAA
AAA*TCAAACAAATCAAAACCGTTCTGCTAATCTAGCAGAGGCTGCTCGGAGCTTGGAGT
AAACCTTGCCAGCTGGAGAACCCATGATGAGACTACACAAAGAATCCCTCGCGATTTTAA
TGTTAGAGAATGCTCCCAAGATGTGGATCCTCGTGTCAGCGATCACGATCCTTGTCCTTG
TAGAATTCTCAATCGCAAACTTGGTCTTCCCTCCTTTCCCCGACAATCTCCCTATAGCTC
TGGACAGATGCTCCCCTTTAAGAGTCTTGACATCCTTGATCTCAAAAGACTCAACGTAGA
GCTCGTCCATCCTCAGGAGGGAGATGGCATCAGGGACATCGAAACCGAGTATGAAAGCGT
GCACGAAATCAGCAGATTTTTGAAGGTTACTGACGTCGGGGGTGTCGGCTATGGTTTTGA
GCTCGACTCTGCGGGAGTTGTGGTTCATGCGGATGTCAACTTTCATCTGGTCGCAGACGG
TAGTGCTGATGTCTAACCAAGCTTTCTTGAGAGGAGAGTAGCGGTTTGGTGGGACGGATA
CCTTCCTGAGCTGGACCTTGCCATCAGACATTTCGTGAGCCTTGAGGGGCTTAAAGATTG
GCTTAGCAGGAAGTGTCTCCGGTTCAGTTGCTGATTGAATTTCCATATCAGTTGATTCTT
CTCGATTGCTAGAGGATGTCGCCGGCAAAGGAAGAAGAAACTAGGAGAAAGATAGACTTG
TAACTCGTCC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2A906TF 766 0 0
AGTTCTATAGTGCAAAAATCTTCATACAAAAAAAAAAAAATCAAACAAATCAAAACCGTT
CTGCTAATCTAGCAGAGGCTGCTCGGAGCTTGGAGTAAACCTTGCCAGCTGGAGAACCCA
TGATGAGACTACACAAAGAATCCCTCGCGATTTTAATGTTAGAGAATGCTCCCAAGATGT
GGATCCTCGTGTCAGCGATCACGATCCTTGTCCTTGTAGAATTCTCAATCGCAAACTTGG
TCTTCCCTCCTTTCCCCGACAATCTCCCTATAGCTCTGGACAGATGCTCCCCTTTAAGAG
TCTTGACATCCTTGATCTCAAAAGACTCAACGTAGAGCTCGTCCATCCTCAGGAGGGAGA
TGGCATCAGGGACATCGAAACCGAGTATGAAAGCGTGCACGAAATCAGCAGATTTTTGAA
GGTTACTGACGTCGGGGGTGTCGGCTATGGTTTTGAGCTCGACTCTGCGGGAGTTGTGGT
TCATGCGGATGTCAACTTTCATCTGGTCGCAGACGGTAGTGCTGATGTCTAACCAAGCTT
TCTTGAGAGGAGAGTAGCGGTTTGGTGGGACGGATACCTTCCTGAGCTGGACCTTGCCAT
CAGACATTTCGTGAGCCTTGAGGGGCTTAAAGATTGGCTTAGCAGGAAGTGTCTCCGGTT
CAGTTGCTGATTGAATTTCCATATCAGTTGATTCTTCTCGATTGCTAGAGGATGTCGCCG
GCAAAGGAAGAAGAAACTAGGAGAAAGATAGACTTGTAACTCGTCC

QA 1 766 1 766
DS 



CO CL1849Contig2 732 2 6 U
GGGGAACACGAACATTCACGAGTTACAAGTCCATCTTTCTCCTAGTTTCTTCTTCCTTTG
CCGGCGACATCCTCTAGCAATCGAGGTTTGAAAAAAATATAATCGTGTTAAAAAATGGCA
GAAGAATCAACTGATATGGAAATTCAATCAGCAACTGAACCGGAGACACTTCCTGCTAAG
CCAATCTTTAAGCCCCTCAAGGCTCACGAAATGTCTGATGGCAAGGTCCAGCTCAGGAAG
GTATCCGTCCCACCAAACCGCTACTCTCCTCTCAAGAAAGCTTGGTTAGACATCAGCACT
ACCGTCTGCGACCAGATGAAAGTTGACATCCGCATGAACCACAACTCCCGCAGAGTCGAG
CTCAAAACCATAGCCGACACCCCCGACGTCAGTAACCTTCAAAAATCTGCTGATTTCGTG
CACGCTTTCATACTCGGTTTCGATGTCCCCGATGCCATCTCCCTCCTGAGGATGGACGAG
CTCTACGTTGAGTCTTTTGAGATCAAGGATGTCAAGACTCTTAAAGGGGAGCATCTGTCC
AGAGCTATAGGGAGATTGTCGGGGAAAGGAGGGAAGACCAAGTTTGCGATTGAGAATTCT
ACAAGGACAAGGATCGTGATCGCTGACACGAGTATCCACATCTTGGGAGCATTCTCTAAC
ATTAAAATCGCGAGGGATTCTTTGTGTAGTCTCATCATGGGTTCTCCAGCTGGCAAGGTT
TACTCCAAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED80TF U 1
AF RR2EM87TF U 6
BS 1 31 RR2ED80TF
BS 32 32 RR2EM87TF
BS 33 449 RR2ED80TF
BS 450 450 RR2EM87TF
BS 451 605 RR2ED80TF
BS 606 732 RR2EM87TF

RD RR2ED80TF 610 0 0
GGGGAACACGAACATTCACGAGTTACAAGTCTATCTTTCTCCTAGTTTCTTCTTCCTTTG
CCGGCGACATCCTCTAGCAATCGAGGTTTGAAAAAAATATAATCGTGTTAAAAAATGGCA
GAAGAATCAACTGATATGGAAATTCAATCAGCAACTGAACCGGAGACACTTCCTGCTAAG
CCAATCTTTAAGCCCCTCAAGGCTCACGAAATGTCTGATGGCAAGGTCCAGCTCAGGAAG
GTATCCGTCCCACCAAACCGCTACTCTCCTCTCAAGAAAGCTTGGTTAGACATCAGCACT
ACCGTCTGCGACCAGATGAAAGTTGACATCCGCATGAACCACAACTCCCGCAGAGTCGAG
CTCAAAACCATAGCCGACACCCCCGACGTCAGTAACCTTCAAAAATCTGCTGATTTCGTG
CACGCTTTCATACTCGGTTTCGATGTCCCTGATGCCATCTCCCTCCTGAGGATGGACGAG
CTCTACGTTGAGTCTTTTGAGATCAAGGATGTCAAGACTCTTAAAGGGGAGCATCTGTCC
AGAGCTATAGGGAGATTGTCGGGGAAAGGAGGGAAGACCAAGTTTGCGATTGAGAATTCT
ACAAG
ACAAG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2EM87TF 727 0 0
GG
ACGAACATTCACGAGTTACAAGTCCATCTTTCTCCTAGTTTCTTCTTCCTTTGCCGGCGA
CATCCTCTAGCAATCGAGGTTTGAAAAAAATATAATCGTGTTAAAAAATGGCAGAAGAAT
CAACTGATATGGAAATTCAATCAGCAACTGAACCGGAGACACTTCCTGCTAAGCCAATCT
TTAAGCCCCTCAAGGCTCACGAAATGTCTGATGGCAAGGTCCTGCTCAGGAAGGTATCCG
TCCCACCAAACCGCTACTCTCCTCTCAAGAAAGCTTGGTTAGACATCAGCACTACCGTCT
GCGACCAGATGAAAGTTGACATCCGCATGAACCACAACTCCCGCAGAGTCGAGCTCAAAA
CCATAGCTGACACCCCCGACGTCAGTAACCTTCAAAAATCTGCTGATTTCGTGCACGCTT
TCATACTCGGTTTCGATGTCCCCGATGCCATCTCCCTCCTGAGGATGGACGAGCTCTACG
TTGAGTCTTTTGAGATCAAGGATGTCAAGACTCTTAAAGGGGAGCATCTGTCCAGAGCTA
TAGGGAGATTGTCGGGGAAAGGAGGGAAGACCAAGTTTGCGATTGAGAATTCTACAAGGA
CAAGGATCGTGATCGCTGACACGAGTATCCACATCTTGGGAGCATTCTCTAACATTAAAA
TCGCGAGGGATTCTTTGTGTAGTCTCATCATGGGTTCTCCAGCTGGCAAGGTTTACTCCA
AGCTC

QA 3 727 3 727
DS 



AS 1 3

CO CL1850Contig1 969 3 11 U
GGACACGAGCTAAGTTCTTTAATGATGCAAAAAGCACTCAAAAGGGTTTTGAGAAGAGAC
AAAGGAGGGTACACACCACACCACTCTCTACACAAAAGAAGTAGCCAACACTCTCTCTCT
TGTGTTCTCTCCACTTTCTCTTCTTCTTGCTCTCTAGAGATCTCTCTATCTCTATCTCCA
CACTGTAACATTTTCTCTGAACGCATCTATGGCTGCTCTGGTTCTCTCACTTCTCCTTCT
AGTTCTAGCCATGGCTGACCATTCCAGTGCCTCATGGTGTGTGTGCAAAGGCCTGAGTGA
TGATGTGTTACAGAAGACCATAGACTATGCTTGTGGAAATGGAGCAGGCTGTAACCCCAT
TCACCCAAAAGCACCTTGCTTTAACCCTGACAATGTTAGGTCTCATTGCAACTATGCAGT
CAACAGCTTCTTCCAAAAGAAGCGTCAAGCTTCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGC
CACTCCTACTAACTCCGATCCAAGTTATTCAGGATGTACCTTTCCTACTAGTGCCAGCGG
CTCTGGAGGCAGCACTACTGTGACACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCAGCTCAACAAG
CACCACACTTCCTGGTGGCAACAGTCCTTATTCAGGAACCTCAACCAATGGGGTTTTTGG
GAACAATAGCACAGGAGCCAACGGGACAGGGGTTAACCCGGACTACACGACAGAAAGCAG
CGCGTTTGTTCTCAAGAACTCAAGCAAACTGCTCACCTTCCTTGTCTTGATCGCCTCGAG
TGGATTCTGTTCTTTCTTGATACTCTAAGGATGTTCATGTTCCCCTGGTTTTGTTGTTGC
AACTTATTGTATTAAAGACATTGGTCTAGCTTTAGATGGTAATCTATCTGTCTGTGTGTT
CTGAGTCTCTCTCTCTCTATGTTATGTTCTTGTTGTAAGAAGATTTCAGCTCTTGCTTGT
ACTCTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2CJ45TF U 1
AF RR2FS16TF U 178
AF RR2FS16JQ C 241
BS 1 186 RR2CJ45TF
BS 187 187 RR2FS16TF
BS 188 264 RR2CJ45TF
BS 265 265 RR2FS16TF
BS 266 347 RR2CJ45TF
BS 348 348 RR2FS16TF
BS 349 486 RR2CJ45TF
BS 487 487 RR2FS16TF
BS 488 631 RR2CJ45TF
BS 632 967 RR2FS16TF
BS 968 969 RR2FS16JQ

RD RR2CJ45TF 631 0 0
GGACACGAGCTAAGTTCTTTAATGATGCAAAAAGCACTCAAAAGGGTTTTGAGAAGAGAC
AAAGGAGGGTACACACCACACCACTCTCTACACAAAAGAAGTAGCCAACACTCTCTCTCT
TGTGTTCTCTCCACTTTCTCTTCTTCTTGCTCTCTAGAGATCTCTCTATCTCTATCTCCA
CACTGTGACATTTTCTCTGAACGCATCTATGGCTGCTCTGGTTCTCTCACTTCTCCTTCT
AGTTCTAGCCATGGCTGACCATTCTAGTGCCTCATGGTGTGTGTGCAAAGGCCTGAGTGA
TGATGTGTTACAGAAGACCATAGACTATGCTTGTGGAAATGGAGCAGACTGTAACCCCAT
TCACCCAAAAGCACCTTGCTTTAACCCTGACAATGTTAGGTCTCATTGCAACTATGCAGT
CAACAGCTTCTTCCAAAAGAAGCGTCAAGCTTCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGC
CACTCCAACTAACTCCGATCCAAGTTATTCAGGATGTACCTTTCCTACTAGTGCCAGCGG
CTCTGGAGGCAGCACTACTGTGACACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCAGCTCAACAAG
CACCACACTTCCTGGTGGCAACAGTCCTTAT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2FS16TF 790 0 0
GG
ACACTGTAACATTTTCTCTGAACGCATCTATGGCTGCTCTGTTTCTCTCACTTCTCCTTC
TAGTTCTAGCCATGGCTGACCATTCCAGTGCCTCATGGTGTGTGTGCAAAGGCCTGAGTG
ATGATGTGTTACAGAAGACCATAGACTATGCTTGTGGAAATGGAGCAGGCTGTAACCCCA
TTCACCCAAAAGCACCTTGCTTTAACCCTGACAATGTTAGGTCTCATTGCAACTATGCAG
TCAACAGCTTCTTCCAAAAGAAGCGTCAAGCTTCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTG
CCACTCCTACTAACTCCGATCCAAGTTATTCAGGATGTACCTTTCCTACTAGTGCCAGCG
GCTCTGGAGGCAGCACTACTGTGACACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCAGCTCAACAA
GCACCACACTTCCTGGTGGCAACAGTCCTTATTCAGGAACCTCAACCAATGGGGTTTTTG
GGAACAATAGCACAGGAGCCAACGGGACAGGGGTTAACCCGGACTACACGACAGAAAGCA
GCGCGTTTGTTCTCAAGAACTCAAGCAAACTGCTCACCTTCCTTGTCTTGATCGCCTCGA
GTGGATTCTGTTCTTTCTTGATACTCTAAGGATGTTCATGTTCCCCTGGTTTTGTTGTTG
CAACTTATTGTATTAAAGACATTGGTCTAGCTTTAGATGGTAATCTATCTGTCTGTGTGT
TCTGAGTCTCTCTCTCTCTATGTTATGTTCTTGTTGTAAGAAGATTTCAGCTCTTGCTTG
TACTCTTA

QA 3 790 3 790
DS 

RD RR2FS16JQ 729 0 0
AGTTCTAGCCATGGCTGACCATTCCAGTGCCTCATGGTGTGTGTGCAAAGGCCTGAGTGA
TGATGTGTTACAGAAGACCATAGACTATGCTTGTGGAAATGGAGCAGGCTGTAACCCCAT
TCACCCAAAAGCACCTTGCTTTAACCCTGACAATGTTAGGTCTCATTGCAACTATGCAGT
CAACAGCTTCTTCCAAAAGAAGCGTCAAGCTTCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGC
CACTCCTACTAACTCCGATCCAAGTTATTCAGGATGTACCTTTCCTACTAGTGCCAGCGG
CTCTGGAGGCAGCACTACTGTGACACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCAGCTCAACAAG
CACCACACTTCCTGGTGGCAACAGTCCTTATTCAGGAACCTCAACCAATGGGGTTTTTGG
GAACAATAGCACAGGAGCCAACGGGACAGGGGTTAACCCGGACTACACGACAGAAAGCAG
CGCGTTTGTTCTCAAGAACTCAAGCAAACTGCTCACCTTCCTTGTCTTGATCGCCTCGAG
TGGATTTTGTTCTTTCTTGATACTCTAAGGATGTTCATGTTCCCCTGGTTTTGTTGTTGC
AACTTATTGTATTAAAGACATTGGTCTAGCTTTAGATGGTAATCTATCTGTCTGTGTGTT
TTGAGTCTCTCTCTCTCTATGTTATGTTCTTGTTGTAAGAAGATTTCAGCTCTTGCTTGT
ACTCTTACG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL1851Contig1 751 2 4 U
AATTTGCACCATCCATCCCTGAGAAGAATATCACTTGTTTGACAAGGCTGGACCACAACA
GGGCCTTGGGTCAGATCTCTGAGAGGTTGAGCGTGCCCGTCTCTGATGTTAAGAACGTGA
TCATCTGGGGTAACCACTCATCCACACAGTACCCTGATGTCAACCACACTAAGGTGCAGA
CTTCATCTGGAGAAAAGCCTGTCCGCGAGCTCGTCAAGAACGATGAGTGGTTGAATGGAG
AGTTCATCACTACGGTTCAACAACGTGGAGCTGCAATCATCAAAGCGAGGAAATTGTCTA
GTGCACTTTCTGCTGCTAGCTCTGCATGTGACCACATCCGTGACTGGGTCCTTGGAACTC
CAGAGGGGACATTTGTTTCCATGGGAGTATACTCAGATGGCTCTTACAACGTTCCATCAG
GACTTATCTACTCCTTCCCTGTCACTTGTCGCAATGGAGAGTGGAGTATTGTCCAAGGGC
TTCCGATCGATGAAGTATCAAGGAAGAAGATGGATCTGACTGCAGAGGAGCTGAAGGAAG
AGAAGGACTTGGCCTACTCATGCCTCTCTTAAACCAATACTCTTCTTCTCAGTCAGGTGT
GAGATCAACAAAGCTTTGAGGGCTTTGTTGAAATAAAGAGTGTGTTTAAAAGATCTCCCA
AACACTGTCCCTGCGCTGATATTCATGTACTCTGTTTTTTCTTTGTGTCTGATTTGGTTT
ACCCATAGTAATAAATAAAACAACTTTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK46JQ C 1
AF RR2BC59TF U 146
BS 1 146 RR2CK46JQ
BS 147 302 RR2BC59TF
BS 303 303 RR2CK46JQ
BS 304 751 RR2BC59TF

RD RR2CK46JQ 751 0 0
AATTTGCACCATCCATCCCTGAGAAGAATATCACTTGTTTGACAAGGCTGGACCACAACA
GGGCCTTGGGTCAGATCTCTGAGAGGTTGAGCGTGCCCGTCTCTGATGTTAAGAACGTGA
TCATCTGGGGTAACCACTCATCCACACAGTACCCTGATGTCAACCACGCTAAGGTGCAGA
CTTCATCTGGAGAAAAGCCTGTCCGCGAGCTCGTCAAGAACGATGAGTGGTTGAATGGAG
AGTTCATCACTACGGTTCAATAACGTGGAGCTGCAATCATCAAAGCGAGGAAATTGTCTA
GTGCACTTTCTGCTGCTAGCTCTGCATGTGACCACATCCGTGACTGGGTCCTTGGAACTC
CAGAGGGGACATTTGTTTCCATGGGAGTATACTCAGATGGCTCTTACAACGTTCCATCAG
GACTTATCTACTCCTTCCCTGTCACTTGTCGCAATGGAGAGTGGAGTATTGTCCAAGGGC
TTCCGATCGATGAAGTATCAAGGAAGAAGATGGATCTGACTGCAGAGGAGCTGAAGGAAG
AGAAGGACTTGGCCTACTCATGCCTCTCTTAAACCAATACTCTTCTTCTCAGTCAGGTGT
GAGATCAACAAAGCTTTGAGGGCTTTGTTGAAATAAAGAGTGTGTTTAAAAGATCTCCCA
AACACTGTCCCTGCGCTGATATTCATGTACTCTGTTTTTTCTTTGTGTCTGATTTGGTTT
ACCCATAGTAATAAA
TAAAACAACTTTTACT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2BC59TF 606 0 0
G
CAGTACCCTGATGTCAACCACACTAAGGTGCAGACTTCATCTGGAGAAAAGCCTGTCCGC
GAGCTCGTCAAGAACGATGAGTGGTTGAATGGAGAGTTCATCACTACGGTTCAACAACGT
GGAGCTGCAATCATCAAAGCGAGGAAATTGTCTAGTTCACTTTCTGCTGCTAGCTCTGCA
TGTGACCACATCCGTGACTGGGTCCTTGGAACTCCAGAGGGGACATTTGTTTCCATGGGA
GTATACTCAGATGGCTCTTACAACGTTCCATCAGGACTTATCTACTCCTTCCCTGTCACT
TGTCGCAATGGAGAGTGGAGTATTGTCCAAGGGCTTCCGATCGATGAAGTATCAAGGAAG
AAGATGGATCTGACTGCAGAGGAGCTGAAGGAAGAGAAGGACTTGGCCTACTCATGCCTC
TCTTAAACCAATACTCTTCTTCTCAGTCAGGTGTGAGATCAACAAAGCTTTGAGGGCTTT
GTTGAAATAAAGAGTGTGTTTAAAAGATCTCCCAAACACTGTCCCTGCGCTGATATTCAT
GTACTCTGTTTTTTCTTTGTGTCTGATTTGGTTTACCCATAGTAATAAATAAAACAACTT
TTACT

QA 2 606 2 606
DS 



AS 1 4

CO CL1852Contig1 623 4 3 U
GGATCTCAAATCTCAAAAACCTAATTCTCCACTCCCAAAAACAAAGAATCAAAGATGGCA
CCAAAGGCAGGAAAGAAGCCAGCAGAGAAGAAACCCGCCGCCGCCGCCGCGGAGAAGCCA
GCTGAGGAGGTCGCCGAGAAAGCCCCGGCGGAGAAGAAGCCAAAGGCCGGGAAGAAGCTG
CCGAAGGAGGCCGGGGCCATCGACAAGAAGAAGAAGCGGAACAAGAAGAGCATCGAGACG
TACAAGATCTACATCTTCAAGGTTCTGAAACAGGTCCACCCTGACATCGGGATCTCGAGC
AAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGAAGCTAGCACAGGAG
GCGTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACCATCACCTCGAGGGAGATCCAGACC
GCCGTTAGGCTTGTTCTCCCTGGAGAGCTAGCTAAGCACGCCGTTTTTGAGGGGACTAAG
GCTGTTACTAAGTTCACTAGCTCTTGAATTCGTGTTTGGGTTAGGGTTTCTAGATCTGGT
CGCTTTTGGTTTTTATCTACTAAGAAAAAGTCGTATGGTTATGCTTTTATCTAGTTTTTT
TTAATGATTTGGTTTGTAATTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C470TF U 1
AF RR2B233JQ C 28
AF RR2B233TF U 217
AF RR2C470JQ C 1
BS 1 218 RR2C470TF
BS 219 449 RR2B233TF
BS 450 623 RR2C470JQ

RD RR2C470TF 289 0 0
GGATCTCAAATCTCAAAAACCTAATTCTCCACTCCCAAAAACAAAGAATCAAAGATGGCA
CCAAAGGCAGGAAAGAAGCCAGCAGAGAAGAAACCCGCCGCCGCCGCCGCGGAGAAGCCA
GCTGAGGAGGTCGCCGAGAAAGCCCCGGCGGAGAAGAAGCCAAAGGCCGGGAAGAAGCTG
CCGAAGGAGGCCGGGGCCATCGACAAGAAGAAGAAGCGGAACAAGAAGAGCATCGAGACG
TACAAGATCTACATCTTCAAGGTTCTGAAACAGGTCCACCCTGACATCG

QA 1 289 1 289
DS 

RD RR2B233JQ 236 0 0
TCCACTCCCAAAAACAAAGAATCAAAGATGGCACCAAAGGCAGGAAAGAAGCCAGCAGAG
AAGAAACCCGCCGCCGCCGCCGCGGAGAAGCCAGCTGAGGAGGTCGCCGAGAAAGCCCCG
GCGGAGAAGAAGCCAAAGGCCGGGAAGAAGCTTCCGAAGGAGGCCGGGGCCATCGACAAG
AAGAAGAAGCGGAACAAGAAGAGCATCGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGT

QA 1 236 1 236
DS 

RD RR2B233TF 236 0 0
CG
GAACAAGAAGAGCATCGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTTCTGAAACAGGTCCA
CCCTGACATCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACAT
CTTCGAGAAGCTAGCACAGGAGGCGTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACCAT
CACCTCGAGGGAGATCCAGACCGCCGTTAGGCTTGTTCTCCCTGGAGAGCT
AGC

QA 3 233 3 233
DS 

RD RR2C470JQ 623 0 0
GGATCTCAAATCTCAAAAACCTAATTCTCCACTCCCAAAAACAAAGAATCAAAGATGGCA
CCAAAGGCAGGAAAGAAGCCAGCAGAGAAGAAACCCGCCGCCGCCGCCGCGGAGAAGCCA
GCTGAGGAGGTCGCCGAGAAAGCCCCGGCGGAGAAGAAGCCAAAGGCCGGGAAGAAGCTG
CCGAAGGAGGCCGGGGCCATCGACAAGAAGAAGAAGCGGAACAAGAAGAGCATCGAGACG
TACAAGATCTACATCTTCAAGGTTTTGAAACAGGTCCACCCTGACATCGGGATCTCGAGC
AAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATTTTCGAGAAGCTAGCACAGGAG
GCGTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACCATCACCTCGAGGGAGGTCCAGACC
GCTGTTAGGCTTGTTCTCCCTGGAGAGCTAGCTAAGCACGCCGTTTTTGAGGGGACTAAG
GCTGTTACTAAGTTCACTAGCTCTTGAATTCGTGTTTGGGTTAGGGTTTCTAGATCTGGT
CGCTTTTGGTTTTTATCTACTAAGAAAAAGTCGTATGGTTATGCTTTTATCTAGTTTTTT
TTAATGATTTGGTTTGTAATTGT

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 5

CO CL1853Contig1 1379 5 14 U
TTCCTGATGGTGCTGTTGCAGTACTGACACCTGACATGCCGGATGTACTATCTCATGTTT
CTGTTCGAGCAAGAAATGGAAAGATCTGCTTTGCGACATGTTTTGATTCTGGTATCTTAT
CTGATCTTCAAGCACTGGATGGGAAAGTGCTGAGCCTAAAACCAACCTCTGCAGATGTGG
TCTATAGAGAGGTAAACGAGAGTGAACTTTCGAGTCAAAGTTCGGATAACTTAGAAGATG
CCCCTCCAAGCATTTCTTTGGTCAAGAAGCAGTTTGTGGGTAGATATGCTATATCGTCTG
AGGAGTTCACAAATGACTTGGTTGGTGCTAAATCAAGAAATATTGGATATCTGAAAGGGA
AAGTTCCTTCTTGGGTTGGTATCCCAACTTCAGTTGCGCTGCCATTTGGTGTTTTTGAGA
AGGTTCTCTCTGAAAAGGCGAATCAGGCGGTGAGTGAGAAACTGCAAGTATTGAAGAAAA
GTCTTGATGAGGGAGACCAAGATGCTCTCGGAGAAATACGCAAGACAGTGTTGGGACTAG
TTGCACCCGCAGAACTGGTTGAAGAACTAAAAAGTACTATGAAAAAATCCGACATGCCAT
GGCCGGGTGATGAAGGTGAACAGAGATGGGAACAAGCATGGGCAGCCATTAAAAAGGTCT
GGGCGTCGAAATGGAACGAGAGAGCGTACTTCAGCACGAAGAAAGTAAAACTGGATCATG
ACTACCTCTGCATGGCTGTTTTGGTCCAAGAAGTCATCAATGCAGACTACGCGTTCGTCA
TTCACACAACCAACCCTTCTTCTGGAGACTCATCAGAGATTTACGCCGAGGTGGTCAAAG
GCCTTGGTGAAACTCTTGTAGGAGCATATCCTGGTCGGTCTCTGAGTTTCATCACCAAGA
AAAACAACCTCGACTCTCCACTGGTGTTGGGTTACCCAAGCAAACCGATTGGGCTATTCA
TAAGACGTTCGATCATCTTCAGGTCTGATTCTAACGGAGAGGATCTCGAAGGTTATGCAG
GTGCAGGTCTTTACGACAGTGTACCGATGGACGAGGAAGACAAAGTCGTTCTCGATTACA
CAACAGATCCTCTGATCACGGACGAGGGCTTCCAGAGAAAGATCCTCTCAGACATTGCAC
GTGCCGGAGATGCCATTGAGAAGCTGTATGGAACTGCACAAGACATTGAAGGGGTGATCA
GAGACGGGAAACTCTATGTTGTCCAGACACGACCACAAGTGTGATCAGTGTATATATGAC
GTTCTTTGTCCAGTGAACTTATTATTTGCTCTATAAGCAAAGAGTAAAAAGCATGAGCAT
ATAGATCAATATGTGTAGTACAAAATAACATCATATCGCATTACCACCAAAGTTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F764TF U 223
AF RR2A147TF U 1
AF RR2GJ40TF U 280
AF RR2A147JQ C 533
AF RR2F764JQ C 677
BS 1 529 RR2A147TF
BS 530 530 RR2GJ40TF
BS 531 652 RR2A147TF
BS 653 685 RR2GJ40TF
BS 686 686 RR2A147JQ
BS 687 696 RR2GJ40TF
BS 697 731 RR2A147JQ
BS 732 732 RR2F764JQ
BS 733 765 RR2A147JQ
BS 766 767 RR2F764JQ
BS 768 1121 RR2A147JQ
BS 1122 1122 RR2F764JQ
BS 1123 1176 RR2A147JQ
BS 1177 1379 RR2F764JQ

RD RR2F764TF 303 0 0
G
GGATAACTTAGAAGATGCCCCTCCAAGCATTTCTTTGGTCAAGAAGCAGTTTGTGGGTAG
ATATGCTATATCGTCTGAGGAGTTCACAAATGACTTGGTTGGTGCTAAATCAAGAAATAT
TGGATATCTGAAAGGGAAAGTTCCTTCTTGGGTTGGTATCCCAACTTCAGTTGCGCTGCC
ATTTGGTGTTTTTGAGAAGGT*CTCTCTGAAAAGGCAAATCAGGCGGTGAGTGAGAAACT
GCAAGTACTGAAGAAAAG*CTTGATGAGGGAGACCAAGATGCTCTCGGAGAAAT
ACGCAAGA

QA 2 295 2 295
DS 

RD RR2A147TF 652 0 0
TTCCTGATGGTGCTGTTGCAGTACTGACACCTGACATGCCGGATGTACTATCTCATGTTT
CTGTTCGAGCAAGAAATGGAAAGATCTGCTTTGCGACATGTTTTGATTCTGGTATCTTAT
CTGATCTTCAAGCACTGGATGGGAAAGTGCTGAGCCTAAAACCAACCTCTGCAGATGTGG
TCTATAGAGAGGTAAACGAGAGTGAACTTTCGAGTCAAAGTTCGGATAACTTAGAAGATG
CCCCTCCAAGCATTTCTTTGGTCAAGAAGCAGTTTGTGGGTAGATATGCTATATCGTCTG
AGGAGTTCACAAATGACTTGGTTGGTGCTAAATCAAGAAATATTGGATATCTGAAAGGGA
AAGTTCCTTCTTGGGTTGGTATCCCAACTTCAGTTGCGCTGCCATTTGGTGTTTTTGAGA
AGGTTCTCTCTGAAAAGGCGAATCAGGCGGTGAGTGAGAAACTGCAAGTATTGAAGAAAA
GTCTTGATGAGGGAGACCAAGATGCTCTCGGAGAAATACGCAAGACAGTTTTGGGACTAG
TTGCACCCGCAGAACTGGTTGAAGAACTAAAAAGTACTATGAAAAAATCCGACATGCCAT
GGCCGGGTGATGAAGGTGAACAGAGATGGGAACAAGCATGGGCAGCCATTAA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2GJ40TF 417 0 0
GTAGATATGCTATATCGTCTGAGGAGTTCACAAATGACTTGGTTGGTGCTAAATCAAGAA
ATATTGGATATCTGAAAGGGAAAGTTCCTTCTTGGGTTGGTATCCCAACTTCAGTTGCTC
TGCCTTTTGGTGTTTTTGAGAAGGTTATCTCCGAAAAGGCGAATCAGGCTGTGAGCGAGA
AAGTGCAAGTATTGAAGAAAAGTCTTGATGAGGGAGACCAAGATGCTCTCGGAGAAATCC
GTAAGACAGTGTTGGGACTAGTTGCACCCGCAGAACTGGTTGAAGAACTAAAAAGTACTA
TGAAAAAGTCCGACATGCCATGGCCGGGTGATGAAGGTGAACAGAGATGGGAACAAGCAT
GGGCAGCCATTAAAAAGGTCTGGGCGTCGAAATGGAACGAGAGAGCCTACTTCAGCA

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR2A147JQ 644 0 0
GGGACTAGTTGCACCCGCAGAACTGGTTGAAGAACTAAAAAGTACTATGAAAAAATCCGA
CATGCCATGGCCGGGTGATGAAGGTGAACAGAGATGGGAACAAGCATGGGCAGCCATTAA
AAAGGTCTGGGCGTCGAAATGGAACGAGAGAGCGTACTTCAGCACGAAGAAAGTAAAACT
GGATCATGACTACCTCTGCGTGGCTGTTTTGGTCCAAGAAGTCATCAATGCAG**TACGC
GTTCGTCATTCACACAACCAACCCTTCTTCTGGAGACTCATCAGAGATTTACGCCGAGGT
GGTCAAAGGCCTTGGTGAAACTCTTGTAGGAGCATATCCTGGTCGGTCTCTGAGTTTCAT
CACCAAGAAAAACAACCTCGACTCTCCACTGGTGTTGGGTTACCCAAGCAAACCGATTGG
GCTATTCATAAGACGTTCGATCATCTTCAGGTCTGATTCTAACGGAGAGGATCTCGAAGG
TTATGCAGGTGCAGGTCTTTACGACAGTGTACCGATGGACGAGGAAGACAAAGTCGTTCT
CGATTACACAACAGATCCTCTGATCACGGACGAGGGCTTCCAGAGAAAGTTCCTCTCAGA
CATTGCACGTGCCGGAGATGCCATTGAGAAGCTGTATGGAACTG

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2F764JQ 703 0 0
CGAGAGAGCGTACTTCAGCACGAAGAAAGTAAAACTGGATCATGACTACCTCTGCATGGC
TGTTTTGGTCCAAGAAGTCATCAATGCAGACTACGCGTTCGTCATTCACACAACCAACCC
TTCTTCTGGAGACTCATCAGAGATTTACGCCGAGGTGGTCAAAGGCCTTGGTGAAACTCT
TGTAGGAGCATATCCTGGTCGGTCTCTGAGTTTCATCACCAAGAAAAACAACCTCGACTC
TCCACTGGTGTTGGGTTACCCAAGCAAACCGATTGGGCTATTCATAAGACGTTCGATCAT
CTTCAGGTCTGATTCTAACGGAGAGGATCTCGAAGGTTATGCAGGTGCAGGTCTTTACGA
CAGTGTACCGATGGACGAGGAAGACAAAGTCGTTCTCGATTACACAACAGATCCTCTGAT
CACGGACGAGGGCTTCCAGAGAAAGATCCTTTCAGACATTGCACGTGCCGGAGATGCCAT
TGAGAAGCTGTATGGAACTGCACAAGACATTGAAGGGGTGATCAGAGACGGGAAACTCTA
TGTTGTCCAGACACGACCACAAGTGTGATCAGTGTATATATGACGTTCTTTGTCCAGTGA
ACTTATTATTTGCTCTATAAGCAAAGAGTAAAAAGCATGAGCATATAGATCAATATGTGT
AGTACAAAATAACATCATATCGCATTACCACCAAAGTTTAAGC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 4

CO CL1854Contig1 539 4 3 U
GGGCAAGTTTAAATTCAAAAGAATTAATACTAAACGTGTGTATCAAAAACAATATGTCGT
CATCCCAGTTCGCTATCTTTTGCGTCATCTTGATTACTTTATTTCCTCTTCATGAATTTG
TCGATGGCCAAGGTGTTCAAGCGGGCACGAAAGCTAAAGGAACTTGCGACCAAAAACAAT
GCGCAGATTCCACAATTTGCTTTTGTTGTTCCTCCACTAGGAAATGTTTCCCGACCAAAC
AAAGATGTACAGGTTGGTGTGCATAAACTATCTCGAGAAGCTACGTCAAGGATTTAAGAA
GACCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATTTAGTTTTGTTTTATATGAATAA
AACATGCTTATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGCCTATTGTATTTGTGTTTAGAGA
CTATCATATTCTATTTTATGTAATTCGCATAAATTAAATTTATTTTCTATCCTTTTCTTT
TATTTTGATATTAATTTCTTAAATACCTGTTTGGGTTAATAGCTAACAATAAGTTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F638TF U 3
AF RR2AU80TF U 3
AF RR2DA02TF U 9
AF RR2EL50TF U 1
BS 1 411 RR2EL50TF
BS 412 412 RR2F638TF
BS 413 539 RR2EL50TF

RD RR2F638TF 472 0 0
GGAAGTTT
AAATTCAAAAGAATTAATACTAAACGTGTGTATCAAAAACAATATGTCGTCATCCCAGTT
CGCTATCTTTTGCGTCATCTTGATTACTTTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCA
AGGTGTTCAAGCGGGCACGAAAGCTAAAGGAACTTGCGACCAAAAACAATGCGCAGATTC
CACAATTTGCTTTTGTTGTTCCTCCACTAGGAAATGTTTCCCGACCAAACAAAGATGTAC
AGGT****GTGCATAAACTATCTCGAGAAGCTACGTCAAGGATTTAAGAAGACCTGAATA
ACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATTTAGTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTTA
TCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGCCTATTGTATTTGTGTTTAGAGACTATCATATT
CTATTTTATGTAATTCGCATAAATTAAATTTATTTTCTAT
CCTG

QA 9 468 9 468
DS 

RD RR2AU80TF 468 0 0
GGAAGTTT
AAATTCAAAAGAATTAATACTAAACGTGTGTATCAAAAACAATATGTCGTCATCCCAGTT
CGCTATCTTTTGCGTCATCTTGATTACTTTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCA
AGGTGTTCAAGCGGGCACGAAAGCTAAAGGAACTTGCGACCAAAAACAATGCGCAGATTC
CACAATTTGCTTTTGTTGTTCCTCCACTAGGAAATGTTTCCCGACCAAACAAAGATGTAC
AGGTTGGTGTGCATAAACTATCTCGAGAAGCTACGTCAAGGATTTAAGAAGACCTGAATA
ACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATTTAGTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTTA
TCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGCCTATTGTATTTGTGTTTAGAGACTATCATATT
CTATTTTATGTAATTCGCATAAATTAAATTTATTTTCTAT

QA 9 468 9 468
DS 

RD RR2DA02TF 462 0 0
GG
AAATTCAAAAGAATTAATACTAAACGTGTGTATCAAAAACAATATGTCGTCATCCCAGTT
CGCTATCTTTTGCGTCATCTTGATTACTTTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCA
AGGTGTTCAAGCGGGCACGAAAGCTAAAGGAACTTGCGACCAAAAACAATGCGCAGATTC
CACAATTTGCTTTTGTTGTTCCTCCACTAGGAAATGTTTCCCGACCAAACAAAGATGTAC
AGGTTGGTGTGCATAAACTATCTCGAGAAGCTACGTCAAGGATTTAAGAAGACCTGAATA
ACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATTTAGTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTTA
TCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGCCTATTGTATTTGTGTTTAGAGACTATCATATT
CTATTTTATGTAATTCGCATAAATTAAATTTATTTTCTAT

QA 3 462 3 462
DS 

RD RR2EL50TF 539 0 0
GGGCAAGTTTAAATTCAAAAGAATTAATACTAAACGTGTGTATCAAAAACAATATGTCGT
CATCCCAGTTCGCTATCTTTTGCGTCATCTTGATTACTTTATTTCCTCTTCATGAATTTG
TCGATGGCCAAGGTGTTCAAGCGGGCACGAAAGCTAAAGGAACTTGCGACCAAAAACAAT
GCGCAGATTCCACAATTTGCTTTTGTTGTTCCTCCACTAGGAAATGTTTCCCGACCAAAC
AAAGATGTACAGGTTGGTGTGCATAAACTATCTCGAGAAGCTACGTCAAGGATTTAAGAA
GACCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATTTAGTTTTGTTTTATATGAATAA
AACATGCTTATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGCCTATTGTATTTGTTTTTAGAGA
CTATCATATTCTATTTTATGTAATTCGCATAAATTAAATTTATTTTCTATCCTTTTCTTT
TATTTTGATATTAATTTCTTAAATACCTGTTTGGGTTAATAGCTAACAATAAGTTTTTG

QA 1 539 1 539
DS 



AS 2 5

CO CL1855Contig1 549 2 2 U
GCTCACCGGTGTTACTTGGCAAGACGCTGGAAAGGTAGAGCTAGTGGATGGATCGTCCTA
TTTAGGACAGCCACTACCGTTCTCGATCTCCACACTGATTTGGATCGAAGTGTTGGTGAT
TGGTTACATTGAGTTCCAAAGAAACGCCGAGCTGGACTCGGAGAAGCGTTTGTATCCAGG
AGGCAAGTTTTTCGACCCGTTGGGTCTAGCTTCTGACCCGGAGAAGAGGGCTCAGCTTCA
GTTGGCTGAGATCAAACACGCTCGTTTAGCAATGGTTGCCTTCTTGGGATTTGCGGTTCA
GGCGGTTGCAACGGGTAAAGGACCGCTCAACAACTGGGCGACTCACCTTAGTGACCCGCT
TCACACCACCATCATCGACACCTTCTCGTCCTCTTGATCTGGTTGCTTTAGCTTTTTATT
GGTGTAATGTAATGATGTAATGATGTCCATCTTTAAGACAAGTTTGTATAACTATAAACA
AACTTCTTGAAAGGTTTAGTGCTGAAATCTTCGAGTGTCATTGGATTAATGATTATGAAC
CGTAACCTC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BR70JQ C 1
AF RR2BR70TF U 1
BS 1 2 RR2BR70JQ
BS 3 549 RR2BR70TF

RD RR2BR70JQ 549 0 0
GCTCACCGGTGTTACTTGGCAAGACGCTGGAAAGGTAGAGCTAGTGGATGGATCGTCCTA
TTTAGGACAGCCACTACCGTTCTCGATCTCCACACTGATTTGGATCGAAGTGTTGGTGAT
TGGTTACATTGAGTTCCAAAGAAACGCCGAGCTGGACTCGGAGAAGCGTTTGTATCCAGG
AGGCAAGTTTTTCGACCCGTTGGGTCTAGCTTCTGACCCGGAGAAGAGGGCTCAGCTTCA
GTTGGCTGAGATCAAACACGCTCGTTTAGCAATGGTTGCCTTCTTGGGATTTGCGGTTCA
GGCGGTTGCAACGGGTAAAGGACCGCTCAACAACTGGGCGACTCACCTTAGTGACCCGCT
TCACACCACCATCATCGACACCTTCTCGTCCTCTTGATCTGGTTGCTTTAGCTTTTTATT
GGTGTAATGTAATGATGTAATGATGTCCATCTTTAAGACAAGTTTGTATAACTATAAACA
AACTTCTTGAAAGGTTTAGTGCTGAAATCTTCGAGTGTCATTGGATTAATGATTATGAAC
CGTAACCTC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2BR70TF 549 0 0
GC
TCACCGGTGTTACTTGGCAAGACGCTGGAAAGGTAGAGCTAGTGGATGGATCGTCCTATT
TAGGACAGCCACTACCGTTCTCGATCTCCACACTGATTTGGATCGAAGTGTTGGTGATTG
GTTACATTGAGTTCCAAAGAAACGCCGAGCTGGACTCGGAGAAGCGTTTGTATCCAGGAG
GCAAGTTTTTCGACCCGTTGGGTCTAGCTTCTGACCCGGAGAAGAGGGCTCAGCTTCAGT
TGGCTGAGATCAAACACGCTCGTTTAGCAATGGTTGCCTTCTTGGGATTTGCGGTTCAGG
CGGTTGCAACGGGTAAAGGACCGCTCAACAACTGGGCGACTCACCTTAGTGACCCGCTTC
ACACCACCATCATCGACACCTTCTCGTCCTCTTGATCTGGTTGCTTTAGCTTTTTATTGG
TGTAATGTAATGATGTAATGATGTCCATCTTTAAGACAAGTTTGTATAACTATAAACAAA
CTTCTTGAAAGGTTTAGTGCTGAAATCTTCGAGTGTCATTGGATTAATGATTATGAACCG
TAACCTC

QA 3 549 3 549
DS 



CO CL1855Contig2 852 3 6 U
GGATTACAGAACATCACAACTCAACAAACGTGTGACAAGACACACAAACAACTCTCGAGA
TGGCCGCTCCCAAGAAGGCTAAGACGGTTCGCTGGTCGGAGACTACGGTTTCGACCCTTT
CGGTTTAGGTAAACCGGCTGAGTATCTCCAGTTCGATCTCGACTCTCTGGACCAGAACTT
AGCCAAGAACATAGCCGGAGACGTGATCGGGACCCGTACGGAGGCCGTTGACCCCAAGTC
GACGCCGTTTCAGCCTTACAGCGAGGTATTTGGGATCCAGAGGTTCCGAGAGTGTGAGCT
GATCCATGGGAGATGGGCTATGCTTGCAACTCTCGGTGCTCTCTCCGTTGAATGGTTCAC
CGGTGTTACTTGGCAAGACGCCGGAAAGGTAGAGCTAGTGGATGGATCGTCCTATTTAGG
ACAGCCACTACCGTTCTCGATCTCGACATTGATTTGGATCGAAGTGTTGGTGATTGGTTA
CATCGAATTCCAAAGAAACGCTGAGCTGGACTCGGAGAAGCGTTTGTATCCAGGAGGCAA
GTTTTTCGACCCGCTGGGTCTAGCTTCTGACCCGGAGAAGAAGGCTCAGCTTCAGTTGGC
TGAGATCAAACACGCTCGTTTAGCCATGGTTGCCTTCTTGGGATTTGCGGTTCAGGCGGC
TGCAACGGGTAAAGGACCACTCAACAACTGGGCGACTCACCTTAGTGACCCGCTTCACAC
CACCATCATCGACACCTTCTCGTCCTCTTGATCTGGTTGCTTTAGCTTTTTATTGGTGTA
ATGTAATGAAGTCCATCTGTAAGACCAAAGTTTGTATAACTATAAACAAACTTCTTGAAA
GGTTTAGTGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY92TF U 1
AF RR2B261TF U 382
AF RR2FY92JQ C 121
BS 1 287 RR2FY92TF
BS 288 382 RR2FY92JQ
BS 383 805 RR2B261TF
BS 806 806 RR2FY92JQ
BS 807 835 RR2B261TF
BS 836 852 RR2FY92JQ

RD RR2FY92TF 287 0 0
GGATTACAGAACATCACAACTCAACAAACGTGTGACAAGACACACAAACAACTCTCGAGA
TGGCCGCTCCCAAGAAGGCTAAGACGGTTCGCTGGTCGGAGACTACGGTTTCGACCCTTT
CGGTTTAGGTAAACCGGCTGAGTATCTCCAGTTCGATCTCGACTCTCTGGACCAGAACTT
AGCCAAGAACATAGCCGGAGACGTGATCGGGACCCGTACGGAGGCCGTTGACCCCAAGTC
GACGCCGTTTCAGCCTTACAGCGAGGTATTTGGGATCCAGAGGTTCC

QA 1 287 1 287
DS 

RD RR2B261TF 456 0 0
G
GGAAAGGTAGAGCTAGTGGATGGATCGTCCTATTTAGGACAGCCACTACCGTTCTCGATC
TCGACATTGATTTGGATCGAAGTGTTGGTGATTGGTTACATCGAATTCCAAAGAAACGCT
GAGCTGGACTCGGAGAAGCGTTTGTATCCAGGAGGCAAGTTTTTCGACCCGCTGGGTCTA
GCTTCTGACCCGGAGAAGAAGGCTCAGCTTCAGTTGGCTGAGATCAAACACGCTCGTTTA
GCCATGGTTGCCTTCTTGGGATTTGCGGTTCAGGCGGCTGCAACGGGTAAAGGACCACTC
AACAACTGGGCGACTCACCTTAGTGACCCGCTTCACACCACCATCATCGACACCTTCTCG
TCCTCTTGATCTGGTTGCTTTAGCTTTTTATTGGTGTAATGTAATGAAGTCCATCTGTAA
GACTAAAGTTTGTATAACTATAAACAAACTTCT
GG

QA 2 454 2 454
DS 

RD RR2FY92JQ 732 0 0
CGGTTTAGGTAAACCGGCTGAGTATCTCCAGTTCGATCTCGACTCTCTGGACCAGAACTT
AGCCAAGAACATAGCCGGAGACGTGATCGGGACCCGTACGGAGGCCGTTGACCCCAAGTC
GACGCCGTTTCAGCCTTACAGCGAGGTATTTGGGATCCAGAGGTTCCGAGAGTGTGAGCT
GATCCATGGGAGATGGGCTATGCTTGCAACTCTCGGTGCTCTCTCCGTTGAATGGTTCAC
CGGTGTTACTTGGCAAGACGCCGGAAGGGTAGAGCTAGTGGATGGATCGTCCTATTTAGG
ACAGCCACTACCGTTCTCGATCTCGACATTGATTTGGATCGAAGTGTTGGTGATTGGTTA
CATCGAATTCCAAAGAAACGCTGAGCTGGACTCGGAGAAGCGTTTGTATCCAGGAGGCAA
GTTTTTCGACCCGCTGGGTCTAGCTTTTGACCCGGAGAAGAAGGCTCAGCTTCAGTTGGC
TGAGATCAAACACGCTCGTTTAGCCATGGTTGCCTTCTTGGGATTTGCGGTTCAGGCGGC
TGCAACGGGTAAAGGACCACTCAACAACTGGGCGACTCACCTTAGTGACCCGCTTCACAC
CACCATCATCGACACCTTCTCGTCCTCTTGATCTGGTTGCTTTAGCTTTTTATTGGTGTA
ATGTAATGAAGTCCATCTGTAAGACCAAAGTTTGTATAACTATAAACAAACTTCTTGAAA
GGTTTAGTGCTG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 5

CO CL1856Contig1 1207 5 8 U
GGGCAACCAACCCAACATTTCTCCCTCGTGACAAATCTCAATTTTGCAAGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGAAGACAGAAACTGAAACTGAAACGTAGTTTTCTTATAATGATGTCAAGTTCT
ATGGAGTATTCTGATTCCGCCGCTACTCGGAGATTCTCTAGAAAGCCGGGCTTCTCCCTT
ACGTGTAGTCGGCTGAGTCAGTACCTGAAAGAGAACGGTAGCTTTGGAGATCTCAGCTTA
GGGATGTCATGCAAGCCTCAAGTCAACGGCAACTCACGTCAGCCCACAACAACAATGAGT
TTATTCCCCTGTGAAGCTCCTTCCATGACGACTGGTCAAGATGTTAAACCGGAGAATCTG
TTTACTCGGCAACCAAGCTTCTCTTCCTCATCTTCCTCTCTCCCCAAGGAAGAAGATGTC
CTCAAAACGACACAAACCATTACTACTACTAGATCTGTGAAACCAGAGCCTCAAACTGCA
CCGTTGACTATATTCTACAACGGGGAGGTGATTGTGTTCAACGACTTTTCTGCTGAAAAA
GCCAAAGAAGTGATGAACTTGGCTAGCAAAGGAACCGCTAATAGCTTCACCGGTTTCACA
TCTACTCTTAACTTAGCCAAGAATCAAACCGAGGTCAGAAGCAACATCGCTCCTACCTCT
AACCAAGCTCCTCATCTCATGAAAACCGCAGCACAACAAGAGCCAATAATGTCCTCCTCA
ACTGCAATGGCATGCGAACTTCCTATTGCTAGAAGAGCTTCACTCCATCGGTTCTTGGCC
AAGAGAAAGGATAGAGTTACGTCAAAGGCACCATACCAACTAAGCGATCCAGCCAAAGCG
TCTTCAAACAACAACAACACCGCCTCTTGGCTCGGTTTAGCAGCTCAAATATGACTGAAC
CACCACCACAAACCTTACCGGGGCTATTCTTTCTGACGTTGCATCAATGAACAAGATTAT
ATATAAAAAACCTTATGCGTCCATGATTCTCAACAACTATATATTCCAATTATTAGGAAA
CTTCATATATATTTTGTATGTATTTGATTAATTCTTGTTAGTGTCTTTTCTTTTAGAAGG
TGTTGTCTTATGTCTTTCTAAACACCCACTCTCTGGGTAAATCTCATAATTAGTAGATCT
CGTATGTTACTGGTTTTGTAAGAAGAACAATTTTTGTTGAGGACTATACTAGTTTTATTT
CTAAAAA


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C156TF U 1
AF RR2C448TF U 3
AF RR2CB61TF U 3
AF RR2CB61JQ C 397
AF RR2C448JQ C 460
BS 1 525 RR2C156TF
BS 526 569 RR2C448TF
BS 570 570 RR2CB61TF
BS 571 693 RR2C448TF
BS 694 980 RR2CB61JQ
BS 981 981 RR2C448JQ
BS 982 1190 RR2CB61JQ
BS 1191 1207 RR2C448JQ

RD RR2C156TF 525 0 0
GGGCAACCAACCCAACATTTCTCCCTCGTGACAAATCTCAATTTTGCAAGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGAAGACAGAAACTGAAACTGAAACGTAGTTTTCTTATAATGATGTCAAGTTCT
ATGGAGTATTCTGATTCCGCCGCTACTCGGAGATTCTCTAGAAAGCCGGGCTTCTCCCTT
ACGTGTAGTCGGCTGAGTCAGTACCTGAAAGAGAACGGTAGCTTTGGAGATCTCAGCTTA
GGGATGTCATGCAAGCCTCAAGTCAACGGCAACTCACGTCAGCCCACAACAACAATGAGT
TTATTCCCCTGTGAAGCTCCTTCCATGACGACTGGTCAAGATGTTAAACCGGAGAATCTG
TTTACTCGGCAACCAAGCTTCTCTTCCTCATCTTCCTCTCTCCCCAAGGAAGAAGATGTC
CTCAAAACGACACAAACCATTACTACTACTAGATCTGTGAAACCAGAGCCTCAAACTGCA
CCGTTGACTATATTCTACAACGGGGAGGTGATTGTGTTCAACGAC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2C448TF 691 0 0
GG
AACCAACCCAACATTTCTCCCTCGTGACAAATCTCAATTTTGCAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGACAGAAACTGAAACTGAAACGTAGTTTTCTTATAATGATGTCAAGTTCTATGG
AGTATTCTGATTCCGCCGCTACTCGGAGATTCTCTAGAAAGCCGGGCTTCTCCCTTACGT
GTAGTCGGCTGAGTCAGTACCTGAAAGAGAACGGTAGCTTTGGAGATCTCAGCTTAGGGA
TGTCATGCAAGCCTCAAGTCAACGGCAACTCACGTCAGCCCACAACAACAATGAGTTTAT
TCCCCTGTGAAGCTCCTTCCATGACGACTAGTCAAGATGTTAAACCGGAGAATCTGTTTA
CTCGGCAACCAAGCTTCTCTTCCTCATCTTCCTCTCTCCTCAAGGAAGAAGATGTCCTCA
AAACGACACAAACCATTACTACTACTAGATCTGTGAAACCAGAGCCTCAAACTGCACCGT
TGACTATATTCTACAACGGGGAGGTGATTGTGTTCAACGACTTTTCTGCTGAAAAAGCCA
AAGAAGTGATGAACTTGGCTAGCAA*GGAACCGCTAATAGCTTCACCGGTTTCACATCTA
CTCTTAACTTAGCCAAGAATCAAACCGAGGTCAGAAGCAACATCGCTCCTACCTCTAACC
AAGCTCCTCATCTCATGAAAACCGCAGCA

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR2CB61TF 698 0 0
GG
AACCAACCCAACATTTCTCCCTCGTGACAAATCTCAATTTTGCAAGAAGAAGAAGAAGAA
GA******CAGAAACTGAAACTGAAACGTAGTTTTCTTATAATGATGTCAAGTTCTATGG
AGTATTCTGATTCCGCCGCTACTCGGAGATTCTCTAGAAAGCCGGGCTTCTCCCTTACGT
GTAGTCGGCTGAGTCAGTACCTGAAAGAGAACGGTAGCTTTGGAGATCTCAGCTTAGGGA
TGTCATGCAAGCCTCAAGTCAACGGCAACTCACGTCAGCCCACAACAACAATGAGTTTAT
TCCCCTGTGAAGCTCCTTCCATGACGACTGGTCAAGATGTTAAACCGGAGAATCTGTTTA
CTCGGCAACCAAGCTTCTCTTCCTCATCTTCCTCTCTCCCCAAGGAAGAAGATGTCCTCA
AAACGACACAAACCATTACTACTACTAGATCTGTGAAACCAGAGCCTCAAACTGCACCGT
TGACTATATTCTACAACGGGGAGGTGATTGTGTTCAACGACTTTTCTGCTGAAAAAGCCA
GAGAAGTGATGAACTTGGCTAGCAAAGGAACCGCTAATAGCTTCACCGGTTTCACATCTA
CTCTTAACTTAGCCAAGAATCAAACCGAGGTCAGAAGCAACATCGCTCCTACCTCTAACC
AAGCTCCTCATCTCATGAAAACCGCAGCA
CAACAAG

QA 3 691 3 691
DS 

RD RR2CB61JQ 794 0 0
TCTCTCCCCAAGGAAGAAGATGTCCTCAAAACGACACAAACCATTACTACTACTAGATCT
GTGAAACCAGAGCCTCAAACTGCACCGTTGACTATATTCTACAACGGGGAGGTGATTGTG
TTCAACGACTTTTCTGCTGAAAAAGCCAGAGAAGTGATGAACTTGGCTAGCAAAGGAACC
GCTAATAGCTTCACCGGTTTCACATCTACTCTTAACTTAGCCAAGAATCAAACCGAGGTC
AGAAGCAACATCGTTCCTACCTCTAACCAAGCTCCTCATTTCATGAAAACCGCAGCACAA
CAAGAGCCAATAATGTCCTCCTCAACTGCAATGGCATGCGAACTTCCTATTGCTAGAAGA
GCTTCACTCCATCGGTTCTTGGCCAAGAGAAAGGATAGAGTTACGTCAAAGGCACCATAC
CAACTAAGCGATCCAGCCAAAGCGTCTTCAAACAACAACAACACCGCCTCTTGGCTCGGT
TTAGCAGCTCAAATATGACTGAACCACCACCACAAACCTTACCGGGGCTATTCTTTCTGA
CGTTGCATCAATGAACAAGATTATATATAAAAAACCTTATGCGTTCATGATTCTCAACAA
CTATATATTCCAATTATTAGGAAACTTCATATATATTTTGTATGTATTTGATTAATTCTT
GTTAGTGTCTTTTCTTTTAGAAGGTGTTGTCTTATGTCTTTCTAAACACCCACTCTCTGG
GTAAATCTCATAATTAGTAGATCTCGTATGTTACTGGTTTTGTAAGAAGAACAATTTTTG
TTGAGGACTATACT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2C448JQ 748 0 0
AAACCAGAGCCTCAAACTGCACCGTTGACTATATTCTACAACGGGGAGGTGATTGTGTTC
AACGACTTTTCTGCTGAAAAAGCCAAAGAAGTGATGAACTTGGCTAGCAAAGGAACCGCT
AATAGCTTCACCGGTTTCACATCTACTCTTAACTTAGCCAAGAATCAAACCGAGGTCAGA
AGCAACATCGCTCCTACCTCTAACCAAGCTCCTCATCTCATGAAAACCGCAGCACAACAA
GAGCCAATAATGTCCTCCTCAACTGCAATGGCATGCGAACTTCCTATTGCTAGAAGAGCT
TCACTCCATCGGTTCTTGGCCAAGAGAAAGGATAGAGTTACGTCAAAGGCACCATACCAA
CTAAGCGATCCAGCCAAAGCGTCTTCAAACAACAACAACACCGTCTCTTGGCTCGGTTTA
GCAGCTCAAATATGACTGAACCACCACCGCGAACCTTACCGGGGCTATTCTTTCTGACGT
TGCATCAATGAACAAGATTATATATAAAAAACCTTATGCGTCCATGATTCTCAACAACTA
TATATTCCAATTATTAGGAAACTTCATATATATTTTGTATGTATTTGATTAATTCTTGTT
AGTGTCTTTTCTTTTAGAAGGTGTTGTCTTATGTCTTTCTAAACACCCACTCTCTGGGTA
AATCTCATAATTAGTAGATCTCGTATGTTACTGGTTTTGTAAGAAGAACAATTTTTGTTG
AGGACTATACTAGTTTTATTTCTAAAAA

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 4

CO CL1857Contig1 783 4 1 U
GGAAAGTCTTGGTGAATGAATATCTGTTTCTTGATTTGGAACCGACATGGCTCCTAACAA
TTGGGCTTTTCTCTGCCTCTTCCTAGGAATCTGAAGCTCTCTATCTCTCTCTCACTCTTT
CCTGTCCGAACTACTCTTTCATCTTGGCAACATCGAATATCTTGACTTCCTTTTCATTTT
CTTCACTCTTTGTATTGGATCTTGGATATGGCTATGCAAACTATGAGAGAAGGTCTTCCC
TCTGCTCCACAGATTTCTTGGTGGAACGCTTTTGGATCTCAGCCGTTGACTCCGGAGATT
CTCTCTGGAGATTCTGATTCATTTGCCGGAGTTAAGGCCAGATCTGCTGGAGGGATAGAA
CAAGGTGTGAATAAACAAAGCAACTCTGTATCTCACTTTGCTTTCTCACTTGGTGAAGTA
AAGAGTTCTGTTCCAAAGCCTCAAGGATCTGCTTTCTCAATGCAACCACCTTACTTGGAA
CTTGGATTTTCTCAGCCACAGATATACACTAAGTATCCATGTGTGGAACAACAATACTAT
GGAGTTCTTTCAGCCTATGGACCTCATAGCAGTGTAATGCTTCCTCTAAACATGGAAACA
GAAGATGGAACAATCTATGTGAACTCAAAGCAATACCATGGAATCATCACGCGACGCCAA
TCACGTGCAAAGGCTGCTGCTATTCTTGATCAGACAAACTGAGTAGCAAATTCCGTAAGC
CTTACATGCATCATTCACGCCATCTCCATGCATTGCGCGTCCTAGAGGATCTGGCGGGAG
ATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2H549TF U 49
AF RR2C318TF U 159
AF RR2H562TF U 1
AF RR2G259TF U 1
BS 1 783 RR2G259TF

RD RR2H549TF 289 0 0
GGCTCCTAACAATTGGGCTTTTCTCTGCCTCTTCCTAGGAATCTGAAGCTCTCTATCTCT
CTCTCACTCTTTCCTGTCCGAACTACTCTTTCATCTTGGCAACATCGAATATCTTGACTT
CCTTTTCATTTTCTTCACTCTTTGTATTGGATCTTGGATATGGCTATGCAAACTATGAGA
GAAGGTCTTCCCTCTGCTCCACAGATTTCTTGGTGGAACGCTTTTGGATCTCAGCCGTTG
ACTCCGGAGATTCTCTCTGGAGATTCTGATTCATTTGCCGGAGTTAAGG

QA 1 289 1 289
DS 

RD RR2C318TF 489 0 0
ATCTTGACTTCCTTTTCATTTTCTTCACTCTTTGTATTGGATCTTGGATATGGCTATGCA
AACTATGAGAGAAGGTCTTCCCTCTGCTCCACAGATTTCTTGGTGGAACGCTTTTGGATC
TCAGCCGTTGACTCCGGAGAGTCTCTCTGGAGATTCTGATTCATTTGCCGGAGTTAAGGC
CAGATCTGCTGGAGGGATAGAACAAGGTGTGAATAAACAAAGCAACTCTGTATCTCACTT
TGCTTTCTCACTTGGTGAAGTAAAGAGTTCTGTTCCAAAGCCTCAAGGATCTGCTTTCTC
AATGCAACCACCTTACTTGGAACTTGGATTTTCTCAGCCACAGATATACACTAAGTATCC
ATGTGTGGAACAACAATACTATGGAGTTCTTTCAGCCTATGGACCTCATAGCAGTGTAAT
GCTTCCTCTAAACATGGAAACAGAAGATGGAACAATCTATGTGAACTCAAAGCAATACCA
TGGAATCAT

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2H562TF 668 0 0
GGAAAGTCTTGGTGAATGAATATCTGTTTCTTGATTTGGAACCGACATGGCTCCTAACAA
TTGGGCTTTTCTCTGCCTCTTCCTAGGAATCTGAAGCTCTCTATCTCTCTCTCACTCTTT
CCTGTCCGAACTACTCTTTCATCTTGGCAACATCGAATATCTTGACTTCCTTTTCATTTT
CTTCACTCTTTGTATTGGATCTTGGATATGGCTATGCAAACTATGAGAGAAGGTCTTCCC
TCTGCTCCACAGATTTCTTGGTGGAACGCTTTTGGATCTCAGCCGTTGACTCCGGAGATT
CTCTCTGGAGATTCTGATTCATTTGCCGGAGTTAAGGCCAGATCTGCTGGAGGGATAGAA
CAAGGTGTGAATAAACAAAGCAACTCTGTATCTCACTTTGCTTTCTCACTTGGTGAAGTA
AAGAGTTCTGTTCCAAAGCCTCAAGGATCTGCTTTCTCAATGCAACCACCTTACTTGGAA
CTTGGATTTTCTCAGCCACAGATATACACTAAGTATCCATGTGTGGAACAACAATACTAT
GGAGTTCTTTCAGCCTATGGACCTCATAGCAGTGTAATGCTTCCTCTAAACATGGAAACA
GAAGATGGAACAATCTATGTGAACTCAAAGCAATACCATGGAATCATCACGCGACGCCCA
TCACGTGC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2G259TF 783 0 0
GGAAAGTCTTGGTGAATGAATATCTGTTTCTTGATTTGGAACCGACATGGCTCCTAACAA
TTGGGCTTTTCTCTGCCTCTTCCTAGGAATCTGAAGCTCTCTATCTCTCTCTCACTCTTT
CCTGTCCGAACTACTCTTTCATCTTGGCAACATCGAATATCTTGACTTCCTTTTCATTTT
CTTCACTCTTTGTATTGGATCTTGGATATGGCTATGCAAACTATGAGAGAAGGTCTTCCC
TCTGCTCCACAGATTTCTTGGTGGAACGCTTTTGGATCTCAGCCGTTGACTCCGGAGATT
CTCTCTGGAGATTCTGATTCATTTGCCGGAGTTAAGGCCAGATCTGCTGGAGGGATAGAA
CAAGGTGTGAATAAACAAAGCAACTCTGTATCTCACTTTGCTTTCTCACTTGGTGAAGTA
AAGAGTTCTGTTCCAAAGCCTCAAGGATCTGCTTTCTCAATGCAACCACCTTACTTGGAA
CTTGGATTTTCTCAGCCACAGATATACACTAAGTATCCATGTGTGGAACAACAATACTAT
GGAGTTCTTTCAGCCTATGGACCTCATAGCAGTGTAATGCTTCCTCTAAACATGGAAACA
GAAGATGGAACAATCTATGTGAACTCAAAGCAATACCATGGAATCATCACGCGACGCCAA
TCACGTGCAAAGGCTGCTGCTATTCTTGATCAGACAAACTGAGTAGCAAATTCCGTAAGC
CTTACATGCATCATTCACGCCATCTCCATGCATTGCGCGTCCTAGAGGATCTGGCGGGAG
ATT

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 5

CO CL1858Contig1 589 5 13 U
GGAAAGACCACACCACACACACGCACCTAGCGAGAGACAGAGAGAGAAGAAATGGCTGCT
TCAGTGATGCTTTCATCGGTGACGTTAAAACCGGCAGGCTTCACTGTGGAGAAGATGTCG
GCCAGAGGATTACCGGCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTCAAAATCGTCGCGAGC
GGTGTCAAGAAGATCAAGACCGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGG
GACGGGGTCGACGCCTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGAC
AAGTATGGAGCTAACGTCGATGGATACAGTCCTATCTACAACGAGGAGGAGTGTTCAGCG
AGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTCACCGGATTGGCTATTTGGGCAGTGACACTCGCC
GGAATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACAAGCGCTTTGGCTCAGTAAATC
TTTTAAAAGACATGTTTCTCTCTATATGTTTGTGTTCTCTGTTTCTCTCTTCTCTGTAAT
GCTCAGAACATACTTTTGAAATTTATAAAAGAACTCTAGTGTTTGCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 10 

AF RR2E281TF U 1
AF RR2FI76JQ C 27
AF RR2GH29JQB C 367
AF RR2GH29TF U 367
AF RR2FI76TF U 27
BS 1 95 RR2E281TF
BS 96 96 RR2FI76TF
BS 97 104 RR2E281TF
BS 105 105 RR2FI76TF
BS 106 317 RR2E281TF
BS 318 318 RR2FI76TF
BS 319 353 RR2E281TF
BS 354 354 RR2FI76TF
BS 355 423 RR2E281TF
BS 424 425 RR2GH29TF
BS 426 586 RR2E281TF
BS 587 588 RR2GH29TF
BS 589 589 RR2FI76JQ

RD RR2E281TF 586 0 0
GGAAAGACCACACCACACACACGCACCTAGCGAGAGACAGAGAGAGAAGAAATGGCTGCT
TCAGTGATGCTTTCATCGGTGACGTTAAAACCGGCGGGCTTCACGGTGGAGAAGATGTCG
GCCAGAGGATTACCGGCGCTCACAAGAGCTTCTCCTTCTTCCTTCAAAATCGTCGCGAGC
GGTGTCAAGAAGATCAAGACCGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGG
GACGGGGTCGACGCCTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGAC
AAGTATGGAGCTAACGTTGATGGATACAGTCCTATCTACAACGAGGAGGAGTGGTCAGCG
AGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTCACCGGATTGGCTATTTGGGCAGTGACACTCGCC
GGA**TCTCGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACAAGCGCTTTGGCTCAGTAAATC
TTTTAAAAGACATGTTTCTCTCTATATGTTTGTGTTCTCTGTTTCTCTCTTCTCTGTAAT
GCTCAGAACATACTTTTGAAATTTATAAAAGAACTCTAGTGTTTGC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2FI76JQ 563 0 0
GG
AGCGAGAGACAGAGAGAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCGGTGACGTTAA
AACCGGCAGGCTTCACTGTGGAGAAGATGTCGGCCAGAGGATTACCGGCGCTCACAAGAG
CTTCTCCTTCTTCCTTCAAAATCGTCGCGAGCGGTGTCAAGAAGATCAAGACCGACAAGC
CCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGGGTCGACGCCTCCGGCAGAAAGG
GCAAGGGTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGACAAGTATGGAGCTAACGTCGATGGATACA
GTCCTATCTACAACGAGGAGGAGTGTTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTCA
CCGGATTGGCTATTTGGGCAGTGACACTCGCCGGAATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTCTTG
TGTACAACACAAGCGCTTTGGCTCAGTAAATCTTTTAAAAGACATGTTTCTCTCTATATG
TTTGTGTTCTCTGTTTCTCTCTTCTCTGTAATGCTCAGAACATACTTTTGAAATTTATAA
AAGAACTCTAGTGTTTGCGTC

QA 3 563 3 563
DS 

RD RR2GH29JQB 223 0 0
GG
TGTGTACAAGGGAGGAGTCACCGGATTGGCTATTTGGGCAGTGGCACTCGCCGGAATTCT
CGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACAAGCGCTTTGGCTCAGTAAATCTTTTAAAA
GACATGTTTCTCTCTATATGTTTGTGTTCTCTGTTTCTCTCTTCTCTGTAATGCTCAGAA
CATACTTTTGAAATTTATAAAAGAACTCTAGTGTTTGCGT
T

QA 3 222 3 222
DS 

RD RR2GH29TF 223 0 0
GG
TGTGTACAAGGGAGGAGTCACCGGATTGGCTATTTGGGCAGTGGCACTCGCCGGAATTCT
CGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACAAGCGCTTTGGCTCAGTAAATCTTTTAAAA
GACATGTTTCTCTCTATATGTTTGTGTTCTCTGTTTCTCTCTTCTCTGTAATGCTCAGAA
CATACTTTTGAAATTTATAAAAGAACTCTAGTGTTTGCGT
T

QA 3 222 3 222
DS 

RD RR2FI76TF 563 0 0
GG
AGCGAGAGACAGAGAGAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCGGTGACGTTAA
AACCGGCAGGCTTCACTGTGGAGAAGATGTCGGCCAGAGGATTACCGGCGCTCACAAGAG
CTTCTCCTTCTTCCTTCAAAATCGTCGCGAGCGGTGTCAAGAAGATCAAGACCGACAAGC
CCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGGGTCGACGCCTCCGGCAGAAAGG
GCAAGGGTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGACAAGTATGGAGCTAACGTCGATGGATACA
GTCCTATCTACAACGAGGAGGAGTGTTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTCA
CCGGATTGGCTATTTGGGCAGTGACACTCGCCGGAATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTCTTG
TGTACAACACAAGCGCTTTGGCTCAGTAAATCTTTTAAAAGACATGTTTCTCTCTATATG
TTTGTGTTCTCTGTTTCTCTCTTCTCTGTAATGCTCAGAACATACTTTTGAAATTTATAA
AAGAACTCTAGTGTTTGCGT
C

QA 3 562 3 562
DS 



AS 1 5

CO CL1859Contig1 749 5 6 U
GAAGAACAAACCACTTTTGGAAGTGAGAGAGAAAAAGAAGCGAGAGAGAACTTCCCGACG
AGATCTACGTTTCCGGCCGACGGTGCGGTCGCCGTCGGTCCGGTTTGCTTGTGTTTTATT
TTTCTTCTTTTTCTTATGTGCATGTCTTAAGAGAGGGAGAGATGTTTGTTCCCTTTTGAG
TTCGGTTTATTTTGACCATCTTTTGTTTCCGGGAAGGAGAGGCTTCTACGGCTCTACCGG
AGTCGGCTCTGTCTTCGGGAGTGGAGGCTTCCTATGCTCTGCGTCGCCGACTTTTGGATA
AAGTTTAATAGTCTGTCCTTCGAGTATGAAGGAGGTTGTTTCTTTGCAGCAAAGATGTAT
GAGATGTTTGGTGTTCTGGCTTTGACGGATGAGATCTCGATCTGTCGATGAAGGCTCTCC
GTAGTAGGATGTTCAGACGAGAAGAGGTTGCGTTATGGTTCATAGTCCGGTGGGATCCGG
TGAAGATGAAGATTACGTGGTGGTTACAGTCCGGTGCGATCCGGTGGAGATGAAGAAGTA
GCGTGGCGGCTGTGTGGGTGGAGTCGCGCGTAGCTAGGGTTTTCACTGTATGGGCTTGAG
CCCAATTATGTTTTTTTAGTTAGCTTGTCTGTTTGGGCCTTCTGATGACTTTTGTAGTGG
TTGGTGGGCTGTTTGGGCCTTCTGATGACTTTTGTAGTGGTTGGTGGGCTTGTACTTGGA
TTTGTTCTTTTATTAAAATCTCAGTTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS83TF U 1
AF RR2EI25TF U 25
AF RR2EI25JQ C 70
AF RR2AS83JQ C 1
AF RR2A413TF U 7
BS 1 6 RR2AS83JQ
BS 7 535 RR2AS83TF
BS 536 536 RR2A413TF
BS 537 651 RR2AS83TF
BS 652 742 RR2A413TF
BS 743 749 RR2AS83JQ

RD RR2AS83TF 651 0 0
GAAGAA
CAAACCACTTTTGGAAGTGAGAGAGAAAAAGAAGCGAGAGAGAACTTCCCGACGAGATCT
ACGTTTCCGGCCGACGGTGCGGTCGCCGTCGGTCCGGTTTGCTTGTGTTTTATTTTTCTT
CTTTTTCTTATGTGCATGTCTTAAGAGAGGGAGAGATGTTTGTTCCCTTTTGAGTTCGGT
TTATTTTGACCATCTTTTGTTTCCGGGAAGGAGAGGCTTCTACGGCTCTACCGGAGTCGG
CTCTGTCTTCGGGAGTGGAGGCTTCCTATGCTCTGCGTCGCCGACTTTTGGATAAAGTTT
AATAGTCTGTCCTTCGAGTATGAAGGAGGTTGTTTCTTTGCAGCAAAGATGTATGAGATG
TTTGGTGTTCTGGCTTTGACGGATGAGATCTCGATCTGTCGATGAAGGCTCTCCGTAGTA
GGATGTTCAGACGAGAAGAGGTTGCGTTATGGTTCATAGTCCGGTGGGATCCGGTGAAGA
TGAAGATTACGTGGTGGTTACAGTCCGGTGCGATCCGGTGGAGATGAAGGAGTAGCGTGG
CGGCTGTGTGGGTGGAGTCGCGCGTAGCTAGGGTTTTCACTGTATGGGCTTGAGCCCAAT
TATGTTTTTTTAGTTAGCTTGTCTGTTTGGGCCTTCTGATGACTT

QA 7 651 7 651
DS 

RD RR2EI25TF 686 0 0
GAGAGAGAAAAAGAAGCGAGAGAGAACTTCCCGACGAGATCTACGTTTCCGGCCGACGGT
GCGGTCGCCGTCGGTCCGGTTTGCTTGTGTTTTATTTTTCTTCTTTTTCTTATGTGCATG
TCTTAAGAGAGGGAGAGATGTTTGTTCCCTTTTGAGTTCGGTTTATTTTGACCATCTTTT
GTTTCCGGGAAGGAGAGGCTTCTACGGCTCTACCGGAGTCGGCTCTGTCTTCGGGAGTGG
AGGCTTCCTATGCTCTGCGTCGCTGACTTTTGGATAAAGTTTAATAGTCTGTCCTTCGAG
TATGAAGGAGGTTGTTTCTTTGCAGCAAAGATGTATGAGATGTTTGGTGTTCTGGCTTTG
ACGGATGAGATCTCGATCTGTCGATGAAGGCTCTCCGTAGTAGGATGTTCAGACGAGAAG
AGGTTGCGTTATGGTTCATAGTCCGGTGGGATCCGGTGAAGATGAAGATTACGTGGTGGT
TACAGTCCGGTGCGATCCGGTGGAGATGAAGAAGTAGCGTGGCGGCTGTGTGGGTGGAGT
CGCGCGTAGCTAGGGTTTTCACTGTATGGGCTTGAGCCCAATTATGTTTTTTTAGTTAGC
TTGTCTGTTTGGGCCTTCTGATGACTTTTGTAGTGGTTGGTGGGCTGTTTGGGCCTTCTG
ATGACTTTTGTAGTGGTTGG
TGGGCT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2EI25JQ 635 0 0
TTTCCGGCCGACGGTGCGGTCGCCGTCGGTCCGGTTTGCTTGTGTTTTATTTTTCTTCTT
TTTCTTATGTGCATGTCTTAAGAGAGGGAGAGATGTTTGTTCCCTTTTGAGTTCGGTTTA
TTTTGACCATCTTTTGTTTCCGGGAAGGAGAGGCTTTTACGGCTCTACCGGAGTCGGCTC
TGTTTTCGGGAGTGGAGGCTTCCTATGCTTTGCGTCGCTGACTTTTGGATAAAGTTTAAT
AGTCTGTCCTTCGAGTATGAAGGAGGTTGTTTTTTTGCAGCAAAGATGTATGAGATGTTT
GGTGTTCTGGCTTTGACGGATGAGATCTCGATCTGTCGATGAAGGCTCTCCGTAGTAGGA
TGTTCAGACGAGAAGAGGTTGCGTTATGGTTCATAGTCCGGTGGGATCCGGTGAAGATGA
AGATTACGTGGTGGTTACAGTCCGGTGCGATCCGGTGGAGATGAAGAAGTAGCGTGGCGG
CTGTGTGGGTGGAGTCGCGCGTAGCTAGGGTTTTCACTGTATGGGCTTGAGCCCAATTAT
GTTTTTTTAGTTAGCTTGTCTGTTTGGGCCTTTTGATGACTTTTGTAGTGGTTGGTGGGC
TGTTTGGGCCTTTTGATGACTTTTGTAG
GGGTTGG

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2AS83JQ 749 0 0
GAAGAACAAACCACTTTTGGAAGTGAGAGAGAAAAAGAAGCGAGAGAGAACTTCCCGACG
AGATCTACGTTTCCGGCCGACGGTGCGGTCGCCGTCGGTCCGGTTTGCTTGTGTTTTATT
TTTCTTCTTTTTCTTATGTGCATGTCTTAAGAGAGGGAGAGATGTTTGTTCCCTTTTGAG
TTCGGTTTATTTTGACCATCTTTTGTTTCCGGGAAGGAGAGGCTTCTACGGCTCTACCGG
AGTCGGCTCTGTCTTCGGGAGTGGAGGCTTCCTATGCTCTGCGTCGCCGACTTTTGGATA
AAGTTTAATAGTCTGTCCTTCGAGTATGAAGGAGGTTGTTTCTTTGCAGCAAAGATGTAT
GAGATGTTTGGTGTTCTGGCTTTGACGGATGAGATCTCGATCTGTCGATGAAGGCTCTCC
GTAGTAGGATGTTCAGACGAGAAGAGGTTGCGTTATGGTTCATAGTCCGGTGGGATCCGG
TGAAGATGAAGATTACGTGGTGGTTACAGTCCGGTGCGATCCGGTGGAGATGAAGGAGTA
GCGTGGCGGCTGTGTGGGTGGAGTCGCGCGTAGCTAGGGTTTTCACTGTATGGGCTTGAG
CCCAATTATGTTTTTTTAGTTAGCTTGTCTGTTTGGGCCTTCTGATGACTTTTGTAGTGG
TTGGTGGGCTGTTTGGGCCTTCTGATGACTTTTGTAGTGTTTGGTGGGCTTGTACTTGGA
TTTGTTCTTTTATTAAAATCTCAGTTGGG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2A413TF 736 0 0
CAAACCACTTTTGGAAGTGAGAGAGAAAAAGAAGCGAGAGAGAACTTCCCGACGAGATCT
ACGTTTCCGGCCGACGGTGCGGTCGCCGTCGGTCCGGTTTGCTTGTGTTTTATTTTTCTT
CTTTTTCTTATGTGCATGTCTTAAGAGAGGGAGAGATGTTTGTTCCCTTTTGAGTTCGGT
TTATTTTGACCATCTTTTGTTTCCGGGAAGGAGAGGCTTCTACGGCTCTACCGGAGTCGG
CTCTGTCTTCGGGAGTGGAGGCTTCCTATGCTCTGCGTCGCCGACCTTTGGATAAAGTTT
AATAGTCTGTCCTTCGAGTATGAAGGAGGTTGTTTCTTTGCAGCAAAGATGTATGAGATG
TTTGGTGTTCTGGCTTTGACGGATGAGATCTCGATCTGTCGATGAAGGCTCTCCGTAGTA
GGATGTTCAGACGAGAAGAGGTTGCGTTATGGTTCATAGTCCGGTGGGATCCGGTGAAGA
TGAAGATTACGTGGTGGTTACAGTCCGGTGCGATCCGGTGGAGATGAAGAAGTAGCGTGG
CGGCTGTGTGGGTGGAGTCGCGCGTAGCTAGGGTTTTCACTGTATGGGCTTGAGCCCAAT
TATGTTTTTTTAGTTAGCTTGTCCGTTTGGGCCTTCTGATGACTTTTGTAGTGGTTGGTG
GGCTGTTTGGGCCTTCTGATGACTTTTGTAGTGGTTGGTGGGCTTGTACTTGGATTTGTT
CTTTTATTAAAATCTC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 3

CO CL1860Contig1 886 3 9 U
GGAGAGAGACAATGGCTACGGCTGCTTCTTCCCTTACAATTGCGTCGTCCTTCTCCGAAC
AACGGACTCAGATTCATTCCTTGAAGCGCTCAAACCTCCCTCTTCAGTACTCCGTCCCGT
ATAATGCCAATTCACGGAGCAGAAGTAGAAGGCTGCGACTCACCGTAACCTCCGTTTCAT
CCCCCAGTGTTGAGCTCCGTACTGGGCCCGATGATCTCATTTCATCCCTCCTCTCCAAGG
TTGCGAACAGCGATGGAGGTGTGGCACTCACCCCTGAGGAACACAAGGAAGTGGCACAAG
TAGCTGGGGAGCTTCAGAAGTATTGTGTGAGCGAGCCTGTTAAATGCCCTCTCATTTTCG
GAGATTGGGACGTGGTGTACTGTTCCAGACCGACCTCTCCTGGTGGAGGCTACAGAAGCG
TGATAGGCCGCCTCTTCTTCAGAACTAAAGAGATGATCCAAGGCATTGATTCTCCTGATA
CCGTGAGGAACAGAGTTTCCTTCACTGCTCTTGGTTTTCTCGACGGAGATGTCTCTTTGA
CAGGGAAGCTGAACGTGCTGGACAGTGAGTGGGTTCAGGTGATATTCGAGCCTCCGGAAC
TAAAGGTGGGATCGTTGGAGTTTAAATACGGTTTCGAAAGCGAAGTGAAGCTTCGGATCA
CATACGTTGATGAGAAACTTAGGTTGGGAATAGGCTCTAGAGGATCACTGTTCGTCTTTA
GGAGACGTCAATAATTAATACATTAAATGAAATTCCATGTCTCTTCTCTCCCAGTTCTGT
ATCATTCAATGCAAATTCACTACAGAAAAGAAGAAACAACATATGGGTGTACCTGCGAGA
GTGTTTTAAGATGGAAACATTGTTGTGTAATGTAAACTTCTATCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2GB12TF U 1
AF RR2GB12JQ C 512
AF RR2G957TF U 601
BS 1 574 RR2GB12TF
BS 575 602 RR2GB12JQ
BS 603 613 RR2G957TF
BS 614 614 RR2GB12JQ
BS 615 628 RR2G957TF
BS 629 629 RR2GB12JQ
BS 630 745 RR2G957TF
BS 746 746 RR2GB12JQ
BS 747 886 RR2G957TF

RD RR2GB12TF 574 0 0
GGAGAGAGACAATGGCTACGGCTGCTTCTTCCCTTACAATTGCGTCGTCCTTCTCCGAAC
AACGGACTCAGATTCATTCCTTGAAGCGCTCAAACCTCCCTCTTCAGTACTCCGTCCCGT
ATAATGCCAATTCACGGAGCAGAAGTAGAAGGCTGCGACTCACCGTAACCTCCGTTTCAT
CCCCCAGTGTTGAGCTCCGTACTGGGCCCGATGATCTCATTTCATCCCTCCTCTCCAAGG
TTGCGAACAGCGATGGAGGTGTGGCACTCACCCCTGAGGAACACAAGGAAGTGGCACAAG
TAGCTGGGGAGCTTCAGAAGTATTGTGTGAGCGAGCCTGTTAAATGCCCTCTCATTTTCG
GAGATTGGGACGTGGTGTACTGTTCCAGACCGACCTCTCCTGGTGGAGGCTACAGAAGCG
TGATAGGCCGCCTCTTCTTCAGAACTAAAGAGATGATCCAAGGCATTGATTCTCCTGATA
CCGTGAGGAACAGAGTTTCCTTCACTGCTCTTGGTTTTCTCGACGGAGATGTCTCTTTGA
CAGGGAAGCTGAACGTGCTGGACAGTGAGTGGGT

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2GB12JQ 374 0 0
TGGTTTTCTCGACGGAGATGTCTCTTTGACAGGGAAGCTGAACGTGCTGGACAGTGAGTG
GGTTCAGGTGATATTCGAGCCTCCGGAACTAAAGGTGGGATCGTTGGAGTTTAAATACGG
TTTCGAAAGCGAAGTGAAGCTTCGGATCACATACGTTGATGAGAAACTTAGGTTGGGAAT
AGGCTCTAGAGGATCGCTGTTCGTCTTTAGGAGGCGTCAATAGTTAATACATTAAATGAA
CTTCCATGTCTCTTCTCTCCCAGTTCTGTATCATTCAATGCAAATTCACTACAGAAAAGA
AGAAACAACATATGGGTGTACCTGCGAGAGTGTTTTAAGATGGAAACATTGTTGTGTAAT
GTAAACTTCTATCC

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR2G957TF 286 0 0
GG
AAGGTGGGATCTTTGGAGTTTAAATATGGTTTCGAAAGCGAAGTGAAGCTTCGGATCACA
TACGTTGATGAGAAACTTAGGTTGGGAATAGGCTCTAGAGGATCACTGTTCGTCTTTAGG
AGACGTCAATAATTAATACATTATATGAAATTCCATGTCTCTTCTCTCCCAGTTCTGTAT
CATTCAATGCAAATTCACTACAGAAAAGAAGAAACAACATATGGGTGTACCTGCGAGAGT
GTTTTAAGATGGAAACATTGTTGTGTAATGTAAACTTCTATCCG

QA 3 286 3 286
DS 



AS 1 4

CO CL1861Contig1 1045 4 11 U
GGAGCCTCATATTATACTCTCTTCCCACAGGTACAGAGAGAAGAGAGAAAGAGAGGAGAA
ATGGGATCCTTATCGGCAGCCACAGTCTTACCGTTCCATCTCCGTCGCCAAAACAAGCAG
CGATCAGGTCTCTACGACCGTCGCCATGAGAATCTACCCGTCGGCGTTTCGTCTTCACAG
AAGAGATGGCTCCTCTACGTCCCGGAGACGAAGCTGAAACGAGAGACTCTGAGGCTCGGT
TTCGTGGCAAGAGCCGCTGACTCCACGAGCTCCTCTCCTTCCGTGGTGGCTGCTTCCGCT
GATAAAACTTTGATCCCTGACGATGAATTCACTCTAGCCAAGATTTCATTTGGTGTTATT
GGGCTCGGTCTCGGTGTCTCGCTCCTCTCTTACGGTTTCGGGGCATACTTTAACATCCTT
CCTGGATCTGAGTGGTCTGCTATTATGCTCACTTATGGATTCCCACTTGCTATTATCGGT
ATGGCTCTCAAGTACGCAGAACTCAAGCCAGTTCCTTGCCTGAGTTATGCTGATGCGGTG
AAGCTTAGGGAGAGCTTTGCTACTCCTATTTTAACCCAGGTTAGAAATGATGTGACGAGA
TACCGTTATGGAGATGAACAACATTTGGAAGAAGCACTAAAACGGATCTTTCAGTATGGA
CTGGGCGGAGGAATACCAAGACGTAGTGCACCTATCTTAACGATGATAAAGGAAGAGGTC
ATGACCGATGGTCGTTACTGCCTCGTCCTTGTATTTGAGGCCAAAGCTCTCAAGTTGTCA
GATTTCGAAAAAAGACAGGCGAAATTCACTTCCTTCTTTGGACCAAACATCACTGCAGAA
GTCGGTGTAGGAGAAAGTGACGATATCTATGAAGTAAGACTGATTTCTAACGCCTATGCA
TCTTCAACGACCTCTTGAATATGAACAAAGCATATACGATCAATTGGCTCTTGTATATCA
ACTTTGTATAATCATCATATGTATAAAAAATTCAGATATCTCTCTTTTTGGCTACGTGTA
TTATGTCAATCTTTATGATTAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV61TF U 1
AF RR2BV27TF U 38
AF RR2EV61JQ C 516
AF RR2BV27JQ C 312
BS 1 254 RR2EV61TF
BS 255 255 RR2BV27TF
BS 256 543 RR2EV61TF
BS 544 544 RR2BV27TF
BS 545 556 RR2EV61TF
BS 557 557 RR2BV27TF
BS 558 625 RR2EV61TF
BS 626 707 RR2BV27TF
BS 708 765 RR2BV27JQ
BS 766 766 RR2EV61JQ
BS 767 1045 RR2BV27JQ

RD RR2EV61TF 626 0 0
GGAGCCTCATATTATACTCTCTTCCCACAGGTACAGAGAGAAGAGAGAAAGAGAGGAGAA
ATGGGATCCTTATCGGCAGCCACAGTCTTACCGTTCCATCTCCGTCGCCAAAACAAGCAG
CGATCAGGTCTCTACGACCGTCGCCATGAGAATCTACCCGTCGGCGTTTCGTCTTCACAG
AAGAGATGGCTCCTCTACGTCCCGGAGACGAAGCTGAAACGAGAGACTCTGAGGCTCGGT
TTCGTGGCAAGAGCTGCTGACTCCACGAGCTCCTCTCCTTCCGTGGTGGCTGCTTCCGCT
GATAAAACTTTGATCCCTGACGATGAATTCACTCTAGCCAAGATTTCATTTGGTGTTATT
GGGCTCGGTCTCGGTGTCTCGCTCCTCTCTTACGGTTTCGGGGCATACTTTAACATCCTT
CCTGGATCTGAGTGGTCTGCTATTATGCTCACTTATGGATTCCCACTTGCTATTATCGGT
ATGGCTCTCAAGTACGCAGAACTCAAGCCAGTTCCTTGCCTGAGTTATGCTGATGCGGTG
AAGTTTAGGGAGAGCTCTGCTACTCCTATTTTAACCCAGGTTAGAAATGATGTGACGAGA
TACCGTTATGGAGATGAACAACATT
C

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2BV27TF 670 0 0
GG
GAAGAGAGAAAGAGAGGAGAAATGGGATCCTTATCGGCAGCCACAGTCTTACCGTTCCAT
CTCCGTCGCCAAAACAAGCAGCGATCAGGTCTCTACGACCGTCGCCATGAGAATCTACCC
GTCGGCGTTTCGTCTTCACAGAAGAGATGGCTCCTCTACGTCCCGGAGACGAAGCTGAAA
CGAGAGACTCTGAGGCTCGGTTTCGTGGCAAGAGCCGCTGACTCCACGAGCTCCTCTCCT
TCCGTGGTGGCTGCTTCCGCTGATAAAACTTT*ATCCCTGACGATGAATTCACTCTAGCC
AAGATTTCATTTGGTGTTATTGGGCTCGGTCTCGGTGTCTCGCTCCTCTCTTACGGTTTC
GGGGCATACTTTAACATCCTTCCTGGATCTGAGTGGTCTGCTATTATGCTCACTTATGGA
TTCCCACTTGCTATTATCGGTATGGCTCTCAAGTACGCAGAACTCAAGCCAGTTCCTTGC
CTGAGTTATGCTGATGCGGTGAAGCTTAGGGAGAGCTT**CTACTCCTATTTTAACCCAG
GTTAGAAATGATGTGACGAGATATCGTTATGGAGATGAACAACATTTGGAAGAAGCACTA
AAACGGATCTTTCAGTATGGACTGGGCGGAGGAATACCAAGACGTAGTGCACCTATCTTA
ACGATGAT

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR2EV61JQ 498 0 0
TTGCCTGAGTTATGCTGATGCGGTGAAGTTTAGGGAGAGCTTTGCTACTCCTATTTTAAC
CCAGGTTAGAAATGATGTGACGAGATACCGTTATGGAGATGAACAACATTCGGAAGAAGC
ACTAAAACGGATATTTCAGTATGGACTGGGCGGAGGAATACCAAGACGTAGTGCACCTAT
TTTAACGATGATAAAGGAAGAGGTTATGACCGATGGTCGTTACTGCCTGGTCCTTGTATT
TGAGGCCAAAGCTCTCAAGTTGTCAGATTTCGAAAAAAGACAGGCGAAATTCACTTCCTT
CTTTGGACCAGACATCACTGCAGAAGTCGGTGTAGGAGAAAGTGACGATCTTTATGAAGT
AAGACTGATTTTTAACGCCTATGCATTTTCAACGACCTCTTGAATATGAACAAAGCATAT
ACGATCAATTGGCTCTTGTATATCAACTTTGTATAATCATCATATGTATAAAAAATTCAG
ATATCTCTCTTTTTGGCT

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2BV27JQ 734 0 0
T
ATCCCTGACGATGAATTCACTCTAGCCAAGATTTCATTTGGTGTTATTGGGCTCGGTCTC
GGTGTCTCGCTCCTCTCTTACGGTTTCGGGGCATACTTTAACATCCTTCCTGGATCTGAG
TGGTCTGCTATTATGCTCACTTATGGATTCCCACTTGCTATTATCGGTATGGCTCTCAAG
TACGCAGAACTCAAGCCAGTTCCTTGCCTGAGTTATGCTGATGCGGTGAGGCTTAGGGAG
AGCTT**CTACTCCTATTTTAACCCAGGTTAGAAATGATGTGACGAGATATCGTTATGGA
GATGAACAACATTTGGAAGAAGCACTAAAACGGATCTTTCAGTATGGACTGGGCGGAGGA
ATACCAAGACGTAGTGCACCTATCTTAACGATGATAAAGGAAGAGGTCATGACCGATGGT
CGTTACTGCCTCGTCCTTGTATTTGAGGCCAAATCTCTCAAGTTGTCAGATTTCGAAAAA
AGACAGGCGAAATTCACTTCCTTCTTTGGACCAAACATCACTGCAGAAGTCGGTGTAGGA
GAAAGTGACGATATCTATGAAGTAAGACTGATTTCTAACGCCTATGCATCTTCAACGACC
TCTTGAATATGAACAAAGCATATACGATCAATTGGCTCTTGTATATCAACTTTGTATAAT
CATCATATGTATAAAAAATTCAGATATCTCTCTTTTTGGCTACGTGTATTATGTCAATCT
TTATGATTAGTTC

QA 2 734 2 734
DS 



AS 1 4

CO CL1862Contig1 973 4 3 U
GGCCACAGTGCCATTACTACTTTTGGTTAATGTGCATGGTACAAGAATGGTGATTAGATT
CACCATTTTAAAAGTTTAATTTGTGAAGTATAAGACTACATAAATAATAAATACAATATA
AAGTTTAATCCTTCTTAATAACTTAACAGTATCATACAGGTGAAGCAGATAGCAGAAACT
CCGGCTGCTTTCTCTGCAAGAGAATTCCACAGAAGAGGCAGAATGGTTTCAGGACAACTT
CGCTAGAGGAAGATTCAGGAAGCGATTTGAGATCATTCGGGAACGAAGGCAATGCGAATA
AGGCCTCTGGAGCGAGCTCTAGAGTCAACCTATTGCAGCATTTGCAGAACCATAAAGGAG
TTGGTGGACATACTTGCATTGAGACGCAACACCCCTCAAGTTTGTGTCCTTGATCACATC
TCTCTTTCCTCTTCTTTTGGTGCGGAGCTTGGCAAACAGCTTCTTCTGGTGAGTGGAAAT
GGACTGGGGCCGCACAATAAGGACAGTTCTCTTCCTCTAATGCGGTTTCTGTGCTATTAC
TTGATCTTGTTAGACTAGATTTTACTTCTAATGAAAGTGTTTGGAGCTGACTATCGACGA
TATCGTGATTGATCTCAACCCATTGTTGCATCTGAGCCAATCCCGCTGGATGCCAATTCC
CAGTGGAAGGAGATGACTCAGCAGTTAGATATGCCGAGAAGCTTAGACCAACCAGTCTTT
CCCGGAGCTCTCTTTCGCTTTCCTGGAGCAGTTTGAGCCACAGATCAATCTCTTCTTCGT
TGTTCATTCTCTGACCTTGCAGTTTTCTGTTGATTTCATCCGTTTTGAGCTCTGATAACA
TTACACGTCTGGAGATTACATTGAGAATGTGTAGCAGCCTTGAAGGAACAGCAGATAAGC
GTTTAGAGATCTTTGGCACAAGATCTTCCATGGGGATATCAGCATGAAACCCAAGGTACG
ACACAGAGAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H265JQ U 1
AF RR2GP12JQ U 172
AF RR2H064JQ U 51
AF RR2H064TF C 273
BS 1 625 RR2H265JQ
BS 626 764 RR2H064JQ
BS 765 973 RR2H064TF

RD RR2H265JQ 627 0 0
GGCCACAGTGCCATTACTACTTTTGGTTAATGTGCATGGTACAAGAATGGTGATTAGATT
CACCATTTTAAAAGTTTAATTTGTGAAGTATAAGACTACATAAATAATAAATACAATATA
AAGTTTAATCCTTCTTAATAACTTAACAGTATCATACAGGTGAAGCAGATAGCAGAAACT
CCGGCTGCTTTCTCTGCAAGAGAATTCCACAGAAGAGGCAGAATGGTTTCAGGACAACTT
CGCTAGAGGAAGATTCAGGAAGCGATTTGAGATCATTCGGGAACGAAGGCAATGCGAATA
AGGCCTCTGGAGCGAGCTCTAGAGTCAACCTATTGCAGCATTTGCAGAACCATAAAGGAG
TTGGTGGACATACTTGCATTGAGACGCAACACCCCTCAAGTTTGTGTCCTTGATCACATC
TCTCTTTCCTCTTCTTTTGGTGCGGAGCTTGGCAAACAGCTTCTTCTGGTGAGTGGAAAT
GGACTGGGGCCGCACAATAAGGACAGTTCTCTTCCTCTAATGCGGTTTCTGTGCTATTAC
TTGATCTTGTTAGACTAGATTTTACTTCTAATGAAAGTGTTTGGAGCTGACTATCGACGA
TATCGTGATTGATCTCAACCCATTG
GT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2GP12JQ 462 0 0
GCAA
AAACTCCGGCTGCTTTCTCTGCAAGAAAATTCCACAGAAGAGGCAGAATGGTTTCAGGAC
AACTTCGCTAGAGGAAGATTCAGGAAGCGATTTGAGATCATTCGGGAACGAAGGCAATGC
GAATAAGGCCTCTGGAGCGAGCTCTAGAGTCAACCTATTGCAGCATTTGCAGAACCATAA
AGGAGTTGGTGGACATACTTGCATTGAGACGCAACACCTCTCAAGTTTGTGTCCTTGATC
ACATCTCTCTTTCCTCTTCTTTTGGTGCGGAGCTTGGCAAACAGCTTCTTCTGGTGAGTG
GAAATGGACTGGGGCCGCACAATAAGGACAGTTCTCTTCCTCTAATGCGGTTTCTGTGCT
ATTACTTGATCTTGTTAGACTAGATTTTACTTCTAATGAAAGTGTTTGGAGCTGACTATC
GACGATATCGTGATTGATCTCAACCCATTGTTGCATCT

QA 5 462 5 462
DS 

RD RR2H064JQ 714 0 0
TGATTAGATTCACCATTTTAAAAGTTTAATTTGTGAAGTATAAGACTACATAAATAATAA
ATACAATATAAAGTTTAATCCTTCTTAATAACTTAACAGTATCATACAGGTGAAGCAGAT
AGCAGAAACTCCGGCTGCTTTCTCTGCAAGAGAATTCCACAGAAGAGGCAGAATGGTTTC
AGGACAACTTCGCTAGAGGAAGATTCAGGAAGCGATTTGAGATCATTCGGGAACGAAGGC
AATGCGAATAAGGCCTCTGGAGCGAGCTCTAGAGTCAACCTATTGCAGCATTTGCAGAAC
CATAAAGGAGTTGGTGGACATACTTGCATTGAGACGCAACACCCCTCAAGTTTGTGTCCT
TGATCACATCTCTCTTTCCTCTTCTTTTGGTGCGGAGCTTGGCAAACAGCTTCTTCTGGT
GAGTGGAAATGGACTGGGGCCGCACAATAAGGACAGTTCTCTTCCTCTAATGCGGTTTCT
GTGCTATTACTTGATCTTGTTAGACTAGATTTTACTTCTAATGAAAGTGTTTGGAGCTGA
CTATCGACGATATCGTGATTGATCTCAACCCATTGTTGCATCTGAGCCAATCCCGCTGGA
TGCCAATTCCCAGTGGAAGGAGATGACTCAGCAGTTAGATATGCCGAGAAGCTTAGACCA
ACCAGTCTTTCCCGGAGCTCTCTTTCGCTTTCCTGGAGCAGTTTGAGCCACAGA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2H064TF 701 0 0
TCATTCGGGAACGAAGGCAATGCGAATAAGGCCTCTGGAGCGAGCTCTAGAGTCAACCTA
TTGCAGCATTTGCAGAACCATAAAGGAGTTGGTGGACATACTTGCATTGAGACGCAACAC
CCCTCAAGTTTGTGTCCTTGATCACATCTCTCTTTCCTCTTCTTTTGGTGCGGAGCTTGG
CAAACAGCTTCTTCTGGTGAGTGGAAATGGACTGGGGCCGCACAATAAGGACAGTTCTCT
TCCTCTAATGCGGTTTCTGTGCTATTACTTGATCTTGTTAGACTAGATTTTACTTCTAAT
GAAAGTGTTTGGAGCTGACTATCGACGATATCGTGATTGATCTCAACCCATTGTTGCATC
TGAGCCAATCCCGCTGGATGCCAATTCCCAGTGGAAGGAGATGACTCAGCAGTTAGATAT
GCCGAGAAGCTTAGACCAACCAGTCTTTCCCGGAGCTCTCTTTCGCTTTCCTGGAGCAGT
TTGAGCCACAGATCAATCTCTTCTTCGTTGTTCATTCTCTGACCTTGCAGTTTTCTGTTG
ATTTCATCCGTTTTGAGCTCTGATAACATTACACGTCTGGAGATTACATTGAGAATGTGT
AGCAGCCTTGAAGGAACAGCAGATAAGCGTTTAGAGATCTTTGGCACAAGATCTTCCATG
GGGATATCAGCATGAAACCCAAGGTACGACACAGAGAGCCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 0 0

AS 1 5

CO CL1864Contig1 1333 5 28 U
GGAACAACATAAAAGAAACCATCAAAAAGGAGATTTCTCCATCTTAACCTCTTCCTTTAT
TCCGTTCACGGCTACGTTCTTATCTACTCACAAGAACCCCAACAGATCAATAAAAAGACT
CTTACTTTCCCTCTCTCCCCTTGCTGAAAAAGATCAATGGGTTCTTCTGCGGAGCAGTGC
ATTTTGGTGACTGGTGGTGCTGGGTTCATTGGGACGCACACTGTTGTTCAGCTTTTGAAT
CAGGGCTTCAAGGTTTCCATCATCGACAATCTTGATAACTCTGTCCTTGAAGCTGTCCAT
AGGGTTCGTGAGCTTGTTGGTCCTGATCTCTCTTCCAAGCTTGAATTCCATCTGGGTGAT
TTGAGAAACAAAGGAGACATTGAGAAACTCTTTTCCAATCAGAGATTCGATGCTGTGATT
CACTTTGCTGGTCTTAAAGCTGTGGGTGAAAGTGTAGCAAACCCTCGTCGTTACTTTGAC
AACAACTTAGTTGGAACTATCAATCTCTATGAGACAATGGCAAAGTACAACTGCAAAATG
ATGGTGTTTTCTTCGTCGGCAACAGTTTATGGCCAACCAGAGATAGTCCCTTGTGTGGAA
GACTTTGAGTTACAGGCTATGAATCCTTACGGTCGCACCAAGCTGTATCTTGAAGAGATA
GCTAGAGACATTCACGCGGCAGAGCCAGAGTGGAGGATAATTCTTCTGAGGTACTTCAAT
CCAGTCGGAGCTCACGAGAGCGGAAGGATTGGAGAAGATCCAAAGGGCATACCGAACAAT
CTCATGCCTTATATCCAGCAAGTTGCGGTTGGAAGGTTACCTGAGCTCAATGTATTTGGA
CATGACTATCCTACACCGGATGGTAGCGCGGTCAGAGACTATATCCATGTGATGGATTTA
GCAGATGGACATGTCGCTGCGCTGAACAAGCTGTTTAATGATCCAAAGATTGGTTGTACT
GCTTATAATCTTGGGACTGGTCAAGGAACTTCTGTCTTGGAAATGGTTTCTGCTTTCGAA
AAAGCTTCTGGCAAGAAAATCCCAATGAAGCTATGTCCAAGAAGAGCTGGAGATGCAACA
GCTGTTTATGCTTCAACTAAGAGAGCTGAGAAAGAACTTGGATGGAAGGCACAATATGGA
GTGGATGAGATGTGCAGAGATCAATGGAACTGGGCAAATAAGAATCCATGGGGTTTCCAG
GAAAAGCCTTGACCATCTTTCATTTTCTCTTTTAAGTTTTTTCTTTTTCTTTCACCACTT
AACATAAAGAAAGGGAAATAAGAATTGTATCGAACGAGTCTTCTTCCAGTTAATAAGAAT
TTACGCTATCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2GP77TF U 7
AF RR2BN53TF U 1
AF RR2BM22TF U 151
AF RR2BN53JQ C 594
AF RR2GP77JQ C 710
BS 1 224 RR2BN53TF
BS 225 225 RR2GP77TF
BS 226 363 RR2BN53TF
BS 364 364 RR2GP77TF
BS 365 494 RR2BN53TF
BS 495 495 RR2GP77TF
BS 496 631 RR2BN53TF
BS 632 632 RR2BM22TF
BS 633 671 RR2BN53TF
BS 672 672 RR2BM22TF
BS 673 699 RR2BN53TF
BS 700 700 RR2BM22TF
BS 701 710 RR2BN53TF
BS 711 711 RR2BM22TF
BS 712 725 RR2BN53TF
BS 726 815 RR2BM22TF
BS 816 816 RR2BN53JQ
BS 817 914 RR2BM22TF
BS 915 945 RR2BN53JQ
BS 946 946 RR2GP77JQ
BS 947 1267 RR2BN53JQ
BS 1268 1268 RR2GP77JQ
BS 1269 1279 RR2BN53JQ
BS 1280 1280 RR2GP77JQ
BS 1281 1322 RR2BN53JQ
BS 1323 1323 RR2GP77JQ
BS 1324 1331 RR2BN53JQ
BS 1332 1333 RR2GP77JQ

RD RR2GP77TF 672 0 0
GG
ATAAAAGAAACCATCAAAAAGGAGATTTCTCCATCTTAACCTCTTCCTTTATTCCGTTCA
CGGCTACGTTCTTATCTACTCACAAGAACCCCAACAGATCAATAAAAAGACTCTTACTTT
CCCTCTCTCCCCTTGCTGAAAAAGATCAATGGGTTCTTCTGCGGAGCAGTGCATTTTGGT
GACTGGTGGTGCTGGGTTCATTGGGACGCACACTGTTGTTCAGCTTTTGAATCAGGGCTT
CAAGGTTTCCATCATCGACAATCTTGATAACTCTGTCCTTGAAGCTGTCCATAGGGTTCG
TGAGCTTGTTGGTCCTGATCTCTCTTCCAAGCTTGAATTCCATCTGGGTGATTTGAGAAA
CAAAGGAGACATTGAGAAACTCTTTTCCAATCAGAGATTCGATGCTGTGATTCACTTTGC
TGGTCTTAAAGCTGTGGGTGAAAGTGTAGCAAACCCTCGTCGTTACTTTGACAACAACTT
AGTTGGAACTATCAATCTCTATGAGACAATGGCAAAGTACAACTGCAAAATGATGGTGTT
TTCTTCGTCGGCAACAGTTTATGGCCAACCAGAGATAGTCCCTTGTGTGGAAGACTTTGA
GTTACAG*CTATGAATCCTTACG*TCGCACCAAGCTGTATCTTGAAGAGATAGCTAGAGA
CAT
TCACGCG

QA 3 665 3 665
DS 

RD RR2BN53TF 725 0 0
GGAACAACATAAAAGAAACCATCAAAAAGGAGATTTCTCCATCTTAACCTCTTCCTTTAT
TCCGTTCACGGCTACGTTCTTATCTACTCACAAGAACCCCAACAGATCAATAAAAAGACT
CTTACTTTCCCTCTCTCCCCTTGCTGAAAAAGATCAATGGGTTCTTCTGCGGAGCAGTGC
ATTTTGGTGACTGGTGGTGCTGGGTTCATTGGGACGCACACTGTCGTTCAGCTTTTGAAT
CAGGGCTTCAAGGTTTCCATCATCGACAATCTTGATAACTCTGTCCTTGAAGCTGTCCAT
AGGGTTCGTGAGCTTGTTGGTCCTGATCTCTCTTCCAAGCTTGAATTCCATCTGGGTGAT
TTG*GAAACAAAGGAGACATTGAGAAACTCTTTTCCAATCAGAGATTCGATGCTGTGATT
CACTTTGCTGGTCTTAAAGCTGTGGGTGAAAGTGTAGCAAACCCTCGTCGTTACTTTGAC
AACAACTTAGTTGGGACTATCAATCTCTATGAGACAATGGCAAAGTACAACTGCAAAATG
ATGGTGTTTTCTTCGTCGGCAACAGTTTATGGCCAACCAGAGATAGTCCCTTGTGTGGAA
GACTTTGAGTTACAGGCTATGAATCCTTACG*TCGCACCAAGCTGTATCTTGAAGAGATA
GCTAGAGACAT*CACGCGGCAGAGCCAGAGTGGAGGATA*TTCTTCTGAG*TACTTCAAT
CCAGT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2BM22TF 764 0 0
G
GATCAATGGGTTCTTCTGCGGAGCAGTGCATTTTGGTGACTGGTGGTGCTGGGTTCATTG
GGACGCACACTGTTGTTCAGCTTTTGAATCAGGGCTTCAAGGTTTCCATCATCGACAATC
TTGATAACTCTGTCCTTGAAGCTGTCCATAGGGTTCGTGAGCTTGTTGGTCCTGATCTCT
CTTCCAAGCTTGAATTCCATCTGGGTGATTTGAGAAACAAAGGAGACATTGAGAAACTCT
TTTCCAATCAGAGATTCGATGCTGTGATTCACTTTGCTGGTCTTAAAGCTGTGGGTGAAA
GTGTAGCAAACCCTCGTCGTTACTTTGACAACAACTTAGTTGGAACTATCAATCTCTATG
AGACAATGGCAAAGTACAACTGCAAAATGATGGTGTTTTCTTCGTCGGCAACAGTTTATG
GCCAACCAGAGATAGTCCCTTGTGTGGAAGACTTTGAGTTACAGGCTATGAATCCTTACG
GTCGCACCAAGCTGTATCTTGAAGAGATAGCTAGAGACATTCACGCGGCAGAGCCAGAGT
GGAGGATAATTCTTCTGAGGTACTTCAATCCAGTCGGAGCTCACGAGAGCGGAAGGATTG
GAGAAGATCCAAAGGGCATACCGAACAATCTCATGCCTTATATCCAGCAAGTTGCGGTTG
GAAG*TTACCTGAGCTCAATGTATTTGGACATGACTATCCTACACCGGATGGTAGCGCGG
TCAGAGACTATATCCATGTGATGGATTTAGCAGATGGACATGT

QA 2 764 2 764
DS 

RD RR2BN53JQ 738 0 0
TGTGGAAGACTTTGAGTTACAGGCTATGAATCTTTACGGTCGCACCAAGCTGTATCTTGA
AGAGATAGCTAGAGACATTCACGCGGCAGAGCCAGAGTGGAGGATAATTCTTCTGAGGTA
CTTCAATCCAGTCGGAGCTCACGAGAGCGGAAGGATTGGAGAAGATCCAAAGGGCATACC
GAACAATCTCATGCCTTATATCCAGCAAGTTGCGGTTGGAAGGTTACCTGAGCTCAATGT
ATTTGGACATGACTATCCTACACCGGATGGTAGCGCGGTCAGAGACTATATCCATGTGAT
GGATTTAGCAGATGGACATGTCGCTGCGCTGAACAAGCTGTTTAATGATCCAGAGATTGG
TTGTACTGCTTATAATCTTGGGACTGGTCAAGGAACTTCTGTCTTGGAAATGGTTTCTGC
TTTCGAAAAAGCTTCTGGCAAGAAAATCCCAATGAAGCTATGTCCAAGAAGAGCTGGAGA
TGCAACAGCTGTTTATGCTTCAACTAAGAGAGCTGAGAAAGAACTTGGATGGAAGGCACA
ATATGGAGTGGATGAGATGTGCAGAGATCAATGGAACTGGGCAAATAAGAATCCATGGGG
TTTCCAGGAAAAGCCTTGACCATCTTTCATTTTCTCTTTTAAGTTTTTTCTTTTTCTTTC
ACCACTTAACATAA*GAAAGGGAAATGAGAATTGTATCGAACGAGTCTTCTTCCAGTTAA
TAAGAATTTGCGCTATCC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2GP77JQ 624 0 0
GGTACTTCAATCCAGTCGGAGCTCACGAGAGCGGAAGGATTGGAAAAGATCCAAAGGGCA
TACCGAACAATCTCATGCCTTATATCCAGCAAGTTGCGGTTGGAAGGTTACCTGAGCTCA
ATGTATTTGGACATGACTATCCTACACCGGATGGTAGCGCGGTCAGAGACTATGTCCATG
TGATGGATTTAGCAGATGGACATGTCGCTGCGCTGAACAAGCTGTTTAATGATCCAAAGA
TTGGTTGTACTGCTTATAATCTTGGGACTGGTCAAGGAACTTCTGTCTTGGAAATGGTTT
CTGCTTTCGAAAAAGCTTCTGGCAAGAAAATCCCAATGAAGCTATGTCCAAGAAGAGCTG
GAGATGCAACAGCTGTTTATGCTTCAACTAAGAGAGCTGAGAAAGAACTTGGATGGAAGG
CACAATATGGAGTGGATGAGATGTGCAGAGATCAATGGAACTGGGCAAATAAGAATCCAT
GGGGTTTCCAGGAAAAGCCTTGACCATCTTTCATTTTCTCTTTTAAGTTTTTTCTTTTTC
TTTCACCACTTAACATAAAGAAAGGGAAATAAGAATTGTATCGAACGAGTCTTCTTCCAG
TTAATAAGAATTTACGCTATCCAC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 5

CO CL1865Contig1 1340 5 7 U
GGAAAATCGAAAGCAAAAGAAGAAAAATGCAAGCAATCGGCAGCTATGGCTGCCTCTGCT
TCAAGCACTACCACTCTCTCTCTAAGTTCATCTCTCCTACTCCTTCTCCTTCTCCATCAC
TTCTTCCTCAGAGATGCCACTCCCTCTGTTGCCCCAAGCTTGGAAGTAGCAGCAACAGCA
ACACTGAGAACGGGCGAGGAAGAAGCGTTACAGTGAGAGCCTCAGTAGAAGACGGCACTG
ACGACAACTTTGCTCCGATTGCTCCTGTTGAGCTGGAATCTCCCGTGGGACAGCTTCTGG
ACCAGATTCTTAGGACTCATCCTCATCTCTTACCCGTCACTGTCGATCAGCAACTCGACA
AGTTATCCACCGAAAACGAGAACCTCAAAGCCGAATCGTCTTCTTCACAAGACATTCTCT
CTAAGAGGATATCTGAAGTTAAGGATAAGGAAAAACGTAAAACATTGGCAGAGATCATTT
ACTGCTTAGTAGTTCATAGATTTGTGGAGAAAGGTATCACTATGATCCCTCAAATTAAAC
CAACTTCAGATCCAGCAGGACGGATAGACTTATGGCCAAACCAAGAAGAGAAGCTTGAAG
TCATTCACTCTGCGGAAGCCTTCGAGATGATACAGAGCCACTTGTCTTCCGTTCTTGGAG
ACGGAACAGCTGTCGGTCCATTAAGCTCCATAGTTCAGATAAGCAAGATCAAACTCGGGA
AACTCTATGCTGCTTCCGTCATGTATGGCTACTTCCTCAGAAGAATCGACCAGAGATACC
AGCTTGAGAGAACCATGAACACACTTCCGAAACGGCCTGAGAAAAACAGGGAACGGTACG
AAGAACCTTCCCCTCCGTACCCGTTATGGGACCCGGATTCCTTGATCCGGATCCAACCGG
AGGAATATGATCCTGATGAGTATGCAATACAGAGAAATGAAGATGAGTCGTCTTCTTACG
GGTTGAGATCATATGTTACCTACTTGGACTCGGATACGCTTCAGAGATACGCCACGATAC
GGTCAAAAGAAGCCATGTCGCTGATAGAGAAGCAGACTCAGGCGCTCTTTGGACGACCAG
ACATAAGGGTACTGGAGGACGGTAAGCTGGATACGTCTAACGATGAGGTTCTGTCTCTGA
GTTTCTCTGGACTTGCGATGTTGGTTTTGGAAGCTGTGACCTTTGGGTCTTTCTTATGGG
ATGCAGAGAGCTACGTTGAATCTAAATACCATTTCCTCAAGGCTTGAGCTTAGTCCTCAT
TTGTATGTTGTTTTCCAAGTTATATGTAAAGAAAGAAGACATTTGTATTTGTACTTTTGA
ATGTAAATTGTTAATCCCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2AF10TF U 1
AF RR2F577TF U 557
AF RR2DB47TF U 530
AF RR2AF10JQ C 549
AF RR2DB47JQ C 625
BS 1 764 RR2AF10TF
BS 765 765 RR2DB47TF
BS 766 791 RR2AF10TF
BS 792 792 RR2DB47TF
BS 793 810 RR2AF10TF
BS 811 1220 RR2DB47TF
BS 1221 1340 RR2AF10JQ

RD RR2AF10TF 810 0 0
GGAAAATCGAAAGCAAAAGAAGAAAAATGCAAGCAATCGGCAGCTATGGCTGCCTCTGCT
TCAAGCACTACCACTCTCTCTCTAAGTTCATCTCTCCTACTCCTTCTCCTTCTCCATCAC
TTCTTCCTCAGAGATGCCACTCCCTCTGTTGCCCCAAGCTTGGAAGTAGCAGCAACAGCA
ACACTGAGAACGGGCGAGGAAGAAGCGTTACAGTGAGAGCCTCAGTAGAAGACGGCACTG
ACGACAACTTTGCTCCGATTGCTCCTGTTGAGCTGGAATCTCCCGTGGGACAGCTTCTGG
ACCAGATTCTTAGGACTCATCCTCATCTCTTACCCGTCACTGTCGATCAGCAACTCGACA
AGTTATCCACCGAAAACGAGAACCTCAAAGCCGAATCGTCTTCTTCACAAGACATTCTCT
CTAAGAGGATATCTGAAGTTAAGGATAAGGAAAAACGTAAAACATTGGCAGAGATCATTT
ACTGCTTAGTAGTTCATAGATTTGTGGAGAAAGGTATCACTATGATCCCTCAAATTAAAC
CAACTTCAGATCCAGCAGGACGGATAGACTTATGGCCAAACCAAGAAGAGAAGCTTGAAG
TCATTCACTCTGCGGAAGCCTTCGAGATGATACAGAGCCACTTGTCTTCCGTTCTTGGAG
ACGGAACAGCTGTCGGTCCATTAAGCTCCATAGTTCAGATAAGCAAGATCAAACTCGGGA
AACTCTATGCTGCTTCCGTCATGTATGGCTACTTCCTCAGAAGA*TCGACCAGAGATACC
AGCTTGAGAGA*CCATGAACACACTTCCGA

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR2F577TF 501 0 0
G
GGACGGATAGACCTATGGCCAAACCAAGAAGAGAAGCTTGAAGTCATTCACTCTGCGGAA
GCCTTCGAGATGATACAGAGCCACTTGTCTTCCGTTCTTGGAGACGGAACAGCTGTCGGT
CCATTAAGCTCCATAGTTCAGATAAGCAAGATCAAACTCGGGAAACTCTATGCTGCTTCC
GTCATGTATGGCTACTTCCTCAGAAGAATCGACCAGAGATACCAGCTTGAGAGAACCATG
AACACACTTCCGAAACGGCCTGAGAAAAACAGGGGACGGTACGAAGAACCTTCCCCTCCG
TACCCGTTATGGGACCCGGATTCCTTGATCCGGATCCAACCGGAGGAATATGATCCTGAT
GAGTATGCAATACAGAGAAATGAAGATGAGTCGTCTTCTTACGGGTTGAGATCATATGTT
ACCTACTTGGACTCGGATACGCTTCAGAGATACGCCACGATACGGTCAAAAGAAGCCATG
TCGCTGATAGAGAAGCAGAC

QA 2 501 2 501
DS 

RD RR2DB47TF 691 0 0
GGAG
ATTAAACCAACTTCAGATCCAGCAGGACGGATAGACTTATGGCCAAACCAAGAAGAGAAG
CTTGAAGTCATTCACTCTGCGGAAGCCTTCGAGATGATACAGAGCCACTTGTCTTCCGTT
CTTGGAGACGGAACAGCTGTCGTTCCATTAAGCTCCATAGTTCAGATAAGCAAGATCAAA
CTCGGGAAACTCTATGCTGCTTCCGTCATGTATGGCTACTTCCTCAGAAGAATCGGCCAG
AGATACCAGCTTGAGAGAACCATGAACACACTTCCGAAACGGCCTGAGAAAAACAGGGAA
CGGTACGAAGAACCTTCCCCTCCGTACCCGTTATGGGACCCGGATTCCTTGATCCGGATC
CAACCGGAGGAATATGATCCTGATGAGTATGCAATACAGAGAAATGAAGATGAGTCGTCT
TCTTACGGGTTGAGATCATATGTTACCTACTTGGACTCGGATACGCTTCAGAGATACGCC
ACGATACGGTCAAAAGAAGCCATGTCGCTGATAGAGAAGCAGACTCAGGCGCTCTTTGGA
CGACCAGACATAAGGGTACTGGAGGACGGTAAGCTGGATACGTCTAACGATGAGGTTCTG
TCTCTGAGTTTCTCTGGACTTGCGATGTTGGTTTTGGAAGCTGTGACCTTTGGGTCTTTC
TTATGGGATGCAGAGAGCTACGTTGAA

QA 5 691 5 691
DS 

RD RR2AF10JQ 792 0 0
GATCCAGCAGGACGGATAGACTTATGGCCAAACCAAGAAGAGAAGCTTGAAGTCATTCAC
TCTGCGGAAGCCTTCGAGATGATACAGAGCCACTTGTCTTCCGTTCTTGGAGACGGAACA
GCTGTCGGTCCATTAAGCTCCATAGTTCAGATAAGCAAGATCAAACTCGGGAAACTCTAT
GCTGCTTCCGTCATGTATGGCTACTTCCTCAGAAGAATCGACCAGAGATACCAGCTTGAG
AGAACCATGAACACACTTCCGAAACGGCCTGAGAAAAACAGGGAACGGTACGAAGAACCT
TCCCCTCCGTACCCGTTATGGGACCCGGATTCCTTGATCCGGATCCAACCGGAGGAATAT
GATCCTGATGAGTATGCAATACAGAGAAATGAAGATGAGTCGTCTTCTTACGGGTTGAGA
TCATATGTTACCTACTTGGACTCGGATACGCTTCAGAGATACGCCACGATACGGTCAAAA
GAAGCCATGTCGCTGATAGAGAAGCAGACTCAGGCGCTCTTTGGACGACCAGACATAAGG
GTACTGGAGGACGGTAAGCTGGATACGTCTAACGATGAGGTTCTGTCTCTGAGTTTCTCT
GGACTTGCGATGTTGGTTTTGGAAGCTGTGACCTTTGGGTCTTTCTTATGGGATGCAGAG
AGCTACGTTGAATCTAAATACCATTTCCTCAAGGCTTGAGCTTAGTCCTCATTTGTATGT
TGTTTTCCAAGTTATATGTAAAGAAAGAAGACATTTGTATTTGTACTTTTGAATGTAAAT
TGTTAATCCCGT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2DB47JQ 715 0 0
AGATGATACAGAGCCACTTGTCTTCCGTTCTTGGAGACGGAACAGCTGTCGTTCCATTAA
GCTCCATAGTTCAGATAAGCAAGATCAAACTCGGGAAACTCTATGCTGCTTCCGTCATGT
ATGGCTACTTCCTCAGAAGAATCGGCCAGAGATACCAGCTTGAGAGAACCATGAACACAC
TTCCGAAACGGCCTGAGAAAAACAGGGAACGGTACGAAGAACCTTCCCCTCCGTACCCGT
TATGGGACCCGGATTCCTTGATCCGGATCCAACCGGAGGAATATGATCCTGATGAGTATG
CAATACAGAGAAATGAAGATGAGTCGTCTTCTTACGGGTTGAGATCATATGTTACCTACT
TGGACTCGGATACGCTTCAGAGATACGCCACGATACGGTCAAAAGAAGCCATGTCGCTGA
TAGAGAAGCAGACTCAGGCGCTCTTTGGACGACCAGACATAAGGGTACTGGAGGACGGTA
AGCTGGATACGTCTAACGATGAGGTTCTGTCTCTGAGTTTCTCTGGACTTGCGATGTTGG
TTTTGGAAGCTGTGACCTTTGGGTCTTTCTTATGGGATGCAGAGAGCTACGTTGAATCTA
AATACCATTTCCTCAAGGCTTGAGCTTAGTCCTCATTTGTATGTTGTTTTCCAAGTTATA
TGTAAAGAAAGAAGACATTTGTATTTGTACTTTTGAATGTAAATTGTTAATCCC
T

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 5

CO CL1866Contig1 1239 5 11 U
GGCTAATCTGAAAAGATATCGCAAAGCGGCAGGCAGCCCAGGGTTTATAACGACATGTTG
GAGGACACGTACGCTAGCAGGGTAACCGCCTGCATGGTACCGTTTGATAGTGAGGCTGCT
GCTAAGCAAAAAGCCATCCTCGAGAAATACACCAATCCCTGGGTTAGGATATCTGTTGAA
GGATTCAGGTGTTGTAAGTACGTTGAGGATGAAATCAGGATTGAATTGATTAATCTCTTC
AAATCATGTGGCCGTGACAGTAGAGTTGATTTCCCCAGAGAGCCTCTTTTGGACAGACGT
GCTTTTGTCACTCTTCGTGCACATGGTGATGATGCACATGTCGCAAAAGAGAAAGCGTTG
CAACTTAATGGAAGTAAAATGAGAGGTTGGAATGCCCTTGTCAAGATTGCACCCGAGGAA
GAGGATGAGGAATACCTGGCGTTATCAGCTTATAGAGAAGCTCTTGGTGATGATCTATTA
TATGACAAAAGATTTATGTTTGGCATTTCCGTTGAGGGGTATGACACCTCCCTTCGTGAA
GATGAAGTCGAGAAGGCTTTGACTACACATTTCTCTTCTTGTGGAGAGATAACACATGTT
TACGTTGATCTCCAGTACAAGTTTACTAATATCTATTTTTCCAAAGAAGAAGGAGAAGCT
AGTGCCATGGCTCTTGATGGAAGTCAAGTGGACGGATTCAAAATAACTACTTCGCTCGTA
GCCACAACAGCCAGTAGTTACACTCCCCTTCCCCCTGATGAAACTTATTTTGGCTCTTGT
TACCCAGCTCATATGCTCGAGTTTGGCGAGGAGATGCAGGAGAAGATCGATTTTTATATG
ACTGAGTGGAGGCTCAATGCGATGACAAAGAAGCTCAGGGCTCTTAAGAAGCACAAGGTC
TGGACTCTTAGGGAGCCTAAGCTCAAGGCTCTTAAGAAGCCCAAGGCCGGGGCTCTTAAG
AAGCTTAAGGCCTGGGCTCTTAGGAAGGAGCTTAAGGCCTGGGCCCTTAAGAAGCTTAAG
GCCAGGGCTCTTAAGAAGCTTAAGGCCAAGGCCAGGGCCAGGAGGGAGAAGGGTCAGAGT
CCTCTTGAGAAGGAGAGGATGTTGATGTAATAAATTTCTCCCTAAGAGACTAACAGAAAC
TCTTTGGTGTTTATCAATCCTGTGATAATACTATTATGCAACCTTCCGTTTGTTTGTGTG
TGTTTTGTGGATGATAAACTTAAAAACTTATTTATCTTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP75TF U 3
AF RR2DJ38TF U 1
AF RR2E507TF U 365
AF RR2DJ38JQ C 548
AF RR2BP75JQ C 541
BS 1 38 RR2DJ38TF
BS 39 39 RR2BP75TF
BS 40 531 RR2DJ38TF
BS 532 532 RR2BP75TF
BS 533 652 RR2DJ38TF
BS 653 653 RR2E507TF
BS 654 705 RR2DJ38TF
BS 706 706 RR2E507TF
BS 707 750 RR2DJ38TF
BS 751 1001 RR2E507TF
BS 1002 1239 RR2BP75JQ

RD RR2BP75TF 688 0 0
GG
AATCTGAAAAGATATCGCAAAGCGGCAGGCAGCCCAGGGTTTATAACGACATGTTGGAGG
ACACGTACGCTAGCAGGGTAACCGCCTGCATGGTACCGTTTGATAGTGAGGCTGCTGCTA
AGCAAAAAGCCATCCTCGAGAAATACACCAATCCCTGGGTTAGGATATCTGTTGAAGGAT
TCAGGTGTTGTAAGTACGTTGAGGATGAAATCAGGATTGAATTGATTAATCTCTTCAAAT
CATGTGGCCGTGACAGTAGAGTTGATTTCCCCAGAGAGCCTCTTTTGGACAGACGTGCTT
TTGTTACTCTTCGTGCACATGGTGATGATGCACATGTCGCAAAAGAGAAAGCGTTGCAAC
TTAATGGAAGTAAAATGAGAGGTTGGAATGCCCTTGTCAAGATTGCACCCGAGGAAGAGG
ATGAGGAATACCTGGCGTTATCAGCTTATAGAGAAGCTCTTGGTGATGATCTATTATATG
ACAAAAGATTTATGTTTGGCATTTCCGTTGAGGGGTATGACACCTCCCTTCGTGAAGATG
AAGTCGAGAAGGCTTTGACTACACATTTCTCTTCTTGTGGAGAGATAACACATGTTTACG
TTGATCTCCAGTACAAGTTTACTAATATCTATTTTTCCAAAGAAGAAG*AGAAGCTAGTG
CCATGGCTCTTGATGGAAGTCAAGTG

QA 3 688 3 688
DS 

RD RR2DJ38TF 750 0 0
GGCTAATCTGAAAAGATATCGCAAAGCGGCAGGCAGCCTAGGGTTTATAACGACATGTTG
GAGGACACGTACGCTAGCAGGGTAACCGCCTGCATGGTACCGTTTGATAGTGAGGCTGCT
GCTAAGCAAAAAGCCATCCTCGAGAAATACACCAATCCCTGGGTTAGGATATCTGTTGAA
GGATTCAGGTGTTGTAAGTACGTTGAGGATGAAATCAGGATTGAATTGATTAATCTCTTC
AAATCATGTGGCCGTGACAGTAGAGTTGATTTCCCCAGAGAGCCTCTTTTGGACAGACGT
GCTTTTGTCACTCTTCGTGCACATGGTGATGATGCACATGTCGCAAAAGAGAAAGCGTTG
CAACTTAATGGAAGTAAAATGAGAGGTTGGAATGCCCTTGTCAAGATTGCACCCGAGGAA
GAGGATGAGGAATACCTGGCGTTATCAGCTTATAGAGAAGCTCTTGGTGATGATCTATTA
TATGACAAAAGATTTATGTTTGGCATTTCCGTTGAGGGGTATGACACCTCCTTTCGTGAA
GATGAAGTCGAGAAGGCTTTGACTACACATTTCTCTTCTTGTGGAGAGATAACACATGTT
TACGTTGATCTCCAGTACAAGTTTACTAATATCTATTTTTCCAAAGAAGAAG*AGAAGCT
AGTGCCATGGCTCTTGATGGAAGTCAAGTGGACGGATTCAAAATAGCTACTTCGCTCGTA
GCCACAACAGCCAGTAGTTACACTCCCCTT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2E507TF 637 0 0
G
TAATGGAAGTAAAATGAGAGGTTGGAATGCCCTTGTCAAGATTGCACCCGAGGAAGAGGA
TGAGGAATACCTGGCGTTATCAGCTTATAGAGAAGCTCTTGGTGATGATCTATTATATGA
CAAAAGATTTATGTTTGGCATTTCCGTTGAGGGGTATGACACCTCCCTTCGTGAAGATGA
AGTCGAGAAGGCTTTGACTACACATTTCTCTTCTTGTGGAGAGATAACACATGTTTACGT
TGATCTCCAGTACAAGTTTACTAATATCTATTTTTCCAAAGAAGAAGGAGAAGCTAGTGC
CATGGCTCTTGATGGAAGTCAAGTGGACGGATTCAAAATAACTACTTCGCTCGTAGCCAC
AACAGCCAGTAGTTACACTCCCCTTCCCCCTGATGAAACTTATTTTGGCTCTTGTTACCC
AGCTCATATGCTCGAGTTTGGCGAGGAGATGCAGGAGAAGATCGATTTTTATATGACTGA
GTGGAGGCTCAATGCGATGACAAAGAAGCTCAGGGCTCTTAAGAAGCACAAGGTCTGGAC
TCTTAGGGAGCCTAAGCTCAAGGCTCTTAAGAAGCCCAAGGCCGGGGCTCTTAAGAAGCT
TAAGGCCTGGGCTCTTAGGAAGGAGCTTAAGGCCTG

QA 2 637 2 637
DS 

RD RR2DJ38JQ 644 0 0
TCGAGAAGGCTTTGACTACACATTTCTCTTCTTGTGGAGAGATAACACATGTTTACGTTG
ATCTCCAGTACAAGTTTACTAATATCTATTTTTCCAAAGAAGAAGGAGAAGCTAGTGCCA
TGGCTCTTGATGGAAGTCAAGTGGACGGATTCAAAATAGCTACTTCGCTCGTAGCCACAA
CAGCCAGTAGTTACACTCCCCTTCCCCCTGATGAAACTTATTTTGGCTCTTGTTACCCAG
CTCATATGCTCGAGTTTGGCGAGGAGATGCAGGAGAAGATCGATTTTTATATGACTGAGT
GGAGGCTCAATGCGATGACAAAGAAGCTCAGGGCTCTTAAGAAGCACAAGGTCTGGACTC
TTAGGGAGCCTAAGCTCAAGGCTCTTAAGAAGCCCAAGGCCGGGGCTCTTAAGAAGCTTA
AGGCCTGGGCTCTTAGGAAGGAGCTTAAGGCCTGGGCCCTTAAGAAGCTTAAGGCCAGGG
CTCTTAAGAAGCTTAAGGCCAAGGCCAGGGCCAGGAGGGAGAAGGGTCAGAGTCCTCTTG
AGAAGGAGAGGATGTTGATGTAATAAATTTCTCCCTAAGAGACTAACAGAAACTCTTTGG
TGTTTATCAATCCTGTGATAATACTATTATGCAACCTTCCG
CCG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2BP75JQ 699 0 0
GATGAAGTCGAGAAGGCTTTGACTACACATTTCTCTTCTTGTGGAGAGATAACACATGTT
TACGTTGATCTCCAGTACAAGTTTACTAATATCTATTTTTCCAAAGAAGAAGGAGAAGCT
AGTGCCATGGCTCTTGATGGAAGTCAAGTGGACGGATTCAAAATAACTACTTCGCTCGTA
GCCACAACAGCCAGTAGTTACACTCCCCTTCCCCCTGATGAAACTTATTTTGGCTCTTGT
TACCCAGCTCATATGCTCGAGTTTGGCGAGGAGATTCAGGAGAAGATCGATTTTTATATG
ACTGAGTGGAGGCTCAATGCGATGACAAAGAAGCTCAGGGCTCTTAAGAAGCGCAAGGTC
TGGACTCTTAGGGAGCCTAAGCTCAAGGCTCTTAAGGAGCCCAAGGCCGGGGCTCTTAAG
AAGCTTAAGGCCTGGGCTCTTAGGAAGGAGCTTAAGGCCTGGGCCCTTAAGAAGCTTAAG
GCCAGGGCTCTTAAGAAGCTTAAGGCCAAGGCCAGGGCCAGGAGGGAGAAGGGTCAGAGT
CCTCTTGAGAAGGAGAGGATGTTGATGTAATAAATTTCTCCCTAAGAGACTAACAGAAAC
TCTTTGGTGTTTATCAATCCTGTGATAATACTATTATGCAACCTTCCGTTTGTTTGTGTG
TGTTTTGTGGATGATAAACTTAAAAACTTATTTATCTTC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 2 4

CO CL1867Contig1 412 2 2 U
GGACATTCTTTTAGATTGATAAGAGAAAACAGAAAGGTTTCTACATATAACAGAAACAAA
AAAAGAAGTTCAGATAAAAAAAACATAATTTTTTTTCTCAATTTCTTAAATCATGAAGTG
TTTTATTTCAGTTCTCGTTTTATGCGTTCTCATGTTTTACGTTTTGAACATTGTGCAAGA
AGTGAATGGCGCTTGTGACCGGTTAGTAAGGACTCCTGGAAAATGTGACCCTGATAAAAA
CAAGACGTGCCATGTTGATAAGAAGATCAAATATCTGAGGTGCAACTGTGCAGATATCTT
TTATGAAAAGAAGCACCAGCGTGACTGCTTTTGTCTTATTAAGGAACCTTGTGGTGAAGA
ATAAAGAGAACAAGGCTGTTATGGCTACAGAAACTTCCTGGCCGATATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA21TF U 1
AF RR2BA21JQ C 13
BS 1 405 RR2BA21TF
BS 406 412 RR2BA21JQ

RD RR2BA21TF 412 0 0
GGACATTCTTTTAGATTGATAAGAGAAAACAGAAAGGTTTCTACATATAACAGAAACAAA
AAAAGAAGTTCAGATAAAAAAAACATAATTTTTTTTCTCAATTTCTTAAATCATGAAGTG
TTTTATTTCAGTTCTCGTTTTATGCGTTCTCATGTTTTACGTTTTGAACATTGTGCAAGA
AGTGAATGGCGCTTGTGACCGGTTAGTAAGGACTCCTGGAAAATGTGACCCTGATAAAAA
CAAGACGTGCCATGTTGATAAGAAGATCAAATATCTGAGGTGCAACTGTGCAGATATCTT
TTATGAAAAGAAGCACCAGCGTGACTGCTTTTGTCTTATTAAGGAACCTTGTGGTGAAGA
ATAAAGAGAACAAGGCTGTTATGGCTACAGAAACTTCCTGGCCGA
TATTTGC

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR2BA21JQ 400 0 0
AGATTGATAAGAGAAAACAGAAAGGTTTTTACATATAACAGAAACAAAAAAAGAAGTTCA
GATAAAAAAAACATAATTTTTTTTTTCAATTTTTTAAATCATGAAGTGTTTTATTTCAGT
TCTCGTTTTATGCGTTTTCATGTTTTACGTTTTGAACATTGTGCAAGAAGTGAATGGCGC
TTGTGACCGGTTAGTAAGGACTCCTGGAAAATGTGACCCTGATAAAAACAAGACGTGCCA
TGTTGATAAGAAGATCAAATATTTGAGGTGCAACTGTGCAGATATTTTTTATGAAAAGAA
GCACCAGCGTGACTGCTTTTGTTTTATTAAGGAACCTTGTGGTGAAGAATAAAGAGAACA
AGGCTGTTATGGCTACAGAAACTTCCTGGCCGATATTTGC

QA 1 400 1 400
DS 



CO CL1867Contig2 572 2 1 U
GGACATTCTTTTAGATTGATAAGAGAAAACAAAAAGGTTTCTACATATAACAGAAACAAA
AAAAAGAAGTTCAGATAAAAAAAAACATAATTTTTTTTCTCAATTTCTTAAATCATGAAG
TGTTTTATTTCAGTTCTCGTTTTATGCGCTCTCATGTTTTACGTCTCGAACATTGTGCAA
GAAGTGAATGGCGCTTGTGACCGGTTAGTAAGGACTCCTGGAAAATGTGGCCCTGATAAA
AACAAGACGTGTCAGGTTGATAAGAAGATCAAATATCTGAGGTGCAACTGTGCAGATATC
TTTTATGAAAAGAAGCATCAGCGTGACTGCTTTTGTCTTATTAAGGAACCTTGTGGTGAA
GAATAAAGAGAACAAGGCTGTTATGGCTACAGAAACTTCCTGGCCGACAATACATTATTT
TTAGTATTACAAATAAAATTAATTTACTAATTAATAATTAAGCGATGAGTGAGAAGAGTT
CTTGTGTTAAAAATTAGTTACTTTTAACGAATATCCAATTCGATTAAAATAAATATTTTT
TAATAATAAGATCCACAAATATTTTCTTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CD09JQ C 1
AF RR2CD09TF U 1
BS 1 572 RR2CD09TF

RD RR2CD09JQ 572 0 0
GGACATTCTTTTAGATTGATAAGAGAAAACAAAAAGGTTTCTACATATAACAGAAACAAA
AAAAAGAAGTTCAGATAAAAAAAAACATAATTTTTTTTCTCAATTTCTTAAATCATGAAG
TGTTTTATTTCAGTTCTCGTTTTATGCGCTCTCATGTTTTACGTCTCGAACATTGTGCAA
GAAGTGAATGGCGCTTGTGACCGGTTAGTAAGGACTCCTGGAAAATGTGGCCCTGATAAA
AACAAGACGTGTCAGGTTGATAAGAAGATCAAATATCTGAGGTGCAACTGTGCAGATATC
TTTTATGAAAAGAAGCATCAGCGTGACTGCTTTTGTCTTATTAAGGAACCTTGTGGTGAA
GAATAAAGAGAACAAGGCTGTTATGGCTACAGAAACTTCCTGGCCGACAATACATTATTT
TTAGTATTACAAATAAAATTAATTTACTAATTAATAATTAAGCGATGAGTGAGAAGAGTT
CTTGTGTTAAAAATTAGTTACTTTTAACGAATATCCAATTCGATTAAAATAAATATTTTT
TAATAATAAGATCCACAAATATTTTCTTTTTT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2CD09TF 572 0 0
GGACATTCTTTTAGATTGATAAGAGAAAACAAAAAGGTTTCTACATATAACAGAAACAAA
AAAAAGAAGTTCAGATAAAAAAAAACATAATTTTTTTTCTCAATTTCTTAAATCATGAAG
TGTTTTATTTCAGTTCTCGTTTTATGCGCTCTCATGTTTTACGTCTCGAACATTGTGCAA
GAAGTGAATGGCGCTTGTGACCGGTTAGTAAGGACTCCTGGAAAATGTGGCCCTGATAAA
AACAAGACGTGTCAGGTTGATAAGAAGATCAAATATCTGAGGTGCAACTGTGCAGATATC
TTTTATGAAAAGAAGCATCAGCGTGACTGCTTTTGTCTTATTAAGGAACCTTGTGGTGAA
GAATAAAGAGAACAAGGCTGTTATGGCTACAGAAACTTCCTGGCCGACAATACATTATTT
TTAGTATTACAAATAAAATTAATTTACTAATTAATAATTAAGCGATGAGTGAGAAGAGTT
CTTGTGTTAAAAATTAGTTACTTTTAACGAATATCCAATTCGATTAAAATAAATATTTTT
TAATAATAAGATCCACAAATATTTTCTTTTTT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 4

CO CL1868Contig1 955 4 19 U
ACATGGCTTCGAGCAAACTTCTTCTTCATCTTCTAGTCTGCTACGTTTCTCTTATCTGCT
TTGCATCATCGTACGATCTTTCTGAAACATCGTCGCCGAAGAAAGTGTCGCTGGGCCTGT
ACTACGAGTCTCTATGTCCCTACTGCTCATCCTTCATCGTTAACCACCTCACGAAGCTCT
TCGAAGAAGATCTCATATCAATCGTCGATCTCCATCTCTCTCCCTGGGGTAACACCAAGC
TCCGCTCCTCCTCCGATAATAATGTCACTGCCGTTTGCCAGCACGGTGCGTTTGAATGCT
TATTGGATACTGTTGAGGCTTGTGCGATCGATGCTTGGCCTAAATTGAGCGATCATTTCC
CGTTTATCCTCTGCGTTGAGGGTTTGGTGACTGAGCACAAGTACGACAAGTGGGAGACTT
GTTATGAGAAGCTCAATCTTAACTCTAAACCTGTTTCCGATTGCCTCAGCAGTGGACATG
GAGACAAGCTTGAGTTGCAATATGCTGCAGAAACGAGTGCACTTCAGCCGCCTCATCAAT
ACGTGCCCTGGGTGGTTGTAGATGGTCAGCCACTTTATGAGGATTATGAAAACTTCATAA
GCTACATCTGCAAAGCTTACAAAGGTAATAAAAAGCCTGACGCATGTGCCAAATACACAT
CCAGCAACTTCATTCGAAGTGCCAAAGTGAATCGCTTCCCACTGGTTTGCCGGAAAGGAG
TCAATAATATGTGGGATTTGTTGGAACGTATCAAAACCTCTTTGTTGTCGTACATCGACG
TCACAGGCCTGCTATAAACATCCTTCTCTTTATTTTATGATATGTAGCATGATTACTCTA
AAAATCTATATGGCTTTTGAGATATGATGAATATATGTATGTATTATCACAAAGTGTATG
GCTGTTACTGTTGCCTGTTAGGTTGTGTGAAAGGCCGATTGATAATAAAGTCTCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA64TF U 1
AF RR2CU94TF U 1
AF RR2DD10TF U 102
AF RR2DD10JQ C 457
BS 1 115 RR2CU94TF
BS 116 116 RR2DA64TF
BS 117 160 RR2CU94TF
BS 161 161 RR2DA64TF
BS 162 241 RR2CU94TF
BS 242 242 RR2DA64TF
BS 243 499 RR2CU94TF
BS 500 500 RR2DD10TF
BS 501 541 RR2CU94TF
BS 542 542 RR2DD10TF
BS 543 544 RR2CU94TF
BS 545 545 RR2DD10TF
BS 546 553 RR2CU94TF
BS 554 554 RR2DD10TF
BS 555 556 RR2CU94TF
BS 557 557 RR2DD10TF
BS 558 627 RR2CU94TF
BS 628 683 RR2DD10TF
BS 684 955 RR2DD10JQ

RD RR2DA64TF 522 0 0
ACATGGCTTCGAGCAAACTTCTTCTTCATCTTCTAGTCTGCTACGTTTCTCTTATCTGCT
TTGCATCATCGTACGATCTTTCTGGAACATCGTCGCCGAAGAAAGTGTCGCTGGGCCTGT
ACTACGAGTCTCTATGTCCCTACTGCTCATCCTTCATCGTTAACCAGCTCACGAAGCTCT
TCGAAGAAGATCTCATATCAATCGTCGATCTCCATCTCTCTCCCTGGGGTAACACCAAGC
TCCGCTCCTCCTCCGATAATAATGTCACTGCCGTTTGCCAGCACGGTGCGTTTGAATGCT
TATTGGATACGGTTGAGGCTTGTGCGATCGATGCTTGGCCTAAATTGAGCGATCATTTCC
CGTTTATCCTCTGCGTTGAGGGTTTGGTGACTGAGCACAAGTACGACAAGTGGGAGACTT
GTTATGAGAAGCTCAATCTTAACTCTAAACCTGTTTCAGATTGCCTCAGCAGTGGACATG
GAGACAAGCTTGAGTTGCAGTATGCTGCAGAAACGAGTGCAC

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2CU94TF 627 0 0
ACATGGCTTCGAGCAAACTTCTTCTTCATCTTCTAGTCTGCTACGTTTCTCTTATCTGCT
TTGCATCATCGTACGATCTTTCTGAAACATCGTCGCCGAAGAAAGTGTCGCTGGGACTGT
ACTACGAGTCTCTATGTCCCTACTGCTCATCCTTCATCGTCAACCACCTCACGAAGCTCT
TCGAAGAAGATCTCATATCAATCGTCGATCTCCATCTCTCTCCCTGGGGTAACACCAAGC
TTCGCTCCTCCTCCGATAATAATGTCACTGCCGTTTGCCAGCACGGTGCGTTTGAATGCT
TATTGGATACTGTTGAGGCTTGTGCGATCGATGCTTGGCCTAAATTGAGCGATCATTTCC
CGTTTATCCTCTGCGTTGAGGGTTTGGTGACTGAGCACAAGTACGACAAGTGGGAGACTT
GTTATGAGAAGCTCAATCTTAACTCTAAACCTGTTTCCGATTGCCTCAGCAGTGGACATG
GAGACAAGCTTGAGTTGCAGTATGCTGCAGAAACGAGTGCACTTCAGCCGCCTCATCAAT
ATGTTCCCTGGGTAGTGGTAGATGGTCAGCCACTTTATGAGGATTATGAAAACTTCATAA
GCTACATCTGCAAAGCTTACAAAGGTA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2DD10TF 582 0 0
G
AAGTGTCGCTGAGCCTGTACTACGAGTCTCTATGTCCCTACTGCTCATCCTTCATCGTTA
ACCACCTCACGAAGCTCTTCGAAGAAGATCTCATATCAATCGTAGATCTCCATCTCTCTC
CCTGGGGTAACACCAAGCTCCGCTCCTCCTCCGATAATAATGTCACTACCGTTTGCCAGC
ACGGTGCGTTTGAATGCTTATTGGATACTGTTGAGGCTTGTGCGATCGATACTTGGCCTA
AATTGAGCGATCATTTCCTGTTTATCCTCTGCGTTGAGGGTTTGGTGACTGAGCACAAGT
ACGACAAGTGGGAGACTTGTTATGAGAGGCTCAATCTTAACTCTAAACCTGTTGACGATT
GCCTCAGCAGTGGACATGGAGACAAGCTTGAGTTGCAATATGCTGCAGAAACGAGTGCAC
TTCAGCCGCCTCATCAATACGTGCCCTGGGTGGTTGTAGATGGTCAGCCACTTTATGAGG
ATTATGAAAACTTCATAAGCTACATCTGCAAAGCTTACAAAGGTAATAAAAAGCCTGACG
CATGTGCCAAATACACATCCAGCAACTTCATTCGAAGTGCC

QA 2 582 2 582
DS 

RD RR2DD10JQ 499 0 0
AC
GATTGCCTCAGCAGTGGACATGGAGACAAGCTTGAGTTGCAATATGCTGCAGAAACGAGT
GCACTTCAGCCGCCTCATCAATACGTGCCCTGGGTGGTTGTAGATGGTCAGCCACTTTAT
GAGGATTATGAAAACTTCATAAGCTACATTTGCAAAGCTTACAAAGGTAATAAAAAGCCT
GACGCATGTGCCAAATACACATCCAGCAACTTCATTCGAAGTGCCAAAGTGAATCGCTTC
CCACTGGTTTGCCGGAAAGGAGTCAATAATATGTGGGATTTGTTGGAACGTATCAAAACC
TCTTTGTTGTCGTACATCGACGTCACAGGCCTGCTATAAACATCCTTCTCTTTATTTTAT
GATATGTAGCATGATTACTCTAAAAATCTATATGGCTTTTGAGATATGATGAATATATGT
ATGTATTATCACAAAGTGTATGGCTGTTACTGTTGCCTGTTAGGTTGTGTGAAAGGCCGA
TTGATAATAAAGTCTCG

QA 3 499 3 499
DS 



AS 2 4

CO CL1869Contig1 809 2 2 U
GACCAAAATCGATGTTTGCCCCCTCAAACAAAGATACTCCTTTTAAGACTTTTGGAGATT
CTCATCACTTACTCTTGTGTACAACAATGTTTTTTAGCCTGGGAATCTCAGGATAGACCG
TCGTGGATCCGTGATGATGACGTTTATGCCTGCTGTTTCTGAGCGCAAGTACGACTGGGA
GAAGAAACAGCTGTTTGCTTTGTCACCTACTGAAGTTGGATCCGTGATCAGCATGGGTCC
TCAGGACAGCTCTGAGTTTTTCCATGACCCTTCCATGAAATCAAGTAATGCTGGTCAAGT
CAGGAAGTCACTGTCCATTAAGCCGCTCGCAGATTCTACCGGCTACTTCTTTCAATTGAG
CGTTGCCGATAACATCCACAACAGCAATGACCGTATTGTGGTTCCTGTCTCCAAAGCTGA
ATTTGCAGTGCTGAAGAGTGCTTTCAGTTTTGCCCTTCCACACATCCTGGGCTGGGATCG
GATAACAGGAGGCGACGTTGGTATTGCAGCGCAGGGGTTTGCTTCACTTCCAAAGGCTGA
TCCGATGCAGTTGGAGTTGGAGTGGGGTAAAGAGTAAAGACTGATTTGAGAGTAGCAATG
TGGAGTAAATTGACAATGCATGTGTTCCTTGTTTTTCTGGAGTTTGTTTTGGCGTACACA
AAACTTGGCGTGATACTCTGTTCTTGAATCTTAACATGTCCTCTCTAAGACTACTTCTAA
TTTTTGGGGCTTCTGCTCGTTATCTTTAGCACTTATGTTATTTTGCGGTGAAAGCATTTT
GGTTTTCAGCTTAATAGTCAGTTTCAAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AU46TF U 1
AF RR2AU46JQ C 1
BS 1 744 RR2AU46TF
BS 745 809 RR2AU46JQ

RD RR2AU46TF 751 0 0
GACCAAAATCGATGTTTGCCCCCTCAAACAAAGATACTCCTTTTAAGACTTTTGGAGATT
CTCATCACTTACTCTTGTGTACAACAATGTTTTTTAGCCTGGGAATCTCAGGATAGACCG
TCGTGGATCCGTGATGATGACGTTTATGCCTGCTGTTTCTGAGCGCAAGTACGACTGGGA
GAAGAAACAGCTGTTTGCTTTGTCACCTACTGAAGTTGGATCCGTGATCAGCATGGGTCC
TCAGGACAGCTCTGAGTTTTTCCATGACCCTTCCATGAAATCAAGTAATGCTGGTCAAGT
CAGGAAGTCACTGTCCATTAAGCCGCTCGCAGATTCTACCGGCTACTTCTTTCAATTGAG
CGTTGCCGATAACATCCACAACAGCAATGACCGTATTGTGGTTCCTGTCTCCAAAGCTGA
ATTTGCAGTGCTGAAGAGTGCTTTCAGTTTTGCCCTTCCACACATCCTGGGCTGGGATCG
GATAACAGGAGGCGACGTTGGTATTGCAGCGCAGGGGTTTGCTTCACTTCCAAAGGCTGA
TCCGATGCAGTTGGAGTTGGAGTGGGGTAAAGAGTAAAGACTGATTTGAGAGTAGCAATG
TGGAGTAAATTGACAATGCATGTGTTCCTTGTTTTTCTGGAGTTTGTTTTGGCGTACACA
AAACTTGGCGTGATACTCTGTTCTTGAATCTTAACATGTCCTCTCTAAGACTACTTCTAA
TTTTTGGGGCTTCTGCTCGTTATC
TTTAGCA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2AU46JQ 809 0 0
GACCAAAATCGATGTTTGCCCCCTCAAACAAAGATACTCCTTTTAAGACTTTTGGAGATT
CTCATCACTTACTCTTGTGTACAACAATGTTTTTTAGCCTGGGAATCTCAGGATAGACCG
TCGTGGATCCGTGATGATGACGTTTATGCCTGCTGTTTCTGAGCGCAAGTACGACTGGGA
GAAGAAACAGCTGTTTGCTTTGTCACCTACTGAAGTTGGATCCGTGATCAGCATGGGTCC
TCAGGACAGCTCTGAGTTTTTCCATGACCCTTCCATGAAATCAAGTAATGCTGGTCAAGT
CAGGAAGTCACTGTCCATTAAGCCGCTCGCAGATTCTACCGGCTACTTCTTTCAATTGAG
CGTTGCCGATAACATCCACAACAGCAATGACCGTATTGTGGTTCCTGTCTCCAAAGCTGA
ATTTGCAGTGCTGAAGAGTGCTTTCAGTTTTGCCCTTCCACACATCCTGGGCTGGGATCG
GATAACAGGAGGCGACGTTGGTATTGCAGCGCAGGGGTTTGCTTCACTTCCAAAGGCTGA
TCCGATGCAGTTGGAGTTGGAGTGGGGTAAAGAGTAAAGACTGATTTGAGAGTAGCAATG
TGGAGTAAATTGACAATGCATGTGTTCCTTGTTTTTCTGGAGTTTGTTTTGGCGTACACA
AAACTTGGCGTGATACTCTGTTCTTGAATCTTAACATGTCCTCTCTAAGACTACTTCTAA
TTTTTGGGGCTTCTGCTCGTTATCTTTAGCACTTATGTTATTTTGCGGTGAAAGCATTTT
GGTTTTCAGCTTAATAGTCAGTTTCAAGT

QA 1 809 1 809
DS 



CO CL1869Contig2 749 2 18 U
GGGACGCAGCAGCAGCACTAGTACTCGTTTTCACTTTGGGGAGAAATATGATGAAGCAAG
CTCGCACTCTGCTCTCCAGGAGCCTTTGCAACCAAAGCAACTCACTTTTCGAAGGAATCT
CTAAGTCTTCCGCGTCGCGTGGTCTCGCAACCTGGACTGATTCCTCCTCCTCTACCACTA
AACGTGGTGATACTGCTAAGCCTAGTGGTCGTGTGTTCGCACCTTACGCTATCTTCAAAG
GAAGAGCTGCTCTCTCTGTTGAACCTGTCCTCCCCACTTTCACCAAAATCGATCCTGGAA
ATCTCAGGATAGACCGTCGTGGATCCGTGATGATGACGTTTATGCCTGCTGTTAGCGAAC
GCAAGTACGACTGGGAGAAGAAACAGTTGTTTGCTTTATCACCTACTGAAGTTGGATCCG
TGATCAGCATGGGTCCCCAGGACAGCTCTGAGTTTTTCCATGACCCTTCCATGAAATCAA
GTAATGCTGGTCAAGTCAGGAAGTCACTGTCCATTAAGCCACTCGCAGATTCTACCGGCT
ACTTCTTTCAATTGAGCGTTACCGATAACATCCACAACAGCAATGACCGTATTGTGGTTC
CTGTCTCCAAAGCTGAATTTGCAGTCCTGAAGAGTGCTTTTAGTTTTGCCCTTCCACACA
TCCTGGGCTGGGATCGGATAACAGAGTGACGTTGGTATTGCTGCCCAGGGTTTGCTTCAC
TTCAAAGCTGATCCGATGCAGTTGGAGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E505TF U 1
AF RR2ED15TF U 1
BS 1 87 RR2E505TF
BS 88 89 RR2ED15TF
BS 90 133 RR2E505TF
BS 134 134 RR2ED15TF
BS 135 298 RR2E505TF
BS 299 299 RR2ED15TF
BS 300 355 RR2E505TF
BS 356 356 RR2ED15TF
BS 357 358 RR2E505TF
BS 359 359 RR2ED15TF
BS 360 436 RR2E505TF
BS 437 437 RR2ED15TF
BS 438 607 RR2E505TF
BS 608 608 RR2ED15TF
BS 609 625 RR2E505TF
BS 626 626 RR2ED15TF
BS 627 661 RR2E505TF
BS 662 749 RR2ED15TF

RD RR2E505TF 661 0 0
GGGACGCAGCAGCAGCACTAGTACTCGTTTTCACTTTGGGGAGAAATATGATGAAGCAAG
CTCGCACTCTGCTCTCCAGGAGCCTTTTGAACCAAAGCAACTCACTTTTCGAAGGAATCT
CTAAGTCTTCCGCTTCGCGTGGTCTCGCAACCTGGACTGATTCCTCCTCCTCTACCACTA
AACGTGGTGATACTGCTAAGCCTAGTGGTCGTGTGTTCGCACCTTACGCTATCTTCAAAG
GAAGAGCTGCTCTCTCTGTTGAACCTGTCCTCCCCACTTTCACCAAAATCGATCCTGGGA
ATCTCAGGATAGACCGTCGTGGATCCGTGATGATGACGTTTATGCCTGCTGTTAGTGAGC
GCAAGTACGACTGGGAGAAGAAACAGTTGTTTGCTTTATCACCTACTGAAGTTGGATCCG
TGATCAGCATGGGTCCTCAGGACAGCTCTGAGTTTTTCCATGACCCTTCCATGAAATCAA
GTAATGCTGGTCAAGTCAGGAAGTCACTGTCCATTAAGCCACTCGCAGATTCTACCGGCT
ACTTCTTTCAATTGAGCGTTACCGATAACATCCACAACAGCAATGACCGTATTGTGGTTC
CTGTCTCGAAAGCTGAATTTGCAGTGCTGAAGAGTGCTTTTAGTTTTGCCCTTCCACACA
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2ED15TF 749 0 0
GGGACGCAGCAGCAGCACTAGTACTCGTTTTCACTTTGGGGAGAAATATGATGAAGCAAG
CTCGCACTCTGCTCTCCAGGAGCCTTTGCAACCAAAGCAACTCACTTTTCGAAGGAATCT
CTAAGTCTTCCGCGTCGCGTGGTCTCGCAACCTGGGCTGATTCCTCCTC***TACCACTA
AACGTGGTGATACTGCTAAGCCTAGTGGTCGTGTGTTCGCACCTTACGCTATCTTTAAAG
GAAGAGCTGCTCTCTCTGTTGAACCTGTCCTCCCCACTTTCACCAAAATCGATCCTGGAA
ATCTCAGGATAGACCGTCGTGGATCCGTGATGATGACTTTTATGCCTGCTGTTAGCGAAC
GCAAGTACGACTGGGAGAAGAAACAGTTGTTTGCTTTGTCACCTACTGAAGTTGGATCCG
TGATCAGCATGGGTCCCCAGGACAGCTCTGAGTTTTTCCATGACCCTTCCATGAAATCAA
GTAATGCTGGTCAAGTCAGGAAGTCACTGTCCATTAAGCCACTCGCAGATTCTACCGGCT
ACTTCTTTCAATTGAGCGTTGCCGATAACATCCACAACAGCAATGACCGTATTGTGGTTC
CTGTCTCCAAAGCTGAATTTGCAGTCCTGAAGAGTGCTTTTAGTTTTGCCCTTCCACACA
TCCTGGGCTGGGATCGGATAACAGAGTGACGTTGGTATTGCTGCCCAGGGTTTGCTTCAC
TTCAAAGCTGATCCGATGCAGTTGGAGCT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 5

CO CL1870Contig1 1095 5 15 U
GGAAGCCCTTTTTCGGAATTTTGTATTTAGATTTAAAGAAGAGATGTTTGTTTTCTTTAG
AATCTGTCTCTATAAGCTGTTCCATACACAATGAGATAGGGTACTGTCCGAACAACTGTG
TCAATGGGAATGGCAAAGTTCACACCCGAAGACATTCCGGTCCCTTTGCGGGTGAATGTG
GCAGTGTTGATGCCTATGGTATGGCCATAAGAATCAAGCAATGGCCCTCCAGAATTGCCT
GAGTTAATGTCAGCATCTGTTTGTATAGCTTCTCGAATACTCTTCCCGTTTGGTGAAGGT
ATCTCTCTTCCCAACCCACTCACTACCCCTATTGTCAAAGTGTTTTCATATCCATAGGGA
TTCCCAATAGCAAAGCAACTCTGACCTACGCGTAGATCACTGGAGGTACCAAGAGCAACA
GGTTTCAACTCACGTCCTTCGGTTTCAATCTTCAAAACAGCAAGATCATTGTCGGGATCA
AGACCCACAATTTTCCCTTCCTTGGTAAACTTTGTCCCCATGGCATCAACTAGAGATACC
TTACAACGTTGTAATCCACTCCGATCTGTAGCTAACTTGGCAATCACATGGTAATTTGTC
ACAATGTGACCAAGCTTGTCCCAAACGAAGCCAGAACCCGTCCCTTCGATCTCTGCATTA
TCCTCAACATTGGATTCATCAGAGGACGCTTTGGGAAGCTCAATGTCTTCGATATACACA
ACAGACGCCGAAGTTTTCTGGAAGAGATTGACATTTCTCTCTTCTTCTTCCTCGACCTCT
TCTTCTTCTTCTATTTCTTTCATTTGCTCTAGTGCGATCGCAGATTCAACTGGGAACTTC
GGTTGATTGGAGGAGCCAAGCAGAGTCGAAGCGAGCACCAGACTCGAACCGAAGAAGATC
AAGCTTCTTCTTTTCCGATCAGGGCTCGAACCGGAGCAAGCTAACATTGACTTCGACCTA
TTGAATGGAGTTATTAAAGTATATAAGACTGAGGAACAAGCTTTAGAAGAAGCGATAGCC
ACGTCCATCATGGCTTCTTCTCCCTTCCTTCTCCAAGCTCTCGGCTCGCACTCCCTCTAC
CACCAACTTACACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB38JQ U 1
AF RR2CE27JQ U 14
AF RR2EO14JQ U 29
AF RR2EO14TF C 368
AF RR2CE27TF C 405
BS 1 42 RR2GB38JQ
BS 43 43 RR2CE27JQ
BS 44 227 RR2GB38JQ
BS 228 228 RR2CE27JQ
BS 229 249 RR2GB38JQ
BS 250 388 RR2CE27JQ
BS 389 389 RR2EO14JQ
BS 390 405 RR2CE27JQ
BS 406 407 RR2EO14JQ
BS 408 652 RR2CE27JQ
BS 653 653 RR2EO14JQ
BS 654 828 RR2CE27JQ
BS 829 841 RR2EO14JQ
BS 842 1075 RR2EO14TF
BS 1076 1095 RR2CE27TF

RD RR2GB38JQ 249 0 0
GGAAGCCCTTTTTCGGAATTTTGTATTTAGATTTAAAGAAGAAATGTTTGTTTTCTTTAG
AATCTGTCTCTATAAGCTGTTCCATACACAATGAGATAGGGTACTGTCCGAACAACTGTG
TCAATGGGAATGGCAAAGTTCACACCCGAAGACATTCCGGTCCCTTTGCGGGTGAATGTG
GCAGTGTTGATGCCTATGGTATGGCCATAAGAATCAAGCAATGGCCCCCCAGAATTGCCT
GAGTTAATG

QA 1 249 1 249
DS 

RD RR2CE27JQ 815 0 0
CGGAATTTTGTATTTAGATTTAAAGAAGAGATGTTTGTTTTCTTTAGAATCTGTCTCTAT
AAGCTGTTCCATACACAATGAGATAGGGTACTGTCCGAACAACTGTGTCAATGGGAATGG
CAAAGTTCACACCCGAAGACATTCCGGTCCCTTTGCGGGTGAATGTGGCAGTGTTGATGC
CTATGGTATGGCCATAAGAATCAAGCAATGGCCCTCCAGAATTGCCTGAGTTAATGTCAG
CATCTGTTTGTATAGCTTCTCGAATACTCTTCCCGTTTGGTGAAGGTATCTCTCTTCCCA
ACCCACTCACTACCCCTATTGTCAAAGTGTTTTCATATCCATAGGGATTCCCAATAGCAA
AGCAACTCTGACCTAAGCGTAGATCACTGGAGAGACCAAGAGCAACAGGTTTCAACTCAC
GTCCTTCGGTTTCAATCTTCAAAACAGCAAGATCATTGTCGGGATCAAGACCCACAATTT
TCCCTTCCTTGGTAAACTTTGTCCCCATGGCATCAACTAGAGATACCTTACAACGTTGTA
ATCCACTCCGATCTGTAGCTAACTTGGCAATCACATGGTAATTTGTCACAATGTGACCAA
GCTTGTCCCAAACGAAGCCAGAACCCGTCCCTTCGATCTTTGCATTATCCTCAACATTGG
ATTCATCAGAGGACGCTTTGGGAAGCTCAATGTCTTCGATATACACAACAGACGCCGAAG
TTTTCTGGAAGAGATTGACATTTCTCTCTTCTTCTTCCTCGACCTCTTCTTCTTCTTCTA
TTTCTTTCATTTGCTCTAGTGCGATCGCAGATTCA

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR2EO14JQ 816 0 0
AGATTTAAAGAAGAGATGTTTGTTTTCTTTAGAATCTGTCTCTATAAGCTGTTCCATACA
CAATGAGATAGGGTACTGTCCGAACAACTGTGTCAATGGGAATGGCAAAGTTCACACCCG
AAGACATTCCGGTCCCTTTGCGGGTGAATGTGGCAGTGTTGATGCCTATGGTATGGCCAT
AAGAATCAAGCAATGGCCCTCCAGAATTGCCTGAGTTAATGTCAGCATCTGTTTGTATAG
CTTCTCGAATACTCTTCCCGTTTGGTGAAGGTATCTCTCTTCCCAACCCACTCACTACCC
CTATTGTCAAAGTGTTTTCATATCCATAGGGATTCCCAATAGCAAAGCAACTCTGACCTA
CGCGTAGATCACTGGAGGTACCAAGAGCAACAGGTTTCAACTCACGTCCTTCGGTTTCAA
TCTTCAAAACAGCAAGATCATTGTCGGGATCAAGACCCACAATTTTCCCTTCCTTGGTAA
ACTTTGTCCCCATGGCATCAACTAGAGATACCTTACAACGTTGTAATCCACTCTGATCTG
TAGCTAACTTGGCAATCACATGGTAATTTGTCACAATGTGACCAAGCTTGTCCCAAACGA
AGCCAGAACCCGTCCCTTCGATCTCTGCATTATCCTCAACATTGGATTCATCAGAGGACG
TTTTGGGAAGCTCAATGTCTTCGATATACACAACAGACGCCGAAGTTTTCTGGAAGAGAT
TGACATTTCTCTCTTCTTCTTCCTCGACCTCTTCTTCTTCTTCTATTTCTTTCATTTGCT
CTAGTGCGATCGCAGATTCAACTGGGAACTTCG
TTG

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2EO14TF 709 0 0
TAGCAAAGCAACTCTGAC*TACGCGTAGATCACTGGAGGTACCAAGAGCAACAGGTTTCA
ACTCACGTCTTTCGGTTTCAATCTTCAAAACAGCAAGATCATTGTCGGGATCAAGACCCA
CAATTTTCCCTTCCTTGGTAAACTTTGTCCCCATGGCATCAACTAGAGATACCTTACAAC
GTTGTAATCCACTCTGATCTGTAGCTAACTTGGCAATCACATGGTAATTTGTCACAATGT
GACCAAGCTTGTCCCAAACGAAGCCAGAACCCGTCCCTTCGATCTCTGCATTATCCTCAA
CATTGGATTCATCAGAGGACGTTTTGGGAAGCTCAATGTCTTCGATATACACAACAGACG
CCGAAGTTTTCTGGAAGAGATTGACATTTCTCTCTTCTTCTTCCTCGACCTCTTCTTCTT
CTTCTATTTCTTTCATTTGCTCTAGTGCGATCGCAGATTCAACTGGGAACTTCGGTTGAT
TGGAGGAGCCAAGCAGAGTCGAAGCGAGCACCAGACTCGAACCGAAGAAGATCAAGCTTC
TTCTTTTCCGATCAGGGCTCGAACCGGAGCAAGCTAACATTGACTTCGACCTATTGAATG
GAGTTATTAAAGTATATAAGACTGAGGAACAAGCTTTAGAAGAAGCGATAGCCACGTCCA
TCATGGCTTCTTCTCCCTTCCTTCTCCAAGCTCTCGGCTCGCACTCCC
C

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2CE27TF 691 0 0
GAG
ACCAAGAGCAACAGGTTTCAACTCACGTC*TTCGGTTTCAATCTTCAAAACAGCAAGATC
ATTGTCGGGATCAAGACCCACAATTTTCCCTTCCTTGGTAAACTTTGTCCCCATGGCATC
AACTAGAGATACCTTACAACGTTGTAATCCACTCCGATCTGTAGCTAACTTGGCAATCAC
ATGGTAATTTGTCACAATGTGACCAAGCTTGTCCCAAACGAAGCCAGAACCCGTCCCTTC
GATCTTTGCATTATCCTCAACATTGGATTCATCAGAGGACGCTTTGGGAAGCTCAATGTC
TTCGATATACACAACAGACGCCGAAGTTTTCTGGAAGAGATTGACATTTCTCTCTTCTTC
TTCCTCGACCTCTTCTTCTTCTTCTATTTCTTTCATTTGCTCTAGTGCGATCGCAGATTC
AACTGGGAACTTCGGTTGATTGGAGGAGCCAAGCAGAGTCGACGCGAGCACCAGACTCGA
ACCGAAGAAGATCAAGCTTCTTCTTTTCCGATCAGGGCTCGAACCGGAGCAAGCTAACAT
TGACTTCGACCTATTGAATGGAGTTATTAAAGTATATAAGACTGAGGAACAAGCTTTAGA
AGAAGCGATAGCCACGTCCATCATGGCTTCTTCTCCCTTCCTTCTCCAAGCTCTCGGCTC
GCACTCCCTCTACCACCAACTTACACCC

QA 4 691 4 691
DS 



AS 2 5

CO CL1871Contig1 661 3 5 U
GGGTTGCGCAACCGGCGAAGAGAGAGAGACGCACGCACACACGGAGAGAAAATGTCGACG
CTTCTGCAATCGCTAATCGATCCAAAGAAGAACTTCCTAGCTCGTATGCATATGAAAGCC
GTATCAACTCGCCTTCGTAGATACGGTCTCAGGTACGATGATCTACACGATCAGTACGAA
AATCTGGATATTAAGGAAGCTCTGAACAGATTGCCTAGGGAGGTCGTTGACGCTCGTAAC
CAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGACCTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTCCCAAGGATCTT
CAGGCGGTCCAGACCCCGTTCCGTGGCTATCTTCAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAAAGG
GAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTCTACCACTCTACCAGCGCACGTTCCCTTAA
GCACATCCTTTTTCCCTATCTTCTGATAAACTCTACTTCTCTGCATCAATCTCCTCTCCA
GATGGGGATTAATTTTTGATATTTTGGAAATCACATTCCTGAACAGAGCTATTTACTTCC
TCAAAAGCCTAAGTCTTGTGATTCTTTTCCTAAATGGGATGATATGTTGCTTATTACATT
TTTCACTTTTTTCTGGCATGAATAAAATCGACGACACAACACTGAGTCTGGTTCAATGAT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2DJ15TF U 1
AF RR2FC11TF U 1
AF RR2DJ15JQ C 393
BS 1 172 RR2DJ15TF
BS 173 173 RR2FC11TF
BS 174 651 RR2DJ15TF
BS 652 654 RR2FC11TF
BS 655 661 RR2DJ15JQ

RD RR2DJ15TF 651 0 0
GGGTTGCGCAACCGGCGAAGAGAGAGAGACGCACGCACACACGGAGAGAAAATGTCGACG
CTTCTGCAATCGCTAATCGATCCAAAGAAGAACTTCCTAGCTCGTATGCATATGAAAGCC
GTATCAACTCGCCTTCGTAGATACGGTCTCAGGTACGATGATCTACACGATCGGTACGAA
AATCTGGATATTAAGGAAGCTCTGAACAGATTGCCTAGGGAGGTCGTTGACGCTCGTAAC
CAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGACCTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTCCCAAGGATCTT
CAGGCGGTCCAGACCCCGTTCCGTGGCTATCTTCAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAAAGG
GAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTCTACCACTCTACCAGCGCACGTTCCCTTAA
GCACATCCTTTTTCCCTATCTTCTGATAAACTCTACTTCTCTGCATCAATCTCCTCTCCA
GATGGGGATTAATTTTTGATATTTTGGAAATCACATTCCTGAACAGAGCTATTTACTTCC
TCAAAAGCCTAAGTCTTGTGATTCTTTTCCTAAATGGGATGATATGTTGCTTATTACATT
TTTCACTTTTTTCTGGCATGAATAAAATCGACGACACAACACTGAGTCTGG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2FC11TF 657 0 0
GGGTTGCGCAACCGGCGA
AGAGAGAGAGACGCACGCACACACGGAGAGAAAATGTCGACGCTTCTGCAATCGCTAATC
GATCCAAAGAAGAACTTCCTAGCTCGTATGCATATGAAAGCCGTATCAACTCGCCTTCGT
AGATACGGTCTCAGGTACGATGATCTACACGATCAGTACGAAAATCTGGATATTAAGGAA
GCTCTGAACAGATTGCCTAGGGAGGTCGTTGACGCTCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCC
ATGGACCTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTCCCAAGGATCTTCAGGCGGTCCAGACCCCG
TTCCGTGGCTATCTTCAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAAAGGGAAAGAAAGGAACGTGAA
GCCTTGGGAGCTCTACCACTCTACCAGCGCACGTTCCCTTAAGCACATCCTTTTTCCCTA
TCTTCTGATAAACTCTACTTCTCTGCATCAATCTCCTCTCCAGATGGGGATTAATTTTTG
ATATTTTGGAAATCACATTCCTGAACAGAGCTATTTACTTCCTCAAAAGCCTAAGTCTTG
TGATTCTTTTCCTAAATGGGATGATATGTTGCTTATTACATTTTTCACTTTTTTCTGGCA
TGAATAAAATCGACGACACAACACTGAGTCTGGTTC
AAT

QA 19 654 19 654
DS 

RD RR2DJ15JQ 269 0 0
ACCACTTTACCAGCGCACGTTCCCTTAAGCACATCCTTTTTCCCTATCTTTTGATAAACT
CTACTTCTCTGCATCAATCTCCTCTCCAGATGGGGATTAATTTTTGATATTTTGGAAATC
ACATTCCTGAACAGAGCTATTTACTTCCTCAAAAGCCTAAGTCTTGTGATTCTTTTCCTA
AATGGGATGATATGTTGCTTATTACATTTTTCACTTTTTTCTGGCATGAATAAAATCGAC
GACACAACACTGAGTCTGGTTCAATGATT

QA 1 269 1 269
DS 



CO CL1871Contig2 659 2 2 U
GGAACCGGTGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGACGCACGCACACACGGAGAGAAAATGTCGAC
GCTTCTACAATCGCTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCTTAGCTCGTATGCATATGAAAGC
TGTATCAACTCGCCTTCGTAGATACGGTCTCAGGTACGATGATCTACACGATCAGTATGA
AAATCTGGACATTAAGGAAGCTCTGAACAGATTGCCTAGGGAGGTCGTTGACGCTCGTAA
CCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGACCTCTCCATGAAGCACGAATACCTTCCCAAGGATCT
TCAGGCGGTGCAGACCCCATTCCGTGGCTATCTTCAGGAGATGCTGGCTCTGGTTGAAAG
GGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTCTACCACTCTACCAGCGCACATTCCCTTA
AGCACATCCTTTTTCCCTATCTTCTGATAAACTCTACTTCTCTGCATCAATCTCCTCTCC
AGATGGGGATTAATTTTTGATATTTTGGAAATCACATTCCTGAACAGAGCTATTTTTACT
TCATCAAAAGCCTAAGTCTTTTGTGATTCTTTTCCTAAATGGGATGATATGTTGCTTGCT
ACATTTTTCACTTTCTGCTGGCATGAATAAAATCGACGACACAACACTGAGTCTGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EZ70JQ C 1
AF RR2EZ70TF U 1
BS 1 19 RR2EZ70JQ
BS 20 659 RR2EZ70TF

RD RR2EZ70JQ 659 0 0
GGAACCGGTGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGACGCACGCACACACGGAGAGAAAATGTCGAC
GCTTCTACAATCGCTCCTCGATCCAAAGAAGAACTTCTTAGCTCGTATGCATATGAAAGC
TGTATCAACTCGCCTTCGTAGATACGGTCTCAGGTACGATGATCTACACGATCAGTATGA
AAATCTGGACATTAAGGAAGCTCTGAACAGATTGCCTAGGGAGGTCGTTGACGCTCGTAA
CCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGACCTCTCCATGAAGCACGAATACCTTCCCAAGGATCT
TCAGGCGGTGCAGACCCCATTCCGTGGCTATCTTCAGGAGATGCTGGCTCTGGTTGAAAG
GGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTGGGAGCTCTACCACTCTACCAGCGCACATTCCCTTA
AGCACATCCTTTTTCCCTATCTTCTGATAAACTCTACTTCTCTGCATCAATCTCCTCTCC
AGATGGGGATTAATTTTTGATATTTTGGAAATCACATTCCTGAACAGAGCTATTTT*ACT
TCCTCAAAAGCCTAAGTCTTTTGTGATTCTTTTCCTAAATGGGATGATATGTTGCTTGCT
ACATTTTTCACTTTCTGCTGGCATGAATAAAATCGACGACACAACACTGAGTCTGGTTC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2EZ70TF 659 0 0
GGAACCGGTGAAGAGAGAG
AGAGAGAGAGACGCACGCACACACGGAGAGAAAATGTCGACGCTTCTACAATCGCTCCTC
GATCCAAAGAAGAACTTCTTAGCTCGTATGCATATGAAAGCTGTATCAACTCGCCTTCGT
AGATACGGTCTCAGGTACGATGATCTACACGATCAGTATGAAAATCTGGACATTAAGGAA
GCTCTGAACAGATTGCCTAGGGAGGTCGTTGACGCTCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCC
ATGGACCTCTCCATGAAGCACGAATACCTTCCCAAGGATCTTCAGGCGGTGCAGACCCCA
TTCCGTGGCTATCTTCAGGAGATGCTGGCTCTGGTTGAAAGGGAAAGAAAGGAACGTGAA
GCCTTGGGAGCTCTACCACTCTACCAGCGCACATTCCCTTAAGCACATCCTTTTTCCCTA
TCTTCTGATAAACTCTACTTCTCTGCATCAATCTCCTCTCCAGATGGGGATTAATTTTTG
ATATTTTGGAAATCACATTCCTGAACAGAGCTATTTTTACTTCATCAAAAGCCTAAGTCT
TTTGTGATTCTTTTCCTAAATGGGATGATATGTTGCTTGCTACATTTTTCACTTTCTGCT
GGCATGAATAAAATCGACGACACAACACTGAGTCTGGTTC

QA 20 659 20 659
DS 



AS 1 3

CO CL1872Contig1 683 3 4 U
CACATTATAGACCATAGCTGCAACTGCTTCTGATCTAAAATCACAAAGCTTTCTTTGTTC
ACAACAATAAAAGTTCTCAAATCTTGAAAAGAAAGCATACATCTCAAATGGGTTTCTCTC
CAGGGAGATAAGAAGGAGAACCCCACTCCACTTGATTCTTCTTTCTACTAAAGATCCCAC
TTAGATTAGGTAAAAGTACTTTCTTTGATACCACAGAGGTTTTAGTCTTCTCCAGTTTGT
TGTGGATAGGCTTCTGTTTATTAGTAGCTTTGTAATGATGCTGCGGTGATGACTCAGCGG
ACATCTTGGCCTCAGCCTCTGCGAGGATCCTCGACGCCACTTCCTCTGCTTTCTTCTGAT
CTCTTTCCCTCCACCTCCTGAGTTCTCCTTCGACTGCTTTCTTAGCAGCATCAGCCATAG
CTGCCTTCTTCAGTGCTTCTTCTGTTGCGGTCTTTAGCTTCTCAATCTC*TCTTGTGTAG
TCTCTAACTTCTTCAGTGTCTCGTTTTCGCTAGCTCTAACTGCTTCCACCTGAGCCTGCG
CAGCTGCCACTTTCATATCCGCCAGCTTATCGAACACCTCAGCTCTCTTGCTCAGCGAGT
TAAACTCCTCCCGAGACAGTGTGATGCTCTGAGCTCCAGACTCTGATGATGTCGACTTAC
GGGCAGCGTCTGTTTTCTCAGAC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B511JQ U 1
AF RR2B511TF C 1
AF RR2GQ14JQ U 1
BS 1 215 RR2B511JQ
BS 216 216 RR2GQ14JQ
BS 217 677 RR2B511JQ
BS 678 683 RR2B511TF

RD RR2B511JQ 678 0 0
CACATTATAGACCATAGCTGCAACTGCTTCTGATCTAAAATCACAAAGCTTTCTTTGTTC
ACAACAATAAAAGTTCTCAAATCTTGAAAAGAAAGCATACATCTCAAATGGGTTTCTCTC
CAGGGAGATAAGAAGGAGAACCCCACTCCACTTGATTCTTCTTTCTACTAAAGATCCCAC
TTAGATTAGGTAAAAGTACTTTCTTTGATACCACAAAGGTTTTAGTCTTCTCCAGTTTGT
TGTGGATAGGCTTCTGTTTATTAGTAGCTTTGTAATGATGCTGCGGTGATGACTCAGCGG
ACATCTTGGCCTCAGCCTCTGCGAGGATCCTCGACGCCACTTCCTCTGCTTTCTTCTGAT
CTCTTTCCCTCCACCTCCTGAGTTCTCCTTCGACTGCTTTCTTAGCAGCATCAGCCATAG
CTGCCTTCTTCAGTGCTTCTTCTGTTGCGGTCTTTAGCTTCTCAATCTC*TCTTGTGTAG
TCTCTAACTTCTTCAGTGTCTCGTTTTCGCTAGCTCTAACTGCTTCCACCTGAGCCTGCG
CAGCTGCCACTTTCATATCCGCCAGCTTATCGAACACCTCAGCTCTCTTGCTCAGCGAGT
TAAACTCCTCCCGAGACAGTGTGATGCTCTGAGCTCCAGACTCTGATGATGTCGACTTAC
GGGCAGCGTCTGTTTTC
T

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2B511TF 683 0 0
CACATTATAGACCATAGCTGCAACTGCTTCTGATCTAAAATCACAAAGCTTTCTTTGTTC
ACAACAATAAAAGTTCTCAAATCTTGAAAAGAAAGCATACATCTCAAATGGGTTTCTCTC
CAGGGAGATAAGAAGGAGAACCCCACTCCACTTGATTCTTCTTTCTACTAAAGATCCCAC
TTAGATTAGGTAAAAGTACTTTCTTTGATACCACAGAGGTTTTAGTCTTCTCCAGTTTGT
TGTGGATAGGCTTCTGTTTATTAGTAGCTTTGTAATGATGCTGCGGTGATGACTCAGCGG
ACATCTTGGCCTCAGCCTCTGCGAGGATCCTCGACGCCACTTCCTCTGCTTTCTTCTGAT
CTCTTTCCCTCCACCTCCTGAGTTCTCCTTCGACTGCTTTCTTAGCAGCATCAGCCATAG
CTGCCTTCTTCAGTGCTTCTTCTGTTGCGGTCTTTAGCTTCTCAATCTC*TCTTGTGTAG
TCTCTAACTTCTTCAGTGTCTCGTTTTCGCTAGCTCTAACTGCTTCCACCTGAGCCTGCG
CAGCTGCCACTTTCATATCCGCCAGCTTATCGAACACCTCAGCTCTCTTGCTCAGCGAGT
TAAACTCCTCCCGAGACAGTGTGATGCTCTGAGCTCCAGACTCTGATGATGTCGACTTAC
GGGCAGCGTCTGTTTTCTCAGAC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2GQ14JQ 677 0 0
CACATTATAGACCATAGCTGCAACTGCTTCTGATCTAAAATCACAAAGCTTTCTTTGTTC
ACAACAATAAAAGTTCTCAAATCTTGAAAAGAAAGCATACATCTCAAATGGGTTTCTCTC
CAGGGAGATAAGAAGGAGAACCCCACTCCACTTGATTCTTCTTTCTACTAAAGATCCCAC
TTAGATTAGGTAAAAGTACTTTCTTTGATACCACAGAGGTTTTAGTCTTCTCCAGTTTGT
TGTGGATAGGCTTCTGTTTATTAGTAGCTTTGTAATGATGCTGCGGTGATGACTCAGCGG
ACATCTTGGCCTCAGCCTCTGCGAGGATCCTCGACGCCATTTCCTCTGCTTTCTTCTGAT
CTCTTTCCCTCCACCTCCTGAGTTCTCCTTCGACTGCTTTCTTAGCAGCATCAGCCATAG
CTGCCTTCTTCAGTGCTTCTTCTGTTGCGGTCTTTAGCTTCTCAATCTCCTCTTGTGTAG
TCTCTAACTTCTTCAGTGTCTCGTTTTCGCTAGCTCTAACTGCTTCCACCTGAGCCTGCG
CAGCTGCCACTTTCATATCCGCCAGCTTATCGAACACCTCAGCTCTCTTGCTCAGCGAGT
TAAACTCCTCCCGAGACAGTGTGATGCTCTGAGCTCCAGACTCTGATGATGTCGACTTAC
GGGCAGCGTCTGTTTTC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 2 4

CO CL1873Contig1 521 2 1 U
CTGCGTTAAACAAACGAGAAATCGAGAGGGGGCTAGGGTTTGTGATTCGATTCCAAGAAA
GATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGTCTGGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGA
AGACGACACGATCGGTGATCTGAAGAAGCTGGTGGCGGCGCAGACGGGTACGAGAGCGGA
GAAGATTCGAATTCAGAAGTGGTACAACATCTACAAGGATCATATCACTCTCAAGGACTA
CGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCTCTACTACAATTAGGCGAACCGGAGGTTCTA
AGCAAGTGTGAGCTGAAGGAATGTTGTTGATTTGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAA
CAAAAAAAGTACGTCTGTAAAATTGGGTAATTGGTTTCTGATTATGTATTTGCTTTGGTA
AACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGCTACTCTTCCAACTTTTGTCTACGGTAAAGTCT
CTCGGTGTTGTGCACGATTGCTATAATTCTAAATGTTGCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EJ26JQ C 1
AF RR2EJ26TF U 1
BS 1 521 RR2EJ26TF

RD RR2EJ26JQ 521 0 0
CTGCGTTAAACAAACGAGAAATCGAGAGGGGGCTAGGGTTTGTGATTCGATTCCAAGAAA
GATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGTCTGGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGA
AGACGACACGATCGGTGATCTGAAGAAGCTGGTGGCGGCGCAGACGGGTACGAGAGCGGA
GAAGATTCGAATTCAGAAGTGGTACAACATCTACAAGGATCATATCACTCTCAAGGACTA
CGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCTCTACTACAATTAGGCGAACCGGAGGTTCTA
AGCAAGTGTGAGCTGAAGGAATGTTGTTGATTTGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAA
CAAAAAAAGTACGTCTGTAAAATTGGGTAATTGGTTTCTGATTATGTATTTGCTTTGGTA
AACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGCTACTCTTCCAACTTTTGTCTACGGTAAAGTCT
CTCGGTGTTGTGCACGATTGCTATAATTCTAAATGTTGCCC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2EJ26TF 521 0 0
CTGCGTTAAACAAACGAGAAATCGAGAGGGGGCTAGGGTTTGTGATTCGATTCCAAGAAA
GATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGTCTGGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGA
AGACGACACGATCGGTGATCTGAAGAAGCTGGTGGCGGCGCAGACGGGTACGAGAGCGGA
GAAGATTCGAATTCAGAAGTGGTACAACATCTACAAGGATCATATCACTCTCAAGGACTA
CGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCTCTACTACAATTAGGCGAACCGGAGGTTCTA
AGCAAGTGTGAGCTGAAGGAATGTTGTTGATTTGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAA
CAAAAAAAGTACGTCTGTAAAATTGGGTAATTGGTTTCTGATTATGTATTTGCTTTGGTA
AACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGCTACTCTTCCAACTTTTGTCTACGGTAAAGTCT
CTCGGTGTTGTGCACGATTGCTATAATTCTAAATGTTGCCC

QA 1 521 1 521
DS 



CO CL1873Contig2 558 2 2 U
GGGCTTAAAAAAAAGTCTGCGTTAAACAAACGAGAGAAATCGAGAGAGGGGCTAGGGTTT
GCGATTCGAATCCAAGAAAGAGGCAAAAAAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGACT
GGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGTGATCTGAAGAAGCT
GGTGGCGGCGCAGACGGGTACGCGAGCGGAGAAGATTAGAATCCAGAAGTGGTACAACAT
CTACAAGGATCATATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCT
CTACTACAATTAAGGCGAACCGGAGGTGATAAAGCAAGTGTGAGTTGAAGGAATGTTGTT
GATTTGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAACAAAAAAAGTACGTCTGTAAAATTGGGT
AATTGGTTTCTGATTATGTATTTGCTTTGGTAAACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGC
TACTCTTCCAACTTTTGTCTACGGTAAAGTCTCTCGGTGTTGTGCACGATTGCTATAATT
CTAAATGTTGCCCATATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2EN36JQ C 1
AF RR2EN36TF U 1
BS 1 553 RR2EN36TF
BS 554 558 RR2EN36JQ

RD RR2EN36JQ 558 0 0
GGGCTTAAAAAAAAGTCTGCGTTAAACAAACGAGAGAAATCGAGAGAGGGGCTAGGGTTT
GCGATTCGAATCCAAGAAAGAGGCAAAAAAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGACT
GGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGTGATCTGAAGAAGCT
GGTGGCGGCGCAGACGGGTACGCGAGCGGAGAAGATTAGAATCCAGAAGTGGTACAACAT
CTACAAGGATCATATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCT
CTACTACAATTAAGGCGAACCGGAGGTGATAAAGCAAGTGTGAGTTGAAGGAATGTTGTT
GATTTGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAACAAAAAAAGTACGTCTGTAAAATTGGGT
AATTGGTTTCTGATTATGTATTTGCTTTGGTAAACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGC
TACTCTTCCAACTTTTGTCTACGGTAAAGTCTCTCGGTGTTGTGCACGATTGCTATAATT
CTAAATGTTGCCCATATC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2EN36TF 558 0 0
GGGCTTAAAAAAAAGTCTGCGTTAAACAAACGAGAGAAATCGAGAGAGGGGCTAGGGTTT
GCGATTCGAATCCAAGAAAGAGGCAAAAAAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGACT
GGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGTGATCTGAAGAAGCT
GGTGGCGGCGCAGACGGGTACGCGAGCGGAGAAGATTAGAATCCAGAAGTGGTACAACAT
CTACAAGGATCATATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCT
CTACTACAATTAAGGCGAACCGGAGGTGATAAAGCAAGTGTGAGTTGAAGGAATGTTGTT
GATTTGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAACAAAAAAAGTACGTCTGTAAAATTGGGT
AATTGGTTTCTGATTATGTATTTGCTTTGGTAAACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGC
TACTCTTCCAACTTTTGTCTACGGTAAAGTCTCTCGGTGTTGTGCACGATTGCTATAATT
CTAAATGTTGCCC
ATATC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 3

CO CL1874Contig1 1339 3 5 U
GCTCAATCTCAGGGTCTGAGTTTGTTGAGATGTTTGTCGGTGTTGGTGCCTCGAGGGTTC
GTGATCTTTTCAAGAAGGCCAAGGAGAACGCTCCTTGCATTGTCTTTGTTGATGAGATTG
ATGCTGTTGGTAGGCAAAGGGGGACAGGAATCGGTGGAGGTAATGATGAGAGAGAACAGA
CTTTGAACCAGTTGCTAACTGAGATGGATGGGTTTGAAGGTAACACTGGTATCATCGTTG
TTGCTGCAACTAACAGAGCAGACATTCTTGACTCTGCTTTGTTGAGGCCAGGACGGTTTG
ACCGGCAGGTAAGTGTTGACGTTCCAGACATCAAGGGGAGAACAGATATTCTCAAGGTTC
ATGCTGGTAATAAGAAGTTTGAAAATGACGTCTCGCTTGAAGTGATAGCAATGAGAACAC
CTGGATTTAGCGGAGCAGATCTTGCTAACCTGTTGAATGAGGCTGCCATATTGGCTGGAC
GACGTGCGAAGACGGCGATATCATCGAAAGAGATTGATGACTCCATTGACAGAATCGTTG
CTGGGATGGAAGGAACTGTGATGACTGATAGCAAGAGCAAAAGCTTGGTTGCTTACCATG
AAGTTGGTCATGCCGTGTGTGGAACATTGACTCCAGGACATGACGCTGTGCAAAAGGTAA
CGTTGGTACCAAGAGGACAAGCGAGAGGTCTGACTTGGTTCATTCCATCAGATGACCCTA
CTCTCATCTCCAAGCAACAACTCTTTGCAAGAATCGTTGGTGGACTCGGTGGTAGAGCCG
CTGAAGAAATCATATTCGGTGAGCCTGAGGTTACTACTGGCGCGGTTGGTGACTTGCAAC
AGATCACCGGTTTGGCTAAGCAGATGGTAACAACATTTGGTATGTCTGAAATTGGACCAT
GGTCGTTGATGGATTCATCGGCGCAAAGCGATGTGATCATGAGGATGATGGCAAGAAACT
CCATGTCTGAGAAGCTCGCAGAGGACATTGACTCTGCGGTGAAGAAACTATCAGACAGTG
CATACGAGATAGCTCTAAGCCACATAAGGAACAACCGTGAAGCCATGGATAAGATAGTTG
AAGTGCTTTTAGAGAAAGAAACTATCGGAGGCGACGAGTTCCGAGCAATTCTCTCCGAGT
TCACCGAGATCCCGCCGGAAAACCGAGTTCCTGCCTCAACCCCAACATCAACACCAACAC
CGGCTGCTGTCTAGGTAATGAATCTCTGTATACTTCTGATTTTTCTGTACATTTGTACTG
TCAAACCTGAGCTCTAGAAATATGTGGTGATGTCCCAATACTGTGTAACACAAGTAAATG
TTATAAGTGGAATTGGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN08TF U 1
AF RR2F424TF U 511
AF RR2F424JQ C 572
BS 1 520 RR2FN08TF
BS 521 521 RR2F424TF
BS 522 652 RR2FN08TF
BS 653 1249 RR2F424TF
BS 1250 1339 RR2F424JQ

RD RR2FN08TF 652 0 0
GCTCAATCTCAGGGTCTGAGTTTGTTGAGATGTTTGTCGGTGTTGGTGCCTCGAGGGTTC
GTGATCTTTTCAAGAAGGCCAAGGAGAACGCTCCTTGCATTGTCTTTGTTGATGAGATTG
ATGCTGTTGGTAGGCAAAGGGGGACAGGAATCGGTGGAGGTAATGATGAGAGAGAACAGA
CTTTGAACCAGTTGCTAACTGAGATGGATGGGTTTGAAGGTAACACTGGTATCATCGTTG
TTGCTGCAACTAACAGAGCAGACATTCTTGACTCTGCTTTGTTGAGGCCAGGACGGTTTG
ACCGGCAGGTAAGTGTTGACGTTCCAGACATCAAGGGGAGAACAGATATTCTCAAGGTTC
ATGCTGGTAATAAGAAGTTTGAAAATGACGTCTCGCTTGAAGTGATAGCAATGAGAACAC
CTGGATTTAGCGGAGCAGATCTTGCTAACCTGTTGAATGAGGCTGCCATATTGGCTGGAC
GACGTGCGAAGACGGCGATATCATCGAAAGAGATTGATGATTCCATTGACAGAATCGTTG
CTGGGATGGAAGGAACTGTGATGACTGATAGCAAGAGCAAAAGCTTGGTTGCTTACCATG
AAGTTGGTCATGCCGTGTGTGGAACATTGACTCCAGGACATGACGCTGTGCA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2F424TF 739 0 0
G
GATTGATGACTCTATTGGCAGAATCGTTGCTGGGATGGAAGGAACTGTGATGACTGATAG
CAAGAGCAAAAGCTTGGTTGCTTACCATGAAGTTGGTCATGCCGTGTGTGGAACATTGAC
TCCAGGACATGACGCTGTGCAAAAGGTAACGTTGGTACCAAGAGGACAAGCGAGAGGTCT
GACTTGGTTCATTCCATCAGATGACCCTACTCTCATCTCCAAGCAACAACTCTTTGCAAG
AATCGTTGGTGGACTCGGTGGTAGAGCCGCTGAAGAAATCATATTCGGTGAGCCTGAGGT
TACTACTGGCGCGGTTGGTGACTTGCAACAGATCACCGGTTTGGCTAAGCAGATGGTAAC
AACATTTGGTATGTCTGAAATTGGACCATGGTCGTTGATGGATTCATCGGCGCAAAGCGA
TGTGATCATGAGGATGATGGCAAGAAACTCCATGTCTGAGAAGCTCGCAGAGGACATTGA
CTCTGCGGTGAAGAAACTATCAGACAGTGCATACGAGATAGCTCTAAGCCACATAAGGAA
CAACCGTGAAGCCATGGATAAGATAGTTGAAGTGCTTTTAGAGAAAGAAACTATCGGAGG
CGACGAGTTCCGAGCAATTCTCTCCGAGTTCACCGAGATCCCGCCGGAAAACCGAGTTCC
TGCCTCAACCCCAACATCAACACCAACACCGGCTGCTGTCTAGGTAATGAATCTCTGTAT
ACTTCTGATTTTTCTGTA

QA 2 739 2 739
DS 

RD RR2F424JQ 768 0 0
CAAGAGCAAAAGCTTGGTTGCTTACCATGAAGTTGGTCATGCCGTGTGTGGAACATTGAC
TCCAGGACATGACGCTGTGCAAAAGGTAACGTTGGTACCAAGAGGACAAGCGAGAGGTCT
GACTTGGTTCATTCCATCAGATGACCCTACTCTCATCTCCAAGCAACAACTCTTTGCAAG
AATCGTTGGTGGACTCGGTGGTAGAGCCGCTGAAGAAATCATATTCGGTGAGCCTGAGGT
TACTACTGGCGCGGTTGGTGACTTGCAACAGATCACCGGTTTGGCTAAGCAGATGGTAAC
AACATTTGGTATGTCTGAAATTGGACCATGGTCGTTGATGGATTCATCGGCGCAAAGCGA
TGTGATCATGAGGATGATGGCAAGAAACTCCATGTTTGAGAAGCTCGCAGAGGACATTGA
CTTTGCGGTGAAGAAACTATCAGACAGTGCATACGAGATAGCTTTAAGCCACATAAGGAA
CAACCGTGAAGCCATGGATAAGATAGTTGAAGTGCTTTTAGAGAAAGAAACTATCGGAGG
CGACGAGTTCCGAGCAATTCTCTCCGAGTTCACCGAGATCCCGCCGGAAAACCGAGTTCC
TGCCTCAACCCCAACATCAACACCAACACCGGCTGCTGTCTAGGTAATGAATCTCTGTAT
ACTTTTGATTTTTCTGTACATTTGTACTGTCAAACCTGAGCTCTAGAAATATGTGGTGAT
GTCCCAATACTGTGTAACACAAGTAAATGTTATAAGTGGAATTGGTAT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 4

CO CL1875Contig1 638 4 14 U
GGATTTACAGAGAGTCGCATCGAGGTTCTGATCTTAGGAAGCAGCAGAAATGGCGGTACC
GTTGTTAACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGA
CCGTAGAATCACCGTCAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATCGATTCAAGGGT**G
GAGAAAGTTCAAGGGCGTGACGTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCAGACAAGAAGAC
ACGTCACTACCTCCCCAACGGATTCAAGAAGTTTGTTGTGCACAACACGAGTGACCTCGA
GCTGCTGATGATGCACAACAGGACGTACTGCGCCGAGATTGCGCACAACGTTTCGACCAA
GAAGAGGAAGGCTATTGTGGAGAGAGCTTCTCAGTTGGATATTGTTGTTACCAACAGGCT
TGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGTAACTAAACTAGCAAAGGCACTTGAAA
TATTAAGTTTGTTTCTGGTTTGTTTGCATTTATTTCCGTTTTTGTAAGACAGATTTTGTT
TAACTGTTTGTGTTTTGCAATCTACAAACATGAGTTTTGGTATTAGACAAACCTAGGTGA
TTCAGTTTCCTAATGGACCACGTTGACATTTAATTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN08TF U 11
AF RR2A736TF U 1
AF RR2DL27TF U 5
AF RR2DL27JQ C 5
BS 1 48 RR2A736TF
BS 49 49 RR2GN08TF
BS 50 64 RR2A736TF
BS 65 65 RR2DL27TF
BS 66 177 RR2A736TF
BS 178 179 RR2DL27TF
BS 180 195 RR2A736TF
BS 196 196 RR2DL27TF
BS 197 473 RR2A736TF
BS 474 474 RR2DL27TF
BS 475 486 RR2A736TF
BS 487 487 RR2GN08TF
BS 488 561 RR2A736TF
BS 562 638 RR2DL27JQ

RD RR2GN08TF 488 0 0
GGAGA
CGCATCGAGGTTCTGATCTTAGGAAGCAGCAGAAATGGCGGTACCGTTGCTAACGAAGAA
GGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGTAGAATCACCGT
CAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATCGATTCAAGGGTTAGGAGAAAGTTCAAGGG
TGTGACGTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCAGACAAGAAGACACGTCACTACCTCCC
CAACGGATTCAAGAAGTTTGTTGTGCACAACACGAGTGACCTCGAGCTGCTGATGATGCA
CAACAGGACGTACTGCGCCGAGATTGCGCACAACGTTTCGACCAAGAAGAGGAAGGCTAT
TGTGGAGAGAGCTTCTCAGTTGGATATTGTTGTTACCAACAGGCTTGCTAGGCTCCGTAG
CCAAGAAGACGAGTGAAGTAACTAAACTAGCAAAGGCATTTGAAATATTAAGTTTGTTTC
TGG

QA 6 488 6 488
DS 

RD RR2A736TF 565 0 0
GGATTTACAGAGAGTCGCATCGAGGTTCTGATCTTAGGAAGCAGCAGAGATGGCGGTACC
GTTGCTAACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGA
CCGTAGAATCACCGTCAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATCGATTCAAGGGTTAG
GAGAAAGTTCAAGGGTGTGACGTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCAGACAAGAAGAC
ACGTCACTACCTCCCCAACGGATTCAAGAAGTTTGTTGTGCACAACACGAGTGACCTCGA
GCTGCTGATGATGCACAACAGGACGTACTGCGCCGAGATTGCGCACAACGTTTCGACCAA
GAAGAGGAAGGCTATTGTGGAGAGAGCTTCTCAGTTGGATATTGTTGTTACCAACAGGCT
TGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGTAACTAAACTAGCAAAGGCATTTGAAA
TATTAATTTTGTTTCTGGTTTGTTTGCATTTATTTCCGTTTTTGTAAGACAGATTTTGTT
TAACTGTTTGTGTTTTGCAAT
CTAC

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2DL27TF 559 0 0
GGACAGAGAGT
CGCATCGAGGTTCTGATCTTAGGAAGCAGCAGAAATGGCGGTACCGTTGTTAACGAAGAA
GGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGTAGAATCACCGT
CAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATCGATTCAAGGGT**GGAGAAAGTTCAAGGG
CGTGACGTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCAGACAAGAAGACACGTCACTACCTCCC
CAACGGATTCAAGAAGTTTGTTGTGCACAACACGAGTGACCTCGAGCTGCTGATGATGCA
CAACAGGACGTACTGCGCCGAGATTGCGCACAACGTTTCGACCAAGAAGAGGAAGGCTAT
TGTGGAGAGAGCTTCTCAGTTGGATATTGTTGTTACCAACAGGCTTGCTAGGCTCCGTAG
CCAAGAAGACGAGTGAAGTAACTAAACTAGCAAAGGCACTTGAAATATTAAGTTTGTTTC
TGGTTTGTTTGCATTTATTTCCGTTTTTGTAAGACAGATTTTGTTTAACTGTTTGTGTTT
TGCAAT
CT

QA 12 557 12 557
DS 

RD RR2DL27JQ 634 0 0
GGACAGAGAGT
CGCATCGAGGTTCTGATCTTAGGAAGCAGCAGAAATGGCGGTACCGTTGTTAACGAAGAA
GGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGTAGAATCACCGT
CAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATCGATTCAAGGGT**GGAGAAAGTTCAAGGG
CGTGACGTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCAGACAAGAAGACACGTCACTACCTCCC
CAACGGATTCAAGAAGTTTGTTGTGCACAACACGAGTGACCTCGAGCTGCTGATGATGCA
CAACAGGACGTACTGCGCCGAGATTGCGCACAACGTTTCGACCAAGAAGAGGAAGGCTAT
TGTGGAGAGAGCTTCTCAGTTGGATATTGTTGTTACCAACAGGCTTGCTAGGCTCCGTAG
CCAAGAAGACGAGTGAAGTAACTAAACTAGCAAAGGCACTTGAAATATTAAGTTTGTTTC
TGGTTTGTTTGCATTTATTTCCGTTTTTGTAAGACAGATTTTGTTTAACTGTTTGTGTTT
TGCAATCTACAAACATGAGTTTTGGTATTAGACAAACCTAGGTGATTCAGTTTCCTAATG
GACCACGTTGACATTTAATTACT

QA 12 634 12 634
DS 



AS 1 4

CO CL1876Contig1 999 4 15 U
TTTTTGCTATCGTCGTCAAGAGCCAGAGAGAGAAAGAGGAATCGGTTGTGTGTTGTCGAA
GCTTCTTGGCTCTCTCTTCTCTTGTCAACGCGTTTCTCTAATCTGCGATCTCTCGTTGAT
CAGAGGATTTCTCACAGATCAACAATCATGGCCACCGCTGGAGGAAACAAGAACATCAAC
GCCAAATTGGTATTGCTTGGGGATGTTGGAGCTGGAAAATCAAGTCTTGTGCTTCGATTC
GTCAAAGATCAGTTTGTTGAATTCCAGGAATCAACGATAGGTGCAGCCTTCTTCTCTCAA
ACATTGGCTGTGAATGATGCAACTGTCAAGTTTGAGATTTGGGATACTGCTGGTCAGGAA
CGTTACCATAGCTTGGCTCCTATGTACTACAGGGGTGCTGCTGCTGCCATTATTGTCTTT
GACATCACTAATCAAGCCTCATTTGAGAGGGCTAAGAAATGGGTTCAGGAACTGCAGGCA
CAAGGTAACCCTAATATGGTGATGGCTCTTGCTGGTAACAAAGCTGATTTATTGGATGCA
AGGAAAGTGTCTGCGGAGGAGGCAGAGACGTACGCACAAGAGAACAGCCTTTTCTTCATG
GAAACCTCAGCTAAGACGGCAACAAATGTTAAAGACATCTTCTACGAAATCGCAAAAAGG
CTACCACGTGTACAGCCAGCAGAAAACCCAGCAGGAATGGTTCTCCCAAGCGGGCCAGCA
GCTACTGCAGTGAGTAGTTCATCATGTTGTGCTTAAGAGAGCTCTCAGCTCTCTCTCTTG
GTTAGTCACTGTAGAAAGAGACATCCAGTCTCTTTATGTGTTTTCTTCTTGTCTTAACGT
TGTCGCTTTGCTTTGCATTGTATATCAAGATGTTTCCGTTCTGTGGAAATCTAAAGATAC
TTGTATTTGAAGAGGTTTGATTTGTAATTAGATATCACAACTTACTATGCGTGTGATCGC
TTCTCTATATATTGTGCACCAAAATCCCTTTTCCTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 5 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN01TF U 1
AF RR2AP30TF U 7
AF RR2AP30JQ C 107
AF RR2GN01JQ C 293
BS 1 227 RR2GN01TF
BS 228 228 RR2AP30TF
BS 229 614 RR2GN01TF
BS 615 693 RR2AP30TF
BS 694 694 RR2AP30JQ
BS 695 823 RR2AP30TF
BS 824 826 RR2AP30JQ
BS 827 829 RR2AP30TF
BS 830 830 RR2AP30JQ
BS 831 834 RR2AP30TF
BS 835 836 RR2AP30JQ
BS 837 888 RR2AP30TF
BS 889 889 RR2AP30JQ
BS 890 901 RR2AP30TF
BS 902 999 RR2AP30JQ

RD RR2GN01TF 614 0 0
TTTTTGCTATCGTCGTCAAGAGCCAGAGAGAGAAAGAGGAATCGGTTGTGTGTTGTCGAA
GCTTCTTGGCTCTCTCTTCTCTTGTCAACGCGTTTCTCTAATCTGCGATCTCTCGTTGAT
CAGAGGATTTCTCACAGATCAACAATCATGGCCACCGCTGGAGGAAACAAGAACATCAAC
GCCAAATTGGTATTGCTTGGGGATGTTGGAGCTGGAAAATCAAGTCTCGTGCTTCGATTC
GTCAAAGATCAGTTTGTTGAATTCCAGGAATCAACGATAGGTGCAGCCTTCTTCTCTCAA
ACATTGGCTGTGAATGATGCAACTGTCAAGTTTGAGATTTGGGATACTGCTGGTCAGGAA
CGTTACCATAGCTTGGCTCCTATGTACTACAGGGGTGCTGCTGCTGCCATTATTGTCTTT
GACATCACTAATCAAGCCTCATTTGAGAGGGCTAAGAAATGGGTTCAGGAACTGCAGGCA
CAAGGTAACCCTAATATGGTGATGGCTCTTGCTGGTAACAAAGCTGATTTATTGGATGCA
AGGAAAGTGTCTGCGGAGGAGGCAGAGACGTACGCACAAGAGAACAGCCTTTTCTTCATG
GAAACCTCAGCTAA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2AP30TF 895 0 0
GGATCGTCGTCAAGAGCC
AGAGAGAGAAAGAGGAATCGGTTGTGTGTTGTCGAAGCTTCTTGGCTCTCTCTTCTCTTG
TCAACGCGTTTCTCTAATCTGCGATCTCTCGTTGATCAGAGGATTTCTCACAGATCAACA
ATCATGGCCACCGCTGGAGGAAACAAGAACATCAACGCCAAATTGGTATTGCTTGGGGAT
GTTGGAGCTGGAAAATCAAGTCTTGTGCTTCGATTCGTCAAAGATCAGTTTGTTGAATTC
CAGGAATCAACGATAGGTGCAGCCTTCTTCTCTCAAACATTGGCTGTGAATGATGCAACT
GTCAAGTTTGAGATTTGGGATACTGCTGGTCAGGAACGTTACCATAGCTTGGCTCCTATG
TACTACAGGGGTGCTGCTGCTGCCATTATTGTCTTTGACATCACTAATCAAGCCTCATTT
GAGAGGGCTAAGAAATGGGTTCAGGAACTGCAGGCACAAGGTAACCCTAATATGGTGATG
GCTCTTGTTGGTAACAAAGCTGATTTATTGGATGCAAGGAAAGTGTCTGCGGAGGAGGCA
GAGACGTACGCACAAGAGAACAGCCTTTTCTTCATGGAAACCTCAGCTAAGACGGCAACA
AATGTTAAAGACATCTTCTACGAAATCGCAAAAAGGCTACCACGTGTACAGCCAGCAGAA
AACCCAGCACGAATGGTTCTCCCAAGCGGGCCAGCAGCTACTGCAGTGAGTAGTTCATCA
TGTTGTGCTTAAGAGAGCTCTCAGCTCTCTCTCTTGGTTAGTCACTGTAGAAAGAGACAT
CCAGTCTCTTTATGTGTTTC**TCT*GTCT**ACGTTGTCGCTTTGCTTTGCATTGTATA
TCAAGATGTTTCCGTTCTGTGGAA*TCTAAAGATACT

QA 19 895 19 895
DS 

RD RR2AP30JQ 893 0 0
GATCTCTCGTTGATCAGAGGATTTCTCACAGATCAACAATCATGGCCACCGCTGGAGGAA
ACAAGAACATCAACGCCAAATTGGTATTGCTTGGGGATGTTGGAGCTGGAAAATCAAGTC
TTGTGCTTCGATTCGTCAAAGATCAGTTTGTTGAATTCCAGGAATCAACGATAGGTGCAG
CCTTCTTCTCTCAAACATTGGCTGTGAATGATGCAACTGTCAAGTTTGAGATTTGGGATA
CTGCTGGTCAGGAACGTTACCATAGCTTGGCTCCTATGTACTACAGGGGTGCTGCTGCTG
CCATTATTGTCTTTGACATCACTAATCAAGCCTCATTTGAGAGGGCTAAGAAATGGGTTC
AGGAACTGCAGGCACAAGGTAACCCTAATATGGTGATGGCTCTTGTTGGTAACAAAGCTG
ATTTATTGGATGCAAGGAAAGTGTCTGCGGAGGAGGCAGAGACGTACGCACAAGAGAACA
GCCTTTTCTTCATGGAAACCTCAGCTAAGACGGCAACAAATGTTAAAGACATCTTCTACG
AAATCGCAAAAAGGCTACCACGTGTACAGCCAGCAGAAAACCCAGCAGGAATGGTTCTCC
CAAGCGGGCCAGCAGCTACTGCAGTGAGTAGTTCATCATGTTGTGCTTAAGAGAGCTCTC
AGCTCTCTCTCTTGGTTAGTCACTGTAGAAAGAGACATCCAGTCTCTTTATGTGTTTTCT
TCTTGTCTTAACGTTGTCGCTTTGCTTTGCATTGTATATCAAGATGTTTCCGTTCTGTGG
AAATCTAAAGATACTTGTATTTGAAGAGGTTTGATTTGTAATTAGATATCACAACTTACT
ATGCGTGTGATCGCTTCTCTATATATTGTGCACCAAAATCCCTTTTCCTTGCG

QA 1 893 1 893
DS 

RD RR2GN01JQ 695 0 0
TCTCTCAAACATTGGCTGTGAATGATGCAACTGTCAAGTTTGAGATTTGGGATACTGCTG
GTCAGGAACGTTACCATAGCTTGGCTCCTATGTACTACAGGGGTGCTGCTGCTGCCATTA
TTGTCTTTGACATCACTAATCAAGCCTCATTTGAGAGGGCTAAGAAATGGGTTCAGGAAC
TGCAGGCACAAGGTAACCCTAATATGGTGATGGCTCTTGCTGGTAACAAAGCTGATTTAT
TGGATGCAAGGAAAGTGTCTGCGGAGGAGGCAGAGACGTACGCACAAGAGAACAGCCTTT
TCTTCATGGAAACCTCAGCTAAGACGGCAACAAATGTTAAAGACATCTTCTACGAAATCG
CAAAAAGGCTACCACGTGTACAGCCAGCAGAAAACCCAGCAGGAATGGTTCTCCCAAGCG
GGCCAGCAGCTACTGCAGTGAGTAGTTCATCATGTTGTGCTTAAGAGAGCTCTCAGCTCT
CTCTCTTGGTTAGTCACTGTAGAAAGAAACATCCAGTCTCTTTATGTGTTTTCTTCTTGT
CTTAACGTTGTCGCTTTGCTTTGCATTGTATATCAAGATGTTTCCGTTCTGTGGAAATCT
AAAGATACTTGTATT*GAAGAGGTTTGATTTGTAATTAGATATCACAACTTACTATGCGT
GTGATCGCTTCTCTATATATTGTGCACCAAAATCC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 2 5

CO CL1877Contig1 967 3 23 U
GCTAATAGAAGCAATAATTCATAACAAAACTAACCAACATTGAAGAACAAGAGACTGTTT
TTGTTTTGTTTGTTGAAGTTGTGTTTTATTGCATTCTTAATAAAAAATTTACAATCGTAA
CAGGTGGAACTCACTCACTCACTCACTCTCCTACGTAGGAACCACCTGAGGCTCAAGCGG
CGGTGGAGCTCCTTCATCCACCACAGGCGCACCAGTCGTTGTGGAGGACTCTTCCTTCTC
ACTCTCCTCAAACCCGGACTTGAACCGGTCATAGTTAGTAACCTCGGCCGGTTTAAACGG
ACGCTCACCCAAAACTTTCAAAAGATCATCCTGATGCAGCACTTCCTTCTCCAGCAGAAG
CTCAGCGATCTCGGCCACTTTCTCCTTGTGCGTCTCTATCAGCTCCACCGTCTTCTCGTA
AGCTTTCCCCACCCATTCCCTCACTTCCTCGTCTATGATCGCGCCGGTCTTGTTGCTGTA
CGGTTTGTTGAAGTCGTATCCATCATCCCTCGGCGGAAACGAGAGCAGACCGACCTTGTC
GCTGAAACCGTACACGGCTACTTGCGCGTACGTCATCTTTGTAACTTTCTCTAGATCGTT
CTGCGCACCCGTTGAGATCTTTCCTATCAATACCTGCTCGGCTGCACGGCCACCTAGAGT
CATGCAAGTCATGTCAAAGAGCTGTTCTTTGGTCATGAGAAGGTTTTCATTAGGAACGTA
CTGAGCAAAACCAAGCGCAGCTGTTCCACGTGGCACGATGGTCACCTTCAGCAATGGCTC
CGCGTGTTCCAGGAACCAACCAGCAACCGCGTGACCAGATTCATGATACGCAACCGTACG
ACGCTCCAGCTTACTTATCACTCAGTTCTTCTTCTCAAGACCACCAATGACACGATCAAT
AGCAGATTCAAAGTGCGCCATCGTGACGGTAGCTCCTTCGTGTCTAGCGGCGATAAGAGC
CGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO24JQ U 1
AF RR2B655JQ U 4
AF RR2B655TF C 239
BS 1 246 RR2FO24JQ
BS 247 247 RR2B655JQ
BS 248 255 RR2FO24JQ
BS 256 256 RR2B655JQ
BS 257 279 RR2FO24JQ
BS 280 280 RR2B655JQ
BS 281 285 RR2FO24JQ
BS 286 286 RR2B655JQ
BS 287 301 RR2FO24JQ
BS 302 302 RR2B655JQ
BS 303 314 RR2FO24JQ
BS 315 315 RR2B655JQ
BS 316 368 RR2FO24JQ
BS 369 369 RR2B655JQ
BS 370 372 RR2FO24JQ
BS 373 373 RR2B655JQ
BS 374 570 RR2FO24JQ
BS 571 571 RR2B655JQ
BS 572 603 RR2FO24JQ
BS 604 604 RR2B655JQ
BS 605 679 RR2FO24JQ
BS 680 903 RR2B655JQ
BS 904 967 RR2B655TF

RD RR2FO24JQ 679 0 0
GCTAATAGAAGCAATAATTCATAACAAAACTAACCAACATTGAAGAACAAGAGACTGTTT
TTGTTTTGTTTGTTGAAGTTGTGTTTTATTGCATTCTTAATAAAAAATTTACAATCGTAA
CAGGTGGAACTCACTCACTCACTCACTCTCCTACGTAGGAACCACCTGAGGCTCAAGCGG
CGGTGGAGCTCCTTCATCCACCACAGGCGCACCAGTCGTTGTGGAGGACTCTTCCTTCTC
ACTCTCTTCAAACCCAGACTTGAACCGGTCATAGTTAGTCACCTCAGCCGGTTTAAACGG
ATGCTCACCCAAAATTTTCAAAAGATCATCCTGATGCAGCACTTCCTTCTCCAGCAGAAG
CTCAGCGACCTCAGCCACTTTCTCCTTGTGCGTCTCTATCAGCTCCACCGTCTTCTCGTA
AGCTTTCCCCACCCATTCCCTCACTTCCTCGTCTATGATCGCGCCGGTCTTGTTGCTGTA
CGGTTTGTTGAAGTCGTATCCATCATCCCTCGGCGGAAACGAGAGCAGACCGACCTTGTC
GCTGAAACCGTACACGGCTACTTGCGCGTATGTCATCTTTGTAACTTTCTCTAGATCGTT
CTGTGCACCCGTTGAGATCTTTCCTATCAATACCTGCTCGGCTGCACGGCCACCTAGAGT
CATGCAAGTCATGTCAAAG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2B655JQ 900 0 0
AG
TAGAAGCAATAGTTCATAACAAAACTAACCAACATTGAAGAACAAGAGACTGTTTTTGTT
TTGTTTGTTGAAGTTGTGTTTTATTGCATTCTTAATAAAAAATTTACAATCGTAACAGGT
GGAACTCACTCACTCACTCACTCTCCTACGTAGGAACCACCTGAGGCTCAAGCGGCGGTG
GAGCTCCTTCATCCACCACAGGTGCACCAGTCGTTGTGGAGGACTCTTCCTTCTCACTCT
CCTCAAACCCGGACTTGAACCGGTCATAGTTAGTAACCTCGGCCGGTTTAAACGGACGCT
CACCCAAAACTTTCAAAAGATCATCCTGATGCAGCACTTCCTTCTCCAGCAGAAGCTCAG
CGATCTCGGCCACTTTCTCCTTGTGCGTCTCTATCAGCTCCACCGTCTTCTCGTAAGCTT
TCCCCACCCATTCCCTCACTTCCTCGTCTATGATCGCGCCGGTCTTGTTGCTGTACGGTT
TGTTGAAGTCGTATCCATCATCCCTCGGCGGAAACGAGAGCAGACCGACCTTGTCGCTGA
AACCGTACACGGCTACTTGCGCGTACGTCATCTTTGTAACTTTCTCTAGATCGTTCTGCG
CACCCGTTGAGATCTTTCCTATCAATACCTGCTCGGCTGCACGGCCACCTAGAGTCATGC
AAGTCATGTCAAAGAGCTGTTCTTTGGTCATGAGAAGGTTTTCATTAGGAACGTACTGAG
CAAAACCAAGCGCAGCTGTTCCACGTGGCACGATGGTCACCTTCAGCAATGGCTCCGCGT
GTTCCAGGAACCAACCAGCAACCGCGTGACCAGATTCATGATACGCAACCGTACGACGCT
CCAGCTTACTTATCACTCAGTTCTTCTTCTCAAGACCACCAATGACACGATCAATAGC

QA 3 900 3 900
DS 

RD RR2B655TF 729 0 0
TCACTCTCCTCAAACCCGGACTTGAACCGGTCATAGTTAGTAACCTCGGCCGGTTTAAAC
GGACGCTCACCCAAAACTTTCAAAAGATCATCCTGATGCAGCACTTCCTTCTCCAGCAGA
AGCTCAGCGATCTCGGCCACTTTCTCCTTGTGCGTCTCTATCAGCTCCACCGTCTTCTCG
TAAGCTTTCCCCACCCATTCCCTCACTTCCTCGTCTATGATCGCGCCGGTCTTGTTGCTG
TACGGTTTGTTGAAGTCGTATCCATCATCCCTCGGCGGAAACGAGAGCAGACCGACCTTG
TCGCTGAAACCGTACACGGCTACTTGCGCGTACGTCATCTTTGTAACTTTCTCTAGATCG
TTCTGCGCACCCGTTGAGATCTTTCCTATCAATACCTGCTCGGCTGCACGGCCACCTAGA
GTCATGCAAGTCATGTCAAAGAGCTGTTCTTTGGTCATGAGAAGGTTTTCATTAGGAACG
TACTGAGCAAAACCAAGCGCAGCTGTTCCACGTGGCACGATGGTCACCTTCAGCAATGGC
TCCGCGTGTTCCAGGAACCAACCAGCAACCGCGTGACCAGATTCATGATACGCAACCGTA
CGACGCTCCAGCTTACTTATCACTCAGTTCTTCTTCTCAAGACCACCAATGACACGATCA
ATAGCAGATTCAAAGTGCGCCATCGTGACGGTAGCTCCTTCGTGTCTAGCGGCGATAAGA
GCCGCTTCC

QA 1 729 1 729
DS 



CO CL1877Contig2 1181 2 4 U
GGAACCGGTGGCCAGTACAAGTACTACTTCAACATCGGTAGCGTCGACTCTTTCGAGGAG
AAACTCGAAGAAGCTCAAGAAGCCTTAGGCATTGATCCTCACCAGTACGTTCCCGTCACG
TACACAACTGAGATGGTCTGGTTCCAAGAGTTTCTGCGGTTCGCGCCGACCCTACTCCTC
TTGGGCACTCTTGTCTACGGAGCCAGGAGGATGCAAGGCGGGTTAGGAGGTCTAGGAGGA
ACCGGAGGAAAGAACGGCCGTGGAATCTTTAACATAGGCAAAGCCACGATAACGAGAGCT
GACAAAAACTCCAAGGACAAGATTTATTTCAAGGACGTCGCTGGATGCGAGGAGGCTAAA
CAAGAGATCATGGAGTTTGTTCATTTCCTCAAAAACCCTAAAAAATACGAAGACTTGGGC
GCTAAGATACCGAAAGGAGCGCTTTTAGTCGGTCCTCCCGGAACAGGAAAGAGCTTTTAG
CCAAAGCAACAGCTGGAGAATCAGGCGTGCCGTTTCTCTCTATCTCCGGTTCAGACTTCA
TGGAGATGTTCGTCGGTGTTGGACCTTCGAGGGTGAGAAACTTGTTCCAAGAAGCTAGAC
AAGCTGCGCCGAGCATCATCTTTATAGACGAGATCGACGCCATCGGTAGAGCGAGAGGAC
GTGGAGGGTTAGGTGGTAACGACGAGCGTGAGAGCACTTTGAACCAGCTGCTTGTCGAGA
TGGATGGGTTTGGTACGACGGCTGGAGTTGTGGTTCTCGCTGGGACCAACAGACCGGATA
TTCTTGATAAAGCTCTGTTACGTCCCGGCCGGTTCGATCGTCAGATAACCATCGATAAAC
CGGATATCAAGGGGCGTGATCAGATATTCCAGATATACTTGAAGAAGATCAAATTAGATC
ACGAGCCTTCTTACTACTCTCAGAGACTTGCTGCTCTCACTCCTGGTTTCGCTGGTGCTG
ACATTGCTTATGTATGTAACGAAGCGGCTCTTATCGCTGCTAGACACGAAGGAGCGACCG
TCACGATGGCACACTTTGAATCTGCTATTGATCGTGTCATTGGTGGTCTTGAGAAGAAGA
ACAGAGTGATAAGTAAGCTGGAGCGTCGTACAGTTGCGTATCATGAATCTGGTCACGCGG
TTGCTGGTTGGTTCCTGGAACACGCGGAGCCATTGCTGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO24TF U 1
AF RR2CU46TF U 522
BS 1 531 RR2FO24TF
BS 532 532 RR2CU46TF
BS 533 727 RR2FO24TF
BS 728 1181 RR2CU46TF

RD RR2FO24TF 727 0 0
GGAACCGGTGGCCAGTACAAGTACTACTTCAACATCGGTAGCGTCGACTCTTTCGAGGAG
AAACTCGAAGAAGCTCAAGAAGCCTTAGGCATTGATCCTCACCAGTACGTTCCCGTCACG
TACACAACTGAGATGGTCTGGTTCCAAGAGTTTCTGCGGTTCGCGCCGACCCTACTCCTC
TTGGGCACTCTTGTCTACGGAGCCAGGAGGATGCAAGGCGGGTTAGGAGGTCTAGGAGGA
ACCGGAGGAAAGAACGGCCGTGGAATCTTTAACATAGGCAAAGCCACGATAACGAGAGCT
GACAAAAACTCCAAGGACAAGATTTATTTCAAGGACGTCGCTGGATGCGAGGAGGCTAAA
CAAGAGATCATGGAGTTTGTTCATTTCCTCAAAAACCCTAAAAAATACGAAGACTTGGGC
GCTAAGATACCGAAAGGAGCGCTTTTAGTCGGTCCTCCCGGAACAGGAAAGAGCTTTTAG
CCAAAGCAACAGCTGGAGAATCAGGCGTGCCGTTTCTCTCTATCTCCGGTTTAGACTTCA
TGGAGATGTTCGTCGGTGTTGGACCTTCGAGGGTGAGAAACTTGTTCCAAGAAGCTAGAC
AAGCTGCGCCGAGCATCATCTTTATAGACGAGATCGACGCCATCGGTAGAGCGAGAGGAC
GTGGAGGGTTAGGTGGTAACGACGAGCGTGAGAGCACTTTGAACCAGCTGCTTGTCGAGA
TGGATGG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2CU46TF 660 0 0
ATCTCCGGTTCAGACTTCATGGAGATGTTCGTCGGTGTTGGACCTTCGAGGGTGAGAAAC
TTGTTCCAAGAAGCTAGACAAGCTGCGCCGAGCATCATCTTTATAGACGAGATCGACGCC
ATCGGTAGAGCGAGAGGACGTGGAGGGTTAGGTGGTAACGACGAGCGTGAGAGCACTTTG
AACCAGCTGCTTGTCGAGATGGATGGGTTTGGTACGACGGCTGGAGTTGTGGTTCTCGCT
GGGACCAACAGACCGGATATTCTTGATAAAGCTCTGTTACGTCCCGGCCGGTTCGATCGT
CAGATAACCATCGATAAACCGGATATCAAGGGGCGTGATCAGATATTCCAGATATACTTG
AAGAAGATCAAATTAGATCACGAGCCTTCTTACTACTCTCAGAGACTTGCTGCTCTCACT
CCTGGTTTCGCTGGTGCTGACATTGCTTATGTATGTAACGAAGCGGCTCTTATCGCTGCT
AGACACGAAGGAGCGACCGTCACGATGGCACACTTTGAATCTGCTATTGATCGTGTCATT
GGTGGTCTTGAGAAGAAGAACAGAGTGATAAGTAAGCTGGAGCGTCGTACAGTTGCGTAT
CATGAATCTGGTCACGCGGTTGCTGGTTGGTTCCTGGAACACGCGGAGCCATTGCTGAAG

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 3

CO CL1878Contig1 1139 3 4 U
AAGATCAAGCCTACTCATGTGGTGGCTAAAGACGGAAGTGGACAGTTTAAGACGATTTCC
GAAGCAGTTAGGGCTTGTCCGCAGAAAAATCCTGGACGTTGCATTATCCATATTAAGGCT
GGTGTCTACAAGGAACAGGTCACTATCCCTAAGAAGGTAAACAACGTTTTCATGTTTGGT
GATGGTGCAACAAAAACAATCATTACTTTCGACAGAAGTGTTGGTCTTAGCCCTGGAACC
ACTACCTCACTCAGTGGCACCGTTCAGGTTGAATCTGAGGGATTCATGGCGAAATGGATT
GGGTTTCAGAACACTGCTGGTCCATTAGGACACCAGGCCGTCGCATTCCGTGTGAACGGA
GACCGTGCGGTCATATTCAACTGCAGATTTGATGGTTACCAAGACACACTCTACGTCAAC
AACGGACGTCAGTTCTACAGGAACATTGTTGTGTCCGGTACAGTCGATTTTATCTTCGGA
AAATCTGCGACCGTGATCCAAAACTCTCTAATCCTCTGCCGAAAGGGAACCAAAGGACAA
ACCAACCACGTTACAGCCGACGGTAACATGAAAGGTAAAGCGGTGAAGATTGGTATCGTT
CTCCATAACTGCCGTATCATGGCGGACAAAGAGCTCGAAGCTGACAGGCTAACCGTCAAA
TCATACCTTGGACGGCCGTGGAAACCATTTGCCACCACCGCTGTTATTGGAACTGAGATT
GGTGATTTGATTCAACCGGTAGGATGGAACGAATGGCAAGGAGAAAAGTTCCATCTGACA
GCTACATATGTTGAGTTCAATAACCGTGGACCAGGAGCTAACACAGCTGCGAGGGCTCCT
TGGGCTAAGATGGCTAAGTCTGCCGCTGAGGTTGAACGTTTCACCGTCGCTAACTGGCTG
ACTCCGGCGAACTGGATTCAAGAAGCCAACGTTCCTGTCCAGCTTGGATTGTAAAAAGTA
ACTACCTAACAAAATAATATAGTGTGTGATCATGTAAAAAGGTAACGGTACGACCTCGTC
TCTCGGGATCAGGGCTCTTTTTGGTTATTATTAGGGTTCTAGGCATTTTGGGATGATGTT
TGTATAAGATTGCTTTTGCTTCACATGCAAAACATATATACAAAATATCTTATTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FI30TF U 482
AF RR2AK18TF U 1
AF RR2AK18JQ C 515
BS 1 742 RR2AK18TF
BS 743 743 RR2AK18JQ
BS 744 806 RR2AK18TF
BS 807 1139 RR2AK18JQ

RD RR2FI30TF 136 0 0
AA
TCTGCGACCGTGATCCAAAACTCTCTAATCCTCTGCCGAAAGGGAACCAAAGGACAAACC
AACCACGTTACAGCCGACGGTAACATGAAAGGTAAAGCGGTGAAGATTGGTATCGTTCTC
CATAACTGCCGTAT

QA 3 136 3 136
DS 

RD RR2AK18TF 806 0 0
AAGATCAAGCCTACTCATGTGGTGGCTAAAGACGGAAGTGGACAGTTTAAGACGATTTCC
GAAGCAGTTAGGGCTTGTCCGCAGAAAAATCCTGGACGTTGCATTATCCATATTAAGGCT
GGTGTCTACAAGGAACAGGTCACTATCCCTAAGAAGGTAAACAACGTTTTCATGTTTGGT
GATGGTGCAACAAAAACAATCATTACTTTCGACAGAAGTGTTGGTCTTAGCCCTGGAACC
ACTACCTCACTCAGTGGCACCGTTCAGGTTGAATCTGAGGGATTCATGGCGAAATGGATT
GGGTTTCAGAACACTGCTGGTCCATTAGGACACCAGGCCGTCGCATTCCGTGTGAACGGA
GACCGTGCGGTCATATTCAACTGCAGATTTGATGGTTACCAAGACACACTCTACGTCAAC
AACGGACGTCAGTTCTACAGGAACATTGTTGTGTCCGGTACAGTCGATTTTATCTTCGGA
AAATCTGCGACCGTGATCCAAAACTCTCTAATCCTCTGCCGAAAGGGAACCAAAGGACAA
ACCAACCACGTTACAGCCGACGGTAACATGAAAGGTAAAGCGGTGAAGATTGGTATCGTT
CTCCATAACTGCCGTATCATGGCGGACAAAGAGCTCGAAGCTGACAGGCTAACCGTCAAA
TCATACCTTGGACGGCCGTGGAAACCATTTGCCACCACCGCTGTTATTGGAACTGAGATT
GGTGATTTGATTCAACCGGTAG*ATGGAACGAATGGCAAGGAGAAAAGTTCCATCTGACA
GCTACATATGTTGAGTTCAATAACCG

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2AK18JQ 625 0 0
TCTGCCGAAAGGGAACCAAAGGACAAACCAACCACGTTACAGCCGACGGTAACATGAAAG
GTAAAGCGGTGAAGATTGGTATCGTTCTCCATAACTGCCGTATCATGGCGGACAAAGAGC
TCGAAGCTGACAGGCTAACCGTCAAATCATACCTTGGACGGCCGTGGAAACCATTTGCCA
CCACCGCTGTTATTGGAACTGAGATTGGTGATTTGATTCAACCGGTAGGATGGAACGAAT
GGCAAGGAGAAAAGTTCCATCTGACAGCTACATATGTTGAGTTCAATAACCGTGGACCAG
GAGCTAACACAGCTGCGAGGGCTCCTTGGGCTAAGATGGCTAAGTCTGCCGCTGAGGTTG
AACGTTTCACCGTCGCTAACTGGCTGACTCCGGCGAACTGGATTCAAGAAGCCAACGTTC
CTGTCCAGCTTGGATTGTAAAAAGTAACTACCTAACAAAATAATATAGTGTGTGATCATG
TAAAAAGGTAACGGTACGACCTCGTCTCTCGGGATCAGGGCTCTTTTTGGTTATTATTAG
GGTTCTAGGCATTTTGGGATGATGTTTGTATAAGATTGCTTTTGCTTCACATGCAAAACA
TATATACAAAATATCTTATTTCTCC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 5

CO CL1879Contig1 760 5 15 U
TTTTTGTCCCTTTTAAACGAAACAAG*ATCAAAAGATGAGTGAAGAAACATATGAAGAAA
CGATGGAAACAAGTCAATCTCCTCGTCCTGCTCCAAAGCTGAACGAGAGGATCCTCTCAA
CTCTATCCAGGAGATCTGTAGCTGCGCACCCGTGGCACGACCTTGAGATCGGTCCTGAAG
CTCCATTAGTCTTCAACGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGGAGCAAAGTGAAATATGAAC
TTGACAAAAAGACTGGTCTTATCAAGGTTGATCGAATCTTGTACTCATCGGTTGTTTATC
CTCACAACTACGGATTCATCCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCCTCTTGATGTTC
TTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTTCGTGCTAGAGCCATTGGAT
TAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCCGTATGTGCAGACG
ATCCAGAGTACAAACATTTCACCGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCGCCTCTCAGAAA
TCCGCCGTTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGCTGTAAACGATT
TCTTGCCATCGGAGAAGGCACATGAAGCAATCCAGTACTCCATGGATCTGTACGCTGAGT
ATATTCTCCATACCTTGAGGAGATGAACCAACAACAACACGTTATCTTCACATATACGGA
AAGAAGTTTACGGTTCCAGTATCCCCCTGCAATAAAATAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2H957TF U 1
AF RR2CK27TF U 1
AF RR2D120TF U 1
AF RR2CK27JQ C 178
AF RR2D120JQ C 349
BS 1 26 RR2CK27TF
BS 27 27 RR2D120TF
BS 28 30 RR2CK27TF
BS 31 31 RR2D120TF
BS 32 70 RR2CK27TF
BS 71 77 RR2D120TF
BS 78 148 RR2CK27TF
BS 149 149 RR2D120TF
BS 150 613 RR2CK27TF
BS 614 617 RR2D120TF
BS 618 618 RR2CK27JQ
BS 619 707 RR2D120TF
BS 708 711 RR2CK27JQ
BS 712 712 RR2D120JQ
BS 713 760 RR2CK27JQ

RD RR2H957TF 577 0 0
TTTTTGTCCCTTTTAAACGAAACAAG*ATCAAAAGATGAGTGTAGAAACATATGAAGAAA
CGATGGAAACAAGTCAATCTCCTCGTCCTGCTCCAAAGCTGAACGAGAGGATCCTCTCAA
CTCTATCCAGGAGATCTGTAGCTGCGCACCCGTGGCACGACCTTGAGATCGGTCCTGAAG
CTCCATTAGTCTTCAACGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGGAGCAAAGTGAAATATGAAC
TTGACAAAAAGACTGGTCTTATTAAGGTTGATCGAATCTTGTACTCATCGGTTGTTTATC
CTCACAACTACGGATTCATCCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCCTCTTGATGTTC
TTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTTCGTGCTAGAGCCATTGGAT
TAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCCGTATGTGCAGACG
ATTCAGAGTACAAACATTTCACCGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCGCCTCTCAGAAA
TCCGCCGTTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCA

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2CK27TF 613 0 0
TTTTTGTCCCTTTTAAACGAAACAAGGATCCAAAGATGAGTGAAGAAACATATGAAGAAA
CGATGGAAACT******TCTCCTCGTCCTGCTCCAAAGCTGAACGAGAGGATCCTCTCAA
CTCTATCCAGGAGATCTGTAGCTGCGCATCCGTGGCACGACCTTGAGATCGGTCCTGAAG
CTCCATTAGTCTTCAACGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGGAGCAAAGTGAAATATGAAC
TTGACAAAAAGACTGGTCTTATCAAGGTTGATCGAATCTTGTACTCATCGGTTGTTTATC
CTCACAACTACGGATTCATCCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCCTCTTGATGTTC
TTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTTCGTGCTAGAGCCATTGGAT
TAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCCGTATGTGCAGACG
ATCCAGAGTACAAACATTTCACCGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCGCCTCTCAGAAA
TCCGCCGTTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGCTGTAAACGATT
TCTTGCCATCGGA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2D120TF 707 0 0
TTTTTGTCCCTTTTAAA**AAACAAG*ATCAAAAGATGAGTGAAGAAACATATGAAGAAA
CGATGGAAACAAGTCAATCTCCTCGTCCTGCTCCAAAGCTGAACGAGAGGATCCTCTCAA
CTCTATCCAGGAGATCTGTAGCTGCGCACCCGTGGCACGACCTTGAGATCGGTCCTGAAG
CTCCATTAGTCTTCAACGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGGAGCAAAGTGAAATATGAAC
TTGACAAAAAGACTGGTCTTATTAAGGTTGATCGAATCTTGTACTCATCGGTTGTTTATC
CTCACAACTACGGATTCATCCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCTTCTTGATGTTC
TTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTTCGTGCTAGAGCCATTGGAT
TAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCCGTATGTGCAGACG
ATCCAGAGTACAAACATTTCACCGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCGCCTCTCAGAAA
TCCGCCGTTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGCTGTAAACGATT
TCTTGCCATCGGAGAAG*CACATGAAGCAATCCAGTACTCCATGGATCTGTACGCTGAGT
ATATTCTCCATACCTTGAGGAGATGAACCAACAACAACACGTTATCT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2CK27JQ 583 0 0
AAGCTCCATTAGTCTTCAACGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGGAGCAAAGTGAAATATG
AACTTGACAAAAAGACTGGTCTTATCAAGGTTGATCGAATCTTGTACTCATCGGTTGTTT
ATCCTCACAACTACGGATTCATCCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCCTCTTGATG
TTCTTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTTCGTGCTAGAGCCATTG
GATTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCCGTATGTGCAG
ACGATCCAGAGTACAAACATTTCACCGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCGCCTCTCAG
AAATCCGCCGTTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGCTGTAAACG
ATTTCTTGCCATCGGAGAAGGCACATGAAGCAATCCAGTACTCCATGGATCTGTACGCTG
AGTATATTCTCCATACCTTGAGGAGATGAACCAACAACAACACGTTATCTTCACCTATAC
GGAAAGAAGTTTACGGTTCCAGTATCCCCCTGCAATAAAATAT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2D120JQ 412 0 0
T
TCTTGATGTTCTTGTCCTCATGCAGAAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTTTTCGTGCTAG
AGCCATTGGATTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCCGT
ATGTGCAGACGATCCAGAGTACAAACATTTCACCGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCG
CCTTTCAGAAATCCGCCGTTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGC
TGTAAACGATTTCTTGCCATCGGAGAAGGCACATGAAGCAATCCAGTACTCCATGGATCT
GTACGCTGAGTATATTCTCCATACCTTGAGGAGATGAACCAACAACAACACGTTATCTTC
ACATATACGGAAAGAAGTTTACGGTTCCAGTATCCCCCTGCAATAAAATAT

QA 2 412 2 412
DS 



AS 1 5

CO CL1880Contig1 735 5 4 U
GGGACGAAAGCAGTAGTAGAAGGAAGAAAGAAAAAAACAAGGAGATTTGTGTTTGATCGA
TCAGTGAGAAGAATGGTGAAATCGACAAGTAAGGATGCTCAGGATCTGTTCCGATCTCTT
CACTCCGCTTATTCCGCTACTCCCACTAATCTCAAGATCATCGACTTGTATGTCGTTTTC
GCCGTCTTCACTGCTTTGATTCAGGTGGCGTATATGGCTTTGGTGGGATCATTTCCATTT
AACTCATTCCTATCTGGAGTTCTCTCTTGTATTGGGACAGCTGTTCTTGCTGTTTGCCTC
CGGATCCAAGTGAACAAAGAAAACAAGGAATTCAAGGATTTGGCACCGGAACGAGCATTT
GCTGATTTCGTCCTCTGCAACTTGGTCTTGCACTTGGTGATCATCAACTTCCTCGGATAG
GTTTCCGTCTCCCATTTTACAGGGTTGCTTTCATGTTATGGACTTTTTAGTTGCGACTTG
GAAATATAACGGTAGCGTTGAGATATTTTATATTTCTGTCAAAGAATACTTTTTATGCAC
TAAACGGAACCCCTGGTTTTGCTCGGCCTAAATTCAAACCACTCATAATCCGGTGCGTGT
CAACAGTCGTTAGTGTTGGTATGAGCTCTGTGCCGTTCAGTGCAAACTGCAATCTGATAG
TTGAAGCTTTATCTACTCGTGTTACACGAGTAGCGAACATTGAGAAGAAATAGCTATACA
GTTGACTTTGACTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2BZ70TF U 1
AF RR2EY81JQ C 13
AF RR2EY81TF U 13
AF RR2C936JQ C 33
AF RR2C936TF U 33
BS 1 509 RR2BZ70TF
BS 510 568 RR2EY81TF
BS 569 734 RR2C936TF
BS 735 735 RR2C936JQ

RD RR2BZ70TF 509 0 0
GGGACGAAAGCAGTAGTAGAAGGAAGAAAGAAAAAAACAAGGAGATTTGTGTTTGATCGA
TCAGTGAGAAGAATGGTGAAATCGACAAGTAAGGATGCTCAGGATCTGTTCCGATCTCTT
CACTCCGCTTATTCCGCTACTCCCACTAATCTCAAGATCATCGACTTGTATGTCGTTTTC
GCCGTCTTCACTGCTTTGATTCAGGTGGCGTATATGGCTTTGGTGGGATCATTTCCATTT
AACTCATTCCTATCTGGAGTTCTCTCTTGTATTGGGACAGCTGTTCTTGCTGTTTGCCTC
CGGATCCAAGTGAACAAAGAAAACAAGGAATTCAAGGATTTGGCACCGGAACGAGCATTT
GCTGATTTCGTCCTCTGCAACTTGGTCTTGCACTTGGTGATCATCAACTTCCTCGGATAG
GTTTCCGTCTCCCATTTTACAGGGTTGCTTTCATGTTATGGACTTTTTAGTTGCGACTTG
GAAATATAACGGTAGCGTTGAGATATTTT

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2EY81JQ 557 0 0
GG
AGTAGAAGGAAGAAAGAAAAAAACAAGGAGATTTGTGTTTGATCGATCAGTGAGAAGAAT
GGTGAAATCGACAAGTAAGGATGCTCAGGATCTGTTCCGATCTCTTCACTCCGCTTATTC
CGCTGCTCCCACTAATCTCAAGATCATCGACTTGTATGTCGTTTTCGCCGTCTTCACTGC
TTTGATTCAGGTGGCGTATATGGCTTTGGTGGGATCATTTCCATTTAACTCATTCCTATC
TGGGGTTCTCTCTTGTATTGGGACAGCTGTTCTTGCTGTTTGCCTCCGGATCCAAGTGAA
CAAAGAAAACAAGGAATTCAAGGATTTGGCACCGGAACGAGCATTTGCTGATTTCGTCCT
CTGCAACTTGGTCTTGCACTTGGTGATCATCAACTTCCTCGGATAGGTTTCCGTCTCCCA
TTTTACAGGGTTGCTTTCATGTTATGGACTTTTTAGTTGCGACTTGGAAATATAACGGTA
GCGTTGAGATATTTTATATTTCTGTCAAAGAATACTTTTTATGCACTAAACGGAACCCCT
GGTTTTGCTCGGCC
C

QA 3 556 3 556
DS 

RD RR2EY81TF 557 0 0
GG
AGTAGAAGGAAGAAAGAAAAAAACAAGGAGATTTGTGTTTGATCGATCAGTGAGAAGAAT
GGTGAAATCGACAAGTAAGGATGCTCAGGATCTGTTCCGATCTCTTCACTCCGCTTATTC
CGCTGCTCCCACTAATCTCAAGATCATCGACTTGTATGTCGTTTTCGCCGTCTTCACTGC
TTTGATTCAGGTGGCGTATATGGCTTTGGTGGGATCATTTCCATTTAACTCATTCCTATC
TGGGGTTCTCTCTTGTATTGGGACAGCTGTTCTTGCTGTTTGCCTCCGGATCCAAGTGAA
CAAAGAAAACAAGGAATTCAAGGATTTGGCACCGGAACGAGCATTTGCTGATTTCGTCCT
CTGCAACTTGGTCTTGCACTTGGTGATCATCAACTTCCTCGGATAGGTTTCCGTCTCCCA
TTTTACAGGGTTGCTTTCATGTTATGGACTTTTTAGTTGCGACTTGGAAATATAACGGTA
GCGTTGAGATATTTTATATTTCTGTCAAAGAATACTTTTTATGCACTAAACGGAACCCCT
GGTTTTGCTCGGCC
C

QA 3 556 3 556
DS 

RD RR2C936JQ 703 0 0
GG
AAACAAGGAGATTTGTGTTTGATCGATCAGTGAGAAGAATGGTGAAATCGACAAGTAAGG
ATGCTCAGGATCTGTTCCGATCTCTTCACTCCGCTTATTCCGCTACTCCCACTAATCTCA
AGATCATCGACTTGTATGTCGTTTTCGCCGTCTTCACTGCTTTGATTCAGGTGGCGTATA
TGGCTTTGGTGGGATCATTTCCATTTAACTCATTCCTATCTTGAGTTCTCTCTTGTATTG
GGACAGCTGTTCTTGCTGTTTGCCTCCGGATCCAAGTGAACAAAGAAAACAAGGAATTCA
AGGATTTGGCACCGGAACGAGCATTTGCTGATTTCGTCCTCTGCAACTTGGTCTTGCACT
TGGTGATCATCAACTTCCTCGGATAGGTTTCCGTCTCCCATTTTACAGGGTTGCTTTCAT
GTTATGGACTTTTTAGTTGCGACTTGGAAATATAACGGTAGCGTTGAGATATTTTATATT
TCTGTCAAAGAATACTTTTTATGCACTAAACGGAACCCCTGGTTTTGCTCGGCCTAAATT
CAAACCACTCATAATCCGGTGCGTGTCAACAGTCGTTAGTGTTGGTATGAGCTCTGTGCC
GTTCAGTGCAAACTGCAATCTGATAGTTGAAGCTTTATCTACTCGTGTTACACGAGTAGC
GAACATTGAGAAGAAATAGCTATACAGTTGACTTTGACTCG

QA 3 703 3 703
DS 

RD RR2C936TF 702 0 0
GG
AAACAAGGAGATTTGTGTTTGATCGATCAGTGAGAAGAATGGTGAAATCGACAAGTAAGG
ATGCTCAGGATCTGTTCCGATCTCTTCACTCCGCTTATTCCGCTACTCCCACTAATCTCA
AGATCATCGACTTGTATGTCGTTTTCGCCGTCTTCACTGCTTTGATTCAGGTGGCGTATA
TGGCTTTGGTGGGATCATTTCCATTTAACTCATTCCTATCTTGAGTTCTCTCTTGTATTG
GGACAGCTGTTCTTGCTGTTTGCCTCCGGATCCAAGTGAACAAAGAAAACAAGGAATTCA
AGGATTTGGCACCGGAACGAGCATTTGCTGATTTCGTCCTCTGCAACTTGGTCTTGCACT
TGGTGATCATCAACTTCCTCGGATAGGTTTCCGTCTCCCATTTTACAGGGTTGCTTTCAT
GTTATGGACTTTTTAGTTGCGACTTGGAAATATAACGGTAGCGTTGAGATATTTTATATT
TCTGTCAAAGAATACTTTTTATGCACTAAACGGAACCCCTGGTTTTGCTCGGCCTAAATT
CAAACCACTCATAATCCGGTGCGTGTCAACAGTCGTTAGTGTTGGTATGAGCTCTGTGCC
GTTCAGTGCAAACTGCAATCTGATAGTTGAAGCTTTATCTACTCGTGTTACACGAGTAGC
GAACATTGAGAAGAAATAGCTATACAGTTGACTTTGACTC

QA 3 702 3 702
DS 



AS 1 5

CO CL1881Contig1 563 5 6 U
GGAGCGTGTGAGCGAAGAAGCAGCGGAGAAAAAA*TGGTTCAGCGTCTTGTATACCGTTC
GCGTCACAGCTACGCCACCAAATCTAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCAGGTGGTAA
ATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCAAGTGGACCCAAATGTCCTGTCACCGGCAA
GCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTAGATTGTCTAG
AAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTATCTGCTTTGGCTGTTAGAGA
AAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTTGAGGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCT
CCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTTGCTCCCAGGAGCTAGATTATCATATAAGCTTCTTTTGA
AAAAAAAA*TGTTTAATGGATCTGTTCTAGCAATAGTACTCTGGTTGCAGAAGTTTGAGA
GAAATACTTTTTTT***TTTTGTTATCCATTGAGTTTTGATTCTGTCGACATTTCTCAAA
TATTGCGTTTTGTTTTCTCGTCC


BQ
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM17JQ C 1
AF RR2AM17TF U 1
AF RR2DV49TF U 1
AF RR2FR36JQ C 1
AF RR2FR36TF U 1
BS 1 5 RR2AM17TF
BS 6 6 RR2DV49TF
BS 7 494 RR2AM17TF
BS 495 497 RR2DV49TF
BS 498 557 RR2AM17TF
BS 558 563 RR2FR36JQ

RD RR2AM17JQ 559 0 0
GGAGCATGTGAGCGAAGAAGCAGCGGAGAAAAAA*TGGTTCAGCGTCTTGTATACCGTTC
GCGTCACAGCTACGCCACCAAATCTAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCAGGTGGTAA
ATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCAAGTGGACCCAAATGTCCTGTCACCGGCAA
GCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTTTAGATTGTCTAG
AAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTATCTGCTTTGGCTGTTAGAGA
AAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTTGAGGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCT
CCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTTGCTCCCAGGAGCTAGATTATCATATAAGCTTCTTTTGA
AAAAAAAA*TGTTTAATGGATCTGTTCTAGCAATAGTACTCTGGTTGCAGAAGTTTGAGA
GAAATACTTTTTTTCTTTTTTGTTATCCATTGAGTTTTGATTCTGTCGACATTTCTCAAA
TATTGCGTTTTGTTTTC
CC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2AM17TF 559 0 0
GGAGCATGTGAGCGAAGAAGCAGCGGAGAAAAAA*TGGTTCAGCGTCTTGTATACCGTTC
GCGTCACAGCTACGCCACCAAATCTAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCAGGTGGTAA
ATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCAAGTGGACCCAAATGTCCTGTCACCGGCAA
GCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTAGATTGTCTAG
AAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTATCTGCTTTGGCTGTTAGAGA
AAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTTGAGGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCT
CCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTTGCTCCCAGGAGCTAGATTATCATATAAGCTTCTTTTGA
AAAAAAAA*TGTTTAATGGATCTGTTCTAGCAATAGTACTCTGGTTGCAGAAGTTTGAGA
GAAATACTTTTTTTCTTTTTTGTTATCCATTGAGTTTTGATTCTGTCGACATTTCTCAAA
TATTGCGTTTTGTTTTC
CC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2DV49TF 564 0 0
GGAGCGTGTGAGCGAAGAAGCAGCGGAGAAAAAA*TGGTTCAGCGTCTTGTGTACCGTTC
GCGTCACAGCTACGCCACCAAATCTAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCAGGTGGTAA
ATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCAAGTGGACCCAAATGTCCTGTCACCGGCAA
GCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTAGATTGTCTAG
AAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTATCTGCTTTGGCTGTTAGAGA
AAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTTGAGGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCT
CCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTTGCTCCCAGGAGCTAGATTATCATATAAGCTTCTTTTGA
AAAAAAAAATGTTTAATGGATCTGTTCTAGCAATAGTACTCTGGTTGCAGAAGTTTGAGA
GAAATACTTTTTTT***TTTTGTTATCCATTGAGTTTTGATTCTGTCGACATTTCTCAAA
TATTGCGTTTTGTT
GAAAAAAAAA

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2FR36JQ 563 0 0
GGAGCGTGTGAGCGAAGAAGAAGCGGAGAAAAAAATGGTTCAGCGTCTTGTATACCGTTC
GCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCAGGTGGTAA
ATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCAAGTGGACCCAAATGTCCTGTCACCGGCAA
GCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTAGATTGTCTAG
AAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTATCCGCTTTGGCTGTTAGAGA
AAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCT
CCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTTGCTCCCAGGAGCTAGATTATCATATAAGCTTCTTTTGA
AAAAAAAA*TGTTTAATGGATCTGTTCTAGCAATAGTACTCTGGTTGCAGAAGTTTGAGA
GAAATACTTTTTTT****TTTGTTATCCATTGAGTTTTGATTCTGTCGACATTTCTCAAA
TATTGCGTTTTGTTTTCTCGTCC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2FR36TF 563 0 0
GGAGCGTGTGAGCGAAGAAGAAGCGGAGAAAAAAATGGTTCAGCGTCTTGTATACCGTTC
GCGTCACAGCTACGCCACCAAATCCAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCAGGTGGTAA
ATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCAAGTGGACCCAAATGTCCTGTCACCGGCAA
GCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTAGATTGTCTAG
AAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTATCCGCTTTGGCTGTTAGAGA
AAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCT
CCAAAAGGCCAAGGAAAAGGTTGCTCCCAGGAGCTAGATTATCATATAAGCTTCTTTTGA
AAAAAAAA*TGTTTAATGGATCTGTTCTAGCAATAGTACTCTGGTTGCAGAAGTTTGAGA
GAAATACTTTTTTT****TTTGTTATCCATTGAGTTTTGATTCTGTCGACATTTCTCAAA
TATTGCGTTTTGTTTTC
TCGTCC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 3

CO CL1882Contig1 888 3 26 U
GGGTTCCACCTCTCTCTATCCCAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAGATGGAGGAAGCAGCGGC
GCATCCATACGTTCCGAGAGATCTGAAGCTGCCTGGGTACGTTCCCATCTCCATGTCCAT
GTCAACTATCCTCGCAGTCTACCTCGGTGCCTCCCTCTTTGTCGTCACCTTCGTCTGGTT
TCTACTCGGGAGGAAGAAAGCGCATCTTGACAGATTGCTAATGTGCTGGTGGGCTTTCAC
CGGTCTCACTCACATGGTTCTCGAGGGCTATTTCGTTTTCTCCCCTGACTTTTTCAAGGA
CAACGCCTCTTGTTATCTCGCTGAAGTTTGGAAAGAATACAGCAAAGGTGATTCTAGATA
CGCGGGGAGAGATTCTGCAGTTATAGCTGTTGAAGGCATCACTGCTGTTATTGAAGGCCC
TGCTTCTCTTCTTGCTGTGTATGCTATTGCTAAGGGGAAGTCGTACAGCTACGTGCTTCA
GCTTGCCATTTCGCTAGGCCAGCTCTACGGATGTCTTGTCTATTTCATTACTGCTCTCTT
GGAAGGAGATAACTTTGCTACTAACTCCTTCTACTACTACTCGTACTACATTTTCGCTAA
TGGATGGTGGGTTTTGATCCCTTTCCTCATTTCCTACCGTTGCTGGAACAAGATTTGTCA
AAGTCCCAACGGTGGGGAGACTAAGATTAAGAAGAAAACCCGTTAGAATGCAAAAAACTC
TTTTACAAGATTCTAGTTTTTTTCATCTCTTCTTTGTGGGTTTGATGCTTGCTTGTTTTC
TGTTTCCTCATTTTACCTGAGAACATCATTAGACTGTTTCTCCTTTGGCAATTGAATTTG
TTTTCATGTTTATTGATGTTATAGCAATGAACAAGGGGTTGAAACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP22TF U 53
AF RR2GR75TF U 1
AF RR2EP22JQ C 174
BS 1 66 RR2GR75TF
BS 67 67 RR2EP22TF
BS 68 153 RR2GR75TF
BS 154 154 RR2EP22TF
BS 155 276 RR2GR75TF
BS 277 277 RR2EP22TF
BS 278 288 RR2GR75TF
BS 289 289 RR2EP22TF
BS 290 304 RR2GR75TF
BS 305 305 RR2EP22TF
BS 306 366 RR2GR75TF
BS 367 367 RR2EP22TF
BS 368 486 RR2GR75TF
BS 487 487 RR2EP22TF
BS 488 492 RR2GR75TF
BS 493 493 RR2EP22TF
BS 494 567 RR2GR75TF
BS 568 568 RR2EP22TF
BS 569 582 RR2GR75TF
BS 583 583 RR2EP22TF
BS 584 633 RR2GR75TF
BS 634 634 RR2EP22TF
BS 635 658 RR2GR75TF
BS 659 660 RR2EP22JQ
BS 661 692 RR2GR75TF
BS 693 888 RR2EP22JQ

RD RR2EP22TF 612 0 0
GCAGCGGCGCATCCATACGTTCCGAGAGATCTGAAGCTGCCTGGGTACGTTCCCATCTCC
ATGTCCATGTCAACTATCCTCGCAGTCTACCTCGGTGCTTCCCTCTTTGTCGTCACCTTC
GTCTGGTTTCTACTCGGGAGGAAGAAAGCGCATCTTGACAGATTGCTAATGTGCTGGTGG
GCTTTCACCGGTCTCACTCACATGGTTCTCGAGGGCTATTTCGTTTTCTCCCCTGACTTT
TTCAAGGACAACGCCTCTTGTTATCTCGCTGAAGTTTGGAAAGAATACAGCAAAGGTGAT
TCTAGATACGCGGGGAGAGATTCTGCAGTTATAGCTGTTGAAGGCATCACTGCTGTTATT
GAAGGCCCTGCTTCTCTTCTTGCTGTGTATGCTATTGCTAAGGGGAAGTCGTACAGCTAC
GTGCTTCAGCTTGCCATTTCGCTAGGCCAGCTCTACGGATGTCTTGTCTATTTCATTACT
GCTCTCTTGGAAGGAGATAACTTTGCTACTAACTCCTTCTACTACTACTCGTACTACATT
TTCGCTAATGGATGGTGGGTTTTGATCCCTTTCCTCATTTCCTACCGTTGCTGGAACAAG
ATTTGT
CAAAGT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2GR75TF 692 0 0
GGGTTCCACCTCTCTCTATCCCAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAGATGGAGGAAGCAGCGGC
GCATCCTTACGTTCCGAGAGATCTGAAGCTGCCTGGGTACGTTCCCATCTCCATGTCCAT
GTCAACTATCCTCGCAGTCTACCTCGGTGCCTCTCTCTTTGTCGTCACCTTCGTCTGGTT
TCTACTCGGGAGGAAGAAAGCGCATCTTGACAGATTGCTAATGTGCTGGTGGGCTTTCAC
CGGTCTCACTCACATGGTTCTCGAGGGCTATTTCGTCTTCTCCCCTGAGTTTTTCAAGGA
CAACACCTCTTGTTATCTCGCTGAAGTTTGGAAAGAATACAGCAAAGGTGATTCTAGATA
CGCGGGCAGAGATTCTGCAGTTATAGCTGTTGAAGGCATCACTGCTGTTATTGAAGGCCC
TGCTTCTCTTCTTGCTGTGTATGCTATTGCTAAGGGGAAGTCGTACAGCTACGTGCTTCA
GCTTGCTATTTCACTAGGCCAGCTCTACGGATGTCTTGTCTATTTCATTACTGCTCTCTT
GGAAGGAGATAACTTTGCTACTAACTCTTTCTACTACTACTCCTACTACATTTTCGCTAA
TGGATGGTGGGTTTTGATCCCTTTCCTCATTTCTTACCGTTGCTGGAACAAGATTTGTGC
AAGTCCCAACGGTGGGGAGACTAAGATTAAGA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2EP22JQ 715 0 0
TCTGGTTTCTACTCGGGAGGAAGAAAGCGCATCTTGACAGATTGCTAATGTGCTGGTGGG
CTTTCACCGGTCTCACTCACATGGTTCTCGAGGGCTATTTCGTTTTCTCCCCTGACTTTT
TCAAGGACAACGCCTCTTGTTATCTCGCTGAAGTTTGGAAAGAATACAGCAAAGGTGATT
CTAGATACGCGGGGAGAGATTCTGCAGTTATAGCTGTTGAAGGCATCACTGCTGTTATTG
AAGGCCCTGCTTCTCTTCTTGCTGTGTATGCTATTGCTAAGGGGAAGTCGTACAGCTACG
TGCTTCAGCTTGCCATTTCGCTAGGCCAGCTCTACGGATGTCTTGTCTATTTCATTACTG
CTCTCTTGGAAGGAGATAACTTTGCTACTAACTCCTTCTACTACTACTCGTACTACATTT
TCGCTAATGGATGGTGGGTTTTGATCCCTTTCCTCATTTCCTACCGTTGCTGGAACAAGA
TTTGTCAAAGTCCCAACGGTGTGGAGACTAAGATTAAGAAGAAAACCCGTTAGAATGCAA
AAAACTCTTTTACAAGATTCTAGTTTTTTTCATCTCTTCTTTGTGGGTTTGATGCTTGCT
TGTTTTCTGTTTCCTCATTTTACCTGAGAACATCATTAGACTGTTTCTCCTTTGGCAATT
GAATTTGTTTTCATGTTTATTGATGTTATAGCAATGAACAAGGGGTTGAAACATG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 5

CO CL1883Contig1 733 5 14 U
TAAGGAAGGGTGAATGTACATTGGTGAATAATAATGAAATAATTAAATACATAATTATGT
GACCCAAAAAGTGAAATATATATAGTCCGGTTACGACAAAGCCACATGAAATGAAATGTT
CATCCCTACTCCATTTTTTAACATATTTTTTTTCTCTTATAATCTACATATATAGAAGAA
ATTTATTCATCTACATTTCCCAATTCCATTTAGTGGCTCCATCCATATGGACATAGACTC
TTCTCTTCACGCAATCCCGGCAATTAGTCTCCTCTTAAGTTCCATCCTCATGAGTTGACG
GTCATTGGCTCCCGTGGCCATCATTCCGCGGTTCTCATAAGCACGTCGGAAAAGATACGG
TATAGCGGTTTCAACCGGTCCATATGGCATGTATTTGCTTACATTGAAACCGGCTCTCTT
TAAACCGAAGGACAATGCATCTGACATACCGTATAGCTGCGCAAACTCTATCTTCCCGTC
CTTTTTATTGATGTTGAGCTCACTCGCCTTCCTTGATGCAAGTCTTCCCGAATCAGCGTT
GTGTGTTGCAAGAACGACACCAAAACCCGATCCGTTGGATGCTTTCTCCATTAGGAAGGT
CATGCAGTCATTGTAGCAAGCGTGCGTGTTCTGAATTGTGTCGTGGACCGGTGACTTGTG
TCCCAGGGAATCTGCTAATGTAGCTTCGCTAGACATATAAGCGCCTCTCACCAACTTAAA
ACCCATAGGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EI65JQ U 16
AF RR2EI65TF C 16
AF RR2BP68JQ U 1
AF RR2C126TF C 53
AF RR2C126JQ U 62
BS 1 108 RR2BP68JQ
BS 109 109 RR2EI65JQ
BS 110 155 RR2BP68JQ
BS 156 156 RR2EI65JQ
BS 157 177 RR2BP68JQ
BS 178 178 RR2EI65JQ
BS 179 235 RR2BP68JQ
BS 236 236 RR2EI65JQ
BS 237 353 RR2BP68JQ
BS 354 354 RR2EI65JQ
BS 355 609 RR2BP68JQ
BS 610 610 RR2C126JQ
BS 611 705 RR2BP68JQ
BS 706 733 RR2C126JQ

RD RR2EI65JQ 489 0 0
GTACATTGGTGAATAATAATGAAATAATTAAATACATAATTATGTGACCCAAAAAGTGAA
ATATATATAGTCCGGTTACGACAAAGCCTCATGAAATGAAATGTTCATCCCTACTCCATT
TTTTAACATATTTTTTTTCTCTTATAATCTACATATATAGAAGAAATTTATTCATCTACA
TTTCCCAATTCCATTTAGTGGCTCCATCCATATGGACATAGACTCTTCTCTTCACGCAAT
CCCGGCAATTAGTCTCCTCTTAAGTTCCATCCTCATGAGTTGACGGTCATTGGCTCCCGT
GGCCATCATTCCGCGGTTCTCATAAGCACGTCGGAAAAGATACGGTATAGCGGTTTCAAC
CGGTCCATATGGCATGTATTTGCTTACATTGAAACCGGCTCTCTTTAAACCGAAGGACAA
TGCATCTGACATACCGTATAGCTGCGCAAACTCTATCTTCCCGTCCTTTTTATTGATGTT
GAGCTCAC
C

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2EI65TF 489 0 0
GTACATTGGTGAATAATAATGAAATAATTAAATACATAATTATGTGACCCAAAAAGTGAA
ATATATATAGTCCGGTTACGACAAAGCCTCATGAAATGAAATGTTCATCCCTACTCCATT
TTTTAACATATTTTTTTTCTCTTATAATCTACATATATAGAAGAAATTTATTCATCTACA
TTTCCCAATTCCATTTAGTGGCTCCATCCATATGGACATAGACTCTTCTCTTCACGCAAT
CCCGGCAATTAGTCTCCTCTTAAGTTCCATCCTCATGAGTTGACGGTCATTGGCTCCCGT
GGCCATCATTCCGCGGTTCTCATAAGCACGTCGGAGAAGATACGGTATAGCGGTTTCAAC
CGGTCCATATGGCATGTATTTGCTTACATTGAAACCGGCTCTCTTTAAACCGAAGGACAA
TGCATCTGACATACCGTATAGCTGCGCAAACTCTATCTTCCCGTCCTTTTTATTGATGTT
GAGCTCAC
C

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2BP68JQ 705 0 0
TAAGGAAGGGTGAATGTACATTGGTGAATAATAATGAAATAATTAAATACATAATTATGT
GACCCAAAAAGTGAAATATATATAGTCCGGTTACGACAAAGCCACATGGAATGAAATGTT
CATCCCTACTCCATTTTTTAACATATTTTTTTTCTATTATAATCTACATATATAGAAAAA
ATTTATTCATCTACATTTCCCAATTCCATTTAGTGGCTCCATCCATATGGACATAAACTC
TTCTCTTCACGCAATCCCGGCAATTAGTCTCCTCTTAAGTTCCATCCTCATGAGTTGACG
GTCATTGGCTCCCGTGGCCATCATTCCGCGGTTCTCATAAGCACGTCGGAAAAAATACGG
TATAGCGGTTTCAACCGGTCCATATGGCATGTATTTGCTTACATTGAAACCGGCTCTCTT
TAAACCGAAGGACAATGCATCTGACATACCGTATAGCTGCGCAAACTCTATCTTCCCGTC
CTTTTTATTGATGTTGAGCTCACTCGCCTTCCTTGATGCAAGTCTTCCCGAATCAGCGTT
GTGTGTTGCAAGAACGACACCAAAACCCGATCCGTTGGATGCTTTCTCCATTAGGAAGGT
CATGCAGTCGTTGTAGCAAGCGTGCGTGTTCTGAATTGTGTCGTGGACCGGTGACTTGTG
TCCCAGGGAATCTGCTAATGTAGCTTCGCTAGACATATAAGCGCC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2C126TF 681 0 0
TTTTTTTTTGACCC
AAAAGTGAAATATATATAGTCCGGTTACGACAAAGCCACATGAAATGAAATGTTCATCCC
TACTCCATTTTTTAACATATTTTTTT*CTCTTATAATCTACATATATAGAAGAAATTTAT
TCATCTACATTTCCCAATTCCATTTAGTGGCTCCATCCATATGGACATAGACTCTTCTCT
TCACGCAATCCCGGCAATTAGTCTCCTCTTAAGTTCCATCCTCATGAGTTGACGGTCATT
GGCTCCCGTGGCCATCATTCCGCGGTTCTCATAAGCACGTCGGAGAAGATACGGTATAGC
GGTTTCAACCGGTCCATATGGCATGTATTTGCTTACATTGAAACCGGCTCTCTTTAAGCC
GAAGGACAATGCATCTGACATACCGTATAGCTGCGCAAACTCTATCTTCCCGTCCTTTTT
ATTGATGTTGAGCTCACTCGCCTTCCTTGATGCAAGTCTTCCCGAATCAGCGTTGTGTGT
TGCAAGAACGACACCAAAACCCGATCCGTTGGATGCTTTCTCCATTAGGAAGGTCATGCA
GTCATTGTAGCAAGCGTGCGTGTTCTGAATTGTGTCGTGGACCGGTGACTTGTGTCCCAG
GGAATCTGCTAATGTAGCTTCGCTAGACATATAAGCGCCTCTCACCAACTTAAAACCCAT
AGGAACC

QA 15 681 15 681
DS 

RD RR2C126JQ 672 0 0
GACCC
AAAAGTGAAATATATATAGTCCGGTTACGACAAAGCCACATGAAATGAAATGTTCATCCC
TACTCCATTTTTTAACATATTTTTTTTCTCTTATAATCTACATATATAGAAGAAATTTAT
TCATCTACATTTCCCAATTCCATTTAGTGGCTCCATCCATATGGACATAGACTCTTCTCT
TCACGCAATCCCGGCAATTAGTCTCCTCTTAAGTTCCATCCTCATGAGTTGACGGTCATT
GGCTCCCGTGGCCATCATTCCGCGGTTCTCATAAGCACGTCGGAAAAGATACGGTATAGC
GGTTTCAACCGGTCCATATGGCATGTATTTGCTTACATTGAAACCGGCTCTCTTTAAGCC
GAAGGACAATGCATCTGACATACCGTATAGCTGCGCAAACTCTATCTTCCCGTCCTTTTT
ATTGATGTTGAGCTCACTCGCCTTCCTTGATGCAAGTCTTCCCGAATCAGCGTTGTGTGT
TGCAAGAACGACACCAAAACCCGATCCGTTGGATGCTTTCTCCATTAGGAAGGTCATGCA
GTCATTGTAGCAAGCGTGCGTGTTCTGAATTGTGTCGTGGACCGGTGACTTGTGTCCCAG
GGAATCTGCTAATGTAGCTTCGCTAGACATATAAGCGCCTCTCACCAACTTAAAACCCAT
AGGAACC

QA 6 672 6 672
DS 



AS 1 5

CO CL1884Contig1 1078 5 7 U
GGAGAGGCATACAGACCATCAAAAAGAAAGGATCTATCTATCATGGCGTTAAGAGAGATG
GTGATAGGTGCTTGTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGATAAA
GCCAAGGAGCTTCTTGCACTCTTCAATTTACCTACGGGACTGTTGCCATTGAAGGACATG
ATAGAAGTTGGGCACAACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATT
GAGCATACATTCGCTGCTATAGGTCGTAAAGTGGTATATGACACGGAGATATCTGCTTTT
GTTGAAGACCGTAGGTTTAAGAGAGTTACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATCTGG
ATTCCTGTGCATGATATCTTCATCAAAGAGAAAGAGCCTGAGAAGATCACATTTGCTAAT
AACACCGGCCTGTCACGAACATTTAATGTTTCAGCATTTCAGATCGAGGGTTGATATAAA
TCAGAAAAAGAGGAGTAACTAAAGCTACTTGATGTAAGCAAGCAATAAAAGAACATTAAA
TGTTCCATATCAATAGAACACAGTTTCATTAATATTGTAAAGAGAATCCTTTCCCTAAGT
GTTTGCACATGACCAGCGTTAGTGAATACTCGTAGGAGAGATAAGATGGAGACGTTTTTC
CTCGGTGAGACACTGATGTACTTGTACTTGCTATTTGGAGATGACTCGGTGATACCCTTG
GATAAGTTTGTTTTCAACACTGAAGCTCATCCATTGCCAATAAGAAACAAGTAAAGTGTT
TACTTTTGAAGACTGTTCCAGAAAATACACACACAACAGATACTTGGAGGGAAGTGATGT
ATAGTAGTAACAGTATCAATTGGAGAAGAGGATATATAGTTCGTTGAGAAACAAAAACAA
CTTTCCGATGTAAGATAAGTTTCAGCATCATAGTTTAACTCATAAAAGTTATTGAGTTAA
TGAAATTGTAGATCTTTGTTTTTTGTAATAGTATGTTTCTTGCGAGTAATACTACTACTT
TTTCCTCAGAGCTTTTCCTTGGTCAGTTGTAATCATACAACCATGGAAATGAATTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR78TF U 7
AF RR2DO30TF U 3
AF RR2GV65TF U 1
AF RR2CT84TF U 4
AF RR2CT84JQ C 553
BS 1 423 RR2GV65TF
BS 424 424 RR2DO30TF
BS 425 567 RR2GV65TF
BS 568 568 RR2CT84TF
BS 569 594 RR2GV65TF
BS 595 731 RR2CT84TF
BS 732 1078 RR2CT84JQ

RD RR2GR78TF 394 0 0
GGATACA
GACCATCAAAAAGAAAGGATCTATCTATCATGGCGTTAAGAGAGATGGTGATAGGTGCTT
GTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGATAAAGCCAAGGAGCTTC
TTGCACTCTTCAATTTACCTACGGGACTGTTGCCATTGAAGGACATGATAGAAGTTGGGC
ACAACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATTGAGCATACATTCG
CTGCTATAGGTCGTAAAGTGGTATATGACACGGAGATATCTGCTTTTGTTGAAGACCGTA
GGTTTAAGAGA*TTACCGGA*TTAAAAGCAGGGAACTCATGATCTGGATTCCTGTGCATG
ATATCTTCATCAAAGAGAAAGA
CCCGA

QA 8 389 8 389
DS 

RD RR2DO30TF 431 0 0
GGAGGC
ATACAGACCATCAAAAAGAAAGGATCTATCTATCATGGCGTTAAGAGAGATGGTGATAGG
TGCTTGTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGATAAAGCCAAGGA
GCTTCTTGCACTCTTCAATTTACCTACGGGACTGTTGCCATTGAAGGACATGATAGAAGT
TGGGCACAACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATTGAGCATAC
ATTCGCTGCTATAGGTCGTAAAGTGGTATATGACACGGAGATATCTGCTTTTGTTGAAGA
CCGTAGGTTTAAGAGAGTTACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATCTGGATTCCTGT
GCATGATATCTTCATCAAAGAGAAAGAGCCTGAGAAGATCACATTTGCTAATAACACCGG
CCTGT

QA 7 431 7 431
DS 

RD RR2GV65TF 594 0 0
GGAGAGGCATACAGACCATCAAAAAGAAAGGATCTATCTATCATGGCGTTAAGAGAGATG
GTGATAGGTGCTTGTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGATAAA
GCCAAGGAGCTTCTTGCACTCTTCAATTTACCTACGGGACTGTTGCCATTGAAGGACATG
ATAGAAGTTGGGCACAACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATT
GAGCATACATTCGCTGCTATAGGTCGTAAAGTGGTATATGACACGGAGATATCTGCTTTT
GTTGAAGACCGTAGGTTTAAGAGAGTTACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATCTGG
ATTCCTGTGCATGATATCTTCATCAAAGAGAAAGAGCCTGAGAAGATCACATTTGCTAAT
AACGCCGGCCTGTCACGAACATTTAATGTTTCAGCATTTCAGATCGAGGGTTGATATAAA
TCAGAAAAAGAGGAGTAACTAAAGCTACTTGATGTAAGCAAGCAATAAAAGAACATTAAA
TGTTCCATATCAATAGAACACAGTTTCTTTAATATTGTAAAGAGAATCCTTTCC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2CT84TF 728 0 0
GGAGGCATAC
GACCATCAAAAAGAAAGGATTTATCTATCATGGCGTTAAGAGAGATGGTGATAGGTGATT
GTGATGATATAGAGAGCTACAGTGAGCCATCCCTTTGTCTGGATAAAGCCAAGGAGCTTC
TTGCACTCTTCAATTTACCTACGGGACTGTTGCCATTGAAGGACATGATAGAAGTTGGGC
ACAACAAAACAAAAGGGTTTGTGTGGATGAGGATGATAAACAAGATTGAGCATACGTTCG
CTGCTATAGGTCGTAAAGTGGTATATGACACGGAGATATCTGCTTTTGTTGAAGACCGTA
GGTTTAAGAGAGTTACCGGAGTTAAAAGCAAGGAACTCATGATCTGGATTCCTGTGCATG
ATATCTTCATCAAAGAGAAAGAGCCTGATAAGATCACATTTGCTAATAACACCGGCCTGT
CACGAACATTTAATGTTTCAGCATTTCAGATCGTGGGTTGATATAAATCAGAAAAAGAGG
AGTAACTAAAGCTACTTGATGTAAGCAAGCAATAAAAGAACATTAAATGTTCCATATCAA
TAGAACACAGTTTCATTAATATTGTAAAGAGAATCCTTTCCCTAAGTGTTTGCACATGAC
CAGCGTTAGTGAATACTCGTAGGAGAGATAAGATGGAGACGTTTTTCCTCGGTGAGACAC
TGATGTACTTGTACTTGCTATTTGGAGATGACTCGGTGATACCCTTGGATAAGTTTGT

QA 11 728 11 728
DS 

RD RR2CT84JQ 526 0 0
ATAGAACACAGTTTCATTAATATTGTAAAGAGAATCCTTTCCCTAAGTGTTTGCACATGA
CCAGCGTTAGTGAATACTCGTAGGAGAGATAAGATGGAGACGTTTTTCCTCGGTGAGACA
CTGATGTACTTGTACTTGCTATTTGGAGATGACTCGGTGATACCCTTGGATAAGTTTGTT
TTCAACACTGAAGCTCATCCATTGCCAATAAGAAACAAGTAAAGTGTTTACTTTTGAAGA
CTGTTCCAGAAAATACACACACAACAGATACTTGGAGGGAAGTGATGTATAGTAGTAACA
GTATCAATTGGAGAAGAGGATATATAGTTCGTTGAGAAACAAAAACAACTTTCCGATGTA
AGATAAGTTTCAGCATCATAGTTTAACTCATAAAAGTTATTGAGTTAATGAAATTGTAGA
TCTTTGTTTTTTGTAATAGTATGTTTCTTGCGAGTAATACTACTACTTTTTCCTCAGAGC
TTTTCCTTGGTCAGTTGTAATCATACAACCATGGAAATGAATTATG

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 4

CO CL1885Contig1 604 4 6 U
GTACAAACAGAAGCCAACATAATCCAATTGTTTGGTCACTAGATTATTCATAGACCCTTC
TGAAAAACAAATCATCTCGATATTAAAAATCAGACGCAAAATAACTTCAAAATACACGAA
TATCATTCTCAAAGAACAGAGTATTGAGCAGTTGTCTGAACCACTAAAAACCCGGTTTAT
TCAGGGTTCCAACACATAAACCGGACTAAAAAAAACCAAACCAACACAAAGTAGAGAGAC
TTCAGTCTTGAGTTGGGGCGTTCTGATTGAGCTAACCAAAACGCTGACCTACACGCATCG
TGTGCTTGAGGAACTTCTCGGCGCACCGTAAGACACAAGTCTCCTCTTGTTTCTGCAGAG
TCTTGCGCGTAAACGAATCCACACAGTCCACGAAACACCTCTCCACCAGCGAATTGTACA
TCCTCAAGCTATCACGTAGCTGAAGCTGATCGATCATGGAGGCCATTTTCGCTTGGTCTT
CAGCACCAAGACCATCGAGACCAGCCATCATGCTCGGATCCATTTTTTTTTCCTTTTAAC
TCTTTCGCTCTTTCTTGGTCTACTAGAGAAACAGCAGTTCTTCGTCCGTCGCCTCCTTAT
TCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2CQ76JQ U 1
AF RR2CQ76TF C 1
AF RR2AG55JQ U 62
AF RR2AG55TF C 62
BS 1 273 RR2CQ76JQ
BS 274 274 RR2AG55JQ
BS 275 516 RR2CQ76JQ
BS 517 565 RR2AG55JQ
BS 566 566 RR2CQ76TF
BS 567 604 RR2AG55JQ

RD RR2CQ76JQ 516 0 0
GTACAAACAGAAGCCAACATAATCCAATTGTTTGGTCACTAGATTATTCATAGACCCTTC
TGAAAAACAAATCATCTCGATATTAAAAATCAGACGCAAAATAACTTCAAAATACACGAA
TATCATTCTCAAAGAACAGAGTATTGAGCAGTTGTCTGAACCACTAAAAACCCGGTTTAT
TCAGGGTTCCAACACATAAACCGGACTAAAAAAAACCAAACCAACACAAAGTAGAGAGAC
TTCAGTCTTGAGTTGGGGCGTTCTGATTGAGCTCACCAAAACGCTGACCTACACGCATCG
TGTGCTTGAGGAACTTCTCGGCGCACCGTAAGACACAAGTCTCCTCTTGTTTCTGCAGAG
TCTTGCGCGTAAACGAATCCACACAGTCCACGAAACACCTCTCCACCAGCGAATTGTACA
TCCTCAAGCTATCACGTAGCTGAAGCTGATCGATCATGGAGGCCATTTTCGCTTGGTCTT
CAGCACCAAGACCATCGAGACCAGCCATCATGCTCG

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2CQ76TF 588 0 0
GTACAAACAGAAGCCAACATAATCCAATTGTTTGGTCACTAGATTATTCATAGACCCTTC
TGAAAAACAAATCATCTCGATATTAAAAATCAGACGCAAAATAACTTCAAAATACACGAA
TATCATTCTCAAAGAACAGAGTATTGAGCAGTTGTCTGAACCACTAAAAACCCGGTTTAT
TCAGGGTTCCAACACATAAACCGGACTAAAAAAAACCAAACCAACACAAAGTAGAGAGAC
TTCAGTCTTGAGTTGGGGCGTTCTGATTGAGCTCACCAAAACGCTGACCTACACGCATCG
TGTGCTTGAGGAACTTCTCGGCGCACCGTAAGACACAAGTCTCCTCTTGTTTCTGCAGAG
TCTTGCGCGTAAACGAATCCACACAGTCCACGAAACACCTCTCCACCAGCGAATTGTACA
TCCTCAAGCTATCACGTAGCTGAAGCTGATCGATCATGGAGGCCATTTTCGCTTGGTCTT
CAGCACCAAGACCATCGAGACCAGCCATCATGCTCGGATCCATTTTTTTT*CCTTTTAAC
TCTTTCGCTCTTTCTTGGTCTACTAGAGAAACAGCAGTTCTTCGTCC
C

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2AG55JQ 543 0 0
GG
AAAACAAATCATCTCGATATTAAAAATCAGACGCAAAATAACTTCAAAATACACGAATAT
CATTCTCAAAGAACAGAGTATTGAGCAGTTGTCTGAACCACTAAAAACCCGGTTTATTCA
GGGTTCCAACACATAAACCGGACTAAAAAAAACCAAACCAACACAAAGTAGAGAGACTTC
AGTCTTGAGTTGGGGCGTTCTGATTGAGCTAACCAAAACGCTGACCTACACGCATCGTGT
GCTTGAGGAACTTCTCGGCGCACCGTAAGACACAAGTCTCCTCTTGTTTCTGCAGAGTCT
TGCGCGTAAACGAATCCACACAGTCCACGAAACACCTCTCCACCAGCGAATTGTACATCC
TCAAGCTATCACGTAGCTGAAGCTGATCGATCATGGAGGCCATTTTCGCTTGGTCTTCAG
CACCAAGACCATCGAGACCAGCCATCATGCTCGGATCCATTTTTTTTTCCTTTTAACTCT
TTCGCTCTTTCTTGGTCTACTAAAGAAACAGCAGTTCTTCGTCCGTCGCCTCCTTATTCC
C

QA 3 543 3 543
DS 

RD RR2AG55TF 543 0 0
GG
AAAACAAATCATCTCGATATTAAAAATCAGACGCAAAATAACTTCAAAATACACGAATAT
CATTCTCAAAGAACAGAGTATTGAGCAGTTGTCTGAACCACTAAAAACCCGGTTTATTCA
GGGTTCCAACACATAAACCGGACTAAAAAAAACCAAACCAACACAAAGTAGAGAGACTTC
AGTCTTGAGTTGGGGCGTTCTGATTGAGCTAACCAAAACGCTGACCTACACGCATCGTGT
GCTTGAGGAACTTCTCGGCGCACCGTAAGACACAAGTCTCCTCTTGTTTCTGCAGAGTCT
TGCGCGTAAACGAATCCACACAGTCCACGAAACACCTCTCCACCAGCGAATTGTACACCC
TCAAGCTATCACGTAGCTGAAGCTGATCGATCATGGAGGCCATTTTCGCTTGGTCTTCAG
CACCAAGACCATCGAGACCAGCCATCATGCTCGGATCCATTTTTTTTTCCTTTTAACTCT
TTCGCTCTTTCTTGGTCTACTAGAGAAACAGCAGTTCTTCGTCCGTCGCCTCCTTATTCC
C

QA 3 543 3 543
DS 



AS 2 4

CO CL1886Contig1 751 2 1 U
AACGAGTCAAATCATTCCTTCTGTATTATTGGAACTCGTGGGACAAAAGTCTAGAGGCAG
AGGAACTGAAACCTCCAGAAAAGTCAGATTGTAGCTAATTAATGTCTTTCAAAAGAATTT
ACAATGTGGAATCAAACTACTATATGTCATCATCTTCCTTCGGCTCAAAGGATGGGGCTA
GTTTGATGAGCTAGGCTCATTGTGGCTTGGGCTAGGTTCTGCTTTCGTGGACTGAACAGG
CTTCTTGAACTGAACCAAGATCATGGTCATGTTATCACAGCCTTCACCACCTGCTGTGTT
TGGAGCCAAGCATCTATCTAGAACTTTTTCACATACCACTGAGAGTTTGCTTTCCGTATT
CATCTGTTCATGTATAAAATCAACGAGTTGTTGGCTTGTCATGCAGTCCCAAATTCCATC
GCAGGCAAGAACAAGGAAATCATCATCATCGCAGAGTTCAACAGTGTTTACATCAGGACT
GGCGGTAACGATTTGCTTTTCAGTTGGCAAAAACTTATTCTGCTTGAATTCCATATCACC
GATAGCTCTTGCTAGGTTCAAGCTTCCATTGACACGACCAGCATGAATGAACCCACCAGC
TTTCAATATCCTTTCTCTCTCAGCTTCAAGATCTGGTTTGTGATCTCTAGAAAGATTGTA
AGCCTGACCCTTTCTGGATATGACACAATGTGAGTCACCAGCATTTGCAACAAATAGCTG
CTTGTGTCTAATAACAGCCACACATGCTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G460JQ U 172
AF RR2BM17JQ U 1
BS 1 751 RR2BM17JQ

RD RR2G460JQ 271 0 0
ATGGGGCTAGTTTGATGAGCTAGGCTCATTGTGGCTTGGGCTAGGTTCTGCTTTCGTGGA
CTGAACAGGCTTCTTGAACTGAACCAAGATCATGGTCATGTTATCACAGCCTTCACCACC
TGCTGTGTTTGGAGCCAAGCATCTATCTAGAACTTTTTCACGTACCACTGAGAGTTTGCT
TTCCGTATTCATCTGTTCATGTATAAAATCAACGAGTTGTTGGCTTGTCATGCAGTCCCA
AATTCCATCGCAGGCAAGAACAAGGAAATCA

QA 1 271 1 271
DS 

RD RR2BM17JQ 751 0 0
AACGAGTCAAATCATTCCTTCTGTATTATTGGAACTCGTGGGACAAAAGTCTAGAGGCAG
AGGAACTGAAACCTCCAGAAAAGTCAGATTGTAGCTAATTAATGTCTTTCAAAAGAATTT
ACAATGTGGAATCAAACTACTATATGTCATCATCTTCCTTCGGCTCAAAGGATGGGGCTA
GTTTGATGAGCTAGGCTCATTGTGGCTTGGGCTAGGTTCTGCTTTCGTGGACTGAACAGG
CTTCTTGAACTGAACCAAGATCATGGTCATGTTATCACAGCCTTCACCACCTGCTGTGTT
TGGAGCCAAGCATCTATCTAGAACTTTTTCACATACCACTGAGAGTTTGCTTTCCGTATT
CATCTGTTCATGTATAAAATCAACGAGTTGTTGGCTTGTCATGCAGTCCCAAATTCCATC
GCAGGCAAGAACAAGGAAATCATCATCATCGCAGAGTTCAACAGTGTTTACATCAGGACT
GGCGGTAACGATTTGCTTTTCAGTTGGCAAAAACTTATTCTGCTTGAATTCCATATCACC
GATAGCTCTTGCTAGGTTCAAGCTTCCATTGACACGACCAGCATGAATGAACCCACCAGC
TTTCAATATCCTTTCTCTCTCAGCTTCAAGATCTGGTTTGTGATCTCTAGAAAGATTGTA
AGCCTGACCCTTTCTGGATATGACACAATGTGAGTCACCAGCATTTGCAACAAATAGCTG
CTTGTGTCTAATAACAGCCACACATGCTGTG

QA 1 751 1 751
DS 



CO CL1886Contig2 685 2 6 U
GGAAGGAGGAGAAGAAAACAAAGTGAGCAACTTTCGTTGCTCTTTTGTTCGAAAAAACAA
AAAAAAAAACAAGACTTTTTCTTACAACGCCGTCCCCTCCAGCATCAAAGAAAAGAGAGA
TGGGAATATACCTAAGTTCACCCAAAACAGATAAGTTGTCAGAAGATGGAGAGAATGATA
AACTTAGATATGGTTTGTCCTCTATGCAAGGTTGGCGTGCCACCATGGAAGATGCTCATG
CTGCAATTCTTGATCTGGATGACAACACTTCCTTCTTGGGTGTCTATGATGGCCACGGAG
GTAAAGTTGTTTCAAAGTTCTGTGCCAAGTATCTACACCAGCAGGTTCTCAGTGATGAGG
CACATGCTGCTGGGGATGTAGGGACTTCTCTTCAAAAGGCATTTTTCAGAATGGATGAGA
TGATGCAAGGACAGAGAGGATGGCGAGAACTGGCGATACTAGGTGACAAGATCAATAAGT
TCAGCGGAATGATTGAAGGGTTTATATGGTCACCAAGAAGCGGTGACAGCGCTAATAGAC
CTGATGCTTGGGCTTTTGAGGAAGGGCCTCATTCTGATTTCACTGGACCTAATTCTGGGA
GCACAGCATGTGTGGCTGTTATTAGACACAAGCAGCTATTTGTTGCAAATGCCGGTGACT
CACATTGTGTCATATCCAGAAAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM17TF U 1
AF RR2G460TF U 76
BS 1 362 RR2BM17TF
BS 363 363 RR2G460TF
BS 364 652 RR2BM17TF
BS 653 653 RR2G460TF
BS 654 674 RR2BM17TF
BS 675 685 RR2G460TF

RD RR2BM17TF 674 0 0
GGAAGGAGGAGAAGAAAACAAAGTGAGCAACTTTCGTTGCTCTTTTGTTCGAAAAAACAA
AAAAAAAAACAAGACTTTTTCTTACAACGCCGTCCCCTCCAGCATCAAAGAAAAGAGAGA
TGGGAATATACCTAAGTTCACCCAAAACAGATAAGTTGTCAGAAGATGGAGAGAATGATA
AACTTAGATATGGTTTGTCCTCTATGCAAGGTTGGCGTGCCACCATGGAAGATGCTCATG
CTGCAATTCTTGATCTGGATGACAACACTTCCTTCTTGGGTGTCTATGATGGCCACGGAG
GTAAAGTTGTTTCAAAGTTCTGTGCCAAGTATCTACACCAGCAGGTTCTCAGTGATGAGG
CATATGCTGCTGGGGATGTAGGGACTTCTCTTCAAAAGGCATTTTTCAGAATGGATGAGA
TGATGCAAGGACAGAGAGGATGGCGAGAACTGGCGATACTAGGTGACAAGATCAATAAGT
TCAGCGGAATGATTGAAGGGTTTATATGGTCACCAAGAAGCGGTGACAGCGCTAATAGAC
CTGATGCTTGGGCTTTTGAGGAAGGGCCTCATTCTGATTTCACTGGACCTAATTCTGGGA
GCACAGCATGTGTGGCTGTTATTAGACACAAGCAGCTATTTGTTGCAAATGCTGGTGACT
CACATTGTGTCATA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2G460TF 610 0 0
TTTTTCTTACAACGCCGTCCCCTCCAGCATCAAAGAAAAGAGAGATGGGAATATACCTAA
GTTCACCCAAAACAGATAAGTTGTCAGAAGATGGAGAGAATGATAAACTTAGATATGGTT
TGTCCTCTATGCAAGGTTGGCGTGCCACCATGGAAGATGCTCATGCTGCAATTCTTGATC
TGGATGACAACACTTCCTTCTTGGGTGTCTATGATGGCCACGGAGGTAAAGTTGTTTCAA
AGTTCTGTGCCAAGTATCTACACCAGCAGGTTCTCAGTGATGAGGCACATGCTGCTGGGG
ATGTAGGGACTTCTCTTCAAAAGGCATTTTTCAGAATGGATGAGATGATGCAAGGACAGA
GAGGATGGCGAGAACTGGCGATACTAGGTGACAAGATCAATAAGTTCAGCGGAATGATTG
AAGGGTTTATATGGTCACCAAGAAGCGGTGACAGCGCTAATAGACCTGATGCTTGGGCTT
TTGAGGAAGGGCCTCATTCTGATTTCACTGGACCTAATTCTGGGAGCACAGCATGTGTGG
CTGTTATTAGACACAAGCAGCTATTTGTTGCAAATGCCGGTGACTCACGTTGTGTCATAT
CCAGAAAGGG

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 5

CO CL1887Contig1 910 5 7 U
GGACGTTTATCCAAAAAAAAAATCTCCAGGCCAGGGGCAAGGAATGATGACTCCGACACA
GTACTACAGGCTCACAACTTCTCCAACAATCCCTTCCTATTTACCATTCTGCCACCCACC
TCGATTTCTTCCTCCGCCTTCTGCTCACAACAACCCGAACCTCGTTTCCAGTTCCCGAGA
AAAACCCAGATTCTTACCACCTTCCTTTGTGTGCTTTGCATCATCATCTTCTCCAATGGC
TACTCCGACGCAGAGCAGCGAGACCAAACCTTTCTCCGTCCTTTTCGTCTGTCTGGGTAA
CATCTGTCGGAGCCCCGCAGCTGAAGGCGTCTTCAGAGACATCGTCAAAAAGAGAGGCCT
CGACTCCAATTTCATCATTGATTCCGCCGGAACCATCGATTATCACGAGGGGAATATGGC
AGATCCAAGGATGAGAAGCGCTGCGAAACGTCGTGGAGTTGAGATAACGTCATTATCTAG
ACCGATAAAGGCATCTGATTTCAGGGAGTTTGATCTCATTCTCGCCATGGATGAGCAGAA
CAAAAAGGATATATTGGAGGCTTACAATGTGTGGAAAGCCAGAGGCAATTACCCTCCTGA
TGCTGATAAAAAGGTGAAGCTCATGTGTTCGTATTGCAAGAAACACAATGACAAGGTAGT
GCCGGACCCGTATTATGGTGGAGCTCAAGGTTTTGAGAAGGTATTGGACTTGCTTGAAGA
TGCATGTGAGTCGTTGCTGGACAGTATCACGGCAGAAAATTGACATTGCAAAGCTCAAAG
TCCTGATTCCTGACACAAACTCTATGTGTCTTATTGAAACTGATGTTATTAAATTTATAA
GACATCTTCAGTGATGCCAAACAGCGTGAGAAAATGGTGTGAAGCTCGAATCTTGTTGAA
TGTTTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D970TF U 51
AF RR2E574TF U 1
AF RR2A060JQ C 244
AF RR2A060TF U 402
AF RR2E574JQ C 410
BS 1 601 RR2E574TF
BS 602 699 RR2A060TF
BS 700 700 RR2E574JQ
BS 701 818 RR2A060TF
BS 819 819 RR2E574JQ
BS 820 836 RR2A060TF
BS 837 910 RR2E574JQ

RD RR2D970TF 365 0 0
CTCCGACACAGTACTACAGGCTCACAACTTCTCCAACAATCCCTTCCTATTTACCATTCT
GCCACCCACCTCGATTTCTTCCTCCGCCTTCTGCTCACAACAACCCGAACCTCGTTTCCA
GTTCCCGAGAAAAACCCAGATTCTTACCACCTTCCTTTGTGTGCTTTGCATCATCATCTT
CTCCAATGGCTACTCCGACGCAGAGCAGCGAGACCAAACCTTTCTCCGTCCTTTTCGTCT
GTCTGGGTAACATCTGTCGGAGCCCCGCAGCTGAAGGCGTCTTCAGAGACATCGTCAAAA
AGAGAGGCCTCGACTCCAATTTCATCATTGATTCCGCCGGAACCATCGATTATCACGAGG
GGAAT

QA 1 365 1 365
DS 

RD RR2E574TF 608 0 0
GGACGTTTATCCAAAAAAAAAATCTCCAGGCCAGGGGCAAGGAATGATGACTCCGACACA
GTACTACAGGCTCACAACTTCTCCAACAATCCCTTCCTATTTACCATTCTGCCACCCACC
TCGATTTCTTCCTCCGCCTTCTGCTCACAACAACCCGAACCTCGTTTCCAGTTCCCGAGA
AAAACCCAGATTCTTACCACCTTCCTTTGTGTGCTTTGCATCATCATCTTCTCCAATGGC
TACTCCGACGCAGAGCAGCGAGACCAAACCTTTCTCCGTCCTTTTCGTCTGTCTGGGTAA
CATCTGTCGGAGCCCCGCAGCTGAAGGCGTCTTCAGAGACATCGTCAAAAAGAGAGGCCT
CGACTCCAATTTCATCATTGATTCCGCCGGAACCATCGATTATCACGAGGGGAATATGGC
AGATCCAAGGATGAGAAGCGCTGCGAAACGTCGTGGAGTTGAGATAACGTCATTATCTAG
ACCGATAAAGGCATCTGATTTCAGGGAGTTTGATCTCATTCTCGCCATGGATGAGCAGAA
CAAAAAGGATATATTGGAGGCTTACAATGTGTGGAAAGCCAGAGGCAATTACCCTCCTGA
T
GCTGATA

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2A060JQ 358 0 0
TCCGACGCAGAGCAGCGAGACCAAACCTTTCTCCGTCCTTTTCGTCTGTCTGGGTAACAT
CTGTCGGAGCCCCGCAGCTGAAGGCGTCTTCAGAGACATCGTCAAAAAGAGAGGCCTCGA
CTCCAATTTCATCATTGATTCCGCCGGAACCATCGATTATCACGAGGGGAATATGGCAGA
TCCAAGGATGAGAAGCGCTGCGAAACGTCGTGGAGTTGAGATAACGTCATTATCTAGACC
GATAAAGGCATCTGATTTCAGGGAGTTTGATCTCATTCTCGCCATGGATGAGCAGAACAA
AAAGTATATATTGGAGGCTTACAATGTGTGGAAAGCCAGAGGCAATTACCCTCCTGAT

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR2A060TF 435 0 0
ATCACGAGGGGAATATGGCAGATCCAAGGATGAGAAGCGCTGCAAAACGTCGTGGAGTTG
ATATAACGTCATTATCTAGACCGATAAAGGCATCTGATTTCAGGGAGTTTGATCTCATTC
TCGCCATGGATGAGCAGAACAAAAAGTATATATTGGAGGCTTACAATGTGTGGAAAGCCA
GAGGCAATTACCCTCCTGATGCTGATAAAAAGGTGAAGCTCATGTGTTCGTATTGCAAGA
AACACAATGACAAGGTAGTGCCGGACCCGTATTATGGTGGAGCTCAAGGTTTTGAGAATG
TATTGGACTTGCTTGAAGATGCATGTGAGTCGTTGCTGGACAGTATCACGGCAGAAAATT
GACATTGCAAAGCTCAAAGTCCTGATTCCTGACACAAACTCTATGTGTCTTATTGAA*CT
GATGTTATTAAATTT

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR2E574JQ 501 0 0
GGGAATATGGCAGATCCAAGGATGAGAAGCGCTGCGAAACGTCGTGGAGTTGAGATAACG
TCATTATCTAGACCGATAAAGGCATCTGATTTCAGGGAGTTTGATCTCATTCTCGCCATG
GATGAGCAGAACAAAAAGGATATATTGGAGGCTTACAATGTGTGGAAAGCCAGAGGCAAT
TACCCTCCTGATGCTGATAAAAAGGTGAAGCTCATGTGTTCGTATTGCAAGAAACACAAT
GACAAGGTAGTGCCGGACCCGTATTATGGTGGAGCTCAAGGTTTTGAGAAGGTATTGGAC
TTGCTTGAAGATGTATGTGAGTCGTTGCTGGACAGTATCACGGCAGAAAATTGACATTGC
AAAGCTCAAAGTCCTGATTCCTGACACAAACTCTATGTGTCTTATTGAAACTGATGTTAT
TAAATTTATAAGACATCTTCAGTGATGCCAAACAGCGTGAGAAAATGGTGTGAAGCTCGA
ATCTTGTTGAATGTTTTCTTT

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 4

CO CL1888Contig1 1347 4 11 U
GGGAGCCCAACGCAGAAAAAAAATATCTCTGTTTCGAATAGTTTCGTTAGCTGCGTCCCT
CCCCTTTGGTGCTTTGAAGAGATGACCATGGCAGCAACCTTCGCGAAACGCCTGATCGGA
AGCCGATCGAGCCAGATCCTCGGAGCTGCGAACTCCACCTCAACCGCGGCCACTTCCGTC
GCTAGAGCCTTCTGCTCGTCGTCCACCACTCCAATCACCGCAACCATGTTCCCCGGAGAC
GGGATCGGTCCCGAGATCGCCGAATCCGTCAAACAGGTGTTCACAACGGCTGGAGTGCCG
ATTAACTGGGAAGAGCACTACGTGAGCACAGAGATAGATCCGAGGACGCAGAGTTTCTTG
ACCTGGGAGAGTCTCGAATCCGTGCGTAGAAACAAAGTCGGTTTGAAAGGTCCGATGGCT
ACTCCTATCGGGAAAGGTCACCGTTCTTTGAACCTGACTCTTAGGAAAGAGCTGAATCTG
TACGCCAACGTTAGGCCTTGCTACAGTCTCCCTGGTTACAAGACTCGTTACGACGATGTT
AATCTTATAACCATCAGGGAGAACACTGAAGGAGAGTATAGTGGGCTCGAGCATCAGGTT
GTTAGAGGTGTGGTGGAGAGTCTTAAGATCATTACGCGTCAGGCGAGTTTGAGAGTTGCG
GAGTATGCTTTTCACTATGCTAAGACTCATGGAAGAGAGAGGGTTTCTGCTATTCACAAA
GCTAACATTATGCAGAAAACTGATGGTCTTTTCCTCAAGTGTTGTCGTGAGGTGGCTGAG
AAGTATCCTGAGATAACTTACGAAGAGGTTGTTATTGACAACTGTTGTATGATGCTTGTG
AAAAACCCAGCACTGTTTGATGTATTGGTGATGCCAAACCTCTACGGTGACATTATCAGT
GACCTGTGTGCCGGACTGGTGGGAGGACTAGGATTGACTCCAAGTTGTAATATCGGGGAA
GATGGTGTAGCCCTAGCTGAAGCAGTTCACGGTTCTGCACCTGATATCGCTGGAAGGAAC
TTGGCGAACCCAGCAGCGTTGCTACTGAGTGGAGTGATGATGTTACGTCACCTGAAGCTG
AACGAACAAGCAGAACAAATCCACAGCGCAATCATCAACACGATAGCGGAGGGCAAATAC
AGAACGGCAGATCTTGGAGGTACTTCGACCACCACGGAATTCACAAAGGCAATCTGTGAT
CATCTCTGAACATATCGTAAAGAAATCTCAATTCTTTATCGAATCTTCCTTTGAGGCTTA
AGCCTTCTTTAGCCTCTGAGATTCTTCTTTGATTCCCTCGTTTTTCGATTAGAATAAAAA
AACAGGCATTGGCTTTTGAAGTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB10TF U 1
AF RR2C709TF U 11
AF RR2C709JQ C 608
AF RR2EB10JQ C 503
BS 1 570 RR2EB10TF
BS 571 571 RR2C709TF
BS 572 597 RR2EB10TF
BS 598 598 RR2C709TF
BS 599 615 RR2EB10TF
BS 616 642 RR2C709TF
BS 643 643 RR2EB10JQ
BS 644 724 RR2C709TF
BS 725 725 RR2EB10JQ
BS 726 738 RR2C709TF
BS 739 1347 RR2EB10JQ

RD RR2EB10TF 615 0 0
GGGAGCCCAACGCAGAAAAAAAATATCTCTGTTTCGAATAGTTTCGTTAGCTGCGTCCCT
CCCCTTTGGTGCTTTGAAGAGATGACCATGGCAGCAACCTTCGCGAAACGCCTGATCGGA
AGCCGATCGAGCCAGATCCTCGGAGCTGCGAACTCCACCTCAACCGCGGCCACTTCCGTC
GCTAGAGCCTTCTGCTCGTCGTCCACCACTCCAATCACCGCAACCATGTTCCCCGGAGAC
GGGATCGGTCCCGAGATCGCCGAATCCGTCAAACAGGTGTTCACAACGGCTGGAGTGCCG
ATTAACTGGGAAGAGCACTACGTGAGCACAGAGATAGATCCGAGGACGCAGAGTTTCTTG
ACCTGGGAGAGTCTCGAATCCGTGCGTAGAAACAAAGTCGGTTTGAAAGGTCCGATGGCT
ACTCCTATCGGGAAAGGTCACCGTTCTTTGAACCTGACTCTTAGGAAAGAGCTGAATCTG
TACGCCAACGTTAGGCCTTGCTACAGTCTCCCTGGTTACAAGACTCGTTACGACGATGTT
AATCTTATAACCATCAGGGAGAACACTGAAAGAGAGTATAGTGGGCTCGAGCATCAG*TT
GTTAGAGGTGTGGTG

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2C709TF 732 0 0
CGCAGAAAAAAAATATCTCTGTTTCGAATAGTTTCGTTAGCTGCGTCCCTCCCCTTTGGT
GCTTTGAAGAGATGACCATGGCAGCAACCTTCGCGAAACGCCTGATCGGAAGCCGATCGA
GCCAGATCCTCGGAGCTGCGAACTCCACCTCAACCGCGGCCACTTCCGTCGCTAGAGCCT
TCTGCTCGTCGTCCACCACTCCAATCACCGCAACCATGTTCCCCGGAGACGGGATCGGTC
CCGAGATCGCCGAATCCGTCAAACAGGTGTTCACAACGGCTGGAGTGCCGATTAACTGGG
AAGAGCACTACGTGAGCACAGAGATAGATCCGAGGACGCAGAGTTTCTTGACCTGGGAGA
GTCTCGAATCCGTGCGTAGAAACAAAGTCGGTTTGAAAGGTCCGATGGCTACTCCTATCG
GGAAAGGTCACCGTTCTTTGAACCTGACTCTTAGGAAAGAGCTGAATCTGTACGCCAACG
TTAGGCCTTGCTACAGTCTCCCTGGTTACAAGACTCGTTACGACGATGTTAATCTTATAA
CCATCAGGGAGAACACTGAAGGAGAGTATAGTGGGCTCGAGCATCAGGTTGTTAGAGGTG
TGGTGGAGAGTCTTAAGATCATTACGCGTCAG*CGAGTTTGAGAGTTGCGGAGTATGCTT
TTCACTATGCTAAGACTCATGGAAGAGAGAGGGTTTCTGCTATTCACAAAGCTA*CATTA
TGCAGAAA
CTGA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2C709JQ 703 0 0
GTGTGGTGGAGAGTCTTAAGATCATTACGCGTCAGGCGAGTTTGAGAGTTGCGGAGTATG
CTTTTCACTATGCTAAGACTCATGGAAGAGAGAGGGTTTCTGCTATTCACAAAGCTAACA
TTATGCAGAAAACTGATGGTCTTTTCCTCAAGTGTTGTCGTGAGGTGGCTGAGAAGTATC
CTGAGATAACTTACGAAGAGGTTGTTATTGACAACTGTTGTATGATGCTTGTGAAAAACC
CAGCACTGTTTGATGTATTGGTGATGCCAAACCTCTACGGTGACATTATCAGTGACCTGT
GTGCCGGACTGGTGGGAGGACTAGGATTGACTCCAAGTTGTAATATCGGGGAAGATGGTG
TAGCCCTAGCTGAAGCAGTTCACGGTTCTGCACCTGATATCGCTGGAAGGAACTTGGCGA
ACCCAGCAGCGTTGCTACTGAGTGGAGTGATGATGTTACGTCACCTGAAGCTGAACGAAC
AAGCAGAACAAATCCACAGCGCAATCATCAACACGATAGCGGAGGGCAAATACAGAACGG
CAGATCTTGGAGGTACTTCGACCACCACGGAATTCACAAAGGCAATCTGTGATCATCTCT
GAACATATCGTAAAGAAATCTCAATTCTTTATCGAATCTTCCTTTGAGGCTTAAGCCTTC
TTTAGCCTCTGAGATTCTTCTTTGATTCCCTCGTTTTTCGATT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2EB10JQ 845 0 0
CTACAGTCTCCCTGGTAC
AGACTCGTTACGACGATGTTAATCTTATA*CCATCAGGGAGA*CACTGAAGGAGAGTATA
GTGGGCTCGAGCATCAGGTTGTTAGAGGTGTGGTGGAGAGTCTTAAGATCATTACGCGTC
AGGCGAGTTTGAGAGTTGCGGAGTATGCTTTTCACTATGCTAAGACTCATGGAAGAGAGA
GGGTTTCTGCTATTCACAAAGCTAACATTATGCAGAAAACTGATGGTCTTTTCCTCAAGT
GTTGTCGTGAGGTGGCTGAGAAGTATCCTGAGATAACTTACGAAGAGGTTGTTATTGACA
ACTGTTGTATGATGCTTGTGAAAAACCCAGCACTGTTTGATGTATTGGTGATGCCAAACC
TCTACGGTGACATTATCAGTGACCTGTGTGCCGGACTGGTGGGAGGACTAGGATTGACTC
CAAGTTGTAATATCGGGGAAGATGGTGTAGCCCTAGCTGAAGCAGTTCACGGTTCTGCAC
CTGATATCGCTGGAAGGAACTTGGCGAACCCAGCAGCGTTGCTACTGAGTGGAGTGATGA
TGTTACGTCACCTGAAGCTGAACGAACAAGCAGAACAAATCCACAGCGCAATCATCAACA
CGATAGCGGAGGGCAAATACAGAACGGCAGATCTTGGAGGTACTTCGACCACCACGGAAT
TCACAAAGGCAATCTGTGATCATCTCTGAACATATCGTAAAGAAATCTCAATTCTTTATC
GAATCTTCCTTTGAGGCTTAAGCCTTCTTTAGCCTCTGAGATTCTTCTTTGATTCCCTCG
TTTTTCGATTAGAATAAAAAAACAGGCATTGGCTTTTGAAGTAAACC

QA 19 845 19 845
DS 



AS 1 5

CO CL1889Contig1 1545 5 15 U
GGACGTGTGAAGCACAAAGCAGATATAGCTAAGAAGATCTTCTCATCACTCAGGGGCTTC
TAAATCTGAGATCTGACATGGAACAACTGTTTTCTGATTGGAATTTTGAAGATAATTTTC
ACATGTCCTCTAATAAAAGATCAGTCAGACCAGAAGATGAACTAGTGGAGCTACTATGGA
GAGATGGTCAAGTGGTTTTACAAAGCCAAGTTCGTAGAGAACCATCAGTCCAAGTCCAAA
CCCACAAAAATGACCAAACACTACGAAAACCCAACAATGCTTTACTTGACAATCAAGAAA
CAATACGAAGACCTAATGACAATGTTCAGGGAGACCAAGAAACCGTCTCCTGGATCCAAT
ACCCTCCTGAAGACGTAGTTGACCCCTTTGAATCGGAGTTCTCCTCCCATTTCTTCTCTT
CAATCGATCACCTTGATGGTCCAAATCATCCCAAGAAGCCACTGACTATCAAAGAGACAG
CCAAACCCGAGGCTAAAGCCATGGCTCCTCCTAAGTTTAGGCCACCGGTTGTAAGTGTTG
GACCGAGCCACTGTGGGAGCAACCACTCTACAAATGATCATCAGGTTACTCATCCTCCGG
TTTCTATGAATGCTAGAAGCAAGAACGTTGAAGAAAGACTTGACACTTCGTCTGGTGGCT
CGTCCGGTTGCAGCAAAGAAACCGAGAGTGGGAGAAGCGTAACCATTAGCCGTAAAAGAA
AGCATGCAATGGACACTGATCAAGAATCCATGTCTCAGTCTGATGTACGTCTGATGTCAA
CTGATGATCAAGCCATGGCTAACAAATCTAGCCAACGGTCAGGATCTACCCGAAGAAGCC
GTGCGGCTGAAGTTCATAATCTCTCAGAAAGGAGTAGGAGAGATCGGATCAATGAGAGAA
TGAAAGCTCTTCAAGAACTTATACCTCATTGCAGTAAAACGGATAAAGCGTCGATTTTGG
ATGAAGCCATTGATTACTTGAAAACACTTCAAATGCAACTCCAAGTGATGTGGATGGGAA
GTGGAATGGCGGCAGCGGCTGCAGCAGCAGCGACTCCGATGATGTTTCCTGGTGTACAGT
CATCTCAGTACATTAATCAGATGGCTATGCAGAGTCAAATGCAAATGCCTCAGTTTCCGG
TTATGAACCGACCCGCTGCACAGAACCATCCCGGTTTAGTATGTCAAAACCCGGCCGTAC
AGTTTCAGATGCAAGCACAGAACCAAATGTTGTCGGAGCAGCTTGCAAGGTACATGGGTG
GGTTTCCACCGATGCCGGCAACGACTCAGACGCAAACAGTGCAACAACCAATGGACATGA
TGAGATTTGAGTCTCAGGTGGGACAACAAAGTCAACTGTCAACACCGGTTACCACCGACA
GTCTTCGTATGGGTAAAACTGGTTGATGTGGAAAATATTCTTATCATCTATTCTTGGAGG
CATAAAACATGAAACTTATGAAATGTATTATACGGTTCTACTAAGGTAGTTCATACATAT
AATTTGTTTAAAACAGTTGAATATTAATAATTAAGTCTTGAGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2F013TF U 241
AF RR2A887TF U 1
AF RR2BG31TF U 507
AF RR2A887JQ C 764
AF RR2BG31JQ C 838
BS 1 301 RR2A887TF
BS 302 302 RR2F013TF
BS 303 373 RR2A887TF
BS 374 374 RR2F013TF
BS 375 536 RR2A887TF
BS 537 537 RR2F013TF
BS 538 814 RR2A887TF
BS 815 1255 RR2BG31TF
BS 1256 1275 RR2A887JQ
BS 1276 1276 RR2BG31JQ
BS 1277 1284 RR2A887JQ
BS 1285 1285 RR2BG31JQ
BS 1286 1329 RR2A887JQ
BS 1330 1330 RR2BG31JQ
BS 1331 1545 RR2A887JQ

RD RR2F013TF 406 0 0
CCCACAAAAATGACCAAACACTACGAAAACCCAACAATTCTTTACTTGACAATCAAGAAA
CAATACGAAGACCTAATGACAATGTTCAGGGAGACCAAGAAACCGTCTCCTGGATCCAAT
ACCCTCCTGAAGACGTAGTTGACCCCTTTGAATCGGAGTTCTCCTCCCATTTCTTCTCTT
CAATCGATCACCTTGATGGTCCAAATCATCCCAAGAAGCCACTGACTATCAAAGAGACAG
CCAAACCCGAGGCTAAAGCCATGGCTCCTCCTAAGTTTAGGCCACCGGTTGTAAGTGTTG
GACCGAGCCACTGTGGGAGCAACCACTCTACAAATGATCATCACGTTACTCATCCTCCGG
TTTCTATGAATGCTAGAAGCAAGAACGTTGAAGAAAGACTTGACAC

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR2A887TF 826 0 0
GGACGTGTGAAGCACAAAGCAGATATAGCTAAGAAGATCTTCTCATCACTCAGGGGCTTC
TAAATCTGAGATCTGACATGGAACAACTGTTTTCTGATTGGAATTTTGAAGATAATTTTC
ACATGTCCTCTAATAAAAGATCAGTCAGACCAGAAGATGAACTAGTGGAGCTACTATGGA
GAGATGGTCAAGTGGTTTTACAAAGCCAAGTTCGTAGAGAACCATCAGTCCAAGTCCAAA
CCCACAAAAATGACCAAACACTACGAAAACCCAACAATGCTTTACTTGACAATCAAGAAA
CCATACGAAGACCTAATGACAATGTTCAGGGAGACCAAGAAACCGTCTCCTGGATCCAAT
ACCCTCCTGAAGATGTAGTTGACCCCTTTGAATCGGAGTTCTCCTCCCATTTCTTCTCTT
CAATCGATCACCTTGATGGTCCAAATCATCCCAAGAAGCCACTGACTATCAAAGAGACAG
CCAAACCCGAGGCTAAAGCCATGGCTCCTCCTAAGTTTAGGCCACCGGTTGTAAGTTTTG
GACCGAGCCACTGTGGGAGCAACCACTCTACAAATGATCATCAGGTTACTCATCCTCCGG
TTTCTATGAATGCTAGAAGCAAGAACGTTGAAGAAAGACTTGACACTTCGTCTGGTGGCT
CGTCCGGTTGCAGCAAAGAAACCGAGAGTGGGAGAAGCGTAACCATTAGCCGTAAAAGAA
AGCATGCAATGGACACTGATCAAGAATCCATGTCTCAGTCTGATGTACGTCTGATGTCAA
CTGATGATCAAGCCATGGCTAACAAATCTAGCCA
CGGTCAGATCTA

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR2BG31TF 749 0 0
G
CTCCTAAGTTTAGGCCACCGGTTGTAAGTGTTGGACCGAGCCACTGTGGGAGCAACCACT
CTACAAATGATCATCAGGTTACTCATCCTCCGGTTTCTATGAATGCTAGAAGCAAGAACG
TTGAAGAAAGACTTGACACTTCGTCTGGTGGCTCGTCCGGTTGCAGCAAAGAAACCGAGA
GTGGGAGAAGCGTAACCATTAGCCGTAAAAGAAAGCATGCAATGGACACTGATCAAGAAT
CCATGTCTCAGTCTGATGTACGTCTGATGTCAACTGATGATCAAGCCATGGCTAACAAAT
CTAGCCAACGGTCAGGATCTACCCGAAGAAGCCGTGCGGCTGAAGTTCATAATCTCTCAG
AAAGGAGTAGGAGAGATCGGATCAATGAGAGAATGAAAGCTCTTCAAGAACTTATACCTC
ATTGCAGTAAAACGGATAAAGCGTCGATTTTGGATGAAGCCATTGATTACTTGAAAACAC
TTCAAATGCAACTCCAAGTGATGTGGATGGGAAGTGGAATGGCGGCAGCGGCTGCAGCAG
CAGCGACTCCGATGATGTTTCCTGGTGTACAGTCATCTCAGTACATTAATCAGATGGCTA
TGCAGAGTCAAATGCAAATGCCTCAGTTTCCGGTTATGAACCGACCCGCTGCACAGAACC
ATCCCGGTTTAGTATGTCAAAACCCGGCCGTACAGTTTCAGATGCAAGCACAGAACCAAA
TGTTGTCGGAGCAGCTTGCAAGGTACAT

QA 2 749 2 749
DS 

RD RR2A887JQ 782 0 0
TGTACGTCTGATGTCAACTGATGATCAAGCCATGGCTAACAAATCTAGCCAACGGTCAGG
ATCTACCCGAAGAAGCCGTGCGGCTGAAGTTCATAATCTCTCAGAAAGGAGGAGGAGAGA
TCGGATCAATGAGAGAATGAAAGCTCTTCAAGAACTTATACCTCATTGCAGTAAAACGGA
TAAAGCGTCGATTTTGGATGAAGCCATTGATTACTTGAAAACACTTCAAATGCAACTCCA
AGTGATGTGGATGGGAAGTGGAATGGCGGCAGCGGCTGCAGCAGCAGCGACTCCGATGAT
GTTTCCTGGTGTACAGTCATCTCAGTACATTAATCAGATGGCTATGCAGAGTCAAATGCA
AATGCCTCAGTTTCCGGTTATGAACCGACCCGCTGCACAGAACCATCCCGGTTTAGTATG
TCAAAACCCGGCCGTACAGTTTCAGATGCAAGCACAGAACCAAATGTTGTCGGAGCAGCT
TGCAAGGTACATGGGTGGGTTTCCACCGATGCTGGCAACGATTCAGACGCAAACAGTGCA
ACAACCAATGGACATGATGAGATTTGGGTCTCAGGTGGGACAACAAAGTCAACTGTCAAC
ACCGGTTACCACCGACAGTCTTCGTATGGGTAAAACTGGTTGATGTGGAAAATATTCTTA
TCATCTATTCTTGGAGGCATAAAACATGAAACTTATGAAATGTATTATACGGTTCTACTA
AGGTAGTTCATACATATAATTTGTTTAAAACAGTTGAATATTAATAATTAAGTCTTGAGA
AC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2BG31JQ 708 0 0
GCCGTGCGGCTGAAGTTCATAATCTCTCAGAAAGGAGTAGGAGAGATCGGATCAATGAGA
GAATGAAAGCTCTTCAAGAACTTATACCTCATTGCAGTAAAACGGATAAAGCGTCGATTT
TGGATGAAGCCATTGATTACTTGAAAACACTTCAAATGCAACTCCAAGTGATGTGGATGG
GAAGTGGAATGGCGGCAGCGGCTGCAGCAGCAGCGACTCCGATGATGTTTCCTGGTGTAC
AGTCATCTCAGTACATTAATCAGATGGCTATGCAGAGTCAAATGCAAATGCCTCAGTTTC
CGGTTATGAACCGACCCGCTGCACAGAACCATCCCGGTTTAGTATGTCAAAACCCGGCCG
TACAGTTTCAGATGCAAGCACAGAACCAAATGTTGTCGGAGCAGCTTGCAAGGTACATGG
GTGGGTTTCCACCGATGCCGGCAACGACTCAGACGCAAACAGTGCAACAACCAATGGACA
TGATGAGATTTGAGTCTCAGGTGGGACAACAAAGTCAACTGTCAACACCGGTTACCACCG
ACAGTCTTCGTATGGGTAAAACTGGTTGATGTGGAAAATATTCTTATCATCTATTCTTGG
AGGCATAAAACATGAAACTTATGAAATGTATTATACGGTTCTACTAAGGTAGTTCATACA
TATAATTTGTTTAAAACAGTTGAATATTAATAATTAAGTCTTGAGAAC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 4

CO CL1890Contig1 840 4 16 U
AAATGAAATCCAATACATCCAAAACAAACAACTGAAAAAATAAAAGTTCAAAATAGATAT
TCTTGAAAACAAACGTGTGATTAATTGAAATGATTAGTCATTGCTGCTATAGCTGGAAGA
GATAAGTAGATAACTAAGTAAAACAGCATCCTTTCCTGCTATCTACAGATGACTCCGATA
TGTTAATAGCGGTTCCTTGCCCCCGAAGATTACCCGCAGCTTCTTGTGCCGCCAACGCTT
TCTTGCTTATGATATGATAAATATCAGACAAGATCTTCTGAAACGCTTTCTCGATGTTAC
TCGCTTCTAAAGCAGACGTCTCGAGAAACGACAACCCTTCCTTCTCAGCCAATGATCGAC
CATCCTCATCAGCAACAGATCTCAGATGGTTTAGATCTGATTTGTTTCCAGCCATCATGA
TCACAATGTTGGAATCAGCGTGATCCCTAAGCTCGTGTAAC*ATCTCAGCACATTCTCGA
AGGTTTGTCTCTTGGTTATGTCGTAGACGAGAAGAGCTCCAACAGCTCCTCTGTAGTAAG
CGCTTGCGATCGCTCTGTAACGCTCTTGTCCCGCTGTGTCCCATATCTGAGCCTTTACTG
TTTTGCCTTCAACCTGTAATGTCCTGGTGGCGAATTCAACGCCAATGGTGGATTTGGATT
CGAGACAGAACTCGTTTCTGGTGAATCTGGAGAGAATGTTGGATTTGCCAACACCGGAGT
CACCGATTAGGACGACCTTGAACAGGTAATCATACTCATTGTCTAATCTATTCGCCATTG
TCTTCTCAAATCCTAGCGTCTGGATCAACCCCTTGAGCAAGCCACAAGGAACGATAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ37JQ U 119
AF RR2C042JQ U 1
AF RR2C042TF C 228
AF RR2BZ37TF C 206
BS 1 140 RR2C042JQ
BS 141 141 RR2BZ37JQ
BS 142 203 RR2C042JQ
BS 204 204 RR2BZ37JQ
BS 205 217 RR2C042JQ
BS 218 218 RR2BZ37JQ
BS 219 505 RR2C042JQ
BS 506 506 RR2C042TF
BS 507 510 RR2C042JQ
BS 511 511 RR2C042TF
BS 512 765 RR2C042JQ
BS 766 766 RR2C042TF
BS 767 789 RR2C042JQ
BS 790 790 RR2C042TF
BS 791 810 RR2C042JQ
BS 811 840 RR2BZ37TF

RD RR2BZ37JQ 145 0 0
GT
GATAAGTAGATAACTAAGTAAAACAGCATCCTTTCCTGCTATCTACAGATGACTCCGATA
TGTTAATAGCGGTTCCTTGCCCCCGAAGATTACCCGCAGCTTCTTGTGCCGCCAACGCTT
TCTTGCTTATGATATGATAAATA

QA 3 145 3 145
DS 

RD RR2C042JQ 826 0 0
AAATGAAATCCAATACATCCAAAACAAACAACTGAAAAAATAAAAGTTCAAAATAGATAT
TCTTGAAAACAAACGTGTGATTAATTGAAATGATTAGTCATTGCTGCTATAGCTGGAAGA
GATAAGTAGATAACTAAGTAGAACAGCATCCTTTCCTGCTATCTACAGATGACTCCGATA
TGTTAATAGCGGTTCCTTGCCCCGGAAGATTACCCGCTGCTTCTTGTGCCGCCAACGCTT
TCTTGCTTATGATATGATAAATATCAGACAAGATCTTCTGAAACGCTTTCTCGATGTTAC
TCGCTTCTAAAGCAGACGTCTCGAGAAACGACAACCCTTCCTTCTCAGCCAATGATCGAC
CATCCTCATCAGCAACAGATCTCAGATGGTTTAGATCTGATTTGTTTCCAGCCATCATGA
TCACAATGTTGGAATCAGCGTGATCCCTAAGCTCGTGTAAC*ATCTCAGCACATTCTCGA
AGGTTTGTCTCTTGGTTATGTCGTAAACGAAAAGAGCTCCAACAGCTCCTCTGTAGTAAG
CGCTTGCGATCGCTCTGTAACGCTCTTGTCCCGCTGTGTCCCATATCTGAGCCTTTACTG
TTTTGCCTTCAACCTGTAATGTCCTGGTGGCGAATTCAACGCCAATGGTGGATTTGGATT
CGAGACAGAACTCGTTTCTGGTGAATCTGGAGAGAATGTTGGATTTGCCAACACCGGAGT
CACCGATTAGGACGACCTTGAACAGGTAATCATACTCATTGTCTA*TCTATTCGCCATTG
TCTTCTCAA*TCCTAGCGTCTGGATCAACC
TGTGGAGATAGAGATC

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR2C042TF 593 0 0
GCCGCCAACGCTTTCTTGCTTATGATATGATAAATATCAGACAAGATCTTCTGAAACGCT
TTCTCGATGTTACTCGCTTCTAAAGCAGACGTCTCGAGAAACGACAACCCTTCCTTCTCA
GCCAATGATCGACCATCCTCATCAGCAACAGATCTCAGATGGTTTAGATCTGATTTGTTT
CCAGCCATCATGATCACAATGTTGGAATCAGCGTGATCCCTAAGCTCGTGTAAC*ATCTC
AGCACATTCTCGAAGGTTTGTCTCTTGGTTATGTCGTAGACGAGAAGAGCTCCAACAGCT
CCTCTGTAGTAAGCGCTTGCGGTCGCTCTGTAACGCTCTTGTCCCGCTGTGTCCCATATC
TGAGCCTTTACTGTTTTGCCTTCAACCTGTAATGTCCTGGTGGCGAATTCAACGCCAATG
GTGGATTTGGATTCGAGACAGAACTCGTTTCTGGTGAATCTGGAGAGAATGTTGGATTTG
CCAACACCGGAGTCACCGATTAGGACGACCTTGAACAGGTAATCATACTCATTGTCTAAT
CTATTCGCCATTGTCTTCTCAAATCCTAGCGTCTGGTTCAACC
TGTGGAGATA

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2BZ37TF 635 0 0
AAGATTACCCGCAGCTTCTTGTGCCGCCAACGCTTTCTTGCTTATGATATGATAAATATC
AGACAAGATCTTCTGAAACGCTTTCTCGATGTTACTCGCTTCTAAAGCAGACGTCTCGAG
AAACGACAAACCTTCCTTCTCAGCCAAAGACCGACCATCCTCATCAGCAACAGATCTCAG
ATGGTTTAGATCAGACTTGTTTCCAGCCATCATGATCACAATGTTGGAATCAGCGTGATC
CCTAAGCTCGTGTAACCATCTCAGCACATTCTCGAAGGTTTGTCTCTTGGTTATGTCGTA
GACGAGAAGAGCTCCAACAGCTCCTCTGTAGTAAGCGCTTGTGATCGCTCTGTAACGCTC
TTGTCCCGCTGTGTCCCATATCTGAGCCTTCACTGTTTTGCCTTCAACCTGTAATGTCCT
GGTGGCGAATTCAACGCCAATGGTGGATTTGGATTCGAGACAGAACTCGTTTCTGGTGAA
TCTGGAGAGAATGTTGGATTTGCCAACACCAGAGTCACCGATTAGGACGACCTTGAACAG
GTAATCATACTCATTGTCTAATCTATTCGCCATTGTCTTCTCAAATCCTAGCGTCTGGAT
CAACCCCTTGAGCAAGCCACAAGGAACGATAATCC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 2 5

CO CL1891Contig1 762 3 7 U
GGAATAAATAAAAGCTATTCATTTGCCAAGAAAAGAAGAAAAAAAAAATCAAAAGAGAGT
TCTCGAATCAGTTTCAATGGCGATTAACAACAAGCTTCCTCTTCTTCTCCTTCTCTCAGT
CATCATTCTCTTCTCAGTCGCCCTGTGCTCAGCGACACTGATGAAGAGGACGTCCTTTTC
ACAGGCATCAACAGCTACAGAACATCACAGAATCTCACTACCTTAAACAAGAACAAAAAC
GCAGAGTGTCTAGCCGACGAGCTCGCTGATCAATTCAAGAACAAACCATGCACCAACGAC
ACCGGCTCAGCCACAGTGCCTGGAACCGAACCACAGTTCTCAGATTACCCTAACATTCTA
GCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGACACAAGAGACGGCTCTATTATGCCCGCGTGTGTT
CCTCGTCTAGAGTCAGGCCTCATCCTCACAAACTTCACCAAGTCGCAATACTCCATGAGT
TTGAACGATTCCAAGTTCACAGGGATGGGCATTGGTAAGGAAGATGACTGGATCGTTGTG
GTTCTCACCACCAGCACACCTGAAGGAAACTATTCTCCAGCTACAAAACAGGATTCGAGT
GGCTTCATCTCTAGTATTGGCCTCTTTAATTACTTGCTTGTTTTCACGTTGTCCTTCTGT
TTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACACCTACCACACATGTCATGAGTTTTTTTTTGTCTC
AAGAATAATTTTTGCTTATGTTATTTACTAAATTTCTTTAGA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2B305JQ C 1
AF RR2EP08TF U 294
AF RR2B305TF U 1
BS 1 294 RR2B305TF
BS 295 441 RR2EP08TF
BS 442 442 RR2B305TF
BS 443 640 RR2EP08TF
BS 641 641 RR2B305TF
BS 642 759 RR2EP08TF
BS 760 762 RR2B305TF

RD RR2B305JQ 761 0 0
GGAATAAATAAAAGCTATTCATTTGCCAAGAAAAGAAGAAAAAAAAAATCAAAAGAGAGT
TCTCGAATCAGTTTCAATGGCGATTAACAACAAGCTTCCTCTTCTTCTCCTTCTCTCAGT
CATCATTCTCTTCTCAGTCGCCCTGTGCTCAGCGACACTGATGAAGAGGACGTCCTTTTC
ACAGGCATCAACAGCTACAGAACATCACAGAATCTCACTACCTTAAACAAGAACAAAAAC
GCAGAGTGTCTAGCCGACGAGCTCGCTGATCAATTCAAGAACAAACCATGCACCAACGAC
ACCGGCTCAGCCACAGTGCCTGGAACCGAACCACAGTTCTCAGATTACCCTAACATTCTA
GCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGACACAAGAGACGGCTCTATTATGCCCGCGTGTGTT
CCTCGTCTAGAGTCAGGCCTCATCCTCACAAACTTCACCAAGTCGCAATACTCCATGAGT
TTGAACGATTCCAAGTTCACAGGGATGGGCATTGGTAAGGAAGATGACTGGATCGTTGTG
GTTCTCACCACCAGCACACCTGAAGGAAACTATTCTCCAGCTACAAAACAGGATTCGAGT
GGCTTCATCTCTAGTATTGGCCTCTTTAATTACTTGCTTGTTTTCACGTTGTCCTTCTGT
TTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACACCTACCACACATGTCATGAGTTTTTTTTTGTCTC
AAGAATAATTTTTGCTTATGTTATTTACTAAATTTCTTT
AG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2EP08TF 466 0 0
G
AACGACACCGGCTCAGCCACAGTGCCTGGAACCGAACCACAGTTCTCAGATTACCCTAAC
ATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGACACAAGAGACGGCTCTATTATGCCCGCG
TGTGTTCCTCGTCTAGAGTCAGGCCTCGTCCTCACAAACTTCACCAAGTCGCAATACTCC
ATGAGTTTGAACGATTCCAAGTTCACAGGGATGGGCATTGGTAAGGAAGATGACTGGATC
GTTGTGGTTCTCACCACCAGCACACCTGAAGGAAACTATTCTCCAGCTACAAAACAGGAT
TCGAGTGGCTTCATCTCTAGTATTGGCCTCTTTAATTACTTGCTTGCTTTCACGTTGTCC
TTCTGTTTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACACCTACCACACATGTCATGAGTTTTTTTT
TGTCTCAAGAATAATTTTTGCTTATGTTATTTACTAAATTTCTTT

QA 2 466 2 466
DS 

RD RR2B305TF 762 0 0
GGAATAAATAAAAGCTATTCATTTGCCAAGAAAAGAAGAAAAAAAAAATCAAAAGAGAGT
TCTCGAATCAGTTTCAATGGCGATTAACAACAAGCTTCCTCTTCTTCTCCTTCTCTCAGT
CATCATTCTCTTCTCAGTCGCCCTGTGCTCAGCGACACTGATGAAGAGGACGTCCTTTTC
ACAGGCATCAACAGCTACAGAACATCACAGAATCTCACTACCTTAAACAAGAACAAAAAC
GCAGAGTGTCTAGCCGACGAGCTCGCTGATCAATTCAAGAACAAACCATGCACCAACGAC
ACCGGCTCAGCCACAGTGCCTGGAACCGAACCACAGTTCTCAGATTACCCTAACATTCTA
GCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGACACAAGAGACGGCTCTATTATGCCCGCGTGTGTT
CCTCGTCTAGAGTCAGGCCTCATCCTCACAAACTTCACCAAGTCGCAATACTCCATGAGT
TTGAACGATTCCAAGTTCACAGGGATGGGCATTGGTAAGGAAGATGACTGGATCGTTGTG
GTTCTCACCACCAGCACACCTGAAGGAAACTATTCTCCAGCTACAAAACAGGATTCGAGT
GGCTTCATCTCTAGTATTGGCCTCTTTAATTACTTGCTTGTTTTCACGTTGTCCTTCTGT
TTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACACCTACCACACATGTCATGAGTTTTTTTTTGTCTC
AAGAATAATTTTTGCTTATGTTATTTACTAAATTTCTTTAGA

QA 1 762 1 762
DS 



CO CL1891Contig2 715 2 2 U
GGGACAACGAAAGGAAAAGAAAAAAATATCAAAAGAGAGTTCTCGAATCAGTTTCAATGG
TGATTAACAACAACAAGCTTCCTCTTCTCCTTCTCTCTGTCATCATTCTCATCTTCAGTC
GCCCTGTGCTCAGCGACACTGATGAAGAGGACGTTCTCTTCACAGGCATCAACAGCTACA
GAACATCGCAGAATCTCACAACCTTAAACAAGAACAAAAACGCAGAGTGTCTAGCCGACG
AACTCGCCGATCAATTCAAGAACAAACCATGCACCAACGACACCGGCTCAGCCACAGTGC
CTGGCACCGAACCACAGTTCTCAGATTACCCTAACATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACG
TCTCAGGCACAAGAGACGGCTCTATTATGCCGCATGCGTTCCTCGTTTAGAGTCAAGCCT
CGTCCTCACAAACTTCACCAAGTCGCAATACTCCATGAGTTTGAACGATTCAAAGTTTAC
AGGGATGGGCATTGGTAAGGAAGATGATTGGATCGTTGTGGTTCTCACCACCAGCACACC
TGAAGGAAACTATTCTCCAGCTACAAAACAGGATTCAAGTGGTTTCATCTTTAGTATTGG
CCTCTTTAATTACTTGCTTGCTTTCACGTTGTCCTTCTGTTTCTTCCTCTGTTGATGAGA
GTGACACCTACCACACATGTCATGAGTTTTTTTTTGTCTCAAGAATAATTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK85TF U 1
AF RR2GK85JQ C 166
BS 1 636 RR2GK85TF
BS 637 715 RR2GK85JQ

RD RR2GK85TF 636 0 0
GGGACAACGAAAGGAAAAGAAAAAAATATCAAAAGAGAGTTCTCGAATCAGTTTCAATGG
TGATTAACAACAACAAGCTTCCTCTTCTCCTTCTCTCTGTCATCATTCTCATCTTCAGTC
GCCCTGTGCTCAGCGACACTGATGAAGAGGACGTTCTCTTCACAGGCATCAACAGCTACA
GAACATCGCAGAATCTCACAACCTTAAACAAGAACAAAAACGCAGAGTGTCTAGCCGACG
AACTCGCCGATCAATTCAAGAACAAACCATGCACCAACGACACCGGCTCAGCCACAGTGC
CTGGCACCGAACCACAGTTCTCAGATTACCCTAACATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACG
TCTCAGGCACAAGAGACGGCTCTATTATGCCGCATGCGTTCCTCGTTTAGAGTCAAGCCT
CGTCCTCACAAACTTCACCAAGTCGCAATACTCCATGAGTTTGAACGATTCAAAGTTTAC
AGGGATGGGCATTGGTAAGGAAGATGATTGGATCGTTGTGGTTCTCACCACCAGCACACC
TGAAGGAAACTATTCTCCAGCTACAAAACAGGATTCAAGTGGTTTCATCTTTAGTATTGG
CCTCTTTAATTACTTGCTTGCTTTCACGTTGTCCTT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2GK85JQ 550 0 0
GCATCAACAGCTACAGAACATCGCAGAATCTCACAACCTTAAACAAGAACAAAAACGCAG
AGTGTCTAGCCGACGAACTCGCCGATCAATTCAAGAACAAACCATGCACCAACGACACCG
GTTCAGCCACAGTGCCTGGCACCGAACCACAGTTTTCAGATTACCCTAACATTCTAGCTA
AATGCCACTTAAACGTTTCAGGCACAAGAGACGGCTCTATTATGCCGCATGCGTTCCTCG
TTTAGAGTCAAGCCTCGTCCTCACAAACTTCACCAAGTCGCAATACTCCATGAGTTTGAA
CGATTCAAAGTTTACAGGGATGGGCATTGGTAAGGAAGATGATTGGATCGTTGTGGTTCT
CACCACCAGCACACCTGAAGGAAACTATTCTCCAGCTACAAAACAGGATTCAAGTGGTTT
CATCTTTAGTATTGGCCTCTTTAATTACTTGCTTGCTTTCACGTTGTCCTTCTGTTTCTT
CCTCTGTTGATGAGAGTGACACCTACCACACATGTCATGAGTTTTTTTTTGTCTCAAGAA
TAATTTTTGC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 3

CO CL1892Contig1 834 3 12 U
GGATAGCGAAAAAAAGAAAACACACAAAATAAGTGTGAGAAAGAGTCTCTCTCTTGAGTG
TTAAAGTCATGCAGCTCAAATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAACACCGTCCA
TGAAACTCAAAACCCTAATCCAAAATCTCCTTGCACACCCTCTCTACCGTTTCCTTAGAG
CTGTCTCTAGAGCTAAATCAATCTTTCTAGAGATGTCTAAACACAACAACAACAAGAAAC
GAAAGCTGACGATGTTTTATCCAAGAAAGGCTTCAAAGAATCAACGCAAGATCTTCTTCG
GATCGTTTAGAATGCACTACAACTGGTGTTCCTCTGATGTTGTTCCTGTGCCTCAACCTT
TCCCTTTTTCTGTCTCTGACATCATTAATGGTGAAGAAGATGATGACTCTCACCTCTCTG
GCTACCTCGAGTGGCTAGAGCACAAGAAGGTCGAGGATTTGGAAGAGGTAAGAGATGATG
AAGGAGCCAATGATGATGATGATATTGATCATTTGGCCGATATGTTCATTGCTAATTGCC
ACGAGAAGTTCTTGCTCGAGAAAGTCGAATCTTACAGGAGGTTTCAAGAAATGTTAGAAA
GGGGTTTGTGAAACATAATATATTTTCATTGTCTCATTAATTAATAATCATGTTGTAAAA
TCTTAGCTAGTTTGATTTGATAATATTGCCACAAGGTGGGGAAATGTGTATCTTGAAAGT
TTTGGTGGTAATGTTCAAGAAGTTGAAACTTTTGGGGTAGTCAGTGAAACATGGTATTGT
AAAAACAATAAATATTCCTGTCCATCTAATTGGGCACATCTAGTTAAGTTGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF86TF U 174
AF RR2EP07TF U 1
AF RR2D288JQ C 139
BS 1 228 RR2EP07TF
BS 229 229 RR2AF86TF
BS 230 311 RR2EP07TF
BS 312 312 RR2AF86TF
BS 313 378 RR2EP07TF
BS 379 379 RR2AF86TF
BS 380 384 RR2EP07TF
BS 385 387 RR2D288JQ
BS 388 399 RR2EP07TF
BS 400 400 RR2D288JQ
BS 401 618 RR2EP07TF
BS 619 834 RR2D288JQ

RD RR2AF86TF 221 0 0
CTTACAGCTGTCTCTAGAGCTAAATCAATCTTTCTAGAGATGTCTAAACACGACAACAAC
AAGAAACGAAAGCTGACGATGTTTTATCCAAGAAAGGCTTCAAAGAATCAACGCAAGATC
TTCTTCGGATCGTTTAGAATGCACTACAACTGGTGTTCCTCTGATGTTGTTCCTGTGCCT
CAACCTTTCCCTTTTTCTGTCTCTGACATCA
TTAATGGTGA

QA 1 211 1 211
DS 

RD RR2EP07TF 618 0 0
GGATAGCGAAAAAAAGAAAACACACAAAATAAGTGTGAGAAAGAGTCTCTCTCTTGAGTG
TTAAAGTCATGCAGCTCAAATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAACACCGTCCA
TGAAACTCAAAACCCTAATCCAAAATCTCCTTGCACACCCTCTCTACCGTTTCCTTAGAG
CTGTCTCTAGAGCTAAATCAATCTTTCTAGAGATGTCTAAACACAACAGCAACAAGAAAC
GAAAGCTGACGATGTTTTATCCAAGAAAGGCTTCAAAGAATCAACGCAAGATCTTCTTCG
GATCGTTTAGATTGCACTACAACTGGTGTTCCTCTGATGTTGTTCCTGTGCCTCAACCTT
TCCCTTTTTCTGTCTCTGGCATCA***ATGGTGAAGAAGCTGATGACTCTCACCTCTCTG
GCTACCTCGAGTGGCTAGAGCACAAGAAGGTCGAGGATTTGGAAGAGGTAAGAGATGATG
AAGGAGCCAATGATGATGATGATATTGATCATTTGGCCGATATGTTCATTGCTAATTGCC
ACGAGAAGTTCTTGCTCGAGAAAGTCGAATCTTACAGGAGGTTTCAAGAAATGTTAGAAA
GGGGTTTGTGAAACATAA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2D288JQ 696 0 0
TCCAAAATCTCCTTGCACACCCTCTCTACCGTTTCCTTAGAGCTGTCTCTAGAGCTAAAT
CAATCTTTCTAGAGATGTCTAAACACAACAACAACAAGAAACGAAAGCTGACGATGTTTT
ATCCAAGAAAGGCTTCAAAGAATCAACGCAAGATCTTTTTCGGATCGTTTAGAATGCACT
ACAACTGGTGTTCCTCTGATGTTGTTCCTGTGCCTCAACCTTTCCCTTTTTCTGTTTCTG
ACATCATTAATGGTGAAGAAGATGATGAGTCTCACCTCTCTGGCTACCTCGAGTGGCTAG
AGCACAAGAAGGTCGAGGATTTGGAAGAGGTAAGAGATGATGAAGGAGCCAATGATGATG
ATGATATTGATCATTTGGCCGATATGTTCATTGCTAATTGCCACGAGAAGTTCTTGCTCG
AGAAAGTCGAATCTTACAGGAGGTTTCAAGAAATGTTAGAAAGGGGTTTGTGAAACATAA
TATATTTTCATTGTCTCATTAATTAATAATCATGTTGTAAAATCTTAGCTAGTTTGATTT
GATAATATTGCCACAAGGTGGGGAAATGTGTATCTTGAAAGTTTTGGTGGTAATGTTCAA
GAAGTTGAAACTTTTGGGGTAGTCAGTGAAACATGGTATTGTAAAAACAATAAATATTCC
TGTCCATCTAATTGGGCACATCTAGTTAAGTTGTGG

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 3

CO CL1893Contig1 998 3 2 U
GGAACGCACTCCTCCATACACAAAGACAACGGCGGAGACGAGGAGGCTGAGAAACACCGA
CGGGGCAAAAGGTCGTTTCCGATAACAAGTAGCTAAATTTTCGAGATCAAACCTCTGCGG
AAGATGGCATACATATCGAATTGGGTCAGATACATGGCTCACAAGCTGGAGTACTCCCTC
ACTCTCAGCCTCAAGAATCATACTAAAGGGATAAATGACCGGGAACTAGCTGGTGTAGTC
CTGAAGAATCTACTCTACGGAAGGCTAACCTACTTACACTCTGGTAAAGGGCAAGAGATG
GCCCCAACAATGGGAGCAGATGACAACACACTGCTTGTCCGTAAGCTACCTGTTGTTGAT
ACAAGGTATGTTTTCGTTGGAGATGCTGTTGTGTTGAAGGACCCGAATGAAACAGATAAG
TATCTAGTGAGAAGACTAGCAGCTTTAGAAGGATCCGAAATGGTATCAAGTGATGAGAAG
GAGGAGCCTTTTGTTCTCGAAAAGGATCAGTGCTGGGTCGTAGCTGAAAACCAAGAGATG
AAATCTAAGGAAGCATACGATAGCCGGACATTTGGTCCGGTCTCGATGGCGGACATAGTA
GGAAGAGCTATATATTGTCTGAGGACAGCCGTTGATCATGGTCCAGTAAGTAACAGTGAA
TTCGCAATGGAAGAGGATTCTCCACTCTTGGCGGTAGAACTTGACGTGGATGAAATGGCT
AAAGACCACAAGGCTTAGTAATAACAAGGAAACCTTTGTATCCCCTTTGTTTCCGTTGGT
TCGAAACTCCAAATCTAGATTCCTTTGGAGTGTCAGAGATTTTTGTGGGCAGATTGTTTG
GCCATTGGTTCTAAGCTTTCATACTTGTTGAGAGTGTTGAAGAAAGCTTCATCAGCTTCT
TCCTCTATAATTAAACAGACATTAAACCAAACCGAACCGAACATGACATTTGTTAAATCT
GTTTTTCTGGTTTTGGTTAAAAAATTTATTTTCTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ68TF U 20
AF RR2C355TF U 1
AF RR2C355JQ C 274
BS 1 642 RR2C355TF
BS 643 998 RR2C355JQ

RD RR2DZ68TF 458 0 0
GGAAAGACAACGGCGGA
GACGAGGAGGCTGAGAAACACCGACGGGGCAAAAGGTCGTTTCCGATAACAAGTAGCTAA
ATTTTCGAGATCAAACCTCTGCGGAAGATGGCATACATATCGAATTGGGTCAGATACATG
GCTCACAAGCTGGAGTACTCCCTCACTCTCAGCCTCAAGAATCATACTAAAGGGATAAAT
GACCGGGAACTAGCTGGTGTAGTCCTGAAGAATCTACTCTACGGAAGGCTAACCTACTTA
CACTCTGGTAAAGGGCAAGAGATGGCCCCAACAATGGGAGCAGATGACAACACACTGCTT
GTCCGTAAGCTACCTGTTGTTGATACAAGGTATGTTTTCGTTGGAGATGCTGTTGTGTTG
AAGGACCCGAATGACACAGATAAGTATCTAGTGAGAAGACTAGCAGCTTTAGAAGGATCC
GAAATGGTATCAAGTGATGAG

QA 18 458 18 458
DS 

RD RR2C355TF 642 0 0
GGAACGCACTCCTCCATACACAAAGACAACGGCGGAGACGAGGAGGCTGAGAAACACCGA
CGGGGCAAAAGGTCGTTTCCGATAACAAGTAGCTAAATTTTCGAGATCAAACCTCTGCGG
AAGATGGCATACATATCGAATTGGGTCAGATACATGGCTCACAAGCTGGAGTACTCCCTC
ACTCTCAGCCTCAAGAATCATACTAAAGGGATAAATGACCGGGAACTAGCTGGTGTAGTC
CTGAAGAATCTACTCTACGGAAGGCTAACCTACTTACACTCTGGTAAAGGGCAAGAGATG
GCCCCAACAATGGGAGCAGATGACAACACACTGCTTGTCCGTAAGCTACCTGTTGTTGAT
ACAAGGTATGTTTTCGTTGGAGATGCTGTTGTGTTGAAGGACCCGAATGAAACAGATAAG
TATCTAGTGAGAAGACTAGCAGCTTTAGAAGGATCCGAAATGGTATCAAGTGATGAGAAG
GAGGAGCCTTTTGTTCTCGAAAAGGATCAGTGCTGGGTCGTAGCTGAAAACCAAGAGATG
AAATCTAAGGAAGCATACGATAGCCGGACATTTGGTCCGGTCTCGATGGCGGACATAGTA
GGAAGAGCTATATATTGTCTGAGGACAGCCGTTGATCATGGT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2C355JQ 725 0 0
TTACACTCTGGTAAAGGGCAAGAGATGGCCCCAACAATGGGAGCAGATGACAACACACTG
CTTGTCCGTAAGCTACCTGTTGTTGATACAAGGTATGTTTTCGTTGGAGATGCTGTTGTG
TTGAAGGACCCGAATGAAACAGATAAGTATCTAGTGAGAAGACTAGCAGCTTTAGAAGGA
TCCGAAATGGTATCAAGTGATGAGAAGGAGGAGCCTTTTGTTCTCGAAAAGGATCAGTGC
TGGGTCGTAGCTGAAAACCAAGAGATGAAATCTAAGGAAGCATACGATAGCCGGACATTT
GGTCCGGTCTCGATGGCGGACATAGTAGGAAGAGCTATATATTGTCTGAGGACAGCCGTT
GATCATGGTCCAGTAAGTAACAGTGAATTCGCAATGGAAGAGGATTCTCCACTCTTGGCG
GTAGAACTTGACGTGGATGAAATGGCTAAAGACCACAAGGCTTAGTAATAACAAGGAAAC
CTTTGTATCCCCTTTGTTTCCGTTGGTTCGAAACTCCAAATCTAGATTCCTTTGGAGTGT
CAGAGATTTTTGTGGGCAGATTGTTTGGCCATTGGTTCTAAGCTTTCATACTTGTTGAGA
GTGTTGAAGAAAGCTTCATCAGCTTCTTCCTCTATAATTAAACAGACATTAAACCAAACC
GAACCGAACATGACATTTGTTAAATCTGTTTTTCTGGTTTTGGTTAAAAAATTTATTTTC
TGGTC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 2 5

CO CL1894Contig1 1093 2 2 U
GGGAGAGAAAGAGAAAGAGAGAGAGAGGCTTTTCTTCTTCGTCTCGATCTCAAGACTTCT
TCGATGAACCGTCTGCATCTGCATTTGAAGATTTAAAACGGCCAGGTTGTTGAAATGATG
ACTGTTCCTCAAAAATTCTCAACTGGGTAACGAACGTTTGTATCCTCAATTTTTGCGGAT
CCAATGTGGAGCTTTGCGTCAAACGTGATTGGCAGCATAGGTGGTCTAAAGAAAGACCAC
CCACCTCCTCCTCAACCCTCCCATTGCTCAGACGACGAGGAGACGAGGTTTCTAACGTTA
GCAGAGACGAAGATGAGGAAGAACAAGGACTAGACTGTCCCATCTGCTTCGAATCATTCA
ACATCGTCGAGAACGTCCCTTACGTCTTATGGTGCGGCCACACTCTTTGCCAGAACTGCG
TCTTCTCCCTCCGCCCTCCTGTTCTCTTGACGCTCTCAGGTCGAGACGTCAGTCTCCCTT
TCTTAGTCTCCTGCCCTTGGTGTCAGCTTCTTTCCTTCGGGGTCGTCTACGACGGCGTCC
TCAAGTTCCCTAAGAAGAACTTCTTCCTCCTCTGGATGGTTGAGTCTCTCAACGGTGACA
GGTCCAGAAGACATGGTACTGGTAGTGATGATAACCACCAATACTGCAATAGCAATAGCA
ATCTGATTGCAAGGCCTGTTGGGAGGAGCCAACCAAGCAGCAGCAGCAGCAGACAGCAGT
TCTCGTTCCACAAGTCGATTGATTTCTTCATCTCCTTCACCTCCAAGTTTCCTTTTGTGG
TTGTTTTCCTTTTGATCGTCTTCTTTGCTATACCTGGCAGCCTCGTCGTTCTTGCCCTTT
ACTTCCTCCTCACCATTCTTCTAGCCGTTCCTTCTGGTTTGGTTCTGTATTTTGCCTACC
CTATTCTTGAAAGGTTGGTTCATGAAATTACTTCATGAGAAACTTTCTTGATTTTGTTAT
TGATTGCAAGCTTGGGAATTGTAATTTGTGGTTTTTGAGTTTTTTAAATTACTGTTATAT
GAGCAACTTTGGTTTTGCAGATTTGTGACTTAATTGATGATTGATTGATCATGTATGTGT
TTAATTAATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ10TFB U 1
AF RR2AZ10JQ C 490
BS 1 669 RR2AZ10TFB
BS 670 1093 RR2AZ10JQ

RD RR2AZ10TFB 669 0 0
GGGAGAGAAAGAGAAAGAGAGAGAGAGGCTTTTCTTCTTCGTCTCGATCTCAAGACTTCT
TCGATGAACCGTCTGCATCTGCATTTGAAGATTTAAAACGGCCAGGTTGTTGAAATGATG
ACTGTTCCTCAAAAATTCTCAACTGGGTAACGAACGTTTGTATCCTCAATTTTTGCGGAT
CCAATGTGGAGCTTTGCGTCAAACGTGATTGGCAGCATAGGTGGTCTAAAGAAAGACCAC
CCACCTCCTCCTCAACCCTCCCATTGCTCAGACGACGAGGAGACGAGGTTTCTAACGTTA
GCAGAGACGAAGATGAGGAAGAACAAGGACTAGACTGTCCCATCTGCTTCGAATCATTCA
ACATCGTCGAGAACGTCCCTTACGTCTTATGGTGCGGCCACACTCTTTGCCAGAACTGCG
TCTTCTCCCTCCGCCCTCCTGTTCTCTTGACGCTCTCAGGTCGAGACGTCAGTCTCCCTT
TCTTAGTCTCCTGCCCTTGGTGTCAGCTTCTTTCCTTCGGGGTCGTCTACGACGGCGTCC
TCAAGTTCCCTAAGAAGAACTTCTTCCTCCTCTGGATGGTTGAGTCTCTCAACGGTGACA
GGTCCAGAAGACATGGTACTGGTAGTGATGATAACCACCAATACTGCAATAGCAATAGCA
ATCTGATTG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2AZ10JQ 604 0 0
CCTGCCCTTGGTGTCAGCTTCTTTCCTTCGGGGTCGTTTACGACGGCGTCCTCAAGTTCC
CTAAGAAGAACTTCTTCCTCCTCTGGATGGTTGAGTCTCTCAACGGTGACAGGTCCAGAA
GACATGGTACTGGTAGTGATGATAACCACCAATACTGCAATAGCAATAGCAATCTGATTG
CAAGGCCTGTTGGGAGGAGCCAACCAAGCAGCAGCAGCAGCAGACAGCAGTTCTCGTTCC
ACAAGTCGATTGATTTCTTCATCTCCTTCACCTCCAAGTTTCCTTTTGTGGTTGTTTTCC
TTTTGATCGTCTTCTTTGCTATACCTGGCAGCCTCGTCGTTCTTGCCCTTTACTTCCTCC
TCACCATTCTTCTAGCCGTTCCTTCTGGTTTGGTTCTGTATTTTGCCTACCCTATTCTTG
AAAGGTTGGTTCATGAAATTACTTCATGAGAAACTTTCTTGATTTTGTTATTGATTGCAA
GCTTGGGAATTGTAATTTGTGGTTTTTGAGTTTTTTAAATTACTGTTATATGAGCAACTT
TGGTTTTGCAGATTTGTGACTTAATTGATGATTGATTGATCATGTATGTGTTTAATTAAT
GTCC

QA 1 604 1 604
DS 



CO CL1894Contig2 1168 3 5 U
GGAGACAAAAGCATCACGGCGGAACAGCGAGGGAGAGAGAAAGAGAAAGAGAGAGAGAGG
CTTTTCTTCTTCGTCTCGATCTCAAGACTTCTTCGATGAACCGTCTGCATCTGCATTTGA
AGATTTAAAACGGCCAGGTTGTTGAAATGATGACTGTTCCTCAAAAATTCTCAACTGGGT
AACGAACGTTTGTATCCTCAATTTTTGCGGATCCAATGTGGAGCTTTGCGTCAAACGTGA
TTGGCAGCATAGGTGGTCTAAAGAAAGACCACCCACCTCCTCCTCAACCCTCAGACGTCG
ACGACGACGAGGTTTCTAACGTTAGCAGAGACGACGAAGACGAGGAAGAACAAGGACTAG
ACTGTCCCATTTGCTTCGAATCATTCAACATCGTCGAGAACGTTCCTTACGTCTTATGGT
GCGGCCACACTCTTTGCCAGAACTGCGTCTTCTCCCTCCGCCCTCCTGTCTTCTTCACAC
TCTCCGGTCAAGACATCAGGCTCCCTTTCCTCGTCTCCTGCCCTTGGTGTCAGCTTCTTT
CCTTGAGAGTCGTCTACGACGGCGTCCTCAAGTTCCCTAAGAAGAACTTCTTCCTCCTCT
GGATGGTTGAGTCTCTCAACGGTGACAGGTCCAGAAGACATGATAACCACCAATACTGCA
GCAGCAATAGCAATAGCAATCTGATTGCAAGGCCTGTTGGGAGGAGCCAACCAAGCAGAA
GCAGACAGCAGTTCTCGTTCCACAAGTCGATTGATTTCTTCATCTCCTTCACCTCCAAGT
TTCCTTTTGTGGTCGTTTTCCTTTTGATTGTCTTCTTTGCTATACCTGGCAGCCTCGTCG
TTCTTGCTCTCTACTTCCTCCTCACCATTCTTCTTGCCGTTCCTTCTGGTTTGGTGCTCT
ATTTTGCCTACCCTATTCTTGAAAGGTTGGTTCATGAAATAACTTCATGAGAAACTTTTT
TGATTTTGTTATTGATTGCAAGCTTGGGAATTGTAATTTGTGGTTTTTGAGTTTTTTAAT
TTACTGTTATATGAGCAACTTTGGTTTTGCAGATTTTGTGACTTAATTGATGATTGATTG
ATCATGTGTGTTTAATTAATGTCTCTTAAAACTCTATAAATAAACTCATGAATTAGTTGT
GTCTTCATTTAAAGCAGTTGTTCTCATG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV11TF U 1
AF RR2CD58TF U 1
AF RR2CD58JQ C 357
BS 1 288 RR2BV11TF
BS 289 691 RR2CD58TF
BS 692 692 RR2CD58JQ
BS 693 703 RR2CD58TF
BS 704 1168 RR2CD58JQ

RD RR2BV11TF 288 0 0
GGAGACAAAAGCATCACGGCGGAACAGCGAGGGAGAGAGAAAGAGAAAGAGAGAGAGAGG
CTTTTCTTCTTCGTCTCGATCTCAAGACTTCTTCGATGAACCGTCTGCATCTGCATTTGA
AGATTTAAAACGGCCAGGTTGTTGAAATGATGACTGTTCCTCAAAAATTCTCAACTGGGT
AACGAACGTTTGTATCCTCAATTTTTGCGGATCCAATGTGGAGCTTTGCGTCAAACGTGA
TTGGCAGCATAGGTGGTCTAAAGAAAGACCACCCACCTCCTCCTCAAC

QA 1 288 1 288
DS 

RD RR2CD58TF 703 0 0
GGAGACAAAAGCATCACGGCGGAACAGCGAGGGAGAGAGAAAGAGAAAGAGAGAGAGAGG
CTTTTCTTCTTCGTCTCGATCTCAAGACTTCTTCGATGAACCGTCTGCATCTGCATTTGA
AGATTTAAAACGGCCAGGTTGTTGAAATGATGACTGTTCCTCAAAAATTCTCAACTGGGT
AACGAACGTTTGTATCCTCAATTTTTGCGGATCCAATGTGGAGCTTTGCGTCAAACGTGA
TTGGCAGCATAGGTGGTCTAAAGAAAGACCACCCACCTCCTCCTCAACCCTCAGACGTCG
ACGACGACGAGGTTTCTAACGTTAGCAGAGACGACGAAGACGAGGAAGAACAAGGACTAG
ACTGTCCCATTTGCTTCGAATCATTCAACATCGTCGAGAACGTTCCTTACGTCTTATGGT
GCGGCCACACTCTTTGCCAGAACTGCGTCTTCTCCCTCCGCCCTCCTGTCTTCTTCACAC
TCTCCGGTCAAGACATCAGGCTCCCTTTCCTCGTCTCCTGCCCTTGGTGTCAGCTTCTTT
CCTTGAGAGTCGTCTACGACGGCGTCCTCAAGTTCCCTAAGAAGAACTTCTTCCTCCTCT
GGATGGTTGAGTCTCTCAACGGTGACAGGTCCAGAAGACATGATAACCACCAATACTGCA
GCAGCAATAGCAATAGCAATCTGATTGCAAG*CCTGTTGGGAG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2CD58JQ 812 0 0
CTAGACTGTCCCATTTGCTTCGAATCATTCAACATCGTCGAGAACGTTCCTTACGTCTTA
TGGTGCGGCCACACTCTTTGCCAGAACTGCGTCTTCTCCCTCCGCCCTCCTGTCTTCTTC
ACACTCTCCGGTCAAGACATCAGGCTCCCTTTCCTCGTCTCCTGCCCTTGGTGTCAGCTT
CTTTCCTTGAGAGTCGTCTACGACGGCGTCCTCAAGTTCCCTAAGAAGAACTTCTTCCTC
CTCTGGATGGTTGAGTCTCTCAACGGTGACAGGTCCAGAAGACATGATAACCACCAATAC
TGCAGCAGCAATAGCAATAGCAATCTGATTGCAAGGCCTGTTGGGAGGAGCCAACCAAGC
AGAAGCAGACAGCAGTTCTCGTTCCACAAGTCGATTGATTTCTTCATCTCCTTCACCTCC
AAGTTTCCTTTTGTGGTCGTTTTCCTTTTGATTGTCTTCTTTGCTATACCTGGCAGCCTC
GTCGTTCTTGCTCTCTACTTCCTCCTCACCATTCTTCTTGCCGTTCCTTCTGGTTTGGTG
CTCTATTTTGCCTACCCTATTCTTGAAAGGTTGGTTCATGAAATAACTTCATGAGAAACT
TTTTTGATTTTGTTATTGATTGCAAGCTTGGGAATTGTAATTTGTGGTTTTTGAGTTTTT
TAATTTACTGTTATATGAGCAACTTTGGTTTTGCAGATTTTGTGACTTAATTGATGATTG
ATTGATCATGTGTGTTTAATTAATGTCTCTTAAAACTCTATAAATAAACTCATGAATTAG
TTGTGTCTTCATTTAAAGCAGTTGTTCTCATG

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 3

CO CL1895Contig1 705 3 6 U
GGAGCGCAGTCCTAGCCGCACGAAACCGAGTAAGACCGTTAACAGACGTCAGCATTCTCC
GTTCACAGACGTCAGCATGGGGAGGCTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCATCTGC
TTTGCCATACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGA
GTCCATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTCATTCTTCG
CGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATTTTGAGAATCTT
GAAAGCTCATGGTCTTGCACCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATCAAGAAAGC
AGTTGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGATT
GATTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACTAAGAAGCT
CCCTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACTCTCGTGGCTTAAGGAAATCA
TAAAGCTGGTCAACCATTTCATTTGCATTGCAACTCAAGTTCTATAACAATGGGACTTTT
GTATCTGTTTTTGATAGTTTTAATGCGATTTTGAATTTAGTGAAAACTCTTCTTTATGTG
TCTTTCATTTTGCTTAGTGTTTACTTTCACCGATCTTTCCAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2AG36TF U 1
AF RR2BN76TF U 1
AF RR2BN76JQ C 341
BS 1 558 RR2AG36TF
BS 559 559 RR2BN76TF
BS 560 611 RR2AG36TF
BS 612 612 RR2BN76TF
BS 613 655 RR2AG36TF
BS 656 705 RR2BN76TF

RD RR2AG36TF 662 0 0
GGAGCGCAGTCCTAGCCGCACGAAACCGAGTAAGACCGTTAACAGACGTCAGCATTCTCC
GTTCACAGACGTCAGCATGGGGAGGCTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCATCTGC
TTTGCCATACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGA
GTCCATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTCATTCTTCG
CGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATTTTGAGAATCTT
GAAAGCTCATGGTCTTGCACCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATCAAGAAAGC
AGTTGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGATT
GATTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACTAAGAAGCT
CCCTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACTCTCGTGGCTTAAGGAAATCA
TAAAGCTGGTCAACCATTCCATTTGCATTGCAACTCAAGTTCTATAACAATGGGACTTTT
GTATCTGTTTT*GATAGTTTTAATGCGATTTTGAATTTAGTGAAAACTCTTCTTT
ATGTGTC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2BN76TF 705 0 0
GGAGCGCAGTCCTAGCCGCACGAAACCGAGTAAGACCGTTAACAGACGTCAGCATTCTCC
GTTCACAGACGTCAGCATGGGGAGGCTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCATCTGC
TTTGCCATACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGA
GTCCATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTCATTCTTCG
TGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATTTTGAGAATCTT
GAAAGCTCATGGTCTTGCACCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATCAAGAAAGC
AGTTGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGATT
GATTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACTAAGAAGCT
CCCTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACTCTCGTGGCTTAAGGAAATCA
TAAAGCTGGTCAACCATTTCATTTGCATTGCAACTCAAGTTCTATAACAATGGGACTTTT
GTATCTGTTTTTGATAGTTTTAATGCGATTTTGAATTTAGTGAAAACTCTTCTTTATGTG
TCTTTCATTTTGCTTAGTGTTTACTTTCACCGATCTTTCCAAAAA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2BN76JQ 360 0 0
TACCACCTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGAC
AAGGATTCCAAGTTCAGATTGATTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTAC
TACAAGAAGACTAAGAAGCTCCCTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACT
CTCGTGGCTTAAGGAAATCATAAAGCTGGTCAACCATTTCATTTGCATTGCAACTCAAGT
TTTATAACAATGGGACTTTTGTATCTGTTTTTGATAGTTTTAATGCGATTTTGAATTTAG
TGAAAACTCTTCTTTATGTGTCTTTCATTTTGCTTAGTGTTTACTTTCACCGATCTTTCC

QA 1 360 1 360
DS 



AS 1 5

CO CL1896Contig1 674 5 15 U
TTTTTGCTTACACAACCAAAGAGCGAGAGAGCTAAAAATGACGAGCGTGAGTGGGTGTGG
TTCGGTGAGCCTCTTAACTAACCGCAATGCGTTCTTAGGAAGCGGACTGCAACACCGTGC
CGTTTTTCTGAAACCATGGTCGCCTCCGTCGCTGCTCAAGTCTGGGTCCATACTCGTGGT
TGAAGCCAAAATCAAAACCAGCAGCGAAGACAGAATCGCCCGCCACTCTCGCATCCGTAA
GAAGGTTAACGGTACGACGGAGAGGCCAAGGATGTGCGTGTTTCGCTCAAACAAGCATCT
CTATGTGCAAGTGATTGATGACACCAAGATGCACACTTTAGCTTCAGCTTCCACCAAGCA
GAAACCCATCTCTGAGGAGTTTGACTACACCTCTGGACCTACCATTGAGGTGGCGAAGAA
AGTAGGGGAAGTGATAGCGAAATCATGCTTGGAGAAAGGGATCACAAAGGTGGCATTTGA
CCGTGGTGGTTACCCTTACCATGGTCGCATTGAAGCTCTTGCCGCTGCTGCTCGTGAACA
CGGTCTTCAGTTTTAACTCTTGTTTTTCTTATCTCCTTTTGTTTCTGCGGAACTATCCAT
TGAAATGTTGAAGTTTCCCTTTAAAAAGAGTACTCTATGTTGATAACCAAAAAAATCTTG
AGTGGCGTTCTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI83TF U 27
AF RR2EX48TF U 1
AF RR2DS41TF U 137
AF RR2EI83JQ C 35
AF RR2EX48JQ C 68
BS 1 159 RR2EX48TF
BS 160 160 RR2DS41TF
BS 161 171 RR2EX48TF
BS 172 172 RR2DS41TF
BS 173 191 RR2EX48TF
BS 192 192 RR2DS41TF
BS 193 255 RR2EX48TF
BS 256 256 RR2DS41TF
BS 257 501 RR2EX48TF
BS 502 502 RR2DS41TF
BS 503 617 RR2EX48TF
BS 618 628 RR2EI83JQ
BS 629 629 RR2EX48JQ
BS 630 667 RR2EI83JQ
BS 668 674 RR2EX48JQ

RD RR2EI83TF 562 0 0
GGAGAGCT
AAAATGACGAGCGTGAGTGGGTGTGGTTCGGTGAGCCTCTTAACTAACCGCAATGCGTTC
TTAGGAAGCGGACTGCAACACCGTGCCGTTTTTCTGAAACCATGGTCGCCTCCGTCGCTG
CTCAAGTCTGGGTCCATACTCGTGGTTGAAGCCAAAATCAAAACCAGCAGCGAAGACAGA
ATCGCCCGCCACTCTCGCATCCGTAAGAAGGTTAACGGTACGACGGATAGGCCAAGGATG
TGCGTGTTTCGCTCAAACAAGCATCTCTATGTGCAAGTGATATTTGACACCAAGATGCAC
ACTTTAGCTTCAGCTTCCACCAAGCAGAAACCCATCTCTGAGGAGTTTGACTACACCTCT
GGACCTACCATTGAGGTGGCGAAGAAAGTAGGGGAAGTGATAGCGAAATCATGCTTGGAG
AAAGGGATCACAAAGGTGGCATTTGACCGTGGTGGGTACCCTTACCATGGTCGCATTGAA
GCTCTTGCCGCTGCTGCTCGTGAACACGGTCTTCAGTTTTAACTCTTGTTTTTCTTGTCT
CCTTTTGTTTCTGC

QA 9 562 9 562
DS 

RD RR2EX48TF 617 0 0
TTTTTGCTTACACAACCAAAGAGCGAGAGAGCTAAAAATGACGAGCGTGAGTGGGTGTGG
TTCGGTGAGCCTCTTAACTAACCGCAATGCGTTCTTAGGAAGCGGACTGCAACACCGTGC
CGTTTTTCTGAAACCATGGTCGCCTCCGTCGCTGCTCAAATCTGGGTCCATGCTCGTGGT
TGAAGCCAAAACCAAAACCAGCAGCGAAGACAGAATCGCCCGCCACTCTCGCATCCGTAA
GAAGGTTAACGGTACAACGGAGAGGCCAAGGATGTGCGTGTTTCGCTCAAACAAGCATCT
CTATGTGCAAGTGATTGATGACACCAAGATGCACACTTTAGCTTCAGCTTCCACCAAGCA
GAAACCCATCTCTGAGGAGTTTGACTACACCTCTGGACCTACCATTGAGGTGGCGAAGAA
AGTAGGGGAAGTGATAGCGAAATCATGCTTGGAGAAAGGGATCACAAAGGTGGCATTTGA
CCGTGGTGGTTACCCTTACCACGGTCGCATTGAAGCTCTTGCCGCTGCTGCTCGTGAACA
CGGTCTTCAGTTTTAACTCTTGTTTTTCTTATCTCCTTTTGTTTCTGCGGAACTATCCAT
TGAAATGTTGAAGTTTC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2DS41TF 468 0 0
G
GGTCGCCTCCGTCGCTGCTCAAGTCTGGGTCCATACTCGTGGTTGAAGCCAAAATCAAAA
CCAGCAGCGAAGACAGAATCGCCCGCCACTCTCGCATCCGTAAGAAGGTTAACGGTACGA
CGGAGAGGCCAAGGATGTGCGTGTTTCGCTCAAACAAGCATCTCTATGTGCAAGTGATTG
ATGACACCAAGATGCACACTTTAGCTCCAGCTTCCACCAAGCAGAAACCCATCTCTGAGG
AGTTTGACTACACCTCTGGACCTACCATTGAGGTGGCGAAGAAAGTAGGGGAAGTGATAG
CGAAATCATGCTTGGAGAAAGGGATCACAAAGGTGGCATTTGACCGTGGTGGTTACCCTT
ACCATGGTCGCATTGAAGCTCTTGCCGCTGCTGCTCGTGAACACGGTCTTCAGTTTTAAC
TCTTGTTTTTCTTATCTCCTTTTGTTTCTGCGGAACTATCCATTGAA

QA 2 468 2 468
DS 

RD RR2EI83JQ 633 0 0
AAAATGACGAGCGTGAGTGGGTGTGGTTCGGTGAGCCTCTTAACTAACCGCAATGCGTTC
TTAGGAAGCGGACTGCAACACCGTGCCGTTTTTTTGAAACCATGGTCGCCTCCGTCGCTG
CTCAAGTCTGGGTCCATACTCGTGGTTGAAGCCAAAATCAAAACCAGCAGCGAAGACAGA
ATCGCCCGCCACTCTCGCATCCGTAAGAAGGTTAACGGTACGACGGATAGGCCAAGGATG
TGCGTGTTTCGCTCAAACAAGCATCTCTATGTGCAAGTGATATTTGACACCAAGATGCAC
ACTTTAGCTTCAGCTTCCACCAAGCAGAAACCCATTTTTGAGGAGTTTGACTACACCTCT
GGACCTACCATTGAGGTGGCGAAGAAAGTAGGGGAAGTGATAGCGAAATCATGCTTGGAG
AAAGGGATCACAAAGGTGGCATTTGACCGTGGTGGGTACCCTTACCATGGTCGCATTGAA
GCTCTTGCCGCTGCTGCTCGTGAACACGGTCTTCAGTTTTAACTCTTGTTTTTCTTGTCT
CCTTTTGTTTCTGCGGAACTATCCATTGAAATGTTGAAGTTTCCCTTTAAAAAGGGTACT
CTATGTTGATAACCAAAAAAATCTTGAGTGGCG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2EX48JQ 607 0 0
AGCCTCTTAACTAACCGCAATGCGTTCTTAGGAAGCGGACTGCAACACCGTGCCGTTTTT
CTGAAACCATGGTCGCCTCCGTCGCTGCTCAAATCTGGGTCCATGCTCGTGGTTGAAGCC
AAAACCAAAACCAGCAGCGAAGACAGAATCGCCCGCCACTCTCGCATCCGTAAGAAGGTT
AACGGTACAACGGAGAGGCCAAGGATGTGCGTGTTTCGCTCAAACAAGCATCTCTATGTG
CAAGTGATTGATGACACCAAGATGCACACTTTAGCTTCAGCTTCCACCAAGCAGAAACCC
ATCTTTGAGGAGTTTGACTACACCTCTGGACCTACCATTGAGGTGGCGAAGAAAGTAGGG
GAAGTGATAGCGAAATCATGCTTGGAGAAAGGGATCACAAAGGTGGCATTTGACCGTGGT
GGTTACCCTTACCACGGTCGCATTGAAGCTCTTGCCGCTGCTGCTCGTGAACACGGTCTT
CAGTTTTAACTCTTGTTTTTCTTATCTCCTTTTGTTTCTGCGGAACTATCCATTGAAATG
TTGAAGTTTCCCTTTAAAAAGAGTACTCTATGTTGATAACCAAAAAAATCTTGGGTGGCG
TTCTCCG

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 3

CO CL1897Contig1 1017 3 13 U
GGGTAGTTAAAAGGTTCCTCCTCCTCTCACACGCTCTGGCTTCTCCCTTCTGGTCGGATT
AGATATTTAGGGCTTTGAAGCTAACTAAAACCGAGCAAAAAAGATGGAGATAGCGGAGCG
TAGGGAGGAGGAGATCAGAGAATCAGGAAACATGGAGAACATAAAGTCCGACTCTTTTTC
CGATGAACGCTACTCTCGCGACCTCAAAGCTGGTCTTCATCCTCTTCGGTATAAGTTTGC
GATTTGGTACACACGTCGCACACCAGGGGTGAGAAGCCAGACATCTTATGAGGATAACAT
TAAGAAGATTGTTGATTTCAGCACGGTGGAAGGGTTTTGGGCATGCTACTGTCACCTAGC
TCGTTCTTCTCTCTTGCCTAGTCCTACTGATCTTCATTTCTTCAAGGATGGCATTCGCCC
CTTGTGGGAGGATTCTGCTAACTGCAATGGAGGAAAGTGGATCATACGTTTCTCCAAAGT
TGTATCCGCTCGCTTCTGGGAGGATCTGCTTCTTGCCTTGGTAGGGGACCAGCTTGATGA
TGCTGACAATATCTGTGGGGCAGTACTGAGCGTCCGCTTCAACGAGGACATTATTAGTGT
ATGGAATCGCAATGCTTCTGATCATCAGGCAGTGATGGGTTTGAGAGACTCAATCAAGCG
GCATTTGAAGCTGCCTCATGCTTATGTTATGGAATACAAACCCCACGATGCTTCTCTCCG
CGACAACTCCTCCTACAGGAACACATGGATGAGAGGATAGAAGTAGACCATTGTGTAACG
TGATGTGGCGAGAGATTTGGGTAGCTCTCTTGCAACCTTGGAAGAAGATGTATGGACTGA
AACCCTGTTTCCTGTAGCACACTTTATCAACATTATATTTTTCCAATCACACTTTCAGAT
ACTTGTGGTTGGAGACACACATTGTTTATGTGCATTGTCTTTAGTACCCTCACTTTACTA
CATTTTTTTTTAGTTCTAGTTCTCTTTCAACAAGTGCAATCTGTCAAATTTATAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ02TF U 1
AF RR2G319TF U 259
AF RR2BN29JQ C 398
BS 1 402 RR2GQ02TF
BS 403 403 RR2G319TF
BS 404 516 RR2GQ02TF
BS 517 517 RR2G319TF
BS 518 570 RR2GQ02TF
BS 571 571 RR2G319TF
BS 572 591 RR2GQ02TF
BS 592 592 RR2G319TF
BS 593 594 RR2GQ02TF
BS 595 595 RR2G319TF
BS 596 625 RR2GQ02TF
BS 626 946 RR2G319TF
BS 947 1017 RR2BN29JQ

RD RR2GQ02TF 625 0 0
GGGTAGTTAAAAGGTTCCTCCTCCTCTCACACGCTCTGGCTTCTCCCTTCTGGTCGGATT
AGATATTTAGGGCTTTGAAGCTAACTAAAACCGAGCAAAAAAGATGGAGATAGCGGAGCG
TAGGGAGGAGGAGATCAGAGAATCAGGAAACATGGAGAACATAAAGTCCGACTCTTTTTC
CGATGAACGCTACTCTCGCGACCTCAAAGCTGGTCTTCATCCTCTTCGGTATAAGTTTGC
GATTTGGTACACACGTCGCACACCAGGGGTGAGAAGCCAGACATCTTATGAGGATAACAT
TAAGAAGATTGTTGATTTCAGCACGGTGGAAGGGTTTTGGGCATGCTACTGTCACCTAGC
TCGTTCTTCTCTCTTGCCTAGTCCTACTGATCTTCATTTCTTTAAGGATGGCATTCGCCC
CTTGTGGGAGGATTCTGCTAACTGCAATGGAGGAAAGTGGATCATACGTTTCTCCAAAGT
TGTATCCGCTCGCTTCTGGGAGGATCTGCTTCTTGCGTTGGTAGGGGACCAGCTTGATGA
TGCTGACAATATCTGTGGGGCAGTACTGAGTGTCCGCTTCAACGAGGACATCATCAGTGT
ATGGAATCGCAATGCTTCTGATCAT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2G319TF 688 0 0
G
ACACCAGGGGTGAGAAGCCAGACATCTTATGAGGATAACATTAAGAAGATTGTTGATTTC
AGCACGGTGGAAGGGTTTTGGGCATGCTACTGTCACCTAGCTCGTTCTTCTCTCTTGCCT
AGTCCTACTGATCTTCATTTCTTCAAGGATGGCATTCGCCCCTTGTGGGAGGATTCTGCT
AACTGCAATGGAGGAAAGTGGATCATACGTTTCTCCAAAGTTGTATCCGCTCGCTTCTGG
GAGGATCTGCTTCTTGCCTTGGTAGGGGACCAGCTTGATGATGCTGACAATATCTGTGGG
GCAGTACTGAGCGTCCGCTTCAACGAGGACATTATTAGTGTATGGAATCGCAATGCTTCT
GATCATCAGGCAGTGATGGGTTTGAGAGACTCAATCAAGCGGCATTTGAAGCTGCCTCAT
GCTTATGTTATGGAATACAAACCCCACGATGCTTCTCTCCGCGACAACTCCTCCTACAGG
AACACATGGATGAGAGGATAGAAGTAGACCATTGTGTAACGTGATGTGGCGAGAGATTTG
GGTAGCTCTCTTGCAACCTTGGAAGAAGATGTATGGACTGAAACCCTGTTTCCTGTAGCA
CACTTTATCAACATTATATTTTTCCAATCACACTTTCAGATACTTGTGGTTGGAGACACA
CATTGTTTATGTGCATTGTCTTTAGTA

QA 2 688 2 688
DS 

RD RR2BN29JQ 620 0 0
TTCTTCAAGGATGGCATTCGCCCCTTGTGGGAGGATTCTGCTAACTGCAATGGAGGAAAG
TGGATCATACGTTTCTCCAAAGTTGTATCCGCTCGCTTCTGGGAGGATCTGCTTCTTGCC
TTGGTAGGGGACCAGCTTGATGATGCTGACAATATCTGTGGGGCAGTACTGAGCGTCCGC
TTCAACGAGGACATTATTAGTGTATGGAATCGCAATGCTTCTGATCATCAGGCAGTGATG
GGTTTGAGAGACTCAATCAAGCGGCATTTGAAGCTGCCTCATGCTTATGTTATGGAATAC
AAACCCCACGATGCTTCTCTCCGCGACAACTCCTCCTACAGGAACACATGGATGAGAGGA
TAGAAGTAGACCATTGTGTAACGTGATGTGGCGAGAGATTTGGGTAGCTCTCTTGCAACC
TTGGAAGAAGATGTATGGACTGAAACCCTGTTTCCTGTAGCACACTTTATCAACATTATA
TTTTTCCAATTACACTTTCAGATACTTGTGGTTGGAGACACACATTGTTTATGTGCATTG
TCTTTAGTACCCTCACTTTACTACATTTTTTTTTAGTTCTAGTTCTCTTTCAACAAGTGC
AATCTGTCAAATTTATAAAA

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 4

CO CL1898Contig1 695 4 2 U
AAAAAGAAAAAAGTTTTGATACACCTCAGAATCATGAAAACTTGGAAATTTGGTACATCA
TCACCAGTGTTATCTTTGAAATACGGAATACAACATAAGAAACACATATGCATACGAATA
TTAAGACATCATAGAGACAGTTTTTGCCAGGGAAGAAGAAGCTCAACAAGAATGACAGGA
GGACTTGGCGATATATAAGAAGATAGAGAGTGACACAGTTGTCCTCATTTATTAGTTGCT
ACTACCACCACCAAAGAGGTAATTCAGAGACGAGCCACCTCCTGGAGCTGAGTGAACCTT
TGTAGAAGGCCGGTCCGTGAGGAAGTTGCCAGAGTTCTGCCCATCAGCGCGCATGTGATT
GTTAGCAGAGTTGCTATTGAGACCAGCTGGGCCTTGTTTGGTAATATCAACAGGTTTTGG
AGCAGCGTTTTTAGAAGGAGGAGGAGCTGGCTGAGTTTCAGTTGGGGCCTTGTTAACAGC
TGCCTTTGGAGCCTCTCCGCTCCCAAAAAGATATCCCAAAGAACTCTGTCCTCCACCTGC
ACTAACTCCACGTCCCATTCTATTTCTCTTACTTCCTTCAAAGGTACTTTAACTCTGCCA
CGACTCTGATAAGAACAGATCCAAGGATTGTTCTCTGGATCGACAAGGTTGATGATCGGA
GAGAGAATAAGAGTTACTGAGAGAAAGCAAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DY72JQ U 1
AF RR2BA48JQ U 51
AF RR2DY72TF C 54
AF RR2BA48TF C 51
BS 1 509 RR2DY72JQ
BS 510 695 RR2BA48JQ

RD RR2DY72JQ 509 0 0
AAAAAGAAAAAAGTTTTGATACACCTCAGAATCATGAAAACTTGGAAATTTGGTACATCA
TCACCAGTGTTATCTTTGAAATACGGAATACAACATAAGAAACACATATGCATACGAATA
TTAAGACATCATAGAGACAGTTTTTGCCAGGGAAGAAGAAGCTCAACAAGAATGACAGGA
GGACTTGGCGATATATAAGAAGATAGAGAGTGACACAGTTGTCCTCATTTATTAGTTGCT
ACTACCACCACCAAAGAGGTAATTCAGAGACGAGCCACCTCCTGGAGCTGAGTGAACCTT
TGTAGAAGGCCGGTCCGTGAGGAAGTTGCCAGAGTTCTGCCCATCAGCGCGCATGTGATT
GTTAGCAGAGTTGCTATTGAGACCAGCTGGGCCTTGTTTGGTAATATCAACAGGTTTTGG
AGCAGCGTTTTTAGAAGGAGGAGGAGCTGGCTGAGTTTCAGTTGGGGCCTTGTTAACAGC
TGCCTTTGGAGCCTCTCCGCTCCCAAAAA

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2BA48JQ 645 0 0
TGG
TACATCATCACCAGTGTTATCTTTGAAATACGGAATACAACATAAGAAACACATATGCAT
ACGAATATTAAGACATCATAGAGACAGTTTTTGCCAGGGAAGAAGAAGCTCAACAAGAAT
GACAGGAGGACTTGGTGATATATAAGAAGATAGAGAGTGACACAGTTGTCCTCATTTATT
AGTTGCTACTACCACCACCAAAGAGGTAATTCAGAGACGAGCCACCTCCTGGAGCTGAGT
GAACCTTTGTAGAAGGCCGGTCCGTGAGGAAGTTGCCAGAGTTCTGCCCATCAGCGCGCA
TGTGATTGTTAGCAGAGTTGCTATTGAGACCAGCTGGGCCTTGTTTGGTAATATCAACAG
GTTTTGGAGCAGCGTTTTTAGAAGGAGGAGGAGCTGGCTGAGTTTCAGTTGGGGCCTTGT
TAACAGCTGCCTTTGGAGCCTCTCCGCTCCCAAAAAGATATCCCAAAGAACTCTGTCCTC
CACCTGCACTAACTCCACGTCCCATTCTATTTCTCTTACTTCCTTCAAAGGTACTTTAAC
TCTGCCACGACTCTGATAAGAACAGATCCAAGGATTGTTCTCTGGATCGACAAGGTTGAT
GATCGGAGAGAGAATAAGAGTTACTGAGAGAAAGCAAGATCC

QA 4 645 4 645
DS 

RD RR2DY72TF 624 0 0
TACATCATCACCAGTGTTATCTTTGAAATACGGAATACAACATAAGAAACACATATGCAT
ACGAATATTAAGACATCATAGAGACAGTTTTTGCCAGGGAAGAAGAAGCTCAACAAGAAT
GACAGGAGGACTTGGCGATATATAAGAAGATAGAGAGTGACACAGTTGTCCTCATTTATT
AGTTGCTACTACCACCACCAAAGAGGTAATTCAGAGACGAGCCACCTCCTGGAGCTGAGT
GAACCTTTGTAGAAGGCCGGTCCGTGAGGAAGTTGCCAGAGTTCTGCCCATCAGCGCGCA
TGTGATTGTTAGCAGAGTTGCTATTGAGACCAGCTGCGCCTTGTTTGGTAATATCAACAG
GTTTTGGAGCAGCGTTTTTAGAAGGAGGAGGAGCTGGCTGAGTTTCAGTTGGGGCCTTGT
TAACAGCTGCCTTTGGAGCCTCTCCGCTCCCAAAAAGATATCCCAAAGAACTCTGTCCTC
CACCTGCACTAACTCCACGTCCCATTCTATTTCTCTTACTTCCTTCAAAGGTACTTTAAC
TCTGCCACGACTCTGATAAGAACAGATCCAAGGATTGTTCTCTGGATCGACAAGGTTGAT
GATCGGAGAGAGAATAAGAGTT
CC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2BA48TF 645 0 0
TGG
TACATCATCACCAGTGTTATCTTTGAAATACGGAATACAACATAAGAAACACATATGCAT
ACGAATATTAAGACATCATAGAGACAGTTTTTGCCAGGGAAGAAGAAGCTCAACAAGAAT
GACAGGAGGACTTGGTGATATATAAGAAGATAGAGAGTGACACAGTTGTCCTCATTTATT
AGTTGCTACTACCACCACCAAAGAGGTAATTCAGAGACGAGCCACCTCCTGGAGCTGAGT
GAACCTTTGTAGAAGGCCGGTCCGTGAGGAAGTTGCCAGAGTTCTGCCCATCAGCGCGCA
TGTGATTGTTAGCAGAGTTGCTATTGAGACCAGCTGGGCCTTGTTTGGTAATATCAACAG
GTTTTGGAGCAGCGTTTTTAGAAGGAGGAGGAGCTGGCTGAGTTTCAGTTGGGGCCTTGT
TAACAGCTGCCTTTGGAGCCTCTCCGCTCCCAAAAAGATATCCCAAAGAACTCTGTCCTC
CACCTGCACTAACTCCACGTCCCATTCTATTTCTCTTACTTCCTTCAAAGGTACTTTAAC
TCTGCCACGACTCTGATAAGAACAGATCCAAGGATTGTTCTCTGGATCGACAAGGTTGAT
GATCGGAGAGAGAATAAGAGTTACTGAGAGAAAGCAAGATCC

QA 4 645 4 645
DS 



AS 1 4

CO CL1899Contig1 819 4 7 U
AAAATCTCGGATTATTTCGAAAACTTTGTTTATAACAACAAAACTCGAATAATATTATCT
GGAATATTTTATGTCATCTCTAAACAAAAGTCGTTTAATTGTCTAAAAAACGAAAACATG
GTTTCTTCAATAATATATAATCATCATTTCTTCTTCTTTGGTTCTTCTTTTGCATAGTCC
TTGACTAATGCTTCCACGTCTTTCCAGAACAAACCCTCAACAAGAACTCCCTCTTTCGTG
AACCATTGGGTGACACTTTTGGTAAACTGGACTGAGTTCCCAGCTGAGATTGATTTTGGA
TCAGCACTGTCGATGGTGAGAGTGTATTCATCAGAGAACCTCGGCAGCTTTGAAGATACA
ACCAAGCCAGTGCTGGTGAATGAACCCTCAAGAGGATAGGTGAACAATATAGCATTCTTC
TCCTTGGTGTACATAATCAGCTGCATCACCCCATTCAGCACTACATACAATGCAATGCAT
CCAATCAGAAAGTCCCTGTTCTCGGGGAACTTCTTGTTGTAGAACTGCGCAACGAGAGCA
ACGGCGATGATCACCGTCCCTAAGATCAGCTTCATGTTGCTAAGCCTCACGTCCTCCTTG
TACCCACGGCTCGTAACGATATCGGAGACGGACTCGTCGAGCATGTGCTTGATGGAGTTG
TGGTCCAGCAGATTGACCTTCTTAACATTCTTGTTCGTCGATTCTGCCTTCTTCTCTTCT
TCCATGGCGGATCAGATCAGATCTCTAGGTCTCTAGGACTCTTCTGGAAATTCAAGTGGT
CTCGAGAACGCAGAGTGTGGTCTGATTTCTCGAGCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H229JQ U 1
AF RR2H260JQ U 57
AF RR2H260TF C 55
AF RR2C521TF C 111
BS 1 287 RR2H229JQ
BS 288 288 RR2H260JQ
BS 289 335 RR2H229JQ
BS 336 336 RR2H260JQ
BS 337 696 RR2H229JQ
BS 697 802 RR2H260TF
BS 803 819 RR2C521TF

RD RR2H229JQ 696 0 0
AAAATCTCGGATTATTTCGAAAACTTTGTTTATAACAACAAAACTCGAATAATATTATCT
GGAATATTTTATGTCATCTCTAAACAAAAGTCGTTTAATTGTCTAAAAAACGAAAACATG
GTTTCTTCAATAATATATAATCATCATTTCTTCTTCTTTGGTTCTTCTTTTGCATAGTCC
TTGACTAATGCTTCCACGTCTTTCCAGAACAAACCCTCAACAAGAACTCCCTCTTTCGTG
AACCATTGGGTGACACTTTTGGTAAACTGGACTGAGTTCCCAGCTGAAATTGATTTTGGA
TCAGCACTGTCGATGGTGAGAGTGTATTCATCAGAAAACCTCGGCAGCTTTGAAGATACA
ACCAAGCCAGTGCTGGTGAATGAACCCTCAAGAGGATAGGTGAACAATATAGCATTCTTC
TCCTTGGTGTACATAATCAGCTGCATCACCCCATTCAGCACTACATACAATGCAATGCAT
CCAATCAGAAAGTCCCTGTTCTCGGGGAACTTCTTGTTGTAGAACTGCGCAACGAGAGCA
ACGGCGATGATCACCGTCCCTAAGATCAGCTTCATGTTGCTAAGCCTCACGTCCTCCTTG
TACCCACGGCTCGTAACGATATCGGAGACGGACTCGTCGAGCATGTGCTTGATGGAGTTG
TGGTCCAGCAGATTGACCTTCTTAACATTCTTGTTC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2H260JQ 643 0 0
ATCTGGAATATTTTATGTCATCTCTAAACAAAAGTCGTTTAATTGTCTAAAAAACGAAAA
CATGGTTTCTTCAATAATATATAATCATCATTTCTTCTTCTTTGGTTCTTCTTTTGCATA
GTCCTTGACTAGTGCTTCCACGTCTTTCCAGAACAAACCCTCAACAAGAACTCCCTCTTT
CGTGAACCATTGGGTGACACTTTTGGTAAACTGGACTGAGTTCCCAGCTGAGATTGATTT
TGGATCAGCACTGTCGATGGTGAGAGTGTATTCATCAGAGAACCTCGGCAGCTTTGAAGA
TACAACCAAGCCAGTGCTGGTGAATGAACCCTCAAGAGGATAGGTGAACAATATAGCATT
CTTCTCCTTGGTGTACATAATCAGCTGCATCACCCCATTCAGCACTACATACAATGCAAT
GCATCCAATCAGAAAGTCCCTGTTCTCGGGGAACTTCTTGTTGTAGAACTGCGCAACGAG
AGCAACGGCGATGATCACCGTCCCTAAGATCAGCTTCATGTTGCTAAGCCTCACGTCCTC
CTTGTACCCACGGCTCGTAACGATATCGGAGACGGACTCGTCGAGCATGTGCTTGATGGA
GTTGTGGTCCAGCAGATTGACCTTCTTAACATTCTTGTTC
GTC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2H260TF 750 0 0
TT
ATCTGGAATATTTTATGTCATCTCTAAACAAAAGTCGTTTAATTGTCTAAAAA*CGAAAA
CATGGTTTCTTCAATAATATATAATCATCATTTCT*CTTCTTTGGTTCTTCTTTTGCATA
GTCCTTGACTAGTGCTTCCACGTCTTTCCAGAACAAACCCTCAACAAGAACTCCCTCTTT
CGTGAACCATTGGGTGACACTTTTGGTAAACTGGACTGAGTTCCCAGCTGAGATTGATTT
TGGATCAGCACTGTCGATGGTGAGAGTGTATTCATCAGAGAACCTCGGCAGCTTTGAAGA
TACAACCAAGCCAGTGCTGGTGAATGAACCCTCAAGAGGATAGGTGAACAATATAGCATT
CTTCTCCTTGGTGTACATAATCAGCTGCATCACCCCATTCAGCACTACATACAATGCAAT
GCATCCAATCAGAAAGTCCCTGTTCTCGGGGAACTTCTTGTTGTAGAACTGCGCAACGAG
AGCAACGGCGATGATCACCGTCCCTAAGATCAGCTTCATGTTGCTAAGCCTCACGTCCTC
CTTGTACCCACGGCTCGTAACGATATCGGAGACGGACTCGTCGAGCATGTGCTTGATGGA
GTTGTGGTCCAGCAGATTGACCTTCTTAACATTCTTGTTCGTCGATTCTGCCTTCTTCTC
TTCTTCCATGGCGGATCAGATCAGATCTCTAGGTCTCTAGGACTCTTCTGGAAATTCAAG
TGGTCTCGAGAACGCAGAGTGTGGTC
CC

QA 3 748 3 748
DS 

RD RR2C521TF 709 0 0
CGAAAACATGGTTTCTTCAATAATATATAATCATCATTTCTTCTTCTTTGGTTCTTCTTT
TGCATAGTCCTTGACTAATGCTTCCACGTCTTTCCAGAACAAACCCTCAACAAGAACTCC
CTCTTTCGTGAACCATTGGGTGACACTTTTGGTAAACTGGACTGAGTTCCCAGCTGAGAT
TGATTTTGGATCAGCACTGTCGATGGTGAGAGTGTATTCATCAGAGAACCTCGGCAGCTT
TGAAGATACAACCAAGCCAGTGCTGGTGAATGAACCCTCAAGAGGATAGGTGAACAATAT
AGCATTCTTCTCCTTGGTGTACATAATCAGCTGCATCACCCCATTCAGCACTACATACAA
TGCAATGCATCCAATCAGAAAGTCCCTGTTCTCGGGGAACTTCTTGTTGTAGAACTGTGC
AACGAGAGCAACCGCGATGATCACCGTCCCTAAGATCAGCTTCATGTTGCTCAGCCTCAC
GTCCTCCTTGTACCCACGGCTCGTAACGATATCGGAGACGGACTCGTCGAGCATGTGCTT
GATGGAGTTGTGGTCCAGCAGATTGACCTTCTTAACATTCTTGTTTGTCGATTCTGCCTT
CTTCTCTTCTTCCATGGCGGATCAGATCAGATCTCTAGGTCTCT********TCTGGAAA
TTCAAGTGGTCTCGAGAACGCAGAGTGTGGTCTGATTTCTCGAGCGTCC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 4

CO CL1900Contig1 1029 4 4 U
GGCCGCACTTGAAGGTTGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGGAAGAGAATCAATCAAGTGA
TGGGAGATGTCAAAGTAGACGAAGATGCGATTCTAAAATCCTTCCTCGCGGAGGTCGGTG
AGGTTGAGAGGGACAACGAAGTCGTCAGGATTCTCTCATGTTTCAAGCTGAACCCGTTTG
AGCATCTTAACTTATCTTTCGATTCTTCCACGGATGAAGTTAAAAGACAGTACAGAAAGA
TATCTTTGATGGTTCATCCTGACAAATGCAAGCATCCTCAAGCACAGGAGGCTTTTGGAG
CATTGGCAAAGGCGCAACAGCTGCTACTGGACGACCAAGAAAGAGATTATATTCTCACTC
AAGTCCAAGCTGCCAAACAAGAGCTTAAGATGAAGAGAAAGAAACAGTTGAAGAAAGATA
CCGCCTCTAAAATAAAGTCCTTGGTTGATGAGGGTAAGCATGAGCAACTATATGAACAAT
CTGAAGAGTTTCAGAAGGAGCTTAAGTTAAAGGTCCGAGAGACATTAACAGACCAAGAGT
GGCGTAGGCGAAAAATGGCTATGAGGATATCAGAAGAAGAGGGAAGACTGAAGAAGGATT
AAGAAGAACAAAAGGAGATACGGAAGAAAAAGCGTGAGCATGAAGAACAGTGGGAAGGAA
CGAGAGAAAACAGGGTGTCAAGCTGGAGAGACTTCATGAAAGCAGGAAAGAAGGCCAAAA
AGGGAGAGACACGTCCTCCAAAACTGAAGACTGAGGACCCAAACAAATCATACGTTCAAA
GGCCGGTCAAGAAAGGCTGATCCCTGTCTCCGTTTGCTGTTGTTGCCATTGATAGATTGG
TCTTCTCGAGTCTGTGTTTCTGCTCATGTCTGTGTTTCTATTTGTACATCACCAACTTCT
TTGTCTTTCCAAATACATCAGAAACATGGAAGAGATATATAGATTTATCTCACTTCTCAA
ACGCTTATGACCTTTTACCCTTATGTATGGTGTTAGACTTTATATAATACACTTTAAGTC
TTTTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT64TF U 1
AF RR2GY42TF U 20
AF RR2EQ34TF U 24
AF RR2AT64JQ C 263
BS 1 262 RR2AT64TF
BS 263 263 RR2GY42TF
BS 264 709 RR2AT64TF
BS 710 1029 RR2AT64JQ

RD RR2AT64TF 709 0 0
GGCCGCACTTGAAGGTTGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGGAAGAGAATCAATCAAGTGA
TGGGAGATGTCAAAGTAGACGAAGATGCGATTCTAAAATCCTTCCTCGCGGAGGTCGGTG
AGGTTGAGAGGGACAACGAAGTCGTCAGGATTCTCTCATGTTTCAAGCTGAACCCGTTTG
AGCATCTTAACTTATCTTTCGATTCTTCCACGGATGAAGTTAAAAGACAGTACAGAAAGA
TATCTTTGATGGTTCATCCTGA*AAATGCAAGCATCCTCAAGCACAGGAGGCTTTTGGAG
CATTGGCAAAGGCGCAACAGCTGCTACTGGACGACCAAGAAAGAGATTATATTCTCACTC
AAGTCCAAGCTGCCAAACAAGAGCTTAAGATGAAGAGAAAGAAACAGTTGAAGAAAGATA
CCGCCTCTAAAATAAAGTCCTTGGTTGATGAGGGTAAGCATGAGCAACTATATGAACAAT
CTGAAGAGTTTCAGAAGGAGCTTAAGTTAAAGGTCCGAGAGACATTAACAGACCAAGAGT
GGCGTAGGCGAAAAATGGCTATGAGGATATCAGAAGAAGAGGGAAGACTGAAGAAGGATT
AAGAAGAACAAAAGGAGATACGGAAGAAAAAGCGTGAGCATGAAGAACAGTGGGAAGGAA
CGAGAGAAAACAGGGTGTCAAGCTGGAGAGACTTCATGAAAGCAGGAAA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2GY42TF 682 0 0
GGGAGA
GAGACAGAGAGAGAGGAAGAGAATCAATCAAGTGATGGGAGATGTCAAAGTAGACGAAGA
TGCGATTCTAAAATCCTTCCTCGCGGAGGTCGGTGAGGTTGAGAGGGACAACGAAGTCGT
CAGGATTCTCTCATGCTTCAAGTTGAACCCGTTTGAGCATCTCAACTTGTCTTTCGATTC
TTCCACGGATGACGTTAAAAGACAGTACAGAAAGATATCTTTGATGGTTCACCCTGACAA
ATGCAAGCATCCTCAAGCACAGGAGGCTTTTGGAGCATTGGCAAAGGCGCAACAGCTGCT
GCTGGACGACCAAGAAAGAGATTATATTCTCACTCAAGTCCAAGCTGCCAAACAAGAGCT
TAAGATGAAGAGAAAGAAACAGTTGAAGAAAGATACCGCCTCCAAAATAAAGTCCTTGGT
TGATGAGGGAAAGCATGAGCAACTATATGAACAATCTGAAGAGTTTCAGAAGGAGCTTAA
GTTAAAGGTCCGAGAGATATTAACAGACCAAGAGTGGCGTAGGCGAAAAATGGCTATGAG
GATATCAGAAGAAGAGGGGAGACTGAAGAAGGATGAAGAAGAACAAAAGGAGATACGGAA
GAAAA*GCGTGAGCATGAAGA*CAGTGGGAAGGAACGAGAGAAAACAGGGTGTCAAGCTG
GAGAGACTTCATGAAA

QA 7 682 7 682
DS 

RD RR2EQ34TF 686 0 0
GG
GAGACAGAGAGAGAGGAAGAGAATCAATCAAGTGATGGGAGATGTCAAAGTAGACGAAGA
TGCGATTCTAAAATCCTTCCTCGCGGAGGTCGGTGAGGTTGAGAGGGACAACGAAGTCGT
CAGGATTCTCTCATGTTTCAAGCTGAACCCGTTTGAGCATCTTAACTTATCTTTCGATTC
TTCCACGGATGAAGTTAAAAGACAGTACAGAAAGATATCTTTGATGGTTCATCCTGACAA
ATGCAAGCATCCTCAAGCACAGGAGGCTTTTGGAGCATTGGCAAAGGCGCAACAGCTGCT
ACTGGACGACCAAGAAAGAGATTATATTCTCACTCAAGTCCAAGCTGCCAAACAAGAGCT
TAAGATGAAGAGAAAGAAACAGTTGAAGAAAGATACCGCCTCTAAAATAAAGTCCTTGGT
TGATGAGGGTAAGCATGAGCAACTATATGAACAATCTGAAGAGTTTCAGAAGGAGCTTAA
GTTAAAGGTCCGAGAGATATTAACAGACCAAGAGTGGCGTAGGCGAAAAATGGCTATGAG
GATATCAGAAGAAGAGGGAAGACTGAAGAAGGATGAAGAAGAACAAAAGGAGATACGGAA
GAAAAAGCGTGAGCATGAAGAACAGTGGGAAGGAACGAGAGAAAACAGGGTGTCAAGCTG
GAGAGACTTCATGAAAGCAGGAAA

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR2AT64JQ 767 0 0
A
AAATGCAAGCATCCTCAAGCACAGGAGGCTTTTGGAGCATTGGCAAAGGCGCAACAGCTG
CTACTGGACGACCAAGAAAGAGATTATATTCTCACTCAAGTCCAAGCTGCCAAACAAGAG
CTTAAGATGAAGAGAAAGAAACAGTTGAAGAAAGATACCGCCTCTAAAATAAAGTCCTTG
GTTGATGAGGGTAAGCATGAGCAACTATATGAACAATCTGAAGAGTTTCAGAAGGAGCTT
AAGTTAAAGGTCCGAGAGACATTAACAGACCAAGAGTGGCGTAGGCGAAAAATGGCTATG
AGGATATCAGAAGAAGAGGGAAGACTGAAGAAGGATTAAGAAGAACAAAAGGAGATACGG
AAGAAAAAGCGTGAGCATGAAGAACAGTGGGAAGGAACGAGAGAAAACAGGGTGTCAAGC
TGGAGAGACTTCATGAAAGCAGGAAAGAAGGCCAAAAAGGGAGAGACACGTCCTCCAAAA
CTGAAGACTGAGGACCCAAACAAATCATACGTTCAAAGGCCGGTCAAGAAAGGCTGATCC
CTGTCTCCGTTTGCTGTTGTTGCCATTGATAGATTGGTCTTCTCGAGTCTGTGTTTCTGC
TCATGTCTGTGTTTCTATTTGTACATCACCAACTTCTTTGTCTTTCCAAATACATCAGAA
ACATGGAAGAGATATATAGATTTATCTCACTTCTCAAACGCTTATGACCTTTTACCCTTA
TGTATGGTGTTAGACTTTATATAATACACTTTAAGTCTTTTCTTTT

QA 2 767 2 767
DS 



AS 1 4

CO CL1901Contig1 1155 4 10 U
TTTTTCGAGGAGAGGGCAGCTCTTGAAGCTAAGTATCAAAAGTTGTATCAGCCTTTTTAT
ACCAAGCGTTATGAGATTGTGAACGGTGTGGTTGAAGTTGAAGGTGAACCTGAAGAAGTA
AAAACAGAACAGGGAGAAGATAAAGCTGCTGAAGAGAAAGGAGTACCTGATTTCTGGCTT
ATTGCATTGAAGAACAATGAAATAACTGCTGAAGAGATAACTGAGAAAGATGAAGGTGCT
CTTAAGTATCTTAAGGATATCAAGTGGAACAAGGTTGAAGAGCCCAAAGGTTTCAAGCTT
GAGTTTTTCTTTGATGAGAACCCTTACTTCAAAAACACTGTCTTGACCAAGACATATCAC
ATGATTGATGAAGATGAGCCTATCCTCGAGAAGGCTATCGGGACGGAGATTGAGTGGTAT
CCTGGAAAATGTTTGACTCAGAAGATCCTTAAAAAGAAGCCAAAGAAGGGATCCAAAAAC
ACAAAGCCAATCACTAAGACTGAGGACTGTGAGAGTTTCTTCAACTTCTTCAATCCACCT
CAAGTTCCTGAGGACGAAGATGATCTTGATGATGAATTGGCTGAAGAACTCCAAGGTCAA
ATGGAGCACGACTATGATATTGGATCAACCATTAAAGAGAAAATCATCTCGCATGCTGTG
TCATGGTTCACTGGTGAAGCTGTTGACGAAGATGACCTTGATATGGAGGATGATGATGAT
GAGATTGATGAAGAAGATGATGATGAGGAGGACGAGGAAGATGATGAAGAGGACGAGGAT
GATGAGGAGGAGGACGAAGATGAAGAGCAAGGAAAGAAGAGCAGAAAGAAGTCATCAGCT
GGGCAAAAGAAGTCTGGAAGAAGTCAACTGGCAGAAGGTCAGCAAGGTGAGAGGCCACCG
GAATGTAAGCAGCAGTGAGTAAACAAACCTCTTCTCAGGTGAAGAAGATTTGGCTTATTG
ATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGAGGTCTTTGTGTTTCTTAATTTGCTGGTTTGT
ATGGTTATAAATCAAGTTTTGGGTGGTGGTTTGCTAAACAAAAATTGGTCATTTGGTTTG
GTTTTTCTGATTTTTCATTTGCTATGTGTTCTCCCTTGAACTGGTTTGAGCAAATAGTAT
TTTGTTTTTATTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW53TF U 1
AF RR2BE44TF U 255
AF RR2BE44JQ C 375
AF RR2FW53JQ C 566
BS 1 469 RR2FW53TF
BS 470 470 RR2BE44TF
BS 471 552 RR2FW53TF
BS 553 553 RR2BE44TF
BS 554 584 RR2FW53TF
BS 585 938 RR2BE44TF
BS 939 939 RR2BE44JQ
BS 940 1043 RR2BE44TF
BS 1044 1145 RR2BE44JQ
BS 1146 1155 RR2FW53JQ

RD RR2FW53TF 590 0 0
TTTTTCGAGGAGAGGGCAGCTCTTGAAGCTAAGTATCAAAAGTTGTATCAGCCTTTTTAT
ACCAAGCGTTATGAGATTGTGAACGGTGTGGTTGAAGTTGAAGGTGAACCTGAAGAAGTA
AAAACAGAACAGGGAGAAGATAAAGCTGCTGAAGAGAAAGGAGTACCTGATTTCTGGCTT
ATTGCATTGAAGAACAATGAAATAACTGCTGAAGAGATAACTGAGAAAGATGAAGGTGCT
CTTAAGTATCTTAAGGATATCAAGTGGAACAAGGTTGAAGAGCCCAAAGGTTTCAAGCTT
GAGTTTTTCTTTGATGAGAACCCTTACTTCAAAAACACTGTCTTGACCAAGACATATCAC
ATGATTGATGAAGATGAGCCTATCCTCGAGAAGGCTATCGGGACGGAGATTGAGTGGTAT
CCTGGAAAATGTTTGACTCAGAAGATCCTTAAAAAGAAGCCAAAGAAGG*ATCCAAAAAC
ACAAAGCCAATCACTAAGACTGAGGACTGTGAGAGTTTCTTCAACTTCTTCAATCCACCT
CAAGTTCCTGAG*ACGAAGATGATCTTGATGATGAATTGGCTGA
GAACTC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2BE44TF 791 0 0
GGATATCAAGTGGAACAAGGTTGAAGAGCCCAAAGGTTTCAAGCTTGAGTTTTTCTTTGA
TGAGAACCCTTACTTCAAAAACACTGTCTTGACCAAGACATATCACATGATTGATGAAGA
TGAGCCTATCCTCGAGAAGGCTATCGGGACGGAGATTGAGTGGTATCCTGGAAAATGTTT
GACTCAGAAGATCCTTAAAAAGAAGCCAAAGAAGGGATCCAAAAACACAAAGCCAATCAC
TAAGACTGAGGACTGTGAGAGTTTCTTCAACTTCTTCAATCCACCTCAAGTTCCTGAGGA
CGAAGATGATCTTGATGATGAATTGGCTGAAGAACTCCAAGGTCAAATGGAGCACGACTA
TGATATTGGATCAACCATTAAAGAGAAAATCATCTCGCATGCTGTGTCATGGTTCACTGG
TGAAGCTGTTGACGAAGATGACCTTGATATGGAGGATGATGATGATGAGATTGATGAAGA
AGATGATGATGAGGAGGACGAGGAAGATGATGAAGAGGACGAGGATGATGAGGAGGAGGA
CGAAGATGAAGAGCAAGGAAAGAAGAGCAGAAAGAAGTCATCAGCTGGGCAAAAGAAGTC
TGGAAGAAGTCAACTGGCAGAAGGTCAGCAAGGTGAGAGGCCACCGGAATGTAAGCAGCA
GTGAGTAAACAAACCTCTTCTCAG*TGAAGAAGATTTGGCTTATTGATGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAAGAGGTCTTTGTGTTTCTTAATTTGCTGGTTTGTATGGTTATAAATCA
AGTTTTGGG
GT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2BE44JQ 771 0 0
TGAGCCTATCCTCGAGAAGGCTATCGGGACGGAGATTGAGTGGTATCCTGGAAAATGTTT
GACTCAGAAGATCCTTAAAAAGAAGCCAAAGAAGGGATCCAAAAACACAAAGCCAATCAC
TAAGACTGAGGACTGTGAGAGTTTCTTCAACTTCTTCAATCCACCTCAAGTTCCTGAGGA
CGAAGATGATCTTGATGATGAATTGGCTGAAGAACTCCAAGGTCAAATGGAGCACGACTA
TGATATTGGATCAACCATTAAAGAGAAAATCATCTCGCATGCTGTGTCATGGTTCACTGG
TGAAGCTGTTGACGAAGATGACCTTGATATGGAGGATGATGATGATGAGATTGATGAAGA
AGATGATGATGAGGAGGACGAGGAAGATGATGAAGAGGACGAGGATGATGAGGAGGAGGA
CGAAGATGAAGAGCAAGGAAAGAAGAGCAGAAAGAAGTCATCAGCTGGGCAAAAGAAGTC
TGGAAGAAGTCAACTGGCAGAAGGTCAGCAAGGTGAGAGGCCACCGGAATGTAAGCAGCA
GTGAGTAAACAAACCTCTTCTCAGGTGAAGAAGATTTGGCTTATTGATGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAAGAGGTCTTTGTGTTTCTTAATTTGCTGGTTTGTATGGTTATAAATCA
AGTTTTGGGTGGTGGTTTGCTAAACAAAAATTGGTCATTTGGTTTGGTTTTTCTGATTTT
TCATTTGCTATGTGTTCTCCCTTGAACTGGTTTGAGCAAATAGTATTTTGT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2FW53JQ 590 0 0
TTGATGATGAATTGGCTGAAGAACTCCAAGGTCAAATGGAGCACGACTATGATATTGGAT
CAACCATTAAAGAGAAAATCATCTCGCATGCTGTGTCATGGTTCACTGGTGAAGCTTTTG
ACGAAGATGACCTTGATATGGAGGATGATGATGATGAGATTGATGAAGAAGATGATGATG
AGGAGGACGAGGAAGATGATGAAGAGGACGAGGATGAGGAGGATGAGGACGAAGATGAAG
AGCAAGGAAAGAAGAGCAGAAAGAAGTCATCAGCTGGGCAAAAGAAGTTTGGAAGAAGTC
AACTGGCAGAAGGTCAGCAAGGTGAGAGGCCACCGGAATGTAAGCAGCAGTGAGTAAACA
AACCTCTTTTCAGGTGAAGAAGATTTGGCTTATTGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
AAGAGGTCTTTGTGTTTCTTAATTTGCTGGTTTGTATGATTATAAATCAAGTTTTGGGTG
GTGGTTTGCTAAACAAAAATTGGTCATTTGGTTTGGTTTTTCTGATTTTTCATTTGCTAT
GTGTTCTCCCTTGAACTGGTTTGAGCAAATAGTATTTTGTTTTTATTGTT

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 5

CO CL1902Contig1 807 5 6 U
GGATCACTCAAAGGAATCTGCTCTCTCGGAAAGTGGAGATAACACAGGTTTAACAACAAT
GTCAGGCATTCACGGGGCTCATGATTTATGTCCTTTGGTCAAGAACATTCTTCTCCTGGA
CTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGCCAACCAATGCTGC
CAAGTTGAGTTTTGAGAAGTACGTATTCTCCAAGACCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGA
AGCGGAGATCACACTCTTGGACAGTAATATTATTGTCTATAAGTTCGCTCAGGACCTTCA
CTTCTTTGTTACTGGAGGCGATAATGAAAATGAGCTCGTCTTATCCTCTGTTCTTCAAGG
CTTTTTCGATGCTGTTGCACTTCTTCTAAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAAGCCCTTGA
GAACTTGGATCTCATCTTTCTGTGCCTCGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGA
AACAGACCCGAGCGTCATTGCCGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCTAGTGGTTC
GCTCTCTGAACAGACACTAACGCAAGCACTGGCAACAGCTCGGGAACATCTCGCTAGAAG
TCTGCTTACATGAGAGTTTCCTCACCTCACATTATGCATAATAACTGTTGTGGGATTTTA
TCTCAATAACGTGTGAAAGGGTTTCTAATAATTCATGCACTTTGCTTACCTCGTTTCTGC
ATACTTAATCTGAAGTTTTGGGTATTATATAGCTGTGTGCAATGCTGGAATTGTTTTTCT
GGAGTTATAAATCTTTTGATTCGTGGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2DS60TF U 1
AF RR2F016TF U 1
AF RR2C573TF U 1
AF RR2DS60JQ C 279
AF RR2C573JQ C 351
BS 1 221 RR2C573TF
BS 222 222 RR2DS60TF
BS 223 683 RR2C573TF
BS 684 684 RR2DS60JQ
BS 685 804 RR2C573TF
BS 805 807 RR2C573JQ

RD RR2DS60TF 684 0 0
GGATCACTCAAAGGAATCTGCTCTCTCGGAAAGTGGAGATAACACAGGTTTAACAACAAT
GTCAGGCATTCACGGGGCTCATGATTTATGTCCTTTGGTCAAGAACATTCTTCTCCTGGA
CTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGCCAACCAATGCTGC
CAAGTTGAGTTTTGAGAAGTACGTATTCTCCAAGACCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGA
AGCTGAGATCACACTCTTGGACAGTAATATTATTGTCTATAAGTTCGCTCAGGACCTTCA
CTTCTTTGTTACTGGAGGCGATAATGAAAATGAGCTCGTCTTATCCTCTGTTCTTCAAGG
CTTTTTCGATGCTGTTGCACTTCTTCTAAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAAGCCCTTGA
GAACTTGGATCTCATCTTTCTGTGCCTCGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGA
AACAGACCCGAGCGTCATTGCCGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCTAGTGGTTC
GCTCTCTGAACAGACACTAACGCAAGCACTGGCAACAGCTCGGGAACATCTCGCTAGAAG
TCTGCTTACATGAGAGTTTCCTCACCTCACATTATGCATAATAACTGTTGTGGGATTTTA
TCTCAATAACGTGTGAAAGG
TTTC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2F016TF 676 0 0
GGATCACTCAAAGGAATCTGCTCTCTCGGAAAGTGGAGATAACACAGGTTTAACAACAAT
GTCAGGCATTCACGGGGCTCATGATTTATGTCCTTTGGTCAAGAACATTCTTCTCCTGGA
CTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGCCAACCAATGCTGC
CAAGTTGAGTTTTGAGAAGTACGTATTCTCCAAGACCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGA
AGCGGAGATCACACTCTTGGACAGTAATATTATTGTCTATAAGTTCGCTCAGGACCTTCA
CTTCTTTGTTACTGGAGGCGATAATGAAAATGAGCTCGTCTTATCCTCTGTTCTTCAAGG
CTTTTTCGATGCTGTTGCACTTCTTCTAAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAAGCCCTTGA
GAACTTGGATCTCATCTTTCTGTGCCTCGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTAA
AACAGACCCGAGCGTCATTGCCGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCTAGTGGTTC
GCTCTCTGAACAGACACTAACGCAAGCACTGGCAACAGCTCGGGAACATCTCGCTAGAAG
TCTGCTTACATGAGAGTTTCCTCACCTCACATTATGCATAATAACTGTTGTGGGATTTTA
TCTCAATAACGTGTGA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2C573TF 804 0 0
GGATCACTCAAAGGAATCTGCTCTCTCGGAAAGTGGAGATAACACAGGTTTAACAACAAT
GTCAGGCATTCACGGGGCTCATGATTTATGTCCTTTGGTCAAGAACATTCTTCTCCTGGA
CTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGCCAACCAATGCTGC
CAAGTTGAGTTTTGAGAAGTACGTATTCTCCAAGACCTCTA*GACCAATGCTCGCACTGA
AGCGGAGATCACACTCTTGGACAGTAATATTATTGTCTATAAGTTCGCTCAGGACCTTCA
CTTCTTTGTTACTGGAGGCGATAATGAAAATGAGCTCGTCTTATCCTCTGTTCTTCAAGG
CTTTTTCGATGCTGTTGCACTTCTTCTAAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAAGCCCTTGA
GAACTTGGATCTCATCTTTCTGTGCCTCGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGA
AACAGACCCGAGCGTCATTGCCGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCTAGTGGTTC
GCTCTCTGAACAGACACTAACGCAAGCACTGGCAACAGCTCGGGAACATCTCGCTAGAAG
TCTGCTTACATGAGAGTTTCCTCACCTCACATTATGCATAATAACTGTTGTGGGATTTTA
TCTCAATAACGTGTGAAAGGGTT*CTAATAATTCATGCACTTTGCTTACCTCGTTTCTGC
ATACTTAATCTGAAGTTTTGGGTATTATATAGCTGTGTGCAATGCTGGAATTGTTTTTCT
GGAGTTATAAATCTTTTGATTCGT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2DS60JQ 529 0 0
ATAAGTTCGCTCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGATAATGAAAATGAGCTCG
TCTTATCCTCTGTTCTTCAAGGCTTTTTCGATGCTGTTGCACTTCTTCTAAGGAACAATG
TGGAAAAGATGGAAGCCCTTGAGAACTTGGATCTCATCTTTCTGTGCCTCGATGAAATGG
TCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAACAGACCCGAGCGTCATTGCCGGGAAAGTAGCAATGC
AGAGCACAGAAGCTAGTGGTTCGCTCTCTGAACAGACACTAACGCAAGCACTGGCAACAG
CTCGGGAACATCTCGCTAGAAGTCTGCTTACATGAGAGTTTCCTCACCTCACATTATGCA
TAATAACTGTTGTGGGATTTTATCTCAATAACGTGTGAAAGGGTTTCTAATAATTCATGC
ACTTTGCTTACCTCGTTTCTGCATACTTAATCTGAAGTTTTGGGTATTATATAGCTGTGT
GCAATGCTGGAATTGTTTTTCTGGAGTTATAAATCTTTTGATTCGT
GGT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2C573JQ 457 0 0
TTT
TTCAAGGCTTTTTCGATGCTGTTGCACTTTTTTTAAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAAG
CCCTTGAGAACTTGGATTTCATCTTTTTGTGCCTCGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGG
TTCTTGAAACAGACCCGAGCGTCATTGCCGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCTA
GTGGTTCGCTTTTTGAACAGACACTAACGCAAGCACTGGCAACAGCTCGGGAACATCTCG
CTAGAAGTCTGCTTACATGAGAGTTTCCTCCCCTCACATTATGCATAATAACTGTTGTGG
GATTTTATCTCAATAACGTGTGAAAGGGTTTTTAATAATTCATGCACTTTGCTTACCTCG
TTTTTGCATACTTAATTTGAAGTTTTGGGTATTATATAGCTGTGTGCAATGCTGGAATTG
TTTTTCTGGAGTTATAAATCTTTTGATTCGTGGT

QA 4 457 4 457
DS 



AS 2 5

CO CL1903Contig1 890 3 4 U
GGACACACAAACACATGAAGGAAGATATTCAGATTTCGAAAATGAAGCAACTGAAAATGA
GTACCGAACTAAACCGGACCTGATCGTAACAATTCATCTTCGAGGCGGCCTTCTCAATCT
CAAGACATCCGAGGCACATAGCTTGGCCTGCATAGACCTCTCTGTCTTTGCAACGCCCGC
ATAGAACCACCTGGGATTACTATTTTTCTGCCCGAGATCATACTTTGAACTTTGATTCAT
GGGAAGAGACAGCTGAGTTGGATTATGTAAGGCTTTTGATTAGTTCTCTCCTTGTAAAGT
GATGAGAACGAGAAGGTAAGACATGTGTTAGCATTAGTGGTTTTAACATTGAAGGATACT
TCAAAGTAGCTTTACATCCTGATATTCAGCTGGATCGATACTCTATCACGTAACTACCAA
CCTCCCCTTGATGCTCACTTGGTAATTTCTGTCATGTCTATGCGGACTCGTGTACAACCT
GCATATGCTGTTAATATGTGGAACGAGGCAGTCAATAAACTACGGCTCGGTACAGAGCAA
CTGGATTTGTATGGGATTCTTGAAGAAACAATGAGGCGTGAAATGTCATTTGATGAGATA
GTCGCCATCCCCAAACAGGACGAGTGACAACATGTGTTGCTTTTATCCTTGCAATGTACA
AAGCCGCTGGTGCATTCGGCCCTCTGACTGATCACATTCAAGGCCCTCTAAGTGTTAGGA
AAAAATATTCAACCTGTTTGTCTCTGTAACTCTGTGTTTTATCTACTTTATGTTTATTTA
TTTAGCAAGCTTTAGCTTTTTAGTTATAAGTTATAAGCGAAGAAAACCACACATGACAAT
TATATGTGATTATGTGATGATATTTTATTAAATATAAGTTGGTTCGAACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB10TF U 1
AF RR2DN90TF U 1
AF RR2DN90JQ C 206
BS 1 329 RR2CB10TF
BS 330 330 RR2DN90TF
BS 331 661 RR2CB10TF
BS 662 890 RR2DN90JQ

RD RR2CB10TF 661 0 0
GGACACACAAACACATGAAGGAAGATATTCAGATTTCGAAAATGAAGCAACTGAAAATGA
GTACCGAACTAAACCGGACCTGATCGTAACAATTCATCTTCGAGGCGGCCTTCTCAATCT
CAAGACATCCGAGGCACATAGCTTGGCCTGCATAGACCTCTCTGTCTTTGCAACGCCCGC
ATAGAACCACCTGGGATTACTATTTTTCTGCCCGAGATCATACTTTGAACTTTGATTCAT
GGGAAGAGACAGCTGAGTTGGATTATGTAAGGCTTTTGATTAGTTCTCTCCTTGTAAAGT
GATGAGAACGAGAAGGTAAGACATGTGTTGGCATTAGTGGTTTTAACATTGAAGGATACT
TCAAAGTAGCTTTACATCCTGATATTCAGCTGGATCGATACTCTATCACGTAACTACCAA
CCTCCCCTTGATGCTCACTTGGTAATTTCTGTCATGTCTATGCGGACTCGTGTACAACCT
GCATATGCTGTTAATATGTGGAACGAGGCAGTCAATAAACTACGGCTCGGTACAGAGCAA
CTGGATTTGTATGGGATTCTTGAAGAAACAATGAGGCGTGAAATGTCATTTGATGAGATA
GTCGCCATCCCCAAACAGGACGAGTGACAACATGTGTTGCTTTTATCCTTGCAATGTACA
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2DN90TF 661 0 0
GGACACACAAACACATGAAGGAAGATATTCAGATTTCGAAAATGAAGCAACTGAAAATGA
GTACCGAACTAAACCGGACCTGATCGTAACAATTCATCTTCGAGGCGGCCTTCTCAATCT
CAAGACATCCGAGGCACATAGCTTGGCCTGCATAGACCTCTCTGTCTTTGCAACGCCCGC
ATAGAACCACCTGGGATTACTATTTTTCTGCCCGAGATCATACTTTGAACTTTGATTCAT
GGGAAGAGACAGCTGAGTTGGATTATGTAAGGCTTTTGATTAGTTCTCTCCTTGTAAAGT
GATGAGAACGAGAAGGTAAGACATGTGTTAGCATTAGTGGTTTTAACATTGAAGGATACT
TCAAAGTAGCTTTACATCCTGATATTCAGCTGGATCGATACTCTATCACGTAACTACCAA
CCTCCCCTTGATGCTCACTTGGTAATTTCTGTCATGTCTATGCGGACTCGTGTACAACCT
GCATATGCTGTTAATATGTGGAACGAGGCAGTCAATAAACTACGGCTCGGTACAGAGCAA
CTGGATTTGTATGGGATTCTTGAAGAAACAATGAGGCGTGAAATGTCATTTGATGAGATA
GTCGCCATCCCCAAACAGGACGAGTGACAACATGTGTTGCTTTTATCCTTGCAATGTACA
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2DN90JQ 685 0 0
T
TCTGCCCGAGATCATACTTTGAACTTTGATTCATGGGAAGAGACAGCTGAGTTGGATTAT
GTAAGGCTTTTGATTAGTTCTCTCCTTGTAAAGTGATGAGAACGAGAAGGTAAGACATGT
GTTAGCATTAGTGGTTTTAACATTGAAGGATACTTCAAAGTAGCTTTACATCCTGATATT
CAGCTGGATCGATACTCTATCACGTAACTACCAACCTCCCCTTGATGCTCACTTGGTAAT
TTCTGTCATGTCTATGCGGACTCGTGTACAACCTGCATATGCTGTTAATATGTGGAACGA
GGCAGTCAATAAACTACGGCTCGGTACAGAGCAACTGGATTTGTATGGGATTCTTGAAGA
AACAATGAGGCGTGAAATGTCATTTGATGAGATAGTCGCCATCCCCAAACAGGACGAGTG
ACAACATGTGTTGCTTTTATCCTTGCAATGTACAAAGCCGCTGGTGCATTCGGCCCTCTG
ACTGATCACATTCAAGGCCCTCTAAGTGTTAGGAAAAAATATTCAACCTGTTTGTCTCTG
TAACTCTGTGTTTTATCTACTTTATGTTTATTTATTTAGCAAGCTTTAGCTTTTTAGTTA
TAAGTTATAAGCGAAGAAAACCACACATGACAATTATATGTGATTATGTGATGATATTTT
ATTAAATATAAGTTGGTTCGAACT

QA 2 685 2 685
DS 



CO CL1903Contig2 739 2 2 U
GGCACATAGCTTGGCCTGCATAGACCTATCTGTCTTTGCAACGCCGTATAGAATCACCTG
GGACTACTATTTCTCTGCCCTAGATCATACTTTGAACTCTGATTCATGGGAAGAGACAGC
TGAGTTGGGTTATGTAAGGCATTTGATTAGTTCTCTCCTTGTAAAGTGATGAGAACGAGA
AGGTAAGACATGTGTTAGCATTAGTGGTTTAACATTGAAGGATACTTCAAAGTAGCTTTA
CATCCTGATATTCAGCTGGATCGATACTCTATCACGTAACTATCAACCTCCCCTTGATGC
TCACTTGGTAATTTCTGTCATGTCTATGCGGACTCGTGTACAACCTGCATATGCTGTTAA
TATGTGGAACGAGGCAGTCAATAAACTACGGCTCGGTACAGAGCAACTGGATTTGTATGG
GATTCTTGAAGAAACAATGAGGCGTGAAATGTCATTTGATGAGATAGTCGCCATCCCCAA
ACAGGACGAGTGACAACATGTGTTGCTTTTATCCTTGCAATGTACAAAGCCGCTGGTGCA
TTCGGCCCTCTGACTGATCACATTCAAGGCCCTCTAAGTGTTAGGAAAAAATATTCAACC
TGTTTGTTTCTGTAACTCTGTGTTTTGTCTACTTTATGTTTGTTCATTTATCAAGCTTTA
GCTTTTTAGTTATAACTTATAAGCGAAGAAAAACCACACATGAGAACAATTATATGTGAT
TATGTGACGATATTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC51TF U 1
AF RR2GC51JQ C 64
BS 1 564 RR2GC51TF
BS 565 739 RR2GC51JQ

RD RR2GC51TF 564 0 0
GGCACATAGCTTGGCCTGCATAGACCTATCTGTCTTTGCAACGCCGTATAGAATCACCTG
GGACTACTATTTCTCTGCCCTAGATCATACTTTGAACTCTGATTCATGGGAAGAGACAGC
TGAGTTGGGTTATGTAAGGCATTTGATTAGTTCTCTCCTTGTAAAGTGATGAGAACGAGA
AGGTAAGACATGTGTTAGCATTAGTGGTTTAACATTGAAGGATACTTCAAAGTAGCTTTA
CATCCTGATATTCAGCTGGATCGATACTCTATCACGTAACTATCAACCTCCCCTTGATGC
TCACTTGGTAATTTCTGTCATGTCTATGCGGACTCGTGTACAACCTGCATATGCTGTTAA
TATGTGGAACGAGGCAGTCAATAAACTACGGCTCGGTACAGAGCAACTGGATTTGTATGG
GATTCTTGAAGAAACAATGAGGCGTGAAATGTCATTTGATGAGATAGTCGCCATCCCCAA
ACAGGACGAGTGACAACATGTGTTGCTTTTATCCTTGCAATGTACAAAGCCGCTGGTGCA
TTCGGCCCTCTGACTGATCACATT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2GC51JQ 676 0 0
C
TACTATTTCTCTGCCCTAGATCATACTTTGAACTCTGATTCATGGGAAGAGACAGCTGAG
TTGGGTTATGTAAGGCATTTGATTAGTTCTCTCCTTGTAAAGTGATGAGAACGAGAAGGT
AAGACATGTGTTAGCATTAGTGGTTTAACATTGAAGGATACTTCAAAGTAGCTTTACATC
CTGATATTCAGCTGGATCGATACTCTATCACGTAACTATCAACCTCCCCTTGATGCTCAC
TTGGTAATTTCTGTCATGTCTATGCGGACTCGTGTACAACCTGCATATGCTGTTAATATG
TGGAACGAGGCAGTCAATAAACTACGGCTCGGTACAGAGCAACTGGATTTGTATGGGATT
CTTGAAGAAACAATGAGGCGTGAAATGTCATTTGATGAGATAGTCGCCATCCCCAAACAG
GACGAGTGACAACATGTGTTGCTTTTATCCTTGCAATGTACAAAGCCGCTGGTGCATTCG
GCCCTCTGACTGATCACATTCAAGGCCCTCTAAGTGTTAGGAAAAAATATTCAACCTGTT
TGTTTCTGTAACTCTGTGTTTTGTCTACTTTATGTTTGTTCATTTATCAAGCTTTAGCTT
TTTAGTTATAACTTATAAGCGAAGAAAAACCACACATGAGAACAATTATATGTGATTATG
TGACGATATTTTATT

QA 2 676 2 676
DS 



AS 2 4

CO CL1904Contig1 878 2 3 U
GGAATTCCCAAAATCTACTTTAGCCCGCGACCATCGAAACTTTCTTGGGAGAGAATAATG
GCGTCGAAGCAAGAATACGGCATCCCTTATACACCTCTTCCTTCATCATCATCACAGCCT
TCTCAACCCGTCATCGTCCTAACTCCTTACCGCCGTCACCGTCGCTCTTCCTTCCTCCAC
AACCTCCGCTGCTCTCTCCTCTTCACCGCCGCAATCCTCCTCCTCCCCGCCGCCGTTTAC
TTCCTCTACCCTTCCGATCCAGAGATCAAAGTCTCTCGAATCCAGCTCAACCACATACGA
GTCCTCGATTCGTTTAAACCCACGCTCGATCTCTCGTTCTCCCTCACGATCAAAGTCAGG
AACCGCGACTTCTTCTCCCTTGATTACGATTCGCTCGTGGTCTCGATCGGGTATAGAGGG
AGAGAGCTGGGGCTTGTCAAGTCTCGAGGCGGACACCTCCGTGCTCGTGATAGCTCTTAT
GTTAATGCGACTCTTGAACTCGATGGTCTAGAGGTTGTTCACGATGTGATTTATTTGATC
GGTGATTTGGCTAAAGGTGTTATTCCTTTTGATACCATCGCTCAGGTCAAAGGTGATCTT
GGTGTTCTTCTCTTCCAAATCCCTATTCAGGGAAAAGTGTCATGCGAGGTGTTTGTTAAT
GTTAACAACCAAAAAATTTCACACCAAGATTGTCATCGTAAGTGAAACATAATCCTGAGC
TGGTCCAAAGATGAGAGAGGAATAGACCAGAGATACATATGTTGAATACTTGAATATCTT
TTGGATATTGAGATATGATTTGTAAGATATTTGTATAGATAAATACTACTGGATTGCCAT
TTCTTAGTCATGTAATTTTGTACGTGAACTATACTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO44TF U 55
AF RR2AD62TF U 1
BS 1 204 RR2AD62TF
BS 205 205 RR2BO44TF
BS 206 878 RR2AD62TF

RD RR2BO44TF 750 0 0
GG
AATGGCGTCGAAGCAAGAATACGGCATCCCTTATACACCTCTTCCTTCATCATCATCACA
GCCTTCTCAACCCGTCATCGTCCTAACTCCTTACCGCCGTCACCGTCGCTCTTCCTTCCT
CCACAACCTCCGCTGCTCTCTCCTCTTCACCGCCGCAATCCTCCTCCTCTCCGCCGCCGT
TTACTTCCTCTACCCTTCCGATCCAGAGATCAAAGTCTCTCGAATCCAGCTCAACCACAT
ACGAGTCCTCGATTCGTTTAAACCCACGCTCGATCTCTCGTTCTCCCTCACGATCAAAGT
CAGGAACCGCGACTTCTTCTCCCTTGATTACGATTCGCTCGTGGTCTCGATCGGGTATAG
AGGGAGAGAGCTGGGGCTTGTCAAGTCTCGAGGCGGACACCTCCGTGCTCGTGATAGCTC
TTATGTTAATGCGACTCTTGAACTCGATGGTCTAGAGGTTGTTCACGATGTGATTTATTT
GATCGGTGATTTGGCTAAAGGTGTTATTCCTTTTGATACCATCGCTCAGGTCAAAGGTGA
TCTTGGTGTTCTTCTCTTCCAAATCCCTATTCAGGGAAAAGTGTCATGCGAGGTGTTTGT
TAATGTTAACAACCAAAAA*TTTCACACCAAGATTGTCATCGTAAGTGAAACATAATCCT
GAGCTGGTCCAAAGATGAGAGAGGA*TAGACCAGAGATACATATGTTGAATACTTGAATA
TCTTTTGGATATTGAGATATGATTTGTA

QA 3 750 3 750
DS 

RD RR2AD62TF 878 0 0
GGAATTCCCAAAATCTACTTTAGCCCGCGACCATCGAAACTTTCTTGGGAGAGAATAATG
GCGTCGAAGCAAGAATACGGCATCCCTTATACACCTCTTCCTTCATCATCATCACAGCCT
TCTCAACCCGTCATCGTCCTAACTCCTTACCGCCGTCACCGTCGCTCTTCCTTCCTCCAC
AACCTCCGCTGCTCTCTCCTCTTCGCCGCCGCAATCCTCCTCCTCCCCGCCGCCGTTTAC
TTCCTCTACCCTTCCGATCCAGAGATCAAAGTCTCTCGAATCCAGCTCAACCACATACGA
GTCCTCGATTCGTTTAAACCCACGCTCGATCTCTCGTTCTCCCTCACGATCAAAGTCAGG
AACCGCGACTTCTTCTCCCTTGATTACGATTCGCTCGTGGTCTCGATCGGGTATAGAGGG
AGAGAGCTGGGGCTTGTCAAGTCTCGAGGCGGACACCTCCGTGCTCGTGATAGCTCTTAT
GTTAATGCGACTCTTGAACTCGATGGTCTAGAGGTTGTTCACGATGTGATTTATTTGATC
GGTGATTTGGCTAAAGGTGTTATTCCTTTTGATACCATCGCTCAGGTCAAAGGTGATCTT
GGTGTTCTTCTCTTCCAAATCCCTATTCAGGGAAAAGTGTCATGCGAGGTGTTTGTTAAT
GTTAACAACCAAAAAATTTCACACCAAGATTGTCATCGTAAGTGAAACATAATCCTGAGC
TGGTCCAAAGATGAGAGAGGAATAGACCAGAGATACATATGTTGAATACTTGAATATCTT
TTGGATATTGAGATATGATTTGTAAGATATTTGTATAGATAAATACTACTGGATTGCCAT
TTCTTAGTCATGTAATTTTGTACGTGAACTATACTTTA

QA 1 878 1 878
DS 



CO CL1904Contig2 938 2 2 U
GGGCCCATCGAAACTTTCTTGGGAGAGAATAATGGCGTCGAAGCAAGAATACGGCATCCC
TTATACACCTCTTCCTTCATCATCATCATCACAGCCTTCTCAAACCGTCATCGTTCTAAC
TCCTTACCGCCGCCACCGTCGCCCTTCCTTCCTCAGCAACCTCCGCTGCTCTCTCCTCTT
CACCGCCGCAATCCTCCTCCTCTCCGCCGCCGTTTACTTCCTCTACCCTTCCGATCCAGA
AATCAAAGTCTCTCGAATCCAGCTCAACCACATACGAGTCCTCGATTCGTTTAAACCCAC
CCTCGATCTCTCGTTCTCCCTCGCGATCAAAGTCAGGAACCGCGACTTCTTCTCCCTTGA
TTACGATTCGCTTGTGGTCTCGATCGGGTATAGAGGGAGAGAGCTAGGCCTTGTCAAGTC
TCGAGGCGGACACCTCCGTGCTCGTGATAGCTCTTATGTTAATGCGACTCTTGAACTCGA
TGGTCTAGAGGTTGTTCACGATGTGATTTATTTGATCGGTGATTTGGCTAAAGGTGTTAT
CCCTTTTGATACGATCGCTCAGGTTAAAGGTGATCTTGGTGTTCTTCTCTTCCAAACCCC
TATTCACGGAAAAGTGTCATGCGAGGTGTTTGTTAATGTTAACAACCAAAAAATTTCACA
CCAAGATTGTCATCGTAAGGTCAAATGTTTATAATCATTAGGTTGTTGTGAAAGCTAATC
TATGTCTCCGCTTCGGTTTTGTAATGCGCAGTGAAACAAAATCCTAAGCTGGTCCAAACA
TGAGAGAGGAGTAGACCAGAGATACATATGTTGAATACTTGAATATCTTTTGGGTATGGA
GAAATGATTTGTAAGATATTTGTATAGATAAATACTACTGGATTGCCATTTCTTAGTCGT
GTAATTTCGTACGTGAGCTATACTTTAACGAGATAGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK58TF U 1
AF RR2BK58JQ C 261
BS 1 653 RR2BK58TF
BS 654 938 RR2BK58JQ

RD RR2BK58TF 653 0 0
GGGCCCATCGAAACTTTCTTGGGAGAGAATAATGGCGTCGAAGCAAGAATACGGCATCCC
TTATACACCTCTTCCTTCATCATCATCATCACAGCCTTCTCAAACCGTCATCGTTCTAAC
TCCTTACCGCCGCCACCGTCGCCCTTCCTTCCTCAGCAACCTCCGCTGCTCTCTCCTCTT
CACCGCCGCAATCCTCCTCCTCTCCGCCGCCGTTTACTTCCTCTACCCTTCCGATCCAGA
AATCAAAGTCTCTCGAATCCAGCTCAACCACATACGAGTCCTCGATTCGTTTAAACCCAC
CCTCGATCTCTCGTTCTCCCTCGCGATCAAAGTCAGGAACCGCGACTTCTTCTCCCTTGA
TTACGATTCGCTTGTGGTCTCGATCGGGTATAGAGGGAGAGAGCTAGGCCTTGTCAAGTC
TCGAGGCGGACACCTCCGTGCTCGTGATAGCTCTTATGTTAATGCGACTCTTGAACTCGA
TGGTCTAGAGGTTGTTCACGATGTGATTTATTTGATCGGTGATTTGGCTAAAGGTGTTAT
CCCTTTTGATACGATCGCTCAGGTTAAAGGTGATCTTGGTGTTCTTCTCTTCCAAACCCC
TATTCACGGAAAAGTGTCATGCGAGGTGTTTGTTAATGTTAACAACCAAAAAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2BK58JQ 678 0 0
AGCTCAACCACATACGAGTCCTCGATTCGTTTAAACCCACCCTCGATCTCTCGTTCTCCC
TCGCGATCAAAGTCAGGAACCGCGACTTCTTCTCCCTTGATTACGATTCGCTTGTGGTCT
CGATCGGGTATAGAGGGAGAGAGCTAGGCCTTGTCAAGTCTCGAGGCGGACACCTCCGTG
CTCGTGATAGCTCTTATGTTAATGCGACTCTTGAACTCGATGGTCTAGAGGTTGTTCACG
ATGTGATTTATTTGATCGGTGATTTGGCTAAAGGTGTTATCCCTTTTGATACGATCGCTC
AGGTTAAAGGTGATCTTGGTGTTCTTCTCTTCCAAACCCCTATTCAGGGAAAAGTGTCAT
GCGAGGTGTTTGTTAATGTTAACAACCAAAAAATTTCACACCAAGATTGTCATCGTAAGG
TCAAATGTTTATAATCATTAGGTTGTTGTGAAAGCTAATCTATGTCTCCGCTTCGGTTTT
GTAATGCGCAGTGAAACAAAATCCTAAGCTGGTCCAAACATGAGAGAGGAGTAGACCAGA
GATACATATGTTGAATACTTGAATATCTTTTGGGTATGGAGAAATGATTTGTAAGATATT
TGTATAGATAAATACTACTGGATTGCCATTTCTTAGTCGTGTAATTTCGTACGTGAGCTA
TACTTTAACGAGATAGTA

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL1905Contig1 868 2 2 U
GCAGATTGGGGCTTATGATGATGCTGAGAAGGCGAAAGATAGTATTGGGATTAGGTCTGG
TGTCGGGAAGATTAGGAACAGGCGTTACATTTGTAGAAAAGGTCCTCTTGTGGTTTACGG
TACCGAAGGGTCTAAGATTGTCAAGGCGTTTAGGAACCTTCCCGGTGTTGAGCTTTGCCA
CGTGGAGAGGCTTAACTTGTTGAAGCTTGCCCCTGGTGGTCACCTCGGGAGGTTTGTGGT
TTGGACCAAGTCTGCTTTCGAGAAGCTTGAGGGGATCTACGGGTCGTTTGAGAAGCCCTC
GGAGAGGAAGAAAGGGTATGTGCTTCCTAGGGCGAAGATGGTGAACGCTGATTTGGCGAG
GATTATTAACTCTGATGAGGTGCAGAGTGTTGTGAAGCCGATTAAGAAGGATGCTAAGAG
GGCTGTGATGAAGAAGAATCCGTTGAAGAATTTGAATGTGATGCTGAAGTTGAATCCGTA
TGCTAAGACGGCGAAGAGGATGTCTTTGTTGGCGGAGGAGCAGAGGGTTAAGGCTAAGAA
GGAGAAGCTCACCAAGAAGAGGAAAACTGTCACCAGGGAGGAGGCATTGGCAATCAAGGC
AGCAGGGAAGTCGTGGTACCAGACTATGATATCGGACAGTGACTACACCGAGTTTGACAA
CTTCACCAAATGGCTCGGTGCTAGCCAGTAATAATAATATTATCTGCTTGAAACACTCTT
TCATGTTTGTAGGGAATGTTTTTGGTTTTATATCTGTTTTGTCTCGAGTTGTCGGATTAC
TAAGCTCAGCGATGAACAATTTTTCATTTCTCTTTCTCTTATTGTGGTGTTACCTTATTT
CTATCAAACGAATGCTTAAATTTAAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV18TF U 1
AF RR2AV18JQ C 1
BS 1 583 RR2AV18TF
BS 584 868 RR2AV18JQ

RD RR2AV18TF 601 0 0
GCAGATTGGGGCTTATGATGATGCTGAGAAGGCGAAAGATAGTATTGGGATTAGGTCTGG
TGTCGGGAAGATTAGGAACAGGCGTTACATTTGTAGAAAAGGTCCTCTTGTGGTTTACGG
TACCGAAGGGTCTAAGATTGTCAAGGCGTTTAGGAACCTTCCCGGTGTTGAGCTTTGCCA
CGTGGAGAGGCTTAACTTGTTGAAGCTTGCCCCTGGTGGTCACCTCGGGAGGTTTGTGGT
TTGGACCAAGTCTGCTTTCGAGAAGCTTGAGGGGATCTACGGGTCGTTTGAGAAGCCCTC
GGAGAGGAAGAAAGGGTATGTGCTTCCTAGGGCGAAGATGGTGAACGCTGATTTGGCGAG
GATTATTAACTCTGATGAGGTGCAGAGTGTTGTGAAGCCGATTAAGAAGGATGCTAAGAG
GGCTGTGATGAAGAAGAATCCGTTGAAGAATTTGAATGTGATGCTGAAGTTGAATCCGTA
TGCTAAGACGGCGAAGAGGATGTCTTTGTTGGCGGAGGAGCAGAGGGTTAAGGCTAAGAA
GGAGAAGCTCACCAAGAAGAGGAAAACTGTCACCAGGGAGGAG
GCATTGGCAATCAAAGCA

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2AV18JQ 868 0 0
GCAGATTGGGGCTTATGATGATGCTGAGAAGGCGAAAGATAGTATTGGGATTAGGTCTGG
TGTCGGGAAGATTAGGAACAGGCGTTACATTTGTAGAAAAGGTCCTCTTGTGGTTTACGG
TACCGAAGGGTCTAAGATTGTCAAGGCGTTTAGGAACCTTCCCGGTGTTGAGCTTTGCCA
CGTGGAGAGGCTTAACTTGTTGAAGCTTGCCCCTGGTGGTCACCTCGGGAGGTTTGTGGT
TTGGACCAAGTCTGCTTTCGAGAAGCTTGAGGGGATCTACGGGTCGTTTGAGAAGCCCTC
GGAGAGGAAGAAAGGGTATGTGCTTCCTAGGGCGAAGATGGTGAACGCTGATTTGGCGAG
GATTATTAACTCTGATGAGGTGCAGAGTGTTGTGAAGCCGATTAAGAAGGATGCTAAGAG
GGCTGTGATGAAGAAGAATCCGTTGAAGAATTTGAATGTGATGCTGAAGTTGAATCCGTA
TGCTAAGACGGCGAAGAGGATGTCTTTGTTGGCGGAGGAGCAGAGGGTTAAGGCTAAGAA
GGAGAAGCTCACCAAGAAGAGGAAAACTGTCACCAGGGAGGAGGCATTGGCAATCAAGGC
AGCAGGGAAGTCGTGGTACCAGACTATGATATCGGACAGTGACTACACCGAGTTTGACAA
CTTCACCAAATGGCTCGGTGCTAGCCAGTAATAATAATATTATCTGCTTGAAACACTCTT
TCATGTTTGTAGGGAATGTTTTTGGTTTTATATCTGTTTTGTCTCGAGTTGTCGGATTAC
TAAGCTCAGCGATGAACAATTTTTCATTTCTCTTTCTCTTATTGTGGTGTTACCTTATTT
CTATCAAACGAATGCTTAAATTTAAGAC

QA 1 868 1 868
DS 



AS 1 3

CO CL1906Contig1 1058 3 4 U
CTTTCATTGTAACATATAATGTGTTTTGTGCAATGCAAGTTTCATAACACATATATAGTC
TCCACCATGTATATAACAAAAAAAAAATTCAAACATAACAAGTTTCAGATTCAGAGATCA
CAATAAAATGATTCTGTAATCCAATAATATTGTTTTCAGATATATCTCAATTACTGAACT
GTATTTTATACTTACACAACGGCTTAAGGAAACATCCAAGGAGCTTTCAACCGGTGAATG
AAGTTTTAGCAGAGAGATGGGTTAAAGCGCGACGATGATACTGGCCTCTTAGCTTCTTAT
ACTTCTGCACAAACGCTGCTGTATCAATATCCTTCTCCATATACTTCTGTTGCAGCTCCT
CTGATTCTTCATCTCCCTTCTTCATAGCATCTTGAAGTCTATGAAGAAGAGAAGCAGGAG
AGTAGAATTTGAGGATCTCGTCTCTTTGATTCTCGAGCTCATTGAGCTTCTCTTGAGCAG
TTGCAAGCTCACTCGTACGGATTATTCTGCATTGGTTTCTGAGCTCCACTATCTGTGGTT
CTTTCTCCAAGTTTTCTCTAGCGAGATGTAATGTTTCTTTGCGAAGCTCTTCTCTGATGT
TGTTTTGAATAGTGACCTGTTCAAGGGAGTTCAAGAAGTGTTGGTACGCATCCTTGTCAG
TCAGAAGCTTACTGAGCTCATCCACACTTTTGTCTTTCAAAAGAGAAATAATGGAGGCAG
CTTCAGTAGGTGAAACATGGGATGGGATGTGCGCTCCTGATGATGACTGAGGCCGAGATA
AGCTAGGAGAGGTGACCAGAGACGGAGAATACCATGGTTGTGGAGATGGTTCTGAAGAAG
AAGAAGGACGAGACTCCCCAAGTTGCTCCTTTGATCCCCAGAAATTAAACATGGTTGGTT
CCTCGATCACCCCCGATTTCGAAGATTACAGAAATATCGCAAATCAGATGATCCCCGATC
GCTCGCTGATACAAGAAGCAAAATCGATTAACTTGAGAGCAGGTCAAGGAAGGATCGAGG
CAGGTTTTTTCTTCCTTTTTTGTTAATCTAATCAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS50JQ U 57
AF RR2AG43JQ U 1
AF RR2AG43TF C 372
BS 1 329 RR2AG43JQ
BS 330 330 RR2BS50JQ
BS 331 833 RR2AG43JQ
BS 834 1058 RR2AG43TF

RD RR2BS50JQ 711 0 0
AGTCTCCACCATGTATATAACAAAAAAAACATTCAAACATAACAAGTTTCAGATTCAGAG
ATCACAATAAAATGATTCTGTAATCCAATAATATTGTTTTCAGATATATCTCAATTACTG
AACTGTATTTTATACTTACACAACGGCTTAAGGAAACATCCAAGGAGCTTTCAACCGGTG
AATGAAGTTTTAGCAGAGAGATGGGTTAAAGCGCGACGATGATACTGGCCTCTTAGCTTC
TTATACTTCTGCACAAACGCTGCTGTATCAATCTCCTTCTCCATATACTTCTGTTGCAGC
TCCTCTGATTCTTCATCTCCCTTCTTCATAGCATCTTGAAGTCTATGAAGAAGAGAAGCA
GGAGAGTAGAATTTGAGGATCTCGTCTCTTTGATTCTCGAGCTCATTGAGCTTCTCTTGA
GCAGTTGCAAGCTCACTCGTACGGATTATTCTGCATTGGTTTCTGAGCTCCACTATCTGT
GGTTCTTTCTCCAAGTTTTCTCTAGCGAGATGTAATGTTTCTTTGCGAAGCTCTTCTCTG
ATGTTGTTTTGAATAGTGACCTGTTCAAGGGAGTTCAAGAAGTGTTGGTACGCATCCTTG
TCAGTCAGAAGCTTACTGAGCTCATCCACACTTTTGTCTTTCAAAAGAGAAATAATGGAG
GCAGCTTCAGTAGGTGAAACATGGGATGGGATGTGCGCTCCTGATGATGAC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2AG43JQ 833 0 0
CTTTCATTGTAACATATAATGTGTTTTGTGCAATGCAAGTTTCATAACACATATATAGTC
TCCACCATGTATATAACAAAAAAAAAATTCAAACATAACAAGTTTCAGATTCAGAGATCA
CAATAAAATGATTCTGTAATCCAATAATATTGTTTTCAGATATATCTCAATTACTGAACT
GTATTTTATACTTACACAACGGCTTAAGGAAACATCCAAGGAGCTTTCAACCGGTGAATG
AAGTTTTAGCAGAGAGATGGGTTAAAGCGCGACGATGATACTGGCCTCTTAGCTTCTTAT
ACTTCTGCACAAACGCTGCTGTATCAATA*CCTTCTCCATATACTTCTGTTGCAGCTCCT
CTGATTCTTCATCTCCCTTCTTCATAGCATCTTGAAGTCTATGAAGAAGAGAAGCAGGAG
AGTAGAATTTGAGGATCTCGTCTCTTTGATTCTCGAGCTCATTGAGCTTCTCTTGAGCAG
TTGCAAGCTCACTCGTACGGATTATTCTGCATTGGTTTCTGAGCTCCACTATCTGTGGTT
CTTTCTCCAAGTTTTCTCTAGCGAGATGTAATGTTTCTTTGCGAAGCTCTTCTCTGATGT
TGTTTTGAATAGTGACCTGTTCAAGGGAGTTCAAGAAGTGTTGGTACGCATCCTTGTCAG
TCAGAAGCTTACTGAGCTCATCCACACTTTTGTCTTTCAAAAGAGAAATAATGGAGGCAG
CTTCAGTAGGTGAAACATGGGATGGGATGTGCGCTCCTGATGATGACTGAGGCCGAGATA
AGCTAGGAGAGGTGACCAGAGACGGAGAATACCATGGTTGTGGAGATGGTTCT

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2AG43TF 687 0 0
ATCT
CCTTCTTCATAGCATCTTGAAGTCTATGAAGAAGAGAAGCAGGAGAGTAGAATTTGAGGA
TCTCGTCTCTTTGATTCTCGAGCTCATTGAGCTTCTCTTGAGCAGTTGCAAGCTCACTCG
TACGGATTATTCTGCATTGGTTTCTGAGCTCCACTATCTGTGGTTCTTTCTCCAAGTTTT
CTCTAGCGAGATGTAATGTTTCTTTGCGAAGCTCTTCTCTGATGTTGTTTTGAATAGTGA
CCTGTTCAAGGGAGTTCAAGAAGTGTTGGTACGCATCCTTGTCAGTCAGAAGCTTACTGA
GCTCATCCACACTTTTGTCTTTCAAAAGAGAAATAATGGAGGCAGCTTCAGTAGGTGAAA
CATGGGATGGGATGTGCGCTCCTGATGATGACTGAGGCCGAGATAAGCTAGGAGAGGTGA
CCAGAGACGGAGAATACCATGGTTGTGGAGATGGTTCTGAAGAAGAAGAAGGACGAGACT
CCCCAAGTTGCTCCTTTGATCCCCAGAAATTAAACATGGTTGGTTCCTCGATCACCCCCG
ATTTCGAAGATTACAGAAATATCGCAAATCAGATGATCCCCGATCGCTCGCTGATACAAG
AAGCAAAATCGATTAACTTGAGAGCAGGTCAAGGAAGGATCGAGGCAGGTTTTTTCTTCC
TTTTTTGTTAATCTAATCAACCC

QA 5 687 5 687
DS 



AS 2 5

CO CL1907Contig1 894 3 7 U
TCATGAACAGTGGCAAGCTTGATGCTTTCATATCACAGGGTAAGGAGTATGTGTTCGTTG
CCAACTCAGACAACTTTGGCGCTGTCGTCGACTTAAAAATCTTGAAGCACCTGATCCAAA
ACAAAAATGAGTACTGTATGGAGGTGACACCAAAAACCCTAGCTGATGTAAAGGGAGGAA
CTCTCATCTCCTACGAAGGAAAAGTACAGCTACTGGAGATTGCTCAGGTACCTGATGAGC
ATGTAAATGAATTCAAATCAATTGAGAAATTCAAGATTTTCAACACGAACAACCTTTGGG
TTAACTTGAAAGCCATCAAAAAGCTTGTGGAAGCTGATGCGCTTAAGATGGAGATCATCC
CAAACCCGAAGGAAGTCGATGGAGTCAAAGTTCTTCAACTGGAAACTGCAGCTGGTGCTG
CGATAAGGTTTTTTGAAAATGCAATCGGTGTGAATGTACCTCGGTCACGGTTCTTACCAG
TGAAGGCAACTTCAGACTTGCTTCTTGTTCAGTCTGATCTGTACACTCTCGTGGATGGCT
TTGTCACAAGGAACAAAGCTAGAACAAACCCCACAAACCCAGCGATCGAACTGGGACCCG
AGTTCAAAAAGGTGGCGAGCTTCCTTAGCCGGTTCAAGTCCATCCCGAGTATAGTCGAGC
TGGATAGCCTTAAGGTCTCTGGTGATGTCGGCTTTGGCTCACGCGTTGTTCTCAAGGGCA
AAGTGTCGGTGAAGGCAAACTCCGGGACAAAACTTGAAATTCCCGATAATGCGGTGGTCA
AGGATAAGGACATCAACGGTCCAGAGGATCTGTGAAGATAGTTTAAAGATCCCTGATGCA
GTCTTTTTCTGTTTTCCTCTTCTTATTATACACGAAAGCACTTTTGATTGAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C819TF U 1
AF RR2CG27TF U 83
AF RR2C180TF U 197
BS 1 472 RR2C819TF
BS 473 473 RR2CG27TF
BS 474 570 RR2C819TF
BS 571 571 RR2CG27TF
BS 572 606 RR2C819TF
BS 607 751 RR2CG27TF
BS 752 894 RR2C180TF

RD RR2C819TF 606 0 0
TCATGAACAGTGGCAAGCTTGATGCTTTCATATCACAGGGTAAGGAGTATGTGTTCGTTG
CCAACTCAGACAACTTTGGCGCTGTCGTCGACTTAAAAATCTTGAAGCACCTGATCCAAA
ACAAAAATGAGTACTGTATGGAGGTGACACCAAAAACCCTAGCTGATGTAAAGGGAGGAA
CTCTCATCTCCTACGAAGGAAAAGTACAGCTACTGGAGATTGCTCAGGTACCTGATGAGC
ATGTAAATGAATTCAAATCAATTGAGAAATTCAAGATTTTCAACACGAACAACCTTTGGG
TTAACTTGAAAGCCATCAAAAAGCTTGTGGAAGCTGATGCGCTTAAGATGGAGATCATCC
CAAACCCGAAGGAAGTCGATGGAGTCAAAGTTCTTCAACTGGAAACTGCAGCTGGTGCTG
CGATAAGGTTTTTTGAAAATGCAATCGGTGTGAATGTACCTCGGTCACGGTTTTTACCAG
TGAAGGCAACTTCAGACTTGCTTCTTGTTCAGTCTGATCTGTACACTCTCGTGGATGGCT
TTGTCACAAGGAACAAAGCTAGAACAAACCTCACAAACCCAGCGATCGAACTGGGACCCG
AGTTCA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2CG27TF 674 0 0
G
GTCGTCGACTTAAAAATCTTGAAGCACCTGATCCAAAACAAAAATGAGTACTGTATGGAG
GTGACACCAAAAACCCTAGCTGATGTAAAGGGAGGAACTCTCATCTCCTACGAAGGAAAA
GTACAGCTACTGGAGATTGCTCAGGTACCTGATGAGCATGTAAATGAATTCAAATCAATT
GAGAAATTCAAGATTTTCAACACGAACAACCTTTGGGTTAACTTGAAAGCCATCAAAAAG
CTTGTGGAAGCTGATGCGCTTAAGATGGAGATCATCCCAAACCCGAAGGAAGTCGATGGA
GTCAAAGTTCTTCAACTGGAAACTGCAGCTGGTGCTGCGATAAGGTTTTTTGAAAATGCA
ATCGGTGTGAATGTACCTCGGTCACGGTTCTTACCAGTGAAGGCAACTTCAGACTTGCTT
CTTGTTCAGTCTGATCTGTACACTCTCGTGGATGGCTTTGTCACAAGGAACAAAGCTAGA
ACAAACCCCACAAACCCAGCGATCGAACTGGGACCCGAGTTCAAAAAGGTGGCGAGCTTC
CTTAGCCGGTTCAAGTCCATCCCGAGTATAGTCGAGCTGGATAGCCTTAAGGTCTCTGGT
GATGTCGGCTTTGGCTCACGCGTTGTTCTCAAGGGCAAAGTGTCGGTGAAGGCAAACTCC
GGGACAAA
CTTGA

QA 2 669 2 669
DS 

RD RR2C180TF 698 0 0
G
GGAAAAGTACAGCTACTGGAGATTGCTCAGGTACCTGATGAGCATGTAAATGAATTCAAA
TCAATTGAGAAATTCAAGATTTTCAACACGAACAACCTTTGGGTTAACTTGAAAGCCATC
AAAAAGCTTGTGGAAGCTGATGCGCTTAAGATGGAGACCATCCCAAACCCGAAGGAAGTC
GATGGAGTCAAAGTTCTTCAACTGGAAACTGCAGCTGGTGCTGCGATAAGGTTTTTTGAA
AATGCAATCGGTGTGAATGTACCTCGGTCACGGTTCTTGCCAGTGAAGGCAACTTCAGAC
TTGCTTCTTGTTCAGTCTGATCTGTACACTCTCGTGGATGGCTTTGTCACAAGGAACAAA
GCTAGAACAAACCCCACAAACCCAGCGATCGAACTGGGACCCGAGTTCAAAAAGGTGGCG
AGCTTCCTTAGCCGGTTCAAGTCCATCCCGAGTATAGTCGAGCTGGATAGCCTTAAGGTC
TCTGGTGATGTCGGCTTTGGCTCGGGCGTTGTTCTCAAGGGCAAAGTGTCGGTGAAGGCA
AACTCCGGGACAAAACTTGAAATTCCCGATAATGCGGTGGTCAAGGATAAGGACATCAAC
GGTCCAGAGGATCTGTGAAGATAGTTTAAAGATCCCTGATGCAGTCTTTTTCTGTTTTCC
TCTTCTTATTATACACGAAAGCACTTTTGATTGAACT

QA 2 698 2 698
DS 



CO CL1907Contig2 155 2 4 U
AGGGATCTTTAAACTATTCTTCACAGATCCTCTGGACCGTTGATGTCCTTATCCTTGACC
ACCGCATTATCGGGAATTTCAAGTTTTGTCCCGGAGTTTGCCTTCCCCGACACTTTGCCC
TTGAAAACAACGCCCGAGCCAAAGCCGACATCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2CG27JQ U 1
AF RR2C180JQ U 28
BS 1 134 RR2CG27JQ
BS 135 135 RR2C180JQ
BS 136 152 RR2CG27JQ
BS 153 155 RR2C180JQ

RD RR2CG27JQ 155 0 0
AGGGATCTTTAAACTATTCTTCACAGATCCTCTGGACCGTTGATGTCCTTATCCTTGACC
ACCGCATTATCGGGAATTTCAAGTTTTGTCCCGGAGTTTGCCTTCCCCGACACTTTGCCC
TTGAAAACAACGCCTGAGCCAAAGCCGACATC
CCC

QA 1 152 1 152
DS 

RD RR2C180JQ 128 0 0
TCCC
CTGGACCGTTGATGTCCTTATCCTTGACCCCCGCATTATCGGGAATTTCAAGTTTTGTCC
CGGAGTTTGCCTTCCCCGACCCTTTGCCCTTGAAAACAACGCCCGAGCCAAAGCCGACAT
CCCC

QA 5 128 5 128
DS 



AS 1 3

CO CL1908Contig1 1184 3 17 U
GGTAAATGATCATCTTTTATTGGAATACTTATTTAGTACAATATAGATAGAACAAGCTCC
TTATCTATGAAGCAAGTAGTAGAGATATGAAGATGATCATGATGGTGGGAAAAAGTGTTT
CATGCATCTGCGAGCTTCTTCTTCTGGTTCTGGAATGAGAGGTTTGGGCGGCGGAAATAT
CGTTTGGCAGGGTTCTTTGTAGTACCGTTAATAAAGCTTTGGTACCATTTGCCAGATTCT
TTGAGATTTCTATCATCGAGGTTTGTCCAGTTAACGTAACTAAGCCCGAATCTAAAGGTA
AAACCTTTGCAGAATTCATAATTGTCTCCAAGAGCCCATGCAAAGTATCCTTTTATGTTG
ACACCCTTCTCCCTGATGACCTTACGGAGAAAACATAGATGACTGCAGAGATAATCGATC
CGCTTGGAATCGGCAATAGCTTCCTCACGGGTTTCTTCACCGGGAGTACTGAATCCATTC
TCAGTGATATAGATCAAAGGGTTATTGTATTTGGTTTTGAAGTAGTCCATAACGTAATAA
ATGCCTTTTGGGTAGTAATAGGCATTGCCGTTTTTT*GCGTCTTTTACGAACAGTGGACC
AAGATTTTCACCACGTGAATTGTTATATGTGAGCTTTACGCCTGGGTCCATCATAGCAGT
GTGATTTGCCCATGAAACTGGGTTAGGTTTTTGCTGGGCGTACTGAGTGGTGTAGTAATT
GAGACCAAGAAAATCATATGAACCCGCAACGAGTTCTGCTTCTGCTTCCGTGAAATTGGG
AAGCCGACTACCCACAATTTGTCTCATGATGTCTGGGTATCTACCCTTTGTTAGCGGCTC
CATGAACCATCCCAAGAAGAATTCTTTCATCCTATCAGCTGCATCTTTGCTGGCTTTGTC
AGTGGCATCAAACGGAAGAAACCATCTAGTTATCATCACTGGTCCGATCTTCCCTCTTTG
AAACTTATATTTTGTCCTGTAAACATCGACCGCCGCAGCATGAGCAAGAAGCTGGTTATG
TGCAACTATATAAGGTTCTGTTGAAGAATTTCCGCCGTAACATCTGTCATCAACCTCCGG
AGAGCATCGACCAGGTGCATCTGTTCCGATTGCATAGCCTCTCGTAGGCACTGTGTACAG
CTGGTTGATCGTGATCCAGTTCTTCACCTTTCCACCAAATTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F057JQ U 1
AF RR2AB96JQ U 24
AF RR2AB96TF C 435
BS 1 54 RR2F057JQ
BS 55 55 RR2AB96JQ
BS 56 284 RR2F057JQ
BS 285 285 RR2AB96JQ
BS 286 295 RR2F057JQ
BS 296 296 RR2AB96JQ
BS 297 476 RR2F057JQ
BS 477 477 RR2AB96JQ
BS 478 576 RR2F057JQ
BS 577 577 RR2AB96JQ
BS 578 654 RR2F057JQ
BS 655 655 RR2AB96JQ
BS 656 674 RR2F057JQ
BS 675 675 RR2AB96JQ
BS 676 682 RR2F057JQ
BS 683 754 RR2AB96JQ
BS 755 1184 RR2AB96TF

RD RR2F057JQ 682 0 0
GGTAAATGATCATCTTTTATTGGAATACTTATTTAGTACAATATAGATAGAACACGCTCC
TTATCTATGAAGCAAGTAGTAGAGATATGAAGATGATCATGATGGTGGGAAAAAGTGTTT
CATGCATCTGCGAGCTTCTTCTTCTGGTTCTGGAATGAGAGGTTTGGGCGGCGGAAATAT
CGTTTGGCAGGGTTCTTTGTAGTACCGTTAATAAAGCTTTGGTACCATTTGCCAGATTCT
TTGAGATTTCTATCATCGAGGTTTGTCCAGTTAACGTAACTAAGTCCGAATCTAACGGTA
AAACCTTTGCAGAATTCATAATTGTCTCCAAGAGCCCATGCAAAGTATCCTTTTATGTTG
ACACCCTTCTCCCTGATGACCTTACGGAGAAAACATAGATGACTGCAGAGATAATCGATC
CGCTTGGAATCGGCAATAGCTTCCTCACGGGTTTCTTCACCGGGAGTACTGAATCCGTTC
TCAGTGATATAGATCAAAGGGTTATTGTATTTGGTTTTGAAGTAGTCCATAACGTAATAA
ATGCCTTTTGGGTAGTAATAGGCATTGCCGTTTTTTTGCGTCTTTTACGAACAGTGGACC
AAGATTTTCACCACGTGAATTGTTATATGTGAGCTTTACGCCTGGGTCCATCATGGCAGT
GTGATTTGCCCATGTAACTGGG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2AB96JQ 731 0 0
AATACTTATTTAGTACAATATAGATAGAACAAGCTCCTTATCTATGAAGCAAGTAGTAGA
GATATGAAGATGATCATGATGGTGGGAAAAAGTGTTTCATGCATCTGCGAGCTTCTTCTT
CTGGTTCTGGAATGAGAGGTTTGGGCGGCGGAAATCTTGTTTGGCAGGGTTCTTTGTAGT
ACCGTTAATAAAGCTTTGGTACCATTTGCCAGATTCTTTGAGATTTCTATCATCGAGGTT
TGTCCAGTTAACGTAACTAAGCCCGAATCTAAAGGTAAAACCTTTGCAGAATTCATAATT
GTCTCCAAGAGCCCATGCAAAGTATCCTTTTATGTTGACACCCTTCTCCCTGATGACCTT
ACGGAGAAAACATAGATGACTGCAGAGATAATCGATCCGCTTGGAATCGGCAATAGCTTC
CTCACGGGTTTCTTCACCGGGAGTACTGAATCCATTCTCAGTGATATAGATCAAAGGGTT
ATTGTATTTGGTTTTGAAGTAGTCCATAACGTAATAAATGCCTTTTGGGTAGTAATAGGC
ATTGCCGTTTTTT*GCGTCTTTTACGAACAGTGGACCAAGATTTTCACCACGTGAATTGT
TATATGTGAGCTTTACGCCTGGGTCCATCATAGCAGTGTGATTTGCCCATGAAACTGGGT
TAGGTTTTTGCTGGGCGTACTGAGTGGTGTAGTAATTGAGACCAAGAAAATCATATGAAC
CCGCAACGAGT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2AB96TF 750 0 0
AATAGCTTCCTCACGGGTTTCTTCACCGGGAGTACTGAATCCATTCTCAGTGATATAGAT
CAAAGGGTTATTGTATTTGGTTTTGAAGTAGTCCATAACGTAATAAATGCCTTTTGGGTA
GTAATAGGCATTGCCGTTTTTT*GCGTCTTTTACGAACAGTGGACCAAGATTTTCACCAC
GTGAATTGTTATATGTGAGCTTTACGCCTGGGTCCATCATAGCAGTGTGATTTGCCCATG
AAACTGGGTTAGGTTTTTGCTGGGCGTACTGAGTGGTGTAGTAATTGAGACCAAGAAAAT
CATATGAACCCGCAACGAGTTCTGCTTCTGCTTCCGTGAAATTGGGAAGCCGACTACCCA
CAATTTGTCTCATGATGTCTGGGTATCTACCCTTTGTTAGCGGCTCCATGAACCATCCCA
AGAAGAATTCTTTCATCCTATCAGCTGCATCTTTGCTGGCTTTGTCAGTGGCATCAAACG
GAAGAAACCATCTAGTTATCATCACTGGTCCGATCTTCCCTCTTTGAAACTTATATTTTG
TCCTGTAAACATCGACCGCCGCAGCATGAGCAAGAAGCTGGTTATGTGCAACTATATAAG
GTTCTGTTGAAGAATTTCCGCCGTAACATCTGTCATCAACCTCCGGAGAGCATCGACCAG
GTGCATCTGTTCCGATTGCATAGCCTCTCGTAGGCACTGTGTACAGCTGGTTGATCGTGA
TCCAGTTCTTCACCTTTCCACCAAATTCCC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 5

CO CL1909Contig1 740 5 6 U
GGAATGATGAAATGTAATTTTTTTTTTAAGTAAACAGACACGAGGCATTCAACAAATGAA
CATACATGATGCCATAGTATGTGTAATACTAGTGTCCGAATCATCCAATCTCCACGGTAG
TATATATATAAAAGTATGCTCACAACTTGTCTTTATGTAAGAAATTGTTCCTGGAGTTGT
TCCTCTGTAACAAAGAAGGCATGGAAGCCATATGGGACCCTATGCGGCAGATCCACCACC
GCCACTGGCTCGGCCGACATTGTTTTTGCGTCTATCACATTCACACATGATTTCCCTGTG
TTTTCATCATGAACAAAGAAGATCAAGTAACCATCATCTTCTTCCCCTGCCTCACGAGGG
ACAAATATAGCCTCTGAACCGTATCTGCCTTGACCCAGATCATAGATTCCCATGATATTG
CCTCCTACTTCTAGCATTGTTTTACCTGTCTCAGCTTCCGCATGCAGATCAAACTTGATA
ATTCCTGTAACCTTAGCGATACTGTCCAGGATTGTTCCATATACATATCGCTGTTTCTTT
CCAGTGTAGCACTCGTTGATTCTGGGGAAATCAACTGCAGATGCCGATAATTTTTTCTGG
GAAGCTGAGCCCGTTTTCATGTTAAATCTCATTTCGTACAGTTCGTTGCTAAAATTCTCG
AGTTTTTCTTTCACATTCCCGCTAACCATGTCAAGATCTGGATTCTCAAGGCGACAAGTG
ATGAGGACGACTTCATCCTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN33JQ U 97
AF RR2AU83JQ U 1
AF RR2GO56JQ U 1
AF RR2F383JQ U 1
AF RR2H946JQ U 1
BS 1 162 RR2AU83JQ
BS 163 163 RR2GO56JQ
BS 164 390 RR2AU83JQ
BS 391 391 RR2F383JQ
BS 392 461 RR2AU83JQ
BS 462 740 RR2F383JQ

RD RR2GN33JQ 306 0 0
CGAATCATCCAATCTCCACGGTAGTATATATATAAAAGTATGCTCACAACTTGTCTTTAT
GTAAGAAATTGTTCCTGGAGTTGTTCCTCTGTAACAAAGAAGGCATGGAAGCCATATGGG
ACCCTATGCGGGAGATCCACCACAGCCACTGGCTCGGCCGACATTGTTTTTGCGTCTATC
ACATTCACACATGATTTCCCTGTGTTTTCATCATGAACAAAGAAAATCAAGTAACCATCA
TCTTCTTCCCCTGCCTCACGAGGGACAAATATAGCCTCTGAACCGTATCTGCCTTGACCC
AAATCA

QA 1 306 1 306
DS 

RD RR2AU83JQ 462 0 0
GGAATGATGAAATGTAATTTTTTTTTTAAGTAAACAGACACGAGGCATTCAACAAATGAA
CATACATGATGCCATAGTATGTGTAATACTAGTGTCCGAATCATCCAATCTCCACGGTAG
TATATATATAAAAGTATGCTCACAACTTGTCTTTATGTAAGAGATTGTTCCTGGAGTTGT
TCCTCTGTAACAAAGAAGGCATGGAAGCCATATGGGACCCTATGCGGCAGATCCACCACC
GCCACTGGCTCGGCCGACATTGTTTTTGCGTCTATCACATTCACACATGATTTCCCTGTG
TTTTCATCATGAACAAAGAAGATCAAGTAACCATCATCTTCTTCCCCTGCCTCACGAGGG
ACAAATATAGCCTCTGAACCGTATCTGCCTCGACCCAGATCATAGATTCCCATGATATTG
CCTCCTACTTCTAGCATTGTTTTACCTGTCTCAGCTTCCGC
C

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR2GO56JQ 717 0 0
GGAATGATGAAATGTAATTTTTTTTT*AAGTAAACAGACACGAGGCATTCAACAAATGAA
CATACATGATGCCATAGTATGTGTAATACTAGTGTCCGAATCATCCAATCTCCACGGTAG
TATATATATAAAAGTATGCTCACAACTTGTCTTTATGTAAGAAATTGTTCCTGGAGTTGT
TCCTCTGTAACAAAGAAGGCATGGAAGCCATATGGGACCCTATGCGGCAGATCCACCACA
GCCACTGGCTCGGCCGACATTGTTTTTGCGTCTATCACATTCACACATGATTTCCCTGTG
TTTTCATCATGAACAAAGAAAATCAAGTAACCATCATCTTCTTCCCCTGCCTCACGAGGG
ACAAATATAGCCTCTGAACCGTATCTGCCTTGACCCAGATCATAGATTCCCATGATATTG
CCTCCTACTTCTAGCATTGTTTTACCTGTCTCAGCTTCCGCATGCAGATCAAACTTGATA
ATTCCTCTAACCTTAGCAATACTGTCCAGGATTGTTCCATATACATATCGCTGTTTCTTT
CCAGTGTAGCACTCGTTGATTCTGGGGAAATCAACTGCAGATGCCGATAATTTTTTCTGG
GAAGCTGAGCCCGTTTTCATGTTAAATCTCATTTCGTACAGCTCGTTGCTAAAATTCTCG
AGTTTTTCTTTCACATTCCCGCTAACCATGTCAAGATCTGGATTCTCAAGGCGACAA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2F383JQ 740 0 0
GGAATGATGAAATGTAATTTTTTTTTTAAGTAAACAGACACGAGGCATTCAACAAATGAA
CATACATGATGCCATAGTATGTGTAATACTAGTGTCCGAATCATCCAATCTCCACGGTAG
TATATATATAAAAGTATGCTCACAACTTGTCTTTATGTAAGAGATTGTTCCTGGAGTTGT
TCCTCTGTAACAAAGAAGGCATGGAAGCCATATGGGACCCTATGCGGCAGATCCACCACC
GCCACTGGCTCGGCCGACATTGTTTTTGCGTCTATCACATTCACACATGATTTCCCTGTG
TTTTCATCATGAACAAAGAAGATCAAGTAACCATCATCTTCTTCCCCTGCCTCACGAGGG
ACAAATATAGCCTCTGAACCGTATCTGCCTTGACCCAGATCATAGATTCCCATGATATTG
CCTCCTACTTCTAGCATTGTTTTACCTGTCTCAGCTTCCGCATGCAGATCAAACTTGATA
ATTCCTGTAACCTTAGCGATACTGTCCAGGATTGTTCCATATACATATCGCTGTTTCTTT
CCAGTGTAGCACTCGTTGATTCTGGGGAAATCAACTGCAGATGCCGATAATTTTTTCTGG
GAAGCTGAGCCCGTTTTCATGTTAAATCTCATTTCGTACAGTTCGTTGCTAAAATTCTCG
AGTTTTTCTTTCACATTCCCGCTAACCATGTCAAGATCTGGATTCTCAAGGCGACAAGTG
ATGAGGACGACTTCATCCTC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2H946JQ 727 0 0
GGAATGATGAAATGTAATTTTTTTTTTAAGTAAACAGACACGAGGCATTCAACAAATGAA
CATACATGATGCCATAGTATGTGTAATACTAGTGTCCGAATCATCCAATCTCCACGGTAG
TATATATATAAAAGTATGCTCACAACTTGTCTTTATGTAAGAAATTGTTCCTGGAGTTGT
TCCTCTGTAACAAAGAAGGCATGGAAGCCATATGGGACCCTATGCGGCAGATCCACCACC
GCCACTGGCTCGGCCGACATTGTTTTTGCGTCTATCACATTCACACATGATTTCCCTGTG
TTTTCATCATGAACAAAGAAGATCAAGTAACCATCATCTTCTTCCCCTGCCTCACGAGGG
ACAAATATAGCCTCTGAACCGTATCTGCCTTGACCCAGATCATAGATTCCCATGATATTG
CCTCCTACTTCTAGCATTGTTTTACCTGTCTCAGCTTCCGCGTGCAGATCAAACTTGATA
ATTCCTGTAACCTTAGCGATACTGTCCAGGATTGTTCCATATACATATCGCTGTTTCTTT
CCAGTGTAGCACTCGTTGATTCTGGGGAAATCAACTGCAGATGCCGATAATTTTTTCTGG
GAAGCTGAGCCCGTTTTCATGTTAAATCTCATTTCGTACAGTTCGTTGCTAAAATTCTCG
AGTTTTTCTTTCACATTCCCGCTAACCATGTCAAGATCTGGATTCTCAAGGCGACAAGTG
ATGAGGA

QA 1 727 1 727
DS 



AS 2 4

CO CL1910Contig1 789 2 2 U
GGGAAGAACAAAAAGCAAGAGACAGAGAGAACACTGTAAAGGTGAATCGGAAAATCAAAA
AGGAACTAAAACGAGAGCAAAGATGTGTCTCCGTTACTCCCTTTGCTTGATCTTCTTCTC
TCTCATTTTACTCCAAGGTTTTGCTAAGAAGACAGGAGATGTGTCGGAATTGCAGATCGG
GGTTAAGTTTAAGCCAAAAACGTGTGAAGTGAAGGCTCACAAAGGTGATATGATCAAGGT
CCACTACAGGGGGAAACTTACCGATGGAACTGTATTTGATTCGAGCTTTGAAAGGGATGA
ACCGTTCGAGTTTGAGTTAGGAAGTGGCCAGGTTATCAAAGGTTGGGATCAAGGTTTGCT
AGGAGCATGTGTAGGAGAGAAGAGGAAGTTAAAGATACCTGCAAAACTTGGATATGGTGA
ACAAGGCTCTCCTCCAACTATCCCCGGTGGGGCAACGCTGATATTTGACACAGAGCTTAT
TGCGGTAAATGAGAAACGAGGTGGTGGTGCAGCAGAAGAAGGAGGAGAAGAAGACGACGG
AGAAGATGTGGACGACACATATGGAGCTCACGAGCTGTGATTCGATTTCCATTTTCCAAC
CGTCTAGCTTCAGAGTTCTACTAATAAGCAGTCTATGGCCATATTTGTCTTTTAATTTTG
GATGCTTTAGATTTTCTTCTAAAATTATGAACAACAACTTTATTTTGGTTTTGCGTTAAA
CTGTGAAACTGGGCGAAATGTTTCAAAGAAAAAGAAATAGTTGCCACTATAAAATCCCTT
TTCAATAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ56TF U 1
AF RR2BJ56JQ C 1
BS 1 752 RR2BJ56TF
BS 753 789 RR2BJ56JQ

RD RR2BJ56TF 752 0 0
GGGAAGAACAAAAAGCAAGAGACAGAGAGAACACTGTAAAGGTGAATCGGAAAATCAAAA
AGGAACTAAAACGAGAGCAAAGATGTGTCTCCGTTACTCCCTTTGCTTGATCTTCTTCTC
TCTCATTTTACTCCAAGGTTTTGCTAAGAAGACAGGAGATGTGTCGGAATTGCAGATCGG
GGTTAAGTTTAAGCCAAAAACGTGTGAAGTGAAGGCTCACAAAGGTGATATGATCAAGGT
CCACTACAGGGGGAAACTTACCGATGGAACTGTATTTGATTCGAGCTTTGAAAGGGATGA
ACCGTTCGAGTTTGAGTTAGGAAGTGGCCAGGTTATCAAAGGTTGGGATCAAGGTTTGCT
AGGAGCATGTGTAGGAGAGAAGAGGAAGTTAAAGATACCTGCAAAACTTGGATATGGTGA
ACAAGGCTCTCCTCCAACTATCCCCGGTGGGGCAACGCTGATATTTGACACAGAGCTTAT
TGCGGTAAATGAGAAACGAGGTGGTGGTGCAGCAGAAGAAGGAGGAGAAGAAGACGACGG
AGAAGATGTGGACGACACATATGGAGCTCACGAGCTGTGATTCGATTTCCATTTTCCAAC
CGTCTAGCTTCAGAGTTCTACTAATAAGCAGTCTATGGCCATATTTGTCTTTTAATTTTG
GATGCTTTAGATTTTCTTCTAAAATTATGAACAACAACTTTATTTTGGTTTTGCGTTAAA
CTGTGAAACTGGGCGAAATGTTTCAAAGAAAA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2BJ56JQ 789 0 0
GGGAAGAACAAAAAGCAAGAGACAGAGAGAACACTGTAAAGGTGAATCGGAAAATCAAAA
AGGAACTAAAACGAGAGCAAAGATGTGTCTCCGTTACTCCCTTTGCTTGATCTTCTTCTC
TCTCATTTTACTCCAAGGTTTTGCTAAGAAGACAGGAGATGTGTCGGAATTGCAGATCGG
GGTTAAGTTTAAGCCAAAAACGTGTGAAGTGAAGGCTCACAAAGGTGATATGATCAAGGT
CCACTACAGGGGGAAACTTACCGATGGAACTGTATTTGATTCGAGCTTTGAAAGGGATGA
ACCGTTCGAGTTTGAGTTAGGAAGTGGCCAGGTTATCAAAGGTTGGGATCAAGGTTTGCT
AGGAGCATGTGTAGGAGAGAAGAGGAAGTTAAAGATACCTGCAAAACTTGGATATGGTGA
ACAAGGCTCTCCTCCAACTATCCCCGGTGGGGCAACGCTGATATTTGACACAGAGCTTAT
TGCGGTAAATGAGAAACGAGGTGGTGGTGCAGCAGAAGAAGGAGGAGAAGAAGACGACGG
AGAAGATGTGGACGACACATATGGAGCTCACGAGCTGTGATTCGATTTCCATTTTCCAAC
CGTCTAGCTTCAGAGTTCTACTAATAAGCAGTCTATGGCCATATTTGTCTTTTAATTTTG
GATGCTTTAGATTTTCTTCTAAAATTATGAACAACAACTTTATTTTGGTTTTGCGTTAAA
CTGTGAAACTGGGCGAAATGTTTCAAAGAAAAAGAAATAGTTGCCACTATAAAATCCCTT
TTCAATAAT

QA 1 789 1 789
DS 



CO CL1910Contig2 712 2 7 U
GGAAAATCAAAAAGGAACTAAAACGAGAGCAAAGATGTGTCTCCGTTACTCCCTTTGCTT
GATCTTCTTCTCTCTCATTTTACTCCAAGGTTTTGCGAAGAAGACAGGAGATGGTCGGAA
TTGCAGATCGGGGTTAAGTTTAAGCCAACAACGTGTGAAGTGAAGGCTCACAAAGGTGAT
ATGATCAAGGTCCACTACAGGGGAAAACTTACCGATGGAACTGTATTTGATTCGAGCTTT
GAAAGGGATGAACCGTTCGAGTTTGAGTTAGGAAGTGGCCAGGTTATCAAAGGTTGGGAT
CAAGGTTTGCTAGGTGCATGTGTAGGAGAGAAGAGGAAGTTAAAGATACCTGCAAAACTT
GGATATGGTGAACAAGGCTCTCCTCCAACTATCCCCGGTGGGGCAACACTGATATTTGAC
ACACAGCTGATTGCGGTAAATGAAAAACGAGGTGGTGGTGCAGCAGAAGGAGGAGAAGAA
GACGACGGAGAAGATGTGGACGACACATATGGAGCTCACGAGCTGTGATTCGATTTCCAT
TTTCCAACCATTTAGCTTCAGAGTTCTACTAATAAGCAGTCTATGGCCCTTTGTCTTTTA
ATTTTGGATGCTTTAGTTTTTCTTCTAAAATTATGAACAACTTTATTTTGGGTTTGCGTT
AAACTGTGAAACTGGTGCGAAATGCTTCAAATAAAAAGCGAGAGTTGCCACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H193JQ C 1
AF RR2H193TF U 1
BS 1 662 RR2H193TF
BS 663 663 RR2H193JQ
BS 664 681 RR2H193TF
BS 682 682 RR2H193JQ
BS 683 696 RR2H193TF
BS 697 697 RR2H193JQ
BS 698 712 RR2H193TF

RD RR2H193JQ 712 0 0
GGAAAATCAAAAAGGAACTAAAACGAGAGCAAAGATGTGTCTCCGTTACTCCCTTTGCTT
GATCTTCTTCTCTCTCATTTTACTCCAAGGTTTTGCGAAGAAGACAGGAGATGGTCGGAA
TTGCAGATCGGGGTTAAGTTTAAGCCAACAACGTGTGAAGTGAAGGCTCACAAAGGTGAT
ATGATCAAGGTCCACTACAGGGGAAAACTTACCGATGGAACTGTATTTGATTCGAGCTTT
GAAAGGGATGAACCGTTCGAGTTTGAGTTAGGAAGTGGCCAGGTTATCAAAGGTTGGGAT
CAAGGTTTGCTAGGTGCATGTGTAGGAGAGAAGAGGAAGTTAAAGATACCTGCAAAACTT
GGATATGGTGAACAAGGCTCTCCTCCAACTATCCCCGGTGGGGCAACACTGATATTTGAC
ACACAGCTGATTGCGGTAAATGAAAAACGAGGTGGTGGTGCAGCAGAAGGAGGAGAAGAA
GACGACGGAGAAGATGTGGACGACACATATGGAGCTCACGAGCTGTGATTCGATTTCCAT
TTTCCAACCATTTAGCTTCAGAGTTCTACTAATAAGCAGTCTATGGCCCTTTGTCTTTTA
ATTTTGGATGCTTTAGTTTTTCTTCTAAAATTATGAACAACTTTATTTTGGGTTTGCGTT
AAACTGTGAAACTGGTGCGAAATGCTTCAAATAAAAAGCGAGAGTTGCCACT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2H193TF 712 0 0
GGAAAATCAAAAAGGAACTAAAACGAGAGCAAAGATGTGTCTCCGTTACTCCCTTTGCTT
GATCTTCTTCTCTCTCATTTTACTCCAAGGTTTTGCGAAGAAGACAGGAGATGGTCGGAA
TTGCAGATCGGGGTTAAGTTTAAGCCAACAACGTGTGAAGTGAAGGCTCACAAAGGTGAT
ATGATCAAGGTCCACTACAGGGGAAAACTTACCGATGGAACTGTATTTGATTCGAGCTTT
GAAAGGGATGAACCGTTCGAGTTTGAGTTAGGAAGTGGCCAGGTTATCAAAGGTTGGGAT
CAAGGTTTGCTAGGTGCATGTGTAGGAGAGAAGAGGAAGTTAAAGATACCTGCAAAACTT
GGATATGGTGAACAAGGCTCTCCTCCAACTATCCCCGGTGGGGCAACACTGATATTTGAC
ACACAGCTGATTGCGGTAAATGAAAAACGAGGTGGTGGTGCAGCAGAAGGAGGAGAAGAA
GACGACGGAGAAGATGTGGACGACACATATGGAGCTCACGAGCTGTGATTCGATTTCCAT
TTTCCAACCATTTAGCTTCAGAGTTCTACTAATAAGCAGTCTATGGCCCTTTGTCTTTTA
ATTTTGGATGCTTTAGTTTTTCTTCTAAAATTATGAACAACTTTATTTTGGGTTTGCGTT
AA*CTGTGAAACTGGTGCGAA*TGCTTCAAATAAAA*GCGAGAGTTGCCACT

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 4

CO CL1911Contig1 705 4 2 U
AAATAGAATAAAACTGTTAATTTATTTTCATGAGTTTTCCGGAATGCAAATTTGCAAACT
GCAAGTGTTTCTCAGGTGCAGAAAAGTATTAATCTCAAAAGAAACAATTTCTACACGAAC
AACGTTTTTCTTCTGTCAATATATAAACTTTTCTTCTGTGTGGAAGAGAACGGAGCACAA
AGAGAGTGAGAAGCCTCGGGACACGGTAATGTTTAAGCAGATGAAGCTATAGCTTTCCTA
CAGTGGGCTTCAAGCCAGTCCATTGTAACACTCTTTGGCCTCTCAAGTGCAAGTCCAAGA
GCTCTGTCCCATATTAGCTGAGAGCAGATACCAAGACTCCTCGAGACACCAAATAGCACC
GTGTAGTACCTTGCTTCGGTTAGACCATAATGGTTGAGCAACACTCCACTGTGAGCATCA
ACATTTGGCCATGGGTTTTTCACCTTTCCGAGTTCGGTGAGAACAGGAGGCACAACTTCA
TAAAGCTTTGAGACCAGCTGGAAAAGAGGGTCATCAGGCAAATGCTTCAACGCAAACTCT
CTTTGGCATACATATCTTGGATCAGTTTTGCGAAGAACACCATGTCCATATCCAGGAACA
ACCTTGCCACTGTTTAATGTTTTCCAGACATATTCTTTCAACTGGTCTTTCGATATGTTT
TCTCCACATTCCTCCACAACTGATTTGATCCAAAGCAAAACTTCC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2F064JQ U 320
AF RR2AO14JQ U 1
AF RR2AO14TF C 1
AF RR2CS74JQ U 5
BS 1 702 RR2AO14JQ
BS 703 705 RR2CS74JQ

RD RR2F064JQ 330 0 0
GAA
AGCAGATACCAAGACTCCTCGAGACACCAAAGAGCACCGTGTAGTACCTTGCTTCGGTTA
GACCATAATGGTTGAGCAACACTCCACTGTGAGCATCAACATTTGGCCATGGGTTCTTCA
CCTTTCCGAGTTCGGTAAGAATAGGAGGCACAACTTCATAAAGCTTTGAGACCAGCTGGA
AAAGAGGGTCATCAGGCAAATGCTTCAACGCAAACTCTCTTTGGCATACATATCTTGGAT
CAGTTTTGCGAAGAACACCATGTCCATATCCAGGAACAACCTTGCCACTGTTTAATGTTT
TCCAGACATATTCTTTCAACTGATCTT

QA 4 330 4 330
DS 

RD RR2AO14JQ 703 0 0
AAATAGAATAAAACTGTTAATTTATTTTCATGAGTTTTCCGGAATGCAAATTTGCAAACT
GCAAGTGTTTCTCAGGTGCAGAAAAGTATTAATCTCAAAAGAAACAATTTCTACACGAAC
AACGTTTTTCTTCTGTCAATATATAAACTTTTCTTCTGTGTGGAAGAGAACGGAGCACAA
AGAGAGTGAGAAGCCTCGGGACACGGTAATGTTTAAGCAGATGAAGCTATAGCTTTCCTA
CAGTGGGCTTCAAGCCAGTCCATTGTAACACTCTTTGGCCTCTCAAGTGCAAGTCCAAGA
GCTCTGTCCCATATTAGCTGAGAGCAGATACCAAGACTCCTCGAGACACCAAATAGCACC
GTGTAGTACCTTGCTTCGGTTAGACCATAATGGTTGAGCAACACTCCACTGTGAGCATCA
ACATTTGGCCATGGGTTTTTCACCTTTCCGAGTTCGGTGAGAACAGGAGGCACAACTTCA
TAAAGCTTTGAGACCAGCTGGAAAAGAGGGTCATCAGGCAAATGCTTCAACGCAAACTCT
CTTTGGCATACATATCTTGGATCAGTTTTGCGAAGAACACCATGTCCATATCCAGGAACA
ACCTTGCCACTGTTTAATGTTTTCCAGACATATTCTTTCAACTGGTCTTTCGATATGTTT
TCTCCACATTCCTCCACAACTGATTTGATCCAAAGCAAAACT
C

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2AO14TF 703 0 0
AAAT
AGAATAAAACTGTTAATTTATTTTCATGAGTTTTCCGGAATGCAAATTTGCAAACTGCAA
GTGTTTCTCAGGTGCAGAAAAGTATTAATCTCAAAAGAAACAATTTCTACACGAACAACG
TTTTTCTTCTGTCAATATATAAACTTTTCTTCTGTGTGGAAGAGAACGGAGCACAAAGAG
AGTGAGAAGCCTCGGGACACGGTAATGTTTAAGCAGATGAAGCTATAGCTTTCCTACAGT
GGGCTTCAAGCCAGTCCATTGTAACACTCTTTGGCCTCTCAAGTGCAAGTCCAAGAGCTC
TGTCCCATATTAGCTGAGAGCAGATACCAAGACTCCTCGAGACACCAAATAGCACCGTGT
AGTACCTTGCTTCGGTTAGACCATAATGGTTGAGCAACACTCCACTGTGAGCATCAACAT
TTGGCCATGGGTTTTTCACCTTTCCGAGTTCGGTGAGAACAGGAGGCACAACTTCATAAA
GCTTTGAGACCAGCTGGAAAAGAGGGTCATCAGGCAAATGCTTCAACGCAAACTCTCTTT
GGCATACATATCTTGGATCAGTTTTGCGAAGAACACCATGTCCATATCCAGGAACAACCT
TGCCACTGTTTAATGTTTTCCAGACATATTCTTTCAACTGGTCTTTCGATATGTTTTCTC
CACATTCCTCCACAACTGATTTGATCCAAAGCAAAACT
C

QA 5 702 5 702
DS 

RD RR2CS74JQ 701 0 0
AGAATAAAACTGTTAATTTATTTTCATGAGTTTTCCGGAATGCAAATTTGCAAACTGCAA
GTGTTTCTCAGGTGCAGAAAAGTATTAATCTCAAAAGAAACAATTTCTACACGAACAACG
TTTTTCTTCTGTCAATATATAAACTTTTCTTCTGTGTGGAAGAGAACGGAGCACAAAGAG
AGTGAGAAGCCTCGGGACACGGTAATGTTTAAGCAGATGAAGCTATAGCTTTCTTACAGT
GGGCTTCAAGCCAGTCCATTGTAACACTCTTTGGCCTCTCAAGTGCAAGTCCAAGAGCTC
TGTCCCATATTAGCTGAGAGCAGATACCAAGACTCCTCGAGACACCAAATAGCACCGTGT
AGTACCTTGCTTCGGTTAGACCATAATGGTTGAGCAACACTCCACTGTGAGCATCAACAT
TTGGCCATGGGTTTTTCACCTTTCCGAGTTCGGTGAGAACAGGAGGCACAACTTCATAAA
GCTTTGAGACCAGCTGGAAAAGAGGGTCATCAGGCAAATGCTTCAACGCAAACTCTCTTT
GGCATACATATCTTGGATCAGTTTTGCGAAGAACACCATGTCCATATCCAGGAACAACCT
TGCCACTGTTTAATGTTTTCCAGACATATTCTTTCAACTGGTCTTTCGATATGTTTTCTC
CACATTCCTCCACAACTGATTTGATCCAAAGCAAAACTTCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 5

CO CL1912Contig1 679 5 4 U
GGAAAGAGCGCTTGGATAAAACACAAAGAGATAGAGAGAGAATTAGAACAATGGCGGCTA
ATTCAATCTGTTCATCTTTAACAGTGCATTCCATGGCGAACAAGAAGCCTTCACCTTCTG
CAGCAAGAACCATAACTTCAAAGAAGGGCACAACAAGTGGACAGGTGAAGCTACTGACAA
GAGTGGAGCAGCTCAAGCTTCTGACCAAAGCCGAGAAGGCTGGACTTTTATCCTTAGCCG
AGAAATCAGGTTTCTCTCTCTCCACCATCGAGCGTCTCGGACTTCTCACCAAAGCCGAGG
AGTTCGGCGTTCTATCCGCCGCCACGAACCCGGAAACGCCTGGAACGCTCTTCACCCTGA
GCCTCGGTTTACTCCTACTCGGACCGGTTTTCGTCTACTTGGTCCCTGAAGATTACTCTT
GGCAAGTGGTGGTTCGGCTCGTGGTGGCTCTCGTGTCTGTCCTCGGTGGCTCTGCTGCTT
TCGCTGCTTCTGGTTTTGTCTCCAATTTGCAGAAATCTGATTAACCAACCCGGTTATTTC
GATTTTTGTTTAAACCGGGTTGGGTTTTTGTATCGAATTCTAAATTGTTTCAAGCTCATT
TCCCTGTCTCTATGTAAATGGTTAAGCCCGTTATGAGGCCCACTAATAATTAAGCCCATG
AAATATCAACCTCTTTCGA


BQ
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ02JQ C 1
AF RR2FF51JQ C 1
AF RR2BQ02TF U 1
AF RR2FF51TF U 1
AF RR2GS72TF U 5
BS 1 637 RR2BQ02TF
BS 638 638 RR2FF51TF
BS 639 660 RR2BQ02TF
BS 661 679 RR2GS72TF

RD RR2BQ02JQ 660 0 0
GGAAAGAGCGCTTGGATAAAACACAAAGAGATAGAGAGAGAATTAGAACAATGGCGGCTA
ATTCAATCTGTTCATCTTTAACAGTGCATTCCATGGCGAACAAGAAGCCTTCACCTTCTG
CAGCAAGAACCATAACTTCAAAGAAGGGCACAACAAGTGGACAGGTGAAGCTACTGACAA
GAGTGGAGCAGCTCAAGCTTCTGACCAAAGCCGAGAAGGCTGGACTTTTATCCTTAGCCG
AGAAATCAGGTTTCTCTCTCTCCACCATCGAGCGTCTCGGACTTCTCACCAAAGCCGAGG
AGTTCGGCGTTCTATCCGCCGCCACGAACCCGGAAACGCCTGGAACGCTCTTCACCCTGA
GCCTCGGTTTACTCCTACTCGGACCGGTTTTCGTCTACTTGGTCCCTGAAGATTACTCTT
GGCAAGTGGTGGTTCGGCTCGTGGTGGCTCTCGTGTCTGTCCTCGGTGGCTCTGCTGCTT
TCGCTGCTTCTGGTTTTGTCTCCAATTTGCAGAAATCTGATTAACCAACCCGGTTATTTC
GATTTTTGTTTAAACCGGGTTGGGTTTTTGTATCGAATTCTAAATTGTTTCAAGCTCATT
TCCCTGTCTCTATGTAAATGGTTAAGCCCGTTATGAGGCCCACTAATAATTAAGCCCATG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2FF51JQ 660 0 0
GGAAAGAGCGCTTGGATAAAACACAAAGAGATAGAGAGAGAATTAGAACAATGGCGGCTA
ATTCAATCTGTTCATCTTTAACAGTGCATTCCATGGCGAACAAGAAGCCTTCACCTTCTG
CAGCAAGAACCATAACTTCAAAGAAGGGCACAACAAGTGGACAGGTGAAGCTACTGACAA
GAGTGGAGCAGCTCAAGCTTCTGACCAAAGCCGAGAAGGCTGGACTTTTATCCTTAGCCG
AGAAATCAGGTTTCTCTCTCTCCACCATCGAGCGTCTCGGACTTCTCACCAAAGCCGAGG
AGTTCGGCGTTCTATCCGCCGCCACGAACCCGGAAACGCCTGGAACGCTCTTCACCCTGA
GCCTCGGTTTACTCCTACTCGGACCGGTTTTCGTTTACTTGGTCCCTGAAGATTACTCTT
GGCAAGTGGTGGTTCGGCTCGTGGTGGCTCTCGTGTCTGTCCTCGGTGGCTTTGCTGCTT
TCGCTGCTTCTGGTTTTGTCTCCAATTTGCAGAAATTTGATTAACCAACCCGGTTATTTC
GATTTTTGTTTAAACCGGGTTGGGTTTTTGTATCGAATTTTAAATTGTTTCAAGCTCATT
TCCCTGTCTCTATGTAAATGGTTAAGCCCGTTATGAGGCCCACTAATAATTAAGCCCATG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2BQ02TF 660 0 0
GGAAAGAGCGCTTGGATAAAACACAAAGAGATAGAGAGAGAATTAGAACAATGGCGGCTA
ATTCAATCTGTTCATCTTTAACAGTGCATTCCATGGCGAACAAGAAGCCTTCACCTTCTG
CAGCAAGAACCATAACTTCAAAGAAGGGCACAACAAGTGGACAGGTGAAGCTACTGACAA
GAGTGGAGCAGCTCAAGCTTCTGACCAAAGCCGAGAAGGCTGGACTTTTATCCTTAGCCG
AGAAATCAGGTTTCTCTCTCTCCACCATCGAGCGTCTCGGACTTCTCACCAAAGCCGAGG
AGTTCGGCGTTCTATCCGCCGCCACGAACCCGGAAACGCCTGGAACGCTCTTCACCCTGA
GCCTCGGTTTACTCCTACTCGGACCGGTTTTCGTCTACTTGGTCCCTGAAGATTACTCTT
GGCAAGTGGTGGTTCGGCTCGTGGTGGCTCTCGTGTCTGTCCTCGGTGGCTCTGCTGCTT
TCGCTGCTTCTGGTTTTGTCTCCAATTTGCAGAAATCTGATTAACCAACCCGGTTATTTC
GATTTTTGTTTAAACCGGGTTGGGTTTTTGTATCGAATTCTAAATTGTTTCAAGCTCATT
TCCCTGTCTCTATGTAAATGGTTAAGCCCGTTATGAG*CCCACTAATAATTAAGCCCATG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2FF51TF 663 0 0
GGAAAGAGCGCTTGGATAAAACACAAAGAGATAGAGAGAGAATTAGAACAATGGCGGCTA
ATTCAATCTGTTCATCTTTAACAGTGCATTCCATGGCGAACAAGAAGCCTTCACCTTCTG
CAGCAAGAACCATAACTTCAAAGAAGGGCACAACAAGTGGACAGGTGAAGCTACTGACAA
GAGTGGAGCAGCTCAAGCTTCTGACCAAAGCCGAGAAGGCTGGACTTTTATCCTTAGCCG
AGAAATCAGGTTTCTCTCTCTCCACCATCGAGCGTCTCGGACTTCTCACCAAAGCCGAGG
AGTTCGGCGTTCTATCCGCCGCCACGAACCCGGAAACGCCTGGAACGCTCTTCACCCTGA
GCCTCGGTTTACTCCTACTCGGACCGGTTTTCGTCTACTTGGTCCCTGAAGATTACTCTT
GGCAAGTGGTGGTTCGGCTCGTGGTGGCTCTCGTGTCTGTCCTCGGTGGCTCTGCTGCTT
TCGCTGCTTCTGGTTTTGTCTCCAATTTGCAGAAATCTGATTAACCAACCCGGTTATTTC
GATTTTTGTTTAAACCGGGTTGGGTTTTTGTATCGAATTCTAAATTGTTTCAAGCTCATT
TCCCTGTCTCTATGTAAATGGTTAAGCCCGTTATGAGGCCCACTAATAATTAAGCCCATG
AAA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2GS72TF 675 0 0
G
GAGCGCTTGGATAAAACACAAAGAGATAGAGAGA**ATTAGAACAATGGCGGCTAATTCA
ATCTGTTCATCTTTAACAGTGCATTCCATGGCGAACAAGAAGCCTTCACCTTCTGCAGCA
AGAACCATAACTTCAAAGAAGGGCACAACAAGTGGACAGGTGAAGCTACTGACAAGAGTG
GAGCAGCTCAAGCTTCTGACCAAAGCCGAGAAGGCTGGACTTTTATCCTTAGCCGAGAAA
TCAGGTTTCTCTCTCTCCACCATCGAGCGTCTCGGACTTCTCACCAAAGCCGAGGAGTTC
GGCGTTCTATCCGCCGCCACGAACCCGGAAACGCCTGGAACGCTCTTCACCCTGAGCCTC
GGTTTACTCCTACTCGGACCGGTTTTCGTCTACTTGGTCCCTGAAGATTACTCTTGGCAA
GTGGTGGTTCAGCTCGTGGTGGCTCTCGTGTCTGTCCTCGGTGGCTCTGCTGCTTTCGCT
GCTTCTGGTTTTGTCTCCAATTTGCAGAAATCTGATTAACCAACCCGGTTATTTCGATTT
TTGTTTAAACCGGGTTGGGTTTTTGTATCGAATTCTAAATTGTTTCAAGCTCATTTCCCT
GTCTCTATGTAAATGGTTAAGCCCGTTATGAG*CCCACTAATAATTAAGCCCATGAAATA
TCAACCTCTTTCGA

QA 2 675 2 675
DS 



AS 1 5

CO CL1913Contig1 898 5 17 U
GGACTGATCCTTTCTTTCATCTTCAGACCCTGCAAGCAGCACACCACACAAAATACAAAA
TGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCAGGCGTCTCTGCAAACCAATTTTTAAGGAACAAGA
ACCCTCACGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCGGGAAACTCTCATGTTGTTC
TACCATCTCGAAGACCATCATTAGTTCCTCTCGCCATCTTCAAACCCAAAACTAAAGCTG
CTCCCAAAAAGGTTGAGAAGATGAAGCCGAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACATCTG
GTGGGATAGGTTTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGAGTCGTGTTGCTATGATCGGTT
TTGCGGCATCGTTGCTAGGTGAAGCGTTGACAGGGAAAGGTATATTAGCACAGTTGAATC
TGGAGACAGGGATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATTGTTCA
CTCTGTTGGGTGCTATCGGAGCTCTTGGGGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCCA
CCGGACTTGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGACAAAGGCGTCCGATCTGCCCTCGGTCTTA
AAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCAAACGAGTTGTTCGTAGGAAGATTGG
CACAGTTGGGAATAGCATTTTCATTGATAGGAGAGATTATAACCGGGAAAGGAGCATTGG
CTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCCCTCGTCCTCTTAA
ACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCAGCCATTAATCCTGGTAATGGAAAGTTCATTACTGATG
ATGGTGAAGAAAGCTAAACTATTTATGTACTTAAAATTTTTAGTTTGTGAGCCCTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB45TF U 1
AF RR2D745TF U 48
AF RR2C607TF U 25
AF RR2FC04TF U 17
AF RR2C607JQ C 256
BS 1 110 RR2EB45TF
BS 111 111 RR2FC04TF
BS 112 260 RR2EB45TF
BS 261 261 RR2C607TF
BS 262 338 RR2EB45TF
BS 339 339 RR2C607TF
BS 340 520 RR2EB45TF
BS 521 521 RR2FC04TF
BS 522 545 RR2EB45TF
BS 546 570 RR2FC04TF
BS 571 571 RR2C607TF
BS 572 745 RR2FC04TF
BS 746 746 RR2C607JQ
BS 747 767 RR2FC04TF
BS 768 768 RR2C607JQ
BS 769 789 RR2FC04TF
BS 790 898 RR2C607JQ

RD RR2EB45TF 551 0 0
GGACTGATCCTTTCTTTCATCTTCAGACCCTGCAAGCAGCACACCACACAAAATACAAAA
TGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCAGGCGTCTCTGCAAACCAATTTTTA*GGAACAAGA
ACCCTCACGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCGGGAAACTCTCATGTTGTTC
TACCATCTCGAAGACCATCATTAGTTCCTCTCGCCATCTTCAAACCCAAAACTAAAGCTG
CTCCCAAAAAGGTTGAGAAGGTGAAGCCGAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACATCTG
GTGGGATAGGTTTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTT
TTGCGGCATCGTTGCTAGGTGAAGCGTTGACAGGGAAAGGTATATTAGCACAGTTGAATC
TGGAGACAGGGATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATTGTTCA
CTCTGTTGGGTGCTATCGGAGCTCTTGGGGACAGAGGAAA*TTCGTCGACGATCCTCCCA
CCGGA
TTGAGA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2D745TF 600 0 0
GG
AAAATACAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCAGGCGTCTCTGCAAACCAATTTTT
AAGGAACAAGAACCCTCACGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCGGGAAACTC
TCATGTTGTTCTACCATCTCGAAGACCATCATTAGTTCCTCTCGCCATCTTCAAACCCAA
AACTAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAGATGAAGCCGGAGGTTGAAGACGGTATCTT
CGGAACATCTGGTGGGATAGGCTTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGC
TATGATCGGTTTTGCGGCATCGTTGCTAGGTGAAGCGTTGACAGG*AAAGGTATATTAGC
ACAGTTGAATCTGGAGACAGGGATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTT
CATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCTATCGGAGCTCTTGGGGACAGAGGAAAATTCGTCGA
CGATCCTCCCACCGGACTTGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTCCGATCTGC
CCTCGGTCTTAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAAGCAAACGAGTTGTTC

QA 3 600 3 600
DS 

RD RR2C607TF 714 0 0
AGACCCTTCAAGCAGCACACCACACAAAATACAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTT
CAGGCGTCTCTGCAAACCAATTTTTAAGGAACAAGAACCCTCACGCTCAGCCCAAAGTTC
ACCATCTCTTCCTCTCGGGAAACTCTCATGTTGTTCTACCATCTCGAAGACCATCATTAG
TTCCTCTCGCCATCTTCAAACCCAAAACTAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAGATGA
AGCCGAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACATCTGGTGGGATAGGTTTCACGAAGCAGA
ACGAGCTCTTTGTGAGTCGTGTTGCTATGATCGGTTTTGCGGCATCGTTGCTAGGTGAAG
CGTTGACAGGGAAAGGTATATTAGCACAGTTGAATCTGGAGACAGGGATACCGATTTACG
AAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCTATCGGAGCTC
TTGGGGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCCACCGGACTTGAGAAAGCCGTCATTC
CTCCCGACAAAGGCGTCCGATCTGCCCTCGGTCTTAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGT
TCACGAAG*CAAACGAGTTGTTCGTAG*AAGATTGGCACAGTTGGGA*TAGCATTTTCAT
TGATAGGAGAGAT*ATAACCGGGAAAGGAGCATTGGCTCA
CTCACATTGAGACT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2FC04TF 773 0 0
GG
ATCTTCAGACCCTGCAAGCAGCACACCACACAAAATACAAAATGGCTCAAACCATGCTGC
TTACTTCAGGCGTCTCTGCAAACCAATTTTTAAGGAACAAGAACCCTCTCGCTCAGCCCA
AAGTTCACCATCTCTTCCTCTCGGGAAACTCTCATGTTGTTCTACCATCTCGAAGACCAT
CATAAGTTCCTCTCGCCATCTTCAAACCCAAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGA
AGGTGAAGCCGAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACATCTGGTGGGATAGGTTTCACGA
AGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTTTTGCTGCATCGTTGCTGG
GTGAGGCGTTGACAGGGAAAGGTATATTAGCACAGTTGAATCTGGAGACAGGGATACCGA
TTTACGAAGCAGAGCCGTTGCTTCTCTTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCTATCG
GAGCTCTTGGGGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCCACCGGACTTGAGAAAGCCG
TCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTCCGATCTGCCCTCGGTCTTAAAGAACAAGGTCCATTGT
TTGGGTTCACGAAGGCAAACGAGTTGTTCGTAGGAAGATTGGCACAGTTGGGAATAGCAT
TTTCATTGATAGGAGAGATTATAACCGGGAAAGGAGCATTGGCTCAACTCAACATTGAGA
CTGGTAT*CCAATTCAAGATATCGAACCC*TCGTCCTCTTAAACGTTGCTT

QA 3 773 3 773
DS 

RD RR2C607JQ 643 0 0
AGAAGATGAAGCCGAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACATCTGGTGGGATAGGTTTCA
CGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGAGTCGTGTTGCTATGATCGGTTTTGCGGCATCGTTGC
TAGGTGAAGCGTTGACAGGGAAAGGTATATTAGCACAGTTGAATCTGGAGACAGGGATAC
CGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCTA
TCGGAGCTCTTGGGGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCCACCGGACTTGAGAAAG
CCGTCATTCCTCCCGACAAAGGCGTCCGATCTGCCCTCGGTCTTAAAGAACAAGGTCCAT
TGTTTGGGTTCACGAAGGCAAACGAGTTGTTCGTAGGAAGATTGGCACAGTTGGGAATAG
CATTTTCATTGATAGGAGAGATTATAACCGGGAAAGGAGCATTGGCTCAACTCAACATTG
AGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCCCTCGTCCTCTTAAACGTTGCTTTCTTCT
TCTTTGCAGCCATTAATCCTGGTAATGGAAAGTTCATTACTGATGATGGTGAAGAAAGCT
AAACTATTTATGTACTTAAAATTTTTAGTTTGTGAGCCCTCTT

QA 1 643 1 643
DS 



AS 2 5

CO CL1914Contig1 542 2 3 U
GAACTTGGAGAGGAATCACTTAAGCTATGAGGACGAGCTGCTCAGACAACACGGAGAAGC
TGAGAGCCCACGAGTTAAATGCATCCATCTCCCATGGGAAACTGCATCGGATAGTGAAGT
GAGCGAGTATCGTCCAGATATTGTTCTTGGCGCAGATGTAATCTATGATCCGTCATGTTT
CCCTCATCTACTTCGGGTTCTAGTAGCCCTTCTAAGGATACCAACCAAAAGAGACAATGG
CTCTCTCGAGACTGAAAGAAGCAGCCCTGCAGTGGCTTATATCGCATCTCGATCCGCAAT
GCAGACACTTTCAATGCGTTCTTGACACTTGTGGATCAGATGAACCTTTCCATCACAGAC
TTGACCGAAGAACTTAAGCCTCCGTATGAGCTTTTACCGTATATGCATTCGTATGACTGC
TCAAGCGTCCGGCTCTTCTCCATATCCTCCAGATAATCTGTTAAGCATTTTTTGTTACTT
TACAACTGAAACTACAGATTCTTTTGAAACTTGTTCCTATATGTTAGTTGGTTGATCAGG
GC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 

AF RR2BB80TF U 1
AF RR2BB80JQ C 1
BS 1 1 RR2BB80JQ
BS 2 540 RR2BB80TF
BS 541 542 RR2BB80JQ

RD RR2BB80TF 542 0 0
G
AACTTGGAGAGGAATCACTTAAGCTATGAGGACGAGCTGCTCAGACAACACGGAGAAGCT
GAGAGCCCACGAGTTAAATGCATCCATCTCCCATGGGAAACTGCATCGGATAGTGAAGTG
AGCGAGTATCGTCCAGATATTGTTCTTGGCGCAGATGTAATCTATGATCCGTCATGTTTC
CCTCATCTACTTCGGGTTCTAGTAGCCCTTCTAAGGATACCAACCAAAAGAGACAATGGC
TCTCTCGAGACTGAAAGAAGCAGCCCTGCAGTGGCTTATATCGCATCTCGATCCGCAATG
CAGACACTTTCAATGCGTTCTTGACACTTGTGGATCAGATGAACCTTTCCATCACAGACT
TGACCGAAGAACTTAAGCCTCCGTATGAGCTTTTACCGTATATGCATTCGTATGACTGCT
CAAGCGTCCGGCTCTTCTCCATATCCTCCAGATAATCTGTTAAGCATTTTTTGTTACTTT
ACAACTGAAACTACAGATTCTTTTGAAACTTGTTCCTATATGTTAGTTGGTTGATCAGG
GC

QA 2 540 2 540
DS 

RD RR2BB80JQ 542 0 0
GAACTTGGAGAGGAATCACTTAAGCTATGAGGACGAGCTGCTCAGACAACACGGAGAAGC
TGAGAGCCCACGAGTTAAATGCATCCATCTCCCATGGGAAACTGCATCGGATAGTGAAGT
GAGCGAGTATCGTCCAGATATTGTTCTTGGCGCAGATGTAATCTATGATCCGTCATGTTT
CCCTCATCTACTTCGGGTTCTAGTAGCCCTTCTAAGGATACCAACCAAAAGAGACAATGG
CTCTCTCGAGACTGAAAGAAGCAGCCCTGCAGTGGCTTATATCGCATCTCGATCCGCAAT
GCAGACACTTTCAATGCGTTCTTGACACTTGTGGATCAGATGAACCTTTCCATCACAGAC
TTGACCGAAGAACTTAAGCCTCCGTATGAGCTTTTACCGTATATGCATTCGTATGACTGC
TCAAGCGTCCGGCTCTTCTCCATATCCTCCAGATAATCTGTTAAGCATTTTTTGTTACTT
TACAACTGAAACTACAGATTCTTTTGAAACTTGTTCCTATATGTTAGTTGGTTGATCAGG
GC

QA 1 542 1 542
DS 



CO CL1914Contig2 1330 3 32 U
AGACGGCGAAGTCATGGCGGCGAGCGAGAACTCGACAGAGGCAGAGTCACAGCAGTACCT
TCATGTACTCTCCGCTTTCCTCGCAATGGAACCGGTGGACTCCGTCATTGCTCTAGCGAG
AGGCTGTTCAGGAGGATCACTTACGGAGAGTGTCCAGAGGTTTCTGTGGGAGGTTTGCGC
CAAAGCTGCTGCCAATGGTAACGCATCATACGCGAAAAAGTTACTAAAGAAACTTATAAC
TGAAGTTGAGTTGGAGAAAAGTGAAGTGTTAGATGAAGTGTACGAAGAGTATGCTCTTTA
CATGTCAGCGGCTTCTAAGGAGGATGCATTGGTGAAAGAAAACATAAGGATCACCAAGTT
CATCTCTTTTCTTTTCCCAGAAGGTTTATACGAACATCCAAGTTGTCCAAGTTCAAGGAA
GTTAGTTGTTCCGCTGCAGTGTTCATTGAACATGCTTGAAGGAGATACCGGGTGTTCAAT
CTGGCCTTCAAGTTTATTTTTGTCAGAGTTTGTTCTGTCATATCCAGAGTTATTCACTGA
TAAATCCTGTTTTGAGGTTGGTTCTGGAGTTGGTTTGGTCGGAATTTGTCTTGCACATGT
AAAGGCAAAGAAGGTGATATTAACAGACGGAGATCTCTTAACTCTATCTAACATGAAGCT
TAACTTGGAGAGGAATCACTTAAACTATGAGGACGAGCTGCTCAAACAACACGGAGAAGC
TGAGAGCCCACGAGTTAAATGCATCCATCTCCCATGGGAAACTGCATCGGATAGTGAAGT
GAGCGAGTATCGTCCAGATATTGTTCTAGGCGCAGATGTAATCTACGATCCGTCATGTTT
CCCTCATCTACTTCGAGTTCTAGTAGCCCTTTTAAGGAGACCAACCAAAAGAGACAATGG
CTGTCTCGAGACTGAAGGAAGCAGGCCTGCAGTGGCTTATATCGCATCTGTGATCCGCAA
TGCAGACACTTTCAATGCGTTCTTGACACTTGTGGATCAGATGAACCTTTCCACCACAGA
CTTGACGGAAGAACTTAAGCCTCCGTTTGAGCTTTTACCGTATATGCATTCGTATGACCG
CTCAAGCGTCCGGCTCTTCTCCATATCCTCCAGATAATGTGCTTTAAGCATTTTTGTTAC
TTTACAACTGAAACTACAGATTCTTTGAAACTTGTTCCTGTATGGTAGTTGTTTGATCAG
GTCAAAGGTTGGGTTGTTAAAATTGCCGTGAGCGTTTCATCTGGTTGTGGCAAAACAACC
GCAAACACTTTCACTGCTTGTTACTACAAAACGTTAAGAGTTTGGATTTGAAGAAAACTT
ATCATCCTTG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU32TF U 1
AF RR2AB45TF U 3
AF RR2EU32JQ C 591
BS 1 52 RR2EU32TF
BS 53 55 RR2AB45TF
BS 56 72 RR2EU32TF
BS 73 73 RR2AB45TF
BS 74 129 RR2EU32TF
BS 130 130 RR2AB45TF
BS 131 225 RR2EU32TF
BS 226 226 RR2AB45TF
BS 227 378 RR2EU32TF
BS 379 379 RR2AB45TF
BS 380 383 RR2EU32TF
BS 384 384 RR2AB45TF
BS 385 489 RR2EU32TF
BS 490 490 RR2AB45TF
BS 491 495 RR2EU32TF
BS 496 496 RR2AB45TF
BS 497 531 RR2EU32TF
BS 532 532 RR2AB45TF
BS 533 535 RR2EU32TF
BS 536 536 RR2AB45TF
BS 537 683 RR2EU32TF
BS 684 684 RR2EU32JQ
BS 685 691 RR2EU32TF
BS 692 692 RR2AB45TF
BS 693 704 RR2EU32TF
BS 705 705 RR2EU32JQ
BS 706 807 RR2AB45TF
BS 808 808 RR2EU32JQ
BS 809 812 RR2AB45TF
BS 813 813 RR2EU32JQ
BS 814 848 RR2AB45TF
BS 849 1330 RR2EU32JQ

RD RR2EU32TF 707 0 0
AGACGGCGAAGTCATGGCGGCGAGCGAGAACTCGACAGAGGCAGAGTCACAG***TACCT
TCATGTACTCTCTGCTTTCCTCGCAATGGAACCGGTGGACTCCGTCATTGCTCTAGCGAG
AGGCTGTTCCGGAGGATCACTTACGGAGAGTGTCCAGAGGTTTCTGTGGGAGGTTTGCGC
CAAAGCTGCTGCCAATGGTAACGCATCATACGCGAAAAAGTTACTGAAGAAACTTATAAC
TGAAGTTGAGTTGGAGAAAAGTGAAGTGTTAGATGAAGTGTACGAAGAGTATGCTCTTTA
CATGTCAGCGGCTTCTAAGGAGGATGCATTGGTGAAAGAAAACATAAGGATCACCAAGTT
CATCTCTTTTCTTTTCCCTGAAGTTTTATACGAACATCCAAGTTGTCCAAGTTCAAGGAA
GTTAGTTGTTCCGCTGCAGTGTTCATTGAACATGCTTGAAGGAGATACCGGGTGTTCAAT
CTGGCCTTCGAGTTTGTTTTTGTCAGAGTTTGTTCTGTCATATCCAGAGTTGTTCGCTGA
TAAATCCTGTTTTGAGGTTGGTTCTGGAGTTGGTTTGGTCGGAATTTGTCTTGCACATGT
AAAGGCAAAGAAGGTGATATTAACAGACGGAGATCTCTTAACTCTATCTAACATGAAGCT
TAACTTGGAGAGGAATCACTTAA*CTATGAG*ACGAGCTGCTCA
ACA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2AB45TF 846 0 0
GG
GGCGAAGTCATGGCGGCGAGCGAGAACTCGACGGAGGCAGAGTCACAGCAGTACCTTCAT
GTACTCTCCGCTTTCCTCGCAATGGAACCGGTGGACTCCGTCATTGCTCTAGCGAGAGGG
TGTTCAGGAGGATCACTTACGGAGAGTGTCCAGAGGTTTCTGTGGGAGGTTTGCGCCAAA
GCTGCTGCCAATGGTAACGCATCATACGCGAAAAAGTTACTAAAGAAACTTATAACTGAA
GTTGAGTTGGAGAAAAGTGAAGTGTTAGATGAAGTGTATGAAGAGTATGCTCTTTACATG
TCAGCGGCTTCTAAGGAGGATGCATTGGTGAAAGAAAACGTAAGGATCACCAAGTTCATC
TCTTTTCTTTTCCCAGAAGGTTTATACGAACATCCAAGTTGTTCAAGTTCAAGGAAGTTA
GTTGTTCCGCTGCAGTGTTCATTGAACATGCTTGAAGGAGATACCGGGTGTTCAATCTGG
CCTTCAAGTTTATTTTTGTCGGAGTTTGTTCTGTCATATCCAGAGTTATTCACTGATAAA
TCCTGTTTTGAGGTTGGTTCTGGAGTTGGTTTGGTTGGAATTTGTCTTGCACATGTAAAG
GCAAAGAAGGTGATATTAACAGACGGAGATCTCTTAACTCTCTCTAACATGAAGCTTAAC
TTGGAGAGGAATCACTTAAGCTATGAGGACGAGCTGCTCAGACAACACGGAGAAGCTGAG
AGCCCACGAGTTAAATGCATCCATCTCCCATGGGAAACTGCATCGGATAGTGAAGTGAGC
GAGTATCGTCCAGATATTGTTCTTGGCGTAGATGTAATCTACGATCCGTCATGTTTCCCT
CATC

QA 3 846 3 846
DS 

RD RR2EU32JQ 740 0 0
TTGCACATGTAAAGGCAAAGAAGGTGATATTAACAGACGGAGATCTCTTAACTCTATCTA
ACATGAAGCTTAACTTGGAGAGGAATCACTTAAACTATGAGGACGAGCTGCTCAAACAAC
ACGGAGAGGCTGAGAGCTCACGAGTTAAATGCATCCATCTCCCATGGGAAACTGCATCGG
ATAGTGAAGTGAGCGAGTATCGTCCAGATATTGTTCTAGGCGCAGATGTAATCTATGATC
CGTCATGTTTCCCTCATCTACTTCGAGTTCTAGTAGCCCTTTTAAGGAGACCAACCAAAA
GAGACAATGGCTGTCTCGAGACTGAAGGAAGCAGGCCTGCAGTGGCTTATATCGCATCTG
TGATCCGCAATGCAGACACTTTCAATGCGTTCTTGACACTTGTGGATCAGATGAACCTTT
CCACCACAGACTTGACGGAAGAACTTAAGCCTCCGTTTGAGCTTTTACCGTATATGCATT
CGTATGACCGCTCAAGCGTCCGGCTCTTCTCCATATCCTCCAGATAATGTGCTTTAAGCA
TTTTTGTTACTTTACAACTGAAACTACAGATTCTTTGAAACTTGTTCCTGTATGGTAGTT
GTTTGATCAGGTCAAAGGTTGGGTTGTTAAAATTGCCGTGAGCGTTTCATCTGGTTGTGG
CAAAACAACCGCAAACACTTTCACTGCTTGTTACTACAAAACGTTAAGAGTTTGGATTTG
AAGAAAACTTATCATCCTTG

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 3

CO CL1915Contig1 1172 3 14 U
GGGTCCGAATAACAAAGTAAACAAATTTGCTCTCCAAGGGGAAAAGAAAAAAAAAAAGCC
GATCTTGGCTTTTCTCTCTTCTCGACGCAGTCTCTCACCGCCGGCGTGTTTTTCTCCGAA
CGAAGCTGATTCATATTGATATGGAGGGAATACAGAATCCTATCCACCGCACTGTCGAAG
AGGTCTTTAGCGACTTTAAGGGTCGTAGAGCTGGTCTCCTCAAGGCTCTCACATCAGATG
GGCAGCAGTTTTACCTCCAGTGTGACCCTGACAAGGAAAACTTGTGTCTTTATGGACTTC
CTAACGAGACATGGGAGGTTAACCTTCCTGTCGATGAGGTCCCTCCCGAGCTTCCTGAAC
CAGCTTTAGGCATCAACTTTGCAAGGAACGGAATGCCTGAAAAAGACTGGATTACTTTGG
TTGCTGTCCACAGCGACTCTTGGCTCATCTCTGTTGCCTTTTACTTCGGTGCCCGTTTCG
GGTTTGGTAAAAACGAGAGGAAGAGGCTCTTCCAGATGATAAATGATCTCCCAACCCTTT
TCGAGGTTATAACTGGCAATGCAAAGCAATCCAAGGACCAATCTGCTAACCACAACAACA
GTAGCAGAAGCAAACCTAGTGGTGTCAAGCCTCGTCAATCTGAGTCTCACACCAAGGCTT
CAAAGATGTCTCCACCACCAAGAGAAGATGATGAGAGCGGAGAAGACGAGGAAGATGATG
AGCAAGGTGCGGTTTGTGGTGCGTGTGGAGAGAACTATGATGACTTCTGGATATGTTGTG
ACGCTTGTGAGAAATGGTTCCATGGAAAATGCGTGAAGATCACACCCGCCAAGGCTGAGC
ACATCAAACACTACAAGTGTCCGACTTGCAGTACCAGCAAGAAGATGAGAGCTTGAAATG
AAGGTGATAATAACAGTAGGGACTGTGAAAGAAGGATAAAGTTTTCACAGTTGTGAGGAG
AAGGAGAAGAAGAACCAAAAAGGCTTTTGATTGTGTAGTCTTAATGGGATTTAGACAGCT
TTGCAGTTAGTTATGTCTTTGTGCTTTTTTTATTTATATTTTGCTGTTAATGTTTAAATT
CTATGACTAATCTGTCTTATGTTTCTGGAAAATTCTGTCTAGTCTGTTAATTAGTTTTTT
TTTCTCTTCTTAATATAATAAAACAACTATTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV01TF U 1
AF RR2BW09TF U 1
AF RR2BW09JQ C 404
BS 1 656 RR2BW09TF
BS 657 657 RR2BW09JQ
BS 658 703 RR2BW09TF
BS 704 704 RR2BW09JQ
BS 705 712 RR2BW09TF
BS 713 713 RR2BW09JQ
BS 714 726 RR2BW09TF
BS 727 727 RR2BW09JQ
BS 728 753 RR2BW09TF
BS 754 754 RR2BW09JQ
BS 755 785 RR2BW09TF
BS 786 786 RR2BW09JQ
BS 787 800 RR2BW09TF
BS 801 1172 RR2BW09JQ

RD RR2DV01TF 652 0 0
GGGTCCGAATAACAAAGTAAACAAATTTGCTCTCCAAGGGGAAAAGAAAAAAAAAA*GCC
GATCTTGGCTTTTCTCTCTTCTCGACGCAGTCTCTCACCGCCGGCGTGTTTTTCTCCGAA
CGAAGCTGATTCATATTGATATGGAGGGAATACAGAATCCTATCCACCGCACTGTCGAAG
AGGTCTTTAGCGACTTTAAGGGTCGTAGAGCTGGTCTCCTCAAGGCTCTCACATCAGATG
GGCAGCAGTTTTACCTCCAGTGTGACCCTGACAAGGAAAACTTGTGTCTTTATGGACTTC
CTAACGAGACATGGGAGGTTAACCTTCCTGTCGATGAGGTCCCTCCCGAGCTTCCTGAAC
CAGCTTTAGGCATCAACTTTGCAAGGAACGGAATGCCTGAAAAAGACTGGATTACTTTGG
TTGCTGTCCACAGCGACTCTTGGCTCATCTCTGTTGCCTTTTACTTCGGTGCCCGTTTCG
GGTTTGGTAAAAACGAGAGGAAGAGGCTCTTCCAGATGATAAATGATCTCCCAACCCTTT
TCGAGGTTATAACTGGCAATGCAAAGCAATCCAAGGACCAATCTGCTAACCACAACAACA
GTAGCAGAAGCAAACCTAGTGGTGTCAAGCCTCGTCAATCTGAGTCTCACAC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2BW09TF 814 0 0
GGGTCCGAATAACAAAGTAAACAAATTTGCTCTCCAAGGGGAAAAGAAAAAAAAAAAGCC
GATCTTGGCTTTTCTCTCTTCTCGACGCAGTCTCTCACCGCCGGCGTGTTTTTCTCCGAA
CGAAGCTGATTCATATTGATATGGAGGGAATACAGAATCCTATCCACCGCACTGTCGAAG
AGGTCTTTAGCGACTTTAAGGGTCGTAGAGCTGGTCTCCTCAAGGCTCTCACATCAGATG
GGCAGCAGTTTTACCTCCAGTGTGACCCTGACAAGGAAAACTTGTGTCTTTATGGACTTC
CTAACGAGACATGGGAGGTTAACCTTCCTGTCGATGAGGTCCCTCCCGAGCTTCCTGAAC
CAGCTTTAGGCATCAACTTTGCAAGGAACGGAATGCCTGAAAAAGACTGGATTACTTTGG
TTGCTGTCCACAGCGACTCTTGGCTCATCTCTGTTGCCTTTTACTTCGGTGCCCGTTTCG
GGTTTGGTAAAAACGAGAGGAAGAGGCTCTTCCAGATGATAAATGATCTCCCAACCCTTT
TCGAGGTTATAACTGGCAATGCAAAGCAATCCAAGGACCAATCTGCTAACCACAACAACA
GTAGCAGAAGCAAACCTAGTGGTGTCAAGCCTCGTCAATCTGAGTCTCACACCAAG*CTT
CAAAGATGTCTCCACCACCAAGAGAAGATGATGAGAGCGGAGA*GACGAGGA*GATGATG
AGCAAG*TGCGGTTTGTGGTGCGTGTGGAGAGA*CTATGATGACTTCTGGATATGTTGTG
ACGCT*GTGAGAAATGGTTC
ATGGAAATGCGTGA

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2BW09JQ 769 0 0
AGACTGGATTACTTTGGTTGCTGTCCACAGCGACTCTTGGCTCATCTCTGTTGCCTTTTA
CTTCGGTGCCCGTTTCGGGTTTGGTAAAAACGAGAGGAAGAGGCTCTTCCAGATGATAAA
TGATCTCCCAACCCTTTTCGAGGTTATAACTGGCAATGCAAAGCAATCCAAGGACCAATC
TGCTAACCACAACAACAGTAGCAGAAGCAAACCTAGTGGTGTCAAGCCTCGTCAATCTGA
GTCTCACACCAAGGCTTCAAAGATGTCTCCACCACCAAGAGAAGATGATGAGAGCGGAGA
AGACGAGGAAGATGATGAGCAAGGTGCGGTTTGTGGTGCGTGTGGAGAGAACTATGATGA
CTTCTGGATATGTTGTGACGCTTGTGAGAAATGGTTCCATGGAAAATGCGTGAAGATCAC
ACCCGCCAAGGCTGAGCACATCAAACACTACAAGTGTCCGACTTGCAGTACCAGCAAGAA
GATGAGAGCTTGAAATGAAGGTGATAATAACAGTAGGGACTGTGAAAGAAGGATAAAGTT
TTCACAGTTGTGAGGAGAAGGAGAAGAAGAACCAAAAAGGCTTTTGATTGTGTAGTCTTA
ATGGGATTTAGACAGCTTTGCAGTTAGTTATGTCTTTGTGCTTTTTTTATTTATATTTTG
CTGTTAATGTTTAAATTCTATGACTAATCTGTCTTATGTTTCTGGAAAATTCTGTCTAGT
CTGTTAATTAGTTTTTTTTTCTCTTCTTAATATAATAAAACAACTATTG

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 3

CO CL1916Contig1 1199 3 3 U
GGATCTTTATTTGATACCTCAAACTCTCTCTCTCTCTCTTAAAGTCGTTTCCCTAGAAAA
AAATGTCATCCAAAGACAAGAAACCGGTGAGGCCATCAAGTAGCCGAGCCGGTGGAATCC
GCACTCTGTCCGATCTCAATCGAAGGTCTGGTCCTGACTCCGACAGTGATTCCGACAGTC
CTCAGGAATACTACACCGGTGGTGAGAAAAGTGGTATGCTTGTTCAAGATCCTTCGAAGA
AAGACGATGTTGATGAGATATTCAATCAAGCTAGACAACTAGGAGCCGTGGAAGGACCTC
TCGAGACTCCTTCTTCAAGCTCCACGAGCTTTACCGGAACTGGGAGATTGCTTTCAGGAG
AGAGTGTTTCAGCTGGTACTCAACAGCCTGAGCCTGTGGTTCACACCATTGTTTTTTGGG
CTAATGGATTCACCATTGATGATGGTCCTTTGAGGAAGTTGGATGATCCAGAGAACGCTT
CTTTTCTCGAGAGCATTCGAAAGTCTGAGTGTCCGAAAGAGCTTGAGCCTGCTGATAGAA
GAGCCCCTGTTCATGTCAATCTGATGCGGAGGGAAGAGAAATGTCCAGAACGAGAGAAGC
GTAAGGTTTCATTCCAGGGTGTTGGGAGGACTCTAGGTGGTAGCAGCAACGACAGCAGCG
GAAGTGGCTCATCAATAGCTCCAGATGCCGCCGCCGCCATTCCCATCCAAACCAACCAAA
CCGGTTTAGCAGCACCATCACCAACTCCAAGTCTTGTAATAGATGAAACCCTTCCGACCA
CATCGATCCAGATTAGACTAACGGATGGGACCAGGCTTGTGGGCAAGTTTAATCTTCATC
ACACTGTCAACGACATTCGAGGTTTCATCGACTCTTCTCGACCTGGAGCGCCGGTTAACT
ACCAGCTTCAGACAATGGGGTTCCCACCTGCGCCCTTGACTGATCCCACTCAGACCATTG
AACAAGCTGGTCTCGCCAACTCTGTTGTTCTTCAGAAGTTTTAGAAGATTTCTTGTTTTT
TTTTTGTCTTTCTATATGGATTATGATCAGAGCTTCATAACTGTTATTGTAATCATAAAA
AAAGATGGTTGGCATGTCTGTAAGTTACTTATACGCTGCATAAATGATCTCTCATGTGGG
AAGAAAAGACTTGTGTTATAGTTTTTCTTTTTTTTTGTCAACGTGTTATAGATTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA44TF U 1
AF RR2FD67TF U 87
AF RR2GA44JQ C 423
BS 1 720 RR2GA44TF
BS 721 769 RR2FD67TF
BS 770 1199 RR2GA44JQ

RD RR2GA44TF 720 0 0
GGATCTTTATTTGATACCTCAAACTCTCTCTCTCTCTCTTAAAGTCGTTTCCCTAGAAAA
AAATGTCATCCAAAGACAAGAAACCGGTGAGGCCATCAAGTAGCCGAGCCGGTGGAATCC
GCACTCTGTCCGATCTCAATCGAAGGTCTGGTCCTGACTCCGACAGTGATTCCGACAGTC
CTCAGGAATACTACACCGGTGGTGAGAAAAGTGGTATGCTTGTTCAAGATCCTTCGAAGA
AAGACGATGTTGATGAGATATTCAATCAAGCTAGACAACTAGGAGCCGTGGAAGGACCTC
TCGAGACTCCTTCTTCAAGCTCCACGAGCTTTACCGGAACTGGGAGATTGCTTTCAGGAG
AGAGTGTTTCAGCTGGTACTCAACAGCCTGAGCCTGTGGTTCACACCATTGTTTTTTGGG
CTAATGGATTCACCATTGATGATGGTCCTTTGAGGAAGTTGGATGATCCAGAGAACGCTT
CTTTTCTCGAGAGCATTCGAAAGTCTGAGTGTCCGAAAGAGCTTGAGCCTGCTGATAGAA
GAGCCCCTGTTCATGTCAATCTGATGCGGAGGGAAGAGAAATGTCCAGAACGAGAGAAGC
GTAAGGTTTCATTCCAGGGTGTTGGGAGGACTCTAGGTGGTAGCAGCAACGACAGCAGCG
GAAGTGGCTCATCAATAGCTCCAGATGCCGCCGCCGCCATTCCCATCCAAACCAACCAAA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2FD67TF 683 0 0
GG
GAGGCCATCAAGTAGCCGAGCCGGTGGAATCCGCACTCTGTCCGATCTCAATCGAAGGTC
TGGTCCTGACTCCGACAGTGATTCCGACAGTCCTCAGGAATACTACACCGGTGGTGAGAA
AAGTGGTATGCTTGTTCAAGATCCTTCGAAGAAAGACGATGTTGATGAGATATTCAATCA
AGCTAGACAACTAGGAGCCGTGGAAGGACCTCTCGAGACTCCTTCTTCAAGCTCCACGAG
CTTTACCGGAACTGGGAGATTGCTTTCAGGAGAGAGTGTTTCAGCTGGTACTCAACAGCC
TGAGCCTGTGGTTCACACCATTGTTTTTTGGGCTAATGGATTCACCATTGATGATGGTCC
TTTGAGGAAGTTGGATGATCCAGAGAACGCTTCTTTTCTCGAGAGCATTCGAAAGTCTGA
GTGCCCGAAAGAGCTTGAGCCTGCTGATAGAAGAGCCCCTGTTCATGTCAATCTGATGCG
GAGGGAAGAGAAATGTCCAGAACGAGAGAAGCGTAAGGTTTCATTCCAGGGTGTTGGGAG
GACTCTAGGTGGTAGCAGCAACGACAGCAGCGGAAGTGGCTCATCAATAGCTCCAGATGC
CGCCGCCGCCATTCCCATCCAAACCAACCAAACCGGTTTAGCAGCACCATCACCAACTCC
AAGTCTTGTAATAGATGAAAC

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2GA44JQ 777 0 0
AATGGATTCACCATTGATGATGGTCCTTTGAGGAAGTTGGATGATCCAGAGAACGCTTCT
TTTCTCGAGAGCATTCGAAAGTCTGAGTGTCCGAAAGAGCTTGAGC*TGCTGATAGAAGA
GCCCCTGTTCATGTCAATCTGATGCGGAGGGAAGAGAAATGTCCAGAACGAGAGAAGCGT
AAGGTTTCATTCCAGGGTGTTGGGAGGACTCTAGGTGGTAGCAGCAACGACAGCAGCGGA
AGTGGCTCATCAATAGCTCCAGATGCCGCCGCCGCCATTCCCATCCAAACCAACCAAACC
GGTTTAGCAGCACCATCACCAACTCCAAGTCTTGTAATAGATGAAACCCTTCCGACCACA
TCGATCCAGATTAGACTAACGGATGGGACCAGGCTTGTGGGCAAGTTTAATCTTCATCAC
ACTGTCAACGACATTCGAGGTTTCATCGACTCTTCTCGACCTGGAGCGCCGGTTAACTAC
CAGCTTCAGACAATGGGGTTCCCACCTGCGCCCTTGACTGATCCCACTCAGACCATTGAA
CAAGCTGGTCTCGCCAACTCTGTTGTTCTTCAGAAGTTTTAGAAGATTTCTTGTTTTTTT
TTTGTCTTTCTATATGGATTATGATCAGAGCTTCATAACTGTTATTGTAATCATAAAAAA
AGATGGTTGGCATGTCTGTAAGTTACTTATACGCTGCATAAATGATCTCTCATGTGGGAA
GAAAAGACTTGTGTTATAGTTTTTCTTTTTTTTTGTCAACGTGTTATAGATTTTCTT

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 5

CO CL1917Contig1 689 5 8 U
GGAAATCGAGTTGACAAATTTAAAAAAAAAAAGAAATCGCGAAGAACCCTAATTTGGAGA
TTGAAGATGATGATGATGATGAAATCCGTTTTCTCAAAGTACGCTCGTGTTCGTGTTCGC
TGCGCCAGAAATTTCTCTACAGGTCGGCCTTCCTCCTCACATTCTCCCAAGGACACTTCT
CTGGGGAGGCCTCCTCCTCTCAGCGAGGACACTAAGACGATTCTTCCACTCTGGCAGCAA
ATTTT*CGAGATGGGGAAGAAAACTGCATGTGGAGCCTTTGGACTGGCTTCTGGATATAA
ACTCTCTTCTGTTGTACTGCCTGATCATTCAGAACCTCTTATAAGAGAGGAACAGTTTAC
TAGAGCTTGTATGGAAAGGATTAAAAAATTCTTGATCGACTACGCTGACAAGTAGTTGAA
GAGGCTGGTGGAAGGAAGAGTTTGATTCTTACTTAAGTTGCAATAACAAGATTTCTGTTC
CAACTATCTTTATCTATTTATGCTGTAATAACAAAGACTGATCTCATCATAGTTTACGTT
TTCTGTTTTGTTTTGTGGTTTGTCATGTCTTCTTCTTTGGATTGTTGGTCATCTTCATGA
ATTAAGTTGTCTCTCTCTCTCTCTTCTTACACTATCATTTGCTTGCTTTTGGGTGTTCCA
TCTTTCCATCTATAAATCAAAATAGTTGA


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C362JQ C 1
AF RR2C362TF U 1
AF RR2FT77JQ C 1
AF RR2FT77TF U 1
AF RR2FE70TF U 8
BS 1 31 RR2C362TF
BS 32 32 RR2FT77TF
BS 33 245 RR2C362TF
BS 246 246 RR2FT77TF
BS 247 438 RR2C362TF
BS 439 439 RR2FT77TF
BS 440 646 RR2C362TF
BS 647 689 RR2FE70TF

RD RR2C362JQ 647 0 0
GGAAATCGAGTTGACAAATTTAAAAAAAAAA*GAAATCGCGAAGAACCCTAATTTGGAGA
TTGAAGATGATGATGATGATGAAATCCGTTTTCTCAAAGTACGCTCGTGTTCGTGTTCGC
TGCGCCAGAAATTTCTCTACAGGTCGGCCTTCCTCCTCACATTCTCCCAAGGACACTTCT
CTGGGGAGGCCTCCTCCTCTCAGCGAGGACACTAAGACGATTCTTCCACTCTGGCAGCAA
ATTTTTCGAGATGGGGAAGAAAACTGCATGTGGAGCCTTTGGACTGGCTTCTGGATATAA
ACTCTCTTCTGTTGTACTGCCTGATCATTCAGAACCTCTTATAAGAGAGGAACAGTTTAC
TAGAGCTTGTATGGAAAGGATTAAAAAATTCTTGATCGACTACGCTGACAAGTAGTTGAA
GAGGCTGGTGGAAGGAAGGGTTTGATTCTTACTTAAGTTGCAATAACAAGATTTCTGTTC
CAACTATCTTTATCTATTTATGCTGTAATAACAAAGACTGATCTCATCATAGTTTACGTT
TTCTGTTTTGTTTTGTGGTTTGTCATGTCTTCTTCTTTGGATTGTTGGTCATCTTCATGA
ATTAAGTTGTCTCTCTCTCTCTCTTCTTACACTATCATTTGCTTGC
C

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2C362TF 654 0 0
GGAAATCGAGTTGACAAATTTAAAAAAAAAA*GAAATCGCGAAGAACCCTAATTTGGAGA
TTGAAGATGATGATGATGATGAAATCCGTTTTCTCAAAGTACGCTCGTGTTCGTGTTCGC
TGCGCCAGAAATTTCTCTACAGGTCGGCCTTCCTCCTCACATTCTCCCAAGGACACTTCT
CTGGGGAGGCCTCCTCCTCTCAGCGAGGACACTAAGACGATTCTTCCACTCTGGCAGCAA
ATTTTTCGAGATGGGGAAGAAAACTGCATGTGGAGCCTTTGGACTGGCTTCTGGATATAA
ACTCTCTTCTGTTGTACTGCCTGATCATTCAGAACCTCTTATAAGAGAGGAACAGTTTAC
TAGAGCTTGTATGGAAAGGATTAAAAAATTCTTGATCGACTACGCTGACAAGTAGTTGAA
GAGGCTGGTGGAAGGAAGGGTTTGATTCTTACTTAAGTTGCAATAACAAGATTTCTGTTC
CAACTATCTTTATCTATTTATGCTGTAATAACAAAGACTGATCTCATCATAGTTTACGTT
TTCTGTTTTGTTTTGTGGTTTGTCATGTCTTCTTCTTTGGATTGTTGGTCATCTTCATGA
ATTAAGTTGTCTCTCTCTCTCTCTTCTTACACTATCATTTGCTTGC
CAAAAAAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2FT77JQ 613 0 0
GGAAATCGAGTTGACAAATTTAAAAAAAAAAAGAAATCGCGAAGAACCCTAATTTGGAGA
TTGAAGATGATGATGATGATGAAATCCGTTTTCTCAAAGTACGCTCGTGTTCGTGTTCGC
TGCGCCAGAAATTTCTCTACAGGTCGGCCTTCCTCCTCACATTCTCCCAAGGACACTTCT
CTGGGGAGGCCTCCTCCTCTCAGCGAGGACACTAAGACGATTCTTCCACTCTGGCAGCAA
ATTTT*CGAGATGGGGAAGAAAACTGCATGTGGAGCCTTTGGACTGGCTTCTGGATATAA
ACTCTCTTCTGTTGTACTGCCTGATCATTCAGAACCTCTTATAAGAGAGGAACAGTTTAC
TAGAGCTTGTATGGAAAGGATTAAAAAATTCTTGATCGACTACGCTGACAAGTAGTTGAA
GAGGCTGGTGGAAGGAAGAGTTTGATTCTTACTTAAGTTGCAATAACAAGATTTCTGTTC
CAACTATCTTTATCTATTTATGCTGTAATAACAAAGACTGATCTCATCATAGTTTACGTT
TTCTGTTTTGTTTTGTGGTTTGTCGTGTCTTCTTCTTTGGATTGTTGGTCATCTTCATGA
ATTAAGTTGTC
CC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2FT77TF 613 0 0
GGAAATCGAGTTGACAAATTTAAAAAAAAAAAGAAATCGCGAAGAACCCTAATTTGGAGA
TTGAAGATGATGATGATGATGAAATCCGTTTTCTCAAAGTACGCTCGTGTTCGTGTTCGC
TGCGCCAGAAATTTCTCTACAGGTCGGCCTTCCTCCTCACATTCTCCCAAGGACACTTCT
CTGGGGAGGCCTCCTCCTCTCAGCGAGGACACTAAGACGATTCTTCCACTCTGGCAGCAA
ATTTT*CGAGATGGGGAAGAAAACTGCATGTGGAGCCTTTGGACTGGCTTCTGGATATAA
ACTCTCTTCTGTTGTACTGCCTGATCATTCAGAACCTCTTATAAGAGAGGAACAGTTTAC
TAGAGCTTGTATGGAAAGGATTAAAAAATTCTTGATCGACTACGCTGACAAGTAGTTGAA
GAGGCTGGTGGAAGGAAGAGTTTGATTCTTACTTAAGTTGCAATAACAAGATTTCTGTTC
CAACTATCTTTATCTATTTATGCTGTAATAACAAAGACTGATCTCATCATAGTTTACGTT
TTCTGTTTTGTTTTGTGGTTTGTCGTGTCTTCTTCTTTGGATTGTTGGTCATCTTCATGA
ATTAAGTTGTC
CC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2FE70TF 682 0 0
GG
GTTGACAAATTTAAAAAAAAAAAGAAATCGCGAAGAACCCTAATTTGGAGATTGAAGATG
ATGATGATGATGAAATCCGTTTTCTCAAAGTACGCTCGTGTTCGTGTTCGCTGCGCCAGA
AATTTCTCTACAGGTCGGCCTTCCTCCTCACATTCTCCCAAGGACACTTCTCTGGGGAGG
CCTCCTCCTCTCAGCGAGGACACTAAGACGATTCTTCCACTCTGGCAGCAAATTTT*CGA
GATGGGGAAGAAAACTGCATGTGGAGCCTTTGGACTGGCTTCTGGATATAAACTCTCTTC
TGTTGTACTGCCTGATCATTCAGAACCTCTTATAAGAGAGGAACAGTTTACTAGAGCTTG
TATGGAAAGGATTAAAAAATTCTTGATCGACTACGCTGACAAGTAGTTGAAGAGGCTGGT
GGAAGGAAGAGTTTGATTCTTACTTAAGTTGCAATAACAAGATTTCTGTTCCAACTATCT
TTATCTATTTATGCTGTAATAACAAAGACTGATCTCATCATAGTTTACGTTTTCTGTTTT
GTTTTGTGGTTTGTCATGTCTTCTTCTTTGGATTGTTGGTCATCTTCATGAATTAAGTTG
TCTCTCTCTCTCTCTTCTTACACTATCATTTGCTTGCTTTTGGGTGTTCCATCTTTCCAT
CTATAAATCAAAATAGTTGA

QA 3 682 3 682
DS 



AS 1 3

CO CL1918Contig1 865 3 6 U
TTTTTCAAGTTGTCCTTTGCATGCATCTAGAGGGGACTCCTGAGAGAGCTAAGGATATAT
CACTCCCAGTCCTGTTTTCTCCACTTTTCTTACTGCAAGGCCTTGGTGTTCTCTTTGCTG
CATCTAAGCTAATAGAGAAGATCGTTGTCTTACTACGTGGGGAAGCTGGACCAGGATTCT
ATTTTAGATTTTCATCAAGGGCACACGATTGCTTGGGTTTCTTGCACCATGGTTCCAGGC
TATTAGGTTGGTGGTCCATTGATGAAGGAAGCAGGGAGGAACAATCTCGACTTTACATTG
ATGGAGAATCTGGTTACAATACCTTCAGTGGTCATCCGCCTGATATTGTCAAGAAAATGC
CAA*GGAAGATCTTGCTGAAGAGGTGTGGAGACTTCAAGCCGCTCTTGGTGAACAAACCG
AGATTACAAAATTCAGCCAGCAGGAATATGAAAGACTGCAAAATGAGAAAGTGCTGTGTA
GGGGTTGCTTTGAAAGAGAAATCAGTTTGGTACTGCTTCCATGTAGGCACCGTGTTCTCT
GCAGTCTCTGTTCAGACAAGTGTAAAAAGTGTCCAGTATGTCGTATAACCATCGAAGAAC
GACTACCTGTATACGACGTTTGACCAGTGTCTAATGTTCGAGAGTAGGATCTGAGGTTGT
TGATGCTCCAAACATTCATCCCTTTTTTTTTTTACCATACTGTAACTTTTGATGTGTGTT
TGCTGAATCCTTTTATCCGTCTGAACGTCTGATTATAAAGTATAGTTGTATCATATGTCG
TTTTGTAGAAAACCTCGTACATACTCTCTCTTACATTAGTTGTAACATACAGCGTTTGTA
TAAATATCAGTCTCTCCCTTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE70JQ C 283
AF RR2BN47TF U 1
AF RR2GE70TF U 283
BS 1 343 RR2BN47TF
BS 344 344 RR2GE70TF
BS 345 363 RR2BN47TF
BS 364 364 RR2GE70TF
BS 365 643 RR2BN47TF
BS 644 865 RR2GE70TF

RD RR2GE70JQ 262 0 0
GATCT
CGACTTTACATTGATGGAGAATCTGGTTACAATACCTTCAGTGGTCATCCGCCTGATATT
GTCAAGAAAATGCCAA*GGAAGATCTTGCTGAAGAGGTGTGGAGACTTCAAGCCGCTCTT
GGTGAACAAACCGAGATTACAAAATTCAGCCAGCAGGAATATGAAAGACTGCAAAATGAG
AAAGTGCTGTGTAGGGGTTGCTTTGAAAGAGAAATCAGTTTGGTACTGCTTCCATGTAGG
CACCGTGTT
TTTTGCAG

QA 6 254 6 254
DS 

RD RR2BN47TF 643 0 0
TTTTTCAAGTTGTCCTTTGCATGCATCTAGAGGGGACTCCTGAGAGAGCTAAGGATATAT
CACTCCCAGTCCTGTTTTCTCCACTTTTCTTACTGCAAGGCCTTGGTGTTCTCTTTGCTG
CATCTAAGCTAATAGAGAAGATCGTTGTCTTACTACGTGGGGAAGCTGGACCAGGATTCT
ATTTTAGATTTTCATCAAGGGCACACGATTGCTTGGGTTTCTTGCACCATGGTTCCAGGC
TATTAGGTTGGTGGTCCATTGATGAAGGAAGCAGGGAGGAACAATCTCGACTTTACATTG
ATGGAGAATCTGGTTACAATACCTTCAGTGGTCATCCGCCTGAGATTGTCAAGAAAATGC
CAAAGGAAGATCTTGCTGAAGAGGTGTGGAGACTTCAAGCCGCTCTTGGTGAACAAACCG
AGATTACAAAATTCAGCCAGCAGGAATATGAAAGACTGCAAAATGAGAAAGTGCTGTGTA
GGGGTTGCTTTGAAAGAGAAATCAGTTTGGTACTGCTTCCATGTAGGCACCGTGTTCTCT
GCAGTCTCTGTTCAGACAAGTGTAAAAAGTGTCCAGTATGTCGTATAACCATCGAAGAAC
GACTACCTGTATACGACGTTTGACCAGTGTCTAATGTTCGAGA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2GE70TF 583 0 0
GATCT
CGACTTTACATTGATGGAGAATCTGGTTACAATACCTTCAGTGGTCATCCGCCTGATATT
GTCAAGAAAATGCCAA*GGAAGATCTTGCTGAAGAGGTGTGGAGACTTCAAGCCGCTCTT
GGTGAACAAACCGAGATTACAAAATTCAGCCAGCAGGAATATGAAAGACTGCAAAATGAG
AAAGTGCTGTGTAGGGGTTGCTTTGAAAGAGAAATCAGTTTGGTACTGCTTCCATGTAGG
CACCGTGTTCTCTGCAGTCTCTGTTCAGACAAGTGTAAAAAGTGTCCAGTATGTCGTATA
ACCATCGAAGAACGACTACCTTTATACGACGTTTGACCAGTGTCTAATGTTCGAGAGTAG
GATCTGAGGTTGTTGATGCTCCAAACATTCATCCCTTTTTTTTTTTACCATACTGTAACT
TTTGATGTGTGTTTGCTGAATCCTTTTATCCGTCTGAACGTCTGATTATAAAGTATAGTT
GTATCATATGTCGTTTTGTAGAAAACCTCGTACATACTCTCTCTTACATTAGTTGTAACA
TACAGCGTTTGTATAAATATCAGTCTCTCCCTTTTTGT

QA 6 583 6 583
DS 



AS 2 5

CO CL1919Contig1 782 2 13 U
GGCTCCCCAAACATTCTCTCCCCCAATCTCGCTGTTACGCACTCTGCATCCATCCAACAA
CAACCACCAAGCAAAGCTTTTGATCTGATCTGATAAGATGGCGAGCATCAGCAACGAGCC
GGAGCGTGAGCACAGAGACGAAGAAGAGTCCGGAGCCAACGAGGACGAAGACACCGGTGC
TCAGGTCGCTCCCATCATCAAACTCGAAGAAGTCGCCGTCACCACCGGCGAAGAAAACGA
AGATACCATCCTCGATCTGAAATCGAAGTTGTATAGGTTCGATAAAGATGGGAGTCAGTG
GAAGGAGAGAGGAGCTGGGACTGTCAAGTTCTTGAAGCACAAGGAGACTGGGAAGATTCG
TCTCGTTATGAGGCAATCCAAAACTCTCAAGATCTGTGCTAATCATCTCGTTACGTCGGG
GATGAGTGTTCAGGAACACGCTGGGAATGACAAGTCTTGTGTGTGGCACGCTCGTGATTT
CTCCGATGGGGAGTTGAAGGATGAGCTTTTCTGTATCCGCTTTGCCAATGTTGAGAACTG
CAAAGCATTCATGCAAAAGTTCAAGGAAGTTGCTGAATCTGAAGAAGAGAAAGAGGAGAG
TAAAGACGCTTCTGACGCTGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTAACAGTGGAAGAGAAGAACAC
GGAGGAGGAGGAGAAGAAGAAAGAAGAGAAACCAGTGGAGAAGGTAGAGAAAGCTGTTGA
AGAAAAGAAAACCGAGGAGACGTGCCCTCAGCGTAAGATGCATATGCCTTGTACAACAAA
CA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 15 0 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2BC63TF U 3
AF RR2B578TF U 1
BS 1 21 RR2B578TF
BS 22 22 RR2BC63TF
BS 23 43 RR2B578TF
BS 44 44 RR2BC63TF
BS 45 55 RR2B578TF
BS 56 56 RR2BC63TF
BS 57 242 RR2B578TF
BS 243 243 RR2BC63TF
BS 244 312 RR2B578TF
BS 313 313 RR2BC63TF
BS 314 346 RR2B578TF
BS 347 347 RR2BC63TF
BS 348 782 RR2B578TF

RD RR2BC63TF 658 0 0
GGC
CCCAAACATTCTCTCCCCCAATCTCGCTGTTACGCACTCTGTGT**ATCCAACAACAACC
A****GCAAAGCTTT*GATCTGATCTGATAAGATGGCGAGCATCAGCAACGAGCCGGAGC
GTGAGCACAGAGACGAAGAAGAGTCCGGAGCCAACGAGGACGAAGACACCGGTGCTCAGG
TCGCTCCCATCATCAAACTCGAAGAAGTCGCCGTCACCACCGGCGAAGAAAACGAAGATA
CCATCCTCGATCTGAAATCGAAGTTGTATAGGTTCGATAAAGATGGGAGTCAGTGGAAGG
AGAGAGGAGCTGGGACTGTCAAGTTCTTGAAGCACAAGGAGACTGGGAAGATTCGTCTCG
TTATGAGGCAATCCAAAACTCTCAAGATCTGTGCTAATCATCTCGTTACGTCGGGGATGA
GTGTTCAGGAACACGCTGGGAATGATAAGTCTTGTGTGTGGCACGCTCGTGATTTCTCCG
ATGGGGAGTTGAAGGATGAGCTTTTCTGTATCCGCTTTGCCAATGTTGAGAACTGCAAAG
CATTCATGCAAAAGTTCAAGGAAGTTGCTGAATCTGAAGAAGAGAAAGAGGAGAGTAAAG
ACGCTTCTGAGGCTGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTAACAGTGGAAGAGAAGA
GCAC

QA 4 654 4 654
DS 

RD RR2B578TF 782 0 0
GGCTCCCCAAACATTCTCTCCTCCAATCTCGCTGTTACGCACTGTGCATCCATCCCACAA
CAACCACCAAGCAAAGCTTTTGATCTGATCTGATAAGATGGCGAGCATCAGCAACGAGCC
GGAGCGTGAGCACAGAGACGAAGAAGAGTCCGGAGCCAACGAGGACGAAGACACCGGTGC
TCAGGTCGCTCCCATCATCAAACTCGAAGAAGTCGCCGTCACCACCGGCGAAGAAAACGA
AGGTACCATCCTCGATCTGAAATCGAAGTTGTATAGGTTCGATAAAGATGGGAGTCAGTG
GAAGGAGAGAGGTGCTGGGACTGTCAAGTTCTTGAAGCACAAGGAGTCTGGGAAGATTCG
TCTCGTTATGAGGCAATCCAAAACTCTCAAGATCTGTGCTAATCATCTCGTTACGTCGGG
GATGAGTGTTCAGGAACACGCTGGGAATGACAAGTCTTGTGTGTGGCACGCTCGTGATTT
CTCCGATGGGGAGTTGAAGGATGAGCTTTTCTGTATCCGCTTTGCCAATGTTGAGAACTG
CAAAGCATTCATGCAAAAGTTCAAGGAAGTTGCTGAATCTGAAGAAGAGAAAGAGGAGAG
TAAAGACGCTTCTGACGCTGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTAACAGTGGAAGAGAAGAACAC
GGAGGAGGAGGAGAAGAAGAAAGAAGAGAAACCAGTGGAGAAGGTAGAGAAAGCTGTTGA
AGAAAAGAAAACCGAGGAGACGTGCCCTCAGCGTAAGATGCATATGCCTTGTACAACAAA
CA

QA 1 782 1 782
DS 



CO CL1919Contig2 1029 3 4 U
AATGTAACACGACTTGTTTAATGAAAAAGTAAAAACACACCAATGCATACATTTTGGAAA
ATCAAAACAAAGGGATATATTCTTTCCACAAAACGAATCCCAAAAACAACCCCAGAATCT
CATATAGACTCAGCAAGTAAACATGATGACACTGACAAAACATGTATCAACTTCAAGAAA
AAAAAGAAAAGAAAGCCAAGTCTCTGATGGATTTAAAACATATGAGGCTGTAAATTAAGT
AGCCTTGTGTGTTTGTTGTACAAGGCATATGCATCTTACGCTGAGGGGACAGTCTCCTCG
GTTTTCTTTTCTTCAACAGCTTTCTCTACCTTCTCCACTGGTTTCTCTTCCTTCTTCTCC
TCCTCCTCCTCCGTGTTCTTCTCTTCCACTGTTAACTTCTCAAGAAGACCAGCAGCCTCA
GAAGCGTCTTTACTCTCCTCTTTCTCTTCTTCAGATTCAGCAACTTCCTTGAACTTTTGC
ATGAATGCTTTGCAGTTCTCAACATTAGCAAAGCGGATACAGAAAAGCTCATCCTTCAAC
TCCCCATCGGAGAAATCACGAGCGTGCCACACACAAGACTTGTCATTCCCAGCGTGTTCC
TGAACACTCATCCCCGATGTAACGAGATGATTAGCACAGATCTTGAGAGTTTTGGATTGC
CTCATAACGAGACGAATCTTCCAAGTCTCCTTATGCTTCAGGAACTTGACAGTCCCAGCA
CCTCTCTCCTTCCACTGACTTCCATCTTTATCGAACCTATACAGCTTCGATTTCAGATCG
AGGATGGTATCTTCGTTTTCTTCACCGGTGGTGACGGCGACTTCTTCGAGTTTGATGATG
GGAGCGACCTGAGCACCGGTGTCTTCGTCCTCGTTGGCTCCGGACTCTTCTTCGTCTCTG
TGCTCACGCTCCGGCTCGTTGCTGATGCTCGCCATCTTATCAGATCAGATCAAAAGCTTT
GCTTGGTGGTTGTTGTTGGATGGGTACACAGTGCGTAACAGCGAGATTGGAGGAGAGAAT
GTTTGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC63JQ U 25
AF RR2FC80JQ U 1
AF RR2FC80TF C 240
BS 1 170 RR2FC80JQ
BS 171 171 RR2BC63JQ
BS 172 730 RR2FC80JQ
BS 731 1029 RR2FC80TF

RD RR2BC63JQ 611 0 0
GAAAAA
AAAAGCACACCAATGCATACATTTTGTAAAATCAAAACAAAGGGATAT**TCTTTCCACA
AAACGAATCCCAAAAACAACCCCAGAATCTCATATAGACTCAGCAAGTAAACATGATGAC
ACTGACAAAACATGTATCAACTTCAAGAAAAAA**GAAAAGAAAGCCAAGTCTCTGATGG
ATTTAAAACATATGAGGCTGTAAATTAAGTAGCCTTGTGTGTTTGTTGTACAAGGCATAT
GCATCTTACGCTGAGGGGACAGTCTCCTCGGTTTTCTTTTCTTCAACAGCTTTCTCTACC
TTCTCCACTGGTTTCTCTTCCTTCTTCTCCTCCTCCTCC***GTGTTCTTCTCTTCCACT
GTTAACTTCTCAAGAAGACCAGCAGCCTCAGAAGCGTCTTTACTCTCCTCTTTCTCTTCT
TCAGATTCAGCAACTTCCTTGAACTTTTGCATGAATGCTTTGCAGTTCTCAACATTGGCA
AAGCGGATACAGAAAAGCTCATCCTTCAACTCCCCATCGGAGAAATCACGAGCGTGCCAC
ACACAAGACTTATCATTCCCAGCGTGTTCCTGAACACTCATCCCCGACGTAACGAGATGA
TTAGC

QA 7 611 7 611
DS 

RD RR2FC80JQ 730 0 0
AATGTAACACGACTTGTTTAATGAAAAAGTAAAAACACACCAATGCATACATTTTGGAAA
ATCAAAACAAAGGGATATATTCTTTCCACAAAACGAATCCCAAAAACAACCCCAGAATCT
CATATAGACTCAGCAAGTAAACATGATGACACTGACAAAACATGTATCAATTTCAAGAAA
AAAAAGAAAAGAAAGCCAAGTCTCTGATGGATTTAAAACATATGAGGCTGTAAATTAAGT
AGCCTTGTGTGTTTGTTGTACAAGGCATATGCATCTTACGCTGAGGGGACAGTCTCCTCG
GTTTTCTTTTCTTCAACAGCTTTCTCTACCTTCTCCACTGGTTTCTCTTCCTTCTTCTCC
TCCTCCTCCTCCGTGTTCTTCTCTTCCACTGTTAACTTCTCAAGAAGACCAGCAGCCTCA
GAAGCGTCTTTACTCTCCTCTTTCTCTTCTTCAGATTCAGCAACTTCCTTGAACTTTTGC
ATGAATGCTTTGCAGTTCTCAACATTAGCAAAGCGGATACAGAAAAGCTCATCCTTCAAC
TCCCCATCGGAGAAATCACGAGCGTGCCACACACAAGACTTGTCATTCCCAGCGTGTTCC
TGAACACTCATCCCCGATGTAACGAGATGATTAGCACAGATCTTGAGAGTTTTGGATTGC
CTCATAACGAGACGAATCTTCCAAGTCTCCTTATGCTTCAGGAACTTGACAGTCCCAGCA
CCTCTCTCCT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2FC80TF 790 0 0
AGTAGCTTGTGTG
TTGTTGTACAAGGCATATGCATCT*ACGCTGAGAGGACAGTCTCCTCGGTTTC**TTTCT
TCAACAGCTTTCTCTAC*TTCTCCACTGGTTTCTCT*CCTTCTTCTCCTCCTCCTCCTCC
GTGTTCTTCTCTTCCACTGTTAACTTCTCAAGAAGACCAGCAGCCTCAGAAGCGTCTTTA
CTCTCCTCTTTCTCTTCTTCAGATTCAGCAACTTCCTTGAACTTTTGCATGAATGCTTTG
CAGTTCTCAACATTAGCAAAGCGGATACAGAAAAGCTCATCCTTCAACTCCCCATCGGAG
AAATCACGAGCGTGCCACACACAAGACTTGTCATTCCCAGCGTGTTCCTGAACACTCATC
CCCGATGTAACGAGATGATTAGCACAGATCTTGAGAGTTTTGGATTGCCTCATAACGAGA
CGAATCTTCCAAGTCTCCTTATGCTTCAGGAACTTGACAGTCCCAGCACCTCTCTCCTTC
CACTGACTTCCATCTTTATCGAACCTATACAGCTTCGATTTCAGATCGAGGATGGTATCT
TCGTTTTCTTCACCGGTGGTGACGGCGACTTCTTCGAGTTTGATGATGGGAGCGACCTGA
GCACCGGTGTCTTCGTCCTCGTTGGCTCCGGACTCTTCTTCGTCTCTGTGCTCACGCTCC
GGCTCGTTGCTGATGCTCGCCATCTTATCAGATCAGATCAAAAGCTTTGCTTGGTGGTTG
TTGTTGGATGGGTACACAGTGCGTAACAGCGAGATTGGAGGAGAGAATGTTTGGGCC

QA 14 790 14 790
DS 



AS 1 4

CO CL1920Contig1 972 4 14 U
GTATCTTCAAATAAAGTGATTGAAATTGAAATTCTCAATCGTCATCATCAAAAAAATTCC
AGTTCGACAAAGTATTTCAACGTACATTGCAAAAATGCACCAAGTTTACCATGAATGCAG
AGTATAAGAAGGCTTCAGGGATAGTGAAGTCAAAGCAACCCGGGAGTAAAGGGCTCGACC
GAGGT**CTGTTCATTAACGCTGCAGGCCAGCTTTGATGTAAGCTGCGTAAAGATCCATG
GAGTCCTTAATTGCGTCGATGGCAGCTTGAGCAGGGAGGAAACCTTCAACAGCGACTTTC
TTGTTCTCGTTCTTCTTGTAGTCTTCGAAGAAGCGGCGGATCTCAGCTAGACGGTGAGGA
GGAAGCTCTTTGATGTCTCTGTAATGACGGAACTCGGGATCATCGGCGCATACTGCAATG
ATCTTGTCGTCTTTTTCACCCTGATCAATCATTGGCATTAAACCAATAGCACGGGCACGA
AGGAATGACCCAGTCAGCACAGGCTCCTGCATGAGTACAAGGACATCAATAGGGTCACTG
TCTTCACATATGGTTCGGGGAATGAAGCCGTAGTTGTGTGGGTACACAATGGATGAGTAG
AGAACACGATCAACCTTAATAAGGCCACTGTTCTTGTCTAGCTCGTACTTCACCTTGCCA
CCTTTGCTAATTTCGACAACACAGTTGAAAACAGCAGGAGCTTCCGGGCCAATCTCCAAG
TCATGCCAAGGATGAGCAGCAGCTGATCTGTTTGTGAAGGCTGCGAAATTCCTCTCGTTA
AGAGTAACATTAGGGTTCCTCAGAGGGGAAGCAGCAACGCTCTTGGGGCTTACTTCATCC
TTGTTATCAGCCATATCGAAATGCTCAAGATGCAGTATCAAGATTCAATCGGCAAACGGA
AGGAGAAGATTCCGTTACGTAATTTTTGTTTTCTTCTCTCTCTCTTATGCAGAAGAGAAA
GTTAGAGTACCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 5 10 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH48JQ U 3
AF RR2D471JQ U 1
AF RR2CH48TF C 185
AF RR2AF81TF C 110
BS 1 13 RR2D471JQ
BS 14 14 RR2CH48JQ
BS 15 50 RR2D471JQ
BS 51 51 RR2CH48JQ
BS 52 54 RR2D471JQ
BS 55 55 RR2CH48JQ
BS 56 730 RR2D471JQ
BS 731 731 RR2AF81TF
BS 732 751 RR2D471JQ
BS 752 860 RR2AF81TF
BS 861 861 RR2CH48TF
BS 862 876 RR2AF81TF
BS 877 877 RR2CH48TF
BS 878 972 RR2AF81TF

RD RR2CH48JQ 330 0 0
ATCTTCAAATAAAGTGATTGAAATTGAAATTCTCAATCGTCATCATCAAAAAAATTCCAG
TTCGACAAAGTATTTCAATGTACATTGCAAAAATGCACCAAGTTTACCATGAATGCAAAG
TATAAAAAGGCTTCAGGGATAGTGAAGTCAAAGCAACCCGGGAGTAAAGGGCTCGACCGA
GGT**CTGTTCATTAACGCTGCAGGCCAGCTTTGATGTAAGCTGCGTAAAGATCCATGGA
GTCCTTAATTGCGTCAATGGCAGCTTGAGCAGGGAGGAAACCTTCAACAGCGACTTTCTT
GTTCTCGTTCTTCTTGTAGTCTTCGAA
AAA

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR2D471JQ 751 0 0
GTATCTTCAAATATAGTGATTGAAATTGAAATTCTCAATCGTCATCATCAGAAAGATTCC
AGTTCGACAAAGTATTTCAACGTACATTGCAAAAATGCACCAAGTTTACCATGAATGCAG
AGTATAAGAAGGCTTCAGGGATAGTGAAGTCAAAGCAACCCGGGAGTAAAGGGCTCGACC
GAGGT**CTGTTCATTAACGCTGCAGGCCAGCTTTGATGTAAGCTGCGTAAAGATCCATG
GAGTCCTTAATTGCGTCGATGGCAGCTTGAGCAGGGAGGAAACCTTCAACAGCGACTTTC
TTGTTCTCGTTCTTCTTGTAGTCTTCGAAGAAGCGGCGGATCTCAGCTAGACGGTGAGGA
GGAAGCTCTTTGATGTCTCTGTAATGACGGAACTCGGGATCATCGGCGCATACTGCAATG
ATCTTGTCGTCTTTTTCACCCTGATCAATCATTGGCATTAAACCAATAGCACGGGCACGA
AGGAATGACCCAGTCAGCACAGGCTCCTGCATGAGTACAAGGACATCAATAGGGTCACTG
TCTTCACATATGGTTCGGGGAATGAAGCCGTAGTTGTGTGGGTACACAATGGATGAGTAG
AGAACACGATCAACCTTAATAAGGCCACTGTTCTTGTCTAGCTCGTACTTCACCTTGCCA
CCTTTGCTAATTTCGACAACACAGTTGAAAACAGCAGGAGCTTCCGGGCCAATCTCCAAG
TCATGCCAAG*ATGAGCAGCAGCTGATCTGT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2CH48TF 732 0 0
AGGTCTG
TCATTAACGCTGCAGGCCAGCTTTGATGTAAGCTGCGTAAAGATCCATGGAGTCTTTA*T
TGCGTCGATGGCAGCTTGAGCAGGGAGGAAACCTTCAACAGCGACTTTCTTGTTCTCGTT
CTTCTTGTAGTCTTCGAAGAAGCGGCGGATCTCAGCTAGACGGTGAGGAGGAAGCTCTTT
GATGTCTCTGTAATGACGGAACTCGGGATCATCGGCGCATACTGCAATGATCTTGTCGTC
TTTTTCACCCTGATCAATCATTGGCATTAAACCAATAGCACGGGCACGAAGGAATGACCC
AGTCAGCACAGGCTCCTGCATGAGTACAAGGACATCAATAGGGTCACTGTCTTCACATAT
GGTTCGGGGAATGAAGTCGTAGTTGTGTGGGTACACAATGGATGAGTAGAGAACACGATC
AACCTTAATAAGGCCACTGTTCTTGTCTAGCTCGTACTTCACCTTGCCACCTTTGCTAAT
TTCGACAACACAGTTGAAAACAGCAGGAGCTTCCGGGCCAATCTCCAAGTCATGCCAAGG
ATGAGCAGCAGCTGATCTGTTTGTGAAGGCTGCGAAATTCCTCTCGTTAAGAGTAACATT
AGGGTTCCTCAGAGGGGAAGCAGCAACGCTCTTGGGGCTTACTTCATCCTTGTTATCAGC
CATGTCGAAATGCTCAAGATGCAGTATCAAGATTCAATCGGCAAACGG
CAGAAGAGATTCCGTTC

QA 8 715 8 715
DS 

RD RR2AF81TF 863 0 0
CCATG
ATGCAGAGTATA*GAGGGCT*CAGGGATAGTGAAGACAAAGCAACCCGGGAGTGATGGGC
TCGACCGAGGTGTCTGTTCATTAACGCTGCAGGCCAGCTTTGATGTAAGCTGCGTAAAGA
TCCATGGAGTCTTTAATTGCGTCGATGGCAGCTTGAGCAGGGAGGAAACTTTCAACAGCA
ACTTTCTTGTTCTCGTTCTTCTTGTAGTCTTCGAAGAAGCGGCGGATCTCAGCTAGACGG
TGAGGAGGAAGCTCTTTGATGTCTCTGTAATGACGGAACTCAGGATCATCAGCGCAAACT
GCAATGATCTTGTCGTCTTTTTCACCCTGATCAATCATGGGCATTAAACCAATAGCGCGG
ACACGAAGGAACGACCCAGTCAGCACAGGCTCCTGCATGAGTACAAGGACATCAATAGGG
TCACTGTCTTCACAAATGGTTCGGGGAATGAAGCCGTAGTTGTGTGGGTACACAATGGAT
GAGTAGAGAACACGATCAACCTTAATAAGGCCACTGTTCTTGTCTAGCTCGTACTTCACC
TTGCCACCTTTGCTAATTTCAACAACACAGTTGAAAACAGCAGGAGCTTCCGGGCCAATC
TCCAAGTCATGCCAAGGATGAGCAGCAGCTGATCTGTTTGTGAAGGCTGCGAAATTCCTC
TCGTTAAGAGTAACATTAGGGTTCCTCAGAGGGGAAGCAGCAACGCTCTTGGGGCTTACT
TCATCCTTGTTATCAGCCATATCGAATTGCTCAAGATGCAGTTTCAAGATTCAATCGGCA
AACGGAAGGAGAAGATTCCGTTACGTAATTTTTGTTTTCTTCTCTCTCTCTTATGCAGAA
GAGAAAGTTAGAGTACCC

QA 6 863 6 863
DS 



AS 1 2

CO CL1921Contig1 757 2 9 U
GGAAATAAGTGAATACGTTTCAGATAGATTGATGAAGCAATATAGACCGGTTCGGTTTCT
TATCTTCCTCTTAACAATTTGTATATGCTTCGTCACAATCCATTCTCAATGCCCACCAAC
ACTACCTGTGCCTCAACCAATGCCGGCACCACCACCACCACCACCACCTGGCCCATCTTC
AAAGCCATGTCCACCACACGGCACATATAAATTCCCACCTGCGCCTCAACCGGTGCCATC
ACTAGCACCTTGCACATGTCCGTGTCCATATGACCCATCTCCAAGAAAAGAGCCACCAAA
GAACGTAACCGTACCGGCATTGTTTGTGTTTGGGGATTCGCTCGTAGACACAGGAAATAA
CAATAACGTAAGCACACCTCTCAGGTGTAATTTTCGACCATATGGTATCGATTTCTTACA
AGGTGTTCCCACTGGTCGGTACTCCGATGGCAAAGTCCCTTCTGACTTTTTAGCGGAGTA
TTTGGGGATAAAATCGCTCGTACCGGCATATATGGATCCAAAATTGCAACCAGATGATTT
ACTCACCGGTGTATGCTTTGCTTCGGGTGGTAGTGGCTACATTCCTTTGACACCCACATA
TTTGAACGTGATACCGATGTTGCACCAATTGGCATATTTCCAACAATACATAGCGAGAGT
GAAGAAGTTAGTATGACAAGAAAAGGGTGATCATATAATAGCCAATGGCTTAGCCATTGT
GATCGCAGTAGCAACGATATGGGCATTACTTATTATG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2DN10TF U 1
AF RR2G092TF U 1
BS 1 47 RR2DN10TF
BS 48 48 RR2G092TF
BS 49 286 RR2DN10TF
BS 287 287 RR2G092TF
BS 288 306 RR2DN10TF
BS 307 307 RR2G092TF
BS 308 501 RR2DN10TF
BS 502 502 RR2G092TF
BS 503 757 RR2DN10TF

RD RR2DN10TF 757 0 0
GGAAATAAGTGAATACGTTTCAGATAGATTGATGAAGCAATATAGACTGGTTCGGTTTCT
TATCTTCCTCTTAACAATTTGTATATGCTTCGTCACAATCCATTCTCAATGCCCACCAAC
ACTACCTGTGCCTCAACCAATGCCGGCACCACCACCACCACCACCACCTGGCCCATCTTC
AAAGCCATGTCCACCACACGGCACATATAAATTCCCACCTGCGCCTCAACCGGTGCCATC
ACTAGCACCTTGCACATGTCCGTGTCCATATGACCCATCTCCAAGACAAGAGCCACCAAA
GAACGTTACCGTACCGGCATTGTTTGTGTTTGGGGATTCGCTCGTAGACACAGGAAATAA
CAATAACGTAAGCACACCTCTCAGGTGTAATTTTCGACCATATGGTATCGATTTCTTACA
AGGTGTTCCCACTGGTCGGTACTCCGATGGCAAAGTCCCTTCTGACTTTTTAGCGGAGTA
TTTGGGGATAAAATCGCTCGTGCCGGCATATATGGATCCAAAATTGCAACCAGATGATTT
ACTCACCGGTGTATGCTTTGCTTCGGGTGGTAGTGGCTACATTCCTTTGACACCCACATA
TTTGAACGTGATACCGATGTTGCACCAATTGGCATATTTCCAACAATACATAGCGAGAGT
GAAGAAGTTAGTATGACAAGAAAAGGGTGATCATATAATAGCCAATGGCTTAGCCATTGT
GATCGCAGTAGCAACGATATGGGCATTACTTATTATG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2G092TF 755 0 0
GGAAATAAGTGAATACGTTTCAGATAGATTGATGAAGCAATATAGACCGGTTCGGTTTCT
TATCTTCCTCTTAACAATTTGTATATGCTTCGTCACAATCCATTCTCAATGCCCACCAAT
ACTACCTGTGCCTCAACCAATGTCGGCACCACCACCACCACCACCACCTGGCCCATCTTC
AAAGCCATGTCCACCACACGGCACATATAAATTCCCACCTGCGCCTCAACCGGTGCCATC
ACTAGCACCTTGCACATGTCCGTGTCCATCTGACCCATCTCCAAGAAAAGAGCCACCAAA
GAACGTAACCGTACCGGCATTGTTTGTGTTTGGGGATTCGCTCGTAGACACAGGAAATAA
CAATAACGTAAGCACACCTCTCAGGTGTAATTTTCGACCATATGGTATCGATTTCTTACA
AGGTGTTCCCACTGGTCGGTACTCCGATGGCAAAGTCCCTTCTGACTTTTTAGCGGAGTA
TTTGGGGATAAAATCGCTCGTACCGGCATATATGGATCCAAAATTGCAACCAGATGATTT
ACTCACCGGTGTATGCTTTGCTTCGGGTGGTAGTGGTTACATTCCTTTGACACCCACATA
TTTGAACGTGATACCGATGTTGCACCAATTGGCATATTTCCAACAATATATAGCGAGAGT
GAAGAAGTTAGTA*GACAAGAAAAGGGTGATCATATAATAGCCAATGGCTTAGCCATTGT
GATCGCAGTAGCAACGATATGGGCATTACTTATTA

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 5

CO CL1922Contig1 829 5 12 U
GAAGCAAAGCCATTTCCCTCTTGTGCCGTGCCGTCGCCGTCTCCGTCGCCATTTCACTAA
CCGTCATATCCGGCCACCATTTTCAACTGTCGCTATCTACTGTAATCGAAAATTTCCGAA
TCCGAAGAAAATGAATTTCTTCAACTCAGCAGCATCCTTATGCAGAAGAGTTAGTCTGAG
GGAACTCATCACCGAGGTTCCTGCTTACGGTGGCAGTGGCATTTCCGATGGTTCTTCAAG
TGGGTTGAGTTTGGTCTTTAAGCGTTGGGCTACTAAGAAAACCGCTGGTTCCACCAAGAA
CGGTCGTGACTCCAAACCCAAGAATCTCGGCGTCAAGAAGTTCGGAGGAGAGAATGTGAT
ACCGGGAAACATAATAGTCCGTCAACGCGGAACTAGGTTTCATCCGGGAGACTATGTGGG
GATCGGGAAGGACCATACGCTGTTTGCATTGAAAGAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAA
CAAGATAACTGGACGTAAATGGATTCATGTTGATCCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCACCC
TATCTACACTAGAGCTGCTGCCGCCAAGTCGACTGAGCTAGAGACAGCTTCTTCGTCGTG
AAAAAAACAAATCTAAAAGTGTCTTCTTTTGTTAGATCATACGATCACTTTTGACTACAA
AGCTGGTTGTGTCTTAGAACAGCAACACTCAATTGAATAACATATGCTGTTTTGTTTTTG
TCTTTGTCTGGAGACTCCGGATACTGATCATTCAAAGCAAA*TAAGTTCTCTAGAAGATT
GTCAACTTTTTTTTTTCTCTCTTGTTTTTATTTAATGTCTCAAACTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK08JQ C 1
AF RR2CK08TF U 1
AF RR2A913TF U 13
AF RR2FR15TF U 21
AF RR2FR15JQ C 239
BS 1 558 RR2CK08TF
BS 559 559 RR2A913TF
BS 560 606 RR2CK08TF
BS 607 607 RR2A913TF
BS 608 696 RR2CK08TF
BS 697 697 RR2A913TF
BS 698 712 RR2CK08TF
BS 713 771 RR2A913TF
BS 772 779 RR2FR15TF
BS 780 780 RR2FR15JQ
BS 781 795 RR2FR15TF
BS 796 829 RR2FR15JQ

RD RR2CK08JQ 716 0 0
GAAGCAAAGCCATTTCCCTCTTGTGCCGTGCCGTCGCCGTCTCCGTCGCCATTTCACTAA
CCGTCATATCCGGCCACCATTTTCAACTGTCGCTATCTACTGTAATCGAAAATTTCCGAA
TCCGAAGAAAATGAATTTCTTCAACTCAGCAGCATCCTTATGCAGAAGAGTTAGTCTGAG
GGAACTCATCACCGAGGTTCCTGCTTACGGTGGCAGTGGCATTTCCGATGGTTCTTCAAG
TGGGTTGAGTTTGGTCTTTAAGCGTTGGGCTACTAAGAAAACCGCTGGTTCCACCAAGAA
CGGTCGTGACTCCAAACCCAAGAATCTCGGCGTCAAGAAGTTCGGAGGAGAGAATGTGAT
ACCGGGAAACATAATAGTCCGTCAACGCGGAACTAGGTTTCATCCGGGAGACTATGTGGG
GATCGGGAAGGACCATACGCTGTTTGCATTGAAAGAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAA
CAAGATAACTGGACGTAAATGGATTCATGTTGATCCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCACCC
TATCTACACTAGAGCTGCCGCCGCCAAGTCGACTGAGCTAGAGACAGCTTTTTCGTCGTG
AAAAAAACAAATCTAAAAGTGTCTTCTTTTGTTAGATCATACGATCACTTTTGACTACAA
AGCTGGTTGTGTCTTAGAACAGCAACACTCAATTGAATAACATATGCTGTTTTGTT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2CK08TF 715 0 0
GAAGCAAAGCCATTTCCCTCTTGTGCCGTGCCGTCGCCGTCTCCGTCGCCATTTCACTAA
CCGTCATATCCGGCCACCATTTTCAACTGTCGCTATCTACTGTAATCGAAAATTTCCGAA
TCCGAAGAAAATGAATTTCTTCAACTCAGCAGCATCCTTATGCAGAAGAGTTAGTCTGAG
GGAACTCATCACCGAGGTTCCTGCTTACGGTGGCAGTGGCATTTCCGATGGTTCTTCAAG
TGGGTTGAGTTTGGTCTTTAAGCGTTGGGCTACTAAGAAAACCGCTGGTTCCACCAAGAA
CGGTCGTGACTCCAAACCCAAGAATCTCGGCGTCAAGAAGTTCGGAGGAGAGAATGTGAT
ACCGGGAAACATAATAGTCCGTCAACGCGGAACTAGGTTTCATCCGGGAGACTATGTGGG
GATCGGGAAGGACCATACGCTGTTTGCATTGAAAGAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAA
CAAGATAACTGGACGTAAATGGATTCATGTTGATCCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCACCC
TATCTACACTAGAGCTGCCGCCGCCAAGTCGACTGAGCTAGAGACAGCTTCTTCGTCGTG
AAAAAA*CAAATCTAAAAGTGTCTTCTTTTGTTAGATCATACGATCACTTTTGACTACAA
AGCTGGTTGTGTCTTAGAACAGCAACACTCAATTGA*TAACATATGCTGTTT
GTT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2A913TF 760 0 0
TTTCCCTCTTGTGCCGTGCCGTCGCCGTCTCCGTCGCCATTTCACTAACCGTCATATCCG
GCCACCATTTTCAACTGTCGCTATCTACTGTAATCGAAAATTTCCGAATCCGAAGAAAAT
GAATTTCTTCAACTCAGCAGCATCCTTATGCAGAAGAGTTAGTCTGAGGGAACTCATCAC
CGAGGTTCCTGCTTACGGTGGCAGTGGCATTTCCGATGGTTCTTCAAGTGGGTTGAGTTT
GGTCTTTAAGCGTTGGGCTACTAAGAAAACCGCTGGTTCCACCAAGAACGGTCGTGACTC
CAAACCCAAGAATCTCGGCGTCAAGAAGTTCGGAGGAGAGAATGTGATACCGGGAAACAT
AATAGTCCGTCAACGCGGAACTAGGTTTCATCCGGGAGACTATGTGGGGATCGGGAAGGA
CCATACGCTGTTTGCATTGAAAGAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAACAAGATAACTGG
ACGTAAATGGATTCATGTTGATCCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCACCCTATCTACACTAG
AGCTGCTGCCGCCAAGTCGACTGAGCTAGAGACAGCTTCTTCGTCGTGAAAAAAACAAAT
CTAAAAGTGTCTTCTTTTGTTAGATCATACGATCACTTTTGACTACAAAGCTGGTTGTGT
CTTAGAACAGCAACACTCAATTGAATAACATATGCTGTTTTGTTTTTGTCTTTGTCTGGA
GACTCCGGATACTGATCATTCAAAGCAAA*TAAGTTCTC
C

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2FR15TF 776 0 0
GG
GTGCCGTGCCGTCGCCGTCTCCGTCGCCATTTCACTAACCGTCATATCCGGCCACCATTT
TCAACTGTCGCTATCTACTGTAATCGAAAATTTCCGAATCCGAAGAAAATGAATTTCTTC
AACTCAGCAGCATCCTTATGCAGAAGAGTTAGTCTGAGGGAACTCATCACCGAGGTTCCT
GCTTACGGTGGCAGTGGCATTTCCGATGGTTCTTCAAGTGGGTTGAGTTTGGTCTTTAAG
CGTTGGGCTACTAAGAAAACCGCTGGTTCCACCAAGAACGGTCGTGACTCCAAACCCAAG
AATCTCGGCGTCAAGAAGTTCGGAGGAGAGAATGTGATACCGGGAAACATAATAGTCCGT
CAACGCGGAACTAGGTTTCATCCGGGAGACTATGTGGGGATCGGGAAGGACCATACGCTG
TTTGCATTGAAAGAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAACAAGATAACTGGACGTAAATGG
ATTCATGTTGATCCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCACCCTATCTACACTAGAGCTGCTGCC
GCCAAGTCGACTGAGCTAGAGACAGCTTCTTCGTCGTGAAAAAAACAAATCTAAAAGTGT
CTTCTTTTGTTAGATCATACGATCACTTTTGACTACAAAGCTGGTTGTGTCTTAGAGCAG
CAACACTCAATTGAATAACATATGCTGTTTTGTTTTTGTCTTTGTCTGGAGACTCCGGAT
ACTGATCATTCAA*GCAAA*TAAGTTCTCTAGAAGAT*GTCAACTTTTTTTTT
C

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR2FR15JQ 591 0 0
AGTGGGTTGAGTTTGGTCTTTAAGCGTTGGGCTACTAAGAAAACCGCTGGTTCCACCAAG
AACGGTCGTGACTCCAAACCCAAGAATCTCGGCGTCAAGAAGTTCGGAGGAGAGAATGTG
ATACCGGGAAACATAATAGTCCGTCAACGCGGAACTAGGTTTCATCCGGGAGACTATGTG
GGGATCGGGAAGGACCATACGCTGTTTGCATTGAAAGAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAA
AACAAGATAACTGGACGTAAATGGATTCATGTTGATCCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCAC
CCTATCTACACTAGAGCTGCTGCCGCCAAGTCGACTGAGCTAGAGACAGCTTTTTCGTCG
TGAAAAAAACAAATCTAAAAGTGTCTTCTTTTGTTAGATCATACGATCACTTTTGACTAC
AAAGCTGGTTGTGTCTTAGAGCAGCAACACTCAATTGAATAACATATGCTGTTTTGTTTT
TGTCTTTGTCTGGAGACTCCGGATACTGATCATTCAAAGCAAAATAAGTTCTCTAGAAGA
TTGTCAACTTTTTTTTTTCTCTCTTGTTTTTATTTAATGTCTCAAACTTCC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 3

CO CL1923Contig1 938 3 6 U
AATGAAAATCTCAATTTATTTCTTCAACAAATTACACAACAACATACACAAACGGTTTCT
TCAAACGTGAGCTTAACAATAATAGGCTGCAAATACAGTAATACTTATTCATACAAAAGA
TAAACAAACTCTTAGTCTTGCTTGCGAGAATTGGCCTTCGCTTTATTCTTTTTAGCACAA
TATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAACCTCTCACAGCTTCTTTGGACACGAACCCTTCC
TCATCCTTTGCAAGGATATAGAGTAGTATCCATTCAACTTTGTTCGAAAGCCATCCAAAA
GGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGTTAAGTTCCACATCTCTTTGAATGTTAACTTG
TTCGGAGCCGTCAGAGCGTACTTGCTAAATATGTTCTCCAGATTAAATGGGACATACCTT
CCTTCGGTATCATAGGTGCTTGAATCACTCCCATGCTTGGCTTTGTGTATGTTGTCGATA
TAGACAGGCAGTAACGGTGATGGCAACCAACTCGGAAGTGTAACGTAGCTAAACGCTAAG
TTTATGATTAAGCTCCAGAAGACAGAGGAGATTGGGTTGAAACCGAGGTCACGGAATCCT
GCATAAGTCTCCCAAGGGTAGACAATACCGTCGCCGTTCTGGTCGAAGAAAGCAACATGT
TGTTGCATAACACTCATGCCTTTGCTGTCATGGCCTTCTGTTCCATTCGGATGCTCTGTA
TCCGGAGCAACTAGTGCTCTTGCCAAATATGGCTTTGGTAGTTTTTCCTCCAAGTCGCTC
CGTACTTTTCGCTCACTGGTAACTGGAGCTAACGGCGCGGTCGTGGCAAAAACTTCTGAC
GCATCTCCCATTTCCCTCTTAGTTTCTTTCTCTCTCTCTTCGGTAAGTGTTAATAATTGA
AGTTGCTCTCAGTTTCTTCTTTTGTAAACAATGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F107JQ U 88
AF RR2B002JQ U 1
AF RR2B002TF C 174
BS 1 158 RR2B002JQ
BS 159 159 RR2F107JQ
BS 160 167 RR2B002JQ
BS 168 168 RR2F107JQ
BS 169 877 RR2B002JQ
BS 878 938 RR2B002TF

RD RR2F107JQ 466 0 0
TGCAAATACAGTAATACTTATTCATACAAAAGGTAAACAAACTCTTAGTCTTGCTTGCGA
GAATTGGCCTTCTCTTTATTCTTTTTAGCACAATATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAA
CCTCTCACAGCTTCTTTGGACACGAACCCTTCCTCATCCTTTGCAAGGATATAGAGTAGT
ACCCATTCAACTTTGTTCGAAAGCCATCCAAAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCG
GTTAAGTTCCACATCTCTTTGAATGTTAACTTATTCGGAGCCGTTAGCGCGTACTTGCTA
AATATGTTCTCCAGATTAAATGGGACATACCTTCCTTCGGTATCATAGGTGCTTGAATCA
CTCCCATGCTTGGCTTTGTGTATGTTGTCGATATAGACAGGCAGTAATGGTGATGGCAAC
CAACTCGGAAGTGTAACGTAGCTAAACGCTAAGTTTATGATTAAGC

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR2B002JQ 877 0 0
AATGAAAATCTCAATTTATTTCTTCAACAAATTACACAACAACATACACAAACGGTTTCT
TCAAACGTGAGCTTAACAATAATAGGCTGCAAATACAGTAATACTTATTCATACAAAAGA
TAAACAAACTCTTAGTCTTGCTTGCGAGAATTGGCCTTGGCTTTATTTTTTTTAGCACAA
TATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAACCTCTCACAGCTTCTTTGGACACGAACCCTTCC
TCATCCTTTGCAAGGATATAGAGTAGTATCCATTCAACTTTGTTCGAAAGCCATCCAAAA
GGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGTTAAGTTCCACATCTCTTTGAATGTTAACTTG
TTCGGAGCCGTCAGAGCGTACTTGCTAAATATGTTCTCCAGATTAAATGGGACATACCTT
CCTTCGGTATCATAGGTGCTTGAATCACTCCCATGCTTGGCTTTGTGTATGTTGTCGATA
TAGACAGGCAGTAACGGTGATGGCAACCAACTCGGAAGTGTAACGTAGCTAAACGCTAAG
TTTATGATTAAGCTCCAGAAGACAGAGGAGATTGGGTTGAAACCGAGGTCACGGAATCCT
GCATAAGTCTCCCAAGGGTAGACAATACCGTCGCCGTTCTGGTCGAAGAAAGCAACATGT
TGTTGCATAACACTCATGCCTTTGCTGTCATGGCCTTCTGTTCCATTCGGATGCTCTGTA
TCCGGAGCAACTAGTGCTCTTGCCAAATATGGCTTTGGTAGTTTTTCCTCCAAGTCGCTC
CGTACTTTTCGCTCACTGGTAACTGGAGCTAACGGCGCGGTCGTGGCAAAAACTTCTGAC
GCATCTCCCATTTCCCTCTTAGTTTCTTTCTCTCTCT

QA 1 877 1 877
DS 

RD RR2B002TF 765 0 0
AGCACAATATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAACCTCTCACAGCTTCTTTGGACACGAA
CCCTTCCTCATC*TTTGCAAGGATATAGAGTAGTATCCATTCAACTTTGTTCGAAAGCCA
TCCAAAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGTTAAGTTCCACATCTCTTTGAATGT
TAACTTGTTCGGAGCCGTCAGAGCGTACTTGCTAAATATGTTCTCCAGATTAAATGGGAC
ATACCTTCCTTCGGTATCATAGGTGCTTGAATCACTCCCATGCTTGGCTTTGTGTATGTT
GTCGATATAGACAGGCAGTAACGGTGATGGCAACCAACTCGGAAGTGTAACGTAGCTAAA
CGCTAAGTTTATGATTAAGCTCCAGAAGACAGAGGAGATTGGGTTGAAACCGAGGTCACG
GAATCCTGCATAAGTCTCCCAAGGGTAGACAATACCGTCGCCGTTCTGGTCGAAGAAAGC
AACATGTTGTTGCATAACACTCATGCCTTTGCTGTCATGGCCTTCTGTTCCATTCGGATG
CTCTGTATCCGGAGCAACTAGTGCTCTTGCCAAATATGGCTTTGGTAGTTTTTCCTCCAA
GTCGCTCCGTACTTTTCGCTCACTGGTAACTGGAGCTAACGGCGCGGTCGTGGCAAAAAC
TTCTGACGCATCTCCCATTTCCCTCTTAGTTTCTTTCTCTCTCTCTTCGGTAAGTGTTAA
TAATTGAAGTTGCTCTCAGTTTCTTCTTTTGTAAACAATGGATCC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 5

CO CL1924Contig1 839 5 18 U
GGAGGGAGGAGCAATGTCGTCTTCTTTGCTGCGGTTTGGAATCTCAAGGCCGATTTCTTC
TTCTTCGTATAAGAACTTAGTAAGCTCTCACTTCTTTGGGCTCGCTACGTCTTCTTTGTC
ATGGGCAAACAACACACCTCACCACATAAACACAAAGCTCAGGCAAAAGCAAAAGCTCTG
CGTTAAAGGTTCAGCACAAGAGATTCCACAGAAACTAGAGGAAGATTCAAAGTTTGTACC
TTTGGCTCCTGAAGATCCTCTGTTCGGCCCTCCTGTTTTGCTGTTGCTTGGATTTCAAGT
TCATGAAGCACAGAAGATACAAGAGCTTCTTAAGGAGCTCGATGGCGAATTCATGAAGAT
TATGTTCTGTACAGAAGATATGGTCCCGCGTTCGTTATGGGAAGCAGTTAACACAAGACA
GACTGACCTCAAGAGAGTGAAAATTGCGGAATCGCTGCCCCGGATCTGCTTC*TTGTCTG
GTTTGACAGGAGAAGAGATGATGATGTTCATTGATGCATTTCCAGAAACTGGGCTAGAAC
CAGCTGTGTTTGCAGCTATGGTTCCGAACAGCGCTGATAAACCCATCTCGGAGTTGGTGG
AAGAAATCATGGGAGATCATGAGTTGTTGAATGGGAGCGGTTCCAGCTGAAGGTTTCTAC
TGATGAAGACAAGAGGACAGCTCGGGAATGGCTCTGTAAGTTGGCTTCTATTAGTTTTGT
TCCGCTATGCGAACTCACATGATCATATAAAGAGTGTTGTGTTACTTGTATTTACAAAAC
AGAGAGAATTTAGTCATTTGATTAATCTTCGTGTACATTACAAAACACTACTTACGTGG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2CU95TF U 1
AF RR2CE84TF U 4
AF RR2CE84JQ C 31
AF RR2E159TF U 71
AF RR2E159JQ C 262
BS 1 161 RR2CU95TF
BS 162 162 RR2CE84TF
BS 163 224 RR2CU95TF
BS 225 225 RR2CE84TF
BS 226 472 RR2CU95TF
BS 473 473 RR2CE84TF
BS 474 529 RR2CU95TF
BS 530 530 RR2CE84TF
BS 531 596 RR2CU95TF
BS 597 597 RR2CE84TF
BS 598 647 RR2CU95TF
BS 648 651 RR2CE84TF
BS 652 652 RR2E159TF
BS 653 707 RR2CE84TF
BS 708 778 RR2E159TF
BS 779 779 RR2CE84JQ
BS 780 837 RR2E159TF
BS 838 839 RR2E159JQ

RD RR2CU95TF 647 0 0
GGAGGGAGGAGCAATGTCGTCTTCTTTGCTGCGGTTTGGAATCTCAAGGCCGATTTCTTC
TTCTTCGTATAAGAACTTAGTAAGCTCTCACTTCTTTGGGCTCGCTACGTCTTCTTTGTC
ATGGGCAAACAACACACCTCACCACATAAACACAAAGCTCAAGCAAAAGCAAAAGCTCTG
CGTTAAAGGTTCAGCACAAGAGATTCCACAGAAACTAGAGGAAGGTTCAAAGTTTGTACC
TTTGGCTCCTGAAGATCCTCTGTTCGGCCCTCCTGTTTTGCTGTTGCTTGGATTTCAAGT
TCATGAAGCACAGAAGATACAAGAGCTTCTTAAGGAGCTCGATGGCGAATTCATGAAGAT
TATGTTCTGTACAGAAGATATGGTCCCGCGTTCGTTATGGGAAGCAGTTAACACAAGACA
GACTGACCTCAAGAGAGTGAAAATTGCGGAATCGCTGCCCCGGATCTGCTTCGTTGTCTG
GTTTGACAGGAGAAGAGATGATGATGTTCATTGATGCATTTCCAGAAACCGGGCTAGAAC
CAGCTGTGTTTGCAGCTATGGTTCCGAACAGCGCTGATAAACCCATCTCGGAGTTGATGG
AAGAAATCATGGGAGATCATGAGTTGTTGAATGGGAGCGGTTCCAGC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2CE84TF 704 0 0
GGGAGGAGCAATGTCGTCTTCTTTGCTGCGGTTTGGAATCTCAAGGCCGATTTCTTCTTC
TTCGTATAAGAACTTAGTAAGCTCTCACTTCTTTGGGCTCGCTACGTCTTCTTTGTCATG
GGCAAACAACACACCTCACCACATAAACACAAAGCTCAGGCAAAAGCAAAAGCTCTGCGT
TAAAGGTTCAGCACAAGAGATTCCACAGAAACTAGAGGAAGATTCAAAGTTTGTACCTTT
GGCTCCTGAAGATCCTCTGTTCGGCCCTCCTGTTTTGCTGTTGCTTGGATTTCAAGTTCA
TGAAGCACAGAAGATACAAGAGCTTCTTAAGGAGCTCGATGGCGAATTCATGAAGATTAT
GTTCTGTACAGAAGATATGGTCCCGCGTTCGTTATGGGAAGCAGTTAACACAAGACAGAC
TGACCTCAAGAGAGTGAAAATTGCGGAATCGCTGCCCCGGATCTGCTTC*TTGTCTGGTT
TGACAGGAGAAGAGATGATGATGTTCATTGATGCATTTCCAGAAACTGGGCTAGAACCAG
CTGTGTTTGCAGCTATGGTTCCGAACAGCGCTGATAAACCCATCTCGGAGTTGGTGGAAG
AAATCATGGGAGATCATGAGCTGTTGAATGGGAGCGGTTCCAGCTGAAAGTTTCTACTGA
TGAAGACAAGAGGACAGCTCGGGAATGGCTCTGTAAGTTGGCTT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2CE84JQ 778 0 0
GCGGTTTGGAATCTCAAGGCCGATTTCTTCTTCTTCGTATAAGAACTTAGTAAGCTCTCA
CTTCTTTGGGCTCGCTACGTCTTCTTTGTCATGGGCAAACAACACACCTCACCACATAAA
CACAAAGCTCAGGCAAAAGCAAAAGCTCTGCGTTAAAGGTTCAGCACAAGAGATTCCACA
GAAACTAGAGGAAGATTCAAAGTTTGTACCTTTGGCTCCTGAAGATCCTCTGTTCGGCCC
TCCTGTTTTGCTGTTGCTTGGATTTCAAGTTCATGAAGCACAGAAGATACAAGAGCTTCT
TAAGGAGCTCGATGGCGAATTCATGAAGATTATGTTCTGTACAGAAGATATGGTCCCGCG
TTCGTTATGGGAAGCAGTTAACACAAGACAGACTGACCTCAAGAGAGTGAAAATTGCGGA
ATCGCTGCCCCGGATCTGCTTC*TTGTCTGGTTTGACAGGAGAAGAGATGATGATGTTCA
TTGATGCATTTCCAGAAACTGGGCTAGAACCAGCTGTGTTTGCAGCTATGGTTCCGAACA
GCGCTGATAAACCCATCTCGGAGTTGGTGGAAGAAATCATGGGAGATCATGAGCTGTTGA
ATGGGAGCGGTTCCAGCTGAAGGTTTCTACTGATGAAGACAAGAGGACAGCTCGGGAATG
GCTCTGTAAGTTGGCTTCTATTAGTTTTGTTCCGCTATGCGAACTCACATGATCATATAA
AGAGTGTTGTGTTACTTGTATTTACAAAACAGAGAGAATTTAGTCATTTGATTAATCT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2E159TF 767 0 0
AAGAACCTAGTAAGCTCTCACTTCTTTGGGCTCGCTACGTCTTCTTTGTCATGGGCAAAC
AACACACCTCACCACATAAACACAAAGCTCAAGCAAAAGCAAAAGCTCTGCGTTAAAGGT
TCAGCACAAGAGATTCCACAGAAACTAGAGGAAGATTCAAAGTTTGTACCTTTGGCTCCT
GAAGATCCTCTGTTCGGCCCTCCTGTTTTGCTGTTGCTTGGATTTCAAGTTCATGAAGCA
CAGAAGATACAAGAGCTTCTTAAGGAGCTCGATGGCGAATTCATGAAGATTATGTTCTGT
ACAGAAGATATGGTCCCGCGTTCGTTATGGGAAGCAGTTAACACAAGACAGACTGACCTC
AAGAGAGTGAAAATTGCGGAATCGCTGCCCCGGATCTGCTTC*TTGTCTGGTTTGACAGG
AGAAGAGATGATGATGTTCATTGATGCATTTCCAGAAACTGGGCTAGAACCAGCTGTGTT
TGCAGCTATGGTTCCGAACAGCGCTGATAAACCCATCTCGGAGTTGGTGGAAGAAATCAT
GGGAGATCATGAGTTGTTGAATGGGAGCGGTTCCAGCTGAAGGTTTCTACTGATGAAGAC
AAGAGGACAGCTCGGGAATGGCTCTGTAAGTTGGCTTCTATTAGTTTTGTTCCGCTATGC
GAACTCACATGATCATATAAAGAGTGTTGTGTTACTTGTATTTACAAA*CAGAGAGAATT
TAGTCATTTGATTAATCTTCGTGTACATTACAAAACACTACTTACGT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2E159JQ 578 0 0
GTTCGGCCCTCCTGTTTTGCTGTTGCTTGGATTTCAAGTTCATGAAGCACAGAAGATACA
AGAGCTTCTTAAGGAGCTCGATGGCGAATTCATGAAGATTATGTTCTGTACAGAAGATAT
GGTCCCGCGTTCGTTATGGGAAGCAGTTAACACAAGACAGACTGACCTCAAGAGAGTGAA
AATTGCGGAATCGCTGCCCCGGATCTGCTTC*TTGTCTGGTTTGACAGGAGAAGAGATGA
TGATGTTCATTGATGCATTTCCAGAAACTGGGCTAGAACCAGCTGTGTTTGCAGCTATGG
TTCCGAACAGCGCTGATAAACCCATCTCGGAGTTGGTGGAAGAAATCATGGGAGATCATG
AGTTGTTGAATGGGAGCGGTTCCAGCTGAAGGTTTCTACTGATGAAGACAAGAGGACAGC
TCGGGAATGGCTCTGTAAGTTGGCTTCTATTAGTTTTGTTCCGCTATGCGAACTCACATG
ATCATATAAAGAGTGTTGTGTTACTTGTATTTACAAAACAGAGAGAATTTAGTCATTTGA
TTAATCTTCGTGTACATTACAAAACACTACTTACGTGG

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 5

CO CL1925Contig1 1375 5 12 U
GGGAAGAATATAGAAACAAGAAATCGTCACACACATTTCGAAACCTCTCTTTCGTCTCAG
ATCTCTCTGCTTAGTCGTGAGAAAATGGCTCTCCGTACCGTCCTCGTCGCTGACGTTCCC
AGCCTCCCTGATTCCGTGTACGGGTTATCCGAAGGTTTAGATATGAGCAAACCGACATCG
TTTAAGATGCCTGGATTCTCTGTGATCGGACACAGAGGAAATGGAATGAATGTGTTGCAA
TCTTCTGATCAGAGAACCAGAGGGTTTAAAGAAAACTCTATCCTCTCTTTTAACTCCGCA
GCCAAGTTTCCCATCGATTTCATTGAGTTCGACGTTCAGGTGACAAAAGATGATTATCCA
GTCATTTTCCACGATGATTTCATCTACTCTCAAGAGAATGGTGTTGTTAATGAGAGTAGA
GTGACTGACTTGAGCTTGTCTGAGTTTCTCCTCTATGGACCTCAGAAAGAAGCTGAGAAA
ATAGGGAAGACCCTTATGAGGAAATCCAAAGAAGGTCAGGTTTTGAAATGGGACGTTGAC
TCTGATGATCCCCTTTGCACGCTCCAAGAAGCTTTCGAACGAGTTGAGCAATCTCTAGGG
TTCAATATCGAGTTGAAATTCGACGATCAGGTTGTCTATGAACGAGAGTTTCTTGTCCAT
GTCCTCAGAACAGTTCTTCAGGTGGTGTTTGATTATGCAAAAGACAGACCAGTGATCTTC
TCAAGTTTCCAACCAGATGCAGCACAGCTTGTTAGGGAACTACAGAGCACTTACCCTGTT
TACTTTCTGACTGATGCGGGGAACCAAATGTACAAAGATGAGAGAAGAAACTCACTAGAA
GAAGCAATAAAAGTTTGCTTGGAAGGAAAGCTACAAGGCATTGTTTCAGAGGTAAAAGGA
GTTTTCAGAAACCCATCAGCCATTCCCAAGATCAAAGAATCTAACCTCTCTCTCCTTACA
TACGGCAAACTCAACAATGTGGGGGAGGCAGTGTACATGCAATATGTGATGGGGATTGAG
GGAGTGATTGTAGACTTTGTTGAGGAGATTTCAGAGTCAGTAAGACTCATGATGATTCGA
CCACCATCACCATCATCACCATTATCATCATCAGCAGCTTCCAAGGATGATGTTGCTGCC
ATTACAAGACCTGAGTTTTCACAAAAGGAGATTGATTTTCTTCTCAAGCTTCTCTCACAG
TTGATACAGCATTGATTGATGAATCATCATTACCTTTGTTTTTCTGGATCGAATATCTCT
CTGCCTTTTCTTTTATAATGTTTCTTTAGGTTTGATTTTCTTTCTTGATTTTTCTTCTTC
CGGGTGTTTTGGTCCCAATAGCTAAACTGTAAATAAATCTGCAATATTTTTACCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AV59TF U 1
AF RR2AD67TF U 1
AF RR2C196TF U 160
AF RR2AD67JQ C 557
AF RR2AV59JQ C 600
BS 1 630 RR2AD67TF
BS 631 631 RR2C196TF
BS 632 681 RR2AD67TF
BS 682 682 RR2C196TF
BS 683 800 RR2AD67TF
BS 801 801 RR2C196TF
BS 802 825 RR2AD67TF
BS 826 826 RR2C196TF
BS 827 839 RR2AD67TF
BS 840 1258 RR2AD67JQ
BS 1259 1259 RR2AV59JQ
BS 1260 1375 RR2AD67JQ

RD RR2AV59TF 677 0 0
GGGAAGAATATAGAAACAAGAAATCGTCACACACATTTCGAAACCTCTCTTTCGTCTCAG
ATCTCTCTGCTTAGTCGTGAGAAAATGGCTCTCCGTACCGTCCTCGTCGCTGACGTTCCC
AGCCTCCCTGATTCCGTGTACGGGTTATCCGAAGGTTTAGATATGAGCAAACCGACATCG
TTTAAGATGCCTGGATTCTCTGTGATCGGACACAGAGGAAATGGAATGAATGTGTTGCAA
TCTTCTGATCAGAGAACCAGAGGGTTTAAAGAAAACTCTATCCTCTCTTTTAACTCCGCA
GCCAAGTTTCCCATCGATTTCATTGAGTTCGACGTTCAGGTGACAAAAGATGATTATCCA
GTCATTTTCCACGATGATTTCATCTACTCTCAAGAGAATGGTGTTGTTAATGAGAGTAGA
GTGACTGACTTGAGCTTGTCTGAGTTTCTCCTCTATGGACCTCAGAAAGAAGCTGAGAAA
ATAGGGAAGACCCTTATGAGGAAATCCAAAGAAGGTCAGGTTTTGAAATGGGACGTTGAC
TCTGATGATCCCCTTTGCACGCTCCAAGAAGCTTTCGAACGAGTTGAGCAATCTCTAGGG
TTCAATATCGAGTTGAAATTCGACGATCAGGTTGTCTATGAACGAGAGTTTCTTGTCCAT
GTCCTCAGAACAGTTCT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2AD67TF 842 0 0
GGGAAGAATATAGAAACAAGAAATCGTCACACACATTTCGAAACCTCTCTTTCGTCTCAG
ATCTCTCTGCTTAGTCGTGAGAAAATGGCTCTCCGTACCGTCCTCGTCGCTGACGTTCCC
AGCCTCCCTGATTCCGTGTACGGGTTATCCGAAGGTTTAGATATGAGCAAACCGACATCG
TTTAAGATGCCTGGATTCTCTGTGATCGGACACAGAGGAAATGGAATGAATGTGTTGCAA
TCTTCTGATCAGAGAACCAGAGGGTTTAAAGAAAACTCTATCCTCTCTTTTAACTCCGCA
GCCAAGTTTCCCATCGATTTCATTGAGTTCGACGTTCAGGTGACAAAAGATGATTATCCA
GTCATTTTCCACGATGATTTCATCTACTCTCAAGAGAATGGTGTTGTTAATGAGAGTAGA
GTGACTGACTTGAGCTTGTCTGAGTTTCTCCTCTATGGACCTCAGAAAGAAGCTGAGAAA
ATAGGGAAGACCCTTATGAGGAAATCCAAAGAAGGTCAGGTTTTGAAATGGGACGTTGAC
TCTGATGATCCCCTTTGCACGCTCCAAGAAGCTTTCGAACGAGTTGAGCAATCTCTAGGG
TTCAATATCGAGTTGAAATTCGACGATCAG*TTGTCTATGAACGAGAGTTTCTTGTCCAT
GTCCTCAGAACAGTTCTTCAG*TGGTGTTTGATTATGCAAAAGACAGACCAGTGATCTTC
TCAAGTTTCCAACCAGATGCAGCACAGCTTGTTAGGGAACTACAGAGCACTTACCCTGTT
TACTTTCTGACTGATGCGGG*AACCAAATGTACAAAGATGAGAGA*GAAACTCACTAGA
GAG

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR2C196TF 681 0 0
GATATGAGCAAACCGACATCGTTTAAGATGCCTGGATTCTCTGTGATCGGACACAGAGGA
AATGGAATGAATGTGTTGCAATCTTCTGATCAGAGAACCAGAGGGTTTAAAGAAAACTCT
ATCCTTTCTTTTAACTCCGCAGCCAAGTTTCCCATCGATTTCATTGAGTTCGACGTTCAG
GTGACAAAAGATGATTATCCAGTCATTTTCCACGATGATTTCATCTACTCTCAAGAGAAT
GGTGTTGTTAATGAGAGTAGAGTGACTGACTTGAGCTTGTCTGAGTTTCTCCTCTATGGA
CCTCAGAAAGAAGCTGAGAAAATAGGGAAGACCCTTATGAGGAAATCCAAAGAAGGTCAG
GTTTTGAAATGGGACGTTGACTCTGATGATCCCCTTTGCACGCTCCAATAAGCTTTCGAA
CGAGTTGAGCAATCTCTAGGGTTCAATATCGAGTTGAAATTCGACGATCAGGTTGTCTAT
GAACGAGAGTTTCTTGTCCATGTCCTCAGAACAGTTCTTCAGGTGGTGTTTGGTTATGCA
AAAGACAGACCAGTGATCTTCTCAAGTTTCCAACCAGATGCAGCACAGCTTGTTAGGGAA
CTACAGAGCACTTACCCTGTTTACTTTCTGACTGATGCGGGGAACCAAATGTACAAAGAT
GAGAGAAGAAACTCACTAGA
A

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2AD67JQ 819 0 0
GCACGCTCCAAGAAGCTTTCGAACGAGTTGAGCAATCTCTAGGGTTCAATATCGAGTTGA
AATTCGACGATCAGGTTGTCTATGAACGAGAGTTTCTTGTCCATGTCCTCAGAACAGTTC
TTCAGGTGGTGTTTGATTATGCAAAAGACAGACCAGTGATCTTCTCAAGTTTCCAACCAG
ATGCAGCACAGCTTGTTAGGGAACTACAGAGCACTTACCCTGTTTACTTTCTGACTGATG
CGGGGAACCAAATGTACAAAGATGAGAGAAGAAACTCACTAGAAGAAGCAATAAAAGTTT
GCTTGGAAGGAAAGCTACAAGGCATTGTTTCAGAGGTAAAAGGAGTTTTCAGAAACCCAT
CAGCCATTCCCAAGATCAAAGAATCTAACCTCTCTCTCCTTACATACGGCAAACTCAACA
ATGTGGGGGAGGCAGTGTACATGCAATATGTGATGGGGATTGAGGGAGTGATTGTAGACT
TTGTTGAGGAGATTTCAGAGTCAGTAAGACTCATGATGATTCGACCACCATCACCATCAT
CACCATTATCATCATCAGCAGCTTCCAAGGATGATGTTGCTGCCATTACAAGACCTGAGT
TTTCACAAAAGGAGATTGATTTTCTTCTCAAGCTTCTCTCACAGTTGATACAGCATTGAT
TGATGAATCATCATTACCTTTGTTTTTCTGGATCGAATATCTTTCTGCCTTTTCTTTTAT
AATGTTTCTTTAGGTTTGATTTTCTTTCTTGATTTTTCTTCTTCCGGGTGTTTTGGTCCC
AATAGCTAAACTGTAAATAAATCTGCAATATTTTTACCC

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2AV59JQ 776 0 0
GTTCAATATCGAGTTGAAATTCGACGATCAGGTTGTCTATGAACGAGAGTTTCTTGTCCA
TGTCCTCAGAACAGTTCTTCAGGTGGTGTTTGATTATGCAAAAGACAGACCAGTGATCTT
CTCAAGTTTCCAACCAGATGCAGCACAGCTTGTTAGGGAACTACAGAGCACTTACCCTGT
TTACTTTCTGACTGATGCGGGGAACCAAATGTACAAAGATGAGAGAAGAAACTCACTAGA
AGAAGCAATAAAAGTTTGCTTGGAAGGAAAGCTACAAGGCATTGTTTCAGAGGTAAAAGG
AGTTTTCAGAAACCCATCAGCCATTCCCAAGATCAAAGAATCTAACCTCTCTCTCCTTAC
ATACGGCAAACTCAACAATGTGGGGGAGGCAGTGTACATGCAATATGTGATGGGGATTGA
GGGAGTGATTGTAGACTTTGTTGAGGAGATTTCAGAGTCAGTAAGACTCATGATGATTCG
ACCACCATCACCATCATCACCATTATCATCATCAGCAGCTTCCAAGGATGATGTTGCTGC
CATTACAAGACCTGAGTTTTCACAAAAGGAGATTGATTTTCTTCTCAAGCTTCTCTCACA
GTTGATACAGCATTGATTGATGAATCATCATTACCTTTGTTTTTCTGGATCGAATATCTC
TCTGCCTTTTCTTTTATAATGTTTCTTTAGGTTTGATTTTCTTTCTTGATTTTTCTTCTT
CCGGGTGTTTTGGTCCCAATAGCTAAACTGTAAATAAATCTGCAATATTTTTACCC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 5

CO CL1926Contig1 1133 5 30 U
GGGCCATTCATTGCGTCAAATTTTCTTAATGAAACTCAGAAGGACTTCTACGAGTTCAAA
GAGGACTGCAACACAGAGAAAAAGATTGCAGCAAAGCTGAAGTCATTAGCCGCAAAGTCT
CTGTTGCTAGAAGATGAAGACAAAGTTCGTCGTGATGTCTTTGACATTTTACGGAATGTT
GTTCTGATTAGAGATCCAGAGGATGCAAGAAAATTCTATCCTCGCTTTAACATTGAGGAT
ACTTCAAGTTTCCAGGATTTGGATGATCACAGCAAAAATGTTCTGAAGAGACTATACTAT
GACTACTATTTCCATCGCCAAGAGGATCTATGGAGGGAAAACGCTTTGAAAACCTTGCCT
GCTCTGTTAAATTCATCTAATATGCTGGCGTGTGGAGAGGATCTTGGTCTCGTTCCAGCT
TGCGTACATCCTGTTATGAAAGAACTGGCTTTGGTCGGTCTCCGCATCCAGCGCATGCCT
AGTGAGTCTGATGTGGAGTTTGGGATTCCGTCTAACTATGACTATATGACGGTCTGTGCT
CCTTCATGCCACGACTGCTCTACACTACGAGCTTGGTGGGAGGAGGACGAAGAGAGAAGA
CAACGGTACTTCAAGGAAGTGATTGGCGTAGATGAAATCCCTCCAAGTCAGTGTGTTCCA
GAGATCACCCATTTCATTCTGAGGCAACATGTTGAAGCTCCATCCATGTGGGCTATTTTC
CCACTTCAGGATATGTTGGCTCTAAAAGAAGAGTACACTGCTCGTCCTGCAAAAGAAGAG
ACGATCAATGACCCCACCAACCCCAAACATTACTGGAGATACCGCGTACACGTGACGTTG
GACTCGCTTATGAAGGACATAGACTTGAAATCAACCATCAAGAAACTCGTTGCAGGCAGC
GGAAGATCTGTTCCGGCTTCTGGTGCAGATGATAACAACAAGAAAGGAGTTATAGCCAAC
GGTTCAACAAAGCCAAACCCATGAAAAAAAAACAAGTCTTTTGATATATGGCTAAATCTT
TGTTGCATAAATGTTTGCTTATCCGTTGTTACCGCTCAAGATAGTATTTAAACTTTCAAC
TTCGTTATGTATTTGTAATTTGTTGTTACCTATCCAAAATAAAGTCTTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2B527TF U 1
AF RR2BA73TF U 228
AF RR2DE45TF U 228
AF RR2BA73JQ C 360
AF RR2DE45JQ C 562
BS 1 299 RR2B527TF
BS 300 300 RR2BA73TF
BS 301 326 RR2B527TF
BS 327 327 RR2BA73TF
BS 328 336 RR2B527TF
BS 337 337 RR2BA73TF
BS 338 353 RR2B527TF
BS 354 354 RR2BA73TF
BS 355 395 RR2B527TF
BS 396 396 RR2BA73TF
BS 397 581 RR2B527TF
BS 582 582 RR2BA73TF
BS 583 584 RR2B527TF
BS 585 585 RR2BA73TF
BS 586 635 RR2B527TF
BS 636 636 RR2BA73TF
BS 637 638 RR2B527TF
BS 639 639 RR2BA73TF
BS 640 665 RR2B527TF
BS 666 666 RR2BA73TF
BS 667 680 RR2B527TF
BS 681 681 RR2BA73TF
BS 682 690 RR2B527TF
BS 691 691 RR2BA73TF
BS 692 746 RR2B527TF
BS 747 747 RR2BA73TF
BS 748 799 RR2B527TF
BS 800 891 RR2BA73TF
BS 892 895 RR2DE45TF
BS 896 1133 RR2BA73JQ

RD RR2B527TF 799 0 0
GGGCCATTCATTGCGTCAAATTTTCTTAATGAAACTCAGAAGGACTTCTACGAGTTCAAA
GAGGACTGCAACACAGAGAAAAAGATTGCAGCAAAGCTGAAGTCATTAGCCGCAAAGTCT
CTGTTGCTAGAAGATGAAGACAAAGTTCGTCGTGATGTCTTTGACATTTTACGGAATGTT
GTTCTGATTAGAGATCCAGAGGATGCAAGAAAATTCTATCCTCGCTTTAACATTGAGGAT
ACTTCAAGTTTCCAGGATTTGGATGATCACAGCAAAAATGTTCTGAAGAGACTATACTAC
GACTACTATTTCCATCGCCAAGAGGACCTATGGAGGAAAAACGCTTTGAAAACATTGCCT
GCTCTGTTAAATTCATCTAATATGCTGGCGTGTGGGGAGGATCTTGGTCTCGTTCCAGCT
TGCGTACATCCTGTTATGAAAGAACTGGCTTTGGTCGGTCTCCGCATCCAGCGCATGCCT
AGTGAGTCTGATGTGGAGTTTGGGATTCCGTCTAACTATGACTATATGACGGTCTGTGCT
CCTTCATGCCACGACTGCTCTACACTACGAGCTTGGTGGGAAGAAGACGAAGAGAGAAGA
CAACGGTACTTCAAGGAAGTGATTGGCGTAGATGATATGCCTCCAAGTCAGTGTGTTCCA
GAGATAACCCATTTCATTCTCAGGCAACATTTTGAAGCTCCATCCATGTGGGCTATTTTC
CCACTTCAGGATATGTTGGCTCTAAAGGAAGAGTACACTGCTCGTCCTGCAAAAGAAGAG
ACGATCAATGACCCCACCA

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2BA73TF 664 0 0
G
AACATTGAGGATACTTCAAGTTTCCAGGATTTGGATGATCACAGCAAAAATGTTCTGAAG
AGACTATACTATGACTACTATTTCCATCGCCAAGAGGATCTATGGAGGGAAAACGCTTTG
AAAACCTTGCCTGCTCTGTTAAATTCATCTAATATGCTGGCGTGTGGAGAGGATCTTGGT
CTCGTTCCAGCTTGCGTACATCCTGTTATGAAAGAACTGGCTTTGGTCGGTCTCCGCATC
CAGCGCATGCCTAGTGAGTCTGATGTGGAGTTTGGGATTCCGTCTAACTATGACTATATG
ACGGTCTGTGCTCCTTCATGCCACGACTGCTCTACACTACGAGCTTGGTGGGAGGAGGAC
GAAGAGAGAAGACAACGGTACTTCAAGGAAGTGATTGGCGTAGATGAAATCCCTCCAAGT
CAGTGTGTTCCAGAGATCACCCATTTCATTCTGAGGCAACATGTTGAAGCTCCATCCATG
TGGGCTATTTTCCCACTTCAGGATATGTTGGCTCTAAAAGAAGAGTACACTGCTCGTCCT
GCAAAAGAAGAGACGATCAATGACCCCACCAACCCCAAACATTACTGGAGATACCGCGTA
CACGTGACGTTGGACTCGCTTATGAAGGACATAGACTTGAAATCAACCATCAAGAAACTC
GTT

QA 2 664 2 664
DS 

RD RR2DE45TF 682 0 0
G
AACATTGAGGATACTTCAAGTTTCCAGGATTTGGATGATCACAGCAAAAATGTTCTGAAG
AGACTATACTATGACTACTATTTCCATCGCCAAGAGGATCTATGGAGGGAAAACGCTTTG
AAAACCTTGCCTGCTCTGTTAAATTCATCTAATATGCTGGCGTGTGGAGAGGATCTTGGT
CTCGTTCCAGCTTGCGTACATCCTGTTATGAAAGAACTGGCTTTGGTCGGTCTCCGCATC
CAGCGCATGCCTAGTGAGTCTGATGTGGAGTTTGGGATTCCGTCTAACTATGACTATATG
ACGGTCTGTGCTCCTTCATGCCACGACTGCTCTACACTACGAGCTTGGTGGGAGGAGGAC
GAAGAGAGAAGACAACGGTACTTCAAGGAAGTGATTGGCGTAGATGAAATCCCTCCAAGT
CAGTGTGTTCCAGAGATCACCCATTTCATTCTGAGGCAACATGTTGAAGCTCCATCCATG
TGGGCTATTTTCCCACTTCAGGATATGTTGGCTCTAAAAGAAGAGTACACTGCTCGTCCT
GCAAAAGAAGAGACGATCAATGACCCCACCAACCCCAAACATTACTGGAGATACCGCGTA
CACGTGACGTTGGACTCGCTTATGAAGGACATAGACTTGAAATCAACCATCAAGAAACTC
GTTGCAG
CAGCGGAGATCTGT

QA 2 668 2 668
DS 

RD RR2BA73JQ 774 0 0
TGCTCTGTTAAATTCATCTAATATGCTGGCGTGTGGAGAGGATCTTGGTCTCGTTCCAGC
TTGCGTACATCCTGTTATGAAAGAACTGGCTTTGGTCGGTCTCCGCATCCAGCGCATGCC
TAGTGAGTCTGATGTGGAGTTTGGGATTCCGTCTAACTATGACTATATGACGGTCTGTGC
TCCTTCATGCCACGACTGCTCTACACTACGAGCTTGGTGGGAGGAGGACGAAGAGAGAAG
ACAACGGTACTTCAAGGAAGTGATTGGCGTAGATGAAATCCCTCCAAGTCAGTGTGTTCC
AGAGATCACCCATTTCATTTTGAGGCAACATGTTGAAGCTCCATCCATGTGGGCTATTTT
CCCACTTCAGGATATGTTGGCTCTAAAAGAAGAGTACACTGCTCGTCCTGCAAAAGAAGA
GACGATCAATGACCCCACCAACCCCAAACATTACTGGAGATACCGCGTACACGTGACGTT
GGACTCGCTTATGAAGGACATAGACTTGAAATCAACCATCAAGAAACTCGTTGCAGGCAG
CGGAAGATCTGTTCCGGCTTCTGGTGCAGATGATAACAACAAGAAAGGAGTTATAGCCAA
CGGTTCAACAAAGCCAAACCCATGAAAAAAAAACAAGTCTTTTGATATATGGCTAAATCT
TTGTTGCATAAATGTTTGCTTATCCGTTGTTACCGCTCAAGATAGTATTTAAACTTTCAA
CTTCGTTATGTATTTGTAATTTGTTGTTACCTATCCAAAATAAAGTCTTGTGTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2DE45JQ 572 0 0
ACACTACGAGCTTGGTGGGAGGAGGACGAAGAGAGAAGACAACGGTACTTCAAGGAAGTG
ATTGGCGTAGATGAAATCCCTCCAAGTCAGTGTGTTCCAGAGATCACCCATTTCATTCTG
AGGCAACATGTTGAAGCTCCATCCATGTGGGCTATTTTCCCACTTCAGGATATGTTGGCT
CTAAAAGAAGAGTACACTGCTCGTCCTGCAAAAGAAGAGACGATCAATGACCCCACCAAC
CCCAAACATTACTGGAGATACCGCGTACACGTGACGTTGGACTCGCTTATGAAGGACATA
GACTTGAAATCAACCATCAAGAAACTCGTTGCAGGCAGCGGAAGATCTGTTCCGGCTTCT
GGTGCAGATGATAACAACAAGAAAGGAGTTATAGCCAACGGTTCAACAAAGCCAAACCCA
TGAAAAAAAAACAAGTCTTTTGATATATGGCTAAATCTTTGTTGCATAAATGTTTGCTTA
TCCGTTGTTACCGCTCAAGATAGTATTTAAACTTTCAACTTCGTTATGTATTTGTAATTT
GTTGTTACCTATCCAAAATAAAGTCTTGTGTT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL1927Contig1 908 2 2 U
GGACGATCCAAAAATCAAATCTTCTCAATTTCTCTCTTAATCGCGACTTACGATCAAAGG
ATGCGGATCTTCGTTAAGACTCTCACGGGAAAGACCATCACCCTCGAGGTGGAAAGCTCC
GACACCATCGACAACGTCAAAGCCAAGATCCAGGACGAGGAAGGTATCCCTCCCGATCAG
CAGAGGCTCATCTTCGCAGGCAAGCAGCTCGAAGACGGCAGAACATTGGCAGACTACAAC
ATCCAGAAGGAGTCTACGCTTCATCTCGTTCTCAGGCTTCGTGGTGGTATGCAGATCTTT
GTCAAGACCTTGACAGGAAAGACCATTACTTTGGAGGTTGAGAGCTCCGACACCATTGAC
GATGTCAAAGCCAAGATTCAGGACAAGGAGGGTATCCCTCCGGACCAGCAGAGATTGATA
TTCGCCGGAAAGCAGCTTGAGGACGGTAGAACATTGGCTGACTATAACATCCAGAAGGAG
TCTACGCTTCACTTGGTGTTGCGTCTGCGTGGTGGTATGCAGATCTTTGTCAAGACACTT
AGCGGCAAGGCCATCACACTGGAGGTGGAGAGCTCTGACACCATTGATAACGTGAAGGCC
AAGATCCAAGACAAGGAAGGTATCCCTCCGGACCAGCAGCGTCTCATCTTCGCTGGCAAG
CAGCTTGAGGATGGTCGCACCTTAGCCGACTACAACATCCAGAAGGAGTCTACGCTTCAC
TTGGTGTTGCGTCTTCGTGGTGGTTTCTAAAACTCTTGTCTTGTGTCCGATCCAAAGTCA
AATGTCTCTGTTTACCTTTCTTGTTTCCTTTTAAGACTTCTCATGGTTTGTGTTTGGGGC
CTTCTTGCAAAGCCCCTGGATGAATAATTTGTGAACTATGTTTGCGTCCTTACTTCTCTT
TCAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW78TF U 1
AF RR2EW78JQ C 364
BS 1 680 RR2EW78TF
BS 681 908 RR2EW78JQ

RD RR2EW78TF 680 0 0
GGACGATCCAAAAATCAAATCTTCTCAATTTCTCTCTTAATCGCGACTTACGATCAAAGG
ATGCGGATCTTCGTTAAGACTCTCACGGGAAAGACCATCACCCTCGAGGTGGAAAGCTCC
GACACCATCGACAACGTCAAAGCCAAGATCCAGGACGAGGAAGGTATCCCTCCCGATCAG
CAGAGGCTCATCTTCGCAGGCAAGCAGCTCGAAGACGGCAGAACATTGGCAGACTACAAC
ATCCAGAAGGAGTCTACGCTTCATCTCGTTCTCAGGCTTCGTGGTGGTATGCAGATCTTT
GTCAAGACCTTGACAGGAAAGACCATTACTTTGGAGGTTGAGAGCTCCGACACCATTGAC
GATGTCAAAGCCAAGATTCAGGACAAGGAGGGTATCCCTCCGGACCAGCAGAGATTGATA
TTCGCCGGAAAGCAGCTTGAGGACGGTAGAACATTGGCTGACTATAACATCCAGAAGGAG
TCTACGCTTCACTTGGTGTTGCGTCTGCGTGGTGGTATGCAGATCTTTGTCAAGACACTT
AGCGGCAAGGCCATCACACTGGAGGTGGAGAGCTCTGACACCATTGATAACGTGAAGGCC
AAGATCCAAGACAAGGAAGGTATCCCTCCGGACCAGCAGCGTCTCATCTTCGCTGGCAAG
CAGCTTGAGGATGGTCGCAC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2EW78JQ 545 0 0
GTCAAAGCCAAGATTCAGGACAAGGAGGGTATCCCTCCGGACCAGCAGAGATTGATATTC
GCCGGAAAGCAGCTTGAGGACGGTAGAACATTGGCTGACTATAACATCCAGAAGGAGTCT
ACGCTTCACTTGGTGTTGCGTCTGCGTGGTGGTATGCAGATCTTTGTCAAGACACTTAGC
GGCAAGGCCATCACACTGGAGGTGGAGAGCTCTGACACCATTGATAACGTGAAGGCCAAG
ATCCAAGACAAGGAAGGTATCCCTCCGGACCAGCAGCGTCTCATCTTCGCTGGCAAGCAG
CTTGAGGATGGTCGCACCTTAGCCGACTACAACATCCAGAAGGAGTCTACGCTTCACTTG
GTGTTGCGTCTTCGTGGTGGTTTCTAAAACTCTTGTCTTGTGTCCGATCCAAAGTCAAAT
GTCTCTGTTTACCTTTCTTGTTTCCTTTTAAGACTTCTCATGGTTTGTGTTTGGGGCCTT
CTTGCAAAGCCCCTGGATGAATAATTTGTGAACTATGTTTGCGTCCTTACTTCTCTTTCA
GTTCC

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 5

CO CL1928Contig1 933 5 28 U
GGAAGGGAATAAAACATAGCAAAACAGCATAAGAGAAACCAAATCAAAAGAAGAAAAAAA
AAGAGTGAAGATGTCTTCAGATCACTCACCTTCTTCATCTCAAGCCTTCCAAGAACACTC
CATCAACAGCTTCCTCTCAAGAAAATTGCTTCAGCAGCTTCCTTTTCATCACAACATACA
ACAGCAACAAGCTCAAGTACCTGACAAGAACAACTTGAGCGGCAACATTCTCTTGCTTCT
CTCTATCCTTGTCTGCGGTATCATCTGCTCACTAGGGTTGCATTACATAATCCGTTGCGC
ATTTAGACGTTCCTCGAGTTTCATGATCTCTGATCCCATCCCAATCCCGTCCACACCACG
AGGCTCAGCAGCAAACAAAGGCATCAAGAAGAAAGTTCTCAAGATGTTCCCGGTAGTGAC
TTACTCACCTGAGATGAACTTGTCAGGGGTTGGCGAAGAGTGTGTCATTTGCTTGTCTGA
TTTCGTAGCTGGAGAACAGATACGGCTGCTTCCAAAGTGTAACCATGGGTTCCACGTTCG
TTGTATCGACAAGTGGCTTACACAACATATGACTTGTCCTAAATGTAGACACTGTCTGGT
TGAGACATGTCAAAAGATCTTAGGAGATTGCGATGAAGCTGATGAGGTTGAAGCAACACC
AAGGGAGAGCATAGAGGTGAGAATTGCTCCTGTAGAACCTGAAGCAAGAGTCAACACTTT
TAGAGAAAGCAGCTAGAGAGTATGTGCCAATAAACAACTAGATTTCAAGATTTTAGTTCT
TCAACAAGATTGGAATACAGTTTTATGTCCCTAGACAGTAGGATTCAAAAATCAAACACA
ATGGAGCTTTTTTGTTTGTTTTTCTTTTGCCCTGAAGCACAAAATGTAAAGAGAATTTAT
CTTAAGCTTTTCATGGCATCATAACTTCATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 5 25 0 0 20 0 20 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H163TF U 1
AF RR2FS26TF U 9
AF RR2BD88TF U 14
AF RR2BD88JQ C 254
AF RR2FS26JQ C 205
BS 1 260 RR2H163TF
BS 261 261 RR2FS26TF
BS 262 646 RR2H163TF
BS 647 647 RR2FS26TF
BS 648 682 RR2H163TF
BS 683 713 RR2FS26TF
BS 714 714 RR2BD88TF
BS 715 776 RR2FS26TF
BS 777 786 RR2BD88TF
BS 787 787 RR2FS26JQ
BS 788 821 RR2BD88TF
BS 822 822 RR2FS26JQ
BS 823 830 RR2BD88TF
BS 831 831 RR2FS26JQ
BS 832 840 RR2BD88TF
BS 841 843 RR2FS26JQ
BS 844 852 RR2BD88TF
BS 853 853 RR2FS26JQ
BS 854 867 RR2BD88TF
BS 868 869 RR2FS26JQ
BS 870 871 RR2BD88TF
BS 872 872 RR2FS26JQ
BS 873 873 RR2BD88TF
BS 874 875 RR2FS26JQ
BS 876 876 RR2BD88TF
BS 877 877 RR2FS26JQ
BS 878 879 RR2BD88TF
BS 880 933 RR2FS26JQ

RD RR2H163TF 691 0 0
GGAAGGGAATAAAACATAGCAAAACAGCATAAGAGAAACCAAATCAAAAGAAGAAAAAAA
AAGAGTGAAGATGTCTTCAGATCACTCACCTTCTTCATCTCAAGCCTTCCAAGAACACTC
CATCAACAGCTTCCTCTCAAGAAAATTGCTTCAGCAGCTTCCTTTTCATCACAACATACA
ACAGCAACAAGCTCAAGTACCTGACAAGAACAACTTGAGCGGCAACATTCTCTTGCTTCT
CTCTATCCTTGTCTGCGGTACCATCTGCTCACTAGGGTTGCATTACATAATCCGTTGCGC
ATTTAGACGTTCCTCGAGTTTCATGATCTCTGATCCCATCCCAATCCCGTCCACACCACG
AGGCTCAGCAGCAAACAAAGGCATCAAGAAGAAAGTTCTCAAGATGTTCCCGGTAGTGAC
TTACTCACCTGAGATGAACTTGTCAGGGGTTGGCGAAGAGTGTGTCATTTGCTTGTCTGA
TTTCGTAGCTGGAGAACAGATACGGCTGCTTCCAAAGTGTAACCATGGGTTCCACGTTCG
TTGTATCGACAAGTGGCTTACACAACATATGACTTGTCCTAAATGTAGACACTGTCTGGT
TGAGACATGTCAAAAGATCTTAGGAGATTGCGATGAAGCTGATGAG*TTGAAGCAACACC
AAGGGAGAGCATAGAGGTGAGA
TTGCTCTGT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2FS26TF 768 0 0
GGAAAAC
ATAGCAAAACAGCATAAGAGAAACCAAATCAAAAGAAGAAAAAAAAAGAGTGAAGATGTC
TTCAGATCACTCACCTTCTTCATCTCAAGCCTTCCAAGAACACTCCATCAACAGCCTCCT
CTCAAGAAAATTGCTTCAGCAGCTTCCTTTTCATCACAACATACAACAGCAACAAGCTCA
AGTACCTGACAAGAACAACTTGAGCGGCAACATTCTCTTGCTTCTCTCTATCCTTGTCTG
CGGTATCATCTGCTCACTAGGGTTGCATTACATAATCCGTTGCGCATTTAGACGTTCCTC
GAGTTTCATGATCTCTGATCCCATCCCAATCCCGTCCACACCATGAGGCTCAGCAGCAAA
CAAAGGCATCAAGAAGAAAGTTCTCAAGATGTTCCCGGTAGTGACTTACTCACCTGAGAT
GAACTTGTCAGGGGTTGGCGAAGAGTGTGTCATTTGCTTGTCTGATTTCGTAGCTGGAGA
ACAGATACGGCTGCTTCCAAAGTGTAACCATGGGTTCCACGTTCGTTGTATCGACAAGTG
GCTTACACAACATATGACTTGTCCTAAATGTAGACACTGTCTGGTTGAGACATGTCAAAA
GATCTTAGGAGATTGCGATGAAGCTGATGAGGTTGAAGCAACACCAAGGGAGAGCATAGA
GGTGAGAATTGCTCCTGTAGAACCTGAAGCAAGAGTCAGCACTTTTAGAGAAAGCAGCTA
GAGAGTATGTGCCAATAAACAACTAGATTTCAAGATTTTAG

QA 8 768 8 768
DS 

RD RR2BD88TF 866 0 0
GG
ATAGCAAAACAGCATAAGAGAAACCAAATCAAAAGAAGAAAAAAAAAGAGTGAAGATGTC
TTCAGATCACTCACCTTCTTCATCTCAAGCCTTCCAAGAACACTCCATCAACAGCTTCCT
CTCAAGAAAATTGCTTCAGCAGCTTCCTTTTCATCACAACATACAACAGCAACAAGCTCA
AGTACCTGACAAGAACAACTTGAGCGGCAACATTCTCTTGCTTCTCTCTATCCTTGTCTG
CGGTATCATCTGCTCACTAGGGTTGCATTACATAATCCGTTGCGCATTTAGACGTTCCTC
GAGTTTCATGATCTCTGATCCCATCCCAATCCCGTCCACACCACGAGGCTCAGCAGCAAA
CAAAGGCATCAAGAAGAAAGTTCTCAAGATGTTCCCGGTAGTGACTTACTCACCTGAGAT
GAACTTGTCAGGGGTTGGCGAAGAGTGTGTCATTTGCTTGTCTGATTTCGTAGCTGGAGA
ACAGATACGGCTGCTTCCAAAGTGTAACCATGGGTTCCACGTTCGTTGTATCGACAAGTG
GCTTACACAACATATGACTTGTCCTAAATGTAGACACTGTCTGGTTGAGACATGTCAAAA
GATCTTAGGAGATTGCGATGAAGCTGATGAGGTTGAAGCAACACCAAGGGAGAGCATAGA
GGTGAGAATTGCTCCTGTAGAACCTGAAGCAAGAGTCAACACTTTTAGAGAAAGCAGCTA
GAGAGTATGTGCCAATAAACAACTAGATTTCAAGATTTTAGTTCTTCAACA*GATTGGAA
TACAGTTTTATGTCCCTAGACAGTAG*ATTCAAAA*TCAAACACAT**GAGCTTTTT*GT
TTGTTTTTCTTTGCCCTTTTATCA

QA 3 866 3 866
DS 

RD RR2BD88JQ 628 0 0
TGCGGTATCATCTGCTCACTAGGGTTGCATTACATAATCCGTTGCGCATTTAGACGTTCC
TCGAGTTTCATGATCTCTGATCCCATCCCAATCCCGTCCACACCACGAGGCTCAGCAGCA
AACAAAGGCATCAAGAAGAAAGTTCTCAAGATGTTCCCGGTAGTGACTTACTCACCTGAG
ATGAACTTGTCAGGGGTTGGCGAAGAGTGTGTCATTTGCTTGTCTGATTTCGTAGCTGGA
GAACAGATACGGCTGCTTCCAAAGTGTAACCATGGGTTCCACGTTCGTTGTATCGACAAG
TGGCTTACACAACATATGACTTGTCCTAAATGTAGACACTGTCTGGTTGAGACATGTCAA
AAGATCTTAGGAGATTGCGATGAAGCTGATGAGGTTGAAGCAACACCAAGGGAGAGCATA
GAGGTGAGAATTGCTCCTGTAGAACCTGAAGCAAGAGTCAACACTTTTAGAGAAAGCAGC
TAGAGAGTATGTGCCAATAAACAACTAGATTTCAAGATTTTAGTTTTTCAACAAGATTGG
AATACAGTTTTATGTCCCTAGACAGTAGGATTCAAAAATCAAACACAATGGAGCTTTTTT
GTTTGTTTTTCTTTTGCCCT
TTTATCAT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2FS26JQ 729 0 0
CAAGAACAACTTGAGCGGCAACATTCTCTTGCTTCTCTCTATCCTTGTCTGCGGTATCAT
CTGCTCACTAGGGTTGCATTACATAATCCGTTGCGCATTTAGACGTTCCTCGAGTTTCAT
GATCTCTGATCCCATCCCAATCCCGTCCACACCATGAGGCTCAGCAGCAAACAAAGGCAT
CAAGAAGAAAGTTCTCAAGATGTTCCCGGTAGTGACTTACTCACCTGAGATGAACTTGTC
AGGGGTTGGCGAAGAGTGTGTCATTTGCTTGTCTGATTTCGTAGCTGGAGAACAGATACG
GCTGCTTCCAAAGTGTAACCATGGGTTCCACGTTCGTTGTATCGACAAGTGGCTTACACA
ACATATGACTTGTCCTAAATGTAGACACTGTCTGGTTGAGACATGTCAAAAGATCTTAGG
AGATTGCGATGAAGCTGATGAGGTTGAAGCAACACCAAGGGAGAGCATAGAGGTGAGAAT
TGCTCCTGTAGAACCTGAAGCAAGAGTCAGCACTTTTAGAGAAAGCAGCTAGAGAGTATG
TGCCAATAAACAACTAGATTTCAAGATTTTAGTTCTTCAACAAGATTGGAATACAGTTTT
ATGTCCCTAGACAGTAGGATTCAAAAATCAAACACAATGGAGCTTTTTTGTTTGTTTTTC
TTTTGCCCTGAAGCTCAAAATGTAAAGAGAATTTATCTTAAGCTTTTCATGGCATCATAA
CTTCATCAT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 4

CO CL1929Contig1 1026 4 5 U
GCACAGACGACACCATTAGCACCTGCTCCTGATTCTGGAGTTTCTAGTTCGATTAGCCAA
GATAAGCCAAAACCTTTGCTGGTTACTCCTGGCCAACTACTGCAGTCTGGATCTACTTCT
GTCTCTTTGTCCCCACCCTCGAACAACGCAGATAAAGATTCTGAGGTGGTTCAAGTATCA
TCTTCAGCTGCGTTGGAACAATCTGTTCCAGTCACATCAGAAGCTCAACCTCCAATACTG
CCATTGCCTTCCTCTGCAAGGCCAACTCAGAAGCCAAACGGACACTCCTTCCCAACCCAT
AATGGTTACAGGGGACGTGGGAGAGGAAGAGGAAGAGGATCAGGGCGATCACACCAGGTA
ATGAAGTTCGCTGAAGATTTTGATTTCACAGCAATGAATGAAAAGTTCAATAAGGATGAA
GTATGGGGTCATCTTGGGAAGAGCACCAATGGTGATGGTGATGATGATTATCCAGTCGTA
GATGAACCGGTGCCTAAAATCGAGGTTAAACCTGTTTACAACAAAGACGACTTTTTCGAT
AGCCTCTCGTCAAATTCCGGTGACAGAGACTCCCCAAATGCAAGGCCTAGGTTCTCAGAG
CTACGGAAACTAGATACTGAGACATTTGGTGAGTTCTCAAGATTCAGAGGAGGCCGAGGA
GGTCGTGGTGGTTATGGTCGAAACGGTTATTCACGTGGTGGTTATGGTGGTCGTGGCTAT
GGAGGCTATAACGGGCGCGGTGGTGGCGGCGGAGGCTATGGATATGGTGGTCGTGGCCAA
GGGAGAGGTGCGTGAAATCGTACTTCCCTAAAAGTTGTGCTAAAAGGATTTCTAAAAGAC
TCGGAAATCCGATGGAGCTCATCATGCTAAAGCGCTTTTGTTATGTTGCAATAAAACAGA
AACTCGAGTCTTATGTATTACTTTTGTTGTCAGAGAAACCCCACCTGTGTGGTTTTCGAG
TGTATCAATTTGATTTGCGATCTTTTGTTATAAGACTTGGTACTACCGTCTTTCAGTATT
CAATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2AN46TF U 361
AF RR2CC16TF U 1
AF RR2CC16JQ C 256
AF RR2DF80TF U 659
BS 1 648 RR2CC16TF
BS 649 658 RR2CC16JQ
BS 659 872 RR2DF80TF
BS 873 873 RR2CC16JQ
BS 874 1026 RR2DF80TF

RD RR2AN46TF 119 0 0
ATGAAGTTCACTGAAGATTTTGATTTCACAGCAATGAATGAAAAGTTCAATAAGGATGAT
GTATGGGGTCATCTTGGGAAGAGCACCAATGGTGATGGTGATGATGATT
ATCCAGTCGT

QA 1 109 1 109
DS 

RD RR2CC16TF 648 0 0
GCACAGACGACACCATTAGCACCTGCTCCTGATTCTGGAGTTTCTAGTTCGATTAGCCAA
GATAAGCCAAAACCTTTGCTGGTTACTCCTGGCCAACTACTGCAGTCTGGATCTACTTCT
GTCTCTTTGTCCCCACCCTCGAACAACGCAGATAAAGATTCTGAGGTGGTTCAAGTATCA
TCTTCAGCTGCGTTGGAACAATCTGTTCCAGTCACATCAGAAGCTCAACCTCCAATACTG
CCATTGCCTTCCTCTGCAAGGCCAACTCAGAAGCCAAACGGACACTCCTTCCCAACCCAT
AATGGTTACAGGGGACGTGGGAGAGGAAGAGGAAGAGGATCAGGGCGATCACACCAGGTA
ATGAAGTTCGCTGAAGATTTTGATTTCACAGCAATGAATGAAAAGTTCAATAAGGATGAA
GTATGGGGTCATCTTGGGAAGAGCACCAATGGTGATGGTGATGATGATTATCCAGTCGTA
GATGAACCGGTGCCTAAAATCGAGGTTAAACCTGTTTACAACAAAGACGACTTTTTCGAT
AGCCTCTCGTCAAATTCCGGTGACAGAGACTCCCCAAATGCAAGGCCTAGGTTCTCAGAG
CTACGGAAACTAGATACTGAGACATTTGGTGAGTTCTCAAGATTCAGA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2CC16JQ 771 0 0
G
CAAGGCCAACTCAGAAGCCAAACGGACACTCCTTCCCAACCCATAATGGTTACAGGGGAC
GTGGGAGAGGAAGAGGAAGAGGATCAGGGCGATCACACCAGGTAATGAAGTTCGCTGAAG
ATTTTGATTTCACAGCAATGAATGAAAAGTTCAATAAGGATGAAGTATGGGGTCATCTTG
GGAAGAGCACCAATGGTGATGGTGATGATGATTATCCAGTCGTAGATGAACCGGTGCCTA
AAATCGAGGTTAAACCTGTTTACAACAAAGACGACTTTTTCGATAGCCTCTCGTCAAATT
CCGGTGACAGAGACTCCCCAAATGCAAGGCCTAGGTTCTCAGAGCTACGGAAACTAGATA
CTGAGACATTTGGTGAGTTCTCAAGATTCAGAGGAGGCCGAGGAGGTCGTGGTGGTTATG
GTCGAAACGGTTATTCACGTGGTGGTTATGGTGGTCGTGGCTATGGAGGCTATAACGGGC
GCGGTGGTGGCGGCGGAGGCTATGGATATGGTGGTCGTGGCCAAGGGAGAGGTGCGTGAA
ATCGTACTTCCCTAAAAGTTGTGCTAAAAGGATTTCTAAAAGACTCGGAAATCCGATGGA
GCTCATCATGCTAAAGCGCTTTTGTTATGTTGCAATAAAACAGAAACTCGAGTCTTATGT
ATTACTTTTGTTGTCAGAGAAACCCCACCTGTGTGGTTTTCGAGTGTATCAATTTGATTT
GCGATCTTTTGTTATAAGACTTGGTACTACCGTCTTTCAGTATTCAATGA

QA 2 771 2 771
DS 

RD RR2DF80TF 368 0 0
GAGGTCGTGGTGGTTATGGTCGAAACGGTTATTCACGTGGTGGTTATGGTGGTCGTGGCT
ATGGAGGCTATAACGGGCGCGGTGGTGGCGGCGGAGGCTATGGATATGGTGGTCGTGGCC
AAGGGAGAGGTGCGTGAAATCGTACTTCCCTAAAAGTTGTGCTAAAAGGATTTCTAAAAG
ACTCGGAAATCCGATGGAGCTCATCATGCTAAAGTGCTTTTGTTATGTTGCAATAAAACA
GAAACTCGAGTCTTATGTATTACTTTTGTTGTCAGAGAAACCCCACCTGTGTGGTTTTCG
AGTGTATCAATTTGATTTGCGATCTTTTGTTATAAGACTTGGTACTACCGTCTTTCAGTA
TTCAATGA

QA 1 368 1 368
DS 



AS 1 5

CO CL1930Contig1 696 5 8 U
AGGGACTCTTCAAAAATCCTAACGTCTTCGTAAAGTAAGCAAAAATCATGGCCGGAGCGA
CTAGTTTGGTGGGAAAGCTTGAGACAGATGCCGAGGTCAAAGTTTCTGCTGGAAAGTCCT
ATGACATGTTCGCAGGGAGACTACAGGACATGCCCAAAGCAGCTCCAGGCAAAATCAAGA
GTTGTGAGCTACAAGAAGGCGACTGGGGCAAAGTCGGTTTAGTGGTCATCTGGAACTACG
TTCAAGATGGTGAGGCAGCAATGACCAAGGAGAGGGTCGAGGCGGTGGAGCCGGAGAAAA
ACCGGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGTGATGTGATGAAAGACTACAAGAGTTTTGTAT
CTACAATCCAGGTGACCCCTAATCATGGGGGGTCTGGTAGTGTTGTGAACTTGCACATGG
AGTACGAGAAAGTAAGCGAAGATGTTGGTCCCCCTGAAACTATCCTCCAGCTTAGTATTG
AAATATTAAAAGATATCGATGAATATCTCTTGACAGAAGAATAGAGGATTACTCTTCGTG
TGTGGGTCTTTTAAGTCTTTAACGCTGCAATAAATAATGTGCCGTGTCCGAGTTTCGGAG
TTTGGCTTGGGTAAAGGACCAAGGTATATGTTGTGGTGTGTGTCGACTCGAGCGTGTATG
TATACTACAGGAGTTATGTTTGAAGTTTTTAGTTTG


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS52TF U 1
AF RR2D373TF U 3
AF RR2CV07JQ C 3
AF RR2CV07TF U 3
AF RR2D373JQ C 234
BS 1 117 RR2DS52TF
BS 118 118 RR2CV07TF
BS 119 551 RR2DS52TF
BS 552 552 RR2D373TF
BS 553 565 RR2DS52TF
BS 566 617 RR2D373TF
BS 618 687 RR2CV07TF
BS 688 696 RR2D373JQ

RD RR2DS52TF 565 0 0
AGGGACTCTTCAAAAATCCTAACGTCTTCGTAAAGTAAGCAAAAATCATGGCCGGAGCGA
CTAGTTTGGTGGGAAAGCTTGAGACAGATGCCGAGGTCAAAGTTTCTGCTGGAAAGTTCT
ATGACATGTTCGCAGGGAGACTACAGGACATGCCCAAAGCAGCTCCAGGCAAAATCAAGA
GTTGTGAGCTACAAGAAGGCGACTGGGGCAAAGTCGGTTTAGTGGTCATCTGGAACTACG
TTCAAGATGGTGAGGCAGCAATGACCAAGGAGAGGGTCGAGGCGGTGGAGCCGGAGAAAA
ACCGGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGTGATGTGATGAAAGACTACAAGAGTTTTGTAT
CTACAATCCAGGTGACCCCTAATCATGGGGGGTCTGGTAGTGTTGTGAACTTGCACATGG
AGTACGAGAAAGTAAGCGAAGATGTTGGTCCCCCTGAAACTATCCTCCAGCTTAGTATTG
AAATATTAAAAGATATCGATGAATATCTCTTGACAGAAGAATAGAGGATTACTCTTCGTG
TGTGGGTCTTT*AAGTCTTTAACGC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2D373TF 615 0 0
GGACTCTTCAAAAATCCTAACGTCTTCGTAAAGTAAGCAAAAATCATGGCCGGAGCGACT
AGTTTGGTGGGAAAGCTTGAGACAGATGCCGAGGTCAAAGTTTCTGCTGGAAAGTTCTAT
GACATGTTCGCAGGGAGACTACAGGACATGCCCAAAGCAGCTCCAGGCAAAATCAAGAGT
TGTGAGCTACAAGAAGGCGACTGGGGCAAAGTCGGTTTAGTGGTCATCTGGAACTACGTT
CAAGATGGTGAGGCAGCAATGACCAAGGAGAGGGTCGAGGCGGTGGAGCCGGAGAAAAAC
CGGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGTGATGTGATGAAAGACTACAAGAGTTTTGTATCT
ACAATCCAGGTGACCCCTAATCATGGGGGGTCTGGTAGTGTTGTGAACTTGCACATGGAG
TACGAGAAAGTAAGCGAAGATGTTGGTCCCCCTGAAACTATCCTCCAGCTTAGCATTGAA
ATATTAAAAGATATCGATGAATATCTCTTGACAGAAGAATAGAGGATTACTCTTCGTGTG
TGGGTCTTTTAAGTCTTTAACGCTGCAATAAATAATGTGCCGTGTCCGAGTTTCGGAGTT
TGGCTTGGGTAAAGG

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2CV07JQ 688 0 0
GGACTCTTCAAAAATCCTAACGTCTTCGTAAAGTAAGCAAAAATCATGGCCGGAGCGACT
AGTTTGGTGGGAAAGCTTGAGACAGATGCCGAGGTCAAAGTTTCTGCTGGAAAGTCCTAT
GACATGTTCGCAGGGAGACTACAGGACATGCCCAAAGCAGCTCCAGGCAAAATCAAGAGT
TGTGAGCTACAAGAAGGCGACTGGGGCAAAGTCGGTTTAGTGGTCATCTGGAACTACGTT
CAAGATGGTGAGGCAGCAATGACCAAGGAGAGGGTCGAGGCGGTGGAGCCGGAGAAAAAC
CGGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGTGATGTGATGAAAGACTACAAGAGTTTTGTATCT
ACAATCCAGGTGACCCCTAATCATGGGGGGTCTGGTAGTGTTGTGAACTTGCACATGGAG
TACGAGAAAGTAAGCGAAGATGTTGGTCCCCCTGAAACTATCCTCCAGCTTAGTATTGAA
ATATTAAAAGATATCGATGAATATCTCTTGACAGAAGAATAGAGGATTACTCTTCGTGTG
TGGGTCTTTTAAGTCTTTAACGCTGCAATAAATAATGTGCCGTGTCCGAGTTTCGGAGTT
TGGCTTGGGTAAAGGACCAAGGTATATGTTGTGGTGTGTGTCGACTCGAGCGTGTATGTA
TACTACAGGAGTTATGTTTGAAGTT
CTT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2CV07TF 688 0 0
GGACTCTTCAAAAATCCTAACGTCTTCGTAAAGTAAGCAAAAATCATGGCCGGAGCGACT
AGTTTGGTGGGAAAGCTTGAGACAGATGCCGAGGTCAAAGTTTCTGCTGGAAAGTCCTAT
GACATGTTCGCAGGGAGACTACAGGACATGCCCAAAGCAGCTCCAGGCAAAATCAAGAGT
TGTGAGCTACAAGAAGGCGACTGGGGCAAAGTCGGTTTAGTGGTCATCTGGAACTACGTT
CAAGATGGTGAGGCAGCAATGACCAAGGAGAGGGTCGAGGCGGTGGAGCCGGAGAAAAAC
CGGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGTGATGTGATGAAAGACTACAAGAGTTTTGTATCT
ACAATCCAGGTGACCCCTAATCATGGGGGGTCTGGTAGTGTTGTGAACTTGCACATGGAG
TACGAGAAAGTAAGCGAAGATGTTGGTCCCCCTGAAACTATCCTCCAGCTTAGTATTGAA
ATATTAAAAGATATCGATGAATATCTCTTGACAGAAGAATAGAGGATTACTCTTCGTGTG
TGGGTCTTTTAAGTCTTTAACGCTGCAATAAATAATGTGCCGTGTCCGAGTTTCGGAGTT
TGGCTTGGGTAAAGGACCAAGGTATATGTTGTGGTGTGTGTCGACTCGAGCGTGTATGTA
TACTACAGGAGTTATGTTTGAAGTT
CTT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2D373JQ 463 0 0
AACTACGTTCAAGATGGTGAGGCAGCAATGACCAAGGAGAGGGTCGAGGCGGTGGAGCCG
GAGAAAAACCGGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGTGATGTGATGAAAGACTACAAGAGT
TTTGTATTTACAATCCAGGTGACCCCTAATCATGGGGGGTTTGGTAGTGTTGTGAACTTG
CACATGGAGTACGAGAAAGTAAGGGAAGATGTTGGTCCCCCTGAAACTATCCTCCAGCTT
AGCATTGAAATATTAAAAGATATCGATGAATATCTCTTGACAGAAGAATAGAGGATTACT
CTTCGTGTGTGGGTTTTTTAAGTTTTTAACGCTGCAATAAATAATGTGCCGTGTCCGAGT
TTCGGAGTTTGGCTTGGGTAAAGGACCAAGGTATATGTTGTGGTGTGTGTCGACTCGAGC
GTGTATGTATACTACAGGAGTTATGTTTGAAGTTTTTAGTTTG

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 5

CO CL1931Contig1 591 5 9 U
GGACAGGACAAAACATCATCTTAATCAACACTAATACAAAATGGCGTCACTTTCACTTGC
GCTTAGATACATCATCATGTTAACCTTTTTCTTAATCCTCAACTCCAAAGAAATATTTTC
ATCACGACTAGTGAGATCATCCAAGGCTAAAGTAGCTCAGATTAGCGCTGATGATTATCC
ATCTTCTGGTCGTAACTCACCTGTACACGACCTTGGCTTCCCTGACTTTCCCTCTTTTCA
AGAACCAATGGTGACGCCTCAGCCTGATTTGCCTCTTCTTCCGCCGCCGCCAACATTTCC
CGATCTTGAAAAGGGTAGGTTTCCTGTACCGGTTTGGCACTCTCTCCCTGATTTCCCGCC
C*TTACCGTTCTTAGATCAGCCCCCTCCTTCCGAACCATTTGGTCCAAGATTCGATGAAT
CCGATAATTGGCTGCCTTCTGTCCCAAGTATCCCTCAAGGGTTTCCATAAACACATGACA
ATTATTGAGGCCTCGCTTCTCAAACATTACTTGAGCTTTTTGTATCAGCTAATAAGTTGA
AAAGTTATGTATGATTAAAGGAAGTCTAATAAAACCAAGTTACAAATTAAG


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G643JQ C 1
AF RR2GM67JQ C 3
AF RR2G643TF U 1
AF RR2GM67TF U 3
AF RR2C477TF U 49
BS 1 4 RR2G643JQ
BS 5 37 RR2G643TF
BS 38 38 RR2GM67TF
BS 39 45 RR2G643TF
BS 46 46 RR2GM67TF
BS 47 65 RR2G643TF
BS 66 66 RR2GM67TF
BS 67 573 RR2G643TF
BS 574 591 RR2GM67TF

RD RR2G643JQ 573 0 0
GGACAGGACAAAACATCATCTTAATCAACACTAATACGAAATGGCTTCACTTTCACTTGC
GCTTATATACATCATCATGTTAACCTTTTTCTTAATCCTCAACTCCAAAGAAATATTTTC
ATCACGACTAGTGAGATCATCCAAGGCTAAAGTAGCTCAGATTAGCGCTGATGATTATCC
ATCTTCTGGTCGTAACTCACCTGTACACGACCTTGGCTTCCCTGACTTTCCCTCTTTTCA
AGAACCAATGGTGACGCCTCAGCCTGATTTGCCTCTTCTTCCGCCGCCGCCAACATTTCC
CGATCTTGAAAAGGGTAGGTTTCCTGTACCGGTTTGGCACTCTCTCCCTGATTTCCCGCC
C*TTACCGTTCTTAGATCAGCCCCCTCCTTCCGAACCATTTGGTCCAAGATTCGATGAAT
CCGATAATTGGCTGCCTTCTGTCCCAAGTATCCCTCAAGGGTTTCCATAAACACATGACA
ATTATTGAGGCCTCGCTTCTCAAACATTACTTGAGCTTTTTGTATCAGCTAATAAGTTGA
AAAGTTATGTATGATTAAAGGAAGTCTAATAAA

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2GM67JQ 571 0 0
GG
AGGACAAAACATCATCTTAATCCACACTATTACAAAATGGCGTCACTTTCACTTGCGCTT
AGATACATCATCGTGTTAACCTTTTTCTTAATCCTCAACTCCAAAGAAATATTTTCATCA
CGACTAGTGAGATCATCCAAGGCTAAAGTAGCTCAGATTAGTGCTGATGACTATCCATTT
TCTGGTCGTAACTCACCGGTACACGACCTTGGCTTCCCTGACTTTCCGTCTTTCCAGGAA
CCAATGGTGACGCCTCAGCCTGATTTGCCTCTTCTTCCGCCGCCGCCAACATTTCCCGAT
CTTGAAAAGGGTAGGTTTCCTGTACCGGTTTGGCACTCTCTCCCTGATTTCCCGCCC*TT
ACCGTTCTTAGATCAGCCCCCTCCTTCCGAACCATTTGGTCCAAGATTCGATGAATCCGA
TAATTGGCTGCCTTCTGTCCCAAGTATCCCTCAAGGGTTTCCATAAACACATGACAATTA
TTGAGGCCTCGCTTCTCAAACATTACTTGAGCTTTTTGTATCAGCTAATAAGTTGAAAAG
TTATGTATGATTCAAGGAAGTCTAATAAA

QA 3 571 3 571
DS 

RD RR2G643TF 573 0 0
GGAC
AGGACAAAACATCATCTTAATCAACACTAATACGAAATGGCTTCACTTTCACTTGCGCTT
ATATACATCATCATGTTAACCTTTTTCTTAATCCTCAACTCCAAAGAAATATTTTCATCA
CGACTAGTGAGATCATCCAAGGCTAAAGTAGCTCAGATTAGCGCTGATGATTATCCATCT
TCTGGTCGTAACTCACCTGTACACGACCTTGGCTTCCCTGACTTTCCCTCTTTTCAAGAA
CCAATGGTGACGCCTCAGCCTGATTTGCCTCTTCTTCCGCCGCCGCCAACATTTCCCGAT
CTTGAAAAGGGTAGGTTTCCTGTACCGGTTTGGCACTCTCTCCCTGATTTCCCGCCC*TT
ACCGTTCTTAGATCAGCCCCCTCCTTCCGAACCATTTGGTCCAAGATTCGATGAATCCGA
TAATTGGCTGCCTTCTGTCCCAAGTATCCCTCAAGGGTTTCCATAAACACATGACAATTA
TTGAGGCCTCGCTTCTCAAACATTACTTGAGCTTTTTGTATCAGCTAATAAGTTGAAAAG
TTATGTATGATTAAAGGAAGTCTAATAAA

QA 5 573 5 573
DS 

RD RR2GM67TF 589 0 0
GG
AGGACAAAACATCATCTTAATCCACACTATTACAAAATGGCGTCACTTTCACTTGCGCTT
AGATACATCATCGTGTTAACCTTTTTCTTAATCCTCAACTCCAAAGAAATATTTTCATCA
CGACTAGTGAGATCATCCAAGGCTAAAGTAGCTCAGATTAGTGCTGATGACTATCCATCT
TCTGGTCGTAACTCACCGGTACACGACCTTGGCTTCCCTGACTTTCCGTCTTTCCAGGAA
CCAATGGTGACGCCTCAGCCTGATTTGCCTCTTCTTCCGCCGCCGCCAACATTTCCCGAT
CTTGAAAAGGGTAGGTTTCCTGTACCGGTTTGGCACTCTCTCCCTGATTTCCCGCCC*TT
ACCGTTCTTAGATCAGCCCCCTCCTTCCGAACCATTTGGTCCAAGATTCGATGAATCCGA
TAATTGGCTGCCTTCTGTCCCAAGTATCCCTCAAGGGTTTCCATAAACACATGACAATTA
TTGAGGCCTCGCTTCTCAAACATTACTTGAGCTTTTTGTATCAGCTAATAAGTTGAAAAG
TTATGTATGATTCAAGGAAGTCTAATAAAACCAAGTTACAAATTAAG

QA 3 589 3 589
DS 

RD RR2C477TF 525 0 0
ACTTTCACTTGCGCTTAGATACATCATCATGTTAACCTTTTTCTTAATCCTCAACTCCAA
AGAAATATTTTCATCACGACTAGTGAGATCATCCAAGGCTAAAGTAGCTCAGATTAGCGC
TGATGATTATCCATCTTCTGGTCGTAACTCACCTGTACACGACCTTGGCTTCCCTGACTT
TCCCTCTTTTCAAGAACCAATGGTGACGCCTCAGCCTGATTTGCCTCTTCTTCCGCCGCC
GCCAACATTTCCCGATCTTGAAAAGGGTAGGTTTCCTGTACCGGTTTGGCACTCTCTCCC
TGATTTCCCGCCCCTTACCGTTCTTAGATCAGCCCCCTCCTTCCGAACCATTTGGTCCAA
GATTCGATGAATCCGATAATTGGCTGCCTTCTGTCCCAAGTATCCCTCAAGGGTTTCCAT
AAACACATGACAATTATTGAGGCCTCGCTTCTCAAACATTACTTGAGCTTTTTGTATCAG
CTAATAAGTTGAAAAGTTATGTATGATTAAAGGAAGTCTAATAAA

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 3

CO CL1932Contig1 1075 3 12 U
GGACGGAACTCGTAACCAGTGAAATCACGTTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCGAAAA
ATTCGAAGCTGAGACGACACAATGGAGACGAGATGTTCTTCCATGGCGGCTGTGTTCTTT
TTCGTGGCGGCTCTAATGGCGTCTTCCTCAATCACAGCAACACCGACACAGTCGTTCGAA
GAAAATTTCAATATAATGTGGTCTGAAAATCACTTCACGACTTCCGAGGGTGGACAGATC
TGGAATCTCGCCCTAGACAACGATACCGGATGTGGATTTCAGACAAAGCACATGTACAGA
TTTGGATGGTTCAGTATGAAGCTAAAGCTTGTCGGCGGCGACTCAGCCGGCGTCGTTACC
GCTTACTACATGTGTTCGGAGAATGGAGCCGGACCGGAGAGAGACGAGATAGATTTTGAA
TTCCTAGGGAACCGAACCGGAGAGCCGTACATCATTCAGACCAATGTGTTTAAGAACGGA
ACCGGGAATCGGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCGACCCGACCAAGGACTACCACACC
TACTCCATTCTCTGGAATAACCACCAGCTCGTGCTCTTCGTGGATAGAGTACCGATTCGA
GTGTACAAGAACAGCGATAAGGTACCGAACAACGATTTCTTCCCGAACCAGAAGCCGATG
TACTTGTTCTCCAGCATCTGGAACGCCGACGACTGGGCAACACGTGGTGGTCTCGAGAAG
ACCGACTGGAAAAAAGCTCCATTCGTCTCTTCCTACAAGGACTTCGCCGTCGAAGGCTGC
CGCTGGAAGGATCCGTTCCCTGCTTGCGTTTCCACCACAACGGAGTATTGGTGGGACCAG
TACGACGCATGGCACTTGTCAAAGACACAGAAGATGGACTATGCGTGGGTGCAACGTAAC
CTCGTCGTATACGATTATTGTCAGGACCGTGAGAGATTCCCTAAAATGCCTTGGGAGTGT
TCCATTAGCCCTTGGGCTTAAGCTCAAATTTTGGTCTTTCATTTAAAGTTTATCAAGTTG
AAATGGTTGCTGTAATAATTTTGTACGTTTTTTATTATTCTTCATTTCTCATTGA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ06TF U 1
AF RR2HA83TF U 4
AF RR2EJ06JQ C 563
BS 1 149 RR2EJ06TF
BS 150 150 RR2HA83TF
BS 151 252 RR2EJ06TF
BS 253 253 RR2HA83TF
BS 254 621 RR2EJ06TF
BS 622 622 RR2HA83TF
BS 623 699 RR2EJ06TF
BS 700 700 RR2HA83TF
BS 701 718 RR2EJ06TF
BS 719 719 RR2HA83TF
BS 720 728 RR2EJ06TF
BS 729 1075 RR2EJ06JQ

RD RR2EJ06TF 728 0 0
GGACGGAACTCGTAACCAGTGAAATCACGTTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCGAAAA
ATTCGAAGCTGAGACGACACAATGGAGACGAGATGTTCTTCCATGGCGGCTGTGTTCTTT
TTCGTGGCGGCTCTAATGGCGTCTTCCTCGATCACAGCAACACCGACACAGTCGTTCGAA
GAAAATTTCAATATAATGTGGTCTGAAAATCACTTCACGACTTCCGAGGGTGGACAGATC
TGGAATCTCGCCTTAGACAACGATACCGGATGTGGATTTCAGACAAAGCACATGTACAGA
TTTGGATGGTTCAGTATGAAGCTAAAGCTTGTCGGCGGCGACTCAGCCGGCGTCGTTACC
GCTTACTACATGTGTTCGGAGAATGGAGCCGGACCGGAGAGAGACGAGATAGATTTTGAA
TTCCTAGGGAACCGAACCGGAGAGCCGTACATCATTCAGACCAATGTGTTTAAGAACGGA
ACCGGGAATCGGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCGACCCGACCAAGGACTACCACACC
TACTCCATTCTCTGGAATAACCACCAGCTCGTGCTCTTCGTGGATAGAGTACCGATTCGA
GTGTACAAGAACAGCGATAAG*TACCGAACAACGATTTCTTCCCGAACCAGAAGCCGATG
TACTTGTTCTCCAGCATCTGGAACGCCGACGACTGGGCA*CACGTGGTGGTCTCGAGA*G
ACCGACTG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2HA83TF 731 0 0
G
GGAACTCGTAACCAGTGAAATCACGTTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCT**TCGAAAAATTC
GAAGCTGAGACGACACAATGGAGACGAGATGTTCTTCCATGGCGGCTGTGTTCTTTTTTG
TGGCGGCTCTAATGGCGTCTTCCTCAATCACAGCTACACCGACACCGTCGTTCGAAGAAA
ATTTCAATATAATGTGGTCTGAAAATCACTTCACGACTTCCGAGGGTGGACAGATCTGGA
ATCTCGCTCTAGACAACGATACCGGATGTGGATTTCAGACAAAGCACATGTACAGATTTG
GATGGTTCAGTATGAAGCTAAAGCTTGTCGGCGGCGACTCAGCCGGCGTCGTTACCGCTT
ACTACATGTGTTCGGAGAATGGAGCCGGACCGGAGAGAGACGAGGTAGATTTTGAATTTG
TAGGGAACCGAACCGGAGAGCCGTACATCATTCAGACCAATGTGTTTAAGAACGGAACCG
GGAATCGGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCGACCCGACCAAGGACTACCACACTTACT
CCATTCTCTGGACTAACCACCAGCTCGTGTTCTTCGTGGATAGAGTACCGATTCGAGTCT
ACAAGAACAGCGATAAGGTACCAAACAACGATTTCTTCCCGAACCAGAAGCCGATGTACT
TGTTCTCCAGCATCTGGAACGCCGACGACTGGGCAACACGTGGTGGTCTCGAGAAGACCG
ACTG
GAAAAA

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR2EJ06JQ 513 0 0
ACCAGCTCGTGCTCTTCGTGGATAGAGTACCGATTCGAGTGTACAAGAACAGCGATAAGG
TACCGAACAACGATTTCTTCCCGAACCAGAAGCCGATGTACTTGTTCTCCAGCATCTGGA
ACGCCGACGACTGGGCAACACGTGGTGGTCTCGAGAAGACCGACTGGAAAAAAGCTCCAT
TCGTCTCTTCCTACAAGGACTTCGCCGTCGAAGGCTGCCGCTGGAAGGATCCGTTCCCTG
CTTGCGTTTCCACCACAACGGAGTATTGGTGGGACCAGTACGACGCATGGCACTTGTCAA
AGACACAGAAGATGGACTATGCGTGGGTGCAACGTAACCTCGTCGTATACGATTATTGTC
AGGACCGTGAGAGATTCCCTAAAATGCCTTGGGAGTGTTCCATTAGCCCTTGGGCTTAAG
CTCAAATTTTGGTCTTTCATTTAAAGTTTATCAAGTTGAAATGGTTGCTGTAATAATTTT
GTACGTTTTTTATTATTCTTCATTTCTCATTGA

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 4

CO CL1933Contig1 759 4 12 U
GGCTTGCACGGACAGTTTTCATCAAAAGTCCGAAGCCTTTGAAATCGAAAATCCAGTTTT
GTCGAATTTTGATCGGGAGAAGAAATGGCGGGAGCGAATCAAACGTGTATATTCTGCCAG
ATCGTGCACGATCCCAACTCCACTACTCGTCTCCTTCACACCGATGAGGAGGTCGTCGCG
TTTCAGGACATCAAGCCTTCCGCCCAGAGGCACTACTTGGTCATTCCAAAAGAACACGTC
CCAACTGTGAGAGACCTCCAGAGAAGAGATGAAGACTACTCTTTGGTGAGTCACATGCTA
AGTGTGGGACAAGAACTCCTGCTGAAAGACGCACCTCAAACCATTCATAGATTTGGTTTT
CACCAGCCGCCTTTTAACAGTGTCGATCATCTCCATCTCCATTGTTTTGCATTGCCTTTT
ATGCCCAGATGGAAAGTCGTCAAGTACATGTCTTTGGGACCTTTCGGTGGTTTTATTGAA
GCACAGAAACTTCTGGAGAAGATAAGGCCTCTTTCTTCAAAAGTGTAACTGAAACCAACT
TATCTAAATTCTTTTTCGGTGCTAAAATTGGTGCTATAACCCTTTTTCATTTACTGGCAT
GTCTGTTATAAAATGCCACATATCATTGTTGATTTTGTATGCAAAAAGGACGTGTCGTGT
AATTTTATGTAACTTCTGTCGCTTGCCAATAGTTGTAGGCAGTGACACCATTCTCATACT
TAATGGGTATGAAATATACATTAATGATTCTTCTAATAT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2DI71TF U 1
AF RR2GQ91TF U 4
AF RR2B102JQ C 4
AF RR2B102TF U 4
BS 1 71 RR2DI71TF
BS 72 72 RR2GQ91TF
BS 73 168 RR2DI71TF
BS 169 169 RR2B102TF
BS 170 273 RR2DI71TF
BS 274 274 RR2GQ91TF
BS 275 439 RR2DI71TF
BS 440 440 RR2GQ91TF
BS 441 529 RR2DI71TF
BS 530 644 RR2GQ91TF
BS 645 757 RR2B102TF
BS 758 759 RR2B102JQ

RD RR2DI71TF 529 0 0
GGCTTGCACGGACAGTTTTCATCAAAAGTCCGAAGCCTTTGAAATCGAAAATCCAGTTTT
GTCGAATTTTGGTCGGGAGAAGAAATGGCGGGAGCGAATCAAACGTGTATATTCTGCCAG
ATCGTGCACGATCCCAACTCCACTACTCGTCTCCTTCACACCGATGAGAAGGTCGTCGCG
TTTCAGGACATCAAGCCTTCCGCCCAGAGGCACTACTTGGTCATTCCAAAAGAACACGTC
CCAACTGTGAGAGACCTCCAGAGAAGAGATGAATACTACTCTTTGGTGAGTCACATGCTA
AGTGTGGGACAAGAACTCCTGCTGAAAGACGCACCTCAAACCATTCATAGATTTGGTTTT
CACCAGCCGCCTTTTAACAGTGTCGATCATCTCCATCTCCATTGTTTTGCATTGCCTTTT
ATGCCCAGATGGAAAGTCGCCAAGTACATGTCTTTGGGACCTTTCGGTGGTTTTATTGAA
GCACAGAAACTTCTGGAGAAGATAAGGCCTCTTTCTTCAAAAGTGTAAC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2GQ91TF 643 0 0
GG
GCACGGACAGTTTTCATCAAAAGTCCGAAGCCTTTGAAATCGAAAATCCAGTTTTGTCGA
ATTTTGATCGGGAGAAGAAATGGCGGGAGCGAATCAAACGTGTATATTCTGCCAGATCGT
GCACGATCCCAACTCCACTACTCGTCTCCTTCACACCGATGAGAAGGTCGTCGCGTTTCA
GGACATCAAGCCTTCCGCCCAGAGGCACTACTTGGTCATTCCAAAAGAACACGTCCCAAC
TGTGAGAGACCTCCAGAGAAGAGATGAAGACTACTCTTTGGTGAGTCACATGCTAAGTGT
GGGACAAGAACTCCTGCTGAAAGACGCACCTCAAACCATTCATAGATTTGGTTTTCACCA
GCCGCCTTTTAACAGTGCCGATCATCTCCATCTCCATTGTTTTGCATTGCCTTTTATGCC
CAGATGGAAAGTCGTCAAGTACATGTCTTTGGGACCTTTCGGTGGTTTTATTGAAGCACA
GAAACTTCTGGAGAAGATAAGGCCTCTTTCTTCAAAAGTGTAACTGAAACCAACTTATCT
AAATTCTTTTTCGGTGCTAAAATTGGTGCTATAACCCTTTTTCATTTACTGGCATGTCTG
TTATAAAATGCCACATATCATTGTTGATTTTGTATGCAA
AA

QA 3 641 3 641
DS 

RD RR2B102JQ 756 0 0
GG
GCACGGACAGTTTTCATCAAAAGTCCGAAGCCTTTGAAATCGAAAATCCAGTTTTGTCGA
ATTTTGATCGGGAGAAGAAATGGCGGGAGCGAATCAAACGTGTATATTCTGCCAGATCGT
GCACGATCCCAACTCCACTACTCGTCTCCTTCACACCGATGAGGAGGTCGTCGCGTTTCA
GGACATCAAGCCTTCCGCCCAGAGGCACTACTTGGTCATTCCAAAAGAACACGTCCCAAC
TGTGAGAGACCTCCAGAGAAGAGATGAAGACTACTCTTTGGTGAGTCACATGCTAAGTGT
GGGACAAGAACTCCTGCTGAAAGACGCACCTCAAACCATTCATAGATTTGGTTTTCACCA
GCCGCCTTTTAACAGTGTCGATCATCTCCATCTCCATTGTTTTGCATTGCCTTTTATGCC
CAGATGGAAAGTCGTCAAGTACATGTCTTTGGGACCTTTCGGTGGTTTTATTGAAGCACA
GAAACTTCTGGAGAAGATAAGGCCTCTTTCTTCAAAAGTGTAACTGAAACCAACTTATCT
AAATTCTTTTTCGGTGCTAAAATTGGTGCTATAACCCTTTTTCATTTACTGGCATGTCTG
TTATAAAATGCCACATATCATTGTTGATTTTGTATGCAAAAAGGACGTGTCGTGTAATTT
TATGTAACTTCTGTCGCTTGCCAATAGTTGTAGGCAGTGACACCATTCTCATACTTAATG
GGTATGAAATATACATTAATGATTCTTCTAATAT

QA 3 756 3 756
DS 

RD RR2B102TF 754 0 0
GG
GCACGGACAGTTTTCATCAAAAGTCCGAAGCCTTTGAAATCGAAAATCCAGTTTTGTCGA
ATTTTGATCGGGAGAAGAAATGGCGGGAGCGAATCAAACGTGTATATTCTGCCAGATCGT
GCACGATCCCAACTCCACTACTCGTCTCCTTCACACCGATGAGGAGGTCGTCGCGTTTCA
GGACATCAAGCCTTCCGCCCAGAGGCACTACTTGGTCATTCCAAAAGAACACGTCCCAAC
TGTGAGAGACCTCCAGAGAAGAGATGAAGACTACTCTTTGGTGAGTCACATGCTAAGTGT
GGGACAAGAACTCCTGCTGAAAGACGCACCTCAAACCATTCATAGATTTGGTTTTCACCA
GCCGCCTTTTAACAGTGTCGATCATCTCCATCTCCATTGTTTTGCATTGCCTTTTATGCC
CAGATGGAAAGTCGTCAAGTACATGTCTTTGGGACCTTTCGGTGGTTTTATTGAAGCACA
GAAACTTCTGGAGAAGATAAGGCCTCTTTCTTCAAAAGTGTAACTGAAACCAACTTATCT
AAATTCTTTTTCGGTGCTAAAATTGGTGCTATAACCCTTTTTCATTTACTGGCATGTCTG
TTATAAAATGCCACATATCATTGTTGATTTTGTATGCAAAAAGGACGTGTCGTGTAATTT
TATGTAACTTCTGTCGCTTGCCAATAGTTGTAGGCAGTGACACCATTCTCATACTTAATG
GGTATGAAATATACATTAATGATTCTTCTAAT

QA 3 754 3 754
DS 



AS 1 3

CO CL1934Contig1 937 3 2 U
GTGCAATTTTTTCTTAATTATAAATACTTCTTAGTAGATTAAACATGCAATACACAATTT
GAAACTGATAGAGAATTAGAACAAGATCATTTGTTTACAGAGAACCATAAAAAAAAAAGA
GTGATGTTTTCAACGCATCTGGAGAATCAAAAACACCGAAGAGGTGAGTACCCAAAACAT
ATCAGCCATCATCAAGATTCATTCAACATGCGACATCGAGTAACAACTTTCCTGAACTCA
TCCAAGCTTAGCTTTCCATCTTTATCAAAATCAAAGCAACGAATCATGTCTTCTAATTCT
TCGTCTGACCAAGTGAAATCATGCACAGTGGCCATTGTCGCCACATCTCTCAGAGTAATG
AAACCTTTTCCCGCTTTATCAAACTGAAAGAAGTATAAGACCAATTCATCCGCAGTCATC
TGCATCTTGCTCATGCTCAGGTCCGATTTATTCTTCTTCGAAGATCCTGACTCTTGGTCC
TGTAGAGAAAGCGCTATTGCCTTGTTTAAGTCGTCATCGTCATCCTCTCCAAGTGGGTCT
GATCTACACAAATGCTTCTTCCTCTTTGGCGGGGAGGCGGTCTTGGTCTTGTTTCTTTTA
CGAGAAACGGAGCTTGGTTTCTCCAGAAACTCCTCGTCTTCATATTCACTCTCGTCTATT
TCATCTTCGAGTCTATAATCGTCGTCTTCTTCTTCATCACCGGAATTAGGTTTTCTCATA
GATGGAGGCACAAGGGCCTTGGCGGCTTTAGAGATGCCGAGAGCTTCTAATCTCGCTCTG
TTCTCGGCGATCCTTGTCAACCTCTTCTTCTCATACTCCGACATCTTCTTATCACCCTTT
CCTTCTTCTTCGATTGGGTCTCTCGTTTCCTCCTCCGACTCCGATTCGTCGCCGCCGGAC
CTCGAACTCTCTCCTTCACCCATTTGAATCTCCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR66JQ U 195
AF RR2FG08JQ U 1
AF RR2FG08TF C 120
BS 1 711 RR2FG08JQ
BS 712 937 RR2FG08TF

RD RR2DR66JQ 405 0 0
AGATTCATTCAACATGTGACAACGAGTAACAACTTTCCTGAACTCATCCAAGCTTAGCTT
TCCATCTTTATCAAAATCAAAGCAACGAATCATGTCTTGTAATTCCTCGTCTGACCAAGT
GAAATCATGCACAGTGGCCATTGGCGCCCCATCTCTCAGAGTAATGAAACCTTTTCCCGC
TTTATCAAACTGAAAGAAGTATAAGACCAATTCATCCACAGTCATCTGCATCTTGCTCAT
GCTCAAGTCCGATTTATTCTTCTTCGAAGATCCTGACTCTTGGTCCTGTAGAGAAAGCGC
TATTGCCTTGTTTAAGTCGTCATCGTCATCCTCTCCAAGTGGGTCTGATCTACACAAATG
CTTCTTCCTCTTTGGCGGGGAGGCGGTCTTG
GTCTTGTTTCTTTT

QA 1 391 1 391
DS 

RD RR2FG08JQ 711 0 0
GTGCAATTTTTTCTTAATTATAAATACTTCTTAGTAGATTAAACATGCAATACACAATTT
GAAACTGATAGAGAATTAGAACAAGATCATTTGTTTACAGAGAACCATAAAAAAAAAAGA
GTGATGTTTTCAACGCATCTGGAGAATCAAAAACACCGAAGAGGTGAGTACCCAAAACAT
ATCAGCCATCATCAAGATTCATTCAACATGCGACATCGAGTAACAACTTTCCTGAACTCA
TCCAAGCTTAGCTTTCCATCTTTATCAAAATCAAAGCAACGAATCATGTCTTCTAATTCT
TCGTCTGACCAAGTGAAATCATGCACAGTGGCCATTGTCGCCACATCTCTCAGAGTAATG
AAACCTTTTCCCGCTTTATCAAACTGAAAGAAGTATAAGACCAATTCATCCGCAGTCATC
TGCATCTTGCTCATGCTCAGGTCCGATTTATTCTTCTTCGAAGATCCTGACTCTTGGTCC
TGTAGAGAAAGCGCTATTGCCTTGTTTAAGTCGTCATCGTCATCCTCTCCAAGTGGGTCT
GATCTACACAAATGCTTCTTCCTCTTTGGCGGGGAGGCGGTCTTGGTCTTGTTTCTTTTA
CGAGAAACGGAGCTTGGTTTCTCCAGAAACTCCTCGTCTTCATATTCACTCTCGTCTATT
TCATCTTCGAGTCTATAATCGTCGTCTTCTTCTTCATCACCGGAATTAGGT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2FG08TF 818 0 0
GAGTGATG
TTTCAACGCATCTGGAGA*TCAAAA*CAC*GAAGAGGTGAGTACCCAAA*CATATCAGCC
ATCATCAAGATTCATTCAACATGCGACATCGAGTAACAACTTTC*TGAACTCATCCAAGC
TTAGCTTTCCATCTTTATCAAAATCAAAGCAACGAATCATGTCTTCTAATTCTTCGTCTG
ACCAAGTGAAATCATGCACAGTGGCCATTGTCGCCACATCTCTCAGAGTAATGAAACCTT
TTCCCGCTTTATCAAACTGAAAGAAGTATAAGACCAATTCATCCGCAGTCATCTGCATCT
TGCTCATGCTCAGGTCCGATTTATTCTTCTTCGAAGATCCTGACTCTTGGTCCTGTAGAG
AAAGCGCTATTGCCTTGTTTAAGTCGTCATCGTCATCCTCTCCAAGTGGGTCTGATCTAC
ACAAATGCTTCTTCCTCTTTGGCGGGGAGGCGGTCTTGGTCTTGTTTCTTTTACGAGAAA
CGGAGCTTGGTTTCTCCAGAAACTCCTCGTCTTCATATTCACTCTCGTCTATTTCATCTT
CGAGTCTATAATCGTCGTCTTCTTCTTCATCACCGGAATTAGGTTTTCTCATAGATGGAG
GCACAAGGGCCTTGGCGGCTTTAGAGATGCCGAGAGCTTCTAATCTCGCTCTGTTCTCGG
CGATCCTTGTCAACCTCTTCTTCTCATACTCCGACATCTTCTTATCACCCTTTCCTTCTT
CTTCGATTGGGTCTCTCGTTTCCTCCTCCGACTCCGATTCGTCGCCGCCGGACCTCGAAC
TCTCTCCTTCACCCATTTGAATCTCCACCC

QA 9 818 9 818
DS 



AS 1 5

CO CL1935Contig1 712 5 12 U
GGACATCATTTTGGAATCTTATTCTTCTTCTTCTTCCATAATTAAGCTCAAACAAAAGAT
TGTCATGGCTACCGGAGAGGAGAAACCGCTGATGGTCGTCGGTCTGGACGAAAGCGAGCA
AAGCACCTACGCTTTGGAGTGGACGCTTGATCGTTTCTTCGCTCCTTATGCTCCGAATTT
TCCGTTCAAGCTCTTAATCATCCACGCCAAACTTAACGCCGTATCTGCCGTTGGTTTCGC
TGGTCCCGGCGGAATTGCGGAGGTTGTGCCTCATGTTGATGCAGATTTGAAGCATACCGC
TGCTAAGGTTGTCGACAAGGCCAAAGGAATCTGTGAGAGCAAATCGGTTCATGACGCGAC
TATGGAAGTTTTCGAAGGCGATGCGAGGAATATCCTGTGCGAGGCTGTGGATAAACACCA
TGCTTCTCTTCTTGTTGTGGGAAACCATGGTCATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTATGGG
GAGCGTGAGCGACTACTGTGCTCACCATGCGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAAGAAGCC
TAAGATCAAGGTCTGATGATCACCCAACAGCCAAAATAAAGTGTATCTGCATAGTCAAAT
CAAAATTGTGCCAAAGAGTGAAATAATGTTTACCTTGATGTGAAATGATTCAAGACAATC
TTTGTGTGTGGTTGTTTATCACATATACTCTTTTAATAGCAGAGTATTCGCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2F419JQ C 99
AF RR2GN91TF U 1
AF RR2CK09JQ C 1
AF RR2F419TF U 1
AF RR2CK09TF U 1
BS 1 41 RR2F419TF
BS 42 45 RR2CK09TF
BS 46 222 RR2F419TF
BS 223 223 RR2CK09TF
BS 224 347 RR2F419TF
BS 348 348 RR2GN91TF
BS 349 353 RR2F419TF
BS 354 354 RR2GN91TF
BS 355 693 RR2F419TF
BS 694 694 RR2CK09JQ
BS 695 707 RR2CK09TF
BS 708 712 RR2CK09JQ

RD RR2F419JQ 390 0 0
TCGGTCTGGACGAAAGCGAGCAAAGCACCTACGCTTTGGAGTGGACGCTTGATCGTTTCT
TCGCTCCTTATGCTCCGAATTTTCCGTTCAAGCTTTTAATCATCCACGCCAAACTTAACG
CCGTTTCTGCCGTTGGTTTCGCTGGTCCCGGCGGAATTGCGGAGGTTGTGCCTCATGTTG
ATGCAGATTTGAAGCATACCGCTGCTAAGGTTGTCGACAAGGCCAAAGGAATCTGTGAGA
GCAAATCGGCTCATGGCGCGACTATGGAAGTTTTCGAAGGCGATGCGAGGAATATCCTGT
GGGAGGCTGTGGATAAACACCATGCTTTTTTTCTTGTTGTGGGAAACCATGGTCATGGAG
CTATCAAGAGGGGGGTTATGGGG
GGGGTGA

QA 1 383 1 383
DS 

RD RR2GN91TF 666 0 0
GGACATCATTTTGGAATCTTATTCTTCTTCTTCTTCCATAA****GCTCAAACAAAAGAT
TGTCATGGCTACCGGAGAGGAGAAACCGCTGATGGTCGTCGGTCTGGACGAAAGCGAGCA
AAGCACCTACGCTTTGGAGTGGACGCTTGATCGTTTCTTCGCTCCTTATGCTCCGAATTT
TCCGTTCAAGCTCTTAATCATCCACGCCAAACTTAACGCCGTCTCTGCCGTTGGTTTCGC
TGGTCCCGGCGGAATTGCGGAGGTTGTGCCTCATGTTGATGCAGATTTGAAGCATACCGC
TGCTAAGGTTGTCGACAAGGCCAAAGGAATCTGTGAGAGCAAATCGGTTCATGACGCGAC
TATGGAAGTTTTCGAAGGCGATGCGAGGAATATCCTGTGCGAGGCTGTGGATAAACACCA
TGCTTCTCTTCTTGTTGTGGGAAACCATGGTCATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTATGGG
GAGCGTGAGCGACTACTGTGCTCACCATGCGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAAGAAGCC
TAAGATCAAGGTCTGATGATCACCCAACAGCCAAAATAAAGTGCATCTGCATAGTCAAAT
CAAAATTGTGCCAA***GTGAAATAATGTTTACCTTGATTTGAAATGATTCAAGACA
ATCTTTGTG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2CK09JQ 712 0 0
GGACATCATTTTGGAATCTTATTCTTCTTCTTCTTCCATAATTAAGCTCAAACAAAAGAT
TGTCATGGCTACCGGAGAGGAGAAACCGCTGATGGTCGTCGGTCTGGACGAAAGCGAGCA
GAGCACCTACGCTTTGGAGTGGACGCTTGATCGTTTCTTCGCTCCTTATGCTCCGAATTT
TCCGTTCAACCTCTTAATCATCCACGCCAAACTTGACGCCGTATCTGCCGTTGGTTTCGC
TGGTCCCGGCGGAATTGCGGAGGTTGTGCCTCATGTTGATGCAGATTTGAAGCATACCGC
TGCTAAGGTTGTCGACAAGGCCAAAGGAATCTGTGAGAGCAAATCGGTTCATGACGCGAC
TATGGAAGTTTTCGAAGGCGATGCGAGGAATATCCTGTGCGAGGCTGTGGATAAACACCA
TGCTTCTCTTCTTGTTGTGGGAAACCATGGTCATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTATGGG
GAGCGTGAGCGACTACTGTGCTCACCATGCGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAAGAAGCC
TAAGATCAAGGTCTGATGATCACCCAACAGCCAAAATAAAGTGTATCTGCATAGTCAAAT
CAAAATTGTGCCAAAGAGTGAAATAATGTTTACCTTGATGTGAAATGATTCAAGACAATC
TTTGTGTGTGGTTGTTTATCACATATACTCTTTTAATAGCAGAGTATTCGCC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2F419TF 694 0 0
GGACATCATTTTGGAATCTTATTCTTCTTCTTCTTCCATAA****GCTCAAACAAAAGAT
TGTCATGGCTACCGGAGAGGAGAAACCGCTGATGGTCGTCGGTCTGGACGAAAGCGAGCA
AAGCACCTACGCTTTGGAGTGGACGCTTGATCGTTTCTTCGCTCCTTATGCTCCGAATTT
TCCGTTCAAGCTCTTAATCATCCACGCCAAACTTAACGCCGTCTCTGCCGTTGGTTTCGC
TGGTCCCGGCGGAATTGCGGAGGTTGTGCCTCATGTTGATGCAGATTTGAAGCATACCGC
TGCTAAGGTTGTCGACAAGGCCAAAGGAATCTGTGAGAGCAAATCGGCTCATGGCGCGAC
TATGGAAGTTTTCGAAGGCGATGCGAGGAATATCCTGTGCGAGGCTGTGGATAAACACCA
TGCTTCTCTTCTTGTTGTGGGAAACCATGGTCATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTATGGG
GAGCGTGAGCGACTACTGTGCTCACCATGCGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAAGAAGCC
TAAGATCAAGGTCTGATGATCACCCAACAGCCAAAATAAAGTGTATCTGCATAGTCAAAT
CAAAATTGTGCCAAAGAGTGAAATAATGTTTACCTTGATGTGAAATGATTCAAGACAATC
TTTGTGTGTGGTTGTTTATCACATATACTCTTT
T

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2CK09TF 707 0 0
GGACATCATTTTGGAATCTTATTCTTCTTCTTCTTCCATAATTAAGCTCAAACAAAAGAT
TGTCATGGCTACCGGAGAGGAGAAACCGCTGATGGTCGTCGGTCTGGACGAAAGCGAGCA
GAGCACCTACGCTTTGGAGTGGACGCTTGATCGTTTCTTCGCTCCTTATGCTCCGAATTT
TCCGTTCAACCTCTTAATCATCCACGCCAAACTTGACGCCGTATCTGCCGTTGGTTTCGC
TGGTCCCGGCGGAATTGCGGAGGTTGTGCCTCATGTTGATGCAGATTTGAAGCATACCGC
TGCTAAGGTTGTCGACAAGGCCAAAGGAATCTGTGAGAGCAAATCGGTTCATGACGCGAC
TATGGAAGTTTTCGAAGGCGATGCGAGGAATATCCTGTGCGAGGCTGTGGATAAACACCA
TGCTTCTCTTCTTGTTGTGGGAAACCATGGTCATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTATGGG
GAGCGTGAGCGACTACTGTGCTCACCATGCGCATTGCTCCGTGATGATCGTGAAGAAGCC
TAAGATCAAGGTCTGATGATCACCCAACAGCCAAAATAAAGTGTATCTGCATAGTCAAAT
CAAAATTGTGCCAAAGAGTGAAATAATGTTTACCTTGATGTGAAATGATTCAAGACA*TC
TTTGTGTGTGGTTGTTTATCACATATACTCTTT*AATAGCAGAGTAT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 4

CO CL1936Contig1 1266 4 20 U
GAATCAAACTTAAGTAGTTGCTTAATGTATCATATTTTACATAAAGTTAAAAGAGAATAT
ACAGTTTAGACATAAGATAGTTTTTTTGTGATCATAAAGATATTAGTAGGATCGATTTTT
AGCTATAGATCTTTATATAAATCTATGTATCTCGTATCATGGTAGCTTGATCGATCCAAT
AGTCTTCTTTCCATCATGGGGTCTACCAAAAACATCCTTCAGATAGTTCGAAGAATACAC
AATCTTTCTGTACCGAGCCACCTCATTGTTCTCTAGCACCTCCGGTAATGGCTCGATAAC
CGTATCATCAACTGGTCCGTAGAAAATAGGGACAGAGATTCGGCTACAACCCTTATGAAC
CAATACACAATGCTCCACGCTCTTATACTTACCGTTGCTCAATATCTGTAATACGTCTCC
AACATTAACAACAATGGCTCCCGGAATTGGAGGGACATCGACCCATTTGTCCTCGTGCTC
GCTGGCTCGACCATATAGGCTGCTTAAGACGCCATCTTCTTGTATGAGGAGAGTGAGGGT
GTTGATGTCTGTATGGCGGCCAGTTCCTATTGCCAGGTTTGGTTCAGGACACTCTGGATA
ATAGTTGAAGTTCATTCTCATAGTTCCAATTAGTGCGTCTTCGTTAGACTCATCTACGAT
TGAATTTAGATTGTTGATGAGTATGTTTAAGATCTTCTTGGTGATTGGTTTGATCCTCTC
GAAATGGTGTATCACTTGTTCCTTGCATAGAGAAGGCCATGTAGTAGCGAAGTCATGTCC
TTCACGAGGATACTGAAACTTGAAAAAGTCTCTCCACTCCAACACACTCTCTTTATACGG
AGTGAAACTTGTTGTCAACCACGCCGTCTCCGACACCGAACTTCCTTTCCAATACCTCTT
CCTCTCATCCGCAGGCAACTCAAAAAAACCACGAGCTGCCGCAATGACTGCCTTTAACTC
CTCCGGAGCTATCCCGCGGTTCACTATCTGAAACACCCCGAGCTTAGCCGCTGCGTCGCA
GATCTCTCTAGCAACTCGTGGGTCTAACCAATCAGACACATCAATGACAGGAACTTGTGA
CGATATAATTTTCTCGGATGTGAAGCGTTCTTGAGGAGGTTGAATGTATGGAGAAGGAAG
TGTGTTTAGGGTTATAAAGTCGACGAGACCTTTAACACCATTCCTTTTGTTTAACACGAA
ATCCCTCACGTCGATCTCGTCCTTTGAGGAGGTAAGAACCATCGTTTCTTTCTTAGATAT
GAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2F446JQ U 1
AF RR2D486JQ U 14
AF RR2D486TF C 472
AF RR2BX12TF C 704
BS 1 336 RR2F446JQ
BS 337 337 RR2D486JQ
BS 338 695 RR2F446JQ
BS 696 743 RR2D486JQ
BS 744 828 RR2D486TF
BS 829 829 RR2BX12TF
BS 830 894 RR2D486TF
BS 895 895 RR2BX12TF
BS 896 912 RR2D486TF
BS 913 913 RR2BX12TF
BS 914 917 RR2D486TF
BS 918 919 RR2BX12TF
BS 920 921 RR2D486TF
BS 922 922 RR2BX12TF
BS 923 962 RR2D486TF
BS 963 963 RR2BX12TF
BS 964 976 RR2D486TF
BS 977 977 RR2BX12TF
BS 978 1260 RR2D486TF
BS 1261 1266 RR2BX12TF

RD RR2F446JQ 695 0 0
GAATCAAACTTAAGTAGTTGCTTAATGTATCATATTTTACATAAAGTTAAAAGAGAATAT
ACAGTTTAGACATAAGATAGTTTTTTTGTGATCATAAAGATATTAGTAGGATCGATTTTT
AGCTATAGATCTTTATATAAATCTATGTATCTCGTATCATGGTAGCTTGATCGATCCAAT
AGTCTTCTTTCCATCATGGGGTCTACCAAAAACATCCTTCAGATAGTTCGAAGAATACAC
AATCTTTCTGTACCGAGCCACCTCATTGTTCTCTAGCACCTCCGGTAATGGCTCGATAAC
CGTATCATCAACTGGTCCGTAGAAAATAGGGACAGA*ATTCGGCTACAACCCTTATGAAC
CAATACACAATGCTCCACGCTCTTATACTTACCGTTGCTCAATATCTGTAATACGTCTCC
AACATTAACAACAATGGCTCCCGGAATTGGAGGGACATCGACCCATTTGTCCTCGTGCTC
GCTGGCTCGACCATATAGGCTGCTTAAGACGCCATCTTCTTGTATGAGGAGAGTGAGGGT
GTTGATGTCTGTATGGCGGCCAGTTCCTATTGCCAGGTTTGGTTCAGGACACTCTGGATA
ATAGTTGAAGTTCATTCTCATAGTTCCAATTAGTGCGTCTTCGTTAGACTCATCTACGAT
TGAATTTAGATTGTTGATGAGTATGTTTAAGATCT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2D486JQ 730 0 0
GTAGTTGCTTAATGTATCATATTTTACATAAAGTTAAAAGAGAATATACAGTTTAGACAT
AAGATAGTTTTTTT*TGATCATAAAGATATTAGTAGGATCGATTTTTAGCTATAGATCTT
TATATAAATCTATGTATCTCGTATCATGGTAGCTTGATCGATCCAATAGTCTTCTTTCCA
TCATGGGGTCTACCAAAAACATCCTTCAGATAGTTCGAAGAATACACAATCTTTCTGTAC
CGAGCCACCTCATTGTTCTCTAGCACCTCCGGTAATGGCTCGATAACCGTATCATCAACT
GGTCCGTAGAAAATAGGGACAGAGATTCGGCTACAACCCTTATGAACCAATACACAATGC
TCCACGCTCTTATACTTACCGTTGCTCAATATCTGTAATACGTCTCCAACATTAACAACA
ATGGCTCCCGGAATTGGAGGGACATCGACCCATTTGTCCTCGTGCTCGCTGGCTCGACCA
TATAGGCTGCTTAAGACGCCATCTTCTTGTATGAGGAGAGTGAGGGTGTTGATGTCTGTA
TGGCGGCCAGTTCCTATTGCCAGGTTTGGTTCAGGACACTCTGGATAATAGTTGAAGTTC
ATTCTCATAGTTCCAATTAGTGCGTCTTCGTTAGACTCATCTACGATTGAATTTAGATTG
TTGATGAGTATGTTTAAGATCTTCTTGGTGATTGGTTTGATCCTCTCGAAATGGTGTATC
ACTTGTTCCT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2D486TF 791 0 0
CTCGTGCTCGCTG*CTCGACCATATAGGCTGCTTAAGACGCCATCTTCTTGTATGAGGAG
AGTGAGGGTGTTGATGTCTGTATGGCGGCCAGTTC*TATTGCCAGGTTTGGTTCAGGACA
CTCTGGATAATAGTTGAAGTTCATTCTCATAGTTCCAATTAGTGCGTCTTCGTTAGACTC
ATCTACGATTGAATTTAGATTGTTGATGAGTATGTTTAAGATCTTCTTGGTGATTGGTTT
GATCCTCTCGAAATGGTGTATCACTTGTTCCTTGCATAGAGAAGGCCATGTAGTAGCGAA
GTCATGTCCTTCACGAGGATACTGAAACTTGAAAAAGTCTCTCCACTCCAACACACTTTC
TTTATACGGAGTGAAACTTGTTGTCAACCACGCCGTCTCCGACACCGAACTTCCTTTCCA
ATATCTCTTCCTCTCATCCGCCGGCAGGTCGAAAAAACCACGAGCTGCCGCAATGACTGC
CTTTAACTCCTTCGGAGCTATCCCGTGGTTCACTATCTGAAACACCCCGAGCTTAGCCGC
TGCGTCGCAGATCTCTCTAGCAACTCGTGGGTCTAACCAATCAGACACATCAATGACAGG
AACTTGTGACGATATAATTTTCTCGGATGTGAAGCGTTCTTGAGGAGGTTGAATGTATGG
AGAAGGAAGTGTGTTTAGGGTTATAAAGTCGACGAGACCTTTAACACCATTCCTTTTGTT
TAACACGAAATCCCTCACGTCGATCTCGTCCTTTGAGGAGGTAAGAACCATCGTTTCTTT
CTTAGATAT
CC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2BX12TF 563 0 0
ATTGGTTTGATCCTCTCGAAATGGTGTATCACTTGTTCTTTGCATAGAGAAGGCCATGTA
GTTGCGAAGTCATGTCCTTCACGAGGATACTGAAACTTGAAAAAGTCTCTCCACTCCAAC
ACACTCTCTTTATACGGAGTGAAACTTGTTGTCAACCACGCCGTCTCCGACACCGAACTT
CCTTTCCAATACCTCTTCCTCTCATCCGCAGGCAACTCAAAAAAGCCACGAGCTGCCGCA
ATGACTGCCTTTAACTCCTCCGGAGCTATCCCGCGGTTCACTATCTGAAACACCCCGAGC
TTAGCCGCTGCGTCGCAGATCTCTCTAGCAACTTGTGGGTCTAACCAATCAGACACATCA
ATGACAGGAACTTGTGACGATATAATTTTCTCGGATGTGAAGCGTTCTTGAGGAGGTTGA
ATGTATGGAGAAGGAAGTGTGTTTAGGGTTATAAAGTCGACGAGACCTTTAACACCATTC
CTTTTGTTTAACACGAAATCCCTCACGTCGATCTCGTCCTTTGAGGAGGTAAGAGCCATG
GTTTCTTTCTTAGATATGAACCC

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 5

CO CL1937Contig1 776 5 6 U
GACACAAACAGTTCCGATCAGAGAAACGAAACTCAGAGGAGAGAGACAGGACAGGAGTGT
TAAAGTAATTTTCACCAGAAATTCATCTCTGTAACTCTGTTCATCGCATGATCGTAGAGA
TCCAGATTCTTTAAATAAAAGAAGAAGAAGAATAAACCAGAGGAGGTAATTGTTGTGCGT
AGCGTAGCTAGGAGAGGAAGAGAAAGAGAGAGAGGGATGGGAGATGTGTGGACATGGATT
ATTTCATTCTTAATCCTTATCACTCTTGTCGGATTCATCGTCTACCAGCTTATTTGCTTA
GCTGATCTGGAGTTTGATTACATAAATCCTTACGACTCTGCATCAAGAATAAACTTTGTG
GTATTACCTGAGTTCATTCTTCAAGGCTTCCTATGTTTCTTCTACCTCGTCACTGGTCAC
TGGTTCATGTCACTACTTGGCGTCCCTTATCTCTACTACAACTTCCAACTTTACTCGAAA
AGACAACATTTGGTAGATGTGACAGAGATCTTCAACTTGCTTGATTGGGAAAAGAAGAAA
CGGCTCTTCAAACTCGCCTACATGATCCTCACTCTCTTCCTCACCATTTTTTGGTTAATC
TATTCAACATTGGATGATCACGAGGACTGAAGGGCAACACACTACCGCCATGTGACATGA
AAAGAAAAGGTTTATGATATATGTTTATTACTGAAGAGTATGTTTTTAGGGTTTGTGGTG
GCATTAGAGATTTGTGTAACCAGATTTTAGTCTATAGTGAAACATTCTTCTGATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT95TF U 162
AF RR2DO10TF U 26
AF RR2GW79TF U 1
AF RR2GW79JQ C 1
AF RR2AT95JQ C 115
BS 1 27 RR2GW79TF
BS 28 665 RR2DO10TF
BS 666 669 RR2GW79TF
BS 670 670 RR2GW79JQ
BS 671 705 RR2GW79TF
BS 706 776 RR2GW79JQ

RD RR2AT95TF 441 0 0
GGAGGTAATTGTTGTGCGTAGCGTATCTAGGAGAGGAAGAGAAAGAGAGAGAGGGATGGG
AGATGTGTGGACATGGATTATTTCATTCTTAATCCTTATCACTCTTGTCGGATTCATCGT
CTACCAGCTTATTTGCTTAGCTGATCTGGAGTTTGATTACATAAATCCTTACGACTCTGC
ATCAAAAATAAACTTTGGGGTATTACCTGAGTTCATTCTTCAAGGCTTCCTATGTTTCTT
CTACCTCGTCACTGGTCACTGGTTCATGTCACTACTTGGCGTCCCTTATCTCTACTACGA
CTTCCAACTTTACTCGAAAAGACAACATTTGGTAGATGTGACAGAGATCTTCAACTTGCT
TGATTGGGAAAAGAAGAAACGGCTCTTCAAACTCGCCTACATGATCCTCACTCTCTTCCT
CACCATTTTTTGGTTAATCTA

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR2DO10TF 640 0 0
GG
GAAACTCAGAGGAGAGAGACAGGACAGGAGTGTTAAAGTAATTTTCACCAGAAATTCATC
TCTGTAACTCTGTTCATCGCATGATCGTAGAGATCCAGATTCTTTAAATAAAAGAAGAAG
AAGAATAAACCAGAGGAGGTAATTGTTGTGCGTAGCGTAGCTAGGAGAGGAAGAGAAAGA
GAGAGAGGGATGGGAGATGTGTGGACATGGATTATTTCATTCTTAATCCTTATCACTCTT
GTCGGATTCATCGTCTACCAGCTTATTTGCTTAGCTGATCTGGAGTTTGATTACATAAAT
CCTTACGACTCTGCATCAAGAATAAACTTTGTGGTATTACCTGAGTTCATTCTTCAAGGC
TTCCTATGTTTCTTCTACCTCGTCACTGGTCACTGGTTCATGTCACTACTTGGCGTCCCT
TATCTCTACTACAACTTCCAACTTTACTCGAAAAGACAACATTTGGTAGATGTGACAGAG
ATCTTCAACTTGCTTGATTGGGAAAAGAAGAAACGGCTCTTCAAACTCGCCTACATGATC
CTCACTCTCTTCCTCACCATTTTTTGGTTAATCTATTCAACATTGGATGATCACGAGGAC
TGAAGGGCAACACACTACCGCCATGTGACATGAAAAGA

QA 3 640 3 640
DS 

RD RR2GW79TF 705 0 0
GACACAAACAGTTCCGATCAGAGAAACGAAACTCAGAGGAGAGAGACAGGACAGGAGTGT
TAAAGTAATTTTCACCAGAAATTCATCTCTGTAACTCTGTTCATCGCATGATCGTAGATA
TCCAGATTCTTTAAATAAAAGAAGAAGAAGAATAAACCAGAGGAGGTAATTGTTGTGCGT
AGCGTAGCTAGGAGAGGAAGAGAAAGAGAGAGAGGGATGGGAGATGTGTGGACACGGATT
ATTTCATTCTTAATCCTTATCACTCTTGTCGGATTCATCGTCTACCAGCTTATTTGCTTA
GCTGATCTGGAGTTTGATTACATAAATCCTTACGACTCTGCATCAAGAATAAACTTTGTG
GTATTACCTGAGTTCATTCCTCAAGGCTTCCTATGTTTCTTCTACCTCGTCACTGGTCAC
TGGTTCATGTCACTACTTGGCGTCCCTTATCTCTACTACAACTTCCAACTTTACTCGAAA
AGACAACATTTGGTAGATGTGACAGAGATCTTCAACTTGCTTGATTGGGAAAAGAAGAAA
CGGCTCTTCAAACTCGCCTACATGATCCTCACTCTCTTCCTCACCATTTTTTGGTTAATC
TATTCAACATTGGATGATCACGAGGACTGAAGGGCAACACACTACCGCCATGTGACATGA
AAAGAAAAG*TTTATGATATATGTTTATTACTGAAGAGTATGTTT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2GW79JQ 776 0 0
GACACAAACAGTTCCGATCAGAGAAACGAAACTCAGAGGAGAGAGACAGGACAGGAGTGT
TAAAGTAATTTTCACCAGAAATTCATCTCTGTAACTCTGTTCATCGCATGATCGTAGATA
TCCAGATTCTTTAAATAAAAGAAGAAGAAGAATAAACCAGAGGAGGTAATTGTTGTGCGT
AGCGTAGCTAGGAGAGGAAGAGAAAGAGAGAGAGGGATGGGAGATGTGTGGACACGGATT
ATTTCATTCTTAATCCTTATCACTCTTGTCGGATTCATCGTCTACCAGCTTATTTGCTTA
GCTGATCTGGAGTTTGATTACATAAATCCTTACGACTCTGCATCAAGAATAAACTTTGTG
GTATTACCTGAGTTCATTCCTCAAGGCTTCCTATGTTTCTTCTACCTCGTCACTGGTCAC
TGGTTCATGTCACTACTTGGCGTCCCTTATCTCTACTACAACTTCCAACTTTACTCGAAA
AGACAACATTTGGTAGATGTGACAGAGATCTTCAACTTGCTTGATTGGGAAAAGAAGAAA
CGGCTCTTCAAACTCGCCTACATGATCCTCACTCTCTTCCTCACCATTTTTTGGTTAATC
TATTCAACATTGGATGATCACGAGGACTGAAGGGCAACACACTACCGCCATGTGACATGA
AAAGAAAAGGTTTATGATATATGTTTATTACTGAAGAGTATGTTTTTAGGGTTTGTGGTG
GCATTAGAGATTTGTGTAACCAGATTTTAGTCTATAGTGAAACATTCTTCTGATCC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2AT95JQ 658 0 0
TAGAGATCCAGATTCTTTAAATAAAAGAAGAAGAAGAATAAACCAGAGGAGGTAATTGTT
GTGCGTAGCGTAGCTAGGAGAGGAAGAGAAAGAGAGAGAGGGATGGGAGATGTGTGGACA
TGGATTATTTCATTCTTAATCCTTATCACTCTTGTCGGATTCATCGTCTACCAGCTTATT
TGCTTAGCTGATCTGGAGTTTGATTACATAAATCCTTACGACTCTGCATCAAGAATAAAC
TTTGTGGTATTACCTGAGTTCATTCTTCAAGGCTTCCTATGTTTTTTCTACCTCGTCACT
GGTCACTGGTTCATGTCACTACTTGGCGTCCCTTATCTCTACTACAACTTCCAACTTTAC
TCGAAAAGACAACATTTGGTAGATGTGACAGAGATCTTCAACTTGCTTGATTGGGAAAAG
AAGAAACGGCTCTTCAAACTCGCCTACATGATCCTCACTCTCTTCCTCACCATTTTTTGG
TTAATCTATTCAACATTGGATGATCACGAGGACTGAAGGGCAACACACTACCGCCATGTG
ACATGAAAAGAAAAGGTTTATGATATATGTTTATTACTGAAGAGTATGTTTTTAGGGTTT
GTGGTGGCATTAGAGATTTGTGTAGCCAGATTTTAGTCTATAGTGAAACATT
TTTTTG

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 5

CO CL1938Contig1 1018 5 8 U
GGAAATATAAGCAAACAACAGACACACATATTTAACATATCAAATTGCATCTCTCCGTCT
CTCTCTTGTGTTCTTTGTTTCTTGTTTCTTGTTCTTACTTGTCGAGTAAAATGGTTAGCG
CGACCGTTGCGAGAAATATTGCCGGCATTTTTGGCAATGTCATCTCACTGTTCTTGTTCC
TATCTCCCATACCAACATTCATAACCATATACAAGATGAAGAAGGTGGAGGAATATAAAG
CTGACCCATACTTAGCCACAGTACTAAACTGCGCACTATGGGTTTTCTATGGCTTACCAA
TAGTCCATCCAGATAGTCTCCTTGTGATCACAATTAATGCCACTGGTCTTGCCATTGAAC
TCTTTTACCTTTGTATCTTTTTCTACTTTTCTCCCACCCCACGTAAGGTGAAAGTGGGGC
TATGGCTGATAGGAGAGATGGTATTTGTAGGAATAGTAGCCACATGCACATTGCTATTGT
TCCACACGCATAACAAGAGATCTTCTTTTGTTGGAATCATTTGTGTCATTTTTGTTAGCC
TCATGTATATTGCTCCTCTCACCATCATGAGTAAGGTGATCAAGACCAAAAGTGTGAGGT
ACATGCCATTCTCTCTCTCACTTGCCAACTTTCTAAACGGTGTCATTTGGGTTATTTATG
CCCTTATTAAATTCGACCTTTTCATTTTGATTGGAAATGGACTAGGGACAGTATCAGGAG
CAGTACAACTTATACTTTATGCTTGTTATTACAAGACAACACCAAAAGATGATGAAGAAG
AGGATAATCATTCTAAGGCTAACTCTCAGTTACAACTCAGTAGCAACCTGCAGGGACAAG
TGAAAGGAGTTCCAGCTTGATTATATCTAGGAGTAGTCGAATATTCAATAAGTTTTCTAC
TTTCTTTTTATGATTTTGAAATTTTGGATGATTTAACTTAAGTATTAAAGCAACGATATT
ATATCTCGTGTTTCAATATCTAGTGTTTCATCTGTGAAATTTAAACTCATTTTTTTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN10TF U 1
AF RR2BG78TF U 1
AF RR2AN10JQ C 204
AF RR2BW47JQ C 279
AF RR2BW47TF U 279
BS 1 407 RR2AN10TF
BS 408 408 RR2BG78TF
BS 409 708 RR2AN10TF
BS 709 797 RR2BG78TF
BS 798 798 RR2BW47TF
BS 799 814 RR2BG78TF
BS 815 972 RR2BW47TF
BS 973 1018 RR2AN10JQ

RD RR2AN10TF 708 0 0
GGAAATATAAGCAAACAACAGACACACATATTTAACATATCAAATTGCATCTCTCCGTCT
CTCTCTTGTGTTCTTTGTTTCTTGTTTCTTGTTCTTACTTGTCGAGTAAAATGGTTAGCG
CGACCGTTGCGAGAAATATTGCCGGCATTTTTGGCAATGTCATCTCACTGTTCTTGTTCC
TATCTCCCATACCAACATTCATAACCATATACAAGATGAAGAAGGTGGAGGAATATAAAG
CTGACCCATACTTAGCCACAGTACTAAACTGCGCACTATGGGTTTTCTATGGCTTACCAA
TAGTCCATCCAGATAGTCTCCTTGTGATCACAATTAATGCCACTGGTCTTGCCATTGAAC
TCTTTTACCTTTGTATCTTTTTCTACTTTTCTCCCACCCCACGTAAGATGAAAGTGGGGC
TATGGCTGATAGGAGAGATGGTATTTGTAGGAATAGTAGCCACATGCACATTGCTATTGT
TCCACACGCATAACAAGAGATCTTCTTTTGTTGGAATCATTTGTGTCATTTTTGTTAGCC
TCATGTATATTGCTCCTCTCACCATCATGAGTAAGGTGATCAAGACCAAAAGTGTGAGGT
ACATGCCATTCTCTCTCTCACTTGCCAACTTTCTAAACGGTGTCATTTGGGTTATTTATG
CCCTTATTAAATTCGACCTTTTCATTTTGATTGGAAATGGACTAGGGA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2BG78TF 818 0 0
GGAAATATAAGCAAACAACAGACACACATATTTAACATATCAAATTGCATCTCTCCGTCT
CTCTCTTGTGTTCTTTGTTTCTTGTTTCTTGTTCTTACTTGTCGAGTAAAATGGTTAGCG
CGACCGTTGCGAGAAATATTGCCGGCATTTTTGGCAATGTCATCTCACTGTTCTTGTTCC
TATCTCCCATACCAACATTCATAACCATATACAAGATGAAGAAGGTGGAGGAATATAAAG
CTGACCCATACTTAGCCACAGTACTAAACTGCGCACTATGGGTTTTCTATGGCTTACCAA
TAGTCCATCCAGATAGTCTCCTTGTGATCACAATTAATGCCACTGGTCTTGCCATTGAAC
TCTTTTACCTTTGTATCTTTTTCTACTTTTCTCCCACCCCACGTAAGGTGAAAGTGGGGC
TATGGCTGATAGGAGAGATGGTATTTGTAGGAATAGTAGCCACATGCACATTGCTATTGT
TCCACACGCATAACAAGAGATCTTCTTTTGTTGGAATCATTTGTGTCATTTTTGTTAGCC
TCATGTATATTGCTCCTCTCACCATCATGAGTAAGGTGATCAAGACCAAAAGTGTGAGGT
ACATGCCATTCTCTCTCTCACTTGCCAACTTTCTAAACGGTGTCATTTGGGTTATTTATG
CCCTTATTAAATTCGACCTTTTCATTTTGATTGGAAATGGACTAGGGACAGTATCAGGAG
CAGTACAACTTATACTTTATGCTTGTTATTACAAGACAACACCAAAAGATGATGAAGAAG
AGGATAATCATTCTAAG*CTAACTCTCAGTTACA
CTCA

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR2AN10JQ 815 0 0
ACCATATACAAGATGAAGAAGGTGGAGGAATATAAAGCTGACCCATACTTAGCCACAGTA
CTAAACTGCGCACTATGGGTTTTCTATGGCTTACCAATAGTCCATCCAGATAGTCTCCTT
GTGATCACAATTAATGCCACTGGTCTTGCCATTGAACTCTTTTACCTTTGTATCTTTTTC
TACTTTTCTCCCACCCCACGTAAGATGAAAGTGGGGCTATGGCTGATAGGAGAGATGGTA
TTTGTAGGAATAGTAGCCACATGCACATTGCTATTGTTCCACACGCATAACAAGAGATCT
TCTTTTGTTGGAATCATTTGTGTCATTTTTGTTAGCCTCATGTATATTGCTCCTCTCACC
ATCATGAGTAAGGTGATCAAGACCAAAAGTGTGAGGTACATGCCATTCTCTCTCTCACTT
GCCAACTTTCTAAACGGTGTCATTTGGGTTATTTATGCCCTTATTAAATTCGACCTTTTC
ATTTTGATTGGAAATGGACTAGGGACAGTATCAGGAGCAGTACAACTTATACTTTATGCT
TGTTATTACAAGACAACACCAAAAGATGATGAAGAAGAGGATAATCATTTTAAGGCTAAC
TCTCAGTTACAACTCAGTAGCAACCTGCAGGGACAAGTGAAAGGAGTTCCAGCTTGATTA
TATCTAGGAGTAGTCGAATATTCAATAAGTTTTCTACTTTCTTTTTATGATTTTGAAATT
TTGGATGATTTAACTTAAGTATTAAAGCAACGATATTATATCTCGTGTTTCAATATCTAG
TGTTTCATCTGTGAAATTTAAACTCATTTTTTTGG

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR2BW47JQ 696 0 0
G
GGGTTATCTATGGCTTACCAATAGTCCATCCAGATAGTCTCCTTGTGATCACAATTAATG
CCACTGGTCTTGCCATTGAACTCTTTTACCTTTGTATCTTTTTCTACTTTTCTCCCACCC
CACGTAAGGTGAAAGTGGGGCTATGGCTGATAGGAGAGATGGTATTTGTAGGAATAGTAG
CCACATGCACATTGCTATTGTTCCACACGCATAACAAGAGATCTTCTTTTGTTGGAATCA
TTTGTGTCATTTTTGTTAGCCTCATGTATATTGCTCCTCTCACCATCATGAGTAAGGTGA
TCAAGACCAAAAGTGTGAGGTACATGCCATTCTCTCTCTCACTTGCCAACTTTTTAAACG
GTGTCATTTGGGTTATTTATGCCCTTATTAAATTCGACCTTTTCATTTTGATTGGAAATG
GACTAGGGACAGTATCAGGAGCAGTACAACTTATACTTTATGCTTGTTATTACAAGACAA
CACCAAAAGATGATGAAGAAGAGGATAATCATTTTAAGGCTAACTCTCAGTTACAACTCA
GTAGCAACCTGCAGGGACAAGTGAAAGGAGTTCCAGCTTGATTATATCTAGGAGTAGTCG
AATATTCAATAAGTTTTCTACTTTCTTTTTATGATTTTGAAATTTTGGATGATTTAACTT
AAGTATTAAAGCAACGATATTATATCTCGTGTT
CC

QA 2 694 2 694
DS 

RD RR2BW47TF 696 0 0
G
GGGTTATCTATGGCTTACCAATAGTCCATCCAGATAGTCTCCTTGTGATCACAATTAATG
CCACTGGTCTTGCCATTGAACTCTTTTACCTTTGTATCTTTTTCTACTTTTCTCCCACCC
CACGTAAGGTGAAAGTGGGGCTATGGCTGATAGGAGAGATGGTATTTGTAGGAATAGTAG
CCACATGCACATTGCTATTGTTCCACACGCATAACAAGAGATCTTCTTTTGTTGGAATCA
TTTGTGTCATTTTTGTTAGCCTCATGTATATTGCTCCTCTCACCATCATGAGTAAGGTGA
TCAAGACCAAAAGTGTGAGGTACATGCCATTCTCTCTCTCACTTGCCAACTTTCTAAACG
GTGTCATTTGGGTTATTTATGCCCTTATTAAATTCGACCTTTTCATTTTGATTGGAAATG
GACTAGGGACAGTATCAGGAGCAGTACAACTTATACTTTATGCTTGTTATTACAAGACAA
CACCAAAAGATGATGAAGAAGAGGATAATCATTCTAAGGCTAACTCTCAGTTACAACTCA
GTAGCAACCTGCAGGGACAAGTGAAAGGAGTTCCAGCTTGATTATATCTAGGAGTAGTCG
AATATTCAATAAGTTTTCTACTTTCTTTTTATGATTTTGAAATTTTGGATGATTTAACTT
AAGTATTAAAGCAACGATATTATATCTCGTGTT
CC

QA 2 694 2 694
DS 



AS 1 4

CO CL1939Contig1 1314 4 34 U
GGGCAACTTATAAACTTTCACAAGTTTCTTAGAAGGTTTAAATGAATATTGAAGGCTTTG
GAAAACTTCCAATGGATGAATCATCTTCCAATATTATCTCCATCACTATTTCATCATCTT
CTTCCTTGAGTACCACGCCACCACGAGGTGATAACACTCATGCGTCTGCCTCTGTTCAAG
AGAGGTCCATCTACTTGAGGTTTGCTATGAGGGTCTCTAGAGCTAAATGGTTTATCTTCT
TGAGGAGAGTGTTTCACTACCAAAACGGATCAAGATCAGATCTCGGCTCCAATCCTTTCA
ACTCCACCACGTGGATGATGTATGAGATGATAGCTCTGCTTGTTCAGCTTACTGTGATAA
CACTCACACTAGCTATCTCAAAAAAAAGAGAGACCTATTTGGCCAGTGAGGTTATGGATC
ACAGGTTATGACGTGGGATGTCTCCTCAGTCTTATGCTGTTGTATGGTCGGTTTCGCCAA
CTAAACCAAGGAAACTGGTTTGTCGATATTGAGCAGCAACATAGAGGCAGAGATGAAACT
AGGAGCTCTCATTTAATGAACAGATGCAGAACGTCTCTAGAGCTTTTCTTTGCGATTTGG
TTTGTGGTTGGGAATGTTTGGGTGTTTGATTCTAGATTTGGTTCTTTCAACCATGCTCCC
AAGCTTCACGCCCTATGCGTCTCTCTTCTTTCTTGGAACGCTCTCTGCTACTCTTTTCCT
TTTCTTCTCTTCCTATTCCTATGTTGCCTTGTGCCTCTCATTAGTAGCCTACTTGGATAC
AACATGAACATGGGATCTTCAGACAGAGGTGCATCTGATGACCAAATCTCTAGTCTCCCT
AGCTGGAAACACAAACGAGTCGACGACAATGCCTCTGATTCTGAATCAGCTCCTAAGACC
GATGATCCGGAGTGTTGTATATGTTTGGCGAAGTATAAAGACAAGGAAGAAGTAAGGAAG
CTTCCATGTTCTCATAAGTTCCACCTGAAGTGTGTAGATCAGTGGCTTCGTATCATCTCT
TGTTGTCCTCTCTGCAAACAAGATCTTTTCAGATGAAAAACGAAAAAAAACTAAAGCAGA
CAAGAGCTCATGAGAGTCAAAATCTATGGTTTTATAGTTTTTTGTTGGGTTCTTATTTTA
AAGGTTTTTATTTTTGTTTTTGTTTTTATTTGAAGCAAGTAGGTTACTTGTGTGAGTGCC
ATAAGTTTTGTACAGGAATAGCTCACCAGTAACCCTAAAGGATTGTGAGATTACAAACCA
AAATGCCACAACATTTATAAAAATCTTGATATAGTGTTTACACTTCATATGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ57TFB U 1
AF RR2EB87TF U 69
AF RR2AZ57JQ C 449
AF RR2BF46TF U 920
BS 1 208 RR2AZ57TFB
BS 209 209 RR2EB87TF
BS 210 386 RR2AZ57TFB
BS 387 387 RR2EB87TF
BS 388 431 RR2AZ57TFB
BS 432 432 RR2EB87TF
BS 433 759 RR2AZ57TFB
BS 760 808 RR2EB87TF
BS 809 809 RR2AZ57JQ
BS 810 848 RR2EB87TF
BS 849 849 RR2AZ57JQ
BS 850 868 RR2EB87TF
BS 869 869 RR2AZ57JQ
BS 870 872 RR2EB87TF
BS 873 873 RR2AZ57JQ
BS 874 884 RR2EB87TF
BS 885 885 RR2AZ57JQ
BS 886 899 RR2EB87TF
BS 900 920 RR2AZ57JQ
BS 921 1068 RR2BF46TF
BS 1069 1070 RR2AZ57JQ
BS 1071 1080 RR2BF46TF
BS 1081 1081 RR2AZ57JQ
BS 1082 1105 RR2BF46TF
BS 1106 1106 RR2AZ57JQ
BS 1107 1122 RR2BF46TF
BS 1123 1123 RR2AZ57JQ
BS 1124 1128 RR2BF46TF
BS 1129 1129 RR2AZ57JQ
BS 1130 1240 RR2BF46TF
BS 1241 1241 RR2AZ57JQ
BS 1242 1257 RR2BF46TF
BS 1258 1258 RR2AZ57JQ
BS 1259 1314 RR2BF46TF

RD RR2AZ57TFB 759 0 0
GGGCAACTTATAAACTTTCACAAGTTTCTTAGAAGGTTTAAATGAATATTGAAGGCTTTG
GAAAACTTCCAATGGATGAATCATCTTCCAATATTATCTCCATCACTATTTCATCATCTT
CTTCCTTGAGTACCACGCCACCACGAGGTGATAACACTCATGCGTCTGCCTCTGTTCAAG
AGAGGTCCATCTACTTGAGGTTTGCTATTAGGGTCTCTAGAGCTAAATGGTTTATCTTCT
TGAGGAGAGTGTTTCACTACCAAAACGGATCAAGATCAGATCTCGGCTCCAATCCTTTCA
ACTCCACCACGTGGATGATGTATGAGATGATAGCTCTGCTTGTTCAGCTTACTGTGATAA
CACTCACACTAGCTATCTCAAAAAAA*GAGAGACCTATTTGGCCAGTGAGGTTATGGATC
ACAGGTTATGATGTGGGATGTCTCCTCAGTCTTATGCTGTTGTATGGTCGGTTTCGCCAA
CTAAACCAAGGAAACTGGTTTGTCGATATTGAGCAGCAACATAGAGGCAGAGATGAAACT
AGGAGCTCTCATTTAATGAACAGATGCAGAACGTCTCTAGAGCTTTTCTTTGCGATTTGG
TTTGTGGTTGGGAATGTTTGGGTGTTTGATTCTAGATTTGGTTCTTTCAACCATGCTCCC
AAGCTTCACGCCCTATGCGTCTCTCTTCTTTCTTGGAACGCTCTCTGCTACTCTTTTCCT
TTTCTTCTCTTCCTATTCCTATGTTGCCTTGTGCCTCTC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2EB87TF 837 0 0
GG
AATGGATGAATCATCTTCCAATATTATCTCCATCACTATTTCATCATCTTCTTCCTTGAG
TACCACGCCACCACGAGGTGATAACACTCATGCGTCTGCCTCTGTTCAAGAGAGGTCCAT
CTACTTGAGGTTTGCTATGAGGGTCTCTAGAGCTAAATGGTTTATCTTCTTGAGGAGAGT
GTTTCACTACCAAAACGGATCAAGATCAGATCTCGGCTCCAATCCTTTCAACTCCACCAC
GTGGATGATGTATGAGATGATAGCTCTGCTTGTTCGGCTTACTGTGATAACACTCACACT
AGCTATCTCAAAAAAAAGAGAGACCTATTTGGCCAGTGAGGTTATGGATCACAGGTTATG
ACGTGGGATGTCTCCTCAGTCTTATGCTGTTGTATGGTCGGTTTCGCCAACTAAACCAAG
GAAACTGGTTTGTCGATATTGAGCAGCATCATAGAGGCAGAGATGAAACTAGGAGCTCTC
ATTTAATGAACAGATGCAGAACGTCTCTAGAGCTTTTCTTTGCGATTTGGTTTGTGGTTG
GGAATGTTTGGGTGTTTGATTCTAGATTTGGTTCTTTCAACCATCCTCCCAAGCTTCACG
CCCTATGCGTCTCTCTTCTTTCTTGGAACGCTCTCTGCTACTCTTTTCCTTTTCTTCTCT
TCCTATTCCTATGTTGCCTTGTGCCTCTCATTAGTAGCCTACTTGGATACAACATGAACA
TGGGATCTTCAGACAGAG*TGCATCTGATGACCAAATCTCTAGTCTCCCTAGCTGGAA*C
ACAAACGAGTCGACGACA*TGCTTCTGATTCTGA*TCAGCTCCTAAGAC
GATGAT

QA 3 831 3 831
DS 

RD RR2AZ57JQ 844 0 0
GTCTTATGCTGTTGTATGGTCGGTTTCGCCAACTAAACCAAGGAAACTGGTTTGTCGATA
TTGAGCAGCAACATAGAGGCAGAGATGAAACTAGGAGCTCTCATTTAATGAACAGATGCA
GAACGTCTCTAGAGCTTTTCTTTGCGATTTGGTTTGTGGTTGGGAATGTTTGGGTGTTTG
ATTCTAGATTTGGTTCTTTCAACCATGCTCCCAAGCTTCACGCCCTATGCGTCTCTCTTC
TTTCTTGGAACGCTCTCTGCTACTCTTTTCCTTTTCTTCTCTTCCTATTCCTATGTTGCC
TTGTGCCTCTCATTAGTAGCCTACTTGGATACAACATGAACATGGGATCTTCAGACAGAG
GTGCATCTGATGACCAAATCTCTAGTCTCCCTAGCTGGAAACACAAACGAGTCGACGACA
ATGCCTCTGATTCTGAATCAGCTCCTAAGACCGATGATCCGGAGTGTTGTATATGTTTGG
CGAAGTATAAAGACAAGGAAGAAGTAAGGAAGCTTCCATGTTCTCATAAGTTCCACCTGA
AGTGTGTAGATCAGTGGCTTCGTATCATCTCTTGTTGTCCTCTCTGCAAACAGGATCTTT
TCAGGTGAAAAACGAAAAAAAACTAAAGCAGACAAGAGCTCATGAGAGTCAAAATCTATG
GTTTTATAGTTTTTTGTTGGGTTCTTCTTTTAAAGGTTTTTATTTTTGTTTTTGTTTTTA
TTTGAAGCAAGTAGGTTACTTGTGTGAGTGCCATAAGTTTTGTACAGGAATAGCTCACCA
GTAACCGTAAAGGATTGTGAGATTATAAACCAAAATGCCACAACATTTATAAAAATCTTG
ATAT

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR2BF46TF 395 0 0
G
ATGTTTGGCGAAGTATAAAGACAAGGAAGAAGTAAGGAAGCTTCCATGTTCTCATAAGTT
CCACCTGAAGTGTGTAGATCAGTGGCTTCGTATCATCTCTTGTTGTCCTCTCTGCAAACA
AGATCTTTTCAGATGAAAAACGAAAAAA**CTAAAGCAGAGAAGAGCTCATGAGAGTCAA
AATCTTTGGTTTTATAGTTTTT*GTTGGTTTCTTATTTTAAAGGTTTTTATTTTTGTTTT
TGTTTTTATTTGAAGCAAGTAGGTTACTTGTGTGAGTGCCATAAGTTTTGTACAGGAATA
GCTCACCAGTAACCCTAAAGTATTGTGAGATTACAAATCAAAATGCCACAACATTTATAA
AAATCTTGATATAGTGTTTACACTTCATATGGTT

QA 2 395 2 395
DS 



AS 1 2

CO CL1940Contig1 773 2 13 U
CAAACTCAAAAGTCTTTATTTCAAATTATGATCTTTGCCGTCTATGAAAAATTGCCACAA
TAGGGATACAAATTTTGCAAAGGTTTACAAAGAAAGATATAATAAACTAAAAAAGGATAG
CCATCACATCTGAAGCTCTCAGGGCAATGTAGTTTGAACCATCCTTGCCCTTGAAGTCGT
TACCAGCATACTTGGAGTAAAGAACTGTGCTTCCAGTCGATATCGATAGTGGCTGAACCT
TACCTTCCTCATCTAGAGTACCGGGTCCAACTGCTATCACCGTGCCAACAGAGGGCTTCT
CTTTGGTAGTCTCGGTAAGCAACAACCCTCCAGCTGTTTTCTCCTCTGCCTCAGCAACCT
TAATGAAAACACGGTCATTCAAGGGCTTGAGATCTTTGATATCCTCTGTCTCAAGAAAAC
CAACAATGTCATCTTCCTTGAGAATGAGATGCTTCACATCGTTAAACTCCACCTCAGTTC
CTGCGTACTTGGAGTAAATGATTTGTGCTCCAGTAGGGATAGTGATATCGATTTTGGTCT
TCCCAATAGTTCTTCCTTCACCAACAGCAATGACTTCACCTCCTTGAGGTTTTGATTGAG
CAGTAGATGGAAGTAAGATACCTCCCATAGTCTTTTCCTCTGCCTCCTTGAGCTTCACCA
AAACTCTATCTCCCAATGGCTTAATTGAAGTATACTTAGGAGCAACGACAGAAGCAGCCC
TGACAACCAAAGAACGGAACTGGCTCTGCTTAAGGGTGCCTGGTTTCAAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE67JQ U 1
AF RR2BE45JQ U 3
BS 1 53 RR2AE67JQ
BS 54 54 RR2BE45JQ
BS 55 61 RR2AE67JQ
BS 62 62 RR2BE45JQ
BS 63 184 RR2AE67JQ
BS 185 185 RR2BE45JQ
BS 186 475 RR2AE67JQ
BS 476 476 RR2BE45JQ
BS 477 601 RR2AE67JQ
BS 602 602 RR2BE45JQ
BS 603 697 RR2AE67JQ
BS 698 698 RR2BE45JQ
BS 699 773 RR2AE67JQ

RD RR2AE67JQ 773 0 0
CAAACTCAAAAGTCTTTATTTCAAATTATGATCTTTGCCGTCTATGAAAAATTTCCACAA
TTGGGATACAAATTTTGCAAAGGTTTACAAAGAAAGATATAATAAACTAAAAAAGGATAG
CCATCACATCTGAAGCTCTCAGGGCAATGTAGTTTGAACCATCCTTGCCCTTGAAGTCGT
TACCCGCATACTTGGAGTAAAGAACTGTGCTTCCAGTCGATATCGATAGTGGCTGAACCT
TACCTTCCTCATCTAGAGTACCGGGTCCAACTGCTATCACCGTGCCAACAGAGGGCTTCT
CTTTGGTAGTCTCGGTAAGCAACAACCCTCCAGCTGTTTTCTCCTCTGCCTCAGCAACCT
TAATGAAAACACGGTCATTCAAGGGCTTGAGATCTTTGATATCCTCTGTCTCAAGAAAAC
CAACAATGTCATCTTCCTTGAGAATGAGATGCTTCACATCGTTAAACTCCACCTCTGTTC
CTGCGTACTTGGAGTAAATGATTTGTGCTCCAGTAGGGATAGTGATATCGATTTTGGTCT
TCCCAATAGTTCTTCCTTCACCAACAGCAATGACTTCACCTCCTTGAGGTTTTGATTGAG
CCGTAGATGGAAGTAAGATACCTCCCATAGTCTTTTCCTCTGCCTCCTTGAGCTTCACCA
AAACTCTATCTCCCAATGGCTTAATTGAAGTATACTTGGGAGCAACGACAGAAGCAGCCC
TGACAACCAAAGAACGGAACTGGCTCTGCTTAAGGGTGCCTGGTTTCAAAGTT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2BE45JQ 749 0 0
CGAATTC
AAGTCTTTATTTCAGATTATGATCTTTGCCGTCTATGAAAAATTGCCACAATAGGGATAC
AAATTTTGCA**GGTTTACAGAGA****TATAATAAACTAAGAAAGGATAGCCATCACAT
CTGAAGCTCTCAGGGCAATGTAGTTTGAACCATCCTTGCCCTTGAAGTCGTTGCCAGCAT
ACTTGGAGTAGAGAACTGTGCTTCCAGTCGATATCGATAGTGGCTGAACCTTACCTTCCT
CATCTAGAGTACCTGGTCCAACTGCTATCACTGTGCCAATAGAGGGCTTTTCTTTGGTAG
TCTCGGTTAGCAACAACCCTCCAGCTGTTTTCTCCTCTGCCTCAGCAACCTTAATGAAGA
CACGGTCATTCAAGGGCTTGAGATCTTTGATATCCTCTGTCTCAAGAAGACCAACAATGT
CATCTTCCTTGAGAATGAGATGCTTCACATCGTTGAACTCCACCTCAGTTCCTGCGTACT
TGGAGTAAATGATTTGTGCTCCAGTAGGGATAGTGATATCGATTTTGGTCTTCCCAATAG
TTCTTCCTTCACCAACAGCAATGACTTCACCTCCTTGAGGTTTTGATTGAGCAGTGGATG
GAAGTAAGATACCTCCCATAGTCTTTTCCTCTGCCTCCTTGATCTTCACCAAAACTCTGT
CTCCCAGTGGCTTAATTGAAGTATACTTAGGAGCAACGACAGAAGCAGCCCTGACAACCA
AAGAACGGAACTGGCTCTGCTT

QA 8 749 8 749
DS 



AS 1 3

CO CL1941Contig1 983 3 5 U
GGTACATAAAAACTTTTACTTGGTTATAAAATATAATACAATTCTGAGTTTATTACAATA
ATCAAGTGTTTAACACATACTAAACACACAAACAAAAAGACATATATGAATAAGTATTTC
CTTTTTGAAGGTAAAAATATCTTAATTCCTTGAGATTTTAAATACTTTTCAGGAAGCCAA
GTTTGATTACACACAACACACACAAGAAGAAGAGATTAAGTATATTCTTGAGTTGCAAAT
AAATCAATCATACAAGCCCTCTTGCTCCCACACATCCACCAGAAAATCCACCATTTCAGG
GAGAGGTATTGGACGAGAGAACCGCTTGTTCATACCCAACAAGCTCTCATATGTTGCATT
CCAGCTTATTGTAGGTTCTCGAACTTTAGCCTTTGTTTGAGAAGAAGATCCATTTGCAAG
CCACTGTTGTCTAGTTTGCAACCAGAGGCTCAATCCATTGTTAACAAATTCATTGGGGTT
GCTACTACTAGCTGAAGCAGCAGTGATGTTAGTGAAGCTGATAGAAGAAACGCTTCTCTG
TGACTGCATCGTGCTGTTGTTATCCATCTCGCAGGTGCTTGTGTTCCAGAAATCGTCTGA
CACGCTCGTCGGCTTCTTCACTAGACGACCTTGAATCCTTAACCCTTTAGACGGCTCATC
CACTGCAACTATAAGCGGTGGTTTATTGCAGCATCCAAAACAACCTCCCATGCAACCAAG
TAACTGGGTAGATCCAAGAAAGGGATATGCATCTACAGCAACCAAAGTAACGACCTTCTA
ATCAACACTCTGATCCCTGGTAAGAGAAGTCTTACCATCCTCAGAAATGGCATATTCGGG
GAAAATTAGGATTAGGGTTTTGTTCAGCCACCTCCCTAGCAGCTTTGCTTGATTCAAGAT
TCAAGAACAGAGCGTCTTCCTCTTCTTTTTCTTCTTTATTCTACTTTTTTTTCTTTTTCT
CCTGCAACTTGTGTGTGTGGTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT29JQ U 1
AF RR2AT78JQ U 4
AF RR2AT78TF C 164
BS 1 316 RR2DT29JQ
BS 317 317 RR2AT78JQ
BS 318 495 RR2DT29JQ
BS 496 840 RR2AT78JQ
BS 841 983 RR2AT78TF

RD RR2DT29JQ 495 0 0
GGTACATAAAAACTTTTACTTGGTTATAAAATATAATACAATTCTGAGTTTATTACAATA
ATCAAGTGTTTAACACATACTAAACACACAAACAAAAAGACATATATGAATAAGTATTTC
CTTTTTGAAGGTAAAAATATCTTAATTCCTTGAGATTTTAAATACTTTTCAGGAAGCCAA
GTTTGATTACACACAACACACACAAGAAGAAGAGATTAAGTATATTCTTGAGTTGCAAAT
AAATCAATCATACAAGCCCTCTTGCTCCCACACATCCACCAGAAAATCCACCATTTCAGG
GAGAGGTATTGGACGAAAGAACCGCTTGTTCATACCCAACAAGCTCTCATATGTTGCATT
CCAGCTTATTGTAGGTTCTCGAACTTTAGCCTTTGTTTGAGAAGAAGATCCATTTGCAAG
CCACTGTTGTCTAGTTTGCAACCAGAGGCTCAATCCATTGTTAACAAATTCATTGGGGTT
GCTACTACTAGCTGA

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR2AT78JQ 838 0 0
ACATAAAAACTTTTACTTGGTTATAAAATATAATACAATTCTGAGTTTATTACAATAATC
AAGTGTTTAACACATACTAAACACACAAACAAAAAGACATATATGAATAAGTATTTCCTT
TTTGAAGGTAAAAATATCTTAGTTCCTTGAGATTTTAAATACTTTTCAGGAAGCCAAGTT
TGATTACACACAACACACACAAGAAGAAGAGATTAAGTATATTCTTGAGTTGCAAATAAA
TCAATCATACAAGCCCTCTTGCTCCCACACATCCACCAGAAAATCCACCATTTCAGGGAG
AGGTATTGGACGAGAGAACCGCTTGTTCATACCCAACAAGCTCTCATATGTTGCATTCCA
GCTTATTGTAGGTTCTCGAACTTTAGCCTTTGTTTGAGAAGAAGATCCATTTGCAAGCCA
CTGTTGTCTAGTTTGCAACCAGAGGCTCAATCCATTGTTAACAAATTCATTGGGGTTGCT
ACTACTAGCTGAAGCAGCAGTGATGTTAGTGAAGCTGATAGAAGAAACGCTTCTCTGTGA
CTGCATCGTGCTGTTGTTATCCATCTCGCAGGTGCTTGTGTTCCAGAAATCGTCTGACAC
GCTCGTCGGCTTCTTCACTAGACGACCTTGAATCCTTAACCCTTTAGACGGCTCATCCAC
TGCAACTATAAGCGGTGGTTTATTGCAGCATCCAAAACAACCTCCCATGCAACCAAGTAA
CTGGGTAGATCCAAGAAAGGGATATGCATCTACAGCAACCAAAGTAACGACCTTCTAATC
AACACTCTGATCCCTGGTAAGAGAAGTCTTACCATCCTCAGAAATGGCATATTCGGG
A

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR2AT78TF 820 0 0
TAC
TTTCAGGAAGCCAAGTTTGAT*ACACACA*CACACACA*GAAGA*GAGATTAAGTATATC
**TGAGT*GCAAATAAATCAATCATACAAGCCCTCTTGCTCCCACACATCCACCAGAAA*
TCCACCATTTCAGGGAGAGGTATTGGACGAGAGAACCGCTTGTTCATACCCAACAAGCTC
TCATATGTTGCATTCCAGCTTATTGTAGGTTCTCGAACTTTAGCCTTTGTTTGAGAAGAA
GATCCATTTGCAAGCCACTGTTGTCTAGTTTGCAACCAGAGGCTCAATCCATTGTTAACA
AATTCATTGGGGTTGCTACTACTAGCTGAAGCAGCAGTGATGTTAGTGAAGCTGATAGAA
GAAACGCTTCTCTGTGACTGCATCGTGCTGTTGTTATCCATCTCGCAGGTGCTTGTGTTC
CAGAAATCGTCTGACACGCTCGTCGGCTTCTTCACTAGACGACCTTGAATCCTTAACCCT
TTAGACGGCTCATCCACTGCAACTATAAGCGGTGGTTTATTGCAGCATCCAAAACAACCT
CCCATGCAACCAAGTAACTGG*TAGATCCAAGAA*GGGATATGCATCTACAGCAACCAAA
GTAACGACCTTCTAATCAACACTCTGATCCCTGGTAAGAGAAGTCTTACCATCCTCAGAA
ATGGCATATTCGGGGAAAATTAGGATTAGGGTTTTGTTCAGCCACCTCCCTAGCAGCTTT
GCTTGATTCAAGATTCAAGAACAGAGCGTCTTCCTCTTCTTTTTCTTCTTTATTCTACTT
TTTTTTCTTTTTCTCCTGCAACTTGTGTGTGTGGTCC

QA 4 820 4 820
DS 



AS 1 4

CO CL1942Contig1 1228 4 8 U
TTTTTCATCACATATTCCATCCACACTAACCAAACCATGAACCGTAATCATCACAAACCA
ATCCTAGTTACATTCTTCACTCTTCTTCTCCAACTTCCAAACCTTATCAATCCATCACCA
TCCCCACCCATAACGGCTCTTTACGCCTTCGGCGACTCTACGGTGGATTCCGGCAACAAC
AGCTACATCCCCACTCTTTTTCAAAGCAACCATCCACCCTACGGCAGATCTTTCCCGGAT
AAACTCTCCACCGGAAGATTCTCAGATGGAAAACTCGCCACCGACTTTATAGCCTCTTCT
CTAGGTCTCAAACCCACTTTACCAGCTTACCTCAACCCCTCGGTCAAACCGGCTGACCTT
TTGACCGGTGTTAGCTTTGCTTCAGCTGGAGGTGGTCTAGATGACCGGACTGCAATGATG
TCGTTGACTTTGACCACGGACAAGCAATGGAGTTATTTTGAGGAGGCTGTACGTAAGATG
AAGAGTGTGGTTGGAGATTCGGAGACTAATCGGGTGATTAAGAATGCTTTGTTTGTGATT
AGTGCTGGGACTAATGATATGATCTATAATGTTTATGATCATGTTCTTGGGAGCTTAATT
TCCGTTTCGGACTATCAAGATTATCTACTCAGCAAAGTCGAAGCGTTTATCCAGAGACTA
CACGACGCAGGAGCACGAAGGATTACAGTAGCTGGACTACCACCAATTGGATGCCTTCCG
GTGCAAGTAACACTTGGTACCGTCACTATCCCTCGCATTCTCCATCATCGGATATGCACG
GAAAATCAAAACGCTGATTCTCAGCTCTACAATCAAAAGCTACGGAAGCTTAACTACCGT
CTCAGTCAGAGGCTTCCAGGCTCGAAAATTCTTTACCTTGACATCTACACTCCATTAATA
GACATGATCAGACATCCTCCCAGATATGGATTGGAAGAAACATTGAAAGGGTGTTGCGGG
ACGGGGCTGCTTGAGGCAGGACCTCTATGCAAGCCATTGTCTCGGACTTGTGAGGATGTT
TCAAAGTACATGTTCTTTGATTCTGTGCATCCATCACAAAAGGCGTACTCTGTCATAGCA
TCTTACGCCTTACAAAAGTTGTTCCCTCTCCTCTAATCTATTTATTTTTATCATCTGCGG
ATTTAAATTTTAATGGTGTAACTAAATATGGGCAGCATCAAACATTGTCTCCACATCATT
CTTATTCAGCTAAGTGTCAAATTGATGT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS76JQ C 6
AF RR2AS76TF U 6
AF RR2E845TF U 1
AF RR2E845JQ C 477
BS 1 19 RR2E845TF
BS 20 20 RR2AS76TF
BS 21 181 RR2E845TF
BS 182 182 RR2AS76TF
BS 183 436 RR2E845TF
BS 437 437 RR2AS76TF
BS 438 666 RR2E845TF
BS 667 1228 RR2E845JQ

RD RR2AS76JQ 608 0 0
CATCACATATTCCATCCACACTAACCAAACCATGAACCGTAATCATCACAAACCAATCCT
AGTTACATTCTTCACTCTTCTTCTCCAACTTCCAAACCTTATCAATCCATCACCATCCCC
ACCCATAACGGCTCTTTACGCCTTCGGCGACTTTACGGTGGATTCCGGCAACAACAGCTA
CATCCCCACTCTTTTTCAAAGCAACCATCCACCCTACGGCAGATCTTTCCCGGATAAACT
CTCCACCGGAAGATTTTCAGATGGAAAACTCGCCACCGACTTTATAGCCTCTTCTCTAGG
TCTCAAACCCACTTTACCAGCTTACCTCAACCCCTCGGTCAAACCGGCTGACCTTTTGAC
CGGTGTTAGCTTTGCTTCAGCTGGAGGTGGTCTAGATGACCGGACTGCAATGATGTCGTT
GACTTTGACCACGGACAAGCAATGGAGTTATTTTGAGGAGGCTGTACGTAAGATGAAGAG
TGTGGTTGGAGATTCGGAGACTAATCGGGTGATTAAGAATGCTTTGTTTGTGATTAGTGC
TGGGACTAATGATATGATCTATAATGTTTATGATCATGTTCTTGGGAGCTTAATTTCCGT
TTCGGACT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2AS76TF 608 0 0
CATCACATATTCCATCCACACTAACCAAACCATGAACCGTAATCATCACAAACCAATCCT
AGTTACATTCTTCACTCTTCTTCTCCAACTTCCAAACCTTATCAATCCATCACCATCCCC
ACCCATAACGGCTCTTTACGCCTTCGGCGACTCTACGGTGGATTCCGGCAACAACAGCTA
CATCCCCACTCTTTTTCAAAGCAACCATCCACCCTACGGCAGATCTTTCCCGGATAAACT
CTCCACCGGAAGATTCTCAGATGGAAAACTCGCCACCGACTTTATAGCCTCTTCTCTAGG
TCTCAAACCCACTTTACCAGCTTACCTCAACCCCTCGGTCAAACCGGCTGACCTTTTGAC
CGGTGTTAGCTTTGCTTCAGCTGGAGGTGGTCTAGATGACCGGACTGCAATGATGTCGTT
GACTTTGACCACGGACAAGCAATGGAGTTATTTTGAGGAGGCTGTACGTAAGATGAAGAG
TGTGGTTGGAGATTCGGAGACTAATCGGGTGATTAAGAATGCTTTGTTTGTGATTAGTGC
TGGGACTAATGATATGATCTATAATGTTTATGATCATGTTCTTGGGAGCTTAATTTCCGT
TTCGGACT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2E845TF 666 0 0
TTTTTCATCACATATTCCACCCACACTAACCAAACCATGAACCGTAATCATCACAAACCA
ATCCTAGTTACATTCTTCACTCTTCTTCTCCAACTTCCAAACCTTATCAATCCATCACCA
TCCCCACCCATAACGGCTCTTTACGCCTTCGGCGACTCTACGGTGGATTCCGGCAACAAC
AACTACATCCCCACTCTTTTTCAAAGCAACCATCCACCCTACGGCAGATCTTTCCCGGAT
AAACTCTCCACCGGAAGATTCTCAGATGGAAAACTCGCCACCGACTTTATAGCCTCTTCT
CTAGGTCTCAAACCCACTTTACCAGCTTACCTCAACCCCTCGGTCAAACCGGCTGACCTT
TTGACCGGTGTTAGCTTTGCTTCAGCTGGAGGTGGTCTAGATGACCGGACTGCAATGATG
TCGTTGACTTTGACCATGGACAAGCAATGGAGTTATTTTGAGGAGGCTGTACGTAAGATG
AAGAGTGTGGTTGGAGATTCGGAGACTAATCGGGTGATTAAGAATGCTTTGTTTGTGATT
AGTGCTGGGACTAATGATATGATCTATAATGTTTATGATCATGTTCTTGGGAGCTTAATT
TCCGTTTCGGACTATCAAGATTATCTACTCAGCAAAGTCGAAGCGTTTATCCAGAGACTA
CACGAC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2E845JQ 752 0 0
GATGAAGAGTGTGGTTGGAGATTCGGAGACTAATCGGGTGATTAAGAATGCTTTGTTTGT
GATTAGTGCTGGGACTAATGATATGATCTATAATGTTTATGATCATGTTCTTGGGAGCTT
AATTTCCGTTTCGGACTATCAAGATTATCTACTCAGCAAAGTCGAAGCGTTTATCCAGAG
ACTACACGACGCAGGAGCACGAAGGATTACAGTAGCTGGACTACCACCAATTGGATGCCT
TCCGGTGCAAGTAACACTTGGTACCGTCACTATCCCTCGCATTCTCCATCATCGGATATG
CACGGAAAATCAAAACGCTGATTCTCAGCTCTACAATCAAAAGCTACGGAAGCTTAACTA
CCGTCTCAGTCAGAGGCTTCCAGGCTCGAAAATTCTTTACCTTGACATCTACACTCCATT
AATAGACATGATCAGACATCCTCCCAGATATGGATTGGAAGAAACATTGAAAGGGTGTTG
CGGGACGGGGCTGCTTGAGGCAGGACCTCTATGCAAGCCATTGTCTCGGACTTGTGAGGA
TGTTTCAAAGTACATGTTCTTTGATTCTGTGCATCCATCACAAAAGGCGTACTCTGTCAT
AGCATCTTACGCCTTACAAAAGTTGTTCCCTCTCCTCTAATCTATTTATTTTTATCATCT
GCGGATTTAAATTTTAATGGTGTAACTAAATATGGGCAGCATCAAACATTGTCTCCACAT
CATTCTTATTCAGCTAAGTGTCAAATTGATGT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 4

CO CL1943Contig1 730 4 5 U
ATTTCACAACAAAAGAATGTTTTTAACATGATGAGATCTAGGAATTACAGCAAACAACTT
CATCAATCACATTTGAAGTAAGAACATATGAAGGACATTTTTGCTTATAAAGAATATGAG
TAAACATTCGATGAGCATGAACTTATATATAAAGAATATGAGTAGATCCACAACAACAAC
CAAAGTGCAAAACCTTCAACGAGCAAGATTGCCACATCATCGATTGCAGGAGAGAGGGAG
AGAGTCGGAGGATGAAGTACGGAGGAGACGGCGGATCTCAGATCGGAGCCTGAAGAACAC
CTGAGCAAAGCCGCCTCTCTGTTGTTTCCCCAACGATGACTTGGTTTGGTTCTCGTTAAA
CTCGAGATCTGTGAAGAAGACTGGTAGTTTCTTCAATAGAATCAGTGACCAACTCCATTC
CCACCATTCTTTCACAGAGCTACTACCTCTTTGCTCTGCCATGGCAGAGACAGATTTGGA
TCTGTGGAGATCATCAGTGGTAGGCTGGTTACGAGAGAGATTCAAGGAAAGCGAAGAAAG
ACGACGACGGAGAAGACCGGGTTCACTAGCTTCGGCGGTGGTGGAAGACACGGGGAGGGA
AGCGGGTTTACGAATCTGAAGGGTTTTCATGATTGAGGAGCTCACGGTTCCTTCTTCTTC
TTCTTCTTTTCTTGAAAGCTTAATGTTGCAGAAGGTGAGGAATATGAAGAAGGAAGAGAA
ATGTGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2HA45JQ U 1
AF RR2FK29JQ U 19
AF RR2FK29TF C 28
AF RR2HA45TF C 212
BS 1 469 RR2HA45JQ
BS 470 470 RR2FK29JQ
BS 471 547 RR2HA45JQ
BS 548 690 RR2FK29JQ
BS 691 730 RR2FK29TF

RD RR2HA45JQ 547 0 0
ATTTCACAACAAAAGAATGTTTTTAACATGATGAGATCTAGGAATTACAGCAAACAACTT
CATCAATCACATTTGAAGTAAGAACATATGAAGGACATTTTTGCTTATAAAGAATATGAG
TAAACATTCGATGAGCATGAACTTATATATAAAGAATATGAGTAGATCCACAACAACAAC
CAAAGTGCAAAACCTTCAACGAGCAAGATTGCCACATCATCGATTGCAGGAGAGAGGGAG
AGAGTCGGAGGATGAAGTACGGAGGAGACGGCGGATCTCAGATCGGAGCCTGAAGAACAC
CTGAGCAAAGCCGCCTCTCTGTTGTTTCCCCAACGATGACTTGGTTTGGTTCTCGTTAAA
CTCGAGATCTGTGAAGAAGACTGGTAGTTTCTTCAATAGAATCAGTGACCAACTCCATTC
CCACCATTCTTTCACAGAGCTACTACCTCTTTGCTCTGCCATGGCAGAGCCAGATTTGGA
TCTGTGGAGATCATCAGTGGTAGGCTGGTTACGAGAGAGATTCAAGGAAAGCGAAGAAAG
ACGACGA

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2FK29JQ 672 0 0
GTTTTTAACATGATGAGATCTAGGAATTACAGCAAACAACTTCATCAATCACATTTGAAG
TAAGAACATATGAAGGACATTTTTGCTTATAAAGAATATGAGTAAACATTCGATGAGCAT
GAACTTATATATAAAGAATATGAGTAGATCCACAACAACAACCAAAGTGCAAAACCTTCA
ACGAGCAAGATTGCCACATCATCGATTGCAGGAGAGAGGGAGAGAGTCGGAGGATGAAGT
ACGGAGGAGACGGCGGATCTCAGATCGGAGCCTGAAGAACACCTGAGCAAAGCCGCCTCT
CTGTTGTTTCCCCAACGATGACTTGGTTTGGTTCTCGTTAAACTCGAGATCTGTGAAGAA
GACTGGTAGTTTCTTCAATAGAATCAGTGACCAACTCCATTCCCACCATTCTTTCACAGA
GCTACTACCTCTTTGCTCTGCCATGGCAGAGACAGATTTGGATCTGTGGAGATCATCAGT
GGTAGGCTGGTTACGAGAGAGATTCAAGGAAAGCGAAGAAAGACGACGACGGAGAAGACC
GGGTTCACTAGCTTCGGCGGTGGTGGAAGACACGGGGAGGGAAGCGGGTTTACGAATCTG
AAGGGTTTTCATGATTGAGGAGCTCACGGTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTCTTGAAAG
CTTAATGTTGCA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2FK29TF 703 0 0
ATGATGAGATCTAGGAATTACAGCAAACAACTTCATCAATCACATTTGAAGTAAGAACAT
ATGAAGGACATTTTTGCTTATAAAGAATATGAGTAAACATTCGATGAGCATGAACTTATA
TATAAAGAATATGAGTAGATCCACAACAACAACCAAAGTGCAAAACCTTCAACGAGCAAG
ATTGCCACATCATCGATTGCAGGAGAGAGGGAGAGAGTCGGAGGATGAAGTACGGAGGAG
ACGGCGGATCTCAGATCGGAGCCTGAAGAACACCTGAGCAAAGCCGCCTCTCTGTTGTTT
CCCCAACGATGACTTGGTTTGGTTCTCGTTAAACTCGAGATCTGTGAAGAAGACTGGTAG
TTTCTTCAATAGAATCAGTGACCAACTCCATTCCCACCATTCTTTCACAGAGCTACTACC
TCTTTGCTCTGCCATGGCAGAGACAGATTTGGATCTGTGGAGATCATCAGTGGTAGGCTG
GTTACGAGAGAGATTCAAGGAAAGCGAAGAAAGACGACGACGGAGAAGACCGGGTTCACT
AGCTTCGGCGGTGGTGGAAGACACGGGGAGGGAAGCGGGTTTACGAATCTGAAGGGTTTT
CATGATTGAGGAGCTCACGGTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTCTTGAAAGCTTAATGTT
GCAGAAGGTGAGGAATATGAAGAAGGAAGAGAAATGTGGTTCC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2HA45TF 519 0 0
CCACATCATCGATTGCAGGAGAGAGGGAGAGAGTCGGAGGATGAAGTACGGAGGAGACGG
CGGATCTCAGATCGGAGCCTGAAGAACACTTGAGCAAAGCCGCCTCTCTGTTGTTTCCCC
AACGATGACTTGGTTTGGTTCTCGTTAAACTCGAGATCTGTGAAGAAGACTGGTAGTTTC
TTCAATAGAATCAGTGACCAACTCCATTCCCACCATTCTTTCACAGAGCTACTACCTCTT
TGCTCTGCCATGGCAGAGCCAGATTTGGATCTGTGGAGATCATCAGTGGTAGGCTGGTTA
CGAGAGAGATTCAAGGAAAGCGAAGAAAGACGACGACGGAGAAGACCGGGTTCACTAGCT
TCGGCGGTGGTGGAAGACACGGGGAGGGAAGCGGGTTTACGAATCTGAAGGGTTTTCATG
ATTGAGGAGCTCATGGTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTCTTGAAAGCTTAATGTTGCAG
AAGGTGAGGAATATGAAGAAGGAAGAGAAATGTGGTTCC

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 4

CO CL1944Contig1 1070 4 11 U
GGGGTCTTTGACCCAAATCGTCGTTTCACAGCGGAGATTTGTTTGATCCAACGAAACCGC
GTCTTCATCTTCCTCTTCATCTTCCTCCCTTGGATTTGGCTGAAGTTGGATTTTGATAGC
AGCTTTTTCTTTTTTTTACTACAACCAAATATGGATGACTGGGAGGATGAACAAATAGCA
CCACTTCCAGCAAAAGTTGTGCTTAAAAGTAACTGGGATGATGAAGATGTAGATGAGAAT
GATATTAAGGACTCATGGGAGGATGATGATGATGACAACGACGACCAACCTGCTCCGGTA
AAGCCTGCTCCTCCGAAGAAAGCAGCAAAAGCTGTTGAGAAAAAGGGCAAAGCAGTTCAA
GTTCCAAAAGAAGAACCTTTAGATCCTCTCTCTGGGAAACTCCGCATGCAGAGGCTTGTT
GAAGAAGCGGACTACAGGGCAACTGCTGAACTCTTTGGAACCAAGGGTGAAGAGAAAAAA
CTTGACGCCTTCATCCCCAAGTCTGAAAGTGATTTTCTGGAGTATGCTGAAATGATTTCT
CATAGGCTTAGACCTTATGAGAAAAGTTATCACTATATCGCATTGCTCAAAGCAGTCATG
AGACTTTCGGTGACCAACATGAAGGCAGCAGATGTTAAAGATGTTGCTTCCTCCGTTACA
GCAATAGCAAATGAAAAGCTTAAGGCTGAGAAAGAAGCTGCTGCTGGTAGAAAGAAGACG
GGTGGCAAGAAGAAACAACTTATTGTAGATAAGGCCGATGACGATCTAGTAGCAGGTCCT
TATGATGCCATGGACGATTTTGACTTCATGTAGATTATAAGAGCTTTGTGAGGGAATGCA
GCTTCTCTATTTTCTGGCATCTATTTGGAAGAAGAGCAAAAGTTTCTTAATTACT****G
GGATATATAGTTGGAACAAAGAAAGCTTGCTTTATGGGTGTTGGTCTTGGGACATTA*GT
CATGTTTTGTTTTTTTTTATGTTGGTATACAAATGTCTTATCTGTGGTCATGGTTCTCTT
TATCTACTATTTAACTGGAACATGGGAAAGAGAAATATCACGTGTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA05TF U 1
AF RR2C075TF U 264
AF RR2C075JQ C 491
AF RR2BA05JQ C 150
BS 1 662 RR2BA05TF
BS 663 663 RR2C075TF
BS 664 680 RR2BA05TF
BS 681 915 RR2C075TF
BS 916 916 RR2BA05JQ
BS 917 955 RR2C075TF
BS 956 956 RR2BA05JQ
BS 957 992 RR2C075TF
BS 993 993 RR2BA05JQ
BS 994 1009 RR2C075TF
BS 1010 1070 RR2BA05JQ

RD RR2BA05TF 680 0 0
GGGGTCTTTGACCCAAATCGTCGTTTCACAGCGGAGATTTGTTTGATCCAACGAAACCGC
GTCTTCATCTTCCTCTTCATCTTCCTCCCTTGGATTTGGCTGAAGTTGGATTTTGATAGC
AGCTTTTTCTTTTTTTTACTACAACCAAATATGGATGACTGGGAGGATGAACAAATAGCA
CCACTTCCAGCAAAAGTTGTGCTTAAAAGTAACTGGGATGATGAAGATGTAGATGAGAAT
GATATTAAGGACTCATGGGAGGATGATGATGATGACAACGACGACCAACCTGCTCCGGTA
AAGCCTGCTCCTCCGAAGAAAGCAGCAAAAGCTGTTGAGAAAAAGGGCAAAGCAGTTCAA
GTTCCAAAAGAAGAACCTTTAGATCCTCTCTCTGGGAAACTCCGCATGCAGAGGCTTGTT
GAAGAAGCGGACTACAGGGCAACTGCTGAACTCTTTGGAACCAAGGGTGAAGAGAAAAAA
CTTGACGCCTTCATCCCCAAGTCTGAAAGTGATTTTCTGGAGTATGCTGAAATGATTTCT
CATAGGCTTAGACCTTATGAGAAAAGTTATCACTATATCGCATTGCTCAAAGCAGTCATG
AGACTTTCGGTGACCAACATGAAGGCAGCAGATGTTAAAGATGTTGCTTCCTCCGTTACA
GCTATAGCAAATGAAAAGCT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2C075TF 752 0 0
GGATGTTGATGAGG
ACGACGACCAACCTGCTCCGGTAAAGCCTGCTCCTCCGAAGAAAGCAGCAAAAGCTGTTG
AGAAAAAGGGCAAAGCAGCTCAAGTTCCAAAAGAAGAACCTTTAGATCCTCTCTCTGAGA
AACTCCGCATGCAGAGGCTTGTTGAAGAAGCGGACTACAGGGCAACCGCTGAACTCTTTG
GAACCAAGGGTGAAGAGAAAAAACTTGACGCCTTCATCCCCAAGTCTGAAAGTGATTTTC
TGGAGTATGCTGAAATGATTTCTCATAGGCTTAGACCTTATGGGAAAAGTTATCACTATA
TCGCATTGCTCAAAGCAGTCATGAGACTTTCGGTGACCAACATGAAGGCAGCAGATGTTA
AAGATGTTGCTTCCTCCGTTACAGCAATAGCTAATGAAAAGCTTAAGGCTGAGAAAGAAG
CTGCTGCTGGTAGAAAGAAGACGGGTGGCAAGAAGAAACAACTTATTGTAGATAAGGCCG
ATGACGATCTAGTAGCAGGTCCTTATGATGCCATGGACGATTTTGACTTCATGTAGATTA
TAAGAGCTTTGTGAGGGAATGCAGCTTCTCTATTTTCTGGCATCTATTTGGAAGAAGAGC
AAAAGTTTCTTAATTACT****GGGATATATAGTTGGA*CAAAGAAAGCTTGCTTTATGG
GTGTTGGTCTTGGGACATAA*GTCATGTTTTGTTTTTTTTTATGTTGGTATACAA*TGTC
TTATCTGTGGTC
AAAAAA

QA 15 746 15 746
DS 

RD RR2C075JQ 519 0 0
TCATCCCCAAGTCTGAAAGTGATTTTCTGGAGTATGCTGAAATGATTTCTCATAGGCTTA
GACCTTATGGGAAAAGTTATCACTATATCGCATTGCTCAAAGCAGTCATGAGACTTTCGG
TGACCAACATGAAGGCAGCAGATGTTAAAGATGTTGCTTCCTCCGTTACAGCAATAGCTA
ATGAAAAGCTTAAGGCTGAGAAAGAAGCTGCTGCTGGTAGAAAGAAGACGGGTGGCAAGA
AGAAACAACTTATTGTAGATAAGGCCGATGACGATCTAGTAGCAGGTCCTTATGATGCCA
TGGACGATTTTGACTTCATGTAGATTATAAGAGCTTTGTGAGGGAATGCAGCTTCTCTAT
TTTCTGGCATCTATTTGGAAGAAGAGCAAAAGTTTCTTAATTACT****GGGATATATAG
TTGGAACAAAGAAAGCTTGCTTTATGGGTGTTGGTCTTGGGACATTAAGTCATGTTTTGT
TTTTTTTTATGTTGGTATACAAATGTCTTATCTGTGGTC

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2BA05JQ 921 0 0
TATGGATGACTGGGAGGATGAACAAATAGCACCACTTCCAGCAAAAGTTGTGCTTAAAAG
TAACTGGGATGATGAAGATGTAGATGAGAATGATATTAAGGACTCATGGGAGGATGATGA
TGATGACAACGACGACCAACCTGCTCCGGTAAAGCCTGCTCCTCCGAAGAAAGCAGCAAA
AGCTGTTGAGAAAAAGGGCAAAGCAGTTCAAGTTCCAAAAGAAGAACCTTTAGATCCTCT
CTCTGGGAAACTCCGCATGCAGAGGCTTGTTGAAGAAGCGGACTACAGGGCAACTGCTGA
ACTCTTTGGAACCAAGGGTGAAGAGAAAAAACTTGACGCCTTCATCCCCAAGTCTGAAAG
TGATTTTCTGGAGTATGCTGAAATGATTTCTCATAGGCTTAGACCTTATGAGAAAAGTTA
TCACTATATCGCATTGCTCAAAGCAGTCATGAGACTTTCGGTGACCAACATGAAGGCAGC
AGATGTTAAAGATGTTGCTTCCTCCGTTACAGCTATAGCAAATGAAAAGCTTAAGGCTGA
GAAAGAAGCTGCTGCTGGTAGAAAGAAGACTGGTGGCAAGAAGAAACAACTTATTGTAGA
TAAGGCCGATGACGATCTAGTAGCGGGTCCTTATGATGCCATGGACGATTTTGACTTCAT
GTAGATTATAAGAGCTTTGTGAGGGAATGCAGCTTC**TATTTTCTGGCATCTATTTGGA
AGAAGAGCAAAAGTTTCTTAATTAATTACGGGGATATATAGTTGGAACAAAGAAAGCTTG
CTTTATGGGTGTTGGTCTTGGGACATTA*GTCATGTTTTGTTTTTTTTTATGTTGGTATA
CAAATGTCTTATCTGTGGTCATGGTTCTCTTTATCTACTATTTAACTGGAACATGGGAAA
GAGAAATATCACGTGTTGTTC

QA 1 921 1 921
DS 



AS 1 4

CO CL1945Contig1 886 4 2 U
GGCCCCTGAATCTTTCCTAAGAAATCAAGAAAACAAAATCTGTCTCCCTGTGAATCCAGG
GGAGAAAGATTTTGATTTTCATTGATTTCTCGTAATCTTTCTGATATTTTGATTCTTATT
TTTTGGTAGTATGGAAACAAAACCTGAGAAAGATGACCAATTAGAGATAGAGCAAATAAA
CAAGAGTCCGACCATGAAGACGAAAAAGATATCACGTGGGATGCACGTGTTCTCCGTCGT
CATGTTCATGCTACGTCGTCGCCGGAGGAGAAAGGCTTTCAACACTAGGTTTTGGCGGCG
TGTGGTTGAGTCCGTACGTAAAGTCCATTCCGAAATTAAGATAATGCCTACGTCTACTAA
CACAATCCTCCTTCCTCCGGTCCCGGAAACTAACCAAGACGGTGGCGATAATGCTGTTGA
TAATGTTGTTGATGATGATGTTGTTGATGGTGAATCCGGGGATCGTTTAACGGAGGCTAT
TGAGGTTTTCACGGCGGCATCTTCATCATCATCGTCGGGAATCTCGGGATATGCATCTGC
CATGTCTCTACGTGATTTGGATCATCACTATGATGACGATGAGGATGATGATGATGATGA
TGTTGATTGTTATAGCGATGTTGAAGAAGGAGATGAAATGATAGATGAAAAAGCTGAGGA
ATTCATCGAGAGATTTTATGAGCAGATGAAAATGCAAAATCAGGTTTACACTGAACGTTG
CAAAGCCAAAGGGATAATAATTAACTGATGATCATCTATCGTTTTACGTCGCTATCATGC
ATGCATGGAAATGTCTGGTTATTTGATTAATTTGTTCAGACGAAGGAGAATGATCTTCAG
GTTTTCTTGGTCGATTCTATTTTTTTGGTATTGTAACTTTTTATTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A511TF U 1
AF RR2GF07TF U 1
AF RR2A511JQ C 150
AF RR2GF07JQ C 536
BS 1 699 RR2A511TF
BS 700 886 RR2A511JQ

RD RR2A511TF 699 0 0
GGCCCCTGAATCTTTCCTAAGAAATCAAGAAAACAAAATCTGTCTCCCTGTGAATCCAGG
GGAGAAAGATTTTGATTTTCATTGATTTCTCGTAATCTTTCTGATATTTTGATTCTTATT
TTTTGGTAGTATGGAAACAAAACCTGAGAAAGATGACCAATTAGAGATAGAGCAAATAAA
CAAGAGTCCGACCATGAAGACGAAAAAGATATCACGTGGGATGCACGTGTTCTCCGTCGT
CATGTTCATGCTACGTCGTCGCCGGAGGAGAAAGGCTTTCAACACTAGGTTTTGGCGGCG
TGTGGTTGAGTCCGTACGTAAAGTCCATTCCGAAATTAAGATAATGCCTACGTCTACTAA
CACAATCCTCCTTCCTCCGGTCCCGGAAACTAACCAAGACGGTGGCGATAATGCTGTTGA
TAATGTTGTTGATGATGATGTTGTTGATGGTGAATCCGGGGATCGTTTAACGGAGGCTAT
TGAGGTTTTCACGGCGGCATCTTCATCATCATCGTCGGGAATCTCGGGATATGCATCTGC
CATGTCTCTACGTGATTTGGATCATCACTATGATGACGATGAGGATGATGATGATGATGA
TGTTGATTGTTATAGCGATGTTGAAGAAGGAGATGAAATGATAGATGAAAAAGCTGAGGA
ATTCATCGAGAGATTTTATGAGCAGATGAAAATGCAAAA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2GF07TF 677 0 0
GGCCCCTGAATCTTTCCTAAGAAATCAAGAAAACAAAATCTGTCTCCCTGTGAATCCAGG
GGAGAAAGATTTTGATTTTCATTGATTTCTCGTAATCTTTCTGATATTTTGATTCTTATT
TTTTGGTAGTATGGAAACAAAACCTGAGAAAGATGACCAATTAGAGATAGAGCAAATAAA
CAAGAGTCCGACCATGAAGACGAAAAAGATATCACGTGGGATGCACGTGTTCTCCGTCGT
CATGTTCATGCTACGTCGTCGCCGGAGGAGAAAGGCTTTCAACACTAGGTTTTGGCGGCG
TGTGGTTGAGTCCGTACGTAAAGTCCATTCCGAAATTAAGATAATGCCTACGTCTACTAA
CACAATCCTCCTTCCTCCGGTCCCGGAAACTAACCAAGACGGTGGCGATAATGCTGTTGA
TAATGTTGTTGATGATGATGTTGTTGATGGTGAATCCGGGGATCGTTTAACGGAGGCTAT
TGAGGTTTTCACGGCGGCATCTTCATCATCATCGTCGGGAATCTCGGGATATGCATCTGC
CATGTCTCTACGTGATTTGGATCATCACTATGATGACGATGAGGATGATGATGATGATGA
TGTTGATTGTTATAGCGATGTTGAAGAAG*AGATGAAATGATAGATGAAAA*GCTGAG*A
ATTCATCGAGAGATTTT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2A511JQ 737 0 0
AAGATGACCAATTAGAGATAGAGCAAATAAACAAGAGTCCGACCATGAAGACGAAAAAGA
TATCACGTGGGATGCACGTGTTCTCCGTCGTCATGTTCATGCTACGTCGTCGCCGGAGGA
GAAAGGCTTTCAACACTAGGTTTTGGCGGCGTGTGGTTGAGTCCGTACGTAAAGTCCATT
CCGAAATTAAGATAATGCCTACGTCTACTAACACAATCCTCCTTCCTCCGGTCCCGGAAA
CTAACCAAGACGGTGGCGATAATGCTGTTGATAATGTTGTTGATGATGATGTTGTTGATG
GTGAATCCGGGGATCGTTTAACGGAGGCTATTGAGGTTTTCACGGCGGCATCTTCATCAT
CATCGTCGGGAATCTCGGGATATGCATCTGCCATGTCTCTACGTGATTTGGATCATCACT
ATGATGACGATGAGGATGATGATGATGATGATGTTGATTGTTATAGCGATGTTGAAGAAG
GAGATGAAATGATAGATGAAAAAGCTGAGGAATTCATCGAGAGATTTTATGAGCAGATGA
AAATGCAAAATCAGGTTTACACTGAACGTTGCAAAGCCAAAGGGATAATAATTAACTGAT
GATCATCTATCGTTTTACGTCGCTATCATGCATGCATGGAAATGTCTGGTTATTTGATTA
ATTTGTTCAGACGAAGGAGAATGATCTTCAGGTTTTCTTGGTCGATTCTATTTTTTTGGT
ATTGTAACTTTTTATTC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2GF07JQ 334 0 0
TCTGCCATGTCTCTACGTGATTTGGATCATCACTATGATGACGATGAGGATGATGATGAT
GATGATGTTGATTGTTATAGCGATGTTGAAGAAGGAGATGAAATGATAGATGAAAAAGCT
GAGGAATTCATCGAGAGATTTTATGAGCAAATGAAAATGCAAAATCAGGTTTACACTGAA
CGTTGCAAAGCCAAAGGGATAATAATTAACTGATGATCATCTATCGTTTTACGTCGCTAT
CATGCATGCATGGAAATGTCTGGTTATTTGATTAATTTGTTCAGACGAAGGAGAATGATC
TTCAGGTTTTCTTGGTCGATTCTATTTTTTTGGT

QA 1 334 1 334
DS 



AS 1 4

CO CL1946Contig1 930 4 6 U
GGACTCTCATTTGTCTTCTTCTATTACAATACTTTCTCCTTTCTCTCTCTTTATAAAAAG
AGCTATACGGATTTTGAAGGCATATACTCACACCATTCAGAAAAATCATTCAGAATTGAC
TTAGGGTAGCATATCATTCGTACAAAATGGCAGCGGTAGAAACTGAGCCAGAGACAAAGG
CTGCGACTGAGCCAGAGACAAAGGCTGCGAGTAAACCAGAGACGAAGGCTGATAGCATGA
ATGGAGAGATTTGGATAGATGTTGATATCAAAGCTTCTGCAGAGAAATTCCACCATATGT
TTGCTAAAAGGCCACACCACGTGTCCAATGCCACCCCTCGCCACATTGGGGGAGTTGAGC
TGCACGAGGGAGAGTGGGACAAAGTTGGAAGCATAGTCTTGTGGAACTACATTCATGAAG
GAAAGCCAAAAGTAGCAAAGGATAGGATCGAAGCGGTGGATCCAGAGAAGAATCTGATAG
AGTTCAGGGTCTTAGAGGGAGATGTGTTAAAGGAGTACAAAACCTTCTTAATAACACTCC
AAGTAACACCAAAGCAAGGAGGACCAGGAAGTGTGGCGAGGTGGCACTTGGAGTATGAGA
GGATTGATGAGAAGGTAGCTCATCCTGAAACTCTACTTCCATTCTTGGAATTAATGTCCA
AAGAGATCGATGAACACCTGCTGTCCACAGAGTAGGTCGAAGACTTTCTTCTGCTTGTTT
AAAACCCTATATATGATGAGTCTGGTGCATGCATGGTATGTATGTGGTGTACATGCATGT
ATATATTTCTGTATTATATGGAGTAATAGTAGTTACGTATATGTTATGTTTTTATCAAGT
TACAAGTTTGTAATTGTAACATGTATGCGTATGAGCTTTCCTTTTTTTTGTATTTTGTGT
GACAAAATAAAATAAAAATCGTACTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G495TF U 101
AF RR2CU91TF U 101
AF RR2A124TF U 1
AF RR2CU91JQ C 152
BS 1 463 RR2A124TF
BS 464 464 RR2CU91TF
BS 465 695 RR2A124TF
BS 696 696 RR2CU91JQ
BS 697 789 RR2A124TF
BS 790 930 RR2CU91JQ

RD RR2G495TF 586 0 0
AAAAATCATTCAGAATTGACTTAGGGTAGCATATCATTCGTACAAAATGGCAGCGGTAGA
AACTGAGCCAGAGACAAAGGCTGCGACTGAGCCAGAGACAAAGGCTGCGAGTAAACCAGA
GACGAAGGCTGATAGCATGAATGGAGAGATTTGGATAGATGTTGATATCAAAGCTTCTGC
AGAGAAATTCCACCATATGTTTGCTAAAAGGCCACACCACGTGTCCAATGCCACCCCTCG
CCACATTGGGGGAGTTGAGCTGCACGAGGGAGAGTGGGACAAAGTTGGAAGCATAGTCTT
GTGGAACTACATTCATGAAGGAAAGCCAAAAGTAGCAAAGGATAGGATCGAAGCGGTGGA
TCCGGAGAAGAATCTGATAAAGTTCAGGGTCTTAGAGGGAGATGTGTTAAAGGAGTACAA
AACCTTCTTAATAACACTCCAAGTAACACCAAAGCAAGGAGGACCAGGAAGTGTGGCGAG
GTGGCACTTGGAGTATGAGAGGATTGATGAGAAGGTAGCTCATCCTGAAACTCTACTTCC
ATTCTTGGA*TTAATGTCCAAAGAGATCGATGAACACCTGCTGTCC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2CU91TF 591 0 0
AAAAATCATTCAGAATTGACTTAGGGTAGCATATCATTCGTACAAAATGGCAGCGGTAGA
AACTGAGCCAGAGACAAAGGCTGCGACTGAGCCAGAGACAAAGGCTGCGAGTAAACCAGA
GACGAAGGCTGATAGCATGAATGGAGAGATTTGGATAGATGTTGATATCAAAGCTTCTGC
AGAGAAATTCCACCATATGTTTGCTAAAAGGCCACACCACGTGTCCAATGCCACCCCTCG
CCACATTGGGGGAGTTGAGCTGCACGAGGGAGAGTGGGACAAAGTTGGAAGCATAGTCTT
GTGGAACTACATTCATGAAGGAAAGCCAAAAGTAGCAAAGGATAGGATCGAAGCGGTGGA
TCCAGAGAAGAATCTGATAGAGTTCAGGGTCTTAGAGGGAGATGTGTTAAAGGAGTACAA
AACCTTCTTAATAACACTCCAAGTAACACCAAAGCAAGGAGGACCAGGAAGTGTGGCGAG
GTGGCACTTGGAGTATGAGAGGATTGATGAGAAGGTAGCTCATCCTGAAACTCTACTTCC
ATTCTTGGAATTAATGTCCAAAGAGATCGATGAACACCTGCTGTCC
ACAGA

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2A124TF 789 0 0
GGACTCTCATTTGTCTTCTTCTATTACAATACTTTCTCCTTTCTCTCTCTTTATAAAAAG
AGCTATACGGATTTTGAAGGCATATACTCACACCATTCAGAAAAATCATTCAGAATTGAC
TTAGGGTAGCATATCATTCGTACAAAATGGCAGCGGTAGAAACTGAGCCAGAGACAAAGG
CTGCGACTGAGCCAGAGACAAAGGCTGCGAGTAAACCAGAGACGAAGGCTGATAGCATGA
ATGGAGAGATTTGGATAGATGTTGATATCAAAGCTTCTGCAGAGAAATTCCACCATATGT
TTGCTAAAAGGCCACACCACGTGTCCAATGCCACCCCTCGCCACATTGGGGGAGTTGAGC
TGCACGAGGGAGAGTGGGACAAAGTTGGAAGCATAGTCTTGTGGAACTACATTCATGAAG
GAAAGCCAAAAGTAGCAAAGGATAGGATCGAAGCGGTGGATCCGGAGAAGAATCTGATAG
AGTTCAGGGTCTTAGAGGGAGATGTGTTAAAGGAGTACAAAACCTTCTTAATAACACTCC
AAGTAACACCAAAGCAAGGAGGACCAGGAAGTGTGGCGAGGTGGCACTTGGAGTATGAGA
GGATTGATGAGAAGGTAGCTCATCCTGAAACTCTACTTCCATTCTTGGAATTAATGTCCA
AAGAGATCGATGAACACCTGCTGTCCACAGAGTAG*TCGAAGACTTTCTTCTGCTTGTTT
AAAACCCTATATATGATGAGTCTGGTGCATGCATGGTATGTATGTGGTGTACATGCATGT
ATATATTTC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2CU91JQ 779 0 0
AGCGGTAGAAACTGAGCCAGAGACAAAGGCTGCGACTGAGCCAGAGACAAAGGCTGCGAG
TAAACCAGAGACGAAGGCTGATAGCATGAATGGAGAGATTTGGATAGATGTTGATATCAA
AGCTTCTGCAGAGAAATTCCACCATATGTTTGCTAAAAGGCCACACCACGTGTCCAATGC
CACCCCTCGCCACATTGGGGGAGTTGAGCTGCACGAGGGAGAGTGGGACAAAGTTGGAAG
CATAGTCTTGTGGAACTACATTCATGAAGGAAAGCCAAAAGTAGCAAAGGATAGGATCGA
AGCGGTGGATCCAGAGAAGAATCTGATAGAGTTCAGGGTCTTAGAGGGAGATGTGTTAAA
GGAGTACAAAACCTTCTTAATAACACTCCAAGTAACACCAAAGCAAGGAGGACCAGGAAG
TGTGGCGAGGTGGCACTTGGAGTATGAGAGGATTGATGAGAAGGTAGCTCATCCTGAAAC
TCTACTTCCATTCTTGGAATTAATGTCCAAAGAGATCGATGAACACCTGCTGTCCACAGA
GTAGGTCGAAGACTTTCTTCTGCTTGTTTAAAACCCTATATATGATGAGTCTGGTGCATG
CATGGTATGTATGTGGTGTACATGCATGTATATATTTCTGTATTATATGGAGTAATAGTA
GTTACGTATATGTTATGTTTTTATCAAGTTACAAGTTTGTAATTGTAACATGTATGCGTA
TGAGCTTTCCTTTTTTTTGTATTTTGTGTGACAAAATAAAATAAAAATCGTACTTATGC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 4

CO CL1947Contig1 1002 4 5 U
TTTTTATTTAATGAGGGTGGAAAAAATTATGGTGTTGACATATAGGAAATGAATAGTGCA
GTGTTACCAAATATCTGCATTTGGCCGTCATTACCAGATATTTTGGTAGCACGTAGAAAG
AGCAATAATCTATCTACATGTTCCGTCTTATTGCTCTCTGTCTCTCTCACACATGTTTGT
TAAACCTCTTTTGGATAGATGTCCATATATGCTTAAAATAATTAGATATTGAAGATCAGA
TGAATTATATTTAACAGAATATGTGAGAACTTTGATTTAAAAAATATCTTGCATTTAAGT
TAAATAATATAGTGAACAAGGTAATGTTATGTTTGAAAAGAATTCTAAGATGGGGTTTTT
GGTTCATTGATTATTGTATGGTTTATATTAATATTTAGAGAAAAATAAATATTTGGCCAA
AATATGTAAAAAGTTAGGAAAACATTAGCAAAAATTTAATAAAAAAAAATGATAAAGAGA
AAAATAAAAGAGGCTGGAGAAGGTGCATAATATGTGTTGGAAAACTTAATGCGGTAATTA
CATATATAATTCTATAAGCATTTGTTTTTAATAAATATTCATGAATTGTTTTTATATAAA
ACTTATGAAAATTAACAATATTATATACATAATATATATTTCATACAATATTTATACTCG
CGAGTTCGCGGACAATCACCTGGTGTGGAGGTAATCTTCGCTTACCCAGGAAGCGCATCA
ATGGAGATCCATCAAGCCATAACTCGCTCCACCACAATCCGAAACGTCTTTCCCCGTCAT
GAACAAGGAGGAGTTTTCGCCGCCGAAGATTACGCTTGTTCCTCGGATAAACCCGGAATC
TGCATCGCCACTTCCAATCCATGAACTATGAATCTCGTCATGCAGACTGCTCTTATTTGG
TCTAAAAAGTATTCAAAGTCTAAGTAGAACAGTCATAATGGGAAATATAAAAGTAACGAG
ATATTATGTTAAAGAGAACATAAAAGAATCAACCTCTTTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DE01TF U 1
AF RR2E935TF U 1
AF RR2E935JQ C 233
AF RR2DE01JQ C 373
BS 1 414 RR2DE01TF
BS 415 674 RR2E935TF
BS 675 675 RR2E935JQ
BS 676 688 RR2E935TF
BS 689 1002 RR2E935JQ

RD RR2DE01TF 414 0 0
TTTTTATTTAATGAGGGTGGAAAAAATTATGGTGTTGACATATAGGAAATGAATAGTGCA
GTGTTACCAAATATCTGCATTTGGCCGTCATTACCAGATATTTTGGTAGCACGTAGAAAG
AGCAATAATCTATCTACATGTTCCGTCTTATTGCTCTCTGTCTCTCTCACACATGTTTGT
TAAACCTCTTTTGGATAGATGTCCATATATGCTTAAAATAATTAGATATTGAAGATCAGA
TGAATTATATTTAACAGAATATGTGAGAACTTTGATTTAAAAAATATCTTGCATTTAAGT
TAAATAATATAGTGAACAAGGTAATGTTATGTTTGAAAAGAATTCTAAGATGGGGTTTTT
GGTTCATTGATTATTGTATGGTTTATATTAATATTTAGAGAAAAATAAATATTT

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR2E935TF 688 0 0
TTTTTATTTAATGAGGGTGGAAAAAATTATGGTGTTGACATATAGGAAATGAATAGTGCA
GTGTTACCAAATATCTGCATTTGGCCGTCATTACCAGATATTTTGGTAGCACGTAGAAAG
AGCAATAATCTATCTACATGTTCCGTCTTATTGCTCTCTGTCTCTCTCACACATGTTTGT
TAAACCTCTTTTGGATAGATGTCCATATATGCTTAAAATAATTAGATATTGAAGATCAGA
TGAATTATATTTAACAGAATATGTGAGAACTTTGATTTAAAAAATATCTTGCATTTAAGT
TAAATAATATAGTGAACAAGGTAATGTTATGTTTGAAAAGAATTCTAAGATGGGGTTTTT
GGTTCATTGATTATTGTATGGTTTATATTAATATTTAGAGAAAAATAAATATTTGGCCAA
AATATGTAAAAAGTTAGGAAAACATTAGCAAAAATTTAATAAAAAAAAATGATAAAGAGA
AAAATAAAAGAGGCTGGAGAAGGTGCATAATATGTGTTGGAAAACTTAATGCGGTAATTA
CATATATAATTCTATAAGCATTTGTTTTTAATAAATATTCATGAATTGTTTTTATATAAA
ACTTATGAAAATTAACAATATTATATACATAATATATATTTCATACAATATTTATACTCG
CGAGTTCGCGGACA*TCACCTGGTGTGG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2E935JQ 770 0 0
AGATCAGATGAATTATATTTAACAGAATATGTGAGAACTTTGATTTAAAAAATATCTTGC
ATTTAAGTTAAATAATATAGTGAACAAGGTAATGTTATGTTTGAAAAGAATTCTAAGATG
GGGTTTTTGGTTCATTGATTATTGTATGGTTTATATTAATATTTAGAGAAAAATAAATAT
TTGGCCAAAATATGTAAAAAGTTAGGAAAACATTAGCAAAAATTTAATAAAAAAAAATGA
TAAAGAGAAAAATAAAAGAGGCTGGAGAAGGTGCATAATATGTGTTGGAAAACTTAATGC
GGTAATTACATATATAATTCTATAAGCATTTGTTTTTAATAAATATTCATGAATTGTTTT
TATATAAAACTTATGAAAATTAACAATATTATATACATAATATATATTTCATACAATATT
TATACTCGCGAGTTCGCGGACAATCACCTGGTGTGGAGGTAATCTTCGCTTACCCAGGAA
GCGCATCAATGGAGATCCATCAAGCCATAACTCGCTCCACCACAATCCGAAACGTCTTTC
CCCGTCATGAACAAGGAGGAGTTTTCGCCGCCGAAGATTACGCTTGTTCCTCGGATAAAC
CCGGAATCTGCATCGCCACTTCCAATCCATGAACTATGAATCTCGTCATGCAGACTGCTC
TTATTTGGTCTAAAAAGTATTCAAAGTCTAAGTAGAACAGTCATAATGGGAAATATAAAA
GTAACGAGATATTATGTTAAAGAGAACATAAAAGAATCAACCTCTTTTCC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2DE01JQ 630 0 0
ATTGTATGGTTTATATTAATATTTAGAGAAAAATAAATATTTGGCCAAAATATGTAAAAA
GTTAGGAAAACATTAGCAAAAATTTAATAAAAAAAAATGATAAAGAGAAAAATAAAAGAG
GCTGGAGAAGGTGCATAATATGTGTTGGAAAACTTAATGCGGTAATTACATATATAATTC
TATAAGCATTTGTTTTTAATAAATATTCATGAATTGTTTTTATATAAAACTTATGAAAAT
TAACAATATTATATACATAATATATATTTCATACAATATTTATACTCGCGAGTTCGCGGA
CAATCACCTGGTGTGGAGGTAATCTTCGCTTACCCAGGAAGCGCATCAATGGAGATCCAT
CAAGCCATAACTCGCTCCACCACAATCCGAAACGTCTTTCCCCGTCATGAACAAGGAGGA
GTTTTCGCCGCCGAAGATTACGCTTGTTCCTCGGATAAACCCGGAATCTGCATCGCCACT
TCCAATCCATGAACTATGAATCTCGTCATGCAGACTGCTCTTATTTGGTCTAAAAAGTAT
TCAAAGTCTAAGTAGAACAGTCATAATGGGAAATATAAAAGTAACGAGATATTATGTTAA
AGAGAACATAAAAGAATCAACCTCTTTTCC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 4

CO CL1948Contig1 806 4 20 U
GCAAAAACCCTTTTCAATGGATCAATAAGTTACATTATGTTTTGATGATTACAATAAACT
GATCCAATACAGAGAAAGTGCAGTCACAGCACACGTGTACTACATACAGAT*ATATTATT
TGTTGTGGTTTTCTTCATAAATCAAAGGACTTGCCTATCAGCAGCATCAGCAACAATGGG
CAACCTCGGGGTCAGACCAAACAAGCAAGCAGAGAATCCATAGATCAAACAGACAAGCAA
GAAGAGGAACACTGTGCTGTCCAAACTCATCACCACATCCAAACCAAACCCATCTCTAGG
ATTAAAGCTCCTCTCAAGCAAATCCGGAAAAATCAACAGCACGTCGAGCACAATGGCCTG
CATCGTGTTGAACCTAACGTACCTGCTGAAGTTAGAGTTCCTCACGACGACGAAGTAGAG
AGCGATGAAGATGAGAAAGCCATTGAAAGGGAAGCTCTTGAAGGCCTTGATGGCGGGAAA
CAGAGGCTGGATGAGGATCTGGAATGGTTGGTATTGCGTGATGATGAATTTACCGTACTG
AATCCCATCGAAGAACGGGTAGAAGTAACATAAGGCAGAGATGATCCGATCTGATGCGTC
GACGGAGTCGTCTCCCTTGGATCGGAGGACGAGTGCGGCGGCTCTTTCCCTTGAAAGACT
AGGTTTTGAGAATTGGGGGTTAGGGTTTAGAGGGAGAGAAAAAGAGCGCCGGGTTAAGTT
TCCGGTTTGGAAGAAGGCGAGAGATGGCAATGGAGAGACGAGATGAGATATTGCCATTGC
TCTGTGTCTGTTTTCACTTCACACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED54JQ U 1
AF RR2FP38JQ U 19
AF RR2FP38TF C 19
AF RR2DV76TF C 201
BS 1 100 RR2ED54JQ
BS 101 103 RR2FP38JQ
BS 104 111 RR2ED54JQ
BS 112 112 RR2FP38JQ
BS 113 122 RR2ED54JQ
BS 123 123 RR2FP38JQ
BS 124 126 RR2ED54JQ
BS 127 127 RR2FP38JQ
BS 128 282 RR2ED54JQ
BS 283 283 RR2FP38JQ
BS 284 495 RR2ED54JQ
BS 496 496 RR2FP38JQ
BS 497 572 RR2ED54JQ
BS 573 573 RR2FP38JQ
BS 574 576 RR2ED54JQ
BS 577 577 RR2FP38JQ
BS 578 675 RR2ED54JQ
BS 676 703 RR2FP38JQ
BS 704 800 RR2FP38TF
BS 801 806 RR2DV76TF

RD RR2ED54JQ 676 0 0
GCAAAAACCCTTTTCAATGGATCAATAAGTTACATTATGTTTTGATGATTACAATAAACT
GATCCAATACAGAGAAAGTGCAGTCACAGCACACGTGTAC***ATACAGATTATATTATT
TGCTGTAGTTTTCTTCATAAATCAAAGGACTTGCCTATCAGCAGCATCAGCAACAATGGG
CAACCTCGGGGTCAGACCAAACAAGCAAGCAGAGAATCCATAGATCAAACAGACAAGCAA
GAAGAGGAACACTGTGCTGTCCAAACTCATCACCACATCCAACCCAAACCCATCTCTAGG
ATTAAAGCTCCTCTCAAGCAAATCCGGAAAAATCAACAGCACGTCGAGCACAATGGCCTG
CATCGTGTTGAACCTAACGTACCTGCTGAAGTTAGAGTTCCTCACGACGACGAAGTAGAG
AGCGATGAAGATGAGAAAGCCATTGAAAGGGAAGCTCTTGAAGGCCTTGATGGCGGGAAA
CAGAGGCTGGATGAGAATCTGGAATGGTTGGTATTGCGTGATGATGAATTTACCGTACTG
AATCCCATCGAAGAACGGGTAGAAGTAACATACGGCTGAGATGATCCGATCTGATGCGTC
GACGGAGTCGTCTCCCTTGGATCGGAGGACGAGTGCGGCGGCTCTTTCCCTTGAAAGACT
AGGTTTTGAGAATTG
C

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2FP38JQ 685 0 0
GGATCAATAAGTTACATTATGTTTTGATGATTACAATAAACTGATCCAATACAGAGAAAG
TGCAGTCACAGCACACGTGTACTACATACAGAT*ATATTATTTGTTGTGGTTTTCTTCAT
AAATCAAAGGACTTGCCTATCAGCAGCATCAGCAACAATGGGCAACCTCGGGGTCAGACC
AAACAAGCAAGCAGAGAATCCATAGATCAAACAGACAAGCAAGAAGAGGAACACTGTGCT
GTCCAAACTCATCACCACATCCAAACCAAACCCATCTCTAGGATTAAAGCTCCTCTCAAG
CAAATCCGGAAAAATCAACAGCACGTCGAGCACAATGGCCTGCATCGTGTTGAACCTAAC
GTACCTGCTGAAGTTAGAGTTCCTCACGACGACGAAGTAGAGAGCGATGAAAATGAAAAA
GCCATTGAAAGGGAAGCTCTTGAAGGCCTTGATGGCGGGAAACAGAGGCTGGATGAGGAT
CTGGAATGGTTGGTATTGCGTGATGATGAATTTACCGTACTGAATCCCATCGAAGAACGG
GTAGAAGTAACATAAGGCAGAAATGATCCGATCTGATGCGTCGACGGAGTCGTCTCCCTT
GGATCGGAGGACGAGTGCGGCGGCTCTTTCCCTTGAAAGACTAGGTTTTGAGAATTGGGG
GTTAGGGTTTAGAGGGAGAGAAAAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2FP38TF 783 0 0
GGATCAATAAGTTACATT*TGTTT*GATGATTACAATAAACTGATCCAATACAGAGAAAG
TGCAGTCACAGCACACGTGTACTACATACAGAT*ATATTATTTGTTGTGGTTTTCTTCAT
AAATCAAAGGACTTGCCTATCAGCAGCATCAGCAACAATGGGCAACCTCGGGGTCAGACC
AAACAAGCAAGCAGAGAATCCATAGATCAAACAGACAAGCAAGAAGAGGAACACTGTGCT
GTCCAAACTCATCACCACATCCAAACCAAACCCATCTCTAGGATTAAAGCTCCTCTCAAG
CAAATCCGGAAAAATCAACAGCACGTCGAGCACAATGGCCTGCATCGTGTTGAACCTAAC
GTACCTGCTGAAGTTAGAGTTCCTCACGACGACGAAGTAGAGAGCGATGAAGATGAGAAA
GCCATTGAAAGGGAAGCTCTTGAAGGCCTTGATGGCGGGAAACAGAGGCTGGATGAGGAT
CTGGAATGGTTGGTATTGCGTGATGATGAATTTACCGTACTGAATCCCATCGAAGAACGG
GTAGAAGTAACATAAGGCAGAGATGATCCGATCTGATGCGTCGACGGAGTCGTCTCCCTT
GGATCGGAGGACGAGTGCGGCGGCTCTTTCCCTTGAAAGACTAGGTTTTGAGAATTGGGG
GTTAGGGTTTAGAGGGAGAGAAAAAGAGCGCCGGGTTAAGTTTCCGGTTTGGAAGAAGGC
GAGAGATGGCAATGGAGAGACGAGATGAGATATTGCCATTGCTCTGTGTCTGTTTTCACT
TC
C

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2DV76TF 606 0 0
ACAAGCAAGCAGAGAATCCATAGATCAAACAGACAAGCAAGAAGAGGAACACTGTGCTGT
CCAAACTCATCACCACATCCAAACCAAACCCATCTCTAGGATTAAAGCTCCTCTCAAGCA
AATCCGGAAAAATCAACAGCACGTCGAGCACAATGGCCTGCATCGTGTTGAACCTAACGT
ACCTGCTGAAGTTAGAGTTCCTCACGACGACGAAGTAGAGAGCGATGAAGATGAGAAAGC
CATTGAAAGGGAAGCTCTTGAAGGCCTTGATGGCGGGAAACAGAGGCTGGATGAGGATCT
GGAATGGTTGGTATTGCGTGATGATGAATTTACCGTACTGAATCCCATCGAAGAACGGGT
AGAAGTAACATAAGGCAGAGATGATCCGATCTGATGCGTCGACGGAGTCGTCTCCCTTGG
ATCGGAGGACGAGCGCGGCGGCTCTTTCCCTTGAAAGACTAGGTTTTGAGAATTGGGGGT
TAGGGTTTAGAGGGAGAGAAAAAGAGCGCCGGGTTAAGTTTCCGGTTTGGAAGAAGGCGA
GAGATGGCAATGGAGAGACGAGATGAGATATTGCCATTGCTCTGTGTCTGTTTTCACTTC
ACACCC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 2 4

CO CL1949Contig1 656 2 2 U
GGATGAAAAAGGGTCAAGACGAGATCCGAACATGCATCAACATCAAACAAAATGAGAGAA
TTGATGAAGAAGATGTTGATAAGCTTCAGTACTTGAAGCTTGTGATCAAAGAAACGTTAA
GACTGCACCCAGCTGCTCCCTTGTTACTCCCAAGAGAAACAATGAGTCAAATCAAGATTC
AAGGCTACAACATTCCGCCAAAAACCTTCCTAGTGGTTAACACTTGGTCGATAGGACAAG
ATCCTAAACACTGGGAAGATCCAGAAGAGTTTATCCCGGAGAGATTTATTGATTCTCCTG
TGGATTACAAAGGACAAAGCTTTGAGATGTTACCATTTGGTTCTGGACGGAGGATGTGCC
CTGGAATGGCTTCAGCAATTGCAACCATTGAGTTGGGACTCTTGAATTTGCTTTACTATT
TTGATTGGGGATTGCCTGAGGAGGGGAAATACATGGACATGGAAGAAGATGGTAATATTA
CCGTTGTTAAGAAAGTTCCTCTTAAGCTTCTTCCAATTCTTCATCACTAAATGATGTCTC
AACTCTGAAGTATACAAAAGATAAAAAAACTATCAAGATAAATGATATGTATCATAGTAT
ATGTTCTTATTTTCCCCCTCCATATATTTTTTTACTTCTATTGAAATAGTTTAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AY64TFB U 1
AF RR2AY64JQ C 15
BS 1 654 RR2AY64TFB
BS 655 656 RR2AY64JQ

RD RR2AY64TFB 656 0 0
GGATGAAAAAGGGTCAAGACGAGATCCGAACATGCATCAACATCAAACAAAATGAGAGAA
TTGATGAAGAAGATGTTGATAAGCTTCAGTACTTGAAGCTTGTGATCAAAGAAACGTTAA
GACTGCACCCAGCTGCTCCCTTGTTACTCCCAAGAGAAACAATGAGTCAAATCAAGATTC
AAGGCTACAACATTCCGCCAAAAACCTTCCTAGTGGTTAACACTTGGTCGATAGGACAAG
ATCCTAAACACTGGGAAGATCCAGAAGAGTTTATCCCGGAGAGATTTATTGATTCTCCTG
TGGATTACAAAGGACAAAGCTTTGAGATGTTACCATTTGGTTCTGGACGGAGGATGTGCC
CTGGAATGGCTTCAGCAATTGCAACCATTGAGTTGGGACTCTTGAATTTGCTTTACTATT
TTGATTGGGGATTGCCTGAGGAGGGGAAATACATGGACATGGAAGAAGATGGTAATATTA
CCGTTGTTAAGAAAGTTCCTCTTAAGCTTCTTCCAATTCTTCATCACTAAATGATGTCTC
AACTCTGAAGTATACAAAAGATAAAAAAACTATCAAGATAAATGATATGTATCATAGTAT
ATGTTCTTATTTTCCCCCTCCATATATTTTTTTACTTCTATTGAAATAGTTTAA
AG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2AY64JQ 642 0 0
CAAGACGAGATCCGAACATGCATCAACATCAAACAAAATGAGAGAATTGATGAAGAAGAT
GTTGATAAGCTTCAGTACTTGAAGCTTGTGATCAAAGAAACGTTAAGACTGCACCCAGCT
GCTCCCTTGTTACTCCCAAGAGAAACAATGAGTCAAATCAAGATTCAAGGCTACAACATT
CCGCCAAAAACCTTCCTAGTGGTTAACACTTGGTCGATAGGACAAGATCCTAAACACTGG
GAAGATCCAGAAGAGTTTATCCCGGAGAGATTTATTGATTCTCCTGTGGATTACAAAGGA
CAAAGCTTTGAGATGTTACCATTTGGTTCTGGACGGAGGATGTGCCCTGGAATGGCTTCA
GCAATTGCAACCATTGAGTTGGGACTCTTGAATTTGCTTTACTATTTTGATTGGGGATTG
CCTGAGGAGGGGAAATACATGGACATGGAAGAAGATGGTAATATTACCGTTGTTAAGAAA
GTTCCTCTTAAGCTTCTTCCAATTCTTCATCACTAAATGATGTCTCAACTCTGAAGTATA
CAAAAGATAAAAAAACTATCAAGATAAATGATATGTATCATAGTATATGTTCTTATTTTC
CCCCTCCATATATTTTTT*ACTTCTATTGAAATAGTTTAAAG

QA 1 642 1 642
DS 



CO CL1949Contig2 1070 2 4 U
GGGGATGGTTTATGGACTTTGTGTCAGGACGAAATAGGAGACTTCACAAACTTTTTGGCG
AGGTTGATACTTTTCTGAATCATATAGTTGATGATCACTTGAAGAACCCTGAAGATAAAC
CAAATCAAGATCGCCCTGATATAGTTGACTCTCTCTTAGATACTATGCATAAAGAAGAAC
AAGGTGAATCTTTCAACCTCACCATTGATCATCTTAAAGGAATCATCCAAAATATATATC
TTGCTGGAGTAGACACAAGTGCCATCACCATGATTTGGGCAATGGCAGAGCTCGTTAGAA
ACCCACGGGGTGATGAAAAAGGCTCAAGACGAGATCCGAACATGCATCAACATCAAACAA
AATGAGAGAATTGATGAAGAAGATGTTGATAAGCTTCAGTACTTGAAGCTTGTGATCAAA
GAAACGTTAAGACTGCACCCAGCTGCTCCTTTGTTACTCCCAAGAGAAACAATGAGTCAA
ATCAAGATTCAAGGCTACAACATTCCGCCAAAAACCTTCCTAGTGGTTAACACTTGGTCG
ATAGGACGAGATCCTAAACACTGGGAAGATCCAGAAGAGTTTATCCCGGAGAGATTTATT
GATTCTCCTGTGGATTACAAAGGACAAAGCTTTGAGATGTTACCATTTGGTTCTGGACGG
AGGATGTGCCCTGGAATGGCTTCAGCGATTGCTACCATTGAGTTGGGACTCTTGAATTTG
CTTTACTATTTTGATTGGGGATTGCCTGAGGAAGGGGAATACATGGACATGGAAGAAGAT
GGTAATATTACCGTTGTTAAGAAAGTTCCTCTTAAGCTTCTTCCAATTCTTCATCACTGA
ATGATGGCTCAACTCTGAAATATACAAAAGATAAAAAAATACTATCAAGATAAATGATAT
GTATCATAGTATATGTTCTTATTTCCCCCCTCCATATAATTTTTACTTCTATTGAAATAG
TTTAAGCTATAAAGAAATCTCTATCGAATGATCTGCATCTTGTTGATCAAACGTATAGTG
TGTCTTCTTTTGTGTTGAATAATAAAATAGATAGTGTACTTTTTTACACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B829TF U 1
AF RR2B829JQ C 208
BS 1 309 RR2B829TF
BS 310 310 RR2B829JQ
BS 311 746 RR2B829TF
BS 747 1070 RR2B829JQ

RD RR2B829TF 746 0 0
GGGGATGGTTTATGGACTTTGTGTCAGGACGAAATAGGAGACTTCACAAACTTTTTGGCG
AGGTTGATACTTTTCTGAATCATATAGTTGATGATCACTTGAAGAACCCTGAAGATAAAC
CAAATCAAGATCGCCCTGATATAGTTGACTCTCTCTTAGATACTATGCATAAAGAAGAAC
AAGGTGAATCTTTCAACCTCACCATTGATCATCTTAAAGGAATCATCCAAAATATATATC
TTGCTGGAGTAGACACAAGTGCCATCACCATGATTTGGGCAATGGCAGAGCTCGTTAGAA
ACCCACGGG*TGATGAAAAAGGCTCAAGACGAGATCCGAACATGCATCAACATCAAACAA
AATGAGAGAATTGATGAAGAAGATGTTGATAAGCTTCAGTACTTGAAGCTTGTGATCAAA
GAAACGTTAAGACTGCACCCAGCTGCTCCTTTGTTACTCCCAAGAGAAACAATGAGTCAA
ATCAAGATTCAAGGCTACAACATTCCGCCAAAAACCTTCCTAGTGGTTAACACTTGGTCG
ATAGGACGAGATCCTAAACACTGGGAAGATCCAGAAGAGTTTATCCCGGAGAGATTTATT
GATTCTCCTGTGGATTACAAAGGACAAAGCTTTGAGATGTTACCATTTGGTTCTGGACGG
AGGATGTGCCCTGGAATGGCTTCAGCGATTGCTACCATTGAGTTGGGACTCTTGAATTTG
CTTTACTATTTTGATTGGGGATTGCC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2B829JQ 863 0 0
ATCATCTTAAAGGAATCATCCAAAATATATATCTTGCTGGAGTAGACACAAGTGCCATCA
CCATGATTTGGGCAATGGCAGAGCTCGTTAGAAACCCACGGGGTGATGAAAAAGGCTCAA
GACGAGATCCGAACATGCATCAACATCAAACAAAATGAGAGAATTGATGAAGAAGATGTT
GATAAGCTTCAGTACTTGAAGCTTGTGATCAAAGAAACGTTAAGACTGCACCCAGCTGCT
CCTTTGTTACTCCCAAGAGAAACAATGAGTCAAATCAAGATTCAAGGCTACAACATTCCG
CCAAAAACCTTCCTAGTGGTTAACACTTGGTCGATAGGACGAGATCCTAAACACTGGGAA
GATCCAGAAGAGTTTATCCCGGAGAGATTTATTGATTCTCCTGTGGATTACAAAGGACAA
AGCTTTGAGATGTTACCATTTGGTTCTGGACGGAGGATGTGCCCTGGAATGGCTTCAGCG
ATTGCTACCATTGAGTTGGGACTCTTGAATTTGCTTTACTATTTTGATTGGGGATTGCCT
GAGGAAGGGGAATACATGGACATGGAAGAAGATGGTAATATTACCGTTGTTAAGAAAGTT
CCTCTTAAGCTTCTTCCAATTCTTCATCACTGAATGATGGCTCAACTCTGAAATATACAA
AAGATAAAAAAATACTATCAAGATAAATGATATGTATCATAGTATATGTTCTTATTTCCC
CCCTCCATATAATTTTTACTTCTATTGAAATAGTTTAAGCTATAAAGAAATCTCTATCGA
ATGATCTGCATCTTGTTGATCAAACGTATAGTGTGTCTTCTTTTGTGTTGAATAATAAAA
TAGATAGTGTACTTTTTTACACT

QA 1 863 1 863
DS 



AS 2 4

CO CL1950Contig1 854 2 2 U
GCCGCTAGGTTCGGGCATTGGCTTCAAAGAAGAAGACACACCTAACTTCACTGGTTCTTT
CTACTCAAAAACCAAAGCCATGGTTGAGGAGCTGCTTAAGGAGTTTGATAACGTATGCAC
TCTAAGGGTTAGGATGCCGATTTCCTCTGATCTGAACAACCCGAGAAACTTCATCACCAA
GATCTCCCGGTACAGCAAAGTAGTGAACATCCCAAACAGCATGACCGTGCTGGACGAGCT
TCTTCCAATCTCGATAGAGATGGCGAAAAGAAACCTGAAAGGGATTTGGAACTTCACTAA
CCCTGGTGTTGTGAGTCATAATGAGGTCCTGGAGGTGTACAGAGACTACATCGACTCAGA
CTTCAAATGGGCGAACTTCACACTGGAGGAGCAAGCTAAGGTCATCGTGGCTCCAAGAAG
CAACAACGAGATGGACGCATCTAAGCTCAAGAAAGAGTTCCCTGAATTACTCTCAATCAA
GGAGTCTCTGATCAAATATGCATTTGAGCCCAACAAGAGAACTTGAGGTAATATATAACT
TATCTCAGTTTTCTTTAAGCTGGTTTGTTATTAGTTTCTCCCCTGGAGTCGTAAACCAAA
AGCAACACTAGCTTTGCCTTTTAGGTTTATCCATTAAGTGGGGTACATCTAGTTTGGATT
CTTATATGTTATTGTTTTGTTGGTATTGTGTTTCTTGTTCCACATTTATAGATAAAAAGT
TGATTTATGTATCATTAATACAAACGGTTAAATCCAGGAACTAGATTTATGGTCTCCAGT
TAAAGCGTTTGATGGTAGAAAACTCTCTACTTTTATTCATTTTGTATCCATGAAGAAAAG
ATTGGTACATTTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT40TF U 1
AF RR2AT40JQ C 1
BS 1 713 RR2AT40TF
BS 714 854 RR2AT40JQ

RD RR2AT40TF 713 0 0
GCCGCTAGGTTCGGGCATTGGCTTCAAAGAAGAAGACACACCTAACTTCACTGGTTCTTT
CTACTCAAAAACCAAAGCCATGGTTGAGGAGCTGCTTAAGGAGTTTGATAACGTATGCAC
TCTAAGGGTTAGGATGCCGATTTCCTCTGATCTGAACAACCCGAGAAACTTCATCACCAA
GATCTCCCGGTACAGCAAAGTAGTGAACATCCCAAACAGCATGACCGTGCTGGACGAGCT
TCTTCCAATCTCGATAGAGATGGCGAAAAGAAACCTGAAAGGGATTTGGAACTTCACTAA
CCCTGGTGTTGTGAGTCATAATGAGGTCCTGGAGGTGTACAGAGACTACATCGACTCAGA
CTTCAAATGGGCGAACTTCACACTGGAGGAGCAAGCTAAGGTCATCGTGGCTCCAAGAAG
CAACAACGAGATGGACGCATCTAAGCTCAAGAAAGAGTTCCCTGAATTACTCTCAATCAA
GGAGTCTCTGATCAAATATGCATTTGAGCCCAACAAGAGAACTTGAGGTAATATATAACT
TATCTCAGTTTTCTTTAAGCTGGTTTGTTATTAGTTTCTCCCCTGGAGTCGTAAACCAAA
AGCAACACTAGCTTTGCCTTTTAGGTTTATCCATTAAGTGGGGTACATCTAGTTTGGATT
CTTATATGTTATTGTTTTGTTGGTATTGTGTTTCTTGTTCCACATTTATAGAT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2AT40JQ 854 0 0
GCCGCTAGGTTCGGGCATTGGCTTCAAAGAAGAAGACACACCTAACTTCACTGGTTCTTT
CTACTCAAAAACCAAAGCCATGGTTGAGGAGCTGCTTAAGGAGTTTGATAACGTATGCAC
TCTAAGGGTTAGGATGCCGATTTCCTCTGATCTGAACAACCCGAGAAACTTCATCACCAA
GATCTCCCGGTACAGCAAAGTAGTGAACATCCCAAACAGCATGACCGTGCTGGACGAGCT
TCTTCCAATCTCGATAGAGATGGCGAAAAGAAACCTGAAAGGGATTTGGAACTTCACTAA
CCCTGGTGTTGTGAGTCATAATGAGGTCCTGGAGGTGTACAGAGACTACATCGACTCAGA
CTTCAAATGGGCGAACTTCACACTGGAGGAGCAAGCTAAGGTCATCGTGGCTCCAAGAAG
CAACAACGAGATGGACGCATCTAAGCTCAAGAAAGAGTTCCCTGAATTACTCTCAATCAA
GGAGTCTCTGATCAAATATGCATTTGAGCCCAACAAGAGAACTTGAGGTAATATATAACT
TATCTCAGTTTTCTTTAAGCTGGTTTGTTATTAGTTTCTCCCCTGGAGTCGTAAACCAAA
AGCAACACTAGCTTTGCCTTTTAGGTTTATCCATTAAGTGGGGTACATCTAGTTTGGATT
CTTATATGTTATTGTTTTGTTGGTATTGTGTTTCTTGTTCCACATTTATAGATAAAAAGT
TGATTTATGTATCATTAATACAAACGGTTAAATCCAGGAACTAGATTTATGGTCTCCAGT
TAAAGCGTTTGATGGTAGAAAACTCTCTACTTTTATTCATTTTGTATCCATGAAGAAAAG
ATTGGTACATTTCG

QA 1 854 1 854
DS 



CO CL1950Contig2 658 2 2 U
GATATCAATACATAAATCAAATTTTTATCTATAAATGTGGAACAAGAACACAATACCAAC
AAAACAATAACATATAAGAATCCAAACTAGATGTACTCCCCCCATAATGGATAAACCTAA
AAGGCAAAGCTAGTTGCTTTTGGTTTACGACTCCAGGGGAGAAACTAATAACAAACCAGC
TTAAAAAAAAACTGAGATAAGTTAATATTACCTCAAGTTCTCTTGTTGGGCTCAAATGCA
TATTTGATCAGAGACTCCTTGATTGAGAGTAATTCAGGGAACTCTTTCTTGAGCTTAGAT
GCGTCCATCTCGTTGTTGCTTCTTGGAGCCACGATGACCTTAGCTTGCTCCTCCAGTGTG
AAGTTCGCCCATTTGAAGTCTGAGTCAATGTAGTCTCTGTACATCTCCAGGACCTCATTG
TGACTCACAACACCAGGGTTGGTGAAGTTCCAAATCCCTTTCAGGTTTCTTTTCGCCATC
TCTATTGAGATTGGAAGAAGCTCGTCCAGCACGGTCATGCTGTTTGGGATGTTCACTACT
TTGCTGTACCGGGAAATCTTGGTGATGAAGTTTCTCGGGTTGTTCAGATCAGAGGAAATC
GGCATCCTAACCCTTAGAGTGCATACGTTATCAAACTCCTTAAGCAGCTCCTCAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2F503TF C 1
AF RR2F503JQ U 35
BS 1 34 RR2F503TF
BS 35 658 RR2F503JQ

RD RR2F503TF 658 0 0
GATATCAATACATAAATCAAATTTTTATCTATAAATGTGGAACAAGAACACAATACCAAC
AAAACAATAACATATAAGAATCCAAACTAGATGTACTCCCCCCATAATGGATAAACCTAA
AAGGCAAAGCTAGTTGCTTTTGGTTTACGACTCCAGGGGAGAAACTAATAACAAACCAGC
TTAAAAAAAAACTGAGATAAGTTAATATTACCTCAAGTTCTCTTGTTGGGCTCAAATGCA
TATTTGATCAGAGACTCCTTGATTGAGAGTAATTCAGGGAACTCTTTCTTGAGCTTAGAT
GCGTCCATCTCGTTGTTGCTTCTTGGAGCCACGATGACCTTAGCTTGCTCCTCCAGTGTG
AAGTTCGCCCATTTGAAGTCTGAGTCAATGTAGTCTCTGTACATCTCCAGGACCTCATTG
TGACTCACAACACCAGGGTTGGTGAAGTTCCAAATCCCTTTCAGGTTTCTTTTCGCCATC
TCTATTGAGATTGGAAGAAGCTCGTCCAGCACGGTCATGCTGTTTGGGATGTTCACTACT
TTGCTGTACCGGGAAATCTTGGTGATGAAGTTTCTCGGGTTGTTCAGATCAGAGGAAATC
GGCATCCTAACCCTTAGAGTGCATACGTTATCAAACTCCTTAAGCAGCTCCTCAACC
C

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2F503JQ 624 0 0
ATGTGGAACAAGAACACAATACCAACAAAACAATAACATATAAGAATCCAAACTAGATGT
ACTCCCCCCATAATGGATAAACCTAAAAGGCAAAGCTAGTTGCTTTTGGTTTACGACTCC
AGGGGAGAAACTAATAACAAACCAGCTTAAAAAAAAACTGAGATAAGTTAATATTACCTC
AAGTTCTCTTGTTGGGCTCAAATGCATATTTGATCAGAGACTCCTTGATTGAGAGTAATT
CAGGGAACTCTTTCTTGAGCTTAGATGCGTCCATCTCGTTGTTGCTTCTTGGAGCCACGA
TGACCTTAGCTTGCTCCTCCAGTGTGAAGTTCGCCCATTTGAAGTCTGAGTCAATGTAGT
CTCTGTACATCTCCAGGACCTCATTGTGACTCACAACACCAGGGTTGGTGAAGTTCCAAA
TCCCTTTCAGGTTTCTTTTCGCCATCTCTATTGAGATTGGAAGAAGCTCGTCCAGCACGG
TCATGCTGTTTGGGATGTTCACTACTTTGCTGTACCGGGAAATCTTGGTGATGAAGTTTC
TCGGGTTGTTCAGATCAGAGGAAATCGGCATCCTAACCCTTAGAGTGCATACGTTATCAA
ACTCCTTAAGCAGCTCCTCAACCC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 3

CO CL1951Contig1 565 3 26 U
CAATATCTTACTTCGGATATGAACGTTTAAATTTAAGAAACCAAATACAAACAATCTTGT
CACAACACTTTTGAGATTGGTCTACTAAAAGCAGAACATTGAACCATATGATAGTGATGA
TAAAAAAATACCCTCAGTTCTTCCTGTCACGAGCACACTTGACTTGCACGGCAAGCGTCT
TGACAACGTTCTTGCATGAATCTTTCTTGTCTTGTTTGAATGTGCTTTTGTTCACCGGAA
TCACACACTCTCCTTTCCCCAAACAATGCTTCTCAACGACTTTCTTTGAAACGGGAGCAT
TACAAGTACCAAGTGTGAAGTTCCCACAAGTACCAATAGGGTTTCCGAAGCTAGCGAACT
CAACTTCTGAGATCTTCTTGTTGCCAGAGCATTTAAGAGTAGCTGTGAGACTCACGTTAT
CAGTGATGGCTTGGACCTGGTCTTGCTTCCTTGTCCAGTGCCTAACACTTGGAGTATATT
CTTCTCCGACGTAAGTACAAACAGTGTCTCTGTTGACGATGACGAAGTCTATAATCTCAG
GCTTCACGTTAGGCTCTTCCTCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2C555JQ U 1
AF RR2BP85JQ U 14
AF RR2BP85TF C 14
BS 1 36 RR2C555JQ
BS 37 37 RR2BP85JQ
BS 38 74 RR2C555JQ
BS 75 75 RR2BP85JQ
BS 76 93 RR2C555JQ
BS 94 94 RR2BP85JQ
BS 95 233 RR2C555JQ
BS 234 234 RR2BP85JQ
BS 235 322 RR2C555JQ
BS 323 323 RR2BP85JQ
BS 324 349 RR2C555JQ
BS 350 350 RR2BP85JQ
BS 351 370 RR2C555JQ
BS 371 371 RR2BP85JQ
BS 372 386 RR2C555JQ
BS 387 387 RR2BP85JQ
BS 388 388 RR2C555JQ
BS 389 389 RR2BP85JQ
BS 390 396 RR2C555JQ
BS 397 397 RR2BP85JQ
BS 398 398 RR2C555JQ
BS 399 399 RR2BP85JQ
BS 400 408 RR2C555JQ
BS 409 409 RR2BP85JQ
BS 410 516 RR2C555JQ
BS 517 565 RR2BP85JQ

RD RR2C555JQ 516 0 0
CAATATCTTACTTCGGATATGAACGTTTAAATTTAAAAAACCAAATACAAACAATCTTGT
CACAACACTTTTGAAATTGGTCTACTAAAAGCAAAACATTGAACCATATGATAGTGATGA
TAAAAAAATACCCTCAGTTCTTCCTGTCACGAGCACACTTGACTTGCACGGCAAGCGTCT
TGACAACGTTCTTGCATGAATCTTTCTTGTCTTGTTTGAATGTGCTTTTGTTCTCCGGAA
TCACACACTCTCCTTTCCCCAAACAATGCTTCTCAACGACTTTCTTTGAAACGGGAGCAT
TACAAGTACCAAGTGTGAAGTTTCCACAAGTACCAATAGGGTTTCCGAAACTAGCGAACT
CAACTTCTGAAATCTTCTTGTTGCCAAAACATTTAAAAATAGCTGTGAAACTCACGTTAT
CAGTGATGGCTTGGACCTGGTCTTGCTTCCTTGTCCAGTGCCTAACACTTGGAGTATATT
CTTCTCCGACGTAAGTACAAACAGTGTCTCTGTTGA

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2BP85JQ 552 0 0
CGGATATGAACGTTTAAATTTAAGAAACCAAATACAAACAATCTTGTCACAACACTTTTG
AGATTGGTCTACTAAAAGCAGAACATTGAACCATATGATAGTGATGATAAAAAAATACCC
TCAGTTCTTCCTGTCACGAGCACACTTGACTTGCACGGCAAGCGTCTTGACAACGTTCTT
GCATGAATCTTTCTTGTCTTGTTTGAATGTGCTTTTGTTCACCGGAATCACACACTCTCC
TTTCCCCAAACAATGCTTCTCAACGACTTTCTTTGAAACGGGAGCATTACAAGTACCAAG
TGTGAAGTTCCCACAAGTACCAATAGGGTTTCCGAAGCTAGCGAACTCAACTTCTGAGAT
CTTCTTGTTGCCAGAGCATTTAAGAGTAGCTGTGAGACTCACGTTATCAGTGATGGCTTG
GACCTGGTCTTGCTTCCTTGTCCAGTGCCTAACACTTGGAGTATATTCTTCTCCGACGTA
AGTACAAACAGTGTCTCTGTTGACGATGACGAAGTCTATAATCTCAGGCTTCACGTTAGG
CTCTTCCTCGCC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2BP85TF 552 0 0
CGGATATGAACGTTTAAATTTAAGAAACCAAATACAAACAATCTTGTCACAACACTTTTG
AGATTGGTCTACTAAAAGCAGAACATTGAACCATATGATAGTGATGATAAAAAAATACCC
TCAGTTCTTCCTGTCACGAGCACACTTGACTTGCACGGCAAGCGTCTTGACAACGTTCTT
GCATGAATCTTTCTTGTCTTGTTTGAATGTGCTTTTGTTCACCGGAATCACACACTCTCC
TTTCCCCAAACAATGCTTCTCAACGACTTTCTTTGAAACGGGAGCATTACAAGTACCAAG
TGTGAAGTTCCCACAAGTACCAATAGGGTTTCCGAAGCTAGCGAACTCAACTTCTGAGAT
CTTCTTGTTGCCAGAGCATTTAAGAGTAGCTGTGAGACTCACGTTATCAGTGATGGCTTG
GACCTGGTCTTGCTTCCTTGTCCAGTGCCTAACACTTGGAGTATATTCTTCTCCGACGTA
AGTACAAACAGTGTCTCTGTTGACGATGACGAAGTCTATAATCTCAGGCTTCACGTTAGG
CTCTTCCTCG
CC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 3

CO CL1952Contig1 816 3 11 U
GGGAAGACTATCTTCTCATTTCTCACAGGATTGAAGAGAGAGATAGAGAGAGTTTAAACT
TTCCTTGTAAGCATAAATCACTCAGTGCACACACAAAGTCTGAGGCTAATGGTTTCTCGA
CAAGAAGGAGCCCTCTTCTCCAGTAAGAGGGATTTAACAATCTTTGGAGAAGAGTTTCAC
AATTCGTTCAAGAAGACTAAACTAGTAGATCAACCACATGGTGGCACTAGACCAATAGAG
CCTCTACCTTGTCCAAGACCCTACCTTGAACGAACCATAGAGCCTAAGGTCTATTCAAGA
ACATCAGAGGATCATATGACAAACCCAAAAGATTTGGTGGTTGTTGGACGACCTAAGATG
AGTCTAGATCTTGAGCTGAACCTTTCACCTTATTATTCACCTTCAAAAACCACTACAAAG
ATAGATGAATCCTCAAATCACAACGTGACCGTGTCATCACCAAATGTTAAAAATTTGACA
AGCCCGAGGGAGAAGACCACGCTGTCTTGGCTTGCGTTTGACGGTGGTGATGATGATGTT
GATCACAAGGAGCAAGAGATGGTACCAAAAGTGTGCATGAAATGCCACATGCTGGTCATG
CTGTCCACATCAACTCCTGTTTGTCCCAACTGCAAGTTCATGCACCCACGTGATCACAGC
TCTACAAAACTGTTTAAACCACCAAATTTGCTATGGCTCCTATGCTAG*CTCTTCAGAGT
TATGGGATATTAATGTTCGTAAG*AATAATATGAGC*GTAGAT*AGATATGGATGTATAT
TCTATGATTCCGTGAAGATATATCCATCTCCTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 0 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP29JQ C 1
AF RR2EP29TF U 1
AF RR2GK70TF U 8
BS 1 9 RR2EP29JQ
BS 10 723 RR2EP29TF
BS 724 724 RR2GK70TF
BS 725 730 RR2EP29TF
BS 731 731 RR2GK70TF
BS 732 744 RR2EP29TF
BS 745 745 RR2GK70TF
BS 746 748 RR2EP29TF
BS 749 749 RR2GK70TF
BS 750 780 RR2EP29TF
BS 781 816 RR2GK70TF

RD RR2EP29JQ 786 0 0
GGGAAGACTATCTTCTCATTTCTCACAGGATTGAAGAGAGAGATAGAGAGAGTTTAAACT
TTCCTTGTAAGCATAAATCACTCAGTGCACACACAAAGTCTGAGGCTAATGGTTTCTCGA
CAAGAAGGAGCCCTCTTCTCCAGTAAGAGGGATTTAACAATCTTTGGAGAAGAGTTTCAC
AATTCGTTCAAGAAGACTAAACTAGTAGATCAACCACATGGTGGCACTAGACCAATAGAG
CCTTTACCTTGTCCAAGACCCTACCTTGAACGAACCATAGAGCCTAAGGTCTATTCAAGA
ACATCAGAGGATCATATGACAAACCCAAAAGATTTGGTGGTTGTTGGACGACCTAAGATG
AGTTTAGATCTTGAGCTGAACCTTTCACCTTATTATTCACCTTCAAAAACCACTACAAAG
ATAGATGAATCCTCAAATCACAACGTGACCGTGTCATCACCAAATGTTAAAAATTTGACA
AGCCCGAGGGAGAAGACCACGCTGTCTTGGCTTGCGTTTGACGGTGGTGATGATGATGTT
GATCACAAGGAGCAAGAGATGGTACCAAAAGTGTGCATGAAATGCCACATGCTGGTCATG
CTGTCCACATCAACTCCTGTTTGTCCCAACTGCAAGTTCATGCACCCACGTGATCACAGC
TTTACAAAACTGTTTAAACCACCAAATTTGCTATGGCTCCTATGCTAGGCTTTTCAGAGT
TATTGGATATTAATGTTCGTAAGGAATAATATGAGC*GTAGATTAGATATGGATGTATAT
TCTATG

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2EP29TF 785 0 0
GGGAAGACT
ATCTTCTCATTTCTCACAGGATTGAAGAGAGAGATAGAGAGAGTTTAAACTTTCCTTGTA
AGCATAAATCACTCAGTGCACACACAAAGTCTGAGGCTAATGGTTTCTCGACAAGAAGGA
GCCCTCTTCTCCAGTAAGAGGGATTTAACAATCTTTGGAGAAGAGTTTCACAATTCGTTC
AAGAAGACTAAACTAGTAGATCAACCACATGGTGGCACTAGACCAATAGAGCCTCTACCT
TGTCCAAGACCCTACCTTGAACGAACCATAGAGCCTAAGGTCTATTCAAGAACATCAGAG
GATCATATGACAAACCCAAAAGATTTGGTGGTTGTTGGACGACCTAAGATGAGTCTAGAT
CTTGAGCTGAACCTTTCACCTTATTATTCACCTTCAAAAACCACTACAAAGATAGATGAA
TCCTCAAATCACAACGTGACCGTGTCATCACCAAATGTTAAAAATTTGACAAGCCCGAGG
GAGAAGACCACGCTGTCTTGGCTTGCGTTTGACGGTGGTGATGATGATGTTGATCACAAG
GAGCAAGAGATGGTACCAAAAGTGTGCATGAAATGCCACATGCTGGTCATGCTGTCCACA
TCAACTCCTGTTTGTCCCAACTGCAAGTTCATGCACCCACGTGATCACAGCTCTACAAAA
CTGTTTAAACCACCAAATTTGCTATGGCTCCTATGCTAG*CTCTTCAGAGTTAT*GGATA
T*AATGTTCGTAAG**ATA*TATGAGC*GTAGAT*AGATATGGATGTATAT
CTATG

QA 10 780 10 780
DS 

RD RR2GK70TF 809 0 0
GG
ATCTTCTCATTTCTTACAGGATCAAAGAGAGAGATAGAGAGAGTTTAAACTTTCCTTATA
AGCATAAATCACTCAGTGCACACACAAAGTCTGAGGCTAATGGTTTCTCGACAAGAAGGA
GCCCTCTTCTCCAGTAAGAGGGATTTAACAATCTTTGGAGAAGAGTTTCACAATTCGTTC
AAGAAGACTAAACTAGTAGATCAATCACATGGTGGCACTAGACCAATAGAGCCTCTACCT
TGTCCAAGACCCTACCTTGAACGAACCATAGAGCCTAAGGTCTATTCAAGAACATCAGAG
GATCATATGACAAACCCAAAAGATTTGGTGGTTGTTGGACGACCTAAGATGAGTCTAGAT
CTTGAGCTGAACCTTTCACCTTCTTATTCACCTTCAAAAACCACTACAAAGATAGATAAA
TCCTCAAATCACAACGTGACCGTGTCATCACCAAATGTAAAAAATTTGACAAGCCCGAGG
GAGAAGACCACGCTGTCTTGGCTTGCGTTTGACGGTGGTGATGATG***TTGATCACAAG
GAGCAAGAGATGGTACCAAAAGTGTGCATGAAATGCCACATGCTGGTCATGCTGTCCACA
TCAACTCCTGTTTGTCCCAACTGCAAGTTCATGCACCCACGTGATCACAGCTCTACAAAA
CTGTTTAAACCACCAAATTTGCTTTGGCTCCTATGCTAG*CTCTTCAGAGTTATGGGATA
TTAATGTTCGTAAG*AATAATATGAGCCGTAGAT*AGATAATGATGTATATTCTATGATT
CCGTGAAGATATATCCATCTCCTTGTC

QA 3 809 3 809
DS 



AS 1 3

CO CL1953Contig1 1468 3 25 U
ATACAAATCTTTGGAGATTTGAGGTTTGATTTGGTTACAGTTCCGATGCTTATACTGGAA
AGGCTCTTCGCATTCGCCTTATGGTGTAAGAAATCTTGTCCATACTTTTTTTCAGCACAA
GGACTTGCCTAGTTTGCATCAAAGCACACAGAAATGGGATGAAGCAAAAAGAAGACATGG
TCTGTTTACACACAAATACATGACTACATGTATACATTACCGATAGATTTATTGGCAATA
GCCTTCAACAGATTTTTATTCATAAAACGGATCTTGTGTCCATTAAAAGGTATATATATG
TTTTAAGTGTTCTTCCTCGCAGAGTAGGCACAGTAAGCCGCCACTCCAGCAAACGCAGCA
GCCGTCACTGAAGCAATAACAGCTGAGTTGTTACTATCCTTCAGTTTTGTAACCACACAG
TTTGATTCAAATCTCTTTCTATGACGTTCTATATCTGCAGCCGAAAGTTTGCCAACGATC
ATATGAGCTTTGTAGAAAATATCCTTAACATCATCATCATCACCCCAAGCATCTTCAAAC
TGACTGATCAAATCTTCAGTTACAAGCTCAACACCTCTTTCTTTGGCTTTCATAGCAGGC
TGCCAAGATCTCAAGAACCCTATAAACCCTTTAAGCGAAAGCTTATGAGGAATGTCAAGC
TGTATAGGCTTCCCTTCTGATCCCATCCCTATGCCTTCAAACGGAAACGGTATCGTTTTG
TAGCCGTCAAACGCAAGATTCATAACGGGAGTTCTATACGGAAACGTGGAGTCAACAAGA
CGTTTCATGATGGCATCGACTTCAGGGGAGATGATTAGGTCGTTGTAGACCCAAACAGCG
ATTAAACCTCCTTCTTTGCGAAGAACACGTTTGGCTATGTTGTAGAATGGTATGAGATCG
AAGTAGTGAACGGCTTGTGCAGCGACGACGAGGTCAACAGAGTTATCTCCGCCGACTAGA
GCGACCATTTTGTCTTCGGACATCTCTGTTGGAGTGTGATGGTAGCTGATCCGCTCGTGT
TTCACCGCTCGTTTCAGTTGTGCTTCGTTTATGTCTGTAGCCACAACTTTCTCGAAGTAC
TCTGCCAGACCAATGGCGGCTTGACCATTTCCAGTACCGACATCCCAAGCCAATTTGTGT
TGACCGGTTCGAGCAGCAAGCTTCGTGAACCAGTCGATCGGGTACCTTGGCCTTGCGTTC
TGGTAAGCATCCGCTAGTTTATCAGACAAAGCAGCCATTCTTTTTTTCTTCTTGATCTCT
CTGTATGTTTCTTGTTTTTGTTCTTGTCTTGGCTTATTACACTGATCTTTATACTGAAGA
ATGATGGAATGGAACAAGTCAAAGTTGAAAAAGTCAGATCTGGCGACGAGTCTTCCTACT
TCTTAACCCAAGAGTTGGTCTTTCTTCCATTTTCCAAATTATTTGAATTTCTTCTCTTTT
TTTTTAATTCTCGTCTGTGTATTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B431JQ U 1
AF RR2B996JQ U 84
AF RR2B996TF C 693
BS 1 111 RR2B431JQ
BS 112 112 RR2B996JQ
BS 113 116 RR2B431JQ
BS 117 117 RR2B996JQ
BS 118 122 RR2B431JQ
BS 123 123 RR2B996JQ
BS 124 199 RR2B431JQ
BS 200 200 RR2B996JQ
BS 201 218 RR2B431JQ
BS 219 219 RR2B996JQ
BS 220 440 RR2B431JQ
BS 441 441 RR2B996JQ
BS 442 722 RR2B431JQ
BS 723 723 RR2B996JQ
BS 724 734 RR2B431JQ
BS 735 735 RR2B996JQ
BS 736 746 RR2B431JQ
BS 747 747 RR2B996JQ
BS 748 773 RR2B431JQ
BS 774 774 RR2B996JQ
BS 775 801 RR2B431JQ
BS 802 886 RR2B996JQ
BS 887 887 RR2B996TF
BS 888 928 RR2B996JQ
BS 929 1468 RR2B996TF

RD RR2B431JQ 801 0 0
ATACAAATCTTTGGAGATTTGAGGTTTGATTTGGTTACAGTTCCGATGCTTATACTGGAA
AGGCTCTTCGCATTCGCCTTATGGTGTAAGAAATCTTGTCCATACTTTTTT*CAGCTCAA
GGGCTTGCCTAGTTTGCATCAAAGCACACAGAAATGGGATGAAGCAAAAAGAAGACATGG
TCTGTTTACACACAAATACGTGACTACATGTATACATTCCCGATAGATTTATTGGCAATA
GCCTTCAACAGATTTTTATTCATAAAACGGATCTTGTGTCCATTAAAAGGTATATATATG
TTTTAAGTGTTCTTCCTCGCAGAGTAGGCACAGTAAGCCGCCACTCCAGCAAACGCAGCA
GCCGTCACTGAAGCAATAACAGCTGAGTTGTTACTATCCTTCAGTTTTGTAACCACACAG
TTTGATTCAAATCTCTTTCTGTGACGTTCTATATCTGCAGCCGAAAGTTTGCCAACGATC
ATATGAGCTTTGTAGAAAATATCCTTAACATCATCATCATCACCCCAAGCATCTTCAAAC
TGACTGATCAAATCTTCAGTTACAAGCTCAACACCTCTTTCTTTGGCTTTCATAGCAGGC
TGCCAAGATCTCAAGAACCCTATAAACCCTTTAAGCGAAAGCTTATGAGGAATGTCAAGC
TGTATAGGCTTCCCTTCTGATCCCATCCCTATGCCTTCAAACGGAAACGGTATCGTTTTG
TAACCGTCAAACGCTAGATTCATAACTGGAGTTCTATACGGAAACGTGGAGTCGACAAGA
CGTTTCATGATGGCATCGACT

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2B996JQ 849 0 0
CG
GTAAGAAATCTTGTCCATACTTTTTTTCAGCACAAGGACTTGCCTAGTTTGCATCAAAGC
ACACAGAAATGGGATGAAGCAAAAAGAAGACATGGTCTGTTTACACACAAATACATGACT
ACATGTATACATTATGGATAGATTTATTGGCAATAGCCTTCAACAGATTTTTATTCATAA
AACGGTTCTTGT**CCATTAAAAGGTATATATATGTTTTAAGTGTTCTTCCTCGCAGAGT
AGGCACAGTAAGCCGCCACTCCAGCAAACGCAGCAGCCGTCACTGAAGCAATAACGGCTG
AGTTGTTACTATCCTTCAGTTTTGTAACCACACAGTTTGATTCAAATCTCTTTCTATGAC
GTTCTATATCTGCAGCCGAAAGTTTGCCAACGATCATATGAGCTTTGTAGAAAATATCCT
TAACATCATCATCATCACCCCAAGCATCTTCAAACTGACTGATCAAATCTTCAGTTACAA
GCTCAACACCTCTTTCTTTGGCTTTCATAGCAGGCTGCCAAGATCTCAAGAACCCTATAA
ACCCTTTAAGCGAAAGCTTATGAGGAATGTCAAGCTGTATAGGCTTCCCTTCTGATCCCA
TCCCTATGCTTTCAAACGGAAACGGTATCGTTTTGTAGCCGTCAAACGCAAGATTCATAA
CGGGAGTTCTATACGGAAACGTGGAGTCAACAAGACGTTTCATGATGGCATCGACTTCAG
GGGAGATGATTAGGTCGTTGTAGACCCAAACAGCGATTAAACCTCCTTCTTTGCGAAGAA
CACGTTTGGCTATGTTGTAGA*TGGTATGAGATCGAAGTAGTGAACGGCTTGTGCAGCGA
CGA
CGAG

QA 3 845 3 845
DS 

RD RR2B996TF 776 0 0
GCT
TTCAAACGGAAACGGTATCGTTT*GTAGCCGTCAAACGCAAGATTCATAACGGGAGTTCT
ATACGGAAACGTGGAGTCAACAAGACGTTTCATGATGGCATCGACTTCAGGGGAGATGAT
TAGGTCGTTGTAGACCCAAACAGCGATTAAACCTCCTTCTTTGCGAAGAACACGTTTGGC
TATGTTGTAGAATGGTATGAGATCGAAGTAGTGAACGGCTTGTGCAGCGACGACGAGGTC
AACAGAGTTATCTCCGCCGACTAGAGCGACCATTTTGTCTTCGGACATCTCTGTTGGAGT
GTGATGGTAGCTGATCCGCTCGTGTTTCACCGCTCGTTTCAGTTGTGCTTCGTTTATGTC
TGTAGCCACAACTTTCTCGAAGTACTCTGCCAGACCAATGGCGGCTTGACCATTTCCAGT
ACCGACATCCCAAGCCAATTTGTGTTGACCGGTTCGAGCAGCAAGCTTCGTGAACCAGTC
GATCGGGTACCTTGGCCTTGCGTTCTGGTAAGCATCCGCTAGTTTATCAGACAAAGCAGC
CATTCTTTTTTTCTTCTTGATCTCTCTGTATGTTTCTTGTTTTTGTTCTTGTCTTGGCTT
ATTACACTGATCTTTATACTGAAGAATGATGGAATGGAACAAGTCAAAGTTGAAAAAGTC
AGATCTGGCGACGAGTCTTCCTACTTCTTAACCCAAGAGTTGGTCTTTCTTCCATTTTCC
AAATTATTTGAATTTCTTCTCTTTTTTTTTAATTCTCGTCTGTGTATTGTTCC

QA 4 776 4 776
DS 



AS 1 4

CO CL1954Contig1 740 4 5 U
TCAAAGAATCACATCCATCTCTTTTGACAATTGAAACTAGTGAAAAATGGGGATAATCAG
AAAGAAACACGATAAAAAATCCCGAAGGCCGTCGTTTAAGAGTGTTTTAACCTCAGTACT
AGCTACACAAGCCGCAATATTCCTCTTATTGCTCGCCGGTGTATCCCTCGCTGGCACAGC
CGTCGCATTTATTGCCACCATGCCGCTATTCATAGTATTCAGTCCGATTCTCGTACCAGC
GGGTATTGCCACTGGTTTACTGGCTACGGGTTTAGCAGCCACCGGTAGCACCGGTGCAAT
GGCTGTCTCCCTCATCCTGTGGCTCTTCAAGCGAGCAACGGGCAAGGAGCCGCCAAAAAT
CATGACAAAAATCTTGAGAAAGGTGTTTCCGGGTGGAGGTACTAGTCATGCAGCTAAACT
GGCAGCAAAACCAGAAGCCGAGACAGCAGCCTCACCAGCGGCCGCACCAGCAGCCTCACC
AGCAGCCGCACCGAGTACATGAAAAGAACCGGTGGGTATAAGCAAAGGATGATAGATAAA
CAATCCAACTTTTAAAAATAAATAATAATTATTACGTGGGGATGGAAGTTAAATTTTCAG
ATATTATTATACTAACGGATATCGTGGTACAAAATAGCAACAAATGTAAGCATTTTTATT
GTATAACATTTTAAGAACGAAGCGATGTATCGTTGATGTTAACCCTATTCAAGTTCAACA
ATGTTATTCTGATTCAAGTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ45TF U 1
AF RR2F115TF U 1
AF RR2F115JQ C 105
AF RR2DZ45JQ C 374
BS 1 226 RR2DZ45TF
BS 227 227 RR2F115TF
BS 228 270 RR2DZ45TF
BS 271 731 RR2F115TF
BS 732 740 RR2DZ45JQ

RD RR2DZ45TF 270 0 0
TCAAAGAATCACATCCATCTCTTTTGACAATTGAAACTAGTGAAAAATGGGGATAATCAG
AAAGAAACACGATAAAAAATCCCGAAGGCCGTCGTTTAAGAGTGTTTTAACCTCAGTACT
AGCTACACAAGCCGCAATATTCCTCTTATTGCTCGCCGGTGTATCCCTCGCTGGCACAGC
CGTCGCATTTATTGCCACCATGCCGCTATTCATAGTATTCAGTCCGGTTCTCGTACCAGC
GGGTATTGCCACTGGTTTACTGGCTACGGG

QA 1 270 1 270
DS 

RD RR2F115TF 731 0 0
TCAAAGAATCACATCCATCTCTTTTGACAATTGAAACTAGTGAAAAATGGGGATAATCAG
AAAGAAACACGATAAAAAATCCCGAAGGCCGTCGTTTAAGAGTGTTTTAACCTCAGTACT
AGCTACACAAGCCGCAATATTCCTCTTATTGCTCGCCGGTGTATCCCTCGCTGGCACAGC
CGTCGCATTTATTGCCACCATGCCGCTATTCATAGTATTCAGTCCGATTCTCGTACCAGC
GGGTATTGCCACTGGTTTACTGGCTACGGGTTTAGCAGCCACCGGTAGCACCGGTGCAAT
GGCTGTCTCCCTCATCCTGTGGCTCTTCAAGCGAGCAACGGGCAAGGAGCCGCCAAAAAT
CATGACAAAAATCTTGAGAAAGGTGTTTCCGGGTGGAGGTACTAGTCATGCAGCTAAACT
GGCAGCAAAACCAGAAGCCGAGACAGCAGCCTCACCAGCGGCCGCACCAGCAGCCTCACC
AGCAGCCGCACCGAGTACATGAAAAGAACCGGTGGGTATAAGCAAAGGATGATAGATAAA
CAATCCAACTTTTAAAAATAAATAATAATTATTACGTGGGGATGGAAGTTAAATTTTCAG
ATATTATTATACTAACGGATATCGTGGTACAAAATAGCAACAAATGTAAGCATTTTTATT
GTATAACATTTTAAGAACGAAGCGATGTATCGTTGATGTTAACCCTATTCAAGTTCAACA
ATGTTATTCTG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2F115JQ 627 0 0
TTTTAACCTCAGTACTAGCTACACAAGCCGCAATATTCCTCTTATTGCTCGCCGGTGTAT
CCCTCGCTGGCACAGCCGTCGCATTTATTGCCACCATGCCGCTATTCATAGTATTCAGTC
CGATTCTCGTACCAGCGGGTATTGCCACTGGTTTACTGGCTACGGGTTTAGCAGCCACCG
GTAGCACCGGTGCAATGGCTGTCTCCCTCATCCTGTGGCTCTTCAAGCGAGCAACGGGCA
AGGAGCCGCCAAAAATCATGACAAAAATCTTGAGAAAGGTGTTTCCGGGTGGAGGTACTA
GTCATGCAGCTAAACTGGCAGCAAAACCAGAAGCCGAGACAGCAGCCTCACCAGCGGCCG
CACCAGCAGCCTCACCAGCAGCCGCACCGAGTACATGAAAAGAACCGGTGGGTATAAGCA
AAGGATGATAGATAAACAATCCAACTTTTAAAAATAAATAATAATTATTACGTGGGGATG
GAAGTTAAATTTTCAGATATTATTATACTAACGGATATCGTGGTACAAAATAGCAACAAA
TGTAAGCATTTTTATTGTATAACATTTTAAGAACGAAGCGATGTATCGTTGATGTTAACC
CTATTCAAGTTCAACAATGTTATTCTG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2DZ45JQ 367 0 0
TTGAGAAAGGTGTTTCCGGGTGGAGGTACTAGTCATGCAGCTAAACTGGCAGCAAAACCA
GAAGTCGAGACAGCAGCCTCACCAGCGGCCGCACCAGCAGCCTCACCAGCAGCCGCACCG
AGTACATGAAAAGAACCGGTGGGTATAAGCAAAGGATGATAGATAAACAATCCAACTTTT
AAAAATAAATAATAATTATTACGTGGGGATGGAAGTTAAATTTTCAGATATTATTATACT
AACGGATATCGTGGTACAAAATAGTAACAAATGTAAGCATTTTTATTGTATAACATTTTA
AGAACGAAGCGATGTATCGTTGATGTTAACCCTATTCAAGTTCAACAATGTTATTCTGAT
TCAAGTT

QA 1 367 1 367
DS 



AS 1 2

CO CL1955Contig1 420 2 4 U
CAAAAAAAACATTATATTAAAATCAGTCATGAAATCACAACCATAAAATATAACTCAGTA
AAAAAATATATATGAAATGTGAAAAAAACAATTAATTAAAAAAGGTCGAAATGTATGTTG
TAAATACAATAACGGCAAAAAGTGTCAGTGTTGAAACTAGGAGCTGGTTGGTGCCCGAAC
TTGAGGGAAATGGTGCCGTCATTTCAGGTGACTCTGGTAAAAATGTCGGTGACCCGTCTG
ATGTTGGCGATGTTGGTGACTCGTCTGATGTTGGCGATGTTGGTGACTCGTCTGATTTTG
GCGATGTGGGTGACCCGTCTGATGTTGGCGATGTTGGTGACTGGTCTGATTTTGGCGATG
ATGTTGGTGACTCCTCTGAAAATGGGGAAGTCATAGGTGTTCCAGCTGATGGCGAAACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK05JQ U 1
AF RR2GD14JQ U 132
BS 1 373 RR2GK05JQ
BS 374 374 RR2GD14JQ
BS 375 395 RR2GK05JQ
BS 396 420 RR2GD14JQ

RD RR2GK05JQ 395 0 0
CAAAAAAAACATTATATTAAAATCAGTCATGAAATCACAACCATAAAATATAACTCAGTA
AAAAAATATATATGAAATGTGAAAAAAACAATTAATTAAAAAAGGTCGAAATGTATGTTG
TAAATACAATAACGGCAAAAAGTGTCAGTGTTGAAACTAGGAGCTGGTTGGTGCCCGAAC
TTGAGGGAAATGGTGCCGTCATTTCAGGTGACTCTGGTAAAAATGTCGGTGACCCGTCTG
ATGTTGGCGATGTTGGTGACTCGTCTGATGTTGGCGATGTTGGTGACTCGTCTGATTTTG
GCGATGTGGGTGACCCGTCTGATGTTGGCGATGTTGGTGACTGGTCTGATTTTGGCGATG
ATGTTGGTGACTCGTCTGAAAATGGGGAAGTCATA

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR2GD14JQ 289 0 0
ACGGCAAAAAGTGTCAGTGTTGAAACTAGGAGCTGGTTGGTGCCCGAACTTGAGGGAAAT
GGTGCCGTCATTTCAGGTGACTCTGGTAAAGATGTCGGTGACCCGTCTGGTGTTGGCGAT
GTTGGTGACTCGTCTGATGTTGGCGATGTTGGTGACTCGTCTGATTTTGGCGATGTGGGT
GACCCGTCTGATGTTGGCGATGTTGGTGACTGGTCTGATTTTGGCGATGATGTTGGTGAC
TCCTCTGAAAATGGTGAAGTCATAGGTGTTCCAGCTGATGGCGAAACAG

QA 1 289 1 289
DS 



AS 1 4

CO CL1956Contig1 636 4 14 U
GGAAAACAATTAGTACTTCTCCTCTTTCTGGTTCTCGCGCTCTGCAAACTCCTCCGTCGA
TTTCAGCTGAGAGAGATGTCGGCATACGACAATGTTATTGGTGGGAAGCTGAAGCTAAAA
GGGAAGGCTCTAGATGTGAAAGCAGGTGGAGTCAAGAAGAAGAAGAAACAGAAGAAACAC
GAAGAGCAAGCTCTCAAAATTACCGAACATGAACTCATAGAAGGAGAAAACACCGAAGCT
TTGGGCAAAATGATTGAAGAAGGAGAAGAAGATGAAGCCGGTATGAGTGAATTGGCGAAA
TACAACGATGATCAGTTAACGCCTGCGGAAAGAAGGTACATAGAGCAGAAGCAGAGACTT
GATGTGCATAAACTAGCCAAGGAAGCGAACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGAGGATTTC
AATCAGTACCTGGCTAACATGAGTGAGCACTACGATATCCCTAAAGTCGGACCTGGCTAA
TATTATTCTTCATTGGCTTTCTTCAACTCTACTGATCGATTTGTCATTGTTAAATAACTT
ATGTTGGATCTATGTTGTGTTATTCCCTTAAAACATTTCAGTTATGTGATCTCGACTCTC
TTTATGACAAAAAAAAACGCATTGGAATCTTGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CA42TF U 46
AF RR2CA42JQ C 7
AF RR2B951JQ C 1
AF RR2B951TF U 1
BS 1 6 RR2B951JQ
BS 7 45 RR2B951TF
BS 46 54 RR2CA42TF
BS 55 55 RR2B951TF
BS 56 129 RR2CA42TF
BS 130 130 RR2B951TF
BS 131 203 RR2CA42TF
BS 204 204 RR2B951TF
BS 205 245 RR2CA42TF
BS 246 246 RR2B951TF
BS 247 249 RR2CA42TF
BS 250 250 RR2B951TF
BS 251 263 RR2CA42TF
BS 264 636 RR2B951TF

RD RR2CA42TF 218 0 0
AAACTCCTCTGTCGATTTCAGCTGAGAGAGATGTCGGCATACGACAATGTTATTGGTGGG
AAGCTGAAGCTAAAAGGGAAGGCTTTAGATGTGAAAGCAGGTGGAGTCAAGAAGAAGAAG
AAACAGAAGAAACACGAAGAGCAAGCTCTCAAAATTACTGAACATGAACTCATAGAAGGA
GAAAACACCGAAGCTTTGGGTAAATTGATTGAAGAAGG

QA 1 218 1 218
DS 

RD RR2CA42JQ 438 0 0
CAATTAGTACTTCTCCTCTTTCTGGTTCTCGCGCTCTGCAAACTCCTCTGTCGATTTCAG
CTGAGAGAGATGTCGGCATACGACAATGTTATTGGTGGGAAGCTGAAGCTAAAAGGGAAG
GCTTTAGATGTGAAAGCAGGTGGAGTCAAGAAGAAGAAGAAACAGAAGAAACACGAAGAG
CAAGCTCTCAAAATTACTGAACATGAACTCATAGAAGGAGAAAACACCGAAGCTTTGGGT
AAATTGATTGAAGAAGGAGAAGAAGATGAAGCGGGTATGAGTGAATTGGCGAAATACAAC
GATGATCAGTTAACGCCTGCAGAAAGAAGGTACATAGAGCAGAAGCAGAGACTTGATGTG
CAGAAACTAGCCAAGGAAGCAAACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGAGGATTTCAATCAG
TATCTTGCTAACATGAGT

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR2B951JQ 636 0 0
GGAAAACAATTAGTACTTCTCCTCTTTCTGGTTCTCGCGCTCTGCAAACTCCTCCGTCGA
TTTCAGCTGAGAGAGATGTCGGCATACGACAATGTTATTGGTGGGAAGCTGAATCTAAAA
GGGAAGGCTCTAGATGTGAAAGCAGGTGGAGTCAAGAAGAAGAAGAAACAGAAGAAACAC
GAAGAGCAAGCTCTCAAAATTACCGAACATGAACTCATAGAAGGAGAAAACACCGAAGCT
TTGGGCAAAATGATTGAAGAAGGAGAAGAAGATGAAGCCGGTATGAGTGAATTGGCGAAA
TACAACGATGATCAGTTAACGCCTGCGGAAAGAAGGTACATAGAGCAGAAGCAGAGACTT
GATGTGCATAAACTAGCCAAGGAAGCGAACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGAGGATTTC
AATCAGTACCTGGCTAACATGAGTGAGCACTACGATATCCCTAAAGTCGGACCTGGCTAA
TATTATTCTTCATTGGCTTTCTTCAACTCTACTGATCGATTTGTCATTGTTAAATAACTT
ATGTTGGATCTATGTTGTGTTATTCCCTTAAAACATTTCAGTTATGTGATCTCGACTCTC
TTTATGACAAAAAAAAACGCATTGGAATCTTGTATC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2B951TF 636 0 0
GGAAAA
CAATTAGTACTTCTCCTCTTTCTGGTTCTCGCGCTCTGCAAACTCCTCCGTCGATTTCAG
CTGAGAGAGATGTCGGCATACGACAATGTTATTGGTGGGAAGCTGAATCTAAAAGGGAAG
GCTCTAGATGTGAAAGCAGGTGGAGTCAAGAAGAAGAAGAAACAGAAGAAACACGAAGAG
CAAGCTCTCAAAATTACCGAACATGAACTCATAGAAGGAGAAAACACCGAAGCTTTGGGC
AAAATGATTGAAGAAGGAGAAGAAGATGAAGCCGGTATGAGTGAATTGGCGAAATACAAC
GATGATCAGTTAACGCCTGCGGAAAGAAGGTACATAGAGCAGAAGCAGAGACTTGATGTG
CATAAACTAGCCAAGGAAGCGAACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGAGGATTTCAATCAG
TACCTGGCTAACATGAGTGAGCACTACGATATCCCTAAAGTCGGACCTGGCTAATATTAT
TCTTCATTGGCTTTCTTCAACTCTACTGATCGATTTGTCATTGTTAAATAACTTATGTTG
GATCTATGTTGTGTTATTCCCTTAAAACATTTCAGTTATGTGATCTCGACTCTCTTTATG
ACAAAAAAAAACGCATTGGAATCTTGTATC

QA 7 636 7 636
DS 



AS 1 3

CO CL1957Contig1 1402 3 7 U
CATATTTTAACTCCTTTCAATGAAACACAACAACATTTGTTTAAACTTTCCTTACACAAG
CAAACACAAACAGAAGCTCATCCCATTGTTTCTGGCTCTGTTGTTTACTCTCACTTTCTC
TCTATATATATTCTTCTACATAAAATCTTATGTTTCAAAGGAGTTATCAAATCTCTCACA
ACACACAGAGACAAACTCACATTAGAGACACAACAAGAACTGAAAGTCGTGCGCTTATTC
CCCGGAGCCTCTTCACCCTTTTGCTAAGACGCACACACTCCTCACTTAGTAAACCATACA
TGACTCTTAACTAAATCCCACAAGCTTACGCTCTTACGGTACTATGCATATATATAGATA
TAGATTTCAGACAGAACGCCACGCCGCCACTTAGCAACGTGGTAATGAAAGGTTGATCGG
CTTTATGGAGAACCAGCTTGTTCGCAGAGATCTAGCAAATCCAATGTCTCGGGAACAGAG
AGCTCAAGGCGGAATTTGGAACCATCGTAGTGGTGAAGAACAGGCCTGAAGGAATCCTCT
TCCAAGGCTTTGCAGATCTTCCTCACTCTGATCCTCACCTGCGCGGGAAATCTTGACTCT
CCTCTGCACTTTTTGTCTTCCCAAGCAGTCGCATCTATATTAGTACCTCCAAAAGTTGTT
GCCTCAAAGATACCATGGAGCTGGTGAGTGGTGTAATTGTAAAGAAACAGAGGCAATCCG
GG*TGTTATTGCCCTCACAGAGTCCCTGTATCTTGGAGGTAACCCAAAGAGGTGACGCTT
CAAATCCTCCTCCATGGTATCGTTGTTACAAACAAAGATGTACCCGCCAAGAACTTCGTT
CCTCGGAAGCGTCTCCGACGCAGGCAGAGTCTTAAACCTCTTGTCAACAGCATTATCATT
GCTATTGTTGTGTTTGCTCAGCTCTTTGTTAGCAACAACAACATTACCATTATACTTGTT
AACCTTCGCGTTGCCTCCTCCACTTTTGAAGAAATCATTCTTCTGGAAAACAACAGCATG
CATGTTGTTGTAAACATTGCTGTTGTTAAACATGTTGAAGTTGTTGTTGTTGTCGTGGAA
ACCAAGCTTGTCGGATGGTCTGAACTCAGAGTAGCCAGCTTTGGAGAGATCGAGGTTGTT
CAACCCTTCGCTTTTCATCCTCGTCTGCTCAGCGAGCTTGGTTGCAACAGTGGACCATTT
GTGATCCTCTGATGCTCTTGACTGAGTCTGGCCTCTAAGCTCATCACCCAATTGCCAGAA
GCTGTCCATATCTCAAAAGGAACTTTATAGGCTCTTCTGCTTCCACGAAATGCGCCGGAC
GTGACGATGAGACACCGGAGAAGAAAGCGCGTCAGAGAGATTGGTAGATTATAGAAATGG
TCACTGAGTCTCTCTCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH63JQ U 1
AF RR2BO59JQ U 9
AF RR2BO59TF C 702
BS 1 81 RR2EH63JQ
BS 82 83 RR2BO59JQ
BS 84 722 RR2EH63JQ
BS 723 723 RR2BO59JQ
BS 724 738 RR2EH63JQ
BS 739 807 RR2BO59JQ
BS 808 1402 RR2BO59TF

RD RR2EH63JQ 738 0 0
CATATTTTAACTCCTTTCAATGAAACACAACAACATTTGTTTAAACTTTCCTTACACAAG
CAAACACAAACAGAAGCTCATTTCATTGTTTCTGGCTCTGTTGTTTACTCTCACTTTCTC
TCTATATATATTCTTCTACATAAAATCTTATGTTTCAAAGGAGTTATCAAATCTCTCACA
ACACACAGAGACAAACTCACATTAGAGACACAACAAGAACTGAAAGTCGTGCGCTTATTC
CCCGGAGCCTCTTCACCCTTTTGCTAAGACGCACACACTCCTCACTTAGTAAACCATACA
TGACTCTTAACTAAATCCCACAAGCTTACGCTCTTACGGTACTATGCATATATATAGATA
TAGATTTCAGACAGAACGCCACGCCGCCACTTAGCAACGTGGTAATGAAAGGTTGATCGG
CTTTATGGAGAACCAGCTTGTTCGCAGAGATCTAGCAAATCCAATGTCTCGGGAACAGAG
AGCTCAAGGCGGAATTTGGAACCATCGTAGTGGTGAAGAACAGGCCTGAAGGAATCCTCT
TCCAAGGCTTTGCAGATCTTCCTCACTCTGATCCTCACCTGCGCGGGAAATCTTGACTCT
CCTCTGCACTTTTTGTCTTCCCAAGCAGTCGCATCTATATTAGTACCTCCAAAAGTTGTT
GCCTCAAAGATACCATGGAGCTGGTGAGTGGTGTAATTGTAAAGAAACAGAGGCAATCCG
GGGTGTTATTGCCCTCAC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2BO59JQ 799 0 0
AACTCCTTTCAATGAAACACAACAACATTTGTTTAAACTTTCCTTACACAAGCAAACACA
AACAGAAGCTCATCCCATTGTTTCTGGCTCTGTTGTTTACTCTCACTTTCTCTCTATATA
TATTCTTCTACATAAAATCTTATGTTTCAAAGGAGTTATCAAATCTCTCACAACACACAG
AGACAAACTCACATTAGAGACACAGCAAGAACTGAGAGTCGTGCGCTTATTCCCCGGAGC
CTCTTCACCCTTTTGCTAAGACGCACACACTCCTCACTTAGTAAACCATACATGACTCTT
AACTAAATCCCACAAGCTTACGCTCTTACGGTACTATGCATATATATAGATATAGATTTC
AGACAGAACGCCACGCCGCCACTTAGCAACGTGGTAATGAAAGGTTGATCGGCTTTATGG
AGAACCAGCTTGTTCGCAGAGATCTAGCAGATCCAATGTCTCGGGAACAGAGAGCTCAAG
GCGGAATTTGGAACCATCGTAGTGGTGAAGAACAGGCCTGAAGGAATCCTCTTCCAAGGC
TTTGCAGATCTTCCTCACTCTGATCCTCACCTGCGCGGGAAATCTTGACTCTCCTTTGCA
CTTTTTGTCTTCCCAAGCAGTCGCATCTATATTAGTACCTCCAAAAGTTGTTGCCTCAAA
GATACCATGGAGCTGGTGAGTGGTGTAATTGTAAAGAAACAGAGGCAATCCGGG*TGTTA
TTGCCCTCACAGAGTCCCTGTATCTTGGAGGTAACCCAAAGAGGTGACGCTTCAAATCCT
CCTCCATGGTATCGTTGTT

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2BO59TF 701 0 0
AAGAAACAGAGGCAATCCGGG*TGT*ATTGCCCTCACAGAGTCCCTGTATCTTGGAGGTA
ACCCAAAGAGGTGACGCTTCAAATCCTCCTCCATGGTATCGTTGTTACAAACAAAGATGT
ACCCGCCAAGAACTTCGTTCCTCGGAAGCGTCTCCGACGCAGGCAGAGTCTTAAACCTCT
TGTCAACAGCATTATCATTGCTATTGTTGTGTTTGCTCAGCTCTTTGTTAGCAACAACAA
CATTACCATTATACTTGTTAACCTTCGCGTTGCCTCCTCCACTTTTGAAGAAATCATTCT
TCTGGAAAACAACAGCATGCATGTTGTTGTAAACATTGCTGTTGTTAAACATGTTGAAGT
TGTTGTTGTTGTCGTGGAAACCAAGCTTGTCGGATGGTCTGAACTCAGAGTAGCCAGCTT
TGGAGAGATCGAGGTTGTTCAACCCTTCGCTTTTCATCCTCGTCTGCTCAGCGAGCTTGG
TTGCAACAGTGGACCATTTGTGATCCTCTGATGCTCTTGACTGAGTCTGGCCTCTAAGCT
CATCACCCAATTGCCAGAAGCTGTCCATATCTCAAAAGGAACTTTATAGGCTCTTCTGCT
TCCACGAAATGCGCCGGACGTGACGATGAGACACCGGAGAAGAAAGCGCGTCAGAGAGAT
TGGTAGATTATAGAAATGGTCACTGAGTCTCTCTCTCTCCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 4

CO CL1958Contig1 1163 4 16 U
AAGAGTTCGCCCTAATATTTTCTCCCTGTCCCGATAATCGAGGAGCCGCCTCAACGTTTT
CTTCCCGACGCCGGTAGAGCCAAGGCTCGCCGGCGTCGGGCACTTCGATCTCCACACTGT
CCTCTCCATTCTCCTGTCCGCTCAAGTTCAAGATCTCGTTCTCCGTTCACCACTTGTGTT
ACCTTTCCTTGGTCGAAGATGTCTTCGATTTCATGTTTTCCCGGGGGTTCTCGGTTACAT
CTCGCCTCTTCTGCTCAGCGACGTCAAAGTCATACCTCTTCTTGTCCGGTTCTGTTAGGA
ATCAGATCTGTAAGGCTCACTCTCCCGCTCCTCCGTACAACGTATTCCTGGCTAGGAAAC
CTCTTCCGACATCCGCCTTTCATACCACCGCAAGTCCAACTTCAAGCCTCAGTTTTCAAC
GTTTGTAAATCTAGGGTTCGTGGGGTTCCACATTTAACTCAGGTTATAGATCTGAAAACT
TGTCGTTTGTTTCGTTTGTGCTCGCCTTTTGTCTCCTTCATCTCCATGGTCGCCGGCCCT
CCTACGCCGCTTGCCCCTCCATCATCATCACCTTCGTCATGCCGTTTGAACGGCGCCTCC
TCCTTCAGATTTTTCCACAGAAGAACGATGTGTCCTTTTGCTCATGATATGGGCTACGTT
CATGTTGTAGTGGGCTTGACAAGCCCAATAAGGATCCAAGGTATTCCAAAGTTTCGTCCC
TCTTGTTCGAAGAGTAGTCAATCCCTCCATTTACCGATGGATTCATCGGGACCATCATTA
TCATCCTCTGCCTCTTTTTTAAAGAGTGCACTCCCTCCATTTTTGTGGAGGTGTTTTTCC
ATATCTATAACCATCTTGCTATCTTGTGGAGCGGTCTGTTCGGGGCCTGAAGATGCAGCG
GAATTCGTTTCGACGAGTTTCCGAGGTGCGGATTGGATGTCAACGTCACAATTTAAAGTG
ACTATCTCTCTGCTGTCCGACCATGTCGTGAAGGCTATATTGACGCATTCAAACCCCGTT
TTGAGTTCGCTATCATCATCTTCTTTTGAAGATCTATCTTTTTTATCTTATGATGTTGTA
GTTTTTGCATTCAATCAAAGAGGATGGACAATTCCCTCTATCATTTGTAACCAATGTTGA
AGTAATGGAAAAAGTTGTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2D661TF U 1
AF RR2D616TF U 8
AF RR2D616JQ C 433
AF RR2D661JQ C 522
BS 1 113 RR2D661TF
BS 114 114 RR2D616TF
BS 115 533 RR2D661TF
BS 534 534 RR2D616TF
BS 535 681 RR2D661TF
BS 682 682 RR2D616JQ
BS 683 694 RR2D661TF
BS 695 705 RR2D616JQ
BS 706 706 RR2D661JQ
BS 707 751 RR2D616JQ
BS 752 752 RR2D661JQ
BS 753 967 RR2D616JQ
BS 968 968 RR2D661JQ
BS 969 1031 RR2D616JQ
BS 1032 1032 RR2D661JQ
BS 1033 1163 RR2D616JQ

RD RR2D661TF 694 0 0
AAGAGTTCGCCCTAATATTTTCTCCCTGTCCCGATAATCGAGGAGCCGCCTCAACGTTTT
CTTCCCGACGCCGGTAGAGCCAAGGCTCGCCGGCGTCGGGCACTTCGATCTCCGCACTGT
CCTCTCCATTCTCCTGTCCGCTCAAGTTCAAGATCTCGTTCTCCGTTCACCACTTGTGTT
ACCTTTCCTTGGTCGAAGATGTCTTCGATTTCATGTTTTCCCGGGGGTTCTCGGTTACAT
CTCGCCTCTTCTGCTCAGCGACGTCAAAGTCATACCTCTTCTTGTCCGGTTCTGTTAGGA
ATCAGATCTGTAAGGCTCACTCTCCCGCTCCTCCGTACAACGTATTCCTGGCTAGGAAAC
CTCTTCCGACATCCGCCTTTCATACCACCGCAAGTCCAACTTCAAGCCTCAGTTTTCAAC
GTTTGTAAATCTAGGGTTCGTGGGGTTCCACATTTAACTCAGGTTATAGATCTGAAAACT
TGTCGTTTGTTTCGTTTGTGCTCGCCTTTTGTCTCCTTCATCTCCATGGTCGCTGGCCCT
CCTACGCCGCTTGCCCCTCCATCATCATCACCTTCGTCATGCCGTTTGAACGGCGCCTCC
TCCTTCAGATTTTTCCACAGAAGAACGATGTGTCCTTTTGCTCATGATATGGGCTACGTT
CATGTTGTAGTGGGCTTGACA*GCCCAATAAGGA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2D616TF 671 0 0
CGCCCTAATATTTTCTCCCTGTCCCGATAATCGAGGAGCCGCCTCAACGTTTTCTTCCCG
ACGCCGGTAGAGCCAAGGCTCGCCGGCGTCGGGCGCTTCGATCTCCACACTGTCCTCTCC
ATTCTCCTGTCCGCTCAAGTTCAAGATCTCGTTCTCCGTTCACCACTTGTGTTACCTTTC
CTTGGTCGAAGATGTCTTCGATTTCATGTTTTCCCGGGGGTTCTCGGTTACATCTCGCCT
CTTCTGCTCAGCGACGTCAAAGTCATACCTCTTCTTGTCCGGTTCTGTTAGGAATCAGAT
CTGTAAGGCTCATTCTCCCGCTCCTCCGTACAACGTATTCCTGGCTAGGAAACCTCTTCC
GACATCCGCCTTTCATACCACCGCAAGTCCAACTTCAAGCCTCAGTTTTCAACGTTTGTA
AATCTAGGGTTCGTGGGGTTCCACATTTAACTCAGGTTATAGATCTGAAAACTTGTCGTT
TGTTTCGTTTGTGCTCGCCTTTTGTCTCCTTCATCTCCATGGTCGCCGGCCCTCCTACGC
CGCTTGCCCCTCCATCATCATCACCTTCGTCATGCCGTTTGAACGGCGCCTCCTCCTTCA
GATTTTTCCACAGAAGA*CGATGTGTCCTTTTGCTCATGATATGGGCTACGTTCATGTTG
TAGTGG
CTTGA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2D616JQ 731 0 0
AGGGTTCGTGGGGTTCCACATTTAACTCAGGTTATAGATCTGAAAACTTGTCGTTTGTTT
CGTTTGTGCTCGCCTTTTGTCTCCTTCATCTCCATGGTCGCCGGCCCTCTTACGCCGCTT
GCCCCTCCATCATCATCACTTTCGTCATGCCGTTTGAACGGCGCCTCCTCCTTCAGATTT
TTCCACAGAAGAACGATGTGTCCTTTTGCTCATGATATGGGCTACGTTCATGTTGTAGTG
GGCTTGACAAGCCCAATAAGGATCCAAGGTATTTCAAAGTTTCGTCCCTCTTGTTCGAAG
AGTAGTCAATCCCTCCATT*ACCGATGGATTCATCGGGACCATCATTATCATCCTCTGCC
TCTTTTTTAAAGAGTGCACTCCCTCCATTTTTGTGGAGGTGTTTTTCCATATCTATAACC
ATCTTGCTATCTTGTGGAGCGGTCTGTTCGGGGCCTGAAGATGCAGCGGAATTCGTTTCG
ACGAGTTTCCGAGGTGCGGATTGGATGTCAACGTCACAATTTAAAGTGACTATCTTTCTG
CTGTCCGACCATGTCGTGAAGGCTATATTGACGCATTCAAACCCCGTTTTGAGTTCGCTG
TCATCATCTTCTTTTGAAGATCTATCTTTTTTATCTTATGATGTTGTAGTTTTTGCATTC
AATCAAAGAGGATGGACAATTCCCTCTATCATTTGTAACCAATGTTGAAGTAATGGAAAA
AGTTGTGTTCC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2D661JQ 642 0 0
CTCCATGGTCGCTGGCCCTC*TACGCCGCTTGCCCCTCCATCATCATCACCTTCGTCATG
CCGTTTGAACGGCGCCTCCTCCTTCAGATTTTTCCACAGAAGAACGATGTGTCCTTTTGC
TCATGATATGGGCTACGTTCATGTTGTAGTGGGCTTGACAAGCCCAATAAGGATCCAAGG
TATTCCAAAGTTTCGTCCCTCTTGTTCGAAGAGTAGTCAATCCCTCCATTTACCGATGGA
TTCATCGGGACCATCATTATCATCCTCTGCCTCTTTTTTAAAGAGTGCACTCCCTCCATT
TTTGTGGAGGTGTTTTTCCATATCTATAACCATCTTGCTATCTTGTGGAGCGGTCTGTTC
GGGGCCTGAAGATGCAGCGGAATTCGTTTCGACGAGTTTCCGAGGTGCGGATTGGATGTC
AACGTCACAATTTAAAGTGACTATCTCTCTGCTGTCCGACCATGTCGTGAAGGCTATATT
GACGCATTCAAACCCCGTTTTGAGTTCGCTATCATCATCTTCTTTTGAAGATCTATCTTT
TTTATCTTATGATGTTGTAGTTTTTGCATTCAATCAAAGAGGATGGACAATTCCCTCTAT
CATTTGTAACCAATGTTGAAGTAATGGAAAAAGTTGTGTTCC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 4

CO CL1959Contig1 748 4 15 U
GCTCTGATGATCAAATCCGTTCCTTCAAATTTAAACTCTTTCTTTAAAATACACTTTGAT
TTTATATTTTGTTAGTTCTTTGTATAAACCATCATTATACTAACAAATTACATAAACACA
TACTTTTGAATTAATTATTTATCAGAGAACTCTGCCGCAACGGAGAAAATTATCCGGTAT
GGGAAATTCATCTCTCGTCGGAATATTCCTAGGATCTTCTTGTCCATCACCTTTAACCCT
AAAGTAAAGCTCTTCACCAAGATACCATTGCTCTGCTTTCTGTGATCTCACGTTCCACAT
CCCTTGATTATCCATCGCTATCAATATAGCCACCCACGAATACGGAAAAACCTGAATTGT
CGACCGAGAAACAGCGTCCACTAAGTTATATCCAGCTCTTTTGCTTTCGGACCAACCTCC
AAACCCCAGTCCGACGACCCAGAAGTTGTAACCGTCGATGTGCCAGCTCTGCGACTCATC
AAGAGGATTCTCAAAAACTATGTGGACGAAGTCTCTGTAACGAATATCGACCACTGATGT
CCCGAAACGCGGCGTTTTGTTGGAAGGATAAGTCGGGAACATGTCGGGGACGATCGTGTT
CTTTAGCTGGAAGTGATCAGCGAGCTTTAACGGTGTTTCGGGAAAGACAAACGAAACGCC
GTTAACTGTGTAACGTAGTCTGTTGGACGATGACATGACATCGTTTTGTAAGATTATCGT
TCTGCTCACGTTTACGCGTCCGTAGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2DW13JQ U 9
AF RR2AR36JQ U 1
AF RR2C383JQ U 9
AF RR2EQ57JQ U 46
BS 1 184 RR2AR36JQ
BS 185 185 RR2DW13JQ
BS 186 327 RR2AR36JQ
BS 328 328 RR2DW13JQ
BS 329 483 RR2AR36JQ
BS 484 484 RR2DW13JQ
BS 485 492 RR2AR36JQ
BS 493 493 RR2DW13JQ
BS 494 540 RR2AR36JQ
BS 541 541 RR2DW13JQ
BS 542 648 RR2AR36JQ
BS 649 649 RR2C383JQ
BS 650 734 RR2AR36JQ
BS 735 747 RR2C383JQ
BS 748 748 RR2EQ57JQ

RD RR2DW13JQ 698 0 0
GATCAAATCCATTCCTTCGAATTTAAACTCTTTCTTTAAAATACACTTTGATTTTATATT
TTGTTAGTTCTTTGTATAAGCCATCATTATACTAACAAACTACATAAGCACGTACTTTTG
AATTAATTATTTATCAGAGAACTCTGCCGCAACGGAGAAAATTATCCGGTATGGGAAATT
CATCTCTCGTCGGAATATTCCTAGGATCTTCTTGTCCATCACCTTTAACCCTAAAGTAAA
GCTCTTCACCAAGATACCATTGTTCTGCTTTCTGTGATCTTACGTTCCACATCCCTTGAT
TATCCATCGCTATCAATATAGCCACCCACGAATAGGGAAAAACCTGAATTGTCGACCGTG
AAACAGCGTCCACTAAGTTATATCCAGCTCTTTTGCTTTCGGACCAACCTCCAAACCCCA
GTCCGACGACCCAGAAGTTGTAACCGTCGATGTGCCAGCTCTGCGATTCATCAAGAGGAT
TCTCAAAAACTATGTGGATGAAGTCTCTGTAACGAATATCGACCACTGATGTCCCGAAAC
GCGGCGTTTTGTTGGAAGGATAAGTCGGGAACATGTCGGGGACGATCGTGTTCTTTAGCT
GGAAGTGATCAGCGAGCTTTAACGGTGTTTCGGGGAAGACAAACGAAACGCCGTTAACTG
TGTAACGTAGTCTGTTGGACGATGACATGACGTCGTTT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2AR36JQ 734 0 0
GCTCTGATGATCAAATCCGTTCCTTCAAATTTAAACTCTTTCTTTAAAATACACTTTGAT
TTTATATTTTGTTAGTTCTTTGTATAAACCATCATTATACTAACAAATTACATAAACACA
TACTTTTGAATTAATTATTTATCAGAGAACTCTGCCGCAACGGAGAAAATTATCCGGTAT
GGGATATTCATCTCTCGTCGGAATATTCCTAGGATCTTCTTGTCCATCACCTTTAACCCT
AAAGTAAAGCTCTTCACCAAGATACCATTGCTCTGCTTTCTGTGATCTCACGTTCCACAT
CCCTTGATTATCCATCGCTATCAATATCGCCACCCACGAATACGGAAAAACCTGAATTGT
CGACCGAGAAACAGCGTCCACTAAGTTATATCCAGCTCTTTTGCTTTCGGACCAACCTCC
AAACCCCAGTCCGACGACCCAGAAGTTGTAACCGTCGATGTGCCAGCTCTGCGACTCATC
AAGTGGATTCTCGAAAACTATGTGGACGAAGTCTCTGTAACGAATATCGACCACTGATGT
TCCGAAACGCGGCGTTTTGTTGGAAGGATAAGTCGGGAACATGTCGGGGACGATCGTGTT
CTTTAGCTGGAAGTGATCAGCGAGCTTTAACGGTGTTTCGGGAAAGACGAACGAAACGCC
GTTAACTGTGTAACGTAGTCTGTTGGACGATGACATGACATCGTTTTGTAAGATTATCGT
TCTGCTCACGTTTA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2C383JQ 739 0 0
GATCAAATCCGTTCCTTCAAATTTAAACTCTTTCTTTAAAATACACTTTGATTTTATATT
TTGTTAGTTCTTTGTATAAACCATCATTATACTAACAAATTACATAAACACATACTTTTG
AATTAATTATTTATCAGAGAACTCTGCCGCAACGGAGAAAATTATCCGGTATGGGATATT
CATCTCTCGTCGGAATATTCCTAGGATCTTCTTGTCCATCACCTTTAACCCTAAAGTAAA
GCTCTTCACCAAGATACCATTGCTCTGCTTTCTGTGATCTCACGTTCCACATCCCTTGAT
TATCCATCGCTATCAATATCGCCACCCACGAATACGGAAAAACCTGAATTGTCGACCGAG
AAACAGCGTCCACTAAGTTATATCCAGCTCTTTTGCTTTCGGACCAACCTCCAAACCCCA
GTCCGACGACCCAGAAGTTGTAACCGTCGATGTGCCAGCTCTGCGACTCATCAAGTGGAT
TCTCGAAAACTATGTGGACGAAGTCTCTGTAACGAATATCGACCACTGATGTTCCGAAAC
GCGGCGTTTTGTTGGAAGGATAAGTCGGGAACATGTCGGGGACGATCGTGTTCTTTAGCT
GGAAGTGATCAGCGAGCTTTAACGGTGTTTCGGGAAAGACAAACGAAACGCCGTTAACTG
TGTAACGTAGTCTGTTGGACGATGACATGACATCGTTTTGTAAGATTATCGTTCTGCTCA
CGTTTACGCGTCCGTAGTG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2EQ57JQ 703 0 0
AAAATACACTTTGATTTTATATTTTGTTAGTTCTTTGTATAAGCCATCATTATACTAACA
AATTACATAAGCACGTACTTTTGAATTAATTATTTATCAGAGAACTCTGCCGCAACGGAA
AAAATTATCCGGTATGGGAAATTCATCTCTCGTCGGAATATTCCTA**ATCTTCTTGTCC
ATCGCCTTTAACCCTAAGGTAAAGCTCTTCACCAAGATACCATTGTTCTGCTTTCTGTGA
TCTTACGTTCCACATCCCTTGATTATCCATCGCTATCAATATAGCCACCCACGAATAGGG
AAAAACCTGAATTGTCGACCGTGAAACAGCGTCCACTAAGTTATATCCAGCTCTTTTGCT
TTCGGACCAACCTCCAAACCCCAGTCCGACGACCCAGAAGTTGTAACCGTCGATGTGCCA
GCTCTGCGATTCATCAAGAGGATTCTCAAAAACTATGTGGATGAAGTCTCTGTAACGAAT
ATCGACCACTGATGTCCCGAAACGCGGCGTTTTGTTGGAAGGATAAGTCGGGAACATGTC
GGGGACGATCGTGTTCTTTAGCTGGAAGTGATCAGCGAGCTTTAACGGTGTTTCGGGGAA
GACAAACGAAACGCCGTTAACTGTGTAACGTAGTCTGTTGGACGATGACATGACGTCGTT
TTGTAAGATTATCGTTCTGGTCACGTTTACGCGTCCGTAGTGG

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 3

CO CL1960Contig1 835 3 4 U
GGGGTCCTCTTTTCTCTCAATCGATCGCGTAAGTGAAGACGAAGAAGAAATGCAGGCGGT
TTCAAGGAGATTAATCCAGCGGCCTCTCTCCGGAGGAGCTTCTATCTATTCATCATCATC
TTCTCTCAGATCGCTCCATGGAGTCTCAGATCGCCTTAATGGAAGCGATAATCGTCGGTA
CTCGTCTTCCCTGGCTACTAAGGGAGTTGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAG
ATCTTCCGTCAGTGGCATTGTAGCTACGGTGTTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTA
TCTTGTGCAGCAACTTGCTAAAATGGGATCGCAAGTGCTAGTTCCTTTCCGAGGCTCTGA
GGACAATCCTCGCCATCTCAAGTTGATGGGAGATTTAGGACAGGTAGTACCGATGAAATT
TGACCCAAGAGATGAAGACTCAATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTCGTTATCAA
TCTCATTGGAAGAGAGTACGAGACCAGAAATTTCAGTTTCGAAGAGGTGAATCATCACAT
GGCCGAGAAACTTGCATTGGTGGCCAAGGAACATGGTGGAATAATGAGATTTATTCAAGT
TTCTTGTCTGGGAGCTTCTGTATCATCTCCTTCAAGAATGCAGAGGGCAAAGGCTGCTGC
TGAGGAAGCTGTCTTGAGCGCCCTTCCTGAGCGACAGTCATGAGACCTGCGACCATGATT
GGTACAGAGGACAGAATCTTGAACCCTGGGCATGTTCGTAAGAATATGGTTTCCTCCCGC
TCATAGTGGTGGGACAACAATTCAGCCCGTATATGTGGTTGATGTGCTGCTGCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C370TF U 148
AF RR2AU50TF U 1
AF RR2E025TF U 18
BS 1 653 RR2AU50TF
BS 654 654 RR2E025TF
BS 655 746 RR2AU50TF
BS 747 835 RR2E025TF

RD RR2C370TF 230 0 0
AGATCGCCTTAATGGAAGCGATAATCGTCGGTACTCGTCTTCCCTGGCTACTGAGGGA*T
TGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCTTCCGTCAGTGGCATTGTAGCTAC
GGTGTTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGG*CGTTATCTTGTGCAGCAACTTGCTAAAATGGG
ATCGCAAGTGCTA*TTCCTTTCCGAGGCTCTGAGGACA*TCCTCGCCATC

QA 1 230 1 230
DS 

RD RR2AU50TF 763 0 0
GGGGTCCTCTTTTCTCTCAATCGATCGCGTAAGTGAAGACGAAGAAGAAATGCAGGCGGT
TTCAAGGAGATTAATCCAGCGGCCTCTCTCCGGAGGAGCTTCTATCTATTCATCATCATC
TTCTCTCAGATCGCTCCATGGAGTCTCAGATCGCCTTAATGGAAGCGATAATCGTCGGTA
CTCGTCTTCCCTGGCTACTAAGGGAGTTGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAG
ATCTTCCGTCAGTGGCATTGTAGCTACGGTGTTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTA
TCTTGTGCAGCAACTTGCTAAAATGGGATCGCAAGTGCTAGTTCCTTTCCGAGGCTCTGA
GGACAATCCTCGCCATCTCAAGTTGATGGGAGATTTAGGACAGGTAGTACCGATGAAATT
TGACCCAAGAGATGAAGACTCAATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTCGTTATCAA
TCTCATTGGAAGAGAGTACGAGACCAGAAATTTCAGTTTCGAAGAGGTGAATCATCACAT
GGCCGAGAAACTTGCATTGGTGGCCAAGGAACATGGTGGAATAATGAGATTTATTCAAGT
TTCTTGTCTGGGAGCTTCTGTATCATCTCCTTCAAGAATGCAGAGGGCAAAGGTTGCTGC
TGAGGAAGCTGTCTTGAGCGCCCTTCCTGAGCGACAGTCATGAGACCTGCGACCATGATT
GGTACAGAGGACAGAATCTTGAACCC
CTGGGCAATGTTCGTTA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2E025TF 818 0 0
GG
ATCGATCGTGTAAGTGAAGACGAAGAAGAAATGCAGGCGGTTTCAAGGAGATTAATCCAG
CGGCCTCTCTCCGGAGGAGCTTCTGTCTATTCATCATCATCTTCTCTCAGATCGCTCCAT
GGAGTCTCAGATCGCCTTAATGGAAGCGATAATCGTCGGTACTCGTCTTCCCTGGCTACT
AAGGGAGTTGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCTTCCGTCAGTGGCATT
GTAGCTACGGTGTTTGGAGCCACTGGGTCTCTTGGTCGTTATCTTGTGCAGCAACTTGCT
AAAATGGGATCGCAAGTGCTAGTTCCTTTCCGAGGCTCTGAGGACAATCCTCGCCATCTC
AAGTTGATGGGAGATTTAGGACAGGTAGTACCGATGAAATTTGACCCAAGAGATGAAGAC
TCAATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTCGTTATCAATCTCATTGGAAGAGAGTAC
GAGACCAGAAATTTCAGTTTCGAAGAGGTGAATCATCACATGGCCGAGAAACTTGCATTG
GTGGCCAAGGAACATGGTGGAATAATGAGATTTATTCAAGTTTCTTGTCTGGGAGCTTCT
GTATCATCTCCTTCAAGAATGCAGAGGGCAAAGGCTGCTGCTGAGGAAGCTGTCTTGAGC
GCCCTTCCTGAGCGACAGTCATGAGACCTGCGACCATGATTGGTACAGAGGACAGAATCT
TGAACCCTGGGCATGTTCGTAAGAATATGGTTTCCTCCCGCTCATAGTGGTGGGACAACA
ATTCAGCCCGTATATGTGGTTGATGTGCTGCTGCAA

QA 3 818 3 818
DS 



AS 1 4

CO CL1961Contig1 981 4 8 U
GCCACCAGATATTCCATATGGATCCAATTGTTTTGGAGGAGTCGAAGTATTTCAAAGAGA
TAGACTTTTCTAAATTCGACAAATCCCAAGGGAAGTTACACCATGATGTGCAGTCCATGG
TGTTCTCCATGTTGGGAATCCCGAAACATTTTGTGGATACTTGGTTTAATGCCCATGAAC
GCAGTCACATCTATGATAGAGATTGCGGAGTTGGGTTTTCCGTTGATTATCAGCGAAGAA
CTGGTGATGCATGTACATATCTAGGGAACACCATAGTCACACTGAGTGTCCTGAGTTATG
TATATGATTTGAGTGATCCAAACATTTTGTTTGTTTGTGCCAGTGGTGATGACAGTTTGA
TAGGTTCCACCACTGAGTTGCCTCGTGATAAGGAGGGTTTATGCGTGTCCCTCTTTAATT
TCGAGACGAAATTTCCACATAATCAACCATTTATATGTTCAAAATTCCTTCTAACGGTTG
AATGTGATGACGGGTCCAAAGAAGTTTTAGGAGTACCTAATCCTCTAAAGTTACTCCAGA
AACTGGGACCAAAAAAATGTTCAAGTCAAGGTTATTGATGATTATTACCAGAGCCTTTGT
GACTTGTTATGGGTTTTTGAAGATGCCGATGTCTGCCATCGAGTGGCTAAGTTAGCCGAA
TATCGAGCATTTAA*GGGAAATAAACATTCTCTTTTCCTCGAGTCGGCATTATTGAGCTT
ACCGAGTCTGGTTGCTAACAGACTCAAATTCGTCAGAAGAACTTTCAATTTAGAAAGATC
AAAGATTTGTATGCGAAATGATGAATTTGAGAATCTTGGTAAGTCTTTTACTCCTTACTG
TCATCAGGGCAGATCTGATGAGGTCCCCAGTTCCGGAAAGGGAACTACCGATGGATTCCG
TAGGAGAGGAAACACCACCGAAAAAGGTGGAACTTCCACCCGACGAAGAGGTCCACGTGA
AAAGCGTGGGCAATGGGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN17TF U 1
AF RR2EN12TF U 70
AF RR2E547TF U 155
AF RR2E547JQ C 295
BS 1 555 RR2BN17TF
BS 556 556 RR2EN12TF
BS 557 557 RR2E547TF
BS 558 674 RR2EN12TF
BS 675 675 RR2E547TF
BS 676 751 RR2EN12TF
BS 752 765 RR2E547TF
BS 766 981 RR2E547JQ

RD RR2BN17TF 555 0 0
GCCACCAGATATTCCATATGGATCCAATTGTTTTGGAGGAGTCGAAGTATTTCAAAGAGA
TAGACTTTTCTAAATTCGACAAATCCCAAGGGAAGTTACACCATGATGTGCAGTCCATGG
TGTTCTCCATGTTGGGAATCCCGAAACATTTTGTGGATACTTGGTTTAATGCCCATGAAC
GCAGTCACATCTATGATAGAGATTGCGGAGTTGGGTTTTCCGTTGATTATCAGCGAAGAA
CTGGTGATGCATGTACATATCTAGGGAACACCATAGTCACACTGAGTGTCCTGAGTTATG
TATATGATTTGAGTGATCCAAACATTTTGTTTGTTTGTGCCAGTGGTGATGACAGTTTGA
TAGGTTCCACCACTGAGTTGCCTCGTGATAAGGAGGGTTTATGCGTGTCCCTCTTTAATT
TCGAGACGAAATTTCCACATAATCAACCATTTATATGTTCAAAATTCCTTCTAACGGTTG
AATGTGATGACGGGTCCAAAGAAGTTTTAGGAGTACCTAATCCTCTAAAGTTACTCCAGA
AACTGGGACCAAAAA

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2EN12TF 682 0 0
GG
AAATTCGACAAATCCCAAGGGAAGTTACACCATGATGTGCAGTCCATGGTGTTCTCCATG
TTGGGAATCCCGAAACATTTTGTGGATACTTGGTTTAATGCCCATGAACGCAGTCACATC
TATGATAGAGATTGCGGAGTTGGGTTTTCCGTTGATTATCAGCGAAGAACTGGTGATGCA
TGTACATATCTAGGGAACACCATAGTCACACTGAGTGTCCTGAGTTATGTATATGATTTG
AGTGATCCAAACATTTTGTTTGTTTGTGCCAGTGGTGATGACAGTTTGATAGGTTCCACC
ACTGAGTTGCCTCGTGATAAGGAGGGTTTATGCGTGTCCCTCTTTAATTTCGAGACGAAA
TTTCCACATAATCAACCATTTATATGTTCAAAATTCCTTCTAACGGTTGAATGTGATGAC
GGGTCCAAAGAAGTTTTAGGAGTACCTAATCCTCTAAAGTTACTCCAGAAACTGGGACCA
AAAAA*TGTTCAAGTCAAGGTTATTGATGATTATTACCAGAGCCTTTGTGACTTGTTATG
GGTTTTTGAAGATGCCGATGTCTGCCATCGAGTGGCTAAGTTAGCCGAATATCGAGCATT
TAAAGGGAAATAAACATTCTCTTTTCCTCGAGTCGGCATTATTGAGCTTACCGAGTCTGG
TTGCTAACAGACTCAAATTC

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR2E547TF 611 0 0
GGATACTTGGTTTAATGCCCATGAACGCAGTCACATCTATGATAGAGATTGCGGAGTTGG
GTTTTCCGTTGATTATCAGCGAAGAACTGGTGATGCATGTACATATCTAGGGAACACCAT
AGTCACACTGAGTGTCCTGAGTTATGTATATGATTTGAGTGATCCAAACATTTTGTTTGT
TTGTGCCAGTGGTGATGACAGTTTGATAGGTTCCACCACTGAGTTGCCTCGTGATAAGGA
GGGTTTATGCGTGTCCCTCTTTAATTTCGAGACGAAATTTCCACATAATCAACCATTTAT
ATGTTCAAAATTCCTTCTAACGGTTGAATGTGATGACGGGTCCAAAGAAGTTTTAGGAGT
ACCTAATCCTCTAAAGTTACTCCAGAAACTGGGACCAAAAAAATGTTCAAGTCAAGGTTA
TTGATGATTATTACCAGAGCCTTTGTGACTTGTTATGGGTTTTTGAAGATGCCGATGTCT
GCCATCGAGTGGCTAAGTTAGCCGAATATCGAGCATTTAA*GGGAAATAAACATTCTCTT
TTCCTCGAGTCGGCATTATTGAGCTTACCGAGTCTGGTTGCTAACAGACTCAAATTCGTC
AGAAGAACTTT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2E547JQ 687 0 0
GTTATGTATATGATTTGAGTGATCCAAACATTTTGTTTGTTTGTGCCAGTGGTGATGACA
GTTTGATAGGTTCCACCACTGAGTTGCCTCGTGATAAGGAGGGTTTATGCGTGTCCCTCT
TTAATTTCGAGACGAAATTTCCACATAATCAACCATTTATATGTTCAAAATTCCTTCTAA
CGGTTGAATGTGATGACGGGTCCAAAGAAGTTTTAGGAGTACCTAATCCTCTAAAGTTAC
TCCAGAAACTGGGACCAAAAAAATGTTCAAGTCAAGGTTATTGATGATTATTACCAGAGC
CTTTGTGACTTGTTATGGGTTTTTGAAGATGCCGATGTCTGCCATCGAGTGGCTAAGTTA
GCCGAATATCGAGCATTTAA*GGGAAATAAACATTCTCTTTTCCTCGAGTCGGCATTATT
GAGCTTACCGAGTCTGGTTGCTAACAGACTCAAATTCGTCAGAAGAACTTTCAATTTAGA
AAGATCAAAGATTTGTATGCGAAATGATGAATTTGAGAATCTTGGTAAGTCTTTTACTCC
TTACTGTCATCAGGGCAGATCTGATGAGGTCCCCAGTTCCGGAAAGGGAACTACCGATGG
ATTCCGTAGGAGAGGAAACACCACCGAAAAAGGTGGAACTTCCACCCGACGAAGAGGTCC
ACGTGAAAAGCGTGGGCAATGGGGGCC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 3

CO CL1962Contig1 864 3 8 U
CCACCCCACAAGCAAACCACTTTATTTGACTCTGATACAAGTCCTTACGAGAAATCCTTA
TTTGAGAGCGATCGGGGCATCACAAAA*CGTTTCAGGACGTATACAAAGAACACAATCTG
AGAGAAAGTACAATGCTTAATTAAGCCAAGTAATGTTTCATCCAGGAAGTGAAGCGAGAC
CAAGCAAGCTCCACCGCAGCTTCATCTTCGTCAGAAAGCCCCATGCTCTTCCTTCTGCTC
ACTCCTTCCGGACTCCTGTTCAAGAACGCGTGCCCGTTCCCCTCGTAAACATGAACCTCG
TGCGCCACTCCAGACGCTTTCAGCTTCTCTTCAAGACTCTTCGCTGCCGTGACATCAGAG
AAACCGACAAAGTTATCAAGCTCCCCAAAATGACCCTGAACAGGCGCCTTGGCTTGCCCC
ACATCCGCAAGCTCAGAGGAAGGAGTTCCGTAGAATCCAACAACAGCATCAACCTCAGGA
ACCAAAACAGAGCTAGCTATAGCCAACGCACCTCCCATACACATCCCAGTCACACCAACC
TTCTTTGATCCATTAGCTTTAAGCCAGTTAACAGAAGCTCGGATGTCTTTGACAGCACCT
TGCCAGTCAAGCCCGTCCATCAGATGCTGCGCCTCCGCAGTGTCGAGACCAACCTTTCCT
CGATACAAATCGGGGATGAGAGCTTTGAAACCGGTGTCGAGGAGCTGTGAGATTTTGATG
GCGTGGTTCTTGATCTCGAAGTCAACTCCCCACCATTCTTGAATCACGACGATCCCTGGT
GCGTCGTCTTTTCCGAACACATACGCATCAAATGTAGTGTCGTCTCTCTGGATTTGGATT
TTCTTGAAAGCGGAATCGGCCCCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF34JQ U 4
AF RR2DJ81JQ U 1
AF RR2DJ81TF C 68
BS 1 67 RR2DJ81JQ
BS 68 68 RR2DF34JQ
BS 69 87 RR2DJ81JQ
BS 88 88 RR2DF34JQ
BS 89 452 RR2DJ81JQ
BS 453 453 RR2DF34JQ
BS 454 721 RR2DJ81JQ
BS 722 864 RR2DJ81TF

RD RR2DF34JQ 588 0 0
CCCCACAAGCAAACCACTTTATTTGACTCTGATACAAGTCCT*AGGAGAAATCCTTATTT
GAGAGCGATAGGGGCATCACAAAA*CGTTTCAGGACGTATACAAAGAACACAATCTGAGA
GAAAGTACAATGCTTAATTAAGCCAAGTAATGTTTCATCCAGGAAGTGAAGCGAGACCAA
GCAAGCTCCACCGCAGCTTCATCTTCGTCAGAAAGCCCCATGCTCTTCCTTCTGCTCACT
CCTTCAGGACTCCTGTTCAAGAACGCGTGCCCGTTCCCCTCGTAAATATGAACCTCGTGC
GCTACTCCAGACGCTTTCAGCTTCTCTTCGAGACTCTTCGCTGCAGTGACATCAGAGAAA
CCGACAAAGTTATCAAGCTCCCCAAAATGAGCCTGAACAGGCGCCTTAGCTTGCCCCACA
TCCGCAAGCTCCGAGGAAGGAGTACCGTAGAATCCAACAACAGCATCAACCTCAGGAACC
AAAACAGAGCTAGCTATAGCCAACGCACCTCCCATACACATCCCAGTGACACCAACCTTC
TTTGATCCATTAGCTTTAAGCCAGTTAACAGAAGCACGGATATCTTT
A

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2DJ81JQ 721 0 0
CCACCCCACAAGCAAACCACTTTATTTGACTCTGATACAAGTCCTTACGAGAAATCCTTA
TTTGAGATCGATCGGGGCATCACAAAAACGTTTCAGGACGTATACAAAGAACACAATCTG
AGAGAAAGTACAATGCTTAATTAAGCCAAGTAATGTTTCATCCAGGAAGTGAAGCGAGAC
CAAGCAAGCTCCACCGCAGCTTCATCTTCGTCAGAAAGCCCCATGCTCTTCCTTCTGCTC
ACTCCTTCCGGACTCCTGTTCAAGAACGCGTGCCCGTTCCCCTCGTAAACATGAACCTCG
TGCGCCACTCCAGACGCTTTCAGCTTCTCTTCAAGACTCTTCGCTGCCGTGACATCAGAG
AAACCGACAAAGTTATCAAGCTCCCCAAAATGACCCTGAACAGGCGCCTTGGCTTGCCCC
ACATCCGCAAGCTCAGAGGAAGGAGTTCCGTAAAATCCAACAACAGCATCAACCTCAGGA
ACCAAAACAGAGCTAGCTATAGCCAACGCACCTCCCATACACATCCCAGTCACACCAACC
TTCTTTGATCCATTAGCTTTAAGCCAGTTAACAGAAGCTCGGATGTCTTTGACAGCACCT
TGCCAGTCAAGCCCGTCCATCAGATGCTGCGCCTCCGCAGTGTCGAGACCAACCTTTCCT
CGATACAAATCGGGGATGAGAGCTTTGAAACCGGTGTCGAGGAGCTGTGAGATTTTGATG
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2DJ81TF 797 0 0
T
CGATCGGGGCATCACAAAA*CGTTTCAGGACGTATACAAAGAACACAATCTGAGAGAAAG
TACAATGCTTAATTAAGCCAAGTAATGTT*CATCCAGGAAGTGAAGCGAGACCAAGCAAG
CTCCACCGCAGCTTCATCTTCGTCAGAAAGCCCCATGCTCTTCTTTCTGCTCACTCCTTC
CGGACTCCTGTTCAAGAACGCGTGCCCGTTCCCCTCGTAAACATGAACCTCGTGCGCCAC
TCCAGACGCTTTCAGCTTCTCTTCAAGACTCTTCGCTGCCGTGACATCAGAGAAACCGAC
AAAGTTATCAAGCTCCCCAAAATGACCCTGAACAGGCGCCTTGGCTTGCCCCACATCCGC
AAGCTCAGAGGAAGGAGTTCCGTAGAATCCAACAACAGCATCAACCTCAGGAACCAAAAC
AGAGCTAGCTATAGCCAACGCACCTCCCATACACATCCCAGTCACACCAACCTTCTTTGA
TCCATTAGCTTTAAGCCAGTTAACAGAAGCTCGGATGTCTTTGACAGCACCTTGCCAGTC
AAGCCCGTCCATCAGATGCTGCGCCTCCGCAGTGTCGAGACCAACCTTTCCTCGATACAA
ATCGGGGATGAGAGCTTTGAAACCGGTGTCGAGGAGCTGTGAGATTTTGATGGCGTGGTT
CTTGATCTCGAAGTCAACTCCCCACCATTCTTGAATCACGACGATCCCTGGTGCGTCGTC
TTTTCCGAACACATACGCATCAAATGTAGTGTCGTCTCTCTGGATTTGGATTTTCTTGAA
AGCGGAATCGGCCCCC

QA 2 797 2 797
DS 



AS 1 3

CO CL1963Contig1 1130 3 13 U
CCATCAAACACATTTTATGAAGCTAAAAATTGACTTGAGAACAATCGCTGTCTTTCTTAC
TCGACAAAAGAAAATCAAGACCAAAGAGGAAATAAAGGTCGCTCTTGTTCTACGATAATA
ACCGGAAGAGGAAAAAAAAACGATTCAAAATAATATGTCCAACGATGAGAAAAAGGAGAT
AGGGAGTGAAATAACAAACACACAACTTCTACTGACAAACACTTCATCTCAGGAGACTTT
GTTCTCGAGTTTCAAACCGCAGCCAATTCTTTACGGATGTCGAAGCTGTAGTTGATCTCC
AAGTAGCACTTGTTATCATCATCAAGAAACTTAGTTCTAGCAAAATATGATCCTCGAGCA
AACATGCCAAAAGGAGTGGTCTCTGCAGGCATCACGTGGTTGTATGGCTCCGACTGAGGA
CTAAAGGTTCCAAGCATTTCCTTTCCTCTGTCCACTTTAACACCGGTCTTCCAAACAGTA
TTGGTGTACCTGAGACCAGAGACAATGTTGTTATTAACCTGAAACGTGAACTTCAAGTTG
TACTTGCTCCCTTCTTTCAAAGTAAACCACATTCCCTTTGGATTCCCATTCTCCGGAACC
ATAAGAACGATATCAGGTCTTCCAGGGGATAAGATCGCCAGGCTAATGATCTTCACTTCA
GGGTCAAGAGTCTCTCCAATGTTGGTGACATCAACACTTCCAAGAAGCTGTTCTTTCCAC
TTCCTCAGACTCTCATCATCCTTATCCTTCTCGAGATGTTCCTTGATAGTGTACTGAGGA
CCCAATTGTAATTTGGAATCATCGTCTTCTTCTTCCTCGGCAGCGCTAAGAGAGGCTTCG
CTCATTTGCCTCCCCAAGGATCCAGCACCCTCGTCGTCGGTGCCATCGTGTTGATGAGAC
GTTTTGGAAGTGTCTTCGTCGTCGAACCCCATGTCCCTGGAACCAGATACAGCTCCAGAC
ATCAAATCAAAATCAGATCAGATCAACTCGTCTTCCTCCCCCTTCTCCCTTCTCTAAAAA
GCCTTGAGAAGTTTGTTTCCAAAATGTATCGGAGAGAGAAGGAGAAAAGAAAAAAAAAGA
ACCGAACCTTTAGGGAGTTTGGCTCTGTGTTTTAACGGGAAGGAGGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F555JQ U 1
AF RR2BL50JQ U 89
AF RR2BL50TF C 450
BS 1 158 RR2F555JQ
BS 159 159 RR2BL50JQ
BS 160 202 RR2F555JQ
BS 203 203 RR2BL50JQ
BS 204 264 RR2F555JQ
BS 265 265 RR2BL50JQ
BS 266 384 RR2F555JQ
BS 385 385 RR2BL50JQ
BS 386 699 RR2F555JQ
BS 700 700 RR2BL50JQ
BS 701 778 RR2F555JQ
BS 779 825 RR2BL50JQ
BS 826 1130 RR2BL50TF

RD RR2F555JQ 778 0 0
CCATCAAACACATTTTATGAAGCTAAAAATTGACTTGAGAACAATCGCTGTCTTTCTTAC
TCGACAAAAGAAAATCAAGACCAAAGAGGAAATAAAGGTCGCTCTTGTTCTACGATAATA
ACCGGAAGAGGAAAAAAAAACGATTCAAAATAATATGTTCAACGATGAGAAAAAGGAGAT
AGGGAGTGAAATAACAAACACATAACTTCTACTGACAAACACTTCATCTCAGGAGACTTT
GTTCTCGAGTTTCAAACCGCAGCCCATTCTTTACGGATGTCGAAGCTGTAGTTGATCTCC
AAGTAGCACTTGTTATCATCATCAAGAAACTTAGTTCTAGCAAAATATGATCCTCGAGCA
AACATGCCAAAAGGAGTGGTCTCTTCAGGCATCACGTGGTTGTATGGCTCCGACTGAGGA
CTAAAGGTTCCAAGCATTTCCTTTCCTCTGTCCACTTTAACACCGGTCTTCCAAACAGTA
TTGGTGTACCTGAGACCAGAGACAATGTTGTTATTAACCTGAAACGTGAACTTCAAGTTG
TACTTGCTCCCTTCTTTCAAAGTAAACCACATTCCCTTTGGATTCCCATTCTCCGGAACC
ATAAGAACGATATCAGGTCTTCCAGGGGATAAGATCGCCAGGCTAATGATCTTCACTTCA
GGGTCAAGAGTCTCTCCAATGTTGGTGACATCAACACTTACAAGAAGCTGTTCTTTCCAC
TTCCTCAGACTCTCATCATCCTTATCCTTCTCGAGATGTTCCTTGATAGTGTACTGAG

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2BL50JQ 737 0 0
GAAATAAAGGTCGCTCTTGTTCTACGATAATAACCGGAAGAGGGAAAAAAA*CGATTCAG
AATAATATGTCCAACGATGAGAAAAAGGAGATAGGGAGTGAAATAACAAACACACAACTT
CTACTGACAAACACTTCATCTCAGGAGACTTTGTTCTCGAGTTTCAAACCGCAGCCAATT
CTTTACGGATGTCGAAGCTGTAGTTGATCTCCAAGTAGCACTTGTTATCATCATCAAGAA
ACTTAGTTCTAGCAGAATATGATCCTCGAGCAAACATGCCAGAAGGAGTGGTCTCTGCAG
GCATCACGTGGTTGTATGGCTCCGACTGAGGACTAAAGGTTCCAAGCATTTCCTTTCCTC
TGTCCACTTTAACACCGGTCTTCCAAACAGTATTGGTGTACCTGAGACCAGAGACAATGT
TGTTATTAACCTGAAACGTGAACTTCAAGTTGTACTTGCTCCCTTCTTTCAAAGTAAACC
ACATTCCCTTTGGATTCCCATTCTCCGGAACCATAAGAACGATATCAGGTCTTCCAGGGG
ATAAGATCGCCAGGCTAATGATCTTCACTTCAGGGTCAAGAGTCTCTCCAATGTTGGTGA
CATCAACACTTCCAAGAAGCTGTTCTTTCCACTTCCTCAGACTCTCATCATCCTTATCCT
TCTCGAGATGTTCCTTGATAGTGTACTGAGGACCCAATTGTAATTTGGAATCATCGTCTT
CTTCTTCCTCGGCAGCG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2BL50TF 681 0 0
GTCCACTTTAACACCGGTCTTCCAAACAGTATTGGTGTACC*GAGACCAGAGACAATGTT
GTTATTAAC*TGAAACGTGAACTTCAAGTTGTACTTGCTCCCTTCTTTCAAAGTAAACCA
CATTCCCTTTGGATTCCCATTCTCCGGAACCATAAGAACGATATCAGGTCTTCCAGGGGA
TAAGATCGCCAGGCTAATGATCTTCACTTCAGGGTCAAGAGTCTCTCCAATGTTGGTGAC
ATCAACACTTCCAAGAAGCTGTTCTTTCCACTTCCTCAGACTCTCATCATCCTTATCCTT
CTCGAGATGTTCCTTGATAGTGTACTGAGGACCCAATTGTAATTTGGAATCATCGTCTTC
TTCTTCCTCGGCAGCGCTAAGAGAGGCTTCGCTCATTTGCCTCCCCAAGGATCCAGCACC
CTCGTCGTCGGTGCCATCGTGTTGATGAGACGTTTTGGAAGTGTCTTCGTCGTCGAACCC
CATGTCCCTGGAACCAGATACAGCTCCAGACATCAAATCAAAATCAGATCAGATCAACTC
GTCTTCCTCCCCCTTCTCCCTTCTCTAAAAAGCCTTGAGAAGTTTGTTTCCAAAATGTAT
CGGAGAGAGAAGGAGAAAAGAAAAAAAAAGAACCGAACCTTTAGGGAGTTTGGCTCTGTG
TTTTAACGGGAAGGAGGAGCC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 4

CO CL1964Contig1 880 4 4 U
GCGGAAAATTGCCGGAAATGCTCTGGAGAAGGACGTGTGCGTATTAAAAAAAGCATCAAG
GTCAAAATTCCTCCAGGTGTTAGCGCAGGTAGCATCCTCAGAGTTGCCGGGGAAGGTGAT
TCTGGTCCCAGAGGTGGACCTCCAGGAGATTTGTATGTATATCTTGATGTTGAAGATGTC
CGTGGAATTCAAAGGGATGGCATAAACCTTTTATCTACTCTTTCCATCACTTACCTTGAT
GCTATACTGGGTGCGGTTGTTAAGGTGAAAACAGTAGAAGGAGACACTGAACTGCAGATA
CCTCCGGGTACTCAACCTGGTGATGTGCTGGTCCTGGCAAAGAAAGGAGCACCAAAACTG
AATAGACCATCTATCCGCGGTGACCACTTGTTTACAGTCAAAGTTACTATACCAAATCAA
ATAAGTGCTGGAGAGCGGGAGTTGCTGGAGGAACTTGCTTCTCTAAGTGATACGTCTGGC
AACCGGCTGCGAACTCGTGCTGAGCCTCAGCAATCCACTACTCTAAACAGTGCACCTATT
AGCTCAGAAAACAGGACAGATGAAGTTAGGGAGAAAAGCCAAGAACCAGAGCAAGAAAAC
GACTCGTGGAAGAACATCAAAGATTTTGCAGGATCGGTCGCAAATGGAGCCATGAAATGG
CTGAGAGATAACCTCTAGAGATCCATGTTCAACTAACATGACCTGCTTTAAAAGGTATTT
TCGGCTGCACCCATGGTACCAATGTGGAAGGAAATGTTAATTGTTTCATTTGTTGATGTG
AGGGTCTTTTGCAGAAAGCTCTTTATTCCTTTTCAGTTTGGTGGATGTTATTTGCCAAGT
CATAATGATTTGATGCGTGAAAAGAGAGCGATTCTGCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB63TF U 112
AF RR2A568TF U 1
AF RR2E395JQ C 685
AF RR2A568JQ C 50
BS 1 710 RR2A568TF
BS 711 732 RR2A568JQ
BS 733 733 RR2E395JQ
BS 734 880 RR2A568JQ

RD RR2AB63TF 358 0 0
GAAGGTGATTCTGGTCCCAGAGGTGGACCTCCAGGAGATTTGTATGTATATCTTGATGTT
GAAGATGTCCGTGGAATTCAAAGGGATGGCATAAACCTTTTATCTACTCTTTCCATCACT
TACCTTGATGCTATACTGGGTGCGGTTGTTAAGGTGAAAACAGTAGAAGGAGACACTGAA
CTGCACATACCTCCGGGTACTCAACCTGGTGATGTGCTGGTCCTGGCAAAGAAAGGAGCA
CCAAAACTGAATAGACCATCTATCCGCGGTGACCACTTGTTTACAGTCAAAGTTACTATA
CCAAATCAAATAAGTGCTGGAGAGCGGGAGTTGCTGGAGGAACTTGCTTCTCTAAGTG

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR2A568TF 710 0 0
GCGGAAAATTGCCGGAAATGCTCTGGAGAAGGACGTGTGCGTATTAAAAAAAGCATCAAG
GTCAAAATTCCTCCAGGTGTTAGCGCAGGTAGCATCCTCAGAGTTGCCGGGGAAGGTGAT
TCTGGTCCCAGAGGTGGACCTCCAGGAGATTTGTATGTATATCTTGATGTTGAAGATGTC
CGTGGAATTCAAAGGGATGGCATAAACCTTTTATCTACTCTTTCCATCACTTACCTTGAT
GCTATACTGGGTGCGGTTGTTAAGGTGAAAACAGTAGAAGGAGACACTGAACTGCAGATA
CCTCCGGGTACTCAACCTGGTGATGTGCTGGTCCTGGCAAAGAAAGGAGCACCAAAACTG
AATAGACCATCTATCCGCGGTGACCACTTGTTTACAGTCAAAGTTACTATACCAAATCAA
ATAAGTGCTGGAGAGCGGGAGTTGCTGGAGGAACTTGCTTCTCTAAGTGATACGTCTGGC
AACCGGCTGCGAACTCGTGCTGAGCCTCAGCAATCCACTACTCTAAACAGTGCACCTATT
AGCTCAGAAAACAGGACAGATGAAGTTAGGGAGAAAAGCCAAGAACCAGAGCAAGAAAAC
GACTCGTGGAAGAACATCAAAGATTTTGCAGGATCGGTCGCAAATGGAGCCATGAAATGG
CTGAGAGATAACCTCTAGAGATCCATGTTCAACTAACATGACCTGCTTTA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2E395JQ 152 0 0
ATGTTCAACTAACATGACCTGCTTTAAAAGGTATTTTCGGCTGCACCCATGGTACCAATG
TGGAAGGAAATGTTAATTGTTTCATTTTTTGATGTGAGGGTCTTTTGCAGAAAGCTTTTT
ATTCCTTTTCAGTTTGGTGGATGTTATTTGCC

QA 1 152 1 152
DS 

RD RR2A568JQ 831 0 0
AAAGCATCAAGGTCAAAATTCCTCCAGGTGTTAGCGCAGGTAGCATCCTCAGAGTTGCCG
GGGAAGGTGATTCTGGTCCCAGAGGTGGACCTCCAGGAGATTTGTATGTATATCTTGATG
TTGAAGATGTCCGTGGAATTCAAAGGGATGGCATAAACCTTTTATCTACTCTTTCCATCA
CTTACCTTGATGCTATACTGGGTGCGGTTGTTAAGGTGAAAACAGTAGAAGGAGACACTG
AACTGCAGATACCTCCGGGTACTCAACCTGGTGATGTGCTGGTCCTGGCAAAGAAAGGAG
CACCAAAACTGAATAGACCATCTATCCGCGGTGACCACTTGTTTACAGTCAAAGTTACTA
TACCAAATCAAATAAGTGCTGGAGAGCGGGAGTTGCTGGAGGAACTTGCTTCTCTAAGTG
ATACGTCTGGCAACCGGCTGCGAACTCGTGCTGAGCCTCAGCAATCCACTACTCTAAACA
GTGCACCTATTAGCTCAGAAAACAGGACAGATGAAGTTAGGGAGAAAAGCCAAGAACCAG
AGCAAGAAAACGACTCGTGGAAGAACATCAAAGATTTTGCAGGATCGGTCGCAAATGGAG
CCATGAAATGGCTGAGAGATAACCTCTAGAGATCCATGTTCAACTAACATGACCTGCTTT
AAAAGGTATTTTCGGCTGCACCCGTGGTACCAATGTGGAAGGAAATGTTAATTGTTTCAT
TTGTTGATGTGAGGGTCTTTTGCAGAAAGCTCTTTATTCCTTTTCAGTTTGGTGGATGTT
ATTTGCCAAGTCATAATGATTTGATGCGTGAAAAGAGAGCGATTCTGCTCT

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 4

CO CL1965Contig1 744 4 4 U
CTTTGGATTGGGTTCTGTTGGACTCGCGGTTGCTGAAGGTGCAAGAGCAAGAGGTGCTGC
TAGGATCATTGGTATTGACGCTAATGCTTCCAAATTTGAGAAAGGTAAACTGATGGGTGT
AACGGACTTCGTAAACCCTAAAGACTTAACCAAGCCAGTACATGAGAGGATTCGAGAGTT
AATGAGTGGAGGCGTGGACTATAGCTTCGAATGTACAGGAAACGTCGATGTTCTTCGCGA
AGCCTTTTTATCCACTCAAGCAGGTTGGGGATCGACGGTGCTTGTAGGAATATATCCGAC
ACCAAAAACATTGCCCCTTCATCCAATGGAGCTTTTTGACGGCCGCACAATCACCGGTTC
TATATTCGGTGGTTTCAAGCCCAAATCTCAGCTTCCAAATTTTGCTCAACAATGCATGAA
AGGGGTTGTGAAATTAGAACCTTTTATTACCAATGAGCTTCCATTTGAGAAGATAAACGA
TGCGTTTCAGCTGCTTCGTGATGGAAAATCTCTTCGTTGTCTTCTCCAAATCTCTAAATT
TCTCAAGAAATGATTCTACGTACCTTCCCAAAGGTTACTATTAAATAATCAACAAGCACT
TCTATTTGTATCATCTTTTCTTATCATAAATTTATGTTTATCATCAATAGTTCGATAAAA
ATTATTATTTGTGCTCAGATATTATTTAATTTGATTAAACTCAAATGATCTCGTTCATTG
TGAGAACCGAGAAACTTTCATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E726JQ C 1
AF RR2BO07JQ C 95
AF RR2D961TF U 162
AF RR2BO07TF U 95
BS 1 95 RR2E726JQ
BS 96 162 RR2BO07TF
BS 163 737 RR2D961TF
BS 738 744 RR2BO07JQ

RD RR2E726JQ 744 0 0
CTTTGGATTGGGTTCTGTTGGACTCGCGGTTGCTGAAGGTGCAAGAGCAAGAGGTGCTGC
TAGGATCATTGGTATTGACGCTAATGCTTCCAAATTTGAGAAAGGTAAACTGATGGGTGT
AACGGACTTCGTAAACCCTAAAGACTTAACCAAGCCAGTACATGAGAGGATTCGAGAGTT
AATGAGTGGAGGCGTGGACTATAGCTTCGAATGTACAGGAAACGTCGATGTTCTTCGCGA
AGCCTTTTTATCCACTCAAGCAGGTTGGGGATCGACGGTGCTTGTAGGAATATATCCGAC
ACCAAAAACATTGCCCCTTCATCCAATGGAGCTTTTTGACGGCCGCACAATCACCGGTTC
TATATTCGGTGGTTTCAAGCCCAAATTTCAGCTTCCAAATTTTGCTCAACAATGCATGAA
AGGGGTTGTGAAATTAGAACCTTTTATTACCAATGAGCTTCCATTTGAGAAGATAAGCGA
TGCGTTTCAGCTGCTTCGTGATGGGAAATCTCTTCGTTGTCTTCTCCAAATCTCTAAATT
TCTCAAGAAATGATTCTACGTACCTTCCCAAAGGTTACTATTAAATAATCAACAAGCACT
TCTATTTGTATCATCTTTTCTTATCATAAATTTATGTTTATCATCAATAGTTCGATAGAA
ATTATTATTTGTGCTCAGATATTATTTAATTTGATTAAACTCAAATGATCTCGTTCATTG
TGAGAACCGAGAAACTT
TCATACC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2BO07JQ 650 0 0
G
TTGAGAAAGGTAAACTGATGGGTGTAACGGACTTCGTAAACCCTAAAGACTTAACCAAGC
CAGTACATGAGAGGATTCGAGAGTTAATGAGTGGAGGCGTGGACTATAGCTTCGAATGTA
CAGGAAACGTCGATGTTTTTCGCGAAGCCTTTTTATCCACTCAAGCAGGTTGGGGATCGA
CGGTGCTTGTAGGAATATATCCGACACCAAAAACATTGCCCCTTCATCCAATGGAGCTTT
TTGACGGCCGCACAATCACCGGTTCTATATTCGGTGGTTTCAAGCCCAAATTTCAGCTTC
CAAATTTTGCTCAACAATGCATGAAAGGGGTTGTGAAATTAGAACCTTTTATTACCAATG
AGCTTCCATTTGAGAAGATAAACGATGCGTTTCAGCTGCTTCGTGATGGAAAATCTCTTC
GTTGTCTTCTCCAAATCTCTAAATTTCTCAAGAAATGATTCTACGTACCTTCCCAAAGGT
TACTATTAAATAATCAACAAGCACTTCTATTTGTATCATCTTTTCTTATCATAAATTTAT
GTTTATCATCAATAGTTCGATAAAAATTATTATTTGTGCTCAGATATTATTTAATTTGAT
TAAACTCAAATGATCTCGTTCATTGTGAGAACCGAGAAACTTTCATACC

QA 2 650 2 650
DS 

RD RR2D961TF 580 0 0
G
TGAGAGGATTCGAGAGTTAATGAGTGGAGGCGTGGACTATAGCTTCGAATGTACAGGAAA
CGTCGATGTTCTTCGCGAAGCCTTTTTATCCACTCAAGCAGGTTGGGGATCGACGGTGCT
TGTAGGAATATATCCGACACCAAAAACATTGCCCCTTCATCCAATGGAGCTTTTTGACGG
CCGCACAATCACCGGTTCTATATTCGGTGGTTTCAAGCCCAAATCTCAGCTTCCAAATTT
TGCTCAACAATGCATGAAAGGGGTTGTGAAATTAGAACCTTTTATTACCAATGAGCTTCC
ATTTGAGAAGATAAACGATGCGTTTCAGCTGCTTCGTGATGGAAAATCTCTTCGTTGTCT
TCTCCAAATCTCTAAATTTCTCAAGAAATGATTCTACGTACCTTCCCAAAGGTTACTATT
AAATAATCAACAAGCACTTCTATTTGTATCATCTTTTCTTATCATAAATTTATGTTTATC
ATCAATAGTTCGATAAAAATTATTATTTGTGCTCAGATATTATTTAATTTGATTAAACTC
AAATGATCTCGTTCATTGTGAGAACCGAGAAACTT
CATA

QA 2 576 2 576
DS 

RD RR2BO07TF 650 0 0
G
TTGAGAAAGGTAAACTGATGGGTGTAACGGACTTCGTAAACCCTAAAGACTTAACCAAGC
CAGTACATGAGAGGATTCGAGAGTTAATGAGTGGAGGCGTGGACTATAGCTTCGAATGTA
CAGGAAACGTCGATGTTCTTCGCGAAGCCTTTTTATCCACTCAAGCAGGTTGGGGATCGA
CGGTGCTTGTAGGAATATATCCGACACCAAAAACATTGCCCCTTCATCCAATGGAGCTTT
TTGACGGCCGCACAATCACCGGTTCTATATTCGGTGGTTTCAAGCCCAAATCTCAGCTTC
CAAATTTTGCTCAACAATGCATGAAAGGGGTTGTGAAATTAGAACCTTTTATTACCAATG
AGCTTCCATTTGAGAAGATAAACGATGCGTTTCAGCTGCTTCGTGATGGAAAATCTCTTC
GTTGTCTTCTCCAAATCTCTAAATTTCTCAAGAAATGATTCTACGTACCTTCCCAAAGGT
TACTATTAAATAATCAACAAGCACTTCTATTTGTATCATCTTTTCTTATCATAAATTTAT
GTTTATCATCAATAGTTCGATAAAAATTATTATTTGTGCTCAGATATTATTTAATTTGAT
TAAACTCAAATGATCTCGTTCATTGTGAGA*CCGAGAAACTT
TCATACC

QA 2 643 2 643
DS 



AS 2 4

CO CL1966Contig1 806 2 6 U
GGCAGACAAAAAAAAAGAACTAATATTCATCATTTGTTACAGGAAAATGATTTAGTCTAA
TCATCATTTGTTATATATATCCTTATGGATGTTAATGAAAAGGATATCACTTACAGGAGC
TAAGAACTACACATCAACGTGTTTGTTCACTAATTCATTGCTAATGGATAAGGCAAAGTG
GCAATATGGCTATGAGCCACTGTTCCAATCCAAAGCTTCCCTTGAACCTCCCTCACTTCA
CTAACAAGCTTCATTACCTTTCCTTCTCTATCCTCAAGAACCTCCAAGACCTTGCCTTCC
TCGTTGAATCTCGATATCACAGTGTACATTCTCATCCCCATGGCTTTTGCCAGCAGCTTC
ATCGGTATGGGCAACCGAAAGTAGATGCTCTTAATCCAAGGGTTGTTTGCAAGAACCTCT
TGAACCGGTGTTCTGCAACAGTCTATTGCAACCCAAAACTCACCCTTCTCGTTCATTCTT
ACATTGTCAGGGAATCCAGGTAGATCTGCCACCACCTCGACTTCACCCCTCTTTGAACCC
TCCAGCCAGTATTTCACTAACCTGCAATTTGTTGTTTCAGTGAAGAGTAGGAAAGATTGG
TCTTTAGAGAGTTGTATGCCATTAGGAAAAGCCAAACCATCCAGCACAATATGTGTTGTT
TTGGTAGGTGGGTCATATCTTAGAAGCCTACCAGTTGATTCTCCTTCAAGTAATATGAAG
AAATGGTTCGCTCTGTCATATCTTTTGCTTGTGTCTGTGAAGAAGATTGAGCCATTTCTG
TGAATGTCGAGATCGTTGGCAAGAGT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL24JQ U 1
AF RR2ED87JQ U 1
BS 1 189 RR2DL24JQ
BS 190 190 RR2ED87JQ
BS 191 374 RR2DL24JQ
BS 375 375 RR2ED87JQ
BS 376 660 RR2DL24JQ
BS 661 806 RR2ED87JQ

RD RR2DL24JQ 660 0 0
GGCAGACAAAAAAAAAGAACTAATATTCATCATTTGTTACAGGAAAATGATTTAGTCTAA
TCATCATTTGTTATATATATCCTTATGGATGTTAATGAAAAGGATATCACTTACAGGAGC
TAAGAACTACACATCAACGTGTTTGTTCACTAATTCATTGCTAATGGATAAGGCAAAGTG
GCAATATGGTTATGAGCCACTGTTCCAATCCAAAGCTTCCCTTGAACCTCCCTCACTTCA
CTAACAAGCTTCATTACCTTTCCTTCTCTATCCTCAAGAACCTCCAAGACCTTGCCTTCC
TCGTTGAATCTCGATATCACAGTGTACATTCTCATCCCCATGGCTTTTGCCAGCAGCTTC
ATCGGTATGGGCAATCGAAAGTAGATGCTCTTAATCCAAGGGTTGTTTGCAAGAACCTCT
TGAACCGGTGTTCTGCAACAGTCTATTGCAACCCAAAACTCACCCTTCTCGTTCATTCTT
ACATTGTCAGGGAATCCAGGTAGATCTGCCACCACCTCGACTTCACCCCTCTTTGAACCC
TCCAGCCAGTATTTCACTAACCTGCAATTTGTTGTTTCAGTGAAGAGTAGGAAAGATTGG
TCTTTAGAGAGTTGTATGCCATTAGGAAAAGCCAAACCATCCAGCACAATATGTGTTGTT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2ED87JQ 806 0 0
GA
CAGACGAAAAAAAAGAACTAATATTCATCATTTGTTACAGGAAAATGATTTAGTCTAATC
ATCATTTGTTATATATATCCTTATGGATGTTAATGAAAAGGATATCACTTACAGGAGCTA
AGAACTACACATCAACGTGTTTGTTCACTAATTCATTGCTAATGGATAAGGCAAAGTGGC
AATATGGCTATGAGCCACTGTTCCAATCCAAAGCTTCCCTTGAACCTCCCTCACTTCACT
AACAAGCTTCATTACCTTTCCTTCTCTATCCTCAAGAAC*TCCAAGACCTTGCCTTCCTC
GTTGAATCTCGATATCACAGTGTACATTCTCATCCCCATGGCTTTTGCCAGCAGCTTCAT
CGGTATGGGCAACCGAAAGTAGATGCTCTTAATCCAAGGGTTGTTTGCAAGAACCTCTTG
AACCGGTGTTCTGCAACAGTCTATTGCAACCCAAAACTCACCCTTCTCGTTCATTCTTAC
ATTGTCAGGGAATCCAGGTAGATCTGCCACCACCTCGACTTCACCCCTCTTTGAACCCTC
CAGCCAGTATTTCACTAACCTGCAATTTGTTGTTTCAGTGAAGAGTAGGAAAGATTGGTC
TTTAGAGAGTTGTATGCCATTAGGAAAAGCCAAACCATCTAGCACAATATGTGTTGTTTT
GGTAGGTGGGTCATATCTTAGAAGCCTACCAGTTGATTCTCCTTCAAGTAATATGAAGAA
ATGGTTCGCTCTGTCATATCTTTTGCTTGTGTCTGTGAAGAAGATTGAGCCATTTCTGTG
AATGTCGAGATCGTTGGCAAGAGT

QA 3 806 3 806
DS 



CO CL1966Contig2 745 2 8 U
GGACTTTCTTATCCATCTCTAAGAACTTCAAATGGAGAAGAAAGGCCAGCATGGTACATA
TGACTCCTTGCTGACTCATCACCCTGTTCTCTGTATCATTGCTTTGTCTGTAATTTTCGT
AGCCATCGATCCCTTTCACATAAGCCCAGTCGGTGGTCGTGAGTTCAAACCAGTGAAGCA
TGAGGTTGCACCATACAAGCAAGTCATGGATAACTGGCCAAGAGACAACCTTAGTCAACT
AGGTCATCACGGGAAACTGCAGTTTGTGGACCAAGTCTTTGGTCCAGAGTCATTAGAGTT
TGATAGTTTAGGTCGTGGTCCATACACAGGATTGGCCGATGGAAGAGTTGTTAGATGGAT
GGGTGAATCAATCGGATGGGAGACATTTTCCGTTGCAACACCAAAATGGTCAGAGAAGAC
TTGCGCAAGAGGTGTGGATTCAACAACAAACAAGCAATGGAAGCATGAGAAACTGTGTGG
ACGACCTCTTGGTCTGAGATTTGATAAAGAGAGTGGAAACTTGTATATTGCAGACGCTTA
CTATGGTCTACTAGTAGTTGGTCCTGAAGGAGGGGTGGCTACGCCTTTAGCTACTCATGT
GGAAAGAAAGCCTATACTCTTTGCCAACGATCTCGACATTCACAGAAATGGCTCAATCTT
CTTCACAGACACAAGCAAAAGATATGACAGAGCGAACCATTTCTTCATATTACTTGAAGA
GAATCAACTGGTAGCTTCTAAGATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED87TF U 1
AF RR2DL24TF U 9
BS 1 255 RR2ED87TF
BS 256 256 RR2DL24TF
BS 257 443 RR2ED87TF
BS 444 444 RR2DL24TF
BS 445 569 RR2ED87TF
BS 570 570 RR2DL24TF
BS 571 719 RR2ED87TF
BS 720 745 RR2DL24TF

RD RR2ED87TF 729 0 0
GGACTTTCTTATCCATCTCTAAGAACTTCAAATGGAGAAGAAAGGCCAGCATGGTACATA
TGACTCCTTGCTGACTCATCACCCTGTTCTCTGTATCATTGCTTTGTCTGTAATTTTCGT
AGCCATCGATCCCTTTCACATAAGCCCAGTCGGTGGTCGTGAGTTCAAACCAGTGAAGCA
TGAGGTTGCACCATACAAGCAAGTCATGGATAACTGGCCAAGAGACAACCTTAGTCAACT
AGGTCATCACGGGAACCTGCAGTTTGTGGACCAAGTCTTTGGTCCAGAGTCATTAGAGTT
TGATAGTTTAGGTCGTGGTCCATACACAGGATTGGCCGATGGAAGAGTTGTTAGATGGAT
GGGTGAATCAATCGGATGGGAGACATTTTCCGTTGCAACACCAAAATGGTCAGAGAAGAC
TTGCGCAAGAGGTGTGGATTCAATAACAAACAAGCAATGGAAGCATGAGAAACTGTGTGG
ACGACCTCTTGGTCTGAGATTTGATAAAGAGAGTGGAAACTTGTATATTGCAGACGCTTA
CTATGGTCTACTAGTAGTTGGTCCTGAAG*AGGGGTGGCTACGCCTTTAGCTACTCATGT
GGAAAGAAAGCCTATACTCTTTGCCAACGATCTCGACATTCACAGAAATGGCTCAATCTT
CTTCACAGACACAAGCAAAAGATATGACAGAGCGAACCATTTCTTCATATTACTTGAAG
AGATCAACTG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2DL24TF 737 0 0
GG
ATCCATCTCTAAGAACTTCAAATGGAGAAGAAAGGCCAGCATGGTACATATGACTCCTTG
CTGACTCATCACCCTGTTCTCTGTATCATTGCTTTGTCTGTAATTTTCGTAGCCATCGAT
CCCTTTCACATAAGCCCAGTCGGTGGTCGTGAGTTCAAACCAGTGAAGCATGAGGTTGCA
CCATACAAGCAAGTCATGGATAACTGGCCAAGAGACAACCTTAGTCAACTAGGTCATCAC
GGGAAACTGGAGTTTGTGGACCAAGTCTTTGGTCCAGAGTCATTAGAGTTTGATAGTTTA
GGTCGTGGTCCATACACAGGATTGTCCGATGGAAGAGTTGTTAGATGGATGGGTGAATCA
ATCGGATGGGAGACATTTTCCGTTGCAACACCAAAATGGTCAGAGAAGACTTGCGCAAGA
GGTGTGGATTCAACAACAAACAAGCAATGGAAGCATGAGAAACTGTGTGGACGACCTCTT
GGTCTGAGATTTGATAAAGAGAGTGGAAACTTGTATATTGCAGACGCTTACTATGGTCTA
CTAGTAGTTGGTCCTGAAGGAGGGGTGGCTACGCCTTTAGCTACTCATGTGGAAGGAAAG
CCTATACTCTTTGCCAACGATCTCGACATTCACAGAAATGGCTCAATCTTCTTCACATAC
ACAAGCAAAAGATATGACAGAGCGAATCATTTCTTCATATTACTTGAAGAGAATCAACTG
GTAGCTTCTAAGATA

QA 3 737 3 737
DS 



AS 1 4

CO CL1967Contig1 983 4 13 U
GGAATGCCGCTTCTCTTCTCTTCTCCTTCGAGCTTTCTCTTCTCCTCTACAGACGCATCT
GGAGCTCTCCCCATCTCCAACCTCTCTCAAGCTCGCTCTCCATCTCTCTCAAACTCTCGA
TCCTCTCTCCATCTCGCACGATCTTGATCTCTCCATCTCCAACCTCTCTCAAGCTCGCTC
TCCATCTCCAACGCATCTCAAGCTCGCTCGAGCTCTCCATCTCCAACGCATCTCAAGCTC
GCTCTCCACCTCTCGACCCTCTCTCCATCAAGCTTCGTCTCGTCTCTCACACCATCTCCA
GAGCTCTCTCTCTCGATCTCAAACCCAGGCTCTCTCAGCTCTCAGGCTTCTCCATAGCAT
CTTTGTCTGTGTATCAAGCTCTCCCAAGCTTCGTCTGTCTCTCACTCTCTCTTAAGGTCT
CAAGCTCTCCCAAGCTTCTCTCACTCAAGCTCTCCCAAGTTTCACACTCAAGCTCTCCCA
AGCTTCTCTCACTCAAGCTCTCCCAAGCTTCTCTCACTCAAACTCTCCCAAGCTTACTCT
GTTTCTGGCTCACTCTGTCGATCTCTTCTCTGACGCATCAGACCGAGAAGCATTACAAGT
ACTTGCGGCAAAGAAGTGTGTTCTGTTGATCAAGATTTTTT*AGAATGGGAAAATGTTGA
TGTTAGAGTAGAAGAAACTCATAGTGATGGTGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGTGATGA
TGATGATGGTGGTGGACATATTGAATATGAATCGAAAGGTGATACAGTAATGGAGGCTTT
GCGTGATAACATCACAAATGGATTTGACAGATGTTGTTTACCATATTAAATCATGTTTTA
GTTAATGATTTGATTTTTCTTTTATTATAACTTTGATTATCATTTATATGTGATAGTTAT
TTAAGACTTGCTGTAATATTTTTTTTATCAGCCAACTTGTTAATTTCATATTTCTTTTAT
CTATAACACATATTTGCCTTATT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO91TF U 1
AF RR2EJ10TF U 2
AF RR2EJ10JQ C 372
AF RR2BO91JQ C 318
BS 1 269 RR2BO91TF
BS 270 270 RR2EJ10TF
BS 271 641 RR2BO91TF
BS 642 699 RR2EJ10TF
BS 700 700 RR2BO91JQ
BS 701 701 RR2EJ10JQ
BS 702 703 RR2BO91JQ
BS 704 704 RR2EJ10JQ
BS 705 763 RR2BO91JQ
BS 764 764 RR2EJ10JQ
BS 765 925 RR2BO91JQ
BS 926 926 RR2EJ10JQ
BS 927 983 RR2BO91JQ

RD RR2BO91TF 649 0 0
GGAATGCCGCTTCTCTTCTCTTCTCCTTCGAGCTTTCTCTTCTCCTCTACAGACGCATCT
GGAGCTCTCCCCATCTCCAACCTCTCTCAAGCTCGCTCTCCATCTCTCTCAAACTCTCGA
TCCTCTCTCCATCTCGCACGATCTTGATCTCTCCATCTCCAACCTCTCTCAAGCTCGCTC
TCCATCTCCAACGCATCTCAAGCTCGCTCGAGCTCTCCATCTCCAACGCATCTCAAGCTC
GCTCTCCACCTCTCGACCCTCTCTCCATCGAGCTTCGTCTCGTCTCTCACACCATCTCCA
GAGCTCTCTCTCTCGATCTCAAACCCAGGCTCTCTCAGCTCTCAGGCTTCTCCATAGCAT
CTTTGTCTGTGTATCAAGCTCTCCCAAGCTTCGTCTGTCTCTCACTCTCTCTTAAGGTCT
CAAGCTCTCCCAAGCTTCTCTCACTCAAGCTCTCCCAAGTTTCACACTCAAGCTCTCCCA
AGCTTCTCTCACTCAAGCTCTCCCAAGCTTCTCTCACTCAAACTCTCCCAAGCTTACTCT
GTTTCTGGCTCACTCTGTCGATCTCTTCTCTGACGCATCAGACCGAGAAGCATTACAAGT
ACTTGCGGCAAAGAAGTGTGTTCTGTTGATCAAGATTTTTT
TAGATGGG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2EJ10TF 698 0 0
GAATGCCGCTTCTCTTCTCTTCTCCTTCGAGCTTTCTCTTCTCCTCTACAGACGCATCTG
GAGCTCTCTCCATCTCCAACCTCTCTCAAGCTCGCTCTCCATCTCTCTCAAACTCTCGAT
CCTCTCTCCATCTCGCACGATCTTGATCTCTCCATCTCCAACCTCTCTCAAGCTCGCTCT
CCATCTCCAACGCATCTCAAGCTCGCTCGAGCTCTCCATCTCCAACGCATCTCAAGCTCG
CTCTCCACCTCTCGACCCTCTCTCCATCAATCTTCGTCTCGTCTCTCACACCATCTCCAG
AGCTCTCTCTCTCGATCTCAAACCCAGGCTCTCTCAGCTCTCAGGCTTCTCCATAGCATC
TTTGTCTGTGTATCAAGCTCTCCCAAGCTTCGTCTGTCTCTCACTCTCTCTTAAGGTCTC
AAGCTCTCCCAAGCTTCTCTCACTCAAGCTCTCCCAAGTTTCACACTCAAGCTCTCCCAA
GCTTCTCTCACTCAAGCTCTCCCAAGCTTCTCTCACTCAAACTCTCCCAAGCTTACTCTG
TTTCTGGCTCACTCTGTCGATCTCTTCTCTGACGCATCAGACCGAGAAGCATTACAAGTA
CTTGCGGCAAAGAAGTGTGTTCTGTTGATCAAGATTTTTT*AGAATGGGAAAATGTTGAT
GTTAGAGTAGAAGAAACTCATAGTGATGGTGATGAAGA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2EJ10JQ 576 0 0
TATCAAGCTCTCCCAAGCTTCGTCTGTCTCTCACTCTCTCTTAAGGTCTCAAGCTCTCCC
AAGCTTCTCTCACTCAAGCTCTCCCAAGTTTCACACTCAAGCTCTCCCAAGCTTCTCTCA
CTCAAGCTCTCCCAAGCTTCTCTCACTCAAACTCTCCCAAGCTTACTCTGTTTCTGGCTC
ACTCTGTCGATCTCTTTTCTGACGCATCAGACCGAGAAGCATTACAAGTACTTGCGGCAA
AGAAGTGTGTTCTGTTGATCAAGATTTTTT*AGAATGGGAAAATGTTGATGTTAGAGTAG
AAGAAACTCATAGTGATGGTGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGTGATGATGATGATGGTG
GTGGACATATTGAATATGAATCGAAAGGTGATACAGTAATGGAGGCTTTGCGTGATAACA
TCACAAATGGATTTGATAGATGTTGTTTACCATATTAAATCATGTTTTAGTTAATGATTT
GATTTTTCTTTTATTATAACTTTGATTATCATTTATATGTGATAGTTATTTAAGACTTGC
TGTAATATTTTTTTTATCAGCCAACTTGTTAATT
CC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2BO91JQ 666 0 0
CTCAAACCCAGGCTCTCTCAGCTCTCAGGCTTCTCCATAGCATCTTTGTCTGTGTATCAA
GCTCTCCCAAGCTTCGTCTGTCTCTCACTCTCTCTTAAGGTCTCAAGCTCTCCCAAGCTT
CTCTCACTCAAGCTCTCCCAAGTTTCACACTCAAGCTCTCCCAAGCTTCTCTCACTCAAG
CTCTCCCAAGCTTCTCTCACTCAAACTCTCCCAAGCTTACTCTGTTTCTGGCTCACTCTG
TCGATCTCTTCTCTGACGCATCAGACCGAGAAGCATTACAAGTACTTGCGGCAAAGAAGT
GTGTTCTGTTGATCAAGATTTTTTTAGAATGGGAAAATGTTGATGTTAGAGTAGAAGAAA
CTCATAGTGATGGTGATGAAGAATAATAAGAAGAAGGTGATGATGATGATGGTGGTGGAC
ATATTGAATATGAATCGAAAGGTGATGCAGTAATGGAGGCTTTGCGTGATAACATCACAA
ATGGATTTGACAGATGTTGTTTACCATATTAAATCATGTTTTAGTTAATGATTTGATTTT
TCTTTTATTATAACTTTGATTATCATTTATATGTGATAGTTATTTAAGACTTGCTGTAAT
ATTTTTTT*ATCAGCCAACTTGTTAATTTCATATTTCTTTTATCTATAACACATATTTGC
CTTATT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 4

CO CL1968Contig1 1100 4 6 U
GGAAGAACACTAAAAAATTCCAGCAAGAGTAAAAATCTGAAGTTGGGTTTTCTTAAAGTC
GCAAGCTTTCGATTTGGGTTTCATTGCACGAAGGCAGCTAGAGATCGGTGAGATCTGGTT
CTCAAACCTCGCAAAAGGGTCTCTCTGTGTTTAGTTCTGAAAAAAAAAACTGAAGAGAAC
AGAGCAGCAATGTGTAGTTTGTCGGCGAGTCTACTGTTACCGGCAAGGCTCAAACCAGGG
TATTCAGACAAACGGAGCAACTCACTCCTTGTCTCGAATGGAAGATCCAAGAGGAAGAAT
AACCAATGCATTGTTCCCATGACAAGATTGTTTGGACCAGCGATCTTCGAATCATCGAAG
CTGAAGGTATTGTTTGTAGGGGTTGATGAGAAGAAGCATCCACCAACGCTCCCAAGGACT
TACACGCTCACTCATAGTGACATTACTGCTAAATTAACTTTAGCTATCTCTCACTCCATT
AACAACTCTCAGTTGCAAGGATGGGCAAATAAGCTATACAGAGATGAAGTGGTAGCAGAG
TGGAAGAAAGTGAAAGGGAAAATGTCGCTTCACGTTCACTGTCATATCAGCGGTGGACAT
ATCTTTTTAGATTTATTCGCAAAGTTTCGATACTACATCTTTTGCAAAGAGCTACCTGTT
GTGTTGAAGGCTATAGTTCATGGAGATGGGAACTTGTTGAACAACTATCAAGAGTTGCAA
GAAGCTCCTGTTTGGGTTTATTTCCATTCCAATGTCGATGAGTTCAACAGAGTTGAATAT
TGGGGTCCCCTTTTGGAAGCTACTACTACTTCACCTGATGATGATGGTCACACCAGGACT
CAAACTGTTCCTGAGTCACAGTGTGCAGATGAGTGCACTTGTTGTTTCCCACCTGTTATC
TCCATACCGTGGTCTTATAGTCTTAGTAATGAAGTGTCTAATGATTACACCCGGATTCAG
GCCGAAGGAATGTCTAACTCCTAATCCAGAGAAAGTTTTGGTGGTTTGTAAATTGAATGA
AATGGAGAAGATCATTGGTTTGGTTTGTTGTGTAGGAAACTAATGATTGTTTGTAAGTTT
GATAAATACAAAGTTAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG95TF U 1
AF RR2EG77TF U 23
AF RR2EG77JQ C 450
AF RR2CG95JQ C 359
BS 1 588 RR2CG95TF
BS 589 589 RR2EG77TF
BS 590 665 RR2CG95TF
BS 666 950 RR2CG95JQ
BS 951 951 RR2EG77JQ
BS 952 1100 RR2CG95JQ

RD RR2CG95TF 665 0 0
GGAAGAACACTAAAAAATTCCAGCAAGAGTAAAAATCTGAAGTTGGGTTTTCTTAAAGTC
GCAAGCTTTCGATTTGGGTTTCATTGCACGAAGGCAGCTAGAGATCGGTGAGATCTGGTT
CTCAAACCTCGCAAAAGGGTCTCTCTGTGTTTAGTTCTGAAAAAAAAAACTGAAGAGAAC
AGAGCAGCAATGTGTAGTTTGTCGGCGAGTCTACTGTTACCGGCAAGGCTCAAACCAGGG
TATTCAGACAAACGGAGCAACTCACTCCTTGTCTCGAATGGAAGATCCAAGAGGAAGAAT
AACCAATGCATTGTTCCCATGACAAGATTGTTTGGACCAGCGATCTTCGAATCATCGAAG
CTGAAGGTATTGTTTGTAGGGGTTGATGAGAAGAAGCATCCACCAACGCTCCCAAGGACT
TACACGCTCACTCATAGTGACATTACTGCTAAATTAACTTTAGCTATCTCTCACTCCATT
AACAACTCTCAGTTGCAAGGATGGGCAAATAAGCTATACAGAGATGAAGTGGTAGCAGAG
TGGAAGAAAGTGAAAGGGAAAATGTCGCTTCACGTTCACTGTCATATCTGCGGTGGACAT
ATCTTTTTAGATTTATTCGCAAAGTTTCGATACTACATCTTTTGCAAAGAGCTACCTGTT
GTGTT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2EG77TF 643 0 0
GG
AAGAGTAAAAATCTGAAGTTGGGTTTTCTTAAAGTCGCAAGCTTTCGATTTGGGTTTCAT
TGCACGAAGGCAGCTAGAGATCGGTGAGATCTGGTTCTCAAGCCTCGCAAAAGGGTCTCT
CTGTGTTTAGTTCTGAAAAAAAAAACTGAAGAGAACAGAGCAGCAATGTGTAGTTTGTCG
GCGAGTCTACTGTTACCGGCAAGGCTCAAACCAGGGTATTCAGACAAACGGAGCAACTCA
CTCCTTGTCTCGAATGGAAGATCCAAGAGGAAGAATAACCAATGCATTGTTCCCATGACA
AGATTGTTTGGACCAGCGATCTTCGAATCATCGAAGC*GAAGGTATTGTTTGTAGGGGTT
GATGAGAAGAAGCATCCACCAACGCTCCCAAGGACTTACACGCTCACTCATAGTGACATT
ACTGCTAAATTAACTTTAGCTATCTCTCACTCCATTAACAACTCTCAGTTGCAAGGATGG
GCAAATAAGCTATACAGAGATGAAGTGGTAGCAGAGTGGAAGAAAGTGAAAGGGAAAATG
TCGCTTCACGTTCACTGTCATATCAGCGGTGGACATATCTTTTTAGATTTATTCGCAAAG
TTTCGATACTACATCTTTTGCAAAGAGCTACCTGTTGTGTT

QA 3 643 3 643
DS 

RD RR2EG77JQ 592 0 0
TAAATTAACTTTAGCTATCTCTCACTCCATTAACAACTCTCAGTTGCAAGGATGGGCAAA
TAAGCTATACAGAGATGAAGTGGTAGCAGAGTGGAAGAAAGTGAAAGGGAAAATGTCGCT
TCACGTTCACTGTCATATCAGCGGTGGACATATCTTTTTAGATTTATTCGCAAAGTTTCG
ATACTACATTTTTTGCAAAGAGCTACCTGTTGTGTTGAAGGCTATAGTTCATGGAGATGG
GAACTTGTTGAACAACTATCAAGAGTTGCAAGAAGCTCCTGTTTGGGTTTATTTCCATTC
CAATGTCGATGAGTTCAACAGATTTGAATATTGGGGTCCCCTTTTGGAAGCTACTACTAC
TTCACCTGATGATGATGGTCACACCAGGACTCAAACTGTTCCTGAGTCACAGTGTGCAGA
TGAGTGCACTTGTTGTTTCCCACCTGTTATCTCCATACCGTGGTCTTATAGTTTTAGTAA
TGAAGTGTCTAATGATTACACCCGGATTCAGGCCGAAGGAATGTCTAACTCCTAATCCAG
AGAAAGTTTTGGTGGTTTGTAAATTGAATGAAATGGAGAAGATCATTGGTTT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2CG95JQ 742 0 0
AGCT
GAAGGTATTGTTTGTAGGGGTTGATGAGAAGAAGCATCCACCAACGCTCCCAAGGACTTA
CACGCTCACTCATAGTGACATTACTGCTAAATTAACTTTAGCTATCTCTCACTCCATTAA
CAACTCTCAGTTGCAAGGATGGGCAAATAAGCTATACAGAGATGAAGTGGTAGCAGAGTG
GAAGAAAGTGAAAGGGAAAATGTCGCTTCACGTTCACTGTCATATCTGCGGTGGACATAT
CTTTTTAGATTTATTCGCAAAGTTTCGATACTACATCTTTTGCAAAGAGCTACCTGTTGT
GTTGAAGGCTATAGTTCATGGAGATGGGAACTTGTTGAACAACTATCAAGAGTTGCAAGA
AGCTCCTGTTTGGGTTTATTTCCATTCCAATGTCGATGAGTTCAACAGAGTTGAATATTG
GGGTCCCCTTTTGGAAGCTACTACTACTTCACCTGATGATGATGGTCACACCAGGACTCA
AACTGTTCCTGAGTCACAGTGTGCAGATGAGTGCACTTGTTGTTTCCCACCTGTTATCTC
CATACCGTGGTCTTATAGTCTTAGTAATGAAGTGTCTAATGATTACACTCGGATTCAGGC
CGAAGGAATGTCTAACTCCTAATCCAGAGAAAGTTTTGGTGGTTTGTAAATTGAATGAAA
TGGAGAAGATCATTGGTTTGGTTTGTTGTGTAGGAAACTAATGATTGTTTGTAAGTTTGA
TAAATACAAAGTTAAGTT

QA 5 742 5 742
DS 



AS 1 4

CO CL1969Contig1 637 4 4 U
GGACCTCTTGGTATGTGACTTACTAGTTGCTCTTCCCTCTTCAATTATTATTCCTCCTTC
TTCTTTGCTTTCGTCTCCAACATCGCCATGGCAGCTCCGTCTCTTGTTCTCCTCCTCGCT
CTCTCTGTTCTCTTCATTTCACTCCCGAGATCTGAATCTCTCCCCGTGAACCCATCCCTC
ATTCTTCAAGGCGACGGATTCGACTGGCCGATCTCTCGTATCGACGCATTCGACATCGAG
GAAGAAGGAGAAAGCCTCGAAGATGGCGACGACGTCGGTGTCGGGGATAGACGGTCATTG
TACTGGCATAGGAAGAGGTACTACATATCGTACGGTGCATTGTCGGCGAACAGAGTCCCC
TGTCCTCCAAGATCTGGGAGATCGTACTACACTCACAACTGCTTCAGAGCCAGAGGTCAG
GTGCATCCGTACAGTCGAGGCTGCTCGTCGATCACTAGATGCCGGAGATAACTAGAAGAA
AAGACTTTGCTGCATTATCCATGGGTGTTTTCGTATTTTCGTATGAACGAACTCTATTTG
TATTGTTCCGTCCGATTTCAATGTATGTGTAGTAAACCGTGTTTAATTACGTTTGTTTAA
CTTAATTAAACCCGGGGATTATTATTCGAGTGCTATT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR2D358JQ C 1
AF RR2GE92JQ C 155
AF RR2GE92TF U 1
AF RR2D358TF U 1
BS 1 619 RR2GE92TF
BS 620 620 RR2D358TF
BS 621 635 RR2GE92TF
BS 636 637 RR2D358JQ

RD RR2D358JQ 637 0 0
GGACCTCTTGGTATGTGACTTACTAGTTGCTCTTCCCTCTTCAATTATTATTCCTCCTTC
TTCTTTGCTTTCGTCTCCAACATCGCCATGGCAGCTCCGTCTCTTGTTCTCCTCCTCGCT
CTCTCTGTTCTCTTCATTTCACTCCCGAGATCTGAATCTCTCCCCGTGAACCCATCCCTC
ATTCTTCAAGGCGACGGATTCGACTGGCCGATCTCTCGTATCGACGCATTCGACATCGAG
GAAGAAGGAGAAAGCCTCGAAGATGGCGACGACGTCGGTGTCGGGGATAGACGGTCATTG
TGCTGGCATAGGAAGAGGTACTACATATCGTACGGTGCATTGTCGGCGAACAGAGTCCCC
TGTCCTCCAAGATCTGGGAGATCGTACTACACTCACAACTGCTTCAGAGCCAGAGGTCAG
GTGCATCCGTACAGTCGAGGCTGCTCGTCGATCACTAGATGCCGGAGATAACTAGAAGAA
AAGACTTTGCTGCATTATCCATGGGTGTTTTCGTATTTTCGTATGAACGAACTCTATTTG
TATTGTTCCGTCCGATTTCAATGTATGTGTAGTAAACCGTGTTTAATTACGTTTGTTTAA
CTTAATTAAACCCGGGGATTATTATTCGAGTGCTATT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2GE92JQ 483 0 0
AATCTCTCCCCGTGAACCCATCCCTCATTCTTCAAGGCGACGGATTCGACTGGCCGATCT
CTCGTATCGACGCATTCGACATCGAGGAAGAAGGAGAAAGCCTCGAAGATGGCGACGACG
TCGGTGTCGGGGATAGACGGTCATTGTACTGGCATAGGAAGAGGTACTACATATCGTACG
GTGCATTGTCGGCGAACAGAGTCCCCTGTCCTCCAAGATCTGGGAGATCGTACTACACTC
ACAACTGCTTCAGAGCCAGAGGTCAGGTGCATCCGTACAGTCGAGGCTGCTCGTCGATCA
CTAGATGCCGGAGATAACTAGAAGAAAAGACTTTGCTGCATTATCCATGGGTGTTTTCGT
ATTTTCGTATGAACGAACTCTATTTGTATTGTTCCGTCCGATTTCAATGTATGTGTAGTA
AACCGTGTTTAATTACGTTTGTTTAACTTAATTAAACCCGGGGATTATTATTCGAGTGCT
A
CC

QA 1 481 1 481
DS 

RD RR2GE92TF 637 0 0
GGACCTCTTGGTATGTGACTTACTAGTTGCTCTTCCCTCTTCAATTATTATTCCTCCTTC
TTCTTTGCTTTCGTCTCCAACATCGCCATGGCAGCTCCGTCTCTTGTTCTCCTCCTCGCT
CTCTCTGTTCTCTTCATTTCACTCCCGAGATCTGAATCTCTCCCCGTGAACCCATCCCTC
ATTCTTCAAGGCGACGGATTCGACTGGCCGATCTCTCGTATCGACGCATTCGACATCGAG
GAAGAAGGAGAAAGCCTCGAAGATGGCGACGACGTCGGTGTCGGGGATAGACGGTCATTG
TACTGGCATAGGAAGAGGTACTACATATCGTACGGTGCATTGTCGGCGAACAGAGTCCCC
TGTCCTCCAAGATCTGGGAGATCGTACTACACTCACAACTGCTTCAGAGCCAGAGGTCAG
GTGCATCCGTACAGTCGAGGCTGCTCGTCGATCACTAGATGCCGGAGATAACTAGAAGAA
AAGACTTTGCTGCATTATCCATGGGTGTTTTCGTATTTTCGTATGAACGAACTCTATTTG
TATTGTTCCGTCCGATTTCAATGTATGTGTAGTAAACCGTGTTTAATTACGTTTGTTTAA
CTTAATTAAACCCGGGGAT*ATTATTCGAGTGCTA
CC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2D358TF 637 0 0
GGACCTCTTGGTATGTGACTTACTAGTTGCTCTTCCCTCTTCAATTATTATTCCTCCTTC
TTCTTTGCTTTCGTCTCCAACATCGCCATGGCAGCTCCGTCTCTTGTTCTCCTCCTCGCT
CTCTCTGTTCTCTTCATTTCACTCCCGAGATCTGAATCTCTCCCCGTGAACCCATCCCTC
ATTCTTCAAGGCGACGGATTCGACTGGCCGATCTCTCGTATCGACGCATTCGACATCGAG
GAAGAAGGAGAAAGCCTCGAAGATGGCGACGACGTCGGTGTCGGGGATAGACGGTCATTG
TGCTGGCATAGGAAGAGGTACTACATATCGTACGGTGCATTGTCGGCGAACAGAGTCCCC
TGTCCTCCAAGATCTGGGAGATCGTACTACACTCACAACTGCTTCAGAGCCAGAGGTCAG
GTGCATCCGTACAGTCGAGGCTGCTCGTCGATCACTAGATGCCGGAGATAACTAGAAGAA
AAGACTTTGCTGCATTATCCATGGGTGTTTTCGTATTTTCGTATGAACGAACTCTATTTG
TATTGTTCCGTCCGATTTCAATGTATGTGTAGTAAACCGTGTTTAATTACGTTTGTTTAA
CTTAATTAAACCCGGGGATTATTATTCGAGTGCTA
TT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 2 4

CO CL1970Contig1 973 2 4 U
GAACGTTGGCTAGTGAGAACGAAGTAATAGTAAATGAAATTGTCCACGAAAATAGCAGTA
CTTTTGCTGACAGCTTCGATGCTGGCACGGGGGATTCAAGCAACCTTCAGGTGAAGGTTA
AGGAGACAATGGAAAAAGCCTTCTGGGATGGCGTCATGGAGTCCATGAAACAGTCACAGC
CAGATTTTAGCTGGGTTATTAAACTCATGAACGAAGTTAGGGATGAACTCTGTGAGATAT
CTCCCAAAGATTGGAGACAAGAGATTGTTCAAACTATCGATACAGATGTGCTGTCACAGT
TACTGGCTGCGGGAAATGTCGACATGGGTTATCTTGGAAATATTCTAGAGTTCTCCCTTG
GAATTTTACTGAAACTCTCGGCTCCAGCTAACGAAGAGGAAATCAGGAGTACGCACCATA
AATTAATGACAGAACTTGGAGAGATAGTTCCAACTGAAGACCAGTCCAATTCATCCTATG
CAGTTTTGATGGTCAAGGGACTGCGCTTTGTTTTGCAGCAGATCCAGATTCTGAAGAAGG
AAATCAGCAAATCTCGTTTGAAACTCTTGGAGCCACTTCTCAAAGGACCTGCTGGTCTGG
AATATCTGAAGAAGTCATTTTCCAGTCGGTATGGTTCCCCAGACCAAGCTGCTTCCTCTC
TGCCGTTGACAAAGCGTTGGCTTTTCAGTGTTCGTGGAGAGGCGGAGAAGGAGTGGGATG
AACATAAAGATGCCCTTTCTGCTGCCACAAATAATAACCCTGGATCATCAGGCCTCCCTT
CAACCACCATGCGAACTGGGGGCAATGTCCCCTCTGTTTCAAAAGTCAATGCCCCTTCGT
CGCCATTTCCAGGTATTGAACTGTCAGAGTGTAAAGGAGAAACTGTGGATCTTCTTGTTC
GTCTTGGGCTCTTAAAAATGGTGAGCGAAATTGGTGGTCTTACTTTAGAAACTATCCCCG
AAACATTTCAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F379TF U 1
AF RR2BB91TF U 523
BS 1 685 RR2F379TF
BS 686 686 RR2BB91TF
BS 687 767 RR2F379TF
BS 768 973 RR2BB91TF

RD RR2F379TF 767 0 0
GAACGTTGGCTAGTGAGAACGAAGTAATAGTAAATGAAATTGTCCACGAAAATAGCAGTA
CTTTTGCTGACAGCTTCGATGCTGGCACGGGGGATTCAAGCAACCTTCAGGTGAAGGTTA
AGGAGACAATGGAAAAAGCCTTCTGGGATGGCGTCATGGAGTCCATGAAACAGTCACAGC
CAGATTTTAGCTGGGTTATTAAACTCATGAACGAAGTTAGGGATGAACTCTGTGAGATAT
CTCCCAAAGATTGGAGACAAGAGATTGTTCAAACTATCGATACAGATGTGCTGTCACAGT
TACTGGCTGCGGGAAATGTCGACATGGGTTATCTTGGAAATATTCTAGAGTTCTCCCTTG
GAATTTTACTGAAACTCTCGGCTCCAGCTAACGAAGAGGAAATCAGGAGTACGCACCATA
AATTAATGACAGAACTTGGAGAGATAGTTCCAACTGAAGACCAGTCCAATTCATCCTATG
CAGTTTTGATGGTCAAGGGACTGCGCTTTGTTTTGCAGCAGATCCAGATTCTGAAGAAGG
AAATCAGCAAATCTCGTTTGAAACTCTTGGAGCCACTTCTCAAAGGACCTGCTGGTCTGG
AATATCTGAAGAAGTCATTTTCCAGTCGGTATGGTTCCCCAGACCAAGCTGCTTCCTCTC
TGCCGTTGACAAAGCGTTGGCTTTTTAGTGTTCGTGGAGAGGCGGAGAAGGAGTGGGATG
AACATAAAGATGCCCTTTCTGCTGCCACAAATAATAACCCTGGATCA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2BB91TF 451 0 0
TCCAGATTCTGAAGAAGGAAATCAGCAAATCTCGTTTGAAACTCTTGGAGCCACTTCTCA
AAGGACCTGCTGGTCTGGAATATCTGAAGAAGTCATTTTCCAGTCGGTATGGTTCCCCAG
ACCAAGCTGCTTCCTCTCTGCCGTTGACTAAGCGTTGGCTTTTCAGTGTTCGTGGAGAGG
CGGAGAAGGAGTGGGATGAACATAAAGATGCCCTTTCTGCTGTCACAAATAATAACCCTG
GATCATCAGGCCTCCCTTCAACCACCATGCGAACTGGGGGCAATGTCCCCTCTGTTTCAA
AAGTCAATGCCCCTTCGTCGCCATTTCCAGGTATTGAACTGTCAGAGTGTAAAGGAGAAA
CTGTGGATCTTCTTGTTCGTCTTGGGCTCTTAAAAATGGTGAGCGAAATTGGTGGTCTTA
CTTTAGAAACTATCCCCGAAACATTTCAACT

QA 1 451 1 451
DS 



CO CL1970Contig2 786 2 7 U
AATAGTATAGTTATCTTAAGTATTATTCAAAAGTTAAAATATTGTAAACATATTATGTCT
TCCTGCGTATACTACACAAATACGAGAGGCTATAATTTATGTTCCAATGTTAATAGTATT
CAGTAAATACAAACGTGGTATTCTCACTTTCGTCTACAAACACTTAAATCTTGATCAAAC
CATAAACACACCAAACCGTTCACAATCTTCAAATTTCAATTCGGTTTCTTCAGCAATTCC
TCGTACCAAAATCCATGAACACTACGCGAAACGTTCGCCACAAGAACCAAAATGTCTGAA
ACCTCTACAACCTTGTCCGAAAGAGAAGCTGCTCCGATTCTTCTTAGCATTGTCTCCACC
AACTGCTTTCTCTTCGTGTTGTTACCCGCCATAACCGCTGCTCGTGTCGCTAGGTATATG
GTCTGTGACACACGTGTGAACACTGGGTCTCCAGCTTGTAAGCTTTTCACAAGCATGTTT
GCAATCACTTGTTTCTTTGTCTCTGCATCGTCAGACTCAAGAAGCTCGGAGAACGTTTCC
ATGATTTCTGGAAGACCCGCATCGGCTTTCGCATCTAACATCTCGTAAAGTCGGTTAATG
CAGGTCCATGTAATGGTCTCCACGTCAGATGCGTTAGGGCTTGCAAGTGTTTGCTGAAGG
ATCAACACACTGATGGAGACAAGAATGACTTTCTGGATTTGGGATTGAATAGCTCTCAGT
CTGGCGAGGTTGAGTTGAAATGTTTCGGGGATAGTTTCTAAAGTAAGACCACCAATTTCG
CTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2F379JQ U 9
AF RR2FR62JQ U 1
BS 1 238 RR2FR62JQ
BS 239 239 RR2F379JQ
BS 240 438 RR2FR62JQ
BS 439 439 RR2F379JQ
BS 440 739 RR2FR62JQ
BS 740 740 RR2F379JQ
BS 741 786 RR2FR62JQ

RD RR2F379JQ 769 0 0
AGTTATCTTAAGTATTATTCAAAAGTTAAAATATTGTAAACATATTATGTCTTCCTGCGT
ATACTACACAAATACGAGAGGCTATAATTTATGTTCCAATGTTAATAGTATTCAGTAAAT
ACAAACGTGGTATTCTCACTTTCGTCTACAAACACTTAAATCTTGATCAAACCATAAACA
CACCAAACCGTTCACAATCTTCAAATTTCAATTCGGTTTCTTCAGCAATTCCTCGTACCA
GAATCCATGAACACTACGCGAAACGTTCGCCACAAGAACCAGAATGTCTGAAGCCTCTAC
AACCTTGTCCGAAAGAGAAGCTGCTCCGATTCTTCTTAGCATTGTCTCCACCAACTGCTT
TCTCTTCGTGTTGTTACTCGCCATAACCGCTGCTCGTGTCGCTAGGTATATGGTCTGTGA
CACACGTGTGAACACTGGGTCTCCAGCTTGTAAGCTTTTCACAAGCATGTTTGCAATCAC
TTGTTTCTTTGTCTCTGCATCGTCAGACTCAAGAAGCTCGGAGAACGTTTCCATGATTTC
TGGAAGACCCGCATCGGCTTTCGCATCTAACATCTCGTAGAGTCGGTTAATGCAGGTCCA
TGTAATGGTCTCCACGTCAGATGCGTTAGGGCTTGCAAGTGTTTGCTGAAGGATCAACAC
ACTGATGGAGACAAGAATGACTTTCTGGATTTGGGATTGAATAGCTCTCAGTCTGGTGAG
GTTGAGTTGAAATGTTTCGGGGATAGTTTCTAAAGTAAGACCACCAATT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2FR62JQ 786 0 0
AATAGTATAGTTATCTTAAGTATTATTCAAAAGTTAAAATATTGTAAACATATTATGTCT
TCCTGCGTATACTACACAAATACGAGAGGCTATAATTTATGTTCCAATGTTAATAGTATT
CAGTAAATACAAACGTGGTATTCTCACTTTCGTCTACAAACACTTAAATCTTGATCAAAC
CATAAACACACCAAACCGTTCACAATCTTCAAATTTCAATTCGGTTTCTTCAGCAATTTC
TCGTACCAAAATCCATGAACACTACGCGAAACGTTCGCCACAAGAACCAAAATGTCTGAA
ACCTCTACAACCTTGTCCGAAAGAGAAGCTGCTCCGATTCTTCTTAGCATTGTCTCCACC
AACTGCTTTCTCTTCGTGTTGTTACCCGCCATAACCGCTGCTCGTGTCGCTAGGTATATG
GTCTGTGACACACGTGTGGACACTGGGTCTCCAGCTTGTAAGCTTTTCACAAGCATGTTT
GCAATCACTTGTTTCTTTGTCTCTGCATCGTCAGACTCAAGAAGCTCGGAGAACGTTTCC
ATGATTTCTGGAAGACCCGCATCGGCTTTCGCATCTAACATCTCGTAAAGTCGGTTAATG
CAGGTCCATGTAATGGTCTCCACGTCAGATGCGTTAGGGCTTGCAAGTGTTTGCTGAAGG
ATCAACACACTGATGGAGACAAGAATGACTTTCTGGATTTGGGATTGAATAGCTCTCAGT
CTGGCGAGGTTGAGTTGAAGTGTTTCGGGGATAGTTTCTAAAGTAAGACCACCAATTTCG
CTCACC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL1971Contig1 958 2 6 U
GGGCCTAGATCATTAAGGAGGTGCATTGCTCTGTTTTTTTTTAGTTTATTTTGCAGATAG
AAGATGAAAACATTATATTTAATCAGAGACGAGCTAGCTCTTATAATCCTATACTTGAAC
AAAGCTGAGGCTAGAGATAAGATATGCAGAGCTATTCAGTACGGTTCCAAATTCTTGAGC
GGTGGAAAACCTGGTACTGCTCAAACTGTCTACATAAACACCAGTCTGGCTAGAAAAGTG
TTCCGTCTTTTCAAGTTTCTCAATGATTTTCAATGTCTTATTAGCCCTGTGCATAGAAGG
ACTCCTCTTCCTCTTGTCTTGCTCGGAAAGTGCAAGAATGCACTCTTGTGTACCTACTTC
TTTCTTGATCAATTCGTCTGGCTTGGTAGATCCGGCATATATAAGAACAAAATATTAACG
GAGTTGATTAGCGGTTTCTCAATTTTCTGCTGGCTTGGATCATCTATCTGTATTGTAATA
ATTGAGATTTGTGAGCTTATAAGGCTCTCTTCATCTATGAAGAAGATGGACAAGGAACTC
AAAGATGATGAAAAGAAGAATCATGATGAGTTGCATCGTGCTAAGCTTCAGAAAACAAAA
GACAGAATAGTAGCTTTGATTAAATCAAGCATGGACATTGTTGTAGCCATTGGTCTGCTT
CGTTTAGCTCCATGGATAATTGGTCATCGTGTCACTGGCTTTTTGGGGCTTATCACCTCA
CTTATCTCTTGTTATCAGTTGCTTCCAGTGCGTCCCAAGTTAAAGACATCCTGAAGCAAG
AAGAAGTTTCTTCTCTAGACGTTCAGAATAATTGTTTCATGTTGATTTCATGTAATCTTA
GGAGTCTACTTTGCTCCTATGTTGTAATAATGATAACTCTTATACTAGACTCTGTTTCAA
CATAGCTGAAAGGATTCTATGTTCAAGTTCAATACTTTTAGTCTCTTACAATCACTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB35TF U 1
AF RR2B981JQ C 307
BS 1 755 RR2FB35TF
BS 756 756 RR2B981JQ
BS 757 770 RR2FB35TF
BS 771 771 RR2B981JQ
BS 772 774 RR2FB35TF
BS 775 958 RR2B981JQ

RD RR2FB35TF 793 0 0
GGGCCTAGATCATTAAGGAGGTGCATTGCTCTGTTTTTTTTTAGTTTATTTTGCAGATAG
AAGATGAAAACATTATATTTAATCAGAGACGAGCTAGCTCTTATAATCCTATACTTGAAC
AAAGCTGAGGCTAGAGATAAGATATGCAGAGCTATTCAGTACGGTTCCAAATTCTTGAGC
GGTGGAAAACCTGGTACTGCTCAAACTGTCTACATAAACACCAGTCTGGCTAGAAAAGTG
TTCCGTCTTTTCAAGTTTCTCAATGATTTTCAATGTCTTATTAGCCCTGTGCATAGAAGG
ACTCCTCTTCCTCTTGTCTTGCTCGGAAAGTGCAAGAATGCACTCTTGTGTACCTACTTC
TTTCTTGATCAATTCGTCTGGCTTGGTAGATCCGGCATATATAAGAACAAAATATTAACG
GAGTTGATTAGCGGTTTCTCAATTTTCTGCTGGCTTGGATCATCTATCTGTATTGTAATA
ATTGAGATTTGTGAGCTTATAAGGCTCTCTTCATCTATGAAGAAGATGGACAAGGAACTC
AAAGATGATGAAAAGAAGAATCATGATGAGTTGCATCGTGCTAAGCTTCAGAAAACAAAA
GACAGAATAGTAGCTTTGATTAAATCAAGCATGGACATTGTTGTAGCCATTGGTCTGCTT
CGTTTAGCTCCATGGATAATTGGTCATCGTGTCACTGGCTTTTTGGGGCTTATCACCTCA
CTTATCTCTTGTTATCAGTTGCTTCCAGTGCGTCC*AAGTTAAAGACATCTTGA
GCAGAGAGCTTCTTCTCTA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2B981JQ 652 0 0
CTTCCTCTTGTCTTGCTCGGAAAGTGCAAGAATGCACTCTTGTGTACCTACTTCTTTCTT
GATCAATTCGTCTGGCTTGGTAGATCCGGCATATATAAGAACAAAATATTAACGGAGTTG
ATTAGCGGTTTCTCAATTTTCTGCTGGCTTGGATCATCTATCTGTATTGTAATAATTGAG
ATTTGTGAGCTTATAAGGCTCTCTTCATCTATGAAGAAGATGGACAAGGAACTCAAAGAT
GATGAAAAGAAGTATCATGATGAGTTGCATCGTGCTAAGCTTCAGAAAACAAAAGACAGA
ATCGTAGCTTTGATTAAATCAAGCATGGACATTGTTGTAGCCATTGGTTTGCTTCGTTTA
GCTCCATGGATAATTGGTCATCGTGTCACTGGCTTTTTGGGGCTTATCACCTCACTTATC
TCTTGTTATCAGTTGCTTCCAGTGCGTCCCAAGTTAAAGACATCCTGAAGCAAGAAGAAG
TTTCTTCTCTAGACGTTCAGAATAATTGTTTCATGTTGATTTCATGTAATCTTAGGAGTC
TACTTTGCTCCTATGTTGTAATAATGATAACTCTTATACTAGACTCTGTTTCAACATAGC
TGAAAGGATTCTATGTTCAAGTTCAATACTTTTAGTCTCTTACAATCACTGG

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL1972Contig1 689 2 11 U
AACTAAAAATTTCTTCAAGTATTAAACGGAGTTACACATTGTTGATAAAGGTTTGATAAT
CAATATGATAATCTAATGGCAGTTTTCTTACTGAAAAATATCAAAAGAAATCAAAGTCCA
GATAGCTACTCTGATCAGACTTGACACTGGTAGATGTGGCTGGTGCAGGAGTAGGAGGAG
CACTCTCAAATTCAACAGGCTTTGGTATCTCTGGAGGGCTTGCACATCGAACCAATGCCC
AATTCACTCCTTCAAAGAAAGGATGCTGCTTAATCTCGGTTGCACCACGCTTGTACGCTA
ATCTATGCTGAGGCTCCTTCACAAGCAGACTCCTAATCAAATCCCTAGCAGCAAAACTGA
CAACTGGAGATTCAGGGAAACGCAAAGGCTGACCAACAACGTTGAAGAGTGTTGCTCGGC
TTCCTGACCCTTTGAACGGTGTTTTACCAAACAAGAGCTCGTACAGAAAGATCCCAAAAG
TCCACCAATCAACCGCACTCCCATGCCCTTCACCTTTGATGATCTCAGGTGCCAGGTATT
CATGCGTGCCAACAAATGACATTGAGCGAGCGCCTGTGGGCTCAGCGATGAGTTCAGGCA
ACGGAGTGACCTGGTTCCCAGTTTCGGTTTTCGGTTTCTTGTCCTTCTTGTCTTTCTTGG
ATTTACTTGAGAAAAACCGTGGAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW51JQ U -1
AF RR2CL27JQ U 1
BS 1 48 RR2CL27JQ
BS 49 49 RR2EW51JQ
BS 50 99 RR2CL27JQ
BS 100 100 RR2EW51JQ
BS 101 139 RR2CL27JQ
BS 140 140 RR2EW51JQ
BS 141 334 RR2CL27JQ
BS 335 335 RR2EW51JQ
BS 336 419 RR2CL27JQ
BS 420 420 RR2EW51JQ
BS 421 689 RR2CL27JQ

RD RR2EW51JQ 510 0 0
GGGAAGAAAAAATTCTTC
AAGTATTAAACTGAGTTGCACATTGTTGATAAAGGTTTGATAATCAATATGATAATCTAA
TGGCAGTTTTCTTACTGAAAAATATCAAAAGAAATCAAAGTCCAGATAGCTACTCTGATC
AGACTTGACACTGGTAGATGTGGCTGGTGCAGGAGTAGGAGGAGCACTCTCAAATTCAAC
AGGCTTTGGTATCTCTGGAGGGCTTGCGCATCGAACCAATGCCCAATTCACTCCTTCAAA
GAAAGGATGTTGCTTAATCTCGGTTGCACCACGCTTGTACGCTAATCTATGCTGAGGCTC
CTTCACAAGCAGACTCCTAATCAAATCCCTAGCAGCAAAACTGACAACTGGAGATTCAGG
GAAACGCAGAGGCTGACCCACAACGTTGAAGAGTGTTGCTCTGCTTCCTGACCCTTTGAA
CGGTGTTTTACCAAACAAGAGCTCGTACAGAAAGATTCCAAAAGTCCACCAATCAACCGC
ACTCCCATGCCC

QA 19 510 19 510
DS 

RD RR2CL27JQ 689 0 0
AACTAAAAATTTCTTCAAGTATTAAACGGAGTTACACATTGTTGATAACGGTTTGATAAT
CAATATGATAATCTAATGGCAGTTTTCTTACTGAAAAATCTCAAAAGAAATCAAAGTCCA
GATAGCTACTCTGATCAGATTTGACACTGGTAGATGTGGCTGGTGCAGGAGTAGGAGGAG
CACTCTCAAATTCAACAGGCTTTGGTATCTCTGGAGGGCTTGCACATCGAACCAATGCCC
AATTCACTCCTTCAAAGAAAGGATGCTGCTTAATCTCGGTTGCACCACGCTTGTACGCTA
ATCTATGCTGAGGCTCCTTCACAAGCAGACTCCTGATCAAATCCCTAGCAGCAAAACTGA
CAACTGGAGATTCAGGGAAACGCAAAGGCTGACCAACAACGTTGAAGAGTGTTGCTCGGT
TTCCTGACCCTTTGAACGGTGTTTTACCAAACAAGAGCTCGTACAGAAAGATCCCAAAAG
TCCACCAATCAACCGCACTCCCATGCCCTTCACCTTTGATGATCTCAGGTGCCAGGTATT
CATGCGTGCCAACAAATGACATTGAGCGAGCGCCTGTGGGCTCAGCGATGAGTTCAGGCA
ACGGAGTGACCTGGTTCCCAGTTTCGGTTTTCGGTTTCTTGTCCTTCTTGTCTTTCTTGG
ATTTACTTGAGAAAAACCGTGGAGAAAAA

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 4

CO CL1973Contig1 1063 4 9 U
GGACGCGCTCTTCTCTTCTTTTGTCATCATCTGTGTCCTCAAGCCTCTTCTCTTGGACGG
TTCTTTGAAAGACCTCTCTCCCTTTAACATCTTTGGATTCTCAATTAACATGCGTGGTGG
TGGTTCAGAACTGGAGCTAGGGAAGAGTAATCTTCTCCCGGCTGAGAATGAGCTGGAGCT
GGAGCTGGAGCTGGGACTGGGACTAGGGCTCAGCCTCGGCAGCGGCGCGTGGAGAGAGCA
TGGGAGGATTCTGACGGCTAAGGATTTTCCTTCTGTTGGGTCTAAACGAGCTGCTGACTC
TTCCTCTCACCAAGGAGCATCTCCTCCTCGTTCAAGTCAGGTTGTGGGATGGCCACCAGT
TGGGTCACACAGGATGAACAGTTTGGTTAACCACCAAGCCGTGAAGGCTGCCAAAGCGGA
AGGAGAAGAGGTGAAGCAGAAGAATAAGGATGAGCCTAAAGATGTCTCAGTTCAGGGTTC
AGGGTTTGTGAAAGTGAACAAGGATGGAGTTGGTATAGGAAGAAAAGTGGATATGAGAGC
TCATTCTTCTTATGAAAACTTGGCTCAGACGCTTGAGGAAATGTTCTTCGGAATGACAGG
TACTACTTGTGGGGAAAAGGTGAGACCTTTAAGACTTTTAGACGGATCATCAGAGTTTGT
ACTCACTTACGAAGATAGGGAAAGTGATTGGATGCTTGTGGGTGATGTTCCATGGAGAAT
GTTTATCACTTCGGTGAAAAGGCTTCGGATCATGGGAACCTCGGAAGCTAATGGTCTTGC
***TCCAAGACATCAAAGAACAGAAGGATAGACAAAGAAACAACCTTGCTTAGCTTCTCT
ACAAAAGCTGGGCATTGACATGGTTTTTTGGTTTGGCTAGTTGCTCAATAAGTATACATA
AAAGTCGAAGGCTAGATTTGATATGTTAAACCTAGATTTCGGATATGGTTTTTCTTTAGG
TCAGTTCAGATCTTGGTCTTTTTCTTCCAGTTGTTTCTCGGCGAGAATAGTCTTGTTATA
TGTAAATAGTTGAAGCTATCTAATGTGATGAGAGTTCTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2GH71TF U 93
AF RR2A542TF U 1
AF RR2GH71JQB C 179
AF RR2A542JQ C 268
BS 1 181 RR2A542TF
BS 182 193 RR2GH71TF
BS 194 452 RR2A542TF
BS 453 453 RR2GH71TF
BS 454 841 RR2A542TF
BS 842 1006 RR2GH71JQB
BS 1007 1007 RR2A542JQ
BS 1008 1062 RR2GH71JQB
BS 1063 1063 RR2A542JQ

RD RR2GH71TF 644 0 0
GG
GGATTCTCAATTAACATGCGTGGTGGTGGTTCAGAACTGGAGCTAGGGAAGAGTAATCTT
CTCCCGGCTGAGAATGAGCTGGAGCTGGAGCTGGAGCTGGGACTGGGACTAGGGCTCAGC
CTCGGCAGCGGCGCGTGGAGAGAGCATGGGAGGATTCTGACGGCTAAGGATTTTCCTTCT
GTTGGGTCTAAACGAGCTGCTGACTCTTCCTCTCACCAAGGAGCATCTCCTCCTCGTTCA
AGTCAGGTTGTGGGATGGCCACCAGTTGGGTCACACAGGATGAACAGTTTGGTTAACCAC
CAAGCTGTGAAGGCTGCCAAAGCGGAAGGAGAAGAGGTGAAGCAGAAGAATAAGGATGAG
CCTAAAGATGTCTCAGTTCAGGGTTCAGGGTTTGTGAAAGTGAACAAGGATGGAGTTGGT
ATAGGAAGAAAAGTGGATATGAGAGCTCATTCTTCTTATGAAAACTTGGCTCAGACGCTT
GAGGAAATGTTCTTCGGAATGACAGGTACTACTTGTGGGGAAAAG*TGAGACCTTTAAGA
CTTTTAGACGGATCATCAGAGTTTGTACTCACTTACGAAGATAGGGAAAGTGATTGGATG
CTTGTGGGTGATGTTCCATGGAGAATGTTTATCACTTCG
TGA

QA 3 641 3 641
DS 

RD RR2A542TF 841 0 0
GGACGCGCTCTTCTCTTCTTTTGTCATCATCTGTGTCCTCAAGCCTCTTCTCTTGGACGG
TTCTTTGAAAGACCTCTCTCCCTTTAACATCTTTGGATTCTCAATTAACATGCGTGGTGG
TGGTTCAGAACTGGAGCTAGGGAAGAGTAATCTTCTCCCGGCTGAGAATGAGCTGGAGCT
G************GGACTGGGACTAGGGCTCAGCCTCGGCAGCGGCGCGTGGAGAGAGCA
TGGGAGGATTCTGACGGCTAAGGATTTTCCTTCTGTTGGGTCTAAACGAGCTGCTGACTC
TTCCTCTCACCAAGGAGCATCTCCTCCTCGTTCAAGTCAGGTTGTGGGATGGCCACCAGT
TGGGTCACACAGGATGAACAGTTTGGTTAACCACCAAGCCGTGAAGGCTGCCAAAGCGGA
AGGAGAAGAGGTGAAGCAGAAGAATAAGGATGGGCCTAAAGATGTCTCAGTTCAGGGTTC
AGGGTTTGTGAAAGTGAACAAGGATGGAGTTGGTATAGGAAGAAAAGTGGATATGAGAGC
TCATTCTTCTTATGAAAACTTGGCTCAGACGCTTGAGGAAATGTTCTTCGGAATGACAGG
TACTACTTGTGGGGAAAAGGTGAGACCTTTAAGACTTTTAGACGGATCATCAGAGTTTGT
ACTCACTTACGAAGATAGGGAAAGTGATTGGATGCTTGTGGGTGATGTTCCATGGAGAAT
GTTTATCACTTCGGTGAAAAGGCTTCGGATCATGGGAACCTCGGAAGCTAATGGTCTTGC
***TCCAAGACATCAAAGAACAGAAGGATAGACAAAGAAACAACCTTGCTTAGCTTCTCT
A

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR2GH71JQB 884 0 0
CTG
GAGCTGGAGCTGGGACTGGGACTAGGGCTCAGCCTCGGCAGCGGCGCGTGGAGAGAGCAT
GGGAGGATT*TGACGGCTAAGGATTT*CCTTCTGTTGGGTCTAAACGAGCTGCTGACTCT
TCCTCTCACCAAGGAGCATCTCCTCCTCGTTCAAGTCAGGTTGTGGGATGGCCACCAGTT
GGGTCACACAGGATGAACAGTTTGGTTAACCACCAAGCTGTGAAGGCTGCCAAAGCGGAA
GGAGAAGAGGTGAAGCAGAAGAATAAGGATGAGCCTAAAGATGTCTCAGTTCAGGGTTCA
GGGTTTGTGAAAGTGAACAAGGATGGAGTTGGTATAGGAAGAAAAGTGGATATGAGAGCT
CATTCTTCTTATGAAAACTTGGCTCAGACGCTTGAGGAAATGTTCTTCGGAATGACAGGT
ACTACTTGTGGGGAAAAGGTGAGACCTTTAAGACTTTTAGACGGATCATCAGAGTTTGTA
CTCACTTACGAAGATAGGGAAGGTGATTGGATGCTTGTGGGTGATGTTCCATGGAGAATG
TTTATCACTTCGGTGAAAAGGCTTCGGATCATGGGAACCTCGGAAGCTAATGGTCTTGCA
GCTCCAAGACATCAAAGAACAGAAGGATAGACAAAGAAACAACCTTGCTTAGCTTCTCTA
CAAAAGCTGGGCATTGACATGGTTTTTTGGTTTGGCTAGTTGCTCAATAAGTATACATAA
AAGTCGAAGGCTAGATTTGATATGTTAAACCTAGATTTCGGATATGGTTTTTCTTTAGGT
CAGTTCAGATCTTGGTCTTTTTCTTCCAGTTGTTTCTCGGCGAGAGTAGTCTTGTTATAT
GTAAATAGTTGAAGCTATCTAATGTGATGAGAGTTCTGTTT

QA 4 884 4 884
DS 

RD RR2A542JQ 796 0 0
TCCTTCTGTTGGGTCTAAACGAGCTGCTGACTCTTCCTCTCACCAAGGAGCATCTCCTCC
TCGTTCAAGTCAGGTTGTGGGATGGCCACCAGTTGGGTCACACAGGATGAACAGTTTGGT
TAACCACCAAGCCGTGAAGGCTGCCAAAGCGGAAGGAGAAGAGGTGAAGCAGAAGAATAA
GGATGGGCCTAAAGATGTCTCAGTTCAGGGTTCAGGGTTTGTGAAAGTGAACAAGGATGG
AGTTGGTATAGGAAGAAAAGTGGATATGAGAGCTCATTCTTCTTATGAAAACTTGGCTCA
GACGCTTGAGGAAATGTTCTTCGGAATGACAGGTACTACTTGTGGGGAAAAGGTGAGACC
TTTAAGACTTTTAGACGGATCATCAGAGTTTGTACTCACTTACGAAGATAGGGAAGGTGA
TTGGATGCTTGTGGGTGATGTTCCATGGAGAATGTTTATCACTTCGGTGAAAAGGCTTCG
GATCATGGGAACCTCGGAAGCTAATGGTCTTGC***TCCAAGACATCAAAGAACAGAAGG
ATAGACAAAGAAACAACCTTGCTTAGCTTCTCTACAAAAGCTGGGCGTTGACATGGTTTT
TTGGTTTGGCTAGTTGCTCAATAAGTATACATAAAAGTCGAAGGTTAGATTTGATATGTT
AAACCTAGATTTCGGATATGGTTTTTCTTTAGGTCAGTTCAGATCTTGGTCTTTTTCTTC
CAGTTGTTTCTCGGCGAGAATAGTCTTGTTATATGTAAATAGTTGAAGCTATCTAATGTG
ATGAGAGTTCTGTTTC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 4

CO CL1974Contig1 1142 4 6 U
GAATAAAAAAAAACCTCTAATTACAATTAAAAATTCGTCGGGCCCCTTAGGAACAGCCAT
TCAAATTTCGAATTTTTATTCATTTTTGCCTTTACTAACTTATAATCAGATCTCTGTAAT
TAAATATTTGCAGCTTGATAACTTCAAATATATTTTTCAAGTAATTCACTCTTATTTAAT
AGATGAAAACGGAAGAATTTTTAATCTATATCCATACAGTAACCTTGTTTTGAATCCATT
CAAATTAAATTGGTATTTTCTTCATCAAAATTATAATAATAATTATTGTGAGGAAACGTC
CACAATAATTAGTCTTGGACAATTTTTTTGTGAAAATGTATGTATAGCCAAAAAAGAACC
ATACCTAAAATCGGGTCAAGTTTTAATTGTTCAAAGGGATTCTGTAGTAATAAGATCCGC
TAAGCCCTATTTGGCTACTCCGGGAGCAAAAGTTCATGGGCATTATAGAGAAATTCTTTA
CGAAGGGGATACATTAGTTACATTTATATATGAAAAATCGAGATCCGGTGATATAACCCA
AGGTCTTCCAAAAGTAGAACAGGTGTTAGAAGTCCGCTCGATTGATTCAATATCGCTGAA
CTTAGAAAAGCGGATTAAGGGTTGGAACAGGTGTATAACAAGAATTCTTGGAATTCCTTG
GGGATTCTTGATTGGTGCTGAGCTAACTATAGTGCAAAGTCGTATTTCTTTGGTTAATAA
GATTCAAAAGGTTTATCGATCCCAGGGGGTGCAGATTCATAATAGACATATCGAAATTAT
TGTACGTCAAATAACATCAAAAGTTTTGGTTTCAGAAGAGGGAATGTCTAATGTTTTTTT
ACCTGGAGAATTGATTGGATTGTTACGAGCAGAACGCACGGGGCGTGCTTTAGAAGAAGC
AATCTGTTATCGAGCCGTTTTATTAGGAATAACTCGAGCATCTTTGAATACTCAAAGTTT
TATATCCGAAGCAAGTTTTCAAGAAACTGCTCGAGTTTTAGCAAAAGCTGCTCTTCGGGG
TCGTATCGATTGGTTGAAAGGCCTGAAAGAAAATGTTGTTCTAGGAGGTGTGATCCCCGC
CGGGACCGGGTTCAACAAAGGATTGGTGCATTGTTCACGGCAACATACCAATATTCTTTT
GG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 

AF RR2DD47TF U 287
AF RR2DI20TF U 1
AF RR2DI20JQ C 514
AF RR2DD47JQ C 562
BS 1 630 RR2DI20TF
BS 631 631 RR2DI20JQ
BS 632 646 RR2DI20TF
BS 647 1065 RR2DI20JQ
BS 1066 1066 RR2DD47JQ
BS 1067 1142 RR2DI20JQ

RD RR2DD47TF 279 0 0
G
GTGAGGAAACGTCCACAATAATTAGTCTTGGACAATTTTTTTGTGAAAATGTATGTATAG
CCAAAAAAGAACCATACCTAAAATCGGGTCAAGTTTTAATTGTTCAAAGGGATTCTGTAG
TAATAAGATCCGCTAAGCCCTATTTGGCTACTCCGGGAGCAAA*GTTCATGGGCATTATA
GAGAAATTCTTTACGAAGGGGATACATTAGTTACATTTATATATGAAAAATCGAGATCCG
GTGATATAACCCAAGGTCTTCCAAAAGTAGAACAGGTG

QA 2 279 2 279
DS 

RD RR2DI20TF 646 0 0
GAATAAAAAAAAACCTCTAATTACAATTAAAAATTCGTCGGGCCCCTTAGGAACAGCCAT
TCAAATTTCGAATTTTTATTCATTTTTGCCTTTACTAACTTATAATCAGATCTCTGTAAT
TAAATATTTGCAGCTTGATAACTTCAAATATATTTTTCAAGTAATTCACTCTTATTTAAT
AGATGAAAACGGAAGAATTTTTAATCTATATCCATACAGTAACCTTGTTTTGAATCCATT
CAAATTAAATTGGTATTTTCTTCATCAAAATTATAATAATAATTATTGTGAGGAAACGTC
CACAATAATTAGTCTTGGACAATTTTTTTGTGAAAATGTATGTATAGCCAAAAAAGAACC
ATACCTAAAATCGGGTCAAGTTTTAATTGTTCAAAGGGATTCTGTAGTAATAAGATCCGC
TAAGCCCTATTTGGCTACTCCGGGAGCAAAAGTTCATGGGCATTATAGAGAAATTCTTTA
CGAAGGGGATACATTAGTTACATTTATATATGAAAAATCGAGATCCGGTGATATAACCCA
AGGTCTTCCAAAAGTAGAACAGGTGTTAGAAGTCCGCTCGATTGATTCAATATCGCTGAA
CTTAGAAAAGCGGATTAAGGGTTGGAACAG*TGTATAACAAGAATT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2DI20JQ 629 0 0
AAAATCGAGATCCGGTGATATAACCCAAGGTCTTCCAAAAGTAGAACAGGTGTTAGAAGT
CCGCTCGATTGATTCAATATCGCTGAACTTAGAAAAGCGGATTAAGGGTTGGAACAGGTG
TATAACAAGAATTCTTGGAATTCCTTGGGGATTCTTGATTGGTGCTGAGCTAACTATAGT
GCAAAGTCGTATTTCTTTGGTTAATAAGATTCAAAAGGTTTATCGATCCCAGGGGGTGCA
GATTCATAATAGACATATCGAAATTATTGTACGTCAAATAACATCAAAAGTTTTGGTTTC
AGAAGAGGGAATGTCTAATGTTTTTTTACCTGGAGAATTGATTGGATTGTTACGAGCAGA
ACGCACGGGGCGTGCTTTAGAAGAAGCAATCTGTTATCGAGCCGTTTTATTAGGAATAAC
TCGAGCATCTTTGAATACTCAAAGTTTTATATCCGAAGCAAGTTTTCAAGAAACTGCTCG
AGTTTTAGCAAAAGCTGCTCTTCGGGGTCGTATCGATTGGTTGAAAGGCCTGAAAGAAAA
TGTTGTTCTAGGGGGTGTGATCCCCGCCGGGACCGGGTTCAACAAAGGATTGGTGCATTG
TTCACGGCAACATACCAATATTCTTTTGG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2DD47JQ 581 0 0
GGTGTTAGAAGTCCGCTCGATTGATTCAATATCGCTGAACTTAGAAAAGCGGATTAAGGG
TTGGAACAGGTGTATAACAAGAATTCTTGGAATTCCTTGGGGATTCTTGATTGGTGCTGA
GCTAACTATAGTGCAAAGTCGTATTTCTTTGGTTAATAAGATTCAAAAGGTTTATCGATC
CCAGGGGGTGCAGATTCATAATAGACATATCGAAATTATTGTACGTCAAATAACATCAAA
AGTTTTGGTTTCAGAAGAGGGAATGTTTAATGTTTTTTTACCTGGAGAATTGATTGGATT
GTTACGAGCAGAACGCACGGGGCGTGCTTTAGAAGAAGCAATCTGTTATCGAGCCGTTTT
ATTAGGAATAACTCGAGCATCTTTGAATACTCAAAGTTTTATATCCGAAGCAAGTTTTCA
AGAAACTGCTCGAGTTTTAGCAAAAGCTGCTTTTCGGGGTCGTATCGATTGGTTGAAAGG
CCTGAAAGAAAATGTTGTTCTAGGAGGTGTGATCCCCGCCGGGACCGGGTTCAACAAAGG
ATTGGTGCATTGTTCACGGCAACATACCAATATTCTTTTGG

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 4

CO CL1975Contig1 861 4 38 U
TTTTTTCTTTTTCCATATGAAGTCTTACGCTTGAAGAAGTTATTGAGATTGTGGAAATCT
ACGACGGAAAAAATTAATCAGTAGATCATGGAAGGAGAGAATCTGATTAAAGATCGCGGC
TTTGTGGCCGCTCCTCTGACGTTCTTCGTCGTCGCCGTCTTCCAGTTGCTGTCAAAGAGG
CTAGACCAGTTGAAGAAGAAAGGGTCGAAGAA***CACGAGGGAAGCGGAACTGAGATCT
GAGATTAAGCAGCTTTTGAGAGAGGCCACTGGGTTGTCTCAGCCAGCCACGTTTGCGCAA
GCGGCTAAGCTTAGGAGGACTGCAGCTAGTAAAGAGAAAGAACTTGCACAATATTTGGAG
CAGCACAATAAAGATATTAATCTGTCATACGATCTGTATGGAAAGGTTCTGCTTGCTTCA
AAGGTTGTGGTATATATGATCTTGGTACTTTGGTTCTGGAGGACTCCAATTGCCATTATT
GCTAAGCAGCTTGTTCAACCCTT*GGGAGGCTGTTATCTTGGGGGACAGGAGGTCACTTG
ACAGGCCATGTGATGGTTGGGATCATACCGTGGCTAATACTCTCGACCAGAGTGAGCAAA
TATGTGTGTATGTTCGTGGAGTTCTAAATCACTGTCCTGAAGAGAGTGGAGTCTAATGTT
TTAGGAGTCGCTTGTGGTCAGACTTGTTTTTTTTTCTCATCATCTACCTTGACACTTTTT
TGTACATGATACGAATCTTATTCTCCGGTTTGTGTTGGATTTGACCAATAACAAGTTTTT
TTTTTGTGCTTACATAGTTGTAACGACATTGGCCGAATGTCATTACAGTAGATCAGTCTC
CACTCCTCTACGTATTGTCAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 
25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2G509TF U 1
AF RR2G563TF U 1
AF RR2BJ31TF U 49
AF RR2BJ31JQ C 241
BS 1 296 RR2G509TF
BS 297 297 RR2BJ31TF
BS 298 318 RR2G509TF
BS 319 319 RR2BJ31TF
BS 320 437 RR2G509TF
BS 438 438 RR2BJ31TF
BS 439 467 RR2G509TF
BS 468 468 RR2BJ31TF
BS 469 473 RR2G509TF
BS 474 474 RR2BJ31TF
BS 475 503 RR2G509TF
BS 504 504 RR2BJ31TF
BS 505 550 RR2G509TF
BS 551 551 RR2BJ31TF
BS 552 584 RR2G509TF
BS 585 585 RR2BJ31TF
BS 586 610 RR2G509TF
BS 611 611 RR2BJ31TF
BS 612 648 RR2G509TF
BS 649 649 RR2BJ31TF
BS 650 661 RR2G509TF
BS 662 663 RR2G563TF
BS 664 664 RR2BJ31TF
BS 665 666 RR2G563TF
BS 667 667 RR2BJ31TF
BS 668 669 RR2G563TF
BS 670 670 RR2BJ31TF
BS 671 679 RR2G563TF
BS 680 680 RR2BJ31TF
BS 681 688 RR2G563TF
BS 689 689 RR2BJ31TF
BS 690 694 RR2G563TF
BS 695 695 RR2BJ31TF
BS 696 707 RR2G563TF
BS 708 708 RR2BJ31TF
BS 709 714 RR2G563TF
BS 715 856 RR2BJ31TF
BS 857 861 RR2BJ31JQ

RD RR2G509TF 661 0 0
TTTTTTCTTTTTCCATATGAAGTCTTACGCTTGAAGAAGTTATTGAGATTGTGGAAATCT
ACGACGGAAAAAATTAATCAGTAGATCATGGAAGGAGAGAATCTGATTAAAGATCGCGGC
TTTGTGGCCGCTCCTCTGACGTTCTTCGTCGTCGCCGTCTTCCAGTTGCTGTCAAAGAGG
CTAGACCAGTTGAAGAAGAAAGGGTCGAAGAA***CACGAGGGAAGCGGAACTGAGATCT
GAGATTAAGCAGCTTTTGAGAGAGGCCACTGGGTTGTCTCAGCCAGCCACGTTTGCTCAA
GCGGCTAAGCTTAGGAGGTCTGCAGCTAGTAAAGAGAAAGAACTTGCACAATATTTGGAG
CAGCACAATAAAGATATTAATCTGTCATACGATCTGTATGGAAAGGTTCTGCTTGCTTCA
AAGGTTGTGGTATATATAATCTTGGTACTTTGGTTCTGGAGGACTCCTATTGCTATTATT
GCTAAGCAGCTTGTTCAACCCTTTGGGAGGCTGTTATCTTGGGGGACAGGAGGTCACTTG
ACAGGCCATGCGATGGTTGGGATCATACCGTGGCTAATACTCTCAACCAGAGTGAGCAAA
TATGTGTGTAGGTTCGTGGAGTTCTAAATCACTGTCCTGAAGAGAGTGAAGTCTAATGTT
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2G563TF 732 0 0
TTTTTTCTTTTTCCATATGAAGTCTTACGCTTGAAGAAGTTATTGAGATTGTGGAAATCT
ACGACGGAAAAAATTAATCAGTAGATCATGGAAGGAGAGAATCTGATTAAAGATCGCGGC
TTTGTGGCCGCTCCTCTGACGTTCTTCGTCGTCGCCGTCTTCCAGTTGCTGTCAAAGAGG
CTAGACCAGTTGAAGAAGAAAGGGTCGAAGAA***CACGAGGGAAGCGGAACTGAGATCT
GAGATTAAGCAGCTTTTGAGAGAGGCCACTGGGTTGTCTCAGCCAGCCACGTTTGCTCAA
GCGGCTAAGCTTAGGAGGTCTGCAGCTAGTAAAGAGAAAGAACTTGCACAATATTTGGAG
CAGCACAATAAAGATATTAATCTGTCATACGATCTGTATGGAAAGGTTCTGCTTGCTTCA
AAGGTTGTGGTATATATAATCTTGGTACTTTGGTTCTGGAGGACTCCTATTGCTATTATT
GCTAAGCAGCTTGTTCAACCCTTTGGGAGGCTGTTATCTTGGGGGACAGGAGGTCACTTG
ACAGGCCATGCGATGGTTGGGATCATACCGTGGCTAATACTCTCAACCAGAGTGAGCAAA
TATGTGTGTAGGTTCGTGGAGTTCTAAATCACTGTCCTGAAGAGAGTGAAGTCTAATGTT
TTATGATTCACTTGTGGTCGGACTTGTTCTTTTT*CTCATCATCTACTTTGACA
GTTCTGTACATGATACGA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2BJ31TF 808 0 0
GG
GTGGAAATCTACGACGGAAAAAATTAATCAGTAAATCATGGAAGGAGAGAATCTGATTAA
AGATCGCGACTTTGTGGCCGCTCCTCTGACGTTCTTCGTCGTCGTCGTCTTCCAGTTGCT
GTCAAAGAGGCTAGACCAGTTGAAGAAGAAAGGGTCGAAGAACAACACGAGGGAAGCGGA
GCTGAGATCTGAGATTAAGCAGCTTTTGAGAGAGGCCACTGGGTTGTCTCAGCCAGCCAC
GTTTGCGCAAGCGGCTAAGCTTAGGAGGACTGCAGCTAGTAAAGAGAAAGAACTTGCACA
ATATTTGGAGCAGCACAATAAAGATATTAATCTGTCATACGATCTGTATGGAAAGGTTCT
GCTTGCTTCAAAGGTTGTGGTATATATGATCTTGGTACTTTGGTTCTGGAGGACTCCAAT
TGCCATTATTGCTAAGCAGCTTGTTCAACCCTT*GGGAGGCTGTTATCTTGGGGGACAGG
AGGTCACTTGACAGGCCATGTGATGGTTGGGATCATACCGTGGCTAATACTCTCGACCAG
AGTGAGCAAATATGTGTGTATGTTCGTGGAGTTCTAAATCACTGTCCTGAAGAGAGTGGA
GTCTAATGTTTTAGGAGTCGCTTGTGGTCAGACTTGTTTTTTTTTCTCATCATCTACCTT
GACACTTTTTTGTACATGATACGAATCTTATTCTCCGGTTTGTGTTGGATTTGACCAATA
ACAAGTTTTTTTTTTGTGCTTACATAGTTGTAACGACATTGGCCGAATGTCATTACAGTA
GATCAGTCTCCACTCCTCTACGTATT

QA 3 808 3 808
DS 

RD RR2BJ31JQ 621 0 0
GAGATTAAGCAGCTTTTGAGAGAGGCCACTGGGTTGTTTCAGCCAGCCACGTTTGCGCAA
GCGGCTAAGCTTAGGAGGACTGCAGCTAGTAAAGAGAAAGAACTTGCACAATATTTGGAG
CAGCACAATAAAGATATTAATCTGTCATACGATCTGTATGGAAAGGTTCTGCTTGCTTCA
AAGGTTGTGGTATATATGATCTTGGTACTTTGGTTCTGGAGGACTCCAATTGCCATTATT
GCTAAGCAGCTTGTTCAACCCTT*GGGAGGCTGTTATCTTGGGGGACAGGAGGTCACTTG
ACAGGCCATGTGATGGTTGGGATCATACCGTGGCTAATACTCTCGACCAGAGTGAGCAAA
TATGTGTGTATGTTCGTGGAGTTCTAAATCACTGTCCTGAAGAGAGTGGAGTCTAATGTT
TTAGGAGTCGCTTGTGGTCAGACTTGTTTTTTTTTCTCATCATCTACCTTGACACTTTTT
TGTACATGATACGAATCTTATTCTCCGGTTTGTGTTGGATTTGACCAATAACAAGTTTTT
TTTTTGTGCTTACATAGTTGTAACGACATTGGCCGAATGTCATTACAGTAGATCAGTCTC
CACTCCTCTACGTATTGTCAA

QA 1 621 1 621
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL1977Contig1 1211 4 6 U
GGGTAGAGGTTTTCGAGGAGCTTTCATTACCAAGTCCTTCTCTATCCACTAACCTTTGCC
TTAGATTGCTCGGAGAAGTAGAAAGAGATTACTTAATGGCTCCCGCATTCGGCAAATGTT
TCACGTTCTGCTGCGCTAAGACCTCTCCGGAAGGAGACGAAATGGCCACGGATGCGTATG
AAGCCGCCATCAAAGGACTTAAGGATCTTCTCAGTAAGAAGGGAGATCTAGGAAACGTGG
CCGCGGAGAAGATCAAAGAGTTGACTCAGGAGCTTAAGGAGCTTGCTTCCAGCAACTCTG
ACGCCGTTGAACGTATCAAATCCGGTTTCACCCACTTCAAAACTCAGAAATACTTGAAAG
ACAGTGCTCGGTTCAATGATCTCGCCAAGGGTCAGAGCCCAAAGTTTCTGGTATTCGCCT
GTTCTGATTCTCGAGTGTGTCCATCTCACATATTGAATTTCCAACCTGGAGAAGCCTTTG
TTGTCAGAAACGTTGCAAACATGGTTCCACCTTTCGACCAGAAGAGACATTCTGGCGTTG
GTGCCGCCGTTGAATACGCAGTTGTACATCTCAAGGTGGAGAACATTCTGGTGATAGGCC
ATAGCCGTTGCGGTGGGATTAAGGGACTCATGTCCATTGAAGATGATGCTGCACCAACTA
AAAGCGACTTTATAGAAAATTGGGTGAAGATCGGTGCATCAGCAAGGAACAAGATCAAGG
AGGAACATCAAGGCCTAGACGATGAAGCTAAATGCACCGAGTGTGAGAAGGAAGCTGTGA
ATGTGTCGCTTGGAAACTTGCTTTCATACCCATTTGTGAGAGCTGAAGTAGTGAAGAACA
CATTGGCGATAAGAGGAGCTCACTACAATTTCGTCAAAGGAACCTTCGATCTCTGGAAGC
TCGATTTCAAGACCACTCCTGCTTATGCCTTCTCTTGAACATAACTCTTGTGAGATTTGC
GCGCTTTTGTCTCACAAAAGCTTTGACTGCATCCTTTCTTTCTTCTCATGTTGATTCTGA
TCTCAACTTTTTTTTTATCATTTCCTTATTTGCAACTTTGCTGCTTCTGTTTCAAAAAGC
TGTAAACAATAATACTCTGAACAACCTTTTAAGCTTTGTTTATTTCGTCTAAGTAACGTG
TTGTTCAAGAAAGACCCACTTGCTAGCATTGTTCGAACTTAAGATTTGGAAATCTATAGA
TGATATTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EJ08TF U 1
AF RR2DE12JQ C 627
AF RR2CQ28JQ C 685
AF RR2CQ28TF U 694
BS 1 661 RR2EJ08TF
BS 662 662 RR2DE12JQ
BS 663 702 RR2EJ08TF
BS 703 728 RR2CQ28TF
BS 729 729 RR2DE12JQ
BS 730 1211 RR2CQ28TF

RD RR2EJ08TF 702 0 0
GGGTAGAGGTTTTCGAGGAGCTTTCATTACCAAGTCCTTCTCTATCCACTAACCTTTGCC
TTAGATTGCTCGGAGAAGTAGAAAGAGATTACTTAATGGCTCCCGCATTCGGCAAATGTT
TCACGTTCTGCTGCGCTAAGACCTCTCCGGAAGGAGACGAAATGGCCACGGATGCGTATG
AAGCCGCCATCAAAGGACTTAAGGATCTTCTCAGTAAGAAGGGAGATCTAGGAAACGTGG
CCGCGGAGAAGATCAAAGAGTTGACTCAGGAGCTTAAGGAGCTTGCTTCCAGCAACTCTG
ACGCCGTTGAACGTATCAAATCCGGTTTCACCCACTTCAAAACTCAGAAATACTTGAAAG
ACAGTGCTCGGTTCAATGATCTCGCCAAGGGTCAGAGCCCAAAGTTTCTGGTATTCGCCT
GTTCTGATTCTCGAGTGTGTCCATCTCACATATTGAATTTCCAACCTGGAGAAGCCTTTG
TTGTCAGAAACGTTGCAAACATGGTTCCACCTTTCGACCAGAAGAGACATTCTGGCGTTG
GTGCCGCCGTTGAATACGCAGTTGTACATCTCAAGGTGGAGAACATTCTGGTGATAGGCC
ATAGCCGTTGCGGTGGGATTAAGGGACTCATGTCCATTGAAGATGATGCTGCACCAACTA
AGAGCGACTTTATAGAAAATTGGGTGAAGATCGGTGCATCAG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2DE12JQ 367 0 0
CTCATGTCCATTGAAGATGATGCTGCACCAACTAAAAGCGACTTTATAGAAAATTGGGTG
AAGATCGGTGCATCAGCAAGGAACAAGATCAAGGAGGAACATCAAGGCCTAGACGATGAA
GCTAAATGCACCGAGTGTGAGAAGGAAGCTGTGAATGTGTCGCTTGGAAACTTGCTTTCA
TACCCATTTGTGAGAGCTGAAGTAGTGAAGAACACATTGGCGATAAGAGGAGCTCACTGC
AATTTCGCCAAAGGAACCTTCGATCTCTGGGAGCTCGATTTCAAGACCACTCCTGCTTAT
GCCTTCTCTTGAACATAACTCTTGTGAGATTTGCGCGCTTTTGTCTCACAAAAGCTTTGA
CTGCATC

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR2CQ28JQ 527 0 0
G
GAAGATCGGTGCATCAGCAAGGAACAAGATCAAGGAGGAACATCAAGGCCTAGACGATGA
AGCTAAATGCACCGAGTGTGAGAAGGAAGCTGTGAATGTGTCGCTTGGAAACTTGCTTTC
ATACCCATTTGTGAGAGCTGAAGTAGTGAAGAACACATTGGCGATAAGAGGAGCTCACTA
CAATTTCGTCAAAGGAACCTTCGATCTCTGGAAGCTCGATTTCAAGACCACTCCTGCTTA
TGCCTTCTCTTGAACATAACTCTTGTGAGATTTGCGCGCTTTTGTCTCACAAAAGCTTTG
ACTGCATCCTTTCTTTCTTCTCATGTTGATTCTGATCTCAACTTTTTTTTTATCATTTCC
TTATTTGCAACTTTGCTGCTTCTGTTTCAAAAAGCTGTAAACAATAATACTCTGAACAAC
CTTTTAAGCTTTGTTTATTTCGTCTAAGTAACGTGTTGTTCAAGAAAGACCCACTTGCTA
GCATTGTTCGAACTTAAGATTTGGAAATCTATAGATGATATTCATC

QA 2 527 2 527
DS 

RD RR2CQ28TF 518 0 0
GTGCATCAGCAAGGAACAAGATCAAGGAGGAACAT*AAGGCCTAGACGATGAAGCTAAAT
GCACCGAGTGTGAGAAGGAAGCTGTGAATGTGTCGCTTGGAAACTTGCTTTCATACCCAT
TTGTGAGAGCTGAAGTAGTGAAGAACACATTGGCGATAAGAGGAGCTCACTACAATTTCG
TCAAAGGAACCTTCGATCTCTGGAAGCTCGATTTCAAGACCACTCCTGCTTATGCCTTCT
CTTGAACATAACTCTTGTGAGATTTGCGCGCTTTTGTCTCACAAAAGCTTTGACTGCATC
CTTTCTTTCTTCTCATGTTGATTCTGATCTCAACTTTTTTTTTATCATTTCCTTATTTGC
AACTTTGCTGCTTCTGTTTCAAAAAGCTGTAAACAATAATACTCTGAACAACCTTTTAAG
CTTTGTTTATTTCGTCTAAGTAACGTGTTGTTCAAGAAAGACCCACTTGCTAGCATTGTT
CGAACTTAAGATTTGGAAATCTATAGATGATATTCATC

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 4

CO CL1978Contig1 694 4 3 U
GGAGATCTCTTCGTTACTTGTGTAACCAAATAATCAATGGCTCTCAAGTTCGTCTCTGGA
GCTCTTTTCTTCTGTCTTCTACTCACAATATATCCTTCTTTCTCATCCTCCAGTTTCATT
TCAGATGGCGTGTTCGGATCTCAGGCTTTGATTACTGGAAGAAACTTACTTCAGACCAAG
AAAACATGTCCGGTGAACTTTGAGTTTATGAACTACACAATCATAACAAGCCAGTGCAAA
GGTCCCAAATTCCCACCAAAGGAATGCTGCTCCGCTTTTTTGGACTTTGCGTGTCCTTAC
ACCGATGAGCTCAACGACCTGAGCAATGACTGTGCTACTACTATGTTCAGTTACATCAAT
CTCTATGGGAAATACCCGCCTGGACTTTTCGCTAACCAGTGCAAAGGAAGTAAAGAAGGT
CTCGAGTGCCCTGCTACGTCTCCCGCTTCAGCTGCAGACGTAAACGCAGCCATCACCACC
GCTTCTTGTCCTCTTTGGCTGACCATTTTTGCAGCTTTCTTGGTTTTTGTTAAATTGTTA
TGAGGCGAAGAAAGCTATTGCAATGTACTAGTAACAACCTGAGGAAGGGTGTGTGTTTGT
ATGCCCCACGATTTGTTTTATTTGTATCATTCTTTTGATCTTAGGAAACTTCAAAACCTT
CTAATTGATAATCCATATGAATTTTGCGTGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AL90JQ C 26
AF RR2H336TF U 1
AF RR2AL90TF U 26
AF RR2H336JQ C 77
BS 1 644 RR2H336TF
BS 645 645 RR2H336JQ
BS 646 694 RR2AL90TF

RD RR2AL90JQ 234 0 0
GG
AAATAATCAATGGCTCTCAAGTTCGTCTCTGGAGCTCTTTTCTTCTGTCTTCTACTCACA
ATATATCCTTCTTTCTCATCCTCCAGTTTCATTTCAGATGGCGTGTTCGGATCTCAGGCT
TTGATTACTGGAAGAAACTTACTTCAGACCAAGAAAACATGTCCGGTGAACTTTGAGTTT
ATGAACTACACAATCATAACAAGCCAGTGCAAAGGTCCCAAATTCCCACCAA

QA 3 234 3 234
DS 

RD RR2H336TF 651 0 0
GGAGATCTCTTCGTTACTTGTGTAACCAAATAATCAATGGCTCTCAAGTTCGTCTCTGGA
GCTCTTTTCTTCTGTCTTCTACTCACAATATATCCTTCTTTCTCATCCTCCAGTTTCATT
TCAGATGGCGTGTTCGGATCTCAGGCTTTGATTACTGGAAGAAACTTACTTCAGACCAAG
AAAACATGTCCGGTGAACTTTGAGTTTATGAACTACACAATCATAACAAGCCAGTGCAAA
GGTCCCAAATTCCCACCAAAGGAATGCTGCTCCGCTTTTTTGGACTTTGCGTGTCCTTAC
ACCGATGAGCTCAACGACCTGAGCAATGACTGTGCTACTACTATGTTCAGTTACATCAAT
CTCTATGGGAAATACCCGCCTGGACTTTTCGCTAACCAGTGCAAAGGAAGTAAAGAAGGT
CTCGAGTGCCCTGCTACGTCTCCCGCTTCAGCTGCAGACGTAAACGCAGCCATCACCACC
GCTTCTTGTCCTCTTTGGCTGACCATTTTTGCAGCTTTCTTGGTTTTTGTTAAATTGTTA
TGAGGCGAAGAAAGCTATTGCAATGTACTAGTAACAACCTGAGGAAGGGTGTGTGTTTGT
ATGCCCCACGATTTGTTTTATTTGTATCATTCTTTTGATCTTAG
AAACTTC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2AL90TF 669 0 0
GG
AAATAATCAATGGCTCTCAAGTTCGTCTCTGGAGCTCTTTTCTTCTGTCTTCTACTCACA
ATATATCCTTCTTTCTCATCCTCCAGTTTCATTTCAGATGGCGTGTTCGGATCTCAGGCT
TTGATTACTGGAAGAAACTTACTTCAGACCAAGAAAACATGTCCGGTGAACTTTGAGTTT
ATGAACTACACAATCATAACAAGCCAGTGCAAAGGTCCCAAATTCCCACCAAAGGAATGC
TGCTCCGCTTTTTTGGACTTTGCGTGTCCTTACACCGATGAGCTCAACGACCTGAGCAAT
GACTGTGCTACTACTATGTTCAGTTACATCAATCTCTATGGGAAATACCCGCCTGGACTT
TTCGCTAACCAGTGCAAAGGAAGTAAAGAAGGTCTCGAGTGCCCTGCTACGTCTCCCGCT
TCAGCTGCAGACGTAAACGCAGCCATCACCACCGCTTCTTGTCCTCTTTGGCTGACCATT
TTTGCAGCTTTCTTGGTTTTTGTTAAATTGTTATGAGGCGAAGAAAGCTATTGCAATGTA
CTAGTAACAACCTGAGGAAGGGTGTGTGTTTGTATGCCCCACGATTTGTTTTATTTGTAT
CATTCTTTTGATCTTAG*AAACTTCAAAACCTTCTAATTGATAATCCATATGAATTTTGC
GTGTCTC

QA 3 669 3 669
DS 

RD RR2H336JQ 617 0 0
TTCTACTCACAATATATCCTTCTTTCTCATCCTCCAGTTTCATTTCAGATGGCGTGTTCG
GATCTCAGGCTTTGATTACTGGAAGAAACTTACTTCAGACCAAGAAAACATGTCCGGTGA
ACTTTGAGTTTATGAACTACACAATCATAACAAGCCAGTGCAAAGGTCCCAAATTCCCAC
CAAAGGAATGCTGCTCCGCTTTTTTGGACTTTGCGTGTCCTTACACCGATGAGCTCAACG
ACCTGAGCAATGACTGTGCTACTACTATGTTCAGTTACATCAATCTCTATGGGAAATACC
CGCCTGGACTTTTCGCTAACCAGTGCAAAGGAAGTAAAGAAGGTCTCGAGTGCCCTGCTA
CGTCTCCCGCTTCAGCTGCAGACGTAAACGCAGCCATCACCACCGCTTCTTGTCCTCTTT
GGCTGACCATTTTTGCAGCTTTCTTGGTTTTTGTTAAATTGTTATGAGGCGAAGAAAGCT
ATTGCAATGTACTAGTAACAACCTGAGGAAGGGTGTGTGTTTGTATGCCCCACGATTTGT
TTTATTTGTATCATTCTTTTGATCTTAGGAAACTTCAAAACCTTCTAATTGATAATCCAT
ATGAATTTTGCGTGTC
C

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 4

CO CL1979Contig1 1284 4 15 U
GAAGGAACATGCATTCGCCAAACAACAAGAGTGGATACCGGGATGCATCAACTGGAGGAG
CAGGGTATAATAGCACTTCGTATGGTCGGTTAAGCAATGAATCACCATTATATTCTAATC
TGGGGTCAAGGGTTGGAGTAGCCTCCTCGGGTTATGAAACCATTTCTCAGTCAAGAGGTG
GCTACAGAGATGCATATACCACGTTGCCACAGAGTGCAACAACAGGGACTGGATCGCTTT
GGTCCAGACAGCCCTTTGAGCAGTTTGGTGTAGCAGAGAGGAATGGCGCTGTTGGTGAGG
AAGTCAGGAATAGATCAGCTCCGATAAATATAGACAACAACAACGCTGCTTCTACCGTCG
ATGCAGAGGCTAAGCTCCTTCAGTCGTTCAGGAACTGTATACTAAAGCTTATTAAACTGG
AAGGATCAGAATGGTTGTTTGGGCAAAGCGACGGAGTCGATGAAGAACTGATTGACAAGG
TAGCTGCAAGAGAAAAGTTTATCTACGAAGCTGAAACGCGAGAAGTGGGCCACATGGGCG
AGCCTCAGGTTTCATCAGTTCCTAACTGTGGAGATGGTTGCGTTTGGAGAGCTGATTTGA
TTGTGAGCTTTGGAGTTTGGTGCATTCACCGTGTCCTTGACTTGTCTCTCATGGAGAGTC
GTCCTGAGCTCTGGGGAAAGTACACTTACGTTCTCAACCGCCTTCAGGGAGTTATAGACC
CAGCGTTCTCAAAGCTGCGGACACCGATGACACCATGCTTCTGCCTTCAGATTCCGGCAA
GCCACCAAAGAGCGAGTCCGCCTTCAGCTTCAAACGGAATGTTACCTCCGGCTGCAAGAC
CAGCCAAAGGCAAATGCACAACAGCAGTCACACTTCTTGAGCTAATCAAAGACGTTGAAA
TATCGATCTCTTGTAGGAAAGGCCGGACCGGTACAGCTGCTGGAGACGTGGCTTTCCCAA
AAGGGAAAGAGAATTTGGCATCCGTGTTGAAGCGGTATAAGCGTCGGTTATCGAATAAAC
CAACCGGTATGAATCAGGATGGACCCGGTTCAAGAAAGAACCTGAATGCAGCAGCTTCTG
TGTACGGACCAATGGGTTGAAGAAGAAGAAGAACATTTGAAAATCTCATGATGATCAAAG
AGATGTCTAGAGGAAGCCCGTAAAAGCAAAACCTCTGCTTCGTTATTGTGTATTAAGGAA
AAGTGGATTTTTGTTGCTTCAGAACTTTTTTTTCCCTTGTTAATTTGGTTGTAATGTTAT
GTTATATACATATCATATTGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL46TF U 1
AF RR2AF12TF U 356
AF RR2EL46JQ C 444
AF RR2AF12JQ C 566
BS 1 708 RR2EL46TF
BS 709 709 RR2AF12TF
BS 710 721 RR2EL46TF
BS 722 722 RR2AF12TF
BS 723 731 RR2EL46TF
BS 732 732 RR2AF12TF
BS 733 771 RR2EL46TF
BS 772 991 RR2AF12TF
BS 992 1051 RR2EL46JQ
BS 1052 1052 RR2AF12JQ
BS 1053 1138 RR2EL46JQ
BS 1139 1139 RR2AF12JQ
BS 1140 1241 RR2EL46JQ
BS 1242 1242 RR2AF12JQ
BS 1243 1284 RR2EL46JQ

RD RR2EL46TF 771 0 0
GAAGGAACATGCATTCGCCAAACAACAAGAGTGGATACCGGGATGCATCAACTGGAGGAG
CAGGGTATAATAGCACTTCGTATGGTCGGTTAAGCAATGAATCACCATTATATTCTAATC
TGGGGTCAAGGGTTGGAGTAGCCTCCTCGGGTTATGAAACCATTTCTCAGTCAAGAGGTG
GCTACAGAGATGCATATACCACGTTGCCACAGAGTGCAACAACAGGGACTGGATCGCTTT
GGTCCAGACAGCCCTTTGAGCAGTTTGGTGTAGCAGAGAGGAATGGCGCTGTTGGTGAGG
AAGTCAGGAATAGATCAGCTCCGATAAATATAGACAACAACAACGCTGCTTCTACCGTCG
ATGCAGAGGCTAAGCTCCTTCAGTCGTTCAGGAACTGTATACTAAAGCTTATTAAACTGG
AAGGATCAGAATGGTTGTTTGGGCAAAGCGACGGAGTCGATGAAGAACTGATTGACAAGG
TAGCTGCAAGAGAAAAGTTTATCTACGAAGCTGAAACGCGAGAAGTGGGCCACATGGGCG
AGCCTCAGGTTTCATCAGTTCCTAACTGTGGAGATGGTTGCGTTTGGAGAGCTGATTTGA
TTGTGAGCTTTGGAGTTTGGTGCATTCACCGTGTCCTTGACTTGTCTCTCATGGAGAGTC
GTCCTGAGCTCTGGGGAAAGTACACTTACGTTCTCAACCGCCTTCAGG*AGTTATAGACC
CGGCGTTCTCAGAGCTGCGGACACCGATGACACCATGCTTCTGCCTTCAGA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2AF12TF 636 0 0
G
GTCGATGCAGAGGCTAAGCTCCTTCAGTCGTTCAGGAACTGTATACTAAAGCTTATTAAA
CTGGAAGGATCAGAATGGTTGTTTGGGCAAAGCGATGGAGTCGATGAAGAACTGATTGAC
AAGGTAGCTGCAAGAGAAAAGTTTATCTATGAAGCTGAAACGCGAGAAGTGG*CCACATG
GGCGAGCCTCAGGTTTCATCAGTTCCTAATTGTGGAGATGGTTGCGTTTGGAGAGCTGAT
TTGATTGTGAGCTTTGGAGTTTGGTGCATTCACCGTGTCCTTGACTTGTCTCTCATGGAG
AGTCGTCCTGAGCTCTGGGGAAAGTACACTTACGTTCTCAACCGCCTTCAGGGAGTTATA
GACCCAGCGTTCTCAAAGCTGCGGACACCGATGACACCGTGCTTCTGCCTTCAGATTCCG
GCAAGCCACCAAAGAGCGAGTCCGCCTTCAGCTTCAAACGGAATGTTACCTCCGGCTGCA
AGACCAGCCAAAGGCAAATGCACAACAGCAGTCACACTTCTTGAGCTAATCAAAGACGTT
GAAATATCGATCTCTTGTAGGAAAGGCCGGACCGGTACAGCTGCTGGAGACGTGGCTTTC
CCAAAAGGGAAAGAGAATTTGGCATCCGTGTTGAA

QA 2 636 2 636
DS 

RD RR2EL46JQ 841 0 0
CAAAGCGACGGAGTCGATGAAGAACTGATTGACAAGGTAGCTGCAAGAGAAAAGTTTTTC
TACGAAGCTGAAACGCGAGAAGTGGGCCACATGGGCGAGCCTCAGGTTTCATCAGTTCCT
AACTGTGGAGATGGTTGCGTTTGGAGAGCTGATTTGATTGTGAGCTTTGGAGTTTGGTGC
ATTCACCGTGTCCTTGACTTGTCTCTCATGGAGAGTCGTCCTGAGCTCTGGGGAAAGTAC
ACTTACGTTCTCAACCGCCTTCAGGGAGTTATAGACCCGGCGTTCTCAGAGCTGCGGACA
CCGATGACACCATGCTTCTGCCTTCAGATTCCGGTAAGCCACCAAAGAGCGAGTCCGCCT
TCAGCTTCAAACGGAATGTTACCTCCGGCTGCAAGACCAGCCAAAGGCAAATGCACAACA
GCAGTCACACTTCTTGAGCTAATCAAAGACGTTGAAATATCAATCTCTTGTAGGAAAGGC
CGAACCGGTACAGCTGCTGGAGACGTGGCTTTCCCAAAAGGGAAAGAGAATTTGGCATCC
GTGTTGAAGCGGTATAAGCGTCGGTTATCGAATAAACCAACCGGTATGAATCAGGATGGA
CCCGGTTCGAGAAAGAACCTGAATGCAGCAGCTTCTGTGTACGGACCAATGGGTTGAAGA
AGAAGAAGAACATTTGAAAATCTCATGATGATCAAGGAGATGTCTAGAGGAAGCCCGTAA
AAGCAAAACCTCTGCTTCGTTATTGTGTATTAAGGAAAAGTGGATTTTTGTTGCTTCAGA
ACTTTTTTTTCCCTTGTTGATTTGGTTGTAATGTTATGTTATATACATATCATATTGGAC
C

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR2AF12JQ 709 0 0
T
TGTGGAGATGGTTGCGTTTGGAGAGCTGATTTGATTGTGAGCTTTGGAGTTTGGTGCATT
CACCGTGTCCTTGACTTGTCTCTCATGGAGAGTCGTCCTGAGCTCTGGGGAAAGTACACT
TACGTTCTCAACCGCCTTCAGGGAGTTATAGACCCAGCGTTCTCAAAGCTGCGGACACCG
ATGACACCGTGCTTCTGCCTTCAGATTCCGGCAAGCCACCAAAGAGCGAGTCCGCCTTCA
GCTTCAAACGGAATGTTACCTCCGGCTGCAAGACCAGCCAAAGGCAAATGCACAACAGCA
GTCACACTTCTTGAGCTAATCAAAGACGTTGAAATATCGATCTCTTGTAGGAAAGGCCGG
ACCGGTACAGCTGCTGGAGACGTGGCTTTCCCAAAAGGGAAAGAGAATTTGGCATCCGTG
TTGAAGCGGTATAAGCGTCGGTTATCGAATAAACCAACCGGTATGAATCAGGATGGACCC
GGTTCAAGAAAGAACCTGAATGCAGCAGCTTCTGTGTACGGACCGATGGGTTGAAGAAGA
AGAAGAACATTTGAAAATCTCATGATGATCAAAGAGATGTCTAGAGGAAGCCCGTAAAAG
CAAAACCTCTGCTTCGTTATTGTGTATTAAGGAAAAGTGGATTTTTGTTGCTTCAGAACT
TTTTTT*CCCTTGTTAATTTGGTTGTAATGTTATGTTATATACATATC

QA 2 709 2 709
DS 



AS 1 4

CO CL1980Contig1 1145 4 5 U
GTCTTGGATCACTACAGCTGTTTCACGGTTCAGAAAGTGTCGGAGGAAGCGAAGGAAACA
GGGGAAAAGGTTTTGGATGTGGCGGTGGCGAGGGAGACTTCTCCAGTGGAGCTTACTGGA
GAGAGGAAAGAGGTTGTGGAGAAGCAGTGTGCTGCTTATTGGACGACTTTAGCTCCAAAT
GTGGAGGATTATAGTGGGAAGACGGCGAAGCTGATAGCTAGTGGCTCGGGGCATCTGATC
AAAGGGATTCTATGGTGTGGTGATGTGACTATGGATAGGCTCAACTGGGGGAATGATTTC
ATGAAACGGAGGTTGAGTAAGGCTGAGAAGGAGAGGGATGTTCATCCTGATACCTTGAAA
AGGATCAAGAGAGTGAAGAAGATGACCAAGATGACAGAAAGTGTGGCAAACGGTGTTCTG
TCTGGAGTAATTAAAGTTTCAGGCTTCTTCACAAGTTCAGTTGCAAACACCAAAGTAGGA
AAGAAATTTTTTAGCCTTCTCCCTGGAGAAATCGTCCTTGCAACTCTTGACGGTTTCAAC
GAGGTCTGTGACGCTGTTGAAGTAGCTGGAAGGAACGTGATGTCAACCTCGTCCACCGTT
GCAACCAAACTTGTTGATCACAGGCATGGTGGTAAAGCGGCAGAGGCGACAAACGAAGGG
CTAGAGGCAGTGGGACATGCTTTTGGGACAGCCTGGGCTGCTTTCAAAATCAGAAAGGCT
ATTAACCCTAAGAGCGTTCTCAAACCTTCCTCTCTTGCAAAATCAACCATTAAGTCGGCA
GTTTCACAGAAGAAAGCCTAGTAAAGGGCTCCGTGTTGAAGCATGAACAGGCATATTGAT
GCATGTTTGTTTGTATTGTCTCTTGTCTTTGGTTCAAATGTAAAACTGAAAAGAGGTTTG
GTGCGTTTGGATTAGTTGTTGTGAAGTGTTTCTCTGACTGAGAATCATGTGATGTAATGA
ATATGCGATGTATTTGCAAGTAGTGGGAGCTCTTAAAATTTATCATCCGAGGCTATTGAG
CCAATAATGTCTGTTATAGTTTTGCTATATGTCAAAGCTTCCCATGCTTAATCATATGGC
TAATGTGATAACATTGGAGTGTAACGGATTCTTCTTGATTATATCCATCTTATTTGAATT
TGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2EK06TF U 1
AF RR2AT33TF U 493
AF RR2AT33JQ C 247
AF RR2EK06JQ C 358
BS 1 419 RR2EK06TF
BS 420 492 RR2AT33JQ
BS 493 605 RR2AT33TF
BS 606 1002 RR2AT33JQ
BS 1003 1145 RR2EK06JQ

RD RR2EK06TF 419 0 0
GTCTTGGATCACTACAGCTGTTTCACGGTTCAGAAAGTGTCGGAGGAAGCGAAGGAAACA
GGGGAAAAGGTTTTGGATGTGGCGGTGGCGAGGGAGACTTCTCCAGTGGAGCTTACTGGA
GAGAGGAAAGAGGTTGTGGAGAAGCAGTGTGCTGCTTATTGGACGACTTTAGCTCCAAAT
GTGGAGGATTATAGTGGGAAGACGGCGAAGCTGATAGCTAGTGGCTCGGGGCATCTGATC
AAAGGGATTCTATGGTGTGGTGATGTGACTATGGATAGGCTCAACTGGGGGAATGATTTC
ATGAAACGGAGGTTGAGTAAGGCTGAGAAGGAGAGGGATGTTCATCCTGATACCTTGAAA
AGGATCAAGAGAGTGAAGAAGATGACCAAGATGACAGAAAGTGTGGCAAACGGTGTTCT

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR2AT33TF 113 0 0
AGCCTTCTCCCTGGAGAAATCGTCCTTGCAACTCTTGACGGTTTCAACGAGGTCTGTGAC
GCTGTTGAAGTAGCTGGAAGGAACGTGATGTCAACCTCGTCCACCGTTGCAAC

QA 1 113 1 113
DS 

RD RR2AT33JQ 758 0 0
CGGGG
ATGGTGTGGTGATGTGACTATGGATAGGCTCAACTGGGGGAATGATTTCATGAAACGGAG
GTTGAGTAAGGCTGAGAAGGAGAGGGATGTTCATCCTGATACCTTGAAAAGGATCAAGAG
AGTGAAGAAGATGACCAAGATGACAGAAAGTGTGGCAAACGGTGTTCTGTCTGGAGTAAT
TAAAGTTTCAGGCTTCTTCACAAGTTCAGTTGCAAACACCAAAGTAGGAAAGAAATTTTT
TAGCCTTCTCCCTGGAGAAATCGTCCTTGCAACTCTTGACGGTTTCAACGAGGTCTGTGA
CGCTGTTGAAGTAGCTGGAAGGAACGTGATGTCAACCTCGTCCACCGTTGCAACCAAACT
TGTTGATCACAGGCATGGTGGTAAAGCGGCAGAGGCGACAAACGAAGGGCTAGAGGCAGT
GGGACATGCTTTTGGGACAGCCTGGGCTGCTTTCAAAATCAGAAAGGCTATTAACCCTAA
GAGCGTTCTCAAACCTTCCTCTCTTGCAAAATCAACCATTAAGTCGGCAGTTTCACAGAA
GAAAGCCTAGTAAAGGGCTCCGTGTTGAAGCATGAACAGGCATATTGATGCATGTTTGTT
TGTATTGTCTCTTGTCTTTGGTTCAAATGTAAAACTGAAAAGAGGTTTGGTGCGTTTGGA
TTAGTTGTTGTGAAGTGTTTCTCTGACTGAGAATCATGTGATGTAATGAATATGCGATGT
ATTTGCAAGTAGTGGGAGCTCTTAAAATTTA
CC

QA 6 756 6 756
DS 

RD RR2EK06JQ 788 0 0
AAAAGGATCAAGAGAGTGAAGAAGATGACCAAGATGACAGAAAGTGTGGCAAACGGTGTT
CTGTCTGGAGTAATTAAAGTTTCAGGCTTCTTCACAAGTTCAGTTGCAAACACCAAAGTA
GGAAAGAAATTTTTTAGCCTTCTCCCTGGAGAAATCGTCCTTGCAACTCTTGACGGTTTC
AACAAGGTCTGTGACGCTGTTGAGGTAGCTGGAAGGAACGTGATGTCAACCTCGTCCACC
GTTGCAACCGAACTTGTTGATCACAGGCATGGTGGTAAAGCGGCAGAGGCGACAAACGAA
GGGCTAGAGGCAGTGGGACATGCTTTTGGGACAGCCTGGGCTGCTTTCAAAATCAGAAAG
GCTATTAACCCTAAGAGCGTTCTCAAACCTTCCTCTCTTGCAAAATCAACCATTTAGTCG
GCAGTTTCACAGAAGAAAGCCTAGTAAAGGGCTCCGTGTTGAAGCATGAACAGGCATATT
GATGCATGTTTGTTTGTATTGTCTCTTGTCTTTGGTTCAAATGTAAAACTGAAAAGAGGT
TTGGTGCGTTTGGATTAGTTGTTGTGAAGTGTTTCTCTGACTGAGAATCATGTGATGTAA
TGAATATGCGATGTATTTGCAAGTAGTGGGAGCTCTTAAAATTTATCATCCGAGGCTATT
GAGCCAATAATGTCTGTTATAGTTTTGCTATATGTCAAAGCTTCCCATGCTTAATCATAT
GGCTAATGTGATAACATTGGAGTGTAACGGATTCTTCTTGATTATATCCATCTTATTTGA
ATTTGTTC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 4

CO CL1981Contig1 660 4 4 U
TTACGAGAATAAAAATTTCTGAAAGTACAAAAACAACATTATTATGAGCATTATCAGCAT
TTCACTGAATATTAAGATAGAACTTGATCATTAATTTCATCAAGGCAATTCATCAAACAC
CATTAAAACAAAAGATATACATAAACAAAAACGGAAACGATTAGAACTTAAACTAAGTCC
TCTTGCACTCTCCTCAAGCCCTCTCGCCTCTGATCCTCCTCGCAAGCTGGATATCCTTAG
GCATGATCGTCACCCTCTTCGCGTGAATCGCACAAAGGTTCGTGTCCTCGAACAGCCCCA
CGAGGTAAGCCTCCGCCGCCTCCTGGAGAGCCGCGACGGCACTGCTCTGGAAACGCAGAT
CCGTCTTGAAGTCCTGAGCGATCTCGCAGACCAGACGCTGGAAGGGGAGCTTGCGGATCA
GGAGCTCAGTGCTCTTCTGGTACTTCCTGATCTCCCTCAGCGCCACCGTTCCGGGACGGA
ACCTGTGCGGCTTCCTCACTCCTCCCGTCGCCGGTGCCGATTTTCTCGCGGCTTTTGTCG
CCAGCTGCTTCCTTGGTGCCTTTCCTCCGGTGGATTTTCTCGCCGTCTGCTTGGTACGAG
CCATTGATTAAGCAAAGGGGAGTTTTTTTTTTGTGTGTGTTCTTCTTTGTTGATGTGTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EZ29JQ U 74
AF RR2AA27TF C 1
AF RR2AA27JQ U 3
AF RR2EZ29TF C 74
BS 1 2 RR2AA27TF
BS 3 232 RR2AA27JQ
BS 233 233 RR2EZ29JQ
BS 234 660 RR2AA27JQ

RD RR2EZ29JQ 317 0 0
AAGATAGAACTTGATCATTAATTTCATCAAGGCAATTCATCAAACACCATTAAAACAAAA
GATATACATAAACAAAAACGGAAACGATTAGAACTTAAACTAAGTCCTCTTGCACTCTCC
TCAAGCCCTCTCGCCTCTGATCCTCCTCGCAAGCTGGATATCCTTAGGCATGATCGTCAC
CCTCTTCGCGTGAATCGCACAAAGGTTCGTGTCCTCGAACAGCCCCACGAGGTAAGCCTC
CGCCGCCTCCTGGAGAGCCGCGACGGCGCTGCTCTGGAAACGCAAATCCGTCTTGAAGTC
CTGAGCGATCTCGC
GGA

QA 1 314 1 314
DS 

RD RR2AA27TF 660 0 0
TTACGAGAATAAAAATTTCTGAAAGTACAAAAACAACATTATTATGAGCATTATCAGCAT
TTCACTGAATATTAAGATAGAACTTGATCATTAATTTCATCAAGGCAATTCATCAAACAC
CATTAAAACAAAAGATATACATAAACAAAAACGGAAACGATTAGAACTTAAACTAAGTCC
TCTTGCACTCTCCTCAAGCCCTCTCGCCTCTGATCCTCCTCGCAAGCTGGATGTCCTTAG
GCATGATCGTCACCCTCTTCGCGTGAATCGCACAAAGGTTCGTGTCCTCGAACAGCCCCA
CGAGGTAAGCCTCCGCCGCCTCCTGGAGAGCCGCGACGGCACTGCTCTGGAAACGCAGAT
CCGTCTTGAAGTCCTGAGCGATCTCGCAGACCAGACGCTGGAAGGGGAGCTTGCGGATCA
GGAGCTCAGTGCTCTTCTGGTACTTCCTGATCTCCCTCAGCGCCACCGTTCCGGGACGGA
ACCTGTGCGGCTTCCTCACTCCTCCCGTCGCCGGTGCCGATTTTCTCGCGGCTTTTGTCG
CCAGCTGCTTCCTTGGTGCCTTTCCTCCGGTGGATTTTCTCGCCGTCTGCTTGGTACGAG
CCATTGATTAAGCAAAGGGGAGTTTTTTTTTTGTGTGTGTTCTTCTTTGTTGATGTGTCC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2AA27JQ 658 0 0
ACGAGAATAAAAATTTCTGAAAGTACAAAAACAACATTATTATGAGCATTATCAGCATTT
CACTGAATATTAAGATAGAACTTGATCATTAATTTCATCAAGGCAATTCATCAAACACCA
TTAAAACAAAAGATATACATAAACAAAAACGGAAACGATTAGAACTTAAACTAAGTCCTC
TTGCACTCTCCTCAAGCCCTCTCGCCTCTGATCCTCCTCGCAAGCTGGATGTCCTTAGGC
ATGATCGTCACCCTCTTCGCGTGAATCGCACAAAGGTTCGTGTCCTCGAACAGCCCCACG
AGGTAAGCCTCCGCCGCCTCCTGGAGAGCCGCGACGGCACTGCTCTGGAAACGCAGATCC
GTCTTGAAGTCCTGAGCGATCTCGCAGACCAGACGCTGGAAGGGGAGCTTGCGGATCAGG
AGCTCAGTGCTCTTCTGGTACTTCCTGATCTCCCTCAGCGCCACCGTTCCGGGACGGAAC
CTGTGCGGCTTCCTCACTCCTCCCGTCGCCGGTGCCGATTTTCTCGCGGCTTTTGTCGCC
AGCTGCTTCCTTGGTGCCTTTCCTCCGGTGGATTTTCTCGCCGTCTGCTTGGTACGAGCC
ATTGATTAAGCAAAGGGGAGTTTTTTTTTTGTGTGTGTTCTTCTTTGTTGATGTGTCC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2EZ29TF 567 0 0
AAGATAGAACTTGATCATTAATTTCATCAAGGCAATTCATCAAACACCATTAAAACAAAA
GATATACATAAACAAAAACGGAAACGATTAGAACTTAAACTAAGTCCTCTTGCACTCTCC
TCAAGCCCTCTCGCCTCTGATCCTCCTCGCAAGCTGGATATCCTTAGGCATGATCGTCAC
CCTCTTCGCGTGAATCGCACAAAGGTTCGTGTCCTCGAACAGCCCCACGAGGTAAGCCTC
CGCCGCCTCCTGGAGAGCCGCGACGGCGCTGCTCTGGAAACGCAGATCCGTCTTGAAGTC
CTGAGCGATCTCGCGGACCAGACGCTGGAAGGGGAGCTTGCGGATCAGGAGCTCAGTGCT
CTTCTGGTACTTCCAGATCTCCCTCAGCGCCACCATTCCGGGACGGAACCTGTGCGGCTT
CTTCACTCCTCCCGTCGCCGGTACCGATTTTCTCGCGGCTTTTGTCGCCAGCTGCTTCCT
TGGTGCCTTTCCTCCGGTGGATTTTCTCGCCGTCTGCTTGGTACGAGCCATTGATTAAGC
AAAGGGGAGTTTTTTTTTT
TGTGTGTC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 4

CO CL1982Contig1 1392 4 12 U
GGACACTAGCAAAAACCTTAAAATCCTCTCTCCACTGAATTAATCTACCCCCCACTCCCG
GAGACGATGAACTTCTTCAGATGTCTGTCACTACTGGTTGTGATGGCACTAGTAGGTGGC
ACAACCGCTGAGAAAGCCAACTCTACCGGAGGAGGAATGGTTTGGTCGACTGCGAGAGAC
GAGGCGGAGCTGGTAGAAGATTCCGGTTTGGTTATCGGAGAACAGGATCAAATCGACGGT
GGCTTCTCCTCCCTTGATGGGATGTTACACTGGGCTATAGGTCACTCGGATCCTGCGACA
TTGAAGGAAGCAGCTAAAGATGCACAGAAGATGTCTATGGATGAGCTGCAGAAGCGTCAA
GTTGAGCTAAAGGAGCTGGTGGAGAAGCTGAACATGCCATCAGACGCCAAGTTGATGCAA
ATAGCTGTCTCTGACTTGAACAATGCTTCCTTGTCTCTTGAAGATCGTCACCGTGCTTTG
CATGAGCTCTTGATCCTCGTTGAACCTATCGATAATGCTAATGATTTGAGCAAATCAGGA
GGGCTTAAAGTTGTGGCAGGAGAGCTTACTCATTCTGACTCAGATGTAAGGAAACTAGCT
GCGTGGGTGCTCGGGAAGGCCAGCCAAAACAACCCTTTTGTTCAAGCTCAGGTTCTTGAA
CTTGGGGCTTTGACAACATTGATAAAGATGGTAAACTCCACCTCTACTGAAGAAGCTGTG
AAAGCACTCTTTGCTGTCTCTGCCTTGATACGGAACAACGTAGCTGGCCAGGACATGTTT
TATGCATCACATGGATACATTATGCTTCAGGATGTAATGAGTAATGGGAGCTTAGATATT
AAACTTAGACGGAAAGCTGTATTCTTAGTGGGTGATTTGGCTGAGGATCAACTACAAAAC
ACAGAGAAATCTGAACTCCCTATATTCACTGATCGTTCCTCCTAAAAACAGTGGTGGATT
TGATCCTTGTGCTTGATCTTGATCTCCAAGAAAAGGCTCTTACAGCAATTAGTACTCTTC
TTCAACTTAAGTCCATAGAGCCTTTGGTTCTCAGAGACTTCTGCGGGCTGGAAGGAGCAT
TAGAGAGAATGAAGCTGCAGCTCAAGGAATCAATGGCGGATGAAGACAAGAGAGACTATG
CTGCAGATGTGGAAAGCCTTCGTGGTGAAGTGGAACTGATCTTCCGTAAAAAGCTTGGAC
TTTTTATGAACCATGATCAGTAACTCCTTGTGCGTTTGATTTATTAGTGGGAAGAGCTTT
AGACTTTAGTCATAGGAGTTGTCTACATATCTGGTTGGCTTAGATAGATTTAAGAGGTTT
CCATCTTTAGTTCCATATCCTGTTTGCTATGTTTAATATATAGTTTTATAAACTTCCACT
ATTTTTTTGGTT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ40TF U 1
AF RR2CF91TF U 2
AF RR2CF91JQ C 542
AF RR2EQ40JQ C 1201
BS 1 297 RR2EQ40TF
BS 298 298 RR2CF91TF
BS 299 345 RR2EQ40TF
BS 346 346 RR2CF91TF
BS 347 641 RR2EQ40TF
BS 642 651 RR2CF91TF
BS 652 652 RR2CF91JQ
BS 653 692 RR2CF91TF
BS 693 1311 RR2CF91JQ
BS 1312 1312 RR2EQ40JQ
BS 1313 1379 RR2CF91JQ
BS 1380 1392 RR2EQ40JQ

RD RR2EQ40TF 641 0 0
GGACACTAGCAAAAACCTTAAAATCCTCTCTCCACTGAATTAATCTACCCCCCACTCCCG
GAGACGATGAACTTCTTCAGATGTCTGTCACTACTGGTTGTGATGGCACTAGTAGGTGGC
ACAACCGCTGAGAAAGCCAACTCTACCGGAGGAGGAATGGTTTGGTCGACTGCGAGAGAC
GAGGCGGAGCTGGTAGAAGATTCCGGTTTGGTTATCGGAGAACAGGATCAAATCGACGGT
GGCTTCTCCTCCCTTGATGGGATGTTACACTGGGCTATAGGTCACTCGGATCCTGCGGCA
TTGAAGGAAGCAGCTAAAGATGCACAGAAGATGTCTATGGATGAGTTGCAGAAGCGTCAA
GTTGAGCTAAAGGAGCTGGTGGAGAAGCTGAACATGCCATCAGACGCCAAGTTGATGCAA
ATAGCTGTCTCTGACTTGAACAATGCTTCCTTGTCTCTTGAAGATCGTCACCGTGCTTTG
CATGAGCTCTTGATCCTCGTTGAACCTATCGATAATGCTAATGATTTGAGCAAATCAGGA
GGGCTTAAAGTTGTGGCAGGAGAGCTTACTCATTCTGACTCAGATGTAAGGAAACTAGCT
GCGTGGGTGCTCGGGAAGGCCAGCCAAAACAACCCTTTTGT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2CF91TF 691 0 0
GGG
ACTAGCAAAAACCTTAAAATCCTCTCTCCACTGAATTAATCTACCCCCCACTCCCGGAGA
CGATGAACTTCTTCAGATGTCTGTCACTACTGGTTGTGATGGCACTAGTAGGTGGCACAA
CCGCTGAGAAAGCCAACTCTACCGGAGGAGGAATGGTTTGGTCGACTGCGAGAGACGAGG
CGGAGCTGGTAGAAGATTCCGGTTTGGTTATCGGAGAACAGGATCAAATCGACGGTGGCT
TCTCCTCCCTTGATGGGATGTTACACTGGGCTATAGGTCACTCGGATCCTGCGACATTGA
AGGAAGCAGCTAAAGATGCACAGAAGATGTCTATGGATGAGCTGCAGAAGCGTCAAGTTG
AGCTAAAGGAGCTGGTGGAGAAGCTGAACATGCCATCAGACGCCAAGTTGATGCAAATAG
CTGTCTCTGACTTGAACAATGCTTCCTTGTCTCTTGAAGATCGTCACCGTGCTTTGCATG
AGCTCTTGATCCTCGTTGAACCTATCGATAATGCTAATGATTTGAGCAAATCAGGAGGGC
TTAAAGTTGTGGCAGGAGAGCTTACTCATTCTGACTCAGATGTAAGGAAACTAGCTGCGT
GGGTGCTCGGGAAGGCCAGCCAAAACAACCCTTTTGTTCAAGCTCAG*TTCTTGAACTTG
GGGCTTTGACAACATTGATAAAGATGGT

QA 4 691 4 691
DS 

RD RR2CF91JQ 839 0 0
GGCTTAAAGTTGTGGCAG*AGAGCTTACTCATTCTGACTCAGATGTAAGGAAACTAGCTG
CGTGGGTGCTCGGGAAGGCCAGCCAAAACAACCCTTTTGTTCAAGCTCAGGTTCTTGAAC
TTGGGGCTTTGACAACATTGATAAAGATGGTAAACTCCACCTCTACTGAAGAAGCTGTGA
AAGCACTCTTTGCTGTCTCTGCCTTGATACGGAACAACGTAGCTGGCCAGGACATGTTTT
ATGCATCACATGGATACATTATGCTTCAGGATGTAATGAGTAATGGGAGCTTAGATATTA
AACTTAGACGGAAAGCTGTATTCTTAGTGGGTGATTTGGCTGAGGATCAACTACAAAACA
CAGAGAAATCTGAACTCCCTATATTCACTGATCGTTCCTCCTAAAAACAGTGGTGGATTT
GATCCTTGTGCTTGATCTTGATCTCCAAGAAAAGGCTCTTACAGCAATTAGTACTCTTCT
TCAACTTAAGTCCATAGAGCCTTTGGTTCTCAGAGACTTCTGCGGGCTGGAAGGAGCATT
AGAGAGAATGAAGCTGCAGCTCAAGGAATCAATGGCGGATGAAGACAAGAGAGACTATGC
TGCAGATGTGGAAAGCCTTCGTGGTGAAGTGGAACTGATCTTCCGTAAAAAGCTTGGACT
TTTTATGAACCATGATCAGTAACTCCTTGTGCGTTTGATTTATTAGTGGGAAGAGCTTTA
GACTTTAGTCATAGGAGTTGTCTACATATCTGGTTGGCTTAGATAGATTTGAGAGGTTTC
CATCTTTAGTTCCATATCCTGTTTGCTATGTTTAATATATAGTTTTATAAACTTCCAC
G

QA 1 838 1 838
DS 

RD RR2EQ40JQ 192 0 0
TTTTTATGAACCATGATCAGTAACTCCTTGTGCGTTTGATTTATTAGTGGGAAGAGCTTT
AGACTTTAGTCATAGGAGTTGTTTACATATTTGGTTGGCTTAGATAGATTTAAGAGGTTT
CCATCTTTAGTTCCATATCCTGTTTGCTATGTTTAATATATAGTTTTATAAACTTCCACT
ATTTTTTTGGTT

QA 1 192 1 192
DS 



AS 1 4

CO CL1983Contig1 1436 4 10 U
GGATCTTAATTAGAAAAAGAACCAAAAAAACCCTAATCACAATCTCTGTCTCAAACCTTC
ATTTTACAACTCGGAATCTCGATCAATATATTTGAAATTCTCCCTTTGTTTTTATATCTC
TTTGTCCATTCGTTTATCCGTGTAGACTTGTCCGAAGAAGCCTGTTTGTTATTTTACTGT
TGTTTTTTTGTCTGAATCGAAAACAAGTTTGGGGAAGAAGATAAGATGGCTGGAGGAGGT
GGAAACAGGAGAGACGAAGGGTCGATTACGATCCAGAGCACCAATTTGTTTGCAGCTTTG
GACACTCGCAAGAAGAAGAACAGTGGTAAGAGCAAAGCCACAGGTTTTCTGGGCGCCTAC
GCCTTTGAAAGTTAAGTCTTGGGCTGATATCGATGATGACGATGAAGATGATGACTATTA
CGCCACCACCGCTCCTCCCTCCTCTGGTTGGGCCACTTCCGAGCCTAAAGACACTCATGT
TGAGGAAAGTGAAAGCGAGGAAGATGTTCTTGATGAAGGTGATGATGATGTGGATGAAGA
GCAGGAGCATGAAACAGAGGTACAAGTTCATCCGGAGCCAGAGCCTGAGGTGAAGAAAGC
ACCTGAAGTTCCTGCGCCTCCTAAAGAGGCAGAGAGGCAACTCTCCAAGAAAGAGAGGAA
AAAGAAGGAACTTGCTGAGCTTGAGGCTTTGTTGGCTGATTTTGGAGTTGCCCCCAAGGA
GGATAATGGCCAAGATGCCTCTAAAGAGGCTAAAGAAGAGACCAATGGAGAAGGGGAGAA
GAAAGAGAACGCAGCAGGTGGGGAGTCAAAGGCATCAAAGAAGAAGAAAAAGAAGGATAA
ACAGAAGGAGGTAAAAGAATCTCAGGAACAACAAGCCAACGCAGATGCTGTAGGTGAAGC
TACTGGGTCTGAACCGGCTGAGGAAGATTCTGCAATTGATGTCAAAGAAAGGCTAAAAAA
GATTGCATCAATGAAGAAGAAGAAATCGAGCAAAGAGGTGGATGCCGGAGCCAAAACAGC
CGCGCAGGAGGCAGCTGCTAGACGTGCAAAGCTGGCGGCTGCAAAGAAGAAGGAGAAGAA
CCACTATAACCAACAGCCTGTGCGGTAAGACCCACCATTTTGATCTTTGATGGACGTATG
AATATGGGCATGTAATTGGCCGTATTTTGTTCATATGGGTCGTCTTCTCTGCTTTAATAA
ATCTTTTGAAGACTTCAAAACGCACATTGAATCCTTTTTCTTTCTAGTCTTATTATGATG
AACAGTCTAAAGACAAAAAACTTGAAGATTTCGTTTATTTTCTGTATGTGTCCCTTTTAA
CCTCAGACCTTTTTAGGGGTGATGATTTTAGTTCTGTTTTCAAATTATCTTCTTATGTAT
GGTTTGATGGTTGCTTTATTATTACTCATGGAGAATCCTCTTACGGGGATCATCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A529TF U 1
AF RR2EO78TF U 494
AF RR2G391JQ C 625
AF RR2A529JQ C 676
BS 1 658 RR2A529TF
BS 659 1219 RR2EO78TF
BS 1220 1220 RR2G391JQ
BS 1221 1278 RR2EO78TF
BS 1279 1285 RR2G391JQ
BS 1286 1286 RR2A529JQ
BS 1287 1320 RR2G391JQ
BS 1321 1321 RR2A529JQ
BS 1322 1366 RR2G391JQ
BS 1367 1436 RR2A529JQ

RD RR2A529TF 658 0 0
GGATCTTAATTAGAAAAAGAACCAAAAAAACCCTAATCACAATCTCTGTCTCAAACCTTC
ATTTTACAACTCGGAATCTCGATCAATATATTTGAAATTCTCCCTTTGTTTTTATATCTC
TTTGTCCATTCGTTTATCCGTGTAGACTTGTCCGAAGAAGCCTGTTTGTTATTTTACTGT
TGTTTTTTTGTCTGAATCGAAAACAAGTTTGGGGAAGAAGATAAGATGGCTGGAGGAGGT
GGAAACAGGAGAGACGAAGGGTCGATTACGATCCAGAGCACCAATTTGTTTGCAGCTTTG
GACACTCGCAAGAAGAAGAACAGTGGTAAGAGCAAAGCCACAGGTTTTCTGGGCGCCTAC
GCCTTTGAAAGTTAAGTCTTGGGCTGATATCGATGATGACGATGAAGATGATGACTATTA
CGCCACCACCGCTCCTCCCTCCTCTGGTTGGGCCACTTCCGAGCCTAAAGACACTCATGT
TGAGGAAAGTGAAAGCGAGGAAGATGTTCTTGATGAAGGTGATGATGATGTGGATGAAGA
GCAGGAGCATGAAACAGAGGTACAAGTTCATCCGGAGCCAGAGCCTGAGGTGAAGAAAGC
ACCTGAAGTTCCTGCGCCTCCTAAAGAGGCAGAGAGGCAACTCTCCAAGAAAGAGAGG

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2EO78TF 790 0 0
G
GCGAGGAAGATGTTCTTGATGAAGGTGATGATGATGTGGATGAAGAGCAGGAGCATGAAA
CAGAGGTACAAGTTCATCCGGAGCCAGAGCCTGAGGTGAAGAAAGCACCTGAAGTTCCTG
CGCCTCCTAAAGAGGCAGAGAGGCAACTCTCCAAGAAAGAGAGGAAAAAGAAGGAACTTG
CTGAGCTTGAGGCTTTGTTGGCTGATTTTGGAGTTGCCCCCAAGGAGGATAATGGCCAAG
ATGCCTCTAAAGAGGCTAAAGAAGAGACCAATGGAGAAGGGGAGAAGAAAGAGAACGCAG
CAGGTGGGGAGTCAAAGGCATCAAAGAAGAAGAAAAAGAAGGATAAACAGAAGGAGGTAA
AAGAATCTCAGGAACAACAAGCCAACGCAGATGCTGTAGGTGAAGCTACTGGGTCTGAAC
CGGCTGAGGAAGATTCTGCAATTGATGTCAAAGAAAGGCTAAAAAAGATTGCATCAATGA
AGAAGAAGAAATCGAGCAAAGAGGTGGATGCCGGAGCCAAAACAGCCGCGCAGGAGGCAG
CTGCTAGACGTGCAAAGCTGGCGGCTGCAAAGAAGAAGGAGAAGAACCACTATAACCAAC
AGCCTGTGCGGTAAGACCCACCATTTTGATCTTTGATGGACGTATGAATATGGGCATGTA
ATTGGCCGTATTTTGTTCATATGGGTCGTCTTCTCTGCTTTAATAAATCTTTTGAAGACT
TCAAA*CGCACATTGAATCCTTTTTCTTTCTAGTCTTATTATGATGAACAGTCTAAAGAC
AAAA
GCTTG

QA 2 785 2 785
DS 

RD RR2G391JQ 742 0 0
AGAGGCAGAGAGGCAACTCTCCAAGAAAGAGAGGAAAAAGAAGGAACTTGCTGAGCTTGA
GGCTTTGTTGGCTGATTTTGGAGTTGCCCCCAAGGAGGATAATGGCCAAGATGCCTCTAA
AGAGGCTAAAGAAGAGACCAATGGAGAAGGGGAGAAGAAAGAGAACGCAGCAGGTGGGGA
GTCAAAGGCATCAAAGAAGAAGAAAAAGAAGGATAAACAGAAGGAGGTAAAAGAATCTCA
GGAACAACAAGCCAACGCAGATGCTGTAGGTGAAGCTACTGGGTCTGAACCGTCTGAGGA
AGATTCTGCAATTGATGTCAAAGAAAGGCTAAAAAAGATTGCATCAATGAAGAAGAAGAA
ATCGAGCAAAGAGGTGGATGCCGGAGCCAAAACAGCCGCGCAGGAGGCAGCTGCTAGACG
TGCAAAGCTGGCGGCTGCAAAGAAGAAGGAGAAGAACCACTATAACCAACAGCCTGTGCG
GTAAGACCCACCATTTTGATCTTTGATGGACGTATGAATATGGGCATGTAATTGGCCGTA
TTTTGTTCATATGGGTCGTCTTTTCTGCTTTAATAAATCTTTTGAAGACTTCAAAACGCA
CATTGAATCCTTTTTCTTTCTAGTCTTATTATGATGAACAGTCTAAAGAAAAAAAACTTG
A*GATTTCGTTTATTTTCTGTATGTGTCCCTTTTAATCTCAGACCTTTTTAGGGGTGATG
ATTTTAGTTCTGTTTTCAAATT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2A529JQ 761 0 0
TGAGCTTGAGGCTTTGTTGGCTGATTTTGGAGTTGCCCCCAAGGAGGATAATGGCCAAGA
TGCCTCTAAAGAGGCTAAAGAAGAGACCAATGGAGAAGGGGAGAAGAAAGAGAACGCAGC
AGGTGGGGAGTCAAAGGCATCAAAGAAGAAGAAAAAGAAGGATAAACAGAAGGAGGTAAA
AGAATCTCAGGAACAACAAGCCAACGCAGATGCTGTAGGTGAAGCTACTGGGTCTGAACC
GGCTGAGGAAGATTCTGCAATTGATGTCAAAGAAAGGCTAAAAAAGATTGCATCAATGAA
GAAGAAGAAATCGAGCAAAGAGGTGGATGCCGGAGCCAAAACAGCCGCGCAGGAGGCAGC
TGCTAGACGTGCAAAGCTGGCGGCTGCAAAGAAGAAGTAGAAGAACCACTATAACCAACA
GCCTGTGCGGTAAGGCCCACCATTTTGATCTTTGATGGACGTATGAATATGGGCATGTAA
TTGGCCGTATTTTGTTCATATGGGTCGTCTTCTCTGCTTTAATAAATCTTTTGAAGACTT
CAAAACGCACATTGAATCCTTTTTCTTTCTAGTCTTATTATGATGAACAGTTTAAAGACA
AAAAACTTGAAGATTTCGTTTATTTTCTGTATGTGTCCCTTTTAACCTCAGACCTTTTTA
GGGGTGATGATTTTAGTTCTGTTTTCAAATTATCTTCTTATGTATGGTTTGATGGTTGCT
TTATTATTACTCATGGAGAATCCTCTTACGGGGATCATCAG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 4

CO CL1984Contig1 1205 4 17 U
AAGATCTTCGATCGAGATCTCAAGCGCGTACATCGTGACAGAGCGGCGTGGCTGTCTCGC
AACAAAAACGACAGCTTTGTCGACGCTGTTGCTGAGAATCTGCTTGACCGCTTAGAGGAT
TGTAAGAAGAGTTTTCCATCTGCATTGTGTTTGGGAGAGATCTCTTGGTGCTGTTCAGCG
TTTACTACGTGCTCGCGGTGGGATTGAAAAGCTAATCATGATGGATACCCCACATGACAT
GATTAAATCATGTAGAGATGCTCCACTTGATAACTCCATCGACACATCTTACTTGGTTGG
TGACGAAGAGTTTCTCCCTATCAAAGAGAGTTCGGTTGATTTGATCATAAGTTCCTTGGG
GGCTTCATTGGACAAACGATCTTCCAGGTTCCATGATACAGTGCAAACTGGCTCTGAAGC
CTGATGGCTCGTTTTTAGCAGCCATTCTTGGTGGAGAAACCTTAAAGGAGCTGAGAATAG
CATGCACTTTGGCTCACATGGAGCGCGAAAGAGGGATTAGTCCCCGCCTATCTCCTTTGG
CACAGGTTAGGGACGCAGGGAATCTGTTGACCAGGGCGAGTTTTAGTCTTCCTGGTGTTG
ACGTTGACGAATATGTTGTTAAATACAAGAGTGCGCTGGATCTTATAGAGCATCTTCGTG
CAATGGGTGAAACCAACGCTCTACTCCAGAGAAACAAGATATTGAATCGTGAAACTGCTC
TTGCCACGGCCGCCATATATGACTCCATGTTCGCCACTGAAGACGGCACTATACCTGCTA
CTTTTCAGGTGATTTACATGACGGGATGGAGAGAACACGCGTCTCATCCTCAGGCCAAAC
GCAGAGGTTCAGCCACCGTATCCTTCACCGATATCCATAAGCAATTCGGTGGTCAATAAA
GCGACACTTTTACAACAAAAAAAAAAAAGACTCGAGTCAGAATCAGTGACTTTTTTAGTT
GTAGTGTGCATGCATATGCCCTTGTGAGGTGAGACCTTCTTGTAAACCATCATGATGTCT
CGCATGGAATAAATAATGGACTATCTGACCAGATATGCAGATACATGTTTGAGAGGAAGT
TGATATTATATATTGTGCAACAACAATTTGTATTTCAAAAATGTTTCCAGATATTTTATC
AAACACAACAATACGTGTATAATTATTGTCTGAAACAATCAAAGCGTATTACAACCGAAG
TTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2G045TF U 1
AF RR2CH84TF U 217
AF RR2CH84JQ C 682
AF RR2G045JQ C 529
BS 1 229 RR2G045TF
BS 230 230 RR2CH84TF
BS 231 429 RR2G045TF
BS 430 430 RR2CH84TF
BS 431 475 RR2G045TF
BS 476 476 RR2CH84TF
BS 477 526 RR2G045TF
BS 527 527 RR2CH84TF
BS 528 532 RR2G045TF
BS 533 682 RR2CH84TF
BS 683 683 RR2G045JQ
BS 684 832 RR2CH84TF
BS 833 833 RR2G045JQ
BS 834 886 RR2CH84TF
BS 887 923 RR2G045JQ
BS 924 926 RR2CH84JQ
BS 927 1205 RR2G045JQ

RD RR2G045TF 532 0 0
AAGATCTTCGATCGAGATCTCAAGCGCGTACATCGTGACAGAGCGGCGTGGCTGTCTCGC
AACAAAAACGACAGCTTTGTCGACGCTGTTGCTGAGAATCTGCTTGACCGCTTAGAGGAT
TGTAAGAAGAGTTTTCCATCTGCATTGTGTTTGGGAGAGATCTCTTGGTGCTGTTCAGCG
TTTACTACGTGCTCGCGGTGGGATTGAAAAGCTAATCATGATGGATACCTCACATGACAT
GATTAAATCATGTAGAGATGCTCCACTTGATAACTCCATCGACACATCTTACTTGGTTGG
TGACGAAGAGTTTCTCCCTATCAAAGAGAGTTCGGTTGATTTGATCATAAGTTCCTTGGG
GGCTTCATTGGACAAACGATCTTCCAGGTTCCATGATACAGTGCAAACTGGCTCTGAAGC
CTGATGGCTTGTTTTTAGCAGCCATTCTTGGTGGAGAAACCTTAAAGGAGCTGAGGATAG
CATGCACTTTGGCTCACATGGAGCGCGAAAGAGGGATTAGTCCCCGTCTATC

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2CH84TF 670 0 0
CATGATGGATACCCCACATGACATGATTAAATCATGTAGAGATGCTCCACTTGATAACTC
CATCGACACATCTTACTTGGTTGGTGACGAAGAGTTTCTCCCTATCAAAGAGAGTTCGGT
TGATTTGATCATAAGTTCCTTGGGG*CTTCATTGGACAAACGATCTTCCAGGTTCCATGA
TACAGTGCAAACTGGCTCTGAAGCCTGATGGCTCGTTTTTAGCAGCCATTCTTGGTGGAG
AAACCTTAAAGGAGCTGAGAATAGCATGCACTTTGGCTCACATGGAGCGCGAAGGAGGGA
TTAGTCCCCGCCTATCTCCTTTGGCACAGGTTAGGGACGCAGGGAATCTGTTGACCAGGG
CGAGTTTTAGTCTTCCTGGTGTTGACGTTGACGAATATGTTGTTAAATACAAGAGTGCGC
TGGATCTTATAGAGCATCTTCGTGCAATGGGTGAAACCAACGCTCTTCTCCAGAGAAACA
AGATATTGAATCGTGAAACTGCTCTTGCCACGGCCGCCATATATGACTCCATGTTCGCCA
CTGAAGACGGCACTATACCTGCTACTTTTCAGGTGATTTACATGACGGGATGGAGAGAAC
ACGCGTCTCATCCTCATGCCAAACGCAGAGGTTCAGCCACCGTATCCTTCACCGATATCC
ATAAGCAATT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2CH84JQ 459 0 0
TTT
TCCAGAGAAACAAGATATTGAATCGTGAAACTGCTCTTGCCACGGCCGCCATATATGACT
CCATGTTCGCCACTGAAGACGGCACTATACCTGCTACTTTTCAGGTGATTTACATGACGG
GATGGAGAGAACACGCGTTTCATCCTCAGGCCAAACGCAGAGGTTCAGCCACCGTATCCT
TCACCGATATCCATAAGCAATTCGGTGGTCAATAAAGCGACACTTTTACAACAAAAAAAA
AAAAGACTCGAGTCAGAATCAGTGACTTTTTTAGTTGTAGTGTGCATGCATATGCCCTTG
TGAGGTGAGACCTTCTTGTAAACCATCATGATGTCTCGCATGGAATAAATAATGGACTAT
CTGACCAGATATGCAGATACATGTTTGAGCGGAAGTTGATATTATATATTGTGCAACAAC
AATTTGTATTTCAAAAATGTTTCCAGATATTTTATC

QA 4 459 4 459
DS 

RD RR2G045JQ 677 0 0
TATCTCCTTTGGCACAGGTTAGGGACGCAGGGAATCTGTTGACCAGGGCGGGTTTTAGTC
TTCCTGGTGTTGACGTTGACGAATATGTTGTTAAATACAAGAGTGCGCTGGATCTTATAG
AGCATCTTCGTGCAATGGGTGAAACCAACGCTCTACTCCAGAGAAACAAGATATTGAATC
GTGAAACTGCTCTTGCCACGGCCGCCATATATGACTCCATGTTCGCCACTGAAGACGGCA
CTATACCTGCTACTTTTCAGGTGATTTACATGACGGGATGGAGAGAACACGCGTCTCATC
CTCAGGCCAAACGCAGAGGTTCAGCCACCGTATCCTTCACCGATATCCATAAGCAATTCG
GTGGTCAATAAAGCGACACTTTTACAACAAAAAAA***AAGACTCGAGTCAGAATCAGTG
ACTTTTTTAGTTGTAGTGTGCATGCATATGCCCTTGTGAGGTGAGACCTTCTTGTAAACC
ATCATGATGTCTCGCATGGAATAAATAATGGACTATCTGACCAGATATGCAGATACATGT
TTGAGAGGAAGTTGATATTATATATTGTGCAACAACAATTTGTATTTCAAAAATGTTTCC
AGATATTTTATCAAACACAACAATACGTGTATAATTATTGTCTGAAACAATCAAAGCGTA
TTACAACCGAAGTTTCC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 4

CO CL1985Contig1 593 4 6 U
AAACATGAACGTGGATATCTTACCAATAACACTAGACATAAAAGTGAAATACTCCTATGA
AATCTTCTGGATTAACAAACGCCACATGGACGCAACAAGAAAAGAAAAAAGGGGGCGAAA
ACTCACTGTATATCTCTCGCTAGATTCACTAACTACTAAACCCATTAATCAACAAAAGAA
GAAGCAAACCAAATGGGTATTGATGAAGATCGGTGTATTACTAGCTAGAGTATTAGAGAC
AAAAGTGGATAATTACATTAAGAGAGCGTATCTCATGCCATCACAAACCATGAGATGGTT
AACCTCCGAGACCCTTCCGTAATCTCCCGACACCCAAACACCATCAGTCCTGCTACCACG
TGGAACCGCAAAACATGACATGATCGATAACGGAAACTTCATCATCGCGCCGTTTTCTCT
CCCGTCTCCTCCGTTGACGATGGTTGAAGGGAACGCGTTTTCGTCAGCAACACGCGGGCT
TTTCCGAAGACTTTGGAGGTTTCGCCTTAATAAAGACAACACCTTCAGCATCTCTTTCCT
TGTTCTTTAGTATATATATCAGTTTTGGTATTTGGAGAGAGCAATGTGTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E713JQ U 1
AF RR2E713TF C 1
AF RR2CJ41JQ U 43
AF RR2CJ41TF C 43
BS 1 83 RR2E713JQ
BS 84 84 RR2CJ41JQ
BS 85 336 RR2E713JQ
BS 337 337 RR2CJ41JQ
BS 338 587 RR2E713JQ
BS 588 593 RR2CJ41JQ

RD RR2E713JQ 589 0 0
AAACATGAACGTGGATATCTTACCAATAACACTAGACATAAAAGTGAAATACTCCTATGA
AATCTTCTGGATTAACAAACGCCTCATGGACGCAACAAGAAAAGAAAAAAGGGGGCGAAA
ACTCACTGTATATCTCTCGCTAGATTCACTAACTACTAAACCCATTAATCAACAAAAGAA
GAAGCAAACCAAATGGGTATTGATGAAGATCGGTGTATTACTAGCTAGAGTATTAGAGAC
AAAAGTGGATAATTACATTAAGAGAGCGTATCTCATGCCATCACAAACCATGAGATGGTT
AACCTCCGAGACCCTTCCGTAATCTCCCGACACCCACACACCATCAGTCCTGCTACCACG
TGGAACCGCAAAACATGACATGATCGATAACGGAAACTTCATCATCGCGCCGTTTTCTCT
CCCGTCTCCTCCGTTGACGATGGTTGAAGGGAACGCGTTTTCGTCAGCAACACGCGGGCT
TTTCCGAAGACTTTGGAGGTTTCGCCTTAATAAAGACAACACCTTCAGCATCTCTTTCCT
TGTTCTTTAGTATATATATCAGTTTTGGTATTTGGAGAGAGCAATGT
CC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2E713TF 589 0 0
AAACATGAACGTGGATATCTTACCAATAACACTAGACATAAAAGTGAAATACTCCTATGA
AATCTTCTGGATTAACAAACGCCTCATGGACGCAACAAGAAAAGAAAAAAGGGGGCGAAA
ACTCACTGTATATCTCTCGCTAGATTCACTAACTACTAAACCCATTAATCAACAAAAGAA
GAAGCAAACCAAATGGGTATTGATGAAGATCGGTGTATTACTAGCTAGAGTATTAGAGAC
AAAAGTGGATAATTACATTAAGAGAGCGTATCTCATGCCATCACAAACCATGAGATGGTT
AACCTCCGAGACCCTTCCGTAATCTCCCGACACCCACACACCATCAGTCCTGCTACCACG
TGGAACCGCAAAACATGACATGATCGATAACGGAAACTTCATCATCGCGCCGTTTTCTCT
CCCGTCTCCTCCGTTGACGATGGTTGAAGGGAACGCGTTTTCGTCAGCAACACGCGGGCT
TTTCCGAAGACTTTGGAGGTTTCGCCTTAATAAAGACAACACCTTCAGCATCTCTTTCCT
TGTTCTTTAGTATATATATCAGTTTTGGTATTTGGAGAGAGCAATGT
CC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2CJ41JQ 551 0 0
AGTGAAATACTCCTATGAAATCTTCTGGATTAACAAACGCCACATGGACGCAACAAGAAA
AGAAAAAAGGGGGCGAAAACTCACTGTATATCTCTCGCTAGATTCACTAACTACTAAACC
CATTAATCAACAAAAGAAGAAGCAAACCAAATGGGTATTGATGAAGATCGGTGTATTACT
AGCTAGAGTATTAGAGACAAAAGTGGATAATTACATTAAGAGAGCGTATCTCATGCCATC
ACAAACCATGAGATGGTTAACCTCCGAGACCCTTCCGTAATCTCCCGACACCCAAACACC
ATCAGTCCTGCTACCACGTGGAACCGCAAAACATGACATGATCGATAACGGAAACTTCAT
CATCGCGCCGTTTTCTCTCCCGTCTCCTCCGTTGACGATGGTTGAAGGGAACGCGTTTTC
GTCAGCAACACGCGGGCTTTTCCGAAGACTTTGGAGGTTTCGCCTTAATAAAGACAACAC
CTTCAGCATCTCTTTCCTTGTTCTTTAGTATATATATCAGTTTTGGTATTTGGAGAGAGC
AATGTGTTTCC

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2CJ41TF 551 0 0
AGTGAAATACTCCTATGAAATCTTCTGGATTAACAAACGCCACATGGACGCAACAAGAAA
AGAAAAAAGGGGGCGAAAACTCACTGTATATCTCTCGCTAGATTCACTAACTACTAAACC
CATTAATCAACAAAAGAAGAAGCAAACCAAATGGGTATTGATGAAGATCGGTGTATTACT
AGCTAGAGTATTAGAGACAAAAGTGGATAATTACATTAAGAGAGCGTATCTCATGCCATC
ACAAACCATGAGATGGTTAACCTCCGAGACCCTTCCGTAATCTCCCGACACCCAAACACC
ATCAGTCCTGCTACCACGTGGAACCGCAAAACATGACATGATCGATAACGGAAACTTCAT
CATCGCGCCGTTTTCTCTCCCGTCTCCTCCGTTGACGATGGTTGAAGGGAACGCGTTTTC
GTCAGCAACACGCGGGCTTTTCCGAAGACTTTGGAGGTTTCGCCTTAATAAAGACAACAC
CTTCAGCATCTCTTTCCTTGTTCTTTAGTATATATATCAGTTTTGGTATTTGGAGAGAGC
AATGT
GTTTCC

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 4

CO CL1986Contig1 1270 4 11 U
GGAAGAAGAAAATACATATTTAGAAATAAAATTTTAAACAAAATGTTTCTAAACGAAAAA
AGAAAGGTAAATCTGAATGGAGCGGTTTTGCTGTTCTCTTGTTTCTTTTGTGCTGTCTCT
GCAACCATTCCACTAAATTCACTAGCTACTAAACAATCCACCAACGCAGTGTCTTGTAAC
ACTCACGGTTCAAGGGTCGCTAAGGTTGATGGTGTGGACGCTAAGCTCTCGGCCGAGCAA
AGATTCATGCGGGACCGTCCACCAAGCTCTTACTGCGTGCGGATCGAAGGATGCAGCGAA
CTAATCACTAAAAGTCCGAACGTACAAAAGTACGAGACCCGTCCTTTCAGTGTAGGGGGA
TTCAACTGGACTTTTATCATCGAACCATTTGGGAGCACGACTAACTTAGGGACGTGGATA
TCTGCATATGTTGCAATAGATCCTAGAGGTCTAGTTGGCGAAAACCGCGAGGTTTATGCA
GATCTCAGATTTTTGGCATACAGCAAGACTTTCGATCAGTACTGGACATCTATGGATACC
GACATCAGACGTTTCCATCAATTCAGGACAACTTGGGGAAATCCAAATTACATCC*GACA
TGTTGACTTTAAAGCTAAAGATAGAGAGTACATTTTCGACAATGACCAATGTGTGTTTGG
CGTAGACATCTCGGTGTATCCTTTCTTTAACAAATGGGAGGTCTTGTCGATCGATAAGAC
GGCCTATGGGCCTAACTCGTGGAAGCTTCTGAAATTCTCAACATTGACCAGAGATTTTTA
CGTATCTGACGAATTCTCCATTGGAGGAAAAACATGGGCATTTAAGGTGTATCCGAACGG
TTATGGCACAGGAGAAGGAAACTCGTTGTCCCTTTATCTGAAACTAACTGAGAACCAAAC
CTTGAAACCTTACGAAAAGGTTTATGTCCGAGCCAAGCTGCGAGTTCTTGACCAAAAACA
ATCAAGACATCTTGAAAAACCAATTCTATCCTGGTTCAACGCCACGGGAGAAAGTTCTGG
GTTCGAGCAGTTTGTGTCTTTGACTGATCTCCAAAATCCAGCCAAAGGTTTCATCGTGAA
TGATTCTCTGTCCGTACAAGTTCAATTCGAGGCTGTCTCATCAACTAATTACTATTCTAG
CAATGCCGCTCAAATCAGTAGTTTCTAAATGTCTACACTGTCGAATCCTTAAAAAAGAGG
CTTTGCATGTATACAAAGCGAATAATAATAAAGACTTGAAACGCTTCAAAACGTCGAAGT
TTCTACCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO78TF U 1
AF RR2BO78JQ C 527
AF RR2B430JQ C 533
AF RR2BH94TF U 885
BS 1 595 RR2BO78TF
BS 596 596 RR2BO78JQ
BS 597 635 RR2BO78TF
BS 636 684 RR2BO78JQ
BS 685 685 RR2B430JQ
BS 686 720 RR2BO78JQ
BS 721 721 RR2B430JQ
BS 722 722 RR2BO78JQ
BS 723 723 RR2B430JQ
BS 724 885 RR2BO78JQ
BS 886 1270 RR2BH94TF

RD RR2BO78TF 635 0 0
GGAAGAAGAAAATACATATTTAGAAATAAAATTTTAAACAAAATGTTTCTAAACGAAAAA
AGAAAGGTAAATCTGAATGGAGCGGTTTTGCTGTTCTCTTGTTTCTTTTGTGCTGTCTCT
GCAACCATTCCACTAAATTCACTAGCTACTAAACAATCCACCAACGCAGTGTCTTGTAAC
ACTCACGGTTCAAGGGTCGCTAAGGTTGATGGTGTGGACGCTAAGCTCTCGGCCGAGCAA
AGATTCATGCGGGACCGTCCACCAAGCTCTTACTGCGTGCGGATCGAAGGATGCAGCGAA
CTAATCACTAAAAGTCCGAACGTACAAAAGTACGAGACCCGTCCTTTCAGTGTAGGGGGA
TTCAACTGGACTTTTATCATCGAACCATTTGGGAGCACGACTAACTTAGGGACGTGGATA
TCTGCATATGTTGCAATAGATCCTAGAGGTCTAGTTGGCGAAAACCGCGAGGTTTATGCA
GATCTCAGATTTTTGGCATACAGCAAGACTTTCGATCAGTACTGGACATCTATGGATACC
GACATCAGACGTTTCCATCAATTCAGGACAACTTGGGGAAATCCAAATTACATCCCGACA
TGTTGACTTTAAAGCTAAAGATAGAGAGTACATTT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2BO78JQ 721 0 0
CATCTA
TGGATACCGACATCAGACGTTTCCATCAATTCAGGACAACTTGGGGAAATCCAAATTACA
TCC*GACATGTTGACTTTAAAGCTAAAGATAGAGAGTACATTTTCGACAATGACCAATGT
GTGTTTGGCGTAGACATCTCGGTGTATCCTTTTTTTAACAAATGGGAGGTCTTGTCGATC
GATAAGACTGTCTATGGGCCTAACTCGTGGAAGCTTCTGAAATTCTCAACATTGACCAGA
GATTTTTACGTATCTGACGAATTCTCCATTGGAGGAAAAACATGGGCATTTAAGGTGTAT
CCGAACGGTTATGGCACAGGAGAAGGAAACTCGTTGTCCCTTTATCTGAAACTAACTGAG
AACCAAACCTTGAAACCTTGCGAAAAGGTTTATGTCCGAGCCAAGCTGCGAGTTCTTGAC
CAAAAACAATCAAGACATCTTGAAAAACCAATTCTATCCTGGTTCAACGCCACGGGAGAA
AGTTCTGGGTTCGAGCAGTTTGTGTCTTTGACTGATCTCCAAAATCCAGCCAAAGGTTTC
ATCGTGAATGATTCTCTGTCCGTACAAGTTCAATTCGAGGCTGTCTCATCAACTAATTAC
TATTCTAGCAATGCCGCTCAAATCAGTAGTTTCTAAATGTCTACACTGTCGAATCCTTAA
AAAAGAGGCTTTGCATGTATACAAAGCGAATAATAATAAAGACTTGA
AACGCTCC

QA 7 713 7 713
DS 

RD RR2B430JQ 711 0 0
TGGATACCGACATCAGACGTTTCCATCAATTCAGGACAACTTGGGGAAATCCAAATTACA
TCC*GACATGTTGACTTTAAAGCTAAAGATAGAGAGTACATTTTCGACAATGACCAATGT
GTGTTTGGCGTAGACATCTCGGTGTATCCTTTCTTTAACAAATGGGGGGTCTTGTCGATC
GATAAGACGGCCTATGGGCCTAACTCGTGGAAGCTTTTGAAATTCTCAACATTGACCAGA
GATTTTTACGTATTTGACGAATTCTCCATTGGAGGAAAAACATGGGCATTTAAGGTGTAT
CCGAACGGTTATGGCACAGGAGAAGGAAACTCGTTGTCCCTTTATTTGAAACTAACTGAG
AACCAAACCTTGAAACCTTACGAAAAGGTTTATGTCCGAGCCAAGCTGCGAGTTCTTGAC
CAAAAACAATCAAGACATCTTGAAAAACCAATTCTATCCTGGTTCAACGCCACGGGAGAA
AGTTCTGGGTTCGAGCAGTTTGTGTCTTTGACTGATCTCCAAAATCCAGCCAAAGGTTTC
ATCGTGAATGATTCTCTGTCCGTACAAGTTCAATTCGAGGCTGTCTCATCAACTAATTAC
TATTCTAGCAATGCCGCTCAAATCAGTAGTTTCTAAATGTCTACATTGTCGAATCTTTAA
ATAAGAGGCTTTGCATGTATACAAAGCGAATAATAATAAAGACTTGA
CAAG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2BH94TF 386 0 0
G
AACTGAGAACCAAACCTTGAAACCTTACGAAAAGGTTTATGTCCGAGCCAAGCTGCGAGT
TCTTGACCAAAAACAATCAAGACATCTTGAAAAACCAATTCTATCCTGGTTCAACGCCAC
GGGAGAAAGTTCTGGGTTCGAGCAGTTTGTGTCTTTGACTGATCTCCAAAATCCAGCCAA
AGGTTTCATCGTGAATGATTCTCTGTCCGTACAAGTTCAATTCGAGGCTGTCTCATCAAC
TAATTACTATTCTAGCAATGCCGCTCAAATCAGTAGTTTCTAAATGTCTACACTGTCGAA
TCCTTAAAAAAGAGGCTTTGCATGTATACAAAGCGAATAATAATAAAGACTTGAAACGCT
TCAAAACGTCGAAGTTTCTACCTTG

QA 2 386 2 386
DS 



AS 1 4

CO CL1987Contig1 899 4 8 U
GGAACTTCAACAATAATATCATTTTCAAAAAG**AAAAAAAAAAAAAACAATAATATTTA
TCGACAACATAACCAACAATGGCAACTTCCATAATCCATCTTTTTGTTACCACCTTGCTC
GTGGCCGCCCACACGGCCTTTGCCGAATCAAACATGCTCCAAGATTTTTGTGTTGCTGAT
CTCAAGGGTGAGAAAGTCAACGGATACCCTTGCAAAGACCCAGCACAAGTAACACCAGAG
GACTTCTACTACACAGGCTTAGCCAATGGTGCATCCACCACCAACACCACATTGGGCTCA
GCCGTTACAAGTGGCAACGTTGAGAAAATCCCTGGCCTCAACACTTTGGGTGTCTCCATG
TCTCGGGTCGACTACGCACCAGGCGGACTCAACCCGCCACATCTTCACCCCAGAGCTTCA
GAAGCCATATTCGTCCTCGAAGGACGTCTCTTTGTCGGATTCTTGACAACCACTGGAAAA
CTCATCTCCAGACACATCAACAAATGAGACGTCTTTGTGTTCCCCAGAGCTCTCCTCCAT
TTCCAGCAGAACCCTAACAATGCTCCTGCTTCCGTGCTCGCTGCTTTCGATAGTCAGAAT
TCGGGAGCTCAAGGTGTTGGACCGACTCTGTTTGGTGCTAACCCTCCGATTCCTGATGAC
TTGCTTGCCAAGGCGTTCTATTTAGAACCACAGGAGGTTCAGAAGGTTAAGGGTAAATTC
CCAGCCAAGAAATAAATATAGGTTTCAGACCATACCCATAAATGCAACAATCATAGACAA
ATAATGAACATAAAAATGTAAACTACTAAAAAAGTGCTTGTAAATATTTTTTAACAATAT
TGAGTTTTCGGTAAATGTTCTACATTTGAATTAATATATTCTAAACTATCTTTCATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ82TF U 1
AF RR2E368TF U 7
AF RR2EI58TF U 14
AF RR2E368JQ C 460
BS 1 32 RR2AQ82TF
BS 33 34 RR2E368TF
BS 35 473 RR2AQ82TF
BS 474 474 RR2E368TF
BS 475 504 RR2AQ82TF
BS 505 505 RR2E368TF
BS 506 698 RR2AQ82TF
BS 699 899 RR2E368JQ

RD RR2AQ82TF 700 0 0
GGAACTTCAACAATAATATCATTTTCAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAACAATAATATTTA
TCGACAACATAACCAACAATGGCAACTTCCATAATCCATCTTTTTGTTACCACCTTGCTC
GTGGCCGCCCACACGGCCTTTGCCGAATCAAACATGCTCCAAGATTTTTGTGTTGCTGAT
CTCAAGGGTGAGAAAGTCAACGGATACCCTTGCAAAGACCCAGCACAAGTAACACCAGAG
GACTTCTACTACACAGGCTTAGCCAATGGTGCATCCACCACCAACACCACATTGGGCTCA
GCCGTTACAAGTGGCAACGTTGAGAAAATCCCTGGCCTCAACACTTTGGGTGTCTCCATG
TCTCGGGTCGACTACGCACCAGGCGGACTCAACCCGCCACATCTTCACCCCAGAGCTTCA
GAAGCCATATTCGTCCTCGAAGGACGTCTCTTTGTCGGATTCTTGACAACCACCGGAAAA
CTCATCTCCAGACACATCAACAAAGGAGACGTCTTTGTGTTCCCCAGAGCTCTCCTCCAT
TTCCAGCAGAACCCTAACAATGCTCCTGCTTCCGTGCTCGCTGCTTTCGATAGTCAGAAT
TCGGGAGCTCAAGGTGTTGGACCGACTCTGTTTGGTGCTAACCCTCCGATTCCTGATGAC
TTGCTTGCCAAGGCGTTCTATTTAGAACCACAGGAGGT
TC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2E368TF 693 0 0
GGAACAA
TAATATCATTTTCAAAAA***AAAAAAAAAAAAAACAATAATATTTATCGACAACA**AC
CAACAATGGCAACTTCCATAATCCATCTTTTTGTTACCACCTTGCTCGTGGCCGCCCACA
CGGCCTTTGCCGAATCAAACATGCTCCAAGATTTTTGTGTTGCTGATCTCAAGGGTGAGA
AAGTCAACGGATACCCTTGCAAAGACCCAGCACAAGTAACACCAGAGGACTTCTACTACA
CAGGCTTAGCCAATGGTGCATCCACCACCAACACCACATTGGGCTCAGCCGTTACAAGTG
GCAACGTTGAGAAAATCCCTGGCCTCAACACTTTGGGTGTCTCCATGTCTCGGGTCGACT
ACGCCCCAGGCGGACTCAACCCGCCACATCTTCACCCCAGAGCTTCAGAAGCTATATTCG
TCCTCGAAGGACGTCTCTTTGTCGGATTCTTGACAACCACTGGAAAACTCATCTCCAGAC
ACATCAACAAATGAGACGTCTTTGTGTTCCCCAGAGCTCTCCTCCATTTCCAGCAGAACC
CTAACAATGCTCCTGCTTCCGTGCTCGCTGCTTTCGATAGTCAGAATTCGGGAGCTCAAG
GTGTTGGACCGACTCTGTTTGGTGCTAACCCTCCGATTCCTGATGACTTGCTTGCCAAGG
CGTTCTATTTAGAACCACAGGAGGT
C

QA 8 692 8 692
DS 

RD RR2EI58TF 676 0 0
TAATATCATTTTCAAAAAG***AAAAAAAAAAAAACAATAATATTTATCGACAACATAAC
CAACAATGGCAACTTCCATAATCCATCTTTTTGTTACCACCTTGCTCGTGGCCGCCCACA
CGGCCTTTGCCGAATCAAACATGCTCCAAGATTTTTGTGTTGCTGATCTCAAGGGTGAGA
AAGTCAACGGATACCCTTGCAAAGACCCAGCACAAGTAACACCAGAGGACTTCTACTACA
CAGGCTTAGCCAATGGTGCATCCACCACCAACACCACATTGGGCTCAGCCGTTACAAGTG
GCAACGTTGAGAAAATCCCTGGCCTCAACACTTTGGGTGTCTCCATGTCTCGGGTCGACT
ACGCACCAGGCGGACTCAACCCGCCACATCTTCACCCCAGAGCTTCAGAAGCCATATTCG
TCCTCGAAGGACGTCTCTTTGTCGGATTCTTGACAACCACCGGAAAACTCATCTCCAGAC
ACATCAACAAAGGAGACGTCTTTGTGTTCCCCAGAGCTCTCCTCCATTTCCAGCAGAACC
CTAACAATGCTCCTGCTTCCGTGCTCGCTGCTTTCGATAGTCAGAATTCGGGAGCTCAAG
GTGTTGGACCGACTCTGTTTGGTGCTAACCCTCCGATTCCTGATGACTTGCTTGCCAAGG
CGTTCTATTTAGAACC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2E368JQ 440 0 0
TTCTTGACAACCACTGGAAAACTCATCTCCAGACACATCAACAAATGAGACGTCTTTGTG
TTCCCCAGAGCTCTCCTCCATTTCCAGCAGAACCCTAACAATGCTCCTGCTTCCGTGCTC
GCTGCTTTCGATAGTCAGAATTCGGGAGCTCAAGGTGTTGGACCGACTCTGTTTGGTGCT
AACCCTCCGATTCCTGATGACTTGCTTGCCAAGGCGTTCTATTTAGAACCACAGGAGGTT
CAGAAGGTTAAGGGTAAATTCCCAGCCAAGAAATAAATATAGGTTTCAGACCATACCCAT
AAATGCAACAATCATAGACAAATAATGAACATAAAAATGTAAACTACTAAAAAAGTGCTT
GTAAATATTTTTTAACAATATTGAGTTTTCGGTAAATGTTCTACATTTGAATTAATATAT
TCTAAACTATCTTTCATGAC

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 4

CO CL1988Contig1 1030 4 9 U
GGGACACAACCCAAGTTACATCTTCAGAACCAGAACCAGAACCTTCTTGTAATCGATATA
TATAAAATCTCAATCTCGATCCTCTCTATCATCATCATCCATCAGCCATGGCATCGCAAG
CTAGCCTTCTCCTTCAGAAACAACTCAAAGATCTCTGTAAGCATCCCGTTGATGGATTCT
CTGCTGGACTCGTCGACGAGAAGAATATATTCGAGTGGAGCGTTACCATTATCGGACCTC
C*AGATACTCTCTATGAAGGAGGATTCTTTAACGCTATCATGACCTTCCCGCAGAACTAT
CCTAATAGCCCACCAACCGTGAGGTTTACTTCAGATATGTGGCATCCTAATGTTTATTCT
GATGGTCGTGTTTGCATATCTATTCTTCACCCTCCCGGTGATGATCCAAGCGGTTATGAG
CTTGCTAGCGAGCGCTGGACCCCCGTTCACACTGTTGAAAGTATTATGTTGAGTATTATA
TCTATGCTCTCTGGTCCCAACGATGAGTCCCCAGCAAACGTTGAAGCTGCTAAAGAGTGG
CGAGAGAAGAGAGACGAGTTCAAGAAGAAAGTCAGCCGCTGTGTCAGAAAGTCTCAAGAA
ATGTTCTGATCAAATTTTAACTTCACAGCTCTAAAGAGAGTTTTCCATCGAACTGTCAAG
ACACAACCCGGTTTTACATCTTCTTTTCGCTGCGTTCGAGAATCAGAGCGTTCTGAAAAG
TGTTGTTCTTGAGAAACTGGCTTATATCATAATGATAAAAAACAAATTAATCGTTTAAGA
ATGCTTTCTTTGCTCAGAACCTTTGATGTGAGGAATGATTTGTACTCTTTTATTTTGCAC
TGTTTGCAGCTCACAGTTTGTTTTTGCTGAAGTACGTTCCGTTTTATAGCGTCTGTTGTC
TTCACACGCCTTGCCGGTTTATCAAATAAAACCGGCGTGCTGTTCCGAGCGGTGTGATAT
CATTTGCATGTAGGACTAAAAGCGACGAGACAATTGTTTTCTGATTGATAAGAGAAAATT
CTATTTAATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ92TF U 1
AF RR2AH93TF U 1
AF RR2EQ92JQ C 137
AF RR2AH93JQ C 139
BS 1 316 RR2AH93TF
BS 317 317 RR2EQ92TF
BS 318 643 RR2AH93TF
BS 644 644 RR2EQ92TF
BS 645 756 RR2AH93TF
BS 757 849 RR2EQ92JQ
BS 850 850 RR2AH93JQ
BS 851 873 RR2EQ92JQ
BS 874 1030 RR2AH93JQ

RD RR2EQ92TF 671 0 0
GGGACACAACCCAAGTTCCATCTTCAGAACCAGAACCAGAACCTTCTTGTAATCGATATA
TA**AAATCTCAATCTCGATCCTCTCTATCATCATCATCCATCAGCCATGGCATCGCAAG
CTAGCCTTCTCCTTCAGAAACAACTCAAAGATCTCTGTAAGCATCCCGTTGATGGATTCT
CTGCTGGACTCGTCGACGAGAAGAATATATTCGAGTGGAGCGTTACCATTATCGGACCTC
C*AGATACTCTCTATGAAGGAGGATTCTTTAACGCTATCATGACCTTCCCGCAGAACTAT
CCTAATAGCCCACCAACCGTGAGGTTTACTTCAGATATGTGGCATCCTAATGTTTATTCT
GATGGTCGTGTTTGCATATCTATTCTTCACCCTCCCGGTGATGATCCAAGCGGTTATGAG
CTTGCTAGCGAGCGCTGGACCCCTGTTCACACTGTTGAAAGTATTATGTTGAGTATTATA
TCTATGCTCTCTGGTCCCAACGATGAGTCCCCAGCAAACGTTGAGGCTGCTAAAGAGTGG
CGAGAGAAGAGAGACGAGTTCAAGAAGAAAGTGAGCCGCTGTGTCAGAAAGTCTCAAGAA
ATGTTCTGATCAAATTTTAACTTCACAGCTCTAAAGAGAGTTTTCCATCGAACTGTCAAG
ACACAACCCGG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2AH93TF 756 0 0
GGGACACAACCCAAGTTACATCTTCAGAACCAGAACCAGAACCTTCTTGTAATCGATATA
TATAAAATCTCAATCTCGATCCTCTCTATCATCATCATCCATCAGCCATGGCATCGCAAG
CTAGCCTTCTCCTTCAGAAACAACTCAAAGATCTCTGTAAGCATCCCGTTGATGGATTCT
CTGCTGGACTCGTCGACGAGAAGAATATATTCGAGTGGAGCGTTACCATTATCGGACCTC
C*AGATACTCTCTATGAAGGAGGATTCTTTAACGCTATCATGACCTTCCCGCAGAACTAT
CCTAATAGCCCACCAAGCGTGAGGTTTACTTCAGATATGTGGCATCCTAATGTTTATTCT
GATGGTCGTGTTTGCATATCTATTCTTCACCCTCCCGGTGATGATCCAAGCGGTTATGAG
CTTGCTAGCGAGCGCTGGACCCCCGTTCACACTGTTGAAAGTATTATGTTGAGTATTATA
TCTATGCTCTCTGGTCCCAACGATGAGTCCCCAGCAAACGTTGAAGCTGCTAAAGAGTGG
CGAGAGAAGAGAGACGAGTTCAAGAAGAAAGTCAGCCGCTGTGTCAGAAAGTCTCAAGAA
ATGTTCTGATCAAATTTTAACTTCACAGCTCTAAAGAGAGTTT*CCATCGAACTGTCAAG
ACACAACCCGGTTTTACATCTTCTTTTCGCTGCGTTCGAGAATCAGAGCGTTCTGAAAAG
TGTTGTTCTTGAGAAACTGGCTTATATCATAATGAT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2EQ92JQ 737 0 0
GA
AACAACTCAAAGATCTCTGTAAGCATCCCGTTGATGGATTCTCTGCTGGACTCGTCGACG
AGAAGAATATATTCGAGTGGAGCGTTACCATTATCGGACCTCC*AGATACTCTCTATGAA
GGAGGATTCTTTAACGCTATCATGACCTTCCCGCAGAACTATCCTAATAGCCCACCAACC
GTGAGGTTTACTTCAGATATGTGGCATCCTAATGTTTATTCTGATGGTCGTGTTTGCATA
TCTATTCTTCACCCTCCCGGTGATGATCCAAGCGGTTATGAGCTTGCTAGCGAGCGCTGG
ACCCCTGTTCACACTGTTGAAAGTATTATGTTGAGTATTATATCTATGCTCTCTGGTCCC
AACGATGAGTCCCCAGCAAACGTTGAGGCTGCTAAAGAGTGGCGAGAGAAGAGAGACGAG
TTCAAGAAGAAAGTGAGCCGCTGTGTCAGAAAGTCTCAAGAAATGTTCTGATCAAATTTT
AACTTCACAGCTCTAAAGAGAGTTTTCCATCGAACTGTCAAGACACAACCCGGTTTTACA
TCTTCTTTTCGCTGCGTTCGAGAATCAGAGCGTTCTGAAAAGTCTTGTTCTTGAGAAACT
GGCT*ATATCATAATGATAAAAAACAAATTAATCGTTTAAGAATGCTTTCTTTGCTCAGA
ACCTTTGATGTGAGGAATGATTTGTACTCTTTTATTTTGCACTGTTTGCAGTTCACAGTT
TGTTTTTGCTGAAGT

QA 3 737 3 737
DS 

RD RR2AH93JQ 892 0 0
AACAACTCAAAAATCTCTGTAAGCATCCCGTTGATGGATTCTCTGCTGGACTCGTCGACG
AGAAGAATATATTCGAGTGGAGCGTTACCATTATCGGACCTCCCAGATACTCTCTATGAA
GGAGGATTCTTTAACGCTATCATGACCTTCCCGCAGAACTATCCTAATAGCCCACCAAGC
GTGAGGTTTACTTCAGATATGTGGCATCCTAATGTTTATTCTGATGGTCGTGTTTGCATA
TCTATTCTTCACCCTCCCGGTGATGATCCAAGCGGTTATGAGCTTGCTAGCGAGCGCTGG
ACCCCCGTTCACACTGTTGAAAGTATTATGTTGAGTATTATATCTATGCTCTCTGGTCCC
AACGATGAGTCCCCAGCAAACGTTGAAGCTGCTAAAGAGTGGCGAGAGAAGAGAGACGAG
TTCAAGAAGAAAGTCAGCCGCTGTGTCAGAAAGTCTCAAGAAATGTTCTGATCAAATTTT
AACTTCACAGCTCTAAAGAGAGTTT*CCATCGAACTGTCAAGACACAACCCGGTTTTACA
TCTTCTTTTCGCTGCGTTCGAGAATCAGAGCGTTCTGAAAAGTGTTGTTCTTGAGAAACT
GGCTTATATCATAATGATAAAAAA***ATTGATCGTTTAAGAATGCTTTCTTTGCTCAGA
ACCTTTGATGTGAGGAATGATTTGTACTCTTTTATTTTGCACTGTTTGCAGCTCACAGTT
TGTTTTTGCTGAAGTACGTTCCGTTTTATAGCGTCTGTTGTCTTCACACGCCTTGCCGGT
TTATCAAATAAAACCGGCGTGCTGTTCCGAGCGGTGTGATATCATTTGCATGTAGGACTA
AAAGCGACGAGACAATTGTTTTCTGATTGATAAGAGAAAATTCTATTTAATC

QA 1 892 1 892
DS 



AS 1 4

CO CL1989Contig1 1057 4 15 U
GGGACCAGATATAGAGAGGGAGATTCCGACTACATGGCGTCACCAACGGCGAAGATAATC
GATGGAAAGGCGATTGCTCATACCATCCGATCAGAGATCGCCGAGGAAGTTCGCCTTTTA
TCTGAGAAACACGGCAAGGTCCCAGGACTAGCGGTGGTCATAGTTGGTGTACGGAAAGAT
TCACAGACTTATGTGAATATGAAGAGGAAAGCATGTGCTGAGGTTGGGATCAAGTCATTT
GATGTTGACCTACCCGAGGATGTTCCTGAAGCTGAGCTTATAACAAAAGTTCATCAACTC
AATTCAGATCCGGAAGTCCATGGTATATTAGTTCAACTCCCATTGCCGAAACATATCAAT
GAGGAGAATGTTCTGGGTGCTATCAGCATTGATAAAGACGTAGATGGATTCCATCCTTTG
AATATTGGTAAGCTAGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCCACGCACCCCTAAG
GGATGTTTGGAGCTCTTGGTGAGGAGTGGCATAAAGATTAAGGGGCAACGAGCAGTTGTA
GTAGGTCGGAGTAACATTGTTGGTTTGCCCGTTTCACTTCTATTGCTCAAGGCTGATGCT
ACTGTTACTACTGTACATTCTCACACCAAGGATCCCGAGGCTATCATACGAGAAGCTGAC
ATCGTTATTGCTGCAGCTGGACAGGCCTGCATGATCAAGGGAGACTGGATAAAGCCAGGG
GCTGCAGTGATCGACGTTGGAACTAACGCAGTCAGCGACCCGAGCAGGAAATTTGGATAC
CGGTTGGTTGGAGATGTTGATTTCGCCGAAGCTTCTAAAGTTGCAGGCTTCATAACTCCG
GTCCCTGGTGGTGTAGGCCCAATGACAGTGGCAATGCTGCTCAAGAACACCTTAGACGGC
GCCAAGCGGGTCATTGGCCAGTAAAACATCCCTATGTATGTTATAAAAGATCCTGGAGTT
TACCCATATCTATATGGCATTATTCCTCTCAAATAAATTTGAATTGGCATTCCATTTGAA
TTTTTTTTGGCTGCATTGATTCAAGATCATGTACAAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FZ78TF U 1
AF RR2G550TF U 1
AF RR2FZ78JQ C 497
AF RR2G550JQ C 644
BS 1 684 RR2FZ78TF
BS 685 685 RR2FZ78JQ
BS 686 700 RR2FZ78TF
BS 701 701 RR2G550TF
BS 702 712 RR2FZ78TF
BS 713 713 RR2G550TF
BS 714 715 RR2FZ78TF
BS 716 716 RR2FZ78JQ
BS 717 744 RR2FZ78TF
BS 745 767 RR2G550TF
BS 768 969 RR2FZ78JQ
BS 970 970 RR2G550JQ
BS 971 987 RR2FZ78JQ
BS 988 988 RR2G550JQ
BS 989 1057 RR2FZ78JQ

RD RR2FZ78TF 744 0 0
GGGACCAGATATAGAGAGGGAGATTCCGACTACATGGCGTCACCAACGGCGAAGATAATC
GATGGAAAGGCGATTGCTCATACCATCCGATCAGAGATCGCCGAGGAAGTTCGCCTTTTA
TCTGAGAAACACGGCAAGGTCCCAGGACTAGCGGTGGTCATAGTTGGTGTACGGAAAGAT
TCACAGACTTATGTGAATATGAAGAGGAAAGCATGTGCTGAGGTTGGGATCAAGTCATTT
GATGTTGACCTACCCGAGGATGTTCCTGAAGCTGAGCTTATAACAAAAGTTCATCAACTC
AATTCAGATCCGGAAGTCCATGGTATATTAGTTCAACTCCCATTGCCGAAACATATCAAT
GAGGAGAATGTTCTGGGTGCTATCAGCATTGATAAAGACGTAGATGGATTCCATCCTTTG
AATATTGGTAAGCTAGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCCACGCACCCCTAAG
GGATGTTTGGAGCTCTTGGTGAGGAGTGGCATAAAGATTAAGGGGCAACGAGCAGTTGTA
GTAGGTCGGAGTAACATTGTTGGTTTGCCCGTTTCACTTCTATTGCTCAAGGCTGATGCT
ACTGTTACTACTGTACATTCTCACACCAAGGATCCCGAGGCTATCATACGAGAAGCTGAC
ATCGTTATTGCTGCAGCTGGACAG*CCTGCATGATCAAGG*AGACTGGATAA*GC*AGGG
GCTGCAGTGATCGACGTTGGAACT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2G550TF 774 0 0
GGGACCAGATATAGAGAGGGAGATTCCGACTACATGGCGTCACCAACGGCGAAGATAATC
GATGGAAAGGCGATTGCTCATACCATCCGATCAGAGATCGCCGAGGAAGTTCGCCTTTTA
TCTGAGAAACACGGCAAGGTCCCAGGACTAGCGGTGGTCATAGTTGGTGTACGGAAAGAT
TCACAGACTTATGTGAATATGAAGAGGAAAGCATGTGCTGAGGTTGGGATCAAGTCATTT
GATGTTGACCTACCCGAGGATGTTCCTGAAGCTGAGCTTATAACAAAAGTTCATCAACTC
AATTCAGATCCGGAAGTCCATGGTATATTAGTTCAACTCCCATTGCCGAAACATATCAAT
GAGGAGAATGTTCTGGGTGCTATCAGCATTGATAAAGACGTAGATGGATTCCATCCTTTG
AATATTGGTAAGCTAGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCCACGCACCCCTAAG
GGATGTTTGGAGCTCTTGGTGAGGAGTGGCATAAAGATTAAGGGGCAACGAGCAGTTGTA
GTAGGTCGGAGTAACATTGTTGGTTTGCCCGTTTCACTTCTATTGCTCAAGGCTGATGCT
ACTGTTACTACTGTACATTCTCACACCAAGGATCCCGAGGCTATCATACGAGAAGCTGAC
ATCGTTATTGCTGCAGCTGGACAG*CCTGCATGATCAAGGGAGACTGGATAAAGC*AGGG
GCTGCAGTGATCGACGTTGGAACTAACGCAGTCAGCGACCCGAGCAG
AATCTGG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2FZ78JQ 561 0 0
TGGTGAGGAGTGGCATAAAGATTAAGGGGCAACGAGCAGTTGTAGTAGGTCGGAGTAACA
TTGTTGGTTTGCCCGTTTCACTTTTATTGCTCAAGGCTGATGCTACTGTTACTACTGTAC
ATTTTCACACCAAGGATCCCGAGGCTATCATACGAGAAGCTGACATCGTTATTGCTGCAG
CTGGACAGGCCTGCATGATCAAGGGAGACTGGATAAAGCCAGGGGCTGCAGTGATCGACG
TTGGAACTAACGCAGTCAGCGACCCGAGCAGGAAATTTGGATACCGGTTGGTTGGAGATG
TTGATTTCGCCGAAGCTTCTAAAGTTGCAGGCTTCATAACTCCGGTCCCTGGTGGTGTAG
GCCCAATGACAGTGGCAATGCTGCTCAAGAACACCTTAGACGGCGCCAAGCGGGTCATTG
GCCAGTAAAACATCCCTATGTATGTTATAAAAGATCCTGGAGTTTACCCATATTTATATG
GCATTATTCCTTTCAAATAAATTTGAATTGGCATTCCATTTGAATTTTTTTTGGCTGCAT
TGATTCAAGATCATGTACAAT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2G550JQ 414 0 0
TCATACGAGAAGCTGACATCGTTATTGCTGCAGCTGGACAGGCCTGCATGATCAAGGGAG
ACTGGATAAAGCCAGGGGCTGCAGTGATCGACGTTGGAACTAACGCAGTCAGCGACCCGA
GCAGGAAATTTGGATACCGGTTGGTTGGAGATGTTGATTTCGCCGAAGCTTTTAAAGTTG
CAGGCTTCATAACTCCGGTCCCTGGTGGTGTAGGCCCAATGACAGTGGCAATGCTGCTCA
AGAACACCTTAGACGGCGCCAAGCGGGTCATTGGCCAGTAAAACATCCCTATGTATGTTA
TAAAAGATCCTGGAGTTTACCCATATCTATATGGCATTATTCCTCTCAAATAAATTTGAA
TTGGCATTCCATTTGAATTTTTTTTGGCTGCATTGATTCAAGATCATGTACAAT

QA 1 414 1 414
DS 



AS 2 4

CO CL1990Contig1 771 2 4 U
AGAGAACTAAAATTGAAATTATTATTGAAAATATCAATTATTGTAGATAACATGATCCAA
GAATACGAAAATTACGAAACAAATAAACTGGTAAGGTCAGGTGTGGATCCTGACTCGGTG
TTCAACATATGATTCTGTAACGTATAGTATTTTCTGTAACGGCATTTTTAAAAGTTTTTA
TTTATGAGGAATGCATGACTTCCTGGAGCAACCAGAAGGAACCACAGACACGTGGACTAT
CGCTTTCCACTCTTGTCCAGGTTTCAATATGATCGGTTTCTCGACCGCAACGGGTTCCAC
AGCAACAAAACTTCTGTAATCTTCAACTCCCAAATCTGACACTTTCTCGTCCCATGGATT
CCACACCACTGCATCAGCTTGTCCTTCCTTGCGTACCACGATTGTCTTATTTTTCTTGTG
GTCCACGATTCTGAGCGTATTTGGAGTCCTTAAGTAAAGCCTGTCAAGCTGTGAATTAAA
AGTTATAAATTTGCCATGGTCAGTGAAACGTGTTCTGTTCTTTTGTTGGTCAAGATAATC
CAAATTTTGCAATCCTTCCACCTGGATTTGACTGATATCGGAAACAGAGAAATAGGGGTG
AAAACCAAATGTGAAGTTAAACGGCTCTACATCAGAGTTTTTAATACGAGGTGTCAAAAT
CAAGTCTCCACCATGCCCCAAAGCTACTTTCAGGCGATATATAAATTTATGAGGCCAGAT
CTTCAAATCAGCTTCGGATGATTTTAGGATGAGGTCAACGTGTGCACCAGA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F637JQ U 1
AF RR2GM92JQ U 6
BS 1 347 RR2F637JQ
BS 348 348 RR2GM92JQ
BS 349 646 RR2F637JQ
BS 647 771 RR2GM92JQ

RD RR2F637JQ 646 0 0
AGAGAACTAAAATTGAAATTATTATTGAAAATATCAATTATTGTAGATAACATGATCCAA
GAATACGAAAATTACGAAACAAATAAACTGGTAAGGTCAGGTGTGGATCCTGACTCGGTG
TTCAACATATGATTCTGTAACGTATAGTATTTTCTGTAACGGCATTTTTAAAAGTTTTTA
TTTATGAGGAATGCATGACTTCCTGGAGCAACCAGAAGGAACCACAGACACGTGGACTAT
CGCTTTCCACTCTTGTCCAGGTTTCAATATGATCGGTTTCTCGACCGCAACGGGTTCCAC
AGCAACAAAACTTCTGTAATCTTCAACTCCCAAATCTGACACTTTCTTGTCCCATGGATT
CCACACCACTGCATCAGCTTGTCCTTCCTTGCGTACCACGATTGTCTTATTTTTCTTGTG
GTCCACGATTCTGAGCGTATTTGGAGTCCTTAAGTAAAGCCTGTCAAGCTGTGAATTAAA
AGTTATAAATTTGCCATGGTCAGTGAAACGTGTTCTGTTCTTTTGTTGGTCAAGATAATC
CAAATTTTGCAATCCTTCCACCTGGATTTGACTGATATCGGAAACAGAGAAATAGGGGTG
AAAACCAAATGTGAAGTTAAACGGCTCTACATCAGAGTTTTTAATA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2GM92JQ 766 0 0
ACTAAAATTGAAATTATTATTGAAAATATCAATTATTGTAGATAACATGATCCAAGAATA
CGAAAATTACGAAACAAATAAACTGGTAAGGTCAGGTGTGGATCCTGACTCGGTGTTCAA
CATATGATTCTGTAACGTATAGTATTTTCTGTAACGGCATTTTTAAAAGTTTTTATTTAT
GAGGAATGCATGACTTCCTGGAGCAACCAGAAGGAACCACAGACACGTGGACTATCGCTT
TCCACTCTTGTCCAGGTTTCAATATGATCGGTTTCTCGACCGCAACGGGTTCCACAGCAA
CAAAACTTCTGTAATCTTCAACTCCCAAATCTGACACTTTCTCGTCCCATGGATTCCACA
CCACTGCATCAGCTTGTCCTTCCTTGCGTACCACGATTGTCTTATTTTTCTTGTGGTCCA
CGATTCTGAGCGTATTTGGAGTCCTTAAGTAAAGCCTGTCAAGCTGTGAATTAAAAGTTA
TAAATTTGCCATGGTCAGTGAAACGTGTTCTGTTCTTTTGTTGGTCAAGATAATCCAAAT
TTTGCAATCCTTCCACCTGGATTTGACTGATATCGGAAACAGAGAAATAGGGGTGAAAAC
CAAATGTGAAGTTAAACGGCTCTACATCAGAGTTTTTAATACGAGGTGTCAAAATCAAGT
CTCCACCATGCCCCAAAGCTACTTTCAGGCGATATATAAATTTATGAGGCCAGATCTTCA
AATCAGCTTCGGATGATTTTAGGATGAGGTCAACGTGTGCACCAGA

QA 1 766 1 766
DS 



CO CL1990Contig2 974 2 10 U
GGGAAGAAAAAAAGTATAATACGTCAATAGATTAGAATGAAATGGGTAACCGGAGTAATC
GGCGTGGATATTAGATAAGGTCAAGAGTAGGCAAACAAGACTATTCTTGTTTCTTTGTTC
AACATAATAGTCTTCTCTTCAAAATCAAATTAGTGTAGTTGTCCGTTTTCTTCACTCGTT
TTTGCGTTCAGAAGTTGACTTTCTGTTCATTCCCATTGGCCTATTTAATAGAATCAAAAG
GATACAAAACTTTCAACAAAGTATCATCCTCGTGAGTGAACAGTGTGAGTAGACGACGAT
TCACGATGGGGAATAAGGCAAATCTGATCTTCTTATGGGCTATGCTCATTGCAGTAGTCG
CCATGGCCACGGAGCATCATTCCTCCATTGAACGTACTAAGGGCATCAATGGTCTCGACA
AGCTCATCGTCCGCGACCGTCGCGGTCGATCTTTCGAGGTTTACTTGTATGGAGGTCAAG
TGACTTCTTGGAAAAATGAGAAAGGAGAGGAATTACTATTTATGAGTACCAAGGCTATAT
TCCAGCCACCGACACCTATTCGTGGAGGGATTCCAGTATTGTTTCCGCAATACGCTAACA
CTGGTCCACTTCCCTCACATGGATTTGTCAGACAAAGGTTTTGGGAAATTGATGCTAATC
CACCTCCTTTACCATCACATCCTTCTTCTACTGCTCACGTTGACCTCATCTTAGAATCAT
CCGAAGCTGATTTGAAGATCTGGCCTCATAAATTTATATATCGACTGAGAGTAGCTTTGG
GACATGGTGGTGACTTGATTTTGACACCTCGTATTAGAAACTCTGATGTAGAGCCGTTTA
ACTTCACATTTGGTTTTCACCCCTATTTCTCTGTTTCTGATATCAGTCAAATCCAGGTGG
AAGGATTGCAAAATTTGGATTATCTTGACCAACAAAAGAACAGAACACGTTTCACTGACC
ATGGCAAATTTATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM92TF U 1
AF RR2GW05TF U 253
BS 1 384 RR2GM92TF
BS 385 387 RR2GW05TF
BS 388 391 RR2GM92TF
BS 392 392 RR2GW05TF
BS 393 493 RR2GM92TF
BS 494 494 RR2GW05TF
BS 495 634 RR2GM92TF
BS 635 635 RR2GW05TF
BS 636 640 RR2GM92TF
BS 641 974 RR2GW05TF

RD RR2GM92TF 642 0 0
GGGAAGAAAAAAAGTATAATACGTCAATAGATTAGAATGAAATGGGTAACCGGAGTAATC
GGCGTGGATATTAGATAAGGTCAAGAGTAGGCAAACAAGACTATTCTTGTTTCTTTGTTC
AACATAATAGTCTTCTCTTCAAAATCAAATTAGTGTAGTTGTCCGTTTTCTTCACTCGTT
TTTGCGTTCAGAAGTTGACTTTCTGTTCATTCCCATTGGCCTATTTAATAGAATCAAAAG
GATACAAAACTTTCAACAAAGTATCATCCTCGTGAGTGAACAGTGTGAGTAGACGACGAT
TCACGATGGGGAATAAGGCAAATCTGATCTTCTTATGGGCTATGCTCATTGCAGTAGTCG
CCATGGCCACGGAGCATCATTCCT***TTGAGCGTACTAAGGGCATCAATGGTCTCGACA
AGCTCATCGTCCGCGACCGTCGCGGTCGATCTTTCGAGGTTTACTTGTATGGAGGTCAAG
TGACTTCTTGGAAGAATGAGAAAGGAGAGGAATTACTATTTATGAGTACCAAGGCTATAT
TCCAGCCACCGACACCTATTCGTGGAGGGATTCCAGTATTGTTTCCGCAATACGCTAACA
CTGGTCCACTTCCCTCACATGGATTTGTCAGACAGAGGTT
CT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2GW05TF 722 0 0
GG
AACAAAGTATCATCCTCGTGAGTGAACAGTGTGAGTAGACGACGATTCACGATGGGGAAT
AAGGCAAATCTGATCTTCTTATGGGCTATGCTCGTTTCAGTAGTCGCCATGGCCACGGAG
CATCATTCCTCCATTGAACGTACTAAGGGCATCAATGGTCTCGACAAGCTCATCGTCCGC
GACCGTCGCGGTCGATCTTTCGAGGTTTACTTGTATGGAGGTCAAGTGACTTCTTGGAAA
AATGAGAAAGGAGAGGAATTACTATTTATGAGTACCAAGGCTATATTCCAGCCACCGACA
CCTATTCGTGGAGGGATTCCAGTATTGTTTCCGCAATACGCTAACACTGGTCCACTTCCC
TCGCATGGGTTTGTCAGACAAAGGTTTTGGGAAATTGATGCTAATCCACCTCCTTTACCA
TCACATCCTTCTTCTACTGCTCACGTTGACCTCATCTTAGAATCATCCGAAGCTGATTTG
AAGATCTGGCCTCATAAATTTATATATCGACTGAGAGTAGCTTTGGGACATGGTGGTGAC
TTGATTTTGACACCTCGTATTAGAAACTCTGATGTAGAGCCGTTTAACTTCACATTTGGT
TTTCACCCCTATTTCTCTGTTTCTGATATCAGTCAAATCCAGGTGGAAGGATTGCAAAAT
TTGGATTATCTTGACCAACAAAAGAACAGAACACGTTTCACTGACCATGGCAAATTTATA

QA 3 722 3 722
DS 



AS 1 4

CO CL1991Contig1 656 4 7 U
TCAAAATCGATATCTAATATAGTAATGAGACTTATTAGTATAATACAAAAA*CAAGTTTC
TCAATTATTCAAGGAACAATAGAGATCAGAAGATCATTGCGCATCTTTGTTTTATTATAA
TAAAATAAGACCAAAACCACAAGTTGTAGACATTAGGAGTTGTGAGTTTTAGTACAAGGC
ATACTTCTGGGTCCAGCTTCTAGCCATGGCTTCGTACTTGACCTTGTCGGTTTTGTATAT
GTGAGCTATATCTGGAACCAGAGGATCGTCAGGGTTTGGGTCTGTGAGAAGAGAGCACAC
AGAGAGAAGCACCTTAGAGATTGTCAGGGCAGGGCTCCACTGGTCTTTGAGGATGTCCAA
ACAGATGTTCCCGTTGTTGTTGATGTTAGGGTGAAACACTTTGGTTCTGAATACAACCTT
GGGAGGTTTGAACGGATAATCTTGAGAGAAATTGATAGTGACAAGGAAAACACCTCCCGA
GTATGGACTTTCGTTAGGACCCATTATTGTAGCTTGCCAATGAAACATGTCTTCTCCTAC
TGGACCTGCACTGCATGACATAGGAGGGTCTCTCTGCAACTCCCTCAGTTCTTTCAAAAT
CCTTCTCGTTGCCATAGTGTTTGATTCAAAGGGAAGCTGTCTTGCTTGGGATCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR2AQ54TF C 1
AF RR2GV55JQB U 19
AF RR2GV55TF C 19
AF RR2AQ54JQ U 313
BS 1 19 RR2AQ54TF
BS 20 292 RR2GV55JQB
BS 293 293 RR2AQ54TF
BS 294 316 RR2GV55JQB
BS 317 317 RR2AQ54TF
BS 318 652 RR2GV55JQB
BS 653 656 RR2AQ54JQ

RD RR2AQ54TF 656 0 0
TCAAAATCGATATCTAATATAGTAATGAGACTTATTAGTATAATACAAAAAACAAGTTTC
TCAATTATTCAAGGAACAATAGAGTTCAGAAGATCATTGCGCATCTTTGTTTTATTATAA
TAAAATAAGACCAAAACCACAAGTTGTAGACATTAGGAGTTGTGAGTTTTAGTACAAGGC
ATACTTCTGGGTCCAGCTTCTAGCCATGGCTTCGTACTTGACCTTGTCGGTTTTGTATAT
GTGAGCTATATCTGGAACCAGAGGATCGTCAGGGTTTGGGTCTGTGAGAAGAGAGCACAC
AGAGAGAAGCACCTTAGAGATTGTCAGGGCAGGGCTCCACTGGTCTTTGAGGATGTCCAA
ACAGATGTTCCCGTTGTTGTTGATGTTAGGGTGAAACACTTTGGTTCTGAATACAACCTT
GGGAGGTTTGAACGGATAATCTTGAGAGAAATTGATAGTGACAAGGAAAACACCTCCCGA
GTATGGACTTTCGTTAGGACCCATTATTGTAGCTTGCCAATGAAACATGTCTTCTCCTAC
TGGACCTGCACTGCATGACATAGGAGGGTCTCTCTGCAACTCCCTCAGTTCTTTCAAAAT
CCTTCTCGTTGCCATAGTGTTTGATTCAAAGGGAAGCTGTCTTGCTTGGGAT
CCCT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2GV55JQB 637 0 0
G
TAGTAATGAGACTTATTAGTATAATACAAAAA*CAAGTTTCTCAATTATTCAAGGAACAA
TAGAGATCAGAAGATCATTGCGCATCTTTGTTTTATTATAATAAAATAAGACCAAAACCA
CAAGTTGTAGACATTAGGAGTTGTGAGTTTTAGTACAAGGCATACTTCTGGGTCCAGCTT
CTAGCCATGGCTTCGTACTTGACCTTGTCGGTTTTGTATATGTGAGCTATATCTGGAACC
AGAGGATCGTCAGGGTTTGGGTCTGTGAGAAGAAAGCACACAGAGAGAAGCACCTTAAAG
ATTGTCAGGGCAGGGCTCCACTGGTCTTTGAGGATGTCCAAACAGATGTTCCCGTTGTTG
TTGATGTTAGGGTGAAACACTTTGGTTCTGAATACAACCTTGGGAGGTTTGAACGGATAA
TCTTGAGAGAAATTGATAGTGACAAGGAAAACACCTCCCGAGTATGGACTTTCGTTAGGA
CCCATTATTGTAGCTTGCCAATGAAACATGTCTTCTCCTACTGGACCTGCACTGCATGAC
ATAGGAGGGTCTCTCTGCAACTCCCTCAGTTCTTTCAAAATCCTTCTCGTTGCCATAGTG
TTTGATTCAAAGGGAAGCTGTCTTGCTTGGGAT
GCC

QA 2 634 2 634
DS 

RD RR2GV55TF 637 0 0
G
TAGTAATGAGACTTATTAGTATAATACAAAAA*CAAGTTTCTCAATTATTCAAGGAACAA
TAGAGATCAGAAGATCATTGCGCATCTTTGTTTTATTATAATAAAATAAGACCAAAACCA
CAAGTTGTAGACATTAGGAGTTGTGAGTTTTAGTACAAGGCATACTTCTGGGTCCAGCTT
CTAGCCATGGCTTCGTACTTGACCTTGTCGGTTTTGTATATGTGAGCTATATCTGGAACC
AGAGGATCGTCAGGGTTTGGGTCTGTGAGAAGAGAGCACACAGAGAGAAGCACCTTAGAG
ATTGTCAGGGCAGGGCTCCACTGGTCTTTGAGGATGTCCAAACAGATGTTCCCGTTGTTG
TTGATGTTAGGGTGAAACACTTTGGTTCTGAATACAACCTTGGGAGGTTTGAACGGATAA
TCTTGAGAGAAATTGATAGTGACAAGGAAAACACCTCCCGAGTATGGACTTTCGTTAGGA
CCCATTATTGTAGCTTGCCAATGAAACATGTCTTCTCCTACTGGACCTGCACTGCATGAC
ATAGGAGGGTCTCTCTGCAACTCCCTCAGTTCTTTCAAAATCCTTCTCGTTGCCATAGTG
TTTGATTCAAAGGGAAGCTGTCTTGCTTGGGAT
GCC

QA 2 634 2 634
DS 

RD RR2AQ54JQ 344 0 0
CTTAAAA
ATTGTCAGGGCAGGGCTCCACTGGTCTTTGAGGATGTCCAAACAAATGTTCCCGTTGTTG
TTGATGTTAGGGTGAAACACTTTGGTTCTGAATACAACCTTGGGAGGTTTGAACGGATAA
TCTTGAGAGAAATTGATAGTGACAAGGAAAACACCTCCCGAGTATGGACTTTCGTTAGGA
CCCATTATTGTAGCTTGCCAATGAAACATGTCTTCTCCTACTGGACCTGCACTGCATGAC
ATAGGAGGGTCTCTCTGCAACTCCCTCAGTTCTTTCAAAATCCTTCTCGTTGCCATAGTG
TTTGATTCAAAGGGAAGCTGTCTTGCTTGGGATCCCT

QA 8 344 8 344
DS 



AS 1 4

CO CL1992Contig1 800 4 5 U
CGTGTTGAAGCAACAGCTTGAGCTTCAAGTTACTCAGTTTGTAGAGTCCTTGTAAACCAC
ATTGCATTTATTTGATTTTAAAGCGTTATTTAACTTCAAAATTACATGTTTTTTTTCTTC
TAACAAATACACTTAAAACAGATTGCTTCTCTTCGGTTTTACATAGCTGCAACGGAGGCA
ATGTTGGGCTGAGAAGACTTGGCAATGCCGTTGCAGACGTTAAAGCCGTACCAAACAGAG
TTAGGCAAGAAGAGGTTATAGTAGAAAGTGGCTGATCTGATGTACGAGCCATATATCTTG
ACGCTCTCTGGTTTCCAGCCGTCGTATCCTTGTCTGAGTAGGTAGAGATAACAGACGTCA
TGCATACACGGTCCTGTTATCTTGTATGTGTCCGAAGAACATCTTTCAAATGCCCTCGAG
TGTGGATCGTCTAGTCTCTTCACGTATACCTGGTTGCCGTAGACATCACCAAACGCGATA
CTGATCTTATCTCTGGTGTAAGACACCGAGGAACAGCTTGTCTTAATGATCACCGTGTAA
GAACACCCACCCGCATTCTCTAGCTGTGGTTTAGGAAGAAATGAATCAATCGGCTGAGGT
TTTATGGTGATGAAGGATCTCGCAGAGGAAGACGTTGTGAGAAAACATAATGCAAAGAGA
AACAAAGCTAACCACCTGAGCATTTTTCCTAAGTTGAAAAGGTTTGGAGATGAACAAAAA
GTTCAGATCTTAGTGGTTAGGACCAAGAAAATGATATTCTAGAGAAACCGACACGAGGAT
CACGTTCTTTTTAATCCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU09JQ U 39
AF RR2EU09TF C 1
AF RR2AW21TFB C 69
AF RR2AW21JQ U 54
BS 1 38 RR2EU09TF
BS 39 121 RR2EU09JQ
BS 122 122 RR2AW21JQ
BS 123 636 RR2EU09JQ
BS 637 800 RR2AW21JQ

RD RR2EU09JQ 598 0 0
TTGTAGAGTCCTTGTAAACCACATTGCATTTATTTGATTTTAAAGCGTTATTTAACTTCA
AAATTACATGTTTTTTTTCTTCTCACAAATACACTTAAAACAGATTGCTTCTCTTCGGTT
TTACATAGCTGCAACGGAGGCAATGTTGGGCTGAGAAGACTTGGCAATGCCGTTGCAGAC
GTTAAAGCCGTACCAAACAGAGTTAGGCAAGAAGAGGTTATAGTAGAAAGTGGCTGATCT
GATGTACGAGCCATATATCTTGACGCTCTCTGGTTTCCAGCCGTCGTATCCTTGTCTGAG
TAGGTAGAGATAACAGACGTCATGCATACACGGTCCTGTTATCTTGTATGTGTCCGAAGA
ACATCTTTCAAATGCCCTCGAGTGTGGATCGTCTAGTCTCTTCACGTATACCTGGTTGCC
GTAGACATCACCAAACGCGATACTGATCTTATCTCTGGTGTAAGACACCGAGGAACAGCT
TGTCTTAATGATCACCGTGTAAGAACACCCACCCGCATTCTCTAGCTGTGGTTTAGGAAG
AAATGAATCAATCGGCTGAGGTTTTATGGTGATGAAGGATCTCGCAGAGGAAGACGTT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2EU09TF 692 0 0
CGTGTTGAAGCAACAGCTTGAGCTTCAAGTTACTCAGTTTGTAGAGTC*TTGTAAACCAC
ATTGCATTTATTTGATTTTAAAGCGTTATTTAACTTCAAAATTACATGTTTTTTT*CTTC
TCACAAATACACTTAAAACAGATTGCTTCTCTTCGGTTTTACATAGCTGCAACGGAGGCA
ATGTTGGGCTGAGAAGACTTGGCAATGCCGTTGCAGACGTTAAAGCCGTACCAAACAGAG
TTAGGCAAGAAGAGGTTATAGTAGAAAGTGGCTGATCTGATGTACGAGCCATATATCTTG
ACGCTCTCTGGTTTCCAGCCGTCGTATCCTTGTCTGAGTAGGTAGAGATAACAGACGTCA
TGCATACACGGTCCTGTTATCTTGTATGTGTCCGAAGAACATCTTTCAAATGCCCTCGAG
TGTGGATCGTCTAGTCTCTTCACGTATACCTGGTTGCCGTAGACATCACCAAACGCGATA
CTGATCTTATCTCTGGTGTAAGACACCGAGGAACAGCTTGTCTTAATGATCACCGTGTAA
GAACACCCACCCGCATTCTCTAGCTGTGGTTTAGGAAGAAATGAATCAATCGGCTGAGGT
TTTATGGTGATGAAGGATCTCGCAGAGGAAGACGTTGTGAGAAAACATAATGCAAAGAGA
AACAAAGCTAACCACCTGAGCATTTTTCCT
CC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2AW21TFB 605 0 0
TATTTGATTTTAAAGCGTTATTTAACTTCAAAATTACATGTTTTTTTTCTTCTAACAAAT
ACACTTAAAACAGATTGCTTCTCTTCGGTTTTACATAGCTGCAACGGAGGCAATGTTGGG
CTGAGAAGACTTGGCAATGCCGTTGCAGACGTTAAAGCCGTACCAAACAGAGTTAGGCAA
GAAGAGGTTATAGTAGAAAGTGGCTGATCTGATGTACGAGCCATATATCTTGACGCTCTC
TGGTTTCCAGCCGTCGTATCCTTGTCTGAGTAGGTAGAGATAACAGACGTCATGCATACA
CGGTCCTGTTATCTTGTATGTGTCCGAAGAACATCTTTCAAATGCCCTCGAGTGTGGATC
GTCTAGTCTCTTCACGTATACCTGGTTGCCGTAGACATCACCAAACGCGATACTGATCTT
ATCTCTGGTGTAAGACACCGAGGAACAGCTTGTCTTAATGATCACCGTGTAAGAACACCC
ACCCCCATTCTCTAGCTGTGGTTTAGGAAGAAATGAATCAATCGGCTGAGGTTTTATGGT
GATGAAGGATCTCGCAGAGGAAGACGTTGTGAGAAAACATAATGCAAAGAGAAACAAAGC
TAACC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2AW21JQ 747 0 0
AAACCACATTGCATTTATTTGATTTTAAAGCGTTATTTAACTTCAAAATTACATGTTTTT
TTTCTTCTAACAAATACACTTAAAACAGATTGCTTCTCTTCGGTTTTACATAGCTGCAAC
GGAGGCAATGTTGGGCTGAGAAGACTTGGCAATGCCGTTGCAGACGTTAAAGCCGTACCA
AACAGAGTTAGGCAAGAAGAGGTTATAGTAGAAAGTGGCTGATCTGATGTACGAGCCATA
TATCTTGACGCTCTCTGGTTTCCAGCCGTCGTATCCTTGTCTGAGTAGGTAGAGATAACA
GACGTCATGCATACACGGTCCTGTTATCTTGTATGTGTCCGAAGAACATCTTTCAAATGC
CCTCGAGTGTGGATCGTCTAGTCTCTTCACGTATACCTGGTTGCCGTAGACATCACCAAA
CGCGATACTGATCTTATCTCTGGTGTAAGACACCGAGGAACAGCTTGTCTTAATGATCAC
CGTGTAAGAACACCCACCCGCATTCTCTAGCTGTGGTTTAGGAAGAAATGAATCAATCGG
CTGAGGTTTTATGGTGATGAAGGATCTCGCAGAGGAAGACGTTGTGAGAAAACATAATGC
AAAGAGAAACAAAGCTAACCACCTGAGCATTTTTCCTAAGTTGAAAAGGTTTGGAGATGA
ACAAAAAGTTCAGATCTTAGTGGTTAGGACCAAGAAAATGATATTCTAGAGAAACCGACA
CGAGGATCACGTTCTTTTTAATCCCCG

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 3

CO CL1993Contig1 1162 3 15 U
AACAAAGGGTTTATTGTATACCATTTATATATAGCAAAGACAGAAACTTGATTAGTTTCA
ATCATATCGTATGAGAATTATATCAACTGTACTTAAAAGGACAGAAACTTAATCAGTTCC
ACGAGCAAAAACAAAGCTCACCTATTCGATTCATTTTAATTCTCATTCGCGCTTCCACCT
CCAACAGGAGGATAGGAAGCCACGGATCCGAACTTATTCTGCTGCATCATATATGGATTT
GCAGGTCCACCACCACTTCCATGATGATAAGGATCATGAGCGTTACTCTGGTGATGATAT
CCTTGCATACCCATATGATGCGGATAGACTGGCATCTGCATCATCGGCGGCTGCGGCACT
CCCACATGTTCTTGGAAGCTCTGTAGAGGGACAGGGGTTGAGGAGAAGAGCTTATCCGAA
GAAGAGGGACCTTCCGAGGTCAATCCCTGCATCCCTTTGAGGTAGAGCCTGTACTTCTGG
AGGTGAGACGCGACGTTCTCTCGAGTCAACCCTTCGACGTTCATAAGCTGCATAATCGTC
TTGGGCACAGCGTTTTTAATCCCCAAGTGAGCCACAACATCCACGAATCTCTTGTGCAGC
TGCGGGGTCCACACCAAACGCGACCGTTTCAGTGTCTTCCCATTAGTCAGATCTTCAGTC
CCCGAATCTCCTTCTTCTTCATCCTCCGATATTATCTTTTGTTTCTTCGAATCCGATCCT
GGACTGCTCGATCCCACTCGATCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGCCGCGGCGACG
ACCCCGATGATGTTGTTGGTGGAGGAAGAGGTGCTTGGACCGGAAGATCCGCCGCGGAGA
GACGAGAAGGTGGTCTCCGAAGCGCGATTCACATCGTGGATGGTACGGCTCTTCTCCGGT
GTTATGCTGAAAGCCATCGCGAGATTCGACGGAACGAGAGAGTATGAGAGCGATGCCAAA
TCTTCGTCGCTTGGTAGCCCCATCTCCCATTCCATTACCCTATCTCCCTCCCCCGATACA
TCGTTCATCCTCACTTCCTCTCCCATCTAGTCTCTCAAAATTCAGATAAAGATTCAATTA
TAAAAGCTTCAGATCAGTGAGATCGGAGATACGCAAGATTGAAAATTCGTGGAGAAGTTT
GGTTTGAGCAATTTTCAAAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC79JQ U 1
AF RR2CF82JQ U 54
AF RR2CF82TF C 679
BS 1 454 RR2AC79JQ
BS 455 455 RR2CF82JQ
BS 456 622 RR2AC79JQ
BS 623 623 RR2CF82JQ
BS 624 752 RR2AC79JQ
BS 753 764 RR2CF82JQ
BS 765 771 RR2AC79JQ
BS 772 772 RR2CF82JQ
BS 773 813 RR2AC79JQ
BS 814 814 RR2CF82JQ
BS 815 847 RR2AC79JQ
BS 848 849 RR2CF82JQ
BS 850 850 RR2CF82TF
BS 851 882 RR2CF82JQ
BS 883 1162 RR2CF82TF

RD RR2AC79JQ 847 0 0
AACAAAGGGTTTATTGTATACCATTTATATATAGCAAAGACAGAAACTTGATTAGTTTCA
ATCATATCGTATGAGAATTATATCAACTGTACTTAAAAGGACAGAAACTTAATCAGTTCC
ACGAGCAAAAACAAAGCTCACCTATTCGATTCATTTTAATTCTCATTCGCGCTTCCACCT
CCAACAGGAGGATAGGAAGCCACGGATCCGAACTTATTCTGCTGCATCATATATGGATTT
GCAGGTCCACCACCACTTCCATGATGATAAGGATCATGAGCGTTACTCTGGTGATGATAT
CCTTGCATACCCATATGATGCGGATAGACTGGCATCTGCATCATCGGCGGCTGCGGCACT
CCCACATGTTCTTGGAAGCTCTGTAGAGGGACAGGGGTTGAGGAGAAGAGCTTATCCGAA
GAAGAGGGACCTTCCGAGGTCAATCCCTGCATCCTTTTGAGGTAGAGCCTGTACTTCTGG
AGGTGAGACGCGACGTTCTCTCGAGTCAACCCTTCGACGTTCATAAGCTGCATAATCGTC
TTGGGCACAGCGTTTTTAATCCCCAAGTGAGCCACAACATCCACGAATCTCTTGTGCAGC
TGCGGGGTCCACACCAAACGCGCCCGTTTCAGTGTCTTCCCATTAGTCAGATCTTCAGTC
CCCGAATCTCCTTCTTCTTCATCCTCCGATATTATCTTTTGTTTCTTCGAATCCGATCCT
GGACTGCTCGATCCCACTCGATCTTCCTCCTC************CTCCGCCACGGCGACG
ACCCCGATGATGTTGTTGGTGGAGGAAGAGGTGTTTGGACCGGAAGATCCGCCGCGGAGA
GACGAGA

QA 1 847 1 847
DS 

RD RR2CF82JQ 829 0 0
AGTTTCAATCATATCGTATGAGAATTATATCAACTGTACTTAAAAGGACAGAAACTTAAT
CAGTTCCACGAGCAAAAACAAAGCTCACCTATTCGATTCATTTTAATTCTCATTCGCGCT
TCCACCTCCAACAGGAGGATAGGAAGCCACGGATCCGAACTTATTCTGCTGCATCATATA
TGGATTTGCAGGTCCACCACCACTTCCATGATGATAAGGATCATGAGCGTTACTCTGGTG
ATGATATCCTTGCATACCCATATGATGCGGATAGACTGGCATCTGCATCATCGGCGGCTG
CGGCACTCCCACATGTTCTTGGAAGCTCTGTGGAGGGACAGGGGTTGAGGAGAAGAGCTT
ATCCGAAGAAGAGGGACCTTCCGAGGTCAATCCCTGCATCCCTTTGAGGTAGAGCCTGTA
CTTCTGGAGGTGAGACGCGACGTTCTCTCGAGTCAACCCTTCGACGTTCATAAGCTGCAT
AATCGTCTTGGGCACAGCGTTTTTAATCCCCAAGTGAGCCACAACATCCACGAATCTCTT
GTGCAGCTGCGGGGTCCACACCAAACGCGACCGTTTCAGTGTCTTCCCATTAGTCAGATC
TTCAGTCCCCGAATCTCCTTCTTCTTCATCCTCCGATATTATCTTTTGTTTCTTCGAATC
CGATCCTGGACTGCTCGATCCCACTCGATCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGCCGC
GGCGACGACCCCGATGATGTTGTTGGTGGAGGAAGAGGTGCTTGGACCGGAAGATCCGCC
GCGGAGAGACGAGAAG*TGGTCTCCGAAGCGCGATTCACATCGTGGATG

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2CF82TF 484 0 0
TCATCCTCCGATATTATCTTTTGTTTCTTCGAATCCGATCCTGGACTGCTCGATCCCACT
CGATCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGCCGCGGCGACGACCCCGATGATGTTGTTG
GTGGAGGAAGAGGTGCTTGGACCGGAAGATCCGCCGCGGAGAGACGAGAAGGTGGTCTCC
GAAGCGCGATTCACATCGTGGATGGTACGGCTCTTCTCCGGTGTTATGCTGAAAGCCATC
GCGAGATTCGACGGAACGAGAGAGTATGAGAGCGATGCCAAATCTTCGTCGCTTGGTAGC
CCCATCTCCCATTCCATTACCCTATCTCCCTCCCCCGATACATCGTTCATCCTCACTTCC
TCTCCCATCTAGTCTCTCAAAATTCAGATAAAGATTCAATTATAAAAGCTTCAGATCAGT
GAGATCGGAGATACGCAAGATTGAAAATTCGTGGAGAAGTTTGGTTTGAGCAATTTTCAA
AGGG

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 4

CO CL1994Contig1 944 4 2 U
GGAACCCAAGCCACTGAGTCTTTCGAGTTTGAAATATACTCTTATCCTTACTAAAATATT
TGTATTTGTAGAAACCATATTGGTTCTACAAATCATATCAACAATTACATATAGACTTTC
TGTATAATCATAATATGGTGGTCAAACTATTTGGGCAGATAAAAGCAGGTAATCCACAAA
GAGTATTGCTCTGTTTTCTGGAAA*GGGCATCGAGTTTGAAGTTATCCATGTCGATCTCA
AAAAATTTGAGCAGAAAAAA*CCAGAGTATCTTCTTCGTCAGCCATTTGGTCAAATTCCA
GCTATTGAAGATGGAGATCTTAAGCTTTTTGAATCACGAGCCATAGCGAGGTATTACGCG
ACCAAGTATGCGGACCAAGGAACGGACCTATTGGGCAAGACCTTGGAGCAACGAACCATC
GTGGAACAGTGGATGGAAGTTGAGGCTAACTACTTCGCCGTTGTGGTTGTACCTTTAATT
ATAAACATCGTGATTAGGCCCAAGTTCGACGTTGCTTTGGTGGAAGAGCTAAAGGTCAAG
TTCGATAAGATCCTGGATGTATATGAGAACCAGTTAGCGACGGACCGGTATTTGGCCGGT
CCTGAGTACACATTGGCTGATCTGACTCATATGCCCGGTATGAGGTATATAATGAATGAA
ACCGGTTTGGGGAGCATGGTTACGTCTCGGGAGAATGTTAACCGGTGGTGGAATGAGATT
TCGGCTAGACCGGCTTGGAAGAAACTTATGGAAATGGCTGCAAATTAAATTAGTTTTAGT
GTATCATTGTTGATGAGGACTAATGATGATGATGCATGTGGTATTCGGCCAAATAAGTGT
TTTCAAACATTTTCTGTCTTTTCCCCTAAATAAAGTTAATCTCAAGTGTTATTGTCTTTA
CCAAATAATGTTATTTTAAAACACGCCTTGATGTTATTGTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK36TF U 6
AF RR2BK36JQ C 531
AF RR2F049TF U 1
AF RR2F049JQ C 164
BS 1 762 RR2F049TF
BS 763 944 RR2F049JQ

RD RR2BK36TF 690 0 0
GG
AAGCCACTGAGTCTTTCGAGTTTGAAATATACTCT*ATCCTTACTAATATATTTGTATTT
GTAGAAACCATATTGGTTCTACAAATCATATCAACAATTACATATAGACTTTCTGTATAA
TCATAATATGGTGGTCAAACTATTTGGGCAGATAAAAGCAGGTAATCCACAAAGAGTATT
GCTCTGTTTTCTGGAAAAGGGCATCGAGTTTGAAGTTATCCATGTCGATCTCAAAAAATT
TGAGCAGAAAAAAACCAGAGTATCTTCTTCGTCAGCCATTTGGTCAAATTCCAGCTATTG
AAGATGGAGATCTTAAGCTTTTTGAATCACGAGCCATAGCGAGGTATTACGCGACCAAGT
ATGCGGACCAAGGAACGGACCTATTGGGCAAGACCTTGGAGCAACGAGCCATCGTGGAAC
AGTGGATGGAAGTTGAGGCTAACTACTTCGCCGTTGTGGTTGTACCTTTAATTATAAACA
TCGTGAT*AGGCCCAAGTTCGACGTTGCTTTGGTGGAAGAGCTAAAGGTCAAGTTCGATA
AGATCCTGGATGTATATGAGAACCAGTTAGCGACGGACCGGTATTTGGCCGGTCCTGAGT
ACACATTGGCTGATCTGACTCATATGCCCGGTATGAGGTATATAATGAATGAAACCGGTT
TGGGGAGCATGGTTACGTCTCGGGAGAA

QA 3 690 3 690
DS 

RD RR2BK36JQ 183 0 0
AAAGGTCAAGTTCGATAAGATCCTGGATGTATATGAGAACCAGTTAGCGACGGACCGGTA
TTTGGCCGGTCCTGAGTACCCATTGGGTGATTTGACTCATATGCCCGGTATGAGGTATAT
AATGAATGAAACCGGTTTGGGGAGCATGGTTACGTTTCGGGAGAATGTTAACCGGTGGTG
GAA

QA 1 183 1 183
DS 

RD RR2F049TF 762 0 0
GGAACCCAAGCCACTGAGTCTTTCGAGTTTGAAATATACTCTTATCCTTACTAAAATATT
TGTATTTGTAGAAACCATATTGGTTCTACAAATCATATCAACAATTACATATAGACTTTC
TGTATAATCATAATATGGTGGTCAAACTATTTGGGCAGATAAAAGCAGGTAATCCACAAA
GAGTATTGCTCTGTTTTCTGGAAA*GGGCATCGAGTTTGAAGTTATCCATGTCGATCTCA
AAAAATTTGAGCAGAAAAAA*CCAGAGTATCTTCTTCGTCAGCCATTTGGTCAAATTCCA
GCTATTGAAGATGGAGATCTTAAGCTTTTTGAATCACGAGCCATAGCGAGGTATTACGCG
ACCAAGTATGCGGACCAAGGAACGGACCTATTGGGCAAGACCTTGGAGCAACGAACCATC
GTGGAACAGTGGATGGAAGTTGAGGCTAACTACTTCGCCGTTGTGGTTGTACCTTTAATT
ATAAACATCGTGATTAGGCCCAAGTTCGACGTTGCTTTGGTGGAAGAGCTAAAGGTCAAG
TTCGATAAGATCCTGGATGTATATGAGAACCAGTTAGCGACGGACCGGTATTTGGCCGGT
CCTGAGTACACATTGGCTGATCTGACTCATATGCCCGGTATGAGGTATATAATGAATGAA
ACCGGTTTGGGGAGCATGGTTACGTCTCGGGAGAATGTTAACCGGTGGTGGAATGAGATT
TCGGCTAGACCGGCTTGGAAGAAACTTATGGAAATGGCTGCA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2F049JQ 781 0 0
AGCAGGTAATCCACAAAGAGTATTGCTCTGTTTTCTGGAAA*GGGCATCGAGTTTGAAGT
TATCCATGTCGATCTCAAAAAATTTGAGCAGAAAAAA*CCAGAGTATCTTCTTCGTCAGC
CATTTGGTCAAATTCCAGCTATTGAAGATGGAGATCTTAAGCTTTTTGAATCACGAGCCA
TAGCGAGGTATTACGCGACCAAGTATGCGGACCAAGGAACGGACCTATTGGGCAAGACCT
TGGAGCAACGAACCATCGTGGAACAGTGGATGGAAGTTGAGGCTAACTACTTCGCCGTTG
TGGTTGTACCTTTAATTATAAACATCGTGATTAGGCCCAAGTTTGACGTTGCTTTGGTGG
AAGAGCTAAAGGTCAAGTTCGATAAGATCCTGGATGTATATGAGAACCAGTTAGCGACGG
ACCGGTATTTGGCCGGTCCTGAGTACACATTGGCTGATTTGACTCATATGCCCGGTATGA
GGTATATAATGAATGAAACCGGTTTGGGGAGCATGGTTACGTCTCGGGAGAATGTTAACC
GGTGGTGGAATGAGATTTCGGCTAGACCGGCTTGGAAGAAACTTATGGAAATGGCTGCAA
ATTAAATTAGTTTTAGTGTATCATTGTTGATGAGGACTAATGATGATGATGCATGTGGTA
TTCGGCCAAATAAGTGTTTTCAAACATTTTCTGTCTTTTCCCCTAAATAAAGTTAATCTC
AAGTGTTATTGTCTTTACCAAATAATGTTATTTTAAAACACGCCTTGATGTTATTGTCTT
T

QA 1 781 1 781
DS 



AS 2 4

CO CL1995Contig1 863 2 10 U
GGAAAGGAATTAAAGTCACGCTTTAAATATCTCTGTCTCAAAAAAACTGTTTTGCCTACA
GAAGAAAACAAGTGAATTCTTTATCTAATTTTCTTTTTCTTTAACACAGTAATTCAATAA
TTGTTGTCTTGTCACTATAAATTATAGCTAAAAATAAATCTCCAGAGAAAATAATATTCT
CGTTCTCCATCTGCTTTCCTCTCATCGGAGCTCCCCTGGTTCTGAAGGAACCAAAGACAA
GATTTTGATCTTGGTGGTGGAGAAAACCGAAAGATTGAAGGAGATGTGTTCTCAGGCTTT
GGAGAGAGACACAACATGGATGGGAAACTGCTGCAGAGTTTCCAGAAGAGCTTTGTGGAT
GTTCAAGACATTCTAGATCAGAACCGGCTGTTGATCAACGAGATCAATCAGAACCACGAG
TCCAAACAGCCTGATAACCTGGGTCGAAACGTCGGTCTCATCAAAGAGCTCAACAACAAC
ATCAGAAGAGTGGCTAGTCTCTACGGTGACCTCTCTCATTCTTTCGCAAGATCGATGGAG
GCTTCATCGGAAGGTGAATCTAGTGGAACCTTGAAATCTGATGGGAAAGCTAACCAGAAG
AGGTTTAGATCCGGTTAGTTATATAAAACCGAGAGTCACCACCAAAAGCTGATTTACATT
CAAAGAGTCCAGAGCTAATTGATTGAAGAGAGTAAAAGAAAGAAAGAGAGTTTTCTTTAC
CACTGCAATATCTCACTGTTGGGAAAATGATAGCTACATACATTTCACCAAAAGATGATT
TTCAGATTTAATTGTTTGTTTGTTTTACTTTGAAAAAACTTGTTGTAAAGTTCACACATT
TCAGTTTATGATTTGGTTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E741TF U 1
AF RR2E741JQ C 100
BS 1 553 RR2E741TF
BS 554 554 RR2E741JQ
BS 555 557 RR2E741TF
BS 558 558 RR2E741JQ
BS 559 567 RR2E741TF
BS 568 568 RR2E741JQ
BS 569 575 RR2E741TF
BS 576 576 RR2E741JQ
BS 577 591 RR2E741TF
BS 592 863 RR2E741JQ

RD RR2E741TF 591 0 0
GGAAAGGAATTAAAGTCACGCTTTAAATATCTCTGTCTCAAAAAAACTGTTTTGCCTACA
GAAGAAAACAAGTGAATTCTTTATCTAATTTTCTTTTTCTTTAACACAGTAATTCAATAA
TTGTTGTCTTGTCACTATAAATTATAGCTAAAAATAAATCTCCAGAGAAAATAATATTCT
CGTTCTCCATCTGCTTTCCTCTCATCGGAGCTCCCCTGGTTCTGAAGGAACCAAAGACAA
GATTTTGATCTTGGTGGTGGAGAAAACCGAAAGATTGAAGGAGATGTGTTCTCAGGCTTT
GGAGAGAGACACAACATGGATGGGAAACTGCTGCAGAGTTTCCAGAAGAGCTTTGTGGAT
GTTCAAGACATTCTAGATCAGAACCGGCTGTTGATCAACGAGATCAATCAGAACCACGAG
TCCAAACAGCCTGATAACCTGGGTCGAAACGTCGGTCTCATCAAAGAGCTCAACAACAAC
ATCAGAAGAGTGGCTAGTCTCTACGGTGACCTCTCTCATTCTTTCGCAAGATCGATGGAG
GCTTCATCGGAAG*TGA*TCTAGTGGA*CCTTGAA*TCTGATGGGAAAGCT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2E741JQ 764 0 0
TTTAACACAGTAATTCAATAATTGTTGTCTTGTCACTATAAATTATAGCTAAAAATAAAT
CTCCAGAGAAAATAATATTCTCGTTCTCCATCTGCTTTCCTCTCATCGGAGCTCCCCTGG
TTCTGAAGGAACCAAAGACAAGATTTTGATCTTGGTGGTGGAGAAAACCGAAAGATTGAA
GGAGATGTGTTCTCAGGCTTTGGAGAGAGACACAACATGGATGGGAAACTGCTGCAGAGT
TTCCAGAAGAGCTTTGTGGATGTTCAAGACATTCTAGATCAGAACCGGCTGTTGATCAAC
GAGATCAATCAGAACCACGAGTCCAAACAGCCTGATAACCTGGGTCGAAACGTCGGTCTC
ATCAAAGAGCTCAACAACAACATCAGAAGAGTGGCTAGTCTCTACGGTGACCTCTCTCAT
TCTTTCGCAAGATCGATGGAGGCTTCATCGGAAGGTGAATCTAGTGGAACCTTGAAATCT
GATGGGAAAGCTAACCAGAAGAGGTTTAGATCCGGTTAGTTATATAAAACCGAGAGTCAC
CACCAAAAGCTGATTTACATTCAAAGAGTCCAGAGCTAATTGATTGAAGAGAGTAAAAGA
AAGAAAGAGAGTTTTCTTTACCACTGCAATATCTCACTGTTGGGAAAATGATAGCTACAT
ACATTTCACCAAAAGATGATTTTCAGATTTAATTGTTTGTTTGTTTTACTTTGAAAAAAC
TTGTTGTAAAGTTCACACATTTCAGTTTATGATTTGGTTTCTTC

QA 1 764 1 764
DS 



CO CL1995Contig2 620 2 3 U
GGATTCTCGTTCTCCATCTGCTTTCCTCTCATCGGAGCTCCCCTGGTTCTGAAGGAACCA
AAGACAAAGATTTTGATCTGTGGTGGTGGAGAAACCGAAAGATGGAAGGAGATGTGTTCT
CAGGCTTTGGAGAGAGACACAACATGGGTGGGAAACTGCTGCAGAGTTTCCAGAAGAGCT
TTGTGGATGTTCAAGACATTTTGGATCAGAACCGGCTGTTGATCAACGAGATCAATCAGA
ACCACGAGTCCAAACAGCCTGATAACTTGGGTCGAAACGTCGGTCTCATCGAAGAGCTCA
ACAACAATATCAGAAGAGTGGCTAGCCTTTACGGTGACCTCTCTCATTCTTTCGCAAGAT
CGATGGAGGCTTCATCAGAAGGTGAATCTAGTGGAACCTTGAAATCTGATGGGAAAGCTA
ACCAGAAGAGGTTTCGATCCGGTTAGTTATATATATAAACCGAGAGCCACCACCAAAAAG
CTGATTTACATTCAAAGACTCAGAGCTAATTTGATTGAAGAGAGTGAAAGAAAAAAAGAG
AGTTTCCTTACTACTGCAATATCTCACTGTTGGAAAATGATAGCTACATACGTTTTCACC
AAAAGATGATTTTCAGATCT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2EQ04JQ C 1
AF RR2EQ04TF U 1
BS 1 2 RR2EQ04JQ
BS 3 618 RR2EQ04TF
BS 619 620 RR2EQ04JQ

RD RR2EQ04JQ 620 0 0
GGATTCTCGTTCTCCATCTGCTTTCCTCTCATCGGAGCTCCCCTGGTTCTGAAGGAACCA
AAGACAAAGATTTTGATCTGTGGTGGTGGAGAAACCGAAAGATGGAAGGAGATGTGTTCT
CAGGCTTTGGAGAGAGACACAACATGGGTGGGAAACTGCTGCAGAGTTTCCAGAAGAGCT
TTGTGGATGTTCAAGACATTTTGGATCAGAACCGGCTGTTGATCAACGAGATCAATCAGA
ACCACGAGTCCAAACAGCCTGATAACTTGGGTCGAAACGTCGGTCTCATCGAAGAGCTCA
ACAACAATATCAGAAGAGTGGCTAGCCTTTACGGTGACCTCTCTCATTCTTTCGCAAGAT
CGATGGAGGCTTCATCAGAAGGTGAATCTAGTGGAACCTTGAAATCTGATGGGAAAGCTA
ACCAGAAGAGGTTTCGATCCGGTTAGTTATATATATAAACCGAGAGCCACCACCAAAAAG
CTGATTTACATTCAAAGACTCAGAGCTAATTTGATTGAAGAGAGTGAAAGAAAAAAAGAG
AGTTTCCTTACTACTGCAATATCTCACTGTTGGAAAATGATAGCTACATACGTTTTCACC
AAAAGATGATTTTCAGATCT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2EQ04TF 620 0 0
GG
ATTCTCGTTCTCCATCTGCTTTCCTCTCATCGGAGCTCCCCTGGTTCTGAAGGAACCAAA
GACAAAGATTTTGATCTGTGGTGGTGGAGAAACCGAAAGATGGAAGGAGATGTGTTCTCA
GGCTTTGGAGAGAGACACAACATGGGTGGGAAACTGCTGCAGAGTTTCCAGAAGAGCTTT
GTGGATGTTCAAGACATTTTGGATCAGAACCGGCTGTTGATCAACGAGATCAATCAGAAC
CACGAGTCCAAACAGCCTGATAACTTGGGTCGAAACGTCGGTCTCATCGAAGAGCTCAAC
AACAATATCAGAAGAGTGGCTAGCCTTTACGGTGACCTCTCTCATTCTTTCGCAAGATCG
ATGGAGGCTTCATCAGAAGGTGAATCTAGTGGAACCTTGAAATCTGATGGGAAAGCTAAC
CAGAAGAGGTTTCGATCCGGTTAGTTATATATATAAACCGAGAGCCACCACCAAAAAGCT
GATTTACATTCAAAGACTCAGAGCTAATTTGATTGAAGAGAGTGAAAGAAAAAAAGAGAG
TTTCCTTACTACTGCAATATCTCACTGTTGGAAAATGATAGCTACATACGTTTTCACCAA
AAGATGATTTTCAGAT
CT

QA 3 618 3 618
DS 



AS 1 4

CO CL1996Contig1 683 4 9 U
TTTTTTTTGGGCTAGGAACAGGCTTAATTATTAATGGGCCTCATAAACATTTACATAAAC
ATTGAAATGAGCTTAAAGCAATTTAGATTCAAATACACGAGCGAATCCGATACAAAAACC
CAACCCGGTTTAAACAAATATCGAAATAACCGGGTTGGTTAATCAGATTTCTGCAAATTG
GAGACAAAACCAGAAGCAGCGAAAGCAGCAGAGCCACCGAGAACAGAGACAACAGCCACG
ACGAGCTGAACCACCACTTGCCAAGAGTAATCTTCAGGGACCAAGTAGACGAAAACCGGT
CCGAGAAGGAGCAAACCGAGGCTCAGGGTGAACAGCGTTCCGGGTGTTTCCGGGTTCGTA
GCGGCGGACAGAACGCCGAACTCCTCGGCTTTGGTGAGCAGTCCGAGACGCTCGATGGTG
GATAGAGAGAAACCTGATTCCTCGGCTAAGGATAAAAGTCCTGCCTTTTCGGCTTTGGTC
AGAAGCTTGAGCTGCTCCACTCTTGTCAGTAGCTTCACCTGTCCACTTGTTGTGCCCTTC
TTTGAAGTTATGGTTCTTGCTGCAGAAGGTGAAGGCTTCTTGTTCGCCATTGAATGTACT
GTTAAAGACGAACAGATTGAATTAGCCGCCATTGCTCTACTTCTCTCTCTCTGTGTTTTG
TCGAAGCGCTCTTTTTTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DL01TF C 1
AF RR2DL01JQ U 8
AF RR2B460JQ U 10
AF RR2B460TF C 10
BS 1 11 RR2DL01TF
BS 12 206 RR2DL01JQ
BS 207 207 RR2B460JQ
BS 208 224 RR2DL01JQ
BS 225 225 RR2B460JQ
BS 226 439 RR2DL01JQ
BS 440 440 RR2B460JQ
BS 441 672 RR2DL01JQ
BS 673 683 RR2B460JQ

RD RR2DL01TF 673 0 0
TTTTTTTTGGGCTAGGAACAGGCTTAATTATTAATGGGCCTCATAAACATTTACATAAAC
ATTGAAATGAGCTTAAAGCAATTTAGATTCAAATACACGAGCGAATCCGATACAAAAACC
CAACCCGGTTTAAACAAATATCGAAATAACCGGGTTGGTTAATCAGATTTCTGCAAATTG
GAGACAAAACCAGAAGCAGCGAAAGCGGCAGAGCCACCGAGAACGGAGACAACAGCCACG
ACGAGCTGAACCACCACTTGCCAAGAGTAATCTTCAGGGACCAAGTAGACGAAAACCGGT
CCGAGAAGGAGCAAACCGAGGCTCAGGGTGAACAGCGTTCCGGGTGTTTCCGGGTTCGTA
GCGGCGGACAGAACGCCGAACTCCTCGGCTTTGGTGAGCAGTCCGAGACGCTCGATGGTG
GATAGAGAGAAACCTGATTTCTCGGCTAAGGATAAAAGTCCTGCCTTTTCGGCTTTGGTC
AGAAGCTTGAGCTGCTCCACTCTTGTCAGTAGCTTCACCTGTCCACTTGTTGTGCCCTTC
TTTGAAGTTATGGTTCTTGCTGCAGAAGGTGAAGGCTTCTTGTTCGCCATTGAATGTACT
GTTAAAGACGAACAGATTGAATTAGCCGCCATTGCTCTACTTCTCTCTCTCTGTGTTTTG
TCGAAGCGCTCT
C

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2DL01JQ 666 0 0
GGGC
CTAGGAACAGGCTTAATTATTAATGGGCCTCATAAACATTTACATAAACATTGAAATGAG
CTTAAAGCAATTTAGATTCAAATACACGAGCGAATCCGATACAAAAACCCAACCCGGTTT
AAACAAATATCGAAATAACCGGGTTGGTTAATCAGATTTCTGCAAATTGGAGACAAAACC
AGAAGCAGCGAAAGCGGCAGAGCCACCGAGAACGGAGACAACAGCCACGACGAGCTGAAC
CACCACTTGCCAAGAGTAATCTTCAGGGACCAAGTAGACGAAAACCGGTCCGAGAAGGAG
CAAACCGAGGCTCAGGGTGAACAGCGTTCCGGGTGTTTCCGGGTTCGTAGCGGCGGACAG
AACGCCGAACTCCTCGGCTTTGGTGAGCAGTCCGAGACGCTCGATGGTGGATAGAGAGAA
ACCTGATTTCTCGGCTAAGGATAAAAGTCCTGCCTTTTCGGCTTTGGTCAGAAGCTTGAG
CTGCTCCACTCTTGTCAGTAGCTTCACCTGTCCACTTGTTGTGCCCTTCTTTGAAGTTAT
GGTTCTTGCTGCAGAAGGTGAAGGCTTCTTGTTCGCCATTGAATGTACTGTTAAAGACGA
ACAGATTGAATTAGCCGCCATTGCTCTACTTCTCTCTCTCTGTGTTTTGTCGAAGCGCTC
T
C

QA 5 665 5 665
DS 

RD RR2B460JQ 674 0 0
GC
CTAGGAACAGGCTTAATTATTAATGGGCCTCATAAACATTTACATAAACATTGAAATGAG
CTTAAAGCAATTTAGATTCAAATACGCGAGCGAATCCGATACAAAAACCCAACCCGGTTT
AAACAAATATCGAAATAACCGGGTTGGTTAATCAGATTTCTGCAAATTGGAGACAAAACC
AGAAGCAGCGAAAGCAGCAGAGCCACCGAGAACAGAGACAACAGCCACGACGAGCTGAAC
CACCACTTGCCAAGAGTAATCTTCAGGGACCAAGTAGACGAAAACCGGTCCGGGAAGGAG
CAAACCGAGGCTCAGGGTGAACAGCGTTCCGGGTGTTTCCGGGTTCGTAGCGGCGGACAG
AACGCCGAACTCCTCGGCTTTGGTGAGCAGTCCGAGACGCTCGATGGTGGATAGAGAGAA
ACCTGATTCCTCGGCTAAGGATAAAAGTCCTGCCTTTTCGGCTTTGGTCAGAAGCTTGAG
CTGCTCCACTCTTGTCAGTAGCTTCACCTGTCCACTTGTTGTGCCCTTCTTTGAAGTTAT
GGTTCTTGCTGCAGAAGGTGAAGGCTTCTTGTTCGCCATTGAATGTACTGTTAAAGACGA
ACAGATTGAATTAGCCGCCATTGCTCTACTTCTCTCTCTCTGTGTTTTGTCGAAGCGCTC
TTTTTTCTTTCC

QA 3 674 3 674
DS 

RD RR2B460TF 674 0 0
GC
CTAGGAACAGGCTTAATTATTAATGGGCCTCATAAACATTTACATAAACATTGAAATGAG
CTTAAAGCAATTTAGATTCAAATACGCGAGCGAATCCGATACAAAAACCCAACCCGGTTT
AAACAAATATCGAAATAACCGGGTTGGTTAATCAGATTTCTGCAAATTGGAGACAAAACC
AGAAGCAGCGAAAGCAGCAGAGCCACCGAGAACAGAGACAACAGCCACGACGAGCTGAAC
CACCACTTGCCAAGAGTAATCTTCAGGGACCAAGTAGACGAAAACCGGTCCGGGAAGGAG
CAAACCGAGGCTCAGGGTGAACAGCGTTCCGGGTGTTTCCGGGTTCGTAGCGGCGGACAG
AACGCCGAACTCCTCGGCTTTGGTGAGCAGTCCGAGACGCTCGATGGTGGATAGAGAGAA
ACCTGATTCCTCGGCTAAGGATAAAAGTCCTGCCTTTTCGGCTTTGGTCAGAAGCTTGAG
CTGCTCCACTCTTGTCAGTAGCTTCACCTGTCCACTTGTTGTGCCCTTCTTTGAAGTTAT
GGTTCTTGCTGCAGAAGGTGAAGGCTTCTTGTTCGCCATTGAATGTACTGTTAAAGACGA
ACAGATTGAATTAGCCGCCATTGCTCTACTTCTCTCTCTCTGTGTTTTGTCGAAGCGCTC
TTTTTTCTTTCC

QA 3 674 3 674
DS 



AS 1 4

CO CL1997Contig1 680 4 15 U
TTCTATCTCAAATGGCTAATGCCATATATTGAATAGGTAGCAATCAACAATGAACGTTTT
GTTACAACGGATTGTTTGTTCATGAAATGACAAGTTTTCTTTGTTTATCATATCTATTGC
TTCACTTGTTACCATATCTATTGCTTCACTTGCAATGAAGTCTCGATCCGTTCCACAAGT
TGGTTCGCTGGCAAGGCACCCTCAAAACGGTCCCAGAGTTTCCCGTCTTTGAATAAAATG
AATGTAGGTAAAGCCTCAACCTGGTATTTGTTGGCAACCTTTGGGTACTTTTCAGTATCG
ATTTTCACAACTGTAATCTTATCTTTCAGAGTTTCACTCACTTCATTGAGTATAGGTACC
ATAAGCTGGCATGGACCACACCATGTGGCATAAAAGTCTACAAGTAAAGGTTTGTCAGAG
TTGAGCAATAAATCATCAAAAGAGTTGAAGGTTTGCTTCCTTGCTCTAACCTGCATAGTG
AGTGGGGCGCAGCGATAAGACGACGGCGAGTTCACTCTTTCGTGACGGATTCCGAAGCGG
CGAATCTGAGACGGTAAGCGCAGGGATGAATGAGAAAATAGCTTCGACGAGGATGAAAAG
GAGAAACACGACTCAGGGGGAGAGACATAGGAGGTGGGCAGAGAAATCGCCATTGAAAAC
AACAAGAGGGTTAAAACTCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY75JQ U 2
AF RR2D185JQ U 40
AF RR2FY75TF C 1
AF RR2FQ79TF C 4
BS 1 3 RR2FY75TF
BS 4 215 RR2FY75JQ
BS 216 216 RR2D185JQ
BS 217 328 RR2FY75JQ
BS 329 329 RR2D185JQ
BS 330 417 RR2FY75JQ
BS 418 418 RR2D185JQ
BS 419 495 RR2FY75JQ
BS 496 496 RR2FY75TF
BS 497 576 RR2D185JQ
BS 577 577 RR2FY75TF
BS 578 580 RR2D185JQ
BS 581 581 RR2FY75TF
BS 582 626 RR2D185JQ
BS 627 680 RR2FY75TF

RD RR2FY75JQ 494 0 0
CC
TATCTCAAATGGCTAATGCCATATATTGAATAGGTAGCAATCAACAATGAACGTTTTGTT
ACAACGGATTGTTTGTTCATGAAATGACAAGTTTTCTTTGTTTATCATATCTATTGCTTC
ACTTGTTACCATATCTATTGCTTCACTTGCAATGAAGTCTCGATCCGTTCCACAAGTTGG
TTCGCTGGCAAGGCACCCTCAAAACGGTCCCAAAGTTTCCCGTCTTTGAATAAAATGAAT
GTAGGTAAAGCCTCAACCTGGTATTTGTTGGCAACCTTTGGGTACTTTTCAGTATCGATT
TTCACAACTGTAATCTTATCTTTCAAAGTTTCACTCACTTCATTGAGTATAGGTACCATA
AGCTGGCATGGACCACACCATGTGGCATAAAAGTCTACAAGTAAAGGTTTGTCAAAGTTG
AGCAATAAATCATCAAAAGAGTTGAAGGTTTGCTTCCTTGCTCTAACCTGCATAGTGAGT
GGGGCGCAGCGA

QA 3 494 3 494
DS 

RD RR2D185JQ 587 0 0
GCAATCAACAATGAACGTTTTGTTACAACGGATTGTTTGTTCATGAAATGACAAGTTTTC
TTTGTTTATCATATCTATTGCTTCACTTGTTACCATATCTATTGCTTCACTTGCAATGAA
GTCTCGATCCGTTCCACAAGTTGGTTCGCTGGCAAGGCACCCTCAAAACGGTCCCAGAGT
TTCCCGTCTTTGAATAAAATGAATGTAGGTAAAGCCTCAACCTGGTATTTGTTGGCAACC
TTTGGGTACTTTTCAGTATCGATTTTCACAACTGTAATCTTATCTTTCAGAGTTTCACTC
ACTTCATTGAGTATAGGTACCATAAGCTGGCATGGACCACACCATGTGGCATAAAAGTCT
ACAAGTAAAGGTTTGTCAGAGTTGAGCAATAAATCATCAAAAGAGTTGAAGGTTTGCTTT
TTTGCTCTAACCTGCATAGTGAGTGGGGCGCAGCGAGAAGACGACGGCGAGTTCACTCTT
TCGTGACGGATTCCGAAGCGGCGAATCTGAGACGGTAAGCGCAGGGATGAATGAGAAGAT
AACTTCGACGAGGATGAAAAGGAGAAACACGACTCAGGGGGAGAGAC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2FY75TF 680 0 0
TTCTATCTCAAATGGCTAATGCCATATATTGAATAGGTAGCAATCAACAATGAACGTTTT
GTTACAACGGATTGTTTGTTCATGAAATGACAAGTTTTCTTTGTTTATCATATCTATTGC
TTCACTTGTTACCATATCTATTGCTTCACTTGCAATGAAGTCTCGATCCGTTCCACAAGT
TGGTTCGCTGGCAAGGCACCCTCAAAACGGTCCCAGAGTTTCCCGTCTTTGAATAAAATG
AATGTAGGTAAAGCCTCAACCTGGTATTTGTTGGCAACCTTTGGGTACTTTTCAGTATCG
ATTTTCACAACTGTAATCTTATCTTTCAGAGTTTCACTCACTTCATTGAGTATAGGTACC
ATAAGCTGGCATGGACCACACCATGTGGCATAAAAGTCTACAAGTAAAGGTTTGTCAGAG
TTGAGCAATAAATCATCAAAAGAGTTGAAGGTTTGCTTCCTTGCTCTAACCTGCATAGTG
AGTGGGGCGCAGCGATAAGACGACGGCGAGTTCACTCTTTCGTGACGGATTCCGAAGCGG
CGAATCTGAGACGGTAAGCGCAGGGATGAATGAGAAAATAGCTTCGACGAGGATGAAAAG
GAGAAACACGACTCAGGGGGAGAGACATAGGAGGTGGGCAGAGAAATCGCCATTGAAAAC
AACAAGAGGGTTAAAACTCC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2FQ79TF 664 0 0
TATCTCAAATGGCTAATGCCATATATTGAATAGGTAGCAATCAACAATGAACGTTTTGTT
ACAACGGATTGTTTGTTCATGAAATGACAAGTTTTCTTTGTTTATCATATCTATTGCTTC
ACTTGTTACCATATCTATTGCTTCACTTGCAATGAAGTCTCGATCCGTTCCACAAGTTGG
TTCGCTGGCAAGGCACCCTCAAAACGGTCCCAGAGTTTCCCGTCTTTGAATAAAATGAAT
GTAGGTAAAGCCTCAACCTGGTATTTGTTGGCAACCTTTGGGTACTTTTCAGTACCGATT
TTCACAACTGTAATCTTATCTTTCAGAGTTTCACTCACTTCATTGAGTATAGGTACCATA
AGCTGGCATGGACCACACCATGTGGCATAAAAGTCTACAAGTAAAGGTTTGTCAGAGTTG
AGCAATAAATCATCAAAAGAGTTGAAGGTTTGCTTCTTTGCTCTAACCTGCATAGTGAGT
GGGGCGCAGCGATAAGACGACGGCGAGTTCACTCTTTCGTGACGGATTCCGAAGCGGCGA
ATCTGAGACGGTAAGCGCAGGGATGAATGAGAAAATAGCTTCGACGAGGATGAAAAGGAG
AAACACGACTCAGGGGGAGAGACATAGGAGGTGGGCAGAGAAATCGCCATTGAAAACAAC
AAGA

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 4

CO CL1998Contig1 1086 4 19 U
GAAAGGTAAAAACTAGTGTAATTACTAAATTTAACAAACTAATCAAAAATCAAGCAGTAG
CATTCGTAAAAAACAATAAACCACCAGGGGAAAGTCAAAAGAGGAAATAAAAACAGAAAG
GCTTTCACAAAAGAATCAGTTTTCTGTCTTAAATAAAACATTAAAAAGTACACCTAATTT
CGGAAAGGACCACGAACGCAAGCCGACCAATCAGAATCTCTGAAGCATCGAACTAGTTCC
ATGTTTGGTCGGAACCAAAAAAAAAAACTAGAGAATCCACACAAATGGCGGCGCATCAAC
CCTTGTCCCAACCACGGTCCGGTACAGATACATTTTATCCACCTTCTGTCTTCCCTCATA
TCCATTTTACTCCATCCGGTTATTATCGTTCTCGTTTATGATCTCTACATTGAGCCATGG
CGCTTTCTGTGCAAGCCTTTTGCATCCCCCAAGAGTGACTTCACATGAAGACATCCAAAG
GGATCGCATTGTTTCATACTTGTTCACATCAGCGAGAAGCGCCGTGTCCCCGAACGGACT
ATCCCTAATCTCTAGCTTCCTCATCTTTTTGCAACCGTTCAACACATACAACATGCCTTT
ATCCGTATCGCCAGCAAAAGCTATGGAGAGCATCTCAAGCTGAGTTGCAAACATGCCGAT
GTAGAGAAAGACTTGGTCTGTAAGGAGACCAGAGACTGAAAGCCGTTTCAAGTTCTTGCA
TGCTTGCACGATTGCTCCAAAGCCTTCGTCTAGAGGCTGAGATGTGACGTGGTCGGGTTT
GTGTGGCTCGAGGATGCAGAGTCTGAACCGGATGAAATTTGGACAGTTCTTGGCAACGGT
TATGAGCGCTGCGTTTGTCATCAGCTGGCAGAAGTAGAGAATAGAGTGAAGCTTAGGGCA
ACCTGCGGAGATGGCAACTAGACCATCTTCAGTCACAGCTGTGTTGCCTCCACCGTTTAA
ATCAGTTGGAAAAACCCTGAGCTCTTGCAACTCTTTACATGTAGAAGCTACCACTTCAAG
ACCTTTGTCACCTATACTATCCAATATCCATAAACGTTGGAACTTCTTGCAATGCTCAAT
AAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2F509JQ U 1
AF RR2CR13JQ U 24
AF RR2ER59JQ U 20
AF RR2CR13TF C 341
BS 1 36 RR2F509JQ
BS 37 37 RR2ER59JQ
BS 38 161 RR2F509JQ
BS 162 162 RR2ER59JQ
BS 163 262 RR2F509JQ
BS 263 263 RR2ER59JQ
BS 264 295 RR2F509JQ
BS 296 296 RR2ER59JQ
BS 297 305 RR2F509JQ
BS 306 306 RR2ER59JQ
BS 307 345 RR2F509JQ
BS 346 346 RR2ER59JQ
BS 347 368 RR2F509JQ
BS 369 369 RR2CR13JQ
BS 370 531 RR2F509JQ
BS 532 532 RR2ER59JQ
BS 533 688 RR2F509JQ
BS 689 806 RR2ER59JQ
BS 807 1086 RR2CR13TF

RD RR2F509JQ 692 0 0
GAAAGGTAAAAACTAGTGTAATTACTAAATTTAACACACTAATCAAAAATCAAGCAGTAG
CATTCGTAAAAAACAATAAACCACCAGGGGAAAGTCAAAAGAGGAAATAAAAACAGAAAG
GCTTTCACAAAAGAATCAGTTTTCTGTCTTAAATAAAACAT*AAAAAGTACACCTAATTT
CGGAAAGGACCACGAACGCAAGCCGACCAATCAGAATCTCTGAAGCATCGAACTAGTTCC
ATGTTTGGTCGGAACCAAAAAAGAAAACTAGAGAATCCACACAAATGGCGGCGCAGCAAC
CCTTGCCCCAACCACGGTCCGGTACAGATACATTTTATCCACCTTTTGTCTTCCCTCATA
TCCATTTTCCTCCATCCGGTTATTATCGTTCTCGTTTATGATCTCTACATTGAGCCATGG
CGCTTTCTGTGCAAGCCTTTTGCATCCCCCAAGAGTGACTTCACATGAAGACATCCAAAG
GGATCGCATTGTTTCATACTTGTTCACATCAGCGAGAAGCGCCGTGTCCCCAAACGGACT
ATCCCTAATCTCTAGCTTCCTCATCTTTTTGCAACCGTTCAACACATACAACATGCCTTT
ATCCGTATCGCCAGCAAAAGCTATGGAGAGCATCTCAAGCTGAGTTGCAAACATGCCGAT
GTAGAGAAAGACTTGGTCTGTAAGGAGA
CCAG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2CR13JQ 665 0 0
A
CTAAATTTAACAAACTAATCAAAAATCAAGCAGTAGCATTCGTAAAAAACAATAAACCAC
CAGGGGAAAGTCAAAAGAGGAAATAAAAACAGAAAGGCTTTCACAAAAGAATCAGTTTTC
TGTCTTAAATAAAACATTAAAAAGTACACCTAATTTCGGAAAGGACCACGAACGCAAGCC
GACCAATCAGAATCTCTGAAGCATCGAACTAGTTCCATGTTTGGTCGGAACCAAAAAA*A
AAACTAGAGAATCCACACAAATGGCGGCGCATCAACCCTTGTCCCAACCACGGTCCGGTA
CAGATAAATTTTATCCACCTTCTGTCTTCCCTCATATCCATTTTACTCCATCCGGTTATT
ATCGTTCTCGTTTATGATCTCTACATTGAGCCATGGCGCTTTCTGTGCAAGCCTTTTGCA
TCCCCCAAGAGTGACTTCCCATGAAGACATCCAAAGGGATCGCATTGTTTCATACTTGTT
CACATCAGCGAGAAGCGCCGTGTCCCCGAACGGACTATCCCTAATCTCTAGCTTCCTCAT
CTTTTTGCAACCGTTCAACACATACAACATGCCTTTATCCGTATCGCCAGCAAAAGCTAT
GGAGAGCATCTCAAGCTGAGTTGCAAACATGCCGATGTAGAGAAAGACTTGGTCTGTAAG
GAGA

QA 2 665 2 665
DS 

RD RR2ER59JQ 787 0 0
TTTTG
CTAAATTTAACAAACTAATCAAAAATCAAGCAGTAGCATTCGTAAAAAACAATAAACCAC
CAGGGGAAAGTCAAAAGAGGAAATAAAAACAGAAAGGCTTTCACAAAAGAATCAGTTTTC
TGTCTTAAATAAAACATTAAAAAGTACACCTAATTTCGGAAAGGACCACGAACGCAAGCC
GACCAATCAGAATCTCTGAAGCATCGAACTAGTTCCATGTTTGGTCGGAACCAAAAAAAA
AAACTAGAGAATCCACACGAATGGCGGCGCATCAACCCTTGTCCCAACCACGGTCCGGTA
CAGATACATTTTATCCACCTTCTGTCTTCCCTCATATCCATTTTCCTCCATCCGGTTATT
ATCGTTCTCGTTTATGATCTCTACATTGAGCCATGGCGCTTTCTGTGCAAGCCTTTTGCA
TCCCCCAAGAGTGACTTCACATGAAGACATCCAAAGGGATCGCATTGTTTCATACTTGTT
CACATCAGCGAGAAGCGCCGTGTCCCCGAACGGACTATCCCTAATCTCTAGCTTCCTCAT
CTTTTTGCAACCGTTCAACACGTACAACATGCCTTTATCCGTATCGCCAGCAAAAGCTAT
GGAGAGCATCTCAAGCTGAGTTGCAAACATGCCGATGTAGAGAAAGACTTGGTCTGTAAG
GAGACCAGAGACTGAAAGCCGTTTCAAGTTCTTGCATGCTTGCACGATTGCTCCAAAGCC
TTCGTCTAGAGGCTGAGATGTGACGTGGTCGGGTTTGTGTGGCTCGAGGATGCAGAGTCT
GA

QA 6 787 6 787
DS 

RD RR2CR13TF 746 0 0
CCACGTCTGTCTT
CCTCATATCCATTT*ACTCCATCCGGTTATTATCGTTCTCGTTTATGATCTCTACATTGA
GCCATGGCGCTTTCTGTGCAAGCCTTT*GCATCCCCCAAGAGTGACTTCACATGAAGACA
TCCAAAGGGATCGCATTGTTTCATACTTGTTCACATCAGCGAGAAGCGCCGTGTCCCCGA
ACGGACTATCCCTAATCTCTAGCTTCCTCATCTTTTTGCAACCGTTCAACACATACAACA
TGCCTTTATCCGTATCGCCAGCAAAAGCTATGGAGAGCATCTCAAGCTGAGTTGCAAACA
TGCCGATGTAGAGAAAGACTTGGTCTGTAAGGAGACCAGAGACTGAAAGCCGTTTCAAGT
TCTTGCATGCTTGCACGATTGCTCCAAAGCCTTCGTCTAGAGGCTGAGATGTGACGTGGT
CGGGTTTGTGTGGCTCGAGGATGCAGAGTCTGAACCGGATGAAATTTGGACAGTTCTTGG
CAACGGTTATGAGCGCTGCGTTTGTCATCAGCTGGCAGAAGTAGAGAATAGAGTGAAGCT
TAGGGCAACCTGCGGAGATGGCAACTAGACCATCTTCAGTCACAGCTGTGTTGCCTCCAC
CGTTTAAATCAGTTGGAAAAACCCTGAGCTCTTGCAACTCTTTACATGTAGAAGCTACCA
CTTCAAGACCTTTGTCACCTATACTATCCAATATCCATAAACGTTGGAACTTCTTGCAAT
GCTCAATAAGCCC

QA 14 746 14 746
DS 



AS 1 3

CO CL1999Contig1 989 3 2 U
GGACACAAAAGCTCCGTCGGTTACTCTCAGCTGTAGGGTTACTATGTTTAGGTCTCTGAT
TCGGACACGATCATAGTCACTCGTCACCATGTCTTCAATCACTCAGAGAGGAAATTCAAG
GCTTTTGTCTGAAGCTGCTGGTTCACATTCTAGAGATAAGATATTGGTTTTGGGAGGAAA
TGGATATGTAGGTTCACATGTATGCAAGGAGGCACTCAGACAAGGTTTCTCTGTCTCCAG
TCTTAGCAGGTCAGGGAGATCTTCTCTGCATGATTCATGGGTCGATGATGTAACCTGGCA
TCAAGGTGATTTGCTTTCACCCGAATCTTTGAAGCCTGCACTGGAAGGAATAACATCTGT
GATTTCATGCGTTGGTGGTTTCGGTTCCAACTCACAAATGGTCCGAATCAACGGAACTGC
AAACATTAATGCTGTTCAAGCTGCTGCACAAGGAGGTGTGAAGAGATTTGTGTATATATC
AGCTGCGGATTTTGGTGTCATAAATAACTTGATTCGAGGCTATTTCCAAGGGAAGAGAGC
AACTGAAGCTGAGATTTTGGATAAGTTCGGAAACAGGGGAACGGTTCTGAGGCCGGGATT
TATCCACGGGACTCGTCAGGTCGGTAGCATAAAGCTGCCACTTAGTCTCATTGGAGCTCC
TCTCGAAATGGTTTTGAAAGTGTTCCCAAAAGAAGTGACGAAAATTCCTGTGATAGGACC
GCTTTTAATACCTCCGGTTAATGTCAAGTCCGTGGCGGGAACTGCTGTAAAAGCTGCAGT
TGATCCAGAGTTTGCTTCTGGAGTCGTCGATGTTTACCAGATTCTTCAACACAAAACGAC
TCCATCCTAAAACAATTTCTTGTCCTAGCTTCCTACGACGGATTGATTTAACTGTTTGAG
AATTTGAATCGTATGTAACCAAACCACGGTCTCTGGTTCTGCAACCAATAAACTATGTAT
TTTCTTTTGGATACTACAAAAAGGGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV27TF U 345
AF RR2AG33TF U 1
AF RR2AG33JQ C 118
BS 1 712 RR2AG33TF
BS 713 989 RR2AG33JQ

RD RR2CV27TF 262 0 0
AAGGAATAACATCTGTGATTTCATGCGTTGGTGGTTTCGGTTCCAACTCACAAATGGTCC
GAATCAACGGAACTGCAAACATCAATGCTGTTCAAGCTGCTGCACAAGGAGGTGTGAAGA
GATTTGTGTATATATCAGCTGCGGATTTTGGTGTCATAAATAACTTGATTCGAGGCTATT
TCCAAGGGAAGAGAGCAACTGAAGCTGAGATTTTTGATAAATTCGGAAACAGAGGAACGG
TTCTAAGGCCAGGATT
CATACA

QA 1 256 1 256
DS 

RD RR2AG33TF 712 0 0
GGACACAAAAGCTCCGTCGGTTACTCTCAGCTGTAGGGTTACTATGTTTAGGTCTCTGAT
TCGGACACGATCATAGTCACTCGTCACCATGTCTTCAATCACTCAGAGAGGAAATTCAAG
GCTTTTGTCTGAAGCTGCTGGTTCACATTCTAGAGATAAGATATTGGTTTTGGGAGGAAA
TGGATATGTAGGTTCACATGTATGCAAGGAGGCACTCAGACAAGGTTTCTCTGTCTCCAG
TCTTAGCAGGTCAGGGAGATCTTCTCTGCATGATTCATGGGTCGATGATGTAACCTGGCA
TCAAGGTGATTTGCTTTCACCCGAATCTTTGAAGCCTGCACTGGAAGGAATAACATCTGT
GATTTCATGCGTTGGTGGTTTCGGTTCCAACTCACAAATGGTCCGAATCAACGGAACTGC
AAACATTAATGCTGTTCAAGCTGCTGCACAAGGAGGTGTGAAGAGATTTGTGTATATATC
AGCTGCGGATTTTGGTGTCATAAATAACTTGATTCGAGGCTATTTCCAAGGGAAGAGAGC
AACTGAAGCTGAGATTTTGGATAAGTTCGGAAACAGGGGAACGGTTCTGAGGCCGGGATT
TATCCACGGGACTCGTCAGGTCGGTAGCATAAAGCTGCCACTTAGTCTCATTGGAGCTCC
TCTCGAAATGGTTTTGAAAGTGTTCCCAAAAGAAGTGACGAAAATTCCTGTG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2AG33JQ 872 0 0
AAGGCTTTTGTCTGAAGCTGCTGGTTCACATTCTAGAGATAAGATATTGGTTTTGGGAGG
AAATGGATATGTAGGTTCACATGTATGCAAGGAGGCACTCAGACAAGGTTTCTCTGTCTC
CAGTCTTAGCAGGTCAGGGAGATCTTCTCTGCATGATTCATGGGTCGATGATGTAACCTG
GCATCAAGGTGATTTGCTTTCACCCGAATCTTTGAAGCCTGCACTGGAAGGAATAACATC
TGTGATTTCATGCGTTGGTGGTTTCGGTTCCAACTCACAAATGGTCCGAATCAACGGAAC
TGCAAACATTAATGCTGTTCAAGCTGCTGCACAAGGAGGTGTGAAGAGATTTGTGTATAT
ATCAGCTGCGGATTTTGGTGTCATAAATAACTTGATTCGAGGCTATTTCCAAGGGAAGAG
AGCAACTGAAGCTGAGATTTTGGATAAGTTCGGAAACAGGGGAACGGTTCTGAGGCCGGG
ATTTATCCACGGGACTCGTCAGGTCGGTAGCATAAAGCTGCCACTTAGTCTCATTGGAGC
TCCTCTCGAAATGGTTTTGAAGGTGTTCCCAAAAGAAGTGACGAAAATTCCTGTGATAGG
ACCGCTTTTAATACCTCCGGTTAATGTCAAGTCCGTGGCGGGAACTGCTGTAAAAGCTGC
AGTTGATCCAGAGTTTGCTTCTGGAGTCGTCGATGTTTACCAGATTCTTCAACACAAAAC
GACTCCATCCTAAAACAATTTCTTGTCCTAGCTTCCTACGACGGATTGATTTAACTGTTT
GAGAATTTGAATCGTATGTAACCAAACCACGGTCTCTGGTTCTGCAACCAATAAACTATG
TATTTTCTTTTGGATACTACAAAAAGGGAGAG

QA 1 872 1 872
DS 



AS 1 3

CO CL2000Contig1 964 3 21 U
GGATTGCTCTCTTTATTATCTCTATTTCTTCTAATCAACCACTGTCACTCTATTTTCTTT
AGACGGAAAAAAATGGTTGAGCAGAAAAAGTTCGCACTGTTCCTAGCCACTCCTGATTCA
GAGTTCGTGAAGAAAGAGTACGGAGGATACCACAACGTGTTCGTGTCCACGTTCGGTGAC
GAAGGAGAGCATTGGGACTCATTTAGAGTCGTAGGGGGCGAGTTTCCGGACGAGAAAGAT
CTTGAAAAGTACGACGGTTTCGTTATTAGTGGAAGCTCTCACGATTCCTTCGAGAATGAT
CCTTGGATCCTTAAGCTATGTGAGATCGTCAAGAAACTTGATGAGATGAAGAAGAAAATT
CTTGGCATCTGCTTTGGCCACCAGATAATAGCTAGAGTAAGAGGAGGAACAGTGGGAAGA
GCAAGGAAGGGACCAGAACTTAAGCTTACAGACATAACCCTCGTGAAGGATGCGATTAAA
CCGGGAAGTTTCTTTGGAAACGAGATTCCGGATACCATAGCCATCCTAAAATTACATCAG
GACGAAGTGTTAGTGTTGCCTGAGTCTGCTAAAGTACTAGCTTATTCCGAAAATTACGAG
GTGGAGATGTTCTCCATTGAGGATCATTTATTCTGTATCCAAGGACATCCCGAGTATAAC
AGAGAGATCCTCCACGAGATCGTTGATCGTGTTCTTGGTCTTGGCTTCATCAAGCAAGAT
TTTGCGGATGCGGCAAAGGCCTCGATGGAGAACAGGGGAGCGGACAGGAAACTTTTGGAG
ACGATTTGCAAGAATTTCCTCAAAGGCAGAGTTCCAGCTAATTAATTAGTTTCACTCCCA
AACTATCTATTTGGCTCTTGTTATATTGGAGCACTTATGGATTTATTACCTTGTTGTATT
CTTATTTCAATATATAACCTATTATTCTCATCCTTGTCAAGAAAACAAAAACTCATTTTT
ATCT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2GI38TF U 1
AF RR2BX33TF U 2
AF RR2BX33JQ C 187
BS 1 45 RR2GI38TF
BS 46 46 RR2BX33TF
BS 47 47 RR2GI38TF
BS 48 48 RR2BX33TF
BS 49 66 RR2GI38TF
BS 67 67 RR2BX33TF
BS 68 214 RR2GI38TF
BS 215 215 RR2BX33TF
BS 216 410 RR2GI38TF
BS 411 411 RR2BX33TF
BS 412 473 RR2GI38TF
BS 474 474 RR2BX33TF
BS 475 558 RR2GI38TF
BS 559 559 RR2BX33TF
BS 560 598 RR2GI38TF
BS 599 599 RR2BX33TF
BS 600 621 RR2GI38TF
BS 622 643 RR2BX33TF
BS 644 644 RR2BX33JQ
BS 645 728 RR2BX33TF
BS 729 964 RR2BX33JQ

RD RR2GI38TF 621 0 0
GGATTGCTCTCTTTATTATCTCTATTTCTTCTAATCAACCACTGTGA*TCTATTTTCTTT
AGACGGGAAAAAATGGTTGAGCAGAAAAAGTTCGCACTGTTCCTAGCCACTCCTGATTCA
GAGTTCGTGAAGAAAGAGTACGGAGGATACCACAACGTGTTCGTGTCCACGTTCGGTGAC
GAAGGAGAGCATTGGGACTCATTTAGAGTCGTAGAGGGCGAGTTTCCGGACGAGAAAGAT
CTTGAAAAGTACGACGGTTTCGTTATTAGTGGAAGCTCTCACGATTCCTTCGAGAATGAT
CCTTGGATCCTTAAGCTATGTGAGATCGTCAAGAAACTTGATGAGATGAAGAAGAAAATT
CTTGGCATCTGCTTTGGCCACCAGATAATAGCTAGAGTAAGAGGAGGAACCGTGGGAAGA
GCAAGGAAGGGACCAGAACTTAAGCTTACAGACATAACCCTCGTGAAGGATGCAATTAAA
CCGGGAAGTTTCTTTGGAAACGAGATTCCGGATACCATAGCCATCCTAAAATTACATCAG
GACGAAGTGTTAGTGTTGTCTGAGTCTGCTAAAGTACTAGCTTATTCCGAAAATTACG*G
GTGGAGATGTTCTCCATTGAG

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2BX33TF 727 0 0
GATTGCTCTCTTTATTATCTCTATTTCTTCTAATCAACCACTGTCTCTCTATTTTCTTTA
GACGGAAAAAAATGGTTGAGCAGAAAAAGTTCGCACTGTTTCTAGCCACTCCTGATTCAG
AGTTCGTGAAGAAAGAGTACGGAGGATACCACAACGTGTTCGTGTCCACGTTCGGTGACG
AAGGAGAGCATTGGGACTCATTTAGAGTCGTAGGGGGCGAGTTTCCGGACGAGAAAGATC
TTGAAAAGTACGACGGTTTCGTTATTAGTGGAAGCTCTCACGATTCCTTCGAGAATGATC
CTTGGATCCTTAAGCTATGTGAGATCGTCAAGAAACTTGATGAGATGAAGAAGAAAATTC
TTGGCATCTGCTTTGGCCACCAGATAATAGCTAGAGTAAGAGGAGGAACAGTGGGAAGAG
CAAGGAAGGGACCAGAACTTAAGCTTACAGACATAACCCTCGTGAAGGATGCGATTAAAC
CGGGAAGTTTCTTTGGAAACGAGATTCCGGATACCATAGCCATCCTAAAATTACATCAGG
ACGAAGTGTTAGTGTTGCCTGAGTCTGCTAAAGTACTAGCTTATTCCGAAAATTACGAGG
TGGAGATGTTCTCCATTGAGGATCATTTATTCTGTATCCAAG*ACATCCCGAGTATAACA
GAGAGATCCTCCACGAGATCGTTGATCGTGTTCTTGGTCTTGGCTTCATCAAGCAAGATT
TTGCGGA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2BX33JQ 778 0 0
GAGCATTGGGACTCATTTAGAGTCGTAGGGGGCGAGTTTCCGGACGAGAAAGATCTTGAA
AAGTACGACGGTTTCGTTATTAGTGGAAGCTCTCACGATTCCTTCGAGAATGATCCTTGG
ATCCTTAAGCTATGTGAGATCGTCAAGAAACTTGATGAGATGAAGAAGAAAATTCTTGGC
ATCTGCTTTGGCCACCAGATAATAGCTAGAGTAAGAGGAGGAACAGTGGGAAGAGCAAGG
AAGGGACCAGAACTTAAGCTTACAGACATAACCCTCGTGAAGGATGCGATTAAACCGGGA
AGTTTCTTTGGAAACGAGATTCCGGATACCATAGCCATCCTAAAATTACATCAGGACGAA
GTGTTAGTGTTGCCTGAGTCTGCTAAAGTACTAGCTTATTCCGAAAATTACGAGGTGGAG
ATGTTCTCCATTGAGGATCATTTATTCTGTATCCAAGGACATCCCGAGTATAACAGAGAG
ATCCTCCACGAGATCGTTGATCGTGTTCTTGGTCTTGGCTTCATCAAGCAAGATTTTGCG
GATGCGGCAAAGGCCTCGATGGAGAACAGGGGAGCGGACAGGAAACTTTTGGAGACGATT
TGCAAGAATTTCCTCAAAGGCAGAGTTCCAGCTAATTAATTAGTTTCACTCCCAAACTAT
CTATTTGGCTCTTGTTATATTGGAGCACTTATGGATTTATTACCTTGTTGTATTCTTATT
TCAATATATAACCTATTATTCTCATCCTTGTCAAGAAAACAAAAACTCATTTTTATCT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 4

CO CL2001Contig1 925 4 15 U
GTTCATCACCAGAAAGCCATCCATCTCTCACGACGTCCCCGCCATAATCATTAAAGCTCC
TCCGGTGTCACCAAGTCCGCCTACAAAACGCAGACCAGGGAGAACCAGCAGGTCCGCCAT
GAAACCTAAAACACACAACCCAAAAAATCTAAAGATGAAGAAAACGTCTGAATCGCCGGA
GCCAGAAGCCAACATAGCGGTTATAGCAGTGGCGGGAGAAGAAGCATTAATGTTAGAGTT
AAATGGAGCCGAGGCTGAGCTAGGACCATGCAACTACTATGGAACCTGTCATGAAGGAAG
AGCTTGTCGCAATAATAATAATAATATCACTGATGGCGATAAAGGAGTTTCATCCTTTGA
TGAAGACATCATCGAACTTTTGTTGGACGAATCAGAACCAAGCCACGTATTCACATCGTG
TGGTGGTAATGCAGAGTTGAATAATCTAGGAGACTATGAACAAGCCAAAGGGTCTTCGGA
GATTTTGAACCAAGAGAATCTCGACTGTCTTCGGTCTTGTCCGTCGATGGAGTCATTTCT
CAACAATGAGCATCAACTCAGCAATGCATTCACGGATTAGTTTATTGATTGGGACTGTGT
TTGGCAACAAGGGAATGACAATAACATTTGCGATGAGAAAGAAGGTTCTGATTCAATGGT
GTCGTGGCTTTTGGACGGTGATGATGAGGCCACGATCGGGAAAAGTAATTGCGAGAACTT
TGGAGAACCATTGGATCATGACGAGGAAAATGCATTGTTCGCCTGGCTTCTCTCTTGAAT
ATATTGACTTTTTTTTAGGTTCACCAACCAATAGAAATTAGTTATTTTATATTGAGTATC
TTTTGAAAAAGGAAACAAAATAATTGTCAAGTTATATTATGTTTTAAAATAAAAAGTAAA
AATAAATAAAAGTAATAGTAATTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2BL91TF U 1
AF RR2EX77TF U 1
AF RR2BL91JQ C 181
AF RR2EX77JQ C 504
BS 1 639 RR2BL91TF
BS 640 644 RR2EX77TF
BS 645 645 RR2BL91JQ
BS 646 703 RR2EX77TF
BS 704 704 RR2BL91JQ
BS 705 707 RR2EX77TF
BS 708 708 RR2BL91JQ
BS 709 716 RR2EX77TF
BS 717 717 RR2BL91JQ
BS 718 749 RR2EX77TF
BS 750 750 RR2BL91JQ
BS 751 755 RR2EX77TF
BS 756 756 RR2BL91JQ
BS 757 768 RR2EX77TF
BS 769 925 RR2BL91JQ

RD RR2BL91TF 639 0 0
GTTCATCACCAGAAAGCCATCCATCTCTCACGACGTCCCCGCCATAATCATTAAAGCTCC
TCCGGTGTCACCAAGTCCGCCTACAAAACGCAGACCAGGGAGAACCAGCAGGTCCGCCAT
GAAACCTAAAACACACAACCCAAAAAATCTAAAGATGAAGAAAACGTCTGAATCGCCGGA
GCCAGAAGCCAACATAGCGGTTATAGCAGTGGCGGGAGAAGAAGCATTAATGTTAGAGTT
AAATGGAGCCGAGGCTGAGCTAGGACCATGCAACTACTATGGAACCTGTCATGAAGGAAG
AGCTTGTCGCAATAATAATAATAATATCACTGATGGCGATAAAGGAGTTTCATCCTTTGA
TGAAGACATCATCGAACTTTTGTTGGACGAATCAGAACCAAGCCACGTATTCACATCGTG
TGGTGGTAATGCAGAGTTGAATAATCTAGGAGACTATGAACAAGCCAAAGGGTCTTCGGA
GATTTTGAACCAAGAGAATCTCGACTGTCTTCGGTCTTGTCCGTCGATGGAGTCATTTCT
CAACAATGAGCATCAACTCAGCAATGCATTCACGGATTAGTTTATTGATTGGGACTGTGT
TTGGCAACAAGGGAATGACAATAACATTTGCGATGAGAA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2EX77TF 787 0 0
GTTCATCACCAGAAAGCCATCCATCTCTCACGACGTCCCCGCCATAATCATTAAAGCTCC
TCCGGTGTCACCAAGTCCGCCTACAAAACGCAGACCAGGGAGAACCAGCAGGTCCGCCAT
GAAACCTAAAACACACAACCCAAAAAATCTAAAGATGAAGAAAACGTCTGAATCGCCGGA
GCCAGAAGCCAACATAGCGGTTATAGCAGTGGCGGGAGAAGAAGCATTAATGTTAGAGTT
AAATGGAGCCGAGGCTGAGCTAGGACCATGCAACTACTATGGAACCTGTCATGAAGGAAG
AGCTTGTCGCAATAATAATAATAATATCACTGATGGCGATAAAGGAGTTTCATCCTTTGA
TGAAGACATCATCGAACTTTTGTTGGACGAATCAGAACCAAGCCACGTATTCACATCGTG
TGGTGGTAATGCAGAGTTGAATAATCTAGGAGACTATGAACAAGCCAAAGGGTCTTCGGA
GATTTTGAACCAAGAGAATCTCGACTGTCTTCGGTCTTGTCCGTCGATGGAGTCATTTCT
CAACAATGAGCATCAACTCAGCAATGCATTCACGGATTAGTTTATTGATTGGGACTGTGT
TTGGCAACAAGGGAATGACAATAACATTTGCGATGAGAAAGAAG*TTCTGATTCAATGGT
GTCGTGGCTTTTGGACGGTGATGATGAGGCCACGATCGGGAAA*GTA*TTGCGAGA*CTT
TGGAGAACCATTGGATCATGACGAGGAAA*TGCAT*GTTCGCCTGGCT
CTCTCTGATATATTGACTT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2BL91JQ 745 0 0
GCCAGAAGCCAACATAGCGGTTATAGCAGTGGCGGGAGAAGAAGCATTAATGTTAGAGTT
AAATGGAGCCGAGGCTGAGCTAGGACCATGCAACTACTATGGAACCTGTCATGAAGGAAG
AGCTTGTCGCAATAATAATAATAATATCACTGATGGCGATAAAGGAGTTTCATCCTTTGA
TGAAGACATCATCGAACTTTTGTTGGACGAATCAGAACCAAGCCACGTATTCACATCGTG
TGGTGGTAATGCAGAGTTGAATAATCTAGGAGACTATGAACAAGCCAAAGGGTCTTCGGA
GATTTTGAACCAAGAGAATCTCGACTGTCTTCGGTCTTGTCCGTCGATGGAGTCATTTCT
CAACAATGAGCATCAACTCAGCAATGCATTCACGGATTAGTTTATTGATTGGGACTGTGT
TTGGCAACAAGGGAATGACAATAACATTTGCGATGAGAAAGAAGGTTCTGATTCAATGGT
GTCGTGGCTTTTGGACGGTGATGATGAGGCCACGATCGGGAAAAGTAATTGCGAGAACTT
TGGAGAACCATTGGATCATGACGAGGAAAATGCATTGTTCGCCTGGCTTCTCTCTTGAAT
ATATTGACTTTTTTTTAGGTTCACCAACCAATAGAAATTAGTTATTTTATATTGAGTATC
TTTTGAAAAAGGAAACAAAATAATTGTCAAGTTATATTATGTTTTAAAATAAAAAGTAAA
AATAAATAAAAGTAATAGTAATTGT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2EX77JQ 422 0 0
ACTGTCTTCGGTCTTGTCCGTCGATGGAGTCATTTCTCAACAATGAGCATCAACTCAGCA
ATGCATTCACGGATTAGTTTATTGATTGGGACTGTGTTTGGCAACAAGGGAATGACAATA
ACATTTGCGATGAGAAAGAAGGTTCTGATTCAATGGTGTCGTGGCTTTTGGACGGTGATG
ATGAGGCCACGATCGGGAAAAGTAATTGCGAGAACTTTGGAGAACCATTGGATCATGACG
AGGAAAATGCATTGTTCGCCTGGCTTCTCTCTTGAATATATTGACTTTTTTTTAGGTTCA
CCAACCAATAGAAATTAGTTATTTTATATTGAGTATCTTTTGAAAAAGGAAACAAAATAA
TTGTCAAGTTATATTATGTTTTAAAATAAAAAGTAAAAATAAATAAAAGTAATAGTAATT
GT

QA 1 422 1 422
DS 



AS 2 4

CO CL2002Contig1 649 2 3 U
GTGCGGACTTCGACAACTTCAGGAAGAGGAATGAGAGGGAGAGGCTGAACCTTGTTTCAA
ATGCTCAAGGGGAGGTTGTTGAGAATCTTTTGGCGGTTCTGGATAATTTCGGGAGAGCCA
AGTCCCAGATCAAGGTGGAGACTGAGGGAGAAGAGAAAGTCACCAACAGCTACCAGAACA
TATACAAACAGTTTGTTGAGATTCTAGGTTCGCTTGGTGTTGTCACTGTGGAGACTGTCG
GCAAACAGTTTGATCCAATGCTACACGAGGCAATAATGAGGGAGGATTCTGCGGAATACG
AAGAGGGTATAGTACTTGAAGAATACAGGAAAGGTTTCTTGCTAGGGGAAAGATTTTTAC
GTCCTTCAATGGTGAAAGTATCAGCTGGACCCGGACCAGAAAAGCCTGGTGAAACTGAAG
GAGAAGTAGCCGTTGCACAAGGAAGCGCAGAAGGAGCAGAAGCAGAAGCGTCTTCTTCAT
CTTGAATGAACGACAATCAAGACTAAGCAGTTTTGTGGTGTGCGTAAGAGAGAGAGAGAG
AGAGAGTGAGAGAAGGGTCTGGTTAAGATTTAATTATTGGCATTGTTGTTGTTGTTACAC
TAAATTACTTCTACAGAGTTTAGCGAAAATAGAATGAGATTTTCTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2EV66JQ C 1
AF RR2EV66TF U 1
BS 1 8 RR2EV66JQ
BS 9 644 RR2EV66TF
BS 645 649 RR2EV66JQ

RD RR2EV66JQ 649 0 0
GTGCGGACTTCGACAACTTCAGGAAGAGGAATGAGAGGGAGAGGCTGAACCTTGTTTCAA
ATGCTCAAGGGGAGGTTGTTGAGAATCTTTTGGCGGTTCTGGATAATTTCGGGAGAGCCA
AGTCCCAGATCAAGGTGGAGACTGAGGGAGAAGAGAAAGTCACCAACAGCTACCAGAACA
TATACAAACAGTTTGTTGAGATTCTAGGTTCGCTTGGTGTTGTCACTGTGGAGACTGTCG
GCAAACAGTTTGATCCAATGCTACACGAGGCAATAATGAGGGAGGATTCTGCGGAATACG
AAGAGGGTATAGTACTTGAAGAATACAGGAAAGGTTTCTTGCTAGGGGAAAGATTTTTAC
GTCCTTCAATGGTGAAAGTATCAGCTGGACCCGGACCAGAAAAGCCTGGTGAAACTGAAG
GAGAAGTAGCCGTTGCACAAGGAAGCGCAGAAGGAGCAGAAGCAGAAGCGTCTTCTTCAT
CTTGAATGAACGACAATCAAGACTAAGCAGTTTTGTGGTGTGCGTAAGAGAGAGAGAGAG
AGAGAGTGAGAGAAGGGTCTGGTTAAGATTTAATTATTGGCATTGTTGTTGTTGTTACAC
TAAATTACTTCTACAGAGTTTAGCGAAAATAGAATGAGATTTTCTGTTG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2EV66TF 649 0 0
GTGCGGAC
TTCGACAACTTCAGGAAGAGGAATGAGAGGGAGAGGCTGAACCTTGTTTCAAATGCTCAA
GGGGAGGTTGTTGAGAATCTTTTGGCGGTTCTGGATAATTTCGGGAGAGCCAAGTCCCAG
ATCAAGGTGGAGACTGAGGGAGAAGAGAAAGTCACCAACAGCTACCAGAACATATACAAA
CAGTTTGTTGAGATTCTAGGTTCGCTTGGTGTTGTCACTGTGGAGACTGTCGGCAAACAG
TTTGATCCAATGCTACACGAGGCAATAATGAGGGAGGATTCTGCGGAATACGAAGAGGGT
ATAGTACTTGAAGAATACAGGAAAGGTTTCTTGCTAGGGGAAAGATTTTTACGTCCTTCA
ATGGTGAAAGTATCAGCTGGACCCGGACCAGAAAAGCCTGGTGAAACTGAAGGAGAAGTA
GCCGTTGCACAAGGAAGCGCAGAAGGAGCAGAAGCAGAAGCGTCTTCTTCATCTTGAATG
AACGACAATCAAGACTAAGCAGTTTTGTGGTGTGCGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTG
AGAGAAGGGTCTGGTTAAGATTTAATTATTGGCATTGTTGTTGTTGTTACACTAAATTAC
TTCTACAGAGTTTAGCGAAAATAGAATGAGATTTTC
TGTTG

QA 9 644 9 644
DS 



CO CL2002Contig2 1153 2 2 U
GGATCCCTCTCTCTCTCCGCCACTCTACAATGGCCGGTCTACTCAAAACTCCGTCGTTAC
ACCTCACACCGTCTCTTACTCATACACCCTCTGTGCCCTTCAAGCCCTTCTGCGTCTCCT
TCGCCGGAGGAAGGAGAACCAGCTTCTCACTCTCTCGCCGAGCTTCTCTCCGTTCCGTCT
CTGGTGGTGGCTATCCTCTCCGGTTACTTAACTTCGTACCCTTTGCTTCTGGAGAAGCCG
AAACGACTGAGACGGAGGTGGAATCGAGCGAACCTGAAGTCCAGGAGACGGATGGTGTTG
AGGGTGAAAACGCTGGCGCTGAGGAAGAAGAAGCGGCGGTTACCACAGCGTTGCTGAGTT
CGTACAAAGAAGCTTTAGCAGAGAACAACGAGGAGAAGATTGCTGAGATAGAAGCATCAC
TGAAGTCCATCGAAGATGAAAAGGTTCAGCTCCAGGAGAAAGCCATCTCTTTATCTAATG
AGTTAACTGTAGAGAGGGATCGGCTGATAAGGATCAGTGCAGATTTCGACAACTTCAGGA
AGAGGAACGAGAGGGAGAGGCTGAACCTTGTTTCAAATACTCAAGGAGAGGTTGTTGAGA
ATCTTTTGTCGGTTTTGGATAATTTCGAGAGAGCTAAGTCACAGATCAAGGTAGAGACTG
AGGGAGAAGAGAAAGTCACCAACAGCTACCAGAACATATACAAACAGTTTGTTGAGATTC
TAGGTTCGCTTGGTGTTGTCACTGTGGAGACTGTCGGCAAACAGTTTGATCCAATGCTTC
ACGAGGCAATAATGAGGGAGGATTCTGCGGAATACGAAGAGGGTATAGTACTTGAAGAAT
ACAGGAAAGGTTTCTTGCTAGGGGAAAGACTTTTACGTCCTTCAATGGTGAAAGTATCAG
CTGGACCCGGACCAGAAAAGCCTGGTGAAACTGAAGGAGAAGTAGCCGTTGCACAAGGAA
GCGCAGAAGGAGCAGAAGCAGAAGCGTCTTCTTCATCTTGAATGAACGACAATCAAGACT
AAGCAGTTTTGTGGTGTGCGTAAGAGAGAGAGAGTGAGAGAAGGGTCTGGTTATGATTTA
ATTATTGGCATTGTTGTTGTTGTTACACTATATTATTTCTACGGAGTTTAGCGAAAATAG
AATGAGATTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F415TF U 1
AF RR2F415JQ C 337
BS 1 576 RR2F415TF
BS 577 1153 RR2F415JQ

RD RR2F415TF 580 0 0
GGATCCCTCTCTCTCTCCGCCACTCTACAATGGCCGGTCTACTCAAAACTCCGTCGTTAC
ACCTCACACCGTCTCTTACTCATACACCCTCTGTGCCCTTCAAGCCCTTCTGCGTCTCCT
TCGCCGGAGGAAGGAGAACCAGCTTCTCACTCTCTCGCCGAGCTTCTCTCCGTTCCGTCT
CTGGTGGTGGCTATCCTCTCCGGTTACTTAACTTCGTACCCTTTGCTTCTGGAGAAGCCG
AAACGACTGAGACGGAGGTGGAATCGAGCGAACCTGAAGTCCAGGAGACGGATGGTGTTG
AGGGTGAAAACGCTGGCGCTGAGGAAGAAGAAGCGGCGGTTACCACAGCGTTGCTGAGTT
CGTACAAAGAAGCTTTAGCAGAGAACAACGAGGAGAAGATTGCTGAGATAGAAGCATCAC
TGAAGTCCATCGAAGATGAAAAGGTTCAGCTCCAGGAGAAAGCCATCTCTTTATCTAATG
AGTTAACTGTAGAGAGGGATCGGCTGATAAGGATCAGTGCAGATTTCGACAACTTCAGGA
AGAGGAACGAGAGGGAGAGGCTGAACCTTGTTTCAA
TACT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2F415JQ 817 0 0
CGCG
TACCACAGCGT*GCTGAGT*CGTACAAAGAAGCTTTAGCAGAGA*CAACGAGGAGAAGAT
TGCTGAGATAGAAGCATCACTGAAGTCCATCGAAGATGAAAAGGTTCAGCTCCAGGAGAA
AGCCATCTCTTTATCTAATGAGTTAACTGTAGAGAGGGATCGGCTGATAAGGATCAGTGC
AGATTTCGACAACTTCAGGAAGAGGAACGAGAGGGAGAGGCTGAACCTTGTTTCAAATAC
TCAAGGAGAGGTTGTTGAGAATCTTTTGTCGGTTTTGGATAATTTCGAGAGAGCTAAGTC
ACAGATCAAGGTAGAGACTGAGGGAGAAGAGAAAGTCACCAACAGCTACCAGAACATATA
CAAACAGTTTGTTGAGATTCTAGGTTCGCTTGGTGTTGTCACTGTGGAGACTGTCGGCAA
ACAGTTTGATCCAATGCTTCACGAGGCAATAATGAGGGAGGATTCTGCGGAATACGAAGA
GGGTATAGTACTTGAAGAATACAGGAAAGGTTTCTTGCTAGGGGAAAGACTTTTACGTCC
TTCAATGGTGAAAGTATCAGCTGGACCCGGACCAGAAAAGCCTGGTGAAACTGAAGGAGA
AGTAGCCGTTGCACAAGGAAGCGCAGAAGGAGCAGAAGCAGAAGCGTCTTCTTCATCTTG
AATGAACGACAATCAAGACTAAGCAGTTTTGTGGTGTGCGTAAGAGAGAGAGAGTGAGAG
AAGGGTCTGGTTATGATTTAATTATTGGCATTGTTGTTGTTGTTACACTATATTATTTCT
ACGGAGTTTAGCGAAAATAGAATGAGATTTTCC

QA 5 817 5 817
DS 



AS 1 4

CO CL2003Contig1 1016 4 13 U
CGCATAAAATGATTTTGCGTGTTCGTGTAAAACAGACAACCCACAAAACAACCAGTTATA
AAGCGACTGATAAGTGTTTCAAGTCTGCTCCTTTAAAGGGGTTCCCTTAACTTTAAAACC
TACTACACATGGCCTGTTAAATTTAACCCCCTGTCTACAAACTCATCCTTGAATTATACA
GCCAAAAGTGCAAACAGCTGCTTGAAGAAGGCTGCCTGCGGTCGAAATGATCTTCCTTTG
CTTTCATATGTTTTGCATCAGGATTTTCGAATTCCAAGCTGTATCACAGAATCTGGGCCT
ACCAGGAATACACGTCTAGTAGTCTGGATTCGGAACACCACGATTCCTTTATATGCTGTT
CGGGGCACACCATCCTTCCATTCTTCAAATATGCCAAACTCCCCTGCTATGCTTTCGAAC
TCTGCTTGGTCTTTATACCGGATACGAACATCACCCTTTATATTTTGAGCCTTTAACACA
AGGTCAGAACCTTGAATTGGTCGTGCTTGTCTCACTAGGCCAGAAAAGTACTTGGTATAG
TTTCCCTCTGTCAAGTATCCCAGGTCCATCGCGTTCCACTCAACCTTCACATCATTTAGC
TTTATAGGTTCCAGATACTGGCTGAAAAACTGTCCCAAACTAGACCCATGTTCACCAAAA
TTGTATGTTCGGCAGACTTCTGGTCGAACAAATTGGCGGCCTTTATGGTTTTCCTTCAAT
CTCAGCCAATCATCCCAGTAAGCCTTGGGCCACTTTGGTGATAGCTCATCCCAAGTCGAT
CTCTTCAGCATCCACCCCAGGCCAGGGAAAAAATCTGATCGGTAAAGTGCATAGGGGTCA
TGCACAAACTGCTTCTGCCCATTATCATTCCACGATGAAGCCGCCATAATGGTTTCATCC
CTATCCATGAGACTAGCTGCGGCCTCAAAGTAATCAAAGAAGTCTGGAGCAATTTCCATA
TCATCTTCTAGTATAATCACTCGGCTAAATTTATGTTTGTAAAACAACTGGTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG39JQ U 1
AF RR2EY25JQ U 80
AF RR2CX70JQ U 29
AF RR2CG39TF C 277
BS 1 85 RR2CG39JQ
BS 86 86 RR2CX70JQ
BS 87 206 RR2CG39JQ
BS 207 207 RR2CX70JQ
BS 208 445 RR2CG39JQ
BS 446 446 RR2CX70JQ
BS 447 486 RR2CG39JQ
BS 487 487 RR2CX70JQ
BS 488 522 RR2CG39JQ
BS 523 523 RR2CX70JQ
BS 524 711 RR2CG39JQ
BS 712 752 RR2CX70JQ
BS 753 1016 RR2CG39TF

RD RR2CG39JQ 711 0 0
CGCATAAAATGATTTTGCGTGTTCGTGTAAAACAGACAACCCACAAAACAACCAGTTATA
AAGCGACTGATAAGTGTTTCAAGTCCGCTCCTTTAAAGGGGTTCCCTTAACTTTAAAACC
TACTACACATGGCCTGTTAAATTTAACCCCCTGTCTACAAACTCATCCTTGAATTATACA
GCCAAAAGTGCAAACAGCTGCTTGAAAAAGGCTGCCTGCGGTCGAAATGATCTTCCTTTG
CTTTCATATGTTTTGCATCAGGATTTTCGAATTCCAAGCTGTATCACAGAATCTGGGCCT
ACCAGGAATACACGTCTAGTAGTCTGGATTCGGAACACCACGATTCCTTTATATGCTGTT
CGGGGCACACCATCCTTCCATTCTTCAAATATGCCAAACTCCCCTGCTATGCTTTCGAAC
TCTGCTTGGTCTTTATACCGGATACAAACATCACCCTTTATATTTTGAGCCTTTAACACA
AGGTCAAAACCTTGAATTGGTCGTGCTTGTCTCACTAGGCCAAAAAAGTACTTGGTATAG
TTTCCCTCTGTCAAGTATCCCAGGTCCATCGCGTTCCACTCAACCTTCACATCATTTAGC
TTTATAGGTTCCAGATACTGGCTGAAAAACTGTCCCAAACTAGACCCATGTTCACCAAAA
TTGTATGTTCGGCAGACTTCTGGTCGAACAAATTGGCGGCCTTTATGGTTT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2EY25JQ 594 0 0
CAAGTCTGCTCCTTTAAAGGGGTTCCCTTAACTTTAAAACCTACTACACATGGCCTGTTA
AATTTAACCCCCTGTCTACAAACTCATCCTTGAATTATACAGCCAAAAGTGCAAACAGCT
GCTTGAAGAAGGCTGCCTGCGGTCGAAATGATCTTCCTTTGCTTTCATATGTTTTGCATC
AGGATTTTCGAATTCCAAGCTGTATCACAGAATCTGGGCCTACCAGGAATACACGTCTAG
TAGTCTGGATTCGGAACACCACGATTCCTTTATATGCTGTTCGGGGCACACCATCCTTCC
ATTCTTCAAATATGCCAAACTCCCCTGCTATGCTTTCGAACTCTGCTTGGTCTTTATACC
GGATACGAACATCACCCTTTATATTTTGAGCCTTTAACACAAGGCCAGAACCTTGAATTG
GTCGTGCTTGTCTCACTAGGCCAGAAAAGTACTTGGTATAGTTTCCCTCTGTCAAGTATC
CCAGGTCCATCGCGTTCCACTCAACCTTCACATCATTTAGCTTTATAGGTTCCAGATACT
GGCTGAAAAACTGTCCCAAACTAGACCCATGTTCACCAAAATTGTATGTTCGG
T

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2CX70JQ 724 0 0
TAAGA
AGACAACCCACAAAACAATCAGTTATAAAGCGACTGATAAGTGTTTCAAGTCTGCTCCTT
TAAAGGGGTTCCCTTAACTTTAAAACCTACTACACATGGCCTGTTAAATTTAACCCCCTG
TCTACAAACTCATCCTTGAATTATACAGCCAAAAGTGCAAACAGCTGCTTGAAGAAGGCT
GCCTGCGGTCGAAATGATCTTCCTTTGCTTTCATATGTTTTGCATCAGGATTTTCGAATT
CCAAGCTGTATCACAGAATCTGGGCCTGCCAGGAATACACGTCTAGTAGTCTGGATTCGG
AACACCACGATTCCTTTATATGCTGTTCGGGGCACACCATCCTTCCATTCTTCAAATATG
CCAAACTCCCCTGCTATGCTTTCGAACTCTGCTTGGTCTTTATACCGGATACGAACATCA
CCCTTTATATTTTGAGCCTTTAACACAAGGTCAGAACCTTGAATTGGTCGTGCTTGTCTC
ACTAGGCCAGAAAAGTACTTGGTATAGTTTCCCTCTGTCAAGTATCCCAGGTCCATCGCG
TTCCACTCAACCTTCACATCATTTAGCTTTATAGGTTCCAGATACTGGCTGAAAAACTGT
CCCAAACTAGACCCATGTTCACCAAAATTGTATGTTCGGCAGACTTCTGGTCGAACAAAT
TGGCGGCCTTTATGGTTTTCCTTCAATCTCAGCCAATCATCCCAGTAAGCCTTGGGCCA

QA 6 724 6 724
DS 

RD RR2CG39TF 740 0 0
AGCTGTATCACAGAATCTGGGC*TACCAGGAATACACGTCTAGTAGTCTG*ATTCGGAAC
ACCACGATTCCTTTATATGCTGTTCGGGGCACACCATCCTTCCAT*CTTCAAATATGCCA
AACTCCCCTGCTATGCTTTCGAACTCTGCTTGGTCTTTATACCGGATACGAACATCACCC
TTTATATTTTGAGCCTTTAACACAAGGTCAGAACCTTGAATTGGTCGTGCTTGTCTCACT
AGGCCAGAAAAGTACTTGGTATAGTTTCCCTCTGTCAAGTATCCCAGGTCCATCGCGTTC
CACTCAACCTTCACATCATTTAGCTTTATAGGTTCCAGATACTGGCTGAAAAACTGTCCC
AAACTAGACCCATGTTCACCAAAATTGTATGTTCGGCAGACTTCTGGTCGAACAAATTGG
CGGCCTTTATGGTTTTCCTTCAATCTCAGCCAATCATCCCAGTAAGCCTTGGGCCACTTT
GGTGATAGCTCATCCCAAGTCGATCTCTTCAGCATCCACCCCAGGCCAGGGAAAAAATCT
GATCGGTAAAGTGCATAGGGGTCATGCACAAACTGCTTCTGCCCATTATCATTCCACGAT
GAAGCCGCCATAATGGTTTCATCCCTATCCATGAGACTAGCTGCGGCCTCAAAGTAATCA
AAGAAGTCTGGAGCAATTTCCATATCATCTTCTAGTATAATCACTCGGCTAAATTTATGT
TTGTAAAACAACTGGTCTAC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 4

CO CL2004Contig1 854 4 7 U
GGTGGAAGGACTGATTGTTGTGTGAAGCATGGTGGTGGGAAACGGTGCAAGTCTATTGGG
TGTGAGAAGAGTGCGCAAGGTAGCACTGACTTCTGCAAGGCGCATGGTGGAGGTAAACGG
TGCTCTTGGGGAGGAGAGTGGAAATGCGAGAAGTTTGCTAGAGGGAAGAGTGTTTTGTGC
GCTGCGCATAACAGTATGGCTCAGGAGAAAGGTGGAAGCAAGATTGGTTTGATTGGTCCT
GGACTTTTCCGTGGCCTTGTCTCTACCTCTTCTCAAACCACTACTACTACAACTGATCAT
TCTCAGTCTGGGGTCAGTGCGGTATCTGATTGTACAGACTCCATTGATCGTTCAAACCAG
ATGCAGTATCATCATGAGAAAAGGCAGAAGGTGATGATACCAATGCAGGTTCTTGTGCCT
CCATCGATGAAATCTTTAAGCTTCACAGACGCTGAGGGACCAGAAAGGGAAACAAACAAC
AAGAGTAGGAGCAGCAATGGGAGGAACATCTATGACTTTATGATTCCGGAGGAGAGAGTT
CATGGCGGTGGGCTAATGTCTCTGCTTAATGGCAGCATGAAACAGACACTCCGTTGATGG
GACTTGAAAGCTTTCTCTGCTGCTGAGTGTGGTGTGTGTGAGAGGGAGAGCTTATCAGCA
AAAAGCTAAAGAATCTGTGTAAAGCTTTATGCAATATGTATAGTTTACCTTTGTCTCTTT
GGTCGTTTGTATATTCATGGGTCTGGTGTTTTTGTATGGTCTTGACTCTACCATCTAGTC
GATGGCTCGAACCCAAGTTTTCATTAATAATTTGGAATGTTGCAATGTAGTATAAAGTGT
TCTTAGTTCTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G646TF U 1
AF RR2G646JQ C 53
AF RR2EV92JQ C 345
AF RR2EV92TF U 345
BS 1 663 RR2G646TF
BS 664 664 RR2EV92TF
BS 665 693 RR2G646TF
BS 694 694 RR2EV92TF
BS 695 719 RR2G646TF
BS 720 848 RR2EV92TF
BS 849 854 RR2G646JQ

RD RR2G646TF 719 0 0
GGTGGAAGGACTGATTGTTGTGTGAAGCATGGTGGTGGGAAACGGTGCAAGTCTATTGGG
TGTGAGAAGAGTGCGCAAGGTAGCACTGACTTCTGCAAGGCGCATGGTGGAGGTAAACGG
TGCTCTTGGGGAGGAGAGTGGAAATGCGAGAAGTTTGCTAGAGGGAAGAGTGTTTTGTGC
GCTGCGCATAACAGTATGGCTCAGGAGAAAGGTGGAAGCAAGATTGGTTTGATTGGTCCT
GGACTTTTCCGTGGCCTTGTCTCTACCTCTTCTCAAACCACTACTACTACAACTGATCAT
TCTCAGTCTGGGGTCAGTGCGGTATCTGATTGTACAGACTCCATTGATCGTTCAAACCAG
ATGCAGTATCATCATGAGAAAAGGCAGAAGGTGATGATACCAATGCAGGTTCTTGTGCCT
CCATCGATGAAATCTTTAAGCTTCACAGACGCTGAGGGACCAGAAAGGGAAACAAACAAC
AAGAGTAGGAGCAGCAATGGGAGGAACATCTATGACTTTATGATTCCGGAGGAGAGAGTT
CATGGCGGTGGGCTAATGTCTCTGCTTAATGGCAGCATGAAACAGACACTCCGTTGATGG
GACTTGAAAGCTTTCTCTGCTGCTGAGTGTGGTGTGTGTGAGAGGGAGAGCTTATCAGCA
AAA*GCTAAAGAATCTGTGTAAAGCTTTATGCA*TATGTATAGTTTACCTTTGTCTCTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2G646JQ 802 0 0
TCTA
TGGGTGTGAGAAGAGTGCGCAAGGTAGCACTGACT*CTGCAAGGCGCATGGTGGAGGTAA
ACGGTGCTCTTGGGGAGGAGAGTGGAAATGCGAGAAGTTTGCTAGAGGGAAGAGTGTTTT
GTGCGCTGCGCATAACAGTATGGCTCAGGAGAAAGGTGGAAGCAAGATTGGTTTGATTGG
TCCTGGACTTTTCCGTGGCCTTGTCTCTACCTCTTCTCAAACCACTACTACTACAACTGA
TCATTCTCAGTCTGGGGTCAGTGCGGTATCTGATTGTACAGACTCCATTGATCGTTCAAA
CCAGATGCAGTATCATCATGAGAAAAGGCAGAAGGTGATGATACCAATGCAGGTTCTTGT
GCCTCCATCGATGAAATCTTTAAGCTTCACAGACGCTGAGGGACCAGAAAGGGAAACAAA
CAACAAGAGTAGGAGCAGCAATGGGAGGAACATCTATGACTTTATGATTCCGGAGGAGAG
AGTTCATGGCGGTGGGCTAATGTCTCTGCTTAATGGCAGCATGAAACAGACACTCCGTTG
ATGGGACTTGAAAGCTTTCTCTGCTGCTGAGTGTGGTGTGTGTGAGAGGGAGAGCTTATC
AGCAAAAAGCTAAAGAATCTGTGTAAAGCTTTATGCAATATGTATAGTTTACCTTTGTCT
CTTTGGTCGTTTGTATATTCATGGGTCTGGTGTTTTTGTATGGTCTTGACTCTACCATCT
AGTCGATGGCTCGAACCCAAGTTTTCATTAATAATTTGGAATGTTGCAATGTAGTATAAA
GTGTTCTTAGTTCTTATT

QA 5 802 5 802
DS 

RD RR2EV92JQ 504 0 0
AGGG
CGTTCAAACCAGATGCAGTATCATCATGAGAAAAGGCAGAAGGTGATGATACCAATGCAG
GTTCTTGTGCCTCCATCGATGAAATCTTTAAGCT*CACAGACGCTGAGGGACCAGAAAGG
GAAACAAACAACAAGAGTAGGAGCAGCAATGGGAGGAACATCTATGACTTTATGATTCCG
GAGGAGAGAGTTCATGGCGGTGGGCTAATGTCTCTGCTTAATGGCAGCATGAAACAGACA
CTCCGTTGATGGGACTTGAAAGCTTTCTCTGCTGCTGAGTGTGGTGTGTGTGAGAGGGAG
AGCTTATCAGCAAAAAGCTAAAGAATCTGTGTAAAGCTTTATGCAATATGTATAGTTTAC
CTTTGTCTCTTTGGTCGTTTGTATATTCATGGGTCTGGTGTTTTTGTATGGTCTTGACTC
TACCATCTAGTCGATGGCTCGAACCCAAGTTTTCATTAATAATTTGGAATGTTGCAATGT
AGTATAAAGTGTTCTTAGTT

QA 5 504 5 504
DS 

RD RR2EV92TF 504 0 0
AGGG
CGTTCAAACCAGATGCAGTATCATCATGAGAAAAGGCAGAAGGTGATGATACCAATGCAG
GTTCTTGTGCCTCCATCGATGAAATCTTTAAGCT*CACAGACGCTGAGGGACCAGAAAGG
GAAACAAACAACAAGAGTAGGAGCAGCAATGGGAGGAACATCTATGACTTTATGATTCCG
GAGGAGAGAGTTCATGGCGGTGGGCTAATGTCTCTGCTTAATGGCAGCATGAAACAGACA
CTCCGTTGATGGGACTTGAAAGCTTTCTCTGCTGCTGAGTGTGGTGTGTGTGAGAGGGAG
AGCTTATCAGCAAAAAGCTAAAGAATCTGTGTAAAGCTTTATGCAATATGTATAGTTTAC
CTTTGTCTCTTTGGTCGTTTGTATATTCATGGGTCTGGTGTTTTTGTATGGTCTTGACTC
TACCATCTAGTCGATGGCTCGAACCCAAGTTTTCATTAATAATTTGGAATGTTGCAATGT
AGTATAAAGTGTTCTTAGTT

QA 5 504 5 504
DS 



AS 1 4

CO CL2005Contig1 1040 4 7 U
GGGAACCCGACTTGGGGATTAAGTCAGTTGTTCCTCTTCTTCACCCTTCTCATCAGTACG
CAACACCGTGATTTGAGATAATTGGTCGCGTAACTCTCAGCTCAGAGATTCTTTTCGTCT
CAAAAAAGTAACGAACCATACAGCGATGGATCTCAATCTCGATGCCCCGCACTCTATGGG
AACGACCATCATCGGCGTAACTTACAACGGAGGCGTCGTCCTCGGAGCCGACTCACGTAC
CAGCACCGGCATGTACGTAGCGAATCGAGCTTCAGACAAGATCACACAGCTCACCGACAA
TGTCTACGTCTGCCGTTCTGGATCGCCTGCTGATTCTCAGGTTGTCTCTGACTATGTCCG
CTACTTCCTTCACCAGCATACAATTCAGCTGGGACAGCCTGCGACTGTTAAGGTTTCGGC
AAACCTTATTAGGATGCTCGCTTACAATAACAAGAACATGCTGCAAACTGGCCTCATAGT
TGGTGGCTGGGATAAGTATGAAGGCGGGAAGATCTATGGAATTCCACTTGGTGGAACTGT
TGTGGAGCAACCGTTTGCTATTGGAGACTCTGGCTCGAGTTACCTTTACGGGTTCTTTGA
TCAGGCCTGGAAAGAAAACATGACCAAAGAAGAAGCTGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGT
TTCACTAGCCATCGCCCGTGATGGAGCCAGTGGAGGAGTTGTAAGGACTGTCATAATAAA
CTCAGAGGGAGTGACCAGAAACTTCTACCCTGGGGATAAGTTGCAGCTATGGCATGAGGA
GTTGGACCCCCAGAACTCCTTGTTAGACATCCTGAACGCTGCTGGTCCTGAACCAATGGC
TATGTGATGCATCATTCTCTCACTCTGTTAAACAAATGTTTAGATGTTTCTCTACATTCA
CCGAAGTCGTATTTTAAACTCTGTTTGAGGTTCTTTTAAATTGACCCGATCTTTCTTCAT
TTAAATGGATATCATGTTTGTTTATTGTTATGGTTCTAATTTGTGTGTCCTGAAAATGAG
TATGTAGAAACGTTACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI86TF U 19
AF RR2AI33TF U 1
AF RR2GI86JQB C 225
AF RR2AI33JQ C 241
BS 1 135 RR2AI33TF
BS 136 136 RR2GI86TF
BS 137 566 RR2AI33TF
BS 567 567 RR2GI86TF
BS 568 736 RR2AI33TF
BS 737 922 RR2GI86JQB
BS 923 1040 RR2AI33JQ

RD RR2GI86TF 678 0 0
GG
AAGTCAGTTGTTCCTCTTCTTCACCCTTCTCATCAGTACGCAACACCGTGATTTGAGATA
ATTGGTCGCGTAACTCTCAGCTCAGAGATTCTTTTCGTCTCAAAAAAGTAACGAACCATA
CAGCGATGGATCTCAATCTCGATGCCCCGCACTCTATGGGAACGACCATCATCGGCGTAA
CTTACAACGGAGGCGTCGTCCTCGGAGCCGACTCACGTACCAGCACCGGCATGTACGTAG
CGAATCGAGCTTCAGACAAGATCACACAGCTCACCGACAATGTCTACGTCTGCCGTTCTG
GATCGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTCTCTGACTATGTCCGCTACTTCCTTCACCAGCATA
CAATTCAGCTGGGACAGCCTGCGACTGTTAAGGTTTCGGCAAACCTTATTAGGATGCTCG
CTTACAATAACAAGAACATGCTGCAAACTGGCCTCATAGTTGGTGGCTGGGATAAGTATG
AAGGCGGGAAGATCTATGGAATTCCACTTGGTGGAACTGTTGTGGAGCAACCGTTTGCTA
TTGGAGACTCTGGCTCGAGTTACCTTTACGGGTTCTTTGATCAGGCCTGGAAA***AACA
TGACCAAAGAAGAAGCTGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGTTTCACTAGCCATCGCCCGTG
ATGGAGCCAGTGGAG
A

QA 3 677 3 677
DS 

RD RR2AI33TF 736 0 0
GGGAACCCGACTTGGGGATTAAGTCAGTTGTTCCTCTTCTTCACCCTTCTCATCAGTACG
CAACACCGTGATTTGAGATAATTGGTCGCGTAACTCTCAGCTCAGAGATTCTTTTCGTCT
CAAAAAAGTAACGAATCATACAGCGATGGATCTCAATCTCGATGCCCCGCACTCTATGGG
AACGACCATCATCGGCGTAACTTACAACGGAGGCGTCGTCCTCGGAGCCGACTCACGTAC
CAGCACCGGCATGTACGTAGCGAATCGAGCTTCAGACAAGATCACACAGCTCACCGACAA
TGTCTACGTCTGCCGTTCTGGATCGCCTGCTGATTCTCAGGTTGTCTCTGACTATGTCCG
CTACTTCCTTCACCAGCATACAATTCAGCTGGGACAGCCTGCGACTGTTAAGGTTTCGGC
AAACCTTATTAGGATGCTCGCTTACAATAACAAGAACATGCTGCAAACTGGCCTCATAGT
TGGTGGCTGGGATAAGTATGAAGGCGGGAAGATCTATGGAATTCCACTTGGTGGAACTGT
TGTGGAGCAACCGTTTGCTATTGGAGGCTCTGGCTCGAGTTACCTTTACGGGTTCTTTGA
TCAGGCCTGGAAAGAAAACATGACCAAAGAAGAAGCTGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGT
TTCACTAGCCATCGCCCGTGATGGAGCCAGTGGAGGAGTTGTAAGGACTGTCATAATAAA
CTCAGAGGGAGTGACC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2GI86JQB 698 0 0
GAGCCGACTCACGTACCAGCACCGGCATGTACGTAGCGAATCGAGCTTCAGACAAGATCA
CACAGCTCACCGACAATGTCTACGTCTGCCGTTCTGGATCGGCTGCTGATTCTCAGGTTG
TCTCTGACTATGTCCGCTACTTCCTTCACCAGCATACAATTCAGCTGGGACAGCCTGCGA
CTGTTAAGGTTTCGGCAAACCTTATTAGGATGCTCGCTTACAATAACAAGAACATGCTGC
AAACTGGCCTCATAGTTGGTGGCTGGGATAAGTATGAAGGCGGGAAGATCTATGGAATTC
CACTTGGTGGAACTGTTGTGGAGCAACCGTTTGCTATTGGAGACTCTGGCTCGAGTTACC
TTTACGGGTTCTTTGATCAGGCCTGGAAA**AAACATGACCAAAGAAGAAGCTGAGCAAC
TTGTTGTGAAGGCGGTTTCACTAGCCATCGCCCGTGATGGAGCCAGTGGAGGAGTTGTAA
GGACTGTCATAATAAACTCAGAGGGAGTGACCAGAAACTTCTACCCTGGGGATAAGTTGC
AGCTATGGCATGAGGAGTTGGACCCCCAGAACTCCTTGTTAGACATCCTGAACGCTGCTG
GTCCTGAACCAATGGCTATGTGATGCATCATTCTCTCACTCTGTTAAACAAATGTTTAGA
TGTTTCTCTACATTCACCGAAGTCGTATTTTAAACTCT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2AI33JQ 800 0 0
CAGCACCGGCATGTACGTAGCGAATCGAGCTTCAGACAAGATCACACAGCTCACCGACAA
TGTCTACGTCTGCCGTTCTGGATCGCCTGCTGATTCTCAGGTTGTCTCTGACTATGTCCG
CTACTTCCTTCACCAGCATACAATTCAGCTGGGACAGCCTGCGACTGTTAAGGTTTCGGC
AAACCTTATTAGGATGCTCGCTTACAATAACAAGAACATGCTGCAAACTGGCCTCATAGT
TGGTGGCTGGGATAAGTATGAAGGCGGGAAGATCTATGGAATTCCACTTGGTGGAACTGT
TGTGGAGCAACCGTTTGCTATTGGAGGCTCTGGCTCGAGTTACCTTTACGGGTTCTTTGA
TCAGGCCTGGAAAGAAAACATGACCAAAGAAGAAGCTGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGT
TTCACTAGCCATCGCCCGTGATGGAGCCAGTGGAGGAGTTGTAAGGACTGTCATAATAAA
CTCAGAGGGAGTGACCAGAAACTTCTACCCTGGGGATAAGTTGCAGCTATGGCATGAGGA
GTTGGAGCCCCAGAACTCCTTGTTAGACATCCTGAACGCTGCTGGTCCTGAACCAATGGC
TATGTGATGCATCATTCTCTCACTCTGTTAAACAAATGTTTAGATGTTTCTCTACATTCA
CCGAAGTCGTATTTTAAACTCTGTTTGAGGTTCTTTTAAATTGACCCGATCTTTCTTCAT
TTAAATGGATATCATGTTTGTTTATTGTTATGGTTCTAATTTGTGTGTCCTGAAAATGAG
TATGTAGAAACGTTACCTCC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL2006Contig1 747 2 4 U
CTTCCAGCAATCAAATTACTTACTAGTTTCTAATCACACTTTTTAGTACATGGTTCCCCT
GAACCTTCAATAATACAACCAAAAACAAAAAGAAATAAACAAAACAATACATAGCGAGGA
ACAAGAGAGCAATAAACATGAAGATTTACCTCATGTTATTATTTCTTGGGAAACAAGTAA
TTTTTCACAGACCCACATCAACATGTCTACCGTAGTTGCTATTGGTCATAATTGTACTGG
TAGATCCACATTCACTCTCCATAAGAGAAATGTCAGATCTATCGAGCTTAATTGCCATCC
ACGGATGATGATGATGATGCTGATGACTTTGACTTTCCTTGCCTAACTGAAATGAAGATC
TCTGCATCCTTACAGCTCTGGGGACACCGTTCCTCGGTGCTTCCATGGAAGATCTTCTCC
TCCCGCTTGGCTGCTTCTCATAAATCTCAGGAGGTCTCTGCTTAGGCGCACTCTGAGACC
GAGCCTTGGCTTTAGAAGACTGAGTATTGGCCATGTAGTTTGGGAAGAGAGGGTAATCGT
AAGAAGACAAAGAATCTCCATTGTAATACTCTTTGAATCTTGAACACTGAGGACTGCTCT
GTGCTGTGTTGAACGAGTTACAGTCCTCGAAATGGCTACTATACGCTCGAGGACTCATGT
CTGTTATAGCCGAAGAGCTGGAGAGTAAAATCTAGACTGAGTGTCATTTCACAATCTTTA
TGTTTTCTTCATTCTCCTGCGAGACAA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS12JQ U 1
AF RR2CQ45TF U 4
BS 1 273 RR2AS12JQ
BS 274 274 RR2CQ45TF
BS 275 671 RR2AS12JQ
BS 672 747 RR2CQ45TF

RD RR2AS12JQ 671 0 0
CTTCCAGCAATCAAATTACTTACTAGTTTCTAATCACACTTTTTAGTACATGGTTCCCCT
GAACCTTCAATAATACAACCAAAAACAAAAAGAAATAAACAAAACAATACATAGCGAGGA
ACAAGAGAGCAATAAACATGAAGATTTACCTCATGTTATTATTTCTTGGGAAACAAGTAA
TTTTTCACAGACCCACATCAACATGTCTACCGTAGTTGCTATTGGTCATAATTGTACTGG
TAGATCCACATTCACTCTCCATAAGAGAAATGTTAGATCTATCGAGCTTAATTGCCATCC
ACGGATGATGATGATGATGCTGATGACTTTGACTTTCCTTGCCTAACTGAAATGAAGATC
TCTGCATCCTTACAGCTCTGGGGACACCGTTCCTCGGTGCTTCCATGGAAGATCTTCTCC
TCCCGCTTGGCTGCTTCTCATAAATCTCAGGAGGTCTCTGCTTAGGCGCACTCTGAGACC
GAGCCTTGGCTTTAGAAGACTGAGTATTGGCCATGTAGTTTGGGAAGAGAGGGTAATCGT
AAGAAGACAAAGAATCTCCATTGTAATACTCTTTGAATCTTGAACACTGAGGACTGCTCT
GTGCTGTGTTGAACGAGTTACAGTCCTCGAAATGGCTACTATACGCTCGAGGACTCATGT
CTGTTATAGCC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2CQ45TF 744 0 0
GG
AGCAATCAAATTACTTACTAGTTTCTAATCACACTTTT*AGTACATGGTTCCCCTGAACC
TTCAATAATACAACCAAAAACAAAAAGAAATAAACAAAACAATACATAGCGAGGAACAAG
AGAGCAATAAACATGAAGATTTACCTCATGTTATTATTTCTTGGGAAACAAGTAATTTTT
CACAGACCCACATCAACATGTCTACCGTAGTTGCTATTGGTCATAATTGTACTGGTAGAT
CCACATTCACTCTCCATAAGAGAAATGTCAGATCTATCGAGCTTAATTGCCATCCACGGA
TGATGATGATGATGCTGATGACTTTGACTTTCCTTGCCTAACTGAGATGAAGATCTCTGC
ATCCTTACAGCTCTGGGGACACCGTTCCTCGGTGCTTCCATGGAAGATCTTCTCCTCCCG
CTTGGCTGCTTCTCATAGATCTCAGGAGGTCTCTGCTTAGGCGCACTCTGAGACCGAGCC
TTGGCTTTAGAAGACTGAGTATTGGCCATGTAGTTTGGGAAGAGAGGGTAATCGTAAGAA
GACAAAGAATCTCCATTGTAATACTCTTTGAATCTTGAACACTGAGGACTGCTCTGTGCT
GTGTTGAACGAGTTACAGTCCTCGAAATGGCTACTATACGCTCGAGGACTCATGTCTGTT
ATAGCCGAAGAGCTGGAGAGTAAAATCTAGACTGAGTGTCATTTCACAATCTTTATGTTT
TCTTCATTCTCCTGCGAGACAA

QA 3 744 3 744
DS 



AS 1 4

CO CL2007Contig1 777 4 4 U
TTTTTTTTGAGTCAAATTTGTCCCACAACACTAGTTTAAATGCTCATACAGAGAGAGCCA
CTTCCAAATCTTACAAAAGCAAAGTCGATAAGAAAGGTAAAAGAGCAAAACTCATCAGAA
TTCAACTACAAACAAATTATTCCCAAAAGCTCCATAAGGGCAACGAACTTAAGCGACGAG
GAATGGTAGAACAGTGAGCATGAAGGCCTCGTAGTTGAAAGTAGCTGATCCTGATAACGC
CGTATCCTTCTCCTTAAACTTCTCGGTCAGCCCCTTTACAGTCAAACAACACTCGATGAA
GTTGTCATATTCAATAGCCCTGTTCCTGCCTCCACTTTTATCAAACTTAGAAACGAGCAG
ATCCAAAACCACAGGAGACACTGAAAACCCGAGGCTCAAGAGTGCATCTCTCAGCTCGTT
TGTATCGATTCTCCCACTTCTGTCCTTATCAAACCTCTCGAATATTGTCCTCCAACTCTG
AAGACTGTAGAAAAGTGAAGTAAACTCTTTCGGTCCGATCTTTCTGACGTTGCTGTTGGT
GAAGAGATACATGAGGAGATGAACAGTTCTCATGCTAAAGCTCTGATTATACGAAGAGAG
CGCTCCCTGAAGCTCCTTATCGTCTATGAAGCCGCTGTTGTCGCGGTGGTGGTGGATTGC
CGCCGTAACCGTAGCCTTGGCTGGAAGGAGGGTAACCAGACATGATGAGAGAGATCGAAG
AAGAGAAAGTGGAGAAGATGTTCTTAATGCGTAAGTTTTGTAACAGTAATCTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV51JQ U 7
AF RR2DV51TF C 7
AF RR2DN21JQ U 9
AF RR2DN21TF C 1
BS 1 8 RR2DN21TF
BS 9 301 RR2DV51JQ
BS 302 626 RR2DN21JQ
BS 627 777 RR2DN21TF

RD RR2DV51JQ 295 0 0
AA
GAGTCAAATTTGTCCCACAACACTAGTTTAAATGCTCATACAGAGAGAGCCACTTCCAAA
TCTTACAAAAGCAAAGTCGATAAGAAAGGTAAAAGAGCAAAACTCATCAGAATTCAACTA
CAAACAAATTATTCCCAAAAGCTCCATAAGGGCAACGAACTTAAGCGACGAGGAATGGTA
GAACAGTGAGCATGAAGGCCTCGTAGTTGAAAGTAGCTGATCCTGATAACGCCGTATCCT
TCTCCTTAAACTTCTCGGTCAGCCCCTTTACAGTCAAACAACACTCGATGAAG

QA 3 295 3 295
DS 

RD RR2DV51TF 295 0 0
AA
GAGTCAAATTTGTCCCACAACACTAGTTTAAATGCTCATACAGAGAGAGCCACTTCCAAA
TCTTACAAAAGCAAAGTCGATAAGAAAGGTAAAAGAGCAAAACTCATCAGAATTCAACTA
CAAACAAATTATTCCCAAAAGCTCCATAAGGGCAACGAACTTAAGCGACGAGGAATGGTA
GAACAGTGAGCATGAAGGCCTCGTAGTTGAAAGTAGCTGATCCTGATAACGCCGTATCCT
TCTCCTTAAACTTCTCGGTCAGCCCCTTTACAGTCAAACAACACTCGATGAAG

QA 3 295 3 295
DS 

RD RR2DN21JQ 618 0 0
GAGTCAAATTTGTCCCACAACACTAGTTTAAATGCTCATACAGAGAGAGCCACTTCCAAA
TCTTACAAAAGCAAAGTCGATAAGAAAGGTAAAAGAGCAAAACTCATCAGAATTCAACTA
CAAACAAATTATTCCCAAAAGCTCCATAAGGGCAACGAACTTAAGCGACGAGGAATGGTA
GAACAGTGAGCATGAAGGCCTCGTAGTTGAAAGTAGCTGATCCTGATAACGCCGTATCCT
TCTCCTTAAACTTCTCGGTCAGCCCCTTTACAGTCAAACAACACTCGATGAAGTTGTCAT
ATTCAATAGCCCTGTTCCTGCCTCCACTTTTATCAAACTTAGAAACGAGCAGATCCAAAA
CCACAGGAGACACTGAAAACCCGAGGCTCAAGAGTGCATCTCTCAGCTCGTTTGTATCGA
TTCTCCCACTTCTGTCCTTATCAAACCTCTCGAATATTGTCCTCCAACTCTGAAGACTGT
AGAAAAGTGAAGTAAACTCTTTCGGTCCGATCTTTCTGACGTTGCTGTTGGTGAAGAGAT
ACATGAGGAGATGAACAGTTCTCATGCTAAAGCTCTGATTATACGAAGAGAGCGCTCCCT
GAAGCTCCTTATCGTCTA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2DN21TF 777 0 0
TTTTTTTTGAGTCAAATTTGTCC*ACAACACTAGTTTAAATGCTCATACAGAGAGAGCCA
CTTCCAAATCT*ACAAAAGCAAAGTCGATAAGAAAGGTAAAAGAGCAAAACTCATCAGAA
TTCAACTACAAACAAATTATTCCCAAAAGCTCCATAAGGGCAACGAACTTAAGCGACGAG
GAATGGTAGAACAGTGAGCATGAAGGCCTCGTAGTTGAAAGTAGCTGATCCTGATAACGC
CGTATCCTTCTCCTTAAACTTCTCGGTCAGCCCCTTTACAGTCAAACAACACTCGATGAA
GTTGTCATATTCAATAGCCCTGTTCCTGCCTCCACTTTTATCAAACTTAGAAACGAGCAG
ATCCAAAACCACAGGAGACACTGAAAACCCGAGGCTCAAGAGTGCATCTCTCAGCTCGTT
TGTATCGATTCTCCCACTTCTGTCCTTATCAAACCTCTCGAATATTGTCCTCCAACTCTG
AAGACTGTAGAAAAGTGAAGTAAACTCTTTCGGTCCGATCTTTCTGACGTTGCTGTTGGT
GAAGAGATACATGAGGAGATGAACAGTTCTCATGCTAAAGCTCTGATTATACGAAGAGAG
CGCTCCCTGAAGCTCCTTATCGTCTATGAAGCCGCTGTTGTCGCGGTGGTGGTGGATTGC
CGCCGTAACCGTAGCCTTGGCTGGAAGGAGGGTAACCAGACATGATGAGAGAGATCGAAG
AAGAGAAAGTGGAGAAGATGTTCTTAATGCGTAAGTTTTGTAACAGTAATCTTGTTC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL2008Contig1 822 2 6 U
AACCCGATAAAAATCAGTGGCATTATTTTAAATCAAAATTGTAACATTTTGTTCAAACTG
TATATTTAAATGAAACAAAACTCAATAATCCGAAGCTTTCTCAGCCCGGTAGAAACTCTT
GGAAAAACTATCAAGAAACTCCAAAAAAGAAGTTTAGGTTTTTTTTCTTTTCTCATCTGT
AAAGGAAACAAAAACCAAAGAAACTTGTAATCTCTTCTGTCTTCCCCGAATCTTTTCTTT
CTTCATATGTCGAGAAAAAGCCTCTGAGGATCTTCCACAACATCCTTAATACGGCGCAAG
AAATACACAGCCTCTCTTCCATCAATCAGCCTATGATCATATGTCAGCGCAACATACATC
ATCGGCCTCGGTACCACGCTTCCTCCCACAACCATTGGTCGTTGCACGATTGAATGCATT
CCAAGTATAGCAAACTGAGGAGGGTTGATGATGGGAGTGCTAATGAAACTTCCGTAAACA
CCACCGTTAGACACTGTGAATGACCCTCCAGCCATCTCGTCAATTGATATGGTTCCTTCA
TTAGCCTTCTTAGCAAGTGAGTCTATCGTCTTCTCAATGTCAGCAAAGTTCATCTGGTCA
GCACCTCTGATGACTGGAACCACAAGACCCTTAGAGGTACCAACAGCAATACTGATGTCT
ACGTAGTCTCTGTAAATGATATCATCTCCATCGATAACGGCATTTACTACTGGTTGGTGC
TGGAGGGCACTAACAGCAGCTTTGATGAAACCAGACACAAGCCCCAACTTCACTCCGTGC
TTCTCAAAGAATGCATCCTTGTATTGAGACCGTAGCTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B780JQ U 1
AF RR2GM30JQ U 174
BS 1 562 RR2B780JQ
BS 563 563 RR2GM30JQ
BS 564 693 RR2B780JQ
BS 694 694 RR2GM30JQ
BS 695 721 RR2B780JQ
BS 722 822 RR2GM30JQ

RD RR2B780JQ 721 0 0
AACCCGATAAAAATCAGTGGCATTATTTTAAATCAAAATTGTAACATTTTGTTCAAACTG
TATATTTAAATGAAACAAAACTCAATAATCCGAAGCTTTCTCAGCCCGGTAGAAACTCTT
GGAAAAACTATCAAGAAACTCCAAAAAAGAAGTTTAGGTTTTTTTTCTTTTCTCATCTGT
AAAGGAAACAAAAACCAAAGAAACTTGTAATCTCTTCTGTCTTCCCCGAATCTTTTCTTT
CTTCATATGTCGAGAAAAAGCCTCTGAGGATCTTCCACAACATCCTTAATACGGCGCAAG
AAATACACAGCCTCTCTTCCATCAATCAGCCTATGATCATATGTCAGCGCAACATACATC
ATCGGCCTCGGTACCACGCTTCCTCCCACAACCATTGGTCGTTGCACGATTGAATGCATT
CCAAGTATAGCAAACTGAGGAGGGTTGATGATGGGAGTGCTAATGAAACTTCCGTAAACA
CCACCGTTAGACACTGTGAATGACCCTCCAGCCATCTCGTCAATTGATATGGTTCCTTCA
TTAGCCTTCTTAGCAAGTGAGTTTATCGTCTTCTCAATGTCAGCAAAGTTCATCTGGTCA
GCACCTCTGATGACTGGAACCACAAGACCCTTAGAGGTACCAACAGCAATACTGATGTCT
ACGTAGTCTCTGTAAATGATATCATCTCCATCGGTAACGGCATTTACTACTGGTTGGTGC
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2GM30JQ 649 0 0
CATCTGTAAAGGAAACAAAGACCAAAGAGACTTGTAATCTCTTCTGTCTTCCCCGAATCT
TTTCTTTCTTCATATGTCGAGAAAAAGCCTCTGAGGATCTTCCACAACATCCTTAATACG
GCGCAAGAAATACACAGCCTCTCTTCCATCAATCAGCCTATGATCATATGTCAGCGCAAC
ATACATCATCGGCCTCGGTACCACGCTTCCTCCCACAACCATTGGTCGTTGCACGATTGA
ATGCATTCCAAGTATAGCAAACTGAGGAGGGTTGATGATGGGAGTGCTAATGAGACTTCC
GTAAACACCACCGTTAGACACTGTGAATGACCCTCCAGCCATCTCGTCGATTGATATGGT
TCCTTCATTAGCCTTCTTAGCAAGTGAGTCTATCGTCTTCTCAATGTCAGCAAAGTTCAT
CTGGTCAGCACCTCTGATGACTGGAACCACAAGACCCTTAGAGGTACCAACAGCAATACT
GATGTCTACGTAGTCTCTGTAAATGATATCATCTCCATCGATAACGGCATTTACTACTGG
TTGGTGCTGGAGGGCACTAACAGCAGCTTTGATGAAACCAGACACAAGCCCCAACTTCAC
TCCGTGCTTCTCAAAGAATGCATCCTTGTATTGAGACCGTAGCTTCATC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 3

CO CL2009Contig1 1302 3 9 U
AGGGGTCCTTCCGCTGTCGTCTGCGTCCGCCATGTTTACTCAATCTTCCGCTCAGCTTGT
GCGACCTAACCTCGGGGTTATTGTTTCGCCGTCTCAGAAACCGTCGATCGTCCCCCCTTC
ACTTCCCCGATTTTTGCGGCTGGAGTCTCAATCTCAGCCTCGCCAATCTATCCCCTGCGC
TTCTTCACCAATCAATAATAACCTTTCCCAGTCAACTCTTTCTTCTTCTTCCTTAATCGA
ATCAGCTCGAATAGGAGAAGTGAAGAGAGTGACAAAGGAGACGAATGTATCAGTGAAGAT
AAACTTGGATGGCACTGGTATTGCAGATAGCTCCACTGGAATCCCTTTCCTTGACCATAT
GTTAGATCAACTTGCTTCACATGGCTTGTTTGATGTGCACGTTAGAGCTACCGGTGATGT
TCACATCGATGATCATCACACTAATGAAGATATAGCTCTTGCCATTGGAACTGCTTTGTT
AAAGGCACTTGGTGAGCGTAAAGGGATTAATCGGTTTGGTGACTTCACAGCTCCTCTAGA
TGAAGCGCTCATACATGTTTCCCTGGACTTGTCTGGTAGACCATATCTTGGTTACAATTT
GGAGATTCCAACTCAGAGAGTTGGAAACTATGACACTCAGTTGGTGGAGCACTTTTTCCA
GTCTTTGGTGAATACTTCCGGTATGACACTTCACATCCGTCAGCTTGCTGGCGAAAACTC
TCATCACATAATAGAGGCCACCTTTAAAGCCTTTGCCAGGGCTCTAAGACAAGCAACGGA
GAATGATCCTCGCCGTGGTGGGACCATACCAAGGTTTGACTTATCATTATATTATACACA
CTTATATAGGATAAATATCATAGAGTATGCAAGATTCATTACGTCATATCTCGGTTTAAG
AGCATATACTCTTTGTGATCCTGAGGAATTGGGATATTTGTCGTCTTGATGAGAGAGAGT
TGAGAGGTTATTGTTAGAAAACGTGTTCGACGGTTATTTGCTTTTGTGGAATTTTGCAGT
TCAAAAGGAGTCTTGTCAAGGTCCTGAGAGCTGAGGAATCAGAAGAAAAGCTCCCAGATT
CACTCTTTATCATCGAGTTCATCATCAGTTAGAAAGTGAATGAGGTGAAGATCACACACT
TTATAAGATGATGCCTTCATCTTTATAATTAATCTGTTGATCAAAGAGTGTTTTGTTTCT
CTGCATTTTGAAAAATGTCTTACCATTGCTGTATCAAACTCAAAAACTTACTGCAACTTC
AAAGGACTGAACAATTTGCTAGAATATCTTGAAACGACTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU09TF U 1
AF RR2DS58TF U 5
AF RR2DS58JQ C 538
BS 1 172 RR2CU09TF
BS 173 173 RR2DS58TF
BS 174 613 RR2CU09TF
BS 614 716 RR2DS58TF
BS 717 717 RR2DS58JQ
BS 718 736 RR2DS58TF
BS 737 737 RR2DS58JQ
BS 738 764 RR2DS58TF
BS 765 1302 RR2DS58JQ

RD RR2CU09TF 613 0 0
AGGGGTCCTTCCGCTGTCGTCTGCGTCCGCCATGTTTACTCAATCTTCCGCTCAGCTTGT
GCGACCTAACCTCGGGGTTATTGTTTCGCCGTCTCAGAAACCGTCGATCGTCCCCCCTTC
ACTTCCCCGATTTTTGCGGCTGGAGTCTCAATCTCAGCCTCGCCAATCTATCTCCTGCGC
TTCTTCACCAATCAATAATAACCTTTCCCAGTCAACTCTTTCTTCTTCTTCCTTAATCGA
ATCAGCTCGAATAGGAGAAGTGAAGAGAGTGACAAAGGAGACGAATGTATCAGTGAAGAT
AAACTTGGATGGCACTGGTATTGCAGATAGCTCCACTGGAATCCCTTTCCTTGACCATAT
GTTAGATCAACTTGCTTCACATGGCTTGTTTGATGTGCACGTTAGAGCTACCGGTGATGT
TCACATCGATGATCATCACACTAATGAAGATATAGCTCTTGCCATTGGAACTGCTTTGTT
AAAGGCACTTGGTGAGCGTAAAGGGATTAATCGGTTTGGTGACTTCACAGCTCCTCTAGA
TGAAGCGCTCATACATGTTTCCCTGGACTTGTCTGGTAGACCATATCTTGGTTACAATTT
GGAGATTCCAACT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2DS58TF 760 0 0
AGGGG
TCCGCTGTCGTCTGCGTCCGCCATGTTTACTCAATCTTCCGCTCAGCTTGTGCGACCTAA
CCTCGGGGTTATTGTTTCGCCGTCTCAGAAACCGTCGATCGTCCCCCCTTCACTTCCCCG
ATTTTTGCGGCTGGAGTCTCAATCTCAGCCTCGCCAATCTATCCCCTGCGCTTCTTCACC
AATCAATAATAACCTTTCCCAGTCAACTCTTTCTTCTTCTTCCTTAATCGAATCAGCTCG
AATAGGAGAAGTGAAGAGAGTGACAAAGGAGACGAATGTATCAGTGAAGATAAACTTGGA
TGGCACTGGTATTGCAGATAGCTCCACTGGAATCCCTTTCCTTGACCATATGTTAGATCA
ACTTGCTTCACATGGCTTGTTTGATGTGCACGTTAGAGCTACCGGTGATGTTCACATCGA
TGATCATCACACTAATGAAGATATAGCTCTTGCCATTGGAACTGCTTTGTTAAAGGCACT
TGGTGAGCGTAAAGGGATTAATCGGTTTGGTGACTTCACAGCTCCTCTAGATGAAGCGCT
CATACATGTTTCCCTGGACTTGTCTGGTAGACCATATCTTGGTTACAATTTGGAGATTCC
AACTCAGAGAGTTGGAAACTATGACACTCAGTTGGTGGAGCACTTTTTCCAGTCTTTGGT
GAATACTTCCGGTATGACACTTCACATCCGTCAGCTTGCTGGCGAAA*CTCTCATCACAT
AATAGAG*CCACCTTTAAAGCCTTTGCCAGGGCTC

QA 6 760 6 760
DS 

RD RR2DS58JQ 765 0 0
AGATGAAGCGCTCATACATGTTTCCCTGGACTTGTCTGGTAGACCATATCTTGGTTACAA
TTTGGAGATTCCAACTCAGAGAGTTGGAAACTATGACACTCAGTTGGTGGAGCACTTTTT
CCAGTCTTTGGTGAATACTTCCGGTATGACACTTCACATCCGTCAGCTTGCTGGCGAAAA
CTCTCATCACATAATAGAGGCCACCTTTAAAGCCTTTGCCAGGGCTCTAAGACAAGCAAC
GGAGAATGATCCTCGCCGTGGTGGGACCATACCAAGGTTTGACTTATCATTATATTATAC
ACACTTATATAGGATAAATATCATAGAGTATGCAAGATTCATTACGTCATATCTCGGTTT
AAGAGCATATACTCTTTGTGATCCTGAGGAATTGGGATATTTGTCGTCTTGATGAGAGAG
AGTTGAGAGGTTATTGTTAGAAAACGTGTTCGACGGTTATTTGCTTTTGTGGAATTTTGC
AGTTCAAAAGGAGTCTTGTCAAGGTCCTGAGAGCTGAGGAATCAGAAGAAAAGCTCCCAG
ATTCACTCTTTATCATCGAGTTCATCATCAGTTAGAAAGTGAATGAGGTGAAGATCACAC
ACTTTATAAGATGATGCCTTCATCTTTATAATTAATCTGTTGATCAAAGAGTGTTTTGTT
TCTCTGCATTTTGAAAAATGTCTTACCATTGCTGTATCAAACTCAAAAACTTACTGCAAC
TTCAAAGGACTGAACAATTTGCTAGAATATCTTGAAACGACTGTC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 4

CO CL2010Contig1 792 4 4 U
GTAGATGATACATCATGAGAAAACATTCTACGATTGATGATAAGTACACCAATTTTATTT
ATTACAACTACGAAAGTGTTCATGATTTATCTCACATACCAAAAACACCCATTTATTATC
ATTGATAGACTTGGACAAGGATCATATCATCTTGACCCTTTAGTTGACGCCATTGGCGTT
TTTGAGTGAAGCTCCACCTTTTGTGGAATGGCGTTCACAGAAGCTCTTCAATCTTTCAAA
TGCGTCCTCAACTGTTGGCGTCTCCATGTCGATAGAATGCCTCAACCAGTTCTGCTGTCT
AAATGCAATCCCTGGCAAAACGACGAGATTTTCTTCCATAGCAAGCTTGCTGCAGAAGTC
TTGATCGTCTTCAATGTCAGCAAAGCACGATATATCCAGCTTGGTCCATAGAAAGGTGCA
CGCTTCGGGTTTCATGTAACAAGTGAGGCCAGGTATGTGCTTAAGCTTAGCGTATCCAAT
ATCAACTTTATGTTTCAGAAAACTTCCCCTCTCAAGGAAGAAATGTTTTGGAGTTCTCTC
CAAAATGTCAGGCATAGCCGCCTGAATAACAGTCGGAGGTTTGGCATTTATCTGGAGAAA
TTCGTTGGCAGATTCTAATATCTTAGTGTTTCTGAAGACACCGTCTAGATCGTGCAGTGC
GAGCCAGCCAGTTCTCCATCCTGGTACATTCCATCCCTTAGATAAGGATCCGAGTGTAAC
CACTGGTACGATGGAAGAGAACTTTCCCATCGGAACAAAAGGGTTATTCCCGAAGACGGT
CCATCTAAACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP30JQ U 1
AF RR2CZ71JQ U 1
AF RR2AY14JQ U 1
AF RR2AY14TFB C 353
BS 1 93 RR2AY14JQ
BS 94 94 RR2CZ71JQ
BS 95 774 RR2AY14JQ
BS 775 792 RR2AY14TFB

RD RR2GP30JQ 552 0 0
GTAGATGATACATCATGAGAAAACATTCTACGATTGATGATAAGTACACCAATTTTATTT
ATTACAACTACGAAAGTGTTCATGATTTATCTCACATACCAAAAACACCCATTTATTATC
ATTGATAGACTTGGACAAGGATCATATCATCTTGACCCTTTAGTTGACGCCATTGGCGTT
TTTGAGTGAAGCTCCACCTTTTGTGGAATGGCGTTCACAGAAGCTCTTCAATCTTTCAAA
TGCGTCCTCAACTGTTGGCGTCTCCATGTCGATAGAATGCCTCAACCAGTTCTGCTGTCT
AAACGCAATCCCTGGCAAAACGACGAGATTTTCTTCCATAGCAAGCTTGCTGCAAAAGTC
TTGATCGTCTTCAATGTCAGCAAAGCACGATATATCCAGCTTGGTCCATAAAAAGGTGCA
CGCTTCGGGTTTCATGTAACAAGTGAGGCCAGGTATGTGCTTAAGCTTAGCGTATCCAAT
ATCAACTTTATGTTTCAGAAAACTTCCCCTCTCAAGGAAGAAATGTTTTGGAGTTCTCTC
CAAAATGTCAGG

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2CZ71JQ 665 0 0
GTAGATGATACATCATGAGAAAACATTCTACGATTGATGATAAGTACACCAATTTTATTT
ATTACAACTACGAAAGTGTTCATGATTTATCTCACATACCAAAAACACCCATTTATTATC
ATTGATAGACTTGGACAAGGATCATATCATCTTGACCCTTTAGTTGACGCCATTGGCGTT
TTTGAGTGAAGCTCCACCTTTTGTGGAATGGCGTTCACAGAAGCTCTTCAATCTTTCAAA
TGCGTCCTCAACTGTTGGCGTCTCCATGTCGATAGAATGCCTCAACCAGTTCTGCTGTCT
AAATGCAATCCCTGGCAAAACGACGAGATTTTCTTCCATAGCAAGCTTGCTGCAGAAGTC
TTGATCGTCTTCAATGTCAGCAAAGCACGATATATCCAGCTTGGTCCATAAAAAGGTGCA
CGCTTCGGGTTTCATGTAACAAGTGTGGCCAGGTATGTGCTTAAGCTTAGCGTATCCAAT
ATCAACTTTATGTTTCAGAAAACTTCCCCTCTCAAGGAAGAAATGTTTTGGAGTTCTCTC
CAAAATGTCAGGCATAGCCGCCTGAATAACAGTCGGAGGTTTGGCATTTATCTGGAGAAA
TTCGTTGGCAGATTCTAATATCTTAGTGTTCCTGAAGACACCGTCTAGATCGTGCAGTGC
GAGCC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2AY14JQ 774 0 0
GTAGATGATACATCATGAGAAAACATTCTACGATTGATGATAAGTACACCAATTTTATTT
ATTACAACTACGAAAGTGTTCATGATTTATCTCGCATACCAAAAACACCCATTTATTATC
ATTGATAGACTTGGACAAGGATCATATCATCTTGACCCTTTAGTTGACGCCATTGGCGTT
TTTGAGTGAAGCTCCACCTTTTGTGGAATGGCGTTCACAGAAGCTCTTCAATCTTTCAAA
TGCGTCCTCAACTGTTGGCGTCTCCATGTCGATAGAATGCCTCAACCAGTTCTGCTGTCT
AAATGCAATCCCTGGCAAAACGACGAGATTTTCTTCCATAGCAAGCTTGCTGCAGAAGTC
TTGATCGTCTTCAATGTCAGCAAAGCACGATATATCCAGCTTGGTCCATAGAAAGGTGCA
CGCTTCGGGTTTCATGTAACAAGTGAGGCCAGGTATGTGCTTAAGCTTAGCGTATCCAAT
ATCAACTTTATGTTTCAGAAAACTTCCCCTCTCAAGGAAGAAATGTTTTGGAGTTCTCTC
CAAAATGTCAGGCATAGCCGCCTGAATAACAGTCGGAGGTTTGGCATTTATCTGGAGAAA
TTCGTTGGCAGATTCTAATATCTTAGTGTTTCTGAAGACACCGTCTAGATCGTGCAGTGC
GAGCCAGCCAGTTCTCCATCCTGGTACATTCCATCCCTTAGATAAGGATCCGAGTGTAAC
CACTGGTACGATGGAAGAGAACTTTCCCATCGGAACAAAAGGGTTATTCCCGAA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2AY14TFB 440 0 0
CAG
AAGTCTTGATCGTCTTCAATGTCAGCAAAGCACGATATATCCAGCTTGGTCCATAGAAAG
GTGCACGCTTCGGGTTTCATGTAACAAGTGAGGCCAGGTATGTGCTTAAGCTTAGCGTAT
CCAATATCAACTTTATGTTTCAGAAAACTTCCCCTCTCAAGGAAGAAATGTTTTGGAGTT
CTCTCCAAAATGTCAGGCATAGCCGCCTGAATAACAGTCGGAGGTTTGGCATTTATCTGG
AGAAATTCGTTGGCAGATTCTAATATCTTAGTGTTTCTGAAGACACCGTCTAGATCGTGC
AGTGCGAGCCAGCCAGTTCTCCATCCTGGTACATTCCATCCCTTAGATAAGGATCCGAGT
GTAACCACTGGTACGATGGAAGAGAACTTTCCCATCGGAACAAAAGGGTTATTCCCGAAG
ACGGTCCATCTAAACCC

QA 4 440 4 440
DS 



AS 1 4

CO CL2011Contig1 778 4 3 U
TTTTTTATCTTCAACAGAACCAATCGTCCATTTGTTCTTCTGCACAATCTCTCACACTTC
TATTTCTCCCTCTCTTTTCACAAGGGAAGGGTGTAGAAGAAACCAAAAAAAAAACTTAAA
CAAAAGAGTAATAATATAACTCAAAAAACCAAAAAATAATAATAATACAGAATGGGTGGT
GTAAAGTTGTTATTCATCTTTGGTCTCTTGATCTTAGCTATGGTAGCTAAATCCGTCAAA
GCGACCTACCCGTTGACTAAATCTTGCATCAATGGAGAAGGTTGCATCGGAGATGATGAT
GAACTTGAATCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGTCAACTCGCTAGAGGACGTCGT
TACATTGGCTATGATGCTCTCAAAAAGAACAATGTGCCTTGCAATAGACGTGGCCGGTCT
TACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCAGTGCGATC
ACGCATTGTTATAGGTACGCTAAGTGAGAACAAAATGATAGAGAGAGGATGATTTGATTC
AACAACGTTCTATCTTTATTCTGCATTCTTGATCGCTAATGATTTCCTTTCTTAACGTAC
CCTATGTTATACGTACAATTTCTTATGTCTTTTTTTATTTAATCATCATCATGATGCATA
TAAGCTTTTGATTCGTTGATATATCGCCTATTTCCTTTGTTGTTGTTCTTCCATTCCGTT
TCGTTCTATATTAAGTTCCGTTTGTCTATTATATACATCATGATGTTTTTGTATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2GD81TF U 1
AF RR2CU39TF U 5
AF RR2GD81JQ C 53
AF RR2CU39JQ C 309
BS 1 630 RR2GD81TF
BS 631 692 RR2CU39TF
BS 693 778 RR2GD81JQ

RD RR2GD81TF 630 0 0
TTTTTTATCTTCAACAGAACCAATCGTCCATTTGTTCTTCTGCACAATCTCTCACACTTC
TATTTCTCCCTCTCTTTTCACAAGGGAAGGGTGTAGAAGAAACCAAAAAAAAAACTTAAA
CAAAAGAGTAATAATATAACTCAAAAAACCAAAAAATAATAATAATACAGAATGGGTGGT
GTAAAGTTGTTATTCATCTTTGGTCTCTTGATCTTAGCTATGGTAGCTAAATCCGTCAAA
GCGACCTACCCGTTGACTAAATCTTGCATCAATGGAGAAGGTTGCATCGGAGATGATGAT
GAACTTGAATCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGTCAACTCGCTAGAGGACGTCGT
TACATTGGCTATGATGCTCTCAAAAAGAACAATGTGCCTTGCAATAGACGTGGCCGGTCT
TACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCAGTGCGATC
ACGCATTGTTATAGGTACGCTAAGTGAGAACAAAATGATAGAGAGAGGATGATTTGATTC
AACAACGTTCTATCTTTATTCTGCATTCTTGATCGCTAATGATTTCCTTTCTTAACGTAC
CCTATGTTATACGTACAATTTCTTATGTCT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2CU39TF 688 0 0
GGATCC
TCAACAGAGCCAATCGTCCATTTGTTCTTCTGCACAATCTCTCACACTTCTATTTCTCCC
TCTCTTTTCACAAGGGAAGGGTGTAGAAGAAACCAAAAAAAAAACTTAAACAAAAGAGTA
ATAATATAACTCAAAAAACCAAAAAATAATAATAATACAGAATGGGTGGTGTAAAGTTGT
TATTCATCTTTGGTCTCTTGATCTTAGCTATGGTAGCTAAATCCGTCAAAGCGACCTACC
CGTTGACTAAATCTTGCATCAATGGAGAAGGTTGCATCGGAGATGATGATGAACTTGAAT
CTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGTCAACTCGCTAGAGGACGTCGTTACATTGGCT
ATGATGCTCTCAAAAAGAACAATGTGCCTTGCAATAGACGTGGCCGGTCTTACTACGATT
GCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCAGTGCGATCACGCATTGTT
ATAGGTACGCTAAGTGAGAACAAAATGATAGAGAGAGGATGATTTGATTCAACAACGTTC
TATCTTTATTCTGCATTCTTGATCGCTAATGATTTCCTTTCTTAACGTACCCTATGTTAT
ACGTACAATTTCTTATGTCTTTTTTTATTTAATCATCATCATGATGCATATAAGCTTTTG
ATTCGTTGATATATCGCCTATT

QA 7 688 7 688
DS 

RD RR2GD81JQ 726 0 0
CACACTTCTATTTCTCCCTCTCTTTTCACAAGGGAAGGGTGTAGAAGAAACCAAAAAAAA
AACTTAAACAAAAGAGTAATAATATAACTCAAAAAACCAAAAAATAATAATAATACAGAA
TGGGTGGTGTAAAGTTGTTATTCATCTTTGGTCTCTTGATCTTAGCTATGGTAGCTAAAT
CCGTCAAAGCGACCTACCCGTTGACTAAATCTTGCATCAATGGAGAAGGTTGCATCGGAG
ATGATGATGAACTTGAATCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGTCAACTCGCTAGAG
GACGTCGTTACATTGGCTATGATGCTCTCAAAAAGAACAATGTGCCTTGCAATAGACGTG
GCCGGTCTTACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCA
GTGCGATCACGCATTGTTATAGGTACGCTAAGTGAGAACAAAATGATAGAGAGAGGATGA
TTTGATTCAACAACGTTCTATCTTTATTCTGCATTCTTGATCGCTAATGATTTCCTTTCT
TAACGTACCCTATGTTATACGTACAATTTCTTATGTCTTTTTTTATTTAATCATCATCAT
GATGCATATAAGCTTTTGATTCGTTGATATATCGCCTATTTCCTTTGTTGTTGTTCTTCC
ATTCCGTTTCGTTCTATATTAAGTTCCGTTTGTCTATTATATACATCATGATGTTTTTGT
ATTTCC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2CU39JQ 467 0 0
ATCTTTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGTCAACTCGCTAGAGGACGTCGTTACATTGG
CTATGATGCTCTCAAAAAGAACAATGTGCCTTGCAATAGACGTGGCCGGTCTTACTACGA
TTGCAAGAAGAGGAGAAGGAACAATCCTTACAGGCGTGGATGCAGTGCGATCACGCATTG
TTATAGGTACGCTAAGTGAGAACAAAATGATAGAGAGAGGATGATTTGATTCAACAACGT
TCTATCTTTATTCTGCATTCTTGATCGCTAATGATTTCCTTTCTTAACGTACCCTATGTT
ATACGTACAATTTCTTATGTCTTTTTTTATTTAATCATCATCATGATGCATATAAGCTTT
TGATTCGTTGATATATCGCCTATTTCCTTTGTTGTTGTTCTTCCATTCCGTTTCGTTCTA
TATTAAGTTCCGTTTGTCTATTATATACATCATGATGTTTTTGTATT

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 4

CO CL2012Contig1 862 4 5 U
GGGCACAATCGTTTTCCACTTGAGCGGCACTCGAAATAAGTAGAAAACTCTTTGCTTTGC
GTTGATTTGATTGCTATGGCTCCTTCTCTTCCTCAGCCTTGGGAACTCCGTATGGATGCT
AACGGCTACGACATCTATTGGAATCCTGAGACCAAAGTTGCTCAATATGAGCGACCTACT
TGCCCTCCACCTCGCAACTTTGCTCAAGTTGCTTGTACCATCGAGTTTGACGGTGCTTGC
AGAGGAAACCCAGGAAAAGCTGGTGCGGGAGCCGTTCTCCGTTCTACACACGATAACAGG
GTGCTCTTCTATTTGCGTCAGGGTCTTGGCATTGCCACCAACAACGTTGCTGAGTATCGA
GCTCTCATTCTTGGTCTCGAGTATGCTCTTGGCAAAGGCTTTCGAAATGTTCGCATCAAG
GGAGACTCGTTGCTTGTCTGTAATCAGGTTCTAGATGAATGG*AGAGTCAACCACCCGAA
ATTGGCGGAGCTTAATGAATATGCCAAGG*ATCTTATGAGCCGGTTTAACTCATGCCGTA
TTCAACACATTGGCAGGGAATTCAATTCTGAGGCTGATGCTCAAGCTAACCGCGCGGTCA
ATCTCGCAGATGGTCAAATCCAATGCGAGTCTAGAGGGTGAAACGCAGGAAGAGACTGCT
GCAGGCAGGCGGCTTTAGAAGAAGGGAGTAATATCCATAGTTCTGTTTTCTTGTTTTTGG
GATCATTTCTTTTAGCATGTGCTATGTGTTAACATAAACATGAACGCGATGATCCTCTCT
CTCTCTCTTTTGCTTTGTTCCACTTCCCAATAAAACAAGTCTCTGTCGTCTACTTCTTAT
TTTATTCAGTAGTTTTTCATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G022TF U 451
AF RR2FA56TF U 1
AF RR2A286TF U 18
AF RR2FA56JQ C 180
BS 1 680 RR2FA56TF
BS 681 786 RR2A286TF
BS 787 788 RR2FA56JQ
BS 789 828 RR2A286TF
BS 829 862 RR2FA56JQ

RD RR2G022TF 164 0 0
CTAGATGAATGGGAGAGTCAACCACCCGAAATTGGCGGAGCTTAATGACTATGCCAAGGG
ATCTTATGAGCCGGTTTAACTCATGCCGTATTCAACACATTGGCAGGGAATTCAATTCTG
AGGCTGATGCTCAAGCTAACCGCTCGGTCAATCTCGCAGATGGT

QA 1 164 1 164
DS 

RD RR2FA56TF 680 0 0
GGGCACAATCGTTTTCCACTTGAGCGGCACTCGAAATAAGTAGAAAACTCTTTGCTTTGC
GTTGATTTGATTGCTATGGCTCCTTCTCTTCCTCAGCCTTGGGAACTCCGTATGGATGCT
AACGGCTACGACATCTATTGGAATCCTGAGACCAAAGTTGCTCAATATGAGCGACCTACT
TGCCCTCCACCTCGCAACTTTGCTCAAGTTGCTTGTACCATCGAGTTTGACGGTGCTTGC
AGAGGAAACCCAGGAAAAGCTGGTGCGGGAGCCGTTCTCCGTTCTACACACGATAACAGG
GTGCTCTTCTATTTGCGTCAGGGTCTTGGCATTGCCACCAACAACGTTGCTGAGTATCGA
GCTCTCATTCTTGGTCTCGAGTATGCTCTTGGCAAAGGCTTTCGAAATGTTCGCATCAAG
GGAGACTCGTTGCTTGTCTGTAATCAGGTTCTAGATGAATGG*AGAGTCAACCACCCGAA
ATTGGCGGAGCTTAATGAATATGCCAAGG*ATCTTATGAGCCGGTTTAACTCATGCCGTA
TTCAACACATTGGCAGGGAATTCAATTCTGAGGCTGATGCTCAAGCTAACCGCGCGGTCA
ATCTCGCAGATGGTCAAATCCAATGCGAGTCTAGAGGGTGAAACGCAGGAAGAGACTGCT
GCAGGCAGGCGGCTTTAGAA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2A286TF 811 0 0
ACTTGAGCGGCACTCGAAATAAGTAGAAAACTCTTTGCTTTGCGTTGATTTGATTGCTAT
GGCTCCTTCTCTTCCTCAGCCTTGGGAACTCCGTATGGATGCTAACGGCTACGACATCTA
TTGGAATCCTGAGACCAAAGTTGCTCAATATGAGCGACCTACTTGCCCTCCACCTCGCAA
CTTTGCTCAAGTTGCTTGTACCATCGAGTTTGACGGTGCTTGCAGAGGAAACCCAGGAAA
AGCTGGTGCGGGAGCCGTTCTCCGTTCTACACACGATAACAGGGTGCTCTTCTATTTGCG
TCAGGGTCTTGGCATTGCCACCAACAACGTTGCTGAGTATCGAGCTCTCATTCTTGGTCT
CGAGTATGCTCTTGACAAAGGCTTTCGAAATGTTCGCATCAGGGGAGACTCGTTGCTTGT
CTGTAATCAGGTTCTAGATGAATGG*AGAGTCAACCACCCGAAATTGGCGGAGCTTAATG
AATATGCCAAGG*ATCTTATGAGCCGGTTTAACTCATGCCGTATTCAACACATTGGCAGG
GAATTCAATTCTGAGGCTTATGCTCAAGCTAACCGCGCGGTCAATCTCGCAGATGGTCAA
ATCCAATGCGAGTCTAGAGGGTGAAACGCAGGAAGAGACTGCTGCAGGCAGGCGGCTTTA
GAAGAAGGGAGTAATATCCATAGTTCTGTTTTCTTGTTTTTGGGATCATTTCTTTTAGCA
TGTGCTATGTGTTAACATAAACATGAACGCGATGATCCTCTCTCTCTCT**TTTGCTTTG
TTCCACTTCCCAATAAAACAAGTCTCTGTCG

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2FA56JQ 683 0 0
TTGCCCTCCACCTCGCAACTTTGCTCAAGTTGCTTGTACCATCGAGTTTGACGGTGCTTG
CAGAGGAAACCCAGGAAAAGCTGGTGCGGGAGCCGTTCTCCGTTCTACACACGATAACAG
GGTGCTCTTCTATTTGCGTCAGGGTCTTGGCATTGCCACCAACAACGTTGCTGAGTATCG
AGCTCTCATTCTTGGTCTCGAGTATGCTCTTGGCAAAGGCTTTCGAAATGTTCGCATCAA
GGGAGACTCGTTGCTTGTCTGTAATCAGGTTCTAGATGAATGG*AGAGTCAACCACCCGA
AATTGGCGGAGCTTAATGAATATGCCAAGG*ATCTTATGAGCCGGTTTAACTCATGCCGT
ATTCAACACATTGGCAGGGAATTCAATTCTGAGGCTGATGCTCAAGCTAACCGCGCGGTC
AATCTCGCAGATGGTCAAATCCAATGCGAGTCTAGAGGGTGAAACGCAGGAAGAGACTGC
TGCAGGCAGGCGGCTTTAGAAGAAGGGAGTAATATCCATAGTTCTGTTTTCTTGTTTTTG
GGATCATTTCTTTTAGCATGTGCTATGTGTTAACATAAACATGAACGCGATGATCCTCTC
TCTCTCTCTTTTGCTTTGTTCCACTTCCCAATAAAACAAGTCTCTGTCGTCTACTTCTTA
TTTTATTCAGTAGTTTTTCATAT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

CO CL2013Contig1 1193 4 15 U
GTCTTTCCTCAACTTCCCTTCCATCGATCATCTCAACACCTTCTCCTCCGATATCGTCTC
CGCCGTCCTCGCCGACGGCAGCGCTAACGGCGGCCCTAAACTCTCGGCCGCTAATGGCGT
CTGGATCGATAAGTCTCTTTCCTTCAAACCTTCCTTCAAGCAGCTCTTGGATGGTTCTTA
CAAAGCTGCTTCTAACCAAGCAGATTTTCAGACAAAGGCTGTGGAAGTGATTGCTGAAGT
GAATTCATGGGCTGAAAAGGAGACGAATGGTCTCATCACCGAGGTTCTACCGGAAGGATC
AGCAGACAGTATGACCAAACTGATATTTGCAAATGCTTTGTACTTCAAGGGAACATGGAA
CGAGAAATTCGACGAATCGCTGACAAAAGACGGAGACTTTCACCTTCTTGACGGTAGTTC
CAAAGTGACTGCTCCGTTTATGACCAGCAAGAAGAAACAGTACGTGAGTGCTTATGATGG
TTTCAAAGTGTTGGGGCTTCCTTACTTACAAGGACAGGATAAGAGACAGTTCTCGATGTA
CTTGTATCTTCCAGATGCAAACAACGGTGTGTCTGATCTTCTCGATAAGATAGTTTCCAA
TCCTGGGTTCTTGGACAGCCACATTCCACGCAGAGAAGTTAAGGTGGGCGAGTTCAAGAT
TCCCAAGTTTAAGTTCTCATTCGGGTTCGAAGCTTCGGATGTTTTGAAAGGATTGGGACT
GACTTCACCCTTCTCTGGTGAAGATGGACTGACTGAGATGGTTGAGTCTCCAGAGATGGG
GAAGAATCTAAAGGTATCAAGCATTTTCCATAAAGCGTGTATTGAGGTGAATGAAGAAGG
AACTGAAGCTGCTGCTGCGTCAGCTGCAGTAATAAAGCTAAGGTCTTTGGCTGTGGAGGA
AGAGATTATAGATTTTGTGGCGGACCATCCGTTTCTGTTGGTGGTCATGGAGAACATAAC
AGGAGTGATTCTGTTTATTGGTCAAGTCATTGATCCGTTGCATTAATCTTGCTTTTACTT
TGAGAGTAATCAAATAAAATATGAGTTGTGGTTTGAGGAATTTTTTCCTGCTACATCCTT
TGTTTAACTTTGATGTGTGCAACAATTAATAATACATACTTTCTTTTTTCACATTTTCTA
TGTATTTCAACTTTTTGTAAAATTAAAAGAAAAAAATCTATTTGCATTTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G454TF U 1
AF RR2B778TF U 172
AF RR2G454JQ C 300
AF RR2B778JQ C 407
BS 1 279 RR2G454TF
BS 280 280 RR2B778TF
BS 281 507 RR2G454TF
BS 508 508 RR2B778TF
BS 509 634 RR2G454TF
BS 635 962 RR2B778TF
BS 963 963 RR2G454JQ
BS 964 1020 RR2B778TF
BS 1021 1021 RR2B778JQ
BS 1022 1059 RR2G454JQ
BS 1060 1060 RR2B778JQ
BS 1061 1072 RR2G454JQ
BS 1073 1082 RR2B778JQ
BS 1083 1132 RR2G454JQ
BS 1133 1193 RR2B778JQ

RD RR2G454TF 635 0 0
GTCTTTCCTCAACTTCCCTTCCATCGATCATCTCAACACCTTCTCCTCCGATATCGTCTC
CGCCGTCCTCGCCGACGGCAGCGCTAACGGCGGCCCTAAACTCTCGGCCGCTAATGGCGT
CTGGATCGATAAGTCTCTTTCCTTCAAACCTTCCTTCAAGCAGCTCTTGGATGGTTCTTA
CAAAGCTGCTTCTAACCAAGCAGATTTTCAGACAAAGGCTGTGGAAGTGATTGCTGAAGT
GAATTCATGGGCTGAAAAGGAGACGAATGGTCTCATCACTGAGGTTCTACCGGAAGGATC
AGCAGACAGTATGACCAAACTGATATTTGCAAATGCTTTGTACTTCAAGGGAACATGGAA
CGAGAAATTCGACGAATCGCTGACAAAAGACGGAGACTTTCACCTTCTTGACGGTAGTTC
CAAAGTGACTGCTCCGTTTATGACCAGCAAGAAGAAACAGTACGTGAGTGCTTATGATGG
TTTCAAAGTGTTGGGGCTTCCTTACTTGCAAGGACAGGATAAGAGACAGTTCTCGATGTA
CTTGTATCTTCCAGATGCAAACAACGGTGTGTCTGATCTTCTCGATAAGATAGTTTCCAA
TCCTGGGTTCTTGGACAGCCACATTCCACGCAGA
C

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2B778TF 855 0 0
G
GGTTCTTACAAAGCTGCTTCTCACCAAGCAGATTTTCAGACAAAGGCTGTGGAAGTGATT
GCTGAAGTGAATTCATGGGCTGAAAAGGAGACGAATGGTCTCATCACCGAGGTTCTACCG
GAAGGATCAGCGGACAGTATGACCAAACTGATATTTGCAAATGCTTTGTACTTCAAGGGA
ACATGGAACGAGAAATTCGACGAATCGCTGACGAAAGACGGAGACTTTCACCTTCTCGAC
GGTAGTTCCAAAGTGACTGCTCCGTTTATGACCAGCAAGAAGAAACAGTACGTGAGTGCT
TATGATGGTTTCAAAGTGTTGGGGCTTCCTTACTTACAAGGACAGGATAAGAGACAGTTC
TCGATGTACTTGTATCTTCCAGATGCAAACAACGGTTTGTCTGATCTTCTCGATAAGATA
GTTTCCAATCCTGGGTTTTTGGATAGCCACATTCCACGCAGAGAAGTTAAGGTGGGCGAG
TTCAAGATTCCCAAGTTTAAGTTCTCATTCGGGTTCGAAGCTTCGGATGTTTTGAAAGGA
TTGGGACTGACTTCACCCTTCTCTGGTGAAGATGGACTGACTGAGATGGTTGAGTCTCCA
GAGATGGGGAAGAATCTAAAGGTATCAAGCATTTTCCATAAAGCGTGTATTGAGGTGAAT
GAAGAAGGAACTGAAGCTGCTGCTGCGTCAGCTGCAGTAATAAAGCTAAGGTCTTTGGCT
GTGGAGGAAGAGATTATAGATTTTGTGGCGGACCATCCGTTTCTGTTGGTGGTCATGGAG
AACATAACAG*AGTGATTCTGTTTATTGGTCAAGTCATTGATCCGTTGCATTAATCTTGC
TTTTACTT
TGAGAG

QA 2 849 2 849
DS 

RD RR2G454JQ 833 0 0
CAGCAGACAGTATGACCAAACTGATATT*GCAAATGCTTTGTACTTCAAGGGAACATGGA
ACGAGAAATTCGACGAATCGCTGACAAAAGACGGAGACTTTCACTTTCTTGACGGTAGTT
CCAAAGTGACTGCTCCGTTTATGACCAGCAAGAAGAAACAGTACGTGAGTGCTTATGATG
GTTTCAAAGTGTTGGGGCTTCCTTACTTGCAAGGACAGGATAAGAGACAGTTCTCGATGT
ACTTGTATCTTCCAGATGCAAACAACGGTGTGTCTGATCTTCTCGATAAGATAGTTTCCA
ATCCTGGGTTCTTGGACAGCCACATTCCACGCAGACAAGTTAAGGTCGGCGAGTTCAAGA
TTCCCAAGTTTAAGTTCTCTTTCGGGTTCGAAGCTTCTGATGTTTTGAAAGGATTGGGAC
TGACTTCACCCTTCTCTGGTGAAGATGGTCTGACTGAGATGGTTGAGTCTCCAGAGATGG
GGAAGAATCTAACGGTATCAAGCATTTTCCATAAAGCGTGTATTGAGGTGAATGAAGAAG
GAACTGAAGCTGCTGCTGCGTCAGCTGCAGTAATAAAGCTAAGGTCTTTGGCTGTGGAGG
AAGAGATTATAGATTTTGTGGCGGACCATCCGTTTCTGCTGGTGGTCATGGAGAACATAA
CAGGAGTGATTCTGTTTATTGGTCAAGTCATTGATCCGTTGCATTAATCTGGCTTTTACT
T*GAGAGTAATCAAATAAAATATGAGTTGTGGTTTGAGGACTTTTTTCCTGCTT******
***TTTAACTTTGATGTGTGCAACAATTAATAATACATACTTTCTTTTTTCAC

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2B778JQ 787 0 0
CTC
GACGGTAGTTCCAAAGTGACTGCTCCGTTTATGACCAGCAAGAAGAAACAGTACGTGAGT
GCTTATGATGGTTTCAAAGTGTTGGGGCTTCCTTACTTACAAGGACAGGATAAGAGACAG
TTCTCGATGTACTTGTATCTTCCAGATGCAAACAACGGTTTGTCTGATCTTCTCGATAAG
ATAGTTTCCAATCCTGGGTTTTTGGATAGCCACATTCCACGCAGAGAAGTTAAGGTGGGC
GAGTTCAAGATTCCCAAGTTTAAGTTCTCATTCGGGTTCGAAGCTTCGGATGTTTTGAAA
GGATTGGGACTGACTTCACCCTTCTCTGGTGAAGATGGACTGACTGAGATGGTTGAGTCT
CCAGAGATGGGGAAGAATCTAAAGGTATCAAGCATTTTCCATAAAGCGTGTATTGAGGTG
AATGAAGAAGGAACTGAAGCTGCTGCTGCGTCAGCTGCAGTAATAAAGCTAAGGTCTTTG
GCTGTGGAGGAAGAGATTATAGATTTTGTGGCGGACCATCCGTTTCTGTTGGTGGTCATG
GAGAACATAACAGGAGTGATTCTGTTTATTGGTCAAGTCATTGATCCGTTGCATTAATCT
TGCTTTTACTTTGAGAGTAATCAAATAAAATATGAGTTGTGGTTTGAGGAATTTTTTCCT
GCTACATCCTTTGTTTAACTTTGATGTGTGCAATAATTAATAATACATACTTTCTTTTTT
CACATTTTCTATGTATTTCAACTTTTTGTAAAATTAAAAGAAAAAAATCTATTTGCATTT
TCCT

QA 4 787 4 787
DS 



AS 1 4

CO CL2014Contig1 679 4 13 U
TAAATTTGTAATTTAAATGACAATTTTCCAATTTAAAATGATAATATGGAACATTAAAGC
CGGGGAAAATAAAACTTAAAAGAAAGCATATGAGCCGACACAGAATCTGCAAGGGTGGTT
GGTCACTTTTTGCGAGACAAAGCAGCGGCGATTCCACCGGCTATGAGGCCGACGACTGTA
GCCGTGATGCCTATCCCAATAACACCATCTTTTGCGATTTTGTCTTCAATGGTTTTCTTT
AAAGCTAAGGCTTGCCTCCAATCAGGTTGAACCTCGAGACAGCGTTCCACGAGCTGCCTG
CTTCTAGAGTAGTCTCCAGTACGGTAATAACCAACAGCAAGAAGATAAAGCTTCTCACGG
TCCTGCAAAGGAGGGCTACTACTTGCTAGAGAAGCTTCGAGCATGTCGATTCCACGCTGG
ATGTCTTCGGCTTGTCGGGAATGGACAAGAGCCCAAGACAATCGCATAATGCTCTCTTTC
TTTTGGTCTTCGGAGTCACCGTCAGTTGCGGTCCTAACTTCTTTCTCACATTCGAGGATG
ACATCACGTTCGCACCAAGGGATCTTATCGCCGCCGCTGAAGAAGGAACCGATTGAATCG
AAGAAACTTCCCATTTTAGAATCCAATTGATTTGAGAGCCTCGCTTCTATTGAATTATGC
TTTGTTTATCTTCTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E920JQ U 141
AF RR2A024JQ U 15
AF RR2A024TF C 15
AF RR2E920TF C 1
BS 1 14 RR2E920TF
BS 15 140 RR2A024JQ
BS 141 174 RR2E920JQ
BS 175 175 RR2A024JQ
BS 176 306 RR2E920JQ
BS 307 307 RR2A024JQ
BS 308 343 RR2E920JQ
BS 344 344 RR2A024JQ
BS 345 390 RR2E920JQ
BS 391 391 RR2A024JQ
BS 392 412 RR2E920JQ
BS 413 655 RR2A024JQ
BS 656 679 RR2E920TF

RD RR2E920JQ 272 0 0
AGCAGCGGCGATTCCACCGGCTATGAGGCCGACGGCTGTAGCCGTGATGCCTATCCCAAT
AACACCATCTTTTGCGATTTTGTCTTCAATGGTTTTCTTTAAAGCTAAGGCTTGCCTCCA
ATCAGGTTGAACCTCGAGACAGCGTTCCACGAGCTGCCTGCTTCTAAAGTAGTCTCCAGT
ACGGTAATAACCAACAGCAAGAAAATAAAGCTTCTCACGGTCCTGCAAAGGAGGGCTACT
ACTTGCTAGAAAAGCTTCGAGCATGTCGATTC

QA 1 272 1 272
DS 

RD RR2A024JQ 642 0 0
AAATGACAATTTTCCAATTTAAAATGATAATATGGAACATTAAAGCCGGGGAAAATAAAA
CTTAAAAGAAAGCATATGAGCCGACACAGAATCTGCAAGGGTGGTTGGTCACTTTTTGCG
AGACAAAGCAGCGGCGATTCCACCGGCTATGAGGCCGACGACTGTAGCCGTGATGCCTAT
CCCAATAACACCATCTTTTGCGATTTTGTCTTCAATGGTTTTCTTTAAAGCTAAGGCTTG
CCTCCAATCAGGTTGAACCTCGAGACAGCGTT**ACGAGCTGCCTGCTTCTAGAGTAGTC
TCCAGTACGGTAATAACCAACAGCAAGAAGATAAAGCTTCTCACGGTCCTGCAAAGGAGG
GCTACTACTTGCTAGAGAAGCTTCGAGCATGTCGATTCCACGCTGGATGTCTTCGGCTTG
TCGGGAATGGACAAGAGCCCAAGACAATCGCATAATGCTCTCTTTCTTTTGGTCTTCGGA
GTCACCGTCAGTTGCGGTCCTAACTTCTTTCTCACATTCGAGGATGACATCACGTTCGCA
CCAAGGGATCTTATCGCCGCCGCTGAAGAAGGAACCGATTGAATCGAAGAAACTTCCCAT
TTTAGAATCCAATTGATTTGAGAGCCTCGCTTCTATTGAAT
C

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2A024TF 642 0 0
AAATGACAATTTTCCAATTTAAAATGATAATATGGAACATTAAAGCCGGGGAAAATAAAA
CTTAAAAGAAAGCATATGAGCCGACACAGAATCTGCAAGGGTGGTTGGTCACTTTTTGCG
AGACAAAGCAGCGGCGATTCCACCGGCTATGAGGCCGACGACTGTAGCCGTGATGCCTAT
CCCAATAACACCATCTTTTGCGATTTTGTCTTCAATGGTTTTCTTTAAAGCTAAGGCTTG
CCTCCAATCAGGTTGAACCTCGAGACAGCGTT**ACGAGCTGCCTGCTTCTAGAGTAGTC
TCCAGTACGGTAATAACCAACAGCAAGAAGATAAAGCTTCTCACGGTCCTGCAAAGGAGG
GCTACTACTTGCTAGAGAAGCTTCGAGCATGTCGATTCCACGCTGGATGTCTTCGGCTTG
TCGGGAATGGACAAGAGCCCAAGACAATCGCATAATGCTCTCTTTCTTTTGGTCTTCGGA
GTCACCGTCAGTTGCGGTCCTAACTTCTTTCTCACATTCGAGGATGACATCACGTTCGCA
CCAAGGGATCTTATCGCCGCCGCTGAAGAAGGAACCGATTGAATCGAAGAAACTTCCCAT
TTTAGAATCCAATTGATTTGAGAGCCTCGCTTCTATTGAAT
C

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2E920TF 679 0 0
TAAATTTGTAATTTAAATGACAATTTTCCAATTTAAAATGATAATATGGAACATTAAAGC
CGGGGAAAATAAAACTTAAAAGAAAGCATATGAGCCGACACAGAATCTGCAAGGGTGGTT
GGTCACTTTTTGCGAGACAAAGCAGCGGCGATTCCACCGGCTATGAGGCCGACGGCTGTA
GCCGTGATGCCTATCCCAATAACACCATCTTTTGCGATTTTGTCTTCAATGGTTTTCTTT
AAAGCTAAGGCTTGCCTCCAATCAGGTTGAACCTCGAGACAGCGTTCCACGAGCTGCCTG
CTTCTAGAGTAGTCTCCAGTACGGTAATAACCAACAGCAAGAAGATAAAGCTTCTCACGG
TCCTGCAAAGGAGGGCTACTACTTGCTAGAGAAGCTTCGAGCATGTCGATTCCACGCTGG
ATGTCTTCGGCTTGTCGGGAATGGACAAGAGCCCAAGACAATCGCATAATGCTCTCTTTC
TTTTGGTCTTCGGAGTCACCGTCAGTTGCGGTCCTAACTTCTTCCTCACATTCGAGGATG
ACATCACGTTCGCACCAAGGGATCTTATCGCCGCCGCTGAAGAAGGAACCGATTGAATCG
AAGAAACTTCCCATTTTAGAATCCAATTGATTTGAGAGCCTCGCTTCTATTGAATTATGC
TTTGTTTATCTTCTCTTCC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 4

CO CL2015Contig1 1042 4 17 U
GGAAATATACAAATAAAAAAATAAACAAACATAAATTTTCAATTTTTTTTAGTACGTGAG
AGTGAGACAAACAAAAAGCGAATCTTACAACTTTCTATCGAAAATGTAGTTCTCACTCTT
TACATGGACGACACACGTACACGTACTAGTCTTTTTTTTTTTCTTTTATTCAAATGATTT
TTATACGCTTTATAATCCAAGCGTGACAGGTACGTTAGCTTCTTGGATCCAGTTAACCGG
AGCCAACCAGTTAGCCACAGTGTACTGATTAATCTCACCAGCAGACCTAGCGACCTTAGC
CCAGCTAACTCTCCTATTGGTGATAGCTCCCGGTCCACGGTTGTTGTACTCAACGTACCT
ACATGACTTGTGGAAGTTCTCTCCGTCCCACATTCTCCACCCTTTCTGGTCTAATCACAT
CTCCGA*TCTCCGTGTTGATCACCACGGTGGTCGAGAACTGCTTCCATGGCCTTCCCAA*
GTACGACTCAACGGTCAGCCTCTCCGCCGCTAGCTTCTTGTCGGGAACGATGCGGCAGTT
CTGGATGACGATACCGATTTTCATGGATAGACCCTTTTCGTTTCCGTCGGCTGTGACCGT
GTTGTATTGTCCCTTGTTTCCTTTGCGGATGACGATGAGTGAGTTTTGGATAACGGTCGC
GGATTTGCCGAAGATGAAGTCGACTGTTCCTGAGACGACGCAGTTTCTGTAGAACTGACG
GCCGTTGTTGACGTATAGTGTGTCTTGGTAACCGTCGAATCTGCAGTTGAAGATCACGGC
ACGGTCTCCGTTGACTCTGATAGCAACGGCTTGGTGCCCATTTGGACCCGCTGTGTTCTT
GAATCCGATCCATCTAGCCATGAATCCTTCAGATTCAACCTGGACTGTGCCACTAGTAGA
AGTGGTGGTTCCGGAACTGAGACCAACACTTCTGTTGTAAGTAATAACGGTCTTTCTTGC
ACCATCTCCGAACATGAAGATGTTGTTCTTCTTCTTAGGGATGATGACTTGCTCTCTGTA
GATACCAGCCTTGATGTGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2CN63JQ U 1
AF RR2AO57JQ U 23
AF RR2AO57TF C 163
AF RR2A881TF C 398
BS 1 111 RR2CN63JQ
BS 112 112 RR2AO57JQ
BS 113 117 RR2CN63JQ
BS 118 118 RR2AO57JQ
BS 119 225 RR2CN63JQ
BS 226 226 RR2AO57JQ
BS 227 404 RR2CN63JQ
BS 405 405 RR2AO57TF
BS 406 431 RR2CN63JQ
BS 432 432 RR2AO57JQ
BS 433 443 RR2CN63JQ
BS 444 444 RR2AO57JQ
BS 445 470 RR2CN63JQ
BS 471 471 RR2AO57JQ
BS 472 626 RR2CN63JQ
BS 627 830 RR2AO57JQ
BS 831 1042 RR2AO57TF

RD RR2CN63JQ 626 0 0
GGAAATATACAAATAAAAAAATAAACAAACATAAATTTTCAATTTTTTTTAGTACGTGAG
AGTGAGACAAACAAAAAGCGAATCTTACAACTTTCTATCGAAAATGTAGTTTTCACTTTT
TACATGGACGACACACGTACACGTACTAGTCTTTTTTTTTTTCTTTTATTCAAATGATTT
TTATACGCTTTATAATCCAAGCGTGACAGGTACGTTAGCTTCTTGAATCCAGTTAACCGG
AGCCAACCAGTTAGCCACAGTGTACTGATTAATCTCACCAGCAGACCTAGCGACCTTAGC
CCAGCTAACTCTCCTATTGGTGATAGCTCCCGGTCCACGGTTGTTGTACTCAACGTACCT
ACATGACTTGTGGAAGTTCTCTCCGTCCCACATTCTCCACCCTT*CTGGTCTAATCACAT
CTCCGA*TCTCAGTGTTGATCACAACGGTGGTCGAGAACTGCTTCCATGGGCTTCCCAA*
GTACGACTCAACGGTCAGCCTCTCCGCCGCTAGCTTCTTGTCGGGAACGATGCGGCAGTT
CTGGATGACGATACCGATTTTCATGGATAGACCCTTTTCGTTTCCGTCGGCTGTGACCGT
GTTGTATTGTCCCTTGTTTCCTTTGC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2AO57JQ 808 0 0
AAACAAACATAAATTTTCAATTTTTTTTAGTACGTGAGA******CAAACAAAAAGCGAA
TCTTACAACTTTCTATCGAAAATGTAGTTCTCACTCTTTACATGGACGACACACGTACAC
GTACTAGTCTTTTTTTTT**CTTTTATTCAAATGATTTTTATACGCTTTATAATCCAAGC
GTGACAGGTACGTTAGCTTCTTGGATCCAGTTAACCGGAGCCAACCAGTTAGCCACAGTG
TACTGATTAATCTCACCAGCAGACCTAGCGACCTTAGCCCAGCTAACTCTCCTATTGGTG
ATAGCTCCCGGTCCACGGTTGTTGTACTCAACGTACCTACATGACTTGTGGAAGTTCTCT
CCGTCCCACATTCTCCACCCTT*CTGGTCTAATCACATCTCCGA*TCTCCGTGTTGATCA
CCACGGTGGTCGAGAACTGCTTCCATGGCCTTCCCAA*GTACGACTCAACGGTCAGCCTC
TCCGCCGCTAGCTTCTTGTCGGGAACGATGCGGCAGTTCTGGATGACGATACCGATTTTC
ATGGATAGACCCTTTTCGTTTCCGTCGGCTGTGACCGTGTTGTATTGTCCCTTGTTTCCT
TTGCGGATGACGATGAGTGAGTTTTGGATAACGGTCGCGGATTTGCCGAAGATGAAGTCG
ACTGTTCCTGAGACGACGCAGTTTCTGTAGAACTGACGGCCGTTGTTGACGTATAGTGTG
TCTTGGTAACCGTCGAATCTGCAGTTGAAGATCACGGCACGGTCTCCGTTGACTCTGATA
GCAACGGCTTGGTGCCCATTTGGACCCG

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2AO57TF 880 0 0
CTTTTATTCAAATGATTTT*ATACGCTTTATAATCCAAGCGTGACAGGTACGTTAGCTTC
T*GGATCCAGTTAAC*GGAGCCAACCAGTTAGCCACAGTGTACTGATTAATCTCACCAGC
AGACCTAGCGAC*TTAGCCCAGCTAACTCTCCTATTGGTGATAGCTCCCGGTCCACGGTT
GTTGTACTCAACGTACGTACATGACTTGTGGAAGTTCTCTCCGTCCCACATTCTCCACCC
TTTCTGGTCTAATCACATCTCCGA*TCTCCGTGTTGATCACCACGGTGGTCGAGAACTGC
TTCCATGGCCTTCCCAA*GTACGACTCAACGGTCAGCCTCTCCGCCGCTAGCTTCTTGTC
GGGAACGATGCGGCAGTTCTGGATGACGATACCGATTTTCATGGATAGACCCTTTTCGTT
TCCGTCGGCTGTGACCGTGTTGTATTGTCCCTTGTTTCCTTTGCGGATGACGATGAGTGA
GTTTTGGATAACGGTCGCGGATTTGCCGAAGATGAAGTCGACTGTTCCTGAGACGACGCA
GTTTCTGTAGAACTGACGGCCGTTGTTGACGTATAGTGTGTCTTGGTAACCGTCGAATCT
GCAGTTGAAGATCACGGCACGGTCTCCGTTGACTCTGATAGCAACGGCTTGGTGCCCATT
TGGACCCGCTGTGTTCTTGAATCCGATCCATCTAGCCATGAATCCTTCAGATTCAACCTG
GACTGTGCCACTAGTAGAAGTGGTGGTTCCGGAACTGAGACCAACACTTCTGTTGTAAGT
AATAACGGTCTTTCTTGCACCATCTCCGAACATGAAGATGTTGTTCTTCTTCTTAGGGAT
GATGACTTGCTCTCTGTAGATACCAGCCTTGATGTGGATC

QA 1 880 1 880
DS 

RD RR2A881TF 645 0 0
CCACCC
TTCTGGTCTAATCACATCTCCGAATCTCCGTGTTGATCACCACGGTGGTCGAGAACTGCT
TCCATGGCCTTCCCAAAGTACGACTCAACGGTCAGCCTCTCCGCCGCTAGCTTCTTGTCG
GGAACGATGCGGCAGTTCTGGATGACGATACCGATTTTCATGGATAGACCCTTTTCGCTT
CCGTCGGCTGTGACCGTGTTGTATTGTCCCTTGTTTCCTTTGCGGATGACGATGAGTGAG
TTTTGGATAACGGTCGCGGATTTGCCGAAGATGAAGTCGACTGTTCCTGAGACGACGCAG
TTTCTGTAGAACTGACGGCCGTTGTTGACGTATAGTGTGTCTTGGTAACCGTCGAATCTG
CAGTTGAAGATCACGGCACGGTCTCCGTTGACTCTGATAGCAACGGCTTGGTGCCCATTT
GGACCCGCTGTGTTCTTGAATCCGATCCATTTAGCCATGAATCCTTCAGATTCAACCTGG
ACTGTGCCACTAGTAGAAGTGGTGGTTCCGGAACTGAGACCAACACTTCTGTTGTAAGTA
ATAACGGTCTTTCTTGCACCATCTCCGAACATGAAGATGTTGTTCTTCTTCTTAGGGATG
ATGACTTGCTCTGTGTAGATACCAGCCTTGATGTGGATC

QA 7 645 7 645
DS 



AS 1 4

CO CL2016Contig1 775 4 23 U
GGATCAAGCGAAGAAGCAAAAGCTCTCAGGTGAAGCAACCATGTCGTGGATGAAAGGAGA
TTTACTTTCCAAAACCAGGAGGCTTGTTGGTGGGCTCGCTACAAGAGAGCCTGTTTGGCT
CAAAGCCATGGAAGCATCACCACCTCCTGTCTTTCCTCGCTCTAATGGGAACCTCAAGAA
GATTGTTCTCCCTGAAGATCCCTACGTTCGTAGATTCGCTCGTAAGCATCCTGAAGCCAA
ACTCGTCGACCCCAACAAGGTTTCGGCGTTTATTCCAGATCCAGCACGCTTTTATGGTTG
CCGGGTTCTTGAACTCACCAAGAATGG*CAACAGCGAGGATGACGCCATGTCTGTAGCTA
ATATGGAGTATCTTGCGGAGAGAAAGGAAAAGAAGAAAGCATACAAACGCCTAAAGGAGC
TTGCTCTTCTGCAAGACAAGGCTCCGCCTCCTAAACCGTATCTCAGTACCAAAAAGGAGA
TGCAAACTCAAGAGAAGAAAGCACCTGCGGATCCTCCTAGCGTCCGCAGGCTAGTTAACC
AGTTGAAACAGCAGAAAGATGTGTTGCTTCAGGACAAAACGGG*AGGTAGTGCTAATCAG
GATCATTGGATAGACGAATAGATTCTCCATCACCCTTTTCTTTTTATGCAAGTTCAGTCT
TTTTATACATGATGACAATTGTTGTTATTCCCATTTGATTGTTTACAGAATATTTTCGAC
AAACAAGTGTTACTCCCATTTGATTGTAGTTGTAATAACACATATCTTTGGATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H207TF U 1
AF RR2G218JQ C 16
AF RR2G218TF U 306
AF RR2H207JQ C 59
BS 1 330 RR2H207TF
BS 331 331 RR2G218TF
BS 332 393 RR2H207TF
BS 394 394 RR2G218TF
BS 395 418 RR2H207TF
BS 419 419 RR2G218TF
BS 420 445 RR2H207TF
BS 446 446 RR2G218TF
BS 447 463 RR2H207TF
BS 464 464 RR2G218TF
BS 465 578 RR2H207TF
BS 579 579 RR2G218TF
BS 580 596 RR2H207TF
BS 597 600 RR2G218TF
BS 601 601 RR2G218JQ
BS 602 715 RR2G218TF
BS 716 716 RR2G218JQ
BS 717 722 RR2G218TF
BS 723 723 RR2G218JQ
BS 724 755 RR2G218TF
BS 756 756 RR2G218JQ
BS 757 769 RR2G218TF
BS 770 775 RR2G218JQ

RD RR2H207TF 596 0 0
GGATCAAGCGAAGAAGCAAAAGCTCTCAGGTGAAGCAACCATGTCGTGGATGAAAGGAGA
TTTACTTTCCAAAACCAGGAGGCTTGTTGGTGGGCTCGCTACAAGAGAGCCTGTTTGGCT
CAAAGCCATGGAAGCATCACCACCTCCTGTCTTTCCTCGCTCTAATGGGAACCTCAAGAA
GATTGTTCTCCCTGAAGATCCCTACGTTCGTAGATTCGCTCGTAAGCATCCTGAAGCCAA
ACTCGTCGACCCCAACAAGGTTTCGGCGTTTATTCCAGATCCAGCACGCTTTTATGGTTG
CCGGGTTCTTGAACTCACCAAGAATGG*CATCAGCGAGGATGACGCCATGTCTGTAGCTA
ATATGGAGTATCTTGCGGAGAGAAAGGAAAAGATGAAAGCATACAAACGCCTAAAGGATC
TTGCTCTTCTGCAAGACAAGGCTCCTCCTCCTAAACCGTATCTTAGTACCAAAAAGGAGA
TGCAAACTCAAGAGAAGAAAGCACCTGCGGATCCTCCTAGCGTCCGCAGGCTAGTTAACC
AGTTGAAACAGCAGAAAGATGTGTTGCTTCAGGACAAACCGGG*AGGTAGTGCTAA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2G218JQ 760 0 0
AAGCAAAAG
CTCAGGTGAAGCAACCATGTCGTGGATGAAAGGAGATTTACTTTCCAAAACCAGGAGGCT
TGTTGGTGGGCTCGCTACAAGAGAGCCCGTTTGGCTTAAAGCCATGGAAGCATCACCACC
TCCTGTCTTTCCTCGCTCTAATGGGAACCTCAAGAAGATTGTTCTCCCTGAAGATCCCTA
CGTTCGTAGATTCGCTCGTAAACATCCTGAAGCAAAACTCGTCGACCCCAACAAGGTTTC
GGCGTTTATTCCAGATCCAGCACGCTTTTATGGTTGCCGGGTTCTTGAACTCACCAAGAA
TGG*CAACAGCGAGGATGACGCCATGTCTGTAGCTAATATGGAGTATCTTGCGGAGAGAA
AGGAAAAGAAGAAAGCATACAAGCGCCTAAAGGAGCTTGCTCTTCTGCAAGACAAGGCTC
CGCCTCCTAAACCGTATCTCAGTACCAAAAAGGTGATGCAAACTCAAGAGAAGAAAGCAC
CTGCGGATCCTCCTAGCGTCCGCAGGCTAGTTAACCAGTTGAAACAGCAGAAAGATGTGT
TGCTTCAGGACAAAACTGG*AGGTAGTGCTAATCAGGATCATTGGATAGACGAATAGATT
CTCCATCACCCTTTTCTTTTTATGCAAGTTCAGTCTTTTTATACATGATGACAATTGTTG
TTATTCCCATTTGATTGTTTACAGAATATTTTCGACAAACAAGTGTTACTCCCATTTGAT
TGTAGTTGTAATAACACATATCTTTGGATGT

QA 10 760 10 760
DS 

RD RR2G218TF 464 0 0
TTCTTGAACTCACCAAGAATGGGCAACAGCGAGGATGACGCCATGTCTGTAGCTAATATG
GAGTATCTTGCGGAGAGAAAGGAAAAGAAGAAAGCATACAAGCGCCTAAAGGAGCTTGCT
CTTCTGCAAGACAAGGCTCCGCCTCCTAAACCGTATCTCAGTACCAAAAAGGTGATGCAA
ACTCAAGAGAAGAAAGCACCTGCGGATCCTCCTAGCGTCCGCAGGCTAGTTAACCAGTTG
AAACAGCAGAAAGATGTGTTGCTTCAGGACAAAACTGGGAGGTAGTGCTAATCAG*ATCA
TTGGATAGACGAATAGATTCTCCATCACCCTTTTCTTTTTATGCAAGTTCAGTCTTTTTA
TACATGATGACAATTGTTGTTATTCCCATTTGATTGTTTACAGAATATTT*CGACAA*CA
AGTGTTACTCCCATTTGATTGTAGTTGTAA*AACACATATCTTT

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2H207JQ 687 0 0
GATTTACTTTCCAAAACCAGGAGGCTTGTTGGTGGGCTCGCTACAAGAGAGCCTGTTTGG
CTCAAAGCCATGGAAGCATCACCACCTCCTGTCTTTCCTCGCTCTAATGGGAACCTCAAG
AAGATTGTTCTCCCTGAAGATCCCTACGTTCGTAGATTCGCTCGTAAGCATCCTGAAGCC
AAACTCGTCGACCCCAACAAGGTTTCGGCGTTTATTCCAGATCCAGCACGCTTTTATGGT
TGCCGGGTTCTTGAACTCACCAAGAATGG*CATCAGCGAGGATGACGCCATGTCTGTAGC
TAATATGGAGTATCTTGCGGAGAGAAAGGAAAAGATGAAAGCATACAAACGCCTAAAGGA
TCTTGCTCTTCTGCAAGACAAGGCTCCTCCTCCTAAACCGTATCTTAGTACCAAAAAGGA
GATGCAAACTCAAGAGAAGAAAGCACCTGCGGATCCTCCTAGCGTCCGCAGGCTAGTTAA
CCAGTTGAAACAGCAGAAAGATGTGTTGCTTCAGGACAAACCGGG*AGGTAGTGCTAATC
AGGATCATTGGATAGACGAATAGATTCTCCATCACCCTTTTCTTTTTATGCAAGTTCAGT
CTTTTTATACATGATGACAATTGTTGTTATTCCCATTTGATTGTTTACGGAACATTTTCA
ACAAACAAGTGTTACTCCCATTTGATT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 2 4

CO CL2017Contig1 638 2 1 U
GACTCTCGTAATACACCAGCCTCAAGTATGGAGTCTGATGATGCCGTTGGTCAGAGTGGA
GAGAACAAAAGTCTCGCATCTGGAACAGTTTCTAGTGTTACATCCAAGGGAACAGGGGAA
GAGCAAAATAGTTCCTCGAGCACTACTGGTAAAGGGAAAGTGGCTCCTACTGCAGGGAGG
TTAGCCAAGATTGAAGAGGAAAAGGCGTTGGCTGATAATTCTTCAAATGCATCCGATGGA
ATGGAACCACGTAGATCTGTCCGCAGGATTCAGCCAACTTCTAGACTGCTTGAAGGTCTG
CAATCATCGATGATGACCTCGAAGATTCCTTCCATGTCACAGGGCAGAAGTCACCAAAGT
CGAAGCAAAAAGTAACCGTAGAGGCAAAGTAGGTGATGGAAGGAGCATAAGCTAAGTGCA
CATAAAAACCTAAGAAGAATATATGTGATTGGTGTTTAGTTGAAGCTCCGTTGTTGGTTG
GGGGGGAAGAGATTATATGTTATTGTAGGTGTGTTTTGATGTTTATTTAGTCGGATGTTC
TCTCTCTCACTCGATGCGTCTCAGAGAGATGAGATGAAGAAGTATATTTGTGACATCGTT
GTTACTAAACAACATTTTTATTATTGCCAAGTATCATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BI36JQ C 1
AF RR2BI36TF U 1
BS 1 638 RR2BI36TF

RD RR2BI36JQ 638 0 0
GACTCTCGTAATACACCAGCCTCAAGTATGGAGTCTGATGATGCCGTTGGTCAGAGTGGA
GAGAACAAAAGTCTCGCATCTGGAACAGTTTCTAGTGTTACATCCAAGGGAACAGGGGAA
GAGCAAAATAGTTCCTCGAGCACTACTGGTAAAGGGAAAGTGGCTCCTACTGCAGGGAGG
TTAGCCAAGATTGAAGAGGAAAAGGCGTTGGCTGATAATTCTTCAAATGCATCCGATGGA
ATGGAACCACGTAGATCTGTCCGCAGGATTCAGCCAACTTCTAGACTGCTTGAAGGTCTG
CAATCATCGATGATGACCTCGAAGATTCCTTCCATGTCACAGGGCAGAAGTCACCAAAGT
CGAAGCAAAAAGTAACCGTAGAGGCAAAGTAGGTGATGGAAGGAGCATAAGCTAAGTGCA
CATAAAAACCTAAGAAGAATATATGTGATTGGTGTTTAGTTGAAGCTCCGTTGTTGGTTG
GGGGGGAAGAGATTATATGTTATTGTAGGTGTGTTTTGATGTTTATTTAGTCGGATGTTC
TCTCTCTCACTCGATGCGTCTCAGAGAGATGAGATGAAGAAGTATATTTGTGACATCGTT
GTTACTAAACAACATTTTTATTATTGCCAAGTATCATC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2BI36TF 638 0 0
GACTCTCGTAATACACCAGCCTCAAGTATGGAGTCTGATGATGCCGTTGGTCAGAGTGGA
GAGAACAAAAGTCTCGCATCTGGAACAGTTTCTAGTGTTACATCCAAGGGAACAGGGGAA
GAGCAAAATAGTTCCTCGAGCACTACTGGTAAAGGGAAAGTGGCTCCTACTGCAGGGAGG
TTAGCCAAGATTGAAGAGGAAAAGGCGTTGGCTGATAATTCTTCAAATGCATCCGATGGA
ATGGAACCACGTAGATCTGTCCGCAGGATTCAGCCAACTTCTAGACTGCTTGAAGGTCTG
CAATCATCGATGATGACCTCGAAGATTCCTTCCATGTCACAGGGCAGAAGTCACCAAAGT
CGAAGCAAAAAGTAACCGTAGAGGCAAAGTAGGTGATGGAAGGAGCATAAGCTAAGTGCA
CATAAAAACCTAAGAAGAATATATGTGATTGGTGTTTAGTTGAAGCTCCGTTGTTGGTTG
GGGGGGAAGAGATTATATGTTATTGTAGGTGTGTTTTGATGTTTATTTAGTCGGATGTTC
TCTCTCTCACTCGATGCGTCTCAGAGAGATGAGATGAAGAAGTATATTTGTGACATCGTT
GTTACTAAACAACATTTTTATTATTGCCAAGTATCATC

QA 1 638 1 638
DS 



CO CL2017Contig2 872 2 6 U
GTCAGAGGCGAGCAATCAAACTCGGAAACAGAAGGAACTAGCTAAACCGGTGAAACCAAT
TGTGCCCCAAAATCCAGGACCAGGGAGCTGGAGATTGCCTTCTAAAGCCGTTTCCAGAGA
GAAACAGACAACAACATCGAAGCCCAAGAGTTTCAAACCTGCGCCCAAGACCAAAGAGAA
ACCGGTTGCTGCATCTAGGATAGTTCCCCGCAAGGACTCTCGCAATACACCAGCCTCAAG
TATGGAATCTGATGATGCCGTTGGTCAGAGTGGAGAGAACAAAAGTACCGCATCTGGAAC
AGTTTCTAGTGTTACATCTAAGGGAACAGGGGAAGAGCAAAATAGTTCCTCGAGCACTAC
TGGTAAAGGGAAAGTGGCTCCTACTGCAGGGAGGTTAGCCAAGATTGAAGAGGATAAGGC
GATGGCTGATAATTCTTCAAATGCATCGGATGGAATGGAACCACGTAGATCTGTCCGCAG
GATTCAGCCAACTTCTAGACTGCTTGAATGTCTGCAATCATCGATGATGACCTCGAAGAT
TCCTTCCATGTCACAGGGCAGAAGTCACCAAAGTCGAAGCAAAAAGCAACCGTAGAGGCA
AAGTAGGTGATGGAAGGAGCATAAGCTAAGTGCACATAAAAACCTAAGAAGAAGAATATA
TGTTATTGGTGTTTGGTTGAAGCTCCGTTGTTGGCTGGGGGGAGGAGATTATATGTTATT
GTAGGTGTGTTTTAATGTTTATTTAGTCGGTTGTTTTCTCTCTCTCACTCGATGTGTCTC
AGAGAGATGAGATGAAGAAGTATATTCGTGACATCGTTGTTACTAAACAACATTTTATTA
TTGCCAAGTATCATCATCATCTTCCCTGACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP10TF U 1
AF RR2CP10JQ C 163
BS 1 641 RR2CP10TF
BS 642 642 RR2CP10JQ
BS 643 655 RR2CP10TF
BS 656 656 RR2CP10JQ
BS 657 689 RR2CP10TF
BS 690 872 RR2CP10JQ

RD RR2CP10TF 689 0 0
GTCAGAGGCGAGCAATCAAACTCGGAAACAGAAGGAACTAGCTAAACCGGTGAAACCAAT
TGTGCCCCAAAATCCAGGACCAGGGAGCTGGAGATTGCCTTCTAAAGCCGTTTCCAGAGA
GAAACAGACAACAACATCGAAGCCCAAGAGTTTCAAACCTGCGCCCAAGACCAAAGAGAA
ACCGGTTGCTGCATCTAGGATAGTTCCCCGCAAGGACTCTCGCAATACACCAGCCTCAAG
TATGGAATCTGATGATGCCGTTGGTCAGAGTGGAGAGAACAAAAGTACCGCATCTGGAAC
AGTTTCTAGTGTTACATCTAAGGGAACAGGGGAAGAGCAAAATAGTTCCTCGAGCACTAC
TGGTAAAGGGAAAGTGGCTCCTACTGCAGGGAGGTTAGCCAAGATTGAAGAGGATAAGGC
GATGGCTGATAATTCTTCAAATGCATCGGATGGAATGGAACCACGTAGATCTGTCCGCAG
GATTCAGCCAACTTCTAGACTGCTTGAATGTCTGCAATCATCGATGATGACCTCGAAGAT
TCCTTCCATGTCACAGGGCAGAAGTCACCAAAGTCGAAGCAAAAAGCAACCGTAGAGGCA
AAGTAGGTGATGGAAGGAGCATAAGCTAAGTGCACATAAAA*CCTAAGAAGAAGA*TATA
TGTTATTGGTGTTTGGTTGAAGCTCCGTT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2CP10JQ 710 0 0
GCCCAAGACCAAAGAGAAACCGGTTGCTGCATCTAGGATAGTTCCCCGCAAGGACTCTCG
CAATACACCAGCCTCAAGTATGGAATCTGATGATGCCGTTGGTCAGAGTGGAGAGAACAA
AAGTACCGCATCTGGAACAGTTTCTAGTGTTACATCTAAGGGAACAGGGGAAGAGCAAAA
TAGTTCCTCGAGCACTACTGGTAAAGGGAAAGTGGCTCCTACTGCAGGGAGGTTAGCCAA
GATTGAAGAGGATAAGGCGATGGCTGATAATTCTTCAAATGCATCGGATGGAATGGAACC
ACGTAGATCTGTCCGCAGGATTCAGCCAACTTCTAGACTGCTTGAATGTCTGCAATCATC
GATGATGACCTCGAAGATTCCTTCCATGTCACAGGGCAGAAGTCACCAAAGTCGAAGCAA
AAAGCAACCGTAGAGGCAAAGTAGGTGATGGAAGGAGCATAAGCTAAGTGCACATAAAAA
CCTAAGAAGAAGAATATATGTTATTGGTGTTTGGTTGAAGCTCCGTTGTTGGCTGGGGGG
AGGAGATTATATGTTATTGTAGGTGTGTTTTAATGTTTATTTAGTCGGTTGTTTTCTCTC
TCTCACTCGATGTGTCTCAGAGAGATGAGATGAAGAAGTATATTCGTGACATCGTTGTTA
CTAAACAACATTTTATTATTGCCAAGTATCATCATCATCTTCCCTGACTC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 4

CO CL2018Contig1 731 4 13 U
GGGCAGAACCAAAAAGAAAAGAAATCTAGACTTTGTAAAATTGCAAGCAAATATACTCTG
GAAACCTCGAGAGTCCGAGACCGAGCCAGATTCAGCTGTAGATCAAATGGCTGGGGTTAT
GCAGAAGTTCCTAGTTGCATCAATGTTCATGTGGATGCTTCCTATTGCCATCTTATACGG
CTTCAACCATGATTTGCTCCCTGGTTCGACAACATTGTCCCCACACTCTCTTACACTTCT
AAGTGGATTTCTTGCGGTGGTATCAGTCAATGTAGTGATTGTGTTCTACATCTGTCTGGC
CCTGAAAGAACCTGTGGATAAACACAAGCCAGACGCTTCGTTTGTCGCAGAGGCCAAAGA
TAGCGTGAAGAAACTGACATCAGGATCAGGAGTCCCAAGCACTGACCCGGCACTTAAGAA
ACAAGAGTAAGAGGTTACCACATCCCATTTTCCTTAAAACAAGGAACTGCGCTGATGTTG
CATCTGATGGCAAGCATATTTCTGGTTCTTGAAATGTATTTTTTATAATTTGTAGAAATT
CTTGGCTGGTAGATTATCCTCTGTTGTGACAGTTGATTGTTTTGGGG*TTTGGTTTAAGC
AACAGAAACTGCAATGTTCATGTTGAACGGATACGATAGCTAATGTTTTAGGGACAAAAC
TGTGTTTCCAGTTGGTGTTCCTTCATTGCAAGGATGCCAAGTGAATTTTACGGTTACAAT
TGTTTACTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EK12TF U 19
AF RR2EK12JQ C 19
AF RR2DB54JQ C 1
AF RR2DB54TF U 47
BS 1 20 RR2DB54JQ
BS 21 46 RR2EK12TF
BS 47 96 RR2DB54TF
BS 97 101 RR2EK12TF
BS 102 587 RR2DB54TF
BS 588 588 RR2EK12TF
BS 589 673 RR2DB54TF
BS 674 674 RR2DB54JQ
BS 675 708 RR2DB54TF
BS 709 709 RR2DB54JQ
BS 710 712 RR2DB54TF
BS 713 713 RR2DB54JQ
BS 714 731 RR2DB54TF

RD RR2EK12TF 636 0 0
GG
GAAATCTAGACTTTGTAAAATTGCAAGCAAATATACTCTGGAAACCTCGAGAGTCCGAGA
CCGGGCCAGATTCAGCTGTAGATCAAATGGCTGGGGTTATGCAGAAGTTCGTTGTTGCAT
CAATGTTCATGTGGATGCTTCCTATTGCCATCTTATACGGCTTCAACCATGATTTGCTCC
CTGGTTCGACAACATTGTCCCCACACTCTCTTACACTTCTAAGTGGATTTCTTGCGGTGG
TATCAGTCAATGTAGTGATTGTGTTCTACATCTGTCTGGCCCTGAAAGAACCTGTGGATA
AACACAAGCCAGACGCTTCGTTTGTCGCAGAGGCCAAAGATAGCGTGAAGAAACTGACAT
CAGGATCAGGAGTCCCAAGCACTGACCCGGCACTTAAGAAACAAGAGTAAGAGGTTACCA
CATCCCATTTTCCTTAAAACAAGGAACTGCGCTGATGTTGCATCTGATGGCAAGCATATT
TCTGGTTCTTGAAATGTATTTTTTATAATTTGTAGAAATTCTTGGCTGGTAGATTATCCT
CTGTTGTGACAGTTGATTGTTTTGGGG*TTTGGTTTAAGCAACAGAAACTGCAATGTTCA
TGTTGAACGGATACGATAGCTAATGTTTTAGGGA

QA 3 636 3 636
DS 

RD RR2EK12JQ 699 0 0
GG
GAAATCTAGACTTTGTAAAATTGCAAGCAAATATACTCTGGAAACCTCGAGAGTCCGAGA
CCGGGCCAGATTCAGCTGTAGATCAAATGGCTGGGGTTATGCAGAAGTTCGTTGTTGCAT
CAATGTTCATGTGGATGCTTCCTATTGCCATCTTATACGGCTTCAACCATGATTTGCTCC
CTGGTTCGACAACATTGTCCCCACACTCTCTTACACTTCTAAGTGGATTTCTTGCGGTGG
TATCAGTCAATGTAGTGATTGTGTTCTACATCTGTCTGGCCCTGAAAGAACCTGTGGATA
AACACAAGCCAGACGCTTCGTTTGTCGCAGAGGCCAAAGATAGCGTGAAGAAACTGACAT
CAGGATCAGGAGTCCCAAGCACTGACCCGGCACTTAAGAAACAAGAGTAAGAGGTTACCA
CATCCCATTTTCCTTAAAACAAGGAACTGCGCTGATGTTGCATCTGATGGCAAGCATATT
TCTGGTTCTTGAAATGTATTTTTTATAATTTGTAGAAATTCTTGGCTGGTAGATTATCCT
CTGTTGTGACAGTTGATTGTTTTGGGG*TTTGGTTTAAGCAACAGAAACTGCAATGTTCA
TGTTGAACGGATACGATAGCTAATGTTTTAGGGACAAAACTGTGTTTCCAGTTGGTGTTC
CTTCATTGCAAGGATGCCAAGTGAATTT
TACGGTCAC

QA 3 690 3 690
DS 

RD RR2DB54JQ 731 0 0
GGGCAGAACCAAAAAGAAAAGAAATCTAGACTTTGTAAAATTGCAAGCAAATATACTCTG
GAAACCTCGAGAGTCCGAGACCGAGCCAGATTCAGC*****ATCAAATGGCTGGGGTTAT
GCAGAAGTTCCTAGTTGCATCAATGTTCATGTGGATGCTTCCTATTGCCATCTTATACGG
CTTCAACCATGATTTGCTCCCTGGTTCGACAACATTGTCCCCACACTTTTTTACACTTTT
AAGTGGATTTCTTGCGGTGGTATCAGTCAATGTAGTGATTGTGTTCTACATCTGTCTGGC
CCTGAAAGAACCTGTGGATAAACACAAGCCAGACGCTTCGTTTGTCGCAGAGGCCAAAGA
TAGCGTGAAGAAACTGACATCAGGATCAGGAGTCCCAAGCACTGACCCGGCACTTAAGAA
ACAAGAGTAAGAGGTTACCACATCCCATTTTCCTTAAAACAAGGAACTGCGCTGATGTTG
CATCTGATGGCAAGCATATTTCTGGTTCTTGAAATGTATTTTTTATAATTTGTAGAAATT
CTTGGCTGGTAGATTATCCTCTGTTGTGACAGTTGATTGTTTTGGGG*TTTGGTTTAAGC
AACAGAAACTGCAATGTTCATGTTGAACGGATACGATAGCTAATGTTTTAGGGACAAAAC
TGTGTTTCCAGTTGGTGTTCCTTCATTGCAAGGATGCCAAGTGAATTTTACGGTTACAAT
TGTTTACTTGT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2DB54TF 685 0 0
GCAAATATACTCTGGAAACCTCGAGAGTCCGAGACCGAGCCAGATTCAGC*****ATCAA
ATGGCTGGGGTTATGCAGAAGTTCCTAGTTGCATCAATGTTCATGTGGATGCTTCCTATT
GCCATCTTATACGGCTTCAACCATGATTTGCTCCCTGGTTCGACAACATTGTCCCCACAC
TCTCTTACACTTCTAAGTGGATTTCTTGCGGTGGTATCAGTCAATGTAGTGATTGTGTTC
TACATCTGTCTGGCCCTGAAAGAACCTGTGGATAAACACAAGCCAGACGCTTCGTTTGTC
GCAGAGGCCAAAGATAGCGTGAAGAAACTGACATCAGGATCAGGAGTCCCAAGCACTGAC
CCGGCACTTAAGAAACAAGAGTAAGAGGTTACCACATCCCATTTTCCTTAAAACAAGGAA
CTGCGCTGATGTTGCATCTGATGGCAAGCATATTTCTGGTTCTTGAAATGTATTTTTTAT
AATTTGTAGAAATTCTTGGCTGGTAGATTATCCTCTGTTGTGACAGTTGATTGTTTTGGG
GGTTTGGTTTAAGCAACAGAAACTGCAATGTTCATGTTGAACGGATACGATAGCTAATGT
TTTAGGGACAAAACTGTGTTTCCAGTTTGTGTTCCTTCATTGCAAGGATGCCAAGTGAAT
TT*ACG*TTACAATTGTTTACTTGT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 2 4

CO CL2019Contig1 581 2 2 U
GTACATCAATAATACGCAGACTTTACATTCATATCAAAATATAAAAAGCAAATGGCCAAC
AAATGGTTTGAGAGATGCATAAATCAAATCACATGAGAATGAAGACAGAGGAAAATAAAG
AAACAATGAAATCAGTAGAATTTGAGAGCTACGAGGCTGGCGACAAGGAAGAGAAGGGAT
GGTGAGAGAGCGTAGGAGGAGGAAGGCGTAACAGAAGGACGACTGGTGCTTCCTCCGTCA
TCAGATGTAGGAGCAGCACCGTTCACAGTTGGTGTAAAAGGTCTAGTTGTATCAGACTGT
GGTGTCTGAGCTGCTGGAGTCGGCTCTGGAACAATTGGAGTTGTTGCTGGACTTGGAGAC
ATGGCCGGTCCAAATGTACCAGCAGGTCCAGGAGCAGCAGCTGGAGAAATATTGGCGTTG
CATTGAAGAGGAACACTAGGCATGTTACAAGCACGTGGAAGAGAGACGGCGGTTGTACGG
TTAATCGGAATGTTAAAAGGAACACTTCCGGTGACAATAAGACAGAGACATCCCATTCCT
CCCGTAGTCAAAGACCTCAACGAGTTACAACAATCAGAGGC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2DK38TF C 1
AF RR2DK38JQ U 3
BS 1 2 RR2DK38TF
BS 3 581 RR2DK38JQ

RD RR2DK38TF 581 0 0
GTACATCAATAATACGCAGACTTTACATTCATATCAAAATATAAAAAGCAAATGGCCAAC
AAATGGTTTGAGAGATGCATAAATCAAATCACATGAGAATGAAGACAGAGGAAAATAAAG
AAACAATGAAATCAGTAGAATTTGAGAGCTACGAGGCTGGCGACAAGGAAGAGAAGGGAT
GGTGAGAGAGCGTAGGAGGAGGAAGGCGTAACAGAAGGACGACTGGTGCTTCCTCCGTCA
TCAGATGTAGGAGCAGCACCGTTCACAGTTGGTGTAAAAGGTCTAGTTGTATCAGACTGT
GGTGTCTGAGCTGCTGGAGTCGGCTCTGGAACAATTGGAGTTGTTGCTGGACTTGGAGAC
ATGGCCGGTCCAAATGTACCAGCAGGTCCAGGAGCAGCAGCTGGAGAAATATTGGCGTTG
CATTGAAGAGGAACACTAGGCATGTTACAAGCACGTGGAAGAGAGACGGCGGTTGTACGG
TTAATCGGAATGTTAAAAGGAACACTTCCGGTGACAATAAGACAGAGACATCCCATTCCT
CCCGTAGTCAAAGACCTCAACGAGTTACAACAATCAGAGG
C

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2DK38JQ 579 0 0
ACATCAATAATACGCAGACTTTACATTCATATCAAAATATAAAAAGCAAATGGCCAACAA
ATGGTTTGAGAGATGCATAAATCAAATCACATGAGAATGAAGACAGAGGAAAATAAAGAA
ACAATGAAATCAGTAGAATTTGAGAGCTACGAGGCTGGCGACAAGGAAGAGAAGGGATGG
TGAGAGAGCGTAGGAGGAGGAAGGCGTAACAGAAGGACGACTGGTGCTTCCTCCGTCATC
AGATGTAGGAGCAGCACCGTTCACAGTTGGTGTAAAAGGTCTAGTTGTATCAGACTGTGG
TGTCTGAGCTGCTGGAGTCGGCTCTGGAACAATTGGAGTTGTTGCTGGACTTGGAGACAT
GGCCGGTCCAAATGTACCAGCAGGTCCAGGAGCAGCAGCTGGAGAAATATTGGCGTTGCA
TTGAAGAGGAACACTAGGCATGTTACAAGCACGTGGAAGAGAGACGGCGGTTGTACGGTT
AATCGGAATGTTAAAAGGAACACTTCCGGTGACAATAAGACAGAGACATCCCATTCCTCC
CGTAGTCAAAGACCTCAACGAGTTACAACAATCAGAGGC

QA 1 579 1 579
DS 



CO CL2019Contig2 740 2 3 U
TTGAGAGATGCATAAATCAAATCACATGAGATGAAGACAGAGGAAAATAAAGAAACAATG
AAATCAGTAGAATTTGAGAGCTACAAGGCTGGCGACAAGGAAGAGAAGAGATGGTGAGAG
AGCGTAGGAGGAGGAAGGAGTAACAGAAGGTCGACTGGCGCTTCCTCCGTTGTCAGCCGC
AGGAGCAGCACCGTTCACGGTTGGTGTAAAAGGTCTAGTTGTTTCAGACTGTGGTGTCTG
AGCTGCTGGAGTCGGCTCTGGAACAATTGGAGTTGTTGCTGGACTTGGAGACATGGCCGG
TCCAAATATACCAGCAGGTCCAGGAGCAGCAGCTGGAGAAATATTGGCGTTGCATTGAAG
AGGAACACTAGGCATGTTACAAGCACGTGGAAGAGAGACGGCGGTTGTAAGGTTAATCGG
AATGTTAAAAGGAACACTTCCGGTGACAATAAGACAGAGACATCCCATTCCTCCCGTAGT
CAAAGACCTCAACGAGTTACAACAATCAGAGGAAGGTGAAGTTCCGTTGGTACTGCTGTT
GGTTAAGATGCTCATACAAGGACCCACGGTGGTCATCATAGACGGTGTACATTGGCTAAG
CGGCGGTTGCTGGCTGCGAACCGGCAAAGCTAGCACTGCGATTAAGGCCACGACAACAAA
GGCTATCACTGGGATCTTCAACATTGTTGATCGAATTAAGCTTTTTTTTCTTTTTTTTTT
GAGGTTTGTGATTGAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR29JQ U 167
AF RR2GR29TF C 1
BS 1 180 RR2GR29TF
BS 181 505 RR2GR29JQ
BS 506 740 RR2GR29TF

RD RR2GR29JQ 339 0 0
CCGTTGTCAGCCGC
AGGAGCAGCACCGTTCACGGTTGGTGTAAAAGGTCTAGTTGTTTCAGACTGTGGTGTCTG
AGCTGCTGGAGTCGGCTCTGGAACAATTGGAGTTGTTGCTGGACTTGGAGACATGGCCGG
TCCAAATATACCAGCAGGTCCAGGAGCAGCAGCTGGAGAAATATTGGCGTTGCATTGAAG
AGGAACACTAGGCATGTTACAAGCACGTGGAAGAGAGACGGCGGTTGTAAGGTTAATCGG
AATGTTAAAAGGAACACTTCCGGTGACAATAAGACAGAGACATCCCATTCCTCCCGTAGT
CAAAGACCTCAACGAGTTACAACAA

QA 15 339 15 339
DS 

RD RR2GR29TF 740 0 0
TTGAGAGATGCATAAATCAAATCACATGAGATGAAGACAGAGGAAAATAAAGAAACAATG
AAATCAGTAGAATTTGAGAGCTACAAGGCTGGCGACAAGGAAGAGAAGAGATGGTGAGAG
AGCGTAGGAGGAGGAAGGAGTAACAGAAGGTCGACTGGCGCTTCCTCCGTTGTCAGCCGC
AGGAGCAGCACCGTTCACGGTTGGTGTAAAAGGTCTAGTTGTTTCAGACTGTGGTGTCTG
AGCTGCTGGAGTCGGCTCTGGAACAATTGGAGTTGTTGCTGGACTTGGAGACATGGCCGG
TCCAAATATACCAGCAGGTCCAGGAGCAGCAGCTGGAGAAATATTGGCGTTGCATTGAAG
AGGAACACTAGGCATGTTACAAGCACGTGGAAGAGAGACGGCGGTTGTAAGGTTAATCGG
AATGTTAAAAGGAACACTTCCGGTGACAATAAGACAGAGACATCCCATTCCTCCCGTAGT
CAAAGACCTCAACGAGTTACAACAATCAGAGGAAGGTGAAGTTCCGTTGGTACTGCTGTT
GGTTAAGATGCTCATACAAGGACCCACGGTGGTCATCATAGACGGTGTACATTGGCTAAG
CGGCGGTTGCTGGCTGCGAACCGGCAAAGCTAGCACTGCGATTAAGGCCACGACAACAAA
GGCTATCACTGGGATCTTCAACATTGTTGATCGAATTAAGCTTTTTTTTCTTTTTTTTTT
GAGGTTTGTGATTGAAGTCC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 4

CO CL2020Contig1 679 4 24 U
TTTTTTGTTAAATACGAAGACTTTTCAATATAAGAAGGAAGCTTCCAATCTCAACGAGAT
GACATAGATTCGAAACATATCAATCGCAGTACTTACAAAACGTGAAATTGCAAACGAAAA
CGAAATCCATAATGAAAACAAGAAAGGAACCCTAAAACTCGTAATCTAGGAGCTGGTAAA
CTTCGTGACAGCCTTAGTACCCTCAGACACAGCGTGTTTCGCCAACTCTCCAGGAAGCAC
AAGCCTCACCGCGGTCTGAATCTCCCTCGAAGTGATGGTGGGCTTCTTGTTGTACCTCGC
GAGCTTGGACGCCTCTCCGGCGAGCTTCTCGAAGATATCGTTGATGAAACTGTTCATGAT
CCCCATGGCCTTGCTTGAGATTCCGATGTCCGGGTGAACCTGCTTCAGGACCTTGAAGAT
GTAGATCTTGTACGTCTCGACGCTCTTCTTCTTCATCTTCCTCTTCTTGTCGCCTCCCGC
GCCTGCCTCCTTGGGGAGCTTCTTCCCGGCCTTCGGTTTCTTCTCCGCCGGAGCTTTCTC
GGCGGCTTTCGATTTCTCCTCCGCCGGTTTCTTCTATACGGGCTTCTTCTCTGCCTTGGG
CGCCATTGATGAGGAGGAAGTTGCGAATCTGAGATCGATTTAGGTTTAAAGGATGTTTTT
TGTGGTTTTGCTTGATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF75JQ U 11
AF RR2DK67JQ U 10
AF RR2DK67TF C 1
AF RR2AF75TF C 11
BS 1 10 RR2DK67TF
BS 11 18 RR2AF75JQ
BS 19 19 RR2DK67JQ
BS 20 33 RR2AF75JQ
BS 34 34 RR2DK67JQ
BS 35 66 RR2AF75JQ
BS 67 67 RR2DK67JQ
BS 68 141 RR2AF75JQ
BS 142 142 RR2DK67JQ
BS 143 205 RR2AF75JQ
BS 206 206 RR2DK67JQ
BS 207 278 RR2AF75JQ
BS 279 279 RR2DK67JQ
BS 280 333 RR2AF75JQ
BS 334 334 RR2DK67JQ
BS 335 378 RR2AF75JQ
BS 379 379 RR2DK67JQ
BS 380 417 RR2AF75JQ
BS 418 418 RR2DK67JQ
BS 419 423 RR2AF75JQ
BS 424 424 RR2DK67JQ
BS 425 629 RR2AF75JQ
BS 630 641 RR2DK67JQ
BS 642 679 RR2DK67TF

RD RR2AF75JQ 619 0 0
AATACGAAAACTTTTCAATATAAAAAGGAAGCTTCCAATCTCAACGAGATGACATAAATT
CGAAACATATCAATCGCAGTACTTACAAAACGTGAAATTGCAAACGAAAACGAAATCCAT
AATGAAAACAAAAAAGGAACCCTAAAACTCGTAATCTAGGAGCTGGTAAACTTCGTGACA
GCCTTAGTACCCTCAAACACAGCGTGTTTCGCCAACTCTCCAGGAAGCACAAGCCTCACC
GCGGTCTGAATCTCCCTCGAAGTGATGGGGGGCTTCTTGTTGTACCTCGCGAGCTTGGAC
GCCTCTCCGGCGAGCTTCTCGAAAATATCGTTGATGAAACTGTTCATGATCCCCATGGCC
TTGCTTGAAATTCCGATGTCCGGGTGAACCTGCTTCAGGACCTTGAAAATGTAAATCTTG
TACGTCTCGACGCTCTTCTTCTTCATCTTCCTCTTCTTGTCGCCTCCCGCGCCTGCCTCC
TTGGGGAGCTTCTTCCCGGCCTTCGGTTTCTTCTCCGCCGGAGCTTTCTCGGCGGCTTTC
GATTTCTCCTCCGCCGGTTTCTTCTATACGGGCTTCTTCTCTGCCTTGGGCGCCATTGAT
GAGGAGGAAGTTGCGAATC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2DK67JQ 632 0 0
A
AATACGAAGACTTTTCAATATAAGAAGGAAGCTTCCAATCTCAACGAGATGACATAGATT
CGAAACATATCAATCGCAGTACTTACAAAACGTGAAATTGCAAACGAAAACGAAATCCAT
AATGAAAACAAGAAAGGAACCCTAAAACTCGTAATCTAGGAGCTGGTAAACTTCGTGACA
GCCTTAGTACCCTCAGACACAGCGTGTTTCGCCAACTCTCCAGGAAGCACAAGCCTCACC
GCGGTCTGAATCTCCCTCGAAGTGATGGTGGGCTTCTTGTTGTACCTCGCGAGCTTGGAC
GCCTCTCCGGCGAGCTTCTCGAAGATATCGTTGATGAAACTGTTCATGATCCCCATGGCC
TTGCTTGAGATTCCGATGTCCGGGTGAACCTGCTTCAGGACCTTGAAGATGTAGATCTTG
TACGTCTCGACGCTCTTCTTCTTCATCTTCCTCTTCTTGTCGCCTCCCGCGTCTGCCTCC
TTGGGGAGCTTCTTCCCGGCCTTCGGTTTCTTCTCCGCCGGAGCTTTCTCGGCGGCTTTC
GATTTCTCCTCCGCCGGTTTCTTCTCTGCGGGCTTCTTCTCTGCCTTGGGCGCCATTGAT
GAGGAGGAAGTTGCGAATCTGAGATCGATTT

QA 2 632 2 632
DS 

RD RR2DK67TF 679 0 0
TTTTTTGTTAAATACGAAGACTTTTCAATATAAGAAGGAAGCTTCCAATCTCAACGAGAT
GACATAGATTCGAAACATATCAATCGCAGTACTTACAAAACGTGAAATTGCAAACGAAAA
CGAAATCCATAATGAAAACAAGAAAGGAACCCTAAAACTCGTAATCTAGGAGCTGGTAAA
CTTCGTGACAGCCTTAGTACCCTCAGACACAGCGTGTTTCGCCAACTCTCCAGGAAGCAC
AAGCCTCACCGCGGTCTGAATCTCCCTCGAAGTGATGGTGGGCTTCTTGTTGTACCTCGC
GAGCTTGGACGCCTCTCCGGCGAGCTTCTCGAAGATATCGTTGATGAAACTGTTCATGAT
CCCCATGGCCTTGCTTGAGATTCCGATGTCCGGGTGAACCTGCTTCAGGACCTTGAAGAT
GTAGATCTTGTACGTCTCGACGCTCTTCTTCTTCATCTTCCTCTTCTTGTCGCCTCCCGC
GTCTGCCTCCTTGGGGAGCTTCTTCCCGGCCTTCGGTTTCTTCTCCGCCGGAGCTTTCTC
GGCGGCTTTCGATTTCTCCTCCGCCGGTTTCTTCTCTGCGGGCTTCTTCTCTGCCTTGGG
CGCCATTGATGAGGAGGAAGTTGCGAATCTGAGATCGATTTAGGTTTAAAGGATGTTTTT
TGTGGTTTTGCTTGATCCC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2AF75TF 665 0 0
AATACGAAGACTTTTCAATATAAGAAGGAAGCTTCCAATCTCAACGAGATGACATAGATT
CGAAACATATCAATCGCAGTACTTACAAAACGTGAAATTGCAAACGAAAACGAAATCCAT
AATGAAAACAAGAAAGGAACCCTAAAACTCGTAATCTAGGAGCTGGTAAACTTCGTGACA
GCCTTAGTACCCTCAGACACAGCGTGTTTCGCCAACTCTCCAGGAAGCACAAGCCTCACC
GCGGTCTGAATCTCCCTCGAAGTGATGGTGGGCTTCTTGTTGTACCTCGCGAGCTTGGAC
GCCTCTCCGGCGAGCTTCTCGAAGATATCGTTGATGAAACTGTTCATGATCCCCATGGCC
TTGCTTGAGATTCCGATGTCCGGGTGAACCTGCTTCAGGACCTTGAAGATGTAGATCTTG
TACGTCTCGACGCTCTTCTTCTTCATCTTCCTCTTCTTGTCGCCTCCCGCGCCTGCCTCC
TTGGGGAGCTTCTTCCCGGCCTTCGGTTTCTTCTCCGCCGGAGCTTTCTCGGCGGCTTTC
GATTTCTCCTCCGCCGGTTTCTTCTATACGGGCTTCTTCTCTGCCTTGGGCGCCATTGAT
GAGGAGGAAGTTGCGAATCTGAGATCGATTTAGGTTTAAAGGATGTTTTTTGTGGTTTTG
CTT
CC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 3

CO CL2021Contig1 994 3 26 U
GGTCCAATTTTGACATCTAAAGGGTAGCTTTAGAAAATAGTACAAAAACGTCTAAAGGCT
TATGCCTCATCTGATTGTGTATATAATAACACTCGAACACTCGAAAGGATAAAACATTTT
CCCAATATCTTGAAGTATACTTATGCCTCATCTGGTTGTGTGTATAACATAACAAAGATC
TCGGACAGGTTACATCGAAAACGAAATGGAACTCTTAGGCAAAGCTTCAAAAGTTTTTAC
CAAGTTCAATCTTTTTCATCAGTGTCATCGTCTGGTGGAGAATAGAATCCAAGATTCCAG
CAACCGTGAAGACACCACCGATAATGGCGCATACATTGGTAATGAAGTGTGAGAAGGATC
TGGAGTTTTCGGTTATGAAAACCTGCATAGGTGAGAGCTCGAAGTGAAACTTGGCGACTG
GTAAATAGTAAGTATGAACAACGCTGCTATGTGCTGTGTACTCATACTCCTCTACCATTG
CATGTCCATTGCTTTGCAATACCTCTGTCTTTACTATTTGTAGATAATGCTCGATGGTAA
CATTAGGGCCGAAATCACGTTGGTTTATGAAGGGGCGGCCGTTCAAACGGTCGTGGCTAT
GACCGAGATAAGGTGACAAGCGCTTTAAGTCAGTGAATGTCTGAGGCAAAGTCTTCCGCC
CAAATGAAAGATGGTTAACAACATGGGACATATTCATCTGAGAAGAATCAAATGAATGTG
ATCCCGAGCGTGCTGAAACCATTAGGTTGCCTGGAACCTTCTTTACACGTATGTATCCTT
CAATTCGGCATCCTCCTGTAGAAGGTGCCTTTTTTAAAGTTTTCGATGCATTGCCTGATT
TGTCCTCTAATGCAAGTTTATGGGGATCTACATGGATTGGTTCTACCAGACCTATCACCA
TCTTCACTAAGGTTCCGTATCACGATCTCCATAGTACGATTCATGATCATGGTGTGCCTT
GTCATCCCTAAGATCACTGCCTTGGCGGAAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A966JQ U 287
AF RR2E742JQ U 1
AF RR2A966TF C 256
BS 1 295 RR2E742JQ
BS 296 296 RR2A966JQ
BS 297 298 RR2E742JQ
BS 299 299 RR2A966JQ
BS 300 361 RR2E742JQ
BS 362 362 RR2A966JQ
BS 363 475 RR2E742JQ
BS 476 476 RR2A966JQ
BS 477 477 RR2E742JQ
BS 478 478 RR2A966JQ
BS 479 495 RR2E742JQ
BS 496 496 RR2A966JQ
BS 497 574 RR2E742JQ
BS 575 575 RR2A966JQ
BS 576 604 RR2E742JQ
BS 605 605 RR2A966JQ
BS 606 625 RR2E742JQ
BS 626 626 RR2A966JQ
BS 627 650 RR2E742JQ
BS 651 651 RR2A966JQ
BS 652 673 RR2E742JQ
BS 674 674 RR2A966JQ
BS 675 745 RR2E742JQ
BS 746 746 RR2A966TF
BS 747 775 RR2E742JQ
BS 776 994 RR2A966TF

RD RR2A966JQ 408 0 0
ATCCAAGATTCCAGCAACCGTGAAGACACCACCGATAATGGCGCATACATTGGTAATGAA
GTGTGAAAAGGATCTGGAGTTTTCGGTTATGAAAACCTGCATAGGTGAAAGCTCGAAGTG
AAACTTGGCGACTGGTAAATAGTAAGTATGAACAACGCTGCTATGTGCTGTGTACTCATA
CTCCTCTACCATTGCATGTCCATTGCTTTGCAATACCTCTGTCTTTACTATTTGTAAATA
ATGCTCGATGGTAACATTAGGGCCGAAATCACGTTGGTTTATGAAGGGGCGGCCGTTCAA
ACGGTCGTGGCTATGACCGAAATAAGGTGACAAGCGCTTTAAGTCAGTGAATGTCTGAGG
CAAAGTCTTCCGCCCAAATGAAAGATGGTTAACAACATGGGACATATT

QA 1 408 1 408
DS 

RD RR2E742JQ 775 0 0
GGTCCAATTTTGACATCTAAAGGGTAGCTTTAGAAAATAGTACAAAAACGTCTAAAGGCT
TATGCCTCATCTGATTGTGTATATAATAACACTCGAACACTCGAAAGGATAAAACATTTT
CCCAATATCTTGAAGTATACTTATGCCTCATCTGGTTGTGTGTATAACATAACAAAGATC
TCGGACAGGTTACATCGAAAACGAAATGGAACTCTTAGGCAAAGCTTCAAAAGTTTTTAC
CAAGTTCAATCTTTTTCATCAGTGTCATCGTCTGGTGGAGAATAGAATCCAAGATCCCGG
CAACCGTGAAGACACCACCGATAATGGCGCATACATTGGTAATGAAGTGTGAGAAGGATC
TTGAGTTTTCGGTTATGAAAACCTGCATAGGTGAGAGCTCGAAGTGAAACTTGGCGACTG
GTAAATAGTAAGTATGAACAACGCTGCTATGTGCTGTGTACTCATACTCCTCTACTACTG
CATGTCCATTGCTTTTCAATACCTCTGTCTTTACTATTTGTAGATAATGCTCGATGGTAA
CATTAGGGCCGAAATCACGTTGGTTTATGAAGGGTCGGCCGTTCAAACGGTCGTGGCTAT
GACCAAGATAAGGTGACAAGCGCTTCAAGTCAGTGAATGTCTGAGGCAAAATCTTCCGCC
CAAATGAAAGATGATTAACAACATGGGACATATTCATCTGAGAAGAATCAAATGAATGTG
ATCCCGAGCGTGCTGAAACCATTAG*TTGCCTGGAACCTTCTTTACACGTATGTA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2A966TF 739 0 0
TCATCAGTGTCATCGTCTGGTGGAGGATAGAATCCAAGATTCCAGCAACCGTGAAGACAC
CACCGATAATGGCGCATACATTGGTAATGAAGTGTGAGAAGGATCTGGAGTTTTCGGTTA
TGAGAACCTGCATAGGTGAGAGCTCGAAGTGAAACTTGGCGACTGGTAAATAGTAAGTAT
GAGCAACGCTGCTATGTGCTGTGTACTCATACTCCTCTACCATTGCATGTCCATTGCTTT
GCAATACCTCTGTCTTTACTATTTGTAGATAATGCTCGATGGTAACATTAGGGCCGAGAT
CACGTTGGTTTATGAAGGGGCGGCCGTTCAAACGGTCGTGGCTATGACCGAGATAAGGTG
ACAAGCGCTTTAAGTCAGTGAATGTCTGAGGCAAAGTCTTCCGCCCAAATGAAAGATGGT
TAACAACATGGGACATATTCATCTGAGAAGAATCAAATGAATGTGATCCCGAGCGTGCTG
AAACCATTAGGTTGCCTGGAACCTTCTTTACACGTATGTATCCTTCAATTCGGCATCCTC
CTGTAGAAGGTGCCTTTTTTAAAGTTTTCGATGCATTGCCTGATTTGTCCTCTAATGCAA
GTTTATGGGGATCTACATGGATTGGTTCTACCAGACCTATCACCATCTTCACTAAGGTTC
CGTATCACGATCTCCATAGTACGATTCATGATCATGGTGTGCCTTGTCATCCCTAAGATC
ACTGCCTTGGCGGAAAATC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 4

CO CL2022Contig1 1286 4 5 U
TACCTACTTACCCAAAAAAATCCACATACCTCTTTCACCACTTCCTCAATAAAAAAAGCT
CCTCCCTTTACATTTTACCCATCAACCAAAAGCAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAA
AATCCTTACACGAAGACATTAAGAAAAATCAAAAACCCAATCTCCAGATGACAATCCTTG
TCTTAACAATTTAGATCGGAAAGAAAGAACTTTTTTTAAAGAACTTTTTTTTGAACACTC
TGTTATAATGGCAGACAATCTAGAACTGAGTCTTTTATGTACAGAGATCACCAACTTCGG
TGATGAAGAAGACAACGGCATAATTCTCGACGAAACTCCGATCGTTGTTCCTGAAATCTC
GATTTCTCAGATGGGTTTTCCATCGGAGAGCGAAGAGGTTATCAGAGAGATGATGGAGAA
GGAGAAGGAGAAGCAGCTTTTGCCCAGTGATGATTACATCACCAGACTCAGAAGTGGAGA
TTTTGATTTGAATGTCAGAAGAAGAGAAGCTCTTAATTGGATTTTGAAGGCTTGTGAGGA
ACACCAGTTTGGACCAATGTGTATTTGCTTATCTATGAACTACTTGGATCGGTTCTTATC
AGTTCATGATGTCCCTAGTGGCAACGCTTGGGCAGTACAGTTGTTGGCTGTGGCTTGTTT
ATCCTTGGCAGCCAAAATTGAAGAAACTGAAGTCCCATTGCTAATAGATCTTCAGGCTGG
ACATCCTCAGTTTGTGTTTGAGGCTAAATCAGTTCAAAGAATGGAGCTTTTGGTGTTGAA
CAGATTGGAATGGAGATTGAGAGCGATAACTCCCTGCTCATACATAAGATATTTCCTGAG
GAAGATGAGTAAATGTGATCAAGAACCATCCAGCACATTGATATCCAGATCATTACAAGT
GATAGCCAGCAAAACCAAAGGTATTGACTTTTTGGAGTTTAGACCTTCTGAAGTTGCTGC
TGCAGTTGCACTTTCTGTTTCTGGAGAACTGTACACAGTACACTTTGACAACTCTTCCCT
CTCTCCTCTTTTCTCACTACTTCAAAAGGAGAGAGTGAAGAAGATTGGGGAAATGATAGA
GAGTGATGGGTCAGGCTTATGTTCACAAACACCCAATGGGGTTTTAGAAGTATCAGCTTG
TTGTTTCAGCTCTAAGACTCGTCATTCTTCTTCTTCCCATACACATCTTTCCTAAATCTC
TCTGTTTCTTCTTCAAATAAATTATCATTATTATTATATGGGAGGAGTGGTTGAGAAACA
AAATAATCACAGCAAAATTTTAAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW79TFB U 1
AF RR2DB90TF U 46
AF RR2DB90JQ C 528
AF RR2AW79JQ C 434
BS 1 102 RR2AW79TFB
BS 103 103 RR2DB90TF
BS 104 688 RR2AW79TFB
BS 689 712 RR2DB90TF
BS 713 1286 RR2AW79JQ

RD RR2AW79TFB 688 0 0
TACCTACTTACCCAAAAAAATCCACATACCTCTTTCACCACTTCCTCAATAAAAAAAGCT
CCTCCCTTTACATTTTACCCATCAACCAAAAGCAAAAAAAAA*CAAAACAAAACAAAAAA
AATCCTTACACGAAGACATTAAGAAAAATCAAAAACCCAATCTCCAGATGACAATCCTTG
TCTTAACAATTTAGATCGGAAAGAAAGAACTTTTTTTAAAGAACTTTTTTTTGAACACTC
TGTTATAATGGCAGACAATCTAGAACTGAGTCTTTTATGTACAGAGATCACCAACTTCGG
TGATGAAGAAGACAACGGCATAATTCTCGACGAAACTCCGATCGTTGTTCCTGAAATCTC
GATTTCTCAGATGGGTTTTCCATCGGAGAGCGAAGAGGTTATCAGAGAGATGATGGAGAA
GGAGAAGGAGAAGCAGCTTTTGCCCAGTGATGATTACATCACCAGACTCAGAAGTGGAGA
TTTTGATTTGAATGTCAGAAGAAGAGAAGCTCTTAATTGGATTTTGAAGGCTTGTGAGGA
ACACCAGTTTGGACCAATGTGTATTTGCTTATCTATGAACTACTTGGATCGGTTCTTATC
AGTTCATGATGTCCCTAGTGGCAACGCTTGGGCAGTACAGTTGTTGGCTGTGGCTTGTTT
ATCCTTGGCAGCCAAAATTGAAGAAACT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2DB90TF 667 0 0
AGGAAT
AAAAAAGCTCCTCCCTTTACATTTTACCCATCAACCAAAAGCAAAAAAAAAACAAAACAA
AACAAAAAAAATCCTTACACGAAGACATTAAGAAAAATCAAAAACCCAATCTCCAGATGA
CAATCCTTGTCTTAACAATTTAGATCGGAAAGAAAGAACTTTTTTTAAAGAACTTTTTTT
TGAACACTCTGTTATAATGGCAGACAATCTAGAACTGAGTCTTTTATGTACAGAGATCAC
CAACTTCGGTGATGAAGAAGACAACGGCATAATTCTCGACGAAACTCCGATCGTTGTTCC
TGAAATCTCGATTTCTCAGATGGGTTTTCCATCGGAGAGCGAAGAGGTTATCAGAGAGAT
GATGGAGAAGGAGAAG******CAGCTTTTGCCCAGTGATGATTACATCACCAGACTCAG
AAGTGGAGATTTTGATTTGAATGTCAGAAGAAGAGAAGCTCTTAATTGGATTTTGAAGGC
TTGTGAGGAACACCAGTTTGGACCAATGTGTATTTGCTTATCTATGAACTACTTGGATCG
GTTCTTATCAGTTCATGATGTCCCTAGTGGCAACGCTTGGGCAGTACAGTTGTTGGCTGT
GGCTTGTTTATCCTTGGCAGCCAAAATTGAAGAAACTGAAGTCCCATTGCTAATAGATCT
T

QA 7 667 7 667
DS 

RD RR2DB90JQ 733 0 0
AGGCTTGTGAGGAACACCAGTTTGGACCAATGTGTATTTGCTTATCTATGAACTACTTGG
ATCGGTTCTTATCAGTTCATGATGTCCCTAGTGGCAACGCTTGGGCAGTACAGTTGTTGG
CTGTGGCTTGTTTATCCTTGGCAGCCAAAATTGAAGAAACTGAAGTCCCATTGCTAATAG
ATCTTCAGGCTGGACATCCTCAGTTTGTGTTTGAGGCTAAATCAGTTCAAAGAATGGAGC
TTTTGGTGTTGAACAGATTGGAATGGAGATTGAGAGCGATAACTCCCTGCTCATACATAA
GATATTTCCTGAGGAAGATGAGTAAATGTGATCAAGAACCATCCAGCACATTGATATCCA
GATCATTACAAGTGATAGCCAGCAAAACCAAAGGTATTGACTTTTTGGAGTTTAGACCTT
CTGAAGTTGCTGCTGCAGTTGCACTTTCTGTTTCTGGAGAACTGTACACAGTACACTTTG
ACAACTCTTCCCTCTCTCCTCTTTTCTCACTACTTCAAAAGGAGAGAGTGAAGAAGATTG
GGGAAATGATAGAGAGTGATGGGTCAGGCTTATGTTCACAAACACCCAATGGGGTTTTAG
AAGTATCAGCTTGTTGTTTCAGCTCTAAGACTCGTCATTCTTCTTCTTCCCATACACATC
TTTCCTAAATCTCTCTGTTTCTTCTTCAAATAAATTATCATTATTATTATATGGGAGGAG
TGGTTGAGAAAC
G

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2AW79JQ 853 0 0
CAGCTTTTGCCCAGTGATGATTACATCACCAGACTCAGAAGTGGAGATTTTGATTTGAAT
GTCAGAAGAAGAGAAGCTCTTAATTGGATTTTGAAGGCTTGTGAGGAACACCAGTTTGGA
CCAATGTGTATTTGCTTATCTATGAACTACTTGGATCGGTTCTTATCAGTTCATGATGTC
CCTAGTGGCAACGCTTGGGCAGTACAGTTGTTGGCTGTGGCTTGTTTATCCTTGGCAGCC
AAAATTGAAGAAACTGAAGTCCCATTGCTAATAGATCTTCAGGCTGGACATCCTCAGTTT
GTGTTTGAGGCTAAATCAGTTCAAAGAATGGAGCTTTTGGTGTTGAACAGATTGGAATGG
AGATTGAGAGCGATAACTCCCTGCTCATACATAAGATATTTCCTGAGGAAGATGAGTAAA
TGTGATCAAGAACCATCCAGCACATTGATATCCAGATCATTACAAGTGATAGCCAGCAAA
ACCAAAGGTATTGACTTTTTGGAGTTTAGACCTTCTGAAGTTGCTGCTGCAGTTGCACTT
TCTGTTTCTGGAGAACTGTACACAGTACACTTTGACAACTCTTCCCTCTCTCCTCTTTTC
TCACTACTTCAAAAGGAGAGAGTGAAGAAGATTGGGGAAATGATAGAGAGTGATGGGTCA
GGCTTATGTTCACAAACACCCAATGGGGTTTTAGAAGTATCAGCTTGTTGTTTCAGCTCT
AAGACTCGTCATTCTTCTTCTTCCCATACACATCTTTCCTAAATCTCTCTGTTTCTTCTT
CAAATAAATTATCATTATTATTATATGGGAGGAGTGGTTGAGAAACAAAATAATCACAGC
AAAATTTTAAAAT

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 2

CO CL2023Contig1 746 2 19 U
CCGACTTTAGTTATAAATTAGTCATCTCCGAGTACAGCTTGAGGCAACAACAAGTGATCT
AAAATAAAATATTCTCAACACCTTGAGAGAGCTTTATTTATTAATACATATATTTTTTGA
TAGCCACATATTGAGTCACTATTCTCACATAGAGCTAACAAAATCAACGATATCAACAAC
ATCATGAAGTAGAGAGTTGGAATTCACCACCCTACAGTTCAACCTGATCTGTCCTTGAGT
TCCCGTAAGAGGTGTAATGTTTCCCATCCTATCCATCGCCTCCACAAACGCATCGAAAAA
TGTTTGTGTGCCATCAGCATATGCTCTAACCAAGGGGATTGTGTCAGTAGCATTAGGACT
AGAGAACAACTCCTGGTCGCTCTGAATAAAACCTTTCTGTTCTTTGAGATTCACATAGTA
TTTATTGTCGAAAACAGTAGGCGTACGTAGATCAAAATCCACCAAGGCACTTAGGTTACC
AGTACGGGGACATAGTCCACGAAGAGTTTGGAGGTAAGTAGTGTTGAGGGTAGGATCCGG
TAAACCGGTGTTGCTGAAGTTGTATAATCTGTCCATAATGAACCGGCATTGATTTTTACC
AAACGTGTGACCCCCGGAGAGAGCAACGAGATCAGAAGGACGGTCGAGGCCAACGTTTCT
AAAGCTGGCTTTAAGTTGTGGAAGTGTGAAGAATGGAGCTGGCAGATTTGCATTAGCTAG
ATTCAGAAACGCCTGTAAGCTGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT87JQB U 75
AF RR2D870JQ U 1
BS 1 103 RR2D870JQ
BS 104 104 RR2GT87JQB
BS 105 111 RR2D870JQ
BS 112 112 RR2GT87JQB
BS 113 150 RR2D870JQ
BS 151 151 RR2GT87JQB
BS 152 186 RR2D870JQ
BS 187 187 RR2GT87JQB
BS 188 293 RR2D870JQ
BS 294 294 RR2GT87JQB
BS 295 297 RR2D870JQ
BS 298 298 RR2GT87JQB
BS 299 389 RR2D870JQ
BS 390 390 RR2GT87JQB
BS 391 423 RR2D870JQ
BS 424 424 RR2GT87JQB
BS 425 603 RR2D870JQ
BS 604 604 RR2GT87JQB
BS 605 746 RR2D870JQ

RD RR2GT87JQB 542 0 0
GT
AACACCTTGAGAGAGCTTTATTTATTAATACATATATTTTTTGATAGCCACATATTGAGT
CACTATTCTCACATAGAGCTAACAAAATCAACGATATCAACAACATCATGAAGTAGAGAG
TTGGAATTCACCACCCTACAGTTCAACCTGATCTGTCCTTGAGTTCCCGTAAGAGGTGTA
ATGTTTCCCATCCTATTCATCGCCTCCACAAACGCATCGAAAAATGTTTGTGTGCCATCA
GCATATGCTCTAACCAAGGGGATTGTGTCAGTAGCATTAGGGCTAGAGAACAACTCCTGG
TCGCTCTGAATAAAACCTTTCTGTTCTTTGAGATTCACATAGTATTTATTGTCGAAAACA
GTAGGCGTACGTAGATCAAAATCCACCAGGGCACTTAGGTTACCAGTACGGGGACATAGT
CCACGAAGAGTTTGGAGGTAAGTAGTGTTGAGGGTAGGATCGGGTAAACCGGTGTTGCTG
AAGTTGTATAATCTGTCCATAATGAACCGGCATTGATTTTTACCAAACGTGTGACCCCCG

QA 3 542 3 542
DS 

RD RR2D870JQ 746 0 0
CCGACTTTAGTTATAAATTAGTCATCTCCGAGTACAGCTTGAGGCAACAACAAGTGATCT
AAAATAAAATATTCTCAACACCTTGAGAGAGCTTTATTTATTATTACATAT*TTTTTTGA
TAGCCACATATTGAGTCACTATTCTCACATGGAGCTAACAAAATCAACGATATCAACAAC
ATCATGGAGTAGAGAGTTGGAATTCACCACCCTACAGTTCAACCTGATCTGTCCTTGAGT
TCCCGTAAGAGGTGTAATGTTTCCCATCCTATCCATCGCCTCCACAAACGCATTGAAGAA
TGTTTGTGTGCCATCAGCATATGCTCTAACCAAGGGGATTGTGTCAGTAGCATTAGGACT
AGAGAACAACTCCTGGTCGCTCTGAATAAGACCTTTCTGTTCTTTGAGATTCACATAGTA
TTTGTTGTCGAAAACAGTAGGCGTACGTAGATCAAAATCCACCAAGGCACTTAGGTTACC
AGTACGGGGACATAGTCCACGAAGAGTTTGGAGGTAAGTAGTGTTGAGGGTAGGATCCGG
TAAACCGGTGTTGCTGAAGTTGTATAATCTGTCCATAATGAACCGGCATTGATTTTTACC
AAATGTGTGACCCCCGGAGAGAGCAACGAGATCAGAAGGACGGTCGAGGCCAACGTTTCT
AAAGCTGGCTTTAAGTTGTGGAAGTGTGAAGAATGGAGCTGGCAGATTTGCATTAGCTAG
ATTCAGAAACGCCTGTAAGCTGTCTC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 4

CO CL2024Contig1 725 4 4 U
GGGTAACTGTAAATAGGATGGCCGCGTCGCTTCCGACCACTTTATGTCTTAGCCATGGCG
ATGAGTGTTGCAAACGTTCACCC*AACCAAGGCTATACCCTTGCCGTGAAGAGGAACGTA
ATGGGTGGTTACTCGCGGCGCTGCGTGGGTACTACAGTGAGGAGATTGGTCGTGACGGCT
GCGACTGAAGGATCTAGAAAATCTAAAGAGAGTCAACCGTCGTGGGCGAATCCTGACTCG
GATGAGCCACCTCCTTGGGCCAGAGAAGAAGGTCGTTCTTCTACGTCCCCAGAGAGCATT
GAGGTTCCCTTCTATGTTTATCTGCTAGCCTCAGCAATCACTGCCATTGCTGCTATCGGT
TCTGTTTTTGAGTACTCGAGTAAGAATCCAGTGTTCGGGGTGTTGGACTCTGACAGTATC
TTTTATACTCCTGTGCTTGGGTTCTTTGCATTTACTGGAATCCCCACTTCTGTATTCTTA
TGGTTCAAATCAGTTGAAGCTGCTAATAAGGAAGCTGCAGAACAAGATAAAAGAGATGGA
TATCGTTAAAGAACTCTGTGGTTTTTTTTTT*GCAACTTATACAGTGATTGTTGTTGTCC
TCCTCCACATACTTATGAAGATCATTCTGCATTTGTTTAAAGGAGCTTGCTTCTGTTTCA
TACACTTGACTATATATTACCCCCACTTGAATTGTTGTAGTTTATATCAATGTCATGTTC
CAAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 

AF RR2CO76TF U 1
AF RR2GV84TF U 13
AF RR2D957JQ C 1
AF RR2CO76JQ C 41
BS 1 632 RR2CO76TF
BS 633 684 RR2D957JQ
BS 685 685 RR2CO76JQ
BS 686 725 RR2D957JQ

RD RR2CO76TF 639 0 0
GGGTAACTGTAAATAGGATGGCCGCGTCGCTTCCGACCACTTTATGTCTTAGCCATGGCG
ATGAGTGTTGCAAACGTTCACCC*AACCAAGGCTATACCCTTGCCGTGAAGAGGAACGTA
ATGGGTGGTTACTCGCGGCGCTGCGTGGGTACTACAGTGAGGAGATTGGTCGTGACGGCT
GCGACTGAAGGATCTAGAAAATCTAAAGAGAGTCAACCGTCGTGGGCGAATCCTGACTCG
GATGAGCCACCTCCTTGGGCCAGAGAAGAAGGTCGTTCTTCTACGTCCCCAGAGAGCATT
GAGGTTCCCTTCTATGTTTATCTGCTAGCCTCAGCAATCACTGCCATTGCTGCTATCGGT
TCTGTTTTTGAGTACTCGAGTAAGAATCCAGTGTTCGGGGTGTTGGACTCTGACAGTATC
TTTTATACTCCTGTGCTTGGGTTCTTTGCATTTACTGGAATCCCCACTTCTGTATTCTTA
TGGTTCAAATCAGTTGAAGCTGCTAATAAGGAAGCTGCAGAACAAGATAAAAGAGATGGA
TATCGTTAAAGAACTCTGTGGTTTTTTTTTT*GCAACTTATACAGTGATTGTTGTTGTCC
TCCTCCACATACTTATGAAGATCATTCTGCAT
TTGTTTA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2GV84TF 620 0 0
GG
AGGATGGCCGCGTCGCTTCCGACCACTTTATGTCTTAGCCATGGCGATGAGTGTTGCAAA
CGTTCACCC*AACCAAGGCTATACCCTTGCCGTGAAGAGGAACGTAATGGGTGGTTACTT
GCGGCGCTGCGTGGGTACTACAGTGAGGAGATTGGTCGTGACGGCTGCGACTGAAGGATC
TAGAAAATCTAAAGAGAGTCAACCGTCGTGGGCGAATCCTGACTCGGATGAGCCACCTCC
TTGGGCCAGAGAAGAAGGTCGTTCTTCTACGTCCCCAGAGAGCATTGAGGTTCCCTTCTA
TGTTTATCTGCTAGCCTCAGCAATCACTGCCATTGCTGCTATCGGTTCTGTTTTTGAGTA
CTCGAGTAAGAATCCAGTGTTCGGGGTGTTGGACTCTGACAGTATCTTTTATACTCCTGT
GCTTGGGTTCTTTGCATTTACTGGAATCCCCACTTCTGTATTCTTATGGTTCAAATCAGT
TGAAGCTGCTAATAAGGAAGCTGCAGAACAAGATAAAAGAGATGGATATCGTTAAAGAAC
TCTGTGGTTTTTTTTTTTGCAACTTATACAGTGATTGTTGTTGTCCTCCTCCACATACTT
ATGAAGATCATTCTGCAT

QA 3 620 3 620
DS 

RD RR2D957JQ 725 0 0
GGGTAACTGTAAATAGGATGGCCGCGTCGCTTCCGACCACTTTATGTCTTAGCCATGGCG
ATGAGTGTTGCAAACGTTCACCC*AACCAAGGCTATACCCTTGCCGTGAAGAGGAACGTA
ATGGGTGGTTACTCGCGGCGCTGCGTGGGTACTACAGTGAGGAGATTGGTCGTGACGGCT
GCGACTGAAGGATCTAGAAAATCTAAAGAGAGTCAACCGTCGTGGGCGAATCCTGACTCG
GATGAGCCACCTCCTTGGGCCAGAGAAGAAGGTCGTTTTTTTACGTCCCCAGAGAGCATT
GAGGTTCCCTTCTATGTTTATTTGCTAGCCTCAGCAATCACTGCCATTGCTGCTATCGGT
TCTGTTTTTGAGTACTCGAGTAAGAATCCAGTGTTCGGGGTGTTGGACTTTGACAGTATC
TTTTATACTCCTGTGCTTGGGTTCTTTGCATTTACTGGAATCCCCACTTCTGTATTTTTA
TGGTTCAAATCAGTTGAAGCTGCTAATAAGGAAGTTGCAGAACAAGATAAAAGAGATGGA
TATCGTTAAAGAACTCTGTGGTTTTTTTTT**GCAACTTATACAGTGATTGTTGTTGTCC
TCCTCCACATACTTATGAAGATCATTCTGCATTTGTTTAAAGGAGCTTGCTTCTGTTTCA
TACACTTGACTATATATTACCCCCGCTTGAATTGTTGTAGTTTATATCAATGTCATGTTC
CAAGG

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2CO76JQ 685 0 0
TTTATGTCTTAGCCATGGCGATGAGTGTTGCAAACGTTCACCCCAACCAAGGCTATACCC
TTGCCGTGAAGAGGAACGTAATGGGTGGTTACTCGCGGCGCTGCGTGGGTACTACAGTGA
GGAGATTGGTCGTGACGGCTGCGACTGAAGGATCTAGAAAATCTAAAGAGAGTCAACCGT
CGTGGGGGAATCCTGACTCGGATGAGCCACCTCCTTGGGCCAGAGAAGAAGGTCGTTTTT
TTACGTCCCCAGAGAGCATTGAGGTTCCCTTTTATGTTTATTTGCTAGCCTCAGCAATCA
CTGCCATTGCTGCTATCGGTTCTGTTTTTGAGTACTCGAGTAAGAATCCAGTGTTCGGGG
TGTTGGACTCTGACAGTATCTTTTATACTCCTGTGCTTGGGTTCTTTGCATTTACTGGAA
TCCCCACTTCTGTATTCTTATGGTTCAAATCAGTTGAAGCTGCTAATAAGGAAGCTGCAG
AACAAGATAAAAGAGATGGATATCGTTAAAGAACTCTGTGGTTTTTTTTTT*GCAACTTA
TACAGTGATTGTTGTTGTCCTCCTCCACATACTTATGAAGATCATTCTGCATTTGTTTAA
AGGAGCTTGCTTCTGTTTCATACACTTGACTATATATTACCCCCACTTGAATTGTTGTAG
TTTATATCAATGTCATGTTCCAAGG

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 4

CO CL2025Contig1 1259 4 16 U
GCACATTCTGTCGGATGATGTGCCGTTGGTGGTTTCGAGGCAGCTTTTGCAGTCATTCGC
ACAAGAGGTCGGGAGACTGGAACCAGAGACCCAGAAGGAGATTGCTCTCTTCACACTCAC
CCAGATTCAGCCCAGAGTTGTCTCTTTCGAGGAACAGGCACTTGTTATTAGAGAAAAGCT
TGCGGCTTTGTATGAATCAGAGCAGGAATGGTCTAGAGCTGCCCAGATGTTGAGTGGCAT
TGATCTTGACTCTGGAATGAGGGCTGTTGACGAAAACTTCAAGCTCTCCAAGTGTATCCA
AATTGCTCGTTTGTATCTCGAGGATGATGATGCTGTAAATGCAGAGACCTATATAAATAA
AGCTTCTTTCTTAGTGAACAGTCAGAATGAAGTTTTAAATTTGCAGTACAAGGTCTGCCA
TGCTAGAATTCTGGACATGAAAAGAAAGTTCTTAGACGCTGCACTTCGGTATTACAGCAT
ATCTCAGATTGAAAAACGCC*AAATAGGGGATGAAGAGATTGATGAGAATGCACTAGAGC
AGGCCCTATCTGCTGCTGTCACATGTACCATATTAGCTGGAGCTGGTCCTCAGCGTTCTC
GTGTTCTTGCAACTTTATATAAAGATGAGCGCTGCTCCAAGCTTAAGATCTATCCCATCC
TGCAGAAGGTTTATCTGGAAAGGATTTTAAGGAAACCAGAGATTGATGCTTTTGCGGAAG
AATTAAGGCCACATCAGAAAGCAACTTTGCCTGACAAATCCACTGTTCTTGACCGTGCCA
TGATTGAGCATAACCTTCTGAGTGCAAGCAAACTTTACACTAACATAAGGTTTGATGAGT
TGGGAACTCTACTGGGAATTGACCCAACTAAGGCGGAGAAGATAGCATCTAATATGATTG
GCCAAGACAGAATGAGAGGTTCCATCGATCGGGAAGAGGCTGTGATACATTTTGAAGATG
ACATTGAGGAACTACAACAGTGGGATCATCAGATATCTGGATTATGCCAAGCTCTCAACG
ATACCTGGATGGGATGGCGAAGAAAGGCCTACCTGTTCCTGTCTGATTCATTTACGAGCT
GTGAGGTTGACTTGAATATAAAGCCGAAGAGTCTCATATCCTAAGCTTTTGCCCTATGCT
GTGTTTTGGAGACGATTTACATTTGTTCCATATTTGAAGTGTTTTTTTACAAATTCATGT
CCATCCCTTTAGGTTAATTTGATACTGAGAAAAAGATTGGGCATGGAATGAGGATTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GM46TF U 1
AF RR2G786TF U 1
AF RR2GM46JQ C 451
AF RR2G786JQ C 598
BS 1 667 RR2G786TF
BS 668 668 RR2GM46JQ
BS 669 691 RR2G786TF
BS 692 692 RR2GM46JQ
BS 693 727 RR2G786TF
BS 728 728 RR2GM46JQ
BS 729 773 RR2G786TF
BS 774 774 RR2GM46JQ
BS 775 802 RR2G786TF
BS 803 888 RR2GM46JQ
BS 889 889 RR2G786JQ
BS 890 996 RR2GM46JQ
BS 997 997 RR2G786JQ
BS 998 1062 RR2GM46JQ
BS 1063 1063 RR2G786JQ
BS 1064 1259 RR2GM46JQ

RD RR2GM46TF 680 0 0
GCACATTCTGTCGGATGATGTGCCGTTGGTGGTTTCGAGGCAGCTTTTGCAGTCATTCGC
ACAAGAGGTCGGGAGACTGGAACCAGAGACCCAGAAGGAGATTGCTCTCTTCACACTCAC
CCAGATTCAGCCCAGAGTTGTCTCTTTCGAGGAACAGGCACTTGTTATTAGAGAAAAGCT
TGCGGCTTTGTATGAATCAGAGCAGGAATGGTCTAGAGCTGCCCAGATGTTGAGTGGCAT
TGATCTTGACTCTGGAATGAGGGCTGTTGACGAAAACTTCAAGCTCTCCAAGTGTATCCA
AATTGCTCGTTTGTATCTCGAGGATGATGATGCTGTAAATGCAGAGACCTATATAAATAA
AGCTTCTTTCTTAGTGAACAGTCAGAATGAAGTTTTAAATTTGCAGTACAAGGTCTGCCA
TGCTAGAATTCTGGACATGAAAAGAAAGTTCTTAGACGCTGCACTTCGGTATTACAGCAT
ATCTCAGATTGAAAAACGCC*AAATAGGGGATGAAGAGATTGATGAGAATGCACTAGAGC
AGGCCCTATCTGCTGCTGTCACATGTACCATATTAGCTGGAGCTGGTCCTCAGCGTTCTC
GTGTTCTTGCAACTTTATATAAAGATGAGCGCTGCTCCAAGCTTAAGATCTATCCCATCC
TGCAGAAAGTTTATCTGGAA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2G786TF 802 0 0
GCACATTCTGTCGGATGATGTGCCGTTGGTGGTTTCGAGGCAGCTTTTGCAGTCATTCGC
ACAAGAGGTCGGGAGACTGGAACCAGAGACCCAGAAGGAGATTGCTCTCTTCACACTCAC
CCAGATTCAGCCCAGAGTTGTCTCTTTCGAGGAACAGGCACTTGTTATTAGAGAAAAGCT
TGCGGCTTTGTATGAATCAGAGCAGGAATGGTCTAGAGCTGCCCAGATGTTGAGTGGCAT
TGATCTTGACTCTGGAATGAGGGCTGTTGACGAAAACTTCAAGCTCTCCAAGTGTATCCA
AATTGCTCGTTTGTATCTCGAGGATGATGATGCTGTAAATGCAGAGACCTATATAAATAA
AGCTTCTTTCTTAGTGAACAGTCAGAATGAAGTTTTAAATTTGCAGTACAAGGTCTGCCA
TGCTAGAATTCTGGACATGAAAAGAAAGTTCTTAGACGCTGCACTTCGGTATTACAGCAT
ATCTCAGATTGAAAAACGCC*AAATAGGGGATGAAGAGATTGATGAGAATGCACTAGAGC
AGGCCCTATCTGCTGCTGTCACATGTACCATATTAGCTGGAGCTGGTCCTCAGCGTTCTC
GTGTTCTTGCAACTTTATATAAAGATGAGCGCTGCTCCAAGCTTAAGATCTATCCCATCC
TGCAGAA*GTTTATCTGGAAAGGATTTTAAG*AAACCAGAGATTGATGCTTTTGCGGAAG
AATTAAG*CCACATCAGAAAGCAACTTTGCCTGACAAATCCACTGTTCTTGAC*GTGCCA
TGATTGAGCATAACCTTCTGAG

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2GM46JQ 809 0 0
CTTAGACGCTGCACTTCGGTATTACAGCATATCTCAGATTGAAAAACGCCCAAATAGGGG
ATGAAGAGATTGATGAGAATGCACTAGAGCAGGCCCTATCTGCTGCTGTCACATGTACCA
TATTAGCTGGAGCTGGTCCTCAGCGTTCTCGTGTTCTTGCAACTTTATATAAAGATGAGC
GCTGCTCCAAGCTTAAGATCTATCCCATCCTGCAGAAGGTTTATCTGGAAAGGATTTTAA
GGAAACCAGAGATTGATGCTTTTGCGGAAGAATTAAGGCCACATCAGAAAGCAACTTTGC
CTGACAAATCCACTGTTCTTGACCGTGCCATGATTGAGCATAACCTTCTGAGTGCAAGCA
AACTTTACACTAACATAAGGTTTGATGAGTTGGGAACTCTACTGGGAATTGACCCAACTA
AGGCGGAGAAGATAGCATTTAATATGATTGGCCAAGACAGAATGAGAGGTTCCATCGATC
GGGAAGAGGCTGTGATACATTTTGAAGATGACATTGAGGAACTACAACAGTGGGATCATC
AGATATTTGGATTATGCCAAGCTCTCAACGATACCTGGATGGGATGGCGAAGAAAGGCCT
ACCTGTTCCTGTTTGATTCATTTACGAGCTGTGAGGTTGACTTGAATATAAAGCCGAAGA
GTCTCATATCCTAAGCTTTTGCCCTATGCTGTGTTTTGGAGACGATTTACATTTGTTCCA
TATTTGAAGTGTTTTTTTACAAATTCATGTCCATCCCTTTAGGTTAATTTGATACTGAGA
AAAAGATTGGGCATGGAATGAGGATTTTT

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2G786JQ 662 0 0
CTCGTGTTCTTGCAACTTTATATAAAGATGAGCGCTGCTCCAAGCTTAAGATCTATCCCA
TCCTGCAGAAGGTTTATCTGGAAAGGATTTTAAGGAAACCAGAGATTGATGCTTTTGCGG
AAGAATTAAGGCCACATCAGAAAGCAACTTTGCCTGACAAATCCACTGTTCTTGACCGTG
CCATGATTGAGCATAACCTTCTGAGTGCAAGCAAACTTTACACTAACATAAGGTTTGATG
AGTTGGGAACTCTACTGGGAATTGACCCAACTAAGGCGGAGAAGATAGCATCTAATATGA
TTGGCCAAGACAGAATGAGAGGTTCCATCGATCGGGAAGAGGCTGTGATACATTTTGAAG
ATGACATTGAGGAACTACAACAGTGGGATCATCAGATATCTGGATTATGCCAAGCTCTCA
ACGATACCTGGATGGGATGGCGAAGAAAGGCCTACCTGTTCCTGTCTGATTCATTTACGA
GCTGTGAGGTTGACTTGAATATAAAGCCGAAGAGTCTCATATCCTAAGCTTTTGCCCTAT
GCTGTGTTTTGGAGACGATTTACATTTGTTCCATATTTGAAGTGTTTTTTTACAAATTCA
TGTCCATCCCTTTAGGTTAATTTGATACTGAGAAAAAGATTGGGCATGGAATGAGGATTT
TT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL2026Contig1 722 2 1 U
GCAGCAAATATGTTTGTAGATTGGCAAAAATGGAGAGCCTCCATGGTCCCTCCAAATGGG
ATCCCAGACTCAGAAGTGAAGGATGAATTGGAATTCAAAAGGATCTATCTTCAGGGTCTT
ACCAAATCCGGACAACCTTTGGTACTTTGTCAGGTCTCCAAGCATTTTCCTGCCAAGGAT
CCAGTTACCTTCAAGAAGTTCGTTGTTCATGTGCTAGACAAAACAATAGCAAGTGGCATC
AAAGGCAAAGAAGTAGGAGATGAAAGGTTAGTAGCCGTTATCGATCTGTCAAACATTACT
TACAAGAACCTTGATGCTCGTGGATTTGTCACCGGCTTTCAGTTCTTACAATCTTACTAC
CCGGAACGCCTTGCCAAATGTTACATCTTGCATATGCCTGGATTCTTCTTGACCGTTTGG
AGATTCATCTGCCGTTTTCTAGAGAAAGCTACTCAGGAAAAGATTGTAATAGTAACGGAC
GAAGAAGAAGAGAGAAAGTTCAAGGAGGAGATCGGAGTAGATGTCTTGCCAGAAGAATAT
GGTGGCCAAGCTAAGCTCACACTAATCCAAGATGTTTTTCTTTCCTCAGACGTCTCCATA
AATGTTAATAATATTAATGTTTGACTATTGTAACACTAAACCCTGCAGTAATCCCTATTA
TTAACTTCTCTATTGTTTGTTGTTCTTGTTCTGTAATGACTATAACAAAACTCTCGTTAG
CG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2FF88JQ C 1
AF RR2FF88TF U 1
BS 1 722 RR2FF88TF

RD RR2FF88JQ 722 0 0
GCAGCAAATATGTTTGTAGATTGGCAAAAATGGAGAGCCTCCATGGTCCCTCCAAATGGG
ATCCCAGACTCAGAAGTGAAGGATGAATTGGAATTCAAAAGGATCTATCTTCAGGGTCTT
ACCAAATCCGGACAACCTTTGGTACTTTGTCAGGTCTCCAAGCATTTTCCTGCCAAGGAT
CCAGTTACCTTCAAGAAGTTCGTTGTTCATGTGCTAGACAAAACAATAGCAAGTGGCATC
AAAGGCAAAGAAGTAGGAGATGAAAGGTTAGTAGCCGTTATCGATCTGTCAAACATTACT
TACAAGAACCTTGATGCTCGTGGATTTGTCACCGGCTTTCAGTTCTTACAATCTTACTAC
CCGGAACGCCTTGCCAAATGTTACATCTTGCATATGCCTGGATTCTTCTTGACCGTTTGG
AGATTCATCTGCCGTTTTCTAGAGAAAGCTACTCAGGAAAAGATTGTAATAGTAACGGAC
GAAGAAGAAGAGAGAAAGTTCAAGGAGGAGATCGGAGTAGATGTCTTGCCAGAAGAATAT
GGTGGCCAAGCTAAGCTCACACTAATCCAAGATGTTTTTCTTTCCTCAGACGTCTCCATA
AATGTTAATAATATTAATGTTTGACTATTGTAACACTAAACCCTGCAGTAATCCCTATTA
TTAACTTCTCTATTGTTTGTTGTTCTTGTTCTGTAATGACTATAACAAAACTCTCGTTAG
CG

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2FF88TF 722 0 0
GCAGCAAATATGTTTGTAGATTGGCAAAAATGGAGAGCCTCCATGGTCCCTCCAAATGGG
ATCCCAGACTCAGAAGTGAAGGATGAATTGGAATTCAAAAGGATCTATCTTCAGGGTCTT
ACCAAATCCGGACAACCTTTGGTACTTTGTCAGGTCTCCAAGCATTTTCCTGCCAAGGAT
CCAGTTACCTTCAAGAAGTTCGTTGTTCATGTGCTAGACAAAACAATAGCAAGTGGCATC
AAAGGCAAAGAAGTAGGAGATGAAAGGTTAGTAGCCGTTATCGATCTGTCAAACATTACT
TACAAGAACCTTGATGCTCGTGGATTTGTCACCGGCTTTCAGTTCTTACAATCTTACTAC
CCGGAACGCCTTGCCAAATGTTACATCTTGCATATGCCTGGATTCTTCTTGACCGTTTGG
AGATTCATCTGCCGTTTTCTAGAGAAAGCTACTCAGGAAAAGATTGTAATAGTAACGGAC
GAAGAAGAAGAGAGAAAGTTCAAGGAGGAGATCGGAGTAGATGTCTTGCCAGAAGAATAT
GGTGGCCAAGCTAAGCTCACACTAATCCAAGATGTTTTTCTTTCCTCAGACGTCTCCATA
AATGTTAATAATATTAATGTTTGACTATTGTAACACTAAACCCTGCAGTAATCCCTATTA
TTAACTTCTCTATTGTTTGTTGTTCTTGTTCTGTAATGACTATAACAAAACTCTCGTTAG
CG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 4

CO CL2027Contig1 658 4 2 U
GGAACCAACTCATTATTGTTATCGTCTCAAATACGCTCGCTTTGTTCATATACTACTTTT
TAACCTTTCTAGAGAGTTTCTATAGAGATGGCGGGTCGAGGAAAACAACTTGGATCTGGC
GCGGCGAAGAAGGCCACTTCTCGTAGTAGCAAGGCGGGGCTCCAATTCCCCGTTGGTCGT
ATCGCTCGATTCCTCAAGGCTGGAAAGTACGCTGAGCGTGTTGGAGCTGGAGCTCCGGTT
TATCTCGCCGCTGTTCTTGAATACCTCGCCGCCGAGGTGCTTGAGCTCGCTGGGAACGCT
GCAAGAGATAACAAGAAGACTCGGATTGTTCCTAGACACATTCAGCTTGCCGTGAGGAAC
GACGAGGAGCTAAGCAAGCTACTTGGAGATGTGACGATTGCAAATGGAGGAGTGATGCCT
AACATTCACAATCTCCTTCTCCCAAACAAGAAGGCTGGCTCATCTAAGCCTACCGATGAA
GAATAGGAGATCCCAAGTGACAAAGCTGATAATGGTGTGATGTCAGAGTGAACAAGCAAT
GATAGTAGAGAACGGTTAACATAACAGCTCTGTGTGTGGTTGGATTAGTAGTAGTTGCAA
ATTATATTTTGTTTCTGTTGTGTGAATATATGAAGAAGAACATGCTTCCTTTCGTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2FY24TF U 1
AF RR2H126TF U 1
AF RR2H126JQ C 21
AF RR2FY24JQ C 91
BS 1 607 RR2FY24TF
BS 608 658 RR2H126TF

RD RR2FY24TF 607 0 0
GGAACCAACTCATTATTGTTATCGTCTCAAATACGCTCGCTTTGTTCATATACTACTTTT
TAACCTTTCTAGAGAGTTTCTATAGAGATGGCGGGTCGAGGAAAACAACTTGGATCTGGC
GCGGCGAAGAAGGCCACTTCTCGTAGTAGCAAGGCGGGGCTCCAATTCCCCGTTGGTCGT
ATCGCTCGATTCCTCAAGGCTGGAAAGTACGCTGAGCGTGTTGGAGCTGGAGCTCCGGTT
TATCTCGCCGCTGTTCTTGAATACCTCGCCGCCGAGGTGCTTGAGCTCGCTGGGAACGCT
GCAAGAGATAACAAGAAGACTCGGATTGTTCCTAGACACATTCAGCTTGCCGTGAGGAAC
GACGAGGAGCTAAGCAAGCTACTTGGAGATGTGACGATTGCAAATGGAGGAGTGATGCCT
AACATTCACAATCTCCTTCTCCCAAACAAGAAGGCTGGCTCATCTAAGCCTACCGATGAA
GAATAGGAGATCCCAAGTGACAAAGCTGATAATGGTGTGATGTCAGAGTGAACAAGCAAT
GATAGTAGAGAACGGTTAACATAACAGCTCTGTGTGTGGTTGGATTAGTAGTAGTTGCAA
ATTATAT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2H126TF 658 0 0
GGAACCAACTCATTATTGTTATCGTCTCAAATACGCTCGCTTTGTTCATATACTACTTTT
TAACCTTTCTAGAGAGTTTCTATAGAGATGGCGGGTCGAGGAAAACAACTTGGATCTGGC
GCGGCGAAGAAGGCCACTTCTCGTAGTAGCAAGGCGGGGCTCCAATTCCCCGTTGGTCGT
ATCGCTCGATTCCTCAAGGCTGGAAAGTACGCTGAGCGTGTTGGAGCTGGAGCTCCGGTT
TATCTCGCCGCTGTTCTTGAATACCTCGCCGCCGAGGTGCTTGAGCTCGCTGGGAACGCT
GCAAGAGATAACAAGAAGACTCGGATTGTTCCTAGACACATTCAGCTTGCCGTGAGGAAC
GACGAGGAGCTAAGCAAGCTACTTGGAGATGTGACGATTGCAAATGGAGGAGTGATGCCT
AACATTCACAATCTCCTTCTCCCAAACAAGAAGGCTGGCTCATCTAAGCCTACCGATGAA
GAATAGGAGATCCCAAGTGACAAAGCTGATAATGGTGTGATGTCAGAGTGAACAAGCAAT
GATAGTAGAGAACGGTTAACATAACAGCTCTGTGTGTGGTTGGATTAGTAGTAGTTGCAA
ATTATATTTTGTTTCTGTTGTGTGAATATATGAAGAAGAACATGCTTCCTTTCGTTCC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2H126JQ 638 0 0
ATCGTCTCAAATACGCTCGCTTTGTTCATATACTACTTTTTAACCTTTCTAGAGAGTTTC
TATAGAGATGGCGGGTCGAGGAAAACAACTTGGATCTGGCGCGGCGAAGAAGGCCACTTC
TCGTAGTAGCAAGGCGGGGCTCCAATTCCCCGTTGGTCGTATCGCTCGATTCCTCAAGGC
TGGAAAGTACGCTGAGCGTGTTGGAGCTGGAGCTCCGGTTTATCTCGCCGCTGTTCTTGA
ATACCTCGCCGCCGAGGTGCTTGAGCTCGCTGGGAACGCTGCAAGAGATAACAAGAAGAC
TCGGATTGTTCCTAGACACATTCAGCTTGCCGTGAGGAACGACGAGGAGCTAAGCAAGCT
ACTTGGAGATGTGACGATTGCAAATGGAGGAGTGATGCCTAACATTCACAATCTCCTTCT
CCCAAACAAGAAGGCTGGCTCATCTAAGCCTACCGATGAAGAATAGGAGATCCCAAGTGA
CAAAGCTGATAATGGTGTGATGTCAGAGTGAACAAGCAATGATAGTAGAGAACGGTTAAC
ATAACAGCTCTGTGTGTGGTTGGATTAGTAGTAGTTGCAAATTATATTTTGTTTCTGTTG
TGTGAATATATGAAGAAGAACATGCTTCCTTTCGTTCC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2FY24JQ 568 0 0
GCGGGTCGAGGAAAACAACTTGGATCTGGCGCGGCGAAGAAGGCCACTTCTCGTAGTAGC
AAGGCGGGGCTCCAATTCCCCGTTGGTCGTATCGCTCGATTCCTCAAGGCTGGAAAGTAC
GCTGAGCGTGTTGGAGCTGGAGCTCCGGTTTATCTCGCCGCTGTTCTTGAATACCTCGCC
GCCGAGGTGCTTGAGCTCGCTGGGAACGCTGCAAGAGATAACAAGAAGACTCGGATTGTT
CCTAGACACATTCAGCTTGCCGTGAGGAACGACGAGGAGCTAAGCAAGCTACTTGGAGAT
GTGACGATTGCAAATGGAGGAGTGATGCCTAACATTCACAATCTCCTTCTCCCAAACAAG
AAGGCTGGCTCATTTAAGCCTACCGATGAAGAATAGGAGATCCCAAGTGACAAAGCTGAT
AATGGTGTGATGTCAGAGTGAACAAGCAATGATAGTAGAGAACGGTTAACATAACAGCTC
TGTGTGTGGTTGGATTAGTAGTAGTTGCAAATTATATTTTGTTTCTGTTGTGTGAATATA
TGAAGAAGAACATGCTTCCTTTCGTTCC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 4

CO CL2028Contig1 1173 4 15 U
GGGTCAACACACAGTTCATGAACAGAGTAATCTCTCTCTCTCTCGGTCTCGATTTCTGAT
TTCTCACTGTACGACCAAAACGATCACCACACACACATAAAAGAACAGGCAAACTGATTG
AACTTCTTCTGAAGACTTCGAAACCATGTCTTGTCTGGGTAGGATCTTGTCTGTTTCCTA
CCCACCTGATCCGTACGGCTCCCGTTTTTCAGTGTCGAAGCTGTCTTCACTCAGGCCGAA
TCGAAGGCTGAGATGGCGTTTCACGGCCTTGGACTCAGACTCTTCCTCTCTCGATTCTGA
CTCCTCCGACAAATTCGCTGCCGGCTTTTGTATCATAGAAGGACCTGAAACAGTACAGGA
CTTTGCCAAAATGCAATTACAAGAGATTCAAGATAACATTAGAAGCCGACGAAACAAGAT
CTTCTTGCACATGGAAGAGGTAAGGAGGCTAAGAATACAACAAAGGATTAGAAACGCAGA
GCTTGGAATCGTAGACGAAGAGCAAGAACACGAGTTACCTAACTTCCCATCCTTTATCCC
ATTCTTACCTCCATTGACTGCTGCCAATTTGAGAGTGTATTACGCAACTTGCTTCTCACT
CATCGCTGGGATCATCCTATTTGGTGGCCTACTAGCTCCTACTCTAGAGCTGAAGCTAGG
TATAGGAGGCACATCATATAAAGATTTCATTCAAAGCCTTCATCTACCTATGCAACTAAG
TCAAGTAGACCCAATAGTAGCGTCCTTCTCCGGAGGAGCTGTTGGTGTGATCTCAGCTTT
GATGGTAGTAGAAGTCAACAACGTGAAGCAGCAAGAGCACAAGAGATGCAAATACTGTCT
AGGAACTGGGTATCTAGCATGTGCTCGTTGCTCGAGCACAGGTGCTCTTATTGTAGCTGA
ACCGGTCTCAGCTATTGCTGGAGGGAATCATTCTGTGTCAACATCCAAAACCGAAAGATG
TTCAAACTGTTCTGGTGCTGGAAAGGTGATGTGTCCGACATGTCTGTGCACAGGGATGGC
TATGGCTAGCGAGCACGACCCTCGTATCGATCCTTTCCTTTGATTCCACTTCTCCAAGAA
ATCTATTTGTCCTTGTAACTTAAACATTGTATGTACTGATGAATAATGAGAACTGTATCC
TTTCATCTGTATATACACAAAATGAAGTTGTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG76TF U 1
AF RR2F567TF U 477
AF RR2FG76JQ C 375
AF RR2F567JQ C 477
BS 1 694 RR2FG76TF
BS 695 695 RR2F567TF
BS 696 715 RR2FG76TF
BS 716 716 RR2F567TF
BS 717 731 RR2FG76TF
BS 732 732 RR2F567TF
BS 733 750 RR2FG76TF
BS 751 751 RR2F567TF
BS 752 786 RR2FG76TF
BS 787 787 RR2F567TF
BS 788 795 RR2FG76TF
BS 796 1066 RR2F567TF
BS 1067 1067 RR2FG76JQ
BS 1068 1118 RR2F567TF
BS 1119 1173 RR2FG76JQ

RD RR2FG76TF 795 0 0
GGGTCAACACACAGTTCATGAACAGAGTAATCTCTCTCTCTCTCGGTCTCGATTTCTGAT
TTCTCACTGTACGACCAAAACGATCACCACACACACATAAAAGAACAGGCAAACTGATTG
AACTTCTTCTGAAGACTTCGAAACCATGTCTTGTCTGGGTAGGATCTTGTCTGTTTCCTA
CCCACCTGATCCGTACGGCTCCCGTTTTTCAGTGTCGAAGCTGTCTTCACTCAGGCCGAA
TCGAAGGCTGAGATGGCGTTTCACGGCCTTGGACTCAGACTCTTCCTCTCTCGATTCTGA
CTCCTCCGACAAATTCGCTGCCGGCTTTTGTATCATAGAAGGACCTGAAACAGTACAGGA
CTTTGCCAAAATGCAATTACAAGAGATTCAAGATAACATTAGAAGCCGACGAAACAAGAT
CTTCTTGCACATGGAAGAGGTAAGGAGGCTAAGAATACAACAAAGGATTAGAAACGCAGA
GCTTGGAATCGTAGACGAAGAGCAAGAACACGAGTTACCTAACTTCCCATCCTTTATCCC
ATTCTTACCTCCATTGACTGCTGCCAATTTGAGAGTGTATTACGCAACTTGCTTCTCACT
CATCGCTGGGATCATCCTATTTGGTGGCCTACTAGCTCCTACTCTAGAGCTGAAGCTAGG
TATAGGAGGCACATCATATAAAGATTTCATTCAA*GCCTTCATCTACCTATGCAATTAAG
TCAAGTAGACC*AATAGTAGCGTCCTTCTCTGGAGGAGCTGTTGGTGTGATCTCAGCTTT
GATGGTGGTAGAAGT

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2F567TF 642 0 0
G
AGAGCTTGGAATCGTAGACGAAGAGCAAGAACACGAGTTACCTAACTTCCCGTCTTTTAT
CCCATTCTTACCTCCATTGACTGCTGCCAATTTGAGAGTGTATTACGCAACTTGCTTCTC
ACTCATCGCTGGGATCATCCTATTTGGTGGCCTACTAGCTCCTACTCTAGAGCTGAAGCT
AGGTATAGGAGGCACATCATATAAAGATTTCATTCAAAGCCTTCATCTACCTATGCAACT
GAGTCAAGTAGACCCAATAGTAGCGTCCTTCTCCGGAGGAGCTGTTGGTGTGATCTCGGC
TTTGATGGTAGTAGAAGTCAACAACGTGAAGCAGCAAGAGCACAAGAGATGCAAATACTG
TCTAGGAACTGGGTATCTAGCATGTGCTCGTTGCTCGAGCACAGGTGCTCTTATTGTAGC
TGAACCGGTCTCAGCTATTGCTGGAGGGAATCATTCTGTGTCAACATCCAAAACCGAAAG
ATGTTCAAACTGTTCTGGTGCTGGAAAGGTGATGTGTCCGACATGTCTGTGCACAGGGAT
GGCTATGGCTAGCGAGCACGACCCTCGTATCGATCCTTTCCTTTGATTCTACTTCTCCAA
GAAATCTATTTGTCCTTGTAACTTAAACATTGTATGTACTG

QA 2 642 2 642
DS 

RD RR2FG76JQ 799 0 0
AATTACAAGAGATTCAAGATAACATTAGAAGC*GACGAAACAAGATCTTCTTGCACATGG
AAGAGGTAAGGAGGCTAAGAATACAACAAAGGATTAGAAACGCAGAGCTTGGAATCGTAG
ACGAAGAGCAAGAACACGAGTTACCTAACTTCCCATCCTTTATCCCATTCTTACCTCCAT
TGACTGCTGCCAATTTGAGAGTGTATTACGCAACTTGCTTCTCACTCATCGCTGGGATCA
TCCTATTTGGTGGCCTACTAGCTCCTACTCTAGAGCTGAAGCTAGGTATAGGAGGCACAT
CATATAAAGATTTCATTCAAAGCCTTCATCTACCTATGCAATTAAGTCAAGTAGACCCAA
TAGTAGCGTCCTTTTCTGGAGGAGCTGTTGGTGTGATTTCAGCTTTGATGGTGGTAGAAG
TCAACAACGTGAAGCAGCAAGAGCACAAGAGATGCAAATACTGTCTAGGAACTGGGTATC
TAGCATGTGCTCGTTGCTCTAGCACAGGTGCTCTTATTGTAGCTGAACCGGTCTCAGCTA
TTGCTGGAGGGAATCATTCTGTGTCAACATCCAAAACCGAAAGATGTTCAAACTGTTCTG
GTGCTGGAAAGGTGATGTGTCCGACATGTCTGTGCACAGGGATGGCTATGGCTAGCGAGC
ACGACCCTCGTATCGATCCTTTTCTTTGATTCCACTTCTCCAAGAAATCTATTTGTCCTT
GTAACTTAAACATTGTATGTACTGATGAATAATGAGAACTGTATCCTTTCATCTGTATAT
ACACAAAATGAAGTTGTTA

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2F567JQ 673 0 0
G
AGAGCTTGGAATCGTAGACGAAGAGCAAGAACACGAGTTACCTAACTTCCCGTCTTTTAT
CCCATTCTTACCTCCATTGACTGCTGCCAATTTGAGAGTGTATTACGCAACTTGCTTCTC
ACTCATCGCTGGGATCATCCTATTTGGTGGCCTACTAGCTCCTACTCTAGAGCTGAAGCT
AGGTATAGGAGGCACATCATATAAAGATTTCATTCAAAGCCTTCATCTACCTATGCAACT
GAGTCAAGTAGACCCAATAGTAGCGTCCTTCTCCGGAGGAGCTGTTGGTGTGATCTCGGC
TTTGATGGTAGTAGAAGTCAACAACGTGAAGCAGCAAGAGCACAAGAGATGCAAATACTG
TCTAGGAACTGGGTATCTAGCATGTGCTCGTTGCTCGAGCACAGGTGCTCTTATTGTAGC
TGAACCGGTCTCAGCTATTGCTGGAGGGAATCATTCTGTGTCAACATCCAAAACCGAAAG
ATGTTCAAACTGTTCTGGTGCTGGAAAGGTGATGTGTCCGACATGTCTGTGCACAGGGAT
GGCTATGGCTAGCGAGCACGACCCTCGTATCGATCCTTTCCTTTGATTCCACTTCTCCAA
GAAATCTATTTGTCCTTGTAACTTAAACATTGTATGTACTGATGAATAATGAGAACTGTA
TCCTTTCATCTG

QA 2 673 2 673
DS 



AS 1 2

CO CL2029Contig1 729 2 3 U
GGACATCTTTCCAACACACCAATCTCTCGCCAGAAAACACAGAGGATCTGAATCTCAGAT
CGAAAGAAAATGGGTTTCTCTTCCCAAGAAAACCCTTCTCTTTTCTTCTTCTTCTTCTTG
CTCTGTCTCTCCACAGTTGCTGCTTACACCAACACAAGCAGCAACAATGGCGAGGAAGGA
GGAAGAAGAGAGCTAGCTTCTTGGAGATGCAATTGGTTTAGAGGGAGTTGGGTTTATGAT
GTAACGTACCCACTTTACGATCCATATAAATGTCCATTCATCGATCCACAGTTTAACTGC
AAGAAGTATGGTCGTCCTGACAATCTTTATCTTAAGTATCGATGGCAACCTTCCTCTTGC
TCTCTCCCCAGATTCAATGGGTTGTATTTCTTGAGGAAGATGAGAGGGAAAAAGATAATG
TTCGTTGGAGATTCACTAAGCACAAACATGTGGCAATCTCTTGCTTGTCTAATTCACGCT
TGGGTTCCTAACGCTCGTTACACTCTTCTTACCCAAAAGGGTCTAGCTTCCCTCACCTTC
GAGGACTACGGAGTGACATTAAAGCTATACAGAACACAGTTCTTAGTGGATTTAGATTCA
GAGAACGTTGGACGAGTGCTTAAGCTGGATTCCATTAAGCAAGGCAAGATGTGGAGAGGC
ATTGACGTCTTGATTTTCAACAGTTGGCATTGGTGGACCCATATTGATCACATCCAGCCG
TGGGATTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW40TF U 1
AF RR2DH49TF U 1
BS 1 339 RR2DH49TF
BS 340 340 RR2DW40TF
BS 341 729 RR2DH49TF

RD RR2DW40TF 646 0 0
GGACATCTTTCCAACACACCAATCTCTCGCCAGAAAACACAGAGGATCTGAATCTCAGAT
CGAGAGAAAATGGGTTTCTCTTCCCAAGAAAACCCTTCTCTTTTCTTCTTCTTCTTCTTG
CTCTGTCTCTCCACAGTTGCTGCTTACACCAACACAAGCAGCAACAATGGCGAGGAAGGA
GGAAGAAGAGAGCTAGCTTCTTGGAGATGCAATTGGTTTAGAGGGAGTTGGGTTTATGAT
GTAACGTACCCACTTTACGATCCATATAAATGTCCATTCATCGATCCACAGTTTAACTGC
AAGAAGTATGGTCGTCCTGACAATCTTTATCTTAAGTATCGATGGCAACCTTCCTCTTGC
TCTCTCCCCAGATTCAATGGGTTGTATTTCTTGAGGAAGATGAGAGGGAAAAAGATAATG
TTCGTTGGAGATTCACTAAGCACAAACATGTGGCAATCTCTTGCTTGTCTAATTCACGCT
TGGGTTCCTAACGCTCGTTACACTCTTCTTACCCAAAAGGGTCTAGCTTCCCTCACCTTC
GAGGACTACGGAGTGACATTAAAGCTATACAGAACACAGTTCTTAGTGGATTTAGATTCA
GAGAACGTTGGACGAGTGCTTAAGCTGGATTCCATTAAGCAAGGCA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2DH49TF 729 0 0
GGACATCTTTCCAACACACCAATCTCTCGCCAGAAAACACAGAGGATCTGAATCTCAGAT
CGAAAGAAAATGGGTTTCTCTTCCCAAGAAAACCCTTCTCTTTTCTTCTTCTTCTTCTTG
CTCTGTCTCTCCACAGTTGCTGCTTACACCAACACAAGCAGCAACAATGGCGAGGAAGGA
GGAAGAAGAGAGCTAGCTTCTTGGAGATGCAATTGGTTTAGAGGGAGTTGGGTTTATGAT
GTAACGTACCCACTTTACGATCCATATAAATGTCCATTCATCGATCCACAGTTTAACTGC
AAGAAGTATGGTCGTCCTGACAATCTTTATCTTAAGTAT*GATGGCAACCTTCCTCTTGC
TCTCTCCCCAGATTCAATGGGTTGTATTTCTTGAGGAAGATGAGAGGGAAAAAGATAATG
TTCGTTGGAGATTCACTAAGCACAAACATGTGGCAATCTCTTGCTTGTCTAATTCACGCT
TGGGTTCCTAACGCTCGTTACACTCTTCTTACCCAAAAGGGTCTAGCTTCCCTCACCTTC
GAGGACTACGGAGTGACATTAAAGCTATACAGAACACAGTTCTTAGTGGATTTAGATTCA
GAGAACGTTGGACGAGTGCTTAAGCTGGATTCCATTAAGCAAGGCAAGATGTGGAGAGGC
ATTGACGTCTTGATTTTCAACAGTTGGCATTGGTGGACCCATATTGATCACATCCAGCCG
TGGGATTAC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 3

CO CL2030Contig1 975 3 16 U
CGAATTGTTCATTCAAGAGCATTTATTTAAGAGCAAAATCTCTCGAAATTTAATATTCCC
AAAAGCAATTCTAATACAATGATATCTCAGAAAGAAAAAAAAACAGAGAAGTTTTAGTCC
TGATTTTAACCAAATCAGAGGACAGGCATATCCAGAGCTTGTAACACATCCTTGAACTCA
AACTCATGAGTATGTTTATTGAACCGCTCCAGCAGTTTGTACCGATTGTCGTTCAAGTAA
AACGACTGAGCTGTATCCATCAGCCATTTCCCCTCCTCGTCTGTGAGTTTGCTTGTGAAC
ACAACATCGCCTCGGATAAACACCAGGTCTTTCGTCTCTGAAAGCTCAGTGTAGAATTTG
CTTGTCAAGTGAGGAGCCGCTTCAGTTCCTCTCGCTTTGTAGTCTTCGAGACCAGTGAAA
ATCATGTGTGGCGCTTCAACTTGAGCAAACATTGTAATGTAACCATTTCCTCTCCACAAT
GGAATAACAAAGTAACGGCACTCAGCTGCTCGTTGCTCCAACAAACGATAAAGCTGAGCT
TTCATAGTGATCCCAATATGCCCTCGTCCCAAATGATAATCGTCCCAGATCGAAGTGAGC
TCCTCCGGCGATTTGGTTTTGGCTCTATCCAAATCCATGATCGAATCCAACGGCTTCGGC
TTCAACGGTGAGAACCCGGACGCGAATCTCGAGTTTCTGACTGAACCAAGCGATGCCCAT
TTGACGTGGTTCCCGGGTAACGCTTCTGAGTGGTTACTTCCGGCATTTCGTTGCGAAGAA
GAAGATGACGACCGCGCCGTGAAGATCTGTCTCGACGGGCAACGGGAAGAATACGAAGAC
GAAGAGAGCTTCTCTGTAGCGAGACTCGAAACGGAACCGAGGATTCGCCTAAGTTTCATG
ATCGGTAAGTTCTAAGGAGCTCTCAGGGGAATTTCGTCGAACACGTTGTGTGGTAGAAGA
TCTATGTATGTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY83JQ U 10
AF RR2H308JQ U 1
AF RR2H308TF C 278
BS 1 47 RR2H308JQ
BS 48 48 RR2DY83JQ
BS 49 61 RR2H308JQ
BS 62 62 RR2DY83JQ
BS 63 89 RR2H308JQ
BS 90 94 RR2DY83JQ
BS 95 100 RR2H308JQ
BS 101 101 RR2DY83JQ
BS 102 254 RR2H308JQ
BS 255 255 RR2DY83JQ
BS 256 260 RR2H308JQ
BS 261 261 RR2DY83JQ
BS 262 272 RR2H308JQ
BS 273 273 RR2DY83JQ
BS 274 756 RR2H308JQ
BS 757 975 RR2H308TF

RD RR2DY83JQ 645 0 0
CATTCAAGAGCATTTATTTAAGAGCAAAATCTCTGGAAATTTAATATTCCCAAAAGCAAT
TCTAATACAATGATATCTCAGAAAGAAGAAAAAACAGAGAAGTTTTAGTCCTGATTTTAA
CCAAATCAGAGGACAGGCATATCCAGAGCTTGTAACACATCCTTGAACTCAAACTCATGA
GTTTGTTTATTGAACCGCTCCAGCAGTTTGTACCGGTTGTCGTTCAAGTAAAACGACTGA
GCTGTATCCATCAGCCATTTCCCCTCCTCGTCTGTGAGTTTGCTTGTGAACACAACATCA
CCTCGGATAAGCACCAAGTCTTTCGTCTCTGAAAGCTCAGTGTAGAATTTGCTTGTCAAG
TAAGGAGCCGCTTCAGTTCCTCTCGCTTTGTAGTCTTCGAGACCAGTGAAAATCATGTGT
GGCGCTTCAACTTGAGCAAACATTGTAATGTAACCATTTCCTCTCCACAATGGAATAACA
AAGTAACGGCACTCAGCTGCTCGTTGCTCCAACAAACGATAAAGCTGAGCTTTCATAGTG
ATCCCAATATGCCCTCGTCCCAAATGATAATCGTCCCAGATCTCAGTGAGCTCCTCCGGC
GATTTGGTTTTGGCTCTATCCAAATCCATGATCGAATCCAACGG
T

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2H308JQ 756 0 0
CGAATTGTTCATTCAAGAGCATTTATTTAAGAGCAAAATCTCTCGAAGTTTAATATTCCC
ACAAGCAATTCTAATACAATGATATCTCA*****AAAAAAGAACAGAGAAGTTTTAGTCC
TGATTTTAACCAAATCAGAGGACAGGCATATCCAGAGCTTGTAACACATCCTTGAACTCA
AACTCATGAGTATGTTTATTGAACCGCTCCAGCAGTTTGTACCGATTGTCGTTCAAGTAA
AACGACTGAGCTGTCTCCATGAGCCATTTCCCTTCCTCGTCTGTGAGTTTGCTTGTGAAC
ACAACATCGCCTCGGATAAACACCAGGTCTTTCGTCTCTGAAAGCTCAGTGTAGAATTTG
CTTGTCAAGTGAGGAGCCGCTTCAGTTCCTCTCGCTTTGTAGTCTTCGAGACCAGTGAAA
ATCATGTGTGGCGCTTCAACTTGAGCAAACATTGTAATGTAACCATTTCCTCTCCACAAT
GGAATAACAAAGTAACGGCACTCAGCTGCTCGTTGCTCCAACAAACGATAAAGCTGAGCT
TTCATAGTGATCCCAATATGCCCTCGTCCCAAATGATAATCGTCCCAGATCGAAGTGAGC
TCCTCCGGCGATTTGGTTTTGGCTCTATCCAAATCCATGATCGAATCCAACGGCTTCGGC
TTCAACGGTGAGAACCCGGACGCGAATCTCGAGTTTCTGACTGAACCAAGCGATGCCCAT
TTGACGTGGTTCCCGGGTAACGCTTCTGAGTGGTTA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2H308TF 698 0 0
CGTCTGTGAGTTTGCTTGTGAACACAACATCGCCTCGGATAAACACCAGGTCTTTCGTCT
CTGAAAGCTCAGTGTAGAATTTGCTTGTCAAGTGAGGAGCCGCTTCAGTTCCTCTCGCTT
TGTAGTCTTCGAGACCAGTGAAAATCATGTGTGGCGCTTCAACTTGAGCAAACATTGTAA
TGTAACCATTTCCTCTCCACAATGGAATAACAAAGTAACGGCACTCAGCTGCTCGTTGCT
CCAACAAACGATAAAGCTGAGCTTTCATAGTGATCCCAATATGCCCTCGTCCCAAATGAT
AATCGTCCCAGATCGAAGTGAGCTCCTCCGGCGATTTGGTTTTGGCTCTATCCAAATCCA
TGATCGAATCCAACGGCTTCGGCTTCAACGGTGAGAACCCGGACGCGAATCTCGAGTTTC
TGACTGAACCAAGCGATGCCCATTTGACGTGGTTCCCGGGTAACGCTTCTGAGTGGTTAC
TTCCGGCATTTCGTTGCGAAGAAGAAGATGACGACCGCGCCGTGAAGATCTGTCTCGACG
GGCAACGGGAAGAATACGAAGACGAAGAGAGCTTCTCTGTAGCGAGACTCGAAACGGAAC
CGAGGATTCGCCTAAGTTTCATGATCGGTAAGTTCTAAGGAGCTCTCAGGGGAATTTCGT
CGAACACGTTGTGTGGTAGAAGATCTATGTATGTCCCC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 3

CO CL2031Contig1 1280 3 31 U
GGAAAGAGAAACCAACATCAACATCGCTGCCTTCTGATCATTTTGCTGCCACGCTTTGAT
CTTCTCCAGGATTTTGTCTGGAGAATGTTTGTTTGAGATTTTGCAATCGAACAAGAAGAA
AAAGACCAAAATAACAAATGGCTCCTGGTAGTAAAGCAGACAAGAAAGCAACGGTAGATG
CAGCTGCTTGGATGTTCAATGTCGTTACTTCTGTCGGAATCATCATTGTCAATAAAGCTT
TAATGGCTACATACGGCTTTAGCTTTGCAACAACCTTGACCGGTCTACATTTCGCCACGA
CCACACTGATGACACTTGTTCTAAGATGTCTAGGCTACATTCAGCCCTCTCATCTTCCCT
TCACAGAGCTTCTTAAGTTCATTATATTCGCAAACTTTTCGATCGTTGGGATGAACGTTA
GTCTCATGTGGAACTCCGTTGGGTTTTATCAGATTGCAAAGCTTAGTATGATTCCTGTAG
CTTGCTTGTTGGAAGTAGTGTTCGATAAGATTCGTTACTCAAGAGACACGAAACTTAGCA
TAGGACTTGTTCTTGTGGGTGTTGGTGTTTGCACTGTTACTGATGTTAGTGTCAACACCA
AA*GGTTTCGTTGCTGCTTTTGTTGCTGTCTGGAGTACTGCTTTGCAACAATACTATGTG
CATTATCTTCAGCGAAAGTATTCACTTACATCATTCAACCTACTGGGTCATACTGCTCCA
GCTCAAGCTGCAACGTTGTTGATAGTCGGTCCATTTCTCGACTTCTGGCTGACAGAAAAA
CGAGTAGACATGTATGACTACAACGTTGTCTCTCCGATGTTTATAACCCTCTCATGCACA
ATAGCGATCGGGACAAACCTCAGCCAATTCATCTGTATTGGGAGATTCACAGCCGTGTCA
TTCCAAGTCCTGGGCCACATGAAGACGATCTTGGTGCTGATAATGGGCTTCTTCTTCTTT
GACCGGGACGGTCTAAACCTGCACGTGGTTCTCGGCATGATTATTGCAGTGCTGGGGATG
ATCTGGTACGGTAATGCCTCGTCCAAGCCAGGAGGTAAGGAGAAGAAAAGCTATTCTCTT
CCGACGGCCCGTCAACCGAAACATGGAGATGATTCGGATTCTGATGAGAAACCAAGGTTG
AAAGCTTAGCTAGCGTTAAGCGAGTTAACAATAAGTCTCTTACTACAGACATGGCACCAT
TTTTTTACTTATTCTTTCTTAGAAGAATATTGTAAAATCCTAGTATTTTAATTTATATTT
TTCAATACGAGCAACTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F851TF U 1
AF RR2B877TF U 51
AF RR2B877JQ C 423
BS 1 58 RR2F851TF
BS 59 59 RR2B877TF
BS 60 82 RR2F851TF
BS 83 83 RR2B877TF
BS 84 118 RR2F851TF
BS 119 121 RR2B877TF
BS 122 346 RR2F851TF
BS 347 347 RR2B877TF
BS 348 383 RR2F851TF
BS 384 384 RR2B877TF
BS 385 436 RR2F851TF
BS 437 437 RR2B877TF
BS 438 442 RR2F851TF
BS 443 443 RR2B877TF
BS 444 466 RR2F851TF
BS 467 467 RR2B877TF
BS 468 529 RR2F851TF
BS 530 530 RR2B877TF
BS 531 541 RR2F851TF
BS 542 542 RR2B877TF
BS 543 550 RR2F851TF
BS 551 551 RR2B877TF
BS 552 689 RR2F851TF
BS 690 690 RR2B877TF
BS 691 715 RR2F851TF
BS 716 716 RR2B877TF
BS 717 722 RR2F851TF
BS 723 723 RR2B877TF
BS 724 729 RR2F851TF
BS 730 889 RR2B877TF
BS 890 1280 RR2B877JQ

RD RR2F851TF 729 0 0
GGAAAGAGAAACCAACATCAACATCGCTGCCTTCTGATCATTTTGCTGCCACGCTTTGTT
CTTCTCCAGGATTTTGTCTGGATAATGTTTGTTTGAGATTTTGCAATCGAACAAGAAG**
*AAGACCAAAATAACAAATGGCTCCTGGTAGTAAAGCAGACAAGAAAGCAACGGTAGATG
CAGCTGCTTGGATGTTCAATGTCGTTACTTCTGTCGGAATCATCATTGTCAATAAAGCTT
TAATGGCTACATACGGCTTTAGCTTTGCAACAACCTTGACCGGTCTACATTTCGCCACGA
CCACACTGATGACACTTGTTCTAAGATGTCTAGGCTACATTCAGCCTTCTCATCTTCCCT
TCACAGAGCTTCTTAAGTTCATTCTATTCGCAAACTTTTCGATCGTTGGGATGAACGTTA
GTCTCATGTGGAACTCTGTTGGATTTTATCAGATTGCAAAGCTTAGCATGATTCCTGTAG
CTTGCTTGTTGGAAGTAGTGTTCGATAAGATTCGTTACTCAAGAGACACCAAACTTAGCA
TTGGACTTGTCCTTGTGGGTGTTGGTGTTTGCACTGTTACTGATGTTAGTGTCAACACCA
AA*GGTTTCGTTGCTGCTTTTGTTGCTGTCTGGAGTACTGCTTTGCAACAATACTATGTG
CATTATCTTCAGCGAAAGTATTCACTTACCTCATTCAACCTACTGGGTCATACTGTTCCA
GCCCAAGCT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2B877TF 839 0 0
ACGCTTTGATCTTCTCCAGGATTTTGTCTGGAGAATGTTTGTTTGAGATTTTGCAATCGA
ACAAGAAGAAAAAGACCAAAGTAACAAATGGCTCCTGGTAGTAAAGCAGACAAGAAAGCA
ACGGTAGATGCTGCTGCTTGGATGTTCAATGTCGTTACTTCTGTCGGAATCATCATTGTC
AATAAAGCTTTAATGGCTACATACGGCTTTAGCTTTGCAACAACCTTGACCGGTCTACAT
TTCGCCACGACCACACTGATGACACTTGTTCTAAGATGTCTAGGCTACATTCAGCCCTCT
CATCTTCCCTTCACAGAGCTTCTTAAGTTCATTATATTTGCAAACTTTTCGATCGTTGGG
ATGAACGTTAGTCTCATGTGGAACTCCGTTGGGTTTTATCAGATTGCAAAGCTTAGTATG
ATTCCTGTAGCTTGCTTGTTGGAAGTAGTGTTCGATAAGATTCGTTACTCAAGAGACACG
AAACTTAGCATAGGACTTGTTCTTGTGGGTGTTGGTGTTTGCACTGTTACTGATGTTAGT
GTCAACACCAAA*GGTTTCGTTGCTGCTTTTGTTGCTGTCTGGAGTACTGCTTTGCAACA
ATACTATGTGCATTATCTTCAGCGAAAGTATTCACTTACATCATTCAACCTACTGGGTCA
TACTGCTCCAGCTCAAGCTGCAACGTTGTTGATAGTCGGTCCATTTCTCGACTTCTGGCT
GACAGAAAAACGAGTAGACATGTATGACTACAACGTTGTCTCTCCGATGTTTATAACCCT
CTCATGCACAATAGCGATCGGGACAAACCTCAGCCAATTCATCTGTATTGGGAGATTCA

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR2B877JQ 858 0 0
CTCATGTGGAACTCCGTTGGGTTTTATCAGATTGCAAAGCTTAGTATGATTCCTGTAGCT
TGCTTGTTGGAAGTAGTGTTCGATAAGATTCGTTACTCAAGAGACACGAAACTTAGCATA
GGACTTGTTCTTGTGGGTGTTGGTGTTTGCACTGTTACTGATGTTAGTGTCAACACCAAA
AGGTTTCGTTGCTGCTTTTGTTGCTGTCTGGAGTACTGCTTTGCAACAATACTATGTGCA
TTATCTTCAGCGAAAGTATTCACTTACATCATTCAACCTACTGGGTCATACTGCTCCAGC
TCAAGCTGCAACGTTGTTGATAGTCGGTCCATTTCTCGACTTCTGGCTGACAGAAAAACG
AGTAGACATGTATGACTACAACGTTGTCTCTCCGATGTTTATAACCCTCTCATGCACAAT
AGCGATCGGGACAAACCTCAGCCAATTCATCTGTATTGGGAGATTCACAGCCGTGTCATT
CCAAGTCCTGGGCCACATGAAGACGATCTTGGTGCTGATAATGGGCTTCTTCTTCTTTGA
CCGGGACGGTCTAAACCTGCACGTGGTTCTCGGCATGATTATTGCAGTGCTGGGGATGAT
CTGGTACGGTAATGCCTCGTCCAAGCCAGGAGGTAAGGAGAAGAAAAGCTATTCTCTTCC
GACGGCCCGTCAACCGAAACATGGAGATGATTCGGATTCTGATGAGAAACCAAGGTTGAA
AGCTTAGCTAGCGTTAAGCGAGTTAACAATAAGTCTCTTACTACAGACATGGCACCATTT
TTTTACTTATTCTTTCTTAGAAGAATATTGTAAAATCCTAGTATTTTAATTTATATTTTT
CAATACGAGCAACTTGCC

QA 1 858 1 858
DS 



AS 1 3

CO CL2032Contig1 892 3 26 U
CTTTTAGGAAAACTAAAACAATTGTATTTTTGAGATGTCCCAGTAACTTAACAAATTAGC
ATTTAACAATCAAAGCACTATATGATGAAAGGGTGCGCAAAATTGATGAATTCAAAGTAA
TTTTATATAACTGAACTTAATATCAAAAAAAAATATCTTTCAACAAAACACAAAACTTTG
TAAAGTTGCAAGGAAAAACGGCTCAAACAATGCAAGAAAATAGCCATATTGCATCT*CAT
CAGTCTTAACACACTTGCGTCTTCTCTTCAGACACTAAATCGACTTCTTCTTGAATCATC
ATGGTTAGTGAAAGATATCTTGTCGGTGACATCAAGTATCTCCTTCCACTTCTTCCCAAT
AGCCATCAGAACAGCTTCATTAGATTTAGTCCTAGTCCACAAGGAGAGCTTGTCTTGCTT
TTGGCGGACACTAGCAACCACACCACAAATCTCATCTGACTCATCAAACTGCTCTCCAAC
TAAAGCCATCAAAGTTTCAAGCCAAGCCTTGTCTAAAGCTTGCTTCCTGTTGTTGGTAAC
AACATAAGTCCACTTGCCGCCGTTAGCACACTCAGGATCTTCCCACTTTGGCTCAACACC
AGCTTTGAACATGTGAATCTCAGCACTGGGTGTCAATCTGCTGGGAACGAATATAGTCTC
GTGCAAACCCCAGAAGTCTTCGACGGTATCGAAGGTACATGCTTTACGGAGGGAAGCTCC
CCACGCGGCGCCTTGCTTTGGTTTTGATTGGTTATCGAACCAGAAACTCCACTTTCTTTC
GAGCTTGTGAGGAGGAGGCTGCTGCTTCTCCGTCGATTCAATCGCCGTTACCTCCGCCGC
CGCAAGGGCTTCGTTCACATCCTCTGTCGCCATATTCTTCTTCGCAGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK88JQ U 108
AF RR2AS44JQ U 1
AF RR2FK88TF C 200
BS 1 128 RR2AS44JQ
BS 129 129 RR2FK88JQ
BS 130 146 RR2AS44JQ
BS 147 147 RR2FK88JQ
BS 148 160 RR2AS44JQ
BS 161 161 RR2FK88JQ
BS 162 162 RR2AS44JQ
BS 163 164 RR2FK88JQ
BS 165 172 RR2AS44JQ
BS 173 173 RR2FK88JQ
BS 174 182 RR2AS44JQ
BS 183 183 RR2FK88JQ
BS 184 236 RR2AS44JQ
BS 237 237 RR2FK88JQ
BS 238 361 RR2AS44JQ
BS 362 362 RR2FK88JQ
BS 363 573 RR2AS44JQ
BS 574 574 RR2FK88JQ
BS 575 675 RR2AS44JQ
BS 676 676 RR2FK88JQ
BS 677 780 RR2AS44JQ
BS 781 781 RR2FK88TF
BS 782 810 RR2AS44JQ
BS 811 811 RR2FK88TF
BS 812 838 RR2AS44JQ
BS 839 892 RR2FK88TF

RD RR2FK88JQ 573 0 0
GAATTCAAAGTAATTTTATATAACTTAACTTAATATTAAAAAAAAATATCTTTCAACAAA
ACACAAAACTTTGTAAAGTTGCAAGGAAAAACGGCTCAAACAATGCAAGAAAATAACCAT
ATTGCATCT*CATCAGTCTTAACACACTTGCGTCTTCTCTTCAAACACTAAATCGACTTC
TTCTTGAATCATCATGGTTAGTGAAAGATATCTTGTCGGTGACATCAAGTATCTCCTTCC
ACTTCTTCCCAATAGCCATCAAAACAGCTTCATTAAATTTAGTCCTAGTCCACAAGGAGA
GCTTGTCTTGCTTTTGGCGGACACTAGCAACCACACCACAAATCTCATCTGACTCATCAA
ACTGCTCTCCAACTAAAGCCATCAAAGTTTCAAGCCAAGCCTTGTCTAAAGCTTGCTTCC
TGTTGTTGGTAACAACATAAGTCCACTTGCCGCCGTTAGCACACTCAGGATCTTCCCACT
TTGGCTCAACACCAGCTTTGAACATGTGAATCTCAGCACTGGGTGTCAATCTGCTGGGAA
CGAATATAGTCTCGTGCAAACCCCAGAAGTCTT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2AS44JQ 838 0 0
CTTTTAGGAAAACTAAAACAATTGTATTTTTGAGATGTCCCAGTAACTTAACAAATTAGC
ATTTAACAATCAAAGCACTATATGATGAAAGGGTGCGCAAAATTGATGAATTCAAAGTAA
TTTTATATGACTGAACTTAATATCAAGAAAAAATATCTTTTAGTAAAACACAGAACTTTG
TAGAGTTGCAAGGAAAAACGGCTCAAACAATGCAAGAAAATAGCCATATTGCATCTTCAT
CAGTCTTAACACACTTGCGTCTTCTCTTCAGACACTAAATCGACTTCTTCTTGAATCATC
ATGGTTAGTGAAAGATATCTTGTCGGTGACATCAAGTATCTCCTTCCACTTCTTCCCAAT
ACCCATCAGAACAGCTTCATTAGATTTAGTCCTAGTCCACAAGGAGAGCTTGTCTTGCTT
TTGGCGGACACTAGCAACCACACCACAAATCTCATCTGACTCATCAAACTGCTCTCCAAC
TAAAGCCATCAAAGTTTCAAGCCAAGCCTTGTCTAAAGCTTGCTTCCTGTTGTTGGTAAC
AACATAAGTCCACTTGCCGCCGTTAGCACACTCTGGATCTTCCCACTTTGGCTCAACACC
AGCTTTGAACATGTGAATCTCAGCACTGGGTGTCAATCTGCTGGGAACGAATATAGTCTC
GTGCAAACCCCAGAAATCTTCGACGGTATCGAAGGTACATGCTTTACGGAGGGAAGCTCC
CCACGCGGCGCCTTGCTTTGGTTTTGATTGGTTATCGAACCAGAAACTCCACTTTCTTTC
TAGCTTGTGAGGAGGAGGCTGCTGCTTCTCGGTCGATTCAATCGCCGTTACCTCCGCC

QA 1 838 1 838
DS 

RD RR2FK88TF 693 0 0
GGCTCAAACAATGCAAGAAAATAGCCATATTGCATCT*CATCAGTCTTAACACACTTGCG
TCTTCTCTTCAGACACTAAATCGACTTCTTCTTGAATCATCATGGTTAGTGAAAGATATC
TTGTCGGTGACATCAAGTATCTCCTTCCACTTCTTCCCAATAGCCATCAGAACAGCTTCA
TTAGATTTAGTCCTAGTCCACAAGGAGAGCTTGTCTTGCTTTTGGCGGACACTAGCAACC
ACACCACAAATCTCATCTGACTCATCAAACTGCTCTCCAACTAAAGCCATCAAAGTTTCA
AGCCAAGCCTTGTCTAAAGCTTGCTTCCTGTTGTTGGTAACAACATAAGTCCACTTGCCG
CCGTTAGCACACTCAGGATCTTCCCACTTTGGCTCAACACCAGCTTTGAACATGTGAATC
TCAGCACTGGGTGTCAATCTGCTGGGAACGAATATAGTCTCGTGCAAACCCCAGAAGTCT
TCGACGGTATCGAAGGTACATGCTTTACGGAGGGAAGCTCCCCACGCGGCGCCTTGCTTT
GGTTTTGATTGGTTATCGAACCAGAAACTCCACTTTCTTTCGAGCTTGTGAGG*******
*****CTTCTCCGTCGATTCAGTCGCCGTTACCTCCGCCGCCGCAAGGGCTTCGTTCACA
TCCTCTGTCGCCATATTCTTCTTCGCAGAATCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 3

CO CL2033Contig1 721 3 10 U
GGACGGTTCACCTGCGAGCGAATGGATAATGTAACCGTTTCTCTCACTCACTCCCCCCAA
TAAGTCTTCCGGAATGAGCTTAGCTTCCGTTTCCTCGTCGCCGCCAGTGGCTTCGCCGTG
TTTCAGGTGCCGAGCTTACACATTCTCTTTCTCTCCTTCGCCTCTCCGTTTATATTTCCC
GCGCGGTGACAAAAGGCCTCGAGTTCGCTCCTTGCGAACGGAATCGGACGGCGCTAAAAC
CGGTAACACGAAGTCGTACGGCTCAGAATTGCTTCGTGAGGAAGAGGAAAGCTCCGAAGA
AGAGTTTGTGGATTGGGAAGATAAAATTCTTGAGGTTACTGTTCCTCTTGTTGGCTTCGT
CAGGATGATTCTCCACTCCGGAAAATATGCAAATCGAGATAGACTAAGCCCAGAGCACGA
GAGAACTGTTGTTGAGATGCTGCTTCCTTATCACCCTGAAGTGGACAAGAAAACCGGATG
TGGCATAGACTACATCATGGTTGGGCATCATCCAGAATTTGAGAACTCTCGATGTTTGTT
TATAGTTCAGAAAGACGGACAAGTAGTTGACTTCTCGTATTGGAAATGCATAAAAGGTTT
GATAAAACAGAAGTATCCTCTGTATGCAGACAGTTTCATCCTCCGGCATTTTCGCAAACG
TAGGCAACTCAGATGAAGAAAGGCTTATTGTAGATTTTCAAACTCAACAGCCCTTTGAGA
T


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 
15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2E593TF U 1
AF RR2BN45TF U 1
AF RR2BN45JQ C 467
BS 1 56 RR2BN45TF
BS 57 57 RR2E593TF
BS 58 132 RR2BN45TF
BS 133 133 RR2E593TF
BS 134 194 RR2BN45TF
BS 195 195 RR2E593TF
BS 196 250 RR2BN45TF
BS 251 251 RR2E593TF
BS 252 663 RR2BN45TF
BS 664 721 RR2BN45JQ

RD RR2E593TF 608 0 0
GGACGGTTCACCTGCGAGCGAATGGATAATGTAACCGTTTCTCTCACTCACTTCCCCCAA
T**GTCTTCCGGAATGAGCTTAGCTTCCGTTTCCTCGTCGCCGCCAGTGGCTTCGCCGTG
TTTCAGGTGCCGAGCTTACACATTCTCTTTCTCTCCTTCGCCTCTCCGTTTATATTTCCC
GCGCGGTGACAAAAGGCCTCGAGTTCGCTCCTTGCGAACGGAATCGGACGGCGCTAAAAC
CGGTAACACGAAGTCGTACGGCTCAGAATTGCTTCGTGAGGAAGAGGAAAGCTCCGAAGA
***GTTTGTGGATTGGGAAGATAAAATTCTTGAGGTTACTGTTCCTCTTGTTGGCTTCGT
CAGGATGATTCTCCACTCCGGAAAATATGCAAATCGAGATAGACTAAGCCCAGAGCACGA
GAGAACTGTTGTTGAGATGCTGCTTCCTTATCACCCTGAAGTTGATAAGAAAACCGGATG
TGGAATAGACTACATCATGGTTGGGCATCATCCAGAATTTGAGAACTCTCGATGTTTGTT
TATAGTTCAGAAAGATGGACAAGTAGTTGACTTCTCGTATTGGAAATGCATAAAAGGTTT
GATAAAAC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2BN45TF 676 0 0
GGACGGTTCACCTGCGAGCGAATGGATAATGTAACCGTTTCTCTCACTCACTCCCCTCAA
TAAGTCTTCCGGAATGAGCTTAGCTTCCGTTTCCTCGTCGCCGCCAGTGGCTTCGCCGTG
TTTCAGGTGCCGTGCTTACACATTCTCTTTCTCTCCTTCGCCTCTCCGTTTATATTTCCC
GCGCGGTGACAAAATGCCTCGAGTTCGCTCCTTGCGAACGGAATCGGACGGCGCTAAAAC
CGGTAACACGCAGTCGTACGGCTCAGAATTGCTTCGTGAGGAAGAGGAAAGCTCCGAAGA
AGAGTTTGTGGATTGGGAAGATAAAATTCTTGAGGTTACTGTTCCTCTTGTTGGCTTCGT
CAGGATGATTCTCCACTCCGGAAAATATGCAAATCGAGATAGACTAAGCCCAGAGCACGA
GAGAACTGTTGTTGAGATGCTGCTTCCTTATCACCCTGAAGTGGACAAGAAAACCGGATG
TGGCATAGACTACATCATGGTTGGGCATCATCCAGAATTTGAGAACTCTCGATGTTTGTT
TATAGTTCAGAAAGACGGACAAGTAGTTGACTTCTCGTATTGGAAATGCATAAAAGGTTT
GATAAAACAGAAGTATCCTCTGTATGCAGACAGTTTCATCCTCCGGCATTTTCGCAAACG
TAG
CACTCAGATGAAG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2BN45JQ 255 0 0
AAGAAAACCGGATGTGGCATAGACTACATCATGGTTGGGCATCATCCAGAATTTGAGAAC
TCTCGATGTTTGTTTATAGTTCAGAAAGACGGACAAGTAGTTGACTTTTCGTATTGGAAA
TGCATAAAAGGTTTGATAAAACAGAAGTATCCTCTGTATGCAGACAGTTTCATCCTCCGG
CATTTTCGCAAACGTAGGCAACTCAGATGAAGAAAGGCTTATTGTAGATTTTCAAACTCA
ACAGCCCTTTGAGAT

QA 1 255 1 255
DS 



AS 1 3

CO CL2034Contig1 1115 3 8 U
GGAGACTTTCCCCTTTGGATATTTTCAGACAAGATTTTCATCTATCTCCTGTTCTTCTTT
TGTTTTTCTTTATCATCTGCTTGAGCATCATTTTGTGTTCTTGTCCTCTCGAATTCTGAT
CCGATTTTATCTCTAATCAAAGCTTAGCGATTTTCAGGAAATTCGATTGATCTCTATTTC
TCTTTTGCCCTAGATTTGGAATTTCTTTTTAGAATTGGTCTTTTCCTTTTCATCGTAATT
CGATGAGTTACCGGGTCTCCGTGCCCCTCCTCCTCCTATGTGCGATAGCTGGGTCATGCT
TACCTTCCGGGCTCGCTTCCTCCGTTGACGTTTGCGATCACCATCATGAATTCAAGGTGT
TCCGATTCGGAATCGAGAGAAAGTGTCCTCCTTTTCTCTATCCCAGACCTCCTTTAGAGG
TGGATGGAGACTTGCTAGACAGACTCATGGATGCACATAACCATGGAAATGCTTATACTT
CCATACTATTTTATTCCCCTCGGTGCCCCTTCTCAACTTCAGTACGCCCAAAGTTTGATG
CTCTGAGTTCAATGTTCCCCCACATAGGTCACCTGGTTGTTGAGCAGTCTCAGGCTTTAC
CATCGGTCTTTTCTAGGTATGGTATCCATAGCTTGCCTTCAATCCTGATGGTGAATCAAA
CACTGAGGATGCGATACCATGGTCAAAAGGATCTTGCATCCCTGATTCAGTTCTACCAAC
AAACAACAGGTCTTAAACCTGTCCAGTATGTGGATGAAGCTGAACCAACAAGCTTGGACA
CCGACGGTAGCCTGATAACATGGCTACACAACGGGTCATTTTTCAGAGAGACAGCAGAAA
GAGATCCCTATTTGGTCCTTGCGCTGATGTTTTTGTTTTTGAAACCGGCGATTTTGATTT
TCCCAATCATGGGAGCGCGGTTGAAAACGTTATGGGAAGCTCATGTTCCGCATTTGAGCT
TGGGAATACTCGGTGAGACTAGCCAACTGTTCGGCCGTGCACTGCACATGATCGATGTGA
GGAGGCTTTGGATTAAACAGAGACTCAACAAAACAAGGGACTTCCAAGAGAGTGCAAAGA
ATGCACTTGCGTCTGTCTCGCTAGGAAAATTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ16TF U 20
AF RR2A766TF U 1
AF RR2CZ16JQ C 511
BS 1 264 RR2A766TF
BS 265 265 RR2CZ16TF
BS 266 498 RR2A766TF
BS 499 499 RR2CZ16TF
BS 500 586 RR2A766TF
BS 587 587 RR2CZ16TF
BS 588 763 RR2A766TF
BS 764 1115 RR2CZ16JQ

RD RR2CZ16TF 664 0 0
TATTTTCAGACAAGATTTTCATCTATCTCCTGTTCTTCTTTTGTTTTTCTTTATCATCTG
CTTGAGCATCATTTTGTGTTCTTGTCCTCTCGAATTCTGATCCGATTTTATCTCTAATCA
AAGCTTAGCGATTTTCAGGAAATTCGATTGATCTCTATTTCTCTTTTGCCCTAGATTTGG
AATTTCTTTTTAGAATTGGTCTTTTCCTTTTCATCGTAATTCGATGAGTTACCGGGTCTC
CGTGCCCCTCCTCCTCCTATGTGCGATAGCTGGGTCATGCTTACCTTCCGGGCTCGCTTC
CTCCGTTGACGTTTGCGGTCATCATCATGAATTCAAGGTGTTCCGATTCGGAATCGAGAG
AAAGTGTCCTCCTTTTCTCTATCCCAGACCTCCTTTAGAGGTGGATGGAGACTTGCTAGA
CAGACTCATGGATGCACATAACCATGGAAATGCTTATACTTCCATACTATTTTATTCCCC
TCGGTGCCCCTTCTCAACTTCAGTACGCCCAAAGTTTGATGCTCTGAGTTCAATGTTCCC
CCACATAGGTCACCTGGTTGTTGAGCAGTCTCAGGCTTTACCATCGGTCTTTTCTAGGTA
TGGTATCCATAGCTTGCCTTCAATCCTGATGGTGAATCAAACACTGAGGATGCGATACCA
TGGT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2A766TF 763 0 0
GGAGACTTTCCCCTTTGGATATTTTCAGACAAGATTTTCATCTATCTCCTGTTCTTCTTT
TGTTTTTCTTTATCATCTGCTTGAGCATCATTTTGTGTTCTTGTCCTCTCGAATTCTGAT
CCGATTTTATCTCTAATCAAAGCTTAGCGATTTTCAGGAAATTCGATTGATCTCTATTTC
TCTTTTGCCCTAGATTTGGAATTTCTTTTTAGAATTGGTCTTTTCCTTTTCATCGTAATT
CGATGAGTTACCGGGTCTCCGTGCTCCTCCTCCTCCTATGTGCGATAGCTGGGTCATGCT
TACCTTCCGGGCTCGCTTCCTCCGTTGACGTTTGCGATCACCATCATGAATTCAAGGTGT
TCCGATTCGGAATCGAGAGAAAGTGTCCTCCTTTTCTCTATCCCAGACCTCCTTTAGAGG
TGGATGGAGACTTGCTAGACAGACTCATGGATGCACATAACCATGGAAATGCTTATACTT
CCATACTATTTTATTCCCTTCGGTGCCCCTTCTCAACTTCAGTACGCCCAAAGTTTGATG
CTCTGAGTTCAATGTTCCCCCACATAGGTCACCTGGTTGTTGAGCAATCTCAGGCTTTAC
CATCGGTCTTTTCTAGGTATGGTATCCATAGCTTGCCTTCAATCCTGATGGTGAATCAAA
CACTGAGGATGCGATACCATGGTCAAAAGGATCTTGCATCCCTGATTCAGTTCTACCAAC
AAACAACAGGTCTTAAACCTGTCCAGTATGTGGATGAAGCTGA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2CZ16JQ 605 0 0
TCTCAACTTCAGTACGCCCAAAGTTTGATGCTCTGAGTTCAATGTTCCCCCACATAGGTC
ACCTGGTTGTTGAGCAGTCTCAGGCTTTACCATCGGTCTTTTCTAGGTATGGTATCCATA
GCTTGCCTTCAATCCTGATGGTGAATCAAACACTGAGGATGCGATACCATGGTCAAAAGG
ATCTTGCATCCCTGATTCAGTTTTACCAACAAACAACAGGTTTTAAACCTGTCCAGTATG
TGGATGAAGCTGAACCAACAAGCTTGGACACCGACGGTAGCCTGATAACATGGCTACACA
ACGGGTCATTTTTCAGAGAGACAGCAGAAAGAGATCCCTATTTGGTCCTTGCGCTGATGT
TTTTGTTTTTGAAACCGGCGATTTTGATTTTCCCAATCATGGGAGCGCGGTTGAAAACGT
TATGGGAAGCTCATGTTCCGCATTTGAGCTTGGGAATACTCGGTGAGACTAGCCAACTGT
TCGGCCGTGCACTGCACATGATCGATGTGAGGAGGCTTTGGATTAAACAGAGACTCAACA
AAACAAGGGACTTCCAAGAGAGTGCAAAGAATGCACTTGCGTCTGTCTCGCTAGGAAAAT
TTACT

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 4

CO CL2035Contig1 1175 4 10 U
AACTTAAAATATTTCCCACTTACAGCAACACATCATCATCTTCATGATATCACATTTTAA
ACACTTTTTAAGCGTTAATTAACTTTTTATCTTACAAACTAAAAAAAAACATAACATCAC
TTATATAATATAGAGTTACATGATTACCCTTGGTGTCATTCATATTCGTCACACTCACGA
TGATGTCAACAGTTGAAAACATCACCAGCAGTAGAAGCAGAAGCCATGATTGGTTGGTTA
TAAAACCCTAGATTGAGAGTATTCATCAGCCCGTCGTAAAATCCACCTCCGCCGCTGGGG
CCGCTGTAGTCAATTAGTCCTCCTCCCTGACCAGTCTCCATCTCAAAGGAAGACGACTCG
ACAAAGTCGACGATCTCGTTGAGGGAATCAAGGCGGTGGTTGAGCTCCAGGAGCTGAGCT
CTGAGAATGGAGTTTTCCGCCTCGATGGTGACGTAGTGCTCCGTCGTGACGGCGATCCCG
GCGACGATATGGCCGTTTTCTTTACGTAGATGAGCGACCTGAGCCGCTAGATCGTCCAAG
TGCTGCTGCTTCCTCATCCTCGACCTCCTCGCCGACTCTCTGTTCGACTGCTTCCTCTTT
CTCTTCCGCTCGTCGAGTAGGTCACGTTGTCGGAGATCAGATTCCGAACCGGAGTTTTGT
AAACCGGTCGTCGAAACAGACGGGTTGCTTGTCGAAGATCCCAGTTCAGTTTTATTCATA
TTTAATATACCAAAAACACACAGAAAAATACTAGTTCAAATAAAGACGCAGGACCCAAGT
TAGGGCTTTGTAAAATCTATAATATAATCTTATTATAAAGGTTTATATGTATATACTATA
TAGTTATAGGGCTAAAGAAGAGATGATTTATGAGAAGACATAGAACCAGTAGAGAAAGAC
GACGGAGAAAGATTGAACGAGATGGGTCCTGCGTCTAAGAGACGAATCTATAGTAAGCCC
AGATCTAAGGATTTCACTAATCACCGGAGACGACATGAATGTTTGAACATCAAGATCCAG
TTCTTTGCCACATCAATATTAGAAAAGGAAGAAAAAAAACAGAACAGGTTTTGTTTCTCG
AGAAAATAAAAAACTGAAAAAGTATAGAAAAAGGAAGACAAAAACACGAACAGTTTTAGA
AGTGATGTATGTATTCGAGAGCGAAGAGGGAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ24JQ U 1
AF RR2AG27JQ U 49
AF RR2EJ24TF C 445
AF RR2AG27TF C 499
BS 1 108 RR2EJ24JQ
BS 109 109 RR2AG27JQ
BS 110 209 RR2EJ24JQ
BS 210 210 RR2AG27JQ
BS 211 660 RR2EJ24JQ
BS 661 860 RR2AG27JQ
BS 861 1027 RR2EJ24TF
BS 1028 1028 RR2AG27TF
BS 1029 1047 RR2EJ24TF
BS 1048 1175 RR2AG27TF

RD RR2EJ24JQ 660 0 0
AACTTAAAATATTTCCCACTTACAGCAACACATCATCATCTTCATGATATCACATTTTAA
ACACTTTTTAAGCGTTAATTAACTTTTTATCTTACAAACTAAAAAAAA*CATAACATCAC
TTATATAATATAGAGTTACATGATTACCCTTGGTGTCATTCATATTCGTCACACTCACGA
TGATGTCAACAGTTGAAAACATCACCAGCGGTAGAAGCAGAAGCCATGATTGGTTGGTTA
TAAAACCCTAGATTGAGAGTATTCATCAGCCCGTCGTAAAATCCACCTCCGCCGCTGGGG
CCGCTGTAGTCAATTAGTCCTCCTCCCTGACCAGTCTCCATCTCAAAGGAAGACGACTCG
ACAAAGTCGACGATCTCGTTGAGGGAATCAAGGCGGTGGTTGAGCTCCAGGAGCTGAGCT
CTGAGAATGGAGTTTTCCGCCTCGATGGTGACGTAGTGCTCCGTCGTGACGGCGATCCCG
GCGACGATATGGCCGTTTTCTTTACGTAGATGAGCGACCTGAGCCGCTAGATCGTCCAAG
TGCTGCTGCTTCCTCATCCTCGACCTCCTCGCCGACTCTCTGTTCGACTGCTTCCTCTTT
CTCTTCCGCTCGTCGAGTAGGTCACGTTGTCGGAGATCAGATTCCGAACCGGAGTTTTGT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2AG27JQ 812 0 0
ATCACATTTTAAACACTTTTTAAGCGTTAATTAACTTTTTATCTTACAAACTAAAAAAAA
ACATAACATCACTTATATAATATAGAGTTACATGATTATCCTTGGTGTCATTCATATTCG
TCACACTCACGATGATGTCAACAGTTGAAAACATCACCAGCAGTAGAAGCAGAAGCCATG
ATTGGTTGGTTATAAAACCTTAGATTGAGAGTATTCATCAGCCCGTCGTAAAATCCACCT
CCGCCGCTGGGGCCGCTGTAGTCAATTAGTCCTCCTCCCTGACCAGTCTCCATCTCAAAG
GAAGACGACTCGACAAAGTCGACGATCTCGTTGAGGGAATCAAGGCGGTGGTTGAGCTCC
AGGAGCTGAGCTCTGAGAATGGAGTTTTCCGCCTCGATGGTGACGTAGTGCTCCGTCGTG
ACGGCGATCCCGGCGACGATATGGCCGTTTTCTTTACGTAGATGAGCGACCTGAGCCGCT
AGATCGTCCAAGTGCTGCTGCTTCCTCATCCTCGACCTCCTCGCCGACTCTCTGTTCGAC
TGCTTCCTCTTTCTCTTCCGCTCGTCGAGTAGGTCACGTTGTCGGAGATCAGATTCCGAA
CCGGAGTTTTGTAAACCGGTCGTCGAAACAGACGGGTTGCTTGTCGAAGATCCCAGTTCA
GTTTTATTCATATTTAATATACCAAAAACACACAGAAAAATACTAGTTCAAATAAAGACG
CAGGACCCAAGTTAGGGCTTTGTAAAATCTATAATATAATCTTATTATAAAGGTTTATAT
GTATATACTATATAGTTATAGGGCTAAAGAAG

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR2EJ24TF 603 0 0
ATGGTGACGTAGTGCTCCGTCGTGACGGCGATCCCGGCGACGATATGGCCGTTTTCTTTA
CGTAGATGAGCGACCTGAGCCGCTAGATCGTCCAAGTGCTGCTGCTTCCTCATCCTCGAC
CTCCTCGCCGACTCTCTGTTCGACTGCTTCCTCTTTCTCTTCCGCTCGTCGAGTAGGTCA
CGTTGTCGGAGATCAGATTCCGAACCGGAGTTTTGTAAACCGGTCGTCGAAACAGACGAG
TTGCTTGTCGAAGATCCCAGTTCAGTTTTATTCATATTTAATATACCAAAAACACACAGA
AAAATACTAGTTCAAATAAAGACGCAGGACCCAAGTTAGGGCTTTGTAAAATCTATAATA
TAATCTTATTATAAAGGTTTATATGTATATACTATATAGTTATAGGGCTAAAGAAGAGAT
GATTTATGAGAAGACATAGAACCAGTAGAGAAAGACGACGGAGAAAGATTGAACGAGATG
GGTCCTGCGTCTAAGAGACGAATCTATAGTAAGCCCAGATCTAAGGATTTCACTAATCAC
CGGAGACGACATGAATGTTTGAACATCAAGATCCAGTTCTTTGTCACATCAATATTAGAA
AAG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2AG27TF 677 0 0
TCTTTACGTAGATGAGCGACCTGAGCCGCTAGATCGTCCAAGTGCTGCTGCTTCCTCATC
CTCGACCTCCTCGCCGACTCTCTGTTCGACTGCTTCCTCTTTCTCTTCCGCTCGTCGAGT
AGGTCACGTTGTCGGAGATCAGATTCCGAACCGGAGTTTTGTAAACCGGTCGTCGAAACA
GACGGGTTGCTTGTCGAAGATCCCAGTTCAGTTTTATTCATATTTAATATACCAAAAACA
CACAGAAAAATACTAGTTCAAATAAAGACGCAGGACCCAAGTTAGGGCTTTGTAAAATCT
ATAATATAATCTTATTATAAAGGTTTATATGTATATACTATATAGTTATAGGGCTAAAGA
AGAGATGATTTATGAGAAGACATAGAACCAGTAGAGAAAGACGACGGAGAAAGATTGAAC
GAGATGGGTCCTGCGTCTAAGAGACGAATCTATAGTAAGCCCAGATCTAAGGATTTCACT
AATCACCGGAGACGACATGAATGTTTGAACATCAAGATCCAGTTCTTTGCCACATCAATA
TTAGAAAAGGAAGAAAAAAAACAGAACAGGTTTTGTTTCTCGAGAAAATAAAAAACTGAA
AAAGTATAGAAAAAGGAAGACAAAAACACGAACAGTTTTAGAAGTGATGTATGTATTCGA
GAGCGAAGAGGGAAGCC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL2036Contig1 1006 2 4 U
GTATCCAAAAAAAACCAATCGACGTCGTATTCTGAAAAGCACACGATCATGGCGATGCTC
ATGGCCTCAAGGTTTAACAGTGAAGCTAAGATCGCGTCTCGATTCCTGTCAACACTCTTG
AGAAACCAAAGAGCGATAGCCTCATCATCATCATCATCATCCATTGCATCCGCATCTTCC
TCCTCTGGTCTCCTCCTTAACCCGTTGACTTCCTCTACTCTCCGTCACTTCAGATCCTCG
CCGGAGATCTCTTCTCTCTCCTTCTCCTCTTTAACGACGAAGAGTCAGCAGAGTCGGAGT
TTTGGAGATGTCTCGAAGCGAGATCCGTCTGTTAAGCGTGAGACTGGAGCTGATGGACTC
AACATCGCTGAGAATGTGTCTCAGCTCATTGGGAAAACTCCTATGGTGTACTTGAATAGC
ATGGCAAAAGGTTGTGTAGCAAGCATTGCTGCTAAGCTCGAGATCATGGAGCCATGTTGC
AGTGTCAAGGACAGGATTGGGTACAGTATGGTTACTGATGCTGAACAAAAAGGATTCATA
TCACCTGGAAAGAGTGTGCTTGTGGAACCTACAAGTGGGAACACGGGTATTGGACTTGCG
TTTATCGCTGCTTCTAGAGGCTATAGACTTATCCTGACAATGCCTTCATCCATGAGTATG
GAGAGAAGAGTTCTCTTGAAGGCGTTTGGAGCTGAGCTTGTGTTAACAGATCCTGCAAAA
GGCATGACTGGTGCAGTTCAGAAGGCTGAGGAAATCTTGAAATCAACTCCTGATGCTTAC
ATGCTCCAACAGTTTGACAACCCTGCCAATCCAAAGATCCATTATGAGACTACTGGTCCT
GAGATATGGGAAGATACAAAGGGGAAAGTGGATATATTCGTTGCAGGATTGGAACTGGTG
GGACTATCACTGGTGTTGGTCGATTCATCAAGAGCAAACCCCAAAGTGCAGTTATTGGTG
TTGACCTACGAAAGCGACATACTTTCCGTGCAACCAGACTCACAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP70TF U 1
AF RR2DO42TF U 312
BS 1 557 RR2GP70TF
BS 558 558 RR2DO42TF
BS 559 576 RR2GP70TF
BS 577 1006 RR2DO42TF

RD RR2GP70TF 576 0 0
GTATCCAAAAAAAACCAATCGACGTCGTATTCTGAAAAGCACACGATCATGGCGATGCTC
ATGGCCTCAAGGTTTAACAGTGAAGCTAAGATCGCGTCTCGATTCCTGTCAACACTCTTG
AGAAACCAAAGAGCGATAGCCTCATCATCATCATCATCATCCATTGCATCCGCATCTTCC
TCCTCTGGTCTCCTCCTTAACCCGTTGACTTCCTCTACTCTCCGTCACTTCAGATCCTCG
CCGGAGATCTCTTCTCTCTCCTTCTCCTCTTTAACGACGAAGAGTCAGCAGAGTCGGAGT
TTTGGAGATGTCTCGAAGCGAGATCCGTCTGTTAAGCGTGAGACTGGAGCTGATGGACTC
AACATCGCTGAGAATGTGTCTCAGCTCATTGGGAAAACTCCTATGGTGTACTTGAATAGC
ATGGCAAAAGGTTGTGTAGCAAGCATTGCTGCTAAGCTCGAGATCATGGAGCCATGTTGC
AGTGTCAAGGACAGGATTGGGTACAGTATGGTTACTGATGCTGAACAAAAAGGATTCATA
TCACCTGGAAAGAGTGTTCTTGTGGAACCTACAAGT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2DO42TF 695 0 0
G
TCGAAGCGAGATCCGTCTGTTAAGCGTGAGACTGGAGCTGATGGACTCAACATCGCTGAG
AATGTGTCTCAGCTCATTGGGAAAACTCCTATGGTGTACTTGAATAGCATGGCAAAAGGT
TGTGTAGCAAGCATTGCTGCTAAGCTCGAGATCATGGAGCCATGTTGCAGTGTCAAGGAC
AGGATTGGGTACAGTATGGTTACTGATGCTGAACAAAAAGGATTCATATCACCTGGAAAG
AGTGTGCTTGTGGAACCTACAAGTGGGAACACGGGTATTGGACTTGCGTTTATCGCTGCT
TCTAGAGGCTATAGACTTATCCTGACAATGCCTTCATCCATGAGTATGGAGAGAAGAGTT
CTCTTGAAGGCGTTTGGAGCTGAGCTTGTGTTAACAGATCCTGCAAAAGGCATGACTGGT
GCAGTTCAGAAGGCTGAGGAAATCTTGAAATCAACTCCTGATGCTTACATGCTCCAACAG
TTTGACAACCCTGCCAATCCAAAGATCCATTATGAGACTACTGGTCCTGAGATATGGGAA
GATACAAAGGGGAAAGTGGATATATTCGTTGCAGGATTGGAACTGGTGGGACTATCACTG
GTGTTGGTCGATTCATCAAGAGCAAACCCCAAAGTGCAGTTATTGGTGTTGACCTACGAA
AGCGACATACTTTCCGTGCAACCAGACTCACAGA

QA 2 695 2 695
DS 



AS 2 4

CO CL2037Contig1 704 2 2 U
GGACAACACAACAAAACTGCAACGAACAATGGCGAGCGCAGATCCTGAATCCACCAACAA
ACCATCGTCCACGGACATGGACCTTAAGAAGGTCTTCAACCAGTTCGACGCCAACGGCGA
CGGTAAGATCTCTGTCTCTGAGCTCGGCAACGTTTTCAAATCCATGGGAACGTCGTACAC
GGAGGCGGAGCTCAACCAAGTGTTGGACGACATCGACATCGACCGCGACGGTTTCATCAA
CATGGAGGAGTTCGCCGCCATCTGCCGCTCATCCTCCTCCGCCACAGAGGTACGTGAAGC
CTTCGATCTCTACGACCAGAACAAGAACGGTCTGATCTCGTCCTCAGAGATCCACAAGGT
TCTCAACCGTCTAGGTATGACGTGTTCCGAAGAAGACTGCGTGAAAATGATCGGGCGTGT
TGACACTGACGGCGACGGAAACGTTAACTTCGAGGAGTTCAAGAAGATGATGTCTTCACC
TGAACTGCTCAACAAGCAAGGATCCGCCTAGGGTTCCGATTCGCCCTAATTTTTTTATGT
TGGATAATGAGATCCATGGTTACATATAATATTGTATGCTACTTGTTTACATTTCTAGGT
TGACAAACAAATCGTTCTCTTCCTATATATGGAATGATGAACGTCTTACCTGTGCAAGTA
TAATTACTTGCTGTTTAAGCAATCGATAAACATATTTAAACTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2BB93JQ C 1
AF RR2BB93TF U 1
BS 1 702 RR2BB93TF
BS 703 704 RR2BB93JQ

RD RR2BB93JQ 704 0 0
GGACAACACAACAAAACTGCAACGAACAATGGCGAGCGCAGATCCTGAATCCACCAACAA
ACCATCGTCCACGGACATGGACCTTAAGAAGGTCTTCAACCAGTTCGACGCCAACGGCGA
CGGTAAGATCTCTGTCTCTGAGCTCGGCAACGTTTTCAAATCCATGGGAACGTCGTACAC
GGAGGCGGAGCTCAACCAAGTGTTGGACGACATCGACATCGACCGCGACGGTTTCATCAA
CATGGAGGAGTTCGCCGCCATCTGCCGCTCATCCTCCTCCGCCACAGAGGTACGTGAAGC
CTTCGATCTCTACGACCAGAACAAGAACGGTCTGATCTCGTCCTCAGAGATCCACAAGGT
TCTCAACCGTCTAGGTATGACGTGTTCCGAAGAAGACTGCGTGAAAATGATCGGGCGTGT
TGACACTGACGGCGACGGAAACGTTAACTTCGAGGAGTTCAAGAAGATGATGTCTTCACC
TGAACTGCTCAACAAGCAAGGATCCGCCTAGGGTTCCGATTCGCCCTAATTTTTTTATGT
TGGATAATGAGATCCATGGTTACATATAATATTGTATGCTACTTGTTTACATTTCTAGGT
TGACAAACAAATCGTTCTCTTCCTATATATGGAATGATGAACGTCTTACCTGTGCAAGTA
TAATTACTTGCTGTTTAAGCAATCGATAAACATATTTAAACTCC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2BB93TF 703 0 0
GGACAACACAACAAAACTGCAACGAACAATGGCGAGCGCAGATCCTGAATCCACCAACAA
ACCATCGTCCACGGACATGGACCTTAAGAAGGTCTTCAACCAGTTCGACGCCAACGGCGA
CGGTAAGATCTCTGTCTCTGAGCTCGGCAACGTTTTCAAATCCATGGGAACGTCGTACAC
GGAGGCGGAGCTCAACCAAGTGTTGGACGACATCGACATCGACCGCGACGGTTTCATCAA
CATGGAGGAGTTCGCCGCCATCTGCCGCTCATCCTCCTCCGCCACAGAGGTACGTGAAGC
CTTCGATCTCTACGACCAGAACAAGAACGGTCTGATCTCGTCCTCAGAGATCCACAAGGT
TCTCAACCGTCTAGGTATGACGTGTTCCGAAGAAGACTGCGTGAAAATGATCGGGCGTGT
TGACACTGACGGCGACGGAAACGTTAACTTCGAGGAGTTCAAGAAGATGATGTCTTCACC
TGAACTGCTCAACAAGCAAGGATCCGCCTAGGGTTCCGATTCGCCCTAATTTTTTTATGT
TGGATAATGAGATCCATGGTTACATATAATATTGTATGCTACTTGTTTACATTTCTAGGT
TGACAAACAAATCGTTCTCTTCCTATATATGGAATGATGAACGTCTTACCTGTGCAAGTA
TAATTACTTGCTGTTTAAGCAATCGATAAACATATTTAAACT
C

QA 1 702 1 702
DS 



CO CL2037Contig2 711 2 4 U
GGACAACACAACAAAACTGCAACGAACAATGGCGAGCGCAGATCCTGAATCCACCAACAA
ACCATCGTCCACGGACATGGACCTTAAGAAGGTCTTCAACCAGTTCGACGCCAACGGCGA
CGGTAAGATCTCTGTCTCTGAGCTCGGCAACGTTTTCAAATCCATGGGAACGTCGTACAC
GGAGGCAGAGCTCAACCAAGTGTTGGACGACATCGACATCGACCGCGACGGTTTCATCAA
CATGGAGGAGTTCGCCGCCATCTGCCGCTCGTCCTCCTCTGCCACAGAGGTACGTGAAGC
CTTCGATCTCTACGACCAGAACAAGAACGGTCTGATCTCGTCCTCCGAGATCCACAAGGT
TCTCAACCGTCTAGGTATGACGTGTTCCGAAGAAGACTGCGTGAAAATGATCGGGCGTGT
TGACACTGACGGCGACGGAAACGTTAACTTCGAGGAGTTCAAGAAGATGATGTCGTCACC
TGAACTTCTCAACAAGCAAGGATCCGCCTAGGGTTCCGATTCGCCCTAATTTTTATGTTG
GATAATGAGATCCATGGTTACATATAATATTGTATAATGCTACTTGTTTACATTTCTAGT
CAACAAACAAATCGTTCTCTTCCTATGTATGGAATGATGAACGTCTTACCTGTGCAAGTA
TGATTACTTGCAGTTTAAGCAATCGATAAACATATTTAAACTTCAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR59TF U 1
AF RR2CR59JQ C 52
BS 1 689 RR2CR59TF
BS 690 690 RR2CR59JQ
BS 691 702 RR2CR59TF
BS 703 711 RR2CR59JQ

RD RR2CR59TF 704 0 0
GGACAACACAACAAAACTGCAACGAACAATGGCGAGCGCAGATCCTGAATCCACCAACAA
ACCATCGTCCACGGACATGGACCTTAAGAAGGTCTTCAACCAGTTCGACGCCAACGGCGA
CGGTAAGATCTCTGTCTCTGAGCTCGGCAACGTTTTCAAATCCATGGGAACGTCGTACAC
GGAGGCAGAGCTCAACCAAGTGTTGGACGACATCGACATCGACCGCGACGGTTTCATCAA
CATGGAGGAGTTCGCCGCCATCTGCCGCTCGTCCTCCTCTGCCACAGAGGTACGTGAAGC
CTTCGATCTCTACGACCAGAACAAGAACGGTCTGATCTCGTCCTCCGAGATCCACAAGGT
TCTCAACCGTCTAGGTATGACGTGTTCCGAAGAAGACTGCGTGAAAATGATCGGGCGTGT
TGACACTGACGGCGACGGAAACGTTAACTTCGAGGAGTTCAAGAAGATGATGTCGTCACC
TGAACTTCTCAACAAGCAAGGATCCGCCTAGGGTTCCGATTCGCCCTAATTTTTATGTTG
GATAATGAGATCCATGGTTACATATAATATTGTATAATGCTACTTGTTTACATTTCTAGT
CAACAAACAAATCGTTCTCTTCCTATGTATGGAATGATGAACGTCTTACCTGTGCAAGTA
TGATTACTTGCAGTTTAAGCAATCGATAA*CATATTTAAACT
TC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2CR59JQ 660 0 0
CACCAACAAACCATCGTCCACGGACATGGACCTTAAGAAGGTCTTCAACCAGTTCGACGC
CAACGGCGACGGTAAGATCTCTGTCTCTGAGCTCGGCAACGTTTTCAAATCCATGGGAAC
GTCGTACACGGAGGCAGAGCTCAACCAAGTGTTGGACGACATCGACATCGACCGCGACGG
TTTCATCAACATGGAGGAGTTCGCCGCCATCTGCCGCTCGTCCTCCTCTGCCACAGAGGT
ACGTGAAGCCTTCGATCTCTACGACCAGAACAAGAACGGTCTGATCTCGTCCTCCGAGAT
CCACAAGGTTCTCAACCGTCTAGGTATGACGTGTTCCGAAGAAGACTGCGTGAAAATGAT
CGGGCGTGTTGACACTGACGGCGACGGAAACGTTAACTTCGAGGAGTTCAAGAAGATGAT
GTCGTCCCCTGAACTTCTCAACAAGCAAGGATCCGCCTAGGGTTCCGATTCGCCCTAATT
TTTATGTTGGATAATGAGATCCATGGTTACATATAATATTGTATAATGCTACTTGTTTAC
ATTTCTAGTCAACAAACAAATCGTTCTCTTCCTATGTATGGAATGATGAACGTCTTACCT
GTGCAAGTATGATTACTTGCAGTTTAAGCAATCGATAAACATATTTAAACTTCAAAAAAA

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL2038Contig1 833 2 5 U
ACTCGGAACAACGGAACTTGCACATTGGAACTTGAAGAATGTGTAAAGTTAATCACCATT
TTCTAACTCAATGTATGAAGTCTATACTTTAAATAAACTATAGTAAGATGTGAATCAATG
AAGCAGTTTGTGCGAGCACTTAGAACAGGGGATATAGCACCATCCTTGTCAATATCAGCC
ACCTCAGCCTTGCAAATGGACTCCACAGCCTCAGCTTGATAGAGTCTTAGTAGTGGACTT
GCTAAGTGGATGTACAGTCGGGGTTGAGTTGAGAAAGTAGCTATCAATCTCCTGGTCTTA
ACACCACCATACTTGGATGTAGTTGAAGAGGATCCAGCCCCACCTCCACAAAACTCTTTT
AAAAATCCCTGCGTGGCTCAGTTTTTGTTGTCAAAGAGTGTGATCCTGTACGTTTGAATA
ATTCTCATCTGGAATGAAATCAATATGGTTCACCAACTCGAAAAAGTTGGTATGCCCTGT
AAATCAAACACAGACCGGTGGGTCACACAGCTTGAAGTGAATGTTGCTTCTAGCAACATA
AGGATAACTGAGCTAGTACACTCTTCCTTCCCTCTGTAGATTCTTGAAACTGTTAAGCCG
GTGTGGGGACGATGGAACCTTGTATCAAGGTTGACTTCTCGTCCAAACAACATGTCAACT
CCAATAAGTTCGCCTCTTTTCTTCAGATTCCGAGCTTCCCATAATGGAAGCAAACGGCCC
ACCACAATCTCCTTACAACGGCCAATCTTCAGATTAGAAGGGTTCACTTAGGAAGTCGCC
ATTACAGTGAGCCGAAGAATCGCCATTCAATGGCACGTTGTGGGGATAATTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL55JQ U 41
AF RR2A442JQ U 1
BS 1 199 RR2A442JQ
BS 200 200 RR2GL55JQ
BS 201 643 RR2A442JQ
BS 644 644 RR2GL55JQ
BS 645 833 RR2A442JQ

RD RR2GL55JQ 630 0 0
GTGTAGAGTTAATCACCATTTTCTAACTCGATGTATGAAGTCTATACTTTAAATAAACTA
TAGTAAGATGTGAATCAATGAAGCAGTTTGTGCGAGCACTTAGAACAGGGGATATAGCAC
CATCCTTGTCAATATCAGCCACCTCAGCCTTGCAAATGGACTCCACAGCCTCAGCTTGAT
AGAGTCTTAGTAGTGGACTTGCTAAGTGGATGTACAGTCGGGGTTGAGTTGAGAAAGTAG
CTATCAATCTCCTGGTCTTAACACCACCATACTTGGATGTAGTTGAAGAGGATCCAGCCC
CACCTCCACAAAACTCTTTTAAAAATCCCTGCGTGGCTCAGTTTTTGTTGTCAAAGAGTG
TGATCCTGTACGTTTGAATAATTCTCATCTGGAATGAAATCAATATGGTTCATCAACTCG
AAAAAGTTGGTATGCCCTGTAAATCAAACACAGACCGGTGGGTCACACAGCTTGAAGTGA
ATGTTGCTTCTAGCAACATAAGGATAACTGAGCTAGTACACTCTTCCTTCCCTCTGTAGA
TTCTTGAAACTGTTAAGCCGGTGTGGGGACGATGGAACCTTGTATCAAGGTTGGCTTCTC
GTCCAAACAACATGTCAACTCCAATAAGTT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2A442JQ 833 0 0
ACTCGGAACAACGGAACTTGCACATTGGAACTTGAAGAATGTGTAAAGTTAATCACCATT
TTCTAACTCAATGTATGAAGTCTATACTTTAAATAAACTATAGTAAGATGTGAATCAATG
AAGCAGTTTGTGCGAGCACTTAGAACAGGGGATATAGCACCATCCTTGTCAATATCAGCC
ACCTCAGCCTTGCAAATGGGCTCCACAGCCTCAGCTTGATAGAGTCTTAGTAGTGGACTT
GCTAAGTGGATGTACAGTCGGGGTTGAGTTGAGAAAGTAGCTATCAATCTCCTGGTCTTA
ACACCACCATACTTGGATGTAGTTGAAGAGGATCCAGCCCCACCTCCACAAAACTCTTTT
AAAAATCCCTGCGTGGCTCAGTTTTTGTTGTCAAAGAGTGTGATCCTGTACGTTTGAATA
ATTCTCATCTGGAATGAAATCAATATGGTTCACCAACTCGAAAAAGTTGGTATGCCCTGT
AAATCAAACACAGACCGGTGGGTCACACAGCTTGAAGTGAATGTTGCTTCTAGCAACATA
AGGATAACTGAGCTAGTACACTCTTCCTTCCCTCTGTAGATTCTTGAAACTGTTAAGCCG
GTGTGGGGACGATGGAACCTTGTATCAAGGTTGACTTCTCGTCTAAACAACATGTCAACT
CCAATAAGTTCGCCTCTTTTCTTCAGATTCCGAGCTTCCCATAATGGAAGCAAACGGCCC
ACCACAATCTCCTTACAACGGCCAATCTTCAGATTAGAAGGGTTCACTTAGGAAGTCGCC
ATTACAGTGAGCCGAAGAATCGCCATTCAATGGCACGTTGTGGGGATAATTGA

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 4

CO CL2039Contig1 880 4 11 U
GATAGATGCACTCATTTAGCAATGATCTAAAATCAAAGTTGTGCTGCTATTACATAATTC
ATCAAAAACCATATAGTAAAAACTAATCTTGGAAAGAAGTACGAGTGAAACACGATGTTC
TGTTTTTAACTAAGAGAGTAGAGAAACACAAAGAAAAGCATCAGAAGTGAAATCTACAGT
TCGTCCTTGGTTGGTGTCTCTTCCTCAACAGGTTCGGCTTCAATGTTTAGACCACCAGGC
AAGTCATCTGATTTTGTCTCAGTAGCTTCCTCACTGGTATCCGTCTCCTCTGCCTCGACT
TCCTCTTCGGCAACGGCATCAGGGCTGATCTTCAGGCTGCTCTTGACGGAGTTGTAGATA
CGGCCTGCAAAGTCCTTTGGGTCGTTGAGTATGAATCCACTCTCGATCAAAGCTGTCTGG
TACATGAGCTGTGCTGTTTCTTTCACACTCTCATCCTCTGGGTCGCTAGCAACTCTTTCC
TTGAGTTCTTTGATGATTGGGTGTCGTGGGTTGATCTCAAGGACTCGCTTTCCTCGCATG
TAAGCCTGCTTGTTTGCGTCGGAGAGAGTTTGGGACTGCATGATCCTCTCCATGTTTGCA
CTCCATCCAAACTTGGACGTTACAACTACACAGGGAGTGTCGGCCAATCGGTTACTGATT
TTAACATCGTCCACGTTCTCACTAGCGAGACTCTCTTTCCACCACTTGGTTAGCTCCTTG
AAAGCTTCTTTTAGCTCCTTCACTTTAGAATCTTTCCCAACCTTCAATCCTTCTTTTGAC
ACATTCTGGAACTTCTTGTCCTCGTAATCCATCAGTACTGCATCAAGTACTCATCAACAG
GTCTGTGAAGAAGATGACCTCATAGCCCTTTTGATGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS92TF C 1
AF RR2BP49JQ U 16
AF RR2DZ32JQ U 81
AF RR2G682JQ U 75
BS 1 16 RR2BS92TF
BS 17 163 RR2BP49JQ
BS 164 164 RR2G682JQ
BS 165 174 RR2BP49JQ
BS 175 175 RR2G682JQ
BS 176 356 RR2BP49JQ
BS 357 357 RR2DZ32JQ
BS 358 563 RR2BP49JQ
BS 564 564 RR2G682JQ
BS 565 745 RR2BP49JQ
BS 746 880 RR2G682JQ

RD RR2BS92TF 441 0 0
GATAGATGCACTCATTTAGCAATGATCTAGAATCAAAGTTGTGCTGCTATTACATAATTC
ATCAAAAACCATATAGTAAAAACTAATCTTGGAAAGAAGTACGAGTGAAACACGATGTTC
TGTTTTTAACTAAGAGAGTAGAGAAACACAAAGAAAAGCATCAGAAGTGAAATCTACAGT
TCGTCCTTGGTTGGTGTCTCTTCCTCAACAGGTTCGGCTTCAATGTTTAGACCACCAGGC
AAGTCATCTGATTTTGTCTCAGTAGCTTCCTCACTGGTATCCGTCTCCTCTGCCTCGACT
TCCTCTTCGGCAACGGCATCAGGGCTGATCTTCAGGCTGCTCTTGACGGAGTTGTAGATA
CGGCCTGCAAAGTCCTTTGGGTCGTTGAGTATGAATCCACTCTCGATCAAAGCTGTCTGG
TACATGAGCTGTGCTGTTTC
C

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR2BP49JQ 730 0 0
C
TAGCAATGATCTAAAATCAAAGTTGTGCTGCTATTACATAATTCATCAAAAACCATATAG
TAAAAACTAATCTTGGAAAGAAGTACGAGTGAAACACGATGTTCTGTTTTTAACTAAGAG
AGTAGAGAAACACAAAGAAAAGCATCAAAAGTGAAATCCACAGTTCGTCCTTGGTTGGTG
TCTCTTCCTCAACAGGTTCGGCTTCAATGTTTAGACCACCAGGCAAGTCATCTGATTTTG
TCTCAGTAGCTTCCTCACTGGTATCCGTCTCCTCTGCCTCGACTTCCTCTTCGGCAACGG
CATCAGGGCTGATCTTCAGGCTGCTCTTGACGGAGTTGTAAATACGGCCTGCAAAGTCCT
TTGGGTCGTTGAGTATGAATCCACTCTCGATCAAAGCTGTCTGGTACATGAGCTGTGCTG
TTTCTTTCACACTCTCATCCTCTGGGTCGCTAGCAACTCTTTCCTTGAGTTCTTTGATGA
TTGGGTGTCGTGGGTTGATCTCAAGGACTCGCTTTCCTCGCATGTAAGCCTGCTTGTTTG
CGTCGGAAAGAGTTTGGGACTGCATGATCCTCTCCATGTTTGCACTCCATCCAAACTTGG
ACGTTACAACTACACAGGGAGTGTCGGCCAATCGGTTACTGATTTTAACATCGTCCACGT
TCTCACTAGCGAGACTCTCTTTCCACCACTTGGTTAGCTCCTTGAAAGCTTCTTTTAGCT
CCTTCACTT

QA 2 730 2 730
DS 

RD RR2DZ32JQ 708 0 0
AACTAATCTTGGAAAGAAGTACGAGTGAA*CACGATGTTCTGTTTTTAACTAAGAGAGTA
GAGAAACACAAAGAAAAGCATCAGAAGTGAAATCTACAGCTCGTCCTTGGTTGGTGTCTC
TTCCTCAACAGGTTCGGCTTCAATGTTTAGACCACCAGGCAAGTCATCTGATTTTGTCTC
AGTAGCTTCCTCACTGGTATCCGTCTCCTCTGCCTCGACTTCCTCTTCGGCAACGGTATC
AGGGCTGATCTTCAGGCTGCTCTTGACGGAGTTGTAGATACGGCCTGCAAAGTCCTTTGG
GTCGTTGAGTATGAATCCACTCTCGATCAAAGCTGTCTGGTACATGAGCTGTGCTGTTTC
TTTCACACTCTCATCCTCTGGGTCGCTAGCAACTCTTTCCTTGAGTTCTTTGATGATTGG
GTGTCGTGGGTTGATCTCAAGGACTCGCTTTCCTCGCATGTAAGCCTGCTTGTTTGCGTC
GGAGAGAGTTTGGGACTGCATGATCCCCTCCATGTTTGCACTCCATCCAAACTTGGACGT
TACAACTACACAGGGAGTGTCGGCCAATCGGTTACTGATTTTAACATCGTCCACGTTCTC
ACTAGCGAGACTCTCTTTCCACCACTTGGTTAGCTCCTTGAAAGCTTCTTTTAGCTCCTT
CACTTTAGAATCTTTCCCAACCTTCAGTCCTTCTTTTGACACATTCTG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2G682JQ 806 0 0
AGTAAA
AACTAATCTTGGAAAGAAGTACGAGTGAAACACGATGTTCTGTTTTTAACTAAGAGAGTA
GAGAAACACAAAGAAAAACATCAGAAGTGAAATCTACAGTTCGTCCTTGGTTGGTGTATC
TTCCTCAACAGGTTCGGCTTCAATGTTTAGACCACCAGGCAAGTCATCTGATTTTGTCTC
AGTAGCTTCCTCACTGGTCTCCGTCTCCTCTGCCTCTACTTCCTCTTCGGCTACGGCATC
AGGGCTGATCTTCAGGCTGCTCTTGACGGAGTTGTAAATACGGCCTGCAAAGTCCTTGGG
GTCGTTGAGTATGAATCCACTCTCGATCAAAGCTGTCTGGTACATGAGCTGTGCTGTTTC
TTTCACACTCTCATCCTCTGGGTCGATAGCAACTCTTTCCTTGAGTTCTTTGATGATTGG
GTGTCGTGGGTTGATCTCAAGGACTCGCTTTCCTCGCATGTAAGCTTGCTTGTTTGCGTC
GGAGAGAGTTTGGGACTGCATGATCCTCTCCATGTTTGCACTCCATCCAAACTTGGACGT
TACAACTACACAGGGAGTGTCGGCCAATCGGTTACTGATTTTAACATCGTCCACGTTCTC
ACTAGCGAGACTCTCTTTCCACCACTTGGTTAGCTCCTTGAAAGCTTCTTTCAGCTCCTT
CACTTTAGAATCTTTCCCAACCTTCAATCCTTCTTTTGACACATTCTGGAACTTCTTGTC
CTCGTAATCCATCAGTACTGCATCAAGTACTCATCAACAGGTCTGTGAAGAAGATGACCT
CATAGCCCTTTTGATGAGCC

QA 7 806 7 806
DS 



AS 1 4

CO CL2040Contig1 840 4 8 U
GGGGAAGCGCGGTGAAGGAATTCAAAGAAGGAGACGAAGTATACGCGAACGTGAGCGAGA
AAGCATTGGAAGGACCGAAGCAATCCGGTTCTCTGGCGGAGTACACTGCCGTGGAAGAGA
AGCTATTAGCCTTAAAGCCTAAAAACATCGATTTCGCTCAAGCAGCAGGGCTTCCACTGG
CTATTGAAACCGCCGACGAAGGTCTCGTTAGGACGGAGTTCTCCGCCGGAAAATCAATCA
TCGTTCTTAACGGCGCCGGAGGAGTAGGAAGCCTTGCGATTCAGCTTGCGAAGCACGTCT
ATGGAGCTTCGAAGGTTGCTGCAACAGCGAGCACTGGGAAGCTAGAGCTAGTGAGAAGCT
TAGGTGCTGATTTAGCTATTGACTACACTAAGGAGAACATTGAAGACTTGACTGACAAAT
TCGATGTCGTCTTTGACGCCATTGGGATGTGTGATAAGGCGG*TGAAGGTGATTAAGGAA
GGAGGGAAGGTTGTGGCCTTGACCGGAGCTGTCACGCCTCCTGGTTTCAGATTCGTTGTG
ACATCTAACGGCGATGTTTTGAAGAAACTGAATCCATACATTGAGAGTGGGAAGGTGAAG
CCTGTGGTCGACCCCAAAGGACCTTTCCCATTTTCGCGCGTGGCTGATGCTTTCTCATAC
CTAGAAACGAACCATGCCACAGGAAAGGTCGTTGTATATCCTATCCCTTGAGTTGCTTTA
AGTGTAGCCTTATTTGTACGTGAGCAAGTATCAAAAGTCCTTGTAGAGTGTTTTGAGTTA
TGAACTCATATGAATATGGAAAACTAAAAATTGCTATTTGTAGCTTATTCATTACAGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C487TF U 1
AF RR2C487JQ C 100
AF RR2AN09JQ C 213
AF RR2AN09TF U 213
BS 1 309 RR2C487TF
BS 310 310 RR2AN09TF
BS 311 459 RR2C487TF
BS 460 460 RR2AN09TF
BS 461 462 RR2C487TF
BS 463 463 RR2AN09TF
BS 464 477 RR2C487TF
BS 478 840 RR2AN09TF

RD RR2C487TF 477 0 0
GGGGAAGCGCGGTGAAGGAATTCAAAGAAGGAGACGAAGTATACGCGAACGTGAGCGAGA
AAGCATTGGAAGGACCGAAGCAATCCGGTTCTCTGGCGGAGTACACTGCCGTGGAAGAGA
AGCTATTAGCCTTAAAGCCTAAAAACATCGATTTCGCTCAAGCAGCAGGGCTTCCACTGG
CTATTGAAACCGCCGACGAAGGTCTCGTTAGGACGGAGTTCTCCGCCGGAAAATCAATCA
TCGTTCTTAACGGCGCCGGAGGAGTAGGAAGCCTTGCGATTCAGCTTGCGAAGCACGTCT
ATGGAGCTTTGAAGGTTGCTGCAACAGCGAGCACTGGGAAGCTAGAGCTAGTGAGAAGCT
TAGGTGCTGATTTAGCTATTGACTACACTAAGGAGAACATTGAAGACTTGACTGACAAAT
TCGATGTCGTCTTTGACGCCATTGGGATGTGTGATAAGGGGGGTGAAGGTGATTAAG

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2C487JQ 691 0 0
AGTACACTGCCGTGGAAGAGAAGCTATTAGCCTTAAAGCCTAAAAACATCGATTTCGCTC
AAGCAGCAGGGCTTCCACTGGCTATTGAAACCGCCGACGAAGGTCTCGTTAGGACGGAGT
TCTCCGCCGGAAAATCAATCATCGTTCTTAACGGCGCCGGAGGAGTAGGAAGCCTTGCGA
TTCAGCTTGCGAAGCACGTTTATGGAGCTTTGAAGGTTGCTGCAACAGCGAGCACTGGGA
AGCTAGAGCTAGTGAGAAGCTTAGGTGCTGATTTAGCTATTGACTACACTAAGGAGAACA
TTGAAGACTTGACTGACAAATTCGATGTCGTCTTTGACGCCATTGGGATGTGTGATAAGG
CGG*TGAAGGTGATTAAGGAAGGAGGGAAGGTTGTGGCCTTGACCGGAGCTGTCACGCCT
CCTGGTTTCAGATTCGTTGTGACATCTAACGGCGATGGTTTGAAGAAACTGAATCCATAC
ATTGAGAGTGGGAAGGTGAAGCCTGTGGTTGACCCCAAAGGACCTTTCCCATTTTCGCGC
GTGGCTGATGCTTTCTCATACCTAGAAACGAACCATGCCCCAGGAAAGGTCGTTGTATAT
CCTATCCCTTGAGTTGCTTTAAGTGTAGCCTTATTTGTATGTGAGCAAGTATCAAAAGTC
CTTGTAGAGTGTTTTGAGTTATGAACTCATA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2AN09JQ 628 0 0
G
CGGAGTTCTCCGCCGGAAAATCAATCATCGTTCTTAACGGCGCCGGAGGAGTAGGAAGCC
TTGCGATTCAGCTTGCGAAGCACGTCTATGGAGCTTCGAAGGTTGCTGCAACAGCGAGCA
CTGGGAAGCTAGAGCTAGTGAGAAGCTTAGGTGCTGATTTAGCTATTGACTACACTAAGG
AGAACATTGAAGACTTGACTGACAAATTCGATGTCGTCTTTGACGCCATTGGGATGTGTG
ATAAGGCGG*TGAAGGTGATTAAGGAAGGAGGGAAGGTTGTGGCCTTGACCGGAGCTGTC
ACGCCTCCTGGTTTCAGATTCGTTGTGACATCTAACGGCGATGTTTTGAAGAAACTGAAT
CCATACATTGAGAGTGGGAAGGTGAAGCCTGTGGTCGACCCCAAAGGACCTTTCCCATTT
TCGCGCGTGGCTGATGCTTTCTCATACCTAGAAACGAACCATGCCACAGGAAAGGTCGTT
GTATATCCTATCCCTTGAGTTGCTTTAAGTGTAGCCTTATTTGTACGTGAGCAAGTATCA
AAAGTCCTTGTAGAGTGTTTTGAGTTATGAACTCATATGAATATGGAAAACTAAAAATTG
CTATTTGTAGCTTATTCATTACAGAAC

QA 2 628 2 628
DS 

RD RR2AN09TF 628 0 0
G
CGGAGTTCTCCGCCGGAAAATCAATCATCGTTCTTAACGGCGCCGGAGGAGTAGGAAGCC
TTGCGATTCAGCTTGCGAAGCACGTCTATGGAGCTTCGAAGGTTGCTGCAACAGCGAGCA
CTGGGAAGCTAGAGCTAGTGAGAAGCTTAGGTGCTGATTTAGCTATTGACTACACTAAGG
AGAACATTGAAGACTTGACTGACAAATTCGATGTCGTCTTTGACGCCATTGGGATGTGTG
ATAAGGCGG*TGAAGGTGATTAAGGAAGGAGGGAAGGTTGTGGCCTTGACCGGAGCTGTC
ACGCCTCCTGGTTTCAGATTCGTTGTGACATCTAACGGCGATGTTTTGAAGAAACTGAAT
CCATACATTGAGAGTGGGAAGGTGAAGCCTGTGGTCGACCCCAAAGGACCTTTCCCATTT
TCGCGCGTGGCTGATGCTTTCTCATACCTAGAAACGAACCATGCCACAGGAAAGGTCGTT
GTATATCCTATCCCTTGAGTTGCTTTAAGTGTAGCCTTATTTGTACGTGAGCAAGTATCA
AAAGTCCTTGTAGAGTGTTTTGAGTTATGAACTCATATGAATATGGAAAACTAAAAATTG
CTATTTGTAGCTTATTCATTACAGAAC

QA 2 628 2 628
DS 



AS 1 4

CO CL2041Contig1 956 4 23 U
GGTCTCATAACAAAAGAAAAATGGCTTCGGCATCTCTCGTCCCGACATCAAACATCTTCC
ATGTCTCTCCTACATTCACAGCTTCAGTCAGAACAAGAGCTAGTAGCTTCATTGTTGCAT
ACTCACAACAACAACAACAACAACAACCAAGAAGGAGAGAGTTACTCCTGAAAACAGCGG
TGGCTATTCCAGCGATTCTGAACTTGAAGGAAGCTCCTATCTCTGAGGCCCGTGAGGTGG
AAGTGGGATCCTTCTTACCACCTTCTGAGACTGACCCTTCCTTCGTCCTCTTCAAAGCCA
AACCTTCTGATACTCCTGCTCTCCGCGCAGGAAACGTGCAGCCGTATCAGTTTGTTCTAC
CACCGAACTGGAAACAGCTCCGAATAGCCAACATCTTGTCAGGCAACTACTGCCAACCGA
AATGCGCAGAGCCATGGATAGAAGTGAAGTTCGAGAACGAGAAGCAAGGCAAAGTTCAAG
TAGTTGCATCTCCTTTGATCCGTCTGACCAACAAGCCGAATGCAACTATTGAAGATCTCG
GTGAGCCTGAGAGAGCGATCGCTTCTCTTGGTCCCTTTGTCACCGGAAACTCTTATGATT
CTGATGAGCTTGTGAATACATCAGTCGAAAAGATCGGTGATCAAACGTACTATAAGTATG
TGTTGGAGACGCCGTTTGCGCTAACGGGAAGTCATAACCTTGCGAAAGCGACGGCGAAGG
GGAACACGGTGGTTCTGTTTGTGGTGAGTGCTACTGAGAAGCAATGGCAGAGCTCACAGA
AGACTCTTCAAGCCATTCTTGATTCTTTTCAGCTGTAAATTATTGTTATGACTCTTAAAG
AACTATAGAGCAAACGGTTTGTGTTGAGTTGGATTAACATTTCATCCCCTTGTATCTATC
TGCTCCAATGTTTCAAACATGAGACACATTGAATAAACCTGATGGTTATTACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 
0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2EP82TF U 1
AF RR2CF21TF U 27
AF RR2EP82JQ C 172
AF RR2CF21JQ C 262
BS 1 120 RR2EP82TF
BS 121 121 RR2CF21TF
BS 122 124 RR2EP82TF
BS 125 125 RR2CF21TF
BS 126 274 RR2EP82TF
BS 275 275 RR2CF21TF
BS 276 583 RR2EP82TF
BS 584 584 RR2CF21TF
BS 585 706 RR2EP82TF
BS 707 781 RR2EP82JQ
BS 782 782 RR2CF21JQ
BS 783 810 RR2EP82JQ
BS 811 811 RR2CF21JQ
BS 812 842 RR2EP82JQ
BS 843 843 RR2CF21JQ
BS 844 887 RR2EP82JQ
BS 888 888 RR2CF21JQ
BS 889 897 RR2EP82JQ
BS 898 901 RR2CF21JQ
BS 902 926 RR2EP82JQ
BS 927 928 RR2CF21JQ
BS 929 953 RR2EP82JQ
BS 954 956 RR2CF21JQ

RD RR2EP82TF 708 0 0
GGTCTCATAACAAAAGAAAAATGGCTTCGGCATCTCTCGTCCCGACATCAAACATCTTCC
ATGTCTCTCCTACATTCACAGCTTCAGTCAGAACAAGAGCTAGTAGCTTCATTGTTGCAT
CCTCTCAACAACAACAACAACAACAACCAAGAAGGAGAGAGTTACTCCTGAAAACAGCGG
TGGCTATTCCAGCGATTCTGAACTTGAAGGAAGCTCCTATCTCTGAGGCCCGTGAGGTGG
AAGTGGGATCCTTCTTACCACCTTCTGAGACTGATCCTTCCTTCGTCCTCTTCAAAGCCA
AACCTTCTGATACTCCTGCTCTCCGCGCAGGAAACGTGCAGCCGTATCAGTTTGTTCTAC
CACCGAACTGGAAACAGCTCCGAATAGCCAACATCTTGTCAGGCAACTACTGCCAACCGA
AATGCGCAGAGCCATGGATAGAAGTGAAGTTCGAGAACGAGAAGCAAGGCAAAGTTCAAG
TAGTTGCATCTCCTTTGATCCGTCTGACCAACAAGCCGAATGCAACTATTGAAGATCTCG
GTGAGCCTGAGAGAGCGATCGCTTCTCTTGGTCCCTTTGTCACTGGAAACTCTTATGATT
CTGATGAGCTTGTGAATACATCAGTCGAAAAGATCGGTGATCAAACGTACTATAAGTATG
TGTTGGAGACGCCGTTTGCGCTAACGGGAAGTCATAACCTTGCGAA
GC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2CF21TF 684 0 0
G
CGGCATCTCTCGTCCCGACATCAAACATCTTCCATGTCTCTCCTACATTCACAGCTTCAG
TCAGAACAAGAGCTAGTAGCTTCATTGTTGCATACTCACAACAACAACAACAACAACAAC
CAAGAAGGAGAGAGTTACTCCTGAAAACAGCGGTGGCTATTCCAGCGATTCTCAACTTGA
AGGAAGCTCCTATCTCTGAGGCCCGTGAGGTGGAAGTGGGATCCTTCTTACCACCTTCCG
AGTCTGACCCTTCCTTCGTCCTCTTCAAAGCCAAACCTTCTGATACTCCTGCTCTCCGCG
CAGGAAACGTGCAGCCGTATCAGTTTGTTCTACCACCGAACTGGAAACAGCTCCGAATAG
CCAACATCTTGTCAGGCAACTACTGCCAACCGAAATGCGCAGAGCCATGGATAGAAGTGA
AGTTCGAGAACGAGAAGCAAGGCAAAGTTCAAGTAGTTGCATCTCCTTTGATCCGTCTGA
CCAACAAGCCGAATGCAACTATTGAAGATCTCGGTGAGCCTGAGAGAGTGATCGCTTCTC
TTGGTCCCTTTGTCACCGGAAACTCTTATGATTCTGATGAGCTTGTGAATACATCAGTCG
AAAAGATCGGTGATCAAACGTACTATAAGTATGTGTTGGAGACGCCGTTTGCGCTAACGG
GAAGTCATAACCTTGCGAA
AGCG

QA 2 680 2 680
DS 

RD RR2EP82JQ 782 0 0
AAACAGCGGTGGCTATTCCAGCGATTCTGAACTTGAAGGAAGCTCCTATCTCTGAGGCCC
GTGAGGTGGAAGTGGGATCCTTCTTACCACCTTCTGAGACTGATCCTTCCTTCGTCCTCT
TCAAAGCCAAACCTTCTGATACTCCTGCTCTCCGCGCAGGAAACGTGCAGCCGTATCAGT
TTGTTCTACCACCGAACTGGAAACAGCTCCGAATAGCCAACATCTTGTCAGGCAACTACT
GCCAACCGAAATGCGCAGAGCCATGGATAGAAGTGAAGTTCGAGAACGAGAAGCAAGGCA
AAGTTCAAGTAGTTGCATCTCCTTTGATCCGTCTGACCAACAAGCCGAATGCAACTATTG
AAGATCTCGGTGAGCCTGAGAGAGCGATCGCTTCTCTTGGTCCCTTTGTCACTGGAAACT
CTTATGATTCTGATGAGCTTGTGAATACATCAGTCGAAAAGATCGGTGATCAAACGTACT
ATAAGTATGTGTTGGAGACGCCGTTTGCGCTAACGGGAAGTCATAACCTTGCGAAAGCGA
CGGCGAAGGGGAACACGGTGGTTCTGTTTGTGGTGAGTGCTACTGAGAAGCAATGGCAGA
GCTCACAGAATACTCTTCAAGCCATTCTTGATTCTTTTCGGCTGTAAATTATTGTTATGA
CTCTTAAAGAAGTATAGAGCAAACGGTTTGTGTTGAGTTGGATTAACATTTCATCCTCTT
GTATCT****GCTCCAATGTTTCAAACATGAGACAT*TTGAATAAACCTGATGGTTATTA
CT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2CF21JQ 695 0 0
CTTCCGAGT
CTGACCCTTCCTTCGTCCTCTTCAAAGCCAAACCTTCTGATACTCCTGCTCTCCGCGCAG
GAAACGTGCAGCCGTATCAGTTTGTTCTACCACCGAACTGGAAACAGCTCCGAATAGCCA
ACATCTTGTCAGGCAACTACTGCCAACCGAAATGCGCAGAGCCATGGATAGAAGTGAAGT
TCGAGAACGAGAAGCAAGGCAAAGTTCAAGTAGTTGCATCTCCTTTGATCCGTCTGACCA
ACAAGCCGAATGCAACTATTGAAGATCTCGGTGAGCCTGAGAGAGTGATCGCTTTTCTTG
GTCCCTTTGTCACCGGAAACTCTTATGATTTTGATGAGCTTGTGAATACATCAGTCGAAA
AGATCGGTGATCAAACGTACTATAAGTATGTGTTGGAGACGCCGTTTGCGCTAACGGGAA
GTCATAACCTTGCGAAAGCGACGGCGAAGGGGAACACGGTGGTTTTGTTTGTGGTGAGTG
CTACTGAGAAGCAATGGCAGAGCTCGCAGAAGACTCTTCAAGCCATTCTTGATTCTTTTC
AGCTGTAAATTATTGTTATGACTCTTAAAGAACTATAGAGCAAACGGTTTGTGTTGAGTT
GGATTAACATTTCATCCCTTTGTATCTATCTGCTCTAATGTTTCAAACATGAGAGACATT
GAATAGACCTGATGGTTATTACTTTT

QA 10 695 10 695
DS 



AS 1 3

CO CL2042Contig1 1120 3 10 U
CCCATTTAACAATGGAGTTCATGATTATAGTTCTGTTCGGTTTCTGAGTGTTTGATATGA
AAATTACAGTACTGATCAGATTATAAACAAATTTTTGTTTGGGGGTTGGATTTGCTTGTC
AGCACTACAAGTTTTACAAAAATATGCTCCACCAGAAATGCTCTACACAAAATCTACCAC
CAACTCTGCTTTCTGTTTCTGTGTGGATCCTGTGAATACCATCATATTGCTTTGTCTAAC
CAGACAGGTAACCTCAACGAAAATTTCATCCCAAGTCTTGTGAGGAAGATTGAGTAGAGG
ATATGCAGCAACAGCACAAAGAATCCACTGTTTAGCAACAGCACTGTTCCGAATATCATA
TAGATGAGGCTCATGGAAGGCATTAGGTTCAGGCCCATGGCGGTGAAAACATAGGAGAGA
GAGGCGTGGATGTTGATTGTGATCACAGCAAGAATGTTTTCTCTTATTAGGAAGGATGAT
GTCAGAACATATCCTATGAGACCCAATGCTCGGACCATTGTGCACAAGAAAATGGAGAGA
CGCCAGCTTGCCTTCATCCTCCACAATGAACCAATAGCAAGCCCCAGAAGACCATGCATA
AGAAAGTAAGTTAAAGCTTTGACCGGACCTGATAATATGAACAAGAGCATGACAGTAGCA
ACCATTGTCTTCCTGCCGCCTGCAATGTTCCATCTTATCGAAGAGATCACTATCGGCAAC
GCGAAGAAACACCCAAAGTAGTTCTCGATGGCGAGAGAGTTGCTGAGGAAGTAAACGAGT
CCCGTGACGGCAGCGAACATGGCGCATTCAACCAGTCTCAGCGTCTTCTGGTAAACCAAC
TCATCTCCCCCTTCTCTCCTCCCATCATCCTCTTGATTACCTGGAAACGAAGCTCTGGTG
CTGGAGATGCTCGAGAGTGCGAAGGAGCTTCGGTTGGAGGTGGAAAGGAGAGAGATTCTG
GGTCTTTGTGGAGAGAGTGACAGCAGGGAGGATGACGAGGAAGCGAAGGAGTGTGTAGTG
GCAAAACGGTAAAATTGAGTGAGAGTGGACTGGTGATGAATGGTTTTGAGGAGATTCATG
GAGGCGAAGAAGAGAATGAGATTGTTTCCACACGGCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE41JQ U 1
AF RR2FU87JQ U 54
AF RR2FU87TF C 362
BS 1 104 RR2EE41JQ
BS 105 105 RR2FU87JQ
BS 106 156 RR2EE41JQ
BS 157 157 RR2FU87JQ
BS 158 261 RR2EE41JQ
BS 262 262 RR2FU87JQ
BS 263 488 RR2EE41JQ
BS 489 489 RR2FU87JQ
BS 490 585 RR2EE41JQ
BS 586 1120 RR2FU87TF

RD RR2EE41JQ 585 0 0
CCCATTTAACAATGGAGTTCATGATTATAGTTCTGTTCGGTTTCTGAGTGTTTGATATGA
AAATTACAGTACTGATCAGATTATAAACAAATTTTTGTTTGGGGTTTGGATTTGCTTGTC
AGCACTACAAGTTTTACAAAAATATGCTCCACCAGAGATGCTCTACACAAAATCTACCAC
CAACTCTGCTTTCTGTTTCTGTGTGGATCCTGTGAATACCATCATATTGCTTTGTCTAAC
CAGACAGGTAACCTCAACGAAGATTTCATCCCAAGTCTTGTGAGGAAGATTGAGTAGAGG
ATATGCAGCAACAGCACAAAGAATCCACTGTTTAGCAACAGCACTGTTCCGAATATCATA
TAGATGAGGCTCATGGAAGGCATTAGGTTCAGGCCCATGGCGGTGAAAACATAGGAGAGA
GAGGCGTGGATGTTGATTGTGATCACAGCAAGAATGTTTTCTCTTATTAGGAAGGATGAT
GTCAGAACGTATCCTATGAGACCCAATGCTCGGACCATTGTGCACAAGAAAATGGAGAGA
CGCCAGCTTGCCTTCATCCTCCACAATGAACCAATAGCAAGCCCC

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2FU87JQ 538 0 0
GATATGAAAATTACAGTACTGATCAGATTATAAACAAATTTTTGTTTGGGGGTTGGATTT
GCTTGTCAGCACTACAAGTTTTACAAAAATATGCTCCACCAGAAATGCTCTACACAAAAT
CTACCACCAACTCTGCTTTCTGTTTCTGTGTGGATCCTGTGAATACCATCATATTGCTTT
GTCTAACCAGGCAGGTAACCTCAACGAAAATTTCATCCCAAGTCTTGTGAGGAAGATTGA
GTAGAGGATATGCAGCAACAGCACAAAGAATCCACTGTTTAGCAACAGCACTGTTCCGAA
TATCATATAGATGAGGCTCATGGAAGGCATTAGGTTCAGGCCCATGGCGGTGAAAACATA
GGAGAGAGAGGCGTGGATGTTGATTGTGATCACAGCAAGAATGTTTTCTCTTATTAGGAA
GGATGATGTCAGAACATATCCTATGAGACCCAATGCTCGGACCATTGTGCACAAGAAAAT
GGAGAGACGCCAGCTTGCCTTCATCCTCCACAATGAACCAATAGCAAGCCCC
AGAAGA

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2FU87TF 759 0 0
AGATGAGGCTCATGGAAGGCATTAGGTTCAGGCCCATGGCGGTGAAAACATAGGAGAGAG
AGGCGTGGATGTTGATTGTGATCACAGCAAGAATGTTTTCTCTTATTAGGAAGGATGATG
TCAGAACATATCCTATGAGACCCAATGCTCGGACCATTGTGCACAAGAAAATGGAGAGAC
GCCAGCTTGCCTTCATCCTCCACAATGAACCAATAGCAAGCCCCAGAAGACCATGCATAA
GAAAGTAAGTTAAAGCTTTGACCGGACCTGATAATATGAACAAGAGCATGACAGTAGCAA
CCATTGTCTTCCTGCCGCCTGCAATGTTCCATCTTATCGAAGAGATCACTATCGGCAACG
CGAAGAAACACCCAAAGTAGTTCTCGATGGCGAGAGAGTTGCTGAGGAAGTAAACGAGTC
CCGTGACGGCAGCGAACATGGCGCATTCAACCAGTCTCAGCGTCTTCTGGTAAACCAACT
CATCTCCCCCTTCTCTCCTCCCATCATCCTCTTGATTACCTGGAAACGAAGCTCTGGTGC
TGGAGATGCTCGAGAGTGCGAAGGAGCTTCGGTTGGAGGTGGAAAGGAGAGAGATTCTGG
GTCTTTGTGGAGAGAGTGACAGCAGGGAGGATGACGAGGAAGCGAAGGAGTGTGTAGTGG
CAAAACGGTAAAATTGAGTGAGAGTGGACTGGTGATGAATGGTTTTGAGGAGATTCATGG
AGGCGAAGAAGAGAATGAGATTGTTTCCACACGGCGACC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 2 4

CO CL2043Contig1 522 2 2 U
GCAGCTCAGCCTCAACGCAGTGGTTCTGTTTTCGGTGGTATTGGCTCTACCATAGCTGAT
GGTATGGCTTGGGGTACTGGGAATGCAGTTGCACACAGGGTTATGGATTCTGTGATGGGA
CCAAGAACCGTTAAGCATGAAACCGTTGTTTCTGAGGCGGCCCCCACTGCTTCTGCTTCC
CCTGTTGCTAACAGCATGGCCTCTGCTTCTTGTGACACTCAGTCCAAGGCTTTCCAGGAG
TGTGTGAACAGCTATGGAAGCGACATCAGTAAGTGCCAGTTCTACATGGACATGCTCTCG
GAATGCAAGAAGAATTCTGGTTCCATGGTTTCTGCTTAAGTGCATCTACTATCGTTATCA
ATAATAAATAAATATGTGAAGAAGAGTTTGTTCTCTCTAGTGTCTTTGATGAATCAGAAG
TTTGAAAGTCTAGTAGTTTTTCTTATTTTGTAAGATTCGGGGATCTCCTATGTCGACGAA
ACCTTTCTCTATGGAATAGTAATCAAAAGCTAATTGAGATCT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2AB79TF U 1
AF RR2AB79JQ C 1
BS 1 521 RR2AB79TF
BS 522 522 RR2AB79JQ

RD RR2AB79TF 522 0 0
GCAGCTCAGCCTCAACGCAGTGGTTCTGTTTTCGGTGGTATTGGCTCTACCATAGCTGAT
GGTATGGCTTGGGGTACTGGGAATGCAGTTGCACACAGGGTTATGGATTCTGTGATGGGA
CCAAGAACCGTTAAGCATGAAACCGTTGTTTCTGAGGCGGCCCCCACTGCTTCTGCTTCC
CCTGTTGCTAACAGCATGGCCTCTGCTTCTTGTGACACTCAGTCCAAGGCTTTCCAGGAG
TGTGTGAACAGCTATGGAAGCGACATCAGTAAGTGCCAGTTCTACATGGACATGCTCTCG
GAATGCAAGAAGAATTCTGGTTCCATGGTTTCTGCTTAAGTGCATCTACTATCGTTATCA
ATAATAAATAAATATGTGAAGAAGAGTTTGTTCTCTCTAGTGTCTTTGATGAATCAGAAG
TTTGAAAGTCTAGTAGTTTTTCTTATTTTGTAAGATTCGGGGATCTCCTATGTCGACGAA
ACCTTTCTCTATGGAATAGTAATCAAAAGCTAATTGAGATC
T

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2AB79JQ 522 0 0
GCAGT
TCAGCCTCAACGCAGTGGTTCTGTTTTCGGTGGTATTGGCTCTACCATAGCTGATGGTAT
GGCTTGGGGTACTGGGAATGCAGTTGCACACAGGGTTATGGATTCTGTGATGGGACCAAG
AACCGTTAAGCATGAAACCGTTGTTTCTGAGGCGGCCCCCACTGCTTCTGCTTCCCCTGT
TGCTAACAGCATGGCCTCTGCTTCTTGTGACACTCAGTCCAAGGCTTTCCAGGAGTGTGT
GAACAGCTATGGAAGCGACATCAGTAAGTGCCAGTTCTACATGGACATGCTCTCGGAATG
CAAGAAGAATTCTGGTTCCATGGTTTCTGCTTAAGTGCATCTACTATCGTTATCAATAAT
AAATAAATATGTGAAGAAGAGTTTGTTCTCTCTAGTGTCTTTGATGAATCAGAAGTTTGA
AAGTCTAGTAGTTTTTCTTATTTTGTAAGATTCGGGGATCTCCTATGTCGACGAAACCTT
TCTCTATGGAATAGTAATCAAAAGCTAATTGAGATCT

QA 6 522 6 522
DS 



CO CL2043Contig2 770 2 2 U
GGATGATCACTGCTGTCTTCCTCTTATAAAATACGCTTCCTCGGCTTTCTAGAGCGTCAA
TTTTTTTGTTTCTCCCTGATAAATATTTTCTCACTTGTTTTCGACGCCTAAGTTTCAAAA
TGCCTCGACGCAGCTCTGGTGGAAGTTCTGGTTACCGCGTTCGCCCTGCACTAGCTCGCC
CTGCACCAGCACGTACCCCGCCTCCTCAAACTGTGAAGCATGCTCCTCCTCCAGCAACCG
CTCAGCCTCAACGCAGTGGTTCTGTTTTTGGTAGTATTGGCTCTACCATAGCTGATGGTA
TGGCATGGGGTACTGGGAATGCAGTTGCACACAGGGTTATGGATACTGTGATGGGACCGA
GAACCATTAAGCATGAAACCGTTGTTTCTGAGGCGGCCCCCACTGCTTCTGCTTCCCCTG
TTGCTAACAGCATGGCCTCTGCTTCTTGTGACACTCAGTCCAAGGCTTTCCAGGAGTGTG
TGAACAGCTATGGAAGCGACATCAGTAAGTGCCAGTTCTACATGGACATGCTCTCGGAAT
GCAAGAAGAACTCTGGTTCCATGGTTTCTGCTTAAGTGCATCATCTACACTATCGTTATC
TGCAATAATAAATAATTTGTGAAGAAGAGTTTGTTCTCTCTAGTGTCTTTGATGAATCAG
AAGTTTGAAAGTCTAGTAGTTTTTTTCTTATTTTGTAAGATCCGGTGATCTCCTATGTCG
ACGACGAAACCTTTCTCTATGGAATAGTAATCAAATGCTAATTGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT87TF U 1
AF RR2FT87JQ C 112
BS 1 755 RR2FT87TF
BS 756 770 RR2FT87JQ

RD RR2FT87TF 756 0 0
GGATGATCACTGCTGTCTTCCTCTTATAAAATACGCTTCCTCGGCTTTCTAGAGCGTCAA
TTTTTTTGTTTCTCCCTGATAAATATTTTCTCACTTGTTTTCGACGCCTAAGTTTCAAAA
TGCCTCGACGCAGCTCTGGTGGAAGTTCTGGTTACCGCGTTCGCCCTGCACTAGCTCGCC
CTGCACCAGCACGTACCCCGCCTCCTCAAACTGTGAAGCATGCTCCTCCTCCAGCAACCG
CTCAGCCTCAACGCAGTGGTTCTGTTTTTGGTAGTATTGGCTCTACCATAGCTGATGGTA
TGGCATGGGGTACTGGGAATGCAGTTGCACACAGGGTTATGGATACTGTGATGGGACCGA
GAACCATTAAGCATGAAACCGTTGTTTCTGAGGCGGCCCCCACTGCTTCTGCTTCCCCTG
TTGCTAACAGCATGGCCTCTGCTTCTTGTGACACTCAGTCCAAGGCTTTCCAGGAGTGTG
TGAACAGCTATGGAAGCGACATCAGTAAGTGCCAGTTCTACATGGACATGCTCTCGGAAT
GCAAGAAGAACTCTGGTTCCATGGTTTCTGCTTAAGTGCATCATCTACACTATCGTTATC
TGCAATAATAAATAATTTGTGAAGAAGAGTTTGTTCTCTCTAGTGTCTTTGATGAATCAG
AAGTTTGAAAGTCTAGTAGTTTTTTTCTTATTTTGTAAGATCCGGTGATCTCCTATGTCG
ACGACGAAACCTTTCTCTATGGAATAGTAATCAAA
T

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2FT87JQ 659 0 0
GTTTCAAAATGCCTCGACGCAGCTCTGGTGGAAGTTCTGGTTACCGCGTTCGCCCTGCAC
TAGCTCGCCCTGCACCAGCACGTACCCCGCCTCCTCAAACTGTGAAGCATGCTCCTCCTC
CAGCAACCGCTCAGCCTCAACGCAGTGGTTCTGTTTTTGGTAGTATTGGCTCTACCATAG
CTGATGGTATGGCATGGGGTACTGGGAATGCAGTTGCACACAGGGTTATGGATACTGTGA
TGGGACCGAGAACCATTAAGCATGAAACCGTTGTTTCTGAGGCGGCCCCCACTGCTTCTG
CTTCCCCTGTTGCTAACAGCATGGCCTCTGCTTCTTGTGACACTCAGTCCAAGGCTTTCC
AGGAGTGTGTGAACAGCTATGGAAGCGACATCAGTAAGTGCCAGTTCTACATGGACATGC
TCTCGGAATGCAAGAAGAACTCTGGTTCCATGGTTTCTGCTTAAGTGCATCATCTACACT
ATCGTTATCTGCAATAATAAATAATTTGTGAAGAAGAGTTTGTTCTCTCTAGTGTCTTTG
ATGAATCAGAAGTTTGAAAGTCTAGTAGTTTTTTTCTTATTTTGTAAGATCCGGTGATCT
CCTATGTCGACGACGAAACCTTTCTCTATGGAATAGTAATCAAATGCTAATTGAGATCC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL2044Contig1 757 2 13 U
AGGAATAAAACTTTTAAATGGACATTATACAAGAACAGCGATAGTGAGGTCGAGCAGCAG
AGCTGACAACGAAGACTTTTCCTTAAACACAAAAGACAAAAGTCTTTTCCTTAAACAAAG
ATAAGATCAACAACGACAACGAGCAAATATAACCCAAGAACTAAACGACACCGAGACCAT
ATATTCTCAATAGACAGACATATCACATCAAATATTTAATTTTCCATTAATTTAATTAAA
AATGCACTTCCCCACCAATCAGACAGCGATGTCATTACGAATGTGACGGAGGAGCACAGG
AATAACAGAGTCCGGCGAGCTAAGCTGAGGAAGATGACCATCTGAAGGAATAACCTCGAC
AACAGATTCACATCCAAGATTGGTGTGAAGATACTCGGAGACTGCCACTGGTACGGCTAA
GTCCTTAACGCTTTGGAGGATATGACAAGGGACAGCTACAAAAGGTAAGATCTGTCTCAT
GTCACTTTGGAAAATGGTCTGGGCCACGGAGAGAGCAATGTCTGGACGCATGTTGAAGAG
CGTTCTGCTGAATTCTTGAACCGCGACTGAGTCTAAGTCGCCACCTACCGCGAGTGGTGC
GAAACCTAAGCACCACGCTTTGTAGTTGCTTCGCATCGCTTCGAAGAGTTGGTTTAAGTC
ATCTTGCTCGGATCCACCTTGGTAATCAACATCGTTCACGTACCTTGGGGAAGCAGAGAT
CATGACGATTTTGGAGAAGAGGTCAGGTCGGTTAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT63JQ U 65
AF RR2F658JQ U 1
BS 1 152 RR2F658JQ
BS 153 153 RR2DT63JQ
BS 154 163 RR2F658JQ
BS 164 164 RR2DT63JQ
BS 165 239 RR2F658JQ
BS 240 240 RR2DT63JQ
BS 241 251 RR2F658JQ
BS 252 252 RR2DT63JQ
BS 253 516 RR2F658JQ
BS 517 517 RR2DT63JQ
BS 518 582 RR2F658JQ
BS 583 583 RR2DT63JQ
BS 584 757 RR2F658JQ

RD RR2DT63JQ 540 0 0
GG
CAACGAAGACTTTTCCTTAAACACAAAAGACAGAAGTCTTT*CCTTAAACAAAGATAAGA
TCAACAACGACAACGAGCAAATATAACCCAAGAACTAAACGACACCGAGACCATATATTC
TCAATAGACAGACATATCACATCAGATATTTAATTTTCCATTAATTTAATTAAAAATGCA
CTTCCCCACCAATCAGACAGCGATGTCATTACGAATGTGACGGAGGAGCACAGGAATAAC
AGAGTCCGGCGAGCTAAGCTGAGGAAGATGACCATCTGAAGGAATAACCTCGACAACAGA
TTCACATCCAAGATTGGTGTGAAGATACTCGGAGACTGCCACTGGTACGGCTAAGTCCTT
AACGCTTTGGAGGATGTGACAAGGGACAGCTACAAAAGGTAAGATCTGTCTCATGTCACT
TTGGAAAATGGTCTGGGCCACGGAGAGAGCAATGTCTGGACGCATGTTGAAGAGCGTTCT
GCTGAATTCTTGAACCGCGACTGAGTCTAAGTCGCCACCTACCGCGAGTGGTGCGAAA

QA 3 540 3 540
DS 

RD RR2F658JQ 757 0 0
AGGAATAAAACTTTTAAATGGACATTATACAAGAACAGCGATAGTGAGGTCGAGCAGCAG
AGCTGACAACGAAGACTTTTCCTTAAACACAAAAGACAAAAGTCTTTTCCTTAAACAAAG
ATAAGATCAACAACGACAACGAGCAAATATAATCCAAGAACTAGACGACACCGAGACCAT
ATATTCTCAATAGACAGACATATCACATCAAATATTTAATTTTCCATTAATTTAATTAAG
AATGCACTTCCTCACCAATCAGACAGCGATGTCATTACGAATGTGACGGAGGAGCACAGG
AATAACAGAGTCCGGCGAGCTAAGCTGAGGAAGATGACCATCTGAAGGAATAACCTCGAC
AACAGATTCACATCCAAGATTGGTGTGAAGATACTCGGAGACTGCCACTGGTACGGCTAA
GTCCTTAACGCTTTGGAGGATATGACAAGGGACAGCTACAAAAGGTAAGATCTGTCTCAT
GTCACTTTGGAAAATGGTCTGGGCCACGGAGAGAGCTATGTCTGGACGCATGTTGAAGAG
CGTTCTGCTGAATTCTTGAACCGCGACTGAGTCTAAGTCGCCGCCTACCGCGAGTGGTGC
GAAACCTAAGCACCACGCTTTGTAGTTGCTTCGCATCGCTTCGAAGAGTTGGTTTAAGTC
ATCTTGCTCGGATCCACCTTGGTAATCAACATCGTTCACGTACCTTGGGGAAGCAGAGAT
CATGACGATTTTGGAGAAGAGGTCAGGTCGGTTAAGA

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 3

CO CL2045Contig1 927 3 6 U
GGGATCTAAAAGGAATTCTCAAGAATAATAAAACAAGAAAAGTAGTAATTGTGTAAAAGA
TCAGCAAAATGGTTGCTCAAGGGTTCACTGTAGATCTTGACAAGCCCCTTGCTTTCCAGG
TTGGTCATCTCGGAGAAGCTTACGACGAATGGGTTCACCAACCTATTGTGACCAAGGAAG
GCCCTAGGTTTTTCCAGAGTGACTTTTGGGAGTTCTTGACACTTACAGTTTGGTGGGCAG
TTCCTGTCATTTGGTTGCCAGTTGTTTCCTGGTGCATCTCCATGTCAGTAAGCATGGGCT
GTGCACTCCCAGAGGTTGTCTTACTGGCAGCCTTGGGAATATTTATCTGGACTTTTATAG
AATACTGTCTTCACCGTTTCCTTTTCCACATGAAGACCAAGAGTTACTGGGGAAACACGA
CACACTATCTTATTCACGGATACCATCACAAGCACCCAGTGGACCACCTTCGACTCGTCT
TTCCTCCTGCCTTAACAGCTATTATGTGCTTTCCTCTCTGGAACCTTGCGCAACTTATTG
CAACTCCTTCAACTGCACCTGCATTGTTTGGAGGCGGCCTGTTCGGCTATGTGATGTACG
ATATCACTCACTACTACCTTCACCATGCCAACCCAACTATACCAGTGACCAAAAACCTCA
AGAATTCCCATTTGAACCATCACTTCAG*ATTCAG*ACAAGGGATATGGAGTA*CTTCAT
CGCTATGGGACATAGTGTTTGGTACACTTCCCACCAAAAAAGCTCTCAAAAGAGAGCAAC
AGAAGTACTAATTAAGATGGATGCAAAAGGAAAAGGATAATTGCAATACACAGTTTATCT
TAAAGTATCATCAGTCTATGTTAATTGATCACGTTTCATTTGTACCAATGTCTTTGTATA
TCAATATACTTCACATCCTATATATGT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN06TF U 1
AF RR2BV31TF U 2
AF RR2BV31JQ C 264
BS 1 458 RR2FN06TF
BS 459 459 RR2BV31TF
BS 460 664 RR2FN06TF
BS 665 665 RR2BV31TF
BS 666 750 RR2FN06TF
BS 751 927 RR2BV31JQ

RD RR2FN06TF 760 0 0
GGGATCTAAAAGGAATTCTCAAGAATAATAAAACAAGAAAAGTAGTAATTGTGTAAAAGA
TCAGCAAAATGGTTGCTCAAGGGTTCACTGTAGATCTTGACAAGCCCCTTGCTTTCCAGG
TTGGTCATCTCGGAGAAGCTTACGACGAATGGGTTCACCAACCTATTGTGACCAAGGAAG
GCCCTAGGTTTTTCCAGAGTGACTTTTGGGAGTTCTTGACACTTACAGTTTGGTGGGCAG
TTCCTGTCATTTGGTTGCCAGTTGTTTCCTGGTGCATCTCCATGTCAGTAAGCATGGGCT
GTGCACTCCCAGAGGTTGTCTTACTGGCAGCCTTGGGAATATTTATCTGGACTTTTATAG
AATACTGTCTTCACCGTTTCCTTTTCCACATGAAGACCAAGAGTTACTGGGGAAACACGA
CACACTATCTTATTCACGGATACCATCACAAGCACCCAATGGACCACCTTCGACTCGTCT
TTCCTCCTGCCTTAACAGCTATTATGTGCTTTCCTCTCTGGAACCTTGCGCAACTTATTG
CAACTCCTTCAACTGCACCTGCATTGTTTGGAGGCGGCCTGTTCGGCTATGTGATGTACG
ATATCACTCACTACTACCTTCACCATGCCAACCCAACTATACCAGTGACCAAAAACCTCA
AGAAATCCCATTTGAACCATCACTTCAG*ATTCAG*ACAAGGGATATGGAGTA*CTTCAT
CGCTATGGGACATAGTGTTTGGTACACTTC
TCACCAAAAA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2BV31TF 758 0 0
GGATCTAAAAGGAATTCTCAAGAATAATAAAACAAGAAAAGTA****TTGTGTAAAAGAT
CAGCAAAATGGTTGCTCAAGGGTTCACTGTAGATCTTGACAAGCCCCTTGCTTTCCAGGT
TGGTCATCTCGGAGAAGCTTACGACGAATGGGTTCACCAACCTATTGTGACCAAGGAAGG
CCCTAGGTTTTTCCAGAGTGACTTTTGGGAGTTCTTGACACTTACAGTTTGGTGGGCAGT
TCCTGTCATTTGGTTGCCAGTTGTTTCCTGGTGCATCTCCATGTCAGTAAGCATGGGCTG
TGCACTCCCAGAGGTTGTCTTACTGGCAGCCTTGGGAATATTTATCTGGACTTTTATAGA
ATACTGTCTTCACCGTTTCCTTTTCCACATGAAGACCAAGAGTTACTGGGGAAACACGAC
ACACTATCTTATTCACGGATACCATCACAAGCACCCAGTGGACCACCTTCGACTCGTCTT
TCCTCCTGCCTTAACAGCTATTATGTGCTTTCCTCTCTGGAACCTTGCGCAACTTATTGC
AACTCCTTCAACTGCACCTGCATTGTTTGGAGGCGGCCTGTTCGGCTATGTGATGTACGA
TATCACTCACTACTACCTTCACCATGCCAACCCAACTATACCAGTGACCAAAAACCTCAA
GAATTCCCATTTGAACCATCACTTCAG*ATTCAG*ACAAGGGATATGGAGTA*CTTCATC
GCTATGGGACATAGTGTTTGGTACACTTC
CCCCAAAAA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2BV31JQ 664 0 0
GTTTCCTGGTGCATCTCCATGTCAGTAAGCATGGGCTGTGCACTCCCAGAGGTTGTCTTA
CTGGCAGCCTTGGGAATATTTATCTGGACTTTTATAGAATACTGTCTTCACCGTTTCCTT
TTCCACATGAAGACCAAGAGTTACTGGGGAAACACGACACACTATCTTATTCACGGATAC
CATCACAAGCACCCAGTGGACCACCTTCGACTCGTCTTTCCTCCTGCCTTAACAGCTATT
ATGTGCTTTCCTCTCTGGAACCTTGCGCAACTTATTGCAACTCCTTCAACTGCACCTGCA
TTGTTTGGAGGCGGCCTGTTCGGCTATGTGATGTACGATATCACTCACTACTACCTTCAC
CATGCCAACCCAACTATACCAGTGACCAAAAACCTCAAGAATTCCCATTTGAACCATCAC
TTCAGGATTCAGGACAAGGGATATGGAGTAACTTCATCGCTATGGGACATAGTGTTTGGT
ACACTTCCCACCAAAAAAGCTCTCAAAAGAGAGCAACAGAAGTACTAATTAAGATGGATG
CAAAAGGAAAAGGATAATTGCAATACACAGTTTATCTTAAAGTATCATCAGTCTATGTTA
ATTGATCACGTTTCATTTGTACCAATGTCTTTGTATATCAATATACTTCACATCCTATAT
ATGT

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 4

CO CL2046Contig1 899 4 8 U
TTTTTGTATTCTCCTCGTCCTTTTAACTCTCCTGAAAACAACACGAAAGAAGATAGAAAA
AATGTCGTTTACAGGAACATTGGATAAATGCAAGGCATGTGACAAAACCGTCTACGTGAT
GGATTTGTTGACGTTAGAAGGAAACACCTATCACAAAAACTGCTTCAGATGCAGCCATTG
CAATGGCGCTCTCGTGATGAGTAACTACTCATCAATGGATGGAGTTCTTTACTGCAAGCG
TCACTTCGAGCAGCTTTTTAAAGAATCTGTCAAGAGCCTTCACACAGGAAAGACAGAGAA
GCCGAATGATCAGCTGACTCGAGCTCCATGCAAGTTATCTTCATTCTTCAGTGGAACACA
AGACAAGTGTGCGACTTGTCAGAAAACAGTCTATCCACTTGAGAAAGTTACAATGGAAGG
AGAATGTTTCCACAAGACTTGTTTCAAGTGTGCACACAGTGGTTGTCCTTTGACTCACTC
TTCATACGCTTCTCTCAACGGTGTACTCTACTGTAAAGTCCATTTCAACCAGCTCTTTCT
TGAGAAAGGAAGTTACAATAACGTCCATCAAGCTGCCGCTAACCACCGTAGGTCAGCCTC
TTCTGGTGCCTCTTCTCCTCCTCATGATGACAACAAACCTGAAGACGAGGCAGTGGTTCC
CGAGGGTGAAGGAGAAGAAGAAGCCCCTGAAGCTGCAGGAGAAGAAAAGCCTGAGCCTGT
GGCTGCGGCTGAGTAACTATCTTTATCAGTTCTCAAGTTTGAAGTTTTATATTGCTTTTT
ATGTTTAAAAATTAATATATGTATACAATCATTTGCTAATTCCTTTTGTAAATTATTGTA
AAGCTTGGAGAGAATCTGTTGTAAACAAACCTTTAACATCCATTTTCTTTAAAGAGTAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO78TF U 44
AF RR2CJ12TF U 1
AF RR2CP96TF U 1
AF RR2CP96JQ C 179
BS 1 198 RR2CJ12TF
BS 199 199 RR2CP96TF
BS 200 328 RR2CJ12TF
BS 329 329 RR2CP96TF
BS 330 546 RR2CJ12TF
BS 547 547 RR2CP96TF
BS 548 705 RR2CJ12TF
BS 706 899 RR2CP96JQ

RD RR2FO78TF 597 0 0
G
GAAAGAAGATAGAAAAAATGTCGTTTACAGGAACATTGGATAAATGCAAGGCATGTGACA
AAACCGTCTACGTGATGGATTTGTTGACGTTAGAAGGAAACACCTATTACAAAAACTGCT
TCAGATGCAGCCATTGCAATGGCGCTCTCGTGATAAGTAACTACTCATCAATGGATGGAG
TTCTTTACTGCAAGCGTCACTTCGAGCAGCTTTTTAAAGAATCTGTCAAGAGCCTTCACA
CAGGAAAGACGGAGAAGCCGAATGATCAGCTGACTCGAGCTCCAAGCAAGTTATCTTCAT
TCTTCAGTGGAACACAAGACAAGTGTGCGACTTGTCAGAAAACAGTCTATCCACTTGAGA
AAGTTACAATGGAAGGAGAATGTTTCCACAAGACTTGTTTCAAGTGTGCACACAGTGGTT
GTCCTTTGACTCACTCTTCATACGCTTCTCTCAACGGTGTACTCTACTGTAAAGTCTATT
TCAACCAGCTCTTTCTTGAGAAAGGAAGTTACAATAACGTCCATCAAGCTGCCGCTAACC
ACCGTAGGT*AGCCTCTTCTGGTGCCTCTTCTCCTCCTCATGATGACA
ACAAACCT

QA 2 589 2 589
DS 

RD RR2CJ12TF 705 0 0
TTTTTGTATTCTCCTCGTCCTTTTAACTCTCCTGAAAACAACACGAAAGAAGATAGAAAA
AATGTCGTTTACAGGAACATTGGATAAATGCAAGGCATGTGACAAAACCGTCTACGTGAT
GGATTTGTTGACGTTAGAAGGAAACACCTATCACAAAAACTGCTTCAGATGCAGCCATTG
CAATGGCGCTCTCGTGATAAGTAACTACTCATCAATGGATGGAGTTCTTTACTGCAAGCG
TCACTTCGAGCAGCTTTTTAAAGAATCTGTCAAGAGCCTTCACACAGGAAAGACAGAGAA
GCCGAATGATCAGCTGACTCGAGCTCCAAGCAAGTTATCTTCATTCTTCAGTGGAACACA
AGACAAGTGTGCGACTTGTCAGAAAACAGTCTATCCACTTGAGAAAGTTACAATGGAAGG
AGAATGTTTCCACAAGACTTGTTTCAAGTGTGCACACAGTGGTTGTCCTTTGACTCACTC
TTCATACGCTTCTCTCAACGGTGTACTCTACTGTAAAGTCCATTTCAACCAGCTCTTTCT
TGAGAA*GGAAGTTACAATAACGTCCATCAAGCTGCCGCTAACCACCGTAGGTCAGCCTC
TTCTGGTGCCTCTTCTCCTCCTCATGATGACAACAAACCTGAAGACGAGGCAGTGGTTCC
CGAGGGTGAAGGAGAAGAAGAAGCCCCTGAAGCTGCAGGAGAAGA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2CP96TF 672 0 0
TTTTTGTATTCTCCTCGTCCTTTTAACTCTCCTGAAAACAACACGAAAGAAGATAGAAAA
AATGTCGTTTACAGGAACATTGGATAAATGCAAGGCATGTGACAAAACCGTCTACGTGAT
GGATTTGTTGACGTTAGAAGGAAACACCTATCACAAAAACTGCTTCAGATGCAGCCATTG
CAATGGCGCTCTCGTGATGAGTAACTACTCATCAATGGATGGAGTTCTTTACTGCAAGCG
TCACTTCGAGCAGCTTTTTAAAGAATCTGTCAAGAGCCTTCACACAGGAAAGACAGAGAA
GCCGAATGATCAGCTGACTCGAGCTCCATGCAAGTTATCTTCATTCTTCAGTGGAACACA
AGACAAGTGTGCGACTTGTCAGAAAACAGTCTATCCACTTGAGAAAGTTACAATGGAAGG
AGAATGTTTCCACAAGACTTGTTTCAAGTGTGCACACAGTGGTTGTCCTTTGACTCACTC
TTCATACGCTTCTCTCAACGGTGTACTCTACTGTAAAGTCCATTTCAACCAGCTCTTTCT
TGAGAAAGGAAGTTACAATAACGTCCATCAAGCTGCCGCTAACCACCGTAG*TCAGCCTC
TTCTGGTGCCTCTTCTCCTCCTCATGATGACA*CAAACCTGAAGACGAGGCAGTGGTTCC
CGAGG
TGAAGAG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2CP96JQ 721 0 0
TGCAATGGCGCTCTCGTGATGAGTAACTACTCATCAATGGATGGAGTTCTTTACTGCAAG
CGTCACTTCGAGCAGCTTTTTAAAGAATCTGTCAAGAGCCTTCACACAGGAAAGACAGAG
AAGCCGAATGATCAGCTGACTCGAGCTCCATGCAAGTTATCTTCATTCTTCAGTGGAACA
CAAGACAAGTGTGCGACTTGTCAGAAAACAGTCTATCCACTTGAGAAAGTTACAATGGAA
GGAGAATGTTTCCACAAGACTTGTTTCAAGTGTGCACACAGTGGTTGTCCTTTGACTCAC
TCTTCATACGCTTCTCTCAACGGTGTACTCTACTGTAAAGTCCATTTCAACCAGCTCTTT
CTTGAGAAAGGAAGTTACAATAACGTCCATCAAGCTGCCGCTAACCACCGTAGGTCAGCC
TCTTCTGGTGCCTCTTCTCCTCCTCATGATGACAACAAACCTGAAGACGAGGCAGTGGTT
CCCGAGGGTGAAGGAGAAGAAGAAGCCCCTGAAGCTGCAGGAGAAGAAAAGCCTGAGCCT
GTGGCTGCGGCTGAGTAACTATCTTTATCAGTTCTCAAGTTTGAAGTTTTATATTGCTTT
TTATGTTTAAAAATTAATATATGTATACAATCATTTGCTAATTCCTTTTGTAAATTATTG
TAAAGCTTGGAGAGAATCTGTTGTAAACAAACCTTTAACATCCATTTTCTTTAAAGAGTA
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 4

CO CL2047Contig1 827 4 2 U
ATATACGAATCAGTCTCTTATTCTTGTGGCAAATTGTCAGGACTGATTTATCCAGTTTGT
ATCCCAAACTGTGATATTTAAATCATTGCC*ACTGGCCCTGGGTTTAAACACTGCAGTAA
CTAACTGTTACAGCAACTACTTGAGACGACTGTAGGCAAAAACGCCGAGACAGCCAATGG
CCAAAGCAAGAACAACAGGTAAAGCAGCAGCAACAACTTCGAGGTTCTGTGTTGTGCTGT
TTGTTCGGTTGCTGTCTAGTCTCTCTATGCGAGACCTTTCTCCAACATACTCCCTAATCA
GATTGCTCAGTGTGTCCATTTGATGCATCATCTGTCGTTGTCCACGAGCAACCAGTACAA
CCTCTTCCATCGGAGGAGACTCCCTTATAAGCTGAGATGCGGATGAGGAGAGTGATAAAA
GGGAGCCATTACCATTTTCCATTGGTAAAGCCAAGTTGTGTTGACTACCTGAAGCAGCTA
TCCTGTTCGGGATCTTGGAATTCAACTCTTCGATGCGTGATGTGAAGTCATCCATCCTCT
CGTTCAGTGTTGATATTTGATCTGACAGCTGAGTGATCACACCCTGATTTGGAAGAGTGG
CTGGTGAAGCAGGGGCTCTGGCATCTAACATTCTATTGTTAACAGCAAGCCTCGTCAAGT
TAGGCAAGACTTTGTGTCTTTGATTTGTGTAAGACTTTGATACACCGCCGTGAAGATACT
TCATTCTACTATCAGCAGACGCTCTTGAGAGGGCTTCTTTAGGGCTAGAAACTGTATCAT
CATCTAAGCTAAGTTTTGTCTTCAAATCGTCTGGCAAAGCCATAACA


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B141JQ U 17
AF RR2BF88JQ U 1
AF RR2BF88TF C 1
AF RR2B141TF C 4
BS 1 754 RR2BF88JQ
BS 755 827 RR2B141TF

RD RR2B141JQ 126 0 0
CT
TATTCTTGGGGCAAATTGTCAGGACTGATTTATCCAGTTTGTATCCCAAACTGTGATATT
TACATCATTGCC*ACTGGCCCTGGGTTTAAACACTGCAGTAACTAACTGTTACAGCAACT
ACTT

QA 3 126 3 126
DS 

RD RR2BF88JQ 755 0 0
ATATACGAATCAGTCTCTTATTCTTGTGGCAAATTGTCAGGACTGATTTATCCAGTTTGT
ATCCCAAACTGTGATATTTAAATCATTGCC*ACTGGCCCTGGGTTTAAACACTGCAGTAA
CTAACTGTTACAGCAACTACTTGAGACGACTGTAGGCAAAAACGCCGAGACAGCCAATGG
CCAAAGCAAGAACAACAGGTAAAGCAGCAGCAACAACTTCGAGGTTCTGTGTTGTGCTGT
TTGTTCGGTTGCTGTCTAGTCTCTCTATGCGAGACCTTTCTCCAACATACTCCCTAATCA
GATTGCTCAGTGTGTCCATTTGATGCATCATCTGTCGTTGTCCACGAGCAACCAGTACAA
CCTCTTCCATCGGAGGAGACTCCCTTATAAGCTGAGATGCGGATGAGGAGAGTGATAAAA
GGGAGCCATTACCATTTTCCATTGGTAAAGCCAAGTTGTGTTGACTACCTGAAGCAGCTA
TCCTGTTCGGGATCTTGGAATTCAACTCTTCGATGCGTGATGTGAAGTCATCCATCCTCT
CGTTCAGTGTTGATATTTGATCTGACAGCTGAGTGATCACACCCTGATTTGGAAGAGTGG
CTGGTGAAGCAGGGGCTCTGGCATCTAACATTCTATTGTTAACAGCAAGCCTCGTCAAGT
TAGGCAAGACTTTGTGTCTTTGATTTGTGTAAGACTTTGATACACCGCCGTGAAGATACT
TCATTCTACTATCAGCAGACGCTCTTGAGAGGGC
C

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2BF88TF 755 0 0
ATA
TACGAATCAGTCTCTTATTCTTGTGGCAAATTGTCAGGACTGATTTATCCAGTTTGTATC
CCAAACTGTGATATTTAAATCATTGCC*ACTGGCCCTGGGTTTAAACACTGCAGTAACTA
ACTGTTACAGCAACTACTTGAGACGACTGTAGGCAAAAACGCCGAGACAGCCAATGGCCA
AAGCAAGAACAACAGGTAAAGCAGCAGCAACAACTTCGAGGTTCTGTGTTGTGCTGTTTG
TTCGGTTGCTGTCTAGTCTCTCTATGCGAGACCTTTCTCCAACATACTCCCTAATCAGAT
TGCTCAGTGTGTCCATTTGATGCATCATCTGTCGTTGTCCACGAGCAACCAGTACAACCT
CTTCCATCGGAGGAGACTCCCTTATAAGCTGAGATGCGGATGAGGAGAGTGATAAAAGGG
AGCCATTACCATTTTCCATTGGTAAAGCCAAGTTGTGTTGACTACCTGAAGCAGCTATCC
TGTTCGGGATCTTGGAATTCAACTCTTCGATGCGTGATGTGAAGTCATCCATCCTCTCGT
TCAGTGTTGATATTTGATCTGACAGCTGAGTGATCACACCCTGATTTGGAAGAGTGGCTG
GTGAAGCAGGGGCTCTGGCATCTAACATTCTATTGTTAACAGCAAGCCTCGTCAAGTTAG
GCAAGACTTTGTGTCTTTGATTTGTGTAAGACTTTGATACACCGCCGTGAAGATACTTCA
TTCTACTATCAGCAGACGCTCTTGAGAGGGC
C

QA 4 754 4 754
DS 

RD RR2B141TF 824 0 0
TACGAATCAGTCTCT*ATTCTTGTGGCAAATTGTCAGGACTGATTTATCCAGTTTGTATC
CCAAACTGTGATATTTACATCATTGCCCACTGGCCCTGGGTTTAAACACTGCAGTAACTA
ACTGTTACAGCAACTACTTGAGACGACTGTAGGCAAAAACGCCGAGACAGCCAATGGCCA
AAGCAAGAACAACAGGTAAAGCAGCAGCAACAACTTCGAGGTTCTGTGTTGTGCTGTTTG
TTCGGTTGCTGTCTAGTCTCTCTATGCGAGACCTTTCTCCAACATACTCCCTAATCAGAT
TGCTCAGTGTGTCCATTTGATGCATCATCTGTCGTTGTCCACGAGCAACCAGTACAACCT
CTTCCATCAGAGGAGACTCCCTTATAAGCTGAGATGCGGATGAGGAGAGTGATAAAAGGG
AGCCATTACCATTTTCCATTGGTAAAGCCAAGTTGTGTTGACTACCTGAAGCAGCTATCC
TGTTCGGGATCTTGGAATTCAACTCTTCGATGCGTGATGTGAAGTCATCCATCCTCTCGT
TCAGTGTTGATATTTGATCTGACAGCTGAGTGATCACACCCTGATTTGGAAGAGTGGCTG
GTGAGGCAGGGGCTCTGGCATCTAACATTCTATTGTTAACAGCAAGCCTCGTCAAGTTAG
GCAAGACTTTGTGTCTTTGATTTGTGTAAGACTTTGATACACCGCCGTGAAGATACTTCA
TTCTACTATCAGCAGACGCTCTTGAGAGGGCTTCTTTAGGGCTAGAAACTGTATCATCAT
CTAAGCTAAGTTTTGTCTTCAAATCGTCTGGCAAAGCCATAACA

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 4

CO CL2048Contig1 850 4 32 U
GGAGAGCTTTAACCCAAACGGTTTTGTAAAAACATTGACCTCTCCGGAACAACATGTCGT
CTTCTTCAAACGTTGTAGTGGAATCGTGCGACGTTGATTCCGAGGAAGGGGTGAAGCTCC
ACACGAGAATCTTCAAACCCAGAGACGAGCAAGTCAGCCACGACGACGGGGATCTAGTGA
TAGTTTTGGTCCACCCTTTCTCGCTCTTGGGTGGTTGTCAGGCACTGCTCAAAGGCATAG
CTTCTGAGTTGGCCTGCAAGGGCTTCAAGTCCGTCACTTTCGATACGAGAGGTGCTGGAA
AATCAACGGGGAGGGCTACTCTTACTGGGTTCGCTGAGGTCAAGGATGTGATCGCTGTTT
GTCGGTGGGTTTCTCAGAACCTCGGTGCTCATAAGATCCTCCTCGTGGGTTCTTCTGCTG
GTGCACCAATAGCAGGATCAGCGGTGGAGCAAGTAGAGCAAGTTGTTGGATATGTGAGTT
TAGGATACCCATTCGGCCTAATGGCATCGGTTCTGTTTGGGCGGCACCACAAGGCCATTC
TCTCATCCCCTAAACCCAAACTCTTCGTTATGGGAACACAAGACGGCTTCACTAGCGTTA
GCCAGCTCAAGAAGAAGCTGAAATCTGCAGCAGGACGCACCGAAACACACCTCCTCGAAG
GCGTTAGCCATTTCCAGATGGAAGGACATGAGTATGATTCTCAGATGGCGGATGTCATAT
GCAACTTTATTTCATCCTTGTAATGACTTCATATGCAACTTCATGATATACATTACCCAT
GTTTGAGAGTTGAAGACTTAATTTGTAACACATCATACACAAAAGAGGATAGTAAACATA
GACATTGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G692TF U 1
AF RR2G692JQ C 47
AF RR2D549TF U 84
AF RR2D549JQ C 127
BS 1 154 RR2G692TF
BS 155 155 RR2D549TF
BS 156 387 RR2G692TF
BS 388 388 RR2D549TF
BS 389 397 RR2G692TF
BS 398 398 RR2D549TF
BS 399 505 RR2G692TF
BS 506 506 RR2D549TF
BS 507 631 RR2G692TF
BS 632 632 RR2D549TF
BS 633 660 RR2G692TF
BS 661 661 RR2D549TF
BS 662 684 RR2G692TF
BS 685 685 RR2D549TF
BS 686 687 RR2G692TF
BS 688 688 RR2D549TF
BS 689 723 RR2G692TF
BS 724 724 RR2D549TF
BS 725 731 RR2G692TF
BS 732 732 RR2D549TF
BS 733 742 RR2G692TF
BS 743 743 RR2D549TF
BS 744 746 RR2G692TF
BS 747 747 RR2D549TF
BS 748 771 RR2G692TF
BS 772 772 RR2D549TF
BS 773 777 RR2G692TF
BS 778 778 RR2D549TF
BS 779 794 RR2G692TF
BS 795 802 RR2D549TF
BS 803 809 RR2G692JQ
BS 810 850 RR2D549JQ

RD RR2G692TF 794 0 0
GGAGAGCTTTAACCCAAACGGTTTTGTAAAAACATTGACCTCTCCGGAACAACATGTCGT
CTTCTTCAAACGTTGTAGTGGAATCGTGCGACGTTGATTCCGAGGAAGGGGTGAAGCTCC
ACACGAGAATCTTCAAACCCAGAGACGAGCAAGTTAGCCACGACGACGGGGATCTAGTGA
TAGTTTTGGTCCACCCTTTCTCGCTCTTGGGTGGTTGTCAGGCACTGCTCAAAGGCATAG
CTTCTGAGTTGGCCTGCAAGGGCTTCAAGTCCGTCACTTTCGATACGAGAGGTGCTGGAA
AATCAACGGGGAGGGCTACTCTTACTGGGTTCGCTGAGGTCAAGGATGTGATCGCTGTTT
GTCGGTGGGTTTCTCAGAACCTCGGTGTTCATAAGATTCTCCTCGTGGGTTCTTCTGCTG
GTGCACCAATAGCAGGATCAGCGGTGGAGCAAGTAGAGCAAGTTGTTGGATATGTGAGTT
TAGGATACCCATTCGGCCTAATGGCCTCGGTTCTGTTTGGGCGGCACCACAAGGCCATTC
TCTCATCCCCTAAACCCAAACTCTTCGTTATGGGAACACAAGACGGCTTCACTAGCGTTA
GCCAGCTCAAGAAGAAGCTGAAATCTGCAGCGGGACGCACCGAAACACACCTCCTCGAAG
*CGTTAGCCATTTCCAGATGGAAG*ACCTGAGTATGATTCTCAGATGGCGGATGTCATAT
GCA*CTTTATT*CATCCTTGTA*TGATTTCATATGCAACTTCATGATATACGTTACC*AT
GTTTGAGAGTTGAA

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2G692JQ 764 0 0
GAACAACATGTCGTCTTCTTCAAACGTTGTAGTGGAATCGTGCGACGTTGATTCCGAGGA
AGGGGTGAAGCTCCACACGAGAATCTTCAAACCCAGAGACGAGCAAGTTAGCCACGACGA
CGGGGATCTAGTGATAGTTTTGGTCCACCCTTTCTCGCTCTTGGGTGGTTGTCAGGCACT
GCTCAAAGGCATAGCTTCTGAGTTGGCCTGCAAGGGCTTCAAGTCCGTCACTTTCGATAC
GAGAGGTGCTGGAAAATCAACGGGGAGGGCTACTCTTACTGGGTTCGCTGAGGTCAAGGA
TGTGATCGCTGTTTGTCGGTGGGTTTCTCAGAACCTCGGTGTTCATAAGATTCTCCTCGT
GGGTTCTTCTGCTGGTGCACCAATAGCAGGATCAGCGGTGGAGCAAGTAGAGCAAGTTGT
TGGATATGTGAGTTTAGGATACCCATTCGGCCTAATGGCCTCGGTTCTGTTTGGGCGGCA
CCACAAGGCCATTCTCTCATCCCCTAAACCCAAACTCTTCGTTATGGGAACACAAGACGG
CTTCACTAGCGTTAGCCAGCTCAAGAAGAAGCTGAAATCTGCAGCGGGACGCACCGAAAC
ACACCTCCTCGAAGGCGTTAGCCATTTCCAGATGGAAGGACCTGAGTATGATTCTCAGAT
GGCGGATGTCATATGCAACTTTATTTCATCCTTGTAATGATTTCATATGCAACTTCATGA
TATACGTTACCCATGTTTGAGAGTTGAAGACTTAATTTGTAAC
T

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2D549TF 719 0 0
GGGTGTGAG
GTTGATTCCGAGGAAGGTGTGAAGCTCCACACGAGAATCTTCAAACCCAGAGACGAGCAA
GTCAGCCACGACGACGGGGATCTAGTGATAGTTTTGGTCCACCCTTTCTCGCTCTTGGGT
GGTTGTCAGGCACTGCTCAAAGGCATAGCTTCTGAGTTGGCCTGCAAGGGCTTCAAGTCC
GTCACTTTCGATACGAGAGGTGCTGGAAAATCAACGGGGAGGGCTACTCTTACTGGGTTC
GCTGAGGTTAAGGATGTGATCGCTGTTTGTCGGTGGGTTTCTCAGAATCTCGGTGCTCAT
AGGATCCTCCTCGTGGGTTCTTCTGCTGGTGCACCAATCGCAGGATCAGCGGTGGAGCAA
GTAGAGCAAGTTGTTGGATATGTGAGTTTAGGATACCCATTTGGCCTAATGGCATCGGTT
CTGTTTGGGCGGCACCACAAGGCCATTCTCTCATCCCCTAAACCCAAACTCTTCGTTATG
GGAACACAAGACGGTTTCACTAGCGTTAGCCAGCTCAAGAAGGAGCTGAAATCTGCAGCA
GGACGCACCGAAACACACCTTCTCGAAGGCGTTAGCCATTTCCAGATGGAAGGACATGAG
TATGATTCTCAGATGGCGGATGTCATATGCAACTTTATTTCATCCTTGTAATGACTTCAT
ATGCAACTTCATGATATACATTACCCATGTTTGAGAGTTGAAGACTTAAT

QA 10 719 10 719
DS 

RD RR2D549JQ 724 0 0
GAATCTTCAAACCCAGAGACGAGCAAGTCAGCCACGACGACGGGGATCTAGTGATAGTTT
TGGTCCACCCTTTCTCGCTCTTGGGTGGTTGTCAGGCACTGCTCAAAGGCATAGCTTCTG
AGTTGGCCTGCAAGGGCTTCAAGTCCGTCACTTTCGATACGAGAGGTGCTGGAAAATCAA
CGGGGAGGGCTACTCTTACTGGGTTCGCTGAGGTTAAGGATGTGATCGCTGTTTGTCGGT
GGGTTTCTCAGAATCTCGGTGCTCATAGGATCCTCCTCGTGGGTTCTTCTGCTGGTGCAC
CAATCGCAGGATCAGCGGTGGAGCAAGTAGAGCAAGTTGTTGGATATGTGAGTTTAGGAT
ACCCATTTGGCCTAATGGCATCGGTTCTGTTTGGGCGGCACCACAAGGCCATTCTCTCAT
CCCCTAAACCCAAACTTTTCGTTATGGGAACACAAGACGGTTTCACTAGCGTTAGCCAGC
TCAAGAAGGAGCTGAAATCTGCAGCAGGACGCACCGAAACACACCTTCTCGAAGGCGTTA
GCCATTTCCAGATGGAAGGACATGAGTATGATTCTCAGATGGCGGATGTCATATGCAACT
TTATTTCATCCTTGTAATGACTTCATATGCAACTTCATGATATACATTACCCATGTTTGA
GAGTTGAAGACTTAATTTGTAACACATCATACACAAAAGAGGATAGTAAACATAGACATT
GTAC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 2 4

CO CL2049Contig1 728 2 3 U
GGAGTCTCGAAACTTTTGTCGGATTTACCAAAGAAAGAAAAAATGGCGGATCAACTGACC
GATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGT
TGCATCACAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAAACCCAACCGAA
GCTGAGCTCCAAGACATGATCAACGAGGTCGATGCAGACGGTAACGGGACCATCGATTTC
CCGGAGTTCCTGAACCTGATGGCGAGGAAAATGAAGGACACTGACTCCGAGGAAGAGCTC
AAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCGGCTGAGCTT
CGACATGTGATGACGAACCTTGGTGAGAAACTTACCGATGAGGAAGTTGATGAGATGATC
CGTGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTTAAAGTCATG
ATGGCTAAGTAAGTGACTGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGTCCTATCCCTTGTTAAAAAAT
TAAAAGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTCTGGTTTGTGTTCTTTAGG
ACATGTTTTTGCTTCTTTCATGTTTTATTTGTCTGCTTTTGGCTTAAGCTATCTCTTTAG
TGTTATGTCAAGTATGAACTTCATGTTTTCAGTATCCTTTGACAATTGATATTCTCTCCT
TTTTTGAG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ24JQ C 1
AF RR2AQ24TF U 1
BS 1 2 RR2AQ24JQ
BS 3 721 RR2AQ24TF
BS 722 728 RR2AQ24JQ

RD RR2AQ24JQ 728 0 0
GGAGTCTCGAAACTTTTGTCGGATTTACCAAAGAAAGAAAAAATGGCGGATCAACTGACC
GATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGT
TGCATCACAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAAACCCAACCGAA
GCTGAGCTCCAAGACATGATCAACGAGGTCGATGCAGACGGTAACGGGACCATCGATTTC
CCGGAGTTCCTGAACCTGATGGCGAGGAAAATGAAGGACACTGACTCCGAGGAAGAGCTC
AAGGAAGCCTTCAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCGGCTGAGCTT
CGACATGTGATGACGAACCTTGGTGAGAAACTTACCGATGAGGAAGTTGATGAGATGATC
CGTGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTTAAAGTCATG
ATGGCTAAGTAAGTGACTGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGTCCTATCCCTTGTTAAAAAAT
TAAAAGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTCTGGTTTGTGTTCTTTAGG
ACATGTTTTTGCTTCTTTCATGTTTTATTTGTCTGCTTTTGGCTTAAGCTATCTCTTTAG
TGTTATGTCAAGTATGAACTTCATGTTTTCAGTATCCTTTGACAATTGATATTCTCTCCT
TTTTTGAG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2AQ24TF 721 0 0
GG
AGTCTCGAAACTTTTGTCGGATTTACCAAAGAAAGAAAAAATGGCGGATCAACTGACCGA
TGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGTTG
CATCACAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAAACCCAACCGAAGC
TGAGCTCCAAGACATGATCAACGAGGTCGATGCAGACGGTAACGGGACCATCGATTTCCC
GGAGTTCCTGAACCTGATGGCGAGGAAAATGAAGGACACTGACTCCGAGGAAGAGCTCAA
GGAAGCCTTCAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCGGCTGAGCTTCG
ACATGTGATGACGAACCTTGGTGAGAAACTTACCGATGAGGAAGTTGATGAGATGATCCG
TGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTTAAAGTCATGAT
GGCTAAGTAAGTGACTGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGTCCTATCCCTTGTTAAAAAATTA
AAAGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTCTGGTTTGTGTTCTTTAGGAC
ATGTTTTTGCTTCTTTCATGTTTTATTTGTCTGCTTTTGGCTTAAGCTATCTCTTTAGTG
TTATGTCAAGTATGAACTTCATGTTTTCAGTATCCTTTGACAATTGATATTCTCTCCTT

QA 3 721 3 721
DS 



CO CL2049Contig2 719 2 1 U
GGAAAAGAATCAGTCTCGAAACTTTTGTCGGATTTACCAAAGAAAGAAAAAATGGCGGAT
CAACTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGAT
GGAGATGGTTGCATCACAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAAAC
CCAACCGAAGCTGAGCTCCAAGACATGATCAATGAGGTCGATGCAGACGGTAACGGGACC
ATCGATTTCCCGGAGTTCCTGAACCTGATGGCCAGGAAAATGAAGGACACTGACTCTGAG
GAAGAGCTCAAGGAAGCCTTTAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCG
GCTGAGCTTCGACATGTGATGACAAACCTTGGTGAGAAACTTACCGATGAGGAAGTTGAT
GAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTT
AAAGTCATGATGGCTAAGTAAGTGAGTGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGAGAGACAGTCTT
ATTATCCCTTGTTAAAACAAAAAGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTC
TGGTTGTGTTCTTTAGGACATGTTTTTGCTTCTTTCGTGTTTTTATTTCTGCTTTTGGCC
TAAGCTATCCCTTTAGTGTTATGTCAAGTATGAACTTCGTGTTTTCAGTATCCTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E139TF U 1
AF RR2E139JQ C 188
BS 1 719 RR2E139TF

RD RR2E139TF 719 0 0
GGAAAAGAATCAGTCTCGAAACTTTTGTCGGATTTACCAAAGAAAGAAAAAATGGCGGAT
CAACTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGAT
GGAGATGGTTGCATCACAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCTCTAGGGCAAAAC
CCAACCGAAGCTGAGCTCCAAGACATGATCAATGAGGTCGATGCAGACGGTAACGGGACC
ATCGATTTCCCGGAGTTCCTGAACCTGATGGCCAGGAAAATGAAGGACACTGACTCTGAG
GAAGAGCTCAAGGAAGCCTTTAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCG
GCTGAGCTTCGACATGTGATGACAAACCTTGGTGAGAAACTTACCGATGAGGAAGTTGAT
GAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTT
AAAGTCATGATGGCTAAGTAAGTGAGTGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGAGAGACAGTCTT
ATTATCCCTTGTTAAAACAAAAAGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTC
TGGTTGTGTTCTTTAGGACATGTTTTTGCTTCTTTCGTGTTTTTATTTCTGCTTTTGGCC
TAAGCTATCCCTTTAGTGTTATGTCAAGTATGAACTTCGTGTTTTCAGTATCCTTTGAC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2E139JQ 532 0 0
AAGCTGAGCTCCAAGACATGATCAATGAGGTCGATGCAGACGGTAACGGGACCATCGATT
TCCCGGAGTTCCTGAACCTGATGGCCAGGAAAATGAAGGACACTGACTCTGAGGAAGAGC
TCAAGGAAGCCTTTAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCGGCTGAGC
TTCGACATGTGATGACAAACCTTGGTGAGAAACTTACCGATGAGGAAGTTGATGAGATGA
TCCGTGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTTAAAGTCA
TGATGGCTAAGTAAGTGAGTGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGAGAGACAGTCTTATTATCC
CTTGTTAAAACAAAAAGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTCTGGTTGT
GTTCTTTAGGACATGTTTTTGCTTCTTTCGTGTTTTTATTTCTGCTTTTGGCCTAAGCTA
TCCCTTTAGTGTTATGTCAAGTATGAACTTCGTGTTTTCAGTATCCTTTGAC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 4

CO CL2050Contig1 1472 4 8 U
GCTGTTCTCTTATATTAAGATTTCTGGGATTTTCAAGATTCTATTGAGTTTCTTGTTTCA
CTTACAGAATTCTATTTTTTATTAATTTTTTTGTTTTTCCAATTTGATTATATTAGTTTC
TGTTTGATCTGAAGAAAAGAATCTTCGTTAAGGGGAATGAAATGAGTAAGAGAGCTTTGC
CCAAATCGCCACCCAAACTTGTTCTATTGCCAGCTCTTCTTATCCTTTCCTCAACATGTC
TGTTTGGCATCCTCACAAACCTTCAAACCTTATCATACCTTTTCCGTCCTCTCGGGGACA
AACCACCACCACCATTCAGACGAATCCCACATTACTACGCCGAGAACGTCTCCATGTCAC
ACCTCTGCCACCTCCACGGATGGACTCCCCGTACAGAGCCAAGGCGAGTCTTCGACGCCA
TCATCTTCAGCAACGAGCTCGACCTCCTAGAGGTGAGATGGCAGGAGCTAGGACCCTACG
TTTCAAAATTCGTCATTCTTGAATCCAACACCACTTTCACAGGCATCCCCAAGCCTCTCT
TCTTCGACTCCGCGAAGGCGAGATTCGCCTTCGCGGAGGGTAAGATAGTCCACGGGGTGT
TCCCTGGGCAGAAGCGTAGTAGTAGTTTACAAGAAGAAGATCCATTCTTGCTCGAAGGCC
GGCAACGGGTTGCTATGAACTGGCTCCTCAGAGAAGCTAATGTCTCTGATGGAGACGCGG
TGATAATGTCCGATGCGGATGAGATTCCCAGTCCTCATACCGTCAAGCTCCTACAGTGGT
GCGACGGGATACCTGACGTGATGCATCTGGAGATGAGGGATTACATGTACTCCTTCGAGT
TCCCCGTTGATTACAGCAGCTGGAGAGCGTCTGTGCATTTATACAGCAGGAAATGGACTC
ACTACCGTCACTCCCGGCAGACCGACTTGATACTGTCTGACGCCGGGTGGCATTGTAGCT
TCTGTTTCAGACGTCTCGGCGAGTTTGTGTTCAAGATGAAAGGGTATAGCCATGCGGATA
GAGTGAGGCGCAAGGAGTTTCTTGACTACTCTAGGATACAGAAACATATTTGTAAAGGAT
ATGATCTCTTTGACATGCTTCCTGAAGAATACAGCTTCAAAGATTTGATTAGCAAAATCG
GACCCATCCCGCCTTCTGCATCTGCTGTGCATCTACCTGCGTTTTTGATTCAGAATGCCG
CCCGCTTTCGCTTTCTCCTACCAGGAGGCTGCCTCAGAGAGCCTTAGCTGTCTCAGAGAC
TTAGAGAGCCTTAGCTAAGTGGGGATAGGAGGATCTTAGTACAAAATAGATAAGCAATGG
TTTCTTGTAGAAAAAAAAGAGGATCGTTACTACATCATGTTAATGTGTTTCCTTCCATTC
ATGTTTACCCTGCCGACGGCATCAAACCTTCCATTCATCAGTGTACCAATTTATTTCGAG
CAAAACTGAATATAACGCAATCCCCTTAAAAT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD41TF U 1
AF RR2A467TF U 2
AF RR2A467JQ C 571
AF RR2AD41JQ C 600
BS 1 650 RR2AD41TF
BS 651 651 RR2A467TF
BS 652 765 RR2AD41TF
BS 766 766 RR2A467TF
BS 767 782 RR2AD41TF
BS 783 813 RR2A467TF
BS 814 1376 RR2A467JQ
BS 1377 1472 RR2AD41JQ

RD RR2AD41TF 782 0 0
GCTGTTCTCTTATATTAAGATTTCTGGGATTTTCAAGATTCTATTGAGTTTCTTGTTTCA
CTTACAGAATTCTATTTTTTATTAATTTTTTTGTTTTTCCAATTTGATTATATTAGTTTC
TGTTTGATCTGAAGAAAAGAATCTTCGTTAAGGGGAATGAAATGAGTAAGAGAGCTTTGC
CCAAATCGCCACCCAAACTTGTTCTATTGCCAGCTCTTCTTATCCTTTCCTCAACATGTC
TGTTTGGCATCCTCACAAACCTTCAAACCTTATCATACCTTTTCCGTCCTCTCGGGGACA
AACCACCACCACCATTCAGACGAATCCCACATTACTACGCCGAGAACGTCTCCATGTCAC
ACCTCTGCCACCTCCACGGATGGACTCCCCGTACAGAGCCAAGGCGAGTCTTCGACGCCA
TCATCTTCAGCAACGAGCTCGACCTCCTAGAGGTGAGATGGCAGGAGCTAGGACCCTACG
TTTCAAAATTCGTCATTCTTGAATCCAACACCACTTTCACAGGCATCCCCAAGCCTCTCT
TCTTCGACTCCGCGAAGGCGAGATTCGCCTTCGCGGAGGGTAAGATAGTCCACGGGGTGT
TCCCTGGGCAGAAGCGTAGTAGTAGTTTACAAGAAGAAGATCCATTCTTGTTCGAAGGCC
GGCAACGGGTTGCTATGAACTGGCTCCTCAGAGAAGCTAATGTCTCTGATGGAGACGCGG
TGATAATGTCCGATGCGGATGAGATTCCCAGTCCTCATACCGTCA*GCTCCTACAGTGGT
GC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2A467TF 812 0 0
GG
GTTCTCTTATATTAAGATTTCTGGGATTTTCAAGATTCTATTGAGTTTCTTGTTTCACTT
ACAGAATTCTATTTTTTATTAATTTTTTTGTTTTTCCAATTTGATTATATTAGTTTCTGT
TTGATCTGAAGAAAAGAATCTTCGTTAAGGGGAATGAAGTGAGTAAGAGAGCTTTGCCCA
AATCGCCACCCAAACTTGTTCTATTGCCAGCTCTTCTTATCCTTTCCTCAACATGTTTGT
TTGGCATCCTCACAAACCTTCAAACCTTATCATACCTTTTCCGTCCTCTCTGGGACAAAC
CACCACCACCATTCAGACGAATCCCACATTACTACGCCGAGAACGTCTCCATGTCACACC
TCTGCCACCTCCACGGATGGACTCCCCGTACAGAGCCAAGGCGAGTCTTCGACGCCATCA
TCTTCAGCAACGAGCTCGACCTCCTAGAGGTGAGATGGCAGGAGCTAGGACCCTACGTTT
CAAAATTCGTCATTCTTGAATCCAACACCACTTTCACAGGCATCCCCAAGCCTCTCTTCT
TCGACTCCGCGAAGGCGAGATTCGCCTTCGCGGAGGGTAAGATAGTCCACGGGGTGTTCC
CTGGGCAGAAGCGTAGTAGTAGTTTACAAGAAGAAGATCCATTCTTGCTCGAAGGCCGGC
AACGGGTTGCTATGAACTGGCTCCTCAGAGAAGCTAATGTCTCTGATGGAGGCGCGGTGA
TAATGTCCGATGCGGATGAGATTCCCAGTCCTCATACCGTCAAGCTCCTACAGTGGTGCG
ACGGGATACCTGACGTGATGCATCTGGAGA

QA 3 812 3 812
DS 

RD RR2A467JQ 806 0 0
TCGCGGAGGGTAAGATAGTCCACGGGGTGTTCCCTGGGCAGAAGCGTAGTAGTAGTTTAC
AAGAAGAAGATCCATTCTTGCTCGAAGGCCGGCAACGGGTTGCTATGAACTGGCTCCTCA
GAGAAGCTAATGTCTCTGATGGAGGCGCGGTGATAATGTCCGATGCGGATGAGATTCCCA
GTCCTCATACCGTCAAGCTCCTACAGTGGTGCGACGGGATACCTGACGTGATGCATCTGG
AGATGAGGGATTACATGTACTCCTTCGAGTTCCCCGTTGATTACAGCAGCTGGAGAGCGT
CTGTGCATTTATACAGCAGGAAATGGACTCACTACCGTCACTCCCGGCAGACCGACTTGA
TACTGTCTGACGCCGGGTGGCATTGTAGCTTCTGTTTCAGACGTCTCGGCGAGTTTGTGT
TCAAGATGAAAGGGTATAGCCATGCGGATAGAGTGAGGCGCAAGGAGTTTCTTGACTACT
CTAGGATACAGAAACATATTTGTAAAGGATATGATCTCTTTGACATGCTTCCTGAAGAAT
ACAGCTTCAAAGATTTGATTAGCAAAATCGGACCCATCCCGCCTTCTGCATCTGCTGTGC
ATCTACCTGCGTTTTTGATTCAGAATGCCGCCCGCTTTCGCTTTCTCCTACCAGGAGGCT
GCCTCAGAGAGCCTTAGCTGTCTCAGAGACTTAGAGAGCCTTAGCTAAGTGGGGATAGGA
GGATCTTAGTACAAAATAGATAAGCAATGGTTTCTTGTAGAAAAAAAAGAGGATCGTTAC
TACATCATGTTAATGTGTTTCCTTCC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2AD41JQ 873 0 0
GTT
CCTGGGCAGAAGCGTAGTAGTAGTTTACAAGAAGAAGATCCATTCTTGTTCGAAGGCCGG
CAACGGGTTGCTATGAACTGGCTCCTCAGAGAAGCTAATGTCTCTGATGGAGACGCGGTG
ATAATGTCCGATGCGGATGAGATTCCCAGTCCTCATACCGTCAAGCTCCTACAGTGGTGC
GACGGGATACCTGACGTGATGCATCTGGAGATGAGGGATTACATGTACTCCTTCGAGTTC
CCCGTTGATTACAGCAGCTGGAGAGCGTCTGTGCATTTATACAGCAGGAAATGGACTCAC
TACCGTCACTCCCGGCAGACCGACTTGATACTGTCTGACGCCGGGTGGCATTGTAGCTTC
TGTTTCAGACGTCTCGGCGAGTTTGTGTTCAAGATGAAAGGGTATAGCCATGCGGATAGA
GTGAGGCGCAAGGAGTTTCTTGACTACTCTAGGATACAGAAACATATTTGTAAAGGATAT
GATCTCTTTGACATGCTTCCTGAAGAATACAGCTTCAAAGATTTGATTAGCAAAATCGGA
CCCATCCCGCCTTCTGCATCTGCTGTGCATCTACCTGCGTTTTTGATTCAGAATGCCGCC
CGCTTTCGCTTTCTCCTACCAGGAGGCTGCCTCAGAGAGCCTTAGCTGTCTCAGAGACTT
AGAGAGCCTTAGCTAAGTGGGGATAGGAGGATCTTAGTACAAAATAGATAAGCAATGGTT
TCTTGTAGAAAAAAAAGAGGATCGTTACTACATCATGTTAATGTGTTTCCTTCCATTCAT
GTTTACCCTGCCGACGGCATCAAACCTTCCATTCATCAGTGTACCAATTTATTTCGAGCA
AAACTGAATATAACGCAATCCCCTTAAAAT

QA 4 873 4 873
DS 



AS 2 4

CO CL2051Contig1 713 2 6 U
GGACGAAAACATTTTCTATTTGAAAAAAAAAACATAACATCAAATACTATTATTTTCTCT
TTCTTTCTTTCATCGTTTCACAGTCTACAAAAAATGGAAGGAAGACAATACTACCCTCCA
AGAGAAACCATCGACGGAAACAGAACCACCATGGGAGGACCTCACTCACCGTGGCATTCA
CCGGTTCCTTATCTCTTCGGTGGTTTAGCCGCGATGCTTGGTCTCATCGCCTTTGCTCTC
CTAATCCTCGGTTGCTCTTATTGGCGCCTCTCTGGTTACTTCGACGGTGAGGAAAACCAG
AGCAGAGACAGCGATCTTGAAGCCGGAGATATGAAACCCGATAAAGCAATGAAGGCTGTA
GCTTTGCCGGAGAAGTTCTTGGTGATAATGGCCGGAGATGTGAATCCCACGTACTTGGCG
ACGCCGGCGGAGAAAAGCTGTACTTGTGACGATGATGAAGACGAGGAGGGTGGTGTTGAC
GTGAAGGGTAACGATCAGGTGGTGCGGCGGAGTACTGAAAGCAACGGTGCGACACATTGA
GAAACAGAGTACGTGAAGAGAAGGATTGTTGTGAACAGTTCTTTAGACTGTTTGTATCTG
ACCCGGTTGCTTCTGGATATCGGGTCCGGTCAGAGCTCTACATGATGAGCTTTAATTATA
GTCTGACTCATAAAGTGGCAGAAGAACTATATATAAAAAGTGAATTGGAATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2E343TF U 1
AF RR2E343JQ C 197
BS 1 682 RR2E343TF
BS 683 685 RR2E343JQ
BS 686 698 RR2E343TF
BS 699 699 RR2E343JQ
BS 700 712 RR2E343TF
BS 713 713 RR2E343JQ

RD RR2E343TF 713 0 0
GGACGAAAACATTTTCTATTTGAAAAAAAAAACATAACATCAAATACTATTATTTTCTCT
TTCTTTCTTTCATCGTTTCACAGTCTACAAAAAATGGAAGGAAGACAATACTACCCTCCA
AGAGAAACCATCGACGGAAACAGAACCACCATGGGAGGACCTCACTCACCGTGGCATTCA
CCGGTTCCTTATCTCTTCGGTGGTTTAGCCGCGATGCTTGGTCTCATCGCCTTTGCTCTC
CTAATCCTCGGTTGCTCTTATTGGCGCCTCTCTGGTTACTTCGACGGTGAGGAAAACCAG
AGCAGAGACAGCGATCTTGAAGCCGGAGATATGAAACCCGATAAAGCAATGAAGGCTGTA
GCTTTGCCGGAGAAGTTCTTGGTGATAATGGCCGGAGATGTGAATCCCACGTACTTGGCG
ACGCCGGCGGAGAAAAGCTGTACTTGTGACGATGATGAAGACGAGGAGGGTGGTGTTGAC
GTGAAGGGTAACGATCAGGTGGTGCGGCGGAGTACTGAAAGCAACGGTGCGACACATTGA
GAAACAGAGTACGTGAAGAGAAGGATTGTTGTGAACAGTTCTTTAGACTGTTTGTATCTG
ACCCGGTTGCTTCTGGATATCGGGTCCGGTCAGAGCTCTACATGATGAGCTTTAATTATA
GTCTGACTCATAAAGTGGCAGA**GACTATATATAAAA*GTGAATTGGAATT
G

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2E343JQ 517 0 0
TCGGTGGTTTAGCCGCGATGCTTGGTCTCATCGCCTTTGCTCTCCTAATCCTCGGTTGCT
CTTATTGGCGCCTCTCTGGTTACTTCGACGGTGAGGAAAACCAGAGCAGAGACAGCGATC
TTGAAGCCGGAGATATGAAACCCGATAAAGCAATGAAGGCTGTAGCTTTGCCGGAGAAGT
TCTTGGTGATAATGGCCGGAGATGTGAATCCCACGTACTTGGCGACGCCGGCGGAGAAAA
GCTGTACTTGTGACGATGATGAAGACGAGGAGGGTGGTGTTGACGTGAAGGGTAACGATC
AGGTGGTGCGGCGGAGTACTGAAAGCAACGGTGCGACACATTGAGAAACAGAGTACGTGA
AGAGAAGGATTGTTGTGAACAGTTCTTTAGACTGTTTGTATTTGACCCGGTTGCTTCTGG
ATATCGGGTCCGGTCAGAGCTCTACATGATGAGCTTTAATTATAGTTTGACTCATAAAGT
GGCAGAAGAACTATATATAAAAAGTGAATTGGAATTG

QA 1 517 1 517
DS 



CO CL2051Contig2 833 2 6 U
GGACGAAAACATTTTCTATTTGAAAAAAAAACATAACATCAAATACTATTATTTTTCTCT
TTCTTTCTTTCATCGTTTCGCAGTCTACAAAAATGGAAGGAAGACAATACTACCCCCAAG
AGAAACCATCGACGGAAACAGAACCACCATGGGAGGACCTCACTCGCCGTGGCATTCACC
GGTTCCTTATCTCTTCGGTGGTTTAGCCGCGATGCTTGGTCTCATCGCCTTTGCTCTCCT
AATCCTCGGTTGCTCTTATTGGCGCCTCTCTGGTTACTTCGACGGTGAGGAAAACCAGAG
CAGAGACAGCGATCTTGAAGCCGGAGATTTGAAACCAGATAAAGCGGTGAAGGCAGTAGC
TTTGCCGGAGAAGTTCTTGGTGATAATGGCCGGAGATGTGAACCCCACGTACTTGGCGAC
GCCGGCGGAGAAAAGCTGTACTTGTGACGATGATGAAGACGAGGAGGGTGGTGTTGACGT
GAAGGGTAATGATCAGGTGGTGCGGCGGAGTACTGAAAGCAACGGTGCGACACATTGAGA
AACAGAGTACGTGAAGAGTAAGAAACAGAGGATCGTCTATTGTGAACAGTTCTTTAGACT
GTTTGTATCTGACCCGGTTGCTTCTGGATATCGGGTCGGGTCAGAGCTACATGATGAGCT
TTAATTATAGTCTGACTCATAAAGTGGCGGAAGAACTATATATAAAAAGTAAATTGGAAT
TTGGATCTTTAGGAAGGTATTAACAATGTTATTTAATCTCAGCTTTTGCTTCATTAAGTT
GATTAGGCTTTTTTGTTTTTAAATTTGTAATTAGTTTGTAATTCATATATCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER77TF U 1
AF RR2ER77JQ C 72
BS 1 691 RR2ER77TF
BS 692 694 RR2ER77JQ
BS 695 707 RR2ER77TF
BS 708 708 RR2ER77JQ
BS 709 721 RR2ER77TF
BS 722 833 RR2ER77JQ

RD RR2ER77TF 729 0 0
GGACGAAAACATTTTCTATTTGAAAAAAAAACATAACATCAAATACTATTATTTTTCTCT
TTCTTTCTTTCATCGTTTCGCAGTCTACAAAAATGGAAGGAAGACAATACTACCCCCAAG
AGAAACCATCGACGGAAACAGAACCACCATGGGAGGACCTCACTCGCCGTGGCATTCACC
GGTTCCTTATCTCTTCGGTGGTTTAGCCGCGATGCTTGGTCTCATCGCCTTTGCTCTCCT
AATCCTCGGTTGCTCTTATTGGCGCCTCTCTGGTTACTTCGACGGTGAGGAAAACCAGAG
CAGAGACAGCGATCTTGAAGCCGGAGATTTGAAACCAGATAAAGCGGTGAAGGCAGTAGC
TTTGCCGGAGAAGTTCTTGGTGATAATGGCCGGAGATGTGAACCCCACGTACTTGGCGAC
GCCGGCGGAGAAAAGCTGTACTTGTGACGATGATGAAGACGAGGAGGGTGGTGTTGACGT
GAAGGGTAATGATCAGGTGGTGCGGCGGAGTACTGAAAGCAACGGTGCGACACATTGAGA
AACAGAGTACGTGAAGAGTAAGAAACAGAGGATCGTCTATTGTGAACAGTTCTTTAGACT
GTTTGTATCTGACCCGGTTGCTTCTGGATATCGGGTCGGGTCAGAGCTACATGATGAGCT
TTAATTATAGTCTGACTCATAAAGTGGCGGAG**ACTATATATAAAA*GTAAATTGGAAT
T
TGGATCTT

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2ER77JQ 762 0 0
ATCGTTTCGCAGTCTACAAAAATGGAAGGAAGACAATACTACCCCCAAGAGAAACCATCG
ACGGAAACAGAACCACCATGGGAGGACCTCACTCGCCGTGGCATTCACCGGTTCCTTATC
TCTTCGGTGGTTTAGCCGCGATGCTTGGTCTCATCGCCTTTGCTCTCCTAATCCTCGGTT
GCTCTTATTGGCGCCTCTCTGGTTACTTCGACGGTGAGGAAAACCAGAGCAGAGACAGCG
ATCTTGAAGCCGGAGATTTGAAACCAGATAAAGCGGTGAAGGCAGTAGCTTTGCCGGAGA
AGTTCTTGGTGATAATGGCCGGAGATGTGAACCCCACGTACTTGGCGACGCCGGCGGAGA
AAAGCTGTACTTGTGACGATGATGAAGACGAGGAGGGTGGTGTTGACGTGAAGGGTAATG
ATCAGGTGGTGCGGCGGAGTACTGAAAGCAACGGTGCGACACATTGAGAAACAGAGTACG
TGAAGAGTAAGAAACAGAGGATCGTCTATTGTGAACAGTTCTTTAGACTGTTTGTATCTG
ACCCGGTTGCTTCTGGATATCGGGTCGGGTCAGAGCTACATGATGAGCTTTAATTATAGT
CTGACTCATAAAGTGGCGGAAGAACTATATATAAAAAGTAAATTGGAATTTGGATCTTTA
GGAAGGTATTAACAATGTTATTTAATCTCAGCTTTTGCTTCATTAAGTTGATTAGGCTTT
TTTGTTTTTAAATTTGTAATTAGTTTGTAATTCATATATCCA

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 4

CO CL2052Contig1 797 4 2 U
CCTCCCATCATCACTAGTCACGACCAAACACAAAAAGGAAGAAACATATCATATAGAGAG
AGAAAGAAACACACCAGTGGCAGAACCGTAAATAAAAGATGTCTAAAGATTGCGGCAACC
ACGGTGGTGGAAAAGAAGCAGCCGTCCGGCGAATCTGCGGCGCCGTGATCGCCTTCATCA
TAATAGTTCTAATCACCATCTTCCTAGTTTGGGTCATACTCAGGCCAACTAAGCCAAGAT
TCATCCTCCAAGACGCCACCGTTTTCGCCCTCAACCTCTCGCAACCAAACCTCCTCACCA
CAAACTTCCAGATCACATTCGCATCTCGTAACCCTAACTCCAAGATCGGTATCTACTACG
ACCGTCTCCACGTCTACGCTACGTACCATAACCAGCAGATAACACTCAGGACAGCAATCC
CTCCGACGTACCAAGGGCACAAAGAAGACAACGTCTGGTCTCCGTTTGTGTACGGAACCG
CTGTTCCGATCGCACCGTACAACTCCGTCGCTTTGGAAGACGAGCAAGGTCATGGACTCG
TTCGGTTGATGATACGCGCCGATGGGCGCGTGAGATGGAAAGTAGGGACGTTGATCACAG
GAAAATATCATATCCATGTTCGGTGTCCGGCTATCATCGATCTTGGGAACAAAGCTGCTG
GTGTTATTGTCGGTGATAACGCCGTTAAGTATACGTTGATTACTAAATGCAGTGTGAACG
TTTAGAACTTTGACGCCGTTAAGTTGCTACTATCTTCTTTTTATATTATATAATCAAATC
ATTTTCTATTTACAAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR2BE40JQ C 1
AF RR2BE40TF U 1
AF RR2AV41TF U 39
AF RR2AV41JQ C 157
BS 1 793 RR2BE40TF
BS 794 797 RR2AV41JQ

RD RR2BE40JQ 793 0 0
CCTCCCATCATCACTAGTCACGACCAAACACAAAAAGGAAGAAACATATCATATAGAGAG
AGAAAGAAACACACCAGTGGCAGAACCGTAAATAAAAGATGTCTAAAGATTGCGGCAACC
ACGGTGGTGGAAAAGAAGCAGCCGTCCGGCGAATCTGCGGCGCCGTGATCGCCTTCATCA
TAATAGTTCTAATCACCATCTTCCTAGTTTGGGTCATACTCAGGCCAACTAAGCCAAGAT
TCATCCTCCAAGACGCCACCGTTTTCGCCCTCAACCTCTCGCAACCAAACCTCCTCACCA
CAAACTTCCAGATCACATTCGCATCTCGTAACCCTAACTCCAAGATCGGTATCTACTACG
ACCGTCTCCACGTCTACGCTACGTACCATAACCAGCAGATAACACTCAGGACAGCAATCC
CTCCGACGTACCAAGGGCACAAAGAAGACAACGTCTGGTCTCCGTTTGTGTACGGAACCG
CTGTTCCGATCGCACCGTACAACTCCGTCGCTTTGGAAGACGAGCAAGGTCATGGACTCG
TTCGGTTGATGATACGCGCCGATGGGCGCGTGAGATGGAAAGTAGGGACGTTGATCACAG
GAAAATATCATATCCATGTTCGGTGTCCGGCTATCATCGATCTTGGGAACAAAGCTGCTG
GTGTTATTGTCGGTGATAACGCCGTTAAGTATACGTTGATTACTAAATGCAGTGTGAACG
TTTAGAACTTTGACGCCGTTAAGTTGCTACTATCTTCTTTTTATATTATATAATCAAATC
ATTTTCTATTTAC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2BE40TF 793 0 0
CCTCCCATCATCACTAGTCACGACCAAACACAAAAAGGAAGAAACATATCATATAGAGAG
AGAAAGAAACACACCAGTGGCAGAACCGTAAATAAAAGATGTCTAAAGATTGCGGCAACC
ACGGTGGTGGAAAAGAAGCAGCCGTCCGGCGAATCTGCGGCGCCGTGATCGCCTTCATCA
TAATAGTTCTAATCACCATCTTCCTAGTTTGGGTCATACTCAGGCCAACTAAGCCAAGAT
TCATCCTCCAAGACGCCACCGTTTTCGCCCTCAACCTCTCGCAACCAAACCTCCTCACCA
CAAACTTCCAGATCACATTCGCATCTCGTAACCCTAACTCCAAGATCGGTATCTACTACG
ACCGTCTCCACGTCTACGCTACGTACCATAACCAGCAGATAACACTCAGGACAGCAATCC
CTCCGACGTACCAAGGGCACAAAGAAGACAACGTCTGGTCTCCGTTTGTGTACGGAACCG
CTGTTCCGATCGCACCGTACAACTCCGTCGCTTTGGAAGACGAGCAAGGTCATGGACTCG
TTCGGTTGATGATACGCGCCGATGGGCGCGTGAGATGGAAAGTAGGGACGTTGATCACAG
GAAAATATCATATCCATGTTCGGTGTCCGGCTATCATCGATCTTGGGAACAAAGCTGCTG
GTGTTATTGTCGGTGATAACGCCGTTAAGTATACGTTGATTACTAAATGCAGTGTGAACG
TTTAGAACTTTGACGCCGTTAAGTTGCTACTATCTTCTTTTTATATTATATAATCAAATC
ATTTTCTATTTAC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2AV41TF 756 0 0
AAGAAACATATCATATAGTGAGAGAAAGAAACACACCAGTGGCAGAACCGTAAATAAAAG
ATGTCTAAAGATTGCGGCAACCACGGTGGTGGAAAAGAAGCAGCCGTCCGGCGAATCTGC
GGCGCCGTGATCGCCTTCATCATAATAGTTCTAATCACCATCTTCCTAGTTTGGGTCATA
CTCAGGCCAACTAAGCCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTTTTCGCCTTCAACCTC
TCGCAACCAAACCTCCTCACCACAAACTTTCAGATCACATTCGCATCTCGTAACCCTAAC
TCCAAGATCGGTATCTACTACGACCGTCTCCACGTCTACGCTACGTACCATAACCAGCAG
ATAACACTCAGGACAGCAATCCCTCCGACGTACCAAGGGCACAAAGAAGACAACGTCTGG
TCTCCGTTTGTGTACGGAACCGCTGTTCCGATCGCACCGTACAACTCCGTCGCTTTGGAA
GACGAGCAAGGTCATGGACTCGTTCGGTTGATGATACGCGCCGATGGGCGCGTGAGATGG
AAAGTAGGGACGTTGATCACAGGAAAATATCATATCCATGTTCGGTGTCCGGCTATCATC
GATCTTGGGAACAAAGCTGCTGGTGTTATTGTCGGTGATAACGCCGTTAAGTATACGTTG
ATTACTAAATGCAGTGTGAACGTTTAGAACTTTGACGCCGTTAAGTTGCTACTATCTTCT
TTTTATATTATATAATCAAATCATTTTCTATTTAC
A

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2AV41JQ 641 0 0
GCGGCGCCGTGATCGCCTTCATCATAATAGTTCTAATCACCATCTTCCTAGTTTGGGTCA
TACTCAGGCCAATTAAGCCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTTTTCGCCTTCAACC
TCTCGCAACCAAACCTCCTCACCACAAACTTTCAGATCACATTCGCATCTCGTAACCCTA
ACTCCAAGATCGGTATTTACTACGACCGTCTCCACGTTTACGCTACGTACCATAACCAGC
AGATAACACTCAGGACAGCAATCCCTCCGACGTACCAAGGGCACAAAGAAGACAACGTCT
GGTCTCCGTTTGTGTACGGAACCGCTGTTCCGATCGCACCGTACAACTCCGTCGCTTTGG
AAGACGAGCAAGGTCATGGACTCGTTCGGTTGATGATACGCGCCGATGGGCGCGTGAGAT
GGAAAGTAGGGACGTTGATCACAGGAAAATATCATATCCATGTTCGGTGTCCGGCTATCA
TCGATCTTGGGAACAAAGCTGCTGGTGTTATTGTCGGTGATAACGCCGTTAAGTATACGT
TGATTACTAAATGCAGTGTGAACGTTTAGAACTTTGACGCCGTTAAGTTGCTACTATCTT
CTTTTTATATTATATAATCAAATCATTTTCTATTTACAAGC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 3

CO CL2053Contig1 1158 3 26 U
GCTTAGGAACTTTAGTATTGAAATGAGAGATAAAAACATACAAAATATATAATTCATTTT
CTCTTTGTACAATTCTCACAAAATCACTCCTCTATAAGTAAATTGTACCAAGAACAGTGA
TCTACACCCAAAAGGTCCATAATGACTTGAGAACAAAGCACGAGCATGCCCATGTATGAT
TGATACTTTGCTTGGCATTTTCCTCTGTTCTTTCGTCTTTTTTCATAGACAATAATTAAA
TTGTTCAAATAATGATGATAAGAATCAAGTCTTGACGCTTACGCTCGGCGACTTCTGGTC
TGGAGCTCTAGGTGCAGTAGGTGGTGGTGCACATTGTTTTTTACCTTTCTTAGAACCCGA
AGTAGTAGAACAAGAAGAAGAAGCAGGGTTACCAGTTGATTTTGCCCGAATATGCGAACG
ATGACTATCAGGTGTGGAAGAAGACGAAGAAGTAGAGAGTAAAGGACCTGATCTAGATCG
GTTTCTCCTTTTCTTCCTCTCTTCTTCTGAAAGCTCTCCTTTATTAACTACCCGCCTCAC
TTTTGTCTCGTTGAAGCGCGGTGGCAACACACAGTTACAGAGAACCCCTAAGCGAGCGAG
TCGGTTGACCCATCTAGGGATTGGTTTCTGGGTAAGTTTAACACAAACTTCATTGCAAAA
ATGGTTGCAGTTCCTTGAGATGAGATTGTACTTGTTTCCTCGATACTCTTCAGCTAGTTT
CTCCATAAAGACTCGGACTTCTTTAGCAGCCATGTCTGTTTTCCCAACAAGAATCGATTT
CCTAAACGTGAAACCAGGACACTTCTTTGGCTCCACTTCAAAGATGCCTGTGCTTGGAGA
CTCATGTGCTCCAAATGCATATTCAACTCCATGAACTTCAACACCAGAATGAAAGACCCC
ACGTCCGAGCCAGTAACCATAAGCATTCATAGGAGTTAGATCGTAGACATTCAGGTAAAC
CGGAAGCAAACCGGTTTTCTCCTTCCGCCTAGCCGAACCCTTCCAGCACAACATCTCTCT
CCGCTTCAATACATCACCGATCCGGGAGGAACCAGAGATTTCGGAGGAGAGGGCAAACGA
AGTGAAACCGGTTAGATCCGGGATTCAAAAGATGAGAACTTTTTAAAGGGCTCCTCGTCG
CTTCATCTTCTGAACTCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ67JQ U 1
AF RR2GR76JQ U 1
AF RR2GZ67TF C 427
BS 1 80 RR2GR76JQ
BS 81 81 RR2GZ67JQ
BS 82 85 RR2GR76JQ
BS 86 86 RR2GZ67JQ
BS 87 213 RR2GR76JQ
BS 214 214 RR2GZ67JQ
BS 215 364 RR2GR76JQ
BS 365 370 RR2GZ67JQ
BS 371 405 RR2GR76JQ
BS 406 406 RR2GZ67JQ
BS 407 408 RR2GR76JQ
BS 409 409 RR2GZ67JQ
BS 410 535 RR2GR76JQ
BS 536 536 RR2GZ67JQ
BS 537 564 RR2GR76JQ
BS 565 565 RR2GZ67JQ
BS 566 606 RR2GR76JQ
BS 607 607 RR2GZ67JQ
BS 608 630 RR2GR76JQ
BS 631 631 RR2GZ67JQ
BS 632 675 RR2GR76JQ
BS 676 676 RR2GZ67JQ
BS 677 696 RR2GR76JQ
BS 697 697 RR2GZ67JQ
BS 698 786 RR2GR76JQ
BS 787 1158 RR2GZ67TF

RD RR2GZ67JQ 759 0 0
GCTC
AGGAACTTTAGTATTGAAATGAGAGATAAAAACATACAAA*TATATAATTCATTTTCTCT
TTGTACAATTCTCATAACATCACTCCTCTATAAGTAAATTGTACCAAGAACAGTGATCTA
CACCCAAAAGGTCCATAATGACTTGAGAACAAAGCACGAGCATGCCCATGTATGATTGAT
ACTTTGCTTGGCATTTTCCTCTGTTCTTTCGTCTTTTTTCATAGACAATAATTAAATTGT
TCAAATAATGATGATAAGAATCAAGTCTTGACGCTTACGCTCGGCGACTTCTGGTCTGGA
GCTCTAGGTGCAGTAGGTGGTGGTGCACATTGTTTTTTACTTTTCTTAGAACCCGAAGTA
GTAGAAGAAGAAGAAGAAGCAGGGTTACCAGTTGATTTTGCCCGAATATGCGAACGATGA
CTATCGGGTGTGGAAGAAGACGAAGAAGTAGAGAGTAAAGGACCTGATCTAGATCGGTTT
CTCCTTTTCTTCCTCTCTTCTTCTGAAAGCTCTCCTTTATTAACTACCCGCCTCACTTTT
GTCTCGTTGAAGCGCGGTGGCAACACACAGTTACAGAGAACCCCTAAGCGAGCGAGTCGG
TTGACCCATCTAGGGATTGGTTTCTGGGTAAGTTTAACACAAACTTCATTGCAAAAATGG
TTGCAGTTCCTTGAGATGAGATTGTACTTGTTTCCTCGATACTCTTCAGCTAGTTTCTCC
ATAAAGACTCGGACTTCTTTAGCAGCCATGTCTGT

QA 5 759 5 759
DS 

RD RR2GR76JQ 786 0 0
GCTTAGGAACTTTAGTATTGAAATGAGAGATAAAAACATACAAAATATATAATTCATTTT
CTCTTTGTACAATTCTCACATAATCTCTCCTCTATAAGTAAATTGTACCAAGAACAGTGA
TCTACACCCAAAAGGTCCATAATGACTTGAGAACAAAGCACGAGCATGCCCATGTATGAT
TGATACTTTGCTTGGCATTTTCCTCTGTTCTTTTGTCTTTTTTCATAGACAATAATTAAA
TTGTTCAAATAATGATGATAAGAATCAAGTCTTGACGCTTACGCTCGGCGACTTCTGGTC
TGGAGCTCTAGGTGCAGTAGGTGGTGGTGCACATTGTTTTTTACCTTTCTTAGAACCCGA
AGTA******CAAGAAGAAGAAGCAGGGTTACCAGTTGATTTTGCTCGCATATGCGAACG
ATGACTATCAGGTGTGGAAGAAGACGAAGAAGTAGAGAGTAAAGGACCTGATCTAGATCG
GTTTCTCCTTTTCTTCCTCTCTTCTTCTGAAAGCTCTCCTTTATTAACTACCCGCTTCAC
TTTTGTCTCGTTGAAGCGCGGTGGTAACACACAGTTACAGAGAACCCCTAAGCGAGCGAG
TCGGTTAACCCATCTAGGGATTGGTTTCTGAGTAAGTTTAACACAAACTTCATTGCAAAA
ATGGTTGCAGTTCCTCGAGATGAGATTGTACTTGTTCCCTCGATACTCTTCAGCTAGTTT
CTCCATAAAGACTCGGACTTCTTTAGCAGCCATGTCTGTTTTCCCAACAAGAATCGATTT
CCTAAA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2GZ67TF 732 0 0
ATCGGGTGT
GGAAGAAGACGAAGAAGTAGAGAGTAAAGGACCTGATCTAGATCGGTTTCTCCTTTTCTT
CCTCTCTTCTTCTGAAAGCTCTCCTTTATTAACTACCCGCCTCACTTTTGTCTCGTTGAA
GCGCGGTGGCAACACACAGTTACAGAGAACCCCTAAGCGAGCGAGTCGGTTGACCCATCT
AGGGATTGGTTTCTGGGTAAGTTTAACACAAACTTCATTGCAAAAATGGTTGCAGTTCCT
TGAGATGAGATTGTACTTGTTTCCTCGATACTCTTCAGCTAGTTTCTCCATAAAGACTCG
GACTTCTTTAGCAGCCATGTCTGTTTTCCCAACAAGAATCGATTTCCTAAACGTGAAACC
AGGACACTTCTTTGGCTCCACTTCAAAGATGCCTGTGCTTGGAGACTCATGTGCTCCAAA
TGCATATTCAACTCCATGAACTTCAACACCAGAATGAAAGACCCCACGTCCGAGCCAGTA
ACCATAAGCATTCATAGGAGTTAGATCGTAGACATTCAGGTAAACCGGAAGCAAACCGGT
TTTCTCCTTCCGCCTAGCCGAACCCTTCCAGCACAACATCTCTCTCCGCTTCAATACATC
ACCGATCCGGGAGGAACCAGAGATTTCGGAGGAGAGGGCAAACGAAGTGAAACCGGTTAG
ATCCGGGATTCAAAAGATGAGAACTTTTTAAAGGGCTCCTCGTCGCTTCATCTTCTGAAC
TCC

QA 10 732 10 732
DS 



AS 1 4

CO CL2054Contig1 1257 4 7 U
GGGATTTCTCTTATTACGAACGTTTGTGGTACTAACTTTTTTATAGAGAAATGGGTAGAT
TTCCTGGATTTGGTGTTTGGATGAATCAGAACACTCAACAGCCTCTTAAGGTCAGATTCA
TTTCCATCAGAGCTCCCAAGGAAGTCAAATCTATATAATTACTATTGGTCAAATGTAGAA
ACAAGAGGAGGAAGATAAGCAAATAAAACTATGGAACGTTGCAGAGAGGAAGCATCCATG
GTATGATCCTCCTCCTAGGGTGAAGGTGACAACGAAAAGTGGAATTTGTCATATGAATAT
AGAATTCACATTGGGAGTGACCCCTTTAGCAGCCTTCGAACATTTGAGTACACCAATTTC
CTTGTCATTAGACATGTCCGCCCGCCAACTTCTGGTTTTTTTCTTATCATTGTATGATTC
AAATGATACTAATTATAGTAATACATACTTGAGAGTGATATTTTTCTTTGATTATAAAGA
AAAATCAATCAAGAAAGGTTTTGAAGAAGGATGGTCCAAGAGAGATTTTAGAGACAGAGA
ACACTGTGGCCTTCGACTTCCTGTGGTGGTCTGGAGCTTTCCCCATAAAGCTTATTGTCG
ATGAAAACATTAAAGATCATACGGCAAAATATAAAAAGGAGAAAATGATGTTCATGAAAG
TGTTTGAGGGTAGCTATAAAGTAGAACCAATATTCGTAGATTCAGAACGCTTGTGCAAGC
ATAGGTTGCCGAAAACCCGAGAAGAATACAAAAAATGTAGTGGTGGACAAGGAAAACTTG
CATCGAAAGTAATAATGGACCAATACTTTCAACCCTCTCCTCCGTTTAATCTGCCACCGT
TTTCCTGGTACATTCATGGGATCACCATCAGGACCACAAAAACTCTGCTCCAGATGATTC
AACTTTCGACTGCGACCTTACGAGAGTTATCTTGAGTTCTCAAGATAATGACGTGGTAAA
GACATCAAGCGACAAACATACTTAGCCTAAATGATCATTCAGAAATATGTGTTGTAAGTT
GTATGTAAGACAACCTATATATTTATAACTCATATAGATTTTAGAAGGAACGATTCGAGA
CGACTTTAGATCTTTACTTATCTTGAAGCTTCTGTAGCTCTCCATCTTGGAATTTCTTAG
TTATAAAATTATTAATTTTGTTAAATAGTTGCTGAGAAATGAACATCTATCTCTTTATGT
GTATTGTGTCTCGGCTTGAAGCAAATATATACAAATACATTGAATTGAATTTCTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN65TF U 1
AF RR2CT95TF U 273
AF RR2CT95JQ C 504
AF RR2DN65JQ C 583
BS 1 618 RR2DN65TF
BS 619 619 RR2CT95TF
BS 620 624 RR2DN65TF
BS 625 1014 RR2CT95TF
BS 1015 1142 RR2CT95JQ
BS 1143 1143 RR2DN65JQ
BS 1144 1257 RR2CT95JQ

RD RR2DN65TF 624 0 0
GGGATTTCTCTTATTACGAACGTTTGTGGTACTAACTTTTTTATAGAGAAATGGGTAGAT
TTCCTGGATTTGGTGTTTGGATGAATCAGAACACTCAACAGCCTCTTAAGGTCAGATTCA
TTTCCATCAGAGCTCCCAAGGAAGTCAAATCTATATAATTACTATTGGTCAAATGTAGAA
ACAAGAGGAGGAAGATAAGCAAATAAAACTATGGAACGTTGCAGAGAGGAAGCATCCATG
GTATGATCCTCCTCCTAGGGTGAAGGTGACAACGAAAAGTGGAATTTGTCATATGAATAT
AGAATTCACATTGGGAGTGACCCCTTTAGCAGCCTTCGAACATTTGAGTACACCAATTTC
CTTGTCATTAGACATGTCCGCCCGCCAACTTCTGGTTTTTTTCTTATCATTGTATGATTC
AAATGATACTAATTATAGTAATACATACTTGAGAGTGATATTTTTCTTTGATTATAAAGA
AAAATCAATCAAGAAAGGTTTTGAAGAAGGATGGTCCAAGAGAGATTTTAGAGACAGAGA
ACACTGTGGCCTTCGACTTCCTGTGGTGGTCTGGAGCTTTCCCCATAAAGCTTATTGTCG
ATGAAAACATTAAAGATCTTACGG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2CT95TF 742 0 0
G
GAAAAGTGGAATTTGTCATATGAATATAGAATTCACATTGGGAGTGACCCCTTTAGCAGC
CTTCGAACATTTGAGTACACCAATTTCCTTGTCATTAGACATGTCCGCCCGCCAACTTCT
GGTTTTTT*CTTATCATTGTATGATTCAAATGATACTAATTATAGTAATACATACTTGAG
AGTGATATTTTTCTTTGATTATAAAGAAAAATCAATCAAGAAAGGTTTTGAAGAAGGATG
GTCCAAGAGAGATTTTAGAGACAGAGAACACTGTGGCCTTCGACTTCCTGTGGTGGTCTG
GAGCTTTCCCCATAAAGCTTATTGTCGATGAAAACATTAAAGATCATACGGCAAAATATA
AAAAGGAGAAAATGATGTTCATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTATAAAGTAGAACCAATAT
TCGTAGATTCAGAACGCTTGTGCAAGCATAGGTTGCCGAAAACCCGAGAAGAATACAAAA
AATGTAGTGGTGGACAAGGAAAACTTGCATCGAAAGTAATAATGGACCAATACTTTCAAC
CCTCTCCTCCGTTTAATCTGCCACCGTTTTCCTGGTACATTCATGGGATCACCATCAGGA
CCACAAAAACTCTGCTCCAGATGATTCAACTTTCGACTGCGACCTTACGAGAGTTATCTT
GAGTTCTCAAGATAATGACGTGGTAAAGACATCAAGCGACAAACATACTTAGCCTAAATG
ATCATTCAGAAATATGTGTTG

QA 2 742 2 742
DS 

RD RR2CT95JQ 754 0 0
AAGAAGGATGGTCCAAGAGAGATTTTAGAGACAGAGAACACTGTGGCCTTCGACTTCCTG
TGGTGGTCTGGAGCTTTCCCCATAAAGCTTATTGTCGATGAAAACATTAAAGATCATACG
GCAAAATATAAAAAGGAGAAAATGATGTTCATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTATAAAGTA
GAACCAATATTCGTAGATTCAGAACGCTTGTGCAAGCATAGGTTGCCGAAAACCCGAGAA
GAATACAAAAAATGTAGTGGTGGACAAGGAAAACTTGCATCGAAAGTAATAATGGACCAA
TACTTTCAACCCTCTCCTCCGTTTAATCTGCCACCGTTTTCCTGGTACATTCATGGGATC
ACCATCAGGACCACAAAAACTCTGCTCCAGATGATTCAACTTTCGACTGCGACCTTACGA
GAGTTATCTTGAGTTCTCAAGATAATGACGTGGTAAAGACATCAAGCGACAAACATACTT
AGCCTAAATGATCATTCAGAAATATGTGTTGTAAGTTGTATGTAAGACAACCTATATATT
TATAACTCATATAGATTTTAGAAGGAACGATTCGAGACGACTTTAGATCTTTACTTATCT
TGAAGCTTCTGTAGCTCTCCATCTTGGAATTTCTTAGTTGTAAAATTATTAATTTTGTTA
AATAGTTGCTGAGAAATGAACATCTATCTCTTTATGTGTATTGTGTCTCGGCTTGAAGCA
AATATATACAAATACATTGAATTGAATTTCTATG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2DN65JQ 660 0 0
CCATAAAGCTTATTGTCGATGAAAACATTAAAGATCTTACGGCAAAATATAAAAAGGAGA
AAATGATGTTCATGAAAGTGTTTGAGGGTAGCTATAAAGTAGAACCAATATTCGTAGATT
CAGAACGCTTGTGCAAGCATAGGTTGCCGAAAACCCGAGAAGAATACAAAAAATGTAGTG
GTGGACAAGGAAAACTTGCATCGAAAGTAATAATGGACCAATACTTTCAACCCTCTCCTC
CGTTTAATCTGCCACCGTTTTCCTGGTACATTCATGGGATCACCATCAGGACCACAAAAA
CTCTGCTCCAGATGATTCAACTTTCGACTGCGACCTTACGAGAGTTATCTTGAGTTCTCA
AGATAATTACGTGGTAAAGACATCAAGCGACAAACATACTTAGCCTAAATGATCATTCAG
AAATATGTGTTGTAAGTTGTATGTAAGACAACCTATATATTTATAACTCATATAGATTTT
AGAAGGAACGATTCGAGACGACTTTAGATCTTTACTTATCTTGAAGCTTCTGTAGCTCTC
CATCTTGGAATTTCTTAGTTATAAAATTATTAATTTTGTTAAATAGTTGCTGAGAAATGA
ACATCTATCTCTTTATGTGTATTGTGTCTCGGCTTGAAGCAAATATATACAAATACATTG

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 3

CO CL2055Contig1 814 3 2 U
GAACTGAAACATAATCTTATTCTCGCAATTTCCAGATGGGAACATTAAGACAGACAAAAC
ATGAATAGTTTTACATATTGAAATAAGCAAAACAAAATGAGAATCAAAAAGAGAAGCAAA
GGAAACAATGAGAATAAGTAAGTATTCATAAATGATCATATCATTCATCGTCTGAGTACT
CAAACTTAACTGAATGTGATTGAAGATCGATCTCTCCTCCTCTGTAGCTTCCTCTTTTCT
TCTTCGTCTTCTCATGTCGGAAACCCCTTCCTCTAACTTGCCCTAGAACCTCTTGAGCTT
TAGCACAATAACCCGAATCAGCACCACCCTTCGCCCAATAAGAGTTGTCTTTAAGCCTAT
CGTCAGTGAACACAACTTCCTCAACGTTCACTCTCTGAAACGGTTTCTTCGGCTCTTTCG
AGTCAGAAAGCCCCTTTCCAGACTTCTTATTAGTTGATTTTGTTTCAACGTTACCGTTCT
CCTGAACATCAGTTTGCTTAACAGGCGTTTCTTGAACATCCATATCTTCTTCTTCTCCTG
CCTTCTTCCTACGTTTAGAGTCCTCATCATCATCATCATCATCATCCTCTGTCTGTTCTT
TTGTCTCTTCTTCAGGCTCTGATCTTTTTCTCTTCTTGGAAACTCTCTCCTCATCACCCA
AAGTCTCAGCCTCGGCAGCTTTTGACTTGGTCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCTTTCTCTT
TCACTCCATCTTCTATCTCACCATCAGTTTCTTTGACCTTCTCCTCTTTAGCTACCTCCA
CTTTCGATTCCTTCTTGTTCTTCTTCTTCTTCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B358JQ U 1
AF RR2B358TF C 34
AF RR2EP61JQ U 1
BS 1 796 RR2B358JQ
BS 797 814 RR2EP61JQ

RD RR2B358JQ 797 0 0
GAACTGAAACATAATCTTATTCTCGCAATTTCCAGATGGGAACATTAAGACAGACAAAAC
ATGAATAGTTTTACATATTGAAATAAGCAAAACAAAATGAGAATCAAAAAGAGAAGCAAA
GGAAACAATGAGAATAAGTAAGTATTCATAAATGATCATATCATTCATCGTCTGAGTACT
CAAACTTAACTGAATGTGATTGAAGATCGATCTCTCCTCCTCTGTAGCTTCCTCTTTTCT
TCTTCGTCTTCTCATGTCGGAAACCCCTTCCTCTAACTTGCCCTAGAACCTCTTGAGCTT
TAGCACAATAACCCGAATCAGCACCACCCTTCGCCCAATAAGAGTTGTCTTTAAGCCTAT
CGTCAGTGAACACAACTTCCTCAACGTTCACTCTCTGAAACGGTTTCTTCGGCTCTTTCG
AGTCAGAAAGCCCCTTTCCAGACTTCTTATTAGTTGATTTTGTTTCAACGTTACCGTTCT
CCTGAACATCAGTTTGCTTAACAGGCGTTTCTTGAACATCCATATCTTCTTCTTCTCCTG
CCTTCTTCCTACGTTTAGAGTCCTCATCATCATCATCATCATCATCCTCTGTCTGTTCTT
TTGTCTCTTCTTCAGGCTCTGATCTTTTTCTCTTCTTGGAAACTCTCTCCTCATCACCCA
AAGTCTCAGCCTCGGCAGCTTTTGACTTGGTCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCTTTCTCTT
TCACTCCATCTTCTATCTCACCATCAGTTTCTTTGACCTTCTCCTCTTTAGCTACCTCCA
CTTTCGATTCCTTCTT
C

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2B358TF 764 0 0
AGATGGGAACATTAAGACAGACAAAACATGAATAGTTTTACATATTGAAATAAGCAAAAC
AAAATGAGAATCAAAAAGAGAAGCAAAGGAAACAATGAGAATAAGTAAGTATTCATAAAT
GATCATATCATTCATCGTCTGAGTACTCAAACTTAACTGAATGTGATTGAAGATCGATCT
CTCCTCCTCTGTAGCTTCCTCTTTTCTTCTTCGTCTTCTCATGTCGGAAACCCCTTCCTC
TAACTTGCCCTAGAACCTCTTGAGCTTTAGCACAATAACCCGAATCAGCACCACCCTTCG
CCCAATAAGAGTTGTCTTTAAGCCTATCGTCAGTGAACACAACTTCCTCAACGTTCACTC
TCTGAAACGGTTTCTTCGGCTCTTTCGAGTCAGAAAGCCCCTTTCCAGACTTCTTATTAG
TTGATTTTGTTTCAACGTTACCGTTCTCCTGAACATCAGTTTGCTTAACAGGCGTTTCTT
GAACATCCATATCTTCTTCTTCTCCTGCCTTCTTCCTACGTTTAGAGTCCTCATCATCAT
CATCATCATCATCCTCTGTCTGTTCTTTTGTCTCTTCTTCAGGCTCTGATCTTTTTCTCT
TCTTGGAAACTCTCTCCTCATCACCCAAAGTCTCAGCCTCGGCAGCTTTTGACTTGGTCT
TCTTCTTCTTCTTTTTCTCTTTCTCTTTCACTCCATCTTCTATCTCACCATCAGTTTCTT
TGACCTTCTCCTCTTTAGCTACCTCCACTTTCGATTCCTTCTT
C

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2EP61JQ 814 0 0
GAACTGAAACATAATCTTATTCTCGCAATTTCCAGATGGGAACATTAAGACAGACAAAAC
ATGAATAGTTTTACATATTGAAATAAGCAAAACAAAATGAGAATCAAAAAGAGAAGCAAA
GGAAACAATGAGAATAAGTAAGTATTCATAAATGATCATATCATTCATCGTCTGAGTACT
CAAACTTAACTGAATGTGATTGAAGATCGATCTCTCCTCCTCTGTAGCTTCCTCTTTTCT
TCTTCGTCTTCTCATGTCGGAAACCCCTTCCTCTAACTTGCCCTAGAACCTCTTGAGCTT
TAGCACCATAACCCGAATCAGCACCACCCTTCGCCCAATAAGAGTTGTCTTTAAGCCTAT
CGTCAGTGAACACAACTTCCTCAACGTTCACTCTCTGAAACGGTTTCTTCGGCTCTTTCG
AGTCAGAAAGCCCCTTTCCAGACTTCTTATTAGTTGATTTTGTTTCAACGTTACCGTTCT
CCTGAACATCAGTTTGCTTAACAGGCGTTTCTTGAACATCCATATCTTCTTCTTCTCCTG
CCTTCTTCCTACGTTTAGAGTCCTCATCATCATCATCATCATCATCCTCTGTCTGTTCTT
TTGTCTCTTCTTCAGGCTCTGATCTTTTTCTCTTCTTGGAAACTCTCTCCTCATCACCCA
AAGTCTCAGCCTCGGCAGCTTTTGACTTGGTCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCTTTCTCTT
TCACTCCATCTTCTATCTCACCATCAGTTTCTTTGACCTTCTCCTCTTTAGCTACCTCCA
CTTTCGATTCCTTCTTGTTCTTCTTCTTCTTCTC

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL2056Contig1 743 2 3 U
AATCTCATTCTTAATCATCTTATACAAGAATCAGAAAGAAGAAGAAAAAGAGAGAGTTTC
AATATGGCGATCGTGAATCCTAACTTTTGTGCACCGTACCCGGTAGAATTGGGAATCGTA
CGAAAGGTGATGACGATAACAGATGGTAACTTCGCTGTCACAGACGTCAACGGCAATCTC
CTTTTCAAAGTCAAAGAACCAATGTTTAGCCTCTCTGACAAAAGGATCTTACTCGACGCA
TCAGACACTCCAATTTTGACTTTGAAAGAAAATAAGGTGAGTCTTCACGATAGATGGCAA
GTGTTTAGAGGAAAGAGTACAGACCAAAATGATTTGGTATACACATTGAAACGATCGTCG
ATGTTTCAGCTGATTAAGCCAAAGTTAGATGTTTTCTTGGCTCCTAATAAGGAAATGAAG
GAATGCGACTTCCATGTCAAAGGAAGTTGGATCGACCGGTCATCTACCATCTATGCTGGA
AAATCTGACGTCATTGTTGCACAGATGCACAAGAAACATACCGCGCAGAGCATATTGATA
GGGAAGAGTAATTTCTCGGTTACGGTTTATCCGAATGTTGATTATGCATTTATAGTCTCT
CTCATTGTCATTCTCGATGACATTAACCGAGAAGATTCTGGAGAGTAAACACAATTTTCT
TGTGAATGACTCTTGATATTCCTTTTGCTACATTTTAGATGGTGTGTTTAAATTACTTAT
TATGTTTCATAATAATTGTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP40TF U 82
AF RR2CJ24TF U 1
BS 1 199 RR2CJ24TF
BS 200 200 RR2GP40TF
BS 201 743 RR2CJ24TF

RD RR2GP40TF 612 0 0
AACTTTTGTGCACCGTACCCGGTAGAATTGGGAATCGTACGAAAGGTGATGACGATAACA
GATGGTAACTTCGCTGTCACAGACGTCAACGGCAATCTCCTTTTCAAAGTCAAAGAACCA
ATGTTTAGCCTCTCTGACAAAAGGATCTTACTCGACGCATCAGACACTCCAATTTTGACT
TTGAAAGAAAATAAGGTGAGTCTTCACGATAGATGGCAAGTGTTTAGAGGAAAGATTACA
GACCAAAATGATTTGGTATACACATTGAAACGATCGTCGATGTTTCAGCTGATTAAGCCA
AAGTTAGATGTTTTCTTGGCTCCTAATAAGGAAATGAAGGAATGCGACTTCCATGTCAAA
GGAAGTTGGATCGACCGGTCATCTACCATCTATGCTGGAAAATCTGACGTCATTGTTGCA
CAGATGCACAAGAAACATACCGCGCAGAGCATATTGATAGGGAAGAGTAATTTCTCGGTT
ACGGTTTATCCGAATGTTGATTATGCATTTATAGTCTCTCTCATTGTCATTCTCGATGAC
AT*AACCGAGAAGATTCTGGAGAGTAAACACAATTT*CTTGTGAATGACTCTTGATATTC
CTTT
GCTACATT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2CJ24TF 743 0 0
AATCTCATTCTTAATCATCTTATACAAGAATCAGAAAGAAGAAGAAAAAGAGAGAGTTTC
AATATGGCGATCGTGAATCCTAACTTTTGTGCACCGTACCCGGTAGAATTGGGAATCGTA
CGAAAGGTGATGACGATAACAGATGGTAACTTCGCTGTCACAGACGTCAACGGCAATCTC
CTTTTCAAAGTCAAAGAACTAATGTTTAGCCTCTCTGACAAAAGGATCTTACTCGACGCA
TCAGACACTCCAATTTTGACTTTGAAAGAAAATAAGGTGAGTCTTCACGATAGATGGCAA
GTGTTTAGAGGAAAGAGTACAGACCAAAATGATTTGGTATACACATTGAAACGATCGTCG
ATGTTTCAGCTGATTAAGCCAAAGTTAGATGTTTTCTTGGCTCCTAATAAGGAAATGAAG
GAATGCGACTTCCATGTCAAAGGAAGTTGGATCGACCGGTCATCTACCATCTATGCTGGA
AAATCTGACGTCATTGTTGCACAGATGCACAAGAAACATACCGCGCAGAGCATATTGATA
GGGAAGAGTAATTTCTCGGTTACGGTTTATCCGAATGTTGATTATGCATTTATAGTCTCT
CTCATTGTCATTCTCGATGACATTAACCGAGAAGATTCTGGAGAGTAAACACAATTTTCT
TGTGAATGACTCTTGATATTCCTTTTGCTACATTTTAGATGGTGTGTTTAAATTACTTAT
TATGTTTCATAATAATTGTCATT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 4

CO CL2057Contig1 968 4 19 U
GGAAGAGAGAATTAAGTAAAATAAAAATGGGAAGAGGGAGAGTAGAGTTGAAGAGGATAG
AGAACAAGATCAATAGGCAAGTGACGTTTGCAAAGAGAAGGAATGGTCTTTTGAAGAAAG
CATACGAGCTTTCCGTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAGTAGAG
GAAAACAGTACGAGTTTTGCAGCAGTTCGAGCATGCTTCGGACACTAGACAGGTACCAAA
AGTGCAACTATGGAGCTCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGGGAGGCCTTAGCAGAACTTA
ATAGCCAGCATGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCTTTACAGAGAACTCAAA
GGAATCTATTGGGAGAAGATCTTGGACCTCTTAGTACAAAAGAGCTCGAGTCACTTGAGA
GACAGCTTGACTCTTCTTTGAAGCAGATCAGAGCTCTCCGAACACAATTCATGCTCGACC
AACTCAATGATCTTCAGAGTAAGGAACGCATGTTGGCTGAGACAAATAAAACTCTGAGGC
TAAGGTTAGCTGATGGATATCAGATGCCTCTCCAACTTAATCCGAACCCAGAAGATCATC
ACCATGTTGAGTACGGTCGTCATCAACAAGTACATGAACACTCTCAGCAAGCTTTCTTCC
AGCCTTTGGAATGCGAACCCATTCTTCAAATGGGGTATCAGGGGCAGCAAGATCATGGAA
TGGGAGCAGGACCAAGTGTGAACAATTACATGTTGGGTTGGCTACCTTATGACACCAACT
CCATTTGAAACTTTCTTCCTTTTTCTGTTCACTTTTTGACATTTTTATTTTAAAAATTTC
TTCTGCTCTCTTAGGCTTCCATTATGATTCCCCCTCTCTATAGTCTGTCTTGTGTGCATG
TGTGTGTGATGTTCTTTTTATGTTCGTCTACTATTCAATAATAAATTCAACATGATTTGC
TACCTCTT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB44TF U 1
AF RR2DL18TF U 2
AF RR2DL18JQ C 201
AF RR2GB44JQ C 293
BS 1 689 RR2GB44TF
BS 690 690 RR2DL18TF
BS 691 703 RR2GB44TF
BS 704 704 RR2DL18JQ
BS 705 709 RR2GB44TF
BS 710 710 RR2DL18JQ
BS 711 729 RR2GB44TF
BS 730 731 RR2DL18TF
BS 732 732 RR2GB44TF
BS 733 733 RR2DL18JQ
BS 734 741 RR2GB44TF
BS 742 744 RR2DL18JQ
BS 745 777 RR2GB44TF
BS 778 778 RR2DL18JQ
BS 779 788 RR2GB44TF
BS 789 789 RR2DL18JQ
BS 790 790 RR2GB44JQ
BS 791 960 RR2DL18JQ
BS 961 968 RR2GB44JQ

RD RR2GB44TF 792 0 0
GGAAGAGAGAATTAAGTAAAATAAAAATGGGAAGAGGGAGAGTAGAGTTGAAGAGGATAG
AGAACAAGATCAATAGGCAAGTGACGTTTGCAAAGAGAAGGAATGGTCTTTTGAAGAAAG
CATACGAGCTTTCCGTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAGTAGAG
GAAAACAGTACGAGTTTTGCAGCAGTTCGAGCATGCTTCGGACACTAGACAGGTACCAAA
AGTGCAACTATGGAGCTCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGGGAGGCCTTAGCAGAACTTA
ATAGCCAGCATGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCTTTACAGAGAACTCAAA
GGAATCTATTGGGAGAAGATCTTGGACCTCTTAGTACAAAAGAGCTCGAGTCACTTGAGA
GACAGCTTGACTCTTCTTTGAAGCAGATCAGAGCTCTCCGAACACAATTCATGCTCGACC
AACTCAATGATCTTCAGAGTAAGGAACGCATGTTGGCTGAGACAAATAAAACTCTGAGGC
TAAGGTTAGCTGATGGATATCAGATGCCTCTCCAACTTAATCCGAACCCAGAAGATCATC
ACCATGTTGAGTACGGTCGTCATCAACAAGTACATGAACACTCTCAGCAAGCTTTCTTCC
AGCCTTTGGAATGCGAACCCATTCTTCAA*TGGGGTATCAGGG*CAGCA*GATCATGGAA
TGGGAGCAGACC*AAGTGTGA**CATTACATGTTGGGTTGGCTACCTTATGACACCA*CT
CCATTTGA
ACTT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2DL18TF 798 0 0
GAAGAGAGAATTAAGTAAAATAAAGATGGGAAGAGGGAGAGTAGAGTTGAAGAGGATAGA
GAACAAGATCAATAGGCAAGTGACGTTTGCAAAGAGAAGGAATGGTCTTTTGAAGAAAGC
ATACGAGCTTTCCGTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAGTAGAGG
AAAACAGTACGAGTTTTGCAGCAGTTCGAGCATGCTTCGGACACTAGACAGGTACCAAAA
GTGCAACTATGGAGCTCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGGGAGGCCTTAGCAGAACTTAA
TAGCCAGCATGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCTTTACAGAGAACTCAAAG
GAATCTATTGGGAGAAGATCTTGGACCTCTTAGTACAAAAGAGCTCGAGTCACTTGAGAG
ACAGCTTGACTCTTCTTTGAAGCAGATCAGAGCTCTCCGAACACAATTCATGCTCGACCA
ACTCAATGATCTTCAGAGTAAGGAACGCATGTTGGCTGAGACAAATAAAACTCTGAGGCT
AAGGTTAGCTGATGGATATCAGATGCCTCTCCAACTTAATCCGAACCCAGAAGATCATCA
CCATGTTGAGTACGGTCGTCATCAACAAGTACATGAACACTCTCAGCAAGCTTTCTTCCA
GCCTTTGGAATGCGAACCCATTCTTCAAATGGGGTATCAGGG*CAGCA*GATCATGGAAT
GGGAGCAGGAC*AAGTGTGA**CATTACATGTTGGGTTGGCTAC*TTATGACACCA*CTC
CATTTGA
GCTTCTTCTTT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2DL18JQ 760 0 0
AGCAGTTCGAGCATGCTTCGGACACTAGACAGGTACCAAAAGTGCAACTATGGAGCTCCA
GAGCCCAATGTGCTTTCAAGGGAGGCCTTAGCAGAACTTAATAGCCAGCATGAGTATCTC
AAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCTTTACAGAGAACTCAAAGGAATCTATTGGGAGAAGAT
CTTGGACCTCTTAGTACAAAAGAGCTCGAGTCACTTGAGAGACAGCTTGACTCTTCTTTG
AAGCAGATCAGAGCTCTCCGAACACAATTCATGCTCGACCAACTCAATGATCTTCAGAGT
AAGGAACGCATGTTGGCTGAGACAAATAAAACTCTGAGGCTAAGGTTAGCTGATGGATAT
CAGATGCCTCTCCAACTTAATCCGAACCCAGAAGATCATCACCATGTTGAGTACGGTCGT
CATCAACAAGTACATGAACACTCTCAGCAAGCTTTCTTCCAGCCTTTGGAATGCGAACCC
ATTCTTCAAATGGGGTATCAGGGGCAGCAAGATCATGGAATGGGAGCAGGACCAAGTGTG
AACAATTACATGTTGGGTTGGCTACCTTATGACACCAACTCCATTTGAAGCTTTCTTCCT
TTTTCTGTTCACTTTTTGACATTTTTATTTTAAAAATTTCTTCTGCTCTCTTAGGCTTCC
ATTATGATTCCCCCTCTCTATAGTCTGTCTTGTGTGCATGTGTGTGTGATGTTCTTTTTA
TGTTCGTCTACTATTCAATAATAAATTCAACATGATTTGC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2GB44JQ 676 0 0
AGAACTTAATAGCCAGCATGAGTATCTCAAGCTTAAGGAGCGTTACGACGCTTTACAGAG
AACTCAAAGGAATCTATTGGGAGAAGATCTTGGACCTCTTAGTACAAAAGAGCTCGAGTC
ACTTGAGAGACAGCTTGACTCTTCTTTGAAGCAGATCAGAGCTCTCCGAACACAATTCAT
GCTCGACCAACTCAATGATCTTCAGAGTAAGGAACGCATGTTGGCTGAGACAAATAAAAC
TCTGAGGCTAAGGTTAGCTGATGGATATCAGATGCCTCTCCAACTTAATCCGAACCCAGA
AGATCATCACCATGTTGAGTACGGTCGTCATCAACAAGTACATGAACACTCTCAGCAAGC
TTTCTTCCAGCCTTTGGAATGCGAACCCATTCTTCAAATGGGGTATCAGGGGCAGCAAGA
TCATGGAATGGGAGCAGGACCAAGTGTGAACAATTACATGTTGGGTTGGCTACCTTATGA
CACCAACTCCATTTGAAACTTTCTTCCTTTTTCTGTTCACTTTTTGACATTTTTATTTTA
AAAATTTCTTCTGCTCTCTTAGGCTTCCATTATGATTCCCCCTCTCTATAGTCTGTCTTG
TGTGCATGTGTGTGTGATGTTCTTTTTATGTTCGTCTACTATTCAATAATAAATTCAACA
TGATTTGCTACCTCTT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 2 4

CO CL2058Contig1 634 2 3 U
GGCTAGCTCTCACGCCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTCTCGCCG
TCGCAAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAAAGGCTTAGGA
TTAACCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAGGGAAACGAGTGGAAGA
AGCCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTTCTTGAGAAGATTGGTATTGAGG
CTAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCAAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCA
AAAAGATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAACGATG
AGGTGCTAATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGACATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCA
GGTTCAAGGTTGTGAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAGAAGG
AGAAGCCTAGGTCTTAGACTCTCTACTGTGCTTATTTTGTCAATGGATTTTTGATACTTG
AAGGCTTTGAAGCCATTTCCCTCTGTCTGTTCTGCTTCAAGATTCTCGAACATGTGTACC
AGTGGTTGAGTTTTAAACTTGGTTTTGTTTCATC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2BT87JQ C 1
AF RR2BT87TF U 1
BS 1 2 RR2BT87JQ
BS 3 630 RR2BT87TF
BS 631 634 RR2BT87JQ

RD RR2BT87JQ 634 0 0
GGCTAGCTCTCACGCCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTCTCGCCG
TCGCAAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAAAGGCTTAGGA
TTAACCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAGGGAAACGAGTGGAAGA
AGCCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTTCTTGAGAAGATTGGTATTGAGG
CTAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCAAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCA
AAAAGATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAACGATG
AGGTGCTAATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGACATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCA
GGTTCAAGGTTGTGAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAGAAGG
AGAAGCCTAGGTCTTAGACTCTCTACTGTGCTTATTTTGTCAATGGATTTTTGATACTTG
AAGGCTTTGAAGCCATTTCCCTCTGTCTGTTCTGCTTCAAGATTCTCGAACATGTGTACC
AGTGGTTGAGTTTTAAACTTGGTTTTGTTTCATC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2BT87TF 634 0 0
GG
CTAGCTCTCACGCCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTCTCGCCGTC
GCAAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAAAGGCTTAGGATT
AACCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAGGGAAACGAGTGGAAGAAG
CCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTTCTTGAGAAGATTGGTATTGAGGCT
AAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCAAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAA
AAGATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAACGATGAG
GTGCTAATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGACATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGG
TTCAAGGTTGTGAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAGAAGGAG
AAGCCTAGGTCTTAGACTCTCTACTGTGCTTATTTTGTCAATGGATTTTTGATACTTGAA
GGCTTTGAAGCCATTTCCCTCTGTCTGTTCTGCTTCAAGATTCTCGAACATGTGTACCAG
TGGTTGAGTTTTAAACTTGGTTTTGTTT
CATC

QA 3 630 3 630
DS 



CO CL2058Contig2 640 2 2 U
GGCTCTCTCTAGCTCTCACGCCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTC
GCCTACGCAAACATGGGTAGGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAAAGGCTT
AGGATTAACCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAGGGAAACGAGTGG
AAGAAGCCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGAAGATTGGTATT
GAGGCTAAGCAGCCTAACTCCGCCATTCGTAAATGTGCCAGAGTTCAGTTGATCAAGAAC
GGCAAAAAGATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAAT
GACGAGGTGCTGATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGACATGCCGTCGGAGATATTCCCGGA
GTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAG
AAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGACTCTCTACTGTTTTTTTTAAGCTTGTTTTGTTAATGGA
TTTTTGATTACTTGAAGGCTTTGAAGCCATTTACCTCTGTTCTGCTTCAAGATTCTCGAA
CATGTGTACCTGTGGTTGAGTTTTAAACTTTGTTTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FJ76JQ C 1
AF RR2FJ76TF U 1
BS 1 8 RR2FJ76JQ
BS 9 640 RR2FJ76TF

RD RR2FJ76JQ 640 0 0
GGCTCTCTCTAGCTCTCACGCCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTC
GCCTACGCAAACATGGGTAGGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAAAGGCTT
AGGATTAACCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAGGGAAACGAGTGG
AAGAAGCCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGAAGATTGGTATT
GAGGCTAAGCAGCCTAACTCCGCCATTCGTAAATGTGCCAGAGTTCAGTTGATCAAGAAC
GGCAAAAAGATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAAT
GACGAGGTGCTGATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGACATGCCGTCGGAGATATTCCCGGA
GTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAG
AAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGACTCTCTACTGTTTTTTTTAAGCTTGTTTTGTTAATGGA
TTTTTGATTACTTGAAGGCTTTGAAGCCATTTACCTCTGTTCTGCTTCAAGATTCTCGAA
CATGTGTACCTGTGGTTGAGTTTTAAACTTTGTTTTGTTT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2FJ76TF 640 0 0
GGCTCTCT
CTAGCTCTCACGCCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTCGCCTACGC
AAACATGGGTAGGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAAAGGCTTAGGATTAA
CCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAGGGAAACGAGTGGAAGAAGCC
TTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGAAGATTGGTATTGAGGCTAA
GCAGCCTAACTCCGCCATTCGTAAATGTGCCAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAAAA
GATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAATGACGAGGT
GCTGATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGACATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGGTT
CAAGGTGGTGAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAGAAGGAGAA
GCCTAGGTCTTAGACTCTCTACTGTTTTTTTTAAGCTTGTTTTGTTAATGGATTTTTGAT
TACTTGAAGGCTTTGAAGCCATTTACCTCTGTTCTGCTTCAAGATTCTCGAACATGTGTA
CCTGTGGTTGAGTTTTAAACTTTGTTTTGTTT

QA 9 640 9 640
DS 



AS 1 4

CO CL2059Contig1 648 4 6 U
GCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGGTAACGGTTACGCTCCAGTTCTCGA
CTGCCACACCTCCCACATTGCTGTCAAGTTCTCTGAGATCCTGACCAAGATTGACAGGCG
TTCTGGTAAGGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGTTCTTGAAGAATGGAGACGCTGGTATAGT
GAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGTTGAGACCTTCTCTGAGTACCCCCCTCTTGG
ACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGACTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGCGTTGA
CAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTGACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCCAAGTG
AACTATCATAATCGAGACTCTATCATCATCAACCGCAGATGAACTAAAGAACTTTGTGTG
TTTTCTTACTTCAGTTTCGTTTGTTGTTGCTTGTTTGTGTTACAGTTTCGTCCCTTCTCC
TTCAGAACGTCATTCTCGTAATTGGGTTCTTGATCGGAGGTGGCGGAGCTACGTCGCACA
AAAGCTTCGTTGATTTTGCGTTTTATTTGTTATCTGATTTTTCCGACTTTTTGGATATTA
TGTTACGATATTACATTCCTGCGGATATTGATTTTGTTGTTTGCTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR2F083JQ C 1
AF RR2F083TF U 1
AF RR2EG61JQ C 98
AF RR2EG61TF U 98
BS 1 177 RR2F083TF
BS 178 178 RR2EG61TF
BS 179 338 RR2F083TF
BS 339 339 RR2EG61TF
BS 340 646 RR2F083TF
BS 647 648 RR2EG61JQ

RD RR2F083JQ 648 0 0
GCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGGTAACGGTTACGCTCCAGTTCTCGA
CTGCCACACCTCCCACATTGCTGTCAAGTTCTCTGAGATCCTGACCAAGATTGACAGGCG
TTCTGGTAAGGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGTTCTTGAAGAATGGAGACGCTGGTATGGT
GAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGTTGAGACCTTCTCTGAGTACCCCCCTCTTGG
ACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGACTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGCGTTGA
CAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTGACCAAGGCTGTCGTCAAGAAGGGTGCCAAGTG
AACTATCATAATCGAGACTCTATCATCATCAACCGCAGATGAACTAAAGAACTTTGTGTG
TTTTCTTACTTCAGTTTCGTTTGTTGTTGCTTGTTTGTGTTACAGTTTCGTCCCTTCTCC
TTCAGAACGTCATTCTCGTAATTGGGTTCTTGATCGGAGGTGGCGGAGCTACGTCGCACA
AAAGCTTCGTTGATTTTGCGTTTTATTTGTTATCTGATTTTTCCGACTTTTTGGATATTA
TGTTACGATATTACATTCCTGCGGATATTGATTTTGTTGTTTGCTT
CC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2F083TF 648 0 0
GCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGGTAACGGTTACGCTCCAGTTCTCGA
CTGCCACACCTCCCACATTGCTGTCAAGTTCTCTGAGATCCTGACCAAGATTGACAGGCG
TTCTGGTAAGGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGTTCTTGAAGAATGGAGACGCTGGTATGGT
GAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGTTGAGACCTTCTCTGAGTACCCCCCTCTTGG
ACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGACTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGCGTTGA
CAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTGACCAAGGCTGTCGTCAAGAAGGGTGCCAAGTG
AACTATCATAATCGAGACTCTATCATCATCAACCGCAGATGAACTAAAGAACTTTGTGTG
TTTTCTTACTTCAGTTTCGTTTGTTGTTGCTTGTTTGTGTTACAGTTTCGTCCCTTCTCC
TTCAGAACGTCATTCTCGTAATTGGGTTCTTGATCGGAGGTGGCGGAGCTACGTCGCACA
AAAGCTTCGTTGATTTTGCGTTTTATTTGTTATCTGATTTTTCCGACTTTTTGGATATTA
TGTTACGATATTACATTCCTGCGGATATTGATTTTGTTGTTTGCTT
CC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2EG61JQ 551 0 0
GG
CCTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGTTCTTGAA
GAATGGAGACGCTGGTATAGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGTTGAGACCTT
CTCTGAGTACCCCCCTCTTGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGACTGTTGCAGT
CGGTGTCATCAAGAGCGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTGACCAAGGCTGC
CGTCAAGAAGGGTGCCAAGTGAACTATCATAATCGAGACTCTATCATCATCAACCGCAGA
TGAACTAAAGAACTTTGTGTGTTTTCTTACTTCAGTTTCGTTTGTTGTTGCTTGTTTGTG
TTACAGTTTCGTCCCTTCTCCTTCAGAACGTCATTCTCGTAATTGGGTTCTTGATCGGAG
GTGGCGGAGCTACGTCGCACAAAAGCTTCGTTGATTTTGCGTTTTATTTGTTATCTGATT
TTTCCGACTTTTTGGATATTATGTTATGATATTACATTCCTGCGGATATTGATTTTGTTG
TTTGCTTTC

QA 3 551 3 551
DS 

RD RR2EG61TF 551 0 0
GG
CCTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGTTCTTGAA
GAATGGAGACGCTGGTATAGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGTTGAGACCTT
CTCTGAGTACCCCCCTCTTGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGACTGTTGCAGT
CGGTGTCATCAAGAGCGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTGACCAAGGCTGC
CGTCAAGAAGGGTGCCAAGTGAACTATCATAATCGAGACTCTATCATCATCAACCGCAGA
TGAACTAAAGAACTTTGTGTGTTTTCTTACTTCAGTTTCGTTTGTTGTTGCTTGTTTGTG
TTACAGTTTCGTCCCTTCTCCTTCAGAACGTCATTCTCGTAATTGGGTTCTTGATCGGAG
GTGGCGGAGCTACGTCGCACAAAAGCTTCGTTGATTTTGCGTTTTATTTGTTATCTGATT
TTTCCGACTTTTTGGATATTATGTTATGATATTACATTCCTGCGGATATTGATTTTGTTG
TTTGCTT
TC

QA 3 549 3 549
DS 



AS 1 4

CO CL2060Contig1 700 4 11 U
TTTTTCATTCCAGAAACTTCTTATCAACCATGGCCCAAAATCAAAATCTGGTCGACTTAA
CCGAGAAGCTAAGCTTGTCTTCGAGCAAGATAGTGTTAACCAGCTCCGACGGCGTTTCTT
TCGAGATCGACGAAGCAGTGGCTCGCAAATCCGAGACCATAGCTGAAATGCTCGAAGCCG
GCTGTGCCGGAGAAATCCCGCTTCAGAACGTCACCGGGGAGATCCTCGACAAAGTCATCG
ACTACTGCAAGAAGCACGTCGAAGAAGAAGCTGGTCCGTTTGGAGAAGAAGAAGATGAAG
AAGAGAAAAAGGCGAAGAAGAAATGGGATGCGGAGTTCGTGAAAGTAGATCTTGAAACCA
TGTTCGAGCTCATCCTGGCTGCTAACGATCTCAACATCCCAGGCCTTCTCGGTCTAACAT
CCCAGGCGGTCGCAGATCACATTAAAGACAAAACACCAGAGGATGTTCGCGAGATTTTCG
GCATCGAGAACGATTTCACACCCGAAGAAGAAGAAGCTGTTCGCAAGGAGCACGCTTGGG
CTTTTGAATGATTTCTAAATTAATAATAATGTTCTTAGATCTGTTTATTTCGTGAATCTT
GATTGACTTCGCCTCTTTAGTTTCCAATGGGTATGTGTGTCTATCGTCTCTTTGATTTCA
ATGGAGCCGCCGCTTTTATAAAAGGATTAGGGTTTTTTTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW89TF U 1
AF RR2F761JQ C 1
AF RR2F761TF U 1
AF RR2EW89JQ C 144
BS 1 69 RR2EW89TF
BS 70 70 RR2F761TF
BS 71 386 RR2EW89TF
BS 387 387 RR2F761TF
BS 388 430 RR2EW89TF
BS 431 431 RR2F761TF
BS 432 438 RR2EW89TF
BS 439 439 RR2F761TF
BS 440 490 RR2EW89TF
BS 491 648 RR2F761TF
BS 649 700 RR2EW89JQ

RD RR2EW89TF 490 0 0
TTTTTCATTCCAGAAACTTCTTATCAACCATGGCCCAAAATCAAAATCTGGTCGACTTAA
CCGAGAAGCCAAGCTTGTCTTCGAGCAAGATAGTGTTAACCAGCTCCGACGGCGTTTCTT
TCGAGATCGACGAAGCAGTGGCTCGCAAATCCGAGACCATAGCTGAAATGCTCGAAGCCG
GCTGTGCCGGAGAAATCCCGCTTCAGAACGTCACCGGGGAGATCCTCGACAAAGTCATCG
ACTACTGCAAGAAGCACGTCGAAGAAGAAGCTGGTCCGTTTGGAGAAGAAGAAGATGAAG
AAGAGAAAAAGGCGAAGAAGAAATGGGATGCGGAGTTCGTGAAAGTAGATCTTGAAACCA
TGTTCGAGCTCATCCTGGCTGCTAACTATCTCAACATCCCAGGCCTTCTCGGTCTAACAT
CCCAGGCGGTTGCAGATCGCATTAAAGACAAAACACCAGAGGATGTTCGCGAGATTTTCG
GCATCGAGAA

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR2F761JQ 650 0 0
TTTTTCATTCCAGAAACTTCTTATCAACCATGGCCCAAAATCAAAATCTGGTCGACTTAA
CCGAGAAGCTAAGCTTGTCTTCGAGCAAGATAGTGTTAACCAGCTCCGACGGCGTTTCTT
TCGAGATCGACGAAGCAGTGGCTCGCAAATCCGAGACCATAGCTGAAATGCTCGAAGCCG
GCTGTGCCGGAGAAATCCCGCTTCAGAACGTCACCGGGGAGATCCTCGACAAAGTCATCG
ACTACTGCAAGAAGCACGTCGAAGAAGAAGCTGGTCCGTTTGGAGAAGAAGAAGATGAAG
AAGAGAAAAAGGCGAAGAAGAAATGGGATGCGGAGTTCGTGAAAGTAGATCTTGAAACCA
TGTTCGAGCTCATCCTGGCTGCTAACGATCTCAACATCCCAGGCCTTCTCGGTCTAACAT
CCCAGGTGGTCGCAGATCACATTAAAGACAAAACACCAGAGGATGTTCGCGAGATTTTCG
GCATCGAGAACGATTTCACACCCGAAGAAGAAGAAGCTGTTCGCAAGGAGCACGCTTGGG
CTTTTGAATGATTTCTAAATTAATAATAATGTTCTTAGATCTGTTTATTTCGTGAATCTT
GATTGACTTCGCCTCTTTAGTTTCCAATGGGTATGTGTGTCTATCGTC
TC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2F761TF 648 0 0
TTTTTCATTCCAGAAACTTCTTATCAACCATGGCCCAAAATCAAAATCTGGTCGACTTAA
CCGAGAAGCTAAGCTTGTCTTCGAGCAAGATAGTGTTAACCAGCTCCGACGGCGTTTCTT
TCGAGATCGACGAAGCAGTGGCTCGCAAATCCGAGACCATAGCTGAAATGCTCGAAGCCG
GCTGTGCCGGAGAAATCCCGCTTCAGAACGTCACCGGGGAGATCCTCGACAAAGTCATCG
ACTACTGCAAGAAGCACGTCGAAGAAGAAGCTGGTCCGTTTGGAGAAGAAGAAGATGAAG
AAGAGAAAAAGGCGAAGAAGAAATGGGATGCGGAGTTCGTGAAAGTAGATCTTGAAACCA
TGTTCGAGCTCATCCTGGCTGCTAACGATCTCAACATCCCAGGCCTTCTCGGTCTAACAT
CCCAGGTGGTCGCAGATCACATTAAAGACAAAACACCAGAGGATGTTCGCGAGATTTTCG
GCATCGAGAACGATTTCACACCCGAAGAAGAAGAAGCTGTTCGCAAGGAGCACGCTTGGG
CTTTTGAATGATTTCTAAATTAATAATAATGTTCTTAGATCTGTTTATTTCGTGAATCTT
GATTGACTTCGCCTCTTTAGTTTCCAATGGGTATGTGTGTCTATCGTC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2EW89JQ 557 0 0
CGCAAATCCGAGACCATAGCTGAAATGCTCGAAGCCGGCTGTGCCGGAGAAATCCCGCTT
CAGAACGTCACCGGGGAGATCCTCGACAAAGTCATCGACTACTGCAAGAAGCACGTCGAA
GAAGAAGCTGGTCCGTTTGGAGAAGAAGAAGATGAAGAAGAGAAAAAGGCGAAGAAGAAA
TGGGATGCGGAGTTCGTGAAAGTAGATCTTGAAACCATGTTCGAGCTCATCCTGGCTGCT
AACTATCTCAACATCCCAGGCCTTCTCGGTCTAACATCCCAGGCGGTTGCAGATCACATT
AAAGACAAAACACCAGAGGATGTTCGCGAGATTTTCGGCATCGAGAACGATTTCACACCC
GAAGAAGAAGAAGCTGTTCGCAAGGAGCACGCTTGGGCTTTTGAATGATTTCTAAATTAA
TAATAATGTTCTTAGATCTGTTTATTCCGTGAATCTTGATTGACTTCGCCTCTTTAGTTT
CCAATGGGTATGTGTGTCTATCGTCTCTTTGATTTCAATGGAGCCGCCGCTTTTATAAAA
GGATTAGGGTTTTTTTC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 4

CO CL2061Contig1 1203 4 17 U
GGGCTCTGTTATCTGATTAGAAAGAAAAAAAGCAATGGAGACGATGAAGATATCTTCATT
CGATCGTGTCAGTGAGCTTAAAGCTTTCGACAACACCAAGACAGGTGTAAAAGGCCTCGT
AGACGCCGGAGTTTCAGAGGTTCCACGCATATTCCATCACTCATCTCTCAAACTATCAAA
CCCTAAACCACTTTCCTCTGACTTGCAACATCTCACAACGATCCCAACGTTTGATCTCGG
TGGACGTGTCTTCGAGGACGAGACTAAGCGCAAGAATGTGATCCAAGGGATTAAAGAGGC
ATCAGAGAAGTGGGGTTTCTTCCAGGTGATTAACCATGGAGTTCCCCTCGATCTTCTAGA
AAAGATGAAAGATGGAGTTCGTGGGTTTCACGAGCAGCTACCAGAAGTGAGGAAACAATA
TTACGGGAGAGATTTCAGCAGAAGGTTTATGTATTTGAGTAACTTTGATCTTTTTAGCGC
TCCAGCTGCTAACTGGAGAGACACTTTCTCTTGTACCATTGCTCCAGATCCTCCAGAACC
AGAGGACTTACCAGAGATTTGTAGGGATGTTATGTTGGAATACACAAAGCATGTGATGAC
TCTAGGAGAGTTTCTCTTTGAGCTTTTATCAGAAGCTCTAGGGTTAGACCCTAACCATTT
GAATGAGATGGATTGCTCAAAGGGTTTGCTCATGCTTAACCATTACTACCCACCCTGTCC
AGAGCCTGACCTAACTTTAGGCACAAGTCAGCATTCAGACAGCTCTTTCCTTACAGTGCT
TCTACCAGATCAAATCGAAGGTTTTCAAGTCAACCGTGAAGGGTATTGG*TTTGATGTTC
CTCATGTTCCTGGTGCACTCATTATCAACATCGGAGATCTTCTACAGCTTATAACAAATG
ACAAGTTCGTCAGTCTGGAGCATCGTGTATTGGCAAATAGATCCACACAAGCTCGAGTCT
CCACCGCGTGTTTCTTCACCACTGGTGTAAGACCGAATCCAAGAATGTACGGACCCATTA
GAGAGCTTCTGTCTAAAGAAAACCCTCCAAAGTACAGAGAGACAACCATGAGAGAGTACA
CTGCTTACTACAATACCAAAGGACTTGATGGGACCTCTGGTTTATTACATTTTAAAATAT
GAACTACAACTTTTCCACACACATTCGACATGGATGTATAAATAATATATCTAGATTCAC
AGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 

AF RR2CF52TF U 1
AF RR2BI72TF U 17
AF RR2CF52JQ C 497
AF RR2BI72JQ C 428
BS 1 369 RR2CF52TF
BS 370 370 RR2BI72TF
BS 371 452 RR2CF52TF
BS 453 453 RR2BI72TF
BS 454 466 RR2CF52TF
BS 467 467 RR2BI72TF
BS 468 673 RR2CF52TF
BS 674 800 RR2BI72TF
BS 801 801 RR2BI72JQ
BS 802 829 RR2BI72TF
BS 830 830 RR2BI72JQ
BS 831 852 RR2BI72TF
BS 853 878 RR2BI72JQ
BS 879 879 RR2CF52JQ
BS 880 963 RR2BI72JQ
BS 964 964 RR2CF52JQ
BS 965 1203 RR2BI72JQ

RD RR2CF52TF 677 0 0
GGGCTCTGTTATCTGATTAGAAAGAAAAAAAGCAATGGAGACGATGAAGATATCTTCATT
CGATCGTGTCAGTGAGCTTAAAGCTTTCGACAACACCAAGACAGGTGTAAAAGGCCTCGT
AGACGCCGGAGTTTCAGAGGTTCCACGCATATTCCATCACTCATCTCTCAAACTATCAAA
CCCTAAACCACTTTCCTCTGACTTGCAACATCTCACAACGATCCCAACGTTTGATCTCGG
TGGACGTGTCTTCGAGGACGAGACTAAGCGCAAGAATGTGATCCAAGGGATTAAAGAGGC
ATCAGAGAAGTGGGGTTTCTTCCAGGTGATTAACCATGGAGTTCCCCTCGATCTTCTAGA
AAAGATGAAGGATGGAGTTCGTGGGTTTCACGAGCAGCTACCAGAAGTGAGGAAACAATA
TTACGGGAGAGATTTCAGCAGAAGGTTTATGTGTTTGAGTAACTTTTATCTTTTTAGCGC
TCCAGCTGCTAACTGGAGAGACACTTTCTCTTGTACCATTGCTCCAGATCCTCCAGAACC
AGAGGACTTACCAGAGATTTGTAGGGATGTTATGTTGGAATACACAAAGCATGTGATGAC
TCTAGGAGAGTTTCTCTTTGAGCTTTTATCAGAAGCTCTAGGGTTAGACCCTAACCATTT
GAATGAGATGGAT
GCTC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2BI72TF 836 0 0
GG
AGAAAGAAAAAAAGCAATGGAGACGATGAAGATATCTTCATTCGATCGTGTCAGTGAGCT
TAAAGCTTTCGACAACACCAAGACAGGTGTAAAAGGCCTCGTAGACGCCGGAGTTTCAGA
GGTTCCACGCATATTCCATCACTCATCTCTCAAACTATCAAACCCTAAACCACTTTCCTC
TGACTTGCAACATCTCACAACGATCCCAACGTTTGATCTCGGTGGACGTGTCTTCGAGGA
CGAGACTAAGCGCAAGAATGTGATCCAAGGGATTAAAGAGGCATCAGAGAAGTGGGGTTT
CTTCCAGGTGATTAACCATGGAGTTCCCCTCGATCTTCTAGAAAAGATGAAAGATGGAGT
TCGTGGGTTTCACGAGCAGCTACCAGAAGTGAGGAAACAATATTACGGGAGAGATTTCAG
CAGAAGGTTTATGTATTTGAGTAACTTTGATCTTTTTAGCGCTCCAGCTGCTAACTGGAG
AGACACTTTCTCTTGTACCATTGCTCCAGATCCTCCAGAACCAGAGGACTTACCAGAGAT
TTGTAGGGATGTTATGTTGGAATACACAAAGCATGTGATGACTCTAGGAGAGTTTCTCTT
TGAGCTTTTATCAGAAGCTCTAGGGTTAGACCCTAACCATTTGAATGAGATGGATTGCTC
AAAGGGTTTGCTCATGCTTAACCATTACTACCCACCCTGTCCAGAGCCTGACCTAACTTT
AGGCACAAGTCAGCATTCAGACAGCTCTTTCCTTACAGTGCTTCTACCAGATCAAATCGA
AG*TTTTCAAGTCAACCGTGAAGGGTATTGGGTTTGATGTTCCTCATGTTCCTG

QA 3 836 3 836
DS 

RD RR2CF52JQ 704 0 0
AGAGACACTTTCTCTTGTACCATTGCTCCAGATCCTCCAGAACCAGAGGACTTACCAGAG
ATTTGTAGGGATGTTATGTTGGAATACACAAAGCATGTGATGACTCTAGGAGAGTTTCTC
TTTGAGCTTTTATCAGAAGCTCTAGGGTTAGACCCTAACCATTTGAATGAGATGGATTGC
TCAAAGGGTTTGCTCATGCTTAACCATTACTACCCACCCTGTCCAGAGCCTGACCTAACT
TTAGGCACAAGTCAGCATTCAGACAGCTCTTTCCTTACAGTGCTTCTACCAGATCAAATC
GAAGGTCTTCAAGTCAACCGTGAAGGGTATTGG*TTTGATGTTCCTCATGTTCCTGGTGC
ACTCATTATCAACATCGGAGATCTTCTACAGCTTATAACAAATGACAAGTTCGTCAGTCT
GGAGCATCGTGTATTGGCAAATAGATCCACACAAGCTCGAGTCTCCACCGCGTGTTTCTT
CACCATTGGTGTAAGACCGAATCCAAGAATGTACGGACCCATTAGAGAGCTTCTGTCTAA
AGAAAACCCTCCAAAGTACAGAGAGACAACCATGAGAGAGTACACTGCTTACTACAATAC
CAAAGGACTTGATGGGACCTCTGGTTTATTACATTTTAAAATATGAACTACAACTTTTCC
ACACACATTCGACATGGATGTATAAATAATATATCTAGATTC
GC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2BI72JQ 776 0 0
AGAGATTTCAGCAGAAGGTTTATGTATTTGAGTAACTTTGATCTTTTTAGCGCTCCAGCT
GCTAACTGGAGAGACACTTTCTCTTGTACCATTGCTCCAGATCCTCCAGAACCAGAGGAC
TTACCAGAGATTTGTAGGGATGTTATGTTGGAATACACAAAGCATGTGATGACTCTAGGA
GAGTTTCTCTTTGAGCTTTTATCAGAAGCTCTAGGGTTAGACCCTAACCATTTGAATGAG
ATGGATTGCTCAAAGGGTTTGCTCATGCTTAACCATTACTACCCACCCTGTCCAGAGCCT
GACCTAACTTTAGGCACAAGTCAGCATTCAGACAGCTCTTTCCTTACAGTGCTTCTACCA
GATCAAATCGAAGGTTTTCAAGTCAACCGTGAAGGGTATTGG*TTTGATGTTCCTCATGT
TCCTGGTGCACTCATTATCAACATCGGAGATTTTCTACAGCTTATAACAAATGACAAGTT
CGTCAGTCTGGAGCATCGTGTATTGGCAAATAGATCCACACAAGCTCGAGTCTCCATCGC
GTGTTTCTTCACCACTGGTGTAAGACCGAATCCAAGAATGTACGGACCCATTAGAGAGCT
TCTGTCTAAAGAAAACCCTCCAAAGTACAGAGAGACAACCATGAGAGAGTACACTGCTTA
CTACAATACCAAAGGACTTGATGGGACCTCTGGTTTATTACATTTTAAAATATGAACTAC
AACTTTTCCACACACATTCGACATGGATGTATAAATAATATATCTAGATTCACAGG

QA 1 776 1 776
DS 



AS 2 4

CO CL2062Contig1 1103 2 6 U
GGAAAAACAGCTAAAATCACAAATGACTCATCTTCTCCACCAAGAGAGAATCTAGGGCTC
CAGATTTACTCTTTTCTCTTCCCTATCCTCTCTTCGATCTACACACATCCTCAATCTCCT
GTACATTTCAAAGGGTACAGATAACCTTTATAGCTTCATCCTCCCGCTTTTACCTGTTTT
AGCTTTTTTTCCATGGCGAAAACTCGACCTGGTGTCCCCTCCAAAATCAAAACCGGAAGG
AAGGAGCTTGACTCTTATACCATCAAAGGCACCAACAAAGTCGTCAGAGCTGGAGAGTGT
GTGTTGATGCGCCCATCGGATGCTGGCAAGCCACCATACGTGGCACGTGTCGAGAAGATC
GAAGCTGATGCTAGGAACAATGTGAAGGTGCACTGTCGTTGGTATTACCGCCCTGAGGAG
TCCCTTGGCGGTAGGAGGCAGTTCCATGGAGCGAAAGAACTTTTCTTGTCTGACCATTTC
GACGTTCAGAGCGGACACACCATCGAAGGGAAATGCATTGTTCACACCTTCAAGAACTAC
ACCAGGCTTGAAAACGTTGGCGCTGAGGATTATTATTGTAGGTTCGAGTACAAGGCTGCT
ACTGGCGCCTTCACCCCTGATCGAGTTGCTGTGTACTGCAAATGTGAAATGCCTTATAAC
CCAGACGATCTCATGGTGCAATGTGAAGGCTGCAAAGACTGGTACCATCCAGGGTGTGTT
GGTATGACGATTGAAGAAGCAAAGAAGCTTGATCACTTTGTATGTGCTGAATGCAGTTCT
GATGACGATGTCAAGAAGTCGCGGAACGGATTTGCTGAGTCTCCAGCTGATGATGTCAAG
GTGGAAACAAAGCGCAGAAAAAGATAATCGCCAGGTTCTGATGAGTAAAACCCGCGCAGA
GGTTGGCAAGTTTTATAACTTGTAAGCTCTTTGGTGCATATTTAAGTAAGTTAGGATTTG
TGTCGTCTTTTGTTGTGATGATGCCTGTATGTTACTTTCCAAAACTTTTAAGAGAATGTG
AAAAAAGAAGAGATGATGATGAAGACAAGTTATGGTGGGCAGAGTCTGTATAGACTTTTC
CGTGGGATCTTTTAAGTTAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ09TF U 1
AF RR2DQ14TF U 559
BS 1 584 RR2CQ09TF
BS 585 585 RR2DQ14TF
BS 586 680 RR2CQ09TF
BS 681 681 RR2DQ14TF
BS 682 688 RR2CQ09TF
BS 689 1103 RR2DQ14TF

RD RR2CQ09TF 699 0 0
GGAAAAACAGCTAAAATCACAAATGACTCATCTTCTCCACCAAGAGAGAATCTAGGGCTC
CAGATTTACTCTTTTCTCTTCCCTATCCTCTCTTCGATCTACACACATCCTCAATCTCCT
GTACATTTCAAAGGGTACAGATAACCTTTATAGCTTCATCCTCCCGCTTTTACCTGTTTT
AGCTTTTTTTCCATGGCGAAAACTCGACCTGGTGTCCCCTCCAAAATCAAAACCGGAAGG
AAGGAGCTTGACTCTTATACCATCAAAGGCACCAACAAAGTCGTCAGAGCTGGAGAGTGT
GTGTTGATGCGCCCATCGGATGCTGGCAAGCCACCATACGTGGCACGTGTCGAGAAGATC
GAAGCTGATGCTAGGAACAATGTGAAGGTGCACTGTCGTTGGTATTACCGCCCTGAGGAG
TCCCTTGGCGGTAGGAGGCAGTTCCATGGAGCGAAAGAACTTTTCTTGTCTGACCATTTC
GACGTTCAGAGCGGACACACCATCGAAGGGAAATGCATTGTTCACACCTTCAAGAACTAC
ACCAGGCTTGAAAACGTTGGCGCTGAGGATTATTATTGTAGGTTTGAGTACAAGGCTGCT
ACTGGCGCCTTCACCCCTGATCGAGTTGCTGTGTACTGCAAATGTGAAATGCCTTATAAC
CCAGACGATCTCATGGTGCAGTGTGAAG
CTGCAAGACTG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2DQ14TF 545 0 0
GGG
GCTGAGGATTATTATTGTAGGTTCGAGTACAAGGCTGCTACTGGCGCCTTCACCCCTGAT
CGAGTTGCTGTGTACTGCAAATGTGAAATGCCTTATAACCCAGACGATCTCATGGTGCAA
TGTGAAGGCTGCAAAGACTGGTACCATCCAGGGTGTGTTGGTATGACGATTGAAGAAGCA
AAGAAGCTTGATCACTTTGTATGTGCTGAATGCAGTTCTGATGACGATGTCAAGAAGTCG
CGGAACGGATTTGCTGAGTCTCCAGCTGATGATGTCAAGGTGGAAACAAAGCGCAGAAAA
AGATAATCGCCAGGTTCTGATGAGTAAAACCCGCGCAGAGGTTGGCAAGTTTTATAACTT
GTAAGCTCTTTGGTGCATATTTAAGTAAGTTAGGATTTGTGTCGTCTTTTGTTGTGATGA
TGCCTGTATGTTACTTTCCAAAACTTTTAAGAGAATGTGAAAAAAGAAGAGATGATGATG
AAGACAAGTTATGGTGGGCAGAGTCTGTATAGACTTTTCCGTGGGATCTTTTAAGTTAAC
TT

QA 4 545 4 545
DS 



CO CL2062Contig2 997 2 2 U
GGGAAAACAGCTAAAATCACAAATGACTCATCTTCTCCACCAAGAGAGAATCTAGGGCTC
CAGATTTACTCTTTTCTCTTCCCTATCCTCTCTTCGATCTACACACATCCTCAATCTCCT
GTACATTTCAAAGGGTACAGATAACCTTTATAGCTTCATCCTCCCGCTTTTACCTGTTTT
AGCTTCTTTTCCATGGCGAAAACTCGACCTGGTGTCCCCTCCAAAATCAAAACCGGAAGG
AAGGAGCTTGACTCTTATACCATCAAAGGCACCAACAAAGTCGTCAGAGCTGGAGAGTGT
GTGTTGATGCGCCCATGGAGCGAAAGAACTTTTCTTGTCTGACCATTTCGACGTTCAGAG
CGGACACACCATCGAAGGGAAATGCATTGTTCACACCTTCAAGAACTACACCAGGCTTGA
AAACGTTGGCGCTGAGGATTATTATTGTAGGTTCGAGTACAAGGCTGCTACTGGCGTTTT
CACCCCTGATCGAGTTGCTGTGTACTGCAAATGTGAAATGCCTTATAACCCAGACGATCT
CATGGTGCAATGTGAAGGCTGCAAAGACTGGTACCATCCGGGGTGTGTTGGTATGACGAT
TGAAGAAGCGAAGAAGCTTGATCACTTTGTATGTGCTGAATGCAGTTCTGATGACGATGT
CAAGAAGTCGCGGAACGGATTTGCTGAGTCTCCAGCTGATGATGTCAAGGTGGAAACAAA
GCGCAGAAAAAGATAATCGCCAGGTTCTGATGAGTGAAAGCCGCGCAGAGATTGGCAAGT
TTTATAACTTGTAAGCTCTTTGGTGCATATTTATTAAGTAAGTTAGGATTTGTGTCGTCT
TTGTTGTGATGATGCCATGTATGTTACTTCCCAAAACTTTTAAGAGAAAATGTGAAAAAA
GGAGAGATGATGATGAAGACAAGTTATGGTGGCAGAGTCTGTATAGGCTTTTCCGTGGGA
TCTTTTAAGTTAACTTTTAGGTCTGTTTATTGTGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX66TF U 1
AF RR2GX66JQ C 242
BS 1 723 RR2GX66TF
BS 724 997 RR2GX66JQ

RD RR2GX66TF 723 0 0
GGGAAAACAGCTAAAATCACAAATGACTCATCTTCTCCACCAAGAGAGAATCTAGGGCTC
CAGATTTACTCTTTTCTCTTCCCTATCCTCTCTTCGATCTACACACATCCTCAATCTCCT
GTACATTTCAAAGGGTACAGATAACCTTTATAGCTTCATCCTCCCGCTTTTACCTGTTTT
AGCTTCTTTTCCATGGCGAAAACTCGACCTGGTGTCCCCTCCAAAATCAAAACCGGAAGG
AAGGAGCTTGACTCTTATACCATCAAAGGCACCAACAAAGTCGTCAGAGCTGGAGAGTGT
GTGTTGATGCGCCCATGGAGCGAAAGAACTTTTCTTGTCTGACCATTTCGACGTTCAGAG
CGGACACACCATCGAAGGGAAATGCATTGTTCACACCTTCAAGAACTACACCAGGCTTGA
AAACGTTGGCGCTGAGGATTATTATTGTAGGTTCGAGTACAAGGCTGCTACTGGCGTTTT
CACCCCTGATCGAGTTGCTGTGTACTGCAAATGTGAAATGCCTTATAACCCAGACGATCT
CATGGTGCAATGTGAAGGCTGCAAAGACTGGTACCATCCGGGGTGTGTTGGTATGACGAT
TGAAGAAGCGAAGAAGCTTGATCACTTTGTATGTGCTGAATGCAGTTCTGATGACGATGT
CAAGAAGTCGCGGAACGGATTTGCTGAGTCTCCAGCTGATGATGTCAAGGTGGAAACAAA
GCG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2GX66JQ 756 0 0
AGGAGCTTGACTCTTATACCATCAAAGGCACCAACAAAGTCGTCAGAGCTGGAGAGTGTG
TGTTGATGCGCCCATGGAGCGAAAGAACTTTTCTTGTCTGACCATTTCGACGTTCAGAGC
GGACACACCATCGAAGGGAAATGCATTGTTCACACCTTCAAGAACTACACCAGGCTTGAA
AACGTTGGCGCTGAGGATTATTATTGTAGGTTCGAGTACAAGGCTGCTACTGGCGTTTTC
ACCCCTGATCGAGTTGCTGTGTACTGCAAATGTGAAATGCCTTATAACCCAGACGATCTC
ATGGTGCAATGTGAAGGCTGCAAAGACTGGTACCATCCGGGGTGTGTTGGTATGACGATT
GAAGAAGCGAAGAAGCTTGATCACTTTGTATGTGCTGAATGCAGTTCTGATGACGATGTC
AAGAAGTCGCGGAACGGATTTGCTGAGTCTCCAGCTGATGATGTCAAGGTGGAAACAAAG
CGCAGAAAAAGATAATCGCCAGGTTCTGATGAGTGAAAGCCGCGCAGAGATTGGCAAGTT
TTATAACTTGTAAGCTCTTTGGTGCATATTTATTAAGTAAGTTAGGATTTGTGTCGTCTT
TGTTGTGATGATGCCATGTATGTTACTTCCCAAAACTTTTAAGAGAAAATGTGAAAAAAG
GAGAGATGATGATGAAGACAAGTTATGGTGGCAGAGTCTGTATAGGCTTTTCCGTGGGAT
CTTTTAAGTTAACTTTTAGGTCTGTTTATTGTGGGC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 4

CO CL2063Contig1 813 4 12 U
CCATAAACGAGCGTGAATCTATAACGTTCCAAATCAAAAGATGAATGGAAGACAAATTTG
TCGCTTTCTCTGTTTTTGTCATCACTTGTATTTCACCTTAGAAAGTTTTATACAAACAAA
CTCGCTACCAAAGAATTTAAACACAAAACAAAGCTCTCAAAGAAAGGTCTTGGTTCCGTA
TTCAACACCATAAAACAAATACTCACGAAACTAGACAAGTAAGAAAGGAAAAAACAAATC
GTACTTTTACAAGAGTAGAAAAACGAAGATGATATACATTTTTGTCTTCTTGCCTCTCCT
TTTGGGGATTCAAACACTGATTCCTCTGCAGCTTACGAAAATAACGAAACAGATTGGCTG
CTGGAGAAGCTTTGCTTGTTCATGGTACACCGCGAAGAGTTTGATATTAGTGAGAGAGAA
TTTCGGAAAGGCGGATTTGAGCATCAGGAGGAGTATCCCTTCCAGGAACATTGACCTTTA
AGAGATTGGAATACTCTGTGGGTGTAAACATTTGGTCCTGTTCCGCTATGAATGCAAGTA
ACGCCTCGAATGGCATGTTCAGTAGTTCATAATATGTACGGACACGATCTAGGTTCTGTT
GTACACTCTCACCATCGACATATGGAATAGCTGCCATGGCCTGTTCCAATGCTATAGTGT
TCCGACATATTTGTTGAACTCCGAAAAGGTTGATGGATCTCATGTCAGCCAAAGCCTTAA
TGATGCATTTGCAGCAGTTCCACAAATGCCACCAAAAACATAATTGCGCTTCTCACCAGA
GATGAAAGGTGCCATTCCCTCGTCCCTACGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS41JQ U 73
AF RR2CS41TF C 1
AF RR2CQ61JQ U 78
AF RR2CQ61TF C 103
BS 1 77 RR2CS41TF
BS 78 100 RR2CS41JQ
BS 101 101 RR2CQ61JQ
BS 102 267 RR2CS41JQ
BS 268 268 RR2CQ61JQ
BS 269 351 RR2CS41JQ
BS 352 352 RR2CQ61JQ
BS 353 365 RR2CS41JQ
BS 366 366 RR2CQ61JQ
BS 367 480 RR2CS41JQ
BS 481 758 RR2CQ61JQ
BS 759 813 RR2CQ61TF

RD RR2CS41JQ 408 0 0
TTTTT
GTCATCACTTGTATTTCACCTTAAAAAGTTTTATACAAACAAACTCGCTACCAAAGAATT
TAAACACAAAACAAAGCTCTCAAAGAAAGGTCTTGGTTCCGTATTCAACACCATAAAACA
AATACTCACGAAACTAGACAAGTAAGAAAGGAAAAAACAAATCGTACTTTTACAAGAGTA
GAAAAACGAAAATGATATACATTTTTGTCTTCTTGCCTCTCCTTTTGGGGATTCAAACAC
TGATTCCTCTGCAGCTTACGAAAATAACGAAACAAATTGGCTGCTGGAAAAGCTTTGCTT
GTTCATGGTACACCGCGAAGAGTTTGATATTAGTGAGAGAGAATTTCGGAAAGGCGGATT
TGAGCATCAGGAGGAGTATCCCTTCCAGGAACATTGACCTTTA

QA 6 408 6 408
DS 

RD RR2CS41TF 601 0 0
CCATAAACGAGCGTGAATCTATAACGTTCCAAATCAAAAGATGAATGGAAGACAAATTTG
TCGCTTTCTCTGTTTTTGTCATCACTTGTATTTCACCTTAGAAAGTTTTATACAAACAAA
CTCGCTACCAAAGAATTTAAACACAAAACAAAGCTCTCAAAGAAAGGTCTTGGTTCCGTA
TTCAACACCATAAAACAAATACTCACGAAACTAGACAAGTAAGAAAGGAAAAAACAAATC
GTACTTTTACAAGAGTAGAAGAACGAAGATGATATACATTTTTGTCTTCTTGCCTCTCCT
TTTGGGGATTCAAACACTGATTCCTCTGCAGCTTACGAAAATAACGAAACAGATTGGCTG
CTGGAGAAGCTTTGCTTGTTCATGGTACACCGCGAAGAGTTTGATATTAGTGAGAGAGAA
TTTCGGAAAGGCGGATTTGAGCATCAGGAGGAGTATCCCTTCCAGGAACATTGACCTTTA
AGAGATTGGAATACTCTGTGGGTGTAAACATTTGGTCCTGTTCCGCTATGAATGCAAGTA
ACGCCTCGAATGGCATGTTCAGTAGTTCATAATATGTACGGACACGATCTAGGTTCTGTT
C

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2CQ61JQ 681 0 0
GTCATCACTTGTATTTCACCTTAGAAAGTTTTATACAAACAAACTCGCTACCAAAGAATT
TAAACACAAAACAAAGCTCTCAAAGAAAGGTCTTGGTTCCGTATTCAACACCATAAAACG
AATACTCACGAAACTAGACAAGTAAGAAAGGAAAAAACAAATCGTACTTTTACAAGAGTA
GAAAAACGAAGATGATATACATTTTTGTCTTCTTGCCTCTCCTTTTGGGGATTCAAACAC
TGATTCCTCTGCAGCTTACGAAAATAACGAAACAGATTGGCTGCTGGAGAAGCTTTGCTT
GTTCATGGTACACCGCGAAGAGTTTGATATTAGTGAGAGAGAATTTCGGAAAGGCGGATT
TGAGCATCAGGAGGAGTATCCCTTCCAGGGACATTGACCTTTAAGAGATTGGAATACTCT
GTGGGTGTAAACATTTGGTCCTGTTCCGCTATGAATGCAAGTAACGCCTCGAATGGCATG
TTCAGTAGTTCATAATATGTACGGACACGATCTAGGTTCTGTTGTACACTCTCACCATCG
ACATATGGAATAGCTGCCATGGCCTGTTCCAATGCTATAGTGTTCCGACATATTTGTTGA
ACTCCGAAAAGGTTGATGGATCTCATGTCAGCCAAAGCCTTAATGATGCATTTGCAGCAG
TTCCACAAATGCCACCAAAAA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2CQ61TF 711 0 0
AAAG
TTTATACAAACAAACTCGCTACCAAAGAATTTAAACACAAAACAAAGCTCTCAAAGAAAG
GTCTTGGTTCCGTATTCAACACCATAAAACGAATACTCACGAAACTAGACAAGTAAGAAA
GGAAAAAACAAATCGTACTTTTACAAGAGTAGAAGAACGAAGATGATATACATTTTTGTC
TTCTTGCCTCTCCTTTTGGGGATTCAAACACTGATTCCTCTGCAGCTTACGAAAATAACG
AAACAGATTGGCTGCTGGAGAAGCTTTGCTTGTTCATGGTACACCGCGAAGAGTTTGATA
TTAGTGAGAGAGAATTTCGGAAAGGCGGATTTGAGCATCAGGAGGAGTATCCCTTCCAGG
GACATTGACCTTTAAGAGATTGGAATACTCTGTGGGTGTAAACATTTGGTCCTGTTCCGC
TATGAATGCAAGTAACGCCTCGAATGGCATGTTCAGTAGTTCATAATATGTACGGACACG
ATCTAGGTTCTGTTGTACACTCTCACCATCGACATATGGAATAGCTGCCATGGCCTGTTC
CAATGCTATAGTGTTCCGACATATTTGTTGAACTCCGAAAAGGTTGATGGATCTCATGTC
AGCCAAAGCCTTAATGATGCATTTGCAGCAGTTCCACAAATGCCACCAAAAACATAATTG
CGCTTCTCACCAGAGATGAAAGGTGCCATTCCCTCGTCCCTACGTGC

QA 5 711 5 711
DS 



AS 1 4

CO CL2064Contig1 765 4 16 U
GGGAACATAACATATCATAAAGCAGAAAGAAAAGTTTAAGAGATAAGAAGAAGAAGAAGA
TGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAACATTTGATGTGTGATGTCGGAGATGGTCAGGGTC
ATCACCTAGCCGCAGCCGCAATCCTCGGTCATGACGGTAGTGTTTGGGCTCAGAGCGCCA
ACTTCCCTCAGTTCAAGGGAGAAGAGTTCGCCAACATAATGAAAGATTTTGATGAACCGG
GCCACTTAGCACCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAATACATGGTGATCCAAGGCG
AGCCTGGCGCTGTAATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAG
GACAGTCATGTGTGTTTGGGCTCTACGAAGAGCCTGTGACACCAGGACAGTGCAACATGG
TCGTCGAGAGGTTGGGTGATTACCTCATCGAACAGGATCTCTAGATCCTCACATTCTCAA
AACCTATTAGAATGTTTCACCTTCCACATTTTTATTTATAAACTTATATTTGGTATTGGG
TTTGTGAAGCCTGATTGAGAGACTGATTTTTGAGAAATTTTTGTGTGTTTTCCTCTTTTT
GTTTTCTTTGGTTTGCGTCATGTTTTGTCAACCATGTTTAATTAATTCGACACTTTTGGT
TATTTTCTCTTCTGTTTTTTTCTTCTTTTGACGAATTGTTCCTTTCTGTCTATTACATCA
ATTGTTAAACATATATAAAGAATATAATGTCTTACGAGCCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR10TF U 1
AF RR2BO25JQ C 41
AF RR2BO25TF U 41
AF RR2GR10JQ C 173
BS 1 171 RR2GR10TF
BS 172 172 RR2BO25TF
BS 173 313 RR2GR10TF
BS 314 314 RR2BO25TF
BS 315 367 RR2GR10TF
BS 368 368 RR2BO25TF
BS 369 414 RR2GR10TF
BS 415 415 RR2BO25TF
BS 416 519 RR2GR10TF
BS 520 520 RR2BO25TF
BS 521 616 RR2GR10TF
BS 617 617 RR2BO25TF
BS 618 680 RR2GR10TF
BS 681 681 RR2BO25TF
BS 682 748 RR2GR10TF
BS 749 765 RR2BO25TF

RD RR2GR10TF 752 0 0
GGGAACATAACATATCATAAAGCAGAAAGAAAAGTTTAAGAGATAAGAAGAAGAAGAAGA
TGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAACATTTGATGTGTGATGTCGGAGATGGTCAGGGTC
ATCACCTAGCCGCAGCCGCAATCCTCGGTCATGACGGTAGTGTTTGGGCTCGGAGCGCCA
ACTTCCCTCAGTTCAAGGGAGAAGAGTTCGCCAACATAATGAAAGATTTTGATGAACCGG
GCCACTTAGCACCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAATACATGGTGATCCAAGGCG
AGCCTGGCGCTGTGATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAG
GACAGTCGTGTGTGTTTGGGCTCTACGAAGAGCCTGTGACACCAGGACAGTGCACCATGG
TCGTCGAGAGGTTGGGTGATTACCTCATCGAACAGGATCTCTAGATCCTCACATTCTCAA
AACCTATTAGAATGTTTCACCTTCCACATTTTTATTTATCAACTTATATTTGGTATTGGG
TTTGTGAAGCCTGATTGAGAGACTGATTTTTGAGAAATTTTTGTGTGTTTTCCTCTTTTT
GTTTTCTTTGGTTTGCTTCATGTTTTGTCAACCATGTTTAATTAATTCGACACTTTTGGT
TATTTTCTCTTCTGTTTTTT*CTTCTTTTGACGAATTGTTCCTTTCTGTCTATTACATCA
ATTGTTAAACATATATAAAGAATATAAT
ATGT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2BO25JQ 720 0 0
G
GATAAGAAGAAGAAGAAGATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAACATTTGATGTGTGAT
GTCGGAGATGGTCAGGGTCATCACCTAGCCGCAGCCGCAATCCTCGGTCATGACGGTAGT
GTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTCCCTCAGTTCAAGGGGGAAGAGTTCGCCAACATAATG
AAAGATTTTGATGAACCGGGCCACTTAGCACCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAA
TACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGCGCTGTAATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGC
ATAACCATAAAGAAAACAGGACAGTCATGTGTGTTTGGGCTCTACGAAGAGCCTGTGACA
CCAGGACAGTGCAACATGGTCGTCGAGAGGTTGGGTGATTACCTCATCGAACAGGATCTC
TAGATCCTCACATTCTCAAAACCTATTAGAATGTTTCACCTTCCACATTTTTATTTATAA
ACTTATATTTGGTATTGGGTTTGTGAAGCCTGATTGAGAGACTGATTTTTGAGAAATTTT
TGTGTGTTTTCCTCTTTTTGTTTTCTTTGGTTTGCGTCATGTTTTGTCAACCATGTTTAA
TTAATTTGACACTTTTGGTTATTTTCTCTTCTGTTTTTTTCTTCTTTTGACGAATTGTTC
CTTTCTGTCTATTACATCAATTGTTAAACATATATAAAGAATATAAT
GTCTTACGAGCC

QA 2 708 2 708
DS 

RD RR2BO25TF 725 0 0
G
GATAAGAAGAAGAAGAAGATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAACATTTGATGTGTGAT
GTCGGAGATGGTCAGGGTCATCACCTAGCCGCAGCCGCAATCCTCGGTCATGACGGTAGT
GTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTCCCTCAGTTCAAGGGGGAAGAGTTCGCCAACATAATG
AAAGATTTTGATGAACCGGGCCACTTAGCACCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAA
TACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGCGCTGTAATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGC
ATAACCATAAAGAAAACAGGACAGTCATGTGTGTTTGGGCTCTACGAAGAGCCTGTGACA
CCAGGACAGTGCAACATGGTCGTCGAGAGGTTGGGTGATTACCTCATCGAACAGGATCTC
TAGATCCTCACATTCTCAAAACCTATTAGAATGTTTCACCTTCCACATTTTTATTTATAA
ACTTATATTTGGTATTGGGTTTGTGAAGCCTGATTGAGAGACTGATTTTTGAGAAATTTT
TGTGTGTTTTCCTCTTTTTGTTTTCTTTGGTTTGCGTCATGTTTTGTCAACCATGTTTAA
TTAATTTGACACTTTTGGTTATTTTCTCTTCTGTTTTTTTCTTCTTTTGACGAATTGTTC
CTTTCTGTCTATTACATCAATTGTTAAACATATATAAAGAATATAATGTCTTACGAGCCA
AAAA

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR2GR10JQ 592 0 0
GAGCGCCAACTTCCCTCAGTTCAAGGGAGAAGAGTTCGCCAACATAATGAAAGATTTTGA
TGAACCGGGCCACTTAGCACCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAATACATGGTGAT
CCAAGGCGAGCCTGGCGCTGTGATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAA
GAAAACAGGACAGTCGTGTGTGTTTGGGCTCTACGAAGAGCCTGTGACACCAGGACAGTG
CACCATGGTCGTCGAGAGGTTGGGTGATTACCTCATCGAACAGGATCTCTAGATCCTCAC
ATTCTCAAAACCTATTAGAATGTTTCACCTTCCACATTTTTATTTATCAACTTATATTTG
GTATTGGGTTTGTGAAGCCTGATTGAGAGACTGATTTTTGAGAAATTTTTGTGTGTTTTC
CTCTTTTTGTTTTCTTTGGTTTGCTTCATGTTTTGTCAACCATGTTTAATTAATTCGACA
CTTTTGGTTATTTTCTCTTCTGTTTTTTTCTTCTTTTGACGAATTGTTCCTTTCTGTCTA
TTACATCAATTGTTAAACATATATAAAGAATATAAT
ATGTCTTAAGATAACG

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 4

CO CL2065Contig1 786 4 8 U
GGGACTCCTCTCCTACAAAACCTAAACGTTTTCTTTTCTCAAAGCAAGCAAAAAAGTCAT
GGCAGAAGCGTCTACTTTGGTGGGGAAGCTTGAGACAGATGTGGAGATCAAAGCTTCTGC
TGGAAAGTTCCATCACATGTTCGCAGGAAGACCACACCATGTGTCAAAAGCAACTCCGGG
CAACATTCAGAATTGTGAGCTACATGAAGGCGACTGGGGCAAAGTCGGTTCAGTTGTCAT
CTGGAAATACGTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTGGCTAAGGAAAGGGTCGAGGCGGTTGA
GCCAGAGAAGAACCTGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGAGATCTGATGGAAGAGTACAA
AAGCTTTGTGATTACAATCCAGGTGACCCCTAAACATGGAGGGCCTGGTAGTGTTGTGCA
TTGGCACCTTGAGTACGAAAAAAATAGCGATGAGGTTGCTCACCCTGAAACTCTCCTCCA
ATTCTGTGTTGAAATCTCAAAAGAGATCGATGAACATCTCTTGAACGAAGAATAGAGGAC
CACTCCTCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGTGCGGCCTTTTTCAGTATCAGATGAAACC
GAAATAAATAATGTGCTGGTGTCCTAGTTTGGGTAAGAGATATATGTTGGCGTGTGTCAC
GTGTGTATGCATAATACTATTATGGTCGAGATATGTTTAAAGTTCTTAATTTGAATCGGC
GTGTAATAGGAGTCAAGCTACAAGGCTACTTGAAGTTTATTTACAAAAAAAGTTTTATGC
TAGCAT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ63TF U 1
AF RR2AC26TF U 2
AF RR2AC26JQ C 76
AF RR2GQ63JQ C 244
BS 1 105 RR2GQ63TF
BS 106 106 RR2AC26TF
BS 107 134 RR2GQ63TF
BS 135 135 RR2AC26TF
BS 136 444 RR2GQ63TF
BS 445 717 RR2AC26TF
BS 718 781 RR2AC26JQ
BS 782 786 RR2GQ63JQ

RD RR2GQ63TF 444 0 0
GGGACTCCTCTCCTACAAAACCTAAACGTTTTCTTTTCTCAAAGCAAGCAAAAAAGTCAT
GGCAGAAGCGTCTACTTTGGTGGGGAAGCTTGAGACAGATGTGGATATCAAAGCTTCTGC
TGGAAAGTTCCATCGCATGTTCGCAGGAAGACCACACCATGTGTCAAAAGCAACTCCGGG
CAACATTCAGAATTGTGAGCTACATGAAGGCGACTGGGGCAAAGTCGGTTCAGTTGTCAT
CTGGAAATACGTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTGGCTAAGGAAAGGGTCGAGGCGGTTGA
GCCAGAGAAGAACCTGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGAGATCTGATGGAAGAGTACAA
AAGCTTTGTGATTACAATCCAGGTGACCCCTAAACATGGAGGGCCTGGTAGTGTTGTGCA
TTGGCACCTTGAGTACGAAAAAAA

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR2AC26TF 716 0 0
GGACTCCTCTCCTACAAAACCTAAACGTTTTCTTTTCTCAAAGCAAGCAAAAAAGTCATG
GCAGAAGCGTCTACTTTGGTGGGGAAGCTTGAGACAGATGTGGAGATCAAAGCTTCTGCT
GGAAAGTTCCATCACATGTTCGCAGGAAGACCACACCATGTGTCAAAAGCAACTCCGGGC
AACATTCAGAATTGTGAGCTACATGAAGGCGACTGGGGCAAAGTCGGTTCAGTTGTCATC
TGGAAATACGTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTGGCTAAGGAAAGGGTCGAGGCGGTTGAG
CCAGAGAAGAACCTGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGAGATCTGATGGAAGAGTACAAA
AGCTTTGTGATTACAATCCAGGTGACCCCTAAACATGGAGGGCCTGGTAGTGTTGTGCAT
TGGCACCTTGAGTACGAAAAAAATAGCGATGAGGTTGCTCACCCTGAAACTCTCCTCCAA
TTCTGTGTTGAAATCTCAAAAGAGATCGATGAACATCTCTTGAACGAAGAATAGAGGACC
ACTCCTCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGTGCGGCCTTTTTCAGTATCAGATGAAACCG
AAATAAATAATGTGCTGGTGTCCTAGTTTGGGTAAGAGATATATGTTGGCGTGTGTCACG
TGTGTATGCATAATACTATTATGGTCGAGATATGTTTAAAGTTCTTAATTTGAATC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2AC26JQ 706 0 0
TTTGGTGGGGAAGCTTGAGACAGATGTGGAGATCAAAGCTTCTGCTGGAAAGTTCCATCA
CATGTTCGCAGGAAGACCACACCATGTGTCAAAAGCAACTCCGGGCAACATTCAGAATTG
TGAGCTACATGAAGGCGACTGGGGCAAAGTCGGTTCAGTTGTCATCTGGAAATACGTTCA
TGATGGAGAGGCAAAGGTGGCTAAGGAAAGGGTCGAGGCGGTTGAGCCAGAGAAGAACCT
GATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGAGATCTGATGGAAGAGTACAAAAGCTTTGTGATTAC
AATCCAGGTGACCCCTAAACATGGAGGGCCTGGTAGTGTTGTGCATTGGCACCTTGAGTA
CGAAAAAAATAGCGATGAGGTTGCTCACCCTGAAACTCTCCTCCAATTCTGTGTTGAAAT
CTCAAAAGAGATCGATGAACATCTCTTGAACGAAGAATAGAGGACCACTCCTCGAGTGTG
TGTGTGTGTGTGTCAGTGCGGCCTTTTTCAGTATCAGATGAAACCGAAATAAATAATGTG
CTGGTGTCCTAGTTTGGGTAAGAGATATATGTTGGCGTGTGTCACGTGTGTATGCATAAT
ACTATTATGGTCGAGATATGTTTAAAGTTCTTAATTTGAATCGGCGTGTAATAGGAGTCA
AGCTACAAGGCTACTTGAAGTTTATTTACAAAAAAAGTTTTATGCT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2GQ63JQ 543 0 0
GAAATACGTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTGGCTAAGGAAAGGGTCGAGGCGGTTGAGCC
AGAGAAGAACCTGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGAGATCTGATGGAAGAGTACAAAAG
CTTTGTGATTACAATCCAGGTGACCCCTAAACATGGAGGGCCTGGTAGTGTTGTGCATTG
GCACCTTGAGTACGAAAAAAATAGCGATGAGGTTGCTCACCCTGAAACTCTCCTCCAATT
CTGTGTTGAAATCTCAAAAGAGATCGATGAACATCTCTTGAACGAAGAATAGAGGACCAC
TCCTCGAGTGTGTGTGTGTGTGT**CAGTGCGGCCTTTTTCAGTATCAGATGAAACCGAA
ATAAATAATGTGCTGGTGTCCTAGTTTGGGTAAGAGATATATGTTGGCGTGTGTCACGTG
TGTATGCATAATACTATTATGGTCGAGATATGTTTAAAGTTCTTAATTTGAATCGGCGTG
TAATAGGAGTCAAGCTACAAGGCTACTTGAAGTTTATTTACAAAAAAAGTTTTATGCTAG
CAT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 4

CO CL2066Contig1 899 4 10 U
GGACAACACCACCACACACCAGAAACTCAACTCAGCCATGGCTTCTAACTCATCTCTTCT
TCTCATCTTAGCCGTTGCTTGCTTGATCTCACCTGCGATCTCGCAGACTTGCTCTACGCA
GAACATACTCTCAGCCGACAGAACTCCCTTCGCGAATTGCCTGGACCTTCCCTCACTAGA
TTCCTACCTCCACTACACATACAATGCAACCAACTCATCTCTCTCCGTCGCTTTCGTCGC
CACTCCGTCTCGCTCCGACGGCTGGGTTGCTTGGGCTATCAACCCGACGGCGACTGGAAT
GAGCGGTTCTCAGGCGTTCCTCGCTTACAGTCCCAGAGCCGGCGCGCCTCCTGTCGTGAA
CACGTACAACATCAGTGGCTACGTCCTCAACGAAGGTAGACTCGCCTTCGACTTCTGGAA
CCTACGCGCCGAAACCATGACCGGCAACAGGATCGTGATTCGCACGACGGTTAGTGTTCC
GGAGGGAGCCGACAGCGTGAACCAGGTGTGGCAGATCGGCGGGAATGTGACCGACGGTCG
TCCTATGGTGCATCCTTTCAATCCGGCGAACTTGGCCTCTAGAGCGGTGTTGAGATTCGC
CGGCTCTGACGCTCCGAGCTCAGCTCCAGGCTCAGCTCCGGGGTCTGCTCCAGGCTCTTC
TCCAGGCTCTGTCCCTGGCTCTGCTCAGGGGCCGACCACTCCTGGTGCCTCCACCACTCC
TGGACAGGCGGCTGGTCCAAGGAACGCGGGTTCGATGACGACCAGCGTAAATTTCGGGGT
CAATTTTGGAATTTTGGTTATGTTGGCTACAGTCCTCATCTTCTGAGTATGATTTCATTA
TCTTTTTTACATTACTTTTTGTATGCGCAATAATGGAGATTCATACTGTTTTACTTTCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2CG16TF U 3
AF RR2FI80TF U 1
AF RR2CG16JQ C 65
AF RR2FI80JQ C 147
BS 1 112 RR2FI80TF
BS 113 113 RR2CG16TF
BS 114 126 RR2FI80TF
BS 127 127 RR2CG16TF
BS 128 639 RR2FI80TF
BS 640 640 RR2CG16TF
BS 641 690 RR2FI80TF
BS 691 691 RR2CG16JQ
BS 692 726 RR2FI80TF
BS 727 899 RR2CG16JQ

RD RR2CG16TF 682 0 0
GG
AACACCACCACACACCAGAAACTCAACTCAGCCATGGCTTCTAACTCATCTCTTCTTCTC
ATCTTAGCCGTTGCTTGCTTGATCTCACCTGCGATCTCGCAGACTTGCTCTACGCAGAAC
ATACTCTCAGCCGACAGAACTCCCTTCGCGAATTGCCTGGACCTTCCCTCACTAGATTCC
TACCTCCACTACACATACAATGCAACCAACTCATCTCTCTCCGTCGCTTTCGTCGCCACT
CCGTCTCGCTCCGACGGCTGGGTTGCTTGGGCTATCAACCCGACGGCGACTGGAATGAGC
GGTTCTCAGGCGTTCCTCGCTTACAGTCCCAGAGCCGGCGCGCCTCCTGTCGTGAACACG
TACAACATCAGTGGCTACGTCCTCAACGAAGGTGGACTCGCCTTCGACTTCTGGAACCTA
CGCGCCGAAACCATGACCGGCAACAGGATCGTGATTCGCACGACGGTTAGTGTTCCGGAG
GGGGCCGACAGCGTGAACTAGGTGTGGCAGATCGGCGGGAATGTGACCGACTGTCGTCCT
ATGGTGCATCCTTTCAATCCGGCGAACTTGGCCTCTAGAGCTGTGTTGAGATTCGCCGGC
TCTGACGCTCCGAGCTCAGCTCCAGGCTCAGCTCCGGGGTCTGCTCCAGGCTCTTCTCCA
GGCTCTGTCCCTGGCTCTGC

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR2FI80TF 726 0 0
GGACAACACCACCACACACCAGAAACTCAACTCAGCCATGGCTTCTAACTCATCTCTTCT
TCTCATCTTAGCCGTTGCTTGCTTGATCTCACCTGCGATCTCGCAGACTTGCACTACGCA
GAACATGCTCTCAGCCGACAGAACTCCCTTCGCGAATTGCCTGGACCTTCCCTCACTAGA
TTCCTACCTCCACTACACATACAATGCAACCAACTCATCTCTCTCCGTCGCTTTCGTCGC
CACTCCGTCTCGCTCCGACGGCTGGGTTGCTTGGGCTATCAACCCGACGGCGACTGGAAT
GAGCGGTTCTCAGGCGTTCCTCGCTTACAGTCCCAGAGCCGGCGCGCCTCCTGTCGTGAA
CACGTACAACATCAGTGGCTACGTCCTCAACGAAGGTAGACTCGCCTTCGACTTCTGGAA
CCTACGCGCCGAAACCATGACCGGCAACAGGATCGTGATTCGCACGACGGTTAGTGTTCC
GGAGGGAGCCGACAGCGTGAACCAGGTGTGGCAGATCGGCGGGAATGTGACCGACGGTCG
TCCTATGGTGCATCCTTTCAATCCGGCGAACTTGGCCTCTAGAGCGGTGTTGAGATTCGC
CGGCTCTGACGCTCCGAGCTCAGCTCCAGGCTCAGCTCCCGGGTCTGCTCCAGGCTCTTC
TCCAGGCTCTGTCCCTGGCTCTGCTCAGGG*CCGACCACTCCTGGTGCCTCCACCACTCC
TGGACA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2CG16JQ 835 0 0
ATCTTAGCCGTTGCTTGCTTGATCTCAC*TGCGATCTCGCAGACTTGCTCTACGCAGAAC
ATACTCTCAGCCGACAGAACTCCCTTCGCGAATTGCCTGGACCTTCCCTCACTAGATTCC
TACCTCCACTACACATACAATGCAACCAACTCATCTCTCTCCGTCGCTTTCGTCGCCACT
CCGTCTCGCTCCGACGGCTGGGTTGCTTGGGCTATCAACCCGACGGCGACTGGAATGAGC
GGTTCTCAGGCGTTCCTCGCTTACAGTCCCAGAGCCGGCGCGCCTCCTGTCGTGAACACG
TACAACATCAGTGGCTACGTCCTCAACGAAGGTGGACTCGCCTTCGACTTCTGGAACCTA
CGCGCCGAAACCATGACCGGCAACAGGATCGTGATTCGCACGACGGTTAGTGTTCCGGAG
GGGGCCGACAGCGTGAACTAGGTGTGGCAGATCGGCGGGAATGTGACCGACTGTCGTCCT
ATGGTGCATCCTTTCAATCCGGCGAACTTGGCCTCTAGAGCTGTGTTGAGATTCGCCGGC
TCTGACGCTCCGAGCTCAGCTCCAGGCTCAGCTCCGGGGTCTGCTCCAGGCTCTTCTCCA
GGCTCTGTCCCTGGCTCTGCTCAGGGGCCGACCACTCCTGGTGCCTCCACCACTCCTGGA
CAGGCGGCTGGTCCAAGGAACGCGGGTTCGATGACGACCAGCGTAAATTTCGGGGTCAAT
TTTGGAATTTTGGTTATGTTGGCTACAGTCCTCATCTTCTGAGTATGATTTCATTATCTT
TTTTACATTACTTTTTGTATGCGCAATAATGGAGATTCATACTGTTTTACTTTCT

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR2FI80JQ 749 0 0
CCTTCGCGAATTGCCTGGACCTTCCCTCACTAGATTCCTACCTCCACTACACATACAATG
CAACCAACTCATCTCTCTCCGTCGCTTTCGTCGCCACTCCGTCTCGCTCCGACGGCTGGG
TTGCTTGGGCTATCAACCCGACGGCGACTGGAATGAGCGGTTCTCAGGCGTTCCTCGCTT
ACAGTCCCAGAGCCGGCGCGCCTCCTGTCGTGAACACGTACAACATCAGTGGCTACGTCC
TCAACGAAGGTAGACTCGCCTTCGACTTCTGGAACCTACGCGCCGAAACCATGACCGGCA
ACAGGATCGTGATTCGCACGACGGTTAGTGTTCCGGAGGGAGCCGACAGCGTGAACCAGG
TGTGGCAGATCGGCGGGAATGTGACCGACGGTCGTCCTATGGTGCATCCTTTCAATCCGG
CGAACTTGGCCTCTAGAGCGGTGTTGAGATTCGCCGGCTCTGACGCTCCGAGCTCAGCTC
CAGGCTCAGCTCCGGGGTTTGCTCCAGGCTCTTCTCCAGGCTCTGTCCCTGGCTCTGCTC
AGGGGCCGACCACTCCTGGTGCCTCCACCACTCCTGGACAGGCGGCTGGTCCAAGGAACG
CGGGTTCGATGACGACCAGCGTAAATTTCGGGGTCAATTTTGGAATTTTGGTTATGTTGG
CTACAGTCCTCATCTTCTGAGTATGATTTCATTATCTTTTTTACATTACTTTTTGTATGC
GCAATAATGGAGATTCATACTGTTTTAC
G

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 4

CO CL2067Contig1 709 4 5 U
GGGACCCGGCTCGTTTTATTTCTCTTCTGACCTTTTTGGTTGATCTTGGAAATTTATCGA
CTCAACATTCTCTTGATTTTCGCAAGTTTGATCTCTCGTTACTTGTCACTGTTTCAGTAA
GCCATGGCAAAGCATCACCCTGATTTGATCACGTGCCGGAAACAGCCCGGCATTGCTATC
GGACGACTGTGTGAGAAATGCGACGGAAAATGCGTGGTTTGCGACTCTTACGTGCGTCCG
TGCACTCTGGTGCGTATTTGTGACGAATGCAACTACGGGTCGTTCCAAGGCCGGTGCACT
ATATGCGGAGGGGTTGGGATCTCGGATGCTTATTACTGCAAGGAGTGTACGCAGCAGGAA
AAAGACAGAGATGGTTGTCCCAAGATTGTCAACCTTGGGAGTACTAAGACGGATCTCTTC
TATGAACGGAAGAAATATGGATTCAAAAAACGATGATCAATGTATGGGGGGGG**TTTTC
CCGATTGCTGGATCTCTTATACTACTATGTCTGTTGCATAAAACTAATATGTATTCATCA
TACATTATGCTTTCTTATTCTTGATAATCTCTAGACTCGAGTTGTCTTTATTGGACTTAT
CTTAGTGTCCAAATAGTCTCTTGCATTGTGTATCGTGTTTGATTTCGGCTGTGTTTGCAA
GTCGCAAACAGAGTAACTATTTTAGCAAAGAATTTATTGTTCTCAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ53TF U 95
AF RR2C244JQ C 1
AF RR2C244TF U 48
AF RR2BQ53JQ C 54
BS 1 55 RR2C244JQ
BS 56 473 RR2C244TF
BS 474 475 RR2C244JQ
BS 476 704 RR2C244TF
BS 705 709 RR2BQ53JQ

RD RR2BQ53TF 356 0 0
CTCGTTACTTGTCACTGTTTCAGTAAGCCATGGCAAAGCATCACCCTGATTTGATCATGT
GCCGGAAACAGCCCGGCATTGCTATCGGACGACTGTGTGAGAAATGCGACGGAAAATGCG
TGGTTTGCGACTCTTACGTGCGTCCGTGCACTCTGGTGCGTATTTGTGACGAATGCAACT
ACGGGTCGTTCCAAGGCCGGTGCACTATATGCGGAGGGGTTGGGATCTCGGATGCTTATT
ACTGCAAGGAGTGTACGCAGCAGGAAAAAGACAGAGATGGTTGTCCCAAGATTGTCAACC
TTGGGAGTGCTAAGACGGATCTCTTCTATGAACGGAAGAAATATGGATTCAAAAAA

QA 1 356 1 356
DS 

RD RR2C244JQ 704 0 0
GGGACCCGGCTCGTTTTATTTCTCTTCTGACCTTTTTGGTTGATCTTGGAAATTTATCGA
CTCAACATTCTCTTGATTTTCGCAAGTTTGATCTCTCGTTACTTGTCACTGTTTCAGTAA
GCCATGGCAAAGCATCACCCTGATTTGATCACGTGCCGGAAACAGCCCGGCATTGCTATC
GGACGACTGTGTGAGAAATGCGACGGAAAATGCGTGGTTTGCGACTCTTACGTGCGTCCG
TGCACTCTGGTGCGTATTTGTGACGAATGCAACTACGGGTCGTTCCAAGGCCGGTGCACT
ATATGCGGAGGGGTTGGGATCTCGGATGCTTATTACTGCAAGGAGTGTACGCAGCAGGAA
AAAGACAGAGATGGTTGTCCCAAGATTGTCAACCTTGGGAGTACTAAGACGGATCTCTTC
TATGAACGGAAGAAATATGGATTCAAAAAACGATGATCAATGTATGGGGGGGG**TTTTC
CCGATTGCTGGATCTCTTATACTACTATGTCTGTTGCATAAAACTAATATGTATTCATCA
TACATTATGCTTTCTTATTCTTGATAATCTCTAGACTCGAGTTGTCTTTATTGGACTTAT
CTTAGTGTCCAAATAGTCTCTTGCATTGTGTATCGTGTTTGATTTCGGCTGTGTTTGCAA
GTCGCAAACAGAGTAACTATTTTAGCAAAGAATTTATTGTTCTC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2C244TF 657 0 0
GGAAATTT
ATCGACTCAACATTCTCTTGATTTTCGCAAGTTTGATCTCTCGTTACTTGTCACTGTTTC
AGTAAGCCATGGCAAAGCATCACCCTGATTTGATCACGTGCCGGAAACAGCCCGGCATTG
CTATCGGACGACTGTGTGAGAAATGCGACGGAAAATGCGTGGTTTGCGACTCTTACGTGC
GTCCGTGCACTCTGGTGCGTATTTGTGACGAATGCAACTACGGGTCGTTCCAAGGCCGGT
GCACTATATGCGGAGGGGTTGGGATCTCGGATGCTTATTACTGCAAGGAGTGTACGCAGC
AGGAAAAAGACAGAGATGGTTGTCCCAAGATTGTCAACCTTGGGAGTACTAAGACGGATC
TCTTCTATGAACGGAAGAAATATGGATTCAAAAAACGATGATCAATGTATGGGGGGGGGG
TTTTCCCGATTGCTGGATCTCTTATACTACTATGTCTGTTGCATAAAACTAATATGTATT
CATCATACATTATGCTTTCTTATTCTTGATAATCTCTAGACTCGAGTTGTCTTTATTGGA
CTTATCTTAGTGTCCAAATAGTCTCTTGCATTGTGTATCGTGTTTGATTTCGGCTGTGTT
TGCAAGTCGCAAACAGAGTAACTATTTTAGCAAAGAATTTATTGTTCTC

QA 9 657 9 657
DS 

RD RR2BQ53JQ 656 0 0
GG
ATCGACTCAACATTCTCTTGATTTTCGCAAGTTTGATCTCTCGTTACTTGTCACTGTTTC
AGTAAGCCATGGCAAAGCATCACCCTGATTTGATCATGTGCCGGAAACAGCCCGGCATTG
CTATCGGACGACTGTGTGAGAAATGCGACGGAAAATGCGTGGTTTGCGACTCTTACGTGC
GTCCGTGCACTCTGGTGCGTATTTGTGACGAATGCAACTACGGGTCGTTCCAAGGCCGGT
GCACTATATGCGGAGGGGTTGGGATCTCGGATGCTTATTACTGCAAGGAGTGTACGCAGC
AGGAAAAAGACAGAGATGGTTGTCCCAAGATTGTCAACCTTGGGAGTGCTAAGACGGATC
TCTTCTATGAACGGAAGAAATATGGATTCAAAAAACGATGATCAATGTATGGGGGGG***
TTTTCCCGATTGCTGGATCTCTTATACTACTATGTCTGTTGCATAAAACTAATATGTATT
CATCATACATTATGCTTTCTTATTCTTGATAATCTCTAGACTCGAGTTGTCTTTATTGGA
CTTATCTTAGTGTCCAAATAGTCTCTTGCATTGTGTATCGTGTTTGATTTCGGCTGTGTT
TGTAAGTCGCAAACAGAGTAACTATTTTAGCAAAGAATTTATTGTTCTCAGTTC

QA 3 656 3 656
DS 



AS 1 3

CO CL2068Contig1 877 3 27 U
AAAGAAGAGTTCCTAGATTTATTTGGGTCAAGTAATGATAAATTTAGCACAAGCAAATGT
TGTTCATACACATTCATGAACTGTGACAATAAATAGTTTGCACAACAATGATAAGACTGA
GAATCTGAAGTTGCCACAACTTCACACCAGCTCTATGCAAAAGTGATGATCCCAAGTCTA
GCAGCAACAACAATTCACCAGCAGAAAATACATTAACGACA******AGCAACTTGTATA
GAGTCACTGAACCTCGGATGCTCCTTCCGAATCAGACAAAGGTAAGAGTGTACAAACTCC
AAGCATATGCCCATTGAGGCAAACATAATACTCAATGCTATCTTCATAAGCCCCCAATCT
ACAGCTAGCACTCTGTGGTATCATCCTCGCCTGAAGCATACTCCACAGCTTCGCTTTGCA
ATAAGGACAAACCTCTGTGGGATGAAACGATGTCCCTTTCCTAATGAGCAACTTCCTCAC
CTTTGACATTGAAAACGATTTGAAAATCCCACGGAAGAATCCCAAATCACCATCTTCTTC
TCCTTGACCCAAATGCTCACAAGGGTCAGAAACATACAGAATGTCATCGTTACGACACTG
CGGAGGGAGGAAGCTCCTTCCTGAAGTTCTAGAGAAACGTGTCCTGTGAACAAAGTGACC
AGGGACTTGAACATCGCTAAAGAGCCCACCTTTACTTGAACCTGAGCAGTAAATCAAAAG
CTTCCCAAGTGCTCTCCAACTACCATCAACACTGTGGCTACCACTAGACTGGAGATCATA
CATCATCTTGGGCGCTCTGGCTCTGCAGAACTCTTTCCACAGCAGTCTCTTAGCGAGATC
ATCAAACCATTTGCAGACAAAAGACAAGTGGCGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED21JQ U 1
AF RR2EP23JQ U 66
AF RR2EP23TF C 124
BS 1 148 RR2ED21JQ
BS 149 149 RR2EP23JQ
BS 150 161 RR2ED21JQ
BS 162 162 RR2EP23JQ
BS 163 221 RR2ED21JQ
BS 222 227 RR2EP23JQ
BS 228 255 RR2ED21JQ
BS 256 256 RR2EP23JQ
BS 257 267 RR2ED21JQ
BS 268 268 RR2EP23JQ
BS 269 339 RR2ED21JQ
BS 340 340 RR2EP23JQ
BS 341 369 RR2ED21JQ
BS 370 370 RR2EP23JQ
BS 371 504 RR2ED21JQ
BS 505 505 RR2EP23JQ
BS 506 519 RR2ED21JQ
BS 520 520 RR2EP23JQ
BS 521 538 RR2ED21JQ
BS 539 539 RR2EP23JQ
BS 540 547 RR2ED21JQ
BS 548 548 RR2EP23JQ
BS 549 551 RR2ED21JQ
BS 552 552 RR2EP23JQ
BS 553 613 RR2ED21JQ
BS 614 776 RR2EP23JQ
BS 777 877 RR2EP23TF

RD RR2ED21JQ 613 0 0
AAAGAAGAGTTCCTAGATTTATTTGGGTCAAGTAATGATAAATTTAGCACAAGCAAATGT
TGTTCATACACATTCATGAACTGTGACAATAAATAGTTTGCACAACAATGATAAGACTGA
GAATCTGAAGTTGCCACAACTTCACACCGGCTCTATGCAAA*GTGATGATCCCAAGTCTA
GCAGCAACAACAATTCACCAGCAGAAAATACATTAACGACAGCTTCAAGCAACTTGTATA
GAGTCACTGAACCTCTGATGCTCCTTCAGAATCAGACAAAGGTAAGAGTGTACAAACTCC
AAGCATATGCCCATTGAGGCAAACATAATACTCAATGCTGTCTTCATAAGCCCCCAATCT
ACAGCTAGCGCTCTGTGGTATCATCCTCGCCTGAAGCATACTCCACAGCTTCGCTTTGCA
ATAAGGACAAACCTCTGTGGGATGAAACGATGTCCCTTTCCTAATGAGCAACTTCCTCAC
CTTTGACATTGAAAACGATTTGAAGATCCCACGGAAGAAACCCAAATCACCATCTTCTCC
TCCTTGATCCAGATGCTCACAAGGGTCAGAAACATACAGAATGTCATCGTTACGACACTG
CGGAGGGAGGAAG

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2EP23JQ 711 0 0
ATACACATTCATGAACTGTGACAATAAATAGTTTGCACAACAATGATAAGACTGAGAATC
TGAAGTTGCCACAACTTCACACCAGCTCTATGCAAAAGTGATGATCCCAAGTCTAGCAGC
AACAACAATTCACCAGCAGAAAATACATTAACGACA******AGCAACTTGTATAGAGTC
ACTGAACCTCGGATGCTCCTTCCGAATCAGACAAAGGTAAGAGTGTACAAACTCCAAGCA
TATGCCCATTGAGGCAAACATAATACTCAATGCTATCTTCATAAGCCCCCAATCTACAGC
TAGCACTCTGTGGTATCATCCTCGCCTGAAGCATACTCCACAGCTTCGCTTTGCAATAAG
GACAAACCTCTGTGGGATGAAACGATGTCCCTTTCCTAATGAGCAACTTCCTCACCTTTG
ACATTGAAAACGATTTGAAAATCCCACGGAAGAATCCCAAATCACCATCTTCTTCTCCTT
GACCCAAATGCTCACAAGGGTCAGAAACATACAGAATGTCATCGTTACGACACTGCGGAG
GGAGGAAGCTCCTTCCTGAAGTTCTAGAGAAACGTGTCCTGTGAACAAAGTGACCAGGGA
CTTGAACATCGCTAAAGAGCCCACCTTTACTTGAACCTGAGCAGTAAATCAAAAGCTTCC
CAAGTGCTCTCCAACTACCATCAACACTGTGGCTACCACTAGACTGGAGAT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2EP23TF 754 0 0
TCTGAAGTTGCCACA*CTTCACACCAGCTCTATGCAAAAGTGATGATCCCAAGTCTAGCA
GCAACAACAATTCACCAGCAGAAAATACATTAACGACA******AGCAACTTGTATAGAG
TCACTGAACCTCGGATGCTCCTTCCGAATCAGACAAAGGTAAGAGTGTACAAACTCCAAG
CATATGCCCATTGAGGCAAACATAATACTCAATGCTATCTTCATAAGCCCCCAATCTACA
GCTAGCACTCTGTGGTATCATCCTCGCCTGAAGCATACTCCACAGCTTCGCTTTGCAATA
AGGACAAACCTCTGTGGGATGAAACGATGTCCCTTTCCTAATGAGCAACTTCCTCACCTT
TGACATTGAAAACGATTTGAAAATCCCACGGAAGAATCCCAAATCACCATCTTCTTCTCC
TTGACCCAAATGCTCACAAGGGTCAGAAACATACAGAATGTCATCGTTACGACACTGCGG
AGGGAGGAAGCTCCTTCCTGAAGTTCTAGAGAAACGTGTCCTGTGAACAAAGTGACCAGG
GACTTGAACATCGCTAAAGAGCCCACCTTTACTTGAACCTGAGCAGTAAATCAAAAGCTT
CCCAAGTGCTCTCCAACTACCATCAACACTGTGGCTACCACTAGACTGGAGATCATACAT
CATCTTGGGCGCTCTGGCTCTGCAGAACTCTTTCCACAGCAGTCTCTTAGCGAGATCATC
AAACCATTTGCAGACAAAAGACAAGTGGCGATTC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL2069Contig1 1073 2 2 U
GGACCATCAATCGTCCTCCCAAAAAGCTTCAGAACCCTAAAAACCCAAGCCCTTAGCCAC
AACCCCCTTCGAGAAAGATGTTGGAGCTTCGTCTAGTCCAAGGCTCTCTGCTGAAGAAGG
TTCTGGAATCAGTCAAGGATCTGGTGAACGATGCCAACTTCGACTGCTCCAGCACCGGGT
TCTCCCTCCAGGCCATGGACTCCAGCCACGTGGCGCTGGTGTCTCTGCTCCTGAGATCCG
AAGGTTTCGAGCACTACAGGTGCGACAGGAACCTCTCCATGGGGATGAATCTCGGCAACA
TGTCCAAGATGCTTAAATGTGCTGGAAATGATGACATCATCACCATCAAAGCCGATGACG
GAAGCGACACCGTCACCTTCATGTTCGAGAGCCCTACACAAGACAAGATTGCAGATTTTG
AGATGAAGCTGATGGATATCGACAGTGAGCATTTAGGAATCCCTGACGCTGAGTACCACT
CTATTGTGAGGATGCCTTCTGGTGAATTTTCCAGGATATGCAAAGATCTCAGTAGCATTG
GCGACACAGTTGTCATCTCTGTGACGAAAGAAGGTGTGAAGTTTTCAACAGCTGGTGATA
TCGGGACAGCTAACATTGTACTCAGGCAGAACACAACTGTGGACAAGCCTGAAGATGCAA
TTGTGATAGAGATGAACGAGCCTGTGTCACTTTCATTTGCGTTGAGGTACATGAACTCCT
TCACAAAGGCGACACCCTTGTCTGAAACCGTGACAATCAGTTTGTCCTCGGAGTTACCAG
TCGTGGTGGAGTATAAAGTGGCTGAGATGGGTTACATTCGGTACTACTTGGCTCCCAAGA
TTGAAGAAGAAGAAGACACTAATGCATAACACGTCTGTGGCTTCTGGACGCAGAAGCTTT
GGAACTCTTCGTGGATGAATGCTGTGTTCTTTACTGTAGTCCTTTGTTAAAATGTTTTTC
TGTTTGGATTCAGTTCGTTTTCTGGATTTACTATGTTACTACTGCAACGCTGGAGTAGAT
CATGGTGAAAACAAGTTCGACTGGTTTTGCAATTTGAGAAAAAAAGGTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP79TF U 1
AF RR2EP79JQ C 235
BS 1 697 RR2EP79TF
BS 698 1073 RR2EP79JQ

RD RR2EP79TF 703 0 0
GGACCATCAATCGTCCTCCCAAAAAGCTTCAGAACCCTAAAAACCCAAGCCCTTAGCCAC
AACCCCCTTCGAGAAAGATGTTGGAGCTTCGTCTAGTCCAAGGCTCTCTGCTGAAGAAGG
TTCTGGAATCAGTCAAGGATCTGGTGAACGATGCCAACTTCGACTGCTCCAGCACCGGGT
TCTCCCTCCAGGCCATGGACTCCAGCCACGTGGCGCTGGTGTCTCTGCTCCTGAGATCCG
AAGGTTTCGAGCACTACAGGTGCGACAGGAACCTCTCCATGGGGATGAATCTCGGCAACA
TGTCCAAGATGCTTAAATGTGCTGGAAATGATGACATCATCACCATCAAAGCCGATGACG
GAAGCGACACCGTCACCTTCATGTTCGAGAGCCCTACACAAGACAAGATTGCAGATTTTG
AGATGAAGCTGATGGATATCGACAGTGAGCATTTAGGAATCCCTGACGCTGAGTACCACT
CTATTGTGAGGATGCCTTCTGGTGAATTTTCCAGGATATGCAAAGATCTCAGTAGCATTG
GCGACACAGTTGTCATCTCTGTGACGAAAGAAGGTGTGAAGTTTTCAACAGCTGGTGATA
TCGGGACAGCTAACATTGTACTCAGGCAGAACACAACTGTGGACAAGCCTGAAGATGCAA
TTGTGATAGAGATGAACGAGCCTGTGTCACTTTCATT
TGCGTT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2EP79JQ 839 0 0
GATCCGAAGGTTTCGAGCACTACAGGTGCGACAGGA*CCTCTCCATGGGGATGAATCTCG
GCAACATGTCCAAGATGCTTAAATGTGCTGGAAATGATGACATCATCACCATCAAAGCCG
ATGACGGAAGCGACACCGTCACCTTCATGTTCGAGAGCCCTACACAAGACAAGATTGCAG
ATTTTGAGATGAAGCTGATGGATATCGACAGTGAGCATTTAGGAATCCCTGACGCTGAGT
ACCACTCTATTGTGAGGATGCCTTCTGGTGAATTTTCCAGGATATGCAAAGATCTCAGTA
GCATTGGCGACACAGTTGTCATCTCTGTGACGAAAGAAGGTGTGAAGTTTTCAACAGCTG
GTGATATCGGGACAGCTAACATTGTACTCAGGCAGAACACAACTGTGGACAAGCCTGAAG
ATGCAATTGTGATAGAGATGAACGAGCCTGTGTCACTTTCATTTGCGTTGAGGTACATGA
ACTCCTTCACAAAGGCGACACCCTTGTCTGAAACCGTGACAATCAGTTTGTCCTCGGAGT
TACCAGTCGTGGTGGAGTATAAAGTGGCTGAGATGGGTTACATTCGGTACTACTTGGCTC
CCAAGATTGAAGAAGAAGAAGACACTAATGCATAACACGTCTGTGGCTTCTGGACGCAGA
AGCTTTGGAACTCTTCGTGGATGAATGCTGTGTTCTTTACTGTAGTCCTTTGTTAAAATG
TTTTTCTGTTTGGATTCAGTTCGTTTTCTGGATTTACTATGTTACTACTGCAACGCTGGA
GTAGATCATGGTGAAAACAAGTTCGACTGGTTTTGCAATTTGAGAAAAAAAGGTTTACC

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 4

CO CL2070Contig1 627 4 13 U
GGAGGCTTTGATCACCGAACCCTAGTTTCTCTCGATCATCGTTTCGCTTCTTCTTCTTTA
GATACTGATCGAATCAACATGGCCAAAAACTCCTTCAAGCTTTCTAATCCTCTGGAGGTG
AGAATGGCTGAACCTACTCGTATTAGAGAGAAGTACCAAGACAGAGTTCCTGTGATTGTG
GAGAAAGCTGCACAAAGTGATGTTCCTGACATTGACAAGAAGAAGTATCTTGTGCCAGCT
GATCTAACCGCTGGACAATTTGTGTACGTTGTGCGCAAAAGAATTAAGCTCGGAGCAGAG
AAAGCAATCTTCGTCTTTGTCAAGAACACGTTACCCCCAACTGCTGCATTGATGTCTGCA
ATCTATGAAGAACACAAAGACGAAGATGGGTTTCTCTACATGACATACAGTGGAGAGAAC
ACGTTTGGATCTTCCTGCTAATATGCTCTGATTTGATAGTTTGATCTTCTTTGGTGATGA
AGATTGTACATTCGTTTTCCCCTCTAGCTTCTTTTCTTCTGATTGGTCGACCTTAATAAT
GTCTTTTACTTTGTGGTTTTATCTTCGGAGAACTCTCTTTCTCAATGGATATGAAAAATA
TATCTTCAGTTAATTTGAGACTCTGTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2DT87TF U 1
AF RR2DA40JQ C 1
AF RR2DT87JQ C 141
AF RR2DA40TF U 1
BS 1 41 RR2DT87TF
BS 42 42 RR2DA40TF
BS 43 75 RR2DT87TF
BS 76 76 RR2DA40TF
BS 77 129 RR2DT87TF
BS 130 130 RR2DA40TF
BS 131 132 RR2DT87TF
BS 133 133 RR2DA40TF
BS 134 143 RR2DT87TF
BS 144 144 RR2DA40TF
BS 145 564 RR2DT87TF
BS 565 626 RR2DA40TF
BS 627 627 RR2DA40JQ

RD RR2DT87TF 564 0 0
GGAGGCTTTGATCACCGAACCCTAGTTTCTCTCGATCATCGATTCGCTTCTTCTTCTTTA
GATACTGATCGAATCGACATGGCCAAAAACTCCTTCAAGCTTTCTAATCCTCTGGAGGTG
AGAATGGCTTAATCTACTCGTATCAGAGAGAAGTACCAAGACAGAGTTCCTGTGATTGTG
GAGAAAGCTGCACAAAGTGATGTTCCTGACATTGACAAGAAGAAGTATCTTGTGCCAGCT
GATCTAACCGCTGGACAATTTGTGTACGTTGTGCGCAAAAGAATTAAGCTCGGAGCAGAG
AAAGCAATCTTCGTCTTTGTCAAGAACACGTTACCCCCAACTGCTGCATTGATGTCTGCA
ATCTATGAAGAACACAAAGACGAAGATGGGTTTCTCTACATGACATACAGTGGAGAGAAC
ACGTTTGGATCTTCCTGCTAATATGCTCTGATTTGATAGTTTGATCTTCTTTGGTGATGA
AGATTGTACATTCGTTTTCCCCTCTAGCTTCTTTTCTTCTGATTGGTCGACCTTAATAAT
GTCTTTTACTTTGTGGTTTTATCT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2DA40JQ 627 0 0
GGAGGCTTTGATCACCGAACCCTAGTTTCTCTCGATCATCGTTTCGCTTCTTCTTCTTTA
GATACTGATCGAATCAACATGGCCAAAAACTCCTTCAAGCTTTCTAATCCTCTGGAGGTG
AGAATGGCTGAACCTACTCGTATTAGAGAGAAGTACCAAGACAGAGTTCCTGTGATTGTG
GAGAAAGCTGCACAAAGTGATGTTCCTGACATTGACAAGAAGAAGTATCTTGTGCCAGCT
GATCTAACCGCTGGACAATTTGTGTACGTTGTGCGCAAAAGAATTAAGCTCGGAGCCGAG
AAAGCAATCTTTGTCTTTGTCAAGAACACGTTACCCCCAACTGCTGCATTGATGTCTGCA
ATCTATGAAGAACACAAAGACGAAGATGGGTTTCTCTACATGACATACAGTGGAGAGAAC
ACGTTTGGATCTTCCTGCTAATATGCTCTGATTTGATAGTTTGATCTTCTT*GGTGATGA
AGATTGTACATTCGTTTTCCCCTCTAGCTTCTTTTCTTCTGATTGGTCGACCTTAATAAT
GTCTTTTACTTTGTGGTTTTATCTTCGGAGAACTCTCTTTCTCAATGGATATGAAAAATA
TATCTTCAGTTAATTTGAGACTCTGTT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2DT87JQ 486 0 0
TATC
AGAGAGAAGTACCAAGACAGAGTTCCTGTGATTGTGGAGAAAGCTGCACAAAGTGATGTT
CCTGACATTGACAAGAAGAAGTATCTTGTGCCAGCTGATCTAACCGCTGGACAATTTGTG
TACGTTGTGCGCAAAAGAATTAAGCTCGGAGCAGAGAAAGCAATCTTCGTCTTTGTCAAG
AACACGTTACCCCCAACTGCTGCATTGATGTCTGCAATCTATGAAGAACACAAAGACGAA
GATGGGTTTCTCTACATGACATACAGTGGAGAGAACACGTTTGGATCTTCCTGCTAATAT
GCTCTGATTTGATAGTTTGATCTTCTTTGGTGATGAAGATTGTACATTCGTTTTCCCCTC
TAGCTTCTTTTCTTCTGATTGGTCGACCTTAATAATGTCTTTTACTTTGTGGTTTTATCT
TCGGAGAACTCTCCTTCTCAATGGATTTGAAAAATATTTCTTCAGTTAATTTGAGACTCT
GT

QA 5 486 5 486
DS 

RD RR2DA40TF 627 0 0
GGAGGCTTTGATCACCGAACCCTAGTTTCTCTCGATCATCGTTTCGCTTCTTCTTCTTTA
GATACTGATCGAATCAACATGGCCAAAAACTCCTTCAAGCTTTCTAATCCTCTGGAGGTG
AGAATGGCTGAACCTACTCGTATTAGAGAGAAGTACCAAGACAGAGTTCCTGTGATTGTG
GAGAAAGCTGCACAAAGTGATGTTCCTGACATTGACAAGAAGAAGTATCTTGTGCCAGCT
GATCTAACCGCTGGACAATTTGTGTACGTTGTGCGCAAAAGAATTAAGCTCGGAGCCGAG
AAAGCAATCTTTGTCTTTGTCAAGAACACGTTACCCCCAACTGCTGCATTGATGTCTGCA
ATCTATGAAGAACACAAAGACGAAGATGGGTTTCTCTACATGACATACAGTGGAGAGAAC
ACGTTTGGATCTTCCTGCTAATATGCTCTGATTTGATAGTTTGATCTTCTT*GGTGATGA
AGATTGTACATTCGTTTTCCCCTCTAGCTTCTTTTCTTCTGATTGGTCGACCTTAATAAT
GTCTTTTACTTTGTGGTTTTATCTTCGGAGAACTCTCTTTCTCAATGGATATGAAAAATA
TATCTTCAGTTAATTTGAGACTCTGT
T

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 3

CO CL2071Contig1 1406 3 7 U
GGACAAACAGATTTGCTGATTTTCAATATATGAAATTAAATCTATCTTGGATAAACAGTG
AAAATTGTCTGAACAATAGACAATATCAAAAGAATAAGAGCAGCAAGAGCAGAGATAAAA
GACCAAGGAGAACTAAAATAAGTGTTCTTGAAACTAGCCCATGTAACGTGCCGACTATTA
TTGTAATACTCATTCACTTCTATAAACAACTCCTTTAGATAACACTTTTCTATTTCGAAC
GCAACGTCTCTGCCTAGAGTGTTCACGAATCCAGCGACCGCTGATTCTGTGCCAAAGTAG
TTCTCTATGATTTTTTGTTCACATAGATACTCAACGTCTTTGTTAATGTTCATCAGACAG
TCTAGTAGTGTCGCGTAGGTAGTGAAATGCTTTGAACACGCCACGTGGCACTGCTCGTAA
GCCACGCAGTTCGGAAAGAAACTTCCCATGAAATCGTCGACTACGATGCGCGGCATCTCT
ATCGCTCCACGTCTGAATCTCACAACGAGGAAGCTCTCTTCGTCTTTTCAGCTCCCTGAT
CTTGATCCCGGCTTGCCGGAGCTTGGATATGCTGTGGATGATGTAGGACGGTGTCTTCTT
CTTCTTCTCTGGATTAGTTGTCTGCGATTTCGCTGGAAGTTTACTCTCCGGGATTAAGCT
TGACCGGACAAGGTCAAGGAGGTGTTTGGCTTTTAGGTCTTTGAACCTGGCGAGATCTTG
TTCTGGTCTATCCATCGTGTTGGTAAAGAACGCAAAGGCTAGAGACTGTAGAGAAACGTT
GCTCTGTCTTTCGCTATCGCTTCTTGTGAGGTCAAACAAAGCTTCAAGAACGAAGAAAGG
GATTTGATTCTCAAGACGGAGAAAATCTCTGTTGAAGAAAGGAAGAACCCAAGCCATGGT
CAAGAGTGGATCATCCTGTTGAAAAGGAACAACGTCGCTGACTTTACGAAACAGCTCAAG
AATGAAACAACCGTCAAGAACCATCATCTCGTTGAACTCATCAGAGTCCATGTGGATTGA
CTCGGAGTAAACCTCTCTCGCAGCTTCCTCAACATTCTTCGCGGTTTTCATGTAATCCTC
TAGTGTCAAGGATTTTGTTTCGTGGGTTCGAGTGACAAGAGCATTTAAGTAACGCCATTT
GTGTTCTTCCATCATCTTGAGCTGCGTTTTGCCTCGGTGGTATGGTCCCACCGAGACAAC
TCGCGGCTCATAGCATCTACCGTTGGAATCAATCATGGTTTGAGGTACCCGGAAGATCGA
GCAAGTTGATTTTCCAGCGGTCGGGCTTAGCAACCGTGGTGGCTCCTTCAGCTTCTTATG
CATCCTATCAATACGGATCTTGAGGAGGCTTTCTCCTTCGTCTTGTACGGAGGCATTAGC
CGGCTGCTCCATTTTCATTGGGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA83JQ U 1
AF RR2AE02JQ U 15
AF RR2FA83TF C 588
BS 1 121 RR2FA83JQ
BS 122 122 RR2AE02JQ
BS 123 577 RR2FA83JQ
BS 578 781 RR2AE02JQ
BS 782 782 RR2FA83TF
BS 783 817 RR2AE02JQ
BS 818 1406 RR2FA83TF

RD RR2FA83JQ 577 0 0
GGACAAACAGATTTGCTGATTTTCAATATATGAAATTAAATCTATCTTGGATAAACAGTG
AAAATTGTCTGAACAATAGACAATATCAAAAGAATAAGAGCAGCAAGAGCAGAGATAAAA
GGCCAAGGAGAACTAAAATAAGTGTTCTTGAAACTAGCCCATGTAACGTGCCGACTATTA
TTGTAATACTCATTCACTTCTATAAACAACTCCTTTAGATAACACTTTTCTATTTCGAAC
GCAACGTCTCTGCCTAGAGTGTTCACGAATCCAGCGACCGCTGATTCTGTGCCAAAGTAG
TTCTCTATGATTTTTTGTTCACATAGATACTCAACGTCTTTGTTAATGTTCATCAGACAG
TCTAGTAGTGTCGCGTAGGTAGTGAAATGCTTTGAACACGCCACGTGGCACTGCTCGTAA
GCCACGCAGTTCGGAAAGAAACTTCCCATGAAATCGTCGACTACGATGCGCGGCATCTCT
ATCGCTCCACGTCTGAATCTCACAACGAGGAAGCTCTCTTCGTCTTTTCAGCTCCCTGAT
CTTGATCCCGGCTTGCCGGAGCTTGGATATGCTGTGG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2AE02JQ 803 0 0
GT
TGATTTTCAATATATGAAATTAAATCTATCTTGGATAAACAGTGAAAATTGTCTGAACAA
TAGACAATATCAAAAGAATAAGAGCAGCAAGAGCAGAGATAAAAGACCAAGGAGAACTAA
AATAAGTGTTCTTGAAACTAGCCCATGTAACGTGCCGACTATTATTGTAATACTCATTCA
CTTCTATAAACAACTCCTTTAGATAACACTTTTCTATTTCGAACGCAACGTCTCTGCCTA
GAGTGTTCACGAATCCAGCGACCGCTGATTCTGTGCCAAAGTAGTTCTCTATGATTTTTT
GTTCACATAGATACTCAACGTCTTTGTTAATGTTCATCAGACAGTCTAGTAGTGTCGCGT
AGGTAGTGAAATGCTTTGAACACGCCACGTGGCACTGCTCGTAAGCCACGCAGTTCGGAA
AGAAACTTCCCATGAAATCGTCGACTACGATGCGCGGCATCTCTATCGCTCCACGTCTGA
ATCTCACAACGAGGAAGCTCTCTTCGTCTTT*CAGCTCCCTGATCTTGATCCCGGCTTGC
CGGAGCTTGGATATGCTGTGGATGATGTAGGACGGTGTCTTCTTCTTCTTCTCTGGATTA
GTTGTCTGCGATTTCGCTGGAAGTTTACTCTCCGGGATTAAGCTTGACCGGACAAGGTCA
AGGAGGTGTTTGGCTTTTAGGTCTTTGAACCTGGCGAGATCTTGTTCTGGTCTATCCATC
GTGTTGGTAAAGAACGCAAAGGCTAGAGACTGTAGAGAAACGTTGTTCTGTCTTTCGCTA
TCGCTTCTTGTGAGGTCAAAC

QA 3 803 3 803
DS 

RD RR2FA83TF 819 0 0
AGGACGGTGTCTCTC
TCTTCTCTGGATTAGT*GTCTGCGATT*CGCTGGAAGTT*ACTCTCCGGGATTAAGCTTG
AC*GGACAAGGTCAAGGAGGTGTTTGGCTTTTAGGTCTTTGAACCTGGCGAGATCTTGTT
CTGGTCTATCCATCGTGTTGGTAAAGAACGCAAAGGCTAGAGACTGTAGAGAAACGTTGC
TCTGTCTTTCGCTATCGCTTCTTGTGAGGTCAAACAAAGCTTCAAGAACGAAGAAAGGGA
TTTGATTCTCAAGACGGAGAAAATCTCTGTTGAAGAAAGGAAGAACCCAAGCCATGGTCA
AGAGTGGATCATCCTGTTGAAAAGGAACAACGTCGCTGACTTTACGAAACAGCTCAAGAA
TGAAACAACCGTCAAGAACCATCATCTCGTTGAACTCATCAGAGTCCATGTGGATTGACT
CGGAGTAAACCTCTCTCGCAGCTTCCTCAACATTCTTCGCGGTTTTCATGTAATCCTCTA
GTGTCAAGGATTTTGTTTCGTGGGTTCGAGTGACAAGAGCATTTAAGTAACGCCATTTGT
GTTCTTCCATCATCTTGAGCTGCGTTTTGCCTCGGTGGTATGGTCCCACCGAGACAACTC
GCGGCTCATAGCATCTACCGTTGGAATCAATCATGGTTTGAGGTACCCGGAAGATCGAGC
AAGTTGATTTTCCAGCGGTCGGGCTTAGCAACCGTGGTGGCTCCTTCAGCTTCTTATGCA
TCCTATCAATACGGATCTTGAGGAGGCTTTCTCCTTCGTCTTGTACGGAGGCATTAGCCG
GCTGCTCCATTTTCATTGGGGTCC

QA 16 819 16 819
DS 



AS 1 4

CO CL2072Contig1 848 4 7 U
GGGTTGTTCTCTTTCTCCACACGACGACACTTACTACGAGCCATGGCCGCCGCCGCAGAG
ATTGACGCTGAGATTCAGCAACAGCTTACCAACGAGGTCAAACTCTTCAACCGTTGGAGC
TTTGACGACGTTTCGGTCACAGACATTAGTCTTGTTGACTACATTGGTGTTCAGCCAGCT
AAGCACGCGACCTTTGTCCCCCACACGGCTGGAAGATACTCTGTGAAGAGGTTCAGGAAG
GCTCAATGCCCAATCGTAGAGAGGCTCACTAACTCTCTCATGATGCACGGGAGGAACAAC
GGTAAAAAGCTGATGGCTGTGAGGATCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCATCTCTTG
ACTGACTTGAACCCAATTCAGGTCATCATTGATGCCATTGTCAACAGTGGTCCACGTGAA
GATGCTACCAGGATTGGATCTGCTGGTGTGGTTAGGAGGCAGGCTGTTGATATCTCTCCT
CTAAGACGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACTGGCGCACGTGAAGCTGCCTTT
AGAAACATCAAGACAATCGCTGAGTGCCTTGCTGATGAGCTCATCAATGCTGCCAAGGGT
TCTTCCAACAGCTATGCCATCAAGAAGAAGGATGAGATTGAGAGAGTTGCAAAGGCCAAC
CGTTAAGGGATCATCTTCCTTTGCCATGGAGCTTGCATTATATCTCATAAGACCTTTTTG
TTCTGTTTTCATTAGATCTTTGGATATGTTTCATAAGCTTTCTCTATCTTTTAACGAAGT
TTTGACTCTTTGCTCTACTTTGGGATCTTGATCAAACTGTTTCATATTTAAGAATACTTC
ATCTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED62TF U 1
AF RR2B284JQ C 153
AF RR2B284TF U 153
AF RR2ED62JQ C 193
BS 1 182 RR2ED62TF
BS 183 183 RR2B284TF
BS 184 304 RR2ED62TF
BS 305 306 RR2B284TF
BS 307 627 RR2ED62TF
BS 628 796 RR2B284TF
BS 797 848 RR2ED62JQ

RD RR2ED62TF 627 0 0
GGGTTGTTCTCTTTCTCCACACGACGACACTTACTACGAGCCATGGCCGCCGCCGCAGAG
ATTGACGCTGAGATTCAGCAACAGCTTACCAACGAGGTCAAACTCTTCAACCGTTGGAGC
TTTGACGACGTTTCGGTCACAGACATTAGTCTTGTTGACTACATTGGTGTTCAGCCAGCT
AAACACGCGACCTTTGTCCCCCACACGGCTGGAAGATACTCTGTGAAGAGGTTCAGGAAG
GCTCAATGCCCAATCGTAGAGAGGCTCACTAACTCTCTCATGATGCACGGGAGGAACAAC
GGTAGGAAGCTGATGGCTGTGAGGATCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCATCTCTTG
ACTGACTTGAACCCAATTCAGGTCATCATTGATGCCATTGTCAACAGTGGTCCACGTGAA
GATGCTACCAGGATTGGATCTGCTGGTGTGGTTAGGAGGCAGGCTGTTGATATCTCTCCT
CTAAGACGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACTGGCGCACGTGAAGCTGCCTTT
AGAAACATCAAGACAATCGCTGAGTGCCTTGCTGATGAGCTCATCAATGCTGCCAAGGGT
TCTTCCAACAGCTATGCCATCAAGAAG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2B284JQ 644 0 0
G
GTTGACTACATTGGTGTTCAGCCAGCTAAGCACGCGACCTTTGTCCCCCACACGGCTGGA
AGATACTCTGTGAAGAGGTTCAGGAAGGCTCAATGCCCAATCGTAGAGAGGCTCACTAAC
TCTCTCATGATGCACGGGAGGAACAACGGTAAAAAGCTGATGGCTGTGAGGATCATCAAG
CACGCCATGGAGATCATCCATCTCTTGACTGACTTGAACCCAATTCAGGTCATCATTGAT
GCCATTGTCAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCTACCAGGATTGGATCTGCTGGTGTGGTT
AGGAGGCAGGCTGTTGATATCTCTCCTTTAAGACGTGTGAACCAAGCCATTTTCTTGCTC
ACCACTGGCGCACGTGAAGCTGCCTTTAGAAACATCAAGACAATCGCTGAGTGCCTTGCT
GATGAGCTCATCAATGCTGCCAAGGGTTCTTCCAACAGCTATGCCATCAAGAAGAAGGAT
GAGATTGAGAGAGTTGCAAAGGCCAACCGTTAAGGGATCATCTTCCTTTGCCATGGAGCT
TGCATTATATTTCATAAGACCTTTTTGTTCTGTTTTCATTAGATCTTTGGATATGTTTCA
TAAGCTTTCTCTATCTTTTAACGAAGTTTTGACTCTTTGCTCT

QA 2 644 2 644
DS 

RD RR2B284TF 644 0 0
G
GTTGACTACATTGGTGTTCAGCCAGCTAAGCACGCGACCTTTGTCCCCCACACGGCTGGA
AGATACTCTGTGAAGAGGTTCAGGAAGGCTCAATGCCCAATCGTAGAGAGGCTCACTAAC
TCTCTCATGATGCACGGGAGGAACAACGGTAAAAAGCTGATGGCTGTGAGGATCATCAAG
CACGCCATGGAGATCATCCATCTCTTGACTGACTTGAACCCAATTCAGGTCATCATTGAT
GCCATTGTCAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCTACCAGGATTGGATCTGCTGGTGTGGTT
AGGAGGCAGGCTGTTGATATCTCTCCTCTAAGACGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTC
ACCACTGGCGCACGTGAAGCTGCCTTTAGAAACATCAAGACAATCGCTGAGTGCCTTGCT
GATGAGCTCATCAATGCTGCCAAGGGTTCTTCCAACAGCTATGCCATCAAGAAGAAGGAT
GAGATTGAGAGAGTTGCAAAGGCCAACCGTTAAGGGATCATCTTCCTTTGCCATGGAGCT
TGCATTATATCTCATAAGACCTTTTTGTTCTGTTTTCATTAGATCTTTGGATATGTTTCA
TAAGCTTTCTCTATCTTTTAACGAAGTTTTGACTCTTTGCTCT

QA 2 644 2 644
DS 

RD RR2ED62JQ 656 0 0
TTTGTCCCCCACACGGCTGGAAGATACTCTGTGAAGAGGTTCAGGAAGGCTCAATGCCCA
ATCGTAGAGAGGCTCACTAACTCTCTCATGATGCACGGGAGGAACAACGGTAGGAAGCTG
ATGGCTGTGAGGATCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCATCTCTTGACTGACTTGAAC
CCAATTCAGGTCATCATTGATGCCATTGTCAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCTACCAGG
ATTGGATCTGCTGGTGTGGTTAGGAGGCAGGCTGTTGATATCTCTCCTCTAAGACGTGTG
AACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACTGGCGCACGTGAAGCTGCCTTTAGAAACATCAAG
ACAATCGCTGAGTGCCTTGCTGATGAGCTCATCAATGCTGCCAAGGGTTCTTCCAACAGC
TATGCCATCAAGAAGAAGGATGAGATTGAGAGAGTTGCAAAGGCCAACCGTTAAGGGATC
ATCTTCCTTTGCCATGGAGCTTACATTATATCTCATAAGACCTTTTTGTTCTGTTTTCAT
TAGATCTTTGGATATGTTTCATAAGCTTTCTCTATCTTTTAATGAAGTTTTGACTCTTTG
CTCTACTTTGGGATCTTGATCAAACTGTTTCATATTTAAGAATACTTCATCTATAT

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 4

CO CL2073Contig1 580 4 1 U
GCGACAAGAAACTATATTTTCAATAATTAACTCATAACGTTTATTATTTTCTATAATAAA
ACAATTAAATTTAGAAAAATATAGACTAACAACATATTAGCATAAAAACTCTCCTCTCTC
ATCTCCTTTGTATTGGTAAGTGAATTTTATTGGTAAGACTGGTAGTGTATTGCCGACAAA
GAGGTTTCTTATATCAATAGCAGCCGAGTGTTCCAAAAAAAAATCAATAGCAGCCGACCA
GCCGTTTAGTTTGGACGACAAGGAGGCTTAATGTAACAATCGCAGTCATGATGGTCTTTC
TTTAGATAAATAATATCTTTACAATCGCAACGCTGAAACTTGTGAGGTGACTTTATTTCG
TTATGACACTTTCTCGGGCCACATTTTCCAGGATACCTACCATGCCATCTACACATGTCT
AGGCCATTCGCTTTTACAATGTTCGAAACTTGGAACATGAGAACGCATAAAACAACAAAC
AAAATAGCACACTTCATGATTTCAGAAATGGATAAAAGGTTGTTTCTATACAATGCAAAA
CCTTTTTGTTATCCTTTATCAATCTCGTGAAAATATGTCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2GC10JQ U 1
AF RR2GC10TF C 1
AF RR2HB42JQ U 1
AF RR2AU87TF C 21
BS 1 580 RR2GC10JQ

RD RR2GC10JQ 580 0 0
GCGACAAGAAACTATATTTTCAATAATTAACTCATAACGTTTATTATTTTCTATAATAAA
ACAATTAAATTTAGAAAAATATAGACTAACAACATATTAGCATAAAAACTCTCCTCTCTC
ATCTCCTTTGTATTGGTAAGTGAATTTTATTGGTAAGACTGGTAGTGTATTGCCGACAAA
GAGGTTTCTTATATCAATAGCAGCCGAGTGTTCCAAAAAAAAATCAATAGCAGCCGACCA
GCCGTTTAGTTTGGACGACAAGGAGGCTTAATGTAACAATCGCAGTCATGATGGTCTTTC
TTTAGATAAATAATATCTTTACAATCGCAACGCTGAAACTTGTGAGGTGACTTTATTTCG
TTATGACACTTTCTCGGGCCACATTTTCCAGGATACCTACCATGCCATCTACACATGTCT
AGGCCATTCGCTTTTACAATGTTCGAAACTTGGAACATGAGAACGCATAAAACAACAAAC
AAAATAGCACACTTCATGATTTCAGAAATGGATAAAAGGTTGTTTCTATACAATGCAAAA
CCTTTTTGTTATCCTTTATCAATCTCGTGAAAATATGTCC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2GC10TF 580 0 0
GCGACAAGAAACTATATTTTCAATAATTAACTCATAACGTTTATTATTTTCTATAATAAA
ACAATTAAATTTAGAAAAATATAGACTAACAACATATTAGCATAAAAACTCTCCTCTCTC
ATCTCCTTTGTATTGGTAAGTGAATTTTATTGGTAAGACTGGTAGTGTATTGCCGACAAA
GAGGTTTCTTATATCAATAGCAGCCGAGTGTTCCAAAAAAAAATCAATAGCAGCCGACCA
GCCGTTTAGTTTGGACGACAAGGAGGCTTAATGTAACAATCGCAGTCATGATGGTCTTTC
TTTAGATAAATAATATCTTTACAATCGCAACGCTGAAACTTGTGAGGTGACTTTATTTCG
TTATGACACTTTCTCGGGCCACATTTTCCAGGATACCTACCATGCCATCTACACATGTCT
AGGCCATTCGCTTTTACAATGTTCGAAACTTGGAACATGAGAACGCATAAAACAACAAAC
AAAATAGCACACTTCATGATTTCAGAAATGGATAAAAGGTTGTTTCTATACAATGCAAAA
CCTTTTTGTTATCCTTTATCAATCTCGTGAAAATATGTCC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2HB42JQ 580 0 0
GCGACAAGAAACTATATTTTCAATAATTAACTCATAACGTTTATTATTTTCTATAATAAA
ACAATTAAATTTAGAAAAATATAGACTAACAACATATTAGCATAAAAACTCTCCTCTCTC
ATCTCCTTTGTATTGGTAAGTGAATTTTATTGGTAAGACTGGTAGTGTATTGCCGACAAA
GAGGTTTCTTATATCAATAGCAGCCGAGTGTTCCAAAAAAAAATCAATAGCAGCCGACCA
GCCGTTTAGTTTGGACGACAAGGAGGCTTAATGTAACAATCGCAGTCATGATGGTCTTTC
TTTAGATAAATAATATCTTTACAATCGCAACGCTGAAACTTGTGAGGTGACTTTATTTCG
TTATGACACTTTCTCGGGCCACATTTTCCAGGATACCTACCATGCCATCTACACATGTCT
AGGCCATTCGCTTTTACAATGTTCGAAACTTGGAACATGAGAACGCATAAAACAACAAAC
AAAATAGCACACTTCATGATTTCAGAAATGGATAAAAGGTTGTTTCTATACAATGCAAAA
CCTTTTTGTTATCCTTTATCAATCTCGTGAAAATATGTCC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2AU87TF 560 0 0
CAATAATTAACTCATAACGTTTATTATTTTCTATAATAAAACAATTAAATTTAGAAAAAT
ATAGACTAACAACATATTAGCATAAAAACTCTCCTCTCTCATCTCCTTTGTATTGGTAAG
TGAATTTTATTGGTAAGACTGGTAGTGTATTGCCGACAAAGAGGTTTCTTATATCAATAG
CAGCCGAGTGTTCCAAAAAAAAT**AATAGCAGCCGACCAGCCGTTTAGTTTGGACGACA
AGGAGGCTTAATGTAACAATCGCAGTCATGATGGTCTTTCTTTAGATAAATAATATCTTT
ACAATAGCAACGCTGAAACTTGTGAGGTGACTTTATTTCGTTATGACACTTTCTCGGGCC
ACATTTTCCAGGATACCTACCATGCCATCTACACATGTCTAGGCCATTCGCTTTTACAAT
GTTCGAAACTTGGAACATGAGAACGCATAAAACAACAAACAAAATAGCACACTTCATGAT
TTCAGAAATGGATAAAAGGTTGTTTCTATACAATGCAAAACCTTTTTGTTATCCTTTATC
AATCTCGTGAAAATATGTCC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

CO CL2074Contig1 1053 2 2 U
TTTTTCTGTGGTTCATATGTCACCTTCTTCCTTCTCCATCGCATCTACTGCCTCACCGGC
TTCTCTTGCCGGTACTCTCGTCTCTAACTCTAAGACTGTTCTTGGTAGTGGTAGTATATA
TTGGAAGAACAATGATGCAACTAAGGCGAATAGGAATCTCAAGTACAGAGTTTGTTCTGT
TTCTGGAGAGTTTAACACACCTGTGGAGAATGTATCATTTCCTCGTGATTACTTCGAGCT
CATTAACCAAGCTAAACAAGCAGTTGAATTGGCTTTGAAGGACGAGAAACAGTTAATGGA
AATTGAGTTCCAACATCTGGTCTTGCTTCTGTTCAAGGTGATGGTGAAGGAGCGACAGAG
GTGACAGAAAGTATGAATATGATACACCAGTTTTGTGACCGCCTTATATCTCCTGATAAG
GCTCGCACCACAAGAATTTTCTTCCCAGAGGCAAACGAAGTCAAATATGCTCAGAAGACC
ATCTTTGAAGGAACTTACTTTAAGCTGGACTATCTGACAAAGCCTTCTCTCTTTGAAGAC
TTTGGTTTCTTTGAGAGAGTAAAGATGACAGATCGAGTGAAGCCTGAAGACCAACTGTTC
CTCGTAGCATACCCTTATTTTAATGTCAACGAGGTGCTTGTAGTGGAAGAGCTATACAAG
GAGGCTGTTGTGAACACTGACCGAAAACTAATCATCTTCAACGGAGAGCTTGACCGCATA
CGTTCAGGCTACTATCCAAAGTTCTTTTACCCGAAACTGGGTGCACTGACCGAGACACTT
CTTCCGAAGATGGATACAGTTTACTACATCCACAACTTCAAGGGTCAGAAAGGAGGTGTA
CTTTTCAGATGCTATCCAGGTCCGTGGCAAGTCCTGAGGAGAACAAGAAACAGTTGCATA
TGTGTTCACCAGCAAGAAACCATGCCTTCTCTCAAAGAAGTTGCCCTAAACATTCTCGCT
TCTGCTTGAGATTCATTCTTGTACTTGAACTTCTTCACTCGTAAAAATCCTACATACTCT
TGTATATTAAAATTCGATTAATTTAGTTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP60TF U 1
AF RR2GP60JQ C 553
BS 1 656 RR2GP60TF
BS 657 1053 RR2GP60JQ

RD RR2GP60TF 656 0 0
TTTTTCTGTGGTTCATATGTCACCTTCTTCCTTCTCCATCGCATCTACTGCCTCACCGGC
TTCTCTTGCCGGTACTCTCGTCTCTAACTCTAAGACTGTTCTTGGTAGTGGTAGTATATA
TTGGAAGAACAATGATGCAACTAAGGCGAATAGGAATCTCAAGTACAGAGTTTGTTCTGT
TTCTGGAGAGTTTAACACACCTGTGGAGAATGTATCATTTCCTCGTGATTACTTCGAGCT
CATTAACCAAGCTAAACAAGCAGTTGAATTGGCTTTGAAGGACGAGAAACAGTTAATGGA
AATTGAGTTCCAACATCTGGTCTTGCTTCTGTTCAAGGTGATGGTGAAGGAGCGACAGAG
GTGACAGAAAGTATGAATATGATACACCAGTTTTGTGACCGCCTTATATCTCCTGATAAG
GCTCGCACCACAAGAATTTTCTTCCCAGAGGCAAACGAAGTCAAATATGCTCAGAAGACC
ATCTTTGAAGGAACTTACTTTAAGCTGGACTATCTGACAAAGCCTTCTCTCTTTGAAGAC
TTTGGTTTCTTTGAGAGAGTAAAGATGACAGATCGAGTGAAGCCTGAAGACCAACTGTTC
CTCGTAGCATACCCTTATTTTAATGTCAACGAGGTGCTTGTAGTGGAAGAGCTATA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2GP60JQ 501 0 0
GAGAGAGTAAAGATGACAGATCGAGTGAAGCCTGAAGACCAACTGTTCCTCGTAGCATAC
CCTTATTTTAATGTCAACGAGGTGCTTGTAGTGGAAGAGCTATACAAGGAGGCTGTTGTG
AACACTGACCGAAAACTAATCATCTTCAACGGAGAGCTTGACCGCATACGTTCAGGCTAC
TATCCAAAGTTCTTTTACCCGAAACTGGGTGCACTGACCGAGACACTTCTTCCGAAGATG
GATACAGTTTACTACATCCACAACTTCAAGGGTCAGAAAGGAGGTGTACTTTTCAGATGC
TATCCAGGTCCGTGGCAAGTCCTGAGGAGAACAAGAAACAGTTGCATATGTGTTCACCAG
CAAGAAACCATGCCTTCTCTCAAAGAAGTTGCCCTAAACATTCTCGCTTCTGCTTGAGAT
TCATTCTTGTACTTGAACTTCTTCACTCGTAAAAATCCTACATACTCTTGTATATTAAAA
TTCGATTAATTTAGTTTCTTT

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 4

CO CL2075Contig1 811 4 13 U
AACAATAGGAACTCGGTTGGAATTAAATATAGATCATACTCAGGGTAATAAGACAAATAT
CTGATTCCATAAAAGTAAAGTACAAAGGTCCTTGCTTCTCTCTGCCTGACTGATAAATAG
AGAAAAAAAGCTCACACCTGAAACTTGAATGTGACAAACAAACAAGCAAAAACAGTTTCT
TTACTTCATTCCTTCGCTGAGGCCTGGCGGCATGCCTAAGCTCTGCGCAAGGTCACTCAT
TCTTTCTTTCATAGCCACAACACTCTTTGCGTGTGCGTCCTTGTAAGCCTCCGTAACCAA
CAGTGAAAGTTTCTCAGAGCCTAACTCCATAGCTGCCTCAGTTATATCAGTACGGATTGG
TTGCTGGTTACCTGATAACGTAACCTTAACAAGCTCGCCTTCACAATAACCATCAAACTC
TGCGGCAGCTAACTCTTTTTGAACACGAACAGCCTCAACTTGAACAACCATTTGAGCTTT
CTTGACAGTCTCATACATATTCTGCATATTACCAAAGATTCCTCCTGCCTTTGACTGTCC
ATCCTCAGTATTATTATTATCTTTGTTGTTTCCACCTCCGAACAACCCATTCACACGAAG
AGACCTATTGGGCTTGTGCCGGTTTGGCCATGCCGCGTTCTTGTTCTGTCTACTACTTCC
TCTCTGGGAATTAAAGCCATGTTGGGAGAAGGGAGATAGTAAAGACTTTGTGAAATCGGT
GGTTGAAGCCATGGTTCTTCTACCGGAGGAGGAGATAAGAGAGCAGAGAGAAAGGGCGAA
GATAAAACGGAGGAGAGAGGAAATGCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE66JQ U 1
AF RR2A587JQ U 50
AF RR2GE66TF C 111
AF RR2A587TF C 110
BS 1 72 RR2GE66JQ
BS 73 73 RR2A587JQ
BS 74 154 RR2GE66JQ
BS 155 155 RR2A587JQ
BS 156 291 RR2GE66JQ
BS 292 292 RR2A587JQ
BS 293 294 RR2GE66JQ
BS 295 295 RR2A587JQ
BS 296 441 RR2GE66JQ
BS 442 442 RR2A587JQ
BS 443 687 RR2GE66JQ
BS 688 738 RR2A587JQ
BS 739 811 RR2A587TF

RD RR2GE66JQ 687 0 0
AACAATAGGAACTCGGTTGGAATTAAATATAGATCATACTCAGGGTAATAAGACAAATAT
CTGATTCCATAAGAGTAAAGTACAAAGGTCCTTGCTTCTCTCTGCCTGACTGATAAATAG
AGAAAAAAAGCTCACACCTGAAACTTGAATGTGATAAACAAACAAGCAAAAACAGTTTCT
TTACTTCATTCCTTCGCTGAGGCCTGGCGGCATGCCTAAGCTCTGCGCAAGGTCACTCAT
TCTTTCTTTCATAGCCACAACACTCTTTGCGTGTGCGTCCTTGTAAGCCTCGGTGACCAA
CAGTGAAAGTTTCTCAGAGCCTAACTCCATAGCTGCCTCAGTTATATCAGTACGGATTGG
TTGCTGGTTACCTGATAACGTAACCTTAACAAGCTCGCCTTCACAATAACCATCAAACTC
TGCGGCAGCTAACTCTTTTTGGACACGAACAGCCTCAACTTGAACAACCATTTGAGCTTT
CTTGACAGTCTCATACATATTCTGCATATTACCAAAGATTCCTCCTGCCTTTGACTGTCC
ATCCTCAGTATTATTATTATCTTTGTTGTTTCCACCTCCGAACAACCCATTCACACGAAG
AGACCTATTGGGCTTGTGCCGGTTTGGCCATGCCGCGTTCTTGTTCTGTCTACTACTTCC
TCTCTGGGAATTAAAGCCATGTTGGGA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2A587JQ 689 0 0
AAGACAAATATCTGATTCCATAAAAGTAAAGTACAAAGGTCCTTGCTTCTCTCTGCCTGA
CTGATAAATAGAGAAAAAAAGCTCACACCTGAAACTTGAATGTGACAAACAAAC***CAA
AAACAGTTTCTTTACTTCATTCCTTCGCTGAGGCCTGGCGGCATGCCTAAGCTCTGCGCA
AGGTCACTCATTCTTTCTTTCATAGCCACAACACTCTTTGCGTGTGCGTCCTTGTAAGCC
TCCGTAACCAACAGTGAAAGTTTCTCAAAGCCTAACTCCATAGCTGCCTCAGTTATATCA
GTACGGATTGGTTGCTGGTTACCTGATAACGTAACCTTAACAAGCTCGCCTTCACAATAA
CCATCAAACTCTGCGGCAGCTAACTCTTTTTGAACACGAACAGCCTCAACTTGAACAACC
ATTTGAGCTTTCTTGACAGTCTCATACATATTCTGCATATTACCAAAGATTCCTCCTGCC
TTTGACTGTCCATCCTCAGTATTATTATTATCTTTGTTGTTTCCACCTCCGAACAACCCA
TTCACACGAAGAGACCTATTGGGCTTGTGCTGGTTTGGCCATGTCGCGTTCTTGTTCTGT
CTACTACTTCCTCTCTGGGAATTAAAGCCATGTTGGGAGAAGGGAGATAGTAAAGACTTT
GTGAAATCGGTGGTTGAAGCCATGGTTCT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2GE66TF 631 0 0
TGATAAATAGAGAAAAAAAGCTCACAC*TGAAACTTGAATGTGATAAACAAACAAGCAAA
AACAGTTTCTTTACTTCATTCCTTCGCTGAGGCCTGGCGGCATGCCTAAGCTCTGCGCAA
GGTCACTCATTCTTTCTTTCATAGCCACAACACTCTTTGCGTGTGCGTCCTTGTAAGCCT
CGGTGACCAACAGTGAAAGTTTCTCAGAGCCTAACTCCATAGCTGCCTCAGTTATATCAG
TACGGATTGGTTGCTGGTTACCTGATAACGTAACCTTAACAAGCTCGCCTTCACAATAAC
CATCAAACTCTGCGGCAGCTAACTCTTTTTGGACACGAACAGCCTCAACTTGAACAACCA
TTTGAGCTTTCTTGACAGTCTCATACATATTCTGCATATTACCAAAGATTCCTCCTGCCT
TTGACTGTCCATCCTCAGTATTATTATTATCTTTGTTGTTTCCACCTCCGAACAACCCAT
TCACACGAAGAGACCTATTGGGCTTGTGCCGGTTTGGCCATGCCGCGTTCTTGTTCTGTC
TACTACTTCCTCTCTGGGAATTAAAGCCATGTTGGGAGAAGGGAGATAGTAAAGACTTTG
TGAAATCGGTGGTTGAAGCCATGGTTCT
TCT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2A587TF 702 0 0
C
TGATAAATAGAGAAAAAAAGCTCACACGTGAAACTTGAATGTGACAAACAAAC***CAAA
AACAGTTTCTTTACTTCATTCCTTCGCTGAGGCCTGGCGGCATGCCTAAGCTCTGCGCAA
GGTCACTCATTCTTTCTTTCATAGCCACAACACTCTTTGCGTGTGCGTCCTTGTAAGCCT
CCGTAACCAACAGTGAAAGTTTCTCAGAGCCTAACTCCATAGCTGCCTCAGTTATATCAG
TACGGATTGGTTGCTGGTTACCTGATAACGTAACCTTAACAAGCTCGCCTTCACAATAAC
CATCAAACTCTGCGGCAGCTAACTCTTTTTGAACACGAACAGCCTCAACTTGAACAACCA
TTTGAGCTTTCTTGACAGTCTCATACATATTCTGCATATTACCAAAGATTCCTCCTGCCT
TTGACTGTCCATCCTCAGTATTATTATTATCTTTGTTGTTTCCACCTCCGAACAACCCAT
TCACACGAAGAGACCTATTGGGCTTGTGCTGGTTTGGCCATGTCGCGTTCTTGTTCTGTC
TACTACTTCCTCTCTGGGAATTAAAGCCATGTTGGGAGAAGGGAGATAGTAAAGACTTTG
TGAAATCGGTGGTTGAAGCCATGGTTCTTCTACCGGAGGAGGAGATAAGAGAGCAGAGAG
AAAGGGCGAAGATAAAACGGAGGAGAGAGGAAATGCTTCCC

QA 2 702 2 702
DS 



AS 1 4

CO CL2076Contig1 785 4 7 U
GGGCCTTAATAATAACTGTGATCCCTTTCTCTTCTCTGACGAAACATTCGGCTGAAGCAA
TGTCGTCTTTTGCGCTAACGTTACACATTCCTTCGGTGGTGTCGGTGCGGAACACTAAAC
TACTCGGGCGGAGTGTCAGCGACTACGGCCGGAATTGGTCGGGACTTCCTAAATCGAGGA
GCAGACGAGGGTATGGTTTTTGTTGTAAGGCGGAGCTGTCGGAGCTAGCTCCAGCCGTCT
CTGCTGGTTATGGTGTTCTTCTTCTAGGAGGCGGTCTCTTCGCCTATAGCAAATCTGGAA
GCAAGGGTTCTCTCTTTGGGGGTTTGACTGGCTCTGTCCTTATGGCTTCTGCCTACTTCC
TTACCAAGTCTCCTGAGACAAGAGTCCTCGGCGATACCATAGGACTTGGCTCTGCCTTCC
TCTTCTCTTCTGTCTTTGGGTTTCGTTTGGCGTCTTCCCGGAAACCAGTCCCATCAGGCC
CGCTACTACTCCTCTCTATCGCCATGTTGTCCTTCTTTGTAATGGCGTATATGCACGACA
GTCTACCTGTGGCTGTGTCAGTACCAGTACCAGTACCAGATGCGTCACCTCTACCTTAGC
CTTGATGAGAGCATGGGCTTTTTAACCAGATAGGAAAGTTCTCAAATGTTTGAATTCAAA
GAACTGTTTTGCTTTACACCCAATAAGTAGCGCAAAGCTTTGTGAGAATGGATAATGTTT
GTAGCTTTTTGAACTTGAATGATCTATGCTGCTGAATAATAGAATTTTGAATATTTATGT
GACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2GW41TF U 1
AF RR2CH07JQ C 36
AF RR2CH07TF U 36
AF RR2GW41JQ C 28
BS 1 542 RR2GW41TF
BS 543 543 RR2CH07TF
BS 544 653 RR2GW41TF
BS 654 654 RR2CH07TF
BS 655 727 RR2GW41TF
BS 728 757 RR2CH07TF
BS 758 785 RR2GW41JQ

RD RR2GW41TF 727 0 0
GGGCCTTAATAATAACTGTGATCCCTTTCTCTTCTCTGACGAAACATTCGGCTGAAGCAA
TGTCGTCTTTTGCGCTAACGTTACACATTCCTTCGGTGGTGTCGGTGCGGAACACTAAAC
TACTCGGGCGGAGTGTCAGCGACTACGGCCGGAATTGGTCGGGACTTCCTAAATCGAGGA
GCAGACGAGGGTATGGTTTTTGTTGTAAGGCGGAGCTGTCGGAGCTAGCTCCAGCCGTCT
CTGCTGGTTATGGTGTTCTTCTTCTAGGAGGCGGTCTCTTCGCCTATAGCAAATCTGGAA
GCAAGGGTTCTCTCTTTGGGGGTTTGACTGGCTCTGTCCTTATGGCTTCTGCCTACTTCC
TTACCAAGTCTCCTGAGACAAGAGTCCTCGGCGATACCATAGGACTTGGCTCTGCCTTCC
TCTTCTCTTCTGTCTTTGGGTTTCGTTTGGCGTCTTCCCGGAAACCAGTCCCATCAGGCC
CGCTACTACTCCTCTCTATCGCCATGTTGTCCTTCTTTGTAATGGCGTATATGCACGACA
GTTTACCTGTGGCTGTGTCAGTACCAGTACCAGTACCAGATGCGTCACCTCTACCTTAGC
CTTGATGAGAGCATGGGCTTTTTAACCAGATAGGAAAGTTCTCAAATGTTTGA*TTCAAA
GAACTGTTTTGCTTTACACCCAATAAGTAGCGCAAAGCTTTGTGAGAATGGATAATGTTT
GTAGCTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2CH07JQ 723 0 0
GG
GACGAAACATTCGGCTGAAGCAATGTCGTCTTTTGCGCTAACGTTACACATTCCTTCGGT
GGTGTCGGTGCGGAACACTAAACTACTCGGGCGGAGTGTCAGCGACTACGGCCGGAATTG
GTCGGGACTTCCTAAATCGAGGAGCAGACGAGGGTATGGTTTTTGTTGTAAGGCGGAGCT
GTCGGAGCTAGCTCCAGCCGTCTCTGCTGGTTATGGTGTTCTTCTTCTAGGAGGCGGTCT
CTTCGCCTATAGCAAATCTGGAAGCAAGGGTTCTCTCTTTGGGGGTTTGACTGGCTCTGT
CCTTATGGCTTCTGCCTACTTCCTTACCAAGTCTCCTGAGACAAGAGTCCTCGGCGATAC
CATAGGACTTGGCTCTGCCTTCCTCTTCTCTTCTGTCTTTGGGTTTCGTTTGGCGTCTTC
CCGGAAACCAGTCCCATCAGGCCCGCTACTACTCCTCTCTATCGCCATGTTGTCCTTCTT
TGTAATGGCGTATATGCACGACAGTCTACCTGTGGCTGTGTCAGTACCAGTACCAGTACC
AGATGCGTTACCTCTACCTTAGCCTTGATGAGAGCATGGGCTTTTTAACCAGATAGGAAA
GTTCTCAAATGTTTGAATTCAAAGAACTGTTTTGCTTTACACCCAATAAGTAGCGCAAAG
CTTTGTGAGAATGGATAATGTTTGTAGCTTTTTGAACTTGAATGATCTATGCTGCTGAAT
G

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR2CH07TF 729 0 0
GG
GACGAAACATTCGGCTGAAGCAATGTCGTCTTTTGCGCTAACGTTACACATTCCTTCGGT
GGTGTCGGTGCGGAACACTAAACTACTCGGGCGGAGTGTCAGCGACTACGGCCGGAATTG
GTCGGGACTTCCTAAATCGAGGAGCAGACGAGGGTATGGTTTTTGTTGTAAGGCGGAGCT
GTCGGAGCTAGCTCCAGCCGTCTCTGCTGGTTATGGTGTTCTTCTTCTAGGAGGCGGTCT
CTTCGCCTATAGCAAATCTGGAAGCAAGGGTTCTCTCTTTGGGGGTTTGACTGGCTCTGT
CCTTATGGCTTCTGCCTACTTCCTTACCAAGTCTCCTGAGACAAGAGTCCTCGGCGATAC
CATAGGACTTGGCTCTGCCTTCCTCTTCTCTTCTGTCTTTGGGTTTCGTTTGGCGTCTTC
CCGGAAACCAGTCCCATCAGGCCCGCTACTACTCCTCTCTATCGCCATGTTGTCCTTCTT
TGTAATGGCGTATATGCACGACAGTCTACCTGTGGCTGTGTCAGTACCAGTACCAGTACC
AGATGCGTTACCTCTACCTTAGCCTTGATGAGAGCATGGGCTTTTTAACCAGATAGGAAA
GTTCTCAAATGTTTGAATTCAAAGAACTGTTTTGCTTTACACCCAATAAGTAGCGCAAAG
CTTTGTGAGAATGGATAATGTTTGTAGCTTTTTGAACTTGAATGATCTATGCTGCTGAAT
GAAAAAA

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR2GW41JQ 758 0 0
TCTCTTCTCTGACGAAACATTCGGCTGAAGCAATGTCGTCTTTTGCGCTAACGTTACACA
TTCCTTCGGTGGTGTCGGTGCGGAACACTAAACTACTCGGGCGGAGTGTCAGCGACTACG
GCCGGAATTGGTCGGGACTTCCTAAATCGAGGAGCAGACGAGGGTATGGTTTTTGTTGTA
AGGCGGAGCTGTCGGAGCTAGCTCCAGCCGTCTCTGCTGGTTATGGTGTTCTTCTTCTAG
GAGGCGGTCTCTTCGCCTATAGCAAATCTGGAAGCAAGGGTTCTCTCTTTGGGGGTTTGA
CTGGCTCTGTCCTTATGGCTTCTGCCTACTTCCTTACCAAGTCTCCTGAGACAAGAGTCC
TCGGCGATACCATAGGACTTGGCTCTGCCTTCCTCTTCTCTTCTGTCTTTGGGTTTCGTT
TGGCGTCTTCCCGGAAACCAGTCCCATCAGGCCCGCTACTACTCCTCTCTATCGCCATGT
TGTCCTTCTTTGTAATGGCGTATATGCACGACAGTTTACCTGTGGCTGTGTCAGTACCAG
TACCAGTACCAGATGCGTCACCTCTACCTTAGCCTTGATGAGAGCATGGGCTTTTTAACC
AGATAGGAAAGTTCTCAAATGTTTGAATTCAAAGAACTGTTTTGCTTTACACCCAATAAG
TAGCGCAAAGCTTTGTGAGAATGGATAATGTTTGTAGCTTTTTGAACTTGAATGATCTAT
GCTGCTGAATAATAGAATTTTGAATATTTATGTGACCG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 2 4

CO CL2077Contig1 812 2 21 U
AGAGCAAGCGATTAATCAAATCCAGCTTATTAAGTTTTTATTATTATACTGGAACCATAA
ACTAAAGAGGTGCTTCAACCAGTAACAAAACACGATCCAGAAACGACATGGATTTGGTAA
TATCATCAGAGCAGACCCTTCTCCTGAAAACCGCGGATACAATCATCAAACATCTCAGGC
AATGACTTGAACGATGCAAATCCTAACTCATGTATCTTCCTTGTATCCATACTATGTGGA
TTGTTGTCCCCTTCTTTGTCACTGCACTTGTTCTCAAGTGGGTAATTAGGATACTTGTTT
CTTAGCAACTCAATGATCTCAGACCAATGAGCAACCGAACTCGAACACACGATTCTCCCT
GATGCTTTAGGCTCTTCCATGGCTAACACGTGTGCACCAACTACATCGTCTATGTGCACA
AACCCGACCGTAAAATTCCGGTACTCTCCAGCAAGACCTTTGACAACGGAGAGGATATAA
AGAAGAGTGCTTGTTGGTTTAGGTCCAAGCAATGGACCAACCACAAAGGAAGGATTCACA
ACCACTAAGTTCAACCCTTTCTCTTCAGCTATCCTCCAAGCCTCTTTCTCACCAAGAGTC
TTTGCATACGCGTACCAAAGGTTGAAGCGTTTGCAATATTCAGTGTCACTCCAATGCGAC
TCGTTGAGCGGAGAGGCTTTGGTGGCGTCGAAGCGGTACCGTATGGAGGAGCAAGAAGAT
GTAAGAACGATCCTTTTGAGAGTGGTTTTGGACTTGGCACAAGAGTTCATCACATTGGTT
GTACCCTTTATGATAGGATCGACCAGTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC46JQ U 48
AF RR2A372JQ U 1
BS 1 72 RR2A372JQ
BS 73 73 RR2DC46JQ
BS 74 80 RR2A372JQ
BS 81 81 RR2DC46JQ
BS 82 119 RR2A372JQ
BS 120 120 RR2DC46JQ
BS 121 149 RR2A372JQ
BS 150 150 RR2DC46JQ
BS 151 151 RR2A372JQ
BS 152 152 RR2DC46JQ
BS 153 396 RR2A372JQ
BS 397 397 RR2DC46JQ
BS 398 466 RR2A372JQ
BS 467 467 RR2DC46JQ
BS 468 608 RR2A372JQ
BS 609 609 RR2DC46JQ
BS 610 635 RR2A372JQ
BS 636 636 RR2DC46JQ
BS 637 647 RR2A372JQ
BS 648 648 RR2DC46JQ
BS 649 812 RR2A372JQ

RD RR2DC46JQ 641 0 0
ACTGGAACCATAAACTAAAGATGTGCTTCAACCAGTAACAAAACACGATCCAGAAACGAC
ATGGATTTGGTAATATCATCAGAGCAGTCCCTTCTCCTGAAAACCGCGGATACAATCATC
AAACATCTCAGGCAATGACTTGAACGATGCAAATCCTAACTCATGTATCTTCCTTGTATC
CATACTATGTGGATTGTTGTCCCCTTCTTTGTCACTGCACTTGTTCTCAAGTGGGTAATT
AGGATACTTGTTTCTTAGCAACTCAATGATCTCAGACCAATGAGCAACCGAACTCGAACA
TATGATTCTCCCTGATGCTTTAGGCTCTTCCATGGCTAACACGTGTGCACCAACTACATC
GTCTATGTGGACAAACCCGACCGTAAAATTCCGGTACTCTCCAGCAAGACCTTTGACAAC
GGAGAGGATATAAAGAAGAGTGCTTGTTGGTTTAGGTCCAAGCAATGGACCAACCACAAA
GGAAGGATTCACTACCACTAAGTTCAACCCTTTCTCTTCGGCTATCCTCCAAGCCTCTTT
CTCACCTAGAGTCTTTGCATACGCGTACCAAAGGTTGAAGCGTTTGCAATATTCAGTGTC
ACTCCAATGCGACTCGTTGAGCGGAGAGGCTTTGGTGGCGT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2A372JQ 812 0 0
AGAGCAAGCGATTAATCAAATCCAGCTTATTAAGTTTTTATTATTATACTGGAACCATAA
ACTAAAGAGGTGTTTCAACCGGTAACAAAACACGATCCAGAAACGACATGGATTTGGTAC
TATCATCAGAGCAGACCCTTCTCCTGAAAGCTGCGGATACAATCATCAAACATCTCAGGC
AATGACTTGAACGATGCAAATCCTAACTCATGTATCTTCCTTGTATCCATACTATGTGGA
TTGTTGTCCCCTTCTTTGTCACTGCACTTGTTCTCAAGTGGGTAATTAGGATACTTGTTT
CTTAGCAACTCAATGATCTCAGACCAATGAGCAACCGAACTCGAACACACGATTCTCCCT
GATGCTTTAGGCTCTTCCATGGCTAACACGTGTGCAGCAACTACATCGTCTATGTGCACA
AACCCGACCGTAAAATTCCGGTACTCTCCAGCAAGACCTTTGACAATGGAGAGGATATAA
AGAAGAGTGCTTGTTGGTTTAGGTCCAAGCAATGGACCAACCACAAAGGAAGGATTCACA
ACCACTAAGTTCAACCCTTTCTCTTCAGCTATCCTCCAAGCCTCTTTCTCACCAAGAGTC
TTTGCATATGCGTACCAAAGGTTGAAGCGTTTGCAGTATTCAGTGTCGCTCCAATGCGAC
TCGTTGAGCGGAGAGGCTTTGGTGGCGTCGAAGCGGTACCGTATGGAGGAGCAAGAAGAT
GTAAGAACGATCCTTTTGAGAGTGGTTTTGGACTTGGCACAAGAGTTCATCACATTGGTT
GTACCCTTTATGATAGGATCGACCAGTGTTTC

QA 1 812 1 812
DS 



CO CL2077Contig2 907 2 20 U
GGCAGCAAGAGAGAGAGAGAGAACACGAATGGAGTGAGTCAACTACTCACCTTGTACTTC
CACAAGATCTCACTTCATTAAAACCGTAATCCAAACAAACTCAAATCCACGGCAGAGACA
GAGAAAGAGATGTCAGAGTATCTGGTCACTGGAGGAACCGGTTTCATCGCTTCTTACATC
ATCAAATCACTCCTCGAACTCGGACACACCGTTCGAACCACTGTCCGAAACCCTCAGGAT
GAAGAGAAAGTAGGTTTCCTATGGGAACTGAGAGGAGCGAAAGAGAGGCTGAAGATGTTC
AAAGCTGATCTAACGGTTGATGGAAGCTTTGACGAAGCAGTAAACGGCGTAGATGGAGTC
TTCCACACGGCTTCTCCTGTTATCGTTCCACAGGATCACAACATTCAAGAAACACTGGTC
GATCCTATCATAAAGGGTACAACCAACGTGATGAACTCTTGTGCCAAGTCCAAAACCACT
CTCAAAAGGATCGTTCTCACATCTTCTTGCTCCTCCATACGGTACCGCTTCGACGCCACC
AAAGCCTCTCCGCTCAACGAGTCGCATTGGAGCGACACTGAATACTGCAAACGCTTCAAC
CTTTGGTACGCATATGCAAAGACTCTAGGTGAGAAAGAGGCTTGGAGGATAGCCGAAGAG
AAAGGGTTGAACTTAGTGGTAGTGAATCCTTCCTTTGTGGTTGGTCCATTGCTTGGACCT
AAACCAACAAGCACTCTTCTTTATATCCTCTCCGTTGTCAAAGGTCTTGCTGGAGAGTAC
CGGATTTTACGGTCGGGTTTGTCCACATAGACGATGTAGTGGTGCACACGTGTAGCCATG
GAAGAGCCTAAAGCATCAGGAGATCATATGTTCGAGTTCGGTGCTCATTGGTCTGAAATC
ATTGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A372TF U 1
AF RR2DC46TF U 107
BS 1 158 RR2A372TF
BS 159 159 RR2DC46TF
BS 160 309 RR2A372TF
BS 310 310 RR2DC46TF
BS 311 381 RR2A372TF
BS 382 382 RR2DC46TF
BS 383 401 RR2A372TF
BS 402 402 RR2DC46TF
BS 403 446 RR2A372TF
BS 447 447 RR2DC46TF
BS 448 497 RR2A372TF
BS 498 498 RR2DC46TF
BS 499 626 RR2A372TF
BS 627 627 RR2DC46TF
BS 628 653 RR2A372TF
BS 654 654 RR2DC46TF
BS 655 680 RR2A372TF
BS 681 681 RR2DC46TF
BS 682 721 RR2A372TF
BS 722 907 RR2DC46TF

RD RR2A372TF 721 0 0
GGCAGCAAGAGAGAGAGAGAGAACACGAATGGAGTGAGTCAACTACTCACCTTGTACTTC
CACAAGATCTCACTTCATTAAAACCGTAATCCAAACAAACTCAAATCCACGGCAGAGACA
GAGAAAGAGATGTCAGAGTATCTGGTCACTGGAGGAACTGGTTTCATCGCTTCTTACATC
ATCAAATCACTCCTCGAACTCGGACACACCGTTCGAACCACTGTCCGAAACCCTCAGGAT
GAAGAGAAAGTAGGTTTCCTATGGGAACTGAGAGGAGCGAAAGAGAGGCTGAAGATGTTC
AAAGCTGATTTAACGGTTGATGGAAGCTTTGACGAAGCAGTAAACGGCGTAGATGGAGTC
TTCCACACGGCTTCTCCTGTTCTCGTTCCACAGGATCACAAGATTCAAGAAACACTGGTC
GATCCTATCATAAAGGGTACAACCAATGTGATGAACTCTTGTGCCAAGTCCAAAACCACT
CTCAAAAGGATCGTTCTTACATCTTCTTGCTCCTCCATACGGTACCGCTTCGACGCCACC
AAAGCCTCTCCGCTCAACGAGTCGCATTGGAGCGACACTGAATACTGCAAACGCTTCAAC
CTTTGGTACGCATATGCAAAGACTCTTGGTGAGAAAGAGGCTTGGAGGATAGCTGAAGAG
AAAGGGTTGAACTTAGTGGTTGTGAATCCTTCCTTTGTGGTTGGTCCATTGCTTGGACCT
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2DC46TF 801 0 0
GG
ACGGCAGAGGCAGAGAAAGAGATGTCAGAGTATCTGGTCACTGGAGGAACCGGTTTCATC
GCTTCTTACATCATCAAATCACTCCTCGAACTCGGACACACCGTTCGAACCACTGTCCGA
AACCCTCAGGATGAAGAGAAAGTAGGTTTCCTATGGGAACTGAGAGGAGCGAAAGAGAGG
CTGAAGATGTTCAAAGCTGATCTAACGGTTGATGGAAGCTTTGACGAAGCAGTAAACGGC
GTAGATGGAGTCTTCCACACGGCTTCTCCTGTTATTGTTCCACAGGATCACAACATTCAA
GAAACATTGGTTGATCCTATCATAAAGGGTACAACCAACGTGATGAACTCTTGTGCCAAG
TCCAAAACCACTCTCAAAAGGATCGTTCTCACATCTTCTTGCTCCTCCATACGGTACCGT
TTCGACGCCACCAAAGCCTCTCCGCTCAACGAGTCGCATTGGAGTGACACTGAATATTGC
AAACGCTTCAACCTTTGGTACGCGTATGCAAAGACTCTAGGTGAGAAAGAGGCTTGGAGG
ATAGCCGAAGAGAAAGGGTTGAACTTAGTGGTAGTGAATCCTTCCTTTGTGGTTGGTCCA
TTGCTTGGACCTAAACCAACAAGCACTCTTCTTTATATCCTCTCCGTTGTCAAAGGTCTT
GCTGGAGAGTACCGGATTTTACGGTCGGGTTTGTCCACATAGACGATGTAGTGGTGCACA
CGTGTAGCCATGGAAGAGCCTAAAGCATCAGGAGATCATATGTTCGAGTTCGGTGCTCAT
TGGTCTGAAATCATTGAGT

QA 3 801 3 801
DS 



AS 1 4

CO CL2078Contig1 618 4 7 U
GGAAACAAAAACAATAAAAATATGTTTCGTTTTACAATAATCCTGATTCTTTTAAGCATA
TACACACAACAAGCGATAGGATCGTCGTTCTTTCTCTATAACCAGGTGCGCCATGGAATC
CTAATGAAAGTCCATTGCAAATCAAAAGACAACGATATGGGATGGCACGTGAGGAAATAC
GGAGGAACTTACAGTATTGATTTCAAGGATCATATACTTGATAAAACACTTTATTGGTGC
AACATCTGGTCAGGTCCTAATTTCAGTCTTAATGCGTCTATCGTCACGTACGAAAGTAAG
CTGTATGAACACAAAAACAATTGGATAAGATGGTCTATAAGGGGAGATGGTATTTATGAA
TCTATCAATGGTGCAACGCCTTGGAAATTCAAGTATCATTGGTATGGAAAAACTTTTAAA
TAAGGTCATCATGATCTCTTTTATGTTCATATATATATGTGTGTGTTTTGTATGTTTCTC
AACTAATTGTGTATTAATGTGACATTGGTATTATGATTCATTCGACGGAATATCTAAGAG
CCAACCCTGATAAATGTATATACTCACAGAAGGGTTGATTTACCTGTCAACTAGTATTTT
TAATAAATTATTTTTGAC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EX36JQ C 1
AF RR2EX36TF U 1
AF RR2CS59JQ C 2
AF RR2CS59TF U 2
BS 1 1 RR2EX36JQ
BS 2 192 RR2EX36TF
BS 193 193 RR2CS59TF
BS 194 540 RR2EX36TF
BS 541 541 RR2CS59TF
BS 542 577 RR2EX36TF
BS 578 618 RR2CS59TF

RD RR2EX36JQ 602 0 0
GGAAACAAAAACAATAAAAATATGTTTCGTTTTACAATAATCCTGATTCTTTTAAGCATA
TACACACAACAAGCGATAGGATCGTCGTTCTTTCTCTATAACCAGGTGCGCCATGGAATC
CTAATGAAAGTCCATTGCAAATCAAAAGACAACGATATGGGATGGCACGTGAGGAAATAC
GGAGGAACTTACGGTATTGATTTCAAGGATCATATACTTGATAAAACACTTTATTGGTGC
AACATCTGGTCAGGTCCTAATTTCAGTCTTAATGCGTCTATCGTCACGTACGAAAGTAAG
CTGTATGAACACAAAAACAATTGGATAAGATGGTCTATAAGGGGAGATGGTATTTATGAA
TCTATCAATGGTGCAACGCCTTGGAAATTCAAGTATCATTGGTATGGAAAAACTTTTAAA
TAAGGTCATCATGATCTCTTTTATGTTCATATATATATGTGTGTGTTTTGTATGTTTCTC
AACTAATTGTGTATTAATGTGACATTGGTATTATGATTCATTCGACGGAATATTTAAGAG
TCAACCCTGATAAATGTATATACTCACAGAAGGGTTGATTTACCTGTCAACTA
TTTTTAATA

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2EX36TF 577 0 0
G
GAAACAAAAACAATAAAAATATGTTTCGTTTTACAATAATCCTGATTCTTTTAAGCATAT
ACACACAACAAGCGATAGGATCGTCGTTCTTTCTCTATAACCAGGTGCGCCATGGAATCC
TAATGAAAGTCCATTGCAAATCAAAAGACAACGATATGGGATGGCACGTGAGGAAATACG
GAGGAACTTACGGTATTGATTTCAAGGATCATATACTTGATAAAACACTTTATTGGTGCA
ACATCTGGTCAGGTCCTAATTTCAGTCTTAATGCGTCTATCGTCACGTACGAAAGTAAGC
TGTATGAACACAAAAACAATTGGATAAGATGGTCTATAAGGGGAGATGGTATTTATGAAT
CTATCAATGGTGCAACGCCTTGGAAATTCAAGTATCATTGGTATGGAAAAACTTTTAAAT
AAGGTCATCATGATCTCTTTTATGTTCATATATATATGTGTGTGTTTTGTATGTTTCTCA
ACTAATTGTGTATTAATGTGACATTGGTATTATGATTCATTCGACGGAATATCTAAGAGT
CAACCCTGATAAATGTATATACTCACAGAAGGGTTG

QA 2 577 2 577
DS 

RD RR2CS59JQ 617 0 0
GAAACAAAAACAATAAAAATATGTTTCGTTTTACAATAATCCTGATTCTTTTAAGCATAT
ACACACAACAAGCGATAGGATCGTCGTTCTTTCTCTATAACCAGGTGCGCCATGGAATCC
TAATGAAAGTCCATTGCAAATCAAAAGACAACGATATGGGATGGCACGTGAGGAAATACG
GAGGAACTTACAGTATTGATTTCAAGGATCATATACTTGATAAAGCACTTTATTGGTGCA
ACATCTGGTCAGGTCCTAATTTCAGTCTTAATGCGTCTATCGTCACGTACGAAAGTAAGC
TGTATGAACACAAAAACAATTGGATAAGATGGTCTATAAGGGGAGATGGTATTTATGAAT
CTATCAATGGTGCAACGCCTTGGAAATTCAAGTATCATTGGTATGGAAAAACTTTTAAAT
AAGGTCATCATGATCTCTTTTATGTTCATATATATATGTGTGTGTTTTGTATGTTTCTCA
ACTAATTGTGTATTAATGTGACATTGGTATTATGATTCATTCGACGGAATATCTAAGAGC
CAACCCTGATAAATGTATATACTCACAGAAGGGTTGATTTACCTGTCAACTAGTATTTTT
AATAAATTATTTTTGAC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2CS59TF 617 0 0
GAAACAAAAACAATAAAAATATGTTTCGTTTTACAATAATCCTGATTCTTTTAAGCATAT
ACACACAACAAGCGATAGGATCGTCGTTCTTTCTCTATAACCAGGTGCGCCATGGAATCC
TAATGAAAGTCCATTGCAAATCAAAAGACAACGATATGGGATGGCACGTGAGGAAATACG
GAGGAACTTACAGTATTGATTTCAAGGATCATATACTTGATAAAGCACTTTATTGGTGCA
ACATCTGGTCAGGTCCTAATTTCAGTCTTAATGCGTCTATCGTCACGTACGAAAGTAAGC
TGTATGAACACAAAAACAATTGGATAAGATGGTCTATAAGGGGAGATGGTATTTATGAAT
CTATCAATGGTGCAACGCCTTGGAAATTCAAGTATCATTGGTATGGAAAAACTTTTAAAT
AAGGTCATCATGATCTCTTTTATGTTCATATATATATGTGTGTGTTTTGTATGTTTCTCA
ACTAATTGTGTATTAATGTGACATTGGTATTATGATTCATTCGACGGAATATCTAAGAGC
CAACCCTGATAAATGTATATACTCACAGAAGGGTTGATTTACCTGTCAACTAGTATTTTT
AATAAATTATTTTTGAC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 3

CO CL2079Contig1 1171 3 24 U
GGGGTTCTTACTATATTCAGAGAGGCATGCCTGGCTCTACTCCTCCTCCTCCTCCTCAGA
CACAACAGCCGTTTCACGGATCACAAGGGTTTCACCATTTCTCCAACCCCAACTCTCCTT
TCGTCTCAAACCCAAACCTGAACCAAGTAGGCGGCGGCTCCACTGCATTCGTGTCTCCTC
CTTTACCAATTGAGTCTTCTCCGGCTGACTCTTCAGCGGCTGCTCCTCCTCCTCCTCCTC
AGTCTGGTGAGAAGAGGAAGAGAGGACGGCCTAGGAAATACGGACAAGACGGTCCTGTTT
CCTTGGCATTGTCTCCCTCAGCCTCCATGTCCCCAAACTCTAACAAACGTGGCCGTGGTA
GACCTCCTGGCTCAGGTAAGAAGCGAAGAGTTGCTTCCACTGGTGAATTGATGTCTTCAT
CGTCTGGGATGAGCTTCACTCCTCATGTAATTGTAGTTTCCATTGGTGAAGACATTGCGT
CAAAGGTTATGTCTTTTACGCAGCAAGGTCCAAGAGCGATTTGTGTCTTATCCACTACCG
GTGCAGTCTCTACCGCAACTATTCTTCAGCCATCACCTTCTCATGGAGCTATTAAATACG
AGGGTCGTTTCGAGCTCTTATCTCTCTCAATTTCTTACATGAACGCAACTGAAAATGACT
ACTCAAACTGCACTGGAAACCTATCCGTCTCACTCGCTAGCCCTGATGGTCGTGTCATTG
GGGGTGGAATTGTTGGGCCTTTGATAGCAGCAAGCCCTGTTCAGGTTATCGTTGGGAGCT
TCCTTTGGGCGGTTCCAAAAGGAAAGATTAAAAAACGAGATGAAGCTTCTGAAGATGTCC
AAGACACTGATGGTTTGGAGAACAACGACAACACTGCACCAACATCACCTCCTCCTCCTG
TTCCTCAACAAAGCCAGAACCTTGTTCAGACTCCTGTAGGGATGTGGTCAACCGGTTCAA
GATCGATGGATATGCATCACGCCCATATGGACATTGATCTAATGCGTGGATGATGATGAT
TCATATGTGTAGTAGATAAGCATTGAAATCTAGGAGATGAAGAAAGCTAACCTCTCTTTA
AGAAAAAAAATGTCTTTTGGTTTATGTTTAGGACAAGAAAAGACTTGTAGTGATTTTTCA
GAACTCATGTGTGTTTAATCGATTTGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK82TF U 1
AF RR2AH78TF U 21
AF RR2AH78JQ C 368
BS 1 188 RR2DK82TF
BS 189 189 RR2AH78TF
BS 190 202 RR2DK82TF
BS 203 203 RR2AH78TF
BS 204 376 RR2DK82TF
BS 377 377 RR2AH78TF
BS 378 384 RR2DK82TF
BS 385 385 RR2AH78TF
BS 386 461 RR2DK82TF
BS 462 462 RR2AH78TF
BS 463 641 RR2DK82TF
BS 642 642 RR2AH78TF
BS 643 659 RR2DK82TF
BS 660 660 RR2AH78TF
BS 661 668 RR2DK82TF
BS 669 669 RR2AH78TF
BS 670 672 RR2DK82TF
BS 673 673 RR2AH78TF
BS 674 721 RR2DK82TF
BS 722 722 RR2AH78TF
BS 723 723 RR2DK82TF
BS 724 724 RR2AH78TF
BS 725 760 RR2DK82TF
BS 761 1171 RR2AH78JQ

RD RR2DK82TF 760 0 0
GGGGTTCTTACTATATTCAGAGAGGCATGCCTGGCTCTACTCCTCCTCCTCCTCCTCAGA
CACAACAGCCGTTTCACGGATCACAAGGGTTTCACCATTTCTCCAACCCCAACTCTCCTT
TCGTCTCAAACCCAAACCTGAACCAAGTAGGCGGCGGCTCCACTGCATTCGTGTCTCCTC
CTTTACCAGTTGAGTCTTCTCCTGCTGACTCTTCAGCGGCTGCTCCTCCTCCTCCTCCTC
AGTCTGGTGAGAAGAGGAAGAGAGGACGGCCTAGGAAATACGGACAAGACGGTCCTGTTT
CCTTGGCATTGTCTCCCTCAGCCTCCATGTCCCCAAACTCTAACAAACGTGGCCGTGGTA
GACCTCCTGGCTCAGGCAAGAAGCAAAGAGTTGCTTCCACTGGTGAATTGATGTCTTCAT
CGTCTGGGATGAGCTTCACTCCTCATGTAATTGTAGTTTCCGTTGGTGAAGACATTGCGT
CAAAGGTTATGTCTTTTACGCAGCAAGGTCCAAGAGCGATTTGTGTCTTATCCACTACCG
GTGCAGTCTCTACCGCAACTATTCTTCAGCCATCACCTTCTCATGGAGCTATTAAATACG
AGGGTCGTTTCGAGCTCTTATCTCTCTCAATTTCTTACATGGACGCAACTGAAAATGACA
ACTCAAACCGCAGTGGAAACCTATCCGTCTCACTCGCTAGCCCTGATGGTCGTGTCATTG
GCG*TGGAATTGTTGGGCCTTTGATAGCAGCAAGCCCTGT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2AH78TF 740 0 0
G
GAGGCATGCCTGGCTCTACTCCTCCTCCTCCTCCTCAGACACAACAGCCGTTTCACGGAT
CACAAGGGTTTCACCATTTCTCCAACCCCAACTCTCCTTTCGTCTCAAACCCAAACCTGA
ACCAAGTAGGCGGCGGCTCCACTGCATTCGTGTCTCCTTCTTTACCAATTGAGTCTTCTC
CGGCTGACTCTTCAGCGGCTGCTCCTCCTCCTC******AGTCTGGTGAGAAGAGGAAGA
GAGGACGGCCTAGGAAATACGGACAAGACGGTCCTGTTTCCTTGGCATTGTCTCCTTCAG
CCTCCATGTCCCCAAGCTCTAACAAACGTGGCCGTGGTAGACCTCCTGGCTCAGGTAAGA
AGCGAAGAGTTGCTTCCACTGGTGAATTGATGTCTTCATCGTCTGGGATGAGCTTCACTC
CTCATGTAATTGTAGTTTCCATTGGTGAAGACATTGCGTCAAAGGTTATGTCTTTTACGC
AGCAAGGTCCAAGAGCGATTTGTGTCTTATCCACTACCGGTGCAGTCTCTACCGCAACTA
TTCTTCAGCCATCACCTTCTCATGGAGCTATTAAATACGAGGGTCGTTTCGAGCTCTTAT
CTCTCTCAATTTCTTACATGAACGCAACTGAAAATGACTACTCAAACTGCACTGGAAACC
TATCCGTCTCACTCGCTAGCCCTGATGGTCGTGTCATTGGGGGTGGAATTGTTGGGCCTT
TGATAGCAGCAAGCCCTGT

QA 2 740 2 740
DS 

RD RR2AH78JQ 804 0 0
TGGCTCAGGTAAGAAGCGAAGAGTTGCTTCCACTGGTGAATTGATGTCTTCATCGTCTGG
GATGAGCTTCACTCCTCATGTAATTGTAGTTTCCATTGGTGAAGACATTGCGTCAAAGGT
TATGTCTTTTACGCAGCAAGGTCCAAGAGCGATTTGTGTCTTATCCACTACCGGTGCAGT
CTCTACCGCAACTATTCTTCAGCCATCACCTTCTCATGGAGCTATTAAATACGAGGGTCG
TTTCGAGCTCTTATCTCTCTCAATTTCTTACATGAACGCAACTGAAAATGACTACTCAAA
CTGCACTGGAAACCTATCCGTCTCACTCGCTAGCCCTGATGGTCGTGTCATTGGGGGTGG
AATTGTTGGGCCTTTGATAGCAGCAAGCCCTGTTCAGGTTATCGTTGGGAGCTTCCTTTG
GGCGGTTCCAAAAGGAAAGATTAAAAAACGAGATGAAGCTTCTGAAGATGTCCAAGACAC
TGATGGTTTGGAGAACAACGACAACACTGCACCAACATCACCTCCTCCTCCTGTTCCTCA
ACAAAGCCAGAACCTTGTTCAGACTCCTGTAGGGATGTGGTCAACCGGTTCAAGATCGAT
GGATATGCATCACGCCCATATGGACATTGATCTAATGCGTGGATGATGATGATTCATATG
TGTAGTAGATAAGCATTGAAATCTAGGAGATGAAGAAAGCTAACCTCTCTTTAAGAAAAA
AAATGTCTTTTGGTTTATGTTTAGGACAAGAAAAGACTTGTAGTGATTTTTCAGAACTCA
TGTGTGTTTAATCGATTTGGTTCC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 3

CO CL2080Contig1 1380 3 15 U
GGATCATCAAACAAAAAAGAAAACACATTTGTCCGAGTTTCGTTCGAGAGCTGCGCCTTC
AAGAAATCGCAAGAGAACTTCTTCATTTTTCTTCGTTCTTTCTACGATTCGATTCCAAAG
TATCTCTATCAGGTCAACGTTCTTCTTTGTGGCATTGAGGGGGTAGAGAGAGATGTCTGA
TCATCTGAGTTCATGTACGGACCGTCTCGTAACATCTGATCACCTTAATTCAGACAGAGG
AGGATCTATTGAATCTTGGGGAGAAAGTTCCAGAGCTCAAGGCACCACGATCATTTCTAC
TTCTAATACTAAATCTACGGATGACAAAACTGTGCAAGTAGAAGAACTTGATGTAGAAGA
CGAAGAGGAACCGCTTATCCAGTCAGCTGAATGGCGTATATGCCAAGACGAGGATTCTGT
TAAGAACCTCGAGTCTCCCTGTTCTTGTAGCGGCAGCTTGAAGTATGCACATCGGAAGTG
TGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACACTATCTGTGAAATATGCCACAAGTCTTA
TCAACCTGGCTACACCGCTCCACCACCTCCTCCCGCTGAAGAAACTGTTATCGATATCGG
TGAAGATTGGGCCAACGGTGTTCCCTTAGACTTCAACGACCCTCGCATTTTTGCAATGGC
GGCTGCAGAACGCCGTTTCTTTGATCCGGACTACGACGAGTATGCTGATTCTAACTCTAG
CGGTGCTGCTTTCCTTCGCTCCGCTGCTCTTATCTTAATGGCGCTTTTATTGCTGCGACA
CGCCATGAACCTTTCAAACAACAACAACTCAGACGACGAAGAAGATGATCCATCAGCTTT
CTTCTTTCTTTTCATGCTCCGTGCTGCCGCTTTTCTCCTCCCTTGTTACATAATGGCTTG
GGCTATCAGTATCTTACAACGCCGAAGACAAAGACAGGAAGCGGCAGCTCTGGCCGCTGC
AGAAGTTGCGTTTATGCTACACAACGGGGCTGGCGGTGGAGGACAACGCAGAGGAGGATT
GCACTTTGCTGTAGCACCCGAGCTGATACCGAATCCACAACACCAGCCCGAAGCCTCACC
ACAATGATTATATATATCCCTGAGTACCGGTTAAAGAATCCAAAGTATCATCATTATCCA
CGACTTTGGTCTCTTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCACTGTTTGTAGTAGC
TGTTTGTTGTTTATGGGTTTATTCCTATGAGCAAAAACACAGAAACTGAGTAAAACAAAA
TACGGGAAGTCTCTCTGTCTTATGTTCTTACAGACGAGAAAATAAAGCTTCTTGATATGC
TTATGTGTATATATACTTTATACTTGAGAAATTACCAACGATCTTAAGAAGATATTCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H077TF U 1
AF RR2GJ25JQB C 476
AF RR2A686TF U 990
BS 1 507 RR2H077TF
BS 508 508 RR2GJ25JQB
BS 509 543 RR2H077TF
BS 544 544 RR2GJ25JQB
BS 545 566 RR2H077TF
BS 567 567 RR2GJ25JQB
BS 568 579 RR2H077TF
BS 580 580 RR2GJ25JQB
BS 581 615 RR2H077TF
BS 616 616 RR2GJ25JQB
BS 617 709 RR2H077TF
BS 710 710 RR2GJ25JQB
BS 711 727 RR2H077TF
BS 728 991 RR2GJ25JQB
BS 992 1380 RR2A686TF

RD RR2H077TF 727 0 0
GGATCATCAAACAAAAAAGAAAACACATTTGTCCGAGTTTCGTTCGAGAGCTGCGCCTTC
AAGAAATCGCAAGAGAACTTCTTCATTTTTCTTCGTTCTTTCTACGATTCGATTCCAAAG
TATCTCTATCAGGTCAACGTTCTTCTTTGTGGCATTGAGGGGGTAGAGAGAGATGTCTGA
TCATCTGAGTTCATGTACGGACCGTCTCGTAACATCTGATCACCTTAATTCAGACAGAGG
AGGATCTATTGAATCTTGGGGAGAAAGTTCCAGAGCTCAAGGCACCACGATCATTTCTAC
TTCTAATACTAAATCTACGGATGACAAAACTGTGCAAGTAGAAGAACTTGATGTAGAAGA
CGAAGAGGAACCGCTTATCCAGTCAGCTGAATGGCGTATATGCCAAGACGAGGATTCTGT
TAAGAACCTCGAGTCTCCCTGTTCTTGTAGCGGCAGCTTGAAGTATGCACATCGGAAGTG
TGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGTGACACTATCTGTGAAATATGCCACAAGTCTTA
TCAGCCTGGCTACACCGCTCCACCACTTCCTCCCGCTGATGAAACTGTTATCGATATCGG
TGAAGATTGGGCCAATGGTGTTCCCTTAGACTTCAACGACCCTCGCATTTTTGCAATGGC
GGCTGCAGAACGCCGTTTCTTTGATCCGGACTACGACGAGTATGCTGAT*CTAACTCTAG
CGGTGCT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2GJ25JQB 844 0 0
AAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACACTATCTGTGAAATATGCCACAAG
TCTTATCAACCTGGCTACACCGCTCCACCACCTCCTCCCGCTGAAGATACTGTTATCGAT
ATCGGTGAAGATTGGGCTAACGGTGTTCCCTTAGACTTCAACGACCCTCGCATTTTTGCA
ATGGCGGCTGCAGAACGCCGTTTCTTTGATCCGGACTACGACGAGTATGCTGATTCTAAC
TCTAGCGGTGCTGCTTTCCTTCGCTCCGCTGCTCTTATCTTAATGGCGCTTTTATTGCTG
CGACACGCCATGAACCTTTCAAACAACAACAACTCAGACGACGAAGAAGATGATCCATCA
GCTTTCTTCTTTCTTTTCATGCTCCGTGCTGCCGCTTTTCTCCTCCCTTGTTACATAATG
GCTTGGGCTATCAGTATCTTACAACGCCGAAGACAAAGACAGGAAGCGGCAGCTCTGGCC
GCTGCAGAAGTTGCGTTTATGCTACACAACGGGGCTGGCGGTGGAGGACAACGCAGAGGA
GGATTGCACTTTGCTGTAGCACCCGAGCTGATACCGAATCCACAACACCAGCCCGAAGCC
TCACCACAATGATTATATATATCCCTGAGTACCGGTTAAAGAATCCAAAGTATCATCATT
ATCCACGACTTTGGTCTCTTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCACTGTTTGTA
GTAGCTGTTTGTTGTTTATGGGTTTATTCCTATGAGCAAAAACACAGAAACTGAGTAAAA
CAAAATACGGGAAGTCTCTCTGTCTTATGTTCTTACAGACGAGAAAATAAAGCTTCTTGA
TATG

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR2A686TF 391 0 0
GG
GGCGGTGGAGGACAACGCAGAGGAGGATTGCACTTTGCTGTAGCACCCGAGCTGATACCG
AATCCACAACACCAGCCCGAAGCCTCACCACAATGATTATATATATCCCTGAGTACCGGT
TAAAGAATCCAAAGTATCATCATTATCCACGACTTTGGTCTCTTCTCTCTTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTTTCACTGTTTGTAGTAGCTGTTTGTTGTTTATGGGTTTATTCCTATGAG
CAAAAACACAGAAACTGAGTAAAACAAAATACGGGAAGTCTCTCTGTCTTATGTTCTTAC
AGACGAGAAAATAAAGCTTCTTGATATGCTTATGTGTATATATACTTTATACTTGAGAAA
TTACCAACGATCTTAAGAAGATATTCAAC

QA 3 391 3 391
DS 



AS 1 2

CO CL2081Contig1 731 2 2 U
GGATCTCTATCCCTCTCTCTCTTTCTTATCGGCTTCCTATACCCTTCGTCGAAGGAAGAA
CCCTAGAAATCGAATTAACAAGATGAATAGGGAGAAGTTAATGAAGATGGCTAACACTGT
CCGCACTGGCGGAAAGGGAACAGTAAGAAGGAAGAAGAAGGCTGTTCACAAGACGAACAC
CACCGATGACAAGAAGCTACAGAGCACTCTTAAGAGAGTTGGAGTCAACTCCATTCCCGG
TATTGAGGAAGTTAACATCTTTAAGGATGATGTTGTCATTCAGTTCATTAACCCTAAGGT
TCAAGCCTCTGTTGCTGCTAACACATGGGCTGTGAGCGGTACACCACAGACCAAAAAACT
GCAAGACATACTTCCTCAGATTATCAGCCAACTTGGGACTGATAACTTGGAAAACCTGAA
GAAGCTAGCAGAGCAATTCCAGAAACAATCACCAGGTGGAGCTGATATTCCAGCAACTAT
CCAAGAAGAGGATGATGATGATGTCCCTGATCTTGTCGTGGGAGAGACGTTCGAGACTCC
AGCTACTGAAGAAGCTGCTCAGCCCAAAGCTGCTACTTCTTAAGAGCTCACTCCACCTTT
TTTGAGCACCTTTCAGATTCTTGTTTTCTCTTAATCTTTTTTTGCGAACAGAAAGACGAT
GTTTTTGTTTATTATCACTTGTCCAGACACCAATGATCCTTTTATTAAGGTTAGATCGGT
TTCTACGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK44TF U 1
AF RR2EK44JQ C 52
BS 1 705 RR2EK44TF
BS 706 731 RR2EK44JQ

RD RR2EK44TF 705 0 0
GGATCTCTATCCCTCTCTCTCTTTCTTATCGGCTTCCTATACCCTTCGTCGAAGGAAGAA
CCCTAGAAATCGAATTAACAAGATGAATAGGGAGAAGTTAATGAAGATGGCTAACACTGT
CCGCACTGGCGGAAAGGGAACAGTAAGAAGGAAGAAGAAGGCTGTTCACAAGACGAACAC
CACCGATGACAAGAAGCTACAGAGCACTCTTAAGAGAGTTGGAGTCAACTCCATTCCCGG
TATTGAGGAAGTTAACATCTTTAAGGATGATGTTGTCATTCAGTTCATTAACCCTAAGGT
TCAAGCCTCTGTTGCTGCTAACACATGGGCTGTGAGCGGTACACCACAGACCAAAAAACT
GCAAGACATACTTCCTCAGATTATCAGCCAACTTGGGACTGATAACTTGGAAAACCTGAA
GAAGCTAGCAGAGCAATTCCAGAAACAATCACCAGGTGGAGCTGATATTCCAGCAACTAT
CCAAGAAGAGGATGATGATGATGTCCCTGATCTTGTCGTGGGAGAGACGTTCGAGACTCC
AGCTACTGAAGAAGCTGCTCAGCCCAAAGCTGCTACTTCTTAAGAGCTCACTCCACCTTT
TTTGAGCACCTTTCAGATTCTTGTTTTCTCTTAATCTTTTTTTGCGAACAGAAAGACGAT
GTTTTTGTTTATTATCACTTGTCCAGACACCAATGATCCTTTTAT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2EK44JQ 680 0 0
A
AGGAAGAACCCTAGAAATCGAATTAACAAGATGAATAGGGAGAAGTTAATGAAGATGGCT
AACACTGTCCGCACTGGCGGAAAGGGAACAGTAAGAAGGAAGAAGAAGGCTGTTCACAAG
ACGAACACCACCGATGACAAGAAGCTACAGAGCACTCTTAAGAGAGTTGGAGTCAACTCC
ATTCCCGGTATTGAGGAAGTTAACATCTTTAAGGATGATGTTGTCATTCAGTTCATTAAC
CCTAAGGTTCAAGCCTCTGTTGCTGCTAACACATGGGCTGTGAGCGGTACACCACAGACC
AAAAAACTGCAAGACATACTTCCTCAGATTATCAGCCAACTTGGGACTGATAACTTGGAA
AACCTGAAGAAGCTAGCAGAGCAATTCCAGAAACAATCACCAGGTGGAGCTGATATTCCA
GCAACTATCCAAGAAGAGGATGATGATGATGTCCCTGATCTTGTCGTGGGAGAGACGTTC
GAGACTCCAGCTACTGAAGAAGCTGCTCAGCCCAAAGCTGCTACTTCTTAAGAGCTCACT
CCACCTTTTTTGAGCACCTTTCAGATTCTTGTTTTCTCTTAATCTTTTTTTGCGAACAGA
AAGACGATGTTTTTGTTTATTATCACTTGTCCAGACACCAATGATCCTTTTATTAAGGTT
AGATCGGTTTCTACGAAAA

QA 2 680 2 680
DS 



AS 1 4

CO CL2082Contig1 748 4 7 U
GTCTCGCTCGTGATTCCTCTCCTCATGCTGTGGCCACTGATTGTGTTTGCCAAGAAGCAT
CCCGTCAACCTCGTAATCTTAATGCTCTTCACTCTCACCATCTCTTTCGCCGTGGGACTT
TGCTGCTCTTTTTCTAAAGGGAGGATTGTCCTGGAGGCATCGATTCTCACAGCTACAATG
GTCCTGGGGTTAACGATATACACTTTCTGGGCAGTAAGGAGAGGCCATGACTTCTCTTTC
CTTGAACCTTTCCTCTTCGGAGCCCTCCTTATCATCCTTGTCTTCTCTATCATACAGGTA
CTCCATCCTCTGGGGAAGCTATCGTCGATGATATTCAGCTGTTTCGCTTCAGTCGTGTTC
TGCGGTTACATTGTCTACGACACGAATCAGCTGATCAAGAAACTCAACTACGACGAGTAT
ATCCATGCTGCTATTTGTCTTTATCTCGACGTCATCAATCTCTTCCTCCATATCCTTGGT
TTTGCCATCCACACCTAGTGACTTGATGCATCATGCACACATCCTATCTGTTAATCTCCT
CGTCATGGGTTACTTAGAACTAGTTCAAGACACAAACTTTAAAAGGCTGGGTTATGCTAT
TTGCTCTAAATAATTTTGCTCTAAATAATTGTTAGAAAATGTAAAGATTATGGTAACTCT
TAAATCTCAAGACTTTCGGTTTAAGAGGTTCCTTGTTTTGCAAGGAATCTCTAGCAGAAA
AGCTACATGTGATTTGGAATATTCGATA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GD39TF U 1
AF RR2GO36TF U 1
AF RR2GD39JQ C 312
AF RR2GO36JQ C 449
BS 1 585 RR2GD39TF
BS 586 586 RR2GO36TF
BS 587 659 RR2GD39TF
BS 660 704 RR2GO36TF
BS 705 705 RR2GD39JQ
BS 706 729 RR2GO36TF
BS 730 748 RR2GD39JQ

RD RR2GD39TF 659 0 0
GTCTCGCTCGTGATTCCTCTCCTCATGCTGTGGCCACTGATTGTGTTTGCCAAGAAGCAT
CCCGTCAACCTCGTAATCTTAATGCTCTTCACTCTCACCATCTCTTTCGCCGTGGGACTT
TGCTGCTCTTTTTCTAAAGGGAGGATTGTCCTGGAGGCATCGATTCTCACAGCTACAATG
GTCCTGGGGTTAACGATATACACTTTCTGGGCAGTAAGGAGAGGCCATGACTTCTCTTTC
CTTGAACCTTTCCTCTTCGGAGCCCTCCTTATCATCCTTGTCTTCTCTATCATACAGGTA
CTCCATCCTCTGGGGAAGCTATCGTCGATGATATTCAGCTGTTTCGCTTCAGTCGTGTTC
TGCGGTTACATTGTCTACGACACGAATCAGCTGATCAAGAAACTCAACTACGACGAGTAT
ATCCATGCTGCTATTTGTCTTTATCTCGACGTCATCAATCTCTTCCTCCATATCCTTGGT
TTTGCCATCCACACCTAGTGACTTGATGCATCATGCACACATCCTATCTGTTAATCTCCT
CGTCATGGGTTACTTAGAACTAGTTCAAGACACAAACTTTAAAAG*CTGGGTTATGCTAT
TTGCTCTAAATAATTTTGCTCTAAATAATTGTTAGAAAATGTAAAGATTATGGTAACTC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2GO36TF 729 0 0
GTCTCGCTCGTGATTCCTCTCCTCATGCTGTGGCCACTGATTGTGTTTGCCAAGAAGCAT
CCCGTCAACCTCGTAATCTTAATGCTCTTCACTCTCACCATCTCTTTCGCCGTGGGACTT
TGCTGCTCTTTTTCTAAAGGGAGGATTGTCCTGGAGGCATCGATTCTCACAGCTACAATG
GTCCTGGGGTTAACGATATACACTTTCTGGGCAGTAAGGAGAGGCCATGACTTCTCTTTC
CTTGAACCTTTCCTCTTCGGAGCCCTCCTTATCATCCTTGTCTTCTCTATCATACAGGTA
CTCCATCCTCTGGGGAAGCTATCGTCGATGATATTCAGCTGTTTCGCTTCAGTCGTGTTC
TGCGGTTACATTGTCTACGACACGAATCAGCTGATCAAGAAACTCAACTACGACGAGTAT
ATCCATGCTGCTATTTGTCTTTATCTCGACGTCATCAATCTCTTCCTCCATATCCTTGGT
TTTGCCATCCACACCTAGTGACTTGATGCATCATGCACACATCCTATCTGTTAATCTCCT
CGTCATGGGTTACTTAGAACTAGTTCAAGACACAAACTTTAAAAGGCTGGGTTATGCTAT
TTGCTCTAAATAATTTTGCTCTAAATAATTGTTAGAAAATGTAAAGATTATGGTAACTCT
TAAATCTCAAGACTTTCGGTTTAAGAGGTTCCTTGTTTTGCAAG*AATCTCTAGCAGAAA
AGCTACATG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2GD39JQ 437 0 0
GGGGAAGCTATCGTCGATGATATTCAGCTGTTTCGCTTCAGTCGTGTTCTGCGGTTACAT
TGTTTACGACACGAATCAGCTGATCAAGAAACTCAATTACGACGAGTATATCCATGCTGC
TATTTGTCTTTATCTGGACGTCATCAATTTCTTCCTCCATATCCTTGGTTTTGCCATCCA
CACCTAGTGACTTGATGCATCATGCACACATCCTATCTGTTAATCTCCTCGTCATGGGTT
ACTTAGAACTAGTTCAAGACACAAACTTTAAAAGGCTGGGTTATGCTATTTGCTCTAAAT
AATTTTGCTCTAAATAATTGTTAGAAAATGTAAAGATTATGGTAACTCTTAAATCTCAAG
ACTTTCGGTTTAAGAGGTTCCTTGTTTTGCAAGGAATCTCTAGCAGAAAAGCTACATGTG
ATTTGGAATATTCGATA

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR2GO36JQ 300 0 0
ACGTCATCAATTTCTTCCTCCATATCCTTGGTTTTGCCATCCACACCTAGTGACTTGATG
CATCATGCACACATCCTATCTGTTAATCTCCTCGTCATGGGTTACTTAGAACTAGTTCAA
GACACAAACTTTAAAAGGCTGGGTTATGCTATTTGCTCTAAATAATTTTGCTCTAAATAA
TTGTTAGAAAATGTAAAGATTATGGTAACTCTTAAATCTCAAGACTTTCGGTTTAAGAGG
TTCCTTGTTTTGCAAGGAATCTCTAGCAGAAAAGCTACATGTGATTTGGAATATTCGATA

QA 1 300 1 300
DS 



AS 1 4

CO CL2083Contig1 1575 4 11 U
AAAACTGGATATGTTTTAGTGAAAATTGCCACAAGAAACAATATACACTATGCAGCATAA
AAGATTCATCTACTGTTGAAAAATAAAAGATTCATCGACTGTTCGAAGTACACAATTAAA
ACACTCGGTCATTGTAGATGCTTGTCTTGTTGATAATGGATTACATACCGACAAAGATTT
GGCCCTTGGATTCTTTCTTCTTTAAATGAATTTCTCATATTGTGTGGAACATTTTATAAG
GTTTTGCAACTAAACTCGTATAGGTAAGCTCTTGTGGCCGCTTACTAGTTTGAGGGGTCA
TCAATCATTATCATGATCTTTCCTGTGGACATCCAGCTGCCATGTGCCATCATCCATTTG
AATCATCCCTTTGTTTGCAAGACACCTCCAGGTACTGGGCACTAAGAACTCGTCTTTCAG
AGCATCTAAACCTTTGTTGACCAATGAAATATCCCGACCAATCACCAGCTTAAACAGCCC
GGCTTTGTCTTGCATCCCTGCCAAGCCGTGCAGGTATATCTCCAAGTTATGGTAGTTCCT
AAAGTTCAAAGACCGTTTCAGGTAAGTCGAGTTCAATGTATTGATCTGGAGCTCCTGCCC
TACTTCTGCATACAGTAAGAGTGGATAATGTGGTGCTACATCCGGAACATTGACTACTCT
TAGGATGTTAAGCTGTTTGAGTGAGTCGACGGTGTTTACGAAGTCTTGGTCCCCAATTCG
TGGACACCCGTACGCAAAAACTGTGATGGGAACTTGTTTTCTCTCAAGACCTGCACTGAT
TATATGTTTCTTGCCATTGACAAGATCTGCAGCTGCAAGAGTTGACATTACTCCGCCCAA
GCTATGGCCTGTGAAAGTGATGCTCACTTCTTCGTTCTTGTAAACTTCTAGCAGTCTCTT
GAGCTCTCCTTGTACCTGTTCTCGTGCGCTAGTAGTGTCATAAGGCGACTTAGCATCAGA
AGAGGTGTAGACATCGAGCCAGCCACTTCCAATACGAGGCACGACCTTGCGGTCGGTTAC
AGGGAACACTTTGACACCCGACTCTAGTGGAAAATCGAAGTCGTTAGCCCATTCATACGG
CTGAAGAGTTCCTCTCCAAGCTACAACAATGTCTCTCCTCCCTAACAGCGCCTTGCCCTC
GTCTGTAGCTACGGCCACGTAACCAATCCAGTTAGTCTGCACGCGCGATGCTTCCTTTGA
CAAAGACTTGACGATGAAGCAGATAGGTAGATTTAAAGAAGCTGTTGCGTAGATGTACTT
GGTCACATTGTACCTGAAAGGGTTGGCTTTAAGGAAGCCAGTTCGAGCAAAGATTTGGTT
CTTAGAGTAATAACAATCACCGGCGTATAAGGACTTACGGTCCCAGTTAAAGGCGTCGTA
ACCAACCTGAGCCATCTCACCGTAGTGAATGAGGTAGCGACGAAGATCAGGGTCGAGTGG
ATCAAGGAGGCCTTTCCATTTTTTTTGGCCGCTTAGCACCTTCCACCTCCTGGCTATCCC
TCCCAACATGCTTGCCTTTAGTTAGTTTTTTCCCCTGCTTTTTTTGGATGGTAACATTGC
TCCTTGTGTGAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM81JQ U 1
AF RR2FV66JQ U 134
AF RR2FV66TF C 853
AF RR2GM81TF C 920
BS 1 523 RR2GM81JQ
BS 524 524 RR2FV66JQ
BS 525 806 RR2GM81JQ
BS 807 940 RR2FV66JQ
BS 941 1271 RR2FV66TF
BS 1272 1272 RR2GM81TF
BS 1273 1338 RR2FV66TF
BS 1339 1339 RR2GM81TF
BS 1340 1465 RR2FV66TF
BS 1466 1466 RR2GM81TF
BS 1467 1575 RR2FV66TF

RD RR2GM81JQ 806 0 0
AAAACTGGATATGTTTTAGTGAAAATTGCCACAAGAAACAATATACACTATGCAGCATAA
AAGATTCATCTACTGTTGAAAAATAAAAGATTCATCGACTGTTCGAAGTACACAATTAAA
ACACTCGGTCATTGTAGATGCTTGTCTTGTTGATAATGGATTACATACCGACAAAGATTT
GGCCCTTGGATTCTTTCTTCTTTAAATGAATTTCTCATATTGTGTGGAACATTTTATAAG
GTTTTGCAACTAAACTCGTATAGGTAAGCTCTTGTGGCCGCTTACTAGTTTGAGGGGTCA
TCAATCATTATCATGATCTTTCCTGTGGACATCCAGCTGCCATGTGCCATCATCCATTTG
AATCATCCCTTTGTTTGCAAGACACCTCCAGGTACTGGGCACTAAGAACTCGTCTTTCAG
AGCATCTAAACCTTTGTTGACCAATGAAATATCCCGACCAATCACCAGCTTAAACAGCCC
GGCTTTGTCTTGCATCCCTGCCAAGCCGTGCAGGTATATCTCCGAGTTATGGTAGTTCCT
AAAGTTCAAAGACCGTTTCAGGTAAGTCGAGTTCAATGTATTGATCTGGAGCTCCTGCCC
TACTTCTGCATACAGTAAGAGTGGATAATGTGGTGCTACATCCGGAACATTGACTACTCT
TAGGATGTTAAGCTGTTTGAGTGAGTCGACGGTGTTTACGAAGTCTTGGTCCCCAATTCG
TGGACACCCGTACGCAAAAACTGTGATGGGAACTTGTTTTCTCTCAAGACCTGCACTGAT
TATATGTTTCTTGCCATTGACAAGAT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2FV66JQ 807 0 0
GTAGATGCTTGTCTTGTTGATAATGGATTACATACCGACAAAGATTTGGCCCTTGGATTC
TTTCTTCTTTAAATGAATTTCTCATATTGTGTGGAACATTTTATAAGGTTTTGCAACTAA
ACTCGTATAGGTAAGCTCTTGTGGCCGCTTACTAGTTTGAGGGGTCATCACTCATTATCA
TGATCTTTCCTGTGGACATCCAGCTGCCATGTGCCATCATCCATTTGAATCATCCCTTTG
TTTGCAAGACACCTCCAGGTACTGGGCACTAAGAACTCGTCTTTCAGAGCATCTAAACCT
TTGTTGACCAATGAAATATCCCGACCAATCACCAGCTTAAACAGCCCGGCTTTGTCTTGC
ATCCCTGCCAAGCCGTGCAGGTATATCTCCAAGTTATGGTAGTTCCTAAAGTTCAGAGAC
CGTTTCAGGTAAGTCGAGTTCAATGTATTGATCTGGAGCTCCTGCCCTACTTCTGCATAC
AGTAAGAGTGGATAATGTGGTGCTACATCCGGAACATTGACTACTCTTAGGATGTTAAGC
TGTTTGAGTGAGTCGACGGTGTTTACGAAGTCTTGGTCCCCAATTCGTGGACACCCGTAC
GCAAAAACTGTGATGGGAACTTGTTTTCTCTCAAGACCTGCACTGATTATATGTTTCTTG
CCATTGACAAGATCTGCAGCTGCAAGAGTTGACATTACTCCGCCCAAGCTATGGCCTGTG
AAAGTGATGCTCACTTCTTCGTTCTTGTAAACTTCTAGCAGTCTCTTGAGCTCTCCTTGT
ACCTGTTCTCGTGCGCTAGTAGTGTCA

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2FV66TF 723 0 0
GAAAGTGATGCTCACTTCTTCGTTCTTGTAAACTTCTAGCAGTCTCTTGAGCTCTCCTTG
TACCTGTTCTCGTGCGCTAGTAGTGTCATAAGGCGACTTAGCATCAGAAGAGGTGTAGAC
ATCGAGCCAGCCACTTCCAATACGAGGCACGACCTTGCGGTCGGTTACAGGGAACACTTT
GACACCCGACTCTAGTGGAAAATCGAAGTCGTTAGCCCATTCATACGGCTGAAGAGTTCC
TCTCCAAGCTACAACAATGTCTCTCCTCCCTAACAGCGCCTTGCCCTCGTCTGTAGCTAC
GGCCACGTAACCAATCCAGTTAGTCTGCACGCGCGATGCTTCCTTTGACAAAGACTTGAC
GATGAAGCAGATAGGTAGATTTAAAGAAGCTGTTGCGTAGATGTACTTGGTCACATTGTG
CCTGAAAGGGTTGGCTTTAAGGAAGCCAGTTCGAGCAAAGATTTGGTTCTTAGAGTAATA
ACAATCGCCGGCGTATAAGGACTTACGGTCCCAGTTAAAGGCGTCGTAACCAACCTGAGC
CATCTCACCGTAGTGAATGAGGTAGCGACGAAGATCAGGGTCGAGTGGATCAAGGAGGCC
TTTCCATTTTTTT*GGCCGCTTAGCACCTTCCACCTCCTGGCTATCCCTCCCAACATGCT
TGCCTTTAGTTAGTTTTTTCCCCTGCTTTTTTTGGATGGTAACATTGCTCCTTGTGTGAA
GCC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2GM81TF 652 0 0
TCTCGTGCGCTAGTAGTGTCATAAGGCGACTTAGCATCAGAAGAGGTGTAGACATCGAGC
CAGCCACTTCCAATACGAGGCACGACTTTGCGGTCGGTTACAGGGAACACTTTGACACCC
GACTCTAGTGGAAAATCGAAGTCGTTAGCCCATTCATACGGCTGAAGAGTTCCTCTCCAA
GCTACAACAATGTCTCTCCTCCCTAACAGCGCCTTGCCCTCGTCTGTAGCTACGGCCACG
TAACCAATCCAGTTAGTCTGCACGCGCGATGCTTCCTTTGACAAAGACTTGACGATGAAG
CAGATAGGTAGATTTAAAGAAGCTGTTGCGTAGATGTACTTGGTCACATTGTACCTGAAA
GGGTTGGCTTTAAGGAAGCCAGTTCGAGCAAAGATTTGGTTCTTAGAGTAATAACAATCA
CCGGCGTATAAGGACTTACGGTCCCAGTTAAAGGCGTCGTAACCAACCTGAGCCATCTCA
CCGTAGTGAATGAGGTAGCGACGAAGATCAGGGTCGAGTGGATCAAGGAGGCCTTTCCAT
TTTTTTTGGCCGCTTAGCACCTTCCACCTCCTGGCTATCCCTCCCAACATGCTTGCCTTT
AGTTAGTTTTTTCCCCTGCTTTTTTTGGATGGTAACATTGCTCCTTGTGT
CC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 4

CO CL2084Contig1 842 4 7 U
CGTACTTTCAAATCTTAAACAATGTGTTTGTGTTAAACATAGATTGTATAGCTCACAAGT
GGTAGAAACTTAACAGAATCCAACATTTGCATGTTTCAAAACAAACAATCAGAAGAAGAA
CTCACGAACCTAACGCTTACAGTTCTTAGTTTATTCTCTTTACTAGTAGTTCATACAATG
ACTGCAACTTTACGACTGAGAATCATCA*ACAACTCATCACGAGTTACTAACGAGTTCGG
ACTTCTCTCTGCTGATGCTGTTCTCTAGTGTTGGCAATGAAGTTCCAGATATAAAGGCCT
TGAAGAGCGCAAGAGCCTCCTTCGGTCTGTGCAAAGGAACTTCATGGCCTGCACCTCTCA
TAGTCACAAAGTTTAGACCATCATACTCCTGAGTCCACCCTCCCACCTGTCCGTCTATGT
ACCAAGGACCATAAGGACTCACTGGACGAAGTTTTAGTGCATCTATGCTGTACCGAGTTG
ATGTGACTGGTACAACAGCATCTGCGTCTCCACTGAACACCCATATACGTAGCCCTGAAG
CTATAAGCTCGTGATAAATGTTCAGAACCGAGGAAGGAGAGTCCTTCCAGTTATCACCCA
CAACATCACTGCAAGTATGCCATTTGGATGGTGCAAGTCCTGGTGGGACATGGAGAGCTT
CTTGAACCTCTGGGAGATTAAAATACACTTTAGAGTGTTTCATAGTGCAAGGATCATACT
GTTCACTCACACGGAGGCCACCTACTGCTCTTTTCTTCTTCAGCAACATTTTTGCCTGGG
AAGAGTTCGCAGTACAGGCTGGGGTGAAGACGCTGTATTGGTCTATCTCACCTATTTCCA
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2F054JQ U 189
AF RR2GM13JQ U 1
AF RR2BW92JQ U 30
AF RR2F054TF C 92
BS 1 208 RR2GM13JQ
BS 209 209 RR2F054JQ
BS 210 607 RR2GM13JQ
BS 608 608 RR2BW92JQ
BS 609 666 RR2GM13JQ
BS 667 719 RR2BW92JQ
BS 720 842 RR2F054TF

RD RR2F054JQ 365 0 0
TTTACGACTGAAAATCATCA*ACAACTCATCACGAGTTACTAACGAGTTCGGACTTCTCT
CTGCTGATGCTGTTCTCTAGTGTTGGCAATGAAGTTCCAGATATAAAGGCCTTGAAGAGC
GCAAGAGCCTCCTTCGGTCTGTGCAAAGGAACTTCATGGCCTGCACCTCTCATAGTCACA
AAGTTTAGACCATCATACTCCTGAGTCCACCCTCCCACCTGTCCGTCTATGTACCAAGGA
CCATAAGGACTCACTGGACGAAGTTTTAGTGCATCTATGCTGTACCGAGTTGATGTGACT
GGTACAACAGCATCTGCGTCTCCACTGAACACCCATATACGTAGCCCTGAAGCTATAAGC
T
AGTG

QA 1 361 1 361
DS 

RD RR2GM13JQ 666 0 0
CGTACTTTCAAATCTTAAACAATGTGTTTGTGTTAAACATAGATTGTATAGCTCACAAGT
GGTAGAAACTTAACAGAATCCAACATTTGCATGTTTCAAAACAAACAATCAGAAGAAGAA
CTCACGAACCTAACGCTTACAGTTCTTAGTTTATTCTCTTTACTAGTAGTTCATACAATG
ACTGCAACTTTACGACTGAGAATCATCACACAACTCATCACGAGTTACTAACGAGTTCGG
ACTTCTCTCTGCTGATGCTGTTCTCTAGTGTTGGCAATGAAGTTCCAGATATAAAGGCCT
TGAAGAGCGCAAGAGCCTCCTTCGGTCTGTGCAAAGGAACTTCATGGCCTGCACCTCTCA
TAGTCACAAAGTTTAGACCATCATACTCCTGAGTCCACCCTCCCACCTGTCCGTCTATGT
ACCAAGGACCATAAGGACTCACTGGACGAAGTTTTAGTGCATCTATGCTGTACCGAGTTG
ATGTGACTGGTACAACAGCATCTGCGTCTCCACTGAACACCCATATACGTAGCCCTGAAG
CTATAAGCTCGTGATAAATGTTCAGAACCGAGGAAGGAGAGTCCTTCCAGTTATCACCCA
CAACATCGCTGCAAGTATGCCATTTGGATGGTGCAAGTCCTGGTGGGACATGGAGAGCTT
CTTGAA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2BW92JQ 690 0 0
GTGTTAAACATAGATTGTATAGCTCACAAGTGGTAGAAACTTAACAGAATCCAACATTTG
CATGTTTCAAAACAAACAATCAGAAGAAGAACTCACGAACCTAACGCTTACAGTTCTTAG
TTTATTCTCTTTACTAGTAGTTCATACAATGACTGCAACTTTACGACTGAGAATCATCAC
ACAACTCATCACGAGTTACTAACGAGTTCGGACTTCTCTCTGCTGATGCTGTTCTCTAGT
GTTGGCAATGAAGTTCCAGATATAAAGGCCTTGAAGAGCGCAAGAGCCTCCTTCGGTCTG
TGCAAAGGAACTTCATGGCCTGCACCTCTCATAGTCACAAAGTTTAGACCATCATACTCC
TGAGTCCACCCTCCCACCTGTCCGTCTATGTACCAAGGACCATAAGGACTCACTGGACGA
AGTTTTAGTGCATCTATGCTGTACCGAGTTGATGTGACTGGTACAACAGCATCTGCGTCT
CCACTGAACACCCATATACGTAGCCCTGAAGCTATAAGCTCGTGATAAATGTTCAGAACC
GAGGAAGGAGAGTCCTTCCAGTTATCACCCACAACATCACTGCAAGTATGCCATTTGGAT
GGTGCAAGTCCTGGTGGGACATGGAGAGCTTCTTGAACCTCTGGGAGATTAAAATACACT
TTAGAGTGTTTCATAGTGCAAGGATCATAC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2F054TF 751 0 0
TGTTTCAAAACAAACAATCAGAAGAAGAACTCACGA*CCTAACGCTTACAGTTCTTAGTT
TATTCTCTTTACTAGTAGTTCATACAATGACTGCAACTTTACGACTGAGAATCATCA*AC
AACTCATCACGAGTTACTAACGAGTTCGGACTTCTCTCTGCTGATGCTGTTCTCTAGTGT
TGGCAATGAAGTTCCAGATATAAAGGCCTTGAAGAGCGCAAGAGCCTCCTTCGGTCTGTG
CAAAGGAACTTCATGGCCTGCACCTCTCATAGTCACAAAGTTTAGACCATCATACTCCTG
AGTCCACCCTCCCACCTGTCCGTCTATGTACCAAGGACCATAAGGACTCACTGGACGAAG
TTTTAGTGCATCTATGCTGTACCGAGTTGATGTGACTGGTACAACAGCATCTGCGTCTCC
ACTGAACACCCATATACGTAGCCCTGAAGCTATAAGCTAGTGATAAATGTTCAGAACCGA
GGAAGGAGAGTCCTTCCAGTTATCACCCACAACATCACTGCAAGTATGCCATTTGGATGG
TGCAAGTCCTGGTGGGACATGGAGAGCTTCTTGAACCTCTGGGAGATTAAAATACACTTT
AGAGTGTTTCATAGTGCAAGGATCATACTGTTCACTCACACGGAGGCCACCTACTGCTCT
TTTCTTCTTCAGCAACATTTTTGCCTGGGAAGAGTTCGCAGTACAGGCTGGGGTGAAGAC
GCTGTATTGGTCTATCTCACCTATTTCCATC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 2 4

CO CL2085Contig1 751 2 4 U
GACGTGGAGGAGGAATCAGATTCAAAGCCCAAAAAATCAAAACTTTGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGAATGGGATCTGGAGCCGGAAGTTTCATCAAAGTTATTCTGAGGAACTTCGA
TGTTCTTGCTGGGCCTGTTGTTAGTCTCGTTTATCCACTACATGCTTCAGTAAGAGCAAT
TGAAACTCAGTCTCACGCTGATGACAAACAATGGCTCACTTACTGGGTTCTTTACTCCTT
ACTCACACTCTTCGAGCTCACATTCGCCAAACTCATCGAATGGGTACCGATATGGTCATA
CGCCAAGCTGATCTTGACTTGCTGGCTTGTCATTCCTTACTTCAGCGGCGCTGCTTATGT
ATACGAACACTTTGTGAGACCTTTGTATGTTAACCCTCAGAGCATTAACATTTGGTATGT
GCCTAAGAAGATGGATTTCTTCAGAAAGCCAGATGATGTGTTGACAGCTGCTGAGAAGTA
CATTGCTGAGAATGGTCCTGATGCTTTCGAGAAGATCTTGAGCCGAGCTGATAAATCAAG
AAGATATAAAGAGCATGAGACTATGTATGGGGAGGAGTTTCAGTATGAAGGGAACTTCAA
AAGCTATTAACTTTAGAGTGTGTGTGAAGCAAGCAAGTTCATTTCTTTGATGTTTGTTTG
TTTTGCTGCTTCTCGTTGTATGTGGGATCTCTGTGGTGTAAAAAAAGAAGTGCTAATAAT
GGAATCATATTACAGTGTTGTGAGATTAGGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO80TF U 1
AF RR2DO80JQ C 2
BS 1 663 RR2DO80TF
BS 664 664 RR2DO80JQ
BS 665 698 RR2DO80TF
BS 699 751 RR2DO80JQ

RD RR2DO80TF 698 0 0
GACGTGGAGGAGGAATCAGATTCAAAGCCCAAAAAATCAAAACTTTGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGAATGGGATCTGGAGCCGGAAGTTTCATCAAAGTTATTCTGAGGAACTTCGA
TGTTCTTGCTGGGCCTGTTGTTAGTCTCGTTTATCCACTACATGCTTCAGTAAGAGCAAT
TGAAACTCAGTCTCACGCTGATGACAAACAATGGCTCACTTACTGGGTTCTTTACTCCTT
ACTCACACTCTTCGAGCTCACATTCGCCAAACTCATCGAATGGGTACCGATATGGTCATA
CGCCAAGCTGATCTTGACTTGCTGGCTTGTCATTCCTTACTTCAGCGGCGCTGCTTATGT
ATACGAACACTTTGTGAGACCTTTGTATGTTAACCCTCAGAGCATTAACATTTGGTATGT
GCCTAAGAAGATGGATTTCTTCAGAAAGCCAGATGATGTGTTGACAGCTGCTGAGAAGTA
CATTGCTGAGAATGGTCCTGATGCTTTCGAGAAGATCTTGAGCCGAGCTGATAAATCAAG
AAGATATAAAGAGCATGAGACTATGTATGGGGAGGAGTTTCAGTATGAAGGGAACTTCAA
AAGCTATTAACTTTAGAGTGTGTGTGAAGCAAGCAAGTTCATTTCTTTGATGTTTGTTTG
TTT*GCTGCTTCTCGTTGTATGTGGGATCTCTGTGGTG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2DO80JQ 750 0 0
ACGTGGAGGAGGAATCAGATTCAAAGCCCAAAAAATCAAAACTTTGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAATGGGATCTGGAGCCGGAAGTTTCATCAAAGTTATTCTGAGGAACTTCGAT
GTTCTTGCTGGGCCTGTTGTTAGTCTCGTTTATCCACTACATGCTTCAGTAAGAGCAATT
GAAACTCAGTCTCACGCTGATGACAAACAATGGCTCACTTACTGGGTTCTTTACTCCTTA
CTCACACTCTTCGAGCTCACATTCGCCAAACTCATCGAATGGGTACCGATATGGTCATAC
GCCAAGCTGATCTTGACTTGCTGGCTTGTCATTCCTTACTTCAGCGGCGCTGCTTATGTA
TACGAACACTTTGTGAGACCTTTGTATGTTAACCCTCAGAGCATTAACATTTGGTATGTG
CCTAAGAAGATGGATTTCTTCAGAAAGCCAGATGATGTGTTGACAGCTGCTGAGAAGTAC
ATTGCTGAGAATGGTCCTGATGCTTTCGAGAAGATCTTGAGCCGAGCTGATAAATCAAGA
AGATATAAAGAGCATGAGACTATGTATGGGGAGGAGTTTCAGTATGAAGGGAACTTCAAA
AGCTATTAACTTTAGAGTGTGTGTGAAGCAAGCAAGTTCATTTCTTTGATGTTTGTTTGT
TTTGCTGCTTCTCGTTGTATGTGGGATCTCTGTGGTGTAAAAAAAGAAGTGCTAATAATG
GAATCATATTACAGTGTTGTGAGATTAGGC

QA 1 750 1 750
DS 



CO CL2085Contig2 807 2 2 U
GGAATTATTCGCTCTTCTCTCTCTGTCTATCTATCAATCTCTATCTGCAGTGAGTAGTGA
ATTACTTGGAGGAAGAATCAGATTCAAAGCCCAAAAAAATCAAAACTTTGAGAGAGAGAG
AGAGAATGGGATCTGGAGCCGGAAGTTTCATCAAAGTTATTCTGAGGAACTTCGATGTTC
TTGCTGGGCCTGTTGTTAGTCTCGTTTATCCACTACATGCTTCAGTAAGAGCAATTGAAA
CTCAATCTCACGCTGATGACAAACAATGGCTCACTTACTGGGTTCTCTACTCCTTACTCA
CACTCTTCGAGCTCACATTCGCCAAACTCATTGAATGGGTACCGATATGGTCATACGCCA
AGCTGATCTTGACTTGCTGGCTTGTGATTCCTTACTTTAGCGGCGCTGCTTATGTATACG
AACACTTTGTGAGACCTTTGTATGTTAACCCTCAGAGCATTAACATTTGGTATGTGCCAA
AGAAGATGGATTTCTTCAGAAAGCCAGATGATGTGTTGACAGCTGCTGAGAAGTACATTG
CTGAGAATGGTCCTGATGCTTTCGAGAAGATCTTAAGCCGAGCTGATAAATCAAAAAGAT
TTAAAGAGCATGAGACCATGTATGGTGAGGAGTATCTGTATGAAGGGAACTTCAAAAGCT
ATTAACTTTAGAGTGTGTGTGAAGCAAGCAAGTTCATTTCTTTGATGTTTGTTTGTTTTG
CTGCTTCTCGTTGTATGTGGGATCTCCGTGGTGTAAAAAAAGAAGTGCTAATAATGGAAT
CATATCACAATGTTGTGAGATTAGACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F337TF U 1
AF RR2F337JQ C 1
BS 1 753 RR2F337TF
BS 754 807 RR2F337JQ

RD RR2F337TF 760 0 0
GGAATTATTCGCTCTTCTCTCTCTGTCTATCTATCAATCTCTATCTGCAGTGAGTAGTGA
ATTACTTGGAGGAAGAATCAGATTCAAAGCCCAAAAAAATCAAAACTTTGAGAGAGAGAG
AGAGAATGGGATCTGGAGCCGGAAGTTTCATCAAAGTTATTCTGAGGAACTTCGATGTTC
TTGCTGGGCCTGTTGTTAGTCTCGTTTATCCACTACATGCTTCAGTAAGAGCAATTGAAA
CTCAATCTCACGCTGATGACAAACAATGGCTCACTTACTGGGTTCTCTACTCCTTACTCA
CACTCTTCGAGCTCACATTCGCCAAACTCATTGAATGGGTACCGATATGGTCATACGCCA
AGCTGATCTTGACTTGCTGGCTTGTGATTCCTTACTTTAGCGGCGCTGCTTATGTATACG
AACACTTTGTGAGACCTTTGTATGTTAACCCTCAGAGCATTAACATTTGGTATGTGCCAA
AGAAGATGGATTTCTTCAGAAAGCCAGATGATGTGTTGACAGCTGCTGAGAAGTACATTG
CTGAGAATGGTCCTGATGCTTTCGAGAAGATCTTAAGCCGAGCTGATAAATCAAAAAGAT
TTAAAGAGCATGAGACCATGTATGGTGAGGAGTATCTGTATGAAGGGAACTTCAAAAGCT
ATTAACTTTAGAGTGTGTGTGAAGCAAGCAAGTTCATTTCTTTGATGTTTGTTTGTTTTG
CTGCTTCTCGTTGTATGTGGGATCTCCGTGGTG
TAAAAAA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2F337JQ 807 0 0
GGAATTATTCGCTCTTCTCTCTCTGTCTATCTATCAATCTCTATCTGCAGTGAGTAGTGA
ATTACTTGGAGGAAGAATCAGATTCAAAGCCCAAAAAAATCAAAACTTTGAGAGAGAGAG
AGAGAATGGGATCTGGAGCCGGAAGTTTCATCAAAGTTATTCTGAGGAACTTCGATGTTC
TTGCTGGGCCTGTTGTTAGTCTCGTTTATCCACTACATGCTTCAGTAAGAGCAATTGAAA
CTCAATCTCACGCTGATGACAAACAATGGCTCACTTACTGGGTTCTCTACTCCTTACTCA
CACTCTTCGAGCTCACATTCGCCAAACTCATTGAATGGGTACCGATATGGTCATACGCCA
AGCTGATCTTGACTTGCTGGCTTGTGATTCCTTACTTTAGCGGCGCTGCTTATGTATACG
AACACTTTGTGAGACCTTTGTATGTTAACCCTCAGAGCATTAACATTTGGTATGTGCCAA
AGAAGATGGATTTCTTCAGAAAGCCAGATGATGTGTTGACAGCTGCTGAGAAGTACATTG
CTGAGAATGGTCCTGATGCTTTCGAGAAGATCTTAAGCCGAGCTGATAAATCAAAAAGAT
TTAAAGAGCATGAGACCATGTATGGTGAGGAGTATCTGTATGAAGGGAACTTCAAAAGCT
ATTAACTTTAGAGTGTGTGTGAAGCAAGCAAGTTCATTTCTTTGATGTTTGTTTGTTTTG
CTGCTTCTCGTTGTATGTGGGATCTCCGTGGTGTAAAAAAAGAAGTGCTAATAATGGAAT
CATATCACAATGTTGTGAGATTAGACG

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 4

CO CL2086Contig1 969 4 4 U
ATATTGATTGTTAAAGCAAGTTAAAGAAGCAAACAAACTGTGGAAGAAAGTTCAAGGAGG
AAAAAGAAAAAAAAACGTAGAAAGAAAAACACAAAACCCAAGCACACAATGTCTCCAAAT
ACGAACAACACTCTTTTTTTTGTTTTGTTTATGTATAAATAACGGTTTGGGTGTATATCA
TGTAACAGTAGAACCACCTTGTGAGCTAGCTTCACCTTTTTTTGAAGGCCTGAAAAAGTT
GGCAAGTTTCTGAGAAACGGTTTGCATTGTCTCCGTTACACAGTACTTTTCTTCGGCTTC
TAAATCATCATCCCCCTCGTAAACCAGATGGATCCCATGCATCTTCAGCACAGCATCTTG
TTTGATTTGTATTTTCTGTTTGATCACTTGTATGGTGTACCCTTCTTTCAACATCGAAAC
CATTGGG*AAGTGATGCGAGTACCGGCAGATGTGAAGCTGATCATCACTTGTTATCGGCA
CTCCAGAGAGGTTCAACGTGTGGTTGACTACGACTTTATCAAGTTTGAGAATTTGGGCTT
GGATCCCCAACACATCAGGCACATGGAAGTCATCTTTGCTTTCTTGGTTAACGGACACAA
CAACAGCAATGATTACGCCTCTTAGCTCTCTGTTCGGTTGAGCTGAAAACCTGACAGGTC
CTTGCCTGAACCAGTCTGGGATTTTGTTCCCAGGCACGCTCAAATTCCTCAGATTTTTCA
AAAAGACCTTGGAGAGTCTTTTCTTTGAGAAGCAATCGGAGTTACATCCGCTCATGTATA
ACCGTTTCAGAGCCTTCAAGTTCTCTAGTCCTGGAATATCTTTCACTTCCTTACAGTTTG
TGAGGTTGAGTTCTTGCAACATCTTCAGCTCCGAAAGGTCGGATACAATTGAAAGCAAAG
AGAAGTCTTGTATTTTGTTAAAACAGAAAGTTATAAAACAGAGCAATCTCATTCATATTT
CTTGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DY26JQ U 1
AF RR2AT66JQ U 629
AF RR2AT66TF C 320
AF RR2DY26TF C 323
BS 1 604 RR2DY26JQ
BS 605 628 RR2AT66TF
BS 629 791 RR2AT66JQ
BS 792 969 RR2AT66TF

RD RR2DY26JQ 604 0 0
ATATTGATTGTTAAAGCAAGTTAAAGAAGCAAACAAACTGTGGAAGAAAGTTCAAGGAGG
AAAAAGAAAAAAAAACGTAGAAAGAAAAACACAAAACCCAAGCACACAATGTCTCCAAAT
ACGAACAACACTCTTTTTTTTGTTTTGTTTATGTATAAATAACGGTTTGGGTGTATATCA
TGTAACAGTAGAACCACCTTGTGAGCTAGCTTCACCTTTTTTTGAAGGCCTGAAAAAGTT
GGCAAGTTTCTGAGAAACGGTTTGCATTGTCTCCGTTACACAGTACTTTTCTTCGGCTTC
TAAATCATCATCCCCCTCGTAAACCAGATGGATCCCATGCATCTTCAGCACAGCATCTTG
TTTGATTTGTATTTTCTGTTTGATCACTTGTATGGTGTACCCTTCTTTCAACATCGAAAC
CATTGGG*AAGTGATGCGAGTACCGGCAGATGTGAAGCTGATCATCACTTGTTATCGGCA
CTCCAGAGAGGTTCAACGTGTGGTTGACTACGACTTTATCAAGTTTGAGAATTTGGGCTT
GGATCCCCAACACATCAGGCACATGGAAGTCATCTTTGCTTTCTTGGTTAACGGACACAA
CAAC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2AT66JQ 163 0 0
TCTGTTCGGTTGAGCTGAAAACCTGACAGGTCCTTGCCTGAACCAGTCTGGGATTTTGTT
CCCAGGCACGCTCAAATTCCTCAGATTTTTCAAAAAGACCTTGGAGAGTCTTTTCTTTGA
GAAGCAATCGGAGTTACATCCGCTCATGTATAACCGTTTCAGA

QA 1 163 1 163
DS 

RD RR2AT66TF 650 0 0
TAA
ACCAGATGGATCCCATGCATCTTCAGCACAGCATCTTGTTTGATTTGTATTTTCTGTTTG
ATCACTTGTATGGTGTACCCTTCTTTCAACATCGAAACCATTGGGGAAGTGATGCGAGTA
CCGGCAGATGTGAAGCTGATCATCACTTGTTATCGGCACTCCAGAGAGGTTCAACGTGTG
GTTGACTACGACTTTATCAAGTTTGAGAATTTGGGCTTGGATCCCCAACACATCAGGCAC
ATGGAAGTCATCTTTGCTTTCTTGGTTAACGGACACAACAACAGCAATGATTACGCCTCT
TAGCTCTCTGTTCGGTTGAGCTGAAAACCTGACAGGTCCTTGCCTGAACCAGTCTGGGAT
TTTGTTCCCAGGCACGCTCAAATTCCTCAGATTTTTCAAAAAGACCTTGGAGAGTCTTTT
CTTTGAGAAGCAATCGGAGTTACATCCGCTCATGTATAACCGTTTCAGAGCCTTCAAGTT
CTCTAGTCCTGGAATATCTTTCACTTCCTTACAGTTTGTGAGGTTGAGTTCTTGCAACAT
CTTCAGCTCCGAAAGGTCGGATACAATTGAAAGCAAAGAGAAGTCTTGTATTTTGTTAAA
ACAGAAAGTTATAAAACAGAGCAATCTCATTCATATTTCTTGCTTCC

QA 4 650 4 650
DS 

RD RR2DY26TF 647 0 0
ACCAGATGGATCCCATGCATCT*CAGCACAGCATCT*GTTTGATTTGTATTTTCTGTTTG
ATCACTTGTATGGTGTACCCTTCTTTCAACATCGAAACCATTGGG*AAGTGATGCGAGTA
CCGGCAGATGTGAAGCTGATCATCACTTGTTATCGGCACTCCAGAGAGGTTCAACGTGTG
GTTGACTACGACTTTATCAAGTTTGAGAATTTGGGCTTGGATCCCCAACACATCAGGCAC
ATGGAAGTCATCTTTGCTTTCTTGGTTAACGGACACAACAACAGCAATGATTACGCCTCT
TAGCTCTCTGTTCGGTTGAGCTGAAAACCTGACAGGTCCTTGCCTGAACCAGTCTGGGAT
TTTGTTCCCAGGCACGCTCAAATTCCTCAGATTTTTCAAAAAGACCTTGGAGAGTCTTTT
CTTTGAGAAGCAATCGGAGTTACATCCGCTCATGTATAACCGTTTCAGAGCCTTCAAGTT
CTCTAGTCCTGGAATATCTTTCACTTCCTTACAGTTTGTGAGGTTGAGTTCTTGCAACAT
CTTCAGCTCCGAAAGGTCGGATACAATTGAAAGCAAAGAGAAGTCTTGTATTTTGTTAAA
ACAGAAAGTTATAAAACAGAGCAATCTCATTCATATTTCTTGCTTCC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 3

CO CL2087Contig1 1136 3 13 U
GGATTTTGCGTCTCAAGACTTCGAACTCGACAATCCCTAATTCCCAAAACTCCCCTCTCG
GATCTCCAACAAGAGTGTGATTACGAAACGATGCCGTCTACAAGGGAAGAGAACGTGTAC
TTAGCCAAGTTAGCGGAGCAAGCCGAGCGTTACGAGGAGATGGTTGAGTTCATGGAGAAA
GTCGCCAAGACCGTTGACTCCGAGGAGCTCACCGTGGAAGAGAGGAACCTCTTGTCCGTC
GCTTACAAGAACGTGATCGGCGCTAGGAGAGCTTCCTGGAGGATCATCTTTTCCATCGAG
CAGAAGGAAGAGAGCAGAGGGAACGAAGACCACGTGTCCATCATCAAGGACTACAGAGGG
AAGATCGAGACCGAGCTCAGCAAGATCTGCGATGGGATCTTGAACCTTCTTGATTCGCAC
CTTGTCCCCGCTGCGTCTTTGGCTGAGTCCAAAGTGTTTTATCTCAAGATGAAGGGAGAT
TACCATAGGTACCTTGCTGAGTTTAAGACTGGTGCTGAGAGGAAGGATGCTGCTGAGAAC
ACTCTCGTTACTTACAAGTCTGCTCAAGATATTGCACTTGCTGATTTACCTCCAACTCAT
CCGATTAGATTGGGACTTGCTCTTAACTTCTCTGTCTTCTACTATGAGATTCTCAACTCA
CCTGATCGTGCTTGCAATCTCGCCAAGCAGGCCTTTGATGAAGCAATCTCTGAGCTGGAC
ACATTAGGAGAAGAATCATACAAGGACAGCACGCTCATAATGCAACTTCTCCGTGACAAT
CTGACCCTCTGGACTTCTGACATCAATGACGAGGCGGGCGGTGATGAGATCAAGGAGGCG
TCAAAAGACGAGCCTGAAGAAGGGAAACAAGCTTAAAACCTTGAAATGACCAAAGCGAGC
GAGGGCATTACTTATGGGATTTGGCTGTTGTAGTTTCTTAAAAACATATGATATGGGGTT
TGTTGTTTGTAGAAGCAGAGAGAAGATCATCATTTGATTTTCTCCCTTGCAAACTCTAAA
ACTCTGTTTGGTCTTTCTTGTTTGGTTTTTTCTTCTAGTGTTTTTGAGTCTTTGGTTTTA
CTCCGTTGCTTGTTATTATTGATTTCTTAGGAAGCGAAGAAACAAAACTTTCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN64TF U 1
AF RR2EA11TF U 591
AF RR2AN64JQ C 246
BS 1 690 RR2AN64TF
BS 691 691 RR2EA11TF
BS 692 727 RR2AN64TF
BS 728 728 RR2EA11TF
BS 729 744 RR2AN64TF
BS 745 745 RR2EA11TF
BS 746 778 RR2AN64TF
BS 779 779 RR2EA11TF
BS 780 805 RR2AN64TF
BS 806 818 RR2EA11TF
BS 819 819 RR2AN64JQ
BS 820 1079 RR2EA11TF
BS 1080 1136 RR2AN64JQ

RD RR2AN64TF 806 0 0
GGATTTTGCGTCTCAAGACTTCGAACTCGACAATCCCTAATTCCCAAAACTCCCCTCTCG
GATCTCCAACAAGAGTGTGATTACGAAACGATGCCGTCTACAAGGGAAGAGAACGTGTAC
TTAGCCAAGTTAGCGGAGCAAGCCGAGCGTTACGAGGAGATGGTTGAGTTCATGGAGAAA
GTCGCCAAGACCGTTGACTCCGAGGAGCTCACCGTGGAAGAGAGGAACCTCTTGTCCGTC
GCTTACAAGAACGTGATCGGCGCTAGGAGAGCTTCCTGGAGGATCATCTTTTCCATCGAG
CAGAAGGAAGAGAGCAGAGGGAACGAAGACCACGTGTCCATCATCAAGGACTACAGAGGG
AAGATCGAGACCGAGCTCAGCAAGATCTGCGATGGGATCTTGAACCTTCTTGATTCGCAC
CTTGTCCCCGCTGCGTCTTTGGCTGAGTCCAAAGTGTTTTATCTCAAGATGAAGGGAGAT
TACCATAGGTACCTTGCTGAGTTTAAGACTGGTGCTGAGAGGAAGGATGCTGCTGAGAAC
ACTCTCGTTACTTACAAGTCTGCTCAAGATATTGCACTTGCTGATTTACCTCCAACTCAT
CCGATTAGATTGGGACTTGCTCTTAACTTCTCTGTCTTCTACTATGAGATTCTCAACTCA
CCTGATCGTGCTTGCAATCTCGCCAAGCAG*CCTTTGATGAAGCAATCTCTGAGCTGGAC
ACATTAG*AGAAGAATCATACAAG*ACAGCACGCTCATAATGCAACTTCTCCGTGACA*T
CTGACCCTCTGGACTTCTGACATCA
T

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2EA11TF 489 0 0
G
CCAACTCATCCGATTAGATTGGGACTTGCTCTTAACTTCTCTGTCTTCTACTATGAGATT
CTCAACTCACCTGATCGTGCTTGCAATCTCGCCAAGCAGGCTTTTGATGAAGCAATCTCT
GAGCTGGACACATTAGGAGAAGAATCATACAAGGACAGCACGCTCATAATGCAACTTCTC
CGTGACAATCTGACCCTCTGGACTTCTGACATCAATGACGAGGCGGGTGGTGATGAGATC
AAGGAGGCGTCAAAAGACGAGCCTGAAGAAGGGAAACAAGCTTAAAACCTTGAAATGACC
AAAGCGAGCGAGGGCATTACTTATGGGATTTGGCTGTTGTAGTTTCTTAAAAACATATGA
TATGGGGTTTGTTGTTTGTAGAAGCAGAGAGAAGATCATCATTTGATTTTCTCCCTTGCA
AACTCTAAAACTCTGTTTGGTCTTTCTTGTTTGGTTTTTTCTTCTAGTGTTTTTGAGTCT
TTGGTTTT

QA 2 489 2 489
DS 

RD RR2AN64JQ 891 0 0
CAAGAACGTGATCGGCGCTAGGAGAGCTTCCTGGAGGATCATCTTTTCCATCGAGCAGAA
GGAAGAGAGCAGAGGGAACGAAGACCACGTGTCCATCATCAAGGACTACAGAGGGAAGAT
CGAGACCGAGCTCAGCAAGATCTGCGATGGGATCTTGAACCTTCTTGATTCGCACCTTGT
CCCCGCTGCGTCTTTGGCTGAGTCCAAAGTGTTTTATCTCAAGATGAAGGGAGATTACCA
TAGGTACCTTGCTGAGTTTAAGACTGGTGCTGAGAGGAAGGATGCTGCTGAGAACACTCT
CGTTACTTACAAGTCTGCTCAAGATATTGCACTTGCTGATTTACCTCCAACTCATCCGAT
TAGATTGGGACTTGCTCTTAACTTCTCTGTCTTCTACTATGAGATTCTCAACTCACCTGA
TCGTGCTTGCAATCTCGCCAAGCAGGCCTTTGATGAAGCAATCTTTGAGCTGGACACATT
AGGAGAAGAATCATACAAGGACAGCACGCTCATAATGCAACTTCTCCGTGACAATCTGAC
CCTCTGGACTTCTGACATCAATGACGAGGCGGGCGGTGATGAGATCAAGGAGGCGTCAAA
AGACGAGCCTGAAGAAGGGAAACAAGCTTAAAACCTTGAAATGACCAAAGCGAGCGAGGG
CATTACTTATGGGATTTGGCTGTTGTAGTTTCTTAAAAACATATGATATGGGGTTTGTTG
TTTGTAGAAGCAGAGAGAAGATCATCATTTGATTTTCTCCCTTGCAAACTCTAAAACTCT
GTTTGGTCTTTCTTGTTTGGTTTTTTCTTCTAGTGTTTTTGAGTCTTTGGTTTTACTCCG
TTGCTTGTTATTATTGATTTCTTAGGAAGCGAAGAAACAAAACTTTCAATT

QA 1 891 1 891
DS 



AS 1 2

CO CL2088Contig1 727 2 2 U
GGGATTCCTCAGATTTCTTTGCAAGAACGAAACGAAACGAAAAAAGCTTCTACGATGTCC
GCCGAATCAGCCAGCGATATTCCTAAGGGACAGGTTGATTTGCTAGATTTCATTGACTGT
TCTGGTGTTGAATGCCTTAACCAAAGCTCGAGTCACTCCTTGCCCAATGCTCTCAAGCAG
GGGTATAGAGAAGATGCGGGGTTAAACCTAGAGAGTGATGCTGATGAACAGCTACTAATC
TATATTCCTTTTAACCAAGTCAAACTGCATTCTTTTGCTATCAAAGGCCCTGAAGAGGAT
GGTCCTAAAACTGTGAAGTTTTTCTCAAACAAAGAGCACATGTGCTTCAGCAATGTCAAT
GATTTTCCTCCAAGTGACACCGCTGAACTAACTGAAGAAAACCTTAAGGGAAGACCGGTG
GTCCTTAAATATGTTAAGTTTCAGAATGTTCGTAGCTTGACGATCTTCATTGAAGACAAC
CAATCGGGTTCTGAGCTCACAAAGGTTCAGAAGATCGCTCTTTACGGCTCAACGGTTGAG
ACTACTGATATGAAGGGGTTGAAGAAGATTGAAGATCACTGAGCAGCAAACAAAAGAGTT
ATAAATCATATATGATCACTTTGATTTCTACTATTCTGTTGTTGGTTTCTTTTCTTTTCA
CTTTTAAAAGTTTTTTTTTTTTTAATATTGAACTAGACTAGAACTTGCGATTACAAGCTT
ATTTCAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF78TF U 1
AF RR2CF78JQ C 1
BS 1 637 RR2CF78TF
BS 638 727 RR2CF78JQ

RD RR2CF78TF 637 0 0
GGGATTCCTCAGATTTCTTTGCAAGAACGAAACGAAACGAAAAAAGCTTCTACGATGTCC
GCCGAATCAGCCAGCGATATTCCTAAGGGACAGGTTGATTTGCTAGATTTCATTGACTGT
TCTGGTGTTGAATGCCTTAACCAAAGCTCGAGTCACTCCTTGCCCAATGCTCTCAAGCAG
GGGTATAGAGAAGATGCGGGGTTAAACCTAGAGAGTGATGCTGATGAACAGCTACTAATC
TATATTCCTTTTAACCAAGTCAAACTGCATTCTTTTGCTATCAAAGGCCCTGAAGAGGAT
GGTCCTAAAACTGTGAAGTTTTTCTCAAACAAAGAGCACATGTGCTTCAGCAATGTCAAT
GATTTTCCTCCAAGTGACACCGCTGAACTAACTGAAGAAAACCTTAAGGGAAGACCGGTG
GTCCTTAAATATGTTAAGTTTCAGAATGTTCGTAGCTTGACGATCTTCATTGAAGACAAC
CAATCGGGTTCTGAGCTCACAAAGGTTCAGAAGATCGCTCTTTACGGCTCAACGGTTGAG
ACTACTGATATGAAGGGGTTGAAGAAGATTGAAGATCACTGAGCAGCAAACAAAAGAGTT
ATAAATCATATATGATCACTTTGATTTCTACTATTCT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2CF78JQ 727 0 0
GGGATTCCTCAGATTTCTTTGCAAGAACGAAACGAAACGAAAAAAGCTTCTACGATGTCC
GCCGAATCAGCCAGCGATATTCCTAAGGGACAGGTTGATTTGCTAGATTTCATTGACTGT
TCTGGTGTTGAATGCCTTAACCAAAGCTCGAGTCACTCCTTGCCCAATGCTCTCAAGCAG
GGGTATAGAGAAGATGCGGGGTTAAACCTAGAGAGTGATGCTGATGAACAGCTACTAATC
TATATTCCTTTTAACCAAGTCAAACTGCATTCTTTTGCTATCAAAGGCCCTGAAGAGGAT
GGTCCTAAAACTGTGAAGTTTTTCTCAAACAAAGAGCACATGTGCTTCAGCAATGTCAAT
GATTTTCCTCCAAGTGACACCGCTGAACTAACTGAAGAAAACCTTAAGGGAAGACCGGTG
GTCCTTAAATATGTTAAGTTTCAGAATGTTCGTAGCTTGACGATCTTCATTGAAGACAAC
CAATCGGGTTTTGAGCTCACAAAGGTTCAGAAGATCGCTCTTTACGGCTCAACGGTTGAG
ACTACTGATATGAAGGGGTTGAAGAAGATTGAAGATCACTGAGCAGCAAACAAAAGAGTT
ATAAATCATATATGATCACTTTGATTTCTACTATTCTGTTGTTGGTTTCTTTTCTTTTCA
CTTTTAAAAGTTTTTTTTTTTTTAATATTGAACTAGACTAGAACTTGCGATTACAAGCTT
ATTTCAT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 4

CO CL2089Contig1 1203 4 18 U
AATATGTAAACTCTAATGAATCCAAGTATAGATTTTCATAGTAGGGGTTACAAAAGGACC
CAAAAACATTGGGAAAAAAAAAAAAAGTGTAAAGTATTTAAATAGGAATTAAAAACACAC
TGAAATCAGTTGCAAACTGGGAATTTGCAAGTCCCCGAGTTAGCCTTGATGAAACGGATA
GCTGTCATGAAAACATCGTGCTGCGAGCTCCCAAGGAGAGCCATATTTGTATACCCGATC
ACAGCAACGGAGTTATAAGGAAAGCCAAAAAAGTTGTATGAATTGAGTAATGCAGTTGTT
GCTTCCCTTAGGAAAGTCTTGTAGGCTTCTCCTCTCCCGTTAAGCGCTTCCCTTACTGTC
ATATCATTACCATATATCCTCCCGGCTACTAACCCAAACGCGACCGCAACCTTCGTGTCT
GGACCTACCACCTTCCAGTAACATCTGTATTCAGGTCTTATCCATAACTGGTGAGAACAA
GTTGAGGGCTCCACAAATGGAACTGGAGGGAT*GGAGGCAAAGGTGGAAGCTTAAATTGA
GGTGGCGATGTAGTTGGAGGAGGACTCATGGCCGGGACCTTAGGAGAAGGTAAGACCGGG
ACTTGAGCAATTGGAGGCAAAGGTGGAAGCTTAACCTGAGGAGGCGGTATGGCTTGAGGA
GGAGGCATGACCGGGACCTGAGGAGGAGGCATAACCGAAGCTGGTGGTGGTTTAGGACAA
GAAGACATTGGCTGAACCGGCTGAGCAAGAAGGGCATCCACAACGAAAGTTTCAATCCCA
AAGAAATTAAACAATAGTTTAAGTTTCTGCGTAGGACCTGAAGCGATGCTGCAACTACTA
CTTGAGCCTTGTTGAGCTCCATTGTCTGAAACCTGAGCGTAACAGTTGCTTAGATCCGGT
GTCCCGTCGAATCTCATCACATATCCTCCAAGCCAGTTAGTGGTTTCTTCTCTTGACATA
TAGACTTGTCCATTTTCATCCAAACATGTGACACTAACCTTGATTCCGGAGACGGGAAAA
TCGAACAAAGATTTCTCTCCATCCTTGCATTGGTCACAAAACACCGTGCCAGTGACCGTG
GCATATCCGGTAACTCCATTCACAGTTAAGCAAAGAATAAGAAAGGCCACAAAGAGAATA
TTATGATTTGAATCCATTTGATATCTCAGACCTAATAACCAATAAAGAAGAAGAAGAGAA
TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 

AF RR2CJ39JQ U 33
AF RR2CX61JQ U 1
AF RR2CX61TF C 462
AF RR2CJ39TF C 476
BS 1 45 RR2CX61JQ
BS 46 46 RR2CJ39JQ
BS 47 139 RR2CX61JQ
BS 140 140 RR2CJ39JQ
BS 141 194 RR2CX61JQ
BS 195 195 RR2CJ39JQ
BS 196 234 RR2CX61JQ
BS 235 236 RR2CJ39JQ
BS 237 391 RR2CX61JQ
BS 392 392 RR2CJ39JQ
BS 393 427 RR2CX61JQ
BS 428 428 RR2CJ39JQ
BS 429 440 RR2CX61JQ
BS 441 441 RR2CJ39JQ
BS 442 512 RR2CX61JQ
BS 513 513 RR2CX61TF
BS 514 537 RR2CX61JQ
BS 538 1203 RR2CX61TF

RD RR2CJ39JQ 439 0 0
TTTTCATAGTAGGGGTTACAAAAGGACCCAAAAACATTGGGAAAAAAAAAAAAAGTGTAA
AGTATTTAAATAGGAATTAAAAACACCCTGAAATCAGTTGCAAACTGGGAATTTGCAAGT
CCCCGAGTTAGCCTTGATGAAACGGATAGCTGTCATGAAAACATCGTGCTGCGAGCTCCC
AAGGAGGGCCATATTTGTATACCCGATCCCAGCAACGGAGTTATAAGGAAAGCCAAAAAA
GTTGTATGAATTGAGTAATGCAGTTGTTGCTTCCCTTAGGAAAGTCTTGTAGGCTTCTCC
TCTCCCGTTAAGCGCTTCCCTTACTGTCATATCATTACCATATATCCTCCCGGCTACTAA
CCCAAACGCGACCGCAACCTTCGTGTCTGGACCTACCACCTTCCAGTAACATCTGTATTC
AGGTCTTATCCATAACTGG

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2CX61JQ 549 0 0
AATATGTAAACTCTAATGAATCCAAGTATAGATTTTCATAGTAGGTGTTACAAAAGGACC
CAAAAACATTGGGAAAAAAAAAAAAAGTGTAAAGTATTTAAATAGGAATTAAAAACACAC
TGAAATCAGTTGCAAACTGTGAATTTGCAAGTCCCCGAGTTAGCCTTGATGAAACGGATA
GCTGTCATGAAAACGTCGTGCTGCGAGCTCCCAAGGAGAGCCATATTTGTATACGTGATC
ACAGCAACGGAGTTATAAGGAAAGCCAAAAAAGTTGTATGAATTGAGTAATGCAGTTGTT
GCTTCCCTTAGGAAAGTCTTGTAGGCTTCTCCTCTCCCGTTAAGCGCTTCCCTTACTGTC
ATATCATTACCATATATCCTCCCGGCTACTAGCCCAAACGCGACCGCAACCTTCGTGTCT
GGACCTATCACCTTCCAGTAGCATCTGTATTCAGGTCTTATCCATAACTGGTGAGAACAA
GTTGAGGGCTCCACAAATGGAACTGGAGGGATTGGAGGCAAAGGTGGAAGCTTAAAT
TGAGGTGGCGAT

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2CX61TF 742 0 0
CCATAACTGGTGAGAACAAGTTGAGGGCTCCACAAATGGAACTGGAGGGAT*GGAGGCAA
AGGTGGAAGCTTAAATTGAGGTGGCGATGTAGTTGGAGGAGGACTCATGGCCGGGACCTT
AGGAGAAGGTAAGACCGGGACTTGAGCAATTGGAGGCAAAGGTGGAAGCTTAACCTGAGG
AGGCGGTATGGCTTGAGGAGGAGGCATGACCGGGACCTGAGGAGGAGGCATAACCGAAGC
TGGTGGTGGTTTAGGACAAGAAGACATTGGCTGAACCGGCTGAGCAAGAAGGGCATCCAC
AACGAAAGTTTCAATCCCAAAGAAATTAAACAATAGTTTAAGTTTCTGCGTAGGACCTGA
AGCGATGCTGCAACTACTACTTGAGCCTTGTTGAGCTCCATTGTCTGAAACCTGAGCGTA
ACAGTTGCTTAGATCCGGTGTCCCGTCGAATCTCATCACATATCCTCCAAGCCAGTTAGT
GGTTTCTTCTCTTGACATATAGACTTGTCCATTTTCATCCAAACATGTGACACTAACCTT
GATTCCGGAGACGGGAAAATCGAACAAAGATTTCTCTCCATCCTTGCATTGGTCACAAAA
CACCGTGCCAGTGACCGTGGCATATCCGGTAACTCCATTCACAGTTAAGCAAAGAATAAG
AAAGGCCACAAAGAGAATATTATGATTTGAATCCATTTGATATCTCAGACCTAATAACCA
ATAAAGAAGAAGAAGAGAATCC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2CJ39TF 728 0 0
AGACAGC
TGAGGGCTCCACAAATGGAACTGGAGGGAT*GGAGGCAAAGGTGGAAGCTTAAAT*GAGG
*GGCGATGTAGTTGGAGGAGGACTCATGGCCGGGAC*TTAGGAGAAGGTAAGACCGGGAC
TTGAGCAATTGGAGGCAAAGGTGGGAGCTTAACCTGAGGAGGCGGTATGGCTTGAGGAGG
AGGCATGACCGGGACCTGAGGAGGAGGCATAACCGAAGCTGGTGGTGGTTTAGGACAAGA
AGACATTGGCTGAACCGGCTGAGCAAGAAGGGCATCCACAACGAAAGTTTCAATCCCAAA
GAAATTAAACAATAGTTTAAGTTTCTGCGTAGGACCTGAAGCGATGCTGCAACTACTACT
TGAGCCTTGTTGAGCTCCATTGTCTGAAACCTGAGCGTAACAGTTGCTTAGATCCGGTGT
CCCGTCGAATCTCATCACATATCCTCCAAGCCAGTTAGTGGTTTCTTCTCTTGACATATA
GACTTGTCCATTTTCATCCAAACATGTGACACTAACCTTGATTCCGGAGACGGGAAA*TC
GAACAAAGATTTCTCTCCATCCTTGCATTGGTCACAAAACACCGTGCCAGTGACCGTGGC
ATATCCGGTAACTCCATTCACAGTTAAGCAAAGAATAAGAAAGGCCACAAAGAGAATATT
ATGATTTGAATCCATTTGATATCTCAGACCTAATAACCAATAAAGAAGAAGAAGAGAATC
C

QA 8 728 8 728
DS 



AS 1 3

CO CL2090Contig1 911 3 25 U
GAGGCATTAAACTGGGTCAGGCCCAACTGGATCAGATGACTTAAAATCAAAATTGGATAA
AAAGACTTCTCTGCTCAACAACATTCGTTGCTAACACAAACCAGAGAAGTAGCTGGAAAA
AAAAAACAAACAGCAACTTGATCTTAACTGTCTCATAGATTTTATTACTACCATGACTCC
AACATGTAGTCCTCTTGAATTACTACAAAAATAATACCAAACGCCAAGATACTGGAATCT
TACAATAGGTTTGGATCTTCAGACTGGAGCGGACTCTGCTTCAATATACCTACAAATCCT
TTCCATAACCTCTCGCCCTTTCACGCTGTTTTGCATGAACTTCTCGGCGCACTTCTGCTC
AACTTTCTCAGCCATTGAGGCCAGAGTCGACAAGGGTTTGATTCGAATGCTTGTCTCCTG
GCTACAAACCGTCCAGGTCGACGGATTTTCTGGATGAGGATCGTATCTTATCCTCTCCTC
CACTTCAATGAACTTTTTGAGAGTAATGTTCTTTGTTGTAAGCTGCATAGAACGTGATTT
GCCATCCACAACAGTAGATTCAACACAGTGACAGATGTCCTGGCCTATGATCCGGTGAAG
GAACCATGGACCGGGAGCATGAATGGTGAGTGCACGGGTGGGTGTGGAGTTTACCGGTGA
CAGTGTCGAGTTTGCGGTTCAAGGTGTCGACTTCAAGGATGTGGGAAAGGATGCGTTTGT
TTTCAGGGTCAGCAAACTTCCTCCAGGAGGCAGCACTCACCCGCTCCCACGGATGCTTGT
AGACATGCTCTTGTTTATATGCTTTTACCATCAAGAAATCTAGAGAGAGAGGTAGGCAAG
GCAATTGACGATCCTGTCTTTGATGGTGAGCGTAGAAGAAAATAACCCCTCAAAACAAGA
AAAGAACGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH96JQ U 1
AF RR2C079JQ U 12
AF RR2C079TF C 201
BS 1 115 RR2EH96JQ
BS 116 116 RR2C079JQ
BS 117 122 RR2EH96JQ
BS 123 123 RR2C079JQ
BS 124 282 RR2EH96JQ
BS 283 283 RR2C079JQ
BS 284 384 RR2EH96JQ
BS 385 385 RR2C079JQ
BS 386 386 RR2EH96JQ
BS 387 387 RR2C079JQ
BS 388 437 RR2EH96JQ
BS 438 438 RR2C079JQ
BS 439 441 RR2EH96JQ
BS 442 442 RR2C079JQ
BS 443 477 RR2EH96JQ
BS 478 478 RR2C079JQ
BS 479 498 RR2EH96JQ
BS 499 499 RR2C079JQ
BS 500 541 RR2EH96JQ
BS 542 542 RR2C079JQ
BS 543 555 RR2EH96JQ
BS 556 556 RR2C079JQ
BS 557 612 RR2EH96JQ
BS 613 693 RR2C079JQ
BS 694 911 RR2C079TF

RD RR2EH96JQ 612 0 0
GAGGCATTAAACTGGGTCAGGCCCAACTGGATCAGATGACTTAAAATCAAAATTGGATAA
AAAGACTTCTCTGCTCAACAACATTCGTTGCTAACACAAACCAGAGAAGTAGCTG*AAAA
AACAAACAAACAGCAACTTGATCTTAACTGTCTCATAGATTTTATTACTACCATGACTCC
AACATGTAGTCCTCTTGAATTACTACAAAAATAATACCAAACGCCAAGATACTGGAATCT
TACAATAGGTTTGGATCTTCAGACTGGAGCGGACTCTGCTTCCATATACCTACAAATCCT
TTCCATAACCTCTCGCCCTTTCACGCTGTTTTGCATGAACTTCTCGGCGCACTTCTGCTC
AACTTTCTCAGCCATTGAGGCCAGGGCCGACAAGGGTTTGATTCGAATGCTTGTCTCCTG
GCTACAAACCGTCCAGGCCGATGGATTTTCTGGATGAGGATCGTATCTTATCCTCTCTTC
CACTTCAATGAACTTTTTAAGAGTAATGTTCTTTGTTGTAAGCTGCATAGAACGTGATTT
GGCATCCACAACAGTTGATTCAACACAGTGACAGATGTCCTGGCCTATGATCCGGTGAAG
GAACCATGGACC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2C079JQ 682 0 0
CTGGGTCAGGCCCAACTGGATCAGATGACTTAAAATCAAAATTGGATAAAAAG*CTTCTC
TGCTCAACAACATTCGTTGCTAACACAAACCAGAGAAGTAGCTGGAAAAAAAAAAGAAAC
AGCAACTTGATCTTAACTGTCTCATAGATTTTATTACTACCATGACTCCAACATGTAGTC
CTCTTGAATTACTACAAAAATAATACCAAACGCCAAGATACTGGAATCTTACAATAGGTT
TGGATCTTCAGACTGGAGCGGACTCTGCTTCAATATACCTACAAATCCTTTCCATAACCT
CTCGCCCTTTCACGCTGTTTTGCATGAACTTCTCGGCGCACTTCTGCTCAACTTTCTCAG
CCATTGAGGCCAGAGTCGACAAGGGTTTGATTCGAATGCTTGTCTCCTGGCTACAAACCG
TCCAGGTCGACGGATTTTCTGGATGAGGATCGTATCTTATCCTCTCCTCCACTTCAATGA
ACTTTTTGAGAGTAATGTTCTTTGTTGTAAGCTGCATAGAACGTGATTTGCCATCCACAA
CAGTAGATTCAACACAGTGACAGATGTCCTGGCCTATGATCCGGTGAAGGAACCATGGAC
CGGGAGCATGAATGGTGAGTGCACGGGTGGGTGTGGAGTTTACCGGTGACAGTGTCGAGT
TTGCGGTTCAAGGTGTCGACTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2C079TF 711 0 0
TACTACAAAAATAATACCAAACGCCAAGATACTG*AATCTTACAATAGGTTTGGATCTTC
AGACTGGAGCGGACTCTGCTTCAATATAC*TACAAATCCTTTCCATAACCTCTCGCCCTT
TCACGCTGTTTTGCATGAACTTCTCGGCGCACTTCTGCTCAACTTTCTCAGCCATTGAGG
CCAGAGTCGACAAGGGTTTGATTCGAATGCTTGTCTCCTGGCTACAAACCGTCCAGGTCG
ACGGATTTTCTGGATGAGGATCGTATCTTATCCTCTCCTCCACTTCAATGAACTTTTTGA
GAGTAATGTTCTTTGTTGTAAGCTGCATAGAACGTGATTTGCCATCCACAACAGTAGATT
CAACACAGTGACAGATGTCCTGGCCTATGATCCGGTGAAGGAACCATGGACCGGGAGCAT
GAATGGTGAGTGCACGGGTGG*TGTGGAGTTTACCGGTGACAGTGTCGAGTTTGCGGTTC
AAGGTGTCGACTTCAAGGATGTGGGAAAGGATGCGTTTGTTTTCAGGGTCAGCAAACTTC
CTCCAGGAGGCAGCACTCACCCGCTCCCACGGATGCTTGTAGACATGCTCTTGTTTATAT
GCTTTTACCATCAAGAAATCTAGAGAGAGAGGTAGGCAAGGCAATTGACGATCCTGTCTT
TGATGGTGAGCGTAGAAGAAAATAACCCCTCAAAACAAGAAAAGAACGTCC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 4

CO CL2091Contig1 932 4 8 U
ACCCAAAGTCTCTCTAATTCAATGCGATAAAAAAAAAAAAGAGTCAAAAGACACAGAGAT
CCGACCATCGGAGCAAAGACGAAGAACATATGATGTCGGAGGGAGGAGCACCGTCGAAAT
ACGTGAAGTTGACGAAGGAGCAAGCTCCGGTCGATGAGGTTAATCCCGGCGAACTCAATC
AACCCATTCAGGTTCCCCATCTAGCTGTTCAGAAATGCAACGAGTGTGGTCAAGCTCTAC
CTGAGAATTTTGAAGCTCCTGCGGATGAGCCATGGACTACTGGAATATTCGGGTGCACTG
AGGACATGAGTAGCTTTTGGCAGGGACTCTTTTGCCCAAGTGTTCTTTTCGGACGTGTCT
ATGAAACTCTGAGTGACGAAGAAACCTCGTGGACCAAAGCATGTATTTGCCACTCGATTG
TAGTTGAAGGAGGTCTAACAGTTGCATCCATTGCCGCTTGTGCTCCCGGTATAGATCCGC
ATACAACATTTCTTATGTGGGAAGGCTTGTTGTTTGTTTGGTGGATGTGTGGCATTTACA
CCGGTAACGTCAGGCAAACTCTACAGAGGAAATATCATCTCCAGAACTCTCCATGTGACC
CATGTATGGTGCATTGTTGCCTACATTTCTGTGCGGTGTGTCAAGAGCACCGTGAGATGA
AGAACCGTCTTTCAGACAACTTTGTGATGCCCATGACTGTGGTTAACCCGCCACCGGTTC
AAGAGATGACTGCCTCTAATGACTCTGTCCCTGTTTCACGTAATGGCTCTGGGCTCGAGA
TGCGGCCATTGTAGAGACTTAATGTTTCAACCAGATTTCAAGGTCCTGTTTTGTTCTGTT
TTGTGATGGACCTGTTGTTTTTATGAGGATTGGATTATATGTAAACCGACTTTGTTTGTT
TAATATTCATACAATCATATATCCTTATCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS78TF U 12
AF RR2CV30TF U 1
AF RR2CN22TF U 14
AF RR2CV30JQ C 212
BS 1 38 RR2CV30TF
BS 39 40 RR2CN22TF
BS 41 51 RR2CV30TF
BS 52 52 RR2CN22TF
BS 53 75 RR2CV30TF
BS 76 76 RR2CN22TF
BS 77 761 RR2CV30TF
BS 762 932 RR2CV30JQ

RD RR2FS78TF 649 0 0
GGAATTCAATGCGATAAAA
AAAAAAAAAAGAGTCAAAAGACACAGAGATCCGACCATCGGAGCAAAGACGAAGAACATA
TGATGTCGGAGGGAGGAGCACCGTCGAAATACGTGAAGTTGACGAAGGAGCAAGCTCCGG
TCGATGAGGTTAATCCCGGCGAACTCAATCAACCCATTCAGGTTCCCCATCTAGCTGTTC
AGAAATGCAACGAGTGTGGCCAAACTCTACCTGAGAATTTTGAAGCTCCTGCAGATGAAC
CATGGACTACTGGAATATTCGGGTGCACTGAGGACATGAGTAGCTTTTGGCAAGGACTCT
TTTGCCCAAGTGTTCTCTTCGGACGTGTCTATGAGACTCTGAGTGACGAAAAAACCTCGT
GGACCAAGGCATGTATTTGCCACTCGATTGTAGTTGAAGGAGGCCTAACAGTTGCATCCA
TTGCTGCTTGTGCTCCCGGTATAGATCCGCATACAACATTTCTTATGTGGGAAGGCTTGC
TGTTCGTTTGGTGGATGTGTGGGATTTACACAGGTAACGTCAGGCAAACTCTACAGAGGA
AATATCATCTCCAGAACTCTCCATGTGACCCATGTATGGTGCATTGTTGCCTCCATTTCT
GTGCGGTTTGTCAAGAGCACCGTGAGATGA

QA 20 649 20 649
DS 

RD RR2CV30TF 766 0 0
ACCCAAAGTCTCTCTAATTCAATGCGATAAAAAAAAAA**GAGTCAAAAGAGACAGAGAT
CCGACCATCGGAGCAGAGACGAAGAACATATGATGTCGGAGGGAGGAGCACCGTCGAAAT
ACGTGAAGTTGACGAAGGAGCAAGCTCCGGTCGATGAGGTTAATCCCGGCGAACTCAATC
AACCCATTCAGGTTCCCCATCTAGCTGTTCAGAAATGCAACGAGTGTGGTCAAGCTCTAC
CTGAGAATTTTGAAGCTCCTGCGGATGAGCCATGGACTACTGGAATATTCGGGTGCACTG
AGGACATGAGTAGCTTTTGGCAGGGACTCTTTTGCCCAAGTGTTCTTTTCGGACGTGTCT
ATGAAACTCTGAGTGACGAAGAAACCTCGTGGACCAAAGCATGTATTTGCCACTCGATTG
TAGTTGAAGGAGGTCTAACAGTTGCATCCATTGCCGCTTGTGCTCCCGGTATAGATCCGC
ATACAACATTTCTTATGTGGGAAGGCTTGTTGTTTGTTTGGTGGATGTGTGGCATTTACA
CCGGTAACGTCAGGCAAACTCTACAGAGGAAATATCATCTCCAGAACTCTCCATGTGACC
CATGTATGGTGCATTGTTGCCTACATTTCTGTGCGGTGTGTCAAGAGCACCGTGAGATGA
AGAACCGTCTTTCAGACAACTTTGTGATGCCCATGACTGTGGTTAACCCGCCACCGGTTC
AAGAGATGACTGCCTCTAATGACTCTGTCCCTGTTTCACGT
AATGG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2CN22TF 751 0 0
GG
AATTCAATGCGATAAAAAAAAAAAAGAGTCAAAAGACACAGAGATCCGACCATCGGAGCA
AAGACGAAGAACATATGATGTCGGAGGGAGGAGCACCGTCGAAATACGTGAAGTTGACGA
AGGAGCAAGCTCCGGTCGATGAGGTTAATCCCGGCGAACTCAATCAACCCATTCAGGTTC
CCCATCTAGCTGTTCAGAAATGCAACGAGTGTGGCCAAACTCTACCTGAGAATTTTGAAG
CTCCTGCAGATGAACCATGGACTACTGGAATATTCGGGTGCACTGAGGACATGAGTAGCT
TTTGGCAAGGACTCTTTTGCCCAAGTGTTCTCTTCGGACGTGTCTATGAGACTCTGAGTG
ACGAAGAAACCTCGTGGACCAAGGCATGTATTTGCCACTCGATTGTAGTTGAAGGAGGCC
TAACAGTTGCATCCATTGCTGCTTGTGCTCCCGGTATAGATCCGCATACAACATTTCTTA
TGTGGGAAGGCTTGCTGTTCGTTTGGTGGATGTGTGGGATTTACACAGGTAACGTCAGGC
AAACTCTACAGAGGAAATATCATCTCCAGAACTCTCCATGTGACCCATGTATGGTGCATT
GTTGCCTCCATTTCTGTGCGGTTTGTCAAGAGCACCGTGAGATGAAGAACCGTCTTTCAG
ACAACTTTGTGATGCCCATGACTGTGGTTAACCCGCCACCGGTTCA*GAGATGACTGCCT
CTAATGACTCAGTCCCTGTTTCACGT
CAT

QA 3 748 3 748
DS 

RD RR2CV30JQ 721 0 0
GAAATGCAACGAGTGTGGTCAAGCTCTACCTGAGAATTTTGAAGCTCCTGCGGATGAGCC
ATGGACTACTGGAATATTCGGGTGCACTGAGGACATGAGTAGCTTTTGGCAGGGACTCTT
TTGCCCAAGTGTTCTTTTCGGACGTGTCTATGAAACTCTGAGTGACGAAGAAACCTCGTG
GACCAAAGCATGTATTTGCCACTCGATTGTAGTTGAAGGAGGTCTAACAGTTGCATCCAT
TGCCGCTTGTGCTCCCGGTATAGATCCGCATACAACATTTTTTATGTGGGAAGGCTTGTT
GTTTGTTTGGTGGATGTGTGGCATTTACACCGGTAACGTCAGGCAAACTCTACAGAGGAA
ATATCATCTCCAGAACTCTCCATGTGACCCATGTATGGTGCATTGTTGCCTACATTTCTG
TGCGGTGTGTCAAGAGCACCGTGAGATGAAGAACCGTCTTTCAGACAACTTTGTGATGCC
CATGACTGTGGTTAACCCGCCACCGGTTCAAGAGATGACTGCCTCTAATGACTCTGTCCC
TGTTTCACGTAATGGCTCTGGGCTCGAGATGCGGCCATTGTAGAGACTTAATGTTTCAAC
CAGATTTCAAGGTCCTGTTTTGTTCTGTTTTGTGATGGACCTGTTGTTTTTATGAGGATT
GGATTATATGTAAACCGACTTTGTTTGTTTAATATTCATACAATCATATATCCTTATCTC
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 2 4

CO CL2092Contig1 531 2 3 U
GATTTCCAAAACCCCTCTTAACCAATATCCCACAACATTCGGCATAGAAAAGAGGAAGAC
CCGCAAATATTTTTTTGATCCTTTACTCAAACCAATACGACCAGAGAGAGAGAGAGAGAA
ACGAACGAGTATTAATGATGAAAACGGTTTAATACTACTATGCGACCATAAGCCTTGCGA
TCATCCCTTGAGTCCAGCGTGCAGTGTCCTTGAGATCTTCATCCTCAGAGTCGAGGCATT
CATTGAGGAACTCCCCGCAAAAGGTGAAGTTGCTGAACAAAGGCTTCGTCTTGTCTCCAA
CAACATCCGCAAGATCACCCAATGCTGCCACCGCTGCTTTCGTCACGCTCTCATCCCTGA
GGGAATCTTTGGAAACAAGTTCAACAAACTGCAAGAGATGTTGAGCGTAGGGGACCATGA
GCTCAGCCTTGGTGTCCTTGAACCCTTGTAGTATCCCAGAGTAAGCCTCGAAGATGCTTC
TGCTGAGTTGGTTTCCATAATCCATAAGCTCCTCGTCGAGGGTGTCCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F504TF C 1
AF RR2F504JQ U 115
BS 1 114 RR2F504TF
BS 115 510 RR2F504JQ
BS 511 531 RR2F504TF

RD RR2F504TF 531 0 0
GATTTCCAAAACCCCTCTTAACCAATATCCCACAACATTCGGCATAGAAAAGAGGAAGAC
CCGCAAATATTTTTTTGATCCTTTACTCAAACCAATACGACCAGAGAGAGAGAGAGAGAA
ACGAACGAGTATTAATGATGAAAACGGTTTAATACTACTATGCGACCATAAGCCTTGCGA
TCATCCCTTGAGTCCAGCGTGCAGTGTCCTTGAGATCTTCATCCTCAGAGTCGAGGCATT
CATTGAGGAACTCCCCGCAGAAGGTGAAGTTGCTGAACAAAGGCTTCGTCTTGTCTCCAA
CAACATCCGCAAGATCACCCAATGCTGCCACCGCTGCTTTCGTCACGCTCTCATCCCTGA
GGGAATCTTTGGAAACAAGTTCAACAAACTGCAAGAGATGTTGAGCGTAGGGGACCATGA
GCTCAGCCTTGGTGTCCTTGAACCCTTGTAGTATCCCAGAGTAAGCCTCGAAGATGCTTC
TGCTGAGTTGGTTTCCATAATCCATAAGCTCCTCGTCGAGGGTGTCCATCC

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2F504JQ 396 0 0
AGAGAAACGAACGAGTATTAATGATGAAAACGGTTTAATACTACTATGCGACCATAAGCC
TTGCGATCATCCCTTGAGTCCAGCGTGCAGTGTCCTTGAGATCTTCATCCTCAGAGTCGA
GGCATTCATTGAGGAACTCCCCGCAAAAGGTGAAGTTGCTGAACAAAGGCTTCGTCTTGT
CTCCAACAACATCCGCAAGATCACCCAATGCTGCCACCGCTGCTTTCGTCACGCTCTCAT
CCCTGAGGGAATCTTTGGAAACAAGTTCAACAAACTGCAAGAGATGTTGAGCGTAGGGGA
CCATGAGCTCAGCCTTGGTGTCCTTGAACCCTTGTAGTATCCCAGAGTAAGCCTCGAAGA
TGCTTCTGCTGAGTTGGTTTCCATAATCCATAAGCT

QA 1 396 1 396
DS 



CO CL2092Contig2 1428 2 4 U
GTGGAGCAAGTTCATCTCTTCTCTCTCCCTATCTTACAGAAATCATCCAGCATCTGCTTG
CAACTGCTGAGCGTACAGATGGGGCAGAGTCTAAGCTAAGATCTGCTTCATATGAAACCT
TGAACGAGGTTGTCCGTTGTTCCAACCTTTTAGAGGCCGCAGGCATCATAGGGCAGCTCC
TCCCTGTCATCATGGGGAAATTAGGTCAGACAATAGATCTCCAGGTAGTATCAACTGAGG
ACCGTGAGAAGCAAGCGGAACTCCAGGCTTCTCTCTGTGGTGTCATCCAGGTCATAATCC
AGAAGCTGAGTAGCAAGGATGAGACGAAACCCATCATAATGCAGAACGCAGATCATATCA
TGATGCTGTTCCTCAGAGTGTTTGGATGCCACAGTTCAAGCGTTCATGAAGAAGCAATGC
TTGCAATCGGTGCTCTTGCCTATGCGACTGGATCTGAGTTTGCAAAATACATGCCTGAGC
TCTTCAAATATCTCCAGACTGGGCTGCAGAACTTCGAGGAGTACCAAGTCTGCTCGATCA
CCGTAGGAGTGGTTGGTGACATTTGCCGTGCACTGGATGACAAAATCCCACCGTTCTGTG
ATCAGATCATGTCTCTCCTAATCCAGAACCTTCAAAGCGAAGCACTCCACAGGTCGGTGA
ACCTCCAATATTCTCATGTTTTGGAGACATTGCTCTGGCGATTGGTGGGCATTTTGAGAG
GTATGTGGCTACAGCTATTCAGATCATGCAAGGGGCTGCTCACGTATGTGCTCAGATGGA
CACCCTCGACGAGGAGCTTATGGATTACGGAAACCAACTCAGGAGAAGCATCTTTGAGGC
TTACTCTGGGATACTACAAGGGTTCAAGGACGCCAAGGCTGAGCTCATGGTCCCCTACGC
TCAACATCTCTTGCAGTTTGTTGAACTTGTTTCCAAAGATTCCCTCAGGGATGAGAGCGT
GACGAAAGCAGCGGTGGCAGCTTTGGGTGATCTTGCGGATGTTGTTGGAGAGAAGACGAA
GCCTTTGTTCAGCAACTTCACCTTCTGCGGGGAGTTCCTCAATGAATGTCTCGACTCAGA
GGATGAAGATCTCAAGGACACTGCACGCTGGACTCAAGGGATGATTGCAAGGCTCATGGT
CGCATAGTAGTATTAAACCGTTTTCATCATTAATACTCGTTCGTCTCTCTTCTCTCTCTC
TCTGGTCGTATTATTGGTTTGAGTAAAGGATCAAAAAAACATTTGCGGGTCACCCTCTTT
TCTCTGCCGAATGTTGTGGGATATTGGTTAAGAGGGGTTTTGGAAATCGTTTTTTTTTTT
TAATTGCTCGAGTCTGAGTCAATCTCTGTTAAAGAGCATGCCGCATGCGTCTTATTTGTC
AAAACAATTTATATTTGTTTTTGTTGGTCAATTCATGTCTCTTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H320TF U 1
AF RR2H320JQ C 671
BS 1 690 RR2H320TF
BS 691 691 RR2H320JQ
BS 692 737 RR2H320TF
BS 738 1428 RR2H320JQ

RD RR2H320TF 737 0 0
GTGGAGCAAGTTCATCTCTTCTCTCTCCCTATCTTACAGAAATCATCCAGCATCTGCTTG
CAACTGCTGAGCGTACAGATGGGGCAGAGTCTAAGCTAAGATCTGCTTCATATGAAACCT
TGAACGAGGTTGTCCGTTGTTCCAACCTTTTAGAGGCCGCAGGCATCATAGGGCAGCTCC
TCCCTGTCATCATGGGGAAATTAGGTCAGACAATAGATCTCCAGGTAGTATCAACTGAGG
ACCGTGAGAAGCAAGCGGAACTCCAGGCTTCTCTCTGTGGTGTCATCCAGGTCATAATCC
AGAAGCTGAGTAGCAAGGATGAGACGAAACCCATCATAATGCAGAACGCAGATCATATCA
TGATGCTGTTCCTCAGAGTGTTTGGATGCCACAGTTCAAGCGTTCATGAAGAAGCAATGC
TTGCAATCGGTGCTCTTGCCTATGCGACTGGATCTGAGTTTGCAAAATACATGCCTGAGC
TCTTCAAATATCTCCAGACTGGGCTGCAGAACTTCGAGGAGTACCAAGTCTGCTCGATCA
CCGTAGGAGTGGTTGGTGACATTTGCCGTGCACTGGATGACAAAATCCCACCGTTCTGTG
ATCAGATCATGTCTCTCCTAATCCAGAACCTTCAAAGCGAAGCACTCCACAGGTCGGTGA
ACCTCCAATATTCTCATGTTTTGGAGACAT*GCTCTGGCGATTGGTGGGCATTTTGAGAG
GTATGTGGCTACAGCTA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2H320JQ 758 0 0
TTCTCATGTTTTGGAGACATTGCTCTGGCGATTGGTGGGCATTTTGAGAGGTATGTGGCT
ACAGCTATTCAGATCATGCAAGGGGCTGCTCACGTATGTGCTCAGATGGACACCCTCGAC
GAGGAGCTTATGGATTACGGAAACCAACTCAGGAGAAGCATCTTTGAGGCTTACTCTGGG
ATACTACAAGGGTTCAAGGACGCCAAGGCTGAGCTCATGGTCCCCTACGCTCAACATCTC
TTGCAGTTTGTTGAACTTGTTTCCAAAGATTCCCTCAGGGATGAGAGCGTGACGAAAGCA
GCGGTGGCAGCTTTGGGTGATCTTGCGGATGTTGTTGGAGAGAAGACGAAGCCTTTGTTC
AGCAACTTCACCTTCTGCGGGGAGTTCCTCAATGAATGTCTCGACTCAGAGGATGAAGAT
CTCAAGGACACTGCACGCTGGACTCAAGGGATGATTGCAAGGCTCATGGTCGCATAGTAG
TATTAAACCGTTTTCATCATTAATACTCGTTCGTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTGGTCGTA
TTATTGGTTTGAGTAAAGGATCAAAAAAACATTTGCGGGTCACCCTCTTTTCTCTGCCGA
ATGTTGTGGGATATTGGTTAAGAGGGGTTTTGGAAATCGTTTTTTTTTTTTAATTGCTCG
AGTCTGAGTCAATCTCTGTTAAAGAGCATGCCGCATGCGTCTTATTTGTCAAAACAATTT
ATATTTGTTTTTGTTGGTCAATTCATGTCTCTTTTGTC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 4

CO CL2093Contig1 1909 4 12 U
GGGAGATCTTCTCTCTGATCCAAGGGGTTTCGCCTTAATTTTTCTCAAAGGTGAAAGAAG
TTTAAGCTTTACATTGACTATATGAGCAGATAGTTAGTTAGTACTACTAGGAAGAAGAGG
GTTACTACTATGGGTTGGTTTAACAAGATCTTCAAAGGCTCTACCCAAAGGTTCCGGGTT
GGGAATAATGACCACGATCACAATGGCGGCGGCTATTATCAGAGTTATCCACATGATAAT
GATGAGCCTAGTGCTGCTGATACAGATCCTGATCCTGATCCTGATGATACTCATCATCAT
ACTCAGGAACCACCTACCTCCGAGGAGGATACATCTAACGAGCAGGAGAATGAAGAAATA
GACCGTGCAATCGCATTGTCACTACTAGAAGAGAGTCAAGGACAGACCAATAATAATACA
GGGAAATACGCAATGGTGGATGAAGATGAGCAACTCGCTAGAGCCATACAAGAAAGTATG
GTAGTTGGGAATAATACACCGCGTCAGAAGCATGGAAGCAGTTATGATGTTGGGAGTGCG
TATGGTGGGGCTGGTGGAGACGTATACGGGAATGGACATATGCATGGAGGTGGAGGTGGA
GGAGGAAATGTATTTGCCAATGGAGATATTTATTATCCAAGACCTACTGCTTTTCCTATG
GATTTCAGGATTTGTGCTGGGTGCAATATGGAGATTGGACATGGAAGATATCTTAATTGC
TTGAATGCACTATGGCATCCAGAATGTTTTCGATGTTATGGCTGTAGGCACCCCATTTCT
GAGTACGAGTTTTCTACATCTGGGAACTACCCTTTTCACAAAGCTTGTTACAGAGAGAGA
TATCATCCAAAGTGTGATGTCTGCAGCCTCTTTATTCCAACAAACCATGCTGGTCTTATT
GAATATAGGGCGCATCCTTTTTGGGTCCAGAAGTATTGCCCTTCCCACGAACACGATGCT
ACCCCAAGATGTTGCAGTTGTGAAAGAATGGAGCCAAGGAATACAGGATATGTTGAACTT
AACGATGGACGGAAACTTTGTCTCGAGTGTCTGGACTCAGCGGTCATGGACACTTTTCAA
TGTCAACCTCTCTACTTGCAGATACAAGAATTCTACGAAGGGCTTTTCATGAAGGTGGAG
CAGGACGTTCCACTTCTTTTAGTTGAGAGGCAAGCACTTAACTAAGCCAGAGAAGGTGAA
AAGAATGGTCACTATCACATGCCAGAGACGAGAGGACTCTGTCTTTCAGAAGAACAAACT
GTTAGCACTGTAAGAAAGAGATCGAAGCATGGGACAGGAAACTGGGCTGGGAATATGATT
ACAGAGCCTTACAAGCTAACGCGTCAATGCGAGGTCACTGCCATTCTCATCTTATTTGGG
CTCCCTAGGCTACTCACC*GGTTCGATCCTAGCTCATGAGATGATGCATGCGTGGATGCG
CCTCAAAGGATTCCGGACACTGAGCCAAGACGTTGAAGAAGGAATATGTCAAGTGATGGC
TCACAAGTGGTTAGAAGCCGAGTTAGCTGCTGGTTCAAGAAACAGCAATGTTGCATCATC
ATCATCATCTTCTCCTTCTTCTAGAGGAGTGAAGAAGGGACCAAGATCGCAGTACGAGAG
GAAGCTTGGTGAGTTTTTCAAGCACCAAATCGAGTCTGATGCTTCTCCGGTTTATGGAGA
CGGGTTCAGGGCCGGGAGGTTAGCGGTTAACAAGTATGGTTTGCCTAAAACACTTGAGCA
TATACAGATGACCGGTAGATTCCCAGTTTAAGAACAAAGTCTTTTGTTTTTTCGATTGTG
ATACCCTTTTTTATTTATAGGATCGTCATTATTCTTATGTGATTGAATTATAGTTGTAAT
CATTCCATGATTCTTTTGTATTTCTATCATCAGATTTAGAGTTGGCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A416TF U 1
AF RR2AB65TF U 721
AF RR2AB65JQ C 1000
AF RR2A416JQ C 1057
BS 1 813 RR2A416TF
BS 814 1388 RR2AB65TF
BS 1389 1389 RR2AB65JQ
BS 1390 1398 RR2AB65TF
BS 1399 1399 RR2AB65JQ
BS 1400 1452 RR2AB65TF
BS 1453 1573 RR2AB65JQ
BS 1574 1574 RR2A416JQ
BS 1575 1664 RR2AB65JQ
BS 1665 1665 RR2A416JQ
BS 1666 1861 RR2AB65JQ
BS 1862 1909 RR2A416JQ

RD RR2A416TF 813 0 0
GGGAGATCTTCTCTCTGATCCAAGGGGTTTCGCCTTAATTTTTCTCAAAGGTGAAAGAAG
TTTAAGCTTTACATTGACTATATGAGCAGATAGTTAGTTAGTACTACTAGGAAGAAGAGG
GTTACTACTATGGGTTGGTTTAACAAGATCTTCAAAGGCTCTACCCAAAGGTTCCGGGTT
GGGAATAATGACCACGATCACAATGGCGGCGGCTATTATCAGAGTTATCCACATGATAAT
GATGAGCCTAGTGCTGCTGATACAGATCCTGATCCTGATCCTGATGATACTCATCATCAT
ACTCAGGAACCACCTACCTCCGAGGAGGATACATCTAACGAGCAGGAGAATGAAGAAATA
GACCGTGCAATCGCATTGTCACTACTAGAAGAGAGTCAAGGACAGACCAATAATAATACA
GGGAAATACGCAATGGTGGATGAAGATGAGCAACTCGCTAGAGCCATACAAGAAAGTATG
GTAGTTGGGAATAATACACCGCGTCAGAAGCATGGAAGCAGTTATGATGTTGGGAGTGCG
TATGGTGGGGCTGGTGGAGACGTATACGGGAATGGACATATGCATGGAGGTGGAGGTGGA
GGAGGAAATGTATTTGCCAATGGAGATATTTATTATCCAAGACCTACTGCTTTTCCTATG
GATTTCAGGATTTGTGCTGGGTGCAATATGGAGATTGGACATGGAAGATATCTTAATTGC
TTGAATGCACTATGGCATCCAGAATGTTTTCGATGTTATGGCTGTAGGCACCCCATTTCT
GAGTACGAGTTTTCTACATCTGGGAACTACCCT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2AB65TF 732 0 0
G
TGAATGCACTATGGCATCCAGAATGTTTTCGATGTTATGGCTGTAGGCACCCCATTTCTG
AGTACGAGTTTTCTACATCTGGGAACTACCCTTTTCACAAAGCTTGTTACAGAGAGAGAT
ATCATCCAAAGTGTGATGTCTGCAGCCTCTTTATTCCAACAAACCATGCTGGTCTTATTG
AATATAGGGCGCATCCTTTTTGGGTCCAGAAGTATTGCCCTTCCCACGAACACGATGCTA
CCCCAAGATGTTGCAGTTGTGAAAGAATGGAGCCAAGGAATACAGGATATGTTGAACTTA
ACGATGGACGGAAACTTTGTCTCGAGTGTCTGGACTCAGCGGTCATGGACACTTTTCAAT
GTCAACCTCTCTACTTGCAGATACAAGAATTCTACGAAGGGCTTTTCATGAAGGTGGAGC
AGGACGTTCCACTTCTTTTAGTTGAGAGGCAAGCACTTAACTAAGCCAGAGAAGGTGAAA
AGAATGGTCACTATCACATGCCAGAGACGAGAGGACTCTGTCTTTCAGAAGAACAAACTG
TTAGCACTGTAAGAAAGAGATCGAAGCATGGGACAGGAAACTGGGCTGGGAATATGATTA
CAGAGCCTTACAAGCTAACGCGTCAATGCGAGGTCACTGCCATTCTCATCTTATTTGGGC
TCCCTAG*CTACTCACCCGGTTCGATCCTAGCTCATGAGATGATGCATGCGTGGATGCGC
CTCAAAGGATT

QA 2 732 2 732
DS 

RD RR2AB65JQ 862 0 0
AATACAGGATATGTTGAACTTAACGATGGACGGAAACTTTGTCTCGAGTGTCTGGACTCA
GCGGTCATGGACACTTTTCAATGTCAACCTCTCTACTTGCAGATACAAGAATTCTACGAA
GGGCTTTTCATGAAGGTGGAGCAGGACGTTCCACTTCTTTTAGTTGAGAGGCAAGCACTT
AACTAAGCCAGAGAAGGTGAAAAGAATGGTCACTATCACATGCCAGAGACGAGAGGACTC
TGTCTTTCAGAAGAACAAACTGTTAGCACTGTAAGAAAGAGATCGAAGCATGGGACAGGA
AACTGGGCTGGGAATATGATTACAGAGCCTTACAAGCTAACGCGTCAATGCGAGGTCACT
GCCATTCTCATCTTATTTGGGCTCCCTAGGCTACTCACC*GGTTCGATCCTAGCTCATGA
GATGATGCATGCGTGGATGCGCCTCAAAGGATTCCGGACACTGAGCCAAGACGTTGAAGA
AGGAATATGTCAAGTGATGGCTCACAAGTGGTTAGAAGCCGAGTTAGCTGCTGGTTCAAG
AAACAGCAATGTTGCATCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTAGAGGAGTGAAGAAGGG
ACCAAGATCGCAGTACGAGAGGAAGCTTGGTGAGTTTTTCAAGCACCAAATCGAGTCTGA
TGCTTTTCCGGTTTATGGAGACGGGTTCAGGGCCGGGAGGTTAGCGGTTAACAAGTATGG
TTTGCCTAAAACACTTGAGCATATACAGATGACCGGTAGATTCCCAGTTTAAGAACAAAG
TCTTTTGTTTTTTCGATTGTGATACCCTTTTTTATTTATAGGATCGTCATTATTCTTATG
TGATTGAATTATAGTTGTAATC

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR2A416JQ 853 0 0
TCAGCGGTCATGGACACTTTTCAATGTCAACCTCTCTACTTGCAGATACAAGAATTCTAC
GAAGGGCTTTTCATGAAGGTGGAGCAGGACGTTCCACTTCTTTTAGTTGAGAGGCAAGCA
CTTAACGAAGCCAGAGAAGGTGAAAAGAATGGTCACTATCACATGCCAGAGACGAGAGGA
CTCTGTCTTTCAGAAGAACAAACTGTTAGCACTGTAAGAAAGAGATCGAAGCATGGGACA
GGAAACTGGGCTGGGAATATGATTACAGAGCCTTACAAGCTAACGCGTCAATGCGAGGTC
ACTGCCATTCTCATCTTATTTGGGCTCCCTAGGCTACTCACC*GGTTCGATCCTAGCTCA
TGAGATGATGCATGCGTGGATGCGCCTCAAAGGATTCCGGACACTGAGCCAAGACGTTGA
AGAAGGAATATGTCAAGTGATGGCTCACAAGTGGTTAGAAGCCGAGTTAGCTGCTGGTTC
AAGAAACAGCAATGTTGCATCATCATCATCATCTTCTCCTTCTTCTAGAGGAGTGAAGAA
GGGACCAAGATCGCAGTACGAGAGGAAGCTTGGTGAGTTTTTCAAGCACCAAATCGAGTT
TGATGCTTCTCCGGTTTATGGAGACGGGTTCAGGGCCGGGAGGTTAGCGGTTAACAAGTA
TGGTTTGCCTAAAACACTTGAGCATATACAGATGACCGGTAGATTCCCAGTTTAAGAACA
AAGTCTTTTGTTTTTTCGATTGTGATACCCTTTTTTATT*ATAGGATCGTCATTATTCTT
ATGTGATTGAATTATAGTTGTAATCATTCCATGATTCTTTTGTATTTCTATCATCAGATT
TAGAGTTGGCCCG

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 2

CO CL2094Contig1 723 2 1 U
GGATCCACAACAAAGCCACCAAACAACTCGCTCCAAAACCCCATCGTTCTAACGATAACA
AATGGCAACTGCTAATCCTGAAACCGCTAAAGCCACGCCTGCCTCCGTGGACACAGCCAA
TCCGGAAGATCTCAAGAAAGTTTTCGACCAGTTCGACTCCAACGGCGGCGGAAAGATCTC
CGCGTCCGAGCTCGGCGGCGTTTTCAAGGCCATGGGGACTTCATACACGGAGGCTGAACT
CACCAGCGCGCTTGAAGATGTCGACGCCGATCGCGACGGCTTCATCGACGTGGACGAGTT
CTCTACTCTCTGCCGCTCGTCTTCCACCGCGTCAGAGATCCGCGACGCCTTCGACCTCTA
CGACCACGACAAGAACGGACTCATCTCCGCCTCTGAGCTGCACCAGGTCCTTAACCGCCT
CGGGATGTCGTGCTCCGCAGAAGAGTGCTCTCGGATGATCGGGCCTGTGGATGCCGACGG
CGATGGGAATGTTAGTTTCGAAGAGTTTCAGAAGATGATGACGTCATCATCCTCCTCCCT
CGCCGACAGCAACAACGGATCCACTGCTGCGGCAAACAGAGGTTCGACCTAAGCCTAGGG
TTTTAGATTCGTTCGATCTGCTTATCTGGATTCTGTGTACACAACTGGATCATGTACTTT
GGCAATAGTTTTACTTTGGTTGTACTTTTAAAAATGTAATAAAAGTCTAACTCATCTCTT
TTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2BG20JQ C 1
AF RR2BG20TF U 1
BS 1 723 RR2BG20TF

RD RR2BG20JQ 723 0 0
GGATCCACAACAAAGCCACCAAACAACTCGCTCCAAAACCCCATCGTTCTAACGATAACA
AATGGCAACTGCTAATCCTGAAACCGCTAAAGCCACGCCTGCCTCCGTGGACACAGCCAA
TCCGGAAGATCTCAAGAAAGTTTTCGACCAGTTCGACTCCAACGGCGGCGGAAAGATCTC
CGCGTCCGAGCTCGGCGGCGTTTTCAAGGCCATGGGGACTTCATACACGGAGGCTGAACT
CACCAGCGCGCTTGAAGATGTCGACGCCGATCGCGACGGCTTCATCGACGTGGACGAGTT
CTCTACTCTCTGCCGCTCGTCTTCCACCGCGTCAGAGATCCGCGACGCCTTCGACCTCTA
CGACCACGACAAGAACGGACTCATCTCCGCCTCTGAGCTGCACCAGGTCCTTAACCGCCT
CGGGATGTCGTGCTCCGCAGAAGAGTGCTCTCGGATGATCGGGCCTGTGGATGCCGACGG
CGATGGGAATGTTAGTTTCGAAGAGTTTCAGAAGATGATGACGTCATCATCCTCCTCCCT
CGCCGACAGCAACAACGGATCCACTGCTGCGGCAAACAGAGGTTCGACCTAAGCCTAGGG
TTTTAGATTCGTTCGATCTGCTTATCTGGATTCTGTGTACACAACTGGATCATGTACTTT
GGCAATAGTTTTACTTTGGTTGTACTTTTAAAAATGTAATAAAAGTCTAACTCATCTCTT
TTC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2BG20TF 723 0 0
GGATCCACAACAAAGCCACCAAACAACTCGCTCCAAAACCCCATCGTTCTAACGATAACA
AATGGCAACTGCTAATCCTGAAACCGCTAAAGCCACGCCTGCCTCCGTGGACACAGCCAA
TCCGGAAGATCTCAAGAAAGTTTTCGACCAGTTCGACTCCAACGGCGGCGGAAAGATCTC
CGCGTCCGAGCTCGGCGGCGTTTTCAAGGCCATGGGGACTTCATACACGGAGGCTGAACT
CACCAGCGCGCTTGAAGATGTCGACGCCGATCGCGACGGCTTCATCGACGTGGACGAGTT
CTCTACTCTCTGCCGCTCGTCTTCCACCGCGTCAGAGATCCGCGACGCCTTCGACCTCTA
CGACCACGACAAGAACGGACTCATCTCCGCCTCTGAGCTGCACCAGGTCCTTAACCGCCT
CGGGATGTCGTGCTCCGCAGAAGAGTGCTCTCGGATGATCGGGCCTGTGGATGCCGACGG
CGATGGGAATGTTAGTTTCGAAGAGTTTCAGAAGATGATGACGTCATCATCCTCCTCCCT
CGCCGACAGCAACAACGGATCCACTGCTGCGGCAAACAGAGGTTCGACCTAAGCCTAGGG
TTTTAGATTCGTTCGATCTGCTTATCTGGATTCTGTGTACACAACTGGATCATGTACTTT
GGCAATAGTTTTACTTTGGTTGTACTTTTAAAAATGTAATAAAAGTCTAACTCATCTCTT
TTC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 4

CO CL2095Contig1 904 4 9 U
TTTTTCCCTCTTAATTAGGCGGCGGTAAAGTTTTCTCCGGTATCAGAAGCTTTGTGGTTT
CTCGAGCGATTCTCTCTGAAGTAGCCTTCTCCGACCGACTACATCTCCGGTGTACCTGCT
TTGTTCAGACACAACTGCAGTTCTAGATAAATAATGTCGGAGGTTAAACCATTGATCGGT
CTTAAATGGGAACCAAAGCTTCCTTCCTTAGCTTTGGACTCCAAAACTGGTTCTAGTACA
AGTAAAGTAGCTGAGAGACACGAAAGCAGCTCTCTTTGGACGTCTAACTCAGAGCTCGTT
GATGGTCTTTGTCTTCCACCTACTGATCCAAAGAAAGTTAACAAGATGATTAGAAAGCAA
ATCAAAGACACCACTGGATCAAACTGGTTTGATATGCCTGCACCAACAATGACTCCTGAG
TTGAAAAGGGACCTTCAGTTGCTTAAGTTGAGGGATGTAATGGATCCTAAGAAACACTAC
AAGAGAGTTGCGTCCCAGTCAAAACTAGCTGAAAAGTATTTCCAGGTTGGTACAGTAATT
GAACCAGCGCAAGAGTTCTATGATCGACTGTCAAAGAAGGATAGAAAAACAAGCCTTGCT
GATGACTTGGTTTCAGACCCCAAAGTTTCTCAGTACAGGAAGCGTAAAGTGAGGGAGATT
GAAGAGAAGAACAGATTTAATCAGGATAAGAGGTGGAAGAGAAAGGGAAGTGACTCCAAG
AAAACAAAACATAGAAGGCACTGAATTGCATTGATCAGAGAATATGATCTCGTTGTTTGG
TTCACCTTACCTTGTAATGACAGACTACTGTTGTTGTTTTTACAGCCTTCGTTTGAAGGA
TTGGCTCTGTTGTTTACATGTCTGGATAATTAAAAAAGCTTTGATGGGGAATTGATTAGA
TCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2G539TF U 1
AF RR2FU54TF U 40
AF RR2FU54JQ C 145
AF RR2G539JQ C 310
BS 1 269 RR2G539TF
BS 270 270 RR2FU54TF
BS 271 638 RR2G539TF
BS 639 639 RR2FU54TF
BS 640 676 RR2G539TF
BS 677 677 RR2FU54JQ
BS 678 680 RR2G539TF
BS 681 892 RR2FU54JQ
BS 893 904 RR2G539JQ

RD RR2G539TF 687 0 0
TTTTTCCCTCTTAATTAGGCGGCGGTAAAGTTTTCTCCGGTATCAGAAGCTTTGTGGTTT
CTCGAGCGATTCTCTCTGAAGTAGCCTTCTCCGACCGACTACATCTCCGGTGTACCTGCT
TTGTTCAGACACAACTGCAGTTCTAGATAAATAATGTCGGAGGTTAAACCATTGATCGGT
CTTAAATGGGAACCAAAGCTTCCTTCCTTAGCTTTGGACTCCAAAACTGGTTCTAGTACA
AGTAAAGTAGCTGAGAGACACGAAAGCAGTTCTCTTTGGACGTCTAACTCAGAGCTCGTT
GATGGTCTTTGTCTTCCACCTACTGATCCAAAGAAAGTTAACAAGATGATTAGAAAGCAA
ATCAAAGACACCACTGGATCAAACTGGTTTGATATGCCTGCACCAACAATGACTCCTGAG
TTGAAAAGGGACCTTCAGTTGCTTAAGTTGAGGGATGTAATGGATCCTAAGAAACACTAC
AAGAGAGTTGCGTCCCAGTCAAAACTAGCTGAAAAGTATTTCCAGGTTGGTACAGTAATT
GAACCAGCGCAAGAGTTCTATGATCGACTGTCAAAGAAGGATAGAAAAACAAGCCTTGCT
GATGACTTGGTTTCAGACCCCAAAGTTTCTCAGTACAG*AAGCGTAAAGTGAGGGAGATT
GAAGAGAAGAACAGATCTAA
TCAGATA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2FU54TF 641 0 0
GG
ATCAGAAGCTTTGTGGTTTCTCGAGCGATTCTCTCTGAAGTAGCCTTCTCCGACCGACTA
CATCTCCGGTGTACCTGCTTTGTTCAGACACAACTGCAGTTCTAGATAAATAATGTCGGA
GGTTAAACCATTGATCGGTCTTAAATGGGAACCAAAGCTTCCTTCCTTAGCTTTGGACTC
CAAAACTGGTTCTAGTACAAGTAAAGTAGCTGAGAGACACGAAAGCAGCTCTCTTTGGAC
GTCTAACTCAGAGCTCGTTGATGGTCTTTGTCTTCCACCTACTGATCCAAAGAAAGTTAA
CAAGATGATTAGAAAGCAAATCAAAGACACCACTGGATCAAACTGGTTTGATATGCCTGC
ACCAACAATGACTCCTGAGTTGAAAAGGGACCTTCAGTTGCTTAAGTTGAGGGATGTAAT
GGATCCTAAGAAACACTACAAGAGAGTTGCGTCCCAGTCAAAACTAGCTGAAAAGTATTT
CCAGGTTGGTACAGTAATTGAACCAGCGCAAGAGTTCTATGATCGACTGTCAAAGAAGGA
TAGAAAAACAAGCCTTGCTGATGACTTGGTTTCAGACCCCAAAGTTTCTCAGTACAGGAA
GCGTAAAGTGAGGGAGATTGAAGAGAAGAACAGAT
CTAA

QA 3 637 3 637
DS 

RD RR2FU54JQ 749 0 0
AGATAAATAATGTCGGAGGTTAAACCATTGATCGGTCTTAAATGGGAACCAAAGCTTCCT
TCCTTAGCTTTGGACTCCAAAACTGGTTCTAGTACAAGTAAAGTAGCTGAGAGACACGAA
AGCAGCTCTCTTTGGACGTCTAACTCAGAGCTCGTTGATGGTCTTTGTCTTCCACCTACT
GATCCAAAGAAAGTTAACAAGATGATTAGAAAGCAAATCAAAGACACCACTGGATCAAAC
TGGTTTGATATGCCTGCACCAACAATGACTCCTGAGTTGAAAAGGGACCTTCAGTTGCTT
AAGTTGAGGGATGTAATGGATCCTAAGAAACACTACAAGAGAGTTGCGTCCCAGTCAAAA
CTAGCTGAAAAGTATTTCCAGGTTGGTACAGTAATTGAACCAGCGCAAGAGTTTTATGAT
CGACTGTCAAAGAAGGATAGAAAAACAAGCCTTGCTGATGACTTGGTTTCAGACCCCAAA
GTTTCTCAGTACAGGAAGCGTAAAGTGAGGGAGATTGAAGAGAAGAACAGATTTAATCAG
GATAAGAGGTGGAAGAGAAAGGGAAGTGACTCCAAGAAAACAAAACATAGAAGGCACTGA
ATTGCATTGATCAGAGAATATGATCTCGTTGTTTGGTTCACCTTACCTTGTAATGACAGA
CTACTGTTGTTGTTTTTACAGCCTTCGTTTGAAGGATTGGCTCTGTTGTTTACATGTCTG
GATAATTAAAAAAGCTTTGATGGGGAAT
G

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2G539JQ 595 0 0
TGTCTTCCACCTACTGATCCAAAGAAAGTTAACAAGATGATTAGAAAGCAAATCAAAGAC
ACCACTGGATCAAACTGGTTTGATATGCCTGCACCAACAATGACTCCTGAGTTGAAAAGG
GACCTTCAGTTGCTTAAGTTGAGGGATGTAATGGATCCTAAGAAACACTACAAGAGAGTT
GCGTCCCAGTCAAAACTAGCTGAAAAGTATTTCCAGGTTGGTACAGTAATTGAACCAGCG
CAAGAGTTTTATGATCGACTGTCAAAGAAGGATAGAAAAACAAGCCTTGCTGATGACTTG
GTTTCAGACCCCAAAGTTTCTCAGTACAGGAAGCGTAAAGTGAGGGAGATTGAAGAGAAG
AACAGATTTAATCAGGATAAGAGGTGGAAGAGAAAGGGAAGTGACTCCAAGAAAACAAAA
CATAGAAGGCACTGAATTGCATTGATCAGAGAATATGATCTCGTTGTTTGGTTCACCTTA
CCTTGTAATGACAGACTACTGTTGTTGTTTTTACAGCCTTCGTTTGAAGGATTGGCTTTG
TTGTTTACATGTCTGGATAATTAAAAAAGCTTTGATGGGGAATTGATTAGATCAT

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 4

CO CL2096Contig1 864 4 25 U
GGAACTCCCAAGGAAGAGAAAGATCTAAAGGTCGAATGGTCCAGGAGAAGAATCTCTCTT
AGATCGTTTGATCCGATCCGAAGAAAAAGATGGGAATCCTGTTCACGCGGATGTTCTCTT
CAGTGTTCGGCAACAAAGAAGCTCGTATCCTCGTCCTCGGTCTCGACAATGCTGGCAAAA
CTACTATCCTCTATCGGCTTCAGATGGGGGAAGTTGTCTCCACGATTCCGACTATTGGGT
TTAACGTCGAGACTGTGCAGTACAACAATATCAAGTTTCAGGTCTGGGATTTAGGTGGAC
AAACGAGCATCAGGCCGTACTGGCGATGTTATTTTCCAAATACACAAGCAGTGATCTATG
TTGTTGACTCGAGCGATACAGATCGAATCGGGGTGGCAAAGGAGGAGTTTCATGCAATTT
TGGAGGAAGAGGAGCTAAAAGGTGCGGTTGTTCTCATATTTGCAAACAAGCAGGATCTTC
CTGGTGCACTCGATGATGCCGCTGTGACAGAAGCCTTGGAGTTGCATAAGATAAAGAGTC
GCCAGTGGGCAATCTTCAAGACTTGTGCTGTTAAAGGCGAGGGGCTTTTTGAGGGTTTGG
ACTGGTTGAGTAATACATTGAAGTCAGGAAGTGGGTAGAAAACTTTCTCGTCATCCGCTC
AACATTGTATCTTATCTTCTTTACGAATGTTTAGTGATTTGCTTAGTTCTTCATTTTAAA
GAGTTAATATCAATGACATGTTCACTTATTACTCTTTTTTGTTTCCTTTGAGAGAGAAAA
AAATTCTACACGGATCTGTGATTGGAACCCATAAGAGATATATCATGTTTTACTTTATTA
ATATGTTTTCTTGTAGGATATACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 
25 10 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BB63TF U 1
AF RR2D729TF U 1
AF RR2D729JQ C 160
AF RR2BB63JQ C 230
BS 1 7 RR2BB63TF
BS 8 8 RR2D729TF
BS 9 74 RR2BB63TF
BS 75 82 RR2D729TF
BS 83 124 RR2BB63TF
BS 125 125 RR2D729TF
BS 126 181 RR2BB63TF
BS 182 182 RR2D729TF
BS 183 184 RR2BB63TF
BS 185 185 RR2D729TF
BS 186 232 RR2BB63TF
BS 233 233 RR2D729TF
BS 234 238 RR2BB63TF
BS 239 239 RR2D729TF
BS 240 241 RR2BB63TF
BS 242 242 RR2D729TF
BS 243 436 RR2BB63TF
BS 437 437 RR2D729TF
BS 438 514 RR2BB63TF
BS 515 515 RR2D729TF
BS 516 685 RR2BB63TF
BS 686 686 RR2D729TF
BS 687 777 RR2BB63TF
BS 778 839 RR2D729JQ
BS 840 864 RR2BB63JQ

RD RR2BB63TF 777 0 0
GGAACTCTCAAGGAAGAGAAAGATCTAAAGGTCGAATGGTCCAGGAGAAGAATCTCTCTT
AGATCGTTTGATCC********GAAAAAGATGGGAATCCTGTTCACGCGGATGTTCTCTT
CAGTTTTCGGCAACAAAGAAGCTCGTATCCTCGTCCTCGGTCTCGACAATGCTGGCAAAA
CCACAATCCTCTATCGGCTTCAGATGGGGGAAGTTGTCTCCACGATTCCGACGATTGGAT
TCAACGTCGAGACTGTGCAGTACAACAATATCAAGTTTCAGGTCTGGGATTTAGGTGGAC
AAACGAGCATCAGGCCGTACTGGCGATGTTATTTTCCAAATACACAAGCAGTGATCTATG
TTGTTGACTCGAGCGATACAGATCGAATCGGGGTGGCAAAGGAGGAGTTTCATGCAATTT
TGGAGGAAGAGGAGCTGAAAGGTGCGGTTGTTCTCATATTTGCAAACAAGCAGGATCTTC
CTGGTGCACTCGATGATGCCGCTGTGACAGAAGCGTTGGAGTTGCATAAGATAAAGAGTC
GCCAGTGGGCAATCTTCAAGACTTGTGCTGTTAAAGGCGAGGGGCTTTTTGAGGGTTTGG
ACTGGTTGAGTAATACATTGAAGTCAGGAAGTGGGTAGAAAACTTTCTCGTCATCCGCTC
AACATTGTATCTTATCTTCTTTACGTATGTTTAGTGATTTGCTTAGTTCTTCATTTTAAA
GAGTTAATATCAATGACATGTTCACTTATTACTCTTTTTTGTTTCCTTTGAGAGAGA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2D729TF 752 0 0
GGAACTCCCAAGGAAGAGAAAGATCTGAAGGTCGAATGGTCGAGGAGAAGAATCTCTCTT
AGATCGTTTGATCTGATCCGAAGAAGAAGATGGGAATCCTGTTCACGCGGATGTTCTCTT
CAGTGTTCGGCAACAAAGAAGCTCGTATCCTCGTCCTCGGTCTCGACAATGCTGGCAAAA
CTACTATCCTCTATCGGCTTCAGATGGGGGAAGTTGTCTCCACGATTCCGACTATTGGGT
TTAACGTGGAGACTGTGCAGTACAACAATATCAAGTTTCAGGTTTGGGATTTAGGTGGAC
AAACGAGCATCAGGCCGTACTGGCGATGTTATTTTCCAAATACACAAGCAGTGATCTATG
TTGTTGACTCGAGCGATACAGATCGAATCGGGGTGGCAAAGGAGGAGTTTCATGCAATTT
TGGAGGAAGAGGAGCTAAAAGGTGCGGTTGTTCTCATATTTGCAAACAAGCAGGATCTTC
CTGGTGCACTCGATGATGCCGCTGTGACAGAAGCCTTGGAGTTGCATAAGATAAAGAGTC
GCCAGTGGGCAATCTTCAAGACTTGTGCTGTTAAAGGCGAGGGGCTTTTTGAGGGTTTGG
ACTGGTTGAGTAATACATTGAAGTCAGGAAGTGGGTAGAAAACTTTCTCGTCATCCGCTC
AACATTGTATCTTATCTTCTTTACGATTGTTTAGTGATTTGCTTAGTTCTTCATTTTAAA
GAGTTAATATCAATGACATGTTCACTTATTAC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2D729JQ 680 0 0
GTCTCGACAATGCTGGCAAAACTACTATCCTCTATCGGCTTCAGATGGGGGAAGTTGTCT
CCACGATTCCGACTATTGGGTTTAACGTGGAGACTGTGCAGTACAACAATATCAAGTTTC
AGGTTTGGGATTTAGGTGGACAAACGAGCATCAGGCCGTACTGGCGATGTTATTTTCCAA
ATACACAAGCAGTGATCTATGTTGTTGACTCGAGCGATACAGATCGAATCGGGGTGGCAA
AGGAGGAGTTTCATGCAATTTTGGAGGAAGAGGAGCTAAAAGGTGCGGTTGTTTTCATAT
TTGCAAACAAGCAGGATTTTCCTGGTGCACTCGATGATGCCGCTGTGACAGAAGCCTTGG
AGTTGCATAAGATAAAGAGTCGCCAGTGGGCAATCTTCAAGACTTGTGCTGTTAAAGGCG
AGGGGCTTTTTGAGGGTTTGGACTGGTTGAGTAATACATTGAAGTCAGGAAGTGGGTAGA
AAACTTTCTCGTCATCCGCTCAACATTGTATCTTATCTTCTTTACGATTGTTTAGTGATT
TGCTTAGTTCTTCATTTTAAAGAGTTAATATCAATGACATGTTCACTTATTACTCTTTTT
TGTTTCCTTTGAGAGAGAAAAAAATTCTACACGGATCTGTGATTGGAACCCATAAGAGAT
ATATCATGTTTTACTTTATT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2BB63JQ 635 0 0
GACGATTGGATTC
AACGTCGAGACTGTGCAGTACAACAATATCAAGTTTCAGGTCTGGGATTTAGGTGGACAA
ACGAGCATCAGGCCGTACTGGCGATGTTATTTTCCAAATACACAAGCAGTGATCTATGTT
GTTGACTCGAGCGATACAGATCGAATCGGGGTGGCAAAGGAGGAGTTTCATGCAATTTTG
GAGGAAGAGGAGCTGAAAGGTGCGGTTGTTCTCATATTTGCAAACAAGCAGGATCTTCCT
GGTGCACTCGATGATGCCGCTGTGACAGAAGCGTTGGAGTTGCATAAGATAAAGAGTCGC
CAGTGGGCAATCTTCAAGACTTGTGCTGTTAAAGGCGAGGGGCTTTTTGAGGGTTTGGAC
TGGTTGAGTAATACATTGAAGTCAGGAAGTGGGTAGAAAACTTTCTCGTCATCCGCTCAA
CATTGTATCTTATCTTCTTTACGTATGTTTAGTGATTTGCTTAGTTCTTCATTTTAAAGA
GTTAATATCAATGACATGTTCACTTATTACTCTTTTTTGTTTCCTTTGAGAGAGAAAAAA
ATTCTACACGGATCTGTGATTGGAACCCATAAGAGATATATCATGTTTTACTTTATTAAT
ATGTTTTCTTGTAGGATATACC

QA 14 635 14 635
DS 



AS 1 4

CO CL2097Contig1 875 4 3 U
AAAAAACAGAGGGAGTATGAAATATAACCATTGCTGATACATTTGAGTGTTTAAAAGAAA
AAGAAAAACAACAAAAGAGTAAAGAATGTATTAAAGTTTGTATCATTCCTTTTGTATGGC
TCAGGAGAATGAAGAGAAGAACTCTGCCTCTCATCATAATCTTTTTCACCTTCTTCTTGA
TAGAAGTATGCCAGTAACTATAGCTGTTCCTGTTACTGCAATCGCCACTGATGATACTAT
CCTCTTCACTGTAAACACTGAGTCGTCGCTCGGTATCTCCATTAGATCTTTCATCGTTAT
AGGTTGCTTCCAGTTCTTCTTGATTCAATTAATATGCCCTCTGCCGACAACTGCAACGAC
CGAGTTGTGCTCACTTGCAACTCTCAGCAAAGAGGATGCCATGTACTGGTCTCGCTCATG
TACAAGAGTCTCCATGAGAGATGGAAACTCCTTGCTCATTTCTTGAATCACCAGAGTCAC
CATATCCACATTGTCCATTTCTTTCAGCATTCTGTCGAGTTCTTCAGCGCTCGGCAAGAA
GACAGCTTGAAACATCAAGGAGTAAAGAAACTTTACCTTGTGCCATAGAGGCATCTTTGC
CCATGTTCTTTTTAACGTAATCTGTACAGGACGATCTACAAGTATCACACCGCCTCCGTA
TTTAAGGGCCTCTTCATATGCCACACGAAACTCAGTACCAGGAAAAACCTCCAGCTGACT
TGCGATCTTTGCAAGAAACCAGCCATAGAGTATTCCAAACGTGTTCTGTTTCTGCTTCCA
ACTTTCAATCATGTCCGACATGGTTGGAATCTTCATAGTCTGAGGTTGGAGAATAGACAC
TCGGCTTGCACACAACTCTACGAAGACAGCCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF71JQ U 167
AF RR2H338JQ U 1
AF RR2H338TF C 173
AF RR2AF71TF C 174
BS 1 661 RR2H338JQ
BS 662 817 RR2H338TF
BS 818 875 RR2AF71TF

RD RR2AF71JQ 225 0 0
CACCTTC
TTCTTGATAGAAGTATGCCAGTAACTATAGCTGTTCCTGTTACTGCAATCGCCACTGATG
ATACTATCCTCTTCACTGTAAACACTGAGTCGTCGCTCGGTATCTCCATTAAATCTTTCA
TCGTTATAGGTTGCTTCCAGTTCTTCTTGATTCCATTAATATGCCCTCTGCCGACAACTG
CAACGACCGAGTTGTGCTCACTTGCAACTCTCAGCAAA

QA 8 225 8 225
DS 

RD RR2H338JQ 661 0 0
AAAAAACAGAGGGAGTATGAAATATAACCATTGCTGATACATTTGAGTGTTTAAAAGAAA
AAGAAAAACAACAAAAGAGTAAAGAATGTATTAAAGTTTGTATCATTCCTTTTGTATGGC
TCAGGAGAATGAAGAGAAGAACTCTGCCTCTCATCATAATCTTTTTCACCTTCTTCTTGA
TAGAAGTATGCCAGTAACTATAGCTGTTCCTGTTACTGCAATCGCCACTGATGATACTAT
CCTCTTCACTGTAAACACTGAGTCGTCGCTCGGTATCTCCATTAGATCTTTCATCGTTAT
AGGTTGCTTCCAGTTCTTCTTGATTCAATTAATATGCCCTCTGCCGACAACTGCAACGAC
CGAGTTGTGCTCACTTGCAACTCTCAGCAAAGAGGATGCCATGTACTGGTCTCGCTCATG
TACAAGAGTCTCCATGAGAGATGGAAACTCCTTGCTCATTTCTTGAATCACCAGAGTCAC
CATATCCACATTGTCCATTTCTTTCAGCATTCTGTCGAGTTCTTCAGCGCTCGGCAAGAA
GACAGCTTGAAACATCAAGGAGTAAAGAAACTTTACCTTGTGCCATAGAGGCATCTTTGC
CCATGTTCTTTTTAACGTAATCTGTACAGGACGATCTACAAGTATCACACCGCCTCCGTA
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2H338TF 646 0 0
C
TTCTTGATAGAAGTATGCCAGTAACTATAGCTGTTCCTGTTACTGCAATCGCCACTGATG
ATACTATCCTCTTCACTGTAAACACTGAGTCGTCGCTCGGTATCTCCATTAGATCTTTCA
TCGTTATAGGTTGCTTCCAGTTCTTCTTGATTCAATTAATATGCCCTCTGCCGACAACTG
CAACGACCGAGTTGTGCTCACTTGCAACTCTCAGCAAAGAGGATGCCATGTACTGGTCTC
GCTCATGTACAAGAGTCTCCATGAGAGATGGAAACTCCTTGCTCATTTCTTGAATCACCA
GAGTCACCATATCCACATTGTCCATTTCTTTCAGCATTCTGTCGAGTTCTTCAGCGCTCG
GCAAGAAGACAGCTTGAAACATCAAGGAGTAAAGAAACTTTACCTTGTGCCATAGAGGCA
TCTTTGCCCATGTTCTTTTTAACGTAATCTGTACAGGACGATCTACAAGTATCACACCGC
CTCCGTATTTAAGGGCCTCTTCATATGCCACACGAAACTCAGTACCAGGAAAAACCTCCA
GCTGACTTGCGATCTTTGCAAGAAACCAGCCATAGAGTATTCCAAACGTGTTCTGTTTCT
GCTTCCAACTTTCAATCATGTCCGACATGGTTGGAATCTTCATA
C

QA 2 645 2 645
DS 

RD RR2AF71TF 702 0 0
TTCTTGATAGAAGTATGCCAGTAACTATAGCTGTTC*TGTTACTGCAATCGCCACTGATG
ATACTATCCTCTTCACTGTAAACACTGAGTCGTCGCTCGGTATCTCCATTAGATCTTTCA
TCGTTATAGGTTGCTTCCAGTTCTTCTTGATTCCATTAATATGCCCTCTGCCGACAACTG
CAACGACCGAGTTGTGCTCACTTGCAACTCTCAGCAAAGAGGATGCCATGTACTGGTCTC
GCTCATGTACAAGAGTCTCCATGAGAGATGGAAACTCCTTGCTCATTTCTTGAATCACCA
GAGTCACCATATCCACATTGTCCATTTCTTTCAGCATTCTGTCGAGTTCTTCAGCGCTCG
GCAAGAAGACAGCTTGAAACATCAAGGAGTAAAGAAACTTTACCTTGTGCCATAGAGGCA
TCTTTGCCCATGTTCTTTTTAACGTAATCTGTACAGGACGATCTCCAAGTATCACACCGC
CTCCGTATTTAAGGGCCTCTTCATATGCCACACGAAACTCAGTACCAGGAAAAACCTCCA
GCTGACTTGCGATCTTTGCAAGAAACCAGCCATAGAGTATTCCAAACGTGTTCTGTTTCT
GCTTCCAACTTTCAATCATGTCCGACATGGTTGGAATCTTCATAGTCTGAGGTTGGAGAA
TAGACACTCGGCTTGCACACAACTCTACGAAGACAGCCTCTC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL2098Contig1 708 2 3 U
TCCCAGAGCTCACCCAACAGATGTGGGATTCAAAGAACATGATGTGCGCCGCAGACCCGC
GCCACGGCCGGTACTTGACAGCGTCGGCAATGTTCCGTGGCAAAATGAGCACAAAAGAAG
TGGACGAGCAGATGATAAACGTGCAGAACAAAAACTCATCCTACTTCGTGGAATGGATAC
CGAACAACGTGAAGTCAAGCGTGTGTGACATAGCGCCTCGAGGTCTCTCCATGGCGTCGA
CCTTTATAGGGAATTCCACGTCGATCCAAGAGATGTCTAGGAGGGTGAGTGAGCAGTTCA
CAGCCATGTTCAGGAGGAAAGCTTTCTTGCATTGGTACACAGGTGAAGGAATGGACGAGA
TGGAGTTCACTGAAGCTGAGAGCAACATGAACGATCTGGTGTCTGAGTATCAGCAATACC
AAGACGCAACCGCAGATGAAGAAGGCGAGTATGAAGAAGAGGAGGAAGAAGAAGTGGAGT
ATCAAGACTGAGAATACCACCGTATCACCATCTCATGTTTCTTTATCCCTGCCCTTAGTT
TTTATTGAGTTTCTTATGTACTTGTTTTGTGATTGTCTTGTGTGTAAAAGTGAGGTTGGA
GCTCAGTATTTGTTTAATTCGTCGTGGTGTTGTTATAAATGAAGTCTATTGTGTGTGTGT
TTATGCTCTTGCTGCTTCAAATAATTAGTTCCCGGATTAGAGTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ64JQ C 1
AF RR2C619TF U 232
BS 1 248 RR2EZ64JQ
BS 249 661 RR2C619TF
BS 662 708 RR2EZ64JQ

RD RR2EZ64JQ 708 0 0
TCCCAGAGCTCACCCAACAGATGTGGGATTCAAAGAACATGATGTGCGCCGCAGACCCGC
GCCACGGCCGGTACTTGACAGCGTCGGCAATGTTCCGTGGCAAAATGAGCACAAAAGAAG
TGGACGAGCAGATGATAAACGTGCAGAACAAAAACTCATCCTACTTCGTGGAATGGATAC
CGAACAACGTGAAGTCAAGCGTGTGTGACATAGCGCCTCGAGGTCTCTCCATGGCGTCGA
CCTTTATAGGGAATTCCACGTCGATCCAAGAGATGTTTAGGAGGGTGAGTGAGCAGTTCA
CAGCCATGTTCAGGAGGAAAGCTTTCTTGCATTGGTACACAGGTGAAGGAATGGACGAGA
TGGAGTTCACTGAAGCTGAGAGCAACATGAACGATCTGGTGTCTTAGTATCAGCAATACC
AAGACGCAACCGCAGATGAAGAAGGCGAGTATGAAGAAGAGGAGGAAGAAGAAGTGGAGT
ATCAAGACTGAGAATACCACCGTATCACCATCTCATGTTTCTTTATCCCTGCCCTTAGTT
TTTATTGAGTTTCTTATGTACTTGTTTTGTGATTGTCTTGTGTGTAAAAGTGAGGTTGGA
GCTCAGTATTTGTTTAATTCGTCGTGGTGTTGTTATAAATGAAGTCTATTGTGTGTGTGT
TTATGCTCTTGCTGCTTCAAATAATTAGTTCCCGGATTAGAGTTATGC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2C619TF 430 0 0
GGGCGTCGACCTTTATA
GGGAATTCCACGTCGATCCAAGAGATGTCTAGGAGGGTGAGTGAGCAGTTCACAGCCATG
TTCAGGAGGAAAGCTTTCTTGCATTGGTACACAGGTGAAGGAATGGACGAGATGGAGTTC
ACTGAAGCTGAGAGCAACATGAACGATCTGGTGTCTGAGTATCAGCAATACCAAGACGCA
ACCGCAGATGAAGAAGGCGAGTATGAAGAAGAGGAGGAAGAAGAAGTGGAGTATCAAGAC
TGAGAATACCACCGTATCACCATCTCATGTTTCTTTATCCCTGCCCTTAGTTTTTATTGA
GTTTCTTATGTACTTGTTTTGTGATTGTCTTGTGTGTAAAAGTGAGGTTGGAGCTCAGTA
TTTGTTTAATTCGTCGTGGTGTTGTTATAAATGAAGTCTATTGTGTGTGTGTT

QA 18 430 18 430
DS 



AS 1 4

CO CL2099Contig1 539 4 3 U
GGAACATAGAGAGATTAAGAGATCACGTGCCGTGCAGATCAATATCACAATTTTCTATGA
TGGCTTCGATGACCATGACATCTTCATTTCTCCCGACCCTCTCAAAGCTACCAGCAACCA
TCTCTGGCAACAACAGACGAAGCCTCACTGTGGTCAAAGCCTCCACGAGCGATAACACAA
CCAAGCAAGAACAGAGCATGAAGATGAGGAGGGATCTAATGTTCACGGCTGCAGCTGCGG
CTGTGTGCACCTTAGCCGAAGTGGCCATGGCAGAAGAAGAAGAACCCAAGAGAGGGACAG
AAGCAGCCAAGAAGAAGTGTGCTCCTGTCTGTGTCACAATGCCTACCGCCAAGATTTGTC
GTAACTAAGTTCACCATTTTCACCAACTAAACTAATATATATATATGTCCACTCCATGTG
TGTCTGTTTTGTGTCTACAAAATTTTCTCAGTCAGTATGTATGATCATAGTTGATAAAAT
CTATAAAAGAAACCTCTGTTAATGTACTTTAATCGTCCACTGAAGCGATTACAAACCGC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F531TF U 2
AF RR2F887JQ C 1
AF RR2F531JQ C 2
AF RR2F887TF U 1
BS 1 1 RR2F887JQ
BS 2 531 RR2F887TF
BS 532 539 RR2F887JQ

RD RR2F531TF 229 0 0
GAACATAGAGAGATTAAGAGATCACGTGCCGTGCAGATCAATATCACAATTTTCTATGAT
GGCTTCGATGACCATGACATCTTCATTTCTCCCGACCCTCTCAAAGCTACCAGCAACCAT
CTCTGGCAACAACAGACGAAGCCTCACTGTGGTCAAAGCCTCCACGAGCGATAACACAAC
CAAGCAAGAACAGAGCATGAAGATGAGGAGGGATCTAATGTTCACGGCT

QA 1 229 1 229
DS 

RD RR2F887JQ 539 0 0
GGAACATAGAGAGATTAAGAGATCACGTGCCGTGCAGATCAATATCACAATTTTCTATGA
TGGCTTCGATGACCATGACATCTTCATTTCTCCCGACCCTTTCAAAGCTACCAGCAACCA
TTTCTGGCAACAACAGACGAAGCCTCACTGTGGTCAAAGCCTCCACGAGCGATAACACAA
CCAAGCAAGAACAGAGCATGAAGATGAGGAGGGATTTAATGTTCACGGCTGCAGCTGCGG
CTGTGTGCACCTTAGCCGAAGTGGCCATGGCAGAAGAAGAAGAACCCAAGAGAGGGACAG
AAGCAGCCAAGAAGAAGTGTGCTCCTGTCTGTGTCACAATGCCTACCGCCAAGATTTGTC
GTAACTAAGTTCACCATTTTCACCAACTAAACTAATATATATATATGTCCACTCCATGTG
TGTCTGTTTTGTGTCTACAAAATTTTCTCAGTCAGTATGTATGATCATAGTTGATAAAAT
CTATAAAAGAAACCTCTGTTAATGTACTTTAATCGTCCACTGAAGCGATTACAAACCGC

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2F531JQ 504 0 0
GAACATAGAGAGATTAAGAGATCACGTGCCGTGCAGATCAATATCACAATTTTTTATGAT
GGCTTCGATGACCATGACATCTTCATTTCTCCCGACCCTCTCAAAGCTACCAGCAACCAT
TTCTGGCAACAACAGACGAAGCCTCACTGTGGTCAAAGCCTCCACGAGCGATAACACAAC
CAAGCAAGAACAGAGCATGAAGATGAGGAGGGATTTAATGTTCACGGCTGCAGCTGCGGC
TGTGTGCACCTTAGCCGAAGTGGCCATGGCAGAAGAAGAAGAACCCAAGAGAGGGACAGA
AGCAGCCAAGAAGAAGTATGCTCCTGTCTGTGTCACAATGCCTACCGCCAAGATTTGTCG
TAACTAAGTTCACTATTTTCACCAACTAAACTAATATATATAT**GTCCACTCCATGTGT
GTCTGTTTTGTGTCTACAAAATTTTCTCAGTCAGTATGTATGATCATAGTTGATAAAATC
TATAAAAGAAACCTCTGTTAATG
C

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2F887TF 531 0 0
G
GAACATAGAGAGATTAAGAGATCACGTGCCGTGCAGATCAATATCACAATTTTCTATGAT
GGCTTCGATGACCATGACATCTTCATTTCTCCCGACCCTCTCAAAGCTACCAGCAACCAT
CTCTGGCAACAACAGACGAAGCCTCACTGTGGTCAAAGCCTCCACGAGCGATAACACAAC
CAAGCAAGAACAGAGCATGAAGATGAGGAGGGATCTAATGTTCACGGCTGCAGCTGCGGC
TGTGTGCACCTTAGCCGAAGTGGCCATGGCAGAAGAAGAAGAACCCAAGAGAGGGACAGA
AGCAGCCAAGAAGAAGTGTGCTCCTGTCTGTGTCACAATGCCTACCGCCAAGATTTGTCG
TAACTAAGTTCACCATTTTCACCAACTAAACTAATATATATATATGTCCACTCCATGTGT
GTCTGTTTTGTGTCTACAAAATTTTCTCAGTCAGTATGTATGATCATAGTTGATAAAATC
TATAAAAGAAACCTCTGTTAATGTACTTTAATCGTCCACTGAAGCGATTA

QA 2 531 2 531
DS 



AS 1 4

CO CL2100Contig1 823 4 9 U
GGGTAGTATTTCTTGACTTTGTAAGCTAACAAACAACAATCATGGCTAAACTTTTTCAGC
TTATTCTTCCTCTCTTCTCAGCGATTCTTCTTCTCGCCTTCACTGCTGCAGAATCCAACT
CTTACTCCAAAACGACTCCGTTTCAAGGATACAAGCCAGAGAAACTCACGCACCTCCGCT
TCTACTTCCATGACGTCATATCCGGTGACAAACCCACCGCCATAAGAGTCACAGTGCCCC
CCGTCGTAAACTCCTCCGCCGTCTCATCATTTGGTGTGGTTGTGATAGCCGACATCCCTT
TGACTGAGGGACCCGACCGGAGCTCCAAGGAAATCGGGAGGGCTCAGGGGATGTATGCGT
CGACGGATATGAACACCTTAAGCTTCACCATGGTGTTTAACTTGGTGTTCACGGAAGGTG
AGTTTAACGGCAGCACCGTCTCTATGTATGGACGGAATGCTATATTCTCAAAGGTGAGAG
AGTTTCCGATAATAGGAGGTACCGGTGCGTTCAGGCTCGCTAGAGGCTATGCACAGGCCG
ACACTTACTCGATTAGTGGTTTGGATGCCGTGGTCGAGTATAATGTCTTCGTTTCGCACT
AAATGACGATGAAAGACAAATATCGAACTTGGCACGTGATGACTAGAGTGAACGAACGTA
ACCAATAACGCTGAATCATTCAAACATTTGGCAGTATAAATTGTAATTACACTTCTTTT*
GTTGATGTTCTTATATTTTGATTTTGCTTTTCTTTAAAACCTGATGTTGTTGTCGTTGTG
TCGACTAAAGTTTAATAAAAGGTGTGTGAGTATATTTTATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2DW49TF U 1
AF RR2B165TF U 57
AF RR2B165JQ C 144
AF RR2DW49JQ C 178
BS 1 94 RR2DW49TF
BS 95 95 RR2B165TF
BS 96 500 RR2DW49TF
BS 501 719 RR2B165TF
BS 720 720 RR2B165JQ
BS 721 763 RR2B165TF
BS 764 773 RR2B165JQ
BS 774 774 RR2DW49JQ
BS 775 823 RR2B165JQ

RD RR2DW49TF 500 0 0
GGGTAGTATTTCTTGACTTTGTAAGCTAACAAACAACAATCATGGCTAAACTTTTTCAGC
TTATTCTTCCTCTCTTCTCAGCGATTCTTCTTCTTGCCTTCACTGCTGCAGAATCCAACT
CTTACTCCAAAACGACTCCGTTTCAAGGATACAAGCCAGAGAAACTCACGCACCTCCGCT
TCTACTTCCATGACGTCATATCCGGTGACAAACCCACCGCCATAAGAGTCACAGTGCCCC
CCGTCGTAAACTCCTCCGCCGTCTCATCATTTGGTGTGGTTGTGATAGCCGACATCCCTT
TGACTGAGGGACCCGACCGGAGCTCCAAGGAAATCGGGAGGGCTCAGGGGATGTATGCGT
CGACGGATATGAACACCTTAAGCTTCACCATGGTGTTTAACTTGGTGTTCACGGAAGGTG
AGTTTAACGGCAGCACCGTCTCTATGTATGGACGGAATGCTATATTCTCAAAGGTGAGAG
AGTTTCCGATAATAGGAGGT

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2B165TF 707 0 0
CAGCTTATTCTTCCTCTCTTCTCAGCGATTCTTCTTCTCGCCTTCACTGCTGCAGAATCC
AACTCTTACTCCAAAACGACTCCGTTTCAAGGATACAAGCCAGAGAAACTCACGCACCTC
CGCTTCTACTTCCATGACGTCATATCCGGTGACAAACCCACCGCCATAAGAGTCACAGTG
CCCCCCGTCGTAAACTCCTCCGCTGTCTCATCATTTGGTGTGGTTGTGATAGCCGACATC
CCTTTGACTGAGGGACCCGACCGGAGCTCCAAGGAAATCGGGAGGGCTCAGGGGATGTAT
GCGTCGACGGATATGAACACCTTAAGCTTCACCATGGTGTTTAACTTGGTGTTCACGGAA
GGTGAGTTTAACGGCAGCACCGTCTCTATGTATGGACGGAATGCTATATTCTCAAAGGTG
AGAGAGTTTCCGATAATAGGAGGTACCGGTGCGTTCAGGCTCGCTAGAGGCTATGCACAG
GCCGACACTTACTCGATTAGTGGTTTGGATGCCGTGGTCGAGTATAATGTCTTCGTTTCG
CACTAAATGACGATGAAAGACAAATATCGAACTTGGCACGTGATGACTAGAGTGAACGAA
CGTAACCAATAACGCTGAATCATTCAAACATTTGGCAGTATAAATTGTAATTACACTTCT
TTTTGTTGATGTTCTTATATTTTGATTTTGCTTTTCTTTAAAACCTG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2B165JQ 680 0 0
CAAGGATACAAGCCAGAGAAACTCACGCACCTCCGCTTCTACTTCCATGACGTCATATCC
GGTGACAAACCCACCGCCATAAGAGTCACAGTGCCCCCCGTCGTAAACTCCTCCGCTGTC
TCATCATTTGGTGTGGTTGTGATAGCCGACATCCCTTTGACTGAGGGACCCGACCGGAGC
TCCAAGGAAATCGGGAGGGCTCAGGGGATGTATGCGTCGACGGATATGAACACCTTAAGC
TTCACCATGGTGTTTAACTTGGTGTTCACGGAAGGTGAGTTTAACGGCAGCACCGTCTCT
ATGTATGGACGGAATGCTATATTCTCAAAGGTGAGAGAGTTTCCGATAATAGGAGGTACC
GGTGCGTTCAGGCTCGCTAGAGGCTATGCACAGGCCGACACTTACTCGATTAGTGGTTTG
GATGCCGTGGTCGAGTATAATGTCTTCGTTTCGCACTAAATGACGATGAAAGACAAATAT
CGAACTTGGCACGTGATGACTAGAGTGAACGAACGTAACCAATAACGCTGAATCATTCAA
ACATTTGGCAGTATAAATTGTAATTACACTTCTTTT*GTTGATGTTCTTATATTTTGATT
TTGCTTTTCTTTAAAACCTGATGTTGTTGTTGTTGTGTCGACTAAAGTTTAATAAAAGGT
GTGTGAGTATATTTTATTGG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2DW49JQ 645 0 0
GCTTCTACTTCCATGACGTCATATCCGGTGACAAACCCACCGCCATAAGAGTCACAGTGC
CCCCCGTCGTAAACTCCTCCGCCGTCTCATCATTTGGTGTGGTTGTGATAGCCGACATCC
CTTTGACTGAGGGACCCGACCGGAGCTCCAAGGAAATCGGGAGGGCTCAGGGGATGTATG
CGTCGACGGATATGAACACCTTAAGCTTCACCATGGTGTTTAACTTGGTGTTCACGGAAG
GTGAGTTTAACGGCAGCACCGTCTCTATGTATGGACGGAATGCTATATTCTCAAAGGTGA
GAGAGTTTCCGATAATAGGAGGTACCGGTGCGTTCAGGCTCGCTAGAGGCTATGCACAGG
CCGACACTTACTCGATTAGTGGTTTGGATGCCGTGGTCGAGTATAATGTCTTCGTTTCGC
ACTAAATGACTATGAAAGACAAATATCGAACTTGGCACGTGATGACTAGAGTGAACGAAC
GTAACCAATAACGCTGAATCATTCAAACATTTGGCAGTATAAATTGTAATTACACTTCTT
TT*GTTGATGTTCTTATATTTTGATTTTGCTTTTCTTTAAAACCTGATGTTGTTGTCGTT
GTGTCGACTAAAGTTTAATAAAAGGTGTGTGAGTATATTTTATTG

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 4

CO CL2101Contig1 1201 4 7 U
GGATAGTGGTCCAAATGATCATATCTTTATATTCTATAGTGACCATGGTGGTCCTGGAGT
TCTTGGGATGCCGACTTCTCCTTACTTATATGCTGATGATTTGAATGATGTCTTGAAGAA
AAAACATGCTTCCGGAACCTACAAAAGTTTGGTGTTTTATCTCGAAGCTTGTGAGTCTGG
AAGTATCTTTGAAGGGCTTCTCGAAGAGGGTTTAAACATCTACGCCACAACTGCATCGAA
CGCAGTAGAAAGCAGTTGGGGTACCTATTGCCCCGGAGAGGAGCCTAGCCCTCCACCTGA
GTATGAAACTTGCTTAGGTGACTTATACAGTGTTGCCTGGATGGAAGACAGTGGCGTGCA
CAATCTACAAACTGAGACTCTGCGCCAACAATATGAACTTGTGAAAAGGAGGACTGTAGG
TTCTGGGTCGAGTTATGGTTCTCATGTCATGCAATACGGCGACGTAGGACTTAACAAGAA
TAAGCTCGACATTTACATGGGAACGAACCCTGCCAATGACAACTTCACCTTTGTGGATGC
TAATTCACTGACGCCACCACCTTCAAGAGTCACAAACCAGCGTGATGCAGATCTTGTCCA
TTTCTGGGATAAGTACCGAAAGGCACCAGAAGGTTCCACCAGAAAAACGGAAGCTCAGAA
GCAAGTCCTTGAAGCCATGTCTCACAGACTTCATGTTGACAACAGTGTGAAACTCGTCGG
CAAACTCTTGTTTGGCATCTCAGAAGGTTCTGAAGTGCTAAACAAAGTACGTCCTGCTGG
ACAACCACTCGCCGATGACTGGAGTTGCCTTAAAAACATGGTGAGAGCTTTTGAGAGACA
CTGTGGATCCCTGTCACAGTACGGTATCAAGCACATGAGGTCCTTTGCAAACATCTGCAA
CGCAGGGATCCAAATGGAGCAAATGGAAGAGGCAGCTTCACAGGCTTGCACCTCAATCCC
ACCTGGTCCTTGGAGCTCTCTTCACCGTGGATTCAGTGCTTAAAGCTCTAATCCCTCTTT
GCATTTGTTTATATTAGTACCAGTTCCCAAAATATTCCTATTTTCGATTTGTAATGGGTA
ATCTCCCTGTATATCTCATTATCATTTCCCTCTTCATTGTGTAATTACAGATTATCCATT
TGCTAATGTACAAAATGCTTGTAGAAACTGAAAATGTAATACAAGGTTTGCTTATTTATA
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 

AF RR2FA31TF U 1
AF RR2FA31JQ C 706
AF RR2BG07TF U 475
AF RR2BG07JQ C 475
BS 1 719 RR2FA31TF
BS 720 722 RR2BG07TF
BS 723 741 RR2FA31TF
BS 742 1184 RR2BG07TF
BS 1185 1185 RR2BG07JQ
BS 1186 1199 RR2BG07TF
BS 1200 1201 RR2BG07JQ

RD RR2FA31TF 741 0 0
GGATAGTGGTCCAAATGATCATATCTTTATATTCTATAGTGACCATGGTGGTCCTGGAGT
TCTTGGGATGCCGACTTCTCCTTACTTATATGCTGATGATTTGAATGATGTCTTGAAGAA
AAAACATGCTTCCGGAACCTACAAAAGTTTGGTGTTTTATCTCGAAGCTTGTGAGTCTGG
AAGTATCTTTGAAGGGCTTCTCGAAGAGGGTTTAAACATCTACGCCACAACTGCATCGAA
CGCAGTAGAAAGCAGTTGGGGTACCTATTGCCCCGGAGAGGAGCCTAGCCCTCCACCTGA
GTATGAAACTTGCTTAGGTGACTTATACAGTGTTGCCTGGATGGAAGACAGTGGCGTGCA
CAATCTACAAACTGAGACTCTGCGCCAACAATATGAACTTGTGAAAAGGAGGACTGTAGG
TTCTGGGTCGAGTTATGGTTCTCATGTCATGCAATACGGCGACGTAGGACTTAACAAGAA
TAAGCTCGACATTTACATGGGAACGAACCCTGCCAATGACAACTTCACCTTTGTGGATGC
TAATTCACTGACGCCACCACCTTCAAGAGTCACAAACCAGCGTGATGCAGATCTTGTCCA
TTTCTGGGATAAGTACCGAAAGGCACCAGAAGGTTCCACCAGAAAAACGGAAGCTCAGAA
GCAAGTCCTTGAAGCCATGTCTCACAGACTTCATGTTGACAACAGTGTGAAACTCGTCG*
*CAACTCTTGTTTGGCATCTC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2FA31JQ 494 0 0
TGTGAAACTCGTCGGCAAACTCTTGTTTGGCATCTCAGAAGGTTTTGAAGTGCTAAACAA
AGTACGTCCTGCTGGACAACCACTCGCCGATGACTGGAGTTGCCTTAAAAACATGGTGAG
AGCTTTTGAGAGACACTGTGGATCCCTGTCACAGTACGGTATCAAGCACATGAGGTCCTT
TGCAAACATTTGCAACGCAGGGATCCAAATGGAGCAAATGGAAGAGGCAGCTTCACAGGC
TTGCACCTCAATCCCACCTGGTCCTTGGAGCTCTTTTCACCGTGGATTCAGTGCTTAAAG
CTCTAATCCCTCTTTGCATTTGTTTATATTAGTACCAGTTCCCAAAATATTCCTATTTTC
GATTTGTAATGGGTAATCTCCCTGTATATCTCATTATCATTTCCCTCTTCATTGTGTAAT
TACAGATTATCCATTTGCTAATGTACAAAATGCTTGTAGAAACTGAAAATGTAATACAAG
GTTTGCTTATTTAT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2BG07TF 727 0 0
G
AAGAATAAGCTCGACATTTACATGGGAACGAACCCTGCCAATGACAACTTCACCTTTGTG
GATGCTAATTCACTGACGCCACCACCTTCAAGAGTCACAAACCAGCGTGATGCAGATCTT
GTCCATTTCTGGGATAAGTACCGAAAGGCACCAGAAGGTTCCACCAGAAAAACGGAAGCT
CAGAAGCAAGTCCTTGAAGCCATGTCTCACAGACTTCATGTTGACAACAGTGTGAAACTC
GTCGGCAAACTCTTGTTTGGCATCTCAGAAGGTTCTGAAGTGCTAAACAAAGTACGTCCT
GCTGGACAACCACTCGCCGATGACTGGAGTTGCCTTAAAAACATGGTGAGAGCTTTTGAG
AGACACTGTGGATCCCTGTCACAGTACGGTATCAAGCACATGAGGTCCTTTGCAAACATC
TGCAACGCAGGGATCCAAATGGAGCAAATGGAAGAGGCAGCTTCACAGGCTTGCACCTCA
ATCCCACCTGGTCCTTGGAGCTCTCTTCACCGTGGATTCAGTGCTTAAAGCTCTAATCCC
TCTTTGCATTTGTTTATATTAGTACCAGTTCCCAAAATATTCCTATTTTCGATTTGTAAT
GGGTAATCTCCCTGTATATCTCATTATCATTTCCCTCTTCATTGTGTAATTACAGATTAT
CCATTTGCTAATGTACAAAATGCTTGTAGAAACTGAAAATGTAATACAAAGTTTGCTTAT
TTAT
AT

QA 2 725 2 725
DS 

RD RR2BG07JQ 727 0 0
G
AAGAATAAGCTCGACATTTACATGGGAACGAACCCTGCCAATGACAACTTCACCTTTGTG
GATGCTAATTCACTGACGCCACCACCTTCAAGAGTCACAAACCAGCGTGATGCAGATCTT
GTCCATTTCTGGGATAAGTACCGAAAGGCACCAGAAGGTTCCACCAGAAAAACGGAAGCT
CAGAAGCAAGTCCTTGAAGCCATGTCTCACAGACTTCATGTTGACAACAGTGTGAAACTC
GTCGGCAAACTCTTGTTTGGCATCTCAGAAGGTTCTGAAGTGCTAAACAAAGTACGTCCT
GCTGGACAACCACTCGCCGATGACTGGAGTTGCCTTAAAAACATGGTGAGAGCTTTTGAG
AGACACTGTGGATCCCTGTCACAGTACGGTATCAAGCACATGAGGTCCTTTGCAAACATC
TGCAACGCAGGGATCCAAATGGAGCAAATGGAAGAGGCAGCTTCACAGGCTTGCACCTCA
ATCCCACCTGGTCCTTGGAGCTCTCTTCACCGTGGATTCAGTGCTTAAAGCTCTAATCCC
TCTTTGCATTTGTTTATATTAGTACCAGTTCCCAAAATATTCCTATTTTCGATTTGTAAT
GGGTAATCTCCCTGTATATCTCATTATCATTTCCCTCTTCATTGTGTAATTACAGATTAT
CCATTTGCTAATGTACAAAATGCTTGTAGAAACTGAAAATGTAATACAAGGTTTGCTTAT
TTATAT

QA 2 727 2 727
DS 



AS 1 2

CO CL2102Contig1 1275 2 6 U
GGACAAAAAAAGAAAAGCGAATCGCGATTTCGAGCTCACTAAATCTAATGGTGTCTCTAA
ACGCTAGACCTGCTCCGTTCTTCGATCCCGTGAGCATGAGTTTACCTGGTCTCGATTCGA
GGGCGTCGGACTCCGACGACGGGTTTGGTTTGACTCCGACCGCAAGGAGAGATGCGGCGT
CGTTTCGCGAGGATACGACGGCGAAGATTCGGAAGCCATACACGATCAAGAAGTCGAGAG
AGAACTGGTCAGAGCAGGAACACGATAAGTTTCTAGAAGCGCTCCATTTATTCGATCGAG
ATTGGAAGAAAATCGAAGCATTTGTTGGATCAAAGACAGTCGTCCAGATACGTAGCCACG
CACAGAAGTACTTTCTCAAAGTTCAGAAGAGCGGTGCTAACGAACACCTTCCTCCTCCAC
GACCTAAGAGGAAAGCTAGTCATTCTTATCCTCACAAGGCTCCTCCTAAAAATGTTGCTC
TTCCCTCCCACGTTGTTGGACCCCTTCCTGCTTCAAGCGCACCCTTGGTTCAACCTCCTT
ATTTGTACAGCTCTTCTTCTGATTCACACTCACTTGTGGGGAACAACCCCCCTGCGTCTA
GCTCTTCTTCTCAGAATCATGCATTAACAACAAAACCCGTGATTCTAGAGGGACCAGGAG
TCTCGGCCGCGGCTCTCCCAAAGAATCGCTGTTGCAGCACCGGTAATAAGGAAGTTACGC
CGAGATTACCAGCGGTGACTGAGTCGAATGATGATGAAGAAGATAGTTGTGAAAAGCCAT
GTAGAGTGATGCCCAACTTTGCTGAAGTCTACAGATTTATTGGAAGTGTGTTTGATCCCA
ACACATCTGGTCACCTCCAGAGATTAAAGCAGATGGATCCAATAAATATGGAGACGGTTC
TTTTACTGATGAGAAACCTATCTGTAAATCTGACAAGTCCAGAGTTTTCTGAACAAAGGA
AGTTGATATCATCATACAGCAGTAAAGCTTTGAAATAGATATTTGGAAAAAGCAACAATG
GACCTTATGAGAGCAAGAAATTTCTCATTCATTGGATGAGCAAATGAATGCCACTTAAGT
TCTGGTTTATGTCTTTGAAGTCGTAGTTAACCGCAGTGGTTTGTCCTATATTGTCTATAT
TCGTATGGGTGATAGAGGGTTTTGCAGAGGTATAATATATATATACACATATATGTGTAG
ATATGTGTTTATAAGGGCAACGTTTGTAAGTGACTTTCTTAAGCTTGAAACGATCTCAGG
AGGTCTTAAGTGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H910TF U 1
AF RR2H910JQ C 579
BS 1 710 RR2H910TF
BS 711 711 RR2H910JQ
BS 712 774 RR2H910TF
BS 775 775 RR2H910JQ
BS 776 789 RR2H910TF
BS 790 1275 RR2H910JQ

RD RR2H910TF 789 0 0
GGACAAAAAAAGAAAAGCGAATCGCGATTTCGAGCTCACTAAATCTAATGGTGTCTCTAA
ACGCTAGACCTGCTCCGTTCTTCGATCCCGTGAGCATGAGTTTACCTGGTCTCGATTCGA
GGGCGTCGGACTCCGACGACGGGTTTGGTTTGACTCCGACCGCAAGGAGAGATGCGGCGT
CGTTTCGCGAGGATACGACGGCGAAGATTCGGAAGCCATACACGATCAAGAAGTCGAGAG
AGAACTGGTCAGAGCAGGAACACGATAAGTTTCTAGAAGCGCTCCATTTATTCGATCGAG
ATTGGAAGAAAATCGAAGCATTTGTTGGATCAAAGACAGTCGTCCAGATACGTAGCCACG
CACAGAAGTACTTTCTCAAAGTTCAGAAGAGCGGTGCTAACGAACACCTTCCTCCTCCAC
GACCTAAGAGGAAAGCTAGTCATTCTTATCCTCACAAGGCTCCTCCTAAAAATGTTGCTC
TTCCCTCCCACGTTGTTGGACCCCTTCCTGCTTCAAGCGCACCCTTGGTTCAACCTCCTT
ATTTGTACAGCTCTTCTTCTGATTCACACTCACTTGTGGGGAACAACCCCCCTGCGTCTA
GCTCTTCTTCTCAGAATCATGCATTAACAACAAAACCCGTGATTCTAGAGGGACCAGGAG
TCTCGGCCGCGGCTCTCCCAAAGAATCGCTGTTGCAGCACCGGTAATAAG*AAGTTACGC
CGAGATTACCAGCGGTGACTGAGTCGAATGATGATGAAGAAGATAGTTGTGAAA*GCCAT
GTAGAGTGA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2H910JQ 697 0 0
GGGAACAACCCCCCTGCGTCTAGCTCTTCTTCTCAGAATCATGCATTAACAACAAAACCC
GTGATTCTAGAGGGACCAGGAGTCTCGGCCGCGGCTCTCCCAAAGAATCGCTGTTGCAGC
ACCGGTAATAAGGAAGTTACGCCGAGATTACCAGCGGTGACTGAGTCGAATGATGATGAA
GAAGATAGTTGTGAAAAGCCATGTAGAGTGATGCCCAACTTTGCTGAAGTCTACAGATTT
ATTGGAAGTGTGTTTGATCCCAACACATCTGGTCACCTCCAGAGATTAAAGCAGATGGAT
CCAATAAATATGGAGACGGTTCTTTTACTGATGAGAAACCTATCTGTAAATCTGACAAGT
CCAGAGTTTTCTGAACAAAGGAAGTTGATATCATCATACAGCAGTAAAGCTTTGAAATAG
ATATTTGGAAAAAGCAACAATGGACCTTATGAGAGCAAGAAATTTCTCATTCATTGGATG
AGCAAATGAATGCCACTTAAGTTCTGGTTTATGTCTTTGAAGTCGTAGTTAACCGCAGTG
GTTTGTCCTATATTGTCTATATTCGTATGGGTGATAGAGGGTTTTGCAGAGGTATAATAT
ATATATACACATATATGTGTAGATATGTGTTTATAAGGGCAACGTTTGTAAGTGACTTTC
TTAAGCTTGAAACGATCTCAGGAGGTCTTAAGTGTCG

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 4

CO CL2103Contig1 957 4 8 U
GGAGAGACTGTTGGATTGGCTCTCTCTCTCTCTTCTCACCGTTCTCTCTCTCTGGATCTT
TCACGGGAGAAGAAGAGATGAGATGCCTTTCTTTTGATTGTAAATATTTTCGATCTTATG
ATCGATTTCTCCTTTCGCATGGCGAATTATCTTTTCGCTTTGGCGAACTTTTCTTCCTTT
TGAGGATTTTGAAGTGATGATTTCAATCAAGCAGAGCTGGTTTTCATTCTTATCTTTCTC
TCTTTTGATTGAATAAAAATAAAGTCTATAAAAGTTTAGCCTTTCGCAGTTCTTCATCTT
TATCCCATCAATTATTTGACTGGATACTTTGTCTCTCTGTCTCAACTGAACATCTTTTCA
AGAGAGTCAGTCTTTACCGCTAGCCTTTAATCGGCGTTTTAGGGTAAAGCTTCTCTGTCG
AGGGATGATTGAGTTTTTTGGGTCTCTTAGATCTATCTGAAGAAGATTTAGAAGAGTTGG
TGTTTTGATAACAGTCCAACAAAAGATCTTTCTTCAATTGATCGAAGTTTCCCCTGGCTA
AATTAACGGTGAACAAAGATGCTTCAGTCAAGTAATTGAGGTTTGAGCGAAAGGTCCTTT
GGCATCAGTGTTTTAATCAAGATGTTTAGCAGAGAGAAATCCCAGCAAAATTCCCAGGAT
TTTAGTGATGATCAAAGCAGCGGCAGGGAAGAGAAGTCGAGCAGCGGTGCAGACAACTTT
CCGGCGATGGAGCTCAAAAACGGTGACTTTACTAGCCGCTGGTTGCATGACAGACGCGTG
TCAAAGATGTTCCCTAGAATGATTAGAAATTGAACGCGTGTCTTTTGAAGCTTCTCGATT
TTCTTTTATTAAGTAGGATGTATTTTAAATCTCTGCTTTGGGCTTCTAAGTTGTAAATTC
TGATGTCATATTGTAAACAAGGCTCATTGGGCTGAGTTAATGAAACTAAGAGTTGCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2BR74TF U 2
AF RR2BK07TF U 1
AF RR2BK07JQ C 180
AF RR2BR74JQ C 272
BS 1 649 RR2BK07TF
BS 650 650 RR2BK07JQ
BS 651 694 RR2BK07TF
BS 695 695 RR2BK07JQ
BS 696 706 RR2BK07TF
BS 707 857 RR2BK07JQ
BS 858 858 RR2BR74JQ
BS 859 957 RR2BK07JQ

RD RR2BR74TF 633 0 0
GG
GAGACTGTTGGATTGGCTCTCTCTCTCTCTTCTCACCGTTCTCTCTCTCTGGATCTTTCA
CGGGAGAAGAAGAGATGAGATGCCTTTCTTTTGATTGTAAATATTTTCGATCTTATGATC
GATTTCTCCTTTCGCATGGCGAATTATCTTTTCGCTTTGGCGAACTTTTCTTCCTTTTGA
GGATTTTGAAGTGATGATTTCAATCAAGCAGAGCTGGTTTTCATTCTTATCTTTCTCTCT
TTTGATTGAATAAAAATAAAGTCTATAAAAGTTTAGCCTTTCGCAGTTCTTCATCTTTAT
CCCATCAATTATTTGACTGGATACTTTGTCTCTCTGTCTCAACTGAACATCTTTTCAAGA
GAGTCAGTCTTTACCGCTAGCCTTTAATCGGCGTTTTAGGGTAAAGCTTCTCTGTCGAGG
GATGATTGAGTTTTTTGGGTCTCTTAGATCTATCTGAAGAAGATTTAGAAGAGTTGGTGT
TTTGATAACAGTCCAACAAAAGATCTTTCTTCAATTGATCGAAGTTTCCCCTGGCTAAAT
TAACGGTGAACAAAGATGCTTCAGTCAAGTAATTGAGGTTTGAGCGAAAGGTCCTTTGGC
ATCAGTGTTTTAATCAAGATGTTTAGCAGAG

QA 3 633 3 633
DS 

RD RR2BK07TF 710 0 0
GGAGAGACTGTTGGATTGGCTCTCTCTCTCTCTTCTCACCGTTCTCTCTCTCTGGATCTT
TCACGGGAGAAGAAGAGATGAGATGCCTTTCTTTTGATTGTAAATATTTTCGATCTTATG
ATCGATTTCTCCTTTCGCATGGCGAATTATCTTTTCGCTTTGGCGAACTTTTCTTCCTTT
TGAGGATTTTGAAGTGATGATTTCAATCAAGCAGAGCTGGTTTTCATTCTTATCTTTCTC
TCTTTTGATTGAATAAAAATAAAGTCTATAAAAGTTTAGCCTTTCGCAGTTCTTCATCTT
TATCCCATCAATTATTTGACTGGATACTTTGTCTCTCTGTCTCAACTGAACATCTTTTCA
AGAGAGTCAGTCTTTACCGCTAGCCTTTAATCGGCGTTTTAGGGTAAAGCTTCTCTGTCG
AGGGATGATTGAGTTTTTTGGGTCTCTTAGATCTATCTGAAGAAGATTTAGAAGAGTTGG
TGTTTTGATAACAGTCCAACAAAAGATCTTTCTTCAATTGATCGAAGTTTCCCCTGGCTA
AATTAACGGTGAACAAAGATGCTTCAGTCAAGTAATTGAGGTTTGAGCGAAAGGTCCTTT
GGCATCAGTGTTTTAATCAAGATGTTTAGCAGAGAGAAATCCCAGCAAA*TTCCCAGGAT
TTTAGTGATGATCAAAGCAGCGGCAGGGAAGAGA*GTCGAGCAGCG
TGCA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2BK07JQ 778 0 0
TTTGAGGA
TTTGAAGTGATGATTTCAATCAAGCAGAGCTGGTTTTCATTCTTATCTTTCTCTCTTTTG
ATTGAATAAAAATAAAGTCTATAAAAGTTTAGCCTTTCGCAGTTCTTCATCTTTATCCCA
TCAATTATTTGACTGGATACTTTGTCTCTCTGTCTCAACTGAACATCTTTTCAAGAGAGT
CAGTCTTTACCGCTAGCCTTTAATCGGCGTTTTAGGGTAAAGCTTCTCTGTCGAGGGATG
ATTGAGTTTTTTGGGTCTCTTAGATCTATCTGAAGAAGATTTAGAAGAGTTGGTGTTTTG
ATAACAGTCCAACAAAAGATCTTTCTTCAATTGATCGAAGTTTCCCCTGGCTAAATTAAC
GGTGAACAAAGATGCTTCAGTCAAGTAATTGAGGTTTGAGCGAAAGGTCCTTTGGCATCA
GTGTTTTAATCAAGATGTTTAGCAGAGAGAAATCCCAGCAAAATTCCCAGGATTTTAGTG
ATGATCAAAGCAGCGGCAGGGAAGAGAAGTCGAGCAGCGGTGCAGACAACTTTCCGGCGA
TGGAGCTCAAAAACGGTGACTTTACTAGCCGCTGGTTGCATGACAGACGCGTGTCAAAGA
TGTTCCCTAGAATGATTAGAAATTGAACGCGTGTCTTTTGAAGCTTCTCGATTTTCTTTT
ATTAAGTAGGGTGTATTTTAAATCTCTGCTTTGGGCTTCTAAGTTGTAAATTCTGATGTC
ATATTGTAAACAAGGCTCATTGGGCTGAGTTAATGAAACTAAGAGTTGCC

QA 9 778 9 778
DS 

RD RR2BR74JQ 686 0 0
AAGTTTAGCCTTTCGCAGTTCTTCATCTTTATCCCATCAATTATTTGACTGGATACTTTG
TCTCTCTGTCTCAACTGAACATCTTTTCAAGAGAGTCAGTCTTTACCGCTAGCCTTTAAT
CGGCGTTTTAGGGTAAAGCTTCTCTGTCGAGGGATGATTGAGTTTTTTGGGTCTCTTAGA
TCTATCTGAAGAAGATTTAGAAGAGTTGGTGTTTTGATAACAGTCCAACAAAAGATCTTT
CTTCAATTGATCGAAGTTTCCCCTGGCTAAATTAACGGTGAACAAAGATGCTTCAGTCAA
GTAATTGAGGTTTGAGCGAAAGGTCCTTTGGCATCAGTGTTTTAATCAAGATGTTTAGCA
GAGAGAAATCCCAGCAAAATTCCCAGGATTTTAGTGATGATCAAAGCAGCGGCAGGGAAG
AGAAGTCGAGCAGCGGTGCAGACAACTTTCCGGCGATGGAGCTCAAAAACGGTGACTTTA
CTAGCCGCTGGTTGCATGACAGACGCGTGTCAAAGATGTTCCCTAGAATGATTAGAAATT
GAACGCGTGTCTTTTGAAGCTTCTCGATTTTCTTTTATTAAGTAGGATGTATTTTAAATC
TCTGCTTTGGGCTTCTAAGTTGTAAATTCTGATGTCATATTGTAAACAAGGCTCATTGGG
CTGAGTTAATGAAACTAAGAGTTG
AC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 3

CO CL2104Contig1 1115 3 3 U
GGGTGCTCACCTCGTACCAGCTACTCTCACTTTCTCAGATTTTTATCCTCTCTCGAGAAA
GTGTTTCAGATTTTTAGCAGAGATGACGAAGAACTACCCAAATGTGAGCGAGGACTACAA
GAAGGCTATTGAGAAGTGCAGGAGGAAGCTCAGAGGCTTGATCGCTGAGAAGCATTGTGC
ACCTATCATGGTCCGCCTCGCATGTCACTCTGCTGGAACATTTGACTCTACCACAAAGAC
TGGTGGTCCCTTTGGAACAATGAGGTTCACCGATGAGCAAGCTCATGAGGCCAACAGTGG
TATCCAGATTGCTCTTGGGTTGTTGGAGCCCATCAGGGTGCAGTTCCCTACCATCTCTTT
TGCTGATTTCCATCAGCTTGCTGGTGTTGTTGCTGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAAT
TCAGTTCCACCCTGGAAGAGAGGACAAGCCTCAGCCACCTCCAGAGGGTCGTCTTCCTGA
TGCTACAAAGGGTTGTAACCACTTGAGAGGAGTCTTTGCAAAGCAGATGGGTTTGACTGA
CAATGACATTGTGGCTTTATCTGGTGCCCACACTCTGGGGAGATGCCACAAGGATAGGTC
TGGCTTTGAAGGTCCTTGGACTTCAAACCCTCTTATTTTCGACAACTCTTATTTCAAGGA
GCTCCTGAGCGGTGAGAAGGAAGGTCTCATTCAACTTGTCTCTGACAAGTCACTATTGGA
CGATCCCAAATTCCGTTCTTTGGTTGAGAAATACGCTGCTGATGAGGAAGCCTTTTTCAA
TGATTACGCTGAGGCCCACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCTTGAGCTGC
GACATGTGTGGATATGGTGTCTCCAAGACTCGGAGGATTCGCATTGCATTTGAACGTTTG
TCATTTGATTGTTTTATGTACTCTCGGATTTGCGTAGCCTTTTCTTTTGTTGGGGGTCTT
GTGATTTGGACGTTGGTACGTTTTGATTTTGCTGGTTAGACATTCTAATAAATCAATTTC
TCAGCGATTAAGAACTTCCGGAAAAATATGGTAAGTGCTTTATCATCTAGACATTTTTTA
ACTTTAAAGAAAAATACGCAATCGATTTTGGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A526TF U 1
AF RR2EP74TF U 677
AF RR2A526JQ C 475
BS 1 680 RR2A526TF
BS 681 1036 RR2EP74TF
BS 1037 1115 RR2A526JQ

RD RR2A526TF 680 0 0
GGGTGCTCACCTCGTACCAGCTACTCTCACTTTCTCAGATTTTTATCCTCTCTCGAGAAA
GTGTTTCAGATTTTTAGCAGAGATGACGAAGAACTACCCAAATGTGAGCGAGGACTACAA
GAAGGCTATTGAGAAGTGCAGGAGGAAGCTCAGAGGCTTGATCGCTGAGAAGCATTGTGC
ACCTATCATGGTCCGCCTCGCATGTCACTCTGCTGGAACATTTGACTCTACCACAAAGAC
TGGTGGTCCCTTTGGAACAATGAGGTTCACCGATGAGCAAGCTCATGAGGCCAACAGTGG
TATCCAGATTGCTCTTGGGTTGTTGGAGCCCATCAGGGTGCAGTTCCCTACCATCTCTTT
TGCTGATTTCCATCAGCTTGCTGGTGTTGTTGCTGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAAT
TCAGTTCCACCCTGGAAGAGAGGACAAGCCTCAGCCACCTCCAGAGGGTCGTCTTCCTGA
TGCTACAAAGGGTTGTAACCACTTGAGAGGAGTCTTTGCAAAGCAGATGGGTTTGACTGA
CAATGACATTGTGGCTTTATCTGGTGCCCACACTCTGGGGAGATGCCACAAGGATAGGTC
TGGCTTTGAAGGTCCTTGGACTTCAAACCCTCTTATTTTCGACAACTCTTATTTCAAGGA
GCTCCTGAGCGGTGAGAAGG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2EP74TF 360 0 0
G
AGGAAGGTCTCATTCAACTTGTCTCTGACAAGTCACTATTGGACGATCCCAAATTCCGTT
CTTTGGTTGAGAAATACGCTGCTGATGAGGAAGCCTTTTTCAATGATTACGCTGAGGCCC
ACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCTTGAGCTGCGACATGTGTGGATATGG
TGTCTCCAAGACTCGGAGGATTCGCATTGCATTTGAACGTTTGTCATTTGATTGTTTTAT
GTACTCTCGGATTTGCGTAGCCTTTTCTTTTGTTGGGGGTCTTGTGATTTGGACGTTGGT
ACGTTTTGATTTTGCTGGTTAGACATTCTAATAAATCAATTTCTCAGCGATTAAGAACT

QA 2 360 2 360
DS 

RD RR2A526JQ 641 0 0
TCCTGATGCTACAAAGGGTTGTAACCACTTGAGAGGAGTCTTTGCAAAGCAGATGGGTTT
GACTGACAATGACATTGTGGCTTTATCTGGTGCCCACACTCTGGGGAGATGCCACAAGGA
TAGGTCTGGCTTTGAAGGTCCTTGGACTTCAAACCCTCTTATTTTCGACAACTCTTATTT
CAAGGAGCTCCTGAGCGGTGAGAAGGAAGGTTTCATTCAACTTGTTTCTGACAAGTCACT
ATTGGACGATCCCAAATTCCGTTCTTTGGTTGAGAAATACGCTGCTGATGAGGAAGCCTT
TTTCAATGATTACGCTGAGGCCCACTTGAAGCTTTTTGAGCTCGGGTTTGCTGATGCTTG
AGCTGCGACATGTGTGGATATGGTGTCTCCAAGACTCGGAGGATTCGCATTGCATTTGAA
CGTTTGTCATTTGATTGTTTTATGTACTTTCGGATTTGCGTAGCCTTTTCTTTTGTTGGG
GGTCTTGTGATTTGGACGTTGGTACGTTTTGATTTTGCTGGTTAGACATTTTAATAAATC
AATTTTTCAGCGATTAAGAACTTCCGGAAAAATATGGTAAGTGCTTTATCATCTAGACAT
TTTTTAACTTTAAAGAAAAATACGCAATCGATTTTGGTTTT

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 4

CO CL2105Contig1 1486 4 13 U
TTTTTTTTTCATTACATGCATTTGTTTGGTTTGGGTACAAAAAAAAAAACTTCCTTCCTC
TTCTATGTGTAATAATAATTAATAACAGCTTGTTGTGTTGTTTTCAATTTTTAAAACATT
GATTTTCCCCACCTAAAAGGGGTTCTTCCTTTGACAAGCCTTGTCTCCATATTCCCCGGA
GTCTGAGGTTCAAACCCTTCACCATTCTCACAGTTCCTCATCTCTTCAACGCTAACACTT
CCTCTAATAGAAGGCGCTAACCCAAGCCTCTTCCACCTGAAAAACCCTTTACCCCCACCA
CTCTTCTTCTCCAAAAGCCTCTCAACCTGCAAATGCATTGCACTGCACTCGCTCTGCAGC
CTCGCCACGTCTTCTCTAAGCCTCTTTATCTCTGCTTGCTGAACATTCATCTCGCGTTTG
GACAAGCACCTCGCTCCTCCTGCAGAGCCTTGCTCAAAGTAATGTGAGCCAGAAGCGTTG
GTTGGACTCCTCGTCAAGCTACCACTCCAGTCAACGTGACGGCTTAGCTTTGTCTGCTCG
GTAAACAACACTCTGATGATTGCTCTCACCGGTAGACGATCGTTCTGTGCTGCGTGGAGA
GCTGCTTCTGGTGAGAGCTTTCTGCTATCAATGAGTCTGCACAGTTCCTTCCTTTCTTGC
TTCAACACCTGAGGATGAGCCTTGAGGTATGTGTCAATGGCACGGTACAAGCCATCCTCC
GTGGTACGAGCATAGCTAGGGAGAGCTTCGATGAGCGAAATAAACTCCGGTAGAGTCAAG
CCACGTCAAGGGCGGCTTCAGCCAAGTAAGAGTCAACAAGTTTGGCCACTTTAACGAGAG
CCGCACCGGTTTTAACACCTTCACTATCCAATCCAACGAACTTCTTCACGAGACGAGTCA
CGAGCCCAACGTCGAGCAAAGTCTTAGACGTGTGGCTGAAGGAAGGTATCATGAGCTCCT
TTAGCGAGGCTTGGTCCAGCTGCCACGCCACTCTGTTCTCGAGCTCCGTCAAGTAGTTCG
GATTCGCTCCGACCATCTTCGCCGTCCTGAGGAGACGGAGGAGGAAGTTGCAGGGAACGG
AGTCTTTCTCCGGCGGGAGGATTCCGATTAGGGTTTCGACGAAGAAACGTTTCTTCATTA
CAGAGACCGTGACGCTTTCTGTCTGTGATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGTGGTGATGG
CGGAGACGTTGCCGGAGAGATCGGGGAGCCATCTGGAAGCGTAGTGGGCGATGATGGAGC
CGACGAGGCCTGGTCGGATGCCTTTGGATTTGATGCCGGTTATGGTCTTGACGAAGTAGT
TCATGTCTTGGATACAAGCTTCGTCGAAACAAGAGTAGTACTCCATGTCTTCTCCGGCGA
ACTTTTCTTGGTCATGATGCGACGGTTGGTTGCCGGAGATGGTGACGGGTTCAGGCGAGT
GTGCTTTCTTCATTTAGGTTCGTGTTCTGTTCCACCGTGAGCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2EX38JQ U 1
AF RR2CY41JQ U 54
AF RR2EX38TF C 693
AF RR2CY41TF C 804
BS 1 166 RR2EX38JQ
BS 167 167 RR2CY41JQ
BS 168 254 RR2EX38JQ
BS 255 255 RR2CY41JQ
BS 256 296 RR2EX38JQ
BS 297 297 RR2CY41JQ
BS 298 393 RR2EX38JQ
BS 394 764 RR2CY41JQ
BS 765 1145 RR2EX38TF
BS 1146 1146 RR2CY41TF
BS 1147 1268 RR2EX38TF
BS 1269 1269 RR2CY41TF
BS 1270 1486 RR2EX38TF

RD RR2EX38JQ 393 0 0
TTTTTTTTTCATTACATGCATTTGTTTGGTTTGGGTACAAAAAAAAAAACTTCCTTCCTC
TTCTATGTGTAATAATAATTAATAACAGCTTGTTGTGTTGTTTTCAATTTTTAAAACATT
GATTTTCCCCACCTAAAAGGGGTTCTTCCTTTGACAAGCCTTGTCTTCATATTCCCCGGA
GTCTGAGGTTCAAACCCTTCACCATTCTCACAGTTCCTCATCTCTTCAACGCTAACACTT
CCTCTAATAGAAGGGGCTAACCCAAGCCTCTTCCACCTGAAAAACCCTTTACCCCCCCCA
CTCTTCTTCTCCAAAAGCCTCTCAACCTGCAAATGCATTGCACTGCACTCGCTCTGCAGC
CTCGCCACGTCTTCTCTAAGCCTCTTTATCTCT

QA 1 393 1 393
DS 

RD RR2CY41JQ 711 0 0
CTTCCTCTTCTATGTGTAATAATAATTAATAACAGCTTGTTGTGTTGTTTTCAATTTTTA
AGACATTGATTTTCTCCACCTAGAAGGGGTTCTTCCTTTGACAAGCCTTGTCTCCATATT
CCCCGGAGTCTGAGGTTCAAACCCTTCACCATTCTCACAGTTCCTCATCTCTTCAATGCT
AACACTTCCTCTAATAGAAGGCGCTAACCCAAGCCTCTTCCACCTGAAAAACCCTTTACC
CCCACCACTCTTCTTCTCCAAAAGCCTCTCAACCTGCAGATGCATTGCACTGCACTCGCT
CTGCAGCCTCGCCACGTCTTCTCTAAGCCTCTTTATCTCTGCTTGCTGAACATTCATCTC
GCGTTTGGACAAGCACCTCGCTCCTCCTGCAGAGCCTTGCTCAAAGTAATGTGAGCCAGA
AGCGTTGGTTGGACTCCTCGTCAAGCTACCACTCCAGTCAACGTGACGGCTTAGCTTTGT
CTGCTCGGTAAACAACACTCTGATGATTGCTCTCACCGGTAGACGATCGTTCTGTGCTGC
GTGGAGAGCTGCTTCTGGTGAGAGCTTTCTGCTATCAATGAGTCTGCACAGTTCCTTCCT
TTCTTGCTTCAACACCTGAGGATGAGCCTTGAGGTATGTGTCAATGGCACGGTACAAGCC
ATCCTCCGTGGTACGAGCATAGCTAGGGAGAGCTTCGATGAGCGAAATAAA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2EX38TF 794 0 0
GTCAATGGCACG*TACAAGCCATCCTCCGTGGTACGAGCATAGCTAGGGAGAGCTTCGAT
GAGCGAAATAAACTCCGGTAGAGTCAAGCCACGTCAAGGGCGGCTTCAGCCAAGTAAGAG
TCAACAAGTTTGGCCACTTTAACGAGAGCCGCACCGGTTTTAACACCTTCACTATCCAAT
CCAACGAACTTCTTCACGAGACGAGTCACGAGCCCAACGTCGAGCAAAGTCTTAGACGTG
TGGCTGAAGGAAGGTATCATGAGCTCCTTTAGCGAGGCTTGGTCCAGCTGCCACGCCACT
CTGTTCTCGAGCTCCGTCAAGTAGTTCGGATTCGCTCCGACCATCTTCGCCGTCCTGAGG
AGACGGAGGAGGAAGTTGCAGGGAACGGAGTCTTTCTCCGGCGGGAGGATTCCGATTAGG
GTTTCGACGAAGAAACGTTTCTTCATTACAGAGGCCGTGACGCTTTCTGTCTGTGATGGT
GGTGGTGGTGGTGGTGGTGTGGTGATGGCGGAGACGTTGCCGGAGAGATCGGGGAGCCAT
CTGGAAGCGTAGTGGGCGATGATGGAGCCGACGAGGTCTGGTCGGATGCCTTTGGATTTG
ATGCCGGTTATGGTCTTGACGAAGTAGTTCATGTCTTGGATACAAGCTTCGTCGAAACAA
GAGTAGTACTCCATGTCTTCTCCGGCGAACTTTTCTTGGTCATGATGCGACGGTTGGTTG
CCGGAGATGGTGACGGGTTCAGGCGAGTGTGCTTTCTTCATTTAGGTTCGTGTTCTGTTC
CACCGTGAGCTCCC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2CY41TF 683 0 0
AAGTAAGAGTCAACAAGTTTGGCCACTTTAACGAGAGCCGCACCGGTTTTAACAC*TTCA
CTATCCAATCCAACGAACTTCTTCACGAGACGAGTCACGAGCCCAACGTCGAGCAAAGTC
TTAGACGTGTGGCTGAAGGAAGGTATCATGAGCTCCTTTAGCGAGGCTTGGTCCAGCTGC
CACGCCACTCTGTTCTCGAGCTCCGTCAAGTAGTTCGGATTCGCTCCGACCATCTTCGCC
GTCCTGAGGAGACGGAGGAGGAAGTTGCAGGGAACGGAGTCTTTCTCCGGCGGGAGGATT
CCGATTAGGGTTTCGACGAAGAAACGTTTCTTCATTACAGAGACCGTGACGCTTTCTGTC
TGTGATGGTGGTGGTGGTGGTG******TGGTGATGGCGGAGACGTTGCCGGAGAGATCG
GGGAGCCATTTGGAAGCGTAGTGGGCGATGATGGAGCCGATGAGGCCTGGTCGGATGCCT
TTGGATTTGATGCCGGTTATGGTCTTGACGAAGTAGTTCATGTCTTGGATACAAGCTTCG
TCGAAACAAGAGTAGTACTCCATGTCTTCTCCGGCGAACTTTTCTTGGTCATGATGCGAC
GGTTGGTTGCCGGAGATGGTGACGGGTTCAGGCGAGTGTGCTTTCTTCATTTAGGTTCGT
GTTCTGT*CCACCGTGAGCTCCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

CO CL2106Contig1 1313 4 7 U
ATTACTATTTCAAACTGTCACACCACACATACATGAAAAAAACCTTATACATGTGCTTAG
AAAGAAAAAAACTCACACCGAAGCAAAAGAAAAAACAAATTAAACCAGCTGGATTATCTT
ACATTGCCAAACTAAAAAACATTCAACCCATTTTGTCCTACACTTACATTTGTTGTGCAC
AAATCATACGAAAGTTTTTTTAAAAAAAAACACTTTCAATTAAGTAAAGAAATAGAAAAT
AAAAACAAAATTAAGGATTAGTAGTGAGGAGAGTGCAAGGAATGTGACGGTAACAAGTGA
GCAAGTGGTCATTGGTTAAACCAGCGGCTTGCATGAAGGAGTGAACAACAGTGGGACCCA
CGAACCGGAAGCCTCGACGGACCATGTCTTTGCTTATGCTCTCCGACTTCGATGTCTTAA
CAGGAATCTTGTGGCCTAGCTTGTAGTTCGTGGAGATGGGCTTGTGGTTCACAAACCCCC
AAAGGTATCTCTCTAGTGACCCGAACGTTTTCTTGACCTCTATGATCTTTGTAGCATTCT
CTACAACACCTCTCACTTTGCTCATCTCTATCTTGTATTCGATGCTTATTGCATTCATCT
TTTTCTCGCTAAGTTTGGCAACCGCTTCCGCCTCAAACTCCATAAACGCCTTCTTGAAGT
CATGGCGTTTTCTCAAGGTTGACGTCCAATCAGAACCTACTTGTGCGCCACTGAGGGTAA
GAAGCTCGAACAAAGTCTTGTCATCATGGACAGGGACTCCCCATTCTTCATCATGGTAGG
CAACGTAAACAGGATCAGAAGTAGGGGTAAGGAAGCTGCATCTTTGAGGATGAGCTTGAG
GATGAATAAGAGGGACAACTTTGGATGAGTTGAAATTAGTTAGGGTTGATTTGGATCTGC
CGTAATGAGCAATCTTCAGTCTCCTTAGGGCTTGTTGTGCAGCCACTTGCTCCCTCCTCA
CGGCGGCTATACTCCCAGGAGCCTCCGTTATGAGACAAGAAGGATAACTTTCTCCTTCCT
TAAAACTCTTTGATTTCTTGCGCTCCAAGCTTCCCCTCACTTCAGCTGAACCACCGTTGC
TAATCACACTGTCCCTCTTGAAGGACTCAGAACAGTTCATAAGGCGATTGCAACTACTTG
ACTGCAACATTCCTCCTCTGGTCAAGCCCACTGACTCCGTTCTGCTCATGTTCTCTATAT
CAGCTCTTAAGTTATACGGTGATGGATGAAAGAAGAGATGTAGAATGAAGAGAGTAATGT
TGAGATTAAATGATGATGATGGAATGGAGAAGAGCAAGTGATTGTCTACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR84JQ U 1
AF RR2AS40JQ U 107
AF RR2DR84TF C 659
AF RR2AS40TF C 654
BS 1 616 RR2DR84JQ
BS 617 1002 RR2AS40JQ
BS 1003 1003 RR2AS40TF
BS 1004 1024 RR2AS40JQ
BS 1025 1079 RR2AS40TF
BS 1080 1080 RR2DR84TF
BS 1081 1313 RR2AS40TF

RD RR2DR84JQ 616 0 0
ATTACTATTTCAAACTGTCACACCACACATACATGAAAAAAACCTTATACATGTGCTTAG
AAAGAAAAAAACTCACACCGAAGCAAAAGAAAAAACAAATTAAACCAGCTGGATTATCTT
ACATTGCCAAACTAAAAAACATTCAACCCATTTTGTCCTACACTTACATTTGTTGTGCAC
AAATCATACGAAAGTTTTTTTAAAAAAAAACACTTTCAATTAAGTAAAGAAATAGAAAAT
AAAAACAAAATTAAGGATTAGTAGTGAGGAGAGTGCAAGGAATGTGACGGTAACAAGTGA
GCAAGTGGTCATTGGTTAAACCAGCGGCTTGCATGAAGGAGTGAACAACAGTGGGACCCA
CGAACCGGAAGCCTCGACGGACCATGTCTTTGCTTATGCTCTCCGACTTCGATGTCTTAA
CAGGAATCTTGTGGCCTAGCTTGTAGTTCGTGGAGATGGGCTTGTGGTTCACAAACCCCC
AAAGGTATCTCTCTAGTGACCCGAACGTTTTCTTGACCTCTATGATCTTTGTAGCATTCT
CTACAACACCTCTCACTTTGCTCATCTCTATCTTGTATTCGATGCTTATTGCATTCATCT
TTTTCTCGCTAAGTTT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2AS40JQ 926 0 0
AGCTGGATTATCTTACATTGCCAAACTAAAAAACATTCAACCCATTTTGTCCTACACTTA
CATTTGTTGTGCACAAATCATACGAAAGTTTTTTTAAAAAAAA*CACTTTCAATTAAGTA
AAGAAATAGAAAATAAAAACAAAATTAAGGATTAGTAGTGAGGAGAGTGCAAGGAATGTG
ACGGTAACAAGTGAGCAAGTGGTCATTGGTTAAACCAGCGGCTTGCATGAAGGAGTGAAC
AACAGTGGGACCCACGAACCGGAAGCCTCGACGGACCATGTCTTTGCTTATGCTCTCCGA
CTTCGATGTCTTAACAGGAATCTTGTGGCCTAGCTTGTAGTTCGTGGAGATGGGCTTGTG
GTTCACAAACCCCCAAAGGTATCTCTCTAGTGGCCCGAACGTTTTCTTGACCTCTATGAT
CTTTGTAGCATTCTCTACAACACCTCTCACTTTGCTCATCTCTATCTTGTATTCGATGCT
TATTGCATTCATCTTTTTCTCGCTAAGTTTGGCAACCGCTTCCGCCTCAAACTCCATAAA
CGCCTTCTTGAAGTCATGGCGTTTTCTCAAGGTTGACGTCCAATCAGAACCTACTTGTGC
GCCACTGAGGGTAAGAAGCTCGAACAAAGTCTTGTCATCATGGACAGGGACTCCCCATTC
TTCATCATGGTAGGCAACGTAAACAGGATCAGAAGTAGGGGTAAGGAAGCTGCATCTTTG
AGGATGAGCTTGAGGATGAATAAGAGGGACAACTTTGGATGAGTTGAAATTAGTTAGGGT
TGATTTGGATCTGCCGTAATGAGCAATCTTCAGTCTCCTTAGGGCTTGTTGTGCAGCCAC
TTGCTCCCTCCTCACGGCGGCTATACTCCCAGGAGCCTCCGTTATGAGACAAGAAG*ATA
ACTTTCTCCTTCCTTAAA
CTCTTTGA

QA 1 918 1 918
DS 

RD RR2DR84TF 572 0 0
GTCATGGCGTTTTCTCAAGGTCGACGTCCAATCAGAACCTACTTGTGCGCCACTGAGGGT
AAGAAGCTCGAACAAAGTCTTGTCATCATGGACAGGGACTCCCCATTCTTCATCATGGTA
GGCAACGTAAACAGGATCAGAAGTAGGGGTAAGGAAGCTGCATCTTTGAGGATGAGGTTG
AGGATGAATAAGAGGGACAACTTTGGATGAGTTGAAATTAGTTAGGGTTGATTTGGATCT
GCCGTAATGAGCAATCTTCAGTCTCCTTAGGGCTTGTTGTGCAGCCACTTGCTCCCTCCT
CACGGCGGCTATACTCCCAGGAGCCTCCGTTATGAGACAAGAAGGATAACTTTCTCCTTC
CTTAAAACTCTTTGATTTCTTGCGCTCCAAGCTTCCCCTCACTTCAGCTGAACCACCGTT
GCTAATCACACTGTCCCTCTTGAAGGACTCAGAACAGTTCATAAGGCGATTGCAACTACT
TGACTGCAACATTCCTCCTCTGGTCAAGCCCACTGACTCCGTTCTGCTCATGTTCTCTAT
ATCAGCTCTTAAGTTATACGGTGATGGATGA
C

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2AS40TF 660 0 0
TTGAA
GTCATGGCGTTTTCTCAAGGTTGACGTCCAATCAGAACCTACTTGTGCGCCACTGAGGGT
AAGAAGCTCGAACAAAGTCTTGTCATCATGGACAGGGACTCCCCATTCTTCATCATGGTA
GGCAACGTAAACAGGATCAGAAGTAGGGGTAAGGAAGCTGCATCTTTGAGGATGAGCTTG
AGGATGAATAAGAGGGACAACTTTGGATGAGTTGAAATTAGTTAGGGTTGATTTGGATCT
GCCGTAATGAGCAATCTTCAGTCTCCTTAGGGCTTGTTGTGCAGCCACTTGCTCCCTCCT
CACGGCGGCTATACTCCCAGGAGCCTCCGTTATGAGACAAGAAGGATAACTTTCTCCTTC
CTTAAAACTCTTTGATTTCTTGCGCTCCAAGCTTCCCCTCACTTCAGCTGAACCACCGTT
GTTAATCACACTGTCCCTCTTGAAGGACTCAGAACAGTTCATAAGGCGATTGCAACTACT
TGACTGCAACATTCCTCCTCTGGTCAAGCCCACTGACTCCGTTCTGCTCATGTTCTCTAT
ATCAGCTCTTAAGTTATACGGTGATGGATGAAAGAAGAGATGTAGAATGAAGAGAGTAAT
GTTGAGATTAAATGATGATGATGGAATGGAGAAGAGCAAGTGATTGTCTACCTCC

QA 6 660 6 660
DS 



AS 1 2

CO CL2107Contig1 1020 2 2 U
GGAGAGCTGAGCTGCAATGGAGGCGACTGCTGCGAATGAACCAGATACGAAAAGCTCCAA
TTCCTCTCCGAGAGTAACGATACCGAACTTCTTCGCATCGCTCTCCTCGGCATTTACGCA
AACACCTTCCGTGCGTACGAACAAGCCCAGTTTGCGACTTCTTCTACCACCAGCTTCAGA
CTCCGTCAAGTTGATTCAAGACTTCCATCGTTCTCTACTCTCCGCGAGTGAGAAATTCTC
AGGCTTCATCCACTCACTCGCCGCCAAGAACCCTCTGTTTCAGGAAGCGGTTCGCTTGTC
CTCCGAGTTTCGCGGTCTTTGCGACGAGATTCGTTTGAGGAACAACACTACAAGGGTTAG
GTTTGGTATGTCGGAACACGGGTTTGCAGCGGTTCTGCCTGGAGATTCGGTTGCAGGAAT
GGTGGTTGCTAACGGGTTGATAAACTTCTTCAACATCTATAACACTATCCTTGTTGTCCG
TCTAGTACTCACCTGGTTCCCCACTGCTCCTCCTGCCATTGTTAACCCCCTCAGCACTTT
ATGTGATCCGTATTTGAACGTATTCCGGGGAGTCATACCGCCTCTTGGAGGATTAGATTT
ATCTCCCATTTTGGCTTTCCTTGTTCTCAACGCCTTCACCAGCACTGCTATGGCGCTTCC
TTGCGAGCTCCCACCAGCTGAAGGAGCGGCTTCTCCATCGTCTTGTGAGACAAAGTGGAT
GAGAAGGAGAAGGCTGAGCAGCAACAAGAACCACACACCCAGCTCCGCTTCTATGAACTG
GCTGAACCAAACCTTATTAAAAACATTACTCTTTTTTACGCTTTAGAATGTGACATATGC
CTTTTGAGTAATTTCATTCTACTACATCTTTGGATTCTGATTTTTTTTTTCTTGTGTAAA
TTTTCTTTATAAAATGAATAAAAAAAAAGTTGTTATTTGTAAGGTTTTTGCAAAATTTCA
GGACAAAACATAAGCTTTGTTTATCTTTTCATTAACAACTTTTCATTAAAGGGTCTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D191TF U 1
AF RR2D191JQ C 327
BS 1 614 RR2D191TF
BS 615 1020 RR2D191JQ

RD RR2D191TF 614 0 0
GGAGAGCTGAGCTGCAATGGAGGCGACTGCTGCGAATGAACCAGATACGAAAAGCTCCAA
TTCCTCTCCGAGAGTAACGATACCGAACTTCTTCGCATCGCTCTCCTCGGCATTTACGCA
AACACCTTCCGTGCGTACGAACAAGCCCAGTTTGCGACTTCTTCTACCACCAGCTTCAGA
CTCCGTCAAGTTGATTCAAGACTTCCATCGTTCTCTACTCTCCGCGAGTGAGAAATTCTC
AGGCTTCATCCACTCACTCGCCGCCAAGAACCCTCTGTTTCAGGAAGCGGTTCGCTTGTC
CTCCGAGTTTCGCGGTCTTTGCGACGAGATTCGTTTGAGGAACAACACTACAAGGGTTAG
GTTTGGTATGTCGGAACACGGGTTTGCAGCGGTTCTGCCTGGAGATTCGGTTGCAGGAAT
GGTGGTTGCTAACGGGTTGATAAACTTCTTCAACATCTATAACACTATCCTTGTTGTCCG
TCTAGTACTCACCTGGTTCCCCACTGCTCCTCCTGCCATTGTTAACCCCCTCAGCACTTT
ATGTGATCCGTATTTGAACGTATTCCGGGGAGTCATACCGCCTCTTGGAGGATTAGATTT
ATCTCCCATTTTGG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2D191JQ 694 0 0
AGATTCGTTTGAGGAACAACACTACAAGGGTTAGGTTTGGTATGTCGGAACACGGGTTTG
CAGCGGTTCTGCCTGGAGATTCGGTTGCAGGAATGGTGGTTGCTAACGGGTTGATAAACT
TCTTCAACATCTATAACACTATCCTTGTTGTCCGTCTAGTACTCACCTGGTTCCCCACTG
CTCCTCCTGCCATTGTTAACCCCCTCAGCACTTTATGTGATCCGTATTTGAACGTATTCC
GGGGAGTCATACCGCCTCTTGGAGGATTAGATTTATCTCCCATTTTGGCTTTCCTTGTTC
TCAACGCCTTCACCAGCACTGCTATGGCGCTTCCTTGCGAGCTCCCACCAGCTGAAGGAG
CGGCTTCTCCATCGTCTTGTGAGACAAAGTGGATGAGAAGGAGAAGGCTGAGCAGCAACA
AGAACCACACACCCAGCTCCGCTTCTATGAACTGGCTGAACCAAACCTTATTAAAAACAT
TACTCTTTTTTACGCTTTAGAATGTGACATATGCCTTTTGAGTAATTTCATTCTACTACA
TCTTTGGATTCTGATTTTTTTTTTCTTGTGTAAATTTTCTTTATAAAATGAATAAAAAAA
AAGTTGTTATTTGTAAGGTTTTTGCAAAATTTCAGGACAAAACATAAGCTTTGTTTATCT
TTTCATTAACAACTTTTCATTAAAGGGTCTAAGC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 4

CO CL2108Contig1 1020 4 4 U
GGGTAACACAGACGCAGATAAAGAATTAAGAAATATAAAAAGGTCAACAAGAATCTTTCA
GACTCTCGTGAACGCGGAGACTTTTGAGGGATCATCCGAATTCTCAGTGCAACTTGACAA
GTTATCATCATCATCTTCTCCCAGATCACAATCAAATCAAACCACATCATCTGAGAAGAG
AAAAAATGGCGGTTACTATGAAACAGATGTCGTTGATCGTGTCTTTGTTTGGCGTCTTGT
CGTTTATTCTCGGAGTCATCGCTGAGAACAAGAAGCCTGCGTCTGGAACTCCAATAAATG
GAAAGGGAGTAGTCATCTGCAAATATCCATCTGATCCAACTGTTGCCTTGGGTTACCTTT
CTGCCGCCTTTCTCCTTGCTTGCACCGTTGCAGGATACAAATCCCTGTTCCTCTCTTACA
AGGGAAGGTCCGTTCCCAACTCTGTCTTGTTCAAAAGCACCAGCTTCTCTGTCTTCTTCA
ACATTGCCTTGATAACATCTGGACTGGCACTGTCTCTGTTGCTGTGGCCAACCATTACAG
AGCAACTTCACTTGACCCGTAATGTACACAGGAACTTAGAGACCAGCTGCCCCACGGCTA
AGACTGGTCTGCTAGGTGGAGGTGCATTTGTGTCATTGGACTCGTGTCTTTTCTGGCTGG
TCGCTCTGATGCTAGCTGATAACGCCCGTGAAGACCATTTGGATGAAGCTGAAAACAGAA
ACGGCGATGGGAACTCTTCTTCCTCCAGGGATGTTAACCTCAAGATTGATGCTTGAGAGA
ATGAATGATCTGCATCTGCTTATTGGTATTGGGGTGTAGTAAGGGGGTTTTATGTTATTC
TACTGCTTGTTTGATTAGGAAAATACAAATAGTTTTTTCTTTTTAAAATACATTTGATTT
TAAAGATGCTATGAATTGATTGTGCAGCTTAATGCACTGTGATTCTCAAAGTTGTATATG
TCTACTCAGTCAGATTCTTGCTTAAATAATATTTTGATTTGGAGTTATCTTACTTCGAAC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW15TFB U 77
AF RR2FQ92TF U 3
AF RR2C388TF U 1
AF RR2AW15JQ C 396
BS 1 695 RR2C388TF
BS 696 696 RR2AW15JQ
BS 697 719 RR2C388TF
BS 720 1020 RR2AW15JQ

RD RR2AW15TFB 318 0 0
GAGACTTTTGAGGGATCATCCGAATTCTCAGTGCAACTTGACAAGTTATCATCATCATCT
TCTCCCAGATCACAATCAAATCAAACCACATCATCTGAGAAGAGAAAAAATGGCGGTTAC
TATGAAACAGATGTCGTTGATCGTGTCTTTGTTTGGCGTCTTGTCGTTTATTCTCGGAGT
CATCGCTGAGAACAAGAAGCCTGCGTCTGGAACTCCAATAAATGGAAAGGGAGTAGTCAT
CTGCAAATATCCATCTGATCCAACTGTTGCCTTGGGTTACCTTTCTGCCGCCTTTCTCCT
TGCTTGCACCGTTGCAGG

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR2FQ92TF 609 0 0
GG
AACACAGACGCAGATAAAGAATTAAGAAATATAAAAAGGTCAACAAGAATCTTTCAGACT
CTCGTGAACGCGGAGACTTTTGAGGGATCATCCGAATTCTCAGTGCAACTTGACAAGTTA
TCATCATCATCTTCTCCCAGATCACAATCAAATCAAACCACATCATCTGAGAAGAGAAAA
AATGGCGGTTACTATGAAACAGATGTCGTTGATCGTGTCTTTGTTTGGCGTCTTGTCGTT
TATTCTCGGAGTCATCGCTGAGAACAAGAAGCCTGCGTCTGGAACTCCAATAAATGGAAA
GGGAGTAGTCATCTGCAAATATCCATCTGATCCAACTGTTGCCTTGGGTTACCTTTCTGC
CGCCTTTCTCCTTGCTTGCACCGTTGCAGGATACAAATCCCTGTTCCTCTCTTACAAGGG
AAGGTCCGTTCCCAACTCTGTCTTGTTCAAAAGCACCAGCTTCTCTGTCTTCTTCAACAT
TGCCTTGATAACATCTGGACTGGCACTGTCTCTGTTGCTGTGGCCAACCATTACAGAGCA
ACTTCACTTGACCCGTAATGTACACAGGAACTTAGAGACCAGCTGCCCCACGGCTAATAC
TGGTCTG

QA 3 609 3 609
DS 

RD RR2C388TF 719 0 0
GGGTAACACAGACGCAGATAAAGAATTAAGAAATATAAAAAGGTCAACAAGAATCTTTCA
GACTCTCGTGAACGCGGAGACTTTTGAGGGATCATCCGAATTCTCAGTGCAACTTGACAA
GTTATCATCATCATCTTCTCCCAGATCACAATCAAATCAAACCACATCATCTGAGAAGAG
AAAAAATGGCGGTTACTATGAAACAGATGTCGTTGATCGTGTCTTTGTTTGGCGTCTTGT
CGTTTATTCTCGGAGTCATCGCTGAGAACAAGAAGCCTGCGTCTGGAACTCCAATAAATG
GAAAGGGAGTAGTCATCTGCAAATATCCATCTGATCCAACTGTTGCCTTGGGTTACCTTT
CTGCCGCCTTTCTCCTTGCTTGCACCGTTGCAGGATACAAATCCCTGTTCCTCTCTTACA
AGGGAAGGTCCGTTCCCAACTCTGTCTTGTTCAAAAGCACCAGCTTCTCTGTCTTCTTCA
ACATTGCCTTGATAACATCTGGACTGGCACTGTCTCTGTTGCTGTGGCCAACCATTACAG
AGCAACTTCACTTGACCCGTAATGTACACAGGAACTTAGAGACCAGCTGCCCCACGGCTA
AGACTGGTCTGCTAGGTGGAGGTGCATTTGTGTCATTGGACTCGTGTCTTTTCTGGCTGG
TCGCTCTGATGCTAGCTGATAACGCCCGTGAAGAC*ATTTGGATGAAGCTGAAAACAGA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2AW15JQ 625 0 0
TACAAATCCCTGTTCCTCTCTTACAAGGGAAGGTCCGTTCCCAACTCTGTCTTGTTCAAA
AGCACCAGCTTCTCTGTCTTCTTCAACATTGCCTTGATAACATCTGGACTGGCACTGTCT
CTGTTGCTGTGGCCAACCATTACAGAGCAACTTCACTTGACCCGTAATGTACACAGGAAC
TTAGAGACTAGCTGCCCCACGGCTAAGACTGGTCTGCTAGGTGGAGGTGCATTTGTGTCA
TTGGACTCGTGTCTTTTCTGGCTGGTCGCTCTGATGCTAGCTGATAACGCCCGTGAAGAC
CATTTGGATGAAGCTGAAAACAGAAACGGCGATGGGAACTCTTCTTCCTCCAGGGATGTT
AACCTCAAGATTGATGCTTGAGAGAATGAATGATCTGCATCTGCTTATTGGTATTGGGGT
GTAGTAAGGGGGTTTTATGTTATTCTACTGCTTGTTTGATTAGGAAAATACAAATAGTTT
TTTCTTTTTAAAATACATTTGATTTTAAAGATGCTATGAATTGATTGTGCAGCTTAATGC
ACTGTGATTCTCAAAGTTGTATATGTCTACTCAGTCAGATTCTTGCTTAAATAATATTTT
GATTTGGAGTTATCTTACTTCGAAC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 4

CO CL2109Contig1 610 4 4 U
TTTGGGAAACATTACATGTTTAGATCTTTTCTTTTAAAGCGCTTTGTATGTGTGTTACAC
TAGACGAGTGTTTTCTGAGATAGTATAATGTTATATATTAGCAACAGCAGGCATGATACT
CTTATGATGTTTTGGATGATCCGGTTTTCTCAAGATCACGTTGTATTGCTCGTTCCATTT
TCCGCTTTCGCCATTCTTCCAATGCTTTCAAGCTGGACGCATCGTTTAGGGAGCGAAAAT
CTTTGAGACGTTTAGAGAGATCGACGGCTGTGTTCTGCTTCACATCTTTCTCCTGCTCTG
TTTCTTGTCCACCAGATGCCTCCTGTTCGATTTCACGGACTCTTTTGATAAGCTGTAAAG
GTTGCATCGAGAGTCTAATCTCTTCGGCTTCCTTCACGTACCGAAGCTGAGCTGAAAGGA
GTCGGCGAGAGGAGGAAGTGAAAAAGCCCTGAAGGAGGAAGAGGAAGATGAAAAGGTTGA
CGATAGTGAGAGCAATTGTGGCGTTCTTGAAAGATAATCTCAAACGCCATTGATGATGAT
TATGATGATCCATTCCTCTCTATATAATTGTGAAACTTCCAACTTTATGAAGAAAGAAAG
ACTCATCAAT


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2BR93TF C 1
AF RR2AO09JQ U 4
AF RR2AO09TF C 4
AF RR2BR93JQ U 4
BS 1 3 RR2BR93TF
BS 4 103 RR2AO09JQ
BS 104 104 RR2BR93JQ
BS 105 610 RR2AO09JQ

RD RR2BR93TF 610 0 0
TTTGGGAAACATTACATGTTTAGATCTTTTCTTTTAAAGCGCTTTGTATGTGTGTTACAC
TAGACGAGTGTTTTCTGAGATAGTATAATGTTATATATTAGCAACAGCAGGCATGATACT
CTTATGATGTTTTGGATGATCCGGTTTTCTCAAGATCACGTTGTATTGCTCGTTCCATTT
TCCGCTTTCGCCATTCTTCCAATGCTTTCAAGCTGGACGCATCGTTTAGGGAGCGAAAAT
CTTTGAGACGTTTAGAGAGATCGACGGCTGTGTTCTGCTTCACATCTTTCTCCTGCTCTG
TTTCTTGTCCACCAGATGCCTCCTGTTCGATTCCACGGACTCTTTTGATAAGCTGTAAAG
GTTGCATCGAGAGTCTAATCTCTTCGGCTTCCTTCACGTACCGAAGCTGAGCTGAAAGGA
GTCGGCGAGAGGAGGAAGTGAAAAAGCCCTGAAGGAGGAAGAGGAAGATGAAAAGGTTGA
CGATAGTGAGAGCAATTGTGGCGTTCTTGAAAGATAATCTCAAACGCCATTGATGATGAT
TATGATGATCCATTCCTCTCTATATAATTGTGAAACTTCCAACTTTATGAAGAAAGAAAG
ACTCATCAAT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2AO09JQ 607 0 0
GGGAAACATTACATGTTTAGATCTTTTCTTTTAAAGCGCTTTGTATGTGTGTTACACTAG
ACGAGTGTTTTCTGAGATAGTATAATGTTATATATTAGCAGCAGCAGGCATGATACTCTT
ATGATGTTTTGGATGATCCGGTTTTCTCAAGATCACGTTGTATTGCTCGTTCCATTTTCC
GCTTTCGCCATTCTTCCAATGCTTTCAAGCTGGACGCATCGTTTAGGGAGCGAAAATCTT
TGAGACGTTTAGAGAGATCGACGGCTGTGTTCTGCTTCACATCTTTCTCCTGCTCTGTTT
CTTGTCCACCAGATGCCTCCTGTTCGATTTCACGGACTCTTTTGATAAGCTGTAAAGGTT
GCATCGAGAGTCTAATCTCTTCGGCTTCCTTCACGTACCGAAGCTGAGCTGAAAGGAGTC
GGCGAGAGGAGGAAGTGAAAAAGCCCTGAAGGAGGAAGAGGAAGATGAAAAGGTTGACGA
TAGTGAGAGCAATTGTGGCGTTCTTGAAAGATAATCTCAAACGCCATTGATGATGATTAT
GATGATCCATTCCTCTCTATATAATTGTGAAACTTCCAACTTTATGAAGAAAGAAAGACT
CATCAAT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2AO09TF 607 0 0
GGGAAACATTACATGTTTAGATCTTTTCTTTTAAAGCGCTTTGTATGTGTGTTACACTAG
ACGAGTGTTTTCTGAGATAGTATAATGTTATATATTAGCAGCAGCAGGCATGATACTCTT
ATGATGTTTTGGATGATCCGGTTTTCTCAAGATCACGTTGTATTGCTCGTTCCATTTTCC
GCTTTCGCCATTCTTCCAATGCTTTCAAGCTGGACGCATCGTTTAGGGAGCGAAAATCTT
TGAGACGTTTAGAGAGATCGACGGCTGTGTTCTGCTTCACATCTTTCTCCTGCTCTGTTT
CTTGTCCACCAGATGCCTCCTGTTCGATTTCACGGACTCTTCTGATAAGCTGTAAAGGTT
GCATCGAGAGTCTAATCTCTTCGGCTTCCTTCACGTACCGAAGCTGAGCTGAAAGGAGTC
GGCGAGAGGAGGAAGTGAAAAAGCCCTGAAGGAGGAAGAGGAAGATGAAAAGGTTGACGA
TAGTGAGAGCAATTGTGGCGTTCTTGAAAGATAATCTCAAACGCCATTGATGATGATTAT
GATGATCCATTCCTCTCTATATAATTGTGAAACTTCCAACTTTATGAAGAAAGAAAGACT
CATCAAT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2BR93JQ 607 0 0
GGGAAACATTACATGTTTAGATCTTTTCTTTTAAAGCGCTTTGTATGTGTGTTACACTAG
ACGAGTGTTTTCTGAGATAGTATAATGTTATATATTAGCAACAGCAGGCATGATACTCTT
ATGATGTTTTGGATGATCCGGTTTTCTCAAGATCACGTTGTATTGCTCGTTCCATTTTCC
GCTTTCGCCATTCTTCCAATGCTTTCAAGCTGGACGCATCGTTTAGGGAGCGAAAATCTT
TGAGACGTTTAGAGAGATCGACGGCTGTGTTCTGCTTCACATCTTTCTCCTGCTCTGTTT
CTTGTCCACCAGATGCCTCCTGTTCGATTTCACGGACTCTTTTGATAAGCTGTAAAGGTT
GCATCGAGAGTCTAATCTCTTCGGCTTCCTTCACGTACCGAAGCTGAGCTGAAAGGAGTC
GGCGAGAGGAGGAAGTGAAAAAGCCCTGAAGGAGGAAGAGGAAGATGAAAAGGTTGACGA
TAGTGAGAGCAATTGTGGCGTTCTTGAAAGATAATCTCAAACGCCATTGATGATGATTAT
GATGATCCATTCCTCTCTATATAATTGTGAAACTTCCAACTTTATGAAGAAAGAAAGACT
CATCAAT

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 4

CO CL2110Contig1 825 4 17 U
CGTTTAGTCTCTCTAATGTTTATAATTTATATATATTAAAAAGAGAGAATACAAGAAACC
TTGCCTAAAAACAATAATGCAATGACTATATAATATGTATGTAAAATGAATTACATATCT
GCAAAAACGTGAAAGTTTTTGGAATCAAGTGCAATGAGTCTAACAGCTGCAATGGCGGCA
GCAACAGACATCAAACTGAAGAAGACAACGTTAAACCAATGCCATATCTTTTGCAAAGGA
CTGAGCTTATTGTTCATAGCCTTATAGTACATGTGGTTGGCTAGAATGAATGTGAGAGGG
AATGTGCTCACTGCACCAGTGAGACTCATGAAGTCTCCAAGGAAAGGCAAGAGCGCAGAG
ACGAGCGTGCTAACCGCTACGTACCCTCCACGGGCCACGATCCTGAACGTCAAGTTTTTC
AAAGCCAATGGGTTTCCTTTGATCCCAAACTTTGTGTCCATGTACTCATATGTTGGACTT
GCAAATATGTGTAAAGCGATAACGGATTGAAGGATGGCAGAGACGTTAGCAAGGGCTTTG
ACCCAGATTGGGCCATGGACACTGTTTAGCAAGTAGGCGGAGGTTGAGGAACCGTAAGCC
CAGTATCCAATGAATGTAACAGCATACATTGGTAGAACTCCAGCTGTGAACTGAAAGTAT
AGAGCCTTCATCATGTTTTTCACAACCGGTTGTCTCACTGTGGCCTGAATCTCTGGAAGC
ATCCCTGTGTTGAATGCGAAGACCAAGTTTGCTGCTGCTCCTGTGATGGTGAAGAGTTTG
TTTAATGATGATCCTTGTATCTCGTAATCTCTTGGTGGTGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G593JQ U 6
AF RR2FG49JQ U 1
AF RR2H095JQ U 63
AF RR2G593TF C 67
BS 1 270 RR2FG49JQ
BS 271 271 RR2G593JQ
BS 272 357 RR2FG49JQ
BS 358 358 RR2H095JQ
BS 359 519 RR2FG49JQ
BS 520 520 RR2H095JQ
BS 521 542 RR2FG49JQ
BS 543 544 RR2H095JQ
BS 545 545 RR2G593TF
BS 546 577 RR2H095JQ
BS 578 578 RR2G593TF
BS 579 686 RR2H095JQ
BS 687 687 RR2G593TF
BS 688 701 RR2H095JQ
BS 702 702 RR2G593TF
BS 703 775 RR2H095JQ
BS 776 825 RR2G593TF

RD RR2G593JQ 351 0 0
AGTCTCTCTAATGTTTATAATTTATATATATTAAAAAGAGAGAATACAAGAAACCTTGCC
TAAGAACAATAATGCAATGACTATATAATATGTATGTAAAATGAATTACATATCTGCAAA
AACGTGAAAGTTTTTGGAATCAAGTGCAATGAGTCTAACAGCTGCAATGGCGGCAGCAAC
AGACATCAAACTGAAGAAGACAACGTTAAACCAATGCCATATCTTTTGCAAAGGACTGAG
CTTATTGTTCATAGCCTTATAGTACATGTGGTTGGCTAGAATGAATGTGAGAGGGAATGT
GCTCACTGCACCAGTGAGACTCATGAAGTCTCCAAGGAAAGGCAAGAGCGC

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR2FG49JQ 542 0 0
CGTTTAGTCTCTCTAATGTTTATAATTTATATATATTAAAAAGAGAGAATACAAGAAACC
TTGCCTAAAAACAATAATGCAATGACTATATAATATGTATGTAAAATGAATTACATATCT
GCAAAAACGTGAAAGTTTTTGGAATCAAGTGCAATGAGTCTAACAGCTGCAATGGCGGCA
GCAACAGACATCAAACTGAAGAAGACAACGTTAAACCAATGCCATATCTTTTGCAAAGGA
CTGAGCTTATTGTTCATAGCCTTATAGTACGTGTGGTTGGCTAGAATGAATGTGAGAGGG
AATGTGCTCACTGCACCAGTGAGACTCATGAAGTCTCCAAGGAAAGGCAAGAGCGCAAAG
ACGAGCGTGCTAACCGCTACGTACCCTCCACGGGCCACGATCCTGAACGTCAAGTTTTTC
AAAGCCAATGGGTTTCCTTTGATCCCAAACTTTGTGTCCATGTACTCATATGTTGGACTT
GCAAATATGTGTAAAGCGATAACGGATTGAAGGATGGCAAAGACGTTAGCAAGGGCTTTG
AC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2H095JQ 713 0 0
AGGAACAATAAT
TAATGCAATGACTATATAATATGTATGTAAAATGAATTACATATCTGCAAAAACGTGAAA
GTTTTTGGAATCAAGTGCAATGAGTCTAACAGCTGCAATGGCGGCAGCAACAGACATCAA
ACTGAAGAAGACAACATTAAACCAATGCCATATCTTTTGCATAGGACTGAGCTTATTGTT
CATAGCCTTATAGTACATGTGGTTGGCTAGAATGAATGTGAGAGGGAATGTGCTCACTGC
ACCAGTGAGACTCATGAAGTCTCCAAGGAAAGGCAAGAGCGCAGAGACGAGCGTGCTAAC
CGCTACGTACCCTCCACGGGCCACGATCCTGAACGTCAAGTTCTTTAGAGCCAATGGGTT
TCCTTTGATCCCAAACTTTGTGTCCATGTACTCATATGTTGGACTTGCAAATATGTGTAA
AGCGATAACGGATTGAAGGATGGCAGAGACGTTAGCAAGGGCTTTGACCCGGATTGGGCC
ATGGACACTGTTTAGCAAGTAGGTGGAGGTTGAGGAACCGTAAGCCCAGTATCCAATGAA
TGTAACAGCATACATTGGTAGAACTCCAGCTGTGAACTGAAAGTATAGAGCCTTCATCAT
GTTTTTCACAACTGGTTGTCTCACTGTTGCCTGAATCTCTGGAAGCATCCCTGTGTTGAA
TGCGAAGACCAAGTTTGCTGCTGCTCCTGTGATGGTGAAGA

QA 13 713 13 713
DS 

RD RR2G593TF 759 0 0
AAGAACAA
TAATGCAATGACTATATAATATGTATGTAAAATGAATTACATATCTGCAAAAACGTGAAA
GTTTT*GGAATCAAGTGCAATGAGTCTAACAGCTGCAATGGCGGCAGCAACAGACATCAA
ACTGAAGAAGACAACGTTAAACCAATGCCATATCTTTTGCAAAGGACTGAGCTTATTGTT
CATAGCCTTATAGTACATGTGGTTGGCTAGAATGAATGTGAGAGGGAATGTGCTCACTGC
ACCAGTGAGACTCATGAAGTCTCCAAGGAAAGGCAAGAGCGCAGAGACGAGCGTGCTAAC
CGCTACGTACCCTCCACGGGCCACGATCCTGAACGTCAAGTTTTTCAAAGCCAATGGGTT
TCCTTTGATCCCAAACTTTGTGTCCATGTACTCATATGTTGGACTTGCAAATATGTGTAA
AGCGATAACGGATTGAAGGATGGCAGAGACGCTAGCAAGGGCTTTGACCCAGATTGGGCC
ATTGACACTGTTTAGCAAGTAGGCGGAGGTTGAGGAACCGTAAGCCCAGTATCCAATGAA
TGTAACAGCATACATTGGTAGAACTCCAGCTGTGAACTGAAAGTATAGAGCCTTCATCAT
GTTTTTCACAACCGGTTGTCTCACTGTGGCCTGAATCTCTGGAAGCATCCCTGTGTTGAA
TGCGAAGACCAAGTTTGCTGCTGCTCCTGTGATGGTGAAGAGTTTGTTTAATGATGATCC
TTGTATCTCGTAATCTCTTGGTGGTGCTTCC

QA 9 759 9 759
DS 



AS 1 2

CO CL2111Contig1 996 2 22 U
GGACAGAGAGATTCAATGGAGAGAGTGAATCAAACATTCTTCTTATCGCATGGATCTCCC
ACATTGAGCATTGATGATAAGTTAGAAGCAGGACAGTTCTTCCAATCATGGTCGGACAAA
GTCTTTCAACACAAACCCAAATCTATTTTAGTCATCTCTGCCCACTGGGACACCGAGTTT
CCATCCGTCAACACTGTTCCCCGCAACTCCACCATCCACGATTTCAATAACTTCCCTGAT
CCCATGTACAAGCTTAAGTATGAAGCACCAGGAGATATTGAGCTGGCGAAAAGGGTTAAA
GAGTTGCTAATGGGAGGAGGAGGAATGAAGCGTGTTGATGAAGATACAGAGAGAGGACTT
GATCATGGAGCTTGGGTTCCTCTTATGTTGATGTATCCTGAAGCAGATATACCGGTTTGT
CAACTCTCTGTTCAATCATCTCAAACCGGGACTTACCATTACAACATGGGCAAAGCATTG
GCTCCACTGAAAGAAGAAGGCGTCCTTATCATTGGATCTGGAAGCGCCACTCATAACTTG
AAGAAGCTTGACTTTAGTATCACTGATGGATCAGCGGTTCCTTGGGCTTTAGAGTTTGAC
CATTGGCTCAAAGACTCTCTCCTACAAGGAAGGTATGAAGATGTGAATGAGTGGGAAGAG
AAAGCTCCAAATGCGAAAATGGCACATCCATGGCCAGAGCATTTCTACCCATTACACGTT
GCAATGGGTGCAGCTGGTGATGACGCCAAGGCAGAGCAAATCCACACAAGTTGGCAACTT
GGGACTCTGTCTTATTCTTCTTATAGCTTCACTTCTTCCCTTTGAAACATTTCATCTTTA
CCTCCTTTCACTTGCCGTGTGATTACTTTAATGTAAGCACTGTGTAAGGCTATGGAGAAA
GATCGAGAGTGTTATGAAACTTATAAGTGAAGAATTGCATCTCTTCATTGAAGTGTTCTG
TTACTACTAGTGAAGAGTTATATCTGTTCACCAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ03TF U 1
AF RR2CG50JQ C 240
BS 1 289 RR2GZ03TF
BS 290 290 RR2CG50JQ
BS 291 298 RR2GZ03TF
BS 299 299 RR2CG50JQ
BS 300 500 RR2GZ03TF
BS 501 501 RR2CG50JQ
BS 502 503 RR2GZ03TF
BS 504 504 RR2CG50JQ
BS 505 524 RR2GZ03TF
BS 525 525 RR2CG50JQ
BS 526 536 RR2GZ03TF
BS 537 537 RR2CG50JQ
BS 538 599 RR2GZ03TF
BS 600 600 RR2CG50JQ
BS 601 606 RR2GZ03TF
BS 607 607 RR2CG50JQ
BS 608 610 RR2GZ03TF
BS 611 611 RR2CG50JQ
BS 612 623 RR2GZ03TF
BS 624 624 RR2CG50JQ
BS 625 726 RR2GZ03TF
BS 727 996 RR2CG50JQ

RD RR2GZ03TF 726 0 0
GGACAGAGAGATTCAATGGAGAGAGTGAATCAAACATTCTTCTTATCGCATGGATCTCCC
ACATTGAGCATTGATGATAAGTTAGAAGCAGGACAGTTCTTCCAATCATGGTCGGACAAA
GTCTTTCAACACAAACCCAAATCTATTTTAGTCATCTCTGCCCACTGGGACACCGAGTTT
CCATCCGTCAACACTGTTCCCCGCAACTCCACCATCCACGATTTCAATAACTTCCCTGAT
CCCATGTACAAGCTTAAGTATGAAGCACCAGGAGATATTGAGCTGGCGAGAAGGGTTAGA
GAGTTGCTAATGGGAGGAGGAGGAATGAAGCGTGTTGATGAAGATACAGAGAGAGGACTT
GATCATGGAGCTTGGGTTCCTCTTATGTTGATGTATCCTGAAGCAGATATACCGGTTTGT
CAACTCTCTGTTCAATCATCTCAAACCGGGACTTACCATTACAACATGGGCAAAGCATTG
GCTCCACTGAAAGAAGAAGGTGTTCTTATCATTGGATCTGGAAGTGCCACTCATAATTTG
AAGAAGCTTGACTTTAGTATCACTGATGGATCAGCGGTTCCTTGGGCTTTAGAGTTTGAT
CATTGGGTCAGAGACTCTCTCCTTCAAGGAAGGTATGAAGATGTGAATGAGTGGGAAGAG
AAAGCTCCAAATGCGAAAATGGCACATCCATGGCCAGAGCATTTCTACCCATTACACGTT
GCAATG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2CG50JQ 757 0 0
TCCCATGTACAAGCTTAAGTATGAAGCACCAGGAGCTATTGAGCTGGCGAAAAGGGTTAA
AGAGTTGCTAATGGGAGGAGGAGGAATGAAGCGTGTTGATGAAGATACAGAGAGAGGACT
TGATCATGGAGCTTGGGTTCCTCTTATGTTGATGTATCCTGAGGCAGATATACCGGTTTG
TCAACTCTCTGTTCAATCATCTCAAACCGGGACTTACCATTACAACATGGGCAAAGCATT
GGCTCCACTGAAAGAAGAAGGCGTCCTTATCATTGGATCTGGAAGCGCCACTCATAACTT
GAAGAAGCTTGACTTTAGTATCACTGATGGATCAGCGGTTCCTTGGGCTTTAGAGTTTGA
CCATTGGCTCAAAGACTCTTTCCTACAAGGAAGGTATGGAGATGTGAATGAGTGGGAAGA
GAAAGCTCCAAATGCGAAAATGGCACATCCATGGCCAGAGCATTTCTACCCATTACACGT
TGCAATGGGTGCAGCTGGTGATGACGCCAAGGCAGAGCAAATCCACACAAGTTGGCAACT
TGGGACTCTGTCTTATTCTTCTTATAGCTTCACTTCTTCCCTTTGAAACATTTCATCTTT
ACCTCCTTTCACTTGCCGTGTGATTACTTTAATGTAAGCACTGTGTAAGGCTATGGAGAA
AGATCGAGAGTGTTATGAAACTTATAAGTGAAGAATTGCATCTCTTCATTGAAGTGTTCT
GTTACTACTAGTGAAGAGTTATATCTGTTCACCAACT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 3

CO CL2112Contig1 973 3 10 U
GGATTGAATCAGAAAGAACACTCATCACAAGAGAAGAGAGAGTTGAGAGATGGCGAGATA
CGATAGAGCAATCACAGTGTTTTCACCAGACGGCCACCTTTTCCAGGTAGAGTACGCCCT
AGAAGCTGTCCGCAAAGGTAACGCCGCCGTCGGCGTCCGAGGCACCGATACTGTCGTCCT
CGCCGTCGAGAAGAAATCCACCCCTAAGCTCCAGGATACCAGATCGGCCAGAAAGATTGT
TAGCCTTGATAACCACGTGGCATTGGCCTGTGCTGGGCTGAAGGCAGATGCTCGTGTCCT
GATAAACAAAGAGAGGATCGAGTGTCAAAGCCACAGGCTTACGTTGGAGGATCCGGTGAC
TGTTGAGTACATCACTCGCTACATAGCAGGGCTTCAGCAGAAGTATACTCAAAGTGGTGG
TGTGAGACCTTTTGGTCTTTCCACTCTTATTGTTGGTTTTGACCCCTACACTCGTATACC
TTCGCTTTATCAGACTGATCCGTCTGGTACCTTCTCTGCTTGGAAGGCTAATGCGACCGG
GAGGAACTCTAACTCGATCAGGGAGTTTCTGGAGAAGAATTATAAAGAAACCTCGGGGCA
AGAGACTGTTAAACTTGCAATCCGTGCTCTGCTTGAGGTAGTTGAGAGTGGTGGAAAGAA
CATTGAG*TTGCTTTAATGACAAGGGAGGAAGGTACTCTGAAGCAGTTGGAAGAAGCTGA
AATCGATGCGATTGTGGCTGAGATTGAAGCTGAGAAGGCGGCTGCAGAAGCAGCCAAGAA
AGGCCCTTCTAGGGAAACATGAGCCATTTCTTACGGCATTGGTCTTGCTTTCTGAATTGT
GTGATGTTGGTTCGAAGAAAAGATATTTGAGGGTTGAATAGACAAAAATCTGGACTGCGT
TTAGTTCATGTTGTTGGATTATTAGCCTGTTTGACATTCTTCATTTTAAATCATATATTT
GGCTATTTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D272TF U 1
AF RR2H786TF U 4
AF RR2D272JQ C 252
BS 1 34 RR2D272TF
BS 35 35 RR2H786TF
BS 36 159 RR2D272TF
BS 160 160 RR2H786TF
BS 161 228 RR2D272TF
BS 229 229 RR2H786TF
BS 230 637 RR2D272TF
BS 638 638 RR2H786TF
BS 639 681 RR2D272TF
BS 682 973 RR2D272JQ

RD RR2D272TF 681 0 0
GGATTGAATCAGAAAGAACACTCATCACAAGAGA*GAGAGAGTTGAGAGATGGCGAGATA
CGATAGAGCAATCACAGTGTTTTCACCAGACGGCCACCTTTTCCAGGTAGAGTACGCCCT
AGAAGCTGTCCGCAAAGGTAACGCCGCCGTCGGCGTCCGGGGCACCGATACTGTCGTCCT
CGCCGTCGAGAAGAAATCCACCCCTAAGCTCCAGGATACCAGATCGGCGAGAAAGATTGT
TAGCCTTGATAACCACGTGGCATTGGCCTGTGCTGGGCTGAAGGCAGATGCTCGTGTCCT
GATAAACAAAGAGAGGATCGAGTGTCAAAGCCACAGGCTTACGTTGGAGGATCCGGTGAC
TGTTGAGTACATCACTCGCTACATAGCAGGGCTTCAGCAGAAGTATACTCAAAGTGGTGG
TGTGAGACCTTTTGGTCTTTCCACTCTTATTGTTGGTTTTGACCCCTACACTCGTATACC
TTCGCTTTATCAGACTGATCCGTCTGGTACCTTCTCTGCTTGGAAGGCTAATGCGACCGG
GAGGAACTCTAACTCGATCAGGGAGTTTCTGGAGAAGAATTATAAAGAAACCTCGGGGCA
AGAGACTGTTAAACTTGCAATCCGTGCTCTGCTTGAG*TAGTTGAGAGTGGTGGAAAGAA
CATTGAG*TTGCTTTAATGAC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2H786TF 678 0 0
GG
GAATCAGAGAGGACACTCATCACAAGAGAAGAGAGAGTTGAGAGATGGCGAGATACGATA
GAGCAATCACAGTGTTTTCACCAGACGGCCACCTTTTCCAGGTAGAGTACGCCCTAGAAG
CTGTCCGCAAAGGTAACGCCGCCGTCGGCGTCCGAGGCACCGATACTGTCGTCCTCGCCG
TCGAGAAGAAATCCACCCCTAAGCTCCAGGATACGAGATCGGCCAGAAAGATTGTTAGCC
TTGATAACCACGTCGCATTGGCCTGTGCTGGGCTGAAGGCAGATGCTCGTGTCCTGATAA
ACAAAGCGAGGATCGAGTGTCAAAGCCACAGGCTTACTTTGGAGGATCCAGTGACTGTTG
AGTACATCACCCGCTACATAGCAGGGCTTCAACAGAAGTATACTCAAAGTGGTGGTGTGA
GACCTTTTGGTCTTTCCACTCTCATTGTTGGTTTTGACCCCTACACTCGCATACCTTCGC
TTTATCAGACCGATCCATCCGGTACCTTCTCTGCTTGGAAGGCTAATGCGACCGGGAGGA
ACTCTAACTCGATCAGGGAGTTTCTGGAGAAGAATTATAAAGAAACCTCGGGGCAAGAGA
CTGTTAAACTTGCAATCCGTGCTCTGCTTGAGGTAGTTGAGAGTGGTGGAAAGAACATTG
AG*TTGCTTTAATGAC

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR2D272JQ 722 0 0
ACCACGTGGCATTGGCCTGTGCTGGGCTGAAGGCAGATGCTCGTGTCCTGATAAACAAAG
AGAGGATCGAGTGTCAAAGCCACAGGCTTACGTTGGAGGATCCGGTGACTGTTGAGTACA
TCACTCGCTACATAGCAGGGCTTCAGCAGAAGTATACTCAAAGTGGTGGTGTGAGACCTT
TTGGTCTTTCCACTCTTATTGTTGGTTTTGACCCCTACACTCGTATACCTTCGCTTTATC
AGACTGATCCGTCTGGTACCTTTTCTGCTTGGAAGGCTAATGCGACCGGGAGGAACTCTA
ACTCGATCAGGGAGTTTCTGGAGAAGAATTATAAAGAAACCTCGGGGCAAGAGACTGTTA
AACTTGCAATCCGTGCTCTGCTTGAGGTAGTTGAGAGTGGTGGAAAGAACATTGAGGTTG
CTTTAATGACAAGGGAGGAAGGTACTCTGAAGCAGTTGGAAGAAGCTGAAATCGATGCGA
TTGTGGCTGAGATTGAAGCTGAGAAGGCGGCTGCAGAAGCAGCCAAGAAAGGCCCTTCTA
GGGAAACATGAGCCATTTCTTACGGCATTGGTCTTGCTTTCTGAATTGTGTGATGTTGGT
TCGAAGAAAAGATATTTGAGGGTTGAATAGACAAAAATCTGGACTGCGTTTAGTTCATGT
TGTTGGATTATTAGCCTGTTTGACATTCTTCATTTTAAATCATATATTTGGCTATTTTAT
GC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 4

CO CL2113Contig1 839 4 6 U
GGAGCACATCTCATTTGCTACGAATCTTATCTCTCTCTTTCTCTTATTTCGTCTCTCCTT
TTTTTGTAAATTTTTACGTCTCTTCTTTGGTAGTGAAGATGGATATGTACAACGATGATA
GCTCTCCGTACTGTTATTTCCATCCAAAGGAAGAATATGTTGGAGTGTGTCCTCTCTGTT
TGAACGAGAGGCTTCTGGTTTTAGCTTCAAAGCAGAGATCATCAAAAACCAGACACTCTT
CATCTTCGCCAATCATTAGCCTCCCTAAGATCTTCACCTTGAGCTCTCTCCTCAGTCGCT
TAGATTTCCGTCACCACCGGAAATTCCATCCCTCTTCCGATCTCGAAGTCTCCACAAGCC
AAGAAGATTCTTTTATTTCCATAAAATTCGAAAACGATGGAAACGCCTCTTGGGAGAGGA
AAACAGTGTCAAAGGTTTGTGTAGACAACACAAACTCAACATGTAAGAAGCAGCAAGCCG
CTCTCACGAGCACTACGAGTATCGTAGAGCACAATAGTGCCAAGTCATCTCTTAAGTGGC
GCAAACGTATTGGTCATCTTTT*CCGTGTCATCAAACTCAGATCAGGATTGCCCACCTCT
TCTTGTCATGTGGCATCATCCAAGGTCGAAGGAACCAAAGCGAGGAAACATGGTTGGATG
GTTAGGACTTTAACCAGAAGAAAATCCAGGAAAAATAAAACGTGAATTTTTATTTTTCAT
ATGTTTATTTATTAAACTTAGACAAAAGTTTCTATATTATTTTTTCTGAGTTTAATATTT
GGTTTGGTCGTTATTTCAATGGTTGATGCTTTTGTTTAAAGAAGAAATACGTTGAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G706TF U 1
AF RR2EI36TF U 3
AF RR2G706JQ C 71
AF RR2EI36JQ C 313
BS 1 562 RR2G706TF
BS 563 563 RR2EI36TF
BS 564 624 RR2G706TF
BS 625 694 RR2EI36TF
BS 695 790 RR2G706JQ
BS 791 839 RR2EI36JQ

RD RR2G706TF 628 0 0
GGAGCACATCTCATTTGCTACGAATCTTATCTCTCTCTTTCTCTTATTTCGTCTCTCCTT
TTTTTGTAAATTTTTACGTCTCTTCTTTGGTAGTGAAGATGGATATGTACAACGATGATA
GCTCTCCGTACTGTTATTTCCATCCAAAGGAAGAATATGTTGGAGTGTGTCCTCTCTGTT
TGAACGAGAGGCTTCTGGTTTTAGCTTCAAAGCAGAGATCATCAAAAACCAGACACTCTT
CATCTTCGCCAATCATTAGCCTCCCTAAGATCTTCACCTTGAGCTCTCTCCTCAGTCGCT
TAGATTTCCGTCACCACCGGAAATTCCATCCCTCTTCCGATCTCGAAGTCTCCACAAGCC
AAGAAGATTCTTTTATTTCCATAAAATTCGAAAACGATGGAAACGCCTCTTGGGAGAGGA
AAACAGTGTCAAAGGTTTGTGTAGACAACACAAACTCAACATGTAAGAAGCAGCAAGCCG
CTCTCACGAGCACTACGAGTATCGTAGAGCACAATAGTGCCAAGTCATCTCTTAAGTGGC
GCAAACGTATTGGTCATCTTTTTCCGTGTCATCAAACTCAGATCAGGATTGCCCACCTCT
TCTTGTCATGTGGCATCATCCAAG
TCGA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2EI36TF 694 0 0
GGG
ACATCTCATTTGCTACGAATCTTATCTCTCTCTTTCTCTTATTTCGTCTCTCCTTTTTTT
GTAAATTTTTACGTCTCTTCTTTGGTAGTGAAGATGGATATGTACAACGATGATAGCTCT
CCGTACTGTTATTTCCATCCAAAGGAAGAATATGTTGGAGTGTGTCCTCTCTGTTTGAAC
GAGAGGCTTCTGGTCTTAGCTTCAAAGCAGAGATCATCAAAAACCAGACACTCTTCATCT
TCGCCAATCATTAGCCTCCCTAAGATCTTCACCTTGAGCTCTCTCCTCAGTCGCTTAGAT
TTCCGTCACCACCGGAAATTCCATCCCTCTTCCGATCTTGAAGTTTCCACAAGCCAAGAA
GATTCTTTTATTTCCATAAA*TTCGAAAACGATGGAAACGCCTCTTGGGAGAGGAAAACA
GTGTCAAAGGTTTGTGTAGACAACACAAACTCAACATGTAAGAAGCAGCAAGCCGCTCTC
ACGAGCACTACGAGTATCGTAGAGCACAATAGTGCCAAGTCATCTCTTAAGTGGCGCAAA
CGTATTGGTCATCTTTT*CCGTGTCATCAAGCTCAGATCAGGATTGCCCACCTCTTCTTG
TCATGTGGCATCATCCAAGGTCGAAGGAACCAAAGCGAGGAAACATGGTTGGATGGTTAG
GACTTTAACCAGAAGAAAATCCAGGAAAA
TA

QA 4 692 4 692
DS 

RD RR2G706JQ 721 0 0
TTTTTACGTCTCTTCTTTGGTAGTGAAGATGGATATGTACAACGATGATAGCTCTCCGTA
CTGTTATTTCCATCCAAAGGAAGAATATGTTGGAGTGTGTCCTCTCTGTTTGAACGAGAG
GCTTCTGGTTTTAGCTTCAAAGCAGAGATCATCAAAAACCAGACACTCTTCATCTTCGCC
AATCATTAGCCTCCCTAAGATCTTCACCTTGAGCTCTCTCCTCAGTCGCTTAGATTTCCG
TCACCACCGGAAATTCCATCCCTCTTCCGATCTCGAAGTCTCCACAAGCCAAGAAGATTC
TTTTATTTCCATAAAATTCGAAAACGATGGAAACGCCTCTTGGGAGAGGAAAACAGTGTC
AAAGGTTTGTGTAGACAACACAAACTCAACATGTAAGAAGCAGCAAGCCGCTCTCACGAG
CACTACGAGTATCGTAGAGCACAATAGTGCCAAGTCATCTCTTAAGTGGCGCAAACGTAT
TGGTCATCTTTT*CCGTGTCATCAAACTCAGATCAGGATTGCCCACCTCTTCTTGTCATG
TGGCATCATCCAAGGTCGAAGGAACCAAAGCGAGGAAACATGGTTGGATGGTTAGGACTT
TAACCAGAAGAAAATCCAGGAAAAATAAAACGTGAATTTTTATTTTTCATATGTTTATTT
ATTAAACTTAGACAAAAGTTTCTATATTATTTTTTCTGAGTTTAATATTTGGTTTGGTCG
G

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2EI36JQ 527 0 0
ACCACCGGAAATTCCATCCCTCTTCCGATCTTGAAGTTTCCACAAGCCAAGAAGATTCTT
TTATTTCCATAAA*TTCGAAAACGATGGAAACGCCTCTTGGGAGAGGAAAACAGTGTCAA
AGGTTTGTGTAGACAACACAAACTCAACATGTAAGAAGCAGCAAGCCGCTCTCACGAGCA
CTACGAGTATCGTAGAGCACAATAGTGCCAAGTCATCTCTTAAGTGGCGCAAACGTATTG
GTCATCTTTT*CCGTGTCATCAAGCTCAGATCAGGATTGCCCACCTCTTCTTGTCATGTG
GCATCATCCAAGGTCGAAGGAACCAAAGCGAGGAAACATGGTTGGATGGTTAGGACTTTA
ACCAGAAGAAAATCCAGGAAAAATAAAACGTGAATTTTTATTTTTCATATGTTTATTTAT
TAAACTTAGACAAAAGTTTCTATATTATTTTTTCTGAGTTTAATATTTGGTTTGGTCGTT
ATTTCAATGGTTGATGCTTTTGTTTAAAGAAGAAATACGTTGAAGCC

QA 1 527 1 527
DS 



AS 2 4

CO CL2114Contig1 677 2 2 U
AGATCCAAACTAGTTATATAATAAAAATTTGAAGTGTACGTGAAATTCCACAGATAATGT
CATAATGAAAAAGACGTGTCAAAAACAAAAACCTTATCTATATAAGAACACTACCGATAC
AAAGTCAAGAAGTAGCCACATTATACAGTACGCAACAAGTTACCCTCATAAACTGGCCCC
GGATAAGGTGAAAACTGAAAACCAACAACAAATATACACAACAAGGTTCTACGGTTTTCA
GATCATCAGTGAAGCTCTGAAGTCTGTGGTTAGACTGCAAACTGATATCAAGAACAGAAC
CGCAACAACGGCCGCCCTAAGAAGTCCTCCGTATGAACATCTCACGGACATAATCTTCTT
AAACAAGACTCTTGTTCTGTTCCCTGATCTCGTTAGCTTCCCCTTCTTTATAGCTTCCCC
GTCCGTATCCTCAACCTCTCTCTTGATAGTTTGCAGACGCAACCTTCTTGAGGCGTTCCC
ATGGATTACGTAGTCAGTGGTAAAACCCGAGGGTTTTTCCCGCCGAGGCTGTAACTTGAT
GCCTGTTCTTGAAAAATCATCGCTCATATCACCTGATGAGCGCTGTTGCTGATACGCTGG
TGCAATCTGATCTGGCACAGCACCGTCGAACTCACACGGAAAAACAAAGTCTTGATCGTC
TTGGAAATCAAGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A045TF C 1
AF RR2A045JQ U 82
BS 1 82 RR2A045TF
BS 83 677 RR2A045JQ

RD RR2A045TF 631 0 0
AGATCCAAACTAGTTATATAATAAAAATTTGAAGTGTACGTGAAATTCCACAGATAATGT
CATAATGAAAAAGACGTGTCAAAAACAAAAACCTTATCTATATAAGAACACTACCGATAC
AAAGTCAAGAAGTAGCCACATTATACAGTACGCAACAAGTTACCCTCATAAACTGGCCCC
GGATAAGGTGAAAACTGAAAACCAACAACAAATATACACAACAAGGTTCTACGGTTTTCA
GATCATCAGTGAAGCTCTGAAGTCTGTGGTTAGACTGCAAACTGATATCAAGAACAGAAC
CGCAACAACGGCCGCCCTAAGAAGTCCTCCGTATGAACATCTCACGGACATAATCTTCTT
AAACAAGACTCTTGTTCTGTTCCCTGATCTCGTTAGCTTCCCCTTCTTTATAGCTTCCCC
GTCCGTATCCTCAACCTCTCTCTTGATAGTTTGCAGACGCAACCTTCTTGAGGCGTTCCC
ATGGATTACGTAGTCAGTGGTAAAACCCGAGGGTTTTTCCCGCCGAGGCTGTAACTTGAT
GCCTGTTCTTGAAAAATCATCGCTCATATCACCTGATGAGCGCTGTTGCTGATACGCTGG
TGCAATCTGATCTGGCACAGCACCGTCGAAC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2A045JQ 596 0 0
A
AAACAAAAACCTTATCTATATAAGAACACTACCGATACAAAGTCAAGAAGTAGCCACATT
ATACAGTACGCAACAAGTTACCCTCATAAACTGGCCCCGGATAAGGTGAAAACTGAAAAC
CAACAACAAATATACACAACAAGGTTCTACGGTTTTCAGATCATCAGTGAAGCTCTGAAG
TCTGTGGTTAGACTGCAAACTGATATCAAGAACAGAACCGCAACAACGGCCGCCCTAAGA
AGTCCTCCGTATGAACATCTCACGGACATAATCTTCTTAAACAAGACTCTTGTTCTGTTC
CCTGATCTCGTTAGCTTCCCCTTCTTTATAGCTTCCCCGTCCGTATCCTCAACCTCTCTC
TTGATAGTTTGCAGACGCAACCTTCTTGAGGCGTTCCCATGGATTACGTAGTCAGTGGTA
AAACCCGAGGGTTTTTCCCGCCGAGGCTGTAACTTGATGCCTGTTCTTGAAAAATCATCG
CTCATATCACCTGATGAGCGCTGTTGCTGATACGCTGGTGCAATCTGATCTGGCACAGCA
CCGTCGAACTCACACGGAAAAACAAAGTCTTGATCGTCTTGGAAATCAAGAACCC

QA 2 596 2 596
DS 



CO CL2114Contig2 1271 2 4 U
ACAGGAAAAGACCGGAAGATTAAATCCGGCAAGAACAAGGTCATCGGCGTGAAGAGAACT
CTTGTTTTCCACTCTGGTCGTGCTCCCAAGGGAACGCGAACGAACTGGGTTATGCACGAG
TATCGCGCCACCGAGCAGGACCTCTGTGCCACCAACCCTGGCCAGAGTCCGTTTGTTATA
TGCAAATTGTTCAAGAAACAAGACCCGAGTCTAGTGGAAGAAGAAGAAGCTGTCTCCTCT
CCAACATCTTCCCTAGTAGATAAGACTAAATCTGAAGTATCAATGGTCGCTGTGAAGCCT
GAGTCTTCTCTTGTAATCTCCGGTGATTCTCGTAATGGTGGTGCTTGCAACGAGGCTACT
ACCTCCAAGCTTGGAGATCTTGATTGGCTGTCTTTTCCAGAGCTGGAGTCCATGACAGTG
TTCTCTCCATTACACTCTCAAGTCCAATTCGAGTTTGGATCCTCTTTCAACGCGTTTCTT
CAGCCTAGCTCTAGTGGCATCTCCGGGAACCATAACAACAACAACTTCCAGATTCAGACT
CAGTACGGTACAAACGACGAAGAAGATACAGATGTATCCCGCTTCCTCAATTCGGTTCTT
GATTTCCAAGACGATCAAGACTTTGTTTTTCCGTGTGAGTTCGACGGTGCAGTGCCAGAT
CAGATTGCACCAGCGTATCAGCAACAGCGCTCGGCAGGTGACGTGAGCGATGATGTTTCA
AGAACGGGTATCAAGTTACAGCCTCGGCGGGAACAACCCTCGGGTGTTACCACTGACTAT
GTAATCCATGGGAACGCCTCAAGAAGGTTGCGTCTGCAAACTATCAAGAGAGAGGTGAGA
ACAACAATCGTTTTTCACATGGATTGTTACCCTCTGTGAGATTAGTATGGTAACAAATGA
ATGGTAACTACTACACAGGTTGAGGATGCGGACCGGGAAGCTGTAAAGAAGGGGAAGCTA
ATGAGACCAGATAACAGAACAGGATTCCTGTTGAAGAAGATTATGCTCGTGAGATGTTCA
TACGGAGGACTTCTTAGGGCGGCCGTCGTTGCGGTTCTGTTCTTGATATCAGTGTGCAGT
CTAACCACAGACCTCAGAGCTTCACTGATGATCTGAAAACCGTAGAACCTTGTTGTGTAT
ATTTGTTGTTGGTTTTCAGTTTTCACCTTATCCGGGGCCAGTTTATGAGGGTAACTTGTT
GCGTACTGTATAATGTGGCTACTTCTTGACTTTGTATCGGTAGTGTTCTTATATAGATAA
GGTTTTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD27TF U 1
AF RR2CD27JQ C 489
BS 1 646 RR2CD27TF
BS 647 647 RR2CD27JQ
BS 648 692 RR2CD27TF
BS 693 1271 RR2CD27JQ

RD RR2CD27TF 711 0 0
ACAGGAAAAGACCGGAAGATTAAATCCGGCAAGAACAAGGTCATCGGCGTGAAGAGAACT
CTTGTTTTCCACTCTGGTCGTGCTCCCAAGGGAACGCGAACGAACTGGGTTATGCACGAG
TATCGCGCCACCGAGCAGGACCTCTGTGCCACCAACCCTGGCCAGAGTCCGTTTGTTATA
TGCAAATTGTTCAAGAAACAAGACCCGAGTCTAGTGGAAGAAGAAGAAGCTGTCTCCTCT
CCAACATCTTCCCTAGTAGATAAGACTAAATCTGAAGTATCAATGGTCGCTGTGAAGCCT
GAGTCTTCTCTTGTAATCTCCGGTGATTCTCGTAATGGTGGTGCTTGCAACGAGGCTACT
ACCTCCAAGCTTGGAGATCTTGATTGGCTGTCTTTTCCAGAGCTGGAGTCCATGACAGTG
TTCTCTCCATTACACTCTCAAGTCCAATTCGAGTTTGGATCCTCTTTCAACGCGTTTCTT
CAGCCTAGCTCTAGTGGCATCTCCGGGAACCATAACAACAACAACTTCCAGATTCAGACT
CAGTACGGTACAAACGACGAAGAAGATACAGATGTATCCCGCTTCCTCAATTCGGTTCTT
GATTTCCAAGACGATCAAGACTTTGTTTTTCCGTGTGAGTTCGACG*TGCAGTGCCAGAT
CAGATTGCACCAGCGTATCAGCAACAGCGCTC
GGCAGTGACGTGAGCGATG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2CD27JQ 783 0 0
CTCTAGTGGCATCTCCGGGAACCATAACAACAACAACTTCCAGATTCAGACTCAGTACGG
TACAAACGACGAAGAAGATACAGATGTATCCCGCTTCCTCAATTCGGTTCTTGATTTCCA
AGACGATCAAGACTTTGTTTTTCCGTGTGAGTTCGACGGTGCAGTGCCAGATCAGATTGC
ACCAGCGTATCAGCAACAGCGCTCGGCAGGTGACGTGAGCGATGATGTTTCAAGAACGGG
TATCAAGTTACAGCCTCGGCGGGAACAACCCTCGGGTGTTACCACTGACTATGTAATCCA
TGGGAACGCCTCAAGAAGGTTGCGTCTGCAAACTATCAAGAGAGAGGTGAGAACAACAAT
CGTTTTTCACATGGATTGTTACCCTCTGTGAGATTAGTATGGTAACAAATGAATGGTAAC
TACTACACAGGTTGAGGATGCGGACCGGGAAGCTGTAAAGAAGGGGAAGCTAATGAGACC
AGATAACAGAACAGGATTCCTGTTGAAGAAGATTATGCTCGTGAGATGTTCATACGGAGG
ACTTCTTAGGGCGGCCGTCGTTGCGGTTCTGTTCTTGATATCAGTGTGCAGTCTAACCAC
AGACCTCAGAGCTTCACTGATGATCTGAAAACCGTAGAACCTTGTTGTGTATATTTGTTG
TTGGTTTTCAGTTTTCACCTTATCCGGGGCCAGTTTATGAGGGTAACTTGTTGCGTACTG
TATAATGTGGCTACTTCTTGACTTTGTATCGGTAGTGTTCTTATATAGATAAGGTTTTTG
TTT

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 3

CO CL2115Contig1 1465 3 7 U
GATCTCCGAAGAGTGGAATAATGCAATCGGAGATGGCAAAAGACACGATGGCTGCTTCCG
AGAAACCGCCGGTTGAGCTACTCCGAGAAAGCAAATCCTCCATCGAAGAAATCATCGCGA
GGATGCTCTCCATCAAGAAACAGGGAGACCCCAAATCCGAGAATCGCGAACTCCTCACTC
AGATGTTTCTCAACTTCATCAACCTCCGTCAGGCGAATCGTGCGATTCTGATTGAAGAAG
AGAGAGTGAAAACAGAGACAGAGCTAGCAAAGTCTCCAATCGATTTCACTGCATTGCAGC
TTCACAATCTCATGTACGAGAAGAGCCATTACCTCAAAGCCACCACATCGTCCCGAGAAT
TCAAATCCAAGTACCCCAACATCGATCTCATATCCGAACAAGACTTCTTCAGAGACGCTC
CCCAACCAATCAAATCTCAGACCCTCTCTAACGATACCTCCCACGATCTGATGCTTAAAA
GACTCAACTTTGAGCTCCATCAGAGGAAAGAAGCGTGCAAGCTTCGAGCTGAGCTGGAAC
AACGCAAGAAGTCTTTGCTGGAAGCTAACGCAGAGCGTAACAAGTTTCTCTCCACTCTTC
CGTTGCTTCTCAAGTCTCTCAAGAAAGCGTCTTTGCCAGTACAGAGCCAGCTGTGTTTGC
CCAGTCCCAAGAAGCTTAGGTATCATGATCTAGCTGAGCTTCTTCCTCCGCCGCTTTACG
TCGTTTATTCAAAGTTCATGGCTCAGAAGGAAGCTTTTGAAGAGAGGATAGATGTCGAGG
TGTCTGGGAGTCTTAAGGATGCTCAGAGTTATGGTAAGCAGCAAGCAGAGAGCTCTGATG
ATGATGGGAAAAGGCAAAGGAAGCGACCCAAGACAGAGAGTTCTGATGAAGCAGTCCATC
CTCTTAAACTTGTCCTTCACATTTATGATGATGAGACTCCAGATCCGAAGTCACGTAAGC
TTGTTGTGCTCAAGTTTGAGTACTTGTTGAAGTTGAATGTTGTATGTGTTGGCATTGAAG
AGTCTCAGGATGGACTAGATAAAAATATCCTGTGCAACTTGTTTCCAGACGATGCTGGAC
TTGAGCCTCCTCATCAGTCAACCAAGCTCATTCTTGGTGATGATCATGGATTTGATGAGA
GCAGAACATCGAGGCCATATAAGTGGGCACAACATTTGGCTGGGATCGAAGTTTTACCTG
AAATGTCACCGTTTGTAACTGGCAAGGATACTCAAAACAGTGATACAGCTTCTGTATCTG
ATCAGCACAATGTGCAGACTGTTCTGAGAAGGATACGGTCTCAGAAAAAAGCGGGTATGC
TAACTCTTATGTGAGTCACATGATTCTGTATGTTTTTTGATTCTCTGTATTTGAAGACTT
TCATGGTATTTGTAGCTCTTCACACATTGTTAGACTGTAATGCCACAACAGGAACAATCA
AACAGAATGAATGTAGCATATTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW31TF U 1
AF RR2CH79TF U 590
AF RR2CH79JQ C 634
BS 1 679 RR2FW31TF
BS 680 680 RR2CH79TF
BS 681 705 RR2FW31TF
BS 706 706 RR2CH79TF
BS 707 744 RR2FW31TF
BS 745 1291 RR2CH79TF
BS 1292 1465 RR2CH79JQ

RD RR2FW31TF 744 0 0
GATCTCCGAAGAGTGGAATAATGCAATCGGAGATGGCAAAAGACACGATGGCTGCTTCCG
AGAAACCGCCGGTTGAGCTACTCCGAGAAAGCAAATCCTCCATCGAAGAAATCATCGCGA
GGATGCTCTCCATCAAGAAACAGGGAGACCCCAAATCCGAGAATCGCGAACTCCTCACTC
AGATGTTTCTCAACTTCATCAACCTCCGTCAGGCGAATCGTGCGATTCTGATTGAAGAAG
AGAGAGTGAAAACAGAGACAGAGCTAGCAAAGTCTCCAATCGATTTCACTGCATTGCAGC
TTCACAATCTCATGTACGAGAAGAGCCATTACCTCAAAGCCACCACATCGTCCCGAGAAT
TCAAATCCAAGTACCCCAACATCGATCTCATATCCGAACAAGACTTCTTCAGAGACGCTC
CCCAACCAATCAAATCTCAGACCCTCTCTAACGATACCTCCCACGATCTGATGCTTAAAA
GACTCAACTTTGAGCTCCATCAGAGGAAAGAAGCGTGCAAGCTTCGAGCTGAGCTGGAAC
AACGCAAGAAGTCTTTGCTGGAAGCTAACGCAGAGCGTAACAAGTTTCTCTCCACTCTTC
CGTTGCTTCTCAAGTCTCTCAAGAAAGCGTCTTTGCCAGTACAGAGCCAGCTGTGTTTGC
CCAGTCCCAAGAAGCTTAG*TATCATGATCTAGCTGAGCTTCTTC*TCCGCCGCTTTACG
TCGTTTATTCAAAGTTCATGGCTC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2CH79TF 703 0 0
G
TCCACTCTTCCGTTGCTTCTCAAGTCTCTCAAGAAAGCGTCTTTGCCAGTACAGAGCCAG
CTGTGTTTGCCCAGTCCCAAGAAGCTTAGGTATCATGATCTAGCTGAGCTTCTTCCTCCG
CCGCTTTACGTCGTTTATTCAAAGTTCATGGCTCAGAAGGAAGCTTTTGAAGAGAGGATA
GATGTCGAGGTGTCTGGGAGTCTTAAGGATGCTCAGAGTTATGGTAAGCAGCAAGCAGAG
AGCTCTGATGATGATGGGAAAAGGCAAAGGAAGCGACCCAAGACAGAGAGTTCTGATGAA
GCAGTCCATCCTCTTAAACTTGTCCTTCACATTTATGATGATGAGACTCCAGATCCGAAG
TCACGTAAGCTTGTTGTGCTCAAGTTTGAGTACTTGTTGAAGTTGAATGTTGTATGTGTT
GGCATTGAAGAGTCTCAGGATGGACTAGATAAAAATATCCTGTGCAACTTGTTTCCAGAC
GATGCTGGACTTGAGCCTCCTCATCAGTCAACCAAGCTCATTCTTGGTGATGATCATGGA
TTTGATGAGAGCAGAACATCGAGGCCATATAAGTGGGCACAACATTTGGCTGGGATCGAA
GTTTTACCTGAAATGTCACCGTTTGTAACTGGCAAGGATACTCAAAACAGTGATACAGCT
TCTGTATCTGATCAGCACAATGTGCAGACTGTTCTGAGAAG
A

QA 2 702 2 702
DS 

RD RR2CH79JQ 832 0 0
TGCCAGTACAGAGCCAGCTGTGTT*GCCCAGTCCCAAGAAGCTTAGGTATCATGATCTAG
CTGAGCTTCTTCCTCCGCCGCTTTACGTCGTTTATTCAAAGTTCATGGCTCAGAAGGAAG
CTTTTGAAGAGAGGATAGATGTCGAGGTGTCTGGGAGTCTTAAGGATGCTCAGAGTTATG
GTAAGCAGCAAGCAGAGAGCTCTGATGATGATGGGAAAAGGCAAAGGAAGCGACCCAAGA
CAGAGAGTTCTGATGAAGCAGTCCATCCTCTTAAACTTGTCCTTCACATTTATGATGATG
AGACTCCAGATCCGAAGTCACGTAAGCTTGTTGTGCTCAAGTTTGAGTACTTGTTGAAGT
TGAATGTTGTATGTGTTGGCATTGAAGAGTCTCAGGATGGACTAGATAAAAATATCCTGT
GCAACTTGTTTCCAGACGATGCTGGACTTGAGCCTCCTCATCAGTCAACCAAGCTCATTC
TTGGTGATGATCATGGATTTGATGAGAGCAGAACATCGAGGCCATATAAGTGGGCACAAC
ATTTGGCTGGGATCGAAGTTTTACCTGAAATGTCACCGTTTGTAACTGGCAAGGATACTC
AAAACAGTGATACAGCTTCTGTATCTGATCAGCACAATGTGCAGACTGTTCTGAGAAGGA
TACGGTCTCAGAAAAAAGCGGGTATGCTAACTCTTATGTGAGTCACATGATTCTGTATGT
TTTTTGATTCTCTGTATTTGAAGACTTTCATGGTATTTGTAGCTCTTCACACATTGTTAG
ACTGTAATGCCACAACAGGAACAATCAAACAGAATGAATGTAGCATATTAGC

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 3

CO CL2116Contig1 984 3 9 U
ATGTCTACCAAATAGTAAAAGAAACACTTTCTCAAGTTGTTTGGTCTTATTTGTTTTTTT
CAGGAACTAAATCCACAACAAACTCGTTCTGCTGACTTAACCGAAGCTAAAGCAAAATGA
ACTATCTCAAACCAAAAATATTTATAAGCAGTTAAGAAAGACAATGGTGAGAGACCAACC
AAGATGATCAGTTTACTTGCACTGGTTATTGGTATTGGATGTAGAACTGTTGGTTAAAGC
TTTGGTAACCACATGAGAAACGATTCCAACCGGACAGAAGAAAAGGCAAAGTGAAACCGA
GTGCCTCGTCTCGATCTTATTCTCCAAGCCATCATTAAAAACTTGTTTAGCAGCAAAAAG
ATCAATAACAAGAAGATGGATCCAAGCAGAAGCAAGCGTCATTTCACTTGAGAACATTTT
CGCTATTCCGGACAACTCTGGCAACAAGTATTTACTGGAAAACATGTATTTGAGCGTATC
AGGTGTCCAAGAAAGGTATAACAAATACGCGTATAGTAGGCCTAAGACGACATACGGTAT
GCTACTCTCCATACACTTCTTGGTAATTTCAGCTTTAGGAGCTACAACCATCAGAGTGTA
AAAGGGAAGAACCGCGGTTGTTCCGACAACAAATACACTGCTTGCGATCTGAGAAGTAGC
TAACCATGAAGCTCGTACGCAGGAAGGTTTCTTGTGAACAAAGGAGGATGGATTCGATGA
AACACTAGGGAGAAAAGCGAGTCGTGATCCTCCGATGAAGCTCCAACGATTCTGGAATTG
AATCTTTAAAGAATCAACGCACACTCTAGACTTGTTGAGACAAAGACTTGCTGTCACCGA
GCTATTAGCTACAAAGCTCCGGTTCATCATCGTGAGAGACGAAGATGACAAAGGCTGAGA
AAAAGCCATCTCCGATCGAAACTTTACGAACTCTTTGAGGGAAATTGGCTCTTCATTTAG
CTTCTACACCGAACTCAAATGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G834JQ U 1
AF RR2GE16JQ U 61
AF RR2GE16TF C 213
BS 1 285 RR2G834JQ
BS 286 286 RR2GE16JQ
BS 287 559 RR2G834JQ
BS 560 560 RR2GE16JQ
BS 561 684 RR2G834JQ
BS 685 685 RR2GE16JQ
BS 686 707 RR2G834JQ
BS 708 724 RR2GE16JQ
BS 725 984 RR2GE16TF

RD RR2G834JQ 707 0 0
ATGTCTACCAAATAGTAAAAGAAACACTTTCTCAAGTTGTTTGGTCTTATTTGTTTTTTT
CAGGAACTAAATCCACAACAAACTCGTTCTGCTGACTTAACCGAAGCTAAAGCAAAATGA
ACTATCTCAAACCAAAAATATTTATAAGCAGTTAAGAAAGACAATGGTGAGAGACCAACC
AAGATGATCAGTTTACTTGCACTGGTTATTGGTATTGGATGTAGAACTGTTGGTTAAAGC
TTTGGTAACCACATGAGAAACGATTCCAACCGGACAGAAGAAAAGACAAAGTGAAACCGA
GTGCCTCGTCTCGATCTTATTCTCCAAGCCATCATTAAAAACTTGTTTAGCAGCAAAAAG
ATCAATAACAAGAAGATGGATCCAAGCAGAAGCAAGCGTCATTTCACTTGAGAACATTTT
CGCTATTCCGGACAACTCTGGCAACAAGTATTTACTGGAAAACATGTATTTGAGCGTATC
AGGTGTCCAAGAAAGGTATAACAAATACGCGTATAGTAGGCCTAAGACGACATACGGTAT
GCTACTCTCCATACACTTCCTGGTAATTTCAGCTTTAGGAGCTACAACCATCAGAGTGTA
AAAGGGAAGAACCGCGGTTGTTCCGACAACAAATACACTGCTTGCGATCTGAGAAGTAGC
TAACCATGAAGCTCGTACGCAGGAGGGTTTCTTGTGAACAAAGGAGG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2GE16JQ 664 0 0
CAGGAACTAAATCCACAACAAACTCGTTCTGCTGACTTAACCGAAGCTAAAGCAAAATGA
ACTATCTCAAACCAAAAATATTTATAAGCAGTTAAGAAAGACAATGGTGAGAGACCAACC
AAGATGATCAGTTTACTTGCACTGGTTATTGGTATTGGATGTAGAACTGTTGGTTAAAGC
TTTGGTAACCACATGAGAAACGATTCCAACCGGACAGAAGAAAAGGCAAAGTGAAACCGA
GTGCCTCGTCTCGATCTTATTCTCCAAGCCATCATTAAAAACTTGTTTAGCAGCAAAAAG
ATCAATAACAAGAAGATGGATCCAAGCAGAAGCAAGCGTCATTTCACTTGAGAACATTTT
CGCTATTCCGGACAACTCTGGCAACAAGTATTTACTGGAAAACATGTATTTGAGCGTATC
AGGTGTCCAAGAAAGGTATAACAAATACGCGTATAGTAGGCCTAAGACGACATACGGTAT
GCTACTCTCCATACACTTCTTGGTAATTTCAGCTTTAGGAGCTACAACCATCAGAGTGTA
AAAGGGAAGAACCGCGGTTGTTCCGACAACAAATACACTGCTTGCGATCTGAGAAGTAGC
TAACCATGAAGCTCGTACGCAGGAAGGTTTCTTGTGAACAAAGGAGGATGGATTCGATGA
AACA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2GE16TF 772 0 0
GTA
TGGATGTAGAACTGTGG**TAAAGCTTTGGTAACCACATGAGAAACGAT*CCAAC*GGAC
AGAAGAGAAGGCAAAGTGAAACCGAGTGCCTCGTCTCGATCTTATTCTCCAAGCCATCAT
TAAAAACTTGTTTAGCAGCAAAAAGATCAATAACAAGAAGATGGATCCAAGCAGAAGCAA
GCGTCATTTCACTTGAGAACATTTTCGCTATTCCGGACAACTCTGGCAACAAGTATTTAC
TGGAAAACATGTATTTGAGCGTATCAGGTGTCCAAGAAAGGTATAACAAATACGCGTATA
GTAGGCCTAAGACGACATACGGTATGCTACTCTCCATACACTTCTTGGTAATTTCAGCTT
TAGGAGCTACAACCATCAGAGTGTAAAAGGGAAGAACCGCGGTTGTTCCGACAACAAATA
CACTGCTTGCGATCTGAGAAGTAGCTAACCATGAAGCTCGTACGCAGGAAGGTTTCTTGT
GAACAAAGGAGGATGGATTCGATGAAACACTAGGGAGAAAAGCGAGTCGTGATCCTCCGA
TGAAGCTCCAACGATTCTGGAATTGAATCTTTAAAGAATCAACGCACACTCTAGACTTGT
TGAGACAAAGACTTGCTGTCACCGAGCTATTAGCTACAAAGCTCCGGTTCATCATCGTGA
GAGACGAAGATGACAAAGGCTGAGAAAAAGCCATCTCCGATCGAAACTTTACGAACTCTT
TGAGGGAAATTGGCTCTTCATTTAGCTTCTACACCGAACTCAAATGCCC

QA 4 772 4 772
DS 



AS 1 4

CO CL2117Contig1 651 4 7 U
GGAGACACAGTGACAGTTCCATCCCCTTCACTTTCCTGTCCGATCCAAACTTGGTGTCAC
AAGATTCAAGCAGCCATGGCAAGTCTTATGATGGCCACACCGTTTCCAGGATCTCTCACT
CAATGCAAGAAAACGAATAACTTGTCTGTTCAGAGAGCCTTTAAGGTTACATGTATGCAG
ACACCTTTGGAGGAGCTATACAACGTCAAAGTGGAAAGGAAAGTGTCAGAGAGACGGTTA
GAGGAGCTAGGGGTTTCGAGATGGTCAGTTTGGAAGACTGGGAAATGCAAACTGCCGTGG
GACTGGCAGGTTGATCAGTTGGTTTACATTGAAGAAGGAGAGGTTCGTGTCGTCCCCGAA
GGCAGCAAGAGGTTTATGCAGTTTTTGGCTGGAGATCTTGTTAGGTACCCGAAATGGTTT
GAGGCTGATCTTTTCTTCAACGCTCCTTACCGCGAACGGTATTGTTTCAAGGCCTATGGT
GATGATTGATTCCAATGTAGAGTTTTTGAGTTTAGAGCCCCCATGAAAGTTTGCACTTGT
GTTTGTGTTGTTGTTGTTGTTGTAGTCTTATGGATCTTTTTTGGGATGATAAAATAACAA
AACAATTTGTCTTATTCTTCTTCAGAAATTTGTGTAACGCTTACATAAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AG53JQ C 1
AF RR2FH04JQ C 5
AF RR2FH04TF U 5
AF RR2AG53TF U 1
BS 1 6 RR2AG53JQ
BS 7 60 RR2FH04TF
BS 61 61 RR2AG53TF
BS 62 453 RR2FH04TF
BS 454 454 RR2AG53TF
BS 455 611 RR2FH04TF
BS 612 651 RR2AG53TF

RD RR2AG53JQ 651 0 0
GGAGACACAGTGACAGTTCCATCCCCTTCACTTTCCTGTCGGATCCAAACTTGGTGTCAC
AAGATTCAAGCAGCCATGGCAAGTCTTATGATGGCCACACCGTTTCCAGGATCTCTCACT
CAATGCAAGAAAACGAATAACTTGTCTGTTCAGAGAGCCTTTAAGGTTACATGTATGCAG
ACCCCTTTGGAGGAGCTATACAACGTCAAAGTGGAAAGGAAAGTGTCAGAGAGACGGTTA
GAGGAGCTAGGGGTTTCGAGATGGTCAGTTTGGAAGACTGGGAAATGCAAACTGCCGTGG
GACTGGCAGGTTGATCAGTTGGTTTACATTGAAGAAGGAGAGGTTCGTGTCGTCCCCGAA
GGCAGCAAGAGGTTTATGCAGTTTTTGGCTGGAGATCTTGTTAGGTACCCGAAATGGTTT
GAGGCTGATCTTTTCTTCAACGCTCCTTACCGCGAACGGTATTGTTTCAAGGCCTATGGT
GATGATTGATTCCAATGTAGAGTTTTTGAGTTTAGAGCCCCCATGAAAGTTTGCACTTGT
GTTTGTGTTGTTGTTGTTGTTGTAGTCTTATGGATCTTTTTTGGGATGATAAAATAACAA
AACAATTTGTCTTATTCTTCTTCAGAAATTTGTGTAACGCTTACATAAAGT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2FH04JQ 609 0 0
GG
ACAGTGACAGTTCCATCCCCTTCACTTTCCTGTCCGATCCAAACTTGGTGTCACGAGATT
CAAGCAGCCATGGCAAGTCTTATGATGGCCACACCGTTTCCAGGATCTCTCACTCAATGC
AAGAAAACGAATAACTTGTCTGTTCAGAGAGCCTTTAAGGTTACATGTATGCAGACACCT
TTGGAGGAGCTATACAACGTCAAAGTGGAAAGGAAAGTGTCAGAGAGACGGTTAGAGGAG
CTAGGGGTTTCGAGATGGTCAGTTTGGAAGACTGGGAAATGCAAACTGCCGTGGGACTGG
CAGGTTGATCAGTTGGTTTACATTGAAGAAGGAGAGGTTCGTGTCGTCCCCGAAGGCAGC
AAGAGGTTTATGCAGTTTTTGGCTGGAGATCTTGTTAGGTACCCGAAATGGTTTGAGGCT
GATCTTTTTTTCAACGCTCCTTACCGCTAACGGTATTGTTTCAAGGCCTATGGTGATGAT
TGATTCCAATGTAGAGTTTTTGAGTTTAGAGCCCCCATGAAAGTTTGCACTTGTGTTTGT
GTTGTTGTTGTTGTTGTAGTCTTATGGATCTTTTTTGGGATGATAAAATAACAAAACAAT
TTGTC
TT

QA 3 607 3 607
DS 

RD RR2FH04TF 607 0 0
GG
ACAGTGACAGTTCCATCCCCTTCACTTTCCTGTCCGATCCAAACTTGGTGTCACGAGATT
CAAGCAGCCATGGCAAGTCTTATGATGGCCACACCGTTTCCAGGATCTCTCACTCAATGC
AAGAAAACGAATAACTTGTCTGTTCAGAGAGCCTTTAAGGTTACATGTATGCAGACACCT
TTGGAGGAGCTATACAACGTCAAAGTGGAAAGGAAAGTGTCAGAGAGACGGTTAGAGGAG
CTAGGGGTTTCGAGATGGTCAGTTTGGAAGACTGGGAAATGCAAACTGCCGTGGGACTGG
CAGGTTGATCAGTTGGTTTACATTGAAGAAGGAGAGGTTCGTGTCGTCCCCGAAGGCAGC
AAGAGGTTTATGCAGTTTTTGGCTGGAGATCTTGTTAGGTACCCGAAATGGTTTGAGGCT
GATCTTTTCTTCAACGCTCCTTACCGCTAACGGTATTGTTTCAAGGCCTATGGTGATGAT
TGATTCCAATGTAGAGTTTTTGAGTTTAGAGCCCCCATGAAAGTTTGCACTTGTGTTTGT
GTTGTTGTTGTTGTTGTAGTCTTATGGATCTTTTTTGGGATGATAAAATAACAAAACAAT
TTGTC

QA 3 607 3 607
DS 

RD RR2AG53TF 651 0 0
GGAGAC
ACAGTGACAGTTCCATCCCCTTCACTTTCCTGTCGGATCCAAACTTGGTGTCACAAGATT
CAAGCAGCCATGGCAAGTCTTATGATGGCCACACCGTTTCCAGGATCTCTCACTCAATGC
AAGAAAACGAATAACTTGTCTGTTCAGAGAGCCTTTAAGGTTACATGTATGCAGACACCT
TTGGAGGAGCTATACAACGTCAAAGTGGAAAGGAAAGTGTCAGAGAGACGGTTAGAGGAG
CTAGGGGTTTCGAGATGGTCAGTTTGGAAGACTGGGAAATGCAAACTGCCGTGGGACTGG
CAGGTTGATCAGTTGGTTTACATTGAAGAAGGAGAGGTTCGTGTCGTCCCCGAAGGCAGC
AAGAGGTTTATGCAGTTTTTGGCTGGAGATCTTGTTAGGTACCCGAAATGGTTTGAGGCT
GATCTTTTCTTCAACGCTCCTTACCGCGAACGGTATTGTTTCAAGGCCTATGGTGATGAT
TGATTCCAATGTAGAGTTTTTGAGTTTAGAGCCCCCATGAAAGTTTGCACTTGTGTTTGT
GTTGTTGTTGTTGTTGTAGTCTTATGGATCTTTTTTGGGATGATAAAATAACAAAACAAT
TTGTCTTATTCTTCTTCAGAAATTTGTGTAACGCTTACATAAAGT

QA 7 651 7 651
DS 



AS 2 4

CO CL2118Contig1 916 2 4 U
GGAAGCAAAACCCATCTCTCACTTCCCAGATTCCCATCACTACTTTTACCAGAAACACAA
AACCTTATAATAAAGATTCAATCTTTCTTCTGAATCGGTGATCACAGCCTCTCATACTTG
TCACCAGATCACATCTCTCTGAGAAGAACAAAGATCTGATCAACATTCCCCTGCGGGCTT
CCGAGAATTGCATATTGTTTGAAACATCCAAAAGAGAATAGAAAGATGGGTCTATCAAGC
CTTCCTGGTCCATCAGAAGGAATGCTATGCGTGTTATTAGTTAACACAGCCTTATCAATC
TCCATCTTCAAAAGCATCGTCAGATCAGTGCTTCAGCTAGTAGGAATCCGTCTCTCTCCT
ACTTCAGTAGCGCCGGCCGCATCTTCAGAGAATCAGATACCAGAGCCTTTTGATTTCCGG
GTCTGCCAGCCTGAGAGTTTCCTTGAGGAATTCAGGAACAGGACCCCCACAGTGAAGTTT
GAGAGCTTGTGCAAGTGCAAGAAACAGGCGGACAACGAGTGTTCTGTATGCCTGTCGAGA
TTCGAAGAGGATTCAGAGATCAACAAGCTAAAATGTGGCCATTTGTTTCACAAAACATGC
TTGGAGAAATGGATAGACTACTGGAACATCACTTGCCCACTCTGTAGGACTCCTCTTGTT
GTTGTCGCACCAGACGACCAGCTGGTTTCCTCTAATGTTTGGTGATTGTCTTCGTATAGA
GTTCTTTTTTTTTGGTTTGGGTTTGGGGTGTGTTTGTTGTTGTTGTGTACAGCTACTACT
GCTTTTACTATTAAATTAGGCTGCGTCACGGCTGATTCTTCTTCAGATTCAGACCGGAGA
TGGGGTATTCTGTTGTACATATTCTGTGAGCTGTTTTATGTATACCCATGTGTAATGGAA
GCTCTTGTTTGAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE05TF U 1
AF RR2EE05JQ C 175
BS 1 647 RR2EE05TF
BS 648 648 RR2EE05JQ
BS 649 725 RR2EE05TF
BS 726 916 RR2EE05JQ

RD RR2EE05TF 729 0 0
GGAAGCAAAACCCATCTCTCACTTCCCAGATTCCCATCACTACTTTTACCAGAAACACAA
AACCTTATAATAAAGATTCAATCTTTCTTCTGAATCGGTGATCACAGCCTCTCATACTTG
TCACCAGATCACATCTCTCTGAGAAGAACAAAGATCTGATCAACATTCCCCTGCGGGCTT
CCGAGAATTGCATATTGTTTGAAACATCCAAAAGAGAATAGAAAGATGGGTCTATCAAGC
CTTCCTGGTCCATCAGAAGGAATGCTATGCGTGTTATTAGTTAACACAGCCTTATCAATC
TCCATCTTCAAAAGCATCGTCAGATCAGTGCTTCAGCTAGTAGGAATCCGTCTCTCTCCT
ACTTCAGTAGCGCCGGCCGCATCTTCAGAGAATCAGATACCAGAGCCTTTTGATTTCCGG
GTCTGCCAGCCTGAGAGTTTCCTTGAGGAATTCAGGAACAGGACCCCCACAGTGAAGTTT
GAGAGCTTGTGCAAGTGCAAGAAACAGGCGGACAACGAGTGTTCTGTATGCCTGTCGAGA
TTCGAAGAGGATTCAGAGATCAACAAGCTAAAATGTGGCCATTTGTTTCACAAAACATGC
TTGGAGAAATGGATAGACTACTGGAACATCACTTGCCCACTCTGTAG*ACTCCTCTTGTT
GTTGTCGCACCAGACGACCAGCTGGTTTCCTCTAATGTTTGGTGATTGTCTTCGTATAGA
GTTCT
TTTT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2EE05JQ 742 0 0
GGGCTTCCGAGAA
TTGCATATTGTTTGAAACATCCAAAAGAGAATAGAAAGATGGGTCTATCAAGCCTTCCTG
GTCCATCAGAAGGAATGCTATGCGTGTTATTAGTTAACACAGCCTTATCAATCTCCATCT
TCAAAAGCATCGTCAGATCAGTGCTTCAGCTAGTAGGAATCCGTCTCTCTCCTACTTCAG
TAGCGCCGGCCGCATCTTCAGAGAATCAGATACCAGAGCCTTTTGATTTCCGGGTCTGCC
AGCCTGAGAGTTTCCTTGAGGAATTCAGGAACAGGACCCCCACAGTGAAGTTTGAGAGCT
TGTGCAAGTGCAAGAAACAGGCGGACAACGAGTGTTCTGTATGCCTGTCGAGATTCGAAG
AGGATTCAGAGATCAACAAGCTAAAATGTGGCCATTTGTTTCACAAAACATGCTTGGAGA
AATGGATAGACTACTGGAACATCACTTGCCCACTCTGTAGGACTCCTCTTGTTGTTGTCG
CACCAGACGACCAGCTGGTTTCCTCTAATGTTTGGTGATTGTCTTCGTATAGAGTTCTTT
TTTTTTGGTTTGGGTTTGGGGTGTGTTTGTTGTTGTTGTGTACAGCTACTACTGCTTTTA
CTATTAAATTAGGCTGCGTCACGGCTGATTCTTCTTCAGATTCAGACCGGAGATGGGGTA
TTCTGTTGTACATATTCTGTGAGCTGTTTTATGTATACCCATGTGTAATGGAAGCTCTTG
TTTGAACTT

QA 14 742 14 742
DS 



CO CL2118Contig2 915 2 4 U
GGAAGCAAAACCCATCTCTCACTTCCCAGATTCCCATCACTACTTTTACCAGAAACACAA
AACCTTATAATAAAGATTCAATCTTTCTTCTGAATCGGTGATCACAGCCTCTCATACTTG
TCACCAGACCACATCTCTCTGAGAAGAACAAAGATCTGATCAACATCCCCGTGCGGGCTT
GCATATTGTTTGAAACATCCAAAGAGAATTGAAAGATGGGTCTATCAAGCCTTCCTGGTC
CATCAGAAGGAATGCTATGCGTGTTATTAGTTAACACAGCCTTATCAATCTCCATCTTCA
AAGGCATCCTCAGATCAGTGCTTCAGCTAGTAGGAATCCGTCTCTCTCCTTCTTCAGTAG
CGCCGGCCGCCTCTTCAGAGAATCAGACATCAGAGACTTTTGATTTCCGGGTCTGCCAGC
CTGAGAGTTTCCTTGAAGAATTCAGGAACAGGACCCCCACAATGAAGTTTGAGAGCTTGT
GCAAGTGCAAGAAACAGGCCGACAACGAGTGTTCTGTATGCCTGTCGAAATTCGAAGAGG
ATTCAGAGATCAACAAGCTAAAATGTGGCCACTTGTTTCACAAAACATGCTTGGAGAAAT
GGATAGACTACTGGAACATCACTTGCCCACTCTGTAGGACTCCTCTTGTTGTTGTCGCAG
CAGACGACCAGCTGGTTTCCTCTAATGTTTGGTGATCGTCTTCGTATAGAGTTCTCTTTT
TTTTGGTTTGGGTTTGGGGTGTGTTTGTTGTTGTTGTGTACAGCTACTACTGCTTTTACT
ATTAAAATTAAATTAGGCTGCGTCACGGTTGATTCTTCATCAGATTCAGACCGGAGATGG
GGTATTCTGTTGTACATATTCTGTGAGCTGTTTTATGTATACCCATGTGTAATGGAAGCT
CTTGTTTGAACTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN11TF U 1
AF RR2EN11JQ C 265
BS 1 723 RR2EN11TF
BS 724 724 RR2EN11JQ
BS 725 771 RR2EN11TF
BS 772 915 RR2EN11JQ

RD RR2EN11TF 771 0 0
GGAAGCAAAACCCATCTCTCACTTCCCAGATTCCCATCACTACTTTTACCAGAAACACAA
AACCTTATAATAAAGATTCAATCTTTCTTCTGAATCGGTGATCACAGCCTCTCATACTTG
TCACCAGACCACATCTCTCTGAGAAGAACAAAGATCTGATCAACATCCCCGTGCGGGCTT
GCATATTGTTTGAAACATCCAAAGAGAATTGAAAGATGGGTCTATCAAGCCTTCCTGGTC
CATCAGAAGGAATGCTATGCGTGTTATTAGTTAACACAGCCTTATCAATCTCCATCTTCA
AAGGCATCCTCAGATCAGTGCTTCAGCTAGTAGGAATCCGTCTCTCTCCTTCTTCAGTAG
CGCCGGCCGCCTCTTCAGAGAATCAGACATCAGAGACTTTTGATTTCCGGGTCTGCCAGC
CTGAGAGTTTCCTTGAAGAATTCAGGAACAGGACCCCCACAATGAAGTTTGAGAGCTTGT
GCAAGTGCAAGAAACAGGCCGACAACGAGTGTTCTGTATGCCTGTCGAAATTCGAAGAGG
ATTCAGAGATCAACAAGCTAAAATGTGGCCACTTGTTTCACAAAACATGCTTGGAGAAAT
GGATAGACTACTGGAACATCACTTGCCCACTCTGTAGGACTCCTCTTGTTGTTGTCGCAG
CAGACGACCAGCTGGTTTCCTCTAATGTTTGGTGATCGTCTTCGTATAGAGTTCTCTTTT
TTT*GGTTTGGGTTTGGGGTGTGTTTGTTGTTGTTGTGTACAGCTACTACT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2EN11JQ 651 0 0
TATTAGTTAACACAGCCTTATCAATCTCCATCTTCAAAGGCATCCTCAGATCAGTGCTTC
AGCTAGTAGGAATCCGTCTCTCTCCTTCTTCAGTAGCGCCGGCCGCCTCTTCAGAGAATC
AGACATCAGAGACTTTTGATTTCCGGGTCTGCCAGCCTGAGAGTTTCCTTGAAGAATTCA
GGAACAGGACCCCCACAATGAAGTTTGAGAGCTTGTGCAAGTGCAAGAAACAGGCCGACA
ACGAGTGTTCTGTATGCCTGTCGAAATTCGAAGAGGATTCAGAGATCAACAAGCTAAAAT
GTGGCCACTTGTTTCACAAAACATGCTTGGAGAAATGGATAGACTACTGGAACATCACTT
GCCCACTCTGTAGGACTCCTCTTGTTGTTGTCGCAGCAGACGACCAGCTGGTTTCCTCTA
ATGTTTGGTGATCGTCTTCGTATAGAGTTCTCTTTTTTTTGGTTTGGGTTTGGGGTGTGT
TTGTTGTTGTTGTGTACAGCTACTACTGCTTTTACTATTAAAATTAAATTAGGCTGCGTC
ACGGTTGATTCTTCATCAGATTCAGACCGGAGATGGGGTATTCTGTTGTACATATTCTGT
GAGCTGTTTTATGTATACCCATGTGTAATGGAAGCTCTTGTTTGAACTTAC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 4

CO CL2119Contig1 1316 4 10 U
AACATTAATCTCAATCCATATAATTAATCGGCCGGCCCACTAATGATACATATTTATACA
AAGTAAAACACCTCAAAAAGTCAAATGTTTATTGAAAAATGCACATAACTAATTTGGCCC
ATTGAAGTAACTTGCATCTTCTGAATTAACAAGAGAGGTTATGTCCTCCCAACTTATTGT
GCTTTGATCTGCGGATGTACTCGTCGTTCCTCCGGCCAAAGCCGCCCCAGAGCCAGCTAA
TGATGAGTAGAATTTTGCGTCCTCGTTGGTCTCAAGATTCGCTATGTTGTTGTTTAAAAA
CATATCGCTGCTTGCTTCTGTCTGAAGATTACTACTCCCAAACCATTGAAAAATCTCTTG
CTGCTGATGTTCATTTTGATCACCACTTGTGTTTGGTAATGGAGAATTTGTGCTGCTACT
CATGATAGCAAAATCCCCTTCTCCTCCTCCTTCTCCTGATCCTAAGTAGTAATAAGGATC
TAACAAAAGCTGAGAGAAGGAGACATCAAAAGGGTTTGTGATAGAATCTTGATGCTGATG
ATGATCAGGGTTTGTTCTCTCCGGTTCTTCTTCAATCTTGACCATGTTATTGAGAGCGAT
AAGTTGCTTTTGTTCTAAGTTGCAAGACGGTGACATTTGGTAGTAGTTACAGTTTGTTGG
TTCCATCATCACAAGAGGTACTTGATGATGAGGAAGCTGTTGTAGTAATGGCCATGATGA
TGATCCAAACATGTTTTTCAGATAAAGATCCGTACTACCATTTTGTACTTGTTGTTGCCT
CTTCATCATCACCATCTCTTGCTTCATTCGAGCTTCTTGGAACTCTTTCCTTTGTTTGTT
TAGAAGCTTCTTCTTCAGCCTCGTGTTCCAGTAGTTCTTGATATCGTTGTCCGTTCTTCC
CGGCAGTTGTGCAGCAATTATAGACCACCTGCTACCAATAGTAACATAGAGGTTACAAAT
GATGTTGTCTTCTTCCTCAGAGAAGCCACCATGTTTGATGTTTGGTCTCAAATAGTTGAG
CCACCTTAGCCTGCAACTCTTCCCACATCTCCTTAGACCAATCTTCTGAGGCAAAGCGAT
CCAGTTGCCTCCTGTACCACTATTCTCGATGTAATCTTTGAGTTTGGCATCTTCCTCAGG
AGACCAAGGCCCTTTCTTCACGTTGGCTTTGTCACAACAAGGTGCCCTTCCCATCGTATT
GATTCTTGACTCTTGATCTTATTCTTATTGTATCTCTTTCTCAATTATGTTGATGTTGAA
GAGGAGGAGGATGATGGTGTGTGATGGTGTGTGTGTGAGGTTATATATACATCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT84JQ U 1
AF RR2EJ69JQ U 7
AF RR2FT84TF C 545
AF RR2EJ69TF C 672
BS 1 135 RR2FT84JQ
BS 136 136 RR2EJ69JQ
BS 137 498 RR2FT84JQ
BS 499 600 RR2EJ69JQ
BS 601 601 RR2FT84TF
BS 602 634 RR2EJ69JQ
BS 635 635 RR2FT84TF
BS 636 662 RR2EJ69JQ
BS 663 1275 RR2FT84TF
BS 1276 1316 RR2EJ69TF

RD RR2FT84JQ 498 0 0
AACATTAATCTCAATCCATATAATTAATCGGCCGGCCCACTAATGATACATATTTATACA
AAGTAAAACACCTCAAAAAGTCAAATGTTTATTGAAAAATGCACATAACTAATTTGGCCC
ATTGAAGTAACTTGCGTCTTCTGAATTAACAAGAGAGGTTATGTCCTCCCAACTTATTGT
GCTTTGATCTGCGGATGTACTCGTCGTTCCTCCGGCCAAAGCCGCCCCAGAGCCAGCTAA
TGATGAGTAGAATTTTGCGTCCTCGTTGGTCTCAAGATTCGCTATGTTGTTGTTTAAAAA
CATATCGCTGCTTGCTTCTGTCTGAAGATTACTACTCCCAAACCATTGAAAAATCTCTTG
CTGCTGATGTTCATTTTGATCACCACTTGTGTTTGGTAATGGAGAATTTGTGCTGCTACT
CATGATAGCAAAATCCCCTTCTCCTCCTCCTTCTCCTGATCCTAAGTAGTAATAAGGATC
TAACAAAAGCTGAGAGAA

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2EJ69JQ 656 0 0
AATCTCAATCCATATAATTAATCGGCCGGCCCGCTAATGATACATATTTATACAAAGTGA
AACACCTCAAAAAGTCAAATGTTTATTGAAAAATGCACATAACTAATTTGGCCCATTGAA
GTAACTTGCATCTTCTGAATTAACAAGAGAGGTTATGTCCTCCCAACTTATTGTGCTTTG
ATCTGCGGATGTACTCGTCGTTCCTCCGGCCAAAGCCGCCCCAGAGCCAGCTAATGATGA
GTAGAATTTTGTGTCCTCGTTGGTCTCAAGATTCGCTATGTTGTTGTTTAAGAACATATC
GCTGCTTGCTTCTGTCTGAAGATTACTACTCCCAAACCGTTGAAAAATCTCTTGCTGCTG
ATGTTCATTTTGATCACCACTTGTGTTTGGTAATGGAGAATTTGTGCTGCTACTCATGAT
AGCAAAATCCCCTTCTCCTCCTCCTTCTCCTGATCCTAAGTAGTAATAAGGATCTAACAA
AAGCTGAGAGAAGGAGACATCAAAAGGGTTTGTGATAGAATCTTGATGCTGATGATGATC
AGGGTTTGTTCTCTCCGGTTCTTCTTCAATCTTGACCATGTTATTGAGAGCGATCAGTTG
CTTTTGTTCTAAGTTGCAAGACGGTGACGTTTGGTAGTAGTTACAGTTTGTTGGTT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2FT84TF 733 0 0
TCAGGGTTTGTTCTCTCCGGTTCTTCTTCAATCTTGACCATGTTATTGAGAGCGATAAGT
TGCTTTTGTTCTAGGTTGCAAGACGGTGACATTTGGTAGTAGTTACAGTTTGTTGGTTCC
ATCATCACAAGAGGTACTTGATGATGAGGAAGCTGTTGTAGTAATGGCCATGATGATGAT
CCAAACATGTTTTTCAGATAAAGATCCGTACTACCATTTTGTACTTGTTGTTGCCTCTTC
ATCATCACCATCTCTTGCTTCATTCGAGCTTCTTGGAACTCTTTCCTTTGTTTGTTTAGA
AGCTTCTTCTTCAGCCTCGTGTTCCAGTAGTTCTTGATATCGTTGTCCGTTCTTCCCGGC
AGTTGTGCAGCAATTATAGACCACCTGCTACCAATAGTAACATAGAGGTTACAAATGATG
TTGTCTTCTTCCTCAGAGAAGCCACCATGTTTGATGTTTGGTCTCAAATAGTTGAGCCAC
CTTAGCCTGCAACTCTTCCCACATCTCCTTAGACCAATCTTCTGAGGCAAAGCGATCCAG
TTGCCTCCTGTACCACTATTCTCGATGTAATCTTTGAGTTTGGCATCTTCCTCAGGAGAC
CAAGGCCCTTTCTTCACGTTGGCTTTGTCACAACAAGGTGCCCTTCCCATCGTATTGATT
CTTGACTCTTGATCTTATTCTTATTGTATCTCTTTCTCAATTATGTTGATGTTGAAGAGG
AGGAGGATGAT
CC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2EJ69TF 645 0 0
CAAGAGGTACTTGATGATGAGGAAGCTGTTGTAGTAATGGCCATGATGATGATCCAAACA
TGTTTTTCAGATAAAGATCCGTACTACCATTTTGTACTTGTTGTTGCCTCTTCATCATCA
CCATCTCTTGCTTCATTCGAGCTTCTTGGAACTCTTTCCTTTGTTTGTTTAGAAGCTTCT
TCTTCAGCCTCGTGTTCCAGTAGTTCTTGATATCGTTGTCCGTTCTTCCCGGCAGTTGTG
CAGCAATTATAGACCACCTGCTACCAATAGTAACATAGAGGTTACAAATGATGTTGTCTT
CTTCCTCAGAGAAGCCACCATGTTTGATGTTTGGTCTCAAATAGTTGAGCCACCTTAGCC
TGCAACTCTTCCCACATCTCCTTAGACCAATCTTCTGAGGCAAAGCGATCCAGTTGCCTC
CTGTACCACTATTCTCGATGTAATCTTTGAGTTTGGCATCTTCCTCAGGAGACCAAGGCC
CTTTCTTCACGTTGGCTTTGTCACAACAAGGTGCCCTTCCCATCGTATTGATTCTTGACT
CTTGATCTTATTCTTATTGTATCTCTTTCTCAATTATGTTGATGTTGAAGAGGAGGAGGA
TGATGGTGTGTGATGGTGTGTGTGTGAGGTTATATATACATCCCT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 3

CO CL2120Contig1 808 3 10 U
GAATAAAAAAAAAAATCAACAAGTTGCTTCTCCATCCTTCGTTGCTTCCTAAATGCGTCT
CTCTGCTTTTTGGAGATAAAAGATATAGAAAAAGAGAGAATGGCGGGGGCAACTTCAAGT
TTGATATCATCGCCATGGCAAGCGACTCTTGAGCATTATAATAATAACAATAAGACTAAG
AGGTTTTATGTCAAAGGTTATCCGTTTCCATGTCATGACCCTATTTGCAATTCTTTTAAT
ATCAAAAGACGTGTTCTTCTTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCCATATTTAAGGACGACCAT
GTCGTTACTCATTCTTCATCCTCTTCCTCATACAAGCTTCAAACCCATTTCTCCATGTCT
TCTGGTTGTGGTTGCTCGTGGATTCAGAACAACTCAATGCTTCATTACTCGCCTACTACA
AGTAACTGGACGTCGAAGAAATGCTCGGCGTTACCAACAAAAACAGTGGATGTCTCCTCA
GTTTCTGACCTTTTTGAGTTCATATGCTCTGGTCCGCTCGTGGAAAAGATCGGTATCACT
CCTGAAAAAGTCGGCCAGGCCATTGACAAATGGTTGCTATACGGCTCACAGCTATGCAGA
CTCTTTCAGCTTAACGAGCTTAAGCTGACCATTCCTCAGAAAGCTAGGCTTTACCATTAC
TATATCCCCGTCTTTGTTTGGTGCCAAGACCAGATTGCTCTGCATAACTCCAAGTTTAAA
GATGGAGATGATGTGCCTCCCCTAGTGATTGGATTCAGCGCACCTCAAGGATGTGGCAAG
ACTACACTTGTGTTTGCACTTGATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN38TF U 1
AF RR2C860TF U 87
AF RR2DJ36TF U 81
BS 1 253 RR2DN38TF
BS 254 254 RR2C860TF
BS 255 271 RR2DN38TF
BS 272 272 RR2C860TF
BS 273 577 RR2DN38TF
BS 578 578 RR2C860TF
BS 579 736 RR2DN38TF
BS 737 737 RR2C860TF
BS 738 763 RR2DN38TF
BS 764 808 RR2DJ36TF

RD RR2DN38TF 782 0 0
GAATAAAAAAAAAAATCAACAAGTTGCTTCTCCATCCTTCGTTGCTTCCTAAATGCGTCT
CTCTGCTTTTTGGAGATAAAAGATATAGAAAAAGAGAGAATGGCGGGGGCAACTTCAAGT
TTGATATCATCGCCATGGCAAGCGACTCTTGAGCATTATAATAATAACAATAAGACTAAG
AGGTTTTATGTCAAAGGTTATCCGTTTCCATGTCATGACCCTATTTGCAATTCTTTTAAT
ATCAAAAGACGTGCTCTTCTTTCTTCTTCCTTTTCCTCTTCCATATTTAAGGACGACCAT
GTCGTTACTCATTCTTCATCCTCTTCCTCATACAAGCTTCAAACCCATTTCTCCATGTCT
TCTGGTTGTGGTTGCTCGTGGATTCAGAACAACTCAATGCTTCATTACTCGCCTACTACA
AGTAACTGGACGTCGAAGAAATGCTCGGCGTTACCAACAAAAACAGTGGATGTCTCCTCA
GTTTCTGACCTTTTTGAGTTCATATGCTCTGGTCCGCTCGTGGAAAAGATCGGTATCACT
CCTGAAAAAGTCGGCCAGGCCATTGACAAATGGTTGCCATACGGCTCACAGCTATGCAGA
CTCTTTCAGCTTAACGAGCTTAAGCTGACCATTCCTCAGAAAGCTAGGCTTTACCATTAC
TATATCCCCGTCTTTGTTTGGTGCCAAGACCAGATTGCTCTGCATAACTCCAAGTTTAAA
GATGGAGATGATGTGC*TCCCCTAGTGATTGGATTCAGCGCAC
TCAGGATGTGGCAGACTAC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2C860TF 680 0 0
AGAAAAAGAGAGAATGGCGGGGGCAACTTCAAGTTTGATATCATCGCCATGGCAAGCGAC
TCTTGAGCATTATAATCATAACAATAAGACTAAGAGGTTTTATGTCAAATGTTATCCGTT
TCCATGTCATGACCCTATTTGCAATTCTTTTAATATCAAAAGACGTGTTCTTCTTTCTTC
TTCCTCTTCCTCTTCCATATTTAAGGACGACCATGTCGTTACTCATTCTTCATCCTCTTC
CTCATACAAGCTTCAAACCCATTTCTCCATGTCTTCTGGTTGTGGTTGCTCGTGGATTCA
GAACAACTCAATGCTTCATTACTCGCCTACTACAAGTAACTGGACGTCGAAGAAATGCTC
GGCGTTACCAACAAAAACAGTGGATGTCTCCTCAGTTTCTGACCTTTTTGAGTTCATATG
CTCTGGTCCGCTCGTGGAAAAGATCGGTATCACTCCTGAAAAAGTCGGCCAGGCCATTGA
CAAATGGTTGCTATACGGCTCACAGCTATGCAGACTCTTTCAGCTTAACGAGCTTAAGCT
GACCATTCCTCAGAAAGCTAGGCTTTACCATTACTATATCCCCGTCTTTGTTTGGTGCCA
AGACCAGATTGCTCTGCATAACTCCAAGTTTAAAGATGGAGATGATGTGCCTCCCCTAGT
GATTGGATTCAGCGCAC
CTC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2DJ36TF 728 0 0
GGATAT
AGAAAAAGAGAGAATGGCGGGGGCAACTTCAAGTTTGATATCATCGCCATGGCAAGCGAC
TCTTGAGCATTATAATAATAACAATAAGACTAAGAGGTTTTATGTCAAAGGTTATCCGTT
TCCATGTCATGACCCTATTTGCAATTCTTTTAATATCAAAAGACGTGTTCTTCTTTCTTC
TTCCTCTTCCTCTTCCATATTTAAGGACGACCATGTCGTTACTCATTCTTCATCCTCTTC
CTCATACAAGCTTCAAACCCATTTCTCCATGTCTTCTGGTTGTGGTTGCTCGTGGATTCA
GAACAACTCAATGCTTCATTACTCGCCTACTACAAGTAACTGGACGTCGAAGAAATGCTC
GGCGTTACCAACAAAAACAGTGGATGTCTCCTCAGTTTCTGACCTCTTTGAGTTCATATG
CTCTGGTCCGCTCGTGGAAAAGATCGGTATCACTCCTGAAAAAGTCGGCCAGGCCATTGA
CAAATGGTTGCTATACGGCTCACAGCTATGCAGACTCTTTCAGCTTAACGAGCTTAAGCT
GACCATTCCTCAGAAAGCTAGGCTTTACCATTACCATATCCCC*******TTTGGTGCCA
AGACCAGATTGCTCTGCATAACTCCAAGTTTAAAGATGGAGATGATGTGCCTCCCCTAGT
GATTGGATTCAGCGCACCTCAAGGATGTGGCAAGACTACACTTGTGTTTGCACTTGATTA
TC

QA 7 728 7 728
DS 



AS 1 2

CO CL2121Contig1 782 2 3 U
ACCACAACAGGGCTTGGGTCAGATCTCCGAGAGGTTGAACGTACCCGTGTCTGATGTTAA
GAACGTGATCATCTGGGGAAACCACTCGTCATCACAGTACCCAGATGTCAACCATGCTAA
GGTGCAGACATCTGCTGGAGAGAAGTCAGTCCGTGAGCTCGTGAAGAACGATGAATACTT
GAATGGAGAATTCATCACCACCGTTCAACAACGTGGAGCTGCAATCATCAAGGCGAGGAA
GTTGTCAAGTGCACTTTCTGCTGCTAGCTCTGCTTGTGATCACATCCGTGACTGGGTCCT
TGGAACTCCAGAGGGTACATTTGTTTCAATGGGAGTATACTCCGATGGCTCTTACGACGT
TCCAGCTGGACTTATCTACTCCTTCCCTGTCACTTGCCGCAATGGAGAGTGGGAGTATTG
TCCAAGGCCTTCCGATCGATGAAATGTCAAGGAAGAAGATGGATTTGACAGCAGAGGAGC
TGAAGGAAGAGAAGGACTTGGCGTACTCATGCCTCTCTTAAACAACCAACGCTCTTCTTC
TGAAGCCATTTTTCAGCTGTCAGGTGTGAGATCAATCATAGCTTTTACGGCTGTCTGAAT
AAGATCTCCAAACACTGTTATAAAAAAAAAGTCTCCAAACACTGTTTTATAACCTTTTTA
TGGTTTTGTCTTCTTATTGAGCATTGTCCCTGGTCTGTTTCTAAACCAGGTTGTCGTTTA
CTTTGTTTCCTGTGTCTTGTGTGGTTTTATCCATGATAAAAATAAAGAAAATTGGTAACT
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2GO34TF U 103
AF RR2GO34JQ C 1
BS 1 102 RR2GO34JQ
BS 103 424 RR2GO34TF
BS 425 782 RR2GO34JQ

RD RR2GO34TF 322 0 0
AGATGTCAACCATGCTAAGGTGCAGACATCTGCTGGAGAGAAGTCAGTCCGTGAGCTCGT
GAAGAACGATGAATACTTGAATGGAGAATTCATCACCACCGTTCAACAACGTGGAGCTGC
AATCATCAAGGCGAGGAAGTTGTCAAGTGCACTTTCTGCTGCTAGCTCTGCTTGTGATCA
CATCCGTGACTGGGTCCTTGGAACTCCAGAGGGTACATTTGTTTCAATGGGAGTATACTC
CGATGGCTCTTACGACGTTCCAGCTGGACTTATCTACTCCTTCCCTGTCACTTGCCGCAA
TGGAGAGTGGGAGTATTGTCCA

QA 1 322 1 322
DS 

RD RR2GO34JQ 782 0 0
ACCACAACAGGGCTTGGGTCAGATCTCCGAGAGGTTGAACGTACCCGTGTCTGATGTTAA
GAACGTGATCATCTGGGGAAACCACTCGTCATCACAGTACCCAGATGTCAACCATGCTAA
GGTGCAGACATCTGCTGGAGAGAAGTCAGTCCGTGAGCTCGTGAAGAACGATGAATACTT
GAATGGAGAATTCATCACCACCGTTCAACAACGTGGAGCTGCAATCATCAAGGCGAGGAA
GTTGTCAAGTGCACTTTCTGCTGCTAGCTCTGCTTGTGATCACATCCGTGACTGGGTCCT
TGGAACTCCAGAGGGTACATTTGTTTCAATGGGAGTATACTCCGATGGCTCTTACGACGT
TCCAGCTGGACTTATCTACTCCTTCCCTGTCACTTGCCGCAATGGAGAGTGG*AGTATTG
TCCAAGGCCTTCCGATCGATGAAATGTCAAGGAAGAAGATGGATTTGACAGCAGAGGAGC
TGAAGGAAGAGAAGGACTTGGCGTACTCATGCCTCTCTTAAACAACCAACGCTCTTCTTC
TGAAGCCATTTTTCAGCTGTCAGGTGTGAGATCAATCATAGCTTTTACGGCTGTCTGAAT
AAGATCTCCAAACACTGTTATAAAAAAAAAGTCTCCAAACACTGTTTTATAACCTTTTTA
TGGTTTTGTCTTCTTATTGAGCATTGTCCCTGGTCTGTTTCTAAACCAGGTTGTCGTTTA
CTTTGTTTCCTGTGTCTTGTGTGGTTTTATCCATGATAAAAATAAAGAAAATTGGTAACT
TC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 4

CO CL2122Contig1 851 4 6 U
GGGATCCTTCCGGAAACCATCTCCGAAACAAAACAATAATGCAGTTCTTCGGCGGATCCG
AGATAAGCCCGTCGCCTCCCGTCCCAACGGCGAGTGGAAACAACGCGCACATGATGTACG
TGTTCAACCGCAACGGCGTGTGTCTCCTATACAAGGAATGGAACCGGCCTCTCCACACGC
TCAACCCTCAGCAAGATCACAAGCTCATGTTCGGTCTCCTCTTCTCCCTCAAATCCCTAA
CCGCCAAAATGGACCCCACCAATGCGGATAAGGGGAACCTAGGGGTCCCACAGTTGCCGG
GGCAAGGATGCTCTTTCCACAGTTTCAGAACCAACACTTACAAGCTTAGCTTCATGGAGA
CTCCCTCTGGTATTAAGATTATCTTAGTAACTCATCCAAAGACGGGAGATTTACGTGAAT
CCCTAAAGTACATATACGGTTTATACGTTGAGTATGTGGTAAAGAACCCTATCTACAGCC
CAGGATCTCCAATCAAGTCAGAGTTGTTCAACACTGCACTTGACCAATATGTGAGGAGCA
TCTCATAGTGTCTGCATTACAAGATTTGGCCATTGGAACTTCTGCTTCACAAAACTTTCT
TCTGAACAATCTCCTAGATAAGAGAGAATTGTGGTAGAAAGATCAATCTCGAATGCACCG
CTTTCCTCTGCATATATATGTTTCGTTCTCTTTTTTTAAAATCAATGTATTTGCTTGTTT
TTTTCTTTGATAAGTTACTGTATTGGCTTGTTTTCAAAGATGTTTATGGTTAACGCATTT
TTTTTTGGTTAACGCAAATCTTGAGATACCATTTGAGCAAGAAACCGTGATTTGGATATT
TTATGTAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT73TF U 1
AF RR2GP16TF U 73
AF RR2GP16JQ C 90
AF RR2GT73JQB C 273
BS 1 195 RR2GT73TF
BS 196 196 RR2GP16TF
BS 197 594 RR2GT73TF
BS 595 696 RR2GP16TF
BS 697 835 RR2GP16JQ
BS 836 851 RR2GT73JQB

RD RR2GT73TF 594 0 0
GGGATCCTTCCGGAAACCATCTCCGAAACAAAACAATAATGCAGTTCTTCGGCGGATCCG
AGATAAGCCCGTCGCCTCCCGTCCCAACGGCGAGTGGAAACAACGCGCACATGATGTACG
TGTTCAACCGCAACGGCGTGTGTCTCCTATACAAGGAATGGAACCGGCCTCTCCACACGC
TCAACCCTCAGCAAGTTCACAAGCTCATGTTCGGTCTCCTCTTCTCCCTCAAATCCCTAA
CCGCCAAAATGGACCCCACCAATGCGGATAAGGGGAACCTAGGGGTCCCACAGTTGCCGG
GGCAAGGATGCTCTTTCCACAGTTTCAGAACCAACACTTACAAGCTTAGCTTCATGGAGA
CTCCCTCTGGTATTAAGATTATCTTAGTAACTCATCCAAAGACGGGAGATTTACGTGAAT
CCCTAAAGTACATATACGGTTTATACGTTGAGTATGTGGTAAAGAACCCTATCTACAGCC
CAGGATCTCCAATCAAGTCAGAGTTGTTCAACACTGCACTTGACCAATATGTGAGGAGCA
TCTCATAGTGTCTGCATTACAAGATTTGGCCATTGGAACTTCTGCTTCACAAAA

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2GP16TF 628 0 0
CGCCTCCCGTCCCAACGGCGAGTGGAAACAACGCGCACATGATGTACGTGTTCAACCGCA
ACGGCGTGTGTCTCCTATACAAGGAATGGAACCGGCCTCTCCACACGCTCAACCCTCAGC
AAGATCACAAGCTCATGTTCGGTCTCCTCTTCTCCCTCAAATCCCTAACCGCCAAAATGG
ACCCCACCAATGCGGATAAGGGGAACCTAGGGGTCCCACAGTTGCCGGGGCAAGGATGCT
CTTTCCACAGTTTCAGAACCAACACTTACAAGCTTAGCTTCATGGAGACTCCCTCTGGTA
TTAAGATTATCTTAGTAACTCATCCAAAGACGGGAGATTTACGTGAATCCCTAAAGTACA
TATACGGTTTATACGTTGAGTATGTGGTAAAGAACCCTATCTACAGCCCAGGATCTCCAA
TCAAGTCAGAGTTGTTCAACACTGCACTTGACCAATATGTGAGGAGCATCTCATAGTGTC
TGCATTACAAGATTTGGCCATTGGAACTTCTGCTTCACAAAACTTTCTTCTGAACAATCT
CCTAGATAAGAGAGAATTGTGGTAGAAAGATCAATCTCGAATGCACCGCTTTCCTCTGCA
TATATATGTTTCGTTCTCTTTTTT
AAAT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2GP16JQ 746 0 0
GCGAGTGGAAACAACGCGCACATGATGTACGTGTTCAACCGCAACGGCGTGTGTCTCCTA
TACAAGGAATGGAACCGGCCTCTCCACACGCTCAACCCTCAGCAAGATCACAAGCTCATG
TTCGGTCTCCTCTTCTCCCTCAAATCCCTAACCGCCAAAATGGACCCCACCAATGCGGAT
AAGGGGAACCTAGGGGTCCCACAGTTGCCGGGGCAAGGATGCTCTTTCCACAGTTTCAGA
ACCAACACTTACAAGCTTAGCTTCATGGAGACTCCCTCTGGTATTAAGATTATCTTAGTA
ACTCATCCAAAGACGGGAGATTTACGTGAATCCCTAAAGTACATATACGGTTTATACGTT
GAGTATGTGGTAAAGAACCCTATTTACAGCCCAGGATCTCCAATCAAGTCAGAGTTGTTC
AACACTGCACTTGACCAATATGTGAGGAGCATCTCATAGTGTCTGCATTACAAGATTTGG
CCATTGGAACTTCTGCTTCACAAAACTTTCTTCTGAACAATCTCCTAGATAAGAGAGAAT
TGTGGTAGAAAGATCAATCTCGAATGCACCGCTTTCCTCTGCATATATATGTTTCGTTCT
CTTTTTTTAAAATCAATGTATTTGCTTGTTTTTTTCTTTGATAAGTTACTGTATTGGCTT
GTTTTCAAAGATGTTTATGGTTAACGCATTTTTTTTTGGTTAACGCAAATCTTGAGATAC
CATTTGAGCAAGAAACCGTGATTTGG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2GT73JQB 579 0 0
GGGAACCTAGGGGTCCCACAGTTGCCGGGGCAAGGATGCTCTTTCCACAGTTTCAGAACC
AACACTTACAAGCTTAGCTTCATGGAGACTCCCTCTGGTATTAAGATTATCTTAGTAACT
CATCCAAAGACGGGAGATTTACGTGAATCCCTAAAGTACATATACGGTTTATACGTTGAG
TATGTGGTAAAGAACCCTATTTACAGCCCAGGATCTCCAATCAAGTCAGAGTTGTTCAAC
ACTGCACTTGACCAATATGTGAGGAGCATTTCATAGTGTTTGCATTACAAGATTTGGCCA
TTGGAACTTTTGCTTCACAAAACTTTTTTTTGAACAATTTCCTAGATAAGAGAGAATTGT
GGTAGAAAGATCAATCTCGAATGCACTGCTTTCCTCTGCATATATATGTTTCGTTCTCTT
TTTTTAAAATCAATGTATTTGCTTGTTTTTTTCTTTGATAAGTTACTGTATTGGCTTGTT
TTCAAAGATGTTTATGGTTAACGCATTTTTTTT*GGTTAACGCAAATCTTGAGATACCAT
TTGAGCAAGAAACCGTGATTTGGATATTTTATGTAGCTT

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 3

CO CL2123Contig1 946 3 10 U
GATTGACAATGTTCTTCCCAGAAGCCAACTTACCATCATGGGTTGTTTGCTACATCCCCG
GGATCATGTCCATCTTAAACATCATCCCAGCCCCAAGATCCTTCCCTTTCATAGTCCCTT
ACCTCCTTTTTGAAAACACAATGTCGGTCACCAAGTTCGGAGCCATGATCTCTGGTTTGT
TCAAGTTTGGAAGCTCTTACGAGTGGGCGGTCACCAAAAAGCTAGGGAGATCCTCTGAGG
CTGATCTGATTGCGTACGCAGAGTCAGGCTCTTTGGTTGACTCCACAAGCATCCAAAGAT
CATCCTCTGATTCGGGTTTGACCGAGCTTAGCAAACTAGGAGCAGCTAAGAAAGCAGGGA
AGACCAAAAGAAACCGTCTGTACAGAACAGAGATTGCTTTGGCTTTCATCCTCTTGGCAG
CCTCGGTGAGAAGCTTGTTGTCTGCACAAGGGATCCACTTCTACTTCCTCTTGTTCCAGG
GACTCACTTTCGTGATTGTTGGTCTTGATTTGATCGGAGAACAGGTCAGTTAGTTTATAT
AAAAAACACCTTTCCTCGTTTTAAACTACACTGCACCATACAAGTTGAAGAACAGAAAAG
AGAGATGCTCAAGGCCAAGTCAGGAGGATGAACCAACTCAGATATGGATTCTTGCTGGTC
CTCTCTACATAAAAAAAAGAACAATTCATTTAAAAACTTTTCTTTTTTTTGTCTTTGATA
CTTTTTACCTGTGATGGTTTAGATTCTTATTTCTTTTGTTTTACGGATAGTATTAGGGAA
GTGGCAGAAAGAAAGGCTTTGATGATGACCTCTCTTTGTTTGTGGTCTTAAGCCAAAAGA
CTTGACTACCGATTTAGAGATTTGTTGTAATGCCACACTCAATTCTTTTGAGTAATTTGT
TGTTGTTTTCTTTCTCCAGGGATTCATCTTTACTTTTGAATCAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F614TF U 1
AF RR2BI55JQ C 193
AF RR2BI55TF U 193
BS 1 207 RR2F614TF
BS 208 208 RR2BI55TF
BS 209 489 RR2F614TF
BS 490 490 RR2BI55TF
BS 491 623 RR2F614TF
BS 624 624 RR2BI55TF
BS 625 633 RR2F614TF
BS 634 634 RR2BI55TF
BS 635 677 RR2F614TF
BS 678 946 RR2BI55TF

RD RR2F614TF 677 0 0
GATTGACAATGTTCTTCCCAGAAGCCAACTTACCATCATGGGTTGTTTGCTACATCCCCG
GGATCATGTCCATCTTAAACATCATCCCAGCCCCAAGATCCTTCCCTTTCATAGTCCCTT
ACCTCCTTTTTGAAAACACAATGTCGGTCACCAAGTTCGGAGCCATGATCTCTGGTTTGT
TCAAGTTTGGAAGCTCTTACGAGTGGGTGGTCACCAAAAAGCTAGGGAGATCCTCTGAGG
CTGATCTGATTGCGTACGCAGAGTCAGGCTCTTTGGTTGACTCCACAAGCATCCAAAGAT
CATCCTCTGATTCGGGTTTGACCGAGCTTAGCAAACTAGGAGCAGCTAAGAAAGCAGGGA
AGACCAAAAGAAACCGTCTGTACAGAACAGAGATTGCTTTGGCTTTCATCCTCTTGGCAG
CCTCGGTGAGAAGCTTGTTGTCTGCACAAGGGATCCACTTCTACTTCCTCTTGTTCCAGG
GACTCACTT*CGTGATTGTTGGTCTTGATTTGATCGGAGAACAGGTCAGTTAGTTTATAT
AAAAAACACCTTTCCTCGTTTTAAACTACACTGCACCATACAAGTTGAAGAACAGAAAAG
AGAGATGCTCAAGGCCAAGTCAG*AGGATGAACTAACTCAGATATGGATTCTTGCTGGTC
CTCTCTACATAAAAAAA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2BI55JQ 754 0 0
GCTCTTACGAGTGGGCGGTCACCAAAAAGCTAGGGAGATCCTCTGAGGCTGATCTGATTG
CGTACGCAGAGTCAGGCTCTTTGGTTGACTCCACAAGCATCCAAAGATCATCCTCTGATT
CGGGTTTGACCGAGCTTAGCAAACTAGGAGCAGCTAAGAAAGCAGGGAAGACCAAAAGAA
ACCGTCTGTACAGAACAGAGATTGCTTTGGCTTTCATCCTCTTGGCAGCCTCGGTGAGAA
GCTTGTTGTCTGCACAAGGGATCCACTTCTACTTCCTCTTGTTCCAGGGACTCACTTTCG
TGATTGTTGGTCTTGATTTGATCGGAGAACAGGTCAGTTAGTTTATATAAAAAACACCTT
TCCTCGTTTTAAACTACACTGCACCATACAAGTTGAAGAACAGAAAAGAGAGATGCTCAA
GGCCAAGTCAGGAGGATGAACCAACTCAGATATGGATTCTTGCTGGTCCTCTCTACATAA
AAAAAAGAACAATTCATTTAAAAACTTTTCTTTTTTTTGTCTTTGATACTTTTTACCTGT
GATGGTTTAGATTCTTATTTCTTTTGTTTTACGGATAGTATTAGGGAAGTGGCAGAAAGA
AAGGCTTTGATGATGACCTCTCTTTGTTTGTGGTCTTAAGCCAAAAGACTTGACTACCGA
TTTAGAGATTTGTTGTAATGCCACACTCAATTCTTTTGAGTAATTTGTTGTTGTTTTCTT
TCTCCAGGGATTCATCTTTACTTTTGAATCAAAG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2BI55TF 754 0 0
GCTCTTACGAGTGGGCGGTCACCAAAAAGCTAGGGAGATCCTCTGAGGCTGATCTGATTG
CGTACGCAGAGTCAGGCTCTTTGGTTGACTCCACAAGCATCCAAAGATCATCCTCTGATT
CGGGTTTGACCGAGCTTAGCAAACTAGGAGCAGCTAAGAAAGCAGGGAAGACCAAAAGAA
ACCGTCTGTACAGAACAGAGATTGCTTTGGCTTTCATCCTCTTGGCAGCCTCGGTGAGAA
GCTTGTTGTCTGCACAAGGGATCCACTTCTACTTCCTCTTGTTCCAGGGACTCACTTTCG
TGATTGTTGGTCTTGATTTGATCGGAGAACAGGTCAGTTAGTTTATATAAAAAACACCTT
TCCTCGTTTTAAACTACACTGCACCATACAAGTTGAAGAACAGAAAAGAGAGATGCTCAA
GGCCAAGTCAGGAGGATGAACCAACTCAGATATGGATTCTTGCTGGTCCTCTCTACATAA
AAAAAAGAACAATTCATTTAAAAACTTTTCTTTTTTTTGTCTTTGATACTTTTTACCTGT
GATGGTTTAGATTCTTATTTCTTTTGTTTTACGGATAGTATTAGGGAAGTGGCAGAAAGA
AAGGCTTTGATGATGACCTCTCTTTGTTTGTGGTCTTAAGCCAAAAGACTTGACTACCGA
TTTAGAGATTTGTTGTAATGCCACACTCAATTCTTTTGAGTAATTTGTTGTTGTTTTCTT
TCTCCAGGGATTCATCTTTACTTTTGAATCAAAG

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 3

CO CL2124Contig1 806 3 2 U
GGCCTAGCTAGCTCTTCTTCACTCCCCCACCGAAACAAAAATGATTATGTCAGAGGAAAA
CCGCAGAGAAATCTGCAAGTACCTTTTCAAAGAAGGAGTGCTATTCGCGAAGAAAGACTT
CAACCTCGCGAAGCACCCGTTGATTGAGTCAGTGCCAAACCTGCAAGTGATCAAGCTGAT
GTAGTCTTTCAAATCAAAGGAGTATGTAAGGGAGACATTCGCTTGGATGCATTACTACTG
GTTTCTCACCAACGAAGGGATTGAGTTCTTGAGGACTTACCTTAACCTACCGTCTGATGT
TGTTCCTGCTACCTTGAAGAAGTCGGCTAAGCCTGTTGGTCGTCCTTTTGGTGGTGGCCC
ACCTGGTGATCGCCCTAGAGGACCTAGGTTTGAAGGAGGAGAGCGTCCCAGGTATGGTGG
GGACCGTGATGGGTACCGTGGAGCTCCTCGT******GGTGAAGGAGAAAAGGGTGGTGC
TCCAGCTGATTACCAGCCATCTTTCCAAGGAAGTGGTGGTAGGCCTGGTTTTGGCCGAGG
TGCTGGAGGTTACAGCTCGGCTGCACCATCTGGTTCAGGTCTCCCTTGATAAAGAAATGC
TTCTTAGTTACACATGGATGAGTTCATTTCAGCTTTAAATTTTGCTTTCTGTTATTCAAC
TTCTGGAGTTCTTTATTGTCTTATCTGAGTTCAGTTCGTTGTTGTAGCAGACACAAGTTT
AGCACTAGCTTTTCTGCAGCTTTGATCCTCAAAACGTTTGATCCTCAATAGTTTCTGTCA
AACAATAAGAAAGGTTTTTTTTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH39TF U 20
AF RR2AV81TF U 1
AF RR2AV81JQ C 50
BS 1 781 RR2AV81TF
BS 782 806 RR2AV81JQ

RD RR2DH39TF 746 0 0
GGGACT
CCCACCGAAACAAAAATGATTATGTCAGAGGAAAACCGCAGAGAAATCTGCAAGTACCTT
TTCAAAGAAGGAGTGTTGTTCGCGAAGAAAGACTTCAACCTCGCGAAGCACCCGTTGATT
GAGTCAGTGCCAAACCTGCAAGTGATCAAGCTGATGCAGTCTTTCAAATCCAAGGAGTAT
GTAAGGGAGACATTCGCGTGGATGCATTACTACTGGTTTCTCACTAACGAAGGGATTGAG
TTCTTGAGGACTTACCTTAACCTCCCGTCTGATGTTGTTCCTGCTACCTTGAAGAAGTCG
GCTAAGCCTATCGGTCGTCCTTTTGGTGGTGGCCCACCTGGTGATCGCCCAAGAGGACCT
AGGTTTGAAGGAGGAGACCGTCCAAGGTATGGTGGGGACCGTGATGGGTACCGTGGAGCT
CCTCGTGGTGGTGGTGAAGGAGAAAAGGGTGGTGCTCCAGCTGATTACCAGCCATCTTTC
CAAGGAAGTGGTGGTAGGCCTGGTTTTGGCCGAGGTGCTGGAGGTTACAGCTCGGCTGCA
CCATCTGGTTCAGGTCTCCCTTGATAAAGAAATGGTTCTTAGTTACACATGGAGGAGTTC
ATTTCAGCTTTAAATTTTGCTTTCTGTTATTCAACTTCTGGAGTTCTTTATTGTCTTATC
TTAGTTCAGTTCGTTGTTGTAGCAGACACAAGTTTAGCACTAGCTTTTCTGCAGCTTTGA
TCCTCAAA
CGTTTAATCCTC

QA 7 734 7 734
DS 

RD RR2AV81TF 785 0 0
GGCCTAGCTAGCTCTTCTTCACTCCCCCACCGAAACAAAAATGATTATGTCAGAGGAAAA
CCGCAGAGAAATCTGCAAGTACCTTTTCAAAGAAGGAGTGCTATTCGCGAAGAAAGACTT
CAACCTCGCGAAGCACCCGTTGATTGAGTCAGTGCCAAACCTGCAAGTGATCAAGCTGAT
GTAGTCTTTCAAATCAAAGGAGTATGTAAGGGAGACATTCGCTTGGATGCATTACTACTG
GTTTCTCACCAACGAAGGGATTGAGTTCTTGAGGACTTACCTTAACCTACCGTCTGATGT
TGTTCCTGCTACCTTGAAGAAGTCGGCTAAGCCTGTTGGTCGTCCTTTTGGTGGTGGCCC
ACCTGGTGATCGCCCTAGAGGACCTAGGTTTGAAGGAGGAGAGCGTCCCAGGTATGGTGG
GGACCGTGATGGGTACCGTGGAGCTCCTCGT******GGTGAAGGAGAAAAGGGTGGTGC
TCCAGCTGATTACCAGCCATCTTTCCAAGGAAGTGGTGGTAGGCCTGGTTTTGGCCGAGG
TGCTGGAGGTTACAGCTCGGCTGCACCATCTGGTTCAGGTCTCCCTTGATAAAGAAATGC
TTCTTAGTTACACATGGATGAGTTCATTTCAGCTTTAAATTTTGCTTTCTGTTATTCAAC
TTCTGGAGTTCTTTATTGTCTTATCTGAGTTCAGTTCGTTGTTGTAGCAGACACAAGTTT
AGCACTAGCTTTTCTGCAGCTTTGATCCTCAAAACGTTTGATCCTCAATAGTTTCTGTCA
A
CAAT

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2AV81JQ 757 0 0
TCAGAGGAAAACCGCAGAGAAATCTGCAAGTACCTTTTCAAAGAAGGAGTGCTATTCGCG
AAGAAAGACTTCAACCTCGCGAAGCACCCGTTGATTGAGTCAGTGCCAAACCTGCAAGTG
ATCAAGCTGATGTAGTCTTTCAAATCAAAGGAGTATGTAAGGGAGACATTCGCTTGGATG
CATTACTACTGGTTTCTCACCAACGAAGGGATTGAGTTCTTGAGGACTTACCTTAACCTA
CCGTCTGATGTTGTTCCTGCTACCTTGAAGAAGTCGGCTAAGCCTGTTGGTCGTCCTTTT
GGTGGTGGCCCACCTGGTGATCGCCCTAGAGGACCTAGGTTTGAAGGAGGAGAGCGTCCC
AGGTATGGTGGGGACCGTGATGGGTACCGTGGAGCTCCTCGT******GGTGAAGGAGAA
AAGGGTGGTGCTCCAGCTGATTACCAGCCATCTTTCCAAGGAAGTGGTGGTAGGCCTGGT
TTTGGCCGAGGTGCTGGAGGTTACAGCTCGGCTGCACCATCTGGTTCAGGTCTCCCTTGA
TAAAGAAATGCTTTTTAGTTACACATGGATGAGTTCATTTCAGCTTTAAATTTTGCTTTC
TGTTATTCAACTTCTGGAGTTCTTTATTGTCTTATCTGAGTTCAGTTCGTTGTTGTAGCA
GACACAAGTTTAGCACTAGCTTTTCTGCAGCTTTGATCCTCAAAACGTTTGATCCTCAAT
AGTTTCTGTCAAACAATAAGAAAGGTTTTTTTTTGTG

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 4

CO CL2125Contig1 1211 4 3 U
GGATCTCTAGCTCTCATAGATCCATCCATCAATGGCTTCCCTCGTCGAATCTGGCTGGCA
GTACCTTTTGACGCATTTTAGCGACTTTCAACTGGCCTGCATTGGGAGTTTCCTCCTCCA
TGAAAGCGTTTTCTTCTTGTCTGGTCTCCCTTTCATTTTTTTAGAAAGGCAAGGCCTTCT
CACCAAGTTCAAAATTCAGGCAAAAAACAACACGCCTGCAGCACAAGGAAAATGTATCAC
TCGCCTCTTGCTTTATCATTTCTGCGTTAACTTGCCCCTCATGATGGCCTCCTATCCTGT
CTTCAGAGCCATGGGAATGCGAAGCAGTTTTCCTCTACCTTCCTGTTGGCAATTCACAAA
AAAAACATTTGAATAGTGTCAGTGTTGAGCATCATGAAAGAACCTGAGCTTATGTTTGAT
CAGGTATATAAGACCCTCTTTTGGTGATGCTCCTGCAGGAAAGAAGTATCTGCCCAGATA
TTATTCTACTTCATCATTGAGGATTTCGTTTTCTATTGGGGCCATCGGATCTTGCATTCT
AAATGGTTGTACAAGAACGTCCACAGTGTGCATCATGAATATGCCACACCATTTGGTTTG
ACATCAGAATACGCTCACCCCGCTGAGATTCTATTCCTGGGATTTGCTGC*ATAGTCGGT
CCAGCCCTCACCGGCCCTCACCTGATTACTCTCTGGTTATGGATGGTTCTGAGAGTGCTT
GAGACAGTTGAGGCTCATTGTGGTTATCATTTCCCATGGAGCCTCTCAAATTTTCTTCCA
CTCTATGGAGGTGCTGACTTCCATGACTACCATCACCGCCTCCTCTACACAAAGTCTGGA
AACTACTCTTCAACTTTTGTGTATATGGACTGGATCTTTGGTACCGATAAGGGCTACAGA
AGATTGAAGTCTCTTAAAGAAACCAGTGAATTGAAACAAACGTGAAATCACCAGTTTGGA
TTGCAGAGAACATAATGCAGATTTTGCATCTTTGTGGAGGTCTTTTATTCTGTAACCTCG
TCTTCTATTCTATTTTGTTTTCCACGTAGCTGCAGCTGTTCTATGTCTTGGTTTATTATG
TGTGTCTAGAATTGCTACAAATGTGGGGGTCCTTGAAAATTAGCATGTGTTTGGGACCTT
TGGGTTGGGAAATTGAATCATTTGTATGAGTTACCTATTTGATTTGTTGCTTAGCTACAC
TTTTAGATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2H224TF U 1
AF RR2H224JQ C 464
AF RR2AJ73JQ C 558
AF RR2AJ73TF U 558
BS 1 642 RR2H224TF
BS 643 1210 RR2AJ73TF
BS 1211 1211 RR2AJ73JQ

RD RR2H224TF 642 0 0
GGATCTCTAGCTCTCATAGATCCATCCATCAATGGCTTCCCTCGTCGAATCTGGCTGGCA
GTACCTTTTGACGCATTTTAGCGACTTTCAACTGGCCTGCATTGGGAGTTTCCTCCTCCA
TGAAAGCGTTTTCTTCTTGTCTGGTCTCCCTTTCATTTTTTTAGAAAGGCAAGGCCTTCT
CACCAAGTTCAAAATTCAGGCAAAAAACAACACGCCTGCAGCACAAGGAAAATGTATCAC
TCGCCTCTTGCTTTATCATTTCTGCGTTAACTTGCCCCTCATGATGGCCTCCTATCCTGT
CTTCAGAGCCATGGGAATGCGAAGCAGTTTTCCTCTACCTTCCTGTTGGCAATTCACAAA
AAAAACATTTGAATAGTGTCAGTGTTGAGCATCATGAAAGAACCTGAGCTTATGTTTGAT
CAGGTATATAAGACCCTCTTTTGGTGATGCTCCTGCAGGAAAGAAGTATCTGCCCAGATA
TTATTCTACTTCATCATTGAGGATTTCGTTTTCTATTGGGGCCATCGGATCTTGCATTCT
AAATGGTTGTACAAGAACGTCCACAGTGTGCATCATGAATATGCCACACCATTTGGTTTG
ACATCAGAATACGCTCACCCCGCTGAGATTCTATTCCTGGGA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2H224JQ 748 0 0
AAGTATCTGCCCAGATATTATTCTACTTCATCATTGAGGATTTCGTTTTCTATTGGGGCC
ATCGGATCTTGCATTCTAAATGGTTGTACAAGAACGTCCACAGTGTGCATCATGAATATG
CCACACCATTTGGTTTGACATCAGAATACGCTCACCCCGCTGAGATTCTATTCCTGGGAT
TTGCTACCATAGTCGGTCCAGCCCTCACCGGCCCTCACCTGATTACTCTCTGGTTATGGA
TGGTTCTGAGAGTGCTTGAGACAGTTGAGGCTCATTGTGGTTATCATTTCCCATGGAGCC
TCTCAAATTTTCTTCCACTCTATGGAGGTGCTGACTTCCATGACTACCATCACCGCCTCC
TCTACACAAAGTCTGGAAACTACTCTTCAACTTTTGTGTATATGGACTGGATCTTTGGTA
CCGATAAGGGCTACAGAAGATTGAAGTCTCTTAAAGAAACCAGTGAATTGAAACAAACGT
GAAATCACCAGTTTGGATTGCAGAGAACATAATGCAGATTTTGCATCTTTGTGGAGGTCT
TTTATTCTGTAACCTCGTCTTCTATTCTATTTTGTTTTCCATGTAGCTGCAGCTGTTCTA
TGTCTTGGTTTATTATGTGTGTCTAGAATTGCTACAAATGTGGGGGTCCTTGAAAATTAG
CATGTGTTTGGGACCTTTGGGTTGGGAAATTGAATCATTTGTATGAGTTACCTATTTGAT
TTGTTGCTTAACTACACTTTTAGATGT
C

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2AJ73JQ 654 0 0
G
GTCCACAGTGTGCATCATGAATATGCCACACCATTTGGTTTGACATCAGAATACGCTCAC
CCCGCTGAGATTCTATTCCTGGGATTTGCTGC*ATAGTCGGTCCAGCCCTCACCGGCCCT
CACCTGATTACTCTCTGGTTATGGATGGTTCTGAGAGTGCTTGAGACAGTTGAGGCTCAT
TGTGGTTATCATTTCCCATGGAGCCTCTCAAATTTTCTTCCACTCTATGGAGGTGCTGAC
TTCCATGACTACCATCACCGCCTCCTCTACACAAAGTCTGGAAACTACTCTTCAACTTTT
GTGTATATGGACTGGATCTTTGGTACCGATAAGGGCTACAGAAGATTGAAGTCTCTTAAA
GAAACCAGTGAATTGAAACAAACGTGAAATCACCAGTTTGGATTGCAGAGAACATAATGC
AGATTTTGCATCTTTGTGGAGGTCTTTTATTCTGTAACCTCGTCTTCTATTCTATTTTGT
TTTCCACGTAGCTGCAGCTGTTCTATGTCTTGGTTTATTATGTGTGTCTAGAATTGCTAC
AAATGTGGGGGTCCTTGAAAATTAGCATGTGTTTGGGACCTTTGGGTTGGGAAATTGAAT
CATTTGTATGAGTTACCTATTTGATTTGTTGCTTAGCTACACTTTTAGATGTT

QA 2 654 2 654
DS 

RD RR2AJ73TF 654 0 0
G
GTCCACAGTGTGCATCATGAATATGCCACACCATTTGGTTTGACATCAGAATACGCTCAC
CCCGCTGAGATTCTATTCCTGGGATTTGCTGC*ATAGTCGGTCCAGCCCTCACCGGCCCT
CACCTGATTACTCTCTGGTTATGGATGGTTCTGAGAGTGCTTGAGACAGTTGAGGCTCAT
TGTGGTTATCATTTCCCATGGAGCCTCTCAAATTTTCTTCCACTCTATGGAGGTGCTGAC
TTCCATGACTACCATCACCGCCTCCTCTACACAAAGTCTGGAAACTACTCTTCAACTTTT
GTGTATATGGACTGGATCTTTGGTACCGATAAGGGCTACAGAAGATTGAAGTCTCTTAAA
GAAACCAGTGAATTGAAACAAACGTGAAATCACCAGTTTGGATTGCAGAGAACATAATGC
AGATTTTGCATCTTTGTGGAGGTCTTTTATTCTGTAACCTCGTCTTCTATTCTATTTTGT
TTTCCACGTAGCTGCAGCTGTTCTATGTCTTGGTTTATTATGTGTGTCTAGAATTGCTAC
AAATGTGGGGGTCCTTGAAAATTAGCATGTGTTTGGGACCTTTGGGTTGGGAAATTGAAT
CATTTGTATGAGTTACCTATTTGATTTGTTGCTTAGCTACACTTTTAGATGT
T

QA 2 653 2 653
DS 



AS 1 4

CO CL2126Contig1 733 4 31 U
TCAAAAAAACAGTATTTTCAAATGTTTAAAGATGATGTTTGGATTCTCATCAAATGCTTT
CAAGAATTTGCATGATCATAAGGTTTAAACTATTATCCATTGATCTTACCAAAAGGGTGG
GCCAAACCAAGAACAATTACAACAGACAACAATATATTTAACCAAGTAGCAACAAACTCA
ACCCAAAATGTAAAGACATGAATGATTATGAGAGCATCAAAAGCATGTTTACAAAGCTTT
TGTTTTAAACAATGTCTTCTTCTCTGTGGGTCTCAATGGTAACATCAGAAGTAGGATAAG
CCGCACAAGTGAGAACAAACCCTTCAGCAATCTGGTCATCATCGAGGAAACTCTGGTCAG
ACTGGTCAACAGAACCAGACACAACTTTACCTGCACAGCTCGAGCAAGAACCAGCACGGC
AAGAGTAAGGCAAGTCGATCCCGGCTTCCTCCGCAGCGTCGAGGACGTAAACGTCGTCGT
CGCACTCAACCTCTTGCTCACCTTCTGGAGTGACGAACTTGACCTTGTATGTAGCCATGG
CGGTGACGCGTCCGCCGCGTGCGGTGCCTGATTTGAGACCGAAGAGGGATTGAGTGTTGG
CTAAAGGGAGGGAACGGAGGCTGATAGGAGATGTCTGGCGGCGGAGGAAGGATGTTCCGA
CGATGGCGCTTGAGAGAGCTGTTGAGGCCATTTTTTGAGTTGGTTTCTTTGTGGCTTGTG
GAAATGGCGTCCC


BQ
10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2F862JQ U 2
AF RR2F862TF C 1
AF RR2DH69JQ U 80
AF RR2DH69TF C 80
BS 1 1 RR2F862TF
BS 2 117 RR2F862JQ
BS 118 118 RR2DH69JQ
BS 119 130 RR2F862JQ
BS 131 131 RR2DH69JQ
BS 132 133 RR2F862JQ
BS 134 134 RR2DH69JQ
BS 135 153 RR2F862JQ
BS 154 154 RR2DH69JQ
BS 155 211 RR2F862JQ
BS 212 212 RR2DH69JQ
BS 213 231 RR2F862JQ
BS 232 232 RR2DH69JQ
BS 233 233 RR2F862JQ
BS 234 234 RR2DH69JQ
BS 235 287 RR2F862JQ
BS 288 288 RR2DH69JQ
BS 289 312 RR2F862JQ
BS 313 313 RR2DH69JQ
BS 314 328 RR2F862JQ
BS 329 329 RR2DH69JQ
BS 330 359 RR2F862JQ
BS 360 360 RR2DH69JQ
BS 361 370 RR2F862JQ
BS 371 371 RR2DH69JQ
BS 372 377 RR2F862JQ
BS 378 378 RR2DH69JQ
BS 379 406 RR2F862JQ
BS 407 407 RR2DH69JQ
BS 408 457 RR2F862JQ
BS 458 733 RR2DH69JQ

RD RR2F862JQ 456 0 0
CAAAAAAACAGTATTTTCAAATGTTTAAAGATGATGTTTGGATTCTCATCAAATGCTTTC
AAGAATTTGCATGATCATAAGGTTTAAACTATTATCCATTGATCTTACCAAAAGGGGGGG
CCAAACCAAAAATAATTACAACAGACAACAATGTATTTAACCAAGTAGCAACAAACTCAA
CCCAAAATGTAAAGACATGAATGATTATGAAAGCATCAAAAGCATGTTTATAGAGCTTTT
GTTTTAAACAATGTCTTCTTCTCTGTGGGTCTCAATGGTAACATCAAAAGTAGGATAAGC
CGCACAAGTGAAAACAAACCCTTCAGCGATCTGGTCATCATCGAGGAAACTCTGGTCAAA
CTGGTCAACGGAACCAAACACAACTTTACCTGCACAGCTCGAGCAGGAACCAGCACGGCA
AGAGTAAGGCAAGTCGATCCCGGCTTCCTCCGCAGC

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR2F862TF 732 0 0
TCAAAGAAACAGTATTT*CAAATGTTTAAAGATGATGTTTGGATTCTCATCAAATGCTTT
CAAGAATTTGCATGATCATAAGGTTTAAACTATTATCCATTGATCTTACCAAAAGGGTGG
GCCAAACCAAGAATAATTACAACAGACAACAATGTATTTAACCAAGTAGCAACAAACTCA
ACCCAAAATGTAAAGACATGAATGATTATGAGAGCATCAAAAGCATGTTTATAGAGCTTT
TGTTTTAAACAATGTCTTCTTCTCTGTGGGTCTCAATGGTAACATCAGAAGTAGGATAAG
CCGCACAAGTGAGAACAAACCCTTCAGCGATCTGGTCATCATCGAGGAAACTCTGGTCAG
ACTGGTCAACGGAACCAGACACAACTTTACCTGCACAGCTCGAGCAGGAACCAGCACGGC
AAGAGTAAGGCAAGTCGATCCCGGCTTCCTCCGCAGCGTCGAGGACGTAAACGTCGTCGT
CGCACTCAACCTCTTGCTCACCTTCTGGAGTGACGAACTTGACCTTGTATGTAGCCATGG
CGGTGACGCGTCCGCCGCGTGCGGTGCCTGATTTGAGACCGAAGAGGGATTGAGTGTTGA
CTAAGGGGAGGGAACGGAGGCTGATAGGAGATGTCTGGCGGCGGAGGAAGGATGTTCCGA
CGATGGCGCTTGAGAGAGCTGTTGAGGCCATTTTTTGAGTTGGTTTCTTTGTGGCTTGTG
GAAATGGCGTCC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2DH69JQ 654 0 0
GAA
GTTTAAACTGTTATCCATTGATCTTACCAAAAGGGTGGGCCAAACCAAGAACAATTACAA
GGGACAACAATATATTTTACCAAGTAGCAACAAACTCAACCCAAAATGTAAAGACATGAA
TGATTATGAGAGCATCAAAAGCATGTTTACGAAGCTTTTGTTTTAAACAATGTCTTCTTC
TCTGTGGGTCTCAATGGTAACATCAGAAGTAGGATAAGCCGCACAAGTGAGAACAAACCC
TTCAGCAATCTGGTCATCATCGAGGAAACTCTGGTCAGACTGGTCAACAGATCCAGACAC
AACTTTACCTGCACAGCTCGAGCAAGAACCAGCACGGCAAGAGTAAGGCAAGTCGATCCC
GGCTTCCTCCGCAGCGTCGAGGACGTAAACGTCGTCGTCGCACTCAACCTCTTGCTCACC
TTCTGGAGTGACGAACTTGACCTTGTATGTAGCCATGGCGGTGACGCGTCCGCCGCGTGC
GGTGCCTGATTTGAGACCGAAGAGGGATTGAGTGTTGGCTAAAGGGAGGGAACGGAGGCT
GATAGGAGATGTCTGGCGGCGGAGGAAGGATGTTCCGACGATGGCGCTTGAGAGAGCTGT
TGAGGCCATTTTTTGAGTTGGTTTCTTTGTGGCTTGTGGAAATGGCGTCCC

QA 4 654 4 654
DS 

RD RR2DH69TF 654 0 0
GAA
GTTTAAACTGTTATCCATTGATCTTACCAAAAGGGTGGGCCAAACCAAGAACAATTACAA
GGGACAACAATATATTTTACCAAGTAGCAACAAACTCAACCCAAAATGTAAAGACATGAA
TGATTATGAGAGCATCAAAAGCATGTTTACGAAGCTTTTGTTTTAAACAATGTCTTCTTC
TCTGTGGGTCTCAATGGTAACATCAGAAGTAGGATAAGCCGCACAAGTGAGAACAAACCC
TTCAGCAATCTGGTCATCATCGAGGAAACTCTGGTCAGACTGGTCAACAGATCCAGACAC
AACTTTACCTGCACAGCTCGAGCAAGAACCAGCACGGCAAGAGTAAGGCAAGTCGATCCC
GGCTTCCTCCGCAGCGTCGAGGACGTAAACGTCGTCGTCGCACTCAACCTCTTGCTCACC
TTCTGGAGTGACGAACTTGACCTTGTATGTAGCCATGGCGGTGACGCGTCCGCCGCGTGC
GGTGCCTGATTTGAGACCGAAGAGGGATTGAGTGTTGGCTAAAGGGAGGGAACGGAGGCT
GATAGGAGATGTCTGGCGGCGGAGGAAGGATGTTCCGACGATGGCGCTTGAGAGAGCTGT
TGAGGCCATTTTTTGAGTTGGTTTCTTTGTGGCTTGTGGAAATGGCGTCC
C

QA 4 653 4 653
DS 



AS 1 4

CO CL2127Contig1 842 4 18 U
CGATGAAACTGTTTATACATTTAATACTCGAAACTCTCTCATTACAAGAGGCCTTAACCA
CTGTGGCTTTTCTTGCAGTAAGGTTCTGGAAAGCCATCAGATTCCTTTAACAAAAGCTTC
ACATTGCATAAAAACTTATTAATCTTTACATGGAAGCCTCTGTAAAATTACAAGAATTAA
AACTGTCACCCTTTAGAGAGGACAATCAAAGTTCATCTCTAGAGTTACTAGGCGATGAAG
TTTTCAAGTCAAGAAGATATCTTGTGGCCATGGAAGCATGAAGAGAAGCACCATAAGGTA
GCACTTCTTCATTGACCTCAAAATAAGGCGAGTGAGGGCTCGCCATCGGTGAATGAGCTT
CGTTCTGCATTCCCACAAAGCTAAAATGTCCAGGCATTGATTCTTGGTAGAAAGAGAAAT
CCTCTGATCCCATCAACGGCTGCATCTCCAAGTAGTTATTGGTCCCTAACATATCACCTG
AAACGTTCTTGAAAAACAAGTGCAAGCCTTTGTCGTTAACGGTAGGTGGGAAGAAAGGTT
TCTGCTCTTGAAGGAAATCAACTGTTGCATTGCACATATGCACACTCGCTTGCCTTGTAA
TAACCTGTTCAATTCTTTTCTTGAGTTGCGTAAAGCTTTTAGCTGAAAAGGCTCTGAATG
TACCACCGATGGTAACAGAGTCTGGAATCACATTAAAAGCACCACCACCTTCAAACTTAG
CAACTGTAACTACCTGCGAGTCTAAAGGATCTGCTTCTCGTGAAACGAGGTGTTGTAAGC
TAATGATAATGTTTGAAGCTGCCAGAATCGGATCTATGGCGTGCTGAGGAAGAGCTGCGT
GA


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2A669JQ U 1
AF RR2DS53JQ U 105
AF RR2BZ84JQ U 2
AF RR2BB21JQ U 2
BS 1 88 RR2A669JQ
BS 89 89 RR2BB21JQ
BS 90 107 RR2A669JQ
BS 108 108 RR2BB21JQ
BS 109 204 RR2A669JQ
BS 205 205 RR2BB21JQ
BS 206 319 RR2A669JQ
BS 320 320 RR2BB21JQ
BS 321 346 RR2A669JQ
BS 347 347 RR2BB21JQ
BS 348 417 RR2A669JQ
BS 418 418 RR2BB21JQ
BS 419 457 RR2A669JQ
BS 458 458 RR2BB21JQ
BS 459 498 RR2A669JQ
BS 499 499 RR2BB21JQ
BS 500 721 RR2A669JQ
BS 722 842 RR2BB21JQ

RD RR2A669JQ 721 0 0
CGATGAAACTGTTTATACATTTAATACTCGAAACTCTCTCATTACAAGAGGCCTTAACCA
CTGTGGCTTTTCTTGCAGTAAGGTTCTGCAAAGCCATCAGATTCCTT*AACAAAAGCTTC
ACATTGCATAAAAACTTATTAATCTTTACATGGAAGCCTCTGTAAAATTACAAGAATTAA
AACTGTCACCCTTTAGAGAGGACA*TCAAAGTTCATCTCTAGAGTTACTAGGCGATGAAG
TTTTCAAGTCAAGAAGATATCTTGTGGCCATGGAAGCATGAAGAGAAGCACCATAAGGTA
GCACTTCTTCATTGACCTCGAAATAAGGCGAGTGAGGGCTCGCCATTGGTGAATGAGCTT
CGTTCTGCATTCCCACAAAGCTAAAATGTCCAGGCATTGATTCTTGGTAGAAAGAGAGAT
CCTCTGATCCCATCAACGGCTGCATCTCCAAGTAGTTCTTGGTCCCTAACATATCACCTG
AAACGTTCTTGAAAAACATGTGCAAGCCTTTGTCGTTAACGGTAGGTGGGAAGAAAGGTT
TCTGCTCTTGAAGGAAATCAACTGTTGCATTGCACATATGCACACTCGCTTGCCTTGTAA
TAACCTGTTCAATTCTTTTCTTGAGTTGCGTAAAGCTTTTAGCTGAAAAGGCTCTGAATG
TACCACCGATGGTAACAGAGTCTGGAATCACATTAAAAGCACCACCACCTTCAAACTTAG
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2DS53JQ 647 0 0
CC
TTAACAAAAGCTTCACATTGCATAAAAACTTATTAATCTTTACATGGAAGCCTCTGTAAA
ATTACAAGAATTAAAACTGTCACCCTTTAGAGAGGACA*TCAAAGTTCATCTCTAGAGTT
ACTAGGCGATGAAGTTTTCAAGTCAAGAAGATATCTTGTGGCCATGGAAGCATGAAGAGA
AGCACCATAAGGTAGCACTTCTTCATTGACCTCGAAATAAGGCGAGTGAGGGCTCGCCAT
TGGTGAATGAGCTTCGTTCTGCATTCCCACAAAGCTAAAATGTCCAGGCATTGATTCTTG
GTAGAAAGAGAAATCCTCTGATCCCATCAACGGCTGCATCTCCAAGTAGTTCTTGGTCCC
TAACATATCACCTGAAACGTTCTTGAAAAACATGTGCAAGCCTTTGTCGTTAACGGTAGG
TGGGAAGAAAGGTTTCTGCTCTTGAAGGAAATCAACTGTTGCATTGCACATATGCACACT
CGCTTGCCTTGTAATAACCTGTTCAATTCTTTTCTTGAGTTGCGTAAAGCTTTTAGCTGA
AAAGGCTCTGAATGTACCACCGATGGTAACAGAGTCTGGAATCACATTAAAAGCACCACC
ACCTTCAAACTTAGCAACTGTAACTACCTGCGAGTCTAAAGGATC

QA 3 647 3 647
DS 

RD RR2BZ84JQ 801 0 0
GG
TGAAACTGTTTATACATTTAATACTCGAAACTCTCTCATTACAAGAGGCCTTAACCACTG
TGGCTTTTCTTGCAGTAAGGTTCTGGAAAGCCATCAGATTCCTTTAACAAAAGCTTCACA
TTGCATAAAAACTTATTGATCTTTACATGGAAGCCTCTGTAAAATTACAAGAATTAAAAC
TGTTACCCTTTT*AGAGGACAATCAAAGTTCATCTCTAGAGTTACTAGGCGATGAGGTTT
TCAAGTCAAGAAGATATCTTGTGGCCATGGAAGCATGAAGGGAAGCACCATAAGGTAGCA
CTTCTTCATTGACCTCAAAATAAGGCGAGTGAGGGCTCGCCATCGGTGAATGAGCTTCGT
TCTGCATTCCCACAAAGCTAAAATGTCCAGGCATTGATTCTTGGTAGAAAGAGAAATCCT
CTGATCCCATCAACGGCTGCATCTCCAAGTAGTTATTGGTCCCTAACATATCACCTGAAA
CGTTCTTGAAAAACAAGTGCAAGCCTTTGTCGTTAACGGTAGGTGGGAAGAAAGGTTTCT
GCTCTTGAAGGAAATCAACTGTTGCATTGCACATATGCACACTCGCTTGCCTTGTAATAA
CCTGTTCAATTCTTTTCTTGAGTTGCGTAAAGCTTTTAGCTGAAAAGGCTCTGAATGTAC
CACCGATGGTAACAGAGTCTGGAGTCACATTAAAAGCACCACCACCTTCAAACTTAGCAA
CTGTAACTACCTGCGAGTCTAAAGGATCTGCTTCTCGTGAAACGAGGTGTTGTAAGCTAA
TGATAATGTTTGAAGCTGC

QA 3 801 3 801
DS 

RD RR2BB21JQ 841 0 0
GG
TGAAACTGTTTATACATTTAATACTCGAAACTCTCTCATTACAAGAGGCCTTAACCACTG
TGGCTTTTCTTGCAGTAAGGTTCTGGAAAGCCATCAGATTCCTTTAACAAAAGCTTCACA
TTGCATAAAAACTTATTGATCTTTACATGGAAGCCTCTGTAAAATTACAAGAATTAAAAC
TGTTACCCTTTT*AGAGGACAATCAAAGTTCATCTCTAGAGTTACTAGGCGATGAGGTTT
TCAAGTCAAGAAGATATCTTGTGGCCATGGAAGCATGAAGGGAAGCACCATAAGGTAGCA
CTTCTTCATTGACCTCAAAATAAGGCGAGTGAGGGCTCGCCATCGGTGAATGAGCTTCGT
TCTGCATTCCCACAAAGCTAAAATGTCCAGGCATTGATTCTTGGTAGAAAGAGAAATCCT
CTGATCCCATCAACGGCTGCATCTCCAAGTAGTTATTGGTCCCTAACATATCACCTGAAA
CGTTCTTGAAAAACAAGTGCAAGCCTTTGTCGTTAACGGTAGGTGGGAAGAAAGGTTTCT
GCTCTTGAAGGAAATCAACTGTTGCATTGCACATATGCACACTCGCTTGCCTTGTAATAA
CCTGTTCAATTCTTTTCTTGAGTTGCGTAAAGCTTTTAGCTGAAAAGGCTCTGAATGTAC
CACCGATGGTAACAGAGTCTGGAATCACATTAAAAGCACCACCACCTTCAAACTTAGCAA
CTGTAACTACCTGCGAGTCTAAAGGATCTGCTTCTCGTGAAACGAGGTGTTGTAAGCTAA
TGATAATGTTTGAAGCTGCCAGAATCGGATCTATGGCGTGCTGAGGAAGAGCTGCGTGA

QA 3 841 3 841
DS 



AS 1 3

CO CL2128Contig1 939 3 26 U
GGACGTCACTCTTTCGATAATGCTCTCTCTCGTCGCCTCTCCTCCGGTAATCTCCGCCGC
TTCTCTCTCTAAACCTCTCCGTTCTCTCTCCAAATCCGCGCTCCCTCTCTCCAGAAGAGC
CAGACCCATTCCACCTTTCCCCAAAACCGCACGCTCCATCACCGTCTATAAATCTCCGAT
GAACAGCCTCTTCAACAGACTCGGATTCGGGTCTCGTCCCCAACCCGACCCGGCTTCCGC
CGCAATCGCGCAAGGACCCGACGACGATGTCCCGTCGCAAGGTCAGCAGTTCGCGCAATT
CGGCGCCGGCTGCTTCTGGGGAGCGGAGTTGGCTTACCAGAGGGTCCCCGGCGTGACGAA
GACGGAGGTCGGGTATAGCCAGGGGTTCGTCGACGGTCCGAGCTACGATGACGTCTGCTC
GGAGACGACGGGGCATAACGAGATCGTTCGGGTTCAGTTCGATCCGAAAGAGGTCAGCTT
TGAGAGCTTGCTTGATGTCTTCTGGAAGCGTCATGATCCGACCACGTTGAATCGCCAGGG
GAATGATGTGGGGACGAGGTATAGATCAGGTATATACGTCTACACAGACGAGCAAGAGAA
GTTAGCTCGTGAATCTATGGAGAATCAGCAGAAGGTCTTGAACGGGAAGATTGTGACCGA
GATACTTCCCGCCACGAAATTCTACAGAGCGGAAAGTTACCACCAGCAGTACTTGGCAAA
AGGTGGTCGCATGGGTTTCAGACAATCTGCTGAGAAAGGTTGCAACGACCCTATCCGATG
CTATGGCTAAAAATGTAGTCAGTCTCTCGAGCACATAAAAACTGTATTATCATCCCATGA
GCTAATATTACATTGTGCGTCTTGCCTTGGTCATGTGGTACTTGTAATAAAGAGAAATGA
TTGATGCATCATATGGAGTGTAAAATACGTCACCACCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C117TF U 1
AF RR2A258TF U 21
AF RR2A258JQ C 325
BS 1 130 RR2C117TF
BS 131 131 RR2A258TF
BS 132 132 RR2C117TF
BS 133 133 RR2A258TF
BS 134 149 RR2C117TF
BS 150 151 RR2A258TF
BS 152 198 RR2C117TF
BS 199 199 RR2A258TF
BS 200 277 RR2C117TF
BS 278 279 RR2A258TF
BS 280 309 RR2C117TF
BS 310 310 RR2A258TF
BS 311 377 RR2C117TF
BS 378 378 RR2A258TF
BS 379 492 RR2C117TF
BS 493 493 RR2A258TF
BS 494 561 RR2C117TF
BS 562 562 RR2A258TF
BS 563 570 RR2C117TF
BS 571 571 RR2A258TF
BS 572 643 RR2C117TF
BS 644 644 RR2A258TF
BS 645 657 RR2C117TF
BS 658 658 RR2A258TF
BS 659 712 RR2C117TF
BS 713 939 RR2A258JQ

RD RR2C117TF 714 0 0
GGACGTCACTCTTTCGATAATGCTCTCTCTCGTCGCCTCTCCTCCGGTAATCTCCGCCGC
TTCTCTCTCTAAACCTCTCCGTTCTCTCTCCAAATCCGCGCTCCCTCTCTCCAGAAGAGC
CAGACCCATTTCCCCTTTCCCCAAAACCGTTCGCTCCATCACCGTCTATAAATCTCCGAT
GAACAGCCTCTTCAACAGGCTCGGATTCGGGTCTCGTCCCCAACCCGACCCGGCTTCCGC
CGCAATCGCGCAAGGACCCGACGACGATGTCCCGTCGTCAGGTCAGCAGTTCGCGCAATT
CGGCGCCGGTTGCTTCTGGGGAGCGGAGTTGGCTTACCAGAGGGTCCCCGGCGTGACGAA
GACGGAGGTCGGGTATATCCAGGGGTTCGTCGACGGTCCGAGCTACGATGACGTCTGCTC
GGAGACGACGGGGCATAACGAGATCGTTCGGGTTCAGTTCGATCCGAAAGAGGTCAGCTT
TGAGAGCTTGCTAGATGTCTTCTGGAAGCGTCATGATCCGACCACGTTGAATCGCCAGGG
GAATGATGTGGGGACGAGGTACAGATCAGGCATATACGTCTACACAGACGAGCAAGAGAA
GTTAGCTCGTGAATCTATGGAGAATCAGCAGAAGGTCTTGAACAGGAAGATTGTGACTGA
GATACTTCCCGCCACGAAATTCTACAGAGCGGAAAGTTACCACCAGCAGTAC
TG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2A258TF 695 0 0
G
GCTCTCTCTCGTCGCCTCTCCTCCGGTAATCTCCGCCGCTTCTCTCTCTAAACCTCTCCG
TTCTCTCTCCAAATCCGCGCTCCCTCTCTCCAGAAGAGCCAGACCCATTCTACCTTTCCC
CAACACCGCACGCTCCATCTCCGTCTATAAATCTCCGATGAACAGCCTCTTCAACAGACT
CGGATTCGGGTCTCGTCCCCAACCCGACCCGGCTTCCGCCGCAATCGCGCAAGGACCCGA
CGACGATGTCCCGTCTCAAGGTCAGCAGTTCGCGCAATTCGGCGCCGGCTGCTTCTGGGG
AGCGGAGTTGGCTTACCAGAGGGTCCCCGGCGTGACGAAGACGGAGGTCGGGTATAGCCA
GGGGTTCGTCGACGGTCCGAGCTACGATGACGTCTGCTCGGAGACGACGGGGCATAACGA
GATCGTTCGGGTTCAGTTCGATCCGAAAGAGGTCAGCTTTGAGAGCTTGCTTGATGTCTT
CTGGAAGCGTCATGATCCGACCACGTTGAATCGCCAGGGGAATGATGTGGGGACGAGGTA
TAGATCAGGTATATACGTCTACACAGACGAGCAAGAGAAGTTAGCTCGTGAATCTATGGA
GAATCAGCAGAAGGTCTTGAACGGGAAGATTGTGACCGAGATACTTCCCGCCACGAAATT
CTACAGAGCGGAAAGTTACCACCAGCAGTAC
TTG

QA 2 692 2 692
DS 

RD RR2A258JQ 615 0 0
GGAGTTGGCTTACCAGAGGGTCCCCGGCGTGACGAAGACGGAGGTCGGGTATAGCCAGGG
GTTCGTCGACGGTCCGAGCTACGATGACGTCTGCTCGGAGACGACGGGGCATAAGGAGAT
CGTTCGGGTTCAGTTCGATCCGAAAGAGGTCAGCTTTGAGAGCTTGCTTGATGTCTTCTG
GAAGCGTCATGATCCGACCACGTTGAATCGCCAGGGGAATGATGTGGGGACGAGGTATAG
ATCAGGTATATACGTCTACACAGACGAGCAAGAGAAGTTAGCTCGTGAATCTATGGAGAA
TCAGCAGAAGGTCTTGAACGGGAAGATTGTGACCGAGATACTTCCCGCCACGAAATTCTA
CAGAGCGGAAAGTTACCACCAGCAGTACTTGGCAAAAGGTGGTCGCATGGGTTTCAGACA
ATCTGCTGAGAAAGGTTGCAACGACCCTATCCGATGCTATGGCTAAAAATGTAGTCAGTC
TCTCGAGCACATAAAAACTGTATTATCATCCCATGAGCTAATATTACATTGTGCGTCTTG
CCTTGGTCATGTGGTACTTGTAATAAAGAGAAATGATTGATGCATCATATGGAGTGTAAA
ATACGTCACCACCAC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 4

CO CL2129Contig1 883 4 4 U
TTTTTCTCCGCCGTTTGTCCATCTCTTTACCTTATCTCCATCTCTGAGTAGCATCCAAGG
TCTTCAAGTGCTCAAAACGAGATGAGAGAGAGCAACGGTTTTCCACAAGTCCTTGAAGTT
GCTCCGTTGAACAGTTTGCCTTACGTCGGTCCATTAAATGGTAATTCATCAATGTCTGGT
AACAAGGCCACCAACGAGACTGCAGAGAAAACAGGACCTCCAGCAATGATATTTCTACCT
TCTGAATCAACTCCAGAGCTTTATACCCTAATCTCTCAATCAAAAACCGGAGTTGCCCTC
ACGGGAAGTGCAGCCATGGGGAAGGTCGGACCAACTATTGGTTTGGTTGATATTGCTGAA
TCCGATGACTCTTACTATTTTCGTGTTTCACTCCCTGGTGTTTCAAGAGATGAAAAGGAG
TTCAGCTGCGAAATCGAACCAGACGGCAAGATTCTGATCAAAGGAGTAACAACCACGGGA
GAGAAGACAGTGTGCAAACACAATCAGGTGTTCAAGATGCTGTCACAAAACTTATGCCCC
CCAGGCCACTTCACCATCTCTTTCCAGCTTCCCGGTCCTGTCAGCAACGAAGATTTCAGC
GGTAATTTTGGTGCAGATGGTGTTCTTGAGGGAGTTGTGAAGAAGCTCTACTACGAAGAC
TGAACAACATCCAGATATTGCTATTAGGAAGATGGTTCATTAGTGTATGCCTGACTGATT
CTGGACCCCAGGTCTTAGAATTTGTGCCTAAAAGGTCATTTTACTCTTCAGTGTGTGTTG
AATCGTTGTCTAGAGATAAATATTTGTTAGTACGCCTGCTTCTCTACAAACAACTCTTTA
AGACTTTTCGTGTTCAAGTGTTTTCATTTAAGTGGTTTGGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FT91TF U 8
AF RR2CB74TF U 1
AF RR2CB74JQ C 140
AF RR2FT91JQ C 145
BS 1 180 RR2CB74TF
BS 181 181 RR2FT91TF
BS 182 728 RR2CB74TF
BS 729 883 RR2CB74JQ

RD RR2FT91TF 652 0 0
GG
GCCGTTTGTCCATCTCTTTACCTTATCTCCATCTCTGAGTAGCATCCAAGGTCTTCAAGT
GCTCAAAACGAGATGAGAGAGAGCAACGGTTTTCCACAAGTCCTTGAAGTTGCTCCGTTG
AACAGTTTGCCTTACGTCGGTCCATTAAATGGTAATTCATCAATGTCTGGTAACAAGGCC
ACCAACGAGACTGCAGAGAAAACAGGACCTCCAGCAATGATATTTCTACCTTCTGAATCA
ACTCCAGAGCTTTATACCCTAATCTCTCAATCAAAAACCGGAGTTGCCCTCACGGGAAGT
GCAGCCATGGGGAAGGTCGGACCAACTATTGGTTTGGTTGATATTGCTGTATCCGATGAC
TCTTACTATTTTCGTGTTTCACTCCCTGGTGTTTCAAGAGATGAAAAGGAGTTCAGCTGC
GAAATCGAACCAGACGGCAAGATTCTGATCAAAGGAGTAACAACCACGGGAGAGAAGACA
GTGTGCAAACACAATCAGGTGTTCAAGATGCTGTCACAAAACTTATGCTCTCCAGGCCAC
TTCACCATCTCTTTCCAGCTTCCCGGTCCTGTCAGCAACGAAGATTTCAGCGGTAATTTT
GGTGCAGATGGTGTTCTTGAGGGAGTTGTGAAGAAGCTCTACTACGAAGA

QA 3 652 3 652
DS 

RD RR2CB74TF 729 0 0
TTTTTCTCCGCCGTTTGTCCATCTCTTTACCTTATCTCCATCTCTGAGTAGCATCCAAGG
TCTTCAAGTGCTCAAAACGAGATGAGAGAGAGCAACGGTTTTCCACAAGTCCTTGAAGTT
GCTCCGTTGAACAGTTTGCCTTACGTCGGTCCATTAAATGGTAATTCATCAATGTCTGGT
GACAAGGCCACCAACGAGACTGCAGAGAAAACAGGACCTCCAGCAATGATATTTCTACCT
TCTGAATCAACTCCAGAGCTTTATACCCTAATCTCTCAATCAAAAACCGGAGTTGCCCTC
ACGGGAAGTGCAGCCATGGGGAAGGTCGGACCAACTATTGGTTTGGTTGATATTGCTGAA
TCCGATGACTCTTACTATTTTCGTGTTTCACTCCCTGGTGTTTCAAGAGATGAAAAGGAG
TTCAGCTGCGAAATCGAACCAGACGGCAAGATTCTGATCAAAGGAGTAACAACCACGGGA
GAGAAGACAGTGTGCAAACACAATCAGGTGTTCAAGATGCTGTCACAAAACTTATGCCCC
CCAGGCCACTTCACCATCTCTTTCCAGCTTCCCGGTCCTGTCAGCAACGAAGATTTCAGC
GGTAATTTTGGTGCAGATGGTGTTCTTGAGGGAGTTGTGAAGAAGCTCTACTACGAAGAC
TGAACAACATCCAGATATTGCTATTAGGAAGATGGTTCATTAGTGTATGCCTGACTGATT
CTGGACCC
A

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2CB74JQ 744 0 0
CTTAC
GTCGGTCCATTAAATGGTAATTCATCAATGTCTGGTGACAAGGCCACCAACGAGACTGCA
GAGAAAACAGGACCTCCAGCAATGATATTTCTACCTTCTGAATCAACTCCAGAGCTTTAT
ACCCTAATCTCTCAATCAAAAACCGGAGTTGCCCTCACGGGAAGTGCAGCCATGGGGAAG
GTCGGACCAACTATTGGTTTGGTTGATATTGCTGAATCCGATGACTCTTACTATTTTCGT
GTTTCACTCCCTGGTGTTTCAAGAGATGAAAAGGAGTTCAGCTGCGAAATCGAACCAGAC
GGCAAGATTCTGATCAAAGGAGTAACAACCACGGGAGAGAAGACAGTGTGCAAACACAAT
CAGGTGTTCAAGATGCTGTCACAAAACTTATGCCCCCCAGGCCACTTCACCATCTCTTTC
CAGCTTCCCGGTCCTGTCAGCAACGAAGATTTCAGCGGTAATTTTGGTGCAGATGGTGTT
CTTGAGGGAGTTGTGAAGAAGCTCTACTACGAAGACTGAACAACATCCAGATATTGCTAT
TAGGAAGATGGTTCATTAGTGTATGCCTGACTGATTCTGGACCCCAGGTCTTAGAATTTG
TGCCTAAAAGGTCATTTTACTCTTCAGTGTGTGTTGAATCGTTGTCTAGAGATAAATATT
TGTTAGTACGCCTGCTTCTCTACAAACAACTCTTTAAGACTTTTCGTGTTCAAGTGTTTT
CATTTAAGTGGTTTGGTTG

QA 6 744 6 744
DS 

RD RR2FT91JQ 739 0 0
GTCGGTCCATTAAATGGTAATTCATCAATGTCTGGTAACAAGGCCACCAACGAGACTGCA
GAGAAAACAGGACCTCCAGCAATGATATTTCTACCTTCTGAATCAACTCCAGAGCTTTAT
ACCCTAATCTCTCAATCAAAAACCGGAGTTGCCCTCACGGGAAGTGCAGCCATGGGGAAG
GTCGGACCAACTATTGGTTTGGTTGATATTGCTGTATCCGATGACTCTTACTATTTTCGT
GTTTCACTCCCTGGTGTTTCAAGAGATGAAAAGGAGTTCAGCTGCGAAATCGAACCAGAC
GGCAAGATTCTGATCAAAGGAGTAACAACCACGGGAGAGAAGACAGTGTGCAAACACAAT
CAGGTGTTCAAGATGCTGTCACAAAACTTATGCTCTCCAGGCCACTTCACCATCTCTTTC
CAGCTTCCCGGTCCTGTCAGCAACGAAGATTTCAGCGGTAATTTTGGTGCAGATGGTGTT
CTTGAGGGAGTTGTGAAGAAGCTCTACTACGAAGACTGAACAACATCCAGATATTGCTAT
TAGGAAGATGGTTCATTGGTGTATGCCTGACTGATTCTGGACCCCAGGTCTTAGAATTTG
TGCCTAAAAGGTCATTTTACTCTTCAGTGTGTGTTGAATCGTTGTCTAGAGATAAATATT
TGTTAGTACGCCTGCTTCTCTACAAACAACTCTTTAAGACTTTTCGTGTTCAAGTGTTTT
CATTTAAGTGGTTTGGTTG

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 4

CO CL2130Contig1 777 4 6 U
GGGACTTCTCTTCGTGTGCGTTTAGAGCATTGCAGAGATCATCACTGCTTGAAGGAGGCG
GTTTCTTCTTCTTCTCACGCATCTCATCTCCGCTAATCAAAATGTCTCTGGTCGCGAATG
AGGAGTTTCAGCACATTCTCCGTGCGCTTAACACAAATGTCGATGGAAAGCAGAAGATCA
TGTTCGCCCTTACCTCAATCAAGGGTATTGGCAGGCGTTTGGCTAACATCGTCTGCAAGA
AAGCAGATGTCGACATGAACAAGAGGGCTGGTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACC
TGATGACCATTGTTGCAAACCCGAAGCAGTACAAGATCCCAGATTGGTTCCTGAACAGGC
AGAAGGACTACAAGGACGGGAAGTACTCCCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGC
TCAGGGACGATCTCGAGCGTCTCAAGAAAATCAGAAACCACCGTGGGCTGAGACACTACT
GGGGTCTTCGTGTCCGTGGACAGCACACCAAGACAACTGGACGCAGAGGAAAGACTGTTG
GTGTCTCGAAGAAGCGTTAAGCAAGCCACCATGTTTCTGCTTTATCGGTTTTGATACATG
TTTCTGCTTTGAACTAGTTTATGTGACACTTTTGGATGTTCGAAATAGTTAGCGTGATAC
TTTTGGATCTTTGTGCTTTCTATCTCTCTTTTCCAGTGGTTACATCTGTTTCAACTTTAA
TTGTTTTGGAGTCTTTATCATGGCTTTGTCACCCTTCAACAGAGTTTTGAATTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO85TF U 8
AF RR2CG63TF U 1
AF RR2CG63JQ C 4
AF RR2DO85JQ C 96
BS 1 356 RR2CG63TF
BS 357 357 RR2DO85TF
BS 358 713 RR2CG63TF
BS 714 714 RR2CG63JQ
BS 715 753 RR2CG63TF
BS 754 777 RR2CG63JQ

RD RR2DO85TF 424 0 0
GACTCTTCATGTGT
TTAGAGCATTGCAGAGATCATCACTGCTTGAAGGAGGCGGCTTCTTCTTCTTCCCACGCA
TCTCATCTCCGCTAATCAAAATGTCTCTGGTCGCGAATGAGGAGTTTCAGCACATTCTCC
GTGTGCTTAACACAAATGTCGATGGAAAGCAGAAGATCATGTTCGCCCTTACCTCAATCA
AGGGTATTGGCAGGCGTTTGGCTAACATCGTCTGCAAGAAAGCAGATGTCGACATGAACA
AGAGGGCTGGTGAGTTGTCTGCAGCTGGGATCGACAACCTGATGACCATTGTTGCAAACC
CGAAGCAGTACAAGATCCCAGATTGGTTCCTGAACAGGCAGAAGGACTACAAGGACGGGA
AGTACTCCCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGACGAT

QA 15 424 15 424
DS 

RD RR2CG63TF 753 0 0
GGGACTTCTCTTCGTGTGCGTTTAGAGCATTGCAGAGATCATCACTGCTTGAAGGAGGCG
GTTTCTTCTTCTTCTCACGCATCTCATCTCCGCTAATCAAAATGTCTCTGGTCGCGAATG
AGGAGTTTCAGCACATTCTCCGTGCGCTTAACACAAATGTCGATGGAAAGCAGAAGATCA
TGTTCGCCCTTACCTCAATCAAGGGTATTGGCAGGCGTTTGGCTAACATCGTCTGCAAGA
AAGCAGATGTCGACATGAACAAGAGGGCTGGTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACC
TGATGACCATTGTTGCAAACCCGAAGCAGTACAAGATCCCAGATTGGTTCCTGAACCGGC
AGAAGGACTACAAGGACGGGAAGTACTCCCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGC
TCAGGGACGATCTCGAGCGTCTCAAGAAAATCAGAAACCACCGTGGGCTGAGACACTACT
GGGGTCTTCGTGTCCGTGGACAGCACACCAAGACAACTGGACGCAGAGGAAAGACTGTTG
GTGTCTCGAAGAAGCGTTAAGCAAGCCACCATGTTTCTGCTTTATCGGTTTTGATACATG
TTTCTGCTTTGAACTAGTTTATGTGACACTTTTGGATGTTCGAAATAGTTAGCGTGATAC
TTTTGGATCTTTGTGCTTTCTATCTCTCTTTTCCAGTGGTTACATCTGTTTCA*CTTTAA
TTGTTTTGGAGTCTTTATCATGGCTTTGTCACC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2CG63JQ 774 0 0
GACTTCTCTTCGTGTGCG
TTAGAGCATTGCAGAGATCATCACTGCTTGAAGGAGGCGGTTTCTTCTTCTTCTCACGCA
TCTCATCTCCGCTAATCAAAATGTCTCTGGTCGCGAATGAGGAGTTTCAGCACATTCTCC
GTGCGCTTAACACAAATGTCGATGGAAAGCAGAAGATCATGTTCGCCCTTACCTCAATCA
AGGGTATTGGCAGGCGTTTGGCTAACATCGTCTGCAAGAAAGCAGATGTCGACATGAACA
AGAGGGCTGGTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTGATGACCATTGTTGCAAACC
CGAAGCAGTACAAGATCCCAGATTGGTTCCTGAACCGGCAGAAGGACTACAAGGACGGGA
AGTACTCCCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGACGATCTCGAGCGTC
TCAAGAAAATCAGAAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTTCGTGTCCGTGGAC
AGCACACCAAGACAACTGGACGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCGAAGAAGCGTTAAG
CAAGCCACCATGTTTCTGCTTTATCGGTTTTGATACATGTTTCTGCTTTGAACTAGTTTA
TGTGACACTTTTGGATGTTCGAAATAGTTAGCGTGATACTTTTGGATCTTTGTGCTTTCT
ATCTCTCTTTTCCAGTGGTTACATCTGTTTCAACTTTAATTGTTTTGGAGTCTTTATCAT
GGCTTTGTCACCCTTCAACAGAGTTTTGAATTTGTT

QA 19 774 19 774
DS 

RD RR2DO85JQ 662 0 0
ATCAAAATGTCTCTGGTCGCGAATGAGGAGTTTCAGCACATTCTCCGTGTGCTTAACACA
AATGTCGATGGAAAGCAGAAGATCATGTTCGCCCTTACCTCAATCAAGGGTATTGGCAGG
CGTTTGGCTAACATCGTCTGCAAGAAAGCAGATGTCGACATGAACAAGAGGGCTGGTGAG
TTGTCTGCAGCTGGGATCGACAACCTGATGACCATTGTTGCAAACCCGAAGCAGTACAAG
ATCCCAGATTGGTTCCTGAACAGGCAGAAGGACTACAAGGACGGGAAGTACTCCCAAGTT
GTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGACGATCTCGAGCGTCTCAAGAAAATCAGA
AACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTTCGTGTCCGTGGACAGCACACCAAGACA
ACTGGGCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCGAAGAAGCGTTAAGCAAGCCACCATGTT
TCTGCTTTATCGGTTTTGATATATGTTTCTGCTTTGAACTAGTTTATGTGACACTTTTGG
ATGTTCGAAATAGTTAGCGTGATACTTTTGGATCTTTGTGCTTTCTATCTCTCTTTTCCA
GTGGTTACATCTGTTTCAACTTTAATTGTTTTGGAGTCTTTATCATGGCTTTGTCACC
CTCC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 4

CO CL2131Contig1 1111 4 5 U
ATCACTTTACTGTTTTTACTCGGTATTAGCCCAAAAACATTCTGTCTGAACAAAACATGA
ACCATTCCTTCTCCTTGTTTCCATCTCAAAGATACAAAATACATTCCCCAAGAAGTGTGG
TCTCCAAGATAAATAAGACATCTTTCACATGTAACATTTGTCAACAAAAACTAAAGAGAA
AACAGAACTCAACTCTAGGGCCTACAATATATATAATGAACTCATATATCTCAGATTCTC
TGATGAGATTGAAGAGGTAAAAAGAAGAAAACTCCTCTCTATGATCAACACAACGAGGTT
CAACTCCCACCTTTGGGTGAAGACGGTCATTTTGTTTCCGAACTGTGATTCTGCAGAGGA
GTTCCTGATGTGTTTCTAGTTTTCTTATACCAAAAGAACATGGACCAAAGTGCTCTAAAC
AACACCCCATTCGCAAAATGAGGAACAAACAAGCGCCCCCAATACGGATAGTACGGACCA
GGAAGCTTGATCAGAGTGAATAACATCATTACAGCTATCAAATGCCACGGTACTTCCGCT
TCCTTAAGACGAGGAGAGATGTTCAAAGCGGTTCCTTGTAGAATGCCTCCAACAACAACA
CCGATGAGTAACGGGAACGGGACTAAAGCAAGCTTCCTCTCATGTGCACAGTAAGACATC
TCGCTGACGGAGGAAACCGCCAAGATGGGAACGAACAAAAGCTTGACGACTGATATGGCG
AGATCGAGAACAAGCTGCACGAAGTTCTCGAAGGCTCTGTTCCAAGGGAAGTCCTTGACC
GGCTGTGGAGAATCGTTCCAAACATCATTTGCTTTCCTCAAAAGGGTGTCGAAAGTAAGC
CTGTTTGAATCCCCTGAATGATCAGATTCCATATGAATCGAGCGGCAGAGGAATAATCTC
TTTGATGCTTTGGCTTCATTTGCACCCTTGAAACTTTTACTGTTCTTAGAGTACAACTGG
GTCGGTGAGTGAGGTCGCGGAGCCAATGAAGAAGGTCGAGGCGAAGAAAGGAAGAGATGA
GACATGGCCATTTTTATATTTAAAGCCTGTTGCTTTGGTTTGCGTCTTTCTCACAGAGAG
ACCATTGAAGGAAGGAAGGAAGGTTCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW14JQ U 1
AF RR2CT14JQ U 35
AF RR2FW14TF C 332
AF RR2CT14TF C 367
BS 1 752 RR2FW14JQ
BS 753 753 RR2CT14JQ
BS 754 762 RR2FW14JQ
BS 763 1094 RR2FW14TF
BS 1095 1111 RR2CT14TF

RD RR2FW14JQ 762 0 0
ATCACTTTACTGTTTTTACTCGGTATTAGCCCAAAAACATTCTGTCTGAACAAAACATGA
ACCATTCCTTCTCCTTGTTTCCATCTCAAAGATACAAAATACATTCCCCAAGAAGTGTGG
TCTCCAAGATAAATAAGACATCTTTCACATGTAACATTTGTCAACAAAAACTAAAGAGAA
AACAGAACTCAACTCTAGGGCCTACAATATATATAATGAACTCATATATCTCAGATTCTC
TGATGAGATTGAAGAGGTAAAAAGAAGAAAACTCCTCTCTATGATCAACACAACGAGGTT
CAACTCCCACCTTTGGGTGAAGACGGTCATTTTGTTTCCGAACTGTGATTCTGCAGAGGA
GTTCCTGATGTGTTTCTAGTTTTCTTATACCAAAAGAACATGGACCAAAGTGCTCTAAAC
AACACCCCATTCGCAAAATGAGGAACAAACAAGCGCCCCCAATACGGATAGTACGGACCA
GGAAGCTTGATCAGAGTGAATAACATCATTACAGCTATCAAATGCCACGGTACTTCCGCT
TCCTTAAGACGAGGAGAGATGTTCAAAGCGGTTCCTTGTAGAATGCCTCCAACAACAACA
CCGATGAGTAACGGGAACGGGACTAAAGCAAGCTTCCTCTCATGTGCACAGTAAGACATC
TCGCTGACGGAGGAAACCGCCAAGATGGGAACGAACAAAAGCTTGACGACTGATATGGCG
AGATCGAGAACAAGCTGCACGAAGTTCTCGAAAGCTCTGTTC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2CT14JQ 728 0 0
CTGCT
TTCTGTCTGAACAAAACATGAACCATTCCTTCTCCTTGTTTCCATCTCAAAGATACAAAA
TACATTCCCCAAGAAGTGTGGTCTCCAAGATAACTAAGACATCTTTCACATGTAACATTT
GTCAACAAAAACTAAAGAGAAAACAGAACTCAACTCTAGGGCCTACAATATATATAATGA
ACTCATATATCTCAGATTCTCTGATGAGATTGAAGAGGTAAAAAGAAGAAAACTCCTCTC
TATGATCAACACAACGAGGTTCAACTCCCACCTTTGGGTGAAGACGGTCATTTTGTTTCC
GAACTGTGATTCTGCAGAGGAGTTCCTGATGTGTTTCTAGTTTTCTTATACCAAAAGAAC
ATGGACCAAAGTGCTCTAAACAACACCCCATTCGCAAAATGAGGAACAAACAAGCGCCCC
CAATACGGATAGTACGGACCAGGAAGCTTGATCAGAGTGAATAACATCATTACAGCTATC
AAATGCCACGGTACTTCCGCTTCCTTAAGACGAGGAGAGATGTTCAAAGCGGTTCCTTGT
AGAATGCCTCCAACAACAACACCGATGAGTAACGGGAACGGGACTAAAGCAAGCTTCCTC
TCATGTGCACAGTAAGACATCTCGCTGACGGAGGAAACCGCCAAGATGGGAACGAACAAA
AGCTTGACGACTGATATGGCGAGATCGAGAACAAGCTGCACGAAGTTCTCGAAGGCTCTG
TTC

QA 6 728 6 728
DS 

RD RR2FW14TF 765 0 0
TTT
TTTCCGAACTGTGATTCTGCAGAGGAGTTC*TGATGTGTTTCTAGTTTTCTTATACCAAA
AGAACATGGACCAAAGTGCTCTAA*CAACACCCCATTCGCAAAATGAGGAACAAACAAGC
GCCCCCAATACGGATAGTACGGACCAGGAAGCTTGATCAGAGTGAATAACATCATTACAG
CTATCAAATGCCACGGTACTTCCGCTTCCTTAAGACGAGGAGAGATGTTCAAAGCGGTTC
CTTGTAGAATGCCTCCAACAACAACACCGATGAGTAACGGGAACGGGACTAAAGCAAGCT
TCCTCTCATGTGCACAGTAAGACATCTCGCTGACGGAGGAAACCGCCAAGATGGGAACGA
ACAAAAGCTTGACGACTGATATGGCGAGATCGAGAACAAGCTGCACGAAGTTCTCGAAGG
CTCTGTTCCAAGGGAAGTCCTTGACCGGCTGTGGAGAATCGTTCCAAACATCATTTGCTT
TCCTCAAAAGGGTGTCGAAAGTAAGCCTGTTTGAATCCCCTGAATGATCAGATTCCATAT
GAATCGAGCGGCAGAGGAATAATCTCTTTGATGCTTTGGCTTCATTTGCACCCTTGAAAC
TTTTACTGTTCTTAGAGTACAACTGGGTCGGTGAGTGAGGTCGCGGAGCCAATGAAGAAG
GTCGAGGCGAAGAAAGGAAGAGATGAGACATGGCCATTTTTATATTTAAAGCCTGTTGCT
TTGGTTTGCGTCTTTCTCACAGAGAGACCATTGAAGGAAG
CC

QA 4 763 4 763
DS 

RD RR2CT14TF 745 0 0
GATGTGTTTCTAGTTTTCTTATACCAAAAGAACATGGACCAAAGTGCTCTAAACAACACC
CCATTCGCAAAATGAGGAACAAACAAGCGCCCCCAATACGGATAGTACGGACCAGGAAGC
TTGATCAGAGTGAATAACATCATTACAGCTATCAAATGCCACGGTACTTCCGCTTCCTTA
AGACGAGGAGAGATGTTCAAAGCGGTTCCTTGTAGAATGCCTCCAACAACAACACCGATG
AGTAACGGGAACGGGACTAAAGCAAGCTTCCTCTCATGTGCACAGTAAGACATCTCGCTG
ACGGAGGAAACCGCCAAGATGGGAACGAACAAAAGCTTGACGACTGATATGGCGAGATCG
AGAACAAGCTGCACGAAGTTCTCGAAGGCTCTGTTCCAAGGGAAGTCCTTGACCGGCTGT
GGAGAATCGTTCCAAACATCATTTGCTTTCCTCAAAAGGGTGTCGAAAGTAAGCCTGTTT
GAATCCCCTGAATGATCAGATTCCATATGAATCGAGCGGCAGAGGAATAATCTCTTTGAT
GCTTTGGCTTCATTTGCACCCTTGAAACTTTTACTGTTCTTAGAGTACAACTGGGTCGGT
GAGTGAGGTCGCGGAGCCAATGAAGAAGGTCGAGGCGAAGAAAGGAAGAGATGAGACATG
GCCATTTTTATATTTAAAGCCTGTTGCTTTGGTTTGCGTCTTTCTCACAGAGAGACCATT
GAAGGAAGGAAGGAAGGTTCTGTCC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 4

CO CL2132Contig1 796 4 3 U
GGGGGATAAAAAAATAATTACAGATCAAAGCAAAGTGAAATTGAAAGCTCTCTCTGACCA
TGTCGTGGATGAAAGGAGATTTACTTTCCAAAAGCAGGAGGCTTGTTGGCGGACTCGCTA
TGCGAGAGCCTGTTTGGCTTAAAGCCATGGAAGCATCACCTCCTCCTGTCTTTCCTCGCT
CTAATGGTAACCTCAAGAAGATTGTTCTCCCTGAAGATTCCTACGTTCGTCGATTCGCAC
GCAAGCATCCTGAAGCGAAACTCGTCGACCCCATCAAGGTTTCGGCGTTTATTCCTGATC
CAGCTCGGGTATATGGTTGTCGTGTCCTTGAACTGACCAAGAATGGCATCAGCGAGGATG
ACGCCATGTCTGTAGCTAATATGGAGTATCTTGCAGAGAGAAAGGAAAAGAAGAAAGCAT
ACAAACGCTTAAAGGAGCTTGCGGTACTGCAAGACAAGACTCCTCCACCTAAACCCTATC
TTAGTTCCAAAAGAGATATGCAAATCCAAGAGAAGAAAACTCCAACGGATCCTCCTAGCG
TCCGCAGGCTTGTTAACCAGTTGAAACAGCAGAAAGAGGTGTTGCTCCAGGATAAACCTG
GAGGAAGTGCTAATCAAGACCACTGGATCGATGAATAAAACTCTCTCCATCATCCTTTAA
TTTTATGCAACCTCTCATCCAATTTATCTTACCATATGGTAGAATCATAGTCTTGACATT
CTATAATATTCAACAAACAAGTGTTATTTCCATTTGACTATCTTTATAATAATGTCATTG
GATGATGTTTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2E520TF U 1
AF RR2GE57TF U 143
AF RR2GE57JQ C 183
AF RR2E520JQ C 538
BS 1 673 RR2E520TF
BS 674 792 RR2GE57TF
BS 793 796 RR2E520JQ

RD RR2E520TF 673 0 0
GGGGGATAAAAAAATAATTACAGATCAAAGCAAAGTGAAATTGAAAGCTCTCTCTGACCA
TGTCGTGGATGAAAGGAGATTTACTTTCCAAAAGCAGGAGGCTTGTTGGCGGACTCGCTA
TGCGAGAGCCTGTTTGGCTTAAAGCCATGGAAGCATCACCTCCTCCTGTCTTTCCTCGCT
CTAATGGTAACCTCAAGAAGATTGTTCTCCCTGAAGATTCCTACGTTCGTCGATTCGCAC
GCAAGCATCCTGAAGCGAAACTCGTCGACCCCATCAAGGTTTCGGCGTTTATTCCTGATC
CAGCTCGGGTATATGGTTGTCGTGTCCTTGAACTGACCAAGAATGGCATCAGCGAGGATG
ACGCCATGTCTGTAGCTAATATGGAGTATCTTGCAGAGAGAAAGGAAAAGAAGAAAGCAT
ACAAACGCTTAAAGGAGCTTGCGGTACTGCAAGACAAGACTCCTCCACCTAAACCCTATC
TTAGTTCCAAAAGAGATATGCAAATCCAAGAGAAGAAAACTCCAACGGATCCTCCTAGCG
TCCGCAGGCTTGTTAACCAGTTGAAACAGCAGAAAGAGGTGTTGCTCCAGGATAAACCTG
GAGGAAGTGCTAATCAAGACCACTGGATCGATGAATAAAACTCTCTCCATCATCCTTTAA
TTTTATGCAACCT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2GE57TF 650 0 0
G
GCCATGGAAGCATCACCTCCTCCTGTCTTTCCTCGCTCTAATGGTAACCTCAAGAAGATT
GTTCTCCCTGAAGATTCCTACGTTCGTCGATTCGCACGCAAGCATCCTGAAGCGAAACTC
GTCGACCCCATCAAGGTTTCGGCGTTTATTCCTGATCCAGCTCGGGTATATGGTTGTCGT
GTCCTTGAACTGACCAAGAATGGCATCAGCGAGGATGACGCCATGTCTGTAGCTAATATG
GAGTATCTTGCAGAGAGAAAGGAAAAGAAGAAAGCATACAAACGCTTAAAGGAGCTTGCG
GTACTGCAAGACAAGACTCCTCCACCTAAACCCTATCTTAGTTCCAAAAGAGATATGCAA
ATCCAAGAGAAGAAAACTCCAACGGATCCTCCTAGCGTCCGCAGGCTTGTTAACCAGTTG
AAACAGCAGAAAGAGGTGTTGCTCCAGGATAAACCTGGAGGAAGTGCTAATCAAGACCAC
TGGATCGATGAATAAAACTCTCTCCATCATCCTTTAATTTTATGCAACCTCTCATCCAAT
TTATCTTACCATATGGTAGAATCATAGTCTTGACATTCTATAATATTCAACAAACAAGTG
TTATTTCCATTTGACTATCTTTATAATAATGTCATTGGATGATGTTTTC

QA 2 650 2 650
DS 

RD RR2GE57JQ 610 0 0
AATGGTAACCTCAAGAAGATTGTTCTCCCTGAAGATTCCTACGTTCGTCGATTCGCACGC
AAGCATCCTGAAGCGAAACTCGTCGACCCCATCAAGGTTTCGGCGTTTATTCCTGATCCA
GCTCGGGTATATGGTTGTCGTGTCCTTGAACTGACCAAGAATGGCATCAGCGAGGATGAC
GCCATGTCTGTAGCTAATATGGAGTATCTTGCAGAGAGAAAGGAAAAGAAGAAAGCATAC
AAACGCTTAAAGGAGCTTGCGGTACTGCAAGACAAGACTCCTCCACCTAAACCCTATCTT
AGTTCCAAAAGAGATATGCAAATCCAAGAGAAGAAAACTCCAACGGATCCTCCTAGCGTC
CGCAGGCTTGTTAACCAGTTGAAACAGCAGAAAGAGGTGTTGCTCCAGGATAAACCTGGA
GGAAGTGCTAATCAAGACCACTGGATCGATGAATAAAACTCTCTCCATCATCCTTTAATT
TTATGCAACCTCTCATCCAATTTATCTTACCATATGGTAGAATCATAGTCTTGACATTCT
ATAATATTCAACAAACAAGTGTTATTTCCATTTGACTATCTTTATAATAATGTCATTGGA
TGATGTTTTC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2E520JQ 259 0 0
GCGTCCGCAGGCTTGTTAACCAGTTGAAACAGCAGAAAGAGGTGTTGCTCCAGGATAAAC
CTGGAGGAAGTGCTAATCAAGACCACTGGATCGATGAATAAAACTCTCTCCATCATCCTT
TAATTTTATGCAACCTTTCATCCAATTTATCTTACCATATGGTAGAATCATAGTCTTGAC
ATTCTATAATATTCAACAAACAAGTGTTATTTCCATTTGACTATCTTTATAATAATGTCA
TTGGATGATGTTTTCTTCC

QA 1 259 1 259
DS 



AS 1 4

CO CL2133Contig1 1260 4 4 U
GAGTTCTCAGGGTGCTGTTGCTGCTTTGGAGAATCGGGAGAGGATGATTTATGGTTTGCA
GTATCATCCTGAGGTGACACATTCACCAAAAGGAATGGAGACGCTTAAGCACTTCCTATT
TGATGTGTGTGGGGTATCTGCGGACTGGAAGATGGAGGATCTGATGGAGGAAGAGATCAA
AGTGATTAACAATACCGTTGCAGCTGATGAACACGTTATCCGCGCTTTGTCTGGTGGTGT
GGACTCTACTGTTGCCGCAACTCTTGTTCACAAGGCTATTGGAGATAGGCTTCACTGCAT
CTTTGTTGACAACGGGCTATTAAGGTATAAGGAGCAAGAACGTGTGATGGATACCTTTCA
GAGAGACTTGTATCTACCTGTTACATGCGTAGACGCGTCTGAGCAGTTTCTGAGTCAACT
CAAAGGCGTAGTGGATCCAGAGACAAAGAGGAAGATAATCGGAAAGGAGTTTATCAACAT
TTTCGATCAGTTTGCCCAGGAGTTGGAGAAGAAGCATGGGAAGAAACCTGCTTTTCTAGT
TCAAGGGACTCTGTACCCTGACGTGATTGAGTCCTGCCCTCCCCCAGGTACTGACAGGAC
TCATTCTCACACCATCAAGAGTCATCATAACGTAGGAGGGCTCCTTAAAGACATGAAACT
GAAGCTCATTGAACCACTCAAGCTTCTCTTCAAAGACGAGGTCCGTGAGCTGGGAAGAAT
CTTGAACGTTCCCGTAGGATTCTTGAAGCGTCACCCGTTCCCTGGTCCAGGGCTCGCTGT
TAGAGTCTTGGGGGATGTTACTCAAGGAAACGCCCTTGAGGTCCTTCGTCAGGTTGATGA
GATCTTCATCCAATCAATCAGAGATGCTGGTCTATATGATTCGATCTGGCAAGCTTTTGC
AGTGTTCTTGCCTGTAAGATCAGTTGGAGTCCAAGGTGACAAGAGAACACATTCTCATGT
GGTTGCTCTTCGTGCAGTTACTAGCCAAGATGGAATGACTGCAGATTGGTTCAATTTTGA
GCACAAGTTTCTGGATGATGTTTCCCGGAAAATCTGCAATAGTGTTCAAGGAGTAAACCG
TGTGGTTCAAGACATTACATCAAAGCCTCCTTCAACAATCGAATGGGAATAAAAGAATCA
GATCAATTTGGGTTTGTTTTGTTTATTGATATCCGCAATTTTTAGAGACCATTTAAAACG
ATTGTTGTGGTCACCACTCACCCATCATCTACCATTGATGCTTATTACTATTACGAGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H468TF U 1
AF RR2AT49TF U 454
AF RR2AT49JQ C 541
AF RR2H468JQB C 583
BS 1 631 RR2H468TF
BS 632 1125 RR2AT49TF
BS 1126 1248 RR2AT49JQ
BS 1249 1260 RR2H468JQB

RD RR2H468TF 631 0 0
GAGTTCTCAGGGTGCTGTTGCTGCTTTGGAGAATCGGGAGAGGATGATTTATGGTTTGCA
GTATCATCCTGAGGTGACACATTCACCAAAAGGAATGGAGACGCTTAAGCACTTCCTATT
TGATGTGTGTGGGGTATCTGCGGACTGGAAGATGGAGGATCTGATGGAGGAAGAGATCAA
AGTGATTAACAATACCGTTGCAGCTGATGAACACGTTATCCGCGCTTTGTCTGGTGGTGT
GGACTCTACTGTTGCCGCAACTCTTGTTCACAAGGCTATTGGAGATAGGCTTCACTGCAT
CTTTGTTGACAACGGGCTATTAAGGTATAAGGAGCAAGAACGTGTGATGGATACCTTTCA
GAGAGACTTGTATCTACCTGTTACATGCGTAGACGCGTCTGAGCAGTTTCTGAGTCAACT
CAAAGGCGTAGTGGATCCAGAGACAAAGAGGAAGATAATCGGAAAGGAGTTTATCAACAT
TTTCGATCAGTTTGCCCAGGAGTTGGAGAAGAAGCATGGGAAGAAACCTGCTTTTCTAGT
TCAAGGGACTCTGTACCCTGACGTGATTGAGTCCTGCCCTCCCCCAGGTACTGACAGGAC
TCATTCTCACACCATCAAGAGTCATCATAAC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2AT49TF 672 0 0
GG
TAATCGGAAAGGAGTTTATCAACATTTTCGATCAGTTTGCCCAGGAGTTGGAGAAGAAGC
ATGGGAAGAAACCTGCTTTTCTAGTTCAAGGGACTCTGTACCCTGACGTGATTGAGTCCT
GCCCTCCCCCAGGTACTGACAGGACTCATTCTCACACCATCAAGAGTCATCATAACGTAG
GAGGGCTCCTTAAAGACATGAAACTGAAGCTCATTGAACCACTCAAGCTTCTCTTCAAAG
ACGAGGTCCGTGAGCTGGGAAGAATCTTGAACGTTCCCGTAGGATTCTTGAAGCGTCACC
CGTTCCCTGGTCCAGGGCTCGCTGTTAGAGTCTTGGGGGATGTTACTCAAGGAAACGCCC
TTGAGGTCCTTCGTCAGGTTGATGAGATCTTCATCCAATCAATCAGAGATGCTGGTCTAT
ATGATTCGATCTGGCAAGCTTTTGCAGTGTTCTTGCCTGTAAGATCAGTTGGAGTCCAAG
GTGACAAGAGAACACATTCTCATGTGGTTGCTCTTCGTGCAGTTACTAGCCAAGATGGAA
TGACTGCAGATTGGTTCAATTTTGAGCACAAGTTTCTGGATGATGTTTCCCGGAAAATCT
GCAATAGTGTTCAAGGAGTAAACCGTGTGGTTCAAGACATTACATCAAAGCCTCCTTCAA
CAATCGAATG

QA 3 672 3 672
DS 

RD RR2AT49JQ 708 0 0
TCAAGGGACTCTGTACCCTGACGTGATTGAGTCCTGCCCTCCCCCAGGTACTGACAGGAC
TCATTCTCACACCATCAAGAGTCATCATAACGTAGGAGGGCTCCTTAAAGACATGAAACT
GAAGCTCATTGAACCACTCAAGCTTCTCTTCAAAGACGAGGTCCGTGAGCTGGGAAGAAT
CTTGAACGTTCCCGTAGGATTCTTGAAGCGTCACCCGTTCCCTGGTCCAGGGCTCGCTGT
TAGAGTCTTGGGGGATGTTACTCAAGGAAACGCCCTTGAGGTCCTTCGTCAGGTTGATGA
GATCTTCATCCAATCAATCAGAGATGCTGGTCTATATGATTCGATCTGGCAAGCTTTTGC
AGTGTTCTTGCCTGTAAGATCAGTTGGAGTCCAAGGTGACAAGAGAACACATTCTCATGT
GGTTGCTTTTCGTGCAGTTACTAGCCAAGATGGAATGACTGCAGATTGGTTCAATTTTGA
GCACAAGTTTTTGGATGATGTTTCCCGGAAAATCTGCAATAGTGTTCAAGGAGTAAACCG
TGTGGTTCAAGACATTACATCAAAGCCTCCTTCAACAATCGAATGGGAATAAAAGAATCA
GATCAATTTGGGTTTGTTTTGTTTATTGATATCCGCAATTTTTAGAGACCATTTAAAACG
ATTGTTGTGGTCACCACTCACCCATCATCTACCATTGATGCTTATTAC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2H468JQB 678 0 0
CCCAGGTACTGACAGGACTCATTCTCACACCATCAAGAGTCATCATAACGTAGGAGGGCT
CCCTAAAGACATGAAACTGAAGCTCATTGAACCACTCAAGCTTCTCTTCAAAGACGAGGT
CCGTGAGCTGGGAAGAATCTTGAACGTTCCCGTAGGATTCTTGAAGCGTCACCCGTTCCC
TGGTCCAGGGCTCGCTGTTAGAGTCTTGGGGGATGTTACTCAAGGAAACGCCCTTGAGGT
CCTTCGTCAGGTTGATGAGATCTTCATCCAATCAATCAGAGATGCTGGTCTATATGATTC
GATCTGGCAAGCTTTTGCAGTGTTCTTGCCTGTAAGATCAGTTGGAGTCCAAGGTGACAA
GAGAACACATTCTCATGTGGTTGCTCTTCGTGCAGTTACTAGCCAAGATGGAATGACTGC
AGATTGGTTCAATTTTGAGCACAAGTTTCTGGATGATGTTTCCCGGAAAATCTGCAATAG
TGTTCAAGGAGTAAACCGTGTGGTTCAAGACATTACATCAAAGCCTCCTTCAACAATCGA
ATGGGAATAAAAGAATCAGATCAATTTGGGTTTGTTTTGTTTATTGATATCCGCAATTTT
TAGAGACCATTTAAAACGATTGTTGTGGTCACCACTCACCCATCATCTACCATTGATGCT
TATTACTATTACGAGCGT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 4

CO CL2134Contig1 850 4 22 U
CAAGCCGGACATGTTTTTTTTTCTTTATTCAGTACATTATTATTTTGTTCACTCATAACA
ACCAACAAAGAGATCAAAATGCACAAACTGCAATCAATATCAAGCGCAAGCAGTCTCACA
AAATCCATATGATCAAGAACAACACATCACTGCTGCAACTGATCATAAACACTATAAATA
AGCCAACCTTCAATAGCAGCAGCTTCAAGACGATCATTCCCCCCAGCTTCATCCAACTTA
GACTGAATCGAATCAAGCCTGCTCATATCATACCAAAGTATCTTATGAGCCAGCTCCCTC
GTCCCAAGGAACTCAACGATCGGAGTCCCTCTCGCTTTCGCAGCAAGCTTCCCAATCTCC
AAGGAGCTCCTAATCACAATCCCGTGATTCTCCTTAAGCAAGACAAGGTCTTCCTGGATC
TGAACGCCGACGAACGTGACGAACTTGGAAGCGAAGAAGCAGTAAAGATCCTTGAGGTTG
TCGGTGAACGGGTTCGGGAGACGGAGGAAGAGACAGAAGTTCTTGGTGCTTAGCTTCACC
GAGGAGAGACGCCACTCTGACTTTGCGTCGGCGGATTTGGTGACGTCCCAGTAAAGGTCG
AAGACGATGGCTCTGTTACCGTTCCAGACGCAGTCTTCTAAGAGACGGGAGAGGTATGGC
GAGATGTCGGTTGAGGATTCGACGTCTATGGCTTTGGTCTGGATCCAGTAACCGTCAACC
ATCGCGAACCCTGGCCCATCGAAGTTGGCCATGTGGTTGTCTTTTGAGAGTTCGCTGCGA
CAAAGGTTGATGTCCGTAAACAACTGATTTTGGGTTTAGAGAGAGAGAGATGAGACGAGG
ACGAAGTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AY67JQ U 1
AF RR2AY67TFB C 263
AF RR2A088TF C 7
AF RR2A088JQ U 47
BS 1 136 RR2AY67JQ
BS 137 137 RR2A088JQ
BS 138 178 RR2AY67JQ
BS 179 179 RR2A088JQ
BS 180 208 RR2AY67JQ
BS 209 209 RR2A088JQ
BS 210 224 RR2AY67JQ
BS 225 225 RR2A088JQ
BS 226 234 RR2AY67JQ
BS 235 235 RR2A088JQ
BS 236 240 RR2AY67JQ
BS 241 241 RR2A088JQ
BS 242 428 RR2AY67JQ
BS 429 429 RR2A088JQ
BS 430 431 RR2AY67JQ
BS 432 432 RR2A088JQ
BS 433 455 RR2AY67JQ
BS 456 456 RR2A088JQ
BS 457 460 RR2AY67JQ
BS 461 461 RR2A088JQ
BS 462 506 RR2AY67JQ
BS 507 850 RR2A088JQ

RD RR2AY67JQ 506 0 0
CAAGCCGGACATGTTTTTTTTTCTTTATTCAGTACATTATTATTTTGTTCACTCATAACA
ACCAACAAAGAGATCAAAATGCACAAACTGCAATCAATATCAAGCGCAAGCAGTCTCACA
AAATCCATATGATCAAAAACAACACATCACTGCTGCAACTGATCATAAACACTATAAAAA
AGCCAACCTTCAATAGCAGCAGCTTCAAAACGATCATTCCCCCCTGCTTCATCCCACTTA
AACTGAATCGAATCAAGCCTGCTCATATCATACCAAAGTATCTTATGAGCCAGCTCCCTC
GTCCCAAGGAACTCAACGATCGGAGTCCCTCTCGCTTTCGCAGCAAGCTTCCCAATCTCC
AAGGAGCTCCTAATCACAATCCCGTGATTCTCCTTAAGCAAGACAAGGTCTTCCTGGATC
TGAACGCCAACAAACGTGACGAACTTGGAAGCGAAAAAGCGGTAAAGATCCTTGAGGTTG
TCGGTGAACGGGTTCGGGAGACGGAG

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2AY67TFB 301 0 0
TCATATCATACCAAAGTATCTTATGAGCCAGCTCCCTCGTCCCAAGGAACTCAACGATCG
GAGTCCCTCTCGCTTTCGCAGCAAGCTTCCCAATCTCCAAGGAGCTCCTAATCACAATCC
CGTGATTCTCCTTAAGCAAGACAAGGTCTTCCTGGATCTGAACGCCGACGAACGTGACGA
ACTTGGAAGCGAAGAAGCGGTAGAGATCCTTGAGGTTGTCGGTGAACGGGTTCGGGAGAC
GGAGGAAGAGACAGAAGTTCTTGGTGCTTAGCTTCACCGAGGAGAGACGCCACTCTGACT
T

QA 1 301 1 301
DS 

RD RR2A088TF 844 0 0
CGGACATG
TTTTTTTTCTTTATTCAGTACATTATTATTT*GTTCACTCATAACAACCAACAAAGAGAT
CAAAATGCACAAACTGCAATCAATATCAAGCGCAAGCAGTCTCACAAAATCCATATGATC
AAGAACAACACATCACTGCTGCAACTGATCATAAACACTATAAATAAGCCAACCTTCAAT
AGCAGCAGCTTCAAGACGATCATTCCCCCCAGCTTCATCCAACTTAGACTGAATCGAATC
AAGCCTGCTCATATCATACCAAAGTATCTTATGAGCCAGCTCCCTCGTCCCAAGGAACTC
AACGATCGGAGTCCCTCTCGCTTTCGCAGCAAGCTTCCCAATCTCCAAGGAGCTCCTAAT
CACAATCCCGTGATTCTCCTTAAGCAAGACAAGGTCTTCCTGGATCTGAACGCCGACGAA
CGTGACGAACTTGGAAGCGAAGAAGCAGTAGAGATCCTTGAGGTTGTCGGTGAACGGGTT
CGGGAGACGGAGGAAGAGACAGAAGTTCTTGGTGCTTAGCTTCACCGAGGAGAGACGCCA
CTCTGACTTTGCGTCGGCGGATTTGGTGACGTCCCAGTAGAGGTCGAAGACGATGGCTCT
GTTACCGTTCCAGACGCAGTCTTCTAAGAGACGGGAGAGGTATGGCGAGATGTCGGTTGA
GGATTCGACGTCTATGGCTTTGGTCTGGATCCAGTAACCGTCAACCATCGCGAACCCTGG
CCCATCGAAGTTGGCCATGTGGTTGTCTTTTGAGAGTTCGCTGCGACAAAGGTTGATGTC
CGTAAACAACTGATTTTGGGTTTAGAGAGAGAGAGATGAGACGAGGACGAAGTAGC

QA 9 844 9 844
DS 

RD RR2A088JQ 804 0 0
GTTCACTCATAACAACCAACAAAGAGATCAAAATGCACAAACTGCAATCAATATCAAGCG
CAAGCAGTCTCACAAAATCCATATGATCAAGAACAACACATCACTGCTGCAACTGATCAT
AAACACTATAAATAAGCCAACCTTCAATAGCAGCAGCTTCAAGACGATCATTCCCCCCAG
CTTCATCCAACTTAGACTGAATCGAATCAAGCCTGCTCATATCATACCAAAGTATCTTAT
GAGCCAGCTCCCTCGTCCCAAGGAACTCAACGATCGGAGTCCCTCTCGCTTTCGCAGCAA
GCTTCCCAATCTCCAAGGAGCTCCTAATCACAATCCCGTGATTCTCCTTAAGCAAGACAA
GGTCTTCCTGGATCTGAACGCCGACGAACGTGACGAACTTGGAAGCGAAGAAGCAGTAAA
GATCCTTGAGGTTGTCGGTGAACGGGTTCGGGAGACGGAGGAAGAGACAGAAGTTCTTGG
TGCTTAGCTTCACCGAGGAGAGACGCCACTCTGACTTTGCGTCGGCGGATTTGGTGACGT
CCCAGTAAAGGTCGAAGACGATGGCTCTGTTACCGTTCCAGACGCAGTCTTCTAAGAGAC
GGGAGAGGTATGGCGAGATGTCGGTTGAGGATTCGACGTCTATGGCTTTGGTCTGGATCC
AGTAACCGTCAACCATCGCGAACCCTGGCCCATCGAAGTTGGCCATGTGGTTGTCTTTTG
AGAGTTCGCTGCGACAAAGGTTGATGTCCGTAAACAACTGATTTTGGGTTTAGAGAGAGA
GAGATGAGACGAGGACGAAGTAGC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 4

CO CL2135Contig1 581 4 5 U
GTGAAAAGTCGAGATTCTACCAGAAAATATTGCAGTTGTGTTTCCAAACAGGAAATTCAT
ACATAGGTAGTTTCCTTATTATCTGCTTTAAAGTGACAAAGCACAAGACACCAGCAGCAT
AAGAAGTTATCTCAGCTGAGGATCACAATGAGAAATAGACAAATGAGGGTTTATATCATA
GGGAAGACTGAAGAGATTCAATTCAAGAAACAATATAGCAACAACAAAGTTTTGATAATC
AGTATTTAGGATCAGTGAAGAATTTGTTGATGCCAGGCATGATCTCAGGGTGCTTGTTGC
GAACGTACTTCCTCAGGAAGTTTTCCTTGTACTTCTCTCCCTCTGCATGGTTATCCAAAA
TCCCAGCTGCCCTATTCTCCTTTGTACATCTGACTTCAGGATTGCCGGTGATGTTTCTGA
TCAACGAAAACGCACAGATCCCAACCGCAACTCCAGTAGCCGCGAACAAAGGATACACCT
CGGGTCTCAACCAACGGCTCGACATTGGAATAGCGGATAAGATGATGTCCGATCGAGAGA
GACTACAAGAGGAAGACGGCTTCTCTGAGAATGAATGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG49TF C 1
AF RR2FM11JQ U 44
AF RR2FM11TF C 44
AF RR2AG49JQ U 152
BS 1 43 RR2AG49TF
BS 44 369 RR2FM11JQ
BS 370 370 RR2AG49JQ
BS 371 572 RR2FM11JQ
BS 573 581 RR2AG49JQ

RD RR2AG49TF 581 0 0
GTGAAAAGTCGAGATTCTACCAGAAAATATTGCAGTTGTGTTTCCAAACAGGAAATTCAT
ACATAGGTAGTTTCCTTATTATCTGCTTTAAAGTGACAAAGCACAAGACACCAGCAGCAT
AAGAAGTTATCTCAGCTGAGGATCACAATGAGAAATAGACAAATGAGGGTTTATATCATA
GGGAAGACTGAAGAGATTCAATTCAAGAAACAATATAGCAACAACAAAGTTTTGATAATC
AGTATTTAGGATCAGTGAAGAATTTGTTGATGCCAGGCATGATCTCAGGGTGCTTGTTGC
GAACGTACTTCCTCAGGAAGTTTTCCTTGTACTTCTCTCCCTCTGCATGGTTATCCAAAA
TCCCAGCTGCCCTATTCTCCTTTGTACATCTGACTTCAGGATTGCCGGTGATGTTTCTG*
**AACGAAAACGCACAGATCCCAACCGCAACTCCAGTAGCCGCGAACAAAGGATACACCT
CGGGTCTCAACCAACGGCTCGACATTGGAATAGCGGATAAGATGATGTCCGATCGAGAGA
GACTACAAGAGGAAGACGGCTTCTCTGAGAAT
GAATGTTCC

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2FM11JQ 531 0 0
CCAAACAGGAAATTCATACATAGGTAGTTTCCTTATTATCTGCTTTAAAGTGACAAAGCA
CAAGACACCAGCAGCATAAGAAGTTATCTCAGCTGAGGATCACAATGAGAAATAGACAAA
TGAGGGTTTATATCATAGGGAAGACTGAAGAGATTCAATTCAAGAAACAATATAGCAACA
ACAAAGTTTTGATAATCAGTATTTAGGATCAGTGAAGAATTTGTTGATGCCAGGCATGAT
CTCAGGGTGCTTGTTGCGAACGTACTTCCTCAGGAAGTTTTCCTTGTACTTCTCTCCCTC
TGCATGGTTATCCAAAATCCCAGCTGTCCTATTCTCCTTTGTACATCTGACTTCAGGATT
GCCGGTGATGTTTCTGATCAACGAAAACGCACAGATCCCAACCGCAACTCCAGTAGCCGC
GAACAAAGGATACACCTCGGGTCTCAACCAACGGCTCGACATTGGAATAGCGGATAAGAT
GATGTCCGATCGAGAGAGACTACAAGAGGAAGACGGCTTCTCTGAGAAT
CC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2FM11TF 531 0 0
CCAAACAGGAAATTCATACATAGGTAGTTTCCTTATTATCTGCTTTAAAGTGACAAAGCA
CAAGACACCAGCAGCATAAGAAGTTATCTCAGCTGAGGATCACAATGAGAAATAGACAAA
TGAGGGTTTATATCATAGGGAAGACTGAAGAGATTCAATTCAAGAAACAATATAGCAACA
ACAAAGTTTTGATAATCAGTATTTAGGATCAGTGAAGAATTTGTTGATGCCAGGCATGAT
CTCAGGGTGCTTGTTGCGAACGTACTTCCTCAGGAAGTTTTCCTTGTACTTCTCTCCCTC
TGCATGGTTATCCAAAATCCCAGCTGTCCTATTCTCCTTTGTACATCTGACTTCAGGATT
GCCGGTGATGTTTCTGATCAACGAAAACGCACAGATCCCAACCGCAACTCCAGTAGCCGC
GAACAAAGGATACACCTCGGGTCTCAACCAACGGCTCGACATTGGAATAGCGGATAAGAT
GATGTCCGATCGAGAGAGACTACAAGAGGAAGACGGCTTCTCTGAGAAT
CC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2AG49JQ 430 0 0
GAAATAGACAAATGAGGGTTTATATCATAGGGAAGACTGAAGAGATTCAATTCAAGAAAC
AATATAGCAACAACAAAGTTTTGATAATCAGTATTTAGGATCAGTGAAGAATTTGTTGAT
GCCAGGCATGATCTCAGGGTGCTTGTTGCGAACGTACTTCCTCAGGAAGTTTTCCTTGTA
CTTCTCTCCCTCTGCATGGTTATCCAAAATCCCAGCTGCCCTATTCTCCTTTGTACATCT
GACTTCAGGATTGCCGGTGATGTTTCTG***AACGAAAACGCACAGATCCCAACCGCAAC
TCCAGTAGCCGCGAACAAAGGATACACCTCGGGTCTCAACCAACGGCTCGACATTGGAAT
AGCGGATAAGATGATGTCCGATCGAGAGAGACTACAAGAGGAAGACGGCTTCTCTGAGAA
TGAATGTTCC

QA 1 430 1 430
DS 



AS 1 2

CO CL2136Contig1 707 2 6 U
GGAAAAGACTGGTTGTTGGTTCAGTCACATTTCCTCTCTCTCTCAGCATTCGCGAGCAAT
TCATTTCACACGTACACAAAGGCTTCTCAGATTTCAATATCCGTTTCTCTGAGTTGTAGT
AATGGGTTCTGAAGGACCAACGGCAGTTACAATTAACATCACAGGCTTCAAGAAGTTCCA
TGGAGTTGCTGAAAACCCTACGGAGAAAATAGCAAGCAACCTGAAAGAATATTTAGCTAA
GAATCCCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGCTTGAGACCGCTGGTCA
AGGAGCTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCGCAATCAATACGAAAGAATCAGA
GTCAGTGAGCTGTGGAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTAACAGTGGTGCTACAAA
ATTCACAATTGAGCAGCAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTTGCCCTGATGAAATGGG
TTGGAAACCTCAGCATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCCAATCTCAACTGTAAGAAA
GACTACTCTTCCTGTTGAAGAGATAACAAAGGCCTTAGAGAAGAAGGGCTTTGAGGTGAT
AACATCAGATGATGCACGTCGTTTTGTGTGCAACTACGTCTATTACCACTCACTGAGATT
TGCAGAACAGAACAAGACCTATTCTCTCTTTGTTCACGTTCCTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ91TF U 1
AF RR2GH52TF U 101
BS 1 587 RR2GZ91TF
BS 588 588 RR2GH52TF
BS 589 616 RR2GZ91TF
BS 617 617 RR2GH52TF
BS 618 679 RR2GZ91TF
BS 680 707 RR2GH52TF

RD RR2GZ91TF 679 0 0
GGAAAAGACTGGTTGTTGGTTCAGTCACATTTCCTCTCTCTCTCAGCATTCGCGAGCAAT
TCATTTCACACGTACACAAAGGCTTCTCAGATTTCAATATCCGTTTCTCTGAGTTGTAGT
AATGGGTTCTGAAGGACCAACGGCAGTTACAATTAACATCACAGGCTTCAAGAAGTTCCA
TGGAGTTGCTGAAAACCCTACGGAGAAAATAGCAAGCAACCTGAAAGAATATTTAGCTAA
GAATCCCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGCTTGAGACCGCTGGTCA
AGGAGCTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCGCAATCAATACGAAAGAATCAGA
GTCAGTGAGCTGTGGAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTAACAGTGGTGCTACAAA
ATTCACAATTGAGCAGCAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTTGCCCTGATGAAATGGG
TTGGAAACCTCAGCATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCCAATCTCAACTGTAAGAAA
GACTACTCTTCCTGTTGAAGAGATAACAAAGGCCTTAGAGAAGAAGG*CTTTGAGGTGAT
AACATCAGATGATGCAGGTCGTTTTGTGTGCAACTACGTCTATTACCACTCACTGAGATT
TGCAGAACAGAACAAGACC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2GH52TF 607 0 0
GG
GTTTCTCTGAGTTGTAGTAATGGGTTCTGAAGGACCAACGGCAGTTACAATTAACATCAC
AGGCTTCAAGAAGTTCCGTGGAGTTGCTGAAAACCCTACGGAGAAAATAGCAAGCAACCT
GAAAGAATATTTAGCTAAGAATCCCCAGTCGAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGT
GCTTGAGACCGCTGGTCAAGGAGCTCTCGCTTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCGCAAT
CAATACGAAAGAATCAGAGTCAGTGAGCTGTGGAAAAACCATATGGGTTCATTTGGGAGT
TAACAGTGGTGCTACAAAATTCGCAATTGAGCAGCAGGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCG
TTGCCCTGATGAAATGGGTTGGAAACCTCAGCATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCC
AATCTCAACTGTAAGAAAGACTACTCTTTCTGTTGAAGAGATAACAAAGGCCTTAGAGAA
GAAGGGCTTTGAGGTGATAACATCAGATGATTCACGTCGTTTTGTGTGCAACTACGTCTA
TTACCACTCACTGAGATTTGCAGAACAGAACAAGACCTATTCTCTCTTTGTTCACGTTCC
TCTTT

QA 3 607 3 607
DS 



AS 1 2

CO CL2137Contig1 1155 2 6 U
GGACTGATCGACCTTCCCACTAACTAACAACAGATCCACAAGCGAATCGGATCGGCGAGC
CTAGAGAGAGAGAGAGATGGTGACGAAGACGGAGGAGACGGAGCTAAACCAACTCGAGAA
TCAAGTCGAGAACGGAGGAGGAGGTGTTTGGGAGTATCTGTGCCTCGTCCGTAAGCTCAA
GGTTCGCCGATCAGAGCTTGTGCTCAAGCACGGTCTCTCGATCTTGAACGATCCGGGAAA
CGATCCGCTCTTGGTCCTGATGAATGGACCCTCTATGAGCAGGTAGCAATTGCAGCTATG
GATTGTCAATCTCTTGCTGTTGCACAGAATTGCATCAAGGTTCTGCAGAAGAAGTTTCCG
GAGAGCAAACGTGTGGGAAAGCTGGAGGCGTTGCTTCTAGAAGCAAAGGGGATGTGGGAA
GAGGCTGAAAAAGCCTATTCAATCCTTTTGGAGGATAATCCACTTGATCAAGTAATACAC
AAAAGAAAGGTGGCTATGGCCAAGGCGCAGGGCAAACCTTCCTTAGCCATTGAACATCTT
AACAAATATCTTGAAGTATTCATGGTTGATCATGATGCATGGAGAGAACTTGCAGAAATT
TATGTTTCCTTGCAAATGTACAAACAAGCAGCTTTCTGTTACGAGGAGCTCATTTTATCT
CAGCCTACTCTTCCATTGTACCACTTAGCATATGCCGAGGTACTCTATACGATTGGTGGA
CATGAAAACCTCATCGCAGCAAGAAAGTACTATGCATCAACCATAGACCTTACAGGTGGT
AAAAGCACAAGAGCCCTCTTTGGATTATGCTTGTGTGGATCAGCAATAGCACAGCTCTCA
AAAGGCAGGAACAAAGAGGACAAGGACATGGCTGCACCAGAGCTTCAGTCTCTAGCTGCA
ACTGCTCTGGAGAAAGAGTACAAGCAAAAAGCTCCTGCCAAACTCAACCTACTCTCTTCT
GCATTAAGAAGCTTGAAGCTCTAGTAAGTTCATCAGAGGCCCATCAGAGTAAAAACGCTG
GCTCACATTTTTCTTGGTTAAAGCTTTTTTTTTTGTTGTCAGAATTTTATCTCGTTGTTC
TCGCTTATTTTATTTTCACTCTTGATTTATTATTTACTGGCTCTTATATACACTGTTTAC
TAGAGGTGTTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD14TF U 1
AF RR2BD14JQ C 341
BS 1 775 RR2BD14TF
BS 776 776 RR2BD14JQ
BS 777 825 RR2BD14TF
BS 826 826 RR2BD14JQ
BS 827 840 RR2BD14TF
BS 841 1155 RR2BD14JQ

RD RR2BD14TF 840 0 0
GGACTGATCGACCTTCCCACTAACTAACAACAGATCCACAAGCGAATCGGATCGGCGAGC
CTAGAGAGAGAGAGAGATGGTGACGAAGACGGAGGAGACGGAGCTAAACCAACTCGAGAA
TCAAGTCGAGAACGGAGGAGGAGGTGTTTGGGAGTATCTGTGCCTCGTCCGTAAGCTCAA
GGTTCGCCGATCAGAGCTTGTGCTCAAGCACGGTCTCTCGATCTTGAACGATCCGGGAAA
CGATCCGCTCTTGGTCCTGATGAATGGACCCTCTATGAGCAGGTAGCAATTGCAGCTATG
GATTGTCAATCTCTTGCTGTTGCACAGAATTGCATCAAGGTTCTGCAGAAGAAGTTTCCG
GAGAGCAAACGTGTGGGAAAGCTGGAGGCGTTGCTTCTAGAAGCAAAGGGGATGTGGGAA
GAGGCTGAAAAAGCCTATTCAATCCTTTTGGAGGATAATCCACTTGATCAAGTAATACAC
AAAAGAAAGGTGGCTATGGCCAAGGCGCAGGGCAAACCTTCCTTAGCCATTGAACATCTT
AACAAATATCTTGAAGTATTCATGGTTGATCATGATGCATGGAGAGAACTTGCAGAAATT
TATGTTTCCTTGCAAATGTACAAACAAGCAGCTTTCTGTTACGAGGAGCTCATTTTATCT
CAGCCTACTCTTCCATTGTACCACTTAGCATATGCCGAGGTACTCTATACGATTGGTGGA
CATGAAAACCTCATCGCAGCAAGAAAGTACTATGCATCAACCATAGACCTTACAG*TGGT
AAAAGCACAAGAGCCCTCTTTGGATTATGCTTGTGTGGATCAGCA*TAGCACAGCTCTCA

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2BD14JQ 815 0 0
TTCTGCAGAAGAAGTTTCCGGAGAGCAAACGTGTGGGAAAGCTGGAGGCGTTGCTTCTAG
AAGCAAAGGGGATGTGGGAAGAGGCTGAAAAAGCCTATTCAATCCTTTTGGAGGATAATC
CACTTGATCAAGTAATACACAAAAGAAAGGTGGCTATGGCCAAGGCGCAGGGCAAACCTT
CCTTAGCCATTGAACATCTTAACAAATATCTTGAAGTATTCATGGTTGATCATGATGCAT
GGAGAGAACTTGCAGAAATTTATGTTTCCTTGCAAATGTACAAACAAGCAGCTTTCTGTT
ACGAGGAGCTCATTTTATCTCAGCCTACTCTTCCATTGTACCACTTAGCATATGCCGAGG
TACTCTATACGATTGGTGGACATGAAAACCTCATCGCAGCAAGAAAGTACTATGCATCAA
CCATAGACCTTACAGGTGGTAAAAGCACAAGAGCCCTCTTTGGATTATGCTTGTGTGGAT
CAGCAATAGCACAGCTCTCAAAAGGCAGGAACAAAGAGGACAAGGACATGGCTGCACCAG
AGCTTCAGTCTCTAGCTGCAACTGCTCTGGAGAAAGAGTACAAGCAAAAAGCTCCTGCCA
AACTCAACCTACTCTCTTCTGCATTAAGAAGCTTGAAGCTCTAGTAAGTTCATCAGAGGC
CCATCAGAGTAAAAACGCTGGCTCACATTTTTCTTGGTTAAAGCTTTTTTTTTTGTTGTC
AGAATTTTATCTCGTTGTTCTCGCTTATTTTATTTTCACTCTTGATTTATTATTTACTGG
CTCTTATATACACTGTTTACTAGAGGTGTTTAATC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 3

CO CL2138Contig1 921 3 5 U
ACTCTGAAACATTTCATTGATGAAGAACAAGTTGATACACAAGGGTAATACACTAAGCTA
GCGAGTATTGAAACTCCTAGAGACTTAAGCCAGCAGTAGAAAGAACATACTCTGGAAACC
ATAGCCAGCAGAATTGAACAAATTCTCTGGATTCTATACCAAAACATAATAAACACAAGC
TAACAGCATAACATAATCGTAGAAACCAGATCAAATTTACAAAACACCCAAGTAAATGGA
TACACCAAAGGAGGAGAGAAGAAGTAAGCGCACACCCTTTAGCAGCGAACTTATTAGGGG
ATACTCTGCTTCTCATTATATCGCTCCGTCCACCTGACGAGCCACGAGAACAAGCAGAAC
CGGAAACCCCGAGGATGATGAAGACCCAGCTTTTGACCATCATACCTCCTCGCTAGGTGC
AGAGAGCCGAAGCCCCAAATCCTTGTAGACGAGCCGGAGACTCCAAAACCGAAACAAGAA
GAAGACACTGCTCCAAGATTTGACCCGTCACAAACGACAACAAGGATAGCACATCTATCC
TCCCTTGGTAAATCCACCACAAGAAGCTAGCATCATCACACCTGCAAATCGAAGAGACTC
GAGACAGAACCAGTCAATAGAGACAGAGCAGAGCCCAAGAACGCCTCCAGAAACACCTCC
ACCGACAACGCTCAAACTCGAGACCACGATCTACTAATCTAGATCTAGATCTACAATCAA
ATATGCTCAAAGCTTAAACAAAAGGACATGCAAGCTAAAAACGAGAAAAAAACAGAGACC
CGACCGACGGAGGCTACGAGAGCCAGAGCCGTCGGCCGGAAACGCGCTTCCGATGATAAG
AGACCTAGAGAGAATACAGAGAGATTTTTAGAGAGAGAAACCTACTTAAACCATCGATGC
CTTAATAGATTAGATTTATCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS25JQ U 1
AF RR2GN39JQ U 1
AF RR2DS25TF C 364
BS 1 247 RR2DS25JQ
BS 248 248 RR2GN39JQ
BS 249 351 RR2DS25JQ
BS 352 746 RR2GN39JQ
BS 747 921 RR2DS25TF

RD RR2DS25JQ 351 0 0
ACTCTGAAACATTTCATTGATGAAGAACAAGTTGATACACAAGGGTAATACACTAAGCTA
GCGAGTATTGAAACTCCTAGAGACTTAAGCCAGCAGTAGAAAGAACATACTCTGGAAACC
ATAGCCAGCAGAATTGAACAAATTCTCTGGATTCTATACCAAAACATAATAAACACAAGC
TAACAGCATAACATAATCGTAGAAACCAGATCAAATTTACAAAACACCCAAGTAAATGGA
TACACCAGAGGAGGAGAGAAGAAGTAAGCGCACACCCTTTAGCAGCGAACTTATTAGGGG
ATACTCTGCTTCTCATTATATCGCTCCGTCCACCTGACGAGCCACGAGAAC

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR2GN39JQ 746 0 0
C
CTCTGAAACATTTCATTGATGAAGAACAAGTTGATACACAAGGGTAATACACTAAGCTAG
CGAGTATTGAAACTCCTAGAGACTTAAGCCAGCAGTAGAAAGAACATACTCTGGAAACCA
TAGCCAGCAGAATTGAACAAATTCTCTGGATTCTATACCAAAACATAATAAACACAAGCT
AACAGCATAACATAATCGTAGAAACCAGATCAAATTTACAAAACACCCAAGTAAATGGAT
ACACCAAAGGAGGAGAGAAGAAGTAAGCGCACACCCTTTAGCAGCGAACTTATTAGGGGA
TACTCTGCTTCTCATTATATCGCTCCGTCCACCTGACGAGCCACGAGAACAAGCAGAACC
GGAAACCCCGAGGATGATGAAGACCCAGCTTTTGACCATCATACCTCCTCGCTAGGTGCA
GAGAGCCGAAGCCCCAAATCCTTGTAGACGAGCCGGAGACTCCAAAACCGAAACAAGAAG
AAGACACTGCTCCAAGATTTGACCCGTCACAAACGACAACAAGGATAGCACATCTATCCT
CCCTTGGTAAATCCACCACAAGAAGCTAGCATCATCACACCTGCAAATCGAAGAGACTCG
AGACAGAACCAGTCAATAGAGACAGAGCAGAGCCCAAGAACGCCTCCAGAAACACCTCCA
CCGACAACGCTCAAACTCGAGACCACGATCTACTAATCTAGATCTAGATCTACAATCAAA
TATGCTCAAAGCTTAAACAAAAGGA

QA 2 746 2 746
DS 

RD RR2DS25TF 558 0 0
AAACCCCGAGGATGATGAAGACCCAGCTTTTGACCATCATACCTCCTCGCTAGGTGCAGA
GAGCCGAAGCCCCAAATCCTTGTAGACGAGCCGGAGACTCCAAAACCGAAACAGGAAGAA
GACACTGCTCCAAGATTTGACCCGTCACAAACGACAACAAGGATAGCACATCTATCCTCC
CTTGGTAAATCCACCACAAGAAGCTAGCATCATCACACCTGCAAATCGAAGAGACTCGAG
ACAGAACCAGTCAATAGAGACAGAGCAGAGCCCAAGAACGCCTCCAGAAACACCTCCACC
GACAACGCTCAAACTCGAGACCACGATCTACTAATCTAGATCTAGATCTACAATCAAATA
TGCTCAAAGCTTAAACAAAAGGACATGCAAGCTAAAAACGAGAAAAAAACAGAGACCCGA
CCGACGGAGGCTACGAGAGCCAGAGCCGTCGGCCGGAAACGCGCTTCCGATGATAAGAGA
CCTAGAGAGAATACAGAGAGATTTTTAGAGAGAGAAACCTACTTAAACCATCGATGCCTT
AATAGATTAGATTTATCC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 4

CO CL2139Contig1 1030 4 25 U
GGCCCGAGACTTTGGTTCACTGTCTCATTCTCACTCTCTCATTGGCCTTCTCTATATAAA
GCTCACAGGTCGAGAGAGACAAGGAGACACACTACATAGACGATCATACAGTTTGATTAC
AAAAGAGATCTGTCGGAAAAAAAATGGAGAATATCGACCAAGAATTCAACAATTACTGGG
AGCACAACTCCTTCCTCCAAAACGAAGACTTCGAATACGACAGCTGGCCTTTGGAGGAAG
CTATTTCTGGGTCGTATGATTCGAGCTCGCCTGATGGGGCGGCTTCGTCGCCGGCTTCTA
AGAATATTGTATCGGAGAGAAACCGAAGACAGAAACTTAACCAGAGACTCTTCGCTCTTC
GATCAGTTGTTCCTAATATCACTAAGATGGATAAAGCATCAATAATCAAAGATGCTATTA
GTTACATACAAGGGTTACAATATGAAGAAGCGAAGCTCGAAGCTGAGATCAGAGAACTTG
AATCAACACCCAAGAGTAGTTTGAGTTTCAGTAAAGATTTTGATCGCGATTTACTGGTTC
CTGTCACGTCCAAGAAGATGAAACAGCTTGATCCTGGTTCTTCTCGTTCTCTCATCGAAG
TTATCGAACTGAAGGTAACATCCATGGGAGATAGGGTAATGGTGGTGAATGTAACATGTA
ATAAGAGGACAGACACAATGGTTAAACTTTGTGAAGTCTTTGAGTCATTGAATCTCAAAA
TCCTCACTTCCAATCTCAACTTTTTTTCTGGCATGATCTTCTACACTCTCTTTATTGAGG
AGGATGAAGAAGAACAAGAGGTGGTGAGGCTAAAAATAGAAACAGGAATAGAAGCATATA
ATGAAACTCAAAGCCCCACTTGGAGCATCGACTCTCTGTACTAATCACTTCTTTTTTTGG
TTTTTGATTTTGTTATGTTATTTTTTACAAATTAATAATGTGTCTCAGTTTTCGTTTCGT
TTGTCCATCACAAAGACTTGTTTTTCGGTTTATATGATTTCTCTAATAACCCTACGCATT
GATTTGGGGG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM12TF U 1
AF RR2H689TF U 4
AF RR2H689JQB C 423
AF RR2EM12JQ C 398
BS 1 361 RR2EM12TF
BS 362 362 RR2H689TF
BS 363 484 RR2EM12TF
BS 485 485 RR2H689TF
BS 486 526 RR2EM12TF
BS 527 527 RR2H689TF
BS 528 572 RR2EM12TF
BS 573 573 RR2H689TF
BS 574 688 RR2EM12TF
BS 689 738 RR2H689TF
BS 739 739 RR2EM12JQ
BS 740 745 RR2H689TF
BS 746 746 RR2EM12JQ
BS 747 771 RR2H689TF
BS 772 780 RR2EM12JQ
BS 781 781 RR2H689JQB
BS 782 856 RR2EM12JQ
BS 857 857 RR2H689JQB
BS 858 905 RR2EM12JQ
BS 906 906 RR2H689JQB
BS 907 910 RR2EM12JQ
BS 911 911 RR2H689JQB
BS 912 957 RR2EM12JQ
BS 958 958 RR2H689JQB
BS 959 1030 RR2EM12JQ

RD RR2EM12TF 688 0 0
GGCCCGAGACTTTGGTTCACTGTCTCATTCTCACTCTCTCATTGGCCTTCTCTATATAAA
GCTCACAGGTCGAGAGAGACAAGGAGACACACTACATAGACGATCATACAGTTTGATTAC
AAAAGAGATCTGTCGGAAAAAAAATGGAGAATATCGACCAAGAATTCAACAATTACTGGG
AGCACAACTCCTTCCTCCAAAACGAAGACTTCGAATACGACAGCTGGCCTTTGGAGGAAG
CTATTTCTGGGTCGTATGATTCGAGCTCGCCTGATGGGGCGGCTTCGTCGCCGGCTTCTA
AGAATATTGTATCGGAGAGAAACCGAAGACAGAAACTTAACCAGAGACTCTTCGCTCTTC
GGTCAGTTGTTCCTAATATCACTAAGATGGATAAAGCATCAATAATCAAAGATGCTATTA
GTTACATACAAGGGTTACAATATGAAGAAGCGAAGCTCGAAGCTGAGATCAGAGAACTTG
AATCTACACCCAAGAGTAGTTTGAGTTTCAGTAAAGATTTTGATCGTGATTTACTGGTTC
CTGTCACGTCCAAGAAGATGAAACAGCTTGATTCTGGTTCTTCTCGTTCTCTCATCGAAG
TTATCGAACTGAAGGTAACATCCATGGGAGATAGGGTAATGGTGGTGAATGTAACATGTA
ATAAGAGGACAGACACAATGGTTAAACT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2H689TF 768 0 0
GG
GAGACTTTGGTTCTCTGTCTCATTCTCACTCTCTCATTGGCCTTCTCTATATAAAGCTCA
CAGGTCGAGAGAGACAAGGAGACACACTACATAGACGATCATCCAGTTTGATTACAAAAG
AGATCTGTCGGAAGAAAAATGGAGAGTATCGACCAAGAATTCAACAATTACTGGGAGCAC
AACTCCTTCCTCCAAAACGAAGACTTCGAATACGACAGCTGGCCTTTGGAGGAAGCTATT
TCTGGGTCGTATGATTCGAGCTCGCCTGATGGGGCGGCTTCGTCGCCGGCTTCTAAGAAT
ATTGTATCGGAGAGAAACCGAAGACAGAAACTTAACCAGAGACTCTTCGCTCTTCGATCA
GTTGTTCCTAATATCACTAAGATGGATAAAGCATCAATAATCAAAGATGCTATTAGTTAC
ATACAAGGGTTACAATATGAAGAAGCTAAGCTCGAAGCTGAGATCAGAGAACTTGAATCA
ACACCGAAGAGTAGTTTGAGTTTCAGTAAAGATTTTGATCGCGATTTACTGGTTCCTGTC
ACGTCCAAGAAGATGAAACAGCTTGATCCTGGTTCTTCTCGTTCTCTCATCGAAGTTATC
GAACTGAAAGTAACATCCATGGGAGATAGGGTAATGGTGGTGAATGTAACATGTAATAAG
AG*ACAGACACAATGGTTAAACTTTGTGAAGTCTTTGAGTCATTGAATCTCAAAATCCTC
ACTTCCAATCTCA*CTTTTTCTCTGGCATGATCTTCTACACTCTCT

QA 3 768 3 768
DS 

RD RR2H689JQB 566 0 0
TACATACAAGGGTTACAATATGAAGAAGCTAAGCTCGAAGCTGAGATCAGAGAACTTGAA
TCAACACCGAAGAGTAGTTTGAGTTTCAGTAAAGATTTTGATCGCGATTTACTGGTTCCT
GTCACGTCCAAGAAGATGAAACAGCTTGATCCTGGTTCTTCTCGTTCTCTCATCGAAGTT
ATCGAACTGAAGGTAACATCCATGGGAGATAGGGTAATGGTGGTGAATGTAACATGTAAT
AAGAGGACAGACACAATGGTTAAACTTTGTGAAGTCTTTGAGTCATTGAATCTCAAAATC
CTCACTTCCAATCTCAACTTTTTTTCTGGCATGATCTTCTACACTCTCTTTATTGAGGAG
GATGAAGAAGAACAAGAGGTGGTGAGGCTAAAAATAGAAACAGGAATAGGAGCATATAAT
GAAACTCAAAGCCCCACTTGGAGCATCGACTCTCTGTACTAATCACTTCTTTTTTTGGTT
TTTGATTTTGTTATGTTATTTTTTACAAATTAATAATGT**CTCAGTTTTCGTTTC*TTT
GTCCATCACAAAGACTTGTTTTTCGG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2EM12JQ 633 0 0
ATCAATAATCAAAGATGCTATTAGTTACATACAAGGGTTACAATATGAAGAAGCGAAGCT
CGAAGCTGAGATCAGAGAACTTGAATCTACACCCAAGAGTAGTTTGAGTTTCAGTAAAGA
TTTTGATCGTGATTTACTGGTTCCTGTCACGTCCAAGAAGATGAAACAGCTTGATTCTGG
TTCTTCTCGTTCTCTCATCGAAGTTATCGAACTGAAGGTAACATCCATGGGAGATAGGGT
AATGGTGGTGAATGTAACATGTAATAAGAGGACAGACACAATGGTTAAACTTTGTGAAGT
CTTTGAGTCATTGAATCTCAAAATCCTCACTTCCAATCTCAACTTTTTTTTTGGCATGAT
TTTTTACACTCTCTTTATTGAGGCGGATGAAGAAGAACAAGAGGTGGTGAGGCTAAAAAT
AGAAACAGGAATAGAAGCATATAATGAAACTCAAAGCCCTACTTGGAGCATCGACTCTCT
GTACTAATCACTTCTTTTTTTGGTTTTTTATTT*GTTATGTTATTTTTTACAAATTAATA
ATGTGTCTCAGTTTTCGTTTTGTTTGTCCATCACAAAGACTTGTTTTTCGGTTTATATGA
TTTCTCTAATAACCCTACGCATTGATTTGGGGG

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 4

CO CL2140Contig1 789 4 8 U
GACACACTCGGTGCATTAGCACTAGCAACCGAACCTCCCAACGAAGGCTTAATGAAGCGT
CAACCAATCGGTAGAACCGCAAGCTTCATCACCAGAGCCATGTGGAGAAACATCATTGGT
CAAAGCATTTATCAGTTAATCGTCCTCGGCATTCTAAACTTTTCTGGCAAACAAATCCTC
AACCTTGAGGGTCCAGACTCAACAGCCGTTCTCAACACCATCATCTTTAACTCCTTCGTC
TTTTGCCAGGTGTTTAACGAGGTGAACAGCCGAGAGATAGAGAAGATAAGTGTGTTTAAA
GGAATGTTCAACAGCTGGGTGTTTGTTGCTGTGATGACTGCAACAGTTGGATTCCAAGTG
ATCATTGTGGAGTTCCTTGGAGCATTTGCAAGCACTGTTCCTTTGAGCTGGCAACATTGG
CTTCTCTGCATTTTGATTGGTTCCATAAGCATGATTCTAGCCGTTGGTCTTAAATTCATC
CCGGTTGAATCCAACAGTCATCACGATGGATATGAGCTGCTTCCTTCTGGTCCATCTGAC
TCTGCATGACCCAGTTTCTTGGTATGCTTGCTACGTCCTATATTTGAATTTTGTTTCTTT
ATTCTCCATGATAGTGATCTGATTTCAATATGTATAAAATCCAACACGTCATGCGTTACC
GGGGTTTTTGAGTTCTTTCTTTGTCTTTGTGTGTCATCAATAAATGTATTTTTGACTACT
TGTCTTGTTATCTGGATTGTTGATTTTCGATGGTTTCTTTTGGAAATCAAGATAAGAGGA
AAGTGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN69JQ C 63
AF RR2FN69TF U 65
AF RR2FQ67TF U 1
AF RR2FQ67JQ C 531
BS 1 94 RR2FQ67TF
BS 95 95 RR2FN69TF
BS 96 289 RR2FQ67TF
BS 290 291 RR2FN69TF
BS 292 548 RR2FQ67TF
BS 549 549 RR2FN69TF
BS 550 753 RR2FQ67TF
BS 754 789 RR2FQ67JQ

RD RR2FN69JQ 655 0 0
GC
CAATCGGTAGAACCGCAAGCTTCATCACCAGAGCCATGTGGAGAAACATCATTGGTCAAA
GCATTTATCAGTTAATCGTCCTCGGCATTCTAAACTTTTCTGGCAAACAAATCCTCAACC
TTGAGGGTCCAGACTCAACAGCCGTTCTCAACACCATCATCTTTAACTCCTTCGTCTTTT
GCCAGGTGTTTAACGAGGTGAACAGCCGAGAGATAGAGAAGATAAGTGTGTTTAAAGGAA
TGTTCAACAGCTGGGTGTTTGTTGCTGTGATGACTGCAACAGTTGGATTCCAAGTGATCA
TTGTGGAGTTCCTTGGAGCATTTGCAAGCACTGTTCCTTTGAGCTGGCAACATTGGCTTC
TCTGCATTTTGATTGGTTCCATAAGCATGATTCTAGCCGTTGGTCTTAAATTCATCCCGG
TTGAATCCAACAGTCATCACGATGGATATGAGCTGCTTCCTTCTGGTCCATCTGACTCTG
CATGACCCAGTTTCTTGGTATGCTTGCTACGTCCTATATTTGAATTTTGTTTCTTTATTC
TCCATGATAGTGATCTGATTTCAATATGTATAAAATCTAACACGTCATGCGTTACCGGGG
TTTTTGAGTTCTTTCTTTGTCTTTGTGTGTCATCAATAAATGTATTTTTGACT

QA 3 655 3 655
DS 

RD RR2FN69TF 653 0 0
CAATCGGTAGAACCGCAAGCTTCATCACCAGAGCCATGTGGAGAAACATCATTGGTCAAA
GCATTTATCAGTTAATCGTCCTCGGCATTCTAAACTTTTCTGGCAAACAAATCCTCAACC
TTGAGGGTCCAGACTCAACAGCCGTTCTCAACACCATCATCTTTAACTCCTTCGTCTTTT
GCCAGGTGTTTAACGAGGTGAACAGCCGAGAGATAGAGAAGATAAGTGTGTTTAAAGGAA
TGTTCAACAGCTGGGTGTTTGTTGCTGTGATGACTGCAACAGTTGGATTCCAAGTGATCA
TTGTGGAGTTCCTTGGAGCATTTGCAAGCACTGTTCCTTTGAGCTGGCAACATTGGCTTC
TCTGCATTTTGATTGGTTCCATAAGCATGATTCTAGCCGTTGGTCTTAAATTCATCCCGG
TTGAATCCAACAGTCATCACGATGGATATGAGCTGCTTCCTTCTGGTCCATCTGACTCTG
CATGACCCAGTTTCTTGGTATGCTTGCTACGTCCTATATTTGAATTTTGTTTCTTTATTC
TCCATGATAGTGATCTGATTTCAATATGTATAAAATCTAACACGTCATGCGTTACCGGGG
TTTTTGAGTTCTTTCTTTGTCTTTGTGTGTCATCAATAAATGTATTTTTGACT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2FQ67TF 753 0 0
GACACACTCGGTGCATTAGCACTAGCAACCGAACCTCCCAACGAAGGCTTAATGAAGCGT
CAACCAATCGGTAGAACCGCAAGCTTCATCACCATAGCCATGTGGAGAAACATCATTGGT
CAAAGCATTTATCAGTTAATCGTCCTCGGCATTCTAAACTTTTCTGGCAAACAAATCCTC
AACCTTGAGGGTCCAGACTCAACAGCCGTTCTCAACACCATCATCTTTAACTCCTTCGTC
TTTTGCCAGGTGTTTAACGAGGTGAACAGCCGAGAGATAGAGAAGATAAACGTGTTTAAA
GGAATGTTCAACAGCTGGGTGTTTGTTGCTGTGATGACTGCAACAGTTGGATTCCAAGTG
ATCATTGTGGAGTTCCTTGGAGCATTTGCAAGCACTGTTCCTTTGAGCTGGCAACATTGG
CTTCTCTGCATTTTGATTGGTTCCATAAGCATGATTCTAGCCGTTGGTCTTAAATTCATC
CCGGTTGAATCCAACAGTCATCACGATGGATATGAGCTGCTTCCTTCTGGTCCATCTGAC
TCTGCATGGCCCAGTTTCTTGGTATGCTTGCTACGTCCTATATTTGAATTTTGTTTCTTT
ATTCTCCATGATAGTGATCTGATTTCAATATGTATAAAATCCAACACGTCATGCGTTACC
GGGGTTTTTGAGTTCTTTCTTTGTCTTTGTGTGTCATCAATAAATGTATTTTTGACTACT
TGTCTTGTTATCTGGATTGTTGATTTTCGATGG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2FQ67JQ 259 0 0
TCCATCTGACTCTGCATGGCCCAGTTTCTTGGTATGCTTGCTACGTCCTATATTTGAATT
TTGTTTCTTTATTCTCCATGATAGTGATCTGATTTCAATATGTATAAAATCCAACACGTC
ATGCGTTACCGGGGTTTTTGAGTTCTTTCTTTGTCTTTGTGTGTCATCAATAAATGTATT
TTTGACTACTTGTCTTGTTATCTGGATTGTTGATTTTCGATGGTTTCTTTTGGAAATCAA
GATAAGAGGAAAGTGAGAG

QA 1 259 1 259
DS 



AS 1 4

CO CL2141Contig1 653 4 2 U
GACATGGCCTGTGCTGCTAAAACAGAAAGGAACCGGACCAGGAGCAAGAAGCTCTCACGC
CATAGCTCTCGTAGGCAACAAAGTGTACGCCTTTGGGGGCGAGTTCCAGCCCCGTGTCCC
CGTGGACAACCATCTCCACGTTTTCGACCTCCACTCTCTAACATGGTCCATCTAAGATGG
TTAGTTCTCGCCGATTCATCACCAAATAAGCGGCGTTTCTTGTTTTTCCCCGATCAGTTA
TGGCGGAGGAAGATGTCATCGCTTACCCCGTGCAGCCTTCCGACCACAAGCGCAAGCTTG
AGAATGTCGAATCCGAGATCCAAGTAATGTGACGTTTAATGCTTATTACCACAAGACGGG
GAAAGCTTCGGGGGCTGTGACTTTAATGGAGTTGCTACGCTTACTACCACTGATCCAAGT
AGAGGAACGTGTGTGTTCCCTGGAAGGTAACTTTCATCTTCTTCTTGGCAAAATATTAGT
ATTGTAACGAATCAACCTCTCACCGTTTTTGTATCAACTCGGAGAAGATGAACAACTCGT
AGTTCTTTGTTTCTTAATTTTAGTTTCTTTCCTTGCAAAAGTTAAGATAACAATGCTCAG
TCCCAGCATTTGCTATTGTTTTCATGTTCTTGTCTTAATATATCATTTAATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2B855JQ C 1
AF RR2B855TF U 132
AF RR2EW34JQ C 13
AF RR2EW34TF U 1
BS 1 131 RR2EW34TF
BS 132 653 RR2B855TF

RD RR2B855JQ 653 0 0
GACATGGCCTGTGCTGCTAAAACAGAAAGGAACCGGACCAGGAGCAAGAAGCTCTCACGC
CATAGCTCTCGTAGGCAACAAAGTGTACGCCTTTGGGGGCGAGTTCCAGCCCCGTGTCCC
CGTGGACAACCATCTCCACGTTTTCGACCTCCACTCTCTAACATGGTCCATCTAAGATGG
TTAGTTCTCGCCGATTCATCACCAAATAAGCGGCGTTTCTTGTTTTTCCCCGATCAGTTA
TGGCGGAGGAAGATGTCATCGCTTACCCCGTGCAGCCTTCCGACCACAAGCGCAAGCTTG
AGAATGTCGAATCCGAGATCCAAGTAATGTGACGTTTAATGCTTATTACCACAAGACGGG
GAAAGCTTCGGGGGCTGTGACTTTAATGGAGTTGCTACGCTTACTACCACTGATCCAAGT
AGAGGAACGTGTGTGTTCCCTGGAAGGTAACTTTCATCTTCTTCTTGGCAAAATATTAGT
ATTGTAACGAATCAACCTCTCACCGTTTTTGTATCAACTCGGAGAAGATGAACAACTCGT
AGTTCTTTGTTTCTTAATTTTAGTTTCTTTCCTTGCAAAAGTTAAGATAACAATGCTCAG
TCCCAGCATTTGCTATTGTTTTCATGTTCTTGTCTTAATATATCATTTAATCC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2B855TF 522 0 0
ATCTCCACGTTTTCGACCTCCACTCTCTAACATGGTCCATCTAAGATGGTTAGTTCTCGC
CGATTCATCACCAAATAAGCGGCGTTTCTTGTTTTTCCCCGATCAGTTATGGCGGAGGAA
GATGTCATCGCTTACCCCGTGCAGCCTTCCGACCACAAGCGCAAGCTTGAGAATGTCGAA
TCCGAGATCCAAGTAATGTGACGTTTAATGCTTATTACCACAAGACGGGGAAAGCTTCGG
GGGCTGTGACTTTAATGGAGTTGCTACGCTTACTACCACTGATCCAAGTAGAGGAACGTG
TGTGTTCCCTGGAAGGTAACTTTCATCTTCTTCTTGGCAAAATATTAGTATTGTAACGAA
TCAACCTCTCACCGTTTTTGTATCAACTCGGAGAAGATGAACAACTCGTAGTTCTTTGTT
TCTTAATTTTAGTTTCTTTCCTTGCAAAAGTTAAGATAACAATGCTCAGTCCCAGCATTT
GCTATTGTTTTCATGTTCTTGTCTTAATATATCATTTAATCC

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2EW34JQ 641 0 0
GCTGCTAAAACAGAAAGGAACCGGACCAGGAGCAAGAAGCTCTCACGCCATAGCTCTCGT
AGGCAACAAAGTGTACGCCTTTGGGGGCGAGTTCCAGCCCCGTGTCCCCGTGGACAACCA
TCTCCACGTTTTCGACCTCCACTCTCTAACATGGTCCATCTAAGATGGTTAGTTCTCGCC
GATTCATCACCAAATAAGCGGCGTTTCTTGTTTTTCCCCGATCAGTTATGGCGGAGGAAG
ATGTCATCGCTTACCCCGTGCAGCCTTCCGACCACAAGCGCAAGCTTGAGAATGTCGAAT
CCGAGATCCAAGTAATGTGACGTTTAATGCTTATTACCACAAGACGGGGAAAGCTTCGGG
GGCTGTGACTTTAATGGAGTTGCTACGCTTACTACCACTGATCCAAGTAGAGGAACGTGT
GTGTTCCCTGGAAGGTAACTTTCATCTTCTTCTTGGCAAAATATTAGTATTGTAACGAAT
CAACCTCTCACCGTTTTTGTATCAACTCGGAGAAGATGAACAACTCGTAGTTCTTTGTTT
CTTAATTTTAGTTTCTTTCCTTGCAAAAGTTAAGATAACAATGCTCAGTCCCAGCATTTG
CTATTGTTTTCATGTTCTTGTCTTAATATATCATTTAATCC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2EW34TF 653 0 0
GACATGGCCTGTGCTGCTAAAACAGAAAGGAACCGGACCAGGAGCAAGAAGCTCTCACGC
CATAGCTCTCGTAGGCAACAAAGTGTACGCCTTTGGGGGCGAGTTCCAGCCCCGTGTCCC
CGTGGACAACCATCTCCACGTTTTCGACCTCCACTCTCTAACATGGTCCATCTAAGATGG
TTAGTTCTCGCCGATTCATCACCAAATAAGCGGCGTTTCTTGTTTTTCCCCGATCAGTTA
TGGCGGAGGAAGATGTCATCGCTTACCCCGTGCAGCCTTCCGACCACAAGCGCAAGCTTG
AGAATGTCGAATCCGAGATCCAAGTAATGTGACGTTTAATGCTTATTACCACAAGACGGG
GAAAGCTTCGGGGGCTGTGACTTTAATGGAGTTGCTACGCTTACTACCACTGATCCAAGT
AGAGGAACGTGTGTGTTCCCTGGAAGGTAACTTTCATCTTCTTCTTGGCAAAATATTAGT
ATTGTAACGAATCAACCTCTCACCGTTTTTGTATCAACTCGGAGAAGATGAACAACTCGT
AGTTCTTTGTTTCTTAATTTTAGTTTCTTTCCTTGCAAAAGTTAAGATAACAATGCTCAG
TCCCAGCATTTGCTATTGTTTTCATGTTCTTGTCTTAATATATCATTTAATCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL2142Contig1 791 2 9 U
AGTGGGTTCTATAAAATATGTTAAGCAATGATTGGAGGTATACATAACTAAACTGCATCA
AAAAGTTTTAAGTGATAGGAAACTGAACATCTCTACTGAACCATACAAACAACATATATA
TGAATATGTAAAGAAAGATATCAAAAAGAAAACGAAACGTTAAGCCGCTATAAAACGAAT
TTTTTTAATCGTTGTATGCTTTGATTCCAACAAAGAAATCTATTGTGAATCTTGTTTTTT
TGGATGCAGTTTCTGGCTATCATGGTGATCACTCGAGATCTCTGAGGCTTTCACTTGTCA
ACCAGAGCTTCTTCTGGACAACGAGTATCACATCCCAATCATGGTCCGAATCCGAGGCTG
CCTTGGTTTCAACTGCTTCCCAATGCAAAGCCTTGAAATACTTCTTCACAAGATCAACGA
CAGACTGTTTGTTCCTTATGAGTATGAAACCGGTTGGCCGAAGTATACGGTCCATCTCTA
ACAGCAAATCCTCTGCGCTGCAACCTCTCTTCTTGACATCAGAAATGATGTCCCAAGCAT
GGAGTAGATCGTAAGTCCCTGGGTAAGTGGAGAAGGCTTCACACCAGTTGTGAACAGCAC
CCATCAGGCCTCTGTCGTATATCAGTTTAAGCGTGTTAGGGCCGTCTTCAGGAACAACAT
TCATAACCCAAACATCTTTGTCATTCAGAGCAGCAGCAAAGGAACCCATGTTTGCTTTCA
TGTCCATTATGTTCCTCACTGTGTCTGATTGAATTGCAGAACTCAAGAGATCCCAGTAAG
CATCTACCCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F855JQ U 66
AF RR2F137JQ U 1
BS 1 86 RR2F137JQ
BS 87 87 RR2F855JQ
BS 88 335 RR2F137JQ
BS 336 336 RR2F855JQ
BS 337 337 RR2F137JQ
BS 338 338 RR2F855JQ
BS 339 396 RR2F137JQ
BS 397 397 RR2F855JQ
BS 398 791 RR2F137JQ

RD RR2F855JQ 352 0 0
TTTTAAG
TGATAGGAAACTGAACATCTCTACTGAACCATACAAACAACATATATATGAATATGTAAA
GAAAGATATCAAAAAGAAAACGAAACGTTAAGCCGCTATAAAACGAATTTTTTTAATCGT
TGTATGCTTTGATTCCAACAAAGAAATCTATTGTGAATCTTGTTTTTTTGGATGCAGTTT
CTGGCTATCATGGTGATCACTCGAGATCTCTGAGGCTTTCACTTGTCAACCAGAGCTTCT
TCTGGACAACGAGTATCACATCCCAATCATGGTCCGAATCCGAGGCTGCCTTGGTTTCAA
CTGCTTCCCAATGCAAAGCCTTGAAATACTTCTTCACAAGATCAA

QA 8 352 8 352
DS 

RD RR2F137JQ 791 0 0
AGTGGGTTCTATAAAATATGTTAAGCAATGATTGGAGGTATACATAACTAAACTGCATCA
AAAAGTTTTAAGTGATAGGAAACTGAGCATCTCTACTGAACCATACAAACAACATATATA
TGAATATGTAAAGAAAGATATCAAAAAGAAAACGAAACGTTAAGCCGCTATAAAACGAAT
TTTTTTAATCGTTGTATGCTTTGATTCCAACAAAGAAATCTATTGTGAATCTTGTTTTTT
TGGATGCAGTTTCTGGCTATCATGGTGATCACTCGAGATCTCTGAGGCTTTCACTTGTCA
ACCAGAGCTTCTTCTGGACAACGAGTATCACATCCGAGTCATGGTCCGAATCCGAGGCTG
CCTTGGTTTCAACTGCTTCCCAATGCAAAGCCTTGAGATACTTCTTCACAAGATCAACGA
CAGACTGTTTGTTCCTTATGAGTATGAAACCGGTTGGCCGAAGTATACGGTCCATCTCTA
ACAGCAAATCCTCTGCGCTGCAACCTCTCTTCTTGACATCAGAAATGATGTCCCAAGCAT
GGAGTAGATCGTAAGTCCCTGGGTAAGTGGAGAAGGCTTCACACCAGTTGTGAACAGCAC
CCATCAGGCCTCTGTCGTATATCAGTTTAAGCGTGTTAGGGCCGTCTTCAGGAACAACAT
TCATAACCCAAACATCTTTGTCATTCAGAGCAGCAGCAAAGGAACCCATGTTTGCTTTCA
TGTCCATTATGTTCCTCACTGTGTCTGATTGAATTGCAGAACTCAAGAGATCCCAGTAAG
CATCTACCCTA

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 3

CO CL2143Contig1 1165 3 11 U
AAAGACGCTTGCTTAGGAGACAACAATTCAATCACATAGAGGAGAGAGAGAGAAATAAAA
GCTCCGAGAGAACGAACGAGAAGGGTAGTTTACAAACAACAAACGCTTTGAGCTGAGAAG
ACCAGAACAAGTCCTCTTCTGTGTGACCAGTCGACAAATGTGGAGATGAGTTAGCAAAAA
AAAAAGATGGTCTTCAAAGGACTATGAAGTGGGGACTCCATAGTTGTTTGAAGACGACGT
CTCGTGAGCACCTGATTGAGCATTGTTCTTCCTCCTGTTTCTTCTCCCGCCATTGTTCTT
CCCCTTCTTGAACTCCTGCTGATGTTCCACCCCTAAAGAGAAGGTGTGATGAGCTCTGGG
ATCAAACGCGAAAGGATCATTCGTCCCCATCGAGTTTGTCTCAAACGGTGACTGCTGAAC
GTTAGTGTCAAAAGCAAAGTTACAAGAGGAAGTGAAAGTTGAAGAAGATGAAGACGAGGA
GAATGCTGAAGCGTCTCCTTGAAACATCTCATTAAACAGATCTTGCAACTGTTCAAAACT
GTCTCCTGAGTTATTCTCACTAGGCTTTGACTGATTCATCATGGTAGCCATCTCGTTCAA
AAAATCTCCCATCCCGTTTTGGTCATGATCATCATCATCACTATTGTAAGCTCCAACGTC
GTAGAGGAACCTCTTGTTGGAGTCAGACAAAACAGAATAGGCCTCTTGGATAGCCTGAAA
CTTCTTCTTTGATTCATCTACAAACTCCGAATCCCCCATTGATGAACAACGATCTGGATG
CCATCTAAGACCAAGCTTCTTGTAAGCAGAACGGAGCTCGGTGGTGGTGCATTCCTTCTT
CAAACCCAGAACACCATACAAATCATCGTTCCCTTTCGACGCCATTACCTTACAAGAAGA
CAAAAAAAAAAATATTCTTTCGATGAATTCAACTACCAAAAAAACAGAGCCACAGTTCAA
TATCTATAAGAACTTTGGTACTATAGTGAGTGGATTCAACGGACTCGAGGCAATGGTCTT
CTGGATGATTAGGGATTGATAGGAGATCGTAGACGATCAAAGAAGAAGTTTGGAGACGAG
AGGGGAGAAAATGTTTTTTTTTGTTGGTGTCTCCTCTGTATCTCTCCTCTGTATCTCTCA
AGCATACACGTTTTAGAGAGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ40JQ U 1
AF RR2CM81JQ U 17
AF RR2CM81TF C 483
BS 1 33 RR2FJ40JQ
BS 34 34 RR2CM81JQ
BS 35 648 RR2FJ40JQ
BS 649 649 RR2CM81JQ
BS 650 665 RR2FJ40JQ
BS 666 790 RR2CM81JQ
BS 791 791 RR2CM81TF
BS 792 810 RR2CM81JQ
BS 811 811 RR2CM81TF
BS 812 827 RR2CM81JQ
BS 828 1165 RR2CM81TF

RD RR2FJ40JQ 665 0 0
AAAGACGCTTGCTTAGGAGACAACAATTCAATCGCATAGAGGAGAGAGAGAGAAATAAAA
GCTCCGAGAGAACGAACGAGAAGGGTAGTTTACAAACAACAAACGCTTTGAGCTGAGAAG
ACCAGAACAAGTCCTCTTCTGTGTGACCAGTCGACAAATGTGGAGATGAGTTAGCAAAAA
AAAAAGATGGTCTTCAAAGGACTATGAAGTGGGGACTCCATAGTTGTTTGAAGACGACGT
CTCGTGAGCACCTGATTGAGCATTGTTCTTCCTCCTGTTTCTTCTCCCGCCATTGTTCTT
CCCCTTCTTGAACTCCTGCTGATGTTCCACCCCTAAAGAGAAGGTGTGATGAGCTCTGGG
ATCAAACGCGAAAGGATCATTCGTCCCCATCGAGTTTGTCTCAAACGGTGACTGCTGAAC
GTTAGTGTCAAAAGCAAAGTTACAAGAGGAAGTGAAAGTTGAAGAAGATGAAGACGAGGA
GAATGCTGAAGCGTCTCCTTGAAACATCTCATTAAACAGATCTTGCAACTGTTCAAAACT
GTCTCCTGAGTTATTCTCACTAGGCTTTGACTGATTCATCATGGTAGCCATCTCGTTCAA
AAAATCTCCCATCCCGTTTTGGTCATGATCATCATCATCACTATTGTAGGCTCCAACGTC
GTAGA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2CM81JQ 811 0 0
GG
GACAACAATTCAATCACATAGTGGAGAGAGAGAGAAATAAAAGCTCCGAGAGAACGAACG
AGAAGGGTAGTTTACAAACAACAAACGCTTTGAGCTGAGAAGACCAGAACAAGTCCTCTT
CTGTGTGACCAGTCGACAAATGTGGAGATGAGTTAGCAAAAAAAAA*GATGGTCTTCAAA
GGACTATGAAGTGGGGACTCCATAGTTGTTTGAAGACGACGTCTCGTGAGCACCTGATTG
AGCATTGTTCTTCCTCCTGTTTCTTCTCCCGCCATTGTTCTTCCCCTTCTTGAACTCCTG
CTGATGTTCCACCCCTAAAGAGAAGGTGTGATGAGCTCTGGGATCAAACGCGAAAGGATC
ATTCGTCCCCATCGAGTTTGTCTCAAACGGTGACTGCTGAACGTTAGTGTCAAAAGCAAA
GTTACAAGAGGAAGTGAAAGTTGAAGAAGATGAAGACGAGGAGAATGCTGAAGCGTCTCC
TTGGAACATCTCATTAAACAGATCTTGCAACTGTTCAAAACTGTCTCCTGAGTTATTCTC
ACTAGGCTTTGACTGATTCATCATGGTAGCCATCTCGTTCAAAAAATCTCCCATCCCGTT
TTGGTCATGATCATCATCATCACTATTGTAAGCTCCAACGTCGTAGAGGAACCTCTTGTT
GGAGTCAGACAAAACAGAATAGGCCTCTTGGATAGCCTGAAACTTCTTCTTTGATTCATC
TACAAACTCCGAATCCCCCATTGATGAACAACGATCTGGATGCCATCTAAGAGCAAGCTT
CTTGTAAGCAGA*CGGAGCTCGGTGGTGG

QA 3 811 3 811
DS 

RD RR2CM81TF 683 0 0
ATGCTGAAGCGTCTCCTTGAAACATCTCATTAAACAGATCTTGCAACTGT*CAAAACTGT
CTCCTGAGTTATTCTCACTAGGCTTTGACTGATTCATCATGGTAGCCATCTCGTTCAAAA
AATCTCCCATCCCGTTTTGGTCATGATCATCATCATCACTATTGTAAGCTCCAACGTCGT
AGAGGAACCTCTTGTTGGAGTCAGACAAAACAGAATAGGCCTCTTGGATAGCCTGAAACT
TCTTCTTTGATTCATCTACAAACTCCGAATCCCCCATTGATGAACAACGATCTGGATGCC
ATCTAAGACCAAGCTTCTTGTAAGCAGAACGGAGCTCGGTGGTGGTGCATTCCTTCTTCA
AACCCAGAACACCATACAAATCATCGTTCCCTTTCGACGCCATTACCTTACAAGAAGACA
AAAAAAAAAATATTCTTTCGATGAATTCAACTACCAAAAAAACAGAGCCACAGTTCAATA
TCTATAAGAACTTTGGTACTATAGTGAGTGGATTCAACGGACTCGAGGCAATGGTCTTCT
GGATGATTAGGGATTGATAGGAGATCGTAGACGATCAAAGAAGAAGTTTGGAGACGAGAG
GGGAGAAAATGTTTTTTTTTGTTGGTGTCTCCTCTGTATCTCTCCTCTGTATCTCTCAAG
CATACACGTTTTAGAGAGAATCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 3

CO CL2144Contig1 1158 3 8 U
GCTTGTTCTCTTATTTAAACATTATTTTAATAATTTTTTTGACACCGTTATTTTTATTGC
CTTGGGTCACAGGCAACCTGATCAAACCCTCAAATATTTTTTTTAAGAAAAGATACAACA
AGACACCACCATCTGTTTTGAACTTTTGAATAACTTCAATCAAACTCCAGGAATGGGGAA
ACGAGAGGTGAAGGACTCGACTCTCTCCTTGAGACTCTCCACTTTCTCTTTCAACGAGAA
ATCAGGAGATGTCACCAGCTTGGTGAACTCTCCAAGCCTTGATCCCGAAACCAGCTTCTT
CGCTTCCATTGTTATCTCAACTCCTTCCTTGATCAAGTCAGCAACCACCACAAAGTCTTT
CTCTGTTAGTCCTCTTGTCGTCATCGCAGGCGTTCCTATCCTTATCCCCCCTGGAACCAA
CGCACTCTTATCCCCAGGGACAGAGTTCTTGTTGAGTGTAATCGATGCCATGTCTAAGAT
TTTCTCTACCCGAGCACCATCCATGCCCAATGGTCTAAGATCGACAAGGACCAGATGATT
GTCGCTGCCACCAGACACCAGATCAAACCCAAGTTCAACCAATCGGTTAGCTAGAGCCCT
ACAGTTAGCCACAACTCTTTTCTGGTAAGCTTTGAATTCCGGCGACTGTGCATGTTTCAA
GCAGACTGCTAATCCACCAATTGTGTGATTATGAGGGCCACCCTGCAGACCAGGGAAGAC
AGCATTGTTAATGGCAGATTCAAGTTCAACCCCATTAACTGGGTCCTTCTTGAAGAAGAT
CATGCCACCTCTCGGACCTCTCAAAGACTTGTGAGTGATTGTTGTGACGATATCACAATA
CTCAAAAGGATCAGCTACCACAGAGGCAGCCACAAGTCCACTGATGTGAGCCATATCCAT
CATCAGAAAAGCACCAACTGAGTCTGCGATCTTCCTCATGCGAGGATAGTCAAAATCTCG
GCTGTATGCACTAGCTCCAGCAATAATAAGCTTTGGTCGGAACAGTGCAGCAGTTTTCTC
GAGCATATCATAGTCCACAATGCCTGTTGATTCATCAAGTCGATAAGGCATGGACTCAAA
GTATATTGAAGTTCCAGATACACGCCTTTTGGCAGTCATGAACCCATGTGACAGATGGCC
GCCATGAGGTAAATCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ24JQ U 17
AF RR2BC17JQ U 1
AF RR2CQ24TF C 433
BS 1 266 RR2BC17JQ
BS 267 267 RR2CQ24JQ
BS 268 277 RR2BC17JQ
BS 278 278 RR2CQ24JQ
BS 279 288 RR2BC17JQ
BS 289 289 RR2CQ24JQ
BS 290 685 RR2BC17JQ
BS 686 1158 RR2CQ24TF

RD RR2CQ24JQ 536 0 0
AAACATTATTTTAATAATTTTTTTGACACCGTTATTTTTATTGCCTTGGGTCACAGGCAA
CCTGATCAAACCCTCAAATATTTTTTTTAAGAAAAGATACAACAAGACACCACCATCTGT
TTTGAACTTTTGAATAACTTCAATCAAACTCCAGGAATGGGGAAACGAGAGGTGAAGGAC
TCGACTCTCTCCTTGAGACTCTCCACTTTCTCTTTCAACGAGAAATCAGGAGATGTCACC
AGCTTGGTGAACTCTCCAAGCCTTGATCCCGAAACCAGCTTCTTCGCTTCCATTGTTATC
TCAACTCCTTCCTTGATCAAGTCAGCAACCACCACAAAGTCTTTCTCTGTTAGTCCTCTT
GTCGTCATCGCAGGCGTTCCTATCCTTATCCCCCCTGGAACCAACGCACTCTTATCCCCA
GGGACAGAGTTCTTGTTGAGTGTAATCGATGCCATGTCTAAGATTTTCTCTACCCGAGCA
CCATCCATGCCCAATGGTCTAAGATCGACAAGGACCAGATGATTGTCGCTGCCACC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2BC17JQ 685 0 0
GCTTGTTCTCTTATTTAAACATTATTTTAATAATTTTTTTGACACCGTTATTTTTATTGC
CTTGGGTCACAGGCAACCTGATCAAACCCTCAAATATTTTTTTTAAGAAAAGATACAACA
AGACACCACCATCTGTTTTGAACTTTTGAATAACTTCAATCAAACTCCAGGAATGGGGAA
ACGAGAGGTGAAGGACTCGACTCTCTCCTTGAGACTCTCCACTTTCTCTTTCAACGAGAA
ATCAGGAGATGTCACCAGCTTGGTGAGCTCTCCAAGCTTTGATCCCGAGACCAGCTTCTT
CGCTTCCATTGTTATCTCAACTCCTTCCTTGATCAAGTCAGCAACCACCACAAAGTCTTT
CTCTGTTAGTCCTCTTGTCGTCATCGCAGGCGTTCCTATCCTTATCCCCCCTGGAACCAA
CGCACTCTTATCCCCAGGGACAGAGTTCTTGTTGAGTGTAATCGATGCCATGTCTAAGAT
TTTCTCTACCCGAGCACCATCCATGCCCAATGGTCTAAGATCGACAAGGACCAGATGATT
GTCGCTGCCACCAGACACCAGATCAAACCCAAGTTCAACCAATCGGTTAGCTAGAGCCCT
ACAGTTAGCCACAACTCTTTTCTGGTAAGCTTTGAATTCCGGCGACTGTGCATGTTTCAA
GCAGACTGCTAATCCACCAATTGTG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2CQ24TF 726 0 0
CCCAGGGACAGAGTTCTTGTTGAGTGTAATCGATGCCATGTCTAAGATTT*CTCTACCCG
AGCACCATCCATGCCCAATGGTCTAAGATCGACAAGGACCAGATGATTGTCGCTGCCACC
AGACACCAGATCAAACCCAAGTTCAACCAATCGGTTAGCTAGAGCCCTACAGTTAGCCAC
AACTCTTTTCTGGTAAGCTTTGAATTCCGGCGACTGTGCATGTTTCAAGCAGACTGCTAA
TCCACCAATTGTGTGATTATGAGGGCCACCCTGCAGACCAGGGAAGACAGCATTGTTAAT
GGCAGATTCAAGTTCAACCCCATTAACTGGGTCCTTCTTGAAGAAGATCATGCCACCTCT
CGGACCTCTCAAAGACTTGTGAGTGATTGTTGTGACGATATCACAATACTCAAAAGGATC
AGCTACCACAGAGGCAGCCACAAGTCCACTGATGTGAGCCATATCCATCATCAGAAAAGC
ACCAACTGAGTCTGCGATCTTCCTCATGCGAGGATAGTCAAAATCTCGGCTGTATGCACT
AGCTCCAGCAATAATAAGCTTTGGTCGGAACAGTGCAGCAGTTTTCTCGAGCATATCATA
GTCCACAATGCCTGTTGATTCATCAAGTCGATAAGGCATGGACTCAAAGTATATTGAAGT
TCCAGATACACGCCTTTTGGCAGTCATGAACCCATGTGACAGATGGCCGCCATGAGGTAA
ATCCAC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 3

CO CL2145Contig1 1224 3 15 U
AAACGGGAAAATATATATATATTTCTACGTTCTCCGTGTAAAATCTTGACTAAAAATATA
TACAACCTGTTGTATAAAAACTGAAATGATAGGGGGAAAAGGAAATAATAACGACAAGAT
GATCAAGATTCAAGACAAGAGAGGCTTCTTAGGGTCAAACTCACTCTCAAAAATATCAAT
CTCTGATAATCCTTCTTTGCCTTTAGCCCACAACACTAGATATAGTCCTATAAACATCAA
AGCCATCCCTCCCACACTTCCAATTCTAACGGGTTCTCCTAATGTAACAACGGAAAAACC
AACGGAAATAACCGTAGCAATAGGACTAAACATTGATACCATAACCGGTCCACGTTTCTT
CATCGCCCACCCATTGAAGCTAACACATGCTCCACTCACCATCCCTCCCAAAAGAAAAAA
ACCAACGAGGTTACTGATGCTAACTAATGACCTGGTAACTATTTTAGTGTTCGGGTTTCG
TAATAACTGTAACATTATTGTTATCACCACTCCTATCAATGACGTTATTGCACTTAACGA
TATTGGTGCTGGAAACTCTGCCAATGTCGATGC****CTGAAGAACGACGTTGGAGGATA
AGACAAGGACAGCTCCGAGGAGGTACATGCATCCCACGACTCTGTCACGATCAAACACGA
ATATTGAAGCATTATCTTTTTCATCTTGTATGATCGAAGCGCTGTGCATTAAGCTCATTG
TCAAAGCGCCGAATACGCACAACAACGTCCCTAAGATCTTCAGTTTGCTGTACATACATT
TCATATTCATCTTCTCTAACCTAACCATCCAGGCGATGAAAAAAATGAGACCAGGAGCGA
GATTAGGCATCGCTGTGGCCATTGCTGGTGATGTCAACCTAATTCCTTCCAGAAACAGAG
TTTGGAACAGAGTAACCCCTGCAAAGGAGATCAAAACTAGTTTACCGATCAGCCTCGGGC
TGAGCTCATTTGGCCACTGCTTCCTTTCGAAGAGAATGGCAAAAGGGGAGAGGATTATGA
AGGTGGCAAAGGTAGAGAAGATGACAATAGTTAAAGGACCGAGACCGAGTGACATCAAAT
AACTCATGAGCAAAGAGTTGCCTGCGTACACAAATTGTACCATTACTAAACCTCCTACAA
TCACCACCTCTTCTATCATCTCCTTCTTCATCTTAGAAATCGATTGATAGAGTTTGGCGG
AAAGAAACTTCATTTTCAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO21JQ U 1
AF RR2CV82JQ U 6
AF RR2CV82TF C 526
BS 1 44 RR2EO21JQ
BS 45 45 RR2CV82JQ
BS 46 95 RR2EO21JQ
BS 96 96 RR2CV82JQ
BS 97 318 RR2EO21JQ
BS 319 319 RR2CV82JQ
BS 320 478 RR2EO21JQ
BS 479 479 RR2CV82JQ
BS 480 573 RR2EO21JQ
BS 574 577 RR2CV82JQ
BS 578 583 RR2EO21JQ
BS 584 584 RR2CV82JQ
BS 585 599 RR2EO21JQ
BS 600 798 RR2CV82JQ
BS 799 1224 RR2CV82TF

RD RR2EO21JQ 599 0 0
AAACGGGAAAATATATATATATTTCTACGTTCTCCGTGTAAAATGTTGACTAAAAATATA
TACAACCTGTTGTATAAAAACTGAAATGATAGGGG*AAAAGGAAATAATAACGACAAGAT
GATCAAGATTCAAGACAAGAGAGGCTTCTTAGGGTCAAACTCACTCTCAAAAATATCAAT
CTCTGATAATCCTTCTTTGCCTTTAGCCCACAACACTAGATATAGTCCTATAAACATCAA
AGCCATCCCTCCCACACTTCCAATTCTAACGGGTTCTCCTAATGTAACAACGGAAAAACC
AACGGAAATAACCGTAGCGATAGGACTAAACATTGATACCATAACCGGTCCACGTTTCTT
CATCGCCCACCCATTGAAGCTAACACATGCTCCACTCACCATCCCTCCCAAAAGAAAAAA
ACCAACGAGGTTACTGATGCTAACTAATGACCTGGTAACTATTTTAGTGTTCGGGTTTTG
TAATAACTGTAACATTATTGTTATCACCACTCCTATCAATGACGTTATTGCACTTAACGA
TATTGGTGCTGGAAACTCTGCCAATGTCGATGCTTACCTGAAGGACGACGTTGGAGGAT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2CV82JQ 799 0 0
GGGGAAA
ATATATATATTTCTATGTTCTCCGTGTAAAATCTTGACTAGAAATATATACAACCTGTTG
TATAGAAACTGAAATGATAGGGGGAAAAGGAAATAATAACGACAAGATGATCAAGATTCA
AGACAAGAGAGGCTTCTTAGGGTCAAACTCACTCTCAAAAATATCAATCTCTGATAATCC
TTCTTTGCCTTTAGCCCACAACACTAGATATAGTCCTATAAACATCAAAGCCATCCCTCC
CACACTTCCAATTCTAACGGGTTCTCCTAATGTAACAACGGAGAAACCAACGGAAATAAC
CGTAGCAATAGGACTAAACATTGATACCATAACCGGTCCACGTTTCTTCATCGCCCACCC
ATTGAAGCTAACACATGCTCCACTCACCATCCCTCCCAAAAGAGAAAAACCAACGAGGTT
ACTGATGCTAACTAATGACCTGGTAACTATTTTAGTGTTCGGGTTTCGTAATAACTGTAA
CATTGTTGTTATCACCACTCCTATCAATGACGTTATTGCACTTAACGATATTGGTGCTGG
AAACTCTGCCAATGTCGATGC****CTGAAGAACGACGTTGGAGGATAAGACAAGGACAG
CTCCGAGGAGGTACATGCATCCCACGACTCTGTCACGATCAAACACGAATATTGAAGCAT
TATCTTTTTCATCTTGTATGATCGAAGCGCTGTGCATTAAGCTCATTGTCAAAGCGCCGA
ATACGCACAACAACGTCCCTAAGATCTTCAGTTTGCTGTACATACATTTCATATTCATCT
TCTCTA
CCTAAC

QA 8 793 8 793
DS 

RD RR2CV82TF 699 0 0
TATTGCACTTAACGATATTGGTGCTGGAAACTCTGCCAATGTCGATGC*****TGAAGAA
CGACGTTGGAGGATAAGACAAGGACAGCTCCGAGGAGGTACATGCATCCCACGACTCTGT
CACGATCAAACACGAATATTGAAGCATTATCTTTTTCATCTTGTATGATCGAAGCGCTGT
GCATTAAGCTCATTGTCAAAGCGCCGAATACGCACAACAACGTCCCTAAGATCTTCAGTT
TGCTGTACATACATTTCATATTCATCTTCTCTAACCTAACCATCCAGGCGATGAAAAAAA
TGAGACCAGGAGCGAGATTAGGCATCGCTGTGGCCATTGCTGGTGATGTCAACCTAATTC
CTTCCAGAAACAGAGTTTGGAACAGAGTAACCCCTGCAAAGGAGATCAAAACTAGTTTAC
CGATCAGCCTCGGGCTGAGCTCATTTGGCCACTGCTTCCTTTCGAAGAGAATGGCAAAAG
GGGAGAGGATTATGAAGGTGGCAAAGGTAGAGAAGATGACAATAGTTAAAGGACCGAGAC
CGAGTGACATCAAATAACTCATGAGCAAAGAGTTGCCTGCGTACACAAATTGTACCATTA
CTAAACCTCCTACAATCACCACCTCTTCTATCATCTCCTTCTTCATCTTAGAAATCGATT
GATAGAGTTTGGCGGAAAGAAACTTCATTTTCAGAAAAA

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 4

CO CL2146Contig1 1096 4 6 U
GGAAAGTAGATTTGATTTTCCCACTTTACACTTTGCTCTCTCTCTCCACCGCTCCTGCGA
CAATGTCGGCTGCTTTCATTCCTTTAGATCATCAATCTCACCACAACATCCTCATGGATT
CCCAGCCTACTACTTCCCCTGTGAAAACAGTGAAGATTAGCAATGTTTCACTCAACGTTT
CCAAGAAAGATCTCAATGAGTTCTTTTCTTTCTCTGGTGACATTCACTACGTCGAGATCG
AAGCGAGACGCAAGAAACTCAGCTTGCTTTTGTTACTTTCAAGGATCCACAAGGCGCAGA
AACTGCCATGCTCTTAACGGGAGCTGTCATTGCTGATCATCGTGTTAGTATTACTCCTGC
TTTGAACTACGAGCTACCACCAGAAGCCCTTGCACTTGACTCGGAATATTCATTTAATGG
CTTCACTGTGAAGAAAGCTGAACATGTAGTCAGCATCATGATGGAAAGAGGTTACGCTGT
CGGCAAAGACGCAATGGAGAAAGCCAAAGCCTTTGACGACAAACACAACTTGGTCTCAAA
CGCTTCAGCAACCATCGCCTCCCTCGACAACAAGATTGGTCTGAGCGAGAAGCTAAGCAT
GGGAACAACTGTTGTGAACGAGAAGCTGAGAGAGGTGGACGAGCGGTATCAAGTGAGGGA
GATCACGAAATCCGCTTTAGCAGCTGCTGAGGAGAGAGCGATCAGCGCAGGCACAGCTTT
CATGGCCAACCCGTACGTCTCTAGCGGAGCTTCTTGGTTATCAAACGCGTTCGGTGCAGT
GACAAAGGCCGTTAGAGCTGAGAATGGAGTAGAAGGGGGGAGGAAAGAGATTATTCAGCT
TGATGACACTTCACCTAAAGCTCCTGCTGTTGTTCCCGTTAGCTCGGTGGACACAGACTT
CATCAACAAACCAAGTTTCTAAAAGATTTGCATTGTCTCAAACTCTCATTCTTTGTGCAT
ATATATGCTTTTACATATTCATTTGTCTTCTTTTCATTGCACAAACATAAACCTTATTGT
TGTTTTGTTGGTTCTCGTTGTTTAGAAATTTTAATAATATAATTCAGCGGAAAAAAAATA
TAAACCTTATTGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2FA80TF U 1
AF RR2FA80JQ C 558
AF RR2BY05JQ C 573
AF RR2BY05TF U 573
BS 1 710 RR2FA80TF
BS 711 711 RR2BY05TF
BS 712 773 RR2FA80TF
BS 774 774 RR2BY05TF
BS 775 785 RR2FA80TF
BS 786 1096 RR2BY05TF

RD RR2FA80TF 797 0 0
GGAAAGTAGATTTGATTTTCCCACTTTACACTTTGCTCTCTCTCTCCACCGCTCCTGCGA
CAATGTCGGCTGCTTTCATTCCTTTAGATCATCAATCTCACCACAACATCCTCATGGATT
CCCAGCCTACTACTTCCCCTGTGAAAACAGTGAAGATTAGCAATGTTTCACTCAACGTTT
CCAAGAAAGATCTCAATGAGTTCTTTTCTTTCTCTGGTGACATTCACTACGTCGAGATCG
AAGCGAGACGCAAGAAACTCAGCTTGCTTTTGTTACTTTCAAGGATCCACAAGGCGCAGA
AACTGCCATGCTCTTAACGGGAGCTGTCATTGCTGATCATCGTGTTAGTATTACTCCTGC
TTTGAACTACGAGCTACCACCAGAAGCCCTTGCACTTGACTCGGAATATTCATTTAATGG
CTTCACTGTGAAGAAAGCTGAACATGTAGTCAGCATCATGATGGAAAGAGGTTACGCTGT
CGGCAAAGACGCAATGGAGAAAGCCAAAGCCTTTGACGACAAACACAACTTGGTCTCAAA
CGCTTCAGCAACCATCGCCTCCCTCGACAACAAGATTGGTCTGAGCGAGAAGCTAAGCAT
GGGAACAACTGTTGTGAACGAGAAGCTGAGAGAGGTGGACGAGCGGTATCAAGTGAGGGA
GATCACGAAATCCGCTTTAGCAGCTGCTGAGGAGAGAGCGATCAGCGCAG*CACAGCTTT
CATGGCCAACCCGTACGTCTCTAGCGGAGCTTCTTGGTTATCAAACGCGTTCG*TGCAGT
GACAA
GCCGTTAGAGCT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2FA80JQ 539 0 0
CCTCCCTCGACAACAAGATTGGTCTGAGCGAGAAGCTAAGCATGGGAACAACTGTTGTGA
ACGAGAAGCTGAGAGAGGTGGACGAGCGGTATCAAGTGAGGGAGATCACGAAATCCGCTT
TAGCAGCTGCTGAGGAGAGAGCGATCAGCGCAGGCACAGCTTTCATGGCCAACCCGTACG
TCTCTAGCGGAGCTTCTTGGTTATCAAACGCGTTCGGTGCAGTGACAAAGGCCGTTAGAG
CTGAGAATGGAGTAGAAGGGGGGAGGAAAGAGATTATTCAGCTTGATGACACTTCACCTA
AAGCTCCTGCTGTTGTTCCCGTTAGCTCGGTGGACACAGACTTCATCGACAAACCAAGTT
TTTAAAAGATTTGCATTGTCTCAAACTCTCATTCTTTGTGCATATATATGCTTTTACATA
TTCATTTGTCTTCTTTTCATTGCACAAACATAAACCTTATTGTTGTTTTGTTGGTTCTCG
TTGTTTAGAAATTTTAATAATATAATTCAGCGGAAAAAAAATATAAACCTTATTGTTAC

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2BY05JQ 524 0 0
G
GATTGGTCTGAGCGAGAAGCTAAGCATGGGAACAACTGTTGTGAACGAGAAGCTGAGAGA
GGTGGACGAGCGGTATCAAGTGAGGGAGATCACGAAATCCGCTTTAGCAGCTGCTGAGGA
GAGAGCGATCAGCGCAGGCACAGCTTTGATGGCCAACCCGTACGTCTCTAGCGGAGCTTC
TTGGTTATCAAACGCGTTCGGTGCAGTGACAAAGGCCGTTAGAGCTGAGAATGGAGTAGA
AGGGGGGAGGAAAGAGATTATTCAGCTTGATGACACTTCACCTAAAGCTCCTGCTGTTGT
TCCCGTTAGCTCGGTGGACACAGACTTCATCAACAAACCAAGTTTCTAAAAGATTTGCAT
TGTCTCAAACTCTCATTCTTTGTGCATATATATGCTTTTACATATTCATTTGTCTTCTTT
TCATTGCACAAACATAAACCTTATTGTTGTTTTGTTGGTTCTCGTTGTTTAGAAATTTTA
ATAATATAATTCAGCGGAAAAAAAATATAAACCTTATTGTTAC

QA 2 524 2 524
DS 

RD RR2BY05TF 524 0 0
G
GATTGGTCTGAGCGAGAAGCTAAGCATGGGAACAACTGTTGTGAACGAGAAGCTGAGAGA
GGTGGACGAGCGGTATCAAGTGAGGGAGATCACGAAATCCGCTTTAGCAGCTGCTGAGGA
GAGAGCGATCAGCGCAGGCACAGCTTTGATGGCCAACCCGTACGTCTCTAGCGGAGCTTC
TTGGTTATCAAACGCGTTCGGTGCAGTGACAAAGGCCGTTAGAGCTGAGAATGGAGTAGA
AGGGGGGAGGAAAGAGATTATTCAGCTTGATGACACTTCACCTAAAGCTCCTGCTGTTGT
TCCCGTTAGCTCGGTGGACACAGACTTCATCAACAAACCAAGTTTCTAAAAGATTTGCAT
TGTCTCAAACTCTCATTCTTTGTGCATATATATGCTTTTACATATTCATTTGTCTTCTTT
TCATTGCACAAACATAAACCTTATTGTTGTTTTGTTGGTTCTCGTTGTTTAGAAATTTTA
ATAATATAATTCAGCGGAAAAAAAATATAAACCTTATTGTTAC

QA 2 524 2 524
DS 



AS 1 4

CO CL2147Contig1 536 4 3 U
TTTTTTTTTCTTAAAAGGAATCATCATCATCATCATCATAATCTGATGGAAAACAACAGA
GATTCAATCACCAGGAGTCATCATCATCACGAATCCACGATCATAATCAAGACAAAAAAA
CATAAATCATGAGCAAATTAATAACCATACTCGGGATTTTTATCCACACAAAAAAACAAA
AACTGAAAATGAAGAGACAAATCAGAAGAAGCTGTAGGAAGAAGATGCATCTAGAGGATG
AATGAGGTAAGTCAGCACCAAGGCCACCACCATTAGCAGATATGCAATCCCTTGATCTAT
CGATGTCCCATCACTAGTCGGAGCAGGAGCGGGAGCTAGAGATTGAGCACCGACGAGAGA
CGAGATGACGGCGAAAACAAATGTGAATAACGCGAAACCAGCAACGTAACTCCTTGACGC
CATCTCTCTCTCTGTTTCTTTGATCCGACGAAAAAAATAAGCTTGCCGGAGTATCTGCAG
AGGCGACGAGACAGACGGAGGAGGAAAGAGAAACAGTGTGAGGAATGATGAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2DJ74JQ U 17
AF RR2GP29JQ U 1
AF RR2GP29TF C 13
AF RR2DJ74TF C 17
BS 1 61 RR2GP29JQ
BS 62 62 RR2DJ74JQ
BS 63 536 RR2GP29JQ

RD RR2DJ74JQ 304 0 0
GGAATCATCATCATCATCATCATAATCTGATGGAAAACAACAGAGATTCAATCACCAGGA
GTCATCATCATCACGAATCCATGATCATAATCAAGACAAAAAAACATAAATCATGAGCAA
ATTAATAACCATACTCGGGATTTTTATCCACACAAAAAAACAAAAACTGAAAATGAAGAG
ACAAATCAGAAGAAGCTGTAGGAAGAAGATGCATCTAGAGGATGAATGAGGTAAGTCAGC
ACCAAGGCCACCACCATTAGCAGATATGCAATCCCTTGATCTATCGATGTCCCATCACTA
GTCG

QA 1 304 1 304
DS 

RD RR2GP29JQ 536 0 0
TTTTTTTTTCTTAAAAGGAATCATCATCATCATCATCATAATCTGATGGAAAACAACAGA
GGTTCAATCACCAGGAGTCATCATCATCACGAATCCACGATCATAATCAAGACAAAAAAA
CATAAATCATGAGCAAATTAATAACCATACTCGGGATTTTTATCCACACAAAAAAACAAA
AACTGAAAATGAAGAGACAAATCAGAAGAAGCTGTAGGAAGAAGATGCATCTAGAGGATG
AATGAGGTAAGTCAGCACCAAGGCCACCACCATTAGCAGATATGCAATCCCTTGATCTAT
CGATGTCCCATCACTAGTCGGAGCAGGAGCGGGAGCTAGAGATTGAGCACCGACGAGAGA
CGAGATGACGGCGAAAACAAATGTGAATAACGCGAAACCAGCAACGTAACTCCTTGACGC
CATCTCTCTCTCTGTTTCTTTGATCCGACGAAAAAAATAAGCTTGCCGGAGTATCTGCAG
AGGCGACGAGACAGACGGAGGAGGAAAGAGAAACAGTGTGAGGAATGATGAAGTCC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2GP29TF 524 0 0
AAAA
GGAATCATCATCATCATCATCATAATCTGATGGAAAACAACAGAGGTTCAATCACCAGGA
GTCATCATCATCACGAATCCACGATCATAATCAAGACAAAAAAACATAAATCATGAGCAA
ATTAATAACCATACTCGGGATTTTTATCCACACAAAAAAACAAAAACTGAAAATGAAGAG
ACAAATCAGAAGAAGCTGTAGGAAGAAGATGCATCTAGAGGATGAATGAGGTAAGTCAGC
ACCAAGGCCACCACCATTAGCAGATATGCAATCCCTTGATCTATCGATGTCCCATCACTA
GTCGGAGCAGGAGCGGGAGCTAGAGATTGAGCACCGACGAGAGACGAGATGACGGCGAAA
ACAAATGTGAATAACGCGAAACCAGCAACGTAACTCCTTGACGCCATCTCTCTCTCTGTT
TCTTTGATCCGACGAAAAAAATAAGCTTGCCGGAGTATCTGCAGAGGCGACGAGACAGAC
GGAGGAGGAAAGAGAAACAGTGTGAGGAATGATGAAGTCC

QA 5 524 5 524
DS 

RD RR2DJ74TF 520 0 0
GGAATCATCATCATCATCATCATAATCTGATGGAAAACAACAGAGATTCAATCACCAGGA
GTCATCATCATCACGAATCCATGATCATAATCAAGACAAAAAAACATAAATCATGAGCAA
ATTAATAACCATACTCGGGATTTTTATCCACACAAAAAAACAAAAACTGAAAATGAAGAG
ACAAATCAGAAGAAGCTGTAGGAAGAAGATGCATCTAGAGGATGAATGAGGTAAGTCAGC
ACCAAGGCCACCACCATTAGCAGATATGCAATCCCTTGATCTATCGATGTCCCATCACTA
GTCGGAGCAGGAGCGGGAGCTAGAGATTGAGCACCGACGAGAGACGAGATGACGGCGAAA
ACAAATGTGAATAACGCGAAACCAGCAACGTAACTCCTTGACGCCATCTCTCTCTCTGTT
TCTTTGATCCGACGAAAAAA*TAAGCTTGCCGGAGTATCTGCAGAGGCGACGAGACAGAC
GGAGGAGGAAAGAGAAACAGTGTGAGGAATGATGAAGTCC

QA 1 520 1 520
DS 



AS 2 4

CO CL2148Contig1 475 2 2 U
GGACCACCTCTAATTCGTCGTTGCTCCTCCGTCTCCGTTTGAAGTCAACATGGCGCCAAA
GAAGGACAAGGTTCCGCCGCCGTCATCTAAGCCGGCGAAATCCGGAGGCGGGAAGCAGAA
GAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGA
TCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACCGAAGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACCCCTTC
CATTCTCTCCGACCGTATGAGGATTAACGGATCTCTAGCAAGGAGGGCTATTAGGGAGCT
GATGGCGAAAGGTGTGATCAGAATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCG
TGCCACCAACACCTAAAATGTTTTGCTCTTTATTTGTTTTTTTTTCTTCTTTACCTCCTT
TGTTTTGTTCTTCGACAACTTGTTAGAATCTTGTTTTCAGAGATATATTGCTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AM65JQ C 1
AF RR2AM65TF U 1
BS 1 9 RR2AM65JQ
BS 10 475 RR2AM65TF

RD RR2AM65JQ 475 0 0
GGACCACCTCTAATTCGTCGTTGCTCCTCCGTCTCCGTTTGAAGTCAACATGGCGCCAAA
GAAGGACAAGGTTCCGCCGCCGTCATCTAAGCCGGCGAAATCCGGAGGCGGGAAGCAGAA
GAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGA
TCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACCGAAGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACCCCTTC
CATTCTCTCCGACCGTATGAGGATTAACGGATCTCTAGCAAGGAGGGCTATTAGGGAGCT
GATGGCGAAAGGTGTGATCAGAATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCG
TGCCACCAACACCTAAAATGTTTTGCTCTTTATTTGTTTTTTTTTCTTCTTTACCTCCTT
TGTTTTGTTCTTCGACAACTTGTTAGAATCTTGTTTTCAGAGATATATTGCTATT

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2AM65TF 475 0 0
GGACCACCT
CTAATTCGTCGTTGCTCCTCCGTCTCCGTTTGAAGTCAACATGGCGCCAAAGAAGGACAA
GGTTCCGCCGCCGTCATCTAAGCCGGCGAAATCCGGAGGCGGGAAGCAGAAGAAGAAGAA
GTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGATCAGGCTAC
TTACGACAAGCTTCTCACCGAAGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACCCCTTCCATTCTCTC
CGACCGTATGAGGATTAACGGATCTCTAGCAAGGAGGGCTATTAGGGAGCTGATGGCGAA
AGGTGTGATCAGAATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCGTGCCACCAA
CACCTAAAATGTTTTGCTCTTTATTTGTTTTTTTTTCTTCTTTACCTCCTTTGTTTTGTT
CTTCGACAACTTGTTAGAATCTTGTTTTCAGAGATATATTGCTATT

QA 10 475 10 475
DS 



CO CL2148Contig2 526 2 2 U
TTATCTTTCACCTCCACTAATTCGCCGTTGCTCCTCCGTCTCCGTTTGAAGTCAACATGG
CGCCAAAGAAGGACAAGGTTCCGCCGCCGTCATCTAAGCCAGCGAAATCCGGAGGCGGGA
AGCAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGT
TGTTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACCGAAGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCA
CTCCTTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATTAACGGGTCTCTAGCAAGGAGGGCTATTA
GGGAGCTGATGGCGAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCT
ATACTCGTGCCACCAACACCTAATTTGTTTTGCTCTTTATTTGTTTTTTTTTCTTTACCT
CCTTTGTTTGGTTCTTCAAGAACTTGTTAGAATCTTGTTATTTTTGAGATATATTGCTAT
TTTACAAATGCATTGACACTACTTAATTTGATTCAAACCGTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BP07JQ C 1
AF RR2BP07TF U 1
BS 1 16 RR2BP07JQ
BS 17 526 RR2BP07TF

RD RR2BP07JQ 526 0 0
TTATCTTTCACCTCCACTAATTCGCCGTTGCTCCTCCGTCTCCGTTTGAAGTCAACATGG
CGCCAAAGAAGGACAAGGTTCCGCCGCCGTCATCTAAGCCAGCGAAATCCGGAGGCGGGA
AGCAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGT
TGTTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACCGAAGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCA
CTCCTTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATTAACGGGTCTCTAGCAAGGAGGGCTATTA
GGGAGCTGATGGCGAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCT
ATACTCGTGCCACCAACACCTAATTTGTTTTGCTCTTTATTTGTTTTTTTTTCTTTACCT
CCTTTGTTTGGTTCTTCAAGAACTTGTTAGAATCTTGTTATTTTTGAGATATATTGCTAT
TTTACAAATGCATTGACACTACTTAATTTGATTCAAACCGTTATCC

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2BP07TF 526 0 0
TTATCTTTCACCTCCA
CTAATTCGCCGTTGCTCCTCCGTCTCCGTTTGAAGTCAACATGGCGCCAAAGAAGGACAA
GGTTCCGCCGCCGTCATCTAAGCCAGCGAAATCCGGAGGCGGGAAGCAGAAGAAGAAGAA
GTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGATCAGGCTAC
TTACGACAAGCTTCTCACCGAAGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACTCCTTCCATTCTCTC
CGACCGTATGAGGATTAACGGGTCTCTAGCAAGGAGGGCTATTAGGGAGCTGATGGCGAA
AGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTATACTCGTGCCACCAA
CACCTAATTTGTTTTGCTCTTTATTTGTTTTTTTTTCTTTACCTCCTTTGTTTGGTTCTT
CAAGAACTTGTTAGAATCTTGTTATTTTTGAGATATATTGCTATTTTACAAATGCATTGA
CACTACTTAATTTGATTCAAACCGTTATCC

QA 17 526 17 526
DS 



AS 1 4

CO CL2149Contig1 606 4 18 U
GGGGAGACGCCAAAGAGAAAAAGAGAGCATCGAAGTTTTGTGTGGAGGAGATCGCGAACG
AGAATGGAGGTTCCAGGTTCATCGAAGAAGATGATCGCAACGCAAGAAGAGATGGTTGCA
GCGAAAGTACCGCTCGGGTACAGAGACCAGTGCGCTCATCTCCTGATCCCGCTCAACAAA
TGCCGCCAGGCCGAGTTTTTCCTCCCGTGGAAGTGCGAGGACGAGCGCCACGTGTACGAG
AAGTGCGAGTACGAGCTCGTCATGGAGAGGATGCTCGCGATGCAGAAGATCCGCGAAGAA
GAAGCTAAAGCGAAACAGAGTAAAGTGCGAGGGAACAACGGCGTTCCTCTGATCCCTAAA
ACCGCTAATGCTTAGGGCTT*****TCCGGTTAACCGATTCCAGATTTGATTTCCGGGAT
TCTCTGGAACTGCGAAGAAGAGGGGCTCTGCTTTTCAATATTTTCTTTTTGCTAGTGATG
AAAAACTTGTTGCTACATTTTCATAGTGTATGTGCAGAGATTCTCTCCCCTACCTTTCTT
CCTCTTGTTAACTTTAAAGTTGTTTCCCAAACAGAAAATAAGATGCAAACTCATCCTTTT
GTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2CN27TF U 1
AF RR2G501TF U 27
AF RR2AL06JQ C 24
AF RR2AL06TF U 293
BS 1 33 RR2CN27TF
BS 34 34 RR2G501TF
BS 35 71 RR2CN27TF
BS 72 72 RR2G501TF
BS 73 137 RR2CN27TF
BS 138 138 RR2G501TF
BS 139 328 RR2CN27TF
BS 329 329 RR2AL06TF
BS 330 371 RR2CN27TF
BS 372 372 RR2AL06TF
BS 373 380 RR2CN27TF
BS 381 385 RR2AL06TF
BS 386 440 RR2CN27TF
BS 441 441 RR2AL06TF
BS 442 525 RR2CN27TF
BS 526 526 RR2AL06TF
BS 527 595 RR2CN27TF
BS 596 606 RR2AL06TF

RD RR2CN27TF 595 0 0
GGGGAGACGCCAAAGAGAAAAAGAGAGCATCGAGGTTTTGTGTGGAGGAGATCGCGAACG
AGAATGGAGGTCCCAGGTTCATCGAAGAAGATGATCGCAACGCAAGAAGAGATGGTTGCA
GCGAAAGTACCGCTCGGTTACAGAGACCAGTGCGCTCATCTCCTGATCCCGCTCAACAAA
TGCCGCCAGGCCGAGTTTTTCCTCCCGTGGAAGTGCGAGGACGAGCGCCACGTGTACGAG
AAGTGCGAGTACGAGCTCGTCATGGAGAGGATGCTCGCGATGCAGAAGATCCGCGAAGAA
GAAGCTAAAGCGAAACAGAGTAAAGTGCAAGGGAACAACGGCGTTCCTCTGATCCCTAAA
ACCGCTAATGCCTAGGGCTTCGATCTCCGGTTAACCGATTCCAGATTTGATTTCCGGGAT
TCTCTGGAACTGCGAAGAAGGGGGGCTCTGCTTTTCAATATTTTCTTTTTGCTAGTGATG
AAAAACTTGTTGCTACATTTTCATAGTGTATGTGCAGAGATTCTCCCCCCTACCTTTCTT
CCTCTTGTTAACTTTAAAGTTGTTTCCCAAACAGAAAATAAGATGCAAACTCATC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2G501TF 571 0 0
GG
ATCGAAGTTTTGTGTGGAGGAGATCGCGAACGAGAATGGAGGTTCCAGGTTCATCGAAGA
AGATGATCGCAACGCAAGAAGAGATGGTTGCAGCGAAAGTACCGCTCGGGTACAGAGACC
AGTGCGCTCATCTCCTGATCCCGCTCAACAAATGCCGCCAGGCCGAGTTTTTCCTCCCGT
GGAAGTGCGAGGACGAGCGCCACGTGTACGAGAAGTGCGAGTACGAGCTCGTCATGGAGA
GGATGCTCGCGATGCAGAAGATCCGCGAAGAAGAAGCTAAAGCGAAACAGAGTAAAGTGC
AAAGGAACAACGGCGTTCCTCTGATCCCTAAAACCGCTAATGCTTAGGGCTT*****TCC
GGTTAACCGATTCCAGATTTGATTTCCGGGATTCTCTGGAACTGCGAAGAAGAGGGGCTC
TACTTTTCAATATTTTCTTTTTGCTAGTGATGAAAAACTTGTTGCTACATTTTCATAGTG
TATGTGCAGAGATTCTCTCCCCTACCTTTCTTCCTCTTGTTAACTTTAAAGTTGTTTCCC
AAACAGAAAATAAGATGCAAACTCATC
CC

QA 3 569 3 569
DS 

RD RR2AL06JQ 583 0 0
AGAGC
ATCGAAGTTTTGTGTGGAGGAGATCGCGAACGGGAATGGAGGTTCCAGGTTCATCGAAGA
AGATGATCGCAACGCAAGAAGAGATGGTTGCAGCGAAAGTACCGCTCGGGTACAGAGACC
AGTGTGCTCATCTCCTGATCCCGCTCAACAAATGCCGCCAGGCCGAGTTTTTCCTCCCGT
GGAAGTGCGTGG**GAGCGCCACGTGTACGAGAAGTGCGAGTACGAGCTCGTCATGGAGA
TGATGCTCGCGATGCAGAAGATCCGCGAAGAAGAAGCTAAAGCGAAACAGAGTAAAGTGC
GAGGGAACAACGGCGTTCCTCTGATCCCTAAAACCGCTAATGCTTAGGGCTT*****TCC
GGTTAACCGATTCCAGATTTGATTTCCGGGATTCTCTGGAACTGCGAAGAAGAGGGGCTC
TGCTTTTCAATATTTTCTTTTTGCTAGTGATGAAAAACTTGTTGCTACATTTTCATAGTG
TATGTGCAGAGATTCTCTCCCCTACCTTTCTTCCTCTTGTTAACTTTAAAGTTGTTTCCC
AAACAGAAAATAAGATGCAAACTCATCCTTTTGTTGGT

QA 6 583 6 583
DS 

RD RR2AL06TF 314 0 0
GCGAAGAAGAAGCTAAAGCGAAACAGAGTAAAGTGCGAGGGAACAACGGCGTTCCTCTGA
TCCCTAAAACCGCTAATGCTTAGGGCTT*****TCCGGTTAACCGATTCCAGATTTGATT
TCCGGGATTCTCTGGAACTGCGAAGAAGAGGGGCTCTGCTTTTCAATATTTTCTTTTTGC
TAGTGATGAAAAACTTGTTGCTACATTTTCATAGTGTATGTGCAGAGATTCTCTCCCCTA
CCTTTCTTCCTCTTGTTAACTTTAAAGTTGTTTCCCAAACAGAAAATAAGATGCAAACTC
ATCCTTTTGTTGGT

QA 1 314 1 314
DS 



AS 2 4

CO CL2150Contig1 738 2 2 U
ATCAAAGCTAAAATCACTTGATACAATGAACATAATTAGAGTCTCCTGCTTGCTTTGTGT
ATTGGCCTTTTTAATTTTTATAACTCCAACATCTTCTCAGCAACTCCACACTAGCTACTC
ATCTCCGAGCCAAGCAGGTGTAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGCT
CATGATCATCTCTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAAG
CCAACAACCTCGAGTTACTTCTTCTTCTGGAAAATCTATGGACGAAAAAAAGAGGTTAGG
TGACGAAGAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAATATCTATCGATGGATTATCCAAGGTTTAG
AAAGAAGACGGCCAGTTCACAACAAGTCTCTACATCCATGATTTTTTTTTTAATTTCGAT
ACAACTATTAATTTAAGCTAGATTAATCAATTAACTAAGCTAAGTTAGGATGGCTAAGTG
GTTGGTATAAGAAGTTTTGGCGATATTATTGTAATTAAGGGACTATGTTCATGTTAATTC
TTTTTATATTATGATAGTGGCCGACAAGATTTAAGCAAAACCCTAAGTCTCTGGTTTGGG
GTTTGGGGTTTGAGCTTATCTGATCTTCGTTTCATGCACTGTATCATGGTGGCTGGTTTG
GTTGTATTTTTATCTTGTATGGAAAACGATGTTTGAGTTCCATTATTAACTGAGTTAATT
ACATGTATGATTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D174TF U 1
AF RR2D174JQ C 92
BS 1 501 RR2D174TF
BS 502 738 RR2D174JQ

RD RR2D174TF 501 0 0
ATCAAAGCTAAAATCACTTGATACAATGAACATAATTAGAGTCTCCTGCTTGCTTTGTGT
ATTGGCCTTTTTAATTTTTATAACTCCAACATCTTCTCAGCAACTCCACACTAGCTACTC
ATCTCCGAGCCAAGCAGGTGTAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGCT
CATGATCATCTCTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAAG
CCAACAACCTCGAGTTACTTCTTCTTCTGGAAAATCTATGGACGAAAAAAAGAGGTTAGG
TGACGAAGAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAATATCTATCGATGGATTATCCAAGGTTTAG
AAAGAAGACGGCCAGTTCACAACAAGTCTCTACATCCATGATTTTTTTTTTAATTTCGAT
ACAACTATTAATTTAAGCTAGATTAATCAATTAACTAAGCTAAGTTAGGATGGCTAAGTG
GTTGGTATAAGAAGTTTTGGC

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR2D174JQ 647 0 0
TCTTCTCAGCAACTCCACACTAGCTACTCATCTCCGAGCCAAGCAGGTGTAAGCGAAAAG
ATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGCTCATGATCATCTCTAGTGAACATGAAAATGTG
ATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAAGCCAACAACCTCGAGTTACTTCTTCTTCTGGA
AAATCTATGGACGAAAAAAAGAGGTTAGGTGACGAAGAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAA
TATCTATCGATGGATTATCCAAGGTTTAGAA*GAAGACGGCCAGTTCACAACAAGTCTCT
ACATCCATGATTTTTTTTTTAATTTCGATACAACTATTAATTTAAGCTAGATTAATCAAT
TAACTAAGCTAAGTTAGGATGGCTAAGTGGTTGGTATAAGAAGTTTTGGCGATATTATTG
TAATTAAGGGACTATGTTCATGTTAATTCTTTTTATATTATGATAGTGGCCGACAAGATT
TAAGCAAAACCCTAAGTCTCTGGTTTGGGGTTTGGGGTTTGAGCTTATCTGATCTTCGTT
TCATGCACTGTATCATGGTGGCTGGTTTGGTTGTATTTTTATCTTGTATGGAAAACGATG
TTTGAGTTCCATTATTAACTGAGTTAATTACATGTATGATTTGATCC

QA 1 647 1 647
DS 



CO CL2150Contig2 567 2 2 U
ATAGCACAAACAGAGAAACTTATCAAAGCTAAAATCACTTGATACAATGAACATAATTAG
AGTCCCCTGCTTGCTTTGTGTATTGGCCTTTTTAATTTTTATAACTCCAACATCTTCTCA
GCAACTCCACACTAGCTACTCATCTCCGAGCCAAGGTGTAAGCGAAAAGATTGTTATTAA
GATGGCGCCACGGAAGCTCATGATCATCTCTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGG
AACTCATGAAGGTTCAAGCCAACAACCTCGAGTTACTTCTTCTTCTGGAAAATCTATGGA
CGAAAAGAAGAGGTTAGGTGACGAAGAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAATATCTATCGAT
GGATTATCCAAGGTTTAGAAGAAGAAGGCCAGTTCACAACAAGTCTCTACGTCCATGAAT
TTTTTTTTTTTAATTTCGATACAACTAATTTAAGCTAGATTAATCAATTAACTAAGCTAA
GTTAGGATGGCTAAGTGGTTGGTATAAGAAGTTTTGGCGATATTATTGTAATTAAGGGAC
TATGTTCATGTTAATTCTTTTTATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2D663TF U 1
AF RR2D663JQ C 35
BS 1 566 RR2D663TF
BS 567 567 RR2D663JQ

RD RR2D663TF 567 0 0
ATAGCACAAACAGAGAAACTTATCAAAGCTAAAATCACTTGATACAATGAACATAATTAG
AGTCCCCTGCTTGCTTTGTGTATTGGCCTTTTTAATTTTTATAACTCCAACATCTTCTCA
GCAACTCCACACTAGCTACTCATCTCCGAGCCAAGGTGTAAGCGAAAAGATTGTTATTAA
GATGGCGCCACGGAAGCTCATGATCATCTCTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGG
AACTCATGAAGGTTCAAGCCAACAACCTCGAGTTACTTCTTCTTCTGGAAAATCTATGGA
CGAAAAGAAGAGGTTAGGTGACGAAGAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAATATCTATCGAT
GGATTATCCAAGGTTTAGAAGAAGAAGGCCAGTTCACAACAAGTCTCTACGTCCATGAAT
TTTTTTTTTTTAATTTCGATACAACTAATTTAAGCTAGATTAATCAATTAACTAAGCTAA
GTTAGGATGGCTAAGTGGTTGGTATAAGAAGTTTTGGCGATATTATTGTAATTAAGGGAC
TATGTTCATGTTAATTCTTTTTATAT
C

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2D663JQ 533 0 0
TCACTTGATACAATGAACATAATTAGAGTCCCCTGCTTGCTTTGTGTATTGGCCTTTTTA
ATTTTTATAACTCCAACATCTTTTCAGCAACTCCACACTAGCTACTCATCTCCGAGCCAA
GGTGTAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGCTCATGATCATCTCTAGT
GAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAAGCCAACAACCTCGAGTT
ACTTCTTCTTCTGGAAAATCTATGGACGAAAAGAAGAGGTTAGGTGACGAAGAAGAGGAG
AAAGCTCTATCGAAATATCTATCGATGGATTATCCAAGGTTTAGAAGAAGAAGGCCAGTT
CACAACAAGTCTTTACGTCCATGAATTTTTTTTTTTTAATTTCGATACAACTAATTTAAG
CTAGATTAATCAATTAACTAAGCTAAGTTAGGATGGCTAAGTGGTTGGTATAAGAAGTTT
TGGCGATATTATTGTAATTAAGGGACTATGTTCATGTTAATTCTTTTTATATC

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 4

CO CL2151Contig1 1179 4 5 U
GGACAACACCACCCTCTAGCTTGTCTCTAGATGGATACCATGAGAGAGAAGCCAATAAAA
TTCTCATCTTCTGTTTTCTGTTTGATCATTTTATTATCGGTCTATAACTCCACTGCGGAG
CTACGACGGTTGGTCCAACCACCAAAATCCGATGGTACACTCAGTTTTCTAGTTGTCGGC
GACTGGGGAAGAAGAGGTTCTTATAATCAGTCTCAAGTAGCTCTTCAGATGGGAAAAACA
GGAAAGGATTTAAATATCGATTTCGTCATTTCGACTGGAGATAACTTTTACGATGACGGA
ATAACAAGTCCATATGATTGTCAATTTCAAGATTCTTTTACGAATATTTACACAGCACCT
AGCTTACAAAAGCCATGGTATAATGTATTAGGAAACCATGACTATAGAGGTAACGTCGCT
GCACAACTCAGTCCGATACTGAAGGATTTGGACTGTCGATGGGTTTGTTTAAGATCTTAC
GTGGTTAACGCCGATATCGTCGATATTTTCTTCGTGGACACAACACCGTTCGTAGATAAA
TATTTTGATGAGCCAAAGGACCATGTTTATGATTGGAGAGGCGTGCTACCAAGAAACAAG
TATCTTAAGAATCTCTTAGCGGATGTCGATGTGGCCTTGCAAAAATCAGTTGCAAAATGG
AAAATAGTGGTAGGTCACCACACAATCAAAAGTGCAGGTCACCACGGGATTACGAAAGAG
CTTGAGAAACAACTTTTACCTATCCTTGAGGCTAATAAAGTTGATCTCTATATAAACGGG
CATGATCATTGCTTGGAGCACATAAGCAGCATTAACAGTGGAATACAATTTATGACAAGT
GGCGGTGGGTCCAAGGCGTGGAAAGGGGACGTGAACGAGTGGAACCCGCAAGAGATGAGG
TTTTACTACGATGGACAAGGATTCATGTCGGTTTGCCTATCGGAAGCAGCACTGCGTATA
GTTTTTTACGATGGATATGGTCGCGTCCTGCATCAATTGAACACTTATAAGGAGGGGATT
TATACGGATATCTAAACGATCTGTACAAATGTTGAGAACCAAATATTAATATTAGTAGTT
CACTGTTTTTATATTTGGTGGTGGCTTTCATGTGACATAGTTATTTTCAATGATGTTATT
ATCCAGCTAATAAAGTTTGAGAAAGGAAAATTTACATGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2B453TF U 1
AF RR2B490TF U 1
AF RR2B453JQ C 239
AF RR2B490JQ C 314
BS 1 750 RR2B453TF
BS 751 751 RR2B453JQ
BS 752 840 RR2B453TF
BS 841 864 RR2B490TF
BS 865 1179 RR2B453JQ

RD RR2B453TF 840 0 0
GGACAACACCACCCTCTAGCTTGTCTCTAGATGGATACCATGAGAGAGAAGCCAATAAAA
TTCTCATCTTCTGTTTTCTGTTTGATCATTTTATTATCGGTCTATAACTCCACTGCGGAG
CTACGACGGTTGGTCCAACCACCAAAATCCGATGGTACACTCAGTTTTCTAGTTGTCGGC
GACTGGGGAAGAAGAGGTTCTTATAATCAGTCTCAAGTAGCTCTTCAGATGGGAAAAACA
GGAAAGGATTTAAATATCGATTTCGTCATTTCGACTGGAGATAACTTTTACGATGACGGA
ATAACAAGTCCATATGATTGTCAATTTCAAGATTCTTTTACGAATATTTACACAGCACCT
AGCTTACAAAAGCCATGGTATAATGTATTAGGAAACCATGACTATAGAGGTAACGTCGCT
GCACAACTCAGTCCGATACTGAAGGATTTGGACTGTCGATGGGTTTGTTTAAGATCTTAC
GTGGTTAACGCCGATATCGTCGATATTTTCTTCGTGGACACAACACCGTTCGTAGATAAA
TATTTTGATGAGCCAAAGGACCATGTTTATGATTGGAGAGGCGTGCTACCAAGAAACAAG
TATCTTAAGAATCTCTTAGCGGATGTCGATGTGGCCTTGCAAAAATCAGTTGCAAAATGG
AAAATAGTGGTAGGTCACCACACAATCAAAAGTGCAGGTCACCACGGGATTACGAAAGAG
CTTGAGAAACAACTTTTACCTATCCTTGAG*CTAATAAAGTTGATCTCTATATAAACGGG
CATGATCATTGCTTGGAGCACATAAGCAGCATTAACAGTGGAATACAATTTATGACAAGT

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2B490TF 870 0 0
GGACAACACCACCCTCTAGCTTGTCTCTAGATGGATACCATGAGAGAGAAGCCAATAAAA
TTCTCATCTTCTGTTTTCTGTTTGATCATTTTATTATCGGTCTATAACTCCACTGCGGAG
CTACGACGGTTGGTCCAACCACCAAAATCCGATGGTACACTCAGTTTTCTAGTTGTCGGC
GACTGGGGAAGAAGAGGTTCTTATAATCAGTCTCAAGTAGCTCTTCAGATGGGAAAAACA
GGAAAGGATTTAAATATCGATTTCGTCATTTCGACTGGAGATAACTTTTACGATGACGGA
ATAACAAGTCCATATGATTGTCAATTTCAAGATTCTTTTACGAATATTTACACAGCACCT
AGCTTACAAAAGCCATGGTATAATGTATTAGGAAACCATGACTATAGAGGTAACGTCGCT
GCACAACTCAGTCCGATACTGAAGGATTTGGACTGTCGATGGGTTTGTTTAAGATCTTAC
GTGGTTAACGCCGATATCGTCGATATTTTCTTCGTGGACACAACACCGTTCGTAGATAAA
TATTTTGATGAGCCAAAGGACCATGTTTATGATTGGAGAGGCGTGCTACCAAGAAACAAG
TATCTTAAGAATCTCTTAGCGGATGTCGATGTGGCCTTGCAAAAATCAGTTGCAAAATGG
AAAATAGTGGTAGGTCACCACACAATCAAAAGTGCAGGTCACCACGGGATTACGAAAGAG
CTTGAGAAACAACTTTTACCTATCCTTGAG*CTAATAAAGTTGATCTCTATATAAACGGG
CATGATCATTGCTTGGAGCACATAAGCAGCATTAACAGTGGAATACAATTTATGACAAGT
GGCGGTGGGTCCAAGGCGTGGAAA
AGGGGA

QA 1 864 1 864
DS 

RD RR2B453JQ 941 0 0
CAGGAAAGGATTTAAATATCGATTTCGTCATTTCGACTGGAGATAACTTTTACGATGACG
GAATAACAAGTCCATATGATTGTCAATTTCAAGATTCTTTTACGAATATTTACACAGCAC
CTAGCTTACAAAAGCCATGGTATAATGTATTAGGAAACCATGACTATAGAGGTAACGTCG
CTGCACAACTCAGTCCGATACTGAAGGATTTGGACTGTCGATGGGTTTGTTTAAGATCTT
ACGTGGTTAACGCCGATATCGTCGATATTTTCTTCGTGGACACAACACCGTTCGTAGATA
AATATTTTGATGAGCCAAAGGACCATGTTTATGATTGGAGAGGCGTGCTACCAAGAAACA
AGTATCTTAAGAATCTCTTAGCGGATGTCGATGTGGCCTTGCAAAAATCAGTTGCAAAAT
GGAAAATAGTGGTAGGTCACCACACAATCAAAAGTGCAGGTCACCACGGGATTACGAAAG
AGCTTGAGAAACAACTTTTACCTATCCTTGAGGCTAATAAAGTTGATCTCTATATAAACG
GGCATGATCATTGCTTGGAGCACATAAGCAGCATTAACAGTGGAATACAATTTATGACAA
GTGGCGGTGGGTCCAAGGCGTGGAAAGGGGACGTGAACGAGTGGAACCCGCAAGAGATGA
GGTTTTACTACGATGGACAAGGATTCATGTCGGTTTGCCTATCGGAAGCAGCACTGCGTA
TAGTTTTTTACGATGGATATGGTCGCGTCCTGCATCAATTGAACACTTATAAGGAGGGGA
TTTATACGGATATCTAAACGATCTGTACAAATGTTGAGAACCAAATATTAATATTAGTAG
TTCACTGTTTTTATATTTGGTGGTGGCTTTCATGTGACATAGTTATTTTCAATGATGTTA
TTATCCAGCTAATAAAGTTTGAGAAAGGAAAATTTACATGG

QA 1 941 1 941
DS 

RD RR2B490JQ 866 0 0
ATGATTGTCAATTTCAAGATTCTTTTACGAATATTTACACAGCACCTAGCTTACAAAAGC
CATGGTATAATGTATTAGGAAACCATGACTATAGAGGTAACGTCGCTGCACAACTCAGTC
CGATACTGAAGGATTTGGACTGTCGATGGGTTTGTTTAAGATCTTACGTGGTTAACGCCG
ATATCGTCGATATTTTCTTCGTGGACACAACACCGTTCGTAGATAAATATTTTGATGAGC
CAAAGGACCATGTTTATGATTGGAGAGGCGTGCTACCAAGAAACAAGTATCTTAAGAATC
TCTTAGCGGATGTCGATGTGGCCTTGCAAAAATCAGTTGCAAAATGGAAAATAGTGGTAG
GTCACCACACAATCAAAAGTGCAGGTCACCACGGGATTACGAAAGAGCTTGAGAAACAAC
TTTTACCTATCCTTGAGGCTAATAAAGTTGATCTCTATATAAACGGGCATGATCATTGCT
TGGAGCACATAAGCAGCATTAACAGTGGAATACAATTTATGACAAGTGGCGGTGGGTCCA
AGGCGTGGAAAGGGGACGTGAACGAGTGGAACCCGCAAGAGATGAGGTTTTACTACGATG
GACAAGGATTCATGTCGGTTTGCCTATCGGAAGCAGCACTGCGTATAGTTTTTTACGATG
GATATGGTCGCGTCCTGCATCAATTGAACACTTATAAGGAGGGGATTTATACGGATATCT
AAACGATCTGTACAAATGTTGAGAACCAAATATTAATATTAGTAGTTCACTGTTTTTATA
TTTGGTGGTGGCTTTCATGTGACATAGTTATTTTCAATGATGTTATTATCCAGCTAATAA
AGTTTGAGAAAGGAAAATTTACATGG

QA 1 866 1 866
DS 



AS 2 4

CO CL2152Contig1 834 2 4 U
GGACGCCCTAAAAACCAGAGATTCCAATAACTTCTCCTCTCTATCTGTTAATACGATTCT
TGATTCTATTTCTCTCAACCATGGGCCACGAATCAAACGCCACGGAGACCGCCACGAAGA
CGACGACGCTCGTGTTCTCGTACGGAACTCTGAAGAGAGGATTCTCGAACCACGTCCTGA
TGCAAGATCTGATCCGATCCGGCGACGCGTCTTTCAAAGGAGTCTACCAAACCTTAGACA
AGTACCCCCTCGTCTGCGGGCCCTACCGCGTCCCTTTCCTCCTCAACAAGCCTGGATCGG
GCCAGCGCGTCACGGGAGAGCTCTACGCGGTTTCTCCTAGCGGTCTCTCCCACCTCGACG
AGCTCGAAGGGACCAGCCGTGGCCATTACGTCAGGCAACCGATCCGTCTCCTTAAGGGGG
AAGGAGGTGATGATCTTGAAACAGAGCATGCTTTGTCGTCGTGCGTGGTGGAGGCTTACT
ACGCGCACAAGAGCTACGAGGAGGAGCTGTGGGAGAGGAATAGGAGGAGATCGTTCGGCG
CGTACACGGAGAAGGAAGCGCGTGGGTACGTGAAGCGGAACGATAGGCCGCAGCATCTTA
GCTTCTTGGATCATATCCGTATTTTCGTTTCTTCTCCATGTGACTAATTTTAATTTTTTC
CCTCTTTCTCTCTTGGTGGAAAAAAAATAAAAAGAAAATAGTTATTACCAAAAAATTTTA
AGGGTCCTACCGATCCGTCGTATCCGTACAGCGGTTGTCCTTTTGATTAGGTTCTGTAAC
GGACCAATGGTTGTTTGGATGTAAAACAATATAAGTACTCTATCTTGATAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK93TF U 1
AF RR2CK93JQ C 325
BS 1 658 RR2CK93TF
BS 659 659 RR2CK93JQ
BS 660 686 RR2CK93TF
BS 687 834 RR2CK93JQ

RD RR2CK93TF 686 0 0
GGACGCCCTAAAAACCAGAGATTCCAATAACTTCTCCTCTCTATCTGTTAATACGATTCT
TGATTCTATTTCTCTCAACCATGGGCCACGAATCAAACGCCACGGAGACCGCCACGAAGA
CGACGACGCTCGTGTTCTCGTACGGAACTCTGAAGAGAGGATTCTCGAACCACGTCCTGA
TGCAAGATCTGATCCGATCCGGCGACGCGTCTTTCAAAGGAGTCTACCAAACCTTAGACA
AGTACCCCCTCGTCTGCGGGCCCTACCGCGTCCCTTTCCTCCTCAACAAGCCTGGATCGG
GCCAGCGCGTCACGGGAGAGCTCTACGCGGTTTCTCCTAGCGGTCTCTCCCACCTCGACG
AGCTCGAAGGGACCAGCCGTGGCCATTACGTCAGGCAACCGATCCGTCTCCTTAAGGGGG
AAGGAGGTGATGATCTTGAAACAGAGCATGCTTTGTCGTCGTGCGTGGTGGAGGCTTACT
ACGCGCACAAGAGCTACGAGGAGGAGCTGTGGGAGAGGAATAGGAGGAGATCGTTCGGCG
CGTACACGGAGAAGGAAGCGCGTGGGTACGTGAAGCGGAACGATAGGCCGCAGCATCTTA
GCTTCTTGGATCATATCCGTATTTTCGTTTCTTCTCCATGTGACTAATTTTAATTTTT*C
CCTCTTTCTCTCTTGGTGGAAAAAAA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2CK93JQ 510 0 0
ACGCGGTTTCTCCTAGCGGTCTCTCCCACCTCGACGAGCTCGAAGGGACCAGCCGTGGCC
ATTACGTCAGGCAACCGATCCGTCTCCTTAAGGGGGAAGGAGGTGATGATCTTGAAACAG
AGCATGCTTTGTCGTCGTGCGTGGTGGAGGCTTACTACGCGCACAAGAGCTACGAGGAGG
AGCTGTGGGAGAGGAATAGGAGGAGATCGTTCGGCGCGTACACGGAGAAGGAAGCGCGTG
GGTACGTGAAGCGGAACGATAGGCCGCAGCATTTTAGCTTCTTGGATCATATCCGTATTT
TCGTTTTTTCTCCATGTGACTAATTTTAATTTTTTCCCTCTTTCTCTCTTGGTGGAAAAA
AAATAAAAAGAAAATAGTTATTACCAAAAAATTTTAAGGGTCCTACCGATCCGTCGTATC
CGTACAGCGGTTGTCCTTTTGATTAGGTTCTGTAACGGACCAATGGTTGTTTGGATGTAA
AACAATATAAGTACTCTATCTTGATAAGTT

QA 1 510 1 510
DS 



CO CL2152Contig2 940 2 2 U
GGACGCCCTAAAAACCAGAGATTCCAATAACTTCTCTCTCTCTCTGTTAATACGATTCTT
GATTCTATTTCTCTCAACCATGGGCCACGAATCAAACGCGACGGAGACCACTATCACCAC
CGCCAAAACGACGACGCTGGTGTTCTCGTACGGAACTCTGAAGAGAGGATTCTCAAACCA
CGTCCTGATGCAAGATCTGATCCGATCCGGCGACGCGTCTTTCAAAGGAGTCTACCAAAC
CTTAGACAAGTACCCCCTCGTCTGCGGGCCCTATCGAGTCCCTTTCCTCCTCAACAAGCC
CGGATCGGGCCAGCGCGTCACGGGAGAGCTCTACGCGGTTTCTCCTCGCGGTCTCTCGCG
CCTCGACGAGCTCGAAGGGACGAGCCGTGGCCATTACGTCAGGCAACCGATCCGTCTCCT
TAAGGAGGAAGGAGGAGATGATCTTGAAACAGAGCATGCCTCGTCGTGCGTGGTGGAGGC
GTACTACGCGCACAAGAGCTACGAGGAGGAGCTGTGGGAGAGGAATAGGAGGAGGTCGTT
CGGCGCGTACACGGAGAAGGAAGCGCGTGGGTACGTGAAGCGGAACGATAGGCCGCAGCA
TCTTAGCTTCTTGGATCATATCCGTATTTTCGTTTCTTCTCCATGTGACTGATTTTAATT
TTCCCTCTCTCTTGGTGGAAAAAAATAAAAAGAAAATAGTTATTACCAAAAAAATATTGT
AAGGGGTCCTACGATCCGTCGTATCCGTACTACGGTTGTCCTTTGATTAGGTTCTGTAAT
GGACCAATGGTTGTTTTTGGATGTAAAACAATATAAGTACTCTATCATGATAAGTTCTTG
GTCGCTCTTGTTAACTTTATAAACGTTAAGTTCCCTGTTGAATAATAAGTCAGTAAGTGT
CTCTAGTTTCAGGTTTTCTTATGTTTTGTATCCAAATTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB29TF U 1
AF RR2EB29JQ C 189
BS 1 684 RR2EB29TF
BS 685 940 RR2EB29JQ

RD RR2EB29TF 684 0 0
GGACGCCCTAAAAACCAGAGATTCCAATAACTTCTCTCTCTCTCTGTTAATACGATTCTT
GATTCTATTTCTCTCAACCATGGGCCACGAATCAAACGCGACGGAGACCACTATCACCAC
CGCCAAAACGACGACGCTGGTGTTCTCGTACGGAACTCTGAAGAGAGGATTCTCAAACCA
CGTCCTGATGCAAGATCTGATCCGATCCGGCGACGCGTCTTTCAAAGGAGTCTACCAAAC
CTTAGACAAGTACCCCCTCGTCTGCGGGCCCTATCGAGTCCCTTTCCTCCTCAACAAGCC
CGGATCGGGCCAGCGCGTCACGGGAGAGCTCTACGCGGTTTCTCCTCGCGGTCTCTCGCG
CCTCGACGAGCTCGAAGGGACGAGCCGTGGCCATTACGTCAGGCAACCGATCCGTCTCCT
TAAGGAGGAAGGAGGAGATGATCTTGAAACAGAGCATGCCTCGTCGTGCGTGGTGGAGGC
GTACTACGCGCACAAGAGCTACGAGGAGGAGCTGTGGGAGAGGAATAGGAGGAGGTCGTT
CGGCGCGTACACGGAGAAGGAAGCGCGTGGGTACGTGAAGCGGAACGATAGGCCGCAGCA
TCTTAGCTTCTTGGATCATATCCGTATTTTCGTTTCTTCTCCATGTGACTGATTTTAATT
TTCCCTCTCTCTTGGTGGAAAAAA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2EB29JQ 752 0 0
TGCAAGATCTGATCCGATCGGGCGACGCGTCTTTCAAAGGAGTCTACCAAAC*TTAGACA
AGTACCCC*TCGTCTGCGGGCCCTATCGAGTCCCTTTCCTCCTCAACAAGCCCGGATCGG
GCCAGCGCGTCACGGGAGAGCTCTACGCGGTTTCTCCTCGCGGTCTCTCGCGCCTCGACG
AGCTCGAAGGGACGAGCCGTGGCCATTACGTCAGGCAACCGATCCGTCTCCTTAAGGAGG
AAGGAGGAGATGATCTTGAAACAGAGCATGCCTCGTCGTGCGTGGTGGAGGCGTACTACG
CGCACAAGAGCTACGAGGAGGAGCTGTGGGAGAGGAATAGGAGGAGGTCGTTCGGCGCGT
ACACGGAGAAGGAAGCGCGTGGGTACGTGAAGCGGAACGATAGGCCGCAGCATCTTAGCT
TCTTGGATCATATCCGTATTTTCGTTTCTTCTCCATGTGACTGATTTTAATTTTCCCTCT
CTCTTGGTGGAAAAAAATAAAAAGAAAATAGTTATTACCAAAAAAATATTGTAAGGGGTC
CTACGATCCGTCGTATCCGTACTACGGTTGTCCTTTGATTAGGTTCTGTAATGGACCAAT
GGTTGTTTTTGGATGTAAAACAATATAAGTACTCTATCATGATAAGTTCTTGGTCGCTCT
TGTTAACTTTATAAACGTTAAGTTCCCTGTTGAATAATAAGTCAGTAAGTGTCTCTAGTT
TCAGGTTTTCTTATGTTTTGTATCCAAATTGA

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 4

CO CL2153Contig1 1031 4 16 U
GGAGAGAAAAAATAACGCTCTCCCGTCTCCTTCTGCAGCCCTAATTGCATCTCCACCCAT
TATTTCCGTTACTGTTATCTCAATCATCTCAGAGATGCCAATCACGCTCTAATAATGATT
CTTTCGCCACGCCGTTACTGCGACCATTATTTCCGACTGTTATCTCAATCATCTCAGAGA
TGCCAATCATGCTCTCTCGTCTCCTTCTGCAGCCCTAATTGCATCTCCTCCCACACTCCT
TGGCTCTGCGAATCCCTTCGCCGCCTTCACCAATCATCCTCCTCCGCCAACAGTTGTTCA
GTTTCAAGTTTGGTTCTCCGGCGAGGTCTGTGGATTTTGCTCTTGGAGATAAGGTTGCGG
TTATTACCACTGACCCCTTCATGGAGCGTATTTCTGCTATTACTGTGTTGATGCGTTGTT
GCATAAGAATACAATCACATCGCTCACTAAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGG
TTCACTTGACAAGACTGCAAAGCTGTGGGACATGAGAACATTGACTCTTCTCAAGACTTA
CGTTTCAGGGGTGCCTGTAAATGCCGTCTCCACTTCTTGACCATGTTGTGCTTGGAGGTG
GTAAGATGCAGCAGCTGTTACAACCACTGATCATCGTGCTGGGAAGTTCGAGGCTAAGTT
TTATGACAAGGTTAGAAACAGAAGAGGGAAGCTTCATATACTTTACCTTCAAGACATGAC
TCATGAGCAACTGTGCCTTCTGGCTTAGAAGCACAGGGACCTGGAACATTGCGTTATGTC
TGTACGAGCATAGATCGGGAGGTGTGGGAGCTGGAGGGACAATTTTCCTTGTCTTTTCCT
CTAGTTTCGTAAAAAGTCTGTCTCATGAGTCAAACTATATCTTTGATATAATAATAATAA
TACTCATGAATTTCATCACTAATATTATGACTCTCTATAGACAATTATTTCATTTACAAT
TTGAAGAATTTGTAAATGTTTTGCAGGATATTCCAATGACTTTGCCCATGACTTTGTTCA
TTTGTTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D029TF U 1
AF RR2G882TF U 12
AF RR2G882JQ C 258
AF RR2D029JQ C 449
BS 1 22 RR2D029TF
BS 23 23 RR2G882TF
BS 24 104 RR2D029TF
BS 105 105 RR2G882TF
BS 106 514 RR2D029TF
BS 515 515 RR2G882TF
BS 516 544 RR2D029TF
BS 545 670 RR2G882TF
BS 671 671 RR2G882JQ
BS 672 689 RR2G882TF
BS 690 690 RR2G882JQ
BS 691 711 RR2G882TF
BS 712 712 RR2G882JQ
BS 713 729 RR2G882TF
BS 730 1005 RR2G882JQ
BS 1006 1031 RR2D029JQ

RD RR2D029TF 544 0 0
GGAGAGAAAAAATAACGCTCTCTCGTCTCCTTCTGCAGCCCTAATTGCATCTCCACCCAT
TATTTCCGTTACTGTTATCTCAATCATCTCAGAGATGCCAATCATGCTCTAATAATGATT
CTTTCGCCACGCCGTTACTGCGACCATTATTTCCGACTGTTATCTCAATCATCTCAGAGA
TGCCAATCATGCTCTCTCGTCTCCTTCTGCAGCCCTAATTGCATCTCCTCCCACACTCCT
TGGCTCTGCGAATCCCTTCGCCGCCTTCACCAATCATCCTCCTCCGCCAACAGTTGTTCA
GTTTCAAGTTTGGTTCTCCGGCGAGGTCTGTGGATTTTGCTCTTGGAGATAAGGTTGCGG
TTATTACCACTGACCCCTTCATGGAGCGTATTTCTGCTATTACTGTGTTGATGCGTTGTT
GCATAAGAATACAATCACATCGCTCACTAAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGG
TTCACTTGACAAGACTGCAAAGCTGTGGGACATGGGAACATTGACTCTTCTCAAGACTTA
CGTT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2G882TF 726 0 0
GG
AACGCTCTCCCGTCTCCTTCTGCAGCCCTAATTGCATCTCCACCCATTATTTCCGTTACT
GTTATCTCAATCATCTCAGAGATGCCAATCACGCTCTAATAATGATTCTTTCGCCACGCC
GTTACTGCGACCATTATTTCCGACTGTTATCTCAATCATCTCAGAGATGCCAATCATGCT
CTCTCGTCTCCTTCTGCAGCCCTAATTGCATCTCCTCCCACACTCCTTGGCTCTGCGAAT
CCCTTCGCCGCCTTCACCAATCATCCTCCTCCGCCAACAGTTGTTCAGTTTCAAGTTTGG
TTCTCCGGCGAGGTCTGTGGATTTTGCTCTTGGAGATAAGGTTGCGGTTATTACCACTGA
CCCCTTCATGGAGCGTATTTCTGCTATTACTGTGTTGATGCGTTGTTGCATAAGAATACA
ATCACATCGCTCACTAAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTCACTTGACAAG
ACTGCAAAGCTGTGGGACATGAGAACATTGACTCTTCTCAAGACTTACGTTTCAGGGGTG
CCTGTAAATGCCGTCTCCACTTCTTGACCATGTTGTGCTTGGAGGTGGTAAGATGCAGCA
GCTGTTACAACCACTGATCATCGTGCTGGGAAGTTCGAGGCTAAGTTTTATGACAAG*TT
AGAAACAGAAGAGGGA*GCTTCATATACTTTACCTTCA*GACATGACTCATGAGCA
CTGTGCCT

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR2G882JQ 750 0 0
TCGCCGCCTTCACCAATCATCCTCCTCCGCCAACAGTTGTTCAGTTTCAAGTTTGGTTCT
CCGGCGAGGTCTGTGGATTTTGCTCTTGGAGATAAGGTTGCGGTTATTACCACTGACCCC
TTCATGGAGCGTATTTCTGCTATTACTGTGTTGATGCGTTGTTGCATAAGAATACAATCA
CATCGCTCACTAAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTCACTTGACAAGACTG
CAAAGCTGTGGGACATGAGAACATTGACTCTTCTCAAGACTTACGTTTCAGGGGTGCCTG
TAAATGCCGTCTCCACTTCTTGACCATGTTGTGCTTGGAGGTGGTAAGATGCAGCAGCTG
TTACAACCACTGATCATCGTGCTGGGAAGTTCGAGGCTAAGTTTTATGACAAGGTTAGAA
ACAGAAGAGGGAAGCTTCATATACTTTACCTTCAAGACATGACTCATGAGCAACTGTGCC
TTCTGGCTTAGAAGCACAGGGACCTGGAACATTGCGTTATGTCTGTACGAGCATAGATCG
GGAGGTGTGGGAGCTGGAGGGACAATTTTCCTTGTCTTTTCCTCTAGTTTCGTAAAAAGT
CTGTCTCATGAGTCAAACTATATCTTTGATATAATAATAATAATACTCATGAATTTCATC
ACTAATATTATGACTCTCTATAGACAATTATTTCATTTACAATTTGAAGAATTTGTAAAT
GTTTTGCAGGATATTCCAATGACTTTGC
TC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2D029JQ 583 0 0
AAAGCAGCTGATGATTCTCACTTCATTACTGGTTCACTTGACAAGACTGCAAAGCTGTGG
GACATGGGAACATTGACTCTTCTCAAGACTTACGTTTCAGGGGTGCCTGTAAATGCCGTC
TCCACTTCTTGACCATGTTGTGCTTGGAGGTGGTAAGATGCATCAGCTGTTACAACCACT
GATCATCGTGCTGGGAAGTTCGAGGCTAAGTTTTATGACAAGGTTAGAAACAGAAGAGGG
AAGCTTCATATACTTTACCTTCAAGACATGACTCATGAGCAACTGTGCCTTCTGGCTTAG
AAGCACAGGGACCTGGAACATTGCGTTATGTCTGTACGAGCATAGATCGGGAGGTGTGGG
AGCTGGAGGGACAATTTTCCTTGTCTTTTCCTCTAGTTTCGTAAAAAGTCTGTCTCATGA
GTCAAACTATATCTTTGATATAATAATAATAATACTCATGAATTTCATCACTAATATTAT
GACTCTCTATAGACAATTATTTCATTTACAATTTGAAGAATTTGTAAATGTTTTGCAGGA
TATTCCAATGACTTTGCCCATGACTTTGTTCATTTGTTTGCCC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 4

CO CL2154Contig1 1340 4 5 U
GGAAGTAAGTGGATCAATAAAGTAACCGAACTCAAAAGAAAATTCATTATTTATGGTCCA
AGACCATACATTTTGATGAATGCAACTTATAAAAATTTGTTGAATAGATAGATAGAGCGA
AAAGATCATAACTATACTTAACAAAAAAATACTCAGAAACGTCCACATACGTCGAAGGTT
TTTTGTTGCTGTCGGAAAAAGTAGAAGTCCAGCTCCGAGTAAAATAGGTACTGGGAGTGG
AATGAAAGGGATGATCCATGAATATTGATATGTATGTTCCATAAAATAAAAAACCCTTTT
TATTTTATTCTTAAATTTATTATTTCTTATTCACTGGTTTGTATATATATATATTTTTTT
CAAAGGGGATAATAAAAAAGCGCATTATTTCAAACTTAAATAGAAATTTTTTCGAATTAG
TATAATCCTTCATAAACCTTTGATTGAAAAGAAATATATATTCAAATCAAAAAATTAGAA
GTTATTAAATAATATTACTAAGTTACTGTAAAAAAACGATTTGTCTTTTTTTTTTTTACT
ACTAAATAAAATTGTGATTTTATGCAGATACAGAAAAAAAGTGAATTATAATTCCGTATT
ACAATAATTTATATACATATATTAAGAATAGAACAAAGATTTACACGACAAAAAAATACT
TAATATTAATTATAAAAAAAAGTTATTTGGGTTTGATTATTTAGAATTATTATTGAATTA
TGGAATTTAGTGATTGTCTTCCAGTACACTAAATGAGCTTTTTTTTTCAAGAAATAGTAT
TATAATCGATATTTTTTTTTTTACATATGAAGTGAAGAAATTTAATAAAATTTTTTCTAA
TATAATCTATACAGTATAGATTAATTAAATGAGCACTCTCATACGGATTTAAAACGTTAA
ATACAAAAAATTTTTCAAGAAAAAGGTAAAAAATAGTTGGGTTTTAAATTTTTGAATGTC
TGTTTTGTTTGAAAAATAATATATAATAAAATTTGAAAGAAAAAAATTACTCGATATGGA
GTACGAAAGAATAGAATAATAAATGTCTTTGACATACAATTATACCACTGAAAAACTTTT
TTCATTTTTGAATGGCAGTTCCAAAAAAACGTACTTCTATCTCGAAAAAGCGTATTCGTA
AAAAAATTTGGAAAAGGAAGGGATATTGGACATCGTTGAAAGCGATTTCTTTAGGGAAAT
CGCTTTCAACAGGTAATTCAAAAAGTTTTTTTGTACAACAAAATAAATAAAAAAACACTA
GAATCATTAGAATTAGCCTAACGTAAAAACAAATTTTTTAGAATACATATAAATAAAGAA
ATCAATAGGAACGAAAAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH46TF U 1
AF RR2BH46JQ C 319
AF RR2AM01TF U 619
AF RR2AM01JQ C 619
BS 1 773 RR2BH46TF
BS 774 774 RR2AM01TF
BS 775 792 RR2BH46TF
BS 793 1139 RR2AM01TF
BS 1140 1340 RR2AM01JQ

RD RR2BH46TF 792 0 0
GGAAGTAAGTGGATCAATAAAGTAACCGAACTCAAAAGAAAATTCATTATTTATGGTCCA
AGACCATACATTTTGATGAATGCAACTTATAAAAATTTGTTGAATAGATAGATAGAGCGA
AAAGATCATAACTATACTTAACAAAAAAATACTCAGAAACGTCCACATACGTCGAAGGTT
TTTTGTTGCTGTCGGAAAAAGTAGAAGTCCAGCTCCGAGTAAAATAGGTACTGGGAGTGG
AATGAAAGGGATGATCCATGAATATTGATATGTATGTTCCATAAAATAAAAAACCCTTTT
TATTTTATTCTTAAATTTATTATTTCTTATTCACTGGTTTGTATATATATATATTTTTTT
CAAAGGGGATAATAAAAAAGCGCATTATTTCAAACTTAAATAGAAATTTTTTCGAATTAG
TATAATCCTTCATAAACCTTTGATTGAAAAGAAATATATATTCAAATCAAAAAATTAGAA
GTTATTAAATAATATTACTAAGTTACTGTAAAAAAACGATTTGTCTTTTTTTTTTTTACT
ACTAAATAAAATTGTGATTTTATGCAGATACAGAAAAAAAGTGAATTATAATTCCGTATT
ACAATAATTTATATACATATATTAAGAATAGAACAAAGATTTACACGACAAAAAAATACT
TAATATTAATTATAAAAAAAAGTTATTTGGGTTTGATTATTTAGAATTATTATTGAATTA
TGGAATTTAGTGATTGTCTTCCAGTACACTAAATGAGCTTTTTTTTTCAAGAA*TAGTAT
TATAATCGATAT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2BH46JQ 784 0 0
ATTATTTCTTATTCACTGGTTTGTATATATATATATTTTTTTCAAAGGGGATAATAAAAA
AGCGCATTATTTCAAACTTAAATAGAAATTTTTTCGAATTAGTATAATCCTTCATAAACC
TTTGATTGAAAAGAAATATATATTCAAATCAAAAAATTAGAAGTTATTAAATAATATTAC
TAAGTTACTGTAAAAAAACGATTTGTCTTTTTTTTTTTTACTACTAAATAAAATTGTGAT
TTTATGCAGATACAGAAAAAAAGTGAATTATAATTCCGTATTACAATAATTTATATACAT
ATATTAAGAATAGAACAAAGATTTACACGACAAAAAAATACTTAATATTAATTATAAAAA
AAAGTTATTTGGGTTTGATTATTTAGAATTATTATTGAATTATGGAATTTAGTGATTGTC
TTCCAGTACACTAAATGAGCTTTTTTTTTCAAGAAATAGTATTATAATCGATATTTTTTT
TTTTACATATGAAGTGAAGAAATTTAATAAAATTTTTTCTAATATAATCTATACAGTATA
GATTAATTAAATGAGCACTCTCATACGGATTTAAAACATTAAATACAAAAAATTTTTCAA
GAAAAAGGTAGAAAATAGTTGGGTTTTAAATTTTTGAATGTCTGTTTTGTTTGAAAAATA
ATATATAATAAAATTTGAAAGAAAAAAATTACTCGATATGGAGTACGAAAGAATAGAATA
ATAAATGTCTTTGACATACAATTATACCACTGAAAAACTTTTTTCATTTTTGAATGGCAG
TTCC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2AM01TF 521 0 0
G
TATTAAGAATAGAACAAAGATTTACACGACAAAAAAATACTTAATATTAATTATAAAAAA
AAGTTATTTGGGTTTGATTATTTAGAATTATTATTGAATTATGGAATTTAGTGATTGTCT
TCCAGTACACTAAATGAGCTTTTTTTTTCAAGAAATAGTATTATAATCGATATTTTTTTT
TTTACATATGAAGTGAAGAAATTTAATAAAATTTTTTCTAATATAATCTATACAGTATAG
ATTAATTAAATGAGCACTCTCATACGGATTTAAAACGTTAAATACAAAAAATTTTTCAAG
AAAAAGGTAAAAAATAGTTGGGTTTTAAATTTTTGAATGTCTGTTTTGTTTGAAAAATAA
TATATAATAAAATTTGAAAGAAAAAAATTACTCGATATGGAGTACGAAAGAATAGAATAA
TAAATGTCTTTGACATACAATTATACCACTGAAAAACTTTTTTCATTTTTGAATGGCAGT
TCCAAAAAAACGTACTTCTATCTCGAAAAAGCGTATTCGT

QA 2 521 2 521
DS 

RD RR2AM01JQ 722 0 0
G
TATTAAGAATAGAACAAAGATTTACACGACAAAAAAATACTTAATATTAATTATAAAAAA
AAGTTATTTGGGTTTGATTATTTAGAATTATTATTGAATTATGGAATTTAGTGATTGTCT
TCCAGTACACTAAATGAGCTTTTTTTTTCAAGAAATAGTATTATAATCGATATTTTTTTT
TTTACATATGAAGTGAAGAAATTTAATAAAATTTTTTCTAATATAATCTATACAGTATAG
ATTAATTAAATGAGCACTCTCATACGGATTTAAAACGTTAAATACAAAAAATTTTTCAAG
AAAAAGGTAAAAAATAGTTGGGTTTTAAATTTTTGAATGTCTGTTTTGTTTGAAAAATAA
TATATAATAAAATTTGAAAGAAAAAAATTACTCGATATGGAGTACGAAAGAATAGAATAA
TAAATGTCTTTGACATACAATTATACCACTGAAAAACTTTTTTCATTTTTGAATGGCAGT
TCCAAAAAAACGTACTTCTATCTCGAAAAAGCGTATTCGTAAAAAAATTTGGAAAAGGAA
GGGATATTGGACATCGTTGAAAGCGATTTCTTTAGGGAAATCGCTTTCAACAGGTAATTC
AAAAAGTTTTTTTGTACAACAAAATAAATAAAAAAACACTAGAATCATTAGAATTAGCCT
AACGTAAAAACAAATTTTTTAGAATACATATAAATAAAGAAATCAATAGGAACGAAAAGA
G

QA 2 722 2 722
DS 



AS 1 4

CO CL2155Contig1 523 4 13 U
GGACTTTCACTTCAGCAGAAAGATAAGACGAAACAATGTCTGTGTCAGCGATCTTTGGCA
CCGGAATGGCCACCGTCGCTGCTTCTCCGGCTCTCCGCCAATTTCAAGTTCCGAAACTGG
GCAACGGAGGAGGACTGGGAATGGTGATAGAGTGTTCGTCGAGGCCGCAGAAGAAATCGA
CTGCGCATCACAGGAAGACGAGGCCGAAGAAGACTCAACCTTGGGACATTAAGAGAAAGC
CTACAGTGTATGCTCCTCTGCCTCCTCTCCCTCCCGATTGGTCGCCGCTCGCTGTTTCTT
CCGACGACGGCGGTGTAATCGCCGCCGGAGATTTGGTCTCAGGCGCTGCCGCATAGTTAT
GAGTTAACTGCTGGTCTGGTTTTACTTTTAGTTTGAGAGCTTTTGTTTGTGTCTGTTTCT
GTTAATTTGTTCTGTTTTCTGTTGTATGTTTCCTTCCTCCTCTTGTGTTAATGATTGGAC
CAAGTTGTGAACTTTTATCAAAGCTTCCTCTGTTTTTGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A710JQ C 1
AF RR2DD93TF U 1
AF RR2BH44TF U 7
AF RR2A710TF U 1
BS 1 8 RR2A710JQ
BS 9 274 RR2DD93TF
BS 275 275 RR2BH44TF
BS 276 318 RR2DD93TF
BS 319 319 RR2A710TF
BS 320 426 RR2DD93TF
BS 427 427 RR2A710TF
BS 428 439 RR2DD93TF
BS 440 440 RR2BH44TF
BS 441 484 RR2DD93TF
BS 485 485 RR2A710TF
BS 486 499 RR2DD93TF
BS 500 523 RR2A710TF

RD RR2A710JQ 523 0 0
GGACTTTCACTTCAGCAGAAAGATAAGACGAAACAATGTCTGTGTCAGCGATCTTTGGCA
CCGGAATGGCCACCGTCGCTGCTTCTCCGGCTCTCCGCCAATTTCAAGTTCCGAAACTGG
GCAACGGAGGAGGACTGGGAATGGTGATAGAGTGTTCGTCGAGGCCGCAGAAGAAATCGA
CTGCGCATCACAGGAAGACGAGGCCGAAGAAGACTCAACCTTGGGACATTAAGAGAAAGC
CTACAGTGTATGCTCCTCTGCCTCCTCTCCCTCCCGATTGGTCGCCGCTCGCTGTTTCTT
CCGACGACGGCGGTGTAATCGCCGCCGGAGATTTGGTCTCAGGCGCTGCCGCATAGTTAT
GAGTTAACTGCTGGTCTGGTTTTACTTTTAGTTTGAGAGCTTTTGTTTGTGTCTGTTTCT
GTTAATTTGTTCTGTTTTCTGTTGTATGTTTCCTTCCTCCTCTTGTGTTAATGATTGGAC
CAAGTTGTGAACTTTTATCAAAGCTTCCTCTGTTTTTGGTTCC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2DD93TF 504 0 0
GGACTTTC
ACTTCAGCAGAAAGATAAGACGAAACAATGTCTGTGTCAGCGATCTTTGGCACCGGAATG
GCCACCGTCGCTGCTTCTCCGGCTCTCCGCCAATTTCAAGTTCCGAAACTGGGCAACGGA
GGAGGACTGGGAATGGTGATAGAGTGTTCGTCGAGGCCGCAGAAGAAATCGACTGCGCAT
CACAGGAAGACGAGGCCGAAGAAGACTCAACCTTGGGACATTAAGAGAAAGCCTACAGTG
TATGCTCCTCTGCCTCCTCTCCCTCCGGATTGGTCGCCGCTCGCTGTTTCTTCCGACGAC
GGCGGTGTAACCGCCGCCGGAGATTTGGTCTCAGGCGCTGCCGCATAGTTATGAGTTAAC
TGCTGGTCTGGTTTTACTTTTAGTTTGAGAGCTTTTGTTTGTGTCTGTTTCTGTTAATGT
GTTCTGTTTTCCGTTGTATGTTTCCTTCCTCCTCTTGTGTTAATGATTGGACCAAGCTGT
GAACTTTTATC
AAAGC

QA 9 499 9 499
DS 

RD RR2BH44TF 493 0 0
GG
ACTTCAGCAGAAAGATAAGACGAAACAATGTCTGTGTCAGCGATCTTTGGCACCGGAATG
GCCGCCGTCGCTGCTTCTCCGGCTCTCCGCCAATTTCAAGTTCCGAAACTGGGCAACGGA
GGAGGACTGGGAATGGTGATAGAGTGTTCGTCGAGGCCGCAGAAGAAATCGACTGCGCAT
CACAGGAAGACGAGGCCGAAGAAGACTCAACCTTGGGACATTAAGAGAAAGCCTACAGTG
TATGCTCCTCTGCCTCCTCTCCCTCCCGATTGGTCGCCGCTCGCTGTTTCTTCCGACGAC
GGCGGTGTAACCGCCGCCGGAGATT*GGTCTCAGGCGCTGCCGCATAGTTATGAGTTAAC
TGCTGGTCTGGTTTTACTTTTAGTTTGAGAGCTTTTGTTTGTGTCTGTTTCTGTTAATGT
GTTCTGTTTTCTGTTGTATGTTTCCTTCCTCCTCTTGTGTTAATGATTGGACCAAGCTGT
GAACTTTTATC

QA 3 493 3 493
DS 

RD RR2A710TF 523 0 0
GGACTTTC
ACTTCAGCAGAAAGATAAGACGAAACAATGTCTGTGTCAGCGATCTTTGGCACCGGAATG
GCCACCGTCGCTGCTTCTCCGGCTCTCCGCCAATTTCAAGTTCCGAAACTGGGCAACGGA
GGAGGACTGGGAATGGTGATAGAGTGTTCGTCGAGGCCGCAGAAGAAATCGACTGCGCAT
CACAGGAAGACGAGGCCGAAGAAGACTCAACCTTGGGACATTAAGAGAAAGCCTACAGTG
TATGCTCCTCTGCCTCCTCTCCCTCCCGATTGGTCGCCGCTCGCTGTTTCTTCCGACGAC
GGCGGTGTAATCGCCGCCGGAGATTTGGTCTCAGGCGCTGCCGCATAGTTATGAGTTAAC
TGCTGGTCTGGTTTTACTTTTAGTTTGAGAGCTTTTGTTTGTGTCTGTTTCTGTTAATTT
GTTCTGTTTTCTGTTGTATGTTTCCTTCCTCCTCTTGTGTTAATGATTGGACCAAGTTGT
GAACTTTTATCAAAGCTTCCTCTGTTTTTGGTTCC

QA 9 523 9 523
DS 



AS 1 2

CO CL2156Contig1 1027 2 4 U
GGAACGAATCGCTTCTCTTCTATCCAAATCTTTTCGTTTCTCTGTTTTTTTTCTTTCTAA
TTTCTCTTATTGGATAGGATGGGAACAGTTCTTGATTCGCATTTCTTGTCTCTCACAGCC
ATTGTTACTGTGGTTTACCAGTTCATATTCTTTGTAATCACAGCTCTTTTCAAGGTCGAT
CAAGTCACTGACTTTGCAGGAAGCACAAACTTCGTTATACTTGCTCTACTGACTCTTGTT
CTTAAATCCACGTGGCATTTTCGCCAGATAGTCTTGACTTTGCTGGTTGTGGTATGGGGT
CTTCGCTTGGGAACATTTCTTCTAATGAGGATCCTGCAATGGGGTGAAGATCGACGCTTT
GACGAAATGCGTCAGAATCTGGTGAAACTAATAGTTTTCTGGACTTTTCAGGCCGTGTGG
GTCTGGACCGTGAGCTTACCTCTAACCGTCGTTAACGCAAGTGATGATGGTGGAGGAGGA
TCACTTAAACCCGCAGATGTAATCGGCTGGACGATGTGGGTTTTTGGTTTCTTGATTGAG
GCTGCAGCTGATCAACAGAAGCCCTCTTTTAAAAACGCTCCAGAGAACAGAGGTAAATGG
TGTGATGCTGGTCTTTGGAAATACTCAAGACATCCAAACTACTTTGGCGAGATGTTACTG
TGGTGGGGAATCTTTGTGGCTGCATCGCCTGTTCTAGAAGGTGCTGAGTATCTTGTCGTG
TTAGGACCAGTCTTTCTCGCTTTACTACTTCTTTTCGTCAGCGGCATATCTTTACTAGAG
GCATCGGCTGACAAAAAGCATGGCCACTTGGGAGCTTACCGATTCTATAAGAAGAGTACA
AGTCCTCTGATTCTTTTGCCGAGAGGAGTGTATGGGAACTTACCAGGATGGTGCAAGAGA
GTCTTTCTCTTCGAGCTTCCTTTTTACAGTAGGAGTCTACCAGAAGAAGCTGCTATTTAC
TAAAGGAGCCCTCCAAGAGAGTATCAGCTGAAAGATTACTCTAATTTGTGATTTAAAAAT
AAATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM14TF U 1
AF RR2EM14JQ C 305
BS 1 700 RR2EM14TF
BS 701 701 RR2EM14JQ
BS 702 722 RR2EM14TF
BS 723 1027 RR2EM14JQ

RD RR2EM14TF 722 0 0
GGAACGAATCGCTTCTCTTCTATCCAAATCTTTTCGTTTCTCTGTTTTTTTTCTTTCTAA
TTTCTCTTATTGGATAGGATGGGAACAGTTCTTGATTCGCATTTCTTGTCTCTCACAGCC
ATTGTTACTGTGGTTTACCAGTTCATATTCTTTGTAATCACAGCTCTTTTCAAGGTCGAT
CAAGTCACTGACTTTGCAGGAAGCACAAACTTCGTTATACTTGCTCTACTGACTCTTGTT
CTTAAATCCACGTGGCATTTTCGCCAGATAGTCTTGACTTTGCTGGTTGTGGTATGGGGT
CTTCGCTTGGGAACATTTCTTCTAATGAGGATCCTGCAATGGGGTGAAGATCGACGCTTT
GACGAAATGCGTCAGAATCTGGTGAAACTAATAGTTTTCTGGACTTTTCAGGCCGTGTGG
GTCTGGACCGTGAGCTTACCTCTAACCGTCGTTAACGCAAGTGATGATGGTGGAGGAGGA
TCACTTAAACCCGCAGATGTAATCGGCTGGACGATGTGGGTTTTTGGTTTCTTGATTGAG
GCTGCAGCTGATCAACAGAAGCCCTCTTTTAAAAACGCTCCAGAGAACAGAGGTAAATGG
TGTGATGCTGGTCTTTGGAAATACTCAAGACATCCAAACTACTTTGGCGAGATGTTACTG
TGGTGGGGAATCTTTGTGGCTGCATCGCCTGTTCTAGAAG*TGCTGAGTATCTTGTCGTG
TT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2EM14JQ 723 0 0
GCTTGGGAACATTTCTTCTAATGAGGATCCTGCAATGGGGTGAAGATCGACGCTTTGACG
AAATGCGTCAGAATCTGGTGAAACTAATAGTTTTCTGGACTTTTCAGGCCGTGTGGGTCT
GGACCGTGAGCTTACCTCTAACCGTCGTTAACGCAAGTGATGATGGTGGAGGAGGATCAC
TTAAACCCGCAGATGTAATCGGCTGGACGATGTGGGTTTTTGGTTTCTTGATTGAGGCTG
CAGCTGATCAACAGAAGCCCTCTTTTAAAAACGCTCCAGAGAACAGAGGTAAATGGTGTG
ATGCTGGTCTTTGGAAATACTCAAGACATCCAAACTACTTTGGCGAGATGTTACTGTGGT
GGGGAATCTTTGTGGCTGCATCGCCTGTTCTAGAAGGTGCTGAGTATCTTGTCGTGTTAG
GACCAGTCTTTCTCGCTTTACTACTTCTTTTCGTCAGCGGCATATCTTTACTAGAGGCAT
CGGCTGACAAAAAGCATGGCCACTTGGGAGCTTACCGATTCTATAAGAAGAGTACAAGTC
CTCTGATTCTTTTGCCGAGAGGAGTGTATGGGAACTTACCAGGATGGTGCAAGAGAGTCT
TTCTCTTCGAGCTTCCTTTTTACAGTAGGAGTCTACCAGAAGAAGCTGCTATTTACTAAA
GGAGCCCTCCAAGAGAGTATCAGCTGAAAGATTACTCTAATTTGTGATTTAAAAATAAAT
AAA

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 4

CO CL2157Contig1 1346 4 5 U
GGACTCTCAGACACAACAACAGCAGATCAAAAGGTAAACAACCCAAAATAATGCTTCTCT
ACTTTATCATCTCCTGTCTCTCTTTTTGTTCCTGTCCAAATCACTCTCTCTTCCTCCATG
GGCATCTGAAACCAAAACCTTGCTCTCCTTCTACTTCTCCAAGAACCTCTTCACCAGAAC
TCTGCATCCAACCACACCTGATCCAGCTTCTCCAGTGGACCACCAAATGTCAGTCCTTGA
CCTCCCTGACCTGGCTCTGGATCTCATTCTCGAGCTTCTTCCACCTTCTGGACTCTCTAG
TATGGCCAGGGTTTGTAGCTCCTTGAGGGAGAGGTGTGTGAGTGATCATCTCTGGGAAAA
ACACTTGATCACCAAATGGGGCAAAGTCCTTGGCCCTGTTGCTCATAGAGATTGGAGATG
CTACCTCTCTTCCTCGTGTCATCTTGATTCACCTAATCACCGAATTGGTCATCATCCTCT
TGGTTTTGACAAAATCATCTCTCTGATCCGATCTATTTCCTCTGGTGATGAAAAGAGGAA
GAGATATGCTGCGTCGTCTCTGCCACTTGATTCCACCATGAGCTTCTGCCTCTCCCTTGA
AACTGGTCGCTTTTGGTTCCCAGTTCAAGTTTACAACCGTGAGAATGGGCATGTAGGGTT
CATGTTGTCATGCTATGATGCGGAGCTCAGCTATGATACTCACACTGATACGTTTCAAGC
CAGGTATGCACCACATGGTAGAAAAGCAGTTGCGGTTGAAAAAGGTGTGACATGGGAAAG
GCTAAGAGCAGCTCCCATCGATATATCTCCTCATCACCTTCATGTGTCAGATTCTCTAAA
CGAGTTGAAACCTGGAGATCACATTGAGATTCAGTGGAGAAGGAACAAAGCGTTCCCTTA
CGGATGGTGGTATGGTGTCGTTGGCCATTTAGAATCATGTGATGGGAATCTCAACCATTG
TCACTGCCATCTTAATGAGATGGTGGTGTTGGAATTCAACCAGTACACAGTGGGATCGAG
GTGGAGAAGAACGATGATAAACAAGAGAGATCATAGAGAGGAAGGTAACGAGGAAGAGGG
GTTCTATGGAGGAATCAGAAAGCTAAGTTGTAAAGAAGAGATCGCAATGTGGACACGTCT
CTGGCCATCTTCCATCTTAGAGTAGGATGAAGATATTAAAACCACAATCATTGTACGGAG
GGTAGGGATGTTAATTTTAGATGTGTGTTCTCTTCTTCTATCTAATGCATGATTTAACTG
TTGATTATTTATTCAAAATTGTCTAAAGTCACTTCATTGAAAAGTGGTATCATAATCACA
AAGCATAAGAGGCAGACTTTTTAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H781TF U 1
AF RR2B541TF U 770
AF RR2H781JQB C 600
AF RR2B541JQ C 746
BS 1 756 RR2H781TF
BS 757 769 RR2H781JQB
BS 770 1118 RR2B541TF
BS 1119 1270 RR2H781JQB
BS 1271 1346 RR2B541JQ

RD RR2H781TF 756 0 0
GGACTCTCAGACACAACAACAGCAGATCAAAAGGTAAACAACCCAAAATAATGCTTCTCT
ACTTTATCATCTCCTGTCTCTCTTTTTGTTCCTGTCCAAATCACTCTCTCTTCCTCCATG
GGCATCTGAAACCAAAACCTTGCTCTCCTTCTACTTCTCCAAGAACCTCTTCACCAGAAC
TCTGCATCCAACCACACCTGATCCAGCTTCTCCAGTGGACCACCAAATGTCAGTCCTTGA
CCTCCCTGACCTGGCTCTGGATCTCATTCTCGAGCTTCTTCCACCTTCTGGACTCTCTAG
TATGGCCAGGGTTTGTAGCTCCTTGAGGGAGAGGTGTGTGAGTGATCATCTCTGGGAAAA
ACACTTGATCACCAAATGGGGCAAAGTCCTTGGCCCTGTTGCTCATAGAGATTGGAGATG
CTACCTCTCTTCCTCGTGTCATCTTGATTCACCTAATCACCGAATTGGTCATCATCCTCT
TGGTTTTGACAAAATCATCTCTCTGATCCGATCTATTTCCTCTGGTGATGAAAAGAGGAA
GAGATATGCTGCGTCGTCTCTGCCACTTGATTCCACCATGAGCTTCTGCCTCTCCCTTGA
AACTGGTCGCTTTTGGTTCCCAGTTCAAGTTTACAACCGTGAGAATGGGCATGTAGGGTT
CATGTTGTCATGCTATGATGCGGAGCTCAGCTATGATACTCACACTGATACGTTTCAAGC
CAGGTATGCACCACATGGTAGAAAAGCAGTTGCGGT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2B541TF 349 0 0
ACATGGGAAAGGCTAAGAGCAGCTCCCATCGATATATCTCCTCATCACCTTCATGTGTCA
GATTCTCTAAACGAGTTGAAACCTGGAGATCACATTGAGATTCAGTGGAGAAGGAACAAA
GCGTTCCCTTACGGATGGTGGTATGGTGTCGTTGGCCATTTAGAATCATGTGATGGGAAT
CTCAACCATTGTCACTGCCATCTTAATGAGATGGTGGTGTTGGAATTCAACCAGTACACA
GTGGGATCGAGGTGGAGAAGAACGATGATAAACAAGAGAGATCATAGAGAGGAAGGTAAC
GAGGAAGAGGGGTTCTATGGAGGAATCAGAAAGCTAAGTTGTAAAGAAG

QA 1 349 1 349
DS 

RD RR2H781JQB 671 0 0
AAACTGGTCGCTTTTGGTTCCCAGTTCAAGTTTACAACCGTGAGAATGGGCATGTAGGGT
TCATGTTGTCATGCTATGATGCGGAGCTCAGCTATGATACTCACACTGATACGTTTCAAG
CCAGGTATGCACCACATGGTAGAAAAGCAGTTGCGGTTGAAAAAGGTGTGACATGGGAAA
GGCTAAGAGCAGCTCCCATCGATATATCTCCTCATCACCTTCATGTGTCAGATTCTCTAA
ACGAGTTGAAACCTGGAGATCACATTGAGATTCAGTGGAGAAGGAACAAAGCGTTCCCTT
ACGGATGGTGGTATGGTGTCGTTGGCCATTTAGAATCATGTGATGGGAATCTCAACCATT
GTCACTGCCATCTTAATGAGATGGTGGTGTTGGAATTCAACCAGTACACAGTGGGATCGA
GGTGGAGAAGAACGATGATAAACAAGAGAGATCATAGAGAGGAAGGTAACGAGGAAGAGG
GGTTCTATGGAGGAATCAGAAAGCTAAGTTGTAAAGAAGAGATCGCAATGTGGACACGTC
TCTGGCCATCTTCCATCTTAGAGTAGGATGAAGATATTAAAACCACAATCATTGTACGGA
GGGTAGGGATGTTAATTTTAGATGTGTGTTCTCTTCTTCTATCTAATGCATGATTTAACT
GTTGATTATTT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2B541JQ 601 0 0
GCAGTTGCGGTTGAAAAAGGTGTGACATGGGAAAGGCTAAGAGCAGCTCCCATCGATATA
TCTCCTCATCACCTTCATGTGTCAGATTCTCTAAACGAGTTGAAACCTGGAGATCACATT
GAGATTCAGTGGAGAAGGAACAAAGCGTTCCCTTACGGATGGTGGTATGGTGTCGTTGGC
CATTTAGAATCATGTGATGGGAATCTCAACCATTGTCACTGCCATCTTAATGAGATGGTG
GTGTTGGAATTCAACCAGTACACAGTGGGATCGAGGTGGAGAAGAACGATGATAAACAAG
AGAGATCATAGAGAGGAAGGTAACGAGGAAGAGGGGTTCTATGGAGGAATCAGAAAGCTA
AGTTGTAAAGAAGAGATCGCAATGTGGACACGTCTCTGGTCATCTTCCATCTTAGAGTAG
GATGAAGATATTAAAACCACAATCATTGTACGGAGGGTAGGGATGTTAATTTTAGATGTG
TGTTCTCTTCTTCTATCTAATGCATGATTTAACTGTTGATTATTTATTCAAAATTGTCTA
AAGTCACTTCATTGAAAAGTGGTATCATAATCACAAAGCATAAGAGGCAGACTTTTTAAG
A

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 4

CO CL2158Contig1 868 4 7 U
GGAACACTTCCCCAAATCTGCACCTCCTCTCATCTATATTTCCATCTCCGTCTTCGTTAT
TTATAACCCAAAATCTATCTAACAGTTTTGTCTCTCTATTTAATATATATCCGTCTCCTC
TCCAAAGTGTTGCTTCAGAGCTACAAAGTTCCAACATTTAAATCGCCGTTGTTGGGAGAT
CTGAAAGGCTGTTTTTTTTTTGTGTGGATCGATTCCATCATCATCATCATCATAGTCCGA
TCATCGTTCCTTTTGTAAAAGGTTTATCTCTAATCGTTTCAGGTAGAAATGTTTTTTTCT
TACATCTTGTTTTGATTCGGTTTTTGTTGTCGTGTTTTAATGTTTTTTTTCTCTCTTTGA
GGTCATTTACTTGTGTTTTTTTTAATAAAAGATCTTGTTTTTGGATGATGATTGAACTTT
TCTTTTATGAACATGTTGATTCTTTTATAAGATTACTTTTTTATGCTGCTTCTGTTTAAG
ATGAGAGCATGATATTTGGTCTTTTTTTTAGTATTATGCTCTTGTTGATTGCGTTTCTTA
GAAGATTAACGATGGTTTTGATACTTTTGAGCCAAAGCTGATGACTTTTATGGTCTGAAT
TTGGTTTTACATATGATTTCTATTTTTGTTTGCTTTATCTGTTTGATTAGAAAATGCTAC
TGTATACTGATTGACAATAAAGTGAGTTGATGGGGACAAAAAAAAAGATTGCTCTAAGTG
CAAGCCACTGTTTTCTCGTATTCTATTAGGTTGTGTAAAGACTTGCTTTCACAATAGATT
GATGAAGGAAATGCCAAAAATGATCAATTAAATTGTTACCCTCTGCTCTTCCTCTCTTTA
TGGTCTGCAGGTTAGGTAAACGGTTTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DH23TF U 1
AF RR2EO73TF U 1
AF RR2EO73JQ C 116
AF RR2DH23JQ C 122
BS 1 200 RR2DH23TF
BS 201 201 RR2EO73TF
BS 202 382 RR2DH23TF
BS 383 383 RR2EO73TF
BS 384 706 RR2DH23TF
BS 707 745 RR2EO73TF
BS 746 868 RR2EO73JQ

RD RR2DH23TF 706 0 0
GGAACACTTCCCCAAATCTGCACCTCCTCTCATCTATATTTCCATCTCCGTCTTCGTTAT
TTATAACCCAAAATCTATCTAACAGTTTTGTCTCTCTATTTAATATATATCCGTCTCCTC
TCCAAAGTGTTGCTTCAGAGCTACAAAGTTCCAACATTTAAATCGCCGTTGTTGGGAGAT
CTGAAAGGCTGTTTTTTTTT*GTGTGGATCGATTCCATCATCATCATCATCATAGTCCGA
TCATCGTTCCTTTTGTAAAAGGTTTATCTCTAATCGTTTCAGGTAGAAATGTTTTTTTCT
TACATCTTGTTTTGATTCGGTTTTTGTTGTCGTGTTTTAATGTTTTTTTTCTCTCTTTGA
GGTCATTTACTTGTGTTTTTTT*AATAAAAGATCTTGTTTTTGGATGATGATTGAACTTT
TCTTTTATGAACATGTTGATTCTTTTATAAGATTACTTTTTTATGCTGCTTCTGTTTAAG
ATGAGAGCATGATATTTGGTCTTTTTTTTAGTATTATGCTCTTGTTGATTGCGTTTCTTA
GAAGATTAACGATGGTTTTGATACTTTTGAGCCAAAGCTGATGACTTTTATGGTCTGAAT
TTGGTTTTACATATGATTTCTATTTTTGTTTGCTTTATCTGTTTGATTAGAAAATGCTAC
TGTATACTGATTGACAATAAAGTGAGTTGATGGGGACAAAAAAAAA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2EO73TF 745 0 0
GGAACACTTCCCCAAATCTGCACCTCCTCTCATCTATATTTCCATCTTCGTCTTCGTTAT
TTATAACCCAAAATCTATCTAACAGTTTTGTCTCTCTATTTAATATATATCCGTCTCCTC
TCCAAAGTGTTGCTTCAGAGCTACAAAGTTCCAACATTTAAATCGCCGTTGTTGGGAGAT
CTGAAAGGCTGTTTTTTTTTTGTGTGGATCGATTCCATCATCATCATCATCATAGTCCGA
TCATCGTTCCTTTTGTAAAAGGTTTATCTCTAATCGTTTCAGGTAGAAATGTTTTTTTCT
TACATCTTGTTTTGATTCGGTTTTTGTTGTCGTGTTTTAATGTTTTTTTTCTCTCTTTGA
GGTCATTTACTTGTGTTTTTTTTAATAAAAGATCTTGTTTTTGGATGATGATTGAACTTT
TCTTTTATGAACATGTTGATTCTTTTATAAGATTACTTTTTTATGCTGCTTCTGTTTAAG
ATGAGAGCATGATATTTGGTCTTTTTTTTAGTATTATGCTCTTGTTGATTGCGTTTCTTA
GAAGATTAACGATGGTTTTGATACTTTTGAGCCAAAGCTGATGACTTTTATGGTCTGAAT
TTGGTTTTACATATGATTTCTATTTTTGTTTGCTTTATCTGTTTGATTAGAAAATGCTAC
TGTATACTGATTGACAATAAAGTGAGTTGATGGGGACAAAAAAAAAGATTGCTCTAAGTG
CAAGCCACTGTTTTCTCGTATTCTA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2EO73JQ 753 0 0
TCCTCT
CCAAAGTGTTGCTTCAGAGCTACAAAGTTCCAACATTTAAATCGCCGTTGTTGGGAGATC
TGAAAGGCTGTTTTTTTTTTGTGTGGATCGATTCCATCATCATCATCATCATAGTCCGAT
CATCGTTCCTTTTGTAAAAGGTTTATCTCTAATCGTTTCAGGTAGAAATGTTTTTTTCTT
ACATCTTGTTTTGATTCGGTTTTTGTTGTCGTGTTTTAATGTTTTTTTTCTCTCTTTGAG
GTCATTTACTTGTGTTTTTTTTAATAAAAGATCTTGTTTTTGGATGATGATTGAACTTTT
CTTTTATGAACATGTTGATTCTTTTATAAGATTACTTTTTTATGCTGCTTCTGTTTAAGA
TGAGAGCATGATATTTGGTCTTTTTTTTAGTATTATGCTCTTGTTGATTGCGTTTCTTAG
AAGATTAACGATGGTTTTGATACTTTTGAGCCAAAGCTGATGACTTTTATGGTCTGAATT
TGGTTTTACATATGATTTCTATTTTTGTTTGCTTTATCTGTTTGATTAGAAAATGCTACT
GTATACTGATTGACAATAAAGTGAGTTGATGGGGACAAAAAAAAAGATTGCTCTAAGTGC
AAGCCACTGTTTTCTCGTATTCTATTAGGTTGTGTAAAGACTTGCTTTCACAATAGATTG
ATGAAGGAAATGCCAAAAATGATCAATTAAATTGTTACCCTCTGCTCTTCCTCTCTTTAT
GGTCTGCAGGTTAGGTAAACGGTTTAC

QA 7 753 7 753
DS 

RD RR2DH23JQ 747 0 0
CCAAAGTGTTGCTTCAGAGCTACAAAGTTCCAACATTTAAATCGCCGTTGTTGGGAGATC
TGAAAGGCTGTTTTTTTTT*GTGTGGATCGATTCCATCATCATCATCATCATAGTCCGAT
CATCGTTCCTTTTGTAAAAGGTTTATCTCTAATCGTTTCAGGTAGAAATGTTTTTTTCTT
ACATCTTGTTTTGATTCGGTTTTTGTTGTCGTGTTTTAATGTTTTTTTTCTCTCTTTGAG
GTCATTTACTTGTGTTTTTTT*AATAAAAGATCTTGTTTTTGGATGATGATTGAACTTTT
CTTTTATGAACATGTTGATTCTTTTATAAGATTACTTTTTTATGCTGCTTCTGTTTAAGA
TGAGAGCATGATATTTGGTCTTTTTTTTAGTATTATGCTCTTGTTGATTGCGTTTCTTAG
AAGATTAACGATGGTTTTGATACTTTTGAGCCAAAGCTGATGACTTTTATGGTCTGAATT
TGGTTTTACATATGATTTCTATTTTTGTTTGCTTTATCTGTTTGATTAGAAAATGCTACT
GTATACTGATTGACAATAAAGTGAGTTGATGGGGACAAAAAAAAAGATTGCTCTAAGTGC
AAGCCACTGTTTTCTCATATTCTATTAGGTTGTGTAAAGACTTGCTTTCACAATAGATTG
ATGAAGGAAATGCCAAAAATGATCAATTAAATTGTTACCCTCTGCTCTTCCTCTCTTTAT
GGTCTGCAGGTTAGGTAAACGGTTTAC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 4

CO CL2159Contig1 721 4 7 U
TTTTTCAACGAAATAACAAAAACGATGTAACCATATCGAGTACAAAGTCGTCTCTTTGAC
AAAATTTGAAACACACAAATTAACGAGAAAACAAACTATAAAACGAAACAAACAACAAAC
AATAAAAGAGTAAGAAACAAAGAATCAGCCAGATTATTATAGTTATTATTACCTTCTTCT
CATTCAGACAAAAGAAGGCATGTCCTTAACCCATGCATCAAGTGGCTTACCAATGGAGTA
AACGATGAAACCAATCTCTCTCAACTTGTCCACATTCAGAACGTTTCTTCCATCGAAGAT
AAAAGCTGGTTTCTGCATGTTGTCAAAGATCTTCTGGTAGTCCAAAGACTTGAACTCATC
CCACTCAGTCAAAACGCAGACCGCATGCGCGTCTTTAGTAGCTTCATACGCGTCCCATTT
CACGCTCACTTGTTTCACCGTGGTGGGGCTCATCGGCTGCAAGTGTAGTGGATGGTCCCA
GTCGAACTTCTTCATCGAAAGGTCTCTCTGAATCTGCTCTTCAGTAACTTGAGGATCATA
GATGCTGATCTGCGCTTTGTCTCCCAACAAACCTTTGCACACGTCAATGGCCGGTGTCTC
CCTCGTGTCACCCGTGTCTTTCTTGAACGCGAATCCGAGGATCGCCACCTTCTTGTTGGA
GACGGTGTTGAACATAGAGGAGACGATCCTGTTCACGAACCGGTTCTTCTGGTAATCGTT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2E660TF C 16
AF RR2F210JQ U 6
AF RR2GM49TF C 1
AF RR2BZ36JQ U 15
BS 1 7 RR2GM49TF
BS 8 168 RR2F210JQ
BS 169 169 RR2BZ36JQ
BS 170 191 RR2F210JQ
BS 192 192 RR2BZ36JQ
BS 193 471 RR2F210JQ
BS 472 721 RR2BZ36JQ

RD RR2E660TF 137 0 0
A
CAAAAACGATGTAACCATATCGAGTACAAAGTCGTCTCTTTGACAAAATTTGAAACACAC
AAATTAACGAGAAAACAAACTATAAAACGAAACAAACAACAAACAATAAAAGAGTAAGAA
ACAAAGAATCAGCCAG

QA 2 137 2 137
DS 

RD RR2F210JQ 466 0 0
GG
ACGAAATAACAAAAACGATGTAACCATATCGAGTACAAAGTCGTCTCTTTGACAAAATTT
GAAACACACAAATTAACGAGAAAACAAACTATAAAACGAAACAAACAACAAACAATAAAA
GAGTAAGAAACAAAGAATCAGCCAGATTATTATAGTTATTACTACCTTCTTCTCATTCAG
ACAAGAGAAGGCATGTCCTTAACCCATGCATCAAGTGGCTTACCAATGGAGTAAACGATG
AAACCAATCTCTCTCAACTTGTCCACATTCAGAACGTTTCTTCCATCGAAGATAAAAGCT
GGTTTCTGCATGTTGTCAAAGATCTTCTGGTAGTCCAAAGACTTGAACTCATCCCACTCA
GTCAAAACGCAGACCGCATGCGCGTCTTTAGTAGCTTCATACGCGTCCCATTTCACGCTC
ACTTGTTTCACCGTGGTGGGGCTCATCGGCTGCAAGTGTAGTGG

QA 3 466 3 466
DS 

RD RR2GM49TF 590 0 0
TTTTTCAACGAAATAACAAAAACGATGTAACCATATCGAGTACAGAGTCGTCTCTTTGAC
AAAATTTGAAACACACAAATAAACGAGAAAACAAACTATAAAACGAAACAAACA*CAAAC
AATAAAAGAGTAAGAAACAAAGAATCAGCCAGATTATTATCGTTATTATTACCTTCTTCT
CGTTCAGACAAAAGAAGGCATGTCCTTAACCCATGCATCAAGCGGCTTACCAATGGAGTA
AACGATGAAACCAATCTCTCTCAACTTGTCCACATTCAGAACGTTTCTTCCATCGAAGAT
AAAAGCTGGTTTCTGCATGTTGTCAAAGATCTTCTGGTAGTCCAAAGACTTGAACTCATC
CCACTCAGTCAAAACGCAAACCGCATGCGCGTCTTTAGTAGCTTCATACGCGTCCCATTT
AACACTCACTTGTTTCACCGTGGTGGGGCTCATCGGCTGCAAGTGTAGTGGATGGTCCCA
GTCGAACTTCTTCATCGAAAGGTCTCTCTGAATCTGCTCTTCAGTAACTTGAGGATCATA
GATGCTGATCTGCGCTTTGTCTCCCAACAAACCTTTGCACACGTCAATG
C

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2BZ36JQ 707 0 0
GG
CAAAAACGATGTAACCATATCGAGTACAAAGTCGTCTCTTTGACAAAATTTGAAACACAC
AAATTAACGAGAAAACAAACTATAAAACGAAACAAACAACAAACAATAAAAGAGTAAGAA
ACAAAGAATCAGCCAGATTATTATAGTTATTATTACCTTCTTCTCATTCAGACAAAAGAA
GGCATGTCCTTAACCCATGCATCAAGTGGCTTACCAATGGAGTAAACGATGAAACCAATC
TCTCTCAACTTGTCCACATTCAGAACGTTTCTTCCATCGAAGATAAAAGCTGGTTTCTGT
ATGTTGTCAAAGATCTTCTGGTAGTCCAAAGACTTGAACTCATCCCACTCAGTCAAAACG
CAGACCGCATGCGCGTCTTTAGTAGCTTCATACGCGTCCCATTTCACGCTCACTTGTTTC
ACCGTGGTGGGGCTCATCGGCTGCAAGTGTAGTGGATGGTCCCAGTCGAACTTCTTCATC
GAAAGGTCTCTCTGAATCTGCTCTTCAGTAACTTGAGGATCATAGATGCTGATCTGCGCT
TTGTCTCCCAACAAACCTTTGCACACGTCAATGGCCGGTGTCTCCCTCGTGTCACCCGTG
TCTTTCTTGAACGCGAATCCGAGGATCGCCACCTTCTTGTTGGAGACGGTGTTGAACATA
GAGGAGACGATCCTGTTCACGAACCGGTTCTTCTGGTAATCGTTG

QA 3 707 3 707
DS 



AS 1 4

CO CL2160Contig1 1161 4 9 U
GTGACCATTTCATCTTGAAACAAAAGAACTACAGAGACAGAACGAGATTACATTTTATTA
CAAGCGAAGATACTACTAGTCGACTACTACAAAACGTCTATAACGACAATACAATGGCAA
AATGGTAGTAAAAAGAATAATAACCCGATCCAGCAAGTTACACCAAGCTTCTCTTTCGCT
TACACCAGAATCTTAACATGCCATCTGAACATTTCTTCCTTTGTCACTGGTAGGCTCAAC
GTCACAAGCCCAACCTCTGCATCGTAGTTGAACTCAGTCTCCGTGCTATCAACGGAGCAT
CTCAGCGGACGCTGAGAAGAGTAAGCTCCAAAACGACCACAACCTCTAACACTTAGAGAT
ATCACCGCTGTTGGAGAAGGGTTTTCGCTGACCGCTGAAGAGGAATAGACCTCAGGTTTC
TCGTCTGTCACGGTAGTGATATCCATGGACTGGATAGCCCCACTAGAGTTAAACATGTCC
AGGAGTCCAATAGGTGCGAACGAGATGCTTGCAGTGATTTCCTTCAAAGGAGAGATGTGG
AAGAGTTCATATTCAAGGACTTCGAGAGTGAGTGGGATTGAGGCACCCTTTGGTAGCCTA
ACCAGCTCTCCTGATTTGTAAGCGTAGACTATTGAATCTCCACTCCAATCTGGACCAGCC
ACTTCAGAGATGAGATCAGCATCCTCCGCACGGACCAAACCCGTGAGAGTACCAGGAGAA
GTATCATGAATCCTGTTCTTCTTGGTATCCTTGCACCAACCAGCACCTTGACAGTTGAAT
ACACCAACTATACCAGTAAACTTATTCATATTCCAGATCTTGAGCAAGCTGGTTCCATCT
CTAGCTGGATCAGCAAATAGGCAGTCACGTGTTGGCCTACCCGGAAGCTTAGCACGAAGA
ACTGAACCATCAGGAAGAACCAGCTTCCTCAATAGATCAAAGTTGTGGTTGCCTGGCTTG
TCACTGACATAGATTGCACATCCACCTACTGCACGAGCTGCCGCATGGTACTCTGCCGTT
GGGTGTAAACTATGGAACATGTCCCAGTCAGGTTGCATGAACTCTCCAAGGAAAAGAGTA
TTATACGCAACTGATGCTATGTGAATAGTGTGAGAAGCAGGATCTCTAGGATAGTAATCA
TCAGACGCTCTAACAATAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW05JQ U 1
AF RR2FW05TF C 1
AF RR2FM43JQ U 39
AF RR2FK21TF C 388
BS 1 461 RR2FW05JQ
BS 462 464 RR2FM43JQ
BS 465 465 RR2FK21TF
BS 466 665 RR2FM43JQ
BS 666 666 RR2FK21TF
BS 667 799 RR2FM43JQ
BS 800 800 RR2FK21TF
BS 801 851 RR2FM43JQ
BS 852 1161 RR2FK21TF

RD RR2FW05JQ 463 0 0
GTGACCATTTCATCTTGAAACAAAAGAACTACAGAGACAGAACGAGATTACATTTTATTA
CAAGCGAAGATACTACTAGTCGACTACTACAAAACGTCTATAACGACAATACAATGGCAA
AATGGTAGTAAAAAGAATAATAACCCGATCCAGCAAGTTACACCAAGCTTCTCTTTCGCT
TACACCAGAATCTTAACATGCCATCTGAACATTTCTTCCTTTGTCACTGGTAGGCTCAAC
GTCACAAGCCCAACCTCTGCATCGTAGTTGAACTCAGTCTCCGTGCTATCAACGGAGCAT
CTCAGCGGACGCTGAGAAGAGTAAGCTCCAAAACGACCACAACCTCTAACACTTAGAGAT
ATCACCGCTGTTGGAGAAGGGTTTTCGCTGACCGCTGAAGAGGAATAGACCTCAGGTTTC
TCGTCTGTCACGGTAGTGATATCCATGGACTGGATAGCCCC
CC

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR2FW05TF 463 0 0
GTGACCATTTCATCTTGAAACAAAAGAACTACAGAGACAGAACGAGATTACATTTTATTA
CAAGCGAAGATACTACTAGTCGACTACTACAAAACGTCTATAACGACAATACAATGGCAA
AATGGTAGTAAAAAGAATAATAACCCGATCCAGCAAGTTACACCAAGCTTCTCTTTCGCT
TACACCAGAATCTTAACATGCCATCTGAACATTTCTTCCTTTGTCACTGGTAGGCTCAAC
GTCACAAGCCCAACCTCTGCATCGTAGTTGAACTCAGTCTCCGTGCTATCAACGGAGCAT
CTCAGCGGACGCTGAGAAGAGTAAGCTCCAAAACGACCACAACCTCTAACACTTAGAGAT
ATCACCGCTGTTGGAGAAGGGTTTTCGCTGACCGCTGAAGAGGAATAGACCTCAGGTTTC
TCGTCTGTCACGGTAGTGATATCCATGGACTGGATAGCCCC
CC

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR2FM43JQ 813 0 0
C
GAACGAGATTACATTTTATTACAAGCGAAGATACTACTAGTCGACTACTACAAAACGTCT
ATAACGACAATACAATGGCAAAATGGTAGTAAAAAGAATAATAACCCGATCCAGCAAGTT
ACACCAAGCTTCTCTTTCGCTTACACCAGAATCTTAACATGCCATCTGAACATTTCTTCC
TTTGTCACTGGTAGGCTCAACGTCACAAGCCCAACCTCTGCATCGTAGTTGAACTCAGTC
TCCGTGCTATCAACGGAGCATCTCAGCGGACGCTGAGAAGAGTAAGCTCCAAAACGACCA
CAACCTCTAACACTTAGAGATATCACCGCTGTTGGAGAAGGGTTTTCGCTGACCGCTGAA
GAGGAATAGACCTCAGGTTTCTCGTCTGTCACGGTAGTGATATCCATGGACTGGATAGCC
CCACTTGAGTTAAACATGTCCAGGAGTCCAATAGGTGCGAACGAGATGCTTGCAGTGATT
TCCTTCAAAGGAGAGATGTGGAAGAGTTCATATTCAAGGACTTCGAGAGTGAGTGGGATT
GAGGCACCCTTTGGTAGCCTAACCAGCTCTCCTGATTTGTAAGCGTAGACTATTGAATCT
CCACTCCAATCTGGACCAGCCACTTCGGAGATGAGATCAGCATCCTCCGCACGGACCAAA
CCCGTGAGAGTACCAGGAGAAGTATCATGAATCCTGTTCTTCTTGGTATCCTTGCACCAA
CCAGCACCTTGACAGTTGAATACACCAACTATACCAGTAA*CTTATTCATATTCCAGATC
TTGAGCAAGCTGGTTCCATCTCTAGCTGGATC

QA 2 813 2 813
DS 

RD RR2FK21TF 774 0 0
CTGACCACTGAAGAG*AATAGACCTCAGGTTTCTCGTCTGTCACGGTAGTGATATCCATG
GACTGAATAGCCCCACTAGAGTTAAACATGTCCAGGAGTCCAATAGGTGCGAACGAGATG
CTTGCAGTGATTTCCTTCAAAGGAGAGATGTGGAAGAGTTCATATTCAAGGACTTCGAGA
GTGAGTGGGATTGAGGCACCCTTTGGTAGTCTAACCAGCTCTCCTGATTTGTAAGCGTAG
ACTATTGAATCTCCACTCCAATCTTTACCAGCCACTTCAGAGATGAGATCAGCATCCTCC
GCACGGACCAAACCCGTGAGAGTACCAGGAGAAGTATCATGAATCCTGTTCTTCTTGGTA
TCCTTGCACCAACCAGCACCTTGACAGTTGAATACACCAACTATACCAGTAAACTTATTC
ATATTCCAGATCTTGAGCAAGCTGGTTCCATCTCTAGCTGGATCAGCAAATAGGCAGTCA
CGTGTTGGCCTACCCGGAAGCTTAGCACGAAGAACTGAACCATCAGGAAGAACCAGCTTC
CTCAATAGATCAAAGTTGTGGTTGCCTGGCTTGTCACTGACATAGATTGCACATCCACCT
ACTGCACGAGCTGCCGCATGGTACTCTGCCGTTGGGTGTAAACTATGGAACATGTCCCAG
TCAGGTTGCATGAACTCTCCAAGGAAAAGAGTATTATACGCAACTGATGCTATGTGAATA
GTGTGAGAAGCAGGATCTCTAGGATAGTAATCATCAGACGCTCTAACAATAGCC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 4

CO CL2161Contig1 976 4 18 U
GATGACACATAAACTAAAATGACATCTTTGTAAATAAATTACATATTAAAGGTTTATATT
TCAAATTGTTTCTCTATTAATAAAAAAGGGGATTACCAAACAATACAATTTTGTGTCGTC
TAAGTGCAGTAGTTTGTCTTGTATTAAGCCTTAAGGAGACGCTTCTCACACGTTAAAATC
CTGTAACTTGCGTGAGGACCCTCGGATGTGTCGCGCAGAGATGTATGCCATCCCATTGCC
TTTGTGATCTCTTGAATTTCATCCATAACATCAACTGAATCCCTAATGTATGCTCGTCCT
CCTGGTCTCAGTATCCGGTCCATCTCTAACAATATGGTCGACATCTCGCATCTTTTTCTT
TCGATTGAGAAGAGTCCTGAGGCATGTAAGAAGTCATATGTCCTTGGGTATGTATCAAAT
GGTTCACACCAATCGTGCATCACTCCTAGTAGCCCACGATCATAAACGACAGGCAGTGTA
TTAGGCCCGCTGATAGGAACAACATTGAGAACCCAGCAATCGAGTTTATGATCATTTAGT
GCAGCTGCAAATCCGCCAAAGCCTGCTTTCATGTCCATAACGTTTCTTAGTTTCATCTTT
TTTCATTTCATGGCACGAATATAACCCCCAATTATTTCATTCCAGAATGTTGACTCTGCC
TTGAATAGCTCTTTCCTAGCGATGTAGGAATCAAATGTGATCGTCTCTAGCCTATCAGGT
GGAGTGTGGAGACGGGCAGGCCATGAAGTAACATTGCCTCCAAATCCATTCTCAGGTATG
CGACTGATACAAGGTTTCAGGTTTGTGTACCAGACATTATCGGGGTCGTCAGATTCACCG
CAAAGAGGTTGCTTGGTTCCATCCTCACGACTCAAATAACAGGTGTTGTTGAGGGGCTTC
TGCCAGATTGCAATGTATCCTTCCTTCTTTACCAGATTCCAGCAAAGGCTATTCGTAAGA
TTCAGCATCTCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G671JQ U 1
AF RR2FR63JQ U 12
AF RR2G671TF C 185
AF RR2FR63TF C 384
BS 1 83 RR2G671JQ
BS 84 84 RR2FR63JQ
BS 85 122 RR2G671JQ
BS 123 123 RR2FR63JQ
BS 124 175 RR2G671JQ
BS 176 176 RR2FR63JQ
BS 177 458 RR2G671JQ
BS 459 459 RR2FR63JQ
BS 460 473 RR2G671JQ
BS 474 474 RR2FR63JQ
BS 475 500 RR2G671JQ
BS 501 501 RR2FR63JQ
BS 502 586 RR2G671JQ
BS 587 771 RR2FR63JQ
BS 772 837 RR2G671TF
BS 838 838 RR2FR63TF
BS 839 892 RR2G671TF
BS 893 976 RR2FR63TF

RD RR2G671JQ 586 0 0
GATGACACATAAACTAAAATGACATCTTTGTAAATAAATTACATATTAAAGGTTTATATT
TCAAATTGTTTCTCTATTAATAAGAAAGGGGATTACCAAACAATACAATTTTGTGTCGTC
TAGGTGCAGTAGTTTGTCTTGTATTAAGCCTTAAGGAGACGCTTCTCACACGTTAGAATC
CTGTAACTTGCGTGAGGACCCTCGGATGTGTCGCGCAGAGATGTATGCCATCCCATTGCC
TTTGTGATCTCTTGAATTTCATCCATAACATCAACTGAATCCCTAATGTATGCTCGTCCT
CCTGGTCTCAGTATCCGGTCCATCTCTAACAATATGGTCGACATCTCGCATCTTTTTCTT
TCGATTGAGAAGAGTCCTGAGGCATGTAAGAAGTCATATGTCCTTGGGTATGTATCAAAT
GGTTCACACCAATCGTGCATCACTCCTAGTAGCCCACGGTCATAAACGACAGGTAGTGTA
TTAGGCCCGCTGATAGGAACGACATTGAGAACCCAGCAATCGAGTTTATGATCATTTAGT
GCAGCTGCAAATCCGCCAAAGCCTGCTTTCATGTCCATAACGTTTC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2FR63JQ 760 0 0
AACTAAAATGACATCTTTGTAAATAAATTACATATTAAAGGTTTATATTTCAAATTGTTT
CTCTGTTAATAAAAAAGGGGATTACCAAACAATACAATTTTGTGTCGTCTAAGTGCAGTA
GTTTGTCTTGTATTAAGCCTTAAGGAGACGCTTCTCACACGTTAAAATCCTGTAACTTGC
GTGAGGACCCTCGGATGTGTCGCGCAAAAATGTATGCCATCCCATTGCCTTTGTGATCTC
TTGAATTTCATCCATAACATCAACTGAATCCCTAATGTATGCTCGTCCTCCTGGTCTCAG
TATCCGGTCCATCTCTAACAATATGGTCGACATCTCGCATCTTTTTCTTTCGATTGAAAA
AAGTCCTGAGGCATGTAAAAAGTCATATGTCCTTGGGTATGTATCAAATGGTTCACACCA
ATCGTGCATCACTCCTAGTAGCCCACGATCATAAATGACAGGCAGTGTATTAGGCCCGCT
GATAGGAACAACATTGAAAACCCAGCAATCGAGTTTATGATCATTTAGTGCAGCTGCAAA
TCCGCCAAAGCCTGCTTTCATGTCCATAACGTTTCTTAGTTTCATCTTTTTTCATTTCAT
GGCACGAATATAACCCCCAATTATTTCATTCCAGAATGTTGACTCTGCCTTGAATAGCTC
TTTCCTAGCGATGTAGGAATCAAATGTGATCGTCTCTAGCCTATCAGGTGGAGTGTGGAG
ACGGGCAGGCCATGAAGTAACATTGCCTCCAAATCCATTC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2G671TF 708 0 0
AACTTGCGTGAGGACCCTCGGATGTGTCGCGCAGAGATGTATGCCATCCCATTGCCTTTG
TGATCTCTTGAATTTCATCCATAACATCAACTGAATCCCTAATGTATGCTCGTCCTCCTG
GTCTCAGTATCCGGTCCATCTCTAACAATATGGTCGACATCTCGCATCTTTTTCTTTCGA
TTGAGAAGAGTCCTGAGGCATGTAAGAAGTCATATGTCCTTGGGTATGTATCAAATGGTT
CACACCAATCGTGCATCACTCCTAGTAGCCCACGGTCATAAACGACAGGTAGTGTATTAG
GCCCGCTGATAGGAACGACATTGAGAACCCAGCAATCGAGTTTATGATCATTTAGTGCAG
CTGCAAATCCGCCAAAGCCTGCTTTCATGTCCATAACGTTTCTTAGTTTCATCTTTTTCC
ATTTCATGGCACGAATATAACCCCCAATTATTTCATTCCAGAATGTTGACTCTGCCTTGA
ATAGTTCTTTCCTAGCGATGTAGGAATCGAATGTGATCGTCTCTAGCCTATCAGGTGGAG
TGTGGAGACGGGCAGGCCATGAAGTAACATTGCCTCCATATCCATTCTCAGGTATGCGAC
TGATACAAGGTTTCAGGTTTGTGTACCAGACATTATCGGGGTCGTCAGATTCATCGCAAA
GAGGTTGCTTGGTTCCATCCTCACGACTCAAATAACAGGTGTTGTTGA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2FR63TF 593 0 0
ATGTAAGAAGTCATATGTCCTTGGGTATGTATCAAATGGTTCACACCAATCGTGCATCAC
TCCTAGTAGCCCACGATCATAAATGACAGGCAGTGTATTAGGCCCGCTGATAGGAACAAC
ATTGAGAACCCAGCAATCGAGTTTATGATCATTTAGTGCAGCTGCAAATCCGCCAAAGCC
TGCTTTCATGTCCATAACGTTTCTTAGTTTCATCTTTTTTCATTTCATGGCACGAATATA
ACCCCCAATTATTTCATTCCAGAATGTTGACTCTGCCTTGAATAGCTCTTTCCTAGCGAT
GTAGGAATCAAATGTGATCGTCTCTAGCCTATCAGGTGGAGTGTGGAGACGGGCAGGCCA
TGAAGTAACATTGCCTCCAAATCCATTCTCAGGTATGCGACTGATACAAGGTTTCAGGTT
TGTGTACCAGACATTATCGGGGTCGTCAGATTCACCGCAAAGAGGTTGTTTGGTTCCATC
CTCAGGACTCAAATAACAGGTGTTGTTGAGGGGCTTCTGCCAGATTGCAATGTATCCTTC
CTTCTTTACCAGATTCCAGCAAAGGCTATTCGTAAGATTCAGCATCTCTGTCC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 4

CO CL2162Contig1 1455 4 8 U
GGAACATTCTTCGTCACCATTAGAGTTGGATCTGTTTTTCTCCATCGTTTATTCTATTCA
GAATTGCCAAGAAAAAAAATATCCTTTGATTTGGTTCGACAATGAGTTCTGGTGGAGGAG
GAGGAGGATCGTCGTCTGAGCCTTCCGGTGTAAAGAAAACATCCAAGCGACCAAAATATT
CAAGATTTACTCAGCAGGAGCTTCCAGCTTGCAAGCCAATTCTTACACCAAGCTGGGTGA
TCTTGACATTTCTTGCTGCTGGGGTTGTCTTCATTCCCCTGGGAGTCATCTGCCTATTTG
CTTCTCAGGGAGTCGTTGAGATTGTTGATAGATATGACACAGACTGTGTTCCAGAATCTT
CCAGGGCCAACAAGGTCGCGTATATACAGAGTGAAGGAAATAAAATGTGTAACAGAACAA
TAACGGTCACAAAAACTATGAAGCATCCTATCTATGTATACTACCAACTCGAGAATTACT
ACCAAAACCATAGAAGGTATGTGAAAAGCAGAAACGATGCACAACTAAGAAATCCGAAAG
CAGAGAGTGATGTGCAGACTTGTGCACCTGAGGATAGTGTGGCTGGACACCCGATTGTTC
CATGCGGTCTAGTTGCTTGGAGTTTGTTCAATGATACTTATAAATTTTCAAGAAATAGCC
AAGAGCTTCTTGTGAATAAGAAAGACATCTCATGGAAGAGTGACAGAGACAGCAAGTTTG
GGAAAAATGTCTACCCTAAAAACTTTCAGACAGGTGCTCCTATTGGTGGTGGAACTCTTG
ATGCCAAGAAACCGTTGAGTGAGCAAGAAGACCTGATAGTGTGGATGCGAACGGCGGCTT
TGCCAATATTTAGGAAGCTGTATGGGAAGATTGAAACGGACCTGAACACAGGGGATACCA
TAACGGTCTTGTTGGAGAACAACTACAACACTTACAGCTTCAATGGTGAGAAGAAGCTCG
TGCTATCAACAACTAGCTGGCTAGGTGGAAGGAATGATTTCCTCGGGGTTGCTTACCTGA
CTGTGGGAAGCATCTGCTTGTTCCTGGCCGTTACATTCTCTGTATTGTATCTAGTTAAGC
CAAGGCAACTCGGAGATCCCTCGTACCTTTCGTGGAACAGAAGTCCCGGAGGTTGACGAG
TTGGTCAAGGCTTCAAGCTTGTTCTATTCAAGCGTAGTTTTGAGCTGAGCTAGCAAAATA
AATGAAGAGAAAATAGGAAATAAGAAGTATATAATAAGTACCTATATAATATAATTTAAA
AAAAAACCTATATAACATAACTCAATGTTGCTGACAACAACGTTTGATTTTCTTATCCAT
ATAACAATGGTAGGAAGATCATTCCCGATTATTAGTGGTGTTTAGAAAATGAGAAATAAT
GTGAATGAATTAATTAATTTAATATTACATATTATTTCCATCTGGTTGTTGAATCTCGAA
AACTTTATTAATTGA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F427TF U 3
AF RR2B903TF U 1
AF RR2F427JQ C 765
AF RR2B903JQ C 595
BS 1 124 RR2B903TF
BS 125 127 RR2F427TF
BS 128 371 RR2B903TF
BS 372 372 RR2F427TF
BS 373 737 RR2B903TF
BS 738 1257 RR2B903JQ
BS 1258 1258 RR2F427JQ
BS 1259 1455 RR2B903JQ

RD RR2F427TF 566 0 0
GGG
ATTCTTCGTCACCATTATAGTTGGATCTGTTTTTCTCCATCGTTTATTCTATTCAGAATT
GCCAAGAAAAAAAATATCCTTTGATTTGGTTCGACAATGAGTTCTGGTGGAGGAGGAGGA
GGATCGTCGTCTGAGCCTTCCGGTGTAAAGAAAACATCCAAGCGACCAAAATATTCAAGA
TTTACTCAGCAGGAGCTTCCAGCTTGCAAGCCAATTCTTACACCAAGCTGGGTGATCTTG
ACATTTCTTGCTGCTGGGGTTGTCTTCATTCCCCTGGGAGTCATCTGCCTATTTGCTTCT
CAGGGAGTCGTTG*GATTGTTGATAGATATGACACAGACTGTGTTCCAGAATCTTCCAGG
GCCAACAAGGTCGCGTATATACAGAGTGAAGGAAATAAAATGT*TAACAGAACAATAACG
GTCACAAAAACTATGAAGCATCCTATCTATGTATACTACCAACTCGAGAATTACTACCAA
AACCATAGAAGGTATGTGAAAAGCAGAAACGATGCACAACTAAGAAATCCGAAAGCAGAG
AGTGATGTGCAGACTTGTGCACC

QA 4 566 4 566
DS 

RD RR2B903TF 737 0 0
GGAACATTCTTCGTCACCATTAGAGTTGGATCTGTTTTTCTCCATCGTTTATTCTATTCA
GAATTGCCAAGAAAAAAAATATCCTTTGATTTGGTTCGACAATGAGTTCTGGTGGAGGAG
GAGG***ATCGTCGTCTGAGCCTTCCGGTGTAAAGAAAACATCCAAGCGACCAAAATATT
CAAGATTTACTCAGCAGGAGCTTCCAGCTTGCAAGCCAATTCTTACACCAAGCTGGGTGA
TCTTGACATTTCTTGCTGCTGGGGTTGTCTTCATTCCCCTGGGAGTCATCTGCCTATTTG
CTTCTCAGGGAGTCGTTGAGATTGTTGATAGATATGACACAGACTGTGTTCCAGAATCTT
CCAGGGCCAACGAGGTCGCGTATATACAGAGTGAAGGAAATAAAATGTGTAACAGAACAA
TAACGGTCACAAAAACTATGAAGCATCCTATCTATGTATACTACCAACTCGAGAATTACT
ACCAAAACCATAGAAGGTATGTGAAAAGCAGAAACGATGCACAACTAAGAAATCCGAAAG
CAGAGAGTGATGTGCAGACTTGTGCACCTGAGGATAGTGTGGCTGGACACCCGATTGTTC
CATGCGGTCTAGTTGCTTGGAGTTTGTTCAATGATACTTATAAATTTTCAAGAAATAGCC
AAGAGCTTCTTGTGAATAAGAAAGACATCTCATGGAAGAGTGACAGAGACAGCAAGTTTG
GGAAAAATGTCTACCCT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2F427JQ 655 0 0
GGTGGTGGAACTCTTGATGCCAAGAAACCGTTGAGTGAGCAAGAAGACCTGATAGTGTGG
ATGCGAACGGCGGCTTTGCCAGTATTTAGGAAGCTGTATGGGAAGATTGAAACGGACCTG
AACACAGGGGATACCATAACGGTCTTGTTGGAGAACAACTACAACACTTACAGCTTCAAT
GGTGAGAAGAAGCTCGTGCTATCAACAACTAGCTGGCTAGGTGGAAGGAATGATTTCCTC
GGGGTTGCTTACCTGACTGTGGGAAGCATCTGCTTGTTCCTGGCCGTTACATTTTCTGTA
TTGTATCTAGTTAAGCCAAGGCAACTCGGAGATCCCTCGTACCTTTCGTGGAACAGAAGT
CCCGGAGGTTGACGAGTTGGTCAAGGCTTCAAGCTTGTTCTATTCAAGCGTAGTTTTGAG
CTGAGCTAGCAAAATAAATGAAGAGAAAATAGGAAATAAGAAGTATATAATAAGTACCTA
TATAATATAATTTAAAAAAAAACCTATATAACATAACTCAATGTTGCTGACAACAACGTT
TGATTTTTTTATCCATATAACAATGGTAGGAAGATCATTCCCGATTATTAGTGGTGTTTA
GAAAATGAGAAATAATGTGAATGAATTAATTAATTTAATATTACATATTATTTCC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2B903JQ 861 0 0
TTGTTCCATGCGGTCTAGTTGCTTGGAGTTTGTTCAATGATACTTATAAATTTTCAAGAA
ATAGCCAAGAGCTTCTTGTGAATAAGAAAGACATCTCATGGAAGAGTGACAGAGACAGCA
AGTTTGGGAAAAATGTCTACCCTAAAAACTTTCAGACAGGTGCTCCTATTGGTGGTGGAA
CTCTTGATGCCAAGAAACCGTTGAGTGAGCAAGAAGACCTGATAGTGTGGATGCGAACGG
CGGCTTTGCCAATATTTAGGAAGCTGTATGGGAAGATTGAAACGGACCTGAACACAGGGG
ATACCATAACGGTCTTGTTGGAGAACAACTACAACACTTACAGCTTCAATGGTGAGAAGA
AGCTCGTGCTATCAACAACTAGCTGGCTAGGTGGAAGGAATGATTTCCTCGGGGTTGCTT
ACCTGACTGTGGGAAGCATCTGCTTGTTCCTGGCCGTTACATTCTCTGTATTGTATCTAG
TTAAGCCAAGGCAACTCGGAGATCCCTCGTACCTTTCGTGGAACAGAAGTCCCGGAGGTT
GACGAGTTGGTCAAGGCTTCAAGCTTGTTCTATTCAAGCGTAGTTTTGAGCTGAGCTAGC
AAAATAAATGAAGAGAAAATAGGAAATAAGAAGTATATAATAAGTACCTATATAATATAA
TTTTAAAAAAAACCTATATAACATAACTCAATGTTGCTGACAACAACGTTTGATTTTCTT
ATCCATATAACAATGGTAGGAAGATCATTCCCGATTATTAGTGGTGTTTAGAAAATGAGA
AATAATGTGAATGAATTAATTAATTTAATATTACATATTATTTCCATCTGGTTGTTGAAT
CTCGAAAACTTTATTAATTGA

QA 1 861 1 861
DS 



AS 1 3

CO CL2163Contig1 1333 3 9 U
ATGTATAAAATCACACATTTATTGCCCTGTTTACATGCAATCTCTCTCGTTACATTCAAA
GTAGACAAGTTGAAAAAACCCCAACTCTGAGTGTTTTCAAACCTTTAACCACTCAAGACA
AGGACACAAACCCCAGCAGAACCTCGCAGGGTAATAATCTTTCATGTAAATCTCTTTACC
AAAACCTATTATGTAAAAGTTGAAGGCCTTCCCGCGATCCTCCATCGTGACGCGTGTCAC
AGGCACAACAGATATAGCGTGTCTCTCGCAGACCACGTTCGCCGTCGGTGGAACTTCAGC
TCTCAGCGAGATGACTTCTGAGGAGAACTTGTTTAAGAAGTAGGAGTCTGCAAAGTAGGC
AGGCGTGCACTGGTATGCTTGTGTGTTGCAAAGCTGAACACCTTCTGCTCTGTGAAACAC
CTCTTCTGGTACCGAACCAGCTCCTCTCGTTGCACTCACCTTTCGCTTCGAAAGCGTCTT
CCATCTTACAACTGCGATACTGCTTGTCAGAAGAGAGCCGTTACCGTCACAAGTCTGACA
TTTGATTAACCCGCGAGATTGGCAATTCGGACAAGGAAGCTTTCCCTCACCGTTACAGTC
TGCACATATTGAGTCGGATCCATCTTTATGAGCAATCAAACCTCTTCCATAACAAGAAGA
ACACTTCATCATCTGATTCTCCTTGTAAAACCCAGGCTCTCCATCAGCATTACACGTCGG
ACATACTACTTCACCTCTTCCTACGCAACCTGTGCACTTGTCAACAGTCTCAGAATGAGG
AACCGGGACTCGAGTTTCTTTGTAAGGGACAAAGAGAGTAGGGAACTGTGACCTCAGGTC
CAGTTGCCATAACTCAGGTGCAGATCCATGTTTCTTCCCGTTGAAGTTCCCACCACCAGT
GAAAGGCACTGTCTGTGTTAAAGCTTCCCTCTCTTCGATGAAAGTGTCGAGAGTTCCGAC
GTAGACATTGCAGTCTTCGACGGCACGGATCTTCCACGTGCGAGCGGGACGGCTTCCCCA
ACAGCAACGGTGGCCGATGTGATCAATGAGCAGCTCTCTTATCTCAATCTCATCAAGGAT
AGCCAATAGCTTCCGGAGTGGGTAACGAAACAGGGGTGGTTAACACGGGAGGATAGAGAG
GAGGAGGATCGGAAACGGCGGAAGCGGAACGGACTTCCTCGAGGGTGACGCCAGCTCCGG
GGAAAGAAAAGTTGTTACGAGCAGAGGAGCTGTTTCTCTGGAGGTACTGGTATGAATCCC
ATCTCTCGGATTCCTTCGTTTTATCTGAAAGCAGAGGCTTCTCCATTGATCACGAATCTC
TCTCTCTCTATCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ78JQ U 1
AF RR2AP14JQ U 3
AF RR2GZ78TF C 680
BS 1 25 RR2GZ78JQ
BS 26 26 RR2AP14JQ
BS 27 313 RR2GZ78JQ
BS 314 314 RR2AP14JQ
BS 315 537 RR2GZ78JQ
BS 538 538 RR2AP14JQ
BS 539 771 RR2GZ78JQ
BS 772 808 RR2AP14JQ
BS 809 1333 RR2GZ78TF

RD RR2GZ78JQ 771 0 0
ATGTATAAAATCACACATTTATTGCTCTGTTTACATGCAATCTCTCTCGTTACATTCAAA
GTAGACAAGTTGAAAAAACCCCAACTCTGAGTGTTTTCAAACCTTTAACCACTCAAGACA
AGGACACAAACCCCAGCAGAACCTCGCAGGGTAATAATCTTTCATGTAAATCTCTTTACC
AAAACCTATTATGTAAAAGTTGAAGGCCTTCCCGCGATCCTCCATCGTGACGCGTGTCAC
AGGCACAACAGATATAGCGTGTCTCTCGCAGACCACGTTCGCCGTCGGTGGAACTTCAGC
TCTCAGCGAGATGGCTTCTGAGGAGAACTTGTTTAAGAAGTAGGAGTCTGCAAAGTAGGC
AGGCGTGCACTGGTATGCTTGTGTGTTGCAAAGCTGAACACCTTCTGCTCTGTGAAACAC
CTCTTCTGGTACCGAACCAGCTCCTCTCGTTGCACTCACCTTTCGCTTCGAAAGCGTCTT
CCATCTTACAACTGCGATACTGCTTGTCAGAAGAGAGCCGTTACCGTCACAAGTCTGGCA
TTTGATTAACCCGCGAGATTGGCAATTCGGACAAGGAAGCTTTCCCTCACCGTTACAGTC
TGCACATATTGAGTCGGATCCATCTTTATGAGCAATCAAACCTCTTCCATAACAAGAAGA
ACACTTCATCATCTGATTCTCCTTGTAAAACCCAGGCTCTCCATCAGCATTACACGTCGG
ACATACTACTTCACCTCTTCCTACGCAACCTGTGCACTTGTCAACAGTCTC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2AP14JQ 806 0 0
GTATAAAATCACACATTTATTGCCCTGTTTACATGCAATCTCTCTCGTTACATTCAAAGT
AGACAAGTTGAAAAAACCCCAACTCTGAGTGTTTTCAAACCTTTAACCACTCAAGACAAG
GACACAAACCCCAGCAGAACCTCGCAGGGTAATAATCTTTCATGTAAATCTCTTTACCAA
AACCTATTATGTAAAAGTTGAAGGCCTTCCCGCGATCCTCCATCGTGACGCGTGTCACAG
GCACAACAGATATAGCGTGTCTCTCGCAGACCACGTTCGCCGTCGGTGGAACTTCAGCTC
TCAGCGAGATGACTTCTGAGGAGAACTTGTTTAAGAAGTAGGAGTCTGCAAAGTAGGCAG
GCGTGCACTGGTATGCTTGTGTGTTGCAAAGCTGAACACCTTCTGCTCTGTGAAACACCT
CTTCTGGTACCGAACCAGCTCCTCTCGTTGCACTCACCTTTCGCTTCGAAAGCGTCTTCC
ATCTTACAACTGCGATACTGCTTGTCAGAAGAGAGCCGTTACCGTCACAAGTCTGACATT
TGATTAACCCGCGAGATTGGCAATTCGGACAAGGAAGCTTTCCCTCACCGTTACAGTCTG
CACATATTGAGTCGGATCCATCTTTATGAGCAATCAAACCTCTTCCATAACAAGAAGAAC
ACTTCATCATCTGATTCTCCTTGTAAAACCCAGGCTCTCCATCAGCATTACACGTCGGAC
ATACTACTTCACCTCTTCCTACGCAACCTGTGCACTTGTCAACAGTCTCAGAATGAGGAA
CCGGGACTCGAGTTTCTTTGTAAGGG

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2GZ78TF 654 0 0
CT
CTTGTAAAACCCAGGCTCTCCATCAGCATTACACGTCGGACATACTACTTCACCTCTTCC
TACGCAACCTGTGCACTTGTCAACAGTCTCAGAATGAGGAACCGGGACTCGAGTTTCTTT
GTAAGGGACAAAGAGAGTAGGGAACTGTGACCTCAGGTCCAGTTGCCATAACTCAGGTGC
AGATCCATGTTTCTTCCCGTTGAAGTTCCCACCACCAGTGAAAGGCACTGTCTGTGTTAA
AGCTTCCCTCTCTTCGATGAAAGTGTCGAGAGTTCCGACGTAGACATTGCAGTCTTCGAC
GGCACGGATCTTCCACGTGCGAGCGGGACGGCTTCCCCAACAGCAACGGTGGCCGATGTG
ATCAATGAGCAGCTCTCTTATCTCAATCTCATCAAGGATAGCCAATAGCTTCCGGAGTGG
GTAACGAAACAGGGGTGGTTAACACGGGAGGATAGAGAGGAGGAGGATCGGAAACGGCGG
AAGCGGAACGGACTTCCTCGAGGGTGACGCCAGCTCCGGGGAAAGAAAAGTTGTTACGAG
CAGAGGAGCTGTTTCTCTGGAGGTACTGGTATGAATCCCATCTCTCGGATTCCTTCGTTT
TATCTGAAAGCAGAGGCTTCTCCATTGATCACGAATCTCTCTCTCTCTATCC

QA 3 654 3 654
DS 



AS 2 4

CO CL2164Contig1 780 2 3 U
GGGTAATAATAATAGAGAAACAGAACAAAGCCTAAAGAAACGATATGATGTCATTTTTCT
CCCTAACGTCTCTTCTGCTTCTTCTTCTCTCTCGTTCGTCGGTGGTTATCTCGGATGGTG
AGTCTTTCCAGAAACTTCCGGTGCCGGAAAATAGGTCAGGCCCTGAAGCTTCCGCCTTCG
ACTCCACCGGAAAAGGATTCTACACCGGAGTCTCTGGTGGTAAAATACTCAAGTATACTC
CTCAGACGGGGTATGTCGATTTTGCACAGATCACAGAATCATCGAACTCTTCATGGTGCG
ATGGAGTAGTTGGGACGGCTTTAGCCGGAAGATGCGGTCGACCGGCGGGGCTAGCCTTCA
AAAGAACAGGTGATCTCTACGTAGCTGATGCACCGTTGGGTCTTCACGTTGTTTCTCCCG
CCGGTGGCTTGGCCGTAAAGATCGCCTACAGTGTTGATGGAAAGCCCTTTAAATTTCTCG
ATGGTCTTGACGTTGATCCAACTACGGGTGTCGTCTACTTCACTTCCTTCAGCTCACGCT
TCACCCCAATCCAAGTGTTGATTGCATTGGGATTAAAGGACGCGACTGGAAAACTCTTCA
AATACGATCCATCAACAAAGGTCGTTACCGTACTGATGGAAAGTTTAAGCGGCTCAGCTG
GTTGTGCCGTGAGCTCGGATGGTTCGTTCGTGCTCGTCAGTCAGTTCACAAGAGCAACAT
AAAGAGTATTGGATCAAGGATCTAAAGCTGGTCTCTGAAGACTCACAAACTCAGTTTCGA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ24TF U 2
AF RR2FL91TF U 1
BS 1 171 RR2FL91TF
BS 172 172 RR2GZ24TF
BS 173 780 RR2FL91TF

RD RR2GZ24TF 196 0 0
GGTAATAATAATAGAGAAACGGAACAAAGCCTAAAGAAACGATATGATGTCATTTTTCTC
CCTAACGTCTCTTCTGCTTCTTCTTCTCTCTCGTTCGTCGGTGGTTATCTCGGATGGTGA
GTCTTTCCAGAAACTTCCGGTGCCGGAAAATATGTCAGGCCCTGAAGCTTCCGCCTTCGA
CTCCACCGGAAAAGGA

QA 1 196 1 196
DS 

RD RR2FL91TF 780 0 0
GGGTAATAATAATAGAGAAACAGAACAAAGCCTAAAGAAACGATATGATGTCATTTTTCT
CCCTAACGTCTCTTCTGCTTCTTCTTCTCTCTCGTTCGTCGGTGGTTATCTCGGATGGTG
AGTCTTTCCAGAAACTTCCGGTGCCGGAAAATAGGTCAGGCCCTGAAGCTTTCGCCTTCG
ACTCCACCGGAAAAGGATTCTACACCGGAGTCTCTGGTGGTAAAATACTCAAGTATACTC
CTCAGACGGGGTATGTCGATTTTGCACAGATCACAGAATCATCGAACTCTTCATGGTGCG
ATGGAGTAGTTGGGACGGCTTTAGCCGGAAGATGCGGTCGACCGGCGGGGCTAGCCTTCA
AAAGAACAGGTGATCTCTACGTAGCTGATGCACCGTTGGGTCTTCACGTTGTTTCTCCCG
CCGGTGGCTTGGCCGTAAAGATCGCCTACAGTGTTGATGGAAAGCCCTTTAAATTTCTCG
ATGGTCTTGACGTTGATCCAACTACGGGTGTCGTCTACTTCACTTCCTTCAGCTCACGCT
TCACCCCAATCCAAGTGTTGATTGCATTGGGATTAAAGGACGCGACTGGAAAACTCTTCA
AATACGATCCATCAACAAAGGTCGTTACCGTACTGATGGAAAGTTTAAGCGGCTCAGCTG
GTTGTGCCGTGAGCTCGGATGGTTCGTTCGTGCTCGTCAGTCAGTTCACAAGAGCAACAT
AAAGAGTATTGGATCAAGGATCTAAAGCTGGTCTCTGAAGACTCACAAACTCAGTTTCGA

QA 1 780 1 780
DS 



CO CL2164Contig2 616 2 4 U
TCAATAAAATTAAAAAAATATATAAACTTCACATATATGGTAAACACCTGCGGCCTTCGA
ATCAAAGATCCAACCATACTATTAAACAAATTTAAAGCTTAAGAATTCCAGCAAAAGGGC
CAGTGAGAGTCCCAATATATAAAATACCATCGAACTCGTTAACTTCGCTAAGCAAAGTAT
CCCCAAATTTATCTTTTAGAGGAATTGTCTGAAGCACTTCACCATTAGAATTGACTTTGA
CCGCTGATGGGCTAGTAGGCACGACGATCTTGTTCACAACCGAAGCGACCCAAAAGTTTC
CAGTAAAACCAATCCTCTTGATATTGTCAGGGTTCGAAACTGAGTTTGTGAAGTCTTCAG
AAGAACCAGCTTTAGATCCCTTGATCCAATACCTCTTTATGTTGCTCTTTGTGAACTGAC
TGACGAGCACGAACGAACCATCCGAGCTCACGGCACAACCAGCTGAGCCGCTTAAACCTT
CCATCAGTACGGTAACGACCTTTGTTGATGGATCGTATTTGAAGAGTTTTCCAGTCGCGT
CCTTTAATCCCAATGCAATCAACACTTGGATTGGGGTGAAGCGTGAGCTGAAGGAAGTGA
AGTAGACGACACCCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ24JQ U 1
AF RR2FL91JQ U 45
BS 1 305 RR2GZ24JQ
BS 306 306 RR2FL91JQ
BS 307 588 RR2GZ24JQ
BS 589 616 RR2FL91JQ

RD RR2GZ24JQ 588 0 0
TCAATAAAATTAAAAAAATATATAAACTTCACATATATGGTAAACACCTGCGGCCTTCGA
ATCAAAGATCCAACCATACTATTAAACAAATTTAAAGCTTAAGAATTCCAGCAAAAGGGC
CAGTGAGAGTCCCAATATATAAAATACCATCGAACTCGTTAACTTCGCTAAGCAAAGTAT
CCCCAAATTTATCTTTTAGAGGAATTGTCTGAAGCACTTCACCATTAGAATTGACTTTGA
CCGCTGATGGGCTAGTAGGCACGACGATCTTGTTCACAACCGAAGCGACCCAAAAGTTTC
CAGTAGAACCAATCCTCTTGATATTGTCAGGGTTCGAAACTGAGTTTGTGAAGTCTTCAG
AAGAACCAGCTTTAGATCCCTTGATCCAATACCTCTTTATGTTGCTCTTTGTGAACTGAC
TGACGAGCACGAACGAACCATCCGAGCTCACGGCACAACCAGCTGAGCCGCTTAAACCTT
CCATCAGTACGGTAACGACCTTTGTTGATGGATCGTATTTGAAGAGTTTTCCAGTCGCGT
CCTTTAATCCCAATGCAATCAACACTTGGATTGGGGTGAAGCGTGAGC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2FL91JQ 572 0 0
CACCTGCGGCCTTCGAATCAAAGATCCAACCATACTATTAAACAAATTTAAAGCTTAAGA
ATTCCAGCAAAAGGGCCAGTGAGAGTCCCAATATATAAACTACCATCGAACTCGTTAACT
TCGCTAAGCAAAGTATCCCCAAATTTATCTTTTAGAGGAATTGTCTGAAGCACTTCACCA
TTAGAATTGACTTTGACCGCTGATGGGTTAGTAGGCACGACGATCTTGTTCACAACCGAA
GCGACCCAAAAGTTTCCAGTAAAACCAATCCTCTTGATATTGTCAGGGTTCGAAACTGAG
TTTGTGAAGTCTTCAGAAGAACCAGCTTTAGATCCCTTGATCCAATACCTCTTTATGTTG
CTCTTTGTGAACTGACTGACGAGCACGAACGAACCATCCGAGCTCACGGCACAACCAGCT
GAGCCGCTTAAACCTTCCATCAGTACGGTAACGACCTTTGTTGATGGATCGTATTTGAAG
AGTTTTCCAGTCGCGTCCTTTAATCCCAATGCAATCAACACTTGGATTGGGGTGAAGCGT
GAGCTGAAGGAAGTGAAGTAGACGACACCCGT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL2165Contig1 821 2 11 U
AACACAAGCAACTTTTAGTCTTAAAAATTGATGTATAATGAAGAACATGGTTTATGGTTA
CATGAACTTGATGCATAAGACAAATTGGATACATATACATCACATAGACGATCAAAACAC
ACGCCAGTGTCCGAACCGTTACACAGAAACAGTGGCACGGAGTGGCTAAAGGGCTTTCCT
GATCTTGTCAACTGCGACTCGCAGAACATCGAGAGATGTGGCGTAAGATATCCGAATACA
ACTATCGTCTCCAAAAGCATCACCAGGAACCATTGCAACCTGAAACTTGTCAAGAAAGTA
TAAAGCAAGAGAGGACGAGTCATTGATCAAACCAAAACCTCCAGCTTCTGATCCATAGTA
TGCACTGAAGTCAATAAAGAGATAAAAAGCTCCCTGAGGTTCAGAGATCTTAACACCTTC
CATTTCACGAAAGCTTTTAACCAAGAAATCTCGTCTCTCTCTGTATGCTTTGACCATCTC
AGCTACAGTCTCTCCTCCAGCTTTTCCTAACCCAAGTGCAGCAACACCTGCCTTCTGAGA
AATGCTACTAGCACCTGAACTAACCTGGCCTTGTAATTTACTGCATGCTGCCACTATATG
CTTAGGGCCAGCAAGATATCCAAGCCTCCATCCCGTCATAGCGAAAGCCTTTGAGAAACC
ATTTACTGTCAAAGTTCGATCATACATGTCTGGCAAAGAAGCAAAGCTTGTGTGTATTGC
AGGCGCATATATTATATGTTCATATATTTCATCCGATAGCACCATAAGCCTTGGATGTTT
AGCAATGATGCGTGCAATCTCTTCAAGCAAACTCTTGGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H408JQB U 17
AF RR2CD15JQ U 1
BS 1 98 RR2CD15JQ
BS 99 99 RR2H408JQB
BS 100 429 RR2CD15JQ
BS 430 430 RR2H408JQB
BS 431 556 RR2CD15JQ
BS 557 557 RR2H408JQB
BS 558 660 RR2CD15JQ
BS 661 661 RR2H408JQB
BS 662 677 RR2CD15JQ
BS 678 678 RR2H408JQB
BS 679 821 RR2CD15JQ

RD RR2H408JQB 672 0 0
AGTCTTAAAAATTGATGTATAATGAAGAACATGGTTTATGGTTACATGAACTTGATGCAT
AAGACAAATTGGATACGTATACATCACATAGACGATCAAAACGCACGCCAGTGTCCGAAC
CGTTACACAGAAACAGTGGCACGGAGTGGCTCAAGGGCTTTCCTGATCTTGTCAACTGCG
GCTCGCAGAACATCGAGAGATGTGGCGTAAGATATCCGAATACAACTATCGTCTCCAAAA
GCATCACCAGGAACCATTGCAACCTGAAACTTGTCAAGAAAGTATAAAGCAAGAGAGGAC
GAGTCATTGATCAAACCAAAACCTTCAGCTTCTGATCCATAGTATGCACTGAAGTCAATA
AAGAGATAAAAAGCTCCCTGAGGTTCAGAGATCTTAACACCTTCCATTTCACGAAAGCTT
TTAACCAAGAAATCTCGTCTCTCTCTGTATGCTTTGACCATCTCAGCTACAGTCTCTCCT
CCAGCTTTTCCTAACCCAAGTGCAGCAACACCTGCCTTCTGAGAAATGCTACTAGCACCT
GAACTAACCTGGCCTTGTAATTTACTGCATGCTGCCACTATATGCTTAGGGCCAGCAAGA
TATCCAAGCCTCCATCCCGTCATAGCGAAAGCCTTTGAGAAACCATTTACTGTCAAAGTT
CGATCATACATG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2CD15JQ 821 0 0
AACACAAGCAACTTTTAGTCTTAAAAATTGATGTATAATGAAGAACATGGTTTATGGTTA
CATGAACTTGATGCATAAGACAAATTGGATACATATACGTCACATAGACGATCAAAACAC
ACGCCAGTGTCCGAACCGTTACACAGAAACAGTGGCACGGAGTGGCTAAAGGGCTTTCCT
GATCTTGTCAACTGCGACTCGCAGAACATCGAGAGATGTGGCGTAAGATATCCGAATACA
ACTATCGTCTCCAAAAGCATCACCAGGAACCATTGCAACCTGAAACTTGTCAAGAAAGTA
TAAAGCAAGAGAGGACGAGTCATTGATCAAACCAAAACCTCCAGCTTCTGATCCATAGTA
TGCACTGAAGTCAATAAAGAGATAAAAAGCTCCCTGAGGTTCAGAGATCTTAACACCTTC
CATTTCACGGAAGCTTTTAACCAAGAAATCTCGTCTCTCTCTGTATGCTTTGACCATCTC
AGCTACAGTCTCTCCTCCAGCTTTTCCTAACCCAAGTGCAGCAACACCTGCCTTCTGAGA
AATGCTACTAGCACCT*AACTAACCTGGCCTTGTAATTTACTGCATGCTGCCACTATATG
CTTAGGGCCAGCAAGATATCCAAGCCTCCATCCCGTCATAGCGAAAGCCTTTGAGAAACC
GTTTACTGTCAAAGTTCTATCATACATGTCTGGCAAAGAAGCAAAGCTTGTGTGTATTGC
AGGCGCATATATTATATGTTCATATATTTCATCCGATAGCACCATAAGCCTTGGATGTTT
AGCAATGATGCGTGCAATCTCTTCAAGCAAACTCTTGGGGT

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 3

CO CL2166Contig1 694 3 32 U
GGAAGTCCACTCTCTCTCTCCCGAACAACAAAAGGAGCAGCAGATAGCGAGAAATCAAAA
AGGCTAATAATGGATGCTAAGATCGGAAAATTCTTTGACTCCGTCGGTTCTTTCTTCAGC
GGCGGCGATAAGATCCCTTGGTCCGAGGGAGATGTCATCGCTGGATGTGAAAGAGAGGTT
CGAGAGGCCACAAACTCCGGATCTGAAGAACTGAAGAAAGAGTGTCTTATGCGACTCTCG
TGGGCTCTTGTTCATTCCCATCAACAGGATGATGTTCAACGTGGAATAGACATGCTTGAA
GCATCTCTTGCGAACAGTGCTCCTCCTTTGGATGACAGAGAGAAACTCTATCTTCTTGCT
GTTGGATACTACAGGAGTGGGGATTGCTCCAAGAGCAGGCAGCTTGTCGACCGCTGCATC
CAGATGCAACCCGATTGGAGGCAAGCTTTGGTACTAAAGAAGTGCATCGAAGACAAAATC
ACCAAGGATGGAGTTATTGGGATAGGCATCACTGCTTCAGCAGTAGGAGCCGTAGGTCTC
ATAGCCGGTGGTATTGTAGCGGCGCTGGCTCGCAAGAAATGAACACGATGATCCTTAACT
TGTTAGGCTTGTTTGTGCATACAATAGCAGCAAGATGCTCTCTTTTAGTTTCTCTTTCTT
GAGAAACTTTGTTTCCCTCTGCCTGCTTCTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW15TF U 1
AF RR2G549TF U 3
AF RR2GF75TF U 3
BS 1 20 RR2CW15TF
BS 21 21 RR2G549TF
BS 22 68 RR2CW15TF
BS 69 71 RR2G549TF
BS 72 89 RR2CW15TF
BS 90 90 RR2G549TF
BS 91 98 RR2CW15TF
BS 99 99 RR2G549TF
BS 100 197 RR2CW15TF
BS 198 198 RR2G549TF
BS 199 231 RR2CW15TF
BS 232 232 RR2G549TF
BS 233 234 RR2CW15TF
BS 235 235 RR2G549TF
BS 236 236 RR2CW15TF
BS 237 237 RR2G549TF
BS 238 284 RR2CW15TF
BS 285 285 RR2G549TF
BS 286 332 RR2CW15TF
BS 333 333 RR2G549TF
BS 334 344 RR2CW15TF
BS 345 345 RR2G549TF
BS 346 365 RR2CW15TF
BS 366 366 RR2G549TF
BS 367 380 RR2CW15TF
BS 381 381 RR2G549TF
BS 382 404 RR2CW15TF
BS 405 405 RR2G549TF
BS 406 420 RR2CW15TF
BS 421 421 RR2G549TF
BS 422 530 RR2CW15TF
BS 531 694 RR2GF75TF

RD RR2CW15TF 530 0 0
GGAAGTCCACTCTCTCTCTCTCGAACAACAAAAGGAGCAGCAGATAGCGAGAAATCAAAA
AGGCTAAT***GGATGCTAAGATCGGAAAGTTCTTTGATTCCGTCGGTTCTTTCTTCAGC
GGCGGCGATAAGATCCCTTGGTCCGAGGGAGATGTCATCGCTGGATGTGAAAGAGAGGTT
CGAGAGGCCACAAACTCTGGATCTGAAGAACTGAAGAAAGAGTGTCTTATGAGATTGTCG
TGGGCTCTTGTTCATTCCCATCAACAGGATGATGTTCAACGTGGGATAGACATGCTTGAA
GCATCTCTTGCGAACAGTGCTCCTCCTTTGGAAGACAGAGAGAAGCTCTATCTTCTTGCT
GTTGGTTACTACAGGAGTGGAGATTGCTCCAAGAGCAGGCAGCTCGTCGACCGCTGCATC
GAGATGCAACCCGATTGGAGGCAAGCTTTGGTACTAAAGAAGTGCATCGAAGACAAAATC
ACCAAGGATGGAGTTATTGGGATAGGCATCACTGCTTCAGCAGTAGGAGC

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2G549TF 529 0 0
GGAAGTCCA
CTCTCTCTCCCGAACAACAAAAGGAGCAGCAGATAGCGAGAAATCAAAAAGGCTAATAAT
GGATGCTAAGATCGGAAAATTCTTTGACTCCGTCGGTTCTTTCTTCAGCGGCGGCGATAA
GATCCCTTGGTCCGAGGGAGATGTCATCGCTGGATGTGAAAGAGAGGTTCGAGAGGCCAC
AAACTCCGGATCTGAAGAACTGAAGAAAGAGTGTCTTATGCGACTCTCGTGGGCTCTTGT
TCATTCCCATCAACAGGATGATGTTCAACGTGGAATAGACATGCTTGAAGCATCTCTTGC
GAACAGTGCTCCTCCTTTGGATGACAGAGAGAAACTCTATCTTCTTGCTGTTGGATACTA
CAGGAGTGGGGATTGCTCCAAGAGCAGGCAGCTTGTCGACCGCTGCATCCAGATGCAACC
CGATTGGAGGCAAGCTTTGGTACTAAAGAAGTGCATCGAAGACAAAATCACCAAGGATGG
AGTTATTGGGATAGGCATCACTGCTTCAGCAGTAGGAGC
C

QA 10 528 10 528
DS 

RD RR2GF75TF 692 0 0
GGAAGTCCA
CTCTCTCTCCCGAACAACAAAAGGAGCAGCAGATAGCGAGAAATCAAAAAGGCTAATAAT
GGATGCTAAGATCGGAAAATTCTTTGACTCCGTCGGTTCTTTCTTCAGCGGCGGCGATAA
GATCCCTTGGTCCGAGGGAGATGTCATCGCTGGATGTGAAAGAGAGGTTCGAGAGGCCAC
AAACTCCGGATCTGAAGAACTGAAGAAAGAGTGTCTTATGCGACTCTCGTGGGCTCTTGT
TCATTCCCATCAACAGGATGATGTTCAACGTGGAATAGACATGCTTGAAGCATCTCTTGC
GAACAGTGCTCCTCCTTTGGATGACAGAGAGAAACTCTATCTTCTTGCTGTTGGATACTA
CAGGAGTGGGGATTGCTCCAAGAGCAGGCAGCTTGTCGACCGCTGCATCCAGATGCAACC
CGATTGGAGGCAAGCTTTGGTACTAAAGAAGTGCATCGAAGACAAAATCACCAAGGATGG
AGTTATTGGGATAGGCATCACTGCTTCAGCAGTAGGAGCCGTAGGTCTCATAGCCGGTGG
TATTGTAGCGGCGCTGGCTCGCAAGAAATGAACACGATGATCCTTAACTTGTTAGGCTTG
TTTGTGCATACAATAGCAGCAAGATGCTCTCTTTTAGTTTCTCTTTCTTGAGAAACTTTG
TTTCCCTCTGCCTGCTTCTTGAC

QA 10 692 10 692
DS 



AS 1 4

CO CL2167Contig1 751 4 13 U
GGATTCATCTCTCATTCAGGTGGATAATAATATCGAAGAGACCTGAAACGTCTTCAATGG
ATACTCTCTCTGCATCCGTTTCATCCTTCAACCTCCCTCCACTATCTCGTAGATCCATCT
CTGGTCGCTTTAAACCCACCGTTAACGCAAACGCTCCCAATCTTTCAAAACCACCAACGT
CGTCTTCTCCATCTTCCTTCTCCCACCACAAAAACCTTACCTTCCCCAGAGGAATATCTT
TAACTCTTCCGAACGCAAAACCCTCAAGAGCTCCACCATCTCCTCCGTCTCCTCCTCCTG
TGCACGAGAAAGCGGCGTCAGGATTTGCTGCGGCGCTCGTTAGTGTTTGTCAATCGAAGA
ACTGTCTTGGTCGGACTCAAGAAGATGTCAGAAGGCTGATGGCGTTTCTTGAGGGAGAAG
ACAAAAAGAGGAACAACAACAAGGTCTTAGTCAATGAAGTTGCTGAGAGAGGTAAATTTG
GTAAACATTTGAAGGGCTTGGTCAAGATGTTGGTTACAAGAGGCAAATCTGGGATTCTCT
TTGATGTCTTAATGGAGTTTGAGAGAATCTGTAATGAATTGGTCCTTGTCCGTACAACAA
AGCTTGTCTGAAACAACTAAAGATTGTAATAAGATTACATCATCAAATACACAGTTGTGT
CATTTGTCTTTTTTCTAATCAGATGTTTACATTATAGACAAAGCCTCTGTTATGTACATA
AGACGGACCAACGTTTAGTTAAGATTCATTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C974TF U 25
AF RR2H851TF U 1
AF RR2C974JQ C 189
AF RR2A331TF U 1
BS 1 162 RR2A331TF
BS 163 163 RR2H851TF
BS 164 210 RR2A331TF
BS 211 211 RR2H851TF
BS 212 220 RR2A331TF
BS 221 221 RR2H851TF
BS 222 235 RR2A331TF
BS 236 236 RR2H851TF
BS 237 369 RR2A331TF
BS 370 370 RR2H851TF
BS 371 448 RR2A331TF
BS 449 449 RR2H851TF
BS 450 751 RR2A331TF

RD RR2C974TF 366 0 0
TAATAATATCGAAGAGACCTGAAACGTCTTCAATGGATACTCTCTCTGCATCCGTTTCAT
CCTTCAACCTCCCTCCACTATCTCGTAGATCCATCTCTGGTCGCTTTAAACCCACCGTTA
ACGCAAACGCTCCCAATCTTTCAAAACCACCAACGTCGTCTTCTCCATCTTCCTTCTCCC
ACCACAAAAACCTTACCTTCCCCAGAGGAATATCTTTAACTCTTCCGAACGCAAAACCCT
CAAGAGCTCCACCATCTCCTCCGTCTCCTCCTCCTGTGCACGAGAAAGCGGCGTCAGGAT
TTGCTGCGGCGCTCGTTAGTGTTTGTCAATCGAAGAACTGTCTTGGTCGGACTCAAGAAG
ATGTCA

QA 1 366 1 366
DS 

RD RR2H851TF 470 0 0
GGATTCATCTCTCATTTAGGTGGATAATAATATCAAAGAGACCTGAAACGTCTTCAATGG
ATACTCTCTCTGCATCCGTTTCATCCTTCAACCTCCCTCCACTATCTCGTAGATCCATCT
CTGGTCGCTTTAAACCCACCGTTAACGCAAACGCTCCCAATCTTTCAAAACCACCAACGT
CGTCTTCTCCATCTTCCTTCTCCCACCACAAAAACCTTACCTTCCCCAGAGGAATATCTT
TAACTCTTCCGAACGCAAAACCCTCAAGAGCTCCACCATCTCCTCCGTCTCCTCCTCCTG
TGCACGAGAAAGCGGCGTCAGGATTTGCTGCGGCGTTCGTTAGTGTTTGTCAATCGAAGA
ACTGTCTTGGTCGGACTCAAGAAGATGTCAGAAGGCTGATGGCGTTTCTTGAGGGAGAAG
ACAAAAAGAGGAACAACAACAAGGTCTTAGTCAATTAAGTTGCTGAGAGA

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR2C974JQ 473 0 0
CCATTTTCCTTCTCCCACCACAAAAACCTTACCTTCCCCAGAGGAATATCTTTAATTTTT
CCGAACGCAAAACCCTCAAGAGCTCCACCATTTCCTCCGTTTCCTCCTCCTGTGCACGAG
AAAGCGGCGTCAGGATTTGCTGCGGCGCTCGTTAGTGTTTGTCAATCGAAGAACTGTCTT
GGTCGGACTCAAGAAGATGTCAGAAGGCTGATGGCGTTTCTTGAGGGAGAAGACAAAAAG
AGGAACAACAACAAGGTTTTAGTCAATGAAGTTGCTGAGAGAGGTAAATTTGGTAAACAT
TTGAAGGGCTTGGTCAAGATGTTGGTTACAAGAGGCAAATCTGGGATTCTCTTTGATGTC
TTAATGGAGTTTGAGAGAATCTGTAATGAATTGGTCCTTGTCCGTACAACAAAGCTTGTC
TGAAACAACTAAAGATTGTAATAAGATTACATCATCAAATACACAGTTGTGTC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2A331TF 751 0 0
GGATTCATCTCTCATTCAGGTGGATAATAATATCGAAGAGACCTGAAACGTCTTCAATGG
ATACTCTCTCTGCATCCGTTTCATCCTTCAACCTCCCTCCACTATCTCGTAGATCCATCT
CTGGTCGCTTTAAACCCACCGTTAACGCAAACGCTCCCAATCCTTCAAAACCACCAACGT
CGTCTTCTCCATCTTCCTTCTCCCACCACAGAAACCTTACATTCCCCAGAGGAATCTCTT
TAACTCTTCCGAACGCAAAACCCTCAAGAGCTCCACCATCTCCTCCGTCTCCTCCTCCTG
TGCACGAGAAAGCGGCGTCAGGATTTGCTGCGGCGCTCGTTAGTGTTTGTCAATCGAAGA
ACTGTCTTGCTCGGACTCAAGAAGATGTCAGAAGGCTGATGGCGTTTCTTGAGGGAGAAG
ACAAAAAGAGGAACAACAACAAGGTCTTGGTCAATGAAGTTGCTGAGAGAGGTAAATTTG
GTAAACATTTGAAGGGCTTGGTCAAGATGTTGGTTACAAGAGGCAAATCTGGGATTCTCT
TTGATGTCTTAATGGAGTTTGAGAGAATCTGTAATGAATTGGTCCTTGTCCGTACAACAA
AGCTTGTCTGAAACAACTAAAGATTGTAATAAGATTACATCATCAAATACACAGTTGTGT
CATTTGTCTTTTTTCTAATCAGATGTTTACATTATAGACAAAGCCTCTGTTATGTACATA
AGACGGACCAACGTTTAGTTAAGATTCATTG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 4

CO CL2168Contig1 1184 4 14 U
GGAAAACACATAAATAAGGATCGATTTGCTAAGGAGTAGACGAAAACACTCGAACCTTCC
GACCGAATCGATGGCGAATTCAGATACGGTGATGCTCGTGATCAGATCCTCACGGCCACA
GTTTCGAAACAACGGCGACAAGATCGCCTTCGTAGTTCACGCTTCCTTAATCGCCTCAGG
TTACAAACTCGTTGCCACGGGAAGGCCTGCGTTCGCCGAAGACGCTCTTTCTTCCTCTCC
TTCTCAAGGAGAGGTAGGGATCGAGGGGTGGAACGAGTTCGAGGAGTACGCGTTTGTGTA
TGCGAAGAAAGGATCGAAGAAGATTCTGGTCAAGTGTTTGGTGATAGATGATAAGCTTCT
TGTTGATGCTATAGCTGAAGGTGGAAGAGAGCCTTCTCATCTCGAGATTGAAGTTGGGAA
CTATGTTGCTGAGTCGAGAGAGGAAGGTGACTACGATGCACAGTTCAAGAATCTGGAGAA
GTTAGTCACTGAGTTGCAGAATCAGATTCTGTACAAGGTTGATGAAGGACTTAAACCTAA
ACCCGTTACTCCTAGGACCCAGTCCAGTTCGGAGACAAATGAAGAGCGCGAGTCTGGATA
TTACGGTAGAAGGCCAGTTCCATTAGGTCCTCAGATTCACCCCTCAGGGGTGATAGTTCC
TCCTATACCCGGCCCAGGTTACAGTGATCTCATCCCTGGCCCAGGTGCTGGAGTATACCC
TGTCAGGGGTGGTTTTGGCGATGGAAGCATGCTTGTAGGACCTAACGATCCTCGCATGTT
CCCTGGAGTTGGTGATCATCAACCTGGCTTCATGGGACCACCACAACCGGGTGTGCCACC
TCCTGGTGCTCGTTATGATCCTATCGGCCCAGGTTTTGAGCCTGGCCGGTTAGGAAGGCA
ACCTCCAAGGAGGCCAGGGGATATTCATCCTGATCTTGAGCATTTTCCCCGCGGTTTTGG
TTCAGATTATATATAGTCAAAAGTAAAGCCATCTCCAAAAGAAACTTGTGGTCTTAATGA
CTTTATGTATCCGTCTTAAAAGTCTATGGTTGTGGCTACGCACAAACAATAATAGGATCT
AGTTTGCTTTGCTTTCTGTCTGAAATTTCTTTCTTTGGTTTTTATTCCACCAGCTGGTTG
TGTTTATAACTTTGAAAGTATATATATAAATAAAAGTTTTGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G892TF U 1
AF RR2A013TF U 40
AF RR2A013JQ C 370
AF RR2G892JQ C 414
BS 1 588 RR2G892TF
BS 589 589 RR2A013TF
BS 590 622 RR2G892TF
BS 623 722 RR2A013TF
BS 723 797 RR2A013JQ
BS 798 798 RR2G892JQ
BS 799 864 RR2A013JQ
BS 865 865 RR2G892JQ
BS 866 1012 RR2A013JQ
BS 1013 1013 RR2G892JQ
BS 1014 1031 RR2A013JQ
BS 1032 1032 RR2G892JQ
BS 1033 1060 RR2A013JQ
BS 1061 1184 RR2G892JQ

RD RR2G892TF 622 0 0
GGAAAACACATAAATAAGGATCGATTTGCTAAGGAGTAGACGAAAACACTCGAACCTTCC
GACCGAATCGATGGCGAATTCAGATACGGTGATGCTCGTGATCAGATCCTCACGGCCACA
GTTTCGAAACAACGGCGACAAGATCGCCTTCGTAGTTCACGCTTCCTTAATCGCCTCAGG
TTACAAACTCGTTGCCACGGGAAGGCCTGCGTTCGCCGAAGACGCTCTTTCTTCCTCTCC
TTCTCAAGGAGAGGTAGGGATCGAGGGGTGGAACGAGTTCGAGGAGTACGCGTTTGTGTA
TGCGAAGAAAGGATCGAAGAAGATTCTGGTCAAGTGTTTGGTGATAGATGATAAGCTTCT
TGTTGATGCTATAGCTGAAGGTGGAAGAGAGCCTTCTCATCTCGAGATTGAAGTTGGGAA
CTATGTTGCTGAGTCGAGAGAGGAAGGTGACTACGATGCACAGTTCAAGAATCTGGAGAA
GTTAGTCACTGAGTTGCAGAATCAGATTCTGTACAAGGTTGATGAAGGACTTAAACCTAA
ACCCGTTACTCCTAGGACCCAGTCCAGTTCGGAGACAAATGAAGAGCGTGAGTCTGGATA
TTACGGTAGAAGGCCAGTTCCA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2A013TF 683 0 0
GG
GAAAACACTCGAACCTTCCGACCGAATCGATGGCGAATTCAGATACGGTGATGCTCGTGA
TCAGATCCTCACGGCCACAGTTTCGAAACAACGGCGACAAGATCGCCTTCGTAGTTCACG
CTTCCTTAATCGCCTCAGGTTACAAACTCGTTGCCACGGGAAGGCCTGCGTTCGCCGAAG
ACGCTCTTTCTTCCTCTCCTTCTCAAGG*********GATCGAGGGGTGGAACGAGTTCG
AGGAGTACGCGTTTGTGTATGTGAAGAAAGGATCGAAGAAGATTCTGGTCAAGTGTTTGG
TGATAGATGATAAGCTTCTTGTTGATGCTATAGCTGAAGGTGGAAGAGAGCCTTCTCATC
TCGAGATTGAAGTTGGGAACTATGTTGCTGAGTCGAGAGAGGAAGGTGACTACGATGCAC
AGTTCAAGAATCTGGAGAAGTTAGTCACTGAGTTGCAGAATCAGATTCTGTACAAGGTTG
ATGAAGGACTTAAACCTAAACCTGTTACTCCTAGGACCCAGTCCAGTTCGGAGACAAATG
AAGAGCGCGAGTCTGGATATTACGGTAGAAGGCCAGTTCCATTAGGTCCTCAGATTCACC
CCTCAGGGGTGATAGTTCCTCCTATACCCGGCCCAGGTTACAGTGATCTCATCCCTGGCC
CAGGTGCTGGAGTATACCCTG

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2A013JQ 691 0 0
TATAGCTGAAGGTGGAAGAGAGCCTTCTCATCTCGAGATTGAAGTTGGGAACTATGTTGC
TGAGTCGAGAGAGGAAGGTGACTACGATGCACAGTTCAAGAATCTGGAGAAGTTAGTCAC
TGAGTTGCAGAATCAGATTCTGTACAAGGTTGATGAAGGACTTAAACCTAAACCTGTTAC
TCCTAGGACCCAGTCCAGTTCGGAGACAAATGAAGAGCGCGAGTCTGGATATTACGGTAG
AAGGCCAGTTCCATTAGGTCCTCAGATTCACCCCTCAGGGGTGATAGTTCCTCCTATACC
CGGCCCAGGTTACAGTGATTTCATCCCTGGCCCAGGTGCTGGAGTATACCCTGTCAGGGG
TGGTTTTGGCGATGGAAGCATGCTTGTAGGACCTAACGATCCTCGCATGTTCCCTGGAGT
TGGTGATCGTCAACCTGGCTTCATGGGACCACCACAACCGGGTGTGCCACCTCCTGGTGC
TCGTTATGATCCTATTGGCCCAGGTTTTGAGCCTGGCCGGTTAGGAAGGCAACCTCCAAG
GAGGCCAGGGGATATTCATCCTGATCTTGAGCATTTTCCCCGCGGTTTTGGTTCAGATTA
TATATAGTCAAAAGTAAAGCCATCTCCAAAAGAAACTTGTGGTTTTAATGACTTTATGTA
TCTGTCTTAAAAGTCTATGGTTGTGGCTACG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2G892JQ 771 0 0
TTGGGAACTATGTTGCTGAGTCGAGAGAGGAAGGTGACTACGATGCACAGTTCAAGAATC
TGGAGAAGTTAGTCACTGAGTTGCAGAATCAGATTCTGTACAAGGTTGATGAAGGACTTA
AACCTAAACCCGTTACTCCTAGGACCCAGTCCAGTTCGGAGACAAATGAAGAGCGTGAGT
CTGGATATTACGGTAGAAGGCCAGTTCCATTAGGTCCTCAGATTCACCCCTCAGGGGTGA
TAGTTCCTCCTATACCCGGCCCAGGTTACAGTGATCTCATCCCTGGCCCAGGTGCTGGAG
TATACCCTGTCAGGGGTGGTTTTGGCGATGGAAGCATGCTTGTAGGACCTAACGATCCTC
GCATGTTCCCTGGAGTTGGTGATCATCAACCTGGCTTCATGGGACCACCACAACCGGGTG
TGCCACCTCCTGGTGCTCGTTATGATCCTATCGGCCCAGGTTTTGAGCCTGGCCGGTTAG
GAAGGCAACCTCCAAGGAGGCCAGGGGATATTCATCCTGATCTTGAGCATTTTCCCCGCG
GTTTTGGTTCAGATTATATATAGTCAAAAGTAAAGCCATCTTCAAAAGAAACTTTTGGTC
TTAATGACTTTATGTATCCGTCTTAAAAGTCTATGGTTGTGGCTACGCACAAACAATAAT
AGGATCTAGTTTGCTTTGCTTTCTGTCTGAAATTTCTTTCTTTGGTTTTTATTCCACCAG
CTGGTTGTGTTTATAACTTTGAAAGTATATATATAAATAAAAGTTTTGGCT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 3

CO CL2169Contig1 801 3 3 U
GATTCATTGATTCTATTGTTTTTATTCAAGTTTATAAAATAGTGGTTATTTCCCAATATT
CATACATCACACAATGTGTAAAATTTATCATCATAATCTAGAAAACCTAGAGAGATGGTA
CAACTCAAGGTTTCACCATTATTAGGAATATAAGGGAGAGAGAAACCTTTTTAGAGCCAA
GCGGGGTTTTTGATGGAAGTGACAACAGCCTTGACTTGCAAGTAATTGTTGAGACTGTAG
ATACCTTTCTCTCTTCCAATGCCACTCATCTTATACCCTCCAAACGGGATCGTAGCATCA
AACACATCGAAACAGTTTATCCAAACGCTTCCAACTCTGAGTGCTCTCATCAACCTGTTC
GCTGTGTCCAGATTCTGTGTGAACACTCCTGCAGCTAAACCGTACCTTGAGTTGTTCGCC
CTTGCAATCACCTCATCCAGATCCTTGAATTTAAGTATGGTTTGAACTGGTCCGAAAATC
TCGTCTTTGGCTATGAGCATGTCGTCCTTGACGTCAGAGAAGACAGTGGGTTGAATGTAG
TAACCTTTGGAACCATGACGGTCACCACCGGTTTGTAAGGTGGCTCCACTATCAACTCCA
TGTCTAATGTACTTCAGGATTTTCTCGAACTGCTCAGAGTCCACCTGGGGACCTTGCTCA
ATGCCTGACTTGAAGGGATCGCCAACAGCGCGGTTGATTGCACGAGCTTTAGCTTTCTCT
ACAAACTCATCATACACGCGTTCATGTACAAATGTACGCGAGCCAGCACAGCAGCATTGT
CCCTGGTTAAAGACAAAGCGA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW42JQ U 5
AF RR2DW42TF C 339
AF RR2BL16JQ U 1
BS 1 518 RR2BL16JQ
BS 519 519 RR2DW42JQ
BS 520 801 RR2BL16JQ

RD RR2DW42JQ 533 0 0
CATTGATTCTATTGTTTTTATTCAAGTTTATAAAATAGTGGTTATTTCCCAATATTCATA
CATCACACAATGTGTAAAATTTATCATCATAATCTAGAAAACCTAGAGAGATGGTACAAC
TCAAGGTTTCACCATTATTAGGAATATAAGGGAGAGAGAAACCTTTTTAGAGCCAAGCGG
GGTTTTTGATGGAAGTGACAACAGCCTTGACTTGCAAGTAATTGTTGAGACTGTAGATAC
CTTTCTCTCTTCCAATGCCACTCATCTTATACCCTCCAAACGGGATCGTAGCATCAAACA
CATCGAAACAGTTTATCCAAACGCTTCCAACTCTGAGTGCTCTCATCAACCTGTTCGCTG
TGTCCAGATTCTGTGTGAACACTCCTGCAGCTAAACCGTACCTTGAGTTGTTCGCCCTTG
CAATCACCTCATCCAGATCCTTGAATTTAAGTATGGTTTGAACTGGTCCGAAAATCTCGT
CTTTGGCTATGAGCATGTCGTCCTTGACGTCAGAGAAGACAGTGGGTTGAATG

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2DW42TF 300 0 0
GAGTGCTCTCATCA*CCTGTTCGCTGTGTCCAGATTCTGTGTGA*CACTCCTGCAGCTAA
ACCGTACCTTGAGTTGTTCGCCCTTGCAATCACCTCATCCAGATCCTTGAATTTAAGTAT
GGTTTGAACTGGTCCGAAAATCTCGTCTTTGGCTATGAGCATGTCGTCCTTGACGTCAGA
GAAGACAGTGGGTTGAATGTAGTAACCTTTGGAACCATGACGGTCACCACCGGTTTGTAA
GGTGGCTCCACTATCAACTCCATGTCTAATGTACTTCAGGATTTTCTCGAACTGCTCAG
C

QA 1 299 1 299
DS 

RD RR2BL16JQ 801 0 0
GATTCATTGATTCTATTGTTTTTATTCAAGTTTATAAAATAGTGGTTATTTCCCAATATT
CATACATCACACAATGTGTAAAATTTATCATCATAATCTAGAAAACCTAGAGAGATGGTA
CAACTCAAGGTTTCACCATTATTAGGAATATAAGGGAGAGAGAAACCTTTTTAGAGCCAA
GCGGGGTTTTTGATGGAAGTGACAACAGCCTTGACTTGCAAGTAATTGTTGAGACTGTAG
ATACCTTTCTCTCTTCCAATGCCACTCATCTTATACCCTCCAAACGGGATCGTAGCATCA
AACACATCGAAACAGTTTATCCAAACGCTTCCAACTCTGAGTGCTCTCATCAACCTGTTC
GCTGTGTCCAGATTCTGTGTGAACACTCCTGCAGCTAAACCGTACCTTGAGTTGTTCGCC
CTTGCAATCACCTCATCCAGATCCTTGAATTTAAGTATGGTTTGAACTGGTCCGAAAATC
TCGTCTTTGGCTATGAGCATGTCGTCCTTGACGTCAGAAAAGACAGTGGGTTGAATGTAG
TAACCTTTGGAACCATGACGGTCACCACCGGTTTGTAAGGTGGCTCCACTATCAACTCCA
TGTCTAATGTACTTCAGGATTTTCTCGAACTGCTCAGAGTCCACCTGGGGACCTTGCTCA
ATGCCTGACTTGAAGGGATCGCCAACAGCGCGGTTGATTGCACGAGCTTTAGCTTTCTCT
ACAAACTCATCATACACGCGTTCATGTACAAATGTACGCGAGCCAGCACAGCAGCATTGT
CCCTGGTTAAAGACAAAGCGA

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL2170Contig1 837 2 14 U
GGGTGTTCTCAGATTCCGTAGCAAAAAGACATTCAGACTCTTCTCTTCTTCTCAATGTCT
GAGAACAACGCAGCCAACAAGATCATGAAGAAGAACCAGATTTGTAAAGACGCCATCGTG
TCTGAACTACAGAAGAAGAAAGTTCATCTCTTTTGCTGCTTAGAGTGTGAAGAACTTGCT
TGCAAAATCGCCGCCGAATCTGACCACATCACTCTTCAATCCATCAACTGGAGGAGCTTT
GCTGATGGATTCCCAAATCTGTTTATCAACAACGCGCATGAAATCAGAGGCCAGCACGTT
GCATTCCTCGCGTCGTTCAGCTCTCCTGCGGTCATCTTTGAGCAGATCTCTGTCATCTAC
TTGCTCCCACGCTTGTTCGTCGCCTCCTTCACCTTGGTGTTGCCTTTCTTCCCAACTGGC
TCCTTTGAGAGGATGGAAGAGGAAGGTGATGTAGCCACTGCTTTCACCATGGCTAGGATT
GTCTCTAACATCCCCATTTCGCGTGGTGGTCCCACTAGTGTAGTCATCTATGACATTCAC
GCTTTGCAGGAAAGGTTCTACTTTGCTGATCAGGTTCTTCCTTTGTTTGAGACTGGGATC
CCTCTGTTGACGAAACGTCTCCAACAGCTTCCTGAAACTGAGAAAATCATAGTTGCGTTT
CCTGATGATGGAGCCTGGAAGCGTTTCCACAAGCTGTTGGATCAGTACCCCACGGTGGTG
TGCACAAAGGTTCGTGAAGGGGATAAGAGAATAGTGAGGCTGAAGAAGGTAACCCTGCTG
GTTGCCACGTTGTCATCGTTGATGATCTTGTGCAGTCTGGTGGTACACTCATCGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI47TF U 1
AF RR2FL69TF U 186
BS 1 311 RR2DI47TF
BS 312 312 RR2FL69TF
BS 313 356 RR2DI47TF
BS 357 357 RR2FL69TF
BS 358 455 RR2DI47TF
BS 456 456 RR2FL69TF
BS 457 494 RR2DI47TF
BS 495 495 RR2FL69TF
BS 496 603 RR2DI47TF
BS 604 604 RR2FL69TF
BS 605 623 RR2DI47TF
BS 624 624 RR2FL69TF
BS 625 727 RR2DI47TF
BS 728 837 RR2FL69TF

RD RR2DI47TF 727 0 0
GGGTGTTCTCAGATTCCGTAGCAAAAAGACATTCAGACTCTTCTCTTCTTCTCAATGTCT
GAGAACAACGCAGCCAACAAGATCATGAAGAAGAACCAGATTTGTAAAGACGCCATCGTG
TCTGAACTACAGAAGAAGAAAGTTCATCTCTTTTGCTGCTTAGAGTGTGAAGAACTTGCT
TGCAAAATCGCCGCCGAATCTGACCACATCACTCTTCAATCCATCAACTGGAGGAGCTTT
GCTGATGGATTCCCAAATCTGTTTATCAACAACGCGCATGAAATCAGAGGCCAGCACGTT
GCATTCCTCGCTTCGTTCAGCTCTCCTGCGGTCATCTTTGAGCAGATCTCTGTCATTTAC
TTGCTCCCACGCTTGTTCGTCGCCTCCTTCACCTTGGTGTTGCCTTTCTTCCCAACTGGC
TCCTTTGAGAGGATGGAAGAGGAAGGTGATGTAGCTACTGCTTTCACCATGGCTAGGATT
GTCTCTAACATCCCTATTTCGCGTGGTGGTCCCACTAGTGTAGTCATCTATGACATTCAC
GCTTTGCAGGAAAGGTTCTACTTTGCTGATCAGGTTCTTCCTTTGTTTGAGACTGGGATC
CCTTTGTTGACGAAACGTCTCCAGCAGCTTCCTGAAACTGAGAAAATCATAGTTGCGTTT
CCTGATGATGGAGCCTGGAAGCGTTTCCACAAGCTGTTGGATCAGTACCCCACGGTGGTG
TGCACAA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2FL69TF 652 0 0
G
ATCGCCGCCGAATCTGACCACATCACTCTTCAATCCATCAACTGGAGGAGCTTTGCTGAT
GGATTCCCGAATCTGTTTATCAACAACGCGCATGAAATCAGAGGCCAGCACGTTGCGTTC
CTCGCGTCGTTCAGCTCTCCTGCGGTCATCTTTGAGCAGATCTCTGTCATCTACTTGCTG
CCACGCTTGTTTGTCGCCTCTTTCACCTTGGTGTTGCCTTTCTTCCCCACTGGCTCCTTT
GAGAGGATGGAAGAGGAAGGTGATGTAGCCACTGCTTTCACCATGGCTAGGATTGTCTCT
AACATCCCCATTTCGCGTGGTGGTCCCACTAGTGTAGTCATCTATGACATTCACGCTTTG
CAGGAAAGGTTCTACTTTGCTGATCAGGTTCTTCCTTTGTTTGAGACTGGGATCCCTCTG
TTGATGAAACGTCTTCAACAGCTTCCTGACACTGAGAAAATCATAGTTGCGTTTCCTGAT
GATGGAGCTTGGAAGCGTTTCCACAAGCTGTTGGATCAGTACCCCACGGTGGTGTGCACA
AAGGTTCGTGAAGGGGATAAGAGAATAGTGAGGCTGAAGAAGGTAACCCTGCTGGTTGCC
ACGTTGTCATCGTTGATGATCTTGTGCAGTCTGGTGGTACACTCATCGAGT

QA 2 652 2 652
DS 



AS 2 4

CO CL2171Contig1 833 2 3 U
GGAGCCCGCATAATCAAGTGAGCTCTCTTTGACCAATCAGTGATCGATCAGTCGAGTGGT
GGTGTAAAATGGAAGATGGAGAGAAGAATGATGGGAAGAGACTAGTGTTTGTGACGGTGG
GAACAACGAGTTTCGACGCGCTTGTGAAAGCAGTGGTCAGCCAAAACGTTAAAGACGAGT
TGCGCAAGAGAGGATATACTCATCTTCTCGTTCAGATGGGTCGAGGAATCTACTCTCCAC
CCAAGTGTGATGGAGCGGATGGATCATCACTAGCCGTTGATTACTTCACATTCTCTTCGA
GTATCGCAGATTATATTCGATCTGCGTCTCTTGTTATTAGTCACGCTGGATCTGGAAGCA
TATTCGAGACGCTAAAGCTAGGGAAACCGTTGATTGTTGTAGTGAACGAGGATCTGATGG
ACAATCATCAGTGTGAATTAGCTGAAGAGCTTGAAGAGAGGAAGCATTTGTACTGCGCTC
GTCCTCACACGCTTCATCAGACCTTGACCAAGATGGAGTTGGGGTCTCTGGTTCGGTACG
ATCCAGGGGATGGGACACCTGTTGCCCGTATTATCGATAGGTTCCTGGGTTTTCCTGATG
ATTAAAACAGATGCGTTTTAAAAAAAAAGTGTTCTGAGAACAGTTTTAACTGATTATGTA
CTAAACTGGTGGTCTTCATGTTGGACTTTGTTTTGTAGTAGAATTATATCTTTGTAATAG
CTAAAGCTTTTTCTGATGTTTGAGAGGATTATGGATAGCTTCGTATTCAACAGTACTCAC
CTTTTGCAGACTGTAACTCGATTTATCAGAAGACGATATTGGACTGGTTTACC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B623JQ C 1
AF RR2B623TF U 1
BS 1 2 RR2B623JQ
BS 3 787 RR2B623TF
BS 788 833 RR2B623JQ

RD RR2B623JQ 833 0 0
GGAGCCCGCATAATCAAGTGAGCTCTCTTTGACCAATCAGTGATCGATCAGTCGAGTGGT
GGTGTAAAATGGAAGATGGAGAGAAGAATGATGGGAAGAGACTAGTGTTTGTGACGGTGG
GAACAACGAGTTTCGACGCGCTTGTGAAAGCAGTGGTCAGCCAAAACGTTAAAGACGAGT
TGCGCAAGAGAGGATATACTCATCTTCTCGTTCAGATGGGTCGAGGAATCTACTCTCCAC
CCAAGTGTGATGGAGCGGATGGATCATCACTAGCCGTTGATTACTTCACATTCTCTTCGA
GTATCGCAGATTATATTCGATCTGCGTCTCTTGTTATTAGTCACGCTGGATCTGGAAGCA
TATTCGAGACGCTAAAGCTAGGGAAACCGTTGATTGTTGTAGTGAACGAGGATCTGATGG
ACAATCATCAGTGTGAATTAGCTGAAGAGCTTGAAGAGAGGAAGCATTTGTACTGCGCTC
GTCCTCACACGCTTCATCAGACCTTGACCAAGATGGAGTTGGGGTCTCTGGTTCGGTACG
ATCCAGGGGATGGGACACCTGTTGCCCGTATTATCGATAGGTTCCTGGGTTTTCCTGATG
ATTAAAACAGATGCGTTTTAAAAAAAAAGTGTTCTGAGAACAGTTTTAACTGATTATGTA
CTAAACTGGTGGTCTTCATGTTGGACTTTGTTTTGTAGTAGAATTATATCTTTGTAATAG
CTAAAGCTTTTTCTGATGTTTGAGAGGATTATGGATAGCTTCGTATTCAACAGTACTCAC
CTTTTGCAGACTGTAACTCGATTTATCAGAAGACGATATTGGACTGGTTTACC

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2B623TF 791 0 0
GG
AGCCCGCATAATCAAGTGAGCTCTCTTTGACCAATCAGTGATCGATCAGTCGAGTGGTGG
TGTAAAATGGAAGATGGAGAGAAGAATGATGGGAAGAGACTAGTGTTTGTGACGGTGGGA
ACAACGAGTTTCGACGCGCTTGTGAAAGCAGTGGTCAGCCAAAACGTTAAAGACGAGTTG
CGCAAGAGAGGATATACTCATCTTCTCGTTCAGATGGGTCGAGGAATCTACTCTCCACCC
AAGTGTGATGGAGCGGATGGATCATCACTAGCCGTTGATTACTTCACATTCTCTTCGAGT
ATCGCAGATTATATTCGATCTGCGTCTCTTGTTATTAGTCACGCTGGATCTGGAAGCATA
TTCGAGACGCTAAAGCTAGGGAAACCGTTGATTGTTGTAGTGAACGAGGATCTGATGGAC
AATCATCAGTGTGAATTAGCTGAAGAGCTTGAAGAGAGGAAGCATTTGTACTGCGCTCGT
CCTCACACGCTTCATCAGACCTTGACCAAGATGGAGTTGGGGTCTCTGGTTCGGTACGAT
CCAGGGGATGGGACACCTGTTGCCCGTATTATCGATAGGTTCCTGGGTTTTCCTGATGAT
TAAAACAGATGCGTTTTAAAAAAAAAGTGTTCTGAGAACAGTTTTAACTGATTATGTACT
AAACTGGTGGTCTTCATGTTGGACTTTGTTTTGTAGTAGAATTATATCTTTGTAATAGCT
AAAGCTTTTTCTGATGTTTGAGAGGATTATGGATAGCTTCGTATTCAACAGTACTCACCT
TTTGC
AGAC

QA 3 787 3 787
DS 



CO CL2171Contig2 831 2 10 U
GGACGAAAACGAATCACCGTCGCACGATATCTGCTCAGCCCGCATAATCGAGTGAGCTCT
CTTTGACCAATCAGTGATCGATCAGGGTTCAAAATCGAGTGGTGGGTGTAAAATGGGAGA
TGGAGAGAAGAATGATGGGAAGAGGATAGTGTTTGTGACGGTGGGAACAACGAGTTTCGA
CGCGCTCGTGAAAGCAGTGGTCAGCCAAAACGTTAAAGACGAGTTGCGCAAGAGAGGATA
TACTCATCTTCTCATTCAGATGGGTCGAGGAATCTACTCTCCACCCAAGTGTGATGGAGC
GGATGGATCATCACTAGCCATTGATTACTTCACATTCTCCTCGAGTATCGCAGATTATAT
TCGATCTGCCTCTCTTGTTATTAGTCACGCTGGATCTGGAAGCATATTCGAGACGCTAAA
GCTAGGGAAACCGTTGATTGTTGTAGTGAACGAGGATCTGATGGACAATCATCAATGTGA
ATTAGCTGAAGAGCTTGAAGAGAGGAAGCATTTGTACTGCGCTCGTCCTCATACCCTTCA
TCAGACCTTGACCAAGATGGAGTTGGGGTCTCTGGTTCGGTACGATCCAGGGGATGGGAC
ACCTGTTGCCCGTATTATCGATAGGTTCCTGGGTTTCCCTGATGATTAAAACAGATGCGT
TTTTTTAAAAAGTGTTCTGAGAACAGTTTTAACTGATTATGTACTAAACTGGTGGTCTTC
ATGTTGGACTTTGTTTTGTAGTAGAATTATATCTTTGTAATAGCTAAAGTTTTTTCTGAT
GTTTGAGAGGATGATGGATAGCTTCGTATTCAATAGTACTCCCCTTTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ41TF U 1
AF RR2EQ41JQ C 47
BS 1 670 RR2EQ41TF
BS 671 671 RR2EQ41JQ
BS 672 736 RR2EQ41TF
BS 737 737 RR2EQ41JQ
BS 738 759 RR2EQ41TF
BS 760 760 RR2EQ41JQ
BS 761 783 RR2EQ41TF
BS 784 784 RR2EQ41JQ
BS 785 797 RR2EQ41TF
BS 798 831 RR2EQ41JQ

RD RR2EQ41TF 797 0 0
GGACGAAAACGAATCACCGTCGCACGATATCTGCTCAGCCCGCATAATCGAGTGAGCTCT
CTTTGACCAATCAGTGATCGATCAGGGTTCAAAATCGAGTGGTGGGTGTAAAATGGGAGA
TGGAGAGAAGAATGATGGGAAGAGGATAGTGTTTGTGACGGTGGGAACAACGAGTTTCGA
CGCGCTCGTGAAAGCAGTGGTCAGCCAAAACGTTAAAGACGAGTTGCGCAAGAGAGGATA
TACTCATCTTCTCATTCAGATGGGTCGAGGAATCTACTCTCCACCCAAGTGTGATGGAGC
GGATGGATCATCACTAGCCATTGATTACTTCACATTCTCCTCGAGTATCGCAGATTATAT
TCGATCTGCCTCTCTTGTTATTAGTCACGCTGGATCTGGAAGCATATTCGAGACGCTAAA
GCTAGGGAAACCGTTGATTGTTGTAGTGAACGAGGATCTGATGGACAATCATCAATGTGA
ATTAGCTGAAGAGCTTGAAGAGAGGAAGCATTTGTACTGCGCTCGTCCTCATACCCTTCA
TCAGACCTTGACCAAGATGGAGTTGGGGTCTCTGGTTCGGTACGATCCAGGGGATGGGAC
ACCTGTTGCCCGTATTATCGATAGGTTCCTGGGTTTCCCTGATGATTAAAACAGATGCGT
TTTTTTAAAA*GTGTTCTGAGAACAGTTTTAACTGATTATGTACTAAACTGGTGGTCTTC
ATGTTGGACTTTGTTT*GTAGTAGAATTATATCTTTGTA*TAGCTAAAGTTTTTTCTGAT
GTT*GAGAGGATGATGG

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2EQ41JQ 785 0 0
ATCGAGTGAGCTCTCTTTGACCAATCAGTGATCGATCAGGGTTCAAAATCGAGTGGTGGG
TGTAAAATGGGAGATGGAGAGAAGAATGATGGGAAGAGGATAGTGTTTGTGACGGTGGGA
ACAACGAGTTTCGACGCGCTCGTGAAAGCAGTGGTCAGCCAAAACGTTAAAGACGAGTTG
CGCAAGAGAGGATATACTCATCTTCTCATTCAGATGGGTCGAGGAATCTACTCTCCACCC
AAGTGTGATGGAGCGGATGGATCATCACTAGCCATTGATTACTTCACATTCTCCTCGAGT
ATCGCAGATTATATTCGATCTGCCTCTCTTGTTATTAGTCACGCTGGATCTGGAAGCATA
TTCGAGACGCTAAAGCTAGGGAAACCGTTGATTGTTGTAGTGAACGAGGATCTGATGGAC
AATCATCAATGTGAATTAGCTGAAGAGCTTGAAGAGAGGAAGCATTTGTACTGCGCTCGT
CCTCATACCCTTCATCAGACCTTGACCAAGATGGAGTTGGGGTCTCTGGTTCGGTACGAT
CCAGGGGATGGGACACCTGTTGCCCGTATTATCGATAGGTTCCTGGGTTTCCCTGATGAT
TAAAACAGATGCGTTTTTTTAAAAAGTGTTCTGAGAACAGTTTTAACTGATTATGTACTA
AACTGGTGGTCTTCATGTTGGACTTTGTTTTGTAGTAGAATTATATCTTTGTAATAGCTA
AAGTTTTTTCTGATGTTTGAGAGGATTATGGATAGCTTCGTATTCAATAGTACTCCCCTT
TTGCT

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 3

CO CL2172Contig1 755 3 4 U
GGAATGAAACAGATACATTACTGAATACCATATAATAAAATATTGTCACATTTTTAAAAG
CAGTTGCTACATAACATTACATGTGAAGACTCAATAACCTATAACAACATTACAAACCAG
CCTCTATATGAAATAACCCTCTTCTTACACATATCTACAAACAAAGCTTAAATATACTTT
CATGCTTAGTCTGAAACCCATCCGATTAAAAAAAAAAAGACAGCTCGGAATCGGTCTAAA
AGTGTAAATAACTCACACGGCACTGAGATTTGTTTTTCAGACTCCCCTCTTTGATCTAGG
TGGAGTCCCAGGAGCGAAAAGGGAGCCTTGGACTGGCTGAGCCATAGGATCAAACTTTTG
GGAAGCTAGATAAGTGAGTGCAGTGACAACATCAGCAACGACGGGTCTCAGATTCGGCTG
CTCTTGCACGCACATTGCCGCCACAGCAAGGGCTTGGTACAATCCTCTCGGAGGGTATTG
ACCTTGAAGCATTGGATCAGCCATTTGAGAGAATTTCCTCCTGTCTTTAAACAGAGGCCT
CGCCCACGCGACTAGATTCTGTTCTCCAGTGCATCTAGAATTGTCTATGGCTTTCCTACC
GGTTATGATCTCCAAAAGAACCACACCGAAGCTATAAACGTCTGATTTGAGTGTTAGCTG
GCCTGTCATTGCGTACTCGGGAGCACAGTATCCGTATGTTCACATAACCCGAGTGGACAC
GTGAGACTTGTCACCCACTGAGCCAAGTTTAGCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F375JQ U 1
AF RR2F375TF C 1
AF RR2D608JQ U 7
BS 1 279 RR2F375JQ
BS 280 280 RR2D608JQ
BS 281 532 RR2F375JQ
BS 533 755 RR2D608JQ

RD RR2F375JQ 533 0 0
GGAATGAAACAGATACATTACTGAATACCATATAATAAAATATTGTCACATTTTTAAAAG
CAGTTGCTACATAACATTACATGTGAAGACTCAATAACCTATAACAACATTACAAACCAG
CCTCTATATGAAATAACCCTCTTCTTACACATATCTACAAACAAAGCTTAAATATACTTT
CATGCTTAGTCTGAAACCCATCCGATTAAAAAAAAAAAGACAGCTCGGAATCGGTCTAAA
AGTGTAAATAACTCACACGGCACTGAGATTTGTTTTTCAAACTCCCCTCTTTGATCTAGG
TGGAGTCCCAGGAGCGAAAAGGGAGCCTTGGACTGGCTGAGCCATAGGATCAAACTTTTG
GGAAGCTAGATAAGTGAGTGCAGTGACAACATCAGCAACGACGGGTCTCAGATTCGGCTG
CTCTTGCACGCACATTGCCGCCACAGCAAGGGCTTGGTACAATCCTCTCGGAGGGTATTG
ACCTTGAAGCATTGGATCAGCCATTTGAGAGAATTTCCTCCTGTCTTTAAAC
C

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2F375TF 533 0 0
GGAATG
AAACAGATACATTACTGAATACCATATAATAAAATATTGTCACATTTTTAAAAGCAGTTG
CTACATAACATTACATGTGAAGACTCAATAACCTATAACAACATTACAAACCAGCCTCTA
TATGAAATAACCCTCTTCTTACACATATCTACAAACAAAGCTTAAATATACTTTCATGCT
TAGTCTGAAACCCATCCGATTAAAAAAAAAAAGACAGCTCGGAATCGGTCTAAAAGTGTA
AATAACTCACACGGCACTGAGATTTGTTTTTCAGACTCCCCTCTTTGATCTAGGTGGAGT
CCCAGGAGCGAAAAGGGAGCCTTGGACTGGCTGAGCCATAGGATCAAACTTTTGGGAAGC
TAGATAAGTGAGTGCAGTGACAACATCAGCAACGACGGGTCTCAGATTCGGCTGCTCTTG
CACGCACATTGCCGCCACAGCAAGGGCTTGGTACAATCCTCTCGGAGGGTATTGACCTTG
AAGCATTGGATCAGCCATTTGAGAGAATTTCCTCCTGTCTTTAAAC
C

QA 7 532 7 532
DS 

RD RR2D608JQ 749 0 0
AAACAGATACATTACTGAATACCATATAATAAAATATTGTCACATTTTTAAAAGCAGTTG
CTACATAACATTACATGTGAAGACTCAATAACCTATAACAACATTACAAACCAGCCTCTA
TATGAAATAACCCTCTTCTTACACATATCTACAAACAAAGCTTAAATATACTTTCATGCT
TAGTCTGAAACCCATCCGATTAAAAAAAAAA*GACAGCTCGGAATCGGTCTAAAAGTGTA
AATAACTCACACGGCACTGAGATTTGTTTTTCAGACTCCCCTCTTTGATCTAGGTGGAGT
CCCAGGAGCGAAAAGGGAGCCTTGGACTGGCTGAGCCATAGGATCAAACTTTTGGGAAGC
TAGATAAGTGAGTGCAGTGACAACATCAGCAACGACGGGTCTCAAATTCGGCTGCTCTTG
CACGCACATTGCCGCCACAGCAAGGGCTTGGTACAATCCTCTCGGAGGGTATTGACCTTG
AAGCATTGGATCAGCCATTTGAGAGAATTTCCTCCTGTCTTTAAACAGAGGCCTCGCCCA
CGCGACTAGATTCTGTTCTCCAGTGCATCTAGAATTGTCTATGGCTTTCCTACCGGTTAT
GATCTCCAAAAGAACCACACCGAAGCTATAAACGTCTGATTTGAGTGTTAGCTGGCCTGT
CATTGCGTACTCGGGAGCACAGTATCCGTATGTTCACATAACCCGAGTGGACACGTGAGA
CTTGTCACCCACTGAGCCAAGTTTAGCCA

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL2173Contig1 728 2 2 U
GTCACTTCCTCTCCCTCGATTCTAGCACCAGAATATTGTGGTTCGACCTCAATTGTGTGG
AAGTCAATGGACTCAGCCACGGAGATCCTTTCAGATACGGGTACAGAGATTGCTTCTTCA
AATTTCAGTTTCTTCACTGCTTTCTCGCACTCTCTTAGCTTCCTTGTCGCATCAGGGTCA
TTAGGAGAAATCCTCTTAACTTGCTGGAAATCCTTCAAGGCATCCTTAAACTTCCCCATG
GCAAGATAAGCAGCACCACGTCTGTAATAGCCCTTGGAGTATTTTGGATCAATTTCAATG
GCCTTTGATGCATCCTGTATAGCACTGCCATATTCCTCCAGCTTTGTGTGAGCAAATGCA
CGGTTTGCCCAATACACAGCGTTATTGCCGTTGAGTTCTATAGCTTGTGTATACAGATCA
ATAGCCTGGGAGAATTTGTGACCTTTGAAAGCTTCATTGGCCTGATTCTTCAACTCCTCG
GCCCGTGAAACATCAGAGTTCTCATGATCAACCTCGTATCCTTCATCTTTTACTTCATGT
GAGCGCACCACCAAATCTAGATTGTTGTCTTCCAAAAACCTTTTGGTAACATCTCCACCA
AATGAGAGACCGACTCCTCTCTTGCTTGGGCCTCTTCCAGGCAGAGGTTGAGGATCACTC
CACAACAGCTCACACATCAATCCTTCCTCAGGAGGCTCACAGAATCGGTCAATGGCTCTG
ATGTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA64JQ U 1
AF RR2CQ65TF C 92
BS 1 505 RR2FA64JQ
BS 506 728 RR2CQ65TF

RD RR2FA64JQ 513 0 0
GTCACTTCCTCTCCCTCGATTCTAGCACCAGAATATTGTGGTTCGACCTCAATTGTGTGG
AAGTCAATGGACTCAGCCACGGAGATCCTTTCAGATACGGGTACAGAGATTGCTTCTTCA
AATTTCAGTTTCTTCACTGCTTTCTCGCACTCTCTTAGCTTCCTTGTCGCATCAGGGTCA
TTAGGAGAAATCCTCTTAACTTGCTGGAAATCCTTCAAGGCATCCTTAAACTTCCCCATG
GCAAGATAAGCAGCACCACGTCTGTAATAGCCCTTGGAGTATTTTGGATCAATTTCAATG
GCCTTTGATGCATCCTGTATAGCACTGCCATATTCCTCCAGCTTTGTGTGAGCAAATGCA
CGGTTTGCCCAATACACAGCGTTATTGCCGTTGAGTTCTATAGCTTGTGTATACAGATCA
ATAGCCTGGGAGAATTTGTGACCTTTGAAAGCTTCATTGGCCTGATTCTTCAACTCCTCG
GCCCGTGAAACATCAGAGTTCTCAT
TCTTAGCC

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR2CQ65TF 637 0 0
CAGATACGGGTACAGAGATTGCTTCTTCAAATTTCAGTTTCTTCACTGCTTTCTCGCACT
CTCTTAGCTTCCTTGTCGCATCAGGGTCATTAGGAGAAATCCTCTTAACTTGCTGGAAAT
CCTTCAAGGCATCCTTAAACTTCCCCATGGCAAGATAAGCAGCACCACGTCTGTAATAGC
CCTTGGAGTATTTTGGATCAATTTCAATGGC*TTTGATGCATCCTGTATAGCACTGCCAT
ATTCCTCCAGCTTTGTGTGAGCAAATGCACGGTTTGCCCAATACACAGCGTTATTGCCGT
TGAGTTCTATAGCTTGTGTATACAGATCAATAGCCTGGGAGAATTTGTGACCTTTGAAAG
CTTCATTGGCCTGATTCTTCATCTCCTCGGCCCGTGAAACATCAGAGTTCTCATGATCAA
CCTCGTATCCTTCATCTTTTACTTCATGTGAGCGCACCACCAAATCTAGATTGTTGTCTT
CCAAAAACCTTTTGGTAACATCTCCACCAAATGAGAGACCGACTCCTCTCTTGCTTGGGC
CTCTTCCAGGCAGAGGTTGAGGATCACTCCACAACAGCTCACACATCAATCCTTCCTCAG
GAGGCTCACAGAATCGGTCAATGGCTCTGATGTCTGC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 2 4

CO CL2174Contig1 532 2 2 U
GGGTTTTCTGCACGGCTGGAGGTCGATCCGAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAACACCACA
AGTGAAGACTGGTTTGTTCGTTGGTCTGAACAAAGGACACGTTGTCACAAGACGCGAGTT
GGCTCCTCGTCCTAACTCCCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACATTGTTCATCAGATC
ACTGATCAGGGAGGTAGCTGGATTTGCTCCCTACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAA
GGTTGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCCAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAG
AGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAAATGAGGTCTGGTGGAGG
TGCTACTACTGAGAAGAAGAAGTAAACATCGTAGTCTTCTGTGTTTTGTTTGGAACTCTT
TTCAAGTTTTGGTTCGCTCTTGCAAATCAACTTTATGTTCTAAAAACCATGTTGTGTTTT
CGTGTTTTGGTAGAGATATTGATCAAACGTTGCTTCACTATGTTACCATTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D349JQ C 1
AF RR2D349TF U 1
BS 1 12 RR2D349JQ
BS 13 532 RR2D349TF

RD RR2D349JQ 532 0 0
GGGTTTTCTGCACGGCTGGAGGTCGATCCGAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAACACCACA
AGTGAAGACTGGTTTGTTCGTTGGTCTGAACAAAGGACACGTTGTCACAAGACGCGAGTT
GGCTCCTCGTCCTAACTCCCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACATTGTTCATCAGATC
ACTGATCAGGGAGGTAGCTGGATTTGCTCCCTACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAA
GGTTGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCCAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAG
AGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAAATGAGGTCTGGTGGAGG
TGCTACTACTGAGAAGAAGAAGTAAACATCGTAGTCTTCTGTGTTTTGTTTGGAACTCTT
TTCAAGTTTTGGTTCGCTCTTGCAAATCAACTTTATGTTCTAAAAACCATGTTGTGTTTT
CGTGTTTTGGTAGAGATATTGATCAAACGTTGCTTCACTATGTTACCATTTA

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2D349TF 532 0 0
GGGTTTTCTGCA
CGGCTGGAGGTCGATCCGAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAACACCACAAGTGAAGACTGG
TTTGTTCGTTGGTCTGAACAAAGGACACGTTGTCACAAGACGCGAGTTGGCTCCTCGTCC
TAACTCCCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGGGA
GGTAGCTGGATTTGCTCCCTACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGTAAAGA
CAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCCAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAA
GAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAAATGAGGTCTGGTGGAGGTGCTACTACTGA
GAAGAAGAAGTAAACATCGTAGTCTTCTGTGTTTTGTTTGGAACTCTTTTCAAGTTTTGG
TTCGCTCTTGCAAATCAACTTTATGTTCTAAAAACCATGTTGTGTTTTCGTGTTTTGGTA
GAGATATTGATCAAACGTTGCTTCACTATGTTACCATTTA

QA 13 532 13 532
DS 



CO CL2174Contig2 556 2 1 U
GGGTTTTCTGAAGCGGCTGGAGGTCGATCCGAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAACACCAC
AAGTGAAGACTGGTTTGTTCGTTGGCCTGAACAAAGGACACGTTGTCACAAGACGCGAGT
TGGCTCCTCGTCCTAACTCCCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACATTGTTCATCAGAT
CACTGATCAGGGAGGTAGCTGGATTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCA
AGGTTGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCCAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGA
GAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAAATGAGGTCTGGTGGAG
GTGCTACTACTGAGAAGAAGAATTAAGCATCTTAGTCTTCTGTGTTTTGTTTGGAACTCT
TTTCAAGTTTTGGATCGCTCTTGCAAATCAGCTTTATGCTCTATAAACCATGTGTTTTCG
TGTTTTGTTAGAGATATTGATTAAACGTTGCTTCACTGTGTTACCATTTATCATAAAGCT
TTTCAAACTTGCTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FA27TF U 1
AF RR2FA27JQ C 23
BS 1 556 RR2FA27TF

RD RR2FA27TF 556 0 0
GGGTTTTCTGAAGCGGCTGGAGGTCGATCCGAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAACACCAC
AAGTGAAGACTGGTTTGTTCGTTGGCCTGAACAAAGGACACGTTGTCACAAGACGCGAGT
TGGCTCCTCGTCCTAACTCCCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACATTGTTCATCAGAT
CACTGATCAGGGAGGTAGCTGGATTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCA
AGGTTGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCCAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGA
GAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAAATGAGGTCTGGTGGAG
GTGCTACTACTGAGAAGAAGAATTAAGCATCTTAGTCTTCTGTGTTTTGTTTGGAACTCT
TTTCAAGTTTTGGATCGCTCTTGCAAATCAGCTTTATGCTCTATAAACCATGTGTTTTCG
TGTTTTGTTAGAGATATTGATTAAACGTTGCTTCACTGTGTTACCATTTATCATAAAGCT
TTTCAAACTTGCTACT

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2FA27JQ 534 0 0
GTCGATCCGAGAAGAAGAGAAAACAATGGCAACACCACAAGTGAAGACTGGTTTGTTCGT
TGGCCTGAACAAAGGACACGTTGTCACAAGACGGGAGTTGGCTCCTCGTCCTAACTCCCG
CAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGGGAGGTAGCTGG
ATTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTTTCAAGGTTGGTAAAGACAAGAGGGC
TTTTAAGGTTGCCAAGAGGAAGTTGGGTACCCCCAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGA
GATGTTTAGTGTTTTCCGCAAAATGAGGTCTGGTGGAGGTGCTACTACTGAGAAGAAGAA
TTAAGCATTTTAGTTTTTTGTGTTTTGTTTGGAACTCTTTTCAAGTTTTGGATCGCTCTT
GCAAATCAGCTTTATGCTCTATAAACCATGTGTTTTTGTGTTTTGTTAGAGATATTGATT
AAACGTTGCTTCACTGTGTTACCATTTATCATAAAGCTTTTCAAACTTGCTACT

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 4

CO CL2175Contig1 1159 4 21 U
AGAGGAAGTATTTAATTTTCTATAATAAAACAAAGATTAGAAGAAGTTAATGGGAGGAGA
GAGAACGAACACACTGAAAAAATGTCTTCTTGATTACAAAAGGATGGAAATTCTAAGTCT
TATGATAAACCGTAATTAACAATTCTCTAACGCAACTAAAGTTCAAGATTCAACCAAAGG
TGAACTGACGACGACAAGACAAGAGAGAAGACTGAATGTCCTTTCCGACACAATTTGATT
TTTCTTTTTTTTTTTTTCATGTCTTTTTGGTTTGTCCGAGCTACTTTTGAGACTTTTGTG
GGGGTGGGTTTGTTTTTTCAATTCAACGTGATCATGTCCTCTTCATGATGTATCCCAAGA
TTAAACCGATTAATCCCACCAAAAAAACGTACATGAACGGGATTCCACCACCACTCTGAC
TCCTCTTGCTTTCACGCTTCAACTGCTCCAATTCTTGTTGAAGTTTCTTGTTCAGTTGAA
GCGCAAAGTTCTTTTCCTCGGTGAGCCTTGCGACGAGAGCTCTCGCCTCAGATGAGTTTT
CCTGAGGTTCAAGCCTGTCCACGCTAAATCTTGCAGCAGCAGTAAAATCAGAAACGTTGG
CACTGTCCGAGACAGAAGCTCTAGGAGAAGAGCCCTCTTCCGATCCTTCACGAACGGGTG
ATGGTGGCCGTGGTGGATCGACATAGACAACTCTCAATTTAGTCTCCTCAACTCGATGCC
CTGCCTCTTTGCTAAACATCTCAGGAGTAACTTCCTTGGCAGTAGCTCCGGGACTGGCGA
TAACACACTGAAGCAAGAACTTGTCCTTGCACTGCATATCAGCAGGAGCTTCCTTTTGCG
CTTGCATCGTCACTAGAACTTCAGAAGAGGATCTCGGAAGAACAACACCAGTGTTAGGCC
TCACACAATACTTCCTCGGATTCGTCGTTTTAACCTTGAAGGCAACATAATCGTCGGTTT
TGTTAGCCAGATAGAGAGACGAAGAGATCTGCTTCTTCAATTCAAAAGGGAATTGAAGGT
CGATAGGATCGATGTCGAGAAGCTCGTTACTCATCCTGATAAGATCTACGACGGAATTTG
ACTCTCCGGTGGAGTTAGAGCGTTGTTCGTCGTCGTCGTTGTCGATCGAGGACAGAGATT
CACGGAGAGAGAGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI44JQB U 1
AF RR2FE72JQ U 76
AF RR2GI44TF C 544
AF RR2FE72TF C 386
BS 1 115 RR2GI44JQB
BS 116 116 RR2FE72JQ
BS 117 227 RR2GI44JQB
BS 228 228 RR2FE72JQ
BS 229 243 RR2GI44JQB
BS 244 244 RR2FE72JQ
BS 245 291 RR2GI44JQB
BS 292 292 RR2FE72JQ
BS 293 513 RR2GI44JQB
BS 514 702 RR2FE72JQ
BS 703 763 RR2FE72TF
BS 764 764 RR2GI44TF
BS 765 914 RR2FE72TF
BS 915 915 RR2GI44TF
BS 916 943 RR2FE72TF
BS 944 944 RR2GI44TF
BS 945 951 RR2FE72TF
BS 952 952 RR2GI44TF
BS 953 1061 RR2FE72TF
BS 1062 1062 RR2GI44TF
BS 1063 1159 RR2FE72TF

RD RR2GI44JQB 513 0 0
AGAGGAAGTATTTAATTTTCTATAATAAAACAAAGATTAGAAGAAGTTAATGGGAGGAGA
GAGAACGAACACACTGAAAAAATGTCTTCTTGATTACAAAAGGATGGAAATTCTAGGTCT
TATGATAAACCGTAATTAACAATTCTCTAACGCAACTAAAGTTCAAGATTCAACCAAAGG
TGAACTGACGACGACAAGACAAGAGAGAAGACTGAATGTCCTTTCCGGCACAATTTGATT
TTTTTTTTTTTTTTTTTCATGTCTTTTTGGTTTGTCCGAGCTACTTTTGAGGCTTTTGTG
GGGGTGGGTTTGTTTTTTCAATTCAACGTGATCATGTCCTCTTCATGATGTATCCCAAGA
TTAAACCGATTAATCCCACCAAAAAAACGTACATGAACGGGATTCCACCACCACTCTGAC
TCCTCTTGCTTTCACGCTTCAACTGCTCCAATTCTTGTTGAAGTTTCTTGTTCAGTTGAA
GCGCAAAGTTCTTTTCCTCGGTGAGCCTTGCGA

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2FE72JQ 627 0 0
GAAAAAATGTCTTCTTGATTACAAAATGATGGAAATTCTAAGTCTTATGATAAACCGTAA
TTAACAATTCTCTAACGCAACTAAAGTTCAAGATTCAACCAAAGGTGAATTGACGACGAC
AAGACAAGAGAGAAGACTGAATGTCCTTTCCGACACAATTTGATTTTTCTTTTTTTTTT*
**CATGTCTTTTTGGTTTGTCCGAGCTACTTTTGAGACTTT*GTGGGGGTGGGTTTGTTT
TTTCAATTCAACGTGATCATGTCCTCTTCATGATGTATCCCAAGATTAGACCGATTAATC
CCACCAGAAGAACGTACATGAACGGGATTCCACCACCACTCTGACTCCTCTTGCTTTCAC
GCTTCAACTGCTCCAATTCTTGTTGAAGTTTCTTGTTCAGTTGAAGCGCAAAGTTCTTTT
CCTCGGTGAGCCTTGCGACGAGAGCTCTCGCCTCAGATGAGTTTTCCTGAGGTTCAAGCC
TGTCCACGCTAAATCTTGCAGCAGCAGTAAAATCAGAAACGTTGGCACTGTCCGAGACAG
AAGCTCTAGGAGAAGAGCCCTCTTCCGATCCTTCACGAACGGGTGATGGTGGCCGTGGTG
GATCGACATAGACAACTCTCAATTTAG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2GI44TF 569 0 0
GAGGTTCAAGCCTGTCCACGATAAATCTTGGAGCAGCAGTAAAATCAGAAACGTCGGCAC
TGTCCGAGACAGAAGCTCTAGGAGAAGACCCCTCTTCCGATCCTTCACGAACGGGTGATG
GTGGCCGTGGTGGATCGACATAGACAACTCTCAATTTAGTCTCCTCAACTCGATGCCCTG
CCTCTTTGCTAAACATCTCAGGAGTAACTTCCTTGGCAGTAGCTCCGGGACTGGCGATAA
CACACTGAAGCAAGAACTTGTCCTTGCACTGCATATCAGCAGGAGCTTCCTTTTGCGCTT
GCATCGTCACTAGAACTTCAGAAGAGGATCTCGGAAGAACAACACCAGTGTTAGGCCTCA
CACAATACTTCCTCGGATTCGTCGTTTTAACCTTGAAGGCAACATAATCGTCGGTTTTGT
TAGCCAGATAGAGAGACGAAGAGATCTGCTTCTTCAATTCAAAAGGGAATTGAAGGTCGA
TAGGATCGATGTCGAGAAGCTCGTTGCTCATCCTGATAAGATCTACGACGGAATTTTGTT
CTCCGGTGGAGTTAGAG
AGCGTTGCTCCC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2FE72TF 774 0 0
AACGTACATGAACGG*ATTCCACCACCACTCTGACTCCTCTTGCTTTCACGCTTCAACTG
CTCCAATTCTTGTTGAAGTTTCTTGTTCAGTTGAAGCGCAGAGTTCTTTTCCTCGGTGAG
CCTTGCGACGAGAGCTCTCGCCTCAGATGAGTTTTCGTGAGGTTCAAGCCTGTCCACGCT
AAATCTTGCAGCAGCAGTAAAATCAGAAACGTTGGCACTGTCCGAGACAGAAGCTCTAGG
AGAAGAGCCCTCTTCCGATCCTTCACGAACGGGTGATGGTGGCCGTGGTGGATCGACATA
GACAACTCTCAATTTAGTCTCCTCAACTCGATGCCCTGCCTCTTTGCTAAACATCTCAGG
AGTAACTTCCTTGGCAGTGGCTCCGGGACTGGCGATAACACACTGAAGCAAGAACTTGTC
CTTGCACTGCATATCAGCAGGAGCTTCCTTTTGCGCTTGCATCGTCACTAGAACTTCAGA
AGAGGATCTCGGAAGAACAACACCAGTGTTAGGCCTCACACAATACTTCTTCGGATTCGT
CGTTTTAACCTTGAAGGCGACATAATTGTCGGTTTTGTTAGCCAGATAGAGAGACGAAGA
GATCTGCTTCTTCAATTCAAAAGGGAATTGAAGGTCGATAGGATCGATGTCGAGAAGCTC
GTTACTCATCCTGATAGGATCTACGACGGAATTTGACTCTCCGGTGGAGTTAGAGCGTTG
TTCGTCGTCGTCGTTGTCGATCGAGGACAGAGATTCACGGAGAGAGAGTTTTCC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 4

CO CL2176Contig1 563 4 8 U
CCTACACACCACGAAAATTAGCGCTCGATTTGAATTTAAATTTCATTTGTTTGTAAACAA
CAAAACAAGAAATATCATCTTTTTCAAATGAAAAAAACAACAACAAATATCATCAGTAAC
ACCAACAGAAGTAGCAGCTAAGAAACAGCACGCAGCAAGTCTTACAAAAGGTGTGTATAC
AAATAATATGGAAGTCCTCTTCACGGTTCTCTTTATTTGAACATCTGACTGAGACTGAAA
ATAAAACAGAGACGACCAGGTTTTCTTCATGATCTTCAAATGTTCCACTAGACCTAGTGA
TGGTCACCGTGACCATGATCACCATGGCCATCCCAGGGGTGCCTCCATCCCATGACTACA
GGACCGTCTTGCTTTGCTCTGTACAGAATCCAGAACCACATGACGCCGCACAAGCCCTTT
CCGGCGACGGTGTGCCACGTCTTCGGAGTTTGTACGGTGACTCCCTTGTATGTTATTCCT
CCTCCTCCACCCATTTTCTCAAATTCGCTACTGCAATTTCAACTCCTTCTCCTACCTGAG
ATTTCGATGCAACAACCATGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FH72JQ U 1
AF RR2FH72TF C 1
AF RR2EX82JQ U 55
AF RR2EX82TF C 55
BS 1 141 RR2FH72JQ
BS 142 142 RR2EX82JQ
BS 143 233 RR2FH72JQ
BS 234 234 RR2EX82JQ
BS 235 392 RR2FH72JQ
BS 393 393 RR2EX82JQ
BS 394 514 RR2FH72JQ
BS 515 563 RR2EX82JQ

RD RR2FH72JQ 516 0 0
CCTACACACCACGAAAATTAGCGCTCGATTTGAATTTAAATTTCATTTGTTTGTAAACAA
CAAAACAAGAAATATCATCTTTTTCAAATGAAAAAAACAACAACAAATATCATCAGTAAC
ACCAACAGAAGTAGCAGCTAAAAAACAGCACGCAGCAAGTCTTACAAAAGGTGTGTATAC
AAATAATATGGAAGTCCTCTTCACGGTTCTCTTTATTTGAACATCTGACTGAGGCTGAAA
ATAAAACAGAGACGACCAGGTTTTCTTCATGATCTTCAAATGTTCCACTAGACCTAGTGA
TGGTCACCGTGACCATGATCACCATGGCCATCCCAGGGGTGCCTCCATCCCATGACTACA
GGACCGTCTTGCTTTGCTCTGTACAGAATCCAAAACCACATGACGCCGCACAAGCCCTTT
CCGGCGACGGTGTGCCACGTCTTCGGAGTTTGTACGGTGACTCCCTTGTATGTTATTCCT
CCTCCTCCACCCATTTTCTCAAATTCGCTACTGC
CC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2FH72TF 516 0 0
CCTACACACCACGAAAATTAGCGCTCGATTTGAATTTAAATTTCATTTGTTTGTAAACAA
CAAAACAAGAAATATCATCTTTTTCAAATGAAAAAAACAACAACAAATATCATCAGTAAC
ACCAACAGAAGTAGCAGCTAAGAAACAGCACGCAGCAAGTCTTACAAAAGGTGTGTATAC
AAATAATATGGAAGTCCTCTTCACGGTTCTCTTTATTTGAACATCTGACTGAGGCTGAAA
ATAAAACAGAGACGACCAGGTTTTCTTCATGATCTTCAAATGTTCCACTAGACCTAGTGA
TGGTCACCGTGACCATGATCACCATGGCCATCCCAGGGGTGCCTCCATCCCATGACTACA
GGACCGTCTTGCTTTGCTCTGTACAGAATCCAGAACCACATGACGCCGCACAAGCCCTTT
CCGGCGACGGTGTGCCACGTCTTCGGAGTTTGTACGGTGACTCCCTTGTATGTTATTCCT
CCTCCTCCACCCATTTTCTCAAATTCGCTACTGC
CC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2EX82JQ 509 0 0
AAACAACAAAACAAGAAATATCATCTTTTTCAAATGAAAAAACCA*CAACAAATATCATC
AGTAACACCAACAGAAGTAGCAGCTAAGAAACAGCACGCAGCAAGTCTTACAAAAGGTGT
GTATACAAATAATATGGAAGTCTTCTTCACGGTTCTCTTTATTTGAACATCTGACTGAGA
CTGAAAATAAAACAGAGACGACCAGGTTTTCTTCATGATCTTCAAATGTTCCACTAGACC
TAGTGATGGTCACCGTGACCATGATCACCATGGCCATCCCAGGGGTGCCTCCATCCCATG
ACTACAGGACCGTCTTGCTTTGCTCTGTACAGAATCCAGAACCACATGACGCCGCACAAG
CCCTTTCCGGCGACGGTGTGCCGCGTCTTCGGAGTTTGTACGGTGACTCCCTTGTATGTT
ATTCCTCCTCCTCCACCCATTTTCTCAAATTCGCTACTGCAATTTCAACTCCTTCTCCTA
CCTGAGATTTCGATGCAACAACCATGTCC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2EX82TF 509 0 0
AAACAACAAAACAAGAAATATCATCTTTTTCAAATGAAAAAACCA*CAACAAATATCATC
AGTAACACCAACAGAAGTAGCAGCTAAGAAACAGCACGCAGCAAGTCTTACAAAAGGTGT
GTATACAAATAATATGGAAGTCTTCTTCACGGTTCTCTTTATTTGAACATCTGACTGAGA
CTGAAAATAAAACAGAGACGACCAGGTTTTCTTCATGATCTTCAAATGTTCCACTAGACC
TAGTGATGGTCACCGTGACCATGATCACCATGGCCATCCCAGGGGTGCCTCCATCCCATG
ACTACAGGACCGTCTTGCTTTGCTCTGTACAGAATCCAGAACCACATGACGCCGCACAAG
CCCTTTCCGGCGACGGTGTGCCGCGTCTTCGGAGTTTGTACGGTGACTCCCTTGTATGTT
ATTCCTCCTCCTCCACCCATTTTCTCAAATTCGCTACTGCAATTTCAACTCCTTCTCCTA
CCTGAGATTTCGATGCAACAACCATGTCC

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 4

CO CL2177Contig1 1021 4 8 U
GGAAACCAAACCTAGAAGAAGAATCCTCCGAAAATGTCGTTGACAACCGTCTTTCGCCGA
GGCTCGTCTAGAGTGGCTACTCTCGCCTTCCGTTCAGTTAGATCTCCGGTTAGCGTCCAC
AGTAGCTCCGAGAGGCTGATTCTTGGTAGCCAGCAACAGTTCAACCGCGCATCGGTGATT
CCTTTCTCGAGATTTTACTCGACGGAAAGTGCGGTCACGAAAACAACCGCGGACGAGAAT
CTGGTGAGCGTTCTCGAATCTGAAATCGATTGCGCCGTTAAGGAGGAGGCCCCTGATCAG
GACGTCATGGAAGAGATGCCAGAAGGGTTTCCTTTCAAGATCATTGATACTCCTGGTGAA
CGAACCGTCTTGCTTCAAAGGAATTTTGAGGATGAAACTATCCAAGTCGAAGTTGACTCC
TCTTCACCTTATGACGATGATGATGAAGATGAACAAGAACAAGCTGAACAGAACGATGAT
GAAGAAGATGATGAACACTCTGTTAAAATCCGGATTCCCATGGTTGTCAGTGTCTCCAAA
GGTGATGGTGTCTGCCTTGAGTTTGGAGTCAGCGCTTTCCCTGATGAGATCGTCATTGAT
AGTTTATCCATCAAACATCCTCAAGGTTCTGACAATGACCTTGCTTATGAAGGACCCGAC
TTTGATGACTTGGATGAGAACCTGCAGAAGGCTTTCCACAGGTTCCTCGAGATCAGAGGG
ATCAAGCCCAGCTTCACTGACTTTCTCGCTGGTTATGTCGCCAACAAAGACAGCAGGGAG
TATCTTCAATGGCTTAAGGACGTCAAGTCCTTTGTTGAGAACTGATTACTCACTCTTTCT
TTCCATCAATAATAAGAGTCAAAGGTTTTTTTTCTTTACTTCAAAATGTTTTGAATTTAT
TTCAGATGAACCTGTTCTCATCTTGGTGGTCCATGATGATACATAAAATTCGTTGAAATG
AGTTGTTGCCTTATTGGATACGTCTACAATTTCATTTCTGATTAATATCTCTGTTCAAAT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2EO38TF U 102
AF RR2B258TF U 1
AF RR2EO38JQ C 439
AF RR2B258JQ C 262
BS 1 118 RR2B258TF
BS 119 119 RR2EO38TF
BS 120 155 RR2B258TF
BS 156 156 RR2EO38TF
BS 157 771 RR2B258TF
BS 772 781 RR2B258JQ
BS 782 782 RR2EO38JQ
BS 783 1021 RR2B258JQ

RD RR2EO38TF 301 0 0
ATCTCCGGTTAGCGTCCACAGTAGCTCCGAGAGGCTGATTCTTGGTAGCCAGCAACAGTT
CAACCGCGCATCGGTGATTCCTTTCTCGAGATTTTACTCGACGGAAAGTGCGGTCACTAA
AACAACCGCGGACGAGAATCTGGTGAGCGTTCTCGAATCTGAAATCGATTGCGCCGTTAA
GGAGGAGGCCCCTGATCAGGACGTCATGGAAGAGATGCCAGAAGGGCTTCCTTTCAAGAT
CATTGATACTCCTGGTGAACGAACCGTCTTGCTTCAAAGGAATTTTGAGGATGAAACTAT
C

QA 1 301 1 301
DS 

RD RR2B258TF 771 0 0
GGAAACCAAACCTAGAAGAAGAATCCTCCGAAAATGTCGTTGACAACCGTCTTTCGCCGA
GGCTCGTCTAGAGTGGCTACTCTCGCCTTCCGTTCAGTTAGATCTCCGGTTAGCGTCCGC
AGTAGCTCCGAGAGGCTGATTCTTGGTAGCCAGCAGCAGTTCAACCGCGCATCGGTGATT
CCTTTCTCGAGATTTTACTCGACGGAAAGTGCGGTCACGAAAACAACCGCGGACGAGAAT
CTGGTGAGCGTTCTCGAATCTGAAATCGATTGCGCCGTTAAGGAGGAGGCCCCTGATCAG
GACGTCATGGAAGAGATGCCAGAAGGGTTTCCTTTCAAGATCATTGATACTCCTGGTGAA
CGAACCGTCTTGCTTCAAAGGAATTTTGAGGATGAAACTATCCAAGTCGAAGTTGACTCC
TCTTCACCTTATGACGATGATGATGAAGATGAACAAGAACAAGCTGAACAGAACGATGAT
GAAGAAGATGATGAACACTCTGTTAAAATCCGGATTCCCATGGTTGTCAGTGTCTCCAAA
GGTGATGGTGTCTGCCTTGAGTTTGGAGTCAGCGCTTTCCCTGATGAGATCGTCATTGAT
AGTTTATCCATCAAACATCCTCAAGGTTCTGACAATGACCTTGCTTATGAAGGACCCGAC
TTTGATGACTTGGATGAGAACCTGCAGAAGGCTTTCCACAGGTTCCTCGAGATCAGAGGG
ATCAAGCCCAGCTTCACTGACTTTCTCGCTGGTTATGTCGCCAACAAAGAC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2EO38JQ 350 0 0
GATGAGGAAGATGAACAAGAACAAGCTGAACAGAACGATGATGAAGAAGATGATGAACAC
TCTGTTAAAATCCGGATTCCCATGGTTGTCAGTGTCTCCAAAGGTGATGGTGTCTGTCTT
GAGTTTGGAGTCAGCGCTTTCCCTGATGAGATCGTCATTGATAGTTTATCCATCAAACAT
CCTCAAGGTTCTGACAATGACCTTGCTTATGAAGGACCCGACTTTGATGACTTGGATGAG
AACCTGCAGAAGGCTTTCCACAGGTTCCTCGAGATCAGAGGGATCAAGCCCAGCTTCACT
GACTTTCTCGCTGGTTATGTCGCCAACAAAGACAGCAGGGAGTATCTTCA

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR2B258JQ 760 0 0
GAAATCGATTGCGCCGTTAAGGAGGAGGCCCCTGATCAGGACGTCATGGAAGAGATGCCA
GAAGGGTTTCCTTTCAAGATCATTGATACTCCTGGTGAACGAACCGTCTTGCTTCAAAGG
AATTTTGAGGATGAAACTATCCAAGTCGAAGTTGACTCCTCTTCACCTTATGACGATGAT
GATGAAGATGAACAAGAACAAGCTGAACAGAACGATGATGAAGAAGATGATGAACACTCT
GTTAAAATCCGGATTCCCATGGTTGTCAGTGTCTCCAAAGGTGATGGTGTCTGCCTTGAG
TTTGGAGTCAGCGCTTTCCCTGATGAGATCGTCATTGATAGTTTATCCATCAAACATCCT
CAAGGTTCTGACAATGACCTTGCTTATGAAGGACCCGACTTTGATGACTTGGATGAGAAC
CTGCAGAAGGCTTTCCACAGGTTCCTCGAGATCAGAGGGATCAAGCCCAGCTTCACTGAC
TTTCTCGCTGGTTATGTCGCCAACAAAGACAGCAGGGAGTGTCTTCAATGGCTTAAGGAC
GTCAAGTCCTTTGTTGAGAACTGATTACTCACTCTTTCTTTCCATCAATAATAAGAGTCA
AAGGTTTTTTTTCTTTACTTCAAAATGTTTTGAATTTATTTCAGATGAACCTGTTCTCAT
CTTGGTGGTCCATGATGATACATAAAATTCGTTGAAATGAGTTGTTGCCTTATTGGATAC
GTCTACAATTTCATTTCTGATTAATATCTCTGTTCAAATC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 2 4

CO CL2178Contig1 857 2 3 U
AAAAGTCAGAACCTTTCATCTTTAAACACACAAACGCAATAATGTGACACGCATAGCAAA
TTGAAACTGTTAAAACCCATTAACGGGCAAGTAGTAAACAAAGAGTAGCTACGATGCAAT
AAGGAAAAGTTTACAAGTAACAAACGCATAAGATAAGTACCAACATAAGTAGTAGAAGGG
AAGCAAAGCAAATCAATCATCAGCTCCATCAGTCTTTCCAGCACCAAAAGGGTCATGATT
GGGACCCAACTCTTCTCCCATATGTCGCTGCACAAGCCTCGAAAGAACAGCCATAACCTT
AGCCTCGCGCTTAGCCTTCTCCTCGTAGTTAAACATAGCCAACGCCCGCCTGTCTTCAGC
ACTGTAAACCTGGTTCTCCTTCCTGATACGAATAGCATTCATACTCTGATGCCTACTCCC
ACTCATCACATACCCAAGATCCTCGAACCTCTGAATCTCATCAGCGTTAAGACCCACTTC
TCCTCTACGCGGGATACGTTTCCCTTGCTGAACGTACTGCGCTATAGCGTCTCCTTCACC
GGGTCTTAACGCACCTCCGTAGCTGATGTGTCCTTCGGCTTTAGGCAACGGCATTGGACC
CACCTCAGCTTCCTCTTCATCTTCTGCTCCTGCAGAAGCTTTCTTCTTTGATTCAATCAT
CTCCTTGAACTTCTTCATCTCCTCTTCATCAAGCTCAGGCTCCTTCACCGCTTCTTCTAC
ATCAATGTTCTTCCCCTTTGATTTGCTACGTTCTTCTTCCCCAGAAGAGCACTAATCTCA
GATTCTTCATCACTGCTCTCATCAGATCACTGTACCTCCTCTTCCTCCTATGACCTCTCC
TCTTCCTACTACTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA44JQ U 248
AF RR2F238JQ U 1
BS 1 286 RR2F238JQ
BS 287 287 RR2AA44JQ
BS 288 857 RR2F238JQ

RD RR2AA44JQ 525 0 0
AACTCTTCTCCCATATGTCGCTGCACAAGCCTCGAAAGAACAGCCATAACCTTAGCCTCG
CGCTTAGCCTTCTCCTCGTAGTTAAACATAGCCAACGCCCGCTTGTCTTCAGCACTGTAA
ACCTGGTTCTCCTTCCTGATACGAATAGCATTCATCCTCTGATGCCTACTCCCACTCATC
ACATACCCAAGATCCTCGAACCTCTGAATCTCATCAGCGTTAAGACCCACTTCTCCTCTA
CGCGGGATACGTTTCCCTTGCTGAACGTACTGCGCTATAGCGTCTCCTTCACCGGGTCTT
AACGCACCTCCGTAGCTGATGTGTCCTTCGGCTTTAGGCAACGGCATTGGACCCACCTCA
GCTTCCTCTTCATCTTCTGCTCCTGCAGAAGCTTTCTTCTTTGATTCAATCATCTCCTTG
AACTTCTTCATCTCCTCTTCATCAAGCTCAGGCTCCTTCACCGCTTCTTCTACATCAATG
TTCTTCCCCTTTGATTTGCTACGTTCTTCTTCCCCAGAAGA
AGAA

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2F238JQ 857 0 0
AAAAGTCAGAACCTTTCATCTTTAAACACACAAACGCAATAATGTGACACGCATAGCAAA
TTGAAACTGTTAAAACCCATTAACGGGCAAGTAGTAAACAAAGAGTAGCTACGATGCAAT
AAGGAAAAGTTTACAAGTAACAAACGCATAAGATAAGTACCAACATAAGTAGTAGAAGGG
AAGCAAAGCAAATCAATCATCAGCTCCATCAGTCTTTCCAGCACCAAAAGGGTCATGATT
GGGACCCAACTCTTCTCCCATATGTCGCTGCACAAGCCTCGAAAGATCAGCCATAACCTT
AGCCTCGCGCTTAGCCTTCTCCTCGTAGTTAAACATAGCCAACGCCCGCCTGTCTTCAGC
ACTGTAAACCTGGTTCTCCTTCCTGATACGAATAGCATTCATACTCTGATGCCTACTCCC
ACTCATCACATACCCAAGATCCTCGAACCTCTGAATCTCATCAGCGTTAAGACCCACTTC
TCCTCTACGCGGGATACGTTTCCCTTGCTGAACGTACTGCGCTATAGCGTCTCCTTCACC
GGGTCTTAACGCACCTCCGTAGCTGATGTGTCCTTCGGCTTTAGGCAACGGCATTGGACC
CACCTCAGCTTCCTCTTCATCTTCTGCTCCTGCAGAAGCTTTCTTCTTTGATTCAATCAT
CTCCTTGAACTTCTTCATCTCCTCTTCATCAAGCTCAGGCTCCTTCACCGCTTCTTCTAC
ATCAATGTTCTTCCCCTTTGATTTGCTACGTTCTTCTTCCCCAGAAGAGCACTAATCTCA
GATTCTTCATCACTGCTCTCATCAGATCACTGTACCTCCTCTTCCTCCTATGACCTCTCC
TCTTCCTACTACTTCTG

QA 1 857 1 857
DS 



CO CL2178Contig2 885 2 16 U
CGTCGTCGTCGTCCAGCGTTAACTTTAGGGATTGAAGATGACGATGAACTCGCTTCCAAG
GCGATTTGGGAAGAATCAAGGATACCTAGATCGTGATCATCGCAGAGGGAGGAGGTCCGA
GTCAGACTCCGACGAAGACTTGAAAGGATTGAGTCACGAGGAGTACAGGAGGCTTAAACG
CCTCAAGATGAGGAAATCTGGCAAGTACTGCATCTGGGAGAACACGCCGAGTCCGCCTAG
AGATCCCAACGAGGAAGAGTCCGATGAAAACGGAGCTGACGACGAGGAGGTTCCGGAGAA
GGATGTCGATGATCCAAAACAACGGAAAGGCGAATCTGATTCGGGTAAGTCGGGATCCGA
ATCTGATAGATCTAGGAAGAAGAGGAAGAGTAAGAGCTCTAGGAGTAAGCGTAGGAGAAG
GAGTAGTGATAGCGAATCGGAAGAGGAGAGCGAGAGTGATGATTCGGATGAGGAAGATAG
GAGGCGTAGAAGAAGGAACAAGAAGAAGAAAAGCAGAAGTAGTAGGAAGAGGAGAGGTCA
TAGGAGGAAGAGGAGGTACAGTGATTCTGATGAGAGCAGTGATGAAGAATCTGAGATTAG
TGCTTCTTCTGGGGAAGAAGAACGTAGCAAATCAAAGGGGAAGAACATTGATGTAGAAGA
AGCGGTGAAGGAGCCTGAGCTTGATGAAGAGGAGATGAAGAAGTTCAAGGAGATGATTGA
ATCAAAGAAGAAAGCTTCTGCAGGAGCAGAAGATGAAGAGGAAGCTGAGGTGGGTCCAAT
GCCGTTGCCTAAAGCCGAAGGACACATCAGCTACGGAGGTGCGTTAAGACCCGGTGAAGG
AGACGCTATAGCGCAGTACGTTCAGCAAGGGAAACGTATCCCGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F238TF U 1
AF RR2AA44TF U 352
BS 1 396 RR2F238TF
BS 397 397 RR2AA44TF
BS 398 450 RR2F238TF
BS 451 451 RR2AA44TF
BS 452 498 RR2F238TF
BS 499 499 RR2AA44TF
BS 500 670 RR2F238TF
BS 671 671 RR2AA44TF
BS 672 720 RR2F238TF
BS 721 721 RR2AA44TF
BS 722 725 RR2F238TF
BS 726 726 RR2AA44TF
BS 727 743 RR2F238TF
BS 744 744 RR2AA44TF
BS 745 762 RR2F238TF
BS 763 885 RR2AA44TF

RD RR2F238TF 776 0 0
CGTCGTCGTCGTCCAGCGTTAACTTTAGGGATTGAAGATGACGATGAACTCGCTTCCAAG
GCGATTTGGGAAGAATCAAGGATACCTAGATCGTGATCATCGCAGAGGGAGGAGGTCCGA
GTCAGACTCCGACGAAGACTTGAAAGGATTGAGTCACGAGGAGTACAGGAGGCTTAAACG
CCTCAAGATGAGGAAATCTGGCAAGTACTGCATCTGGGAGAACACGCCGAGTCCGCCTAG
AGATCCCAACGAGGAAGAGTCCGATGAAAACGGAGCTGACGACGAGGAGGTTCCGGAGAA
GGATGTCGATGATCCAAAACAACGGAAAGGCGAATCTGATTCGGGTAAGTCGGGATCCGA
ATCTGATAGATCTAGGAAGAAGAGGAAGAGTAAGAGGTCTAGGAGTAAGCGTAGGAGAAG
GAGTAGTGATAGCGAATCGGAAGAGGAGAGTGAGAGTGATGATTCGGATGAGGAAGATAG
GAGGCGTAGAAGAAGGAATAAGAAGAAGAAAAGCAGAAGTAGTAGGAAGAGGAGAGGTCA
TAGGAGGAAGAGGAGGTACAGTGATTCTGATGAGAGCAGTGATGAAGAATCTGAGATTAG
TGCTTCTTCTGGGGAAGAAGAACGTAGCAAATCAAAGGGGAAGAACATTGATGTAGAAGA
AGCGGTGAAG*AGCCTGAGCTTGATGAAGAGGAGATGAAGAAGTTCAAGGAGATGATTGA
*TCAA*GAAGAAAGCTTCTGCAG*AGCAGAAGATGAAGAGGA
GCTGAGTGGGTCCA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2AA44TF 534 0 0
GGGATCTGAATCTGATAGATCTAGGAAGAAGAGGAAGAGTAAGAGCTCTAGGAGTAAGCG
TAGGAGAAGGAGTAGTGATAGCGAATCGGAAGAGGAGAGCGAGAGTGATGATTCGGATGA
GGAAGATAGGAGGCGTAGAAGAAGGAACAAGAAGAAGAAAAGCAGAAGTAGTAGGAAGAG
GAGAGGTCATAGGAGGAAGAGGGGGTACAGTGATTCTGATGAGAGCAGTGATGAAGAATC
TGAGATTT***CTTCTTCTGGGGAAGAAGAACGTAGCAAATCAAAGGGGAAGAACATTGA
TGTAGAAGAAGCGGTGAAGGAGCCTGAGCTTGATGAAGAGGAGATGAAGAAGTTCAAGGA
GATGATTGAATCAAAGAAGAAAGCTTCTGCAGGAGCAGAAGATGAAGAGGAAGCTGAGGT
GGGTCCAATGCCGTTGCCTAAAGCCGAAGGACACATCAGCTACGGAGGTGCGTTAAGACC
CGGTGAAGGAGACGCTATAGCGCAGTACGTTCAGCAAGGGAAACGTATCCCGCG

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 2

CO CL2179Contig1 783 2 20 U
GAAAAAATTCGAAACATTGTATGAAAATTCATAACTTTAAATTTGGCAGTACATGATGAA
AAAGACAAGTAAAATAGCATATGAGAAAATAGACAAAAGTAAACAAAATTATCACTGATC
AGTTTTCAAGTTTTTCTTGCGCTGCTTGATTCGCTCAACACTTTCATTCTTCTTCTTCTG
CCCCATCTTCATGGCATCGTAAAGCTTCCTCTTGTTACGTGACATCATCAATGTCGGCAT
ATCAGCAGTATCTTGAGCAATTTGAGCTGCATCAGGAACTGATTCTTCACCCTCACCTTC
TTCCACCATAGGTGCTGCTGCTGCTGCTACATCATCAACTGCACTTCCCGTCACTTCCTT
TTTCAGCTCATCATGGTACTGCTTCTCCAGCTGTGCCATCTTCTTCTTGGTTTTAGCAGC
TTCAGCTTCCTCAGCGCGGCTCATAACACCAGCGTACAACAAGTTCTGAGGATCTTCGAG
ATCTTCTTTGCCAACACCTGGCAAAGGAAGGACATCGTTCCTGGCTGCTGCTTGTAGCCT
CTTAATGGTTTCAGCATAATCAGGAACGTATCCTTCTGCTTCGTTGTCCACAAATGGTGA
CAAGTGAGGCGGTGGAATCCTTCCGACCAGATACTTTTCCGTTGGTAAGATTATGCGGGC
GTTCACACAGTCATAGATCCACTGCGGTTGAACATACTCCCTTGATAGATACATATGACC
AGCGCTTGGCTTATCAATGATATGATGTGTGATACTCTCATCATCCTCCTTGAAAGCGCA
CCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2FS59JQ U 1
AF RR2ER41JQ U 29
BS 1 80 RR2FS59JQ
BS 81 81 RR2ER41JQ
BS 82 97 RR2FS59JQ
BS 98 98 RR2ER41JQ
BS 99 128 RR2FS59JQ
BS 129 129 RR2ER41JQ
BS 130 201 RR2FS59JQ
BS 202 202 RR2ER41JQ
BS 203 216 RR2FS59JQ
BS 217 217 RR2ER41JQ
BS 218 324 RR2FS59JQ
BS 325 327 RR2ER41JQ
BS 328 456 RR2FS59JQ
BS 457 457 RR2ER41JQ
BS 458 504 RR2FS59JQ
BS 505 505 RR2ER41JQ
BS 506 552 RR2FS59JQ
BS 553 553 RR2ER41JQ
BS 554 616 RR2FS59JQ
BS 617 783 RR2ER41JQ

RD RR2FS59JQ 616 0 0
GAAAAAATTCGAAACATTGTATGAAAATTCATAACTTTAAATTTGGCAGTACATGATGAA
AAAGACAAGTAAAATAGCAT*TGAGAAAATAGACAAA*GTAAACAAAATTATCACTGATC
AGTTTTCAGGTTTTTCTTGCGCTGCTTGATTCGCTCAACACTTTCATTCTTCTTCTTCTG
CCCCATCTTCATGGCATCGTAGAGCTTCCTCTTGTTGCGTGACATCATCAATGTCGGCAT
ATCAGCAGTATCTTGAGCAATTTGAGCTGCATCAGGAACTGATTCTTCACCCTCACCTTC
TTCCACCATAGGTGCTGCTGCTGC***TACATCATCAACTGCACTTCCCGTCACTTCCTT
TTTCAGCTCATCATGGTACTGCTTCTCCAGCTGTGCCATCTTCTTCTTGGTTTTAGCAGC
TTCAGCTTCCTCAGCGCGGCTCATAACACCAGCGTATAACAAGTTCTGAGGATCTTCGAG
ATCTTCTTTGCCAACACCTGGCAACGGAAGGACATCGTTCCTGGCTGCTGCTTGTAGCCT
CTTAATGGTTTCGGCATAATCAGGAACGTATCCTTCTGCTTCGTTGTCCACAAATGGTGA
CAAGTGAGGCGGTGGA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2ER41JQ 755 0 0
TCATAACTTTAAATTTGGCAGTACATGATGAAAAAGACAAGTAAAATGGCATATGGGAAA
ATAGACAAAAGTAAACAAAATTATCACTGATCAGTTTTCAAGTTTTTCTTGCGCTGCTTG
ATTCGCTCAACACTTTCATTCTTCTTCTTCTGCCCCATCTTCATGGCATCGTAAAGCTTC
CTCTTGTTACGTGACATCATCAATGTCGGCATATCAGCAGTATCTTGAGCAATTTGAGCT
GCATCAGGAACTGATTCTTCACCCTCACCTTCTTGCACCATAGGTGCTGCTGCTGCTGCT
ACATCATCAACTGCACTTCCCGTCACTTCCTTTTTCAGCTCTTCATGGTACTGCTTCTCC
AGCTGTGCCATCTTCTTCTTGGTTTTAGCAGCTTCAGCTTCCTCAGCGCGGCTCATAACA
CCAGCGTACAATAAGTTCTGAGGATCTTCGAGATCTTCTTTGCCAACACCTGGCAAAGGA
AGTACATCGTTTCTTGCTGCTGCTTGTAGCCTCTTAATGGTTTCAGCATAATCAGGAACG
TATCCTTCTGCTTCGTTGTCCACAAATGGTGACAAGTGAGGCGGTGGAATCCTTCCGACC
AGATACTTTTCCGTTGGTAAGATTATGCGGGCGTTCACACAGTCATAGATCCACTGCGGT
TGAACATACTCCCTTGATAGATACATATGACCAGCGCTTGGCTTATCAATGATATGATGT
GTGATACTCTCATCATCCTCCTTGAAAGCGCACCT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL2180Contig1 666 2 2 U
GGATCAAAACCCATTTCTCCTCTAATTATTTACCCTCTCCCTCATAAACGAACAGATAGC
AATATTAACTATCATATATAGAAGAAAAAAATATCGTATTGTATAGAATACTCATCAAAA
CCATAGAATATGCCTTTCAGGATCAAGCCCCTACCTCTCATCTTCCTCGTACTCATTTTT
TGCTCTTCATCACTAGCTATAGTGGAAGGCTCTATCCAACTGGGAGGCGCAAAGATGCAT
GAGAGTTTCATGCGTTACAAGAGTGAGGAGACGGAAGTGAACAAGATCATCATGAGCCAC
AGGAAGTTGATGTTCCACTCGACTGCGTATTACGACGACGCAGGACCCAACCCTAAGCAC
GATCCAAGAAGGAGGCCCGGAGGCAAGCCTTGAATCATTCAAGACACGATTATCGCTCTA
TATATATATAAGCACATGCATGAACGGGTATCTTTATATATGAATGTATGCAATCCTCCT
ATTCTGACTTTTGTTTGAGGATGAGATCAGTGTACAATACCCTTCAGAAACGCTTTGGTG
AAAGGAGATTAGTATACTAAATTACTAATTAATTATAATCACCTTGTTTTATTGACATGT
ATGTAGTAGCCTTTAATTCTCTGTGTACTTCGTTATATCGGATATTAAATAAAGAGAGTT
ATTGCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2CW49JQ C 1
AF RR2CW49TF U 1
BS 1 2 RR2CW49JQ
BS 3 666 RR2CW49TF

RD RR2CW49JQ 666 0 0
GGATCAAAACCCATTTCTCCTCTAATTATTTACCCTCTCCCTCATAAACGAACAGATAGC
AATATTAACTATCATATATAGAAGAAAAAAATATCGTATTGTATAGAATACTCATCAAAA
CCATAGAATATGCCTTTCAGGATCAAGCCCCTACCTCTCATCTTCCTCGTACTCATTTTT
TGCTCTTCATCACTAGCTATAGTGGAAGGCTCTATCCAACTGGGAGGCGCAAAGATGCAT
GAGAGTTTCATGCGTTACAAGAGTGAGGAGACGGAAGTGAACAAGATCATCATGAGCCAC
AGGAAGTTGATGTTCCACTCGACTGCGTATTACGACGACGCAGGACCCAACCCTAAGCAC
GATCCAAGAAGGAGGCCCGGAGGCAAGCCTTGAATCATTCAAGACACGATTATCGCTCTA
TATATATATAAGCACATGCATGAACGGGTATCTTTATATATGAATGTATGCAATCCTCCT
ATTCTGACTTTTGTTTGAGGATGAGATCAGTGTACAATACCCTTCAGAAACGCTTTGGTG
AAAGGAGATTAGTATACTAAATTACTAATTAATTATAATCACCTTGTTTTATTGACATGT
ATGTAGTAGCCTTTAATTCTCTGTGTACTTCGTTATATCGGATATTAAATAAAGAGAGTT
ATTGCC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2CW49TF 666 0 0
GG
ATCAAAACCCATTTCTCCTCTAATTATTTACCCTCTCCCTCATAAACGAACAGATAGCAA
TATTAACTATCATATATAGAAGAAAAAAATATCGTATTGTATAGAATACTCATCAAAACC
ATAGAATATGCCTTTCAGGATCAAGCCCCTACCTCTCATCTTCCTCGTACTCATTTTTTG
CTCTTCATCACTAGCTATAGTGGAAGGCTCTATCCAACTGGGAGGCGCAAAGATGCATGA
GAGTTTCATGCGTTACAAGAGTGAGGAGACGGAAGTGAACAAGATCATCATGAGCCACAG
GAAGTTGATGTTCCACTCGACTGCGTATTACGACGACGCAGGACCCAACCCTAAGCACGA
TCCAAGAAGGAGGCCCGGAGGCAAGCCTTGAATCATTCAAGACACGATTATCGCTCTATA
TATATATAAGCACATGCATGAACGGGTATCTTTATATATGAATGTATGCAATCCTCCTAT
TCTGACTTTTGTTTGAGGATGAGATCAGTGTACAATACCCTTCAGAAACGCTTTGGTGAA
AGGAGATTAGTATACTAAATTACTAATTAATTATAATCACCTTGTTTTATTGACATGTAT
GTAGTAGCCTTTAATTCTCTGTGTACTTCGTTATATCGGATATTAAATAAAGAGAGTTAT
TGCC

QA 3 666 3 666
DS 



AS 1 4

CO CL2181Contig1 955 4 4 U
GTATGGTTGAGTGCGATGATAGAACGGTTTAAATCCAAAATGCCGTAGAATTTGTATATT
GTCACACATATATAAAAGGAAAGTTGAATATGATAAAACGAATAATACAAGCCGTTACAC
CGTTTATTAGACCTAGCAACATATATGAAAGAATCTTGAACTTCAAACAAATTTATAGCT
ATAATTTTATTTTTCTTTTTGGTGGTGATCAGATATATATTGTTATCAAGGTCCAATGAA
CCTCTATTTTAATAAGTGTATATTTTGGTTGTTAAGACATTCGTTGGAATGTTGCCTATT
TTCAAACTAAGGCTCTGAATGGAAAAAACGGATTAAGGGTTACAGATCTAGCGGATCAAG
TGAAACGAGTAGAATAGGAGTGGATCTATCGAATCTAGTGGTACAAGTATAGATTAAACG
GATCTAGCGGTTCAAAACATATGTTTGAATGGTGGAAGTGGATAAAAAGTGGTTCAAAGT
ACTGTACAAATTTAAATTAATTTACATAAAATATTATAGCACTATTTTCTTTTCTTTTTA
AAAAAGAAAAGTATATATTTACAATTATAGCACTATTTTCATAATTTAAAAGAGTTATTT
TAAAAATTACTGTGTAAATGAATATATATTTTTATTCAAAATATAATAGATTTTTTTTTA
TAAACTTAATTGTTTTATAAAATTATGATTTGTTGAATTGGAAAATAAAAATTTATACAG
TGGTTTTGTTCATCTAATAAAACAATGTTAGGTTGAATTAGTTAACATGTATATTATTGA
AAACAAAATTAAAATAAATAATAAAGATGAGAGATACGCTAGAAACACTACAGAATTGTT
GAGTAGTTACTGTAACAGACCGTTCGTAAGTTTTGTTCTCGTAGTTGGACTGCTTGTGGT
CTAATTATCTATTCTATTAATTCTTCAACATGACCAGTTGATATGGGTTAGGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FZ96TF U 1
AF RR2FZ84TF U 1
AF RR2FZ96JQ C 398
AF RR2FZ84JQ C 459
BS 1 681 RR2FZ84TF
BS 682 682 RR2FZ96JQ
BS 683 702 RR2FZ84TF
BS 703 955 RR2FZ96JQ

RD RR2FZ96TF 632 0 0
GTATGGTTGAGTGCGATGATAGAACGGTTTAAATCCAAAATGCCGTAGAATTTGTATATT
GTCACACATATATAAAAGGAAAGTTGAATATGATAAAACGAATAATACAAGCCGTTACAC
CGTTTATTAGACCTAGCAACATATATGAAAGAATCTTGAACTTCAAACAAATTTATAGCT
ATAATTTTATTTTTCTTTTTGGTGGTGATCAGATATATATTGTTATCAAGGTCCAATGAA
CCTCTATTTTAATAAGTGTATATTTTGGTTGTTAAGACATTCGTTGGAATGTTGCCTATT
TTCAAACTAAGGCTCTGAATGGAAAAAACGGATTAAGGGTTACAGATCTAGCGGATCAAG
TGAAACGAGTAGAATAGGAGTGGATCTATCGAATCTAGTGGTACAAGTATAGATTAAACG
GATCTAGCGGTTCAAAACATATGTTTGAATGGTGGAAGTGGATAAAAAGTGGTTCAAAGT
ACTGTACAAATTTAAATTAATTTACATAAAATATTATAGCACTATTTTCTTTTCTTTTTA
AAAAAGAAAAGTATATATTTACAATTATAGCACTATTTTCATAATTTAAAAGAGTTATTT
TAAAAATTACTGTGTAAATGAATATATATTTT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2FZ84TF 702 0 0
GTATGGTTGAGTGCGATGATAGAACGGTTTAAATCCAAAATGCCGTAGAATTTGTATATT
GTCACACATATATAAAAGGAAAGTTGAATATGATAAAACGAATAATACAAGCCGTTACAC
CGTTTATTAGACCTAGCAACATATATGAAAGAATCTTGAACTTCAAACAAATTTATAGCT
ATAATTTTATTTTTCTTTTTGGTGGTGATCAGATATATATTGTTATCAAGGTCCAATGAA
CCTCTATTTTAATAAGTGTATATTTTGGTTGTTAAGACATTCGTTGGAATGTTGCCTATT
TTCAAACTAAGGCTCTGAATGGAAAAAACGGATTAAGGGTTACAGATCTAGCGGATCAAG
TGAAACGAGTAGAATAGGAGTGGATCTATCGAATCTAGTGGTACAAGTATAGATTAAACG
GATCTAGCGGTTCAAAACATATGTTTGAATGGTGGAAGTGGATAAAAAGTGGTTCAAAGT
ACTGTACAAATTTAAATTAATTTACATAAAATATTATAGCACTATTTTCTTTTCTTTTTA
AAAAAGAAAAGTATATATTTACAATTATAGCACTATTTTCATAATTTAAAAGAGTTATTT
TAAAAATTACTGTGTAAATGAATATATATTTTTATTCAAAATATAATAGATTTTTTTTTA
TAAACTTAATTGTTTTATAAA*TTATGATTTGTTGAATTGGA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2FZ96JQ 558 0 0
GTGGTACAAGTATAGATTAAACGGATCTAGCGGTTCAAAACATATGTTTGAATGGTGGAA
GTGGATAAAAAGTGGTTCAAAGTACTGTACAAATTTAAATTAATTTACATAAAATATTAT
AGCACTATTTTCTTTTCTTTTTAAAAAAGAAAAGTATATATTTACAATTATAGCACTATT
TTCATAATTTAAAAGAGTTATTTTAAAAATTACTGTGTAAATGAATATATATTTTTATTC
AAAATATAATAGATTTTTTTTTATAAACTTAATTGTTTTATAAAATTATGATTTGTTGAA
TTGGAAAATAAAAATTTATACAGTGGTTTTGTTCATCTAATAAAACAATGTTAGGTTGAA
TTAGTTAACATGTATATTATTGAAAACAAAATTAAAATAAATAATAAAGATGAGAGATAC
GCTAGAAACACTACAGAATTGTTGAGTAGTTACTGTAACAGACCGTTCGTAAGTTTTGTT
CTCGTAGTTGGACTGCTTGTGGTCTAATTATCTATTCTATTAATTCTTCAACATGACCAG
TTGATATGGGTTAGGTCC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2FZ84JQ 497 0 0
TGGATAAAAAGTGGTTCAAAGTACTGTACAAATTTAAATTAATTTACATAAAATATTATA
GCACTATTTTCTTTTCTTTTTAAAAAAGAAAAGTATATATTTACAATTATAGCACTATTT
TCATAATTTAAAAGAGTTATTTTAAAAATTACTGTGTAAATGAATATATATTTTTATTCA
AAATATAATAGATTTTTTTTTATAAACTTAATTGTTTTATAAAATTATGATTTGTTGAAT
TGGAAAATAAAAATTTATACAGTGGTTTTGTTCATCTAATAAAACAATGTTAGGTTGAAT
TAGTTAACATGTATATTATTGAAAACAAAATTAAAATAAATAATAAAGATGAGAGATACG
CTAGAAACACTACAGAATTGTTGAGTAGTTACTGTAACAGACCGTTCGTAAGTTTTGTTC
TCGTAGTTGGACTGCTTGTGGTCTAATTATCTATTCTATTAATTCTTCAACATGACCAGT
TGATATGGGTTAGGTCC

QA 1 497 1 497
DS 



AS 1 4

CO CL2182Contig1 1262 4 9 U
GGATGAGCTTTTCATCTTTTCTCATAAACGAGCTTCTCCGTTGAAGTCCCAGGGGTTTCT
CCATCTTGAGTTATGCTTCTCACGCTGTCTGACCTCTCTCGATGCCACTGCGTCTCTGAC
TCCGCCACTGCACCTCCGCTACTCTGCGTTGTACCCTCGCGAGATCTCTGCTCATGTCTC
TCTATCTCCATTGCCGTCTCTATCAATTTTTGAATAATCAAAGGGTGAAGACGAACCAGA
AAAACGATGCGGTGTGGAGGAGCAGAGAGGAGTGCGGAGGAAGAGAGAAAAGGCTGTACA
GAGGATTACCACCGCTGAGCCAGACTAATCTGGGTATTGTTTGAGTTTTACTAGATTTTG
CTCTTATTTGAAATTACCATTTTTGCAGGTTTGTGATTTGAGGATGATGGGTTATATATA
GTTTATGCTGGAAAAAGACGATGGTTGAGTGACATTTTTTGTGGTTCATGGCAAGAGACA
GTGATATACAGAAAAAGGAAAATGGAAAGTGTAGCCATACCAGAGCATTCGATCAAACTC
CTCCCTGTTGCACAGCCTGGAGTATTTGATCTGGTGGGTTATGTCATCTCCGCCGGGGAA
GGGAAACCATACCAGAGCGTCTTCTACAATGGAATCATTGAGGTAGTTAAGCAAGGAAAA
ATTGTGGAGAGGCATGGACGTCTTGATTTTCAACGGTTGGCATTAGTGGACCCACATCGA
TCACATCCAGACATACATGGAAGATGGGACAGATTGTACAAAGACATGAACAGACTGGTC
GCTTATTACAAAGGGATGACCACTTGGCTCGATGGGTTAATGCATTTGTCAACCCATCTA
AGACCAAGGTTTTTTTCAATGGCGTTCCTCCTGTTCACCGATGGAAGGGATTGGGGAGAG
CCAATGAAGTCATGTAAGAGTCGCACACAGCCATTCTACGGGAGGAAATATTCAGGAGGG
TCACCTGTTGCTTGGGTGATTTTTAACAAAGTGATGAGGAGATTGAAGAAACCGGTCTAT
CTCAGCGCCGTAAAGATACTCATCCTTGTGCTTACATTGGAACCATCCTGGTTATGATTG
TAGCCACTGGTATCTTCCTGGTCTACCTGATTCCTGGAATGTACTCTTTTACTCTGCTCT
TTTCTCTTGAAGTCTCTTTTGTCCTATCATCAATGTATAGGTTACTGAATAACAGTCTAT
TTCTGTAGTTACGTTTGAATTGTTGTCGCTTTATTCTTGACTGAAATAACGTTTTAGATA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2FO70TF U 1
AF RR2AQ16TF U 22
AF RR2FO70JQ C 497
AF RR2AQ16JQ C 460
BS 1 48 RR2FO70TF
BS 49 49 RR2AQ16TF
BS 50 528 RR2FO70TF
BS 529 794 RR2AQ16TF
BS 795 795 RR2AQ16JQ
BS 796 831 RR2AQ16TF
BS 832 866 RR2AQ16JQ
BS 867 867 RR2FO70JQ
BS 868 1262 RR2AQ16JQ

RD RR2FO70TF 528 0 0
GGATGAGCTTTTCATCTTTTCTCATAAACGAGCTTCTCCGTTGAAGTCTCAGGGGTTTCT
CCATCTTGAGTTATGCTTCTCACGCTGTCTGACCTCTCTCGATGCCACTGCGTCTCTGAC
TCCGCCACTGCACCTCCGCTACTCTGCGTTGTACCCTCGCGAGATCTCTGCTCATGTCTC
TCTATCTCCATTGCCGTCTCTATCAATTTTTGAATAATCAAAGGGTGAAGACGAACCAGA
AAAACGATGCGGTGTGGAGGAGCAGAGAGGAGTGCGGAGGAAGAGAGAAAAGGCTGTACA
GAGGATTACCACCGCTGAGCCAGACTAATCTGGGTATTGTTTGAGTTTTACTAGATTTTG
CTCTTATTTGAAATTACCATTTTTGCAGGTTTGTGATTTGAGGATGATGGGTTATATATA
GTTTATGCTGGAAAAAGACGATGGTTGAGTGACATTTTTTGTGGTTCATGGCAAGAGACA
GTGATATACAGAAAAAGGAAAATGGAAAGTGTAGCCATACCAGAGCAT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2AQ16TF 814 0 0
GG
ATAAACGAGCTTCTCCGTTGAAGTCCCAGGGGTTTCTCCATCTTGAGTTATGCTTCTCAC
GCTGTCTGACCTCTCTCGATGCCACTGCGTCTCTGACTCCGCCACTGCACCTCCGCTACT
CTGCGTTGTACCCTCGCGAGATCTCTGCTCATGTCTCTCTATCTCCATTGCCGTCTCTAT
CAATTTTTGAATAATCAAAGGGTGAAGACGAACCAGAAAAACGATGCGGTGTGGAGGAGC
AGAGAGGAGTGCGGAGGAAGAGAGAAGAGGCTGTACAGAGGATTACCACCGCTGAGCCAG
ACTAATCTGGGTATTGTTTGAGTTTTACTAGATTTTGCTCTTATTTGAAATTACCATTTT
TGCAGGTTTGTGATTTGAGGATGATGGGTTATATATAGTTTATGCTGGAAAAAGACGATG
GTTGAGTGACATTTTTTGTGGTTCATGGCAAGAGACAGTGATATACAGAAAAAGGAAAAT
GGAAAGTGTAGCCATACCAGAGCATTCGATCAAACTCCTCCCTGTTGCACAGCCTGGAGT
ATTTGATCTGGTGGGTTATGTCATCTCCGCCGGGGAAGGGAAACCATACCAGAGCGTCTT
CTACAATGGAATCATTGAGGTAGTTAAGCAAGGAAAAATTGTGGAGAGGCATGGACGTCT
TGATTTTCAACGGTTGGCATTAGTGGACCCACATCGATCACATCCAGACATACATGGAAG
ATGGGACAGATTGTACAAAGACATGAACAGACTGGTCGCTTATTACAAAGG*ATGACCAC
TTGGCTCGATGGGTTAATGCATTTGTCA
CCCA

QA 3 810 3 810
DS 

RD RR2FO70JQ 748 0 0
GGAAAATGGAAAGTGTAGCCATACCAGAGCATTCGATCAAACTCCTCCCTGTTGCACAGC
CTGGAGTATTTGATCTGGTGGGTTATGTCACCTCCGCCGGGGAAGGGAAACCATACCAGA
GCGTCTTCTACAATGGAATCATTGAGGTAGTTAAGCAAGGAAAAATTGTGGAGAGGCATG
GACGTCTTGATTTTCAACGGTTGGCATTAGTGGACCCATATCGATCACATCCAGACATAC
ATGGAAGATGGGACAGATTGTACAAAGACATGAACAGACTGGTCGCTTATTACAAAGGGA
TGACCACTTGGCTCGATGGGTTAATGCATTTGTCAACCCATCTAAGACCAAGGTTTTTTT
CAATGGCGTTCCTCCTGTTCACCGATGGAAGGGATTGGGGAGAGCCAATGAAGTCATGTA
AGAGTCGCACACAGCCATTTTACGGGAGGAAATATTCAGGAGGGTCACCTGTTGCTTGGG
TGATTTTTAACAAAGTGATGAGGAGATTGAAGAAACCGGTCTATTTCAGCGCCGTAAAGA
TACTCATCCTTGTGCTTACATTGGAACCATCCTGGTTATGATTGTAGCCACTGGTATCTT
CCTGGTCTACCTGATTCCTGGAATGTACTCTTTTACTTTGCTCTTTTCTCTTGAAGTCTC
TTTTGTCCTATCATCAATGTATAGGTTACTGAATAACAGTCTATTTCTGTAGTTACGTTT
GAATTGTTGTCGCTTTATTCTTGAC
CCG

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2AQ16JQ 803 0 0
TGTGGTTCATGGCAAGAGACAGTGATATACAGAAAAAGGAAAATGGAAAGTGTAGCCATA
CCAGAGCATTCGATCAAACTCCTCCCTGTTGCACAGCCTGGAGTATTTGATCTGGTGGGT
TATGTCATCTCCGCCGGGGAAGGGAAACCATACCAGAGCGTCTTCTACAATGGAATCATT
GAGGTAGTTAAGCAAGGAAAAATTGTGGAGAGGCATGGACGTCTTGATTTTCAACGGTTG
GCATTAGTGGACCCACATCGATCACATCCAGACATACATGGAAGATGGGACAGATTGTAC
AAAGACATGAACAGACTGGTCGCTTATTACAAAGGGATGACCACTTGGCTCGATGGGTTA
ATGCATTTGTCAACCCATCTAAGACCAAGGTTTTTTTCAATGGCGTTTCTCCTGTTCACC
GATGGAAGGGATTGGGGAGAGCCAATGAAGTCATGTAAGAGTCGCACACAGCCATTCTAC
GGGAGGAAATATTCAGGAGGGTCACCTGTTGCTTGGGTGATTTTTAACAAAGTGATGAGG
AGATTGAAGAAACCGGTCTATCTCAGCGCCGTAAAGATACTCATCCTTGTGCTTACATTG
GAACCATCCTGGTTATGATTGTAGCCACTGGTATCTTCCTGGTCTACCTGATTCCTGGAA
TGTACTCTTTTACTCTGCTCTTTTCTCTTGAAGTCTCTTTTGTCCTATCATCAATGTATA
GGTTACTGAATAACAGTCTATTTCTGTAGTTACGTTTGAATTGTTGTCGCTTTATTCTTG
ACTGAAATAACGTTTTAGATACC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2184Contig1 926 4 19 U
GGGGAAAAAAGCATTTTATTGGTAAATCTCAAATCAACACTCTGGTTCGAGTTTTGGCAA
CGATAATAGTAATACATAACTTACGCAAACAGCAAATGAGTTTCTTCACATGTATATTTT
ACAGACAAAACCTCTATTGAGAAAACGTATGTGCATAAATAATACCAAACCAGTATTGGC
CCCTCTCACTCATTCATTACCTCTCTTCTCTTGCCGGAGCATTAGGATTCCCCATCATAT
CCATCATCATTTTCTCAGGTGAATCTTCCCAATTCGTAAACGTCTTTAAATCAATCTTTC
GACGTTGGTCGGTGAAAAGCTCTTCTCTTTTCTTGTACGCTTCTTGAACTTCCTTAGCTG
CTTTTCCACCTAATGCCCATGCTTCAACATCTGACACCAAAGCCTCTACTGGTAAATAAC
CCTGGTTTGGGAAGAGAGAGCCAGGCTGGTAAGTTTTATCAACTGCATGATGACGGATTG
TGATCTTAGCAAAGTCCTCGTCTATGAAAATTCTCTCGTTTCCTTGTGTTCCCCCAAAAC
CAATTCCAACAGGTTTTGGGTTTGCATCATAGACTCTACCAGAGGGATGAAGATGGCTAT
ATGCAAAGTTTTTCTCTTTCCCTGAAGATGAGAATGCGTGAAAGACAGGACTAATGGAGA
ACAAGTTCCCAGAGCTTCCGTAAAATGTATCTCTGTTCTCAAAACCCTGCTGCAAGATTG
CACCAATGACCCACTTCCTCTCGCTTGAAGTACCCTCATGATCAACTCCACCACTTGCGG
AAACTATCAATAGTATAGGAGCATGATATCCTTGAACGTTGTCCCACAATCGATTCATGC
CTTTCCCATGATGGTATGAGCGGTAAAGAAGATTTTCATTGGTTTCATCGTTATTGCAGG
GAAAGCATGAGCTCAAGATCTCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW33JQ U 49
AF RR2FZ27JQ U 1
AF RR2GV11JQB U 34
AF RR2EW33TF C 149
BS 1 77 RR2FZ27JQ
BS 78 78 RR2GV11JQB
BS 79 83 RR2FZ27JQ
BS 84 84 RR2GV11JQB
BS 85 125 RR2FZ27JQ
BS 126 126 RR2GV11JQB
BS 127 286 RR2FZ27JQ
BS 287 287 RR2GV11JQB
BS 288 299 RR2FZ27JQ
BS 300 300 RR2GV11JQB
BS 301 337 RR2FZ27JQ
BS 338 338 RR2GV11JQB
BS 339 436 RR2FZ27JQ
BS 437 437 RR2GV11JQB
BS 438 496 RR2FZ27JQ
BS 497 497 RR2GV11JQB
BS 498 592 RR2FZ27JQ
BS 593 663 RR2GV11JQB
BS 664 926 RR2EW33TF

RD RR2EW33JQ 462 0 0
GAGTTTTGGCAACGATAATAGTAATACATAACTTACGCAAACAGCAAATGAGTTTCTTCA
CATGTATATTTTACGGACAAAACCTCTATTGAGAAAACGTATGTGCATAAATAATACCAA
ACCAGTATTGGCCCCTCTCACTCATTCATTACCTCTCTTCTCTTGCCGGAGCATTAGGAT
TCCCCATCATATCCATCATCATTTTCTCAGGTGAATCTTCCCAATTCGTAAACGTCTTTA
AATCAATCTTTCGACGTTGGTCGGTGAAAAGCTCTTCTCTTTTCTTGTACGCTTCTTGAA
CTTCCTTAGCTGCTTTTCCACCTAATGCCCATGCTTCAACATCTGACACCAAAGCCTCTA
CTGGTAAATAACCCTGGTTTGGGAAGAGAGAGCCAGGCTGGTAAGTTTTATCAACTGCAT
GATGACGGATTGTGATCTTAGCAAAGTCCTCGTCTATGAAAA

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2FZ27JQ 592 0 0
GGGGAAAAAAGCATTTTATTGGTAAATCTCAAATCAACACTCTGGTTCGAGTTTTGGCAA
CGATAATAGTAATACATGACTTATGCAAACAGCAAATGAGTTTCTTCACATGTATATTTT
ACAGAAAAAACCTCTATTGAGAAAACGTATGTGCATAAATAATACCAAACCAGTATTGGC
CCCTCTCACTCATTCATTACCTCTCTTCTCTTGCCGGAGCATTAGGATTCCCCATCATAT
CCATCATCATTTTCTCAGGTGAATCTTCCCAATTCGTAAACGTCTTCAAATCAATCTTTA
GACGTTGGTCGGTGAAAAGCTCTTCTCTTTTCTTGTATGCTTCTTGAACTTCCTTAGCTG
CTTTTCCACCTAATGCCCATGCTTCAACATCTGACACCAAAGCCTCTACTGGTAAATAAC
CCTGGTTTGGGAAGAGGGAGCCAGGCTGGTAAGTTTTATCAACTGCATGATGACGGATTG
TGATCTTAGCAAAGTCTTCGTCTATGAAAATTCTCTCGTTTCCTTGTGTTCCCCCAAAAC
CAATTCCAACAGGTTTTGGGTTTGCATCATAGACTCTACCAGAGGGATGAAG

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2GV11JQB 630 0 0
TGGTAAATGTTAAAT
GAGTTTTGGCAACGATAATAGTAATACATAACTTACGCAAACAGCAAATGAGTTTCTTCA
CATGTATATTTTACAGGCAAAACCTCTATTGAGAAAACGTATGTGCATAAATAATACCAA
ACCAGTATTGGCCCCTCTCACTCATTCATTACCTCTCTTCTCTTGCCGGAGCATTAGGAT
TCCCCATCATATCCATCATCATTTTCTCAGGTGAATCTTCCCAATTCGTAAACGTCTTTA
AATCAATCTTTCGACGTTGGTCGGTGAAAAGCTCTTCTCTTTTCTTGTACGCTTCTTGAA
CTTCCTTAGCTGCTTTTCCACCTAATGCCCATGCTTCAACATCTGACACCAAAGCCTCTA
CTGGTAAATAACCCTGGTTTGGGAAGAGAGAGCCAGGCTGGTAAGTTTTATCAACTGCAT
GATGACGGATTGTGATCTTAGCAAAGTCCTCGTCTATGAAAATTCTCTCGTTTCCTTGTG
TTCCACCAAAACCAATTCCAACAGGTTTTGGGTTTGCATCATAGACTCTACCAGAGGGAT
GAAGATGGCTATATGCAAAGTTTTTCTCTTTCCCTGAAGATGAGAATGCGTGAAAGACAG
GACTAATGGAGAACA

QA 16 630 16 630
DS 

RD RR2EW33TF 778 0 0
GTATGTGCATAAT
ATACCAAACCAGTATTGGCCC*TCTCACTCATTCATTACCTCTCTTCTCT*GCCGGAGCA
TTAGGATTCCCCATCATATCCATCATCATTT*CTCAGGTGAATCTTCCCAATTCGTAAAC
GTCTTTAAATCAATCTTTCGACGTTGGTCGGTGAAAAGCTCTTCTCTTTTCTTGTACGCT
TCTTGAACTTCCTTAGCTGCTTTTCCACCTAATGCCCATGCTTCAACATCTGACACCAAA
GCCTCTACTGGTAAATAACCCTGGTTTGGGAAGAGAGAGCCAGGCTGGTAAGTTTTATCA
ACTGCATGATGACGGATTGTGATCTTAGCAAAGTCCTCGTCTATGAAAATTCTCTCGTTT
CCTTGTGTTCCCCCAAAACCAATTCCAACAGGTTTTGGGTTTGCATCATAGACTCTACCA
GAGGGATGAAGATGGCTATATGCAAAGTTTTTCTCTTTCCCTGAAGATGAGAATGCGTGA
AAGACAGGACTAATGGAGAACAAGTTCCCAGAGCTTCCGTAAAATGTATCTCTGTTCTCA
AAACCCTGCTGCAAGATTGCACCAATGACCCACTTCCTCTCGCTTGAAGTACCCTCATGA
TCAACTCCACCACTTGCGGAAACTATCAATAGTATAGGAGCATGATATCCTTGAACGTTG
TCCCACAATCGATTCATGCCTTTCCCATGATGGTATGAGCGGTAAAGAAGATTTTCATTG
GTTTCATCGTTATTGCAGGGAAAGCATGAGCTCAAGATCTCCCCC

QA 14 778 14 778
DS 



AS 1 4

CO CL2185Contig1 1287 4 5 U
GGAGAATAAAAATTCTGGATCGGAGAGTTCCATAACCTGGGAATTGCTCCTTCTTCTTCT
CTGATCCCGCGAATTCTTTTACCAAAACTCGGTTGGGTTTTTCCAATTTTAAATCAAAAG
GCTCCAACACTTGCGATTCTCTCGTAACTAATCTCTCAATCTAGGGTTTCGCGAGTTCGC
CTCGGAGTTTGGTCTGTGATCGTGTGAGAGGATGTCTCGGTGTTACCCGTTCCCTCCACC
TGGCTTTGTACCGAACCAAGTTCGAGACGAGTCTCTGATCGAACCGATCAAAAAGGGGAC
AAAGGAGGAAGTTAAGAGAGACAAGAAAGATAAAAAACACAACAAGGATAAAAAGAGGAA
AGAGAGGGCTGGCCGAAGCAGAGACCACCGTCATCATAAGAGACTGCGCAAAGATGAAAG
CGCCAATGCTAGTAAGAAGTTTGATGATGACAATGAGCTTGAGTCCCTGGAGAAGAGCTG
CCTTACGATGGAACTTGACCATCAAACGCCGTCTCAGAACTCTTCTGATAGCACTCTTCG
TAGCAGTGAGAATGAGGGACCGAATCATATTCAGTTTCAGAGTCAGCCCTTCGATGGTAG
GCATAACGACTCTGGTGAGTTTGTTTGTTTACTTGCTGTCGGGTCTGTTTTGATTCAAGT
GCTTGCCACGATGATGACTCTCTTTCTTCGAATTGTTGCTATGGGTTTTGAAGAAACTAG
CATACAAGTCTTGTTACATGGCAAAGGGCAGAAATATCCTGAGATGATGATGACTAACAA
GGATCAAAAACAGTGTTCTTCCCGGGAAAAGTTAGATTCTGGTATGCAACTAGGTAAAGA
GAAACGGGCCTCTAGTCTTAGAGAAAGTATTGGACCTTCAAAGCTCTGCAGCAAATGCCA
TCCTTCCACGGCCATGCGATTCTTGAAACTCATCGAGAACTGGGCTCCTGATCGGCTTGA
GAGTAAGCTCAACGACTGTGAAGATGAAGAATTGTGGTTGTTGATGAAAGTTGGAGCCAA
AAGACATCATGGTCAAGCTAGCGTTCAGACGAGCAGCAAGGGAAGTAGTTCGATGGTGTG
GGCAACTACTGCTCAGTTTCTTCCAGAGGCCGAACTACACGCATTGCCATTCACTGTACC
CTTCTGATTTCAGAGAGTTGTTGACATGACAAACAGATTGTTTCCCGATGTATTGTAGAT
TAGCATTTTGAACTCGGAAGTATATGTGTGGTCATTTTGTAGATACACAGTTAATATATA
CATAGTAAGTATATCAAAATTGATTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2EV76TF U 1
AF RR2FR89TF U 1
AF RR2EV76JQ C 443
AF RR2FR89JQ C 524
BS 1 500 RR2EV76TF
BS 501 711 RR2FR89TF
BS 712 714 RR2EV76JQ
BS 715 747 RR2FR89TF
BS 748 1287 RR2EV76JQ

RD RR2EV76TF 500 0 0
GGAGAATAAAAATTCTGGATCGGAGAGTTCCATAACCTGGGAATTGCTCCTTCTTCTTCT
CTGATCCCGCGAATTCTTTTACCAAAACTCGGTTGGGTTTTTCCAATTTTAAATCAAAAG
GCTCCAACACTTGCGATTCTCTCGTAACTAATCTCTCAATCTAGGGTTTCGCGAGTTCGC
CTCGGAGTTTGGTCTGTGATCGTGTGAGAGGATGTCTCGGTGTTACCCGTTCCCTCCACC
TGGCTTTGTACCGAACCAAGTTCGAGACGAGTCTCTGATCGAACCGATCAAAAAGGGGAC
AAAGGAGGAAGTTAAGAGAGACAAGAAAGATAAAAAACACAACAAGGATAAAAAGAGGAA
AGAGAGGGCTGGCCGAAGCAGAGACCACCGTCATCATAAGAGACTGCGCAAAGATGAAAG
CGCCAATGCTAGTAAGAAGTTTGATGATGACAATGAGCTTGAGTCCCTGGAGAAGAGCTG
CCTTACGATGGAACTTGACC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2FR89TF 760 0 0
GGAGAATAAAAATTCTGGATCGGAGAGTTCCATAACCTGGGAATTGCTCCTTCTTCTTCT
CTGATCCCGCGAATTCTTTTACCAAAACTCGGTTGGGTTTTTCCAATTTTAAATCAAAAG
GCTCCAACACTTGCGATTCTCTCGTAACTAATCTCTCAATCTAGGGTTTCGCGAGTTCGC
CTCGGAGTTTGGTCTGTGATCGTGTGAGAGGATGTCTCGGTGTTACCCGTTCCCTCCACC
TGGCTTTGTACCGAACCAAGTTCGAGACGAGTCTCTGATCGAACCGATCAAAAAGGGGAC
AAAGGAGGAAGTTAAGAGAGACAAGAAAGATAAAAAACACAACAAGGATAAAAAGAGGAA
AGAGAGGGCTGGCCGAAGCAGAGACCACCGTCATCATAAGAGACTGCGCAAAGATGAAAG
CGCCAATGCTAGTAAGAAGTTTGATGATGACAATGAGCTTGAGTCCCTGGAGAAGAGCTG
CCTTACGATGGAACTTGACCATCAAACGCCGTCTCAGAACTCTTCTGATAGCACTCTTCG
TAGCAGTGAGAATGAGGGACCGAATCATATTCAGTTTCAGAGTCAGCCCTTCGATGGTAG
GCATAACGACTCTGGTGAGTTTGTTTGTTTACTTGCTGTCGGGTCTGTTTTGATTCAAGT
GCTTGCCACGATGATGACTCTCTTTCTTCGAATTGTTGCTATGGGTTTTGAG**AACTAG
CATACAAGTCTTGTTACATGGCAAAGG
CAGAATATCCTGA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2EV76JQ 845 0 0
GATGATGACAATGAGCTTGAGTCCCTG*AGAAGAGCTGCCTTACGATGGAACTTGACCAT
CAAACGCCGTCTCAGA*CTCTTCTGATAGCACTCTTCGTAGCAGTGAGAATGAGGGACCG
AATCATATTCAGTTTCAGAGTCAGCCCTTCGATGGTAGGCATAACGACTCTGGTGAGTTT
GTTTGTTTACTTGCTGTCGGGTCTGTTTTGATTCAAGTGCTTGCCACGATGATGACTCTC
TTTCTTCGAATTGTTGCTATGGGTTTTGAAGAAACTAGCATACAAGTCTTGTTACATGGC
AAAGGGCAGAAATATCCTGAGATGATGATGACTAACAAGGATCAAAAACAGTGTTCTTCC
CGGGAAAAGTTAGATTCTGGTATGCAACTAGGTAAAGAGAAACGGGCCTCTAGTCTTAGA
GAAAGTATTGGACCTTCAAAGCTCTGCAGCAAATGCCATCCTTCCACGGCCATGCGATTC
TTGAAACTCATCGAGAACTGGGCTCCTGATCGGCTTGAGAGTAAGCTCAACGACTGTGAA
GATGAAGAATTGTGGTTGTTGATGAAAGTTGGAGCCAAAAGACATCATGGTCAAGCTAGC
GTTCAGACGAGCAGCAAGGGAAGTAGTTCGATGGTGTGGGCAACTACTGCTCAGTTTCTT
CCAGAGGCCGAACTACACGCATTGCCATTCACTGTACCCTTCTGATTTCAGAGAGTTGTT
GACATGACAAACAGATTGTTTCCCGATGTATTGTAGATTAGCATTTTGAACTCGGAAGTA
TATGTGTGGTCATTTTGTAGATACACAGTTAATATATACATAGTAAGTATATCAAAATTG
ATTTT

QA 1 845 1 845
DS 

RD RR2FR89JQ 764 0 0
TCTGATAGCACTCTTCGTAGCAGTGAGAATGAGGGACCGAATCATATTCAGTTTCAGAGT
CAGCCCTTCGATGGTAGGCATAACGACTCTGGTGAGTTTGTTTGTTTACTTGCTGTCGGG
TCTGTTTTGATTCAAGTGCTTGCCACGATGATGACTCTCTTTCTTCGAATTGTTGCTATG
GGTTTTGAAGAAACTAGCATACAAGTCTTGTTACATGGCAAAGGGCAGAAATATCCTGAG
ATGATGATGACTAACAAGGATCAAAAACAGTGTTCTTCCCGGGAAAAGTTAGATTCTGGT
ATGCAACTAGGTAAAGAGAAACGGGCCTCTAGTCTTAGAGAAAGTATTGGACCTTCAAAG
CTCTGCAGCAAATGCCATCCTTCCACGGCCATGCGATTCTTGAAACTCATCGAGAACTGG
GCTCCTGATCGGCTTGAGAGTAAGCTCAACGACTGTGAAGATGAAGAATTGTGGTTGTTG
ATGAAAGTTGGAGCCAAAAGACATCATGGTCAAGCTAGCGTTCAGACGAGCAGCAAGGGA
AGTAGTTCGATGGTGTGGGCAACTACTGCTCAGTTTCTTCCAGAGGCCGAACTACACGCA
TTGCCATTCACTGTACCCTTCTGATTTCAGAGAGTTGTTGACATGACAAACAGATTGTTT
CCCGATGTATTGTAGATTAGCATTTTGAACTCGGAAGTATATGTGTGGTCATTTTGTAGA
TACACAGTTAATATATACATAGTAAGTATATCAAAATTGATTTT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 3

CO CL2186Contig1 824 3 2 U
CCATAAGAAAAGTTTACCACTTTTTCATGTATCTATTTTGTAAACTCTTTGTAATATCAA
TATATTTGATTTGTCGAATAAAAAGATGTCACATTTTAAATGGAAAACATAAAATCATAT
AATTTTTATATGTATTCACACAACTGCATTTCTTTACTCCTTTCAAAGAGAGATTTATGC
ACTAACATCCAAGAAAACCTACCGGTTTTGACTAAACTCCAGAGATTGAAGGATTTCATA
TTAGACCTCCAAGAAGCAACCAGCTTGCACATGACCAACATGTGTTTCTAATTTTACCCA
TCGAAAGCTGCTTAAATCACATATGTACCCTACGGTGGAGCCACTATAACCAGCCAAAGT
CTTGCCGTTGCCGATCACAATCAACTTCCCCGACCTCGTTACCACGTACGCCACACTGTA
CATGTCAGCAGGGATCTGGCTTACTTTCTGCCACGTGTCATTTTTCAGAACCATCACATC
TCCACGCCAGCACGCAAACAGATCTCCGTCTTCGGTGGTGGTAGTGTATATCGGAGTGCT
TACGGTTTCCCCGCCGTCGAGAAACTCCTCTTTCACTGGACCCCATAGCCACATGGACAC
ATCGAAGGATTCAGCAGATTTACTGAACTGCCCCTGTTCCTCCGTGGCGTATCCACCGAT
GACGTGGAATTTGCCAGCGTGGAATATGGCCTTGCACTCGTCTCGTTCCCGTGACATATC
AGGCAAAAACGTCCACTTGTCTTCTGCTAGATCATACACCATCGCTGAGGTCAGCGCTTG
CTTCTCTTCGTCGTGTCCTCCGGCAACCAACACCGTCCGGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ27JQ U 123
AF RR2D058JQ U 1
AF RR2D058TF C 203
BS 1 702 RR2D058JQ
BS 703 824 RR2D058TF

RD RR2CZ27JQ 493 0 0
TTTTTATATGTATTCACACAACTGCATTTCTTTACTCCTTTCAAAGAGAGATTTATGCAC
TAACATCCAAGAAAACCTACCGGTTTTGACTAAACTCCAGAGATTGAAGGATTTCATATT
GGACCTCCAAGAAGCAACCAGCTTGCACATGACCAACATGTGTTTCTAATTTTACCCATC
GAAAGCTGCTTAAATCACATATGTACCCTACGGTGGAGCCACTATAACCAGCCAAAGTCT
TGCCGTTGCCGATCACAATCAACTTCCCCGACCTCGTTACCACGTACGCCACACTGTACA
TGTCAGCAGGGATCTGGCTTACTTTCTGCCACGTGTCATTTTTCAGAACCATCACATCTC
CACGCCAGCACGCAAACAGATCTCCGTCTTCGGTGGTGGTAGTGTATATCGGAGTGCTTA
CGGTTTCCCCGCCGTCGAGAAACTCCTTTTTCACTGGACCCCATAGCCACATGGACACAT
CGAAGGATTCAGC

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR2D058JQ 702 0 0
CCATAAGAAAAGTTTACCACTTTTTCATGTATCTATTTTGTAAACTCTTTGTAATATCAA
TATATTTGATTTGTCGAATAAAAAGATGTCACATTTTAAATGGAAAACATAAAATCATAT
AATTTTTATATGTATTCACACAACTGCATTTCTTTACTCCTTTCAAAGAGAGATTTATGC
ACTAACATCCAAGAAAACCTACCGGTTTTGACTAAACTCCAGAGATTGAAGGATTTCATA
TTAGACCTCCAAGAAGCAACCAGCTTGCACATGACCAACATGTGTTTCTAATTTTACCCA
TCGAAAGCTGCTTAAATCACATATGTACCCTACGGTGGAGCCACTATAACCAGCCAAAGT
CTTGCCGTTGCCGATCACAATCAACTTCCCCGACCTCGTTACCACGTACGCCACACTGTA
CATGTCAGCAGGGATCTGGCTTACTTTCTGCCACGTGTCATTTTTCAGAACCATCACATC
TCCACGCCAGCACGCAAACAGATCTCCGTCTTCGGTGGTGGTAGTGTATATCGGAGTGCT
TACGGTTTCCCCGCCGTCGAGAAACTCCTCTTTCACTGGACCCCATAGCCACATGGACAC
ATCGAAGGATTCAGCAGATTTACTGAACTGCCCCTGTTCCTCCGTGGCGTATCCACCGAT
GACGTGGAATTTGCCAGCGTGGAATATGGCCTTGCACTCGTC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2D058TF 622 0 0
CGGTTTTGACTAAACTCCAGAGATTGAAGGATTTCATATTAGACCTCCAAGAAGCAACCA
GCTTGCACATGACCAACATGTGTTTCTAATTTTACCCATCGAAAGCTGCTTAAATCACAT
ATGTACCCTACGGTGGAGCCACTATAACCAGCCAAAGTCTTGCCGTTGCCGATCACAATC
AACTTCCCCGACCTCGTTACCACGTACGCCACACTGTACATGTCAGCAGGGATCTGGCTT
ACTTTCTGCCACGTGTCATTTTTCAGAACCATCACATCTCCACGCCAGCACGCAAACAGA
TCTCCGTCTTCGGTGGTGGTAGTGTATATCGGAGTGCTTACGGTTTCCCCGCCGTCGAGA
AACTCCTCTTTCACTGGACCCCATAGCCACATGGACACATCGAAGGATTCAGCAGATTTA
CTGAACTGCCCCTGTTCCTCCGTGGCGTATCCACCGATGACGTGGAATTTGCCAGCGTGG
AATATGGCCTTGCACTCGTCTCGTTCCCGTGACATATCAGGCAAAAACGTCCACTTGTCT
TCTGCTAGATCATACACCATCGCTGAGGTCAGCGCTTGCTTCTCTTCGTCGTGTCCTCCG
GCAACCAACACCGTCCGGTCCC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 4

CO CL2187Contig1 1421 4 18 U
GTGAAAGCGAATAAAAATGTAAAAAACCCATGTTTTTGTACATTGCTAATCTTCATCATT
CTTGCTTGCAAAGCTAACTAACATTTATAAGTACATAGGAAACTGAATGGTACGAGCTGA
TTCTGGAACAATGTAAGAAACACTTGATAAACACCAAACCGGAAATTCTGAAATGGAAAA
AGACAGTATGTGCAAGTGTTTTGTTATGTGCAAAGGCACCGAGATCACGTGTAAAGCCTT
AGCCGGCTTGTGATCGGTACTCTGCAGATGGGACAGTTTGATATCCTGGATCCGCAATCT
CTACACGTCATGTGACCACAGCCAAAAGCCACGTCTCTCCGGCTAGTCAGACAAATTGGG
CAATTCTGAGTATGTTCGTCTGATGCAGGTGATGGTTGTTCAGTACGAATAGTAGGCGTG
TAAGGAATGGGTGGTGGCCTCGGGTTTATTTTCTTAGCTAATCCCGTTGTTTTCCCGAGT
AAGCTGAGTTCAGTTGCTGCTCGATACTGAAAGGGAATCTCCATGAGAGCAGCAAGAGCA
AAGGCAGTTTCTTTGGCTGACTCTGATGAATCTCTCTTAATGATCTCTGTGAAATTCACA
AACTGAAAGTTGTCGAACGCACGCTTAGGGATCTTATCATCGAACTTCCTCATGTCTTCC
CATGGACCGTCTCCAACACCGATTAAAACAATCGACAAAGCATATGAGCTGGCGTTAACA
ACGGCTTCGATAGTTGTTCTCTCTTGTTTACTGAGTTCTCCCTCGGCCTTATCAAAACCT
CTTGTTACCTGCCCATCAGCGACAATCACCAGAACATGAAACTGTCCGTTGCTCTTTTCA
ACAATGTCGACAGCAGCATCAATGAGCGGTCCGTAAGACGTTGGCCCTGATAAAATCAAG
TTAGGTGTGATTCTTTTGTAACATGCTAAGACCTCTTCAAAGCCATGGCATGGGGAGTTG
TCGCTGTGGAAACCGAACACTTCCTCGTCATGTGTCGTTGAGTCGCCAAAGCCGAAACAG
GGGATGAGATTGTCTTCGTCGAAAGGAGCTAACGTTTGGCCGATAACAAAGATTGCCTTC
TCATATGGACTCTGAGTTCTTCCGAGAGCGTGAAGAGATTTTCCATTGAAAGAAGTTTTC
CCTGGTCCAGGGACGTGAAACGGTCAGGGATGAGTGCGTACTTCTTCTTGGCAGCGTTTA
TCTTGTCGGTAACTGAGATAGAAAGATCCGACGGGGATGGTTCATCAGATATAGACGACG
TCGTTCTCTCTGTAAAACTTGGACTGCTTTTGCCTTTTCCACTTCCCAACTTCCGCATGA
GATTCCCCATACCCATAGACATCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTC
TGGAAGGCTACTCTCGATAAACCAATTACTGTCTTTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED07JQ U 1
AF RR2AB87JQ U 19
AF RR2ED07TF C 176
AF RR2AU88TF C 696
BS 1 138 RR2ED07JQ
BS 139 139 RR2AB87JQ
BS 140 163 RR2ED07JQ
BS 164 164 RR2AB87JQ
BS 165 171 RR2ED07JQ
BS 172 172 RR2AB87JQ
BS 173 177 RR2ED07JQ
BS 178 178 RR2AB87JQ
BS 179 527 RR2ED07JQ
BS 528 578 RR2AB87JQ
BS 579 579 RR2ED07TF
BS 580 618 RR2AB87JQ
BS 619 619 RR2ED07TF
BS 620 690 RR2AB87JQ
BS 691 721 RR2ED07TF
BS 722 722 RR2AU88TF
BS 723 874 RR2ED07TF
BS 875 1421 RR2AU88TF

RD RR2ED07JQ 527 0 0
GTGAAAGCGAATAAAAATGTAAAAAACCCATGTTTTTGTACATTGCTAATCTTCATCATT
CTTGCTTGCAAAGCTAACTAACATTTATAAGTACATAGGAAACTGAATGGTACGAGCTGA
TTCTGGAACAATGTAAGAGACACTTGATAAACACCAAACCGGAGATTCTGAGATGGAGAA
AGACAGTATGTGCAAGTGTTTTGTTATGTGCAAAGGCACCGAGATCACGTGTAAAGCCTT
AGCCGGCTTGTGATCGGTACTCTGCAGATGGGACAGTTTGATATCCTGGATCCGCAATCT
CTACACGTCATGTGACCACAGCCAAAAGCCACGTCTCTCCGGCTAGTCAGACAAATTGGG
CAATTCTGAGTATGTTCGTCTGATGCAGGTGATGGTTGTTCAGTACGAATAGTAGGCGTG
TAAGGAATGGGTGGTGGCCTCGGGTTTATTTTCTTAGCTAATCCCGTTGTTTTCCCGAGT
AAGCTGAGTTCAGTTGCTGCTCGATACTGAAAGGGAATCTCCATGAG

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2AB87JQ 672 0 0
GTAAAAAACCCATGTTTTTGTACATTGCTAATCTTCATCATTCTTGCTTGCAAAGCTAAC
TAACATTTATAAGTACATAGGAAACTGAATGGTACGAGCTGATTCTGGAACAATGTAAGA
AACACTTGATAAACACCAAACCGGAAATTCTGAAATGGAAAAAGACAGTATGTGCAAGTG
TTTTGTTATGTGCAAAGGCACCGAGATCACGTGTAAAGCCTTAGCCGGCTTGTGATCGGT
ACTCTGCAAATGGGACAGTTTGATATCCTGGATCCGCAATCTCTACACGTCATGTGACCA
CAGCCAAAAGCCACGTCTCTCCGGCTAGTCAGACAAATTGGGCAATTCTGAGTATGTTCG
TCTGATGCAGGTGATGGTTGTTCAGTACGAATAGTAGGCGTGTAAGGAATGGGTGGTGGC
CTCGGGTTTATTTTCTTAGCTAATCCCGTTGTTTTCCCGAGTAAGCTGAGTTCAGTTGCT
GCTCGATACTGAAAGGGAATCTCCATGAGAGCAGCAAGAGCAAAGGCAGTTTCTTTGGCT
GACTCTGATGAATCTCTCTTCATGATCTCTGTGAAATTCACAAACTGAAAGTTGTCGAAC
TCACGCTTAGGGATCTTATCATCGAACTTCCTCATGTCTTCCCATGGACCGTCTCCAACA
CCGATTAAAACA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2ED07TF 700 0 0
TGAG
AAGACAGTATGTGCAAGTGTTT*GTTATGTGCAAAGGCAC*GAGATCACGTGTAAAGC*T
TAGCCGGCTTGTGATCGGTACTCTGCAGATGGGACAGTTTGATATCCTGGATCCGCAATC
TCTACACGTCATGTGACCACAGCCAAAAGCCACGTCTCTCCGGCTAGTCAGACAAATTGG
GCAATTCTGAGTATGTTCGTCTGATGCAGGTGATGGTTGTTCAGTACGAATAGTAGGCGT
GTAAGGAATGGGTGGTGGCCTCGGGTTTATTTTCTTAGCTAATCCCGTTGTTTTCCCGAG
TAAGCTGAGTTCAGTTGCTGCTCGATACTGAAAGGGAATCTCCATGAGAGCAGCAAGAGC
AAAGGCAGTTTCTTTGGCTGACTCTGATGAATCTCTCTTAATGATCTCTGTGAAATTCAC
AAACTGAAAGTTGTCGAACGCACGCTTAGGGATCTTGTCATCGAACTTCCTCATGTCTTC
CCATGGACCGTCTCCAACACCGATTAAAACAATCGACAAAGCATATGAGCTGGCGTTAAC
AATGGCTTCGATAGTTGTTCTCTCTTGTTTACTGAGTTCTCCCTCGGCCTTATCAAAACC
TCTTGTTACCTGCCCATCAGCGACAATCACCAGAACATGAAACTGTCCGTTGCTCTTTTC
AACAATGTCGACAGCAGCATCAATGAGCGGTCCGT
C

QA 5 699 5 699
DS 

RD RR2AU88TF 726 0 0
CAAAGCATATGAGCTGGCGTTAACAACGGCTTCGATAGTTGTTCTCTCTTGTTTACTGAG
TTCTCCCTCGGCCTTATCAAAACCTCTTGTTACCTGCCCATCAGCGACAATCACCAGAAC
ATGAAACTGTCCGTTGCTCTTTTCAACAATGTCGACAGCAGCATCAATGAGCGGTCCGTA
AGACGTTGGCCCTGATAAAATCAAGTTAGGTGTGATTCTTTTGTAACATGCTAAGACCTC
TTCAAAGCCATGGCATGGGGAGTTGTCGCTGTGGAAACCGAACACTTCCTCGTCATGTGT
CGTTGAGTCGCCAAAGCCGAAACAGGGGATGAGATTGTCTTCGTCGAAAGGAGCTAACGT
TTGGCCGATAACAAAGATTGCCTTCTCATATGGACTCTGAGTTCTTCCGAGAGCGTGAAG
AGATTTTCCATTGAAAGAAGTTTTCCCTGGTCCAGGGACGTGAAACGGTCAGGGATGAGT
GCGTACTTCTTCTTGGCAGCGTTTATCTTGTCGGTAACTGAGATAGAAAGATCCGACGGG
GATGGTTCATCAGATATAGACGACGTCGTTCTCTCTGTAAAACTTGGACTGCTTTTGCCT
TTTCCACTTCCCAACTTCCGCATGAGATTCCCCATACCCATAGACATCTCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTGGAAGGCTACTCTCGATAAACCAATTACTGTCTT
TTATCC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 3

CO CL2188Contig1 660 3 23 U
TTCCTTAAAACTGGGATTAAAAAGCTATAACAAGTAGACAAAATCTTAGAACATTAAAAT
CATGAAAAATTCAATGTGAAATCCTCCATAAACAAAATGGATAAAATAGCAAAAATCTCA
ACACTATCCAAGAAAATCCTCCTTACATTCCAGTGAAAGCCTTCTTTGAGAAAGCAGAAG
CACCGGCTGGTATCACCTTCAACACATTGAACCTCCCAGTCTTGGACAATGGCCTGCATT
GGCCAATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAACAAGGTGAGACATGAGCTGGGA
TGTTCGAATGCCTCTTCTCATACCTCTGATACTTCTTGACAAAGTGAAGGTAATTCCTTC
GCACGATAATGGTCCTCTGCATCTTGGCACTGTGGCAAGTACCAGCTAAGATACGGCCTC
TAATAGAAACAGTTCCAGTGAAGGGACATTTACTGTCAATGTAAGTTCCTGAAATGGCTT
CGCGAGGAGTATTGAAGCCCAAGCCGATGTTCTTCACAAATCTGTTTCCACCCTTCCCAG
GTCGCTTTCCCTTGCCTGATGTCTTGGAGCTGAGGAAGACCTTAGGTTGCTTTAGAAAAG
CTTTCTCAGTCTGTTCCGCCATGGCTGCTGTTTTGTTCCCGACAGGCAAGAATGTAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 0 20 0 20 20 20 20 20 20 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM67JQ U 121
AF RR2F208JQ U 50
AF RR2BM67TF C 1
BS 1 49 RR2BM67TF
BS 50 61 RR2F208JQ
BS 62 62 RR2BM67TF
BS 63 68 RR2F208JQ
BS 69 69 RR2BM67TF
BS 70 82 RR2F208JQ
BS 83 83 RR2BM67TF
BS 84 92 RR2F208JQ
BS 93 93 RR2BM67TF
BS 94 107 RR2F208JQ
BS 108 111 RR2BM67TF
BS 112 121 RR2F208JQ
BS 122 169 RR2BM67JQ
BS 170 170 RR2F208JQ
BS 171 176 RR2BM67JQ
BS 177 177 RR2F208JQ
BS 178 409 RR2BM67JQ
BS 410 410 RR2F208JQ
BS 411 425 RR2BM67JQ
BS 426 426 RR2F208JQ
BS 427 463 RR2BM67JQ
BS 464 568 RR2F208JQ
BS 569 660 RR2BM67TF

RD RR2BM67JQ 343 0 0
G
CACTATCCAAGAAAATCCTCCTTACATTCCAGTGAAAGCCTTCTTTGAAAAAGCAAAAGC
ACCGGCTGGTATCACCTTCAACACATTGAACCTCCCAGTCTTGGACAATGGCCTGCATTG
GCCAATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAACAAGGTGAGACATGAGCTGGGAT
GTTCGAATGCCTCTTCTCATACCTCTGATACTTCTTGACAAAGTGAAGGTAATTCCTTCG
CACGATAATGGTCCTCTGCATCTTGGCACTGTGGCAAGTACCAGCTAAAATACGGCCTCT
AATAAAAACAGTTCCAGTGAAGGGACATTTACTGTCAATGTA

QA 2 343 2 343
DS 

RD RR2F208JQ 519 0 0
AACATTAAAATCTTGAAAA*TTCAATGTGAAATTCTCCATAAATAAAATGGATAAAATCT
TGAAAATCTCAACACTATCCAAGAAAATCCTCCTTACATTCCAGTGAAAGCCTTCTTTGA
GAAAGCAGAAGCACCAGCTGGTATCACCTTCAACACATTGAACCTCACAGTCTTGGACAA
TGGCCTGCATTGGCCAATGATAACATGGTCCCCTTCCTTGACACGGAAACAAGGTGAGAC
ACGAGCTGGGATGTTCGAATGCCTCTTCTCATACCTCTGATACTTCTTGACAAAGTGAAG
GTAATTCCTTCGCACGATAATGGTCCTCTGCATCTTGGCACTGTGGCAAGTACCAGCTAA
GATACGACCTCTAATAGAAACAGTTCCAGTGAAAGGACATTTACTGTCAATGTAAGTTCC
TGAAATGGCTTCGCGAGGAGTATTGAAGCCCAAGCCGATGTTCTTCACAAATCTGTTTCC
ACCCTTCCCAGGTCGCTTTCCCTTGCCTGATGTCTTGGA

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2BM67TF 660 0 0
TTCCTTAAAACTGGGATTAAAAAGCTATAACAAGTAGACAAAATCTTAGTGCATTAAAAT
CATGAAAAATTCAATGTGAT*TCCTCCATAAACAAAATGGATAAAATAGCAGAGATCTCA
GCACTATCCAAGAGAATCCTCCTTACATTCCAGTGAAAGCCTTCTTTGAGAAAGCAGAAG
CACCGGCTGGTATCACCTTCAACACATTGAACCTCCCAGTCTTGGACAATGGCCTGCATT
GGCCAATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAACAAGGTGAGACATGAGCTGGGA
TGTTCGAATGCCTCTTCTCATACCTCTGATACTTCTTGACAAAGTGAAGGTAATTCCTTC
GCACGATAATGGTCCTCTGCATCTTGGCACTGTGGCAAGTACCAGCTAAGATACGGCCTC
TAATAGAAACAGTTCCAGTGAAGGGACATTTACTGTCAATGTAAGTTCCTGAAATGGCTT
CGCGAGGAGTCTTGAAGCCCAAGCCGATGTTCTTCACAAATCTGTTTCCACCCTTCCCAG
GTCGCTTTCCCTTGCCTGATGTCTTGGAGCTGAGGAAGACCTTAGGTTGCTTTAGAAAAG
CTTTCTCAGTCTGTTCCGCCATGGCTGCTGTTTTGTTCCCGACAGGCAAGAATGTAGTCC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 4

CO CL2189Contig1 811 4 15 U
GGAGATAAGCACAAACAAAACAATCTTATTCCGCAAGTGTTCCCTCTAATGGCGAGAGAG
AAAAACAAATCTCCAACGGTGAAGAAAACTCCCATGGCGTCAAAAGAGAAGCCAAAGAAG
CTGAGAAAACCCAAAACCACCACTCATCCTCCATATTTTCAGATGATAAAAGAGGCTTTG
ATGAATCTAAAAGAGAAGAACGGGTCGAGCCCTTACGCTATAGCAAAGCAGATAGAGGAG
AAATACAAACCTGTACTCCCTGAGAATTTCCGTAAAACACTTTCTCTGCAGCTTAAAAAC
TCTGTCGCTAAAGGCAAGCTCGTGAAGATCAGAGCCTCATACAAGCTCTCAGAGACGACC
ACGAGGACGACGAGGCAGCAGCAGAAGAAGAAGAAGATGGAGACTCGGTCGAAGAAGACT
GTGAGCAAGCCTCCAGAAATGGTGACGAAGAATAAGAGGACAGCAAAGAAGCCAAGACAG
CTTAAGTCGATCAAGTCTCCAGGTTCTAAGAAGGTCTTGAGAGCTTCCGCTTCTTGATCG
ACAAGAAAGACGAAGAGGAGAGGGTGTGTGAATATGAATAATAA*GGGTTTTCTCTGTAA
AATAGTTGACTCTGTTTTTGGTTTCGGGGGTTACTCCTTCTTTAGGGCTTATAAGGATAA
TGAGTCATGGTATGTATACAACTACGTACTTTTCAATGTAATATATGCAATAACTTGTGG
CTGTATAGCCCTACGACTGCGGTCTGCGGAGAGACCATACCTATGTTCTTGTGTTACTAT
GTTTGCAGTGAATATAAATTTGAGCCAGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD68TF U 1
AF RR2DD68JQ C 571
AF RR2C559TF U 5
AF RR2C559JQ C 309
BS 1 108 RR2DD68TF
BS 109 109 RR2C559TF
BS 110 452 RR2DD68TF
BS 453 453 RR2C559TF
BS 454 584 RR2DD68TF
BS 585 585 RR2C559TF
BS 586 629 RR2DD68TF
BS 630 630 RR2C559TF
BS 631 649 RR2DD68TF
BS 650 655 RR2C559TF
BS 656 656 RR2C559JQ
BS 657 772 RR2C559TF
BS 773 773 RR2C559JQ
BS 774 785 RR2C559TF
BS 786 811 RR2C559JQ

RD RR2DD68TF 649 0 0
GGAGATAAGCACAAACAAAACAATCTTATTCCGCAAGTGTTCCCTCTAATGGCGAGAGAG
AAAAACAAATCTCCAACGGTGAAGAAAACTCCCATGGCGTCAAAAGAGGAGCCAAAGAAG
CTGAGAAAACCCAAAACCACCACTCATCCTCCATATTTTCAGATGATAAAAGAGGCTTTG
ATGAATCTAAAAGAGAAGAACGGGTCGAGCCCTTACGCTATAGCAAAGCAGATAGAGGAG
AAATACAAACCTGTACTCCCTGAGAATTTCCGTAAAACACTTTCTCTGCAGCTTAAAAAC
TCTGTCGCTAAAGGCAAGCTCGTGAAGATCAGAGCCTCATACAAGCTCTCAGAGACGACC
ACGAGGACGACGAGGCAGCAGCAGAAGAAGAAGAAGATGGAGACTCGGTCGAAGAAGACT
GTGAGCAAGCCTCCAGAAATGGTGACGAAGAAGAAGAGGACAGCAAAGAAGCCAAGACAG
CTTAAGTCGATCAAGTCTCCAGGTTCTAAGAAGGTCTTGAGAGCTTCCGCTTCTTGATCG
ACAAGAAAGACGAAGAGGAGAGGGTGTGTGAATATGAATAATAAAGGGTTTTCTCTGTAA
AATAGTTGACTCTGTTTTTGGTTTCGGGG*TTACTCCTTCTTTAGGGCT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2DD68JQ 185 0 0
AATATGAATAATAA*GGGTTTTCTCTGTAAAATAGTTGACTCTGTTTTTGGTTTCGGGGG
TTACTCCTTCTTTAGGGCTTATAAGGATAATGAGTCATGGTATGTATACAACTACGTACT
TTTCAATGTAATATATGCAATAACTTGTGGCTGTATAGCCCTACGACTGCGGTCTGCGGA
GAGAC

QA 1 185 1 185
DS 

RD RR2C559TF 781 0 0
GG
AAGCACAAACAAAACAATCTTATTCCGCAAGTGTTCCCTCTAATGGCGAGAGAGAAAAAC
AAATCTCCAACGGTGAAGAAAGCTCCCATGGCGTCAAAAGAGAAGCCAAAGAAGCTGAGA
AAACCCAAAACCACCACTCATCCTCCATATTTTCAGATGATAAAAGAGGCTTTGATGAAT
CTAAAAGAGAAGAACGGGTCGAGCCCTTACGCTATAGCAAAGCAGATAGAGGAGAAATAC
AAACCTGTACTCCCTGAGAATTTCCGTAAAACACTTTCTCTGCAGCTTAAAAACTCTGTC
GCTAAAGGCAAGCTCGTGAAGATCAGAGCCTCATACAAGCTCTCAGAGACGACCACGAGG
ACGACGAGGCAGCAGCAGAAGAAGAAGAAGATGGAGACTCGGTCGAAGAAGACTGTGAGC
AAGCCTCCAGAAATGGTGACGAAGAATAAGAGGACAGCAAAGAAGCCAAGACAGCTTAAG
TCGATCAAGTCTCCAGGTTCTAAGAAGGTCTTGAGAGCTTCCGCTTCTTGATCGACAAGA
AAGACGAAGAGGAGAGGGTGTGTGAATATGAATAATAA*GGGTTTTCTCTGTAAAATAGT
TGACTCTGTTTTTGGTTTCGGGGGTTACTCCTTCTTTAGGGCTTATAAG*ATAATGAGTC
ATGGTATGTATACAACTACGTACTTTTCAATGTAATATATGCAATAACTTGTGGCTGTAT
AGCCCTACGACTGCGGTCTGCGGAGAGACCATACCTATGTTCTTGTTTTACTATGTTTG

QA 3 781 3 781
DS 

RD RR2C559JQ 503 0 0
TAAAGGCAAGCTCGTGAAGATCAGAGCCTCATACAAGCTTTCAGAGACGACCACGAGGAC
GACGAGGCAGCAGCAGAAGAAGAAGAAGATGGAGACTCGGTCGAAGAAGACTGTGAGCAA
GCCTCCAGAAATGGTGACGAAGAATAAGAGGACAGCAAAGAAGCCAAGACAGCTTAAGTC
GATCAAGTTTCCAGGTTTTAAGAAGGTCTTGAGAGCTTCCGCTTTTTGATCGACAAGAAA
GACGAAGAGGAGAGGGTGTGTGAATATGAATAATAA*GGGTTTTTTCTGTAAAATAGTTG
ACTCTGTTTTTGGTTTCGGGGGTTACTCCTTCTTTAGGGCTTATAAGGATAATGAGTCAT
GGTATGTATACAACTACGTACTTTTCAATGTAATATATGCAATAACTTGTGGCTGTATAG
CCCTACGACTGCGGTTTGCGGAGAGACCATACCTATGTTCTTGTGTTACTATGTTTGCAG
TGAATATAAATTTGAGCCAGCAG

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL2190Contig1 1152 2 8 U
GCTGTAAAACCTAGTGTTGAAGCTGCTGATGCAGAGAAAGAAGAAGGGAAAGGAAAAGAA
GAAAGTGGTGAGGAGAAGGCAGGTGAACAAGTGTAGCTGAAGAAGACAAGAAGGATAAGG
AGGAGACCAAGGTGGTTGATGTTTCTGAATCAACGGATGAAGCCGGAGGCAAACAAGTTG
ATGTTCAACTTGTTAGAGAAGCACCTGAAGAGACTGTAGAAGACAAGATCAAAGACGTTG
AGGTTCCTGAAGTCAAGGCAAAGCCAGAGGCTTCCGAAAAAGTTGAGACTCAGCCTGAGA
AAGCAAATGTTGAAGTAGTGAAAACAGAGGAAACAACACAAGAAGCAGCTAAGGTTGAGG
TTGAGGGAAAGCTGGAGGATACCATTGTTGTTGAGACCAAAGAGACTTGTGAATCTGCCC
CCCAAAAGGAGACAGAAGGAGACGCTTCTTCTCCTGCTGATGTCACTGAGAAAGCCATTA
CTGAGGAGAAGCATGTGGTGGAAGAACCATCAAAGGATGATACAGAGAACGTAACTGAAG
CAAAAGGAATCGTTACCAAAGCACCAGCTACAGAAGAAGAGAACATCAAGAAGGATGATG
AAACACCTGCTGCAGAAGATGTCAAGAGCGAAGAGACTTTGAAAGAAACTGAAAGAAACA
AACAAGAGGAATCAGTCGCAGAGAAAGTAGCAGAGGTTGTAGAGACAGCACCCGTTGTTA
AAGAGATAGAAGAGCCAGAAGTCACAGCCAAAGAAGTTGTTGTTGTTAAGCCAAAAAATA
CAAACAGCATCATGTCAAAGGTGAAGAAGTCTCTTGTTAAGGCAAAGAAAGCAATCATTG
GGAAATCTCCAAGCTCCAAGACTATCACAACTGAAGAAGCCAAAGAAGAGATCATCAAAG
CCAAGTGATTAAAGAAAAAGAGTCATGGATTACTTAAAAGTCTTTCAGGTATTTTAAATT
TATTTTGTTGGTTTTGTTTCTTTGTGTTGGGGGGGAAGGAAAAAAATACAGAACATTCTT
TTTATTTTGTGTTTGATGGCTTTGTGTGGTTATAACTTTTATGTCTGTAAAACCTACAAA
GATTTGGCTTTGTGTTATGGATGTGTGTTTGAGAAATTTCTTTCAACATTTATTGTATTC
ATTCAATTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB65TF U 1
AF RR2FB65JQ C 459
BS 1 670 RR2FB65TF
BS 671 671 RR2FB65JQ
BS 672 697 RR2FB65TF
BS 698 698 RR2FB65JQ
BS 699 735 RR2FB65TF
BS 736 736 RR2FB65JQ
BS 737 751 RR2FB65TF
BS 752 1152 RR2FB65JQ

RD RR2FB65TF 758 0 0
GCTGTAAAACCTAGTGTTGAAGCTGCTGATGCAGAGAAAGAAGAAGGGAAAGGAAAAGAA
GAAAGTGGTGAGGAGAAGGCAGGTGAACAAGTGTAGCTGAAGAAGACAAGAAGGATAAGG
AGGAGACCAAGGTGGTTGATGTTTCTGAATCAACGGATGAAGCCGGAGGCAAACAAGTTG
ATGTTCAACTTGTTAGAGAAGCACCTGAAGAGACTGTAGAAGACAAGATCAAAGACGTTG
AGGTTCCTGAAGTCAAGGCAAAGCCAGAGGCTTCCGAAAAAGTTGAGACTCAGCCTGAGA
AAGCAAATGTTGAAGTAGTGAAAACAGAGGAAACAACACAAGAAGCAGCTAAGGTTGAGG
TTGAGGGAAAGCTGGAGGATACCATTGTTGTTGAGACCAAAGAGACTTGTGAATCTGCCC
CCCAAAAGGAGACAGAAGGAGACGCTTCTTCTCCTGCTGATGTCACTGAGAAAGCCATTA
CTGAGGAGAAGCATGTGGTGGAAGAACCATCAAAGGATGATACAGAGAACGTAACTGAAG
CAAAAGGAATCGTTACCAAAGCACCAGCTACAGAAGAAGAGAACATCAAGAAGGATGATG
AAACACCTGCTGCAGAAGATGTCAAGAGCGAAGAGACTTTGAAAGAAACTGAAAGAAACA
AACAAGAGGA*TCAGTCGCAGAGAAAGTAGCAGAGGT*GTAGAGACAGCACCCGTTGTTA
AAGAGATAGAAGAGC*AGAAGTCACAGCCAA
GAAGTTG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2FB65JQ 694 0 0
GAT
GTCACTGAGAAAGCCATTACTGAGGAGAAGCATGTGGTGGAAGAACCATCAAAGGATGAT
ACAGAGAACGTAACTGAAGCAAAAGGAATCGTTACCAAAGCACCAGCTACAGAAGAAGAG
AACATCAAGAAGGATGATGAAACACCTGCTGCAGAAGATGTCAAGAGCGAAGAGACTTTG
AAAGAAACTGAAGGAAACAAACAAGAGGAATCAGTCGCAGAGAAAGTAGCAGAGGTTGTA
GAGACAGCACCCGTTGTTAAAGAGATAGAAGAGCCAGAAGTCACAGCCAAAGAAGTTGTT
GTTGTTAAGCCAAAAAATACAAACAGCATCATGTCAAAGGTGAAGAAGTCTCTTGTTAAG
GCAAAGAAAGCAATCATTGGGAAATCTCCAAGCTCCAAGACTATCACAACTGAAGAAGCC
AAAGAAGAGATCATCAAAGCCAAGTGATTAAAGAAAAAGAGTCATGGATTACTTAAAAGT
CTTTCAGGTATTTTAAATTTATTTTGTTGGTTTTGTTTCTTTGTGTTGGGGGGGAAGGAA
AAAAATACAGAACATTCTTTTTATTTTGTGTTTGATGGCTTTGTGTGGTTATAACTTTTA
TGTCTGTAAAACCTACAAAGATTTGGCTTTGTGTTATGGATGTGTGTTTGAGAAATTTCT
TTCAACATTTATTGTATTCATTCAATTAGCC

QA 4 694 4 694
DS 



AS 1 4

CO CL2191Contig1 1082 4 11 U
GGAGACATACGGAGAGTTCTGTCGGAACCCAATCGAACGGCGAATGGAGGCAGACAGAGA
CGTCGTGATCGGAGGCGGGGCATCTCGATACGCGCTGAAACCAGCGCGTATAAACAGCGA
GGACATACTGATCTGCGTAGACGTAGATGCAGAATCGATGGTGGAGATGAATACGACGGG
AACTAACGGGAGGCCATTGACGAGGATGGAGTGCGTCAAGCAAGCCATCATCCTCTTCAT
CCACAATAAGCTATCCATCAACCCGGATCATCGCTTTACTTTCGCTACTCTCTCCAAATC
AGCCGCCTGGCTTAAAAAGGATTTCACAAGCGATGCCGCATCTGCTGTTGCTTCTCTAAG
AGGATTGTCAGCTACTAAATCCTCTGGTCGAGCTGATCTCACACAACTGTTCCGTGTAGC
GGCTCAGGAAGCCAAAATTTCCAGAGCACAGAACCGGATATTGAGGGTGATTCTCATATA
CTGCAGGTCATCCGTGAGGCCATCACATGATTGGCCGACAAAGCAGAAGCTCTTCACTCT
GGATGTTATGTACCTTCACGACAAACCGAGTCCTGATAACTGTCCTCAAGATGTGTACGA
CTCTCTTGTTGATGCTGTAGAACATATTTCAGAGTATGAAGGTTACATCTTTGAGAGCGG
TCAAGGGCTTGCAAGGTCTGTTTTCAAGCCCATGTCAATACTGTTATCCCATCCTCAGCA
AAGATGTGCTCAAGAAGATCTCGACATCCCCAAGTCTCTTGCAAAGAAGGTGCCTGTGGT
TGAGGCAGCAAGTGTTGATGATAATCACAATCCTCAGGCCATGAGCCAATAAGAACACTT
GTTTTGTAATCTTTAGCGGTGACATTGTCTAAGATTGGAAAGTTCAAAGATCCATCTAAG
GAAAAAACACAAATGTTCAAATAAATATAAATTGTTTTCTTTTCTTAACATAAAGAGCAG
GTGTATAAATATATGAATATTTGCTCTTTATTGATTTTTAGGTAAATTTAATTTTAATGT
TATTGTAAAAACTTACTTATCTTTTAGACGGCTTAGAATATATGCAATATTTATTTGGAA
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2A196TF U 1
AF RR2CF25TF U 7
AF RR2CF25JQ C 113
AF RR2A196JQ C 409
BS 1 171 RR2A196TF
BS 172 172 RR2CF25TF
BS 173 277 RR2A196TF
BS 278 278 RR2CF25TF
BS 279 402 RR2A196TF
BS 403 403 RR2CF25TF
BS 404 451 RR2A196TF
BS 452 452 RR2CF25TF
BS 453 761 RR2A196TF
BS 762 951 RR2CF25JQ
BS 952 1082 RR2A196JQ

RD RR2A196TF 762 0 0
GGAGACATACGGAGAGTTCTGTCGGAACCCAATCGAACGGCGAATGGAGGCAGACAGAGA
CGTCGTGATCGGAGGCGGGGCATCTCGATACGCGCTGAAACCAGCGCGTATAAACAGCGA
GGACATACTGATCTGCGTAGACGTAGATGCAGAATCGATGGTGGAGATGAAGACGACGGG
AACTAACGGGAGGCCATTGACGAGGATGGAGTGCGTCAAGCAAGCCATCATCCTCTTCAT
CCACAATAAGCTATCCATCAACCCGGATCATCGCTTTGCTTTCGCTACTCTCTCCAAATC
AGCCGCCTGGCTTAAAAAGGATTTCACAAGCGATGCCGCATCTGCTGTTGCTTCTCTAAG
AGGATTGTCAGCTACTAAATCCTCTGGTCGAGCTGATCTCACGCAACTGTTCCGTGTAGC
GGCTCAGGAAGCCAAAATTTCCAGAGCACAGGACCGGATATTGAGGGTGATTCTCATATA
CTGCAGGTCATCCGTGAGGCCATCACATGATTGGCCGACAAAGCAGAAGCTCTTCACTCT
GGATGTTATGTACCTTCACGACAAACCGAGTCCTGATAACTGTCCTCAAGATGTGTACGA
CTCTCTTGTTGATGCTGTAGAACATATTTCAGAGTATGAAGGTTACATCTTTGAGAGCGG
TCAAGGGCTTGCAAGGTCTGTTTTCAAGCCCATGTCAATACTGTTATCCCATCCTCAGCA
AAGATGTGCTCAAGAAGATCTCGACATCCCCAAGTCTCTTG
C

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2CF25TF 755 0 0
GG
ACGGAGAGTTCTGTCGGAACCCAATCGAACGGCGAATGGAGGCAGACAGAGACGTCGTGA
TCGGAGGCGGGGCATCTCGATACGCGCTGAAACCAGCGCGTATAAACAGCGAGGACATAC
TGATCTGCGTAGACGTAGATGCAGAATCGATGGTGGAGATGAATACGACGGGAACTAACG
GGAGGCCATTGACGAGGATGGAGTGCGTCAAGCAAGCCATCATCCTCTTCATCCACAATA
AGCTATCCATCAACCCGGATCATCGCTTTACTTTCGCTACTCTCTCCAAATCAGCCGCCT
GGCTTAAAAAGGATTTCACAAGCGATGCCGCATCTGCTGTTGCTTCTCTAAGAGGATTGT
CAGCTACTAAATCCTCTGGTCGAGCTGATCTCACACAACTGTTCCGTGTAGCGGCTCAGG
AAGCCAAAATTTCCAGAGCACAGAACCGGATATTGAGGGTGATTCTCATATACTGCAGGT
CATCCGTGAGGCCATCACATGATTGGCCGACAAAGCAGAAGCTCTTCACTCTGGATGTTA
TGTACCTTCACGACAAACCGAGTCCTGATAACTGTCCTCAAGATGTGTACGACTCTCTTG
TTGATGCTGTAGAACATATTTCAGAGTATGAAGGTTACATCTTTGAGAGCGGTCAAGGGC
TTGCAAAGTCTGTTTTCAAGCCCATGTCAATACTGTTATCCCATCCTCAGCAAAGATGTG
CTCAAGAAGATCTCGACATCCCCAAGTCTCTTG

QA 3 755 3 755
DS 

RD RR2CF25JQ 839 0 0
AACAGCGAGGACATACTGATCTGCGTAGACGTAGATGCAGAATCGATGGTGGAGATGAAT
ACGACGGGAACTAACGGGAGGCCATTGACGAGGATGGAGTGCGTCAAGCAAGCCATCATC
CTCTTCATCCACAATAAGCTATCCATCAACCCGGATCATCGCTTTACTTTCGCTACTCTC
TCCAAATCAGCCGCCTGGCTTAAAAAGGATTTCACAAGCGATGCCGCATCTGCTGTTGCT
TCTCTAAGAGGATTGTCAGCTACTAAATCCTCTGGTCGAGCTGATCTCACACAACTGTTC
CGTGTAGCGGCTCAGGAAGCCAAAATTTCCAGAGCACAGAACCGGATATTGAGGGTGATT
CTCATATACTGCAGGTCATCCGTGAGGCCATCACATGATTGGCCGACAAAGCAGAAGCTC
TTCACTCTGGATGTTATGTACCTTCACGACAAACCGAGTCCTGATAACTGTCCTCAAGAT
GTGTACGACTCTCTTGTTGATGCTGTAGAACATATTTCAGAGTATGAAGGTTACATCTTT
GAGAGCGGTCAAGGGCTTGCAAGGTCTGTTTTCAAGCCCATGTCAATACTGTTATCCCAT
CCTCAGCAAAGATGTGCTCAAGAAGATCTCGACATCCCCAAGTCTCTTGCAAAGAAGGTG
CCTGTGGTTGAGGCAGCAAGTGTTGATGATAATCACAATCCTCAGGCCATGAGCCAATAA
GAACACTTGTTTTGTAATCTTTAGCGGTGACATTGTCTAAGATTGGAAAGTTCAAAGATC
CATCTAAGGAAAAAACACAAATGTTCAAATAAATATAAATTGTTTTCTTTTCTTAACAT

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR2A196JQ 674 0 0
GTTCCGTGTAGCGGCTCAGGAAGCCAAAATTTCCAGAGCACAGGACCGGATATTGAGGGT
GATTCTCATATACTGCAGGTCATCCGTGAGGCCATCACATGATTGGCCGACAAAGCAGAA
GCTCTTCACTCTGGATGTTATGTACCTTCACGACAAACCGAGTCCTGATAACTGTCCTCA
AGATGTGTACGACTCTCTTGTTGATGCTGTAGAACATATTTCAGAGTATGAAGGTTACAT
CTTTGAGAGCGGTCAAGGGCTTGCAAGGTCTGTTTTCAAGCCCATGTCAATACTGTTATC
CCATCCTCAGCAAAGATGTGCTCAAGAAGATCTCGACATCCCCAAGTCTCTTGCAAAGAA
GGTGCCTGTGGTTGAGGCAGCAAGTGTTGATGATAATCACAATCCTCAGGCCATGAGCCA
ATAAGAACACTTGTTTTGTAATCTTTAGCGGTGACATTGTCTAAGATTGGAAAGTTCAAA
GATCCATCTAAGGAGAAAACACAAATGTTCAAATAAATATAAATTGTTTTCTTTTCTTAA
CATAAAGAGCAGGTGTATAAATATATGAATATTTGCTCTTTATTGATTTTTAGGTAAATT
TAATTTTAATGTTATTGTAAAAACTTACTTATCTTTTAGACGGCTTAGAATATATGCAAT
ATTTATTTGGAACT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 4

CO CL2192Contig1 726 4 12 U
TTTTTTTTTGTGAAAACAAGCTTCTTATTTATCGATTTATTCAGCTAAAACTCCAACAAA
GATGGGAGTTTTCAACAAAAGAGAGTTCTTAAAATATTCTACACAAGTCTATGCTCTAAA
CATAAAACACCAATATTACAAATACATATCATGACATTGTTACTGTTGAAACTTGAAACC
AACTTTCTATTGTTTTGTTTCAGTTTTGCAGATTTATTGCCATTCAGCAAAGAGGGTACT
TTCTTTTTTGTACTTATTCATCATCCCTCTGTGTCACTTTCTGTGACGACACAAGCTGCC
AAGGAGTATACGTGAGGCCTCTCGAGATAAGGTAAAGCACAAACACCACATACGCAACAG
CGAATATGACCACCGGCACAAGCAAAACCACACTCGTCGCAGCTTTCGAGAAGAAATCCA
CCATCAGATACCCATTTATAGCAATCACGAGAGCAGCCACGATCCACGATACGGTTTGCA
CCAAAGGTTGGATTTTGAAGCTGCCCATGATCTGCTCGTTAGACACCAAGCAGAGCAGAG
GGATGACGGCGAAAGGGATCTGAACAGACTGAAGAACGTTCAGCCACTCGTTAAGCTCGC
CGAGCAAAGAATCAGAAGAATCAAAGACGAGGGCCACGATCATCGTCGGGACGATGGCGC
AGCTTCGCGTGATCAAGGCTCTAACCCATTTCTTCATCTTGAGGTTCAAGAACCCTCCCA
TTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM88JQ U 53
AF RR2G988JQ U 11
AF RR2FM88TF C 11
AF RR2G988TF C 1
BS 1 12 RR2G988TF
BS 13 52 RR2G988JQ
BS 53 145 RR2FM88JQ
BS 146 146 RR2G988JQ
BS 147 290 RR2FM88JQ
BS 291 291 RR2G988JQ
BS 292 343 RR2FM88JQ
BS 344 344 RR2G988JQ
BS 345 497 RR2FM88JQ
BS 498 498 RR2G988JQ
BS 499 534 RR2FM88JQ
BS 535 726 RR2G988TF

RD RR2FM88JQ 482 0 0
CCAACAAAGATGGGAGTTTTCAACAAAAGAGAGTTCTTAAAATATTCTACACAAGTCTAT
GCTCTAAACATAAAACACCAATATTACAAATACGTATCATGACATTGTTACTGTTGAAAC
TTGAAACCAACTTTCTATTGTTTTGTTTCAGTTTTGCAGATTTATTGCCATTCAGCAAAG
AGGGTACTTTCTTTTTTGTACTTATTCATCATCCCTCTGTGTCACTTTCTGTGACGACGC
AAGCTGCCAAGGAGTATACGTGAGGCCTCTCGAGATAAGGTAAAGCACAAATACCACATA
CGCAACAGCGAATATGACCACCGGCACAAGCAAAACCACACTCGTCGCAGCTTTCGAGAA
GAAATCCACCATCAGATACCCATTTATAGCAATCACGAGAGCAGCCACGATCCACGATAC
GGTTTGCACCAAAGGTTGGATTTTGGAGCTGCCCATGATCTGCTCGTTAGACACCAAGCA
GA

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR2G988JQ 529 0 0
GA
AAAACAAGCTTCTTATTTATCGATTTATTCAGCTAAAACTCCAACAAAGATGGGAGTTTT
CAACAAAAGAGAGTTCTTAAAATATTCTACACAAGTCTATGCTCTAAACATAAAACACCA
ATATTACAAATACATATCATGACATTGTTACTGTTGAAACTTGAAACCAACTTTCTATTG
TTTTGTTTCAGTTTTGCAGATTTATTGCCATTCAGCAAAGAGGGTACTTTCTTTTTTGTA
CTTATTCATCATCCCTCTGTGTCACTTTCTGTGACGACACAAGCTGCCAAGGAGTATACG
TGAGGCCTCTCGAGATAAGGTAAAGCACAAACACCACATACGCAACAGCGAATATGACCA
CCGGCACAAGCAAAACCACACTCGTCGCAGCTTTCGAGAAGAAATCCACCATCAGATACC
CATTTATAGCAATCACGGGAGCAGCCACGATCCACGATACGGTTTGCACCAAAGGTTGGA
TTTTGAAGCTGCCCATGATCTGCTCGTTAGACACCAAGCAGA
GCAGA

QA 3 524 3 524
DS 

RD RR2FM88TF 542 0 0
GA
AAAACAAGCTTCTTATTTATCGATTTATTCAGCTAAAACTCCAACAAAGATGGGAGTTTT
CAACAAAAGAGAGTTCTTAAAATATTCTACACAAGTCTATGCTCTAAACATAAAACACCA
ATATTACAAATACGTATCATGACATTGTTACTGTTGAAACTTGAAACCAACTTTCTATTG
TTTTGTTTCAGTTTTGCAGATTTATTGCCATTCAGCAAAGAGGGTACTTTCTTTTTTGTA
CTTATTCATCATCCCTCTGTGTCACTTTCTGTGACGACGCAAGCTGCCAAGGAGTATACG
TGAGGCCTCTCGAGATAAGGTAAAGCACAAACACCACATACGCAACAGCGAATATGACCA
CCGGCACAAGCAAAACCACACTCGTCGCAGCTTTCGAGAAGAAATCCACCATCAGATACC
CATTTATAGCAATCACGAGAGCAGCCACGATCCACGATACGGTTTGCACCAAAGGTTGGA
TTTTGGAGCTGCCCATGATCTGCTCGTTAGACACCAAGCAGAGCAGAGGGATGACGGCG
C

QA 3 541 3 541
DS 

RD RR2G988TF 726 0 0
TTTTTTTTTGTGAAAACAAGCTTCTTATTTATCGATTTATTCAGCTAAAACTCCAACAAA
GATGGGAGTTT*CAACAAAAGAGAGTTCTTAAAATATTCTACACAAGTCTATGCTCTAAA
CATAAAACACCAATATTACAAATACATATCATGACATTGTTACTGTTGAAACTTGAAACC
AACTTTCTATTGTTTTGTT*CAGTTTTGCAGATTTATTGCCATTCAGCAAAGAGGGTACT
TTCTTTTTTGTACTTATTCATCATCCCTCTGTGTCACTTTCTGTGACGACACAAGCTGCC
AAGGAGTATACGTGAGGCCTCTCGAGATAAGGTAAAGCACAAACACCACATACGCAACAG
CGAATATGACCACCGGCACAAGCAAAACCACACTCGTCGCAGCTTTCGAGAAGAAATCCA
CCATCAGATACCCATTTATAGCAATCACGGGAGCAGCCACGATCCACGATACGGTTTGCA
CCAAAGGTTGGATTTTGAAGCTGCCCATGATCTGCTCGTTAGACACCAAGCAGAGCAGAG
GGATGACGGCGAAAGGGATCTGAACAGACTGAAGAACGTTCAGCCACTCGTTAAGCTCGC
CGAGCAAAGAATCAGAAGAATCAAAGACGAGGGCCACGATCATCGTCGGGACGATGGCGC
AGCTTCGCGTGATCAAGGCTCTAACCCATTTCTTCATCTTGAGGTTCAAGAACCCTCCCA
TTATAC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 3

CO CL2193Contig1 1417 3 7 U
CGGTATAAACTTTTTACCATTTTATTTCGTTGATACATCATACATCATACATCATCATTA
CCCGTTAACTGATAACGTGAACTTTTAAGTAGGGTTATAACCTCCATCTACTCTCCAAGA
AAATATATATCTTTCTTATTTCCTTTTTGAGACAACAACTCATAATGTCTTCCCCTAGAA
AATTTAAGCTCGCAATGGAAATAGACACCAAACATCTAACCTTTTAAATCATTAAAAAAA
TAGATAGTATTTTGATTCATTAATTTCATCATAGAAACTCCTTACAAGCATTTTCCTCCA
TAACCTGCGTTTCTAAACAATGCTTGCTTTATATCTTCGGAGTTGATGAAATCTCTCTGC
TGAGCTACCTCGGAACAAGAAGCATGCAAAGAGAAATCACTAAAGCAGCTAATAACACAT
TGTTCAATCTCCAAGCCTAGAGTCTCAAGTGTATTAACAGTTGATAGAAGCAATCCCGGT
TTGGGTGAGCAACATATCTCAACCCGAGTATCTTGGTCTCTCCGGTCCACTTCAAACTTT
GGTGAGTTTCTGACCAGATGTTCCTTTGTATTAAGATCCTTGATATCACCGAAGAGCTTA
GAATGATGAGAACTGTTGCTAACTCCAAGTTCTTGTTCCTCCTCTTGTAACTTGTTGATT
TTGTCTGAAAGCTCCTTCATGTAATCTATGGCATCTCCTAGTATCGATGTCCTGTCCATC
TTACTGATTTTTGGAACAATGGATCTGAGCATAGAGAGGCGATCGTTAAGACGTTTTCTT
CGACGTCTCTCCGCCATGAGATTCTTTGAAGGTTGTCCTTCGAGCTTTTTGCTCTTCTTC
TTGCTTATTGTCTCTCCTCCTCCTCCAGAGTATCCAACACTGAAGCTTTTGCTCTGATCA
GACTCCACAAATGGAGATGGATACGACGACTGATTAATGAAGCTCTCTTCTTGGGAAGTT
GGAAGCGTCACTTGAGGTGAAGAGGAAGAGGAGTCTATAATCTCTTGTAACACCTCAAGA
AAAGGGTCATCGAATGTTAAGGCCGTGGAGGAGATCAACGGCGGAGATGAAGATGAGGGT
GGTGGTAGTGGTGGTGTTTGGTGAAGAAACAACGGTGGAGGTTGAGAGATTAGGTTCATA
AAAGAAGATGAGTACAGAAGCGTATTTTCGTCTTCTTCTTCATTGTTGAAACAGAGGTAA
TCAATGTTCCATCCATTTGAGAATAACTGATGATGATCAAATCCGCCATTAAAGCTCAGG
TTGCTGATGTTGTAGTTGTCGGTGGTTTCTTGCTTTGTCGGAACAAGAAGCTCTTCGAAC
ACATTCATTTGAGTCGACAGTTCCATTTTCTGTAATGAAGGAAGATAAATAGCGTGTCTG
TGTGAAAGAGAGAGATAGAGGGAGTTTTGTGGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F248JQ U 1
AF RR2D994JQ U 204
AF RR2D994TF C 652
BS 1 236 RR2F248JQ
BS 237 237 RR2D994JQ
BS 238 679 RR2F248JQ
BS 680 680 RR2D994JQ
BS 681 747 RR2F248JQ
BS 748 972 RR2D994JQ
BS 973 1417 RR2D994TF

RD RR2F248JQ 747 0 0
CGGTATAAACTTTTTACCATTTTATTTCGTTGATACATCATACATCATACATCATCATTA
CCCGTTAACTGATAACGTGAACTTTTAAGTAGGGTTATAACCTCCATCTACTCTCCAAGA
AAATATATATCTTTCTTATTTCCTTTTTGAGACAACAACTCATAATGTCTTCCCCTAGAA
AATTTAAGCTCGCAATGGAAATAGACACCAAACATCTAACCTTTTAAATCATTAAATAAA
TAGATAGTATTTTGATTCATTAATTTCATCATAGAAACTCCTTACAAGCATTTTCCTCCA
TAACCTGCGTTTCTAAACAATGCTTGCTTTATATCTTCGGAGTTGATGAAATCTCTCTGC
TGAGCTACCTCGGAACAAGAAGCATGCAAAGAGAAATCACTAAAGCAGCTAATAACACAT
TGTTCAATCTCCAAGCCTAGAGTCTCAAGTGTATTAACAGTTGATAGAAGCAATCCCGGT
TTGGGTGAGCAACATATCTCAACCCGAGTATCTTGGTCTCTCCGGTCCACTTCAAACTTT
GGTGAGTTTCTGACCAGATGTTCCTTTGTATTAAGATCCTTGATATCACCGAAGAGCTTA
GAATGATGAGAACTGTTGCTAACTCCAAGTTCTTGTTCCTCCTCTTGTAACTTGTTGATT
TTGTCTGAAAGCTCCTTCACGTAATCTATGGCATCTCCTAGTATCGATGTCCTGTCCATC
TTACTGATTTTTGGAACAATGGATCTG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2D994JQ 769 0 0
GACACCAAACATCTAACCTTTTAAATCATTAAAAA****GATAGTATTTTGATTCATTAA
TTTCATCATAGAAACTCCTTACAAGCATTTTCCTCCATAACCTGCGTTTCTAAACAATGC
TTGCTTTATATCTTCGGAGTTGATGAAATCTCTCTGCTGAGCTACCTCGGAACAAGAAGC
ATGCAAAGAGAAATCACTAAAGCAGCTAATAACACATTGTTCAATCTCCAAGCCTAGAGT
CTCAAGTGTATTAACAGTTGATAGAAGCAATCCCGGTTTGGGTGAGCAACATATCTCAAC
CCGAGTATCTTGGTCTCTCCGGTCCACTTCAAACTTTGGTGAGTTTCTGACCAGATGTTC
CTTTGTATTAAGATCCTTTATATCACCGAAGAGCTTAGAATGATGAGAACTGTTGCTAAC
TCCAAGTTCTTGTTCCTCCTCTTGTAACTTGTTGATTTTGTCTGAAAGCTCCTTCATGTA
ATCTATGGCATCTCCTAGTATCGATGTCCTGTCCATCTTACTGATTTTTGGAACAATGGA
TCTGAGCATAGAGAGGCGATCGTTAAGACGTTTTCTTCGACGTCTCTCCGCCATGAGATT
CTTTGAAGGTTGTCCTTCGAGCTTTTTGCTCTTCTTCTTGCTTATTGTCTCTCCTCCTCC
TCCAGAGTATCCAACACTGAAGCTTTTGCTCTGATCAGACTCCACAAATGGAGATGGATA
CGACGACTGATTAATGAAGCTCTCTTCTTGGGAAGTTGGAAGCGTCACT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2D994TF 766 0 0
CTTGTTGA
TTTGTCTGAAAGCTC*TTCATGTAATCTATGGCATCTCCTAGTATCGATGTCCTGTCCAT
CTTACTGATTTT*GGAACAATGGATCTGAGCATAGAGAGGCGATCGTTAAGACGTTTTCT
TCGACGTCTCTCCGCCATGAGATTCTTTGAAGGTTGTCCTTCGAGCTTTTTGCTCTTCTT
CTTGCTTATTGTCTCTCCTCCTCCTCCAGAGTATCCAACACTGAAGCTTTTGCTCTGATC
AGACTCCACAAATGGAGATGGATACGACGACTGATTAATGAAGCTCTCTTCTTGGGAAGT
TGGAAGCGTCACTTGAGGTGAAGAGGAAGAGGAGTCTATAATCTCTTGTAACACCTCAAG
AAAAGGGTCATCGAATGTTAAGGCCGTGGAGGAGATCAACGGCGGAGATGAAGATGAGGG
TGGTGGTAGTGGTGGTGTTTGGTGAAGAAACAACGGTGGAGGTTGAGAGATTAGGTTCAT
AAAAGAAGATGAGTACAGAAGCGTATTTTCGTCTTCTTCTTCATTGTTGAAACAGAGGTA
ATCAATGTTCCATCCATTTGAGAATAACTGATGATGATCAAATCCGCCATTAAAGCTCAG
GTTGCTGATGTTGTAGTTGTCGGTGGTTTCTTGCTTTGTCGGAACAAGAAGCTCTTCGAA
CACATTCATTTGAGTCGACAGTTCCATTTTCTGTAATGAAGGAAGATAAATAGCGTGTCT
GTGTGAAAGAGAGAGATAGAGGGAGTTTTGTGGATTCC

QA 9 766 9 766
DS 



AS 1 4

CO CL2194Contig1 719 4 4 U
GGAACACTTACAAACGGGTTGGGAGATAATACATAGTGATATCAGAAAGTATCGATGGCG
CAGGTTTTATACCGTTTGGTAGCAACGATAACATGTTTCGTGTGTTTAGGGTTTAATATT
GGGATGTGTTCGGAGCCCGACGCCTTGATCAAGACTTACGTGTCATCATCTCTACCGACT
AACGATGGCTTGGTCATGTCCACCAAGCTTAAGGTACACAAGATCTCTGGATCGGAATGG
GATTCACTTGTAATCGACTCCGAAGTCCCGGTCATGGTTATGTTCACAGCCGACTGGTGC
GGCCCATGTCGCGTCATGAGCCCTATGTTTGACAGACTCGCCTCCGACTTCACGGACGGC
TTCAAATTCTACACCCTGGACGTTGATCAGGAACAAGACATTGCAGAACGTTACGCCATA
CGCGCCATGCCAACCACTATTATCTTTAAAGGCGGAAACGAGGTGGCTAGAGTAGTTGGA
GTTGATCTTGGGAAATTAACTGAACTCGTGAAGCAATACATTTAATGGTGTCCCTTGGCT
CGTCTCGACTCCTTTTATTTACATTTGCTTGCTTTCTTTGGGTCAAAACCTTCCTTTATT
TGTCCAGCTGCATTGTGTTATCGAGTAGTTTTTTTTTTTTTTGAAAAACGTGTTATCGAG
TAGTTGCCTGTGTTCTTTAACTTCTGTGTCAAAATTAAAAATAATAAAATCGAATATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 0 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2EM27TF U 1
AF RR2ED79TF U 167
AF RR2EM27JQ C 173
AF RR2ED79JQ C 548
BS 1 639 RR2EM27TF
BS 640 644 RR2ED79TF
BS 645 693 RR2EM27TF
BS 694 719 RR2ED79TF

RD RR2EM27TF 694 0 0
GGAACACTTACAAACGGGTTGGGAGATAATACATAGTGATATCAGAAAGTATCGATGGCG
CAGGTTTTATACCGTTTGGTAGCAACGATAACATGTTTCGTGTGTTTAGGGTTTAATATT
GGGATGTGTTCGGAGCCCGACGCCTTGATCAAGACTTACGTGTCATCATCTCTACCGACT
AACGATGGCTTGGTCATGTCCACCAAGCTTAAGGTACACAAGATCTCTGGATCGGAATGG
GATTCACTTGTAATCGACTCCGAAGTCCCGGTCATGGTTATGTTCACAGCCGACTGGTGC
GGCCCATGTCGCGTCATGAGCCCTATGTTTGACAGACTCGCCTCCGACTTCACGGACGGC
TTCAAATTCTACACCCTGGACGTTGATCAGGAACAAGACATTGCAGAACGTTACGCCATA
CGCGCCATGCCAACCACTATTATCTTTAAAGGCGGAAACGAGGTGGCTAGAGTAGTTGGA
GTTGATCTTGGGAAATTAACTGAACTCGTGAAGCAATACATTTAATGGTGTCCCTTGGCT
CGTCTCGACTCCTTTTATTTACATTTGCTTGCTTTCTTTGGGTCAAAACCTTCCTTTATT
TGTCCAGCTGCATTGTGTTATCGAGTAGTTTTTTTTTTTG****AAAACGTGTTATCGAG
TAGTTGCCTGTGTTCTTTAACTTCTGTGTCAAA
T

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2ED79TF 553 0 0
GATCTC
TACCGACTAACGATGGCTTGGTCATGTCCACCAAGCTTAATGTACACAAGATCTCTGGAT
CGGAATGGGATTCACTTGTAATCGACTCCGAAGTCCCGGTCACGGTTATGTTCACAGCCG
ACTGGTGCGGCCCATGTCGCGTCATGAGCCCTATGTTTGACAGACTCGCCTCCGACTTCA
CGGACGGCTTCAAATTCTACACCCTGGACGTTGATCAGGAACAAGACATTGCAGAACGTT
ACGCCATACGCGCCATGCCAACCACTATTATCTTTAAAGGCGGAAACGAGGTGGCTAGAG
TAGTTGGAGTTGATCTTGGGAAATTAACTGAACTCGTGAAGCAATACATTTAATGGTGTC
CCTTGGCTCGTCTCGACTCCTTTTATTTACATTTGCTTGCTTTCTTTGGGTCAAAACCTT
CCTTTATTTGTCCAGCTGCATTGTGTTATCGAGTAGTTTTTTTTTTTTTTGAAAAACGTG
TTATCGAGTAGTTGCCTGTGTTCTTTAACTTCTGTGTCAAAATTAAAAATAATAAAATCG
AATATTT

QA 7 553 7 553
DS 

RD RR2EM27JQ 547 0 0
TACCGACTAACGATGGCTTGGTCATGTCCACCAAGCTTAAGGTACACAAGATTTCTGGAT
CGGAATGGGATTCACTTGTAATCGACTCCGAAGTCCCGGTCATGGTTATGTTCACAGCCG
ACTGGTGCGGCCCATGTCGCGTCATGAGCCCTATGTTTGACAGACTCGCCTCCGACTTCA
CGGACGGCTTCAAATTTTACACCCTGGACGTTGATCAGGAACAAGACATTGCAGAACGTT
ACGCCATACGCGCCATGCCAACCACTATTATCTTTAAAGGCGGAAACGAGGTGGCTAGAG
TAGTTGGAGTTGATCTTGGGAAATTAACTGAACTCGTGAAGCAATACATTTAATGGTGTC
CCTTGGCTCGTCTCGACTCCTTTTATTTACATTTGCTTGCTTTTTTTGGGTCAAAACCTT
CCTTTATTTGTCCAGCTGCATTGTGTTATCGAGTAGTTTTTTTTTTTT**GAAAAACGTG
TTATCGAGTAGTTGCCTGTGTTCTTTAACTTCTGTGTCAAAATTAAAAATAATAAAATCG
AATATTT

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2ED79JQ 172 0 0
ACTCCTTTTATTTACATTTGCTTGCTTTCTTTGGGTCAAAACCTTCCTTTATTTGTCCAG
CTGCATTGTGTTATCGAGTAGTTTTTTTTTTTTTTGAAAAACGTGTTATCGAGTAGTTGC
CTGTGTTCTTTAACTTCTGTGTCAAAATTAAAAATAATAAAATCGAATATTT

QA 1 172 1 172
DS 



AS 1 4

CO CL2195Contig1 548 4 7 U
GGGACTTGACTTAAAAGAGAACCGAATCGAATCCCCTCATTATAAAATCCAAAATCCCTT
CGCTGCGTTTCTTCTGCATTGACCGGATCGCTTCCTTCTTACGCGGACTCATCCTCAATT
CACCATGACTCGTGGAAGTCAGAGAGAGCGTGACCGTGAAAGAGCCGCGGCTCGTGCTGG
AGGAAAAGGAAAGTCTGCTGACGATGGATTGACGCCGGAGCAACGCCGTGAAAGAGATGG
AAAAGCATTGCAAGAGAAAGCAGCAAAGAAGGCTGCTCAAGCTGCAGCTGCTGCAGGTTC
TGGTGGAGGTGCAGGAGGCAAAGGAACTGCTAAGAAGTGATCTCATTTGGTTTGTCTCTT
GGGGAAATAATGTAGACTTTTACGGTTCTTTTTATAAACATCTCGCAAAATATTTCAAAT
TTGGGTTAACTTCGACTTGAGTTGTACTCTTGTCTGAATCCCGTTATGCTGTCTCTGTTG
AAAAATTGATATCTGATACCTGTGGTAACTTATTCTGTCTTTATATGATCTGTTATGAAT
ATTCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A008JQ C 74
AF RR2A008TF U 37
AF RR2BM43TF U 1
AF RR2BM43JQ C 33
BS 1 107 RR2BM43TF
BS 108 108 RR2A008TF
BS 109 199 RR2BM43TF
BS 200 200 RR2A008TF
BS 201 201 RR2BM43TF
BS 202 202 RR2A008TF
BS 203 548 RR2BM43TF

RD RR2A008JQ 324 0 0
CTGCATTGACCGGATCGCTTCGTTCTTACGCGGACTCATCCTCAATTCACCATGACTCGT
GGAAGTCAGAGAGAGCGTGACCGTGAAAGAGCCGCGGCTCGTGCTGGAGGAAAAGGAAAG
TCTGCTGACGATGGATTGACGCCGGAGCAACGCCGTGAAAGAGATGGAAAAGCATTGCAA
GAGAAAGCAGCAAAGAAGGCTGCTCAAGCTGCAGCTGCTGCAGGTTTTGGTGGAGGTGCA
GGAGGCAAAGGAACTGCTAAGAAGTGATCTCATTTGGTTTGTCTCTTGGGGAAATAATGT
AGACTTTTACGGTTCTTTTTATAA

QA 1 324 1 324
DS 

RD RR2A008TF 475 0 0
GG
ATTATAAAATCCAAA*TCCCTTCGCTGCGTTTCTTCTGCATTGACCGGATCGCTTCGTTC
TTACGCGGACTCATCCTCAATTCACCATGACTCGTGGAAGTCAGAGAGAGCGTGACCGTG
AAAGAGCCGCGGCTCGTGCTGGAGGAAAAGGAAAGTCTGCTGACGATGGATTGACGCCGG
AGCAACGCCGTGAAAGAGATGGAAAAGCATTGCAAGAGAAAGCAGCAAAGAAGGCTGCTC
AAGCTGCAGCTGCTGCAGGTTCTGGTGGAGGTGCAGGAGGCAAAGGAACTGCTAAGAAGT
GATCTCATTTGGTTTGTCTCTTGGGGAAATAATGTAGACTTTTACGGTTCTTTTTATAAA
CATCTCGCAAAATATTTCAAATTTGGGTTAACTTCGACTTGAGTTGTACTCTTGTCTGAA
TCCCGGTATGCTGTCTCTGTTGAAAAATTAATATCTTATGCTTGTGGTAACTT

QA 3 475 3 475
DS 

RD RR2BM43TF 548 0 0
GGGACTTGACTTAAAAGAGAACCGAATCGAATCCCCTCATTATAAAATCCAAAATCCCTT
CGCTGCGTTTCTTCTGCATTGACCGGATCGCTTCCTTCTTACGCGGATTCATCCTCAATT
CACCATGACTCGTGGAAGTCAGAGAGAGCGTGACCGTGAAAGAGCCGCGGCTCGTGCTGG
AGGAAAAGGAAAGTCTGCTTATGATGGATTGACGCCGGAGCAACGCCGTGAAAGAGATGG
AAAAGCATTGCAAGAGAAAGCAGCAAAGAAGGCTGCTCAAGCTGCAGCTGCTGCAGGTTC
TGGTGGAGGTGCAGGAGGCAAAGGAACTGCTAAGAAGTGATCTCATTTGGTTTGTCTCTT
GGGGAAATAATGTAGACTTTTACGGTTCTTTTTATAAACATCTCGCAAAATATTTCAAAT
TTGGGTTAACTTCGACTTGAGTTGTACTCTTGTCTGAATCCCGTTATGCTGTCTCTGTTG
AAAAATTGATATCTGATACCTGTGGTAACTTATTCTGTCTTTATATGATCTGTTATGAAT
ATTCTTGC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2BM43JQ 516 0 0
CCCCTC
ATTATAAAATCCAAAATCCCTTCGCTGCGTTTTTTCTGCATTGACCGGATCGCTTCCTTC
TTACGCGGATTCATCCTCAATTCACCATGACTCGTGGAAGTCAGAGAGAGCGTGACCGTG
AAAGAGCCGCGGCTCGTGCTGGAGGAAAAGGAAAGTCTGCTTATGATGGATTGACGCCGG
AGCAACGCCGTGAAAGAGATGGAAAAGCATTGCAAGAGAAAGCAGCAAAGAAGGCTGCTC
AAGCTGCAGCTGCTGCAGGTTCTGGTGGAGGTGCAGGAGGCAAAGGAACTGCTAAGAAGT
GATCTCATTTGGTTTGTCTCTTGGGGAAATAATGTAGACTTTTACGGTTCTTTTTATAAA
CATCTCGCAAAATATTTCAAATTTGGGTTAACTTCGACTTGAGTTGTACTCTTGTCTGAA
TCCCGTTATGCTGTCTCTGTTGAAAAATTGATATCTGATACCTGTGGTAACTTATTCTGT
CTTTATATGATCTGTTATGAATATTCTTGC

QA 7 516 7 516
DS 



AS 2 4

CO CL2196Contig1 587 2 1 U
GGATTTTCGCGTTTGTAACTTCAGTGGAGAAGGAAATATCCAAATCGATCCGTTAAAAAA
GGGATTTCGAATTTTCCGGAGCTATGTCGAGTGCGGTGGACGCGACGGGTAACCCGATCC
CTACATCTGCAGTGTTGACTGCGTCGGCGAAGCATATAGGTTTAAGATGTATGCCTGAGA
ACGTTGCGTTCCTCAAATGCAAGAAGAATGATCCTAACCCCGAGAAGTGTCTCGACAAGG
GTCGTGACGTCACTCGCTGCGTGCTTGGCTTGCTGAAGGATCTACACCAGAAGTGCCAGA
AGGAGATGGATGACTATGTTGGGTGTATGTATTACTACACCAACGAGTTTGATCTGTGTA
GGAAAGAGCAAGAAGCCTTCGAGAAAGTGTGTCCCCTGAAGTGAGAAGAATCACAGGCTA
TTGTCATGTTTTTTTTTAATTTTTAATCTCTTAATAAAGAAAAATGTTCATTTTTGAATG
AGCTTTACTCTCTACTACTTTTTGTTGTCATTACCATTTTTTTTTCCTCTCAAATGTTTT
CAAAGACAAGGAAATGACTTTCACTGTTTGAAGGTTCTTTAATCAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CI22JQ C 1
AF RR2CI22TF U 1
BS 1 587 RR2CI22TF

RD RR2CI22JQ 587 0 0
GGATTTTCGCGTTTGTAACTTCAGTGGAGAAGGAAATATCCAAATCGATCCGTTAAAAAA
GGGATTTCGAATTTTCCGGAGCTATGTCGAGTGCGGTGGACGCGACGGGTAACCCGATCC
CTACATCTGCAGTGTTGACTGCGTCGGCGAAGCATATAGGTTTAAGATGTATGCCTGAGA
ACGTTGCGTTCCTCAAATGCAAGAAGAATGATCCTAACCCCGAGAAGTGTCTCGACAAGG
GTCGTGACGTCACTCGCTGCGTGCTTGGCTTGCTGAAGGATCTACACCAGAAGTGCCAGA
AGGAGATGGATGACTATGTTGGGTGTATGTATTACTACACCAACGAGTTTGATCTGTGTA
GGAAAGAGCAAGAAGCCTTCGAGAAAGTGTGTCCCCTGAAGTGAGAAGAATCACAGGCTA
TTGTCATGTTTTTTTTTAATTTTTAATCTCTTAATAAAGAAAAATGTTCATTTTTGAATG
AGCTTTACTCTCTACTACTTTTTGTTGTCATTACCATTTTTTTTTCCTCTCAAATGTTTT
CAAAGACAAGGAAATGACTTTCACTGTTTGAAGGTTCTTTAATCAGC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2CI22TF 587 0 0
GGATTTTCGCGTTTGTAACTTCAGTGGAGAAGGAAATATCCAAATCGATCCGTTAAAAAA
GGGATTTCGAATTTTCCGGAGCTATGTCGAGTGCGGTGGACGCGACGGGTAACCCGATCC
CTACATCTGCAGTGTTGACTGCGTCGGCGAAGCATATAGGTTTAAGATGTATGCCTGAGA
ACGTTGCGTTCCTCAAATGCAAGAAGAATGATCCTAACCCCGAGAAGTGTCTCGACAAGG
GTCGTGACGTCACTCGCTGCGTGCTTGGCTTGCTGAAGGATCTACACCAGAAGTGCCAGA
AGGAGATGGATGACTATGTTGGGTGTATGTATTACTACACCAACGAGTTTGATCTGTGTA
GGAAAGAGCAAGAAGCCTTCGAGAAAGTGTGTCCCCTGAAGTGAGAAGAATCACAGGCTA
TTGTCATGTTTTTTTTTAATTTTTAATCTCTTAATAAAGAAAAATGTTCATTTTTGAATG
AGCTTTACTCTCTACTACTTTTTGTTGTCATTACCATTTTTTTTTCCTCTCAAATGTTTT
CAAAGACAAGGAAATGACTTTCACTGTTTGAAGGTTCTTTAATCAGC

QA 1 587 1 587
DS 



CO CL2196Contig2 512 2 2 U
GATCCAAATCGATCCGTTAAAAAGGGATTTCGAATTTTCCGGAGCTATGTCGAGTGCGGT
GGACGCGACGGGTAACCCGATCCCTACATCTGCAGTGTTGACTGCTTCGGCGAAGCATAT
AGGTTTAAGATGTATGCTTGAGAACGTTGCGTTCCTCAAATGCAAGAAGAATGATCCTAA
CCCCGAGAAGTGTCTCGACAAGGGTCGTGACGTCACTCGCTACGTGCTTGGCTTGCTGAA
GGATCTACACCAGAAGTGCCAGAAGGAGATGGATGACTATGTTGGGTGTATGTATTACTA
CACGAACGAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAGCAAGAAGCCTTCGAGTAAGTGTGTCCCCT
GAAGTGAGAAGAATCGACAGGCTACTGTCATGTTTTTTCTTTTTTTAATTTGTAATCTCT
TAATAAAGAAAAATGTTCATTTTTGAATGAGCTTTACTCTCTACTACTTTTTGTTGTTGT
CATCACCATTTTTTTTCCTCTCAAATGTTTTC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GJ56JQB C 1
AF RR2GJ56TF U 1
BS 1 1 RR2GJ56JQB
BS 2 512 RR2GJ56TF

RD RR2GJ56JQB 512 0 0
GATCCAAATCGATCCGTTAAAAAGGGATTTCGAATTTTCCGGAGCTATGTCGAGTGCGGT
GGACGCGACGGGTAACCCGATCCCTACATCTGCAGTGTTGACTGCTTCGGCGAAGCATAT
AGGTTTAAGATGTATGCTTGAGAACGTTGCGTTCCTCAAATGCAAGAAGAATGATCCTAA
CCCCGAGAAGTGTCTCGACAAGGGTCGTGACGTCACTCGCTACGTGCTTGGCTTGCTGAA
GGATCTACACCAGAAGTGCCAGAAGGAGATGGATGACTATGTTGGGTGTATGTATTACTA
CACGAACGAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAGCAAGAAGCCTTCGAGTAAGTGTGTCCCCT
GAAGTGAGAAGAATCGACAGGCTACTGTCATGTTTTTTCTTTTTTTAATTTGTAATCTCT
TAATAAAGAAAAATGTTCATTTTTGAATGAGCTTTACTCTCTACTACTTTTTGTTGTTGT
CATCACCATTTTTTTTCCTCTCAAATGTTTTC

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2GJ56TF 512 0 0
G
ATCCAAATCGATCCGTTAAAAAGGGATTTCGAATTTTCCGGAGCTATGTCGAGTGCGGTG
GACGCGACGGGTAACCCGATCCCTACATCTGCAGTGTTGACTGCTTCGGCGAAGCATATA
GGTTTAAGATGTATGCTTGAGAACGTTGCGTTCCTCAAATGCAAGAAGAATGATCCTAAC
CCCGAGAAGTGTCTCGACAAGGGTCGTGACGTCACTCGCTACGTGCTTGGCTTGCTGAAG
GATCTACACCAGAAGTGCCAGAAGGAGATGGATGACTATGTTGGGTGTATGTATTACTAC
ACGAACGAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAGCAAGAAGCCTTCGAGTAAGTGTGTCCCCTG
AAGTGAGAAGAATCGACAGGCTACTGTCATGTTTTTTCTTTTTTTAATTTGTAATCTCTT
AATAAAGAAAAATGTTCATTTTTGAATGAGCTTTACTCTCTACTACTTTTTGTTGTTGTC
ATCACCATTTTTTTTCCTCTCAAATGTTTTC

QA 2 512 2 512
DS 



AS 1 4

CO CL2197Contig1 511 4 2 U
TTTTTTCTTGTCTGCCAAGAAGAAAGAGGAACTCAAACTGTTGAAACTGTTTGTCTGAAA
CCCTAAAAGAAAAAGAGGTTCGGAGATGACAGAGGAAACAACAAGATATGCTGTAGTAAC
TGGAGCAAACAGGGGAATTGGGTTAGAGATCTGCAGACAATTAGCGAGCAATGGGATTAG
AGTTGTTTTGACCTCTCGAGATGAGAAGAGAGGACTTGAAGCTGTTGAGACACTGAGACA
AGAAACTGGAGTTTCTGATCAAACCCTTGTCTTTCATCAGCTTGATGTCACTGATCCTGC
TAGTGTCACATCTCTTGCTGAGTTTGTAAAACTCCAATTTGGAAAACTCGATATCTTGGT
ATGATTAAGCTAGTGCTTTTTTTTTTCTTTTCTGATTAAGCTGCTCCTATTAGACGTGAT
TAACAGTTCTAGTAACGCTTGATCTTGAAAAAGCCAGTTAGGTTTGCCTACTCCATGAAT
TGTACATGTTGTGAAAAAACCCGAAAAAAAA


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GV92JQB C 1
AF RR2GV92TF U 1
AF RR2H184TF U 1
AF RR2H184JQ C 1
BS 1 484 RR2GV92TF
BS 485 511 RR2GV92JQB

RD RR2GV92JQB 511 0 0
TTTTTTCTTGTCTGCCAAGAAGAAAGAGGAACTCAAACTGTTGAAACTGTTTGTCTGAAA
CCCTAAAAGAAAAAGAGGTTCGGAGATGACAGAGGAAACAACAAGATATGCTGTAGTAAC
TGGAGCAAACAGGGGAATTGGGTTAGAGATCTGCAGACAATTAGCGAGCAATGGGATTAG
AGTTGTTTTGACCTCTCGAGATGAGAAGAGAGGACTTGAAGCTGTTGAGACACTGAGACA
AGAAACTGGAGTTTCTGATCAAACCCTTGTCTTTCATCAGCTTGATGTCACTGATCCTGC
TAGTGTCACATCTCTTGCTGAGTTTGTAAAACTCCAATTTGGAAAACTCGATATCTTGGT
ATGATTAAGCTAGTGCTTTTTTTTTTCTTTTCTGATTAAGCTGCTCCTATTAGACGTGAT
TAACAGTTCTAGTAACGCTTGATCTTGAAAAAGCCAGTTAGGTTTGCCTACTCCATGAAT
TGTACATGTTGTGAAAAAACCCGAAAAAAAA

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2GV92TF 484 0 0
TTTTTTCTTGTCTGCCAAGAAGAAAGAGGAACTCAAACTGTTGAAACTGTTTGTCTGAAA
CCCTAAAAGAAAAAGAGGTTCGGAGATGACAGAGGAAACAACAAGATATGCTGTAGTAAC
TGGAGCAAACAGGGGAATTGGGTTAGAGATCTGCAGACAATTAGCGAGCAATGGGATTAG
AGTTGTTTTGACCTCTCGAGATGAGAAGAGAGGACTTGAAGCTGTTGAGACACTGAGACA
AGAAACTGGAGTTTCTGATCAAACCCTTGTCTTTCATCAGCTTGATGTCACTGATCCTGC
TAGTGTCACATCTCTTGCTGAGTTTGTAAAACTCCAATTTGGAAAACTCGATATCTTGGT
ATGATTAAGCTAGTGCTTTTTTTTTTCTTTTCTGATTAAGCTGCTCCTATTAGACGTGAT
TAACAGTTCTAGTAACGCTTGATCTTGAAAAAGCCAGTTAGGTTTGCCTACTCCATGAAT
TGTA

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2H184TF 484 0 0
TTTTTTCTTGTCTGCCAAGAAGAAAGAGGAACTCAAACTGTTGAAACTGTTTGTCTGAAA
CCCTAAAAGAAAAAGAGGTTCGGAGATGACAGAGGAAACAACAAGATATGCTGTAGTAAC
TGGAGCAAACAGGGGAATTGGGTTAGAGATCTGCAGACAATTAGCGAGCAATGGGATTAG
AGTTGTTTTGACCTCTCGAGATGAGAAGAGAGGACTTGAAGCTGTTGAGACACTGAGACA
AGAAACTGGAGTTTCTGATCAAACCCTTGTCTTTCATCAGCTTGATGTCACTGATCCTGC
TAGTGTCACATCTCTTGCTGAGTTTGTAAAACTCCAATTTGGAAAACTCGATATCTTGGT
ATGATTAAGCTAGTGCTTTTTTTTTTCTTTTCTGATTAAGCTGCTCCTATTAGACGTGAT
TAACAGTTCTAGTAACGCTTGATCTTGAAAAAGCCAGTTAGGTTTGCCTACTCCATGAAT
TGTA

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2H184JQ 511 0 0
TTTTTTCTTGTCTGCCAAGAAGAAAGAGGAACTCAAACTGTTGAAACTGTTTGTCTGAAA
CCCTAAAAGAAAAAGAGGTTCGGAGATGACAGAGGAAACAACAAGATATGCTGTAGTAAC
TGGAGCAAACAGGGGAATTGGGTTAGAGATCTGCAGACAATTAGCGAGCAATGGGATTAG
AGTTGTTTTGACCTCTCGAGATGAGAAGAGAGGACTTGAAGCTGTTGAGACACTGAGACA
AGAAACTGGAGTTTCTGATCAAACCCTTGTCTTTCATCAGCTTGATGTCACTGATCCTGC
TAGTGTCACATCTCTTGCTGAGTTTGTAAAACTCCAATTTGGAAAACTCGATATCTTGGT
ATGATTAAGCTAGTGCTTTTTTTTTTCTTTTCTGATTAAGCTGCTCCTATTAGACGTGAT
TAACAGTTCTAGTAACGCTTGATCTTGAAAAAGCCAGTTAGGTTTGCCTACTCCATGAAT
TGTACATGTTGTGAAAAAACCCGAAAAAAAA

QA 1 511 1 511
DS 



AS 1 3

CO CL2198Contig1 1459 3 21 U
GGACTGTAAATTATATATATATAGCTATCATCATTTCGTTTCTATCCTGAGCTGATATAA
TTTTTTTGAAGTTTTTTTTTTTTTTTAATATGTTTCTCAGCCTAGTGTCACTCAGGTGAA
TATTGATTTGTTTTGGAAATGTTTCAGAATTTTGGGTCAATGGAGGACAGTGTGTTTTGT
GGTGTTTTTGATGGACATGGTCCTTATGGTCACATTATCGCAAAGAGAGTCAGGGATTTG
CTTCCACTCAAGTTAGGCTCTCACTTGGAGTCCTATGTCTCCTGCGAGGAGGTTCTTAAA
GAGATCAGCCTCAACACTGCTGATAGAAAGACCTCAGACAACCTTGTTCACATATCTGCT
AACGGAGAATCCCGAGTCTACAATAAGGATCAGGATATGGTTCAGACACTGTTAACCTCA
ATTGTTAAAGCCTACAGATTCATGGACAAGGAGTTGAAGATGCAAGTGGATGTTGATTGT
TTTTGTAGTGGAACTACTGCAGTAACTATGGTTAAGCAGGGTCAACATCTTGTTGTTGGA
AACATTGGGGATTCAAGAGCAGTATTGGGTATGAGGAACAAAGAGAATAAACTTGTTCCT
TTTCAGTTAACTGAAGATCTAAAACCAGATGTTCCAGCTGAAGCAGCAAGGATAAAGAGA
TGCAGAGGACGTATATTCGCTCTCCGAGATGAACCTGGGGTTGCCCGCCTCTGGCTTCCT
AACCACAACTCACCTGGTCTGGCCATGGCTCGTGCTTTTGGAGATTTTTGCCTTAAGGAC
TTTGGTCTCATTTCTGTGCCTGACGTGTCCTACCGTCGCCTCACTGAGAAAGATGAATTT
GTTGTCTTGGCAACTGATGGGATCTGGGATGTATTGACGAATGAAGAAGTTGTGGAGATT
GTAGCGAAAGCACCAACACGTTGCACAGCTGGTCGAGCCTTGGTGGAAGCTGCAGTGAGG
AATTGGAGATGGAAGTTCCCCACTTCAAAAGTCGATGACTGCGCTGTAGTTTGCCTCTTC
CTTGATTCCAAACCAGACAAATTATCAACTGCTTCTTTCTCAGAGGATAAACACATCAGC
AATGGCCTTACTGAACCGGACACAGCATCAACGTCAACTCCAGGCTCCGGAACCGAATCA
CCTGAGCTCAATGGAGTCGACAGAATCAACACACTCGTGAATCTCCCCATGTACGTGCCA
ACGAAGGAGTAGGGAGATGGAACAGAGGCAGGAGGTGAAAATGTGAGATTAGACTTTGTC
TATCTCTCTCCCTTCAGGTTTTTATTAGTCTCAGTGTCTCTTATACTCTATCAAAAGCCA
CTGGTTGTATATATATCTACTCTGCCAATACTTCTCCTACAATCTCTCTCTTTTTGTAAA
TAAATTTCTGAAGCTGCATTTGTGTTTGTTTGGGCACTACCATTCAACCAACATAATTTA
ATTACATGAAGAGTTAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BB01TF U 1
AF RR2EV62TF U 430
AF RR2BB01JQ C 704
BS 1 623 RR2BB01TF
BS 624 624 RR2EV62TF
BS 625 761 RR2BB01TF
BS 762 872 RR2EV62TF
BS 873 873 RR2BB01JQ
BS 874 938 RR2EV62TF
BS 939 939 RR2BB01JQ
BS 940 977 RR2EV62TF
BS 978 978 RR2BB01JQ
BS 979 1007 RR2EV62TF
BS 1008 1008 RR2BB01JQ
BS 1009 1028 RR2EV62TF
BS 1029 1029 RR2BB01JQ
BS 1030 1127 RR2EV62TF
BS 1128 1128 RR2BB01JQ
BS 1129 1136 RR2EV62TF
BS 1137 1137 RR2BB01JQ
BS 1138 1150 RR2EV62TF
BS 1151 1151 RR2BB01JQ
BS 1152 1198 RR2EV62TF
BS 1199 1459 RR2BB01JQ

RD RR2BB01TF 761 0 0
GGACTGTAAATTATATATATATAGCTATCATCATTTCGTTTCTATCCTGAGCTGATATAA
TTTTTTTGAAGTTTTTTTTTTTTTTTAATATGTTTCTCAGCCTAGTGTCACTCAGGTGAA
TATTGATTTGTTTTGGAAATGTTTCAGAATTTTGGGTCAATGGAGGACAGTGTGTTTTGT
GGTGTTTTTGATGGACATGGTCCTTATGGTCACATTATCGCAAAGAGAGTCAGGGATTTG
CTTCCACTCAAGTTAGGCTCTCACTTGGAGTCCTATGTCTCCTGCGAGGAGGTTCTTAAA
GAGATCAGCCTCAACACTGCTGATAGAAAGACCTCAGACAACCTTGTTCACATATCTGCT
AACGGAGAATCCCGAGTCTACAATAAGGATCAGGATATGGTTCAGACACTGTTAACCTCA
ATTGTTAAAGCCTACAGATTCATGGACAAGGAGTTGAAGATGCAAGTGGATGTTGATTGT
TTTTGTAGTGGAACTACTGCAGTAACTATGGTTAAGCAGGGTCAACATCTTGTTGTTGGA
AACATTGGGGATTCAAGAGCAGTATTGGGTATGAGGAACAAAGAGAATAAACTTGTTCCT
TTTCAGTTAACTGAAGATCTAAA*CCAGATGTTCCAGCTGAAGCAGCAAGGATAAAGAGA
TGCAGAGGACGTATATTCGCTCTCCGAGATGAACCTGGGGTTGCCCGCCTCTGGCTTCCT
AACCACAACTCACCTGGTCTGGCCATGGCTCGTGCTTTTGG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2EV62TF 769 0 0
GCCTACGGATTCATGGACAAGGAGTTGAGGATGCAAGTGGATGTTGATTGTTTTTGTAGT
GGAACTACTGCAGTAACTATGGTTAAGCAGGGTCAACATCTTGTTGTTGGAAACATTGGG
GATTCAAGAGCAGTATTGGGTATGAGGAACAAAGAGAATAAACTTGTTCCTTTTCAGTTA
ACTGAAGATCTAAAACCAGATGTTCCAGCTGAAGCAGCAAGGATAAAGAGATGCAGAGGA
CGTATATTTGCTCTCCGAGATGAACCTGGGGTTGCCCGCCTCTGGCTTCCTAACCACAAC
TCACCTGGTCTGGCCATGGCTCGTGCTTTTGGAGATTTTTGCCTTAAGGACTTTGGTCTC
ATTTCTGTGCCTGACGTGTCCTACCGTCGCCTCACTGAGAAAGATGAATTTGTTGTCTTG
GCAACTGATGGGATCTGGGATGTGTTGACGAATGAAGAAGTTGTGGAGATTGTAGCGAAA
GCACCAACACGTTGCACAGCTGGTCGAGCTTTGGTGGAAGCTGCAGTGAGGAATTGGAGA
TGGAAGTTTCCCACTTCAAAAGTCGATGACTGCGCTGTGGTTTGCCTCTTCCTTGATTCT
AAACCAGACAAATTATCAACTGCTTCTTTCTCAGAGGATAAACACATCAGCAATGGCCTT
ACTGAACCGGACACAGCATCAACGTCAACTCCAGGCTCGGGAACCGATTCACCTGAGCTC
A*TGGAGTCGACAGAATCAACACACTCGTGAATCTCCCCATGTACGTGC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2BB01JQ 756 0 0
CCCGCCTCTGGCTTCCTAACCACAACTCACCTGGTCTGGCCATGGCTCGTGCTTTTGGAG
ATTTTTGCCTTAAGGACTTTGGTCTCATTTCTGTGCCTGACGTGTCCTACCGTCGCCTCA
CTGAGAAAGATGAATTTGTTGTCTTGGCAACTGATGGGATTTGGGATGTATTGACGAATG
AAGAAGTTGTGGAGATTGTAGCGAAAGCACCAACACGTTGCACAGCTGGTCGAGCCTTGG
TGGAAGCTGCAGTGAGGAATTGGAGATGGAAGTTCCCCACTTCAAAAGTCGATGACTGCG
CTGTAGTTTGCCTCTTCCTTGATTCCAGACCAGACAAATTATCAACTGCTTCTTTCTCAG
AGGATAAACACATCAGCAATGGCCTTACTGAACCGGACACAGCATCAACGTCAACTCCAG
GCTCCGGAACCGAATCACCTGAGCTCAATGGAGTCGACAGAATCAACACACTCGTGAATC
TCCCCGTGTACGTGCCAACGAAGGAGTAGGGAGATGGAACAGAGGCAGGAGGTGAAAATG
TGAGATTAGACTTTGTCTATCTCTCTCCCTTCAGGTTTTTATTAGTCTCAGTGTCTCTTA
TACTCTATCAAAAGCCACTGGTTGTATATATATCTACTCTGCCAATACTTCTCCTACAAT
CTCTCTCTTTTTGTAAATAAATTTCTGAAGCTGCATTTGTGTTTGTTTGGGCACTACCAT
TCAACCAACATAATTTAATTACATGAAGAGTTAGAC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 4

CO CL2199Contig1 622 4 32 U
TTTTAGCAAGCTCAAAACTTAATTGGTCAGCATCATAAGTCATAACTTAACAATTTTTGA
GCAAGCTCAAATCTTTTATTGATCATCATCATCATAAGTTGTAACAAACAGAGGCAAACA
TTACCCTCAAACAAACAAAAGGAGTAGCAAAATAAAAAAGAGAGTTCTTTGCCGAATTGG
AACCCAGAGATCCAGCAAAAAGACCCTCATTTGGAGAACCCACCACGCTTCTGGTAACTA
GCGACCTCGCCTTCGTTAGGAAAGAAACCCATGAGCCTCCCCGCCGAGTTCTGATACGCA
TACATGAACCCACCCATGAGTCCGATCAGTCCTCCCGTCACCATTGACGGTCCTTTGATC
CCAGGCTTAATCCCTGATAGATAGCCGACGGTGACGGAAACGCCGGTGATGGTGGAGAAA
CGGAGGTAATCGAGTACGCTGAAGTTTCCGACGACTTTTGTGAATGGTGGATTCCGATCG
ACGACGGGGTATTGGGGCTTCTCTAAGGCAGTGATGTCAGTGTTCATCTTCTTCGATCAA
TCTACAATTCTCTGATCTGAATCGAATCTATCTTCTCCCTCTCTCTCTTTAGGTTATTCA
ATCCGCAACAAATGCAGGGCCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D778JQ U 5
AF RR2CP85JQ U 59
AF RR2CP85TF C 59
AF RR2D778TF C 1
BS 1 4 RR2D778TF
BS 5 76 RR2D778JQ
BS 77 77 RR2CP85JQ
BS 78 90 RR2D778JQ
BS 91 91 RR2CP85JQ
BS 92 159 RR2D778JQ
BS 160 160 RR2CP85JQ
BS 161 161 RR2D778JQ
BS 162 162 RR2CP85JQ
BS 163 186 RR2D778JQ
BS 187 187 RR2CP85JQ
BS 188 188 RR2D778JQ
BS 189 189 RR2CP85JQ
BS 190 198 RR2D778JQ
BS 199 199 RR2CP85JQ
BS 200 201 RR2D778JQ
BS 202 202 RR2CP85JQ
BS 203 215 RR2D778JQ
BS 216 216 RR2CP85JQ
BS 217 248 RR2D778JQ
BS 249 249 RR2CP85JQ
BS 250 260 RR2D778JQ
BS 261 261 RR2CP85JQ
BS 262 263 RR2D778JQ
BS 264 264 RR2CP85JQ
BS 265 297 RR2D778JQ
BS 298 298 RR2CP85JQ
BS 299 380 RR2D778JQ
BS 381 381 RR2CP85JQ
BS 382 385 RR2D778JQ
BS 386 569 RR2CP85JQ
BS 570 622 RR2D778TF

RD RR2D778JQ 381 0 0
AGCAAGCTCAAAACTTAATTGGTCAGCATCATAAGTCATAACTTAACAATTTTTGAGCAA
GCTCAAATCTTT*ATTGATCATCATCGTCATAAGTTGTAACAAACAGAGGCAAACATTAC
CCTCAAACAAACAAAAGGAGTAGCAAAATAAAAAAAAAAGTTCTTTGCCGAATTGGAACC
CAAAAATCCAGCAATAA*ACCCTCATTTGGAAAACCCACCACGCTTCTGGTAACTAGCGA
CCTCCCCTTCGTTAGGGAAAAAACCCATGAGCCTCCCCGCCGAGTTCTGATACCCATACA
TGAACCCACCCATGAGTCCGATCAGTCCTCCCGTCACCATTGACGGTCCTTTGATCCCAG
GCTTAATCCCTGATAGGTAGC

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR2CP85JQ 515 0 0
GG
GCAAGCTCAAATCTTTTATTGATCATCATCATCATAAGTTGTAACAAACAGAGGCAAACA
TTATCCTCAAACAAACAAAAGGAGTAGCAAAATAAAAAAGAGAGTTCTTTGCCGAATTGG
AACCCAGAGATCCAGCAAAAAGACTCTCATTTGGAGAACCCACCGCGCTTCTGGTGACTA
GCGACCTCGCCTTCGTTAGGAAAGAAACCCATGAGCCTCCCCGCCGAGTTCTGGTACGCA
TACATGAACCCACCCATGAGTCCTATCAGTCCTCCCGTCACCATTGACGGTCCTTTGATC
CCAGGCTTAATCCCTGATAGATAGCCGACGGTGACGGAAACGCCGGTGATGGTGGAGAAA
CGGAGGTAATCGAGTACGCTGAAGTTTCCGACGACTTTTGTGAATGGTGGATTCCGATCG
ACGACGGGGTATTGGGGCTTCTCTAAGGCAGTGATGTCAGTGTTCATCTTCTTCGATCAA
TCTACAATTCTCTGATCTGAATCGAATCT
CCCT

QA 3 511 3 511
DS 

RD RR2CP85TF 515 0 0
GG
GCAAGCTCAAATCTTTTATTGATCATCATCATCATAAGTTGTAACAAACAGAGGCAAACA
TTATCCTCAAACAAACAAAAGGAGTAGCAAAATAAAAAAGAGAGTTCTTTGCCGAATTGG
AACCCAGAGATCCAGCAAAAAGACTCTCATTTGGAGAACCCACCGCGCTTCTGGTGACTA
GCGACCTCGCCTTCGTTAGGAAAGAAACCCATGAGCCTCCCCGCCGAGTTCTGGTACGCA
TACATGAACCCACCCATGAGTCCTATCAGTCCTCCCGTCACCATTGACGGTCCTTTGATC
CCAGGCTTAATCCCTGATAGATAGCCGACGGTGACGGAAACGCCGGTGATGGTGGAGAAA
CGGAGGTAATCGAGTACGCTGAAGTTTCCGACGACTTTTGTGAATGGTGGATTCCGATCG
ACGACGGGGTATTGGGGCTTCTCTAAGGCAGTGATGTCAGTGTTCATCTTCTTCGATCAA
TCTACAATTCTCTGATCTGAATCGAATCT
CCCT

QA 3 511 3 511
DS 

RD RR2D778TF 622 0 0
TTTTAGCAAGCTCAAAACTTAATTGGTCAGCATCATAAGTCATAACTTAACAATTTTTGA
GCAAGCTCAAATCTTT*ATTGATCATCATCGTCATAAGTTGTAACAAACAGAGGCAAACA
TTACCCTCAAACAAACAAAAGGAGTAGCAAAATAAAAAAGAGAGTTCTTTGCCGAATTGG
AACCCAGAGATCCAGCAATAG*ACCCTCATTTGGAGAACCCACCACGCTTCTGGTAACTA
GCGACCTCGCCTTCGTTAGGGAAGAAACCCATGAGCCTCCCCGCCGAGTTCTGATACGCA
TACATGAACCCACCCATGAGTCCGATCAGTCCTCCCGTCACCATTGACGGTCCTTTGATC
CCAGGCTTAATCCCTGATAGGTAGCCGACGGTGACGGAAACGCCGGTGATGGTGGAGAAA
CGGAGGTAATCGAGTACGCTGAAGTTTCCGACGACTTTTGTGAATGGTGGATTCCGATCG
ACGACGGGGTATTGGGGCTTCTCTAAGGCAGTAATGTCAGTGTTCATCTTCTTCGATCAA
TCTACAATTCTCTGATCTGAATCGAATCTATCTTCTCCCTCTCTCTCTTTAGGTTATTCA
ATCCGCAACAAATGCAGGGCCC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 4

CO CL2200Contig1 526 4 1 U
GGAAGAACCCAACAACTATAATAGTACAAAAAAAAAGAAAAGAAAAATGGAGGCAGGGAA
GACACCACCGGCGACGACAACGACACCGACGGAGAAGAAACCAGAGCAAGAAGTGAAAAA
CGACGACTTGCCGACAAACAGTCCTTACGTGGACGACTCTGGTAGCTTGGAGGATTATAA
AATGAAAGCTTATGGAGCCCAAGGCCACCAAGAGGTTAAGGCTGGCCTCGGTGGTGGATC
TACCGATGCTCCTACTCCTTCTGGTGGAGGAACCACCGCTACTGCTGAGAAAGCTCCTTG
AAAGCTTAAAAAACTTTAATAATAATGGGTTAAAATACCAAGATTTGTAGCCACTTTATT
CGAATCACTGATCCAAGTTCCGTTTGTATGGGTTATCTTTTTTTTTCTCAAGCTTCTAAA
CTAATAAGGTTCCGAACCTGTTAGCCAACTCGGTGGGTTATGTACTAAAATGTAATTGCA
TGTATTACTGAGTGTGAAAATAATTTCCTGAGTTTCATAAGGTAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU89TF U 1
AF RR2G075JQ C 252
AF RR2FV91TF U 1
AF RR2G075TF U 1
BS 1 526 RR2CU89TF

RD RR2CU89TF 526 0 0
GGAAGAACCCAACAACTATAATAGTACAAAAAAAAAGAAAAGAAAAATGGAGGCAGGGAA
GACACCACCGGCGACGACAACGACACCGACGGAGAAGAAACCAGAGCAAGAAGTGAAAAA
CGACGACTTGCCGACAAACAGTCCTTACGTGGACGACTCTGGTAGCTTGGAGGATTATAA
AATGAAAGCTTATGGAGCCCAAGGCCACCAAGAGGTTAAGGCTGGCCTCGGTGGTGGATC
TACCGATGCTCCTACTCCTTCTGGTGGAGGAACCACCGCTACTGCTGAGAAAGCTCCTTG
AAAGCTTAAAAAACTTTAATAATAATGGGTTAAAATACCAAGATTTGTAGCCACTTTATT
CGAATCACTGATCCAAGTTCCGTTTGTATGGGTTATCTTTTTTTTTCTCAAGCTTCTAAA
CTAATAAGGTTCCGAACCTGTTAGCCAACTCGGTGGGTTATGTACTAAAATGTAATTGCA
TGTATTACTGAGTGTGAAAATAATTTCCTGAGTTTCATAAGGTAAA

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2G075JQ 264 0 0
CTACTCCTTTTGGTGGAGGAACCCCCGCTACTGCTGAGAAAGCTCCTTGAAAGCTTAAAA
AACTTTAATAATAATGGGTTAAAATACCAAGATTTGTAGCCACTTTATTCGAATCACTGA
TCCAAGTTCCGTTTGTATGGGTTATTTTTTTTTTTTTCAAGCTTTTAAACTAATAAGGTT
CCGAACCTGTTAGCCAACTCGGTGGGTTATGTACTAAAATGTAATTGCATGTATTACTGA
GTGTGAAAATAATTTCCTGAGTTT

QA 1 264 1 264
DS 

RD RR2FV91TF 522 0 0
GGAAGAACCCAACAATTATAATAGTACAAAAAAA**GATAAGAAAAATGGAGGCAGAGAA
GACACCACCGACGACAACAACGAC******GGAGAAGAAACCAGAGCAAGAAGTGAAAAA
CGACGACTTGCCGACAAACAGTCCTTACGTGGACGACTCTGGTAGCTTGGAGGATTATAA
AATGAAAGCTTATGGAGCCCAAGGCCACCAAGAGGTTAAGGCTGGCCTCGGTGGTGGATC
TACCGATGCTCCTACTCCTTCAGGTGGAGGAACCACCGCTACTGCTGAGAAAGCTCCTTG
AAAGCTTAAAAAACTTTAATAATAATGGATTAAAATACCAAGATTTGTAGCCACTTTGTT
CGAATCACTGATCCAAGTTCCGTTTGTATGGGTTATCTTTTTTTTTCTCAAGCTTCTAAA
CTAATAAGGTTCCGAACCTGTTAGCCAACTCGGTGGGTTATGTACTAAAATGTAATTGCA
TGTATTACTGAGTGTGAAAATAATTTCCTGAGTTT
CATAATG

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2G075TF 515 0 0
GGAAGAACCCAACAACTATAATAGTACAAAAAAAAAGAAAAGAAAAATGGAGGCAGGGAA
GACACCACCGGCGACGACAACGACACCGACGGAGAAGAAACCAGAGCAAGAAGTGAAAAA
CGACGACTTGCCGACAAACAGTCCTTACGTGGACGACTCTGGTAGCTTGGAGGATTATAA
AATGAAAGCTTATGGAGCCCAAGGCCACCAAGAGGTTAAGGCTGGCCTCGGTGGTGGATC
TACCGATGCTCCTACTCCTTCTGGTGGAGGAACCACCGCTACTGCTGAGAAAGCTCCTTG
AAAGCTTAAAAAACTTTAATAATAATGGGTTAAAATACCAAGATTTGTAGCCACTTTATT
CGAATCACTGATCCAAGTTCCGTTTGTATGGGTTATCTTTTTTTTTCTCAAGCTTCTAAA
CTAATAAGGTTCCGAACCTGTTAGCCAACTCGGTGGGTTATGTACTAAAATGTAATTGCA
TGTATTACTGAGTGTGAAAATAATTTCCTGAGTTT

QA 1 515 1 515
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2202Contig1 553 4 4 U
GGGTGACGTTTCGTTCATCGCTTCCTCCGAAGAAAGAGTCCCGAAGAAAGCACAAAAAAA
ATAAATAAAAAAGAGCTGTGAGATTTGAGATTTGAGATCATCTAAAGCAAAGCAAAGCCA
TGGATGCTATTGATTCCGTCGTCGATCCTCTCAGAGACTTCGCTAAGGATAGCATTCGTC
TCGTCAAGCGTTGTCACAAACCAGATCGCAAAGAATTCACGAAAGTTGCTGTTCGTACAG
CGATTGGGTTCGTTGTGATGGGATTCGTGGGCTTCTTTGTGAAGCTCATCTTTATTCCAA
TCAACAACATAATCGTCGGTGCCACTTAGGGAGCAAAGGACAGAATGAGAGAAAGGCAAA
AACTAGTTTTGAGATATGACAACTAGAGCATTTGCTGTTTTCAACAATTCGCACGTTATG
TTTATGTGTAATCGGATTTCATTTGTTTCTATCGTTTTTTTTTTCTTTAATTTTTGTTCA
CGACTGAAAAAATTGGACTCATCTTGAATGCAGATCAAACTAATTTAGAACCTTGTGGCC
GAGGATTTCATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F217JQ C 1
AF RR2E651TF U 98
AF RR2F217TF U 1
AF RR2BV01TF U 321
BS 1 103 RR2F217TF
BS 104 514 RR2E651TF
BS 515 532 RR2F217TF
BS 533 553 RR2BV01TF

RD RR2F217JQ 533 0 0
GGGTGACGTTTCGTTCATCGCTTCCTCCGAAGAAAGAGTCCCGAAGAAAGCACAAAAAAA
ATAAATAAAAAAGAGCTGTGAGATTTGAGATTTGAGATCATCTAAAGCAAAGCAAAGCCA
TGGATGCTATTGATTCCGTCGTCGATCCTCTCAGAGACTTCGCTAAGGATAGCATTCGTC
TCGTCAAGCGTTGTCACAAACCAGATCGCAAAGAATTCACGAAAGTTGCTGTTCGTACAG
CGATTGGGTTCGTTGTGATGGGATTCGTGGGCTTCTTTGTGAAGCTCATCTTTATTCCAA
TCAACAACATAATCGTCGGTGCCACTTAGGGAGCAAAGGACAGAATGAGAGAAAGGCAAA
AACTAGTTTTGAGATATGACAACTAGAGCATTTGCTGTTTTCAACAATTCGCACGTTATG
TTTATGTGTAATCGGATTTCATTTGTTTCTATCGTTTTTTTTTTCTTTAATTTTTGTTCA
CGACTGAAAAAATTGGACTCATCTTGAATGCAGATCAAACTAATTTAGAACC
C

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2E651TF 417 0 0
GGATCG
AAAGCAAAGCAAAGCCATGGATGCTATTGATTCCGTCGTCGATCCTCTCAGAGACTTCGC
TAAGGATAGCATTCGTCTCGTCAAGCGTTGTCACAAACCAGATCGCAAAGAATTCACGAA
AGTTGCTGTTCGTACAGCGATTGGGTTCGTTGTGATGGGATTCGTGGGCTTCTTTGTGAA
GCTCATCTTTATTCCAATCAACAACATAATCGTCGGTGCCACTTAGGGAGCAAAGGACAG
AATGAGAGAAAGGCAAAAACTAGTTTTGAGATATGACAACTAGAGCATTTGCTGTTTTCA
ACAATTCGCACGTTATGTTTATGTGTAATCGGATTTCATTTGTTTCTATCGTTTTTTTTT
TCTTTAATTTTTGTTCACGACTGAAAAAATTGGACTCATCTTGAATGCAGA

QA 7 417 7 417
DS 

RD RR2F217TF 533 0 0
GGGTGACGTTTCGTTCATCGCTTCCTCCGAAGAAAGAGTCCCGAAGAAAGCACAAAAAAA
ATAAATAAAAAAGAGCTGTGAGATTTGAGATTTGAGATCATCTAAAGCAAAGCAAAGCCA
TGGATGCTATTGATTCCGTCGTCGATCCTCTCAGAGACTTCGCTAAGGATAGCATTCGTC
TCGTCAAGCGTTGTCACAAACCAGATCGCAAAGAATTCACGAAAGTTGCTGTTCGTACAG
CGATTGGGTTCGTTGTGATGGGATTCGTGGGCTTCTTTGTGAAGCTCATCTTTATTCCAA
TCAACAACATAATCGTCGGTGCCACTTAGGGAGCAAAGGACAGAATGAGAGAAAGGCAAA
AACTAGTTTTGAGATATGACAACTAGAGCATTTGCTGTTTTCAACAATTCGCACGTTATG
TTTATGTGTAATCGGATTTCATTTGTTTCTATCGTTTTTTTTTTCTTTAATTTTTGTTCA
CGACTGAAAAAATTGGACTCATCTTGAATGCAGATCAAACTAATTTAGAACC
C

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2BV01TF 233 0 0
GCCACTTAGGGAGCAAAGGACAGAATGAGAGAAAGGCAAAAACTAGTTTTGAGATATGAC
AACTAGATCATTTGCTGTTTTCAACAATTCGCACGTTATGTTTATGTGTAATCGGATTTC
ATTTGTTTCTATCGTTTTTTTTTTCTTTAATTTTTGTTCACGACTGAAAAAATTGGACTC
ATCTTGAATGCAGATCAAACTAATTTAGAACCTTGTGGCCGAGGATTTCATTG

QA 1 233 1 233
DS 



AS 0 0

AS 2 4

CO CL2204Contig1 843 2 10 U
GGAACTACTCAACAAGAGAAGTAGAAAAGAAAAAGGGAACCGATTTCGAATTTTCCGCCG
CCTCCGTTGTCTTCGATCTCTTTCTGCTCATCACTTCCTCTCCTCACAGCTAATCTTCTG
ATAGCAAGGTTCTTTACGGATCTTTAACTCTTTTGATTCCGGAAGATGCTTCCTCTTTCG
CTGCTCAAGACTGCTCAAGGGCATCCCATGCTTGTGGAGCTCAAGAATGGAGAAACCTAC
AATGGGCATTTAGTAAATTGTGATACGTGGATGAACATTCATCTCCGTGAAGTCATCTGC
ACATCAAAGGTTATCTTCTGCCTTTTGTATAGTTTGTTACAAGACTTGCATATTATTCTC
TATTTCCTCATTGTCTGGTTGATGACACTTAAGATGTGTTGGCTTGTCCGCTTGATTTAC
GCTGTAGGACGGAGACAGGTTTTGGAGGATGCCCGAATGTTACATCCGCGGTAACACAAT
CAAGTACCTTCGAGTTCCAGATGAGGTAATTGATAAAGTACAGGAGGAGAAGACCCGCAC
AGATAGAAAACCACCAGGGGTTGGACGTGGAAGAGGGCGTGGTATGGATGATGGAGGGGG
CAGAGGCCGAGGCCGAGGAGCTCCAATGGCGAAGATGACTGGCAACAGAGGAGCAGGTCG
TGGCCGTGGTTGATGCAATAATTTATATAAAAAGACTATCCAATCTCTTCTGCTGCTGCT
GCACTCGCATTTTAAGAGTTCTCTTGTCTGTTTTTATTTCATCTTTGAGCAGAATATATA
AAACTAAATCACAATGAGCTGAATATAAAAAATTCGAAGCTGTTCTAAGCTTTATCTCTT
GCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2BO12TF U 1
AF RR2BO12JQ C 50
BS 1 650 RR2BO12TF
BS 651 651 RR2BO12JQ
BS 652 656 RR2BO12TF
BS 657 657 RR2BO12JQ
BS 658 692 RR2BO12TF
BS 693 693 RR2BO12JQ
BS 694 732 RR2BO12TF
BS 733 733 RR2BO12JQ
BS 734 747 RR2BO12TF
BS 748 843 RR2BO12JQ

RD RR2BO12TF 754 0 0
GGAACTACTCAACAAGAGAAGTAGAAAAGAAAAAGGGAACCGATTTCGAATTTTCCGCCG
CCTCCGTTGTCTTCGATCTCTTTCTGCTCATCACTTCCTCTCCTCACAGCTAATCTTCTG
ATAGCAAGGTTCTTTACGGATCTTTAACTCTTTTGATTCCGGAAGATGCTTCCTCTTTCG
CTGCTCAAGACTGCTCAAGGGCATCCCATGCTTGTGGAGCTCAAGAATGGAGAAACCTAC
AATGGGCATTTAGTAAATTGTGATACGTGGATGAACATTCATCTCCGTGAAGTCATCTGC
ACATCAAAGGTTATCTTCTGCCTTTTGTATAGTTTGTTACAAGACTTGCATATTATTCTC
TATTTCCTCATTGTCTGGTTGATGACACTTAAGATGTGTTGGCTTGTCCGCTTGATTTAC
GCTGTAGGACGGAGACAGGTTTTGGAGGATGCCCGAATGTTACATCCGCGGTAACACAAT
CAAGTACCTTCGAGTTCCAGATGAGGTAATTGATAAAGTACAGGAGGAGAAGACCCGCAC
AGATAGAAAACCACCAGGGGTTGGACGTGGAAGAGGGCGTGGTATGGATGATGGAGGGGG
CAGAGGCCGAGGCCGAGGAGCTCCAATGGCGAAGATGACTGGCAACAGAG*AGCAG*TCG
TGGCCGTGGTTGATGCAATAATTTATATAAAA*GACTATCCAATCTCTTCTGCTGCTGCT
GCACTCGCATTT*AAGAGTTCTCTTGT
CTGTTTT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2BO12JQ 794 0 0
ATTTTCCGCCGCCTCCGTTGTCTTCGATCTCTTTCTGCTCATCACTTCCTCTCCTCACAG
CTAATCTTCTGATAGCAAGGTTCTTTACGGATCTTTAACTCTTTTGATTCCGGAAGATGC
TTCCTCTTTCGCTGCTCAAGACTGCTCAAGGGCATCCCATGCTTGTGGAGCTCAAGAATG
GAGAAACCTACAATGGGCATTTAGTAAATTGTGATACGTGGATGAACATTCATCTCCGTG
AAGTCATCTGCACATCAAAGGTTATCTTCTGCCTTTTGTATAGTTTGTTACAAGACTTGC
ATATTATTCTCTATTTCCTCATTGTCTGGTTGATGACACTTAAGATGTGTTGGCTTGTCC
GCTTGATTTACGCTGTAGGACGGAGACAGGTTTTGGAGGATGCCCGAATGTTACATCCGC
GGTAACACAATCAAGTACCTTCGAGTTCCAGATGAGGTAATTGATAAAGTACAGGAGGAG
AAGACCCGCACAGATAGAAAACCACCAGGGGTTGGACGTGGAAGAGGGCGTGGTATGGAT
GATGGAGGGGGCAGAGGCCGAGGCCGAGGAGCTCCAATGGCGAAGATGACTGGCAACAGA
GGAGCAGGTCGTGGCCGTGGTTGATGCAATAATTTATATAAAAAGACTATCCAATCTCTT
CTGCTGCTGCTGCACTCGCATTTTAAGAGTTCTCTTGTCTGTTTTTATTTCATCTTTGAG
CAGAATATATAAAACTAAATCACAATGAGCTGAATATAAAAAATTCGAAGCTGTTCTAAG
CTTTATCTCTTGCT

QA 1 794 1 794
DS 



CO CL2204Contig2 718 2 6 U
GGACTCAACAAGAGAAGTAGAAAAGAAAAAGGGAACCGATTTCGAATTTTCCGCCGCCTC
CGTTGTCTTCGATCTCTTTCTGCTCATCACTTCCTCTCCTCACAGCTAATCTTCTGATAG
CAAGGTTCTTTACGGATCTTTAACTCTTTTGATTCCGGAAGATGCTTCCTCTTTCGCTGC
TCAAGACTGCTCAAGGGCATCCCATGCTTGTGGAGCTCAAGAATGGAGAAACCTACAATG
GGCATTTAGTAAATTGTGATACGTGGATGAACATTCATCTCCGTGAAGTCATCTGCACAT
CAAAGGACGGAGACAGGTTTTGGAGGATGCCCGAATGTTACATCCGCGGTAACACAATCA
AGTACCTTCGAGTTCCAGATGAGGTAATTGATAAAGTACAGGAGGAGAAGACCCGCACAG
ATAGAAAACCACCGGGGGTTGGACGTGGAAGAGGACGTGGTATGGATGATGGAGGGGGCA
GAGGCCGAGGCCGAGGAGCTCCAATGGCGAAGATGACTGGCAACAGAGGAGCAGGTCGTG
GCCGTGGTTGATGCCAACAACTTATATAAAAAGACTATCCAATCTCTGCTGCTGCTGCTG
CTGCACTCGCATTTTAAGAGTTCTCTTGTGTTTTTTTTTTGTCATCTTTGAGCTGAATAT
ATAAAACTAAATCACAATGAGCTGAATATAAAAAATTCGAAGCTGTTCTAAGCTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2E265TF U 1
AF RR2E265JQ C 292
BS 1 639 RR2E265TF
BS 640 640 RR2E265JQ
BS 641 694 RR2E265TF
BS 695 695 RR2E265JQ
BS 696 714 RR2E265TF
BS 715 718 RR2E265JQ

RD RR2E265TF 718 0 0
GGACTCAACAAGAGAAGTAGAAAAGAAAAAGGGAACCGATTTCGAATTTTCCGCCGCCTC
CGTTGTCTTCGATCTCTTTCTGCTCATCACTTCCTCTCCTCACAGCTAATCTTCTGATAG
CAAGGTTCTTTACGGATCTTTAACTCTTTTGATTCCGGAAGATGCTTCCTCTTTCGCTGC
TCAAGACTGCTCAAGGGCATCCCATGCTTGTGGAGCTCAAGAATGGAGAAACCTACAATG
GGCATTTAGTAAATTGTGATACGTGGATGAACATTCATCTCCGTGAAGTCATCTGCACAT
CAAAGGACGGAGACAGGTTTTGGAGGATGCCCGAATGTTACATCCGCGGTAACACAATCA
AGTACCTTCGAGTTCCAGATGAGGTAATTGATAAAGTACAGGAGGAGAAGACCCGCACAG
ATAGAAAACCACCGGGGGTTGGACGTGGAAGAGGACGTGGTATGGATGATGGAGGGGGCA
GAGGCCGAGGCCGAGGAGCTCCAATGGCGAAGATGACTGGCAACAGAGGAGCAGGTCGTG
GCCGTGGTTGATGCCAACAACTTATATAAAAAGACTATCCAATCTCTGCTGCTGCTGCTG
CTGCACTCGCATTTTAAGAGTTCTCTTGTGTTTTTTTTT*GTCATCTTTGAGCTGAATAT
ATAAAACTAAATCACAATGAGCTGAATATAAAAA*TTCGAAGCTGTTCTAAGCT
AAGC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2E265JQ 427 0 0
TCTGCACATCAA
AGGACGGAGACAGGTTTTGGAGGATGCCCGAATGTTACATCCGCGGTAACACAATCAAGT
ACCTTCGAGTTCCAGATGAGGTAATTGATAAAGTACAGGAGGAGAAGACCCGCACAGATA
GAAAACCACCGGGGGTTGGACGTGGAAGAGGACGTGGTATGGATGATGGAGGGGGCAGAG
GCCGAGGCCGAGGAGCTCCAATGGCGAAGATGACTGGCAACAGAGGAGCAGGTCGTGGCC
GTGGTTGATGCCAACAACTTATATAAAAAGACTATCCAATTTCTGCTGCTGCTGCTGCTG
CACTCGCATTTTAAGAGTTCTCTTGTGTTTTTTTTTTGTCATCTTTGAGCTGAATATATA
AAACTAAATCACAATGAGCTGAATATAAAAAATTCGAAGCTGTTTTAAGCTAAGC

QA 13 427 13 427
DS 



AS 1 2

CO CL2205Contig1 488 2 2 U
ACAAAAAGGAAAAATCCCTTTTCCGTCCAAAGCAAATCAAACCTAGGTAGAGATGATCAG
CATTCTCGCTCAGGAGCGTCTTCTCGGCTTCACGCTAGGTAGCGCCTTGACAGGTTTCAT
CGTCCTTGAGCAGCGAAAACTCATCCGTGAATCCGTCGCCGATCGTAAATCTCAATCCGT
CGATCAATCTCAGGTGAAAGAAGGCATATTCGGGAAGAAATATCGGATGGAGTTTGCGTC
TCTGTGGAACAAAGCTGTGGACCAGACCTTTGAACCTGCCATTCAATACCTTAGTTCACG
TAAATGGTAGAGAGAGAGAGAGATGGATACTTTCCGCTCAATCCTTGCCCTGTTTCTCTA
CTTATTGTTGCTTTATTTTTACAATTGTATGATGTTATCTTGTTGAATACACACTAGTAT
TCCTGTTTTGCTCTTTACTTTTCTTTGAGCACAGTGTTGTTGTGTTTACTGAGAATGTCC
TTTGGTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2CF90JQ C 1
AF RR2CF90TF U 1
BS 1 483 RR2CF90TF
BS 484 488 RR2CF90JQ

RD RR2CF90JQ 488 0 0
ACAAAAAGGAAAAATCCCTTTTCCGTCCAAAGCAAATCAAACCTAGGTAGAGATGATCAG
CATTCTCGCTCAGGAGCGTCTTCTCGGCTTCACGCTAGGTAGCGCCTTGACAGGTTTCAT
CGTCCTTGAGCAGCGAAAACTCATCCGTGAATCCGTCGCCGATCGTAAATCTCAATCCGT
CGATCAATCTCAGGTGAAAGAAGGCATATTCGGGAAGAAATATCGGATGGAGTTTGCGTC
TCTGTGGAACAAAGCTGTGGACCAGACCTTTGAACCTGCCATTCAATACCTTAGTTCACG
TAAATGGTAGAGAGAGAGAGAGATGGATACTTTCCGCTCAATCCTTGCCCTGTTTCTCTA
CTTATTGTTGCTTTATTTTTACAATTGTATGATGTTATCTTGTTGAATACACACTAGTAT
TCCTGTTTTGCTCTTTACTTTTCTTTGAGCACAGTGTTGTTGTGTTTACTGAGAATGTCC
TTTGGTCG

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2CF90TF 488 0 0
ACAAAAAGGAAAAATCCCTTTTCCGTCCAAAGCAAATCAAACCTAGGTAGAGATGATCAG
CATTCTCGCTCAGGAGCGTCTTCTCGGCTTCACGCTAGGTAGCGCCTTGACAGGTTTCAT
CGTCCTTGAGCAGCGAAAACTCATCCGTGAATCCGTCGCCGATCGTAAATCTCAATCCGT
CGATCAATCTCAGGTGAAAGAAGGCATATTCGGGAAGAAATATCGGATGGAGTTTGCGTC
TCTGTGGAACAAAGCTGTGGACCAGACCTTTGAACCTGCCATTCAATACCTTAGTTCACG
TAAATGGTAGAGAGAGAGAGAGATGGATACTTTCCGCTCAATCCTTGCCCTGTTTCTCTA
CTTATTGTTGCTTTATTTTTACAATTGTATGATGTTATCTTGTTGAATACACACTAGTAT
TCCTGTTTTGCTCTTTACTTTTCTTTGAGCACAGTGTTGTTGTGTTTACTGAGAATGTCC
TTT
GGTCG

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 4

CO CL2206Contig1 1164 4 3 U
GGGTTGAGCCTCAAACTAACGTTGACCACTACTACCACCATAATCACAACACTTCGAAAA
CCCTAGCCGTATCGTTCAACTTTTCAAATCCTTCACCTTCCTCGGTGGTTTGACTTTGCC
ACCGCCGGGGGAGGATCTTTATCCTCTTTCCTCCTTTTTCTTAAACCGTTTCCTGTATCT
CTATCAAAGGTGTGGCGGTGTTGAGGTAAGAATCATCGGTGGTCTTGGTGGTATGGATTT
CCGATGGTCCAAGTGGAAACCATTCCTCACGTGATGCGTATGGCATCATATTGCTCTCCT
TTGTTAATCTATGATCATTGTAGCGGGTTGTTGGTGGTTGTGAGCACGGGTCTCAGAGCT
GAATCTTCCAGCTTTGCGATTCTGGTGTTTAGATTTGTTGTGATGCCACAAACTGTGATG
TGGCGTTTGTGATACCTCTCTCC*ATGTCTGCCCATGTGTTTGAGGTTATGTTTGCGCCC
TTTCCTCGGTTTCACTGGCTCGGGTGTGTATGTGTGCTTTGGTTTTATATTTTATCAAGT
GGTTCTTGGTTGATTAAGTTAGTTGTGGTTCTGTTTCATGGTGTTTTTGGAAGTTTGTGG
TGAACGTTTTTTTTTTTTCTTGGATAATACTTTCCTCTCTGTTTCCCATTGAGCAAGTGG
TTTGGTTTCTTCAATTTCGGATTTCAACAGCAGGGGAATAAAAAGACTATCTTCACAGAA
TTAAAACATGATTCTGCGGAAAGAGTTTTCTTCACATCAAGCTTAGCTCTACTCAAGCTA
CTAGTGTAGATAAAAGCAGGGCATCCAGTTGTGAAGTAAAATGAACTTTGGATAGTGCAG
TCTCATTTGTATCTCAAGAAATCTCTGTTTGAGATATTTTGAATGCTTGGTCGCTGGAAT
ATGTGCAAGCAAATAGGAATGTGATAAGCTTTTAAAATTGCAGAGTGTAATCTTTGCAGA
AGCTGTATCACTGCATACATGATCTGGGGTACACCACCGGGTTCCACCTGTTGAAGGTGT
GAACGGTTTGTCTTTGTGTACTACTGCTTGGCTCAATAGCCTTCATATATTGGCTATTTT
CTTTTCATGCCTATTGGTGTGTTTTAAGTTTTTGTAACAACATTGTGCAACTTCTGCCTT
GGTGGCTTTATAACATTCAGCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA61TF U 1
AF RR2C327TF U 75
AF RR2GA61JQ C 641
AF RR2C327JQ C 391
BS 1 516 RR2GA61TF
BS 517 794 RR2C327TF
BS 795 1164 RR2C327JQ

RD RR2GA61TF 516 0 0
GGGTTGAGCCTCAAACTAACGTTGACCACTACTACCACCATAATCACAACACTTCGAAAA
CCCTAGCCGTATCGTTCAACTTTTCAAATCCTTCACCTTCCTCGGTGGTTTGACTTTGCC
ACCGCCGGGGGAGGATCTTTATCCTCTTTCCTCCTTTTTCTTAAACCGTTTCCTGTATCT
CTATCAAAGGTGTGGCGGTGTTGAGGTAAGAATCATCGGTGGTCTTGGTGGTATGGATTT
CCGATGGTCCAAGTGGAAACCATTCCTCACGTGATGCGTATGGCATCATATTGCTCTCCT
TTGTTAATCTATGATCATTGTAGCGGGTTGTTGGTGGTTGTGAGCACGGGTCTCAGAGCT
GAATCTTCCAGCTTTGCGATTCTGGTGTTTAGATTTGTTGTGATGCCACAAACTGTGATG
TGGCGTTTGTGATACCTCTCTCC*ATGTCTGCCCATGTGTTTGAGGTTATGTTTGCGCCC
TTTCCTCGGTTTCACTGGCTCGGGTGTGTATGTGTG

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2C327TF 734 0 0
TTCAACTTTTCAAATCCTTCACCTTCCTCGGTGGTTTGGCTTTGCCACCGCCGGGGGAGG
ATCTTTATCCTCTTTCCTCCTTTTTCTTAAACCGTTTCCTGTATCTCTATCAAAGGTGTG
GCGGTGTTGAGGTAAGAATCATCGGTGGTCTTGGTGGTATGGATTTCCGATGGTCCAAGT
GGAAACCATTCCTCACGTGATGCGTATGGCATCATATTGCTCTCCTTTGTTAATCTATGA
TCATTGTAGCGGGTTGTTGGTGGTTGTGAGCACGGGTCTCAGAGCTGAATCTTCCAGCTT
TGCGATTCTGGTGTTTAGATTTGTTGTGATGCCACAAACTGTGATGTGGCGTTTGTGATA
CCTCTCTCC*ATGTCTGCCCATGTGTTTGAGGTTATGTTTGCGCCCTTTCCTCGGTTTCA
CTGGCTCGGGTGTGTATGTGTGCTTTGGTTTTATATTTTATCAAGTGGTTCTTGGTTGAT
TAAGTTAGTTGTGGTTCTGTTTCATGGTGTTTTTGGAAGTTTGTGGTGAACGTTTTTTTT
TTTTCTTGGATAATACTTTCCTCTCTGTTTCCCATTGAGCAAGTGGTTTGGTTTCTTCAA
TTTCGGATTTCAACAGCAGGGGAATAAAAAGACTATCTTCACAGAATTAAAACATGATTC
TGCGGAAAGAGTTTTCTTCACATCAAGCTTAGCTCTACTCAAGCTACTAGTGTAGATAAA
GCAGGCATCCAGTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2GA61JQ 484 0 0
GTTTCCCATTGAGCAAGTGGTTTGGTTTCTTCAATTTCGGATTTCAACAGCAGGGGAAAA
AGAAGACTATCTTCACAGAATTAAAACATGATTCTGCGGAAAGAGTTTTCTTCACATCAG
GCTGAGCTCTACTCAAGGTACTAGTGTAGATAAAAGCAGGGTATCCAGTTGTGAAGTAAA
ATGAACTTTGGATAGTGCAGTCTCATTTGTATCTCAAGAAATCTCTGTTTGAGATATTTT
GAATGCTTGGTCGCTGGAATATGTGCAAGCAAATAGGAATGTGATAAGCTTTTAAAATTG
CAGAGTGTAATCTTTGCAGAAGCTGTATCACTGCATACATGATCTGGGGTACACCACCGG
GTTCCACCTGTTGAAGGTGTGAACGGTTTGTCTTTGTGTACTATTGCTTGGCTCAATAGC
CTTCATATATTGGCTATTTTCTTTTCATGCCTATTGGTGTGTTTTAAGTTTTTGTGACAA
CATT

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2C327JQ 774 0 0
AGATTTGTTGTGATGCCACAAACTGTGATGTGGCGTTTGTGATACCTCTCTCCCATGTCT
GCCCATGTGTTTGAGGTTATGTTTGCGCCCTTTCCTCGGTTTCACTGGCTCGGGTGTGTA
TGTGTGCTTTGGTTTTATATTTTATCAAGTGGTTCTTGGTTGATTAAGTTAGTTGTGGTT
CTGTTTCATGGTGTTTTTGGAAGTTTGTGGTGAACGTTTTTTTTTTTTCTTGGATAATAC
TTTCCTCTCTGTTTCCCATTGAGCAAGTGGTTTGGTTTCTTCAATTTCGGATTTCAACAG
CAGGGGAATAAAAAGACTATCTTCACAGAATTAAAACATGATTCTGCGGAAAGAGTTTTC
TTCACATCAAGCTTAGCTCTACTCAAGCTACTAGTGTAGATAAAAGCAGGGCATCCAGTT
GTGAAGTAAAATGAACTTTGGATAGTGCAGTCTCATTTGTATCTCAAGAAATCTCTGTTT
GAGATATTTTGAATGCTTGGTCGCTGGAATATGTGCAAGCAAATAGGAATGTGATAAGCT
TTTAAAATTGCAGAGTGTAATCTTTGCAGAAGCTGTATCACTGCATACATGATCTGGGGT
ACACCACCGGGTTCCACCTGTTGAAGGTGTGAACGGTTTGTCTTTGTGTACTACTGCTTG
GCTCAATAGCCTTCATATATTGGCTATTTTCTTTTCATGCCTATTGGTGTGTTTTAAGTT
TTTGTAACAACATTGTGCAACTTCTGCCTTGGTGGCTTTATAACATTCAGCGTC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL2208Contig1 894 2 4 U
GCGAAAATGCACCAAGTTATAACGAGCATGTAGGTAGTAGTTCATTAACGCTGCAGGCCA
GCTTTGATGTAAGCTGCGTAAAGATCCATGGAGTCCTTAATCCCGTCTATGGCAGCTTGA
GCAGGGAGGAAACCTTCAACATCCACTTTCTTGTTCTCGTTCTTCTTGTAATCCTCGAAA
AAGCGGCGGATTTCACCTAGACGGTGAGGAGGAAGCTCTTTGATATCTCTGTAATGACGG
AACTCGGGATCATCTGCACAAACTGCAATGATCTTGTCGTCTTTTTCACCCTGATCAATC
ATGGGCATTAACCCAATAGCACGAGCACGAAGGAAGGATCCAGTTAGCACAGGCTCCTGC
ATGAGTACCAGGACATCTATAGGATCACTGTCTTCACAAATGGTTCGAGGAATGAAGCCG
TAGTTGTGTGGGTACACAATGGATTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGT
GGTAGCCGTTTCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTAATTCTCCGTCACCCGTTAC
CACCATGGTAGGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGATGC
GTCGCCAGCACAAAGGCCATGCGATCCGTCGAGTTATCATGAATCATCAGAGCAACGGGC
AGAGCCCGCGTCGACCTTTTATCTAATAAATGCATCCCTTCCAGAAGTCGGGGTTTGTTG
CACGTATTAGCTCTAGAATTACTACGGTTATCCGAGTAGTAGTTACCATCAAACAAACTA
TAACTGATTTAATGAGCCATTCGCAGTTTCACAGTCTGAATTCGTTCATACTTACACATG
CATGGCTTAATCTTTGAGACAAGCATATGACTACTGGCAGGATCAACCAGGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX75JQ U 1
AF RR2DV27TF C 286
BS 1 323 RR2FX75JQ
BS 324 324 RR2DV27TF
BS 325 417 RR2FX75JQ
BS 418 894 RR2DV27TF

RD RR2FX75JQ 417 0 0
GCGAAAATGCACCAAGTTATAACGAGCATGTAGGTAGTAGTTCATTAACGCTGCAGGCCA
GCTTTGATGTAAGCTGCGTAAAGATCCATGGAGTCCTTAATCCCGTCTATGGCAGCTTGA
GCAGGGAGGAAACCTTCAACATCCACTTTCTTGTTCTCGTTCTTCTTGTAATCCTCGAAA
AAGCGGCGGATTTCACCTAGACGGTGAGGAGGAAGCTCTTTGATATCTCTGTAATGACGG
AACTCGGGATCATCTGCACAAACTGCAATGATCTTGTCGTCTTTTTCACCCTGATCAATC
ATGGGCATTAACCCAATAGCACGGGCACGAAGGAAGGATCCAGTTAGCACAGGCTCCTGC
ATGAGTACCAGGACATCTATAGGATCACTGTCTTCACAAATGGTTCGAGGAATGAAG

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR2DV27TF 609 0 0
TCACCCTGATCAATCATGGGCATTAACCCAATAGCACGAGCACGAAGGAAGGATCCAGTT
AGCACAGGCTCCTGCATGAGTACCAGGACATCTATAGGATCACTGTCTTCACAAATGGTT
CGAGGAATGAAGCCGTAGTTGTGTGGGTACACAATGGATTGGGTAATTTGCGCGCCTGCT
GCCTTCCTTGGATGTGGTAGCCGTTTCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTAATTC
TCCGTCACCCGTTACCACCATGGTAGGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAG
AAATTTGAATGATGCGTCGCCAGCACAAAGGCCATGCGATCCGTCGAGTTATCATGAATC
ATCAGAGCAACGGGCAGAGCCCGCGTCGACCTTTTATCTAATAAATGCATCCCTTCCAGA
AGTCGGGGTTTGTTGCACGTATTAGCTCTAGAATTACTACGGTTATCCGAGTAGTAGTTA
CCATCAAACAAACTATAACTGATTTAATGAGCCATTCGCAGTTTCACAGTCTGAATTCGT
TCATACTTACACATGCATGGCTTAATCTTTGAGACAAGCATATGACTACTGGCAGGATCA
ACCAGGTAC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 3

CO CL2209Contig1 1055 3 9 U
GGAGTTGTTGTTTGTCTTTGAAACTTGAAAGCTCTCACAAGAAAATCTACACAACCTGTA
GAGTGTTCGGATTACCTTTCAGCAACAATGAGTTATTCTCATCAAAGCATGGCTTCTGGT
AGTCGAAATGCAAGGGGATATGAATTTGGAAGGACTTATGTTGTGAGGCCTAAAGGAAAG
CATCAAGCCACTCTAGTATGGCTTCATGGTCTCGGTGACAATGGTTCTAGCTCATCTCAG
CTCATGGAAAGCTTGCATCTTCCAAATATAAAATGGATTTGCCCGACTGCTCCTACGCGT
CCTGTTTCAAGTCTTGGTGGATATACCTGCACTGCTTGGTTTGATGTTGGGGAAATTTCT
GAAGACAGTCATGATGATTTGGAAGGTTTAGATGCTTCAGCTTCACATATTGCTAACCTT
TTGTCCTCTGAACCAGCAGATGTTAAAGTGGGAATAGGAGGTTTTAGTATGGGAGCAGCG
ATATCTCTTTACTCTGCCACTTGCTATGCTCTTGGACGTTATGGACCTGGCCACACATAC
CCTATTAACTTACGAGCTGTTGTAGGACTCAGCGGCTGGCTTCCTGGTTGGAAGAGCTTA
AGGAACAAAATAGAATGCTCGTATGAGGCTGCAAGACGTGCTGCATCTTTACCAATCATA
CTTACACATGGAACTGCCGATGATTTGGATCCCTATAGGTTTGGAGAGAAATCTGCGCAG
TCTCTTGGCATGGCTGGATTTCGACAAGCTGTCTTCAAGCCATACGAAGGACTTGGTCAC
TACACTGTTCCAAAAGAACTGGATGAAGTCGTTCAGTGGCTCACAACAAGGCTCGGGCTG
GAGGGCTCACGCTAAACAGTACAGACTGCCATGCATCTAGCAATATAGGCCCTATGGTCG
ACCACAAATAACTTGAGATAGTATAATGTATAATGGGTGGGTTTCTTTGGCGGGGGGTTA
TATAGTTCGTTGTTTTTGGGATTTATTTTGTCGCTTGTTGTTTTGTTTGTCCATGTTGGA
ATATTGATCATGAATAAAGTAATGCTACAAAGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G638TF U 1
AF RR2EG44TF U 286
AF RR2G638JQ C 756
BS 1 688 RR2G638TF
BS 689 689 RR2EG44TF
BS 690 698 RR2G638TF
BS 699 699 RR2EG44TF
BS 700 735 RR2G638TF
BS 736 887 RR2EG44TF
BS 888 888 RR2G638JQ
BS 889 1034 RR2EG44TF
BS 1035 1055 RR2G638JQ

RD RR2G638TF 735 0 0
GGAGTTGTTGTTTGTCTTTGAAACTTGAAAGCTCTCACAAGAAAATCTACACAACCTGTA
GAGTGTTCGGATTACCTTTCAGCAACAATGAGTTATTCTCATCAAAGCATGGCTTCTGGT
AGTCGAAATGCAAGGGGATATGAATTTGGAAGGACTTATGTTGTGAGGCCTAAAGGAAAG
CATCAAGCCACTCTAGTATGGCTTCATGGTCTCGGTGACAATGGTTCTAGCTCATCTCAG
CTCATGGAAAGCTTGCATCTTCCAAATATAAAATGGATTTGCCCGACTGCTCCTACGCGT
CCTGTTTCAAGTCTTGGTGGATATACCTGCACTGCTTGGTTTGATGTTGGGGAAATTTCT
GAAGACAGTCATGATGATTTGGAAGGTTTAGATGCTTCAGCTTCACATATTGCTAACCTT
TTGTCCTCTGAACCAGCAGATGTTAAAGTGGGAATAGGAGGTTTTAGTATGGGAGCAGCG
ATATCTCTTTACTCTGCCACTTGCTATGCTCTTGGACGTTATGGACCTGGCCACACATAC
CCTATTAACTTACGAGCTGTTGTAGGACTCAGCGGCTGGCTTCCTGGTTGGAAGAGCTTA
AGGAACAAAATAGAATGCTCGTATGAGGCTGCAAGACGTGCTGCATCTTTACCAATCATA
CTTACACATGGAACTGCCGATGATTTGG*TCCCTATAG*TTTGGAGAGAAATCTGCGCAG
TCTCTTGGCATGGCT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2EG44TF 752 0 0
ACTGCTCCTACGCGTCCTGTTTCAAGTCTTGGTGGATATACCTGCACTGCTTGGTTTGAT
GTTGGGGAAATTTCTGAAGACAGTCATGATGATTTGGAAGGTTTAGATGCTTCAGCTTCA
CATATTGCTAACCTTTTGTCCTCTGAACCAGCAGATGTTAAAGTGGGAATAGGAGGTTTT
AGTATGGGAGCAGCGATATCTCTTTACTCTGCCACTTGCTATGCTCTTGGACGTTATGGA
TCTGGCCACACATACCCTATTAACTTACGAGCTGTTGTAGGACTCAGCGGCTGGCTTCCT
GGTTGGAAGAGCTTAAGGAACAAAATAGAATGCTCGTATGAGGCTGCAAGACGTGCTGCA
TCTTTACCAATCATACTTACACATGGAACTGCCGATGATTTGGATCCCTATAGGTTTGGA
GAGAAATCTGCGCAGTCTCTTGGCATGGCTGGATTTCGACAAGCTGTCTTCAAGCCATAC
GAAGGACTTGGTCACTACACTGTTCCAAAAGAACTGGATGAAGTCGTTCAGTGGCTCACA
ACAAGGCTCGGGCTGGAGGGCTCACGCTAAACAGTACAGACTGCCATGCATCTAGCAATA
TATGCCCTATGGTCGACCACAAATAACTTGAGATAGTATAATGTATAATGGGTGGGTTTC
TTTGGCGGGGGGTTATATAGTTCGTTGTTTTTGGGATTTATTTTGTCGCTTGTTGTTTTG
TTTGTCCATGTTGGAATATTGATCATGAA
AAA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2G638JQ 300 0 0
CAAGCCGTAGGAAGGACTTGGTCACTACACTGTTCCAAAAGAACTGGATGAAGTCGTTCA
GTGGCTCACAACAAGGCTCGGGCTGGAGGGCTCACGCTAAACAGTACAGACTGCCATGCA
TCTAGCAATATAGGCCCTATGGTCGACCACAAATAACTTGAGATAGTATAATGTATAATG
GGTGGGTTTCTTTGGCGGGGGGTTATATAGTTCGTTGTTTTTGGGATTTATTTTGTCGCT
TGTTGTTTTGTTTGTCCATGTTGGAATATTGATCATGAATAAAGTAATGCTACAAAGGTC

QA 1 300 1 300
DS 



AS 1 3

CO CL2210Contig1 1149 3 13 U
GGATAAATGGATTGGCGGGAGCTGGGGGCGGGATCATTGCTCAACTCCTCACTTATCCTC
TCCAAACTGTGAATACGCGCCAACAGACGGAGCGGGATCTCAAGAGGGAGAGGAAGAAAC
TTGGCACTTTCCAACACATGTGCCAGGTTGTGAAACAAGAAGGATGGGGGCGACTGTATG
GTGGATTGGCTCCGTCTCTCGTTGGAACCGCTGCGTCACAGGGTGTGTACTATTACTTCT
ACCAAGTGTTTCGGAACCAAGTTGAAGCTGCTGCTCTTCGACAAAAGAAGAAAGGCTTGG
GTGACGGATCTGTTGGCATGTTTTCTTCTCTCCTTGTTGCTGCCTTAGCTGGATCAGTTA
ATGTTCTTATGACGAATCCAATTTGGGTGATTGTTACACGCATGCAGACCCACAAAAAAA
TTCCAAAAGGTCTACAGACGGTCCCCGAGCCACCTTCTGCTGATGTAGAAGCTCTTGTTC
CAGTTGAGCCTCGTCCATACGGAACCTTTAACACGATTCAAGAGATTTACGATGAAGCTG
GAGTGACTGGCTTCTGGAAAGGTGTAATTCCGACATTGATCATGGTTTGTAATCCAGCAA
TGCAATTTATGTTATATGAAACAATGTTATCAAAGCTGAAGAAAAAACGTGCGCTCAAGG
GTAGCACCAACGTGACGGCTTTGGAGACATTTCTTCTAGGAGCTGTGGCTAAACTCGGAG
CTACAGTCACAACCTATCCTCTCTTGGTTGTAAAGTCACGACTTCAAGCCAAACAGGTCA
CAACAGGGGACAAAAGACAACATTACAAAGGAACGCTGGATGCGATTCTGAAGATGATAC
GATACGAAAGGGCTGCACGGGTTCTACAAAGGGATGAGCACGAAGATTGTTCAGAGCGTT
TTCGCTGCTGCTGTTCTGTTCATGATCAAGGAAGAGCTTGTCAAGGGTGCTAAGCTTTTG
CTTTCCAACGCCACTTTTATCAAGTCCAAGCCTTCTTGAAAGCTCAATCCAACTAGGATT
TTGGAAATGAGATTGAAAAAAAAGAGAGGTTAAATTAAAGTTTCAATAATTTCTTGATTA
TGTAGTTGTTATCACACACTCTTGGAATGTCATGTTCCTGATTATTGCAATTAAGTATTG
TATTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS77TF U 1
AF RR2C611TF U 203
AF RR2B036JQ C 476
BS 1 604 RR2CS77TF
BS 605 605 RR2C611TF
BS 606 610 RR2CS77TF
BS 611 611 RR2C611TF
BS 612 642 RR2CS77TF
BS 643 697 RR2C611TF
BS 698 698 RR2B036JQ
BS 699 781 RR2C611TF
BS 782 782 RR2B036JQ
BS 783 844 RR2C611TF
BS 845 845 RR2B036JQ
BS 846 962 RR2C611TF
BS 963 1149 RR2B036JQ

RD RR2CS77TF 642 0 0
GGATAAATGGATTGGCGGGAGCTGGGGGCGGGATCATTGCTCAACTCCTCACTTATCCTC
TCCAAACTGTGAATACGCGCCAACAGACGGAGCGGGATCTCAAGAGGGAGAGGAAGAAAC
TTGGCACTTTCCAACACATGTGCCAGGTTGTGAAACAAGAAGGATGGGGGCGACTGTATG
GTGGATTGGCTCCGTCTCTCGTTGGAACCGCTGCGTCACAGGGTGTGTACTATTACTTCT
ACCAAGTGTTTCGGAACCAAGTTGAAGCTGCTGCTCTTCGACAAAAGAAGAAAGGCTTGG
GTGACGGATCTGTTGGCATGTTTTCTTCTCTCCTTGTTGCTGCCTTAGCTGGATCAGTTA
ATGTTCTTATGACGAATCCAATTTGGGTGATTGTTACACGCATGCAGACCCACAAAAAAA
TTCCAAAAGGTCTACAGACGGTCCCCGAGCCACCTTCTGCTGATGTAGAAGCTCTTGTTC
CAGTTGAGCCTCGTCCATACGGAACCTTTAACACGATTCAAGAGATTTACGATGAAGCTG
GAGTGACTGGCTTCTGGAAAGGTGTAATTCCGACATTGATCATGGTTTGTAATCCAGCAA
TGCA*TTTATTTTATATGAAACAATGTTATCAAAGCTGAAGA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2C611TF 762 0 0
G
GGAACCGCTGCGTCACAGGGTGTGTACTATTACTTCTACCAAGTGTTTCGGAACCAAGTT
GAAGCTGCTGCTCTTCGACAAAAGAAGAAAGGCTTGGGTGACGGATCTGTTGGCATGTTT
TCTTCTCTCCTTGTTGCTGCCTTAGCTGGATCAGTTAATGTTCTTATGACGAATCCAATT
TGGGTGATTGTTACACGCATGCAGACCCACAAAAAAATTCCAAAAGGTCTACAGACGGTC
CCCGAGCCACCTTCTGCTGATGTAGAAGCTCTTGTTCCAGTTGAGCCTCGTCCATACGGA
ACCTTTAACACGATTCAAGAGATTTACGATGAAGCTGGAGTGACTGGCTTCTGGAAAGGT
GTAATTCCGACATTGATCATGGTTTGTAATCCAGCAATGCAATTTATGTTATATGAAACA
ATGTTATCAAAGCTGAAGAAAAAACGTGCGCTCAAGGGTAGCACCAACGTGACGGCTTTG
GAGACATTTCTTCTTGGAGCTGTGGCTAAACTCGGAGCTACAGTCACAACCTATCCTCTC
TTGGTTGTAAAGTCACGACTTCAAGCCAAACAGGTCACCACAGGGGACAAAAGACAACAT
TACAAAGGAACGCTGGATGCGATTCTGAAGATGATACGATATGAAAGGGCTGCACGGGTT
CTACAAAGGGATGAGCACGAAGATTGTTCAGAGCGTTTTCGCTGCTGCTGTTCTGTTCAT
GATCAAGGAAGAGCTTGTCAAGGGTGCTAAGCTTTTGCT
CT

QA 2 760 2 760
DS 

RD RR2B036JQ 674 0 0
TGTTCCAGTTGAGCCGCGTCCATACGGAACCTTTAACACGATTCAAGAGATTTACGATGA
AGCTGGAGTGACTGGCTTCTGGAAAGGTGTAATTCCGACATTGATCATGGTTTGTAATCC
AGCAATGCAATTTATGTTATACGAGACAATGTTATCAAAGCTGAAGAAAAAACGTGCGCT
CAAGGGTAGCACCAACGTGACGGCTTTGGAGACATTTTTTTTAGGAGCTGTGGCTAAACT
CGGAGCTACAGTCACAACCTATCCTTTTTTGGTTGTAAAGTCACGACTTCAAGCCAAACA
GGTCACAACAGGGGACAAAAGACAACATTACAAAGGAACGCTGGATGCGATTTTGAAGAT
GATACGATACGAA*GGGCTGCACGGGTTTTACAAAGGGATGAGCACGAAGATTGTTCAGA
GCGTTTTCGCTGCTGCTGTTCTGTTCATGATCAAGGAAGAGCTTGTGAAGGGTGTTAAGC
TTTTGCTTTCCAACGCCACTTTTATCAAGTCCAAGCCTTCTTGAAAGCTCAATCCAACTA
GGATTTTGGAAATGAGATTGAAAAAAAAGAGAGGTTAAATTAAAGTTTCAATAATTTCTT
GATTATGTAGTTGTTATCACACACTCTTGGAATGTCATGTTCCTGATTATTGCAATTAAG
TATTGTATTTTTGC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 4

CO CL2211Contig1 1052 4 9 U
GGCTTAAAAGTCTTTGAAACAGATTGCCTTCACAATTCGTATACATGAGGGGATAAAATT
AGTATCAGGAAGGGTCTGTTGAGTCAAAAATGTACGTCCAATATAACTGAAAAATAAGCA
AATTTGATAGAAAAAAAAAACAAAGAAGAAATCATCACAGAGAAAGATATAGAGAGAAAA
CAGAGTATAATACCCCAAAATGTGTAACGCCGTTTTGATTCCTGCGCTTACATACGTTGA
AATTGTAGATGATGCGGGGAAGCTGCTGATAGTTGTTATTTGGGAGAAGCTAAGGTGAGT
TTTAGGATGAAACCGATGATGAGTCCGATTAGTCCAACCAAAGCTGCCAACTTCAAGGAT
AGCCCGCTGTTACTCTGGTTTCTCCGTCTCTTCACCATCTCCAGTTCATGTTGCAGCTGT
TGTGTTTGCTTAACGGCTGCATCTCGCTCTTCCTTCAGCCGCTGTATAGTAGAGATGGTA
TCAGAGCCATTTCCATCGCCATTGGTTGCTCCAGATTCAGAGGATCTTTGGGTTGTAGAG
GGGGAGATATACGAGACCTTGAGCTTACACTCTGTTAACGTTTTCCCACTATCCTTAGTG
AAAGTGTCTTGTGGAAGTTCATCAACATCAGTGTGTGGGGGTACGATGGTGCTTTGAAGG
AGAAACTTGTCTTTGCACTGCATATCTGGAGGATACTCCCGTTGCGCTTGTAGGGTAACT
CTAATGATGCAGGAGTCCCAGGGCTGAATAACACCAGTGTTGGGTCTTACAAAATACTTT
TTTGGTGATGTTGTTTTCACCTTGAAAGCAACATAGTTCTCAGTTTTATTGGCGACTTTA
AGATCACAATAGCTTTGCTTCTCAAGTTCAAAAAGAAATTTGAGTTCATCAGGTACAATG
GAGATAAGCTGATTCTCGCCAACGCCAGACATTGCAACAGAGTTTCAACAAGAATCAATC
TCTCTACAATTCTTCAAACCTGTAAGCCACGTCCAAATCCAAACCCCTAATTCAAACAAT
TACGATTCTTTTTTTTTTATTTTACGGGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H523JQB U 1
AF RR2BR23JQ U 252
AF RR2EB92JQ U 44
AF RR2BR23TF C 382
BS 1 221 RR2H523JQB
BS 222 222 RR2EB92JQ
BS 223 326 RR2H523JQB
BS 327 327 RR2EB92JQ
BS 328 467 RR2H523JQB
BS 468 732 RR2EB92JQ
BS 733 733 RR2BR23TF
BS 734 820 RR2EB92JQ
BS 821 1052 RR2BR23TF

RD RR2H523JQB 467 0 0
GGCTTAAAAGTCTTTGAAACAGATTGCCTTCACAATTCGTATACATGAGGGGATAAAATT
AGTATCAGGAAGGGTCTGTTGAGTCAAAAATGTACGTCCAATATAACTGAAAAATAAGCA
AATTTGATAGAAAAAAAAAACAAAGAAGAAATCATCACAGAGAAAGATATAGAGAGAAAA
CAGAGTATAATACCCCAAAATGTGTAACGCCGTTTTGATTCTTGCGCTTACATACGTTGA
AATTGTAGATGATGCGGGGAAGCTGCTGATAGTTGTTATTTGGGAGAAGCTAAGGTGAGT
TTTAGGATGAAACCGATGATGAGTCCAATTAGTCCAACCAAAGCTGCCAACTTCAAGGAT
AGCCCGCTGTTACTCTGGTTTCTCCGTCTCTTCACCATCTCCAGTTCATGTTGCAGCTGT
TGTGTTTGCTTAACGGCTGCATCTCGCTCTTCCTTCAGCCGCTGTAT

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2BR23JQ 227 0 0
ATGCGGGGAAGCTGCTGATAGTTGTTATTTGGGAGAAGCTAAGGTGAGTTTTAGGATGAA
ACCGATGATGAGTCCGATTAGTCCAACCAAAGCTGCCAACTTCAAGGATAGCCCGCTGTT
ACTCTGGTTTCTCCGTCTCTTCACCATCTCCAGTTCATGTTGCAGCTGTTGTGTTTGCTT
AACGGCTGCATCTCGCTCTTCCTTCAGCCGCTGTATAGTAAAGATGG

QA 1 227 1 227
DS 

RD RR2EB92JQ 777 0 0
CATGAGGGGATAAAATTAGTATCAGGAAGGGTCTGTTGAGTCAAAAATGTACGTCCAATA
TAACTGAAAAATAAGCAAATTTGATAGAAAAAAAAA*CAAAGAAGAGATCATCACAGAGA
AAGATATAGAGAGAAAACAGAGTATAATACCCCAAAATGTGTAACGCCGTTTTGATTCCT
GCGCTTACATACGTTGAGATTGTAGATGATGCGGGGAAGCTGCTGATAGTTGTTATTTGG
GAGAAGCTAAGGTGAGTTTTAGGATGAAACCGATGATGAGTCCGATTAGTCCAACCAAGG
CTGCCAACTTCAAGGATAGCCCGCTGTTACTCTGGTTTCTCCGTCTCTTCACCATCTCCA
GTTCATGTTGCAGCTGTTGTGTTTGCTTAACGGCTGCATCTCGCTCTTCCTTCAGCCGCT
GTATAGTAGAGATGGTATCAGAGCCATTTCCATCGCCATTGGTTGCTCCAGATTCAGAGG
ATCTTTGGGTTGTAGAGGGGGAGATATACGAGACCTTGAGCTTACACTCTGTTAACGTTT
TCCCACTATCCTTAGTGAAAGTGTCTTGTGGAAGTTCATCAACATCAGTGTGTGGGGGTA
CGATGGTGCTTTGAAGGAGAAACTTGTCTTTGCACTGCATATCTGGAGGATACTCCCGTT
GCGCTTGTAGGGTAACTCTAATGATGCAG*AGTCCCAGGGCTGAATAACACCAGTGTTGG
GTCTTACAAAATACTTTTTTGGTGATGTTGTTTTCACCTTGAAAGCAACATAGTTCT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2BR23TF 671 0 0
CTCCGTCTCTTCACCATCTCCAGTTCATGTTGCAGCTGTTGTGTTTGCTTAACGGCTGCA
TCTCGCTCTTCCTTCAGCCGCTGTATAGTAGAGATGGTATCAGAGCCATTTCCATCGCCA
TTGGTTGCTCCA*ATTCAGAGGATCTTTGGGTTGTAGAGGGGGAGATATACGAGACCTTG
AGCTTACACTCTGTTAACGTTTTCCCACTATCCTTAGTGAAAGTGTCTTGTGGAAGTTCA
TCAACATCAGTGTGTGGGGGTACGATGGTGCTTTGAAGGAGAAACTTGTCTTTGCACTGC
ATATCTGGAGGATACTCCCGTTGCGCTTGTAGGGTAACTCTAATGATGCAGGAGTCCCAG
GGCTGAATAACACCAGTGTTGGGTCTTACAAAATACTTTTTTGGTGATGTTGTTTTCACC
TTGAAAGCAACATAGTTCTCAGTTTTATTGGCGACTTTAAGATCACAATAGCTTTGCTTC
TCAAGTTCAAAAAGAAATTTGAGTTCATCAGGTACAATGGAGATAAGCTGATTCTCGCCA
ACGCCAGACATTGCAACAGAGTTTCAACAAGAATCAATCTCTCTACAATTCTTCAAACCT
GTAAGCCACGTCCAAATCCAAACCCCTAATTCAAACAATTACGATTCTTTTTTTTTTATT
TTACGGGAATC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 4

CO CL2212Contig1 737 4 6 U
AGCTAAAGAAAATTCATTAAAATGAGGTAGACGATTAGATCAAATTTCGTATATGTCTGC
TCATCAGAGTTAAAAAACAAAAGAGAAACAACTCATTAAAACAAAAACAAAAACAAAAAA
AAATGAGAGAAGAGATATTCCACTACTGGTTTCCAATGCAAACTCATTCCATATAATATC
TAAATCTCAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGCTTTGTGATCTTGGATTTTAGATGGCAGCT
GCGATCCTTCCAGCGACTTGGTCAAGATCTCTCTGACCACTTGATGTGATCTTCCTCCCA
CCTTTAGTGTCAAGGTCGACAATGTTCATAATCTGGAGCTGCTGAAGAATGTGACGAGCG
ACACCACCACTGCTCTTGCAGAAATGAGGTGGTCTGCTTCCGTTCCTCTTGCTTCCTCCA
TAGATTCTTCTGAAGGCACCAACTCCAAGTCCACCTCTCAGGTACACTTTCCTTGCCATT
GACGCGGCTCTGATGTAGTACCAGTCAGGGTCATAAGGAGCAAGCTCCTTAAGTTTACCA
GTCTTGACTATGTCTGTCCACGGTGGCAGCTCGATCTTGCCGGAGCGCTTAAGATGGGCA
GCGTATGCCTTGACGAACTCGTGGGGAGAGACATCCTTCACCGTTTTGCCTGTCGCCATT
ATTGTTCCTGCTTCTTCTTCCTACTTCGTCGTCAGCGGCGCTGCTAGAGGCGTATAATAT
TATTCGAGTGGGAGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2GB29JQ U 234
AF RR2GP74JQ U 1
AF RR2GP74TF C 350
AF RR2GB29TF C 126
BS 1 336 RR2GP74JQ
BS 337 337 RR2GB29JQ
BS 338 380 RR2GP74JQ
BS 381 381 RR2GB29JQ
BS 382 734 RR2GP74JQ
BS 735 737 RR2GB29TF

RD RR2GB29JQ 194 0 0
GGCAGCTGCGATCCTTCCAGCGACTTGGTCAAGATCTCTCTGACCACTTGATGTGATCTT
CCTCCCACCTTTAGTGTCAAGGTCGACAATGTTCATAATCTGGAGCTGCTGAAGAATGTG
ACGAGCGACACCACCACTGCTCTTGCAGAAATGAGGTGGTCTGCTTCCGTTCCTCTTGCT
TCCTCCATAGAT
CC

QA 1 192 1 192
DS 

RD RR2GP74JQ 736 0 0
AGCTAAAGAAAATTCATTAAAATGAGGTAGACGATTAGATCAAATTTCGTATATGTCTGC
TCATCAGAGTTAAAAAACAAAAGAGAAACAACTCATTAAAACAAAAACAAAAACAAAAAA
AAATGAGAGAAGAGATATTCCACTACTGGTTTCCAATGCAAACTCATTCCATATAATATC
TAAATCTCAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGCTTTGTGATCTTGGATTTTAGATGGCAGCT
GCGATCCTTCCAGCGACTTGGTCAAGATCTCTCTGACCACTTGATGTGATCTTCCTCCCA
CCTTTAGTGTCAAGGTCGACAATGTTCATAATCTGGGGCTGCTGAAGAATGTGACGAGCG
ACACCACCACTGCTCTTGCAAAAATGAGGTGGTCTGCTTCCGTTCCTCTTGCTTCCTCCA
TAGATTCTTCTGAAGGCACCAACTCCAAGTCCACCTCTCAGGTACACTTTCCTTGCCATT
GACGCGGCTCTGATGTAGTACCAGTCAGGGTCATAAGGAGCAAGCTCCTTAAGTTTACCA
GTCTTGACTATGTCTGTCCACGGTGGCAGCTCGATCTTGCCGGAGCGCTTAAGATGGGCA
GCGTATGCCTTGACGAACTCGTGGGGAGAGACATCCTTCACCGTTTTGCCTGTCGCCATT
ATTGTTCCTGCTTCTTCTTCCTACTTCGTCGTCAGCGGCGCTGCTAGAGGCGTATAATAT
TATTCGAGTGGGAG
CC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2GP74TF 387 0 0
TGTGACGAGCGACACCACCACTGCTCTTGCAGAAATGAGGTGGTCTGCTTCCGTTCCTCT
TGCTTCCTCCATAGATTCTTCTGAAGGCACCAACTCCAAGTCCACCTCTCAGGTACACTT
TCCTTGCCATTGACGCGGCTCTGATGTAGTACCAGTCAGGGTCATAAGGAGCAAGCTCCT
TAAGTTTACCAGTCTTGACTATGTCTGTCCACGGTGGCAGCTCGATCTTGCCGGAGCGCT
TAAGATGGGCAGCGTATGCCTTGACGAACTCGTGGGGAGAGACATCCTTCACCGTTTTGC
CTGTCGCCATTATTGTTCCTGCTTCTTCTTCCTACTTCGTCGTCAGCGGCGCTGCTAGAG
GCGTATAATATTATTCGAGTGGGAG
CC

QA 1 385 1 385
DS 

RD RR2GB29TF 612 0 0
G
GAGAAGAGATATTCCACTACTGGTTTCCAATGCAAACTCATTCCATATAATATCTAAATC
TCAAAAAAAAAGAAGAAAAAAAAGCTTTG*GATCTTGGATTTTAGATGGCAGCTGCGATC
CTTCCAGCGACTTGGTCAAGATCTCTCTGACCACTTGATGTGATCTTCCTCCCACCTTTA
GTGTCAAGGTCGACAATGTTCATAATCTGGAGCTGCTGAAGAATGTGACGAGCGACACCA
CCACTGCTCTTGCAGAAATGAGGTGGTCTGCTTCCGTTCCTCTTGCTTCCTCCATAGATC
CTTCGGAAGGCACCAACTCCAAGTCCACCTCTCAGGTACACTTTCCTTGCCATTGACGCG
GCTCTGATGTAGTACCAGTCAGGGTCATAAGGAGCAAGCTCCTTAAGTTTACCAGTCTTG
ACTATGTCTGTCCACGGTGGCAACTCAATCTTGCCGGAGCGCTTGAGATGGGCAGCGTAA
GCCTTGACGAACTCGTGTGGAGAGACATCCTTCACCGTTTTGCCTGTCGCCATTATTGTT
CCTGCTTCTTCTTCCTACGTCGTCG***GCGGCGCTGCTAGAGGCGTATAATATTATTCG
AGTGGGAGGCC

QA 2 612 2 612
DS 



AS 1 2

CO CL2213Contig1 817 2 2 U
GGGCTCTCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTGCAATGGCGTCTCTTCAGCAAACCATGTTCTC
TCTGCAGTCCAAACTCCCTCCCTCATCTTTCCACATCGCAGTATCTCTCCCTATGCGAAA
GACATCCTTACCCCTCCGAATCAGAGGCGGAAACGCCGCGGGAGCGAGAATGTCCGCCAC
TGCTGCAGGAAGCTACGCGATGGCTCTCGCGGACGTCGCGAAGAGGAACGACACTCTCGA
ACTCACGAGCGCCGACGTCGAGAAGCTCGAGAACGTCTTCTCAGACCCGCAGGTGCTCAA
CTTCTTCGCCAACCCAACCGTCGAGGTCGAGAAGAAGCGCCTCGTGATCGACGAGATCGT
CAAAGCGTCCTCTCTCCAGACCCACACCTCCAACTTCCTCAACCTCCTGGTCGACGCGAA
CCGGGTCGACATCGTGACGGACATCGTGAAGGAGTTCGAGATTGTGTACAACAAGATAAC
GGACACGCAGCTGGCGGAGGTTAGGTCGGTGGTGAAGCTGGAGCCGCCGCAGCTCGCGCA
GATCGCGAAACAGGTTCAGAAGCTGACCGGAGCCAAGAACGTGAGGGTTAAAACGGTTCT
TGATCCGAGTCTTGTCGCTGGGTTTACGATTCGGTATGGTGATTCCGGGTCCAAGCTTAT
TGATATGAGTGTGAAGAAGCAGCTTGAGGATATCGCTGCTCAGCTAGAGCTCGGTGAGAT
TCAGTTAGCTGCATGAGAAAAATTGTATTGACAAAACAACCGCTTCTTCTTTTTTTTTTA
CTTGTGCAAGTTTAATTCTTTCTCTCTTTTTTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF57TF U 1
AF RR2FF57JQ C 279
BS 1 705 RR2FF57TF
BS 706 817 RR2FF57JQ

RD RR2FF57TF 708 0 0
GGGCTCTCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTGCAATGGCGTCTCTTCAGCAAACCATGTTCTC
TCTGCAGTCCAAACTCCCTCCCTCATCTTTCCACATCGCAGTATCTCTCCCTATGCGAAA
GACATCCTTACCCCTCCGAATCAGAGGCGGAAACGCCGCGGGAGCGAGAATGTCCGCCAC
TGCTGCAGGAAGCTACGCGATGGCTCTCGCGGACGTCGCGAAGAGGAACGACACTCTCGA
ACTCACGAGCGCCGACGTCGAGAAGCTCGAGAACGTCTTCTCAGACCCGCAGGTGCTCAA
CTTCTTCGCCAACCCAACCGTCGAGGTCGAGAAGAAGCGCCTCGTGATCGACGAGATCGT
CAAAGCGTCCTCTCTCCAGACCCACACCTCCAACTTCCTCAACCTCCTGGTCGACGCGAA
CCGGGTCGACATCGTGACGGACATCGTGAAGGAGTTCGAGATTGTGTACAACAAGATAAC
GGACACGCAGCTGGCGGAGGTTAGGTCGGTGGTGAAGCTGGAGCCGCCGCAGCTCGCGCA
GATCGCGAAACAGGTTCAGAAGCTGACCGGAGCCAAGAACGTGAGGGTTAAAACGGTTCT
TGATCCGAGTCTTGTCGCTGGGTTTACGATTCGGTATGGTGATTCCGGGTCCAAGCTTAT
TGATATGAGTGTGAAGAAGCAGCTTGAGGATATCGCTGCTCAGCT
AGA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2FF57JQ 539 0 0
TCTCAGACCCGCAGGTGCTCAACTTCTTCGCCAACCCAACCGTCGAGGTCGAGAAGAAGC
GCCTCGTGATCGACGAGATCGTCAAAGCGTCCTCTCTCCAGACCCACACCTCCAACTTCC
TCAACCTCCTGGTCGACGCGAACCGGGTCGACATCGTGACGGACATCGTGAAGGAGTTCG
AGATTGTGTACAACAAGATAACGGACACGCAGCTGGCGGAGGTTAGGTCGGTGGTGAAGC
TGGAGCCGCCGCAGCTCGCGCAGATCGCGAAACAGGTTCAGAAGCTGACCGGAGCCAAGA
ACGTGAGGGTTAAAACGGTTCTTGATCCGAGTCTTGTCGCTGGGTTTACGATTCGGTATG
GTGATTCCGGGTCCAAGCTTATTGATATGAGTGTGAAGAAGCAGCTTGAGGATATCGCTG
CTCAGCTAGAGCTCGGTGAGATTCAGTTAGCTGCATGAGAAAAATTGTATTGACAAAACA
ACCGCTTCTTCTTTTTTTTTTACTTGTGCAAGTTTAATTCTTTCTCTCTTTTTTCCTCC

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 4

CO CL2214Contig1 1149 4 2 U
GGAACCAAAAACATAAACACAAACGCCAATCGAAACTCTCGCGTTTGCTATGGAGAAGAA
GTGTTTTGGACTTGCGGTGGCATTTGTATTCTTAGTATTGGTTCATGTCTCTGTACCGGT
TCCCTTTATAGTGCTTCATGGGATTGCAGCTGCATGTTCTGAGGGCAAAGAAGCTAACTT
CACACAGCTTCTCTCTAACTTCTCTGGCTCTCCTGGTTTTTGCCTAGAAGTTGGAAATGG
AGAACTCGATTCATGGTTCATGCCACTTGCTAAACAAGCGGAAATAGCGTGTGAGAAAGT
GAAGCAAATGAAAGAGTTGCGTCAAGGATACAACATTGTTGGAGGATCTCAGGGGAATCT
AGTGGCTAGAGGCTTGATTGAGTTCTGCGATGGTGGACCTCCGGTTTACAACTATGTATC
TTTAGCAGGTCCCCATGCTGGAATCTCTTCTGTTCCGCTGTGTGGTTCTGGATTATGGTG
TGAAATAGCAGATGAGCTGATCAAGTCAGATATTTATAGCGACTTCATTCAAGATCATCT
TGCTCCTAGTGGTTATCTCAAAATCCCTACGGAAATGAAAAAGTACCTAGAAAGTTCCAA
GTATCTACCTAAGCTTAACAATGAGATACCAGGCCAAAGAAACTCCACTTACAAAGAACG
TTTCGCCAGCTTACATAACTTGGTTCTTACCATGTTTGAAGACGATAAGGTCATTGTTCC
AAAAGATTCATCTTGGTTCGGGTTTTACCCTGATGGTGATTTCGGACCTCTTCTCACCGT
TCGAGAGACAAAACTCTTTAAAGAGGACTGGATCGGTCTGAAACCATTGATTGATACTGG
GAAAGTGGAGTTTGTCAGTGTAGATGGCGCACACCTAAGAATGTCAAATATAGATATCGT
CAAATATGTTGTACCTTATCTCCAAAACCAACCTTCTTCCGCGCAAAAAAGATTCAATCG
CAAAACGAAAGAGCCTTTGCGCCCTTGAAAGAGAAAATATTTCATGTTTCACATGCTTAT
TTATGAAATAGTGAAAAAAACCTTAGTGATGGATGAATGTGTAGAACAAAAATCATTATT
CATGTAGATACAAATAATATACACTAGACCTTGGTTTCTTTTGTTTATAATAAATGTTGT
ATTCGTAAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2DP63TF U 1
AF RR2B458TF U 1
AF RR2B458JQ C 239
AF RR2DP63JQ C 302
BS 1 739 RR2B458TF
BS 740 1149 RR2B458JQ

RD RR2DP63TF 253 0 0
GGAACCAAAAACATAAACACAAACGCCAATCGAAACTCTCGCGTTTGCTATGGAGAAGAA
GTGTTTTGGACTTGCGGTGGCATTTGTATTCTTAGTATTGGTTCATGTCTCTGTATCGGT
TCCCTTTATAGTGCTTCATGGGATTGCAGCTGCATGTTCTGAGGGCAAAGAAGCTAACTT
CACACAGCTTCTCTCTAACTTCTCTGGCTCTCCTGGTTTT*GCCTAGAAGT*GGAAATGG
AGAACTCG
TTCTG

QA 1 248 1 248
DS 

RD RR2B458TF 739 0 0
GGAACCAAAAACATAAACACAAACGCCAATCGAAACTCTCGCGTTTGCTATGGAGAAGAA
GTGTTTTGGACTTGCGGTGGCATTTGTATTCTTAGTATTGGTTCATGTCTCTGTACCGGT
TCCCTTTATAGTGCTTCATGGGATTGCAGCTGCATGTTCTGAGGGCAAAGAAGCTAACTT
CACACAGCTTCTCTCTAACTTCTCTGGCTCTCCTGGTTTTTGCCTAGAAGTTGGAAATGG
AGAACTCGATTCATGGTTCATGCCACTTGCTAAACAAGCGGAAATAGCGTGTGAGAAAGT
GAAGCAAATGAAAGAGTTGCGTCAAGGATACAACATTGTTGGAGGATCTCAGGGGAATCT
AGTGGCTAGAGGCTTGATTGAGTTCTGCGATGGTGGACCTCCGGTTTACAACTATGTATC
TTTAGCAGGTCCCCATGCTGGAATCTCTTCTGTTCCGCTGTGTGGTTCTGGATTATGGTG
TGAAATAGCAGATGAGCTGATCAAGTCAGATATTTATAGCGACTTCATTCAAGATCATCT
TGCTCCTAGTGGTTATCTCAAAATCCCTACGGAAATGAAAAAGTACCTAGAAAGTTCCAA
GTATCTACCTAAGCTTAACAATGAGATACCAGGCCAAAGAAACTCCACTTACAAAGAACG
TTTCGCCAGCTTACATAACTTGGTTCTTACCATGTTTGAAGACGATAAGGTCATTGTTCC
AAAAGATTCATCTTGGTTC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2B458JQ 911 0 0
GGAGAACTCGATTCATGGTTCATGCCACTTGCTAAACAAGCGGAAATAGCGTGTGAGAAA
GTGAAGCAAATGAAAGAGTTGCGTCAAGGATACAACATTGTTGGAGGATCTCAGGGGAAT
CTAGTGGCTAGAGGCTTGATTGAGTTCTGCGATGGTGGACCTCCGGTTTACAACTATGTA
TCTTTAGCAGGTCCCCATGCTGGAATCTCTTCTGTTCCGCTGTGTGGTTCTGGATTATGG
TGTGAAATAGCAGATGAGCTGATCAAGTCAGATATTTATAGCGACTTCATTCAAGATCAT
CTTGCTCCTAGTGGTTATCTCAAAATCCCTACGGAAATGAAAAAGTACCTAGAAAGTTCC
AAGTATCTACCTAAGCTTAACAATGAGATACCAGGCCAAAGAAACTCCACTTACAAAGAA
CGTTTCGCCAGCTTACATAACTTGGTTCTTACCATGTTTGAAGACGATAAGGTCATTGTT
CCAAAAGATTCATCTTGGTTCGGGTTTTACCCTGATGGTGATTTCGGACCTCTTCTCACC
GTTCGAGAGACAAAACTCTTTAAAGAGGACTGGATCGGTCTGAAACCATTGATTGATACT
GGGAAAGTGGAGTTTGTCAGTGTAGATGGCGCACACCTAAGAATGTCAAATATAGATATC
GTCAAATATGTTGTACCTTATCTCCAAAACCAACCTTCTTCCGCGCAAAAAAGATTCAAT
CGCAAAACGAAAGAGCCTTTGCGCCCTTGAAAGAGAAAATATTTCATGTTTCACATGCTT
ATTTATGAAATAGTGAAAAAAACCTTAGTGATGGATGAATGTGTAGAACAAAAATCATTA
TTCATGTAGATACAAATAATATACACTAGACCTTGGTTTCTTTTGTTTATAATAAATGTT
GTATTCGTAAT

QA 1 911 1 911
DS 

RD RR2DP63JQ 845 0 0
GAAGC
AATGAAAGAGTTGCGTCAAGGATACAACATTGT*GGAAGATCTCAGGGGAATCTAGTGGC
TAGAGGCTTGATTGAGTTCTGCGATGGTGGACCTCCGGTTTACAACTATGTATCTTTAGC
AGGTCCCCATGCTGGAATCTCTTCTGTTCCGCTGTGTGGTTCTGGATTATGGTGTGAAAT
AGCAGATGAGCTGATCAAGTCAGATATTTATAGCGACTTCATTCAAGATCATCTTGCTCC
TAGTGGTTATCTCAAAATCCCTACGGAAATGAAAAAGTACCTAGAAAGTTCCAAGTATCT
ACCTAAGCTTAACAATGAGATACCAGGCCAAAGAAACTCCGCTTACAAAGAACGTTTCGC
CAGCTTACATAACTTGGTTCTTATCATGTTTGAAGACGATAAGGTCATTGTTCCAAAAGA
TTCATCTTGGTTCGGGTTTTACCCTGATGGTGATTTCGGACCTCTTCTCACCGTTCGAGA
GACAAAACTCTTTAAAGAGGACTGGATCGGTCTGAAACCATTGATTGATACTGGGAAAGT
GGAGTTTGTCAGTGTAGATGGCGCACACCTAAGAATGTCAAATATGGATATCGTCAAATA
TGTTGTACCTTATCTCCAAAACCAACCTTCTTCCGCGCAAAAAAGATTCAATCGCAAAAC
GAAAGAGCCTTTGCGCCCTTGAAAGAGAAAATATTTCATGTTTCATATGCTTATTTATGA
AATAGTGAAAAAAACCTTAGTGATGGATGAATGTGTAGAACAAAAATCATTATTCATGTA
GATACAAATAATATACACTAGACCTTGGTTTCTTTTGTTTATAATAAATGTTGTATTC
AC

QA 6 843 6 843
DS 



AS 1 4

CO CL2215Contig1 1107 4 5 U
ATTGTACTAGCATCCACTGCTTTCTTCATGGTCTTGCTCCCTACAGGAACATTTAGCTCA
GGGTTCATCGGTATGGCGCTATCTTACGGTTTATCTTTGAACATGGGACTTGTTTACTCC
GTACAGAACCAGTGCTACTTAGCTAACTGGATCATCTCCGTTGAGAGGCTTAATCAGTAC
ACACATTTAACACCTGAAGCTCCTGAAGTAATAGAAGAGACACGACCACCTGCTAACTGG
CCGGTCACAGGCCGAGTTGAAATCTCTGATCTGCAGATAAGATACAGGCGAGAGTCCCCA
TTGGTTTTAAAAGGAATCAGCTGTGTGTTTGAAGGAGGACACAAGATTGGTATTGTTGGT
AGGACCGGTAGTGGAAAGACAACTCTGATCAGTGCTTTGTTCAGACTTGTTGAGCCTGTT
GGAGGAAAGATTTGTTGTTGACGGTGTAGACATCTCCAAGATAGGAGTTCATGATTCTGA
GATTCAAGGTTTGGGATTATACCTCAGGATCCAACTCTGTTTAATGGAACAGTGAGGTAT
AAACTTGGATCCTTTGTGTCAGCATACAGATGCTGAGATTTGGGAGGTTCTTGGAAAGTG
TCAGCTGAAAGATGTGGTTCAAGAAAAAGAGAACGGCTTAGATTCACTAGTTGTGGAGGA
TGGATCGAACTGGAGCATGGGACAGGGACAGCTGTTTTGTTTAGGCAGAGCAGTTTTGAG
AAGAAGTAGAGTATTGGTTTTAGACGAAGCAACTGCCTCTATAGACAACGCTACAGATTT
GATACTTCAGAAAACAATACGGCGAGAGTTTGCTGATTGCACTGTCATAACCGTCGCTCA
CCGTATCCCCACCGTCATGGACTGTACAATGGTTCTCTCCATAAGCGACGGACGCATTGT
GGAGTATGATGCGCCCATGAAGTTGATGGAGAATGAGAACTCATTGTTTGGTAAGCTTGT
GAAAGAGTATTGGTCTCATTACCACTCAGCTGACTCTCACTGAGTATGTGCTGCTATGAT
GTCGACATTGTTGTTGTATAACTCAAATCTCTTACACGGTGGATGATATATTACAACAAT
TAATTAACTCAAAACAATAATTGTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CB26TF U 1
AF RR2CB26JQ C 337
AF RR2A292JQ C 671
AF RR2A292TF U 671
BS 1 585 RR2CB26TF
BS 586 671 RR2CB26JQ
BS 672 738 RR2A292TF
BS 739 739 RR2CB26JQ
BS 740 1107 RR2A292TF

RD RR2CB26TF 585 0 0
ATTGTACTAGCATCCACTGCTTTCTTCATGGTCTTGCTCCCTACAGGAACATTTAGCTCA
GGGTTCATCGGTATGGCGCTATCTTACGGTTTATCTTTGAACATGGGACTTGTTTACTCC
GTACAGAACCAGTGCTACTTAGCTAACTGGATCATCTCCGTTGAGAGGCTTAATCAGTAC
ACACATTTAACACCTGAAGCTCCTGAAGTAATAGAAGAGACACGACCACCTGCTAACTGG
CCGGTCACAGGCCGAGTTGAAATCTCTGATCTGCAGATAAGATACAGGCGAGAGTCCCCA
TTGGTTTTAAAAGGAATCAGCTGTGTGTTTGAAGGAGGACACAAGATTGGTATTGTTGGT
AGGACCGGTAGTGGAAAGACAACTCTGATCAGTGCTTTGTTCAGACTTGTTGAGCCTGTT
GGAGGAAAGATTTGTTGTTGACGGTGTAGACATCTCCAAGATAGGAGTTCATGATTCTGA
GATTCAAGGTTTGGGATTATACCTCAGGATCCAACTCTGTTTAATGGAACAGTGAGGTAT
AAACTTGGATCCTTTGTGTCAGCATACAGATGCTGAGATTTGGGA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2CB26JQ 758 0 0
GGACACAAGATTGGTATTGTTGGTAGGACCGGTAGTGGAAAGACAACTCTGATCAGTGCT
TTGTTCAGACTTGTTGAGCCTGTTGGAGGAAAGATT*GTTGTTGACGGTGTAGACATCTC
CAAGATAGGAGTTCATGAT*CTGAGAT*CAAGGTTTGGGATTATACCTCAGGATCCAACT
CTGTTTAATGGAACAGTGAGGTATAA*CTTGGATCCTTTGTGTCAGCATACAGATGCTGA
GATTTGGGAGGTTCTTGGAAAGTGTCAGCTGAAAGATGTGGTTCAAGAAAAAGAGAACGG
CTTAGATTCACTAGTTGTGGAGGATGGATCGAACTGGAGCATGGGACAGAGACAGCTGTT
TTGTTTAGGCAGAGCAGTTTTGAGAAGAAGTAGAGTATTGGTTTTAGACGAAGCAACTGC
CTCTATAGACAACGCTACAGATTTGATACTTCAGAAAACAATACGGCGAGAGTTTGCTGA
TTGCACTGTCATAACCGTTGCTCACCGTATCCCCACCGTCATGGACTGTACAATGGTTCT
CTCCATAAGCGACGGACGCATTGTGGAGTATGATGCGCCAATGAAGTTGATGGAGAATGA
GAACTCATTGTTTGGCAAACTTGTGAAAGAGTATTGGTCTCATTACCACTCAGCTGACTC
TCACTGAGTATGTGCTGCTATGATGTCGACATTGTTGTTGTATAACTCAAATCTCTTACA
CGGTGGATGATATATTACAACAATTAATTAACTCAAAA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2A292JQ 437 0 0
G
GGAGCATGGGACAGGGACAGCTGTTTTGTTTAGGCAGAGCAGTTTTGAGAAGAAGTAGAG
TATTGGTTTTAGACGAAGCAACTGCCTCTATAGACAACGCTACAGATTTGATACTTCAGA
AAACAATACGGCGAGAGTTTGCTGATTGCACTGTCATAACCGTCGCTCACCGTATCCCCA
CCGTCATGGACTGTACAATGGTTCTCTCCATAAGCGACGGACGCATTGTGGAGTATGATG
CGCCCATGAAGTTGATGGAGAATGAGAACTCATTGTTTGGTAAGCTTGTGAAAGAGTATT
GGTCTCATTACCACTCAGCTGACTCTCACTGAGTATGTGCTGCTATGATGTCGACATTGT
TGTTGTATAACTCAAATCTCTTACACGGTGGATGATATATTACAACAATTAATTAACTCA
AAACAATAATTGTATG

QA 2 437 2 437
DS 

RD RR2A292TF 437 0 0
G
GGAGCATGGGACAGGGACAGCTGTTTTGTTTAGGCAGAGCAGTTTTGAGAAGAAGTAGAG
TATTGGTCTTAGACGAAGCAACTGCCTCTATAGACAACGCTACAGATTTGATACTTCAGA
AAACAATACGGCGAGAGTTTGCTGATTGCACTGTCATAACCGTCGCTCACCGTATCCCCA
CCGTCATGGACTGTACAATGGTTCTCTCCATAAGCGACGGACGCATTGTGGAGTATGATG
CGCCCATGAAGTTGATGGAGAATGAGAACTCATTGTTTGGTAAGCTTGTGAAAGAGTATT
GGTCTCATTACCACTCAGCTGACTCTCACTGAGTATGTGCTGCTATGATGTCGACATTGT
TGTTGTATAACTCAAATCTCTTACACGGTGGATGATATATTACAACAATTAATTAACTCA
AAACAATAATTGTATG

QA 2 437 2 437
DS 



AS 2 4

CO CL2216Contig1 175 2 3 U
GCGACTAAACTGGTTTTCTTATAACTGCTTTCCCTTATCAATTTCAGTGTTGTTTTGGTT
TAAGTGTTTTGCTCTTTTATTTTTTATGTACTCTTTATCTTCCGTGGTCCTTATTGCGAA
TTGGGTTGCAGTTTCTAACTTTAACTGACTGCAGAAATTTTTTATTTGATTGGTT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE09JQ C 1
AF RR2BE09TF U 1
BS 1 1 RR2BE09JQ
BS 2 168 RR2BE09TF
BS 169 175 RR2BE09JQ

RD RR2BE09JQ 175 0 0
GCGACTAAACTGGTTTTCTTATAACTGCTTTCCCTTATCAATTTCAGTGTTGTTTTGGTT
TAAGTGTTTTGCTCTTTTATTTTTTATGTACTCTTTATCTTCCGTGGTCCTTATTGCGAA
TTGGGTTGCAGTTTCTAACTTTAACTGACTGCAGAAATTTTTTATTTGATTGGTT

QA 1 175 1 175
DS 

RD RR2BE09TF 175 0 0
G
CGACTAAACTGGTTTTCTTATAACTGCTTTCCCTTATCAATTTCAGTGTTGTTTTGGTTT
AAGTGTTTTGCTCTTTTATTTTTTATGTACTCTTTATCTTCCGTGGTCCTTATTGCGAAT
TGGGTTGCAGTTTCTAACTTTAACTGACTGCAGAAATTTTTTATTTG
ATTGGTT

QA 2 168 2 168
DS 



CO CL2216Contig2 841 2 2 U
GAGAGGAACACGACGATACCGACCAAGAAGGAGCAGGTGTTCTCCACCTACTCTGATAAC
CAGCCGGGTGTGTTGATCCAGGTCTACGAAGGTGAGAGGGCTAGGACCAAGGACAGCAAC
CTCCTTGGAAAGTTTGAGCTCTCCGGCATCCCTCCTGCTCCGCGTGGTGTCCCTCAGATC
ACAGTCTGTTTCGACATTGATGCAAACGGCATCCTCAACGTCTCTGCCGAGGACAAGACA
ACGGGGCAAAAGAACAAGATCACGATCACCAACGACAAGGGTCGGTTGTCTAAGGACGAG
ATCGAGAAGATGGTGCAAGAAGCTGAGAAGTACAAGTCTGAGGATGAGGAGCACAAGAAG
AAGGTCGAAGCCAAGAATGCTCTTGAGAACTATGCTTACAACATGAGGAACACCATCCGT
GACGACAAGATTGGTGAGAAGCTTCCTGCTGCTGACAAGAAGAAGATTGAGGATTCGGTT
GAGGAGGCGATCCAGTGGCTTGATGGTAACCAAACGGCTGAAGCAGACGAGTTTGAAGAC
AAGATGAAGGAGTTGGAGAGTGTGTGCAACCCCATCATTGCTAAGATGTATCAAGGAGCT
GGTGGTGAAGCAGGTCCCGCTGATGATGAAGCTCCACCTGCTTCTGGAGGTGCTGGTCCC
AAGATTGAGGAAGTCGACTAAACTGGTTTTTTTATAACTGTTTTCCCTTATCAATTTCAG
TGTTGTTTTGGTTTAAGTGTTTTGCTCTTTTATTTTTTATGTACTCTTTATCTTCCGTGG
TCCTTATTGCGAATTGGGTTGCAGTTTTTAACTTTAACTGATTGCAGAAATTTTTTATTT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2GB87TF U 1
AF RR2GB87JQ C 427
BS 1 591 RR2GB87TF
BS 592 841 RR2GB87JQ

RD RR2GB87TF 591 0 0
GAGAGGAACACGACGATACCGACCAAGAAGGAGCAGGTGTTCTCCACCTACTCTGATAAC
CAGCCGGGTGTGTTGATCCAGGTCTACGAAGGTGAGAGGGCTAGGACCAAGGACAGCAAC
CTCCTTGGAAAGTTTGAGCTCTCCGGCATCCCTCCTGCTCCGCGTGGTGTCCCTCAGATC
ACAGTCTGTTTCGACATTGATGCAAACGGCATCCTCAACGTCTCTGCCGAGGACAAGACA
ACGGGGCAAAAGAACAAGATCACGATCACCAACGACAAGGGTCGGTTGTCTAAGGACGAG
ATCGAGAAGATGGTGCAAGAAGCTGAGAAGTACAAGTCTGAGGATGAGGAGCACAAGAAG
AAGGTCGAAGCCAAGAATGCTCTTGAGAACTATGCTTACAACATGAGGAACACCATCCGT
GACGACAAGATTGGTGAGAAGCTTCCTGCTGCTGACAAGAAGAAGATTGAGGATTCGGTT
GAGGAGGCGATCCAGTGGCTTGATGGTAACCAAACGGCTGAAGCAGACGAGTTTGAAGAC
AAGATGAAGGAGTTGGAGAGTGTGTGCAACCCCATCATTGCTAAGATGTAT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2GB87JQ 415 0 0
AAGATTGGTGAGAAGCTTCCTGCTGCTGACAAGAAGAAGATTGAGGATTCGGTTGAGGAG
GCGATCCAGTGGCTTGATGGTAACCAAACGGCTGAAGCAGACGAGTTTGAAGACAAGATG
AAGGAGTTGGAGAGTGTGTGCAACCCCATCATTGCTAAGATGTATCAAGGAGCTGGTGGT
GAAGCAGGTCCCGCTGATGATGAAGCTCCACCTGCTTCTGGAGGTGCTGGTCCCAAGATT
GAGGAAGTCGACTAAACTGGTTTTTTTATAACTGTTTTCCCTTATCAATTTCAGTGTTGT
TTTGGTTTAAGTGTTTTGCTCTTTTATTTTTTATGTACTCTTTATCTTCCGTGGTCCTTA
TTGCGAATTGGGTTGCAGTTTTTAACTTTAACTGATTGCAGAAATTTTTTATTTG

QA 1 415 1 415
DS 



AS 1 4

CO CL2217Contig1 1374 4 3 U
GCGTGTCGGCTTCTGGATTATTACTGCCAGCAACGAGTTCCGTACTTGTGGGCCCGTCAA
ACAAGAACTCACTTCTCATACTGGACCCACCTTACTTTCTATGTTTACAAGTACACACTA
TGCTGGAAAAGAAATCAACACAACTTACGCAAGCGGTGAGCCGTGGAAGAAGATGTTTGG
TCCTGTCTTTGTTTATCTCAACTCTGCCCCCTCTCCCGATCTCATGTGGACCGATGCTAA
ACGACAGTTGGCTGCCGAGGTTAAAAGCTGGCCTTATGAGTTCGTGAAGTCAGAAGATTA
CCCTCTTCGCCAACAAAGAGGAACAGTCCAGGGTCAACTATCTGTCAAGGACAGTTTCAA
AAGCAAGTCGAAGTTAAACGAAGAAATTGCTTTTGTGGGTTTAGCATTACCTGGTGAAGT
TGGTTCATGGCAAGCCGAAACCAAGGGATATCAATTTTGGACACAAGCAGACAAAACGGG
GACGTTCACCATAGCGAATGTGAGACCTGGCACTTATAACCTCTTCGCATGGGTTGCCGG
ACATATTGGCGACTACAAATACGAGCGTGAAATTACAATTACACCAGGTAAAGAAATAAA
CGTAGGACCCTTAGTGTATGAGCCGCCAAGAAGTGGTCCAACGTTGTGGGAGATCGGTGT
ACCGGATCGGAGCGCCGCAGAATTCAATATCCCGGATCCGGACCCAGCCCTTATAACCAA
ACTATATGCTAATCACCCAAATGCTCCTGAAGACAGATTTAGACAATATGGTCTATGGGA
TCGTTACAGTGCAGTGTATCCTAAAGAAGATGTTACTTTTACTGTTGGAGTGAGTGACTA
TAAAAAAGATTGGTTCTTTGCACATCTCAACAGAAAAACTGGAGGAAAGAAACTTCAAGC
AACGACATGGAAAATTGTTTTTAACTTAAAAGAAGTGTCCCAAAATGGAAATTATACTCT
TCGAATGGCTTTGGCTGCAGCCAACACTGCCGATATATTAGTTGAGGTTAACAAACCACC
TAGCACCAAACCTATGTTCAGGACTGGGATGGTAGGTCGGGATAACGCGATCGCTAGACA
TGGAATTCACGGGTTATACAGATTGTTCAATATAGGCGTTCAGACGAATTTGCTCAAGGT
TGGTGACAATACGATTTATCTCACTCAAAACCGGGTCACTAGTATTTTTGCAGGTGTTAT
GTATGATTATCTTCGATTGGAAGGTCCTTCAGGAGCCAAACAATAATCTCTTAAATATAG
ATAAGTGAGTGATATGAGAGTTTATTTTTTTTATTTTTTAAATAAGAAGATTTGTTATTA
ATAATCAATAATTTTTGTAACCAGTGAAATAAATATTTTGACTATTTGTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AI57TF U 1
AF RR2DD48TF U 154
AF RR2AI57JQ C 613
AF RR2DD48JQ C 627
BS 1 602 RR2AI57TF
BS 603 808 RR2DD48TF
BS 809 1374 RR2AI57JQ

RD RR2AI57TF 602 0 0
GCGTGTCGGCTTCTGGATTATTACTGCCAGCAACGAGTTCCGTACTTGTGGGCCCGTCAA
ACAAGAACTCACTTCTCATACTGGACCCACCTTACTTTCTATGTTTACAAGTACACACTA
TGCTGGAAAAGAAATCAACACAACTTACGCAAGCGGTGAGCCGTGGAAGAAGATGTTTGG
TCCTGTCTTTGTTTATCTCAACTCTGCCCCCTCTCCCGATCTCATGTGGACCGATGCTAA
ACGACAGTTGGCTGCCGAGGTTAAAAGCTGGCCTTATGAGTTCGTGAAGTCAGAAGATTA
CCCTCTTCGCCAACAAAGAGGAACAGTCCAGGGTCAACTATCTGTCAAGGACAGTTTCAA
AAGCAAGTCGAAGTTAAACGAAGAAATTGCTTTTGTGGGTTTAGCATTACCTGGTGAAGT
TGGTTCATGGCAAGCCGAAACCAAGGGATATCAATTTTGGACACAAGCAGACAAAACGGG
GACGTTCACCATAGCGAATGTGAGACCTGGCACTTATAACCTCTTCGCATGGGTTGCCGG
ACATATTGGCGACTACAAATACGAGCGTGAAATTACAATTACACCAGGTAAAGAAATAAA
CG

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2DD48TF 655 0 0
G
GGTGAGCCGTGGAAGAAGATGTTTGGTCCTGTCTTTGTTTATCTCAACTCTGCCCCCTCT
CCCGATCTCATGTGGACCGATGCTAAACGACAGTTGGCTGCCGAGGTTAAAAGCTGGCCT
TATGAGTTCGTGAAGTCAGAAGATTACCCTCTTCGCCAACAAAGAGGAACAGTCCAGGGT
CAACTATCTGTCAAGGACAGTTTCAAAGGCAAGTCGAAGTTAAACGAAGAAATTGCTTTT
GTGGGTTTAGCATTACCTGGTGAAGTTGGTTCATGGCAAGCCGAAACCAAGGGATATCAA
TTTTGGACACAAGCAGACAAAACGGGGACGTTCACCATAGCGAATGTGAGACCTGGCACT
TATAACCTCTTCGCATGGGTTGCCGGACATATTGGCGACTACAAATACGAGCGTGAAATT
ACAATTACACCAGGTAAGGAAATAAACGTAGGACCCTTAGTGTATGAGCCGCCAAGAAGT
GGTCCAACGTTGTGGGAGATCGGTGTACCGGATCGGAGCGCCGCAGAATTCAATATCCCG
GATCCGGACCCAGCCCTTATAACCAAACTATATGCTAATCACCCAAATGCTCCTGAAGAC
AGATTTAGACAATATGGTCTATGGGATCGTTACAGTGCAGTGTATCCTAAAGAA

QA 2 655 2 655
DS 

RD RR2AI57JQ 762 0 0
AGTGTATGAGCCGCCAAGAAGTGGTCCAACGTTGTGGGAGATCGGTGTACCGGATCGGAG
CGCCGCAGAATTCAATATCCCGGATCCGGACCCAGCCCTTATAACCAAACTATATGCTAA
TCACCCAAATGCTCCTGAAGACAGATTTAGACAATATGGTCTATGGGATCGTTACAGTGC
AGTGTATCCTAAAGAAGATGTTACTTTTACTGTTGGAGTGAGTGACTATAAAAAAGATTG
GTTCTTTGCACATCTCAACAGAAAAACTGGAGGAAAGAAACTTCAAGCAACGACATGGAA
AATTGTTTTTAACTTAAAAGAAGTGTCCCAAAATGGAAATTATACTCTTCGAATGGCTTT
GGCTGCAGCCAACACTGCCGATATATTAGTTGAGGTTAACAAACCACCTAGCACCAAACC
TATGTTCAGGACTGGGATGGTAGGTCGGGATAACGCGATCGCTAGACATGGAATTCACGG
GTTATACAGATTGTTCAATATAGGCGTTCAGACGAATTTGCTCAAGGTTGGTGACAATAC
GATTTATCTCACTCAAAACCGGGTCACTAGTATTTTTGCAGGTGTTATGTATGATTATCT
TCGATTGGAAGGTCCTTCAGGAGCCAAACAATAATCTCTTAAATATAGATAAGTGAGTGA
TATGAGAGTTTATTTTTTTTATTTTTTAAATAAGAAGATTTGTTATTAATAATCAATAAT
TTTTGTAACCAGTGAAATAAATATTTTGACTATTTGTTTGTC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2DD48JQ 748 0 0
CAAGAAGTGGTCCAACGTTGTGGGAGATCGGTGTACCGGATCGGAGCGCCGCAGAATTCA
ATATCCCGGATCCGGACCCAGCCCTTATAACCAAACTATATGCTAATCACCCAAATGCTC
CTGAAGACAGATTTAGACAATATGGTCTATGGGATCGTTACAGTGCAGTGTATCCTAAAG
AAGATGTTACTTTTACTGTTGGAGTGAGTGACTATAAAAAAGATTGGTTCTTTGCACATC
TCAACAGAAAAACTGGAGGAAAGAAACTTCAAGCAACGACATGGAAAATTGTTTTTAACT
TAAAAGAAGTGTCCCAAAATGGAAATTATACTCTTCGAATGGCTTTGGCTGCAGCCAACA
CTGCCGATATATTAGTTGAGGTTAACAAACCACCTAGCACCAAACCTATGTTCAGGACTG
GGATGGTAGGTCGGGATAACGCGATCGCTAGACATGGAATTCACGGGTTATACAGATTGT
TCAATATAGGCGTTCAGACGAATTTGCTCAAGGTTGGTGACAATACGATTTATCTCACTC
AAAACCGGGTCACTAGTATTTTTGCAGGTGTTATGTATGATTATCTTCGATTGGAAGGTC
CTTCAGGAGCCAAACAATAATCTCTTAAATATAGATAAGTGAGTGATATGAGAGTTTATT
TTTTTTATTTTTTAAATAAGAAGATTTGTTATTAATAATCAATAATTTTTGTAACCAGTG
AAATAAATATTTTGACTATTTGTTTGTC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 4

CO CL2218Contig1 563 4 2 U
GGAACAAAATAAGAAAGTAAAGAAAGAACCAAAGCTTTTTAAGCAGTTCTGTTAATCTAT
TATAATTTGATTTAGACAAAGTGTCTGATCCATGGCTGCATCCAGAGAATTTATCATATG
TTGCCTCTTAACACTTCTTTTGTGCACTTCCTTCATGAGAGTCCAGTCTGGTGCTGCAGA
CATCAGAGGAGGATGTGGTGGCGGCGACGGCAGTTTTCAGGAAGAAAATGAACGGTGTGT
AGAGAAGGTCAAAGATGACGACGACGATGATGTGGATGATGTTTTCAAAGTGATCAACAA
GATGAGGATATATGCTTGATCATGGTTCTTCATTTATATTTAAACATTTTGTTCGGTTTA
ATCTTATTTTCTCAAGTTTGTTTCTCGTTTTTTTTTTTGTTACTGGCGTCGATTTTCTGT
ATTTGTGTTAATTTAATTTTATCTTTACCTTTCCCGATTAATGAGAGAAATTGTGATCTG
AAGAAGGTCAGCTCTGTTTGTTGCGGGATTATTTTTTGGAAACTCGTCTGAGTGTCTTGG
AAATACTAAGAAAATAAGACGAG


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BZ92JQ C 89
AF RR2BZ92TF U 4
AF RR2DQ38JQ C 1
AF RR2DQ38TF U 1
BS 1 5 RR2DQ38JQ
BS 6 563 RR2DQ38TF

RD RR2BZ92JQ 318 0 0
TCCATGGCTGCATCCAGAGAATTTATCATATGTTGCCTTTTAACACTTTTTTTGTGCACT
TCCTTCATGAGAGTCCAGTCTGGTGCTGCAGACATCAGAGGAGGATGTGGGGGCGGGGAC
GGCAGTTTTCAGGAAGAAAATGAACGGTGTGTAGAGAAGGTCAAAGATGACGACGACGAT
GATGTGGATGATGTTTTCAAAGTGATCAACAAGATGAGGATATATGCTTGATCATGGTTT
TTCATTTATATTTAAACATTTTGTTCGGTTTAATTTTATTTTTTCAAGTTTGTTTTTCGT
TTTTTTTT
GTTACGGGGG

QA 1 308 1 308
DS 

RD RR2BZ92TF 484 0 0
GG
AAAATAAGAAAGTAAAGAAAGAACCAAAGCTTTTTAAGCAGTTCTGTTAATCTATTATAA
TTTGATTTAGACAAAGTGTCTGATCCATGGCTGCATCCAGAGAATTTATCATATGTTGCC
TCTTAACACTTCTTTTGTGCACTTCCTTCATGAGAGTCCAGTCTGGTGCTGCAGACATCA
GAGGAGGATGTGGTGGCGGCGACGGCAGTTTTCAGGAAGAAAATGAACGGTGTGTAGAGA
AGGTCAAAGATGACGACGACGATGATGTGGATGATGTTTTCAAAGTGATCAACAAGATGA
GGATATATGCTTGATCATGGTTCTTCATTTATATTTAAACATTTTGTTCGGTTTAATCTT
ATTTTCTCAAGTTTGTTTCTCGTTTTTTTTT**GTTACTGGCGTCGATTTTCTGTATTTG
TGTTAATTTAATTTTATCTTTACCTTTCCCGATTAATGAGAGAAATTGTGATCTGAAGAA
GG

QA 3 484 3 484
DS 

RD RR2DQ38JQ 563 0 0
GGAACAAAATAAGAAAGTAAAGAAAGAACCAAAGCTTTTTAAGCAGTTCTGTTAATCTAT
TATAATTTGATTTAGACAAAGTGTTTGATCCATGGCTGCATCCAGAGAATTTATCATATG
TTGCCTCTTAACACTTCTTTTGTGCACTTCCTTCATGAGAGTCCAGTCTGGTGCTGCAGA
CATCAGAGGAGGATGTGGTGGCGGCGACGGCAGTTTTCAGGAAGAAAATGAACGGTGTGT
AGAGAAGGTCAAAGATGACGACGACGATGATGTGGATGATGTTTTCAAAGTGATCAACAA
GATGAGGATATATGCTTGATCATGGTTCTTCATTTATATTTAAACATTTTGTTCGGTTTA
ATCTTATTTTTTCAAGTTTGTTTCTCGTTTTTTTTTTTGTTACTGGCGTCGATTTTCTGT
ATTTGTGTTAATTTAATTTTATCTTTACCTTTCCCGATTAATGAGAGAAATTGTGATCTG
AAGAAGGTCAGCTCTGTTTGTTGCGGGATTATTTTTTGGAAACTCGTCTGAGTGTCTTGG
AAATACTAAGAAAATAAGACGAG

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2DQ38TF 563 0 0
GGAAC
AAAATAAGAAAGTAAAGAAAGAACCAAAGCTTTTTAAGCAGTTCTGTTAATCTATTATAA
TTTGATTTAGACAAAGTGTCTGATCCATGGCTGCATCCAGAGAATTTATCATATGTTGCC
TCTTAACACTTCTTTTGTGCACTTCCTTCATGAGAGTCCAGTCTGGTGCTGCAGACATCA
GAGGAGGATGTGGTGGCGGCGACGGCAGTTTTCAGGAAGAAAATGAACGGTGTGTAGAGA
AGGTCAAAGATGACGACGACGATGATGTGGATGATGTTTTCAAAGTGATCAACAAGATGA
GGATATATGCTTGATCATGGTTCTTCATTTATATTTAAACATTTTGTTCGGTTTAATCTT
ATTTTCTCAAGTTTGTTTCTCGTTTTTTTTTTTGTTACTGGCGTCGATTTTCTGTATTTG
TGTTAATTTAATTTTATCTTTACCTTTCCCGATTAATGAGAGAAATTGTGATCTGAAGAA
GGTCAGCTCTGTTTGTTGCGGGATTATTTTTTGGAAACTCGTCTGAGTGTCTTGGAAATA
CTAAGAAAATAAGACGAG

QA 6 563 6 563
DS 



AS 2 4

CO CL2219Contig1 573 2 2 U
GGACAACACTAGCCCCACCTGCTCAACAACTTATAGCCTTCTTTACATTTTCAGCGAACA
GACTGAAGCCAAGTGAGAGAAATGAATACAAAGACTTGCCTCGTCTTCTTTCTCTCTTCT
CTAATCATCACAAACATCGCCTTAGCGCAAGGCCGAGCTCCTCACGGGTTAGTTTATGAG
ACCCCAGTGGCGTTTTCACCTTCTGCATTTGACTTCTTCCACGCACAACCAGAAAACCCT
GATGATACCACTTTAGACCCTTGCGCTGAATCCAGCTGCTCGCCTCTCCCCGTGGCAGCG
AAGGTTCAGGGAGCTTCTGCAAAAGAACAGCAAAGCGAGATAGCAACAATGTCCATTGGT
TCCAGAGGCGGAATGGGAGCTGGTGGTGCGGTCATGATCATATTTGGACTTGTGTTTCCT
ATGCTGATGTGAACCATTACAACTCAATCCAACCTAGTGTTTTTGAGCTGATATTATGAT
AGAGCAATATAGCTAGAGTTCGAGTTGAAATATGTGTGTGTTTTTTTTTCCTTCACTCTT
GTATCTAAATTTTCATATGAAGTGGTTTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2D746TF U 1
AF RR2D746JQ C 113
BS 1 571 RR2D746TF
BS 572 573 RR2D746JQ

RD RR2D746TF 573 0 0
GGACAACACTAGCCCCACCTGCTCAACAACTTATAGCCTTCTTTACATTTTCAGCGAACA
GACTGAAGCCAAGTGAGAGAAATGAATACAAAGACTTGCCTCGTCTTCTTTCTCTCTTCT
CTAATCATCACAAACATCGCCTTAGCGCAAGGCCGAGCTCCTCACGGGTTAGTTTATGAG
ACCCCAGTGGCGTTTTCACCTTCTGCATTTGACTTCTTCCACGCACAACCAGAAAACCCT
GATGATACCACTTTAGACCCTTGCGCTGAATCCAGCTGCTCGCCTCTCCCCGTGGCAGCG
AAGGTTCAGGGAGCTTCTGCAAAAGAACAGCAAAGCGAGATAGCAACAATGTCCATTGGT
TCCAGAGGCGGAATGGGAGCTGGTGGTGCGGTCATGATCATATTTGGACTTGTGTTTCCT
ATGCTGATGTGAACCATTACAACTCAATCCAACCTAGTGTTTTTGAGCTGATATTATGAT
AGAGCAATATAGCTAGAGTTCGAGTTGAAATATGTGTGTGTTTTTTTTTCCTTCACTCTT
GTATCTAAATTTTCATATGAAGTGGTTTAAA
CC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2D746JQ 461 0 0
TTTT
TTCTCTAATCATCACAAACATCGCCTTAGCGCAAGGCCGAGCTCCTCACGGGTTAGTTTA
TGAGACCCCAGTGGCGTTTTCACCTTCTGCATTTGACTTTTTCCACGCACAACCAGAAAA
CCCTGATGATACCACTTTAGACCCTTGCGCTGAATCCAGCTGCTCGCCTCTCCCCGTGGC
AGCGAAGGTTCAGGGAGCTTCTGCAAAAGAACAGCAAAGCGAGATAGCAACAATGTCCAT
TGGTTCCAGAGGCGGAATGGGAGCTGGTGGTGCGGTCATGATCATATTTGGACTTGTGTT
TCCTATGCTGATGTGAACCATTACAACTCAATCCAACCTAGTGTTTTTGAGCTGATATTA
TGATAGAGCAATATAGCTAGAGTTCGAGTTGAAATATGTGTGTGTTTTTTTTTCCTTCAC
TCTTGTATCTAAATTTTCATATGAAGTGGTTTAAACC

QA 5 461 5 461
DS 



CO CL2219Contig2 592 2 1 U
GGACAACACTAGCCCCACCTGCTCAACAACTTATAGCCTTTTTTACATTTTCAACAAACA
GACTGAAGCCAAGTGTGAGAAATGAATACAAAGACTTGCCTCTTCCTCCTGTCTTCTCTA
ATCATCACAAACATCGCCTTAGCGCAAGGCCGAGCTCCTCACGGATTGGTTTATGAGACC
CCAGTGGCGTTTTCACCTTCTGCATTTGACTTCTTCCACGCACAACCAGAAAACCCTGGT
GATACCACTTTAGACCCTTGCGCTGAATCCAGCTGCTCGCCTCTCCCCGTGGCTGCGAAG
GTTCAAGGAGCTTCTGCAAAAGAACAACAAAGCGAGATAGCAACAATGTCCATTGGTTCC
AGAAGCGGAACGGGAGCTGGTGGCGCGGTCATGATCATCTTTGGACTTGTGTTTCCTATG
CTGATGTGAACTATTACAACTCAATCCAACCTAGTGTCTTGAGATGATATTATGATAGAA
CAATATAGCTAGAGTTCGAGTTGAAAATGTGTGTTTGTTTTTTTTTCCTTCACTCTTGTA
TCTAAATTTCCATATGAAGTGGTTTAAAGCAGAGTATATGACTATTTACCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DP22TF U 1
AF RR2DP22JQ C 39
BS 1 592 RR2DP22TF

RD RR2DP22TF 592 0 0
GGACAACACTAGCCCCACCTGCTCAACAACTTATAGCCTTTTTTACATTTTCAACAAACA
GACTGAAGCCAAGTGTGAGAAATGAATACAAAGACTTGCCTCTTCCTCCTGTCTTCTCTA
ATCATCACAAACATCGCCTTAGCGCAAGGCCGAGCTCCTCACGGATTGGTTTATGAGACC
CCAGTGGCGTTTTCACCTTCTGCATTTGACTTCTTCCACGCACAACCAGAAAACCCTGGT
GATACCACTTTAGACCCTTGCGCTGAATCCAGCTGCTCGCCTCTCCCCGTGGCTGCGAAG
GTTCAAGGAGCTTCTGCAAAAGAACAACAAAGCGAGATAGCAACAATGTCCATTGGTTCC
AGAAGCGGAACGGGAGCTGGTGGCGCGGTCATGATCATCTTTGGACTTGTGTTTCCTATG
CTGATGTGAACTATTACAACTCAATCCAACCTAGTGTCTTGAGATGATATTATGATAGAA
CAATATAGCTAGAGTTCGAGTTGAAAATGTGTGTTTGTTTTTTTTTCCTTCACTCTTGTA
TCTAAATTTCCATATGAAGTGGTTTAAAGCAGAGTATATGACTATTTACCGC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2DP22JQ 554 0 0
TTT
TTTACATTTTCAACAAACAGACTGAAGCCAAGTGTGAGAAATGAATACAAAGACTTGCCT
CTTCCTCCTGTCTTCTCTAATCATCACAAACATCGCCTTAGCGCAAGGCCGAGCTCCTCA
CGGATTGGTTTATGAGACCCCAGTGGCGTTTTCACCTTCTGCATTTGACTTCTTCCACGC
ACAACCAGAAAACCCTGGTGATACCACTTTAGACCCTTGCGCTGAATCCAGCTGCTCGCC
TCTCCCCGTGGCTGCGAAGGTTCAAGGAGCTTCTGCAAAAGAACAACAAAGCGAGATAGC
AACAATGTCCATTGGTTCCAGAAGCGGAACGGGAGCTGGTGGCGCGGTCATGATCATCTT
TGGACTTGTGTTTCCTATGCTGATGTGAACTATTACAACTCAATCCAACCTAGTGTCTTG
AGATGATATTATGATAGAACAATATAGCTAGAGTTCGAGTTGAAAATGTGTGTTTGTTTT
TTTTTCCTTCACTCTTGTATCTAAATTTCCATATGAAGTGGTTTAAAGCAGAGTATATGA
CTATTTACCGC

QA 4 554 4 554
DS 



AS 1 2

CO CL2220Contig1 1135 2 4 U
GGGTGTAATATCAACAGATAAAGTGATCGGTTATGCGATCAATTATTGCCCCGGTAAAAA
TCTCCATTCCCTGAGGATTATGCAATCCGAAAGCATGTTCTCCGACGAGATCATCAGATT
CTACGCGGCGGAGCTTGTACTCGCGTTCGAGTATTTGCATAACCAAGGAATCGTTTACAG
AGATCTGAAGCCAGATAATGTGATGATCCAAGATAATGGACATTTAATGCTGGTGGATTT
CGATCTCTCGACGAATCTACCTCCGAGAACGCCCTCACCGTCACCATCCACGGCGAAAAC
TCCGTCGCCGGGTAGGAGGAAGAAACGTCTCTTCCGACTCGCTAGCTTCTGCAGCTCGGG
AATCTCGCCGGAAGAAGAATCTAATTCGATCCGCTTATCGTCGTCGTCATTGGCCGTGTC
GGATTCTTCGGGAGAGAAGTCGAACTCCCTTCGTGGGAACAGAGGAGTACGTCGCGCCGG
AGGTTATATCCGGAGGAGGTCACGATTTCGCCGTCGATTGGTGGTCGTTAGGTGTGGTTC
TGTACGAGATGCTGTACGGGACGACGCCGTTTAGGGGATCGAACCGGAAAGAAACGTTTT
TCCGGATTTTATCTAAACCGCCGAATCTGGTGGGTGAGACGACATCGTTACGGGATCTGA
TTAGGAGGTTGTTGGAGAAAGATCCTAGCCGTAGGATTAGCCTTGAGGAAATCAAGGGTC
ATGAATTCTTCAGAGGATTAGATTGGGAGAAAGTGTTATTGGTTTCTAGACCGCCGTATA
TTCCGGCGCTCCATGATGAGGGTAAAGATGGAAGTACGAAAATGGATGTGGAGAATATTG
TCCAAGAGATTTTCGCTGCTCGAGAAGAAGGTGAGAAACAGAAGGATAATATTAGTAATG
CTGATGTGAAGACTAAAGGTGAAAACGGTGGAGAATGGGTGAAGGGGTTGAATAACAATA
ACAATTTGGAAAGTGACAATAATTTTTTGGTATTTTAATTCGATTTGTTTCTTTTTTTTT
CATTTTTAACACGATAATATTTATGTTATGCGGATAATCTATACTATTATGTGTATATTT
AAATAGTGTTAGGTGATTCTTCCAAACTTTATACGGATGTAACTATTTAAAATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB14TF U 1
AF RR2AB14JQ C 373
BS 1 448 RR2AB14TF
BS 449 449 RR2AB14JQ
BS 450 509 RR2AB14TF
BS 510 1135 RR2AB14JQ

RD RR2AB14TF 509 0 0
GGGTGTAATATCAACAGATAAAGTGATCGGTTATGCGATCAATTATTGCCCCGGTAAAAA
TCTCCATTCCCTGAGGATTATGCAATCCGAAAGCATGTTCTCCGACGAGATCATCAGATT
CTACGCGGCGGAGCTTGTACTCGCGTTCGAGTATTTGCATAACCAAGGAATCGTTTACAG
AGATCTGAAGCCAGATAATGTGATGATCCAAGATAATGGACATTTAATGCTGGTGGATTT
CGATCTCTCGACGAATCTACCTCCGAGAACGCCCTCACCGTCACCATCCACGGCGAAAAC
TCCGTCGCCGGGTAGGAGGAAGAAACGTCTCTTCCGACTCGCTAGCTTCTGCAGCTCGGG
AATCTCGCCGGAAGAAGAATCTAATTCGATCCGCTTATCGTCGTCGTCATTGGCCGTGTC
GGATTCTTCGGGAGAGAAGTCGAACTCC*TTCGTGGGAACAGAGGAGTACGTCGCGCCGG
AGGTTATATCCGGAGGAGGTCACGATTTC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2AB14JQ 763 0 0
AGAAGAATCTAATTCGATCCGCTTATCGTCGTCGTCATTGGCCGTGTCGGATTCTTCGGG
AGAGAAGTCGAACTCCCTTCGTGGGAACAGAGGAGTACGTCGCGCCGGAGGTTATATCCG
GAGGAGGTCACGATTTCGCCGTCGATTGGTGGTCGTTAGGTGTGGTTCTGTACGAGATGC
TGTACGGGACGACGCCGTTTAGGGGATCGAACCGGAAAGAAACGTTTTTCCGGATTTTAT
CTAAACCGCCGAATCTGGTGGGTGAGACGACATCGTTACGGGATCTGATTAGGAGGTTGT
TGGAGAAAGATCCTAGCCGTAGGATTAGCCTTGAGGAAATCAAGGGTCATGAATTCTTCA
GAGGATTAGATTGGGAGAAAGTGTTATTGGTTTCTAGACCGCCGTATATTCCGGCGCTCC
ATGATGAGGGTAAAGATGGAAGTACGAAAATGGATGTGGAGAATATTGTCCAAGAGATTT
TCGCTGCTCGAGAAGAAGGTGAGAAACAGAAGGATAATATTAGTAATGCTGATGTGAAGA
CTAAAGGTGAAAACGGTGGAGAATGGGTGAAGGGGTTGAATAACAATAACAATTTGGAAA
GTGACAATAATTTTTTGGTATTTTAATTCGATTTGTTTCTTTTTTTTTCATTTTTAACAC
GATAATATTTATGTTATGCGGATAATCTATACTATTATGTGTATATTTAAATAGTGTTAG
GTGATTCTTCCAAACTTTATACGGATGTAACTATTTAAAATAG

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 4

CO CL2221Contig1 1348 4 12 U
GGGTGTGGAGGCGTTGAACAATGTTTTGCTTATTGGAATGACAAACAGAAAGGACTTGCT
TGATGAAGCTCTTTTAAGGCCGGGAAGATTGGAGGTTCAAGTTGAGATAAGCCTTCCTGA
TGAAGCTGGGCGTTTCCAAATTCTTCAGATTCACACAAACAAGATGAAGGAAAATTCTTT
CCTTGGTCATGATATCAATCTCCAAGAGCTTGCTGCTCGAACAAAAAATTACAGTGGTGC
GGAGCTTGAAGGAGTGGTTAAAAGTGCTACCTCATATGCGTTAAACGGACAATTAAGCAT
GGATGATCTTACAAAGCCAGTGGAAGAAGAGAATATCAAGATCACTATGGAGGACTTTCT
CCATGCAATCCATGAAGTTCAGCCTGCCTTTGGAGCCTCCACAGATGACCTGGAGCGCTG
CAGACTTAATGGGATGGTGGATTCTGGTGATCGGCATAACCACATTTACAAAAGAGCGAT
GCTTCTAGTCGAGCAAGTTAAAGTTAGTAGTAGAAGTCCTCTTGTCACCTGTCTTCTAGA
GGGGCCAAGTGGAAGTGGAAAAACTGCTTTAGCCGCAACTGTTGGTATCGATAGTGACTT
CCCCTATGTTAAGATCGTCTCTGCTGAAACTATGATTGGTCTTCAGGAGAGCACCAAATG
TGCTCACATTGTCAAGGTCTTTGAGGATGCATATAAATCACCAATGAGCATCATTATCCT
TGATGATATCGAAAGATTGTTGGAGTACGTAGCAATCGGTCCTCGTTTCTCAAACATTAT
TTCTCAGACGTTAATGGTTCTTCTCAAGCGACTTCCTCCGAAGGGGAAGAAACTTCTCGT
GTTTGGGACAACAAGTCAACTAACCTTCTTAGACTCTGTTGGTATCTGTGATGCCTTCTC
TATCACTTACTCTGTTCCAACATTGAGAACAGAGGATGCAAAGAAGGTGCTTCAGCAGCT
TAATGTCTTCTCGGAGGATGATATCGATGCAGCTGCCGAGGCTCTCGATGATATGCCAAT
CAAGAAGCTGTACATGCTAATAGAGATGGCGGCGCAAGGAGAAGACGGTGGATCCGCAGA
AGCTATCTATGCTGGGAGAGAGAAAATCAAGATCACTCATTTCTTCGATTGCCTACAAGA
CGTTGTCCGATTCTAAAAACTTCCCAGGCAAATCATATTTTCTTCTTCATAAAGCTTTTG
AAACAATTGGTTTGGTAATAAATCTTTGGATTTTATTTTATTTGGTGGATGAATTGAACT
GAGAGGGCTTTCTTGTGCTGTTGCATTGTTCTTTTGGTGAATGAGACAATATTGCTTTTG
GCTTTTTAGTTACAAAAGCGTTCGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E288TF U 1
AF RR2GY51TF U 437
AF RR2BH21TF U 707
AF RR2E288JQ C 728
BS 1 646 RR2E288TF
BS 647 647 RR2GY51TF
BS 648 685 RR2E288TF
BS 686 686 RR2GY51TF
BS 687 773 RR2E288TF
BS 774 1155 RR2GY51TF
BS 1156 1216 RR2BH21TF
BS 1217 1217 RR2E288JQ
BS 1218 1219 RR2BH21TF
BS 1220 1220 RR2E288JQ
BS 1221 1327 RR2BH21TF
BS 1328 1348 RR2E288JQ

RD RR2E288TF 774 0 0
GGGTGTGGAGGCGTTGAACAATGTTTTGCTTATTGGAATGACAAACAGAAAGGACTTGCT
TGATGAAGCTCTTTTAAGGCCGGGAAGATTGGAGGTTCAAGTTGAGATAAGCCTTCCTGA
TGAAGCTGGGCGTTTCCAAATTCTTCAGATTCACACAAACAAGATGAAGGAAAATTCTTT
CCTTGGTCATGATATCAATCTCCAAGAGCTTGCTGCTCGAACAAAAAATTACAGTGGTGC
GGAGCTTGAAGGAGTGGTTAAAAGTGCTACCTCATATGCGTTAAACGGACAATTAAGCAT
GGATGATCTTACAAAGCCAGTGGAAGAAGAGAATATCAAGATCACTATGGAGGACTTTCT
CCATGCAATCCATGAAGTTCAGCCTGCCTTTGGAGCCTCCACAGATGACCTGGAGCGCTG
CAGACTTAATGGGATGGTGGATTCTGGTGATCGGCATAACCACATTTACAAAAGAGCGAT
GCTTCTAGTCGAGCAAGTTAAAGTTAGTAGTAGAAGTCCTCTTGTCACCTGTCTTCTAGA
GGGGCCAAGTGGAAGTGGAAAAACTGCTTTAGCCGCAACTGTTGGTATCGATAGTGACTT
CCCCTATGTTAAGATCGTCTCTGCTGAAACTATGATTGGTCTTCAG*AGAGCACCAAATG
TGCTCACATTGTCAAGGTCTTTGAG*ATGCATATAAATCACCAATGAGCATCATTATCCT
TGATGATATCGAAAGATTGTTGGAGTACGTAGCAATCGGTCCTCGTTTCTCAA
C

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2GY51TF 719 0 0
GTGGATTCTGGTGATCGGCATAACCACATTTACAAA*GAGCGATGCTTCTAGTCGAGCAA
GTTAAAGTTAGTAGTAGAAGTCCTCTTGTCACCTGTCTTCTAGAGGGGCCAAGTGGAAGT
GGAAAAACTGCTTTAGCTGCAACTGTTGGTATCGATAGTGACTTCCCCTATGTTAAGATC
GTCTCTGCTGAAACTATGATTGGTCTTCAGGAGAGCACCAAATGTGCTCACATTGTCAAG
GTCTTTGAGGATGCATATAAATCACCAATGAGCATCATTATCCTTGATGATATCGAAAGA
TTGTTGGAGTACGTAGCAATCGGTCCTCGTTTCTCAAACATTATTTCTCAGACGTTAATG
GTTCTTCTCAAGCGACTTCCTCCGAAGGGGAAGAAACTTCTCGTGTTTGGGACAACAAGT
CAACTAACCTTCTTAGACTCTGTTGGTATCTGTGATGCCTTCTCTATCACTTACTCTGTT
CCAACATTGAGAACAGAGGATGCAAAGAAGGTGCTTCAGCAGCTTAATGTCTTCTCGGAG
GATGATATCGATGCAGCTGCCGAGGCTCTCGATGATATGCCAATCAAGAAGCTGTACATG
CTAATAGAGATGGCGGCGCAAGGAGAAGACGGTGGATCCGCAGAAGCTATCTATGCTGGG
AGAGAGAAAATCAAGATCACTCATTTCTTCGATTGCCTACAAGACGTTGTCCGATTCTA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2BH21TF 621 0 0
G
GCATCATTATCCTTGATGATATCGAAAGATTGTTGGAGTACGTAGCAATCGGTCCTCGTT
TCTCAAACATTATTTCTCAGACGTTAATGGTTCTTCTTAAACGACTTCCTCCGAAGGGGA
AGAAACTTCTCGTGTTTGGGACAACAAGTCAACTAACCTTCTTAGACTCTGTTGGTATCT
GTGATGCCTTCTCTATCACTTACTCTGTTCCAACATTGAGAACAGAGGATGCAAAGAAGG
TGCTTCAGCAGCTTAATGTCTTCTCGGAGGATGATATCGATGCAGCTGCCGAGGCTCTCG
ATGATATGCCGATCAAGAAGCTGTACATGCTAATTGAGATGGCGGCGCAAGGAGAAGACG
GTGGATCCGCCGAAGCTATCTATGCTGGGAGAGAGAAAATCAAGATCACTCATTTCTTCG
ATTGCCTACAAGACGTTGTCCGATTCTAAAAACTTCCCAGGCAAATCATATTTTCTTCTT
CATAAAGCTTTTGAAACAATTGGTTTGGTTATTAATCTTTGGATTTTATTTTATTTGGTG
GATGAATTGAACTGAGAGGGCTTTCTTGTGCTGTTGCATTGTTCTTTTGGTGAATGAGAC
AATATTGCTTTTGGCTTTTT

QA 2 621 2 621
DS 

RD RR2E288JQ 621 0 0
ATCGAAAGATTGTTGGAGTACGTAGCAATCGGTCCTCGTTTCTCAAACATTATTTCTCAG
ACGTTAATGGTTCTTCTCAAGCGACTTCCTCCGAAGGGGAAGAAACTCCTCGTGTTTGGG
ACAACAAGTCAACTAACCTTCTTAGACTCTGTTGGTATCTGTGATGCCTTCTCTATCACT
TACTCTGTTCCAACATTGAGAACAGAGGATGCAAAGAAGGTGCTTCAGCAGCTTAATGTC
TTCTCG*AGGATGATATCGATGCAGCTGCCGAGGCTCTCGATGATATGCCAATCAAGAAG
CTGTACATGCTAATAGAGATGGCGGCGCAAGGAGAAGACGGTGGATCCGCAGAAGCTATC
TATGCTGGGAGAGAGAAAATCAAGATCACTCATTTCTTCGATTGCCTACAAGACGTTGTC
CGATTCTAAAAACTTCCCAGGCAAATCATATTTTCTTCTT*ATAAAGCTTTTGAAACAAT
TGGTTTGGTATTAAGTCTTTGGATTTTATTTTATTTGGTGGTTGAATTGAACTGAGAGGG
CTTTCTTGTGCTGTTGCATTGTTCTTTTGGTGAATGAGACAATATTGCTTTTGGCTTTTT
AGTTACAAAAGCGTTCGTCCC

QA 1 621 1 621
DS 



AS 2 4

CO CL2222Contig1 1103 2 2 U
GGATCGAACAATTTTCTCTTGGTCTCTCTGAGTCCCCCTCCTTACCCCTATCTTTCTCTC
CCACACTTCCTCCTCTGCAATGGCTTCATCAATAGTAACCTCAAGCTTCAAGCCTTAGCC
ATGGCGGACTCTTCCTCTTCCTCTTCCACCATCTTCTCCCATCCTTCACTCTCCACCATC
TCTTCTCGCTGCTCCCTCCTCAGCGGACGTACTAACCTCCCGCTCGCCTTCTCCCGCGTC
TCCCTATCTCTCAAAGCCAAAACCAACCTAAAGAAGTCGCCTTTCGTCTCCTTCGTCGCT
CAGACTTCGGATTGGGACGGGGAAGAAGCAGGTGGGGACGTGAGCGCTTCCGTGGCCGTT
GAGGAGAACGAGCCTGAAGCTACGTTCTCGGAGGGAGATGTGGGCTAAGGAGGTGACTTC
CCGGAGCCGCCGGAGGAAGCGAAGCTCTTCCTCGGAAACTTGGCTTATGATGTTGACAGT
CAAGCCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCCGGTACTGTTGAAATCGCTGAGGTTATCTAC
AATAGGGAGACAGACCAGAGTCGTGGGTTTGGATTTGTGACAATGAGTACGGTGGAAGAA
GCTGAGACTGCTGTTGAGAAGTTCAACCGTTATGATCTGAGCGGAAGGCTTCTGACAGTA
AACAAGGCAGCACCAAGGGGGTCACGTCCAGAACGCCAACCTAGGGTATATGAACCTGCG
TTCAGAGTCTATGTGGGAAACCTACCTTGGGATGTTGACAACGGTCGTCTAGAGCAAGTT
TTCAGTGAGCATGGTAAAGTTGTGGAAGCTCGTGTGGTGTATGACCGTGAGACGGGTCGT
TCACGTGGGTTCGGTTTTGTCACGATGTCTAACGAGACTGAACTCAATGACGCTATCGCT
GCTCTTGATGGACAGAACATGGAGAGTAGAGCAATCAGAGTGAATGTAGCGGAGGAGCGT
CCGAGGCGTGGGTTTTAAGGATTGAGATTATCCCTTCTGCCAGTTTCCTCTCTCTCTATC
TCTCTCTATCGCTTTGCATTTTGTTTAGACGAAGATTCTTACACTCTTTGATGATTTTTT
GTTGTGTCTGAGCACCTTTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD45TF U 1
AF RR2BD45JQ C 272
BS 1 832 RR2BD45TF
BS 833 1103 RR2BD45JQ

RD RR2BD45TF 832 0 0
GGATCGAACAATTTTCTCTTGGTCTCTCTGAGTCCCCCTCCTTACCCCTATCTTTCTCTC
CCACACTTCCTCCTCTGCAATGGCTTCATCAATAGTAACCTCAAGCTTCAAGCCTTAGCC
ATGGCGGACTCTTCCTCTTCCTCTTCCACCATCTTCTCCCATCCTTCACTCTCCACCATC
TCTTCTCGCTGCTCCCTCCTCAGCGGACGTACTAACCTCCCGCTCGCCTTCTCCCGCGTC
TCCCTATCTCTCAAAGCCAAAACCAACCTAAAGAAGTCGCCTTTCGTCTCCTTCGTCGCT
CAGACTTCGGATTGGGACGGGGAAGAAGCAGGTGGGGACGTGAGCGCTTCCGTGGCCGTT
GAGGAGAACGAGCCTGAAGCTACGTTCTCGGAGGGAGATGTGGGCTAAGGAGGTGACTTC
CCGGAGCCGCCGGAGGAAGCGAAGCTCTTCCTCGGAAACTTGGCTTATGATGTTGACAGT
CAAGCCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCCGGTACTGTTGAAATCGCTGAGGTTATCTAC
AATAGGGAGACAGACCAGAGTCGTGGGTTTGGATTTGTGACAATGAGTACGGTGGAAGAA
GCTGAGACTGCTGTTGAGAAGTTCAACCGTTATGATCTGAGCGGAAGGCTTCTGACAGTA
AACAAGGCAGCACCAAGGGGGTCACGTCCAGAACGCCAACCTAGGGTATATGAACCTGCG
TTCAGAGTCTATGTGGGAAACCTACCTTGGGATGTTGACAACGGTCGTCTAGAGCAAGTT
TTCAGTGAGCATGGTAAAGTTGTGGAAGCTCGTGTGGTGTATGACCGTGAGA

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR2BD45JQ 832 0 0
AGAAGTCGCCTTTCGTCTCCTTCGTCGCTCAGACTTCGGATTGGGACGGGGAAGAAGCAG
GTGGGGACGTGAGCGCTTCCGTGGCCGTTGAGGAGAACGAGCCTGAAGCTACGTTCTCGG
AGGGAGATGTGGGCTAAGGAGGTGACTTCCCGGAGCCGCCGGAGGAAGCGAAGCTCTTCG
TCGGAAACTTGGCTTATGATGTTGACAGTCAAGCCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCCG
GTACTGTTGAAATCGCTGAGGTTATCTACAATAGGGAGACAGACCAGAGTCGTGGGTTTG
GATTTGTGACAATGAGTACGGTGGAAGAAGCTGAGACTGCTGTTGAGAAGTTCAACCGTT
ATGATCTGAGCGGAAGGCTTCTGACAGTAAACAAGGCAGCACCAAGGGGGTCACGTCCAG
AACGCCAACCTAGGGTATATGAACCTGCGTTCAGAGTCTATGTGGGAAACCTACCTTGGG
ATGTTGACAACGGTCGTCTAGAGCAAGTTTTCAGTGAGCATGGTAAAGTTGTGGAAGCTC
GTGTGGTGTATGACCGTGAGACGGGTCGTTCACGTGGGTTCGGTTTTGTCACGATGTCTA
ACGAGACTGAACTCAATGACGCTATCGCTGCTCTTGATGGACAGAACATGGAGAGTAGAG
CAATCAGAGTGAATGTAGCGGAGGAGCGTCCGAGGCGTGGGTTTTAAGGATTGAGATTAT
CCCTTCTGCCAGTTTCCTCTCTCTCTATCTCTCTCTATCGCTTTGCATTTTGTTTAGACG
AAGATTCTTACACTCTTTGATGATTTTTTGTTGTGTCTGAGCACCTTTGATG

QA 1 832 1 832
DS 



CO CL2222Contig2 731 2 3 U
CTGAAGGCGGTTATGTGCTATAGTATAAGCATTAGTTCAGACAACAAAAAAATCATCAAA
GGTGTTCAGACACAACAAAAAATCATCGAAGAGTGTAAGAATCTCGTCTAAACAAAATGC
AAAGCGATAGAGAGATAAGAGAGAGAGGAAACTGGTAGAAGAGATAATCTCAATCCTTAA
AACCCACGCCTCGGACGCTCCTCAGCTACGTTCACCCTGATTGCTCTACCCTCCATGTTC
TGTCCATCAAGAGCAGCGATAGCGTCATTGAGTTCAGTCTCGTTAGACATTGTGACAAAA
CCGAACCCACGTGAACGACCAGTCTCACGGTCATACACCACTCGAGCTTCCACAACTTTG
CCATGCTCACTGAAAACTTGCTCTAGGCGACCGTTGTCCACATCCCACGGTAGGTTTCCC
ACATAGACTCTGAACGCAGGTTCATATACCCGGGGTTGGCGCTCTGGACGTGATCCTCTC
GGTGCTGCCTTGTTTACTGTCAGAAGCCTTCCGTTCAAATCATAACGGTTGAACTTCTCA
ACAGCAGTCTCAGCTTCTTCCACGGTACTCATTGTCACAAATCCAAACCCACGACTCTGG
TCTGTCTCCCTATTGTAGATAACCTCAGCGATTTCAACAGTACCGGCTTGCTCAAAGAGC
ATAGCCAAGGCTTGACTATCAACATCGTAAGCCAAGTTTCCGACGAAGAGTTTCGCTTCT
TCCGGCGGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP78JQ U 281
AF RR2FP78TF C 1
BS 1 280 RR2FP78TF
BS 281 508 RR2FP78JQ
BS 509 731 RR2FP78TF

RD RR2FP78JQ 228 0 0
CGTTAGACATTGTGACAAAACCGAACCCACGTGAACGACCAGTCTCACGGTCATACACCA
CTCGAGCTTCCACAACTTTGCCATGCTCACTGAAAACTTGCTCTAGGCGACCGTTGTCCA
CATCCCACGGTAGGTTTCCCACATAGACTCTGAACGCAGGTTCATATACCCGGGGTTGGC
GCTCTGGACGTGATCCTCTCGGTGCTGCCTTGTTTACTGTCAGAAGCC

QA 1 228 1 228
DS 

RD RR2FP78TF 731 0 0
CTGAAGGCGGTTATGTGCTATAGTATAAGCATTAGTTCAGACAACAAAAAAATCATCAAA
GGTGTTCAGACACAACAAAAAATCATCGAAGAGTGTAAGAATCTCGTCTAAACAAAATGC
AAAGCGATAGAGAGATAAGAGAGAGAGGAAACTGGTAGAAGAGATAATCTCAATCCTTAA
AACCCACGCCTCGGACGCTCCTCAGCTACGTTCACCCTGATTGCTCTACCCTCCATGTTC
TGTCCATCAAGAGCAGCGATAGCGTCATTGAGTTCAGTCTCGTTAGACATTGTGACAAAA
CCGAACCCACGTGAACGACCAGTCTCACGGTCATACACCACTCGAGCTTCCACAACTTTG
CCATGCTCACTGAAAACTTGCTCTAGGCGACCGTTGTCCACATCCCACGGTAGGTTTCCC
ACATAGACTCTGAACGCAGGTTCATATACCCGGGGTTGGCGCTCTGGACGTGATCCTCTC
GGTGCTGCCTTGTTTACTGTCAGAAGCCTTCCGTTCAAATCATAACGGTTGAACTTCTCA
ACAGCAGTCTCAGCTTCTTCCACGGTACTCATTGTCACAAATCCAAACCCACGACTCTGG
TCTGTCTCCCTATTGTAGATAACCTCAGCGATTTCAACAGTACCGGCTTGCTCAAAGAGC
ATAGCCAAGGCTTGACTATCAACATCGTAAGCCAAGTTTCCGACGAAGAGTTTCGCTTCT
TCCGGCGGCTC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 3

CO CL2223Contig1 877 3 12 U
ATGGTTAAAACGAACTTTTTTTTATTATTACAATCTCAGATGAGTTCAAATCAGGCTTGG
TTCCAATAATACTTACATTACATAAACGACTAACGAGGGGAGCAATCAATCACCAGAGAC
CAACAAACTGCTAATTCTAAGACATGCCATACCCAACAGTGCCTATGCTCCTATGTGCTG
CTACTGCAACCGCGGCAGCTCCAGCAGGACCATACTGGGATTGTGCCTGCAACAGCTTAG
CATCAATACCCACCTTGTGCTGTGATTGGACATAAGGGTTTGGGTTCAGCTCAGCTGGCT
TCCAGGAGTTGCATTGGGTAGGGACAACAAACTGCGGTTTTGGCTGGGAAGCAGCTTCTG
TACCACCACCACCACGCTTCTCTTGGTTCATGGTGTTAGGATGGAAAAAACAGTTGGGAA
ATGCGGTCTGTGGAGGGGGTACCGTGCTTCTGTAGTATGATGTCCTTGCATCATGGGACG
ACTCTTTGAGGTTCATTGCATTCTCATAACTTACAGATGTTTCCACAGCACGGCCTGGTC
TAGCTGATGGTACTCTTGGAGGAGGTCCTAAAGGTTTAGTTGAAGTTGATGGAGCTACAC
CGTTTCTTGAAGGTTTGAAAGTAACACGTCTACCGTCTGGTGCATTCAAGCCAGGCTGAG
CACTGGAGGCTACTACACTGGAGTGAACTGTAGACCGTGGAAGTGAAGTATGCTTTCTCT
CTGGAGGTATGACTGGCCCACTTTTGCCGCTATTTTCTTCTAGGTACGCAAACTGTTTCC
TCAAATGACCAATGGCACTAGGATATAAGAAACTTGAGCCTTCAGATCCGTTCATATAAT
CCTTGAGCAACTGAGGATGGTATTCTAGTATCTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E481JQ U 291
AF RR2CZ12JQ U 1
AF RR2E481TF C 592
BS 1 302 RR2CZ12JQ
BS 303 303 RR2E481JQ
BS 304 406 RR2CZ12JQ
BS 407 407 RR2E481JQ
BS 408 419 RR2CZ12JQ
BS 420 420 RR2E481JQ
BS 421 494 RR2CZ12JQ
BS 495 495 RR2E481JQ
BS 496 633 RR2CZ12JQ
BS 634 634 RR2E481TF
BS 635 720 RR2CZ12JQ
BS 721 877 RR2E481TF

RD RR2E481JQ 232 0 0
TCAA
CTGGCTTCCAGGAGTTGCATTGGGTAGGGACAACAAACTGCGGTTTTGGCTGGGAAGCAG
CTTCTGTACCACCACCACCACGCTTCTCTTGGTTCATGGTGTTAGGATGGAAAAAACAGT
TGGGAAATGCGGTCTGTGGAGGGGGTACCGTGCTTCTGTAGTATGATGTCCTTGCATCAT
GGGACGACTCTTTGAGGTTCATTGCATTCTCATAACTTACAGATGTTT

QA 5 232 5 232
DS 

RD RR2CZ12JQ 720 0 0
ATGGTTAAAACGAACTTTTTTTTATTATTACAATCTCAGATGAGTTCAAATCAGGCTTGG
TTCCAATAATACTTACATTACATAAACGACTAACGAGGGGAGCAATCAATCACCAGAGAC
CAACAAACTGCTAATTCTAAGACATGCCATACCCAACAGTGCCTATGCTCCTATGTGCTG
CTACTGCAACCGCGGCAGCTCCAGCAGGACCATACTGGGATTGTGCCTGCAACAGCTTAG
CATCAATACCCACCTTGTGCTGTGATTGGACATAAGGGTTTGGGTTCAGCTCAGCTGGCT
TCGAGGAGTTGCATTGGGTAGGGACAACAAACTGCGGTTTTGGCTGGGAAGCAGCTTCTG
TACCACCACCACCACGCTTCTCTTGGTTCATGGTGTTAGGATGGAAGAAACAGTTGGGAG
ATGCGGTCTGTGGAGGGGGTACCGTGCTTCTGTAGTATGATGTCCTTGCATCATGGGACG
ACTCTTTGAGGTTCCTTGCATTCTCATAACTTACAGATGTTTCCACAGCACGGCCTGGTC
TAGCTGATGGTACTCTTGGAGGAGGTCCTAAAGGTTTAGTTGAAGTTGATGGAGCTACAC
CGTTTCTTGAAGGTTTGAAAGTAACACGTCTACTGTCTGGTGCATTCAAGCCAGGCTGAG
CACTGGAGGCTACTACACTGGAGTGAACTGTAGACCGTGGAAGTGAAGTATGCTTTCTCT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2E481TF 286 0 0
GAGC
TACACCGTTTCTTGAAGGTTTGAAAGTAACACGTCTACCGTCTGGTGCATTCAAGCCAGG
CTGAGCACTGGAGGCTACTACACTGGAGTGAACTGTAGACCGTGGAAGTGAAGTATGCTT
TCTCTCTGGAGGTATGACTGGCCCACTTTTGCCGCTATTTTCTTCTAGGTACGCAAACTG
TTTCCTCAAATGACCAATGGCACTAGGATATAAGAAACTTGAGCCTTCAGATCCGTTCAT
ATAATCCTTGAGCAACTGAGGATGGTATTCTAGTATCTCCCC

QA 5 286 5 286
DS 



AS 1 3

CO CL2224Contig1 1061 3 4 U
TGTTTTGTTCATCTCTGTTCCCAAGAACCAAACTTTGGATTCTCTCCTCTGTTCTTCTTC
GTACTTTTTGTAATAATTTTTCTGTATCGAGAGAGAAGGGATGTATTATCAGTTGACAAA
GTCTTCTTACATGGACTCTTTGAAGATTCTTGAGGCTGACATCGAGCACGCAAATGGACT
GGCTGGTGAGATTCCCATGGAAAAGAGCGGTGTCCGACTTCAGATGAAACTGGTCTGCAG
CAATTTGGCTCCTTTCTTCATTTTCCTGCTTCAATGGATGGACTTCTCATGTCTCCTTCC
AAGATATTTTGATTTCTTCCACATACTCATCTACAAGGTACGTTCTGATGGGCGGTGGAA
TCTATCCAGGTACGGAAGGAAAGCTACAATCAGAGAGTTTTACGGTGTTATATTACCATC
ACTGGAGCGTCTTCATATCAACTTCTCCGACTTACCAGGCGACAGCGTATGGTACTCGAA
TCCAAAAGCCATCGCCAAGAAGAATTACGACGTTGAAGACAACAGATTCATCATGACCAG
CGTTGACTCGGAGGAAAGAGAAGAGGAATGCGGGATATGCTTAGAGCCGTGCACCAAGAT
GGTGTTACCTAACTGCTGTCACGCCATGTGCATCAAGTGCTACAGGAACTGGAACACGAA
GTCCGAGTCATGCCCGTTTTGTAGAGGCAGCATCAAGAGAGTGAACTCGGAGGATCTGTG
GGTGCTGACTTGCGATGATGATGTGGTGGATCCAGAGACGGTCACGAAGGAGGATTTGCT
GCGGTTCTACCTACACATCAATAGCCTCCCTAAAGATTATCCGGAAGCCGTCTTCTTAGG
CTACAACGAGTACTTGATATGATGTTGTTATCACATCACGGATATGGGTGTACAGAGGGA
GAGAAAGATCCCAGACCACCTTTTAACTAAGTGTATATAAAGAATCTGGTGATCCATGAT
TTAATCCTTCGTCTTTTAGGTTATGATAATAATAAGATGATTGTCATAAAATATGTGTAC
CTTGTTATGATATATAAAAGAGAGACTATGATCTCTGTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A464TF U 1
AF RR2A464JQ C 146
AF RR2G527TF U 559
BS 1 200 RR2A464TF
BS 201 201 RR2A464JQ
BS 202 705 RR2A464TF
BS 706 1061 RR2G527TF

RD RR2A464TF 705 0 0
TGTTTTGTTCATCTCTGTTCCCAAGAACCAAACTTTGGATTCTCTCCTCTGTTCTTCTTC
GTACTTTTTGTAATAATTTTTCTGTATCGAGAGAGAAGGGATGTATTATCAGTTGACAAA
GTCTTCTTACATGGACTCTTTGAAGATTCTTGAGGCTGACATCGAGCACGCAAATGGACT
GGCTGGTGAGATTCCCATGGGAAAGAGCGGTGTCCGACTTCAGATGAAACTGGTCTGCAG
CAATTTGGCTCCTTTCTTCATTTTCCTGCTTCAATGGATGGACTTCTCATGTCTCCTTCC
AAGATATTTTGATTTCTTCCACATACTCATCTACAAGGTACGTTCTGATGGGCGGTGGAA
TCTATCCAGGTACGGAAGGAAAGCTACAATCAGAGAGTTTTACGGTGTTATATTACCATC
ACTGGAGCGTCTTCATATCAACTTCTCCGACTTACCAGGCGACAGCGTATGGTACTCGAA
TCCAAAAGCCATCGCCAAGAAGAATTACGACGTTGAAGACAACAGATTCATCATGACCAG
CGTTGACTCGGAGGAAAGAGAAGAGGAATGCGGGATATGCTTAGAGCCGTGCACCAAGAT
GGTGTTACCTAACTGCTGTCACGCCATGTGCATCAAGTGCTACAGGAACTGGAACACGAA
GTCCGAGTCATGCCCGTTTTGTAGAGGCAGCATCAAGAGAGTGAA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2A464JQ 860 0 0
ATTCTTGAGGCTGACATCGAGCACGCAAATGGACTGGCTGGTGAGATTCCCATGGAAAAG
AGCGGTGTCCGACTTCAGATGAAACTGGTCTGCAGCAATTTGGCTCCTTTCTTCATTTTC
CTGCTTCAATGGATGGACTTCTCATGTCTCCTTCCAAGATATTTTGATTTCTTCCACATA
CTCATCTACAAGGTACGTTCTGATGGGCGGTGGAATCTATCCAGGTACGGAAGGAAAGCT
ACAATCAGAGAGTTTTACGGTGTTATATTACCATCACTGGAGCGTCTTCATATCAACTTC
TCCGACTTACCAGGCGACAGCGTATGGTACTCGAATCCAAAAGCCATCGCCAAGAAGAAT
TACGACGTTGAAGACAACAGATTCATCATGACCAGCGTTGACTCGGAGGAAAGAGAAGAG
GAATGCGGGATATGCTTAGAGCCGTGCACCAAGATGGTGTTACCTAACTGCTGTCACGCC
ATGTGCATCAAGTGCTACAGGAACTGGAACACGAAGTCCGAGTCATGCCCGTTTTGTAGA
GGCAGCATCAAGAGAGTGAACTCGGAGGATCTGTGGGTGCTGACTTGCGATGATGATGTG
GTGGATCCAGAGACGGTCACGAAGGAGGATTTGCTGCGGTTCTACCTACACATCAATAGC
CTCCCTAAAGATTATCCGGAAGCCGTCTTCTTAGGCTACAACGAGTACTTGATATGATGT
TGTTATCACATCACGGATATGGGTGTACAGAGGGAGAGAAAGATCCCAGACCACCTTTTA
ACTAAGTGTATATAAAGAATCTGGTGATCCATGATTTAATCCTTCGTCTTTTAGGTTATG
ATAATAATAAGATGATTGTC

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR2G527TF 503 0 0
G
GAAGAGGAATGCGGGATATGCTTAGAGCCGTGCACCAAGATGGTGTTACCTAACTGCTGT
CACGCCATGTGCATCAAGTGCTACAGGAACTGGAACACGAAGTCCGAGTCATGCCCGTTT
TGTAGAGGCAGCATCAAGAGAGTGAACTCGGAGGATCTGTGGGTGCTGACTTGCGATGAT
GATGTGGTGGATCCAGAGACGGTCACGAAGGAGGATTTGCTGCGGTTCTACCTACACATC
AATAGCCTCCCTAAAGATTATCCGGAAGCCGTCTTCTTAGGCTACAACGAGTACTTGATA
TGATGTTGTTATCACATCACGGATATGGGTGTACAGAGGGAGAGAAAGATCCCAGACCAC
CTTTTAACTAAGTGTATATAAAGAATCTGGTGATCCATGATTTAATCCTTCGTCTTTTAG
GTTATGATAATAATAAGATGATTGTCATAAAATATGTGTACCTTGTTATGATATATAAAA
GAGAGACTATGATCTCTGTTTA

QA 2 503 2 503
DS 



AS 1 3

CO CL2225Contig1 1054 3 2 U
GGGGTCGGGTTGGGCAAAAGCTAACAAGAAAAGGGCATGAAAAAAGAAAAGACATATCTG
ATCAACCCGGCCCACTTTAACCTCTTTGTTGGCCGCGTAACATGTTCTAACGCGGCCATC
TCACAAAGAACATATATTTAAAGACACACAGACACAAGATTCAAAAGCTTAAAGCTTTGA
TAGTAACCAAGAAAGAACCCTAGCTTGCATCACAAGACACATCTTCATAAAAACACATTA
GCTTCCTATCACTCTACTTTATATTTTAAAAAAATGGTGAGAAGAAGAGAAAACCTTACG
TTATCAGTCTTAACACCGCCCCTTGGCGAGGCCAAAACGGCAGCAACAACTCCGGTGGGT
TTACAGAAGCCGAAGAAACGGTTATCAAAACAACTATCTATGTTGGAGACACCACGAGAC
ATTGCTTGGGAAAGAAGGACGTCAGATGATAATGATCCAAGAGAAGAAGATGCTTCACAA
AGGCGTTTCAGACAATCTTAGTGAACAGACTAAACTAACTGATGAGGATTTAAACGAGCT
TAAAGGATCTATTGAGTTAGGTTTTGGTTTCAGTGAGGAAGCTGGACAAAAGCTATGCAA
TACTTTACCAGCTCTTGATCTTTACTTTGTAGTGAACCGTCAGCTCTCTCCTCTCCCTTC
ACCTAGCAGCAGCAGCCGTACCAGCAGCGCATCTTCATCAGCTTTCTCAATGAGTATTCC
TGGTAGTCCCAAGAAGACTGATTCAGATTCATTGAAGATAGTATGTCCAGGGGACAATCC
TCAACAAGTCAAGCAGAGATTGAGACATTGGGCACAAGCAGTTGCATGTTCTGTGATGCA
GACTTATTGATAAGGTGTATATGTGATTGTAAGCTTCAATCACTCAGATTTTCTTTTGAG
AGATAGGAAGTTCAAGAATCATTAAATCAAGATTCTGAAGAAACAAGAAAAGCATTAAAA
AGATAGAGAAGAAGGTTGTGTATATACTTTTATGCTAAGGGAACAAAAGATGAGAAAACA
AAAAAAATCTTTTCTTGTTCATAAACTGTATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H066TF U 99
AF RR2AZ42TFB U 1
AF RR2AZ42JQ C 358
BS 1 773 RR2AZ42TFB
BS 774 1054 RR2AZ42JQ

RD RR2H066TF 105 0 0
AACATGTTCTAACGCGGCCATCTCACAAAGAACATATATTTAAAGACACACAGACACAAG
ATTCAAAAGCTTAAAGCTTTGATAGTAACCAAGAAAGAACCCTAG

QA 1 105 1 105
DS 

RD RR2AZ42TFB 773 0 0
GGGGTCGGGTTGGGCAAAAGCTAACAAGAAAAGGGCATGAAAAAAGAAAAGACATATCTG
ATCAACCCGGCCCACTTTAACCTCTTTGTTGGCCGCGTAACATGTTCTAACGCGGCCATC
TCACAAAGAACATATATTTAAAGACACACAGACACAAGATTCAAAAGCTTAAAGCTTTGA
TAGTAACCAAGAAAGAACCCTAGCTTGCATCACAAGACACATCTTCATAAAAACACATTA
GCTTCCTATCACTCTACTTTATATTTTAAAAAAATGGTGAGAAGAAGAGAAAACCTTACG
TTATCAGTCTTAACACCGCCCCTTGGCGAGGCCAAAACGGCAGCAACAACTCCGGTGGGT
TTACAGAAGCCGAAGAAACGGTTATCAAAACAACTATCTATGTTGGAGACACCACGAGAC
ATTGCTTGGGAAAGAAGGACGTCAGATGATAATGATCCAAGAGAAGAAGATGCTTCACAA
AGGCGTTTCAGACAATCTTAGTGAACAGACTAAACTAACTGATGAGGATTTAAACGAGCT
TAAAGGATCTATTGAGTTAGGTTTTGGTTTCAGTGAGGAAGCTGGACAAAAGCTATGCAA
TACTTTACCAGCTCTTGATCTTTACTTTGTAGTGAACCGTCAGCTCTCTCCTCTCCCTTC
ACCTAGCAGCAGCAGCCGTACCAGCAGCGCATCTTCATCAGCTTTCTCAATGAGTATTCC
TGGTAGTCCCAAGAAGACTGATTCAGATTCATTGAAGATAGTATGTCCAGGGG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2AZ42JQ 697 0 0
GGTTTACAGAAGCCGAAGAAACGGTTATCAAAACAACTATCTATGTTGGAGACACCACGA
GACATTGCTTGGGAAAGAAGGACGTCAGATGATAATGATCCAAGAGAAGAAGATGCTTCA
CAAAGGCGTTTCAGACAATCTTAGTGAACAGACTAAACTAACTGATGAGGATTTAAACGA
GCTTAAAGGATCTATTGAGTTAGGTTTTGGTTTCAGTGAGGAAGCTGGACAAAAGCTATG
CAATACTTTACCAGCTCTTGATCTTTACTTTGTAGTGAACCGTCAGCTCTCTCCTCTCCC
TTCACCTAGCAGCAGCAGCCGTACCAGCAGCGCATCTTCATCAGCTTTCTCAATGAGTAT
TCCTGGTAGTCCCAAGAAGACTGATTCAGATTCATTGAAGATAGTATGTCCAGGGGACAA
TCCTCAACAAGTCAAGCAGAGATTGAGACATTGGGCACAAGCAGTTGCATGTTCTGTGAT
GCAGACTTATTGATAAGGTGTATATGTGATTGTAAGCTTCAATCACTCAGATTTTCTTTT
GAGAGATAGGAAGTTCAAGAATCATTAAATCAAGATTCTGAAGAAACAAGAAAAGCATTA
AAAAGATAGAGAAGAAGGTTGTGTATATACTTTTATGCTAAGGGAACAAAAGATGAGAAA
ACAAAAAAAATCTTTTCTTGTTCATAAACTGTATACC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 4

CO CL2226Contig1 1136 4 16 U
GAGAACTGTCTTTTCTGTATACTTATGTATACTTTCCCCGGTTCCGTTGCTACTGCGGGC
TTTACGCAATCGATCGGATCATCTAGATATCCCTTCAACACAACACAACATAGGTCGTCG
AAAGGATCTCGGAGACCCGCCAAAGCACGAAAGCCAGGATCTTTCAGAAAATGAATTCCT
ATTCGAAGAGTGCATAACCGCATGGATAAGCTCACACTAACCCGTCAATTTGGGATCCAA
TTCGGGATTTTCCTTGAGGGATATTGGTAAGGAATTGGAATGTAATAATATCGATTCATA
ATGGATTCATATCGATACAGAAGAAAAGGTTCTCTATCGATTCAACAAGTGCTGTACTTA
TGGGAAAGCGATAGAGAAAGAGAAAAAAAAAAACGAAGATTTCACATAGTGATTTTTTTT
TTGATCAAAAAAAA*TATGATTGAATTTATTTCGTACCCTTCGCTCAATGGGAACATGGG
TCAGATTCTATAGGATCAAACCTATGGGACTTAAGAATGATGGAAGGGAATAAAATAAAA
AAAGAAATCAAATAAAGAAAAGAGAGGGAAAATAAAGAAATAATAAGTAAATAAAAATGA
AGTAGAAGAACCCAGATTCCAAATGAACAAATTCAAACTTGAAAAAGTCTCTTTCTGATT
CTCGAAGAATGAGGGGCAAAGAGATTGATCGAGAAAGATCTCTTGTTCTTATTATAAGAT
CGTGTGATTGGACCCGCAGATGTTTGGTAAAAAGAATAATCTTATCCTTTGAGAATAATC
AAAAATAGAAAGTGTTCAATTGGAACATGAAAACGTGACCGAGTTTATCCTAGTTACTCT
TCGGGACGGAGTGGAAGAAGGGAGGAGATTCGCGAACGAGGAAAGGGACCCAATGACTTC
GAAAGAATTGAACGAGGAGCCGTATGAGGTGAAAATCTCATGTCCGGTTCTGTAGAGTGG
CAGTAAGGGTGACTTATCTGTCAACTTTTCCACTATCACCCCCAAAAAATCAAACTCTGC
CTTACGTAAAGTTGCCAGAGTACGATTAACCTCGGGATTTGAAATCACTGCTTATATACC
TGGTATTGGCCATAATTTACAAGAACATTCTGTAGTCTTAGTAAGAGGGGAAGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN44JQ C 105
AF RR2FN44TF U 105
AF RR2H306TF U 1
AF RR2CD85TF U 423
BS 1 322 RR2H306TF
BS 323 323 RR2FN44TF
BS 324 374 RR2H306TF
BS 375 375 RR2FN44TF
BS 376 392 RR2H306TF
BS 393 393 RR2FN44TF
BS 394 421 RR2H306TF
BS 422 422 RR2FN44TF
BS 423 434 RR2H306TF
BS 435 435 RR2FN44TF
BS 436 470 RR2H306TF
BS 471 471 RR2FN44TF
BS 472 645 RR2H306TF
BS 646 646 RR2CD85TF
BS 647 659 RR2H306TF
BS 660 1136 RR2CD85TF

RD RR2FN44JQ 424 0 0
G
CAACATAGGTTGTCGAAAGGATTTTGGAGACCCGCCAAAGCACGAAAGCCAGGATTTTTC
AGAAAATGAATTCCTATTCGAAGAGTGCATAACCGCATGGATAAGCTCACACTAACCCGT
CAATTTGGGATCCAATTCGGGATTTTCCTTGAGGGATATTGGTAAGGAATTGGAATGTAA
TAATATCGATTCATAATGGATTCATATCGATACAGAAGAAAAGGTTTTCTATCGATTCAA
CAAGTGCTGTACTTATGGGAAAGCGATAGAGAAAGAGAAAAAAAAAAACGAAGATTTCAC
ATAGTGATTTTTTTTTTGATCAAAAAAAA*TATGATTGAATTTATTTCGTACCCTTCGCT
CAATGGGAACATGGGTCAGATTCTATAGGATCAAACCTATGGGACTTAAGAATGATGGAA
GGG

QA 2 424 2 424
DS 

RD RR2FN44TF 424 0 0
G
CAACATAGGTCGTCGAAAGGATCTCGGAGACCCGCCAAAGCACGAAAGCCAGGATCTTTC
AGAAAATGAATTCCTATTCGAAGAGTGCATAACCGCATGGATAAGCTCACACTAACCCGT
CAATTTGGGATCCAATTCGGGATTTTCCTTGAGGGATATTGGTAAGGAATTGGAATGTAA
TAATATCGATTCATAATGGATTCATATCGATACAGAAGAAAAGGTTCTCTATCGATTCAA
CAAGTGCTGTACTTATGGGAAAGCGATAGAGAAAGAGAAAAAAAAAAACGAAGATTTCAC
ATAGTGATTTTTTTTTTGATCAAAAAAAA*TATGATTGAATTTATTTCGTACCCTTCGCT
CAATGGGAACATGGGTCAGATTCTATAGGATCAAACCTATGGGACTTAAGAATGATGGAA
GGG

QA 2 424 2 424
DS 

RD RR2H306TF 661 0 0
GAGAACTGTCTTTTCTGTATACTTATGTATACTTTCCCCGGTTCCGTTGCTACTGCGGGC
TTTACGCAATCGATCGGATCATCTAGATATCCCTTCAACACAACACAACATAGGTCGTCG
AAAGGATCTCGGAGACCCGCCAAAGCACGAAAGCCAGGATCTTTCAGAAAATGAATTCCT
ATTCGAAGAGTGCATAACCGCATGGATAAGCTCACACTAACCCGTCAATTTGGGATCCAA
TTCGGGATTTTCCTTGAGGGATATTGGTAAGGAATTGGAATGTAATAATATCGATTCATA
ATGGATTCATATCGATACAGAATAAAAGGTTCTCTATCGATTCAACAAGTGCTGTACTTA
TGGGAAAGCGATAGGGAAAGAGAAAAAAAAAA*CGAAGATTTCACATAGTGATTTTTTTT
T*GATCAAAAAAAAATATGATTGAATTTATTTCGTACCCTTCGCTCAATGAGAACATGGG
TCAGATTCTATAGGATCAAACCTATGGGACTTAAGAATGATGGAAGGGAATAAAATAAAA
AAAGAAATCAAATAAAGAAAAGAGAGGGAAAATAAAGAAATAATAAGTAAATAAAAATGA
AGTAGAAGAACCCAGATTCCAAATGAACAAATTCAAACTTGAAAA*GTCTCTTTCTGAT
CT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2CD85TF 714 0 0
GATCA
AAAAAAAATATGATTGAATTTATTTCGTACCCTTCGCTCAATGAGAACATGGGTCAGATT
CTATAGGATCAAACCTATGGGACTTAAGAATGATGGAAGGGAATAAAATAAAAAAAGAAA
TCAAATAAAGAAAAGAGAGGGAAAATAAGGAAATAATAAGTAAATAAAAATGAAGTAGAA
GAACCCAGATTCCAAATGAACAAATTCAAACTTGAAAAAGTCTCTTTCTGATTCTCGAAG
AATGAGGGGCAAAGAGATTGATCGAGAAAGATCTCTTGTTCTTATTATAAGATCGTGTGA
TTGGACCCGCAGATGTTTGGTAAAAAGAATAATCTTATCCTTTGAGAATAATCAAAAATA
GAAAGTGTTCAATTGGAACATGAAAACGTGACCGAGTTTATCCTAGTTACTCTTCGGGAC
GGAGTGGAAGAAGGGAGGAGATTCGCGAACGAGGAAAGGGACCCAATGACTTCGAAAGAA
TTGAACGAGGAGCCGTATGAGGTGAAAATCTCATGTCCGGTTCTGTAGAGTGGCAGTAAG
GGTGACTTATCTGTCAACTTTTCCACTATCACCCCCAAAAAATCAAACTCTGCCTTACGT
AAAGTTGCCAGAGTACGATTAACCTCGGGATTTGAAATCACTGCTTATATACCTGGTATT
GGCCATAATTTACAAGAACATTCTGTAGTCTTAGTAAGAGGGGAAGGGT

QA 6 714 6 714
DS 



AS 1 3

CO CL2227Contig1 1029 3 5 U
GGAAACCCGCGTCGTCGTCTCTCTCTCTCTCTTTACGCTCACCGCCGACCATGGCCAAAG
AGAAACTGAAGCCTCTTCCCACCTCTGACGGAGGTGAAATCGCCGACACTACTCCTAGAG
AGAAGAAGCATAAGAAGAAGAACAGGAAGCGATCTGAGCCCGATCCCGATGTGCCTTCAA
CAACGAGAGAGCCACGTCATTCCGGTGTTGATGAAGAGAGAGATGGAGGGGTAGTGGAGG
ATGCTCATAACGAGCCAACAATGGGTGATAAATTCGAGAGTCTTCATTTGTTAGAGGGAG
AGAAACTTAGAAGCGAGGAGGAGAGTAATAGAGTAGATGATAAGAAGCCTCCTACAGCAT
CCTCTGTGAATGTTCTTTTGAGACAGGCATTGCATGCTGATGATCGCTCTCTTCTACTTG
ATTGCCTGTACAACCGAGATGAACAGGTGATTGCTAACTCGGTTGCTAAGTTGAATTCAG
CAGAAGTACTCAAGCTTCTTAATTCCCTTCTACCAATACTACAATCAAGGGGTGCGGTTT
TAGCTTGTGCGATTCCGTGGATAAAGTGTGTGTTACTTACTCATTCCAGTGGGATTATGT
CCCAAGAGTCTTCTTTGATCGCTTTGAACTCCATGTATCAGCTCATTGAATCACGAGTAT
CAACTCTTCACACTGCCGTAGAAGTTTCAAGCGGCTTAGACTTGCTTGTGGACGATTTGG
ATGAAGAAGAAGAAGATGAAGGTCCATTGATTTACGAGGACAAGGACACTGATGATGAAG
AAGGACAAGGACCAGATGAAGCAATGGAAACAGATGAAGATGGAGACGAATCAGCGGATG
AAGCAGCTGATGGTGTCAATGCTTTTGAGGATTTTGACGACATGAGCGATTGAGAAGACT
CCTGACAACAGAAAAAAGTTTTGATTTGTGAGTGCTGTTTGGTCGTTACATGTTAATGTC
TTCTCCGCTATTAAGTAATGGGTTGTATTGATTAGACTTTGTTCTGAAAAAGAGGTTTGT
TTTTACACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW60TF U 1
AF RR2EN03TF U 1
AF RR2EN03JQ C 180
BS 1 279 RR2BW60TF
BS 280 280 RR2EN03TF
BS 281 289 RR2BW60TF
BS 290 622 RR2EN03TF
BS 623 1029 RR2EN03JQ

RD RR2BW60TF 289 0 0
GGAAACCCGCGTCGTCGTCTCTCTCTCTCTCTTTACGCTCACCGCCGACCATGGCCAAAG
AGAAACTGAAGCCTCTTCCCACCTCTGACGGAGGTGAAATCGCCGACACTACTCCTAGAG
AGAAGAAGCATAAGAAGAAGAACAGGAAGCGATCTGAGCCCGATCCCGATGTGCCTTCAA
CAACGAGAGAGCCACGTCATTCCGGTGTTGATGAAGAGAGAGATGGAGGGGTAGTGGAGG
ATGCTCATAACGAGCCAACAATGGGTGATAAATTCGAGATTCTTCATTT

QA 1 289 1 289
DS 

RD RR2EN03TF 622 0 0
GGAAACCCGCGTCGTCGTCTCTCTCTCTCT**TTACGCTCACCGCCGACCATGGCCAAAG
AGAAACTGAAGCCTCTTCCCACCTCTGACGGAGGTGAAATCGCCGACACTACTCCTAGAG
AGAAGAAGCATAAGAAGAAGAACAGGAAGCGATCTGAGCCCGATCCCGATGTGCCTTCAA
CAACGAGAGAGCCACGTCATTCCGGTGTTGATGAAGAGAGAGATGGAGGGGTAGTGGAGG
ATGCTCATAACGAGCCAACAATGGGTGATAAATTCGAGAGTCTTCATTTGTTAGAGGGAG
AGAAACTTAGAAGCGAGGAGGAGAGTAATAGAGTAGATGATAAGAAGCCTCCTACAGCAT
CCTCTGTGAATGTTCTTTTGAGACAGGCATTGCATGCTGATGATCGCTCTCTTCTACTTG
ATTGCCTGTACAACCGAGATGAACAGGTGATTGCTAACTCGGTTGCTAAGTTGAATTCAG
CAGAAGTACTCAAGCTTCTTAATTCCCTTCTACCAATACTACAATCAAGGGGTGCGGTTT
TAGCTTGTGCGATTCCGTGGATAAAGTGTGTGTTACTTACTCATTCCAGTGGGATTATGT
CCCAAGAGTCTTCTTTGATCGC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2EN03JQ 850 0 0
AA
AACGAGAGAGCCACGTCATTCCGGTGTTGATGAAGAGAGAGATGGAGGGGTAGTGGAGGA
TGCTCATAACGAGCCAACAATGGGTGATAAATTCGAGAGTCTTCATTTGTTAGAGGGAGA
GAAACTTAGAAGCGAGGAGGAGAGTAATAGAGTAGATGATAAGAAGCCTCCTACAGCATC
CTCTGTGAATGTTCTTTTGAGACAGGCATTGCATGCTGATGATCGCTCTCTTCTACTTGA
TTGCCTGTACAACCGAGATGAACAGGTGATTGCTAACTCGGTTGCTAAGTTGAATTCAGC
AGAAGTACTCAAGCTTCTTAATTCCCTTCTACCAATACTACAATCAAGGGGTGCGGTTTT
AGCTTGTGCGATTCCGTGGATAAAGTGTGTGTTACTTACTCATTCCAGTGGGATTATGTC
CCAAGAGTCTTCTTTGATCGCTTTGAACTCCATGTATCAGCTCATTGAATCACGAGTATC
AACTCTTCACACTGCCGTAGAAGTTTCAAGCGGCTTAGACTTGCTTGTGGACGATTTGGA
TGAAGAAGAAGAAGATGAAGGTCCATTGATTTACGAGGACAAGGACACTGATGATGAAGA
AGGACAAGGACCAGATGAAGCAATGGAAACAGATGAAGATGGAGACGAATCAGCGGATGA
AGCAGCTGATGGTGTCAATGCTTTTGAGGATTTTGACGACATGAGCGATTGAGAAGACTC
CTGACAACAGAAAAAAGTTTTGATTTGTGAGTGCTGTTTGGTCGTTACATGTTAATGTCT
TCTCCGCTATTAAGTAATGGGTTGTATTGATTAGACTTTGTTCTGAAAAAGAGGTTTGTT
TTTACACT

QA 3 850 3 850
DS 



AS 1 3

CO CL2228Contig1 1049 3 4 U
GAGTTCCTCTGCATTGAACAATAAAAGGCAAAAGGATGAAAACTGTAGCTCACATACATT
AAAGTTGTTGGCAGATTCGAGTCTTAAGTTTACTATTTTCTGTACTTTCTCACATACGAG
ATCAAAGACGACAGAAGATAAGAGAAGAAAACAAGAGTCTAATCTATGTTATGGAAGCCA
GGGAGAAGTGAAGTTATGAAGCCGAAAACTATCATCTGAATCTCTTTGACTATTCCCCAC
CATTGATTCCCCTGCTGGCTTGCATCCACATTTTCATTTGCGTTTGCTCTGTTCCCGTTT
TCACCTTCATTCTCTTGTCCCTCGGGAACCGCATCTCCGTTAAGTGGGACTACAGCAGCG
GGGTCATTATCAGCTCTGGCAGCAACAGGTGGTTGAGGTCGAGGTGGTGGTACAGCGGCT
CTATGCATACCTTGTGAGAGCCATCGGACAAAAGGTGCAAGGGCTCCAGTTTGGTATAAG
TAAATGATGGTAGCGAAAATCACAAGGACAGCAAGCCTCTGTCTCGAACCATCTTGGTTG
AAGAGAAAGATGACAGCAGCAAGCTTGAGTATGAGGAATATGTCAAGCTGAAAGGCGATC
TCGAATCTCCGTACAACCACTTGCCTTTGTTGTTGTTGTGCAGGCTGTTGCTGCTGCTGC
TGACCTTGCCCAGCTTGGGCTTGGTTCTCTCCCCCACCCTCAGTCTCATTGCTTGGTCTA
GCTGTGGGAAGATTGTAAGTGAGAGGAATAAGATAATTAGAGGGAAGAGCTCCAAATTGA
TGATTCACAGGAACCGCATAGATCCCAGCTCCACGGTTCGTTTGTTCATTGTACTGCCCA
GGATTCGATCCGGGATACATTGGAGCTCGATCTAGATTCTGAGGCTTGATCCCAGAATCT
TCGGGTTTCTTATCAGAAGAAGAAGGTTGCTGTGACGCTGAAGAAGGCGCCTTCTGGGGT
TCTTCCGCCATTTTTTTTTTTATCAAAAAGGATTGTACTGTATACACGACGACGCAGAAG
CTCTTTCTCTATTTAATCCGCCAAATCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E576JQ U 1
AF RR2DR90JQ U 1
AF RR2E576TF C 436
BS 1 611 RR2DR90JQ
BS 612 612 RR2E576TF
BS 613 753 RR2DR90JQ
BS 754 1049 RR2E576TF

RD RR2E576JQ 259 0 0
GAGTTCCTCTGCATTGAACAATAAAAGGCAAAAGGATGAAAACTGTAGCTCACATACATT
AAAGTTGTTGGCAGATTCGAGTCTTAAGTTTACTATTTTCTGTACTTTCTCACATACGAG
ATCAAAGACGACAGAAGATAAGAGAAGAAAACAAGAGTCTAATCTATGTTATGGAAGCCA
GGGAGAAGTGAAGTTATGAAGCCGAAAACTATCATCTGAATCTCTTTGACTATTCCCCAC
CATTGATTCCCCTGCTG
TC

QA 1 257 1 257
DS 

RD RR2DR90JQ 753 0 0
GAGTTCCTCTGCATTGAACAATAAAAGGCAAAAGGATGAAAACTGTAGCTCACATACATT
AAAGTTGTTGGCAGATTCGAGTCTTAAGTTTACTATTTTCTGTACTTTCTCACATACGAG
ATCAAAGACGACAGAAGATAAGAGAAGAAAACAAGAGTCTAATCTATGTTATGGAAGCCA
GGGAGAAGTGAAGTTATGAAGCCGAAAACTATCATCTGAATCTCTTTGACTATTCCCCAC
CATTGATTCCCCTGCTGGCTTGCATCCACATTTTCATTTGCGTTTGCTCTGTTCCCGTTT
TCACCTTCATTCTCTTGTCCCTCGGGAACCGCATCTCCGTTAAGTGGGACTACAGCAGCG
GGGTCATTATCAGCTCTGGCAGCAACAGGTGGTTGAGGTCGAGGTGGTGGTACAGCGGCT
CTATGCATACCTTGTGAGAGCCATCGGACAAAAGGTGCAAGGGCTCCAGTTTGGTATAAG
TAAATGATGGTAGCGAAAATCACAAGGACAGCAAGCCTCTGTCTCGAACCATCTTGGTTG
AAGAGAAAGATGACAGCAGCAAGCTTGAGTATGAGGAATATGTCAAGCTGAAAGGCGATC
TCGAATCTCCG*ACAACCACTTGCCTTTGTTGTTGTTGTGCAGGCTGTTGCTGCTGCTGC
TGACCTTGCCCAGCTTGGGCTTGGTTCTCTCCCCCACCCTCAGTCTCATTGCTTGGTCTA
GCTGTGGGAAGATTGTAAGTGAGAGGAATAAGA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2E576TF 614 0 0
GAGAGCCATCGGACAAAAGGTGCAAGGGCTCCAGTTTGGTATAAGTAAATGATGGTAGCG
AAAATCACAAGGACAGCAAGCCTCTGTCTCGAACCATCTTGGTTGAAGAGAAAGATGACA
GCAGCAAGCTTGAGTATGAGGAATATGTCAAGCTGAAAGGCGATCTCGAATCTCCGTACA
ACCACTTGCCTTTGTTGTTGTTGTGCAGGCTGTTGCTGCTGCTGCTGACCTTGCCCAGCT
TGGGCTTGGTTCTCTCCCCCACCCTCAGTCTCATTGCTTGGTCTAGCTGTGGGAAGATTG
TAAGTGAGAGGAATAAGATAATTAGAGGGAAGAGCTCCAAATTGATGATTCACAGGAACC
GCATAGATCCCAGCTCCACGGTTCGTTTGTTCATTGTACTGCCCAGGATTCGATCCGGGA
TACATTGGAGCTCGATCTAGATTCTGAGGCTTGATCCCAGAATCTTCGGGTTTCTTATCA
GAAGAAGAAGGTTGCTGTGACGCTGAAGAAGGCGCCTTCTGGGGTTCTTCCGCCATTTTT
TTTTTTATCAAAAAGGATTGTACTGTATACACGACGACGCAGAAGCTCTTTCTCTATTTA
ATCCGCCAAATCCC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 3

CO CL2229Contig1 1146 3 45 U
AAAGTTTAATCAGCAGTTGTATGCTTAACTGTGGATTGTATGACAAACAAAATTACATTT
TAAAAAAAAGGAATCAGATATCCAAATTATGTGATATTGACATAAACACAACAAACAAAC
AAAAAGACAATACAGATGAATGAATCAGTCCGTCTCTAACCGAAAAATGTAGGTGTCATA
GTAACTCCCAGCTTTCTCAAGATCTCCCAGCTCAGTGTAACAATCTGCAATAGCTCCATA
AGCTTCAGTGCTTCCAGAATCTTCTCCTTCCCTATTCGAGATGGCTAAAACCATGTTGTG
ATACTGTATAGCATCTCTATACTTCCCTTGACGCTGCAGCGAAGCGCCTAAGCCTCTAGC
AGCTTTCTTCTCTTCGATGGGGTCTCCGAAACTCTGGGCAAGCTCCAAAGCAATCTTGAA
CTCTGAAAAAGCTTTCTCTAGGTCTTGATTCCTCAGAAAGGTCTTGCCCGTTTTCAGCTT
GGAGATCAACTCTTGTTTCTTTGGGTCCACAATGATCTCACTCTCTGGCGGGATTCTAGC
TCCTACGGGTGCGTAACTTAACCCTGGGGCGTAAGACTCGATTTTGGCTTGTCTCCTAAG
GGCTGTGTTGATCTGTCGTAGCTGTTCGTTCAGCCTCTGTAACTCCCCTTTCCTCTGCCG
AGCAAGCAACCCTCCAACAGTGGCTCCAACAAGTGCGACAAGCAACAAAAGAGGCATGTT
GAAGACGGAAACTCTCAGGAGGCTCGCATATCTCAGCAGACAAGGCTTGGAGAGGTGTAC
CAATGAGAAGGGAGTTTGTAAACAACACTGCCATCACCGGTAACTTGAGCCTCCCAAATC
CCTCAATAGCTGATAACTTATCAAAACTTTGCAGGGTTGGAGATGGTGTTTGTAAGAAGA
TTCCCTTGCTTTCAGGCTCATTGGGCTTGGTAGACAGAAGTTTAATCTTGGAGATAAGAT
GATGTGCTCCAGGTGAGGAGGAGGAGTAGCCAATAGATTTAGCTAACTTGTTCCCAGTCT
CTCGTGAATTTTCGTGCGGCGGAGTACGGACGCCGGAAGTATGGGAGAAGGAGGAGCAAC
ACCGGATAATCGCCATCGCCGCCATCTCTGAGGATATGTTTTTAAACCCCGCTTCCACTC
GCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO37JQ U 1
AF RR2EM04JQ U 42
AF RR2EM04TF C 387
BS 1 71 RR2AO37JQ
BS 72 73 RR2EM04JQ
BS 74 75 RR2AO37JQ
BS 76 76 RR2EM04JQ
BS 77 84 RR2AO37JQ
BS 85 85 RR2EM04JQ
BS 86 97 RR2AO37JQ
BS 98 98 RR2EM04JQ
BS 99 117 RR2AO37JQ
BS 118 118 RR2EM04JQ
BS 119 150 RR2AO37JQ
BS 151 151 RR2EM04JQ
BS 152 255 RR2AO37JQ
BS 256 256 RR2EM04JQ
BS 257 333 RR2AO37JQ
BS 334 334 RR2EM04JQ
BS 335 357 RR2AO37JQ
BS 358 358 RR2EM04JQ
BS 359 387 RR2AO37JQ
BS 388 388 RR2EM04JQ
BS 389 441 RR2AO37JQ
BS 442 442 RR2EM04JQ
BS 443 455 RR2AO37JQ
BS 456 456 RR2EM04JQ
BS 457 483 RR2AO37JQ
BS 484 484 RR2EM04JQ
BS 485 528 RR2AO37JQ
BS 529 529 RR2EM04JQ
BS 530 546 RR2AO37JQ
BS 547 547 RR2EM04JQ
BS 548 574 RR2AO37JQ
BS 575 575 RR2EM04JQ
BS 576 610 RR2AO37JQ
BS 611 611 RR2EM04JQ
BS 612 616 RR2AO37JQ
BS 617 764 RR2EM04JQ
BS 765 765 RR2EM04TF
BS 766 855 RR2EM04JQ
BS 856 856 RR2EM04TF
BS 857 865 RR2EM04JQ
BS 866 866 RR2EM04TF
BS 867 877 RR2EM04JQ
BS 878 878 RR2EM04TF
BS 879 900 RR2EM04JQ
BS 901 1146 RR2EM04TF

RD RR2AO37JQ 616 0 0
AAAGTTTAATCAGCAGTTGTATGCTTAACTGTGGATTGTATGACAAACAAAATTACATTT
TAAAAAAAAGGGGTCTGATATCCATATTATGTGATAT*GACATAAACACAACAAACAGAC
AAAAAGACAATACAGATGAATGAATCAGTCTGTCTCTAACCGAAAAATGTAGGTGTCATA
GTAACTCCCAGCTTTCTCAAGATCTCCCAGCTCAGTGTAACAATCTGCAATAGCTCCATA
AGCTTCAGTGCTTCCGGAATCTTCTCCTTCCCTATTCGAGATGGCTAAAACCATGTTGTG
ATACTGTATAGCATCTCTATACTTCCCTTGACGTTGCAGCGAAGCGCCTAAGCCTCTGGC
AGCTTTCTTCTCTTCGATGGGGTCTCCTAAACTCTGGGCAAGCTCCAAAGCAATCTTGAA
CTCTGAAAAAGCTTTCTCTAGCTCTTGATTCCTCAAAAAGGTCTTGCCCGTTTTCAGCTT
GGAAATCAACTCTTGTTTCTTTGGGTCCACAATGATCTCACTCTCTGGTGGGATTCTAGC
TCCTACCGGTGCGTAACTTAACCCTGGGGCGTAAAACTCGATTTTGGCTTGTCTCCTAAG
GGCTGTGTTGGTCTGT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2EM04JQ 860 0 0
GACAAACAAAATTACATTTTAAAAAAG*GGAATCAGATATCCAATTTATGTGATTTTGAC
ATAAACACAACAAACAAACAAAAAGACAATACAGATGAATGAATCAGTCCGTCTCTAACC
GAGAAATGTAGGTGTCATAGTAACTCCCAGCTTTCTCAAGATCTCCCAGCTCAGTGTAAC
AATCTGCAATAGCTCCATACGCTTCAGTGCTTCCAGAATCTTCTCCTTCCCTATTCGAGA
TGGCTAGAACCATGTTGTGATACTGTATAGCATCTCTATACTTCCCTTGACGCTGCAGCG
AAGCGCCTAAGCCTCTAGCAGCTTTCTTCTCTTCGATGGGGTCTCCGAGACTCTGGGCAA
GCTCCAAAGCAATCTTGAACTCTGAAAAAGCTTTCTCTAGGTCTTGATTCCTCAGAAAGG
TCTTGCCCGTTTTCAGCTTGGAGATCAACTCTTGTTTCTTTGGGTCCACAATGATCTCAC
TCTCTGGCGGGATTCTAGCTCCTACGGGTGCGTAACTTAACCCTGGGGCGTAAGACTCGA
TTTTGGCTTGTCTCCTAAGGGCTGTGTTGATCTGTCGTAGCTGTTCGTTCAGCCTCTGTA
ACTCCCCTTTCCTCTGCCGAGCAAGCAACCCTCCAACAGTGGCTCCAACAAGTGCGACAA
GCAACAAAAGAGGCATGTTGAAGACGGAAACTCTCAGGAGGCTCGCATATCTCAGCAGAC
AAG*CTTGGAGAGGTGTACCAATGAGAAGGGAGTTTGTAAACAACACTGCCATCACCGGT
AACTTGAGCCTCCCAAATCCCTCAATAGCTGATA*CTTATCAAA*CTTTGCAGGGT*GGA
GATGGTGTTTGTAAGAAGA
T

QA 1 859 1 859
DS 

RD RR2EM04TF 760 0 0
CGAG
ACTCTGGGCAAGCTCCAAAGCAATCTTGAACTCTGAAAA*GCTTTCTCTAGGTCTTGATT
CCTCAGAAAGGTCTTGCCCGTTT*CAGCTTGGAGATCAACTCTTGTTTCTTTGGGTCCAC
AATGATCTCACTCTCTGGCGGGATTCTAGCTCCTACGGGTGCGTAACTTAACCCTGGGGC
GTAAGACTCGATTTTGGCTTGTCTCCTAAGGGCTGTGTTGATCTGTCGTAGCTGTTCGTT
CAGCCTCTGTAACTCCCCTTTCCTCTGCCGAGCAAGCAACCCTCCAACAGTGGCTCCAAC
AAGTGCGACAAGCAACAAAAGAGGCATGTTGAAGACGGAAACTCTCAGGAGGCTCGCATA
TCTCAGCAGACAAGGCTTGGAGAGGTGTACCAATGAGAAGGGAGTTTGTAAACAACACTG
CCATCACCGGTAACTTGAGCCTCCCAAATCCCTCAATAGCTGATAACTTATCAAAACTTT
GCAGGGTTGGAGATGGTGTTTGTAAGAAGATTCCCTTGCTTTCAGGCTCATTGGGCTTGG
TAGACAGAAGTTTAATCTTGGAGATAAGATGATGTGCTCCAGGTGAGGAGGAGGAGTAGC
CAATAGATTTAGCTAACTTGTTCCCAGTCTCTCGTGAATTTTCGTGCGGCGGAGTACGGA
CGCCGGAAGTATGGGAGAAGGAGGAGCAACACCGGATAATCGCCATCGCCGCCATCTCTG
AGGATATGTTTTTAAACCCCGCTTCCACTCGCTCCC

QA 5 760 5 760
DS 



AS 1 4

CO CL2230Contig1 1412 4 26 U
GCTGGACCATATGGGGAAGATGTGGTCTTTGTTGCTAATGATTGGCACACTGCTCTCCTT
CCTTGTTACCTCAAGTCTATGCATCAGTCACGCGGAATCTACATGAATGCAAAGGTTGTG
TTCTGCATTCACAACATAGCCTACCAAGGAAGATTTGCCTTTGAAGACTTTTCTCTTCTC
AATTTGCCTGACAGCTTTAAGAGCTCTTTCGACTTCATGGACGGGTACGAAAAGCCAGTA
AAAGGAAGGAAGACCAACTGGATGAAGGCTGCGATTCTAGAAGCATGGCGTGTCTTAACA
GTTAGTCCATACTATGCTCAAGAGCTCATCTCTGGCATCGATAGAGGCGTGGAGCTGCAT
TCATACCTTCGGATGAAAACAGTTTCTGGAATTATTAACGGCATGGATGTTCAAGAATGG
AACCCGGCTACTGACAAGTACATCGATATCAAATACGACATTACCACTGTAACGGAAGCT
AAGCCACTGATCAAAGAAGCGCTTCAGGCTGCTGTTGGACTTCCAGTGGACAGGGATGTC
CCCTGTGATCGGTTTCATTGGAAGGTTGGAAGAGCAGAAGGGCTCTGATATTCTGGTCGA
AGCTATCTCCAAGTTCATGGGTCTCAATGTTCAGATGGTTATCCTTGGAACCGGTAAGAA
GAAGATGGAGGCTCAGATTCTTGAACTTGAGGAGAAGTTCCCAGGGAAGGCGGTTGGAGT
GGCGAAATTCAACGTGCCATTGGCTCATATGATCACAGCAGGAGCTGACTTCATCATTGT
CCCGAGCAGGTTTGAGCCGTGCGGTCTCATTCAGCTGCACGCCGTGAGGTATGGAACCGT
CCCCATTGTGGCATCTACTGGTGGGCTTGTGGACACTGTTAAAGATGGCTACACAGGTTT
CCACATTGGAAGATTCAACGTCAAGTGTGAAGTTGTAGATCCAGATGATGTGATTGCAAC
AGCAAAGGCTGTAGCTAGAGCTGTTGCAGTGTACGGGACACCTGCTATGAAAGAGATGGT
CAAGAACTGCATGGACCAAGACTTCTCCTGGAAGGGACCAGCGAGACTGTGGGAGAAGGT
ACTATTGTCACTAGATGTTGCCGGAAGTGAAGCTGGAGTCGAAGGTGAAGAGATAGCTCC
CCTGGCGAAGGAGAACGTAGCGACACCTTGAGAATGTGAGTTTTTGAGTTTGGTGGAAGA
AACTAGGACTAGGGAAGCCGGCAGGAAAAAGTAATGTGTTTGGTTATGTATATATACGGG
AGATGTTTCACTCTAATATAATAATAAGTGCATGTTCGTTTAATCATCCGGTTGGTATCA
TTTTATGTTTCCTATGAGTTGAACCTAACGTGGAAGTTGTCAAAGTGTTCAACGGCTTTT
GCTGTGTCTCAATTTAGTAAACATTAGCCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ42TF U 1
AF RR2H592TF U 39
AF RR2H592JQB C 547
AF RR2BQ42JQ C 725
BS 1 81 RR2BQ42TF
BS 82 82 RR2H592TF
BS 83 455 RR2BQ42TF
BS 456 456 RR2H592TF
BS 457 581 RR2BQ42TF
BS 582 582 RR2H592TF
BS 583 614 RR2BQ42TF
BS 615 691 RR2H592TF
BS 692 692 RR2H592JQB
BS 693 709 RR2H592TF
BS 710 710 RR2H592JQB
BS 711 761 RR2H592TF
BS 762 762 RR2H592JQB
BS 763 777 RR2H592TF
BS 778 778 RR2H592JQB
BS 779 789 RR2H592TF
BS 790 790 RR2H592JQB
BS 791 824 RR2H592TF
BS 825 894 RR2H592JQB
BS 895 895 RR2BQ42JQ
BS 896 1233 RR2H592JQB
BS 1234 1234 RR2BQ42JQ
BS 1235 1277 RR2H592JQB
BS 1278 1278 RR2BQ42JQ
BS 1279 1301 RR2H592JQB
BS 1302 1412 RR2BQ42JQ

RD RR2BQ42TF 614 0 0
GCTGGACCATATGGGGAAGATGTGGTCTTTGTTGCTAATGATTGGCACACTGCTCTCCTT
CCTTGTTACCTCAAGTCTATGTATCAGTCACGCGGAATCTACATGAATGCAAAGGTTGTG
TTCTGCATTCACAACATAGCCTACCAAGGAAGATTTGCCTTTGAAGACTTTTCTCTTCTC
AATTTGCCTGACAGCTTTAAGAGCTCTTTCGACTTCATGGACGGGTACGAAAAGCCAGTA
AAAGGAAGGAAGACCAACTGGATGAAGGCTGCGATTCTAGAAGCATGGCGTGTCTTAACA
GTTAGTCCATACTATGCTCAAGAGCTCATCTCTGGCATCGATAGAGGCGTGGAGCTGCAT
TCATACCTTCGGATGAAAACAGTTTCTGGAATTATTAACGGCATGGATGTTCAAGAATGG
AACCCGGCTACTGACAAGTACATCGATATCAAATATGACATTACCACTGTAACGGAAGCT
AAGCCACTGATCAAAGAAGCGCTTCAGGCTGCTGTTGGACTTCCAGTGGACAGGGATGTC
CCCTGTGATCGGTTTCATTGGAAGGTTGGAAGAGCAGAAGG*CTCTGATATTCTGGTCGA
AGCTATCTCCAAGT

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2H592TF 786 0 0
G
GATTGGCACACTGCTCTCCTTCCTTGTTACCTCAAGTCTATGCATCAGTCACGCGGAATC
TACATGAATGCAAAGGTTGTGTTCTGCATTCACAACATAGCCTACCAAGGAAGATTTGCC
TTTGAAGACTTTTCTCTTCTCAATTTGCCTGACAGCTTTAAGAGCTCTTTCGACTTCATG
GACGGGTACGAAAAGCCAGTAAAAGGAAGGAAGATCAACTGGATGAAGGCTGCGATTCTA
GAAGCATGGCGTGTCTTAACAGTTAGTCCATACTATGCTCAAGAGCTCATCTCTGGCATC
GATAGAGGCGTGGAGCTGCATTCATACCTTCGGATGAAAACAGTTTCTGGAATTATTAAC
GGCATGGATGTTCAAGAATGGAACCCGGCTACTGACAAGTACATCGATATCAAATACGAC
ATTACCACTGTAACGGAAGCTAAGCCACTGATCAAAGAAGCGCTTCAGGCTGCTGTTGGA
CTTCCAGTGGACAGGGATGTCCC*TGTGATCGGTTTCATTGGAAGGTTGGAAGAGCAGAA
GGGCTCTGATATTCTGGTCGAAGCTATCTCCAAGTTCATGGGTCTCAATGTTCAGATGGT
TATCCTTGGAACCGGTAAGAAGAAGATGGAGGCTCAGATTCTTGAACTTGAG*AGAAGTT
CCCAGGGAAG*CGGTTGGAGTGGCGAAATTCAACGTGCCATTGGCTCATATGATCACAGC
AG*AGCTGACTTCATCAT*GTCCCGAGCAG*TTTGAGCCGTGCGGTCTCATTCAGCTGCA
CGCCG

QA 2 786 2 786
DS 

RD RR2H592JQB 755 0 0
GATCGGTTTCATTGGAAGGTTGGAAGAGCAGAAGGGCTCTGATATTCTGGTCGAAGCTAT
CTCCAAGTTCATGGGTCTCAATGTTCAGATGGTTATCCTTGGAACCGGTAAGAAGAAGAT
GGAGGCTCAGATTCTTGAACTTGAGGAGAAGTTCCCAGGGAAGGCGGTTGGAGTGGCGAA
ATTCAACGTGCCATTGGCTCATATGATCACAGCAGGAGCTGACTTCATCATTGTCCCGAG
CAGGTTTGAGCCGTGCGGTCTCATTCAGCTGCACGCCGTGAGGTATGGAACCGTCCCCAT
TGTGGCATCTACTGGTGGGCTTGTGGACACTGTTAAAGATGGCTACACGGGTTTCCACAT
TGGAAGATTCAACGTCAAGTGTGAAGTTGTAGATCCAGATGATGTGATTGCAACAGCAAA
GGCTGTAGCTAGAGCTGTTGCAGTGTACGGGACACCTGCTATGAAAGAGATGGTCAAGAA
CTGCATGGACCAAGACTTCTCCTGGAAGGGACCAGCGAGACTGTGGGAGAAGGTACTATT
GTCACTAGATGTTGCCGGAAGTGAAGCTGGAGTCGAAGGTGAAGAGATAGCTCCCCTGGC
GAAGGAGAACGTAGCGACACCTTGAGAATGTGAGTTTTTGAGTTTGGTGGAAGAAACTAG
GACTAGGGAAGCCGGCAGGAAAAAGTAGTGTGTTTGGTTATGTATATATACGGGAGATGT
TTCACTCTAATGTAATAATAAGTGCATGTTCGTTT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2BQ42JQ 688 0 0
AAATTCAACGTGCCATTGGCTCATATGATCACAGCAGGAGCTGACTTCATCATTGTCCCG
AGCAGGTTTGAGCCGTGCGGTCTCATTCAGCTGCACGCCATGAGGTATGGAACCGTCCCC
ATTGTGGCATCTACTGGTGGGCTTGTGGACACTGTTAAAGATGGCTACACAGGTTTCCAC
ATTGGAAGATTCAACGTCAAGTGTGAAGTTGTAGATCCAGATGATGTGATTGCAACAGCA
AAGGCTGTAGCTAGAGCTGTTGCAGTGTACGGGACACCTGCTATGAAAGAGATGGTCAAG
AACTGCATGGACCAAGACTTCTCCTGGAAGGGACCAGCGAGACTGTGGGAGAAGGTACTA
TTGTCACTAGATGTTGCCGGAAGTGAAGCTGGAGTCGAAGGTGAAGAGATAGCTCCTCTG
GCGAAGGAGAACGTAGCGACACCTTGAGAATGTGAGTTTTTGAGTTTGGTGGAAGAAACT
AGGACTAGGGAAGCCGGCAGGAAAAAGTAATGTGTTTGGTTATGTATATATACGGGAGAT
GTTTCACTCTAATATAATAATAAGTGCATGTTCGTTTAATCATCCGGTTGGTATCATTTT
ATGTTTCCTATGAGTTGAACCTAACGTGGAAGTTGTCAAAGTGTTCAACGGCTTTTGCTG
TGTCTCAATTTAGTAAACATTAGCCACT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 4

CO CL2231Contig1 563 4 6 U
AGACCATAAAAGAAAACAAGCAAAACACTAATGATCTTTTACACACACATTGTCTGATAC
AAAGAAAAATAAAGAGATTGACAGAAACATCATAAGAAGGCAGACAAATTAACCAATGGC
TAATACATCAAAAGGAACATACTTTATTACAAACAAAGATCACACAAAGAAGATGAATTT
AAACAGAGGTAGGCTTGTAGTCTATGACCAACACTTTATCCAAGCTGCCTAGGAACATGG
TGGCGAACTCAACGTGAATAGGATGAGCAACGTACTCAGCTACAGCTTCTTTGCTCTCAA
ACGTGGATTCAAAGATGTGTGTGAAACCTTGATGCAGATTCTCTATGCTCACATCTTTTC
CCCAGTGGAAAGCTTTCATAGGTTCGATGAGATTGACGAGATTAGCGTAACCTTTGATAA
GTTCATCGATCTTCTCTGGGGTGACGTCATCTTTGAACTTAGCAAGCAGAACGTGCTTCA
CAGGTCCCTTTGCTTCCTCCATTTTCTCCCTGCGATTGCTCACTGCTCTCTCTCTAATCT
ATCTGTATGGTTGCAGTTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW01JQ U 1
AF RR2DQ93JQ U 16
AF RR2DQ93TF C 16
AF RR2G037TF C 450
BS 1 120 RR2GW01JQ
BS 121 121 RR2DQ93JQ
BS 122 523 RR2GW01JQ
BS 524 524 RR2DQ93JQ
BS 525 530 RR2GW01JQ
BS 531 563 RR2G037TF

RD RR2GW01JQ 532 0 0
AGACCATAAAAGAAAACAAGCAAAACACTAATGATCTTTTACACACACATTGTCTGATAC
AAAGAAAAATAAAGAGATTGACAGAAACATCATAAGAAGGCAGACAAATTAACCAATGGC
AAATACATCAAAAGGAACATACTTTATTACAAACAAAGATCACACAAAGAAGATGAATTT
AAACAGAGGTAGGCTTGTAGTCTATGACCAACACTTTATCCAAGCTGCCTAGGAACATGG
TGGCGAACTCAACGTGAATAGGATGAGCAACGTACTCAGCTACAGCTTCTTTGCTCTCAA
ACGTGGATTCAAAGATGTGTGTGAAACCTTGATGCAGATTCTCTATGCTCACATCTTTTC
CCCAGTGGAAAGCTTTCATAGGTTCGATGAGATTGACGAGATTAGCGTAACCTTTGATAA
GTTCATCGATCTTCTCTGGGGTGACGTCATCTTTGAACTTAGCAAGCAGAACGTGCTTCA
CAGGTCCCTTTGCTTCCTCCATTTTCTCCCTGCGATTGCTCACCGCTCTC
CC

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2DQ93JQ 519 0 0
ACAAGCAAAACACTAATGATCTTTTACACACACATTGTCTGATACAAAGAAAAATAAAGA
GATTGACAGAAACATCATAAGAAGGCAGACAAATTAACCAATGGCTAATACATCAAAAGG
AACATACTTTATTACAAACAAAGATCACACAAAGAAGATGAATTTAAACAGAGGTAGGCT
TGTAGTCTATGACCAACACTTTATCCAAGCTGCCTAGGAACATGGTGGCGAACTCAACGT
GAATAGGATGAGCAACGTACTCAGCTACAGCTTCTTTGCTCTCAAACGTGGATTCAAAGA
TGTGTGTGAAACCTTGATGCAGATTCTCTATGCTCACATCTTTTCCCCAGTGGAAAGCTT
TCATAGGTTCGATGAGATTGACGAGATTAGCGTAACCTTTGATAAGTTCATCGATCTTCT
CTGGGGTGACGTCATCTTTGAACTTAGCAAGCAGAACGTGCTTCACAGGTCCCTTTGCTT
CCTCCATTTTCTCCCTGCGATTGCTCACTGCTCTC
TCCC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2DQ93TF 519 0 0
ACAAGCAAAACACTAATGATCTTTTACACACACATTGTCTGATACAAAGAAAAATAAAGA
GATTGACAGAAACATCATAAGAAGGCAGACAAATTAACCAATGGCTAATACATCAAAAGG
AACATACTTTATTACAAACAAAGATCACACAAAGAAGATGAATTTAAACAGAGGTAGGCT
TGTAGTCTATGACCAACACTTTATCCAAGCTGCCTAGGAACATGGTGGCGAACTCAACGT
GAATAGGATGAGCAACGTACTCAGCTACAGCTTCTTTGCTCTCAAACGTGGATTCAAAGA
TGTGTGTGAAACCTTGATGCAGATTCTCTATGCTCACATCTTTTCCCCAGTGGAAAGCTT
TCATAGGTTCGATGAGATTGACGAGATTAGCGTAACCTTTGATAAGTTCATCGATCTTCT
CTGGGGTGACGTCATCTTTGAACTTAGCAAGCAGAACGTGCTTCACAGGTCCCTTTGCTT
CCTCCATTTTCTCCCTGCGATTGCTCACTGCTCTC
TCCC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2G037TF 114 0 0
TCTTTGAACTTAGCAAGCAGAACGTGCTTCACAGGTCCCTTTGCTTCCTCCATTTTCTCC
CTGCGATTGCTCACTGCTCTCTCTCTAATCTATCTGTATGGTTGCAGTTTATCC

QA 1 114 1 114
DS 



AS 1 4

CO CL2232Contig1 1312 4 8 U
GTAATGTAAGCTAATAACATCTTCATTCAACTTCAAAACTTTCAGACAGAGATTCCTAAA
ATAGTGATCAAGAGGTTTCTTCAAACTATATAGACAGGAGTTGAAAGCTACTCCTGACCT
AAGATACTATATTAATTATTAAGTAATAGTTCTATATAAAGAAAGATCTAAGTTTCTTCA
TGTGGTTGCAACAGTAGAGTTCCAAGTTCCTCCAATCAATGTGCCAACTCTCCCTCCTTT
GATTGCTTTCGCGATGTTTCCAGGCTCAGACAGATTGAAGACCACAACTGGGATGTTGTT
TTCTTGGCATAAAGTGATAGCAGTCATATCCATCACGGAGAGATCCTTTGAGGTTACTTC
TTGGTAAGTTAGTGACTCGTGGAGGCGAGCGTTTGGGTTTCTCTTGGGATCATCGTCAAA
GACTCCATCTACATTTGTTGCTTTCAGTACTACTTCTGCGTTAATCTCAGCACATCGAAG
AGCTGCTGCAGTATCGGTGGTGAAAAACGGATTGCCTGTTCCGGCTGCGAATATCACAAC
CCTGCCTTTTT*CTAGATGTCTAATAGCTCGTCTTCTAATATAAGGCTCTGCGACTTCCG
ACATGCGGAAAGCGGTTTGAACACGTGTCGGGATGCCGATGCTCTCCATCGTCGCTTGAA
GAAATATTGCATTCATCACAGTTGCCAGCATCCCGATGTAATCAGCAGAGGAGCGGTCAA
GGCCACTGCAACCAGCCCAGGTGGATCCACGAAAGATGTTTCCTCCTCCAACAACAATCG
CAACCTCAATGCCAAGCCGAGTGACAGCTGCAACCTCCCTTGCAATCGCCATAGTAACCT
TTGGATCAATATTCTGCTACTCGTCTCCAGCAAGAGCTTCTCCACTAACTTTAAGCAAAA
CCCTTCTCCATTTAAGCGGTGGGTTACATGTTCCATCAAAGGAAGGCATTCCCGGAAACG
ATGACTGCCCACCGTTTAACCCACTTCCGTTCATGGGTTCTGGAGTTGAACCATTGTTGG
AGGACAAGGAAGAAGAGCAGCTGATAACTACGCGCCTACTGAAACTCTGTTCGGAGAAGA
AACTACGATGGCGAGGCGTGAGAGAGCCGAAAGAGGTTGGGGAAGTTGAGATTGGCGAGT
AAGAAGTGAGGGGCAACGGAATCGCCATTGCTGGAGAAAGAAAAGATGATGAAAAGAATT
TGAATTTGAGATGCTTCCAGTAGAGAAGCGTCGCCGGCAGGCAAGGTGGAGGGACTTGAG
TTTGCGAAGATAAGGTCTGGTTCGAATGTAATTTTACCTTAGCTCAACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW83JQ U 1
AF RR2EQ50JQ U 28
AF RR2FW83TF C 240
AF RR2EQ50TF C 619
BS 1 59 RR2FW83JQ
BS 60 60 RR2EQ50JQ
BS 61 479 RR2FW83JQ
BS 480 480 RR2EQ50JQ
BS 481 598 RR2FW83JQ
BS 599 620 RR2EQ50JQ
BS 621 918 RR2FW83TF
BS 919 1312 RR2EQ50TF

RD RR2FW83JQ 598 0 0
GTAATGTAAGCTAATAACATCTTCATTCAACTTCAAAACTTTCAGACAGAGATTCCTAAG
ATAGTGATCAAGAGGTTTCTTCAAACTATATAGACAGGAGTTGAAAGCTACTCCTGACCT
AAGATACTATATTAATTATTAAGTAATAGTTCTATATAAAGAAAGATCTAAGTTTCTTCA
TGTGGTTGCAACAGTAGAGTTCCAAGTTCCTCCAATCAATGTGCCAACTCTCCCTCCTTT
GATTGCTTTCGCGATGTTTCCAGGCTCAGACAGATTGAAGACCACAACTGGGATGTTGTT
TTCTTGGCATAAAGTGATAGCAGTCATATCCATCACGGAGAGATCCTTTGAGGTTACTTC
TTGGTAAGTTAGTGACTCGTGGAGGCGAGCGTTTGGGTTTCTCTTGGGATCATCGTCAAA
GACTCCATCTACATTTGTTGCTTTCAGTACTACTTCTGCGTTAATCTCAGCACATCGAAA
AGCTGCTGCAGTATCGGTGGTGAAAAACGGATTGCCTGTTCCGGCTGCGAATATCACAAC
CCTGCCTTTTT*CTAGATGTCTAATAGCTCGTCTTCTAATATAAGGCTCTGCGACTTC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2EQ50JQ 593 0 0
CG
ACTTCAAAACTTTCAGACAGAGATTCCTAAAATAGTGATCAAGAGGTTTCTTCAAACTGT
ATAGACAGGAGTTGAAAGCTACTCCTGACCTAAGATACTATATTAATTATTAAGTAATAG
TTCTATATAAAGAAAGATCTAAGTTTCTTCATGTGGTTGCAACAGTAGAGTTCCAAGTTC
CTCCAATCAATGTGCCAACTCTCTCTCCTTTGATTGCTTTCGCGATGTTTCCAGGCTCAA
ACAGATTGAAGACCACAACTGGGATGTTGTTTTCTTGGCATAAAGTGATAGCAGTCATAT
CCATCACGGAAAGATCCTTTGAGGTTACTTCTTGGTAAGTTAGTGACTCGTGGAGGCGAG
CGTTTGGGTTTCTCTTGGGATCATCGTCAAAGACTCCATCTACATTTGTTGCTTTCAGTA
CTACTTCTGCGTTAATCTCAGCACATCGAAGAGCTGCTGCAGTATCGGTGGTGAAAAACG
GATTACCTGTTCCGGCTGCGAATATCACAACCCTGCCTTTTTTCTAGATGTCTAATAGCT
CGTCTTCTAATATAAGGCTCTGCGACTTCCGACATGCGGAAAGCGGTTTGA

QA 3 593 3 593
DS 

RD RR2FW83TF 680 0 0
TGATTGCTTTCGCGATGTTTCCAGGCTCAGACAGATTGAAGACCACAACTGGGATGTTGT
TTTCTTGGCATAAAGTGATAGCAGTCATATCCATCACGGAGAGATCCTTTGAGGTTACTT
CTTGGTAAGTTAGTGACTCGTGGAGGCGAGCGTTTGGGTTTCTCTTGGGATCATCGTCAA
AGACTCCATCTACATTTGTTGCTTTCAGTACTACTTCTGCGTTAATCTCAGCACATCGAA
GAGCTGCTGCAGTATCGGTGGTGAAAAACGGATTGCCTGTTCCGGCTGCGAATATCACAA
CCCTGCCTTTTT*CTAGATGTCTAATAGCTCGTCTTCTAATATAAGGCTCTGCGACTTCC
GACATGCGGAAAGCGGTTTGAACACGTGTCGGGATGCCGATGCTCTCCATCGTCGCTTGA
AGAAATATTGCATTCATCACAGTTGCCAGCATCCCGATGTAATCAGCAGAGGAGCGGTCA
AGGCCACTGCAACCAGCCCAGGTGGATCCACGAAAGATGTTTCCTCCTCCAACAACAATC
GCAACCTCAATGCCAAGCCGAGTGACAGCTGCAACCTCCCTTGCAATCGCCATAGTAACC
TTTGGATCAATATTCTGCTACTCGTCTCCAGCAAGAGCTTCTCCACTAACTTTAAGCAAA
ACCCTTCTCCATTTAAGCG
C

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2EQ50TF 694 0 0
TG
ACACGTGTCGGGATGCCGATGCTCTCCATCGTCGCTTGAAGAA*TATTGCATTCATCACA
GTTGCCAGCATCCCGATGTAATCAGCAGAGGAGCGGTCAAGGCCACTGCAACCAGCCCAG
GTGGATCCACGAAAGATGTTTCCTCCTCCAACAACAATCGCAAC*TCAATGCCAAGCCGA
GTGACAGCTGCAACCTCCCTTGTAATCGCCATAGTAACCTTTGGATCAATATTCTGCTCC
TCGTCTCCAGCAAGAGCTTCTCCACTAACTTTAAGCAAAACCCTTCTCCATTTAAGCGGT
GGGTTACATGTTCCATCAAAGGAAGGCATTCCCGGAAACGATGACTGCCCACCGTTTAAC
CCACTTCCGTTCATGGGTTCTGGAGTTGAACCATTGTTGGAGGACAAGGAAGAAGAGCAG
CTGATAACTACGCGCCTACTGAAACTCTGTTCGGAGAAGAAACTACGATGGCGAGGCGTG
AGAGAGCCGAAAGAGGTTGGGGAAGTTGAGATTGGCGAGTAAGAAGTGAGGGGCAACGGA
ATCGCCATTGCTGGAGAAAGAAAAGATGATGAAAAGAATTTGAATTTGAGATGCTTCCAG
TAGAGAAGCGTCGCCGGCAGGCAAGGTGGAGGGACTTGAGTTTGCGAAGATAAGGTCTGG
TTCGAATGTAATTTTACCTTAGCTCAACTTCC

QA 3 694 3 694
DS 



AS 1 4

CO CL2233Contig1 1393 4 19 U
GGGAGCTGCAACTTAAAGGTGCGGGTAAGACTCCTTATAGCCGCTTTGCTGACGGGCTTG
CGGTGCTGCGTAGTAGCATCAGGGAGTTCCTTTGCAGCGAGGCTATGCATTTTCTTGATA
TCCCTACCACACGTGCCCTTTGTCTTCTCACAACCGGTCAAGATGTCACTCGCGACATGT
TCTATGATGGTAATCCAAAGGAAGAGCCTGGCGCAATTGTGTGCAGGGTGTCTCAGTCTT
TTCTCCGCTTCGGCTCGTACCAGATACATGCTTCTAGAGGAAAAGAGGATCTTGACATCG
TTCGGAAGCTGGCAGACTATGCCATCAAACATCATTTCCCACATATAGAGAGCATGAACA
GAAGCGACAGCTTATCTTTCAGAACCAGCAAAGAAGAAGTGGATCTAACATCGAACAAGT
ATGCAGCATGGGTTGTTTAGATTGCGGAGCGTACAGCTACCTTAGTGGCAAGATGGCAAG
GTGTAGGCTTCACTCATGGTGTGCTCAACACTGACAATACGAGCATTTTGGGTCAGACTA
TAGACTATGGTCCGTTTGGGTTCTTGGATGCTTTTGATCCGAGTTTCACCCCTAACACGA
CAGACCTCCCTGGAAGAAGATACTGTTTTGCAAACCAGCCTGACATCGGCTTATGGAATA
TTGCTCAGTTTGCCAAGTCTCTGGCTGTTGCTGAGCTGATAAATCAAAAGGAGGCGAATT
ACGCCATGGAGAGGTACGGTGAGAAGTTCATGGATGAGTATCAAGCCATAATGTCAAAGA
AGCTTGGTCTTTCCAAGTATAACAAGGACATCATTAGTAAACTTCTGAACAATATGGCTG
TTGATAAAGTCGACTACACAAACTTCTTCCGGCTTCTTTCAAACGTCAAAGCAAACCCGG
ACACACCTGAAAATGAGCTGTTGAAGCCCTTGAAAGCTGCGCTCTTGGACATTGGAAAGG
AGAGAAAAGAAGCTTGGATCAAATGGGTGCAAGCGTATATACAGGAGGTGAGTGGTAGTG
ACACATCAGATGAAGAAAGAAAGGCAAGGATGGATTCAGTGAACCCAAAGTACATTTTAA
GGAACTATCTCTGCCAAAGCGCAATAGATGCAGCTGAACAAGGCGACTTTTCAGAGGTCA
ACAACTTGATCCGTCTCAGGAAAAATCCTTACGAGGAACAGCCAGGGATGGAGAAATATG
CTCGGTTGCCTCCAGCTTGGGCTTATAGGCCAGGCGTCTGCATGCTTTCTTGCTCCTCCT
AGTTCTTTTCCTTTTCCTACTTTTGTTTTTTCCGTTGTAGAAAGGAAGAGGAAAACTAAA
ACACTCTTTATATGTGTATGGTTTTGTAATGCATTACATTGTCAAGATAAGTTCTATGTT
TTGTTTTACGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO66TF U 1
AF RR2H037TF U 470
AF RR2H037JQ C 700
AF RR2AO66JQ C 596
BS 1 519 RR2AO66TF
BS 520 520 RR2H037TF
BS 521 596 RR2AO66TF
BS 597 597 RR2H037TF
BS 598 801 RR2AO66TF
BS 802 802 RR2H037TF
BS 803 819 RR2AO66TF
BS 820 821 RR2H037TF
BS 822 828 RR2AO66TF
BS 829 831 RR2H037TF
BS 832 847 RR2AO66TF
BS 848 848 RR2H037TF
BS 849 853 RR2AO66TF
BS 854 854 RR2H037TF
BS 855 866 RR2AO66TF
BS 867 965 RR2H037TF
BS 966 1138 RR2AO66JQ
BS 1139 1139 RR2H037JQ
BS 1140 1393 RR2AO66JQ

RD RR2AO66TF 866 0 0
GGGAGCTGCAACTTAAAGGTGCGGGTAAGACTCCTTATAGCCGCTTTGCTGACGGGCTTG
CGGTGCTGCGTAGTAGCATCAGGGAGTTCCTTTGCAGCGAGGCTATGCATTTTCTTGATA
TCCCTACCACACGTGCCCTTTGTCTTCTCACAACCGGTCAAGATGTCACTCGCGACATGT
TCTATGATGGTAATCCAAAGGAAGAGCCTGGCGCAATTGTGTGCAGGGTGTCTCAGTCTT
TTCTCCGCTTCGGCTCGTACCAGATACATGCTTCTAGAGGAAAAGAGGATCTTGACATCG
TTCGGAAGCTGGCAGACTATGCCATCAAACATCATTTCCCACATATAGAGAGCATGAACA
GAAGCGACAGCTTATCTTTCAGAACCAGCAAAGAAGAAGTGGATCTAACATCGAACAAGT
ATGCAGCATGGGTTGTTTAGATTGCGGAGCGTACAGCTACCTTAGTGGCAAGATGGCAAG
GTGTAGGCTTCACTCATGGTGTGCTCAACACTGACAATATGAGCATTTTGGGTCAGACTA
TAGACTATGGTCCGTTTGGGTTCTTGGATGCTTTTGATCCGAGTTTCACCCCTAACGCGA
CAGACCTCCCTGGAAGAAGATACTGTTTTGCAAACCAGCCTGACATCGGCTTATGGAATA
TTGCTCAGTTTGCCAAGTCTCTGGCTGTTGCTGAGCTGATAAATCAAAAGGAGGCGAATT
ACGCCATGGAGAGGTACGGTGAGAAGTTCATGGATGAGTATCAAGCCATAATGTCAAAGA
AGCTTGGTCTTTCCAAGTATA*CAAGGACATCATTAGTA**CTTCTGAC**ATATGGCTG
TTGATAA*GTCGATTACACAAACTTC

QA 1 866 1 866
DS 

RD RR2H037TF 496 0 0
G
AGATGGCAAGGTGTAGGCTTCACTCATGGTGTGTTCAACACTGACAATACGAGCATTTTG
GGTCAGACTATAGACTATGGTCCGTTTGGGTTCTTGGATGCTTTTGATCCGAGTTTCACC
CCTAACACGACAGACCTCCCTGGAAGAAGATACTGTTTTGCAAACCAGCCTGACATCGGC
TTATGGAATATTGCTCAGTTTGCCAAGTCTCTGGCTGTTGCTGAGCTGATAAATCAAAAG
GAGGCGAATTACGCCATGTAGAGGTACGGTGAGAAGTTCATGGATGAGTATCAAGCCATA
ATGTCAAAGAAGCTTGGTCTTTCCAAGTATAACAAGGACATCATTAGTAAACTTCTGAAC
AATATGGCTGTTGATAAAGTCGACTACACAAACTTCTTCCGGCTTCTTTCAAACGTCAAA
GCAAACCCGGACACACCTGAAAATGAGCTGTTGAAGCCCTTGAAAGCTGCGCTCTTGGAC
ATTGGAAAGGAGAGA

QA 2 496 2 496
DS 

RD RR2H037JQ 581 0 0
TAAATCAAAAGGAGGCGAATTACGCCATGTAGAGGTACGGTGAGAAGTTCATGGATGAGT
ATCAAGCCATAATGTCAAAGAAGCTTGGTCTTTCCAAGTATAACAAGGACATCATTAGTA
AACTTCTGAACAATATGGCTGTTGATAAAGTCGACTACACAAACTTCTTCCGGCTTTTTT
CAAACGTCAAAGCAAACCCGGACACACCTGAAAATGAGCTGTTGAAGCCCTTGAAAGCTG
CGCTTTTGGACATTGGAAAGGAGAGAAAAGAAGTTTGGATCAAATGGGTGCAAGCGTATA
TACAGGAGGTGAGTGGTAGTGACACATCAGATGAAGAAAGAAAGGCAAGGATGGATTCAG
TGAACCCAAAGTACATTTTAAGGAACTATTTCTGCCAAAGCGCAATAGATGCAGCTGAAC
AAGGCGACTTTTCAGAGGTCAACAACTTGATCCGTTTCATGAAAAATCCTTACGAGGAAC
AGCCAGGGATGGAGAAATATGCTCGGTTGCCTCCAGCTTGGGCTTATAGGCCAGGCGTCT
GCATGCTTTCTTGCTCCTCCTAGTTCTTTTCCTTTTCCTAC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2AO66JQ 798 0 0
CG
CGACAGACCTCCCTGGAAGAAGATACTGTTTTGCAAACCAGCCTGACATCGGCTTATGGA
ATATTGCTCAGTTTGCCAAGTCTCTGGCTGTTGCTGAGCTGATAAATCAAAAGGAGGCGA
ATTACGCCATGGAGAGGTACGGTGAGAAGTTCATGGATGAGTATCAAGCCATAATGTCAA
AGAAGCTTGGTCTTTCCAAGTATAACAAGGACATCATTAGTAA*CTTCTGAACAATATGG
CTGTTGATAAAGTCGATTACACAAACTTCTTCCGGCTTCTTTCAAACGTCAAAGCAAACC
CGGACACACCTGAAAATGAGTTGTTGAAGCCCTTGAAAGCTGCGCTCTTGGACATTGGAA
AGGAGAGAAAAGAAGCTTGGATCAAATGGGTGCAAGCGTATATACAGGAGGTGAGTGGTA
GTGACACATCAGATGAAGAAAGAAAGGCAAGGATGGATTCAGTGAACCCAAAGTACATTT
TAAGGAACTATCTCTGCCAAAGCGCAATAGATGCAGCTGAACAAGGCGACTTTTCAGAGG
TTAACAACTTGATCCGTCTCAGGAAAAATCCTTACGAGGAACAGCCAGGGATGGAGAAAT
ATGCTCGGTTGCCTCCAGCTTGGGCTTATAGGCCAGGCGTCTGCATGCTTTCTTGCTCCT
CCTAGTTCTTTTCCTTTTCCTACTTTTGTTTTTTCCGTTGTAGAAAGGAAGAGGAAAACT
AAAACACTCTTTATATGTGTATGGTTTTGTAATGCATTACATTGTCAAGATAAGTTCTAT
GTTTTGTTTTACGTTG

QA 3 798 3 798
DS 



AS 2 4

CO CL2234Contig1 746 2 14 U
AACCAAACGGGAAAATATCTTATCACAGAAACAAATGAACACTGTAATTTTGACCCAAAA
AAATGAACACTGTAATCTACAGAGAGTTTTTTTCTTTTTCATTTCAATCATTAACAATAA
TTTCCGTAACAACAACAAAAAAAAAATGTATTCTTAAAAATCTAAAAAATGTTTTCTTCG
TGGATTGTTGAGAGCACTCTTTTAAGCGATCGATCCGCAAGCTTCCTAGCTCGCCCAGAC
GCGTATCTTTTCAATTGCCGTACCGAACCGAACCGGTAATAACCGATTGTATTAGTACTC
TTAAACTGCGTCGTTTTAATCGGCAGGTTACCCTTAATTTGCATCACCGCCATCGAAGTT
CTATTAACGGCGACGTTCCGTTCGTTAGGCTGATTCATCCCCATCACCGGAGAGATCCTC
CCGCTCTCACGACGGCGGTTTTTATTCTTCGCAGCTTTCTCCATCGCGACGCTGGCTTTC
ACCGCCAGAGCCGCCATGTCCGAAGCAGTGAGACGGTACCGACGTTTGGAGATAGGGAGA
ACGAAGTAGATTTGGTCAGCCAGAAGAATCTCCTCCGGTTCGATCGCCGGGATGAAGTCG
TTGTAATAGAGAGAATCCGAATTACATAGAAAATAAGAAGAAGACCGAGAGGAGAAGGAA
GACGAAGAAGAAGCCATTGATTCCGCTTCAAGAACCTGTGAAGCTAACACGGGGACATTG
TATTCCCGGAGATCGCCGTTAACCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE66JQ U 1
AF RR2F433JQ U 24
BS 1 138 RR2BE66JQ
BS 139 139 RR2F433JQ
BS 140 156 RR2BE66JQ
BS 157 157 RR2F433JQ
BS 158 323 RR2BE66JQ
BS 324 324 RR2F433JQ
BS 325 351 RR2BE66JQ
BS 352 352 RR2F433JQ
BS 353 414 RR2BE66JQ
BS 415 415 RR2F433JQ
BS 416 427 RR2BE66JQ
BS 428 428 RR2F433JQ
BS 429 601 RR2BE66JQ
BS 602 746 RR2F433JQ

RD RR2BE66JQ 605 0 0
AACCAAACGGGAAAATATCTTATCACAGAAACAAATGAACACTGTAATTTTGACCCAAAA
AAATGAACACTGTAATCTACAGAGAGTTTTTTTCTTTTTCATTTCAATCATTAACAATAA
TTTCCGTAACAACAACAACAAAAAAATGTATTCTTAGAAATCTAAAAAATGTTTTCTTCG
TGGATTGTTGAGAGCACTCTTTTAAGCGATCGATCCGCAAGCTTCCTAGCTCGCCCAGAC
GCGTATCTTTTCAATTGCCGTACCGAACCGAACCGGTAATAACCGATTGTATTAGTACTC
TTAAACTGCGTCGTTTTAATCGGTAGGTTACCCTTAATTTGCATCACCGCCGTCGAAGTT
CTATTAACGGCGACGTTCCGTTCGTTAGGCTGATTCATCCCCATCACCGGAGAGGTCCTC
CCGCTCTTACGACGGCGGTTTTTATTCTTCGCAGCTTTCTCCATCGCGACGCTGGCTTTC
ACCGCCAGAGCCGCCATGTCCGAAGCAGTGAGACGGTACCGACGTTTGGAGATAGGGAGA
ACGAAGTAGATTTGGTCAGCCAGAAGAATCTCCTCCGGTTCGATCGCCGGGATGAAGTCG
T
CGTA

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2F433JQ 723 0 0
CACAGAAACAAATGAACACTGTAATTTTGACCCAAAAAAATGAACACTGTAATCTACAGA
GAGTTTTTTT**TTTTCATTTCAATCATTAACAATAATTTCCGTAACAACAACAAAAAAA
AA**GTATTCTTAAAAATCTAAAAAATGTTTTCTTCGTGGATTGTTGAGAGCACTCTTTT
AAGCGATCGATCCGCAAGCTTCCTAGCTCGCCCAGACGCGTATCTTTTCAATTGCCGTAC
CGAACCGGACCGGTAATAACCGATTGTATTAGTACTCTTAAACTGCGTCGTTTTAATCGG
CAGGTTACCCTTAATTTGCATCACCGCCATCGAAGTTCTATTAACGGCGACGTTCCGTTC
GTTAGGCTGATTCATCCCCATCACCGGAGAGATCCTCCCGCTCTCACGACGGCGGTTTTT
ATTCTTCGCAGCTTTCTCCATCGCGACGCTGGCTTTCACCGCCAGAGCCGCCATGTCCGA
AGCAGTGAGACGGTACCGACGTTTGGAGATAGGGAGAACGAAGTAGATTTGGTCAGCCAG
AAGAATCTCCTCCGGTTCGATCGCCGGGATGAAGTCGTTGTAATAGAGAGAATCCGAATT
ACATAGAAAATAAGAAGAAGACCGAGAGGAGAAGGAAGACGAAGAAGAAGCCATTGATTC
CGCTTCAAGAACCTGTGAAGCTAACACGGGGACATTGTATTCCCGGAGATCGCCGTTAAC
CGT

QA 1 723 1 723
DS 



CO CL2234Contig2 706 2 7 U
GGACGCGTCCTCTCTGTACCTCTCTCGCTTAGTTGTCAATTACTCTCTCTCAAGCGATCA
GAATTCAAGTTTTGTTTCTTTTTGTTATAGTTTTAACCTAAAAAAGATTCGAAAGAAAAA
CTCAAATGGGTCTTTGCGTATCTGTTGGTCGTAGCGACTGCGATTCTTCTCCGGCTGCTA
AAATCGTGACGGTTAACGGCGATCTCCGGGAATACAATGTCCCCGTGTTAGCTTCACAGG
TTCTTGAAGCGGAATCAATGGCTTCCTCTTCGTCTTCCTCCTCCTCTCGGTCTTCTTCTT
ATTTTCTATGTAATTCGGATTCTCTCTATTACAACGACTTCATCCCGGCGATCGAACCGG
AGGAGATTCTTCTGGCTGACCAAATCTACTTCGTTCTCCCTATCTCCAAACGTCGGTACC
GTCTCACTGCTTCGGACATGGCGGCTCTGGCGGTGAAAGCCAGCGTCGCGATGGAGAAAG
CTGCGAAGAATAAAAACCGCCGTCGTAAGAGCGGGAGGACCTCTCCGGTGATGGGGATGA
ATCAGCCTAACGAACGGAACGTCGCCGTTAATAGAACTTCGACGGCGGTGATGCAAATTA
AGGGTAACCTACCGATTAAAACGACGCAGTTTAAGAGTACTAATACAATCGGTTATTACC
GGTTCGGTTCGGTACGGCAATTGAAAAGATACGCGTCTGGGCGAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F433TF U 1
AF RR2BE66TF U 1
BS 1 223 RR2BE66TF
BS 224 224 RR2F433TF
BS 225 268 RR2BE66TF
BS 269 271 RR2F433TF
BS 272 332 RR2BE66TF
BS 333 333 RR2F433TF
BS 334 706 RR2BE66TF

RD RR2F433TF 653 0 0
GGACGCGTCCTCTCTGTACCTCTCTCGCTTAGTTGTCAATTACTCTCTCTCAAGCGATCA
GAATTCAAGTTTTGTTTCTTTTTGTTATAGTTTTAACCTAAAAAAGATTCGAAAGAAAAA
CTCAAATGGGTCTTTGCGTATCTGTTGGTCGTAGCGACTGCGATTCTTCTCCGGCTGCTA
AAATCGTGACGGTTAACGGCGATCTCCGGGAATACAATGTCCCCGTGTTAGCTTCACAGG
TTCTTGAAGCGGAATCAATGGCTTCTTCTTCGTCTTCCTTCTCCTCTCGGTCTTCTTCTT
ATTTTCTATGTAATTCGGATTCTCTCTATTACAACGACTTCATCCCGGCGATCGAACCGG
AGGAGATTCTTCTGGCTGACCAAATCTACTTCGTTCTCCCTATCTCCAAACGTCGGTACC
GTCTCACTGCTTCGGACATGGCGGCTCTGGCGGTGAAAGCCAGCGTCGCGATGGAGAAAG
CTGCGAAGAATAAAAACCGCCGTCGTGAGAGCGGGAGGATCTCTCCGGTGATGGGGATGA
ATCAGCCTAACGAACGGAACGTCGCCGTTAATAGAACTTCGATGGCGGTGATGCAAATTA
AGGGTAACCTGCCGATTAAAACGACGCAGTTTAAGAGTACTAATACAATC
TGT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2BE66TF 706 0 0
GGACGCGTCCTCTCTGTACCTCTCTCGCTTAGTTGTCAATTACTCTCTCTCAAGCGATCA
GAATTCAAGTTTTGTTTCTTTTTGTTATAGTTTTAACCTAAAAAAGATTCGAAAGAAAAA
CTCAAATGGGTCTTTGCGTATCTGTTGGTCGTAGCGACTGCGATTCTTCTCCGGCTGCTA
AAATCGTGACGGTTAACGGCGATCTCCGGGAATACAATGTCCCGGTGTTAGCTTCACAGG
TTCTTGAAGCGGAATCAATGGCTTCCTC***GTCTTCCTCCTCCTCTCGGTCTTCTTCTT
ATTTTCTATGTAATTCGGATTCTCTCTATTACGACGACTTCATCCCGGCGATCGAACCGG
AGGAGATTCTTCTGGCTGACCAAATCTACTTCGTTCTCCCTATCTCCAAACGTCGGTACC
GTCTCACTGCTTCGGACATGGCGGCTCTGGCGGTGAAAGCCAGCGTCGCGATGGAGAAAG
CTGCGAAGAATAAAAACCGCCGTCGTAAGAGCGGGAGGACCTCTCCGGTGATGGGGATGA
ATCAGCCTAACGAACGGAACGTCGCCGTTAATAGAACTTCGACGGCGGTGATGCAAATTA
AGGGTAACCTACCGATTAAAACGACGCAGTTTAAGAGTACTAATACAATCGGTTATTACC
GGTTCGGTTCGGTACGGCAATTGAAAAGATACGCGTCTGGGCGAGC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 3

CO CL2235Contig1 759 3 16 U
GGACTCGTGTTCACCTCGTGCCAGCCACTCTCATTCCCCCCAAACCAACAAAGATTTTAG
CGAAGATGACGACGAAGAGCTACCCAACTGTTAGCGAAGATTACCAAAAGGCTATCGAGA
AGTGCAAGAGGAAGCTTAGAGGTTTGATCGCTGAGAAGAACTGTGCACCTATCATGGTCC
GCCTCGCATGGCACTCTGCTGGAACGTTTGATTGTGCATCAAGGACTGGTGGTCCTTTCG
GAACGATGAGGTTTGATGCTGAGCAAGGTCATGGAGCTAACAGTGGTATCCACATTGCTC
TTAGGCTGTTGGAGCCTATCAGAGAGCAGTTCCCTACCATCTCTTTCGCTGACTTCCATC
AGCTTGCTGGTGTTGTGGCTGTTGAAGTCACCGGTGGACCTGAGATCCCTTTCCACCCTG
GAAGAGAGGACAAGCCGCAGCCACCACCAGAGGGACGTCTCCCTGATGCTACAAAGGGAT
GTGACCACTTGAGGCAGGTGTTTATGAAGCAGATGGGTTTATCTGACATTGATATCGTCG
CTTTATCTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGTTTCGAAGGTG
CTTGGACTTCGAACCCTCTTATTTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAGCTCTTGAGCGGTG
AGAAGGAAGGTCTTCTTCAGCTTGTCTCCGACAAGGCTCTGTTGGATGATCCTGTGTTCC
GTCCTCTTGTTGACAAATACGCTTCTGATGAAGAAGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E670TF U 1
AF RR2GF86TF U 6
AF RR2A538TF U 5
BS 1 11 RR2E670TF
BS 12 12 RR2A538TF
BS 13 122 RR2E670TF
BS 123 217 RR2A538TF
BS 218 218 RR2GF86TF
BS 219 241 RR2A538TF
BS 242 242 RR2GF86TF
BS 243 352 RR2A538TF
BS 353 353 RR2GF86TF
BS 354 397 RR2A538TF
BS 398 398 RR2GF86TF
BS 399 431 RR2A538TF
BS 432 432 RR2GF86TF
BS 433 448 RR2A538TF
BS 449 449 RR2GF86TF
BS 450 759 RR2A538TF

RD RR2E670TF 122 0 0
GGACTCGTGTTTACCTCGTGCCAGCCACTCTCATTCCCCCCAAACCAACAAAGATTTTAG
CGAAGATGACGACGAAGAGCTACCCAACTGTTAGCGAAGATTACCAAAAGGCTATCGAGA
AG

QA 1 122 1 122
DS 

RD RR2GF86TF 585 0 0
G
GTGTTCACCTCGTGCCAGCCACTCTCATTCCCCCCAAACCAACAAAGATTTTAGCGAAGA
TGACGACGAAGAGCTACCCAACTGTTAGCGAAGATTACCAGAAGGCTATCGAGAAGTGCA
AGAGGAAGCTTAGAGGTTTGATCGCTGAGAAGAACTGTGCACCTATCATG*TCCGCCTCG
CATGGCACTCTGCTGGAACGTTTGATTGTGCATCGAGGACTGGTGGTCCTTTCGGAACGA
TGAGGTTTGATGCTGAGCAAGGTCATGGAGCTAACAGTGGTATCCACATTGCTCTTAGGC
TGTTGGAGCCTATCAGAGAGCAGTTCCCTACCATCTCTTTCGCTGACTTCCATCAGCTTG
CTGGTGTTGTGGCTGTTGAGGTCACTGGTGGACCTGAGATCCCTT*CCACCCTGGAAGAG
AGGACAAGCCGCAGCCACCACCAGAGGGACGTCTCCCTGATGCTACAAAGGGATGTGACC
ATTTGAGGCAGGTGTTTGTGAAGCAGATGGGTTTATCTGACATTGATATCGTCGCTTTAT
CTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGT

QA 2 585 2 585
DS 

RD RR2A538TF 755 0 0
GG
GTGTTCACCTCGTGCCAGCCACTCTCATTCCCCCCAAACCAACAAAGATTTTAGCGAAGA
TGACGACGAAGAGCTACCCAACTGTTAGCGAAGATTACCAAAAGGCTATCGAGAAGTGCA
AGAGGAAGCTTAGAGGTTTGATCGCTGAGAAGAACTGTGCACCTATCATGGTCCGCCTCG
CATGGCACTCTGCTGGAACGTTTGATTGTGCGTCAAGGACTGGTGGTCCTTTCGGGACGA
TGAGGTTTGATGCTGAGCAAGGTCATGGAGCTAACAGTGGTATCCACATTGCTCTTAGGC
TGTTGGAGCCTATCAGAGAGCAGTTCCCTACCATCTCTTTCGCTGATTTCCATCAGCTTG
CTGGTGTTGTGGCTGTTGAAGTCACCGGTGGTCCTGAGATCCCTTTCCACCCTGGAAGAG
AGGACGAGCCGCAGCCACCACCTGAGGGACGTCTCCCTGATGCTACAAAGGGATGTGACC
ACTTGAGGCAGGTGTTTATGAAGCAGATGGGTTTATCTGACATTGATATCGTCGCTTTAT
CTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGTTTCGAAGGTGCTTGGA
CTTCGAACCCTCTTATTTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAGCTCTTGAGCGGTGAGAAGG
AAGGTCTTCTTCAGCTTGTCTCCGACAAGGCTCTGTTGGATGATCCTGTGTTCCGTCCTC
TTGTTGACAAATACGCTTCTGATGAAGAAGCGT

QA 3 755 3 755
DS 



AS 1 2

CO CL2236Contig1 946 2 10 U
GCAAGCACCAATGAATTTGAATGGAAAGACGATAAGTAATTCAGCGTTCACCAATTACAA
AGTAAACACCATCATGCGAGAGAGCTTTTAGTTTACACCTAAATCTCATTTAAACTTTAA
CCAAGGTGACTGTAAAAGCGACGATAAAAAACAACCCAAAGCAGAGCATCCTAAAAGAAA
TTATAGCAAGAGGGTAATCGAGAAAGAAAAAGACAACATTAGACAAGGACAAGGACAAAG
CACACAGCAAGATGCAGAGACCTCGCGTTTGCTTAAGAGATGTTCATCGCTTCTGCGTGA
TAGGTTTCGAGATCCTTGTCTAGTTCTTCAGCCGACTTCTCCACCGCCTTCTTTCCGCCT
CGGCCGCCTTTATTCCCTCTTCCACCACCGGCTTGGCCTCGGCCTCTACCACGAAACCCT
CCTCGGCCACTTCTCACACCACCTCCTTGTTGGTTTACAATTGGAAGGCGTCTAATAGAA
AGAGCTGCACTTCTTCCTCTTCCCCTCCCACCTCTAACTCCTTGTCCGATGGAAACAGTT
CTCTTCATCCTTCCGTTCAATCCGGTTACATTCACACGAGCTGCCACAGGAGCAACCTCA
TTGTTTCCACCCAGAATCTCCAATTTTCATTGACCTTCCATCCAACAAGACATTGTTGTA
TCTCTTCATAGCTTGGAATGCATCACTTCTTCTCATGTACACAACTTCTGCCGAGCCATT
TGGGCGCCCGTTCTGGTCATAGTGAATTGCATATCTTTTCATCTCTCCAATCTCACCAAA
GAGTTCCCTGATATCTTCATTTGTGACTCCCTGATCGAGGTTGGTAACATAAACAGTGGT
TCCAACTTCTATGCCAGTTACTCCAACAGATCTCATGCTTTCTTCAAACAAACCATTCTG
CCACGGCAAGTTCTTCTTCCTGCGGTTAAGCTTGTTGGAGAATGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL34JQ U 1
AF RR2D233JQ U 200
BS 1 480 RR2DL34JQ
BS 481 481 RR2D233JQ
BS 482 503 RR2DL34JQ
BS 504 504 RR2D233JQ
BS 505 573 RR2DL34JQ
BS 574 574 RR2D233JQ
BS 575 585 RR2DL34JQ
BS 586 586 RR2D233JQ
BS 587 767 RR2DL34JQ
BS 768 946 RR2D233JQ

RD RR2DL34JQ 767 0 0
GCAAGCACCAATGAATTTGAATGGAAAGACGATAAGTAATTCAGCGTTCACCAATTACAA
AGTAAACACCATCATGCGAGAGAGCTTTTAGTTTACACCTAAATCTCATTTAAACTTTAA
CCAAGGTGACTGTAAAAGCGACGATAAAAAACAACCCAAAGCAGAGCATCCTAAAAGAAA
TTATAGCAAGAGGGTAATCGAGAAAGAAAAAGACAACATTAGACAAGGACAAGGACAAAG
CACACAGCAAGATGCAGAGACCTCGCGTTTGCTTAAGAGATGTTCATCGCTTCTGCGTGA
TAGGTTTCGAGATCCTTGTCTAGTTCTTCAGCCGACTTCTCCACCGCCTTCTTTCCGCCT
CGGCCGCCTTTATTCCCTCTTCCACCACCGGCTTGGCCTCGGCCTCTACCACGAAACCCT
CCTCGGCCACTTCTCACACCACCTCCTTGTTGGTTTACAATTGGAAGGCGTCTAATAGAA
GGAGCTGCACTTCTTCCTCTTCCTCTCCCACCTCTAACTCCTTGTCCGATGGAAACAGTT
CTCTTCATCCTTCCGTTCAATCCGGTTACATTCGCACGAGCTGCCCCAGGAGCAACCTCA
TTGTTTCCACCCAGAATCTCCAATTTTCATTGACCTTCCATCCAACAAGACATTGTTGTA
TCTCTTCATAGCTTGGAATGCATCACTTCTTCTCATGTACACAACTTCTGCCGAGCCATT
TGGGCGCCCGTTCTGGTCATAGTGAATTGCATATCTTTTCATCTCTC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2D233JQ 747 0 0
GAGAAAGAAAAAGACAACATTAGACAAGGACAAGGACAAAGCACACAGCAAGATGCAGAG
ACCTCGCGTTTGCTTAAGAGATGTTCATCGCTTCTGCGTGATAGGTTTCGAGATCCTTGT
CTAGTTCTTCAGCCGACTTCTCCACCGCCTTTTTTCCGCCTCGGCCGCCTTTATTCCCTC
TTCCACCACCGGCTTGGCCTCGGCCTCTACCACGAAACCCTCCTCGGCCACTTCTCACAC
CACCTCCTTGTTGGTTTACAATTGGAAGGCGTCTAATAGAAAGAGCTGCACTTCTTCCTC
TTCCCCTCCCACCTCTAACTCCTTGTCCGATGGAAACAGTTCTCTTCATCCTTCCGTTCA
ATCCGGTTACATTCACACGAGCTGCCACAGGAGCAACCTCATTGTTTCCACCCAGAATCT
CCAATTT*CATTGACCTTCCATCCAACAGGACATTGTTGTATCTCTTCATAGCTTGGAAT
GCATCACTTCTTCTCATGTACACAACTTCTGCCGAGCCATTTGGGCGCCCGTTCTGGTCA
TAGTGAATTGCATATCTTTTCATCTCTCCAATCTCACCAAAGAGTTCCCTGATATCTTCA
TTTGTGACTCCCTGATCGAGGTTGGTAACATAAACAGTGGTTCCAACTTCTATGCCAGTT
ACTCCAACAGATCTCATGCTTTCTTCAAACAAACCATTCTGCCACGGCAAGTTCTTCTTC
CTGCGGTTAAGCTTGTTGGAGAATGAG

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 3

CO CL2237Contig1 569 3 3 U
GTCACTTCTTTCTTCCCACCAATTTACTACATCTTCCAGTGCACTCCTCGTTGGTACTTC
ATCTACCTCGCAGGCATTACCTCTATGGGAATCTTCACCATCATCACACTCTTCACTCCA
TCACTTTCCTCTCCCAAGTACCGAGGTTTTCGAGCTTTGCTCTTTGCCTCCATGGGGCTT
TTCGGGATCGTGCCTGCTGTCCACGCTATAGTGGTCAACTGGGAAAACCCGCAAAGGAAC
GTGACTCTCATGTACGAGCTGGGCATGGCAGTGTTCTATCTTGTTGGGACAGGTTTCTAT
GTAGGGAGAGTACCTGAGAGGCTTAAGCCTGGATGGTTTGATCGTGTTGGGCATAGTCAT
CAGATCTTCCATGTGTTCGTTATGTTGGGCGCTTTGTCCCACTATGCAGCTGCTCTTTTG
TTATTGGACTGGCGTGACCATGTTGGTTGTTAACCCATATATATTTTGTAATTCTTTTGA
GTTTTTGTTTTAAATACTAGTGTGTTTGTATCACGTGAAGCCAAATTGTAATGACTCGTT
CGTTGTTAAACTGAATTGTATTTTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2AM55TF U 1
AF RR2BK96JQ C 32
AF RR2BK96TF U 32
BS 1 203 RR2AM55TF
BS 204 204 RR2BK96TF
BS 205 569 RR2AM55TF

RD RR2AM55TF 569 0 0
GTCACTTCTTTCTTCCCACCAATTTACTACATCTTCCAGTGCACTCCTCGTTGGTACTTC
ATCTACCTCGCAGGCATTACCTCTATGGGAATCTTCACCATCATCACACTCTTCACTCCA
TCACTTTCCTCTCCCAAGTACCGAGGTTTTCGAGCTTTGCTCTTTGCCTCCATGGGGCTT
TTCGGGATCGTGCCTGCTGTCCATGCTATAGTGGTCAACTGGGAAAACCCGCAAAGGAAC
GTGACTCTCATGTACGAGCTGGGCATGGCAGTGTTCTATCTTGTTGGGACAGGTTTCTAT
GTAGGGAGAGTACCTGAGAGGCTTAAGCCTGGATGGTTTGATCGTGTTGGGCATAGTCAT
CAGATCTTCCATGTGTTCGTTATGTTGGGCGCTTTGTCCCACTATGCAGCTGCTCTTTTG
TTATTGGACTGGCGTGACCATGTTGGTTGTTAACCCATATATATTTTGTAATTCTTTTGA
GTTTTTGTTTTAAATACTAGTGTGTTTGTATCACGTGAAGCCAAATTGTAATGACTCGTT
CGTTGTTAAACTGAATTGTATTTTTTTCT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2BK96JQ 538 0 0
G
CTTCCAGTGCACTCCTCGTTGGTACTTCATCTACCTCGCAGGCATTACCTCTATGGGAAT
CTTCACCATCATCACACTCTTCACTCCATCACTTTCCTCTCCCAAGTACCGAGGTTTTCG
AGCTTTGCTCTTTGCCTCCATGGGGCTTTTCGGGATCGTGCCTGCTGTCCACGCTATAGT
GGTCAACTGGGAAAACCCGCAAAGGAACGTGACTCTCATGTACGAGCTGGGCATGGCAGT
GTTCTATCTTGTTGGGACAGGTTTCTATGTAGGGAGAGTACCTGAGAGGCTTAAGCCTGG
ATGGTTTGATCGTGTTGGGCATAGTCATCAGATCTTCCATGTGTTCGTTATGTTGGGCGC
TTTGTCCCACTATGCAGCTGCTCTTTTGTTATTGGACTGGCGTGACCATGTTGGTTGTTA
ACCCATATATATTTTGTAATTCTTTTGAGTTTTTGTTTTAAATACTAGTGTGTTTGTATC
ACGTGAAGCCAAATTGTAATGACTCGTTCGTTGTTAAACTGAATTGTATTTTTTTC
G

QA 2 537 2 537
DS 

RD RR2BK96TF 538 0 0
G
CTTCCAGTGCACTCCTCGTTGGTACTTCATCTACCTCGCAGGCATTACCTCTATGGGAAT
CTTCACCATCATCACACTCTTCACTCCATCACTTTCCTCTCCCAAGTACCGAGGTTTTCG
AGCTTTGCTCTTTGCCTCCATGGGGCTTTTCGGGATCGTGCCTGCTGTCCACGCTATAGT
GGTCAACTGGGAAAACCCGCAAAGGAACGTGACTCTCATGTACGAGCTGGGCATGGCAGT
GTTCTATCTTGTTGGGACAGGTTTCTATGTAGGGAGAGTACCTGAGAGGCTTAAGCCTGG
ATGGTTTGATCGTGTTGGGCATAGTCATCAGATCTTCCATGTGTTCGTTATGTTGGGCGC
TTTGTCCCACTATGCAGCTGCTCTTTTGTTATTGGACTGGCGTGACCATGTTGGTTGTTA
ACCCATATATATTTTGTAATTCTTTTGAGTTTTTGTTTTAAATACTAGTGTGTTTGTATC
ACGTGAAGCCAAATTGTAATGACTCGTTCGTTGTTAAACTGAATTGTATTTTTTTC
G

QA 2 537 2 537
DS 



AS 1 4

CO CL2238Contig1 1208 4 19 U
GGTCTGGGTGGAAGCTTGTCGTTGGTGATGTCTTCCGTGCTCCGTCCAACCCTTCGCTTC
TGTGTGTCATGGTTGGTGACGGTGTTCAGATTCTTGGCATGGCTGTTGTGACTATCTTGT
TCGCAGCTCTTGGGTTCATGTCACCGGCTTCACGTGGAACACTTATCACCGGTATGCTCT
TCTTCTACATGATCCTTGGCATCGCAGCTGGTTATGTTGCGGTTCGTCTCTGGAGGACGA
TTGGATGTGGTGAACACCGTGGATGGATGTCTGTTGCATGGAAAGCTGCTTGCTTTTTCC
CGGGCATTGCGTTTCTCATCCTCACAACGCTCAACTTCCTTCTCTGGGGTAGCCACAGTA
CTGGAGCTATCCCTTTCTCTCTGTTTGTCATCCTCATCCTCCTGTGGTTCTGCATCTCGG
TTCCTCTCACCCTCATCGGTGGTTACTTTGGAGCCAGGGCTCCTCACATTGAGTTCCCGG
TCCGAACCAACCAGATTCCCAGGGAAATCCCAGCTCAGAAATACCCGTCATGGCTTCTAG
TTCTTGGCGCTGGTACACTTCCTTTCGGGACCCTCTTCATCGAGCTGTTCTTCATCATGT
CCAGCATCTGGATGGGCCGTGTCTACTACGTCTTCGGCTTCCTGTTCGTTGTCATGATCC
TTCTCGTTGTGGTGTGTGCTGAGGTCTCCCTAGTGCTAACGTACATGCACTTGTGTGTGG
AAGACTATAAATGGTGGTGGAAATCTTTCTTTGCGTCAGGATCCGTTGCTATCTACATAT
TCATCTACTCCATAAACTATCTCGTCTTCGACCTCAAAAACTTGAGTGGACCCGTTTCAG
CGACTCTTTATCTGGGCTACTCTCTGTTCATGGTCCTGGCTATCATGCTCGCCACAGGTA
CTGTCGGTTTCCTCTCTTCCTTCTGGTTCGTGCACTACTTGTTCTCTTCGGTGAAACTTG
ACTGAGGATCGGAGCCGGAGGATTACGGTTCAGAATGATCGTTTAAAGTTTTGAAGAAGA
GAGTAATGTCGTTTAAGCAAAAGTCCATCTCATTGCTCCAAGTGTAAGGGTTCAATATTT
TTTTCTTTTTAATGTCAGTCCCAAGGATTTGTTCATGTTTCTTGTTTTTCATCTTGTTAC
ATCATTATGGGAATGCATCTGAACTTAGAAAATGTTTATTTTTAGTTCTATATTAAAAAT
GGATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK16TF U 1
AF RR2FI46TF U 126
AF RR2GK16JQ C 628
AF RR2FI46JQ C 406
BS 1 169 RR2GK16TF
BS 170 170 RR2FI46TF
BS 171 343 RR2GK16TF
BS 344 344 RR2FI46TF
BS 345 505 RR2GK16TF
BS 506 506 RR2FI46TF
BS 507 547 RR2GK16TF
BS 548 548 RR2FI46TF
BS 549 553 RR2GK16TF
BS 554 554 RR2FI46TF
BS 555 710 RR2GK16TF
BS 711 755 RR2FI46TF
BS 756 853 RR2FI46JQ
BS 854 854 RR2GK16JQ
BS 855 1128 RR2FI46JQ
BS 1129 1129 RR2GK16JQ
BS 1130 1168 RR2FI46JQ
BS 1169 1169 RR2GK16JQ
BS 1170 1208 RR2FI46JQ

RD RR2GK16TF 713 0 0
GGTCTGGGTGGAAGCTTGTCGTTGGTGATGTCTTCCGTGCTCCGTCCAACCCTTCGCTTC
TGTGTGTCATGGTTGGTGACGGTGTTCAGATTCTTGGCATGGCTGTTGTGACTATCTTGT
TCGCAGCTCTTGGGTTCATGTCACCGGCTTCACGTGGAACACTTATCACGGGTATGCTCT
TCTTCTACATGATCCTTGGCATCGCAGCTGGTTATGTTGCGGTTCGTCTCTGGAGGACGA
TTGGATGTGGTGAACACCGTGGATGGATGTCTGTTGCATGGAAAGCTGCTTGCTTTTTCC
CGGGCATTGCGTTTCTCATCCTCACAACGCTCAACTTCCTTCTGTGGGGTAGCCACAGTA
CTGGAGCTATCCCTTTCTCTCTGTTTGTCATCCTCATCCTCCTGTGGTTCTGCATCTCGG
TTCCTCTCACCCTCATCGGTGGTTACTTTGGAGCCAGGGCTCCTCACATTGAGTTCCCGG
TCCGAACCAACCAGATTCCCAGGGAGATCCCAGCTCAGAAATACCCGTCATGGCTTCTAG
TTCTTGGAGCTGGAACACTTCCTTTCGGGACCCTCTTCATCGAGCTGTTCTTCATCATGT
CCAGCATCTGGATGGGCCGTGTCTACTACGTCTTCGGCTTCCTGTTCGTTGTCATGATCC
TTCTCGTTGTGGTGTGTGCTGAGGTCTCCCTAGTGCTAACGTACATGCAC
CTG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2FI46TF 630 0 0
GCTCTTGGGTTCATGTCACCGGCTTCGCGTGGAACACTTATCACCGGTATGCTCTTCTTC
TACATGATCCTTGGCATTGCAGCTGGTTATGTTGCTGTTCGTCTCTGGAGGACGATTGGA
TGTGGTGAACACCGTGGATGGATGTCTGTTGCATGGAAAGCTGCTTGCTTTTTCCCGGGT
ATTGCGTTTCTTATCCTCACAACGCTCAACTTCCTTCTCTGGGGTAGCCACAGTACTGGA
GCTATTCCTTTCTCTCTGTTTGTCATCCTCATCCTCCTGTGGTTCTGCATCTCGGTTCCT
CTCACCCTCATCGGTGGTTACTTTGGAGCCAGGGCTCCTCACATTGAGTTCCCGGTCCGA
ACCAACCAGATTCCCAGGGAAATCCCAGCTCAGAAATACCCGTCATGGCTTCTAGTTCTT
GGCGCTGGTACACTTCCTTTCGGGACCCTCTTCATCGAGCTGTTCTTCATCATGTCCAGC
ATCTGGATGGGCCGTGTCTACTACGTCTTCGGCTTCCTGTTCGTTGTCATGATCCTTCTC
GTTGTGGTGTGTGCTGAGGTCTCTCTAGTGCTAACGTACATGCACTTGTGTGTGGAAGAC
TATAAATGGTGGTGGAAATCTTTCTTTGCG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2GK16JQ 565 0 0
ACGTCTTCGGCTTCCTGTTCGTTGTCATGATCCTTCTCGTTGTGGTGTGTGCTGAGGTCT
CCCTAGTGCTAACGTACATGCACCTGTGTGTGGAAGACTATAAATGGTGGTGGAAATCCT
TCTTTGCGTCAGGATTCGTTGCTATCTACATATTCATCTACTCCATAAACTATCTCGTCT
TCGACCTCAAAAACTTGAGTGGACCCGTTTCAGCGACTCTTTATCTGGGCTACTCTCTGT
TCATGGTCCTGGCTATCATGCTCGCCACAGGTACTGTCGGTTTCCTCTCTTCCTTCTGGT
TCGTGCACTACTTGTTCTCTTCGGTGAAACTTGACTGAGGATCGGAGCCGGAGGATTACG
GTTCAGAATGGTCGTTTAAAGTTTTGAAGAAGAGAGTAATGTCGTTTAAGCAAA*GTCCA
TCTCATTGCTCCAAGTGTAAGGGTTCAATATTTTTTTCTTTTTAATGTCAGTCTCAAGGA
TTTGTTCATGTTTCTTGTTTTTCATCTTGTTACATCATTATGGGAATGCATCTGAACTTA
GAAAATGTTTATTTTTAGTTCTATA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2FI46JQ 803 0 0
GGTTCTGCATCTCGGTTCCTCTCACCCTCATCGGTGGTTACTTTGGAGCCAGGGCTCCTC
ACATTGAGTTCCCGGTCCGAACCAACCAGATTCCCAGGGAAATCCCAGCTCAGAAATACC
CGTCATGGCTTCTAGTTCTTGGCGCTGGTACACTTCCTTTCGGGACCCTCTTCATCGAGC
TGTTCTTCATCATGTCCAGCATCTGGATGGGCCGTGTCTACTACGTCTTCGGCTTCCTGT
TCGTTGTCATGATCCTTCTCGTTGTGGTGTGTGCTGAGGTCTCTCTAGTGCTAACGTACA
TGCACTTGTGTGTGGAAGACTATAAATGGTGGTGGAAATCTTTCTTTGCGTCAGGATCCG
TTGCTATCTACATATTCATCTACTCCATAAACTATCTCGTCTTCGACCTCAAAAACTTGA
GTGGACCCGTTTCAGCGACTCTTTATCTTGGCTACTCTCTGTTCATGGTCCTGGCTATCA
TGCTCGCCACAGGTACTGTCGGTTTCCTCTCTTCCTTCTGGTTCGTGCACTACTTGTTCT
CTTCGGTGAAACTTGACTGAGGATCGGAGCCGGAGGATTACGGTTCAGAATGATCGTTTA
AAGTTTTGAAGAAGAGAGTAATGTCGTTTAAGCAAAAGTCCATCTCATTGCTCCAAGTGT
AAGGGTTCAATATTTTTTTCTTTTTAATGTCAGTCCCAAGGATTTGTTCATGTTTCTTGT
TTT*CATCTTGTTACATCATTATGGGAATGCATCTGAACTTAGGAAATGTTTATTTTTAG
TTCTATATTAAAAATGGATTTTG

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 4

CO CL2239Contig1 725 4 5 U
GGAATACAATACAGACTTGTTTGAAGATTGACGAGCTCTCTAATGGCTACATCTTACATC
CAGCTTCTGCTTCTTGTTCTCGCACCACTTCTCTTCTTACCGGCTTTGTACGCTGTTGAT
TTTGGAGAATGGATACGATTACGGTAACTTCAGTCGTGTAGAGATCTCTCCGAACCCGGT
TGGACCTGAAGACAACTACCTAGACATTACTGTATCTGGCTATGCAAGTAAGCAAATGAA
CAATGTAACTATAGAAGTGCACGCTAAATCAAACGAAACTAATGACCTTCTAGGAGTCTT
CTATATCTGTAAGGTGGCTAATGCATGCGTTATTAAATCTGGCCTCTGTTTTAGTCCTGA
ATGCGCTATTGAAGCTGGCACCAAGTTTGTGTTACCTATTCCCAAAGTTCCAGTGGATGA
CCTTGAGGATGACTTCAAATATGTCGTATCTCTGCTTGAGGACGATCCCGTCAACTCTTC
TGACTATGATGAAAAGTTTATAGAAAGAATGTGTGTTAACTTCGTTGTACCTATGTCGGA
TTCCTCATTGGAGTCTGCTTAGGCAAGTCGGTGGGTGGAAAATATGTTATCAAGCATTTA
TATGAGTTTTTTTTACACATACTCGCTTGTTTTCCCCCTTTCTTAAGTGTGTTTCCAATA
ATACCAAGTTCTGGTACTTTATGTTGTAATTTTGGTTTGCTAATACAAACATTTTACTTC
AGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2G167TF U 1
AF RR2GA56JQ C 188
AF RR2GA56TF U 188
AF RR2G167JQ C 44
BS 1 613 RR2G167TF
BS 614 614 RR2GA56TF
BS 615 649 RR2G167TF
BS 650 718 RR2GA56TF
BS 719 725 RR2G167JQ

RD RR2G167TF 649 0 0
GGAATACAATACAGACTTGTTTGAAGATTGACGAGCTCTCTAATGGCTACATCTTACATC
CAGCTTCTGCTTCTTGTTCTCGCACCACTTCTCTTCTTACCGGCTTTGTACGCTGTTGAT
TTTGGAGAATGGATACGATTACGGTAACTTCAGTCGTGTAGAGATCTCTCCGAACCCGGT
TGGACCTGAAGACAACTACCTAGACATTACTGTATCTGGCTATGCAAGTAAGCAAATGAA
CAATGTAACTATAGAAGTGCACGCTAAATCAAACGAAACTAATGACCTTCTAGGAGTCTT
CTATATCTGTAAGGTGGCTAATGCATGCGTTATTAAATCTGGCCTCTGTTTTAGTCCTGA
ATGCGCTATTGAAGCTGGCACCAAGTTTGTGTTACCTATTCCCAAAGTTCCAGTGGATGA
CCTTGAGGATGACTTCAAATATGTCGTATCTCTGCTTGAGGACGATCCCGTCAACTCTTC
TGACTATGATGAAAAGTTTATAGAAAGAATGTGTGTTAACTTCGTTGTACCTATGTCGGA
TTCCTCATTGGAGTCTGCTTAGGCAAGTCGGTGGGTGGAAAATATGTTATCAAGCATTTA
TATGAGTTTTTTT*ACACATACTCGCTTGTTTTCCCCCTTTCTTAAGTG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2GA56JQ 533 0 0
GAAGACAACTACCTAGACATTACTGTATCTGGCTATGCAAGTAAGCAAATGAACAATGTA
ACTATAGAAGTGCACGCTAAATCAAACGAAACTAATGACCTTCTAGGAGTCTTCTATATC
TGTAAGGTGGCTAATGCATGCGTTATTAAATCTGGCCTCTGTTTTAGTCCTGAATGCGCT
ATTGAAGCTGGCACCAAGTTTGTGTTACCTATTCCCAAAGTTCCAGTGGATGACCTTGAG
GATGACTTCAAATATGTCGTATCTCTGCTTGAGGACGATCCCGTCAACTCTTCTGACTAT
GATGAAAAGTTTATAGAAAGAATGTGTGTTAACTTCGTTGTACCTATGTCGGATTCCTCA
TTGGAGTCTGCTTAGGCAAGTCGGTGGGTGGAAAATATGTTATCAAGCATTTATATGAGT
TTTTTTTACACATACTCGCTTGTTTTCCCCCTTTCTTAAGTGTGTTTCCAATAATACCAA
GTTCTGGTACTTTATGTTGTAATTTTGGTTTGCTAATACAAACATTTTACT
CC

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2GA56TF 533 0 0
GAAGACAACTACCTAGACATTACTGTATCTGGCTATGCAAGTAAGCAAATGAACAATGTA
ACTATAGAAGTGCACGCTAAATCAAACGAAACTAATGACCTTCTAGGAGTCTTCTATATC
TGTAAGGTGGCTAATGCATGCGTTATTAAATCTGGCCTCTGTTTTAGTCCTGAATGCGCT
ATTGAAGCTGGCACCAAGTTTGTGTTACCTATTCCCAAAGTTCCAGTGGATGACCTTGAG
GATGACTTCAAATATGTCGTATCTCTGCTTGAGGACGATCCCGTCAACTCTTCTGACTAT
GATGAAAAGTTTATAGAAAGAATGTGTGTTAACTTCGTTGTACCTATGTCGGATTCCTCA
TTGGAGTCTGCTTAGGCAAGTCGGTGGGTGGAAAATATGTTATCAAGCATTTATATGAGT
TTTTTTTACACATACTCGCTTGTTTTCCCCCTTTCTTAAGTGTGTTTCCAATAATACCAA
GTTCTGGTACTTTATGTTGTAATTTTGGTTTGCTAATACAAACATTTTACT
CC

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2G167JQ 682 0 0
TGGCTACATCTTACATCCAGCTTCTGCTTCTTGTTCTCGCACCACTTCTCTTCTTACCGG
CTTTGTACGCTGTTGATTTTGGAGAATGGATACGATTACGGTAACTTCAGTCGTGTAGAG
ATCTCTCCGAACCCGGTTGGACCTGAAGACAACTACCTAGACATTACTGTATCTGGCTAT
GCAAGTAAGCAAATGAACAATGTAACTATAGAAGTGCACGCTAAATCAAACGAAACTAAT
GACCTTCTAGGAGTCTTCTATATCTGTAAGGTGGCTAATGCATGCGTTATTAAATCTGGC
CTCTGTTTTAGTCCTGAATGCGCTATTGAAGCTGGCACCAAGTTTGTGTTACCTATTCCC
AAAGTTCCAGTGGATGACCTTGAGGATGACTTCAAATATGTCGTATCTCTGCTTGAGGAC
GATCCCGTCAACTCTTCTGACTATGATGAAAAGTTTATAGAAAGAATGTGTGTTAACTTC
GTTGTACCTATGTCGGATTCCTCATTGGAGTCTGCTTAGGCAAGTCGGTGGGTGGAAAAT
ATGTTATCAAGCATTTATATGAGTTTTTTTTACACATACTCGCTTGTTTTCCCCCTTTCT
TAAGTGTGTTTCCAATAATACCAAGTTCTGGTACTTTATGTTGTAATTTTGGTTTGCTAA
TACAAACATTTTACTTCAGTAC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 4

CO CL2240Contig1 597 4 2 U
CCATGTAAAATGTCACGTAACATTTATAGTACATGGTACATTTTTTTTCATTTGATACAA
TATTTAAACACTAAGATGATAATGATCCCAAGTCATTAAACACAATATATAAGTTTGTAG
TAAAACAACATTTCATGTCTTCAATCATCCTCACGCGTTGCCTCCTTCTCTGTTTCCTTC
ACTTGGTGAAGAAGGCACCTTCTCAGATTCCTCTTCCCCAGCTCCAGTCACCGGTGTTGC
AGGAACAGAGGGATTTGCAGGCTTAACCATTGGGAATGGCCAGCCGTGGAATGGAAATCT
ATACATGAAGAAACCTGCTATCGCAGAGTTCCTTGCAGACTCATCATCAATCTTGGACAT
GGAAGATGATGAATCAACCTCGGTGGAGTCAGAAACAAGCATTGCCGGAGGATCAATATG
TCTTTTTGGAACTTCTTCTGTTGAGGGCCTTGAGGCTGCTACAGCCACTTTGGGGCTGGA
AGAGGAGAGCACAAGTGGGGAAGTGAGGAAGGTGAGAAAAATAAGGCAGAGAGAGACTCT
TGAGATTGACATTGTAGCTTGACTTGTTTACTTGTGATGGTGTATGTTTGATGATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GT93JQB U 1
AF RR2GT93TF C 1
AF RR2F909JQ U 49
AF RR2F909TF C 49
BS 1 363 RR2GT93JQB
BS 364 597 RR2F909JQ

RD RR2GT93JQB 363 0 0
CCATGTAAAATGTCACGTAACATTTATAGTACATGGTACATTTTTTTTCATTTGATACAA
TATTTAAACACTAAGATGATAATGATCCCAAGTCATTAAACACAATATATAAGTTTGTAG
TAAAACAACATTTCATGTCTTCAATCATCCTCACGCGTTGCCTCCTTCTCTGTTTCCTTC
ACTTGGTGAAGAAGGCACCTTCTCAGATTCCTCTTCCCCAGCTCCAGTCACCGGTGTTGC
AGGAACAGAGGGATTTGCAGGCTTAACCATTGGGAATGGCCAGCCGTGGAATGGAAATCT
ATACATGAAGAAACCTGCTATCGCAGAGTTCCTTGCAGACTCATCATCAATCTTGGACAT
GGA

QA 1 363 1 363
DS 

RD RR2GT93TF 478 0 0
CCATGTAAAATGTCACGTAACATTTATAGTACATGGTACATTTTTTTTCATTTGATACAA
TATTTAAACACTAAGATGATAATGATCCCAAGTCATTAAACACAATATATAAGTTTGTAG
TAGAACAACATTTCATGTCTTCAATCATCCTCACGCGTTGCCTCCTTCTCTGTTTCCTTC
ACTTGGTGAAGAAGGCACCTTCTCAGATTCCTCTTCCCCAGCTCCAGTCACCGGTGTTGC
AGGAACAGAGGGATTTGCAGGCTTAACCATTGGGAATGGCCAGCCGTGGAATGGAAATCT
ATACATGAAGAAACCTGCTATCGCAGAGTTCCTTGCAGACTCATCATCAATCTTGGACAT
GGAAGATGATGAATCAACCTCGGTGGAGTCAGAAACAAGCATTGCCGGAGGATCAATATG
TCTTTTTGGAACTTCTTCTGTTGAGGGCCTTGAGGCTGCTACAGCCACTTTGGGGCTG

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2F909JQ 549 0 0
CATTTGATACAATATTTAAACACTAAGATGATAATGATCCCAAGTCATTAAACACAATAT
ATAAGTTTGTAGTAAAACAACATTTCATGTCTTCAATCATCCTCACGCGTTGCCTCCTTC
TCTGTTTCCTTCACTTGGTGAAGAAGGCACCTTCTCAAATTCCTCTTCCCCAGCTCCAGT
CACCGGTGTTGCAGGAACAGAGGGATTTGCAGGCTTAACCATTGGGAATGGCCAGCCGTG
GAATGGAAATCTATACATGAAGAAACCTGCTATCGCAAAGTTCCTTGCAAACTCATCATC
AATCTTGGACATGGAAGATGATGAATCAACCTCGGTGGAGTCAGAAACAAGCATTGCCGG
AGGATCAATATGTCTTTTTGGAACTTCTTCTGTTGAGGGCCTTGAGGCTGCTACAGCCAC
TTTGGGGCTGGAAGAGGAGAGCACAAGTGGGGAAGTGAGGAAGGTGAGAAAAATAAGGCA
GAGAGAGACTCTTGAGATTGACATTGTAGCTTGACTTGTTTACTTGTGATGGTGTATGTT
TGATGATCC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2F909TF 549 0 0
CATTTGATACAATATTTAAACACTAAGATGATAATGATCCCAAGTCATTAAACACAATAT
ATAAGTTTGTAGTAGAACAACATTTCATGTCTTCAATCATCCTCACGCGTTGCCTCCTTC
TCTGTTTCCTTCACTTGGTGAAGAAGGCACCTTCTCAGATTCCTCTTCCCCAGCTCCAGT
CACCGGTGTTGCAGGAACAGAGGGATTTGCAGGCTTAACCATTGGGAATGGCCAGCCGTG
GAATGGAAATCTATACATGAAGAAACCTGCTATCGCAGAGTTCCTTGCAGACTCATCATC
AATCTTGGACATGGAAGATGATGAATCAACCTCGGTGGAGTCAGAAACAAGCATTGCCGG
AGGATCAATATGTCTTTTTGGAACTTCTTCTGTTGAGGGCCTTGAGGCTGCTACAGCCAC
TTTGGGGCTGGAAGAGGAGAGCACAAGTGGGGAAGTGAGGAAGGTGAGAAAAATAAGGCA
GAGAGAGACTCTTGAGATTGACATTGTAGCTTGACTTGTTTACTTGTGATGGTGTATGTT
TGATGATCC

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 3

CO CL2241Contig1 903 3 6 U
GACGTTTCTCAGAACGCGCGATTGAGAAGCCGGCCGCCATGGATCCAGCAGGAGGAGGAG
CAACGGTGGTGGCCAACGACATCAGAGGAGGAGAAGGCGAGAAATTCGCGGTGGGGAATA
TTTATTCGGTGAAAGTGATCACCGGAGATGAGTTCCGAGGGATCGTCATGGCTTACGATC
CAATCCGCAACTACGTCGTTTTCGAAGAGGGTACGAAACCTAGAGCTGGGCATTCGAAGA
ACACTCGGATGGTGAATGCGAGTTTCATAACAGGGCTTTCGTATTTGGGCAAAACCGAAG
ATCCGCTTCTTACTGACAGCTGTTGTGTTAATCTTGACTCGCTCCGAGCTAAAGAAGCAC
TTGCTATCAGGCAAGCGGAAGCAGAAGCTGAGAGAATGGGTGTTGGTGTTACCGCTGAGG
CGCAGAGCATCTTCGACGCGTTGTCTAAGACACTTCCTGTGCAGTGGGAAAACTCAGACA
TTTTGGTGATGAAAGAAGTGCGTGTTCGTAGCCCGTATCTTTCCGATTGTGTCTTTGGAG
GAACTGATGCTGCCAACAACCGAGTCAAGAAAGTGCTTGAACTGGTGAGACGAAGGTTGC
AACTTGTGGGCACATGAGGCCAGTGGAAAGGAGACGGTCAGTGAAGTCGCCAGAAAGGGT
ATGTCGCAGCTACTAACCCAAGAAAGCGTTTAGATCTGATCGGCAAAGGGAGAAGTGAGC
TTCTCTCGCATGTTGTTGTCTTTACCAGATTAGAGATTTCTTGAGTTCCAGGGATTTGAA
ACTCAAGCAGACTAGTTTCACCTTGTTTTTTAAAAAATTATCCGTATTTATCACATTTTC
GTGCATTTTGCAATCTTACTTGTTTTTGTTGATGTTGGTATTAAATCTTTAATATTTTCA
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2AC34TF U 9
AF RR2CN71TF U 1
AF RR2CN71JQ C 156
BS 1 83 RR2CN71TF
BS 84 84 RR2AC34TF
BS 85 595 RR2CN71TF
BS 596 596 RR2CN71JQ
BS 597 618 RR2CN71TF
BS 619 903 RR2CN71JQ

RD RR2AC34TF 583 0 0
TCAGGACGCGCGATTGAGAAGCCGGCCGCCATGGATCCAGCAGGAGGAG***CAACGGTG
GTGGCCAACGACATCATCGGAGGAGAAGGCGA*AAATTCGCGGTGGGGAATATTTATTCG
GTTAAAGTGATCACCGGAGATGAGTTCCGAGGGATCGTCATGGCTTACGATCCAATCCGC
AACTACGTCGTTTTCGAAGAGGGTACGAAACCTAGAGCTGGGCATTCGAAGAACACTCGG
ATGGTGAATGCGAGTTTCATAACGGGGCTTTCGTATTTGGGCAAAACCGAAGATCCGCTT
CTTACTGACAACTGTTGTGTTAATCTTGACTCGCTCCGAGCTAAAGAAGCACTTGCTATC
AGGCAAGCGGAAGCAGAAGCTGAGAGAATGGGTGTTGGTGTTACCGCTGAGGCGCAGAGC
ATCTTCGACGCGTTGTCTAAGACACTTCCTGTGCAGTGGGAAAACTCAGACATTTTGGTG
ATGAAAGAAGTGCGTGTTCGTAGCCCTTATCTTTCCGATTGTGTCTTTGGAGGAACTGAT
GCTGCCAACAACCGAGTCAAGAAAGTGCTTGAACTGGTGAGAC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2CN71TF 625 0 0
GACGTTTCTCAGAACGCGCGATTGAGAAGCCGGCCGCCATGGATCCAGCAGGAGGAGGAG
CAACGGTGGTGGCCAACGACATCGGAGGAGGAGAAGGCGAGAAATTCGCGGTGGGGAATA
TTTATTCGGTGAAAGTGATCACCGGAGATGAGTTCCGAGGGATCGTCATGGCTTACGATC
CAATCCGCAACTACGTCGTTTTCGAAGAGGGTACGAAACCTAGAGCTGGGCATTCGAAGA
ACACTCGGATGGTGAATGCGAGTTTCATAACAGGGCTTTCGTATTTGGGCAAAACCGAAG
ATCCGCTTCTTACTGACAGCTGTTGTGTTAATCTTGACTCGCTCCGAGCTAAAGAAGCAC
TTGCTATCAGGCAAGCGGAAGCAGAAGCTGAGAGAATGGGTGTTGGTGTTACCGCTGAGG
CGCAGAGCATCTTCGACGCGTTGTCTAAGACACTTCCTGTGCAGTGGGAAAACTCAGACA
TTTTGGTGATGAAAGAAGTGCGTGTTCGTAGCCCGTATCTTTCCGATTGTGTCTTTGGAG
GAACTGATGCTGCCAACAACCGAGTCAAGAAAGTGCTTGAACTGGTGAGACGAAG*TTGC
AACTTGTGGGCACATGAG
CCAGTGG

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2CN71JQ 748 0 0
CGAGGGATCGTCATGGCTTACGATCCAATCCGCAACTACGTCGTTTTCGAAGAGGGTACG
AAACCTAGAGCTGGGCATTCGAAGAACACTCGGATGGTGAATGCGAGTTTCATAACAGGG
CTTTCGTATTTGGGCAAAACCGAAGATCCGCTTCTTACTGACAGCTGTTGTGTTAATCTT
GACTCGCTCCGAGCTAAAGAAGCACTTGCTATCAGGCAAGCGGAAGCAGAAGCTGAGAGA
ATGGGTGTTGGTGTTACCGCTGAGGCGCAGAGCATTTTCGACGCGTTGTTTAAGACACTT
CCTGTGCAGTGGGAAAACTCAGACATTTTGGTGATGAAAGAAGTGCGTGTTCGTAGCCCG
TATCTTTCCGATTGTGTCTTTGGAGGAACTGATGCTGCCAACAACCGAGTCAAGAAAGTG
CTTGAACTGGTGAGACGAAGGTTGCAACTTGTGGGCACATGAGGCCAGTGGAAAGGAGAC
GGTCAGTGAAGTCGCCAGAAAGGGTATGTCGCAGCTACTAACCCAAGAAAGCGTTTAGAT
CTGATCGGCAAAGGGAGAAGTGAGCTTCTCTCGCATGTTGTTGTCTTTACCAGATTAGAG
ATTTCTTGAGTTCCAGGGATTTGAAACTCAAGCAGACTAGTTTCACCTTGTTTTTTAAAA
AATTATCCGTATTTATCACATTTTCGTGCATTTTGCAATCTTACTTGTTTTTGTTGATGT
TGGTATTAAATCTTTAATATTTTCACCC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 3

CO CL2242Contig1 542 3 1 U
GGAATTTCTCAATCGATAAACCCTAAAAAGCTCGTCGTTGAATCACATCTCTGACCTCTG
GAATACAAAAATGTCGGCGGTAGGAACATCGAAAGGGATCTTGGAGATAGCTAAGTTCGG
TTTCTACGTCGCTGTACCTATCGGTCTTATGTATACATTCGCCAACAACAGCACCAATAT
CAAGAAATTCATGGGCGATCTTTCGTATGTTGTCTACCCTGAAGAGGCACCTCGACCTCC
TTCACCCGAGGAGATGCGAGAGATGGCGCGAGAGCTTGCCCGTAAGAAGAACATCCCCTG
AATTGAATTGAGGAATAAGTTAATATTGCAATTGCTCGGGATAAGGTAATAATGTATCTT
TGTTGATTCCTGTAAGAATATAAATGGGATGTGTAACTCAATAATGAGGAAGAACATGCG
TGTACTTTTTACTATACGCATCAATAATTTGAGAGACACGGGTGATAACAAACAATAGTG
CCTTCTTCTTCATCTCTTGTTAACCAGAGGCGATGCAATTCCATATTCCTCAGTATAAAT
CC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2DN03TF U 1
AF RR2CR90JQ C 1
AF RR2CR90TF U 1
BS 1 542 RR2CR90TF

RD RR2DN03TF 231 0 0
GGAATTTCTCAATCGATAAACCCTAAAAAGCTCGTCGTTGAATCACATCTCTGACCTCTG
GAATACAAAAATGTCGGCGGTAGGAACATCGAAAGGGATCTTGGAGATAGCTAAGTTCGG
TTTCTACGTCGCTGTACCTATCGGTCTTATGTATACATTCGCCAACAACAGCACCAATAT
CAAGAAATTCATGGGCGATCTTTCGTATGTTGTCTACCCTGAAGAGGCACC

QA 1 231 1 231
DS 

RD RR2CR90JQ 542 0 0
GGAATTTCTCAATCGATAAACCCTAAAAAGCTCGTCGTTGAATCACATTTCTGACCTCTG
GAATACAAAAATGTCGGCGGTAGGAACATCGAAAGGGATCTTGGAGATAGCTAAGTTCGG
TTTTTACGTCGCTGTACCTATCGGTCTTATGTATACATTCGCCAACAACAGCACCAATAT
CAAGAAATTCATGGGCGATCTTTCGTATGTTGTCTACCCTGAAGAGGCACCTCGACCTCC
TTCACCCGAGGAGATGCGAGAGATGGCGCGAGAGCTTGCCCGTAAGAAGAACATCCCCTG
AATTGAATTGAGGAATAAGTTAATATTGCAATTGCTCGGGATAAGGTAATAATGTATCTT
TGTTGATTCCTGTAAGAATATAAATGGGATGTGTAACTCAATAATGAGGAAGAACATGCG
TGTACTTTTTACTATACGCATCAATAATTTGAGAGACACGGGTGATAACAAACAATAGTG
CCTTCTTCTTCATCTCTTGTTAACCAGAGGCGATGCAATTCCATATTCCTCAGTATAAAT
CC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2CR90TF 542 0 0
GGAATTTCTCAATCGATAAACCCTAAAAAGCTCGTCGTTGAATCACATCTCTGACCTCTG
GAATACAAAAATGTCGGCGGTAGGAACATCGAAAGGGATCTTGGAGATAGCTAAGTTCGG
TTTCTACGTCGCTGTACCTATCGGTCTTATGTATACATTCGCCAACAACAGCACCAATAT
CAAGAAATTCATGGGCGATCTTTCGTATGTTGTCTACCCTGAAGAGGCACCTCGACCTCC
TTCACCCGAGGAGATGCGAGAGATGGCGCGAGAGCTTGCCCGTAAGAAGAACATCCCCTG
AATTGAATTGAGGAATAAGTTAATATTGCAATTGCTCGGGATAAGGTAATAATGTATCTT
TGTTGATTCCTGTAAGAATATAAATGGGATGTGTAACTCAATAATGAGGAAGAACATGCG
TGTACTTTTTACTATACGCATCAATAATTTGAGAGACACGGGTGATAACAAACAATAGTG
CCTTCTTCTTCATCTCTTGTTAACCAGAGGCGATGCAATTCCATATTCCTCAGTATAAAT
CC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 2 4

CO CL2243Contig1 724 2 19 U
GAACTCTTTTATTGGGCTTTTCGGCCCAATCTAAACTTTAACAGGCTAAAGTAAATTAGC
TTTGCATCAAATTGCATAAAGTCCGTAACAAAAACCATAAACAAACCGTCACAAGTCACC
CCAAAAAAAGACTAAACTCTCGGGGGGTCACTCACGAGCAACCACAATGAGTTTTTTCCC
AACGTTCTTACCGTGGAAAAGTCCTAACAAAGCAAAAGGTCCACTCTCGAGTCCTTCGGC
TATGTCCTCAATGTACGTTATCTTCCCTTCTCTTACGTAAGGAAGCACAAAATCCAAAAA
CTTTGAGTATTTGTCGTAAAAATCAAAAACAGCAAAGCCTTGAACCTTTATCCTCTTGTA
AAGGATCGTGGTCAGGTTGTGTACACCATCTGGCTCCACTAGGTTATACTGTGAGATCAT
TCCACAAACTGCGATACGACCATTTAACTTCATGTTTATCAGTACTGCATCCAACATTTT
GCCTCCCACGTTCTCAAAATATATGTCAATCCCTTCCGGGAAATACCTCTTTAGGGCAGC
GTTAAGGTCATTTTCCTCTTTGTAATTGAAAGCGTCGTCGAATCCAAACGTTGTCTTGAG
AAGATCAACCTTTTCTTTCCTACCAGCGCTTCCAACGACATAACAACCCATCAGCTTTGC
AAATTGTCCCACAGGCTGACCAACTGCACCGGATGCAGCTGACACGAAGACAGTCTCTCC
TCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2A146JQ U 34
AF RR2EL58JQ U 1
BS 1 53 RR2EL58JQ
BS 54 54 RR2A146JQ
BS 55 78 RR2EL58JQ
BS 79 79 RR2A146JQ
BS 80 142 RR2EL58JQ
BS 143 143 RR2A146JQ
BS 144 145 RR2EL58JQ
BS 146 146 RR2A146JQ
BS 147 198 RR2EL58JQ
BS 199 199 RR2A146JQ
BS 200 214 RR2EL58JQ
BS 215 215 RR2A146JQ
BS 216 318 RR2EL58JQ
BS 319 319 RR2A146JQ
BS 320 325 RR2EL58JQ
BS 326 326 RR2A146JQ
BS 327 327 RR2EL58JQ
BS 328 328 RR2A146JQ
BS 329 724 RR2EL58JQ

RD RR2A146JQ 572 0 0
AACTTTAACAGGCTAAAGTAAATTAGCTTTGCATCAAATTGCATAAAGTCCGTAACAAAA
ACCATAAACAAACCGTCACAAGTCACCCCAAAAAAAGACTAAACTCTCGGGGGGTCACTC
ACGAGCAACCACAATGAGTTTTTTCCCAACGTTCTTACCGTGGAAAAGTCCTAACAAAGC
AAAAGGTCCACTCTCGAGTCCTTCGGCTATGTCCTCAATGTACGTTATCTTCCCTTCTCT
TACGTAAGGAAGCACAAAATCCAAAAACTTTGAGTATTTGTCGTAAAAATCAAAAACAGC
AAAGCCTTGAACCTTTATCCTCTTGTAAAGGATCGTGGTCAGGTTGTGTACACCATCTGG
CTCCACTAGGTTATACTGTGAGATCATTCCACAAACTGCGATACGACCATTTAACTTCAT
GTTTATCAGTACTGCATCCAACATTTTGCCTCCCACGTTCTCAAAATATATGTCAATCCC
TTCCGGGAAATACCTCTTTAGGGCAGCGTTAAGGTCATTTTCCTCTTTGTAATTGAAAGC
GTCGTCGAATCCAAACGTTGTCTTGAGAAGAT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2EL58JQ 724 0 0
GAACTCTTTTATTGGGCTTTTCGGCCCAATCTAAACTTTAACAGGCTAAAGTAGATTAGC
TTTGCATCAAATTGCATAGAGTCCGTAACAAAAACCATAAACAAACCGTCACAAGTCACC
CCAAAAAAAGACTAAACTCTCGTGGTGTCACTCACGAGCAACCACAATGAGTTTTTTCCC
AACGTTCTTACCGTGGAAGAGTCCTAACAAAGCAGAAGGTCCACTCTCGAGTCCTTCGGC
TATGTCCTCAATGTACGTTATCTTCCCTTCTCTTACGTAAGGAAGCACAAAATCCAAAAA
CTTTGAGTATTTGTCGTAGAAATCAGAGACAGCAAAGCCTTGAACCTTTATCCTCTTGTA
AAGGATCGTGGTCAGGTTGTGTACACCATCTGGCTCCACTAGGTTATACTGTGAGATCAT
TCCACAAACTGCGATACGACCATTTAACTTCATGTTTATCAGTACTGCATCCAACATTTT
GCCTCCCACGTTCTCAAAATATATGTCAATCCCTTCCGGGAAATACCTCTTTAGGGCAGC
GTTAAGGTCATTTTCCTCTTTGTAATTGAAAGCGTCGTCGAATCCAAACGTTGTCTTGAG
AAGATCAACCTTTTCTTTCCTACCAGCGCTTCCAACGACATAACAACCCATCAGCTTTGC
AAATTGTCCCACAGGCTGACCAACTGCACCGGATGCAGCTGACACGAAGACAGTCTCTCC
TCTC

QA 1 724 1 724
DS 



CO CL2243Contig2 763 2 11 U
GGACACCAAGTATTAAGAATCCTATCGAAAGCACGCATCATCCACTCAAGAATAAATCAT
ATTAGTAATTCAAAAGTACGTAAATAGGGAGAAATGGCGAGCACAGAGCCAGCAACGGTG
ACCAACAAACAAATCATATTCTCAGGTTATGTGAGTGGATTCCCGAAGGAGTCCGATCTA
AAATTCACCACACCCACCATCGATCTAAGGATTCCAGAGAGATCCACATCGATTCTGGTG
AAGAATCTTTACTTGTCTTGCGATCCTTACATGCGCATTTGCATGGGAAAGCCTGAGCCG
TTGAGTTCTTCGCTCGTCCCACCGTTCAATACAGGCGAGCCAATCATTGGCCTTGGAGTG
TCTAAAGTGATAGATTCAGGGCACCCAGATTACAAAAAAGGAGACTTACTCTGGGGAGTA
GTTGGATGGGGAGGAGTACAGTGTTATTACTCTATTTCCTTATTCACATTTTAAGATCCA
TCACACCGATATTCCATTATCTTACTACACTGGACTTCTTGGCATGCCTGGTATGACTGC
TTATGCTGGATTTTACGAAATTTGTTCACCTAAGAGAGGAGAGACTGTCTTCGTGTCAGC
TGCATCCGGTGCAGTTGGTCAGCCTGTGGGACAATTTGCAAAGCTGATGGGTTGTTATGT
CGTTGGAAGCGCTGGTAGGAAAGAAAAGGTTGATCTTCTCAGACAACGTTTGGATTCGAC
GACGCTTTCAATTACAAGAGGAAATGACTTTACGCTGCCCTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL58TF U 1
AF RR2A146TF U 25
BS 1 82 RR2EL58TF
BS 83 83 RR2A146TF
BS 84 192 RR2EL58TF
BS 193 193 RR2A146TF
BS 194 430 RR2EL58TF
BS 431 431 RR2A146TF
BS 432 688 RR2EL58TF
BS 689 689 RR2A146TF
BS 690 705 RR2EL58TF
BS 706 706 RR2A146TF
BS 707 763 RR2EL58TF

RD RR2EL58TF 763 0 0
GGACACCAAGTATTAAGAATCCTATCGAAAGCACGCATCATCCACTCAAGAATAAATCAT
ATTAGTAATTCAAAAGTACGTAGATAGGGAGAAATGGCGAGCACAGAGCCAGCAACGGTG
ACCAACAAACAAATCATATTCTCAGGTTATGTGAGTGGATTCCCGAAGGAGTCCGATCTA
AAATTCACCACATCCACCATCGATCTAAGGATTCCAGAGAGATCCACATCGATTCTGGTG
AAGAATCTTTACTTGTCTTGCGATCCTTACATGCGCATTTGCATGGGAAAGCCTGAGCCG
TTGAGTTCTTCGCTCGTCCCACCGTTCAATACAGGCGAGCCAATCATTGGCCTTGGAGTG
TCTAAAGTGATAGATTCAGGGCACCCAGATTACAAAAAAGGAGACTTACTCTGGGGAGTA
GTTGGATGGG*AGGAGTACAGTGTTATTACTCTATTTCCTTATTCACATTTTAAGATCCA
TCACACCGATATTCCATTATCTTACTACACTGGACTTCTTGGCATGCCTGGTATGACTGC
TTATGCTGGATTTTACGAAATTTGTTCACCTAAGAGAGGAGAGACTGTCTTCGTGTCAGC
TGCATCCGGTGCAGTTGGTCAGCCTGTGGGACAATTTGCAAAGCTGATGGGTTGTTATGT
CGTTGGAAGCGCTGGTAGGAAAGAAAAG*TTGATCTTCTCAGACA*CGTTTGGATTCGAC
GACGCTTTCAATTACAAGAGGAAATGACTTTACGCTGCCCTAA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2A146TF 737 0 0
TCGAAAGCACGCATCATCCACTCAAGAATAAATCATATTAGTAATTCAAAAGTACGTAAA
TAGGGAGAAATGGCGAGCACAGAGCCAGCAACGGTGACCAACAAACAAATCATATTCTCA
GGTTATGTGAGTGGATTCCCGAAGGAGTCCGATCTAAAATTCACCACACCCACCATCGAT
CTAAGGATTCCAGAGAGATCCACATCGATTCTGGTGAAGAATCTTTACTTGTCTTGCGAT
CCTTACATGCGCATTTGCATGGGAAAGCCTGAGCCGTTGAGTTCTTCGCTCGTCCCACCG
TTCAATACAGGCGAGCCAATCATTGGCCTTGGAGTGTCTAAAGTGATAGATTCAGGGCAC
CCAGATTACAAAAAAGGAGACTTACTCTGGGGAGTAGTTGGATGGGGAGGAGTACAGTGT
TATTACTCTATTTCCTTATTCACATTTTAAGATCCATCACACCGATATTCCATTATCTTA
CTACACTGGACTTCTTGGCATGCCTGGTATGACTGCTTATGCTGGATTTTACGAAATTTG
TTCACCTAAGAGAGGAGAGACTGTCTTCGTGTCAGCTGCATCCGGTGCAGTTGGTCAGCT
TGTGGGACAATTTGCAAAGCTGATGGGTTGTTATGTCGTTGGAAGCGCTGGTAGGAAAGA
AAAGGTTGATCTTCTCAGACAACGTTTGGATTCGACGACGCTTTCA*TTACAAGAGGAAA
ATGACCTTAACGCTGCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 3

CO CL2244Contig1 1005 3 4 U
GACTGAACACGTGTGGAATGCTATTATTTTGAACAAAAGAGAAAATGAAGACAAATATGT
CCAAATTTTCATGACATTATTGGTGAGACAACAATGATGCTCCTCTTGAAGAGAGGACAC
ATCTAAAGAAAGAAAACAACACAATATGAATTGTACAACAGAATGAATTTGAATTTGAAT
TTGTTCACAACATAAAATTATAATCAAATCATTCCCTTAATGGTATTCTTGGAAGTTGAC
ATGACCAGTTGCCTGAGCATGCTCCACAGCTTCCTTTTGTCCAATAACACCAATTTGGCA
AACACCACAACGCAGAGTGAAGTTTGCAGTATCTGTGTAACTCCTTTTCCTTTGTTGGTC
CTTTACTAGATTTAGAACAAGCCCTT*CTATAGCACCAATGGATCTATCTTTACCAACTG
GAAATATAGCCATATCAAAGTCTTCCTCAGCATCTTCAAATGGAGACAAAGCGAGAGCAT
CATAGTGAAGACCGTCATAGATCAGCATAACCCTTTCGCTATAGTTTTTGGTCTGTCCAT
ACAGGTCACATCGACTAGTTTGAATATCATAAGCCGCAATCTCTCGACCATAATAGTCTG
CTAATATCGAAAGCTCAATCGCACCTCCCCACTTGTCTGGATTGAGAATCCAAGCACAAT
ATTCTTCATTTTGCTTCCCTAGAAATGCTTCGTTATACTTCTCCTTGTCGCTTGCAACTG
CAGCAGCTATCACCTGTCTTAGCTCAGGAGCTTTCTTCTTGTCCTTGTCCATGACATAAC
CGATTGCGTTGAAGAGACAACTGTTGTCAGATGATATAACTCTCCTCACAATGATTCCTT
CCATGATAATAATCTCAAACTAGCAAGAAAACGCCGTTGGCGTTGGGGTCAAGAGAGAGA
GAGAGAGATCTGATTCTGGAAAATTGAGAAATATAAAACAGATTGTTATGGTGGGGTGGT
TGCCGTTTTTGCTCAATAAATCTTTGCTTCGTTTCGTCTCGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ79JQB U 13
AF RR2EF82JQ U 1
AF RR2EF82TF C 253
BS 1 20 RR2EF82JQ
BS 21 21 RR2GJ79JQB
BS 22 729 RR2EF82JQ
BS 730 1005 RR2EF82TF

RD RR2GJ79JQB 660 0 0
AC
GGAATGCTATTATTTTGAACCAAAGAGAAAATGAAGACAAATATGTCCAAATTTTCATGA
CATTATTGGTGAGACAACAATGATGCTCCTCTTGAAGATAGGATACATCTAAAGAAAGAG
AACAACACAATATGAATTGTACAACATACTGAATTTGAATTTGAATTTGTTCACAACATA
AAATTATAATCAAATCATTCCCTTAATGGTATTCTTGGAAGTTGACATGACCAGTTGCCT
GAGCATGCTCCACAGCTTCCTTTTGTTCAATAACACCAATTTGGCAAACACCACAACGCA
GAGTGAAGTTTGCAGTATCTGTGTAACTCCTTTTCCTTTGTTGGTCCTTTACTAGATTTA
GAACAAGCCCTT*CAATGGCCCCAATGGATCTATCTTTACCAACCGGAAATATAGTCATA
TCAAAGTCTTCCTCAGCATCTTCAAATGGAGACAAAGCGAGAGCATCATAGTGAAGACCG
TCATAGATCAGCATAACTCTTTCGCTGTAGTTTTTGGTCTGTCCATACAAATCACATCGA
CTGGTTTGAATATCATAAGCTGCAATCTCTCGACCATAATAGTCTGCTAATATCGAAAGC
TCAATCGCACCTCCCCACTTCTCCGGATTGAGAATCCAAGCACAATATTCTTCATTTT

QA 3 660 3 660
DS 

RD RR2EF82JQ 729 0 0
GACTGAACACGTGTGGAATGTTATTATTTTGAACAAAAGAGAAAATGAAGACAAATATGT
CCAAATTTTCATGACATTATTGGTGAGACAACAATGATGCTCCTCTTGAAGAGAGGACAC
ATCTAAAGAAAGAAAACAACACAATATGAATTGTACAACAGAATGAATTTGAATTTGAAT
TTGTTCACAACATAAAATTATAATCAAATCATTCCCTTAATGGTATTCTTGGAAGTTGAC
ATGACCAGTTGCCTGAGCATGCTCCACAGCTTCCTTTTGTCCAATAACACCAATTTGGCA
AACACCACAACGCAGAGTGAAGTTTGCAGTATCTGTGTAACTCCTTTTCCTTTGTTGGTC
CTTTACTAGATTTAGAACAAGCCCTT*CTATAGCACCAATGGATCTATCTTTACCAACTG
GAAATATAGCCATATCAAAGTCTTCCTCAGCATCTTCAAATGGAGACAAAGCGAGAGCAT
CATAGTGAAGACCGTCATAGATCAGCATAACCCTTTCGCTATAGTTTTTGGTCTGTCCAT
ACAGGTCACATCGACTAGTTTGAATATCATAAGCCGCAATCTCTCGACCATAATAGTCTG
CTAATATCGAAAGCTCAATCGCACCTCCCCACTTGTCTGGATTGAGAATCCAAGCACAAT
ATTCTTCATTTTGCTTCCCTAGAAATGCTTCGTTATACTTCTCCTTGTCGCTTGCAACTG
CAGCAGCTA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2EF82TF 753 0 0
CTGAGCATGCTCCACAGCT*CCTTTTGTCCAATAACACCAATTTGGCAAACACCACAACG
CAGAGTGAAGTTTGCAGTATCTGTGTAACTC*TTTTCCTTTGTTGGTCCTTTACTAGATT
TAGAACAAGCCCTTTCTATAGCACCAATGGATCTATCTTTACCAACTGGAAATATAGCCA
TATCAAAGTCTTCCTCAGCATCTTCAAATGGAGACAAAGCGAGAGCATCATAGTGAAGAC
CGTCATAGATCAGCATAACCCTTTCGCTATAGTTTTTGGTCTGTCCATACAGGTCACATC
GACTAGTTTGAATATCATAAGCCGCAATCTCTCGACCATAATAGTCTGCTAATATCGAAA
GCTCAATCGCACCTCCCCACTTGTCTGGATTGAGAATCCAAGCACAATATTCTTCATTTT
GCTTCCCTAGAAATGCTTCGTTATACTTCTCCTTGTCGCTTGCAACTGCAGCAGCTATCA
CCTGTCTTAGCTCAGGAGCTTTCTTCTTGTCCTTGTCCATGACATAACCGATTGCGTTGA
AGAGACAACTGTTGTCAGATGATATAACTCTCCTCACAATGATTCCTTCCATGATAATAA
TCTCAAACTAGCAAGAAAACGCCGTTGGCGTTGGGGTCAAGAGAGAGAGAGAGAGATCTG
ATTCTGGAAAATTGAGAAATATAAAACAGATTGTTATGGTGGGGTGGTTGCCGTTTTTGC
TCAATAAATCTTTGCTTCGTTTCGTCTCGTTCC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 3

CO CL2245Contig1 704 3 1 U
GCTTCAAAGGCTATTTTTACTTATCATCTTCAAGTCCCAATATTTTGAGGCCATTACATT
GGTTTATTTCAAATTCAGTTCCACAAATTTTCAAAACACTCTCCATGTGAGGACATGTAT
TATTGAAACAAAGAAATAAACATCTTCTACGAGTGAGAACATAATAAAAAGGTCTGAAAT
GGATTTAACTTATCACATTTCAAGCGGCATGCGTCTTTGTTATTTTGGATTCAAGACCTT
TCATTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAACTCCACTTGAGCCGCCATTGTGTCCAG
CTTATAAAGTTGCAAGGTGTGGTTCGCAACTTCTTGCCCAAAGGTCCAACCAAAAACACC
TCCTCCTAAGAAGGACAATGCAGCACCATGCGGACTCCTAGAGTGTTTCCAGGCAAAAGC
GGCAGTAGATAGAGCTCCAAGTGCAGCTCCGGCAACACCAAAAGTCGCAGCTTCCCTGGC
GGTTTTAAGGGTGGGTCCATGAACGGGATCGGAAGCAATGAACTCCTCAACGTCGGATGA
AGACCAAGAAGGAAGAGGCGCCTCGCGTTTAGTGAACCTCGTGTAGTTCTCCAGGAACGA
CAACTTCTCCTCCCAGAACCCCTTGAATCCATCCGCAAACGACCTCGAGTCTCCCATCTT
TGATT*GATTCTTCGCACTCTTTTTTTTTCCTCTCCTCAGATCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BH39JQ U 1
AF RR2CX94JQ U 157
AF RR2BH39TF C 1
BS 1 704 RR2BH39JQ

RD RR2BH39JQ 704 0 0
GCTTCAAAGGCTATTTTTACTTATCATCTTCAAGTCCCAATATTTTGAGGCCATTACATT
GGTTTATTTCAAATTCAGTTCCACAAATTTTCAAAACACTCTCCATGTGAGGACATGTAT
TATTGAAACAAAGAAATAAACATCTTCTACGAGTGAGAACATAATAAAAAGGTCTGAAAT
GGATTTAACTTATCACATTTCAAGCGGCATGCGTCTTTGTTATTTTGGATTCAAGACCTT
TCATTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAACTCCACTTGAGCCGCCATTGTGTCCAG
CTTATAAAGTTGCAAGGTGTGGTTCGCAACTTCTTGCCCAAAGGTCCAACCAAAAACACC
TCCTCCTAAGAAGGACAATGCAGCACCATGCGGACTCCTAGAGTGTTTCCAGGCAAAAGC
GGCAGTAGATAGAGCTCCAAGTGCAGCTCCGGCAACACCAAAAGTCGCAGCTTCCCTGGC
GGTTTTAAGGGTGGGTCCATGAACGGGATCGGAAGCAATGAACTCCTCAACGTCGGATGA
AGACCAAGAAGGAAGAGGCGCCTCGCGTTTAGTGAACCTCGTGTAGTTCTCCAGGAACGA
CAACTTCTCCTCCCAGAACCCCTTGAATCCATCCGCAAACGACCTCGAGTCTCCCATCTT
TGATT*GATTCTTCGCACTCTTTTTTTTTCCTCTCCTCAGATCG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2CX94JQ 539 0 0
GAACATAATAAAAAGGTCTGAAATGGATTTAACTTATCACATTTCAAGCGGCATGCGTCT
TTGTTATTTTGGATTCAAGACCTTTCATTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAACTT
CACTCGAGACCCCATTGTGTCCAGCTTATAGAGTTGCAAGGTGTGGTTCGCAACTTCTTG
CCCAAAGGTCCAACCAAAAACACCTCCTCCTAAAAAGGACAATGCAGCACCATGCGGACT
CCTAGAGTATTTCCAGGCAAAAGCGGCAGTAGATACAGCTCCAAGTGCAGCTCCGGCAAC
ACCAAAAGTCGCAGCTTCCCTGGCGGTTTTAAGGGTGGGTCCATGAACGGGATCGGAAGC
TATGAACTCCTCAACGTCAGATGAAGACCAAGAAGGAAGAGGCGCCTCGCGTTTAGTGAA
CTTCGTGTAGTTCTCCAGGAACGACAACTTCTCCTCCCAGAACCCCTTGAATCCATCCGC
AAACGACCTCGATTCTCCCATCTTCGATTTGACTCTTCGCACT
TTTTCTTTTCTGTCCT

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2BH39TF 704 0 0
GCTTCAAAGGCTATTTTTACTTATCATCTTCAAGTCCCAATATTTTGAGGCCATTACATT
GGTTTATTTCAAATTCAGTTCCACAAATTTTCAAAACACTCTCCATGTGAGGACATGTAT
TATTGAAACAAAGAAATAAACATCTTCTACGAGTGAGAACATAATAAAAAGGTCTGAAAT
GGATTTAACTTATCACATTTCAAGCGGCATGCGTCTTTGTTATTTTGGATTCAAGACCTT
TCATTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAACTCCACTTGAGCCGCCATTGTGTCCAG
CTTATAAAGTTGCAAGGTGTGGTTCGCAACTTCTTGCCCAAAGGTCCAACCAAAAACACC
TCCTCCTAAGAAGGACAATGCAGCACCATGCGGACTCCTAGAGTGTTTCCAGGCAAAAGC
GGCAGTAGATAGAGCTCCAAGTGCAGCTCCGGCAACACCAAAAGTCGCAGCTTCCCTGGC
GGTTTTAAGGGTGGGTCCATGAACGGGATCGGAAGCAATGAACTCCTCAACGTCGGATGA
AGACCAAGAAGGAAGAGGCGCCTCGCGTTTAGTGAACCTCGTGTAGTTCTCCAGGAACGA
CAACTTCTCCTCCCAGAACCCCTTGAATCCATCCGCAAACGACCTCGAGTCTCCCATCTT
TGATT*GATTCTTCGCACTCTTTTTTTTTCCTCTCCTCAGATCG

QA 1 704 1 704
DS 



AS 2 4

CO CL2246Contig1 570 2 2 U
CATGTTTACTTCCTCTTTTCTTATGATTTCAATCATATCAACATCATATGGAATGGTTTG
ATGTATAGCAAGTTCAAGGATTACATCATTTAAAAAATAAACAACTCAAACGAGAGTAAT
CGATAGTAGACTGACAGGAAAATGTCAAATGAGTGTTTCCGGATCAAGCTTATTCGGGAT
CATCTGGAAAACAAAACAAAAAAACAAAAAACCTTAGGCTTTTGTAGCTCCTCCGGCTTT
GACAAGGTCTTCAAGAGACTTGAGAATCTGTGACTCGCTCATCCCATCCAAGTTTACACA
CCTCTCCACACCCATATCATATCGCGCCCACATCTGAGGCTGGATCCCACTGCATTCGCG
GATCAGGAAGGGAAACTTAGGGTTTAGAGACTTCAAATCTCTGTAATTCTTCTCCACGAA
CGTTCTGGCGGGAGCGCTAGCTGGGGAAGATTGACAGAAAAGGATCCTGAGCTCTTTGAG
AGACTTCGATACGTTTCCTCTCCACGCCATTGCTTCTTCTCTTCTTCTACAGTCGCGCAA
CACAGAATCAAAGACGAGACGGGACCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2A351TF C 1
AF RR2A351JQ U 22
BS 1 21 RR2A351TF
BS 22 570 RR2A351JQ

RD RR2A351TF 570 0 0
CATGTTTACTTCCTCTTTTCTTATGATTTCAATCATATCAACATCATATGGAATGGTTTG
ATGTATAGCAAGTTCAAGGATTACATCATTTAAAAAATAAACAACTCAAACGAGAGTAAT
CGATAGTAGACTGACAGGAAAATGTCAAATGAGTGTTTCCGGATCAAGCTTATTCGGGAT
CATCTGGAAAACAAAACAAAAAAACAAAAAACCTTAGGCTTTTGTAGCTCCTCCGGCTTT
GACAAGGTCTTCAAGAGACTTGAGAATCTGTGACTCGCTCATCCCATCCAAGTTTACACA
CCTCTCCACACCCATATCATATCGCGCCCACATCTGAGGCTGGATCCCACTGCATTCGCG
GATCAGGAAGGGAAACTTAGGGTTTAGAGACTTCAAATCTCTGTAATTCTTCTCCACGAA
CGTTCTGGCGGGAGCGCTAGCTGGGGAAGATTGACAGAGAAGGATCCTGAGCTCTTTGAG
AGACTTCGATACGTTTCCTCTCCACGCCATTGCTTCTTCTCTTCTTCTACAGTCGCGCAA
CACAGAATCAAAGACGAGACGGGACCT
CCC

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2A351JQ 549 0 0
TATGATTTCAATCATATCAACATCATATGGAATGGTTTGATGTATAGCAAGTTCAAGGAT
TACATCATTTAAAAAATAAACAACTCAAACGAGAGTAATCGATAGTAGACTGACAGGAAA
ATGTCAAATGAGTGTTTCCGGATCAAGCTTATTCGGGATCATCTGGAAAACAAAACAAAA
AAACAAAAAACCTTAGGCTTTTGTAGCTCCTCCGGCTTTGACAAGGTCTTCAAGAGACTT
GAGAATCTGTGACTCGCTCATCCCATCCAAGTTTACACACCTCTCCACACCCATATCATA
TCGCGCCCACATCTGAGGCTGGATCCCACTGCATTCGCGGATCAGGAAGGGAAACTTAGG
GTTTAGAGACTTCAAATCTCTGTAATTCTTCTCCACGAACGTTCTGGCGGGAGCGCTAGC
TGGGGAAGATTGACAGAAAAGGATCCTGAGCTCTTTGAGAGACTTCGATACGTTTCCTCT
CCACGCCATTGCTTCTTCTCTTCTTCTACAGTCGCGCAACACAGAATCAAAGACGAGACG
GGACCTCCC

QA 1 549 1 549
DS 



CO CL2246Contig2 617 2 1 U
GACCACAGCAGGTCCCGTCTCGTCTTTGATTCTGTGTTGCGCGACTGTAGAAGAAGAGAA
GAAGCAATGGCGTGGAGAGGAAACGTATCGAAGTCTCTCAAAGAGCTCAGGATCCTTCTC
TGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCTTCCGCCAGAACGTTCGTGGAGAAGAATTACAGAGAT
TTGAAGTCTCTAAACCCTAAGTTCCCCTTCCTGATCCGCGAATGCAGTGGGATCCAGCCT
CAGATGTGGGCACGATATGATATGGGTGTGGAGAGGTGTGTAAACTTGGATGGGATGAGC
GAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTTGAAGACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCC
TAAGGTTATTTGTTTTTGTTTTCCCAGATGATCCCGAATAAGCTTTAACCGGAAACACTC
ATTTGACATTTTCCTGTCAGTCTACTATCGATTACTCTCGTTTGAGTTGTTTATTTTTAA
ATGATGTAATCCTTGAACTTGCTATACATCAAACCATTCCATATGATGATGATATGATTG
AAATCATAAGAAAAGAGGAAGTAAACATAACAATTGTATGCCATTTAAAGCAATTAGTAT
GGGTACTGGTGATTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FM95TF U 1
AF RR2FM95JQ C 75
BS 1 617 RR2FM95TF

RD RR2FM95TF 617 0 0
GACCACAGCAGGTCCCGTCTCGTCTTTGATTCTGTGTTGCGCGACTGTAGAAGAAGAGAA
GAAGCAATGGCGTGGAGAGGAAACGTATCGAAGTCTCTCAAAGAGCTCAGGATCCTTCTC
TGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCTTCCGCCAGAACGTTCGTGGAGAAGAATTACAGAGAT
TTGAAGTCTCTAAACCCTAAGTTCCCCTTCCTGATCCGCGAATGCAGTGGGATCCAGCCT
CAGATGTGGGCACGATATGATATGGGTGTGGAGAGGTGTGTAAACTTGGATGGGATGAGC
GAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTTGAAGACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCC
TAAGGTTATTTGTTTTTGTTTTCCCAGATGATCCCGAATAAGCTTTAACCGGAAACACTC
ATTTGACATTTTCCTGTCAGTCTACTATCGATTACTCTCGTTTGAGTTGTTTATTTTTAA
ATGATGTAATCCTTGAACTTGCTATACATCAAACCATTCCATATGATGATGATATGATTG
AAATCATAAGAAAAGAGGAAGTAAACATAACAATTGTATGCCATTTAAAGCAATTAGTAT
GGGTACTGGTGATTTCT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2FM95JQ 543 0 0
GAGAGGAAACGTATCGAAGTCTCTCAAAGAGCTCAGGATCCTTTTCTGTCAATCTTCCCC
AGCTAGCGCTTCCGCCAGAACGTTCGTGGAGAAGAATTACAGAGATTTGAAGTCTCTAAA
CCCTAAGTTCCCCTTCCTGATCCGCGAATGCAGTGGGATCCAGCCTCAGATGTGGGCACG
ATATGATATGGGTGTGGAGAGGTGTGTAAACTTGGATGGGATGAGCGAGTCACAGATTCT
CAAGTCTCTTGAAGACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAGGTTATTTGTT
TTTGTTTTCCCAGATGATCCCGAATAAGCTTTAACCGGAAACACTCATTTGACATTTTCC
TGTCAGTCTACTATCGATTACTCTCGTTTGAGTTGTTTATTTTTAAATGATGTAATCCTT
GAACTTGCTATACATCAAACCATTCCATATGATGATGATATGATTGAAATCATAAGAAAA
GAGGAAGTAAACATAACAATTGTATGCCATTTAAAGCAATTAGTATGGGTACTGGTGATT
TCT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 4

CO CL2247Contig1 430 4 5 U
GGAGAAGAGAAGAAACATTTTCTAGGGTTCACGCAGACGCCGCTTGTCCTTTCCCTCTGT
GAGCAGCAACCGACGAAAATGGGTCATGACAACGTGTGGAACTCTCATCCGAAGAAGTAC
GGTCCTGGCTCACGCACCTGCCGTGTGTGTGGAAACTCCCACGGGCTGATCAGGAAGTAT
GGTCTCAACTGCTGCAGACAGTGTTTCCGCAGCAATGCCAAGGAGATTGGATTCATCAAG
TATCGTTAATGAAAGCACCAGTTCTCGATTGATGCTTATGATACACAAACATGATGGCGT
CAATAAATTGGCTCTGAAGCTTTTTTAGTTTTTTTTCATTTTTGTATCGAATAAGTTGGT
GGACAAGACCTATGTATTTTGTCTTAAAAGCTTATGTTTCAATGGAACAATGCTATATGA
TCAAAATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A491JQ C 24
AF RR2A491TF U 4
AF RR2GO47TF U 1
AF RR2GO47JQ C 26
BS 1 47 RR2GO47TF
BS 48 48 RR2A491TF
BS 49 78 RR2GO47TF
BS 79 79 RR2A491TF
BS 80 430 RR2GO47TF

RD RR2A491JQ 399 0 0
AG
GGTTCACGCAGACGCCGCTTGTCCTTTCC*TCTGTGAGCAGCAACCGACGAAAATGGGTC
ATGACAACGTGTGGAACTCTCATCCGAAGAAGTACGGTCCTGGCTCACGCACCTGCCGTG
TGTGTGGAAACTCCCACGGGCTGATCAGGAAGTATGGTCTCAACTGCTGCAGACAGTGTT
TCCGCAGCAATGCCAAGGAGATTGGATTCATCAAGTATCGTTAATGAAAGCACCAGTTCT
TGATTGATGCTTATGATACACAAACATGATGGCGTCAATAAATTGGCTCTGAAGCTTTTT
TAGTTTTTTTTCATTTTTGTATCGAATAAGTTGGTGGACAAGACCTATGTATTTTGTCTT
AAAAGCTTATGTTTCAATGGAACAATGCTATATGA
CC

QA 3 397 3 397
DS 

RD RR2A491TF 419 0 0
GTG
GAGAAGAAACATTTTCTAGGGTTCACGCAGACGCCGCTTGTCCTTTCC*TCTGTGAGCAG
CAACCGACGAAAATGGGTCATGACAACGTGTGGAACTCTCATCCGAAGAAGTACGGTCCT
GGCTCACGCACCTGCCGTGTGTGTGGAAACTCCCACGGGCTGATCAGGAAGTATGGTCTC
AACTGCTGCAGACAGTGTTTCCGCAGCAATGCCAAGGAGATTGGATTCATCAAGTATCGT
TAATGAAAGCACCAGTTCTTGATTGATGCTTATGATACACAAACATGATGGCGTCAATAA
ATTGGCTCTGAAGCTTTTTTAGTTTTTTTTCATTTTTGTATCGAATAAGTTGGTGGACAA
GACCTATGTATTTTGTCTTAAAAGCTTATGTTTCAATGGAACAATGCTATATGA
CC

QA 4 417 4 417
DS 

RD RR2GO47TF 430 0 0
GGAGAAGAGAAGAAACATTTTCTAGGGTTCACGCAGACGCCGCTTGTTCTTTCCCTCTGT
GAGCAGCAACCGACGAAA*TGGGTCATGACAACGTGTGGAACTCTCATCCGAAGAAGTAC
GGTCCTGGCTCACGCACCTGCCGTGTGTGTGGAAACTCCCACGGGCTGATCAGGAAGTAT
GGTCTCAACTGCTGCAGACAGTGTTTCCGCAGCAATGCCAAGGAGATTGGATTCATCAAG
TATCGTTAATGAAAGCACCAGTTCTCGATTGATGCTTATGATACACAAACATGATGGCGT
CAATAAATTGGCTCTGAAGCTTTTTTAGTTTTTTTTCATTTTTGTATCGAATAAGTTGGT
GGACAAGACCTATGTATTTTGTCTTAAAAGCTTATGTTTCAATGGAACAATGCTATATGA
TCAAAATACC

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2GO47JQ 405 0 0
GGTTCACGCAGACGCCGCTTGTTCTTTCCCTCTGTGAGCAGCAACCGACGAAA*TGGGTC
ATGACAACGTGTGGAACTCTCATCCGAAGAAGTACGGTCCTGGCTCACGCACCTGCCGTG
TGTGTGGAAACTCCCACGGGCTGATCAGGAAGTATGGTCTCAACTGCTGCAGACAGTGTT
TCCGCAGCAATGCCAAGGAGATTGGATTCATCAAGTATCGTTAATGAAAGCACCAGTTCT
CGATTGATGCTTATGATACACAAACATGATGGCGTCAATAAATTGGCTCTGAAGCTTTTT
TAGTTTTTTTTCATTTTTGTATCGAATAAGTTGGTGGACAAGACCTATGTATTTTGTCTT
AAAAGCTTATGTTTCAATGGAACAATGCTATATGATCAAAATACC

QA 1 405 1 405
DS 



AS 1 3

CO CL2248Contig1 1092 3 6 U
AAAAATATCATCCATACAGAAAGAACCATGTCATTAATAAAAAAGGAATGCGTAATGAGA
AAATCCGATAAGGCAAATTCTTGCTTCTGTTTTGTCTATCAAACTGTTGAATGTCCATCT
GATTGTGTTTCTGTTCGGACGTACGTCATGCTACGAGTGCTTGGGGCGGCTACGATGTTG
TTTCCCGTCTCAGCTGAATCGCGTTTCCATTGCATACTTCTGGCTCCTCCAGCTCTAACA
ATAGGACGACCTCTAAATGCACCACCAGGGATACCTCTTCGGTATGGTGAGGCTCTTGCG
TACCTTCCTGCTCGAGCCCATGACGCAGCCTCCTGTTGTTGTTGTTGCCCATTACTTCCT
TTCACAATCTTGAGAATCCGAAACATGAACGAGGTACCGTCAAGAAACAATGCATTATCT
GCAGCTTCTTTGCGCGTGAACTCAATATAAGCTGAACCACTTGGTTGCCCTGTCGCTGGA
TCTGTAACTATGACAGCTTTAAGCACTTCACCACAATTGTTAAAATGCCTTGAAAGGGTA
TCCCTGGTGGCACCAAAGTGAACATTGGCGACAAAAATTGTTCGAGAACTAGCATCTTCC
ACTGGTGATTTAACCTCATCCTGATGGCTTATAGTAGTTTGCTCAGCACGAGAACTACTA
AAGTATTCATCCATACTTTCCCCCAGATGATCCCACAACCAGGCCACAAAAAAATCACTA
TCATCTGCAAGAAATATCTTCAATTCGTTATTTGCTTCCTCTTTCCTTCTCCCGTTCTTA
AGCAATACTATCACATACTCCACTAGAATGTCATCAGTGTAATCTCCCATGTACTCTTTC
AATTTAACCTTCACTCTCTCTTTCAGCTTGGAGACTCCTTCCTCACTGAAATCACCATTG
AAGGTCCGATCGGCGCTTCCCATCTCCGCTGAAACTTCCTCTCCGGATGTTGGTGTGGGT
TCTTAGGGTTTTGGTTCTCTTTGTGTCGGGTGGGGAAATCGAAAGAGCACCCGCTCGATT
TCTGGTTAGATGGAACGGAACCAATATTAGAAATATTAATACATCAGAAATAAGAGAGAA
GGATTTCGCTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS46JQ U 1
AF RR2B482JQ U 1
AF RR2B482TF C 245
BS 1 25 RR2B482JQ
BS 26 26 RR2DS46JQ
BS 27 373 RR2B482JQ
BS 374 374 RR2DS46JQ
BS 375 651 RR2B482JQ
BS 652 1092 RR2B482TF

RD RR2DS46JQ 569 0 0
AAAAATATCATCCATACAGAAAGAACCATGTCATTAATAAAAAAGGAATGCGTAATGAGA
AAATCCGATAAGGCAAATTCTTGCTTCTGTTTTGTCTATCAAACTGTTGAATGTCCGTCT
GATTGTGTTTCTGTTCGGACGTACGTCATGCTACGAGTGCTTGGGGCGGCTACGATGTTG
TTTCCCGTCTCAGCTGAATCGCGTTTCCATTGCATACTTCTGGCTCCTCCAGCTCTAACA
ATAGGACGACCTCTAAATGCACCACCGGGGATACCTCTTCGGTATGGTGAGGCTCTTGCG
TACCTTCCTGCTCGAGCCCATGACGCAGCCTCCTGTTGTTGTTGTTGCCCATTACTTCCT
TTCACAATCTTGAGAATCCGAAACATGAACGAGGTACCGTCAAGAAACAATGCATTATCT
GCAGCTTCTTTGCGCGTGAACTCAATATAAGCTGAACCACTTGGTTGCCCTGTCGCTGGA
TCTGTAACTATGACAGCTTTAAGCACTTCACCACACTTGTTAAAATGCCTTGAAAGGGTA
TCCTTGGTGGCACCAAAGTGAACATTGGC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2B482JQ 651 0 0
AAAAATATCATCCATACAGAAAGAATCATGTCATTAATAAAAAAGGAATGCGTAATGAGA
AAATCCGATAAGGCAAATTCTTGCTTCTGTTTTGTCTATCAAACTGTTGAATGTCCATCT
GATTGTGTTTCTGTTCGGACGTACGTCATGCTACGAGTGCTTGGGGCGGCTACGATGTTG
TTTCCCGTCTCAGCTGAATCGCGTTTCCATTGCATACTTCTGGCTCCTCCAGCTCTAACA
ATAGGACGACCTCTAAATGCACCACCAGGGATACCTCTTCGGTATGGTGAGGCTCTTGCG
TACCTTCCTGCTCGAGCCCATGACGCAGCCTCCTGTTGTTGTTGTTGCCCATTACTTCCT
TTCACAATCTTGAAAATCCGAAACATGAACGAGGTACCGTCAAGAAACAATGCATTATCT
GCAGCTTCTTTGCGCGTGAACTCAATATAAGCTGAACCACTTGGTTGCCCTGTCGCTGGA
TCTGTAACTATGACAGCTTTAAGCACTTCACCACAATTGTTAAAATGCCTTGAAAGGGTA
TCCCTGGTGGCACCAAAGTGAACATTGGCGACAAAAATTGTTCGAGAACTAGCATCTTCC
ACTGGTGATTTAACCTCATCCTGATGGCTTATAGTAGTTTGCTCAGCACGA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2B482TF 848 0 0
GACGACCTCTAAATGCACCACCAGGGATACCTCTTCGGTATGGTGAGGCTCTTGCGTACT
T**CTGCTCGAGCCCATGACGCAGCCTCCTGTTGTTGTTGTTGCCCATTACTTCCTTTCA
CAATCTTGAGAATCCGAGACATGAACGAGGTACCGTCAAGAGACAATGCATTATCTGCAG
CTTCTTTGCGCGTGAACTCAATATAAGCTGAACCACTTGGTTGCCCTGTCGCTGGATCTG
TAACTATGACAGCTTTAAGCACTTCACCACAATTGTTAAAATGCCTTGAAAGGGTATCCC
TGGTGGCACCAAAGTGAACATTGGCGACAAAGATTGTTCGAGAACTAGCATCTTCCACTG
GTGATTTAACCTCATCCTGATGGCTTATAGTAGTTTGCTCAGCACGAGAACTACTAAAGT
ATTCATCCATACTTTCCCCCAGATGATCCCACAACCAGGCCACAAAAAAATCACTATCAT
CTGCAAGAAATATCTTCAATTCGTTATTTGCTTCCTCTTTCCTTCTCCCGTTCTTAAGCA
ATACTATCACATACTCCACTAGAATGTCATCAGTGTAATCTCCCATGTACTCTTTCAATT
TAACCTTCACTCTCTCTTTCAGCTTGGAGACTCCTTCCTCACTGAAATCACCATTGAAGG
TCCGATCGGCGCTTCCCATCTCCGCTGAAACTTCCTCTCCGGATGTTGGTGTGGGTTCTT
AGGGTTTTGGTTCTCTTTGTGTCGGGTGGGGAAATCGAAAGAGCACCCGCTCGATTTCTG
GTTAGATGGAACGGAACCAATATTAGAAATATTAATACATCAGAAATAAGAGAGAAGGAT
TTCGCTCC

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 4

CO CL2249Contig1 1102 4 17 U
GGAGAAAGAAACCAAGATCTCTGTTTCCGACACATTATCGTGACAAAAGATGTCGTCAGG
ATCCGACAAAGAGAGAGAGACATTCGTCTACACGGCGAAGCTCTCCGAACAAGCCGAGCG
ATACGACGAGATGGTTGAGACGATGAAGAAAGTGGCGAAAGTGGACAGCGAGCTGACGGT
GGAGGAGAGGAATCTGTTGTCCGTTGGGTACAAGAACGTGATCGGAGCAAGAAGGGCCTC
GTGGAGGATCATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAGACGAACGT
GAAACACATCAAGGGTTATCGTCAAAAGGTGGAAGATGAGCTCGCTGACATCTGTAAAGA
CATTCTTTCCATCATTGATGAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGTGAAGCCACTGT
TTTCTATTACAAGATGAAAGGAGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACTGAGCA
AGAGAGGAAGGAAGCTTCTGAACAGTCTCTTAAAGGCTATGGGGCTGCAACACAAGCTGC
AAGCACTGACCTTCCTTCGACCCACCCGATTCGTCTTGGTCTTGCTCTTAACTTCTCTGT
TTTCTACTATGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGCCTT
CGATGAGGCGATCGCAGAGTTGGATACTCTAAGCGAGGAGTCGTACAAGGACAGCACTTT
GATCATGCAGCTCCTGAGAGACAATCTCACCCTCTGGACTTCTGATCTTCCTGAAGATGG
AGGAGAAGACAACGTCAAGTCGTCTGATGAACCCAATCAAGAACATTGCAAGATCATAGA
AGCCACTGATAAATGATCAGAGGCTTTGGAAGTTGAATGAGTTTAGATTAAACTCCATAT
AGCTTGGTTTCATCAAAGAGATGGGATCAGAGATAACCGAATTTAAATTTTCTTTATTTT
TAATTACCTTTTTTTTTCTTTCTTTTGCTGTCAATCTCGTGATATCAAATATGTTTTCTG
TTACGCATTTTTATATTATGCCTTGATCTGTGATATGTTTTGACTATTTATAATACACAA
AGCAATGCAACTGTATTATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT19TF U 3
AF RR2CH22TF U 1
AF RR2AS73TF U 8
AF RR2AS73JQ C 242
BS 1 90 RR2CH22TF
BS 91 91 RR2GT19TF
BS 92 361 RR2CH22TF
BS 362 362 RR2GT19TF
BS 363 521 RR2CH22TF
BS 522 522 RR2AS73TF
BS 523 667 RR2CH22TF
BS 668 668 RR2AS73TF
BS 669 677 RR2CH22TF
BS 678 678 RR2GT19TF
BS 679 709 RR2CH22TF
BS 710 710 RR2AS73TF
BS 711 743 RR2CH22TF
BS 744 744 RR2AS73TF
BS 745 771 RR2CH22TF
BS 772 822 RR2AS73TF
BS 823 1102 RR2AS73JQ

RD RR2GT19TF 691 0 0
GGAAAGA
AACCAAGATCTCTGTTTCCGACACATTATCGTGACAAAAGATGTCGTCAGGATCCGACAA
AGAGAGAGAGACATTCGTCTACACGGCGAAGCTCTCCGAACAAGCCGAGCGATACGACGA
GATGGTTGAGACGATGAAGAAAGTGGCGAAAGTGGACAGCGAGCTGACGGTGGAGGAGAG
GAATCTGTTGTCCGTTGGGTACAAGAACGTGATCGGAGCAAGAAGGGCCTCGTGGAGGAT
AATGTCGTCGATTGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAGACAAACGTGAAACACAT
CAAGGGTTATCGTCAAAAGGTGGAAGATGAGCTCGCTGACATCTGTAAAGACATTCTTTC
CATCATTGATGAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGTGAAGCCACTGTTTTCTATTA
CAAGATGAAAGGAGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACTGAGCAAGAGAGGAA
GGAAGCTTCTGAACAGTCTCTTAAAGGCTATGAGGCTGCAACACAAGCTGCAAGCACTGA
CCTTCCTTCGACCCACCCGATTCGTCTTGGTCTTGCGCTTAACTTCTCTGTTTTCTACTA
TGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGCCTTCGATGAG*C
GATCGCAGAGTTGGATACTCTAAG

QA 8 691 8 691
DS 

RD RR2CH22TF 771 0 0
GGAGAAAGAAACCAAGATCTCTGTTTCCGACACATTATCGTGACAAAAGATGTCGTCAGG
ATCCGACAAAGAGAGAGAGACATTCGTCTATACGGCGAAGCTCTCCGAACAAGCCGAGCG
ATACGACGAGATGGTTGAGACGATGAAGAAAGTGGCGAAAGTGGACAGCGAGCTGACGGT
GGAGGAGAGGAATCTGTTGTCCGTTGGGTACAAGAACGTGATCGGAGCAAGAAGGGCCTC
GTGGAGGATCATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAGACGAACGT
GAAACACATCAAGGGTTATCGTCAAAAGGTGGAAGATGAGCTCGCTGACATCTGTAAAGA
CGTTCTTTCCATCATTGATGAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGTGAAGCCACTGT
TTTCTATTACAAGATGAAAGGAGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACTGAGCA
AGAGAGGAAGGAAGCTTCTGAACAGTCTCTTAAAGGCTATGAGGCTGCAACACAAGCTGC
AAGCACTGACCTTCCTTCGACCCACCCGATTCGTCTTGGTCTTGCTCTTAACTTCTCTGT
TTTCTACTATGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGCCTT
CGATGAG*CGATCGCAGGGTTGGATACTCTAAGCGAGGAGTCGTACAAG*ACAGCACTTT
GATCATGCAGCTCCTGAGAGACA*TCTCACCCTCTGGACTTCTGATCTTCC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2AS73TF 815 0 0
GG
AACCAAGATCTCTGTTTCCGACACATTATCGTGACAAAAGATGTCGTCAGGATCCGACAA
AGAGAGAGAGACATTCGTCTACACGGCGAAGCTCTCCGAACAAGCCGAGCGATACGACGA
GATGGTTGAGACGATGAAGAAAGTGGCGAAAGTGGACAGCGAGCTGACGGTGGAGGAGAG
GAATCTGTTGTCCGTTGGGTACAAGAACGTGATCGGAGCAAGAAGGGCCTCGTGGAGGAT
CATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAGACGAACGTGAAACACAT
CAAGGGTTATCGTCAAAAGGTGGAAGATGAGCTCGCTGACATCTGTAAAGACATTCTTTC
CATCATTGATGAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGTGAAGCCACTGTTTTCTATTA
CAAGATGAAAGGAGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACTGAGCAAGAGAGGAA
GGAAGCTTCTGAACAGTCTCTTAAAGGCTATGGGGCTGCAACACAAGCTGCAAGCACTGA
CCTTCCTTCGACCCACCCGATTCGTCTTGGTCTTGCTCTTAACTTCTCTGTTTTCTACTA
TGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGCCTTCGATGAGGC
GATCGCAGAGTTGGATACTCTAAGCGAGGAGTCGTACAAGGACAGCACTTTGATCATGCA
GCTCCTGAGAGACAATCTCACCCTCTGGACTTCTGATCTTCCTGAAGATGGAGGAGAAGA
CAACGTCAAGTCGTCTGATGAACCCAATCAAGA

QA 3 815 3 815
DS 

RD RR2AS73JQ 861 0 0
TGGAGGATCATGTCGTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAGACGAACGTG
AAACACATCAAGGGTTATCGTCAAAAGGTGGAAGATGAGCTCGCTGACATCTGTAAAGAC
ATTCTTTCCATCATTGATGAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGTGAAGCCACTGTT
TTCTATTACAAGATGAAAGGAGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACTGAGCAA
GAGAGGAAGGAAGCTTCTGAACAGTCTCTTAAAGGCTATGGGGCTGCAACACAAGCTGCA
AGCACTGACCTTCCTTCGACCCACCCGATTCGTCTTGGTCTTGCTCTTAACTTCTCTGTT
TTCTACTATGAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGCCTTC
GATGAGGCGATCGCAGAGTTGGATACTCTAAGCGAGGAGTCGTACAAGGACAGCACTTTG
ATCATGCAGCTCCTGAGAGACAATCTCACCCTCTGGACTTCTGATCTTCCTGAAGATGGA
GGAGAAGACAACGTCAAGTCGTCTGATGAACCCAATCAAGAACATTGCAAGATCATAGAA
GCCACTGATAAATGATCAGAGGCTTTGGAAGTTGAATGAGTTTAGATTAAACTCCATATA
GCTTGGTTTCATCAAAGAGATGGGATCAGAGATAACCGAATTTAAATTTTCTTTATTTTT
AATTACCTTTTTTTTTCTTTCTTTTGCTGTCAATCTCGTGATATCAAATATGTTTTCTGT
TACGCATTTTTATATTATGCCTTGATCTGTGATATGTTTTGACTATTTATAATACACAAA
GCAATGCAACTGTATTATTAG

QA 1 861 1 861
DS 



AS 1 3

CO CL2250Contig1 690 3 4 U
AAAACGAACCGAATAGTGTGTTACTCGAAATGTAGAAAGTTTTATTACAAAGCATTATTA
GCCACAAGGAGGCCAAGTTTACGAACAAAGTATAAATTGTCTACACACACCATCAACACA
CGAAATATAGGGACCTCTTATTACTTACGCTTTTTATTCAAACAAACTAATAAAAACTCA
GTTTAAGCGTAGCACAACAATTCACCATATAAACAGGCCAGACTCAAATCCAAATATCGG
AAGTGCAGTCTCCACCTGGATACCTCATCTCATGGGCAAGCGCAGGACCCTCTGGTTCAT
CACCAAAGTCCACAAAGAGATCAGGGTTTATGGAGAGACCACCTTTCTCTGTATCAACAT
CAAGCTGTATTATGTGTGATCCTTTCTCCATGAGTTCCGGGTAAAACTGACGATCCCATG
CACTATAGAGCGAGTTTGTTGCATACAATCGTTTCCCATCGAGGCTCAGCTGGATCATTT
GAGGTCCTCCTCTTAGAGATTTCCCCTTGATCTGAGGAACATCATATTGGAAAGTGTTAC
CGTCTTCTCCAACCGCCTTAACAGGACTGCCCTTTTGTAGTAATCCTCCCACCCATATTT
GTCCGGTTAAGACAGGGTTTTTAGGGTCTTCAATGTTGTACTGACGAATGTCTCCATGAA
GCCAGTTCACAAAGTGGAGGAACCGGTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E551JQ U 1
AF RR2E551TF C 154
AF RR2GX36JQ U 23
BS 1 106 RR2E551JQ
BS 107 107 RR2GX36JQ
BS 108 571 RR2E551JQ
BS 572 690 RR2GX36JQ

RD RR2E551JQ 571 0 0
AAAACGAACCGAATAGTGTGTTACTCGAAATGTAGAAAGTTTTATTACAAAGCATTATTA
GCCACAAGGAGGCCAAGTTTACGAACAAAGTATAAATTGTCTACACGCACCATCAACACA
CGAAATATAGGGACCTCTTATTACTTACGCTTTTTATTCAAACAAACTAATAAAAACTCA
GTTTAAGCGTAGCACAACAATTCACCATATAAACAGGCCAGACTCAAATCCAAATATCGG
AAGTGCAGTCTCCACCTGGATACCTCATCTCATGGGCAAGCGCAGGACCCTCTGGTTCAT
CACCAAAGTCCACAAAGAGATCAGGGTTTATGGAGAGACCACCTTTCTCTGTATCAACAT
CAAGCTGTATTATGTGTGATCCTTTCTCCATGAGTTCCGGGTAAAACTGACGATCCCATG
CACTATAGAGCGAGTTTGTTGCATACAATCGTTTCCCATCGAGGCTCAGCTGGATCATTT
GAGGTCCTCCTCTTAGAGATTTCCCCTTGATCTGAGGAACATCATATTGGAAAGTGTTAC
CGTCTTCTCCAACCGCCTTAACAGGACTGCC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2E551TF 444 0 0
TTATTCAAACAAACTAATAAAAACTCAGTTTAAGCGTAGCACAACAATTCACCATATAAA
CAGGCCAGACTCAAATCCAAATATCGGAAGTGCAGTCTCCACCTGGATACCTCATCTCAT
GGGCAAGCGCAGGACCCTCTGGTTCATCACCAAAGTCCACAAAGAGATCAGGGTTTATGG
AGAGACCACCTTTCTCTGTATCAACATCAAGCTGTATTATGTGTGATCCTTTCTCCATGA
GTTCCGGGTAAAACTGACGATCCCATGCACTATAGAGCGAGTTTGTTGCATACAATCGTT
TCCCATCGAGGCTCAGCTGGATCATTTGAGGTCCTCCTCTTAGAGATTTCCCCTTGATCT
GAGGAACATCATATTGGAAAGTGTTACCGTCTTCTCCAACCGCCTTAACAGGACTGCCCT
TTTGTAGTAATCCTCCCACCCAT
C

QA 1 443 1 443
DS 

RD RR2GX36JQ 668 0 0
ACTCGAAATGTAGAAAGTTTTATTACAAAGCATTATTAGCCACAAGGAGGCCAAGTTTAC
GAACAAAGTATAAATTGTCTACACACACCATCAACACACGAAATATAGGGACCTCTTATT
ACTTACGCTTTTTATTCAAACAAACTAATAAAAACTCAGTTTAAGCGTAGCACAACAATT
CACCATATAAACAGGCCAGACTCAAATCCAAATATCGGAAGTGCAGTCTCCACCTGGATA
CCTCATCTCATGGGCAAGCGCAGGACCCTCTGGTTCATCACCAAAGTCCACAAAGAGATC
AGGGTTTATGGAGAGACCACCTTTCTCTGTATCAACATCAAGCTGTATTATGTGTGATCC
TTTCTCCATGAGTTCCGGGTAAAACTGACGATCCCATGCACTATAGAGCGAGTTTGTTGC
ATACAATCGTTTCCCATCGAGGCTCAGCTGGATCATTTGAGGTCCTCCTCTTAGAGATTT
CCCCTTGATCTGAGGAACATCATATTGGAAAGTGTTACCGTCTTCTCCAACCGCCTTAAC
AGGACTGCCCTTTTGTAGTAATCCTCCCACCCATATTTGTCCGGTTAAGACAGGGTTTTT
AGGGTCTTCAATGTTGTACTGACGAATGTCTCCATGAAGCCAGTTCACAAAGTGGAGGAA
CCGGTCAT

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL2251Contig1 1228 2 2 U
GGGTCGTCCTCCGAACCAAGCAAACTCCGATCCCTCATTAAAATCCTCTCTCAGCCACCG
TGGCTCCGGATATCTTACGACGGTTGTTCCCAGCTCGGACCCGAAGACCCGCCCCGATTA
TCCCTTTCACCCGGCTGGAAATGAACCTTTTCCGGTTCTGCTTCGGTCTGAAAGTCCTCG
GCTACTTCATGATCCTTCTCGTCCTCGCCTTCGTCGCCGTATCTTACTACGCCGTCGTCG
TCAACACATGGTGGCCGATCTTAATCGAAACCGACCATAGAGCTCTCTCTGCTCTCGCCT
GCTTAATCATCTTGGTCTTCCACTTCTTGTTGATAATGCTGTTGTGGAGCTACTTCACTG
TAGTGTTTACGGACCCAGGTTCTGTTCCTGAGCATTTCAGAAGAGAGCTTGGTGGTGATA
GTTTGGAGGCTGGTGCTTCGACAGAACAAGGAGCTTTTGGTTACTGTCCGAAATGTCGGA
ATGTTAAGCCGCCTCGTTGCCATCATTGTTCTGTCTGTAAGGTCAAAGATGTGTTCTCAA
GATGGATCATCACTGTGTTTGGATTGTTAACTGTGTTGGAGCGCGTAACTACAAGTTCTT
CCTTCTCTTTCTGTTGTATACGTTTCTCGAGACATTGTTGGATGTTGCAGTCTTGCTTCC
TAGTTTCATTGAATTCTTCAGCCAAGCTATCAAGCATTCCCCTTCGCCGGGTCAACTAGC
ATCCCTAGTTCTGGCTTTCGTTCTTAACTTAGCGTTCGTTTTCAGCCTTCTCTGTTTCGT
AGTCATGCATCTCTCTCTTATCTCAACAAACACTACTTCAGTCGAGGTTCATGAGAAGAA
CGGAGATGTCAGATGGAAATATGACTTGGGAAAGAAGAAAAACTTCGAGCAGGTTTTTGG
GAAGAAGAAGGCGTTTTGGCTTCTCCCGTTGTACTCTAAAGACGATCTCAATAACATAAC
TTCACTTCAAGGGCTTGAGTTTCCAACTCATTCAGACATCGACCCTTGATTCAAACAACA
ATCAATCAACTAAACATGGTTAAGATTTCCCTCCAATGTAGATGGCCCTTCTCAAACCAC
ATTACATTTGTTGTAATATTTAAAAAGATATGATTCATTTGTTACTATATGTTCTTTCAG
CTTATCTGATATAGTGATATTGAGAACCAGTGATTAATTGTTGTACAAGTAAACTAATCA
CAGATGATATCTATGAGCAATCTCCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL78TF U 1
AF RR2EL78JQ C 540
BS 1 705 RR2EL78TF
BS 706 1228 RR2EL78JQ

RD RR2EL78TF 705 0 0
GGGTCGTCCTCCGAACCAAGCAAACTCCGATCCCTCATTAAAATCCTCTCTCAGCCACCG
TGGCTCCGGATATCTTACGACGGTTGTTCCCAGCTCGGACCCGAAGACCCGCCCCGATTA
TCCCTTTCACCCGGCTGGAAATGAACCTTTTCCGGTTCTGCTTCGGTCTGAAAGTCCTCG
GCTACTTCATGATCCTTCTCGTCCTCGCCTTCGTCGCCGTATCTTACTACGCCGTCGTCG
TCAACACATGGTGGCCGATCTTAATCGAAACCGACCATAGAGCTCTCTCTGCTCTCGCCT
GCTTAATCATCTTGGTCTTCCACTTCTTGTTGATAATGCTGTTGTGGAGCTACTTCACTG
TAGTGTTTACGGACCCAGGTTCTGTTCCTGAGCATTTCAGAAGAGAGCTTGGTGGTGATA
GTTTGGAGGCTGGTGCTTCGACAGAACAAGGAGCTTTTGGTTACTGTCCGAAATGTCGGA
ATGTTAAGCCGCCTCGTTGCCATCATTGTTCTGTCTGTAAGGTCAAAGATGTGTTCTCAA
GATGGATCATCACTGTGTTTGGATTGTTAACTGTGTTGGAGCGCGTAACTACAAGTTCTT
CCTTCTCTTTCTGTTGTATACGTTTCTCGAGACATTGTTGGATGTTGCAGTCTTGCTTCC
TAGTTTCATTGAATTCTTCAGCCAAGCTATCAAGCATTCCCCTTC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2EL78JQ 689 0 0
AGATGGATCATCACTGTGTTTGGATTGTTAACTGTGTTGGAGCGCGTAACTACAAGTTCT
TCCTTCTCTTTCTGTTGTATACGTTTCTCGAGACATTGTTGGATGTTGCAGTCTTGCTTC
CTAGTTTCATTGAATTCTTCAGCCAAGCTATCAAGCATTCCCCTTCGCCGGGTCAACTAG
CATCCCTAGTTCTGGCTTTCGTTCTTAACTTAGCGTTCGTTTTCAGCCTTCTCTGTTTCG
TAGTCATGCATCTCTCTCTTATCTCAACAAACACTACTTCAGTCGAGGTTCATGAGAAGA
ACGGAGATGTCAGATGGAAATATGACTTGGGAAAGAAGAAAAACTTCGAGCAGGTTTTTG
GGAAGAAGAAGGCGTTTTGGCTTCTCCCGTTGTACTCTAAAGACGATCTCAATAACATAA
CTTCACTTCAAGGGCTTGAGTTTCCAACTCATTCAGACATCGACCCTTGATTCAAACAAC
AATCAATCAACTAAACATGGTTAAGATTTCCCTCCAATGTAGATGGCCCTTCTCAAACCA
CATTACATTTGTTGTAATATTTAAAAAGATATGATTCATTTGTTACTATATGTTCTTTCA
GCTTATCTGATATAGTGATATTGAGAACCAGTGATTAATTGTTGTACAAGTAAACTAATC
ACAGATGATATCTATGAGCAATCTCCACC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 3

CO CL2252Contig1 1367 3 16 U
GGGAAGCGGTGGGAGATCGATCTTCCCCTATTTCATCTCTGCTCCTCCTCCTCTTACGTA
ACCCTAACGAAGTCGGAGTTTCGCCATTGAAATCGACGGAGAAAGAGGCGGGTGATTACT
AGATAGAAAGAGAGAGAGAAGAAGGGAGTAATGGATCTGGATCAATGGATTTCGAAGGTT
AAGGAGGGTCAGCATCTCTCCGAGGAAGAGCTTCAGCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAG
ATTCTGATAGAGGAGTCAAACGTGCAGCCTGTCAACAGTCCAGTCACCGTCTGTGGTGAT
ATCCATGGCCAGTTTCATGATCTCATGAAGCTTTTCCAGACCGGTGGTCATGTTCCCCAC
ACCAATTACATATTCATGGGGGACTTTGTGGATAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTCTTC
ACTATTCTTCTGCTTCTTAAAGCTAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAAAT
CATGAAAGTAGGCAGCTAACTCAGGTATATGGTTTCTATGACGAGTGCCAAAGGAAGTAT
GGTAACGCCAACGCCTGGCGATATTGCACAGATGTTTTTGACTATCTTACCCTATCAGCT
ATTATAGATGGCACAGTTCTATGTGTTCATGGTGGCCTTTCCCCGGATGTCCGGACAATT
GATCAGATAAGACTGGTCGATAGAAATTGTGAAATTCCCCATGAAGGGCCCTTCTGCGAT
CTTATGTGGAGCGATCCCGAAGATATTGAAACATGGGCTGTTAGTCCACGTGGAGCTGGC
TGGCTTTTCGGATCCAGGGTTACTACTGAGTTCAATCACATCAACAAACTTGAGCTAGTG
TGCCGTGCTCACCAACTGGTACAAGAAGGTCTTAAGTACATGTTCCAAGATAAAGGCCTT
GTAACTGTATGGTCTGCACCTAATTACTGCTACCGCTGTGGCAATGTCGCCTCTATATTG
AGTTTCGATGAGAACATGGAAAGGGATGTGAAGTACTTCAACGAGACAGAAGAGAACAAT
CAAATGAGAGGGCCAAGGACTGGAGTTCCGTATTTCCTGTGATGAAACGACGATTATAGT
TGGACGTGATGATGCTGATGATGAAGCCATTGCTACCATTGGCAATATGGTCAGGTCTCA
AAAAGGTTATTATGTAGATATAATACTTATCTACTGATGGGTTTCACTTATTATTGTACT
TGCATTATTTTTGTCCCAACATTTTCCTTGTGAAATTCAACAATTCGAGACTTTATAGTT
TTAAGTCCATTCTTTTTCTTTTTTGTTTTCCCCGATTGTTTCTTCTGTATTGTTTACTTA
CAAAGTTGCACTGTTTCCTCCTTTAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D913TF U 1
AF RR2D913JQ C 581
AF RR2AV65TF U 702
BS 1 707 RR2D913TF
BS 708 708 RR2AV65TF
BS 709 722 RR2D913TF
BS 723 723 RR2AV65TF
BS 724 740 RR2D913TF
BS 741 741 RR2AV65TF
BS 742 746 RR2D913TF
BS 747 747 RR2AV65TF
BS 748 787 RR2D913TF
BS 788 788 RR2AV65TF
BS 789 794 RR2D913TF
BS 795 795 RR2AV65TF
BS 796 811 RR2D913TF
BS 812 1176 RR2AV65TF
BS 1177 1177 RR2D913JQ
BS 1178 1367 RR2AV65TF

RD RR2D913TF 825 0 0
GGGAAGCGGTGGGAGATCGATCTTCCCCTATTTCATCTCTGCTCCTCCTCCTCTTACGTA
ACCCTAACGAAGTCGGAGTTTCGCCATTGAAATCGACGGAGAAAGAGGCGGGTGATTACT
AGATAGAAAGAGAGAGAGAAGAAGGGAGTAATGGATCTGGATCAATGGATTTCGAAGGTT
AAGGAGGGTCAGCATCTCTCCGAGGAAGAGCTTCAGCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAG
ATTCTGATAGAGGAGTCAAACGTGCAGCCTGTCAACAGTCCAGTCACCGTCTGTGGTGAT
ATCCATGGCCAGTTTCATGATCTCATGAAGCTTTTCCAGACCGGTGGTCATGTTCCCCAC
ACCAATTACATATTCATGGGGGACTTTGTGGATAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTCTTC
ACTATTCTTCTGCTTCTTAAAGCTAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAAAT
CATGAAAGTAGGCAGCTAACTCAGGTATATGGTTTCTATGACGAGTGCCAAAGGAAGTAT
GGTAACGCCAACGCCTGGCGATATTGCACAGATGTTTTTGACTATCTTACCCTATCAGCT
ATTATAGATGGCACAGTTCTATGTGTTCATGGTGGCCTTTCCCCGGATGTCCGGACAATT
GATCAGATAAGACTGGTCGATAGAAATTGTGAAATTCCCCATGAAGG*CCCTTCTGCGAT
CT*ATGTGGAGCGATCCCGA*GATAT*GAAACATGGGCTGTTAGTCCACGTGGAGCTGGC
TGGCTTT*CGGATC*AGGGTTACTACTGAGT
CATCACATCAACAA

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2D913JQ 688 0 0
ACTATCTTACCCTATCAGCTATTATAGATGGCACAGTTCTATGTGTTCATGGTGGCCTTT
CCCCGGATGTCCGGACAATTGATCAGATAAGACTGGTCGATAGAAATTGTGAAATTCCCC
ATGAAGGGCCCTTCTGCGATCTTATGTGGAGCGATCCCGAAGATATTGAAACATGGGCTG
TTAGTCCACGTGGAGCTGGCTGGCTTTTCGGATCCAGGGTTACTACTGAGTTCAATCACA
TCAACAAACTTGAGCTAGTGTGCCGTGCTCACCAACTGGTACAAGAAGGTCTTAAGTACA
TGTTCCAAGATAAAGGCCTTGTAACTGTATGGTCTGCACCTAATTACTGCTACCGCTGTG
GCAATGTCGCTTCTATATTGAGTTTCGATGAGAACATGGAAAGGGATGTGAAGTACTTCA
ACGAGACAGAAGAGAACAATCAAATGAGAGGGCCAAGGACTGGAGTTCCGTATTTCCTGT
GATGAAACGACGATTATAGTTGGACGTGATGATGCTGATGATGAAGCCATTGCTATCATT
GGCAGTATGGTCAGGTCTCAAAAAGGTTATTATGTAGATATAATACTTATCTACTGATGG
GTTTCACTTATTATTGTACTTGCATTATTTTTGTCCCAACATTTTCCTTGTGAAATTCAA
CAATTCGAGACTTTATAGTTTTAAGTCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2AV65TF 666 0 0
GGAAG
GGCCCTTTTGCGATCTTATGTGGAGCGATCCCGAAGATATTGAAACATGGGCTGTTAGTC
CACGTGGAGCTGGCTGGCTTTTCGGATCCAGGGTTACTACTGAGTTCAATCACATCAACA
AACTTGAGCTAGTGTGCCGTGCTCACCAACTGGTACAAGAAGGTCTTAAGTACATGTTCC
AAGATAAAGGCCTTGTAACTGTATGGTCTGCACCTAATTACTGCTACCGCTGTGGCAATG
TCGCCTCTATATTGAGTTTCGATGAGAACATGGAAAGGGATGTGAAGTACTTCAACGAGA
CAGAAGAGAACAATCAAATGAGAGGGCCAAGGACTGGAGTTCCGTATTTCCTGTGATGAA
ACGACGATTATAGTTGGACGTGATGATGCTGATGATGAAGCCATTGCTACCATTGGCAAT
ATGGTCAGGTCTCAAAAAGGTTATTATGTAGATATAATACTTATCTACTGTTGGGTTTCA
CTTATTATTGTACTTGCATTATTTTTGTCCCAACATTTTCCTTGTGAAATTCAACAATTC
GAGACTTTATAGTTTTAAGTCCATTCTTTTTCTTTTTTGTTTTCCCCGATTGTTTCTTCT
GTATTGTTTACTTACAAAGTTGCACTGTTTCCTCCTTTAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT
T

QA 6 666 6 666
DS 



AS 1 2

CO CL2253Contig1 1151 2 2 U
AGACTTTCTTTACGAGATTATTAGGGGAAGGAAGCAAAGTTTCGCAGGAAATCTAGAAGC
AATCAATCAAGATCTCCGGAAAGAATCTCCGTCTTGTTTCGCCAGATTCTCTCTCAGGTA
AGAAGTTGAATTGAGTGGATTAGATTGAATATGAGACCCGTACTCGCCTGCTAATGTCAC
TGTTTCGGATCTTCATTAATCAGGACGACGACGATATGGCAACATCGAAGAAAGTGATAA
CGCGTGAAGAGTGGGAGAAGAAGCTAAACGCTGTAAAGCTTAGGAAAGAAGACATGAACA
CTCTCGTCATGAACTTTCTCGTCACTGAGGGTTATGTTGAAGCTGCTGACAAGTTCCAAA
GGGAGTCTGGCACCAAACCAGAGATAGATCTTGCAACCATCACTGATCGAATGGCTGTTA
AAAAGGCTGTTCAAAACGGCAATGTCGAGGATGCTATTGAAAAAGTTAATGACTTGAATC
CTGAGATACTAGGCACAAACCCCGAGCCCTTCTTTCATCTTCAGCAGCAAAGGTTGATTG
AGCTTATCCGACAAGGCAAGACTGAAGAAGCCTTGGAGTTTGCTCAGGAGGAACTTGCTC
CACGTGGCGAAGAAAACCAAGCGTTTCTGCAAGAACTGGAAATTGTAGCGCTGCTTGTTT
TTGAAGATGCCTCTAACTGTCCTGTTAAAGATCTTCTTGACATCTCCCACCGTCTTAAGA
CAGCAAGTGAAGTGAACGCAGCAATTCTTACTAGCCAGAGTCATGAGAAAGATCCGAAAC
TTCCAAGCTTGTTGAAGATGCTGGTTTGGGCTCAGAACCAGCTGGATGAGAAAGCAGTGT
ATCCGCACATCAATGATTTGTCTACCGCCCAGCTCCAAGACCCGTTTGAATAATTTTGTA
CCTGCTAAAGGGAACAACAATCAAATGATATGCCCTCTCTCCCATTTCAATTTCAATAAG
TCAAGGTTCATTATGTTTTAGCGAATGCTTTTTTCTTTCCCTTTTTTTTTTGCATTGGAT
GGAGTTGTTTAGGATATGTGCAAGGGAACATAAAGCTGTTTCTAGTCAAATGTTGTGATT
GTCAACATATCCCATGACTCACTGCATGGTGCCCCTTTGATTTGAATGAAGTTATTCGCT
CGTTTTGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT34TF U 1
AF RR2FT34JQ C 448
BS 1 730 RR2FT34TF
BS 731 1151 RR2FT34JQ

RD RR2FT34TF 730 0 0
AGACTTTCTTTACGAGATTATTAGGGGAAGGAAGCAAAGTTTCGCAGGAAATCTAGAAGC
AATCAATCAAGATCTCCGGAAAGAATCTCCGTCTTGTTTCGCCAGATTCTCTCTCAGGTA
AGAAGTTGAATTGAGTGGATTAGATTGAATATGAGACCCGTACTCGCCTGCTAATGTCAC
TGTTTCGGATCTTCATTAATCAGGACGACGACGATATGGCAACATCGAAGAAAGTGATAA
CGCGTGAAGAGTGGGAGAAGAAGCTAAACGCTGTAAAGCTTAGGAAAGAAGACATGAACA
CTCTCGTCATGAACTTTCTCGTCACTGAGGGTTATGTTGAAGCTGCTGACAAGTTCCAAA
GGGAGTCTGGCACCAAACCAGAGATAGATCTTGCAACCATCACTGATCGAATGGCTGTTA
AAAAGGCTGTTCAAAACGGCAATGTCGAGGATGCTATTGAAAAAGTTAATGACTTGAATC
CTGAGATACTAGGCACAAACCCCGAGCCCTTCTTTCATCTTCAGCAGCAAAGGTTGATTG
AGCTTATCCGACAAGGCAAGACTGAAGAAGCCTTGGAGTTTGCTCAGGAGGAACTTGCTC
CACGTGGCGAAGAAAACCAAGCGTTTCTGCAAGAACTGGAAATTGTAGCGCTGCTTGTTT
TTGAAGATGCCTCTAACTGTCCTGTTAAAGATCTTCTTGACATCTCCCACCGTCTTAAGA
CAGCAAGTGA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2FT34JQ 704 0 0
AGGATGCTATTGAAAAAGTTAATGACTTGAATCCTGAGATACTAGGCACAAACCCCGAGC
CCTTCTTTCATCTTCAGCAGCAAAGGTTGATTGAGCTTATCCGACAAGGCAAGACTGAAG
AAGCCTTGGAGTTTGCTCAGGAGGAACTTGCTCCACGTGGCGAAGAAAACCAAGCGTTTC
TGCAAGAACTGGAAATTGTAGCGCTGCTTGTTTTTGAAGATGCCTCTAACTGTCCTGTTA
AAGATCTTCTTGACATCTCCCACCGTCTTAAGACAGCAAGTGAAGTGAACGCAGCAATTC
TTACTAGCCAGAGTCATGAGAAAGATCCGAAACTTCCAAGCTTGTTGAAGATGCTGGTTT
GGGCTCAGAACCAGCTGGATGAGAAAGCAGTGTATCCGCACATCAATGATTTGTCTACCG
CCCAGCTCCAAGACCCGTTTGAATAATTTTGTACCTGCTAAAGGGAACAACAATCAAATG
ATATGCCCTCTCTCCCATTTCAATTTCAATAAGTCAAGGTTCATTATGTTTTAGCGAATG
CTTTTTTCTTTCCCTTTTTTTTTTGCATTGGATGGAGTTGTTTAGGATATGTGCAAGGGA
ACATAAAGCTGTTTCTAGTCAAATGTTGTGATTGTCAACATATCCCATGACTCACTGCAT
GGTGCCCCTTTGATTTGAATGAAGTTATTCGCTCGTTTTGATCT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 4

CO CL2254Contig1 1066 4 21 U
GTGGTTCTTCTCCGTTTAATCTAACGGCCATGTCAACTACAACCATCGCCCCTCTCCGTC
GTAGTTCTAACTCTCTCAACGGATATCACACCAACGCCGTTGCCTTTGACGGAACCGTCG
AGTCAGTAAGTACTAGCCAAATGGAGGACATTGTTGCAGCAACCGACGACGGCTACGCCA
ACCCCAACAACGGAGACAGAGAAAGAAGCAAGGTGTCGTTTATGAAGTGGAGGATGTGCA
ATCCTGTCCACGTGGTGAGAGTCCATTGGGTACCGTGTTTGTTAGCGGTAGGAGTTCTGT
TCTTCACGGGGGTGGAGGAGTACATGCTCCAGATGATTCCCCCGAGTTCCGAGCCGTTCG
ATATTGGTTTTGTGGCCACGCGCTCTCTGTATCGCCTCTTGGCTTCTTCACCTGATCTAA
ATACCGTTCTAGCCGCTCTAAACACGGTGTTCGTAGGGATGCAAACGACATATATTGTAT
GGACATGGTTGATGGAAGGACGACCAAGAGCGACCATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTT
GTCGTGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTTCCTCAGGATTTTCTAGGATCAG
GGGTAGATTTTCCGGTAGGAAACGTCTCGTTCTTCCTCTTCTACTCAGGCCATGTCTCAG
GGTCGACGATAGCATCCTTGGACATGAGGAGAATGAAGAGGTTGAGACTAGCCTTGCTTT
TTGACATCCTCAATGTATTACAATCGATCAGGCTTCTCGGGACGAGAGGACAATACACGA
TCGATCTTGCTGTCGGAGTTGGCGCTGGGGTTCTCTTTGACTCACTGGCTGGAAAATACG
AAGAGATGATGAGCAAGAGACACAATGTAGGCAATAGTTCTAGTTTGATTTCGGATCGCT
AGTTATTAATTTTTTTTTCTAAAAGTTTTTAGCCTGGACATATTTAATGTAGTTGAAATC
TAATTTGTTAAATTTACTTTCTTTCAGATTGCTCTAATTAAATGGTGACCTAACTAAATG
TGTACGTTATTGTGAAGTTACCATAGAGGTTTCATATTGTCTTTAG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CN87TF U 2
AF RR2F247TF U 1
AF RR2F247JQ C 196
AF RR2CN87JQ C 350
BS 1 17 RR2F247TF
BS 18 18 RR2CN87TF
BS 19 159 RR2F247TF
BS 160 160 RR2CN87TF
BS 161 164 RR2F247TF
BS 165 165 RR2CN87TF
BS 166 188 RR2F247TF
BS 189 191 RR2CN87TF
BS 192 370 RR2F247TF
BS 371 371 RR2CN87TF
BS 372 505 RR2F247TF
BS 506 506 RR2CN87TF
BS 507 647 RR2F247TF
BS 648 648 RR2F247JQ
BS 649 697 RR2F247TF
BS 698 872 RR2F247JQ
BS 873 873 RR2CN87JQ
BS 874 917 RR2F247JQ
BS 918 918 RR2CN87JQ
BS 919 985 RR2F247JQ
BS 986 1066 RR2CN87JQ

RD RR2CN87TF 597 0 0
G
GGTTCTTCTCCGTTTAATCTAACGGCCATGTCAACTACAACCATCGCCCCTCTCCGTCGT
AGTTCTAACTCTCTCAACGGATATCACACCAACGCCGTTGCCTTTGACGGAACCGTCGAG
TCAGTAAGTACTAGCCAAATGGAGGACATTGTTGCAGCAACCGACGACGGCTACGCCAAC
CCCAACAACGGAGACAGAGGAAGAAGCAAGGTGTCGTTTATGACGTGGAGGATGTGCAAC
CCTGTCCACGTGGTGAGAGTCCATTGGGTACCGTGTTTGTTAGCGGTAGGAGTTCTGTTC
TTCACGGGAGTAGAGGAGTACATGCTCCAGATGATTCCGCCGAGTTCTGAGCCGTTCGAT
ATTGGTTTTGTGGCCACGCGCTCTCTGTATCGCCTCTTGGCTTCTTCACCTGATCTAAAT
ACCGTTCTAGCCGCTCTAAACACGGTGTTCGTAGGGATGCAAACGACATATATTGTATGG
ACATGGTTGATGGAAGGACGACCAAGAGCGACCATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTTGT
CGTGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTTCCTCACGATTTTCTAGGATC

QA 2 597 2 597
DS 

RD RR2F247TF 697 0 0
GTGGTTCTTCTCCGTTTCATCTAACGGCCATGTCAACTACAACCATCGCCCCTCTCCGTC
GTAGTTCTAACTCTCTCAACGGATATCACACCAACGCCGTTGCCTTTGACGGAACCGTCG
AGTCAGTAAGTACTAGCCAAATGGAGGACATTGTTGCAGTAACCTACGACGGCTACGCCA
ACCCCAAC***GGAGACAGAGAAAGAAGCAAGGTGTCGTTTATGAAGTGGAGGATGTGCA
ATCCTGTCCACGTGGTGAGAGTCCATTGGGTACCGTGTTTGTTAGCGGTAGGAGTTCTGT
TCTTCACGGGGGTGGAGGAGTACATGCTCCAGATGATTCCCCCGAGTTCCGAGCCGTTCG
ATATTGGTTT*GTGGCCACGCGCTCTCTGTATCGCCTCTTGGCTTCTTCACCTGATCTAA
ATACCGTTCTAGCCGCTCTAAACACGGTGTTCGTAGGGATGCAAACGACATATATTGTAT
GGACATGGTTGATGGAAGGACGACCGAGAGCGACCATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTT
GTCGTGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTTCCTCAGGATTTTCTAGGATCAG
GGGTAGATTTTCCGGTAGGAAACGTCTCGTTCTTCCTCTTCTACTCACGCCATGTCTCAG
GGTCGACGATAGCATCCTTGGACATGAGGAGAATGAA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2F247JQ 790 0 0
ACAGAGAAAGAAGCAAGGTGTCGTTTATGAAGTGGAGGATGTGCAATCCTGTCCACGTGG
TGAGAGTCCATTGGGTACCGTGTTTGTTAGCGGTAGGAGTTCTGTTCTTCACGGGGGTGG
AGGAGTACATGCTCCAGATGATTCCCCCGAGTTCCGAGCCGTTCGATATTGGTTT*GTGG
CCACGCGCTCTCTGTATCGCCTCTTGGCTTCTTCACCTGATCTAAATACCGTTCTAGCCG
CTCTAAACACGGTGTTCGTAGGGATGCAAACGACATATATTGTATGGACATGGTTGATGG
AAGGACGACCGAGAGCGACCATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTTGTCGTGGCATTCTTG
GTTACTCTACTCAGCTCCCTCTTCCTCAGGATTTTCTAGGATCAGGGGTAGATTTTCCGG
TAGGAAACGTCTCGTTCTTCCTCTTCTACTCAGGCCATGTCTCAGGGTCGACGATAGCAT
CCTTGGACATGAGGAGAATGAAGAGGTTGAGACTAGCCTTGCTTTTTGACATCCTCAATG
TATTACAATCGATCAGGCTTCTCGGGACGAGAGGACAATACACGATCGATCTTGCTGTCG
GAGTTGGCGCTGGGGTTCTCTTTGACTCACTGGCTGGAAAATACGAAGAGATGATGAGCA
AGAGACACAATGTAGGCTATAGTTCTAGTTTGATTTCGGATCGCTAGTTATTAATTTTTT
TT*CTAAAAGTTTTTAGCCTGGACATATTTAATGTAGTTGAAATCTAATTTGTTAAATTT
ACTTTCTTTC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2CN87JQ 717 0 0
T
GAGCCGTTCGATATTGGTTTTGTGGCCACGCGCTCTCTGTATCGCCTCTTGGCTTCTTCA
CCTGATCTAAATACCGTTCTAGCCGCTCTAAACACGGTGTTCGTAGGGATGCAAACGACA
TATATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGACGACCAAGAGCGACCATCTCGGCTTGCTTC
ATGTTTACTTGTCGTGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTTCCTCAGGATTTT
CTAGGATCAGGGGTAGATTTTCCTGTAGGAAACGTCTCGTTCTTCCTCTTCTACTCAGGC
CATGTCGCAGGGTCGACGATAGCATCCTTGGACATGAGGAGAATGAAGAGGTTGAGACTA
GCCTTGCTTTTTGACATCCTTAATGTATTACAATCGATCAGGCTTCTCGGGACGAGAGGA
CAATACACGATCGATCTTGCTGTCGGAGTTGGCGCTGGGGTTCTCTTTGACTCACTGGCT
GGAAAATACGAAGAGATGATGAGCAAGAGACACAATGTAGGCAATAGTTCTAGTTTGATT
TCGGCTCGCTAGTTATTAATTTTTTTTTCTAAAAGTTTTTAGTCTGGACATATTTAATGT
AGTTGAAATCTAATTTGTTAAATTTACTTTCTTTCAGATTGCTCTAATTAAATGGTGACC
TAACTAAATGTGTACGTTATTGTGAAGTTACCATAGAGGTTTCATATTGTCTTTAG

QA 2 717 2 717
DS 



AS 1 4

CO CL2255Contig1 576 4 6 U
GGGAGTTCGAGAAGACAGAGAGAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCGGT**
***TGAAACCGGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCAAGAGGATTACCGTCGCTCG
CAAGAGCTCCTTCCTCCTTCAAAATCGTCGCTAGTGGCGTTAAGAAGATCAAGACCGACA
AACCCTTCGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCGACGCCTCCGGCAGAA
AGGGCAAGGGATACGGTGTTTACAAATTCGTCGACAAGTACGGAGCTAACGTTGATGGAT
ACAGTCCTATCTACAACGAGGACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAG
TCACCGGATTGGCAATCTGGGCGGTGACACTCGCCGGAATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTC
TTGTGTACAACACAAGTGCTCTAGCTCAGTAAATCTATAAGATATGTGTGTAACTCATGT
TTCTCTAAATGCTTTTGTGTTATTGTTCTCTTAATGTTGTTGAAAAACTCATAACATACT
TTGAATCTATAAGAATTCTAGCTAGTTTTTGTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2DO63TF U 1
AF RR2DO63JQ C 1
AF RR2DG10TF U 7
AF RR2EG72TF U 48
BS 1 8 RR2DO63JQ
BS 9 359 RR2DO63TF
BS 360 360 RR2DG10TF
BS 361 369 RR2DO63TF
BS 370 572 RR2DG10TF
BS 573 576 RR2EG72TF

RD RR2DO63TF 370 0 0
GGGAGTTC
GAGAAGACAGAGAGAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCGGT*****TGAAA
CCGGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCAAGAGGATTACCGTCGCTCGCAAGAGCT
CCTTCCTCCTTCAAAATCGTCGCTAGTGGCGTTAAGAAGATCAAGACCGACAAACCCTTC
GGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCGACGCCTCCGGCAGAAAGGGCAAG
GGATACGGTGTTTACAAATTCGTCGACAAGTACGGAGCTAACGTTGATGGATACAGTCCT
ATCTACAACGAGGACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGA*TCACCGGA
T
G

QA 9 369 9 369
DS 

RD RR2DO63JQ 574 0 0
GGGAGTTCGAGAAGACAGAGAGAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCGGT**
***TGAAACCGGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCAAGAGGATTACCGTCGCTCG
CAAGAGCTCCTTCCTCCTTCAAAATCGTCGCTAGTGGCGTTAAGAAGATCAAGACCGACA
AACCCTTCGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCGACGCCTCCGGCAGAA
AGGGCAAGGGATACGGTGTTTACAAATTCGTCGACAAGTACGGAGCTAACGTTGATGGAT
ACAGTCCTATCTACAACGAGGACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAG
TCACCGGATTGGCAATCTGGGCGGTGACACTCGCCGGAATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTC
TTGTGTACAACACAAGTGCTCTAGCTCAGTAAATCTATAAGATATGTGTGTAACTCATGT
TTCTCTAAATGCTTTTGTGTTATTGTTCTCTTAATGTTGTTGAAAAACTCATAACATACT
TTGAATCTATAAGAATTCTAGCTAGTTTTTGT
AT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2DG10TF 566 0 0
GG
GAGAAGACAGAGAGAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCGGTGACGTTGAAA
CCGGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCAAGAGGATTACCGTCGCTCGCAAGAGCT
CCTTCCTCCTTCAAAATCGTCGCTAGTGGCGTTAAGAAGATCAAGACCGACAAACCCTTC
GGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCGACGCCTCCGGCAGAAAGGGCAAG
GGATACGGTGTTTACAAATTCGTCGACAAGTACGGAGCTAACGTTGATGGATACAGTCCT
ATCTACAACGAGGACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTCACCGGA
TTGGCAATCTGGGCGGTGACACTCGCCGGAATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTAC
AACACAAGTGCTCTAGCTCAGTAAATCTATAAGATATGTGTGTAACTCATGTTTCTCTAA
ATGCTTTTGTGTTATTGTTCTCTTAATGTTGTTGAAAAACTCATAACATACTTTGAATCT
ATAAGAATTCTAGCTAGTTTTTGT

QA 3 566 3 566
DS 

RD RR2EG72TF 529 0 0
CTTTCATCGGTGAC
GTTGAAACCGGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCAAGAGGATTACCGTCGCTCGC
AAGAGCTCCTTCCTCCTTCAAAATCGTCGCTAGTGGCGTTAAGAAGATCAAGACCGACAA
ACCCTTCGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCGACGCCTCCGGCAGAAA
GGGCAAGGGATACGGTGTTTACAAATTCGTCGACAAGTACGGAGCTAACGTTGATGGATA
CAGTCCTATCTACAACGAGGACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAGGGGAGGAGT
CACCGGATTGGCAATCTGGGCGGTGACACTCGCCGGAATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTCT
TGTGTACAACACAAGTGCTCTAGCTCAGTAAATCTATAAGATATGTGTGTAACTCATGTT
TCTCTAAATGCTTTTGTGTTATTGTTCTCTTAATGTTGTTGAAAAACTCATAACATACTT
TGAATCTATAAGAATTCTAGCTAGTTTTTGTATAC

QA 15 529 15 529
DS 



AS 1 4

CO CL2256Contig1 994 4 12 U
GGCAATTCAATCTGTCAAAAAAGGAGCTGCACAAGAAGGCATGACCATAAGAGATTATAT
CTGGCGTGGTCATGATCCTACTTCTGTTGCTGTTATGACTGAGGACGGCGCTGCAGTGAC
AGGTTTGGCAATTGCTGCGGCATCTCTTGTTGCTGTCAAAATGACAGGAAATCCTATTTA
TGATCCTATAGGATCTATTGTTGTTGGAAATTTACTTGGAATGGTGGCTATATTCCTCAT
TCAACGGAACCGACATGCCTTGATTGGAAGAGCAATGGATGATCAAGACATGCGTAAAGT
TCTTCATTTTCTAAAGAACGACTCGGCTGTAGATGCTTTATATGATTGCAAAAGTGAAGT
GATTGGCCCTGGATCCTTCAGATTCAAGGCTGAAATAGATTTCAACGGGCAGGTCGTTGT
CCAAAACTATCTGAAGAGAACTGGGCGTGAAGAGTGGGCGAAACAGTTTCGCGAGGCTGC
AAAGAGAGGGGATGATTCTGCAATGCTCAATGTTATGTCTAACTATGGTGAGGAGGTTGT
AACGGCTTTAGGAAGCGAAGTAGACCGGTTAGAGAAAGAGATCCAAGAGCTTGTCCCTGG
AATCCAGCACGTTGACATCGAAGCACACAATCCCATAGACCAATCTCTACTATGATCTGA
AACTTTTCAGACAAGGTCTGAGTTATCGATACATTCCTCTTGGCCTCAAGAAATGGAAGC
CACGACAGGTCTGGCACTCTTGGAGAAATAGGAAAAGAGTGTTGTATCAGGTTTCTGCTT
TGGAAATATGTGCTGATGAATTCTTCTCTGTCTGTTTTGATGTTAGAAACAAACTCCCAT
GAGTGTTGACTTTAAAAATTCTATGCACAACAAAATGCTTGTTGTAGTTCAGATCTCCAT
TGTATTTTTAGAATTTGAATTTGAAGTGAAAAAACTGAAATGAGGTTGGAGGTGCTCTGA
TGAGTTGAAACGGCGTGTTAGAAAAGTTGGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP42TF U 1
AF RR2DL26TF U 96
AF RR2DL26JQ C 220
AF RR2CP42JQ C 312
BS 1 600 RR2CP42TF
BS 601 601 RR2DL26TF
BS 602 607 RR2CP42TF
BS 608 609 RR2DL26TF
BS 610 640 RR2CP42TF
BS 641 641 RR2DL26TF
BS 642 652 RR2CP42TF
BS 653 728 RR2DL26TF
BS 729 729 RR2DL26JQ
BS 730 746 RR2DL26TF
BS 747 885 RR2DL26JQ
BS 886 994 RR2CP42JQ

RD RR2CP42TF 652 0 0
GGCAATTCAATCTGTCAAAAAAGGAGCTGCACAAGAAGGCATGACCATAAGAGATTATAT
CTGGCGTGGTCATGATCCTACTTCTGTTGCTGTTATGACTGAGGACGGCGCTGCAGTGAC
AGGTTTGGCAATTGCTGCGGCATCTCTTGTTGCTGTCAAAATGACAGGAAATCCTATTTA
TGATCCTATAGGATCTATTGTTGTTGGAAATTTACTTGGAATGGTGGCTATATTCCTCAT
TCAACGGAACCGACATGCCTTGATTGGAAGAGCAATGGATGATCAAGACATGCGTAAAGT
TCTTCATTTTCTAAAGAACGACTCGGCTGTAGATGCTTTATATGATTGCAAAAGTGAAGT
GATTGGCCCTGGATCCTTCAGATTCAAGGCTGAAATAGATTTCAACGGGCAGGTCGTTGT
CCAAAACTATCTGAAGAGAACTGGGCGTGAAGAGTGGGCGAAACAGTTTCGCGAGGCTGC
AAAGAGAGGGGATGATTCTGCAATGCTCAATGTTATGTCTAACTATGGTGAGGAGGTTGT
AACGGCTTTAGGAAGCGAAGTAGACCGGTTAGAGAAAGAGATCCAAGAGCTTGTCCCTGG
GATCCAGTGCGTTGACATCGAAGCACACAATCCCATAGAC*AATCTCTACTA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2DL26TF 651 0 0
G
GACTGAGGACGGCGCTGCAGTGACAGGTTTGGCAATTGCTGCGGCATCTCTTGTTGCTGT
CAAAATGACAGGAAATCCTATTTATGATCCTATAGGATCTATTGTTGTTGGAAATTTACT
TGGAATGGTGGCTATATTCCTCATTCAACGGAACCGACATGCCTTGATTGGAAGAGCAAT
GGATGATCAAGACATGCGTAAAGTTCTTCATTTTCTAAAGAACGACTCGGCTGTAGATGC
TTTATATGATTGCAAAAGTGAAGTGATTGGCCCTGGATCCTTCAGATTCAAGGCTGAAAT
AGATTTCAACGGGCAGGTCGTTGTCCAAAACTATCTGAAGAGAACTGGGCGTGAAGAGTG
GGCGAAACAGTTTCGCGAGGCTGCAAAGAGAGGGGATGATTCTGCAATGCTCAATGTTAT
GTCTAACTATGGTGAGGAGGTTGTAACGGCTTTAGGAAGCGAAGTAGACCGGTTAGAGAA
AGAGATCCAAGAGCTTGTCCCTGGAATCCAGCACGTTGACATCGAAGCACACAATCCCAT
AGACCAATCTCTACTATGATCTGAAACTTTTCAGACAAGGTCTGAGTTATCGATACATTC
CTCTTGGCCTCAAGAAATGGAAGCCACGACAG*TCTGGCACTCTTGGAGA

QA 2 651 2 651
DS 

RD RR2DL26JQ 666 0 0
AATGGTGGCTATATTCCTCATTCAACGGAACCGACATGCCTTGATTGGAAGAGCAATGGA
TGATCAAGACATGCGTAAAGTTCTTCATTTTCTAAAGAACGACTCGGCTGTAGATGCTTT
ATATGATTGCAAAAGTGAAGTGATTGGCCCTGGATCCTTCAGATTCAAGGCTGAAATAGA
TTTCAACGGGCAGGTCGTTGTCCAAAACTATCTGAAGAGAACTGGGCGTGAAGAGTGGGC
GAAACAGTTTCGCGAGGCTGCAAAGAGAGGGGATGATTCTGCAATGCTCAATGTTATGTC
TAACTATGGTGAGGAGGTTGTAACGGCTTTAGGAAGCGAAGTAGACCGGTTAGAGAAAGA
GATCCAAGAGCTTGTCCCTGGAATCCAGCACGTTGACATCGAAGCACACAATCCCATAGA
CCAATCTCTACTATGATCTGAAACTTTTCAGACAAGGTCTGAGTTATCGATACATTCCTC
TTGGCCTCAAGAAATGGAAGCCACGACAGGTCTGGCACTCTTGGAGAAATAGGAAAAGAG
TGTTGTATCAGGTTTCTGCTTTGGAAATATGTGCTGATGAATTCTTCTCTGTCTGTTTTG
ATGTTAGAAACAAACTCCCATGAGTGTTGACTTTAAAAATTCTATGCACAACAAAATGCT
TGTTGT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2CP42JQ 683 0 0
TAAAGAACGACTCGGCTGTAGATGCTTTATATGATTGCAAAAGTGAAGTGATTGGCCCTG
GATCCTTCAGATTCAAGGCTGAAATAGATTTCAACGGGCAGGTCGTTGTCCAAAACTATC
TGAAGAGAACTGGGCGTGAAGAGTGGGCGAAACAGTTTCGCGAGGCTGCAAAGAGAGGGG
ATGATTCTGCAATGCTCAATGTTATGTCTAACTATGGTGAGGAGGTTGTAACGGCTTTAG
GAAGCGAAGTAGACCGGTTAGAGAAAGAGATCCAAGAGCTTGTCCCTGGAATCCAGTGCG
TTGACATCGAAGCACACAATCCCATAGACCAATCTCTACTATGTTCTGAAACTTTTCAGA
CAAGGTCTGAGTTATCGATACATTCCTCTTGGCCTCAAGAAATGGAAGCCACGACAGGTC
TGGCACTCTTGGAGAAATAGGAAAAGAGTGTTGTATCAGGTTTCTGCTTTGGAAATATGT
GCTGATGAATTCTTCTCTGTCTGTTTTGATGTTAGAAACAAACTCTCATGAGTGTTGACT
TTAAAAATTCTATGCACAACAAAATGCTTGTTGTAGTTCAGATCTCCATTGTATTTTTAG
AATTTGAATTTGAAGTGAAAAAACTGAAATGAGGTTGGAGGTGCTCTGATGAGTTGAAAC
GGCGTGTTAGAAAAGTTGGTGTT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

CO CL2257Contig1 1087 4 11 U
GGACATGACTCGATCATCTCCTCCTCCTTCTTCCCGTTAAACACAAACCAAAAAATCCCG
AAACTTTGTTCCCATTCTCTTCTCTCTTTTGATTAGATCGATCCCCAGTTAGAAGATTTC
TTAAAGGCTTGAGGGAGGAAGCGAGTTGAATTTTGATTAATGTCTTTGGTATCTGGAGCT
GTATCTGGTTCCAGGGACATGGACAACAAGAAGAATGAAGGCACAGACGACGAGGGTGTT
GGATCCGTGGGGAGACAGATGAGCGAGTCTTCTCTTAGCGCTGCCGAGGAAGAAGAAGAC
GACGATTCCAAATTACATTTGGGCCCTCAGTACACTATCAAGGAGCATCTCGAGAAGGAC
AAAGATGATGAGAGTCTGAGGAAATGGAAGGAACAGCTTCTTGGAAGTGTTGACGTCACC
AACATTGGAGAGACACTTGACCCTGAAGTGAGGATCATTAGCCTGGCTATCTTATCCCCT
GGAAGACCAGACATTGTTCTTATGGTACCTGAGAATGGGAATCCAAAGGGGATGTGGTTT
ACTTTGAAAGAAGGGGAGCAAGTACTGTTTGAAATTCACATTTCAGGTAAACAACAACAT
CGTCTCTGGTCTTAGGTACACCAATACTGTTTGGAAGACTGGTGTTAAAGTGGACAGAGG
AAAGGAAATGCTTGGAACCTTTAGTCCTCAGTTAGAGCCATACAACCACGTGATGCCTGA
AGAGACCACTCCTTCCGGCATGTTTGCTAGAGGATCATATTTTGCAAGAACTAAGTTTCT
TGATGATGATAACAAGTGCTACTTGGAGATCAACTACAGCTTTGACATCCGTAAAGAATG
GCCTGCTGTTTGAAATGAAACTCAAAGAACAAATTCTCCTGAGATGAAGTCTTGTCAGTA
GAAAGTTTATGTTTGTTCCACTCCCCATCTCTCTCTTTTTTTTTTTTGCCTTTCACGTGA
AACATTTTATTGTGAATCGTGCTAGAACAAGAACGACAGATAGTTCCTTCCTCTTTGATC
TTGATTTTATTAATGCCGTTTGGTGGGAATCAGTATGTGTGGTTTGTTCTCAAAGTATGT
TTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH57TF U 66
AF RR2CD41TF U 1
AF RR2GN46TF U 66
AF RR2GH57JQB C 609
BS 1 231 RR2CD41TF
BS 232 232 RR2GH57TF
BS 233 558 RR2CD41TF
BS 559 559 RR2GN46TF
BS 560 615 RR2CD41TF
BS 616 616 RR2GN46TF
BS 617 662 RR2CD41TF
BS 663 735 RR2GN46TF
BS 736 736 RR2GH57JQB
BS 737 748 RR2GN46TF
BS 749 1087 RR2GH57JQB

RD RR2GH57TF 494 0 0
GG
GTTCCCATTCTCTTCTCTCTTTTGATTAGATCGATCCCCAGTTAGAAGATTTCTTAAAGG
CTTGAGGGAGGAAGCGAGTTGAATTTTGATTAATGTCTTTGGTATCTGGAGCTGTATCTG
GTTCCAGGGACATGGACAACAAGAAGAATGAAGGCACAGACGACGAGGGTGTTGGATCCG
TGGGGAGACAGATGAGCGAGTCTTCTCTTAGCGCTGCCGAGGAAGAAGAAGACGACGATT
CCAAATTACATTTGGGCCCTCAGTACACTATCAAGGAGCATCTCGAGAAGGACAAAGATG
ATGAGAGTCTGAGGAAACGGAAGGAACAGCTTCTTGGAAGTGTTGACGTCACCAACATTG
GAGAGACACTTGACCCTGAAGTGAGGATCATTAGCCTGGCTATCTTATCCCCTGGAAGAC
CAGACATTGTTCTTATGGTACCTGAGAATGGGAATCCAAAGGGGATGTGGTTTACTTTGA
AAGAAGGG
AGTA

QA 3 490 3 490
DS 

RD RR2CD41TF 662 0 0
GGACATGACTCGATCATCTCCTCCTCCTTCTTCCCGTTAAACACAAACCAAAAAATCCCG
AAACTTTGTTCCCATTCTCTTCTCTCTTTTGATTAGATCGATCCCCAGTTAGAAGATTTC
TTAAAGGCTTGAGGGAGGAAGCGAGTTGAATTTTGATTAATGTCTTTGGTATCTGGAGCT
GTATCTGGTTCCAGGGACATGGACAACAAGAAGAATGAAGGCACAGACGACTAGGGTGTT
GGATCCGTGGGGAGACAGATGAGCGAGTCTTCTCTTAGCGCTGCCGAGGAAGAAGAAGAC
GACGATTCCAAATTACATTTGGGCCCTCAGTACACTATCAAGGAGCATCTCGAGAAGGAC
AAAGATGATGAGAGTCTGAGGAAATGGAAGGAACAGCTTCTTGGAAGTGTTGACGTCACC
AACATTGGAGAGACACTTGACCCTGAAGTGAGGATCATTAGCCTGGCTATCTTATCCCCT
GGAAGACCAGACATTGTTCTTATGGTACCTGAGAATGGGAATCCAAAGGGGATGTGGTTT
ACTTTGAAAGAAGGGGAGTAAGTACTGTTTGAAATTCACATTTCAGGTAAACAACAACAT
CGTCTCTGGTCTTAG*TACACCAATACTGTTTGGAAGACTGGTGTTAAAGTGGACAGAGG
AA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2GN46TF 685 0 0
GG
GTTCCCATTCTCTTCTCTCTTTTGATTAGATCGATCCCCAATTAGAAGATTTCTTAAAGA
CTTGAGGGAGGAAGCGAGTTGAATTT*GATTAATGTCTTTGGTATCTGGAGCTGTATCTG
GTTCCAGGGACATGGACAACAAGAAGAACGAAGGCACGGACGACGAGGGCGTTGGATCCG
TGGGGAGACAGATGAGCGAGTCTTCTCTTAGCGCTGCCGAGGAAGAAGAAGACGACGATT
CCAAATTACATTTGGGCCCTCAGTACACTATCAAGGAGCATCTCGAGAAGGACAAAGATG
ATGAGAGTCTGAGGAAATGGAAGGAACAGCTTCTTGGAAGTGTTGACGTCACCAACATTG
GAGAGACACTTGACCCTGAAGTGAGGATCATTAGCCTGGCCATCTTATCCCCTGGAAGAC
CAGACATTGTTCTTATGGTACCTGAGAATGGGAATCCAAAGGGGATGTGGTTTACTTTGA
AAGAAGGG*AGCAAGTACTGTTTGAAATTCACATTTCAGGTTAACAACAACATTGTCTCT
GGTCTTAGGTACACCAATACTGTTTGGAAGACTGGTGTTAAAGTGGACAGAGGAAAGGAA
ATGCTTGGAACCTTTAGTCCTCAGTTAGAGCCATACAACCACGTGATGCCTGAAGAGACC
ACTCCTTCTGGCATGTTTGCT
CG

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2GH57JQB 479 0 0
GTCTTAGGTACACCAATACTGTTTGGAAGACTGGTGTTAAAGTGGACAGAGGAAAGGAAA
TGCTTGGAACCTTTAGTCCTCAGTTGGAGCCATACAACCACGTGATGCCTGAAGAGACCA
CTCCTTCCGGCATGTTTGCTAGAGGATCATATTTTGCAAGAACTAAGTTTCTTGATGATG
ATAACAAGTGCTACTTGGAGATCAACTACAGCTTTGACATCCGTAAAGAATGGCCTGCTG
TTTGAAATGAAACTCAAAGAACAAATTCTCCTGAGATGAAGTCTTGTCAGTAGAAAGTTT
ATGTTTGTTCCACTCCCCATCTCTCTCTTTTTTTTTTTTGCCTTTCACGTGAAACATTTT
ATTGTGAATCGTGCTAGAACAAGAACGACAGATAGTTCCTTCCTCTTTGATCTTGATTTT
ATTAATGCCGTTTGGTGGGAATCAGTATGTGTGGTTTGTTCTCAAAGTATGTTTCTCCC

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 2

CO CL2258Contig1 791 2 16 U
GTGGTCAGGACAGACGGCGGATTATTCGTCGGAAAGTTCATCGATCGGAACTCCGGGAGA
CAGCGAGGAAGAGGACGAAGAAAGCGAAGACAATGACAAAGAACAAGGGCTTCGAGGATT
GGCTTCGATGAGCTCTCTAGAAGATTCTCTCCCCAACAAAAGAGGGTTATCGAATCACTA
CAAAGGGAAATCAAAATCGTTTGGGAATTTAGGAGAGATCGGGAGTGTAAAAGAAGTGCC
AAAGCAAGAGAATCCGTTGAATAAGCGTAGAAGGTTACAGATCTGCAACAAGTTAGCAAG
AAAGATCGTTCTACTCGTGGCAAAACCCCTAAATCTATGCCTCTTTTGCCTGTAAACGAA
GATCAAGATGATGATGATGAAAGAGGAGGAAGGGAGATCTGAGCGATGAAGAGCGAGGAG
GAACAAGAGGAGTTGTCGTTGCGAGAAACTCATCGTTCAAGAACAGAGCATTCAAGTCTA
GGAGTTGTTTTGCTCTATCAGATCTGCAGGAAGAAGAAGATGAGTGATTTGATTTAATCA
ACAATAATGCAAATCATGATTTTTTTTTCTTCTTTTGTTCATAGTTTCTTCTTTTTTTTT
CCTTATCTAAAAATATAATTTTTACTTTCGTCGAATTAGTGTTTTTCTCTTTAATTCGGG
GAATTAATTATTATATTATGTCGATTGGGAGAAAAGTAATCAACTGCGTTAGTGTTTGTT
CCTTTCTTTCTGCTTATCTGTCTATTGTCCTTTTTCCATCAATCTCCACATTATCTTGAT
TCTTTATATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G465TF U 1
AF RR2A585JQ C 90
BS 1 104 RR2G465TF
BS 105 105 RR2A585JQ
BS 106 136 RR2G465TF
BS 137 137 RR2A585JQ
BS 138 509 RR2G465TF
BS 510 510 RR2A585JQ
BS 511 550 RR2G465TF
BS 551 551 RR2A585JQ
BS 552 612 RR2G465TF
BS 613 613 RR2A585JQ
BS 614 648 RR2G465TF
BS 649 649 RR2A585JQ
BS 650 694 RR2G465TF
BS 695 695 RR2A585JQ
BS 696 705 RR2G465TF
BS 706 791 RR2A585JQ

RD RR2G465TF 705 0 0
GTGGTCAGGACAGACGGCGGATTATTCGTCGGAAAGTTCATCGATCGGAACTCCGGGAGA
CAGCGAGGAAGAGGACGAAGAAAGCGAAGACAATGACAAAGAACTAGGGCTTCGAGGATT
GGCTTCGATGAGCTCTTTAGAAGATTCTCTCCCCAACAAAAGAGGGTTATCGAATCACTA
CAAAGGGAAATCAAAATCGTTTGGGAATTTAGGAGAGATCGGGAGTGTAAAAGAAGTGCC
AAAGCAAGAGAATCCGTTGAATAAGCGTAGAAGGTTACAGATCTGCAACAAGTTAGCAAG
AAAGATCGTTCTACTCGTGGCAAAACCCCTAAATCTATGCCTCTTTTGCCTGTAAACGAA
GATCAAGATGATGATGATGAAAGAGGAGGAAGGGAGATCTGAGCGATGAAGAGCGAGGAG
GAACAAGAGGAGTTGTCGTTGCGAGAAACTCATCGTTCAAGAACAGAGCATTCAAGTCTA
GGAGTTGTTTTGCTCTATCAGATCTGCAG*AAGAAGAAGATGAGTGATTTGATTTAATCA
ACAATAATGCGAATCATGATTTTTTTTTCTTCTTTTGTTCATAGTTTCTTCTTTTTTTTT
CCTTATCTAAAA*TATAATTTTTACTTTCGTCGAATTAGTGTTTTTCT*TTTAATTCGGG
GAATTAATTATTATATTATGTCGATTGGGAGAAA*GTAATCAACT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2A585JQ 702 0 0
ACG
ATGACAAAGAACAAGGGCTTCGAGGATTGGCTTCGATGAGCTCTCTCGAAGATTCTCTCC
CCAACAAA***GGGTTATCGAATCACTACAAAGGGAAATCAAAATCGTTTGGGAATTTAG
GAGAGATCGGGAGTGTAAAAGAAGTGCCAAAGCAAGAGAATCCGTTGAATAAGCGTAGAA
GGTTACAGATCTGCAACAAGTTAGCAAGAA*GATCGTTCTACTCGTGGCAAAACCC*TAA
ATCTATGCCTCTTTTGCCTGTAAACGAAGATCAAGATGATGATGATGAA*GAGGAGGA*G
GGAGATCTGAGCGATGAAGAGCGAGGAGGAACAAGAGGAGTTGTCGTTGCGAGAAACTCA
TCGTTCAAGAACAGAGCATTCAAGTCTAGGAGTTGTTTTGCTCTATCAGATCTGCAGGAA
GAAGAAGATGAGTGATTTGATTTAATCAACAATAATGCAAATCATGATTTTTTTT*CTTC
TTTTGTTCATAGTTTCTTCTTTTTTTTTCCTTATCTAAAAATATAATTTTTACTTTCGTC
GAATTAGTGTTTTTCTCTTTAATTCGGGGAATTAATTATTATATTATGTCGATTGGGAGA
AAAGTAATCAACTGCGTTAGTGTTTGTTCCTTTCTTTCTGCTTATCTGTCTATTGTCCTT
TTTCCATCAATCTCCACATTATCTTGATTCTTTATATAA

QA 4 702 4 702
DS 



AS 1 4

CO CL2259Contig1 757 4 6 U
AAATCATTAGATGCAGACATCGACTCTTCTTATTGCAATCACATGTTTATATATGTATGA
TTTTATTCGATCAGATCATTTTACATTACTCTATCAAATGTTCAGAGATGACACTTTTAT
TCGATCGGATCGGTTACATTATCGGCATTGCAACCATACGTTAACACAAATCTCCCACAC
ATATATAAACATGGCAGTTGTTCCGGATCCTAGGAGAGACTCTTCCGGATGTCAGACCCG
ACCCTACCGATAGGAGAAACCTGGCAGTTGTTCCGCACGGCAGTGAGATTATACGGCGGC
GTATCGGTTGCAAGCCATTGCTCCACATCAAAGTATTGATGTTCACTCTTTAAATGAACA
CTGACCGTCGTGACGTCCACGTAGTCAACAAACCAGGCCGGGTAATCGCCGGAGCCGTCT
GAGGTCAGACTCACTGAACAGACTGGGCTAGGAAGACACTGCGCCTTACCACTGAAAAAG
TCCAAATTGCCTCTCTCGAAGTAGTCGTAACTTGGTCCCATTAACCCACCCCATGTCACT
ATGTCTGGGATATCAATGTCCTGTCCCGAATTGTTGGAGATTTTAACGCTTATGATAGAA
TCTGTGCCGGCATTTTCCACCGGTCCGGTTTCGATGTAGAATGTGTAGGCGCAGTGTGGT
TCGCGGTCGGCGAATGCAACGACAGATAGGGTGATGATGACGAGGAGGGAGAGGAGGAGA
ACGTCACGGCCAGCCATAGTTGGAGATATGAATGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D711JQ U 1
AF RR2D711TF C 1
AF RR2AR78JQ U 65
AF RR2AR78TF C 65
BS 1 132 RR2D711JQ
BS 133 133 RR2AR78JQ
BS 134 385 RR2D711JQ
BS 386 386 RR2AR78JQ
BS 387 538 RR2D711JQ
BS 539 757 RR2AR78JQ

RD RR2D711JQ 540 0 0
AAATCATTAGATGCAGACATCGACTCTTCTTATTGCAATCACATGTTTATATATGTATGA
TTTTATTCGATCAGATCATTTTACATTACTCTATCAAATGTTCAGAGATGACACTTTTAT
TCGATCGGATCGTTTACATTATCGGCATTGCAACCATACGTTAACACAAATCTCCCACAC
ATATATAAACATGGCAGTTGTTCCGGATCCTAGGAGAGACTCTTCCGGATGTCAGACCCG
ACCCTACCGATAGGAGAAACCTGGCAGTTGTTCCGCACGGCAGTGAGATTATACGGCGGC
GTATCGGTTGCAAGCCATTGCTCCACATCAAAGTATTGATGTTCACTCTTTAAATGAACA
CTGACCGTCGTGACGTCCACGTAGTTAACAAACCAGGCCGGGTAATCGCCGGAGCCGTCT
GAGGTCAGACTCACTGAACAGACTGGGCTAGGAAGACACTGCGCCTTACCACTGAAAAAG
TCCAAATTGCCTCTCTCGAAGTAGTCGTAACTTGGTCCCATTAACCCACCCCATGTCA
GC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2D711TF 540 0 0
AAATCATTAGATGCAGACATCGACTCTTCTTATTGCAATCACATGTTTATATATGTATGA
TTTTATTCGATCAGATCATTTTACATTACTCTATCAAATGTTCAGAGATGACACTTTTAT
TCGATCGGATCGTTTACATTATCGGCATTGCAACCATACGTTAACACAAATCTCCCACAC
ATATATAAACATGGCAGTTGTTCCGGATCCTAGGAGAGACTCTTCCGGATGTCAGACCCG
ACCCTACCGATAGGAGAAACCTGGCAGTTGTTCCGCACGGCAGTGAGATTATACGGCGGC
GTATCGGTTGCAAGCCATTGCTCCACATCAAAGTATTGATGTTCACTCTTTAAATGAACA
CTGACCGTCGTGACGTCCACGTAGTTAACAAACCAGGCCGGGTAATCGCCGGAGCCGTCT
GAGGTCAGACTCACTGAACAGACTGGGCTAGGAAGACACTGCGCCTTACCACTGAAAAAG
TCCAAATTGCCTCTCTCGAAGTAGTCGTAACTTGGTCCCATTAACCCACCCCATGTCA
GC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2AR78JQ 693 0 0
ATTCGATCAGATCATTTTACATTACTCTATCAAATGTTCAGAGATGACACTTTTATTCGA
TCGGATCGGTTACATTATCGGCATTGCAACCATACGTTAACACAAATCTCCCACACATAT
ATAAACATGGCAGTTGTTCCGGATCCTAGGAGAGACTCTTCCGGATGTCAGACCCGACCC
TACCGATAGGAGAAACCTGGCAGTTGTTCCGCACGGCAGTGAGATTATACGGCGGCGTAT
CGGTTGCAAGCCATTGCTCCACATCAAAGTATTGATGTTCACTCTTTAAATGAACACTGA
CCGTCGTGACGTCCACGTAGTCAACAAACCAGGCCGGGTAATCGCCGGAGCCGTCTGAGG
TCAGACTCACTGAACAGACTGGGCTAGGAAGACACTGCGCCTTACCACTGAAAAAGTCCA
AATTGCCTCTCTCGAAGTAGTCGTAACTTGGTCCCATTAACCCACCCCATGTCACTATGT
CTGGGATATCAATGTCCTGTCCCGAATTGTTGGAGATTTTAACGCTTATGATAGAATCTG
TGCCGGCATTTTCCACCGGTCCGGTTTCGATGTAGAATGTGTAGGCGCAGTGTGGTTCGC
GGTCGGCGAATGCAACGACAGATAGGGTGATGATGACGAGGAGGGAGAGGAGGAGAACGT
CACGGCCAGCCATAGTTGGAGATATGAATGTCC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2AR78TF 693 0 0
ATTCGATCAGATCATTTTACATTACTCTATCAAATGTTCAGAGATGACACTTTTATTCGA
TCGGATCGGTTACATTATCGGCATTGCAACCATACGTTAACACAAATCTCCCACACATAT
ATAAACATGGCAGTTGTTCCGGATCCTAGGAGAGACTCTTCCGGATGTCAGACCCGACCC
TACCGATAGGAGAAACCTGGCAGTTGTTCCGCACGGCAGTGAGATTATACGGCGGCGTAT
CGGTTGCAAGCCATTGCTCCACATCAAAGTATTGATGTTCACTCTTTAAATGAACACTGA
CCGTCGTGACGTCCACGTAGTCAACAAACCAGGCCGGGTAATCGCCGGAGCCGTCTGAGG
TCAGACTCACTGAACAGACTGGGCTAGGAAGACACTGCGCCTTACCACTGAAAAAGTCCA
AATTGCCTCTCTCGAAGTAGTCGTAACTTGGTCCCATTAACCCACCCCATGTCACTATGT
CTGGGATATCAATGTCCTGTCCCGAATTGTTGGAGATTTTAACGCTTATGATAGAATCTG
TGCCGGCATTTTCCACCGGTCCGGTTTCGATGTAGAATGTGTAGGCGCAGTGTGGTTCGC
GGTCGGCGAATGCAACGACAGATAGGGTGATGATGACGAGGAGGGAGAGGAGGAGAACGT
CACGGCCAGCCATAGTTGGAGATATGAATGTCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 3

CO CL2260Contig1 1150 3 14 U
AGAATAAAAAATAAAAATGTGAGAAATGGATTAACAAACGAAACAGTATGAGTTTCAAAA
CCATATTCCAAAACACAAGAAAAGAGACAACAAAACGTTAAGAAAATCAAACAGACAAGT
TCTTGCGAACTAAGCTAAAGAGAAAGTAAATGGAGAGGTAAATGGTAAACAATGGCTCAC
CGGATAAAATACGATTTTCACTGGCAAAGCTGCTCGACGGCAGTCACGATCTGAGCCGGT
TGAACAACGGTCCACTCCTCCAGTGTACCAGCGTACGGGGTAGGAACGTCCTGAAAAAAC
AAACACATCACCGGAGCATCTAAATAGTCATGAAAGTTCTCATTAATGGCAGCCGTAAAA
CTAGCTCCAATCCCACCGGTTCTCATACACTCCTCCACGATCAAAACCCGGGGCGTTTTC
TTAACCGAGTTCCCAATCGTGTGAAAATCAAACGGTTTCAGCGACCTGATGTCGATAACC
TCAGGGTCATACCCTTTGTTCACCAGAGTTTTAGCTGCCTGCATCACATGGTACCTCATC
CGCGAGTAAGTGAGGATGGTGATGTGCTCTCCAGGTCTGACCATCTCAGCTTCTTCAAGA
TTACAGATGTACTCTTCGTCCGGGATTTTCTCCTTGAGGTTGTAAAGCAGAACGTGCTCA
AACAGAATCACAGGGTTCTCGCTCCTGATCGCAGCTTTCATCAATCCCTTGGCGTTGTAA
GGAGTCGAGCAAGCAACCATCTGGATCCCAGGAATGGACTGGAAGTAAGACTCTAGCCGC
TGTGAATGCTCAGCCCCAAGCTGGCGTCCCACTCCACCGGGACCACGAATGACAACCGGG
ATAGTGAACTGGCCACCAGATGTGTAGTGAAGCATTCCACAGTTGTTGGAGATTTGGTTG
AAGGCCAGGAGGAGGAAACCCATGTTCATACCTTCGATGACGGGTCTTAGACCAGTCATG
GCAGCTCCAATGCCCATACCAGTGAATGCGTTTTCACAAATAGGAGTGTCGAGGACCCTG
AGGTCGCCGAATTTGTCAGCAAGGCCTTTGGTAACTTTGTAGGAGCCACCGTAATGGCCC
ACGTCTTCACCCATAACACATACATGTGGATCTCTGTCCATCTCTTCTTCCAGACCTTCC
TGAAGAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF16JQ U 201
AF RR2E883JQ U 1
AF RR2E883TF C 523
BS 1 278 RR2E883JQ
BS 279 279 RR2FF16JQ
BS 280 294 RR2E883JQ
BS 295 295 RR2FF16JQ
BS 296 297 RR2E883JQ
BS 298 298 RR2FF16JQ
BS 299 358 RR2E883JQ
BS 359 359 RR2FF16JQ
BS 360 411 RR2E883JQ
BS 412 412 RR2FF16JQ
BS 413 445 RR2E883JQ
BS 446 446 RR2FF16JQ
BS 447 752 RR2E883JQ
BS 753 1150 RR2E883TF

RD RR2FF16JQ 255 0 0
CTG
GCAAAGCTGCTCGACGGCAGTCACGATCTGAGCCGGTTGAACAACGGTCCACTCCTCCAG
TGTACCAGCGTACGGGGTAGGAACGTCCTGAAAAAACAAACACATCACCGGAGCATCTAA
ATAGTCATGAAAGTTCTCATTAATGGCAGCCGTAAAACTAGCTCCAATCCCACCGGTTCT
CATACACTCCTCCACGATCAAAACCCGGGGCGTTTTCTTAACCGAGTTCCCAATCGTGTG
AAAATCAAACGG

QA 4 255 4 255
DS 

RD RR2E883JQ 752 0 0
AGAATAAAAAATAAAAATGTGAGAAATGGATTAACAAACGAAACAGTATGAGTTTCAAAA
CCATATTCCAAAACACAAGAAAAGAGACAACAAAACGTTAAGAAAATCAAACAGACAAGT
TCTTGCGAACTAAGCTAAAGAGAAAGTAAATGGAGAGGTAAATGGTAAACAATGGCTCAC
CGGATAAAATACGATTTTCACTGGCAAAGCTGCTCGACGGCAGTCACGATCTGAGCCGGT
TGAACAACGGTCCACTCCTCCAGTGTACCAGCGTACGGTGTAGGAACGTCCTGAGAAGAC
AAACACATCACCGGAGCATCTAAATAGTCATGAAAGTTCTCATTAATGGCAGCCGTAAGA
CTAGCTCCAATCCCACCGGTTCTCATACACTCCTCCACGATCAAAACCCGGTGCGTTTTC
TTAACCGAGTTCCCAATCGTGTGAAGATCAAACGGTTTCAGCGACCTGATGTCGATAACC
TCAGGGTCATACCCTTTGTTCACCAGAGTTTTAGCTGCCTGCATCACATGGTACCTCATC
CGCGAGTAAGTGAGGATGGTGATGTGCTCTCCAGGTCTGACCATCTCAGCTTCTTCAAGA
TTACAGATGTACTCTTCGTCCGGGATTTTCTCCTTGAGGTTGTAAAGCAGAACGTGCTCA
AACAGAATCACAGGGTTCTCGCTCCTGATCGCAGCTTTCATCAATCCCTTGGCGTTGTAA
GGAGTCGAGCAAGCAACCATCTGGATCCCAGG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2E883TF 628 0 0
ATCACATGGTACCTCATCCGCGAGTAAGTGAGGATGGTGATGTGCTCTCCAGGTCTGACC
ATCTCAGCTTCTTCAAGATTACAGATGTACTCTTCGTCCGGGATTTTCTCCTTGAGGTTG
TAAAGCAGAACGTGCTCAAACAGAATCACAGGGTTCTCGCTCCTGATCGCAGCTTTCATC
AATCCCTTGGCGTTGTAAGGAGTCGAGCAAGCAACCATCTGGATCCCAGGAATGGACTGG
AAGTAAGACTCTAGCCGCTGTGAATGCTCAGCCCCAAGCTGGCGTCCCACTCCACCGGGA
CCACGAATGACAACCGGGATAGTGAACTGGCCACCAGATGTGTAGTGAAGCATTCCACAG
TTGTTGGAGATTTGGTTGAAGGCCAGGAGGAGGAAACCCATGTTCATACCTTCGATGACG
GGTCTTAGACCAGTCATGGCAGCTCCAATGCCCATACCAGTGAATGCGTTTTCACAAATA
GGAGTGTCGAGGACCCTGAGGTCGCCGAATTTGTCAGCAAGGCCTTTGGTAACTTTGTAG
GAGCCACCGTAATGGCCCACGTCTTCACCCATAACACATACATGTGGATCTCTGTCCATC
TCTTCTTCCAGACCTTCCTGAAGAGCCC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 4

CO CL2261Contig1 604 4 2 U
GGATACCAACTAAACTAATCACACAATATCCCCAGTTTTTTATCTCTTTTTCTTTTGTAT
GATTCAGGAATAGTAACCGATTTTATAAATCGAAATACAGGGAGCCCCTCCCTCAAAAAA
AATTGATTTATTTATCTTATTATTAATCAAGAATTTTGTATATAGCTAGAACGACCCTCA
CAAATTGCGAATACTAATTTGTTAAGAATGAATCGAATTGAAGCTATAGCGTCATCATTT
GCTGGAATAGAAATATCCGCGAGATCGGGATTACAATTTGTATCGATTAAAGAAATGGTT
GGAATTCCCAAAGTTATACATTCTCGAAGAGCCGTATATTCTTCTTGCTGATCGATGATG
ATTACAATATCAGGCAATCCCGTCATATATTTAATCCCGCCTAGATATGTTTCCAAGCGA
GATAATTGTCTCTTCAACACAGCTGCATCCCTTTTCGGAAGACGGTGGAATCCCTCTGTC
TTTTGTTCAGTTCTCAAGTCCCTAAACTTATGAAGTCTTTTTTCTGTAGTAGACCAATTT
GTTAACATGCCGCCGAGCCACTTTTTATTAACATAATGACACCGAGCCCTTATTGCAGCC
CGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2GB46JQ U 1
AF RR2GB46TF C 1
AF RR2AO23JQ U 57
AF RR2AO23TF C 57
BS 1 495 RR2GB46JQ
BS 496 604 RR2AO23JQ

RD RR2GB46JQ 496 0 0
GGATACCAACTAAACTAATCACACAATATCCCCAGTTTTTTATCTCTTTTTCTTTTGTAT
GATTCAGGAATAGTAACCGATTTTATAAATCGAAATACAGGGAGCCCCTCCCTCAAAAAA
AATTGATTTATTTATCTTATTATTAATCAAGAATTTTGTATATAGCTAGAACGACCCTCA
CAAATTGCGAATACTAATTTGTTAAGAATGAATCGAATTGAAGCTATAGCGTCATCATTT
GCTGGAATAGAAATATCCGCGAGATCGGGATTACAATTTGTATCGATTAAAGAAATGGTT
GGAATTCCCAAAGTTATACATTCTCGAAGAGCCGTATATTCTTCTTGCTGATCGATGATG
ATTACAATATCAGGCAATCCCGTCATATATTTAATCCCGCCTAGATATGTTTCCAAGCGA
GATAATTGTCTCTTCAACACAGCTGCATCCCTTTTCGGAAGACGGTGGAATCCCTCTGTC
TTTTGTTCAGTTCTC
C

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR2GB46TF 496 0 0
GGATACCAACTAAACTAATCACACAATATCCCCAGTTTTTTATCTCTTTTTCTTTTGTAT
GATTCAGGAATAGTAACCGATTTTATAAATCGAAATACAGGGAGCCCCTCCCTCAAAAAA
AATTGATTTATTTATCTTATTATTAATCAAGAATTTTGTATATAGCTAGAACGACCCTCA
CAAATTGCGAATACTAATTTGTTAAGAATGAATCGAATTGAAGCTATAGCGTCATCATTT
GCTGGAATAGAAATATCCGCGAGATCGGGATTACAATTTGTATCGATTAAAGAAATGGTT
GGAATTCCCAAAGTTATACATTCTCGAAGAGCCGTATATTCTTCTTGCTGATCGATGATG
ATTACAATATCAGGCAATCCCGTCATATATTTAATCCCGCCTAGATATGTTTCCAAGCGA
GATAATTGTCTCTTCAACACAGCTGCATCCCTTTTCGGAAGACGGTGGAATCCCTCTGTC
TTTTGTTCAGTTCTC
C

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR2AO23JQ 548 0 0
GTATGATTCAGGAATAGTAACCGATTTTATAAATCGAAATACAGGGAGCCCCTCCCTCAA
AAAAAATTGATTTATTTATCTTATTATTAATCAAGAATTTTGTATATAGCTAGAACGACC
CTCACAAATTGCGAATACTAATTTGTTAAGAATGAATCGAATTGAAGCTATAGCGTCATC
ATTTGCTGGAATAGAAATATCCGCGAGATCGGGATTACAATTTGTATCGATTAAAGAAAT
GGTTGGAATTCCCAAAGTTATACATTCTCGAAGAGCCGTATATTCTTCTTGCTGATCGAT
GATGATTACAATATCAGGCAATCCCGTCATATATTTAATCCCGCCTAGATATGTTTCCAA
GCGAGATAATTGTCTCTTCAACACAGCTGCATCCCTTTTCGGAAGACGGTGGAATCCCTC
TGTCTTTTGTTCAGTTCTCAAGTCCCTAAACTTATGAAGTCTTTTTTCTGTAGTAGACCA
ATTTGTTAACATGCCGCCGAGCCACTTTTTATTAACATAATGACACCGAGCCCTTATTGC
AGCCCGCC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2AO23TF 548 0 0
GTATGATTCAGGAATAGTAACCGATTTTATAAATCGAAATACAGGGAGCCCCTCCCTCAA
AAAAAATTGATTTATTTATCTTATTATTAATCAAGAATTTTGTATATAGCTAGAACGACC
CTCACAAATTGCGAATACTAATTTGTTAAGAATGAATCGAATTGAAGCTATAGCGTCATC
ATTTGCTGGAATAGAAATATCCGCGAGATCGGGATTACAATTTGTATCGATTAAAGAAAT
GGTTGGAATTCCCAAAGTTATACATTCTCGAAGAGCCGTATATTCTTCTTGCTGATCGAT
GATGATTACAATATCAGGCAATCCCGTCATATATTTAATCCCGCCTAGATATGTTTCCAA
GCGAGATAATTGTCTCTTCAACACAGCTGCATCCCTTTTCGGAAGACGGTGGAATCCCTC
TGTCTTTTGTTCAGTTCTCAAGTCCCTAAACTTATGAAGTCTTTTTTCTGTAGTAGACCA
ATTTGTTAACATGCCGCCGAGCCACTTTTTATTAACATAATGACACCGAGCCCTTATTGC
AGCCCGCC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 3

CO CL2262Contig1 581 3 4 U
GCATCGGCTAGTAGTTTGTGGTATGTTTTGGCTTATATGGAGGCTAAGAAGAGACTGAAG
AAAGGAGATAGAGTGTTTATGATAAGCTTTGGAGCTGGTTTTAAGTGTAATAGCTGCGTT
TGGGAAGTTGTGAGAGATCTCACCGTTGGAGTATCAAAAGGGAATGTGTGGAATGATTGC
ATTGATGATTATCCACCTAAATCGATTTCGAATCCTTATTTGAAGAAGTTTGGTTGGATT
CAAGATGAAGAACTTGAGACTTTTAAGATCCCTAACGGATTTATGTAAAACGTTTTCCGC
ACAAATATGCAAAACCAGAAAACAACACAAAGGTGAAAATTTTCTTTCTTATTTCTTTCT
TTTTTTCCTTTTTAGTTAATTTTTTACATGTTTTTATTTTGTTAAAGAATGGGATTGGAA
CAGGGACCGGATATGAATGCATGTAAAAGAAACTTGGACTTCCTTTTGCTTTTTATAATT
TTTTGTGTAATAATAATTTGTTGATTTTACACTGTTATAATCAGGGCAAGCACTTCCAAT
AAGATGAGAATTTTTACTAATTTGCCATCATATTGGAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A455JQ C 213
AF RR2FF82TF U 1
AF RR2A102TF U 140
BS 1 316 RR2FF82TF
BS 317 318 RR2A102TF
BS 319 516 RR2FF82TF
BS 517 581 RR2A102TF

RD RR2A455JQ 119 0 0
TCCTTATTTGAAGAAGTTTGGTTGGATTCAAGATGAAGAACTTGAGACTTCTAAGATCCC
TAACGGATTTATGTAAAACGTTTTCCGCACAAATACGCAAAACCA
GAAAACAACACAAA

QA 1 105 1 105
DS 

RD RR2FF82TF 516 0 0
GCATCGGCTAGTAGTTTGTGGTATGTTTTGGCTTATATGGAGGCTAAGAAGAGACTGAAG
AAAGGAGATAGAGTGTTTATGATAAGCTTTGGAGCTGGTTTTAAGTGTAATAGCTGCGTT
TGGGAAGTTGTGAGAGATCTCACCGTTGGAGTATCAAAAGGGAATGTGTGGAATGATTGC
ATTGATGATTATCCACCTAAATCGATTTCGAATCCTTATTTGAAGAAGTTTGGTTGGATT
CAAGATGAAGAACTTGAGACTTTTAAGATCCCTAACGGATTTATGTAAAACGTTTTCCGC
ACAAATATGCAAAACC**AAAACAACACAAAGGTGAAAATTTTCTTTCTTATTTCTTTCT
TTTTTTCCTTTTTAGTTAATTTTTTACATGTTTTTATTTTGTTAAAGAATGGGATTGGAA
CAGGGACCGGATATGAATGCATGTAAAAGAAACTTGGACTTCCTTTTGCTTTTTATAATT
TTTTGTGTAATAATAATTTGTTGATTTTACACTGTT

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2A102TF 442 0 0
TCACCGTTGGAGTATCAAAAGGGAATGTGTGGAATGATTGCATTGATGATTATCCACCTA
AATCGATTTCGAATCCTTATTTGAAGAAGTTTGGTTGGATTCAAGATGAAGAACTTGAGA
CTTTTAAGATCCCTAACGGATTTATGTAAAACGTTTTCCGCACAAATATGCAAAACCAGA
AAACAACACAAAGGTGAAAATTTTCTTTCTTATTTCTTTCTTTTTTTCCTTTTTAGTTAA
TTTTTTACATGTTTTTATTTTGTTAAAGAATGGGATTGGAACAGGGACCGGATATGAATG
CATGTAAAAGAAACTTGGACTTCCTTTTGCTTTTTATAATTTTTTGTGTAATAATAATTT
GTTGATTTTACACTGTTATAATCAGGGCAAGCACTTCCAATAAGATGAGAATTTTTACTA
ATTTGCCATCATATTGGAATGC

QA 1 442 1 442
DS 



AS 1 4

CO CL2263Contig1 713 4 14 U
GTGTAGCGGGTATAGTTTAGTGGTAAAAGTGTGATTCGTTCCTTTAACCCCTTTAATAGT
TAAAGGGTCTCTCGGTTTGATTAATCTTCCGATCAAAAACTTTATTTCTGAAAAGGATTT
AGTCCTTTACCTTTCAATGAAAAATTCAAGGAAGATTATGGATTCTCGTAATTTGTATCC
AAAGACTCTAATTAATTGTCAATTTGGATTATGAAATTTCGAAACATAATTTTTGAATTG
GATGACTATTTACAATTCAATAAGTATAACAAGAGGATCCACGGATAAAGCCAGAAAAGT
T*ATTTCTAATCGTAACTAAATCTTCAGTTCTATTTTTTGTTTGGTATAGAAAAAATTGA
AGCAAAATAGCTATTAAACGAGAACTTTGGTTTACTAAAGACATCGACATATTATATTGT
TTTAGCTCGGTGGAAACAAAATACTTTTCCTAAGGATTCCGTTAAATAGAAATAAAGAAC
GAAGTAACTAGAAAGATTTTTTGAGTTCGCCTTTTCTATCTTCTAGAAGGATCATCTATA
AAGCAAAATTTTCTGTGAAAGCATCCAGACGGGAAAAAAGCTAACATAGATGTTATGAGT
CAAATTTGGATTTCGTTCCCATCTTATTTTATTTGGGAATTTCCCCATCCATCATAAAGG
AGCCGAATGAAACCAAAGTTTCATGTTCGGTTTTGAATTAGAGACGTTAAAAA


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC86JQ C 2
AF RR2FC86TF U 2
AF RR2CL75TF U 1
AF RR2CL75JQ C 521
BS 1 159 RR2CL75TF
BS 160 160 RR2FC86TF
BS 161 277 RR2CL75TF
BS 278 278 RR2FC86TF
BS 279 281 RR2CL75TF
BS 282 282 RR2FC86TF
BS 283 301 RR2CL75TF
BS 302 302 RR2FC86TF
BS 303 643 RR2CL75TF
BS 644 644 RR2CL75JQ
BS 645 666 RR2CL75TF
BS 667 667 RR2CL75JQ
BS 668 685 RR2CL75TF
BS 686 713 RR2CL75JQ

RD RR2FC86JQ 362 0 0
G
GTAGCGGGTATAGTTTAGTGGTAAAAGTGTGATTCGTTCCTTTAACCCCTTTAATAGTTA
AAGGGTCTCTCGGTTTGATTAATCTTCCGATCAAAAACTTTATTTCTGAAAAGGATTTAG
TCCTTTACCTTTCAATGAAAAATTCAAGGAAGATTATGGATTCTCGTAATTTGTATCCAA
AGACTCTAATTAATTGTCAATTTGGATTATGAAATTTCGAAACATAATTTTTGAATTGGA
TGACTATTTACAATTCAATAAGTATAACAAGAGGATCCACGGATAAAGCCAGAAAAGTT*
ATTTCTAATCGTAACTAAATCTTCAGTTCTATTTTTTGTTTGGTATAGAAAAAATTGAAG
C

QA 2 362 2 362
DS 

RD RR2FC86TF 362 0 0
G
GTAGCGGGTATAGTTTAGTGGTAAAAGTGTGATTCGTTCCTTTAACCCCTTTAATAGTTA
AAGGGTCTCTCGGTTTGATTAATCTTCCGATCAAAAACTTTATTTCTGAAAAGGATTTAG
TCCTTTACCTTTCAATGAAAAATTCAAGGAAGATTATGGATTCTCGTAATTTGTATCCAA
AGACTCTAATTAATTGTCAATTTGGATTATGAAATTTCGAAACATAATTTTTGAATTGGA
TGACTATTTACAATTCAATAAGTATAACAAGAGGATCCACGGATAAAGCCAGAAAAGTT*
ATTTCTAATCGTAACTAAATCTTCAGTTCTATTTTTTGTTTGGTATAGAAAAAATTGAAG
C

QA 2 362 2 362
DS 

RD RR2CL75TF 685 0 0
GTGTAGCGGGTATAGTTTAGTGGTAAAAGTGTGATTCGTTCCTTTAACCCCTTTAATAGT
TAAAGGGTCTCTCGGTTTGATTAATCTTCCGATCAAAAACTTTATTTCTGAAAAGGATTT
AGTCCTTTACCTTTCAATGAAAAATTCAAGGAAGATTATAGATTCTCGTAATTTGTATCC
AAAGACTCTAATTAATTGTCAATTTGGATTATGAAATTTCGAAACATAATTTTTGAATTG
GATGACTATTTACAATTCAATAAGTATAACAAGAGGACCCATGGATAAAGCCAGAAAAGT
TTATTTCTAATCGTAACTAAATCTTCAGTTCTATTTTTTGTTTGGTATAGAAAAAATTGA
AGCAAAATAGCTATTAAACGAGAACTTTGGTTTACTAAAGACATCGACATATTATATTGT
TTTAGCTCGGTGGAAACAAAATACTTTTCCTAAGGATTCCGTTAAATAGAAATAAAGAAC
GAAGTAACTAGAAAGATTTTTTGAGTTCGCCTTTTCTATCTTCTAGAAGGATCATCTATA
AAGCAAAATTTTCTGTGAAAGCATCCAGACGGGAAAAAAGCTAACATAGATGTTATGAGT
CAAATTTGGATTTCGTTCCCATCTTATTTTATTTGGGAATTTCGCCATCCATCATAAAGG
AGCCGA*TGAAACCAAAGTTTCATG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2CL75JQ 193 0 0
TTT
TAGAAGGATCATCTATAAAGCAAAATTTTCTGTGAAAGCATCCAGACGGGAAAAAAGCTA
ACATAGATGTTATGAGTCAAATTTGGATTTCGTTCCCATCTTATTTTATTTGGGAATTTC
CCCATCCATCATAAAGGAGCCGAATGAAACCAAAGTTTCATGTTCGGTTTTGAATTAGAG
ACGTTAAAAA

QA 4 193 4 193
DS 



AS 1 4

CO CL2264Contig1 874 4 4 U
GTCTCAAAACAACTCTCCCCCTCTTATCTTAATATAAATCAGTCTATGTTTTAATCTCTT
GAAGACAATCTAAAGCTTTCATCTTTCATTTAGTTTCTTGCATTCAATAAAGCTCTTCAT
GAGCTATTTATTTTTACATCTTTAGATTTCTATTTTATGAAACTCATTTGAGTATAAATC
TATTTGTTTTGGATTTCACATGAAGCAACACCTGGATTTTCATGTTAAATAATGCAATTA
TCTGAGCGTTGCAGGCCTAGAATCGAGAATAGAGTGGAAAAACCAGCAATTATCATGTTG
CTCTGCCGCCTATAGCAAAATATGTTACCATCACAATAATCCATGTCATGTTCTTGCACC
AACAGAAGATAAAGTATATGAAGACAGCTAACTTCGGGAGTTGATTGACACCCCGGCACT
TGACTGGCAGAGGGCTGCTTTTGCAAAGGAAATGGAGGGATTGCCATCAACAACACGTTC
TGTACGAGAAGTTCCGCCTGAGCTAAAATGTCCGCTATGCAAAGAAGTAATGGAAGATGA
TGCACTTACAAGCTGGTCATGTTGTTTCCAGAGCTTCTGTGCGACAAGTAAAGTACTGCA
GTTTCAGTATCTGTTGTTCCTCTCAGTTTTCGTGAATTCTTAAACCTCAAAGTAAAGCAA
GGAGTGACTGGAGTCTAGGGAATGCTCAGTCATGTGATATAGACTTCTTCTATACAATAG
AAAGTGAACATCACTAAAACTAAAGTAAGTATTTTGGATTTGTTTTAAGGGTTATCTATC
CTATTAAAAGTGAAGTACAAATGAGAATTAACCCTCATTTTATTTCATTATTTACAACTG
ATTGCCACTGATTTTAATTAAAGAATTTTTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C665TF U 22
AF RR2D151TF U 1
AF RR2DI12JQ C 305
AF RR2D151JQ C 64
BS 1 325 RR2D151TF
BS 326 326 RR2D151JQ
BS 327 369 RR2D151TF
BS 370 874 RR2D151JQ

RD RR2C665TF 198 0 0
TCTTATCTTAATATAAATCAGTCTATGTTTTAATCTCTTGAAGACAATCTAAAGCTTTCA
TCTTTCATTTAGTTTCTTGCATTCAATAAAGCTCTTCATGAGCTATTTATTTTTACATCT
TTAGATTTCTATTTTATGAAACTCATTTGAG*ATAAATCTATTTGTTTTGG*TTTCACAT
GAAGCA
GACCTGGATTTT

QA 1 186 1 186
DS 

RD RR2D151TF 371 0 0
GTCTCAAAACAACTCTCCCCCTCTTATCTTAATATAAATCAGTCTATGTTTTAATCTCTT
GAAGACAATCTAAAGCTTTCATCTTTCATTTAGTTTCTTGCATTCAATAAAGCTCTTCAT
GAGCTATTTATTTTTACATCTTTAGATTTCTATTTTATGAAACTCATTTGAGTATAAATC
TATTTGTTTTGGATTTCACATGAAGCAACACCTGGATTTTCATGTTAAATAATGCAATTA
TCTGAGCGTTGCAGGCCTAGAATCGAGAATAGAGTGGAAAAACCAGCAATTATCATGTTG
CTCTGCCGCCTATAGCAAAATATGT*ACCATCACAATAATCCATGTCATGTTCTTGCACC
AACAGAAGA
AA

QA 1 369 1 369
DS 

RD RR2DI12JQ 155 0 0
GCCGCCTATAGCAAAATATGTTACCATCACAATAATCCATGTCATGTTCTTGCACCAACA
GAAGATAAAGTATATGAAGACAGCTAACTTCGGGAGTTGATTGACACCCCGGCACTTGAC
TGGCAGAGGGCTGCTTTTGCAAGGGAAATGG
GGGG

QA 1 151 1 151
DS 

RD RR2D151JQ 811 0 0
GACAATCTAAAGCTTTCATCTTTCATTTAGTTTCTTGCATTCAATAAAGCTCTTCATGAG
CTATTTATTTTTACATCTTTAGATTTCTATTTTATGAAACTCATTTGAGTATAAATCTAT
TTGTTTTGGATTTCACATGAAGCAACACCTGGATTTTCATGTTAAATAATGCAATTATCT
GAGCGTTGCAGGCCTAGAATCGAGAATAGAGTGGAAAAACCAGCAATTATCATGTTGTTC
TGCCGCCTATAGCAAAATATGTTACCATCACAATAATCCATGTCATGTTCTTGCACCAAC
AGAAGATAAAGTATATGAAGACAGCTAACTTCGGGAGTTGATTGACACCCCGGCACTTGA
CTGGCAGAGGGCTGCTTTTGCAAAGGAAATGGAGGGATTGCCATCAACAACACGTTCTGT
ACGAGAAGTTCCGCCTGAGCTAAAATGTCCGCTATGCAAAGAAGTAATGGAAGATGATGC
ACTTACAAGCTGGTCATGTTGTTTCCAGAGCTTCTGTGCGACAAGTAAAGTACTGCAGTT
TCAGTATCTGTTGTTCCTCTCAGTTTTCGTGAATTCTTAAACCTCAAAGTAAAGCAAGGA
GTGACTGGAGTCTAGGGAATGCTCAGTCATGTGATATAGACTTCTTCTATACAATAGAAA
GTGAACATCACTAAAACTAAAGTAAGTATTTTGGATTTGTTTTAAGGGTTATCTATCCTA
TTAAAAGTGAAGTACAAATGAGAATTAACCCTCATTTTATTTCATTATTTACAACTGATT
GCCACTGATTTTAATTAAAGAATTTTTGCTC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 4

CO CL2265Contig1 1320 4 23 U
GGTCTATCAATCTATCTACAACCTCAAACATGGATTTGTACGAAGTTACATTGAAATTGG
CACAGAATGGATCCTCAGTAAATCTTTCTTTGGTAATCACAATACTCGTGTTTTTTATTA
TTGAGGAGAAGAGTACGGAGGAGAAAAAAAAAACACAAAAGAACAGAAACAGGAACAGCT
TTTTGAAGTTTTTTACACAGAAAACAAGATGTAGTAAAAGGCAAGACCAGCTTTGCAAAT
TAAAATGCAGGGCAAATGTCCTCCAAACTCTCCCCTAAACATTCAATAATGTCACTTGTG
AGAGTTGATCTCTTATGTTTTGTAAAAGCCAGAGCTGCAAACTTTCTCAGCAAGCCAAAT
GCAGCTATGCATCCCAAGATGGCTGGACTCTCAAAGGGACCTTCAGGATCTGACTTAAGC
TGTTGCGCCCATGACAAAAACACTGCAACACCCCCAGAGAGAATATCACCTTGTCCACCA
CATCGCCTGGGAGAACCATATATGCTCACTGATTTTACTATCTCCCCATTGCTTATAAGA
TCAGACTTCCCTTTCCTCAGAATCGTTACACCACCAATCTGTTTAGCCAAAGAACGTAGC
TGATCTCCAGCATTCTCTTCGTCCACTTCACAGTTGAGCACTTTCTGAACCAGGCGCTTG
TACTCGTTCACATTTGGAGTCAAGACAGCAAGCGGATAGCTCTTGACAAGATCAATTGAA
TTTGTTACAAGAAACAGTCCGTCCCCATCTACAACAAAAGGTACATTGGACTTCTTGGCG
AGAAGCATGATCTTACTCACACATTCCAGGAGGAATGGATCCCTTCCGAGACCAGGACCA
ATGACAAGGCAATCAAATCTTTCCATCCATTTATCCACTTCTCCTATCACTTTATCCTCC
ACTTTTCTCTTCTCTTCCTCACTGAACTGACTGATGGTGTAAGATTCCTCGAGAACAGGG
TGAACAATGAGCTCAGGACTATAGCTCTTAATAACAGGAGCTGCGTCTTTCGTGCAGAAC
ACATGAGACAAATCAGCACCGATTTTGAGAGCTGAAATGGCGGCAAAGTAAGGAGCTCCA
GTGTATTCACGACACCCTCCAATCACAGCTATCTTCCCAGCTTGGCCTTTGTGTCGTTTA
GGGTCGAGCGATGGTGTGACGGTTCTAAGAACACTCTCAGCGTCGGCGGCCTCCGATTTG
GAACTCATTGTTGCTCTGATGAGCTTTGGGAGATGAGTTCTTGAGCAGCCACAAAGCGTT
CGTACCAAGAACTGTTGCCTTCTCAGCACAGTTGAAGAAGAATGCTTCACCAACATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ05JQ U 95
AF RR2GX81JQ U 1
AF RR2GX81TF C 406
AF RR2FZ05TF C 721
BS 1 152 RR2GX81JQ
BS 153 153 RR2FZ05JQ
BS 154 216 RR2GX81JQ
BS 217 217 RR2FZ05JQ
BS 218 237 RR2GX81JQ
BS 238 238 RR2FZ05JQ
BS 239 243 RR2GX81JQ
BS 244 244 RR2FZ05JQ
BS 245 254 RR2GX81JQ
BS 255 255 RR2FZ05JQ
BS 256 339 RR2GX81JQ
BS 340 340 RR2FZ05JQ
BS 341 357 RR2GX81JQ
BS 358 358 RR2FZ05JQ
BS 359 393 RR2GX81JQ
BS 394 394 RR2FZ05JQ
BS 395 754 RR2GX81JQ
BS 755 845 RR2GX81TF
BS 846 846 RR2FZ05TF
BS 847 1034 RR2GX81TF
BS 1035 1035 RR2FZ05TF
BS 1036 1106 RR2GX81TF
BS 1107 1320 RR2FZ05TF

RD RR2FZ05JQ 346 0 0
AATCACAATACTCGTGTTTTTTATTATTGAGGAGAAGAGTACGGAGGAGAAAAAAAAAAC
ACAAAAGAACAGAAACAGGAACAGCTTTTTGAAGTTTTTTACACAGAAAACAAGATGTAG
TAAAAGGCAAGACCAGCTTTGCAAATTAAAATGCAGGGCAAATGTCCTCCAAACTCTCCC
CTAAACATTCAATAATGTCACTTGTGAGAGTTGATCTCTTATGTTTTGTAAAAGCCAGAG
CTGCAAACTTTCTCAGCAAGCCAAATGCAGCTATGCATCCCAAGATGGCTGGACTCTCAA
AGGGACTTTCAGGATCTGACTTAAGCTGTTGCGCCCATGACAAAAA

QA 1 346 1 346
DS 

RD RR2GX81JQ 754 0 0
GGTCTATCAATCTATCTACAACCTCAAACATGGATTTGTACGAAGTTACATTGAAATTGG
CACAGAATGGATCCTCAGTAAATCTTTCTTTGGTAATCACAATACTCGTGTTTTTTATTA
TTGAGGAGAAGAGTACGGAGGAGAAAAAAAAA*CACAAAAGAACAGAAACAGGAACAGCT
TTTTGAAGTTTTTTACACAGAAAACAAGATGTAGTAGAAGGCAAGACCAGCTTTGCAGAT
TAAGATGCAGGGCAGATGTCCTCCAAACTCTCCCCTAAACATTCAATAATGTCACTTGTG
AGAGTTGATCTCTTATGTTTTGTAAAAGCCAGAGCTGCAGACTTTCTCAGCAAGCCAGAT
GCAGCTATGCATCCCAAGATGGCTGGACTCTCAGAGGGACCTTCAGGATCTGACTTAAGC
TGTTGCGCCCATGACAAAAACACTGCAACACCCCCAGAGAGAATATCACCTTGTCCACCA
CATCGCCTGGGAGAACCATATATGCTCACTGATTTTACTATCTCCCCATTGCTTATAAGA
TCAGACTTCCCTTTCCTCAGAATCGTTACACCACCAATCTGTTTAGCCAAAGAACGTAGC
TGATCTCCAGCATTCTCTTCGTCCACTTCACAGTTGAGCACTTTCTGAACCAGGCGCTTG
TACTCGTTCACATTTGGAGTCAAGACAGCAAGCGGATAGCTCTTGACAAGATCAATTGAA
TTTGTTACAAGAAACAGTCCGTCCCCATCTACAA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2GX81TF 702 0 0
GGATCTGACTTAAGCTGTTGCGCCCATGACAAAAACACTGCAACACCCCCAGAGAGAATA
TCACTTTGTCCACCACATCGCCTGGGAGAACCATATATGCTCACTGATTTTACTATCTCC
CCATTGCTTATAAGATCAGACTTCCCTTTCCTCAGAATCGTTACACCACCAATCTGTTTA
GCCAAAGAACGTAGCTGATCTCCAGCATTCTCTTCGTCCACTTCACAGTTGAGCACTTTC
TGAACCAGGCGCTTGTACTCGTTCACATTTGGAGTCAAGACAGCAAGCGGATAGCTCTTG
ACAAGATCAATTGAATTTGTTACAAGAAACAGTCCGTCCCCATCTACAACAAAAGGTACA
TTGGACTTCTTGGCGAGAAGCATGATCTTACTCACACATTCCAGGAGGAATGGATCCCTT
CCGAGACCAGGACCAATGACGAGGCAATCAAATCTTTCCATCCATTTATCCACTTCTCCT
ATCACTTTATCCTCCACTTTTCTCTTCTCTTCCTCACTGAACTGACTGATGGTGTAAGAT
TCCTCGAGAACAGGGTGAACAATGAGCTCAGGACTATAGCTCTTAATAACAGGAGCTGCG
TCTTTCGTGCAGAACACATGAGACAAATCTGCACCGATTTTGAGAGCTGAAATGGCGGCA
AAGTAAGGAGCTCCAGTGTATTCACGACACCCTCCAATCAC
C

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2FZ05TF 600 0 0
TTTGTTACAAGAAACAGTCCGTCCCCATCTACAACAAAAGGTACATTGGACTTCTTGGCG
AGAAGCATGATCTTACTCACACATTCCAGGAGGAGTGGATCCCTTCCGAGACCAGGACCA
ATGACAAGGCAATCAAATCTTTCCATCCATTTATCCACTTCTCCTATCACTTTATCCTCC
ACTTTTCTCTTCTCTTCCTCACTGAACTGACTGATGGTGTAAGATTCCTCGAGAACAGGG
TGAACAATGAGCTCAGGACTATAGCTCTTAATAACAGGAGCTGCGTCTTTCGTGCAGAAC
ACATGAGACAAATCAGCACCGATTTTGAGAGCTGAAATGGTGGCAAAGTAAGGAGCTCCA
GTGTATTCACGACACCCTCCAATCACAGCTATCTTCCCAGCTTGGCCTTTGTGTCGTTTA
GGGTCGAGCGATGGTGTGACGGTTCTAAGAACACTCTCAGCGTCGGCGGCCTCCGATTTG
GAACTCATTGTTGCTCTGATGAGCTTTGGGAGATGAGTTCTTGAGCAGCCACAAAGCGTT
CGTACCAAGAACTGTTGCCTTCTCAGCACAGTTGAAGAAGAATGCTTCACCAACATTTCC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 4

CO CL2266Contig1 1482 4 3 U
AGGAAAAAGATGATTTTTTTGTTTATTGGACATAAGAAAGCTAGCAGTAGAGAAAAACGA
AGCTTTGCCCTTATTCTGCCACAAATATTGTTTCTTAAACTTGCAGTCAAAAGGATTGCT
GCTAAATCATATAACATTTCATTGATCAAGCAGAGAACATGCTCACTTGGGAAGGCCAGT
TTCCGGATCGAGAAGAGCCTGAGTTTGGTCAGGAAGCACGACAGGACCTCTTCCAGGTTT
AGTGCAGATAAAATAACTGACTTCCCCTTTTTGATCCTGTGATCCAATGTTGTCTTTTAT
TTCAGGTGGAGGTTGCAGATTTTCGACACTGTTTGCTCCATCTAATCCTGCCTCCTTTAG
AATCGAACTATCTCCCACTACGTAACTCTTCATATCAGTGTCAGACTTAGGGGGAAAGTA
GTAGAGAAGCCCTTGGAGCAATTGAACTGCTACCTTTCTGTTGCGTGCAATCAGTACAGC
ATTTGGGCCAGCATCAAATGTGTAAGCAACCTGTGGTGTGCCTTCAGAACGATTCCATTT
TTCAACCAAGCTAATTATCCTGTGGGAGGTGTCATTCATGTAAAATATGGGTGGAGATGT
ATCCAGACAAACAGCATGAAACTGGTTGCTGTCTGCGCAGCTCAATCGTGTAAAGGATGC
AAAATCTCGGTTTTTAATAGCTTCCTCCATTTGCAGGATTCGTTTAGGCACAACTTCTTT
TGCTCTATGTTGTAAAAGCAAACTCGTCTCAACACTTTCACGCATTCCAGAGGTGCTGCT
CGTTTCCTTCTGCCGTGAACTCACCACGGCAATGATGATAACAAGATCGTTCCAACGTTT
CTCATCTGCTAGTTGAACTGCAACGCTGTCACTTCCATCTTCTTTGCTTCCCATTTCCCA
CTTGACAAATCCACCAAACAAACTCCGGCAAGCACTTCCTGAACCTTGCCTGGCTATTGC
AGAAAGATGGCTTGCATCTTCATCTACATTCATCAACTCTGCCAGAGAAAAAACAAGACA
AGCAAATCCAGCAGCAGAAGATGCTAAGCCAGCAGCAGTAGGGAAGTTGTTATGAGAAGC
AATATGAAGATGAAGTTTCTCCCAGTCTTTCTTCTCTATCTTGACACCTTTCTCCTTGTC
TTCAACCTCACCACCACGACCTCGAATCTCCCTCAAACAGTTTTGGTACCTACTCCCAGA
AAGAGAGATCTCCTTGCCATTGAGCCACATTCGGTCGCGATCAAAAGCGGGACTGACGGC
AACAGTGGTGATGGTACAGAGGTGATCGGGATCGAGAGTAACGCTGATGCTGTCGTTGAC
GGGGAGGATACGGACTTCATCTCTCTTTCCCCAATACTTTATCACCGCGATGTTCGTTGG
AGTTTGCGCCGTCACCATGTACACCCATTTCTCCGCCGCCATATCAAGAAGATATACTCT
CCTCCAAGCGTGTAGATAGAAACTGTGATCTTCTGTCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP22JQ U 1
AF RR2BI29JQ U 49
AF RR2BI29TF C 623
AF RR2GP22TF C 1215
BS 1 422 RR2GP22JQ
BS 423 1007 RR2BI29JQ
BS 1008 1482 RR2BI29TF

RD RR2GP22JQ 422 0 0
AGGAAAAAGATGATTTTTTTGTTTATTGGACATAAGAAAGCTAGCAGTAGAGAAAAACGA
AGCTTTGCCCTTATTCTGCCACAAATATTGTTTCTTAAACTTGCAGTCAAAAGGATTGCT
GCTAAATCATATAACATTTCATTGATCAAGCAGAGAACATGCTCACTTGGGAAGGCCAGT
TTCCGGATCGAGAAGAGCCTGAGTTTGGTCAGGAAGCACGACAGGACCTCTTCCAGGTTT
AGTGCAGATAAAATAACTGACTTCCCCTTTTTGATCCTGTGATCCAATGTTGTCTTTTAT
TTCAGGTGGAGGTTGCAGATTTTCGACACTGTTTGCTCCATCTAATCCTGCCTCCTTTAG
AATCGAACTATCTCCCACTACGTAACTCTTCATATCAGTGTCAGACTTAGGGGGAAAGTA
GT

QA 1 422 1 422
DS 

RD RR2BI29JQ 959 0 0
G
GAGAAAAACGAAGCTTTGCCCTTATTCTGCCACAAATATTGTTTCTTAAACTTGCAGTCA
AAAGGATTGCTGCTAAATCATATAACATTTCATTGATCAAGCAGAGAACATGCTCACTTG
GGAAGGCCAGTTTCCGGATCGAGAAGAGCCTGAGTTTGGTCAGGAAGCACGACAGGACCT
CTTCCAGGTTTGGTGCAGATAAAATAACTGACTTCGCCTTTTTGATCCTGTGATCCAATG
TTGTCTTTTATTTCAGGTGGAGGTTGCAGATTTTCTACACTGTTTGCTCCATCTAATCCT
GCCTCCTTTAGAATCGAACTATCTCCCACTACGTAACTCTTCATATCAGTGTCAGACTTA
GGGGGAAAGTAGTAGAGAAGCCCTTGGAGCAATTGAACTGCTACCTTTCTGTTGCGTGCA
ATCAGTACAGCATTTGGGCCAGCATCAAATGTGTAAGCAACCTGTGGTGTGCCTTCAGAA
CGATTCCATTTTTCAACCAAGCTAATTATCCTGTGGGAGGTGTCATTCATGTAAAATATG
GGTGGAGATGTATCCAGACAAACAGCATGAAACTGGTTGCTGTCTGCGCAGCTCAATCGT
GTAAAGGATGCAAAATCTCGGTTTTTAATAGCTTCCTCCATTTGCAGGATTCGTTTAGGC
ACAACTTCTTTTGCTCTATGTTGTAAAAGCAAACTCGTCTCAACACTTTCACGCATTCCA
GAGGTGCTGCTCGTTTCCTTCTGCCGTGAACTCACCACGGCAATGATGATAACAAGATCG
TTCCAACGTTTCTCATCTGCTAGTTGAACTGCAACGCTGTCACTTCCATCTTCTTTGCTT
CCCATTTCCCACTTGACAAATCCACCAAACAAACTCCGGCAAGCACTTCCTGAACCTTGC
CTGGCTATTGCAGAAAGATGGCTTGCATCTTCATCTACATTCATCAACTCTGCCAGAG

QA 2 959 2 959
DS 

RD RR2BI29TF 860 0 0
TGGTTGCTGTCTGCGCAGCTCAATCGTGTAAAGGATGCAAAATCTCGGTTTTTAATAGCT
TCCTCCATTTGCAGGATTCGTTTAGGCACAACTTCTTTTGCTCTATGTTGTAAAAGCAAA
CTCGTCTCAACACTTTCACGCATTCCAGAGGTGCTGCTCGTTTCTTTCTGCCGTGAACTC
ACCACGGCAATGATGATAACAAGATCGTTCCAACGTTTCTCATCTGCTAGTTGAACTGCA
ACGCTGTCACTTCCATCTTCTTTGCTTCCCATTTCCCACTTGACAAATCCACCAAACAAA
CTCCGGCAAGCACTTCCTGAACCTTGCCTGGCTATTGCAGAAAGATGGCTTGCATCTTCA
TCTACATTCATCAACTCTGCCAGAGAAAAAACAAGACAAGCAAATCCAGCAGCAGAAGAT
GCTAAGCCAGCAGCAGTAGGGAAGTTGTTATGAGAAGCAATATGAAGATGAAGTTTCTCC
CAGTCTTTCTTCTCTATCTTGACACCTTTCTCCTTGTCTTCAACCTCACCACCACGACCT
CGAATCTCCCTCAAACAGTTTTGGTACCTACTCCCAGAAAGAGAGATCTCCTTGCCATTG
AGCCACATTCGGTCGCGATCAAAAGCGGGACTGACGGCAACAGTGGTGATGGTACAGAGG
TGATCGGGATCGAGAGTAACGCTGATGCTGTCGTTGACGGGGAGGATACGGACTTCATCT
CTCTTTCCCCAATACTTTATCACCGCGATGTTCGTTGGAGTTTGCGCCGTCACCATGTAC
ACCCATTTCTCCGCCGCCATATCAAGAAGATATACTCTCCTCCAAGCGTGTAGATAGAAA
CTGTGATCTTCTGTCTGTCC

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR2GP22TF 232 0 0
CCTTGCCATGAGCCCA
TCGGTCGCGATCAAAAGCGGGACTGACG*CAACAGTGGTGATGGTACAGAGGTGATCGGG
ATCGAGAGTAACGCTGATGCTGTCGTTGACGGGGAGGATACGGACTTCATCTCTCTTTCC
CCAATACTTTATCACCGCGATGTTCGTTGGAGTTTGCGCCGTCACCATGTACGCCCATTT
CTCCGCCGCCATATCAAGAGGATATACTCTCCTCC
C

QA 17 231 17 231
DS 



AS 1 3

CO CL2267Contig1 590 3 8 U
GGAATCTTGTCATTTCAGCGGCGCTATCTAAAGAAATCAACCGAGGGTTCAAATCGCAGT
CTGAGAGACAATGTCGACAGTAGGAGAACTTGCTTGCAGCTACGCTGTTATGATCCTTGA
GGACGAGGGCATTGCCATCACTTCTGACAAGATTGCAACAATTGTGAAAGCCTCTGGTGT
GGAGATTGAGTCATACTGGCCAATGCTATTCGCCAAGATGGCTGAGAAGCGTAACGTCAC
CGACCTCATCATGAATGTTGGTGCTGGTGGAGGTGGAGGTGGTGCACCTGTTTCTGTCGC
CGCACCTGCTGCTGCTGGAGGTGCCGCAGCTGCTGCCCCTGCCAAGGAAGAGAAGAAGGA
CGAGCCAGCAGAAGAGAGCGATGGAGATCTTGGATTCGGCTTGTTCGATTAGAGAGTCTC
CTTTGTTTTTAACTCTTTTTTACAATGTGTTGTACTGCTTTAGTTGATTTCAGATCTAAA
GTTTACGCATTGTCAGACATTACTACTACACTTTGGTCCATTTGTTATATCATCTACTCA
ACTCCGAATTTGCAGTCTCTTTTCTTATTTGAACTTAAAAGGGAGAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 0 0 
20 20 20 20 0 0 20 0 0 20 20 0 20 0 0 0 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG96TF U 101
AF RR2AJ60TF U 1
AF RR2EG96JQ C 10
BS 1 296 RR2AJ60TF
BS 297 297 RR2EG96TF
BS 298 479 RR2AJ60TF
BS 480 480 RR2EG96JQ
BS 481 487 RR2AJ60TF
BS 488 489 RR2EG96JQ
BS 490 493 RR2AJ60TF
BS 494 590 RR2EG96JQ

RD RR2EG96TF 228 0 0
TACGCTGTTATGATCCTTGAGGACGAGGGCATTGCCATCACTTCTGACAAGATTGCAACA
ATTGTGAAAGCCTCTGGTGTGGAGATTGAGTCATACTGGCCAATGCTATTCGCCAAGATG
GCTGACAAGCGTAACGTCACCGACCTCATCATGAATGTTGGTGCTGGTGGAGGTGGAGGT
GGTGCACCTGTTTCTGTCGCCGCACCTGCTGCTGCTGGAGGTGCCGCA

QA 1 228 1 228
DS 

RD RR2AJ60TF 497 0 0
GGAATCTTGTCATTTCAGCGGCGCTATCTAAAGAAATCAACCGAGGGTTCAAATCGCAGT
CTGAGAGACAATGTCGACAGTAGGAGAACTTGCTTGCAGCTACGCTGTTATGATCCTTGA
GGACGAGGGCATTGCCATCACTTCTGACAAGATTGCAACAATTGTGAAAGCCTCTGGTGT
GGAGATTGAGTCATACTGGCCAATGCTATTCGCCAAGATGGCTGAGAAGCGTAACGTCAC
CGACCTCATCATGAATGTTGGTGCTGGTGGAGGTGGAGGTGGTGCACCTGTTTCTGCCGC
CGCACCTGCTGCTGCTGGAGGTGCCGCAGCTGCTGCCCCTGCCAAGGAAGAGAAGAAGGA
CGAGCCAGCAGAAGAGAGCGATGGAGATCTTGGATTCGGCTTGTTCGATTAGAGAGTCTC
CTTTGTTTTTAACTCTTTTTTACAATGTGTTGTACTGCTTTAGTTGATTTCAGATCTAAG
GTTTACGTTTTGTTGTT

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2EG96JQ 581 0 0
GG
ATTTCAGCGGCGCTATCTAAAGAAATCAACCGAGGGTTCAAATCGCAGTCTGAGAGACAA
TGTCGACAGTAGGAGAACTTGCTTGCAGCTACGCTGTTATGATCCTTGAGGACGAGGGCA
TTGCCATCACTTCTGACAAGATTGCAACAATTGTGAAAGCCTCTGGTGTGGAGATTGAGT
CATACTGGCCAATGCTATTCGCCAAGATGGCTGAGAAGCGTAACGTCACCGACCTCATCA
TGAATGTTGGTGCTGGTGGAGGTGGAGGTGGTGCACCTGTTTCTGTCGCCGCACCTGCTG
CTGCTGGAGGTGCCGCAGCTGCTGCCCCTGCCAAGGAAGAGAAGAAGGACGAGCCAGCAG
AAGAGAGCGATGGAGATCTTGGATTCGGCTTGTTCGATTAGAGAGTCTCCTTTGTTTTTA
ACTCTTTTTTACAATGTGTTGTACTGCTTTAGTTGATTTCAGATTTTCAGTTTTGGCATT
TTCAGACATTACTACTACACTTTGGTCCATTTGTTATATCATCTACTCAACTCCGAATTT
GCAGTCTCTTTTCTTATTTGAACTTAAAAGGGAGAATAT

QA 3 581 3 581
DS 



AS 1 3

CO CL2268Contig1 939 3 4 U
GGCCTCGAGTGCGGCGACGCTACCGTTAACCACCGCGTCATCTCCCTAAACATATTCGCC
GGTCAGATATCCGGTCAGATCCCGCCTGAAGTCGGTGACTTACCGTATCTTCAGAATCTT
ATATTCCACAAGATCACTAACATCACCGGTCAGATCCCATCCACTATCACCAAGCTCAAG
TATCTCCGTTATCTCAGGCTTAGCTGGCTGAACCTCACCGGCCCGGTTCCTGAGTTTCTG
AGTCAGCTCATGAACCTCGACTACTTAAACCTTTCCTTCAATCAGCTCTCTGGTTCCTTA
CCTAGCTCTCTCTCCTCGTTACCTAAACTTTCGTACGTTGATCTTAGTAGGAATAAGCTT
ACAGGTACAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTCTAGCAGAACCTCCTTACCTTCTCTTA
TCACACAACCAGCTCTCCGGTTCTATACCCAAATCACTAGGCAACACTGATTTTAACCAC
ATAGATTTCTCAAGGAACAAGCTCACAGGCGATGCTTCGATGTTGTTTGGAGCCAAAAAA
ACGACGTTTTCCATTGACTTATCAAGAAACATGTTCCAGTTCGATCTGTCCAGAGTTGAG
CTCCATGAGTCATTTGCTGTCTTGGACTTGAACCACAATAAGATCACTGGGAGTATTCCG
GTTCAGTGGACTAAAAATTCTCTCCAAATCTTAAACGTCAGCTATAACAGACTGTGTGGA
CGCATCCCCACTAGAGGAAGTTTTCAAAGATTTGATTCTTATACATATTTTCACAACAAG
TGTTTGTGTGGTGCACCTCTTGGTAGTTGCAAGTGAAAAAACCAAGCTTATCTCTTGGTT
TTCCCAAATAAATATGTAATGTCATCCGGATGGATCAGTGACAAAAAAAAAAAAGTCATC
CTGATGGATTAAATAAAACATTATCACAACTTGTATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC14TF U 1
AF RR2FE56JQ C 512
AF RR2FE56TF U 345
BS 1 633 RR2CC14TF
BS 634 634 RR2FE56TF
BS 635 654 RR2CC14TF
BS 655 939 RR2FE56TF

RD RR2CC14TF 654 0 0
GGCCTCGAGTGCGGCGACGCTACCGTTAACCACCGCGTCATCTCCCTAAACATATTCGCC
GGTCAGATATCCGGTCAGATCCCGCCTGAAGTCGGTGACTTACCGTATCTTCAGAATCTT
ATATTCCACAAGATCACTAACATCACCGGTCAGATCCCATCCACTATCACCAAGCTCAAG
TATCTCCGTTATCTCAGGCTTAGCTGGCTGAACCTCACCGGCCCGGTTCCTGAGTTTCTG
AGTCAGCTCATGAACCTCGACTACTTAAACCTTTCCTTCAATCAGCTCTCTGGTTCCTTA
CCTAGCTCTCTCTCCTCGTTACCTAAACTTTCGTACGTTGATCTTAGTAGGAATAAGCTT
ACAGGTACAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTCTAGCAGAACCTCCTTACCTTCTCTTA
TCACACAACCAGCTCTCCGGTTCTATACCCAAATCACTAGGCAACACTGATTTTAACCAC
ATAGATTTCTCAAGGAACAAGCTCACAGGCGATGCTTCGATGTTGTTTGGAGCCAAAAAA
ACGACGTTTTCCATTGACTTATCAAGAAACATGTTCCAGTTCGATCTGTCCAGAGTTGAG
CTCCATGAGTCATTTGCTGTCTTGGACTTGAAC*ACAATAAGATCACTGGGAGT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2FE56JQ 282 0 0
ATGCTTCGATGTTGTTTGGAGCCAAAAAAACGACGTTTTCCATTGACTTATCAAGAAACA
TGTTCCAGTTCGATCTGTCCAGAGTTGAGCTCCATGAGTCATTTGCTGTTTTGGACTTGA
ACCACAATAAGATCACTGGGAGTATTCCGGTTCAGTGGACTAAAAATTTTTTCCAAATTT
TAAACGTCAGCTATAACAGACTGTGTGGACGCATCCCCACTAGAGGAAGTTTTCAAAGAT
TTGATTTTTATACATATTTTCACAACAAGTGTTTGTGTGGTG

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR2FE56TF 595 0 0
CGGG
AGGAATAAGCTTACAGGTACAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTCTAGCAGAACCTCCT
TACCTTCTCTTATCACACAACCAGCTCTCCGGTTCTATACCCAAATCACTAGGCAACACT
GATTTTAACCACATAGATTTCTCAAGGAACAAGCTCACAGGCGATGCTTCGATGTTGTTT
GGAGCCAAAAAAACGACGTTTTCCATTGACTTATCAAGAAACATGTTCCAGTTCGATCTG
TCCAGAGTTGAGCTCCATGAGTCATTTGCTGTCTTGGACTTGAACCACAATAAGATCACT
GGGAGTATTCCGGTTCAGTGGACTAAAAATTCTCTCCAAATCTTAAACGTCAGCTATAAC
AGACTGTGTGGACGCATCCCCACTAGAGGAAGTTTTCAAAGATTTGATTCTTATACATAT
TTTCACAACAAGTGTTTGTGTGGTGCACCTCTTGGTAGTTGCAAGTGAAAAAACCAAGCT
TATCTCTTGGTTTTCCCAAATAAATATGTAATGTCATCCGGATGGATCAGTGACAAAAAA
AAAAAAGTCATCCTGATGGATTAAATAAAACATTATCACAACTTGTATTCG

QA 5 595 5 595
DS 



AS 1 4

CO CL2269Contig1 1088 4 2 U
GGAGTGAACAAACAAAAAAAAAAAGCTCCAGCTCTCTCTTTCCCGTCGTCTTCTACGTTG
ATTCGAGCAGAGTTCGTCGTGTCCAGAAAAAAATGTCTCAGTCAGCAGTGGATGTTCCGC
CAAAAGGTGGGTTCAGCTTCGATCTGTGCAAGCGAAACGATATGCTTATACAAAAGGGTC
TTAAAGCTCCCTCCTTTTTGAAGACCGGAACCACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGGACG
GTGTGATACTAGGTGCGGATACGCGAGCAACTGAAGGGCCTATCGTTGCTGATAAGAACT
GTGAGAAAATTCACTACATGGCTCCTAACATTTATTGTTGTGGTGCTGGAACCGCTGCTG
ACACTGAAGCTGTCACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGCGGTTGCATCGTTACCAGACTG
GCCGAGACTCTCGGGTTATTACTGCCTTGACCCTTCTAAAGAAACACCTTTTCAGCTATC
AAGGTCATGTCTCAGCTGCTCTCGTCCTTGGTGGAGTTGACATCACTGGTCCTCATCTTC
ATACTATATACCCACACGGTTCAACGGACACTCTACCATTCGCTACAATGGGTTCTGGGT
CTCTTGCTGCTATGTCTGTGTTTGAGGCAAAGTACAAAGAAGGTCTAACTAGGGATGAAG
GAATTAAGCTGGTCGCTGAGGCCATTTGCTCTGGTATATTCAACGACCTGGGTAGTGGTA
GCAACGTGGACATCTGCGTTATCACTAAGGGGAACAAGGAATATCTGAGGAACTACATGG
AACCAAACCCAAGAACCTATGTCAGCAGTAAAGGCTATTCGTTCACCAAGAAAACAGAGG
TTCTCCGCACCAAAATCACCCCATTGATGGAGCGAGTTGAAATTACAGAAGTGGGTGAAG
CCATGGAAGAGTAAATGAAGAGCGAAGTGTGCGTGAGAGACATATCAGTCTTGTCTTTCT
TTACCAATGAAATGTTTTAAGGATCATTCCAAAATCTTGTGGCTCTGTCCCCATCTTTTT
AGGATTCCACTCTCATGAGACTCAGAAATTTTCTTAAAAGCTAATTACATTTCCAAATCT
TGTGGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB51TF U 109
AF RR2EL70TF U 1
AF RR2FB51JQ C 871
AF RR2EL70JQ C 332
BS 1 626 RR2EL70TF
BS 627 1088 RR2EL70JQ

RD RR2FB51TF 318 0 0
TGGATGTTCCGCCAAAAGGTGGGTTCAGCTTCGATCTGTGCAAGCGAAACGATATGCTTA
TACAAAAGGGTCTTAAAGCTCCCTCCTTTTTGAAGACCGGAACCACCATCGTCGGTTTGA
TCTTCAAGGACGGTGTGATACTAGGTGCGGATACGCGAGCAACTGAAGGGCCTATCGTTG
CTGATAAGAACTGTGAGAAAATTCACTACATGGCTCCTAACATTTATTGTTGTGGTGCTG
GAACCGCTGCTGACACTGAAGCTGTCACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGCGGTTGCATC
GTTACCAGACTGGCCGAG

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR2EL70TF 626 0 0
GGAGTGAACAAACAAAAAAAAAAAGCTCCAGCTCTCTCTTTCCCGTCGTCTTCTACGTTG
ATTCGAGCAGAGTTCGTCGTGTCCAGAAAAAAATGTCTCAGTCAGCAGTGGATGTTCCGC
CAAAAGGTGGGTTCAGCTTCGATCTGTGCAAGCGAAACGATATGCTTATACAAAAGGGTC
TTAAAGCTCCCTCCTTTTTGAAGACCGGAACCACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGGACG
GTGTGATACTAGGTGCGGATACGCGAGCAACTGAAGGGCCTATCGTTGCTGATAAGAACT
GTGAGAAAATTCACTACATGGCTCCTAACATTTATTGTTGTGGTGCTGGAACCGCTGCTG
ACACTGAAGCTGTCACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGCGGTTGCATCGTTACCAGACTG
GCCGAGACTCTCGGGTTATTACTGCCTTGACCCTTCTAAAGAAACACCTTTTCAGCTATC
AAGGTCATGTCTCAGCTGCTCTCGTCCTTGGTGGAGTTGACATCACTGGTCCTCATCTTC
ATACTATATACCCACACGGTTCAACGGACACTCTACCATTCGCTACAATGGGTTCTGGGT
CTCTTGCTGCTATGTCTGTGTTTGAG

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2FB51JQ 122 0 0
AGG
GAGTTGAAATTACAGAAGTGGGTGAAGCCATGGAAGAGTAAATGAAGAGCGAAGTGTGCG
TGAGAGACATATCAGTTTTGTCTTTCTTTACCAATGAAATGTTTTAAGGATCATTCCAA

QA 4 122 4 122
DS 

RD RR2EL70JQ 757 0 0
TTATTGTTGTGGTGCTGGAACCGCTGCTGACACTGAAGCTGTCACTGATATGGTCAGCTC
ACAGCTGCGGTTGCATCGTTACCAGACTGGCCGAGACTCTCGGGTTATTACTGCCTTGAC
CCTTCTAAAGAAACACCTTTTCAGCTATCAAGGTCATGTCTCAGCTGCTTTCGTCCTTGG
TGGAGTTGACATCACTGGTCCTCATCTTCATACTATATACCCACACGGTTCAACGGACAC
TCTACCATTCGCTACAATGGGTTCTGGGTCTCTTGCTGCTATGTCTGTGTTTGAGGCAAA
GTACAAAGAAGGTCTAACTAGGGATGAAGGAATTAAGCTGGTCGCTGAGGCCATTTGCTC
TGGTATATTCAACGACCTGGGTAGTGGTAGCAACGTGGACATCTGCGTTATCACTAAGGG
GAACAAGGAATATCTGAGGAACTACATGGAACCAAACCCAAGAACCTATGTCAGCAGTAA
AGGCTATTCGTTCACCAAGAAAACAGAGGTTCTCCGCACCAAAATCACCCCATTGATGGA
GCGAGTTGAAATTACAGAAGTGGGTGAAGCCATGGAAGAGTAAATGAAGAGCGAAGTGTG
CGTGAGAGACATATCAGTCTTGTCTTTCTTTACCAATGAAATGTTTTAAGGATCATTCCA
AAATCTTGTGGCTCTGTCCCCATCTTTTTAGGATTCCACTCTCATGAGACTCAGAAATTT
TCTTAAAAGCTAATTACATTTCCAAATCTTGTGGCTC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL2270Contig1 964 2 4 U
GATAGGTGATTATGTCGCCGGTCAACTCACCCTCCGCCTCCAGCAACTCGATGTTCAATG
CGGAACCAAGACAAAGGACAATGTGTTTGTGACAGTGGTTGCATCCATACAATACAGAGT
CTTGGTTGACAAGGCAAGTGATGCTTTCTACAGACTTAGCAATCCAACATCACAAATCAA
AGCCTATGTCTTTGATGTGATCAGAGCATGCGTACCGAAGCTGAACTTGGACGATGTGTT
CGAGCAGAAGAATGAAATAGCCAAATCCGTGGAAGAAGAGCTAGACAAAGCCATGACTGC
TTATGGTTATGAGATCCTTCAAACCCTTATCATCGACATCGAGCCTGATCAACAGGTCAA
ACGCGCCATGAACGAAATCAACGCCGCGGCGAGGATGAGAGTGGCGGCGAACGAGAAAGC
AGAGGCGGAGAAAATCATTCAGATAAAGAGAGCAGAAGGTGAAGCTGAGTCCAAGTACCT
TTTTGGTCTCGGTATCGCTCGCCAGAGACAAGCTATCGTGGACGGTCTCAGAGACAGTGT
TCTCGGTTTCGCTGGAAACGTGCCGGGGACGTCAGCTAAGGATGTGTTGGACATGGTGAT
GATGACTCAGTACTTTGACACGATGAGAGACATCGGAGCTCACTCCAAATCTTCGTCCGT
GTTTATTCCTCACGGTCCCGGCGCCGTCGCTGACGTGGCAACACAGATTCGAAACGGATT
ACTTCAGGCCCACCAGACTAATCCCTAAATGGCTCTGTTAAGAGTCAACTCTCTAAAAGT
CTTCTCCCCACTAAATATTTATGATATATACATATATTTTTTTATCGTGATTGTGGTTTT
ATATTTTCTTTTGCTAGATTTAATAATTGTGTCTGTCTGTCTTTGTGATTTTGTAATTAT
ATTGCCAATTAAGTTTGTATAAATTAAAAAGAAGATGCAAGTATAACTCTTATCTCTCAC
TGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2GL13TF U 1
AF RR2GL13JQ C 339
BS 1 580 RR2GL13TF
BS 581 581 RR2GL13JQ
BS 582 660 RR2GL13TF
BS 661 964 RR2GL13JQ

RD RR2GL13TF 660 0 0
GATAGGTGATTATGTCGCCGGTCAACTCACCCTCCGCCTCCAGCAACTCGATGTTCAATG
CGGAACCAAGACAAAGGACAATGTGTTTGTGACAGTGGTTGCATCCATACAATACAGAGT
CTTGGTTGACAAGGCAAGTGATGCTTTCTACAGACTTAGCAATCCAACATCACAAATCAA
AGCCTATGTCTTTGATGTGATCAGAGCATGCGTACCGAAGCTGAACTTGGACGATGTGTT
CGAGCAGAAGAATGAAATAGCCAAATCCGTGGAAGAAGAGCTAGACAAAGCCATGACTGC
TTATGGTTATGAGATCCTTCAAACCCTTATCATCGACATCGAGCCTGATCAACAGGTCAA
ACGCGCCATGAACGAAATCAACGCCGCGGCGAGGATGAGAGTGGCGGCGAACGAGAAAGC
AGAGGCGGAGAAAATCATTCAGATAAAGAGAGCAGAAGGTGAAGCTGAGTCCAAGTACCT
TTTTGGTCTCGGTATCGCTCGCCAGAGACAAGCTATCGTGGACGGTCTCAGAGACAGTGT
TCTCGGTTTCGCTGGAAACGTGCCGGGGACGTCAGCTAAG*ATGTGTTGGACATGGTGAT
GATGACTCAGTACTTTGACACGATGAGAGACATCGGAGCTCACTCCAAATCTTCGTCCGT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2GL13JQ 626 0 0
TCGAGCCTGATCAACAGGTCAAACGCGCCATGAACGAAATCAACGCCGCGGCGAGGATGA
GAGTGGCGGCGAACGAGAAAGCAGAGGCGGAGAAAATCATTCAGATAAAGAGAGCAGAAG
GTGAAGCTGAGTCCAAGTACCTTTTTGGTCTCGGTATCGCTCGCCAGAGACAAGCTATCG
TGGACGGTCTCAGAGACAGTGTTCTCGGTTTCGCTGGAAACGTGCCGGGGACGTCAGCTA
AGGATGTGTTGGACATGGTGATGATGACTCAGTACTTTGACACGATGAGAGACATCGGAG
CTCACTCCAAATCTTCGTCCGTGTTTATTCCTCACGGTCCCGGCGCCGTCGCTGACGTGG
CAACACAGATTCGAAACGGATTACTTCAGGCCCACCAGACTAATCCCTAAATGGCTCTGT
TAAGAGTCAACTCTCTAAAAGTCTTCTCCCCACTAAATATTTATGATATATACATATATT
TTTTTATCGTGATTGTGGTTTTATATTTTCTTTTGCTAGATTTAATAATTGTGTCTGTCT
GTCTTTGTGATTTTGTAATTATATTGCCAATTAAGTTTGTATAAATTAAAAAGAAGATGC
AAGTATAACTCTTATCTCTCACTGTT

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 4

CO CL2271Contig1 1490 4 13 U
TTTTTATCAGCTTGAAAGAAAAAGGTAAGATTCTTGAAGTGCTGAGGAACTGGCCTGAGA
AGAATATTCAGGTCATTGTTGTCACCGATGGGGAGCGCATTTTAGGTTTAGGTGATTTTG
GTTGTCAGGGAATGGGAATACCAGTTGGGAAACTTTCTCTGTATACAGCACTTGGAGGTG
TCCGCCCATCTGCGTGTCTGCCTGTGACAATTGATGTTGGGACAAACAATGAGAAACTGT
TGAATGATGAGTTCTACATTGGACTCCGCCAAAGGAGAGCTACTGGAGAGGAGTACGCTG
AACTTATGCATGAGTTCATGATAGCTGTCAAACAGAACTATGGGGAGAAAGTTGTTATTC
AGTTTGAAGACTTTGCCAACCACAATGCTTTTGACCTGTTAGCTAAGTATGGTACAACAC
ATCTTGTGTTCAATGATGATATTCAGGGCACAGCATCAGTTGTGCTTGCTGGACTTATCG
GCGCACTTAGATTTGTTGGTGGATCCTTAGCTAACCACAGATTCCTCTTCCTCGGTGCTG
GAGAGGCTGGCACAGGAATAGCTGAACTAATTGCTCTTGAGATATCAAAGAAGTGCCAAA
TTCCATTGGAAGAGGCTCGGAAGAATATTTGGCTTGTGGATTCGAAGGGATTGATTGTCA
GTTCCCGTAAAGAATCCATTCAACACTTCAAAAAGCCTTGGGCTCATGACCATAAACCCA
TAAAGGAGCTTGTTGATGCAGTCAAGGCAATCAAGCCGACCGTTTTAATTGGAACATCAG
GAGTAGGTCAAACGTTCACACAAGAAGTGGTGGAAACCATGGCAGAGCTAAATGAGAAAC
CCATCATCCTTTCTCTTTCAAACCCAACTTCTCAGTCAGAATGTACAGCAGAACAGGCTT
ATACTTGGAGTAAGGGACGAGTGATATTTGCAAGTGGAAGCCCATTTGCGCCGGTAGAGC
ATGAGGGGAGGACGTTTGTGCCTGGACAGGCAAACAATGCTCACATATTCCCTGGGTTCG
GACTGGGGCTAATAATGTCAGGGACCATTCGTGTTCATGATGACATGCTTCTGGCTGCTT
CAGAAGCTTTGGCTGAGCAACTGATGGAGGAGCACTATGAGAAGGGGATGATATTCCCTC
CCTTTAGGAATATCAGAAAAATCTCAGCTCGTATTGCAGCTAGAGTGGCTGCCAAGGCCT
ATGAACTGGGATTGGCGACGAGGTTGCCTCAGCCCAAGGAGCTGGAGAAGTGTGCTGAGA
GCAGCATGTACAACCCTTCCTATCATAGCTATCGCTAAGGGGATTATAAGCTTTACACTC
TCTCCTCCCATTCTTTCACCATCTTAATATATGTGTTTGTTATCATCACTATTCGCAATA
ATCTACTAAAACTGCTTCTCTAGAGTCTAGTAGTCATGTTATGTTATGTTGTTTTAGCAT
CTTCGTATAAACATATGTGCAACTGATTTCGTATGATTTTCCTTTTTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI49TF U 1
AF RR2D560TF U 444
AF RR2D560JQ C 1106
AF RR2CI49JQ C 707
BS 1 614 RR2CI49TF
BS 615 615 RR2D560TF
BS 616 643 RR2CI49TF
BS 644 959 RR2D560TF
BS 960 960 RR2CI49JQ
BS 961 993 RR2D560TF
BS 994 994 RR2CI49JQ
BS 995 1038 RR2D560TF
BS 1039 1139 RR2CI49JQ
BS 1140 1140 RR2D560JQ
BS 1141 1272 RR2CI49JQ
BS 1273 1273 RR2D560JQ
BS 1274 1490 RR2CI49JQ

RD RR2CI49TF 643 0 0
TTTTTATCAGCTTGAAAGAAAAAGGTAAGATTCTTGAAGTGCTGAGGAACTGGCCTGAGA
AGAATATTCAGGTCATTGTTGTCACCGATGGGGAGCGCATTTTAGGTTTAGGTGATTTTG
GTTGTCAGGGAATGGGAATACCAGTTGGGAAACTTTCTCTGTATACAGCACTTGGAGGTG
TCCGCCCATCTGCGTGTCTGCCTGTGACAATTGATGTTGGGACAAACAATGAGAAACTGT
TGAATGATGAGTTCTACATTGGACTCCGCCAAAGGAGAGCTACTGGAGAGGAGTACGCTG
AACTTATGCATGAGTTCATGATAGCTGTCAAACAGAACTATGGGGAGAAAGTTGTTATTC
AGTTTGAAGACTTTGCCAACCACAATGCTTTTGACCTGTTAGCTAAGTATGGTACAACAC
ATCTTGTGTTCAATGATGATATTCAGGGCACAGCATCAGTTGTGCTTGCTGGACTTATCG
GCGCACTTAGATTTGTTGGTGGATCCTTAGCTAACCACAGATTCCTCTTCCTCGGTGCTG
GAGAGGCTGGCACAGGAATAGCTGAACTAATTGCTCTTGAGATATCAAAGAAGTGCCAAA
TTCCATTGGAAGAG*CTCGGAAGAATATTTGGCTTGTGGATTC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2D560TF 595 0 0
G
AGGGCACAGCATCAGTTGTGCTTGCTGGACTTATCGGCGCACTTAGATTTGTTGGTGGAT
CCTTAGCTAACCACAGATTCCTCTTCCTCGGTGCTGGAGAGGCTGGCACAGGAATAGCTG
AACTAATTGCTCTTGAGATATCAAAGAAGTGCCAAATTCCATTGGAAGAGGCTCGGAAGA
ATATTTGGCTTGTGGATTCGAAGGGATTGATTGTCAGTTCCCGTAAAGAATCCATTCAAC
ACTTCAAAAAGCCTTGGGCTCATGACCATAAACCCATAAAGGAGCTTGTTGATGCAGTCA
AGGCAATCAAGCCGACCGTTTTAATTGGAACATCAGGAGTAGGTCAAACGTTCACACAAG
AAGTGGTGGAAACCATGGCAGAGCTAAATGAGAAACCCATCATCCTTTCTCTTTCAAACC
CAACTTCTCAGTCAGAATGTACAGCAGAACAGGCTTATACTTGGAGTAAGGGACGAGTGA
TATTTGCAAGTGGAAGCCCATTTGCGCCGGTAGAGTATGAGGGGAGGACGTTTGTGCCTG
GACAGGCAAGCAATGCTCACATATTCCCTGGGTTCGGACTGGGGCTAATAATGT

QA 2 595 2 595
DS 

RD RR2D560JQ 274 0 0
GGAGGAGCACTATGAGAAGGGGATGATATTCCCTCCCTTTAGGAATATCAGAAAAATTTC
AGCTCGTATTGCAGCTAGAGTGGCTGCCAAGGCCTATGAACTGGGATTGGCGACGAGGTT
GCCTCAGCCCAAGGAGCTGGAGAAGTGTGCTGAGAGCAGCATGTACAACCCTTCCTATCA
TAGCTATCGCTAAGGGGATTATAAGCTTTACACTCTC**CTCCCATTCTTTCCCCATCTT
AATATATGTGTTTGTTATCATCACTATTCGCAAT

QA 1 274 1 274
DS 

RD RR2CI49JQ 784 0 0
TGACCATAAACCCATAAAGGAGCTTGTTGATGCAGTCAAGGCAATCAAGCCGACCGTTTT
AATTGGAACATCAGGAGTAGGTTAAACGTTCACACAAGAAGTGGTGGAAACCATGGCAGA
GCTAAATGAGAAACCCATCATCCTTTCTCTTTCAAACCCAACTTCTCAGTCAGAATGTAC
AGCAGAACAGGCTTATACTTGGAGTAAGGGACGAGTGATATTTGCAAGTGGAAGCCCATT
TGCGCCGGTAGAGCATGAGGGGAGGACGTTTGTGCCTGGACAGGCAAACAATGCTTACAT
ATTCCCTGGGTTCGGACTGGGGCTAATAATGTCAGGGACCATTCGTGTTCATGATGACAT
GCTTCTGGCTGCTTCAGAAGCTTTGGCTGAGCAACTGATGGAGGAGCACTATGAGAAGGG
GATGATATTCCCTTCCTTTAGGAATATCAGAAAAATCTCAGCTCGTATTGCAGCTAGAGT
GGCTGCCAAGGCCTATGAACTGGGATTGGCGACGAGGTTGCCTCAGCCCAAGGAGCTGGA
GAAGTGTGCTGAGAGCAGCATGTACAGCCCTTCCTATCATAGCTATCGCTAAGGGGATTA
TAAGCTTTACACTCTCTCCTCCCATTCTTTCACCATCTTAATATATGTGTTTGTTATCAT
CACTATTCGCAATAATCTACTAAAACTGCTTCTCTAGAGTCTAGTAGTCATGTTATGTTA
TGTTGTTTTAGCATCTTCGTATAAACATATGTGCAACTGATTTCGTATGATTTTCCTTTT
TAGG

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 4

CO CL2272Contig1 1209 4 9 U
TTTCTCTGTGAATGATGGCTTATTCTGTGAACATTCAATCTTATGATATGTTAAAAGCAC
AAATAACTTTTAGGAGTTTCAACTTCAAAAAAACAAAACAATTTTCACCTGCGGTAGTCA
ATACCAAAATAATCATACCCGATAAACAGTTTTTTTGTATGTTTACTAACAATCTTCTAC
ATTTTCTAAAAATTATGTATTCAACAACATAGTTCTCTCCCCCTTTGATGGCTTATTCTG
AGGGAGGCCCTGCCTGTCGTAAAAAAAAAGCCATGTCCTGAACCAAGTTGAGCATTTTTT
TAAAGGTTTTGATGGTGAACCCACGGATGAACCAAGAAAGCGGAGGTAGATTTAATGGAG
GATATGGCTGGAAGTATTGGTTTATTATAAGTTTTGACCCAATCCTTCCTTGGCCACCGC
TACATCTTTTATATTCTTCTGGACTCTTTGGTAACCTCTTTTTGCACAACCGCTCTTGAT
CTACATATATAGGCTCCACTTTAAAGTTGCCGTGGAACTCTTTCATCAATATTACTTTCT
CTTTCTTATATTTTGTCGTAAGATCTTTTCTGTTTTCTTCCATAGTTAGATGTATCGGGA
TAGATATAGTCGTCAGCGAAAGGAAGTTATAAGCCATAGCTTTCTCTACCATGACGACCC
GCTTCGGACCATTCTCCTTCAGAACCTTTCTTGATGTGTTTTTCTTGATAACAAACAAAA
ATATATATCACAGTTTCAAGTATTGGCTATATTTAATACCACATTCGAATCATATATATA
ATGATCAGCAAAGAAAACCATTAGGAAACGCCACTTCTCCCTATCGAAAAACGGATCGCT
TTCAGTCATCACGTAGTAGACAATATTAGGAGTCGTTCCCACGGTCAATTCTATGTTCAT
ATGGTAAAGACCCTTCTTATTTGTCATCTTGATCTTGGGAGGTGTATTATGCCATGAATG
CTTCTTCTCTGCTTCATGCCAAAGTCCCTCTTGTCTCGTGTCCTCTTTTTCATCATAATA
CACCACCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTAGTAGTGTCTTTCTCTGACTCCGACTTAGATTC
GCCATTTTCAGATCTCTGGGACTCGGCCTTAAGAGGCTGTTGACTGTTCAAATTGATCCA
GCTACCAAATCCAGTGAACACACCCATTTTATATTCGAAAGTTTAGCCTACTAAAACTGA
TTAGAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ37JQ U 307
AF RR2FZ32JQ U 4
AF RR2FZ32TF C 1
AF RR2DI88TF C 418
BS 1 9 RR2FZ32TF
BS 10 211 RR2FZ32JQ
BS 212 212 RR2FZ32TF
BS 213 306 RR2FZ32JQ
BS 307 322 RR2EQ37JQ
BS 323 323 RR2FZ32JQ
BS 324 416 RR2EQ37JQ
BS 417 698 RR2FZ32TF
BS 699 1209 RR2DI88TF

RD RR2EQ37JQ 110 0 0
TTTTGATGGTGAACCCCCGGATGAACCAAGAAAGCGGAGGTAGATTTAATGGAGGATATG
GCTGGAAGTATTGGTTTATTATAAGTTTTGACCCAATCCTTCCTTGGCCA

QA 1 110 1 110
DS 

RD RR2FZ32JQ 369 0 0
CCCTGG
GAATGATGGCTTATTCTGTGAACATTCAATCTTATGATATGTTAAAAGCACAAATAACTT
TTAGGAGTTTCAACTTCAAAAAAACAAAACAATTTTCACCTGCGGTAGTCAATACCAAAA
TAATCATACCCGATAAACAGTTTTTTTGTATGTTTACTAACAATCTTCTACATTTTCTAA
AAATTATGTATTCAACAACATATTTCTCTCCCCCTTTGATGGCTTATTCTGAGGGAGGCC
CTGCCTGTCGTAAAAAAAAAGCCATGTCCTGAACCAAGTTGAGCATTTTTTTAAAGGTTT
TGATGGTGAACCCACGGATGAACCAAAAAAGCGGAGGTAAATTTAATGGAGGATATGGCT
GGA

QA 7 369 7 369
DS 

RD RR2FZ32TF 699 0 0
TTTCTCTGTGAATGATGGCTTATTCTGTGAACATTCAATCTTATGATATGTTAAAAGCAC
AAATAACTTTTAGGAGTTTCAACTTCAAAAAAACAAAACAATTTTCAGCTGCGGTAGTCG
ATACCAAAATAATCATACGCGATAAACAGTTTTTTTGTATGTTTACTAACAATCTTCTAC
ATTTTCTAAAAATTATGTATTCAACAACATAGTTCTCTCTCGCTTTGATGGCTTATTCTG
AGGGAGGCCCTGCCTGTCGTAAAGAAAAAGCCATGTCCTGAAGCAAGTTGAGCATTTTTT
TAGAGGTTTTGATGGTGAACCCACGGATGAACCAAGAAAGCGGAGGTAGATTTAATGGAG
GATATGGCTGGAAGTATTGGTTTATTATAAGTTTTGACCCAATCCTTCCTTGGCCACCGC
TACATCTTTTATATTCTTCTGGACTCTTTGGTAACCTCTTTTTGCACAACCGCTCTTGAT
CTACATATATAGGCTCCACTTTAAAGTTGCCGTGGAACTCTTTCATCAATATTACTTTCT
CTTTCTTATATTTTGTCGTAAGATCTTTTCTGTTTTCTTCCATAGTTAGATGTATCGGGA
TAGATATAGTCGTCAGCGAAAGGAAGTTATAAGCCATAGCTTTCTCTACCATGACGACCC
GCTTCGGACCATTCTCCTTCAGAACCTTTCTTGATGTG
C

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2DI88TF 792 0 0
CGCTACATCTTTTATATTCTTCTGGACTCTTTGGTAACCTCTTTT*GCACAACCGCTCTT
GATCTACATATATAGGCTCCACTTTAAAGTTGCCGTGGAACTCTTTCATCAATATTACTT
TCTCTTTCTTATATTTTGTCGTAAGATCTTTTCTGTTTTCTTCCATAGTTAGATGTATCG
GGATAGATATAGTCGTCAGCGAAAGGAAGTTATAAGCCATAGCTTTCTCTACCATGACGA
CCCGCTTCGGACCATTCTCCTTCAGAACCTTTCTTGATGTGTTTTTCTTGATAACAAACA
AAAATATATATCACAGTTTCAAGTATTGGCTATATTTAATACCACATTCGAATCATATAT
ATAATGATCAGCAAAGAAAACCATTAGGAAACGCCACTTCTCCCTATCGAAAAACGGATC
GCTTTCAGTCATCACGTAGTAGACAATATTAGGAGTCGTTCCCACGGTCAATTCTATGTT
CATATGGTAAAGACCCTTCTTATTTGTCATCTTGATCTTGGGAGGTGTATTATGCCATGA
ATGCTTCTTCTCTGCTTCATGCCAAAGTCCCTCTTGTCTCGTGTCCTCTTTTTCATCATA
ATACACCACCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTAGTAGTGTCTTTCTCTGACTCCGACTTAGA
TTCGCCATTTTCAGATCTCTGGGACTCGGCCTTAAGAGGCTGTTGACTGTTCAAATTGAT
CCAGCTACCAAATCCAGTGAACACACCCATTTTATATTCGAAAGTTTAGCCTACTAAAAC
TGATTAGAGCCC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 3

CO CL2273Contig1 427 3 2 U
GGACCACAATTTCAATATCTACGATGAAAAGTGTGTTTAAACCTTCGCTTGTTGGTGTTA
TGCTCACAATTCTTCTGCTCAGAGAAATGGTGATTGCTGCTTGGGATCCGAGACGCGCAT
GTGATACATCTTATAAATACAAAAACGGAAAATGTGTATTAAAAAACTGCCAAGCGTTCT
GTCTCAAAACATTTAATGCAAATGCGGTTGGTATGTGCGTTCCGGCAGACAAAGGAAAAA
TGGACTGCAAATGTATACATCATTGCCCTCCTTGATTTTGTTTTATCTCCGTTAAAACTC
ACATAATATTTATAGTAATACTACACTTGTGTCAGAAAAAGAATAGGAATTTTAGTAAAT
TTTTGCGGGTGTTTTGACGTAATAAGATGTATTATGTTATTGAATTAAATATAAATAACA
AATATTG


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2HB05TF U 2
AF RR2FE48JQ C 1
AF RR2FE48TF U 1
BS 1 1 RR2FE48JQ
BS 2 427 RR2FE48TF

RD RR2HB05TF 359 0 0
GACCACAATTTCAATATCTACGATGAAAAGTGTGTTTAAACCTTCGCTTATTGGTGTTAT
ACTCACAATTCTTCTGCTCGGAGAAATGGTGATTGCTGCTTGGGATCCGAGACGCGCATG
TGATACATCTTATAAATACAAAAACGGAAAATGTGTATTAAAAAACTGCCAAGCGTTCTG
TCTCAAAACATTTAATGCAAATGCGGTTGGTATGTGCGTTCCGGCAGACAAAGGAAAAAT
GGACTGCAAATGTATACATCATTGCCCTCCTTGATTTTGTTTTATCTGCGTTAAAACTCA
CATAATATTTATAGTAATACTACACTTGTGTCAGAAAAAGAATAAGAATTTTA
AGTTAC

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR2FE48JQ 427 0 0
GGACCACAATTTCAATATTTACGATGAAAAGTGTGTTTAAACCTTCGCTTGTTGGTGTTA
TGCTCACAATTCTTCTGCTCAGAGAAATGGTGATTGCTGCTTGGGATCCGAGACGCGCAT
GTGATACATCTTATAAATACAAAAACGGAAAATGTGTATTAAAAAACTGCCAAGCGTTCT
GTCTCAAAACATTTAATGCAAATGCGGTTGGTATGTGCGTTCCGGCAGACAAAGGAAAAA
TGGACTGCAAATGTATACATCATTGCCCTCCTTGATTTTGTTTTATCTCCGTTAAAACTC
ACATAATATTTATAGTAATACTACACTTGTGTCAGAAAAAGAATAGGAATTTTAGTAAAT
TTTTGCGGGTGTTTTGACGTAATAAGATGTATTATGTTATTGAATTAAATATAAATAACA
AATATTG

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR2FE48TF 427 0 0
G
GACCACAATTTCAATATCTACGATGAAAAGTGTGTTTAAACCTTCGCTTGTTGGTGTTAT
GCTCACAATTCTTCTGCTCAGAGAAATGGTGATTGCTGCTTGGGATCCGAGACGCGCATG
TGATACATCTTATAAATACAAAAACGGAAAATGTGTATTAAAAAACTGCCAAGCGTTCTG
TCTCAAAACATTTAATGCAAATGCGGTTGGTATGTGCGTTCCGGCAGACAAAGGAAAAAT
GGACTGCAAATGTATACATCATTGCCCTCCTTGATTTTGTTTTATCTCCGTTAAAACTCA
CATAATATTTATAGTAATACTACACTTGTGTCAGAAAAAGAATAGGAATTTTAGTAAATT
TTTGCGGGTGTTTTGACGTAATAAGATGTATTATGTTATTGAATTAAATATAAATAACAA
ATATTG

QA 2 427 2 427
DS 



AS 1 4

CO CL2274Contig1 1024 4 7 U
GGGGAAGCTCTCTCTCTAGAAATCGTTGAAGAATCCTGATTCCATACCAATGGCGACCTC
GCTAGCTCGAATCCCCAGAAGATGCGTCACCTCGTCCCTGTCTTCGAATCTGATCCGGCG
TTACTTCGCAGCGGAAGCTGTAGCGGTGGCGACGAGGACGGAAGCTCCTAAGCCCAAATC
GGAGGTGACGCCGTCGGCGGATCGGGCGAAGTGGGACTACAGAGGCCAGAGACAGATCAT
TCCTCTGGGACAGTGGCTACCCAAGGTCGCAGTCGACGCCTACGTGGCACCTAACGTTGT
GTTGGCCGGTCAGGTCACAGTCTGGGACGGGTCATCCGTCTGGAACGGTGCCGTTTTGAG
GGGAGATCTCAACAAGATCACCCTTGGCTTCTGCTCTAATGTACAAGAACGCTGTGTTGT
TCATGCCGCCTGGTCGTCCCCAACAGGATTACCAGCAGAGACATTGATCGATAGGTATGT
GACGGTTGGTGCATACAGTCTTTTAAGATCGTGCACTATCGAACCAGAATGCATCATCGG
GCAACACTCGATTTTGATGGAAGGTCCCCTGGTGGAGACCCGGTCTATCCTGGAAGCTGG
TTCCGTTGTTCCACCTGGGAGGAGAATCCCATCTGGTGAACTCTGGGGGAGGCAATCCGG
CAAGGTTTATTCGAACACTCACCAATGAGGAAACCTTGGAGATCCCGAAACTGGCTGTTG
CCATTAACCACCTTAGTGGAGACTACTTCTCCGAGTTCTTGCCTTACTCAACTGTCTATC
TTGAGGTTGAGAAGTTCAAGAAATCCCTTGGGATTGCTGTCTAGAAAGCTTTCCTTTTCT
CAGGTTTTCTGGCTACTTCCCTCATTTTGAAGATTCCTTTTCTGTTTCCGAATCGTATCT
TAATAAGTAGCTGCGGAACAAAACTCAGTTTCCAAATGTTGTCTTTTCTGTTTATTTTGT
TAAATTCATATCCTTGTGTTCGAACTTTCGATAATAAGATGATAATGGTGAAAACCTTTT
CCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2H758TF U 1
AF RR2CZ30JQ C 214
AF RR2CZ30TF U 141
AF RR2H758JQB C 311
BS 1 295 RR2H758TF
BS 296 405 RR2CZ30TF
BS 406 406 RR2H758JQB
BS 407 565 RR2CZ30TF
BS 566 566 RR2H758JQB
BS 567 660 RR2CZ30TF
BS 661 1024 RR2H758JQB

RD RR2H758TF 295 0 0
GGGGAAGCTCTCTCTCTAGAAATCGTTGAAGAATCCTGATTCCATACCAATGGCGACCTC
GCTAGCTCGAATCCCCAGAAGATGCGTCACCTCGTCCCTGTCTTCGAATCTGATCCGGCG
TTACTTCGCAGCGGAAGCTGTAGCGGTGGCGACGAGGACGGAAGCTCCTAAGCCCAAATC
GGAGGTGACGCCGTCGGCGGATCGGGCGAAGTGGGACTACAGAGGCCAGAGACAGATCAT
TCCTCTGGGACAGTGGCTACCCAAGGTCGCAGTCGACGCCTACGTGGCACCTAAC

QA 1 295 1 295
DS 

RD RR2CZ30JQ 149 0 0
GGACTACAGAGGCCAGAGACAGATCATTCCTCTGGGACAGTGGCTACCCAAGGTCGCAGT
CGACGCCTACGTGGCACCTAACGTTGTGTTGGCCGGTCAGGTCACAGTCTGGGACGGGTC
ATCCGTCTGGAACGGTGCCGTTTTGAGGG

QA 1 149 1 149
DS 

RD RR2CZ30TF 520 0 0
TAGCGGTGGCGACGAGGACGGAAGCTCCTAAGCCCAAATCGGAGGTGACGCCGTCGGCGG
ATCGGGCGAAGTGGGACTACAGAGGCCAGAGACAGATCATTCCTCTGGGACAGTGGCTAC
CCAAGGTCGCAGTCGACGCCTACGTGGCACCTAACGTTGTGTTGGCCGGTCAGGTCACAG
TCTGGGACGGGTCATCCGTCTGGAACGGTGCCGTTTTGAGGGGAGATCTCAACAAGATCA
CCCTTGGCTTCTGCTCTAATGTACATGAACGCTGTGTTGTTCATGCCGCCTGGTCGTCCC
CAACAGGATTACCAGCAGAGACATTGATCGATAGGTATGTGACGGTTGGTGCATACAGTC
TTTTAAGATCGTGCACTATCGAACCAGAATGCATCATCGGGCAACACTCGATTTTGATGG
AAGGTTCCCTGGTGGAGACCCGGTCTATCCTGGAAGCTGGTTCCGTTGTTCCACCTGGGA
GGAGAATCCCATCTGGTGAACTCTGGGGGAGGCAATCCGG

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2H758JQB 714 0 0
CAGGTCACAGTCTGGGACGGGTCATCCGTCTGGAACGGTGCCGTTTTGAGGGGAGATCTC
AACAAGATCACCCTTGGCTTCTGCTCTAATGTACAAGAACGCTGTGTTGTTCATGCCGCC
TGGTCGTCCCCAACAGGATTACCAGCAGAGACATTGATCGATAGGTATGTGACGGTTGGT
GCATACAGTCTTTTAAGATCGTGCACTATCGAACCAGAATGCATCATCGGGCAACACTCG
ATTTTGATGGAAGGTCCCC*GGTGGAGACCCGGTCTATCCTGGAAGCTGGTTCCGTTGTT
CCACCTGGGAGGAGAATCCCATTTGGTGAACTCTGGGG*AGGCAATCCGGCAAGGTTTAT
TCGAACACTCACCAATGAGGAAACCTTGGAGATCCCGAAACTGGCTGTTGCCATTAACCA
CCTTAGTGGAGACTACTTCTCCGAGTTCTTGCCTTACTCAACTGTCTATCTTGAGGTTGA
GAAGTTCAAGAAATCCCTTGGGATTGCTGTCTAGAAAGCTTTCCTTTTCTCAGGTTTTCT
GGCTACTTCCCTCATTTTGAAGATTCCTTTTCTGTTTCCGAATCGTATCTTAATAAGTAG
CTGCGGAACAAAACTCAGTTTCCAAATGTTGTCTTTTCTGTTTATTTTGTTAAATTCATA
TCCTTGTGTTCGAACTTTCGATAATAAGATGATAATGGTGAAAACCTTTTCCTG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 4

CO CL2275Contig1 1406 4 7 U
GAGAGATGGTATGAACCTTACACCCTATGAATATATAGTGTGCAGACAGGGTCTGCTCGG
GTCTGAATCATATTTTAATGGTCCGAAGAAGAGCATGTTGGTTGCATCGGAGTTTATTGG
ATGCTCTCCTTCGCTTAGTGGGGCTATAAGGGTAAACCCGTGGAACGTGGAAGCGACGGG
AGAAGCTCTAAACGAGGCCCTCTCGATGCGTGATCCCGAGAAACAACTCCGGCATGAGAA
ACACTTCCGGTATGTTAGCACTCACGACGTTGCGTTTTGGTCGAGGAGTTTCCTGCAAGA
CCTGGAGAGGATATGCGTAGATCATTTCAAGAAGAGGTGTTGGGGGATGGGGATCAGTTT
TGGTTTCAGAGTTGTGGCGCTCGATCCTAACTTCAGAAAGCTTTCGATACCGTGCATTGT
GTCGGACTACAAAAGGGCGAAAAGCAGAGCGATACTGTTGGATTATGATGGCACTTTGAT
GCCTCAGAACTCCATCAATAAAGCTCCCAGCCATGAAGTTCTCAAATTCTTGAATGAGCT
TTGTGAGGACAAGAAGAATTCGATTTTCATTGTCAGCGGAAGAGGAAGGGAAAGCTTAGG
CAAATGGTTCTCTCCATGCGAAAACATTGGAATCGCAGCTGAGCATGGATACTTTTTAAA
GTGGCCAGGGAACAAAGAATGGGAAACATGTGGTCAGAGCTGTGATTTTGGTTGGATGCA
GATCGTGGAACCTGTAATGAAACAGTACACTGAAGCTACGGATGGCTCTTCTATCGAAAT
TAAAGACAGTGCTCTGGTTTGGCAATATAGGGATGCGGATTCTGGCTTTGGTTCTTTGCA
ATCAAAGGAAATGTTGGAGCATTTGGAGAGTGTTCTAGCTAATGAGCCTGTTGCAGTCAA
AAGCGGCCACTACATCGTAGAAGTCAAGCCTCAGGGAGTGAGCAAAGGATCAGTGGCAGA
GTAGATATTTTCATCAATGGATGAGAAGGGAAAACCAGTTGATTTCGTGCTATGTATTGG
AGATGACAGATCTGACGAGGACATGTTTGAAGCGATTGGTAATGCCATGTCGAAAAGATT
GCTCTGTGACAATGCGCTCGTCTTTGCATGCACAGTTGGGCAAAAGCCAAGCAAGGCTAA
ATATTATTTGGACGATACTATGGAAGTGACAAGCATGCTTGAGTCTCTAGCTGAAGCATC
AGAGGCTGCAAACTTCAATATGCGTGAACTCGATGAAGCCCTTTGATTTCCAAACCAGAG
TCCTTAGCAAGGATGTTGAAGTAACAAGCAAAACAGCATTTCCTGATCTTTGCTTTTTTT
TTCTTCTTCTAATATTATTACCTATTTGTTATTGTAATTGGATGATCTTGAGAAACTATG
AATTGTTGGATTCGGGTGTTTATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH64TF U 1
AF RR2C922JQ C 920
AF RR2C922TF U 924
AF RR2BH64JQ C 611
BS 1 753 RR2BH64TF
BS 754 925 RR2BH64JQ
BS 926 926 RR2C922JQ
BS 927 1071 RR2C922TF
BS 1072 1072 RR2BH64JQ
BS 1073 1259 RR2C922TF
BS 1260 1406 RR2BH64JQ

RD RR2BH64TF 753 0 0
GAGAGATGGTATGAACCTTACACCCTATGAATATATAGTGTGCAGACAGGGTCTGCTCGG
GTCTGAATCATATTTTAATGGTCCGAAGAAGAGCATGTTGGTTGCATCGGAGTTTATTGG
ATGCTCTCCTTCGCTTAGTGGGGCTATAAGGGTAAACCCGTGGAACGTGGAAGCGACGGG
AGAAGCTCTAAACGAGGCCCTCTCGATGCGTGATCCCGAGAAACAACTCCGGCATGAGAA
ACACTTCCGGTATGTTAGCACTCACGACGTTGCGTTTTGGTCGAGGAGTTTCCTGCAAGA
CCTGGAGAGGATATGCGTAGATCATTTCAAGAAGAGGTGTTGGGGGATGGGGATCAGTTT
TGGTTTCAGAGTTGTGGCGCTCGATCCTAACTTCAGAAAGCTTTCGATACCGTGCATTGT
GTCGGACTACAAAAGGGCGAAAAGCAGAGCGATACTGTTGGATTATGATGGCACTTTGAT
GCCTCAGAACTCCATCAATAAAGCTCCCAGCCATGAAGTTCTCAAATTCTTGAATGAGCT
TTGTGAGGACAAGAAGAATTCGATTTTCATTGTCAGCGGAAGAGGAAGGGAAAGCTTAGG
CAAATGGTTCTCTCCATGCGAAAACATTGGAATCGCAGCTGAGCATGGATACTTTTTAAA
GTGGCCAGGGAACAAAGAATGGGAAACATGTGGTCAGAGCTGTGATTTTGGTTGGATGCA
GATCGTGGAACCTGTAATGAAACAGTACACTGA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2C922JQ 174 0 0
GAAG
TCAAGCCTCAGGGAGTGAGCAAAGGATCAGTGGCAGAGTAGATATTTTCATCAATGGATG
AGAAGGGAAAACCAGTTGATTTCGTGCTATGTATTGGAGATGACAGATCTGACGAGGACA
TGTTTGAAGCGATTGGTAATGCCATGTCGAAAAGATTGCTCTGTGACAAT

QA 5 174 5 174
DS 

RD RR2C922TF 336 0 0
TCA
AGCCTCAGGGAGTGAGCAAAGGATCAGTGGCAGAGTAGATATTTTCATCAATGGATGAGA
AGGGAAAACCAGTTGATTTCGTGCTATGTATTGGAGATGACAGATCTGACGAGGACATGT
TTGAAGCGATTGGTAATGCCATGTCAAAAAGATTGCTCTGTGACAATGCGCTCGTCTTTG
CATGCACAGTTGGGCAAAAGCCAAGCAAGGCTAAATATTATTTGGACGATACTATGGAAG
TGACAAGCATGCTTGAGTCTCTAGCTGAAGCATCAGAGGCTGCAAACTTCAATATGCGTG
AACTCGATGAAGCCCTTTGATTTCCAAACCAGA

QA 4 336 4 336
DS 

RD RR2BH64JQ 796 0 0
TCTCCATGCGAAAACATTGGAATCGCAGCTGAGCATGGATACTTTTTAAAGTGGCCAGGG
AACAAAGAATGGGAAACATGTGGTCAGAGCTGTGATTTTGGTTGGATGCAGATCGTGGAA
CCTGTAATGAAACAGTACACTGAAGCTACGGATGGCTCTTCTATCGAAATTAAAGACAGT
GCTCTGGTTTGGCAATATAGGGATGCGGATTCTGGCTTTGGTTCTTTGCAATCAAAGGAA
ATGTTGGAGCATTTGGAGAGTGTTCTAGCTAATGAGCCTGTTGCAGTCAAAAGCGGCCAC
TACATCGTAGAAGTCGAGCCTCAGGGAGTGAGCAAAGGATCAGTGGCAGAGAAGATATTT
TCATCAATGGATGAGAAGGGAAAACCAGTTGATTTCGTGCTATGTATTGGAGATGACAGA
TCTGACGAGGACATGTTTGAAGCGATTGGTAATGCCATGTCGAAAAGATTGCTCTGTGAC
AATGCGCTCGTCTTTGCATGCACAGTTGGGCAAAAGCCAAGCAAGGCTAAATATTATTTG
GACGATACTATGGAAGTGACAAGCATGCTTGAGTCTCTAGCTGAAGCATCAGAGGCTGCA
AACTTCAATATGCGTGAACTCGATGAAGCCCTTTGATTTCCAAACCAGAGTCCTTAGCAA
GGATGTTGAAGTAACAAGCAAAACAGCATTTCCTGATCTTTGCTTTTTTTTTCTTCTTCT
AATATTATTACCTATTTGTTATTGTAATTGGATGATCTTGAGAAACTATGAATTGTTGGA
TTCGGGTGTTTATTGG

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 4

CO CL2276Contig1 1262 4 18 U
GGCGGCTGATCCGTGAAAAAGATGGGGGTTGATCTTGAATCTATATCGGAGGCTACATCT
GGAGCTATAGGCTCGCTTCTCAGCACAACCATTCTGTACCCTCTCGATACCTGCAAATCC
AAGTTCCAAGCCGAGATCAGCGTTCGCGGTCAGCAGAAATACAGATACTTGTCGGATGTA
TTTTGGGAAGCGATTTCTACAGGGAATGTTCTGTCTCTGTATCAAGGCCTTGGGACGAAG
AATCTTCAGTCCTTCGTTTCCTCTTTCATCTACTTCTACAGTTATAGCTATTTCAAGAGG
TTGCATTGTGAAAGGATTGGTTCTAAGTCAATTGGTACAAAGGCTAACCTGCTCCTTGCT
GCTGCTGCTGGAGTTTGTACCTCTGTTCTCACCCAACCTCTAGATACAGCTTCATCGAGG
ATGCAAACCAGCGAGTTTGGAAAAGCTAAAGGGGTTGTGGAATACCTTAACTGAAGGTGC
TTGGGGAAATGCATTTGATGGCATTGGGATCTCTCTTTTACTCACCTCCAATCCTGCAAT
TCAGTATACAGTGTTTGATCAGCTGAAACAGAACCTCCTTGAAAAAAGAAAGGCAAAAAC
CAACAAAGACTCTTCCCCCGTAGTCCTCTCTGCTTTTATGGCCTTCTTGTTAGGTGCCGT
GTCGAAGAGTGCTGCTACCGTCATCACATATCCAGCAATCAGGTGCAAGGTGATGATCCA
AGCAGCGGATGACTCGAAGGACAGTGAAGCGAAGAAGCACCCAAAAAGAACCAGCAAAAC
GATTAGCGGGGTCATCTCTGCCATATGGAAAAAAGAAGGGATCTTAGGGTTCTTCAAAGG
CTTGCAGGCTCAGATCTTAAAGACGGTTCTGAGCTCGGCGTTGCTGCTAATGATCAAGGA
GAAAATCACTGCAACCACATGGTTTCTCATTCTTGCAATAAGAAAAACTCTGTTTGCCAC
GAAAGGTAGGTTGAAAAATCCATAAAGATGAATCATCCGACCGCAAGTGTCCCAAGGCCA
TGCAAGAGTAAAAAACTTTGGTCTGGCAAGTATGTTATTGAATTGGAGCAGGCAAGCATT
GTAGACTTTTCTCTTTTCAAAAACAATTTGGATTTTTGTTTTAAACAAGGATCTGATTTA
TAGGGATTGCCAGATTGAGTTTCTGGGAATAGAGAACTTTCTGGTTATTGTGTAGTTACG
TTTTTATTTCTTCAGTTGTAATAAAAAACAATGATCTATCTGTAGGATCATGTGACTCTT
AT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2G684TF U 1
AF RR2B390TF U 38
AF RR2B390JQ C 479
AF RR2G684JQ C 588
BS 1 418 RR2G684TF
BS 419 702 RR2B390TF
BS 703 703 RR2B390JQ
BS 704 739 RR2B390TF
BS 740 740 RR2B390JQ
BS 741 778 RR2B390TF
BS 779 779 RR2B390JQ
BS 780 811 RR2B390TF
BS 812 1022 RR2B390JQ
BS 1023 1023 RR2G684JQ
BS 1024 1051 RR2B390JQ
BS 1052 1052 RR2G684JQ
BS 1053 1076 RR2B390JQ
BS 1077 1077 RR2G684JQ
BS 1078 1090 RR2B390JQ
BS 1091 1091 RR2G684JQ
BS 1092 1236 RR2B390JQ
BS 1237 1262 RR2G684JQ

RD RR2G684TF 418 0 0
GGCGGCTGATCCGTGAAAAAGATGGGGGTTGATCTTGAATCTATATCGGAGGCTACATCT
GGAGCTATAGGCTCGCTTCTCAGCACAACCATTCTGTACCCTCTCGATACCTGCAAATCC
AAGTTCCAAGCCGAGATCAGCGTTCGCGGTCAGCAGAAATACAGATACTTGTCGGATGTA
TTTTGGGAAGCGATTTCTACAGGGAATGTTCTGTCTCTGTATCAAGGCCTTGGGACGAAG
AATCTTCAGTCCTTCGTTTCCTCTTTCATCTACTTCTACAGTTATAGCTATTTCAAGAGG
TTGCATTGTGAAAGGATTGGTTCTAAGTCAATTGGTACAAAGGCTAACCTGCTCCTTGCT
GCTGCTGCTGGAGTTTGTACCTCTGTTCTCACCCAACCTCTAGATACAGCTTCATCGA

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR2B390TF 774 0 0
AATCTATATCGGAGGCTACATCTGGAGCTATAGGCTCGCTTCTCAGCACAACCATTCTGT
ACCCTCTCGATACCTGCAAATCCAAGTTCCAAGCCGAGATCAGCGTTCGCGGTCAGCAGA
AATACAGATACTTGTCGGATGTATTTTGGGAAGCGATTTCTACAGGGAATGTTCTGTCTC
TGTATCAAGGCCTTGGGACGAAGAATCTTCAGTCCTTCGTTTCCTCTTTCATCTACTTCT
ACAGTTATAGCTATTTCAAGAGGTTGCATTGTGAAAGGATTGGTTCTAAGTCAATTGGTA
CAAAGGCTAACCTGCTCCTTGCTGCTGCTGCTGGAGTTTGTACCTCTGTTCTCACCCAAC
CTCTAGATACAGCTTCATCGAGGATGCAAACCAGCGAGTTTGGAAAAGCTAAAGGGGTTG
TGGAATACCTTAACTGAAGGTGCTTGGGGAAATGCATTTGATGGCATTGGGATCTCTCTT
TTACTCACCTCCAATCCTGCAATTCAGTATACAGTGTTTGATCAGCTGAAACAGAACCTC
CTTGAAAAAAGAAAGGCAAAAACCAACAAAGACTCTTCCCCCGTAGTCCTCTCTGCTTTT
ATGGCCTTCTTGTTAGGTGCCGTGTCGAAGAGTGCTGCTACCGTCATCACATATCCAGCA
ATCAG*TGCAAGGTGATGATCCAAGCAGCGGATGACTCGAAG*ACAGTGAAGCGAAGAAG
CACCCAAAAAGAACCAGCAAA*CGATTAGCGGGGTCATCTCTGCCATATGGAAA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2B390JQ 759 0 0
GCTTGGGGAAATGCATTTGATGGCATTGGGATCTCTCTTTTACTCACCTCCAATCCTGCA
ATTCAGTATACAGTGTTTGATCAGCTGAAACAGAACCTCCTTGAAAAAAGAAAGGCAAAA
ACCAACAAAGACTCTTCCCCCGTAGTCCTCTCTGCTTTTATGGCCTTCTTGTTAGGTGCC
GTGTCGAAGAGTGCTGCTACCGTCATCACATATCCAGCAATCAGGTGCAAGGTGATGATC
CAAGCAGCGGATGACTCGAAGGACAGTGAAGCGAAGAAGCACCCAAAAAGAACCAGCAAA
ACGATTAGCGGGGTCATTTCTGCCATATGGAAAAAAGAAGGGATCTTAGGGTTCTTCAAA
GGCTTGCAGGCTCAGATCTTAAAGACGGTTCTGAGCTCGGCGTTGCTGCTAATGATCAAG
GAGAAAATCACTGCAACCACATGGTTTCTCATTCTTGCAATAAGAAAAACTCTGTTTGCC
ACGAAAGGTAGGTTGAAAAATCCATAAAGATGAATCATCCGACCGCAAGTGTCCCAAGGC
CATGTAAGAGTAAAAAACTTTGGTCTGGCAAGTGTGTTATTGAATTGGAGCAGGCAAGTA
TTGTAGACTTTTTTCTTTTCAAAAACAATTTGGATTTTTGTTTTAAACAAGGATCTGATT
TATAGGGATTGCCAGATTGAGTTTCTGGGAATAGAGAACTTTCTGGTTATTGTGTAGTTA
CGTTTTTATTTCTTCAGTTGTAATAAAAAACAATGATC
C

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2G684JQ 675 0 0
GAAAGGCAAAAACCAACAAAGACTCTTCCCCTGTAGTCCTCTCTGCTTTTATGGCCTTCT
TGTTAGGTGCCGTGTCGAAGAGTGCTGCTACCGTCATCACATATCCAGCAATCAGGTGCA
AGGTGATGATCCAAGCAGCGGATGACTCGAAGGACAGTGAAGCGAAGAAGCACCCAAAAA
GAACCAGCAAAACGATTAGCGGGGTCATCTCTGTCATATGGAAAAAAGAAGGGATCTTAG
GGTTCTTCAAAGGCTTGCAGGCTCAGATCTTAAAGACGGTTCTGAGCTCGGCGTTGCTGC
TAATGATCAAGGAGAAAATCACTGCAACCACATGGTTTCTCATTCTTGCAATAAGAAAAA
CTCTGTTTGCCACGAAAGGTAGGTTGAAAAATCCATAAAGATGAATCATCCGACCGCAAG
TGTCCCAAGGCCATGCAAGAGTAAAAAACTTTGGTCTGGCAAGTATGTTATTGAATTGGA
GCAGGCAAGCATTGTAGACTTTTCTCTTTTCAAAAACAATTTGGATTTTTGTTTTAAACA
AGGATCTGATTTATAGGGATTGCCAGATTGAGTTTCTGGGAATAGAGAACTTTCTGGTTA
TTGTGTAGTTACGTTTTTATTTCTTCAGTTGTAATAAAAAACAATGATCTATCTGTAGGA
TCATGTGACTCTTAT

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 4

CO CL2277Contig1 431 4 3 U
GGAATACCAAAGAACACAAACCTATAAACAATGGCTGACGCAACAGAAAGAGCTGAGCAC
GACCGTGTTTTCAAGAAATTTGATGCTAACGGAGATGGAAAAATATCTGCTTCCGAGCTT
GGAGATGCTCTCAAGAACCTTGGCTCGGTCACACACGACGACATTAAGCGTATGATGGCC
GAGATTGATACGGATGGTGATGGATACATATCGTACCAAGAATTTTCTGATTTCGCAAGT
GCCAACCGTGGTCTCATGAAAGATGTGGCCAAGATTTTCTAAACGATATTATCAAATTTT
ATTTGAGAGATAATCATGTTTAATTTGTTTTCTTAATGACAATCATCTGATTAAGTATGT
TTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATGATATAATTGAAAATTCTCGATT
CTTTTAACGGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW96JQ C 231
AF RR2AR66TF U 1
AF RR2BW96TF U 292
AF RR2GM66TF U 1
BS 1 92 RR2AR66TF
BS 93 93 RR2GM66TF
BS 94 431 RR2AR66TF

RD RR2BW96JQ 186 0 0
TTTCGCAAGTGCCAACCGTGGTCTCATGAAAGATGTGGCCAAGATTTTCTAAACGATATT
ATCAAATTTTATTTGAGAGATAATCATGTTTAATTTGTTTTCTTAATGACAATCATCTGA
TTAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATGATATAATTGAAA
ATTCTC

QA 1 186 1 186
DS 

RD RR2AR66TF 431 0 0
GGAATACCAAAGAACACAAACCTATAAACAATGGCTGACGCAACAGAAAGAGCTGAGCAC
GACCGTGTTTTCAAGAAATTTGATGCTAACGGGGATGGAAAAATATCTGCTTCCGAGCTT
GGAGATGCTCTCAAGAACCTTGGCTCGGTCACACACGACGACATTAAGCGTATGATGGCC
GAGATTGATACGGATGGTGATGGATACATATCGTACCAAGAATTTTCTGATTTCGCAAGT
GCCAACCGTGGTCTCATGAAAGATGTGGCCAAGATTTTCTAAACGATATTATCAAATTTT
ATTTGAGAGATAATCATGTTTAATTTGTTTTCTTAATGACAATCATCTGATTAAGTATGT
TTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATGATATAATTGAAAATTCTCGATT
CTTTTAACGGT

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR2BW96TF 140 0 0
TCAAATTTTATTTGAGAGATAATCATGTTTAATTTGTTTTCTTAATGACAATCATCTGAT
TAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATGATATAATTGAAAA
TTCTCGATTCTTTT
AACGAT

QA 1 134 1 134
DS 

RD RR2GM66TF 425 0 0
GGAATACCAAAGAACACAAACCTATAAACAATGGCTGACGCAACAGAAAGAGCTGAGCAC
GACCGTGTTTTCAAGAAATTTGATGCTAACGGAGATGGAAAAATATCTGCTTCCGAGCTT
GGAGATGCTCTCAAGAACCTTGGCTCGGTCACACACGACGACATTAAGCGTATGATGGCC
GAGATTGATACGGATGGTGATGGATACATATCGTACCAAGAATTTTCTGATTTCGCAATT
GCCAACCGTGGTCTCATGAAAGATGTGGCCAAGATTTTCTAAACGATATTATCAAATTTT
ATTTGAGAGATAATCATGTTTAATTTGTTTTCTTAATGACAATCATCTGATTAAGTATGT
TTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATGATATAATTGAAAATTCTCGATT
CTTTT

QA 1 425 1 425
DS 



AS 1 4

CO CL2278Contig1 1301 4 6 U
TTTTTTTTCTAGAATTAGAAGTTTGTTATTTGTGGTGTTGGTGTTGAGATCACATGGCTG
GGATTTGCTGTGTTGTTGTTGGGGAGAGTGAACCGGCTGCCCCGGTTGATTCAGTTACTC
GAACTTCTCTTAAACGGAGGTTAGATCTACTTCCCTCGATCAAGATCGTCGCCAAATCCT
CCGTCACTCCTCCGCTTAAACGGCAGAAGCGTGAGACACCATCTCTCGTTTTGGCGCGGG
AAAATCTAGATCTGAAATCGAACTTGAGTAGAGATAGGAGGAAGGTGGAGGAGGAGGAGA
AAAATCTAAATACGACGGAGGCAGAGAGCTGTTTCTTCTCCGACGATGCGCCTAAGATCG
GCACGACGTCGGTTTGCGGCAGGAGGAGAGACATGGAGGACGCCGTATCCCTCCACCCTT
CGCTTCTTCGGAATCTCCACTTCTACGGCGTGTTCGACGGCCACGGCTGCTCTCACGTCG
CGGAGAAGTGCAGAGAGCGGTTGCACGAGATAGTGAAGCACGAGGTCGAAGCTATGAACG
GCGACGAGTGTTGGAAGGAGACGATGGCGAAGAGCTTCAAGAAGATGGATACGGAAGTTA
GCCGGCGAGACTCGAGCACGAAGAGCTCCTGCAGATGTGAATTGCAGTCTCCTCAGTGCG
ACGCAGTCGGATCCACCGCCGTCGTGTCCGTGCTCACGCCGGAGAAGATCGTCGTCTCTA
ATTGCGGCGACTCTCGCGCCGTGCTTTGCCGTAACGGTGTCGCCGTCCCTCTCTCGATAG
ATCATAAGCCGGATCGACCCGATGAGTTGAATCGGATCCAGGAAGCAGGCGGGCGGGTTA
TCTACTGGGACGGAGCTAGGGTTCTAGGAGTTCTCGCCATGTCTAGAGCAATTGGTGATA
ATTACCTTAAACCGTACGTGATTCCGGATCCGGAGGTGACGGTAACGGATCGAACAGACG
ATGACGAGTGTTTGATCCTGGCGAGTGATGGACTCTGGGACGTTGTGACGAACGAGACGG
CGTGCGGCGTGGCTCGCATGTGTCTTAAAGCTGCGGAAGGTGGAGGAGACTCTGAGACGG
CGCACAACGCGTGCTCCGATGCGGCGTTGCTATTGACGAAGCTGGCTCTGGCGAGACAGA
GCTCTGATAACATGAGCGTTGTAGTGGTTGACTTGAGGAAAAGAAGGATAATCGAGTATC
TTAATTAGTGCTATAATTAGTATAAAACATTAGATAAATTGTTTCATAGCTAATTGTATT
TTTTGCTGATTTTGTTTTCTATTCTAGTTTAGTTTTCTCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DI51TF U 1
AF RR2F355TF U 1
AF RR2F355JQ C 428
AF RR2DI51JQ C 847
BS 1 739 RR2DI51TF
BS 740 740 RR2F355JQ
BS 741 753 RR2DI51TF
BS 754 1007 RR2F355JQ
BS 1008 1008 RR2DI51JQ
BS 1009 1301 RR2F355JQ

RD RR2DI51TF 753 0 0
TTTTTTTTCTAGAATTAGAAGTTTGTTATTTGTGGTGTTGGTGTTGAGATCACATGGCTG
GGATTTGCTGTGTTGTTGTTGGGGAGAGTGAACCGGCTGCCCCGGTTGATTCAGTTACTC
GAACTTCTCTTAAACGGAGGTTAGATCTACTTCCCTCGATCAAGATCGTCGCCAAATCCT
CCGTCACTCCTCCGCTTAAACGGCAGAAGCGTGAGACACCATCTCTCGTTTTGGCGCGGG
AAAATCTAGATCTGAAATCGAACTTGAGTAGAGATAGGAGGAAGGTGGAGGAGGAGGAGA
AAAATCTAAATACGACGGAGGCAGAGAGCTGTTTCTTCTCCGACGATGCGCCTAAGATCG
GCACGACGTCGGTTTGCGGCAGGAGGAGAGACATGGAGGACGCCGTATCCCTCCACCCTT
CGCTTCTTCGGAATCTCCACTTCTACGGCGTGTTCGACGGCCACGGCTGCTCTCACGTCG
CGGAGAAGTGCAGAGAGCGGTTGCACGAGATAGTGAAGCACGAGGTCGAAGCTATGAACG
GCGACGAGTGTTGGAAGGAGACGATGGCGAAGAGCTTCAAGAAGATGGATACGGAAGTTA
GCCGGCGAGACTCGAGCACGAAGAGCTCCTGCAGATGTGAATTGCAGTCTCCTCAGTGCG
ACGCAGTCGGATCCACCGCCGTCGTGTCCGTGCTCACGCCGGAGAAGATCGTCGTCTCTA
ATTGCGGCGACTCTCGCGC*GTGCTTTGCCGTA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2F355TF 744 0 0
TTTTTTTTCTAGAATTAGAAGTTTGTTATTTGTGGTGTTGGTGTTGAGATCACATGGCTG
GGATTTGCTGTGTTGTTGTTGGGGAGAGTGAACCGGCTGCCCCGGTTGATTCAGTTACTC
GAACTTCTCTTAAACGGAGGTTAGATCTACTTCCCTCGATCAAGATCGTCGCCAAATCCT
CCGTCACTCCTCCGCTTAAACGGCAGAAGCGTGAGACACCATCTCTCGTTTTGGCGCGGG
AAAATCTAGATCTGAAATCGAACTTGAGTAGAGATAGGAGGAAGGTGGAGGAGGAGGAGA
AAAATCTAAATACGACGGAGGCAGAGAGCTGTTTCTTCTCCGACGATGCGCCTAAGATCG
GCACGACGTCGGTTTGCGGCAGGAGGAGAGACATGGAGGACGCCGTATCCCTCCACCCTT
CGCTTCTTCGGAATCTCCACTTCTACGGCGTGTTCGACGGCCACGGCTGCTCTCACGTCG
CGGAGAAGTGCAGAGAGCGGTTGCACGAGATAGTGAAGCACGAGGTCGAAGCTATGAACG
GCGACGAGTGTTGGAAGGAGACGATGGCGAAGAGCTTCAAGAAGATGGATACGGAAGTTA
GCCGGCGAGACTCGAGCACGAAGAGCTCCTGCAGATGTGAATTGCAGTCTCCTCAGTGCG
ACGCAGTCAGATCCACCGCCGTCGTGTCCGTGCTCACGCCGGAGAAGATCGTCGTCTCTA
ATTGCGGCGACTCTCGCGC
CGTGC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2F355JQ 874 0 0
CTCGG
ATCTCCACTTCTACGGCGTGT*CGACGGCCACGGCTGCTCTCACGTCGCGGAGAAGTGCA
GAGAGCGGTTGCACGAGATAGTGAAGCACGAGGTCGAAGCTATGAACGGCGACGAGTGTT
GGAAGGAGACGATGGCGAAGAGCTTCAAGAAGATGGATACGGAAGTTAGCCGGCGAGACT
CGAGCACGAAGAGCTCCTGCAGATGTGAATTGCAGTCTCCTCAGTGCGACGCAGTCGGAT
CCACCGCCGTCGTGTCCGTGCTCACGCCGGAGAAGATCGTCGTCTCTAATTGCGGCGACT
CTCGCGCCGTGCTTTGCCGTAACGGTGTCGCCGTCCCTCTCTCGATAGATCATAAGCCGG
ATCGACCCGATGAGTTGAATCGGATCCAGGAAGCAGGCGGGCGGGTTATCTACTGGGACG
GAGCTAGGGTTCTAGGAGTTCTCGCCATGTCTAGAGCAATTGGTGATAATTACCTTAAAC
CGTACGTGATTCCGGATCCGGAGGTGACGGTAACGGATCGAACAGACGATGACGAGTGTT
TGATCCTGGCGAGTGATGGACTCTGGGACGTTGTGGCGAACGAGACGGCGTGCGGCGTGG
CTCGCATGTGTCTTAAAGCTGCGGAAGGTGGAGGAGACTCTGAGACGGCGCACAACGCGT
GCTCCGATGCGGCGTTGCTATTGACGAAGCTGGCTCTGGCGAGACAGAGCTCTGATAACA
TGAGCGTTGTAGTGGTTGACTTGAGGAAAAGAAGGATAATCGAGTATCTTAATTAGTGCT
ATAATTAGTATAAAACATTAGATAAATTGTTTCATAGCTAATTGTATTTTTTGCTGATTT
TGTTTTCTATTCTAGTTTAGTTTTCTCTC

QA 6 874 6 874
DS 

RD RR2DI51JQ 455 0 0
GGGACGGAGCTAGGGTTCTAGGAGTTCTCGCCATGTCTAGAGCAATTGGTGATAATTCCC
TTAACCCGTACGTGATTCCGGATCCGGAGGTGACGGTAACGGATCGAACAGACGATGACG
AGTGTTTGATCCTGGCGAGTGATGGACTCTGGGACGTTGTGACGAACGAGACGGCGTGCG
GCGTGGCTCGCATGTGTCTTAAAGCTGCGGAAGGTGGAGGAGACTCTGAGACGGCGCACA
ACGCGTGCTCCGATGCGGCGTTGCTATTGACGAAGCTGGCTCTGGCGAGACAGAGCTCTG
ATAACATGAGCGTTGTAGTGGTTGACTTGAGGAAAAGAAGGATAATCGAGTATCTTAATT
AGTGCTATAATTAGTATAAAACATTAGATAAATTGTTTCATAGCTAATTGTATTTTTTGC
TGATTTTGTTTTCTATTCTAGTTTAGTTTTCTCTC

QA 1 455 1 455
DS 



AS 1 4

CO CL2279Contig1 444 4 4 U
GGAAAACACAATTAGTTCATTATTTAAGATGAAAATATCTTTTCAAACTTCGCTTATTGG
CTTCATTTTGGTCACAATCTTTCTACTAGGAGTAGTGGTGTCTGCTCAAAAGGGAGGACC
AAGCACAGAAAGAACTTGTACTGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAA
GCAATGTGAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGACAAAAGGGGATGGTAGGTGCCTACCCAT
AGGCAAAGGAGATTTTCAATGCAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACC
CACATTGAAGCTCAAATCTATTCCATTTTTAATAAGTCACAACTTTTTTTCACGTGTGAT
ATTTAAAAAAATAGATCTTCATTAGAAGGTCATGTTTCATTTATTTCTAAATAAAATTTT
GGCATCATAACTAAATCATCTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B151JQ C 1
AF RR2B151TF U 1
AF RR2BB73TF U 2
AF RR2CW19TF U 6
BS 1 7 RR2B151JQ
BS 8 407 RR2B151TF
BS 408 432 RR2BB73TF
BS 433 444 RR2CW19TF

RD RR2B151JQ 408 0 0
GGAAAACACAATTAGTTCATTATTTAAGATGAAAATATCTTTTCAAACTTCGCTTATTGG
CTTCATTTTGGTCACAATCTTTCTACTAGGAGTAGTGGTGTCTGCTCAAAAGGGAGGACC
AAGCACAGAAAGAACTTGTACTGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAA
GCAATGTGAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGACAAAAGGGGATGGTAGGTGCCTACCCAT
AGGCAAAGGAGATTTTCAATGCAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACC
CACATTGAAGCTCAAATCTATTCCATTTTTAATAAGTCACAACTTTTTTTCACGTGTGAT
ATTTAAAAAAATAGATCTTCATTAGAAGGTCATGTTTCATTTATTTC
G

QA 1 407 1 407
DS 

RD RR2B151TF 408 0 0
GGAAAAC
ACAATTAGTTCATTATTTAAGATGAAAATATCTTTTCAAACTTCGCTTATTGGCTTCATT
TTGGTCACAATCTTTCTACTAGGAGTAGTGGTGTCTGCTCAAAAGGGAGGACCAAGCACA
GAAAGAACTTGTACTGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAAGCAATGT
GAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGACAAAAGGGGATGGTAGGTGCCTACCCATAGGCAAA
GGAGATTTTCAATGCAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACCCACATTG
AAGCTCAAATCTATTCCATTTTTAATAAGTCACAACTTTTTTTCACGTGTGATATTTAAA
AAAATAGATCTTCATTAGAAGGTCATGTTTCATTTATTTC
G

QA 8 407 8 407
DS 

RD RR2BB73TF 431 0 0
GGAAAC
ACAATTAGTTCATTATTTAAGATGAAAATATCTTTTCAAACTTCGCTTATTGGCTTCATT
TTGGTCACAATCTTTCTACTAGGAGTAGTGGTGTCTGCTCAAAAGGGAGGACCAAGCACA
GAAAGAACTTGTACTGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAAGCAATGT
GAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGACAAAAGGGGATGGTAGGTGCCTACCCATAGGCAAA
GGAGATTTTCAATGCAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACCTACATTG
AAGCTCAAATCTATTCCATTTTTAATAAGTCACAACTTTTTTTCACGTGTGATATTTAAA
AAA*TAGATCTTCATTAGAAGGTCATGTTTCATTTATTTCTAAATAAAATTTTGGCATCA
TAACT

QA 7 431 7 431
DS 

RD RR2CW19TF 439 0 0
GG
ACAATTAGTTCATTATTTAAGATGAAAATATCTTTTTAAACTTCGCTTATTGGCTTCATT
TTGGTCACAATCTTTCTACTAGGAGTAGTGGTGTCTGTTCAAAAGGGAGGACCAAGCACA
GAAAGAACTTGTACTGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAAGCAATGT
GAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGCCAAAAGGAGTTGGTAGGTGCCTACCCATAGGCAAA
GGAGATTTTCAATGCAGATGCTATTATAAATGCCGCCGCTGATATTTTTAACCTACATTG
AAGCTCAAATCTATTCCATTTTTAATAAGTCACAACTTCTTTTCATGTGCGATATTTAAA
AAA*TAGATCTTCATTAGAAGGTCATGTTTCATTTATTTCTAAATAAAATTTTGGCATCA
TAACTAAATCATCTCAT

QA 3 439 3 439
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL2281Contig1 658 2 3 U
TTTTGCAAACGTCAATTTTCGGGACATGAAAATAGAAATAAAACATGCTGTTACTCGAAA
AGTAAATCAAAGTTGCAAGATGAAACACAAATAAGGTCTGTGCAAAGATTCATCAGAGGT
AAATCGTGGTCTACTAACAAGCCGAGGTGATATAATAACAGAAGAAGGAGACTCTGAGGA
GACTACTACTACTCTGCCTTGCATCTCTTCTCTAGGTCCTCCAAATGCTCAAGGTCTTTG
TTGTACTTGCAGATGCGATGAATACACCAGTAGAGAAGGATCCCCGCCGCACACAGAACC
ACGTTCCTCTGAGCCTTGTAGATGGATTTCTCGTAGCGATCTCGCTCTGTAGCAGTGCAA
ACCTCAGATGAGCACTCTAGTCTATGCTCATTCTTCCAATAAATATCGAGGAGTTGAAAC
CCGGCGAAGGCGACGATGGAGGCGGCAGGCTGGAGAATGAGCGAGACGAGTGACACGATG
CGTTTCTTCAGAAGCATAGGGTAAGGGAGAGTCAATATGACGGCGATCGCGACCTCCGCG
GCAACCACATACGTCAGGATCAACCACTGCAATGCCATCTTCTTCTTCTTCTAGATCTCT
CTTTCGCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCCTTCGGTCCTCTTCGTTTATGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E257JQ U 20
AF RR2E257TF C 1
BS 1 21 RR2E257TF
BS 22 421 RR2E257JQ
BS 422 658 RR2E257TF

RD RR2E257JQ 402 0 0
CC
GGACATGAAAATAGAAATAAAACATGCTGTTACTCGAAAAGTAAATCAAAGTTGCAAGAT
GAAACACAAATAAGGTCTGTGCAAAGATTCATCAGAGGTAAATCGTGGTCTACTAACAAG
CCGAGGTGATATAATAACAGAAGAAGGAGACTCTGAGGAGACTACTACTACTCTGCCTTG
CATCTCTTCTCTAGGTCCTCCAAATGCTCAAGGTCTTTGTTGTACTTGCAGATGCGATGA
ATACACCAGTAGAGAAGGATCCCCGCCGCACACAGAACCACGTTCCTCTGAGCCTTGTAG
ATGGATTTCTCGTAGCGATCTCGCTCTGTAGCAGTGCAAACCTCAGATGAGCACTCTAGT
CTATGCTCATTCTTCCAATAAATATCGAGGAGTTGAAACC

QA 3 402 3 402
DS 

RD RR2E257TF 658 0 0
TTTTGCAAACGTCAATTTTCGGGACATGAAAATAGAAATAAAACATGCTGTTACTCGAAA
AGTAAATCAAAGTTGCAAGATGAAACACAAATAAGGTCTGTGCAAAGATTCATCAGAGGT
AAATCGTGGTCTACTAACAAGCCGAGGTGATATAATAACAGAAGAAGGAGACTCTGAGGA
GACTACTACTACTCTGCCTTGCATCTCTTCTCTAGGTCCTCCAAATGCTCAAGGTCTTTG
TTGTACTTGCAGATGCGATGAATACACCAGTAGAGAAGGATCCCCGCCGCACACAGAACC
ACGTTCCTCTGAGCCTTGTAGATGGATTTCTCGTAGCGATCTCGCTCTGTAGCAGTGCAA
ACCTCAGATGAGCACTCTAGTCTATGCTCATTCTTCCAATAAATATCGAGGAGTTGAAAC
CCGGCGAAGGCGACGATGGAGGCGGCAGGCTGGAGAATGAGCGAGACGAGTGACACGATG
CGTTTCTTCAGAAGCATAGGGTAAGGGAGAGTCAATATGACGGCGATCGCGACCTCCGCG
GCAACCACATACGTCAGGATCAACCACTGCAATGCCATCTTCTTCTTCTTCTAGATCTCT
CTTTCGCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCCTTCGGTCCTCTTCGTTTATGATCTCC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 3

CO CL2282Contig1 549 3 6 U
GGGATTAAAAACAGAATCCATGATATTTTAAAGACGTTCAGATAATCACCAAAACACTTA
AAACAAAAAAAGGAAAACGCTCTCAGTATCAAAATACAAAATAACGAACTGGTGGGCAAA
ACCACAGCTAAATCAAAGTTCTTGTACTTTTGCTTCATATGTTGCTCGGATACATGAAGA
CTCTCACCCTCATTCCCATGGACTTAGGAGGCAAGTTGGATGTGAATTTGGCACGGACAA
CACCGCTGTTACCGTGAGGCCTGGTAACTTTCCCCCAGATGCAGCGGTAGTGGCTGCCGT
TCTTCTTGGTCTTAGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCCCTTTCCCTTGTACCATGTCACCT
CCTCTGTAGTGTTGACTCCTTCAATCTGAATAAAAAACGTGTTTGGGTACTGGTTGGACT
TGGACCTTTTGTATCCCAAGATGGTTCCCCTAACGTAAAGTCTGACACGTTCTCCTTGGC
GTCCCTTCACCATTTTCTCAGTCGGCTGATAAACACGCACAAGACTGCTACTGCAAATGA
GGAAGACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF44JQ U 1
AF RR2A320JQ U 328
AF RR2FF44TF C 1
BS 1 282 RR2FF44JQ
BS 283 327 RR2FF44TF
BS 328 487 RR2A320JQ
BS 488 488 RR2FF44TF
BS 489 521 RR2A320JQ
BS 522 549 RR2FF44TF

RD RR2FF44JQ 282 0 0
GGGATTAAAAACAGAATCCATGATATTTTAAAGACGTTCAGATAATCACCAAAACACTTA
AAACAAAAAAAGGAAAACGCTCTCAGTATCAAAATACAAAATAACGAACTGGTGGGCAAA
ACCACAGCTAAATCAAAGTTCTTGTACTTTTGCTTCATATGTTGCTCGGATACATGAAGA
CTCTCACCCTCATTCCCATGGACTTAGGAGGCAAGTTGGATGTGAATTTGGCACGGACAA
CACCGCTGTTACCGTGAGGCCTGGTAACTTTCCCCCAGATGC

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR2A320JQ 194 0 0
AAGCCATCCCCTTTCCCTTGTACCATGTCACCTCCTCTGTAGTGTTGACTCCTTCAATCT
GAATAAAAAACGTGTTTGGGTACTGGTTGGACTTGGACCTTTTGTATCCCAAGATGGTTC
CCCTAACGTAAAGTCTGACACGTTCTCCTTGGCGTCCCTTGACCATTTTCTCAGTCGGCT
GATAAACACGCACA

QA 1 194 1 194
DS 

RD RR2FF44TF 549 0 0
GGGATTAAAAACAGAATCCATGATATTTTAAAGACGTTCAGATAATCACCAAAACACTTA
AAACAAAGAAAGGAAAACGCTCTCAGTATCAAAATACAAAATAACGAACTGGTGGGCAAA
ACCACAGCTAAATCAAAGTTCTTGTACTTTTGCTTCATATGTTGCTCGGATACATGAAGA
CTCTCACCCTCATTCCCATGGACTTAGGAGGCAAGTTGGATGTGAATTTGGCACGGACAA
CACCGCTGTTACCGTGAGGCCTGGTAACTTTCCCCCAGATGCAGCGGTAGTGGCTGCCGT
TCTTCTTGGTCTTAGCCTTGTAGATGTAAGCCATCCTCTTTCCCTTGTACCATGTCACCT
CCTCTGTAGTGTTGACTCCTTCAATCTGAATAAGAGACGTGTTTGGGTACTGGTTGGACT
TGGACCTTTTGTATCCCAAGATGGTTCCCCTCACGTAGAGTCTGACACGTTCTCCTTGGC
GTCCCTTCACCATTTTCTCAGTCGGCTGATAAACACGCACAAGACTGCTACTGCAAATGA
GGAAGACCC

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

CO CL2283Contig1 1011 2 10 U
GGCAATGACTGGGAAGAGCATTTGGCTGTGAAGCATTTCTCGGTTGAAGGACAGCTCGAG
TTCAAAGCTGTTCTCTTTGTTCCCAAGAGAGCTCCTTTTGATCTCTTTGACACCAAGAAG
AAGCCCAACAACATCAAGCTTTACGTTCGTCGTGTCTTCATCATGGACAACTGTGAGGAC
ATCATTCCCGAGTACCTTGGGTTTGTCAAAGGTATTGTCGACTCTGAAGATCTTCCTCTC
AACATCTCAAGAGAGACGTTGCAGCAGAACAAGATCCTTAAGGTCATCCGCAAGAACCTC
GTGAAGAAGTGCATGGAGCTCTTCTTTGAGATTGCTGAGAACAAGGAGGACTACAACAAG
TTCTACGAAGCATTCTCTAAGAATTTGAAGCTCGGTATCCACGAGGACTCCCAGAACAGA
ACCAAGATCGCTGAATTGCTCCGTTACCACTCGACCAAGAGCGGTGATGAGTTGACCAGC
CTCAAGGACTACGTGACAAGGATGAAGGAAGGTCAGGAAGATATCTTCTACATCACCGGT
GAGAGCAAAAAGGCTGTGGAGAACTCTCCATTCCTCGAGAAGCTCAAGAAGAAAGGGGTA
TGAAGTTCTCTACATGGTTGATGCCATCGATGAGTACGCCATTGGCCAGCTCAAGGAATT
TGAGGGAAAGAAGCTCGTGTCTGCAACCAAGGAAAGACTGAAACTGGGAGAGACTGCCCT
TCTCACTTCAGGTTTCAGCTTAGACGAGCCCAACACCTTCGGAAGCAGAATCCACAGGAT
GTTGAAGCTGGGATTGAGCATTGATGACGATGATGCAGTGGAAGCCGATGCAGAGATGCC
TCCGCTTGAGGATGATGCCGATGCTGAGGGTAGCAAGATGGAGAGTCGACTAAATCCTGC
CCAGTTGCTGCAGATGATGGTTTTTCTGGATTTCTCTGATCCTTTTTATCGTTTGAACCT
TTATTTCAGTATTTTTCCTTCTCTTCTGGAGTATATCTACTTTTTTGTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A980TF U 1
AF RR2GV15TF U 243
BS 1 548 RR2A980TF
BS 549 549 RR2GV15TF
BS 550 636 RR2A980TF
BS 637 637 RR2GV15TF
BS 638 657 RR2A980TF
BS 658 658 RR2GV15TF
BS 659 697 RR2A980TF
BS 698 698 RR2GV15TF
BS 699 714 RR2A980TF
BS 715 1011 RR2GV15TF

RD RR2A980TF 733 0 0
GGCAATGACTGGGAAGAGCATTTGGCTGTGAAGCATTTCTCGGTTGAAGGACAGCTCGAG
TTCAAAGCTGTTCTCTTTGTTCCCAAGAGAGCTCCTTTTGATCTCTTTGACACCAAGAAG
AAGCCCAACAACATCAAGCTTTACGTTCGTCGTGTCTTCATCATGGACAACTGTGAGGAC
ATCATTCCCGAGTACCTTGGGTTTGTCAAAGGTATTGTCGACTCTGAAGATCTTCCTCTC
AACATCTCAAGAGAGACGTTGCAGCAGAACAAGATCCTTAAGGTCATCCGCAAGAACCTC
GTGAAGAAGTGCATGGAGCTCTTCTTTGAGATTGCTGAGAACAAGGAGGACTACAACAAG
TTCTACGAAGCATTCTCTAAGAATTTGAAGCTCGGTATCCACGAGGACTCCCAGAACAGA
ACCAAGATCGCTGAATTGCTCCGTTACCACTCGACCAAGAGCGGTGATGAGTTGACCAGC
CTCAAGGACTACGTGACAAGGATGAAGGAAGGTCAGGAAGATATCTTCTACATCACCGGT
GAGAGCAAGAAGGCTGTGGAGAACTCTCCATTCCTCGAGAAGCTCAAGAAGAAAGGGGTA
TGAAGTTCTCTACATGGTTGATGCCATCGATGAGTATGCCATTGGCCAGCTCAAGGAGTT
TGAGGGAAAGAAGCTCGTGTCTGCAACCAAGGAAAGATTGAAACTGGGAGAGAC
GGAGGACGAGAAGAAGAAA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2GV15TF 769 0 0
G
ATCTCAAGAGAGACGTTGCAGCAGAACAAGATCCTTAAGGTCATCCGCAAGAACCTCGTG
AAGAAGTGCATGGAGCTCTTCTTTGAGATTGCTGAGAACAAGGAGGACTACAACAAGTTC
TACGAAGCATTCTCTAAGAATTTGAAGCTCGGTATCCACGAGGACTCTCAGAACAGAACC
AAGATCGCTGAATTGCTCCGTTACCACTCGACCAAGAGCGGTGATGAGTTGACTAGCCTC
AAGGACTATGTGACAAGGATGAAGGAAGGTCAGGAAGATATCTTCTACATCACCGGTGAG
AGCAAAAAGGCTGTGGAGAACTCTCCATTCCTTGAGAAGCTCAAGAAGAAAGGG*TATGA
AGTTCTCTACATGGTTGATGCCATCGATGAGTACGCTATTGGCCAGCTCAAGGAATTTGA
GGGAAAGAAGCTCGTGTCTGCAACCAAGGAAGGTCTGAAACTGGGGGAGACTGCCCTTCT
CACTTCAGGTTTCAGCTTAGACGAGCCCAACACCTTCGGAAGCAGAATCCACAGGATGTT
GAAGCTGGGATTGAGCATTGATGACGATGATGCAGTGGAAGCCGATGCAGAGATGCCTCC
GCTTGAGGATGATGCCGATGCTGAGGGTAGCAAGATGGAGAGTCGACTAAATCCTGCCCA
GTTGCTGCAGATGATGGTTTTTCTGGATTTCTCTGATCCTTTTTATCGTTTGAACCTTTA
TTTCAGTATTTTTCCTTCTCTTCTGGAGTATATCTACTTTTTTGTACG

QA 2 769 2 769
DS 



AS 1 2

CO CL2284Contig1 757 2 2 U
GGGAAAATCAAACAAGAGCAACTCAGAGACATCCTCAGAGATTCAGAAGCGAGACTACAT
CCATGTGAGAGCTAGGCGAGGTGAAGCCACCGACAGACATAGCTTAGCAGAAAGGGCAAG
GAGAGAAAAGTTAAGCAAGAAGATGAAATGTCTCCAAGACATTGTTCCTGGATGCAATAA
AGTTACTGGTAAAGCCGGTATGCTTGATGAGATCATCGACTATGTCCAATCTCTGCAGCA
ACAAGTCGAGTTCTTGTCTATGAAACTCTCTGTCTTAAATCCAGAGCTTGAGTTTCATAT
CAATGAATTATCCACTAAACAGTTTCAGGCTTGCTTCACAGATCTTCCAGAAGCTGTCCC
AAAGCAGCCAATGATGGTGGATGCAAGTTCTTTTCCATTACAGCAGCATGGATCTCTAGA
TTACTCTCTCATAAATTCAAACCAAACCACAATTTTTAGCTCTAAAGATCAGACATCATC
AAGCTGGGAACTTCACTCACAATGTCTTTACAACAACTTGAGAACCGATTCAGTTTCAAG
TTTCTTCAGCCACAAGTAAAAAAAACTCAGGATAGGGCTCGCTGAAAAATCTGTCTTATC
CATGTTATCTTTAAATTTGAACTAGAAAGACAGAGGAAACTAATCCAAAGATCTTTCAAC
CTATTGTGGTCAAAAAACTTATTGTTGTACATTTGTAGTATACATATGATATCTCCAAAA
TACAATCTCACTTATTATTATTTGATTTACAAATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ12TF U 1
AF RR2GJ12JQB C 104
BS 1 452 RR2GJ12TF
BS 453 757 RR2GJ12JQB

RD RR2GJ12TF 455 0 0
GGGAAAATCAAACAAGAGCAACTCAGAGACATCCTCAGAGATTCAGAAGCGAGACTACAT
CCATGTGAGAGCTAGGCGAGGTGAAGCCACCGACAGACATAGCTTAGCAGAAAGGGCAAG
GAGAGAAAAGTTAAGCAAGAAGATGAAATGTCTCCAAGACATTGTTCCTGGATGCAATAA
AGTTACTGGTAAAGCCGGTATGCTTGATGAGATCATCGACTATGTCCAATCTCTGCAGCA
ACAAGTCGAGTTCTTGTCTATGAAACTCTCTGTCTTAAATCCAGAGCTTGAGTTTCATAT
CAATGAATTATCCACTAAACAGTTTCAGGCTTGCTTCACAGATCTTCCAGAAGCTGTCCC
AAAGCAGCCAATGATGGTGGATGCAAGTTCTTTTCCATTACAGCAGCATGGATCTCTAGA
TTACTCTCTCATAAATTCAAACCAAACCACAA
TTC

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2GJ12JQB 654 0 0
TTAGCAGAAAGGGCAAGGAGAGAAAAGTTAAGCAAGAAGATGAAATGTCTCCAAGACATT
GTTCCTGGATGCAATAAAGTTACTGGTAAAGCCGGTATGCTTGATGAGATCATCGACTAT
GTCCAATCTCTGCAGCAACAAGTCGAGTTCTTGTCTATGAAACTCTCTGTCTTAAATCCA
GAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAAACAGTTTCAGGCTTGCTTCACAGAT
CTTCCAGAAGCTGTCCCAAAGCAGCCAATGATGGTGGATGCAAGTTCTTTTCCATTACAG
CAGCATGGATCTCTAGATTACTCTTTCATAAATTCAAACCAAACCACAATTTTTAGCTCT
AAAGATCAGACATCATCAAGCTGGGAACTTCACTCACAATGTCTTTACAACAACTTGAGA
ACCGATTCAGTTTCAAGTTTCTTCAGCCACAAGTAAAAAAAACTCAGGATAGGGCTCGCT
GAAAAATCTGTCTTATCCATGTTATCTTTAAATTTGAACTAGAAAGACAGAGGAAACTAA
TCCAAAGATCTTTCAACCTATTGTGGTCAAAAAACTTATTGTTGTACATTTGTAGTATAC
ATATGATATCTCCAAAATACAATCTCACTTATTATTATTTGATTTACAAATTGC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 4

CO CL2285Contig1 1355 4 9 U
AACAAAAACTACACATTATTATCATATATAAGTATTGCAAACCCACAAATCTCTCAAATA
AATAAATAAATTATTTTATTCCATATACAAGCAACAAATGCCCACTATAACTGTGAAAAT
GCACCAAACATAAAAATACCAATAAAAATGGACTTATTATATAGAACCCCCTCCAAACAC
CATCACATAGTTGGACTATATTCATCATATCGACTCTGTTCCATCAACACGGCTTCTCTT
GCCCCGGTGCTTTCGGTTGCGGTGACGCCTCGGAATCCCACCAAACGTGACCGGATCATG
AACCCTAAGCCGCTGAGCCTCTGCGGGATTCACTACGCACTCAGGTAGAGCAACTTTGTA
CCTGTTCCGATCATAGCAATATGAGTACGTCATGTGTTTCCTCCTGAAAATACCCATCTT
AACCCTCTGTGATGGGCTAATCTCCTGAGCCGCACGGATATCCTCGTCCGCTCCTTCGTC
GCACTTAGGAAACTGCTCAATTGGGTCCACAGCGCAGCCATGAAGGACTAAGTCAGTGAG
CTGCGTGACATAAGGGGCATATTTGTAGTTTACACCGTACTTGCCACCGTTAGTTGCCCA
TTTAGAACCGTCCCATATTGTTGTGTAGAGAGACATCGGCTTTGCTGGGAAGTCACCGCC
CATCGATGCTGTTCGCTTTACCTCCCTGATAGGAACATTGTCTACAAAGAATATGATGTG
AGAATCCGACCAGAGGATACTGTACTGATGATAATCTTCAGTTGGATCAAACCAGAGATT
AGATCTCTCTTCTCTTCCTAAATGAGTGCTTCCATTACCGTAAATATTTGTCTGAATCCT
CCATTCTTTTCCTCTTATGTTACCAAGAAACTCAAAATCAATCTCATCATGATTCTTCTC
ATACATGTCTCCATCTGACATATAAAAGGCAACAACTACTCCAGCTGAATAATCAGAAGG
TAATTTGATTGAAGCACTGAATAATCCATGTAAGTAAAGATCATTTGAGACAAACCCAGA
ACCGGTCCTTTCATCGAGCGTTAACCGGACAGATTTGCCATCCTTATGAACAAACAAGTT
CTTGTCACCAAAAGCTGCGTGTAACTTTCTTCGAAAGATGTGATTGGAAGATTTTGCAGA
GTGAATCCAGAAACAAAACCGGAGAACAGAGACATGAACACGAAGAAACGACTCAGAGTT
ACCATTTTTAAGATGGTATCTGTGGTACCAAACGGTTCCGTGTGTCTGAGTATGGGGGAA
GATTAAAGAGGAAGAGATAAGAGCTTGCGTGGGAGAGCTATATGTTTAGCCGTTTAGGTA
TAGAGAGAGAAAGAGGACGGGGAAAAGAGAGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AU75JQ U 77
AF RR2D834JQ U 1
AF RR2D834TF C 478
AF RR2AU75TF C 646
BS 1 116 RR2D834JQ
BS 117 117 RR2AU75JQ
BS 118 831 RR2D834JQ
BS 832 914 RR2D834TF
BS 915 915 RR2AU75TF
BS 916 938 RR2D834TF
BS 939 939 RR2AU75TF
BS 940 1059 RR2D834TF
BS 1060 1355 RR2AU75TF

RD RR2AU75JQ 626 0 0
TATTCCATATACAAGCAACAAATGCC*ACTATAACTGTGGAAATGCACCAAACATAAAAA
TACCAATAAAAATGGACTTATTATATAGAACCCCCTCCAAACACCATCACATAGTTGGAC
TATATTCATCATATCGACTCTGTTCCATCAACACGGCTTCTCTTGCCCCGGTGCTTTCGG
TTGCGGTGACGCCTCGGAATCCCACCAAACGTGACGGGATCATGAACCCTGAGCCGCTGA
GCCTCTGCGGGATTCACTACGCACTCAGGTAGAGCAACTTTGTACCTGTTCCGATCATAG
CAATATGAGTACGTCATGTGTTTCCTCCTGAAAATGCCCATCTTAACCCTCTGTGATGGG
CTAATCTCCTGAGCCGCCCGGATATCCTCGTCCGCTCCTTCGTCGCACTTAGGAAACTGT
TCAATTGGGTCCACAGCGCAGCCATGAAGGACTAAGTCAGTGAGCTGCGTGACATAAGGG
GCATATTTGTAGTTTACACCGTACTTGCCACCGTTAGTTGCCCATTTAGAACCGTCCCAT
ATTGTTGTGTAGAGAGACATCGGCTTTGATGGGAAGTCACCGCCCATCGATGCTGTTCGC
TTTACCTCCCTGATAGGAACATTGTC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2D834JQ 831 0 0
AACAAAAACTACACATTATTATCATATATAAGTATTGCAAACCCACAAATCTCTCAAATA
AATAAATAAATTATTTTATTCCATATACAAGCAACAAATGCCCACTATAACTGTGACAAT
GCACCAAACATAAAAATACCAATAAAAATGGACTTATTATATAGAACCCCCTCCAAACAC
CATCACATAGTTGGACTATATTCATCATATCGACTCTGTTCCATCAACACGGCTTCTCTT
GCCCCGGTGCTTTCGGTTGCGGTGACGCCTCGGAATCCCACCAAACGTGACCGGATCATG
AACCCTAAGCCGCTGAGCCTCTGCGGGATTCACTACGCACTCAGGTAGAGCAACTTTGTA
CCTGTTCCGATCATAGCAATATGAGTACGTCATGTGTTTCCTCCTGAAAATACCCATCTT
AACCCTCTGTGATGGGCTAATCTCCTGAGCCGCACGGATATCCTCGTCCGCTCCTTCGTC
GCACTTAGGAAACTGCTCAATTGGGTCCACAGCGCAGCCATGAAGGACTAAGTCAGTGAG
CTGCGTGACATAAGGGGCATATTTGTAGTTTACACCGTACTTGCCACCGTTAGTTGCCCA
TTTAGAACCGTCCCATATTGTTGTGTAGAGAGACATCGGCTTTGCTGGGAAGTCACCGCC
CATCGATGCTGTTCGCTTTACCTCCCTGATAGGAACATTGTCTACAAAGAATATGATGTG
AGAATCCGACCAGAGGATACTGTACTGATGATAATCTTCAGTTGGATCAAACCAGAGATT
AGATCTCTCTTCTCTTCCTAAATGAGTGCTTCCATTACCGTAAATATTTGT

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR2D834TF 582 0 0
GTCGCACTTAGGAAACTGCTCAATTGGGTCCACAGCGCAGCCATGAAGGACTAAGTCAGT
GAGCTGCGTGACATAAGGGGCATATTTGTAGTTTACACCGTACTTGCCACCGTTAGTTGC
CCATTTAGAACCGTCCCATATTGTTGTGTAGAGAGACATCGGCTTTGCTGGGAAGTCACC
GCCCATCGATGCTGTTCGCTTTACCTCCCTGATAGGAACATTGTCTACAAAGAATATGAT
GTGAGAATCCGACCAGAGGATACTGTACTGATGATAATCTTCAGTTGGATCAAACCAGAG
ATTAGATCTCTCTTCTCTTCCTAAATGAGTGCTTCCATTACCGTAAATATTTGTCTGAAT
CCTCCATTCTTTTCCTCTTATGTTACCAAGAAACTCAAAATCAATCTCATCATGATTCTT
CTCATACATGTCTCCATTTGACATATAAAAGGCAACAACTATTCCAGCTGAATAATCAGA
AGGTAATTTGATTGAAGCACTGAATAATCCATGTAAGTAAAGATCATTTGAGACAAACCC
AGAACCGGTCCTTTCATCGAGCGTTAACCGGACAGATTTGCC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2AU75TF 710 0 0
TGGGAAGTCACCGCCCATCGATGCTGTTCGCTTTACCTCCCTGATAGGAACATTGTCTAC
GAAGAATATGATGTGAGAATCCGACCAGAGGATACTGTGCTGATGATAATCTTCAGTTGG
ATCAAACCAGAGATTAGATCTCTCTTCTCTTCCTAAATGAGTGCTTCCATTACCGTAAAT
ATTTGTCTGAATCCTCCATTCTTTTCCTCTTATGTTACCAAGAAACTCAAAATCAATCTC
ATCATGATTCTTCTCATACATGTCTCCATCTGACATATAAAAGGCAACAACTACTCCAGC
TGAATAATCAGAAGGTAATTTGATTGAAGCACTGAATAATCCATGTAAGTAAAGATCATT
TGAGACAAACCCAGAACCGGTCCTTTCATCGAGCGTTAACCGGACAGATTTGCCATCCTT
ATGAACAAACAAGTTCTTGTCACCAAAAGCTGCGTGTAACTTTCTTCGAAAGATGTGATT
GGAAGATTTTGCAGAGTGAATCCAGAAACAAAACCGGAGAACAGAGACATGAACACGAAG
AAACGACTCAGAGTTACCATTTTTAAGATGGTATCTGTGGTACCAAACGGTTCCGTGTGT
CTGAGTATGGGGGAAGATTAAAGAGGAAGAGATAAGAGCTTGCGTGGGAGAGCTATATGT
TTAGCCGTTTAGGTATAGAGAGAGAAAGAGGACGGGGAAAAGAGAGAGAG

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 3

CO CL2286Contig1 1124 3 2 U
GGATGGAGGAACAGAGATAGAGAGAGAGAGAGAAGCGCAAATATCAGAGAGACAGTGAAG
AAGTGAAGAATCATCTTTAACTCTTTGCCTAACTGTGACGAACCCAAAGTGAGGATGCTT
AGCTTGAGGTATTCATTACCGTATCTTCCTCAAACAAAGGAATCAACTAAACTCTTCTCC
AAGAGGCCTAGCACTGTTGTGGTTTGTGCGGCTAGAGGTCCAAGACCTCGATCTCCTCGA
GTATGGAAAACAAGGAAGAGAATTGGAAGTATCTCCAAGTCTGCCAAGATGATTGCTTGT
ATAAAAGAATTGTCGAACGTTAAAGAAGAAGTATACGGAGCGCTTGATTCCTTCATTGCC
TGGGAGTTAGAGTTCCCTCTTGTCATAGTCAAGAAG*GCTTTAGCTATTCTTGAAGATGA
AAGAGAGTGGAAGAAGATTATTCAGGTGACAAAGTGGATGTTGAGCAAAGGTCAAGGAAG
AACAATGGGAACTTACTTCTCATTACTAAACGCTCTAGCTGAAGATAACCGGCTCGACGA
AGCTGAGGAACTATGGAACAAGTTGTTCATGGAGCATTTAGAAGGAACTCCAAGAAAGTT
CTTCAACAAAATGATCTCTATCTATTACAAGAGAGACATGCACCACAAACTCTTTGAGGT
GTTTGCTGACATGGAGGAGCTTGGAGTGAAACCGAACATTGCGATTGTGGATATGGTTGG
GAAAGTGTTTTTGAAACTTGGGATGAATGATAAGTACGAGAAGCTGATGAAGAAATATCC
TCCACCACAGTGGGAGTTCAGATATATCAAGGGAAGACGTGTTAAGGTCAAGGCTAAGCA
GCTGAATGAGCTAAGCGAAGGTGAAGGAGGCTTAAGCAGCGACGAAGACAAGATTGAGAG
TAAATCTGATATGTTGTCAGTTGAGGAAGCAAACGAAGATGGTGATGATTTCAGTGAAGA
GGAAGAAGAAGGTTTGGGTGTGAATCAAAGACAGATTGGAACATCTAGAGAACCATGTCT
TGATCATTTGAACTCTTCTTGACTTATAACTACTGTTCACTTATTGAGCCTTTGAGATTT
AGTATGTACTATTGGATCATGCATGGAAAAGAGATTTGAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS43TF U 235
AF RR2GE51TF U 1
AF RR2GE51JQ C 366
BS 1 673 RR2GE51TF
BS 674 1124 RR2GE51JQ

RD RR2CS43TF 420 0 0
CCTCGAGTATGGAAAACAAGGAAGAGAATTGGAAGTATCTCCAAGTCTGCCAAGATGATT
GCTTGTATAAAAGAATTGTCGAACGTTAAAGAAGAAGTATACGGAGCGCTTGATTCCTTC
ATTGCCTGGGAGTTGGAGTTCCCTCTTGTCATAGTCAAGAAGAGCTTTAGCTATTCTTGA
AGACGAAAGAGAGTGGAAGAAGATTATTCAGGTGACAAAATGGATGCTGAGCAAAGGCCA
AGGAAGAACAATGGGAACTTACTTCTCATTACTAAACGCTCTAACTGAAGATAACCGGCT
TGACGAAGCTGAGGAACTATGGAACAAGTTGTTCATGGAGCATTTAGAAGGAACTCCAAG
AAAGTTCTTCAACAAAATGATCTCTATCTATTACAAGAGAGACATGCACCACAAACTCTT

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR2GE51TF 673 0 0
GGATGGAGGAACAGAGATAGAGAGAGAGAGAGAAGCGCAAATATCAGAGAGACAGTGAAG
AAGTGAAGAATCATCTTTAACTCTTTGCCTAACTGTGACGAACCCAAAGTGAGGATGCTT
AGCTTGAGGTATTCATTACCGTATCTTCCTCAAACAAAGGAATCAACTAAACTCTTCTCC
AAGAGGCCTAGCACTGTTGTGGTTTGTGCGGCTAGAGGTCCAAGACCTCGATCTCCTCGA
GTATGGAAAACAAGGAAGAGAATTGGAAGTATCTCCAAGTCTGCCAAGATGATTGCTTGT
ATAAAAGAATTGTCGAACGTTAAAGAAGAAGTATACGGAGCGCTTGATTCCTTCATTGCC
TGGGAGTTAGAGTTCCCTCTTGTCATAGTCAAGAAG*GCTTTAGCTATTCTTGAAGATGA
AAGAGAGTGGAAGAAGATTATTCAGGTGACAAAGTGGATGTTGAGCAAAGGTCAAGGAAG
AACAATGGGAACTTACTTCTCATTACTAAACGCTCTAGCTGAAGATAACCGGCTCGACGA
AGCTGAGGAACTATGGAACAAGTTGTTCATGGAGCATTTAGAAGGAACTCCAAGAAAGTT
CTTCAACAAAATGATCTCTATCTATTACAAGAGAGACATGCACCACAAACTCTTTGAGGT
GTTTGCTGACATG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2GE51JQ 759 0 0
GTTA
GAGTTCCCTCTTGTCATAGTCAAGAAG*GCTTTAGCTATTCTTGAAGATGAAAGAGAGTG
GAAGAAGATTATTCAGGTGACAAAGTGGATGTTGAGCAAAGGTCAAGGAAGAACAATGGG
AACTTACTTCTCATTACTAAACGCTCTAGCTGAAGATAACCGGCTCGACGAAGCTGAGGA
ACTATGGAACAAGTTGTTCATGGAGCATTTAGAAGGAACTCCAAGAAAGTTTTTCAACAA
AATGATCTCTATCTATTACAAGAGAGACATGCACCACAAACTCTTTGAGGTGTTTGCTGA
CATGGAGGAGCTTGGAGTGAAACCGAACATTGCGATTGTGGATATGGTTGGGAAAGTGTT
TTTGAAACTTGGGATGAATGATAAGTACGAGAAGCTGATGAAGAAATATCCTCCACCACA
GTGGGAGTTCAGATATATCAAGGGAAGACGTGTTAAGGTCAAGGCTAAGCAGCTGAATGA
GCTAAGCGAAGGTGAAGGAGGCTTAAGCAGCGACGAAGACAAGATTGAGAGTAAATCTGA
TATGTTGTCAGTTGAGGAAGCAAACGAAGATGGTGATGATTTCAGTGAAGAGGAAGAAGA
AGGTTTGGGTGTGAATCAAAGACAGATTGGAACATCTAGAGAACCATGTCTTGATCATTT
GAACTCTTCTTGACTTATAACTACTGTTCACTTATTGAGCCTTTGAGATTTAGTATGTAC
TATTGGATCATGCATGGAAAAGAGATTTGAGAGCC

QA 5 759 5 759
DS 



AS 1 4

CO CL2287Contig1 1279 4 17 U
GGAGACTGGGAATAGATGGACTTTCTATAGGAACGATTTTACTTACGGGATTTATTACTA
CTTTAGCTACTTTAGTGGCTTTTCCAGTTACTCGGGATTCCCGATTATTCTATTTTCTGA
TGTTAGCAATGTACAGCGGCCAAATAGGATTATTTTCTTCTCGGGATATTTTACTTTTTT
TCATCATGTGGGAATTAGAATTAATTCCCGTTTATCTCCTTTTATCCATGTGGGGTGGAA
AGAAACGTTTGTATTCAGCTACAAAATTTATTTTATACACTGCAGGAAGTTCTATTTTTT
TATTAATAGGAATTTTAGGTATAAGTTTATATGGTTCGAACGAACCAACATTAAATTTAG
AACTATTAGCGAATCAAGTCTATCCTGTCACACTCGAAATACTATTTTATATTGGATTTC
TTATTGCTTTTGCCGTCAAATTACCGATTATACCTTTACATACTTGGTTACCTGACACCC
ACGGCGAGGCACATTACAGTACCTGTATGCTTCTCGCTGGAATCTTATTAAAAATGGGAG
CATATGGATTGGTTCGAATCAATATGGAATTATTACCTCACGCTCATTCTATGTTTTCTC
CTTGGTTGATGGTAGTCGGTACAATCCAAATAATTTATGCAGCTTTAACATCTCTCGGTC
AACGTAATTTAAAAAAGAGAATAGCCTATTCTTCTGTATCTCATATGGGTTTTATAATTA
TAGGTATTGGTTCTATAACGGATCCTGGGCTTAATGGAGCTATTTTACAAATAATCTCTC
ATGGATTTATTGGCGCTGCACTTTTTTTCTTGGCAGGAACTAGTTATGATAGAATCCGGC
TTGTTTATCTTGATGAAATGGGTGGAATGGCTATCTCCATTCCAAAGATATTTACAATGT
TCACTATCTTATCGATGGCTTCCCTTACATTACCGGGCATGAGTGGTTTTATTGCAGAAT
TAATCGTTTTTTTTGGAATAATTACCAGCCAAAAATATTTCTTAATTTCAAAAATTTTAA
TTATTTTTGTAATGGCAATTGGAATGATATTAACTCCTATATATTTATTATCTATGTTAC
GTCAAATGTTCTATGGATACAAGTTAATTAATGCCAAAAACTTTTCTTTTTTTGATTCTG
GACCCCGAGAGTTATTTCTTTCAATCTCTATTCTTCTACCCATAATTGGTATTGGGATTT
ATCCTGATTTTGTGCTCTCATTAGCAAGTGACAAGGTCGAATCCATTTTATCTAATTATT
TTTATGGATAGTTTTCAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2F881TF U 1
AF RR2GX82TF U 295
AF RR2GX82JQ C 507
AF RR2F881JQ C 822
BS 1 311 RR2F881TF
BS 312 312 RR2GX82TF
BS 313 660 RR2F881TF
BS 661 661 RR2GX82TF
BS 662 675 RR2F881TF
BS 676 676 RR2GX82TF
BS 677 680 RR2F881TF
BS 681 681 RR2GX82TF
BS 682 712 RR2F881TF
BS 713 854 RR2GX82TF
BS 855 907 RR2GX82JQ
BS 908 908 RR2F881JQ
BS 909 926 RR2GX82JQ
BS 927 927 RR2F881JQ
BS 928 1000 RR2GX82JQ
BS 1001 1001 RR2F881JQ
BS 1002 1279 RR2GX82JQ

RD RR2F881TF 714 0 0
GGAGACTGGGAATAGATGGACTTTCTATAGGAACGATTTTACTTACGGGATTTATTACTA
CTTTAGCTACTTTAGTGGCTTTTCCAGTTACTCGGGATTCCCGATTATTCTATTTTCTGA
TGTTAGCAATGTACAGCGGCCAAATAGGATTATTTTCTTCTCGGGATATTTTACTTTTTT
TCATCATGTGGGAATTAGAATTAATTCCCGTTTATCTCCTTTTATCCATGTGGGGTGGAA
AGAAACGTTTGTATTCAGCTACAAAATTTATTTTATACACTGCAGGAAGTTCTATTTTTT
TATTAATAGGAGTTTTAGGTATAAGTTTATATGGTTCGAACGAACCAACATTAAATTTAG
AACTATTAGCGAATCAAGTCTATCCTGTCACACTCGAAATACTATTTTATATTGGATTTC
TTATTGCTTTTGCCGTCAAATTACCGATTATACCTTTACATACTTGGTTACCTGACACCC
ACGGCGAGGCACATTACAGTACCTGTATGCTTCTCGCTGGAATCTTATTAAAAATGGGAG
CATATGGATTGGTTCGAATCAATATGGAATTATTACCTCACGCTCATTCTATGTTTTCTC
CTTGGTTGATGGTAGTCGGTACAATCCAAATAATTTATGCAGCTTTAACATCTCTCGGTC
GACGTAATTTAAAAA*GAGA*TAGCCTATTCTTCTGTATCTCATATGGGTTT
AT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2GX82TF 560 0 0
TTTTTTTATTAATAGGAATTTTAGGTATAAGTTTATATGGTTCGAACGAACCAACATTAA
ATTTAGAACTATTAGCGAATCAAGTCTATCCTGTCACACTCGAAATACTATTTTATATTG
GATTTCTTATTGCTTTTGCCGTCAAATTACCGATTATACCTTTACATACTTGGTTACCTG
ACACCCACGGCGAGGCACATTACAGTACCTGTATGCTTCTCGCTGGAATCTTATTAAAAA
TGGGAGCATATGGATTGGTTCGAATCAATATGGAATTATTACCTCACGCTCATTCTATGT
TTTCTCCTTGGTTGATGGTAGTCGGTACAATCCAAATAATTTATGCAGCTTTAACATCTC
TCGGTCAACGTAATTTAAAAAAGAGAATAGCCTATTCTTCTGTATCTCATATGGGTTTTA
TAATTATAGGTATTGGTTCTATAACGGATCCTGGGCTTAATGGAGCTATTTTACAAATAA
TCTCTCATGGATTTATTGGCGCTGCACTTTTTTTCTTGGCAGGAACTAGTTATGATAGAA
TCCGGCTTGTTTATCTTGAT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2GX82JQ 773 0 0
ATGCTTCTCGCTGGAATCTTATTAAAAATGGGAGCATATGGATTGGTTCGAATCAATATG
GAATTATTACCTCACGCTCATTCTATGTTTTCTCCTTGGTTGATGGTAGTCGGTACAATC
CAAATAATTTATGCAGCTTTAACATCTCTCGGTCAACGTAATTTAAAAAAGAGAATAGCC
TATTCTTCTGTATCTCATATGGGTTTTATAATTATAGGTATTGGTTCTATAACGGATCCT
GGGCTTAATGGAGCTATTTTACAAATAATCTCTCATGGATTTATTGGCGCTGCACTTTTT
TTCTTGGCAGGAACTAGTTATGATAGAATCCGGCTTGTTTATCTTGATGAAATGGGTGGA
ATGGCTATCTCCATTCCAAAGATATTTACAATGTTCACTATTTTATCGATGGCTTCCCTT
GCATTACCGGGCATGAGTGGTTTTATTGCAGAATTAATCGTTTTTTTTGGAATAATTACC
AGCCAAAAATATTTTTTAATTTCAAAAATTTTAATTATTTTTGTAATGGCAATTGGAATG
ATATTAACTCCTATATATTTATTATCTATGTTACGTCAAATGTTCTATGGATACAAGTTA
ATTAATGCCAAAAACTTTTCTTTTTTTGATTCTGGACCCCGAGAGTTATTTCTTTCAATC
TCTATTCTTCTACCCATAATTGGTATTGGGATTTATCCTGATTTTGTGCTCTCATTAGCA
AGTGACAAGGTCGAATCCATTTTATCTAATTATTTTTATGGATAGTTTTCAGG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2F881JQ 458 0 0
AGTTATGATAGAATCCGGCTTGTTTATCTTGATGAAATGGGTGGAATGGCTATCTCCATT
CCAAAGATATTTACAATGTTCACTATCTTATCGATGGCTTCCCTTACATTACCGGGCATG
AGTGGTTTTATTGCAGAATTAATCGTTTTTTTTGGAATAATTACCAGCCAAAAATATTTC
TTAATTTCAAAAATTTTAATTATTTTTGTAATGGCAATTGGAATGATATTAACTCCTATA
TATTTATTATCTATGTTACGTCAAATGTTCTATGGATACAAGTTAATTAATGCCAAAAAC
TTTTCTTTTTTTGATTCTGGACCCCGAGAGTTATTTCTTTCAATCTCTATTCTTCTACCC
ATAATTGGTATTGGGATTTATCCTGATTTTGTGCTCTCATTAGCAAGTGACAAGGTCGAA
TCCATTTTATCTAATTATTTTTATGGATAGTTTTCAGG

QA 1 458 1 458
DS 



AS 1 4

CO CL2288Contig1 406 4 1 U
GGGTATGGTGATGAAGTGGCGGATGACGTCAGAGCTTTGTTGAGGAGGTATAAAGAAGGA
GTTTGGTCGATGGTACCGTGCTCCGATGCCACCGGAATATTCCTTTGTTGGAGAGATCAG
CCGGTGGTTTGGGCTAGTGCGTGGCGGCCAACGTAAAAGGGTTTAGGGTTTTTTTTATCG
ACATATATGCACGCGCCCTTGTTGGTTAAGATAGTTGTTTCACACGTATGGGAATGGCTA
ATGATGGCTTGGGATTGAGAGTTTACTACTGAGATAATGCGTTCATAATATGAAATTTGC
TTTTTGATATATTTTTTGCTTTCTTCTTTGAGTTAAGTTTTGTGATTAGTTTGATTTATG
CGGAAGAATTAAATTTTTCCTCTATAATGAAGGTGTTATTTTTCGT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2G885JQ C 1
AF RR2GP05JQ C 1
AF RR2G885TF U 1
AF RR2GP05TF U 1
BS 1 406 RR2G885TF

RD RR2G885JQ 406 0 0
GGGTATGGTGATGAAGTGGCGGATGACGTCAGAGCTTTGTTGAGGAGGTATAAAGAAGGA
GTTTGGTCGATGGTACCGTGCTCCGATGCCACCGGAATATTCCTTTGTTGGAGAGATCAG
CCGGTGGTTTGGGCTAGTGCGTGGCGGCCAACGTAAAAGGGTTTAGGGTTTTTTTTATCG
ACATATATGCACGCGCCCTTGTTGGTTAAGATAGTTGTTTCACACGTATGGGAATGGCTA
ATGATGGCTTGGGATTGAGAGTTTACTACTGAGATAATGCGTTCATAATATGAAATTTGC
TTTTTGATATATTTTTTGCTTTCTTCTTTGAGTTAAGTTTTGTGATTAGTTTGATTTATG
CGGAAGAATTAAATTTTTCCTCTATAATGAAGGTGTTATTTTTCGT

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR2GP05JQ 406 0 0
GGGTATGGTGATGAAGTGGCGGATGACGTCAGAGCTTTGTTGAGGAGGTATAAAGAAGGA
GTTTGGTCGATGGTACCGTGCTCCGATGCCACCGGAATATTCCTTTGTTGGAGAGATCAG
CCGGTGGTTTGGGCTAGTGCGTGGCGGCCAACGTAAAAGGGTTTAGGGTTTTTTTTATCG
ACATATATGCACGCGCCCTTGTTGGTTAAGATAGTTGTTTCACACGTATGGGAATGGCTA
ATGATGGCTTGGGATTGAGAGTTTACTACTGAGATAATGCGTTCATAATATGAAATTTGC
TTTTTGATATATTTTTTGCTTTCTTCTTTGAGTTAAGTTTTGTGATTAGTTTGATTTATG
CGGAAGAATTAAATTTTTCCTCTATAATGAAGGTGTTATTTTTCGT

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR2G885TF 406 0 0
GGGTATGGTGATGAAGTGGCGGATGACGTCAGAGCTTTGTTGAGGAGGTATAAAGAAGGA
GTTTGGTCGATGGTACCGTGCTCCGATGCCACCGGAATATTCCTTTGTTGGAGAGATCAG
CCGGTGGTTTGGGCTAGTGCGTGGCGGCCAACGTAAAAGGGTTTAGGGTTTTTTTTATCG
ACATATATGCACGCGCCCTTGTTGGTTAAGATAGTTGTTTCACACGTATGGGAATGGCTA
ATGATGGCTTGGGATTGAGAGTTTACTACTGAGATAATGCGTTCATAATATGAAATTTGC
TTTTTGATATATTTTTTGCTTTCTTCTTTGAGTTAAGTTTTGTGATTAGTTTGATTTATG
CGGAAGAATTAAATTTTTCCTCTATAATGAAGGTGTTATTTTTCGT

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR2GP05TF 406 0 0
GGGTATGGTGATGAAGTGGCGGATGACGTCAGAGCTTTGTTGAGGAGGTATAAAGAAGGA
GTTTGGTCGATGGTACCGTGCTCCGATGCCACCGGAATATTCCTTTGTTGGAGAGATCAG
CCGGTGGTTTGGGCTAGTGCGTGGCGGCCAACGTAAAAGGGTTTAGGGTTTTTTTTATCG
ACATATATGCACGCGCCCTTGTTGGTTAAGATAGTTGTTTCACACGTATGGGAATGGCTA
ATGATGGCTTGGGATTGAGAGTTTACTACTGAGATAATGCGTTCATAATATGAAATTTGC
TTTTTGATATATTTTTTGCTTTCTTCTTTGAGTTAAGTTTTGTGATTAGTTTGATTTATG
CGGAAGAATTAAATTTTTCCTCTATAATGAAGGTGTTATTTTTCGT

QA 1 406 1 406
DS 



AS 1 4

CO CL2289Contig1 416 4 2 U
GGGTACATAAAATCTCTAAGCTCTTTCATCAAAACAAGAATGGTGTGCAGAGCAGAAGAA
GCTTTGAAGCAGAGAGAGAACCTAAAGAGGTGTAAACAAGATCATGATCGCCAAAAGAAG
AAGGTGCAATCGATCACAGATTGCAACAAAGAGAAAAGTTGCAGATTCAAGCGAAGCACT
TCTAATCTCGACCAGGACGACGCTTCCTCGGCCATATTTTTCCTCGCTTGCATTGCCTGC
TCATCCTTCTCCAATAATCTCTAAGTATTCTTAGCTGTAACAGCTTCCACAATTAATTAC
TTTTCAGACAACGTTTCTTAATTAAATTGTAGTTCTTCTATTTGATTCTGTTGTTACCTT
ATCCTATGTTAATTTTCTTATTTTTTATTTTCATATTTTAATAGTACAGATGTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GL05JQ C 1
AF RR2GL05TF U 1
AF RR2G446JQ C 20
AF RR2G446TF U 20
BS 1 386 RR2GL05TF
BS 387 416 RR2G446TF

RD RR2GL05JQ 386 0 0
GGGTACATAAAATCTCTAAGCTCTTTCATCAAAACAAGAATGGTGTGCAGAGCAGAAGAA
GCTTTGAAGCAGAGAGAGAACCTAAAGAGGTGTAAACAAGATCATGATCGCCAAAAGAAG
AAGGTGCAATCGATCACAGATTGCAACAAAGAGAAAAGTTGCAGATTCAAGCGAAGCACT
TCTAATCTCGACCAGGACGACGCTTCCTCGGCCATATTTTTCCTCGCTTGCATTGCCTGC
TCATCCTTCTCCAATAATCTCTAAGTATTCTTAGCTGTAACAGCTTCCACAATTAATTAC
TTTTCAGACAACGTTTCTTAATTAAATTGTAGTTCTTCTATTTGATTCTGTTGTTACCTT
ATCCTATGTTAATTTTCTTATTTTTT

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR2GL05TF 386 0 0
GGGTACATAAAATCTCTAAGCTCTTTCATCAAAACAAGAATGGTGTGCAGAGCAGAAGAA
GCTTTGAAGCAGAGAGAGAACCTAAAGAGGTGTAAACAAGATCATGATCGCCAAAAGAAG
AAGGTGCAATCGATCACAGATTGCAACAAAGAGAAAAGTTGCAGATTCAAGCGAAGCACT
TCTAATCTCGACCAGGACGACGCTTCCTCGGCCATATTTTTCCTCGCTTGCATTGCCTGC
TCATCCTTCTCCAATAATCTCTAAGTATTCTTAGCTGTAACAGCTTCCACAATTAATTAC
TTTTCAGACAACGTTTCTTAATTAAATTGTAGTTCTTCTATTTGATTCTGTTGTTACCTT
ATCCTATGTTAATTTTCTTATTTTTT

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR2G446JQ 397 0 0
GCTCTTTCATCAAAACAAGAATGGTGTGCAGAGCAGAAGAAGCTTTGAAGCAGAGAGAGA
ACCTAAAGAGGTGTAAACAAGATCATGATCGCCAAAAGAAGAAGGTGCAATCGATCACGG
ATTGCAACAAAGAGAAAAGTTGCAGATTCAAGCGAAGCACTTCTAATCTCGACCAGGACG
GCGCTTCCTCGGCCATATTTTTCCTCGCTTGCATTGCCTGCTCATCCTTCTCCAATAATC
TCTAAGTATTCTTAGCTGTAACAGCTTCCACAATTAATTACTTTTCAGACAACGTTTCTT
AATTAAATTGTAGTTCTTCTATTTGATTCTGTTGTTACCTTATCCTATGTTAATTTTCTT
ATTTTTTATTTTCATATTTTAATAGTACAGATGTTTG

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR2G446TF 397 0 0
GCTCTTTCATCAAAACAAGAATGGTGTGCAGAGCAGAAGAAGCTTTGAAGCAGAGAGAGA
ACCTAAAGAGGTGTAAACAAGATCATGATCGCCAAAAGAAGAAGGTGCAATCGATCACGG
ATTGCAACAAAGAGAAAAGTTGCAGATTCAAGCGAAGCACTTCTAATCTCGACCAGGACG
GCGCTTCCTCGGCCATATTTTTCCTCGCTTGCATTGCCTGCTCATCCTTCTCCAATAATC
TCTAAGTATTCTTAGCTGTAACAGCTTCCACAATTAATTACTTTTCAGACAACGTTTCTT
AATTAAATTGTAGTTCTTCTATTTGATTCTGTTGTTACCTTATCCTATGTTAATTTTCTT
ATTTTTTATTTTCATATTTTAATAGTACAGATGTTTG

QA 1 397 1 397
DS 



AS 1 3

CO CL2290Contig1 895 3 15 U
GTTTCTATAAGATAAAAGTACATGAACAGAAACGAGTTTGCTTGCGTTCGCATAAGACAT
ACAAACAGACTTATTCTCCAAAGCCCTACAATGGCTAAAATCCTTTTTCCAATAATCTCT
CACTATCAAAAAACAAAACAAAAAACTTAAAAAAACACAAAACAAAAGTAACATATAACC
TCTAGTACAATCTGCCTCAAAACACCAAACCTTAGACACAACCCTCAAGACCAAGAAGAA
CCATTACATGACAATAAAGAAAACTCAGGAAGAAGGATCATCCTCTTCTTCATTTTTTTG
TTTTTGTTTTGAACTCTTCTTATGTATTACAGCCTCGCCGGAGACTGATACAGTTTCCAC
TATCCCTCATTGAAAGAAAAAAAGAAAAAGAAAACAGAAAAGAAGCCTAGGAGGACCAAT
AAATTTAGAAAACCAAACCAT*GACAGGAAAATCTATGGGATTTTCTGGTTAGCTCTAGC
CTCTAGCTGATGGTGTTTGTCAAGTTTCGTCCTCATAGGCTTTT*GTATCAAGGAGAGAA
GATATCATCTAATCGTTCACAGTGATGGCTCGCCTCTGTTTGGTTGCCTCTTGTTCACAC
TGTAACTGCCAACATAACCTGGAGATGAACTTCTAGCTGAAACATCCGAAGAAGGACCTC
CTCCTCCAATCCCATAGCTAAAAGAACCAGGCCCTTCTGTCTCAGGAGCTGATGATCTCC
AAGTGGGATCACTATACACTGCACCATTCCCATAAAACTCCGCAAGTCCTGCTCCATCAT
AACCTGTGTTGTTAGTCCCCGAGGCAGAAGAGAATGAAGACGACGGTGCTGCCTTGCTAG
GCCCTATGTTTCTTGTTCCAAACCCAAAACCAGATTCACCGTTTCCTCCATAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW88JQ U 1
AF RR2DC01JQ U 32
AF RR2DC01TF C 307
BS 1 101 RR2FW88JQ
BS 102 102 RR2DC01JQ
BS 103 296 RR2FW88JQ
BS 297 298 RR2DC01JQ
BS 299 383 RR2FW88JQ
BS 384 386 RR2DC01JQ
BS 387 441 RR2FW88JQ
BS 442 442 RR2DC01JQ
BS 443 497 RR2FW88JQ
BS 498 499 RR2DC01JQ
BS 500 524 RR2FW88JQ
BS 525 525 RR2DC01JQ
BS 526 610 RR2FW88JQ
BS 611 667 RR2DC01JQ
BS 668 895 RR2DC01TF

RD RR2FW88JQ 610 0 0
GTTTCTATAAGATAAAAGTACATGAACAGAAACGAGTTTGCTTGCGTTCGCATAAGACAT
ACAAACAGACTTATTCTCCAAAGCCCTACAATGGCTAAAATTCTTTTTCCAATAATCTCT
CACTATCAAAAAACAAAACAAAAAACTTAAAAAAACACAAAACAAAAGTAACATATAACC
TCTAGTACAATCTGCCTCAAAACACCAAACCTTAGACACAACCCTCAAGACCAAGAAGAA
CCATTACATGACAATAAAGAAAACTCAGGAAGAAGGATCATCCTCTTCTTCATTTT**TG
TTTTTGTTTTGAACTCTTCTTATGTATTACAGCCTCGCCGGAGACTGATACAGTTTCCAC
TATCCCTCATTGAAAGAAAAAAA***AAAGAAAACAGAAAAGAAGCCTAGGAGGACCAAT
AAATTTAGAAAACCAAACCATTGACAGGAAAATCTATGGGATTTTCTGGTTAGCTCTAGC
CTCTAGCTGATGGTGTTGATCAAGTTTCGTCCTCATAGGCTTTTTGTATCAAGGAGAGAA
GATATCATCTAATCGTTCACAGTGATGGCTCGCCTCTGTTTGGTTGCCTCTTGTTCACAC
TGTAACTGCC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2DC01JQ 645 0 0
ACGAGTTTGTTTGCGTTCGCATAAGACATACAAACAGACTTATTCTCCAAAGCCCTACAA
TGGCTAAAATCCTTTTTCCAATAATCTCTCACTATCAAAAAACAAAACAAAAAACTTAAA
AAAACACAAAACAAAAGTAACATATAACCTCTAGTACAATCTGCCTCAAAACACCAAACC
TTAGACACAACCCTCAAGACCAAGAAGAACCATTACATGACAATAAAGAAAACTCAGGAA
GAAGGATCATCCTCTTCTTCATTTTTTTGTTTTTGTTTTGAACTCTTCTTATGTATTACA
GCCTCGCCGGAGACTGATACAGTTTCCACTATCCCTCATTGAAAGAAAAAAAGAAAAAGA
AAACAGAAAAGAAGCCTAGGAGGACCAATAAATTTAGAAAACCAAACCAT*GACAGGAAA
ATCTATGGGATTTTCTGGTTAGCTCTAGCCTCTAGCTGATGGTGTTTGTCAAGTTTCGTC
CTCATAGGCTTTT*GTATCAAGGAGAGAAGATATCATCTAATCGTTCACAGTGATGGCTC
GCCTCTGTTTGGTTGCCTCTTGTTCACACTGTAACTGCCAACATAACCTGGAGATGAACT
TCTAGCTGAAACATCCGAAGAAGGACCTCCTCCTCC
AATCCCATA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2DC01TF 589 0 0
TTTTGAACTCTTCTTATGTATTACAGCCTCGCCGGAGACTGATACAGTTTCCACTATCCC
TCATTGAAAGAAAAAAAGAAAAAGAAAACAGAAAAGAAGCCTAGGAGGACCAATAAATTT
AGAAAACCAAACCAT*GACAGGAAAATCTATGGGATTTTCTGGTTAGCTCTAGCCTCTAG
CTGATGGTGTTTGTCAAGTTTCGTCCTCATAGGCTTTT*GTATCAAGGAGAGAAGATATC
ATCTAATCGTTCACAGTGATGGCTCGCCTCTGTTTGGTTGCCTCTTGTTCACACTGTAAC
TGCCAACATAACCTGGAGATGAACTTCTAGCTGAAACATCCGAAGAAGGACCTCCTCCTC
CAATCCCATAGCTAAAAGAACCAGGCCCTTCTGTCTCAGGAGCTGATGATCTCCAAGTGG
GATCACTATACACTGCACCATTCCCATAAAACTCCGCAAGTCCTGCTCCATCATAACCTG
TGTTGTTAGTCCCCGAGGCAGAAGAGAATGAAGACGACGGTGCTGCCTTGCTAGGCCCTA
TGTTTCTTGTTCCAAACCCAAAACCAGATTCACCGTTTCCTCCATAACC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 3

CO CL2291Contig1 831 3 4 U
ATTTGTAAGAAAACCAATTTTAATCTTAGATATTACATTTTGATATGTTTTATAATTTAC
ATTATACATCTAACTCTGCCATATTTTCTTTTTCCTTCTTTCATATTTTCACTCTTTTAT
TTTTTTCATCTTTACTCACAAATGAATTTTAAGTAAAAACAACAACATAAATCTTATTAT
AAAAGCTTTCTCTCATCAGGATCACTTTCAATCTCTGGCCTTTGTTGTCCTCGGTTCCTC
CGCCGTTCGCGAGCTTCTGTACCACCAAATTTTAACCTCCCTGTATCCCTAAACCTATCT
TTCTCTGCCGGAACAATCACACACTCTGGTGGTGGCTTCGGATACCTAATTGTATCATAG
CAATAAGAATAATACATAAAACGTTGTCGGAATCTTCTCATGGCGGCACGTTGATGTGAA
TTGATAGAGGAGTAATCTTGTGACTCAAGGAACTCGACGGAGTCAGAGCAATCAACAGGA
ACTTCTTGGATGGGATCAACAGAGCAACCATCAAGAGAGAAAGATTTGAATTCTGCGACA
AAAGGAGCAAATTTATAATTAGCTTTGTATTTTCCGCCAGAAGTTGCCCAATCAGAGGCA
TCCCAGATGGTGGCGTAAAGAGCCATTGGCTTTGCTGGATAATCGGCTCCCATAGCTTCA
CTTCTTATTACTTCTCTTATCGGCACATCATCTACCCAAAATATGATCTTGTGAGGAGTC
CAGAGGATGCTGTAACGATGAAACTCTTTAGAAGGATCGAACCAGAGACGGTATCTTTCT
TCACGACCTCTAGGCGTGCTTCCATTACCGTACAGATTTGTCTGAAACCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX02JQ U 40
AF RR2AX86JQ U 1
AF RR2AX86TFB C 620
BS 1 367 RR2AX86JQ
BS 368 368 RR2EX02JQ
BS 369 789 RR2AX86JQ
BS 790 831 RR2AX86TFB

RD RR2EX02JQ 562 0 0
TTGATATGTTTTATAATTTACATTATACATCTAACTCTGCCATATTTTCTTTTTCCTTCT
TTCATATTTTCACTCTTTTATTTTTTTCATCTTTACTCACAAATGAATTTTAAGTAAAAA
CAACAACATAAATCTTATTATAAAAGCTTTCTCTCATCAGGATCACTTTCAATCTCTGGC
CTTTGTTGTCCTCGGTTCCTCCGCCGTTCGCGAGCTTCTGTACCACCAAATTTTAACCTC
CCTGTATCCCTAAACCTATCTTTCTCTGCCGGAACAATCACACACTCTGGTGGTGGCTTC
GGATACCTAATTGTATCATAGCAATAAGAATAATACATAAAACGTTGTCGGAATCTTCTC
ATGGCGGCACGTTGATGTGAATTGATAGAGGAGTAATCTTGTGACTCAAGGAACTCGACG
GAGTCAGAGCAATCAACAGGAACTTCTTGGATGGGATCAACAGAGCAACCATCAAGAGAG
AAAGATTTGAATTCTGCGACAAAAGGAGCAAATTTATAATTAGCTTTGTATTTTCCGCCA
GAAGTTGCCCAATCGGAGGCAT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2AX86JQ 789 0 0
ATTTGTAAGAAAACCAATTTTAATCTTAGATATTACATTTTGATATGTTTTATAATTTAC
ATTATACATCTAACTCTGCCATATTTTCTTTTTCCTTCTTTCATATTTTCACTCTTTTAT
TTTTTTCATCTTTACTCACAAATGAATTTTAAGTAAAAACAACAACATAAATCTTATTAT
AAAAGCTTTCTCTCATCAGGATCACTTTCAATCTCTGGCCTTTGTTGTCCTCGGTTCCTC
CGCCGTTCGCGAGCTTCTGTACCACCAAATTTTAACCTCCCTGTATCCCTAAACCTATCT
TTCTCTGCCGGAACAATCACACACTCTGGTGGTGGCTTCGGATACCTAATTGTATCATAG
CAATAAGGATAATACATAAAACGTTGTCGGAATCTTCTCATGGCGGCACGTTGATGTGAA
TTGATAGAGGAGTAATCTTGTGACTCAAGGAACTCGACGGAGTCAGAGCAATCAACAGGA
ACTTCTTGGATGGGATCAACAGAGCAACCATCAAGAGAGAAAGATTTGAATTCTGCGACA
AAAGGAGCAAATTTATAATTAGCTTTGTATTTTCCGCCAGAAGTTGCCCAATCAGAGGCA
TCCCAGATGGTGGCGTAAAGAGCCATTGGCTTTGCTGGATAATCGGCTCCCATAGCTTCA
CTTCTTATTACTTCTCTTATCGGCACATCATCTACCCAAAATATGATCTTGTGAGGAGTC
CAGAGGATGCTGTAACGATGAAACTCTTTAGAAGGATCGAACCAGAGACGGTATCTTTCT
TCACGACCT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2AX86TFB 212 0 0
GAGCCATTGG
CTTTGCTGGATAATCGGCTCCCATAGCTTCACTTCTTATTACTTCTCTTATCGGCACATC
ATCTACCCAAAATATGATCTTGTGAGGAGTCCAGAGGATGCTGTAACGATGAAACTCTTT
AGAAGGATCGAACCAGAGACGGTATCTTTCTTCACGACCTCTAGGCGTGCTTCCATTACC
GTACAGATTTGTCTGAAACCTC

QA 11 212 11 212
DS 



AS 1 3

CO CL2292Contig1 1839 3 5 U
GGATCCATCATCAACACTAAACGCTCTTTCTCTCTTTCTCCGCCGTGTGTGTGTAGGGCT
AAAATTATCAAATCCGTCGGTCTCGGAGATAACAGGTTGAACTTGGATCAGGCCAATGGG
AGGAGGGTTTAGAGTTTTGCATTTGGTGAGGCCGTTCTTGGCCTTTCTGCCTGAGGTGCA
GAGTGCTGACAGGAAGGTGCCTTTCAGAGAGAAGGTTATCTACACTGTCATCTCTCTCTT
CATCTTTCTCGTCTGCAGTCAGCTCCCTCTCTATGGTATTCACTCTACCACCGGCGCGGA
TCCTTTCTACTGGATGCGTGTCATTCTTGCTTCCAACCGTGGGACTGTTATGGAGCTTGG
GATTACTCCCATTGTTACGTCTGGGCTCGTGATGCAGCTCTTGGCAGGGTCGAAGATTAT
TGAGGTTGACAACAATGTCCGTGAGGACCGTGCCCTCTTGAATGGTGCTCAGAAGCTTCT
AGGTATTCTGATTGCCATCGGTGAGGCAGTTGCATATGTTCTTTCTGGAATGTATGGCCC
CGTCGGACAGCTTGGTGTTGGAAATGCCATTCTCATCATCCTCCAGCTTTTCTTTGCCGG
AATCATTGTTATCTGCCTTGACGAGCTTCTTCAGAAGGGATACGGTCTTGGCTCAGGAAT
CTCCCTTTTCATTGCCACCAACATCTGTGAGAGCATTATCTGGAAGGCGTTTAGCCCAAC
GACCATCAACACTGGTCGTGGAGCTGAGTTTGAAGGTGCTGTTATTGCATTGTTCCATAT
GCTGATAACCAAGTCCAACAAGGTTGCAGCTCTCCGCCAAGCATTCTACCGGCAAAACCT
TCCAAATGTTACCAACTTGCTTGCCACAGTCTTGATCTTCCTGATTGTCATCTACTTCCA
AGGGTTCCGTGTGGTTTTGCCTGTGATATCAAAGAATGCCCGTGGGCAACAGGGTTCTTA
CCCAATCAAGCTGTTCTACACCTCTAACATGCCCATCATTCTCCAATCCGCTCTCGTCTC
AAACCTTTACTTCATCTCCCAGCTTCTCTACAGGAAGTTCAGTGGAAACTTCTTTGTAAA
CCTTTTGGGACAATGGAAAGAATCTGAGTACAGTGGGCAATCTATTCCAGTTAGTGGTCT
GGCTTACCTCATCACAGCTCCAGCAAGTTTCTCGGACATGGCAGCCCACCCGTTCCATGC
TCTGTTCTACATTGTCTTCATGCTCACTGCTTGTGCTCTTTTCTCAAAGACATGGGATTG
AGGTCTCCGGATCTTCTGCTAGGGACGTAGCCAAGCAGCTCAAGGAACAACAAATGGTGA
TGCCAGGACACAGAGAGTCAAACTTACAGAAGGAGCTGAACAGGTATATCCCAACAGCAG
CAGCTTTCGGAGGAGTGTGTATTGGTGCACTTACCGTTCTGGCTGATTTCATGGGAGCCA
TTGGGTCCGGGACTGGAATCCTCTTGGCAGTCACCATCATATATCAGTACTTCGAGACCT
TTGAGAAGGAAAAAGCAAGTGAACTCGGCTTCTTCGGGTTCTAAGTTACCCCTAAGGCCA
CAAACTTTGCTTAGGCAAAGGCAGAGTTTCATAGCAGAGAAGGCACTTTTACTTTAGCTT
CTGTGCCAACCTCAAAGGGTAACAGACCGTTTGAGGAGAGCACTTGGGGTAGACTTTTTT
GTTGTTTAAACAAAACTTTCACTTGTAGTTTCTCTTTTTAATATAATTTATGTTTTTATG
TTACTTAAAGAAGTTAAAAATCTGTAGACGACCCTTAAAATGTATGGTTTCTAGGAGTTT
CACTTATGATCGAATAAACAGGTTTACATGTTGGAATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL76TF U 1
AF RR2A827TF U 489
AF RR2DL76JQ C 1087
BS 1 652 RR2DL76TF
BS 653 1247 RR2A827TF
BS 1248 1248 RR2DL76JQ
BS 1249 1300 RR2A827TF
BS 1301 1839 RR2DL76JQ

RD RR2DL76TF 652 0 0
GGATCCATCATCAACACTAAACGCTCTTTCTCTCTTTCTCCGCCGTGTGTGTGTAGGGCT
AAAATTATCAAATCCGTCGGTCTCGGAGATAACAGGTTGAACTTGGATCAGGCCAATGGG
AGGAGGGTTTAGAGTTTTGCATTTGGTGAGGCCGTTCTTGGCCTTTCTGCCTGAGGTGCA
GAGTGCTGACAGGAAGGTGCCTTTCAGAGAGAAGGTTATCTACACTGTCATCTCTCTCTT
CATCTTTCTCGTCTGCAGTCAGCTCCCTCTCTATGGTATTCACTCTACCACCGGCGCGGA
TCCTTTCTACTGGATGCGTGTCATTCTTGCTTCCAACCGTGGGACTGTTATGGAGCTTGG
GATTACTCCCATTGTTACGTCTGGGCTCGTGATGCAGCTCTTGGCAGGGTCGAAGATTAT
TGAGGTTGACAACAATGTCCGTGAGGACCGTGCCCTCTTGAATGGTGCTCAGAAGCTTCT
AGGTATTCTGATTGCCATCGGTGAGGCAGTTGCATATGTTCTTTCTGGAATGTATGGCCC
CGTCGGACAGCTTGGTGTTGGAAATGCCATTCTCATCATCCTCCAGCTTTTCTTTGCCGG
AATCATTGTTATCTGCCTTGACGAGCTTCTTCAGAAGGGATACGGTCTTGGC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2A827TF 812 0 0
G
GATTGCCATCGGTGAGGCAGTTGCATATGTTCTTTCTGGAATGTATGGCCCCGTTGGACA
GCTTGGTGTTGGAAATGCCATTCTCATCATCCTCCAGCTTTTCTTTGCCGGAATCATTGT
TATCTGCCTTGACGAGCTTCTTCAGAAGGGATACGGTCTTGGCTCAGGAATCTCCCTTTT
CATTGCCACCAACATCTGTGAGAGCATTATCTGGAAGGCGTTTAGCCCAACGACCATCAA
CACTGGTCGTGGAGCTGAGTTTGAAGGTGCTGTTATTGCATTGTTCCATATGCTGATAAC
CAAGTCCAACAAGGTTGCAGCTCTCCGCCAAGCATTCTACCGGCAAAACCTTCCAAATGT
TACCAACTTGCTTGCCACAGTCTTGATCTTCCTGATTGTCATCTACTTCCAAGGGTTCCG
TGTGGTTTTGCCTGTGATATCAAAGAATGCCCGTGGGCAACAGGGTTCTTACCCAATCAA
GCTGTTCTACACCTCTAACATGCCCATCATTCTCCAATCCGCTCTCGTCTCAAACCTTTA
CTTCATCTCCCAGCTTCTCTACAGGAAGTTCAGTGGAAACTTCTTTGTAAACCTTTTGGG
ACAATGGAAAGAATCTGAGTACAGTGGGCAATCTATTCCAGTTAGTGGTCTGGCTTACCT
CATCACAGCTCCAGCAAGTTTCTCGGACATGGCAGCCCACCCGTTCCATGCTCTGTTCTA
CATTGTCTTCATGCTCACTGCTTGTGCTCTTTTCTCAA*GACATGGGATTGAGGTCTCCG
GATCTTCTGCTAGGGACGTAGCCAAGCAGCT

QA 2 812 2 812
DS 

RD RR2DL76JQ 753 0 0
GGGACAATGGAAAGAATCTGAGTACAGTGGGCAATCTATTCCAGTTAGTGGTCTGGCTTA
CCTCATCACAGCTCCGGCAAGTTTCTCGGACATGGCAGCTCACCCGTTCCATGCTCTGTT
CTACATTGTCTTCATGCTCACTGCTTGTGCTCTTTTCTCAAAGACATGG*ATTGAGGTCT
CCGGATCTTCTGCTAGGGATGTAGTCAAGCAGCTCAAGGAACAACAAATGGTGATGCCAG
GACACAGAGAGTCAAACTTACAGAAGGAGCTGAACAGGTATATCCCAACAGCAGCAGCTT
TCGGAGGAGTGTGTATTGGTGCACTTACCGTTCTGGCTGATTTCATGGGAGCCATTGGGT
CCGGGACTGGAATCCTCTTGGCAGTCACCATCATATATCAGTACTTCGAGACCTTTGAGA
AGGAAAAAGCAAGTGAACTCGGCTTCTTCGGGTTCTAAGTTACCCCTAAGGCCACAAACT
TTGCTTAGGCAAAGGCAGAGTTTCATAGCAGAGAAGGCACTTTTACTTTAGCTTCTGTGC
CAACCTCAAAGGGTAACAGACCGTTTGAGGAGAGCACTTGGGGTAGACTTTTTTGTTGTT
TAAACAAAACTTTCACTTGTAGTTTCTCTTTTTAATATAATTTATGTTTTTATGTTACTT
AAAGAAGTTAAAAATCTGTAGACGACCCTTAAAATGTATGGTTTCTAGGAGTTTCACTTA
TGATCGAATAAACAGGTTTACATGTTGGAATAG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL2293Contig1 806 2 11 U
GGGTCTCCTTCCATAAAACATCTCCGCCAGATAAAACTCCGATCTCTCCTTGCCTGAAGA
TGCAGTATTTCTACATATTGATCGTATCTATACTCCTCACCCTTAATTTCAAGGGTGAAG
CCAGTGTCTCTGTTTTCTTCATTGATGGATCCGACAACCAATACCTTCGCCCACCATCAC
AGCAGGCGCTTACCATGTCGCTCTCTCAAGTATCTGCATCAGTCTCTGCTTTGTTGGGTC
TCGCACCTCCAGCTACTTTAACAGCTGATGGCTCATCCATGCTGAACAAGATTCTTAAAC
CTAATCCATTTGAGAGGCCTCGTGCTGCTTTTGTGCTAGAAATCGCTGGAGCTGATGATG
CGCTTGTTGAAACCTTACCTAGTCATTCTTTGTTGGGAAATGCTGTGAGAGGCAGTATCA
GTTCTGATTCTTACAAAGCTGATATTGAACTTCCAGAAAGTGAAGTAGATGTTGTGTCTG
TCAATGAACCCTTAACTGATGCCACTGACAAAGACATGAACGAGTTTGCATCTTGGTTGG
GTGGATCATATGTTGCTGGATCTACTGAACCATTGACTGGATTGCTGAGTATCCCTCTGG
TTGGTGCGGCTAACGTTGAGTTCCATTTGGAAAAGGAAGCAGAGAGGAAATTTGCTTTGA
ACCTTTTGGAACTATATAAGAATGTCAAACGGGCTGTCAACCTTCATGAGGATTTATCTC
ATGGTATTGAGAGACCTGCTGAATAACAGTTGGACGCTTTGGCGGTATCGATGCTTTAGC
ACAGAGTATGGACAAGTATGGCTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D840TF U 1
AF RR2FR65TF U 50
BS 1 169 RR2D840TF
BS 170 170 RR2FR65TF
BS 171 297 RR2D840TF
BS 298 298 RR2FR65TF
BS 299 635 RR2D840TF
BS 636 636 RR2FR65TF
BS 637 710 RR2D840TF
BS 711 711 RR2FR65TF
BS 712 735 RR2D840TF
BS 736 736 RR2FR65TF
BS 737 806 RR2D840TF

RD RR2D840TF 806 0 0
GGGTCTCCTTCCATAAAACATCTCCGCCAGATAAAACTCCGATCTCTCCTTGCCTGAAGA
TGCAGTATTTCTACATATTGATCGTATCTATACTCCTCACCCTTAATTTCAAGGGTGAAG
CCAGTGTCTCTGTTTTCTTCATTGATGGATCCGACAACCAATACCTTCGTCCACCATCAC
AGCAGGCGCTTACCATGTCGCTCTCTCAAGTATCTGCATCAGTCTCTGCTTTGTTGGGTC
TCGCACCTCCAGCTACTTTAACAGCTGATGGCTCATCCATGCTGAACAAGATTCTTAGAC
CTAATCCATTTGAGAGGCCTCGTGCTGCTTTTGTGCTAGAAATCGCTGGAGCTGATGATG
CGCTTGTTGAAACCTTACCTAGTCATTCTTTGTTGGGAAATGCTGTGAGAGGCAGTATCA
GTTCTGATTCTTACAAAGCTGATATTGAACTTCCAGAAAGTGAAGTAGATGTTGTGTCTG
TCAATGAACCCTTAACTGATGCCACTGACAAAGACATGAACGAGTTTGCATCTTGGTTGG
GTGGATCATATGTTGCTGGATCTACTGAACCATTGACTGGATTGCTGAGTATCCCTCTGG
TTGGTGCGGCTAACGTTGAGTTCCATTTGGAAAAG*AAGCAGAGAGGAAATTTGCTTTGA
ACCTTTTGGAACTATATAAGAATGTCAAACGGGCTGTCAACCTTCATGAG*ATTTATCTC
ATGGTATTGAGAGAC*TGCTGAATAACAGTTGGACGCTTTGGCGGTATCGATGCTTTAGC
ACAGAGTATGGACAAGTATGGCTAAG

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2FR65TF 746 0 0
GG
GCCTGAAGATGCAGTATTTCTACATATTGATCGTATCTATACTCCTCACCCTTAATTTCA
AGGGTGAAGCCAGTGTCTCTGTTTTCTTCATTGATGGATCCGACAACCAATACCTTCGCC
CACCATCACAGCAGGCGCTTACCATGTCGCTCTCTCAAGTATCTGCATCAGTCTCTGCTT
TGTTGGGTCTCGCACCTCCAGCTACTTTAACAGCTGATGGCTCATCCATGCTGAACAAGA
TTCTTAAACCTAATCCATTTGAGAGGCCTCGTGCTGCTTTTGTGCTAGAAATCGCTGGAG
CTGATGATGCGCTTGTTGAAACCTTACCTAGTCATTCTTTGTTGGGAAATGCTGTGAGAG
GCAGTATCAGTTCTGATTCTTACAAAGCTGATATTGAACTTCCAGAAAGTGAAGTAGATG
TTGTGTCTGTCAATGAACCCTTAACTGATGCCACTGACAAAGACATGAACGAGTTTGCAT
CTTGGTTGGGTGGATCATATGTTGCTGGATCTACTGAACCATTGACTGGATTGCTGAGTA
TCCCTCTGGTTGGTGCGGCTAACGTTGAGTTCCATTTGGAAAAGGAAGCAGAGAGGAAAT
TTGCTTTGAACCTTTTGGAACTATATAAGAATGTCAAACGGGCTGTCAACCTTCATGAGG
ATTTATCTCATGGTATTGAGAGACCTGCTGAATTACAGTTGGACGCTTTGGCGGTATCGA
TGCTT*AGCACAGAGTATGGACAA

QA 3 746 3 746
DS 



AS 1 4

CO CL2294Contig1 1255 4 17 U
GGGTGACCATAATCATTTAAATTTAAAAAATTTAAATCAAATTAAAAAGAAAAGAGGAAA
ACCCTAGCTTTCTCCGTCTCTCTCTCTAACCTTGAGAAAGTCTCGAGACTTTTGAGAGAG
TCGAACCTCGAAATATGTACAAGGAACGTAGTGGTGGATCGTCGAGATCGGAGATCCTCG
GCGGAGCAGTTGATCGGAAACGAATCAACGACGCACTCACCAAGAAGCTAGAGAAATCTT
CACCTTCCACCTCTAGAGCTTTCGCCTCCACTGCTAAACCTCAGCTTGTGGAGTCTGAAA
CGGACAGTGAAGAAGGTTCGGATGTGAGTGGATCGGAGGGTGATGAAGAGACATCGTGGA
TCTCGGGGTTTTGTAACTTGAGAGGGAATGATTTCTTCTGTGAAGTGGATGAGGATTATA
TACAAGATGATTTCAATCTTTGTGGGTTAAGTGGTCAAGTTCCTTACTATGACTATGCGC
TTGATCTCATCCTAGATGTTGAGTCTTCAAACAGCGAGATGTTTACTGAAGAACAGAATG
AACTTGTGGAGTCAGCTGCTGAGATGCTGTACGGTCTTATTCATGTTCGTTACATTTTGA
CTACTAAAGGAATGGCTGCAATGACTGAGAAGTACAAGAACTGTGACTTCGGGAGATGCC
CTAGAGTTTTCTGTTGCGGACAATCTTGTCTTCCTGTTGGACAGTCTGATATCCCAAGAT
CGAGTACTGTGAAGATATACTGCCCCAAATGCGAAGATATATCTTACCCGCGATCTAAGT
TCCAAGGCAATATTGATGGGGCTTACTTGGAACCACATTCCCTCACTTATTCTTGATGAC
ATATGGGAACTTAAAGCCGCAGAAACCGACTCAGAAGTATGTTCCAAGAATATTTGGGGT
TTAAGGTACACAAACCATGATACACACCACTATTGTAAGATAGATACATCTAGTGGCTTG
GCTTTTGCATCCGGATGTGAGCAATTCGTTGCGATTCAAGTGGAGGCACACACCATTCAG
TCACTGGAATCTTGAAAGAATCTCACCAAGTGTACCAAGAAAACTCATCGCAATAGCCTG
GCTTGTTGGGGGAACACCAATCTGTACTCCGAAATATTTTTCCCCAGTTAGTTAGATTTT
TTTGTTCTCCCTGTTGTTTGGTGTCTTTTATGTTCTATCAGCTTATTTGGTTATTTTGAA
ACTCAGAAATTGTTCAATTCAGTTATAGGTTCTGAAACTTACATTTAGTTGGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR35TF U 1
AF RR2ER43TF U 317
AF RR2GR35JQ C 886
AF RR2ER43JQ C 1006
BS 1 365 RR2GR35TF
BS 366 366 RR2ER43TF
BS 367 682 RR2GR35TF
BS 683 905 RR2ER43TF
BS 906 906 RR2GR35JQ
BS 907 937 RR2ER43TF
BS 938 938 RR2GR35JQ
BS 939 1005 RR2ER43TF
BS 1006 1006 RR2GR35JQ
BS 1007 1039 RR2ER43TF
BS 1040 1040 RR2GR35JQ
BS 1041 1062 RR2ER43TF
BS 1063 1091 RR2GR35JQ
BS 1092 1092 RR2ER43JQ
BS 1093 1196 RR2GR35JQ
BS 1197 1197 RR2ER43JQ
BS 1198 1255 RR2GR35JQ

RD RR2GR35TF 682 0 0
GGGTGACCATAATCATTTAAATTTAAAAAATTTAAATCAAATTAAAAAGAAAAGAGGAAA
ACCCTAGCTTTCTCCGTCTCTCTCTCTAACCTTGAGAAAGTCTCGAGACTTTTGAGAGAG
TCGAACCTCGAAATATGTACAAGGAACGTAGTGGTGGATCGTCGAGATCGGAGATCCTCG
GCGGAGCAGTTGATCGGAAACGAATCAACGACGCACTCACCAAGAAGCTAGAGAAATCTT
CACCTTCCACCTCTAGAGCTTTCGCCTCCACTGCTAAACCTCAGCTTGTGGAGTCTGAAA
CGGACAGTGAAGAAGGTTCGGATGTGAGTGGATCGGAGGGTGATGAAGAGACATCGTGGA
TCTCGTGGTTTTGTAACTTGAGAGGGAATGATTTCTTCTGTGAAGTGGATGAGGATTATA
TACAAGATGATTTCAATCTTTGTGGGTTAAGTGGTCAAGTTCCTTACTATGACTATGCGC
TTGATCTCATCCTAGATGTTGAGTCTTCAAACAGCGAGATGTTTACTGAAGAACAGAATG
AACTTGTGGAGTCAGCTGCTGAGATGCTGTACGGTCTTATTCATGTTCGTTACATTTTGA
CTACTAAAGGAATGGCTGCAATGACTGAGAAGTACAAGAACTGTGACTTCGGGAGATGCC
CTAGAGTTTTCTGTTGCGGACA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2ER43TF 752 0 0
TTCGGATGTGAGTGGATCGGAGGGTGATGAAGAGACATCGTGGATCTCGGGGTTTTGTAA
CTTGAGAGGGAATGATTTCTTCTGTGAAGTGGATGAGGATTATATACAAGATGATTTCAA
TCTTTGTGGGTTAAGTGGTCAAGTTCCTTACTATGACTATGCGCTTGATCTCATCCTAGA
TGTTGAGTCTTCAAACAGCGAGATGTTTACTGAAGAACAGAATGAACTTGTGGAGTCAGC
TGCTGAGATGCTGTACGGTCTTATTCATGTTCGTTACATTTTGACTACTAAAGGAATGGC
TGCAATGACTGAGAAGTACAAGAACTGTGACTTCGGGAGATGCCCTAGAGTTTTCTGTTG
CGGACAATCTTGTCTTCCTGTTGGACAGTCTGATATCCCAAGATCGAGTACTGTGAAGAT
ATACTGCCCCAAATGCGAAGATATATCTTACCCGCGATCTAAGTTCCAAGGCAATATTGA
TGGGGCTTACTTGGAACCACATTCCCTCACTTATTCTTGATGACATATGGGAACTTAAAG
CCGCAGAAACCGACTCAGAAGTATGTTCCAAGAATATTTGGGGTTTAAGTTACACAAACC
ATGATACACACCACTATTGTATGATAGATACATCTAGTGGCTTGGCTTTTGCATCCGGAT
GTGAGCAATTCGTTGCGATTCAAGTGGAG*CACACACCATTCAGTCACTGGAATCTTGAA
AGA*TCTCACCAAGTGTACCAAGAAA
CTCATC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2GR35JQ 370 0 0
AAGAATATTTGGG*TTTAAGGTACACAAACCATGATACACACCACTATTGTAAGATAGAT
ACATCTAGTGGCTTGGCTTTTGCATCCGGATGTGAGCAATTTGTTGCGATTCAAGTGGAG
GCACACACCATTCAGTCACTGGAATCTTGAAAGAATCTCACCAAGTGTACCAAGAAAACT
CATCGCAATAGCCTGGCTTGTTGGGG*AACACCAATCTGTACTCCGAAATATTTTTCCCC
AGTTAGTTAGATTTTTTTGTTCTCCCTGTTGTTTGGTGTCTTTTATGTTCTATCAGCTTA
TTTGGTTATTT*GAAACTCAGAAATTGTTCAATTCAGTTATAGGTTCTGAAACTTACATT
TAGTTGGTGC

QA 1 370 1 370
DS 

RD RR2ER43JQ 237 0 0
GCACACCCCATTCAGTCACTGGAATCTTGAAAGAATCTCACCAAGTGTACCAAGAAAACT
CATCGCAATAGCCTGGCTTGTTGGGGGAACACCAATCTGTATTCCGAAATATTTTTCCCC
AGTTAGTTAGATTTTTTTGTTTTCCCTGTTGTTTGGTGTTTTTTATGTTCTATCAGCTTA
TTTGGTTATTTTGAAACTCAGAAATTGTTCAATTCAGTTATAGGTTTTGAAACTTAC

QA 1 237 1 237
DS 



AS 1 3

CO CL2295Contig1 1246 3 4 U
GTCAACTGATAATAATAAAATAAATCTACACCACATAACATTGCGTAATCTCCCAGAATG
CGTGTCGTTTGTAGATTCCATACTATTTTTCGTCTCTGGCTGAAGCAAGTGTGCAAGTCC
AACTATGCATATACAACAGTAACTTGAAAATGTTATAGAAACTAATAACTGAAAACCAAA
GACCCAACCACTGTTCTTGGAAGGCCAAATGTAACAATACACTTGTTTCTTGTCTTCTCT
TTTCTCTCTTTTTCACATTCTACTATCCAAAAAAGGGGGAAAAAACTTTTAGATATATTT
TGCTACCAACAAATATTAACGCCTCACGAATTGGCTAAAAAGCCTAAAACGGAAAAAAGA
TCACTAATGCCAGATTCAAACAAATAAAGATTTATGTTTCTCAAACAAGATTTACCTCAC
TGACTTGAATCTTCTTCACCCAACTTAACCATTTATCTGTTTTTCATCAGCTTCGGACAC
TGCAACCGCTTCAGAAGCTCCTTCGACAGACTCGCTGTTACTTTTATTGTTGCCGTTATC
GCTTTCTTTGGTCTCCCGTTCATCCAACGTCTTGTCGTCTCCAGAGACATTTGTGTTCCC
TGATTCTTCTGTAGACGAGGCTTTGACTTGTTCATCTTTTGGTTTTGGGTCATTAGAGAC
GGAAGCAGTGCACTTGTTTTTGCTGCTAAGGTGGTCACCAGTAACAGAGAGATGATTGTT
GTTGTTGTTGCTGCTACTATTTTTCTCTCTGTTGCTTTGACGTGTTACCCACTTGAGCTG
CAACGTGTTTTCTTGCCAGCATTTTGCGTTAGCAAACGCTTTCTCGGCTGCGCTGCGTTT
CACAAACGTGATACAAGCTGCACGGTTACGGTTTTCTTTATCTGTTTCATCCTGATCCTT
GCCACCATCAGTCGATGCATCGTCTTCGAGTTCCACTTTTGAGACTTCGCCATAAGATGA
AAAATGTTCCTTTAGGACAGCAATATCAGCTAACCCGGTTGGCAAAGGAGGAACAACTTT
GATGGTAGTCGGGCGGTTGTCCAACTTATACCTATTCACCATAGGAGTGTTCAAACTTGT
GGTGAACGGATACGGTCTTTGCTTTAAGTGTTTTTGGGGATCGGGAGATGGCGTTTCAGT
GCTTATTTTAGCAGAATAAAGTGGTTTCTGGATAGGCACTTTCTTCTTATCTGTGGATGA
CTCTGTTTTTGGTGACGAGGTTGCAGCATAGGAGTTAGAGGCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB47JQ U 133
AF RR2F412JQ U 1
AF RR2F412TF C 603
BS 1 500 RR2F412JQ
BS 501 501 RR2FB47JQ
BS 502 780 RR2F412JQ
BS 781 1246 RR2F412TF

RD RR2FB47JQ 574 0 0
G
CAACAGTAACTTGAAAATGTTATAGAAACTAATAACTGAAAACCAAAGACCCAACCATTG
TTCTTGGAAGGCCAAATGTAACAATACACTTGTTTCTTGTCTTCTCTTTTCTCTCTTTTT
CACATTCTACTATCCAAAAA*GGGGGAAAAAACTTTTAGATATATTTTGCTACCAACAAA
TATTAACGCCTCACGAATTGGCTAAAAAGCCTAAAACGGAAAAAAGATCACTAATGCCAG
ATTCAAACAAATAAAGATTTATGTTTCTCAGACAAGATTTACCTCACTGACTTGAATCTT
CTTCACCCAACTTAACCATTTATCTGTTTTTCATCAGCTTCGGACACTGCAACCGCTTCA
GAAGCTCCTTCGACAGACTCGCTGTTACTTTTATTGTTGCCGTTATCGCTTTCTTTGGTC
TCCCGTTCATCCAACGTCTTGTCGTCTCCAGAGACATTTGTGTTCCCTGATTCTTCTGTA
GACGAGGCTTTGACTTGTTCATCTTTTGGTTTTGGGTCATTAGAGACGGAAGCAGTGCAC
TTGTTTTTGCTGCTAAGGTGGTCACCAGTAACA

QA 2 574 2 574
DS 

RD RR2F412JQ 780 0 0
GTCAACTGATAATAATAAAATAAATCTACACCACATAACATTGCGTAATCTCCCAGAATG
CGTGTCGTTTGTAGATTCCATACTATTTTTCGTCTCTGGCTGAAGCAAGTGTGCAAGTCC
AACTATGCATATACAACAGTAACTTGAAAATGTTATAGAAACTAATAACTGAAAACCAAA
GACCCAACCACTGTTCTTGGAAGGCCAAATGTAACAATACACTTGTTTCTTGTCTTCTCT
TTTCTCTCTTTTTCACATTCTACTATCCAAAAAAGGGGGAAAAAACTTTTAGATATATTT
TGCTACCAACAAATATTAACGCCTCACGAATTGGCTAAAAAGCCTAAAACGGAAAAAAGA
TCACTAATGCCAGATTCAAACAAATAAAGATTTATGTTTCTCAAACAAGATTTACCTCAC
TGACTTGAATCTTCTTCACCCAACTTAACCATTTATCTGTTTTTCATCAGCTTCGGACAC
TGCAACCGCTTCAGAAGCTC*TTCGACAGACTCGCTGTTACTTTTATTGTTGCCGTTATC
GCTTTCTTTGGTCTCCCGTTCATCCAACGTCTTGTCGTCTCCAGAGACATTTGTGTTCCC
TGATTCTTCTGTAGACGAGGCTTTGACTTGTTCATCTTTTGGTTTTGGGTCATTAGAGAC
GGAAGCAGTGCACTTGTTTTTGCTGCTAAGGTGGTCACCAGTAACAGAGAGATGATTGTT
GTTGTTGTTGCTGCTACTATTTTTCTCTCTGTTGCTTTGACGTGTTACCCACTTGAGCTG

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2F412TF 644 0 0
ATTCTTCTGTAGACGAGGCTTTGACTTGTTCATCTTTTGGTTTTGGGTCATTAGAGACGG
AAGCAGTGCACTTGTTTTTGCTGCTAAGGTGGTCACCAGTAACAGAGAGATGATTGTTGT
TGTTGTTGCTGCTACTATTTTTCTCTCTGTTGCTTTGACGTGTTACCCACTTGAGCTGCA
ACGTGTTTTCTTGCCAGCATTTTGCGTTAGCAAACGCTTTCTCGGCTGCGCTGCGTTTCA
CAAACGTGATACAAGCTGCACGGTTACGGTTTTCTTTATCTGTTTCATCCTGATCCTTGC
CACCATCAGTCGATGCATCGTCTTCGAGTTCCACTTTTGAGACTTCGCCATAAGATGAAA
AATGTTCCTTTAGGACAGCAATATCAGCTAACCCGGTTGGCAAAGGAGGAACAACTTTGA
TGGTAGTCGGGCGGTTGTCCAACTTATACCTATTCACCATAGGAGTGTTCAAACTTGTGG
TGAACGGATACGGTCTTTGCTTTAAGTGTTTTTGGGGATCGGGAGATGGCGTTTCAGTGC
TTATTTTAGCAGAATAAAGTGGTTTCTGGATAGGCACTTTCTTCTTATCTGTGGATGACT
CTGTTTTTGGTGACGAGGTTGCAGCATAGGAGTTAGAGGCTGTC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 4

CO CL2296Contig1 1239 4 13 U
AAAAGAACTTTGGCAACAGAGCCCTTATTGCAAACAACACTCATAACAATGCTTTTACTA
CATAGCGCCAAAAGACGGAGCAAACTACAAAAAGAAAATGAAATGGAACAATCAAACAAC
ATAACCCATTTATACATATCTCTCTCTCATTCTCTTTGGACATATCTTGAAATCAGACAA
AAAAAACGACCCCATTTTGTAATTTCGAGGTTTTCTAGGTCCACACTTCTAATACAGTAA
CGCATCAGAAGATGCCATGAGGTCCTGATGCCATGACTGGCTGGTTCATATAAAACATGT
TCATACTAATCTGATTCACGAGGAAATCATCAGACTCTGAACCAGACAGAGGGTTCGAAC
AGATCCCGTTGGTATTGTCGAGGAAACCGATGATGTCGTTTAGAGATTCAAGCCTGTGGC
TAAGTTCATCGAGCTGAGCTCTGAGAACAGAGTTCTCTGCTTCGACGGTTAAGTAGTGCT
GCGTTGTGATGCTGACACTTGTCACAATCTCGTCATTCTCTTTCTTGAGATGAATAACCT
GAGCCGTTAGATCGTCAAGAAGCCTCTGTTTCTTCATCCTCGACCTCCTCGCTGATTCAC
GGTTCGAGAGCATTCTCTTCCGTTTCCTCTGCTCCGTGAGACTCTCCTCAGGTCCTGACG
ACGTTTGAATCGTCGAAGAAGTTGTTCCAGACGACGACGAGTCCATTCAGCACACACACA
CACACAAACAAACAAACAAAGAAGTCTTTTACGAGAAGAGAGATTATATTAAAAATGGGT
TTTCTTGTAAGAGAAGTCAAGAACAAGACAGGACAGGACCCAGATCGAAGACGAAAACAA
AGAAGAAACAAAAGAAAAAAAGTTATTTTTTTTAAACTAGGGTTTTGATTTAATTATACG
ACTATGTAATAAAAGACGGAGAGTTTGAGAAACTATGAGACGTAGTAAAGCCAGTAAAGG
AAGACAACAGAGAAAGATTGAACGAGATGGGTCCTGCGCCTGATTGTAGAGTTTAACATA
AACCCAGAGAGGAAGATCTCACTGAGTATAATCGGAGACATGTGTCTCAAACACCAAGAA
CTGCTGATTAAGCATCAAGGTTTTGTCTATTTTTTTTTAAAAGATTATTTTCACAAGAGC
TGAGATATTTTTTTTAACACAAAAGAGCTGAGATCTTTTATAATGAATCGTTTAAAGGAA
AACGAAATCAAGAGAAGAAGAAGAAGGAGAGAAGGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2GG72JQB U 1
AF RR2EA81JQ U 12
AF RR2EA81TF C 572
AF RR2GG72TF C 1009
BS 1 246 RR2GG72JQB
BS 247 247 RR2EA81JQ
BS 248 276 RR2GG72JQB
BS 277 277 RR2EA81JQ
BS 278 305 RR2GG72JQB
BS 306 306 RR2EA81JQ
BS 307 421 RR2GG72JQB
BS 422 422 RR2EA81JQ
BS 423 495 RR2GG72JQB
BS 496 496 RR2EA81JQ
BS 497 545 RR2GG72JQB
BS 546 747 RR2EA81JQ
BS 748 1239 RR2EA81TF

RD RR2GG72JQB 545 0 0
AAAAGAACTTTGGCAACAGAGCCCTTATTGCAAACAACACTCATAACAATGCTTTTACTA
CATAGCGCCAAAAGACGGAGCAAACTACAAAAAGAAAATGAAATGGAACAATCAAACAAC
ATAACCCATTTATACATATCTCTCTCTCATTCTCTTTGGACATATCTTGAAATCAGACAA
AAAAAACGACCCCATTTTGTAATTTCGAGGTTTTCTAGGTCCACACTTCTAATACAGTAA
CGCATCGGAAGATGCCATGAGGTCCTGATGCCATGAGTGGCTGGTTCATATAAAACATGT
TCATATTAATCTGATTCACGAGGAAATCATCAGACTCTGAACCAGACAGAGGGTTCGAAC
AGATCCCGTTGGTATTGTCGAGGAAACCGATGATGTCGTTTAGAGATTCAAGCCTGTGGC
TGAGTTCATCGAGCTGAGCTCTGAGAACAGAGTTCTCTGCTTCGACGGTTAAGTAGTGCT
GCGTTGTGATGCTGAGACTTGTCACAATCTCGTCATTCTCTTTCTTGAGATGAATAACCT
GAGCC

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2EA81JQ 736 0 0
GGCAACAGAGCCTTTATTGCAAACAACACTCATAACAATGCTTTTACTACATAGCGCCAA
AAGACGGAGCAAACTACAAAAAGAAAATGAAATGGAACAATCAAACAACATAACCCATTT
ATACATCTCTCTCTCTCATTTTCTTTGGACATATCTTGAAATCAGACAAAAAAACCGACC
CCATTTTGTAATTTCGAGGTTTTCTAGGTCCACACTTCTAATACAGTAACGCATCAGAAG
ATGCCATGAGGTTCTGATGCCATGACTGGCTGGTTCATATAAAACATGTTCATACTAATC
TGATTCACGAGGAAATCATCAGACTCTGAACGAGACAGAGGGTTCGAACAGATCCCGTTG
GTATTGTCGAGGAAACCGATGATGTCGTTTAGAGATTCAAGCCTGTGGCTAAGTTCATCG
AGCTGAGCTCTGAGAACAGAGTTCTCTGCTTCGACGGTTAAGTAGTGCTGCGTTGTGATG
CTGACACTTGTCACAATCTCGTCATTCTCTTTTTTGAGCTGAATAACCTGAGCCGTTAGA
TCGTCAAGAAGCCTCTGTTTCTTCATCCTCGACCTCCTCGCTGATTCACGGTTCGAGAGC
ATTCTCTTCCGTTTCCTCTGCTCCGTGAGACTCTCCTCAGGTCCTGACGACGTTTGAATC
GTCGAAGAAGTTGTTCCAGACGACGACGAGTCCATTCAGCACACACACACACACAAACAA
ACAAACAAAGAAGTCT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2EA81TF 668 0 0
CTTCATCCTCGACCTCCTCGCTGATTCACGGTTCGAGAGCATTCTCTTCCGTTTCCTCTG
CTCCGTGAGACTCTCCTCAGGTCCTGACGACGTTTGAATCGTCGAAGAAGTTGTTCCAGA
CGACGACGAGTCCATTCAGCACACACACACACACAAACAAACAAACAAAGAAGTCTTTTA
CGAGAAGAGAGATTATATTAAAAATGGGTTTTCTTGTAAGAGAAGTCAAGAACAAGACAG
GACAGGACCCAGATCGAAGACGAAAACAAAGAAGAAACAAAAGAAAAAAAGTTATTTTTT
TTAAACTAGGGTTTTGATTTAATTATACGACTATGTAATAAAAGACGGAGAGTTTGAGAA
ACTATGAGACGTAGTAAAGCCAGTAAAGGAAGACAACAGAGAAAGATTGAACGAGATGGG
TCCTGCGCCTGATTGTAGAGTTTAACATAAACCCAGAGAGGAAGATCTCACTGAGTATAA
TCGGAGACATGTGTCTCAAACACCAAGAACTGCTGATTAAGCATCAAGGTTTTGTCTATT
TTTTTTTAAAAGATTATTTTCACAAGAGCTGAGATATTTTTTTTAACACAAAAGAGCTGA
GATCTTTTATAATGAATCGTTTAAAGGAAAACGAAATCAAGAGAAGAAGAAGAAGGAGAG
AAGGGCCC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2GG72TF 227 0 0
GAGTTTAACATAAACCCAGAGAGGAAGATCTCACTGAGTATAATCGGAGACATGTGTCTC
AAACACCAAGAACTGCTGATTAAGCATCAAGGTTTTGTCTATTTTTTTTTAAAAGATTAT
TTTCACAAGAGCTGAGATATTTTTTTTAACACAAAAGAGCTGAGATCTTTTATAATGAAT
CGTTTAAAGGAAAACGAAATCAAGAGAAGAAGAAGAAGGAGAGAAG
C

QA 1 226 1 226
DS 



AS 1 4

CO CL2297Contig1 1284 4 14 U
TCCACTATCTTAACCGTTTTAGATAGCTGTGGAATGAAGATAAGAAGTGATGATCCTGTG
GCTATGAAAACCTTCATCATAAGCATCCAGAACAAGACAAATGAAATTAAAACCTCCCCG
GATATCAAGACTGATATAAATAAATTTACAATGGAAAAAATGCTTGAAACCATTGCTGCA
ATCAAGAACAACAAGTTGAGAGCCAAAGAGGATTCTGTCCAGAATACAAGGGTAAAGAAG
TGGCTTCAAAAGTTGAGAGTGGAAGAAGTACTATTAAGAGGACTCACATGGAGCAAGCTG
CTTGACACCGAGAAGAAGGGTCAGTGGTGGTTATCTGGCGACTTGGCGGTTAAAACAAAC
CACGCTGAAGATGTAGCACAAACAATGGACGCAGAGGTTGTTGAGGCCCAGAAAATGTTA
AAGCTAGCTGATGCACAGAGGATGAACACAGACTCCAGGAAAGCTATATTTTGCGTGATC
ATGAGTAGTGAAGACTACATTGATGCATTTGAGAAACTACTTAGATTGGATCTGCCAGGA
AAGCAGGACAGAGAGATCATGAGGGTTCTTGTTGAATGCTGTTTACAGGAGAAAGTATTT
AACAAGTACTACACAGTTCTCGCTTTAAAGTTGTGTGAGCACGACAAGAACCATAAGTTT
ACACTACAGTACTGCATCTGGGACCATTTCAAAGAACTAGAGTCAATGTCACTTCAGAGA
TCAATGCATTTGGGGAAATTTGTGGGGGAGATGATTGTATCCTTCAATTTTTTTCTTGCG
GTTTTCAAATGTGTGGACTTGGGGAATCCAGTGCAGTTGACTCCAAAGAGAATCATGCAC
TTTCGGATGCTGTTTGAGGCCATCTTTGAGCACACTGAGAAACTTGTGTGGAACTTGTTC
ACTCGCATAGCCGTGAATCCGGACTATGAAGCTTTAAGGGATGGCATCAAGTTCTTCATG
AAGGAATACGTTGTGAAATCCAATAAGGCGATTTATGGAAAATTCAGGAAAGCCAAAGAA
GCTCTCAACAATTCAGATGGATCGCTGCTCATGTGATTCTTGTTGCCATCCCTGGGCTAA
CAGTTTTTCAAGCTCTTTTGAGTTTACTTTAGTTGTTATGTCATTGTGTCTTACAGTGTA
CACATTTTCGTTTGACTGAGACTTGGGTTTTTTGGAGCTACTATTTATTTAAGGTTTCCA
AGTTTCAGGATCTCAAGTTTCATCAGCCTTAATAAAAACTTGTAAAAACGGGTTGACATT
TGATTTTTGACCTTTTTTTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW42TF U 1
AF RR2BP30TF U 179
AF RR2GW42JQ C 676
AF RR2BP30JQ C 934
BS 1 320 RR2GW42TF
BS 321 729 RR2BP30TF
BS 730 953 RR2GW42JQ
BS 954 954 RR2BP30JQ
BS 955 1023 RR2GW42JQ
BS 1024 1024 RR2BP30JQ
BS 1025 1058 RR2GW42JQ
BS 1059 1059 RR2BP30JQ
BS 1060 1094 RR2GW42JQ
BS 1095 1095 RR2BP30JQ
BS 1096 1129 RR2GW42JQ
BS 1130 1130 RR2BP30JQ
BS 1131 1172 RR2GW42JQ
BS 1173 1284 RR2BP30JQ

RD RR2GW42TF 324 0 0
TCCACTATCTTAACCGTTTTAGATAGCTGTGGAATGAAGATAAGAAGTGATGATCCTGTG
GCTATGAAAACCTTCATCATAAGCATCCAGAACAAGACAAATGAAATTAAAACCTCCCCG
GATATCAAGACTGATATAAATAAATTTACAATGGAAAAAATGCTTGAAACCATTGCTGCA
ATCAAGAACAACAAGTTGAGAGCCAAAGAGGATTCTGTCCAGAATACAAGGGTAAAGAAG
TGGCTTCAAAAGTTGAGAGTGGAAGAAGTACTATTAAGAGGACTCACATGGAGCAAGCTG
CTTGACACCGAGAAGAAGGG
GTCA

QA 1 320 1 320
DS 

RD RR2BP30TF 557 0 0
G
AATCAAGAACAACAAGTTGAGAGCCAAAGAGGATTCTGTCCAGAATACAAGGGTAAAGAA
GTGGCTTCAAAAGTTGAGAGTGGAAGAAGTACTATTAAGAGGACTCACATGGAGCAAGCT
GCTTGACACCGAGAAGAAGGGTCAGTGGTGGTTATCTGGCGACTTGGCGGTTAAAACAAA
CCACGCTGAAGATGTAGCACAAACAATGGACGCAGAGGTTGTTGAGGCCCAGAAAATGTT
AAAGCTAGCTGATGCACAGAGGATGAACACAGACTCCAGGAAAGCTATATTTTGCGTGAT
CATGAGTAGTGAAGACTACATTGATGCATTTGAGAAACTACTTAGATTGGATCTGCCAGG
AAAGCAGGACAGAGAGATCATGAGGGTTCTTGTTGAATGCTGTTTACAGGAGAAAGTATT
TAACAAGTACTACACAGTTCTCGCTTTAAAGTTGTGTGAGCACGACAAGAACCATAAGTT
TACACTACAGTACTGCATCTGGGACCATTTCAAAGAACTAGAGTCAATGTCACTTCAGAG
ATCAATGCAT
CTGGCG

QA 2 551 2 551
DS 

RD RR2GW42JQ 497 0 0
ATT
TGGGACCATTTCAAAGAACTAGAGTCAATGTCACTTCAGAGATCAATGCATTTGGGGAAA
TTTGTGGGGGAGATGATTGTATCCTTCAATTTTTTTCTTGCGGTTTTCAAATGTGTGGAC
TTGGGGAATCCAGTGCAGTTGACTCCAAAGAGAATCATGCACTTTCGGATGCTGTTTGAG
GCCATCTTTGAGCACACTGAGAAACTTGTGTGGAACTTGTTCACTCGCATAGCCGTGAAT
CCGGACTATGAAGCTTTAAGGGATGGCATCAAGTTTTTCATGAAGGAATACGTTGTGAAA
TCCAATAAGGCGATTTATGGAAAATTCAGGAAAGCCAAAGAAGCTTTCAACAATTCAGAT
GGATCGCTGCTCATGTGATTTTTGTTGCCATCCCTGGGCTAACAGTTTTTCAAGCTTTTT
TGAGTTTACTTTAGTTGTTATGTCATTGTGTTTTACAGTGTACACATTTTCGTTTGACTG
AGACTTGGGTTTTT

QA 4 497 4 497
DS 

RD RR2BP30JQ 351 0 0
C
TAAGGGATGGCATCAAGTTCTTCATGAAGGAATACGTTGTGAAATCCAATAAGGCGATTT
ATGGAAAATTCAGGAAAGCCAAAGAAGCTCTCAACAATTCAGATGGATCGCTGCTCATGT
GATTCTTGTTGCCATCCCTGGGCTAACAGTTTTTCAAGCTCTTTTGAGTTTACTTTAGTT
GTTATGTCATTGTGTCTTACAGTGTACACATTTTCGTTTGACTGAGACTTGGGTTTTTTG
GAGCTACTATTTATTTAAGGTTTCCAAGTTTCAGGATCTCAAGTTTCATCAGCCTTAATA
AAAACTTGTAAAAACGGGTTGACATTTGATTTTTGACCTTTTTTTTCTTT

QA 2 351 2 351
DS 



AS 1 2

CO CL2298Contig1 522 2 3 U
ACTAACAGCAATCTTTCTGGATTAAAATACCCTGAAACAAGTTTGTGTCAAAACACTAGA
GATGTCTTTCAAGGAAAAAACAACATAGATAAATAAGTTTGTTGTGAAAACAGATCACTT
GATCTTCATCTTCGGCCTCAACTGGTTGCTGTGGCCACACTTCTTCTTCCTGCAGTTCAC
AGCCCTTGGGTGCAGACGAGCGTAACACTTGCGACAGATCATCTTGTCTTGATTGTACTT
ACGAGCCAAAGCCATCAAAGACGGCTCGATGATACCTCCCCTTAGCCTCAGGACAAGATG
CAGAGTCGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGCCAAGGTGCGACCGTCTTCAAGCTGTTT
TCCGGCGAAAATCAACCTCTGCTGATCCGGAGGGATTCCTTCTTTGTCCTGGATCTTGGC
CTTGACATTGTCGATGGTGTCACTGCTCTCCACCTCGAGGGTGATGGTCTTGCCCGTCAG
CGTCTTCACGAATATCTGCATCTTCTCCGCCGCAAGGATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E579JQ U 337
AF RR2B887TF C 1
BS 1 336 RR2B887TF
BS 337 451 RR2E579JQ
BS 452 522 RR2B887TF

RD RR2E579JQ 115 0 0
GGTGCGACCGTCTTCAAGCTGTTTTCCGGCGAAAATCAACCTCTGCTGATCCGGAGGGAT
TCCTTCTTTGTCCTGGATCTTGGCCTTGACATTGTCGATGGTGTCACTGCTCTCC

QA 1 115 1 115
DS 

RD RR2B887TF 522 0 0
ACTAACAGCAATCTTTCTGGATTAAAATACCCTGAAACAAGTTTGTGTCAAAACACTAGA
GATGTCTTTCAAGGAAAAAACAACATAGATAAATAAGTTTGTTGTGAAAACAGATCACTT
GATCTTCATCTTCGGCCTCAACTGGTTGCTGTGGCCACACTTCTTCTTCCTGCAGTTCAC
AGCCCTTGGGTGCAGACGAGCGTAACACTTGCGACAGATCATCTTGTCTTGATTGTACTT
ACGAGCCAAAGCCATCAAAGACGGCTCGATGATACCTCCCCTTAGCCTCAGGACAAGATG
CAGAGTCGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGCCAAGGTGCGACCGTCTTCAAGCTGTTT
TCCGGCGAAAATCAACCTCTGCTGATCCGGAGGGATTCCTTCTTTGTCCTGGATCTTGGC
CTTGACATTGTCGATGGTGTCACTGCTCTCCACCTCGAGGGTGATGGTCTTGCCCGTCAG
CGTCTTCACGAATATCTGCATCTTCTCCGCCGCAAGGATCCC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 2 4

CO CL2299Contig1 637 2 2 U
TTACAAACACCAATGGCAATCTTCTATTATTTCAATGCAAAAGGAACCGTATGGTGTTAC
CATTGATTCTCAATAATATAACAATCATCTCCAAATAAAAATCAAGAGTTATACATTTAT
TGGAAGTTTCTGAGTTTGAAAGGAGAAATACAAGAATGTCAAAAACAAACAAATGATATA
GGTTCAGCAAAGCTTGCACAATGTATAGATGTTTAACGCTGTGAGACGGATTCAGCAGAG
AAGAGGTACTTGACACGGGAGAGAACCGAATCATGAGCAGGATCATAGGGATGGTCCTTG
GAAGGGATCTCGAGAATCGCAGGCACTGGCTTGTTGTAGCTATCCACCAAGAAACGGATC
ATATTGGTAACGTATTGGCTGATGAGGATGATAGCAATATCATCTATCGATGAGAATTCC
TTGAAAGCATCCTCAATTTGTCTAACAGTTGTCTTTGAATCCACAATGAGGTAGTTAGTC
TTCCTCCTGATGTCAACATTACCAACTCCAGCCATCAAGAATCCAACGACGGTGTCCTCG
TCGGCGATCATAGCGATGAGGGCAGAGTTGCGAGCAGGGATCGAAGCTCTCCCAGCCATT
TTGATTCAACTTCTCTTCTCTGTTTCTTCGATTTTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AE43TF C 1
AF RR2AE43JQ U 3
BS 1 2 RR2AE43TF
BS 3 637 RR2AE43JQ

RD RR2AE43TF 637 0 0
TTACAAACACCAATGGCAATCTTCTATTATTTCAATGCAAAAGGAACCGTATGGTGTTAC
CATTGATTCTCAATAATATAACAATCATCTCCAAATAAAAATCAAGAGTTATACATTTAT
TGGAAGTTTCTGAGTTTGAAAGGAGAAATACAAGAATGTCAAAAACAAACAAATGATATA
GGTTCAGCAAAGCTTGCACAATGTATAGATGTTTAACGCTGTGAGACGGATTCAGCAGAG
AAGAGGTACTTGACACGGGAGAGAACCGAATCATGAGCAGGATCATAGGGATGGTCCTTG
GAAGGGATCTCGAGAATCGCAGGCACTGGCTTGTTGTAGCTATCCACCAAGAAACGGATC
ATATTGGTAACGTATTGGCTGATGAGGATGATAGCAATATCATCTATCGATGAGAATTCC
TTGAAAGCATCCTCAATTTGTCTAACAGTTGTCTTTGAATCCACAATGAGGTAGTTAGTC
TTCCTCCTGATGTCAACATTACCAACTCCAGCCATCAAGAATCCAACGACGGTGTCCTCG
TCGGCGATCATAGCGATGAGGGCAGAGTTGCGAGCAGGGATCGAAGCTCTCCCAGCCATT
TTGATTCAACTTCTCTTCTCTGTTTCTTCGATTTTCC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2AE43JQ 635 0 0
ACAAACACCAATGGCAATCTTCTATTATTTCAATGCAAAAGGAACCGTATGGTGTTACCA
TTGATTCTCAATAATATAACAATCATCTCCAAATAAAAATCAAGAGTTATACATTTATTG
GAAGTTTCTGAGTTTGAAAGGAGAAATACAAGAATGTCAAAAACAAACAAATGATATAGG
TTCAGCAAAGCTTGCACAATGTATAGATGTTTAACGCTGTGAGACGGATTCAGCAGAGAA
GAGGTACTTGACACGGGAGAGAACCGAATCATGAGCAGGATCATAGGGATGGTCCTTGGA
AGGGATCTCGAGAATCGCAGGCACTGGCTTGTTGTAGCTATCCACCAAGAAACGGATCAT
ATTGGTAACGTATTGGCTGATGAGGATGATAGCAATATCATCTATCGATGAGAATTCCTT
GAAAGCATCCTCAATTTGTCTAACAGTTGTCTTTGAATCCACAATGAGGTAGTTAGTCTT
CCTCCTGATGTCAACATTACCAACTCCAGCCATCAAGAATCCAACGACGGTGTCCTCGTC
GGCGATCATAGCGATGAGGGCAGAGTTGCGAGCAGGGATCGAAGCTCTCCCAGCCATTTT
GATTCAACTTCTCTTCTCTGTTTCTTCGATTTTCC

QA 1 635 1 635
DS 



CO CL2299Contig2 983 2 2 U
GGACTCGCGCTAGTTAGTGAGTAGTGACTGACATTCATCATCTTCGAAAAATCGCAATGG
ATCTTCTCAACAACCCTCCCACAACAACAGTGGGTCTATCAGAGACTTTCGCTAGGTTAA
AGTCACAACGCAAAGTGGCTCTGATTCCATATATCACAGCTGGTGATCCAGATCTTTCCA
CAACAGCTAAAGCTCTCAAAGTCCTCGACTCCTGTGGCTCCGACATTATCGAACTCGGTG
TTCCTTACTCTGATCCTTTAGCTGATGGTCCAGCAATCCAGGCTGCTGCGAGACGTTCTT
TGCTTAAAGGAACCAACTTTAACTCCATTATCTCCATGCTTAAAGAGGTTATTCCTCAGT
TGTCTTGTCCTATTGCACTGTTTACGTATTACAACCCTATCCTAAGGCGAGGGATCGATA
ACTACATGACGATCATCAAGGATGCTGGAGTTCATGGACTTCTTGTACCTGACGTTCCAC
TCGAAGAGACTGAGACTCTGCGGAAGGAAGCTCAAAAGCATCACATTGAACTTGTACTGC
TCACAACACCCACAACCCCGAAAGAACGAATGAATGCCATTGTTGAAGCATCCCAAGGAT
TCATCTACCTTGTAAGTTCAGTAGGAGTAACTGGTACGAGAGAGTCTGTTAACGAACACG
TTCAGTTTTTTTTACAACAGATCAAAGAGGCTACAAGCAAGCCAGTCGCTGTTGGATTTG
GCATATCGAAACCTGAGCATGTGAAACAGGTAGCTGAGTGGGGAGCTGATGGAGTCATTG
TAGGAAGCGCAATGGTAAAGATATTGGGAGAGGCTGAGTCACCTGAACAAGGACTTAAGG
AGCTTGAAGTCTTCACTAAGTCTTTAAAGTCTTCTCTTGACTCTTGAATACAAACAAACA
CCAATGGCAATCTTCTACTATTTCAATCCAAAAGGAACCGGATGGTGTTACCATTGATTC
TCAATAATATAACAATCATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D440TF U 1
AF RR2D440JQ C 500
BS 1 593 RR2D440TF
BS 594 983 RR2D440JQ

RD RR2D440TF 593 0 0
GGACTCGCGCTAGTTAGTGAGTAGTGACTGACATTCATCATCTTCGAAAAATCGCAATGG
ATCTTCTCAACAACCCTCCCACAACAACAGTGGGTCTATCAGAGACTTTCGCTAGGTTAA
AGTCACAACGCAAAGTGGCTCTGATTCCATATATCACAGCTGGTGATCCAGATCTTTCCA
CAACAGCTAAAGCTCTCAAAGTCCTCGACTCCTGTGGCTCCGACATTATCGAACTCGGTG
TTCCTTACTCTGATCCTTTAGCTGATGGTCCAGCAATCCAGGCTGCTGCGAGACGTTCTT
TGCTTAAAGGAACCAACTTTAACTCCATTATCTCCATGCTTAAAGAGGTTATTCCTCAGT
TGTCTTGTCCTATTGCACTGTTTACGTATTACAACCCTATCCTAAGGCGAGGGATCGATA
ACTACATGACGATCATCAAGGATGCTGGAGTTCATGGACTTCTTGTACCTGACGTTCCAC
TCGAAGAGACTGAGACTCTGCGGAAGGAAGCTCAAAAGCATCACATTGAACTTGTACTGC
TCACAACACCCACAACCCCGAAAGAACGAATGAATGCCATTGTTGAAGCATCC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2D440JQ 484 0 0
GCGGAAGGAAGCTCAAAAGCATCACATTGAACTTGTACTGCTCACAACACCCACAACCCC
GAAAGAACGAATGAATGCCATTGTTGAAGCATCCCAAGGATTCATCTACCTTGTAAGTTC
AGTAGGAGTAACTGGTACGAGAGAGTCTGTTAACGAACACGTTCAGTTTTTTTTACAACA
GATCAAAGAGGCTACAAGCAAGCCAGTCGCTGTTGGATTTGGCATATCGAAACCTGAGCA
TGTGAAACAGGTAGCTGAGTGGGGAGCTGATGGAGTCATTGTAGGAAGCGCAATGGTAAA
GATATTGGGAGAGGCTGAGTCACCTGAACAAGGACTTAAGGAGCTTGAAGTCTTCACTAA
GTCTTTAAAGTCTTCTCTTGACTCTTGAATACAAACAAACACCAATGGCAATCTTCTACT
ATTTCAATCCAAAAGGAACCGGATGGTGTTACCATTGATTCTCAATAATATAACAATCAT
CTCC

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 3

CO CL2300Contig1 1359 3 10 U
GCAGAGACCACTGGCTAGGCGGCTCTGGACCCTCATTCAACGCATCGAAGGCTTCTATAA
AGCTGCTTCTTTTCTTAACCTCTTGTCATTTCTTTATACCGGAAGGTATAGGAACCTCAT
TGAAAAAGCTTTAAGAGCAAGGCTTGTCTATAATAGTCCCCATATGAACCGATCTGTCAG
CTTCGAGTACATGAATCGCCAACTTGTCTGGAATGAATTTTCTGAAATGCTTTTGCTGCT
TCTGCCGCTGCTCAACTCTTCAGCTATTAAGAATATTCTAAGTCCATTTGCCAAGGAAAG
GTCCTCAAACAATAAAGAGGATACAGTTGCTTGCCCCATTTGCCAAGTGGATCCTGCAAT
TCCGTTTATTGCTCTACCTTGCCAGCACAGGTACTGTTACTACTGTATAAGGACCCGCTG
CGCTTCGGCAGCATCATTCCGGTGTCTTAGATGTAATGAGCCTGTGGTTGCCATACAACT
GGAAGGTGTTTCAAGTGGCAAATGAATGGGTGAAGAATTACAAATATTACTGAAACATGA
TTAGAACGGGTGTTTGCAAACAGGCTATACAATAAAGGAACAAGAACATGTGAAGGATAA
AAACTGTGGAAGAAACAAGTTTTAGGGATAGATATGAACTTCCTTTGTACATTAAAAAGG
GTTGTAAACCGTTCGGTCTTACTTTATTAGCAAATCAAATTGGAATGTCGGCTATACTTG
AATAAATCCATTTCCTTATATATGGGGCCTACTTACTACTAAGCTCCTAATTCCATATTA
GTCTTACATAAAGTGGCAGAAGAGCAAGTGCGAAGAAAAAGATCACTGGCTGGTGGCAGA
AAGCAGACTGATCTCTATCTCTTGGAGGCTTTTCCCTTTAGTCTCGATCACGTTCTTCTG
CACAAAGATAACTGCCACCACGCAGAAGAAGCCGAAGATTGCATTTAGAAGCACCGAACC
TAGTTGCTCCAGCATTCTTAGAAACAGCAGCCCCACGAAGAAGTTTATTACCCAGTGAAC
AGCAAGACAAACAGCCAATGCTGTTGCCCGAAGACGACCAGGGCATATCTCAGACAGGAG
AATACTTGGAACAGGACCAGCTCCAGTTGCAAAAGACAACACAAACAGTAGCATTCCTCC
GACAGAGAGAAACAAGGTTCCAAAAGTTGATGAAAACGAAGTATATGCCATTGCCTGGAG
ACCCAGCGATACTGCCATGCCCGCAAAACTCCCAATAAGCAATACTTTTCTCCCCAGCTT
ATCCATCAAAACCACCGCTACTGTAGAGCCTAAGAGGTTGCATACTCCTACACATATGTT
GGCCGAGGCTGAAGGTACACCAGCTTTCTTGAAAACAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC14JQ C 1
AF RR2DL30JQ U 716
AF RR2EA53JQ U 660
BS 1 659 RR2FC14JQ
BS 660 745 RR2EA53JQ
BS 746 746 RR2DL30JQ
BS 747 774 RR2EA53JQ
BS 775 775 RR2DL30JQ
BS 776 872 RR2EA53JQ
BS 873 873 RR2DL30JQ
BS 874 875 RR2EA53JQ
BS 876 876 RR2DL30JQ
BS 877 1359 RR2EA53JQ

RD RR2FC14JQ 737 0 0
GCAGAGACCACTGGCTAGGCGGCTCTGGACCCTCATTCAACGCATCGAAGGCTTCTATAA
AGCTGCTTCTTTTCTTAACCTCTTGTCATTTCTTTATACCGGAAGGTATAGGAACCTCAT
TGAAAAAGCTTTAAGAGCAAGGCTTGTCTATAATAGTCCCCATATGAACCGATCTGTCAG
CTTCGAGTACATGAATCGCCAACTTGTCTGGAATGAATTTTCTGAAATGCTTTTGCTGCT
TCTGCCGCTGCTCAACTCTTCAGCTATTAAGAATATTCTAAGTCCATTTGCCAAGGAAAG
GTCCTCAAACAATAAAGAGGATACAGTTGCTTGCCCCATTTGCCAAGTGGATCCTGCAAT
TCCGTTTATTGCTCTACCTTGCCAGCACAGGTACTGTTACTACTGTATAAGGACCCGCTG
CGCTTCGGCAGCATCATTCCGGTGTCTTAGATGTAATGAGCCTGTGGTTGCCATACAACT
GGAAGGTGTTTCAAGTGGCAAATGAATGGGTGAAGAATTACAAATATTACTGAAACATGA
TTAGAACGGGTGTTTGCAAACAGGCTATACAATAAAGGAACAAGAACATGTGAAGGATAA
AAACTGTGGAAGAAACAAGTTTTAGGGATAGATATGAACTTCCTTTGTACATTAAAAAGG
GTTGTAAACCGTTCGGTCTTACTTTATTAGCAAATCAAATTGGAATGTCGGCTATACTTG
AATAAATCCATTTCCTT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2DL30JQ 202 0 0
ACTTGAATAAATCCATTTCCTTATATATGGGGCCTACTTACTACTAAGCTCCTAATTCCA
TATTAGTCTTACATAAAGTGGCAGAAGAGCAAGTGCGAAGAAAAAGATCACTGGCTGGTG
GCAGAGAGCAGACTGATCTCTATCTCTTGGAGGCTTTTCCCTTTAGTCTCGATCACGTTC
TTCTGCACAAAGATAACTGCCA

QA 1 202 1 202
DS 

RD RR2EA53JQ 700 0 0
GGTTGTAAACCGTTCGGTCTTACTTTATTAGCAAATCAAATTGGAATGTCGGCTATACTT
GAATAAATCCATTTCCTTATATATGGTGCCTACTTACTACTAAGCTCCTAATTCCTTATT
AGTCTTACATAAAGTGGCAGAAGAGCAAGTGCGAAGAAAAAGATCACTGGCTGGTGGCAG
AAAGCAGACTGATCTCTATCTCTTGGAGGCTTT*CCTTTTAGTCTCGATCACGTTCTTCT
GCACAAAGATAACTGCCACCACGCAGAAGAAGCCGAAGATTGCATTTAGAAGCACCGAAC
CTAGTTGCTCCAGCATTCTTAGAAACAGCAGCCCCACGAAGAAGTTTATTACCCAGTGAA
CAGCAAGACAAACAGCCAATGCTGTTGCCCGAAGACGACCAGGGCATATCTCAGACAGGA
GAATACTTGGAACAGGACCAGCTCCAGTTGCAAAAGACAACACAAACAGTAGCATTCCTC
CGACAGAGAGAAACAAGGTTCCAAAAGTTGATGAAAACGAAGTATATGCCATTGCCTGGA
GACCCAGCGATACTGCCATGCCCGCAAAACTCCCAATAAGCAATACTTTTCTCCCCAGCT
TATCCATCAAAACCACCGCTACTGTAGAGCCTAAGAGGTTGCATACTCCTACACATATGT
TGGCCGAGGCTGAAGGTACACCAGCTTTCTTGAAAACAGT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL2301Contig1 655 2 1 U
GGGACCCAGAATCTTCTCTGACTCATTACATTCCATTTATCACTTCCATTCCCTAGAAGA
AAAAAAATGTCGGCAGCAGAGGCAGAGAACATCCCCACCATCGTCTCCTCAGGAGATGCT
AAAGCGAAGAAGACGAAGGAAGCTAAACCTAAGAAGAAGCCTGCAGTTGCAGAGAAGAAG
AAGGCTCCGAAGAAGAAAGCTTCTTCTTCTCCTCCATCTCACCCTAAATACGAAGAGATG
ATTAAAGATGCAATCACGACGTTGAAGGAGAGGACCGGATCTAGCCAATACGCGATTCAG
AAGTTCATCGAGGAGAAGGAGAAGTCTCTTCCTCCTACCTTCAGGAAGCTTCTGCTCGTC
AATCTCAAGAGGCTCGTTGCGTCCGAGAAGTTGGTTAAGGTCAAAGGATCTTTCAAACTT
CCCTCTGCCAAATCCGTTGCAGCAGCAGCGGCAGCTAAACCGGCCGCGGTTAAGAAGAAA
CCAGCAGCTGTATCGAAGGGTAAAGTTGCAGCAAAGGCTCCGGTTAAGGCCAAACCAGAA
GCTAAGAAACCTGCTGCAAAGCCAAAGGCTAAAGTTGTTGCTGCTAAGCCTAAAGCGAAG
ACAAAGAGCGTTGCTGCTGTGTCCAAGACGAAAGCTGTTGCGGCGGCTAAGCCTA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E388TF U 1
AF RR2CQ84TF U 2
BS 1 655 RR2E388TF

RD RR2E388TF 655 0 0
GGGACCCAGAATCTTCTCTGACTCATTACATTCCATTTATCACTTCCATTCCCTAGAAGA
AAAAAAATGTCGGCAGCAGAGGCAGAGAACATCCCCACCATCGTCTCCTCAGGAGATGCT
AAAGCGAAGAAGACGAAGGAAGCTAAACCTAAGAAGAAGCCTGCAGTTGCAGAGAAGAAG
AAGGCTCCGAAGAAGAAAGCTTCTTCTTCTCCTCCATCTCACCCTAAATACGAAGAGATG
ATTAAAGATGCAATCACGACGTTGAAGGAGAGGACCGGATCTAGCCAATACGCGATTCAG
AAGTTCATCGAGGAGAAGGAGAAGTCTCTTCCTCCTACCTTCAGGAAGCTTCTGCTCGTC
AATCTCAAGAGGCTCGTTGCGTCCGAGAAGTTGGTTAAGGTCAAAGGATCTTTCAAACTT
CCCTCTGCCAAATCCGTTGCAGCAGCAGCGGCAGCTAAACCGGCCGCGGTTAAGAAGAAA
CCAGCAGCTGTATCGAAGGGTAAAGTTGCAGCAAAGGCTCCGGTTAAGGCCAAACCAGAA
GCTAAGAAACCTGCTGCAAAGCCAAAGGCTAAAGTTGTTGCTGCTAAGCCTAAAGCGAAG
ACAAAGAGCGTTGCTGCTGTGTCCAAGACGAAAGCTGTTGCGGCGGCTAAGCCTA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2CQ84TF 646 0 0
GGAC
CCAGAATCTTCTCTGACTCATTACATTCCATTTATCACTTCCATTCCCTAGAAGAAAAAA
A*TGTCGGCAGCAGAGGCAGAGAACATCCCCACCATCGTCTCCTCAGGAGATGCTAAAGC
GAAGAAGACGAAGGAAGCTAAACCTAAGAAGAAGCCTGCAGTTGCAGAGAAGAAGAAGGC
TCCGAAGAAGAAAGCTTCTTCTTCTCCTCCATCTCACCCTAAATACGAAGAGATGATTAA
AGATGCAATCACGACGTTGAAGGAGAGGACCGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTT
CATCGAGGAGAAGGAGAAGTCTCTTCCTCCTACCTTCAGGAAGCTTCTGCTCGTCAATCT
CAAGAGGCTCGTTGCGTCCGAGAAGTTGGTTAAGGTCAAAGGATCTTTCAAACTTCCCTC
TGCCAAATCCGTTGCAGCAGCAGCGGCAGCTAAACCGGCCGCGGTTAAGAAGAAACCAGC
AGCTGTATCGAAGGGTAAAGTTGCAGCAAAGGCTCCGGTTAAGGCCAAACCAGAAGCTAA
GAAACCTGCTGCAAAGCCAAAGGCTAAAGTTGTTGCTGCTAAGCCTAAAGCGAAGACAAA
GAGCGTTGCTGCTGTGTCCAAGACGAAAGCTGTTGCGGC
GGC

QA 5 643 5 643
DS 



AS 2 4

CO CL2302Contig1 306 2 2 U
GCTGAAGCTCCCAAGTTCAAACTCATCACTCCTTCCATCCTCTCCGACCGTCTTCGTATC
AATGGGTCACTTGCTAGGAAGGCTATCAGAGATTTGATGGCTAAAGGAACCATCAGGATG
GTCTCTACTCACTCCAGCCAGCAGATTTACACTAGGGCCACCCACAACTAAGCTCCTTGT
TTTCTAGTTTGCCATATGTACTTCTCAAGTCTTCGACTCAATGTTTAGATGTTCATCTTT
TCCCTTTAATCAAGAATGGAGTTTTAGTTGTGCTTTCTTGTCTTAAAAAGATTTATTAAG
TTTTAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2CS02JQ C 1
AF RR2CS02TF U 1
BS 1 2 RR2CS02JQ
BS 3 306 RR2CS02TF

RD RR2CS02JQ 306 0 0
GCTGAAGCTCCCAAGTTCAAACTCATCACTCCTTCCATCCTCTCCGACCGTCTTCGTATC
AATGGGTCACTTGCTAGGAAGGCTATCAGAGATTTGATGGCTAAAGGAACCATCAGGATG
GTCTCTACTCACTCCAGCCAGCAGATTTACACTAGGGCCACCCACAACTAAGCTCCTTGT
TTTCTAGTTTGCCATATGTACTTCTCAAGTCTTCGACTCAATGTTTAGATGTTCATCTTT
TCCCTTTAATCAAGAATGGAGTTTTAGTTGTGCTTTCTTGTCTTAAAAAGATTTATTAAG
TTTTAC

QA 1 306 1 306
DS 

RD RR2CS02TF 306 0 0
GC
TGAAGCTCCCAAGTTCAAACTCATCACTCCTTCCATCCTCTCCGACCGTCTTCGTATCAA
TGGGTCACTTGCTAGGAAGGCTATCAGAGATTTGATGGCTAAAGGAACCATCAGGATGGT
CTCTACTCACTCCAGCCAGCAGATTTACACTAGGGCCACCCACAACTAAGCTCCTTGTTT
TCTAGTTTGCCATATGTACTTCTCAAGTCTTCGACTCAATGTTTAGATGTTCATCTTTTC
CCTTTAATCAAGAATGGAGTTTTAGTTGTGCTTTCTTGTCTTAAAAAGATTTATTAAGTT
TTAC

QA 3 306 3 306
DS 



CO CL2302Contig2 582 2 3 U
TTTTTCAGCTCCTCCACCCCTGTTCCTTGTAGCCGCTGCTCTTCTGTTCAGTCAATTTCT
TCAATGGCACCGAAGAAGGACAAAGTTCCACCACCATCCTCTAAACCCGCCAAATCTGGC
GGCGGGAAGCAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAAAAGGTGAACAAC
ATGGTTCTCTTCGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCTCTGAAGCTCCCAAGTTCAAA
CTCATCACTCCTTCCATCCTCTCCGACCGTCTTCGTATCAATGGGTCACTTGCTAGGAAG
GCTATCACAGATTTGATGGCTAAAGGAACCATCAGGATGGTCTCTACTCACTCCAGCCAG
CAGATTTACACTAGGGCCACCCACAACTAAGTGTTTCCTTTCATTGTGTTTCCTCTCTCT
CTCTCTTTTGCCCACATGTACTTCTCAAGTCGTTGACTCAATGTTTACTTGTTCATCTTT
TTTCCCTTCAATCAAGAATGGAGTTTTAGTTGTGCTCTCTTGTCTTCAAAAGATTTATTA
AGTTTTACTTGAAACATAAAACACAACTGGTATTTGATATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ13TF U 204
AF RR2DQ13JQ C 1
BS 1 203 RR2DQ13JQ
BS 204 353 RR2DQ13TF
BS 354 582 RR2DQ13JQ

RD RR2DQ13TF 150 0 0
TTACGACAAGCTTCTCTCTGAAGCTCCCAAGTTCAAACTCATCACTCCTTCCATCCTCTC
CGACCGTCTTCGTATCAATGGGTCACTTGCTAGGAAGGCTATCACAGATTTGATGGCTAA
AGGAACCATCAGGATGGTCTCTACTCACTC

QA 1 150 1 150
DS 

RD RR2DQ13JQ 582 0 0
TTTTTCAGCTCCTCCACCCCTGTTCCTTGTAGCCGCTGCTCTTCTGTTCAGTCAATTTCT
TCAATGGCACCGAAGAAGGACAAAGTTCCACCACCATCCTCTAAACCCGCCAAATCTGGC
GGCGGGAAGCAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAAAAGGTGAACAAC
ATGGTTCTCTTCGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCTTTGAAGCTCCCAAGTTCAAA
CTCATCACTCCTTCCATCCTCTCCGACCGTCTTCGTATCAATGGGTCACTTGCTAGGAAG
GCTATCAGAGATTTGATGGCTAAAGGAACCATCAGGATGGTCTCTACTCACTCCAGCCAG
CAGATTTACACTAGGGCCACCCACAACTAAGTGTTTCCTTTCATTGTGTTTCCTCTCTCT
CTCTCTTTTGCCCACATGTACTTCTCAAGTCGTTGACTCAATGTTTACTTGTTCATCTTT
TTTCCCTTCAATCAAGAATGGAGTTTTAGTTGTGCTCTCTTGTCTTCAAAAGATTTATTA
AGTTTTACTTGAAACATAAAACACAACTGGTATTTGATATGG

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 3

CO CL2303Contig1 691 3 6 U
AGAGTTAGGTTACCCTTTGAATCCATTGTAAATAATAATCATCTTCATACATGGGAGGAA
CAAACTTAGTATGGGAATTACAAAAACAAAGAAAAGGAGCTAATGTTGGAGAATTGAGCA
AACCAAACCTTCGTGCTTCTGCTGCATCCTCCATCAAGCCAAATAAAGAAAATTAAACAA
GAAAAGAGTTTTGAGGAAAGCAAAAGCTGATTGTATAGTTTCAACAGAAACTGGATTTTT
CTGGTTGCACCAAAAATCCAATCCTTGGTATTGGAACTGATACTTTGTGTCTACTAGGCC
TGAGCAACTTAAAAACATAGCGTCGTTCTTGATCAATTGCTTTTATCAGTGGTAGGTGCC
AAGTTCAACTCCTGCATCTGTGTCTCAACTGGTACTAACCCTGTCTGAGCAAGAAACCAA
TTGAGGAGGACAAAGAGAGAAGATGCGATAAGAATGAGGAAGCCAACGTGAACAAGCAAC
ATGGATTGGCCACTGGTGAAAGCTATGGAGAGCATGAAAGTCAGACAGAGACCCAGCAGA
AGAAACGCTAATCTCAGAGTGTTCCATGTTGGAGCATTGACGCCTGGAGCTAGAGCTCCG
AAAAGAACAGCTTCCGTTGACGAAATCTCTGATTTTTGCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTCC
ATCTTTTTTTTTCTTTCTTCCACAGAAACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DE92JQ U 1
AF RR2AK32TF C 1
AF RR2AK32JQ U 22
BS 1 17 RR2DE92JQ
BS 18 18 RR2AK32TF
BS 19 68 RR2DE92JQ
BS 69 69 RR2AK32JQ
BS 70 143 RR2DE92JQ
BS 144 691 RR2AK32JQ

RD RR2DE92JQ 143 0 0
AGAGTTAGGTTACCCTT*GAATCCATTGTAAATAATAATCATCTTCATACATGGGAGGAA
CAAACTTAATATGGGAATTACAAAAACAAAGAAAAGGAGCTAATGTTGGAGAATTGAGCA
AACCAAACCTTCGTGCTTCTGCT

QA 1 143 1 143
DS 

RD RR2AK32TF 691 0 0
AGAGTTAGGTTACCCTTTGAATCCATTGTAAATAATAATCATCTTCATACATGGGAGGAA
CAAACTTAGTATGGGAATTACAAAAACAAAGAAAAGGAGCTAATGTTGGAGAATTGAGCA
AACCAAACCTTCGTGCTTCTGCTGCATCCTCCATCAAGCCAAATAAAGAAAATTAAACAA
GAAAAGAGTTTTGAGGAAAGCAAAAGCTGATTGTATAGTTTCAACAGAAACTGGATTTTT
CTGGTTGCACCAAAAATCCAATCCTTGGTATTGGAACTGATACTTTGTGTCTACTAGGCC
TGAGCAACTTAAAAACATAGCGTCGTTCTTGATCAATTGCTTTTATCAGTGGTAGGTGCC
AAGTTCAACTCCTGCATCTGTGTCTCAACTGGTACTAACCCTGTCTGAGCAAGAAACCAA
TTGAGGAGGACAAAGAGAGAAGATGCGATAAGAATGAGGAAGCCAACGTGAACAAGCAAC
ATGGATTGGCCACTGGTGAAAGCTATGGAGAGCATGAAAGTCAGACAGAGACCCAGCAGA
AGAAACGCTAATCTCAGAGTGTTCCATGTTGGAGCATTGACGCCTGGAGCTAGAGCTCCG
AAAAGAACAGCTTCCGTTGACGAAATCTCTGATTTTTGCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTCC
ATCTTTTTTTTTCTTTCTTCCACAGAAACCC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2AK32JQ 670 0 0
TCCATTGTAAATAATAATCATCTTCATACATGGGAGGAACAAACTTAGTATGGGAATTAC
AAAAACAAAGAAAAGGAGCTAATGTTGGAGAATTGAGCAAACCAAACCTTCGTGCTTCTG
CTGCATCCTCCATCAAGCCAAATAAAGAAAATTAAACAAGAAAAGAGTTTTGAGGAAAGC
AAAAGCTGATTGTATAGTTTCAACAGAAACTGGATTTTTCTGGTTGCACCAAAAATCCAA
TCCTTGGTATTGGAACTGATACTTTGTGTCTACTAGGCCTGAGCAACTTAAAAACATAGC
GTCGTTCTTGATCAATTGCTTTTATCAGTGGTAGGTGCCAAGTTCAACTCCTGCATCTGT
GTCTCAACTGGTACTAACCCTGTCTGAGCAAGAAACCAATTGAGGAGGACAAAGAGAGAA
GATGCGATAAGAATGAGGAAGCCAACGTGAACAAGCAACATGGATTGGCCACTGGTGAAA
GCTATGGAGAGCATGAAAGTCAGACAGAGACCCAGCAGAAGAAACGCTAATCTCAGAGTG
TTCCATGTTGGAGCATTGACGCCTGGAGCTAGAGCTCCGAAAAGAACAGCTTCCGTTGAC
GAAATCTCTGATTTTTGCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTCCATCTTTTTTTTTCTTTCTTCC
ACAGAAACCC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 4

CO CL2304Contig1 1081 4 3 U
GAACAAAAACCACTCAAATTGTATTTAGTTTTATCTTTCTTGATTCTACTGCAGCAACAA
TCCCACAAAGCATTACTGTGTAAAGTGTAAACTAAAAGACGAGATGATGCCAAAAGAAAA
CAACCCCAGGAACTCATGAATATAGAACAGGACAAATATAGAAGAAAAGAAAAAAAAACT
AGCATGCTATAGATCAGAAAGAAATGAACAAAAAAAAACTGTACTGCGATTCACTTTTTT
TTTCCGCTGCTTGATCATCTTCTTAGAGAAAGCAGTCAGGTAATGGGGGATCTTCCTTGT
GTGTTACTTAAGTCTTGTGAACAAATCGGTTGCACTACCTACTGATACTTCTTTTCTTTG
CTTACGGGCATCATCATTGGAAACTTCTTTGAGAGACTTCGAATGACTTTAGAAGTCGAG
TTCAGTTTCTCGTTAATGTGGTCTTGGTACTTCTCGTACACAAGAGGAAGAGAAAGACTG
AAAAGAATCCCAACGTAGACAAGAGTGAGGGAGTTGATTAACGTCCCCACATAGGATACA
GCCCACAAGACCAGTGACATCTGAAGGAGACGAATGGGATTTCTAGCAATGGTGATATCA
CTTGCAATTGAGAGTACACGATTGATCAAAACCCTAATATCATCGGCAGCCTTGACTGCA
AACTCCTCAGGGATCTCCATATTGGGAACTGGTGGTAAAGGTCGGTTGAGAAGTGAAGCA
GACTTGGCCCATAAGAAAAGGATGGCAACAAGGAGAAGGAGAACATTGGAGACGAAAGAC
AAGAGGTTGTAACCAGCTCTCTCAAACAGAAACCAAAACAAAGTGGAAGAAGCTAACAAG
ATGAATGCACCAGTCCGGTTTCTCCATAACAGCAAATCAGCAACTGAAGCACCACCGAGA
GATCTGTGAACAGAAACGCGCGCGGAATCATCTCCCATGGCGATTTTATCAGTTATGGTT
CTTTCCGCACATGATAGAGTTTTCAAGGGAAAAAGATGAAAGCTTTTGGATGAATCGTGC
CTCCTTTCTTTCTCTCTCTCTCTTTCTAAACCACCGCAGAGATCAAAGCTTCTTCCTTCC
C


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2G009JQ U 1
AF RR2G009TF C 1
AF RR2B116JQ U 70
AF RR2B116TF C 480
BS 1 142 RR2G009JQ
BS 143 800 RR2B116JQ
BS 801 1081 RR2B116TF

RD RR2G009JQ 143 0 0
GAACAAAAACCACTCAAATTGTATTTAGTTTTATCTTTCTTGATTCTACTGCAGCAACAA
TCCCACAAAGCATTACTGTGTAAAGTGTAAACTAAAAGACGAGATGATGCCAAAAGAAAA
CAACCCCAGGAACTCATGAATA
C

QA 1 142 1 142
DS 

RD RR2G009TF 126 0 0
GAACAAAAACCACTCAAATTGTATTTAGTTTTATCTTTCTTGATTCTACTGCAGCAACAA
TCCCACAAAGCATTACTGTGTAAAGTGTAAACTAAAAGACGAGATGATGCCAAAAGAAAA
CAACCC

QA 1 126 1 126
DS 

RD RR2B116JQ 731 0 0
GCACAAAGCATTACTGTA
TAAACTAAAAGACGAGATGATGCCAAAAGAAAACAACCCCAGGAACTCATGAATATAGAA
CAGGACAAATATAGAAGAAAAGAAAAAAAAACTAGCATGCTATAGATCAGAAAGAAATGA
ACAAAAAAAAACTGTACTGCGATTCACTTTTTTTTTCCGCTGCTTGATCATCTTCTTAGA
GAAAGCAGTCAGGTAATGGGGGATCTTCCTTGTGTGTTACTTAAGTCTTGTGAACAAATC
GGTTGCACTACCTACTGATACTTCTTTTCTTTGCTTACGGGCATCATCATTGGAAACTTC
TTTGAGAGACTTCGAATGACTTTAGAAGTCGAGTTCAGTTTCTCGTTAATGTGGTCTTGG
TACTTCTCGTACACAAGAGGAAGAGAAAGACTGAAAAGAATCCCAACGTAGACAAGAGTG
AGGGAGTTGATTAACGTCCCCACATAGGATACAGCCCACAAGACCAGTGACATCTGAAGG
AGACGAATGGGATTTCTAGCAATGGTGATATCACTTGCAATTGAGAGTACACGATTGATC
AAAACCCTAATATCATCGGCAGCCTTGACTGCAAACTCCTCAGGGATCTCCATATTGGGA
ACTGGTGGTAAAGGTCGGTTGAGAAGTGAAGCAGACTTGGCCCATAAGAAAAGGATGGCA
ACAAGGAGAAGGAGAACATTGGAGACGAAAGACAAGAGGTTGTAACCAGCTCT

QA 19 731 19 731
DS 

RD RR2B116TF 602 0 0
GAGAT
GAATCCCAACGTAGACAAGAGTGAGGGAGTTGATTAACGTCCCCACATAGGATACAGCCC
ACAAGACCAGTGACATCTGAAGGAGACGAATGGGATTTCTAGCAATGGTGATATCACTTG
CAATTGAGAGTACACGATTGATCAAAACCCTAATATCATCGGCAGCCTTGACTGCAAACT
CCTCAGGGATCTCCATATTGGGAACTGGTGGTAAAGGTCGGTTGAGAAGTGAAGCAGACT
TGGCCCATAAGAAAAGGATGGCAACAAGGAGAAGGAGAACATTGGAGACGAAAGACAAGA
GGTTGTAACCAGCTCTCTCAAACAGAAACCAAAACAAAGTGGAAGAAGCTAACAAGATGA
ATGCACCAGTCCGGTTTCTCCATAACAGCAAATCAGCAACTGAAGCACCACCGAGAGATC
TGTGAACAGAAACGCGCGCGGAATCATCTCCCATGGCGATTTTATCAGTTATGGTTCTTT
CCGCACATGATAGAGTTTTCAAGGGAAAAAGATGAAAGCTTTTGGATGAATCGTGCCTCC
TTTCTTTCTCTCTCTCTCTTTCTAAACCACCGCAGAGATCAAAGCTTCTTCCTTCCC

QA 6 602 6 602
DS 



AS 1 2

CO CL2305Contig1 459 2 2 U
GAGCGACGAGGCTAAAAGGAAAATCGTCAACAACATCGTTCACGCGCTGTCGGATTTCGT
GGAGATCGAGTCGGAGGAGAAGGTTCAGCTGAACGTCGCAACGGACGGTGATCTCGGGAC
TATTTACTCGGTCACGGTGCCTGTTAGGAGGGTGAAAGCAGAGTACCAAGACGTCGACGA
GGTTGGGTCTATACCCGATGGGGATTACAAAGATACGCTTGATGGTTCTGTGGATGTCAG
GTTCGATTTTTATGTTCCAGAGTAAGAAGTTAGTAAGAGTTATTATCTTGTTTGTCTGTT
CTCGTGATACTTGTTCTTGAAATGTGATTATGGAGGGAATAAAGAAAGTTCCTTAACACT
CCCACTGTATATATATATGCAACTTATGTTCTTGGCAAATGGTTTGTGCTGGTCTGATTT
ATAGCAAGAATCCAAGAAACCCTATCTTGGTGTTCAATT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BX15JQ C 1
AF RR2BX15TF U 1
BS 1 1 RR2BX15JQ
BS 2 459 RR2BX15TF

RD RR2BX15JQ 459 0 0
GAGCGACGAGGCTAAAAGGAAAATCGTCAACAACATCGTTCACGCGCTGTCGGATTTCGT
GGAGATCGAGTCGGAGGAGAAGGTTCAGCTGAACGTCGCAACGGACGGTGATCTCGGGAC
TATTTACTCGGTCACGGTGCCTGTTAGGAGGGTGAAAGCAGAGTACCAAGACGTCGACGA
GGTTGGGTCTATACCCGATGGGGATTACAAAGATACGCTTGATGGTTCTGTGGATGTCAG
GTTCGATTTTTATGTTCCAGAGTAAGAAGTTAGTAAGAGTTATTATCTTGTTTGTCTGTT
CTCGTGATACTTGTTCTTGAAATGTGATTATGGAGGGAATAAAGAAAGTTCCTTAACACT
CCCACTGTATATATATATGCAACTTATGTTCTTGGCAAATGGTTTGTGCTGGTCTGATTT
ATAGCAAGAATCCAAGAAACCCTATCTTGGTGTTCAATT

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR2BX15TF 459 0 0
G
AGCGACGAGGCTAAAAGGAAAATCGTCAACAACATCGTTCACGCGCTGTCGGATTTCGTG
GAGATCGAGTCGGAGGAGAAGGTTCAGCTGAACGTCGCAACGGACGGTGATCTCGGGACT
ATTTACTCGGTCACGGTGCCTGTTAGGAGGGTGAAAGCAGAGTACCAAGACGTCGACGAG
GTTGGGTCTATACCCGATGGGGATTACAAAGATACGCTTGATGGTTCTGTGGATGTCAGG
TTCGATTTTTATGTTCCAGAGTAAGAAGTTAGTAAGAGTTATTATCTTGTTTGTCTGTTC
TCGTGATACTTGTTCTTGAAATGTGATTATGGAGGGAATAAAGAAAGTTCCTTAACACTC
CCACTGTATATATATATGCAACTTATGTTCTTGGCAAATGGTTTGTGCTGGTCTGATTTA
TAGCAAGAATCCAAGAAACCCTATCTTGGTGTTCAATT

QA 2 459 2 459
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL2307Contig1 1171 2 2 U
GGGAAGCCGAAGAAGAAGAGAAACGATCGGGAGAGAAAGAGAGAGAGAGATAAGTCATCT
ATCCATCTGATTCCTTCGATCTGCTAAGAGATTTCTCTGGGTGAAGGAAGGAAGGAAGGA
AGGAAGAAGATAGATCTTCTTTGTCTGCATCATCATCATCAACATCGCCAGGAGAAAGTA
AAAGAAAGAACGTAGTAGTGTCTAAAGGGAGGAGTAAGATTCATACTGAGAGGAGGATAG
AAAATGGCTGATGGGATGTCGAGCTTTTGGGGTCCTGTGACCTCTACTATTGAGTGTTGT
GAGAAGAACTACGCCTACTCCTCTTACATCGCTGAGTTCTACAACACCATCTCCGGTGTC
CCCGGAATCCTACTCGCTCTCATTGGTCTTGTCAATGCCATTAGGCAACGCTTTGAGAAG
AGGTTTAGCATCCTTCACATCTCCAACATGATCCTTGCTATCGGCAGCATGCTCTACCAT
GCCACTTTGCAGCACGTGCAACAACAGAGTGATGAGACCCCAATGGTGTGGGAGATACTT
CTCTACATGTACATCCTCTACTCACCGGACTGGCATTACAGAAGCACCATGCCCACTTTT
CTCTTCCTCTACGGTGCTGCCTTCGCCGCAGTCCACGCTTACCTCACGTTCGGCATCGGT
TTTAAAGTCCACTACGTGGTCCTCTGCCTTCTCTGCATCCCTCGGATGTACAAGTACTAC
ATCCACACCGAGGACACCGCGGCCAAGAGGATTGCCAAGTGGTACGTCGCTACGATCCTG
GTGGGAAGCGTGTGCTGGTTCTGTGACCGTGTGTTTTGCAAGACGATATCTCAGTGGCCT
GTGAATCCTCAGGGGCATGCTTTTTGGCATGTCTTCATGAGTTTCAACTCTTACTGCGCG
AACACGTTCTTGATGTTCTGTCGAGCTCAGCAACGTGGATGGAATCCAAAGGTGAAGTAC
TTTCTGGGAGTTCTTCCTTATGTCAAGATCGAGAAGCCGAAGGAACAGTGAGAAAGATTG
GGAGGAACAAAGAGCCCAGAAGAAGACCTTTATTATATTTTTTTTTGGAAGTGAAACTCT
CTAGATACATAAGTCTAGATTCTTTTTTCTTGTATTATTTTTTATTGGGAATGATGATGA
TCTTAAGAAGAATTGATTTTTAGCTTTGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU70TF U 1
AF RR2FU70JQ C 478
BS 1 778 RR2FU70TF
BS 779 1171 RR2FU70JQ

RD RR2FU70TF 778 0 0
GGGAAGCCGAAGAAGAAGAGAAACGATCGGGAGAGAAAGAGAGAGAGAGATAAGTCATCT
ATCCATCTGATTCCTTCGATCTGCTAAGAGATTTCTCTGGGTGAAGGAAGGAAGGAAGGA
AGGAAGAAGATAGATCTTCTTTGTCTGCATCATCATCATCAACATCGCCAGGAGAAAGTA
AAAGAAAGAACGTAGTAGTGTCTAAAGGGAGGAGTAAGATTCATACTGAGAGGAGGATAG
AAAATGGCTGATGGGATGTCGAGCTTTTGGGGTCCTGTGACCTCTACTATTGAGTGTTGT
GAGAAGAACTACGCCTACTCCTCTTACATCGCTGAGTTCTACAACACCATCTCCGGTGTC
CCCGGAATCCTACTCGCTCTCATTGGTCTTGTCAATGCCATTAGGCAACGCTTTGAGAAG
AGGTTTAGCATCCTTCACATCTCCAACATGATCCTTGCTATCGGCAGCATGCTCTACCAT
GCCACTTTGCAGCACGTGCAACAACAGAGTGATGAGACCCCAATGGTGTGGGAGATACTT
CTCTACATGTACATCCTCTACTCACCGGACTGGCATTACAGAAGCACCATGCCCACTTTT
CTCTTCCTCTACGGTGCTGCCTTCGCCGCAGTCCACGCTTACCTCACGTTCGGCATCGGT
TTTAAAGTCCACTACGTGGTCCTCTGCCTTCTCTGCATCCCTCGGATGTACAAGTACTAC
ATCCACACCGAGGACACCGCGGCCAAGAGGATTGCCAAGTGGTACGTCGCTACGATCC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2FU70JQ 694 0 0
CATGCCACTTTGCAGCACGTGCAACAACAGAGTGATGAGACCCCAATGGTGTGGGAGATA
CTTCTCTACATGTACATCCTCTACTCACCGGACTGGCATTACAGAAGCACCATGCCCACT
TTTCTCTTCCTCTACGGTGCTGCCTTCGCCGCAGTCCACGCTTACCTCAGGTTCGGCATC
GGTTTTAAGGTCCACTACGTGGTCCTCTGCCTTCTCTGCATCCCTCGGATGTACAAGTAC
TACATCCACACCGAGGACACCGCGGCCAAGAGGATTGCCAAGTGGTACGTCGCTACGATC
CTGGTGGGAAGCGTGTGCTGGTTCTGTGACCGTGTGTTTTGCAAGACGATATCTCAGTGG
CCTGTGAATCCTCAGGGGCATGCTTTTTGGCATGTCTTCATGAGTTTCAACTCTTACTGC
GCGAACACGTTCTTGATGTTCTGTCGAGCTCAGCAACGTGGATGGAATCCAAAGGTGAAG
TACTTTCTGGGAGTTCTTCCTTATGTCAAGATCGAGAAGCCGAAGGAACAGTGAGAAAGA
TTGGGAGGAACAAAGAGCCCAGAAGAAGACCTTTATTATATTTTTTTTTGGAAGTGAAAC
TCTCTAGATACATAAGTCTAGATTCTTTTTTCTTGTATTATTTTTTATTGGGAATGATGA
TGATCTTAAGAAGAATTGATTTTTAGCTTTGCTG

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 4

CO CL2308Contig1 1313 4 3 U
GGAAGAAATCTCGTTTGTTTCATCCGCAATTAACGACCTCTCAAGCTTCCGCGAGCAATG
ATAAGAGCGTTGGGAGGTGTTTCTACAGACATGTTCACCATGTGTCAACCACTTCGGTCT
AGAGGAAACTTGGTGATGCTGTTTAAAGGTTGTAGAAGGTTTGTGAGAACAGCATGCCAA
GTTTCAATCCCTGGTGGTTCTTTGGGGAATGAATTAAAAGCACCTCCGAGGTTTCTTAGG
GATAAGAAGATAGTTCCAGATGCTGATCCTCCTCATAAGGAAGATATCCATAAGCTGTAT
CAACTTTTTGAGCAAAGTAAAAGACTCACCATCTTGACTGGAGCTAGGATTAGCACTGAA
TGTGGCATCCCTGATTATAGAAGTCCCAATGGAGCATACAGTTCTGGTTTCAAGCCAATT
ACCCATCAGGAATTCACTCGATCAAGCCGATCTCGTAGGCGGTATTGGGCAAGGAGTTAT
GCCGTTTGGAGACGGTTCACTGCAGCACAACCAGGTCCAGCTCATACTGCTTTAGCATCA
CTAGAAAGAGCTGGACGAATTGATTCTATCATAACACAAAGCGTTGACAGGTTGCATCAT
CGTGCTGGGAGTGATCCGCTTGAATTACACGGCACAGTATATACTGTTATGTGCTTAGAT
TGTGGCTTCTCGTTTCCCCGAGACTCGTTTCAGGATCAGCTTAAAGCTCTCAATCCTAAG
TGGGCAGAAGCTTTAGAAAGTATAGATCATGGAGAACCAGGTTCAGAGAAGACCTTTGGC
ATGAAACAAAGACCTGATGGTGATATTGAGATTGACGAGAAGTTTTGGGAAGAAGGTTTT
CATATACCAGTTTGCGAGAAATGCGAAGGAGTACTAAAACCTGACGTAATTTTCTTTGGA
GACAATATCCCAAAGGAAAGAGCTGCTCAAGCAATGGAAGCTGCGAAACAGAGCGATGCA
TTTCTAGTGTTGGGTTCGTCTTTAATGACAATGTCCGCTTTTCGTCTTGTCAGAGCGGCT
CATGAAGCTGGTGCGGTGACTGCAATTGTAAATATAGGCGTTACCAGAGCTGATGACATT
GTTCCTTTGAAAATCAGTGCAAGGGTTGGTGAGATATTACCCAGAGTTCTTGATGTGGGA
TCGCTCGGTGTTCCAGCTCTATAGGACAATATGTTCACGAACCAGAGGTTGATCAATTAA
GTGACTGTGATTAATCAATTGTTTAATGCATACTTCAATTCCTGTAATGTATCTTTTCAA
GATTGTAATTTTCAACAGAAAAAAATAAAAGAGTAATTATCATTTTTTAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FY23TF U 1
AF RR2FY23JQ C 534
AF RR2ER35JQ C 1023
AF RR2ER35TF U 1023
BS 1 690 RR2FY23TF
BS 691 1023 RR2FY23JQ
BS 1024 1313 RR2ER35TF

RD RR2FY23TF 690 0 0
GGAAGAAATCTCGTTTGTTTCATCCGCAATTAACGACCTCTCAAGCTTCCGCGAGCAATG
ATAAGAGCGTTGGGAGGTGTTTCTACAGACATGTTCACCATGTGTCAACCACTTCGGTCT
AGAGGAAACTTGGTGATGCTGTTTAAAGGTTGTAGAAGGTTTGTGAGAACAGCATGCCAA
GTTTCAATCCCTGGTGGTTCTTTGGGGAATGAATTAAAAGCACCTCCGAGGTTTCTTAGG
GATAAGAAGATAGTTCCAGATGCTGATCCTCCTCATAAGGAAGATATCCATAAGCTGTAT
CAACTTTTTGAGCAAAGTAAAAGACTCACCATCTTGACTGGAGCTAGGATTAGCACTGAA
TGTGGCATCCCTGATTATAGAAGTCCCAATGGAGCATACAGTTCTGGTTTCAAGCCAATT
ACCCATCAGGAATTCACTCGATCAAGCCGATCTCGTAGGCGGTATTGGGCAAGGAGTTAT
GCCGTTTGGAGACGGTTCACTGCAGCACAACCAGGTCCAGCTCATACTGCTTTAGCATCA
CTAGAAAGAGCTGGACGAATTGATTCTATCATAACACAAAGCGTTGACAGGTTGCATCAT
CGTGCTGGGAGTGATCCGCTTGAATTACACGGCACAGTATATACTGTTATGTGCTTAGAT
TGTGGCTTCTCGTTTCCCCGAGACTCGTTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2FY23JQ 768 0 0
AGCATCACTAGAAAGAGCTGGACGAATTGATTCTATCATAACACAAAGCGTTGACAGGTT
GCATCATCGTGCTGGGAGTGATCCGCTTGAATTACACGGCACAGTATATACTGTTATGTG
CTTAGATTGTGGCTTCTCGTTTCCCCGAGACTCGTTTCAGGATCAGCTTAAAGCTCTCAA
TCCTAAGTGGGCAGAAGCTTTAGAAAGTATAGATCATGGAGAACCAGGTTCAGAGAAGAC
CTTTGGCATGAAACAAAGACCTGATGGTGATATTGAGATTGACGAGAAGTTTTGGGAAGA
AGGTTTTCATATACCAGTTTGCGAGAAATGCGAAGGAGTACTAAAACCTGACGTAATTTT
CTTTGGAGACAATATCCCAAAGGAAAGAGCTGCTCAAGCAATGGAAGCTGCGAAACAGAG
CGATGCATTTCTAGTGTTGGGTTCGTCTTTAATGACAATGTCCGCTTTTCGTCTTGTCAG
AGCGGCTCATGAAGCTGGTGCGGTGACTGCAATTGTAAATATAGGCGTTACCAGAGCTGA
TGACATTGTTCCTTTGAAAATCAGTGCAAGGGTTGGTGAGATATTACCCAGAGTTCTTGA
TGTGGGATCGCTCGGTGTTCCAGCTCTATAGGACAATATGTTCACGAACCAGAGGTTGAT
CAATTAAGTGACTGTGATTAATCAATTGTTTAATGCA*ACTTCAATTCCTGTAATGTATC
TTTTCAAGATTGTAATTTTCAACAGAAAAAAATAAAAGAGTAATTATC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2ER35JQ 291 0 0
G
GAAGCTGGTGCGGTGACTGCAATTGTAAATATAGGCGTTACCAGAGCTGATGACATTGTT
CCTTTGAAAATCAGTGCAAGGGTTGGTGAGATATTACCCAGAGTTCTTGATGTGGGATCG
CTCGGTGTTCCAGCTCTATAGGACAATATGTTCACGAACCAGAGGTTGATCAATTAAGTG
ACTGTGATTAATCAATTGTTTAATGCATACTTCAATTCCTGTAATGTATCTTTTCAAGAT
TGTAATTTTCAACAGAAAAAAATAAAAGAGTAATTATCATTTTTTAATGC

QA 2 291 2 291
DS 

RD RR2ER35TF 291 0 0
G
GAAGCTGGTGCGGTGACTGCAATTGTAAATATAGGCGTTACCAGAGCTGATGACATTGTT
CCTTTGAAAATCAGTGCAAGGGTTGGTGAGATATTACCCAGAGTTCTTGATGTGGGATCG
CTCGGTGTTCCAGCTCTATAGGACAATATGTTCACGAACCAGAGGTTGATCAATTAAGTG
ACTGTGATTAATCAATTGTTTAATGCATACTTCAATTCCTGTAATGTATCTTTTCAAGAT
TGTAATTTTCAACAGAAAAAAATAAAAGAGTAATTATCATTTTTTAATGC

QA 2 291 2 291
DS 



AS 1 4

CO CL2309Contig1 1099 4 3 U
ATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGAATTAG
GGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGC
GCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCTC
TTTGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGG
GCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCGATAGCGTATATTTAAGTTGTT
GCAGTTAAAAAGCTCTTGCTTGTCTACGAGTACTTGGAGAACAACAGTCTCGCCAGAGCA
CTTTTCGGTCCTCCAGAGACTCAAATAAGGCTAGATTGGCCGACGAGGCAGAGGATTTGC
GTCGGTATAGCAAGAGGATTGGCTTATCTCCACGAGGAATCAAGACTCAAGATTGTACAC
AGAGACATCAAAGCAACTAATGTCTTGCTGGACAAGGAACTAAATGCAAAGATTTCGGAT
TTCGGTCTCGCTAAGCTTGATGAAGAAGAAAACACACACATGAGCACACGAGTCGCTGGA
ACATACGGATACATGGCTCCTGAATATGCCATGAGAGGCCACTTGACAGATAAAGCAGAT
GTCTACAGTTTCGGTGTCGTGGCTTTAGAGATTGTTCACGGACGAAGCAACACGAGCGCA
CGATCCAAAGGCGAAACCTTCCACCTTCTTGACTGGGTACACGTTTTAAGGGAGCAAAAC
AACTTGATAGAAGTAGTAGACTCGAGGCTTGGGAACAGACTACAACAGAGAAGAAGCAAT
GACGATGATCAACATCGGGATCCTCTGCACCAGTCAAGTTCCATCGGACAGACCGTCCAT
GTCTATTGTGGTCAGCATGCTCGAAGGAAGCTCCACGGTGAATGTTGAGAAGCTTCTTGA
AGCATCGTTCAGCAGAGGAAACGAGAAAGATGCAGAGAGCGTGAGGGCGATGAAGAAGCA
TTACGCAATTTTTAGTGGAGAGGAGATGACGAGTATGACGGATCAGTGTGTCAACACCTA
TGGACCATTCACGTCGTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E666JQ C 1
AF RR2E666TF U 1
AF RR2D159TF U 224
AF RR2D159JQ C 711
BS 1 306 RR2E666TF
BS 307 926 RR2D159TF
BS 927 1099 RR2D159JQ

RD RR2E666JQ 306 0 0
ATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGAATTAG
GGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGC
GCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCTC
TTTGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGG
GCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCGATAGCGTATATTTAAGTTGTT
GCAGTT

QA 1 306 1 306
DS 

RD RR2E666TF 306 0 0
ATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGAATTAG
GGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGC
GCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCTC
TTTGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGG
GCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCGATAGCGTATATTTAAGTTGTT
GCAGTT

QA 1 306 1 306
DS 

RD RR2D159TF 709 0 0
G
GAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGC
GTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCTTGCTTGTCTACGAGTACTTGGAGAACAA
CAGTCTCGCCAGAGCACTTTTCGGTCCTCCAGAGACTCAAATAAGGCTAGATTGGCCGAC
GAGGCAGAGGATTTGCGTCGGTATAGCAAGAGGATTGGCTTATCTCCACGAGGAATCAAG
ACTCAAGATTGTACACAGAGACATCAAAGCAACTAATGTCTTGCTGGACAAGGAACTAAA
TGCAAAGATTTCGGATTTCGGTCTCGCTAAGCTTGATGAAGAAGAAAACACACACATGAG
CACACGAGTCGCTGGAACATACGGATACATGGCTCCTGAATATGCCATGAGAGGCCACTT
GACAGATAAAGCAGATGTCTACAGTTTCGGTGTCGTGGCTTTAGAGATTGTTCACGGACG
AAGCAACACGAGCGCACGATCCAAAGGCGAAACCTTCCACCTTCTTGACTGGGTACACGT
TTTAAGGGAGCAAAACAACTTGATAGAAGTAGTAGACTCGAGGCTTGGGAACAGACTACA
ACAGAGAAGAAGCAATGACGATGATCAACATCGGGATCCTCTGCACCAGTCAAGTTCCAT
CGGACAGACCGTCCATGTCTATTGTGGTCAGCATGCTCGAAG
AAGCTC

QA 2 703 2 703
DS 

RD RR2D159JQ 389 0 0
CACGAGCGCACGATCCAAAGGCGAAACCTTCCACCTTCTTGACTGGGTACACGTTTTAAG
GGAGCAAAACAACTTGATAGAAGTAGTAGACTCGAGGCTTGG*AACAGACTACAACAGAG
AAGAAGCAATGACGATGATCAACATCGGGATCCTCTGCACCAGTCAAGTTCCATCGGACA
GACCGTCCATGTTTATTGTGGTCAGCATGCTCGAAGGAAGCTCCACGGTGAATGTTGAGA
AGCTTCTTGAAGCATCGTTCAGCAGAGGAAACGAGAAAGATGCAGAGAGCGTGAGGGCGA
TGAAGAAGCATTACGCAATTTTTAGTGGAGAGGAGATGACGAGTATGACGGATCAGTGTG
TCAACACCTATGGACCATTCACGTCGTCT

QA 1 389 1 389
DS 



AS 1 2

CO CL2310Contig1 1364 2 2 U
GATCGCCATCGTCTTCCTCCATCAAGGTCAACTCTTTTTCTTCCTCTGTTTCTTCAAGTT
TCATCAATGGCAGAGTCTCCCTTACTCGGTGCAGCGCCGTCCTGTCAAACTCTTCTTCCA
GTAAGGGTGTTACTGAACTAGCCGACATAGATTGGGACAACATCGGCTTCGGTCTTAAGC
CCACCGATTACATGTATGCCATGAAATGTAACCTTGGTGGTGAGTTCTCAAATGGTGAGT
TGCAACGTTTTGGGAACATTGAAGTTAGCCCATCTGCTGGTGTACTCAACTACGGACAGG
GATTGTTCGAAGGGATGAAAGCTTACAGAAAGCAAGACGGTGAGAATATACTCCTCTTCC
GTCCTGAAGAGAATGCAAAGCGTATGAGAAGTGGTGCTGAGAGGATGTGTATGCCTGCTC
CTACCATTGACCAGTTTGTCGAAGCTGTGAAAGCAACTGTCTTAGCAAACAAACGTTGGG
TTCCACCTCCAGGTAAAGGTTCCTTGTACATCAGACCTTTGCTAATGGGAACTGGAGCTG
TTCTTGGTCTTGCACCTGCACCAGAATATACTTTCCTTGTCTATGTCTCTCCTGTTGGGA
ACTACTTCAAAGAAAGTGTGTCACCAATCAATTTGATTGTGGAAAGTGAATTTCACCGTG
CGACACCTGGTGGTACCGGAGGTGTTAAAACCATTGGCAATTATGCTGCAGTACTGAAAG
CACAGGCTGTTGCGAAAGCCAAAGGATATTCAGATGTTTTGTACCTTGATTGCATCTACA
AAAGATATCTCGAGGAGGTCACGTCTTGCAATATCTTCATTGTCAAGGACAATGTGGTCT
CTACTCCTGAAATAAGAGGAACCATCTTACCAGGGATCACGCGGAAAAGTATAGTTGACG
TTGCTCGTAGTCAAGGGTTTAAGGTGGAGGAGCGGAATGTGACTGTGGATGAGTTGCTAG
AAGCGGACGAGGTTTTCTGCACTGGAACTGCTGTGGTTGTCTCTCCCGTTGGAAGCATTA
CTTATAAAGGCAAAAGAGTATCTTACGGAGAAGGTAGCTTTGGACCTGTCTCGGAGAAAC
TCTACACCGTTCTGACAAGCTTGCAGATGGGTCTGAGCGAAGACAACATGGAGTGGACTG
TGAATCTGAGTTAAAGAAAAACAGGCGAAGACATTTGTTATATCAATATTACTCTTTAGT
TTTTGTTATCATTTTCATGAAGTCTTGTTTCGTATTGGTGAAACTAAAAGTTGAGATCTT
ACAACTTGGCTACTTCAAGATCAGTAGATGTTATCTTGTACCAAACCCTGTAGTTATGCT
TTGTGTTTGAAGCCAAAATATAAATAAATTTCCGGTTCCTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU02TF U 1
AF RR2FK73JQ C 607
BS 1 667 RR2GU02TF
BS 668 1364 RR2FK73JQ

RD RR2GU02TF 667 0 0
GATCGCCATCGTCTTCCTCCATCAAGGTCAACTCTTTTTCTTCCTCTGTTTCTTCAAGTT
TCATCAATGGCAGAGTCTCCCTTACTCGGTGCAGCGCCGTCCTGTCAAACTCTTCTTCCA
GTAAGGGTGTTACTGAACTAGCCGACATAGATTGGGACAACATCGGCTTCGGTCTTAAGC
CCACCGATTACATGTATGCCATGAAATGTAACCTTGGTGGTGAGTTCTCAAATGGTGAGT
TGCAACGTTTTGGGAACATTGAAGTTAGCCCATCTGCTGGTGTACTCAACTACGGACAGG
GATTGTTCGAAGGGATGAAAGCTTACAGAAAGCAAGACGGTGAGAATATACTCCTCTTCC
GTCCTGAAGAGAATGCAAAGCGTATGAGAAGTGGTGCTGAGAGGATGTGTATGCCTGCTC
CTACCATTGACCAGTTTGTCGAAGCTGTGAAAGCAACTGTCTTAGCAAACAAACGTTGGG
TTCCACCTCCAGGTAAAGGTTCCTTGTACATCAGACCTTTGCTAATGGGAACTGGAGCTG
TTCTTGGTCTTGCACCTGCACCAGAATATACTTTCCTTGTCTATGTCTCTCCTGTTGGGA
ACTACTTCAAAGAAAGTGTGTCACCAATCAATTTGATTGTGGAAAGTGAATTTCACCGTG
CGACACC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2FK73JQ 758 0 0
TCAAAGAAGGTGTGTCACCAATCAATTTGATTGTGGAGAGTGAATTTCACCGTGCGACAC
CTGGTGGTACCGGAGGTGTTAAAACCATTGGCAATTATGCTGCAGTACTGAAAGCACAGG
CTGTTGCGAAAGCCAAAGGATATTCAGATGTTTTGTACCTTGATTGCATCTACAAAAGAT
ATCTCGAGGAGGTCACGTCTTGCAATATCTTCATTGTCAAGGACAATGTGGTCTCTACTC
CTGAAATAAGAGGAACCATCTTACCAGGGATCACGCGGAAAAGTATAGTTGACGTTGCTC
GTAGTCAAGGGTTTAAGGTGGAGGAGCGGAATGTGACTGTGGATGAGTTGCTAGAAGCGG
ACGAGGTTTTCTGCACTGGAACTGCTGTGGTTGTCTCTCCCGTTGGAAGCATTACTTATA
AAGGCAAAAGAGTATCTTACGGAGAAGGTAGCTTTGGACCTGTCTCGGAGAAACTCTACA
CCGTTCTGACAAGCTTGCAGATGGGTCTGAGCGAAGACAACATGGAGTGGACTGTGAATC
TGAGTTAAAGAAAAACAGGCGAAGACATTTGTTATATCAATATTACTCTTTAGTTTTTGT
TATCATTTTCATGAAGTCTTGTTTCGTATTGGTGAAACTAAAAGTTGAGATCTTACAACT
TGGCTACTTCAAGATCAGTAGATGTTATCTTGTACCAAACCCTGTAGTTATGCTTTGTGT
TTGAAGCCAAAATATAAATAAATTTCCGGTTCCTGTTT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 3

CO CL2311Contig1 1383 3 9 U
GGGATTCTCGTTCCTCGTCCTTTTCTCTCTTCCCTGCATATCCTTTCCCTTCCCTCTTCA
AAGCAGGTTCTTTCTTCTGTTGATCAAAAAACAATCCGATAACAACCCACGGGGTCCCGA
TTTGACGTTGTTTCCATAGAAATTAGAAAAAAAAAAGAGAGAAGCTTGGATCGAATAAAA
AAAAAGAAATGGTGTCGGACAATGAGATGGGTTTGGTATTAGCTGTGGCGTCGAGCGTAT
TCATAGGTTCCAGCTTCATTTTGAAAAAGAAAGGTCTCAAACGTGCTGCTGCTAATGGCA
CCCGAGCTGGGATTGGAGGTTATACCTATTTGTTAGAGCCACTCTGGTGGGTTGGCTTGG
TCACAATGACCTTTGGAGAAATTGCAAACTTTGTAGCCTACGTTTATGCCCCCGCTGTAC
TAGTTACTCCTCTCGGTGCTTTAAGTATAATCATCAGTGCTGTATTGGCACACTTCCTGT
TAAACGAGAAACTTAAGAAAATGGGAGTTTGGGGCTGTGTTTGCTGCATCGTGGGCTCGG
TTATGATCGTAATACACGCACCTCAGGAGCAGACTCCTAACTCTGTTCAAGCAATCTGGA
CACTAGCAATGCAACCAGCTTTTCTAATTTACGTGGCCACGTCAATGTCCATTGTCCTGG
CTTTGATTCTCTACTGCGAACCTCTCTGCGGCCAAACCAACGTTCTTGTTTACATCGGAA
TCTGTTCATTGATGGGTTCTCTCACAGTTATGAGCATAAAGGCTGTGGGGATCGCTGTAA
AGTTAACACTTGAGGGAGTAAACCAGGTTTGGTATCCAGAGACTTGGTTCTTTCTCATGG
TTGCAGCTATATGTGTCGTTACGCAAATGATATACCTGAACAAGGCGCTGGACACATTCA
ACGCAGCAATAGTTTCTCCAATTTATTATGTGATGTTCACAACCCTCACAATTGTTGCTA
GTGCGATCATGTTTAAGGACTGGTATGGGCAAGACGCAGGGAGCATAGCGTCTGAGATAT
GTGGATTCATCACAGTGCTAACGGGAACGGTTATACTTCATGCCACGAGAGAAGAGGAAC
AAGCTTCTTCAGGTAGAGCGAGATGGCAGGAATCAGGGAAGAGCTTTAACGAAGAACATC
TCGTAAGGTTGTACAGTCCTCCTGAGTGTCAGGAAAGTAAAAGCCTCAATAAGACCGTCT
CTTTGTTGAACTGAAACGAGGTTGGTGGTGTCCGAATCAAATCAAATGGCATAGAATCTT
ATCTCTCTAGTGGGGGGAAAATGTAACTTTTTGTGTATACTTGATAGTTCTGTAATAGTT
GTATTGTTTATGAGATTTCTCTATACAATACATTGGGTTTTAGAGAAGAAAAAATCTCCA
TTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2BS14TF U 1
AF RR2E945TF U 308
AF RR2E945JQ C 653
BS 1 370 RR2BS14TF
BS 371 371 RR2E945TF
BS 372 463 RR2BS14TF
BS 464 464 RR2E945TF
BS 465 547 RR2BS14TF
BS 548 548 RR2E945TF
BS 549 634 RR2BS14TF
BS 635 860 RR2E945TF
BS 861 1383 RR2E945JQ

RD RR2BS14TF 637 0 0
GGGATTCTCGTTCCTCGTCCTTTTCTCTCTTCCCTGCATATCCTTTCCCTTCCCTCTTCA
AAGCAGGTTCTTTCTTCTGTTGATCAAAAAACAATCCGATAACAACCCACGGGGTCCCGA
TTTGACGTTGTTTCCATAGAAATTAGAAAAAAAAAAGAGAGAAGCTTGGATCGAATAAAA
AAAAAGAAATGGTGTCGGACAATGAGATGGGTTTGGTATTAGCTGTGGCGTCGAGCGTAT
TCATAGGTTCCAGCTTCATTTTGAAAAAGAAAGGTCTCAAACGTGCTGCTGCTAATGGCA
CCCGAGCTGGGATTGGAGGTTATACCTATTTGTTAGAGCCACTCTGGTGGGTTGGCTTGG
TCACAATGACTTTTGGAGAAATTGCAAACTTTGTAGCCTACGTTTATGCCCCCGCTGTAC
TAGTTACTCCTCTCGGTGCTTTAAGTATAATCATCAGTGCTGTTTTGGCACACTTCCTGT
TAAACGAGAAACTTAAGAAAATGGGAGTTTGGGGCTGTGTTTGCTGCATCGTGGGCTCGG
TTATGATTGTAATACACGCACCTCAGGAGCAGACTCCTAACTCTGTTCAAGCAATCTGGA
CACTAGCAATGCAACCAGCTTTTCTAATTTACGT
AGC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2E945TF 553 0 0
G
GGGATTGGAGGTTATACCTATTTGTTAGAGCCACTCTGGTGGGTTGGCTTGGTCACAATG
ACCTTTGGAGAAATTGCAAACTTTGTAGCCTACGTTTATGCCCCCGCTGTACTAGTTACT
CCTCTCGGTGCTTTAAGTATAATCATCAGTGCTGTATTGGCACACTTCCTGTTAAACGAG
AAACTTAAGAAAATGGGAGTTTGGGGCTGTGTTTGCTGCATCGTGGGCTCGGTTATGATC
GTAATACACGCACCTCAGGAGCAGACTCCTAACTCTGTTCAAGCAATCTGGACACTAGCT
ATGCAACCAGCTTTTCTAATTTACGTGGCCACGTCAATGTCCATTGTCCTGGCTTTGATT
CTCTACTGCGAACCTCTCTGCGGCCAAACCAACGTTCTTGTTTACATCGGAATCTGTTCA
TTGATGGGTTCTCTCACAGTTATGAGCATAAAGGCTGTGGGGATCGCTGTAAAGTTAACA
CTTGAGGGAGTAAACCAGGTTTGGTATCCAGAGACTTGGTTCTTTCTCATGGTTGCAGCT
ATATGTGTCGTT

QA 2 553 2 553
DS 

RD RR2E945JQ 731 0 0
TGTCCTGGCTTTGATTCTCTACTGCGAACCTCTCTGCGGCCAAACCAACGTTCTTGTTTA
CATCGGAATCTGTTCATTGATGGGTTCTCTCACAGTTATGAGCATAAAGGCTGTGGGGAT
CGCTGTAAAGTTAACACTTGAGGGAGTAAACCAGGTTTGGTATCCAGAGACTTGGTTCTT
TCTCATGGTTGCAGCTATATGTGTCGTTACGCAAATGATATACCTGAACAAGGCGCTGGA
CACATTCAACGCAGCAATAGTTTCTCCAATTTATTATGTGATGTTCACAACCCTCACAAT
TGTTGCTAGTGCGATCATGTTTAAGGACTGGTATGGGCAAGACGCAGGGAGCATAGCGTC
TGAGATATGTGGATTCATCACAGTGCTAACGGGAACGGTTATACTTCATGCCACGAGAGA
AGAGGAACAAGCTTCTTCAGGTAGAGCGAGATGGCAGGAATCAGGGAAGAGCTTTAACGA
AGAACATCTCGTAAGGTTGTACAGTCCTCCTGAGTGTCAGGAAAGTAAAAGCCTCAATAA
GACCGTCTCTTTGTTGAACTGAAACGAGGTTGGTGGTGTCCGAATCAAATCAAATGGCAT
AGAATCTTATCTCTCTAGTGGGGGGAAAATGTAACTTTTTGTGTATACTTGATAGTTCTG
TAATAGTTGTATTGTTTATGAGATTTCTCTATACAATACATTGGGTTTTAGAGAAGAAAA
AATCTCCATTC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL2312Contig1 1248 2 6 U
GTATAATTCTATTTGATTTCATGGTCCACGAACAGCTCTGAAGAAATTAGTGACAAAGAG
GGAAACGGAAAGAAAGAAAGAACAAAAGTGAATAGTTTTCAGCATTTGGTAAGAATCTCA
GAACCAGTTCTAGTAATCAGAATTGTATGCTCACACTGTGCGGCTACCCCACCATCAGTC
GTTAGAGTGGTCCAGTTGTCTGGCCATGTTACACATTCCGTGGTTCCAATCGTTAGAATC
GGTTCGATTGTGAATGTTTGTCCCTCAACCATTTGCCCAGGCTCATCATTTCGGTAATGA
TAAATCAAGGGTTCTGAGTGGAATACTGGTCCAACACCATGACCAACAAAGCGTTCCACC
ACGTTGTAGCCATACTTTTCGGCATGCTCACTTATTCGCTTGCCGATTTTCTTGAAGCTT
GCTCCATCTTTACAAACGGCTATCCCCCTCTCTAAGCATTCCTCCGTAATCTGTACAAGT
CGTTTAAAACCTTCATTTACTTCTCCACAGAAAAAAGTCCTTGATGTATCTCCATGGTAA
CCATCCAAGTAAACCGTGACATCGATGTTTATTATATCTCCACTCTGTAGCTGACGAGAA
TCCGGTATCCCGTGACACATACACTCGTTAACCGATGTACACACACTTTTAGGGAATCCA
CCATACCCAAGAGGCGAAGGATAAGCACCAGCTTCGATGATCATATCATGCACCGCTTTG
TCTATCTCATTAGTCGTCACAGAAGGTTTAACCAAAGTTCCAGCAAAGTTTAGAACCCGA
GCAGCGAGCTCGCAAGCAGCTCTCATCTTCGCAATACCTTCAGGACCAGGGATCTGGAAC
TCAGGAGATATATCAGGTAACACACCAGACTCGACATAAGGAGGCCTTGGTATGTGGTCA
GGGACGAGAAGACGTGGCGATACTCTTCCACGTCGTAACGGTGGATTTCTCCTAACTTTT
GAAGTTTTCTCCAGCTCTCTCATCCTTCTGATTCTAATGGCTTCTTCTAATCCAGATACT
TTCTTAGCAGAAACGTGAAATTTTCTCGGAGGATACGAGTTCTTCTGACCGGAGAGCAGT
GATGGAGAAGAGGAAGTGAGCGGAGCTGGAGCTGCTCCGATGAAGCTCCTGGAAGATGAT
ACATACTCGCCGTTGAAAGAAGAACGGAGTTGTAACGACGATGGCGAGAAACTGGATAGA
AAAACCGTAGACGCCATCTTAGCAACCTCACTGCTAAACGGACTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV16JQ U 1
AF RR2C504TF C 520
BS 1 582 RR2EV16JQ
BS 583 583 RR2C504TF
BS 584 632 RR2EV16JQ
BS 633 633 RR2C504TF
BS 634 675 RR2EV16JQ
BS 676 1248 RR2C504TF

RD RR2EV16JQ 675 0 0
GTATAATTCTATTTGATTTCATGGTCCACGAACAGCTCTGAAGAAATTAGTGACAAAGAG
GGAAACGGAAAGAAAGAAAGAACAAAAGTGAATAGTTTTCAGCATTTGGTAAGAATCTCA
GAACCAGTTCTAGTAATCAGAATTGTATGCTCACACTGTGCGGCTACCCCACCATCAGTC
GTTAGAGTGGTCCAGTTGTCTGGCCATGTTACACATTCCGTGGTTCCAATCGTTAGAATC
GGTTCGATTGTGAATGTTTGTCCCTCAACCATTTGCCCAGGCTCATCATTTCGGTAATGA
TAAATCAAGGGTTCTGAGTGGAATACTGGTCCAACACCATGACCAACAAAGCGTTCCACC
ACGTTGTAGCCATACTTTTCGGCATGCTCACTTATTCGCTTGCCGATTTTCTTGAAGCTT
GCTCCATCTTTACAAACGGCTATCCCCCTCTCTAAGCATTCCTCCGTAATCTGTACAAGT
CGTTTAAAACCTTCATTTACTTCTCCACAGAAAAAAGTCCTTGATGTATCTCCATGGTAA
CCATCCAAGTAAACCGTGACATCGATGTTTATTATATCTCCATTCTGTAGCTGACGAGAA
TCCGGTATCCCGTGACACATACACTCGTTAACTGATGTACACACACTTTTAGGGAATCCA
CCATACCCAAGAGGC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2C504TF 729 0 0
CTTGATGTATCTCCATGGTAACCATCCAAGTAA*CCGTGACATCGATGTTTATTATATCT
CCACTCTGTAGCTGACGAGAATCCGGTATCCCGTGGCACATACACTCGTTAACCGATGTG
CACACACTTTTAGGGAATCCACCATACCCAAGAGGCGAAGGATAAGCACCAGCTTCGATG
ATCATATCATGCACCGCTTTGTCTATCTCATTAGTCGTCACAGAAGGTTTAACCAAAGTT
CCAGCAAAGTTTAGAACCCGAGCAGCGAGCTCGCAAGCAGCTCTCATCTTCGCAATACCT
TCAGGACCAGGGATCTGGAACTCAGGAGATATATCAGGTAACACACCAGACTCGACATAA
GGAGGCCTTGGTATGTGGTCAGGGACGAGAAGACGTGGCGATACTCTTCCACGTCGTAAC
GGTGGATTTCTCCTAACTTTTGAAGTTTTCTCCAGCTCTCTCATCCTTCTGATTCTAATG
GCTTCTTCTAATCCAGATACTTTCTTAGCAGAAACGTGAAATTTTCTCGGAGGATACGAG
TTCTTCTGACCGGAGAGCAGTGATGGAGAAGAGGAAGTGAGCGGAGCTGGAGCTGCTCCG
ATGAAGCTCCTGGAAGATGATACATACTCGCCGTTGAAAGAAGAACGGAGTTGTAACGAC
GATGGCGAGAAACTGGATAGAAAAACCGTAGACGCCATCTTAGCAACCTCACTGCTAAAC
GGACTCTCC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 2 4

CO CL2313Contig1 730 2 6 U
GGGGGGCAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAACCATGGGAAGATCTCCTTGCTGCGAGAAA
GAACACATGAACAAAGGTGCTTGGACTAAAGAAGAAGACGAGAGACTCGTCTCTTACATC
AAATCACACGGCGAAGGCTGTTAGCGATCTCTCCCTAGAGCTGCCGGTCTCCTCCGTTGC
GGCAAGAGCTGCCGTCTCCGGTGGATTAACTATCTCCGGCCTGATCTCAAAAGAGGAAAC
TTTACCCACGACGAAGATGAAGTTATCATCAAGCTTCACAGCCTCCTTGGAAACAAGTGG
TCTTTAATTGCGGCGAGGTTACCTGGAAGAACAGATAACGAGATCAAGAATTATTGGAAC
ACACATATAAAGAGGAAACTTTTGAGCAAAGGGATTGATCCCAACACTCACAGATCAATC
AACGCCGCGAAAGATCATGATCTGAAGAAAACAGGGGACCAAGTTGTAAAAGATGTGTCT
TTTGGGTCTCTGTTTCATAAAACAGAAAAGTCTGAGGAGCAAAAGCAAAATAAAAACCAA
AAGCAAAATCTAATCAATGGGTTCGTTTGCAAAGAAGAGAGGGTTGAGCATCACCCAGTT
GTTGTTGTTGTCCAAGAAAAGATTTGCCCAGAATTGAATCTCGAGCTTAGATCAGTCCAC
CGTGGCAAACAGAGTTATGATGATCAGACAGAGAGAGATCTGCTACACTGCATCCCATCT
TACGTCGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D039TF U 1
AF RR2DI30TF U 6
BS 1 59 RR2D039TF
BS 60 61 RR2DI30TF
BS 62 142 RR2D039TF
BS 143 143 RR2DI30TF
BS 144 286 RR2D039TF
BS 287 730 RR2DI30TF

RD RR2D039TF 286 0 0
GGGGGGCAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAACCATGGGAAGATCTCCTTGCTGCGAGAAT
*AACACATGAACAAAGGTGCTTGGACTAAAGAAGAAGACGAGAGACTCGTCTCTTACATC
AAATCACACGGCGAAGGCTGTTGGCGATCTCTCCCTAGAGCTGCCGGTCTCCTCCGTTGC
GGCAAGAGCTGCCGTCTCCGGTGGATTAACTATCTCCGGCCTGATCTCAAAAGAGGAAAC
TTTACCCACGACGAAGATGAAGTTATCATCAAGCTTCACAGCCTCC

QA 1 286 1 286
DS 

RD RR2DI30TF 725 0 0
GG
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAACCATGGGAAGATCTCCTTGCTGCGAGAAAGAACACA
TGAACAAAGGTGCTTGGACTAAAGAAGAAGACGAGAGACTCGTCTCTTACATCAAATCAC
ACGGCGAAGGCTGTTAGCGATCTCTCCCTAGAGCTGCCGGTCTCCTCCGTTGCGGCAAGA
GCTGCCGTCTCCGGTGGATTAACTATCTCCGGCCTGATCTCAAAAGAGGAAACTTTACCC
ACGACGAAGATGAAGTTATCATCAAGCTTCACAGCCTCCTTGGAAACAAGTGGTCTTTAA
TTGCGGCGAGGTTACCTGGAAGAACAGATAACGAGATCAAGAATTATTGGAACACACATA
TAAAGAGGAAACTTTTGAGCAAAGGGATTGATCCCAACACTCACAGATCAATCAACGCCG
CGAAAGATCATGATCTGAAGAAAACAGGGGACCAAGTTGTAAAAGATGTGTCTTTTGGGT
CTCTGTTTCATAAAACAGAAAAGTCTGAGGAGCAAAAGCAAAATAAAAACCAAAAGCAAA
ATCTAATCAATGGGTTCGTTTGCAAAGAAGAGAGGGTTGAGCATCACCCAGTTGTTGTTG
TTGTCCAAGAAAAGATTTGCCCAGAATTGAATCTCGAGCTTAGATCAGTCCACCGTGGCA
AACAGAGTTATGATGATCAGACAGAGAGAGATCTGCTACACTGCATCCCATCTTACGTCG
AAA

QA 3 725 3 725
DS 



CO CL2313Contig2 553 2 3 U
AAATTCAAACTCGATTTATATGACTGCATTATCAAATGAGACGTCGATACAATTGATCAT
AATATTTTGAAGTTTATGTACAAAGATTAGGAGAAAGACATTAAAATAAAGTAAAAGCGA
GATATAGAGTAACATTATCAGATCTACAAATTTATTTTTGATTACTTGTTTAGTTCATTT
CCAAGCTCCGAAAATCCATAAACCTCGTATTCAAACCCAAAAAGTCATAACCAATGCTGC
TAATACTACTAATGTCAAGTGAAAAATGGCTAATGCTACTGCTATCCTCTGTTTGACATT
TGGCAGTATCACTACTAAACTCCATGCCGTTTTCGACGTAAAGATGGGATGCAGTGTAGG
CAGATCTCTCTCTTGTCTGATCATCATAACTCTTGTTTTGCCACGGTGGACTGATCCTAA
GCTCGAGATTCAATTCTGGGCAAATCTTTTCTTGGACAACAACAACAACTGGGTGATGCT
CAACCCTCTCTTCTTTGCAAACGAACCCATTGATTAAATTTTGCTTTTGGTTTTTATTTT
GCTTTTGCTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2DI30JQ U 1
AF RR2D039JQ U 38
BS 1 516 RR2DI30JQ
BS 517 517 RR2D039JQ
BS 518 553 RR2DI30JQ

RD RR2DI30JQ 553 0 0
AAATTCAAACTCGATTTATATGACTGCATTATCAAATGAGACGTCGATACAATTGATCAT
AATATTTTGAAGTTTATGTACAAAGATTAGGAGAAAGACATTAAAATAAAGTAAAAGCGA
GATATAGAGTAACATTATCAGATCTACAAATTTATTTTTGATTACTTGTTTAGTTCATTT
CCAAGCTCCGAAAATCCATAAACCTCGTATTCAAACCCAAAAAGTCATAACCAATGCTGC
TAATACTACTAATGTCAAGTGAAAAATGGCTAATGCTACTGCTATCCTCTGTTTGACATT
TGGCAGTATCACTACTAAACTCCATGCCGTTTTCGACGTAAAGATGGGATGCAGTGTAGG
CAGATCTCTCTCTTGTCTGATCATCATAACTCTTGTTTTGCCACGGTGGACTGATCCTAA
GCTCGAGATTCAATTCTGGGCAAATCTTTTCTTGGACAACAACAACAACTGGGTGATGCT
CAACCCTCTCTTCTTTGCAAACGAACCCATTGATTAGATTTTGCTTTTGGTTTTTATTTT
GCTTTTGCTCCTC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2D039JQ 511 0 0
GAGACGTCGATACAATTGATCATAATATTTTGAAGTTTATGTACAAAGATTAGGAGAAAG
ACATTAAAATAAAGTAAAAGCGAGATATAGAGTAACATTATCAGATCTACAAATTTATTT
TTGATTACTTGTTTAGTTCATTTCCAAGCTCCGAAAATCCATAAACCTCGTATTCAAACC
CAAGAAGTCATAACCAATGCTGCTAATACTACTAATGTCAAGTGAAGAATGGCTAATGCT
ACTGCTATCCTCTGTTTGACATTTGGCAGTATCACTACTAGACTCCATGCCGTTTTCGAC
GTAAAGATGGGATGCAGTGTAGGCAGATCTCTCTCTTGTCTGATCATCATAACTCTTGTT
TTGCCACGGTGGACTGATCCTAAGCTCGAGATTCAATTCTGGGCAAATCTTTTCTTGGAC
AACAACAACAACTGGGTGATGCTCAACCCTCTCTTCTTTGCAAACGAACCCATTGATTAA
ATTTTGCTTTTGGTTTTTATTTTGCTTTTGC

QA 1 511 1 511
DS 



AS 1 3

CO CL2314Contig1 1262 3 6 U
AAAAAAAAACTATCGATTGCTTCCTTCCTCCTAGCGTTTTCTCCTCTGTCGATCTTCTTC
TTCTTCAACTCACACTCCGGCGTCTATTAGTCTACCAACCGCGCCTTCAGAGGAAAAAGT
CATTTTGGAAACATGCCGGGTCAGAAGATTGAAACAGGTCATGAGGACATGGTCCATGAC
GTGCAGATGGATTACTACGGGAAGCGAGTTGCAACTGCCTCGTCTGACTGCACCATCAAG
ATAACCGGCGTCAGCAACAACGGTGGATCCCAGCACCTAGCTACATTAACCGGCCACCGT
GGTCCTGTCTGGCAGGTCGCGTGGGCCCACCCTAAGTTCGGGTCATTCCTTGCTTCATGC
TCCTATGACGGTCAGGTCATACTCTGGAAAGAAGGCAACCAAAACCAATGGACCCAAGCT
CATGTCTTCACGGACCATAAATCTTCGGTCAACTCCATTGCTTGGGCTCCTCATGACCTC
GGACTATCCTTGGCTTGTGGGTCATCCGATGGAAACATTTTCGGTATTCACAGGCCGTGC
TGATGGTGGCTGGGACACCACGAAGATAGACCAAGCGCATCCGGTTGGAGTCACTTCTGT
CCCATGGGCACCAGTTACTGCGCCCGGTGCTCTTGTGAGCTCTGGCTTGCTCGATCCGGT
TTACAAGCTGGCTTCTGGTGGGTGTGATAATACAGTGAAAGTGTGGAAGCTCTCAAACGG
GTCGCGGAAGATGGATTGCTTTCCGGCTCTTCAGAAGCACACGGATTGGGTCCGTGATGT
GGCTTGGGCACCCAACTTGGGTCTTCCTAAGTCCACCATAGCCAGTGGGTCACAGGATGG
GAAAGTGATCATATGGACTGTGGGGAAAGAAGGTGAGCAGTGGGAAGGTAAGGTTCTGGA
GGACTTTATGACTCCGGTGTGGCGGGTGTCGTGGTCGTTGACCGGGAACATGTTGGCTGT
GTCCGATGGGAACAACAACGTGACGGTGTGGAAGGAGGCTGTTGATGGGGAGTGGGAACA
AGTCACCGTTCTGGAATGAGATGTTTCGCTATTTCCTTTACTGAATTGAAGTCTTTTTTT
AAAAGGATCTTTTTTCTCAGGCTGGTTTGGTGGTCTATCTGAGGGAATGTGGATGTGGTT
TTTTTCTTAATTTGGGTTTGGAACATTATGGACATTTTTCATCTTTCCTAGCGACTTGTT
CTTTTGTTTTATCCTTTTGAAAAGACCATCTTCATGAGATATATTATCTTAGTTTTAAAC
TG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2H990TF U 261
AF RR2H247TF U 1
AF RR2H247JQ C 590
BS 1 413 RR2H247TF
BS 414 414 RR2H990TF
BS 415 520 RR2H247TF
BS 521 521 RR2H990TF
BS 522 669 RR2H247TF
BS 670 1262 RR2H247JQ

RD RR2H990TF 278 0 0
G
GGTGGATCCCAGCACCTAGCTACATTAACCGGTCACCGTGGTCCTGTCTGGCAGGTCGCG
TGGGCCCACCCTAAGTTCGGGTCATTCCTTGCTTCATGCTCCTATGACGGTCAGGTCATA
CTCTGGAAAGAAGGCAACCAAAACCAATGGACCCAAGCTCATGTCTTCACGGACCATAAA
TCTTCGGTCAACTCCATTGCTTGGGCTCCTCATGACCTCGGACTATCCTTGGCTTGTGGG
TCATCCGATGGAAACATTTTCGGTATTCACAGGCCGT

QA 2 278 2 278
DS 

RD RR2H247TF 669 0 0
AAAAAAAAACTATCGATTGCTTCCTTCCTCCTAGCGTTTTCTCCTCTGTCGATCTTCTTC
TTCTTCAACTCACACTCCGGCGTCTATTAGTCTACCAACCGCGCCTTCAGAGGAAAAAGT
CATTTTGGAAACATGCCGGGTCAGAAGATTGAAACAGGTCATGAGGACATGGTCCATGAC
GTGCAGATGGATTACTACGGGAAGCGAGTTGCAACTGCCTCGTCTGACTGCACCATCAAG
ATAACCGGCGTCAGCAACAACGGTGGATCCCAGCACCTAGCTACATTAACCGGCCACCGT
GGTCCTGTCTGGCAGGTCGCGTGGGCCCACCCTAAGTTCGGGTCATTCCTTGCTTCATGC
TCCTATGACGGTCAGGTCATACTCTGGAAAGAAGGCAACCAAAACCAATGGACTCAAGCT
CATGTCTTCACGGACCATAAATCTTCGGTCAACTCCATTGCTTGGGCTCCTCATGACCTC
GGACTATCCTTGGCTTGTGGGTCATCCGATGGAAACATTT*CGGTATTCACAGGCCGTGC
TGATGGTGGCTGGGACACCACGAAGATAGACCAAGCGCATCCGGTTGGAGTCACTTCTGT
CCCATGGGCACCAGTTACTGCGCCCGGTGCTCTTGTGAGCTCTGGCTTGCTCGATCCGGT
TTACAAGCT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2H247JQ 673 0 0
GTCACTTCTGTCCCATGGGCACCAGTTACTGCGCCCGGTGCTCTTGTGAGCTCTGGCTTG
CTCGATCCGGTTTACAAGCTGGCTTCTGGTGGGTGTGATAATACAGTGAAAGTGTGGAAG
CTCTCAAACGGGTCGCGGAAGATGGATTGCTTTCCGGCTCTTCAGAAGCACACGGATTGG
GTCCGTGATGTGGCTTGGGCACCCAACTTGGGTCTTCCTAAGTCCACCATAGCCAGTGGG
TCACAGGATGGGAAAGTGATCATATGGACTGTGGGGAAAGAAGGTGAGCAGTGGGAAGGT
AAGGTTCTGGAGGACTTTATGACTCCGGTGTGGCGGGTGTCGTGGTCGTTGACCGGGAAC
ATGTTGGCTGTGTCCGATGGGAACAACAACGTGACGGTGTGGAAGGAGGCTGTTGATGGG
GAGTGGGAACAAGTCACCGTTCTGGAATGAGATGTTTCGCTATTTCCTTTACTGAATTGA
AGTCTTTTTTTAAAAGGATCTTTTTTCTCAGGCTGGTTTGGTGGTCTATCTGAGGGAATG
TGGATGTGGTTTTTTTCTTAATTTGGGTTTGGAACATTATGGACATTTTTCATCTTTCCT
AGCGACTTGTTCTTTTGTTTTATCCTTTTGAAAAGACCATCTTCATGAGATATATTATCT
TAGTTTTAAACTG

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL2315Contig1 1008 2 2 U
GGAGATCATAACAGGAGTTGCTCGAGGACTGCTCTATCTCCACGAGGACGCGCCTAACTG
CATTATCCACAGAGACATTAAGGCTGGTAACATTTTGCTTGATGAGAAATGGGTTCCTAA
GATTGCGGATTTTGGGATGGCTAGGCTCTTTCAGGAGGACGCGACACACGTCAACACTCG
CGTCGCTGGAACCAATGGCTACATGGCGCCGGAGTATGTAATGAACGGTGTTCTATCGGT
AAAAGCAGACGTGTTCAGCTTTGGTGTTGTGGTTCTAGAGCTCATCAGTGGCCAGAAGAA
CTCGAGTTTTAGTCTGAAACACGCTGACCAGACTCTTCTTGAATGGGCATATAGATTGTA
CAAGAAAGGCAGGACGATGGTGATGGTAGACTCGGGTATAGCAGCTTCAGCTGATCCAGA
ACAAGTGAGACTCTGCGTTCAGATCGGACTGCTATGCGTACAAGGCGATCCCCACCAGAG
ACCAGCAATGAGAAGAGTGTCTTTGCTTCTCTCGAGAAAACCAGGGAATCTGGAAGAACC
AGAGCGTCCCGGTGTCCCGGGGTCTAGATACCGCCGTAGAACGCATCATCGTCCATCAGG
AGGAGCATCCTCGGTTGGGACATTGTCGACGACGGGATCGAGTTCAGATTCGTTTGGTTC
GAACTTGAACACAAACAGTGGAACCGGGACAGGTGGAGCTGCTACTCCAGCGTCTTCCAG
GACACCGACAAGGGCTCCTCACAACGCAACTAGAAGTGCAGGTGTCAGCTCTAGCTCGGA
CCCTCATGGTAAACGACCTATGACGAGTTATTAAAAAGAGTAGATGATATCTTTGTTTAC
ATGTTTGATTGTATATAGCGAGCCCCTTTTTTGTTTTGTTTGAAAAGTAAAATTATTGTT
GTTAGAGGAGAGGGTTTTAGATTTAGTAATGTGTGAGAAAGAAGAAGAAATGTTCATTCA
TTTGTTATTTACATTGTTAGTATATATTAAAAAATAAAATCCCTCGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG91TF U 1
AF RR2FG91JQ C 450
BS 1 687 RR2FG91TF
BS 688 1008 RR2FG91JQ

RD RR2FG91TF 688 0 0
GGAGATCATAACAGGAGTTGCTCGAGGACTGCTCTATCTCCACGAGGACGCGCCTAACTG
CATTATCCACAGAGACATTAAGGCTGGTAACATTTTGCTTGATGAGAAATGGGTTCCTAA
GATTGCGGATTTTGGGATGGCTAGGCTCTTTCAGGAGGACGCGACACACGTCAACACTCG
CGTCGCTGGAACCAATGGCTACATGGCGCCGGAGTATGTAATGAACGGTGTTCTATCGGT
AAAAGCAGACGTGTTCAGCTTTGGTGTTGTGGTTCTAGAGCTCATCAGTGGCCAGAAGAA
CTCGAGTTTTAGTCTGAAACACGCTGACCAGACTCTTCTTGAATGGGCATATAGATTGTA
CAAGAAAGGCAGGACGATGGTGATGGTAGACTCGGGTATAGCAGCTTCAGCTGATCCAGA
ACAAGTGAGACTCTGCGTTCAGATCGGACTGCTATGCGTACAAGGCGATCCCCACCAGAG
ACCAGCAATGAGAAGAGTGTCTTTGCTTCTCTCGAGAAAACCAGGGAATCTGGAAGAACC
AGAGCGTCCCGGTGTCCCGGGGTCTAGATACCGCCGTAGAACGCATCATCGTCCATCAGG
AGGAGCATCCTCGGTTGGGACATTGTCGACGACGGGATCGAGTTCAGATTCGTTTGGTTC
GAACTTGAACACAAACAGTGGAACCGG
G

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2FG91JQ 559 0 0
TGCTATGCGTACAAGGCGATCCCCACCAGAGACCAGCAATGAGAAGAGTGTCTTTGCTTC
TCTCGAGAAAACCAGGGAATCTGGAAGAACCAGAGCGTCCCGGTGTCCCGGGGTCTAGAT
ACCGCCGTAGAACGCATCATCGTCCATCAGGAGGAGCATCCTCGGTTGGGACATTGTCGA
CGACGGGATCGAGTTCAGATTCGTTTGGTTCGAACTTGAACACAAACAGTGGAACCGGGA
CAGGTGGAGCTGCTACTCCAGCGTCTTCCAGGACACCGACAAGGGCTCCTCACAACGCAA
CTAGAAGTGCAGGTGTCAGCTCTAGCTCGGACCCTCATGGTAAACGACCTATGACGAGTT
ATTAAAAAGAGTAGATGATATCTTTGTTTACATGTTTGATTGTATATAGCGAGCCCCTTT
TTTGTTTTGTTTGAAAAGTAAAATTATTGTTGTTAGAGGAGAGGGTTTTAGATTTAGTAA
TGTGTGAGAAAGAAGAAGAAATGTTCATTCATTTGTTATTTACATTGTTAGTATATATTA
AAAAATAAAATCCCTCGGC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 4

CO CL2316Contig1 993 4 3 U
CGAAATTTATTGGTTAAACCAGTATTATTAAAACTGAACCAATTACAAACGAAAACCTGA
AACCCAAGTACACCAGATCAGCACACAAAAGGCAACAAGATCTGCATACAAAAGATAGGT
ATTCAAAGCAAAAGTTTTATCACAAAGTTCCGCAGCATCGAAAAACGATATAACCGACCA
GAGAAATATCCTTTTCTAATGGGACTGACAGGCAAATCACTCCAGCTTAACTCCGTAGAC
TCATATCTAATGGGGCTGAAAAAGCAACTTCTCTTTTGGATCTTTGTTCTGACTTAGCGG
AAAAAAAGTGGAACAGATCGTTTAGGTACTTTGCCTTCCAGCTTAAGTCTCCTATAAGAC
TCTCTGATATGGCAAGGTCTGATAGGTCCTGAGTCGTTCCTTTCCCCCATTACAACTCTA
GCTGTTTCCACTAGTTCACCAACAAACATCTTCGCTATACCACAGTTCACAATTATAACT
GGCATACTGATCTTCTGACTCCCTGTCACTCCCTGTAATAACTTCCTCATGTTTCCTTTT
TGAAATGCAGATCTCCTAAAAGATTCATATCTGCTCATTTGATCCTCAGTGAACTGCGAC
AAAATGACCTGCATCTTAGCCATCTTAGCGGGATCAACAGTAGTTGGATACTTGGTTAAC
TCAGCTTCCATATTCTCTTCCTCCTCTTCTTCATCTTCATCTTTGTTCTTCCCTTCAGCA
ACAACAACAACGGAGGAGGAGGTTTTAGACTTCTTGCTCTGACGGCGAACACCACCCACG
TCTCTCTCACTCTCCTCCGGAGCCTGGTCCATTTCAATCCGTCCCTCTTCATCGCCTCCG
CCTCCGGGTGATTCCGGCGGTGATTCGTCTTGCTCCTCCTCCTCCTCTATCGCTGCTTCA
AACGGATCCTTCGAATGCTTCATTTTTTCCTGAAAACCTTTGATACTCGGATCCGATTTT
CAAGAGGCCCGCAGCGCAACTGGGAAGCTCCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F668JQ U 1
AF RR2F668TF C 1
AF RR2ED25JQ U 12
AF RR2ED25TF C 399
BS 1 259 RR2F668JQ
BS 260 531 RR2ED25JQ
BS 532 993 RR2ED25TF

RD RR2F668JQ 263 0 0
CGAAATTTATTGGTTAAACCAGTATTATTAAAACTGAACCAATTACAAACGAAAACCTGA
AACCCAAGTACACCAGATCAGCACACAAAAGGCAACAAGATCTGCATACAAAAGATAGGT
ATTCAAAGCAAAAGTTTTATCACAAAGTTCCGCAGCATCGAAAAACGATATAACCGACCA
GAGAAATATCCTTTTCTAATGGGACTGACAGGCAAATCACTCCAGCTTAACTCCGTAGAC
TCATATCTAATGGGGCTGA
AAAA

QA 1 259 1 259
DS 

RD RR2F668TF 268 0 0
CGAAATTTATTGGTTAAACCAGTATTATTAAAACTGAACCAATTACAAACGAAAACCTGA
AACCCAAGTACACCAGATCAGCACACAAAAGGCAACAAGATCTGCATACAAAAGATAGGT
ATTCAAAGCAAAAGTTTTATCACAAAGTTCCGCAGCATCGAAGAACGATATAACCGACCA
GAGAAATATCCTTTTCTAATGGGACTGACAGGCAAATCACTCCAGCTTAACTCCGTAGAC
TCATATCTAATGGGGCTGA
GAAAGCAAC

QA 1 259 1 259
DS 

RD RR2ED25JQ 520 0 0
GGTTAAACCAGTATTATTAAAACTGAACCAATTACAAACGAAAACCTGAAACCCAAGTAC
ACCAGATCAGCACACAAAAGGCAACAAGATCTGCATACGAAAGATAGGTATTCAAAGCAA
AAGTTTTATCACAAAGTTCCGCAGCATCGAAAAACGATATAACCGACCAGAAAAATATCC
TTT*CTAATGGGACTGACAGGCAAATCACTCCAG*TTAACTCCGTAAACTTATATCTAAC
GGGGCTGAAAAAGCAACTTCTCTTTTGGATCTTTGTTCTGACTTAGCGGAAAAAAAGTGG
AACAGATCGTTTAGGTACTTTGCCTTCCAGCTTAAGTCTCCTATAAGACTCTCTGATATG
GCAAGGTCTGATAGGTCCTGAGTCGTTCCTTTCCCCCATTACAACTCTAGCTGTTTCCAC
TAGTTCACCAACAAACATCTTCGCTATACCACAGTTCACAATTATAACTGGCATACTGAT
CTTCTGACTCCCTGTCACTCCCTGTAATAACTTCCTCATG

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2ED25TF 595 0 0
CCTTTCCCCCATTACAACTCTAGCTGTTTCCACTAGTTCACCAACAAACATCTTCGCTAT
ACCACAGTTCACAATTATAACTGGCATACTGATCTTCTGACTCCCTGTCACTCCCTGTAA
TAACTTCCTCATGTTTCCTTTTTGAAATGCAGATCTCCTAAAAGATTCATATCTGCTCAT
TTGATCCTCAGTGAACTGCGACAAAATGACCTGCATCTTAGCCATCTTAGCGGGATCAAC
AGTAGTTGGATACTTGGTTAACTCAGCTTCCATATTCTCTTCCTCCTCTTCTTCATCTTC
ATCTTTGTTCTTCCCTTCAGCAACAACAACAACGGAGGAGGAGGTTTTAGACTTCTTGCT
CTGACGGCGAACACCACCCACGTCTCTCTCACTCTCCTCCGGAGCCTGGTCCATTTCAAT
CCGTCCCTCTTCATCGCCTCCGCCTCCGGGTGATTCCGGCGGTGATTCGTCTTGCTCCTC
CTCCTCCTCTATCGCTGCTTCAAACGGATCCTTCGAATGCTTCATTTTTTCCTGAAAACC
TTTGATACTCGGATCCGATTTTCAAGAGGCCCGCAGCGCAACTGGGAAGCTCCCC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

CO CL2317Contig1 689 2 15 U
GGTCTTCACATTATTGAGCTTTATATTGAGTTGAGTCTTTACATAAACTATTAAGAAGAG
AATACAAGAAAGGGTTCACAGAACCAAGAAATCAAATCATTTACAGTTCTAAGTGATCAT
TAATTAGGCATATTAGCAATTGAAAACCCGTCTGGGTTGTCCACTGAGCATTCCTGGAAA
AGCAGCAACCTCGCTTGTCACAACTTCACTTATCAAGCCCTTGAAGATTAGCCTCTCAAT
GTCTAACACTAACCCTGGTGTCTCTCCTTCAATCTCCTTCCAGTTCATGCCCTGGCTTTG
CAAGTCCTCCCAAAAAAGGTCTTCGTCGTCTTCATCCAAGATACATTTTGAGTTATCTTG
TAATCGATCAATCTCTGAACACATAGTTTTCAGAAGTTCTTTCCCTTTTGAACTTTTGTT
TGTTGTCCTTAGCTGGCTGATTGATGTTGTTATGTATGGTTGTTGCTTCGTACACCCTTC
TGCTGTGAATTTGCGAGCTAAGATCTCGTTTATGGTGTCAAATACAAGCTTCCTCCTGCT
TCTCTCTATCAGGTTCGCCGTCTGTTGTTGTCCGAATCCTATGCCTCTATGTTTGATGTC
ATGTTGAGTCACATTACTTGTCTTGCTCTGTTCCAGGACAAAGAAAAGGCTTGGATTGAT
TGGTAGGTGTGCTTGGTGCAGCTGAATGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM89JQ U 1
AF RR2AH44JQ U 1
BS 1 178 RR2AH44JQ
BS 179 179 RR2CM89JQ
BS 180 217 RR2AH44JQ
BS 218 218 RR2CM89JQ
BS 219 269 RR2AH44JQ
BS 270 270 RR2CM89JQ
BS 271 291 RR2AH44JQ
BS 292 292 RR2CM89JQ
BS 293 342 RR2AH44JQ
BS 343 343 RR2CM89JQ
BS 344 525 RR2AH44JQ
BS 526 526 RR2CM89JQ
BS 527 547 RR2AH44JQ
BS 548 548 RR2CM89JQ
BS 549 689 RR2AH44JQ

RD RR2CM89JQ 646 0 0
GGTCTTCACATTATTGAGCTTTATATTGAGTTGAGTCTTTACATAAACTATTAAGAAGAG
AATACAAGAAAGGGTTCACAGAACCAAGAAATCAAATCATTTACAGTTCTAAGTGATCAT
TAATTAGGCATATTAGCAATTGAAAACCCGTCTGGGTTGTCCACTGAGCATTCCTGGAAA
AGCAGCAACCTCGCTTGTCACAACTTCACTTATCAAGCCCTTGAAGATTAGCCTCTCAAT
GTCTAACACTAACCCTGGTGTCTCTCCTTCAATCTCCTTCCAGTTCATGCTCTGGCTTTG
CAAGTCCTCCCAAAAAAGGTCTTCGTCGTCTTCATCCAAGATACATTTTGAGTTATCTTG
TAATCGATCAATCTCTGAACACATAGTTTTCAGAAGTTCTTTCCCTTTTGAACTTTTGTT
TGTTGTCCTTAGCTGGCTGATTGATGTTGTTATGTATGGTTGTTGCTTCGTACACCCTTC
TGCTGTGAATTTGCGAGCTAAGATCTCGTTTATGGTGTCAAATACAAGCTTCCTCCTGCT
TCTCTCTATCAGGTTCGCCGTCTGTTGTTGTCCGAATCCTATGCCTCTATGTTTGCTGTC
ATGTTGAGTCACATTACTTGTCTTGCTCTGTTCCAGGACAAA
AAAA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2AH44JQ 689 0 0
GGTCTTCACATTATTGAGCTTTATATTGAGTTGAGTCTTTACATAAACTATTAAGAAGAG
AATACAAGAAAGGGTTCACAGAACCAAGAAATCAAATCATTTACAGTTCTAAGTGATCAT
TAATTAGGCATATTAGCAATTGAAAACCCGTCTGGGTTGTCCACTGAGCATTCCTGGAGA
AGCAGCAACCTCGCTTGTCACAACTTCACTTATCAAGTCCTTGAAGATTAGCCTCTCAAT
GTCTAACACTAACCCTGGTGTCTCTCCTTTAATCTCCTTCCAGTTCATGCCTTGGCTTTG
CAAGTCCTCCCAAAAAAGGTCTTCGTCGTCTTCATCCAAGATGCATTTTGAGTTATCTTG
TAATCGATCAATCTCTGAACACATAGTTTTCAGAAGTTCTTTCCCTTTTGAACTTTTGTT
TGTTGTCCTTAGCTGGCTGATTGATGTTGTTATGTATGGTTGTTGCTTCGTACACCCTTC
TGCTGTGAATTTGCGAGCTAAGATCTCGTTTATGGTGTCAAATACGAGCTTCCTCCTGCT
TCTCTCTGTCAGGTTCGCCGTCTGTTGTTGTCCGAATCCTATGCCTCTATGTTTGATGTC
ATGTTGAGTCACATTACTTGTCTTGCTCTGTTCCAGGACAAAGAAAAGGCTTGGATTGAT
TGGTAGGTGTGCTTGGTGCAGCTGAATGC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 4

CO CL2318Contig1 1598 4 6 U
ACTCATATAGTCCTCCGATTATCAAATGTATACATAGATATAAACACAAAGCCTATGGCT
TTTATTCAGATTAAACAATGGCAATAGAATTATTTTTTAAAAAAACGGTGAGCCTTAACA
AAATCATTACAAAACTCACCGATTATTCATTAAATAAATCTCAAGTGAACACGCACTAAT
ACTTGATGTAAGCAACAGAAGAAGTGTTGGCGTCTTTGATGAGTGTACCAAGAAGAGGAG
CGATCAAACACTTCTTGTCCTTCTCCTTGTAGAAGTAACCCAAACATTTGCAATCACGGT
CGCACTTAGCCTTGCAATCGTCTACAGAAGTTGGGCCTTGTCCATCATTAACATAAGGCC
CAGTAAAATGCTCAACGCCGACGATCTTGTAGTAATTCACGGCCTTACTTTTTCCTCCGC
TGCAAAACTGCGTCGTTTTAGGTGGTGAACATTGGTCGCTCCATCCGAGTAACCCTTTGG
GTGTAGGGCACGCAACGCACATTCCACGGTCGCAATAACCGTAGTCACCGCAGAACGACG
GTAAGCCGCATTGTCTGACGAAGTAAGTGGAGAAGAAAGAGAAGGACTCTTCCCATGTGA
GGTACGTTGCTGGGTCGAACCACGAGAAGGCCTTGAGGCTACCGTCGGAGCCGAGTCTGA
GATATGAGATGGTTCCGTTGTAGTTGATCTTGTTCAGGTTTAGAGTTCCATCTCCGCTTC
CAATTGGTCGGGATTGGAGTAAACGACGGTTGTTACCTGGATTAGTTGTTGTTGGTTGTG
GTGCGGGTTCTAGGAGGAGCTCATAAGCTGACGGCTCCGTTAAGTTGTCGAACTCTCTTC
TAACGGCGAACGTTACGGTGCCGCGGAAGTCGTGGTTGGGCCATCCGCCGTATACTAACG
GCTGTCCTGTTTTGTTAACGTACATGGTCAAGCCTTTGGTGTCAAGAACCATGCTGTAGG
GACCATCCGAGCCGTCCATGTCGGATTTACGGCTGACGAGTTTGTTAGGTCCGTTGACTT
TAAGCGATTGTCCGGTGAGGAGTGTGTCGGTGGGGTGGTCAAAGCTCTGCCAAACAAACT
TGCCGTTTTTGTCGTGTAGCACGATGTTACCGTTGGGTAAGATTTGGAATCCTGTGACGC
CTTTGTTGGCCGTGTTGGTCTGCCACTTGACTCGTCCGTTTGACTCGGCAAGGACTAGGT
TACCGTTGCGTCCGAATGAGAGAGTTGCGTTTTCACCTACGGGGTTGTTACGGTTCGCGT
CCCAGATCCAACGCATGAGTGACTCCTCGCTTCTGAGCCCAACACGGAGGGCTAAGACGT
AGGCACTAGGGGTGGTGTTGTAGAACAAGAGCTGGAACGGTCTTGTGAAGAAGCTCGCGT
TGGGTGAGTTGATGAATCTGTAGCTAGCGTCGTACTCGGTGATGTATTCGCCGAACTCGC
CTTCGTTTACGACTCTGAACTGTTTCTCTGGTGGGACTTGGGCTGTGACCAATGAGACAG
TGGCAATGGCGAGTGCCACGATTACAAACCGAAGCATGATTGGTTTGGCCATTTCTTTTG
TGTTACTGAGATTGAGTGGTGGTGGAAGTGTGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E973JQ U 1
AF RR2CB72JQ U 73
AF RR2E973TF C 522
AF RR2CB72TF C 850
BS 1 104 RR2E973JQ
BS 105 105 RR2CB72JQ
BS 106 565 RR2E973JQ
BS 566 789 RR2CB72JQ
BS 790 1148 RR2E973TF
BS 1149 1598 RR2CB72TF

RD RR2E973JQ 565 0 0
ACTCATATAGTCCTCCGATTATCAAATGTATACATAGATATAAACACAAAGCCTATGGCT
TTTATTCAGATTAAACAATGGCAATAGAATTATTTTTTAAAAAA*CGGTGAGCCTTAACA
AAATCATTACAAAACTCACCGATTATTCATTAAATAAATCTCAAGTGAACACGCACTAAT
ACTTGATGTAAGCAACAGAAGAAGTGTTGGCGTCTTTGATGAGTGTACCAAGAAGAGGAG
CGATCAAACACTTCTTGTCCTTCTCCTTGTAGAAGTAACCCAAACATTTGCAATCACGGT
CGCACTTAGCCTTGCAATCGTCTACAGAAGTTGGGCCTTGTCCATCATTAACATAAGGCC
CAGTAAAATGCTCAACGCCGACGATCTTGTAGTAATTCACGGCCTTACTTTTTCCTCCGC
TGCAAAACTGCGTCGTTTTAGGTGGTGAACATTGGTCGCTCCATCCGAGTAACCCTTTGG
GTGTAGGGCACGCAACGCACATTCCACGGTCGCAATAACCGTAGTCACCGCAGAACGACG
GTAAGCCGCATTGTCTGACGAAGTA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2CB72JQ 717 0 0
AAACAATGGCAATAGAATTATTTTTTAAAAAAACGGTGAGCCTTAACAAAATCATTACAA
AACTCACCGATTATTCATTAAATAAATCTCAAGTGAACACGCACTAATACTTGATGTAAG
CAACAGAAGAAGTGTTGGCGTCTTTGATGAGTGTACCAAGAAGAGGAGCGATCAAACACT
TCTTGTCCTTCTCCTTGTAGAAGTAACCCAAACATTTGCAATCACGGTCGCACTTAGCCT
TGCAATCGTCTACAGAAGTTGGGCCTTGTCCATCATTAACATAAGGCCCAGTAAAATGCT
CAACGCCGACGATCTTGTAGTAATTCACGGCCTTACTTTTTCCTCCGCTGCAGAACTGCG
TCGTTTTAGGTGGTGAACATTGGTCGCTCCATCCGAGTAACCCTTTGGGTGTAGGGCACG
CAACGCACATTCCACGGTCGCAATAACCGTAGTCACCGCAAAACGACGGTAAGCCGCATT
GTCTGACGAAGTAAGTGGAGAAGAAAGAGAAGGACTCTTCCCATGTGAGGTACGTTGCTG
GGTCGAACCACGAGAAGGCCTTGAGGCTACCGTCGGAGCCGAGTCTGAGATATGAGATGG
TTCCGTTGTAGTTGATCTTGTTCAGGTTTAGAGTTCCATCTCCGCTTCCAATTGGTCGGG
ATTGGAGTAAACGACGGTTGTTACCTGGATTAGTTGTTGTTGGTTGTGGTGCGGGTT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2E973TF 628 0 0
TAGTCACCGCAGAACGACGGTAAGCCGCATTGTCTGACGAAGTAAGTGGAGAAGAAAGAG
AAGGACTCTTCCCATGTGAGGTACGTTGCTGGGTCGAACCACGAGAAGGCCTTGAGGCTA
CCGTCGGAGCCGAGTCTGAGATATGAGATGGTTCCGTTGTAGTTGATCTTGTTCAGGTTT
AGAGTTCCATCTCCGCTTCCAATTGGTCGGGATTGGAGTAAACGACGGTTGTTACCTGGA
TTAGTTGTTGTTGGTTGTGGTGCGGGTTCTAGGAGGAGCTCATAAGCTGACGGCTCCGTT
AAGTTGTCGAACTCTCTTCTAACGGCGAACGTTACGGTGCCGCGGAAGTCGTGGTTGGGC
CATCCGCCGTATACTAACGGCTGTCCTGTTTTGTTAACGTACATGGTCAAGCCTTTGGTG
TCAAGAACCATGCTGTAGGGACCATCCGAGCCGTCCATGTCGGATTTACGGCTGACGAGT
TTGTTAGGTCCGTTGACTTTAAGCGATTGTCCGGTGAGGAGTGTGTCGGTGGGGTGGTCA
AAGCTCTGCCAAACAAACTTGCCGTTTTTGTCGTGTAGCACGATGTTACCGTTGGGTAAG
ATTTGGAATCCTGTGACGCCTTTGTTG
C

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2CB72TF 749 0 0
ACGTTACGGTGCCGCG*AAGTCGTGGTTGGGCCATCCGCCGTATACTAACGGCTGTCCTG
TTT*GTTAACGTACATGGTCAAGC*TTTGGTGTCAAGAACCATGCTGTAGGGGCCATCCG
AGCCGTCCATGTCGGATTTACGGCTGACGAGTTTGTTAGGTCCGTTGACTTTAAGCGATT
GTCCGGTGAGGAGTGTGTCGGTGGGGTGGTCAAAGCTCTGCCAAACAAACTTGCCGTTTT
TGTCGTGTAGCACGATGTTACCGTTGGGTAAGATTTGGAATCCTGTGACGCCTTTGTTGG
CCGTGTTGGTCTGCCACTTGACTCGTCCGTTTGACTCGGCAAGGACTAGGTTACCGTTGC
GTCCGAATGAGAGAGTTGCGTTTTCACCTACGGGGTTGTTACGGTTCGCGTCCCAGATCC
AACGCATGAGTGACTCCTCGCTTCTGAGCCCAACACGGAGGGCTAAGACGTAGGCACTAG
GGGTGGTGTTGTAGAACAAGAGCTGGAACGGTCTTGTGAAGAAGCTCGCGTTGGGTGAGT
TGATGAATCTGTAGCTAGCGTCGTACTCGGTGATGTATTCGCCGAACTCGCCTTCGTTTA
CGACTCTGAACTGTTTCTCTGGTGGGACTTGGGCTGTGACCAATGAGACAGTGGCAATGG
CGAGTGCCACGATTACAAACCGAAGCATGATTGGTTTGGCCATTTCTTTTGTGTTACTGA
GATTGAGTGGTGGTGGAAGTGTGAGATCC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 3

CO CL2319Contig1 869 3 5 U
GGCCTTAACTAAATTACTCTGTAACCAAATCAAATGTAGTTCGGTTGAGTTTGCCTGATT
CAAAGTAATCAAACCGAACCGAACATGTTTGAACTACATTACAAGTATTTTTCCATTACA
AGTTTTAAACAAAATTGGAATCATGGATTCCAACAGAAGTACAAAACTTAAATCATCTCA
GGTCTAGCGAAGCAGATCATAATGGTTTCTACCACTGTAAAGAAGCCTAACAACATTCCT
GGTCTTGTTCCCTTTTCCCCATCCTCCTCTAAACTCAGCTCCATACTCTGCAATTGGTAT
AAACCCCGACCCATACCCTCCTCCTCTCCTATGCTCATGCTCTGGTATGTAGACGATGAT
TGGCTGTTTACATAGCTTGGAAAGAACTAGCAGCTCAGACTCTCCTCCCCAGAAATCATG
TCTTCCGATCCGCTGACAATACCGTTTCAGAGACTCTTCCACAGTGATAGCTATTAAAGC
TTCTTTGTACTTCTCCCTTTCCTTGGGGTCATTGCATATAACCTCTTTCACAGCCATTCG
TAGTTCATCTGCATCATCTCTCTCTCTCCGGGGATTGATAGTAAGTCCTTTGTTAAAGGC
CATTCCTTTCACCAAAGCTCTAAAGAGACAGCGACCATCCCCAGTAACTCTATCCACCGC
GTACTGCTCAACCTTCTTTGCTGCCGGAGACCCATTTAAGGAGGAACCGATTCTGGCGAA
GAAGGCATAGCTATTGCTCTGCGTGGCGCCTAAGAAGGAAGCAGAGGAGATTGAAGGAGT
ACTAGGGGAGGACACAAGCTCGAACCTAGCGAGGCCATGTCTCAGCTGCTCAAGAATCTT
ATTGTTCGAAGGTTTTAGCTCTTCCATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY18JQ U 1
AF RR2F719JQ U 67
AF RR2F719TF C 246
BS 1 163 RR2GY18JQ
BS 164 164 RR2F719JQ
BS 165 169 RR2GY18JQ
BS 170 781 RR2F719JQ
BS 782 869 RR2F719TF

RD RR2GY18JQ 169 0 0
GGCCTTAACTAAATTACTCTGTAACCAAATCAAATGTAGTTCGGTTGAGTTTGCCTGATT
CAAAGTAATCAAACCGAACCGAACATGTTTGAACTACATTACAAGTATTTTTCCATTACA
AGTTTTAAACAAAATTGGAATCATGGATTCCAACAGAAGTACAGAACTT

QA 1 169 1 169
DS 

RD RR2F719JQ 715 0 0
AG
TCAAACCGAACCGAACATGTTTGAACTACATTACAAGTATTTTTCCATTACAAGTTTTAA
ACAAAATTGGAATCATGGATTCCAACAGAAGTACAAAACTTAAATCATCTCAGGTCTAGC
GAAGCAGATCATAATGGTTTCTACCACTGTAAAGAAGCCTAACAACATTCCTGGTCTTGT
TCCCTTTTCCCCATCCTCCTCTAAACTCAGCTCCATACTCTGCAATTGGTATAAACCCCG
ACCCATACCCTCCTCCTCTCCTATGCTCATGCTCTGGTATGTAGACGATGATTGGCTGTT
TACATAGCTTGGAAAGAACTAGCAGCTCAGACTCTCCTCCCCAGAAATCATGTCTTCCGA
TCCGCTGACAATACCGTTTCAGAGACTCTTCCACAGTGATAGCTATTAAAGCTTCTTTGT
ACTTCTCCCTTTCCTTGGGGTCATTGCATATAACCTCTTTCACAGCCATTCGTAGTTCAT
CTGCATCATCTCTCTCTCTCCGGGGATTGATAGTAAGTCCTTTGTTAAAGGCCATTCCTT
TCACCAAAGCTCTAAAGAGACAGCGACCATCCCCAGTAACTCTATCCACCGCGTACTGCT
CAACCTTCTTTGCTGCCGGAGACCCATTTAAGGAGGAACCGATTCTGGCGAAGAAGGCAT
AGCTATTGCTCTGCGTGGCGCCTAAGAAGGAAGCAGAGGAGATTGAAGGAGTA

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR2F719TF 624 0 0
TTG
TCCCTTTTCCCCATCCTCCTCTAAACTCAGCTCCATACTCTGCAATTGGTATAAACCCCG
ACCCATACCCTCCTCCTCTCCTATGCTCATGCTCTGGTATGTAGACGATGATTGGCTGTT
TACATAGCTTGGAAAGAACTAGCAGCTCAGACTCTCCTCCCCAGAAATCATGTCTTCCGA
TCCGCTGACAATACCGTTTCAGAGACTCTTCCACAGTGATAGCTATTAAAGCTTCTTTGT
ACTTCTCCCTTTCCTTGGGGTCATTGCATATAACCTCTTTCACAGCCATTCGTAGTTCAT
CTGCATCATCTCTCTCTCTCCGGGGATTGATAGTAAGTCCTTTGTTAAAGGCCATTCCTT
TCACCAAAGCTCTAAAGAGACAGCGACCATCCCCAGTAACTCTATCCACCGCGTACTGCT
CAACCTTCTTTGCTGCCGGAGACCCATTTAAGGAGGAACCGATTCTGGCGAAGAAGGCAT
AGCTATTGCTCTGCGTGGCGCCTAAGAAGGAAGCAGAGGAGATTGAAGGAGTACTAGGGG
AGGACACAAGCTCGAACCTAGCGAGGCCATGTCTCAGCTGCTCAAGAATCTTATTGTTCG
AAGGTTTTAGCTCTTCCATGG

QA 4 624 4 624
DS 



AS 1 4

CO CL2320Contig1 1031 4 6 U
GGGTCCTTATCTTCTTCTTCCCAGATTTCCTCCAAACTGTGCAAAACTTTCATCTCCAAC
TCATCTCCTTCTTCGAGTGTTTAGAAACGTTTCTCGTTAGGTGATTCAACGAAGAGAAAG
AGAGGGGGCCGTCAATGACCTCGCTACTCCTCCCCAGGACGCTCCCCCTCCTCCTCAACG
GTTTTCTCAACCGCCGTCATCAATTCAGCATCGCATCATCATCGGCGTGTTTCCTCTCTC
GCCGGCGCCGTCTGTTGTCGTGTTGTTCTCTTGCTGATAAACCGCAGTTTCGAGAGGAGG
ATGATTCTCCCGTGAACGTGAAGAACTCGACGGCGCCTGTTGATGACGAGAGCTGGCGTT
ATGAAGATCCAGATTATCGCAAGTGGAAGAACCTTGAGGCGGAGATACTCGGAGACGTCG
AACCTATAGCTCTTCTCGCTAAAGATATTCTTCACTCCGATCGATATTTGGATGGGGAAC
GGTTGGACCTTGAGGATGAGAAAATAATCATGGAAAAGCTTCTTCCCTTTCACCCCTACG
CTAAAGATAAAATTGGCTGCGGTCTTGATTTTATTATGGTTGATCGGCATCCTCAGTTCA
CGCACTCGAGGTGCCTGTTTGTTGTGAGAACGGATGGTGGGTGGATAGATTTCTCCTACC
AGAAGTGTCTTCGAGCCTATGTTCGAGATAGGTATCCGTCTCACGCAGAGAGATTTATTC
GTGAACATTTTAAGCGCGCTAGTAGCTAAACCTCATTACTGGATGTTTTGTTAATCTAAC
ACCGTCCCAGTGCAACAGCGAACATTCTCATATAATTTTTGCTGCTTACCGTTAGAGAAA
GAAGTTACACAAAACGAAAACTTTCTTGTAGAAAAATTGGACTGGCTCAATCGATTGGTA
GGGCTTGAATTAATTAGGAAGAAATAATAGCAGAAGAGTAGTTTAGTGATCCGCTTATTT
TTTCATATTTGAAAACTACCATCATAGTTTCATGTAACCAAAGCTTTTTAATGGTCTCTC
CTCTTCCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2A108JQ C 71
AF RR2A108TF U 1
AF RR2GL84TF U 608
AF RR2GZ01TF U 608
BS 1 690 RR2A108TF
BS 691 691 RR2GL84TF
BS 692 771 RR2A108TF
BS 772 772 RR2GL84TF
BS 773 794 RR2A108TF
BS 795 1031 RR2GL84TF

RD RR2A108JQ 709 0 0
CTTCGAGTGTTTAGAAACGTTTCTCGTTAGGTGATTCAACGAAGAGAAAGAGAGGGGGCC
GTCAATGACCTCGCTACTCCTCCCCAGGACGCTCCCCCTCCTCCTCAACGGTTTTCTCAA
CCGCCGTCATCAATTCAGCATCGCATCATCATCGGCGTGTTTCCTCTCTCGCCGGCGCCG
TCTGTTGTCGTGTTGTTCTCTTGCTGATAAACCGCAGTTTCGAGAGGAGGATGATTCTCC
CGTGAACGTGAAGAACTCGACGGCGCCTGTTGATGACGAGAGCTGGCGTTATGAAGATCC
AGATTATCGCAAGTGGAAGAACCTTGAGGCGGAGATACTCGGAGACGTCGAACCTATAGC
TCTTCTCGCTAAAGATATTCTTCACTCCGATCGATATTTGGATGGGGAACGGTTGGACCT
TGAGGATGAGAAAATAATCATGGAAAAGCTTCTTCCCTTTCACCCCTACGCTAAAGATAA
AATTGGCTGCGGTCTTGATTTTATTATGGTTGATCGGCATCCTCAGTTCAGGCACTCGAG
GTGCCTGTTTGTTGTGAGAACGGATGGTGGGTGGATAGATTTCTCCTACCAGAAGTGTCT
TCGAGCCTATGTTCGAGATAGGTATCCGTCTCACGCAGAGAGATTTATTCGTGAACATTT
TAAGCGCGCTAGTAGCTAAACCTCATTACTGGATGTTTTGT
TAATCTAA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2A108TF 794 0 0
GGGTCCTTATCTTCTTCTTCCCAGATTTCCTCCAAACTGTGCAAAACTTTCATCTCCAAC
TCATCTCCTTCTTCGAGTGTTTAGAAACGTTTCTCGTTAGGTGATTCAACGAAGAGAAAG
AGAGGGGGCCGTCAATGACCTCGCTACTCCTCCCCAGGACGCTCCCCCTCCTCCTCAACG
GTTTTCTCAACCGCCGTCATCAATTCAGCATCGCATCATCATCGGCGTGTTTCCTCTCTC
GCCGGCGCCGTCTGTTGTCGTGTTGTTCTCTTGCTGATAAACCGCAGTTTCGAGAGGAGG
ATGATTCTCCCGTGAACGTGAAGAACTCGACGGCGCCTGTTGATGACGAGAGCTGGCGTT
ATGAAGATCCAGATTATCGCAAGTGGAAGAACCTTGAGGCGGAGATACTCGGAGACGTCG
AACCTATAGCTCTTCTCGCTAAAGATATTCTTCACTCCGATCGATATTTGGATGGGGAAC
GGTTGGACCTTGAGGATGAGAAAATAATCATGGAAAAGCTTCTTCCCTTTCACCCCTACG
CTAAAGATAAAATTGGCTGCGGTCTTGATTTTATTATGGTTGATCGGCATCCTCAGTTCA
CGCACTCGAGGTGCCTGTTTGTTGTGAGAACGGATGGTGGGTGGATAGATTTCTCCTACC
AGAAGTGTCTTCGAGCCTATGTTCGAGATATGTATCCGTCTCACGCAGAGAGATTTATTC
GTGAACATTTTAAGCGCGCTAGTAGCTAAACCTCATTACTGGATGTTTTGT*AATCTAAC
ACCGTCCCAGTGCA

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2GL84TF 424 0 0
GAGGTGCCTGTTTGTTGTGAGAACGGATGGTGGGTGGATAGATTTCTCCTACCAGAAGTG
TCTTCGAGCCTATGTTCGAGATAGGTATCCGTCTCACGCAGAGAGATTTATTCGTGAACA
TTTTAAGCGCGCTAGTAGCTAAACCTCATTACTGGATGTTTTGTTAATCTAACACCGTCC
CAGTGCAACAGCGAACATTCTCATATAATTTTTGCTGCTTACCGTTAGAGAAAGAAGTTA
CACAAAACGAAAACTTTCTTGTAGAAAAATTGGACTGGCTCAATCGATTGGTAGGGCTTG
AATTAATTAGGAAGAAATAATAGCAGAAGAGTAGTTTAGTGATCCGCTTATTTTTTCATA
TTTGAAAACTACCATCATAGTTTCATGTAACCAAAGCTTTTTAATGGTCTCTCCTCTTCC
ATCC

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR2GZ01TF 420 0 0
GAGGTGCCTGTTTGTTGTGAGAACGGATGGTGGGTGGATAGATTTCTCCTACCAGAAGTG
TCTTCGAGCCTATGTTCGAGATAGGTATCCGTCTCACGCAGAGAGATTTATTCGTGAACA
TTTTAAGCGCGCTAGTAGCTAAACCTCATTACTGGATGTTTTGTTAATCTAACACCGTCC
CAGTGCAACAGCGAACATTCTCATATAATTTTTGCTGCTTACCGTTAGAGAAAGAAGTTA
CACAAAACGAAAACTTTCTTGTAGAAAAATTGGACTGGCTCAATCGATTGGTAGGGCTTG
AATTAATTAGGAAGAAATAATAGCAGAAGAGTAGTTTAGTGATCCGCTTATTTTTTCATA
TTTGAAAACTACCATCATAGTTTCATGTAACCAAAGCTTTTTAATGGTCTCTCCTCTTCC

QA 1 420 1 420
DS 



AS 1 4

CO CL2321Contig1 1258 4 19 U
CAAATGATAATGATGATAATATCATTTCACTACTGAGGTCAATGTCACATGCACAACGTC
TTTTTGCATTAAGAGTGTGTGTTACAAAAATTACAAATAAAAATTTCACTCTCTTTGATC
GCTAAAAAAACTTCTTGTACCTTCTCCTCTCCTAGTATTATATAATATATGTGCCATCTT
GTTTTGTTTTTTTTCGCCTCTACTCTTCTAACGAATGTCTTGATGAACGGTAAAGATCAT
ACGGAGCCCATAGATGATCCACACTACAAGGCTTCCTCGAATCTAGTCTCAACCATGGCT
TCCCTTTCCCACTCCAATGAAGAAGACTTATAGGACCAGGATGCAACGTTCTACACTTCC
CTTCAAAGTTGCCCCCTCCGAGCCCATGCTGGTTCCACCGATGATCAACGGCTTTTATAT
CACCCGCGAATATAAGCAGAAACGGAGGCAATGATCCCAAGTGGTAGATCCTCCGCTGCT
TCTGAACCGTCATCCACTCTTCTACCTTCTGTGTATACATTCCTCTCCTCCATTTTCCAA
CGTCCACGACCATCACGCCCGTGTTGAAATAACACGGTCGTTTCCCTTCAAGTACTTTGA
CTAGTTCCGGGTCCGACCAGAAAGCTTTTGTGAAATAATACGTAAAGTTTGCCTGGCAGT
ACTCTAGAGCCGCGACGACTTTACCTTCCATCTCAACATGCCATAGCTTCTCTATGTCGT
CTACCACGACTAGGTCCGAGTCTAGGTATATGATCCGGTCAACGCTAGTGGGAATGATAT
CCGCCAGGTAGATTCTCGCGTAGTTTAGAGGCTGGTCTAGGGCTTCCCTGATGGATTTTG
AGATCTTGCTGCGGACTAGGCTCGGATCAAACTGATAAATCTTGAAGTTGAGGTAAGGAA
AGGTGGATTTGATGCTGGTGAAGAGATCGTTTTCGAAATGAGCGAGGGAGAGGAAATGAA
AAGAGAGGTTTTCAGGACAAGTGGAATGTTGAAGGAGAGACAAGACAGCAGCCATTGTTC
CACGGAGGTAGTTTGTATCGAGCGTCATGGCGATATGAATGTAGTCAGCCTCATGGTTCC
CGCATTGATCACCGTTCCTGAAAGCTGGGGCTTCTCTGAATACAGGAAGGGTTGGAGCAG
AGGGCTTGTGGAGAATGACTCCAACACGAACTGCCTTTGTGGAGGTTGTGAACAAGAGGA
GGTTAAAGGACAGGAGGCCTAGGAGTTGTGTGTAGGAGCGGCTCCTTGAGGCCATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT38JQB U 1
AF RR2GN61JQ U 51
AF RR2GT38TF C 525
AF RR2GN61TF C 516
BS 1 371 RR2GT38JQB
BS 372 372 RR2GN61JQ
BS 373 500 RR2GT38JQB
BS 501 501 RR2GN61JQ
BS 502 585 RR2GT38JQB
BS 586 735 RR2GN61JQ
BS 736 766 RR2GN61TF
BS 767 767 RR2GT38TF
BS 768 771 RR2GN61TF
BS 772 772 RR2GT38TF
BS 773 841 RR2GN61TF
BS 842 842 RR2GT38TF
BS 843 844 RR2GN61TF
BS 845 845 RR2GT38TF
BS 846 862 RR2GN61TF
BS 863 863 RR2GT38TF
BS 864 925 RR2GN61TF
BS 926 926 RR2GT38TF
BS 927 1258 RR2GN61TF

RD RR2GT38JQB 587 0 0
CAAATGATAATGATGATAATATCATTTCACTACTGAGGTCAATGTCACATGCACAACGTC
TTTTTGCATTAAGAGTGTGTGTTACAAAAATTACAAATAAAAATTTCACTCTCTTTGATC
GCTAAAAAAACTTCTTGTACCTTCTCCTCTCCTAGTATTATATAATATATGTGCCATCTT
GTTTTGTTTTTTTTCGCCTCTACTCTTCTAACGAATGTCTTGATGAACGGTAAAGATCAT
ACGGAGCCCATAGATGATCCACACTACAAGGCTTCCTCGAATCTAGTCTCAACCATGGCT
TCCCTTTCCCACTCCAATGAAGAAGACTTATAGGACCAGGATGCAACGTTCTACACTTCC
CTTCAAAGTTGTCCCCTCCGAGCCCATGCTGGTTCCACCGATGATCAACGGCTTTTATAT
CACCCGCGAATATAAGCAGAAACGGAGGCAATGATCCCAAGTGGTAGATCCTCCGCTGCT
TCTGAACCGTCATCCACTCT*CTACCTTCTGTGTATACATTCCTCTCCTCCATTTTCCAA
CGTCCACGACCATCACGCCCGTGTTGAAATAACACGGTCGTTTCC
CT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2GN61JQ 685 0 0
GT
ACAACGTCTTTTTGCATTAAGAGTGTGTGTTACAAAAATTACAAATAAAAATTTCACTCT
CTTTGATCGCTAAAAAAACTTCTTGTACCTTCTCCTCTCCTAGTATTATATAATATATGT
GCCATCTTGTTTTGTTTTTTTTCGCCTCTACTCTTCTAACGAATGTCTTGATGAACGGTA
AAGATCATACGGAGCCCATAGATGATCCACACTACAAGGCTTCCTCGAATCTAGTCTCAA
CCATGGCTTCCCTTTCCCACTCCAATGAAGAAGACTTATAGGACCAGGATGCAACGTTCT
ACACTTCCCTTCAAAGTTGCCCCCTCCGAGCC*ATGCTGGTTCCACCGATGATCAACGGC
TTTTATATCACCCGCGAATATAAGCAGAAACGGAGGCAATGATCCCAAGTGGTAGATCCT
CCTCTGCTTCTGAACCGTCATCCACTCTTCTACCTTCTGTGTATACATTCCTCTCCTCCA
TTTTCCAACGTCCACGACCATCACGCCCGTGTTGAAATAACACGGTCGTTTCCCTTCAAG
TACTTTGACTAGTTCCGGGTCCGACCAGAAAGCTTTTGTGAAATAATACGTAAAGTTTGC
CTGGCAGTACTCTAGAGCCGCGACGACTTTACCTTCCATCTCAACATGCCATAGCTTCTC
TATGTCGTCTACCACGACTAGGT

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR2GT38TF 537 0 0
CTCCTCCAT
TTTCCAACGTCCACGACCATCACGCCCGTGTTGAAATAACACGGTCGTTTCCTTTCAAGT
ACTTTGACTAGTTCCGGGTCCGACCAGAAAGCTTTTGTGAAATAATACGTAAAGTTTGCC
TGGCAGTACTCTGGAGCCGCGACGACTTTACCTTCCATTTCAACATGCCATAGCTTCTCT
ATGTCGTCTACCACGACTAGGTCCGAGTCTAGGTATATGATCCGGTCAACGCTAGTGGGA
ATGATATCCGCGAGGTAGATTCTCGCGTAGTTTAGAGGCTGGTCTAGGGCTTCCCTGATG
GATTTTGAGATCTTGCTGCGGACTAGGCTCGGATCAAACTGATAAATCTTGAAGTTGAGG
TAAGGAAAGGTGGATTTGATGCTGGTGAAGAGATCGTTTTCGAAATGAGCGAGGGAGAGG
AAATGAAAAGAGAGGTTTTCAGGACAAGTGGAATGTTGAAGGAGAGACAAGACAGCAGCC
ATTGTTCCACGGAGGTAGTTTGTGTCGAGCGTCATGGCGATATGAAT
C

QA 10 536 10 536
DS 

RD RR2GN61TF 743 0 0
GTATACATTCTCTCTCCA
TTTCCAACGTCCACGACCATCACGCCCGTGTTGAAATAACACGGTCGTT*CCCTTCAAGT
ACTTTGACTAGTTCCGGGTCCGACCAGAAAGCTTTTGTGAAATAATACGTAAAGTTTGCC
TGGCAGTACTCTAGAGCCGCGACGACTTTACCTTCCATCTCAACATGCCATAGCTTCTCT
ATGTCGTCTACCACGACTAGGTCCGAGTCTAGGTATATGATCCGGTCAACGCTGGTGG*A
ATGATATCCGCCAGGTAGATTCTCGCGTAGTTTAGAGGCTGGTCTAGGGCTTCCCTGATG
GATTTTGATATTTTGCTGCGGACTAGGCTTGGATCAAACTGATAAATCTTGAAGTTGAGG
TAAGGAAAGGTGGATTTGATGCTGGTGAAGAGGTCGTTTTCGAAATGAGCGAGGGAGAGG
AAATGAAAAGAGAGGTTTTCAGGACAAGTGGAATGTTGAAGGAGAGACAAGACAGCAGCC
ATTGTTCCACGGAGGTAGTTTGTATCGAGCGTCATGGCGATATGAATGTAGTCAGCCTCA
TGGTTCCCGCATTGATCACCGTTCCTGAAAGCTGGGGCTTCTCTGAATACAGGAAGGGTT
GGAGCAGAGGGCTTGTGGAGAATGACTCCAACACGAACTGCCTTTGTGGAGGTTGTGAAC
AAGAGGAGGTTAAAGGACAGGAGGCCTAGGAGTTGTGTGTAGGAGCGGCTCCTTGAGGCC
ATCCC

QA 19 743 19 743
DS 



AS 1 3

CO CL2322Contig1 1301 3 9 U
GGAAGAATCCTTAAAACATCTGTTTCTCATTGTCCGCTTGGTAAAATATAGTTTTAAGGC
AACCGATGTCGGCTTCATGTGCTGTAACACCGTCTGTTAGAACAGAACTGTTCAGCTCAT
TATCTAAAAGACCCACCTTTCCTGCTCAAACTCGTCGACCAAGGAACAAATGCGAAATCA
GCAGAAGGGGTTTTGCAGTGAGAGGAGGGATTGTTGCTTCTGGAGTTTCAGTCATGGGTA
CTCCTCCTTCTTCACCATCATCAGCTGCTTCTCAGCCAATTCAAGGTGGGGAGAGATTAG
ATTTTAAGCCAGAAGGATATAACTTTTGGGAATGGAGAGGTCACAAGATTCATTATGTGG
TTCAAGGAGAAGGCTTGCCTCTTGTTCTTATTCATGGCTTTGGTGCTTCTGTCTTTCACT
GGAGATATAACATTCCTGAACTGGCAAAGAAGTACAAAGTGTACGCCTTGGACTTACTCG
GTTTCGGATGGAGTGACAAAGCTCTCATAGAGTATGATGCCATGGTTTGGACTGATCAAG
TTATTGACTTTATCAAAGAGATTGTCAAAGAGCCATCTGTTGTGGTTGGAAACAGCCTGG
GGGGATTCACAGCTTTGTCAGTTGCGGTGGGATTACCAGAGCAAGTCACAG*AGTTGCGC
TTCTAAACTCTGCACGACAGTTCGCATCCGAGAGTAGAAAGCAAGAGGAAGCTGAGGAGC
CCTCCGCGTTGACCAAGTTTATAGTTAAGCCACTCAAGGAGATCTTCCAACGCGTGGTTC
TTGGGTTCTTGTTCTGGCAAGCCAAGCAGCCTTCTCGTATCGAATCTGTCTTAAAGAGTG
TGTACATAAACGCTGCTAACGTTGATGACTACCTCGTTGAATCCATTTCAAAACCTGCAA
CAGACCCAAATGCTGGAGAAGTTTACTACAGATTGATGACGGTTCTTGACGAACCAGAGT
AGATACACTTTAGATAGTGTTCTAAGCAAGATGACTTGCCCGCTTCTGTTGCTTTGGGGA
GATCTTGACCCGTGGGTTGGTCCTGCTAAAGCCGAGAAAATCAAAGCGTTTTACTCCAAC
TCGTCGCTGGTGCACTTACAAGCAGGGCATTGTCCTCATGATGAAGTCCCTGAAGCTGTA
AACGTAGCTTTGTTGGATTGGTTGTCTAATGTAGTTGCCAAACCATCTTCCCCTGAAGTC
TCAGAGGTGTAAAAGACTTTTTTTTTGCAAAGGAAGTATATAGTTTGTAAATACATTGTT
ACCTCTTCTTCTTGGATAATATGATTTGAGATTAAGCAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E780TF U 1
AF RR2C467TF U 19
AF RR2E780JQ C 453
BS 1 336 RR2E780TF
BS 337 338 RR2C467TF
BS 339 671 RR2E780TF
BS 672 709 RR2C467TF
BS 710 710 RR2E780JQ
BS 711 716 RR2C467TF
BS 717 717 RR2E780JQ
BS 718 730 RR2C467TF
BS 731 1301 RR2E780JQ

RD RR2E780TF 671 0 0
GGAAGAATCCTTAAAACATCTGTTTCTCATTGTCCGCTTGGTAAAATATAGTTTTAAGGC
AACCGATGTCGGCTTCATGTGCTGTAACACCGTCTGTTAGAACAGAACTGTTCAGCTCAT
TATCTAAAAGACCCACCTTTCCTGCTCAAACTCGTCGACCAAGGAACAAATGCGAAATCA
GCAGAAGGGGTTTTGCAGTGAGAGGAGGGATTGTTGCTTCTGGAGTTTCAGTCATGGGTA
CTCCTCCTTCTTCACCATCATCAGCTGCTTCTCAGCCAATTCAAGGTGGGGAGAGATTAG
ATTTTAAGCCAGAAGGATATAACTTTTGGGAATGGA**GGTCACAAGATTCATTATGTGG
TTCAAGGAGAAGGCTTGCCTCTTGTTCTTATTCATGGCTTTGGTGCTTCTGTCTTTCACT
GGAGATATAACATTCCTGAACTGGCAAAGAAGTACAAAGTGTACGCCTTGGACTTACTCG
GTTTCGGATGGAGTGACAAAGCTCTCATAGAGTATGATGCCATGGTTTGGACTGATCAAG
TTATTGACTTTATCAAAGAGATTGTCAAAGAGCCATCTGTTGTGGTTGGAAACAGCCTGG
GGGGATTCACAGCTTTGTCAGTTGCGGTGGGATTACCAGAGCAAGTCACAG*AGTTGCGC
TTCTAAACTCT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2C467TF 715 0 0
GGGT
TTTCTCATTGTCCGCTTGGTAAAATATAGTTTTAAGGCAACCGATGTCGGCTTCATGTGC
TGTAACACCGTCTGTTAGAACAGAACTGTTCAGCTCATTATCTAAAAGACCCACCTTTCC
TGCTCAAACTCGTCGACCAAGGAACAAATGCGAAATCAGCAGAAGGGGTTTTGCAGTGAG
AGGAGGGATTGTTGCTTCTGGAGTTTCAGTCATGGGTACTCCTCCTTCTTCACCATCATC
AGCTGCTTCTCAGCCAATTCAAGGTGGGGAGAGATTAGATTTTAAGCCAGAAGGATATAA
CTTTTGGGAATGGAGAGGTCACAAGATTCATTATGTGGTTCAAGGAGAAGGCTTGCCTCT
TGTTCTTATTCATGGCTTTGGTGCTTCTGTCTTTCACTGGAGATATAACATTCCTGAACT
GGCAAAGAAGTACAAAGTGTACGCCTTGGACTTACTCGGTTTCGGATGGAGTGACAAAGC
TCTCATAGAGTATGATGCCATGGTTTGGACTGATCAAGTTATTGACTTTATCAAAGAGAT
TGTCAAAGAGCCATCTGTTGTGGTTGGAAACAGCCTGGGGGGATTCACAGCTTTGTCAGT
TGCGGTGGGATTACCAGAGCAAGTCACAG*AGTTGCGCTTCTAAACTCTGCACGACAGTT
CGCATCCGAGAGTAGAAAGCAAGAGGA*GCTGAG*AGCCCTCCGCGTT
GAC

QA 5 712 5 712
DS 

RD RR2E780JQ 849 0 0
TACAAAGTGTACGC*TTGGACTTACTCGGTTTCGGATGGAGTGACAAAGCTCTCATAGAG
TATGATGCCATGGTTTGGACTGATCAAGTTATTGACTTTATCAAAGAGATTGTCAAAGAG
CCATCTGTTGTGGTTGGAAACAGCCTGGGGGGATTCACAGCTTTGTCAGTTGCGGTGGGA
TTACCAGAGCAAGTCACAGGAGTTGCGCTTCTAAACTCTGCAGGACAGTTCGCATCCGAG
AGTAGAAAGCAAGAGGAAGCTGAGGAGCCCTCCGCGTTGACCAAGTTTATAGTTAAGCCA
CTCAAGGAGATCTTCCAACGCGTGGTTCTTGGGTTCTTGTTCTGGCAAGCCAAGCAGCCT
TCTCGTATCGAATCTGTCTTAAAGAGTGTGTACATAAACGCTGCTAACGTTGATGACTAC
CTCGTTGAATCCATTTCAAAACCTGCAACAGACCCAAATGCTGGAGAAGTTTACTACAGA
TTGATGACGGTTCTTGACGAACCAGAGTAGATACACTTTAGATAGTGTTCTAAGCAAGAT
GACTTGCCCGCTTCTGTTGCTTTGGGGAGATCTTGACCCGTGGGTTGGTCCTGCTAAAGC
CGAGAAAATCAAAGCGTTTTACTCCAACTCGTCGCTGGTGCACTTACAAGCAGGGCATTG
TCCTCATGATGAAGTCCCTGAAGCTGTAAACGTAGCTTTGTTGGATTGGTTGTCTAATGT
AGTTGCCAAACCATCTTCCCCTGAAGTCTCAGAGGTGTAAAAGACTTTTTTTTTGCAAAG
GAAGTATATAGTTTGTAAATACATTGTTACCTCTTCTTCTTGGATAATATGATTTGAGAT
TAAGCAGAG

QA 1 849 1 849
DS 



AS 1 4

CO CL2323Contig1 920 4 19 U
AATGATTATTGAGCTTCTAGTGTAATGGTCGAAGCATAAAACACACTACTTAAAAGAGTT
ACAATGAAAGCATTAGAGTATATTTTAAAATCCAGAAGACAAAAAAGCATGTAAAAGGGA
ATAGAGTAAAAAGGTTGCATTTATTTCACAAAGATACAAACAACATGGAGCTTGTCTGTC
TTCTCACAGTAGATCAGAGAGAGCTTTTCTACTCTTTAGAAGTCATCCTAGCCTTGTTAA
CCTGGATAATAAGTACGGTTACGACGAGGACGAGGGTGGACACTGTAAACAGTCGGCACA
GTATAAAGCTTAACACTTATTTTGCGTCCAACCATGTTGCTCCCATCAAGATACATCACC
TTTTCTTCAGCATCTTCTCCATAAAGGTCTACAACAGCTGCACCAATGCTTTCGTGAACA
TTGATTCTAGTGACCTCTCCACATGAAGAGAAATGTTCAAACAACATTTTCTCGATATCA
GCTTTATCAAGAAGAGTGTCATAACCTTGAACAATTACAGCAGGGAGACAGCCCGCATGT
TCGTTTAACGGATAAGGCTCAGCAATGACGGTCCATCCTCCCACGTCAATTCCACTAAGT
TGCGAGGCCTTGTCCACTGCGCCTTCTCCAAGAAAATAAATAAGACCAAAACTGTGTAGA
CCATCTTTCATTTCGCGGATATAAACATCTGTGATCTCTCCACACGAAGAGAAATGTTTC
CTCAACGCGTTTACTACATCATCATGGGGAAGGTCAGTGTTATATCCTCTTACGCGAATC
CTCCCTATGTCGCGCTTTCTTGGTCTGGTTCTCTTAGTATCACTTTCGTCCAATGTCAGC
AGACTCATCCCTTTGATCGCGGATCCCTCCATTGGAGACGAGCTGAAAAGATCGACTTGA
CTAGGTTTTCGAGAGGCGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI54JQB U 1
AF RR2GI54TF C 1
AF RR2B837JQ U 26
AF RR2B837TF C 117
BS 1 97 RR2GI54JQB
BS 98 98 RR2B837JQ
BS 99 191 RR2GI54JQB
BS 192 192 RR2B837JQ
BS 193 196 RR2GI54JQB
BS 197 197 RR2B837JQ
BS 198 198 RR2GI54JQB
BS 199 199 RR2B837JQ
BS 200 218 RR2GI54JQB
BS 219 219 RR2B837JQ
BS 220 395 RR2GI54JQB
BS 396 396 RR2B837JQ
BS 397 460 RR2GI54JQB
BS 461 461 RR2B837JQ
BS 462 493 RR2GI54JQB
BS 494 494 RR2B837JQ
BS 495 503 RR2GI54JQB
BS 504 900 RR2B837JQ
BS 901 920 RR2B837TF

RD RR2GI54JQB 504 0 0
AATGATTATTGAGCTTCTAGTGTAATGGTCGAAGCATAAAACACACTACTTAAAAGAGTT
ACAATGAAAGCATTAGAGTATATTTTAAAATCCAGAAAACAAAAAAGCATGTAAAAGGGA
ATAGAGTAAAAAGGTTGCATTTATTTCACAAAGATACAAACAACATGGAGCTTGTCTGTC
TTCTCACAGTAAATCAAAAAGAGCTTTTCTACTCTTTAAAAGTCATCCTAGCCTTGTTAA
CCTGGATAATAAGTACGGTTACGACGAGGACGAGGGTGGACACTGTAAACAGTCGGCACA
GTATAAAGCTTAACACTTATTTTGCGTCCAACCATGTTGCTCCCATCAAGATACATCACC
TTTTCTTCAGCATCTTCTCCATAAAGGTCTACAACGGCTGCACCAATGCTTTCGTGAACA
TTGATTCTAGTGACCTCTCCACATGAAGAGAAATGTTCAA*CAACATTTTCTCGATATCA
GCTTTATCAAGAAAAGTGTCATA
C

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2GI54TF 504 0 0
AATGATTATTGAGCTTCTAGTGTAATGGTCGAAGCATAAAACACACTACTTAAAAGAGTT
ACAATGAAAGCATTAGAGTATATTTTAAAATCCAGAAGACAAAAAAGCATGTAAAAGGGA
ATAGAGTAAAAAGGTTGCATTTATTTCACAAAGATACAAACAACATGGAGCTTGTCTGTC
TTCTCACAGTAGATCAGAGAGAGCTTTTCTACTCTTTAGAAGTCATCCTAGCCTTGTTAA
CCTGGATAATAAGTACGGTTACGACGAGGACGAGGGTGGACACTGTAAACAGTCGGCACA
GTATAAAGCTTAACACTTATTTTGCGTCCAACCATGTTGCTCCCATCAAGATACATCACC
TTTTCTTCAGCATCTTCTCCATAAAGGTCTACAACGGCTGCACCAATGCTTTCGTGAACA
TTGATTCTAGTGACCTCTCCACATGAAGAGAAATGTTCAA*CAACATTTTCTCGATATCA
GCTTTATCAAGAAGAGTGTCATA
C

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2B837JQ 875 0 0
C
GGTCGAAGCATAAAACACACTACTTAAAAGAGTTACAATGAAAGCATTAGAGTATATTTT
AAAATCCAGAAGACAAAAAAGCATATAAAAGGGAATAGAGTAAAAAGGTTGCATTTATTT
CACAAAGATACAAACAACATGGAGCTTGTCTGTCTTCTCACAGTAGATCAGAGAGAGCTT
TTCTACTCTTTAGAAGTCATCCTAGCCTTGTTAACCTGGATAATAAGTACGGTTACGACG
AGGACGAGGGTGGACACTGTAAACAGTCGGCACAGTATAAAGCTTGACACTTATTTTGCG
TCCAACCATGTTGCTCCCATCAAGATACATCACCTTTTCTTCAGCATCTTCTCCATAAAG
GTCTACAACAGCTGCACCAATGCTTTCGTGAACATTGATTCTAGTGACCTCTCCACATGA
AGAGAAATGTTCAAACAACATTTTCTCGATATCAGCTTTATCAAGAAGAGTGTCATAACC
TTGAACAATTACAGCAGGGAGACAGCCCGCATGTTCGTTTAACGGATAAGGCTCAGCAAT
GACGGTCCATCCTCCCACGTCAATTCCACTAAGTTGCGAGGCCTTGTCCACTGCGCCTTC
TCCAAGAAAATAAATAAGACCAAAACTGTGTAGACCATCTTTCATTTCGCGGATATAAAC
ATCTGTGATCTCTCCACACGAAGAGAAATGTTTCCTCAACGCGTTTACTACATCATCATG
GGGAAGGTCAGTGTTATATCCTCTTACGCGAATCCTCCCTATGTCGCGCTTTCTTGGTCT
GGTTCTCTTAGTATCACTTTCGTCCAATGTCAGCAGACTCATCCCTTTGATCGCGGATCC
CTCCATTGGAGACGAGCTGAAAAGATCGACTTGA

QA 2 875 2 875
DS 

RD RR2B837TF 804 0 0
GGGAATAGAGTAAAAAGGTTGCATTTATTTCACAAAGATACAAACAACATGGAGCTTGTC
TGTCTTCTCACAGTAGATCAGAGAGAGCTTTTCTACTCTTTAGAAGTCATCCTAGCCTTG
TTAACCTGGATAATAAGTACGGTTACGACGAGGACGAGGGTGGACACTGTAAACAGTCGG
CACAGTATAAAGCTTGACACTTATTTTGCGTCCAACCATGTTGCTCCCATCAAGATACAT
CACCTTTTCTTCAGCATCTTCTCCATAAAGGTCTACAACAGCTGCACCAATGCTTTCGTG
AACATTGATTCTAGTGACCTCTCCACATGAAGAGAAATGTTCAAACAACATTTTCTCGAT
ATCAGCTTTATCAAGAAGAGTGTCATAACCTTGAACAATTACAGCAGGGAGACAGCCCGC
ATGTTCGTTTAACGGATAAGGCTCAGCAATGACGGTCCATCCTCCCACGTCAATTCCACT
AAGTTGCGAGGCCTTGTCCACTGCGCCTTCTCCAAGAAAATAAATAAGACCAAAACTGTG
TAGACCATCTTTCATTTCGCGGATATAAACATCTGTGATCTCTCCACACGAAGAGAAATG
TTTCCTCAACGCGTTTACTACATCATCATGGGGAAGGTCAGTGTTATATCCTCTTACGCG
AATCCTCCCTATGTCGCGCTTTCTTGGTCTGGTTCTCTTAGTATCACTTTCGTCCAATGT
CAGCAGACTCATCCCTTTGATCGCGGATCCCTCCATTGGAGACGAGCTGAAAAGATCGAC
TTGACTAGGTTTTCGAGAGGCGGC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL2324Contig1 636 2 13 U
GGGTTCAAACATCATTTGCAGACTGTCTCTCTCTTTTTTCCTCTCTCATCTGCCTTGTTA
AAAAAAAAAAAAAAGAACATGGCTGCTTTTGAGAGAAGCTCTGATTTGGATGCTATACAG
GAGCATCTCTTGGAAGACTTTTTGGTAGCTGATGGTTTCATGGGAGATTTCGACTTTAAT
GCTTCTTTTGTCTCAGGACTCTGGTGTATAGAACCTGTGATGAATCAAGTTCCTAAACAA
GAACCCGATTCTCCGGTTCTTGATCCGGACTCGTTCGTCAAAGAGTTTTTACAAGTGGAA
GTGGAATCACCTACATCAACGGGAATTTCAGAGCAGAATTCATCACCACATGAGACTGAT
CAGAGTGCCTCAGCCAGGAAAAAAACAGAGAGGTTCGAAGAACAAGAAGAAGAAGAAGAA
CAGAGGCACTACCGAGGAGTGAGAAGAAGGCCGTGGGGGAAATTTGCAGCAGAGATTCGG
GATCCAGCAAAGAAAGGATCTCGGATTTGGCTAGGGACGTTTGAAAGTAATGTTGATGCC
GCAAGAGCATATGACTGTGCAGCTTTCAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTC
CCTCTAGACGCTGGCAAATATGAAGCTCCCGTGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH05TF U 34
AF RR2C367TF U 1
BS 1 146 RR2C367TF
BS 147 147 RR2DH05TF
BS 148 309 RR2C367TF
BS 310 310 RR2DH05TF
BS 311 367 RR2C367TF
BS 368 368 RR2DH05TF
BS 369 384 RR2C367TF
BS 385 385 RR2DH05TF
BS 386 491 RR2C367TF
BS 492 492 RR2DH05TF
BS 493 553 RR2C367TF
BS 554 554 RR2DH05TF
BS 555 636 RR2C367TF

RD RR2DH05TF 538 0 0
TTTTTTCCTCTCTCATCTGCCTTGTTAAAAAAAAAAAAAAG***CATGGCTGCTTTTGAG
GGAAGCTCTGATTTGGATGCTATACAGGAGCATCTCTTGGAAGACTTTTTGGTAGCTGAT
GGTTTCATGGGAGATTTCGACTTTAATGCTTCTTTTGTCTCAGGACTCTGGTGTATAGAA
CCTGTGATGAATCAAGTTCCTAAACAAGAACCCGATTCTCCGGTTCTTGATCCGGACTCG
TTCGTCAAAGAGTTTTTACAAGTGGAAGTGGAATCACCTACATCAACGGGGATTTCAGAG
CAGAATTCATCATCACATGAGACTGATCAGAGTGCCTCAGCCAGGAAAAAAACAGAGAGG
TTCGAAGAACAAGAAGAAGAAGACGAACAGAGGCACTACCGAGGAGTGAGAATAAGGCCG
TGGGGGAAATTTGCAGCAGAGATTCGGGATCCAGCAAAGAAAGGATCTCGGATTTGGCTA
GGGACGTTTGAAAGTAATGTTGATGCCGCAAGAGCATATGACTGTGCAGCT
TTCAAGC

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2C367TF 636 0 0
GGGTTCAAACATCATTTGCAGACTGTCTCTCTCTTTTTTCCTCTCTCATCTGCCTTGTTA
AAAAAAAAAAAAAAGAACATGGCTGCTTTTGAGAGAAGCTCTGATTTGGATGCTATACAG
GAGCATCTCTTGGAAGACTTTTTGGTTGCTGATGGTTTCATGGGAGATTTCGACTTTAAT
GCTTCTTTTGTCTCAGGACTCTGGTGTATAGAACCTGTGATGAATCAAGTTCCTAAACAA
GAACCCGATTCTCCGGTTCTTGATCCGGACTCGTTCGTCAAAGAGTTTTTACAAGTGGAA
GTGGAATCATCTACATCAACGGGAATTTCAGAGCAGAATTCATCACCACATGAGACTGAT
CAGAGTGTCTCAGCCAGGAAAAAA*CAGAGAGGTTCGAAGAACAAGAAGAAGAAGAAGAA
CAGAGGCACTACCGAGGAGTGAGAAGAAGGCCGTGGGGGAAATTTGCAGCAGAGATTCGG
GATCCAGCAAATAAAGGATCTCGGATTTGGCTAGGGACGTTTGAAAGTAATGTTGATGCC
GCAAGAGCATATGGCTGTGCAGCTTTCAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTC
CCTCTAGACGCTGGCAAATATGAAGCTCCCGTGAAT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 3

CO CL2325Contig1 1437 3 6 U
GGAAGAGGAAATAGACGATGTCTGTGGGGGACGAAGACGGAGAACCGCTCAGCCCGATGG
CGCGTGTGTTCCAGTCGCCAGGCACCAGCTGCTGCATCATCACCATGATCGGTTGCAAAA
TCAAGATCAATGCTGACGTCATTCTAAGTGGCATGAACCATAATGTTTCCACACATCCCC
GTTTCTCAAGCAAATTGTCAGATGATGGTTTGAGTTGGGTTAAGACAAAAGTCAACATAG
AGGACCATGTGTTTATAGTAGATATGGACTCGAACGAGATCGGAGAAGATGGAGAAAGCT
ACGTTGAGGACTACGTTACACGTCTCACTATGCTTCCTCTTGATAAATCGAAACCTTTAT
GGGATATTCACATCCTCAACGTCAAAACATCTGATGCAGAGGCTGTCTGTGTGATAAGAT
CTCACCATTCATTAGGAGATGGATCATCCCTTATGTCTCTCTTAGTCGCATGTACTCAGA
AAACATCAAACGGGAACACTGCTTCTACTACCCCTGTTCTTACCAGACGTAAAATGGTGC
CGAACGACAACACCTCATGGTTCTTAAGGTCGGTATTAGAGGTTTTTTCATCAGTGAGAC
TGATTTGGAATACTTTCGTGGATATCTTGCTGGCCCTGGCGATTGCTTTGTTCTTGAAGG
ATACGAAGACACATCTAAAAGGCGATATGGGTATCCAGAGTAATCCGAAGAAATTTTGCC
ACCGAATTGTCTCGTTGGATGACATAAGACTCATAAAAGAAGTTATGAACATGACTATCA
ACGATGTTTTGCTCGGAGTTACACAGTCTGCTATTTCACGCTATCTAAGTAATATGCCTG
GTAATATACGACTTACAGCATGTGTTTTAGTAAACTTAAGGCCAGACACTGGGATTCAGC
CATTAGCAGATATGACGGCTAAAGACTCGAAATGCAGATGGGGAAACTACTTCAGCTCTA
TCTATTTCCCTTTATATACTGGCTCAGAAACTGATCCATTAGTGTATCTATCGAAGGCTA
AATCAAATATGGATCGGAGCAAGAACTCACTTCTTGCTACTTTGATATATTCAAGTACAA
AATTATTCTTCAATATTTTTGGAGCAAAGGTAGGTGCAATATTAGTCGAACGACTTTTTT
TGAACACAACGACAGTCATTTCAAACATGATCGGCCCTATGGATGAAATCAGCTTCCATG
GCCACCCCATTGCCTACATTGCTCCAAGTGTCTATGGACACTCTCATGGATTAACACTAC
ATTTCCTAAGTTATGCGGAAAAAATGGTGATTTCGATAGGGGTTGATTCTACAGCCATAC
CAAGTCCTCACAAGCTTTGCGATGCAATAGAGGACTCTCTAAAAGCCATGAAAGCCGCTC
TCTCAGAAAGAGGATTAGTAAAAGCACCTTCAGTAAAAGATGTTTATATGAGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ08TF U 35
AF RR2B753TF U 1
AF RR2B753JQ C 669
BS 1 86 RR2B753TF
BS 87 87 RR2DZ08TF
BS 88 178 RR2B753TF
BS 179 179 RR2DZ08TF
BS 180 864 RR2B753TF
BS 865 1437 RR2B753JQ

RD RR2DZ08TF 496 0 0
G
GACGGAGAACCGCTCAGCCCGATGGCGCGTGTGTTCCAGTCGCCAGGCACCAGCTGCTGC
ATCATCACCATGATCGGTTGCAAAATCAAGATCAATGCTGACGTCATTCTAAGTGGCATG
AACCATAATGTTTCCACACATCCCCGTTTCTCAAGCAAATTGTCAGATGATGGTTTGAGT
TGGGTTAAGACAAAAGTCAACATAGAGGACCATGTGTTTATAGTAGATATGGACTCGAAC
GAGATCGGAGAAGATGGAGAAAGCTACGTTGAGGACTACGTTACACGTCTCACTATGCTT
CCTCTTGATAAATCGAAACCTTTATGGGATATTCACATCCTCAACGTCAAAACATCTGAT
GCAGAGGCTGTCTGTGTGATAAGATCTCACCATTCATTGGGAGATGGATCATCCCTTATG
TCTCTCTTAGTCGCATGTACTCAGAAAACATCAAACGGGAACACTGCTTCTACTACCCCT
GTTCTTACCAGACGT

QA 2 496 2 496
DS 

RD RR2B753TF 864 0 0
GGAAGAGGAAATAGACGATGTCTGTGGGGGACGAAGACGGAGAACCGCTCAGCCCGATGG
CGCGTGTGTTCCAGTCGCCAGGCACCGGCTGCTGCATCATCACCATGATCGGTTGCAAAA
TCAAGATCAATGCTGACGTCATTCTAAGTGGCATGAACCATAATGTTTCCACACATCCTC
GTTTCTCAAGCAAATTGTCAGATGATGGTTTGAGTTGGGTTAAGACAAAAGTCAACATAG
AGGACCATGTGTTTATAGTAGATATGGACTCGAACGAGATCGGAGAAGATGGAGAAAGCT
ACGTTGAGGACTACGTTACACGTCTCACTATGCTTCCTCTTGATAAATCGAAACCTTTAT
GGGATATTCACATCCTCAACGTCAAAACATCTGATGCAGAGGCTGTCTGTGTGATAAGAT
CTCACCATTCATTAGGAGATGGATCATCCCTTATGTCTCTCTTAGTCGCATGTACTCAGA
AAACATCAAACGGGAACACTGCTTCTACTACCCCTGTTCTTACCAGACGTAAAATGGTGC
CGAACGACAACACCTCATGGTTCTTAAGGTCGGTATTAGAGGTTTTTTCATCAGTGAGAC
TGATTTGGAATACTTTCGTGGATATCTTGCTGGCCCTGGCGATTGCTTTGTTCTTGAAGG
ATACGAAGACACATCTAAAAGGCGATATGGGTATCCAGAGTAATCCGAAGAAATTTTGCC
ACCGAATTGTCTCGTTGGATGACATAAGACTCATAAAAGAAGTTATGAACATGACTATCA
ACGATGTTTTGCTCGGAGTTACACAGTCTGCTATTTCACGCTATCTAAGTAATATGCCTG
GTAATATACGACTTACAGCATGTG

QA 1 864 1 864
DS 

RD RR2B753JQ 769 0 0
ACACATCTAAAAGGCGATATGGGTATCCAGAGTAATCCGAAGAAATTTTGCCACCGAATT
GTCTCGTTGGATGACATAAGACTCATAAAAGAAGTTATGAACATGACTATCAACGATGTT
TTGCTCGGAGTTACACAGTCTGCTATTTCACGCTATCTAAGTAATATGCCTGGTAATATA
CGACTTACAGCATGTGTTTTAGTAAACTTAAGGCCAGACACTGGGATTCAGCCATTAGCA
GATATGACGGCTAAAGACTCGAAATGCAGATGGGGAAACTACTTCAGCTCTATCTATTTC
CCTTTATATACTGGCTCAGAAACTGATCCATTAGTGTATCTATCGAAGGCTAAATCAAAT
ATGGATCGGAGCAAGAACTCACTTCTTGCTACTTTGATATATTCAAGTACAAAATTATTC
TTCAATATTTTTGGAGCAAAGGTAGGTGCAATATTAGTCGAACGACTTTTTTTGAACACA
ACGACAGTCATTTCAAACATGATCGGCCCTATGGATGAAATCAGCTTCCATGGCCACCCC
ATTGCCTACATTGCTCCAAGTGTCTATGGACACTCTCATGGATTAACACTACATTTCCTA
AGTTATGCGGAAAAAATGGTGATTTCGATAGGGGTTGATTCTACAGCCATACCAAGTCCT
CACAAGCTTTGCGATGCAATAGAGGACTCTCTAAAAGCCATGAAAGCCGCTCTCTCAGAA
AGAGGATTAGTAAAAGCACCTTCAGTAAAAGATGTTTATATGAGTCTCC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 4

CO CL2326Contig1 814 4 6 U
TTTTTAAACCAGTGATAACCGGTGAATTATATTTTTAAACCAGAAATAACCGGTGAACTC
TGTTTTGATAGGTGGAAGGTTACCGATGGCGTGGTATCCACAATCCTACGTGGAGAAAGT
TCCGATGACGAATATGAACATGAGACCCGATAAATCAAACGGGTATCCGGGTCGGACTTA
CCGGTTCTACTCCGGAGAGACGGTTTACGCCTTCGGAGATGGACTCAGCTACACCAAGTT
CAGCCACAGCTTAGTCAAAGCTCCACGGCTAGTCTCTCTCAGTCTTGAAGAGAATCACGT
TTGCCGATCATCGGAATGTCAATCGCTGGACGCGATCGGACCGCATTGTGATAACGCTGT
CTCCGGTACGGGTGGAACGGCGTTTGAGGTTCATGTTAAGGTACAGAACGGAGGAGATAG
AGAAGGAATCCACACGGTGTTTCTGTTCACGACGCCGCCGGCGGTTCACGGGTCGCCGAG
GAAGCATCTTTTGGGGTTTGAGAAGATTCGTTTGGGGAAGATGGAAGCAGCTGTGGTGGT
GTTTAAGGTTGATGTCTGTAAAGACCTGAGCGTTGTGGATGAAGTTGGGAAGAGGAAGAT
TGGTTTGGGTCAGCACCTTCTTCATGTGGGTGACGTGAAGCATTCTTTGAGCATTAGGAT
CTGATTCCAACAGATTCTAATTTTTATTTTTGAATTCAAAATGGGAACTTATAAATATGC
TTATTTATTAAGCTTATATGCATGTTAAAGAAAAGAACATGAATAAAAACGTAATTGTGA
ATCTGTTATTTTTAATGTTTTCCTAAATAATCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC18TF U 1
AF RR2GC18JQ C 215
AF RR2DU94JQ C 294
AF RR2CI65TF U 576
BS 1 657 RR2GC18TF
BS 658 658 RR2CI65TF
BS 659 685 RR2GC18TF
BS 686 739 RR2CI65TF
BS 740 740 RR2GC18JQ
BS 741 814 RR2CI65TF

RD RR2GC18TF 685 0 0
TTTTTAAACCAGTGATAACCGGTGAATTATATTTTTAAACCAGAAATAACCGGTGAACTC
TGTTTTGATAGGTGGAAGGTTACCGATGGCGTGGTATCCACAATCCTACGTGGAGAAAGT
TCCGATGACGAATATGAACATGAGACCCGATAAATCAAACGGGTATCCGGGTCGGACTTA
CCGGTTCTACTCCGGAGAGACGGTTTACGCCTTCGGAGATGGACTCAGCTACACCAAGTT
CAGCCACAGCTTAGTCAAAGCTCCACGGCTAGTCTCTCTCAGTCTTGAAGAGAATCACGT
TTGCCGATCATCGGAATGTCAATCGCTGGACGCGATCGGACCGCATTGTGATAACGCTGT
CTCCGGTACGGGTGGAACGGCGTTTGAGGTTCATGTTAAGGTACAGAACGGAGGAGATAG
AGAAGGAATCCACACGGTGTTTCTGTTCACGACGCCGCCGGCGGTTCACGGGTCGCCGAG
GAAGCATCTTTTGGGGTTTGAGAAGATTCGTTTGGGGAAGATGGAAGCAGCTGTGGTGGT
GTTTAAGGTTGATGTCTGTAAAGACCTGAGCGTTGTGGATGAAGTTGGGAAGAGGAAGAT
TGGTTTGGGTCAGCACCTTCTTCATGTGGGTGACGTGAAGCATTCTTTGAGCATTAG*AT
CTGATTCCAACAGATTCTAATTTTT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2GC18JQ 573 0 0
GGAGATGGACTCAGCTACACCAAGTTCAGCCACAGCTTAGTCAAAGCTCCACGGCTAGTC
TCTCTCAGTCTTGAAGAGAATCACGTTTGCCGATCATCGGAATGTCAATCGCTGGACGCG
ATCGGACCGCATTGTGATAACGCTGTCTCCGGTACGGGTGGAACGGCGTTTGAGGTTCAT
GTTAAGGTACAGAACGGAGGAGATAGAGAAGGAATCCACACGGTGTTTCTGTTCACGACG
CCGCCGGCGGTTCACGGGTCGCCGAGGAAGCATCTTTTGGGGTTTGAGAAGATTCGTTTG
GGGAAGATGGAAGCAGCTGTGGTGGTGTTTAAGGTTGATGTCTGTAAAGACCTGAGCGTT
GTGGATGAAGTTGGGAAGAGGAAGATTGGTTTGGGTCAGCCCCTTCTTCATGTGGGTGAC
GTGAAGCATTCTTTGAGCATTAGGATCTGATTCCAACAGATTCTAATTTTTATTTTTGAA
TTCAAAATGGGAACTTATAAATATGCTTATTTATTAAGCTTATATGCATGTTAAAGAAAA
GAACATGAATAAAAACGTAATTGTGAATCTGTT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2DU94JQ 511 0 0
ATCACGTTTGCCGATCATCGGAATGTCAATCGCTGGACGCGATCGGACCGCATTGTGATA
ACGCTGTCTCCGGTACGGGTGGAACGGCGTTTGAGGTTCATGTTAAGGTACAGAACGGAG
GAGATAGAGAAGGAATCCACACGGTGTTTCTGTTCACGACGCCGCCGGCGGTTCACGGGT
CGCCGAGGAAGCATCTTTTGGGGTTTGAGAAGATTCGTTTGGGGAAGATGGAAGAAGCTG
TGGTGATGTTTAAGGTTGATGTCTGTAAAGACCTGAGCGTTGTGGATGAAGTTGGGAAGA
GGAAGATTGGTTTGGGTCAGCACCTTCTTCATGTGGGTGACGTGAAGCATTCTTTGAGCA
TTAGGATCTGATTCCAACAGATTCTAATTTTTATTTTTGAATTCAAAATGGGAACTTATA
AATATGCTTATTTATTAAGCTTATATGCATGTTAAAGAAAAGAACATGAATAAAAACGTA
ATTGTGAATCTGTTATTTTTAATGTTTTCCT

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2CI65TF 239 0 0
G
GGATGAAGTTGGGAAGAGGAAGATTGGTTTGGGTCAGCACCTTCTTCATGTGGGTGACGT
GAAGCATTCTTTGAGCATTAGGATCTGATTCCAACAGATTCTAATTTTTATTTTTGAATT
CAAAATGGGAACTTATAAATATGCTTATTTATTAAGCTTATAT*CATGTTAAAGAAAAGA
ACATGAATAAAAACGTAATTGTGAATCTGTTATTTTTAATGTTTTCCTAAATAATCGC

QA 2 239 2 239
DS 



AS 1 3

CO CL2327Contig1 761 3 8 U
CGAAAATTCGTTTCTTTTAGAACTTTATAAAAAGAAAACAAGAGGAAGTTTCTCTCTAAT
TCTTGAATTGTTGTACCATACAACAAAAACATGCATATCCATCTCTTTGATCAACATCAT
TGGTCCCAAAATCAAGTCATCTCACTATATAGGTTTTAAGGTAATTTAGTTGTCTCCGTT
GATCCATAAGCAGCATCAGCTGAAGAAGTATCGATGTCGTTGAGACCCAACTCCTCGTTC
TGCTCCCATGACCTCTCGAACTCTTCATATGTGAGCCGATGATCATCTTTGATATCATCT
GTTAGTGGTGAAATAAAGGAATTTGCTAATTCATCATCAAGAATCAACGTCCATGGCTGT
TCTAAGCTTAGGAGCTTAGTTAGCCTGGATCCAAATTCTCTCCACTTGTTCTTCTTACTC
TCATCTAGACTGTCACCAAAAGTGAATCCGTGAACTCTCGCTAAGCTTTCTCTGATCTGC
GTGACCAACCCTTCAACTGTTGTTACCATTCCACCAAGTGTACCACCAGCTAGCTCCAGA
TCAAGTTCCGGGATTATCACTCCTGCCGTGTCCGACTTGATAACATCTCGGCTAAGATCA
GTGATGTTCTTCACAGAGAGTGTAATTTTCTTTCCCTTCTCAGGAATAGCACCACCAGGC
TTCAACTCAGAGTTGCGATAGCCACAATCCTCACATGTGGATGCCATGACAATAACCTCC
TGGAAGTACGGGATTTTAGTCACGAACATCCGTGTCTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH22JQ U 39
AF RR2FH96JQ U 1
AF RR2DH22TF C 158
BS 1 88 RR2FH96JQ
BS 89 89 RR2DH22JQ
BS 90 99 RR2FH96JQ
BS 100 100 RR2DH22JQ
BS 101 276 RR2FH96JQ
BS 277 277 RR2DH22TF
BS 278 490 RR2FH96JQ
BS 491 761 RR2DH22TF

RD RR2DH22JQ 169 0 0
CAAGAGGAAGTTTCTCTCTAATTCTTGAATTGTTGTACCATACAACAAAAACATGCATAT
CCATCTCTTTGATCAACATCATTGGTCCCAAAATCAAGTCATCTCACTATATAGGTTTTA
AGGTAATTTAGTTGTCTCCGTTGATCCATAAGCAGCATCAGCTGAAGAA

QA 1 169 1 169
DS 

RD RR2FH96JQ 490 0 0
CGAAAATTCGTTTCTTTTAGAACTTTATAAAAAGAAAACAAGAGGAAGTTTCTCTCTAAT
TCTTGAATTGTTGTACCATACAACAAAA*CATGCATATCTATCTCTTTGATCAACATCAT
TGGTCCCAAAATCAAGTCATCTCACTATATAGGTTTTAAGGTAATTTAGTTGTCTCCGTT
GATCCATAAGCAGCATCAGCTGAAGAAGTATCGATGTCGTTGAGACCCAACTCCTCGTTC
TGCTCCCATGACCTCTCGAACTCTTCATATGTGAGCTGATGATCATCTTTGATATCATCT
GTTAGTGGTGAAATAAAGGAATTTGCTAATTCATCATCAAGAATCAACGTCCATGGCTGT
TCTAAGCTTAGGAGCTTAGTTAGCCTGGATCCAAATTCTCTCCACTTGTTCTTCTTACTC
TCATCTAGACTGTCACCAAAAGTGAATCCGTGAACTCTCGCTAAGCTTTCTCTGATCTGC
GTGACCAACC

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR2DH22TF 604 0 0
AAGGTAATTTAGTTGTCTCCGTTGATCCATAAGCAGCATCAGCTGAAGAAGTATCGATGT
CGTTGAGACCCAACTCCTCGTTCTGCTCCCATGACCTCTCGAACTCTTCATATGTGAGCC
GATGATCATCTTTGATATCATCTGTTAGTGGTGAAATAAAGGAATTTGCTAATTCATCAT
CAAGAATCAACGTCCATGGCTGTTCTAAGCTTAGGAGCTTAGTTAGCCTGGATCCAAATT
CTCTCCACTTGTTCTTCTTACTCTCATCTAGACTGTCACCAAAAGTGAATCCGTGAACTC
TCGCTAGGCTTTCTCTGATCTGCGTGACCAACCCTTCAACTGTTGTTACCATTCCACCAA
GTGTACCACCAGCTAGCTCCAGATCAAGTTCCGGGATTATCACTCCTGCCGTGTCCGACT
TGATAACATCTCGGCTAAGATCAGTGATGTTCTTCACAGAGAGTGTAATTTTCTTTCCCT
TCTCAGGAATAGCACCACCAGGCTTCAACTCAGAGTTGCGATAGCCACAATCCTCACATG
TGGATGCCATGACAATAACCTCCTGGAAGTACGGGATTTTAGTCACGAACATCCGTGTCT
CACC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 4

CO CL2328Contig1 1075 4 5 U
ACAAGGAGGTTTTAGGCAAACAGAAGGAGAATGTTGGTTCTTCGCGCTCCCACAGGACCC
GTGTCCGCCGTCAGATTCATCACCAAACCCAACCCTCGTACTCCCCCTTCATCGGATCCA
TGGCTCGGACTAGTTCCCTCCGCGAACACTCGCAGTCGTCGACGCGTCGTCCTCACTCTC
TCCAGCTCTGACTCAAACGGAAGCGTCAAATCCGCCGCACCTTCTTCTCCTCCACCTTCC
CAACAAGTCCCAGACGACACAGTCTTCGTCGGTCAAGAGAATGTTCCCCTCGAAGGCGTT
ATTCAATTCGATAAACCCAAATCAAATGCATCATTCAAGAAATGGGGCCGTGTGGGTTTA
CTTGCTGGTGGGGATGTTTTGGCTTTGCTTATTTTCTCTGCAATTGGGAGATTCAGCCAT
GGATTCCCTGTGTTTAGCTTCGATACTCTTCACACAGCCGACCCTTTCATTGCTGGATGG
TTTCTGAGTGCTTATTTCTTGGGAGGATATGCGGAGGAAGGGAGAGGAATGAAGGGTCAG
TCCAAAGCTGTGCTAGCAGCCGCTAAGTCTTGGGCTCTCGGTGTTCCGCTTGGGGTGATC
ATAAGGTCAACCTCGTCAGGCCACATCCCAGCTTATAGCTTTGTCTTGGTGACAATGGGA
AGTACAGCTGTTTTACTTATTGGGTGGAGAGCACTATTATTCAGTGTGCTTCCTTCAGAG
TCAAAGAAGAAAGATGATACATATAGAAAAGGCAGCGCATTCGAACTTTTTGAGTTGCTT
ACTTCATTAATAAGACGGTGGTGATGGAGCTTCGCATCCATTAATGTACGCGCGGATGGA
AGTTGATATTCCATATGCATATATCTAATCCTGTCAGCAGTGGAAAGATTTGGAAAGTTA
CAGGGAGGGATGATTACTTGTCCCAAACAATTCATATAATGTATGAATACTCTGAAAACC
AGTCAGCTTAAGCAAACCAAAATGTCAAACAATAGTGAGTTGCCAAGTGATGGAATCAAA
TTGGCAAGTACACAACTGTTGAGATAATGTGAGATAAATGAAGCATTGAAAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G677TF U 1
AF RR2E376TF U 458
AF RR2E376JQ C 568
AF RR2A049TF U 501
BS 1 604 RR2G677TF
BS 605 605 RR2E376TF
BS 606 617 RR2G677TF
BS 618 973 RR2E376TF
BS 974 1075 RR2A049TF

RD RR2G677TF 617 0 0
ACAAGGAGGTTTTAGGCAAACAGAAGGAGAATGTTGGTTCTTCGCGCTCCCACAGGACCC
GTGTCCGCCGTCAGATTCATCACCAAACCCAACCCTCGTACTCCCCCTTCATCGGATCCA
TGGCTCGGACTAGTTCCCTCCGCGAACACTCGCAGTCGTCGACGCGTCGTCCTCACTCTC
TCCAGCTCTGACTCAAACGGAAGCGTCAAATCCGCCGCACCTTCTTCTCCTCCACCTTCC
CAACAAGTCCCAGACGACACAGTCTTCGTCGGTCAAGAGAATGTTCCCCTCGAAGGCGTT
ATTCAATTCGATAAACCCAAATCAAATGCATCATTCAAGAAATGGGGCCGTGTGGGTTTA
CTTGCTGGTGGGGATGTTTTGGCTTTGCTTATTTTCTCTGCAATTGGGAGATTCAGCCAT
GGATTCCCTGTGTTTAGCTTCGATACTCTTCACACAGCCGACCCTTTCATTGCTGGATGG
TTTCTGAGTGCTTATTTCTTGGGAGGATATGCGGAGGAAGGGAGAGGAATGAAGGGTCAG
TCCAAAGCTGTGCTAGCAGCCGCTAAGTCTTGGGCTCTCGGTGTTCCGCTTGGGGTGATC
ATAAAGTCAACCTCGTC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2E376TF 516 0 0
G
CGACCCTTTCATTGCTGGATGGTTTCTGAGTGCTTATTTCTTGGGAGGATATGCGGAGGA
AGGGAGAGGAATGAAGGGTCAGTCCAAAGCTGTGCTAGCAGCCGCTAAGTCTTGGGCTCT
CGGTGTTCCGCTTGGGGTGATCATAAGGTCAACCTCGTCAGGCCACATCCCAGCTTATAG
CTTTGTCTTGGTGACAATGGGAAGTACAGCTGTTTTACTTATTGGGTGGAGAGCACTATT
ATTCAGTGTGCTTCCTTCAGAGTCAAAGAAGAAAGATGATACATATAGAAAAGGCAGCGC
ATTCGAACTTTTTGAGTTGCTTACTTCATTAATAAGACGGTGGTGATGGAGCTTCGCATC
CATTAATGTACGCGCGGATGGAAGTTGATATTCCATATGCATATATCTAATCCTGTCAGC
AGTGGAAAGATTTGGAAAGTTACAGGGAGGGATGATTACTTGTCCCAAACAATTCATATA
ATGTATGAATACTCTGAAAACCAGTCAGCTTAAGC

QA 2 516 2 516
DS 

RD RR2E376JQ 406 0 0
TCTTGGGCTCTCGGTGTTCCGCTTGGGGTGATCATAAGGTCAACCTCGTCAGGCCACATC
CCAGCTTATAGCTTTGTCTTGGTGACAATGGGAAGTACAGCTGTTTTACTTATTGGGTGG
AGAGCACTATTATTCAGTGTGCTTCCTTCAGAGTCAAAGAAGAAAGATGATACATATAGA
AAAGGCAGCGCATTCGAACTTTTTGAGTTGCTTACTTCATTAATAAGACGGTGGTGATGG
AGCTTCGCATCCATTAATGTACGCGCGGATGGAAGTTGATATTCCATATGCATATATTTA
ATCCTGTCAGCAGTGGAAAGATTTGGAAAGTTACAGGGAGGGATGATTACTTGTCCCAAA
CAATTCATATAATGTATGAATACTCTGAAAACCAGTCAGCTTAAGC

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR2A049TF 575 0 0
GGGAGGATATGCGGAGGAAGGGAGAGGAATGAAGGGTCAGTCCAAAGCTGTGCTAGCAGC
CGCTAAGTCTTGGGCTCTCGGTGTTCCGCTTGGGGTGATCATAAGGTCAACCTCGTCAGG
CCACATCCCAGCTTATAGCTTTGTCTTGGTGACAATGGGAAGTACAGCTGTTTTACTTAT
TGGGTGGAGAGCACTATTATTCAGTGTGCTTCCTTCAGAGTCAAAGAAGAAAGATGATAC
ATATAGAAAAGGCAGCGCATTCGAACTTTTTGAGTTGCTTACTTCATTAATAAGACGGTG
GTGATGGAGCTTCGCATCCATTAATGTACGCGCGGATGGAAGTTGATATTCCATATGCAT
ATATCTAATCCTGTCAGCAGTGGAAAGATTTGGAAAGTTACAGGGAGGGATGATTACTTG
TCCCAAACAATTCATATAATGTATGAATACTCTGAAAACCAGTCAGCTTAAGCAAACCAA
AATGTCAAACAATAGTGAGTTGCCAAGTGATGGAATCAAATTGGCAAGTACACAACTGTT
GAGATAATGTGAGATAAATGAAGCATTGAAAATGT

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 4

CO CL2329Contig1 475 4 4 U
CATAGTCGAGTAAATAATCCATAAGATACAAAAGTCTAAAAGACAAATACGAAAATAAAG
ATACAAAAGTCTAAAAGACAAATACGAAAATAAAAAAGATTAACAACAGATTATTGAACG
ATACACAAGTATCTTTTTCATTGCATGCAAAGGAAAATAAATCGTTGAACTGATAAATTC
ACCGATCAGAAACAAGCATCCAAGAGACAGCAACAGCAGAGCGCAGCCAAACATCCTTCG
AGCATACCAGCTTGTTACTTTTGCTGCGGAGCTTGAGAGTATTGAGGTGGAGGATAACCT
TGAGCAGGGTATCCCTGACCATATCCCGGCGGTGGATAACCGGCGGCAGGATAGCCAGCC
GGAGGATAACCGTCCTTAGGAGGATACCCTTGGGGAGGAGGAGCACCGACAGGATATTGT
TCTTGATTATACATCTTTTGAATTCTTCTACCTTTTTTTTTTCTTTCTCTTCTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM92JQ U 1
AF RR2CM92TF C 1
AF RR2BR60JQ U 9
AF RR2BR60TF C 9
BS 1 230 RR2CM92JQ
BS 231 231 RR2BR60JQ
BS 232 462 RR2CM92JQ
BS 463 475 RR2BR60JQ

RD RR2CM92JQ 470 0 0
CATAGTCGAGTAAATAATCCATAAGATACAAAAGTCTAAAAGACAAATACGAAAATAAAG
ATACAAAAGTCTAAAAGACAAATACGAAAATAAAAAAGATTAACAACAGATTATTGAACG
ATACACAAGTATCTTTTTCATTGCATGCAAAGGAAAATAAATCGTTGAACTGATAAATTC
ACCGATCAGAAACAAGCATCCAAGAGACAGCAACAGCAGAGCGCAGCCAACCATCCTTCG
AGCATACCAGCTTGTTACTTTTGCTGCGGAGCTTGAGAGTATTGAGGTGGAGGATAACCT
TGAGCAGGGTATCCCTGACCATATCCCGGCGGTGGATAACCGGCGGCAGGATAGCCAGCC
GGAGGATAACCGTCCTTAGGAGGATACCCTTGGGGAGGAGGAGCACCGACAGGATATTGT
TCTTGATTATACATCTTTTGAATTCTTCTACCTTTTTTTTTT
TTCTTTCC

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2CM92TF 470 0 0
CATAGTCGAGTAAATAATCCATAAGATACAAAAGTCTAAAAGACAAATACGAAAATAAAG
ATACAAAAGTCTAAAAGACAAATACGAAAATAAAAAAGATTAACAACAGATTATTGAACG
ATACACAAGTATCTTTTTCATTGCATGCAAAGGAAAATAAATCGTTGAACTGATAAATTC
ACCGATCAGAAACAAGCATCCAAGAGACAGCAACAGCAGAGCGCAGCCAACCATCCTTCG
AGCATACCAGCTTGTTACTTTTGCTGCGGAGCTTGAGAGTATTGAGGTGGAGGATAACCT
TGAGCAGGGTATCCCTGACCATATCCCGGCGGTGGATAACCGGCGGCAGGATAGCCAGCC
GGAGGATAACCGTCCTTAGGAGGATACCCTTGGGGAGGAGGAGCACCGACAGGATATTGT
TCTTGATTATACATCTTTTGAATTCTTCTACCTTTTTTTTTT
TTCTTTCC

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2BR60JQ 467 0 0
AGTAAATAATCCATAAGATACAAAAGTCTAAAAGACAAATACGAAAATAAAGATACAAAA
GTCTAAAAGACAAATACGAAAATAAAAAAGATTAACAACAGATTATTGAACGATACATAA
GTATCTTTTTCATTGCATGCAAAGGAAAATAAATCGTTGAACTGATAAATTCACCGATCA
GAAACAAGCATCCAAGAGACAGCAACAGCAGAGCGCAGCCAAACATCCTTCGAGCATACC
AGCTTGTTGCTTTTGCTGCGGAGCTTGAGAGTATTGAGGTGGAGGATAACCTTGAGCAGG
GTATCCCTGACCATATCCCGGCGGTGGATAACCGGCGGCAGGATAGCCAGCCGGAGGATA
ACCGTCCTTAGGAGGATACCCTTGGGGAGGAGGAGCACCGACAGGATGTTGTTCTTGATT
ATACATCTTTTGAATTCTTCTACCTTTTTTTTTTCTTTCTCTTCTCC

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2BR60TF 467 0 0
AGTAAATAATCCATAAGATACAAAAGTCTAAAAGACAAATACGAAAATAAAGATACAAAA
GTCTAAAAGACAAATACGAAAATAAAAAAGATTAACAACAGATTATTGAACGATACATAA
GTATCTTTTTCATTGCATGCAAAGGAAAATAAATCGTTGAACTGATAAATTCACCGATCA
GAAACAAGCATCCAAGAGACAGCAACAGCAGAGCGCAGCCAAACATCCTTCGAGCATACC
AGCTTGTTGCTTTTGCTGCGGAGCTTGAGAGTATTGAGGTGGAGGATAACCTTGAGCAGG
GTATCCCTGACCATATCCCGGCGGTGGATAACCGGCGGCAGGATAGCCAGCCGGAGGATA
ACCGTCCTTAGGAGGATACCCTTGGGGAGGAGGAGCACCGACAGGATGTTGTTCTTGATT
ATACATCTTTTGAATTCTTCTACCTTTTTTTTTT
CTTTCTCTTCTCC

QA 1 454 1 454
DS 



AS 2 4

CO CL2330Contig1 893 2 4 U
GGACCTCTTTCCCCTTCACACATCTTCTCTTCCTTATCTCCAAAATCTTTACGTATTTTT
TGTTTTTGTTCTTTATATTCAGAAATCTTCTCTGTTTCTTCTCGACAACATATCAAACAA
ACAAAACTCTTTTTTCCTCTGTTTCTTCTCGACAACATATCAAACAAACAAAACTCAGAC
CCTTTGATGATCGGACACTGATGACTCCGGTTCTCTGCGAAATCTTGCTCTCCGGGCTCA
CGGTTAAATCTGCTCTCTGCCGTAGAACTCACCTCGTTCAATCTTTCTCCGTCGTCTTCC
TCTACTGGTTTTACAACGTTTCATGAATTGTTGAAAACTCCCAAAGCTAATCCTTAATTA
CAAAAAATATATTCATTGCTTTTCAGACAAATCTAAGAAACCATCAAAAACAAATCTGTC
CTTTTTTTAGTTCTTGTAATAATTTTCTTGGTTAAACCTTTTTTCGGCGGAATAAAATGG
CTTCATCTAGCAGCACATACCGGAGCTCTAGCTCTTCCGACGGCGGAAACCCATCTGGTT
CCGTCGTCGCCGTCGACGACCGAAAGCGTAAGAGAATGCTATCGAACCGTGAATCTGCAC
GTAGATCGAGGATGCGTAAACAGAAACACGTGGACGATCTAACGGCTCAGATCAACCAGC
TTTCGAACGACAACCGTCAGATCTTGACGAGTCTCACCGTCACAACTCAGCTTTATATGA
AGATCCAAGCGGAGAACTCTATCTTGACCGCTCAGATGACAGAGCTGAGCACCAGACTCG
AGTCGTTGAACGAGATCGTCGATCTCGTGACACCAACACAACGGTGGTGGTGTCGACAGA
TCGACGCTGTGGATCGATGATCGTACGGTGGGATAATTGCGACGGATATTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF18TF U 1
AF RR2GD91TF U 130
BS 1 232 RR2DF18TF
BS 233 233 RR2GD91TF
BS 234 606 RR2DF18TF
BS 607 893 RR2GD91TF

RD RR2DF18TF 606 0 0
GGACCTCTTTCCCCTTCACACATCTTCTCTTCCTTATCTCCAAAATCTTTACGTATTTTT
TGTTTTTGTTCTTTATATTCAGAAATCTTCTCTGTTTCTTCTCGACAACATATCAAACAA
ACAAAACTCTTTTTTCCTCTGTTTCTTCTCGACAACATATCAAACAAACAAAACTCAGAC
CCTTTGATGATCGGACACTGATGACTCCGGTTCTCTGCGAAATCTTGCTCTCTGGGCTCA
CGGTTAAATCTGCTCTCTGCCGTAGAACTCACCTCGTTCAATCTTTCTCCGTCGTCTTCC
TCTACTGGTTTTACAACGTTTCATGAATTGTTGAAAACTCCCAAAGCTAATCCTTAATTA
CAAAAAATATATTCATTGCTTTTCAGACAAATCTAAGAAACCATCAAAAACAAATCTGTC
CTTTTTTTAGTTCTTGTAATAATTTTCTTGGTTAAACCTTTTTTCGGCGGAATAAAATGG
CTTCATCTAGCAGCACATACCGGAGCTCTAGCTCTTCCGACGGCGGAAACCCATCTGGTT
CCGTCGTCGCCGTCGACGACCGAAAGCGTAAGAGAATGCTATCGAACCGTGAATCTGCAC
GTAGAT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2GD91TF 764 0 0
TTTTTTCCTCTGTTTCTTCTCGACAACATATCAAACAAACAAAACTCAGACCCTTTGATG
ATCGGACACTGATGACTCCGGTTCTCTGCGAAATCTTGCTCTCCGGGCTCACGGTTAAAT
CTGCTCTCTGCCGTAGAACTCACCTCGTTCAATCTTTCTCCGTCGTCTTCCTCTACTGGT
TTTACAACGTTTCATGAATTGTTGAAAACTCCCAAAGCTAATCCTTAATTACAAAAAATA
TATTCATTGCTTTTCAGACAAATCTAAGAAACCATCAAAAACAAATCTGTCCTTTTTTTA
GTTCTTGTAATAATTTTCTTTGTTAAACCTTTTTTCGGCGGAATAAAATGGCTTCATCTA
GCAGCACATACCGGAGCTCTAGCTCTTCCGACGGCGGAAACCCATCTGGTTCCGTCGTCG
CCGTCGACGACCGAAAGCGTAAGAGAATGCTATCGAACCGTGAATCTGCACGTAGATCGA
GGATGCGTAAACAGAAACACGTGGACGATCTAACGGCTCAGATCAACCAGCTTTCGAACG
ACAACCGTCAGATCTTGACGAGTCTCACCGTCACAACTCAGCTTTATATGAAGATCCAAG
CGGAGAACTCTATCTTGACCGCTCAGATGACAGAGCTGAGCACCAGACTCGAGTCGTTGA
ACGAGATCGTCGATCTCGTGACACCAACACAACGGTGGTGGTGTCGACAGATCGACGCTG
TGGATCGATGATCGTACGGTGGGATAATTGCGACGGATATTACG

QA 1 764 1 764
DS 



CO CL2330Contig2 656 2 4 U
ATATTATTAATCAACAAAAAAGCACACACCAATACATGACAAAGGATAGCTAACATATAT
GCCCCCAAAATATATTTTTATTTATCCTTCCAACCAATCAAGATGCATGTACTATAATTA
CATCTCCACACCAACCCAAACACAAAAGCTAAACTTAAAAAAGAAATAAAAAGGGGGGCA
ATAGTACTAGTTTTTATAATTAATTTTAATTTAATACATATTCATCATATCATTAGCCAT
GATTGGTTGGTTAGAGTAAACCGAACCACCCCAAGGATTAACGCCGCTCATCATATCATC
GTAATATCCGTCGCAATTAATCCCAACCGTACGATCATCGAATCCACAGCCGTCGATCTG
GTCGACACCACCAACGTTGTTGTTGGTGGTCACGAGATCGACGATCTCGTTCAACGACTC
GAGTCTGGTGCTCAGCTCTGTCATCTGAGCGGTCAAGATAGAGTTCTCCGCTTGGATCTT
CATATAAAGCTGAGTTGTGACGGTGAGACTCGTCAAGATCTGACGGTTGTCGTTCGAAAG
CTGGTTGATCTGAGCCGTTAGATCGTCCACGTGTTTCTGTTTACGCATCCTCGATCTACG
TGCAGATTCACGGTTCGATAGCATTCTCTTACGCTTTCGGTCGTCGACGGCGACGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2GD91JQ U 1
AF RR2DF18JQ U 174
BS 1 373 RR2GD91JQ
BS 374 374 RR2DF18JQ
BS 375 653 RR2GD91JQ
BS 654 656 RR2DF18JQ

RD RR2GD91JQ 653 0 0
ATATTATTAATCAACAAAAAAGCACACACCAATACATGACAAAGGATAGCTAACATATAT
GCCCCCAAAATATATTTTTATTTATCCTTCCAACCAATCAAGATGCATGTACTATAATTA
CATCTCCACACCAACCCAAACACAAAAGCTAAACTTAAAAAAGAAATAAAAAGGGGGGCA
ATAGTACTAGTTTTTATAATTAATTTTAATTTAATACATATTCATCATATCATTAGCCAT
GATTGGTTGGTTAGAGTAAACCGAACCACCCCAAGGATTAACGCCGCTCATCATATCATC
GTAATATCCGTCGCAATTAATCCCAACCGTACGATCATCGAATCCACAGCCGTCGATCTG
GTCGACACCACCACCGTTGTTGTTGGTGGTCACGAGATCGACGATCTCGTTCAACGACTC
GAGTCTGGTGCTCAGCTCTGTCATCTGAGCGGTCAAGATAGAGTTCTCCGCTTGGATCTT
CATATAAAGCTGAGTTGTGACGGTGAGACTCGTCAAGATCTGACGGTTGTCGTTCGAAAG
CTGGTTGATCTGAGCCGTTAGATCGTCCACGTGTTTCTGTTTACGCATCCTCGATCTACG
TGCAGATTCACGGTTCGATAGCATTCTCTTACGCTTTCGGTCGTCGACGGCGA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2DF18JQ 483 0 0
GGGGGCAATAGTACTAGTTTTTATAATTAATTTTAATTTAATACATATTCATCATATCAT
TAGCCATGATTGGTTGGTTAGAGTAAACCGGACCACCCCAAGGATTAACGCCGCTCATCA
TATCATCGTAATATCCGTCGCAATTAATCCCAACCGTACGATCATCGAATCCACAGCCGT
CGATCTGGTCGACACCACCAACGTTGTTGTTGGTGGTCACGAGATCGACGATCTCGTTCA
ACGACTCGAGTCTGGTGCTCAGCTCTGTCATCTGAGCGGTCAAGATAGAGTTCTCCGCTT
GGATCTTCATATAAAGCTGAGTTGTGACGGTGAGACTCGTCAAGATCTGACGGTTGTCGT
TCGAAAGCTGGTTGATCTGAGCCGTTAGATCGTCCACGTGTTTCTGTTTACGCATCCTCG
ATCTACGTGCAGATTCACGGTTCGATAGCATTCTCTTACGCTTTCGGTCGTCGACGGCGA
CGA

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 4

CO CL2331Contig1 512 4 12 U
GGACCGTCCAAGATCCATAAAGAAAAAAAAGAAAAAAAATGATGATGAAGTCTTTGATTT
GTCTCTCGCTCATCCTCCTCCCTCTCATCGCCGTCGTGGAAGGCAACCTCGGTGGGTGGA
AGAAGATCGAAAACTTATCAGATGCGAACGTGGTGTCGCTCGCGAAGTATGCGGTTGATG
AGCATAACAAGCAGTCAAAAGCGAATCTGGTGTTCGTGAAGATAGTCGAGGGGAAGGAGC
AAGTGGTTAGCGGGAAAAAGTACGATCTGACGATTGCGGCCAAGGATGGTGCTGGTGCGA
CGAAGAACTACGAGGCTGTGGTGGTGGAAAGGGTGTGGGCTCATTACAGGAGTCTTGAGT
CTTTCAAGGCTGTGTAGATCTGATTTGGAATATTGATACGATATCTATATAGGTTTCCTT
GGTTTGAGATTTTGACATGATATGTTGTTGTTGTTTGGTAATAAAAAGTTTTCTTGATAT
TAAATAAAAGATCTGTTTTACTTGGAGCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2G169JQ C 1
AF RR2BJ69JQ C 4
AF RR2BJ69TF U 4
AF RR2G169TF U 1
BS 1 5 RR2G169JQ
BS 6 29 RR2BJ69TF
BS 30 32 RR2G169TF
BS 33 196 RR2BJ69TF
BS 197 197 RR2G169TF
BS 198 223 RR2BJ69TF
BS 224 224 RR2G169TF
BS 225 258 RR2BJ69TF
BS 259 259 RR2G169TF
BS 260 499 RR2BJ69TF
BS 500 509 RR2G169TF
BS 510 512 RR2G169JQ

RD RR2G169JQ 512 0 0
GGACCGTCCAAGATCCATAAAGAAAAAAAAGAAAAAAAATGATGATGAAGTCTTTGATTT
GTCTCTCGCTCATCCTCCTCCCTTTCATCGCCGTCGTGGAAGGCAACCTCGGTGGGTGGA
AGAAGATCGAAAACTTATCAGATGCGAACGTGGTGTCGCTCGCGAAGTATGCGGTTGATG
AGCATAACAAGCAGTCAAAAGGGAATTTGGTGTTTGTGAAGATAGTCGAGGGGAAGGAGC
AAGTGGTTAGCGGGAAAAAGTACGATTTGACGATTGCGGCCAAGGATGGTGCTGGTGCGA
CGAAGAACTACGAGGCTGTGGTGGTGGAAAGGGTGTGGGCTCATTACAGGAGTCTTGAGT
CTTTCAAGGCTGTGTAGATTTGATTTGGAATATTGATACGATATTTATA**GGTTTCCTT
GGTTTGAGATTTTGACATGATATGTTGTTGTTGTTTGGTAATAAAAAGTTTTCTTGATAT
TAAATAAAAGATTTGTTTTACTTGGAGCTTTG

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2BJ69JQ 496 0 0
GG
GTCCAAGATCCATAAAGAAAAAAAG**AAAAAAATGATGATGAAGTCTTTGATTTGTCTC
TCGCTCATCCTCCTCCCTCTCATCGCCGTCGTGGAAGGCAACCTCGGTGGGTGGAAGAAG
ATCGAAAACTTATCAGATGCGAACGTGGTGTCGCTCGCGAAGTATGCGGTTGATGAGCAT
AACAAGCAGTCGAAAGCGAATCTGGTGTTCGTGAAGATGGTCGAGGGGAAGGAGCAAGTG
GTTAGCGGGAAAA*GTACGATCTGACGATTGCGGCCAAGGATGGTGCTGGTGCGACGAAG
AACTACGAGGCTGTGGTGGTGGAAAGGGTGTGGGCTCATTACAGGAGTCTTGAGTCTTTC
AAGGCTGTGTAGATCTGATTTGGAATATTGATACGATATCTATATAGGTTTCCTTGGTTT
GAGATTTTGACATGATATGTTGTTGTTGTTTGGTAATAAAAAGTTTTCTTGATATTAAAT
AAAAGATCTGTTTT

QA 3 496 3 496
DS 

RD RR2BJ69TF 496 0 0
GG
GTCCAAGATCCATAAAGAAAAAAAG**AAAAAAATGATGATGAAGTCTTTGATTTGTCTC
TCGCTCATCCTCCTCCCTCTCATCGCCGTCGTGGAAGGCAACCTCGGTGGGTGGAAGAAG
ATCGAAAACTTATCAGATGCGAACGTGGTGTCGCTCGCGAAGTATGCGGTTGATGAGCAT
AACAAGCAGTCGAAAGCGAATCTGGTGTTCGTGAAGATGGTCGAGGGGAAGGAGCAAGTG
GTTAGCGGGAAAA*GTACGATCTGACGATTGCGGCCAAGGATGGTGCTGGTGCGACGAAG
AACTACGAGGCTGTGGTGGTGGAAAGGGTGTGGGCTCATTACAGGAGTCTTGAGTCTTTC
AAGGCTGTGTAGATCTGATTTGGAATATTGATACGATATCTATATAGGTTTCCTTGGTTT
GAGATTTTGACATGATATGTTGTTGTTGTTTGGTAATAAAAAGTTTTCTTGATATTAAAT
AAAAGATCTGTTTT

QA 3 496 3 496
DS 

RD RR2G169TF 512 0 0
GGACC
GTCCAAGATCCATAAAGAAAAAAAAGAAAAAAAATGATGATGAAGTCTTTGATTTGTCTC
TCGCTCATCCTCCTCCCTCTCATCGCCGTCGTGGAAGGCAACCTCGGTGGGTGGAAGAAG
ATCGAAAACTTATCAGATGCGAACGTGGTGTCGCTCGCGAAGTATGCGGTTGATGAGCAT
AACAAGCAGTCAAAAGCGAATCTGGTGTTCGTGAAGATAGTCGAGGGGAAGGAGCAAGTG
GTTAGCGGGAAAAAGTACGATCTGACGATTGCGGCCAAGGATGGTGCTGGTGCGACGAAG
AACTACGAGGCTGTGGTGGTGGAAAGGGTGTGGGCTCATTACAGGAGTCTTGAGTCTTTC
AAGGCTGTGTAGATCTGATTTGGAATATTGATACGATATCTATA**GGTTTCCTTGGTTT
GAGATTTTGACATGATATGTTGTTGTTGTTTGGTAATAAAAAGTTTTCTTGATATTAAAT
AAAAGATCTGTTTTACTTGGAGCT
CTG

QA 6 509 6 509
DS 



AS 1 4

CO CL2332Contig1 484 4 10 U
GGAAAACAACAGGAATCCAAACAATCTAAACGAAGAACTAAACATGAAGATGGCAACATT
GTTGCTTATCACATTTCTCATAGTCTCGGCATCATTCCCTCATCTCGCTAGTTCCAAGAG
CAATGGGAAATCATGTCTTACAAATGCGGTTAAGGTTTGCTTTGATGGCATTTCTCGTGG
AGCGCCGGTGAAGGCTGCATGTTGTAAGAGTCTGAAAGAGAATCATACATGTCTGTGTGA
TTTAATTAAATCCCGTGTGGTCGATACCAGTGTCCTTGGCTCTAGTCTCAAGTCTTGTGG
CATGCCTAACCCCAAATGTTGAACATATTAAAAGAATATCGAGCAACCATACCAAAGAAT
CCGTGCTTTATTTTTTTCGGTTTTTATACAATTTTTTAGTGACTAGAATAAATTACTATA
ATTTGTAAACCATTTTGGTAACCAATTCGAAATTTTAAATAGTATTTCTATAACTTTTTA
ACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2BD66JQ C 1
AF RR2BD66TF U 1
AF RR2AQ48JQ C 3
AF RR2AQ48TF U 3
BS 1 55 RR2BD66TF
BS 56 56 RR2AQ48TF
BS 57 76 RR2BD66TF
BS 77 77 RR2AQ48TF
BS 78 376 RR2BD66TF
BS 377 377 RR2AQ48TF
BS 378 378 RR2BD66TF
BS 379 379 RR2AQ48TF
BS 380 453 RR2BD66TF
BS 454 484 RR2AQ48TF

RD RR2BD66JQ 208 0 0
GGAAAACAC
CAGGAATCCAAACAATTTAAACGAAGAACTAAACATGAAGATGGCAGCATTGTTGCTTAT
CCCATTTTTCATAGTTTCGGCATCATTCCCTCATCTCGCTAGTTCCAAGAGCAATGGGAA
ATCATTTTTTACAAATGCGGTTAAGGTTTGCTTTGATGGCATTTTTCGTGGAGCGCCGGT
GAAGGCTGCATGTTGTAAG

QA 10 208 10 208
DS 

RD RR2BD66TF 468 0 0
GGAAAACAACAGGAATCCAAACAATCTAAACGAAGAACTAAACATGAAGATGGCAGCATT
GTTGCTTATCACATTTTTCATAGTCTCGGCATCATTCCCTCATCTCGCTAGTTCCAAGAG
CAATGGGAAATCATGTCTTACAAATGCGGTTAAGGTTTGCTTTGATGGCATTTCTCGTGG
AGCGCCGGTGAAGGCTGCATGTTGTAAGAGTCTGAAAGAGAATCATACATGTCTGTGTGA
TTTAATTAAATCCCGTGTGGTCGATACCAGTGTCCTTGGCTCTAGTCTCAAGTCTTGTGG
CATGCCTAACCCCAAATGTTGAACATATTAAAAGAATATCGAGCAACCATACCAAAGAAT
CCGTGCTTTATTTTTT*CAGTTTTTATACAATTTTTTAGTGACTAGAATAAATTACTATA
ATTTGTAAACCATTTTGGTAACCAATTCGAAAT
AAATAGTATTTCTAT

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR2AQ48JQ 482 0 0
GGAACGA
CAGGAATCCAAACAATTTAAACGAATAACTAAACATGAAGATGGTGACATTGTTGCTTAT
CACATTTCTCATAGTCTCGGCATCATTCCCTCATCTCGCTAGTTCCAAGAGCAATGGGAA
ATCATGTCTTACAAATGCGGTTAAGGTTTGCTTTGATGGCATTTCTCGTGGAGCGCCGGT
GAGGGCTGCATGTTGTAAGAGTCTGAAAGAGAATCATACATGTCTGTGTGATTTAATTAA
ATCCCGTGTGGTCGATACCAGTGTCCTTGGCTCTAGTCTCAAGTCTTGTGGCATGCCTAA
CCCCAAATGTTGAACATATTAAAAGAATATCGAGCAACCATACCAAAGAATCCGTGCTTT
ATTTTTTTCGGTTTTTATACAATTTTTTAGTGACTAGAATAAATTACTATAATTTGTAAA
CCATTTTGGTAACCAATTCGAAATTTTAAATAGTATTTCTATAACTTTTTAACCC

QA 8 482 8 482
DS 

RD RR2AQ48TF 482 0 0
GGAACGA
CAGGAATCCAAACAATCTAAACGAATAACTAAACATGAAGATGGTGACATTGTTGCTTAT
CACATTTCTCATAGTCTCGGCATCATTCCCTCATCTCGCTAGTTCCAAGAGCAATGGGAA
ATCATGTCTTACAAATGCGGTTAAGGTTTGCTTTGATGGCATTTCTCGTGGAGCGCCGGT
GAGGGCTGCATGTTGTAAGAGTCTGAAAGAGAATCATACATGTCTGTGTGATTTAATTAA
ATCCCGTGTGGTCGATACCAGTGTCCTTGGCTCTAGTCTCAAGTCTTGTGGCATGCCTAA
CCCCAAATGTTGAACATATTAAAAGAATATCGAGCAACCATACCAAAGAATCCGTGCTTT
ATTTTTTTCGGTTTTTATACAATTTTTTAGTGACTAGAATAAATTACTATAATTTGTAAA
CCATTTTGGTAACCAATTCGAAATTTTAAATAGTATTTCTATAACTTTTTAACCC

QA 8 482 8 482
DS 



AS 1 3

CO CL2333Contig1 1395 3 10 U
CCGAACAAGGAATATAACTAATTCTAAATGTAGGTACGATGAATTTTCAATTTACAAAAA
GAAGGATATGGTCAATTTCTCACATAGAGGCAAACAAAGAGATTATGTAGACATGAAGTT
ATAATCACATTCTTAGTGTGTGAAAAATCGTATAAACTCTTCAGTGGAGAGTAGTCAAAT
AAATCAAAGAGTTGAGGAAGTAGAAAATATCATCTCAAGAAGCTGCGGATGTAAACTTCC
GTTGCTAACCACAACACCACCCGCCGGAAAGATGATCCTCCTTTCCGATTGATCTTCCTC
CAGAATGATATCAACCCCTTCCCAATCTGTTACCTTTCCTCCAGCTTCATGAACGCATAT
GATCCCAACGGCATGATCCCAAGACTTTATAGTTCGCTCAGTTCTGGCTCGGAAAAGGAA
GACCGATGCTCTACCAGAAGCTACCATCAAGTACTTGCACAAACTTCCACAACATGTGGG
CAAAAGCCGAATCTCATTACCATGCAAGTCACCTGAATCTGTCTTTACGTCGAACAGACT
AGACAAGGGAAGTGATTCCCAGGGTTGGCTCTCTTGAATACAAAACCGAGCCTTGTTCAC
TAAACCACATGCATCAACAAAACGCCTTGTCCAATCACCTGATACTTGTAAACTCTTGGT
CCACGTTCCACAACCAGTATGGGAGAGCATTATGGTCCCGTTGGATTCATCTGAAGAGTC
TCCAGGCCAGTTTGGACAGCCCATGACTCCTAGCACAATTTCATTATCTACAACAAGGGC
CAATCCTACCACATATAAAGCCTCATCTCCTTTAAGGAACCCTCTTGTGCCATCTATTGG
ATCCAAAACCCAGTAAGTAGCTGGTTTGTTACAAAAAGTATAAGCATCTTTGCCACCTCT
ATCAATAGCTTCAAGCACATCAAGATCAGACAAGCGATCATCTCCAACGCTAGCTTTTGC
GATGACTTCACTCACCACAGAGCCCACGAGATTGTTCTCACGCAAGAAAAGAGAATCTTC
TTCAGCGACCAAAGGTATCGAAGGAAAAAATTTCGATAGCTCTAAGCTGACTAAAGCTTG
CACTCCGAAGTCTGCGATTGTAACTGGTGTTTGGTCATTCTTCTCGAGGATCTTGTCTTT
AGAAGAGAAAAGCGATCTCTTTACATCGATACAGAGGCGACAAGCTCTGTCAACAGCATC
AATGGCGGATTCTAGCTCTTTGTGGTACTTAGCTTGATGCTTCGGAAACGGGAGAGTGGC
CCTTACGATGAAGTATCTTCTGCGGGGAGGATTGGATACCGGTGGGAATCTAACGGCGGA
GACACGGGCTCCGGTGTCGAGAATGTGCATCGCAGCCGGTAGTCCGGTATAACTAAACCG
GTTTTAATTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY49JQ U 20
AF RR2GK30JQ U 1
AF RR2GK30TF C 634
BS 1 205 RR2GK30JQ
BS 206 206 RR2FY49JQ
BS 207 315 RR2GK30JQ
BS 316 316 RR2FY49JQ
BS 317 413 RR2GK30JQ
BS 414 414 RR2FY49JQ
BS 415 606 RR2GK30JQ
BS 607 607 RR2FY49JQ
BS 608 812 RR2GK30JQ
BS 813 1395 RR2GK30TF

RD RR2FY49JQ 651 0 0
AATTCTAAATGTAGGTATGATGAATTTTCAATTTACAAAAAGAAGGATATGGTCAATTTC
TCACATAGAGGCAAACAAAGAGATTATGTAGACATGAAGTTATAATCACATTCTTAGTGT
GTGAAAAATCGTATAAACTCTTCAGTGGAGAGTAGTCAAATAAATCAAAGAGTTGAGGAA
GTAGAAAATATCATCTCAAGAAGCTGCGGATGTAAACTTCCGTTGCTAACCACAACACCA
CCCGCCGGAAAGATGATCCTCCTTTCCGATTGATCTTCCTCCAGATTGATATCAACCCCT
TCCCAATCTGTTACCTTTCCTCCGGCTTCATGAACGCATATGATCCCAACGGCATGATCC
CAAGACTTTATAGTTCGCTCAGTTCTGGCTCGGAAAAGGAAGACCGATGCTCTACCAGAA
GCTACCATCAAGTACTTGCACAAACTTCCACAACATGTGGGCAAAAGCCGAATCTCATTA
CCATGCAAGTCACCTGAATCTGTCTTTACGTCGAACAGACTAGACAAGGGAAGTGATTCC
CAGGGTTGGCTCTCTTGAATACAAAACCGAGCCTTGTTCACTAAACCACATGCATCAACA
AAACGCCTTGTCCAATCACCTGCTACTTGTAAACTCTTGGTCCACGTTCCA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2GK30JQ 812 0 0
CCGAACAAGGAATATAACTAATTCTAAATGTAGGTACGATGAATTTTCAATTTACAAAAA
GAAGGATATGGTCAATTTCTCACATAGAGGCAAACAAAGAGATTATGTAGACATGAAGTT
ATAATCACATTCTTAGTGTGTGAAAAATCGTATAAACTCTTCAGTGGAGAGTAGTCAAAT
AAATCAAAGAGTTGAGGAAGTAGAAGATATCATCTCAAGAAGCTGCGGATGTAAACTTCC
GTTGCTAACCACAACACCACCCGCCGGAAAGATGATCCTCCTTTCCGATTGATCTTCCTC
CAGAATGATATCAACTCCTTCCCAATCTGTTACCTTTCCTCCAGCTTCATGAACGCATAT
GATCCCAACGGCATGATCCCAAGACTTTATAGTTCGCTCAGTTCTGGCTCGGAGAAGGAA
GACCGATGCTCTACCAGAAGCTACCATCAAGTACTTGCACAAACTTCCACAACATGTGGG
CAAAAGCCGAATCTCATTACCATGCAAGTCACCTGAATCTGTCTTTACGTCGAACAGACT
AGACAAGGGAAGTGATTCCCAGGGTTGGCTCTCTTGAATACAAAACCGAGCCTTGTTCAC
TAAACCGCATGCATCAACAAAACGCCTTGTCCAATCACCTGATACTTGTAAACTCTTGGT
CCACGTTCCACAACCAGTATGGGAGAGCATTATGGTCCCGTTGGATTCATCTGAAGAGTC
TCCAGGCCAGTTTGGACAGCCCATGACTCCTAGCACAATTTCATTATCTACAACAAGGGC
CAATCCTACCACATATAAAGCCTCATCTCCTT

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR2GK30TF 762 0 0
CATCA
CTGATACTTGTAAACTCTTG*TCCACGTTCCACAACCAGTATGGGAGAGCATTATGGTCC
CGTTGGATTCATCTGAAGAGTCTCCAGGCCAGTTTGGACAGCCCATGACTCCTAGCACAA
TTTCATTATCTACAACAAGGGCCAATCCTACCACATATAAAGCCTCATCTCCTTTAAGGA
ACCCTCTTGTGCCATCTATTGGATCCAAAACCCAGTAAGTAGCTGGTTTGTTACAAAAAG
TATAAGCATCTTTGCCACCTCTATCAATAGCTTCAAGCACATCAAGATCAGACAAGCGAT
CATCTCCAACGCTAGCTTTTGCGATGACTTCACTCACCACAGAGCCCACGAGATTGTTCT
CACGCAAGAAAAGAGAATCTTCTTCAGCGACCAAAGGTATCGAAGGAAAAAATTTCGATA
GCTCTAAGCTGACTAAAGCTTGCACTCCGAAGTCTGCGATTGTAACTGGTGTTTGGTCAT
TCTTCTCGAGGATCTTGTCTTTAGAAGAGAAAAGCGATCTCTTTACATCGATACAGAGGC
GACAAGCTCTGTCAACAGCATCAATGGCGGATTCTAGCTCTTTGTGGTACTTAGCTTGAT
GCTTCGGAAACGGGAGAGTGGCCCTTACGATGAAGTATCTTCTGCGGGGAGGATTGGATA
CCGGTGGGAATCTAACGGCGGAGACACGGGCTCCGGTGTCGAGAATGTGCATCGCAGCCG
GTAGTCCGGTATAACTAAACCGGTTTTAATTTGATCC

QA 6 762 6 762
DS 



AS 2 4

CO CL2334Contig1 910 2 2 U
TAACTTCTCCACTATTCGAAATTACATATACAGTTTCTGACGACGTCGCCAGCGATTGAT
CAAGAGAACGTCGCTCCTATGGAGGGAGTCAACACGTCGGTGAGCGAGAAGAAGAAGCCT
GCAGCGAAGGGAGGCAAGACGAAGAGAGCTAAGGAAGTGAAGGTGAAGGAGAAGAAGAAG
ACTGTGAAGAAAGCTGTCTCAACTCATCCTACTTACGAAGAGATGATCGAGGATGCGATC
GTTACGCTGAAGGAGAGAACCGGATCGAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAG
AAGCATAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGGAAGCTGTTGCTTCTCAATCTGAAGAGACTC
GTTGCTTCCGAGAAGCTTGTCAAGGTCAAGGCCTCGTTTAAGATTCCGTCGGCTAAACCA
TCATCATCCCCCAAAGCGGCGGCTGCGACATCTGCTCCGGTGAAAAAGAAGAAGAAACCT
ACCACCGCGGCGGCGAAGGAGAAGGTAACCGCCGCTTCCAAATCCAAGGGAGCTAAGGTG
TCTAAGAAACCAACTGCTCGTAAGGCCACTGTTGCTGCGCCCAAGAAGAAAGCCGTTAAG
GCTGAGGAGAGACCAGCCAAGGCAGCGAAAACATCGAAGGCAACATCTCCGGGGAAAAAG
GCTGTTCCTGCTAAGAAGAAGGCTCCCTTAATGGCGACTAAGAAGAAGACTCCAGTGAAG
AAGAGTGTGAAGCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGTGAAGAGGGCTTCAAGGATGGCCAAG
AAGTGAAATTAGGGCTTAGTGTTGACGATCTTGGTACTAGCTTACTCTCTAGGCGTTAAT
CTTGTATATCTTTTCTTTATGTCTATTTAAAGTTCTCGTGGTTTCATATATAAATGGCTA
AATCCTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT79TF U 1
AF RR2DT79JQ C 183
BS 1 561 RR2DT79TF
BS 562 910 RR2DT79JQ

RD RR2DT79TF 561 0 0
TAACTTCTCCACTATTCGAAATTACATATACAGTTTCTGACGACGTCGCCAGCGATTGAT
CAAGAGAACGTCGCTCCTATGGAGGGAGTCAACACGTCGGTGAGCGAGAAGAAGAAGCCT
GCAGCGAAGGGAGGCAAGACGAAGAGAGCTAAGGAAGTGAAGGTGAAGGAGAAGAAGAAG
ACTGTGAAGAAAGCTGTCTCAACTCATCCTACTTACGAAGAGATGATCGAGGATGCGATC
GTTACGCTGAAGGAGAGAACCGGATCGAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAG
AAGCATAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGGAAGCTGTTGCTTCTCAATCTGAAGAGACTC
GTTGCTTCCGAGAAGCTTGTCAAGGTCAAGGCCTCGTTTAAGATTCCGTCGGCTAAACCA
TCATCATCCCCCAAAGCGGCGGCTGCGACATCTGCTCCGGTGAAAAAGAAGAAGAAACCT
ACCACCGCGGCGGCGAAGGAGAAGGTAACCGCCGCTTCCAAATCCAAGGGAGCTAAGGTG
TCTAAGAAACCAACTGCTCGT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2DT79JQ 728 0 0
TGTGAAGAAAGCTGTCTCAACTCATCCTACTTACGAAGAGATGATCGAGGATGCGATCGT
TACGCTGAAGGAGAGAACCGGATCGAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAA
GCATAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGGAAGCTGTTGCTTCTCAATCTGAAGAGACTCGT
TGCTTCCGAGAAGCTTGTCAAGGTCAAGGCCTCGTTTAAGATTCCGTCGGCTAAACCATC
ATCATCCCCCAAAGCGGCGGCTGCGACATCTGCTCCGGTGAAAAAGAAGAAGAAACCTAC
CACCGCGGCGGCGAAGGAGAAGGTAACCGCCGCTTCCAAATCCAAGGGAGCTAAGGTGTC
TAAGAAACCAACTGCTCGTAAGGCCACTGTTGCTGCGCCCAAGAAGAAAGCCGTTAAGGC
TGAGGAGAGACCAGCCAAGGCAGCGAAAACATCGAAGGCAACATCTCCGGGGAAAAAGGC
TGTTCCTGCTAAGAAGAAGGCTCCCTTAATGGCGACTAAGAAGAAGACTCCAGTGAAGAA
GAGTGTGAAGCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGTGAAGAGGGCTTCAAGGATGGCCAAGAA
GTGAAATTAGGGCTTAGTGTTGACGATCTTGGTACTAGCTTACTCTCTAGGCGTTAATCT
TGTATATCTTTTCTTTATGTCTATTTAAAGTTCTCGTGGTTTCATATATAAATGGCTAAA
TCCTTTTC

QA 1 728 1 728
DS 



CO CL2334Contig2 868 2 6 U
TAACTGCTCCTCAATTCGAAATTACATATTCAGTTTCTGATGACGTCGCTAGCTATTGAT
CAAGAGAACGTCGCTCCTATGGAGGGAGTCAACACGTCGGTGAGCGAGAAGAAGAAACCT
GCAGCGAAGGGAGGCAAGACGAAGAAAGCTAAGGAAGTGAAGGTGAAGGAGAAGAAGAAG
ACTGTGAAGAAAGCTGTCTCAACTCATCCTACTTACGAAGAGATGATCAAGGATGCGATC
GTTACGCTGAAGGAGAGAACCGGATCGAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAG
AAGCATAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGGAAGCTGCTGCTCCTCAATCTGAAGAGGCTC
GTTGCTTCCGAGAAGCTTGTCAAGGTCAAGGCCTCGTTTAAGATTCCGTCGGCTAAGCCA
TCATCCCCCAAAGCGGCGGCTGTGACATCTGCTCCGGTGAAGAAGAAGAAGAAACCTACC
ACCGCGGCGGCGAAGGAGAAGGTAACCGCCGCTTCCAAATCCGAGGGAGCAAAGGTGTCT
AAGAAACCAACTGCTCGTAAGGCCACTGTTGCGCTCACGAAGAAAGCTGTTGAGGCTGAG
GAGAGACCAGCCAAGGCAGCGAAAACATTGAAAGTTACATCTCCGGGGAAAAAGGCTGTT
CCTGCTAAGAAGAAGGCTCCCAAGAAGAAGACACCAGTGAAGTAGAGTGTGAAGCCAAAG
ACGGTGAAGTCTCCAGTGAAGAGGGCTTCAAGGAAGGCCAAGAAGTGAAATTAGGGCTTA
GTGTTAACGATTTGGTAGTAGCTTACTCTCTAGGCGCTAATCTTGTACATCTCTTCTTTA
TCTCTATTTAAAGTTCTCGTGGTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY69TF U 1
AF RR2EY69JQ C 453
BS 1 675 RR2EY69TF
BS 676 676 RR2EY69JQ
BS 677 723 RR2EY69TF
BS 724 724 RR2EY69JQ
BS 725 739 RR2EY69TF
BS 740 868 RR2EY69JQ

RD RR2EY69TF 740 0 0
TAACTGCTCCTCAATTCGAAATTACATATTCAGTTTCTGATGACGTCGCTAGCTATTGAT
CAAGAGAACGTCGCTCCTATGGAGGGAGTCAACACGTCGGTGAGCGAGAAGAAGAAACCT
GCAGCGAAGGGAGGCAAGACGAAGAAAGCTAAGGAAGTGAAGGTGAAGGAGAAGAAGAAG
ACTGTGAAGAAAGCTGTCTCAACTCATCCTACTTACGAAGAGATGATCAAGGATGCGATC
GTTACGCTGAAGGAGAGAACCGGATCGAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAG
AAGCATAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGGAAGCTGCTGCTCCTCAATCTGAAGAGGCTC
GTTGCTTCCGAGAAGCTTGTCAAGGTCAAGGCCTCGTTTAAGATTCCGTCGGCTAAGCCA
TCATCCCCCAAAGCGGCGGCTGTGACATCTGCTCCGGTGAAGAAGAAGAAGAAACCTACC
ACCGCGGCGGCGAAGGAGAAGGTAACCGCCGCTTCCAAATCCGAGGGAGCAAAGGTGTCT
AAGAAACCAACTGCTCGTAAGGCCACTGTTGCGCTCACGAAGAAAGCTGTTGAGGCTGAG
GAGAGACCAGCCAAGGCAGCGAAAACATTGAAAGTTACATCTCCGGGGAAAAAGGCTGTT
CCTGCTAAGAAGAAG*CTCCCAAGAAGAAGACACCAGTGAAGTAGAGTGTGAAGCCAAAG
ACG*TGAAGTCTCCAGTGA
G

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2EY69JQ 416 0 0
TCCGGTGAAGAAGAAGAAGAAACCTACCACCGCGGCGGCGAAGGAGAAGGTAACCGCCGC
TTCCAAATCCGAGGGAGCAAAGGTGTCTAAGAAACCAACTGCTCGTAAGGCCACTGTTGC
GCTCACGAAGAAAGCTGTTGAGGCTGAGGAGAGACCAGCCAAGGCAGCGAAAACATTGAA
GGTTACATCTCCGGGGAAAAAGGCTGTTCCTGCTAAGAAGAAGGCTCCCAAGAAGAAGAC
ACCAGTGAAGTAGAGTGTGAAGCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGTGAAGAGGGCTTCAAG
GAAGGCCAAGAAGTGAAATTAGGGCTTAGTGTTAACGATTTGGTAGTAGCTTACTCTCTA
GGCGCTAATCTTGTACATCTCTTCTTTATCTCTATTTAAAGTTCTCGTGGTTTCAT

QA 1 416 1 416
DS 



AS 1 4

CO CL2335Contig1 2002 4 10 U
GGGCGTCTGTCTCCTCGTGTTCCCACTTCAGGATTATCTGCACAAAAGTTTGTAAAGGAA
AGCGTGTGGAAGACGAAACTAGCCTCAAGCTTCTTCTTCTGCTCTGTTTTTTTATCTTCT
TGCTAAGTAAAACAATAATGGGCGTGAAAGTAGCAACGACCTCAACCTTCAACCACTTGG
TGGCTGTTCATCATTCTCAAACCCTAGTTTCCTCCGCCGTTTCTTCTCCTTCAAGAAGAC
GAAGCTTCGGACACCACGACGGACGGTCTCTGTCCTGTCAGAGCCCGAGTCTCTTCGGCT
CTTCGAATCTCCGCCACAACTCCAAGTCCTCCTGCGAGCTCTTGAAATCATCTAAACCGA
CCAAAACTCAGCTCATTCGCAGAGCCTTCACCGGAAGCGTCGACCCTTTCTCCGAGGAAG
AGTTCTCCAAAAAGATGCAAGAGCTCACTCTCAAATTCCAAGAGGACAACGAAACAGAGA
CGACAACAACAAACAGTTTCGGCCTCGACAGATCATCCAGTTCCGTGGAACCCCCGTGGC
CCGAGATGGTGCAAATGTCTTCCATCGAGAGGAAAGCGAACAGCGTCGACCTCCCTATCT
CGCTCCGCATCATCAAAAGAAAGCTGCGGATGGAGGAAGAAGGACTTATCATCAACCGAG
GAGTCGGAGAAGAATCGGCTTGCTGCTCTGTGAAAAGAGCCTTCTCTTCTATGGTGTTTA
TGATCCGCGAGCTGCAGAGCTTCACGCTGCACATGAGAGAGCTTCTTCTCTTCGAAGATC
TCCAAGGGATCCTCCTCCGCGTTAGAAAAGAGATGCATGCGTCGTTCGTGTGGCTGTTCC
AGCAAGTTTTCTCCGCGACTCCTACTCTTATGGTCTCTGTTATGATCCTTCTCGCGAACT
TCACGGTTTATTCTATTGGAAGCAACTCCGCTTTAGCCGCCGCAACGCCTCCAACCGCCT
CCGTCTCTTTCAGGTTTGACACTACGGAGATAACTGAGTCACAGGAGAAGTTCGACTCAG
ATATGATCAAGACGTTCTCTGTTTCTTCTCCCAACGGGAAGACATCTTTTGTCGGCGGAG
GAAACGGTGGGAACAACGTCCCGCCCGTGCAGATCGGAACAGAGGGAGATGGTTCTGATC
AGTTCAGAACACCATCTCAGTTCTCGTCGTCATCTCTCGGCTCAACAACTGCGGATTCAG
AGGTATCGGTGTCGGGGCAGGAAGAGACTAGGCTGTGGAACTCGATCCTGGAGGAGACGG
CGAAGATGGAGGCGTTGGATCACGACACGATGAAGCAGATGGTTGCTCCAGTGGAGGCAC
GAGTAGAGGCGGAAGAGTCAATGGATTACTTCAAGACGGAGCTTCTCTACCAAACGGGTC
TGTCTCAGCAGCCTGATAACGTTCTCCTTCTTGCTAATTACGCTCAGTTTCTCTACCTAA
TCATACATGATTATGACAGAGCGGAGAAGTATTTCAAGAGAGCGGCAAAAGCAGAGCCAG
CTGACGCGGAGGCGTTGAGTAAATACGCGACGTTCTTGTGGAAGGCAAGGAACGATTTGT
GGAGAGCAGAGGAGACGTTCTTGGAAGCAATCTCTGCTGATCCAACCAACTCATTTTACT
CTGCAAACTACGCACATTTCCTTTGGAACACGGGTGGTGATGAGACGTGTTTCCCTCTCG
ACGCTCCACCACAACAGAACACAACCTAAAGATAAAAAGAGTGATAACAATTGTCCAAGT
GTACAGTGTGTTCCTTTTTAATACAATTCATGTCATGTGGCAACTTTTTGTTCTGTAAAA
CAAACAAGACTTTTGTTTATATATACGCACATATTTCAAAAGTTTTGTTTTTACTTTTTT
TTCTTTTCAAAATGTACTTGGACTATTCCATGGTGTCACGGACTTGTTCTTTTACGTGAA
CAAACCATGCGTCTGTCAGTTTCTCATCTACTTTACACAGTCCAGAAAGACGATTATTTT
CTCGTTGAAAGTTTATAATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ18TF U 1
AF RR2A741TF U 452
AF RR2A741JQ C 986
AF RR2BZ18JQ C 1351
BS 1 507 RR2BZ18TF
BS 508 508 RR2A741TF
BS 509 642 RR2BZ18TF
BS 643 643 RR2A741TF
BS 644 662 RR2BZ18TF
BS 663 1184 RR2A741TF
BS 1185 1185 RR2A741JQ
BS 1186 1220 RR2A741TF
BS 1221 1837 RR2A741JQ
BS 1838 2002 RR2BZ18JQ

RD RR2BZ18TF 662 0 0
GGGCGTCTGTCTCCTCGTGTTCCCACTTCAGGATTATCTGCACAAAAGTTTGTAAAGGAA
AGCGTGTGGAAGACGAAACTAGCCTCAAGCTTCTTCTTCTGCTCTGTTTTTTTATCTTCT
TGCTAAGTAAAACAATAATGGGCGTGAAAGTAGCAACGACCTCAACCTTCAACCACTTGG
TGGCTGTTCATCATTCTCAAACCCTAGTTTCCTCCGCCGTTTCTTCTCCTTCAAGAAGAC
GAAGCTTCGGACACCACGACGGACGGTCTCTGTCCTGTCAGAGCCCGAGTCTCTTCGGCT
CTTCGAATCTCCGCCACAACTCCAAGTCCTCCTGCGAGCTCTTGAAATCATCTAAACCGA
CCAAAACTCAGCTCATTCGCAGAGCCTTCACCGGAAGCGTCGACCCTTTCTCCGAGGAAG
AGTTCTCCAAAAAGATGCAAGAGCTCACTCTCAAATTCCAAGAGGACAACGAAACAGAGA
CGACAACAACAAACAGTTTCGGCCTCGGCAGATCATCCAGTTCCGTGGAACCCCCGTGGC
CCGAGATGGTGCAAATGTCTTCCATCGAGAGGAAAGCGAACAGCGTCGACCTCCCTATCT
CGCTCCGCATCATCAAAAGAAAGCTGCGGATGGAGGAAGAAG*ACTTATCATCAACCGAG
GA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2A741TF 775 0 0
G
AAATTCCAAGAGGACAACGAAACAGAGACGACAACAACAAACAGTTTCGGCCTCGACAGA
TCATCCAGTTCCGTGGAACCCCCGTGGCCCGAGATGGTGCAAATGTCTTCCATCGAGAGG
AAAGCGAACAGCGTCGACCTCCCTATCTCGCTCCGCATCATCAAAAGAAAGCTGCGGATG
GAGGAAGAAGGACTTATCATCAACCGAGGAGTCGGAGAAGAATCGGCTTGCTGCTCTGTG
AAAAGAGCCTTCTCTTCTATGGTGTTTATGATCCGCGAGCTGCAGAGCTTCACGCTGCAC
ATGAGAGAGCTTCTTCTCTTCGAAGATCTCCAAGGGATCCTCCTCCGCGTTAGAAAAGAG
ATGCATGCGTCGTTCGTGTGGCTGTTCCAGCAAGTTTTCTCCGCGACTCCTACTCTTATG
GTCTCTGTTATGATCCTTCTCGCGAACTTCACGGTTTATTCTATTGGAAGCAACTCCGCT
TTAGCCGCCGCAACGCCTCCAACCGCCTCCGTCTCTTTCAGGTTTGACACTACGGAGATA
ACTGAGTCACAGGAGAAGTTCGACTCAGATATGATCAAGACGTTCTCTGTTTCTTCTCCC
AACGGGAAGACATCTTTTGTCGGCGGAGGAAACGGTGGGAACAACGTCCCGCCCGTGCAG
ATCGGAACAGAGGGAGATGGTTCTGATCAGTTCAGAACACCATCTCAGTTCTCGTCGTCA
TCTCTCGGCTCA*CAACTGCGGATTCAGAGGTATCGGTGTCGGGGCAG
AAGAGA

QA 2 769 2 769
DS 

RD RR2A741JQ 852 0 0
GGAGATAACTGAGTCACAG*AGAAGTTCGACTCAGATATGATCAAGACGTTCTCTGTTTC
TTCTCCCAACGGGAAGACATCTTTTGTCGGCGGAGGAAACGGTGGGAACAACGTCCCGCC
CGTGCAGATCGGAACAGAGGGAGATGGTTCTGATCAGTTCAGAACACCATCTCAGTTCTC
GTCGTCATCTCTCGGCTCAACAACTGCGGATTCAGAGGTATCGGTGTCGGGGCAGGAAGA
GACTAGGCTGTGGAACTCGATCCTGGAGGAGACGGCGAAGATGGAGGCGTTGGATCACGA
CACGATGAAGCAGATGGTTGCTCCAGTGGAGGCACGAGTAGAGGCGGAAGAGTCAATGGA
TTACTTCAAGACGGAGCTTCTCTACCAAACGGGTCTGTCTCAGCAGCCTGATAACGTTCT
CCTTCTTGCTAATTACGCTCAGTTTCTCTACCTAATCATACATGATTATGACAGAGCGGA
GAAGTATTTCAAGAGAGCGGCAAAAGCAGAGCCAGCTGACGCGGAGGCGTTGAGTAAATA
CGCGACGTTCTTGTGGAAGGCAAGGAACGATTTGTGGAGAGCAGAGGAGACGTTCTTGGA
AGCAATCTCTGCTGATCCAACCAACTCATTTTACTCTGCAAACTACGCACATTTCCTTTG
GAACACGGGTGGTGATGAGACGTGTTTCCCTCTCGACGCTCCACCACAACAGAACACAAC
CTAAAGATAAAAAGAGTGATAACAATTGTCCAAGTGTACAGTGTGTTCCTTTTTAATACA
ATTCATGTCATGTGGCAACTTTTTGTTCTGTAAAACAAACAAGACTTTTGTTTATATATA
CGCACATATTTC

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR2BZ18JQ 652 0 0
TCAAGACGGAGCTTCTCTACCAAACGGGTCTGTCTCAGCAGCCTGATAACGTTCTCCTTC
TTGCTAATTACGCTCAGTTTCTCTACCTAATCATACATGATTATGACAGAGCGGAGAAGT
ATTTCAAGAGAGCGGCAAAAGCAGAGCCAGCTGACGCGGAGGCGTTGAGTAAATACGCGA
CGTTCTTGTGGAAGGCAAGGAACGATTTGTGGAGAGCAGAGGAGACGTTCTTGGAAGCAA
TCTCTGCTGATCCAACCAACTCATTTTACTCTGCAAACTACGCACATTTCCTTTGGAACA
CGGGTGGTGATGAGACGTGTTTCCCTCTCGACGCTCCACCACAACAGAACACAACCTAAA
GATAAAAAGAGTGATAACAATTGTCCAAGTGTACAGTGTGTTTCTTTTTAATACAATTCA
TGTCATGTGGCAACTTTTTGTTCTGTAAAACAAACAAGACTTTTGTTTATATATACGCAC
ATATTTCAAAAGTTTTGTTTTTACTTTTTTTTCTTTTCAAAATGTACTTGGACTATTCCA
TGGTGTCACGGACTTGTTCTTTTACGTGAACAAACCATGCGTCTGTCAGTTTCTCATCTA
CTTTACACAGTCCAGAAAGACGATTATTTTCTCGTTGAAAGTTTATAATGTG

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 3

CO CL2336Contig1 829 3 19 U
GGACTCCCTTGCCGTCGCTTCCAGTTGGTCAGGAACTTATTCGCAGAACAACAATGGCCA
CTCAAGCTGCCTCATTCACTGGCAACTTAAAGAAAGCTGTGGCGGGTATAAAGCGTATCA
ATCTCGACGATCTTCGTTGGCGAGTTTTTGATGCCAAAGGCCAGGTACTGGGTAGACTAG
CATCTCAGATATCAACAGTGCTTCAAGCCAAAGATAAGCCTACTTATTGTCCCAACCGCG
ACGATGGCGATATTTGCATTGTTCTCAATGCTAAGGATATCGGCATCACTGGTAGAAAGC
TCACTGACAAGTTCTACCGCTGGCACACCGGATATGTTGGACACCTGAAAGAACGGAGTC
TGAAAGATCAGATGGCCAAAGACCCCACTGAGGTCATCCGCAAGGCTGTCTGGCGCATGC
TTCCTAGTAACAATTTGCGTGATGACAGAGATCGGAAGCTGAGGATATTTGAAGGCAATG
AACATCCTTTTGGGGACAAGCCACTCGAGCCATTCGTGATGCCGCCTCGTACAGTGAGAG
AGATGCGACCCCGCGCCAGGCGAGCAATGATCCGTGCCCAGAAGAAGGCTGAGCAGGCAG
AAAATGGTGGAGCAGAGGTTAAAAAAGGCAAGAAGAGGACTCCTCCTTCTCAAACTGTAA
CTGCGTAGAAGAAAAGCTTCACAGATGTGACTCAGTCTTATTAAGCAACGATCATAATGC
AGTCGTGGTGTAAGCTTTTTTTGGTTGTTGAGTGCCAGACGATAGACACGGCCCTATCAT
AAAGCAAAGCAAAACCCTTAAACAGGGTCTCGTTTCTGGTTTAACTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 0 0 0 0 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL91TF U 1
AF RR2FU11TF U 9
AF RR2EL91JQ C 145
BS 1 37 RR2EL91TF
BS 38 38 RR2FU11TF
BS 39 43 RR2EL91TF
BS 44 44 RR2FU11TF
BS 45 538 RR2EL91TF
BS 539 556 RR2FU11TF
BS 557 557 RR2EL91JQ
BS 558 622 RR2FU11TF
BS 623 623 RR2EL91JQ
BS 624 651 RR2FU11TF
BS 652 654 RR2EL91JQ
BS 655 659 RR2FU11TF
BS 660 660 RR2EL91JQ
BS 661 674 RR2FU11TF
BS 675 675 RR2EL91JQ
BS 676 690 RR2FU11TF
BS 691 691 RR2EL91JQ
BS 692 701 RR2FU11TF
BS 702 829 RR2EL91JQ

RD RR2EL91TF 538 0 0
GGACTCCCTTGCCGTCGCTTCCAGTTGGTCAGGAACT*ATTCGGAGAACAACAATGGCCA
CTCAAGCTGCCTCATTCACTGGCAACTTAAAGAAAGCTGTGGCGGGTATAAAGCGTATCA
ATCTCGACGATCTTCGTTGGCGAGTTTTTGATGCCAAAGGCCAGGTACTGGGTAGACTAG
CATCTCAGATATCAACAGTGCTTCAAGCCAAAGATAAGCCTACTTATTGTCCCAACCGCG
ACGATGGCGATATTTGCATTGTTCTCAATGCTAAGGATATCGGCATCACTGGTAGAAAGC
TCACTGACAAGTTCTACCGCTGGCACACCGGATATGTTGGACACCTGAAAGAACGGAGTC
TGAAAGATCAGATGGCCAAAGACCCCACTGAGGTCATCCGCAAGGCTGTCTGGCGCATGC
TTCCTAGTAACAATTTGCGTGATGACAGAGATCGGAAGCTGAGGATATTTGAAGGCAATG
AACATCCTTTTGGGGACAAGCCACTCGAGCCATTCGTGATGCCGCCTCGTACAGTGAG

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2FU11TF 693 0 0
GG
GCCGTCGCTTCC*GTTGGTCAGGAACTTATTCTCTGAACAACGATGGCCACTCAAGCTGC
CTTATTCAGTGGCAACTTAAAGAAAGCTGTGGCGGGTATAAAGCGTATCAATCTCGACGG
TCTTCGTTGGCGAGTTTTTGATGCCAAAGGCCAGGTACTGGGTAGACTAGCATCTCAGAT
ATCAACTGTGCTTCAAGCCAAAGATAAGCCTACTTATTGTCCCAACCGCGACGATGGCGA
TATTTGCATTGTTCTCAATGCTAAGGATATCGGCATCACTGGTAGAAAGCTCACTGACAA
GTTCTACCGCTGGCACACCGGATATGTTGGACACCTGAAAGAACGGAGTCTGAAAGATCA
GATGGTCAAAGACCCCACTGAGGTCATCCGCAAGGCTGTCTGGCGCATGCTTCCTAGTAA
CAATTTGCGTGATGACAGAGATCGGAAGTTGAGGATATTTGAAGGCAATGAACATCCTTT
TGGGGACAAGCCACTCGAGCCATTCGTCATGCCGCCTCGTACAGTGAGAGAGATGCGACC
CCGCGCTAGGCGAGCAATGATCCGTGCCCAGAAGAAGGCTGAGCAGGCAGAAAATGGTGG
AGCAGAGGTTAAGAAAGGCAAGAAGAGGACTCCTCCTTCTCCTTCTGTAGCTGCGTAGAA
GAAAGGCTTCACAGATGTGATTCAGTCTTAT

QA 3 693 3 693
DS 

RD RR2EL91JQ 685 0 0
TTTTTGATGCCAAAGGCCAGGTACTGGGTAGACTAGCATCTCAGATATCAACAGTGCTTC
AAGCCAAAGATAAGCCTACTTATTGTCCCAACCGCGACGATGGCGATATTTGCATTGTTC
TCAATGCTAAGGATATCGGCATCACTGGTAGAAAGCTCACTGACAAGTTCTACCGCTGGC
ACACCGGATATGTTGGACACCTGAAAGAACGGAGTCTGAAAGATCAGATGGCCAAAGACC
CCACTGAGGTCATCCGCAAGGCTGTCTGGCGCATGCTTCCTAGTAACAATTTGCGTGATG
ACAGAGATCGGAAGCTGAGGATATTTGAAGGCAATGAACATCCTTTTGGGGACAAGCCAC
TCGAGCCATTCGTGATGCCGCCTCGTACAGTGAGAGAGATGCGACCCCGCGCCAGGCGAG
CAATGATCCGTGCCCAGAAGAAGGCTGAGCAGGCAGAAAATGGTGGAGCAGAGGTTAAAA
AAGGCAAGAAGAGGACTCCT***TCTCAAAGTGTAACTGCGTAGAAGAAAAGCTTCACAG
ATGTGACTCAGTCTTATTAAGCAACGATCATAATGCAGTCGTGGTGTAAGCTTTTTTTGG
TTGTTGAGTGCCAGACGATAGACACGGCCCTATCATAAAGCAAAGCAAAACCCTTAAACA
GGGTCTCGTTTCTGGTTTAACTGTT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 3

CO CL2337Contig1 1016 3 15 U
GGGTCGGTCACCGAGTAAAATAACAAATCACTCTCTCTTTCTCTCTATCTGACTGTTCGA
TCCTCAAAAATGGCGGACAAAGGTGCGATTAGGGTGAGCGGAATGCAGTTTTCGTACGAT
GCGCAGGATCCTATATTCTTCGATTTCAGCCTCGATCTCCCCGCCGGATCTCGTTGCCTC
TTGGTTGGTGCTAATGGATCTGGGAAGACGACATTGTTGAAGATTCTAGCAGGAAAGCAT
ATGGTTGGAGGGAAGAACATTGTGCAGGTCCTGAATCGCTCTGCTTTTCACGACACGGAC
CATGTCTGTGGTGGTGACTTGTCTTACCTTGGAGGCTCTTGGAGCAAAACCGCTGGTTCT
GCTGGTGAGATTCCTCTCCAGGGTGATTTCTCAGCAGAGCATATGATATTCGGAGTTGAA
GGGATTGATCCTGAGAGAAGAGAGAAACTGATTGATCTTCTTGATATCAACCTTCAGTGG
CGTATGCACAAGGTTTCTGATGGGCAGAGGCGTCGTGTGCAAATATGCATGGGTCTTTTA
CTTCCATTCAAGGTACTGTTACTGGATGAGGTCACTGTTGACCTCGACGTTGTTGCTAGG
ATGGATTTGTTGGAATTCTTCAAAGAAGAATGTGAACAGAGAGGAGCTACAATTGTATAT
GCAACGCATATTTTCGACGGACTAGAGACATGGGCTAGTCATTTGGCCTATATCCATGGA
GGAGAGCTGAAGCTCTCTGCTAAACTGAAGGAGGTCAAGGATTTAGAAACGTCACCGAAT
TTGCTCTCTGTGGTTGAAAATTGGCTTCGGTCTGAAACCGAAGTGGAGAAGAAGACTAAG
AAGAAACCTGTTGCTTCGTCTCCATTTATGTCATCTAGACAAATGGCGTATTACCGATGA
AATCTCAACATCTTTTGAGAAATCATCAGTAAGAATAAGAGTTTTTCACATTTGCAATTG
TTTTTCTCTACTACTTTGTTTGCTTTAATGATCTCATCTAAATATAAGTTTAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB46TF U 1
AF RR2CM47TF U 64
AF RR2CM47JQ C 218
BS 1 251 RR2CB46TF
BS 252 252 RR2CM47TF
BS 253 275 RR2CB46TF
BS 276 276 RR2CM47TF
BS 277 296 RR2CB46TF
BS 297 297 RR2CM47TF
BS 298 301 RR2CB46TF
BS 302 302 RR2CM47TF
BS 303 309 RR2CB46TF
BS 310 310 RR2CM47TF
BS 311 464 RR2CB46TF
BS 465 465 RR2CM47TF
BS 466 548 RR2CB46TF
BS 549 707 RR2CM47TF
BS 708 1016 RR2CM47JQ

RD RR2CB46TF 548 0 0
GGGTCGGTCACCGAGTAAAATAACAAATCACTCTCTCTTTCTCTCTATCTGACTGTTCGA
TCCTCAAAAATGGCGGACAAAGGTGCGATTAGGGTGAGCGGAATGCAGTTTTCGTACGAT
GCGCAGGATCCTATATTCTTCGATTTCAGCCTCGATCTCCCCGCCGGATCTCGTTGCCTC
TTGGTTGGTGCTAATGGATCTGGGAAGACGACATTGTTGAAGATTCTAGCAGGAAAGCAT
ATGGTTGGAGGAAAGAACATTGTGCAGGTCCTGAACCGCTCTGCTTTTCACGACACAGAC
CTTGTCTGTAGTGGTGACTTGTCTTACCTTGGAGGCTCTTGGAGCAAAACCGCTGGTTCT
GCTGGTGAGATTCCTCTCCAGGGTGATTTCTCAGCAGAGCATATGATATTCGGAGTTGAA
GGGATTGATCCTGAGAGAAGAGAGAAACTGATTGATCTTCTTGACATCAACCTTCAGTGG
CGTATGCACAAGGTTTCTGATGGGCAGAGGCGTCGTGTGCAAATATGCATGGGTCTTTTA
CTTCCATT

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2CM47TF 649 0 0
TCAAAAATGGCGGA*AAAGGTGCGATTAGGGTGAGCGGAATGCAGTTTTCGTACGATGTG
CAGGATCCTATATTCTTCGATTTCAGCCTCGATCTCCCCGCCGGATCTCGTTGCCTCTTG
GTTGGTGCTAATGGATCTGGGAAGACGACATTGTTGAAGATTCTAGCAGGAAAGCATATG
GTTGGAGGGAAGAACATTGTGCAGGTCCTGAATCGCTCTGCTTTTCACGACACGGACCAT
GTCTGTGGTGGTGACTTGTCTTACCTTGGAGGCTCTTGGAGCAAAACCGCTGGTTCTGCT
GGTGAGATTCCTCTCCAGGGTGATTTCTCAGCAGAGCATATGATATTCGGAGTTGAAGGG
ATTGATCCTGAGAGAAGAGAGAAACTGATTGATCTTCTTGATATCAACCTTCAGTGGCGT
ATGCACAAGGTTTCTGATGGGCAGAGGCGTCGTGTGCAAATATGCATGGGTCTTTTACTT
CCATTCAAGGTACTGTTACTGGATGAGGTCACTGTTGACCTCGACGTTGTTGCTAGGATG
GATTTGTTGGAATTCTTCAAAGAAGAATGTGAACAGAGAGGAGCTACAATTGTATATGCA
ACGCATATTTTCGACGGACTAGAGACATGGGCTAGTCATTTGGC
TATAT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2CM47JQ 799 0 0
TGAAGATTCTAGCAGGAAAGCATATGGTTGGAGGGAAGAACATTGTGCAGGTCCTGAATC
GCTCTGCTTTTCACGACACGGACCATGTCTGTGGTGGTGACTTGTCTTACCTTGGAGGCT
CTTGGAGCAAAACCGCTGGTTCTGCTGGTGAGATTCCTCTCCAGGGTGATTTCTCAGCAG
AGCATATGATATTCGGAGTTGAAGGGATTGATCCTGAGAGAAGAGAGAAACTGATTGATC
TTCTTGATATCAACCTTCAGTGGCGTATGCACAAGGTTTCTGATGGGCAGAGGCGTCGTG
TGCAAATATGCATGGGTCTTTTACTTCCATTCAAGGTACTGTTACTGGATGAGGTCACTG
TTGACCTCGACGTTGTTGCTAGGATGGATTTGTTGGAATTCTTCAAAGAAGAATGTGAAC
AGAGAGGAGCTACAATTGTATATGCAACGCATATTTTCGACGGACTAGAGACATGGGCTA
GTCATTTGGCCTATATCCATGGAGGAGAGCTGAAGCTCTCTGCTAAACTGAAGGAGGTCA
AGGATTTAGAAACGTCACCGAATTTGCTCTCTGTGGTTGAAAATTGGCTTCGGTCTGAAA
CCGAAGTGGAGAAGAAGACTAAGAAGAAACCTGTTGCTTCGTCTCCATTTATGTCATCTA
GACAAATGGCGTATTACCGATGAAATCTCAACATCTTTTGAGAAATCATCAGTAAGAATA
AGAGTTTTTCACATTTGCAATTGTTTTTCTCTACTACTTTGTTTGCTTTAATGATCTCAT
CTAAATATAAGTTTAAACT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2339Contig1 1492 4 17 U
GGAAGCTCAACTCAATAGTTCTGGTCTCTGCTCAGCTCTTACGACGCCCTGTGGAGATGA
CTAGCATTGTGCGGTTTGCGGCGGCGATAAGCTGCCTTTGGGTGTGTTGTGTCGGGTGTG
TGGCTCAGAGCGGATCTAGTAGCAGCAATACAGAGGATGCGATCTGGTTGATGGAAAGTA
AATTGATGGCGACATCTAATTCTTCACAGCTTCTCATGGTGCCTCTCACCTTGATTCAAG
GAGCTGCCTCCAAAGGAGCTGTTTGTCTGGATGGGACACTGCCTGGTTATCATATACACC
GTGGTTTTGGATCAGGTGCTAACCGCTGGCTCATCCAACTCGAGGGAGGAGGATGGTGCA
ACACACGGAGGAACTGTGTCTTCAGGAAAACCACACGCCGTGGCTCATCGAATCACATGG
AGAAAGTTTTGGCCTTCACTGGAATCTTAAGCAATAAAGCTAACGAGAATCCTGACTTTT
TCAACTGGAACAGAGTCAAACTGCGTTACTGTGATGGTGCCTCTTTCACTGGCGATAGTG
AGGACCAGAGTTCACAACTATACTATAGAGGACAAAGAATCTGGCAAGTAGCTATGGAAG
AACTGCTCTCTAAAGGCATGCAAAAAGCAGATCAGGCTCTGCTTTCTGGATGTTCAGCTG
GAGGATTAGCTTCCATCCTGCACTGCGATAAGTTCAAGGAACTCTTACCCGGTACTACCA
AAGTTAAATGCTTAAGTGATGCTGGAATGTTCATGGATGCAGTGGATGTCTCTGGTGGCC
ACTCGCTCAGGAACATGTTCCAAGGTGTTGTTACAGTCCAGAACCTCCAAAAGGAACTGT
CCACTACTTGTACAAAGCATTTGGATCCAACTTCGTGCTTCTTTCCCCAAAACTTGGTTT
CAGAGATTAAGACTCCCATGTTTCTTCTAAATGCAGCTTACGACGCTTGGCAGGTACAAG
AGAGCTTAGCTCCTCCATCTGCTGACAGAACCGGCTCTTGGAAACCATGCACATCAGATC
ACTCTCGTTGTAACTCATCTCAAATCCAGTTCTTCCAAGACTTCAGGAGTAAAATGGTGA
ATGTTGTAAAGTCTTTCTCGGCCTCGACTCAAAACGGTCTGTTCATAAACTCATGCTTCG
CTCACTGCCAATCCGAAAGACAGGACACTTGGTTTGCACCTGATTCTCCTAAGCTTAATG
GCAAGACGGTAGCTGAATCTGTTGGGGATTGGTACTTTGACCGAAAAGCAGTCAAAGCCA
TTGACTGTCCTTACCCTTGTGACAAAACATGCCACAACCTCATCTTCAAATGAGTTGAAA
AAAATAAAAAAAAAATCCTCAAACTCAAACAGCTTCTTGATTCATTCACATTATTTATGA
TGCTATCTTCTCCTTGTTGTCCGTTTTTATTTGTGGTTGAGTATATGCATTGGATTTAAA
AGTGTATACACTTAAATGAAGCTTAAAAATTAATAAAAAGATCACATTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY05TF U 1
AF RR2AQ20TF U 358
AF RR2AQ20JQ C 709
AF RR2EY05JQ C 929
BS 1 626 RR2EY05TF
BS 627 1066 RR2AQ20TF
BS 1067 1067 RR2AQ20JQ
BS 1068 1107 RR2AQ20TF
BS 1108 1111 RR2AQ20JQ
BS 1112 1112 RR2EY05JQ
BS 1113 1135 RR2AQ20JQ
BS 1136 1136 RR2EY05JQ
BS 1137 1225 RR2AQ20JQ
BS 1226 1226 RR2EY05JQ
BS 1227 1334 RR2AQ20JQ
BS 1335 1335 RR2EY05JQ
BS 1336 1363 RR2AQ20JQ
BS 1364 1364 RR2EY05JQ
BS 1365 1450 RR2AQ20JQ
BS 1451 1451 RR2EY05JQ
BS 1452 1492 RR2AQ20JQ

RD RR2EY05TF 626 0 0
GGAAGCTCAACTCAATAGTTCTGGTCTCTGCTCAGCTCTTACGACGCCCTGTGGAGATGA
CTAGCATTGTGCGGTTTGCGGCGGCGATAAGCTGCCTTTGGGTGTGTTGTGTCGGGTGTG
TGGCTCAGAGCGGATCTAGTAGCAGCAATACAGAGGATGCGATCTGGTTGATGGAAAGTA
AATTGATGGCGACATCTAATTCTTCACAGCTTCTCATGGTGCCTCTCACCTTGATTCAAG
GAGCTGCCTCCAAAGGAGCTGTTTGTCTGGATGGGACACTGCCTGGTTATCATATACACC
GTGGTTTTGGATCAGGTGCTAACCGCTGGCTCATCCAACTCGAGGGAGGAGGATGGTGCA
ACACACGGAGGAACTGTGTCTTCAGGAAAACCACACGCCGTGGCTCATCGAATCACATGG
AGAAAGTTTTGGCCTTCACTGGAATCTTAAGCAATAAAGCTAACGAGAATCCTGACTTTT
TCAACTGGAACAGAGTCAAACTGCGTTACTGTGATGGTGCCTCTTTCACTGGCGATAGTG
AGGACCAGAGTTCACAACTATACTATAGAGGACAAAGAATCTGGCAAGTAGCTATGGAAG
AACTGCTCTCTAAAGGCATGCAAAAA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2AQ20TF 750 0 0
GCAACACACGGAGGAACTGTGTCTTCAGGAAAACCACACGCCGTGGCTCATCGAATCACA
TGGAGAAAGTTTTGGCCTTCACTGGAATCTTAAGCAATAAAGCTAACGAGAATCCTGACT
TTTTCAACTGGAACAGAGTCAAACTGCGTTACTGTGATGGTGCCTCTTTCACTGGCGATA
GTGAGGACCAGAGTTCACAACTATACTATAGAGGACAAAGAATCTGGCAAGTAGCTATGG
AAGAACTGCTCTCTAAAGGCATGCAAAAAGCAGATCAGGCTCTGCTTTCTGGATGTTCAG
CTGGAGGATTAGCTTCCATCCTGCACTGCGATAAGTTCAAGGAACTCTTACCCGGTACTA
CCAAAGTTAAATGCTTAAGTGATGCTGGAATGTTCATGGATGCAGTGGATGTCTCTGGTG
GCCACTCGCTCAGGAACATGTTCCAAGGTGTTGTTACAGTCCAGAACCTCCAAAAGGAAC
TGTCCACTACTTGTACAAAGCATTTGGATCCAACTTCGTGCTTCTTTCCCCAAAACTTGG
TTTCAGAGATTAAGACTCCCATGTTTCTTCTAAATGCAGCTTACGACGCTTGGCAGGTAC
AAGAGAGCTTAGCTCCTCCATCTGCTGACAGAACCGGCTCTTGGAAACCATGCACATCAG
ATCACTCTCGTTGTAACTCATCTCAAATCCAGTTCTTCCAAGACTTCAG*AGTAAAATGG
TGAATGTTGTAAAGTCTTTCTCGGCCTCGA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2AQ20JQ 784 0 0
CCGGTACTACCAAAGTTAAATGCTTAAGTGATGCTGGAATGTTCATGGATGCAGTGGATG
TCTCTGGTGGCCACTCGCTCAGGAACATGTTCCAAGGTGTTGTTACAGTCCAGAACCTCC
AAAAGGAACTGTCCACTACTTGTACAAAGCATTTGGATCCAACTTCGTGCTTCTTTCCCC
AAAACTTGGTTTCAGAGATTAAGACTCCCATGTTTCTTCTAAATGCAGCTTACGACGCTT
GGCAGGTACAAGAGAGCTTAGCTCCTCCATCTGCTGACAGAACCGGCTCTTGGAAACCAT
GCACATCAGATCACTCTCGTTGTAACTCATCTCAAATCCAGTTCTTCCAAGACTTCAGGA
GTAAAATGGTGAATGTTGTAAAGTCTTTTTCGGCCTCGACTCAGAACGGTCTGTTCATAA
ACTCATGTTTCGCTCACTGCCAATCCGAAAGACAGGACACTTGGTTTGCACCTGATTCTC
CTAAGCTTAATGGCAAGACGGTAGCTGAATCTGTTGGTGATTGGTACTTTGACCGAAAAG
CAGTCAAAGCCATTGACTGTCCTTACCCTTGTGACAAAACATGCCACAACCTCATCTTCA
AATGAGTTGAAAAAAATAAAAAAAAA*TCCTCAAACTCAAACAGCTTCTTGATTCTTTCA
CATTATTTATGATGCTATCTTCTCCTTGTTGTCCGTTTTTATTTGTGGTTGAGTATATGC
ATTGGATTTAAAAGTGTATACATTTAAATGAAGCTTAAAAATTAATAAAAAGATCACATT
TCAC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2EY05JQ 536 0 0
AAATGCAGCTTACGACGCTTGGCAGGTACAAGAGAGCTTAGCTCCTCCATCTGCTGACAG
AACCGGCTCTTGGAAACCATGCACATCAGATCACTCTCGTTGTAACTCATCTCAAATCCA
GTTCTTCCAAGACTTCAGGAGTAAAATGGTGAATGTTGTAAAGTCTTTCTCGGCCTCGAC
TCAAAACGGTCTTTTCATAAACTCATGCTTCGCTCACTGCCAATCCGAAAGACAGGACAC
TTGGTTTGCACCTGATTCTCCTAAGCTTAATGGCAAGACGGTAGCTGAATCTGTTGGGGA
TTGGTACTTTGACCGAAAAGCAGTCAAAGCCATTGACTGTCCTTACCTTTGTGACAAAAC
ATGCCACAACCTCATCTTCAAATGAGTTGAACAAAATAAAAAAAAAATCCTCAAACTCAA
ACAGCTTCTTGATTCATTCACATTATTTATGATGCTATCTTCTCCTTGTTGTCCGTTTTT
ATTTGTGTTTGAGTATATGCATTGGATTTAAAAGTGTATACACTTAAATGAAGCTT

QA 1 536 1 536
DS 



AS 2 4

CO CL2340Contig1 1357 2 2 U
GGAATTCGATCAGAAAATGCTCAGAGAACTCAGCAAAGGCGATAGCTTTTCTTCAAGGGC
TTGACTCCGACCCTTTACACTCACCGGATCCGATCTACAAAGATGGTGAAACCATCGGAC
TTCAGAGCAGTACACTCGTTTATCCGGTCACATTACACCAAGGTCAACCCAATCACCACC
CGCCGGTCAATCCCACCCTCCAACGGCTTCGCTTCCCACCACACCTCCTCACCACCACCC
AAACCCAACGCGGGCTTGTCTCAGATCCTCTCCTCTCCCACCAATCTCAACCAAAAGCTG
CAGTCTTTCGTGAAAAACCCAAACTTTACGTCTGCGTTCAGGTTGCTGTCCACTAAGACC
TCCGGGTTTCGTAAAGTCGATGGGAGCTTTGCGAGGAAGGTCGTCGACAAGCCTGTGAAG
GCTGTCAGCTCCAGCTTCGCTAGGTACCGTGAGGCTATGGGGTTGCATGTTGATGCGTTC
TGGAAGAAGAATAGTCTTGTCTTGTATGGAGCTGGTGGTGTGTTTGTGTGTATCTTCCTT
TGGAGGATTATGTTTGGTATTGCGAGTACCTTTGTTGGCCTCTCTGAGGGTATGGCTAAG
TATGGGTTTCTAGCTCTCTCCTCTGCCATCGTTGCCTTCTCTGGACTGTACCTGCGGTCA
AGGTTTACGATAAATCCCGGATAAAGTATACAGGATGACGATGAGGAAGATCAACACAGC
AGCTGATATTCTTGAAGTTATGGGAGCGCCTCTGGCTGGATCAGATTTGAGAGCCTATGT
GATGTCAGGTGGTGGGATAACGTTCAAGAAATTCAAGCCAACGATTAGGAGCAAGCGTTG
CTTTCTCCTCTTCCCTGTTCAAGGTTCTGAGAGAAAGGGACTTGTTAGCGTCGAAGTTAA
GAAGAAGAAAGGCCAGTATGATATGAAGCTTTTGGCGGTGGATATTCCAATGGCGTCTGG
TCCTGACCAACGGTTATTTTTGATTGGGGATGAAGAAGGGTACAAAGTGGGTGGTGGTTT
AATCTCCGAGTTGAGAGACCCTGTTGTGAAAGCCATGGCAGCAACCAAGGAGTTCGATAA
TCTTGACAGAATCGAAGAGGAAGAAGACGCTGAGAGAGAGCTTCAAGAAGCTGAAAGAAA
GCACCGTGAAGAGATTGAGAAGATCGAAAAAGAGAGCTCTTAATCTCGTTTTTTATTACT
TCCCTGGAATGCTTGAAAACGTTTCTTTCACTATCTTCCAGTATCTCATCAGTGGATATA
ATAAAAGAAACAACAACCCCTTGAATCTTTCTGAAAACCCAGTTTATGTTTTTCTTTTCC
TGCTCAACTTCTTGCATCACGTTTTTGATGTATATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK58TF U 1
AF RR2AW59JQ C 574
BS 1 693 RR2DK58TF
BS 694 1357 RR2AW59JQ

RD RR2DK58TF 700 0 0
GGAATTCGATCAGAAAATGCTCAGAGAACTCAGCAAAGGCGATAGCTTTTCTTCAAGGGC
TTGACTCCGACCCTTTACACTCACCGGATCCGATCTACAAAGATGGTGAAACCATCGGAC
TTCAGAGCAGTACACTCGTTTATCCGGTCACATTACACCAAGGTCAACCCAATCACCACC
CGCCGGTCAATCCCACCCTCCAACGGCTTCGCTTCCCACCACACCTCCTCACCACCACCC
AAACCCAACGCGGGCTTGTCTCAGATCCTCTCCTCTCCCACCAATCTCAACCAAAAGCTG
CAGTCTTTCGTGAAAAACCCAAACTTTACGTCTGCGTTCAGGTTGCTGTCCACTAAGACC
TCCGGGTTTCGTAAAGTCGATGGGAGCTTTGCGAGGAAGGTCGTCGACAAGCCTGTGAAG
GCTGTCAGCTCCAGCTTCGCTAGGTACCGTGAGGCTATGGGGTTGCATGTTGATGCGTTC
TGGAAGAAGAATAGTCTTGTCTTGTATGGAGCTGGTGGTGTGTTTGTGTGTATCTTCCTT
TGGAGGATTATGTTTGGTATTGCGAGTACCTTTGTTGGCCTCTCTGAGGGTATGGCTAAG
TATGGGTTTCTAGCTCTCTCCTCTGCCATCGTTGCCTTCTCTGGACTGTACCTGCGGTCA
AGGTTTACGATAAATCCCGGATAAAGTATACAG
ATGACGA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2AW59JQ 784 0 0
GTTGGGTTATCA
GAGGGTATGGCTAAGTATGGGTTTCTAGCTCTCTCCTCTGCCATCGTTGCCTTCTCTGGA
CTGTACCTGCGGTCAAGGTTTACGATAAATCC*GGATAAAGTATACAGGATGACGATGAG
GAAGATCAACACAGCAGCTGATATTCTTGAAGTTATGGGAGCGCCTCTGGCTGGATCAGA
TTTGAGAGCCTATGTGATGTCAGGTGGTGGGATAACGTTCAAGAAATTCAAGCCAACGAT
TAGGAGCAAGCGTTGCTTTCTCCTCTTCCCTGTTCAAGGTTCTGAGAGAAAGGGACTTGT
TAGCGTCGAAGTTAAGAAGAAGAAAGGCCAGTATGATATGAAGCTTTTGGCGGTGGATAT
TCCAATGGCGTCTGGTCCTGACCAACGGTTATTTTTGATTGGGGATGAAGAAGGGTACAA
AGTGGGTGGTGGTTTAATCTCCGAGTTGAGAGACCCTGTTGTGAAAGCCATGGCAGCAAC
CAAGGAGTTCGATAATCTTGACAGAATCGAAGAGGAAGAAGACGCTGAGAGAGAGCTTCA
AGAAGCTGAAAGAAAGCACCGTGAAGAGATTGAGAAGATCGAAAAAGAGAGCTCTTAATC
TCGTTTTTTATTACTTCCCTGGAATGCTTGAAAACGTTTCTTTCACTATCTTCCAGTATC
TCATCAGTGGATATAATAAAAGAAACAACAACCCCTTGAATCTTTCTGAAAACCCAGTTT
ATGTTTTTCTTTTCCTGCTCAACTTCTTGCATCACGTTTTTGATGTATATGT

QA 13 784 13 784
DS 



CO CL2340Contig2 634 2 18 U
GTGACCAAAGACGATAGCTTTTCTTCGAGGGCTTGACTCCGACCCTTAACACTCACCGAA
TCCGATCTACAAAGATGGTGAAACCATCGGACTTCAGAGCAGTACACACGTTTATCCGGT
CACATTACTCCAAGGTCAACCCAATCACCACCCGCCGGTCAATCCCACCCTCGAACGGCG
TCGCTTCCCACCACAACACCTCACCACCACACAAACCCCACTTGGGCTTATCTCAGATCC
TCTCCTTCAACCAAAAGCTCCAACCTTTAGGTCTCCCTCGCCTGAAAAACCCAAACTTTA
CATTTACATGTGCGTTCAGGTTGCTGTCCACTAAGACCTCCGGGTTTCGTAAAGTCGATG
GGAGCTTCGCGAGGAAGGTCGTTGACAAGCCTGTGAAGGCTGTTAGCTCCAGCTTCGCTA
GGTACCGTGAGGCTATGGGGTTGCACGTTGATGCGTTCTGGAAGAAGAATAGTCTCGTCT
TGTACGGAGCTGGTGGTGTGTTTGTGTGTATCTTCCTTTGGAGGATTATGTTTGGTATTG
CGAGTACCTTTGTTGGCCTATCAGAGGGTATGGCTAAGTATGGGTTCCTAGCTCTCTCCT
CTGCCATCGTTGCCTTCTCTGGACTGTACCTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY96TF U 1
AF RR2AW59TFB U 58
BS 1 195 RR2GY96TF
BS 196 196 RR2AW59TFB
BS 197 197 RR2GY96TF
BS 198 198 RR2AW59TFB
BS 199 210 RR2GY96TF
BS 211 211 RR2AW59TFB
BS 212 281 RR2GY96TF
BS 282 282 RR2AW59TFB
BS 283 409 RR2GY96TF
BS 410 410 RR2AW59TFB
BS 411 476 RR2GY96TF
BS 477 477 RR2AW59TFB
BS 478 559 RR2GY96TF
BS 560 560 RR2AW59TFB
BS 561 562 RR2GY96TF
BS 563 563 RR2AW59TFB
BS 564 625 RR2GY96TF
BS 626 634 RR2AW59TFB

RD RR2GY96TF 625 0 0
GTGACCAAAGACGATAGCTTTTCTTCGAGGGCTTGACTCCGACCCTTAACACTCACCGAA
TCCGATCTACAAAGATGGTGAAACCATCGGACTTCAGAGCAGTACACACGTTTATCCGGT
CACATTACTCCAAGGTCAACCCAATCACCACCCGCCGGTCAATCCCACCCTCGAACGGCG
TCGCTTCCCACCACACCTCCTCACCACCACCCAAACCCCACTTGGGCTTATCTCAGATCC
TCTCCTTCAACCAAAAGCTCCAACCTTTAGGTCTCCCTCGCGTGAAAAACCCAAACTTTA
CATTTACATGTGCGTTCAGGTTGCTGTCCACTAAGACCTCCGGGTTTCGTAAAGTCGATG
GGAGCTTCGCGAGGAAGGTCGTTGACAAGCCTGTGAAGGCTGTTAGCTCTAGCTTCGCTA
GGTACCGTGAGGCTATGGGGTTGCACGTTGATGCGTTCTGGAAGAAGAATAGTCTCTTCT
TGTACGGAGCTGGTGGTGTGTTTGTGTGTATCTTCCTTTGGAGGATTATGTTTGGTATTG
CGAGTACCTTTGTTGGCCTCTCTGAGGGTATGGCTAAGTATGGGTTCCTAGCTCTCTCCT
CTGCCATCGTTGCCTTCTCTGGACT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2AW59TFB 577 0 0
GA
ATCCGATCTACAAAGATGGTGAAACCATCGGACTTCAGAGCAGTACACACGTTTATCCGG
TCACATTACTCCAAGGTCAACCCAATCACCACCCGCCGGTCAATCCCACCCTCGAACGGG
GTCGCTTCCCACCACAACACCTCACCACCACACAAACCCCACTTGGGCTTGTCTCAGATC
CTCTCCTTCAACCAAAAGCTCCAACCTTTAGGTCTCCCTCGCCTGAAAAACCCAAACTTT
ACATTTACGT*TGCGTTCAGGTTGCTGTCCACTAAGACCTCTGGGTTTCGTAAAGTCGAT
GGGAGCTTCGCGAGGAAGGTCGTTGACAAGCCTGTGAAGGCTGTTAGCTCCAGCTTCGCT
AGGTACCGTGAGGCTATGGGGTTGCACGTTGATGCGTTCTGGAAGAAGAATAGTCTTGTC
TTGTATGGAGCTGGTGGTGTGTTTGTGTGTATCTTCCTTTGGAGGATTATGTTTGGTATT
GCGAGTACCTTTGTTGGGTTATCAGAGGGTATGGCTAAGTATGGGTTTCTAGCTCTCTCC
TCTGCCATCGTTGCCTTCTCTGGACTGTACCTGCG

QA 3 577 3 577
DS 



AS 1 4

CO CL2341Contig1 876 4 8 U
GAACTCGAGGTGGAAGATGCCGTATGAGGAGAGTGGATCGAATTCGAATTTGTATTACTC
TTTTGAGGTTGCTGGTGTCCATGTGATCATGCTTGGCTCATACACGGATTATGATCGGTA
CTCAGATCAATACAATTGGTTAAAGGGTGATCTCTCAAAGGTGGACAGAGAAAGGACTCC
GTGGCTAATAGCATTGTTTCACGTGCCGTGGTATAACAGTAACGATGCCCATCAAAATGA
AGGTGATGGGATGATGGCTGAAATGGAGCCTTTGCTTTATGCGAGCGGTGTTGATATTGT
ATTCACTGGCCATGTCCATGCTTATGAACGCACGAAACGTGTCAACAATGGTAAATCAGA
TCCATGTGGCCCCGTACACATAACTATAGGAGATGGAGGAAACAGAGAAGGACTAGCTCG
CAAGTACAAAGATCCGTCGCCAGAGTGGTCAGTCTTCAGGGAAGCAAGCTTTGGACAAGG
CGAACTTCAGATGGTGAATTCAACCCATGCGCATTGGACCTGGCATAGGAACGATGACGA
TGAGCCAACAAAGTCTGATGAAGTTTGGTTAACCTCACTTGTGGACTCAGGATGTTGGAC
GGAGAAGAAATGGAATGAAAACCTCAGGAAAATACTCATGGAACCTTGATGATAAGTGAG
AATTGCAGTAAAGTAGTCCGAAGTACATATAAAAAGCTACAAGGTTGTTGTGTTAGACTA
TTGGCCACACCATAGTAGAAGACGTCCACAAGCTGCATAGAATTAGTAGTTTCAACTTTG
AAATTTTGTAAACTTGTAAACTTTGTGTTGTGATGTGTTGTTGTATTGTTGTCACGTTAC
TTTCATACAGTTTTTATCTTAATGTGTTTTATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2FP55TF U 1
AF RR2CB79JQ C 522
AF RR2H059JQ C 177
AF RR2CB79TF U 522
BS 1 627 RR2FP55TF
BS 628 628 RR2CB79TF
BS 629 661 RR2FP55TF
BS 662 662 RR2CB79TF
BS 663 694 RR2FP55TF
BS 695 791 RR2CB79TF
BS 792 792 RR2H059JQ
BS 793 876 RR2CB79TF

RD RR2FP55TF 698 0 0
GAACTCGAGGTGGAAGATGCCGTATGAGGAGAGTGGATCGAATTCGAATTTGTATTACTC
TTTTGAGGTTGCTGGTGTCCATGTGATCATGCTTGGCTCATACACGGATTATGATCGGTA
CTCAGATCAATACAATTGGTTAAAGGGTGATCTCTCAAAGGTGGACAGAGAAAGGACTCC
GTGGCTAATAGCATTGTTTCACGTGCCGTGGTATAACAGTAACGATGCCCATCAAAATGA
AGGTGATGGGATGATGGCTGAAATGGAGCCTTTGCTTTATGCGAGCGGTGTTGATATTGT
ATTCACTGGCCATGTCCATGCTTATGAACGCACGAAACGTGTCAACAATGGTAAATCAGA
TCCATGTGGCCCCGTACACATAACTATAGGAGATGGAGGAAACAGAGAAGGACTAGCTCG
CAAGTACAAAGATCCGTCGCCAGAGTGGTCAGTCTTCAGGGAAGCAAGCTTTGGACAAGG
CGAACTTCAGATGGTGAATTCAACCCATGCGCATTGGACCTGGCATAGGAACGATGACGA
TGAGCCAACAAAGTCTGATGAAGTTTGGTTAACCTCACTTGTGGACTCAGGATGTTGGAC
GGAGAAGAAATGGAATGAAAACCTCAG*AAAATACTCATGGAACCTTGATGATAAGTGAG
A*TTGCAGTAAAGTAGTCCGAAGTACATATAAAA
GCTA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2CB79JQ 225 0 0
GGCATAGGAACGATGACGATGAGCCAACAAAGTCTGATGAAGTTTGGTTAACCTCACTTG
TGGACTCAGGATGTTGGACGGAGAAGAAATGGAATGAAAACCTCAGGAAAATACTCATGG
AACCTTGATGATAAGTGAGAATTGCAGTAAAGTAGTCCGAAGTACATATAAAAAGCTACA
AGGTTGTTGTGTTAGACTATTGGCCACACCATAGTAGAAGACGTC

QA 1 225 1 225
DS 

RD RR2H059JQ 696 0 0
CTCCGTGGCTAATAGCATTGTTTCACGTGCCGTGGTATAACAGTAACGATGCCCATCAAA
ATGAAGGTGATGGGATGATGGCTGAAATGGAGCCTTTGCTTTATGCGAGCGGTGTTGATA
TTGTATTCACTGGTCATGTCCATGCTTATGAACGCACGAAACGTGTCAACAATGGTAAAT
CAGATCCATGTGGTCCCGTACACATAACTATAGGAGATGGAGGAAACAGAGAAGGACTAG
CTCGCAAGTACAAAGATCCGTCGCCAGAGTGGTCAGTCTTCAGGGAAGCAAGCTTTGGAC
ATGGCGAACTTCAGATGGTGAATTCAACCCATGCGCATTGGACCTGGCATAGGAACGACG
ACGATGAGCCAACAAAGTCTGATGAAGTTTGGTTAACCTCACTTGTGGACTCAGGATGTT
GGACGGAGAAGAAATGGAATGAAAACCTCAGGAAAATACTCATGGAACCTTGATGATAAG
TGAGAATTGCAGTAAAGTAGTCCGAAGTACATATAAAAAGCTACAAGGTTGTTGTGTTAG
ACTATTGGCCACACCATAGTAGAAGACGTCCACAAGCTGCATAGAATTAGTAGTTTCAAC
TTTGAAATTTTGTAAACTTGTAAACTTTGTGTTGTGATGTGTTGTTGTATTGTTGTCACG
TTACTTTCATACAGTTTTTATCTTAATGTGTTTTA
C

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2CB79TF 355 0 0
GGCATAGGAACGATGACGATGAGCCAACAAAGTCTGATGAAGTTTGGTTAACCTCACTTG
TGGACTCAGGATGTTGGACGGAGAAGAAATGGAATGAAAACCTCAGGAAAATACTCATGG
AACCTTGATGATAAGTGAGAATTGCAGTAAAGTAGTCCGAAGTACATATAAAAAGCTACA
AGGTTGTTGTGTTAGACTATTGGCCACACCATAGTAGAAGACGTCCACAAGCTGCATAGA
ATTAGTAGTTTCAACTTTGAAATTTTGTAAGCTTGTAAACTTTGTGTTGTGATGTGTTGT
TGTATTGTTGTCACGTTACTTTCATACAGTTTTTATCTTAATGTGTTTTATATCC

QA 1 355 1 355
DS 



AS 1 3

CO CL2342Contig1 855 3 6 U
AATTTAGGATAAAAAATTATCAACAAATATATGGTGAAACTTATTCAGGTTTTGCTATAA
GCAATGTTATACTTCAATTCAGGTTAACAATATAGGATGATAGATAGATACACGGAATCA
GAACTGTGTCTGAATAGTAAAAGTCCGATTCACAGTATTGACTGGAGCTGCTGTATCTCA
GCGGAATCTGATGAAACATTGTCTTCTTAAAATGGTGATCTGTACACTTCAACCATAGCT
TTCCCTTTATCAAGAACTTCAAAAGGAACTGTCTGTAAAAGGCTGTCTAGTGCTGTTAAC
GCCGTACCAAGCTGCGACTTCATCAATTCAACAGTAGCGTTTGGATCCTTCCTCGACGCA
CGTAGAAACAGCGAATCCATTTCTTCCAGTGCTCTGAGACAGCGATCAACATCATTAGAC
GCGGTTTGGGAATAACCAGCATCTGAAGCGTACTGAGCAACGGCTCGAATGTTTACACGC
AAGGAACTAGCAGGTCCAGACCTGAGTACCGATCTACATGCCTCGAATTCAGGCTTCTCC
ACGCTCAAAATTTTCTCAAGATCTTGAAATTGAAGCTGAGCTAGAATGACTGGTGGTACA
TATGCTTCAAGTGGATCAAGTCTTTTCCTCTTCACGTACTTATCAATCAGGCTACTCGCC
ATTGCATCGTTAGGGAAAGGAAGGAGGCGGGAGAGTATGAAGGAGACGGAGATCACTCGT
CGGCTCTGTTTCTTCCATACCAGAGGTGACGAAGATGCGCAAGTTGGCCTTTCGCGGTGC
TTTGAAAGTGGGAGGAGGCTCGCAGTAGCGTTAAGTGAAGCCATTCCGGATAACACCACA
GGCATCTTATCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT27JQ U 54
AF RR2DK03JQ U 1
AF RR2DK03TF C 267
BS 1 61 RR2DK03JQ
BS 62 62 RR2DT27JQ
BS 63 94 RR2DK03JQ
BS 95 97 RR2DT27JQ
BS 98 577 RR2DK03JQ
BS 578 855 RR2DK03TF

RD RR2DT27JQ 460 0 0
GCTATAAGCAATGTTATACTTCAATTCAGGTTAACAATATAGGATGATAGATAGATACAC
GGAATCAGAACTGTGTCTGAATAGTAAAAGTCCGTTTCACAGTATTGACTGGAGCTGCTG
TATCTCAGCGGAGTCTGATGAAACATTGTCTTCTTCGAATGGTGATCTGTACACTTCAAC
CATAGCTTTCCCTTTATCAAGAACTTCAGAAGGAACTGTTTGTAAAAGGCTGTCTAGTGC
TGTTAACGCCGTACCAAGCTGCGACTTCATCAAATCAACAGTTGCGTTTGGGTCCTTCCT
CGACGCACGTAGAAACAGCGAATCCATTTCTTCCAGTGCTCTGAGACAGCGATCAACATC
ATTAGACGCGGTTTGGGAATAACCAGCATCTGAAGCGTACTGAGCAACGGCTCGAATGTT
TACACGCAAGGAACTAGCAGGTCCAGACCTGAGTACCGAT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2DK03JQ 577 0 0
AATTTAGGATAAAAAATTATCAACAAATATATGGTGAAACTTATTCAGGTTTTGCTATAA
GTAATGTTATACTTCAATTCAGGTTAACAATATA***TGATAGATAGATACACGGAATCA
GAACTGTGTCTGAATAGTAAAAGTCCGATTCACAGTATTGACTGGAGCTGCTGTATCTCA
GCGGAATCTGATGAAACATTGTCTTCTTAAAATGGTGATCTGTACACTTCAACCATAGCT
TTCCCTTTATCAAGAACTTCAAAAGGAACTGTCTGTAAAAGGCTGTCTAGTGCTGTTAAC
GCCGTACCAAGCTGCGACTTCATCAATTCAACAGTAGCGTTTGGATCCTTCCTCGACGCA
CGTAGAAACAGCGAATCCATTTCTTCCAGTGCTCTGAGACAGCGATCAACATCATTAGAC
GCGGTTTGGGAATAACCAGCATCTGAAGCGTACTGAGCAACGGCTCGAATGTTTACACGC
AAGGAACTAGCAGGTCCAGACCTGAGTACCGATCTACATGCCTCGAATTCAGGCTTCTCC
ACGCTCAAAATTTTCTCAAGATCTTGAAATTGAAGCT

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2DK03TF 589 0 0
AACTGTCTGTAAAAGGCTGTCTAGTGCTGTTAACGCCGTACCAAGCTGCGACTTCATCAA
TTCAACAGTAGCGTTTGGATCCTTCCTCGACGCACGTAGAAACAGCGAATCCATTTCTTC
CAGTGCTCTGAGACAGCGATCAACATCATTAGACGCGGTTTGGGAATAACCAGCATCTGA
AGCGTACTGAGCAACGGCTCGAATGTTTACACGCAAGGAACTAGCAGGTCCAGACCTGAG
TACCGATCTACATGCCTCGAATTCAGGCTTCTCCACGCTCAAAATTTTCTCAAGATCTTG
AAATTGAAGCTGAGCTAGAATGACTGGTGGTACATATGCTTCAAGTGGATCAAGTCTTTT
CCTCTTCACGTACTTATCAATCAGGCTACTCGCCATTGCATCGTTAGGGAAAGGAAGGAG
GCGGGAGAGTATGAAGGAGACGGAGATCACTCGTCGGCTCTGTTTCTTCCATACCAGAGG
TGACGAAGATGCGCAAGTTGGCCTTTCGCGGTGCTTTGAAAGTGGGAGGAGGCTCGCAGT
AGCGTTAAGTGAAGCCATTCCGGATAACACCACAGGCATCTTATCACCC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 2 4

CO CL2343Contig1 554 2 3 U
GAATAGTATAGATCAGAATTTAAATTCTAGTAAGAAAGTAATAAAAGTGTGTACAATATT
CAAATCCAAAATACAATATTGTTGCTAACTTGGTCACAAGCTATAATCGAATTTTACCAA
ATACGTCTGCAAGACAATGTCACACATAATTATTTACCCTATTTTATATGCACTTTAATC
ATATTCATATACCAAACGACCAACAAACGCCATCAGCAGCATCGACTTTTCACACAATTT
ATTCATCGATCAGCTTTCACCTTTTCTTTACCGTTTGGTTTGCATCGACGATGTTCAAGA
CTCGTCCATAAAGCCAGTGCCATAACCACTTGACCTTATGAACTTCTTTAGGAGAAGAAC
CATGATTGCGATTGTGAGCCCAACCGCTGCCAACGTGAACAGTCTGTCATCGACTGGCTT
CTGAGCCGCTCTTCTTACCATTGTTTGCTCACCACTTCCAGAAGCTTTTGCCGCAACCTC
AACCGTTGCTAACGCTCCTGCTGTGGGACTCACGTTAGCTTCTCTATTGACTGCTTCAGC
TGCTTCTTCGATTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E151JQ U 92
AF RR2D938JQ U 1
BS 1 476 RR2D938JQ
BS 477 477 RR2E151JQ
BS 478 554 RR2D938JQ

RD RR2E151JQ 400 0 0
GGTCACAAGCTATAATCGAATTTTACCAAATACGTCTGCAAGACAATGTCACACATAATT
ATTTACCCTATTTTATATGCACTTTAATCATATTCATATACCAAACGACCAACAAACGCC
ATCAGCAGCATCGACTTTTCACACAATTTATTCATCGATCAGCTTTCACCTTTTCTTTAC
CGTTTGGTTTGCATCGACGATGTTCAAGACTCGTCCATAAAGCCAGTGCCATAACCACTT
GACCTTATGAACTTCTTTAGGAGAAGAACCATGATTGCGATTGTGAGCCCAACCGCTGCC
AACGTGAACAGTCTGTCATCGACTGGCTTCTGAGCCGCTCTTCTTACCATTGTTTGCTCA
CCACTTCCAGAAGCTTTTGCCGCAACCTCAACCGTTGCTA

QA 1 400 1 400
DS 

RD RR2D938JQ 554 0 0
GAATAGTATAGATCAGAATTTAAATTCTAGTAAGAAAGTAATAAAAGTGTGTACAATATT
CAAATCCAAAATACAATATTGTTGCTAACTTGGTCACAAGCTATAATCGAATTTTACCAA
ATACGTCTGCAAGACAATGTCACACATAATTATTTACCCTATTTTATATGCACTTTAATC
ATATTCATATACCAAACGACCAACAAACGCCATCAGCAGCATCGACTTTTCACACAATTT
ATTCATCGATCAGCTTTCACCTTTTCTTTACCGTTTGGTTTGCATCGACGATGTTCAAGA
CTCGTCCATAAAGCCAGTGCCATAACCACTTGACCTTATGAACTTCTTTAGGAGAAGAAC
CATGATTGCGATTGTGAGCCCAACCGCTGCCAACGTGAACAGTCTGTCATCGACTGGCTT
CTGAGCCGCTCTTCTTACCATTGTTTGCTCACCACTTCCAGAAGCTTTTGCCGCAATCTC
AACCGTTGCTAACGCTCCTGCTGTGGGACTCACGTTAGCTTCTCTATTGACTGCTTCAGC
TGCTTCTTCGATTA

QA 1 554 1 554
DS 



CO CL2343Contig2 770 2 16 U
GGGACGGCGGCGGATCACATTTCCGGTTAGATCTAGAAGATGGCGGATGAGAAGTATAAC
CGTAAGAATCCGGCCGTGAAGAGGATTCTGCAGGAGGTTAAGGAGATGCAAGCTAATCCA
TCCGACGATTCCATGTCTCTCCCCCTTGAGGAGAACATATTTGAGTGGCAATTCGCCATC
AGAGGCCCTGCGGATACTGAGTTTGAAGGTGGGATCTATCATGGGAGGATTCAACTGCCT
GCAGATTACCCTTTCAAACCTCCTTCCTTCATGTTGTTGACTCCTAATGGCCGTTTTGAA
ACCAATACCAAGATTTGCTTGAGCATTTCGAATTACCATCCCGAACATTGGCAACCGTCA
TGGAGTGTTCGCACTGCTTTGGTGGCTCTCATTGCCTTCATGCCTACAAGCCCCAACGGA
GCACTGGGCTCAGTAGAGTATCCGAAAGAAGAGAGGCGTACACTAGCCGTTAAATCACGT
GAGGCTCCACCCAAGTATGGCTCTCCTGAACGTCAGAAAGTTATAGATGAGATTCATCAT
TACATCCTTAGCAAAGCGACAGTGGTTTCAAAACCTCTTCCTCTGGAATGTAACCAAACT
GCTTCCACTGAATCAGTAGCTCATTCCCAAACTGAGCCACAGGAAGCCATAACAGTAGTG
GAAAACCATCCGTCGTCACAGCAGACACCATACCTGATGATCGATAATCGAAGAGCAGCT
GAAGCAGTCAATAGAGAAGCTAACGTGAGTCCACAGCAGAGCGTTAGCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E151TF U 1
AF RR2D938TF U 91
BS 1 119 RR2E151TF
BS 120 120 RR2D938TF
BS 121 125 RR2E151TF
BS 126 126 RR2D938TF
BS 127 130 RR2E151TF
BS 131 131 RR2D938TF
BS 132 359 RR2E151TF
BS 360 360 RR2D938TF
BS 361 459 RR2E151TF
BS 460 460 RR2D938TF
BS 461 524 RR2E151TF
BS 525 525 RR2D938TF
BS 526 593 RR2E151TF
BS 594 594 RR2D938TF
BS 595 625 RR2E151TF
BS 626 770 RR2D938TF

RD RR2E151TF 625 0 0
GGGACGGCGGCGGATCACATTTCCGGTTAGATCTAGAAGATGGCGGATGAGAAGTATAAC
CGTAAGAATCCGGCCGTGAAGAGGATTCTGCAGGAGGTTAAGGAGATGCAAGCTAATCCG
TCCGATGATTTCATGTCTCTCCCCCTTGAGGAGAACATATTTGAGTGGCAATTCGCCATC
AGAGGCCCTGCGGATACTGAGTTTGAAGGTGGGATCTATCATGGGAGGATTCAACTGCCT
GCAGATTACCCTTTCAAACCTCCTTCCTTCATGTTGTTGACTCCTAATGGCCGTTTTGAA
ACCAATACCAAGATTTGCTTGAGCATTTCGAATTACCATCCCGAACATTGGCAACCGTCG
TGGAGTGTTCGCACTGCTTTGGTGGCTCTCATTGCCTTCATGCCTACAAGCCCCAACGGA
GCACTGGGCTCAGTAGAGTATCCGAAAGAAGAGAGGCGTGCACTAGCCGTTAAATCACGT
GAGGCTCCACCCAAGTATGGCTCTCCTGAACGTCAGAAAGTTATTGATGAGATTCATCAT
TACATCCTTAGCAAAGCGACAGTGGTTTCAAAACCTCTTCCTCTGGAATGTAATCAAACT
GCTTCCACTGAATCAGTAGCTCATT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2D938TF 680 0 0
CAGGAGGTTAAGGAGATGCAAGCTAATCCATCCGACGATTCCATGTCTCTCCCCCTTGAG
GAGAACATATTTGAGTGGCAATTCGCCATCAGAGGCCCTGCGGATACTGAGTTTGAAGGT
GGGATCTATCATGTGAGGATTCAGCTGCCTGCAGATTACCCTTTCAAACCTCCTTCCTTC
ATGTTGTTGACTCCTAATGGCCGTTTTGAAACCAATACCAAGATTTGCTTGAGCATTTCG
AATTACCATCCCGAGCATTGGCAGCCTTCATGGAGTGTTCGCACTGCTTTGGTGGCTCTC
ATTGCCTTCATGCCTACAAGCCCCAACGGAGCACTGGGCTCAGTAGAGTATCCGAAAGAA
GAGAGGCGTACACTAGCCGTTAAATCACGTGAGGCTCCACCCAAGTATGGCTCTCCTGAA
CGTCAGAAAGTTATAGATGAGATTCATCATTACATCCTTAGCAAAGCGACAGTGGTTTCA
AAACCTCTTCCTCTGGAATGTAACCAAACTGCTTCCACTGAATCAGTAGCTCATTCCCAA
ACTGAGCCACAGGAAGCCATAACAGTAGTGGAAAACCATCCGTCGTCACAGCAGACACCA
TACCTGATGATCGATAATCGAAGAGCAGCTGAAGCAGTCAATAGAGAAGCTAACGTGAGT
CCACAGCAGAGCGTTAGCAA

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL2344Contig1 777 2 2 U
TTTTTTTTTCAAGTGAAAGCTGTTGCTTTTAAAGGTGACGTTTTGATAGTAGGAGAGAGG
GTTACAAAGACTACAACAAACAAACACACAACACAACTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGCTC
AACAACATCACGCACTCTTCGGTTGTACTCACGCTTGCTTTCGCTGTACATCCGAGCGGC
TTCCGAGTTTGCAGGAAAATTCGGATTAGGGTCACAGAGCAACGACTGGATGGAGGTAAG
TATAGCAGCAACATCATATATAGGGCTCCACTGGTTTTGCAAAATGTCCAAGCAAATACT
CCCATCTGCATAAATATTTGGATGGAACATCCGTGAGACAAAACGAACTGTTGGAGGTTT
ATTAGGATAATCTTCAAAGAACTGCAGTGAGAGTTTGAAAGTACCTCCATCCCATGGTGT
GTCATCAGGCCCGAAAATGACAGCGTTCCAAAGCATGATGTTATTGTCTTGTGGAGCACC
GCTGATACCAGCAGGTGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAATCCCTCATCAACCTCTTCCT
TGCTGGTGTCAACATCCTCCCTCTCTTAACTTAACCGTGGAAAAGAACAGATCTTGTTGT
TGTTTGAGTAATAATAAGCTGGCGATTAAAGGAGGAAGAGGGTAGGAGAAGGAGAGAGGT
TTTTCAAGAGAACATCTGTGTGGAGGCAGGCGATGACCGACGGTGGGGGCCGGTTCTCGG
GTTTCACCGTGCGATGAGAGAGAGATAATGAATTGGTGGAACTCTTACGTAATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FC22TF C 1
AF RR2FC22JQ U 10
BS 1 10 RR2FC22TF
BS 11 777 RR2FC22JQ

RD RR2FC22TF 777 0 0
TTTTTTTTTCAAGTGAAAGCTGTTGCTTT*AAAGGTGACGTTTTGATAGTAGGAGAGAGG
GTTACAAAGACTACAACAAACAAACACACAACACAACTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGCTC
AACAACATCACGCACTCTTCGGTTGTACTCACGCTTGCTTTCGCTGTACATCCGAGCGGC
TTCCGAGTTTGCAGGAGAATTCGGATTAGGGTCACAGAGCAACGACTGGATGGAGGTAAG
TATAGCAGCAACATCATATATAGGGCTCCACTGGTTTTGCAGAATGTCCAAGCAAATACT
CCCATCTGCATAAATATTTGGATGGAACATCCGTGAGACAAAACGAACTGTTGGAGGTTT
ATTAGGATAATCTTCAGAGAACTGCAGTGAGAGTTTGAAAGTACCTCCATCCCATGGTGT
GTCATCAGGCCCGAAAATGACAGCGTTCCAGAGCATGATGTTATTGTCTTGTGGAGCACC
GCTGATACCAGCAGGTGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAATCCCTCATCAACCTCTTCCT
TGCTGGTGTCAACATCCTCCCTCTCTTAACTTAACCGTGGAAAAGAACAGATCTTGTTGT
TGTTTGAGTAATAATAAGCTGGCGATTAAAGGAGGAAGAGGGTAGGAGAAGGAGAGAGGT
TTTTCAAGAGAACATCTGTGTGGAGGCAGGCGATGACCGACGGTGGGGGCCGGTTCTCGG
GTTTCACCGTGCGATGAGAGAGAGATAATGAATTGGTGGAACTCTTACGTAATATCC

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2FC22JQ 768 0 0
C
AAGTGAAAGCTGTTGCTTTTAAAGGTGACGTTTTGATAGTAGGAGAGAGGGTTACAAAGA
CTACAACAAACAAACACACAACACAACTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGCTCAACAACATCA
CGCACTCTTCGGTTGTACTCACGCTTGCTTTCGCTGTACATCCGAGCGGCTTCCGAGTTT
GCAGGAAAATTCGGATTAGGGTCACAGAGCAACGACTGGATGGAGGTAAGTATAGCAGCA
ACATCATATATAGGGCTCCACTGGTTTTGCAAAATGTCCAAGCAAATACTCCCATCTGCA
TAAATATTTGGATGGAACATCCGTGAGACAAAACGAACTGTTGGAGGTTTATTAGGATAA
TCTTCAAAGAACTGCAGTGAGAGTTTGAAAGTACCTCCATCCCATGGTGTGTCATCAGGC
CCGAAAATGACAGCGTTCCAAAGCATGATGTTATTGTCTTGTGGAGCACCGCTGATACCA
GCAGGTGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAATCCCTCATCAACCTCTTCCTTGCTGGTGTC
AACATCCTCCCTCTCTTAACTTAACCGTGGAAAAGAACAGATCTTGTTGTTGTTTGAGTA
ATAATAAGCTGGCGATTAAAGGAGGAAGAGGGTAGGAGAAGGAGAGAGGTTTTTCAAGAG
AACATCTGTGTGGAGGCAGGCGATGACCGACGGTGGGGGCCGGTTCTCGGGTTTCACCGT
GCGATGAGAGAGAGATAATGAATTGGTGGAACTCTTACGTAATATCC

QA 2 768 2 768
DS 



AS 1 3

CO CL2345Contig1 1115 3 14 U
GGGTACTGCTCACTAAAACAAACATTACACGAAACACAATACTTGGAAGCAACATAGAAC
AAAAAAGAAGAAGAGATTGGAATCTCCATTCTGTATTTACAAATTCTGGTTCTCAATCTG
AAAAATCAAACACAGTCCTTTGTTGAAGGAAAATAACCTCACCAAGCGCTTTGCCACCAC
CCGGGATCTCTAGTTCAAGGCAATCTGAATTGTAAACATGTTCTCTTTGCTTCTGATGTA
TATCATAGCTATACTATCACTGCTGGATTTTCCTGAACTCTGTAAGAACTGGGTAGATAT
TCTCAAAGGCTGTGTAAGTCTCTTCTCTCATCTTGGCTCCAGTTATAACAATCTTCCCTG
AGACAAAAATAAGTAGCACAATCTTTGGTTGTTTCATCCTATATATCAGCCCTGGGAATA
GTTCAGGCTCGTAACTTGAGAAAGCACTGTGAGAGTATGCAAGACCTTCAAGCCTAATGG
GGAATTTGACATCACAAGACCCTACAATATTCTGAATCTTGAAATCCTTGAACTTTGCAG
GAAAGCCAAGCTTTTGAACAATCCGAGCGTACTTTCTCGCAGCAAGCTTTGAAAAATGTT
CACTCTTGGCTCCGGTACACACCATTTTCCCAGAAGCAAAAATCAAAGCTGTAGTCTTTG
GCTCTCTTATCCTCATGATTACTGCAGCAAAACGCTTGGGGTTATATTCAGCATTACGAG
CCTGCAAAGCTATGGATTTAAGATCAAGCTTGCAGTCTAAGTTCACTGTCGAGACAATGT
TTTGAAGAGTTGGAATAATCCCTGAAGGATGCTTCATAAGGTCAACTGGCTGACTCCCTT
CCATTCCTTGTTCAGCCATTCTCTTTCGTTGGATTGAAATGTGGAATCTCAAATCTAGGG
TTTCGTAACCTCCAAATGATATGAAAGGACAAAGGATTTGTATATATATACACAAATGAA
GGAAGAGAGAAATTAGAGAGGGAAAAAGAGATTTGTAAATTTGTAAAATGGGATTTATAA
AGGAAGAGACTCGTTTTCTATCTCTCTGCCTTTGGCTCTCTCTCTCTCTTTGGGGATGAG
GTTTTGTTTCTGAGAAGGTCGCGTTTTAGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A285JQ U 72
AF RR2FX53JQ U 1
AF RR2A285TF C 265
BS 1 122 RR2FX53JQ
BS 123 123 RR2A285JQ
BS 124 197 RR2FX53JQ
BS 198 198 RR2A285JQ
BS 199 222 RR2FX53JQ
BS 223 223 RR2A285JQ
BS 224 370 RR2FX53JQ
BS 371 371 RR2A285TF
BS 372 622 RR2FX53JQ
BS 623 623 RR2A285TF
BS 624 638 RR2FX53JQ
BS 639 639 RR2A285TF
BS 640 694 RR2FX53JQ
BS 695 1115 RR2A285TF

RD RR2A285JQ 293 0 0
AA
AGATTGGAATCTCCATTCTGTATTTACAAATTTTGGTTCTCAATCTGAAAAATCAAACAC
AGTCCTTTGTTGAAGGAAAATAACCTCACCAAGCGCTTTGCCACCCCCCGGGATCTCTAG
TTCAAGGCAATCTGAATTGTAAACATGTTCTCTTTGCTTCTGATGTATATCATAGCTATA
CTATCACTGCTGGATTTTCCTGAACTCTGTAAGAACTGGGTACATATTCTCAAAGGCTGT
GTAAGTCTCCTCTCTCATCTTGGCTCCCGTTATAACAATCTTCC
CTGAAAC

QA 3 286 3 286
DS 

RD RR2FX53JQ 694 0 0
GGGTACTGCTCACTAAAACAAACATTACACGAAACACAATACTTGGAAGCAACATAGAAC
AAAAAAGAAGAAGAGATTGGAATCTCCATTCTGTATTTACAAATTCTGGTTCTCAATCTG
AATAATCAAACACAGTCCTTTGTTGAAGGAAAATAACCTCACCAAGCGCTTTGCCACCAC
CCGGGATCTCTAGTTCATGGCAATCTGAATTGTAAACATGTTTTCTTTGCTTCTGATGTA
TATCATAGCTATACTATCACTGCTGGATTTTCCTGAACTCTGTAAGAACTGGGTAGATAT
TCTCAAAGGCTGTGTAAGTCTCTTCTCTCATCTTGGCTCCAGTTATAACAATCTTCCCTG
AGACAAAAATCAGTAGCACAATCTTTGGTTGTTTCATCCTATATATCAGCCCTGGGAATA
GTTCAGGCTCGTAACTTGAGAAAGCACTGTGAGAGTATGCAAGACCTTCAAGCCTAATGG
GGAATTTGACATCACAAGACCCTACAATATTCTGAATCTTGAAATCCTTGAACTTTGCAG
GAAAGCCAAGCTTTTGAACAATCCGAGCGTACTTTCTCGCAGCAAGCTTTGAAAAATGTT
CACTCTTGGCTCCGGTACACAC*ATTTTCCCAGAAGCAGAAATCAAAGCTGTAGTCTTTG
GCTCTCTTATCCTCATGATTACTGCAGCAAAACG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2A285TF 851 0 0
TGGATTTT
CTGAACTCTGTAAGAACTGGGTAGATAT*CTCAAAGGCTGTGTAAGTCTCTTCTCTCATC
TTGGCTCCAGTTATAACAATCTTCC*TGAGACAAAAATAAGTAGCACAATCTTTGGTTGT
TTCATCCTATATATCAGCCCTGGGAATAGTTCAGGCTCGTAACTTGAGAAAGCACTGTGA
GAGTATGCAAGACCTTCAAGCCTAATGGGGAATTTGACATCACAAGACCCTACAATGTTC
TGAATCTTGAAATCCTTGAATTTTGCGGGAAAGCCAAGCTTTTGAACAATCCGAGCGTAC
TTTCTCGCAGCCAGCTTTGAAAAATGTTCACTCTTGGCTCCGGTACACACCATTTTCCCA
GAAGCAAAAATCAAAGCTGTAGTTTTTGGCTCTCTTATCCTCATGATTACTGCAGCAAAA
CGCTTGGGGTTATATTCAGCATTACGAGCCTGCAAAGCTATGGATTTAAGATCAAGCTTG
CAGTCTAAGTTCACTGTCGAGACAATGTTTTGAAGAGTTGGAATAATCCCTGAAGGATGC
TTCATAAGGTCAACTGGCTGACTCCCTTCCATTCCTTGTTCAGCCATTCTCTTTCGTTGG
ATTGAAATGTGGAATCTCAAATCTAGGGTTTCGTAACCTCCAAATGATATGAAAGGACAA
AGGATTTGTATATATATACACAAATGAAGGAAGAGAGAAATTAGAGAGGGAAAAAGAGAT
TTGTAAATTTGTAAAATGGGATTTATAAAGGAAGAGACTCGTTTTCTATCTCTCTGCCTT
TGGCTCTCTCTCTCTCTTTGGGGATGAGGTTTTGTTTCTGAGAAGGTCGCGTTTTAGATC
TCC

QA 9 851 9 851
DS 



AS 1 2

CO CL2346Contig1 722 2 12 U
TAATTGCATCTATATTTATGAATAAACTACAAAATATAATTACAATCCCAAAACAGACAA
AACCAATCAAATTCAGCGATTTTTAGAAACGCCATGACATATGATCGAGCTTATAATAAA
AAAGCTGATCATATATCCTAAGATAATATTATAAACCCATTACTTTTCTTTAATTATTAA
ATTGAACAAATGCCTTTCACACGTATATTTCGTGTTAAATAAAGTACTTAACGATTTTTT
TAATTGTATTCAGAAGTTGCCATTATTGTTGAACTGTTGTTGCTGCTGTAAAAACCAAAA
GTCTTCATCGCTTTCTCCTATGTCCCATAAACTGTCCGAAGAAGAAGCAGCTCCATTAAT
ATTTTCAAACCAGTTAAGGTTACTCTGCTCCTGCATAGCCGGTACATCTTCGTCTAGTAA
CCTAGAATAATCGAAATAATTCTCCGGTAGCATTTGTGGACCCACCAAGTTCTGATCCGG
GTAATAACTATTACCCACTTGACCCGAGTAGTATTCTGGGTTCGGGTTTGGAGCACTGTA
GTACTCCGTCAAGTCTGACACCGGAAACAACGCCACGCTGGAATTTTCCGGGGTGATATA
ATCGTTGTTGTTCATTACACCAGATTGTTGTCCCATGTTGTAATCATACGTCATGAATTG
ATTGTTAGAGGTTGTGATGCAAGATGACGTTGCGGCAGATCCTGTGGTTAGGGCTGCCGC
TG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2H803JQ U 1
AF RR2GK03JQ U 145
BS 1 198 RR2H803JQ
BS 199 199 RR2GK03JQ
BS 200 239 RR2H803JQ
BS 240 241 RR2GK03JQ
BS 242 297 RR2H803JQ
BS 298 298 RR2GK03JQ
BS 299 495 RR2H803JQ
BS 496 496 RR2GK03JQ
BS 497 565 RR2H803JQ
BS 566 566 RR2GK03JQ
BS 567 661 RR2H803JQ
BS 662 722 RR2GK03JQ

RD RR2H803JQ 661 0 0
TAATTGCATCTATATTTATGAATAAACTACAAAATATAATTACAATCCCAAAACAGACAA
AACCAATCAAATTCAGCGATTTTTAGAAACGCCATGACATATGATCGAGCTTATAATAAA
AAAGCTGATCATATATCCTAAGATAATATTATAAACCCATTACTTTTCTTTAATTATTAA
ATTGAACAAATGCCTTTCGCACGTATATTTCGTGTTAAATAAAGTACTTAACGATTTTT*
*AATTGTATTCAGAAGTTGCCATTATTGTTGAACTGTTGTTGCTGCTGTAAAAACCAGAA
GTCTTCATCGCTTTCTCCTATGTCCCATAAACTGTCCGAAGAAGAAGCAGCTCCATTAAT
ATTTTCAAACCAGTTAAGGTTACTCTGCTCCTGCATAGCCGGTACATCTTCGTCTAGTAA
CCTAGAATAATCGAAATAATTCTCCGGTAGCATTTGTGGACCCACCAAGTTCTGATCCGG
GTAATAACTATTACCTACTTGACCCGAGTAGTATTCTGGGTTCGGGTTTGGAGCACTGTA
GTACTCCGTCAAGTCTGACACCGGAGACAACGCCACGCTGGAATTTTCCGGGGTGATATA
ATCGTTGTTGTTCATTACACCAGATTGTTGTCCCATGTTGTAATCATACGTCATGAATTG
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2GK03JQ 578 0 0
G
ATATTATAAACCCATTACTTTTCTTTAATTATTAAATTGAACAAATGCCTTTCACACGTA
TATTTCGTGTTAAATAAAGTACTTAACGATTTTTTTAATTGTATTCAGAAGTTGCCATTA
TTGTTGAGCTGTTGTTGCTGCTGTAAAAACCAAAAGTCTTCATCGCTTTCTCCTATGTCC
CATAAACTGTCCGAAGAAGAAGCAGCTCCATTAATATTTTCAAACCAGTTAAGGTTACTC
TGCTCCTGCATAGCCGGTACATCTTCGTCTAGTAACCTAGAATAATCGAAATAATTCTCC
GGTAGCATTTGTGGACCCACCAAGTTCTGATCCGGGTAATAACTATTACCCACTTGACCC
GAGTAGTATTCTGGGTTCGGGTTTGGAGCACTGTAGTACTCCGTCAAGTCTGACACCGGA
AACAACGCCACGCTGGAATTTTCCGGGGTGATATAATCGTTGTTGTTCATTACACCAGAT
TGTTGTCCCATGTTGTAATCATACGTCATGAATTGATTGTTAGAGGTTGTGATGCAAGAT
GACGTTGCGGCAGATCCTGTGGTTAGGGCTGCCGCTG

QA 2 578 2 578
DS 



AS 1 4

CO CL2347Contig1 1016 4 2 U
GGAGTTGGGGCAAAACCATCGGTTGGTTATACGATTCAACAGCCGAAGATGTGAACACGA
GTATAAATATTCATTCGAGAGGATGGACTAGTTCATATATATATCCGGATCAACCGGTAT
TTCTAGGTTGTATTCCACCAGGAGGGCCAGAGGCGATGGTGCAGCAACGACGATGGGGGA
CGGGCATGCTCGAAGTCCTTTTCAACAAACAAAGCCCCTTGATCGGTATCTTTAGCCAGA
AAATGAAATTTCGACAACGGTTGTCTTATATTTACGTCTTCACGTGGGGTTTAAGGTCAA
TCCCTGAGTTATTTTACTGTCTCTTGCCTGCTTATTGTCTACTCCACAACTCTGCCTTGT
TTCCAAAGGGAATTTGTTCAGGCATAACTGTCACACTTGTGGGGATGCACTGCCTTTACA
CACTTTGGGAATTTATGAGCCTTGGATTTTCGGTACATTCATGGTATGCCTCCCAGTCAT
TTTGGAGGATAAAAGCTACTTGTATTTGGTTATTTAGTGTCACTGATGTCATATTCAAGC
TTCTTGGAGTTTCGAAAACCGTATTCATAGTTACAAAAAAGACTTTCACCGAGACAAAAT
CAGGAACTGGGGACGGACCATCTTGTAGTGCGGACCCAAATGCTGGTAAATTTGAATTCG
ACGACTCAGTTTATTTTTTGCCTGGCACGTTCATTGTGTTGGTCAATCTAGCCGCTATAG
CCGGGTTTTCAGTGGGTCTACAACGATTAAGTCATATCTACGGAGGCGGTGGTTCTACTT
TTGTAGAGGCTTGTGCATGCATTTTGGTGGTTATGTTGTTTCTTCCATTTCTAAAGGGTT
TATTTGAGAAGGGAAAATTTGGTATTCCATTGTCTACGCTCTATAAAGCTGCCTTTTTAG
CAGTGTTATTTGTTGTATTTTCTGTAGGAAAGTAGTTTATATAGCGATGTGGGTTTGTTA
TGCAACAAAACTAAGTTTATCATGACATTGTCCTAATGAAGAATTAATGATATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GJ94TF U 1
AF RR2GJ94JQB C 394
AF RR2C982JQ C 591
AF RR2C982TF U 591
BS 1 684 RR2GJ94TF
BS 685 1016 RR2C982TF

RD RR2GJ94TF 684 0 0
GGAGTTGGGGCAAAACCATCGGTTGGTTATACGATTCAACAGCCGAAGATGTGAACACGA
GTATAAATATTCATTCGAGAGGATGGACTAGTTCATATATATATCCGGATCAACCGGTAT
TTCTAGGTTGTATTCCACCAGGAGGGCCAGAGGCGATGGTGCAGCAACGACGATGGGGGA
CGGGCATGCTCGAAGTCCTTTTCAACAAACAAAGCCCCTTGATCGGTATCTTTAGCCAGA
AAATGAAATTTCGACAACGGTTGTCTTATATTTACGTCTTCACGTGGGGTTTAAGGTCAA
TCCCTGAGTTATTTTACTGTCTCTTGCCTGCTTATTGTCTACTCCACAACTCTGCCTTGT
TTCCAAAGGGAATTTGTTCAGGCATAACTGTCACACTTGTGGGGATGCACTGCCTTTACA
CACTTTGGGAATTTATGAGCCTTGGATTTTCGGTACATTCATGGTATGCCTCCCAGTCAT
TTTGGAGGATAAAAGCTACTTGTATTTGGTTATTTAGTGTCACTGATGTCATATTCAAGC
TTCTTGGAGTTTCGAAAACCGTATTCATAGTTACAAAAAAGACTTTCACCGAGACAAAAT
CAGGAACTGGGGACGGACCATCTTGTAGTGCGGACCCAAATGCTGGTAAATTTGAATTCG
ACGACTCAGTTTATTTTTTGCCTG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2GJ94JQB 623 0 0
CACTTGTGGGGATGCACTGCCTTTACACACTTTGGGAATTTATGAGCCTTGGATTTTCGG
TACATTCATGGTATGCCTCCCAGTCATTTTGGAGGATAAAAGCTACTTGTATTTGGTTAT
TTAGTGTCACTGATGTCATATTCAAGCTTCTTGGAGTTTCGAAAACCGTATTCATAGTTA
CAAAAAAGACTTTCACCGAGACAAAATCAGGAACTGGGGACGGACCATCTTGTAGTGCGG
ACCCAAATGCTGGTAAATTTGAATTCGACGACTCAGTTTATTTTTTGCCTGGCACGTTCA
TTGTGTTGGTCAATCTAGCCGCTATAGCCGGGTTTTCAGTGGGTTTACAACGATTAAGTC
ATATTTACGGAGGCGGTGGTTTTACTTTTGTAGAGGCTTGTGCATGCATTTTGGTGGTTA
TGTTGTTTCTTCCATTTCTAAAGGGTTTATTTGAGAAGGGAAAATTTGGTATTCCATTGT
TTACGCTCTATAAAGCTGCCTTTTTAGCAGTGTTATTTGTTGTATTTTTTGTAGGAAAGT
AGTTTATATAGCGATGTGGGTTTGTTATGCAACAAAACTAAGTTTATCATGACATTGTCC
TAATGAAGAATTAATGATATTTT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2C982JQ 408 0 0
GAGACAAAATCAGGAACTGGGGACGGACCATCTTGTAGTGCGGACCCAAATGCTGGTAAA
TTTGAATTCGACGACTCAGTTTATTTTTTGCCTGGCACGTTCATTGTGTTGGTCAATCTA
GCCGCTATAGCCGGGTTTTCAGTGGGTCTACAACGATTAAGTCATATCTACGGAGGCGGT
GGTTCTACTTTTGTAGAGGCTTGTGCATGCATTTTGGTGGTTATGTTGTTTCTTCCATTT
CTAAAGGGTTTATTTGAGAAGGGAAAATTTGGTATTCCATTGTCTACGCTCTATAAAGCT
GCCTTTTTAGCAGTGTTATTTGTTGTATTTTCTGTAGGAAAGTAGTTTATATAGCGATGT
GGGTTTGTTATGCAACAAAACTAAGTTTATCATGACATTGTCCTAATG

QA 1 408 1 408
DS 

RD RR2C982TF 426 0 0
GAGACAAAATCAGGAACTGGGGACGGACCATCTTGTAGTGCGGACCCAAATGCTGGTAAA
TTTGAATTCGACGACTCAGTTTATTTTTTGCCTGGCACGTTCATTGTGTTGGTCAATCTA
GCCGCTATAGCCGGGTTTTCAGTGGGTCTACAACGATTAAGTCATATCTACGGAGGCGGT
GGTTCTACTTTTGTAGAGGCTTGTGCATGCATTTTGGTGGTTATGTTGTTTCTTCCATTT
CTAAAGGGTTTATTTGAGAAGGGAAAATTTGGTATTCCATTGTCTACGCTCTATAAAGCT
GCCTTTTTAGCAGTGTTATTTGTTGTATTTTCTGTAGGAAAGTAGTTTATATAGCGATGT
GGGTTTGTTATGCAACAAAACTAAGTTTATCATGACATTGTCCTAATGAAGAATTAATGA
TATTTT

QA 1 426 1 426
DS 



AS 1 4

CO CL2348Contig1 1068 4 44 U
GGAGGGGATTTAAACCGAACTAAAGAAATCTGGCTTGTCGCCTAAGTTGGAATCGATTTT
GAACAAAACGAAAAAGAGAGAGACAGAGAGGTCAATCAGAAAGAACACTCAATACAGAAA
AGAGAAAAGAGTGAGAGATGGCGAGATATGATCGAGCAATCACAGTGTTCTCCCCCGACG
GCCACCTTTTTCAGGTGGAGTATGCCCTAGAAGCTGTCCGTAAGAGTAACGCCGCCGTCG
GAGTCCGCGGCACCGATACCGTCGTCCTCGCCGTCGAGAAAAAATCAACCCCTAAGCTCC
AGGATACAAGATCAGCTAGAAAGATTGTGAGTCTAGATAACCACGTGGCGTTGGCCTGTG
CTGGGCTCAAAGCGGATGCTCGTGTCCTGATTAACAAGGCGAGGATCGAGTGTCAAAGCC
ACAGGCTTACGTTGGAGGATCCCGTGACCGTCGAGTACATCACTCGCTACATTGCCGGGC
TTCAGCAGAAGTACACTCAGAGTGGGGGTGTGAGACCTTTTGGTCTTTCCACTCTTATTG
TCGGTTTTGATCCCTACACTCGTATTCCTTCGCTTTATCAGACTGATCCGTCTGGGACAT
TCTCTGCTTGGAAGGCTAATGCGACCGGGAGAAACTCAAACTCGATCAGGGAGTTTCTGG
AGAAGAATTATAAAGAGACCTCGGGCCAAGAAACTGTGAAGCTTGCTATCCGTGCTCTGC
TTGAGGTTGTTGAGAGTGGGGGAAAGAACATAGAGGTTGCTCTGATGACACGGGAGGAAG
GTACTCTGAGGCAGCTAGAAGAAGCTGAAATCGATGCTATTGTCGCTGAGATCGAAGCAG
AGAAAGCTGCTGCAGAAGCAGCCAAGAAAGGCCCTTCAAAGGAAACCTGAGAGCATGAGC
CAGGATCTTTACAATAACGGTCTCAGTTTTCAAGTTGTAACTTTTGGTTCAAATTATGCT
ATTTTGAGGGTTGAATAGAAAATCTGGACTGCGTGAATTCGTTTCGCTGGATCATTAGCC
TGTGTTGACGACATTCTTGCTTTCCAAATCTTAATCGACAATTTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2EQ83TF U 81
AF RR2BF03TF U 1
AF RR2EQ83JQ C 283
AF RR2BF03JQ C 293
BS 1 114 RR2BF03TF
BS 115 115 RR2EQ83TF
BS 116 126 RR2BF03TF
BS 127 127 RR2EQ83TF
BS 128 224 RR2BF03TF
BS 225 225 RR2EQ83TF
BS 226 280 RR2BF03TF
BS 281 281 RR2EQ83TF
BS 282 370 RR2BF03TF
BS 371 371 RR2EQ83TF
BS 372 448 RR2BF03TF
BS 449 449 RR2EQ83TF
BS 450 475 RR2BF03TF
BS 476 476 RR2EQ83TF
BS 477 493 RR2BF03TF
BS 494 494 RR2EQ83TF
BS 495 598 RR2BF03TF
BS 599 599 RR2EQ83TF
BS 600 637 RR2BF03TF
BS 638 638 RR2EQ83TF
BS 639 725 RR2BF03TF
BS 726 726 RR2EQ83JQ
BS 727 743 RR2BF03TF
BS 744 751 RR2EQ83JQ
BS 752 752 RR2BF03JQ
BS 753 823 RR2EQ83JQ
BS 824 824 RR2BF03JQ
BS 825 844 RR2EQ83JQ
BS 845 845 RR2BF03JQ
BS 846 890 RR2EQ83JQ
BS 891 892 RR2BF03JQ
BS 893 917 RR2EQ83JQ
BS 918 918 RR2BF03JQ
BS 919 964 RR2EQ83JQ
BS 965 965 RR2BF03JQ
BS 966 1004 RR2EQ83JQ
BS 1005 1005 RR2BF03JQ
BS 1006 1028 RR2EQ83JQ
BS 1029 1031 RR2BF03JQ
BS 1032 1043 RR2EQ83JQ
BS 1044 1044 RR2BF03JQ
BS 1045 1057 RR2EQ83JQ
BS 1058 1058 RR2BF03JQ
BS 1059 1068 RR2EQ83JQ

RD RR2EQ83TF 565 0 0
G
GACAGCGAGGTGAATTAGAAAGAACACTCAATACAGAAAAGAGAAAAGAGTGAGAGATGG
CGAGATATGATCGAGCAATCACAGTGTTCTCCCCCGACGGCCACCTTTTTCAGGTGGAGT
ATGCCCTAGAAGCTGTCCGTAAGAGTAACGCCGCCGTCGGAGTCCGCGGCACCGATACCG
TCGTCCTCGCCGTCGAGAAAAAATCCACCCCTAAGCTCCAGGATACAAGATCAGCTAGAA
AGATTGTGAGTCTAGATAACCACGTTGCGTTGGCCTGTGCTGGGCTCAAAGCGGATGCTC
GTGTCCTGATTAACAAGGCGAGGATCGAGTGTCAGAGCCACAGGCTTACGTTGGAGGATC
CCGTGACCGTCGAGTACATCACTCGGTACATTGCCGGGCTTCAGCAGAAGTACACTCAGA
GTGGGGGTGTGAGACCTTTTGGTCTTTCCACTCTTATTGTTGGTTTTGATCCCTACACTC
GTATTCCTTCGCTTTATCAGACTGATCCGTCTGGGACATTCTCTGCTTGGAAGGCTAATG
CGACTGGGAGAAACTCAAACTCGA

QA 2 565 2 565
DS 

RD RR2BF03TF 743 0 0
GGAGGGGATTTAAACCGAACTAAAGAAATCTGGCTTGTCGCCTAAGTTGGAATCGATTTT
GAACAAAACGAAAAAGAGAGAGACAGAGAGGTCAATCAGAAAGAACACTCAATAGAGAAA
AGAGAACAGAGTGAGAGATGGCGAGATATGATCGAGCAATCACAGTGTTCTCCCCCGACG
GCCACCTTTTTCAGGTGGAGTATGCCCTAGAAGCTGTCCGTAAGGGTAACGCCGCCGTCG
GAGTCCGCGGCACCGATACCGTCGTCCTCGCCGTCGAGAAGAAATCAACCCCTAAGCTCC
AGGATACAAGATCAGCTAGAAAGATTGTGAGTCTAGATAACCACGTGGCGTTGGCCTGTG
CTGGGCTCAAGGCGGATGCTCGTGTCCTGATTAACAAGGCGAGGATCGAGTGTCAAAGCC
ACAGGCTTACGTTGGAGGATCCCGTGACTGTCGAGTACATCACTCGCTACATTGCTGGGC
TTCAGCAGAAGTAGACTCAGAGTGGGGGTGTGAGACCTTTTGGTCTTTCCACTCTTATTG
TCGGTTTTGATCCCTACACTCGTATTCCTTCGCTTTATCAGACTGATCCGTCTGGGACGT
TCTCTGCTTGGAAGGCTAATGCGACCGGGAGAAACTCGAACTCGATCAGGGAGTTTCTGG
AGAAGAATTATAAAGAGACCTCGGGCCAAGAAACTGTGAAGCTTGCTATCCGTGCTCTGC
TTGAG*TTGTTGAGAGTGGGGGA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2EQ83JQ 786 0 0
AAATCCA
CCCTAAGCTCCAGGATACAAGATCAGCTAGAAAGATTGTGAGTCTAGATAACCACGTTGC
GTTGGCCTGTGCTGGGCTCAAAGCGGATGCTCGTGTCCTGATTAACAAGGCGAGGATCGA
GTGTCAGAGCCACAGGCTTACGTTGGAGGATCCCGTGACCGTCGAGTACATCACTCGGTA
CATTGCCGGGCTTCAGCAGAAGTACACTCAGAGTGGGGGTGTGAGACCTTTTGGTCTTTC
CACTCTTATTGTTGGTTTTGATCCCTACACTCGTATTCCTTCGCTTTATCAGACTGATCC
GTCTGGGACATTCTCTGCTTGGAAGGCTAATGCGACTGGGAGAAACTCAAACTCGATCAG
GGAGTTTCTGGAGAAGAATTATAAAGAAACCTCTGGTCAAGAAACTGTGAAGCTTGCTAT
CCGTGCTCTGCTTGAGGTTGTTGAGAGTGGGGGAAAGAACATTGAGGTTGCTCTGATGAC
ACGGGAGGAAGGTACTCTGAGGCAGCTAGAAGAAGCTGAAATCGATGCTATTGTGGCTGA
GATCGAAGCAGAGAAGGCTGCTGCAGAAGCAGCCAAGAAAGGCCCTTCAAAGGAAACCTG
A**GCATGAGCCAGGATCTTTACAATAATGGTCTCAGTTTTCAAGTTGTAACTTTTGGTT
CAAATTATGCTATTT*GAGGGTTGAATAGAAAATCTGGACTGCGTGAATTCGTTTTGCTG
GATCATTAGCCTGTGTTGA***CATTCTTGCTTTTCAAATCTTAATCGGCAATTTTAGC

QA 8 786 8 786
DS 

RD RR2BF03JQ 776 0 0
TAAGCTCCAGGATACAAGATCAGCTAGAAAGATTGTGAGTCTAGATAACCACGTGGCGTT
GGCCTGTGCTGGGCTCAAGGCGGATGCTCGTGTCCTGATTAACAAGGCGAGGATCGAGTG
TCAAAGCCACAGGCTTACGTTGGAGGATCCCGTGACTGTCGAGTACATCACTCGCTACAT
TGCTGGGCTTCAGCAGAAGTAGACTCAGAGTGGGGGTGTGAGACCTTTTGGTCTTTCCAC
TCTTATTGTCGGTTTTGATCCCTACACTCGTATTCCTTCGCTTTATCAGACTGATCCGTC
TGGGACGTTTTCTGCTTGGAAGGCTAATGCGACCGGGAGAAACTCGAACTCGATCAGGGA
GTTTCTGGAGAAGAATTATAAAGAGACCTCGGGCCAAGAAACTGTGAAGCTTGCTATCCG
TGCTCTGCTTGAGGTTGTTGAGAGTGGGGGAAAGAACATAGAGGTTGCTCTGATGACACG
GGAGGAAGGTACTCTGAGGCAGCTAGAAGAAGCTGAAATCGATGCTATTGTCGCTGAGAT
CGAAGCAGAGAAAGCTGCTGCAGAAGCAGCCAAGAAAGGTCCTTCAAAGGAAACCTGAGA
GCATGAGCCAGGATCTTTACAATAACGGTCTCAGTTTTCAAGTTGTAACTTTTGGTTCAA
ATTATGTTATTTTGAGGGTTGAATAGAAAATCTGGACTGCGTGAATTTGTTTCGTTGGAT
CATTAGCCTGTGTTGACGACATTCTTGCTTTCCAAATTTTAATCGACAATTTTAGC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 4

CO CL2349Contig1 525 4 17 U
GGAATACACACTTAACATTGGTTTTCTTCCAATCTACCTCTAAAATTTTCGCTCTCACTA
TCAAAATGAAGTATTCGATGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCTTGTTCATGATATTCG
TTGCTACAGGGATGGGTCCAATAACAGTGGAGGCACGCACATGTGAGTCACAGAGCCATA
GGTTCAAGGGTCCATGTGTGAGCGAAAACAACTGTGCAAACGTGTGCCACAACGAAGGTT
TTGGCGGAGGCAAATGCCGTGGACTTCGTCGTCGGTGCTTCTGCACCAGAAATTGCTGAT
TCATTGAATCTTATAACTCATCAAAATCATCGATCAATCGTCTTGTGTTTGCTTCTTTCT
TATATCTACATCTTCCGTACAGTACCATGTCGTACCGTACGCGTGTGCATCTCTAGTGTG
TTCTCGAATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTAGGAGCTTTAATGTAATATATTATTTCTAAT
GAATGAATGGTAACTGCAGACTTGATAATATAAACATTATGAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C609JQ C 4
AF RR2EK83TF U 1
AF RR2C609TF U 4
AF RR2BC88TF U 6
BS 1 19 RR2EK83TF
BS 20 21 RR2C609TF
BS 22 41 RR2EK83TF
BS 42 42 RR2C609TF
BS 43 51 RR2EK83TF
BS 52 52 RR2C609TF
BS 53 59 RR2EK83TF
BS 60 60 RR2C609TF
BS 61 72 RR2EK83TF
BS 73 73 RR2C609TF
BS 74 176 RR2EK83TF
BS 177 177 RR2C609TF
BS 178 272 RR2EK83TF
BS 273 273 RR2C609TF
BS 274 353 RR2EK83TF
BS 354 354 RR2C609TF
BS 355 525 RR2EK83TF

RD RR2C609JQ 471 0 0
GGAC
ACACTTAACATTGGTTTTCTTCCAATCTACCTCTAAAATTTTCGCTCTCACTATCAAAAT
GAAGTATTCGATGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCTTGTTCATGATATTCGTTGCTAC
AGGGATGGGTCCAATAACAGTGGAGGCACGCACATGTGAGTCACAGAGCCATAGGTTCAA
GGGTCCATGTGTGAGCGAAAACAACTGTGCAAACGTGTGCCACAACGAAGGTTTTGGCGG
AGGCAAATGCCGTGGACTTCGTCGTCGGTGCTTCTGCACCAGAAATTGCTGATTCATTGA
ATCTTATAACTCATCAAAATCATCGATCAATCGTCTTGTGTTTGCTTCTTTCTTATATCT
ACATCTTCCGTACAGTACCATGTCGTACCGTACGCGTGTGCATCTCTAGTGTGTTCTCGA
ATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTAGGAGCTTTAATGTAATATATTATT

QA 5 471 5 471
DS 

RD RR2EK83TF 525 0 0
GGAATACACACTTAACATTAATTTTCTTCCAATCTACCTCTGAAATTTTCGTTCTCACTC
TCAAAATGAAGTTTTCGATGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCTTGTTCATGATATTCG
TTGCTACAGGGATGGGTCCAATAACAGTGGAGGCACGCACATGTGAGTCACAGAGCTATA
GGTTCAAGGGTCCATGTGTGAGCGAAAACAACTGTGCAAACGTGTGCCACAACGAAGGTT
TTGGCGGAGGCAAATGCCGTGGACTTCGTCGTAGGTGCTTCTGCACCAGAAATTGCTGAT
TCATTGAATCTTATAACTCATCAAAATCATCGATCAATCGTCTTGTGTTTGCTCCTTTCT
TATATCTACATCTTCCGTACAGTACCATGTCGTACCGTACGCGTGTGCATCTCTAGTGTG
TTCTCGAATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTAGGAGCTTTAATGTAATATATTATTTCTAAT
GAATGAATGGTAACTGCAGACTTGATAATATAAACATTATGAAAT

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2C609TF 508 0 0
GGAC
ACACTTAACATTGGTTTTCTTCCAATCTACCTCTAAAATTTTCGCTCTCACTATCAAAAT
GAAGTATTCGATGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCTTGTTCATGATATTCGTTGCTAC
AGGGATGGGTCCAATAACAGTGGAGGCACGCACATGTGAGTCACAGAGCCATAGGTTCAA
GGGTCCATGTGTGAGCGAAAACAACTGTGCAAACGTGTGCCACAACGAAGGTTTTGGCGG
AGGCAAATGCCGTGGACTTCGTCGTCGGTGCTTCTGCACCAGAAATTGCTGATTCATTGA
ATCTTATAACTCATCAAAATCATCGATCAATCGTCTTGTGTTTGCTTCTTTCTTATATCT
ACATCTTCCGTACAGTACCATGTCGTACCGTACGCGTGTGCATCTCTAGTGTGTTCTCGA
ATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTAGGAGCTTTAATGTAATATATTATTTCTAATGAATGAA
TGGTAACTGCAGACTTGATA
ATAT

QA 5 504 5 504
DS 

RD RR2BC88TF 502 0 0
GG
ACACTTAGCATTAATTTTCTTCCAATCTACCTCTGAAATTTTCGTTCTCACTCTCAAAAT
GAAGTTTTCGATGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCTTGTTCATGATATTCGTTGCTAC
AGGGATGGGTCCAATAACAGTGGAGGCACGCACATGTGAGTCATAGAGCCATAGGTTCAA
GGGTCCATGTGTGAGCGAAAACAACTGTGCAAACGTGTGCCACAACGAAGGTTTTGGCGG
AGGCAAATGCCGTGGACTTCGTCGTAGGTGCTTCTGCACCAGAAATTGCTGATTCATTGA
ATCTTATAACTCATCAAAATCATCGATCAATCGTCTTGTGTTTGCTCCTTTCTTATATCT
ACATCTTCCGTACAGTACCATGTCGTACCGTACGCGTGTGCATCTCTAGTGTGTTCTCGA
ATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTAGGAGCTTTAATGTAATATATTATTTCTAATGAATGAA
TGGTAACTGCAGACTTGATA

QA 3 502 3 502
DS 



AS 1 2

CO CL2350Contig1 813 2 18 U
GCGAATCCTGAAAACCTTATTGAAAAGGACAGTTTGAAATTTTCCAATCTTGAAATAGGA
GGGGATAAAAAGAAAAGAGAGAGAGTTCGACACTGCATTTACTTTAAGCTTTTGAAACAC
ATTACAACTTCATCACATAGTTTTTGAAGATCATCTTTAACATGTTTCTCCTAATCGCAT
GATTGACAGTTTTACCCGTGGTTCGAAACAAGGCAGTCCCGCAACCAAGGGAGCTTGTAA
TTCTATTTAACGTTGTCCACACTGAAACAGAAATTTTAAGGCAAAGAGTATTTGAAACTA
AACTCGTTCTGCGCTTCTAATCCCAGCATTCTTATCGAATTCATCTGAAGGAACAACGTC
CGCGATAATCTTTTCTTGACCACGCCAAAGAATCTTGTCAATGACTCCAAATTCTTTAGC
TTTTGGTGCATCCATGTAATATGGCCTTCTCATCACGTTAGCCACAGTCTCCACGGAATT
CCCAGTGTGCTTTGATAGTAGTCCCACAAGTATATCCCTGTTCGTTATAACCTCTTTGGC
ACGAATCAGGACATCACTAGCAGGCACCAACCCAGAAGAAGGCACACGAGGCTGCTGGAT
CATCGCTTTGGAATGTGGCATCATAAACCGTTTACCCTTTGTACCCGCTGAAAGTAACAA
ACATGCATGACCTATGGCTGCTCCCACACACACTGTATGTACCTCGTTTTTAAGTTGCAT
CAAGGAATCATATATCGCAAAACCTTCTGATTCCATCCCAACCGTCTCGCCATCGTCACG
AGTGGTCCCTGTGGAGTTGATGTAAATGTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H754JQB U 1
AF RR2FK91JQ U 76
BS 1 104 RR2H754JQB
BS 105 105 RR2FK91JQ
BS 106 106 RR2H754JQB
BS 107 107 RR2FK91JQ
BS 108 160 RR2H754JQB
BS 161 161 RR2FK91JQ
BS 162 264 RR2H754JQB
BS 265 265 RR2FK91JQ
BS 266 277 RR2H754JQB
BS 278 278 RR2FK91JQ
BS 279 281 RR2H754JQB
BS 282 282 RR2FK91JQ
BS 283 558 RR2H754JQB
BS 559 559 RR2FK91JQ
BS 560 566 RR2H754JQB
BS 567 567 RR2FK91JQ
BS 568 580 RR2H754JQB
BS 581 813 RR2FK91JQ

RD RR2H754JQB 580 0 0
GCGAATCCTGAAAACCTTATTGAAAAGGACAGTTTGAAATTTTCCAATCTTGAAATAGGA
GGGGATAAAAAGAAAAGAGAGAGAGTTCGACACTGCATTTACTT*AGGCTTTTGAAACAC
ATTACAACTTCATCACATAGTTTTTGAAGATCATCTTTAATATGTTTCTCCTAATCGCAT
GATTGACAGTTTTACCCGTGGTTCGAAACAAGGCAGTCCCGCAACCAAGGGAGCTTGTAA
TTCTATTTAACGTTGTCCACACTGCAACAGAAATTTTGAGGTAAAGAGTATTTGAAACTA
AACTCGTTCTGCGCTTCTAATCCCAGCATTCTTATCGAATTCATCTGAAGGAACAACGTC
CGCGATAATCTTTTCTTGACCACGCCAAAGAATCTTGTCAATGACTCCAAATTCTTTAGC
TTTTGGTGCATCCATGTAATATGGCCTTCTCATCACGTTAGCCACAGTCTCCACGGAATT
CCCAGTGTGCTTTGATAGTAGTCCCACAAGTATATCCCTGTTCGTTATAACCTCTTTGGC
ACGAATCAGGACATCACTGGCAGGCATCAACCCAGAAGAA

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2FK91JQ 738 0 0
GA
AGAGAGAGTTCGACACTGCATTTACTTTAAGCTTTTGAAACACATTACAACTTCATCACA
TAGTTTTTGAAGATCATCTTTAACATGTTTCTCCTAATCGCATGATTGACAGTTTTACCC
GTGTTTCGAAACAAGGCAGTCCCGCAACCAAGGGAGCTTGTAATTCTATTTAACGTTGTC
CACACTGAAACAGAGATTTTAAGGCAAAGAGTATTTGAAATTAAACTGGTTCTGCGCTTC
TAATCCCAGCATTCTTATCGAATTCATCTGAAGGAACAACGTCTGCGATAATCTTTTCTT
GACCACGCCAAAGAATCTTGTCAATGACTCCAAATTCTTTAGCTTTTGGTGCATCCATGT
AATATGGTCTTCTCATCACGTTAGCCACAGTCTCCACGGAATTCCCAGTGTGCTTTGATA
GTAGTCCCACAAGTATATCCCTGTTCGTTATAACCTCTTTGGCACGAATCAGGACATCAC
TAGCAGGCACCAACCCAGAAGAAGGCACACGAGGCTGCTGGATCATCGCTTTGGAATGTG
GCATCATAAACCGTTTACCCTTTGTACCCGCTGAAAGTAACAAACATGCATGACCTATGG
CTGCTCCCACACACACTGTATGTACCTCGTTTTTAAGTTGCATCAAGGAATCATATATCG
CAAAACCTTCTGATTCCATCCCAACCGTCTCGCCATCGTCACGAGTGGTCCCTGTGGAGT
TGATGTAAATGTATAT

QA 3 738 3 738
DS 



AS 1 3

CO CL2351Contig1 1234 3 24 U
CTCAAACCAAATCCTTATTTTGTGTATCTGAACAATAATTAATTACACATTAATAAGTAA
ATCAATCACACATAAAAAACACACACAAAAAAAAACAGAGGAAACAGAGAAGATATGAAG
GTAAAAGGGAAGAGAATCTGAGCCCTAAGGATTGCTATCACTGGGAGGAAAACGTGGGAG
ATAAGGTATCCATGTTGTAGGATCTCTCCAGTCAAACGCAGGCAATGATGCATTAGGGTT
TCCTAAAGGAAGAAAAGGAAAAGGGAAAGAAGGAAGCGGAGGCAGAGTAGGCAACGGCGG
CAGAGTAGAGTACGGCCAAGGGAACCAGTACGGTGGCATATAAGGCCAGAAGAGCTTCGA
ATCTCTCAACTTATTCTCCACCTTCTCCTCTCGCTGGTGGTGATGTCTCTTTCCGCCGCT
GCAAAGTGTGCTGTTTCGGTGAGAAGGTTTGTAGCTGAGTGCGCTTAAGCTGTAGATACA
GACGCGATCTTGCTTCGACTTGATGGATACTTCGTTGGCTGCTGTCTGAAAAACGGGGAT
GTTGCAGACGACGACGTTGTTGTCGGAGGAGGGTTTGAGCAACTTGGCGCTGCACTGAGA
GGATATGGCGATTCCGTCGACGCAATCTATCCCGTCGACGTGAGGGATGTCGAGCTTGTA
AACGCCGTTGCTGTTTGTTGTTCTGTTCACCGATATGTTCACTTCCTCTGTTGTTTTTGG
TGAACTCGCTTTGAATCTACAGCTCACATGAACTTCCACTCCTGAGACAGACAGAGAGAG
AGTAGACTGGTTTTTAAGGCCCTAATCAGACCGAAACTGTACCAAGAAAACCAATTGAAG
ACAGGATCAATGAGGAAATTAAACCGAACAAATTTGAAAATTGGCAAACCGAAATTTATA
TAACCGGATTGACAAATTCTAAAAGGCTAGATAATTTAAGTCACAATTCATGTAAATGTT
ACAATCATGAGAAAGTGTTGGCCAATCCTAAGTTAACAGACAAGTTCATGTAATGTTAAA
ATCAAGATCTCTGACCTTGTAAGAAATAGCTCTGTCTTGAGAAAGTGTTGATTGAACAAG
TGTCACAGTAGACAACTCCGACGACTGTGATGCGAGAAGAAGGGTCCGAGCTTCCTCCCG
ATGGTGAATGGCCACGACCACGGCCAAAAGCTTGATGTGACAAGCTAGAAGCTAGAAGGA
GAAGACAGAGAAGAGGAAGATACATTGTGGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW29JQ U 1
AF RR2CH69JQ U 1
AF RR2EW29TF C 437
BS 1 56 RR2CH69JQ
BS 57 57 RR2EW29JQ
BS 58 67 RR2CH69JQ
BS 68 68 RR2EW29JQ
BS 69 70 RR2CH69JQ
BS 71 71 RR2EW29JQ
BS 72 92 RR2CH69JQ
BS 93 95 RR2EW29JQ
BS 96 258 RR2CH69JQ
BS 259 259 RR2EW29JQ
BS 260 270 RR2CH69JQ
BS 271 271 RR2EW29JQ
BS 272 441 RR2CH69JQ
BS 442 442 RR2EW29JQ
BS 443 483 RR2CH69JQ
BS 484 484 RR2EW29JQ
BS 485 504 RR2CH69JQ
BS 505 505 RR2EW29JQ
BS 506 547 RR2CH69JQ
BS 548 548 RR2EW29TF
BS 549 669 RR2CH69JQ
BS 670 670 RR2EW29TF
BS 671 754 RR2CH69JQ
BS 755 1234 RR2EW29TF

RD RR2EW29JQ 533 0 0
CCCAAG
CCAAATCCTTATTTTGTTTATCTGAACAATAATTAATTACACATTAATAAGTAAATCAAT
CACACATAAAAAACACACACAAAAAAAAACAGAGGAAACAGAGAAGATATGAAGGTAAAA
GGGAAGAGAATCTGAGCCCTAAGGATTGTTATCACTTGGAGGAAAGCGTGGGAGATAAGG
TATCCATGTTGTCGGATCTCTCCAGTCAAACGCAGGCAATGATGCGTTAGGGTTTCCTAA
AGGAAGAAAAGGAAAAGGGAAAGAAGGAAGCGGAGGCAGAGTAGGCAACGGTGGCAGAGT
AGAGTACGGCCAAGGGAACCAGTACGGTGGCATATAAGGCCAGAAGAGCTTCGAATCTCT
CAACTTATTCTCCACCTTCTCCTCTCGCTGGTGGTGATGTCTCTTTCCGCCGCTGCAAAG
TGTGGTGTTTCTGTGAGAAGGTTTGTAGCTGAGTGCGCTTAAGCTGTAGATACAGACGCG
ATCTTGCTTCGACTTGATGGATACTTCGTTGGCTGCTGTCTGAAAAA

QA 7 533 7 533
DS 

RD RR2CH69JQ 754 0 0
CTCAAACCAAATCCTTATTTTGTGTATCTGAACAATAATTAATTACACATTAATAATTAA
ATCAATCGCAGATAAAAAACACACACAAAAAA***CAGAGGAAACAGAGAAGATATGAAG
GTAAAAGGGAAGAGAATCTGAGCCCTAAGGATTGCTATCACTGGGAGGAAAACGTGGGAG
ATAAGGTATCCATGTTGTAGGATCTCTCCAGTCAAACGCAGGCAATGATGCATTAGGGTT
TCCTAAAGGAAGAAAAGGGAAAGGGAAAGACGGAAGCGGAGGCAGAGTAGGCAACGGCGG
CAGAGTAGAGTACGGCCAAGGGAACCAGTACGGTGGCATATAAGGCCAGAAGAGCTTCGA
ATCTCTCAACTTATTCTCCACCTTCTCCTCTCGCTGGTGGTGATGTCTCTTTCCGCCGCT
GCAAAGTGTGCTGTTTCGGTGGGAAGGTTTGTAGCTGAGTGCGCTTAAGCTGTAGATACA
GACACGATCTTGCTTCGACTTGATAGATACTTCGTTGGCTGCTGTCTGAAAAACGGGGAT
GTTGCAGCCGACGACGTTGTTGTCGGAGGAGGGTTTGAGCAACTTGGCGCTGCACTGAGA
GGATATGGCGATTCCGTCGACGCAATCTATCCCGTCGACGTGAGGGATGTCGAGCTTGTA
AACGCCGTTTCTGTTTGTTGTTCTGTTCACCGATATGTTCACTTCCTCTGTTGTTTTTGG
TGAACTCGCTTTGAATCTACAGCTCACATGAACT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2EW29TF 798 0 0
TCTGTGAGAAGG
TTGTAGCTGAGTGCGCTTAAGCTGTAGATACAGACGCGATCTTGCTTCGACTTGATGGAT
ACTTCGTTGGCTGCTGTCTGAAAAACGGGGATGTTGCAGACGACGTTGTTGTTGTCGGAG
GAGGGTTTGAGCAGCTTGGCGCTGCACTGAGAGGCTATGGCGATTCCGTCGACGCAATCT
ATCCCGTCGACGTGAGGGATGTCGAGCTTGTAAACGCCGTTGCTGTTTGTTGTTCTGTTC
ACTGATATGTTCACTTCTTCTGTTGTTTTTGGTGAACTCGCTTTGAATCTACAGCTCACA
TGAACTTCCACTCCTGAGACAGACAGAGAGAGAGTAGACTGGTTTTTAAGGCCCTAATCA
GACCGAAACTGTACCAAGAAAACCAATTGAAGACAGGATCAATGAGGAAATTAAACCGAA
CAAATTTGAAAATTGGCAAACCGAAATTTATATAACCGGATTGACAAATTCTAAAAGGCT
AGATAATTTAAGTCACAATTCATGTAAATGTTACAATCATGAGAAAGTGTTGGCCAATCC
TAAGTTAACAGACAAGTTCATGTAATGTTAAAATCAAGATCTCTGACCTTGTAAGAAATA
GCTCTGTCTTGAGAAAGTGTTGATTGAACAAGTGTCACAGTAGACAACTCCGACGACTGT
GATGCGAGAAGAAGGGTCCGAGCTTCCTCCCGATGGTGAATGGCCACGACCACGGCCAAA
AGCTTGATGTGACAAGCTAGAAGCTAGAAGGAGAAGACAGAGAAGAGGAAGATACATTGT
GGCTCC

QA 13 798 13 798
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2353Contig1 464 4 13 U
GGGCCGCACTTGCTTTGCTTCTCCTCAGTGTTTGAATTTATAGAGTCGTCTACACTTCAA
GATGCAGAACGAAGAGGGTCAGGTCACGGAACTATACATTCCTAGGAAATGCTCTGCTAC
TAACCGGATGATCACGTCAAAGGATCATGCCTCTGTGCAACTCAACATTGGTCATTTAGA
TGCTGATGGCATCTACACCGGTCAATTCACTACCTTTGCTCTCTGCGGTTTTGTTCGTGC
CCAGGGAGATGCTGACAGTGGTGTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAGCCAA
ACAAGTCTAAAGAGCCTAATTAAGCTGTCTTTTTTACTTTGTTCTGAATGTTGATTATTT
AATTCAAAAAGATCATCGGACATAATGATATTTGCTTGACTCTTGGTTTTAATGCTTTTT
*GGCACTGGCTTGTTCTAATTTTCCTCTACTGAGATAATATCTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU37TF U 1
AF RR2BX84JQ C 1
AF RR2BX84TF U 1
AF RR2CN54TF U 19
BS 1 37 RR2DU37TF
BS 38 38 RR2BX84TF
BS 39 53 RR2DU37TF
BS 54 54 RR2BX84TF
BS 55 153 RR2DU37TF
BS 154 154 RR2BX84TF
BS 155 216 RR2DU37TF
BS 217 217 RR2BX84TF
BS 218 271 RR2DU37TF
BS 272 272 RR2BX84TF
BS 273 278 RR2DU37TF
BS 279 450 RR2BX84TF
BS 451 464 RR2CN54TF

RD RR2DU37TF 278 0 0
GGGCCGCACTTGCTTTGCTTCTCCTCAGTGTTTGAATATATAGAGTCGTCTACTCTTCAA
GATGCAGAACGAAGAGGGTCAGGTCACGGAACTATACATTCCTAGGAAATGCTCTGCTAC
TAACCGGATGATCACGTCAAAGGATCATGCCTCCGTGCAACTCAACATTGGTCATTTAGA
TGCTGATGGCATCTACACCGGTCAATTCACTACCTTGGCTCTCTGCGGTTTTGTTCGTGC
CCAGGGAGATGCTGACAGTGGTGTGGACAGGTTGTGGC

QA 1 278 1 278
DS 

RD RR2BX84JQ 452 0 0
GGGCCGCACTTGCTTTGCTTCTCCTCAGTGTTTGAATTTATAGAGTCGTCTACACTTCAA
GATGCAGAACGAAGAGGGTCAGGTCACGGAACTATACATTCCTAGGAAATGCTCTGCTAC
TAACCGGATGATCACGTCAAAGGATCATGCCTCTGTGCAACTCAACATTGGTCATTTAGA
TGCTGATGGCATCTACACCGGTCAATTCACTACCTTTGCTCTCTGCGGTTTTGTTCGTGC
CCAGGGAGATGCTGACAGTGGTGTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAGCCAA
ACAAGTCTAAAGAGCCTAATTAAGCTGTCTTTTTTACTTTGTTCTGAATGTTGATTATTT
AATTCAAAAAGATCATCGGACATAATGATATTTGCTTGACTCTTGGTTTTAATGCTTTTT
*GGCACTGGCTTGTTCTAATTTTCCTCTAC
CG

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR2BX84TF 452 0 0
GGGCCGCACTTGCTTTGCTTCTCCTCAGTGTTTGAATTTATAGAGTCGTCTACACTTCAA
GATGCAGAACGAAGAGGGTCAGGTCACGGAACTATACATTCCTAGGAAATGCTCTGCTAC
TAACCGGATGATCACGTCAAAGGATCATGCCTCTGTGCAACTCAACATTGGTCATTTAGA
TGCTGATGGCATCTACACCGGTCAATTCACTACCTTTGCTCTCTGCGGTTTTGTTCGTGC
CCAGGGAGATGCTGACAGTGGTGTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAGCCAA
ACAAGTCTAAAGAGCCTAATTAAGCTGTCTTTTTTACTTTGTTCTGAATGTTGATTATTT
AATTCAAAAAGATCATCGGACATAATGATATTTGCTTGACTCTTGGTTTTAATGCTTTTT
*GGCACTGGCTTGTTCTAATTTTCCTCTAC
CG

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR2CN54TF 446 0 0
TTCTCCTCAGTGTTTGAATTTATAGAGTCGTCTACACTTCAAGATGCAGAACGAAGAGGG
TCAGGTCACGGAACTATACATTCCTAGGAAATGCTCTGCTACTAACCGGATGATCACGTC
AAAGGATCATGCCTCTGTGCAACTCAACATTGGTCATTTAGATGCTGATGGCATCTACAC
CGGTCAATTCACTACCTTTGCTCTCTGCGGTTTTGTTCGTGCCCGGGGAGATGCTGACAG
TGGTGTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAGCCAAACAAGTCTAAAGAGCCTA
ATTAAGCTGGCTTTTTTACTTTGTTCTGAATGTTGATTATTTAATTCAAAAAGATCATCG
GACATAATGATATTTGCTTGACTCTTGGTTTTAATGCTTTTTTGGCACTGGCTTGTTCTA
ATTTTCCTCTACTGAGATAATATCTT

QA 1 446 1 446
DS 



AS 1 4

CO CL2354Contig1 983 4 3 U
GCATGAAATGTTTTATAAAGAAACGCAGATAGAACAGATAAGGTTTAAGTTTTATGGAGT
TTTATTACTCAAAGAAAGAGATAATTTCAGCAAGATACAACCACAAAAGCTCATCTACTT
TGGGTGGAGGACTTGCAAAAGAGTTTTCTTTCATCAAGTGCTGATATTTGGCAACAACAA
TACAAGAATCAATAGAAAAATCCGGAGGTTCTCTGAAGATTATTAACTTCAAACTTTAAA
AAAGTGTGATGAGCGCAAGAATGCATAAAAGGGGCTGGCTGTTCAACGCTGAAGTTGCTT
GATGTGTGCGATCTGTTTGCCAGGGTTCAAACCCTTTGGACAGGCACGAGCACAGTTCAA
GATTGTATGGCAACGGTAAAGCTTGAACTCGTCGTCAATAGCCTCCAGTCTTTCCTTTGT
GTACTCATCCCGACTGTCGCTTATCCACCTGTTTGCATGCAGCAAAGCGGCAGGGCCAAG
GTAAGACTCAGGGTTCCACCAATAACTAGGACACGACGTGCTACAACAAGCACACAAGAT
ACACTCATACATCCCATCAAGCTTCGCCCTATCCTTCTTACTCTGCAGAATCTCCTTCCC
AGCCTCATCCCCCGGACTCTTCCTCTTCAACCACGGCTCAATACTCTTATACTGATTATA
AAAGTTCGTCATAGCACCATGGGACCACAGTCCTTGAGATCGATCTGGTAGTCTTGGAGC
TCCGGTTTGCCGGGGCTGTCGGGGTTCCACCGGTAGATCTGGAACGTCTTCAGGTTCGAT
CCTCTCCCTCCGCCGCCGCCGGACGAAGGTTTTGATTCCGTTGAGGAGGATGTGCATCGC
GACGGGATTAACCTAGCCGCCGTGGTTAATCTCGCCGGTTTGGTTCTGACTAATTTTCCG
ATTAAACCGGACGCCATTTTTTCGTGGAGAAATGAAATGATTGCAAGAGACGGAGCGATT
GAAAATTAATTTATATTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H429JQB U 1
AF RR2B314JQ U 122
AF RR2B314TF C 284
AF RR2ET09TF C 213
BS 1 387 RR2H429JQB
BS 388 610 RR2B314JQ
BS 611 983 RR2ET09TF

RD RR2H429JQB 387 0 0
GCATGAAATGTTTTATAAAGAAACGCAGATAGAACAGATAAGGTTTAAGTTTTATGGAGT
TTTATTACTCAAAGAAAGAGATAATTTCAGCAAGATACAACCACAAAAGCTCATCTACTT
TGGGTGGAGGACTTGCAAAAGAGTTTTCTTTCATCAAGTGCTGATATTTGGCAACAACAA
TACAAGAATCAATAGAAAAATCCGGAGGTTCTCTGAAGATTATTAACTTCAAACTTTAAA
AAAGTGTGATGAGCGCAAGAATGCATAAAAGGGGCTGGCTGTTCAACGCTGAAGTTGCTT
GATGTGTGCGATCTGTTTGCCAGGGTTCAAACCCTTTGGACAGGCACGAGCACAGTTCAA
GATTGTATGGCAACGGTAAAGCTTGAA

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR2B314JQ 489 0 0
GGGTGGAGGACTTGCAAAAGAGTTTTCTTTCATCAAGTGCTGATATTTGGTAACAACAAT
ACAAGAATCAATAGAAAAATCCGGAGGTTCTCTGAAGATTATTAACTTCAAACTTTAAAA
AAGTGTGATGAGCGCAAGAATGCATAAAAGGGGCTGGCTGTTCAACGCTGAAGTTGCTTG
ATGTGTGCGATCTGTTTGCCAGGGTTCAAACCCTTTGGACAGGCACGAGCACAGTTCAAG
ATTGTATGGCAACGGTAAAGCTTGAACTCGTCGTCAATAGCCTCCAGTCTTTCCTTTGTG
TACTCATCCCGACTGTCGCTTATCCACCTGTTTGCATGCAGCAAAGCGGCAGGGCCAAGG
TAAGACTCAGGGTTCCACCAATAACTAGGACACGACGTGCTACAACAAGCACACAAGATA
CACTCATACATCCCATCAAGCTTCGCCCTATCCTTCTTACTCTGCAGAATCTCCTTCCCA
GCCTCATCC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2B314TF 327 0 0
CAACGCTGAAGTTGCTTGATGTGTGCGATCTGTTTGCCAGGGTTCAAACCCTTTGGACAG
GCACGAGCACAGTTCAAGATTGTATGGCAACGGTAAAGCTTGAACTCGTCGTCAATAGCC
TCCAGTCTTTCCTTTGTGTACTCATCCCGACTGTCGCTTATCCACCTGTTTGCATGCAGC
AAAGCGGCAGGGCCAAGGTAAGACTCAGGGTTCCACCAATAACTAGGACACGACGTGCTA
CAACAAGCACACAAGATACACTCATACATCCCATCAAGCTTCGCCCTATCCTTCTTACTC
TGCAGAATCTCCTTCCCAGCCTCATCC

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR2ET09TF 771 0 0
CTGAAGATTATTAACTTCAAACTT*AAAAAAGTGTGATGAGCGCAAGAATGCATAAAAGG
GGCTGGCTGTTCAACGCTGAAGTTGCTTGATGTGTGCGATCTGTTTGCCAGGGTTCAAAC
CCTTTGGACAGGCACGAGCACAGTTCAAGATTGTATGGCAACGGTAAAGCTTGAACTCGT
CGTCAATAGCCTCCAGTCTTTCCTTTGTGTACTCATCCCGACTGTCGCTTATCCACCTGT
TTGCATGCAGCAAAGCGGCAGGGCCAAGGTAAGACTCAGGGTTCCACCAATAACTAGGAC
ACGACGTGCTACAACAAGCACACAAGATACACTCATACATCCCATCAAGCTTCGCCCTAT
CCTTCTTACTCTGCAGAATCTCCTTCCCAGCCTCATCCCCCGGACTCTTCCTCTTCAACC
ACGGCTCAATACTCTTATACTGATTATAAAAGTTCGTCATAGCACCATGGGACCACAGTC
CTTGAGATCGATCTGGTAGTCTTGGAGCTCCGGTTTGCCGGGGCTGTCGGGGTTCCACCG
GTAGATCTGGAACGTCTTCAGGTTCGATCCTCTCCCTCCGCCGCCGCCGGACGAAGGTTT
TGATTCCGTTGAGGAGGATGTGCATCGCGACGGGATTAACCTAGCCGCCGTGGTTAATCT
CGCCGGTTTGGTTCTGACTAATTTTCCGATTAAACCGGACGCCATTTTTTCGTGGAGAAA
TGAAATGATTGCAAGAGACGGAGCGATTGAAAATTAATTTATATTTTTCCC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL2355Contig1 457 2 2 U
GGGTCGAAGAGAAAGGTGAATCGAGAAAAGCGAAGAAGAAGAAGAAGATGAGTGGAGGAA
TGGAGACGAACAAGAACAAATTCATCGAGGATTGGGGATCGGCTAGGGAGAATCTCGAGC
ACAACTTCCGATGGACACGTCGCAACTTCGCTCTCATCGGAATCTTCGGCATCGCCCTCC
CCATCATCGTCTACAAGGGCATCGTCAAAGATTTCCATATGCAAGACGAAGATGCAGGCA
GACCACACAGGAAGTTCCTATGAGCTTGTTTGCGACAACACTCTCTTCTGCAAAATGTCT
CAGCTGTGTGAAGTTTTCAAGAAGCTGATGCTATCACTCTCCTTTTCTTTCTTTTTTTTT
GCATTTTATTCAGAATAAAGAACATCTGTTGAAGGATTATAATTGCTGTTTCGAAAAGTT
TGTTTTGATTGGCAAATAAAAAAACTCAAGTTCGCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GH59JQB C 1
AF RR2GH59TF U 1
BS 1 2 RR2GH59JQB
BS 3 457 RR2GH59TF

RD RR2GH59JQB 457 0 0
GGGTCGAAGAGAAAGGTGAATCGAGAAAAGCGAAGAAGAAGAAGAAGATGAGTGGAGGAA
TGGAGACGAACAAGAACAAATTCATCGAGGATTGGGGATCGGCTAGGGAGAATCTCGAGC
ACAACTTCCGATGGACACGTCGCAACTTCGCTCTCATCGGAATCTTCGGCATCGCCCTCC
CCATCATCGTCTACAAGGGCATCGTCAAAGATTTCCATATGCAAGACGAAGATGCAGGCA
GACCACACAGGAAGTTCCTATGAGCTTGTTTGCGACAACACTCTCTTCTGCAAAATGTTT
CAGCTGTGTGAAGTTTTCAAGAAGCTGATGCTATCACTCTCCTTTTCTTTCTTTTTTTTT
GCATTTTATTCAGAATAAAGAACATCTGTTGAAGGATTATAATTGCTGTTTCGAAAAGTT
TGTTTTGATTGGCAAATAAAAAAACTCAAGTTCGCCC

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR2GH59TF 457 0 0
GG
GTCGAAGAGAAAGGTGAATCGAGAAAAGCGAAGAAGAAGAAGAAGATGAGTGGAGGAATG
GAGACGAACAAGAACAAATTCATCGAGGATTGGGGATCGGCTAGGGAGAATCTCGAGCAC
AACTTCCGATGGACACGTCGCAACTTCGCTCTCATCGGAATCTTCGGCATCGCCCTCCCC
ATCATCGTCTACAAGGGCATCGTCAAAGATTTCCATATGCAAGACGAAGATGCAGGCAGA
CCACACAGGAAGTTCCTATGAGCTTGTTTGCGACAACACTCTCTTCTGCAAAATGTCTCA
GCTGTGTGAAGTTTTCAAGAAGCTGATGCTATCACTCTCCTTTTCTTTCTTTTTTTTTGC
ATTTTATTCAGAATAAAGAACATCTGTTGAAGGATTATAATTGCTGTTTCGAAAAGTTTG
TTTTGATTGGCAAATAAAAAAACTCAAGTTCGCCC

QA 3 457 3 457
DS 



AS 1 4

CO CL2356Contig1 508 4 7 U
GGAAATAGAAACACTTCATTTATTTCCTAAATTTTTAAGCTTTAACCCACTATTAATCCA
TTTTTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTCTACTCTTATTCACCTTATTAATTGCATTC
ATCATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATGCGCAGAAAAAGAAAACAGAACTATGCCCT
TCTCCAATCAAGTTAAACCGTTTTTGTCTTCCAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAAG
AAATTCCCAGCTCCTCATATTGGTTTTGGTAGTGGTTATTGTGAAGATTTACAGAAG*GG
AATTTGTCACTGTGCTGTTCCTTGAGCTTCACGCTAAATGTTGTGAATATAATACAGAAC
CTAAATTCTATATTACCGTTTAACTATAAAGTATCATTAAAATAAAGTATTATGATATTT
GTATCAGATCTTTGGTTTATTTATAATAAATAACAATATAAATGTTAAATAATTGCAATC
TTTAATAATAAAATTGGACTTTTCAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW41TF U 1
AF RR2EU83TF U 32
AF RR2GR52JQ C 32
AF RR2GR52TF U 32
BS 1 324 RR2EW41TF
BS 325 325 RR2GR52TF
BS 326 326 RR2EW41TF
BS 327 327 RR2EU83TF
BS 328 409 RR2EW41TF
BS 410 410 RR2EU83TF
BS 411 508 RR2EW41TF

RD RR2EW41TF 508 0 0
GGAAATAGAAACACTTCATTTATTTCCTAAATTTTTAAGCTTTAACCCACTATTAATCCA
TTTTTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTCTACTCTTATTCACCTTATTAATTGCATTC
ATCATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATGCGCAGAAAAAGAAAACAGAACTATGCCCT
TCTCCAATCAAGTTAAACCGTTTTTGTCTTCCAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAAG
AAATTCCCAGCTCCTCATATTGGTTTTGGTAGTGGTTATTGTGAAGATTTACAGAAG*GG
AATTTGTCACTGTGCTGTTCCTTGTGTTTCACGCTAAATGTTGTGAATATAATACAGAAC
CTAAATTCTATATTACCGTTTAACTATAAAGTATCATTAAAATAAAGTACTATGATATTT
GTATCAGATCTTTGGTTTATTTATAATAAATAACAATATAAATGTTAAATAATTGCAATC
TTTAATAATAAAATTGGACTTTTCAAAA

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2EU83TF 475 0 0
TTTTTAAGCTTTAACCCACTATTAATCCATTTTTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTC
TACTCTTATTCACCTTATTAATTGCATTCATCATTCTTCCACTAGGAATGACGACAAATG
CGCAGAAAAAGAAAACAGAACTATGCCCTTCTCCAATCAAGTTAAACCGTTTTTGTCTTC
CAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAAGAAATTCCCAGCTCCTCATATTGGTTTTGGTA
GTGGTTATTGTGAAGATTTACAGAAG*GGAATTTGTCACTGTGCTGTTCCTTGTGCTTCA
CGCTAAATGTTGTGAATATAATACAGAACCTAAATTCTATATTACCGTTTAACTATAAAG
TATCATTAAAATAAAGTATTATGATATTTGTATCAGATCTTTGGTTTATTTATAATAAAT
AACAATATAAATGTTAAATAATTGCAATCTTTAATAATAAAATTGGAC
ATTTTAT

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR2GR52JQ 460 0 0
TTTTTAAGCTTTAACCCACTATTAATCCATTTTTGTTATCCACGATGAGAAAATCCCTTC
TACTCTTATTCACCTTATTAATTGCATTCATCATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATG
CGCAGAAAAAGAAAACAGAACTATGCCCTTCTCCAATCAAGTTAAACCGTTTTTGTCTTC
CAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAAGAAATTCCCAGCTCCTCATATTGGTTTTGGTA
GTGGTTATTGTGAAGATTTACAGAAG*GGAATTTGTCACTGTGCTGTTCCTTGAGCTTCA
CGCTAAATGTTGTGAATATAATACAGAACCTAAATTCTATATTACCGTTTAACTATAAAG
TATCATTAAAATAAAGTATTATGATATTTGTATCAGATCTTTGGTTTATTTATAATAAAT
AACAATATAAATGTTAAATAATTGCAATCTTTAATAATAA

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2GR52TF 460 0 0
TTTTTAAGCTTTAACCCACTATTAATCCATTTTTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTC
TACTCTTATTCACCTTATTAATTGCATTCATCATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATG
CGCAGAAAAAGAAAACAGAACTATGCCCTTCTCCAATCAAGTTAAACCGTTTTTGTCTTC
CAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAAGAAATTCCCAGCTCCTCATATTGGTTTTGGTA
GTGGTTATTGTGAAGATTTACAGAAGAGGAATTTGTCACTGTGCTGTTCCTTGAGCTTCA
CGCTAAATGTTGTGAATATAATACAGAACCTAAATTCTATATTACCGTTTAACTATAAAG
TATCATTAAAATAAAGTATTATGATATTTGTATCAGATCTTTGGTTTATTTATAATAAAT
AACAATATAAATGTTAAATAATTGCAATCTTTAATAATAA

QA 1 460 1 460
DS 



AS 0 0

AS 2 4

CO CL2358Contig1 415 2 2 U
GGGATTAGGGTTTTGCTGCAGTGGCCGTATAAGCAACCCTAGCCGATCAGATCTCTCCTC
TATCTTCCTTACACAGAGATGGCCAAGTCGAAGAATCACACAGCGCATAACCAGTCGGCC
AAGGCCCACAAGAACGGAATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACCCCCACCAGAGGG
ATGGACCCAAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCAAGGAAGCACAACGTCAAGAGCGGC
GAGAATGCCACCACTGAAGACTAAGTTTGTATTCTCTCTTGAGACTCTTTTAGTAGACTA
AAGAACCAATGTGTTGTCCTTTTCTGAATCTTCTTCGTTTCATTATGTTTCCGCAAATGG
TTTGTGCACTCTTATAATCCATGCCTTAAATTTAATATCAAAGATTTTAAATTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2BJ81JQ C 1
AF RR2BJ81TF U 1
BS 1 414 RR2BJ81TF
BS 415 415 RR2BJ81JQ

RD RR2BJ81JQ 415 0 0
GGGATTAGGGTTTTGCTGCAGTGGCCGTATAAGCAACCCTAGCCGATCAGATCTCTCCTC
TATCTTCCTTACACAGAGATGGCCAAGTCGAAGAATCACACAGCGCATAACCAGTCGGCC
AAGGCCCACAAGAACGGAATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACCCCCACCAGAGGG
ATGGACCCAAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCAAGGAAGCACAACGTCAAGAGCGGC
GAGAATGCCACCACTGAAGACTAAGTTTGTATTCTCTCTTGAGACTCTTTTAGTAGACTA
AAGAACCAATGTGTTGTCCTTTTCTGAATCTTCTTCGTTTCATTATGTTTCCGCAAATGG
TTTGTGCACTCTTATAATCCATGCCTTAAATTTAATATCAAAGATTTTAAATTCG

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR2BJ81TF 415 0 0
GGGATTAGGGTTTTGCTGCAGTGGCCGTATAAGCAACCCTAGCCGATCAGATCTCTCCTC
TATCTTCCTTACACAGAGATGGCCAAGTCGAAGAATCACACAGCGCATAACCAGTCGGCC
AAGGCCCACAAGAACGGAATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACCCCCACCAGAGGG
ATGGACCCAAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCAAGGAAGCACAACGTCAAGAGCGGC
GAGAATGCCACCACTGAAGACTAAGTTTGTATTCTCTCTTGAGACTCTTTTAGTAGACTA
AAGAACCAATGTGTTGTCCTTTTCTGAATCTTCTTCGTTTCATTATGTTTCCGCAAATGG
TTTGTGCACTCTTATAATCCATGCCTTAAATTTAATATCAAAGATTTTAAATTC
G

QA 1 414 1 414
DS 



CO CL2358Contig2 407 2 3 U
GGGCTGTGGCCGTATAAGCAACCCAAGCCGATCAGATCTCTCCTCTATCTTCATTACACA
GAGATGGCCAAGTCGAAGAATCACACAGCGCATAACCAGTCGGCCAAGGCCCACAAGAAC
GGAATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACCCACACCAGAGGGATGGACCCAAAGTTC
TTGAGGAACCAGAGGTATGCAAGGAAGCACAACGTCAAGAGCGGCGAGAATGCCACCACT
GAAGACTAAGTTTGTATTCTCTCTTGAGACTCTTTTTAGTAGACTAAAGAACCAATGTGT
TGTCCTTTTTTGAATCTTTTTCGTTTCCTTATGTTTCCGCAAATGGTTTGTGCACTGTTT
CAATCCATGCCTTAATTCAGTATCAGAGATTTTAAATTCTATTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM73JQ C 1
AF RR2CM73TF U 1
BS 1 5 RR2CM73JQ
BS 6 399 RR2CM73TF
BS 400 407 RR2CM73JQ

RD RR2CM73JQ 407 0 0
GGGCTGTGGCCGTATAAGCAACCCAAGCCGATCAGATCTCTCCTCTATCTTCATTACACA
GAGATGGCCAAGTCGAAGAATCACACAGCGCATAACCAGTCGGCCAAGGCCCACAAGAAC
GGAATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACCCACACCAGAGGGATGGACCCAAAGTTC
TTGAGGAACCAGAGGTATGCAAGGAAGCACAACGTCAAGAGCGGCGAGAATGCCACCACT
GAAGACTAAGTTTGTATTCTCTCTTGAGACTCTTTTTAGTAGACTAAAGAACCAATGTGT
TGTCCTTTTTTGAATCTTTTTCGTTTCCTTATGTTTCCGCAAATGGTTTGTGCACTGTTT
CAATCCATGCCTTAATTCAGTATCAGAGATTTTAAATTCTATTAAGC

QA 1 407 1 407
DS 

RD RR2CM73TF 407 0 0
GGGCT
GTGGCCGTATAAGCAACCCAAGCCGATCAGATCTCTCCTCTATCTTCATTACACAGAGAT
GGCCAAGTCGAAGAATCACACAGCGCATAACCAGTCGGCCAAGGCCCACAAGAACGGAAT
CAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACCCACACCAGAGGGATGGACCCAAAGTTCTTGAG
GAACCAGAGGTATGCAAGGAAGCACAACGTCAAGAGCGGCGAGAATGCCACCACTGAAGA
CTAAGTTTGTATTCTCTCTTGAGACTCTTTTTAGTAGACTAAAGAACCAATGTGTTGTCC
TTTTTTGAATCTTTTTCGTTTCCTTATGTTTCCGCAAATGGTTTGTGCACTGTTTCAATC
CATGCCTTAATTCAGTATCAGAGATTTTAAATTC
TATTAAGC

QA 6 399 6 399
DS 



AS 1 2

CO CL2359Contig1 995 2 2 U
CGAGAATCTGAACCAGACAGTTTCTCTGATCTTCTCAGAGGAAATCTTCTTTTCTCTCTG
GTGGATCTCTTGAAGAAGAAAAAGCGAAGAACAATCTCACTATCTTCTCTACCTATCTCT
GCTGGTGAATTTAGATGGCTGGAGCTGTGAGATTATCGGCGACGTCGGTTCAGGCCATTC
GCGTGTCTTCCTCCTTCGCCTCCTTTGCAACCACTCTCAACTCTCTGAAACCTTGCTCAC
CTCCGAATCTGAATTCCGACAAGAGAGTTCGTCAGCTCTCTTCTTCTCCCTCCTGCTCCT
CTTCTCATTACACATCTTTAGGTCGCTAGCCACATCCCTCTTAAACGATCCAAGAGCAAG
GTGGTTCACGTCAAGGTAGATGAGAGTGTGGCGGAGACAGAACCACCGAAATGGTGGGAG
AGGAATGCTGGACCGAACATGGTTGACATTCATTCCACTGAAGAATTCTTGAAGGCTTTA
AGCGAAGCTGGCGAAAGACTAGTCATTGTAGAGTTTTATGGAACTTGGTGTGCTTCTTGC
AGAGCATTGTTCCCCAAGCTTTGCAAGACAGCGGTAGAACATCCGGATATACTGTTCCTC
AAAGTAAACTTTGATGAGAATAAACCAATGTGCAAGAGTTTGAACGTCAAAGTGCTTCCT
TATTTCCACTTTTACCGTGGAGCTGGTGGCCAGCTCGAGTCCTTCTCATGTTCTCTTGCC
AAGTTTCAGAAGATAAAAGATGCAATCCGACTACACAACACAGATCGTTGCAGCATCGGT
CCAGCCAAGGGACCTGAAGGGTTTACGTTGGAATCTTTATCCGTGCAGACGAATGCAGCC
AAACCAGCTGGATCAAGTTGAATTTGCCATACGTTTATAGATTCATTACTGCAACAGTCT
CTGATTGGTCAAGCAAACACCGAGTTTTATATTCTCTGTATATCTGTCACTTTATTGGTA
TAAAAGAATCCTTCCTGAAGCGTGTTATGATACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO42TF U 1
AF RR2CO42JQ C 301
BS 1 665 RR2CO42TF
BS 666 995 RR2CO42JQ

RD RR2CO42TF 665 0 0
CGAGAATCTGAACCAGACAGTTTCTCTGATCTTCTCAGAGGAAATCTTCTTTTCTCTCTG
GTGGATCTCTTGAAGAAGAAAAAGCGAAGAACAATCTCACTATCTTCTCTACCTATCTCT
GCTGGTGAATTTAGATGGCTGGAGCTGTGAGATTATCGGCGACGTCGGTTCAGGCCATTC
GCGTGTCTTCCTCCTTCGCCTCCTTTGCAACCACTCTCAACTCTCTGAAACCTTGCTCAC
CTCCGAATCTGAATTCCGACAAGAGAGTTCGTCAGCTCTCTTCTTCTCCCTCCTGCTCCT
CTTCTCATTACACATCTTTAGGTCGCTAGCCACATCCCTCTTAAACGATCCAAGAGCAAG
GTGGTTCACGTCAAGGTAGATGAGAGTGTGGCGGAGACAGAACCACCGAAATGGTGGGAG
AGGAATGCTGGACCGAACATGGTTGACATTCATTCCACTGAAGAATTCTTGAAGGCTTTA
AGCGAAGCTGGCGAAAGACTAGTCATTGTAGAGTTTTATGGAACTTGGTGTGCTTCTTGC
AGAGCATTGTTCCCCAAGCTTTGCAAGACAGCGGTAGAACATCCGGATATACTGTTCCTC
AAAGTAAACTTTGATGAGAATAAACCAATGTGCAAGAGTTTGAACGTCAAAGTGCTTCCT
TATTT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2CO42JQ 695 0 0
CTTCTCATTACACATCTTTAGGTCGCTAGCCACATCCCTCTTAAACGATCCAAGAGCAAG
GTGGTTCACGTCAAGGTAGATGAGAGTGTGGCGGAGACAGAACCACCGAAATGGTGGGAG
AGGAATGCTGGACCGAACATGGTTGACATTCATTCCACTGAAGAATTCTTGAAGGCTTTA
AGCGAAGCTGGCGAAAGACTAGTCATTGTAGAGTTTTATGGAACTTGGTGTGCTTCTTGC
AGAGCATTGTTCCCCAAGCTTTGCAAGACAGCGGTAGAACATCCGGATATACTGTTCCTC
AAAGTAAACTTTGATGAGAATAAACCAATGTGCAAGAGTTTGAACGTCAAAGTGCTTCCT
TATTTCCACTTTTACCGTGGAGCTGGTGGCCAGCTCGAGTCCTTCTCATGTTCTCTTGCC
AAGTTTCAGAAGATAAAAGATGCAATCCGACTACACAACACAGATCGTTGCAGCATCGGT
CCAGCCAAGGGACCTGAAGGGTTTACGTTGGAATCTTTATCCGTGCAGACGAATGCAGCC
AAACCAGCTGGATCAAGTTGAATTTGCCATACGTTTATAGATTCATTACTGCAACAGTCT
CTGATTGGTCAAGCAAACACCGAGTTTTATATTCTCTGTATATCTGTCACTTTATTGGTA
TAAAAGAATCCTTCCTGAAGCGTGTTATGATACTT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL2360Contig1 448 2 1 U
GAACCAAACATTTCATCATCTTCTTCATCTAACATCTTTTTCTCCCTCTCTCTTTTCTGA
ACCCAGATTCACAAACTAGTCTCTGTTCTTTGCTAACTTACCCATCTATATGTGTGTGTT
GTCTTTGCTTTTATAAGAGTCAGTTTTTTTGTTCTTTTTTGTTTCTGTGAGGTGGCTATC
TTCGTTGATATTCCTGTTCTAACGTAGAAACAGCTTTATAAAATCCTTGAAAGCATGTAA
AATTAAGTCTCAGATCCATTTTCTTCTTCTTGCAAAAAAAAAAAATATTAACTTATAGAT
AAAATTTTCATAAATTGGTGTCTCTCTCGTTTTAATTTGTGTTTGGAGAAACAAGTCCTG
GCTAAGTTTAAAACACAAGTGTAAACACAAATTTATAAAAACTTCAAATCATGTAAATTT
CGTCTCAATTAATTTATCTTCCTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CD95TF U 1
AF RR2CD95JQ C 21
BS 1 448 RR2CD95TF

RD RR2CD95TF 448 0 0
GAACCAAACATTTCATCATCTTCTTCATCTAACATCTTTTTCTCCCTCTCTCTTTTCTGA
ACCCAGATTCACAAACTAGTCTCTGTTCTTTGCTAACTTACCCATCTATATGTGTGTGTT
GTCTTTGCTTTTATAAGAGTCAGTTTTTTTGTTCTTTTTTGTTTCTGTGAGGTGGCTATC
TTCGTTGATATTCCTGTTCTAACGTAGAAACAGCTTTATAAAATCCTTGAAAGCATGTAA
AATTAAGTCTCAGATCCATTTTCTTCTTCTTGCAAAAAAAAAAAATATTAACTTATAGAT
AAAATTTTCATAAATTGGTGTCTCTCTCGTTTTAATTTGTGTTTGGAGAAACAAGTCCTG
GCTAAGTTTAAAACACAAGTGTAAACACAAATTTATAAAAACTTCAAATCATGTAAATTT
CGTCTCAATTAATTTATCTTCCTTCCCC

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR2CD95JQ 428 0 0
TTT
TTCATCTAACATCTTTTTCTCCCTCTTTCTTTTCTGAACCCAGATTCACAAACTAGTCTC
TGTTCTTTGCTAACTTACCCATCTATATGTGTGTGTTGTCTTTGCTTTTATAAGAGTCAG
TTTTTTTGTTCTTTTTTGTTTCTGTGAGGTGGCTATCTTCGTTGATATTCCTGTTCTAAC
GTAGAAACAGCTTTATAAAATCCTTGAAAGCATGTAAAATTAAGTCTCAGATCCATTTTC
TTCTTCTTGCAAAAAAAAAAAATATTAACTTATAGATAAAATTTTCATAAATTGGTGTCT
CTCTCGTTTTAATTTGTGTTTGGAGAAACAAGTCCTGGCTAAGTTTAAAACACAAGTGTA
AACACAAATTTATAAAAACTTCAAATCATGTAAATTTCGTCTCAATTAATTTATCTTCCT
TCCCC

QA 4 428 4 428
DS 



AS 1 4

CO CL2361Contig1 427 4 10 U
GGACAGCACATAAAAGCATCAGAAGAAGAAACAAATTACAAGTTTT*AAATCAAAGAGAA
GTAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGAC
TCTTGCAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAAC
TGTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCA
GGAAAAACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGAT
TTGGGCGTTATGTTGCCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTT
ATATGTGTGGTTGTGTAATGTTTTCGTATGTAACTTAAGAAAAAAGAAAAAAATATAACT
ATTGATT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2AO40TF U 1
AF RR2EB28TF U 4
AF RR2AF26JQ C 1
AF RR2AF26TF U 1
BS 1 5 RR2AF26JQ
BS 6 46 RR2AO40TF
BS 47 47 RR2EB28TF
BS 48 367 RR2AO40TF
BS 368 368 RR2EB28TF
BS 369 390 RR2AO40TF
BS 391 391 RR2EB28TF
BS 392 396 RR2AO40TF
BS 397 413 RR2EB28TF
BS 414 427 RR2AF26TF

RD RR2AO40TF 396 0 0
GGACA
GCACATAAAAGCATCAGAAGAAGAAACAAATTACAAGTTTTTAAATCAAAGAGAAGTAAG
AGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACTCTTG
CAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAACTGTAG
CTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCAGGAAA
AACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGATTTGGG
CGTTATGTTGCCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTTATATG
TGCGGTTGTGTAATGTTTTCGTATGCAACTT

QA 6 396 6 396
DS 

RD RR2EB28TF 410 0 0
GG
GCACATAAAAGCATCAGAAGAAGAAACAAATTACAAGTTTT*AAATCAAAGAGAAGTAGG
GGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACTCTTG
CAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAACTGTAG
CTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCAGGAAA
AACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGATTTGGG
CGTTATGTTGCCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTTATATG
TGTGGTTGTGTAATGTTTTCGTATGTAACTTAAGAAAAAAGAAAAAAA

QA 3 410 3 410
DS 

RD RR2AF26JQ 427 0 0
GGACAGCACATAAAAGCATCAGAAGAAGAAACAAATTACAAGTTTT*AAATCAAAGAGAA
GTAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGAC
TCTTGCAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAAC
TGTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCA
GGAAAAACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGAT
TTGGGCGTTATGTTGCCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTT
ATATGTGTGGTTGTGTAATGTTTTCGTATGTAACTTAAGAAAAAAGAAAAAAATATAACT
ATTGATT

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR2AF26TF 427 0 0
GGACA
GCACATAAAAGCATCAGAAGAAGAAACAAATTACAAGTTTT*AAATCAAAGAGAAGTAAG
AGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACTCTTG
CAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGGTCAAACTGTAG
CTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCAGGAAA
AACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGATTTGGG
CGTTATGTTGCCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTTATATG
TGTGGTTGTGTAATGTTTTCGTATGTAACTTAAGAAAAAAGAAAAAAATATAACTATTGA
TT

QA 6 427 6 427
DS 



AS 1 3

CO CL2362Contig1 775 3 31 U
GGGCCGTGAAAGTTCTCATCTCCGTTTCTTCTTCGTCCACGTTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTTGAAGTTGGCGTGATCGACTTCTTTGTGCAAATTCAGACATGCGGCAATCACGAGCT
AGACTGTTCAAGGAGTACAAAGAGGTTCAGAGAGAGAAAGTAGCTGATCCTGATATTCAA
TTGGTGTGTGATGATACCAACATTTTCAAATGGACTGCACTTATCAAGGGACCATCCGAG
ACTCCTTATGAAGGCGGAGTGTTTCAGCTTGCTTTTGCTGTTCCTGAACCGTATCCTCTG
CAGCCTCCTCAAGTGCGGTTCTTGACCAAAATATTCCATCCCGATGTACATTTCAAGACT
GGGGAAATCTGTCTTGACATATTGAAGAACGCCTGGAGCCCTGCGTGGACGCTTCAGTCG
GTGTGTAGAGCTATCATAGCATTGATGGCTCATCCTGAGGCAGACAGTCCTCTCAACTGC
GACTCAGGAAACCTTCTAAGGTCTGGGGATGTCAGAGGCTTCGATTCAATGGCACGCATG
TACACACGCCTCGCCGCTATGCCCAAGAAAGGATGATCCTCTCTTTGCTCTCTTTTCGGG
TTATAACTCGTTTTCTGTGAAATGTAATGAAAAATGATTTGGGAAAACGAATACATTATT
AACAATTCATATGTAAGGCTGCAAAAGAGATGTTTCTTCTTGAACATGGTTTACAATGTT
ATTGCTGATACATATGAGCACGGTCTACCGGTTTTAATAAGAAGTGATGTCTACC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS48TF U 172
AF RR2AZ14TFB U 1
AF RR2AZ14JQ C 1
BS 1 4 RR2AZ14JQ
BS 5 171 RR2AZ14TFB
BS 172 185 RR2CS48TF
BS 186 186 RR2AZ14TFB
BS 187 272 RR2CS48TF
BS 273 273 RR2AZ14TFB
BS 274 314 RR2CS48TF
BS 315 315 RR2AZ14TFB
BS 316 342 RR2CS48TF
BS 343 343 RR2AZ14TFB
BS 344 347 RR2CS48TF
BS 348 348 RR2AZ14TFB
BS 349 368 RR2CS48TF
BS 369 369 RR2AZ14TFB
BS 370 379 RR2CS48TF
BS 380 380 RR2AZ14TFB
BS 381 392 RR2CS48TF
BS 393 393 RR2AZ14TFB
BS 394 431 RR2CS48TF
BS 432 432 RR2AZ14TFB
BS 433 522 RR2CS48TF
BS 523 523 RR2AZ14TFB
BS 524 554 RR2CS48TF
BS 555 555 RR2AZ14TFB
BS 556 579 RR2CS48TF
BS 580 580 RR2AZ14TFB
BS 581 589 RR2CS48TF
BS 590 590 RR2AZ14TFB
BS 591 628 RR2CS48TF
BS 629 708 RR2AZ14TFB
BS 709 775 RR2AZ14JQ

RD RR2CS48TF 463 0 0
GATATTCAATTGGTCTGTGATGATACCAACATTTTCAAATGGACTGCACTTATCAAGGGA
CCATCCGAGACTCCTTATGAAGGCGGAGTGTTTCAGCTTGCATTTGCTGTTCCTGAACCG
TATCCTCTGCAGCCTCCTCAAGTCCGGTTCTTGACCAAAATATTCCATCCCAATGTGCAT
TTCAAGACTGGGGAAATATGTCTTGACACATTGAAGAACGCGTGGAGCCCTGCGTGGACG
CTTCAGTCGGTGTGTAGAGCGATCATAGCATTGATGGCTCATCCTGAGGCAGACAGTCCT
CTCAACTGCGACTCAGGAAACCTTCTAAGGTCTGGGGATGTCAGAGGCTTCAATTCAATG
GCACGCATGTACACACGCCTCGCAGCTATGCCCAAGAAAGGATGATCCCCTCTTTGCTTT
CTTTTCGGGTTATAACTCGTTTTCTGTGAAATGTAAT
GAAAAA

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR2AZ14TFB 708 0 0
GGGG
CGTGAAAGTTCTCATCTCCGTTTCTTCTTCGTCCACGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTT
GAAGTTGGCGTGATCGACTTCTTTGTGCAAATTCAGACATGCGGCAATCACGAGCTAGAC
TGTTCAAGGAGTACAAAGAGGTTCAGAGAGAGAAAGTAGCTGATCCTGATATTCAATTGG
TGTGTGATGATACCAACATTTTCAAATGGACTGCACTTATCAAGGGACCATCCGAGACTC
CTTATGAAGGCGGAGTGTTTCAGCTTGCTTTTGCTGTTCCTGAACCGTATCCTCTGCAGC
CTCCTCAAGTGCGGTTCTTGACCAAAATATTCCATCCCGATGTACATTTCAAGACTGGGG
AAATCTGTCTTGACATATTGAAGAACGCCTGGAGCCCTGCGTGGACGCTTCAGTCGGTGT
GTAGAGCTATCATAGCATTGATGGCTCATCCTGAGGCAGACAGTCCTCTCAACTGCGACT
CAGGAAACCTTCTAAGGTCTGGGGATGTCAGAGGCTTCGATTCAATGGCACGCATGTACA
CACGCCTCGCCGCTATGCCCAAGAAAGGATGATCCTCTCTTTGCTCTCTTTTCGGGTTAT
AACTCGTTTTCTGTGAAATGTAATGAAAAATGATTTGGGAAAACGAATACATTATTAACA
ATTCATATGTAAGGCTGCAAAAGAGATGTTTCTTCTTGAACATG

QA 5 708 5 708
DS 

RD RR2AZ14JQ 775 0 0
GGGCCGTGAAAGTTCTCATCTCCGTTTCTTCTTCGTCCACGTTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTTGAAGTTGGCGTGATCGACTTCTTTGTGCAAATTCAGACATGCGGCAATCACGAGCT
AGACTGTTCAAGGAGTACAAAGAGGTTCAGAGAGAGAAAGTAGCTGATCCTGATATTCAA
TTGGTGTGTGATGATACCAACATTTTCAAATGGACTGCACTTATCAAGGGACCATCCGAG
ACTCCTTATGAAGGCGGAGTGTTTCAGCTTGCTTTTGCTGTTCCTGAACCGTATCCTCTG
CAGCCTCCTCAAGTGCGGTTCTTGACCAAAATATTCCATCCCGATGTACATTTCAAGACT
GGGGAAATCTGTCTTGACATATTGAAGAACGCCTGGAGCCCTGCGTGGACGCTTCAGTCG
GTGTGTAGAGCTATCATAGCATTGATGGCTCATCCTGAGGCAGACAGTCCTCTCAACTGC
GACTCAGGAAACCTTCTAAGGTCTGGGGATGTCAGAGGCTTCGATTCAATGGCACGCATG
TACACACGCCTCGCCGCTATGCCCAAGAAAGGATGATCCTCTCTTTGCTCTCTTTTCGGG
TTATAACTCGTTTTCTGTGAAATGTAATGAAAAATGATTTGGGAAAACGAATACATTATT
AACAATTCATATGTAAGGCTGCAAAAGAGATGTTTCTTCTTGAACATGGTTTACAATGTT
ATTGCTGATACATATGAGCACGGTCTACCGGTTTTAATAAGAAGTGATGTCTACC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 4

CO CL2363Contig1 1376 4 7 U
ATCAAAACGGAAACTGAAACATTGTTTGTCAAAGAACACACAAAAAAGAGAGTCACAGCG
GTTGATAATAATAAAGTTGTAATTCGAATAAAAAAAAGTAGTTAACTACTTGATGGTAGC
TTTGGGGATGCTGGAAGTGCAAGGTCCAGCTGACGTCATGAATGGTATGCCTTTGTATGT
AGCTACCCCACTTTCATCAGTGTAGAGATGCGGTGTTATCTTCTCAAGTTGCTTCTTTTT
TGGGTTCAGCACATCTTCTGGCTTCCCTTCCACCCCTGAGAATGAAACACGCTCTCCTGG
TTTAGCTCCAGCAGGTGGTAACAATGGTTCCACAACAGAATGATCTTCATTTGAAGCACA
TAGAACCAGTCCTTCAGACATAACATCTCGTAGCTTTCCAGGTTTCACATTCGTGATGAG
TGCAACAAGGCGGTTCGTTAGATCATCAGGACTGCAGAATTTTGCTAGGCCACTAACGAC
TTGCCGCACTTTACCCTCTCCGACATCTATTTCTTCCACAAGCAAACTGTCTGCAGATGG
ATGTTTCCACGCTTTTCGAATTAGACCGACCTGAATATTTAGCAAACTGACACTAAGCTC
CACCTCCTTGTTAGCTGCTGGTTCTGTTTCAGCAGGTTTCTTCTTCTCTTTTGTAGCCTT
CTTCTTTGGCTCCTCAACGTCAGTTTTCTTGGTGCTTGGCTGCACTTCTGACTTCTTCTC
AGCAGGCTCTGCACTTTCTGCTGCTTTCTTTGCATTAGCATTTGCATCCACCTTGACGAC
AGCTTTTGATACCTCGAAGTCAAACTGGGGTAACTTCACAGAGATTGGTCCAAACAATGT
TGACAACCCTTCTCTAATCTGGATGTAGTTCATCCATCTTACAACATGTGGTATTTTCTC
CTTGTCTGAATCCGAGAGGCCAAGCGCTGAAGAATGCAGAGCTGCAAACACAACAACATC
AGCTGCCGATGGCGTCAATCCATTCCCCAAGATTACAGACTTGACAGCTAACTCTGCATT
CAACTTCTCAAGAGCTGCAAAGCAATCTTTTGAACTCGCTGGGAGACCTTCCGCATATTC
CAGCCAATTTAAAACCTCCCCGTTGTTTTGTGCAGACGCTTCCTTTCCAGATGCCTTCAA
AACATTAGCATAGAGCGTCTTGACATCACTCTCACCAGCCCCTCCAACAAAAGATGCAGA
GTCCAAGGAGAAATGTTTACAGAGCCCTGATACGATCATCTGCTTCGTCTTTGAATCCAT
CTTCAACTTCCTCTCTTTCTCTATCTTTTGCCTTCTTCTTCTTTTGAGGCTCTTCGCTGA
AACAGAACACTGCTGCTGCACTTGTCTTCGATAGGGTTCTGCTTTTGTAATAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK60TF C 1
AF RR2FK60JQ U 45
AF RR2FF04JQ U 28
AF RR2FF04TF C 662
BS 1 27 RR2FK60TF
BS 28 243 RR2FF04JQ
BS 244 244 RR2FK60JQ
BS 245 375 RR2FF04JQ
BS 376 376 RR2FK60JQ
BS 377 824 RR2FF04JQ
BS 825 1376 RR2FF04TF

RD RR2FK60TF 459 0 0
ATCAAAACGGAAACTGAAACATTGTTTGTCAAAGAACACACAAAAAAGAGAGTCACAGCG
GTTGATAATAATAAAGTTGTAATTCGAATAAAAAAAAGTAGTTAACTACTTGATGGTAGC
TTTGGGGATGCTGGAAGTGCAAGGTCCAGCTGACGTCATGAATGGTATGCCTTTGTATGT
AGCTACCCCACTTTCATCAGTGTAGAGATGCGGTGTTATCTTCTCAAGTTGCTTCTTTTT
TGGGTTCAGCACATCTTCTGGCTTCCCTTCCACCCCTGAGAATGAAACACGCTCTCCTGG
TTTAGCTCCAGCAGGTGGTAACAATGGTTCCACAACAGAATGATCTTCATTTGAAGCACA
TAGAACCAGTCCTTCAGACATAACATCTCGTAGCTTTCCAGGTTTCACATTCGTGATGAG
TGCAACAAGGCGGTTCGTTAGATCATCAGGACTGCAGA
C

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2FK60JQ 415 0 0
AAAGAGAGTCACAGCGGTTGATAATAATAAAGTTGTAATTCGAATAAAAAAAAGTAGTTA
ACTACTTGATGGTAGCTTTGGGGATGCTGGAAGTGCAAGGTCCAGCTGACGTCATGAATG
GTATGCCTTTGTATGTAGCTACCCCACTTTCATCAGTGTAGAGATGCGGTGTTATCTTCT
CAAGTTGCTTCTTTTTTGGGTTCAGCACATCTTCTGGCTTCCCTTCCACCCCTGAGAATG
AAACACGCTCTCCTGGTTTAGCTCCAGCAGGTGGTAACAATGGTTCCACAACAGAATGAT
CTTCATTTGAAGCACATAAAACCAGTCCTTCAGACATAACATCTCGTAACTTTCCAGGTT
TCACATTCGTGATGAGTGCAACAAGGCGGTTCGTTAGATCATCAGGACTGCAGA
C

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR2FF04JQ 797 0 0
GTCAAAGAACACACAAAAAAGAGAGTCACAGCGGTTGATAATAATAAAGTTGTAATTCGA
ATAAAAAAAAGTAGTTAACTACTTGATGGTAGCTTTGGGGATGCTGGAAGTGCAAGGTCC
AGCTGACGTCATGAATGGTATGCCTTTGTATGTAGCTACCCCACTTTCATCAGTGTAGAG
ATGCGGTGTTATCTTCTCAAGTTGCTTCTTTTTTGGCTTCAGCACATCTTCTGGCTTCCC
TTCCACCCCTGAGAATGAAACACGCTCTCCTGGTTTAGCTCCAGCAGGTGGTAACAATGG
TTCCACAACAGAATGATCTTCATTTGAAGCACATAGAACCAGTCCTTCTGACATAACATC
TCGTAGCTTTCCAGGTTTCACATTCGTGATGAGTGCAACAAGGCGGTTCGTTAGATCATC
AGGACTGCAGAATTTTGCTAGGCCACTAACGACTTGCCGCACTTTACCCTCTCCGACATC
TATTTCTTCCACAAGCAAACTGTCTGCAGATGGATGTTTCCACGCTTTTCGAATTAGACC
GACCTGAATATTTAGCAAACTGACACTAAGCTCCACCTCCTTGTTAGCTGCTGGTTCTGT
TTCAGCAGGTTTCTTCTTCTCTTTTGTAGCCTTCTTCTTTGGCTCCTCAACGTCAGTTTT
CTTGGTGCTTGGCTGCACTTCTGACTTCTTCTCAGCAGGCTCTGCACTTTCTGCTGCTTT
CTTTGCATTAGCATTTGCATCCACCTTGACGACAGCTTTTGATACCTCGAAGTCAAACTG
GGGTAACTTCACAGAGA

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2FF04TF 715 0 0
TTCTTTGGCTCCTCAACGTCAGTTTTCTTGGTGCTTGGCTGCACTTCTGACTTCTTCTCA
GCAGGCTCTGCACTTTCTGCTGCTTTCTTTGCATTAGCATTTGCATCCACCTTGACGACA
GCTTTTGATACCTCGAAGTCAAACTGGGGTAACTTCACAGAGATTGGTCCAAACAATGTT
GACAACCCTTCTCTAATCTGGATGTAGTTCATCCATCTTACAACATGTGGTATTTTCTCC
TTGTCTGAATCCGAGAGGCCAAGCGCTGAAGAATGCAGAGCTGCAAACACAACAACATCA
GCTGCCGATGGCGTCAATCCATTCCCCAAGATTACAGACTTGACAGCTAACTCTGCATTC
AACTTCTCAAGAGCTGCAAAGCAATCTTTTGAACTCGCTGGGAGACCTTCCGCATATTCC
AGCCAATTTAAAACCTCCCCGTTGTTTTGTGCAGACGCTTCCTTTCCAGATGCCTTCAAA
ACATTAGCATAGAGCGTCTTGACATCACTCTCACCAGCCCCTCCAACAAAAGATGCAGAG
TCCAAGGAGAAATGTTTACAGAGCCCTGATACGATCATCTGCTTCGTCTTTGAATCCATC
TTCAACTTCCTCTCTTTCTCTATCTTTTGCCTTCTTCTTCTTTTGAGGCTCTTCGCTGAA
ACAGAACACTGCTGCTGCACTTGTCTTCGATAGGGTTCTGCTTTTGTAATAACCC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 4

CO CL2364Contig1 813 4 7 U
GCAATTATTTTGGAATGTACCAGTTGTGTTCGAAATGATATTAAGAAAGAATCGGCTGGA
ATTTCCAGATATATTACTCAAAAGAATCGGCATAACACTCCTAGTCGATTGGAATTGAGA
AAATTCTGTCCCTATTGTTATAAACATACAATTCATGGGGAAATCAAGAAATAGATAAAA
TTGAGTCCTTGTACGTCAAATTTTATTTTAAGAACAGGAATAATGAGAGTATCTACGTAT
TATTACATATATATAAATATAAACAAATAAAATAATAGAAAGAAATAAAATCCTATATTC
TTAATTCTATATAGAAACTCTATCCTATATAGAAATAGAATTTTTTTATTTTGATCCGAT
CAAAATAGGATTTTAGAGGTAAGGAATAAAAAATTATGAATAAATCTAAGCGACCTTTTA
CTAAATCCAAGCGATCTTTTCGTCGGCGTTTGCCCCCGATCCAATCGGGGGATCGAATTG
ATTATAGAAACATGAGTTTAATTAGTCGATTTATTAGTGAACAAGGAAAAATATTATCTA
GACGGGTGAATAGAGTAACTTTAAAACAACAACGATTAATTACTATTGCTATAAAACAAG
CTCGTATTTTATCTTTGTTACCTTTTCTTAATAATCAGAAACAATTTGAGAGAAGTGAGT
CGACCCCTAGAACTACTAGCCTTAGAACCAGAAAAAAATAGACTTATTCTTCAATTGAAT
AACTAATCTGAAGGAATTAAAAAAGAGGTTAATATTTTGTTCGACAAATCCAATCAAGAA
TTAAAATTTGATTGTTACGTCTGTGTCTGTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2ER34TF U 1
AF RR2ER34JQ C 113
AF RR2GR39JQ C 356
AF RR2GR39TF U 356
BS 1 374 RR2ER34TF
BS 375 375 RR2GR39TF
BS 376 697 RR2ER34TF
BS 698 698 RR2GR39TF
BS 699 733 RR2ER34TF
BS 734 812 RR2GR39TF
BS 813 813 RR2ER34JQ

RD RR2ER34TF 741 0 0
GCAATTATTTTGGAATGTACCAGTTGTGTTCGAAATGATATTAAGAAAGAATCGGCTGGA
ATTTCCAGATATATTACTCAAAAGAATCGGCATAACACTCCTAGTCGATTGGAATTGAGA
AAATTCTGTCCCTATTGTTATAAACATACAATTCATGGGGAAATCAAGAAATAGATAAAA
TTGAGTCCTTGTACGTCAAATTTTATTTTAAGAACAGGAATAATGAGAGTATCTACGTAT
TATTACATATATATAAATATAAACAAATAAAATAATAGAAAGAAATAAAATCCTATATTC
TTAATTCTATATAGAAACTCTATCCTATATAGAAATAGAATTTTTTTATTTTGATCCGAT
CAAAATAGGATTTTCGAGGTAAGGAATAAAAAATTATGAATAAATCTAAGCGACCTTTTA
CTAAATCCAAGCGATCTTTTCGTCGGCGTTTGCCCCCGATCCAATCGGGGGATCGAATTG
ATTATAGAAACATGAGTTTAATTAGTCGATTTATTAGTGAACAAGGAAAAATATTATCTA
GACGGGTGAATAGAGTAACTTTAAAACAACAACGATTAATTACTATTGCTATAAAACAAG
CTCGTATTTTATCTTTGTTACCTTTTCTTAATAATCAGAAACAATTTGAGAGAAGTGAGT
CGACCCCTAGAACTACTAGCCTTAGAACCAGAAAAAA*TAGACTTATTCTTCAATTGAAT
AACTAATCTGAAG
AATAAAAA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2ER34JQ 701 0 0
AATTGAGAAAATTCTGTCCCTATTGTTATAAACATACAATTCATGGGGAAATCAAGAAAT
AGATAAAATTGAGTCCTTGTACGTCAAATTTTATTTTAAGAACAGGAATAATGAGAGTAT
CTACGTATTATTACATATATATAAATATAAACAAATAAAATAATAGAAAGAAATAAAATC
CTATATTCTTAATTCTATATAGAAACTCTATCCTATATAGAAATAGAATTTTTTTATTTT
GATCCGATCAAAATAGGATTTTCGAGGTAAGGAATAAAAAATTATGAATAAATCTAAGCG
ACCTTTTACTAAATCCAAGCGATCTTTTCGTCGGCGTTTGCCCCCGATCCAATCGGGGGA
TCGAATTGATTATAGAAACATGAGTTTAATTAGTCGATTTATTAGTGAACAAGGAAAAAT
ATTATCTAGACGGGTGAATAGAGTAACTTTAAAACAACAACGATTAATTACTATTGCTAT
AAAACAAGCTCGTATTTTATCTTTGTTACCTTTTCTTAATAATCAGAAACAATTTGAGAG
AAGTGAGTCGACCCCTAGAACTACTAGCCTTAGAACCAGAAAAAAATAGACTTATTCTTC
AATTGAATAACTAATCTGAAGGAATTAAAAAAGAGGTTAATATTTTGTTCGACAAATCCA
ATCAAGAATTAAAATTTGATTGTTACGTCTGTGTCTGTCAC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2GR39JQ 458 0 0
CCGATCAAAATAGGATTTTAGAGGTAAGGAATAAAAAATTATGAATAAATTTAAGCGACC
TTTTACTAAATCCAAGCGATCTTTTCGTCGGCGTTTGCCCCCGATCCAATCGGGGGATCG
AATTGATTATAGAAACATGAGTTTAATTAGTCGATTTATTAGTGAACAAGGAAAAATATT
ATCTAGACGGGTGAATAGAGTAGCTTTAAAACAACAACGATTAATTACTATTGCTATAAA
ACAAGCTCGTATTTTATCTTTGTTACCTTTTCTTAATAATCAGAAACAATTTGAGAGAAG
TGAGTCGACCCCTAGAACTACTAGCCTTAGAACCAGAAAAAAATAGACTTATTCTTCAAT
TGAATAACTAATCTGAAGGAATTAAAAAAGAGGTTAATATTTTGTTCGACAAATCCAATC
AAGAATTAAAATTTGATTGTTACGTCTGTGTCTGTCA
T

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR2GR39TF 458 0 0
CCGATCAAAATAGGATTTTAGAGGTAAGGAATAAAAAATTATGAATAAATCTAAGCGACC
TTTTACTAAATCCAAGCGATCTTTTCGTCGGCGTTTGCCCCCGATCCAATCGGGGGATCG
AATTGATTATAGAAACATGAGTTTAATTAGTCGATTTATTAGTGAACAAGGAAAAATATT
ATCTAGACGGGTGAATAGAGTAGCTTTAAAACAACAACGATTAATTACTATTGCTATAAA
ACAAGCTCGTATTTTATCTTTGTTACCTTTTCTTAATAATCAGAAACAATTTGAGAGAAG
TGAGTCGACCCCTAGAACTACTAGCCTTAGAACCAGAAAAAAATAGACTTATTCTTCAAT
TGAATAACTAATCTGAAGGAATTAAAAAAGAGGTTAATATTTTGTTCGACAAATCCAATC
AAGAATTAAAATTTGATTGTTACGTCTGTGTCTGTCA
T

QA 1 457 1 457
DS 



AS 2 4

CO CL2365Contig1 882 2 2 U
GGATGCGGCTTATAGCTTGAGATAAGCTCTGTTTTTTTTTTCACCATATCTCAGATTTTC
TTTTGTTTTTTTCAATATGGGAGCTAGATTTTCACGTATAGCGAAAAGGGTTCTTCCTAA
GTCTAAAGTAAGGATTTTGATGGTGGGTCTTGATGGTTCAGGGAGGACTACAATCCTTTA
CAAGCTAAAGCTCGGTGAAGTTGTCACAACAGTGCCTACTATTGGGTTCAACCTCGAGAC
GGTAGAATACAAAGGCATCAATTTCACTGTATGGGATATAGGGGGACAAGAGAAGATTCG
CAAACTGTGGAGACACTATTTTCAGAACTCGCAAGGGCTCATCTTTGTGGTGGACAGCAG
TGACACTGCAAGGTTATCAGAAGCTCGTAATGAGTTGCATCGAATACTAACCAATAATGA
ACTACAAGATGCATGCGTACTCGTCTTTGCGAACAAGCAAGATTCAAGAAATGCTCTACC
GGTAGACCAAGTTGCCAACAACCTTGGTCTGCACGGCCTAACCAAACGCTGTTGGTTTAT
ACAGGGAACATCAGCCATCACTGGGCAAGGCTTATACGAGGGCCCTGAATGGCTCTCAAA
AACTGTCCCTAACAAACCTGGACGATCTGGTTCGCTTGGTAGTTTCCGGAGTGATTCCTC
CGAGAGAAGGCCTGTACGAGGTGTGAAGTATTGATAGACTATGTTGTCTTCTATGTTCTA
TGTATTTGTATGGCTATGGCTTTTTTTTCATGTGTCTCAAAGAGAGTGAATAAGATTTAG
GGTAGAACTCATTACTTACATCCTTAATGAATTTTTTCCTCAGTTATTTGGACATTTGTA
TGCTGTTTTACCCCAGGAGTGAAACTAAGTATTGTTCTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D057TF U 1
AF RR2D057JQ C 199
BS 1 565 RR2D057TF
BS 566 882 RR2D057JQ

RD RR2D057TF 565 0 0
GGATGCGGCTTATAGCTTGAGATAAGCTCTGTTTTTTTTTTCACCATATCTCAGATTTTC
TTTTGTTTTTTTCAATATGGGAGCTAGATTTTCACGTATAGCGAAAAGGGTTCTTCCTAA
GTCTAAAGTAAGGATTTTGATGGTGGGTCTTGATGGTTCAGGGAGGACTACAATCCTTTA
CAAGCTAAAGCTCGGTGAAGTTGTCACAACAGTGCCTACTATTGGGTTCAACCTCGAGAC
GGTAGAATACAAAGGCATCAATTTCACTGTATGGGATATAGGGGGACAAGAGAAGATTCG
CAAACTGTGGAGACACTATTTTCAGAACTCGCAAGGGCTCATCTTTGTGGTGGACAGCAG
TGACACTGCAAGGTTATCAGAAGCTCGTAATGAGTTGCATCGAATACTAACCAATAATGA
ACTACAAGATGCATGCGTACTCGTCTTTGCGAACAAGCAAGATTCAAGAAATGCTCTACC
GGTAGACCAAGTTGCCAACAACCTTGGTCTGCACGGCCTAACCAAACGCTGTTGGTTTAT
ACAGGGAACATCAGCCATCACTGGG

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2D057JQ 684 0 0
AGTTGTCACAACAGTGCCTACTATTGGGTTCAACCTCGAGACGGTAGAATACAAAGGCAT
CAATTTCACTGTATGGGATATAGGGGGACAAGAGAAGATTCGCAAACTGTGGAGACACTA
TTTTCAGAACTCGCAAGGGCTCATCTTTGTGGTGGACAGCAGTGACACTGCAAGGTTATC
AGAAGCTCGTAATGAGTTGCATCGAATACTAACCAATAATGAACTACAAGATGCATGCGT
ATTCGTCTTTGCGAACAAGCAAGATTCAAGAAATGCTCTACCGGTAGACCAAGTTGCCAA
CAACCTTGGTCTGCACGGCCTAACCAAACGCTGTTGGTTTATACAGGGAACATCAGCCAT
CACTGGGCAAGGCTTATACGAGGGCCCTGAATGGCTCTCAAAAACTGTCCCTAACAAACC
TGGACGATCTGGTTCGCTTGGTAGTTTCCGGAGTGATTCCTCCGAGAGAAGGCCTGTACG
AGGTGTGAAGTATTGATAGACTATGTTGTCTTCTATGTTCTATGTATTTGTATGGCTATG
GCTTTTTTTTCATGTGTCTCAAAGAGAGTGAATAAGATTTAGGGTAGAACTCATTACTTA
CATCCTTAATGAATTTTTTCCTCAGTTATTTGGACATTTGTATGCTGTTTTACCCCAGGA
GTGAAACTAAGTATTGTTCTTAGC

QA 1 684 1 684
DS 



CO CL2365Contig2 381 2 3 U
GGGGGCAAGGCTTATACGAGGGACTTGAATGGCTCTCAAAAACCGTCCCTAACAAACCTG
GACGATCTGGTTCGCTTGGTAGTTTCCGGAGTGATTCCTCCGAGAGAAGGCTCGTACGAG
GTGTGAAGTATTGATAGACTATGGCGTCTTCTATGTTCTATGTATCTGTATGGCTATGGC
CTTTTTTTTCCATGTGTCTCAATGAGAGTGAATAAGATTTAGGGTAGAACTCATTACTTA
CATCCTTAATGAATTTTTTTCCTCAGTTATTTGGACATTTGTATGCTGTTTTGCCCCAGG
AGTGAAACTAAGTATTGTTCTTAGTATATTTATACATTCAGTTGTAAACTGTAAAGTGTA
AGATCTTCAACTGCATAAAAA


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK15JQ C 1
AF RR2GK15TF U 1
BS 1 2 RR2GK15JQ
BS 3 374 RR2GK15TF
BS 375 381 RR2GK15JQ

RD RR2GK15JQ 381 0 0
GGGGGCAAGGCTTATACGAGGGACTTGAATGGCTCTCAAAAACCGTCCCTAACAAACCTG
GACGATCTGGTTCGCTTGGTAGTTTCCGGAGTGATTCCTCCGAGAGAAGGCTCGTACGAG
GTGTGAAGTATTGATAGACTATGGCGTCTTCTATGTTCTATGTATCTGTATGGCTATGGC
CTTTTTTTTCCATGTGTCTCAATGAGAGTGAATAAGATTTAGGGTAGAACTCATTACTTA
CATCCTTAATGAATTTTTTTCCTCAGTTATTTGGACATTTGTATGCTGTTTTGCCCCAGG
AGTGAAACTAAGTATTGTTCTTAGTATATTTATACATTCAGTTGTAAACTGTAAAGTGTA
AGATCTTCAACTGCATAAAAA

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR2GK15TF 374 0 0
GG
GGGCAAGGCTTATACGAGGGACTTGAATGGCTCTCAAAAACCGTCCCTAACAAACCTGGA
CGATCTGGTTCGCTTGGTAGTTTCCGGAGTGATTCCTCCGAGAGAAGGCTCGTACGAGGT
GTGAAGTATTGATAGACTATGGCGTCTTCTATGTTCTATGTATCTGTATGGCTATGGCCT
TTTTTTTCCATGTGTCTCAATGAGAGTGAATAAGATTTAGGGTAGAACTCATTACTTACA
TCCTTAATGAATTTTTTTCCTCAGTTATTTGGACATTTGTATGCTGTTTTGCCCCAGGAG
TGAAACTAAGTATTGTTCTTAGTATATTTATACATTCAGTTGTAAACTGTAAAGTGTAAG
ATCTTCAACTGC

QA 3 374 3 374
DS 



AS 1 4

CO CL2366Contig1 494 4 5 U
GGCCAGTTGCATTTGCTACCTCTAGGGTTTTCCACATATTCGGCGTCTTCTCTCCGGATT
CGAAATGGCGAAGAGAACCAAGAAGGTCGGAATCGTCGGCAAGTACGGTACTCGTTATGG
AGCGAGTATCAGGAAGCAGATTAAGAAGATGGAGGTCAGCCAGCACAGCAAGTACTTCTG
CGAGTTCTGCGGCAAGTACGGAGTGAAGCGAAAGGCTGTTGGTATTTGGGGATGCAAGGA
CTGCGGCAAGGTCAAGGCTGGTGGTGCTTACACCATGAACACCGCTAGTGCCGTCACCGT
TAGAAGCACAATCAGGAGGTTGAGGGAGCAGATCGAGGGTTAATTTGTCTCAGTCATAAT
TTTGCTTATTTGCTGTGACAATTATGGTTTTCAAGTACTACTATGCTTTTGTGTTTTTGA
TTCAAGACAGTTGTTGTTTACATTTAGCCGTGGATCAGTTATTCTGTGACAACTATGTTT
TTGCTCTGCTATTT


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AN24JQ C 1
AF RR2AN24TF U 1
AF RR2A904JQ C 2
AF RR2A904TF U 2
BS 1 3 RR2AN24JQ
BS 4 201 RR2AN24TF
BS 202 202 RR2A904TF
BS 203 474 RR2AN24TF
BS 475 494 RR2A904TF

RD RR2AN24JQ 474 0 0
GGCCAGTTGCATTTGCTACCTCTAGGGTTTTCCACATATTCGGCGTCTTCTCTCCGGATT
CGAAATGGCGAAGAGAACCAAGAAGGTCGGAATCGTCGGCAAGTACGGTACTCGTTATGG
AGCGAGTATCAGGAAGCAGATTAAGAAGATGGAGGTCAGCCAGCACAGCAAGTACTTTTG
CGAGTTTTGCGGCAAGTACGGTGTGAAGCGAAAGGCTGTTGGTATTTGGGGATGCAAGGA
CTGCGGCAAGGTCAAGGCTGGTGGTGCTTACACCATGAACACCGCTAGTGCCGTCACCGT
TAGAAGCACAATCAGGAGGTTGAGGGAGCAGATCGAGGGTTAATTTGTCTCAGTCATAAT
TTTGCTTATTTGCTGTGACAATTATGGTTTTCAAGTACTACTATGCTTTTGTGTTTTTGA
TTCAAGACAGTTGTTGTTTACATTTAGCCGTGGATCAGTTATTCTGTGACAACT

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2AN24TF 474 0 0
GGC
CAGTTGCATTTGCTACCTCTAGGGTTTTCCACATATTCGGCGTCTTCTCTCCGGATTCGA
AATGGCGAAGAGAACCAAGAAGGTCGGAATCGTCGGCAAGTACGGTACTCGTTATGGAGC
GAGTATCAGGAAGCAGATTAAGAAGATGGAGGTCAGCCAGCACAGCAAGTACTTCTGCGA
GTTCTGCGGCAAGTACGGTGTGAAGCGAAAGGCTGTTGGTATTTGGGGATGCAAGGACTG
CGGCAAGGTCAAGGCTGGTGGTGCTTACACCATGAACACCGCTAGTGCCGTCACCGTTAG
AAGCACAATCAGGAGGTTGAGGGAGCAGATCGAGGGTTAATTTGTCTCAGTCATAATTTT
GCTTATTTGCTGTGACAATTATGGTTTTCAAGTACTACTATGCTTTTGTGTTTTTGATTC
AAGACAGTTGTTGTTTACATTTAGCCGTGGATCAGTTATTCTGTGACAACT

QA 4 474 4 474
DS 

RD RR2A904JQ 493 0 0
GG
CAGTTGCATTTGCTACCTCTAGGGTTTTCCACATATTCGGCGTCTTCTCTCCGGATTCGA
AATGGCGAAGAGAACCAATAAGGTCGGAATCGTCGGCAAGTACGGTACTCGTTATGGAGC
GAGTATCAGGAAGCAGATTAAGAAGATGGAGGTCAGCCAGCACAGCAAGTACTTTTGCGA
GTTTTGCGGCAAGTACGGAGTGAAGCGAAAGGCTGTTGGTATTTGGGGATGCAAGGACTG
CGGCAAGGTCAAGGCTGGTGGTGCTTACACCATGAACACCGCTAGTGCCGTCACCGTTAG
AAGCACAATCAGGAGGTTGAGGGAGCAGATCGAGGGTTAATTTGTTTCAGTCATAATTTT
GCTTATTTGCTGTGACAATTATGGTTTTCAAGTACTACTATGCTTTTGTGTTTTTGATTC
AAGACAGTTGTTGTTTACATTTAGCCGTGGATCAGTTATTCTGTGACAACTATGTTTTTG
TTCTGCTATTT

QA 3 493 3 493
DS 

RD RR2A904TF 493 0 0
GG
CAGTTGCATTTGCTACCTCTAGGGTTTTCCACATATTCGGCGTCTTCTCTCCGGATTCGA
AATGGCGAAGAGAACCAATAAGGTCGGAATCGTCGGCAAGTACGGTACTCGTTATGGAGC
GAGTATCAGGAAGCAGATTAAGAAGATGGAGGTCAGCCAGCACAGCAAGTACTTCTGCGA
GTTCTGCGGCAAGTACGGAGTGAAGCGAAAGGCTGTTGGTATTTGGGGATGCAAGGACTG
CGGCAAGGTCAAGGCTGGTGGTGCTTACACCATGAACACCGCTAGTGCCGTCACCGTTAG
AAGCACAATCAGGAGGTTGAGGGAGCAGATCGAGGGTTAATTTGTCTCAGTCATAATTTT
GCTTATTTGCTGTGACAATTATGGTTTTCAAGTACTACTATGCTTTTGTGTTTTTGATTC
AAGACAGTTGTTGTTTACATTTAGCCGTGGATCAGTTATTCTGTGACAACTATGTTTTTG
CTCTGCTATTT

QA 3 493 3 493
DS 



AS 1 3

CO CL2367Contig1 1606 3 11 U
GGAGAATAGCCATGATCACTAGAGAAAGTGCTTTTCTTTAAATTCCACCTTCTCTCGGTG
CTTTGTGGCGGTGGAGATGGCAGAGGAGGAGGAGCATCAGAGTTGTGTCCATGACGTGAA
GTCCGACCCGGCTGGTGTTTCTGGGACAAGGAAAGTGGGTTCCAGAGCTGAGATCGATAC
TTCTCCTCCATTCGGGTCGGTTCAGGAGGCGGTGACTTGGTTCGGTGGTCGTGGCTCTTG
GGTTCCTTCCAAGCTTCAAGACAATTACAATGGTGTGGGAGAATTTAACATAAAGAGAAT
GGAAGAGCATGCAGCAGAGCTAGAGAAGGATCTGATAGTGAAAGAGCTAGAAACTCTTGA
TGTTCTTGAAGCACTTGGGTCAACTAAGAGGATCGTTGAAGATTTGAAGCGACAGCTTCA
TCAAGAATCCTTGAGATCAGCTGAGAATCTCATCAGCTCAGAAATCAAAGAGATGAACAA
AGAGCATCGCAATCACAATCACAATCACAATCCCATGTCATCTCCCGATATGATCTTAAT
GGAACTGAAGCAAGCCAAGATAAACCTCGGTAAAACAATGGATGATCTTGTGATGATCCA
GTCCTCTGTTGAGTCTCTGAACAAGAAAATGAAAGAAGAGAAAGAGTTTCTTGACAAGAC
AAGAGAGAAGCTCACGAATGGGTTTGGAGGAGCGGTGTCTCTAGCTGAGGAGCTGATCAG
TAGAGTTAGGGTGAAACCAGATGAAACGCTAAGGGAACAGGTGAAGATGGTTGCTGAAAC
GTGTCTAAACAAGCAGAACAAGAACTGTCTGAGAATTACTGCGGAGATGAGATTGGTTGC
TGCTAGAAAAATGGAAGAAGCTGCAAGAGCTGCGGAAGCACTAGCCATTGCTGAGATAAC
AATGTTATCATCATCATCATCATCAAACGGTGAAAGCGAGGAAGATGATACTGATAGCTC
AAGAAGTGGGGTTTTGAAGAAGCTTGAGGAAGCTACACAAGGAGTTAAACAAAGCAAACA
AGATTTAGAAACTGCGTTAAACCGTTTAGAGATAGCTAACGTGAAGCAACTCGCAGCTGA
AAGCGCTTTCCGCGGGTGGACAAAACACTCACCTATGAGTCAAACCCGACGCTCTTTCTT
CAGACATCTGAACAAGCAGCATGAGCCAGTTAACAATCTCTCCAAGCCAGTTCTAAAGTC
TAATGTCTCAATGCGTGATGTTCTAAGACGTAAGCAAGTTCCAAAGGAAGGTGTTGTTTC
CGAGAGGCAGAGCATTGAAGGAAAGAGGTGGAATGTGAATTTGAGCCAAATGCTGAAGCA
TGAGAATAAGTCATTTTCGGCAAGAGGTGAGAAGGAGGAGGTGCATGAAGAGAAACGGTT
TGTCACGCAGAGGAGAAAGTTTGGGTTCATACACATTACGCTTCCCATGCAGAAACAGAG
TAAAAAAAAATCTAGCGTTTAATAAAACAACACCTTACAACTAAGTCAGTCACTACTAGT
TTGGTCCTTTATGTGTTTGTTTGTAATTGGATTTTCATTTGGTATGTTGTGTTGTGATTG
CTTTTCTTGTCTTTGTACTCATGAGAATAAATATACATCTAGTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC83TF U 1
AF RR2EB70TF U 466
AF RR2EB70JQ C 763
BS 1 525 RR2GC83TF
BS 526 526 RR2EB70TF
BS 527 576 RR2GC83TF
BS 577 577 RR2EB70TF
BS 578 676 RR2GC83TF
BS 677 677 RR2EB70TF
BS 678 716 RR2GC83TF
BS 717 1202 RR2EB70TF
BS 1203 1203 RR2EB70JQ
BS 1204 1239 RR2EB70TF
BS 1240 1606 RR2EB70JQ

RD RR2GC83TF 722 0 0
GGAGAATAGCCATGATCACTAGAGAAAGTGCTTTTCTTTAAATTCCACCTTCTCTCGGTG
CTTTGTGGCGGTGGAGATGGCAGAGGAGGAGGAGCATCAGAGTTGTGTCCATGACGTGAA
GTCCGACCCGGCTGGTGTTTCTGGGACAAGGAAAGTGGGTTCCAGAGCTGAGATCGATAC
TTCTCCTCCATTCGGGTCGGTTCAGGAGGCGGTGACTTGGTTCGGTGGTCGTGGCTCTTG
GGTTCCTTCCAAGCTTCAAGACAATTACAATGGTGTGGGAGAATTTAACATAAAGAGAAT
GGAAGAGCATGCAGCAGAGCTAGAGAAGGATCTGATAGTGAAAGAGCTAGAAACTCTTGA
TGTTCTTGAAGCACTTGGGTCAACTAAGAGGATCGTTGAAGATTTGAAGCGACAGCTTCA
TCAAGAATCCTTGAGATCAGCTGAGAATCTCATCAGCTCAGAAATCAAAGAGATGAACAA
AGAGCATCGCAATCACAATCACAATCACAATCCCATGTCATCTCCGGATATGATCTTAAT
GGAACTGAAGCAAGCCAAGATAAACCTCGGTAAAACCATGGATGATCTTGTGATGATCCA
GTCCTCTGTTGAGTCTCTGAACAAGAAAATGAAAGAAGAGAAAGAGTTTCTTGACAAGAC
AAGAGAGAAGCTCACGTATGGGTTTGGAGGAGCGGTGTCTCTAGCTGAGGAGCTGA
GCAGAG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2EB70TF 776 0 0
G
AAAGAGATGAACAAAGCGCATCGCAATCGCAATCACAATCACAATCCCATGTCATCTCCC
GATATGATCTTAATGGAACTGAAGCAAGCCAAGATAAACCTCGGTAAAACAATGGATGAT
CTTGTGATGATCCAGTCCTCTGTTGAGTCTCTGAACAAGAAAATGAAGGAAGAGAAAGAG
TTTCTTGACAAGACAAGAGAGAAGCTCACGAATGGGTTTGGAGGAGCGGTGTCTCTAGGT
GAGGAGCTGATCAGTAGAGTTAGGGTGAAACCAGATGAAACGCTAAGGGAACAGGTGAAG
ATGGTTGCTGAAACGTGTCTAAACAAGCAGAACAAGAACTGTCTGAGAATTACTGCGGAG
ATGAGATTGGTTGCTGCTAGAAAAATGGAAGAAGCTGCAAGAGCTGCGGAAGCACTAGCC
ATTGCTGAGATAACAATGTTATCATCATCATCATCATCAAACGGTGAAAGCGAGGAAGAT
GATACTGATAGCTCAAGAAGTGGGGTTTTGAAGAAGCTTGAGGAAGCTACACAAGGAGTT
AAACAAAGCAAACAAGATTTAGAAACTGCGTTAAACCGTTTAGAGATAGCTAACGTGAAG
CAACTCGCAGCTGAAAGCGCTTTCCGCGGGTGGACAAAACACTCACCTATGAGTCAAACC
CGACGCTCTTTCTTCAGACATCTGAACAAGCAGCATGAGCCAGTTAACAATCTCTCCAAG
CCAGTTCTAAAGTCTA*TGTCTCAATGCGTGATGTTCTAAGACGTAAGCAAGT
CC

QA 2 774 2 774
DS 

RD RR2EB70JQ 844 0 0
TGAAGAT
GTTGCTGAAACGTGTCTAAACAAGCAGAACAAGAACTGTCTGAGAATTACTGCGGAGATG
AGATTGGTTGCTGCTAGAAAAATGGAAGAAGCTGCAAGAGCTGCGGAAGCACTAGCCATT
GCTGAGATAACAATGTTATCATCATCATCATCATCAAACGGTGAAAGCGAGGAAGATGAT
ACTGATAGCTCAAGAAGTGGGGTTTTGAAGAAGCTTGAGGAAGCTACACAAGGAGTTAAA
CAAAGCAAACAAGATTTAGAAACTGCGTTAAACCGTTTAGAGATAGCTAACGTGAAGCAA
CTCGCAGCTGAAAGCGCTTTCCGCGGGTGGACAAAACACTCACCTATGAGTCAAACCCGA
CGCTCTTTCTTCAGACATCTGAACAAGCAGCATGAGCCAGTTAACAATCTCTCCAAGCCA
GTTCTAAAGTCTAATGTCTCAATGCGTGATGTTTTAAGACGTAAGCAAGTTCCAAAGGAA
GGTGTTGTTTCCGAGAGGCAGAGCATTGAAGGAAAGAGGTGGAATGTGAATTTGAGCCAA
ATGCTGAAGCATGAGAATAAGTCATTTTCGGCAAGAGGTGAGAAGGAGGAGGTGCATGAA
GAGAAACGGTTTGTCACGCAGAGGAGAAAGTTTGGGTTCATACACATTACGCTTCCCATG
CAGAAACAGAGTAAAAAAAAATCTAGCGTTTAATAAAACAACACCTTACAACTAAGTCAG
TCACTACTAGTTTGGTCCTTTATGTGTTTGTTTGTAATTGGATTTTCATTTGGTATGTTG
TGTTGTGATTGCTTTTCTTGTCTTTGTACTCATGAGAATAAATATACATCTAGTCAC

QA 8 844 8 844
DS 



AS 1 3

CO CL2368Contig1 439 3 9 U
GGGAGGAATTCTACATAAACTGCTCTTCACTCTTCAGGAGGAGTCTTCTGTTGTTCGTAA
AAGTCTTGAGAGAGGTTACAACAATGGCTGACAGAAAACAAGTTGAGGACGTGAAACCAA
CCGTGGATACTGCAACCCAGAGCCGCGTTCTAGGACAGCATGGTAATGAGCCAAGGGATG
CCATGGCCCAATTCCGAGCCACCAAAGATCCTGATGTTAAGAAACTGGACAATGACCAGT
TGGCCTTGTTGTTGCAGCGGACAAGTGAGGCTAGAGCAGCCATCACGGCAGAGCTGAACC
GGCGGCTTAACAACTGAGCACGATCGACGTGTCAATGGATCCACCTTTATTATCTAGCAT
AAGTTGTTGTTGTTTTTCTAAGCAAGTGTAACGTGTTGTTCAACTAACTACTCTGGTTTT
AATTTAATGAAGTTGTGTT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 

AF RR2CY62TF U 1
AF RR2CN81JQ C 2
AF RR2CN81TF U 2
BS 1 71 RR2CY62TF
BS 72 72 RR2CN81TF
BS 73 136 RR2CY62TF
BS 137 137 RR2CN81TF
BS 138 206 RR2CY62TF
BS 207 207 RR2CN81TF
BS 208 433 RR2CY62TF
BS 434 434 RR2CN81TF
BS 435 439 RR2CY62TF

RD RR2CY62TF 439 0 0
GGGAGGAATTCTACATAAACTGCTCTTCACTCTTCAGGAGGAGTCTTCTGTTGTTCGTAA
AAGTCTTGAGAAAGGTTACAACAATGGCTGACAGAAAACAAGTTGAGGACGTGAAACCAA
CCGTGGATACTGCAACTCAGAGCCGCGTTCTAGGACAGCATGGTAATGAGCCAAGGGATG
CCATGGCCCAATTCCGAGCCACCAAAAATCCTGATGTTAAGAAACTGGACAATGACCAGT
TGGCCTTGTTGTTGCAGCGGACAAGTGAGGCTAGAGCAGCCATCACGGCAGAGCTGAACC
GGCGGCTTAACAACTGAGCACGATCGACGTGTCAATGGATCCACCTTTATTATCTAGCAT
AAGTTGTTGTTGTTTTTCTAAGCAAGTGTAACGTGTTGTTCAACTAACTACTCTGGTTTT
AATTTAATGAAGTCGTGTT

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2CN81JQ 438 0 0
GGAGGAATTCTACATAAACTGCTCTTCACTCTTCAGGAGGAGTCTTCTGTTGTTCGTAAA
AGTCTTGAGAGAGGTTACAACAATGGCTGACAGAAAACAAGTTGAGGACGTGAAACCAAC
CGTGGATACTGCAACCCAGAGCCGCGTTCTAGGACAGCATGGTAATGAGCCAAGGGATGC
CATGGCCCAATTCCGAGCCACCAAAGATCCTGATGTTAAGAAACTGGACAATGACCAGTT
GGCCTTGTTGTTGCAGCGGACAAGTGAGGCTAGAGCAGCCATCACGGCAGAGCTGAACCG
GCGGCTTAACAACTGAGCACGATCGACGTGTCAATGGATCCACCTTTATTATCTAGCATA
AGTTGTTGTTGTTTTTCTAAGCAAGTGTAACGTGTTGTTCAACTAACTACTCTGGTTTTA
ATTTAATGAAGTTGTGTT

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR2CN81TF 438 0 0
GGAGGAATTCTACATAAACTGCTCTTCACTCTTCAGGAGGAGTCTTCTGTTGTTCGTAAA
AGTCTTGAGAGAGGTTACAACAATGGCTGACAGAAAACAAGTTGAGGACGTGAAACCAAC
CGTGGATACTGCAACCCAGAGCCGCGTTCTAGGACAGCATGGTAATGAGCCAAGGGATGC
CATGGCCCAATTCCGAGCCACCAAAGATCCTGATGTTAAGAAACTGGACAATGACCAGTT
GGCCTTGTTGTTGCAGCGGACAAGTGAGGCTAGAGCAGCCATCACGGCAGAGCTGAACCG
GCGGCTTAACAACTGAGCACGATCGACGTGTCAATGGATCCACCTTTATTATCTAGCATA
AGTTGTTGTTGTTTTTCTAAGCAAGTGTAACGTGTTGTTCAACTAACTACTCTGGTTTTA
ATTTAATGAAGTTGTGTT

QA 1 438 1 438
DS 



AS 1 3

CO CL2369Contig1 1368 3 9 U
GGAGGAGCTTCCGCCTTACTCAGAGTGTGGAGCAGGAGGAGAAACAAGAACAGGGCAAAA
ATGGACTATATGAATGCACCCGGGAGACACCATCTTTTCGTGCCAGGACCAGTGAACATA
CCGGAGCAGGTGATCCGGGCGATGAACAGAAACAACGAGGATTACCGTTCACCAGCCATC
CCAGCACTTACAAAAACGTTGTTGGAGGACGTGAAGAAGATATTCAAGACAACATCTGGA
ACACCGTTTATGTTTCCAACCACTGGTACTGGTGCTTGGGAGAGTGCCTTGACCAACACG
CTATCTCCTGGAGACAGGATCGTCTCGTTTCTGATTGGGCAGTTTAGCTTGCTGTGGATT
GACCAGCAGAAGAGGCTAAACTTCAACGTTGATGTGGTAGAGAGTGATTGGGGACAAGGT
GCTAATCCCCAAGTCTTGGCCTCAAAGCTCTCACAGGACCAAACTCATTCCATCAAAGCC
ATTTGTATTGTCCACAACGAGACCGCGACTGGAGTCACTAATGACATCTCTGCCGTCCGA
ACCCTCCTCGATCACTACAAGCACCCGGCTTTGCTGCTTGTGGACGGTGTCTCGTCCATA
TGTGCGCTTGATTTCCGAATGGATGAGTGGGGAGTGGATGTGGCCTTGACCGGATCTCAG
AAAGCTTTATCTCTTCCAACTGGCCTTGGTATTGTGTGCGCCAGTCCAAAAGCTTTGGAA
GCTACCAAAACTTCAAAATCCCTCAAAGTCTTCTTTGATTGGAATGACTACCTCAAGTTT
TACAAGCTCGGAACATATTGGCCATACACACCTTCCATTCAACTCCTCTACGGTCTTAGA
GCTGCTCTTGATCTTATCTTTGAAGAAGGACTTGAAAATGTCATCGCCCGTCATGCCCGT
TTGGGAGAGGCCACAAGGCTCGCGGTGGAAGCGTGGGGGCTGAAAAACTGTACACAAAAG
GAGGAGTGGATAAGTAACACAGTGACAGCGGTCATGGTGCCGCCGAATATAGACAGTACT
GAGATTGTGAAAAGGGCGTGGAAGAGGTACAACCTTGGTCTTGGTCTTGGTCTCAACAAA
GTGGCTGGCAAGGTTTTCAGAATTGGGCTCCTTGGACATCTTAATGAGTTGCAACTTCTT
GGATGTTTGGCTGGAGTGGAGATGATACTCAAGGATGTTGGCTACCCAATTGTATTGGGA
AGTGGAGTTGCAGCTGCTTCCACTTATCTGCAGCACCAGATCCCTCTCATTCCTTCCAGG
ATCTAATTCATATCCCTATTTCTCCATCTTCCTCTCCACCCCCTTTCAATGTATAACAAA
ACTATTTGTTCTCTTTTCTCAGCTTTTTTATTTCACTAAAATAATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G689TF U 1
AF RR2BR12TF U 241
AF RR2D374JQ C 650
BS 1 290 RR2G689TF
BS 291 291 RR2BR12TF
BS 292 561 RR2G689TF
BS 562 728 RR2BR12TF
BS 729 729 RR2D374JQ
BS 730 868 RR2BR12TF
BS 869 869 RR2D374JQ
BS 870 906 RR2BR12TF
BS 907 1368 RR2D374JQ

RD RR2G689TF 563 0 0
GGAGGAGCTTCCGCCTTACTCAGAGTGTGGAGCAGGAGGAGAAACAAGAACAGGGCAAAA
ATGGACTATATGAATGCACCCGGGAGACACCATCTTTTCGTGCCAGGACCAGTGAACATA
CCGGAGCAGGTGATCCGGGCGATGAACAGAAACAACGAGGATTACCGTTCACCAGCCATC
CCAGCACTTACAAAAACGTTGTTGGAGGACGTGAAGAAGATATTCAAGACAACATCTGGA
ACACCGTTTATGTTTCCAACCACTGGTACTGGTGCTTGGGAGAGTGCCTTTACCAACACG
CTATCTCCTGGAGACAGGATCGTCTCGTTTCTGATTGGGCAGTTTAGCTTGCTGTGGATT
GACCAGCAGAAGAGGCTAAACTTCAACGTTGATGTGGTAGAGAGTGATTGGGGACAAGGT
GCTAATCCCCAAGTCTTGGCCTCAAAGCTCTCACAGGACCAAACTCATTCCATCAAAGCC
ATTTGTATTGTCCACAACGAGACCGCGACTGGAGTCACTAATGACATCTCTGCCGTCCGA
ACCCTCCTCGATCACTACAAG
CA

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2BR12TF 672 0 0
G
CACCTTTTATGTTTCCAACCACTGGTACTGGTGCTTGGGAGAGTGCCTTGACCAACACGC
TATCTCCTGGAGACAGGATCGTCTCGTTTCTGATTGGGCAGTTTAGCTTGCTGTGGATTG
ACCAGCAGAAGAGGCTAAACTTCAACGTTGATGTGGTAGAGAGTGATTGGGGACAAGGTG
CTAATCTCCAAGTCTTGGCCTCAAAGCTCTCACAGGACCAAACTCATTCCATCAAAGCCA
TTTGTATTGTCCACAACGAGACCGCGACTGGAGTCACTAATGACATCTCTGCCGTCCGAA
CCCTCCTCGATCACTACAAGCACCCGGCTTTGCTGCTTGTGGACGGTGTCTCGTCCATAT
GTGCGCTTGATTTCCGAATGGATGAGTGGGGAGTGGATGTGGCCTTGACCGGATCTCAGA
AAGCTTTATCTCTTCCAACTGGCCTTGGTATTGTGTGCGCCAGTCCAAAAGCTTTGGAAG
CTACCAAGACTTCAAAATCCCTCAAAGTCTTCTTTGATTGGAATGACTACCTCAAGTTTT
ACAAGCTCGGAACATATTGGCCATACACACCTTCCATTCAACTCCTCTACGGTCTTAGAG
CTGCTCTTGATCTTATCTTTGAAGAAG*ACTTGAAAATGTCATCGCCCGTCATGCCCGTT
TGGGA
AAGCCA

QA 2 666 2 666
DS 

RD RR2D374JQ 719 0 0
CCGGATCTCAGAAAGCTTTATCTCTTCCAACTGGCCTTGGTATTGTGTGCGCCAGTCCAA
AAGCTTTGGAAGCTACCAAAACTTCAAAATCCCTCAAAGTCTTCTTTGATTGGAATGACT
ACCTCAAGTTTTACAAGCTCGGAACATATTGGCCATACACACCTTCCATTCAACTCCTGT
ACGGTCTTAGAGCTGCTCTTGATCTTATCTTTGAAGAAGGACTTGAAAATGTCATCGCCC
GTCATGCTCGTTTGGGAGAGGCCACAAGGCTCGCGGTGGAAGCGTGGGGGCTGAAAAACT
GTACACAAAAGGAGGAGTGGATAAGTAACACAGTGACAGCGGTCATGGTGCCGCCGAATA
TAGACAGTACTGAGATTGTGAAAAGGGCGTGGAAGAGGTACAACCTTGGTCTTGGTCTTG
GTCTCAACAAAGTGGCTGGCAAGGTTTTCAGAATTGGGCTCCTTGGACATCTTAATGAGT
TGCAACTTCTTGGATGTTTGGCTGGAGTGGAGATGATACTCAAGGATGTTGGCTACCCAA
TTGTATTGGGAAGTGGAGTTGCAGCTGCTTCCACTTATCTGCAGCACCAGATCCCTCTCA
TTCCTTCCAGGATCTAATTCATATCCCTATTTCTCCATCTTCCTCTCCACCCCCTTTCAA
TGTATAACAAAACTATTTGTTCTCTTTTCTCAGCTTTTTTATTTCACTAAAATAATATC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 3

CO CL2370Contig1 944 3 5 U
GGATCTTCAAGAACCCACAACTCACCAGATTCCAAATTGCCTTTTCCCCACCAAACCCAC
TACTTCTCTCTCGCCCTGGGATTCAGAATCTAAGGATGTCCATGAACAAGAGGTCGGTGG
TGATTGCATCATCTACGACGGCGGCATCAGAGAAGCAGAAAAAGAGGTATCCAGGAGAAT
CGAAAGGGTTTGTGGAGGAGATGAGGTTTGTGGCAATGAAACTTCACACGAAAGAGCAAG
CCAAGGAAGGAGAGAAAGAGACCAAATCTCCCGAGGAGCGTCCTGTCTCTATATGGGAAC
CCACTGTCGATGGTTACTTGAGGTTTTTGGTGGATACTAAATTGGTTTATGACACGCTTG
AAGAAGAAGTCACTTCCCCTACTTATGCTGAATTCAAGAACACAGGATTGGAAAGGTCAG
AGAAATTAGCCATTGATTTGGAGTGGTTCAAGGAACAAGGTTACGAGATTCCAAAGCCAA
CTGCTCTTGGTAAAACATACTCCCAGTATCTAAAGGATTTAGCAGAAAAAGATCCTCAAG
CATTCATTTGTCACTTCTACAACATCTACTTCGCCCACAGTGCCGGCGGCAGAATGATTG
GGAGAAAGGTAGCGGAGAGAATACTCGAAGGTAGAGAACTCGAGTTCTACAAATGGGACG
GCGAGCTTTCCCAGTTGTTGTAGAACGTGAGGGAAAAACTGAATAAAGTTGCCGAGGTGT
GGACAAGAGAGGAAAAGAATCACTGTCTGGAAGAGACCGATAAATCATTCAAGTATTCTG
GTGAGATACTTCGTCTCATATTGTCCTGATTTGATTCTCACTCTCTCTTGAAAATCCTGC
TCAAGTGTTTATATTCCTTTGTTATATATGTATCTCTTTTGTTTGTAATTAAACTCTTTG
TTTCAGACCTGTTTACTATGTTAAAAAACTGATATTTTCTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G204TF U 1
AF RR2DQ75TF U 164
AF RR2DQ75JQ C 225
BS 1 270 RR2G204TF
BS 271 271 RR2DQ75TF
BS 272 414 RR2G204TF
BS 415 668 RR2DQ75TF
BS 669 944 RR2DQ75JQ

RD RR2G204TF 414 0 0
GGATCTTCAAGAACCCACAACTCACCAGATTCCAAATTGCCTTTTCCCCACCAAACCCAC
TACTTCTCTCTCGCCCTGGGATTCAGAATCTAAGGATGTCCATGAACAAGAGGTCGGTGG
TGATTGCATCATCTACGACGGCGGCATCAGAGAAGCAGAAAAAGAGGTATCCAGGAGAAT
CGAAAGGGTTTGTGGAGGAGATGAGGTTTGTGGCAATGAAACTTCACACGAAAGAGCAAG
CCAAGGAAGGAGAGAAAGAGACCAAATCTCGCGAGGAGCGTCCTGTCTCTATATGGGAAC
CCACTGTCGATGGTTACTTGAGGTTTTTGGTGGATACTAAATTGGTTTATGACACGCTTG
AAGAAGAAGTCACTTCCCCTACTTATGCTGAATTCAAGAACACAGGATTGGAAA

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR2DQ75TF 505 0 0
GAGGTATCCAGGAGAATCGAAAGGGTTTGTGGAGGAGATTAGGTTTGTGGCAATGAAACT
TCACACGAAAGAGCAAGCCAAGGAAGGAGAGAAAGAGACCAAATCTCCCGAGGAGCGTCC
TGTCTCTATATGGGAACCCACTGTCGATGGTTACTTGAGGTTTTTGGTGGATACTAAATT
GGTTTATGACACGCTTGAAGAAGAAGTCACTTCCCCTACTTATGCTGAATTCAAGAACAC
AGGATTGGAAAGGTCAGAGAAATTAGCCATTGATTTGGAGTGGTTCAAGGAACAAGGTTA
CGAGATTCCAAAGCCAACTGCTCTTGGTAAAACATACTCCCAGTATCTAAAGGATTTAGC
AGAAAAAGATCCTCAAGCATTCATTTGTCACTTCTACAACATCTACTTCGCCCACAGTGC
CGGCGGCAGAATGATTGGGAGAAAGGTAGCGGAGAGAATACTCGAAGGTAGAGAACTCGA
GTTCTACAAATGGGACGGCGAGCTT

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR2DQ75JQ 720 0 0
CACACGAAAGAGCAAGCCAAGGAAGGAGAGAAAGAGACCAAATCTCCCGAGGAGCGTCCT
GTCTCTATATGGGAACCCACTGTCGATGGTTACTTGAGGTTTTTGGTGGATACTAAATTG
GTTTATGACACGCTTGAAGAAGAAGTCACTTCCCCTACTTATGCTGAATTCAAGAACACA
GGATTGGAAAGGTCAGAGAAATTAGCCATTGATTTGGAGTGGTTCAAGGAACAAGGTTAC
GAGATTCCAAAGCCAACTGCTCTTGGTAAAACATACTCCCAGTATCTAAAGGATTTAGCA
GAAAAAGATCCTCAAGCATTCATTTGTCACTTCTACAACATCTACTTCGCCCACAGTGCC
GGCGGCAGAATGATTGGGAGAAAGGTAGCGGAGAGAATACTCGAAGGTAGAGAACTCGAG
TTCTACAAATGGGACGGCGAGCTTTCCCAGTTGTTGTAGAACGTGAGGGAAAAACTGAAT
AAAGTTGCCGAGGTGTGGACAAGAGAGGAAAAGAATCACTGTCTGGAAGAGACCGATAAA
TCATTCAAGTATTCTGGTGAGATACTTCGTCTCATATTGTCCTGATTTGATTCTCACTCT
CTCTTGAAAATCCTGCTCAAGTGTTTATATTCCTTTGTTATATATGTATCTCTTTTGTTT
GTAATTAAACTCTTTGTTTCAGACCTGTTTACTATGTTAAAAAACTGATATTTTCTTGCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 4

CO CL2371Contig1 1541 4 10 U
GGTACAAGCACATTTACCTCAACTAAAGCCACCAAAGTGTAACCCACTAATAGACCAAAG
TTCATGTGAAGAGGCAAAAGGTTTCAAGGCAACGTTCTTCTTCATGGCACTCTACTTGGT
GGCTTTAGGAAGTGGCTGTGTTAAACCAAACATGATAGCTCACGGTGCGGACCAGTTCTG
TCAGTCACACCCTAAACAATCTAAAAGGCTCTCATCTTACTTCAATGCCGCCTATTTCGC
CTTCTCCATGGGCGAGCTTATCGCGCTAACTCTCCTCGTTTGGGCCCAAACTCATTCAGG
CATGGATGTTGGATTTGGAGTCTCTGCTGCAGCCATGACGATGGGCCTCATTAGCTTAGT
CTCCGGCACTATGTTTTTTCGTAACAAACGTCCACGTCGAAGCATCTTCACTCCCATTGC
CCAAGTTGTTGTGGCTGCCATATCAAAAAGAAAGCTTGTGGCTCCCTCGGACCCAAGAAT
GCTTCATGGAGGACATCATGCCTCAAATGACGTCGTACCTTCATCCACTTTACCACACAC
TCCTCGTCTCAGGTTCTTGGACAAGGCATGCATCAAAGTCCAAGAAACAAACACAAAGGA
GAGTCCATGGAAGCTCTGCACGGTATCACAAGTAGAGCAAGTCAAAACCTTAATTTCACT
TGTTCCAATTTTCGCAAGCACCATCGTCTTCAACACTATCTTAGCTCAGCTCCAAACGTT
CTCGGTTCAACAAGGAAGTTCCATGAACACTAGTCTATCAAATTCAGTTCCACATTCCGC
CGGCTTCACTCCAAGCAATCCCTTACATAATGCTCATCTTCCTCGTCCCTCTCTACGACT
CTATATTCGTTCCTTTTGCGCGCAAGTTCACGGGACACAACTCAGGCATTACTCCATTGA
CTCGGATAGGAATTGGACTATTCCTCTCTACTTTCTCCATGGTTTCAGCTGCCTTACTCG
AGAAGAAACGTAGAGACTCTTCGGTTATTGACGGTAGAATCTTGAGTATCTTCTGGATCA
CGCCGCAGTTCTTGATCTTTGGGGTCTCAGAGATGTTTACTGCCGTTGGATTGATTGAGT
TCTTTTACAAACAATCTGCAAAGGGCATGGAGTCATTCCTGATGGCTTTGACTTATTGTT
CGTATTCCTTTGGGTTTTACTTGAGCTCTGTGCTCGTTTCGATCGTGAACAAGATAACTT
CCACGTCAGTCAACTCCAAAGGGTGGCTCGGGGACAACGATCTGAACAAGGACAGGCTCG
ATCTGTTTTATTGGCTTTTAGCGGTTCTCAGTCTACTGAACTTTCTTAGCTATCTCTTCT
GGTCTCGTTGGAACATTAAGTCTTCGAGAAGCAACAACTCCAATGTGGTGGGAGATGATA
ACATTTAGCTTGATGCATATTACATGTTTAAAACTCCAGCATATAATTAATAATGAATAA
GTTTATTGACGTAGTATATTGATTTCACAGTCTCACGTTACGTACTCCCTGTAATCATTT
TTATATATAAAAAAAAACAAATGGTCCCCGGTAACCCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV30TF U 1
AF RR2BS44TF U 459
AF RR2BS44JQ C 787
AF RR2GV30JQB C 1012
BS 1 579 RR2GV30TF
BS 580 580 RR2BS44TF
BS 581 615 RR2GV30TF
BS 616 616 RR2BS44TF
BS 617 720 RR2GV30TF
BS 721 1188 RR2BS44TF
BS 1189 1191 RR2BS44JQ
BS 1192 1212 RR2BS44TF
BS 1213 1516 RR2BS44JQ
BS 1517 1541 RR2GV30JQB

RD RR2GV30TF 720 0 0
GGTACAAGCACATTTACCTCAACTAAAGCCACCAAAGTGTAACCCACTAATAGACCAAAG
TTCATGTGAAGAGGCAAAAGGTTTCAAGGCAACGTTCTTCTTCATGGCACTCTACTTGGT
GGCTTTAGGAAGTGGCTGTGTTAAACCAAACATGATAGCTCACGGTGCGGACCAGTTCTG
TCAGTCACACCCTAAACAATCTAAAAGGCTCTCATCTTACTTCAATGCCGCCTATTTCGC
CTTCTCCATGGGCGAGCTTATCGCGCTAACTCTCCTCGTTTGGGCCCAAACTCATTCAGG
CATGGATGTTGGATTTGGAGTCTCTGCTGCAGCCATGACGATGGGCCTCATTAGCTTAGT
CTCCGGCACTATGTTTTTTCGTAACAAACGTCCACGTCGAAGCATCTTCACTCCCATTGC
CCAAGTTGTTGTGGCTGCCATATCAAAAAGAAAGCTTGTGGCTCCCTCGGACCCAAGAAT
GCTTCATGGAGGACATCATGCCTCAAATGACGTCGTACCTTCATCCACTTTACCACACAC
TCCTCGTCTCAGGTTCTTGGACAAGGCATGCATCAAAGTTCAAGAAACAAACACAAAGGA
GAGTCCATGGAAGCTTTGCACGGTATCACAAGTAGAGCAAGTCAAAACCTTAATTTCACT
TGTTCCAATTTTCGCAAGCACCATCGTCTTCAACACTATCTTAGCTCAGCTCCAAACGTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2BS44TF 762 0 0
G
GGCTCCCTCGGACCCAAGAATGCTTCATGGAGGACATCATGCCTCAAATGACGTCGTACC
TTCATCCACTTTACCACACACTCCTCGTCTCAGGTTCTTGGACAAGGCATGCATCAAAGT
CCAAGAAACAAATACAAAGGAGAGTCCATGGAAGCTCTGCACGGTATCGCAAGTAGAGCA
AGTCAAAACCTTAATTTCACTTGTTCCAATTTTTGCAAGCACCATCGTCTTCAACACTAT
CTTAGCTCAGCTCCAAACGTTCTCGGTTCAACAAGGAAGTTCCATGAACACTAGTCTATC
AAATTCAGTTCCACATTCCGCCGGCTTCACTCCAAGCAATCCCTTACATAATGCTCATCT
TCCTCGTCCCTCTCTACGACTCTATATTCGTTCCTTTTGCGCGCAAGTTCACGGGACACA
ACTCAGGCATTACTCCATTGACTCGGATAGGAATTGGACTATTCCTCTCTACTTTCTCCA
TGGTTTCAGCTGCCTTACTCGAGAAGAAACGTAGAGACTCTTCGGTTATTGACGGTAGAA
TCTTGAGTATCTTCTGGATCACGCCGCAGTTCTTGATCTTTGGGGTCTCAGAGATGTTTA
CTGCCGTTGGATTGATTGAGTTCTTTTACAAACAATCTGCAAAGGGCATGGAGTCATTCC
TGATGGCTTTGACTTATTGTTCGTATTCCTTTGGGTTTTACTTGAGCTCTGTGCTCGTTT
CGATCGTGA**CAGATAACTTCCACGTCAGTCA
CTCCAAAG

QA 2 754 2 754
DS 

RD RR2BS44JQ 730 0 0
CACTCCAAGCAATCCCTTACATAATGCTCATCTTCCTCGTCCCTCTCTACGACTCTATAT
TCGTTCCTTTTGCGCGCAAGTTCACGGGACACAACTCAGGCATTACTCCATTGACTCGGA
TAGGAATTGGACTATTCCTCTCTACTTTCTCCATGGTTTCAGCTGCCTTACTCGAGAAGA
AACGTAGAGACTCTTCGGTTATTGACGGTAGAATCTTGAGTATCTTCTGGATCACGCCGC
AGTTCTTGATCTTTGGGGTCTCAGAGATGTTTACTGCCGTTGGATTGATTGAGTTCTTTT
ACAAACAATCTGCAAAGGGCATGGAGTCATTCCTGATGGCTTTGACTTATTGTTCGTATT
CCTTTGGGTTTTACTTGAGCTCTGTGCTCGTTTCGATCGTGAACAAGATAACTTCCACGT
CAGTCAACTCCAAAGGGTGGCTCGGGGACAACGATCTGAACAAGGACAGGCTCGATCTGT
TTTATTGGCTTTTAGCGGTTCTCAGTCTACTGAACTTTCTTAGCTATCTCTTCTGGTCTC
GTTGGAACATTAAGTCTTCGAGAAGCAACAACTCCAATGTGGTGGGAGATGATAACATTT
AGCTTGATGCATATTACATGTTTAAAACTCCAGCATATAATTAATAATGAATAAGTTTAT
TGACGTAGTATATTGATTTCACAGTCTCACGTTACGTACTCCCTGTAATCATTTTTATAT
ATAAAAAAAA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2GV30JQB 530 0 0
TCTGGATCACGCCGCAGTTCTTGATCTTTGGGGTCTCAGAAATGTTTACTGCCGTTGGAT
TGATTGAGTTCTTTTACAAACAATCTGCAAAGGGCATGGAGTCATTCCTGATGGCTTTGA
CTTATTGTTCGTATTCCTTTGGGTTTTACTTGAGCTCTGTGCTCGTTTCGATCGTGAACA
AGATAACTTCCACGTCAGTCAACTCCAAAGGGTGGCTCGGGGACAACGATCTGAACAAGG
ACAGGCTCGATCTGTTTTATTGGCTTTTAGCGGTTCTCAGTCTACTGAACTTTCTTAGCT
ATCTCTTCTGGTCTCGTTGGAACATTAAGTCTTCGAGAAGCAACAACTCTAATGTGGTGG
GAGATGATAACATTTAGCTTGATGCATATTACATGTTTAAAACTCCAGCATATAATTAGT
AATGAATAAGTTTATTGACGTAGTATATTGATTTCATAGTCTCACGTTAC****TCCCTG
TAATCATTTTTATATATATAAAAAAACAAATGGTCCCCGGTAACCCCCCC

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 2

CO CL2372Contig1 873 2 6 U
GGGAACTTTTCAATTCCTCTCATCCAATCGCACGGTGAGATCGAGCCTAGAACCGACCCA
TCTGTTCCTCTGGTCATCATCGCGACACAAGATGTTCGCTTGACGGGACCTTTTTCTCGC
CGCGCGATCTTTGCCTCTTCCCTGTAATTCGCCGTCTTTTACTTAAATAAACGAGATCTG
TTTTTCCACGACTTTGAAGGAGTATGTTGACGCCAGCAAGGAAGAGGTTGATGAGGGATT
TCAAGAGGTTGCAGCAAGACCCACCTGCTGGTATCAGCGGTGCTCCCCAGGACAACAATA
TCATGCTCTGGAATGCTGTCATATTCGGGCCTGATGACACCCCGTGGGATGGAGGTACTT
TCAAACTCTCACTGCAGTTCTCTGAGGATTATCCAAATAAACCACCAACAGTTCGCTTTG
TGTCACGGATGTTCCATCCGAATATTTATGCAGATGGGAGTATTTGCTTGGACATTCTAC
AAAACCAGTGGAGTCCAATATATGATGTTGCTGCTATACTTACCTCCATCCAGTCATTGC
TCTGTGACCCTAATCCGAATTCTCCTGCAAATTCGGAAGCCGCTCGGATGTACAGCGAAA
ACAAGCGTGAGTACAACAGAAAAGTGCGTGATGTTGTCGAGCAAAGCGGGACTGCTGACT
AAGTATTAGTTACTTGTAAGCTTTGCTGCAACTCTTCACTCAATCTCCACCCATTAAGCG
ACGGCTTTTTTATCTTTTCCCATTCATGTCCTTTTGTGTGTTTCAAAACTCTAAAATGAT
TGGGATGCTGTGATGGCTTCTATGAAAGTCTAACATCCTTGTAAAAACTTTGTACCAAAC
CTTTTGAATTATTCACCTTTTTTTTTCTTGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK29TF U 1
AF RR2GK29JQ C 181
BS 1 575 RR2GK29TF
BS 576 576 RR2GK29JQ
BS 577 644 RR2GK29TF
BS 645 645 RR2GK29JQ
BS 646 665 RR2GK29TF
BS 666 873 RR2GK29JQ

RD RR2GK29TF 665 0 0
GGGAACTTTTCAATTCCTCTCATCCAATCGCACGGTGAGATCGAGCCTAGAACCGACCCA
TCTGTTCCTCTGGTCATCATCGCGACACAAGATGTTCGCTTGACGGGACCTTTTTCTCGC
CGCGCGATCTTTGCCTCTTCCCTGTAATTCGCCGTCTTTTACTTAAATAAACGAGATCTG
TTTTTCCACGACTTTGAAGGAGTATGTTGACGCCAGCAAGGAAGAGGTTGATGAGGGATT
TCAAGAGGTTGCAGCAAGACCCACCTGCTGGTATCAGCGGTGCTCCCCAGGACAACAATA
TCATGCTCTGGAATGCTGTCATATTCGGGCCTGATGACACCCCGTGGGATGGAGGTACTT
TCAAACTCTCACTGCAGTTCTCTGAGGATTATCCAAATAAACCACCAACAGTTCGCTTTG
TGTCACGGATGTTCCATCCGAATATTTATGCAGATGGGAGTATTTGCTTGGACATTCTAC
AAAACCAGTGGAGTCCAATATATGATGTTGCTGCTATACTTACCTCCATCCAGTCATTGC
TCTGTGACCCTAATCCGAATTCTCCTGCAAATTCG*AAGCCGCTCGGATGTACAGCGAAA
ACAAGCGTGAGTACAACAGAAAAGTGCGTGATGTTGTCGAGCAA*GCGGGACTGCTGACT
AAGTA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2GK29JQ 693 0 0
TTTTTCCACGACTT
TGAAGGAGTATGTTGACGCCAGCAAGGAAGAGGTTGATGAGGGATTTCAAGAGGTTGCAG
CAAGACCCACCTGCTGGTATCAGCGGTGCTCCCCAGGACAACAATATCATGCTTTGGAAT
GCTGTCATATTCGGGCCTGATGACACCCCGTGGGATGGAGGTACTTTCAAACTCTCACTG
CAGTTTTTTGAGGATTATCCAAATAAACCACCAACAGTTCGCTTTGTGTCACGGATGTTC
CATCCGAATATTTATGCAGATGGGAGTATTTGCTTGGACATTTTACAAAACCAGTGGAGT
CCAATATATGATGTTGCTGCTATACTTACCTCCATCCAGTCATTGCTCTGTGACCCTAAT
CCGAATTTTCCTGCAAATTCGGAAGCCGCTCGGATGTACAGCGAAAACAAGCGTGAGTAC
AACAGAAAAGTGCGTGATGTTGTCGAGCAAAGCGGGACTGCTGACTAAGTATTAGTTACT
TGTAAGCTTTGCTGCAACTCTTCACTCAATCTCCACCCATTAAGCGACGGCTTTTTTATC
TTTTCCCATTCATGTCCTTTTGTGTGTTTCAAAACTCTAAAATGATTGGGATGCTGTGAT
GGCTTCTATGAAAGTCTAACATCCTTGTAAAAACTTTGTACCAAACCTTTTGAATTATTC
ACCTTTTTTTTTCTTGTAT

QA 15 693 15 693
DS 



AS 1 3

CO CL2373Contig1 1741 3 5 U
TTTTTTACCGGCATGGACATGTAGATATCAAATAAAATAGAAAAAAAGATTTCTTTATCT
GAGTAATGAGTCATCTGACAATTCATGATTTAGATTCAACTACTTATTAATAAACTAATA
GCAAGGAAGAAACAATTTGAGTTGATGCGTTTACCTAAGTAAGGACCAATAAAATAAAAT
ATTTTGATCTTCGAAACCAATTAAATGAAATTCTAAAGGTTCAATTTTATGGGGCAGTGC
GCGAGAAATCAAATTATAAATAAATGATAGAATTTTGAGCGCCCTGAAAATGCCATAATA
TATAACATTAAGATATATAAAGGTGTTCGGAAATGGTTGAAGTAGATGAATAGGAGGATC
GCTATGACTATAGCCCTTGGTAAATTTACCAAAGACGAAAAAGATTTATTTGATATTATG
GATGACTGGTTACGGAGGGACCGCTTCGTTTTTGTAGGTTGGTCTGGTCTATTGCTCTTT
CCTTGTGCCTATTTCGCTTTGGGGGGTTGGTTCACAGGTACAACCTTTGTAACTTCATGG
TATACTCATGGATTGGCTAGTTCCTATTTTAGAAGGTTGCAATTTTTTAACTGCTGCAGT
TTCTACTCCTGCTAATAGTTTAGCGCATTCTTTGTTGTTACTGTGGGGTCCTGAAGCACA
AGGAGATTTTACTCGTTGGTGTCAATTAGGCGGTCTGTGGGCTTTTGTTGCTCTCCACGG
TGCTTTCGCATTAATAGGTTTTATGTTACGTCAATTTGAACTTGCTCGATCTGTTCAATT
GCGACCTTATAATGCAATCGCATTCTCTGGTCCAATTGCTGTTTTTGTTTCTGTCTTTCT
AATTTATCCACTAGGTCAATCGGGTTGGTTCTTTGCGCCTAGTTTTGGTGTAGCGGCTAT
ATTTCGATTCATCCTCTTTTTCCAAGGGTTTCATAATTGGACATTGAACCCATTTCATAT
GATGGGAGTCGCTGGTGTACTGGGCGCGGCTCTGTTATGCGCTATTCATGGTGCTACTGT
AGAAAATACTTTATTTGAAGATGGTGATGGTGCAAATACATTCCGTGCTTTTAACCCAAC
TCAAGCCGAAGAAACTTATTCAATGGTCACCGCTAACCGCTTTTGGTCACAAATCTTTGG
GGTCGCTTTTTCCAATAAACGTTGGTTACATTTCTTTATGTTATTTGTACCAGTAACTGG
TTTATGGATGAGTGCTCTTGGAGTAGTCGGTCTAGCTTTGAACCTACGTGCCTATGACTT
CGTTTCCCAGGAAATCCGTGCAGCGGAAGATCCGGAATTTGAGACTTTCTATACTAAAAA
TATTCTTTTAAACGAAGGTATTCGCGCTTGGATGGCGGCTCAAGATCAGCCTCATGAAAA
CCTTATATTCCCTGAGGAGGTTCTACCACGTGGAAACGCTCTTTAATGGAACTTTAGCTT
TAGCTGGTCGTGACCAAGAAACCACTGGTTTCGCTTGGTGGGCCGGGAATGCCCGACTTA
TCAATTTATCTGGTAAACTATTGGGAGCTCATGTAGCCCATGCCGGATTAATCGTATTCT
GGGCCGGAGCAATGAACTTATTTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTG
ACTCAGTTGTGGTTATTCAACCATGGCTCCATTCGAAGAAGTTACTCGGTTTCACTCCCG
TTGCTACTCCTGTCTACTAACTTTATTTCTTTATTGGCCAAACAAGTTTCTATAATATAA
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2E154TF U 1
AF RR2E154JQ C 613
AF RR2C012TF U 1042
BS 1 662 RR2E154TF
BS 663 663 RR2E154JQ
BS 664 685 RR2E154TF
BS 686 1042 RR2E154JQ
BS 1043 1741 RR2C012TF

RD RR2E154TF 685 0 0
TTTTTTACCGGCATGGACATGTAGATATCAAATAAAATAGAAAAAAAGATTTCTTTATCT
GAGTAATGAGTCATCTGACAATTCATGATTTAGATTCAACTACTTATTAATAAACTAATA
GCAAGGAAGAAACAATTTGAGTTGATGCGTTTACCTAAGTAAGGACCAATAAAATAAAAT
ATTTTGATCTTCGAAACCAATTAAATGAAATTCTAAAGGTTCAATTTTATGGGGCAGTGC
GCGAGAAATCAAATTATAAATAAATGATAGAATTTTGAGCGCCCTGAAAATGCCATAATA
TATAACATTAAGATATATAAAGGTGTTCGGAAATGGTTGAAGTAGATGAATAGGAGGATC
GCTATGACTATAGCCCTTGGTAAATTTACCAAAGACGAAAAAGATTTATTTGATATTATG
GATGACTGGTTACGGAGGGACCGCTTCGTTTTTGTAGGTTGGTCTGGTCTATTGCTCTTT
CCTTGTGCCTATTTCGCTTTGGGGGGTTGGTTCACAGGTACAACCTTTGTAACTTCATGG
TATACTCATGGATTGGCTAGTTCCTATTTTAGAAGGTTGCAATTTTTTAACTGCTGCAGT
TTCTACTCCTGCTAATAGTTTAGCGCATTCTTTGTTGTTACTGTGGGGTCCTGAAGCACA
AG*AGATTTTACTCGTTGGTGTCAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2E154JQ 703 0 0
TAATAGTTTAGCGCATTCTTTGTTGTTACTGTGGGGTCCTGAAGCACAAGGAGATTTTAC
TCGTTGGTGTCAATTAGGCGGTCTGTGGGCTTTTGTTGCTCTCCACGGTGCTTTCGCATT
AATAGGTTTTATGTTACGTCAATTTGAACTTGCTCGATCTGTTCAATTGCGACCTTATAA
TGCAATCGCATTCTCTGGTCCAATTGCTGTTTTTGTTTCTGTCTTTCTAATTTATCCACT
AGGTCAATCGGGTTGGTTCTTTGCGCCTAGTTTTGGTGTAGCGGCTATATTTCGATTCAT
CCTCTTTTTCCAAGGGTTTCATAATTGGACATTGAACCCATTTCATATGATGGGAGTCGC
TGGTGTACTGGGCGCGGCTCTGTTATGCGCTATTCATGGTGCTACTGTAGAAAATACTTT
ATTTGAAGATGGTGATGGTGCAAATACATTCCGTGCTTTTAACCCAACTCAAGCCGAAGA
AACTTATTCAATGGTCACCGCTAACCGCTTTTGGTCACAAATCTTTGGGGTTGCTTTTTC
CAATAAACGTTGGTTACATTTCTTTATGTTATTTGTACCAGTAACTGGTTTATGGATGAG
TGCTCTTGGAGTAGTCGGTCTAGCTTTGAACCTACGTGCCTATGACTTCGTTTCCCAGGA
AATCCGTGCAGCGGAAGATCCGGAATTTGAGACTTTCTATACT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2C012TF 700 0 0
G
GGTGATGGTGCAAATACATTCCGTGCTTTTAACCCAACTCAAGCCGAAGAAACTTATTCA
ATGGTCACCGCTAACCGCTTTTGGTCACAAATCTTTGGGGTCGCTTTTTCCAATAAACGT
TGGTTACATTTCTTTATGTTATTTGTACCAGTAACTGGTTTATGGATGAGTGCTCTTGGA
GTAGTCGGTCTAGCTTTGAACCTACGTGCCTATGACTTCGTTTCCCAGGAAATCCGTGCA
GCGGAAGATCCGGAATTTGAGACTTTCTATACTAAAAATATTCTTTTAAACGAAGGTATT
CGCGCTTGGATGGCGGCTCAAGATCAGCCTCATGAAAACCTTATATTCCCTGAGGAGGTT
CTACCACGTGGAAACGCTCTTTAATGGAACTTTAGCTTTAGCTGGTCGTGACCAAGAAAC
CACTGGTTTCGCTTGGTGGGCCGGGAATGCCCGACTTATCAATTTATCTGGTAAACTATT
GGGAGCTCATGTAGCCCATGCCGGATTAATCGTATTCTGGGCCGGAGCAATGAACTTATT
TGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTGTGGTTATTCAACC
ATGGCTCCATTCGAAGAAGTTACTCGGTTTCACTCCCGTTGCTACTCCTGTCTACTAACT
TTATTTCTTTATTGGCCAAACAAGTTTCTATAATATAAT

QA 2 700 2 700
DS 



AS 1 4

CO CL2374Contig1 521 4 1 U
GGATCAAGAAAAAAGAAGAAAAAAACAAGAACCATTTAAGAGCTTATAAAACAATGGCTA
TCGAAAAGAAAACCCTGATCGCCTCTTTCATCACCATTATGATGATGGTAATGATGATCG
CGAACCAAGTTGAGGCCAGGAACCATGTCACAATCAAGCCGCCTCCAAAGTGATCATAGT
CTTTGTTTTTCTAAATCGATGGCTCCAAAAGTTTATGAGAAAATAAATGGTTCCTTCAAC
GAGGAGCTTCAAGCATGGTTTAACTAATTTTTATTACTATATATATAT**CATTATTTCA
TCCTCTTATGTGTTTAGTAATGGATGTATATCTTATAAATAATGTTTCACAAAATAATAT
TTTTAATGTGAATGAAATGTACTAGTTTCATATTTCATATTTCATATTTCATAGACAGAG
ATTGATGTTGTGAACTCTCTAGGAATTGACAACACTATTGTTCACATTCGTCTTTTTAGT
TTGTAATTAAAGAGAATACAAATATCCTTGTTATTTTAATA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A228TF U 82
AF RR2EB43TF U 1
AF RR2BU64TF U 1
AF RR2C254TF U 1
BS 1 521 RR2BU64TF

RD RR2A228TF 289 0 0
CCTCTTTCATCACCATTATGATGATGGTAATGATGATCGCGAACCAAGTTGAGGCCAGGA
ACCATGTCACAATCAAGCCGCCTCCAAAGTGATCATAGTCTTTGTTTTTCTAAATCGATG
GCTCCAAAAGTTTATGAGAAAATAAATGGTTCCTTCAACGAGGAGCTTCAAGCATGGTTT
AACTAATTTTTATTACTATATATATAT**CATTATTTCATCCTCTTATGTGTTTAGTAAT
GGATGTATATCTTATAAATAATGTTTCACAAAATAATATTTTTAATGTG

QA 1 289 1 289
DS 

RD RR2EB43TF 414 0 0
GGATCAAGAAAAAAGAAGAAAAAAACAAGAACCATTTAAGAGCTTATAAAACAATGGCTA
TCGAAAAGAAAACCCTGATCGCCTCTTTCATCACCATTATGATGATGGTAATGATGATCG
CGAACCAAGTTGAGGCCAGGAACCATGTCACAATCAAGCCGCCTCCAAAGTGATCATAGT
CTTTGTTTTTCTAAATCGATGGCTCCAAAAGTTTATGAGAAAATAAATGGTTCCTTCAAC
GAGGAGCTTCAAGCATGGTTTAACTAATTTTTATTACTATATATATATATCATTATTTCA
TCCTCTTATGTGTTTAGTAATGGATGTATATCTTATAAATAATGTTTCACAAAATAATAT
TTTTAATGTGAATGAAATGTACTAGTTTCATATTTCATATTTCATATTTCATAG

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR2BU64TF 521 0 0
GGATCAAGAAAAAAGAAGAAAAAAACAAGAACCATTTAAGAGCTTATAAAACAATGGCTA
TCGAAAAGAAAACCCTGATCGCCTCTTTCATCACCATTATGATGATGGTAATGATGATCG
CGAACCAAGTTGAGGCCAGGAACCATGTCACAATCAAGCCGCCTCCAAAGTGATCATAGT
CTTTGTTTTTCTAAATCGATGGCTCCAAAAGTTTATGAGAAAATAAATGGTTCCTTCAAC
GAGGAGCTTCAAGCATGGTTTAACTAATTTTTATTACTATATATATAT**CATTATTTCA
TCCTCTTATGTGTTTAGTAATGGATGTATATCTTATAAATAATGTTTCACAAAATAATAT
TTTTAATGTGAATGAAATGTACTAGTTTCATATTTCATATTTCATATTTCATAGACAGAG
ATTGATGTTGTGAACTCTCTAGGAATTGACAACACTATTGTTCACATTCGTCTTTTTAGT
TTGTAATTAAAGAGAATACAAATATCCTTGTTATTTTAATA

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2C254TF 513 0 0
GGATCAAGAAAAAAGAAGAAAAAAACAAGAACCATTTAAGAGCTTATAAAACAATGGCTA
TCGAAAAGAAAACCCTGATCGCCTCTTTCATCACCATTATGATGATGGTAATGATGATCG
CGAACCAAGTTGAGGCCAGGAACCATGTCACAATCAAGCCGCCTCCAAAGTGATCATAGT
CTTTGTTTTTCTAAATCGATGGCTCCAAAAGTTTATGAGAAAATAAATGGTTCCTTCAAC
GAGGAGCTTCAAGCATGGTTTAACTAATTTTTATTACTATATATATAT**CATTATTTCA
TCCTCTTATGTGTTTAGTAATGGATGTATATCTTATAAATAATGTTTCACAAAATAATAT
TTTTAATGTGAATGAAATGTACTAGTTTCATATTTCATATTTCATATTTCATAGACAGAG
ATTGATGTTGTGAACTCTCTAGGAATTGACAACACTATTGTTCACATTCGTCTTTTTAGT
TTGTAATTAAAGAGAATACAAATATCCTTGTTA

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 4

CO CL2375Contig1 955 4 17 U
GGCAAAAGGTTTTAACAATACTGTATAACCTTCCCTCTTCCACAAGTATCAGAAATTCAT
CGGAATCTACAAGACTCCGGCCAAAATAAAACTACAGTCACATGTCTCTCTTGAGTGCCA
CCTTTACTTTTATTTCGAATAATCAAAACAAATCACGAATAATAAAATGGAATACATATA
TGGAACATAAACAAATAGAAAAGATGAAGTTTGAGATGTAGAAGAAGCATCTCTCATCAA
CTTTTTTAAGCAAGGTTGATCGTGAAGGAGACATAAGGATGTGTCTCGGAGTCACCGGCT
AAACCAGCCATGGCTCCTGCATCCTCCTCGCTTTTCCAGTATAAACTGTTAGTAGAATCG
CACAAGCGTTCAAGAATGGAGCGTACTTTCTTCTCGCTTTTAACAGCCGGAGATAAGACA
CATGCCAAGAAGGCCGGAGGTAAACCATATCTCATTATGCTCTCGGCGAATATACGCACA
GCACAGAAATGCATCCATGAGCTGAAAACCTCTCCGTAACTGGTGTAGCACCACTGCAAA
AGAGAGCTTCTCAAACTTTCCTGATCATGAACCAGCTTCTCTAGCTCTTGTTTACGAGTC
TCTTGTGCTTCAACGCTATGTTCAAAATCACGAACTTGGAACCCTTTCTCACGCGCATTA
GTCCTGAAATTATCTGCAACACGAGTGAAGAGAGTGACACCACCCAGTACCTCGATGTCA
TTCTTTCTCAAATCTCTCTTCTTCTTCTCCGATCGATCTCTACTTCAATAAATTCGAATC
AGCAGAGTTTTGAAGTTAAGCTCTGCGTTGATGAAGCTTGTTTGAGAAATGAGATTAGAC
TCAATGATCTGTGACATCATGCATTCCAAGTAAGATATTGATGCAGCCTACAAGTATGTC
GTTGAATAAACTAGCTGCTCTTCTCGTGTTCCTTTTGGTTGAGTCATGAGTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D844JQ U 1
AF RR2CC30JQ U 14
AF RR2GL95JQ U 14
AF RR2GL95TF C 338
BS 1 223 RR2D844JQ
BS 224 224 RR2CC30JQ
BS 225 290 RR2D844JQ
BS 291 291 RR2CC30JQ
BS 292 299 RR2D844JQ
BS 300 300 RR2CC30JQ
BS 301 410 RR2D844JQ
BS 411 411 RR2GL95JQ
BS 412 416 RR2CC30JQ
BS 417 417 RR2GL95JQ
BS 418 464 RR2CC30JQ
BS 465 465 RR2GL95JQ
BS 466 477 RR2CC30JQ
BS 478 478 RR2GL95JQ
BS 479 523 RR2CC30JQ
BS 524 655 RR2GL95JQ
BS 656 955 RR2GL95TF

RD RR2D844JQ 410 0 0
GGCAAAAGGTTTTAACAATACTGTATAACCTTCCCTCTTCCACAAGTATCAGAAATTCAT
CGGAATCTACAAGACTCCGGCCAAAATAAAACTACAGTCACATGTCTCTCTTGAGTGCCA
CCTTTACTTTTATTTCGAATAATCAAAACAAATCACGAATAATAAAATGGAATACATATA
TGGAACATAAACAAATAGAAAAGATGAAGTTTGAGATGTAGAAAAAGCATCTCTCATCAA
CTTTTTTAAGCAAGGTTGATCGTGAAGGAGACATAAGGATGTGTCTCGGAATCACCGGCC
AAACCAGCCATGGCTCCTGCATCCTCCTCGCTTTTCCAGTATAAACTGTTAGTAGAATCG
CACAAGCGTTCAAGAATGGAGCGTACTTTCTTCTCGCTTTTAACAGCCGG

QA 1 410 1 410
DS 

RD RR2CC30JQ 510 0 0
AACAATACTGTATAACCTTCCCTCTTCCACAAGTATCAGAAATTCATCGGAATCTACAAG
ACTCCGGCCAAAATAAAACTACAGTCACATGTCTCTCTTGAGTGCCACCTTTACTTTTAT
TTCGAATAATCAAAACAAATCACGAATAATAAAATGGAATACATATATGGAACATAAACA
AATAGAAAAGATGAAGTGTGAGATGTAGAAGAAGCATCTCTCATCAACTTTTTTAAGCAA
GGTTGATCGTGAAGGAGACATAAGGATGTGTCTCGGAGTCACCGGCTAAACCAGCCATGG
CTCCTGCATCCTCCTCGCTTTTCCAGTATAAACTGTCAGTAGAATCGCACAAGCGTTCAA
GAATAGAGCGTACTTTCTTCTCGCTTTTAACAGCCGGGGATAAAACACATGCCAAGAAGG
CCGGAGGTAAACCATATCTCATTATGCTCTCAGCGAATATACGCCCAGCACAGAAATGCA
TCCATGAGCTGAAAACCTCTCCGTAACTGG

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2GL95JQ 642 0 0
AACAATACTGTATAACCTTCCCTCTTCCA**AGTATCAGAAATTCATCGGAGTCTACAAG
ACTCCGGCCAAAATAAAACTACAGTCACATGTCTCTCTTGAGTGCCACCTTTACTTTTAT
TTCGAATAATCAAAACAAATCACGAATAATAAAATGGAATACATATATGGAACATAAACA
AATAGAAAAGATGAAGTTTGAGATGTAGAAGAAGCATCTCTCATCAACTTTTTTAAGCAA
GGTTGATCGTGAAGGAGACATAAGGATGTGTCTCGGAGTCACCGGCTAAACCAGCCATGG
CTCCTGCATCCTCCTCGCTTTTCCAGTATAAACTGTTAGTAGAATCGCACAAGCGTTCAA
GAATGGAGCGTACTTTCTTCTCGCTTTTAACAGCCGGAGATAAGACACATGCCAAGAAGG
CCGGAGGTAAACCATATCTCATTATGCTCTCGGCGAATATACGCACAGCACAGAAATGCA
TCCATGAGCTGAAAACCTCTCCGTAACTGGTGTAGCACCACTGCAAAAGAGAGCTTCTCA
AACTTTCCTGATCATGAACCAGCTTCTCTAGCTCTTGTTTACGAGTCTCTTGTGCTTCAA
CGCTATGTTCAAAATCACGAACTTGGAACCCTTTCTCACGCG

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2GL95TF 618 0 0
AGTATAAACTGTTAGTAGAATCGCACAAGCGTTCAAGAATGGAGCGTACTTTCTTCTCGC
TTTTAACAGCCGGAGATAAGACACATGCCAAGAAGGCCGGAGGTAAACCATATCTCATTA
TGCTCTCGGCGAATATACGCACAGCACAGAAATGCATCCATGAGCTGAAAACCTCTCCGT
AACTGGTGTAGCACCACTGCAAAAGAGAGCTTCTCAAACTTTCCTGATCATGAACCAGCT
TCTCTAGCTCTTGTTTACGAGTCTCTTGTGCTTCAACGCTATGTTCAAAATCACGAACTT
GGAACCCTTTCTCACGCGCATTAGTCCTGAAATTATCTGCAACACGAGTGAAGAGAGTGA
CACCACCCAGTACCTCGATGTCATTCTTTCTCAAATCTCTCTTCTTCTTCTCCGATCGAT
CTCTACTTCAATAAATTCGAATCAGCAGAGTTTTGAAGTTAAGCTCTGCGTTGATGAAGC
TTGTTTGAGAAATGAGATTAGACTCAATGATCTGTGACATCATGCATTCCAAGTAAGATA
TTGATGCAGCCTACAAGTATGTCGTTGAATAAACTAGCTGCTCTTCTCGTGTTCCTTTTG
GTTGAGTCATGAGTGCCC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL2376Contig1 979 2 16 U
AGAAGCAAGCACATCGAATATTTGATCAAACTAATCTTTTAACATTGCATGTTGAGAATA
ACATCTTCTGGGAAGAAAGATCTAACAAATGGCATTATGTACAGATATAAATTAAATGAT
ATGAAACATTTCTGAGTCGAGGCTGTGTTGTAATCTTATGAGCAACATGGGAGTCAGATG
TATCCTTTCAATTCAGACAAGCTTTGATATGGCCTTGCAAGACACCCAGAAGGCCTTGGA
TGCAATACTCAGGATCATCGGGTTCTGATATATGCCTATGGCAGTAGCGCTCCAAGAAGC
AACGTTGTAAATAACTTTACTTCCTTCCCATGCTTTACGAAGCTTCCCCTTTCGCTTCTT
CACTGAAAACATCGTGCTAAGTGCTTTCTGAAGCTGATCAGGTGATATATCCTTAGTCTG
CTTAAGGGAAGATAAATAAGTAGCCATGAAACAAGCGATACCGTCAGCTATATCCTCCTC
CCTAACAACAACATAATCATCATCTTCCGTTTGACCCAAACTCCCCTCACCCCATAAATC
ATCTTTACTAACTACATCCCAAGAGCTACCTTCTTCAGCAAGATCTTGGAGAAGTGAAAC
TTGAGCTAGCTCAATCTTCTCCCGAAAGCCATCACATTCAACTCTAGACTTGATGAGATC
ATAGAATTTATCGGCTTCGGGATCTCCTGAATCGGAAGAAGGAAGCTCCTCTTCTTCTTC
CTCCCTCTCCGACGACGAGCCAACGGTTTTGGTTTTATCTCCGCCGGCGGGAGAAGCAGT
ATCGGCGAGATTGAGCAGCTCGAGAGCTCTCTGGCAATCGTCGAGCAGATTCTGCAACGT
CTTCCGCTTGACACGAATGCTATCCAAATCGACGGTATCGTGAGTCGAGCTCGAGACCTC
GATTTCCATGGGGTTTTAATCGAGACGAAGAAGACGATTGATTGATTGATTGTTCTTCTT
CAACCTTTTTTTTGTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H033JQ U 1
AF RR2GO05TF C 169
BS 1 169 RR2H033JQ
BS 170 170 RR2GO05TF
BS 171 190 RR2H033JQ
BS 191 191 RR2GO05TF
BS 192 353 RR2H033JQ
BS 354 354 RR2GO05TF
BS 355 451 RR2H033JQ
BS 452 453 RR2GO05TF
BS 454 477 RR2H033JQ
BS 478 478 RR2GO05TF
BS 479 488 RR2H033JQ
BS 489 489 RR2GO05TF
BS 490 522 RR2H033JQ
BS 523 523 RR2GO05TF
BS 524 696 RR2H033JQ
BS 697 979 RR2GO05TF

RD RR2H033JQ 696 0 0
AGAAGCAAGCACATCGAATATTTGATCAAACTAATCTTTTAACATTGCATGTTGAGAATA
ACATCTTCTGGGAAGAAAGATCTAACAAATGGCATTATGTACAGATATAAATTAAATGAT
ATGAAACATTTCTGAGTCGAGGCTGTGTTGTAATCTTATGAGCAACATGTGAGTCAGATG
TATCCTTTCATTTCAGACAAGCTTTGATATGGCCTTGCAAGACACCCAGAAGGCCTTGGA
TGCAATACTCAGGATCATCGGGTTCTGATATATGCCTATGGCAGTAGCGCTCCAAGAAGC
AACGTTGTAAATAACTTTACTTCCTTCCCATGCTTTACGAAGCTTCCCCTTTCTCTTCTT
CACTGAAAACATCGTGCTAAGTGCTTTCTGAAGCTGATCAGGTGATATATCCTTAGTCTG
CTTAAGGGAAGATAAATAAGTAGCCATGAAA**AGCGATACCGTCAGCTATATCCTCTTC
CCTAACAAGAACATAATCATCATCTTCCGTTTGACCCAAACTTCCCTCACCCCATAAATC
ATCTTTACTAACTACATCCCAAGAGCTACCTTCTTCAGCAAGATCTTGGAGAAGTGAAAC
TTGAGCTAGCTCAATCTTCTCCCGAAAGCCATCACATTCAACTCTAGACTTGATGAGATC
ATAGAATTTATCGGCTTCGGGATCTCCTGAATCGGA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2GO05TF 811 0 0
GGGAGTCAGATGTATC**TTCAAT*CAGACAAGCTTTGATATGGC*TTGCAAGACACCCA
GAAGGC*TTGGATGCAATACTCAGGATCATCGGGTTCTGATATATGC*TATGGCAGTTGC
GCTCCAAGAAGCAACGTTGTAAATAACTTTACTTCCTTCCCATGCTTTACGAAGCTTCCC
CTTTCGCTTCTTCACTGAAAACATCGTGCTAAGTGCTTTCTGAAGCTGATCAGGTGATAT
ATCCTTAGTCTGCTTAAGGGAAGATAAATAAGTAGCCATGAAACAAGCGATACCGTCAGC
TATATCCTCCTCCCTAACAACAACATAATCATCATCTTCCGTTTGACCCAAACTCCCCTC
ACCCCATAAATCATCTTTACTAACTACATCCCAAGAGCTACCTTCTTCAGCAAGATCTTG
GAGAAGTGAAACTTGAGCTAGCTCAATCTTCTCCCGAAAGCCATGACATTCAACTCTAGA
CTTGATGAGATCATAGAATTTATCGGCTTCGGGATCTCCTGAATCGGAAGAAGGAAGCTC
CTCTTCTTCTTCCTCCCTCTCCGACGACGAGCCAACGGTTTTGGTTTTATCTCCGCCGGC
GGGAGAAGCAGTATCGGCGAGATTGAGCAGCTCGAGAGCTCTCTGGCAATCGTCGAGCAG
ATTCTGCAACGTCTTCCGCTTGACACGAATGCTATCCAAATCGACGGTATCGTGAGTCGA
GCTCGAGACCTCGATTTCCATGGGGTTTTAATCGAGACGAAGAAGACGATTGATTGATTG
ATTGTTCTTCTTCAACCTTTTTTTTGTTTTC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 4

CO CL2377Contig1 470 4 6 U
GGATACTGGGATCAACAAGAAGAATGGCAAAAGCTATGGAGCTTTGGGTTGGAGAGATGA
AAAAGATGGGTGAGAAGATAAACCATAGAAACCCGTTGATGCAAAACAAGAAGAGTACAT
CTTCTATTGTGTCCAAACAACAACAAGGAGAAGAAGAAAGAGGAGTTACTCAAAATGTAA
GAGAGAAGGATACAACTATGTCTGAGCTCACTGTCTGTCTTCTCATGGACCGTTTTGTTC
CATGGTGATCCTCCAATATAGTATTTTTTAGATCTCCCCTTTGTTGATGTTTATATATAT
CCAGAGTTATATGAATATATATGTATATATATGTTGTATATGCAGACCATGATCTTAAAT
TTCCATGTAAATCTATGACAGTAATGTGTTTTGAGGGCTATTATTTGTTTTATTAGCCAA
TATATAGTGTTTAATTATTATAATAAAAATGATGACAGCTTTCTTTTGAT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2B491TF U 1
AF RR2CP32JQ C 1
AF RR2CP32TF U 1
AF RR2D877TF U 1
BS 1 111 RR2B491TF
BS 112 112 RR2CP32TF
BS 113 176 RR2B491TF
BS 177 177 RR2CP32TF
BS 178 468 RR2B491TF
BS 469 470 RR2CP32JQ

RD RR2B491TF 468 0 0
GGATACTGGGATCAACAAGAAGAATGGCAAAAGCTATGGAGCTTTGGGTTGGAGAGATGA
AAAAGATGGGTGAGAAGATAAACCATAGAAACCCGTTGATGCAAAACAAGAGGAGTACAT
CTTCTATTGTGTCCAAACAACAACAAGGAGAAGAAGAAAGAGGAGTTACTCAAAATATAA
GAGAGAAGGATACAACTATGTCTGAGCTCACTGTCTGTCTTCTCATGGACCGTTTTGTTC
CATGGTGATCCTCCAATATAGTATTTTTTAGATCTCCCCTTTGTTGATGTTTATATATAT
CCAGAGTTATATGAATATATATGTATATATATGTTGTATATGCAGACCATGATCTTAAAT
TTCCATGTAAATCTATGACAGTAATGTGTTTTGAGGGCTATTATTTGTTTTATTAGCCAA
TATATAGTGTTTAATTATTATAATAAAAATGATGACAGCTTTCTTTTG

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR2CP32JQ 470 0 0
GGATACTGGGATCAACAAGAAGAATGGCAAAAGCTATGGAGCTTTGGGTTGGAGAGATGA
AAAAGATGGGTGAGAAGATAAACCATAGAAACCCGTTGATGCAAAACAAGAAGAGTACAT
TTTTTATTGTGTCCAAACAACAACAAGGAGAAGAAGAAAGAGGAGTTACTCAAAATGTAA
GAGAGAAGGATACAACTATGTTTGAGCTCACTGTCTGTTTTTTCATGGACCGTTTTGTTC
CATGGTGATCCTCCAATATAGTATTTTTTAGATCTCCCCTTTGTTGATGTTTATATATAT
CCAGAGTTATATGAATATATATGTATATATATGTTGTATATGCAGACCATGATTTTAAAT
TTCCATGTAAATTTATGACAGTAATGTGTTTTGAGGGCTATTATTTGTTTTATTAGCCAA
TATATAGTGTTTAATTATTATAATAAAAATGATGACAGCTTTTTTTTGAT

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR2CP32TF 470 0 0
GGATACTGGGATCAACAAGAAGAATGGCAAAAGCTATGGAGCTTTGGGTTGGAGAGATGA
AAAAGATGGGTGAGAAGATAAACCATAGAAACCCGTTGATGCAAAACAAGAAGAGTACAT
CTTCTATTGTGTCCAAACAACAACAAGGAGAAGAAGAAAGAGGAGTTACTCAAAATGTAA
GAGAGAAGGATACAACTATGTCTGAGCTCACTGTCTGTCTTCTCATGGACCGTTTTGTTC
CATGGTGATCCTCCAATATAGTATTTTTTAGATCTCCCCTTTGTTGATGTTTATATATAT
CCAGAGTTATATGAATATATATGTATATATATGTTGTATATGCAGACCATGATCTTAAAT
TTCCATGTAAATCTATGACAGTAATGTGTTTTGAGGGCTATTATTTGTTTTATTAGCCAA
TATATAGTGTTTAATTATTATAATAAAAATGATGACAGCTTTCTTTTG
AT

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR2D877TF 449 0 0
GGATACTGGGATCAACAAGAAGAATGGCAAAAGCTATGGAGCTTTGGGTTGGAGAGATGA
AAAAGATGGGTGAGAAGATAAACCATAGAAACCCGTTGATGCAAAACAAGAAGAGTACAT
CTTCTATTGTGTCCAAACAACAACAAGTAGAAGAAGAAAGAGGAGTTACTCAAAATGTAA
GAGAGAAGGATACAACTATGTCTGAGCTCACTGTCTGTCTTCTCATGGACCGTTTTGTTC
CATGGTGATCCTCCA*TATAGTATTTTTTAGATCTCCCCTTTGTTGATGTTTATATATAT
CCAGAGTTATATGAATATATATGTATATATATGTTGTATATGCAGACCATGATCTTAAAT
TTCCATGTAAATCTATGACAGTAATGTGTTTTGAGGGCTATTATTTGTTTTATTAGCCAA
TATATAGTGTTTAATTATTATAATAAAAA

QA 1 449 1 449
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2379Contig1 830 4 24 U
CAAGAGAACACAAATAGTATTAACCAAAAACTTTTACACGGTTTGCCCCAAAGAATCAGA
CCTCATAGAATACAACAGAGACAACAACAGCATACTACTTACACATTATAAATTACATCC
CAAAGCAAACAAATCTCAAACAATCAACAATACAGACCTCCTTCTCTCCCTCTTTCTCTC
TACTAATCTACATGATTCTTCTCTCAAATACAAAGCAGCCATGGCAGAAGCAATCGAAGC
TCCCTATGAAAGAAACCAATAATACCAGCTAATCAATCTTATTCGGATCATTCAAGACAA
ACTCTGCATACAGATCCTTCAATGCAATCACCACCGTCGTTATCAACGGTCCCATTATAG
CTCCCTCGAGAGCAGAAGGAAACAGAGTCACTCCACCAATAATACTTAGTCCAGTAAGGT
AAGCATTAGACCCCGGAATGTCATCTTGAATCTCCGAAGCACCATACTCCATCAACACAA
GATGCGTCACCGACAGAGTCACCGCAACAATGTATCTTCCTTCCAGCACAAGCTGCAACG
CCGCAGGGATCGTGGCGAACCAGTAAGGGAAGATCGGTAACAGAGCGCTAATAAAAGCCA
GAACGGTCGACATGTAAAGGAAATGGATATTGTAAAGTCTAAACAACAGCCAAGTGAGAC
ATCCTTGGAAGAACGCGATCTCCGCAGTAGCTAAAAGCACGCCAGAGATAGCCAAGTCTA
AAACTTCAACGCATCTGACTCTAGCAGCCGCGTTGATGGGAAGCATGTTCATGACTTGCT
CAGTCACACCACCTGATTCCGACGTAATAAGAATGTATAAAACCCAAATC


BQ
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2C347JQ U 1
AF RR2ER08JQ U 1
AF RR2ER08TF C 26
AF RR2H221JQ U 1
BS 1 5 RR2C347JQ
BS 6 6 RR2ER08JQ
BS 7 52 RR2C347JQ
BS 53 53 RR2ER08JQ
BS 54 58 RR2C347JQ
BS 59 59 RR2ER08JQ
BS 60 67 RR2C347JQ
BS 68 68 RR2ER08JQ
BS 69 79 RR2C347JQ
BS 80 80 RR2ER08JQ
BS 81 168 RR2C347JQ
BS 169 169 RR2ER08JQ
BS 170 221 RR2C347JQ
BS 222 222 RR2ER08JQ
BS 223 232 RR2C347JQ
BS 233 233 RR2ER08JQ
BS 234 345 RR2C347JQ
BS 346 346 RR2ER08JQ
BS 347 374 RR2C347JQ
BS 375 375 RR2ER08JQ
BS 376 424 RR2C347JQ
BS 425 425 RR2ER08JQ
BS 426 558 RR2C347JQ
BS 559 830 RR2ER08JQ

RD RR2C347JQ 558 0 0
CAAGAAAACACAAATAGTATTAACCAAAAACTTTTACACGGTTTGCCCCAAAAAATCAAA
CCTCATAAAATACAACAGAAACAACAACAGCATACTACTTACACATTATAAATTACATCC
CAAAGCAAACAAATCTCAAACAATCAACAATACAGACCTCCTTCTCTCTCTCTTTCTCTC
TACTAATCTACATGATTCTTCTCTCAAATACAAAGCAGCCAGGGCAGAAGCACTCGAAGC
TCCCTATGAAAGAAACCAATAATACCAGCTAATCAATCTTATTCGGATCATTCAAGACAA
ACTCTGCATACAGATCCTTCAATGCAATCACCACCGTCGTTATCAGCGGTCCCATTATAG
CTCCCTCGAGAGCAAAAGGAAACAGAGTCACTCCACCAATAATACTTAGTCCAGTAAGGT
AAGCGTTAGACCCCGGAATGTCATCTTGAATCTCCGAAGCACCATACTCCATCAACACAA
GATGCGTCACCGACAGAGTCACCGCAACAATGTATCTTCCTTCCAGCACAAGCTGCAACG
CCGCAGGGATCGTGGCGA

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2ER08JQ 830 0 0
CAAGAGAACACAAATAGTATTAACCAAAAACTTTTACACGGTTTGCCCCAAAGAATCAGA
CCTCATAGAATACAACAGAGACAACAACAGCATACTACTTACACATTATAAATTACATCC
CAAAGCAAACAAATCTCAAACAATCAACAATACAGACCTCCTTCTCTCCCTCTTTCTCTC
TACTAATCTACATGATTCTTCTCTCAAATACAAAGCAGCCATGGCAGAAGCAATCGAAGC
TCCCTATGAAAGAAACCAATAATACCAGCTAATCAATCTTATTCGGATCATTCAAGACAA
ACTCTGCATACAGATCCTTCAATGCAATCACCACCGTCGTTATCAACGGTCCCATTATAG
CTCCCTCGAGAGCAGAAGGAAACAGAGTCACTCCACCAATAATACTTAGTCCAGTAAGGT
AAGCATTAGACCCCGGAATGTCATCTTGAATCTCCGAAGCACCATACTCCATCAACACAA
GATGCGTCACCGACAGAGTCACCGCAACAATGTATCTTCCTTCCAGCACAAGCTGCAACG
CCGCAGGGATCGTGGCGAACCAGTAAGGGAAGATCGGTAACAGAGCGCTAATAAAAGCCA
GAACGGTCGACATGTAAAGGAAATGGATATTGTAAAGTCTAAACAACAGCCAAGTGAGAC
ATCCTTGGAAGAACGCGATCTCCGCAGTAGCTAAAAGCACGCCAGAGATAGCCAAGTCTA
AAACTTCAACGCATCTGACTCTAGCAGCCGCGTTGATGGGAAGCATGTTCATGACTTGCT
CAGTCACACCACCTGATTCCGACGTAATAAGAATGTATAAAACCCAAATC

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR2ER08TF 805 0 0
CCAAAAC
TTTACACGGTTTGCCCCAAAGAATCAGACCTCATAGAATACAACAGAGACAACAACAGCA
TACTACTTACACATTATAAATTACATCCCAAAGCAAACAA*TCTCAAACAATCAACAATA
CAGACCTCTTTCTCTCCCTCTTTCTCTCTACTAATCTACATGATTCTTCTCTCAAATACA
AAGCAGCCATGGCAGAAGCAATCGAAGCTCCCTATGAAAGAAACCAATAATACCAGCTAA
TCAATCTTATTCGGATCATTCAAGACAAACTCTGCATACAGATCCTTCAATGCAATCACC
ACCGTCGTTATCAACGGTCCCATTATAGCTCCCTCGAGAGCAGAAGGAAACAGAGTCACT
CCACCAATAATACTTAGTCCAGTAAGGTAAGCATTAGACCCCGGAATGTCATCTTGAATC
TCCGAAGCACCATACTCCATCAACACAAGATGCGTCACCGACAGAGTCACCGCAACAATG
TATCTTCCTTCCAGCACAAGCTGCAACGCCGCAGGGATCGTGGCGAACCAGTAAGGGAAG
ATCGGTAACAGAGCGCTAATAAAAGCCAGAACGGTCGACATGTAAAGGAAATGGATATTG
TAAAGTCTAAACAACAGCCAAGTGAGACATCCTTGGAAGAACGCGATCTCCGCAGTAGCT
AAAAGCACGCCAGAGATAGCCAAGTCTAAAACTTCAACGCATCTGACTCTAGCAGCCGCG
TTGATGGGAAGCATGTTCATGACTTGCTCAGTCACACCACCTGATTCCGACGTAATAAGA
ATGTATAAAACCCAAAT
C

QA 8 804 8 804
DS 

RD RR2H221JQ 829 0 0
CAAGAGAACACAAATAGTATTAACCAAAAACTTTTACACGGTTTGCCCCAAAGAATCAGA
CCTCATAGAATACAACAGAGACAACAACAGCATACTACTTACACATTATAAATTACATCC
CAAAGCAAACAAATCTCAAACAATCAACAATACAGACCTCCTTCTCTCCCTCTTTCTCTC
TACTAATCTACATGATTCTTCTCTCAAATACAAAGCAGCCATGGCAGAAGCACTCGAAGC
TCCCTATGAAAGAAACCAATAATACCAGCTAATCAATCTTATTCGGATCATTCAAGACAA
ACTCTACATACAGATCCTTCAATGCAATCACCACCGTCGTTATCAACGGTCCCATTATAG
CTCCCTCGAGAGCAGAAGGAAACAGAGTCACTCCACCAATAATACTTAGTCCAGTAAGGT
AAGCATTAGACCCCGGAATGTCATCTTGAATCTCCGAAGCACCATACTCCATCAACACAA
GATGCGTCACCGACAGAGTCACCGCAACAATGTATCTTCCTTCCAGCACAAGCTGCAACG
CCGCAGGGATCGTGGCGAACCAGTAAGGGAAGATCGGTAACAGAGCGCTAATAAAAGCCA
GAACGGTCGACATGTAAAGGAAATGGATATTGTAAAGTCTAAACAACAGCCAAGTGAGAC
ATCCTTGGAAGAACGCGATCTCCGCAGTAGCTAAAAGCACGCCAGAGATAGCCAAGTCTA
AAACTTCAACGCATCTGACTCTAGCAGCCGCGTTGATGGGAAGCATGTTCATGACTTGCT
CAGTCACACCACCTGATTCCGACGTAATAAGAATGTATAAAACCCAAAT

QA 1 829 1 829
DS 



AS 1 3

CO CL2380Contig1 646 3 2 U
AAGCAAAATAGTTGTTTAATAAATCTTGATAATTTCTTAGCCAGTCTACGCCGAGTACAT
AACTACTAATGAAACCGATACAGAAACTATATAAAAGCGAAACTTAGTAGAAATTTTGAA
AAGTAAAACAGCAACAGGAAGTTGAAGTTCTTGTGTTATGTCTCTTCAATAGCCTTCCTC
TTGCTCGTACTCAGCCTCCTCATCTTCATACTCTCCTTCTTCATCAGCCGTGGCATCCTG
GTACTGCTGGTACTCCGAGACAAGATCGTTCATGTTGCTCTCAGCTTCAGTAAACTCCAT
CTCATCCATGCCTTCCCCTGTGTACCAATGCAAGAAAGCTTTCCTCCTGAACATGGCAGT
GAACTGCTCACTGACTCTCCTGAACATCTCTTGGATCGAAGTGGAGTTGCCAATGAACGT
GGAAGCCATCTTCAAACCGGTCGGTGGAATGTCACAGACGGTTGACTTGACATTGTTGGG
GATCCACTCGACGAAATAGGAGGAGTTCTTGTTCTGAACGTTCAGCATCTGCTCATCAAC
TTCCTTGGTGCTCATCTTGCCGCGGAACATAGCTGAGGCAGTGAGGTAGCGACCGTGTCT
CGGGTCAGCAGCGCACATCATGTTCTCTGCATCCCACATTTGCTGA


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ82JQ U 1
AF RR2DQ82TF C 1
AF RR2FY36JQ U 1
BS 1 469 RR2DQ82JQ
BS 470 646 RR2FY36JQ

RD RR2DQ82JQ 470 0 0
AAGCAAAATAGTTGTTTAATAAATCTTGATAATTTCTTAGCCAGTCTACGCCGAGTACAT
AACTACTAATGAAACCGATACAGAAACTATATAAAAGCGAAACTTAGTAGAAATTTTGAA
AAGTAAAACAGCAACAGGAAGTTGAAGTTCTTGTGTTATGTCTCTTCAATAGCCTTCCTC
TTGCTCGTACTCAGCCTCCTCATCTTCATACTCTCCTTCTTCATCAGCCGTGGCATCCTG
GTACTGCTGGTACTCCGAGACAAGATCGTTCATGTTGCTCTCAGCTTCAGTAAACTCCAT
CTCATCCATGCCTTCCCCTGTGTACCAATGCAAGAAAGCTTTCCTCCTGAACATGGCAGT
GAACTGCTCACTGACTCTCCTGAACATCTCTTGGATCGAAGTGGAGTTGCCAATGAACGT
GGAAGCCATCTTCAAACCGGTCGGTGGAATGTCACAGACGGTTGACTTG
C

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR2DQ82TF 470 0 0
AA
GCAAAATAGTTGTTTAATAAATCTTGATAATTTCTTAGCCAGTCTACGCCGAGTACATAA
CTACTAATGAAACCGATACAGAAACTATATAAAAGCGAAACTTAGTAGAAATTTTGAAAA
GTAAAACAGCAACAGGAAGTTGAAGTTCTTGTGTTATGTCTCTTCAATAGCCTTCCTCTT
GCTCGTACTCAGCCTCCTCATCTTCATACTCTCCTTCTTCATCAGCCGTGGCATCCTGGT
ACTGCTGGTACTCCGAGACAAGATCGTTCATGTTGCTCTCAGCTTCAGTAAACTCCATCT
CATCCATGCCTTCCCCTGTGTACCAATGCAAGAAAGCTTTCCTCCTGAACATGGCAGTGA
ACTGCTCACTGACTCTCCTGAACATCTCTTGGATCGAAGTGGAGTTGCCAATGAACGTGG
AAGCCATCTTCAAACCGGTCGGTGGAATGTCACAGACGGTTGACTTG
C

QA 3 469 3 469
DS 

RD RR2FY36JQ 646 0 0
AG
GCAAAATAGTTGTTTAATAAATCTTGATAATTTCTTAGCCAGTCTACGCCGAGTACATAA
CTACTAATGAAACCGATACAGAAACTGTATAAAAGCGAAACTTAGTAGAAATTTTGAAAA
GTAAAACAGCAACAGGAAGTTGAAGTTCTTGTGTTATGTCTCTTCAATAGCCTTCCTCTT
GCTCGTACTCAGCCTCCTCATCTTCATACTCTCCTTCTTCATCAGCCGTGGCATCCTGGT
ACTGCTGGTACTCCGAGACAAGACCGTTCATGTTGCTCTCAGCTTCAGTAAACTCCATCT
CATCCATGCCTTCCCCTGTGTACCAATGCAAGAAAGCTTTCCTCCTGAACATGGCAGTGA
ACTGCTCACTGACTCTCCTGAACATCTCTTGGATCGAAGTGGAGTTGCCAATGAACGTGG
AAGCCATCTTCAAACCGGTCGGTGGAATGTCACAGACGGTTGACTTGACATTGTTGGGGA
TCCACTCGACGAAATAGGAGGAGTTCTTGTTCTGAACGTTCAGCATCTGCTCATCAACTT
CCTTGGTGCTCATCTTGCCGCGGAACATAGCTGAGGCAGTGAGGTAGCGACCGTGTCTCG
GGTCAGCAGCGCACATCATGTTCTCTGCATCCCACATTTGCTGA

QA 3 646 3 646
DS 



AS 1 4

CO CL2381Contig1 659 4 2 U
GGAGAAACAAATAAACTTACATATTGATCAAAGAGATTGTGTGTCTGTGATGGAGATAAC
GCCGAAGAGGTATTGGAGAAGGTGGAGAGGATACGAGAAGCTTGATGGGTCATCAACGGT
GGAAAGAAGGAATGGAAAACGGGTCAAAATGAATCCGACCCGCAAGAAACGCTTATGGAG
GATCAAGATAATGCCGAAACTGAGGATCCTCAGAAGAGCGTCCCCTAAGAAGCTTCTCAT
TTGGTTACGCGATTCTTATGTTAATATGATGATGAGGTTGGCGAACTCACGGGTCGTAGG
AGCTTCTGGATACGGTGGATCCGGTTTTGGATCGGGTCGGATGAAAGAGTATGATGAGAA
AGTGCTCGTGGAGATTTACAAGTCCATATTGATGGCGCAGGCGCAGGGGAATCTCGTGCA
ACGCGACACGGCTAGCAAGCTTCCTTCTGAACCAGTGGTTGTATCTGTCTCTCCTGTTGT
TCAGTAATTTTTAAAATCACAACAATTCTCCTTTTTCCTTATAATAAAAGATAATTATAA
TTCTTGACTTGTTTGATATATACATTTCGAGATTGCCGATATGAAAGTTTGTGATCTTGG
TCTGTATTGGAGATACTTAAAACTACAAGCAAAAGAAAATAAAAGAATTTAACATGTTC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F050JQ C 1
AF RR2F050TF U 1
AF RR2B915JQ C 1
AF RR2B915TF U 1
BS 1 542 RR2F050TF
BS 543 659 RR2B915TF

RD RR2F050JQ 544 0 0
GGAGAAACAAATAAACTTACATATTGATCAAAGAGATTGTGTGTCTGTGATGGAGATAAC
GCCGAAGAGGTATTGGAGAAGGTGGAGAGGATACGAGAAGCTTGATGGGTCATCAACGGT
GGAAAGAAGGAATGGAAAACGGGTCAAAATGAATCCGACCCGCAAGAAACGCTTATGGAG
GATCAAGATAATGCCGAAACTGAGGATCCTCAGAAGAGCGTCCCCTAAGAAGCTTCTCAT
TTGGTTACGCGATTCTTATGTTAATATGATGATGAGGTTGGCGAACTCACGGGTCGTAGG
AGCTTCTGGATACGGTGGATCCGGTTTTGGATCGGGTCGGATGAAAGAGTATGATGAGAA
AGTGCTCGTGGAGATTTACAAGTCCATATTGATGGCGCAGGCGCAGGGGAATCTCGTGCA
ACGCGACACGGCTAGCAAGCTTCCTTCTGAACCAGTGGTTGTATCTGTCTCTCCTGTTGT
TCAGTAATTTTTAAAATCACAACAATTCTCCTTTTTCCTTATAATAAAAGATAATTATAA
TT
AG

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2F050TF 544 0 0
GGAGAAACAAATAAACTTACATATTGATCAAAGAGATTGTGTGTCTGTGATGGAGATAAC
GCCGAAGAGGTATTGGAGAAGGTGGAGAGGATACGAGAAGCTTGATGGGTCATCAACGGT
GGAAAGAAGGAATGGAAAACGGGTCAAAATGAATCCGACCCGCAAGAAACGCTTATGGAG
GATCAAGATAATGCCGAAACTGAGGATCCTCAGAAGAGCGTCCCCTAAGAAGCTTCTCAT
TTGGTTACGCGATTCTTATGTTAATATGATGATGAGGTTGGCGAACTCACGGGTCGTAGG
AGCTTCTGGATACGGTGGATCCGGTTTTGGATCGGGTCGGATGAAAGAGTATGATGAGAA
AGTGCTCGTGGAGATTTACAAGTCCATATTGATGGCGCAGGCGCAGGGGAATCTCGTGCA
ACGCGACACGGCTAGCAAGCTTCCTTCTGAACCAGTGGTTGTATCTGTCTCTCCTGTTGT
TCAGTAATTTTTAAAATCACAACAATTCTCCTTTTTCCTTATAATAAAAGATAATTATAA
TT
AG

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2B915JQ 659 0 0
GGAGAAACAAATAAACTTACATATTGATCAAAGAGATTGTGTGTCTGTGATGGAGATAAC
GCCGAAGAGGTATTGGAGAAGGTGGAGAGGATACGAGAAGCTTGATGGGTCATCAACGGT
GGAAAGAAGGAATGGAAAACGGGTCAAAATGAATCCGACCCGCGAGAAACGCTTATGGAG
GATCAAGATAATGCCGAAACTGAGGATCCTCAGAAGAGCGTCCCCTAAGAAGCTTCTCAT
TTGGTTACGCGATTCTTATGTTAATATGATGATGAGGTTGGCGAACTCACGGGTCGTAGG
AGCTTCTGGATACGGTGGATCCGGTTTTGGATCGGGTCGGATGAAAGAGTATGATGAGAA
AGTGCTCGTGGAGATTTACAAGTCCATATTGATGGCGCAGGCGCAGGGGAATCTCGTGCA
ACGCGACACGGCTAGCGATCTTCCTTCTGAACCAGTGGTTGTATCTGTCTCTCCTGTTGT
TCAGTAATTTTTAAAATCACAACAATTCTCCTTTTTCCTTATAATAAAAGATAATTATAA
TTCTTGACTTGTTTGATATATACATTTCGAGATTGCCGATATGAAAGTTTGTGATCTTGG
TCTGTATTGGAGATACTTAAAACTACAAGCAAAAGAAAATAAAAGAATTTAACATGTTC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2B915TF 659 0 0
GGAGAAACAAATAAACTTACATATTGATCAAAGAGATTGTGTGTCTGTGATGGAGATAAC
GCCGAAGAGGTATTGGAGAAGGTGGAGAGGATACGAGAAGCTTGATGGGTCATCAACGGT
GGAAAGAAGGAATGGAAAACGGGTCAAAATGAATCCGACCCGCGAGAAACGCTTATGGAG
GATCAAGATAATGCCGAAACTGAGGATCCTCAGAAGAGCGTCCCCTAAGAAGCTTCTCAT
TTGGTTACGCGATTCTTATGTTAATATGATGATGAGGTTGGCGAACTCACGGGTCGTAGG
AGCTTCTGGATACGGTGGATCCGGTTTTGGATCGGGTCGGATGAAAGAGTATGATGAGAA
AGTGCTCGTGGAGATTTACAAGTCCATATTGATGGCGCAGGCGCAGGGGAATCTCGTGCA
ACGCGACACGGCTAGCGATCTTCCTTCTGAACCAGTGGTTGTATCTGTCTCTCCTGTTGT
TCAGTAATTTTTAAAATCACAACAATTCTCCTTTTTCCTTATAATAAAAGATAATTATAA
TTCTTGACTTGTTTGATATATACATTTCGAGATTGCCGATATGAAAGTTTGTGATCTTGG
TCTGTATTGGAGATACTTAAAACTACAAGCAAAAGAAAATAAAAGAATTTAACATGTTC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 3

CO CL2382Contig1 1123 3 10 U
GGATCTCCACTCTCAGAAACGCCGTCGTTTCAGCTATGGCGTTGAGCTCAGCTGCTACTC
TTAAACTAACCTCCTTGTCCTTCTCCGCGAAGAAGAAGACGAGGAATCCGTCTCTCTCCT
TCACCATCAACTGCTCATCATCATCATCATTCGACGAACCACCTAAACCTTCTCTCACCT
CTTCTACTCCACCCATTCGCGTCTCCTCCTCGAGCTCCGCCCCGAAAGCTCGATTCGTCG
CTCGTCAGAAACAGTCCGTCTCCGTTCGCCAGCTCCAACGACCTCTAATTGAGTATATGA
GCCTACCTGCAAGTCAGTACTCAGTGCTAGACGCGGAGAGGATTGAGAGAGTTGATGATA
ACACGTTCAGATGCTATGTTTACACCTTCAAGTTCTTCAACTTCGAAGTCTGCCCTGTTC
TCCTTGTCAGGGTCGAAGAACAGACTAATGGCTGCTGCATCAAGCTCTTATCCTGCAAGC
TTGAGGGATCTCCCGTTGTGGTTGCTCAAAATGATAAATTTGATGCTTCTATGGTGAACC
GGGTATCGTGTGATAGCAGCACTCAGGAGGGGTCATCAGAGCAACAGATTACTTCTGATG
CAGTCATTGAGGTCAATATCGAGATTCCTTTTGCATTTAGAGTCTTCCCAGTCGGAGCAA
TTGAAGCGACGGGGACACAAGTTCTTGACCAGATTCTTAGACTCATGCTACCACGATTCT
TGTCTCAGCTCTCGAAAGACTATCAAGCATGGGCTTCTGGAGACACTTCAAGGCAACCTC
TTGGGACCGGCGAGATCTGATAGTAAAGCCAAAAAAAAATCTACCTTACCTGGTTCAGAG
AACCTATGCATCCTGGAGACTAGAGTTTTAGCAAATTCTCGATCATTTTAAAATGTTTTC
TTTGGGTTGTATAACGACTAGTGAATTTGTATTCTCTGGAATAACTCTTTAAACCTTCTC
AGGAGAAATGCATGCTTGTTTGTTTTGTTTGTTCCACTGTGGGTGTCGGTGTTTCATGTT
AATCCAACCAGGAGTTTCTTACCCGGGTCTGGATTTTGTACCAAAAACCTGTTTGTTCGA
ATGTTGGTAAGGCCGGTATATTGGATGGACCAGTTCAGATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB67TF U 6
AF RR2CL24TF U 1
AF RR2CL24JQ C 390
BS 1 217 RR2CL24TF
BS 218 219 RR2CB67TF
BS 220 302 RR2CL24TF
BS 303 303 RR2CB67TF
BS 304 331 RR2CL24TF
BS 332 332 RR2CB67TF
BS 333 565 RR2CL24TF
BS 566 566 RR2CB67TF
BS 567 661 RR2CL24TF
BS 662 1123 RR2CL24JQ

RD RR2CB67TF 623 0 0
TCATCACACAA
AAACGCTGTCGTTTCAGCTATGGCGTTGAGCTCAGCTGCTACTCTTAAACTAACCTCCTT
GTCCTTCTCCGCGAAGAAGAAGACGAGGAATCCGTCTCTGTCCTTCACCATCAACTGCTC
ATCATCATCATCATTCGACGAACCACCTAAACCTTCTCTCACCTCTTCTACTCCACCGAT
TCGCGTCTCCTCCTCGAGTTCCGCCCCGAAAGCTCGATTCGTCGCTCGTCAGAAACAGTC
CGTCTCCGTTCGCCAGCTCCAACGACCTCTAATTGAGTATATGAGCCTACCTGCAAGTCA
GTACTCGGTGCTAGACGCGGAGAGGATTGAGAGAGTTGATGATAACACGTTCAGATGCTA
TGTTTACACCTTCAAGTTCTTCAACTTCGAAGTCTGCCCTGTTCTCCTCGTCAGGGTCGA
AGAACAGACTAACGGCTGCTGCATCAAGCTCTTATCCTGCAAGCTTGAGGGATCTCCTGT
TGTGGTTGCTCAAAATGATAAATTTGATGCTTCTATGGTGAACCGGGTATCGTGTGATAG
CAGCACTCAGGAGGGATCATCAGAGCAACAGATTACTTCAGATGCAGTCATTGAGGTCAA
TATCGAGAT
CCT

QA 12 620 12 620
DS 

RD RR2CL24TF 665 0 0
GGATCTCCACTCTCAGAAACGCCGTCGTTTCAGCTATGGCGTTGAGCTCAGCTGCTACTC
TTAAACTAACCTCCTTGTCCTTCTCCGCGAAGAAGAAGACGAGGAATCCGTCTCTCTCCT
TCACCATCAACTGCTCATCATCATCATCATTCGACGAACCACCTAAACCTTCTCTCACCT
CTTCTACTCCACCCATTCGCGTCTCCTCCTCGAGCTCTTCCCCGAAAGCTCGATTCGTCG
CTCGTCAGAAACAGTCCGTCTCCGTTCGCCAGCTCCAACGACCTCTAATTGAGTATATGA
GCTTACCTGCAAGTCAGTACTCAGTGCTAGATGCGGAGAGGATTGAGAGAGTTGATGATA
ACACGTTCAGATGCTATGTTTACACCTTCAAGTTCTTCAACTTCGAAGTCTGCCCTGTTC
TCCTTGTCAGGGTCGAAGAACAGACTAATGGCTGCTGCATCAAGCTCTTATCCTGCAAGC
TTGAGGGATCTCCCGTTGTGGTTGCTCAAAATGATAAATTTGATGCTTCTATGGTGAACC
GGGTATCGTGTGATAGCAGCACTCACGAGGGGTCATCAGAGCAACAGATTACTTCTGATG
CAGTCATTGAGGTCAATATCGAGATTCCTTTTGCATTTAGAGTCTTCCCAGTCGGAGCAA
T
TGAA

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2CL24JQ 734 0 0
AAGTTCTTCAACTTCGAAGTCTGCCCTGTTCTCCTTGTCAGGGTCGAAGAACAGACTAAT
GGCTGCTGCATCAAGCTCTTATCCTGCAAGCTTGAGGGATCTCCCGTTGTGGTTGCTCAA
AATGATAAATTTGATGCTTCTATGGTGAACCGGGTATCGTGTGATAGCAGCACTCAGGAG
GGGTCATCAGAGCAACAGATTACTTCTGATGCAGTCATTGAGGTCAATATCGAGATTCCT
TTTGCATTTAGAGTCTTCCCAGTCGGAGCAATTGAAGCGACGGGGACACAAGTTCTTGAC
CAGATTCTTAGACTCATGCTACCACGATTCTTGTCTCAGCTCTCGAAAGACTATCAAGCA
TGGGCTTCTGGAGACACTTCAAGGCAACCTCTTGGGACCGGCGAGATCTGATAGTAAAGC
CAAAAAAAAATCTACCTTACCTGGTTCAGAGAACCTATGCATCCTGGAGACTAGAGTTTT
AGCAAATTCTCGATCATTTTAAAATGTTTTCTTTGGGTTGTATAACGACTAGTGAATTTG
TATTCTCTGGAATAACTCTTTAAACCTTCTCAGGAGAAATGCATGCTTGTTTGTTTTGTT
TGTTCCACTGTGGGTGTCGGTGTTTCATGTTAATCCAACCAGGAGTTTCTTACCCGGGTC
TGGATTTTGTACCAAAAACCTGTTTGTTCGAATGTTGGTAAGGCCGGTATATTGGATGGA
CCAGTTCAGATTCT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 4

CO CL2383Contig1 692 4 13 U
GGAGTTGATTCCCCAAAGATTCAAAATTTGAACTTGAACTGCAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AAAGTGGTTATGGCGACGACGGCGAAGAATATGAAGGGTTTCTACAAGCAGACGAAGAGC
AACATCACCGGAGGTATCTCCAAGTCCAAGCCTTCTTCCCGGAGAGTGTCTCCCAAACAC
GCGGCCACCCAGGGCTCCGATGCTACGCAGCCGGCGGCGTTGATTTCGCACGGCTCCCTC
GATCTCAAGGGTGATTACGACGAGAAGGAGGAGATGCTCAGGCAATTTGACATGAACATG
GCTTACGGTCCGTGCGTGGGTATGACGAGACTTGATCGATGGGAACGTGCATTGCGCTTA
GGGATGAATCCTCCCTGTGAAATCGAGAAGCTTTTGAAGACTGACAAGGTTCAGCAGGAT
TGTCTTTGGCAAGGTCGCGTCTAAAAGTTTCGATCTTTTTTCAGATATTCCCGCCCCTTG
TATGATCCATTGTCACTTGCTGATCTTTTGTGCATGTTTGGTTCAGCCACTGGCTGGATC
ACACACACTGTTGTTTTAATCTTAAAAAACCTTGGTAATGGAATGCATTTTGTTGGCTTT
AGTCTTTGACATTGTGTTGTCTGTCGGCTTAAGGTCTTGTGTTTGTATCCCAACAATGTT
TTCCTCCCTGTTTATTCAATATCATCTTGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H540JQB C 1
AF RR2H540TF U 17
AF RR2E667TF U 6
AF RR2E667JQ C 6
BS 1 11 RR2H540JQB
BS 12 16 RR2E667TF
BS 17 54 RR2H540TF
BS 55 58 RR2E667TF
BS 59 213 RR2H540TF
BS 214 214 RR2E667TF
BS 215 495 RR2H540TF
BS 496 496 RR2E667TF
BS 497 545 RR2H540TF
BS 546 547 RR2E667TF
BS 548 576 RR2H540TF
BS 577 629 RR2E667TF
BS 630 692 RR2E667JQ

RD RR2H540JQB 576 0 0
GGAGTTGATTCCCCAAAGATTCAAAATTTGAACTTGAACTGCAGAGAGAGAGAG****AG
AAAGTGGTTATGGCGACGACGGCGAAGAATATGAAGGGTTTCTACAAGCAGACGAAGAGC
AACATCACCGGAGGTATCTCCAAGTCCAAGCCTTCTTCCCGGAGAGTGTTTCCCAAACAC
GCGGCCACCCAGGGCTCCGATGCTACGCAGCCGTCGGCGTTGATTTCGCACGGCTCCCTC
GATCTCAAGGGTGATTACGACGAGAAGGAGGAGATGCTCAGGCAATTTGACATGAACATG
GCTTACGGTCCGTGCGTGGGTATGACGAGACTTGATCGATGGGAACGTGCATTGCGCTTA
GGGATGAATCCTCCCTGTGAAATCGAGAAGCTTTTGAAGACTGACAAGGTTCAGCAGGAT
TGTCTTTGGCAAGGTCGCGTCTAAAAGTTTCGATCTTTTTTCAGATATTCCCGCCCCTTG
TATGATCCATTGTCATTTGCTGATCTTTTGTGCATGTTTGGTTCAGCCACTGGCTGGATC
ACACA**CTGTTGTTTTAATCTTAAAAAACCTTGGT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2H540TF 560 0 0
AGATTCAAAATTTGAACTTGAACTGCAGAGAGAGAGAG****AGAAAGTGGTTATGGCGA
CGACGGCGAAGAATATGAAGGGTTTCTACAAGCAGACGAAGAGCAACATCACCGGAGGTA
TCTCCAAGTCCAAGCCTTCTTCCCGGAGAGTGTCTCCCAAACACGCGGCCACCCAGGGCT
CCGATGCTACGCAGCCGTCGGCGTTGATTTCGCACGGCTCCCTCGATCTCAAGGGTGATT
ACGACGAGAAGGAGGAGATGCTCAGGCAATTTGACATGAACATGGCTTACGGTCCGTGCG
TGGGTATGACGAGACTTGATCGATGGGAACGTGCATTGCGCTTAGGGATGAATCCTCCCT
GTGAAATCGAGAAGCTTTTGAAGACTGACAAGGTTCAGCAGGATTGTCTTTGGCAAGGTC
GCGTCTAAAAGTTTCGATCTTTTTTCAGATATTCCCGCCCCTTGTATGATCCATTGTCAT
TTGCTGATCTTTTGTGCATGTTTGGTTCAGCCACTGGCTGGATCACACA**CTGTTGTTT
TAATCTTAAAAAACCTTGGT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2E667TF 624 0 0
GGGATT
CCCAAAGATTCAAAATTTGAACTTGAACTGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGTGGTTAT
GGCGACGACGGCGAAGAATATGAAGGGTTTCTACAAGCAGACGAAGAGCAACATCACCGG
AGGTATCTCCAAGTCCAAGCCTTCTTCCCGGAGAGTGTCTCCCAAACACGCGGCCACCCA
GGGCTCCGATGCTACGCAGCCGGCGGCGTTGATTTCGCACGGCTCCCTCGATCTCAAGGG
TGATTACGACGAGAAGGAGGAGATGCTCAGGCAATTTGACATGAACATGGCTTACGGTCC
GTGCGTGGGTATGACGAGACTTGATCGATGGGAACGTGCATTGCGCTTAGGGATGAATCC
TCCCTGTGAAATCGAGAAGCTTTTGAAGACTGACAAGGTTCAGCAGGATTGTCTTTGGCA
AGGTCGCGTCTAAAAGTTTCGATCTTTTTTCAGATATTCCCGCCCCTTGTATGATCCATT
GTCACTTGCTGATCTTTTGTGCATGTTTGGTTCAGCCACTGGCTGGATCACACACACTGT
TGTTTTAATCTTAAAAAACCTTGGTAATGGAATGCATTTTGTTGGCTTTAGTCTTTGACA
TTGTGTTGTCTGTCGGCT

QA 7 624 7 624
DS 

RD RR2E667JQ 687 0 0
GGGATT
CCCAAAGATTCAAAATTTGAACTTGAACTGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGTGGTTAT
GGCGACGACGGCGAAGAATATGAAGGGTTTCTACAAGCAGACGAAGAGCAACATCACCGG
AGGTATCTCCAAGTCCAAGCCTTCTTCCCGGAGAGTGTCTCCCAAACACGCGGCCACCCA
GGGCTCCGATGCTACGCAGCCGGCGGCGTTGATTTCGCACGGCTCCCTCGATCTCAAGGG
TGATTACGACGAGAAGGAGGAGATGCTCAGGCAATTTGACATGAACATGGCTTACGGTCC
GTGCGTGGGTATGACGAGACTTGATCGATGGGAACGTGCATTGCGCTTAGGGATGAATCC
TCCCTGTGAAATCGAGAAGCTTTTGAAGACTGACAAGGTTCAGCAGGATTGTCTTTGGCA
AGGTCGCGTCTAAAAGTTTCGATCTTTTTTCAGATATTCCCGCCCCTTGTATGATCCATT
GTCACTTGCTGATCTTTTGTGCATGTTTGGTTCAGCCACTGGCTGGATCACACACACTGT
TGTTTTAATCTTAAAAAACCTTGGTAATGGAATGCATTTTGTTGGCTTTAGTCTTTGACA
TTGTGTTGTCTGTCGGCTTAAGGTCTTGTGTTTGTATCCCAACAATGTTTTCCTCCCTGT
TTATTCAATATCATCTTGAGG

QA 7 687 7 687
DS 



AS 1 4

CO CL2384Contig1 949 4 5 U
GATTACTCAAGCATCCACAATAAATCAGGTTCCTTTGGATGCTTCCTCAGTGGACTTGGT
TCTAGCCATTTCCAGAACATCTGATTTTCCAAGTGACAAAATCTATAGCGAGTTCTCAAG
AGTTCTGAAGCCTGGCGGTTCTGCTTTTGTCTGCACGAACTCGGAGGGTGAAACTATAGA
ATTGCAACAGACCCTTCAAAGGAGAGTGACCTTGGCTGGTTTTCTGGAGCCACAGTCTCT
TGATTTGAAATCAATTAAGTTGCCTAACTTCAGCTTATCCGTTGGGATTAAGGCAAAGAA
ACCTACTTGGAAGATTGGTTCATCATTCGCTCTCAAGAAGCCTGCAAAAGCTCTCCCGAA
GATTAATCTAGGCGATGCCTTGGATCTTATTGATGATCTTATTGATGAGGACTCTCTCTT
AACAGAGGAGGACCTGAAGAAGCCACAGCTTCCTGTTGCTAGTGGTTGTGAGACCACTAA
GAAAGCTTGCAAGAACTGCGTCTGTGGTAGAGCTGAGATAGAGGAGAAAGCTGTGAAGTT
GGGACTCACCGAGGATCAAATCGAGAATCCACAGTCAGCATGTGGCAGCTGTGGGCTCGG
TGATGCCTTCCGCTGTGGTACATGCCCTTACAAGGGTCTCCCACCCTTCAAACTAGGCGA
GAAGGTAACCCTATCTCAAAACTTCCTTGAAGCTGACATATAAGCCTGTGAAAAGGTCTT
CATGCGTGTGCTTGTTTCTCACCGAAGCCAAAAACCTTTTGTTAAACACAGAGTAGTTTG
ATCACTTTGTGTCCTTTTCGTATATTTTGTCTGTTGCTACTTTCTTTATTTCTCGGCTTT
TGAATGGCTTTAATAGACAATCGTTGGGTGTTAGCTCACAATACACATTGGAACCTTTAT
ATCAATGAAGAACAGCTTTTCACTTTGTTAAATAAGATTAGCTTGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY26TFB U 52
AF RR2FR07TF U 1
AF RR2FR07JQ C 152
AF RR2AY26JQ C 418
BS 1 663 RR2FR07TF
BS 664 664 RR2FR07JQ
BS 665 711 RR2FR07TF
BS 712 928 RR2FR07JQ
BS 929 949 RR2AY26JQ

RD RR2AY26TFB 474 0 0
GGACTTGGTTCTAGCCATTTCCAGAACATCTGATTTTCCAAGTGACAAAATCTATAGCGA
GTTCTCAAGAGTTCTGAAGCCTGGCGGTTCTGCTTTTGTCTGCACGAACTCGGAGGGTGA
AACTATAGAATTGCAACAGACCCTTCAAAGGAGAGTGACCTTGGCTGGTTTTCTGGAGCC
ACAGTCTCTTGATTTGAAATCAATTAAGTTGCCTAACTTCAGCTTATCCGTTGGGATTAA
GGCAAAGAAACCTACTTGGAAGATTGGTTCATCATTTGCTCTCAAGAAGCCTGCAAAAGC
TCTCCCGAAGATTAATCTAGGCGATGCCTTGGATCTTATTGATGATCTTATTGATGAGGA
CTCTCTCTTAACAGAGGAG*ACCTGAAGAAGCCACAGCTTCCTGTTGCTAGTGGTTGTGA
GACCACTAAGAAAGCTTGCAAGAACTGCGTCTGTGGTAGAGCTGAGATAGAGGA

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2FR07TF 711 0 0
GATTACTCAAGCATCCACAATAAATCAGGTTCCTTTGGATGCTTCCTCAGTGGACTTGGT
TCTAGCCATTTCCAGAACATCTGATTTTCCAAGTGACAAAATCTATAGCGAGTTCTCAAG
AGTTCTGAAGCCTGGCGGTTCTGCTTTTGTCTGCACGAACTCGGAGGGTGAAACTATAGA
ATTGCAACAGACCCTTCAAAGGAGAGTGACCTTGGCTGGTTTTCTGGAGCCACAGTCTCT
TGATTTGAAATCAATTAAGTTGCCTAACTTCAGCTTATCCGTTGGGATTAAGGCAAAGAA
ACCTACTTGGAAGATTGGTTCATCATTCGCTCTCAAGAAGCCTGCAAAAGCTCTCCCGAA
GATTAATCTAGGCGATGCCTTGGATCTTATTGATGATCTTATTGATGAGGACTCTCTCTT
AACAGAGGAGGACCTGAAGAAGCCACAGCTTCCTGTTGCTAGTGGTTGTGAGACCACTAA
GAAAGCTTGCAAGAACTGCGTCTGTGGTAGAGCTGAGATAGAGGAGAAAGCTGTGAAGTT
GGGACTCACCGAGGATCAAATCGAGAATCCACAGTCAGCATGTGGCAGCTGTGGGCTCGG
TGATGCCTTCCGCTGTGGTACATGCCCTTACAAGGGTCTCCCACCCTTCAAACTAGGCGA
GAAAGTAACCCTATCTCAAAACTTCCTTGAAGCTGACATATAAGCCTGTGA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2FR07JQ 777 0 0
TGCACGAACTCGGAGGGTGAAACTATAGAATTGCAACAGACCCTTCAAAGGAGAGTGACC
TTGGCTGGTTTTCTGGAGCCACAGTCTCTTGATTTGAAATCAATTAAGTTGCCTAACTTC
AGCTTATCCGTTGGGATTAAGGCAAAGAAACCTACTTGGAAGATTGGTTCATCATTCGCT
CTCAAGAAGCCTGCAAAAGCTCTCCCGAAGATTAATTTAGGCGATGCCTTGGATCTTATT
GATGATCTTATTGATGAGGACTCTCTCTTAACAGAGGAGGACCTGAAGAAGCCACAGCTT
CCTGTTGCTAGTGGTTGTGAGACCACTAAGAAAGCTTGCAAGAACTGCGTCTGTGGTAGA
GCTGAGATAGAGGAGAAAGCTGTGAAGTTGGGACTCACCGAGGATCAAATCGAGAATCCA
CAGTCAGCATGTGGCAGCTGTGGGCTCGGTGATGCCTTCCGCTGTGGTACATGCCCTTAC
AAGGGTCTCCCACCCTTCAAACTAGGCGAGAAGGTAACCCTATCTCAAAACTTCCTTGAA
GCTGACATATAAGCCTGTGAAAAGGTCTTCATGCGTGTGCTTGTTTCTCACCGAAGCCAA
AAACCTTTTGTTAAACACAGAGTAGTTTGATCACTTTGTGTCCTTTTCGTATATTTTGTC
TGTTGCTACTTTCTTTATTTCTCGGCTTTTGAATGGCTTTAATAGACAATCGTTGGGTGT
TAGCTCACAATACACATTGGAACCTTTATATCAATGAAGAACAGCTTTTCACTTTGT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2AY26JQ 532 0 0
CTTACCAGAGGAG
GACCTGAAGAAGCCACAGCTTCCTGTTGCTAGTGGTTGTGAGACCACTAAGAAAGCTTGC
AAGAACTGCGTCTGTGGTAGAGCTGAGATAGAGGAGAAAGCTGTGAAGTTGGGACTCACC
GAGGATCAAATCGAGAATCCACAGTCAGCATGTGGCAGCTGTGGGCTCGGTGATGCCTTC
CGCTGTGGTACATGCCCTTACAAGGGTCTCCCACCCTTCAAACTAGGCGAGAAGGTAACC
CTATCTCAAAACTTCCTTGAAGCTGACATATAAGCCTGTGAAAAGGTCTTCATGCGTGTG
CTTGTTTCTCACCGAAGCCAAAA*CCTTTTGTTAAACACAGAGTAGTTTGATCACTTTGT
GTCCTTTTCGTATATTTTGTCTGTTGCTACTTTCTTTATTTCTCGGCTTTTGAATGGCTT
TAATAGACAATCGTTGGGTGTTAGCTCACAATACACATTGGAACCTTTATATCAATGAAG
AACAGCTTTTCACTTTGTTAAATAAGATTAGCTTGGACC

QA 14 532 14 532
DS 



AS 1 2

CO CL2385Contig1 1241 2 2 U
GGATAGTCTCGCCTCCCCCAAAAACCCTCCTGCCCTTCCTTACTTTCAAACCTTTCGTCT
CCAGAAATACTCAGAAGATGAGCAACGACAAGGACAACTTCAGCCTCGCCGATCTCGCTG
CTGCTCTTAAAGACGAGGATCGAGCCGGCATCATGAACATTCTCAAGAACAAGATGGCTG
GGGACGTGCTCGAGAATCTGTCTCCTCAAGTGAGAGCGCGTGTCGATGCCTTGAAGGATA
TACAGAGCCAACACGATGAACTTGAGGCTAAGTTCCGCGAGGAGAGAGCTGTTCTTGAAG
CCAAGTATGAACAGTTGTATCAGCCTTTGTATGCCAAGCGTTTTGAAATTGTTAATGGAA
CTACCGAAATCGAGCTTACTCCAGAGGATGCTAAGATGTACCAAGGCCAAGGAGAGGACA
AAACTGCTCAAGAGAAAGGAGTTCCCAGTTTCTGGCTGACTGCTTTGCAAAACAATGATG
TTACTTCCGAGGAGGTCACAGAGCGTGATGAAGAGGCTCTCAAGTATCTTAAAGATATCA
AGTGGTGCAAGACCGAAGAGCCTAAAGGATTCAAGCTCGAGATTCTTAAAAAGAAGCCTA
ATAGAGGTTCTACGAACGCCAAACCAATCACTAAAATGGAAGCTTGTGAAAGCTTCTTCA
ACTTCTTTAATCCTCCAGAAGTCCCGGATGAAGATGAAGATATCGACGAGGACAGAGCTG
AGGAACTTCAGAATCTGATGGAACAAGATTATTACATTGGTTCTACTATCCGAGACAAGA
TTATCCCGCATGCCGTCTCATGGTTTACTGGTGAGGCTGTGGAAGGACAGGAGTTTGATG
ATGATGAAGATGATGATGATGAAGATGAAGATGATGATAGTGACGAGGATGATGAAGAGG
ACGAGGATGATGATGATGATGAGATGGAGGATGATAACAAGACTAAAAAGAAGAAGGGAG
GCAGATCTCAGATTGTTGGTGATGGTCAGCAGGGCGAGAGACCACCAGACTGCAAGCAAC
AGTGATCTCGATGCTCTACTGAACAAAAAGGCATGTGTGAAAATATATCTCGAGTCATTC
CCAGTTCATCTAGAATTGAAAATTGAGAAAAAAAAAAGTTTTAGTTGTTTTTTTTATAGT
GTGAAAGTCTTCTCCTTATTGATGATGTTCTCATTCGAGTTCTGCTCATTTGTATTGTTG
GTGTTTATTTTCGTTGAATTATTTAAGACTTAATACCTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI12TF U 1
AF RR2EI12JQ C 641
BS 1 740 RR2EI12TF
BS 741 1241 RR2EI12JQ

RD RR2EI12TF 740 0 0
GGATAGTCTCGCCTCCCCCAAAAACCCTCCTGCCCTTCCTTACTTTCAAACCTTTCGTCT
CCAGAAATACTCAGAAGATGAGCAACGACAAGGACAACTTCAGCCTCGCCGATCTCGCTG
CTGCTCTTAAAGACGAGGATCGAGCCGGCATCATGAACATTCTCAAGAACAAGATGGCTG
GGGACGTGCTCGAGAATCTGTCTCCTCAAGTGAGAGCGCGTGTCGATGCCTTGAAGGATA
TACAGAGCCAACACGATGAACTTGAGGCTAAGTTCCGCGAGGAGAGAGCTGTTCTTGAAG
CCAAGTATGAACAGTTGTATCAGCCTTTGTATGCCAAGCGTTTTGAAATTGTTAATGGAA
CTACCGAAATCGAGCTTACTCCAGAGGATGCTAAGATGTACCAAGGCCAAGGAGAGGACA
AAACTGCTCAAGAGAAAGGAGTTCCCAGTTTCTGGCTGACTGCTTTGCAAAACAATGATG
TTACTTCCGAGGAGGTCACAGAGCGTGATGAAGAGGCTCTCAAGTATCTTAAAGATATCA
AGTGGTGCAAGACCGAAGAGCCTAAAGGATTCAAGCTCGAGATTCTTAAAAAGAAGCCTA
ATAGAGGTTCTACGAACGCCAAACCAATCACTAAAATGGAAGCTTGTGAAAGCTTCTTCA
ACTTCTTTAATCCTCCAGAAGTCCCGGATGAAGATGAAGATATCGACGAGGACAGAGCTG
AGGAACTTCAGAATCTGATG

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2EI12JQ 601 0 0
AGC
TTGTGAAAGCTTCTTCAACTTCTTTAATCCTCCAGAAGTCCCGGATGAAGATGAAGATAT
CGACGAGGACAGAGCTGAGGAACTTCAGAATCTGATGGAACAAGATTATTACATTGGTTC
TACTATCCGAGACAAGATTATCCCGCATGCCGTCTCATGGTTTACTGGTGAGGCTGTGGA
AGGACAGGAGTTTGATGATGATGAAGATGATGATGATGAAGATGAAGATGATGATAGTGA
CGAGGATGATGAAGAGGACGAGGATGATGATGATGATGAGATGGAGGATGATAACAAGAC
TAAAAAGAAGAAGGGAGGCAGATCTCAGATTGTTGGTGATGGTCAGCAGGGCGAGAGACC
ACCAGACTGCAAGCAACAGTGATCTCGATGCTCTACTGAACAAAAAGGCATGTGTGAAAA
TATATCTCGAGTCATTCCCAGTTCATCTAGAATTGAAAATTGAGAAAAAAAAAAGTTTTA
GTTGTTTTTTTTATAGTGTGAAAGTCTTCTCCTTATTGATGATGTTCTCATTCGAGTTCT
GCTCATTTGTATTGTTGGTGTTTATTTTCGTTGAATTATTTAAGACTTAATACCTTGG

QA 4 601 4 601
DS 



AS 1 4

CO CL2386Contig1 1073 4 27 U
GGGCCACTAACGAGATCTAGCACTAGCACGGACCGACCCCGTAGCGTGTAAGGAGACGAA
AATAAGCAGGAGAGGGAGCTTCACTGAACCCTACAAGAAGGAAGACGAAGGAGAGGATTA
GATTCAGCACAGATCGATCTAAGAAGAAGAAGAAAGATGAACATTTTCAGATTAGCAGGT
GATATGACTCACCTGGCCAGTGTCCTCGTCTTGCTCCTCAAGATCCACACCATCAAATCC
TGCGCTGGTGTGTCATTGAAGACTCAAGAGCTCTACGCCATTGTATTCGCGACGCGTTAT
TTGGATATTTTCACGAGCCTTGTCTCCGTCTACAACACCTTCATGAAGTTGGTCTTCTTA
GGAAGCTCCTTCTCCATTGTTTGGTACATGAGGTATCACAAGGCCGTCCAAAGGACTTAC
GACAGAGAGCAAGATACCTTTCGCCATTGGTTCCTTGTCCTTCCCTGCCTTCTCTTGGCT
CTTCTCATTCACGAAAAGTTCACCTTTCTTGAGGTACTGTGGACGTTTTCGTTGTACTTG
GAGGCTGTTGCTATATTACCTCAGCTTGTCTTGCTTCAAAGGACTAGAAATATCGATAAC
TTGACCGGGCAATACATATTCCTCCTTGGGGGGTACAGGGGATTGTACATCCTAAACTGG
ATCTACCGTTACTTCACTGAGCCTCACTTTGTTCACTGGATAACATGGATCGCGGGGTTT
GTTCAGACATTGCTCTATGCCGACTTCTTCTATTATTATTTCCTAAGCTGGAAAAACAAC
AAAAAGCTCCAGTCGCCAGCTTAATCTCTGGATTTTCGATGCTCGGAAACCCTACCGATG
CAGTTTGGTGCCTGGATACAATATCTGCTGGAAAGTTTACCAGTCTACTCTGTTGTTAGT
TAATGGAGGAGACGAGCATAGATTTTATGTACCAGAGATCTAACTTGTTGTTACACATTT
TTGAACTTTTTCGTGTCTCAGCTTTTGTTAAGTGTTACTAAAATATTTCGACAGTACAAA
TCTTGCAAGTATGACTAGTCTACCGTTTCCTATATACAAAATTATTATGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG75TF U 1
AF RR2BM20TF U 66
AF RR2CG75JQ C 553
AF RR2BM20JQ C 348
BS 1 105 RR2CG75TF
BS 106 106 RR2BM20TF
BS 107 137 RR2CG75TF
BS 138 150 RR2BM20TF
BS 151 272 RR2CG75TF
BS 273 273 RR2BM20TF
BS 274 318 RR2CG75TF
BS 319 319 RR2BM20TF
BS 320 374 RR2CG75TF
BS 375 375 RR2BM20TF
BS 376 377 RR2CG75TF
BS 378 378 RR2BM20TF
BS 379 422 RR2CG75TF
BS 423 423 RR2BM20TF
BS 424 425 RR2CG75TF
BS 426 426 RR2BM20TF
BS 427 458 RR2CG75TF
BS 459 459 RR2BM20TF
BS 460 461 RR2CG75TF
BS 462 462 RR2BM20TF
BS 463 464 RR2CG75TF
BS 465 465 RR2BM20TF
BS 466 506 RR2CG75TF
BS 507 507 RR2BM20TF
BS 508 668 RR2CG75TF
BS 669 773 RR2BM20TF
BS 774 1073 RR2BM20JQ

RD RR2CG75TF 668 0 0
GGGCCACTAACGAGATCTAGCACTAGCACGGACCGACCCCGTAGCGTGTAAGGAGACGAA
AATAAGCAGGAGAGGGAGCTTCACTGAACCCTACAAGAAGGAAGAGGAAGGAGAGGATTA
GATTCAGCACAGATCGA*************AGAAAGATGAACATTTTCAGATTAGCAGGT
GATATGACTCACCTGGCCAGTGTCCTCGTCTTGCTCCTCAAGATCCACACCATCAAATCC
TGCGCTGGTGTGTCATTGAAGACTCAAGAGCTTTACGCCATTGTATTCGCGACGCGTTAT
TTGGATATTTTCACGAGCTTTGTCTCCGTCTACAACACCTTCATGAAGTTGGTCTTCTTA
GGAAGCTCCTTCTCGATCGTTTGGTACATGAGGTATCACAAGGCCGTCCAAAGGACTTAC
GATAGGGAGCAAGATACCTTTCGCCATTGGTTCCTTGTGCTCCCTTGCCTTCTCTTGGCT
CTTCTCATTCACGAAAAGTTCACCTTCCTTGAGGTACTGTGGACGTTTTCGTTGTACTTG
GAGGCTGTTGCTATATTACCTCAGCTTGTCTTGCTTCAAAGGACTAGAAATATCGATAAC
TTGACCGGGCAATACATATTCCTCCTTGGGGGGTACAGGGGATTGTACATCCTAAACTGG
ATCTACCG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2BM20TF 719 0 0
GCAGGAGAGGGAGCTTCACTGAACCCTAGAAGAAGGAAGACGAAGGAGAGGATTAGATTC
AGCACAGATCGATCTAAGAAGAAGAAGAAAGATGAACATTTTCAGATTAGCAGGTGATAT
GACTCACCTGGCCAGTGTCCTCGTCTTGCTCCTCAAGATCCACACCATCAAATCCTGCGC
TGGTGTGTCATTGAAGACTCAAGAGCTCTACGCCATTGTATTTGCGACGCGTTATTTGGA
TATTTTCACGAGCCTTGTCTCCGTCTACAACACCTTCATGAAGTTGGTCTTCTTAGGAAG
CTCCTTCTCCATTGTTTGGTACATGAGGTATCACAAGGCCGTCCAAAGGACTTACGACAG
AGAGCAAGATACCTTTCGCCATTGGTTCCTTGTCCTTCCCTGCCTTCTCTTGGCTCTTCT
CATTCACGAAAAGTTCACCTTTCTTGAGGTACTGTGGACGTTTTCGTTGTACTTGGAGGC
TGTTGCTATATTACCTCAGCTTGTCTTGCTTCAAAGGACTAGAAATATCGATAACTTGAC
CGGGCAATACATATTCCTCCTTGGGGGGTACAGGGGATTGTACATCCTAAACTGGATCTA
CCGTTACTTCACTGAGCCTCACTTTGTTCACTGGATAACATGGATCGCGGGGTTTGTTCA
GACATTGCTCTATGCCGACTTCTTCTATTATTATTTCCTAAGCTGGAA
AAAAACAAAAA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2CG75JQ 268 0 0
ATATTACTTCAGCTTGTCTTGCTTCAAAGGACTAGAAATATCGATAACTTGACCGGGCAA
TACATATTCCTCCTTGGGGGGTACAGGGGATTGTACATCCTAAACTGGATCTACCGTTAC
TTCACTGAGCCTCACTTTGTTCACTGGATAACATGGATCGCGGGGTTTGTTCAGACATTG
CTCTATGCCGACTTCTTCTATTATTATTTCCTAAGCTGGAAGAACAACAAAAAGCTCCAG
TTGCCAGCTTAATTTCTGGATTTTCGAT

QA 1 268 1 268
DS 

RD RR2BM20JQ 726 0 0
GTTGGTCTTCTTAGGAAGCTCCTTCTCCATTGTTTGGTACATGAGGTATCACAAGGCCGT
CCAAAGGACTTACGACAGAGAGCAAGATACCTTTCGCCATTGGTTCCTTGTCCTTCCCTG
CCTTCTCTTGGCTCTTCTCATTCACGAAAAGTTCACCTTTCTTGAGGTACTGTGGACGTT
TTCGTTGTACTTGGAGGCTGTTGCTATATTACCTCAGCTTGTCTTGCTTCAAAGGACTAG
AAATATCGATAACTTGACCGGGCAATACATATTCCTCCTTGGGGGGTACAGGGGATTGTA
CATCCTAAACTGGATCTACCGTTACTTCACTGAGCCTCACTTTGTTCACTGGATAACATG
GATCGCGGGGTTTGTTCAGACATTGCTCTATGCCGACTTCTTCTATTATTATTTCCTAAG
CTGGAAAAACAACAAAAAGCTCCAGTCGCCAGCTTAATCTCTGGATTTTCGATGCTCGGA
AACCCTACCGATGCAGTTTGGTGCCTGGATACAATATCTGCTGGAAAGTTTACCAGTCTA
CTCTGTTGTTAGTTAATGGAGGAGACGAGCATAGATTTTATGTACCAGAGATCTAACTTG
TTGTTACACATTTTTGAACTTTTTCGTGTCTCAGCTTTTGTTAAGTGTTACTAAAATATT
TCGACAGTACAAATCTTGCAAGTATGACTAGTCTACCGTTTCCTATATACAAAATTATTA
TGTTCC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 4

CO CL2387Contig1 538 4 11 U
GGGACAATAAACAGTAAACAAAGCAAAATGAAGTCTGTTTACATCTTCATAGCGTTGTTC
ATCTTCTTCCTCGCCGTTCTTGGTGAGTCGCCGGAGAAGATAGGAGCCGACGAGAAGTTC
AAATGCCTGGAGGAGTACGGGGGAGACGTAGGTCCCGCGTTCTGTAACCCTAAGTTCTTC
CCCACGTTGTGTCGCCAAAACTGCAGGAGTTTCAAAGGTGCTAAAGGCGGTAAATGCGTG
AAGAAACACAAAAGCAAACCTATCAAATGTTTCTGCGACTACTGCAAAGACGATTAGATA
TATATTACAAGCTAGAAATCATACACCGCTTATTATTACTGTTTAAAACGCTAAACGCAA
CCGCCCAACCCCCTATAGCGTTTTATACTTTGATATAAGTTTATGGTTGTATGTGATTCA
TGTAATAATGTCCGAAGACGTATGAGTATTATCCCCCTAATAAAATGCATACATGTATAT
GCTAATTTATGATCAAATGATTCCGAGCTCGTATAGAAAACGAATTTGATTTAATTCG


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AY87TFB U 1
AF RR2DB49TF U 2
AF RR2FV55JQ C 2
AF RR2FV55TF U 2
BS 1 69 RR2AY87TFB
BS 70 70 RR2DB49TF
BS 71 156 RR2AY87TFB
BS 157 157 RR2FV55TF
BS 158 194 RR2AY87TFB
BS 195 195 RR2DB49TF
BS 196 227 RR2AY87TFB
BS 228 228 RR2DB49TF
BS 229 272 RR2AY87TFB
BS 273 494 RR2DB49TF
BS 495 538 RR2FV55TF

RD RR2AY87TFB 273 0 0
GGGACAATAAACAGTAAACAAAGCAAAATGAAGTCTGTTTACATCTTCATAGCGTTGTTC
ATCTTCTTCTTCGCCGTTCTTGGTGAGTCGCCGGAGAAGATAGGAGCCGACGAGAAGTTC
AAATGCCTGGAGGAGTACGGGGGAGACGTAGGTCCCACGTTCTGTAACCCTAAGTTCTTC
CCCACGTTGTGTCGTCAAAACTGCAGGAGTTTCAAAGGTGCTAAAGGGGGTAAATGCGTG
AAGAAACACAAAAGCAAACCTATCAAATGTTT
C

QA 1 272 1 272
DS 

RD RR2DB49TF 493 0 0
GGACAATAAACAGTAAACAAAGCAAAATGAAGTCTGTTTACATCTTCATAGCGTTGTTCA
TCTTCTTCCTCGCCGTTCTTGGTGAGTCGCCGGAGAAGATAGGAGCCGACGAGAAGTTCA
AATGCCTGGAGGAGTACGGGGGAGACGTAGGTCCCACGTTCTGTAACCCTAAGTTCTTCC
CCACGTTGTGTCGCCAAAACTGCAGGAGTTTCAAAGGTGCTAAAGGCGGTAAATGCGTGA
AGAAACACAAAAGCAAACCTATCAAATGTTTCTGCGACTACTGCAAAGACGATTAGATAT
ATATTACAAGCTAGAAATCATACACCGCTTATTATTACTGTTTAAAACGCTAAACGCAAC
CGCCCAACCCCCTATAGCGTTTTATACTTTGATATAAGTTTATGGTTGTATGTGATTCAT
GTAATAATGTCCGAAGACGTATGAGTATTATCCCCCTAATAAAATGCATACATGTATATG
CTAATTTATGATC

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR2FV55JQ 537 0 0
GGACAATAAACAGTAAACAAAGCAAAATGAAGTCTGTTTACATCTTCATAGCGTTGTTCA
TCTTCTTCCTCGCCGTTCTTGGTGAGTCGCCGGAGAAGATAGGAGCCGACGAGAAGTTCA
AATGCCTGGAGGAGTACGGGGGAGACGTAGGTCCCGCGTTCTGTAACCCTAAGTTTTTCC
CCACGTTGTGTCGCCAAAACTGCAGGAGTTTCAAAGGTGCTAAAGGCGGTAAATGCGTGA
AGAAACACAAAAGCAAACCTATCAAATGTTTTTGCGACTACTGCAAAGACGATTAGATAT
ATATTACAAGCTAGAAATCATACACCGCTTATTATTACTGTTTAAAACGCTAAACGCAAC
CGCCCAACCCCCTATAGCGTTTTATACTTTGATATAAGTTTATGGTTGTATGTGATTCAT
GTAATAATGTCCGAAGACGTATGAGTATTATCCCCCTAATAAAATGCATACATGTATATG
CTAATTTATGATCAAATGATTCCGAGCTCGTATAGAAAACGAATTTGATTTAATTCG

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2FV55TF 537 0 0
GGACAATAAACAGTAAACAAAGCAAAATGAAGTCTGTTTACATCTTCATAGCGTTGTTCA
TCTTCTTCCTCGCCGTTCTTGGTGAGTCGCCGGAGAAGATAGGAGCCGACGAGAAGTTCA
AATGCCTGGAGGAGTACGGGGGAGACGTAGGTCCCGCGTTCTGTAACCCTAAGTTCTTCC
CCACGTTGTGTCGCCAAAACTGCAGGAGTTTCAAAGGTGCTAAAGGCGGTAAATGCGTGA
AGAAACACAAAAGCAAACCTATCAAATGTTTCTGCGACTACTGCAAAGACGATTAGATAT
ATATTACAAGCTAGAAATCATACACCGCTTATTATTACTGTTTAAAACGCTAAACGCAAC
CGCCCAACCCCCTATAGCGTTTTATACTTTGATATAAGTTTATGGTTGTATGTGATTCAT
GTAATAATGTCCGAAGACGTATGAGTATTATCCCCCTAATAAAATGCATACATGTATATG
CTAATTTATGATCAAATGATTCCGAGCTCGTATAGAAAACGAATTTGATTTAATTCG

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 4

CO CL2388Contig1 512 4 1 U
GCGTTGCCCTTTGCGTGATGAAAAACCTGTCTACAAAGATGTTAAAGGCTCTGGTGGCTT
GGTTCTGAGCATTGTTGAAATTGAAAAGCTGAGACTGAAGCGAGAAGGGGAAGACAGGAT
GACACGAGCTCGACTAGAGAGACAGATCGAGGAGTTTGGAAATGATTGTCTTAAAGAATT
TCAAGAGCAAATGCTTGCAGTGGAGTTGCTAAACGAGAGATTGATCGTGGTTGAAAATGA
AGTGAAGATCTGTAGAGAGACACTTTCTGAAAGCAAGAATGATGAGACTTCTGAAGTTGC
TGCTACTGCTGCTACTGCTGCTGCTGCTGCTATGGAAGAGACATGAGATGCTCTTAAGGT
TTGTGCAATTAGTGAAGCTTTTGAAGATCGTTCCAACAGATATTATATTAGCTTCGTTTT
GTATGATGTAGACGATGTTGATTGAATCTCTTTAATCTCGTTCTAGGAAATGTAATCAAC
GGTTTTGATCAGTAAGAGTCTTAATTAGTTAC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2BC31JQ C 1
AF RR2E109JQ C 1
AF RR2BC31TF U 1
AF RR2E109TF U 1
BS 1 512 RR2BC31TF

RD RR2BC31JQ 512 0 0
GCGTTGCCCTTTGCGTGATGAAAAACCTGTCTACAAAGATGTTAAAGGCTCTGGTGGCTT
GGTTCTGAGCATTGTTGAAATTGAAAAGCTGAGACTGAAGCGAGAAGGGGAAGACAGGAT
GACACGAGCTCGACTAGAGAGACAGATCGAGGAGTTTGGAAATGATTGTCTTAAAGAATT
TCAAGAGCAAATGCTTGCAGTGGAGTTGCTAAACGAGAGATTGATCGTGGTTGAAAATGA
AGTGAAGATCTGTAGAGAGACACTTTCTGAAAGCAAGAATGATGAGACTTCTGAAGTTGC
TGCTACTGCTGCTACTGCTGCTGCTGCTGCTATGGAAGAGACATGAGATGCTCTTAAGGT
TTGTGCAATTAGTGAAGCTTTTGAAGATCGTTCCAACAGATATTATATTAGCTTCGTTTT
GTATGATGTAGACGATGTTGATTGAATCTCTTTAATCTCGTTCTAGGAAATGTAATCAAC
GGTTTTGATCAGTAAGAGTCTTAATTAGTTAC

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2E109JQ 512 0 0
GCGTTGCCCTTTGCGTGATGAAAAACCTGTCTACAAAGATGTTAAAGGCTCTGGTGGCTT
GGTTCTGAGCATTGTTGAAATTGAAAAGCTGAGACTGAAGCGAGAAGGGGAAGACAGGAT
GACACGAGCTCGACTAGAGAGACAGATCGAGGAGTTTGGAAATGATTGTCTTAAAGAATT
TCAAGAGCAAATGCTTGCAGTGGAGTTGCTAAACGAGAGATTGATCGTGGTTGAAAATGA
AGTGAAGATCTGTAGAGAGACACTTTCTGAAAGCAAGAATGATGAGACTTCTGAAGTTGC
TGCTACTGCTGCTACTGCTGCTGCTGCTGCTATGGAAGAGACATGAGATGCTCTTAAGGT
TTGTGCAATTAGTGAAGCTTTTGAAGATCGTTCCAACAGATATTATATTAGCTTCGTTTT
GTATGATGTAGACGATGTTGATTGAATCTCTTTAATCTCGTTCTAGGAAATGTAATCAAC
GGTTTTGATCAGTAAGAGTCTTAATTAGTTAC

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2BC31TF 512 0 0
GCGTTGCCCTTTGCGTGATGAAAAACCTGTCTACAAAGATGTTAAAGGCTCTGGTGGCTT
GGTTCTGAGCATTGTTGAAATTGAAAAGCTGAGACTGAAGCGAGAAGGGGAAGACAGGAT
GACACGAGCTCGACTAGAGAGACAGATCGAGGAGTTTGGAAATGATTGTCTTAAAGAATT
TCAAGAGCAAATGCTTGCAGTGGAGTTGCTAAACGAGAGATTGATCGTGGTTGAAAATGA
AGTGAAGATCTGTAGAGAGACACTTTCTGAAAGCAAGAATGATGAGACTTCTGAAGTTGC
TGCTACTGCTGCTACTGCTGCTGCTGCTGCTATGGAAGAGACATGAGATGCTCTTAAGGT
TTGTGCAATTAGTGAAGCTTTTGAAGATCGTTCCAACAGATATTATATTAGCTTCGTTTT
GTATGATGTAGACGATGTTGATTGAATCTCTTTAATCTCGTTCTAGGAAATGTAATCAAC
GGTTTTGATCAGTAAGAGTCTTAATTAGTTAC

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2E109TF 512 0 0
GCGTTGCCCTTTGCGTGATGAAAAACCTGTCTACAAAGATGTTAAAGGCTCTGGTGGCTT
GGTTCTGAGCATTGTTGAAATTGAAAAGCTGAGACTGAAGCGAGAAGGGGAAGACAGGAT
GACACGAGCTCGACTAGAGAGACAGATCGAGGAGTTTGGAAATGATTGTCTTAAAGAATT
TCAAGAGCAAATGCTTGCAGTGGAGTTGCTAAACGAGAGATTGATCGTGGTTGAAAATGA
AGTGAAGATCTGTAGAGAGACACTTTCTGAAAGCAAGAATGATGAGACTTCTGAAGTTGC
TGCTACTGCTGCTACTGCTGCTGCTGCTGCTATGGAAGAGACATGAGATGCTCTTAAGGT
TTGTGCAATTAGTGAAGCTTTTGAAGATCGTTCCAACAGATATTATATTAGCTTCGTTTT
GTATGATGTAGACGATGTTGATTGAATCTCTTTAATCTCGTTCTAGGAAATGTAATCAAC
GGTTTTGATCAGTAAGAGTCTTAATTAGTTAC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 4

CO CL2389Contig1 549 4 11 U
GGGGAAACAGGAGGAATGAGCGGAGTTTCAACGGCAGCGTATTTCGCGCGGCGAGCGGCG
CAGAAGGAGAGGGTTCGAATCCTCTATCGACGCGCTCTTAAGGATACTCTCAATTGGGCT
GTTCATCGCCACATTTTCTACCGAGACGCTTCCGATCTGCGGGAGAAGTTCAACGCCAAC
CAAGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAAACTGATCGCTCATGGTGAAGCTGAGTAC
GACAAATGGCGGCACCCTGATCCTTATATCGTTCCATGGGCTCCTGGTGGCCCCAAGTTC
TGTAGAAACCC*ACTCCACCTGCTGGGATTGAGATTGTGTACAACTATGGTCAAGAAGAC
AACCCATAAACCTAATTTTCCTGTGGCTATGGTTCAGAAAATAAATTTTTACTTTCAAAG
ATGTTTCGTTTTAGCGTGACCACTCTTGTTTCAGCATGGTTTACATTTGTTCATCTAAAA
CATGTCATCATGAATCATGGATGTCCCATGAAAACTTATTCAATAA*CAACAAAAGTGTG
TTCTGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2F590TF U 7
AF RR2G294JQ C 1
AF RR2BL77TF U 5
AF RR2G294TF U 1
BS 1 8 RR2G294JQ
BS 9 152 RR2BL77TF
BS 153 153 RR2G294TF
BS 154 291 RR2BL77TF
BS 292 292 RR2G294TF
BS 293 311 RR2BL77TF
BS 312 312 RR2G294TF
BS 313 526 RR2BL77TF
BS 527 527 RR2G294TF
BS 528 546 RR2BL77TF
BS 547 549 RR2G294JQ

RD RR2F590TF 452 0 0
GG
AGGAGGAATGAGCGGAGTTTCAACGGCAGCGTATTTCGCGCGGCGAGCGGCGCAGAAGGA
GAGGGTTCGAATCCTCTATCGACGCGCCCTTAAGGATACTCTCAATTGGGCTGTTCACCG
CCACATTTTCTACCGAGACGCTTCTGATCTGCGCGAGAAGTTCAACGCCAACCAAGATGT
GGAGGATGTTGACAGAATCGACAAACTGATCGCTCATGGTGAAGCTGAGTACGACAAATG
GCGGCACCCTGATCCTTATATCGTTCCATGGGCTCCTGGTGGCTCCAAGTTCTGTAGAAA
CCCCACTCCACCTGCTGGGATTGAGATTGTGTACAACTATGGTCAAGAAGACAACCCATA
AACCTAATTTTCCTGTGGCTATGGTTCAGAAAATAAATTTTTACTTTCAAAGATGTTTCG
TTTTAGCGTGACCACTCTTGTTTCAGCATG

QA 3 452 3 452
DS 

RD RR2G294JQ 549 0 0
GGGGAAACAGGAGGAATGAGCGGAGTTTCAACGGCAGCGTATTTCGCGCGGCGAGCGGCG
CAGAAGGAGAGGGTTCGAATCCTCTATCGACGCGCTCTTAAGGATACTCTCAATTGGGCT
GTTCATCGCCACATTTTCTACCGAGACGCTTCCGATCTGCGGGAGAAGTTCAACGCCAAC
CAAGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAAACTGATCGCTCATGGTGAAGCTGAGTAC
GACAAATGGCGGCACCCTGATCCTTATATCGTTCCATGGGCTCCTGGTGGCCCCAAGTTC
TGTAGAAACCC*ACTCCACCTGCTGGGATTGAGATTGTGTACAACTATGGTCAAGAAGAC
AACCCATAAACCTAATTTTCCTGTGGCTATGGTTCAGAAAATAAATTTTTACTTTCAAAG
ATGTTTCGTTTTAGCGTGACCACTCTTGTTTCAGCATGGTTTACATTTGTTCATCTAAAA
CATGTCATCATGAATCATGGATGTCCCATGAAAACTTATTCAATAA*CAACAAAAGTGTG
TTCTGTCTC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2BL77TF 542 0 0
GGAC
AGGAGGAATGAGCGGAGTTTCAACGGCAGCGTATTTCGCGCGGCGAGCGGCGCAGAAGGA
GAGGGTTCGAATCCTCTATCGACGCGCTCTTAAGGATACTCTCAATTGGGCTGTTCATCG
CCACATTTTCTACCGAGACGCTTCTGATCTGCGGGAGAAGTTCAACGCCAACCAAGATGT
GGAGGATGTTGACAGAATCGACAAACTGATCGCTCATGGTGAAGCTGAGTACGACAAATG
GCGGCACCCTGATCCTTATATCGTTCCATGGGCTCCTGGTGGCTCCAAGTTCTGTAGAAA
CCCCACTCCACCTGCTGGGATTGAGATTGTGTACAACTATGGTCAAGAAGACAACCCATA
AACCTAATTTTCCTGTGGCTATGGTTCAGAAAATAAATTTTTACTTTCAAAGATGTTTCG
TTTTAGCGTGACCACTCTTGTTTCAGCATGGTTTACATTTGTTCATCTAAAACATGTCAT
CATGAATCATGGATGTCCCATGAAAACTTATTCAATAAACAACAAAAGTGTGTTCTGT

QA 5 542 5 542
DS 

RD RR2G294TF 549 0 0
GGGGAAAC
AGGAGGAATGAGCGGAGTTTCAACGGCAGCGTATTTCGCGCGGCGAGCGGCGCAGAAGGA
GAGGGTTCGAATCCTCTATCGACGCGCTCTTAAGGATACTCTCAATTGGGCTGTTCATCG
CCACATTTTCTACCGAGACGCTTCCGATCTGCGGGAGAAGTTCAACGCCAACCAAGATGT
GGAGGATGTTGACAGAATCGACAAACTGATCGCTCATGGTGAAGCTGAGTACGACAAATG
GCGGCACCCTGATCCTTATATCGTTCCATGGGCTCCTGGTGGCCCCAAGTTCTGTAGAAA
CCC*ACTCCACCTGCTGGGATTGAGATTGTGTACAACTATGGTCAAGAAGACAACCCATA
AACCTAATTTTCCTGTGGCTATGGTTCAGAAAATAAATTTTTACTTTCAAAGATGTTTCG
TTTTAGCGTGACCACTCTTGTTTCAGCATGGTTTACATTTGTTCATCTAAAACATGTCAT
CATGAATCATGGATGTCCCATGAAAACTTATTCAATAA*CAACAAAAGTGTGTTCTGT
CTC

QA 9 546 9 546
DS 



AS 1 4

CO CL2390Contig1 1050 4 12 U
GGGTTCAAGTTACATCATCAATCATTATTTAGAACGCAGTCGTTTTACAAGACCTAACTT
CGACAGAGAGACACAGTTAACAACACAGATATACAAGGGGGGGACAAGACAGGAACAAAA
CTCGAAACAAGGAGAGACTAATACCAAACACAGAAGACGCTTCTCGGTGACATGACATGT
CATCTCTAGTCTTCTTCTGCACCCGAAACTCGCTTCCTCGCGTATCTGAACGAGGTGGTA
GGGCTGGGATCAGTTTGCTCAACGGGAGCAAAATCATTGTAGAATTGAACTGAGATGAGT
TGGTTGTTAGGTGAACCAATTGGCGCAGGTGAGTTGTCTGAACTCATAGTCATATTGCCT
GCAAACAATCCTTGAAAGAGTAGAAAGGCGAAGAACAGAAACGAAACTACCACTGAGAAG
ATGCTAAAGCATGAATAAGGGGATGATGATGAGGATGACTTGGCTGCTTTGATTCTTCTA
AGTGAATTTTTCATCCTTTCAATCCTGGCACGCTTTCTCATGGCGAGCTCAGCAATTTCC
TTCATCACCTTATGGTCGTTAACAGTGAAAGAAGGGCCTTTTGGAGGTCTAGGCGGCTTC
GAAGCCTTTCTCGACTTCTTAACTTTAACAATATCATTGCTTTTTCTCTCAGAAAGATCT
AAACTTTGGCTGCTTGTTTCTGTTCCCATCAGGGGATAGTTTAGATCATCATCACCCTCA
ACCTTTTCAGACACACCAAAGTTCACCAGTTCACTATTTCCCGAAACAGTAGTATCTGAT
GTGGATTCAGGCGTAACATGAGGTAGACCAGCTTCGATGTCTAGTTCAAGATCTTGCTCT
CCTGAAACCAATTGATCCATCCTACTACAGTACGTTACTTCTCAAACTGCCTACTACTGA
AACGCCAACAAAAAGCAAAAGCTGATCCAGCCCTTTACTTCCTTCCCCTCGTCAGGATAT
TAGCCTGCAAAATACTTGCTTAATCGTCCTGGAATTTAGGGTTCTTGAGTGGTTGAAAAT
CTGAATTGAATTTTGCCCCTTTTGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP70JQ U 41
AF RR2F778JQ U 1
AF RR2F778TF C 536
AF RR2EP70TF C 421
BS 1 102 RR2F778JQ
BS 103 103 RR2EP70JQ
BS 104 561 RR2F778JQ
BS 562 562 RR2EP70JQ
BS 563 694 RR2F778JQ
BS 695 714 RR2EP70TF
BS 715 715 RR2F778TF
BS 716 788 RR2EP70TF
BS 789 789 RR2F778TF
BS 790 978 RR2EP70TF
BS 979 979 RR2F778TF
BS 980 1050 RR2EP70TF

RD RR2EP70JQ 557 0 0
CGTTTTACAAGACCTAACTTCGACAGAGAGACACAGTTAACAACACAGATATACAAGGGG
GGGACAAGACAGGAACAAAACTCGAAACAAGGAGAGACTAATACCAAACACAGAAGACGC
TTCTCGGTGACATGACATGTCATCTCTAGTCTTCTTCTGCACCCGAAACTCGCTTCCTCG
CGTATCTGAACGAGGTGGTAGGGCTGGGATCAGTTTGCTCAACGGGAGCAAAATCATTGT
AGAATTGAACTGAGATGAGTTGGTTGTTAGGTGAACCAATTGGCGCAGGTGAGTTGTCTG
AACTCATAGTCATATTGCCTGCAAACAATCCTTGAAAGAGTAGAAAGGCGAAGAACAGAA
ACGAAACTACCACTGAGAAGATGCTAAAGCATGAATAAGGGGATGATGATGAGGATGACT
TGGCTGCTTTGATTCTTCTAAGTGAATTTTTCATCCTTTCAATCCTGGCACGCTTTCTCA
TGGCGAGCTCAGCAATTTCCTTCATCACCTTATGGTCGTTAACAGTGAAAGAAGGGCCTT
TTGGAGGTCTAGGCGGC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2F778JQ 697 0 0
GGGTTCAAGTTACATCATCAATCATTATTTAGAACGCAGTCGTTTTACAAGACCTAACTT
CGACAGAGAGACACAGTTAACAACACAGATATACAAGGGGGG*ACAAGACAGGAACAAAA
CTCGAAACAAGGAGAGACTAATACCAAACACAGAAGACGCTTCTCGGTGACATGACATGT
CATCTCTAGTCTTCTTCTGCACCCGAAACTCGCTTCCTCGCGTATCTGAACGAGGTGGTA
GGGCTGGGATCAGTTTGCTCAACGGGAGCAAAATCATTGTAGAATTGAACTGAGATGAGT
TGGTTGTTAGGTGAACCAATTGGCGCAGGTGAGTTGTCTGAACTCATAGTCATATTGCCT
GCAAACAATCCTTGAAAGAGTAGAAAGGCGAAGAACAGAAACGAAACTACCACTGAGAAG
ATGCTAAAGCATGAATAAGGGGATGATGATGAGGATGACTTGGCTGCTTTGATTCTTCTA
AGTGAATTTTTCATCCTTTCAATCCTGGCACGCTTTCTCATGGCGAGCTCAGCAATTTCC
TTCATCACCTTATGGTCGTTAGCAGTGAAAGAAGGGCCTTTTGGAGGTCTAGGCGGCTTC
GAAGCCTTTCTCGACTTCTTAACTTTAACAATATCATTGCTTTTTCTCTCAGAAAGATCT
AAACTTTGGCTGCTTGTTTCTGTTCCCATCAGGG
ATA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2F778TF 480 0 0
TTTCCTTCATCACTTTATGGTCGTTAGCAGTGAAAGAAGGGCCTTTTGGAGGTCTAGGCG
GCTTCGAAGCCTTTCTCGACTTCTTAACTTTAACAATATCATTGCTTTTTCTCTCAGAAA
GATCTAAACTTTGGCTGCTTGTTTCTGTTCCCATCAGGGGATAGTTTAGATCATCATCAC
CCTCAACCTTTTCAGACACACCAAAGTTCACCAGTTCACTATTTCCCGAAACAGTAGTAT
CTGATGTGGATTCAGGCGTAACATGAGGTAGACCAGCTTCGATGTCTAGTTCAAGATCTT
GCTCTCCTGAAACCAATTGATCCATCCTACTACAGTACGTTACTTCTCAAACTGCCTACT
ACTGAAACGCCCACAAAAAGCAAAAGCTGATCCAGCCCTTTACTTCCTTCCCCTCGTCAG
GATATTAGCTTGCAAAATACTTGCTTAATCGTCCTGGAATTTAGGGTTCTTGAGTGGTT
C

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR2EP70TF 630 0 0
ATGCTAAAGCATGAATAAGGGGATGATGATGAGGATGACTTGGCTGCTTTGATTCTTCTA
AGTGAATTTTTCATCCTTTCAATCCTGGCACGCTTTCTCATGGCGAGCTCAGCAATTTCC
TTCATCACCTTATGGTCGTTAACAGTGAAAGAAGGGCCTTTTGGAGGTCTAGGCGGCTTC
GAAGCCTTTCTCGACTTCTTAACTTTAACAATATCATTGCTTTTTCTCTCAGAAAGATCT
AAACTTTGGCTGCTTGTTTCTGTTCCCATCAGGGGATAGTTTAGATCATCATCATCCTCA
ACCTTTTCAGACACACCAAAGTTCACCAGTTCACTATTTCCCGAAACAGTAGTATCTGAT
GTGGATTCTGGCGTAACATGAGGTAGACCAGCTTCGATGTCTAGTTCAAGATCTTGCTCT
CCTGAAACCAATTGATCCATCCTACTACAGTACGTTACTTCTCAAACTGCCTACTACTGA
AACGCCAACAAAAAGCAAAAGCTGATCCAGCCCTTTACTTCCTTCCCCTCGTCAGGATAT
TAGCCTGCAAAATACTTGTTTAATCGTCCTGGAATTTAGGGTTCTTGAGTGGTTGAAAAT
CTGAATTGAATTTTGCCCCTTTTGATCTCC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 4

CO CL2391Contig1 1159 4 20 U
GGTTACAGAAATGGACACTTAAATTCTCAACGGTCGCTTTACCAAATGAATGAACCAAAA
TAAAAACAGGAAGTGCAACGAATATTGTACAGGATTAAAAAGAAACATGTAATCCACAAG
AATCATAAGTAGAAATAGAAATTTGAAAAACGTTTTTGGTTGCACATTGCTTGAGAGAAG
AAGGTGTCAATACTCTTCACCTTCATCTTCCTCATCGTCTCCACCTTCAGCACCAACTTC
TTCATAATCTTTCTCCAGTGCCGCCAAGTCTTCACGTGCCTCTGAGAATTCACCTTCCTC
CATTCCTTCACCAACGTACCAGTGCACAAACGCTCTCTTCGCGTACATCAGATCAAACTT
GTGGTCGATCCGTGAGAACACCTCTGCAACGGCTGTGTTGTTGCTGATCATGCAGACCGC
TCTCTGGACCTTAGCGAGGTCGCCTCCAGGAACAACTGTTGGAGGTTGGTAATTGATTCC
ACATTTGAAACCGGTGGGACACCAGTCAACAAATTGAACAGTCCTCTTAGTCTTGATAGT
ACCGACAGCAGCATTAACATCTTTAGGAACAACATCTCCACGGTACATCAAACAACAAGC
CATGTATTTCCCGTGCCTCGGGTCACACTTGGCCATCATGCTAGCTGGCTCAAACACGGC
ATTAGTGATCTCAGGGACCGAAAGCTGCTCATGGTAAGCCTTTGCTGCTGAGATAACCGG
AGCATAAGAGGACAGCATGAAATGGATACGGGGGTAAAGGACAAGATTGGTCTGGAACTC
GGTGATATCCACATTAATAGCTCCATCAAACCTCAACGACGTTGTCAAGGACGATATGAT
CTGAGATATCAACCTGTTGAGGTTCGTGTAAGTAGGCCTCTCGATATCTAAGGATCTGCG
GCAAATATCATAGATGGCTTCGTTATCCAAGAGGACAGCAACATCGGTGTGTTCGAGTAG
AGAGTGGGTTGAAAGAACACTGTTGTAAGACTCAACAACAGCAGCAGAAACCTGAGGAGA
AGGGTGAATGGTGAAGCCAAGTTTAGACTTTTTACCATAATCAACAGACAAACGCTCTAA
CAAGAGAGAACCCAAACCAGAACCAGTTCCACCACCAACAGCATTAAACACCAAGAACCC
TTGCAATCCAGTACAGTTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 10 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO93JQ U 1
AF RR2E005JQ U 5
AF RR2GO93TF C 98
AF RR2E005TF C 459
BS 1 174 RR2GO93JQ
BS 175 175 RR2E005JQ
BS 176 176 RR2GO93JQ
BS 177 177 RR2E005JQ
BS 178 179 RR2GO93JQ
BS 180 180 RR2E005JQ
BS 181 184 RR2GO93JQ
BS 185 185 RR2E005JQ
BS 186 285 RR2GO93JQ
BS 286 286 RR2E005JQ
BS 287 340 RR2GO93JQ
BS 341 341 RR2E005JQ
BS 342 366 RR2GO93JQ
BS 367 367 RR2E005JQ
BS 368 378 RR2GO93JQ
BS 379 655 RR2E005JQ
BS 656 757 RR2GO93TF
BS 758 758 RR2E005TF
BS 759 790 RR2GO93TF
BS 791 1159 RR2E005TF

RD RR2GO93JQ 378 0 0
GGTTACAGAAATGGACACTTAAATTCTCAACGGTCGCTTTACCAAATGAATGAACCAAAA
TAAAAACAGGAAGTGCAACGAATATTGTACAGGATTAAAAAGAAACATGTAATCCACAAG
AATCATAAGTAGAAATAGAAATTTGAAAAACGTTTTTGGTTGCACATTGCTTGAAAAAAA
AAGGGGTCAATACTCTTCACCTTCATCTTCCTCATCGTCTCCACCTTCAGCACCAACTTC
TTCATAATCTTTCTCCAGTGCCGCCAAGTCTTCACGTGCCTCTGAAAATTCACCTTCCTC
CATTCCTTCACCAACGTACCAGTGCACAAACGCTCTCTTCCCGTACATCAGATCAAACTT
GTGGTCCATCCGTGAGAA

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR2E005JQ 651 0 0
ACAGAAATGGACACTTAAATTCTCAACGGTCGCTTTACCAAATGAATGAACCAAAATAAA
AACAGGAAGTGCAACGAATATTGTACAGGATTAAAAAGAAACATGTAATCCACAAGAATC
ATAAGTAGAAATAGAAATTTGAAAAACGTTTTTGGTTGCACATTGCTTGAGAGAAGAAGG
TGTCAATACTCTTCACCTTCATCTTCCTCATCGTCTCCACCTTCAGCACCAACTTCTTCA
TAATCTTTCTCCAGTGCCGCCAAGTCTTCACGTGCCTCTGAGAATTCACCTTCCTCCATT
CCTTCACCAACGTACCAGTGCACAAACGCTCTCTTCGCGTACATCAGATCAAACTTGTGG
TCGATCCGTGAGAACACCTCTGCAACGGCTGTGTTGTTGCTGATCATGCAGACCGCTCTC
TGGACCTTAGCGAGGTCGCCTCCAGGAACAACTGTTGGAGGTTGGTAATTGATTCCACAT
TTGAAACCGGTGGGACACCAGTCAACAAATTGAACAGTCCTCTTAGTCTTGATAGTACCG
ACAGCAGCATTAACATCTTTAGGAACAACATCTCCACGGTACATCAAACAACAAGCCATG
TATTTCCCGTGCCTCGGGTCACACTTGGCCATCATGCTAGCTGGCTCAAAC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2GO93TF 694 0 0
AAAAGAAACATGTA*TCCACAAGAATCATAAGTAGAAATAGAAATTTGAAAAACGTTTTT
GGT*GCACATTGCTTGAGAGAAGAAGGTGTCAATACTCTTCACCTTCATCTTCCTCATCG
TCTCCACCTTCAGCACCAACTTCTTCATAATCTTTCTCCAGTGCCGCCAAGTCTTCACGT
GCCTCTGAGAATTCACCTTCCTCCATTCCTTCACCAACGTACCAGTGCACAAACGCTCTC
TTCGCGTACATCAGATCAAACTTGTGGTCGATCCGTGAGAACACCTCTGCAACGGCTGTG
TTGTTGCTGATCATGCAGACCGCTCTCTGGACCTTAGCGAGGTCGCCTCCAGGAACAACT
GTTGGAGGTTGGTAATTGATTCCACATTTGAAACCGGTGGGACACCAGTCAACAAATTGA
ACAGTCCTCTTAGTCTTGATAGTACCGACAGCAGCATTAACATCTTTAGGAACAACATCT
CCACGGTACATCAAACAACAAGCCATGTATTTCCCGTGCCTCGGGTCACACTTGGCCATC
ATGCTAGCTGGCTCAAACACGGCATTAGTGATCTCAGGGACCGAAAGCTGCTCATGGTAA
GCCTTTGCTGCTGAGATAACCGGAGCATAAGAGGACAGCATGAAATGGATACGGGGGTAA
GGGACAAGATTGGTCTGGAACTCGGTGATATCC
C

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2E005TF 701 0 0
G
TGGAGGTTGGTAATTGATTCCACATTTGAAACCGGTGGGACACCAGTCAACAAATTGAAC
AGTCCTCTTAGTCTTGATAGTACCGACAGCAGCATTAACATCTTTAGGAACAACATCTCC
ACGGTACATCAAACAACAAGCCATGTATTTCCCGTGCCTCGGGTCACACTTGGCCATCAT
GCTAGCTGGCTCAAACACGGCATTAGTGATCTCAGGGACCGAAAGCTGCTCATGGTAAGC
CTTTGCTGCTGAGATAACCGGAGCATAAGAGGACAGCATGAAGTGGATACGGGGGTAAAG
GACAAGATTGGTCTGGAACTCGGTGATATCCACATTAATAGCTCCATCAAACCTCAACGA
CGTTGTCAAGGACGATATGATCTGAGATATCAACCTGTTGAGGTTCGTGTAAGTAGGCCT
CTCGATATCTAAGGATCTGCGGCAAATATCATAGATGGCTTCGTTATCCAAGAGGACAGC
AACATCGGTGTGTTCGAGTAGAGAGTGGGTTGAAAGAACACTGTTGTAAGACTCAACAAC
AGCAGCAGAAACCTGAGGAGAAGGGTGAATGGTGAAGCCAAGTTTAGACTTTTTACCATA
ATCAACAGACAAACGCTCTAACAAGAGAGAACCCAAACCAGAACCAGTTCCACCACCAAC
AGCATTAAACACCAAGAACCCTTGCAATCCAGTACAGTTC

QA 2 701 2 701
DS 



AS 1 2

CO CL2392Contig1 1005 2 10 U
GCACTGCGTCGGAACTACTTATTCGTGTGGAAAGTAAACCCACGGATCCTGCCGTAGAAT
TCAACAAATGAGAGAGAATAGAAGAATGGTACGGAGACTCATCTCATGTTCTTGTCTGTG
TGTGTGTGTTCTCTCAAGGTTTGAGAACAAGTGAAAGACCAAACCTTGGATGCTTGTCCA
ACGCCTTAGTGTCGATCTCACTGGAAACAGTCACTAGGGATTTCGGCAAGACCTCGTGCT
GAAAAAGAGCACCGAGTGTGCCACGGCTGTTGAATTTAGCTTTCACCGAGGTCGAAGGAT
CAATCGCGTATGACCCACCAACAGTTATCGTGTTCTCATTAGTCGAGAATTTCCTGTAAA
CCTCACCAACTGCAGAACTTCTCTTGGATTCGTCAAGGTGATGAAGGTAAGATGCTTTGA
TTGAGTCTCCTTTGTCTCCCAATATAATGGAAGCGGAAGCATCTGGTTTGGCCACACTGA
TTCCAGCGTTGTACTTGGTGAAAGTTTTGGAGGAGGTGTCGTATCCAGCTTCAGCACCAA
ATGAGATGACTGGTGTACCTAGAGTGGCTGTTATGTCGATCAACGGGTTCTGCTTCAAAG
CTGCAGCAGCGGTAACAGTGGCGTGGTCGTGGAAGTACTGGACCTCGAGCTTGCCAGAAC
TGTTGTCAGGGACTTTGAAGGAGACGATGGCTTTGGTCGATGGGAGGATCTCAGTGAAAG
TGACAGTTGTCAAAATAGTGGAATCAGTGTCGACTTTGACGTCGAAGACAGCATTCTTGT
ACTTGTATTGAGTGGCAACATCAGCAGCATGCACGCCTCCTTTCTTGAGAGCAGTAGACG
TAAGGGCCACGCCGGAGGCACTGTAAGTGGAGATACTGAATTTGTGATCGGAGGTGTAGT
CTCTCGTCAACAGATCTTTGGCTTTTTTGCCGATATCCGAGAACATTCCTGGACCTTTGC
TCATGGTTGATCGGCGATTTTGTAGAGAGAGATCAGCCAAGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ26JQ U 1
AF RR2AM33TF C 393
BS 1 400 RR2BQ26JQ
BS 401 401 RR2AM33TF
BS 402 471 RR2BQ26JQ
BS 472 472 RR2AM33TF
BS 473 724 RR2BQ26JQ
BS 725 725 RR2AM33TF
BS 726 745 RR2BQ26JQ
BS 746 746 RR2AM33TF
BS 747 794 RR2BQ26JQ
BS 795 1005 RR2AM33TF

RD RR2BQ26JQ 794 0 0
GCACTGCGTCGGAACTACTTATTCGTGTGGAAAGTAAACCCACGGATCCTGCCGTAGAAT
TCAACAAATGAGAGAGAATAGAAGAATGGTACGGAGACTCATCTCATGTTCTTGTCTGTG
TGTGTGTGTTCTCTCAAGGTTTGAGAACAAGTGAAAGACCAAACCTTGGATGCTTGTCCA
ACGCCTTAGTGTCGATCTCACTGGAAACAGTCACTAGGGATTTCGGCAAGACCTCGTGCT
GAAAAAGAGCACCGAGTGTGCCACGGCTGTTGAATTTAGCTTTCACCGAGGTCGAAGGAT
CAATCGCGTATGACCCACCAACAGTTATCGTGTTCTCATTAGTCGAGAATTTCCTGTAAA
CCTCACCAACTGCAGAACTTCTCTTGGATTCGTCAAGGTGGTGAAGGTAAGATGCTTTGA
TTGAGTCTCCTTTGTCTCCCAATATAATGGAAGCGGAAGCATCTGGTTTGGTCACACTGA
TTCCAGCGTTGTACTTGGTGAAAGTTTTGGAGGAGGTGTCGTATCCAGCTTCAGCACCAA
ATGAGATGACTGGTGTACCTAGAGTGGCTGTTATGTCGATCAACGGGTTCTGCTTCAAAG
CTGCAGCAGCGGTAACAGTGGCGTGGTCGTGGAAGTACTGGACCTCGAGCTTGCCAGAAC
TGTTGTCAGGGACTTTGAAGGAGACGATGGCTTTGGTCGATGGGAGGATCTCAGTGAAAG
TGACTGTTGTCAAAATAGTGGAATCCGTGTCGACTTTGACGTCGAAGACAGCATTCTTGT
ACTTGTATTGAGTG

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2AM33TF 613 0 0
TCG
AGGTGATGAAGGTAAGATGCTTTGATTGAGTCTCCTTTGTCTCCCAGTATAATGGAAGCG
GAAGCATCTGGTTTGGCGACACTGATTCCAGCGTTGTACTTGGTGAAAGTTTTGGAGGAG
GTGTCGTATCCAGCTTCAGCACCAAATGAGATGACTGGTGTACCTAGAGTGGCTGTTATG
TCGATCAGTGGGTTCTGCTTCAAAGCTGCAGCAGCGGTAACAGTGGCGTGGTCGTGGAAG
TACTGGACCTCGAGCTTGCCGGAACTGTTGTCAGGGACTTTGAAGGAGACGATGGCTTTG
GTGGATGGGAGGATCTCAGTGAAAGTGACAGTTGTCAAAATAGTGGAATCAGTGTCGACT
TTGACGTCGAAGACAGCATTCTTGTACTTGTATTGAGTGGCAACATCAGCAGCATGCACG
CCTCCTTTCTTGAGAGCAGTAGACGTAAGGGCCACGCCGGAGGCACTGTAAGTGGAGATA
CTGAATTTGTGATCGGAGGTGTAGTCTCTCGTCAACAGATCTTTGGCTTTTTTGCCGATA
TCCGAGAACATTCCTGGACCTTTGCTCATGGTTGATCGGCGATTTTGTAGAGAGAGATCA
GCCAAGTTTT

QA 4 613 4 613
DS 



AS 1 2

CO CL2393Contig1 963 2 2 U
GGATAGTAAAAACAGAGCAACTCTCCGACGCCATTTGTGTGGTTGTGAAAAGGCAAAAAA
AAAACAGAGAAAAGATTCAATGTCTGTAACAGCAGCAACTCACATGAACACGATCAATCA
TTTGTCGTCGACAACCTGTAAAACCTCCAATCTCATCTGCTCCAATCACAGATTGTCTCA
ACCTTTTCATCGTAAACCCAAATCGTTTCCTCAGCTGCTTCCCAAAACCACCCTAAATGG
CTCCTCCTCCTCTCGCTCTCCTTCGTCTATCGTCACTCGAAGATCGAGATTCAACTCTCG
CAACAAACGCTTCTCTGTTTCCATGGAGTGGCAAGACTGCACAGTGAAGATGGAAGTAGA
TATACCAGTATCAGTAGCGTATAACTTCTACTTGGATCGTGAATCTTTCCCTAAGTGGAT
GCCTTTCATTTCATCCGTTGAGGTGTTAAAGGACAAGCCTGATCTATCACGTTGGTCACT
CAAGTACAATGCTTTTGGCCAAGACATTAAGTATTCTTGGCTTGCTCGCAATCTTCAGCC
TACTCCTAATCAGAAAATCCATTGGAGATCTCTTGAAGGTCTTCCTAATAAAGGCAGCGT
TAGGTTCTTCCCTAAAGGTCCTTCATCTTGCCTCGTTGAGCTAACTGTATCATATGAAGT
CCCTGCGCTTTTGACCCCTGTGGCATCCGCGCTCCGGCCCTTTCTAGAAAGCTTGCTTAG
AGGTGGACTTGAAAGATTTGCAACCTTGGCTAAAACCACTTAAAAAAAAGAAAAAAAGGA
ATCTGTATGTAATGCATCTCTGTGATTCTGGGCTTTTAAGAATATATCTTGGTATATAAA
ATGGTCTGGAACTCGATTATGTCCCCATGATTAAGGAGGGGTTGTCTACTCTGACTCTTG
TAATTCTTAAAGTTACAATCTTTATCTCTCTTAATAATAACAGAGCATTTGGTTTAGTTC
ACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2G665TF U 1
AF RR2G665JQ C 317
BS 1 693 RR2G665TF
BS 694 963 RR2G665JQ

RD RR2G665TF 693 0 0
GGATAGTAAAAACAGAGCAACTCTCCGACGCCATTTGTGTGGTTGTGAAAAGGCAAAAAA
AAAACAGAGAAAAGATTCAATGTCTGTAACAGCAGCAACTCACATGAACACGATCAATCA
TTTGTCGTCGACAACCTGTAAAACCTCCAATCTCATCTGCTCCAATCACAGATTGTCTCA
ACCTTTTCATCGTAAACCCAAATCGTTTCCTCAGCTGCTTCCCAAAACCACCCTAAATGG
CTCCTCCTCCTCTCGCTCTCCTTCGTCTATCGTCACTCGAAGATCGAGATTCAACTCTCG
CAACAAACGCTTCTCTGTTTCCATGGAGTGGCAAGACTGCACAGTGAAGATGGAAGTAGA
TATACCAGTATCAGTAGCGTATAACTTCTACTTGGATCGTGAATCTTTCCCTAAGTGGAT
GCCTTTCATTTCATCCGTTGAGGTGTTAAAGGACAAGCCTGATCTATCACGTTGGTCACT
CAAGTACAATGCTTTTGGCCAAGACATTAAGTATTCTTGGCTTGCTCGCAATCTTCAGCC
TACTCCTAATCAGAAAATCCATTGGAGATCTCTTGAAGGTCTTCCTAATAAAGGCAGCGT
TAGGTTCTTCCCTAAAGGTCCTTCATCTTGCCTCGTTGAGCTAACTGTATCATATGAAGT
CCCTGCGCTTTTGACCCCTGTGGCATCCGCGCT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2G665JQ 647 0 0
GTTTCCATGGAGTGGCAAGACTGCACAGTGAAGATGGAAGTAGATATACCAGTATCAGTA
GCGTATAACTTCTACTTGGATCGTGAATCTTTCCCTAAGTGGATGCCTTTCATTTCATCC
GTTGAGGTGTTAAAGGACAAGCCTGATCTATCACGTTGGTCACTCAAGTACAATGCTTTT
GGCCAAGACATTAAGTATTCTTGGCTTGCTCGCAATCTTCAGCCTACTCCTAATCAGAAA
ATCCATTGGAGATCTCTTGAAGGTCTTCCTAATAAAGGCAGCGTTAGGTTCTTCCCTAAA
GGTCCTTCATCTTGCCTCGTTGAGCTAACTGTATCATATGAAGTCCCTGCGCTTTTGACC
CCTGTGGCATCCGCGCTCCGGCCCTTTCTAGAAAGCTTGCTTAGAGGTGGACTTGAAAGA
TTTGCAACCTTGGCTAAAACCACTTAAAAAAAAGAAAAAAAGGAATCTGTATGTAATGCA
TCTCTGTGATTCTGGGCTTTTAAGAATATATCTTGGTATATAAAATGGTCTGGAACTCGA
TTATGTCCCCATGATTAAGGAGGGGTTGTCTACTCTGACTCTTGTAATTCTTAAAGTTAC
AATCTTTATCTCTCTTAATAATAACAGAGCATTTGGTTTAGTTCACC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 3

CO CL2394Contig1 941 3 21 U
GTAATCCAGACGACTACGTGATCAAGGATGAGGACATGGACCGAGGAGCGATGCATGCAG
GAGGGGATGTGGATGGAAGGCTTGATGAGGCAACTGCTAGTCTCATGCTAGATACTAGAC
CTTCGAAAGTCATATCTAATGAGCTCATTGTGACTGTTAGTTGTTCACTAGTCAAAATGG
ACTACGAAGGTCGTTCAGATGGCCGTTCAATCAAGTCAACGATTGCACATGTTTCTCCGC
TGAAACTTGTTCTGGTGCACGCAACAGCAGAGGCTACGGAGCATTTGAAGCAACACAGCT
TGAACAGCATCTGTCCACACGTGTACGCTCCGAAAATAGAGGAAACCGTGGATGTGACTT
CTGATCTATGTGCTTATAAGGTCCAACTCTCCGAAAAGCTGATGAGCAATGTGATCTTCA
AGAAGCTGGGAGATTCAGAAGTAGCATGGGTGGATTCAGAAGTAGGGAAGACAGGGAGCG
AGATGAGGCGTCTACAGCCAATGGGGAGTGCAGCTGCTCCTCACAAACCAGTACTAGTGG
GTGATCTGAAAATGCAAGACTTCAAGCAGTTTCTGTCAAGCAAAGGAGTTCAGGTAGAGT
TTGCAGGTGGTGGAGCTTTACGATGCGGTGAATATGTCACTCTAAGGAAGGTCGGTCCAA
CTGGTCAGAAGGGGGGAGCATCGGGGCCACAGCAAATCCTGATAGAAGGACCGTTGTGTG
AAGATTATTATAAAATAAGGGACTATCTCTATTCTCAGTTTTACCTCCTCTGATGGTATA
AGTAAGAGAGAAGATGCAGCTTCTTCTTCATCTTCTTCTTCTGTTGTTTCCAACACTTCC
AACTACTTCAGTTTTTTGTTTTGAATGACTCAAGTGTAATCTTTTTTGTTTTGAATGACT
CAAGTGTAATCTTTACATAGTCGAGAGCCTTGTCCTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR19TF U 1
AF RR2AM96TF U 133
AF RR2AM96JQ C 413
BS 1 238 RR2FR19TF
BS 239 239 RR2AM96TF
BS 240 391 RR2FR19TF
BS 392 392 RR2AM96TF
BS 393 488 RR2FR19TF
BS 489 489 RR2AM96TF
BS 490 610 RR2FR19TF
BS 611 611 RR2AM96TF
BS 612 637 RR2FR19TF
BS 638 638 RR2AM96TF
BS 639 643 RR2FR19TF
BS 644 644 RR2AM96TF
BS 645 650 RR2FR19TF
BS 651 651 RR2AM96TF
BS 652 709 RR2FR19TF
BS 710 710 RR2AM96TF
BS 711 720 RR2FR19TF
BS 721 721 RR2AM96TF
BS 722 725 RR2FR19TF
BS 726 859 RR2AM96TF
BS 860 941 RR2AM96JQ

RD RR2FR19TF 728 0 0
GTAATCCAGACGACTACGTGATCAAGGATGAGGACATGGACCGAGGAGCGATGCATGCAG
GAGGGGATGTGGATGGAAGGCTTGATGAGGCAACTGCTAGTCTCATGCTAGATACTAGAC
CTTCGAAAGTCATATCTAATGAGCTCATTGTGACTGTTAGTTGTTCACTAGTCAAAATGG
ACTACGAAGGTCGTTCAGATGGCCGTTCAATCAAGTCAACGATTGCACATGTTTCTCCTC
TGAAACTTGTTCTGGTGCACGCAACAGCAGAGGCTACGGAGCATTTGAAGCAACACAGCT
TGAACAGCATCTGTCCACACGTGTACGCTCCGAAAATAGAGGAAACCGTGGATGTGACTT
CTGATCTATGTGCTTATAAGGTCCAACTCTCTGAAAAGCTGATGAGCAATGTGATCTTCA
AGAAGCTGGGAGATTCAGAAGTAGCATGGGTGGATTCAGAAGTAGGGAAGACAGGGAGCG
AGATGAGGTGTCTACAGCCAATGGGGAGTGCAGCTGCTCCTCACAAACCAGTACTAGTGG
GTGATCTGAAAATGCAAGACTTCAAGCAGTTTCTGTCAAGCAAAGGAGTTCAGGTAGAGT
TTGCAGGTGGAGGAGCTTTACGATGCGGTGAATATGTTACTCTGAGGAAG*TCGGTCCAA
CTGGTCAGAAGGGGGGAGCATCGGGGCCACAGCAAATCCTGATAGAAGG*CCGTTGTGTG
GAGAT
ATT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2AM96TF 727 0 0
GATCC
AATGAGCTCATTGTGACTGTTAGTTGTTCACTTGTTAAAATGGACTACGAAGGTCGTTCA
GATGGCCGTTCAATGAAGTCAACGATTGCACATGTTTCTCCGCTGAAACTTGTTCTGGTG
CACGCAACAGCAGAGGCTACGGAGCATTTGAAGCAACACAGCTTGAACAGCATCTGTCCA
CACGTGTACGCTCCGAATATAGAGGAAACCGTGGATGTGACTTCTGATCTATGTGCTTAT
AAGGTCCAACTCTCCGAAAAGCTGATGAGCAATGTGATCTTCAAGAAGCTGGGAGATTCA
GAAGTAGCATGGGTGGATTCAGAAGTAGGGAAGACAGGGAGCGAGATGAGGCGTCTACAG
CCAATGGGGAGTGCAGCTGCTCCTCACAAACCAGTACTAGTGGGTGATCTGAAAATGCAA
GACTTCAAGCAGTTTCTGTCAAGCAAAGGAGTTCAGGTAGAGTTTGCAGGTGGTGGAGCT
TTACGATGCGGTGAATATGTCACTCTAAGGAAGGTCGGTCCAACTGGTCAGAAGGGGGGA
GCATCGGGGCCACAGCAAATCCTGATAGAAGGACCGTTGTGTGAAGATTATTATAAAATA
AGGGACTATCTCTATTCTCAGTTTTACCTCCTCTGATGGTATAAGTAAGAGAGAAGATGC
AGCTTCTTCTTCATCTTCTTCTTCTGTTGTTTCCAACACTTCCAACTACTTCAGTTTTTT
GT

QA 6 727 6 727
DS 

RD RR2AM96JQ 529 0 0
GATCTTCAAGAAGCTGGGAGATTCAGAAGTAGCATGGGTGGATTCAGAAGTAGGGAAGAC
AGGGAGCGAGATGAGGCGTTTACAGCCAATGGGGAGTGCAGCTGCTCCTCACAAACCAGT
ACTAGTGGGTGATCTGAAAATGCAAGACTTCAAGCAGTTTCTGTCAAGCAAAGGAGTTCA
GGTAGAGTTTGCAGGTGGTGGAGCTTTACGATGCGGTGAATATGTCACTTTAAGGAAGGT
CGGTCCAACTGGTCAGAAGGGGGGAGCATCGGGGCCACAGCAAATCCTGATAGAAGGACC
GTTGTGTGAAGATTATTATAAAATAAGGGACTATCTCTATTTTCAGTTTTACCTCCTCTG
ATGGTATAAGTAAGAGAGAAGATGCAGCTTCTTCTTCATCTTCTTCTTCTGTTGTTTCCA
ACACTTCCAACTACTTCAGTTTTTTGTTTTGAATGACTCAAGTGTAATCTTTTTTGTTTT
GAATGACTCAAGTGTAATCTTTACATAGTCGAGAGCCTTGTCCTTTGAC

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 4

CO CL2395Contig1 1070 4 8 U
TTTTTTATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAGGGTTTTCTCTCTAG
CTTTGTCGCCGCTGCCTCTTCGGCTCCGATGAGCTTACATAGCATCGGGGCCGGATCTCT
AGTCTTCTTGCGTAGTTTAATCTATTTTCTCTTTTTTCATCATCAAATCCTCTTTTACTC
TTAGCAGATTTGGATTTTTAGGGTTTTGATTTTCTTTAGATCCTTAGATCTGGAGTTGTC
GATCTCCTTGAATCTTGTTCAGATGTTGTTGTTTTTGGTTTAGCCTTGTCTGATAGCTTC
AGCGTGGCCTGTGTTTCATCGCTTATTCCATTTGATGTCTGTTATTTGTCAGAGAGAGTG
AATCTGAGACGTTTTTGGGGAGGGGTTTTTAGTGTTTATCCTCCGTCTGGTTTATGCAAC
GGTATTAGTAGTGGTGTGATGGTGGCGTGGTTGTGTGTGGTGAGCAGAACAGGCCTCTTG
TGCTTCAGAATTTCAAGTTCCTGTCACCCTTTTATCTCTCTGTATTAATGGAGTCCTTCT
CGCGACCTTTAATAAGTGTGTGTTCCGGTTCTTCGTCTGATTCTCTTGTTCCTCTGTGGC
TTCTGGTGAAGCAATATAAAGAGGTTGGGTTTTAGACCTTCCGATGAAGGGTTCGCTGGA
GAAGGGGGCTTTAGTCTCAGGTGTTGGTCTCTTCTCTCTGTGGAGTGTCATTCTAGGCTT
ATTGGCTCTGGCTTGATACCTTGAACTGTGGATTCAGGTATGTTTGGTCTTGTGTTGGCC
TCTACTTTGTTATCTCTCTTGTGCTTGGTTGGTTTTTGACAAGAGTGCCGGCATTTCTTG
GATTGGTTGATTTACTTCTATTCTCCTCATCAAAGATTGTCTACAGATTCAGATGTATGA
ATGTAAGGCTTATTTAAGTGCTTGTTGAAACTGTTGTATGTGCTGCCTTATGTTTGGGCT
CGAGATTCCTTTGTGTGGAATATGTTTCCGGGGATGGTAATATGTATCCTCCGGTTATTT
GAAATCCATCTTGTATGTTTTTAAGTTGTATCAATCAAATTCTGACGGGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2EA46TF U 1
AF RR2G464TF U 1
AF RR2EA46JQ C 236
AF RR2G464JQ C 313
BS 1 91 RR2EA46TF
BS 92 92 RR2G464TF
BS 93 169 RR2EA46TF
BS 170 170 RR2G464TF
BS 171 351 RR2EA46TF
BS 352 352 RR2G464TF
BS 353 645 RR2EA46TF
BS 646 1070 RR2EA46JQ

RD RR2EA46TF 645 0 0
TTTTTTATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAGGGTTTTCTCTCTAG
CTTTGTCGCCGCTGCCTCTTCGGCTCCGATG*GCTTACATAGCATCGGGGCCGGATCTCT
AGTCTTCTTGCGTAGTTTAATCTATTTTCTCTTTTTTCATCATCAAATC*TCTTTTACTC
TTAGCAGATTTGGATTTTTAGGGTTTTGATTTTCTTTAGATCCTTAGATCTGGAGTTGTC
GATCTCCTTGAATCTTGTTCAGATGTTGTTGTTTTTGGTTTAGCCTTGTCTGATAGCTTC
AGCGTGGCCTGTGTTTCATCGCTTATTCCATTTGATGTCTGTTATTTGTCAAAGAGAGTG
AATCTGAGACGTTTTTGGGGAGGGGTTTTTAGTGTTTATCCTCCGTCTGGTTTATGCAAC
GGTATTAGTAGTGGTGTGATGGTGGCGTGGTTGTGTGTGGTGAGCAGAACAGGCCTCTTG
TGCTTCAGAATTTCAAGTTCCTGTCACCCTTTTATCTCTCTGTATTAATGGAGTCCTTCT
CGCGACCTTTAATAAGTGTGTGTTCCGGTTCTTCGTCTGATTCTCTTGTTCCTCTGTGGC
TTCTGGTGAAGCAATATAAAGAGGTTGGGTTTTAGACCTTCCGAT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2G464TF 631 0 0
TTTTTTATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAGGGTTTTCTCTCTAG
CTTTGTCGCCGCTGCCTCTTCGGCTCCGATGAGCTTACATAGCATCGGGGCCGGATCTCT
AGTCTTCTTGCGTAGTTTAATCTGTTTTCTCTTTTTTCATCATCAAATCCTCTTTTACTC
TTAGCAGATTTGGATTTTTAGGGTTTTGATTTTCTTTAGATCCTTAGATCTGGAGTTGTC
GATCTCCTTGAATCTTGTTCAGATGTTGTTGTTTTTGGTTTAGCCTTGTCTGATAGCTTC
AGCGTGGCCTGTGTTTCATCGCTTATTCCATTTGATGTCTGTTATTTGTCAGAGAGAGTG
AATCTGAGACGTTTTTGGGGAGGGGTTTTTAGTGTTTATCCTCTGTCTGGTTTATGCAAC
GGTATTAGTAGTGGTGTGATGGTGGCGTGGTTGTGTGTGGTGAGCAGAACAGGCCTTTTG
TGCTTCAGAATTTCAAGTTCCTGTCACCCTTTTATCTCTCTGTATTAATGGAGTCCTTCT
CGCGACCTTTAATAAGTGTGTGTTCCGGTTCTTCGTCTGATTCTCTTGTTCCTCTGTGGC
TTCTGGTGAAGCAATATAAAGAGGTTGGGTT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2EA46JQ 835 0 0
TTGTCGATCTCCTTGAATCTTGTTCAGATGTTGTTGTTTTTGGTTTAGC*TTGTCTGATA
GCTTCAGCGTGGC*TGTGTTTCATCGCTTATTCCATTTGATGTCTGTTATTTGTCAGAGA
GAGTGAATCTGAGACGTTTTTGGGGAGGGGTTTTTAGTGTTTATCCTCCGTCTGGTTTAT
GCAACGGTATTAGTAGTGGTGTGATGGTGGCGTGGTTGTGTGTGGTGAGCAGAACAGGCC
TCTTGTGCTTCAGAATTTCAAGTTCCTGTCACCCTTTTATCTCTCTGTATTAATGGAGTC
CTTCTCGCGACCTTTAATAAGTGTGTGTTCCGGTTCTTCGTCTGATTCTCTTGTTCCTCT
GTGGCTTCTGGTGAAGCAATATAAAGAGGTTGGGTTTTAGACCTTCCGATGAAGGGTTCG
CTGGAGAAGGGGGCTTTAGTCTCAGGTGTTGGTCTCTTCTCTCTGTGGAGTGTCATTCTA
GGCTTATTGGCTCTGGCTTGATACCTTGAACTGTGGATTCAGGTATGTTTGGTCTTGTGT
TGGCCTCTACTTTGTTATCTCTCTTGTGCTTGGTTGGTTTTTGACAAGAGTGCCGGCATT
TCTTGGATTGGTTGATTTACTTCTATTCTCCTCATCAAAGATTGTCTACAGATTCAGATG
TATGAATGTAAGGCTTATTTAAGTGCTTGTTGAAACTGTTGTATGTGCTGCCTTATGTTT
GGGCTCGAGATTCCTTTGTGTGGAATATGTTTCCGGGGATGGTAATATGTATCCTCCGGT
TATTTGAAATCCATCTTGTATGTTTTTAAGTTGTATCAATCAAATTCTGACGGGG

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR2G464JQ 755 0 0
GTTTCATCGCTTATTCCATTTGATGTCTGTTATTTGTCAGAGAGAGTGAATCTGAGACGT
TTTTGGGGAGGGGTTTTTAGTGTTTATCCTCTGTCTGGTTTATGCAACGGTATTAGTAGT
GGTGTGATGGTGGCGTGGTTGTGTGTGGTGAGCAGAACAGGCCTTTTGTGCTTCAGAATT
TCAAGTTCCTGTCACCCTTTTATCTCTCTGTATTAATGGAGTCCTTCTCGCGACCTTTAA
TAAGTGTGTGTTCCGGTTCTTCGTCTGATTCTCTTGTTCCTCTGTGGCTTCTGGTGAAGC
AATATAAAGAGGTTGGGTTTTAGACCTTCCGATGAAGGGTTCGCTGGAGAAGGGGGCTTT
AGTCTCAGGTGTTGGTCTCTTCTCTTTGTGGAGTGTCATTCTAGGCTTATTGGTTCTGGC
TTGATACCTTGAACTGTGGATTCAGGTATGTTTGGTCTTGTGTTGGCCTCTACTTTGTTA
TCTCTCTTGTGCTTGGTTGGTTTTTGACAAGAGTGCCGGCATTTCTTGGATTGGTTGATT
TGCTTCTATTCTCCTCATCAAAGATTGTCTACAGATTCAGATGTATGAATGTAAGGCTTA
TTTAAGTGCTTGTTGAAACTGTTGTATGTGCTGCCTTATGTTTGGGCTCGAGATTCCTTT
GTGTGGAATATGTTTCCGGGGATGGTAATATGTATCCTCCGGTTATTTGAAATCCATCTT
GTATGTTTTTAAGTTGTATCAATCAAATTCTGACG

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 4

CO CL2396Contig1 738 4 9 U
GGGAGGAAAAGGAAGAGAAAAGAAAAGACGCACACACCGCAGACTCCATCGTCTCTCCAG
ATACTCTTATTCGTCTCTGAAACTCATCTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTGGAA
CGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCCCAAGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACTTACC
GTTTCATCGTGTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAACAAGTAATCGTGGAGAAACTCGGCG
AACCTGGTCAATCACATGATGACTTTGCGGCAAGTCTTCCAGCTGATGAATGCAGATACG
CCATCTTCGACTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCA
TCGCATGGTCTCCGGACACAGCGAGAGTGAGAAGCAAAATGATCTATGCGAGCTCTAAGG
ACAGGTTCAAGAGAGAGCTAGACGGGATTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTG
AGATGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTATATCAAAACT
TTGTTTCTTATGCTTTATCCCTAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCATT
TTATCGGTCTTTGTCTTGAGTGTCTTTTTTTCTTTTGGTTCTTAGAGTGTCTTGTTTAGA
ACTTAAGAGAATTGGCTTGTGCTCTTTTACACTTGTGTAAGAAACCCAAACCGTTTTATC
AACAGATTACCCTATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2F225TF U 1
AF RR2FU66JQ C 42
AF RR2FU66TF U 1
AF RR2F225JQ C 7
BS 1 120 RR2F225TF
BS 121 121 RR2FU66TF
BS 122 144 RR2F225TF
BS 145 145 RR2FU66TF
BS 146 333 RR2F225TF
BS 334 334 RR2FU66TF
BS 335 703 RR2F225TF
BS 704 704 RR2FU66TF
BS 705 738 RR2F225TF

RD RR2F225TF 738 0 0
GGGAGGAAAAGGAAGAGAAAAGAAAAGACGCACACACCGCAGACTCCATCGTCTCTCCAG
ATACTCTTATTCGTCTCTGAAACTCATCTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTGGAA
TGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACTTACC
GTTTCATCGTGTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAACAAGTAATCGTGGAGAAACTCGGCG
AACCTGGTCAATCACATGATGACTTTGCGGCAAGTCTTCCAGCTGATGAATGCAGATACG
CCATCTTCGACTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCA
TCGCATGGTCTCCGGACACAGCGAGAGTGAGAAGCAAAATGATCTATGCGAGCTCTAAGG
ACAGGTTCAAGAGAGAGCTAGACGGGATTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTG
AGATGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTATATCAAAACT
TTGTTTCTTATGCTTTATCCCTAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCATT
TTATCGGTCTTTGTCTTGAGTGTCTTTTTTTCTTTTGGTTCTTAGAGTGTCTTGTTTAGA
ACTTAAGAGAATTGGCTTGTGCTCTTTTACACTTGTGTAAGAA*CCCAAACCGTTTTATC
AACAGATTACCCTATTGG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2FU66JQ 697 0 0
GACTCCATCGTCTCTCCAGATACTCTTATTCGTCTCTGAAACTCATCTGATTCAGCCATG
GCTAATGCAGCGTCTGGAACGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCCCAAGTTTCTCGAACTC
AAGGCCAAGAGGACTTACCGTTTCATCGTGTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAACAAGTA
ATCGTGGA*AAACTCGGCGAACCTGGTCAATCACATGATGACTTTGCGGCAAGTCTTCCA
GCTGATGAATGCAGATACGCCATCTTCGACTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAG
AAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCATGGTCTCCGGACACAGCGAGAGTGAGAAGCAAAATG
ATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGGTTCAAGAGAGAGCTAGACGGGATTCAAGTAGAGCTT
CAAGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGA
ACGGTTGTATATCAAAACTTTGTTTCTTATGCTTTATCCCTAAGTTTGCTGTGACGGCAC
CAACCAAAACAGCTTCATTTTATCGGTCTTTGTCTTGAGTGTCTTTTTTTCTTTTGGTTC
TTAGAGTGTCTTGTTTAGAACTTAAGAGAATTGGCTTGTGCTCTTTTACACTTGTGTAAG
AAACCCAAACCGTTTTATCAACAGATTACCCTATTGG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2FU66TF 738 0 0
GGGAGG
AAAAGGAAGAGAAAAGAAAAGACGCACACACCGCAGACTCCATCGTCTCTCCAGATACTC
TTATTCGTCTCTGAAACTCATCTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTGGAACGGCAG
TCCATGATGACTGCAAGCCCAAGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACTTACCGTTTCA
TCGTGTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAACAAGTAATCGTGGA*AAACTCGGCGAACCTG
GTCAATCACATGATGACTTTGCGGCAAGTCTTCCAGCTGATGAATGCAGATACGCCATCT
TCGACTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCAT
GGTCTCCGGACACAGCGAGAGTGAGAAGCAAAATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGGT
TCAAGAGAGAGCTAGACGGGATTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGG
ATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTATATCAAAACTTTGTTT
CTTATGCTTTATCCCTAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCG
GTCTTTGTCTTGAGTGTCTTTTTTTCTTTTGGTTCTTAGAGTGTCTTGTTTAGAACTTAA
GAGAATTGGCTTGTGCTCTTTTACACTTGTGTAAGAAACCCAAACCGTTT*ATCAACAGA
TTACCCTATTGG

QA 7 738 7 738
DS 

RD RR2F225JQ 732 0 0
AAAAGGAAGAGAAAAGAAAAGACGCACACACCGCAGACTCCATCGTCTCTCCAGATACTC
TTATTCGTCTCTGAAACTCATCTGATTCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCTGGAATGGCAG
TCCATGATGACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGAACTCAAGGCCAAGAGGACTTACCGTTTCA
TCGTGTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAACAAGTAATCGTGGAGAAACTCGGCGAACCTG
GTCAATCACATGATGACTTTGCGGCAAGTCTTCCAGCTGATGAATGCAGATACGCCATCT
TCGACTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCAT
GGTCTCCGGACACAGCGAGAGTGAGAAGCAAAATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGGT
TCAAGAGAGAGCTAGACGGGATTCAAGTAGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACTGAGATGG
ATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTATATCAAAACTTTGTTT
CTTATGCTTTATCCCTAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCG
GTCTTTGTCTTGAGTGTCTTTTTTTCTTTTGGTTCTTAGAGTGTCTTGTTTAGAACTTAA
GAGAATTGGCTTGTGCTCTTTTACACTTGTGTAAGAAACCCAAACCGTTTTATCAACAGA
TTACCCTATTGG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 4

CO CL2397Contig1 727 4 2 U
GGACACAAAGAAAGTGAAAATGGCAGCGACGACTTTGTCAATCGCGAGCTCAATCCGCTC
CTATCCTTCCCCCACTCTCGCTTCCCCCCATCACTTCCCTTCTCACTCCCCCGCATTCAC
ATTCCCATCTCGCTTCGGTTCATCTCCCTCCACACTACTCACCCACCGCGCAACCCACCT
CCGTCCCATCTCCGCCGTCGAAGCACCGGAGAAAATCGAAAAAATCGGATCCGAAATCTC
ATCCCTCACCCTCGAGGAAGCACGCGTCCTCGTGGACTACCTCCAGGACAAGTTCGGCGT
CTCGCCGCTCTCCTTAGCTCCCGCCGCAGCGGCTGTCGCTGCTCCGGGAGACGGCGGAGG
CGCGGCGGCTGCGGTGGAAGAGCAGACCGAGTTCGACGTGGTGATCAACGAGGTCCCCAG
CAATGCGCGTATCGCGGTGATCAAAGCAGTGAGGGCGTTGACTAGCTTGGCGTTGAAGGA
AGCCAAGGAGCTTATTGAAGGGTTGCCGAAGAAGTTTAAGGAAGGTGTTACTAAGGACGA
AGCTGAAGAGGCTAAGAAGCAGCTTGAAGAAGCTGGTGCCAAGGTTTCCATTGCTTAAAT
TTATAAAAAAATGTGTTCTTTTTCATAATTTCATGTATCTTTTTCGTGTTGTTAGTATAG
TTTGCGGTTGGGATTGTTGATGCGGATTTGAGCAATTGTTGAAATCTTAATCAATTTGCT
TTCCCCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GI28TF U 1
AF RR2GA71TF U 1
AF RR2GI28JQB C 1
AF RR2GA71JQ C 137
BS 1 610 RR2GA71TF
BS 611 727 RR2GI28JQB

RD RR2GI28TF 579 0 0
GGACACAAAGAAAGTGAAAATGGCAGCGACGACTTTGTCAATCGCGAGCTCAATCCGCTC
CTATCCTTCCCCCACTCTCGCTTCCCCCCATCACTTCCCTTCTCACTCCCCCGCATTCAC
ATTCCCATCTCGCTTCGGTTCATCTCCCTCCACACTACTCACCCACCGCGCAACCCACCT
CCGTCCCATCTCCGCCGTCGAAGCACCGGAGAAAATCGAAAAAATCGGATCCGAAATCTC
ATCCCTCACCCTCGAGGAAGCACGCGTCCTCGTGGACTACCTCCAGGACAAGTTCGGCGT
CTCGCCGCTCTCCTTAGCTCCCGCCGCAGCGGCTGTCGCTGCTCCGGGAGACGGCGGAGG
CGCGGCGGCTGCGGTGGAAGAGCAGACCGAGTTCGACGTGGTGATCAACGAGGTCCCCAG
CAATGCGCGTATCGCGGTGATCAAAGCAGTGAGGGCGTTGACTAGCTTGGCGTTGAAGGA
AGCCAAGGAGCTTATTGAAGGGTTGCCGAAGAAGTTTAAGGAAGGTGTTACTAAGGACGA
AGCTGAAGAGGCTAAGAAGCAGCTTGAAGAAGCTGGTGC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2GA71TF 610 0 0
GGACACAAAGAAAGTGAAAATGGCAGCGACGACTTTGTCAATCGCGAGCTCAATCCGCTC
CTATCCTTCCCCCACTCTCGCTTCCCCCCATCACTTCCCTTCTCACTCCCCCGCATTCAC
ATTCCCATCTCGCTTCGGTTCATCTCCCTCCACACTACTCACCCACCGCGCAACCCACCT
CCGTCCCATCTCCGCCGTCGAAGCACCGGAGAAAATCGAAAAAATCGGATCCGAAATCTC
ATCCCTCACCCTCGAGGAAGCACGCGTCCTCGTGGACTACCTCCAGGACAAGTTCGGCGT
CTCGCCGCTCTCCTTAGCTCCCGCCGCAGCGGCTGTCGCTGCTCCGGGAGACGGCGGAGG
CGCGGCGGCTGCGGTGGAAGAGCAGACCGAGTTCGACGTGGTGATCAACGAGGTCCCCAG
CAATGCGCGTATCGCGGTGATCAAAGCAGTGAGGGCGTTGACTAGCTTGGCGTTGAAGGA
AGCCAAGGAGCTTATTGAAGGGTTGCCGAAGAAGTTTAAGGAAGGTGTTACTAAGGACGA
AGCTGAAGAGGCTAAGAAGCAGCTTGAAGAAGCTGGTGCCAAGGTTTCCATTGCTTAAAT
TTATAAAAAA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2GI28JQB 727 0 0
GGACACAAAGAAAGTGAAAATGGCAGCGACGACTTTGTCAATCGCGAGCTCAATCCGCTC
CTATCCTTCCCCCACTCTCGCTTCCCCCCATCACTTCCCTTCTCACTCCCCCGCATTCAC
ATTCCCATCTCGCTTCGGTTCATCTCCCTCCACACTACTCACCCACCGCGCAACCCACCT
CCGTCCCATCTCCGCCGTGGAAGCACCGGAGAAAATCGAAAAAATCGGATCCGAAATCTC
ATCCCTCACCCTCGAGGAAGCACGCGTCCTCGTGGACTACCTCCAGGACAAGTTCGGCGT
CTCGCCGCTCTCCTTAGCTCCCGCCGCAGCGGCTGTCGCTGCTCCGGGAGACGGCGGAGG
CGCGGCGGCTGCGGTGGAAGAGCAGACCGAGTTCGACGTGGTGATCAACGAGGTCCCCAG
CAATGCGCGTATCGCGGTGATCAAAGCAGTGAGGGCGTTGACTAGCTTGGCGTTGAAGGA
AGCCAAGGAGCTTATTGAAGGGTTGCCGAAGAAGTTTAAGGAAGGTGTTACTAAGGACGA
AGCTGAAGAGGCTAAGAAGCAGCTTGAAGAAGCTGGTGCCAAGGTTTCCATTGCTTAAAT
TTATAAAAAAATGTGTTCTTTTTCATAATTTCATGTATCTTTTTCGTGTTGTTAGTATAG
TTTGCGGTTGGGATTGTTGATGCGGATTTGAGCAATTGTTGAAATCTTAATCAATTTGCT
TTCCCCC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2GA71JQ 591 0 0
GGTTCATCTCCCTCCACACTACTCACCCACCGCGCAACCCACCTCCGTCCCATCTCCGCC
GTCGAAGCACCGGAGAAAATCGAAAAAATCGGATCCGAAATCTCATCCCTCACCCTCGAG
GAAGCACGCGTCCTCGTGGACTACCTCCAGGACAAGTTCGGCGTCTCGCCGCTCTCCTTA
GCTCCCGCCGCAGCGGCTGTCGCTGCTCCGGGAGACGGCGGAGGCGCGGCGGCTGCGGTG
GAAGAGCAGACCGAGTTCGACGTGGTGATCAACGAGGTCCCCAGCAATGCGCGTATCGCG
GTGATCAAAGCAGTGAGGGCGTTGACTAGCTTGGCGTTGAAGGAAGCCAAGGAGCTTATT
GAAGGGTTGCCGAAGAAGTTTAAGGAAGGTGTTACTAAGGACGAAGCTGAAGAGGCTAAG
AAGCAGCTTGAAGAAGCTGGTGCCAAGGTTTCCATTGCTTAAATTTATAAAAAAATGTGT
TCTTTTTCATAATTTCATGTATCTTTTTCGTGTTGTTAGTATAGTTTGCGGTTGGGATTG
TTGATGCGGATTTGAGCAATTGTTGAAATCTTAATCAATTTGCTTTCCCCC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 4

CO CL2398Contig1 991 4 13 U
ATAGAGACGACTCTCTCGACAATGGCGACGACGAAGCTGTTTTCTCCGTCGCTGTCTTGT
CCATGGATGACGACTTCAAGAGATGTAGTAATAATCAAAGAGCGGAGGAGACTCCGGGAC
TTTGTGACGAAACGAAACAGAGTCTCCCCTGTTACCGCCATGATTATGGAGCCTCTCAGC
GCTGTTTCTTCATCGGCGGTTCAGATTCATCAATGGTGGGAACAGAGCCCTAGTTCGTTA
CTGTTGATGGCGGAGACTGGTGGTGGTTACTCGTTGGCTAGCTACTACACGTCATTGGGT
TTGTTCGTTATTTCAGTTCCAGGTCTTTGGTCTCTCATCAAACGCTCTGTTAAATCAAAG
ATAGTGAGGAAGACGTTCGTTGTTAGCGAAGGAGAAGGAGTGAAGAAGGAGCCAAAGCAA
GTTGCTGGAGAGATTCTCTCTTTCTTCACAAGGAAGAATTTTAACATCACTGATCGTGGA
GAAACGATCACGTTTGAAGGAACAATGGTTCCGAGTAGAGGACAAGCTGCTCTGCTCACG
TTCTGTACATGTATAAGTTTAGCAAGTGTGGGTCTTGTCTTAACCATTACATTGCCTGAT
TTTGGAAACAATTGGTTCTTCATTACCATTCTTAGTCCACTCGCAGGAGCGTATTACTGG
AAGAAGGCGTCGAGGAAAGAGGAGATAAAGGTGAAGATGATGGTGGGAGAAAATGGGACA
CTGAGTGAGGTTGTGGTTCAAGGAGATGATGTACAGGTTGAAGAAATGAGGAAGGACCTT
CAGCTTAGTGAGAAAGACATGGTTTATGTTAAAGGTCTCTTTGAGAGATCATGAACACAA
TTTTGCTTTTCCTTTTGAGATCGGGGGAGAATGTGTTTATACATCTGTTTCTAGTATGAG
ACTAAATGACCATTTGACTCAATTTCATAATGTCCATACTTCATAGGAGTAGTAAGCTAA
TTGTTTACATTAAAAGATCTATATACTGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM51TF U 1
AF RR2FI03TF U 28
AF RR2EN34TF U 194
AF RR2CM51JQ C 582
BS 1 306 RR2CM51TF
BS 307 307 RR2FI03TF
BS 308 327 RR2CM51TF
BS 328 328 RR2FI03TF
BS 329 646 RR2CM51TF
BS 647 647 RR2FI03TF
BS 648 661 RR2CM51TF
BS 662 729 RR2FI03TF
BS 730 730 RR2EN34TF
BS 731 758 RR2FI03TF
BS 759 858 RR2EN34TF
BS 859 859 RR2CM51JQ
BS 860 991 RR2EN34TF

RD RR2CM51TF 661 0 0
ATAGAGACGACTCTCTCGACAATGGCGACGACGAAGCTGTTTTCTCCGTCGCTGTCTTGT
CCATGGATGACGACTTCAAGAGATGTAGTAATAATCAAAGAGCGGAGGAGACTCCGGGAC
TTTGTGACGAAACGAAACAGAGTCTCCCCTGTTACCGCCATGATTATGGAGCCTCTCAGC
GCTGTTTCTTCATCGGCGGTTCAGATTCATCAATGGTGGGAACAGAGCCCTAGTTCGTTA
CTGTTGATGGCGGAGACTGGTGGTGGTTACTCGTTGGCTAGCTACTACACGTCATTGGGT
TTGTTCTTTATTTCAGTTCCAGGTCTTCGGTCTCTCATCAAACGCTCTGTTAAATCAAAG
ATAGTGAGGAAGACGTTCGTTGTTAGCGAAGGAGAAGGAGTGAAGAAGGAGCCAAAGCAA
GTTGCTGGAGAGATTCTCTCTTTCTTCACAAGGAAGAATTTTAACATCACTGATCGTGGA
GAAACGATCACGTTTGAAGGAACAATGGTTCCGAGTAGAGGACAAGCTGCTCTGCTCACG
TTCTGTACATGTATAAGTTTAGCAAGTGTGGGTCTTGTCTTAACCATTACATTGCCTGAT
TTTGGAAACAATTGGTTCTTCATTACCATTCTTAGTCCACTCGCAG*AGCGTATTACTGG
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2FI03TF 732 0 0
G
CGACGAAGCTGTTTTCTCCGTCGCTGTCTTGTCCATGGATGACGACTTCAAGAGATGTAG
TAATAATCAAAGAGCGGAGGAGACTCCGGGACTTTGTGACGAAACGAAACAGAGTCTCCC
CTGTTACCGCCATGGTTATGGAGCCTCTCAGCGCTGTTTCTTCATCGGCGGTTCAGATTC
ATCAATGGTGGGAACAGAGCCCTAGTTCGTTACTGTTGATGGCGGAGACTGGTGGTGGTT
ACTCGTTGGCTAGCTACTACACGTCATTGGGTTTGTTCGTTATTTCAGTTCCAGGTCTTT
GGTCCCTCATCAAACGCTCTGTTAAATCAAAGATAGTGAGGAAGACGTTCGTTGTTAGCG
AAGGAGAAGGAGTGAAGAAGGAGCCAAAGCAAGTTGCTGGAGAGATTCTCTCTTTCTTCA
CAAGGAAGAATTTTAACATCACTGATCGTGGAGAAACGATCACGTTTGAAGGAACAATGG
TTCCGAGTAGAGGACAAGCTGCTCTGCTCACGTCCTGTACATGTATAAGTTTAGCAAGTG
TGGGTCTTGTCTTAACCATTACATTGCCTGATTTTGGAAACAATTGGTTCTTCATTACCA
TTCTTAGTCCACTCGCAGGAGCGTATTACTGGAAGAAGGCGTCGAGGAAAGAGGAGATAA
AGGTGAAGATGATGGTGGGAGAAAATGGGACACTGAGTGAG*TTGTGGTTCAAGGAGATG
ATGTACAGGT
G

QA 2 731 2 731
DS 

RD RR2EN34TF 798 0 0
G
GGCGGTTCAGATTCATCAATGGTGGGAACAGAGCCCTAGTTCGTTACTGTTGATGGCGGA
GACTGGTGGTGGTTACTCGTTGGCTAGCTACTACACGTCATTGGGTTTGTTCGTTATTTC
AGTTCCAGGTCTTTGGTCTCTCATCAAACGCTCTGTTAAATCAAAGATAGTGAGGAAGAC
GTTCGTTGTTAGCGAAGGAGAAGGAGTGAAGAAGGAGCCAAAGCAAGTTGCTGGAGAGAT
TCTCTCTTTCTTCACAAGGAAGAATTTTAACATCACTGATCGTGGAGAAACGATCACGTT
TGAAGGAACAATGGTTCCGAGTAGAGGACAAGCTGCTCTGCTCACGTTCTGTACATGTAT
AAGTTTAGCAAGTGTGGGTCTTGTCTTAACCATTACATTGCCTGATTTTGGAAACAATTG
GTTCTTCATTACCATTCTTAGTCCACTCGCAGGAGCGTATTACTGGAAGAAGGCGTCGAG
GAAAGAGGAGATAAAGGTGAAGATGATGGTGGGAGAAAATGGGACACTGAGTGAGGTTGT
GGTTCAAGGAGATGACGTACAGGTTGAAGAAATGAGGAAGGACCTTCAGCTTAGTGAGAA
AGACATGGTTTATGTTAAAGGTCTCTTTGAGAGATCATGAACACAATTTTGCTTTTCCTT
TTGATATCGGGGGAGAATGTGTTTATACATCTGTTTCTAGTATGAGACTAAATGACCATT
TGACTCAATTTCATAATGTCCATACTTCATAGGAGTAGTAAGCTAATTGTTTACATTAAA
AGATCTATATACTGAGT

QA 2 798 2 798
DS 

RD RR2CM51JQ 401 0 0
AACCATTACATTGCCTGATTTTGGAAACAATTGGTTTTTCATTACCATTTTTAGTCCACT
CGCAGGAGGGTATTACTGGAAGAAGGCGTCGAGGAAAGAGGAGATAAAGGTGAAGATGAT
GGTGGGAGAAAATGGGACACTGAGTGAGGTTGTGGTTCAAGGAGATGATGTACAGGTTGA
AGAAATGAGGAAGGACCTTCAGCTTAGTGAGAAAGACATGGTTTATGTTAAAGGTTTTTT
TGAGAGATCATGAACACAATTTTGCTTTTCCTTTTGAGATCGGGGGAGAATGTGTTTATA
CATCTGTTTTTAGTATGAGACTAAATGACCATTTGACTCAATTTCATAATGTCCATACTT
CATAGGAGTAGTAAGCTAATTGTTTACATTAAAAGATCTAT

QA 1 401 1 401
DS 



AS 2 4

CO CL2399Contig1 923 2 4 U
GGAGAACAAAACACGAAGTACTTACTGGGAAAAGCTTAAAGGTCACACGAATAGATATTC
GATCCAATCTAGTATAGAACTATCAGTTTGTCATCTTCTTCAGTCTCAATGATGTATCTC
CCTTCTGAAGACTCCTCATCACCAGTTCTCAACGCTTCCTCTATGCACGCACCAAGGCCG
AGTATGTTGATACAGAAATGCGAAAATGGATTTAAGATGAGGAAGCTGAATGATGATGCT
GAAGAAAACAATGACTCCTTACAGATGGAGTCAAACATCACACATGCAGAGGAGGCGAAT
AAGCTTCCTCTAGTTTCTGAACCAGTAGCAGCAGCTCTGGTGCCTCATGCAACCAAGCCC
GACACTACCGAAGAAGATACTCAGAAAGTATGTGCCAGAGAACAGTTGTATAAGCTATGT
GGTGTGAGGCATTGGAAAGCACCATTGTATAAGTTTTTCAACCAAGATGGCCCTGACAAT
GAGAAAGTATTTTAAGTCGAAGTCAATGTTGAAATAAAGGAAGTTTCAGGGATAACGTTT
CTGGAGTGTTTTGGAGATCCACACAACAAGAAGAAAATAGCAGCTGAGCAGGCTGCAGAA
GTAGCGCTTTGGTTTCTCAAGAATGTGGGTCATACCGTCTAGACTGACAATGCTTCTGGT
CGTGAGGGAGGGCAAAAAAACGCTTTAGAATCTGTTAATGACATATGACTTAAGTAGGTC
TAGTTTTGTTCATGTTAATTGGCTTTTAGCTGGTTAGCATTTGATAGAATCTCTCTACCT
AGGAAGTTCAAAAGTGTGTCAGCCTCTACCCTCAACATTCTCACATCGTATAAGAGACTA
TGTTTGATGTCTGTCAAAGTTTGTGTACAAGGATCATCTTTTCTGTAACGTTAGTAGTAA
GTAAAAACTATGAAGTTATGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D543TF U 1
AF RR2D543JQ C 191
BS 1 589 RR2D543TF
BS 590 590 RR2D543JQ
BS 591 671 RR2D543TF
BS 672 923 RR2D543JQ

RD RR2D543TF 671 0 0
GGAGAACAAAACACGAAGTACTTACTGGGAAAAGCTTAAAGGTCACACGAATAGATATTC
GATCCAATCTAGTATAGAACTATCAGTTTGTCATCTTCTTCAGTCTCAATGATGTATCTC
CCTTCTGAAGACTCCTCATCACCAGTTCTCAACGCTTCCTCTATGCACGCACCAAGGCCG
AGTATGTTGATACAGAAATGCGAAAATGGATTTAAGATGAGGAAGCTGAATGATGATGCT
GAAGAAAACAATGACTCCTTACAGATGGAGTCAAACATCACACATGCAGAGGAGGCGAAT
AAGCTTCCTCTAGTTTCTGAACCAGTAGCAGCAGCTCTGGTGCCTCATGCAACCAAGCCC
GACACTACCGAAGAAGATACTCAGAAAGTATGTGCCAGAGAACAGTTGTATAAGCTATGT
GGTGTGAGGCATTGGAAAGCACCATTGTATAAGTTTTTCAACCAAGATGGCCCTGACAAT
GAGAAAGTATTTTAAGTCGAAGTCAATGTTGAAATAAAGGAAGTTTCAGGGATAACGTTT
CTGGAGTGTTTTGGAGATCCACACAACAAGAAGAAAATAGCAGCTGAGC*GGCTGCAGAA
GTAGCGCTTTGGTTTCTCAAGAATGTGGGTCATACCGTCTAGACTGACAATGCTTCTGGT
CGTGAGGGAGG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2D543JQ 733 0 0
TACAGAAATGCGAAA*TGGATTTAAGATGAGGAAGCTGAATGATGATGCTGAAGAAAACA
ATGACTCCTTACAGATGGAGTCAAACATCACACATGCAGAGGAGGCGAATAAGCTTCCTC
TAGTTTCTGAACCAGTAGCAGCAGCTCTGGTGCCTCATGCAACCAAGCCCGACACTACCG
AAGAAGATACTCAGAAAGTATGTGCCAGAGAACAGTTGTATAAGCTATGTGGTGTGAGGC
ATTGGAAAGCACCATTGTATAAGTTTTTCAACCAAGATGGCCCTGACAATGAGAAAGTAT
TTTAAGTCGAAGTCAATGTTGAAATAAAGGAAGTTTCAGGGATAACGTTTCTGGAGTGTT
TTGGAGATCCACACAACAAGAAGAAAATAGCAGCTGAGCAGGCTGCAGAAGTAGCGCTTT
GGTTTCTCAAGAATGTGGGTCATACCGTCTAGACTGACAATGCTTCTGGTCGTGAGGGAG
GGCAAAAAAACGCTTTAGAATCTGTTAATGACATATGACTTAAGTAGGTCTAGTTTTGTT
CATGTTAATTGGCTTTTAGCTGGTTAGCATTTGATAGAATCTCTCTACCTAGGAAGTTCA
AAAGTGTGTCAGCCTCTACCCTCAACATTCTCACATCGTATAAGAGACTATGTTTGATGT
CTGTCAAAGTTTGTGTACAAGGATCATCTTTTCTGTAACGTTAGTAGTAAGTAAAAACTA
TGAAGTTATGGTT

QA 1 733 1 733
DS 



CO CL2399Contig2 886 2 2 U
GGATTTCAGACAGAGACACAGAACAAAACACGAACTACTTACTGGGAAAAGCTTAAAGGT
CACACGAATATTCGATCCAATCTAGTATAGAACTATCAATTTATCATCTTCTTCAGTCTC
AATGATGTATCTCCCTTCTGAAGACTCCTCATCACCAGTTCCCAACGCTTCCTCTATGGC
ACCAAAACCGAGGATGTTGATACAGAAATGCGAAAATGGATTTAAGATGAGGAAGCTGAA
TGATGATGCTGAAGAAAACAATGACTCCTTACAGATGGAGTCAGACGTCACACATGCAGA
GGAGGCGAATAAGCTTCCTCTAGTGTCTGAACCAGAAGCAGCAGCTTTGGTGCCTCATGA
AACCAAGCCCGAAACTACTGAAGATACTCAGAAAGTATGTGCCAGAGAACAGTTGTATAA
GCTATGTGGTGTGAGGCATTGGAAAGCACCATTATATAAGTTCTTCAACCAAGATGGCCC
TGACAATAAGAAATTATTTAAAGTCGAAGTCAATGTTGAAATAAAGGAAGTTTCAGGGGT
AACGTTTCTGGAGTGTTTTGGAGATCCACACAACAAGAAGAAAATAGCAGCTGACCAGGC
AGCAGAAGTAGCGCTTTGGTTTCTCAAGAATGTGGGTCATACCGTCCAGACTAACAATGC
TTCTGGTCGTGAGGGAGGACATAAAACGCTTTAGAATCTGTTAACATATGACTTAAATAG
TCTAGTTTTGTTCATGTTAATTGGCTTTTAGCTGGTTAGCATTTGATAGAATCTCTACCT
CGGGAGTTAAAAAGTGTGTAGGCCTCTACCCTCAACATTCTCACATCGTATAAGAGACTA
TGTTTGATGTCTGTCAAAGTTTGTGTACAAGGATCATCTTTTCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC27TF U 1
AF RR2DC27JQ C 178
BS 1 526 RR2DC27TF
BS 527 886 RR2DC27JQ

RD RR2DC27TF 531 0 0
GGATTTCAGACAGAGACACAGAACAAAACACGAACTACTTACTGGGAAAAGCTTAAAGGT
CACACGAATATTCGATCCAATCTAGTATAGAACTATCAATTTATCATCTTCTTCAGTCTC
AATGATGTATCTCCCTTCTGAAGACTCCTCATCACCAGTTCCCAACGCTTCCTCTATGGC
ACCAAAACCGAGGATGTTGATACAGAAATGCGAAAATGGATTTAAGATGAGGAAGCTGAA
TGATGATGCTGAAGAAAACAATGACTCCTTACAGATGGAGTCAGACGTCACACATGCAGA
GGAGGCGAATAAGCTTCCTCTAGTGTCTGAACCAGAAGCAGCAGCTTTGGTGCCTCATGA
AACCAAGCCCGAAACTACTGAAGATACTCAGAAAGTATGTGCCAGAGAACAGTTGTATAA
GCTATGTGGTGTGAGGCATTGGAAAGCACCATTATATAAGTTCTTCAACCAAGATGGCCC
TGACAATAAGAAATTATTTAAAGTCGAAGTCAATGTTGAAATAAAG
AAGTT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2DC27JQ 709 0 0
GGCACCAAAA
CCGAGGATGTTGATACAGAAATGCGAAAATGGATTTAAGATGAGGAAGCTGAATGATGAT
GCTGAAGAAAACAATGACTCCTTACAGATGGAGTCAGACGTCACACATGCAGAGGAGGCG
AATAAGCTTCCTCTAGTGTCTGAACCAGAAGCAGCAGCTTTGGTGCCTCATGAAACCAAG
CCCGAAACTACTGAAGATACTCAGAAAGTATGTGCCAGAGAACAGTTGTATAAGCTATGT
GGTGTGAGGCATTGGAAAGCACCATTATATAAGTTCTTCAACCAAGATGGCCCTGACAAT
AAGAAATTATTTAAAGTCGAAGTCAATGTTGAAATAAAGGAAGTTTCAGGGGTAACGTTT
CTGGAGTGTTTTGGAGATCCACACAACAAGAAGAAAATAGCAGCTGACCAGGCAGCAGAA
GTAGCGCTTTGGTTTCTCAAGAATGTGGGTCATACCGTCCAGACTAACAATGCTTCTGGT
CGTGAGGGAGGACATAAAACGCTTTAGAATCTGTTAACATATGACTTAAATAGTCTAGTT
TTGTTCATGTTAATTGGCTTTTAGCTGGTTAGCATTTGATAGAATCTCTACCTCGGGAGT
TAAAAAGTGTGTAGGCCTCTACCCTCAACATTCTCACATCGTATAAGAGACTATGTTTGA
TGTCTGTCAAAGTTTGTGTACAAGGATCATCTTTTCTGT

QA 11 709 11 709
DS 



AS 1 3

CO CL2400Contig1 811 3 16 U
GCCCTTGGTGTTATATTGAACTATTTGTTCTATTTTGGTAAGCTAAGTGCAACTCTGTGG
CGACTTTGGGAAGACTTTATCACTGTTGGTGGACTCTCCGTTCTTCCTCAAGTCATGTGG
TCTACTTTTGTCCCTCTTGTCCCAAACAGTATCTTGCCTGGGACAACTGCTTGTGTTATT
GCTGTAGCCGCTGTATTTATGGCACGAACCGGCAAACTCTCAGAGGAAGGTGTTAAGTTT
GTCGAGTCTTTATCTGGATGGACAGCGACACTTATGTTCATGTGGATGCCAGTTTCCCAA
ATGTGGACAAATTTCCTAAGTCCAGACAATATAAAAGGCTTATCACCAATCACAATGTTG
CTTTCTATGACGGGGAACGGGCTTATGCTCCCAAGAGCACTATTTATCCGTGATTTGATG
TGGTTCACTGGTTCAATATGGGCAACTCTCTTTTATGGATATGGAAACATCCTGTGCCTA
TACCTGTCTGACTGCACCAGCAAGTCATTCTTTGCGGCATCCACAATTGGTTTGATCTCA
TGGATAGGACTTGCTTTATGGAGAGATTCAGCAGCTCATGGTCACAACTCGCCGTTTAGA
TCACTGAAGGAACTGGTTTTTGGATCATAACTGAAAGAGCTTGAACGCACTGTTTGCTTC
AAAGCAAGCAAGCACATAGGGAGGGATTACTTGTTTGTATCAAGGACCAAGCCATATGTA
TTATTTTATGTTAAT*GTTATTTGTA*TTTGTCC*AAGTTCCTACATGAAACGCCTATTT
AGTGCCACATTATTACTTGTGCTGATCACAA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK22TF U 1
AF RR2DM07TF U 6
AF RR2EZ13JQ C 371
BS 1 263 RR2AK22TF
BS 264 264 RR2DM07TF
BS 265 489 RR2AK22TF
BS 490 490 RR2DM07TF
BS 491 733 RR2AK22TF
BS 734 734 RR2DM07TF
BS 735 735 RR2AK22TF
BS 736 736 RR2DM07TF
BS 737 738 RR2AK22TF
BS 739 739 RR2DM07TF
BS 740 745 RR2AK22TF
BS 746 746 RR2DM07TF
BS 747 747 RR2AK22TF
BS 748 752 RR2DM07TF
BS 753 786 RR2AK22TF
BS 787 811 RR2DM07TF

RD RR2AK22TF 788 0 0
GCCCTTGGTGTTATATTGAACTATTTGTTCTATTTTGGTAAGCTAAGTGCAACTCTGTGG
CGACTTTGGGAAGACTTTATCACTGTTGGTGGACTCTCCGTTCTTCCTCAAGTCATGTGG
TCTACTTTTGTCCCTCTTGTCCCAAACAGTATCTTGCCTGGGACAACTGCTTGTGTTATT
GCTGTAGCCGCTGTATTTATGGCACGAACCGGCAAACTCTCAGAGGAAGGTGTTAAGTTT
GTCGAGTCTTTATCTGGATGGACGGCGACACTTATGTTCATGTGGATGCCAGTTTCCCAA
ATGTGGACAAATTTCCTAAGTCCAGACAATATAAAAGGCTTATCACCAATCACAATGTTG
CTTTCTATGACGGGGAACGGGCTTATGCTCCCAAGAGCACTATTTATCCGTGATTTGATG
TGGTTCACTGGTTCAATATGGGCAACTCTCTTTTATGGATATGGAAACATCCTGTGCCTA
TACCTGTCT*ACTGCACCAGCAAGTCATTCTTTGCGGCATCCACAATTGGTTTGATCTCA
TGGATAGGACTTGCTTTATGGAGAGATTCAGCAGCTCATGGTCACAACTCGCCGTTTAGA
TCACTGAAGGAACTGGTTTTTGGATCATAACTGAAAGAGCTTGAACGCACTGTTTGCTTC
AAAGCAAGCAAGCACATAGGGAGGGATTACTTGTTTGTATCAAGGACCAAGCCATATGTA
TTATTTTATGTTATTTGTAATTTGTC******CC*AAGTTCCTACATGAAACGCCTATTT
AGTGCC
AC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2DM07TF 806 0 0
G
GGTGTTATATTGAACTATTTGTTCTATTTTGGTAAGCTAAGTGCAACTCTGTGGCGACTT
TGGGAAGACTTTATCACTGTTGGTGGACTCTCCGTTCTTCCTCAAGTCATGTGGTCTACT
TTTGTCCCTCTTGTCCCAAACAGTATCTTGCCTGGGACAACTGCTTGTGTTATTGCTGTA
GCCGCTGTATTTATGGCACGAACCGGCAAACTCTCAGAGGAAGGTGTTAAGTTTGTCGAG
TCTTTATCTGGATGGACAGCGACACTTATGTTCATGTGGATGCCAGTTTCCCAAATGTGG
ACAAATTTCCTAAGTCCAGACAATATAAAAGGCTTATCACCAATCACAATGTTGCTTTCT
ATGACGGGGAACGGGCTTATGCTCCCAAGAGCACTATTTATCCGTGATTTGATGTGGTTC
ACTGGTTCAATATGGGCAACTCTCTTTTATGGATATGGAAACATCCTGTGCCTATACCTG
TCTGACTGCACCAGCAAGTCATTCTTTGCGGCATCCACAATTGGTTTGATCTCATGGATA
GGACTTGCTTTATGGAGAGATTCAGCAGCTCATGGTCACAACTCGCCGTTTAGATCACTG
AAGGAACTGGTTTTTGGATCATAACTGAAAGAGCTTGAACGCACTGTTTGCTTCAAAGCA
AGCAAGCACATAGGGAGGGATTACTTGTTTGTATCAAG*ACCAAGCCATATGTATTATTT
TATGTTAAT*GTTATTTGTA*TTTGTCC*AAGTTCCTACATGAA*CGCCTATTTAGTGCC
ACATTATTACTTGTGCTGATCACAA

QA 2 806 2 806
DS 

RD RR2EZ13JQ 416 0 0
CGGGGAACGGGCTTATGCTCCCAAGAGCACTATTTATCCGTGATTTGATGTGGTTCACTG
GTTCAATATG**CAACTTTCTTTTATGGATATGGAAACATCCTGTGCCTATACCTGTCTG
ACTGCACCAGCAAGTCATTTTTTGCGGCATCCACAATTGGTTTGATCTCATGGATAGGAC
TTGCTTTATGGAGAGATTCAGCAGCTCATGGTCACAACTCGCCGTTTAGATCACTGAAGG
AACTGGTTTTTGGATCATAACTGAAAGAGCTTGAACGCACTGTTTGCTTCAAAGCAAGCA
AGCACATAGGGAGGGATTACTTGTTTGTATCAAGGACCAAGCCATATGTATTATTTTATG
TTAAT*GTTATTTGTAATTTGTCCCAAGTTCCTACATGAAACGCCTATTTAGTGCC

QA 1 416 1 416
DS 



AS 1 4

CO CL2401Contig1 1249 4 15 U
GGAAGGTCCCTGAAACCATATAGTATATAAAATACATGATTTGTCCCGTCTCCTATCTAT
ATCTCAGACACTCTTTCGATCGTCATATCACTTTGGGGCCTAAATTTTCAGTGTGTAAAT
GGGTATATTTCCTGAGTTTGGTGGCTGGATCAGTCAGAACACTCAACAGCCTAAAGAATC
TGAAAATGTTAAATCCAAGCCTGTGAGAGAGACAAAAACTCATGATGAGAGAGATGAGAC
GAGGGAGCAATTAAAACTGTGGAGAGATGCAAATAAGAAGAAACAATATAATGAACCTTC
TCCTACGGGGAAGGTGCATACAGACCATAATACTGATAGCTCTTCCAGTATGGAAATGGA
ATTTACATTAGGATTGCCACCTCAAGCAGCTTACGACTTTTTAACTAATCATGACAACAA
AACATACTCTAGAGAAATCAATGGCCGCCCACTTCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTAC
ATCAGAGAGAGGTCTAGGGGATAGGCCGATCCTGGAGGTTGATAAAGAGTTGTCATGGAA
CTTCCTTTTCTTTTCAGGAACTATCCCAATACGTCTATATGTCCTCGAAAAGCCAGAAGA
ACTTTCTGCATATAACTGGAAAAGTAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGTTCAGGGT
TGACTACACAGTGGAGCCAATATATGTTGATGCAGAACGCTTGTGCAAGCACAAGAAGCC
GAAGAGTATTGAAGAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGATTGATTGCGTCCAAGAT
TAAAGTGGACCAGAGTTTTAGGCTTTCTTTTCCTTGGAATCTGCCTCTGCTGTCTTTGTA
CTTTCGCCGGTTCACTGTTGAGACCACTAAGAAAGTGGCGGAAGATCTTCAAATGCGGGC
TGGTGATATCCGAGGTTTTTGAAATACACAAAACCCCGGTATCCGTCGGTTGTAACGTCT
TCGTAAAACAACACATCAAATAGTGTTTTAAAATCGCGTTATCATAAATTAGAATAGCAG
AATTTTTAAAGTTAAAATCTTAATATTTTCACGAATAAGTACTAGGGAAATTTTGCACCT
TGCCAGGGATGAAAGTGATGAACAAATTTTCCTAGACATGATATTAATTATGTTATATCG
ATTATTTGCATCGGTAAAATAAGAAATTTTACAACCCTGAAAAGGCAGAAAATAGATGTA
CTATACTATATGGTGTAATATACAGTAGTGGAAACAAAGCATTTTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E519TF U 1
AF RR2DU96TF U 18
AF RR2DU96JQ C 829
AF RR2E519JQ C 583
BS 1 189 RR2E519TF
BS 190 190 RR2DU96TF
BS 191 211 RR2E519TF
BS 212 212 RR2DU96TF
BS 213 233 RR2E519TF
BS 234 234 RR2DU96TF
BS 235 249 RR2E519TF
BS 250 679 RR2DU96TF
BS 680 680 RR2E519JQ
BS 681 692 RR2DU96TF
BS 693 923 RR2E519JQ
BS 924 924 RR2DU96JQ
BS 925 1010 RR2E519JQ
BS 1011 1011 RR2DU96JQ
BS 1012 1249 RR2E519JQ

RD RR2E519TF 255 0 0
GGAAGGTCCCTGAAACCATATAGTATATAAAATACATGATTTGTCCCGTCTCCTATCTAT
ATCTCAGACACTCTTTCGATCGTCATATCACTTTGGGGCCTAAATTTTCAGTGTGTAAAT
GGGTATATTTCCTGAGTTTGGTGGCTGGATCAGTCAGAACACTCAACAGCCTAAAGAATC
TGAAAATGT*AAATCCAAGCCTGTGAGAGAG*CAAAAACTCATGATGAGAGAG*TGAGAC
GAGGGAGCA
TTAAAA

QA 1 249 1 249
DS 

RD RR2DU96TF 675 0 0
GG
ATAGTATATAAAATACATGATTTGTCCCGTCTCCTATCTATATCTCAGACACTCTTTCGA
TCGTCATATCACTTTGGGGCCTAAATTTTCAGTGTGTAAATGGGTATATTTCCTGAGTTT
GGTGGCTGGATCAGTCAGAACACTCAACAGCCTAAAGAATCTGAAAATGTTAAATCCAAG
CCTGTGAGAGAGACAAAAACTCATGATGAGAGAGATGAGACGAGGGAGCAATTAAAACTG
TGGAGAGATGCAAATAAGAAGAAACAATATAATGAACCTTCTCCTACGGGGAAGGTGCAT
ACAGACCATAATACTGATAGCTCTTCCAGTATGGAAATGGAATTTACATTAGGATTGCCA
CCTCAAGCAGCTTACGACTTTTTAACTAATCATGACAACAAAACATACTCTAGAGAAATC
AATGGCCGCCCACTTCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGAGAGGTCTAGGG
GATAGGCCGATCCTGGAGGTTGATAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTTTTCAGGA
ACTATCCCAATACGTCTATATGTCCTCGAAAAGCCAGAAGAACTTTCTGCATATAACTGG
AAAAGTAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGTTCAGGGTTGACTACACAGTGGAGCCA
*TATATGTTGATG

QA 3 675 3 675
DS 

RD RR2DU96JQ 344 0 0
GCTGTCTTTGTACTTTCGCCGGTTCACTGTTGAGACCACTAAGAAAGTGGCGGAAGATCT
TCAAATGCGGGCTGGTGATATCCGAGGTTTTTGAAATACACAAAACCCCGGTATCCGTCG
GTT**AACGTCTTCGTAAAACAACACATCAAATAGTGTTTTAAAATCGCGTTATCATAAA
TTAGAATAGCAGAATTTTTAAAGTTAAAATCTTGATATTTTCACGAATAAGTACTAGGGA
AATTTTGCACCTTGCCAGGGATGAAAGTGATGAACAAATTTTCCTAGACATGATATTAAT
TATGTTATATCGATTATTTGCATCGGTAAAATAAGAAATTTTAC

QA 1 344 1 344
DS 

RD RR2E519JQ 667 0 0
CCTCGAAAAGCCAGAAGAACTTTCTGCATATAACTGGAAAAGTAGAAAAGGAATGGACTA
CATGGAAACGTTCAGGGTTGACTACACAGTGGAGCCAATATATGTTGATGCAGAACGCTT
GTGCAAGCACAAGAAGCCGAAGAGTATTGAAGAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGG
ATTGATTGCGTCCAAGATTAAAGTGGACCAGAGTTTTAGGCTTTCTTTTCCTTGGAATCT
GCCTCTGCTGTCTTTGTACTTTCGCCGGTTCACTGTTGAGACCACTAAGAAAGTGGCGGA
AGATCTTCAAATGCGGGCTGGTGATATCCGAGGTTTTTGAAGTACACAAAACCCCGGTAT
CCGTCGGTTGTAACGTCTTCGTAAAACAACACATCAAATAGTGTTTTAAAATCGCGTTAT
CATAAATTCGAATAGCAGAATTTTTAAAGTTAAAATCTTAATATTTTCACGAATAAGTAC
TAGGGAAATTTTGCACCTTGCCAGGGATGAAAGTGATGAACAAATTTTCCTAGACATGAT
ATTAATTATGTTATATCGATTATTTGCATCGGTAAAATAAGAAATTTTACAACCCTGAAA
AGGCAGAAAATAGATGTACTATACTATATGGTGTAATATACAGTAGTGGAAACAAAGCAT
TTTGTGC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 3

CO CL2402Contig1 757 3 5 U
GGAGCCATTGCGGTCTTATCCCGAACTCCCAACAAAACACTCAGAAATTTTCTTGGTGGT
CTCTCCAATGGCGTTCTCAGCGACTCTGTCTCAACTTTCTTCTCTTTCGACAATCTCCTC
TTCACTGCCACTTTCTTCTAGAAGCTTCCCTCTTCGATCTCAGACTCAGTTCAGAGTCAA
AGCAGAGGCAGAGAATGAGAAACAGAGCACACAGGCTAAATCCGAAGGGGAAGCTTCACC
AGCTCCAACCAAAACCCCTAAAACTCTTCCCAAGAAACCAGTTTACTCGATGAAGAAGGG
TCAAATCGTTCGTGTAGACAAGGAGAAGTACCTCAACAGCATCGATTACTTATCAGTTGG
TCATCCACCTTTCTACAAAGGACTAGATTACATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTCCTGGA
CATTCGTGTCTTTGAGACAGGAGAGTATGCCCTTGTTGGATGGGTTGGTATACCAACCGC
ACCGGCTTGGCTACCAACAGATATGCTCATCAAGTCCGAGAAACTCGTTTACGAGCGACT
ATAGAGTCCACAAGTCTCCAAGAAGAATTGCAACTGATACGATGGGTTGTGAGATAATGA
TAACACAATGGAACCACCATGATCATGTCAAGAGTTTTACAATGTATCAAATAAGTTACC
GTAGTCAAAAGAAAAAAAACTGTTGTGGAATGTAAAAAATGTGATGAGACTGAATCTTAC
AAAAAGAATGCAGCTTTAATAGTTGCATACCTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CY39TF U 13
AF RR2B535TF U 1
AF RR2B535JQ C 153
BS 1 41 RR2B535TF
BS 42 42 RR2CY39TF
BS 43 93 RR2B535TF
BS 94 94 RR2CY39TF
BS 95 757 RR2B535TF

RD RR2CY39TF 439 0 0
GTCTTATCCCGAACTCCCAACAAAACACTCAGAAATTTTCTTGGTGGTCTCTCCAATGGC
GTTCTCAGCGACTCTGTCTCAACTTTCTTCTCTTTCGACAATCTCCTCTTCACTGCCACT
TTCTTCTAGAAGCTTCCCTCTTCGATCTCAGACTCAGTTCAGAGTCAAAGCAGAGGCAGA
GAATGAGAAACAGAGTACACAGACTAAATCCGAAGGGGAAGCTTCACCAGCTCCAACCAA
AACCCCTAAAACTCTTCCCAAGAAACCAGTTTACTCGATGAAGAAGGGTCAGATCGTTCG
TGTAGACAAGGAGAAGTACCTCAACAGCATCAATTACTTATCAGTTGGTCATCCACCTTT
CTACAAAGGACTAGATTACATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTCCTGGACATTCGTGTCTT
TGAGACAGGAGAGTATGCC

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2B535TF 757 0 0
GGAGCCATTGCGGTCTTATCCCGAACTCCCAACAAAACACTGAGAAATTTTCTTGGTGGT
CTCTCCAATGGCGTTCTCAGCGACTCTGTCTCAGCTTTCTTCTCTTTCGACAATCTCCTC
TTCACTGCCACTTTCTTCTAGAAGCTTCCCTCTTCGATCTCAGACTCAGTTCAGAGTCAA
AGCAGAGGCAGAGAATGAGAAACAGAGCACACAGGCTAAATCCGAAGGGGAAGCTTCACC
AGCTCCAACCAAAACCCCTAAAACTCTTCCCAAGAAACCAGTTTACTCGATGAAGAAGGG
TCAAATCGTTCGTGTAGACAAGGAGAAGTACCTCAACAGCATCGATTACTTATCAGTTGG
TCATCCACCTTTCTACAAAGGACTAGATTACATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTCCTGGA
CATTCGTGTCTTTGAGACAGGAGAGTATGCCCTTGTTGGATGGGTTGGTATACCAACCGC
ACCGGCTTGGCTACCAACAGATATGCTCATCAAGTCCGAGAAACTCGTTTACGAGCGACT
ATAGAGTCCACAAGTCTCCAAGAAGAATTGCAACTGATACGATGGGTTGTGAGATAATGA
TAACACAATGGAACCACCATGATCATGTCAAGAGTTTTACAATGTATCAAATAAGTTACC
GTAGTCAAAAGAAAAAAAACTGTTGTGGAATGTAAAAAATGTGATGAGACTGAATCTTAC
AAAAAGAATGCAGCTTTAATAGTTGCATACCTAAACC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2B535JQ 605 0 0
TTCGATCTCAGACTCAGTTCAGAGTCAAAGCAGAGGCAGAGAATGAGAAACAGAGCACAC
AGGCTAAATCCGAAGGGGAAGCTTCACCAGCTCCAACCAAAACCCCTAAAACTCTTCCCA
AGAAACCAGTTTACTCGATGAAGAAGGGTCAAATCGTTCGTGTAGACAAGGAGAAGTACC
TCAACAGCATCGATTACTTATCAGTTGGTCATCCACCTTTCTACAAAGGACTAGATTACA
TCTATGAAGATCGCGGCGAGGTCCTGGACATTCGTGTCTTTGAGACAGGAGAGTATGCCC
TTGTTGGATGGGTTGGTATACCAACCGCACCGGCTTGGCTACCAACAGATATGCTCATCA
AGTCCGAGAAACTCGTTTACGAGCGACTATAGAGTCCACAAGTCTCCAAGAAGAATTGCA
ACTGATACGATGGGTTGTGAGATAATGATAACACAATGGAACCACCATGATCATGTCAAG
AGTTTTACAATGTATCAAATAAGTTACCGTAGTCAAAAGAAAAAAAACTGTTGTGGAATG
TAAAAAATGTGATGAGACTGAATCTTACAAAAAGAATGCAGCTTTAATAGTTGCATACCT
AAACC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 4

CO CL2403Contig1 1248 4 6 U
GCTAAAGTAGAACGATCCACACATAGAGTCTGATACATACGCGCACACACACTACTTGGT
ATACTGCATTAATTATTGCAGATCCAAGAAAGAGTAATTGATGCTAAGAAACAACATAAT
TTTCTTTTTCTGAAGTTTTGTTTTCATATCCTGAAATTCAAGAGATGTGATGTTCCATCC
AGACCTTTCTCAAAATATCCATCAGTGTATTCTTTTATGGTAATGTCTCTGTATTTTGGA
GGGTCTTCTTCAGACACAAGCTCTTTCATTGGTCCATAAACTGTGGAATTGGCATGTTTA
CTTGAGCTAAAAAAGCTTGCAACTGAAATCCTTGGTCCTTGTCTATTCGCAAGCACCCTA
TGCTCCACGCTAACGAACTTATCGTTCGTTAAAAGCTGCAAGAAATCTCCCATGTTGATG
ACAAGAGCTCCAGGAAGAGGAGCCACATCAACCCAAGAGTCTTGATGAAGAATTTGTAGA
CCACCGATGTTGTCTTGAAGAAAAACCGTGAGGAAGGAGTTGTCTGAGTGTTGACTTATC
CCCAAAGTTAGGTCAGGTTGTGGACAAGGTGGGTAATAATGGCATACCATAAGCAAAGTC
TTCAAGCACTCCTTGCTCTTAAGGGTCTCAGATTCCAAACCTAGTGCTTCTGAGAGAAGC
TCAAAGAGTAAACCACCTAAACTCATCACATGTTTTGAGTATTCGAACACAGCATCCCTG
CAAGCCACTGGGAGCTCCTCAGGAGCTGGAGGATCTGGAACTATGTAACAAACGAACGAA
TCTCTCCAGTTAACAGAAGGAGAAGAACTGTATAGATCGAAGTTACTATTGTAGATAAAC
TTTTTGTTAGTGTCACCACGGGTGAAGTATTGTTTCTTGACCTCAGGATCTTCCTCATGG
AACCTACGAACTCCATCTTTAATCTCTTCAAGAACGCTCAAAGGAACACCATGGTTGATC
ACCTGGAAGAATCCCCAATTCTCAGCCGCGTATTTAACCTTCTCTACGACGGCTTCACGT
GAAGATGTGTCCACGTGGACGCTTGCGAAGTCGATGGTAGGGATCTCCAGGTCTGAAACA
GAGACAGAGGGTTTCTTGTCGGTCAAGGCATCTCTAGGGATGTGGAAGATAGGAGGGACT
TCAGTTATTTTAGCGTCGACCAGCCCTTTTACTCCTTCTTTGGTCTCGTCGAAAGCTTTG
CGCTCCATATAAGGATCGAATTCGGTAGAGGCCATTTTTTTCTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG25JQB U 1
AF RR2CZ67JQ U 125
AF RR2GG25TF C 240
AF RR2CZ67TF C 618
BS 1 221 RR2GG25JQB
BS 222 222 RR2CZ67JQ
BS 223 733 RR2GG25JQB
BS 734 794 RR2CZ67JQ
BS 795 827 RR2GG25TF
BS 828 1248 RR2CZ67TF

RD RR2GG25JQB 733 0 0
GCTAAAGTAGAACGATCCACACATAGAGTCTGATACATACGCGCACACACACTACTTGGT
ATACTGCATTAATTATTGCAGATCCAAGAAAGAGTAATTGATGCTAAGAAACAACATAAT
TTTCTTTTTCTGAAGTTTTGTTTTCATATCCTGAAATTCAAGAGATGTGATGTTCCATCC
AGACCTTTCTCAAAATATCCATCAGTGTATTCTTTTATGGTGATGTCTCTGTATTTTGGA
GGGTCTTCTTCAGACACAAGCTCTTTCATTGGTCCATAAACTGTGGAATTGGCATGTTTA
CTTGAGCTAAAAAAGCTTGCAACTGAAATCCTTGGTCCTTGTCTATTCGCAAGCACCCTA
TGCTCCACGCTAACGAACTTATCGTTCGTTAAAAGCTGCAAGAAATCTCCCATGTTGATG
ACAAGAGCTCCAGGAAGAGGAGCCACATCAACCCAAGAGTCTTGATGAAGAATTTGTAGA
CCACCGATGTTGTCTTGAAGAAAAACCGTGAGGAAGGAGTTGTCTGAGTGTTGACTTATC
CCCAAAGTTAGGTCAGGTTGTGGACAAGGTGGGTAATAATGGCATACCATAAGCAAAGTC
TTCAAGCACTCCTTGCTCTTAAGGGTCTCAGATTCCAAACCTAGTGCTTCTGAGAGAAGC
TCAAAGAGTAAACCACCTAAACTCATCACATGTTTTGAGTATTCGAACACAGCATCCCTG
CAAGCCACTGGGA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2CZ67JQ 670 0 0
TTTTTCTGAAGTTTTGTTTTCATATCCTGAAATTCAAGAGATGTGATGTTCCATCCAGAC
CTTTCTCAAAATATCCATCAGTGTATTCTTTTATGGTAATGTCTCTGTATTTTGGAGGGT
CTTCTTCAGACACAAACTCTTTCATTGGTCCATAAACTGTGGAATTGGCATGTTTACTTG
AGCTAAAAAAGCTTGCAACTGAAATCCTTGGTCCTTGAATATTTGCAAGCACCCTATGCT
CCACGCTAACGAACTTATCGTTCGTTATAAGCTGCAAGAAATCTCCCATGTTGATGACAA
GAGCTCCTGGAAGAGGAGCCACATCAACCCAAGAGTCTTGATGAAAAATTTGTAGACCGC
CGATGTTGTCTTGAAAAAAAACCGTGAGGAAGGAGTTGTCTGAGTGTTGATTTATCCCCA
AAGTTAGTTCAGGTTGTGGACAAGGTGGGTAATAATGGCAGACCATAAGCAAAGTCTTCA
AGCACTCCTTGCTCTTAAGGGTCTCAGATTCCAAACCTAGTGCTTCTGAGAGAAGCTCAA
AGAGTAAACCACCTAAACTCATCACATGTTTTGAGTATTCGAACACAGCATCCCTGCAAG
TCACTGGGAGCTCCTCAGGAGCTGGAGGATCTGGAACTATGTAACAAACGAACGAATCTC
TCCAGTTAAC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2GG25TF 588 0 0
AGGGTCTTCTTCAGACACAAGCTCTTTCATTGGTCCATAAACTGTGGAATTGGCATGTTT
ACTTGAGCTAAAAAAGCTTGCAACTGAAATCCTTGGTCCTTGTCTATTCGCAAGCACCCT
ATGCTCCACGCTAACGAACTTATCGTTCGTTAAAAGCTGCAAGAAATCTCCCATGTTGAT
GACAAGAGCTCCAGGAAGAGGAGCCACATCAACCCAAGAGTCTTGATGAAGAATTTGTAG
ACCACCGATGTTGTCTTGAAGAAGAACCGTGAGGAAGGAGTTGTCTGAGTGTTGACTTAT
CCCCAAAGTTAGGTCAGGTTGTGGACAAGGTGGGTAATAATGGCATACCATAAGCAAAGT
CTTCAAGCACTCCTTGCTCTTAAGGGTCTCAGATTCCAAACCTAGTGCTTCTGAGAGAAG
CTCAAAGAGTAAACCACCTAAACTCATCACATGTTTTGAGTATTCGAACACAGCATCCCT
GCAAGCCACTGGGAGTTCCTCAGGAGTTGGAGGATCTGGAACTATGTAACAAACGAACGA
ATCTCTCCAGTTAACAGAAGGAGAAGAACTGTATAGATCGAAGTTACT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2CZ67TF 631 0 0
CTTAAGGGTCTCAGATTCCAAACATAGTGCTTCTGAGAGAAGCTCAAAGAGTAAACCACC
TAAACTCATCACATGTTTTGAGTATTCGAACACAGCATCCCTGCAAGTCACTGGGAGCTC
CTCAGGAGCTGGAGGATCTGGAACTATGTAACAAACGAACGAATCTCTCCAGTTAACAGA
AGGAGAAGAACTGTATAGATCGAAGTTACTATTGTAGATAAACTTTTTGTTAGTGTCACC
ACGGGTGAAGTATTGTTTCTTGACCTCAGGATCTTCCTCATGGAACCTACGAACTCCATC
TTTAATCTCTTCAAGAACGCTCAAAGGAACACCATGGTTGATCACCTGGAAGAATCCCCA
ATTCTCAGCCGCGTATTTAACCTTCTCTACGACGGCTTCACGTGAAGATGTGTCCACGTG
GACGCTTGCGAAGTCGATGGTAGGGATCTCCAGGTCTGAAACAGAGACAGAGGGTTTCTT
GTCGGTCAAGGCATCTCTAGGGATGTGGAAGATAGGAGGGACTTCAGTTATTTTAGCGTC
GACCAGCCCTTTTACTCCTTCTTTGGTCTCGTCGAAAGCTTTGCGCTCCATATAAGGATC
GAATTCGGTAGAGGCCATTTTTTTCTTGTTT

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 4

CO CL2404Contig1 832 4 9 U
GGGCAACCTCCTCAAAAAACATTTTATCAACATAATACATATATGCTTAGCCTATCATGA
GCAACATCCCTAGATCTCTCACCGACTCATCGCTCTCTATATTTCTTCTAACCATATCTT
CTGCAGTCGATCCTTGGCCCTTTTCTATCACCGTCTTTTGACACAAGCTGCTCTTCTCCG
TCGTTAATCGTTTTCTCAATCAATCTTCGTGTTTCTCTATAGGTGTTTTGGTAAGAGAGA
TTCGATCTTTTTGATGGGTTTTGAAGAACACGTACATAAACAGATGGTGTTCAAGTTTCA
CTTTCCTCATCTCCACATACTCCATCATAACCATCATCATGTTCCCAAAGGCTGTGTTGC
GATCGTGGTTGGTCACGAGGGAGATGAAGAAGGTCTACACAGATTCGTTGTTCCCTTGAT
GTTCTTGAGCCATCCTCTGTTCTTGAGGCTCTTGAAAGAAGCTGAAGAAGAGTACGGTTT
CAAACACGCTGGTCCCATCACGATTCCTTGTCGTGTCGATGAGTTTAAGCATGTTCAGGA
GATAATCGACGAGGAGACTCATCGACGTCATGGTCACGGACACAACAACCACAACCACCA
CCACCACAACAACAACCATTTGCGATGTTTCTGAAGATCTGTGTTTGGTTTTGTTTGGTT
TGACATGTAATTGATATTGGTTCGGTTTGGTTTGACTTTTCGTTTGAGATTGGTTTAGTT
TGCTTAGTGATGATGATGATGAAAAATACAGAGTGCAATTAAATGTTAATGCTTCTCTCA
TCTTTTACCAATGTAATCGTGAGAAAAAAGGAATTTCAATGTGTGATTGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU69TF U 35
AF RR2FO18TF U 1
AF RR2FO18JQ C 147
AF RR2DU69JQ C 249
BS 1 619 RR2FO18TF
BS 620 620 RR2FO18JQ
BS 621 649 RR2FO18TF
BS 650 707 RR2FO18JQ
BS 708 708 RR2DU69JQ
BS 709 803 RR2FO18JQ
BS 804 804 RR2DU69JQ
BS 805 825 RR2FO18JQ
BS 826 832 RR2DU69JQ

RD RR2DU69TF 160 0 0
ATACATATATGCTTAGCCTATCATGAGCAACATCCCTAGATCTCTCACCGACTCATCGCT
CTCTATATTTCTTCTAACCATATCTTCTGCAGTCGATCCTTGGCCCTTTTCTATCACCGT
CTTTTAACACAAGCTGCTCTTCTCCGTCGTTAATCGTTTT

QA 1 160 1 160
DS 

RD RR2FO18TF 649 0 0
GGGCAACCTCCTCAAAAAACATTTTATCAACATAATACATATATGCTTAGCCTATCATGA
GCAACATCCCTAGATCTCTCACCGACTCATCGCTCTCTATATTTCTTCTAACCATATCTT
CTGCAGTCGATCCTTGGCCCTTTTCTATCACCGTCTTTTGACACAAGCTGCTCTTCTCCG
TCGTTAATCGTTTTCTCAATCAATCTTCGTGTTTCTCTATAGGTGTTTTGGTAAGAGAGA
TTCGATCTTTTTGATGGGTTTTGAAGAACACGTACATAAACAGATGGTGTTCAAGTTTCA
CTTTCCTCATCTCCACATACTCCATCATAACCATCATCATGTTCCCAAAGGCTGTGTTGC
GATCGTGGTTGGTCACGAGGGAGATGAAGAAGGTCTACACAGATTCGTTGTTCCCTTGAT
GTTCTTGAGCCATCCTCTGTTCTTGAGGCTCTTGAAAGAAGCTGAAGAAGAGTACGGTTT
CAAACACGCTGGTCCCATCACGATTCCTTGTCGTGTCGATGAGTTTAAGCATGTTCAGGA
GATAATCGACGAGGAGACTCATCGACGTCATGGTCACGGACACAACAACCACAACCACCA
CCACCACAACAACAACCATCTGCGATGTTTCTGAAGATCTGTGTTTGGT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2FO18JQ 679 0 0
ATCACCGTCTTTTGACACAAGCTGCTCTTCTCCGTCGTTAATCGTTTTCTCAATCAATCT
TCGTGTTTCTCTATAGGTGTTTTGGTAAGAGAGATTCGATCTTTTTGATGGGTTTTGAAG
AACACGTACATAAACAGATGGTGTTCAAGTTTCACTTTCCTCATCTCCACATACTCCATC
ATAACCATCATCATGTTCCCAAAGGCTGTGTTGCGATCGTGGTTGGTCACGAGGGAGATG
AAGAAGGTCTACACAGATTCGTTGTTCCCTTGATGTTCTTGAGCCATCCTCTGTTCTTGA
GGCTCTTGAAAGAAGCTGAAGAAGAGTACGGTTTCAAACACGCTGGTCCCATCACGATTC
CTTGTCGTGTCGATGAGTTTAAGCATGTTCAGGAGATAATCGACGAGGAGACTCATCGAC
GTCATGGTCACGGACACAACAACCACAACCACCACCACCACAACAACAACCATTTGCGAT
GTTTTTGAAGATCTGTGTTTGGTTTTGTTTGGTTTGACATGTAATTGATATTGGTTCGGT
TTGGTTTGACTTTTCGTTTGATATTGGTTTAGTTTGCTTAGTGATGATGATGATGAAAAA
TACAGAGTGCAATTAAATGTTAATGCTTCTCTCATCTTTTACCAATGTAATCGTGAGGAA
AAAGGAATTTCAATGTGTG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2DU69JQ 584 0 0
TTTTGATGGGTTTTGAAGAACACGTACATAAACAGATGGTGTTCAAGTTTCACTTTCCTC
ATCTCCACATACTCCATCATAACCATCATCATGTTCCCAAAGGCTGTGTTGCGATCATGG
TTGGTCACGAGGGAGATGAAGAAGGTCTACACAGATTCGTTGTTCCCTTGATGTTCTTGA
GCCATCCTCTGTTCTTGAGGCTCTTGAAAGAAGCTGAAGAAGAGTACGGTTTCAAACACG
CTGGTCCCATCACGATTCCTTGCCGTGTCGATGAGTTTAAGCATGTTCAGGAGATAATCG
ACGAGGAGACTCATCGACGTCATGGTCACGGACACAACAACCACAACCACCACCACCACA
ACAACAACCATTTGCGATGTTTCTGAAGATCTGTGTTTGGTTTTGTTTGGTTTGACATGT
AATTGATATTGGTTCGGTTTGGTTTGACTTTTCGTTTGAGATTGGTTTAGTTTGCTTAGT
GATGATGATGATGAAAAATACAGAGTGCAATTGAATGTTAATGCTTCTCTCATCTTTTAC
CAATGTAATCGTGAGAAAAAAGGAATTTCAATGTGTGATTGCCG

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 3

CO CL2405Contig1 753 3 3 U
GGGGTCGTTCGTTCGCAAATCATCAAACAGTTTCGTCTCTTTGCGATCAGATCTCATTGG
AGAGCTAATGGCTTCAGGTTTCAGCGGAGATGAAACTGCTCCTTTCTTCGGATTCCTCGG
CGCTGCCGCCGCTCTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCAGCGTACGGGACAGCGAAGAGCGG
TGTTGGTGTGGCGTCGATGGGTGTGATGAGACCAGAGCTTGTGATGAAATCGATTGTTCC
CGTTGTTATGGCTGGTGTGTTAGGTATTTACGGTCTGATCATTGCTGTCATCATCAGTAC
CGGAATCAACCCTAAGGCCAAGTCGTACTATCTATTCGATGGCTATGCTCATCTATCTTC
CGGTCTCGCTTGTGGTCTCGCCGGTCTCTCCGCCGGTATGGCTATTGGTATCGTCGGCGA
CGCTGGTGTTAGAGCGAATGCACAACAACCGAAGCTGTTTGTGGGAATGATTTTGATTCT
CATTTTTGCTGAAGCACTTGCGTTGTACGGTCTCATTGTTGGTATCATCCTCTCTTCTCG
TGCTGGTCAGTCTAGAGCCGAGTGAAAAAACCAGAAAGCCTTTTGGTTTAAGTCCTCTTT
GTAATGTTTTATGATATGTTTTCTTTTGCGGCATTGTGAGTTCTTTTGGTGTTTCTCATG
AAAAACAACAAGTAACATGAGTGATAATCATTTGACTTTTGGTTCTGAATATTTTTTTTC
TTTTGCACACTATATGGAATGCATCAATAATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET61TF U 1
AF RR2BM70TF U 56
AF RR2ET61JQ C 1
BS 1 569 RR2ET61TF
BS 570 664 RR2BM70TF
BS 665 753 RR2ET61JQ

RD RR2ET61TF 570 0 0
GGGGTCGTTCGTTCGCAAATCATCAAACAGTTTCGTCTCTTTGCGATCAGATCTCATTGG
AGAGCTAATGGCTTCAGGTTTCAGCGGAGATGAAACTGCTCCTTTCTTCGGATTCCTCGG
CGCTGCCGCCGCTCTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCAGCGTACGGGACAGCGAAGAGCGG
TGTTGGTGTGGCGTCGATGGGTGTGATGAGACCAGAGCTTGTGATGAAATCGATTGTTCC
CGTTGTTATGGCTGGTGTGTTAGGTATTTACGGTCTGATCATTGCTGTCATCATCAGTAC
CGGAATCAACCCTAAGGCCAAGTCGTACTATCTATTCGATGGCTATGCTCATCTATCTTC
CGGTCTCGCTTGTGGTCTCGCCGGTCTCTCCGCCGGTATGGCTATTGGTATCGTCGGCGA
CGCTGGTGTTAGAGCGAATGCACAACAACCGAAGCTGTTTGTGGGAATGATTTTGATTCT
CATTTTTGCTGAAGCACTTGCGTTGTACGGTCTCATTGTTGGTATCATCCTCTCTTCTCG
TGCTGGTCAGTCTAGAGCCGAGTGAAAAA
A

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2BM70TF 611 0 0
ATTGGAGAGCTAATGGCTTCAGGTTTCAGCGGAGATGAAACTGCTCCTTTCTTCGGATTC
CTCGGCGCTGCCGCCGCTCTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCAGCGTACGGGACAGCGAAG
AGCGGTGTTGGTGTGGCGTCGATGGGTGTGATGAGACCAGAGCTTGTGATGAAATCGATT
GTTCCCGTTGTTATGGCTGGTGTGTTAGGTATTTACGGTCTGATCATTGCTGTCATCATC
AGTACCGGAATCAACCCTAAGGCCAAGTCGTACTATCTATTCGATGGCTATGCTCATCTA
TCTTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTCGCCGGTCTCTCCGCCGGTATGGCTATTGGTATCGTC
GGCGACGCTGGTGTTAGAGCGAATGCACAACAACCGAAGCTGTTTGTGGGAATGATTTTG
ATTCTCATTTTTGCTGAAGCACTTGCGTTGTACGGTCTCATTGTTGGTATCATCCTCTCT
TCCCGTGCTGGTCAGTCTAGAGCCGAGTGAAAAAACCAGAAAGCCTTTTGGTTTAAGTCC
TCTTTGTAATGTTTTATGATATGTTTTCTTTTGCGGCATTGTGAGTTCTTTTGGTGTTTC
TCATGAAAA
CA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2ET61JQ 753 0 0
GGGGTCGTTCGTTCGCAAATCATCAAACAGTTTCGTCTCTTTGCGATCAGATCTCATTGG
AGAGCTAATGGCTTCAGGTTTCAGCGGAGATGAAACTGCTCCTTTCTTCGGATTCCTCGG
CGCTGCCGCCGCTCTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCAGCGTACGGGACAGCGAAGAGCGG
TGTTGGTGTGGCGTCGATGGGTGTGATGAGACCAGAGCTTGTGATGAAATCGATTGTTCC
CGTTGTTATGGCTGGTGTGTTAGGTATTTACGGTCTGATCATTGCTGTCATCATCAGTAC
CGGAATCAACCCTAAGGCCAAGTCGTACTATCTATTCGATGGCTATGCTCATCTATCTTC
CGGTCTCGCTTGTGGTCTCGCCGGTCTCTCCGCCGGTATGGCTATTGGTATCGTCGGCGA
CGCTGGTGTTAGAGCGAATGCACAACAACCGAAGCTGTTTGTGGGAATGATTTTGATTCT
CATTTTTGCTGAAGCACTTGCGTTGTACGGTCTCATTGTTGGTATCATCCTCTCTTCTCG
TGCTGGTCAGTCTAGAGCCGAGTGAAAAAACCAGAAAGCCTTTTGGTTTAAGTCCTCTTT
GTAATGTTTTATGATATGTTTTCTTTTGCGGCATTGTGAGTTCTTTTGGTGTTTCTCATG
AAAAACAACAAGTAACATGAGTGATAATCATTTGACTTTTGGTTCTGAATATTTTTTTTC
TTTTGCACACTATATGGAATGCATCAATAATTT

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 4

CO CL2406Contig1 1361 4 11 U
AGAAAACAAGATCCAAATTCCACACACACGACAATAACAACAATACCAACAAAGTCCACT
CACACAACAATAACAACAGAAACAAACAAAAACAAAAGATACAAAACAAAATGCATTCCG
GTAGTAAACAAACCACGCCACGAACACTTTATTCATTTTGCGTTTGGTCACTCATTTGTT
GCCCTCATAAACAGATTTATCAAGAACCCAAACGGCTGGCCAATACACAGACCCGATCCA
TAACTTCCCATCTTCCCTCTCATAAGCTTCACTAACATACTTCATCGTTGTCCCTTCACT
ATCCTCAAGCATCCCAATAATCTCTCCCGTCTCTCCAGAGAGTTTCAAGATTATTCCATG
AGGCTTCCCTCCGTTCATGAGATGAACCACTGTCTCCAACTTCAATGTATGCATGAAAAA
CTTTCCAACCCAAGAGTGAATAAGAAACAACCGAGTGAACAAATTGTTCTTGCAGTGCAA
CGCGACCCAAAAATCGCCCGTAGGGGTACATCGGATATTGTCCGGAAGGCCAGGGACCCT
CGCGAAAACCTCCTTGGTCCCGGCCTTAGGACCTTTGACCCATATTCTGTGGAGAATGCC
CGTACCACCTTCACAGGTGATTACAAAAGATCCATCTTTGCTTAGAGCTAAACCATTAGG
TAAATGAAGTTTGTCCATTATAACTTTGGCCTCTTTCTTCTTCATATCGTATCTAATTAC
TCTTCCCACTTTGTCCCCGGATATAGACACGTAAAATACTTCCCCGAAATGGTATTTGTC
GCTGCTATCATTGAAATAGAAGACGTCTTCTTCTTCGTCTATGTCCATTTGGTTCGCAAA
CATAACTTTGCGGCCTTCGGCTTCATCAACGACTAACTCGGCCAAGCCTCCTTCTGGTCC
GACCTTCATGACCCCAAAGTAACCATCACAAATGTACAAGTCTCCTGTTTTCCTGTGGAA
GCTAAGTCCCAAGGGCCTTCCACAACTTGGTACTACTTGATTCCTCGAACAGTTATCTCT
GTGAGGAGAAGTGTAGGCGAAGTCGACCCAGCCAAGTTCTTCGCCGCGCCATTTGAGGAT
GCGACCGTCAGTGACACCGACATAAGGGCCTTCACCTTGTGAATCAAACTCTAAGCTCTC
TGGTCCAACGCCGGGAAGAGGAATGGTCTTAGCCACTCGAAGAACGTGTTTCGTACCCTT
TAAACGGTCCGGCTCGATGATAGTTGACCAGAATAAATAGCAAACGACGGCTACGATAAC
CGGAGCGGCCGCGACCGGCGTCAGAACTCTGCGGTTGATTGGCATTATTTTTCCTTTCTC
CTCTCTTCTCTCTCTCTGTGGCTAATACGTGGAAAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FN15JQ U 1
AF RR2D741JQ U 20
AF RR2FN15TF C 580
AF RR2D741TF C 608
BS 1 146 RR2FN15JQ
BS 147 147 RR2D741JQ
BS 148 509 RR2FN15JQ
BS 510 510 RR2D741JQ
BS 511 791 RR2FN15JQ
BS 792 840 RR2D741JQ
BS 841 910 RR2FN15TF
BS 911 911 RR2D741TF
BS 912 1265 RR2FN15TF
BS 1266 1266 RR2D741TF
BS 1267 1361 RR2FN15TF

RD RR2FN15JQ 801 0 0
AGAAAACAAGATCCAAATTCCACACACACGACAATAACAACAATACCAACAAAGTCCACT
CACACAACAATAACAACAGAAACAAACAAAAACAAAAGATACAAAACAAAATGCATTCCG
GTAGTAAACAAACCACGCCACGAACATTTTATTCATTTTGCGTTTGGTCACTCATTTGTT
GCCCTCATAAACAGATTTATCAAGAACCCAAACGGCTGGCCAATACACAGACCCGATCCA
TAACTTCCCATCTTCCCTCTCATAAGCTTCACTAACATACTTCATCGTTGTCCCTTCACT
ATCCTCAAGCATCCCAATAATCTCTCCCGTCTCTCCAGAGAGTTTCAAGATTATTCCATG
AGGCTTCCCTCCGTTCATGAGATGAACCACTGTCTCCAACTTCAATGTATGCATGAAAAA
CTTTCCAACCCAAGAGTGAATAAGAAACAACCGAGTGAACAAATTGTTCTTGCAGTGCAA
CGCGACCCAAAAATCGCCCGTAGGGGTACGTCGGATATTGTCCGGAAGGCCAGGGACCCT
CGCGAAAACCTCCTTGGTCCCGGCCTTAGGACCTTTGACCCATATTCTGTGGAGAATGCC
CGTACCACCTTCACAGGTGATTACAAAAGATCCATCTTTGCTTAGAGCTAAACCATTAGG
TAAATGAAGTTTGTCCATTATAACTTTGGCCTCTTTCTTCTTCATATCGTATCTAATTAC
TCTTCCCACTTTGTCCCCGGATATAGACACGTAAAATACTTCCCCGAAATGGTATTTGTC
GCTGCTATCAT
GAATAGAGAC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2D741JQ 832 0 0
CCACACACACGACAATAACAACGATACCAACAAAGTCCACTCACACAACAATAACAACAG
AAACAAACAAAAACAAAAGATACAAAACAAAATGCATTCCGGTAGTAAACAAACCACGCC
ACGAACACTTTATTCATTTTGCGTTTGGTCACTCATTTGTTGCCCTCATAAACAGATTTA
TCAAGAACCCAAACGGCTGGCCAATACACAGACCCGATCCATAACTTCCCATCTTCCCTC
TCATAAGCTTCACTAACATACTTCATCGTTGTCCCTTCACTATCCTCAAGCATCTCAATA
ATCTCTCCCGTCTCTCCAGAGAGTTTCAAGATTATTCCATGAGGCTTCCCTCCGTTCATG
AGATGAACCACTGTCTCCAACTTCAATGTATGCATGAAAAACTTTCCAACCCAAGAGTGA
ATAAGAAACAACCGAGTGAACAAATTGTTCTTGCAGTGCAACGCGACCCAAAAATCGCCC
GTAGGGGTACATCGGATATTGTCCGGAAGGCCAGGGACCCTCGCGAAAACCTCCTTGGTC
CCGGCCTTAGGACCTTTGACCCATATTCTGTGGAGAATGCCCGTACCACCTTCACAGGTG
ATTACAAAAGATCCATCTTTGCTTAGAGCTAAACCATTAGGTAAATGAAGTTTGTCCATT
ATAACTTTGGCCTCTTTCTTCTTCATATCGTATCTAATTACTCTTCCCACTTTGTCCCCG
GATATAGACACGTAAAATACTTCCCCGAAATGGTATTTGTCGCTGCTATCATTGAAATAG
AAGACGTCTTCTTCTTCGTCTATGTCCATTTGGTTCGCAAA
ATAACTTTGCG

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR2FN15TF 782 0 0
GACCCATATCTGTGAG
ATGCCCGTACCAC*TTCACAGGTGAT*ACAAA*GATCCATCTTTGCTTAGAGCTAAACCA
TTAGGTAAATGAAGTTTGTCCATTATAACTTTG*CCTCTTTCTTCTTCATATCGTATCTA
ATTACTCTTCCCACTTTGTCCCCGGATATAGACACGTAAAATACTTCCCCGAAATGGTAT
TTGTCGCTGCTATCATTGAAATAGAAGACGTCTTCTTCTTCGTCTATGTCCATTTGGTTC
GCAAACATAACTTTGCGGCCTTCGGCTTCATCAACGACTAACTCGGCCAAGCCTCCTTCT
GGTCCGACCTTCATGGCCCCAAAGTAACCATCACAAATGTACAAGTCTCCTGTTTTCCTG
TGGAAGCTAAGTCCCAAGGGCCTTCCACAACTTGGTACTACTTGATTCCTCGAACAGTTA
TCTCTGTGAGGAGAAGTGTAGGCGAAGTCGACCCAGCCAAGTTCTTCGCCGCGCCATTTG
AGGATGCGACCGTCAGTGACACCGACATAAGGGCCTTCACCTTGTGAATCAAACTCTAAG
CTCTCTGGTCCAACGCCGGGAAGAGGAATGGTCTTAGCCACTCGAAGAACGTGTTTCGTA
CCCTTTAAACGGTCCGGCTCGATGATAGTTGACCAGAATAAATAGCAAACGACGGCTACG
ATAACCGGAG*GGCCGCGACCGGCGTCAGAACTCTGCGGTTGATTGGCATTATTTTTCCT
TTCTCCTCTCTTCTCTCTCTCTGTGGCTAATACGTGGAAAGAAAAA

QA 17 782 17 782
DS 

RD RR2D741TF 754 0 0
CCACTTCACAGGTGATAC
AAAGATCCATCTTTGCTTAGAGCTAAACCATTAGGTAAATGAAGTT*GTCCATTATAACT
TTGGC*TCTT*CTTCTTCATATCGTATCTAATTACTCTTCCCACTTTGTCCCCGGATATA
GACACGTAAAATACTTCCCCGAAATGGTATTTGTCGCTGCTATCATTGAAATAGAAGACG
TCTTCTTCTTCGTCTATGTCCATTTGGTTCGCAAACATAACTT*GCGGCCTTCGGCTTCA
TCAACGACTAACTCGGCCAAGCCTCCTTCTGGTCCGACCTTCATGACCCCAAAGTAACCA
TCACAAATGTACAAGTCTCCTGTTTTCCTGTGGAAGCTAAGTCCCAAGGGCCTTCCACAA
CTTGGTACTACTTGATTCCTCGAACAGTTATCTCTGTGAGGAGAAGTGTAGGCGAAGTCG
ACCCAGCCAAGTTCTTCGCCGCGCCATTTGAGGATGCGACCGTCAGTGACACCGACATAA
GGGCCTTCACCTTGTGAATCAAACTCTAAGCTCTCTGGTCCAACGCCGGGAAGAGGAATG
GTCTTAGCCACTCGAAGAACGTGTTTCGTACCCTTTAAACGGTCCGGCTCGATGATAGTT
GACCAGAATAAATAGCAAACGACGGCTACGATAACCGGAGCGGCCGCGACCGGCGTCAGA
ACTCTGCGGTTGATTGGCATTATTTTTCCTTTCTCCTCTCTTCTCTCTCTCTGTGGCTAA
TACGTGGAAAGAAAAA

QA 19 754 19 754
DS 



AS 1 4

CO CL2407Contig1 732 4 10 U
GGAAATCAACAGACCCAAATATAAATATTTAAGCCTTTTCTCAAAAAGAGAAAGAATATA
TATACATTACTTATATAACTCCTGTTCTTCTTCAAAATCGTGAGATCGAAGCAGCTCCTC
CGTCTTTCCAATAATCATCAAACTATAACTAAGAGAGAAGAAATATGAAGAAGATGGTGG
TGGTGATGGTGATCATGTTGGTGATGGTGAGTGAAGCGAGTATGATAAAGCAGACATGCA
AAGAGACACCAGATTTCAATCTATGCGTCTCTCTCCTCGACTCCGACCCACGTGGCTCCT
CTGCCGACACCTCTGGCCTCGCTCTTATCCTCGTCGACAAAATCAAGGGGTTGGCGACGA
AGACCTTGAACGAAATCAACTATCTATATAAAAAGAGACCGGAACTGAAACAGGCTTTAG
ACGAATGTAGTCGAAGATACAAAACAATCTTAAAGGCTGATGTTCCCGAAGCCATTGAAG
CTATATCTAAAGGAGTTCCGAAGTTCGGCGAGGACGGTGTGATCGATGCTGGTGTGGAAG
CTGCTGTATGTGAAGGAGAATTTAAAGGGAAATCTCCGTTGACTAGTTTGACCAAATCAA
TGCAGAAAATCTCTAATGTGACAAGAGCCATTGTGAGAATGTTGCTTTGATTTTATCTTT
TATGTTCATACATGTGGTATAAGCCGTATGGGTGTTTGATGGGATTTTATCCTTCATAAG
AATAAAACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ61TF U 6
AF RR2H031JQ C 1
AF RR2H031TF U 1
AF RR2FZ61JQ C 277
BS 1 7 RR2H031JQ
BS 8 107 RR2FZ61TF
BS 108 108 RR2H031TF
BS 109 193 RR2FZ61TF
BS 194 194 RR2H031TF
BS 195 227 RR2FZ61TF
BS 228 228 RR2H031TF
BS 229 592 RR2FZ61TF
BS 593 721 RR2H031TF
BS 722 732 RR2H031JQ

RD RR2FZ61TF 587 0 0
GG
AACAGACCCAAATATAAATATTTAAGCCTTTTCTCAAAAAGAGAAAGAATATATATACAT
TACTTATATAACTCCTGTTCTTCTTCAAAATCGTGAGATCAAAGCAGCTCCTCCGTCTTT
CCAATAATCATCAAACTATAACTAAGAGAGAAGAAATATGAAGAAGATGGTGGTGGTGAT
GGTGATGATGTTGGTGATGGTGAGTGAAGCGAGTATGATAGAGCAGACATGCAAAGAGAC
ACCAGATTTCAATCTATGCGTCTCTCTCCTCGACTCCGACCCACGTGGCTCCTCTGCCGA
CACCTCTGGCCTCGCTCTTATCCTCGTCGACAAAATCAAGGGGTTGGCGACGAAGACCTT
GAACGAAATCAACTATCTATATAAAAAGAGACCGGAACTGAAACAGGCTTTAGACGAATG
TAGTCGAAGATACAAAACAATCTTAAAGGCTGATGTTCCCGAAGCCATTGAAGCTATATC
TAAAGGAGTTCCGAAGTTCGGCGAGGACGGTGTGATCGATGCTGGTGTGGAAGCTGCTGT
ATGTGAAGGAGAATTTAAAGGGAAATCTCCGTTGACTAGTTTGAC

QA 3 587 3 587
DS 

RD RR2H031JQ 732 0 0
GGAAATCAACAGACCCAAATATAAATATTTAAGCCTTTTCTCAAAAAGAGAAAGAATATA
TATACATTACTTATATAACTCCTGTTCTTCTTCAAAATCGTGAGATCGAAGCAGCTCCTC
CGTCTTTCCAATAATCATCAAACTATAACTAAGAGAGAAGAAATATGAAGAAGATGGTGG
TGGTGATGGTGATCATGTTGGTGATGGTGAGTGAAGCGAGTATGATAAAGCAGACATGCA
AAGAGACACCAGATTTCAATCTATGCGTCTCTCTCCTCGACTCCGACCCACGTGGCTCCT
CTGCCGACACCTCTGGCCTCGCTCTTATCCTCGTCGACAAAATCAAGGGGTTGGCGACGA
AGACCTTGAACGAAATCAACTATCTATATAAAAAGAGACCGGAACTGAAACAGGCTTTAG
ACGAATGTAGTCGAAGATACAAAACAATCTTAAAGGCTGATGTTCCCGAAGCCATTGAAG
CTATATCTAAAGGAGTTCCGAAGTTCGGCGAGGACGGTGTGATCGATGCTGGTGTGGAAG
CTGCTGTATGTGAAGGAGAATTTAAAGGGAAATCTCCGTTGACTATTTTGACCAAATCAA
TGCAGAAAATCTCTAATGTGACAAGAGCCATTGTGAGAATGTTGCTTTGATTTTATCTTT
TATGTTCATACATGTGGTATAAGCCGTATGGGTGTTTGATGGGATTTTATCCTTCATAAG
AATAAAACTTTT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2H031TF 735 0 0
GGAAATC
AACAGACCCAAATATAAATATTTAAGCCTTTTCTCAAAAAGAGAAAGAATATATATACAT
TACTTATATAACTCCTGTTCTTCTTCAAAATCGTGAGATCGAAGCAGCTCCTCCGTCTTT
CCAATAATCATCAAACTATAACTAAGAGAGAAGAAATATGAAGAAGATGGTGGTGGTGAT
GGTGATCATGTTGGTGATGGTGAGTGAAGCGAGTATGATAAAGCAGACATGCAAAGAGAC
ACCAGATTTCAATCTATGCGTCTCTCTCCTCGACTCCGACCCACGTGGCTCCTCTGCCGA
CACCTCTGGCCTCGCTCTTATCCTCGTCGACAAAATCAAGGGGTTGGCGACGAAGACCTT
GAACGAAATCAACTATCTATATAAAAAGAGACCGGAACTGAAACAGGCTTTAGACGAATG
TAGTCGAAGATACAAAACAATCTTAAAGGCTGATGTTCCCGAAGCCATTGAAGCTATATC
TAAAGGAGTTCCGAAGTTCGGCGAGGACGGTGTGATCGATGCTGGTGTGGAAGCTGCTGT
ATGTGAAGGAGAATTTAAAGGGAAATCTCCGTTGACTATTTTGACCAAATCAATGCAGAA
AATCTCTAATGTGACAAGAGCCATTGTGAGAATGTTGCTTTGATTTTATCTTTTATGTTC
ATACATGTGGTATAAGCCGTATGGGTGTTTGATGGGATTTTATCCTTCATAAGA
TAAAACTTTTAAGA

QA 8 721 8 721
DS 

RD RR2FZ61JQ 456 0 0
TCGACTCCGACCCACGTGGCTCCTCTGCCGACACCTCTGGCCTCGCTCTTATCCTCGTCG
ACAAAATCAAGGGGTTGGCGACGAAGACCTTGAACGAAATCAACTATCTATATAAAAAGA
GACCGGAACTGAAACAGGCTTTAGACGAATGTAGTCGAAGATACAAAACAATCTTAAAGG
CTGATGTTCCCGAAGCCATTGAAGCTATATCTAAAGGAGTTCCGAAGTTCGGCGAGGACG
GTGTGATCGATGCTGGTGTGGAAGCTGCTGTATGTGAAGGAGAATTTAAAGGGAAATCTC
CGTTGACTAGTTTGACCAAATCAATGCAGAAAATCTCTAATGTGACAAGAGCCATTGTGA
GAATGTTGCTTTGATTTTATCTTTTATGTTCATACATGTGGTATAAGCCGTATGGGTGTT
TGATGGGATTTTATCCTTCATAAGA
ATAAAACTTGT

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 4

CO CL2408Contig1 687 4 7 U
GGATTAGTGATCAAAACAAGACATGTCAAACGTAAACTTTCTTGAGATTCAATACAGGCT
CTCTAAGAACAAGATGTTGAGGAAGCCTTCAAGATTGTTCTCGAGAGACAGGCAATCCTC
AGGACTCTCTTCACCTGGATCAGTGGGCGTCCCTCAGCCTACAATCAACGAGATGAGACG
TGTTTTCAACAGATTTGATTCAGACAAAGACGGCAAAATCTCTCAGACTGAGTACAAGGT
GGTGCTTAGAGCTCTAGGACAAGAGAGAGCGATCCAAGACGTGCCCAAGATCTTTAAGGC
CGCGGATTTGGACGGTGATGGGTTTATTGACTTCAAGGAGTTTATAGAAGCACACAAGAG
AAGTGGAGGGATTAGATCTTTGGATATACGAAACGCTTTCTGGACATTTGATCTGAACGG
GGATGGGAAGATAAGCGCAGAAGAAGTGATGTCGGTTCTGAGGAAGCTTGGTGAGAGGTG
CAACTTAGAAGACTGCAAGAGAATGGTGAGAGCTGTTGATGCAGATGGAGATGGATTGGT
TAATATGGAAGAGTTCATGAGGATGATGACTCAATCTATGAACATTGTCTGAACAGATCT
TTCTCTATTATTGTAATAAAGGTTATTATTTATACATATCTTATTTCAAAAACATGAATG
TTGCAAATTTAAACCGACATGATCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2HB95JQ C 29
AF RR2HB95TF U 29
AF RR2DG76TF U 1
AF RR2DG76JQ C 119
BS 1 56 RR2DG76TF
BS 57 57 RR2HB95TF
BS 58 120 RR2DG76TF
BS 121 121 RR2HB95TF
BS 122 287 RR2DG76TF
BS 288 288 RR2HB95TF
BS 289 687 RR2DG76TF

RD RR2HB95JQ 607 0 0
AACGTAAACTTTCTTGAGATTCAATACAGGCTCTCTAAGAACAAGATGTTGAGGAAGCCT
TCAAGATTGTTCTCGAGAGACAGGCAATCCTCAGGACTCTCTTCACCTGGATCAGTGGGC
GTCCCTCAGCCTACAATCAACGAGATGAGACGTGTTTTCAACAGATTTGATTCAGACAAA
GACGGCAAAATCTCTCAGACTGAGTACAAGGTGGTGCTTAGAGCTCTAGGACAAGAGAGA
GCGATCCA*GACGTGCCCAAGATCTTTAAGGCCGCGGATTTGGACGGTGATGGGTTTATT
GACTTCAAGGAGTTTATAGAAGCACACAAGAGAAGTGGAGGGATTAGATCTTTGGATATA
CGAAACGCTTTCTGGACATTTGATCTGAACGGGGATGGGAAGATAAGCGCAGAAGAAGTG
ATGTCGGTTCTGAGGAAGCTTGGTGAGAGGTGCAACTTAGAAGACTGCAAGAGAATGGTG
AGAGCTGTTGATGCAGATGGAGATGGATTGGTTAATATGGAAGAGTTCATGAGGATGATG
ACTCAATCTATGAACATTGTCTGAACAGATCTTTCTCTATTATTGTAATAAAGGTTATTA
TTTAT
GT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2HB95TF 606 0 0
AACGTAAACTTTCTTGAGATTCAATACAGGCTCTCTAAGAACAAGATGTTGAGGAAGCCT
TCAAGATTGTTCTCGAGAGACAGGCAATCCTCAGGACTCTCTTCACCTGGATCAGTGGGC
GTCCCTCAGCCTACAATCAACGAGATGAGACGTGTTTTCAACAGATTTGATTCAGACAAA
GACGGCAAAATCTCTCAGACTGAGTACAAGGTGGTGCTTAGAGCTCTAGGACAAGAGAGA
GCGATCCA*GACGTGCCCAAGATCTTTAAGGCCGCGGATTTGGACGGTGATGGGTTTATT
GACTTCAAGGAGTTTATAGAAGCACACAAGAGAAGTGGAGGGATTAGATCTTTGGATATA
CGAAACGCTTTCTGGACATTTGATCTGAACGGGGATGGGAAGATAAGCGCAGAAGAAGTG
ATGTCGGTTCTGAGGAAGCTTGGTGAGAGGTGCAACTTAGAAGACTGCAAGAGAATGGTG
AGAGCTGTTGATGCAGATGGAGATGGATTGGTTAATATGGAAGAGTTCATGAGGATGATG
ACTCAATCTATGAACATTGTCTGAACAGATCTTTCTCTATTATTGTAATAAAGGTTATTA
TTTAT
G

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2DG76TF 687 0 0
GGATTAGTGATCAAAACAAGACATGTCAAACGTAAACTTTCTTGAGATTCAATACAAGCT
CTCTAAGAACAAGATGTTGAGGAAGCCTTCAAGATTGTTCTCGAGAGACAGGCAATCCTC
TGGACTCTCTTCACCTGGATCAGTGGGCGTCCCTCAGCCTACAATCAACGAGATGAGACG
TGTTTTCAACAGATTTGATTCAGACAAAGACGGCAAAATCTCTCAGACTGAGTACAAGGT
GGTGCTTAGAGCTCTAGGACAAGAGAGAGCGATCCAAGACGTGCCCAGGATCTTTAAGGC
CGCGGATTTGGACGGTGATGGGTTTATTGACTTCAAGGAGTTTATAGAAGCACACAAGAG
AAGTGGAGGGATTAGATCTTTGGATATACGAAACGCTTTCTGGACATTTGATCTGAACGG
GGATGGGAAGATAAGCGCAGAAGAAGTGATGTCGGTTCTGAGGAAGCTTGGTGAGAGGTG
CAACTTAGAAGACTGCAAGAGAATGGTGAGAGCTGTTGATGCAGATGGAGATGGATTGGT
TAATATGGAAGAGTTCATGAGGATGATGACTCAATCTATGAACATTGTCTGAACAGATCT
TTCTCTATTATTGTAATAAAGGTTATTATTTATACATATCTTATTTCAAAAACATGAATG
TTGCAAATTTAAACCGACATGATCACC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2DG76JQ 569 0 0
TCT
GGACTCTCTTCACCTGGATCAGTGGGCGTCCCTCAGCCTACAATCAACGAGATGAGACGT
GTTTTCAACAGATTTGATTCAGACAAAGACGGCAAAATCTCTCAGACTGAGTACAAGGTG
GTGCTTAGAGCTCTAGGACAAGAGAGAGCGATCCAAGACGTGCCCAGGATCTTTAAGGCC
GCGGATTTGGACGGTGATGGGTTTATTGACTTCAAGGAGTTTATAGAAGCACACAAGAGA
AGTGGAGGGATTAGATCTTTGGATATACGAAACGCTTTCTGGACATTTGATCTGAACGGG
GATGGGAAGATAAGCGCAGAAGAAGTGATGTCGGTTCTGAGGAAGCTTGGTGAGAGGTGC
AACTTAGAAGACTGCAAGAGAATGGTGAGAGCTGTTGATGCAGATGGAGATGGATTGGTT
AATATGGAAGAGTTCATGAGGATGATGACTCAATCTATGAACATTGTCTGAACAGATCTT
TCTCTATTATTGTAATAAAGGTTATTATTTATACATATCTTATTTCAAAAACATGAATGT
TGCAAATTTAAACCGACATGATCACC

QA 4 569 4 569
DS 



AS 1 3

CO CL2409Contig1 668 3 3 U
CGACGCACAAAAGTCAATACATATTATCAATTTAGAATTTTTTAAAGCTCCAAAAATCAA
AAGAATGAGATGGTACAAGTAATACAAATCGTGGATATACAGAGATCCAGCTTCCTCAAG
TTGCTATATTACAGACGTGGGACTTAGAGCAAGTTAACAAACACCAAGAAAGCCGTGAAG
ACGGCCAGCCAAAGACGAAAAGCAGCTGTGGTGGCTGCGTTTGTGTCGCTTGCTGCGGTA
GGAGACATAGCGGGGCAGGCGAGACCTTCTTTACCTTCTTGGCACTGGTTTGCGAAAAGT
CCCGGTGGGTATTTCCCATAGAGATTGATGTAACTGAACATAGTGGTAGCACACTCATTA
CTCAAGTCGTTGATCTCATCAGTGTAAGGACATGCAAAGTCCTTGAAAGCGGCACAGCAT
TCCTTGGCTGGGAATTTGGGACCTTTGCATTGGCTTGTTATGATTGTGTAGTTCATAAAC
TCAAAGTTCACAGGACATGCTTTCTTGGTCTGAAGTAGGTTTCTTCCAATAGCCAAATTC
TGCGGTTCGAACACGCCATCTGAGATGAAACTTGAAGATGAGAAGGATGCAAGTACTGTG
AGTACAAGGATGAATGATGTAAGAGCTCTAGATAGGAAGTTGAACTCCATGATTCTTTTG
GTTAACAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ55JQ U 1
AF RR2GO35JQ U 26
AF RR2EJ55TF C 39
BS 1 562 RR2EJ55JQ
BS 563 602 RR2GO35JQ
BS 603 668 RR2EJ55TF

RD RR2EJ55JQ 562 0 0
CGACGCACAAAAGTCAATACATATTATCAATTTAGAATTTTTTAAAGCTCCAAAAATCAA
AAGAATGAGATGGTACAAGTAATACAAATCGTGGATATACAGAGATCCAGCTTCCTCAAG
TTGCTATATTACAGACGTGGGACTTAGAGCAAGTTAACAAACACCAAGAAAGCCGTGAAG
ACGGCCAGCCAAAGACGAAAAGCAGCTGTGGTGGCTGCGTTTGTGTCGCTTGCTGCGGTA
GGAGACATAGCGGGGCAGGCGAGACCTTCTTTACCTTCTTGGCACTGGTTTGCGAAAAGT
CCCGGTGGGTATTTCCCATAGAGATTGATGTAACTGAACATAGTGGTAGCACACTCATTA
CTCAAGTCGTTGATCTCATCAGTGTAAGGACATGCAAAGTCCTTGAAAGCGGCACAGCAT
TCCTTGGCTGGGAATTTGGGACCTTTGCATTGGCTTGTTATGATTGTGTAGTTCATAAAC
TCAAAGTTCACAGGACATGCTTTCTTGGTCTGAAGTAGGTTTCTTCCAATAGCCAAATTC
TGCGGTTCGAACACGCCATCTG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2GO35JQ 577 0 0
ATCAATTTAGAATTTTTTAAAGCTCCAAAAATCAAAAGAATGAGATGGTACAAGTAATAC
AAATCGTGGATATACAGAGATCCAGCTTCCTCAAGTTGCTATATTACAGACGTGGGACTT
AGAGCAAGTTAACAAACACCAAGAAAGCCGTGAAGACGGCCAGCCAAAGACGAAAAGCAG
CTGTGGTGGCGGCGTTTGTGTCGCTTGCTGCGGTAGGAGACATAGCGGGGCAGGCGAGAC
CTTCTTTACCTTCTTGGCACTGGTTTGCGAAAAGTCCCGGTAGGTATTTCCCATAGAGAT
TGATGTAACTGAACATAGTGGTAGCACACTCATTACTCAAGTCGTTGATCTCATCAGTGT
AAGGACATGCAAAGTCCTTGAAAGCGGCACAGCATTCCTTGGCTGGGAATTTGGGACCTT
TGCATTGGCTTGTTATGATTGTGTAGTTCATAAAATCAAAGTTCACAGGACATGCTTTCT
TGGTCTGAAGTAGGTTTCTTCCAATAGCCAAATTCTGCGGTTCGAACACGCCATCTGAGA
TGAAACTTGAAGATGAGAAGGATGCAAGTACTGTGAG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2EJ55TF 630 0 0
TTTTTAAAGCTCCAAAAATCAAAAGAATGAGATGGTACAAGTAATACAAATCGTGGATAT
ACAGAGATCCAGCTTCCTCAAGTTGCTATATTACAGACGTGGGACTTAGAGCAAGTTAAC
AAACACCAAGAAAGCCGTGAAGACGGCCAGCCAAAGACGAGAAGCAGCTGTGGTGGCTGC
GTTTGTGTCGCTTGCTGCGGTAGGAGACATAGCGGGGCAGGCGAGACCTTCTTTACCTTC
TTGGCACTGGTTTGCGAAAAGTCCCGGTGGGTATTTCCCATAGAGATTGATGTAACTGAA
CATAGTGGTAGCACACTCATTACTCAAGTCGTTGATCTCATCAGTGTAAGGACATGCAAA
GTCCTTGAAAGCGGCACAGCATTCCTTGGCTGGGAATTTGGGACCTTTGCATTGGCTTGT
TATGATTGTGTAGTTCATAAACTCAAAGTTCACAGGACATGCTTTCTTGGTCTGAAGTAG
GTTTCTTCCAATAGCCAAATTCTGCGGTTCGAACACGCCATCTGAGATGAAACTTGAAGA
TGAGAAGGATGCAAGTACTGTGAGTACAAGGATGAATGATGTAAGAGCTCTAGATAGGAA
GTTGAACTCCATGATTCTTTTGGTTAACAA

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 3

CO CL2410Contig1 783 3 2 U
GGATGCGCGGGCGGATACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAAACCCTTAGCTGAACGG
TGCGAGATGGCGAGCTCAGTGACGCTGCTTCTGTGTAGTCTTCTTCTTCTCGGAACCCTG
AGCGCGATTCAGGTCAAGAAGTCGAAGGAGAACTTAAAGGAGATCACACACAAGGTTTAT
TTCGATGTTGAGATTGATGGGAAAGAAGCTGGCCGTATTGTCATGGGTCTATATGGAAAG
ACAGTCCCTAAAACTGCAGAGAATTTTCGAGCTTTGTGCACAGGGGAAAAGGGAATAGGT
AAGAAAGGGAAGGCTCTACATTACAAGGGGAGCTCGTTCCACAGGGTCATACCAAGCTTT
ATGCTCCAGGGAGGCGATTTCACCCAGGGCAATGGTATGGGAGGAGAGTCTATCTATGGT
GAGACGTTTCCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCATACTGGTCCAGGGCTTCTATCAATG
GCAAACGCCGGCCAAGACACCAACGGTTCTCAGTTTTTCATCACTACAGTGACAACAAGC
TGGTTGGACGGGAGGCACGTAGTATTCGGGAAGGTAGTGTCGGGAATGGACGTGGTGTAC
AAAATCGAAGCTGAGGGTAATCAGAGTGGAACTCCTAAGAGTAAAGTTGTGATTGTCGAC
AGTGGTGAGCTTCCTCTGTAACTCAACTTTCATGTAGTTTTTCTCCATCTCATCAGTCAT
TGATGTGAGTTAAATCTAGTGCGTGAGACTTTTGTGTTTAAACGACTATCTTAGCCACTT
GAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2H827TF U 1
AF RR2AH48TF U 346
AF RR2H827JQ C 52
BS 1 569 RR2H827TF
BS 570 783 RR2H827JQ

RD RR2H827TF 569 0 0
GGATGCGCGGGCGGATACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAAACCCTTAGCTGAACGG
TGCGAGATGGCGAGCTCAGTGACGCTGCTTCTGTGTAGTCTTCTTCTTCTCGGAACCCTG
AGCGCGATTCAGGTCAAGAAGTCGAAGGAGAACTTAAAGGAGATCACACACAAGGTTTAT
TTCGATGTTGAGATTGATGGGAAAGAAGCTGGCCGTATTGTCATGGGTCTATATGGAAAG
ACAGTCCCTAAAACTGCAGAGAATTTTCGAGCTTTGTGCACAGGGGAAAAGGGAATAGGT
AAGAAAGGGAAGGCTCTACATTACAAGGGGAGCTCGTTCCACAGGGTCATACCAAGCTTT
ATGCTCCAGGGAGGCGATTTCACCCAGGGCAATGGTATGGGAGGAGAGTCTATCTATGGT
GAGACGTTTCCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCATACTGGTCCAGGGCTTCTATCAATG
GCAAACGCCGGCCAAGACACCAACGGTTCTCAGTTTTTCATCACTACAGTGACAACAAGC
TGGTTGGACGGGAGGCACGTAGTATTCGG

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2AH48TF 213 0 0
GTCATACCAAGCTTTATGCTCCAGGCAGGCGATTTCACCCAAGGCAATGGTATGGGAGGA
GAGTCTATCTATGGTGAGACGTTTCCTGATGAGAACTTCAAACTCAAACATACTGGTCCA
GGGCTTCTATCAATGGCAAACGCCGGCCAAGACACCAACGGTTCTCAGTTTTTCATCACA
ACAGTGACAACAAGCTGGTTGGACGGGAGGCAC

QA 1 213 1 213
DS 

RD RR2H827JQ 732 0 0
GCT
GAACGGTGCGAGATGGCGAGCTCAGTGACGCTGCTTCTGTGTAGTCTTCTTCTTCTCGGA
ACCCTGAGCGCGATTCAGGTCAAGAAGTCGAAGGAGAACTTAAAGGAGATCACACACAAG
GTTTATTTCGATGTTGAGATTGATGGGAAAGAAGCTGGCCGTATTGTCATGGGTCTATAT
GGAAAGACAGTCCCTAAAACTGCAGAGAATTTTCGAGCTTTGTGCACAGGGGAAAAGGGA
ATAGGTAAGAAAGGGAAGGCTCTACATTACAAGGGGAGCTCGTTCCACAGGGTCATACCA
AGCTTTATGCTCCAGGGAGGCGATTTCACCCAGGGCAATGGTATGGGAGGAGAGTCTATC
TATGGTGAGACGTTTCCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCATACTGGTCCAGGGCTTCTA
TCAATGGCAAACGCCGGCCAAGACACCAACGGTTCTCAGTTTTTCATCACTACAGTGACA
ACAAGCTGGTTGGACGGGAGGCACGTAGTATTCGGGAAGGTAGTGTCGGGAATGGACGTG
GTGTACAAAATCGAAGCTGAGGGTAATCAGAGTGGAACTCCTAAGAGTAAAGTTGTGATT
GTCGACAGTGGTGAGCTTCCTCTGTAACTCAACTTTCATGTAGTTTTTCTCCATCTCATC
AGTCATTGATGTGAGTTAAATCTAGTGCGTGAGACTTTTGTGTTTAAACGACTATCTTAG
CCACTTGAT

QA 4 732 4 732
DS 



AS 1 3

CO CL2411Contig1 1166 3 4 U
GCACTAATTTTTTTTAGCTGTCATAAGAATTTACGGAGAAGCTGATCGGTTCTGTCTGTA
TAAAGCCAGTTTCATAAACAAACAGAAAAAGAAAAAAAACAAGAACCCACACAACTTCTT
CAACAAAACTAGTTGCAGTCTCCACTTAAACACTATCCAAAGCATCACTCTGCAACTCAT
CTTTGTTCCTTGGAGGAACTAACCTTTCCGTTGCAAGTCTCTCTTCTAGAGCTCTTGCTC
CTCTTTCTCTCCTCCTAGAAGCTTCAGCAGAGTCAGATCCGGGTAATGGAGCACCGCTGG
TAGTATAACCATGGTCTTCGCTGGTCGCATTTGATCGTCCACAAAGCATCCGATGAAATA
TTGAGGCTATAGGATCAATGATCGGTCTGAGGAATTCAGGAAAGAAAGTGGAGAAGGCAA
AGTCGTCACTCGGATCACCTCTGAGCTTTGTCTCTGGCCTCCTCTGCAAGTATCTGAGGT
ATAACCAGCCCATATACGTACCAAAAATCAAAGTGGGAAGGTATGCTGCTGAATTAAGTG
TGAAGAAGCTTGAGGCTATTGACAAAACTAGCATAATAGAGGGCAACCACTTTGCTTTTA
TCTTTACGAGTAGTACCTCCTGGTCAGGTATTATCTGCTTAATCCCGACAAGAAGGCCTG
CCAAGACACCATGAAAACCTGCGAAGGGCATATATAGGTAGATTTCGAGCCTGGTGATGT
AGTATAAAGCAATGGCAGTGACGAAAACGCAGAGATAGGTAAGGAAGTTCACTACGAAGA
TGAACTTAAGGAACTCCTTGGAACCCCAGACAGGTTCAAGGAACTTTCCCATAAAGAGGA
GAGAAACAACGCTGAAGACAACACCATATAGTGAGAGTTCAAAATAGCCGCTTGTAATCA
GATTCCACCCAAATGGAATAGTCCTGGCTGGGATGAGAGCGAGGTACGTGACGGTGGAGG
GAATGAAGTGAACCAAGACGTGGCCGACCACAAGCACGAGAGCGAGTCCTTTGCAGAGCT
TGGTGAAATTTGTGAACATATCGCTCCCGGAGAACTCATGTCGCCGGAGTATCAAATCTG
AGATCGTAACGACGGATCTCGTCGACGCAGCTGAACCTGGAGCCGGCAATTATTATTTAG
TTATTATACTAAACGTGTTACTGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB32JQ U 1
AF RR2FB20JQ U 1
AF RR2FB32TF C 408
BS 1 790 RR2FB20JQ
BS 791 791 RR2FB32TF
BS 792 802 RR2FB20JQ
BS 803 1166 RR2FB32TF

RD RR2FB32JQ 754 0 0
GCACTAATTTTTTTTAGCTGTCATAAGAATTTACGGAGAAGCTGATCGGTTCTGTCTGTA
TAAAGCCAGTTTCATAAACAAACAGAAAAAGAAAAAAAACAAGAACCCACACAACTTCTT
CAACAAAACTAGTTGCAGTCTCCACTTAAACACTATCCAAAGCATCACTCTGCAACTCAT
CTTTGTTCCTTGGAGGAACTAACCTTTCCGTTGCAAGTCTCTCTTCTAGAGCTCTTGCTC
CTCTTTCTCTCCTCCTAGAAGCTTCAGCAGAGTCAGATCCGGGTAATGGAGCACCGCTGG
TAGTATAACCATGGTCTTCGCTGGTCGCATTTGATCGTCCACAAAGCATCCGATGAAATA
TTGAGGCTATAGGATCAATGATCGGTCTGAGGAATTCAGGAAAGAAAGTGGAGAAGGCAA
AGTCGTCACTCGGATCACCTCTGAGCTTTGTCTCTGGCCTCCTCTGCAAGTATCTGAGGT
ATAACCAGCCCATATACGTACCAAAAATCAAAGTGGGAAGGTATGCTGCTGAATTAAGTG
TGAAGAAGCTTGAGGCTATTGACAAAACTAGCATAATAGAGGGCAACCACTTTGCTTTTA
TCTTTACGAGTAGTACCTCCTGGTCAGGTATTATCTGCTTAATCCCGACAAGAAGGCCTG
CCAAGACACCATGAAAACCTGCGAAGGGCATATATAGGTAGATTTCGAGCCTGGTGATGT
AGTATAAAGCAATGGCAGTGACGAAAACGCAGAG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2FB20JQ 803 0 0
GCACTAATTTTTTTTAGCTGTCATAAGAATTTACGGAGAAGCTGATCGGTTCTGTCTGTA
TAAAGCCAGTTTCATAAACAAACAGAAAAAGAAAAAAAACAAGAACCCACACAACTTCTT
CAACAAAACTAGTTGCAGTCTCCACTTAAACACTATCCAAAGCATCACTCTGCAACTCAT
CTTTGTTCCTTGGAGGAACTAACCTTTCCGTTGCAAGTCTCTCTTCTAGAGCTCTTGCTC
CTCTTTCTCTCCTCCTAGAAGCTTCAGCAGAGTCAGATCCGGGTAATGGAGCACCGCTGG
TAGTATAACCATGGTCTTCGCTGGTCGCATTTGATCGTCCACAAAGCATCCGATGAAATA
TTGAGGCTATAGGATCAATGATCGGTCTGAGGAATTCAGGAAAGAAAGTGGAGAAGGCAA
AGTCGTCACTCGGATCACCTCTGAGCTTTGTCTCTGGCCTCCTCTGCAAGTATCTGAGGT
ATAACCAGCCCATATACGTACCAAAAATCAAAGTGGGAAGGTATGCTGCTGAATTAAGTG
TGAAGAAGCTTGAGGCTATTGACAAAACTAGCATAATAGAGGGCAACCACTTTGCTTTTA
TCTTTACGAGTAGTACCTCCTGGTCAGGTATTATCTGCTTAATCCCGACAAGAAGGCCTG
CCAAGACACCATGAAAACCTGCGAAGGGCATATATAGGTAGATTTCGAGCCTGGTGATGT
AGTATAAAGCAATGGCAGTGACGAAAACGCAGAGATAGGTAAGGAAGTTCACTACGAAGA
TGAACTTAAG*AACTCCTTGGA
C

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2FB32TF 759 0 0
AGT
GAGAAGGCAAAGTCGTCACTCGGATCACCTCTGAGCTTTGTCTCTG*CCTCCTCTGCAAG
TATCTGAGGTATAACCAGCCCATATACGTACCAAAAATCAAAGTGGGAAGGTATGCTGCT
GAATTAAGTGTGAAGAAGCTTGAGGCTATTGACAAAACTAGCATAATAGAGGGCAACCAC
TTTGCTTTTATCTTTACGAGTAGTACCTCCTGGTCAGGTATTATCTGCTTAATCCCGACA
AGAAGGCCTGCCAAGACACCATGAAAACCTGCGAAGGGCATATATAGGTAGATTTCGAGC
CTGGTGATGTAGTATAAAGCAATGGCAGTGACGAAAACGCAGAGATAGGTAAGGAAGTTC
ACTACGAAGATGAACTTAAGGAACTCCTTGGAACCCCAGACAGGTTCAAGGAACTTTCCC
ATAAAGAGGAGAGAAACAACGCTGAAGACAACACCATATAGTGAGAGTTCAAAATAGCCG
CTTGTAATCAGATTCCACCCAAATGGAATAGTCCTGGCTGGGATGAGAGCGAGGTACGTG
ACGGTGGAGGGAATGAAGTGAACCAAGACGTGGCCGACCACAAGCACGAGAGCGAGTCCT
TTGCAGAGCTTGGTGAAATTTGTGAACATATCGCTCCCGGAGAACTCATGTCGCCGGAGT
ATCAAATCTGAGATCGTAACGACGGATCTCGTCGACGCAGCTGAACCTGGAGCCGGCAAT
TATTATTTAGTTATTATACTAAACGTGTTACTGTCC

QA 4 759 4 759
DS 



AS 1 4

CO CL2412Contig1 784 4 6 U
GAAACTATAATCATATAATTCTTTACCTTTCCGAATCATGATGAATTCAAGAATTTTCAT
TGCCATCTTATTATCCTGCATTATCGCTTCGATTCATGCATATTATCCCGATGCCCTACA
AGATCTCTGCGTTGCTGATAAATCTCATGGAACCAAGTTGAACGGGTTCCCATGCAAAGA
AATGTCAAACATCACATCGTCCGACTTCTTCTTCGCCGGAATATCAAGCCCCGCCTCCAT
AAACTCCACGATGGGCTCTGCCGTGACGGGAGCCAACGTGGAAAAGATCCCAGGACTCAA
TACTCTCTCAGTTTCCCTAGCACGTATAGACTACGCGCCGGGTGGCTTAAACCCACCTCA
CACTCACCCACGTGCCACTGAAGTCGTTTTTGTCCTCGAAGGAGAGCTCGAAGTTGGGTT
TATCACGGCGGCAAACAAGCTTTTCTCTAAAACCATTAAACTTGGTGAAGTTTTTTGTGT
TCCCAAGAGGGCTTGTGCATTTTCAAAAGAACAATGGAAAATCTCCAGCATCTGTTTTGT
GTGCGTTTAATAGTCAGTTACCGGGAACGGTGTCTGTTGCGGTGACGCTTTTTGCGACGG
AGCCTGCTTTGCCGGAAGATGTGTTGACAAAGACTTTTCAGGTGGGATCTAAGATGGTTG
ACAAGATTAAAGAAAGGCTTTCTACCAAAAAATAATTCAATTATATGTAATTGGTTCATG
ATGAAAACCTTTGAAATTTTTTTTCTTATAAAGGTTGTGGTAACTAAAAATAAATTATTA
CTGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 

AF RR2GL51TF U 1
AF RR2G444TF U 1
AF RR2G444JQ C 206
AF RR2GL51JQ C 210
BS 1 640 RR2G444TF
BS 641 641 RR2G444JQ
BS 642 676 RR2G444TF
BS 677 677 RR2G444JQ
BS 678 687 RR2G444TF
BS 688 784 RR2G444JQ

RD RR2GL51TF 595 0 0
GAAACTATAATCATATAATTCTTTACCTTTCCGAATCATGATGAATTCAAGAATTTTCAT
TGCCATCTTATTATCCTGCATTATCGCTTCGATTCATGCATATTATCCCGATGCCCTACA
AGATCTCTGCGTTGCTGATAAATCTCATGGAACCAAGTTGAACGGGTTCCCATGCAAAGA
AATGTCAAACATCACATCGTCCGACTTCTTCTTCGCCGGAATATCAAGCCCCGCCTCCAT
AAACTCCACGATGGGCTCTGCCGTGACGGGAGCCAACGTGGAAAAGATCCCAGGACTCAA
TACTCTCTCAGTTTCCCTAGCACGTATAGACTACGCGCCGGGTGGCTTAAACCCACCTCA
CACTCACCCACGTGCCACTGAAGTCGTTTTTGTCCTCGAAGGAGAGCTCGAAGTTGGGTT
TATCACGGCGGCAAACAAGCTTTTCTCTAAAACCATTAAACTTGGTGAAGTTTTTTGTGT
TCCCAAGAGGGCTTGTGCATTTTCAAAAGAACAATGGAAAATCTCCAGCATCTGTTTTGT
GTGCGTTTAATAGTCAGTTACCGGGAACGGTGTCTGTTGCGGTGACGCTTTTTGC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2G444TF 687 0 0
GAAACTATAATCATATAATTCTTTACCTTTCCGAATCATGATGAATTCAAGAATTTTCAT
TGCCATCTTATTATCCTGCATTATCGCTTCGATTCATGCATATTATCCCGATGCCCTACA
AGATCTCTGCGTTGCTGATAAATCTCATGGAACCAAGTTGAACGGGTTCCCATGCAAAGA
AATGTCAAACATCACATCGTCCGACTTCTTCTTCGCCGGAATATCAAGCCCCGCCTCCAT
AAACTCCACGATGGGCTCTGCCGTGACGGGAGCCAACGTGGAAAAGATCCCAGGACTCAA
TACTCTCTCAGTTTCCCTAGCACGTATAGACTACGCGCCGGGTGGCTTAAACCCACCTCA
CACTCACCCACGTGCCACTGAAGTCGTTTTTGTCCTCGAAGGAGAGCTCGAAGTTGGGTT
TATCACGGCGGCAAACAAGCTTTTCTCTAAAACCATTAAACTTGGTGAAGTTTTTTGTGT
TCCCAAGAGGGCTTGTGCATTTTCAAAAGAACAATGGAAAATCTCCAGCATCTGTTTTGT
GTGCGTTTAATAGTCAGTTACCGGGAACGGTGTCTGTTGCGGTGACGCTTTTTGCGACGG
AGCCTGCTTTGCCGGAAGATGTGTTGACAAAGACTTTTCACGTGGGATCTAAGATGGTTG
ACAAGATTAAAGAAAG*CTTTCTACCA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2G444JQ 579 0 0
TTCT
TCTTCGCCGGAATATCAAGCCCCGCCTCCATAAACTCCACGATGGGTTCTGCCGTGACGG
GAGCCAACGTGGAAAAGATCCCAGGACTCAATACTCTTTCAGTTTCCCTAGCACGTATAG
ACTACGCGCCGGGTGGCTTAAACCCACCTCACACTCACCCACGTGCCACTGAAGTCGTTT
TTGTCCTCGAAGGAGAGCTCGAAGTTGGGTTTATCACGGCGGCAAACAAGCTTTTCTCTA
AAACCATTAAACTTGGTGAAGTTTTTTGTGTTCCCAAGAGGGCTTGTGCATTTTCAAAAG
AACAATGGAAAATCTCCAGCATCTGTTTTGTGTGCGTTTAATAGTCAGTTACCGGGAACG
GTGTCTGTTGCGGTGACGCTTTTTGCGACGGAGCCTGCTTTGCCGGAAGATGTGTTGACA
AAGACTTTTCAGGTGGGATTTAAGATGGTTGACAAGATTAAAGAAAGGCTTTCTACCAAA
AAATAATTCAATTATATGTAATTGGTTCATGATGAAAACCTTTGAAATTTTTTTTCTTAT
AAAGGTTGTGGTAACTAAAAATAAATTATTACTGC

QA 5 579 5 579
DS 

RD RR2GL51JQ 575 0 0
TCTTCGCCGGAATATCAAGCCCCGCCTCCATAAACTCCACGATGGGTTCTGCCGTGACGG
GAGCCAACGTGGAAAAGATCCCAGGACTCAATACTCTTTCAGTTTCCCTAGCACGTATAG
ACTACGCGCCGGGTGGCTTAAACCCCCCTCACACTCACCCACGTGCCACTGAAGTCGTTT
TTGTCCTCGAAGGAGAGCTCGAAGTTGGGTTTATCACGGCGGCAAACAAGCTTTTCTCTA
AAACCATTAAACTTGGTGAAGTTTTTTGTGTTCCCAAGAGGGCTTGTGCATTTTCAAAAG
AACAATGGAAAATCTCCAGCATCTGTTTTGTGTGCGTTTAATAGTCAGTTACCGGGAACG
GTGTCTGTTGCGGTGACGCTTTTTGCGACGGAGCCTGCTTTGCCGGAAGATGTGTTGACA
AAGACTTTTCAGGTGGGATCTAAGATGGTTGACAAGATTAAAGAAAGGCTTTCTACCAAA
AAATAATTCAATTATATGTAATTGGTTCATGATGAAAACCTTTGAAATTTTTTTTCTTAT
AAATGTTGTGGTAACTAAAAATAAATTATTACTGC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 4

CO CL2413Contig1 726 4 15 U
GAGACTATGGTTCTTGGGTTCCGTCCCCCCAACAAAGCTCGCCCTTGCGACTTAGTCGGG
GCTGCTCTCTTTGGAGACGGGGCAGCTGCCCTGATCATCGGAGCAGACCCTACAGAGCCA
GAAAGCCCCTTCATGGAGCTTCACTATGCGCTGCAGCAGTTCCTACCAGGAACGCATGGG
GTGATTGACGGGCGGTTGTCAGAGGAGGGCATAAGCTTCAAGCTAGGAAGAGAACTGCCT
CAGAAGATCGAAGACAACATAGAGGAGTTCTGCAAGAAGCTGGTGGCAAAGGCTGGCTCT
GGCTCATTGGAGTTGAATGACCTGTTCTGGGCCGTTCATCCCGGTGGACCGGCCATCCTA
AACGGGCTAGAGACGAAACTGAAGCTGAAACCAGAGAAGTTGGAATGCAGCAGACAGGCG
TTGATGGATTATGGGAACGCAAGCAGCAACACCATCTTCTACATAATGGACAAAGTAAGA
GGTGAGCTTGAGAAGAAAGGCAGAGGTGGAGAAGAGTGGGGTCTAGGTTTAGCCTTCGGA
CCGGGAATTACGTTCGAGGGATTTCTCATGAGGAGCCTCTAAATGTGGCTATGGACCCGA
TATATGTGATACAAAAATATTAAAGTACATTTACGAAAAGTCTACATGAAACAATGAAGT
CTGAAAAATATGCTTATGAATTTAATCTTTTAACTAATTTATAAAATTTTATACATTTCT
TTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 

AF RR2AY60TFB U 90
AF RR2BK08JQ C 1
AF RR2F336JQ C 167
AF RR2F336TF U 114
BS 1 89 RR2BK08JQ
BS 90 117 RR2AY60TFB
BS 118 118 RR2BK08JQ
BS 119 125 RR2AY60TFB
BS 126 126 RR2F336TF
BS 127 182 RR2AY60TFB
BS 183 183 RR2F336TF
BS 184 302 RR2AY60TFB
BS 303 303 RR2F336TF
BS 304 359 RR2AY60TFB
BS 360 360 RR2F336TF
BS 361 480 RR2AY60TFB
BS 481 481 RR2F336TF
BS 482 495 RR2AY60TFB
BS 496 726 RR2F336TF

RD RR2AY60TFB 406 0 0
CCTGATCATCGGAGCAGACCCTACAGAGTCAGAAAGTCCCTTCATGGAGCTTCACTATGC
GCTGCAGCAGTTCCTACCAGGAACGCATGGGGTCATTGACGGGCGGTTGTCAGAGGAGGG
CATAAGCTTCAAGCTAGGAAGAGAACTGCCTCAGAAGATCGAAGACAACATAGAGGAGTT
CTGCAAGAAGCTGGTGGCAAAGGCTGGCTCTGGTTCATTGGAGTTGAATGACCTGTTCTG
GGCCGTTCATCCCGGTGGACCGGCCATCCTGAACGGGCTAGAGACGAAACTGAAGCTGAA
ACCAGAGAAGTTGGAATGCAGCAGACAGGCGTTGATGGATTATGGGAACGCAAGCAGCAA
CACCATCTTCTACATAATGGACAAAGTAAGATGTGAGCTTGAGAAG

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR2BK08JQ 726 0 0
GAGACTATGGTTCTTGGGTTCCGTCCCCCCAACAAAGCTCGCCCTTGCGACTTAGTCGGG
GCTGCTCTCTTTGGAGACGGGGCAGCTGCCCTGATCATCGGAGCAGACCCTACAGAGCCA
GAAAGCCCCTTCATGGAGCTTCACTATGCGCTGCAGCAGTTCCTACCAGGAACGCATGGG
GTGATTGACGGGCGGTTGTCAGAGGAGGGCATAAGCTTCAAGCTAGGAAGAGAACTGCCT
CAGAAGATCGAAGACAACATAGAGGAGTTCTGCAAGAAGCTGGTGGCAAAGGCTGGCTCT
GGTTCATTGGAGTTGAATGACCTGTTCTGGGCCGTTCATCCCGGTGGACCGGCCATCCTA
AACGGGCTAGAGACGAAACTGAAGCTGAAACCAGAGAAGTTGGAATGCAGCAGACAGGCG
TTGATGGATTATGGGAACGCAAGCAGCAACACCATCTTCTACATAATGGACAAAGTAAGA
GGTGAGCTTGAGAAGAAAGGCAGAGGTGGAGAAGAGTGGGGTCTAGGTTTAGCCTTCGGA
CCGGGAATTACGTTCGAGGGATTTCTCATGAGGAGCCTCTAAATGTGGCTATGGACCCGA
TACATGTGATACAAAAATATTAAAGTACATTTACGAAAAGTCTACATGAAACAATGAAGT
CTGAAAAATATGCTTATGAATTTAATCTTTTAACTAATTTATAAAATTTTATACATTTCT
TTTGAT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2F336JQ 560 0 0
CAGGAACGCATGGGGTGATTGACGGGCGGTTGTCAGAGGAGGGCATAAGCTTCAAGCTAG
GAAGAGAACTGCCTCAGAAGATCGAAGACAACATAGGGGAGTTCTGCAAGAAGCTGGTGG
CAAAGGCTGGCTCTGGCTCATTGGAGTTGAATGACCTGTTCTGGGCCGTTCATCCCGGTG
GACCGGCCATCCTAAACGGGCTAGAGACGAAACTGAAGCTGAAACCAGAGAAGTTGGAAT
GCAGCAGACAGGCGTTGATGGATTATGGGAACGCAAGCAGCAACACCATCTTCTACATAA
TGGACAAAGTAAGAGGTGAGCTTGAGAAGAAAGGCAGAGGTGGAGAAGAGTGGGGTCTAG
GTTTAGCCTTCGGACCGGGAATTACGTTCGAGGGATTTCTCATGAGGAGCCTCTAAATGT
GGCTATGGACCCGATATATGTGATACAAAAATATTAAAGTACATTTACGAAAAGTCTACA
TGAAACAATGAAGTCTGAAAAATATGCTTATGAATTTAATCTTTTAACTAATTTATAAAA
TTTTATACATTTCTTTTGAT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2F336TF 613 0 0
GGAGT
CAGAAAGCCCCTTCATGGAGCTTCACTATGCGCTGCAGCAGTTCCTACCAGGAACGCATG
GGGTGATTGACGGGCGGTTGTCAGAGGAGGGCATAAGCTTCAAGCTAGGAAGAGAACTGC
CTCAGAAGATCGAAGACAACATAGGGGAGTTCTGCAAGAAGCTGGTGGCAAAGGCTGGCT
CTGGCTCATTGGAGTTGAATGACCTGTTCTGGGCCGTTCATCCCGGTGGACCGGCCATCC
TAAACGGGCTAGAGACGAAACTGAAGCTGAAACCAGAGAAGTTGGAATGCAGCAGACAGG
CGTTGATGGATTATGGGAACGCAAGCAGCAACACCATCTTCTACATAATGGACAAAGTAA
GAGGTGAGCTTGAGAAGAAAGGCAGAGGTGGAGAAGAGTGGGGTCTAGGTTTAGCCTTCG
GACCGGGAATTACGTTCGAGGGATTTCTCATGAGGAGCCTCTAAATGTGGCTATGGACCC
GATATATGTGATACAAAAATATTAAAGTACATTTACGAAAAGTCTACATGAAACAATGAA
GTCTGAAAAATATGCTTATGAATTTAATCTTTTAACTAATTTATAAAATTTTATACATTT
CTTTTGAT

QA 6 613 6 613
DS 



AS 1 3

CO CL2414Contig1 1067 3 2 U
GGGACTTGAGTATAAGATCTGAGAATAATTAGGGTTTCCTTCCGCCGCCGCCGCTGTTGT
CGACGATTCACTTTGCGTTAATGGCGGTATCGTACAATGCATTAGCACAGTCTTTACAGG
CGACAAGTAACTGCTTCATCCCCAAAGCCATGTGCATCAAGCAGAGAAGCAGCAGATCCA
GTGGTGTCGTATTCGCTTCTAATGATAACAACATTGCTCTTCAATCTAAGGTAGATAACT
TGTTGGACCGCACAAAATGGGATGACAAAGGATTAGCTGTGGCAATAGCACAAAACGTTG
ACACTGGAGCTGTGTTAATGCAAGGCTTTGCTAACAGAGAGGCTCTCTCCACGACCCTCA
CTTCTCGTAAAGCTACGTTCTTCAGCTGATCAAGATCAACCTTATGGACCAAGGGAGAGA
CATCCAACAACTTCATCAATGTCCTCGATGTTTATCTTGACTGCGACCGTGATTCGATAA
TCTACCTTGGAACACCTGATGGGCCTACTTGTCACACAGGAGCAGAGACTTGTTACTACA
CCTCAGTGTTCGATCAACTAAACAATGATGAGGCTTCAGGAAACAAGATAGCATTAACAA
CATTGTATTCACTAGAATCAATCATTTCAAAGCGGAAAGAAGAATCAACAGTTCCTCAGG
AAGGCAAACCATCGTGGACTAGACGGTTATTGACGGATGACGCTCTGCTTTGCTCAAAGA
TCAGGGAAGAAGCAGACGAGTTATGCAGAACACTGGAGGATACGGAGGACGTTTCAAGAA
CAGCATCGGAGATGGCTGATGTGTTGTACCATTCGATGGTGCTTCTGTCTAAAAGGGATG
TGAAGTTTGAAGATGTTCTTGAAATTCTTAGGAAACGATTCTCTCAGTCTGGGATCGAGG
AGAAGCAAAACCGCACAAAGTGACCGTTTACAAGTGTTGAATAATGTTGTGTTTGCGATA
ATTCTCCTTGAAGTTAATGCTGTTCCACTAATTTGTTCAGCCTGGAACTTTGTACTGTAC
ATCAGATGTTCTATCAGATAAAAAGGATAATAAATTTGTCTTCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL21TF U 1
AF RR2AR15TF U 42
AF RR2EL21JQ C 188
BS 1 655 RR2EL21TF
BS 656 1067 RR2EL21JQ

RD RR2EL21TF 655 0 0
GGGACTTGAGTATAAGATCTGAGAATAATTAGGGTTTCCTTCCGCCGCCGCCGCTGTTGT
CGACGATTCACTTTGCGTTAATGGCGGTATCGTACAATGCATTAGCACAGTCTTTACAGG
CGACAAGTAACTGCTTCATCCCCAAAGCCATGTGCATCAAGCAGAGAAGCAGCAGATCCA
GTGGTGTCGTATTCGCTTCTAATGATAACAACATTGCTCTTCAATCTAAGGTAGATAACT
TGTTGGACCGCACAAAATGGGATGACAAAGGATTAGCTGTGGCAATAGCACAAAACGTTG
ACACTGGAGCTGTGTTAATGCAAGGCTTTGCTAACAGAGAGGCTCTCTCCACGACCCTCA
CTTCTCGTAAAGCTACGTTCTTCAGCTGATCAAGATCAACCTTATGGACCAAGGGAGAGA
CATCCAACAACTTCATCAATGTCCTCGATGTTTATCTTGACTGCGACCGTGATTCGATAA
TCTACCTTGGAACACCTGATGGGCCTACTTGTCACACAGGAGCAGAGACTTGTTACTACA
CCTCAGTGTTCGATCAACTAAACAATGATGAGGCTTCAGGAAACAAGATAGCATTAACAA
CATTGTATTCACTAGAATCAATCATTTCAAAGCGGAAAGAAGAATCAACAGTTCC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2AR15TF 615 0 0
GG
GCCGCCGCCGCTTTTGTCGACGATTCACTTTGCGTTAATGGCGGTATCGTACAATGCATT
AGCACAGTCTTTACAGGCGACAAGTAACTGCTTCATCCCCAAAGCCATGTGCATCAAGCA
GAGAAGCAGCAGATCCAGTGGTGTCGTATTCGCTTCTAATGATAACAACATTGCTCTTCA
ATCTAAGGTAGATAACTTGTTGGACCGCATAAAATGGGATGACAAAGGATTAGCTGTGGC
AATAGCACAAAACGTTGACACTGGAGCTGTGTTAATGCAAGGCTTTGCTAACAGAGAGGC
TCTCTCCACGACCCTCACTTCTCGTAAAGCTACGTTCTTCAGCCGATCAAGATCAACCTT
ATGGACCAAGGGAGAGACATCCAACAACTTCATCAATGTCCTCGATGTTTATCTTGACTG
CGACCGTGATTCGATAATCTACCTTGGAACACCTGATGGGCCTACTTGTCACACAGGAGC
AGAGACTTGTTACTACGCCTCAGTGTTCGATCAACTAAACAATGATGAGGCTTCAGGAAA
CAAGATAGCATTAACAACATTGTATTCACTAGAATCAATCATTTCAAAGCGGAAAGAAGA
ATCAACAGTTCC
T

QA 3 614 3 614
DS 

RD RR2EL21JQ 880 0 0
CGTATTCGCTTCTAATGATAACAACAT*GCTCTTCAATCTAAGGTAGATAACTTGTTGGA
CCGCACAAAATGGGATGACAAAGGATTAGCTGTGGCAATAGCACAAAACGTTGACACTGG
AGCTGTGTTAATGCAAGGCTTTGCTAACAGAGAGGCTCTCTCCACGACCCTCACTTCTCG
TAAAGCTACGTTCTTCAGCTGATCAAGATCAACCTTATGGACCAAGGGAGAGACATCCAA
CAACTTCATCAATGTCCTCGATGTTTATCTTGACTGCGACCGTGATTCGATAATCTACCT
TGGAACACCTGATGGGCCTACTTGTCACACAGGAGCAGAGACTTGTTACTACACCTCAGT
GTTCGATCAACTAAACAATGATGAGGCTTCAGGAAACAAGATAGCATTAACAACATTGTA
TTCACTAGAATCAATCATTTCAAAGCGGAAAGAAGAATCAACAGTTCCTCAGGAAGGCAA
ACCATCGTGGACTAGACGGTTATTGACGGATGACGCTCTGCTTTGCTCAAAGATCAGGGA
AGAAGCAGACGAGTTATGCAGAACACTGGAGGATACGGAGGACGTTTCAAGAACAGCATC
GGAGATGGCTGATGTGTTGTACCATTCGATGGTGCTTCTGTCTAAAAGGGATGTGAAGTT
TGAAGATGTTCTTGAAATTCTTAGGAAACGATTCTCTCAGTCTGGGATCGAGGAGAAGCA
AAACCGCACAAAGTGACCGTTTACAAGTGTTGAATAATGTTGTGTTTGCGATAATTCTCC
TTGAAGTTAATGCTGTTCCACTAATTTGTTCAGCCTGGAACTTTGTACTGTACATCAGAT
GTTCTATCAGATAAAAAGGATAATAAATTTGTCTTCTGTT

QA 1 880 1 880
DS 



AS 1 4

CO CL2415Contig1 797 4 12 U
GGACGACAGCATCAGCAGATAGATAATGGCATCTCTCTTGGAAAAGGCAACTTCGACTCT
TAATGAAGCCAAAGAATCCGTCACAGCCACTGCTGAATCCGTTGGTGCTTCTCTAACTGA
TGCTCAGAAAACCGTTGCAGCCTCCACTGAAACTGCCAGAACCTCTCTAGCCGATGCTCA
GGCAACCGTTGCAGCCACAACTGAAACGGTCAAGACCGAGGCCAAAGCTGCGCCAGGGAA
AGTGTCTGGTGTGTCCACACAGGCAAGAGAAGCTGTGGAGAATGTTATGTCAAGAGGTAT
AGAAGGAGCCAAGTCCTTATTTCATGGTTTGGAGGAGAAGAAGACCGAAATTTCCTCCAA
GCTTGTTGGAGCTGTTACTAATGTCGTTGGTGGAGCATCGAGCAGCACCACCGTGGCAAG
CCGAGACCTTCCCATATCCACAGATAATCAGCCTTTGTTAACTGGTGAGCGCGGGGTTGA
TACAACGCCATGGTGGAAAAACTGTTGTGGAGTCCTTGATCTTCTCAAGACATCTACTAC
AAAATAAAAGGTCAAGCTGATGAAGAACAGAGAGAGCACTAGAACAATATGTAAAAGCCT
TTTGATTATTTATTTCCTTCCTTTTTCTTATTTTGGTTTGAGATTGTGTCTTTTCTTTTT
TTGAAACAAAGTTTGAGATTGTGTCCATGTCTTTGTTTTTATTTGTATTTTGATACGTTG
ATTGTTCCCATGAACTTGTGTAAAAAGTAAGAACCGATAAATCCAAAACAAGTAATTTTT
TTTGTGATGATTGATTC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL15JQ C 1
AF RR2FL15TF U 1
AF RR2CZ36TF U 3
AF RR2CZ36JQ C 71
BS 1 4 RR2FL15JQ
BS 5 223 RR2FL15TF
BS 224 224 RR2CZ36TF
BS 225 305 RR2FL15TF
BS 306 306 RR2CZ36TF
BS 307 513 RR2FL15TF
BS 514 514 RR2CZ36TF
BS 515 604 RR2FL15TF
BS 605 605 RR2CZ36TF
BS 606 728 RR2FL15TF
BS 729 745 RR2CZ36TF
BS 746 797 RR2CZ36JQ

RD RR2FL15JQ 728 0 0
GGACGACAGCATCAGCAGATAGATAATGGCATCTCTCTTGGAAAAGGCAACTTCGACTCT
TAATGAAGCCAAAGAATCCGTCACAGCCACTGCTGAATCCGTTGGTGCTTCTCTAACTGA
TGCTCAGAAAACCGTTGCAGCCTCCACTGAAACTGCCAGAACCTCTCTAGCCGATGCTCA
GGCAACCGTTGCAGCCACAACTGAAACGGTCAAGACCGAGGCCGAAGCTGCGCCAGGGAA
AGTGTCTGGTGTGTCCACACAGGCAAGAGAAGCTGTGGAGAATGTTATGTCAAGAGGTAT
AGAAGTAGCCAAGTCCTTATTTCATGGTTTGGAGGAGAAGAAGACCGAAATTTCCTCCAA
GCTTGTTGGAGCTGTTACTAATGTCGTTGGTGGAGCATCGAGCAGCACCACCGTGGCAAG
CCGAGACCTTCCCATATCCACAGATAATCAGCCTTTGTTAACTGGTGAGCGCGGGGTTGA
TACAACGCCATGGTGGAAAAACTGTTGTGGAGTTCTTGATCTTCTCAAGACATCTACTAC
AAAATAAAAGGTCAAGCTGATGAAGAACAGAGAGAGCACTAGAACAATATGTAAAAGCCT
TTTGGTTATTTATTTCCTTCCTTTTTCTTATTTTGGTTTGAGATTGTGTCTTTTCTTTTT
TTGAAACAAAGTTTGAGATTGTGTCCATGTCTTTGTTTTTATTTGTATTTTGATACGTTG
ATTGTTCC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2FL15TF 728 0 0
GGAC
GACAGCATCAGCAGATAGATAATGGCATCTCTCTTGGAAAAGGCAACTTCGACTCTTAAT
GAAGCCAAAGAATCCGTCACAGCCACTGCTGAATCCGTTGGTGCTTCTCTAACTGATGCT
CAGAAAACCGTTGCAGCCTCCACTGAAACTGCCAGAACCTCTCTAGCCGATGCTCAGGCA
ACCGTTGCAGCCACAACTGAAACGGTCAAGACCGAGGCCGAAGCTGCGCCAGGGAAAGTG
TCTGGTGTGTCCACACAGGCAAGAGAAGCTGTGGAGAATGTTATGTCAAGAGGTATAGAA
GTAGCCAAGTCCTTATTTCATGGTTTGGAGGAGAAGAAGACCGAAATTTCCTCCAAGCTT
GTTGGAGCTGTTACTAATGTCGTTGGTGGAGCATCGAGCAGCACCACCGTGGCAAGCCGA
GACCTTCCCATATCCACAGATAATCAGCCTTTGTTAACTGGTGAGCGCGGGGTTGATACA
ACGCCATGGTGGAAAAACTGTTGTGGAGTTCTTGATCTTCTCAAGACATCTACTACAAAA
TAAAAGGTCAAGCTGATGAAGAACAGAGAGAGCACTAGAACAATATGTAAAAGCCTTTTG
GTTATTTATTTCCTTCCTTTTTCTTATTTTGGTTTGAGATTGTGTCTTTTCTTTTTTTGA
AACAAAGTTTGAGATTGTGTCCATGTCTTTGTTTTTATTTGTATTTTGATACGTTGATTG
TTCC

QA 5 728 5 728
DS 

RD RR2CZ36TF 744 0 0
GG
GACAGCATCAGCAGATAGATAATGGCATCTCTCTTGGAAAAGGCAACTTCGACTCTTAAT
GAAGCCAAAGAATCCGTCACAGCCACTGCTGAATCCGTTGGTGCTTCTCTAACTGATGCT
CAGAAAACCGTTGCAGCCTCCACTGAAACTGCCAGAACCTCTCTAGCCGATGCTCAGGCA
ACCGTTGCAGCCACAACTGAAACGGTCAAGACCGAGGCCAAAGCTGCGCCAGGGAAAGTG
TCTGGTGTGTCCACACAGGCAAGAGAAGCTGTGGAGAATGTTATGTCAAGAGGTATAGAA
GGAGCCAAGTCCTTATTTCATGGTTTGGAGGAGAAGAAGACCGAAATTTCCTCCAAGCTT
GTTGGAGCTGTTACTAATGTCGTTGGTGGAGCATCGAGCAGCACCACCGTGGCAAGCCGA
GACCTTCCCATATCCACAGATAATCAGCCTTTGTTAACTGGTGAGCGCGGGGTTGATACA
ACGCCATGGTGGAAAAACTGTTGTGGAGTCCTTGATCTTCTCAAGACATCTACTACAAAA
TAAAAGGTCAAGCTGATGAAGAACAGAGAGAGCACTAGAACAATATGTAAAAGCCTTTTG
ATTATTTATTTCCTTCCTTTTTCTTATTTTGGTTTGAGATTGTGTCTTTTCTTTTTT*GA
AACAAAGTTTGAGATTGTGTCCATGTCTTTGTTTTTATTTGTATTTTGATATGTTGATTG
TTCCCATGAACTTGTGTAAAA
G

QA 3 743 3 743
DS 

RD RR2CZ36JQ 727 0 0
AAAGAATCCGTCACAGCCACTGCTGAATCCGTTGGTGCTTCTCTAACTGATGCTCAGAAA
ACCGTTGCAGCCTCCACTGAAACTGCCAGAACCTCTCTAGCCGATGCTCAGGCAACCGTT
GCAGCCACAACTGAAACGGTCAAGACCGAGGCCAAAGCTGCGCCAGGGAAAGTGTCTGGT
GTGTCCACACAGGCAAGAGAAGCTGTGGAGAATGTTATGTCAAGAGGTATAGAAGGAGCC
AAGTCCTTATTTCATGGTTTGGAGGAGAAGAAGACCGAAATTTCCTCCAAGCTTGTTGGA
GCTGTTACTAATGTCGTTGGTGGAGCATCGAGCAGCACCACCGTGGCAAGCCGAGACCTT
CCCATATCCACAGATAATCAGCCTTTGTTAACTGGTGAGCGCGGGGTTGATACAACGCCA
TGGTGGAAAAACTGTTGTGGAGTCCTTGATCTTCTCAAGACATCTACTACAAAATAAAAG
GTCAAGCTGATGAAGAACAGAGAGAGCACTAGAACAATATGTAAAAGCCTTTTGATTATT
TATTTCCTTCCTTTTTCTTATTTTGGTTTGAGATTGTGTCTTTTCTTTTTTTGAAACAAA
GTTTGAGATTGTGTCCATGTCTTTGTTTTTATTTGTATTTTGATATGTTGATTGTTCCCA
TGAACTTGTGTAAAAAGTAAGAACCGATAAATCCAAAACAAGTAATTTTTTTTGTGATGA
TTGATTC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL2416Contig1 1322 2 2 U
GCAAGAAGGGAAGTCTATGATCTTGTGGGCGATCGCGAGGATGCTGGGTTCTTTATCAGT
GGCAGTACAGATTGTCTGGTTAAAATCTGGGATCCAAGTCTGCGTGGATCTGAACTTCGG
GCAACTCTGAAAGGACATACTGGTACCGTGCGTGCTATAAGCTCTGACAGAGCAAAGATA
GTTTCAGGATCAGATGATCAATCCGTAATCGTATGGGACAAACAGACACTTCAGCTTCTC
GAAGAACTGAAAGGCCACGATTCTCAGGTTAGCTGTGTCAAGATGATATCAGGTGAACGT
GTTCTCACTGCTTCACATGATGGGACAGTTAAGATGTGGGATGTTCGAACTGATATGTGC
GTCTCAACTGTTGGCCGATTCAATAATGCTATTCTTTCAATTGAATATGATGACACAACA
GGAATCTTGGCTGCTGCTGGCAGAGACACGGTCGCAAATATATGGGATCTTCGTTCAGGA
AGACAGATGCATAAACTGAAAGGGCATACAAAATGGATACGGTCACTTCGAATGGTGGAA
GATACCTTGATAACAGGGAGCGATGACTGGACAGCAAGAGTGTGGTCTATCTCCAGAGGA
TCATGCGACGCTATTTTAGCATGCCATGCTGGGCCAGTACAATCTGTTGAATACTCCACA
CTCGACAAAGGAATAATTACAGGTTCCGCTGATGGATTGCTCCGTTTTTGGGAAAATGAC
GATGATGGCATTAAATGCGTGAAGAACATAACGCTCCATAATTCGTCTATACTATCAATC
AACGCTGGTGAGCATTGGTTAGGCATCGGAGCAGCGGATAACTCGATGTCTCTTTTCCAT
CGTCCTTCTAACGCTGGAACCAAAGTCTCAGGCTGGCAACTGTACAGAGTACCCCAAAAA
ACAGCCGCTGTGGTGAGATGTGTTGCGTCTGATCTGGAGAGGAAACGGATATGTAGCGGT
GGCCGGAATGGAGTTCTCCGGCTTTGGGATGCGACCATCAACATCTGATTTCACTTCCAC
ATCTATGTTATTCCTGTGTCTCCCTTTTTACTCTTTCTTTTTTGGTTTTTCCTTATCTGT
TTGCGTTTCTATGCCCTTTTGAATATTTTCTTTCGCTTTTTCTTTTACTCTGGGTGTTTT
TCATTTATGATTTTTTTATCTTATTAGTTTACATTTTGTGCTTTTTTATGCCCTTTGAAG
AAACATTTTTATTTTTTTCTTCTACTTTTTCTCGGTGTAATCTTTTTATGTTTAATTACT
TACAAATATGTTTGACCAGTGATTCTTATTTCGATTGGTCTATCAATAAACTAGCGTTTT
GG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2G420TF U 1
AF RR2EG27JQ C 480
BS 1 666 RR2G420TF
BS 667 1322 RR2EG27JQ

RD RR2G420TF 666 0 0
GCAAGAAGGGAAGTCTATGATCTTGTGGGCGATCGCGAGGATGCTGGGTTCTTTATCAGT
GGCAGTACAGATTGTCTGGTTAAAATCTGGGATCCAAGTCTGCGTGGATCTGAACTTCGG
GCAACTCTGAAAGGACATACTGGTACCGTGCGTGCTATAAGCTCTGACAGAGCAAAGATA
GTTTCAGGATCAGATGATCAATCCGTAATCGTATGGGACAAACAGACACTTCAGCTTCTC
GAAGAACTGAAAGGCCACGATTCTCAGGTTAGCTGTGTCAAGATGATATCAGGTGAACGT
GTTCTCACTGCTTCACATGATGGGACAGTTAAGATGTGGGATGTTCGAACTGATATGTGC
GTCTCAACTGTTGGCCGATTCAATAATGCTATTCTTTCAATTGAATATGATGACACAACA
GGAATCTTGGCTGCTGCTGGCAGAGACACGGTCGCAAATATATGGGATCTTCGTTCAGGA
AGACAGATGCATAAACTGAAAGGGCATACAAAATGGATACGGTCACTTCGAATGGTGGAA
GATACCTTGATAACAGGGAGCGATGACTGGACAGCAAGAGTGTGGTCTATCTCCAGAGGA
TCATGCGACGCTATTTTAGCATGCCATGCTGGGCCAGTACAATCTGTTGAATACTCCACA
CTCGAC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2EG27JQ 843 0 0
G
AGACAGATGCATAAACTGAAAGGGCATACAAAATGGATACGGTCACTTCGAATGGTGGAA
GATAC*TTGATAACAGGGAGCGATGACTGGACAGCAAGAGTGTGGTCTATCTCCAGAGGA
TCATGCGACGCTGTTTTAGCATGCCATGCTGGGCCAGTACAATCTGTTGAATACTCCACT
CTCGACAAAGGAATAATTACAGGTTCCGCTGATGGATTGCTCCGTTTTTGGGAAAATGAC
GATGATGGCATTAAATGCGTGAAGAACATAACGCTCCATAATTCGTCTATACTATCAATC
AACGCTGGTGAGCATTGGTTAGGCATCGGAGCAGCGGATAACTCGATGTCTCTTTTCCAT
CGTCCTTCTAACGCTGGAACCAAAGTCTCAGGCTGGCAACTGTACAGAGTACCCCAAAAA
ACAGCCGCTGTGGTGAGATGTGTTGCGTCTGATCTGGAGAGGAAACGGATATGTAGCGGT
GGCCGGAATGGAGTTCTCCGGCTTTGGGATGCGACCATCAACATCTGATTTCACTTCCAC
ATCTATGTTATTCCTGTGTCTCCCTTTTTACTCTTTCTTTTTTGGTTTTTCCTTATCTGT
TTGCGTTTCTATGCCCTTTTGAATATTTTCTTTCGCTTTTTCTTTTACTCTGGGTGTTTT
TCATTTATGATTTTTTTATCTTATTAGTTTACATTTTGTGCTTTTTTATGCCCTTTGAAG
AAACATTTTTATTTTTTTCTTCTACTTTTTCTCGGTGTAATCTTTTTATGTTTAATTACT
TACAAATATGTTTGACCAGTGATTCTTATTTCGATTGGTCTATCAATAAACTAGCGTTTT
GG

QA 2 843 2 843
DS 



AS 1 4

CO CL2417Contig1 1128 4 15 U
GGACTCCAAAAGCTTCCATAGATTTATTTCCGTTTGGTTCCGCGACGATTCTCTCCGATT
GAAATTTGGATTCGATTGGGAGAAGGAGGAAATAAATGGCGCAGGGTGTAGAAGAATGGT
ACAAACAGATGCCGATCATCACTCGCTCTTATCTCACGGCCGCTGTTGTCACCACCGTCG
GATGTTCCCTCGATATAATATCACCGTATAGTCTCTACTTGAATCCCACCCTTGTGGTGA
AGCAACACCAGTACTGGCGTCTCTTTACCAACTTCTTGTATTTCAGGAAGATGGATTTGG
ACTTCATGTTCCATATGTTCTTTCTCGCACGTTACTGCAAACTCCTTGAAGAAAACTCAT
TCAGGGGAAAAACTGCTGATTTCCTTTACATGCTCCTCTTTGGAGCTACTGTACTTACTG
GTATTGTTCTCCTCGGCGGAATGATTCCCTACTTATCCGCATCCTTTGCTAAGATCATCT
TCCTCAGCAACTCCTTAACTTTCATGATGGTATATGTGTGGAGTAAACAAAATCCTTATA
TTCACATGAGTTTCCTTGGTCTGTTCACCTTCACAGCAGCTTACCTACCATGGGTGCTTC
TTGGGTTCTCTGCACTTGTTGGTGCCAGTCCTTGGGTGGATCTTCTGGGTATGATAGCAG
GTCATGCTTACTACTTTCTGTCCGAGGTGTATCCGCGAATGACTAATCGTCGTCCTTTAA
AGACTCCAGCTTTCCTCAAAGCCCTGTTTGCAGATGAACCAGTCGTGGTGGCACGGCCAG
AGAACGTTAGGTTTGCTGCTGCACCTTTCGATGAAATCCACCAAGACTGATCACTACACT
TTCACAACCGGAACACCAATTTCGTTTGGTCAGATATAAAATGGTATGCAATGGAAGAAG
ATAATAGCACAAAGCCTATTGACTATGACACGCTAGTTGTGAAGT*AGTGTTAGTCTCAA
GTAGTATGGTGTCTCTTGGTTCCTTCTGGTTTCTCTCATCGTGTTGTGTATACAGATTTG
CTTTCATTTTAGCGCTTATGTTCTCTTTATTGACACACTCAAGTTGTACACAAACCTCCA
GTTATGTCTACAATGTTAATTATTGTCTTCGAATATCAGAACTAGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV77TF U 1
AF RR2EV77JQ C 454
AF RR2GQ04JQ C 523
AF RR2GQ04TF U 523
BS 1 529 RR2EV77TF
BS 530 530 RR2GQ04TF
BS 531 562 RR2EV77TF
BS 563 563 RR2GQ04TF
BS 564 659 RR2EV77TF
BS 660 660 RR2GQ04TF
BS 661 732 RR2EV77TF
BS 733 733 RR2GQ04TF
BS 734 739 RR2EV77TF
BS 740 740 RR2GQ04TF
BS 741 757 RR2EV77TF
BS 758 758 RR2GQ04TF
BS 759 786 RR2EV77TF
BS 787 1111 RR2GQ04TF
BS 1112 1128 RR2EV77JQ

RD RR2EV77TF 786 0 0
GGACTCCAAAAGCTTCCATAGATTTATTTCCGTTTGGTTCCGCGACGATTCTCTCCGATT
GAAATTTGGATTCGATTGGGAGAAGGAGGAAATAAATGGCGCAGGGTGTAGAAGAATGGT
ACAAACAGATGCCGATCATCACTCGCTCTTATCTCACGGCCGCTGTTGTCACCACCGTCG
GATGTTCCCTCGATATAATATCACCGTATAGTCTCTACTTGAATCCCACCCTTGTGGTGA
AGCAACACCAGTACTGGCGTCTCTTTACCAACTTCTTGTATTTCAGGAAGATGGATTTGG
ACTTCATGTTCCATATGTTCTTTCTCGCACGTTACTGCAAACTCCTTGAAGAAAACTCAT
TCAGGGGAAAAACTGCTGATTTCCTTTACATGCTCCTCTTTGGAGCTACTGTACTTACTG
GTATTGTTCTCCTCGGCGGAATGATTCCCTACTTATCCGCATCCTTTGCTAAGATCATCT
TCCTCAGCAACTCCTTAACTTTCATGATGGTATATGTGTGGAGTAAACAGAATCCTTATA
TTCACATGAGTTTCCTTGGTCTTTTCACCTTCACAGCAGCTTACCTACCATGGGTGCTTC
TTGGGTTCTCTGCACTTGTTGGTGCCAGTCCTTGGGTGGATCTTCTGGGTATGATAGCAC
GTCATGCTTACTACTTTCTGTCCGAGGTGTATCCGCGAATGACTAATCGTCGTCCTTTAA
AGACTCCAGCTT*CCTCAA*GCCCTGTTTGCAGATGA*CCAGTCGTGGTGGCACGGCCAG
AGAACG

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2EV77JQ 675 0 0
TATCCGCATCCTTTGCTAAGATCATCTTCCTCAGCAACTCCTTAACTTTCATGATGGTAT
ATGTGTGGAGTAAACAGAATCCTTATATTCACATGAGTTTCCTTGGTCTTTTCACCTTCA
CAGCAGCTTACCTACCATGGGTGCTTCTTGGGTTCTCTGCACTTGTTGGTGCCAGTCCTT
GGGTGGATCTTCTGGGTATGATAGCAGGTCATGCTTACTACTTTCTGTCCGAGGTGTATC
CGCGAATGACTAATCGTCGTCCTTTAAAGACTCCAGCTTTCCTCAAAGCCCTGTTTGCAG
ATGAACCAGTCGTGGTGGCACGGCCAGAGAACGTTAGGTTTGCTGCTGCACCTTTCGACG
AAATCCACCAAGACTGATCACTACACTTTCACAACCGGAACACCAATATGGTTTGGTCAG
ATATAAAATGGTATGCAATGGAAGAAGATAATAGCACAAAGCCTATTGACTATGACACGC
TAGTTGTGAAGTTAGTGTTAGTCTCAAGTAGTCTGGTGTCTCTTGGTTCCTTCTGGTTTC
TCTCATCGTGTTGTGTATACAGATTTGCTTTCATTTTAGCGCTTATGTTCTCTTTATTGA
CACACTCAAGTTGTACACAAACCTCCAGTTATGTCTACAATGTTAATTATTGTCTTCGAA
TATCAGAACTAGCAC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2GQ04JQ 589 0 0
GC
AAACAAAATCCTTATATTCACATGAGTTTCCTTGGTCTGTTCACCTTCACAGCAGCTTAC
CTACCATGGGTGCTTCTTGGGTTCTCTGTACTTGTTGGTGCCAGTCCTTGGGTGGATCTT
CTGGGTATGATAGCAGGTCATGCTTACTACTTTCTGTCCGAGGTGTATCCGCGAATGACT
AATCGTCGTCCTTTAAAGACTCCAGCTTTCCTCAAAGCCCTGTTTGCAGATGAACCAGTC
GTGGTGGCACGGCCAGAGAACGTTAGGTTTGCTGCTGCACCTTTCGATGAAATCCACCAA
GACTGATCACTACACTTTCACAACCGGAACACCAATTTCGTTTGGTCAGATATAAAATGG
TATGCAATGGAAGAAGATAATAGCACAAAGCCTATTGACTATGACACGCTAGTTGTGAAG
T*AGTGTTAGTCTCAAGTAGTATGGTGTCTCTTGGTTCCTTCTGGTTTCTCTCATCGTGT
TGTGTATACAGATTTGCTTTCATTTTAGCGCTTATGTTCTCTTTATTGACACACTCAAGT
TGTACACAAACCTCCAGTTATGTCTACAATGTTAATTATTGTCTTCG

QA 3 589 3 589
DS 

RD RR2GQ04TF 589 0 0
GC
AAACAAAATCCTTATATTCACATGAGTTTCCTTGGTCTGTTCACCTTCACAGCAGCTTAC
CTACCATGGGTGCTTCTTGGGTTCTCTGTACTTGTTGGTGCCAGTCCTTGGGTGGATCTT
CTGGGTATGATAGCAGGTCATGCTTACTACTTTCTGTCCGAGGTGTATCCGCGAATGACT
AATCGTCGTCCTTTAAAGACTCCAGCTTTCCTCAAAGCCCTGTTTGCAGATGAACCAGTC
GTGGTGGCACGGCCAGAGAACGTTAGGTTTGCTGCTGCACCTTTCGATGAAATCCACCAA
GACTGATCACTACACTTTCACAACCGGAACACCAATTTCGTTTGGTCAGATATAAAATGG
TATGCAATGGAAGAAGATAATAGCACAAAGCCTATTGACTATGACACGCTAGTTGTGAAG
T*AGTGTTAGTCTCAAGTAGTATGGTGTCTCTTGGTTCCTTCTGGTTTCTCTCATCGTGT
TGTGTATACAGATTTGCTTTCATTTTAGCGCTTATGTTCTCTTTATTGACACACTCAAGT
TGTACACAAACCTCCAGTTATGTCTACAATGTTAATTATTGTCTTCG

QA 3 589 3 589
DS 



AS 1 2

CO CL2418Contig1 921 2 2 U
GGAGGTTTCTCAAACTCCGCTGTAAAACCTTCAGGGCATTTAGATCGAATCCTCTCTTTC
GCGGAAGAAAATGCAATCGATTCGTAGCAGTACAAGGTTGCTCCAGAGGAACCGCTTCTC
CTCCAACACCCTCCCTCGTTTCACTTCTTCGTCTTCTTCTTCTCCAAGCTGGTCTGATAA
TGAATCGAGGAGGCTAGGAGGAGGGTTTGATTCATTCCGTTCCACAAGAGCTTTCGATTC
ACCAGCAGCGTCCTATCTCCTTAGCTCGTTGACAAAGGCCGCTTCTTTCTCTTCCGCACT
ACCTAGACAAGACTTTACGTATTCATCGAGGTGCTTTTCCACCGTTGGAGAGTCTGTTCC
TCAAGGGTTTCCTGTGTCAGCTCCTGATGCGCCTCCAAGAATCAAGTTCAAGAGGCTTGA
TAAAACCGCCAAGCATATTATGCAGATTGTAGGCAAGGAGGCTGTGGAGGAAGTGAGAAC
GAGTAGAGAGATACCGGAGATAAGGCCCGGTTACATTGTGCAACTGAAAGTGGAAGTGCC
TGAGAACAAGAGGCGTGTTTCAATCGTAAAAGGAATTGTGATAGCAAGGCGTAATGCTGG
TCTTAACTCTACGTTTAGGATTAGAAAGCTTGTGGCTGGAGTGGGAGTCGAATCCATGTT
CCCTTTGTATTCTCCAAACCTGAGGGAGATTAAGGTGTTGGACAAGAAGAGGGTAAGAAG
AGCGAAACTCTACTACCTCAGGGACAAGATGAATGCTCTCAAAAAGCATTAGCACCTCAA
TAATCATTACCAAAAAAGAAAAAGAGAGAGAGAACTCTGTACTCTTAAACAAAATCTTTG
AGTGTTTTTCTTTAATGATGACTTAGCATTGAGTCATATATTGGACTGTGTAATGTTATG
AATAATGATGGACCCAGCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C737TF U 1
AF RR2C737JQ C 144
BS 1 679 RR2C737TF
BS 680 921 RR2C737JQ

RD RR2C737TF 680 0 0
GGAGGTTTCTCAAACTCCGCTGTAAAACCTTCAGGGCATTTAGATCGAATCCTCTCTTTC
GCGGAAGAAAATGCAATCGATTCGTAGCAGTACAAGGTTGCTCCAGAGGAACCGCTTCTC
CTCCAACACCCTCCCTCGTTTCACTTCTTCGTCTTCTTCTTCTCCAAGCTGGTCTGATAA
TGAATCGAGGAGGCTAGGAGGAGGGTTTGATTCATTCCGTTCCACAAGAGCTTTCGATTC
ACCAGCAGCGTCCTATCTCCTTAGCTCGTTGACAAAGGCCGCTTCTTTCTCTTCCGCACT
ACCTAGACAAGACTTTACGTATTCATCGAGGTGCTTTTCCACCGTTGGAGAGTCTGTTCC
TCAAGGGTTTCCTGTGTCAGCTCCTGATGCGCCTCCAAGAATCAAGTTCAAGAGGCTTGA
TAAAACCGCCAAGCATATTATGCAGATTGTAGGCAAGGAGGCTGTGGAGGAAGTGAGAAC
GAGTAGAGAGATACCGGAGATAAGGCCCGGTTACATTGTGCAACTGAAAGTGGAAGTGCC
TGAGAACAAGAGGCGTGTTTCAATCGTAAAAGGAATTGTGATAGCAAGGCGTAATGCTGG
TCTTAACTCTACGTTTAGGATTAGAAAGCTTGTGGCTGGAGTGGGAGTCGAATCCATGTT
CCCTTTGTATTCTCCAAAC
C

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2C737JQ 778 0 0
CTTCTTCGTCTTCTTCTTCTCCAAGCTGGTCTGATAATGAATCGAGGAGGCTAGGAGGAG
GGTTTGATTCATTCCGTTCCACAAGAGCTTTCGATTCACCAGCAGCGTCCTATCTCCTTA
GCTCGTTGACAAAGGCCGCTTCTTTCTCTTCCGCACTACCTAGACAAGACTTTACGTATT
CATCGAGGTGCTTTTCCACCGTTGGAGAGTCTGTTCCTCAAGGGTTTCCTGTGTCAGCTC
CTGATGCGCCTCCAAGAATCAAGTTCAAGAGGCTTGATAAAACCGCCAAGCATATTATGC
AGATTGTAGGCAAGGAGGCTGTGGAGGAAGTGAGAACGAGTAGAGAGATACCGGAGATAA
GGCCCGGTTACATTGTGCAACTGAAAGTGGAAGTGCCTGAGAACAAGAGGCGTGTTTCAA
TCGTAAAAGGAATTGTGATAGCAAGGCGTAATGCTGGTCTTAACTCTACGTTTAGGATTA
GAAGGCTTGTGGCTGGAGTGGGAGTCGAATCCATGTTCCCTTTGTATTCTCCAAACCTGA
GGGAGATTAAGGTGTTGGACAAGAAGAGGGTAAGAAGAGCGAAACTCTACTACCTCAGGG
ACAAGATGAATGCTCTCAAAAAGCATTAGCACCTCAATAATCATTACCAAAAAAGAAAAA
GAGAGAGAGAACTCTGTACTCTTAAACAAAATCTTTGAGTGTTTTTCTTTAATGATGACT
TAGCATTGAGTCATATATTGGACTGTGTAATGTTATGAATAATGATGGACCCAGCTTT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 2 4

CO CL2419Contig1 1147 2 4 U
GCAGCCATTGTACCACTTTACATATCTGAGATATCACCAACTGAAATCCGTGGAGCACTC
GGATCTGTGAACCAGTTGTTCATCTGTATAGGAATACTTGCTGCCTTGATAGCTGGTTTA
CCCCTCGCAGCTAACCCTCTATGGTGGAGGACGATGTTTGGTGTTGCAGTTATCCCTTCC
GTTTTATTAGCCATAGGAATGGCTTTTTCTCCAGAAAGCCCAAGGTGGCTCGTTCAGCAA
GGAAAACTTACTCAAGCCGAAAAGGCTATCAAAACTCTTTACGGTAAAGAAAAAGTGGTT
GAACTAGTGCGTGACTTATCAACCTCTGGCCAAGGTACTTCTGAGCCAGAAGCAGGATGG
TTTGATCTATTCAGCAGCCGCTACTGGAAAGTTGTAAGCGTTGGTGCGGCGCTCTTCTTG
TTTCAACAGTTAGCTGGGATAAATGCAGTTGTGTACTACTCTACATCTGTGTTCCGCAGC
GCCGGAATCCAATCTGATGTTGCAGCCAGTGCCCTTGTGGGAGCATCAAACGTGTTTGGA
ACTGCTGTTGCTTCGTCGTTGATGGACAAAATGGGAAGGAAAAGTCTTCTACTCACTAGC
TTTGGTGGAATGGCGTTGTCGATGCTGTTGCTCTCTTTGTCCTTCACATGGAAAGCTCTA
GCTGCATATTCAGGCACTCTCGCTGTTGTTGGAACTGTTCTATATGTCCTGTCATTCTCA
CTTGGTGCTGGCCCAGTACCAGCTCTTCTTCTTCCAGAGATATTCGCATCCCGTATCAGA
GCAAAAGCCGTTGCTCTTTCTCTCGGCATGCACTGGATCTCAAACTTTGTGATTGGACTC
TACTTCTTAAGTGTTGTGACTAAATTCGGAATCAGCAGTGTCTACTTGGGTTTCGCGGGA
GTGTGTGTCCTTGCGGTCATGTACATCGCAGGAAACGTGGTGGAGACTAAAGGACGATCG
CTCGAGGAAATAGAGCTTGCTCTTACCTCCGGTGCTTGAAATTAAACAAAAAGAATATCA
ATACCACTTTGTTTCATCCTGTATTCCTGTTAGTCTCTATCTCTCTTTCGGTCAACTCTT
CTTGTTCTTTAATAACTTGTGCAATGGACTAAGTAATCAATCGATAACGAGAAATCGGTT
CATTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D343TF U 1
AF RR2D343JQ C 321
BS 1 673 RR2D343TF
BS 674 674 RR2D343JQ
BS 675 748 RR2D343TF
BS 749 1147 RR2D343JQ

RD RR2D343TF 748 0 0
GCAGCCATTGTACCACTTTACATATCTGAGATATCACCAACTGAAATCCGTGGAGCACTC
GGATCTGTGAACCAGTTGTTCATCTGTATAGGAATACTTGCTGCCTTGATAGCTGGTTTA
CCCCTCGCAGCTAACCCTCTATGGTGGAGGACGATGTTTGGTGTTGCAGTTATCCCTTCC
GTTTTATTAGCCATAGGAATGGCTTTTTCTCCAGAAAGCCCAAGGTGGCTCGTTCAGCAA
GGAAAACTTACTCAAGCCGAAAAGGCTATCAAAACTCTTTACGGTAAAGAAAAAGTGGTT
GAACTAGTGCGTGACTTATCAACCTCTGGCCAAGGTACTTCTGAGCCAGAAGCAGGATGG
TTTGATCTATTCAGCAGCCGCTACTGGAAAGTTGTAAGCGTTGGTGCGGCGCTCTTCTTG
TTTCAACAGTTAGCTGGGATAAATGCAGTTGTGTACTACTCTACATCTGTGTTCCGCAGC
GCCGGAATCCAATCTGATGTTGCAGCCAGTGCCCTTGTGGGAGCATCAAACGTGTTTGGA
ACTGCTGTTGCTTCGTCGTTGATGGACAAAATGGGAAGGAAAAGTCTTCTACTCACTAGC
TTTGGTGGAATGGCGTTGTCGATGCTGTTGCTCTCTTTGTCCTTCACATGGAAAGCTCTA
GCTGCATATTCAG*CACTCTCGCTGTTGTTGGAACTGTTCTATATGTCCTGTCATTCTCA
CTTGGTGCTGGCCCAGTACCAGCTCTTC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2D343JQ 827 0 0
AACCTCTGGCCAAG*TACTTCTGAGCCAGAAGCAGGATGGTTTGATCTATTCAGCAGCCG
CTACTGGAAAGTTGTAAGCGTTGGTGCGGCGCTCTTCTTGTTTCAACAGTTAGCTGGGAT
AAATGCAGTTGTGTACTACTCTACATCTGTGTTCCGCAGCGCCGGAATCCAATCTGATGT
TGCAGCCAGTGCCCTTGTGGGAGCATCAAACGTGTTTGGAACTGCTGTTGCTTCGTCGTT
GATGGACAAAATGGGAAGGAAAAGTCTTCTACTCACTAGCTTTGGTGGAATGGCGTTGTC
GATGCTGTTGCTCTCTTTGTCCTTCACATGGAAAGCTCTAGCTGCATATTCAGGCACTCT
CGCTGTTGTTGGAACTGTTCTATATGTCCTGTCATTCTCACTTGGTGCTGGCCCAGTACC
AGCTCTTCTTCTTCCAGAGATATTCGCATCCCGTATCAGAGCAAAAGCCGTTGCTCTTTC
TCTCGGCATGCACTGGATCTCAAACTTTGTGATTGGACTCTACTTCTTAAGTGTTGTGAC
TAAATTCGGAATCAGCAGTGTCTACTTGGGTTTCGCGGGAGTGTGTGTCCTTGCGGTCAT
GTACATCGCAGGAAACGTGGTGGAGACTAAAGGACGATCGCTCGAGGAAATAGAGCTTGC
TCTTACCTCCGGTGCTTGAAATTAAACAAAAAGAATATCAATACCACTTTGTTTCATCCT
GTATTCCTGTTAGTCTCTATCTCTCTTTCGGTCAACTCTTCTTGTTCTTTAATAACTTGT
GCAATGGACTAAGTAATCAATCGATAACGAGAAATCGGTTCATTCAG

QA 1 827 1 827
DS 



CO CL2419Contig2 877 2 10 U
GCTTTATGGTAAAGAAAAAGTGGTTGAACTAGTTCGTGACTTGTCAACCTCTGGCCAAGG
TACTTCTGAGCCAGAGGCAGGATGGTTTGATCTATTCAGCAGCCGCTACTGGGAAGTTGT
AAGCGTTGGCGCGGCGCTATTCTTGTTTCAGCAGTTAGCTGGGATAAATGCAGTTGTATA
CTACTCTACATCTGTGTTCCGCAGCGCCGGAATCCAATCTGATGTTGCAGCCAGTGCTCT
TGTGGGAGCATCAAACGTGTTTGGAACTGCTGTTGCTTCGTCGTTGATGGACAAAATGGG
AAGGAAAAGTCTTCTACTCACTAGCTTTGGTGGAATGGCGTTGTCGATGCTGTTACTCTC
TGTGTCCTTCACATGGAAAGCTCTAGCTGCATATTCAGGCACTCTCGCTGTTGTTGGAAC
TGTTCTATATGTCCTGTCATTCTCACTTGGTGCGGGCCCAGTACCAGCTCTTCTTCTTCC
AAAGATATTCGCATCCCGGATCAGAGCAAAAGCCGTTGCTCTTTCTCTCGGCATGCACTG
GATATCAAACTTTGTGATTGGACTCTACTTCTTAAGTGTTGTGACTAAATTCGGAAACAG
CAGTGTCTACTTGGGTTTCGCAGGAGTGTGTGTCCTTGCAGTCATGTACATCGCAGGAAA
CGTGGTGGAGACTAAAGGACGATCGCTCGAGGAAATAGAGCTTGCTCTTACCTCCGGTAC
TTGAAATTAAACAAAAAGAATATCAATACCACTTTGTTTCATCATTGATCCTGTATTCCT
GTTAGTCTCTATCTCTCTTTCGGTCAACTCTTCTTGTTCTTTAATAACTTGTACAATGGA
CTAAGTAATCAATCAATAACGAGAAATCGGTTCATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F135TF U 1
AF RR2DE14JQ C 252
BS 1 318 RR2F135TF
BS 319 319 RR2DE14JQ
BS 320 378 RR2F135TF
BS 379 379 RR2DE14JQ
BS 380 433 RR2F135TF
BS 434 434 RR2DE14JQ
BS 435 654 RR2F135TF
BS 655 655 RR2DE14JQ
BS 656 729 RR2F135TF
BS 730 877 RR2DE14JQ

RD RR2F135TF 729 0 0
GCTTTATGGTAAAGAAAAAGTGGTTGAACTAGTTCGTGACTTGTCAACCTCTGGCCAAGG
TACTTCTGAGCCAGAGGCAGGATGGTTTGATCTATTCAGCAGCCGCTACTGGGAAGTTGT
AAGCGTTGGCGCGGCGCTATTCTTGTTTCAGCAGTTAGCTGGGATAAATGCAGTTGTATA
CTACTCTACATCTGTGTTCCGCAGCGCCGGAATCCAATCTGATGTTGCAGCCAGTGCTCT
TGTGGGAGCATCAAACGTGTTTGGAACTGCTGTTGCTTCGTCGTTGATGGACAAAATGGG
AAGGAAAAGTCTTCTACTTACTAGCTTTGGTGGAATGGCGTTGTCGATGCTGTTACTCTC
TGTGTCCTTCACATGGAAGGCTCTAGCTGCATATTCAGGCACTCTCGCTGTTGTTGGAAC
TGTTCTATATGTCTTGTCATTCTCACTTGGTGCGGGCCCAGTACCAGCTCTTCTTCTTCC
AAAGATATTCGCATCCCGGATCAGAGCAAAAGCCGTTGCTCTTTCTCTCGGCATGCACTG
GATATCAAACTTTGTGATTGGACTCTACTTCTTAAGTGTTGTGACTAAATTCGGAAACAG
CAGTGTCTACTTGGGTTTCGCAGGAGTGTGTGTCCTTGCAGTCATGTACATCGCGGGAAA
CGTGGTGGAGACTAAAGGACGATCGCTCGAGGAAATAGAGCTTGCTCTTACCTCCGGTAC
TTGAAATTA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2DE14JQ 626 0 0
CAAACGTGTTTGGAACTGCTGTTGCTTCGTCGTTGATGGACAAAATGGGAAGGAAAAGTC
TTCTACTCACTAGCTTTGGTGGAATGGCGTTGTCGATGCTGTTGCTCTCTTTGTCCTTCA
CATGGAAAGCTCTAGCTGCATATTCAGGCCCTCTCGCTGTTGTTGGAACTGTTCTATATG
TCCTGTCATTCTCACTTGGTGCGGGCCCAGTACCAGCTCTTCTTCTTCCAGAGATATTCG
CATCCCGGATCAGAGCAAAAGCCGTTGCTCTTTCTCTCGGCATGCACTGGATCTCAAACT
TTGTGATTGGACTCTACTTCTTAAGTGTTGTGACTAAATTCGGAATCAGCAGTGTCTACT
TGGGTTTCGCGGGAGTGTGTGTCCTTGCCGTCATGTACATCGCAGGAAACGTGGTGGAGA
CTAAAGGACGATCGCTCGAGGAAATAGAGCTTGCTCTTACCTCTGGTGTTTGAAATTAAA
CAAAAAGAATATCAATACCACTTTGTTTCATCATTGATCCTGTATTCCTGTTAGTCTCTA
TCTCTCTTTCGGTCAACTCTTCTTGTTCTTTAATAACTTGTACAATGGACTAAGTAATCA
ATCAATAACGAGAAATCGGTTCATTC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 4

CO CL2420Contig1 656 4 12 U
TTTTTAGCAATGGCGAAACTAAACCTTAGCCTCGTATCGTCGATTCTTATCGGTCTCGTC
GCGATCGCTTCCGCCGCAGTTATCTTCGAGGAGCGCTTTGATGATGGATGGGAGAAGAGA
TGGGTTAAATCTGAGTGGAAGAAAGATGACAAGTCTGCTGGGGAGTGGAACCACACTTCT
GGAAATTGGTCTGGTGATGCTAACGATAAAGGTATCCAGACCAGTGAGGACTACAGATTC
TACGCCATTTCAGCTGAGTTCCCTGAGTTCAGCAACAAGGACAAAACCTTAGTCTTCCAG
TTCTCAGTCAAGCACGAGCAAAAGCTTGACTGTGGTGGCGGCTACATGAAGCTTCTCAGT
GGGGATGTTGACCAGAAGAAGTTTGGTGGCGACACTCCATACAGCATCATGTTTGGTCCA
GATATCTGTGGCTACAGCACGAAGAAAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGACGCCAAC
CACCTGATCAAGAAGGATGTTCCGTGTGAAACTGACCAGCTCACCCATGTGTACACTTTC
ATCCTCCGCCCAGATGCTACTTACACCATTCTCATTGACAATGTTGAGAAGCAAACCGGT
AGCCTGTACGCTGATTGGGATCTTCTACCACCCAAGAAGATCAAGGACCCCAGCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 0 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2BT94TF U 2
AF RR2E637TF U 1
AF RR2C633TF U 1
AF RR2EJ07TF U 2
BS 1 22 RR2C633TF
BS 23 23 RR2BT94TF
BS 24 187 RR2C633TF
BS 188 188 RR2BT94TF
BS 189 215 RR2C633TF
BS 216 216 RR2BT94TF
BS 217 272 RR2C633TF
BS 273 273 RR2BT94TF
BS 274 637 RR2C633TF
BS 638 638 RR2EJ07TF
BS 639 652 RR2C633TF
BS 653 656 RR2EJ07TF

RD RR2BT94TF 492 0 0
TTTTTA
CAATGGCGAAAGTAAACCTTAGCGTCGTCTCGTTGATTCTTATCGGTCTCGTTGCGATCG
CTTCCGCCGCAGTTATCTTCGAGGAGCGCTTTGATGATGGATGGGAGAAGAGATGGGTTA
AATCTGAGTGGAAGAAAGATGACAAGTCTGCTGGGGAGCGGAACCACACTTCTGGAAATT
GGTCTGGTGATGCTAACGATAAAGGTATCCAGACCAGTGAGGACTACAGATTCTACGCCA
TTTCAGCTGAGTTCCCTGAGTTCAGCAACAAGGACAAGACCTTAGTCTTCCAGTTCTCAG
TCAAGCACGAGCAGAAGCTTGACTGTGGTGGCGGCTACATGAAGCTTCTGAGTGGGGATG
TTGACCAGAAGAAGTTTGGTGGTGACACTCCATACAGCATCATGTTTGGTCCAGATATCT
GTGGCTACAGCACGAAGAAAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGACGCCAACCACCTGA
TCAAGA

QA 7 492 7 492
DS 

RD RR2E637TF 595 0 0
TTTTTAG
CAATGGCGAAACTAAGCCTTAGCCTCGTATCGTCGATTCTTATCGGTCTCGTCGCGATCG
CTTCCGCCGCAGTTATCTTCGAGGAGCGCTTTGATGATGGATGGGAGAAGAGATGGGTTA
AATCTGAGTGGAAGAAAGATGACAAGTCTGCTGGGGAGTGGAACCACACTTCTGGAAATT
GGTCTGGTGATGCTAACGATAAAGGTATTCAGACCAGTGAGGACTACAGATTCTACGCCA
TTTCAGCTGAGTTCCCTGAGTTCAGTAACAAGGACAAAACCTTAGTCTTCCAGTTCTCAG
TCAAGCACGAGCAAAAGCTTGACTGTGGTGGCGGCTACATGAAGCTTCTCAGTGGGGATG
TTGACCAGAAGAAGTTTGGTGGCGACACTCCATACAGCATCATGTTTGGTCCAGATATCT
GTGGCTACAGCACGAAGAAAGTGCATGCTATCCTCACCTACAATGACGCCAACCACCTGA
TCAAGAAGGATGTTCCGTGTGAAACTGACCAGCTCACCCATGTGTACACTTTCATCCTCC
GCCCAGATGCTACTTACACCATTCTCATTGACAATGTTGAGAAGCAAA

QA 8 595 8 595
DS 

RD RR2C633TF 652 0 0
TTTTTAGCAATGGCGAAACTAAGCCTTAGCCTCGTATCGTCGATTCTTATCGGTCTCGTC
GCGATCGCTTCCGCCGCAGTTATCTTCGAGGAGCGCTTTGATGATGGATGGGAGAAGAGA
TGGGTTAAATCTGAGTGGAAGAAAGATGACAAGTCTGCTGGGGAGTGGAACCACACTTCT
GGAAATTCGTCTGGTGATGCTAACGATAAAGGTATTCAGACCAGTGAGGACTACAGATTC
TACGCCATTTCAGCTGAGTTCCCTGAGTTCAGTAACAAGGACAAAACCTTAGTCTTCCAG
TTCTCAGTCAAGCACGAGCAAAAGCTTGACTGTGGTGGCGGCTACATGAAGCTTCTCAGT
GGGGATGTTGACCAGAAGAAGTTTGGTGGCGACACTCCATACAGCATCATGTTTGGTCCA
GATATCTGTGGCTACAGCACGAAGAAAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGACGCCAAC
CACCTGATCAAGAAGGATGTTCCGTGTGAAACTGACCAGCTCACCCATGTGTACACTTTC
ATCCTCCGCCCAGATGCTACTTACACCATTCTCATTGACAATGTTGAGAAGCAAACCGGT
AGCCTGTACGCTGATTGGGATCTTCTACCACCCAAGA*GATCAAGGACCCCA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2EJ07TF 655 0 0
TTTTTA
CAATGGCGAAAGTAAACCTTAGCGTCGTCTCGTTGATTCTTATCGGTCTCGTTGCGATCG
CTTCCGCCGCAGTTATCTTCGAGGAGCGCTTTGATGATGGATGGGAGAAGAGATGGGTTA
AATCTGAGTGGAAGAAAGATGACAAGTCTGCTGGGGAGTGGAACCACACTTCTGGAAATT
GGTCTGGTGATGCTAACGATAAAGGTATCCAGACCAGTGAGGACTACAGATTCTACGCCA
TTTCAGCTGAGTTCCCTGAGTTCAGCAACAAGGACAAGACCTTAGTCTTCCAGTTCTCAG
TCAAGCACGAGCAAAAGCTTGACTGTGGTGGCGGCTACATGAAGCTTCTGAGTGGGGATG
TTGACCAGAAGAAGTTTGGTGGTGACACTCCATACAGCATCATGTTTGGTCCAGATATCT
GTGGCTACAGCACGAAGAAAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGACGCCAACCACCTGA
TCAAGAAGGATGTTCCGTGTGAAACTGACCAGCTCACCCATGTGTACACTTTCATCCTCC
GCCCAGATGCTACTTACACCATTCTCATTGACAATGTTGAGAAGCAAACCGGTAGCCTGT
ACGCTGATTGGGATCTTCTACCACCCAAGAAGATCAAGGACCCCAGCGC

QA 7 655 7 655
DS 



AS 1 4

CO CL2421Contig1 869 4 28 U
GAAGAGAAACTATACATTCTGGTGTATCCATTTGCAGAGATTAATAAAAGCAAGAGTAGT
TTCTGAATCACCAAATCACATGACATACATCTCGAGGTCAGTTTTAACCACAACAGCCAC
CTCCCTGTGCGATCGCACCGTCTCTTCCTCCAGCTGCACCTTGAGGACGCCCGTAACCAA
TCTTTATGCCCGATGACTCGTTGGATACATCAAAGACACCGTCCTGAATATTCTGGAGGA
TCTTTGCTGCAGTCTTTATGAAAGCCTCCTCAACGTTCTGAGCTGTTCTTGCAGAAGCTT
CCAAGAACAAGAGTCCATGTTCTTTGGCAAACTGTTCTCCCTCCTCTTTGCTAACAGCTC
TCTTGTGACCAAGATCGCATTTGTTCCCAATCAGCATAATACTCATGTTAGGATTAGCAT
GCTGCCGAGCATCCTCTAACCAGCTCGCCAGATGGTTAAAAGTCTCTCTCCTGGTGATGT
CGTAGACAAGTAAAGCTCCAGCAGCTCCTCTATAGTACGACCTAGTGATGGATCTAAACG
ACTCTTGTCCAGCGGTGTCCCAAATTTGGAGTTTGATTGGGCGTCCATCGACAGTGACCA
TACGAGCACCGAACTCGACACCAATGGTGAGATCGTGGACTGGTTGGAACCTCTTATCAG
TAAATTGCAGAAGCAAGCAAGATTTCCCCACACCTGTGTCGCCGATGATGATGTACTTGA
AGAGGTAATCGTAAGACATGGTTCTCTGATGAATCGAGAGCAAGGTGGATGGATGATTGC
TTAAGAGAGGAGGAAGAAGAGATGGAGAGTTACAAGTCACCGACGAGCTTTTTCGGTTTT
TATTTTATTTTCAAGGTTTCTCGATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT94JQ U 1
AF RR2BH77JQ U 10
AF RR2CT94TF C 147
AF RR2BH77TF C 164
BS 1 52 RR2CT94JQ
BS 53 53 RR2BH77JQ
BS 54 92 RR2CT94JQ
BS 93 93 RR2BH77JQ
BS 94 204 RR2CT94JQ
BS 205 205 RR2BH77JQ
BS 206 340 RR2CT94JQ
BS 341 341 RR2BH77JQ
BS 342 368 RR2CT94JQ
BS 369 369 RR2BH77JQ
BS 370 484 RR2CT94JQ
BS 485 485 RR2BH77JQ
BS 486 511 RR2CT94JQ
BS 512 512 RR2BH77JQ
BS 513 655 RR2CT94JQ
BS 656 656 RR2BH77JQ
BS 657 658 RR2CT94JQ
BS 659 659 RR2BH77JQ
BS 660 741 RR2CT94JQ
BS 742 743 RR2BH77TF
BS 744 751 RR2CT94TF
BS 752 752 RR2BH77TF
BS 753 756 RR2CT94TF
BS 757 757 RR2BH77TF
BS 758 769 RR2CT94TF
BS 770 773 RR2BH77TF
BS 774 862 RR2CT94TF
BS 863 869 RR2BH77TF

RD RR2CT94JQ 746 0 0
GAAGAGAAACTATACATTCTGGTGTATCCATTTGCAGAGATTAATAAAAGCACGAGTAGT
TTCTGAATCACCAAATCACATGACATACATCTTGAGGTCAGTTTTAACCACAACAGCCAC
CTCCCTGTGCGATCGCACCGTCTCTTCCTCCAGCTGCACCTTGAGGACGCCCGTAACCAA
TCTTTATGCCCGATGACTCGTTGGGTACATCAAAGACACCGTCCTGAATATTCTGGAGGA
TCTTTGCTGCAGTCTTTATGAAAGCCTCCTCAACGTTCTGAGCTGTTCTTGCAGAAGCTT
CCAAGAACAAGAGTCCATGTTCTTTGGCAAACTGTTCTCCTTCCTCTTTGCTAACAGCTC
TCTTGTGAGCAAGATCGCATTTGTTCCCAATCAGCATAATACTCATGTTAGGATTAGCAT
GCTGCCGAGCATCCTCTAACCAGCTCGCCAGATGGTTAAAAGTCTCTCTCCTGGTGATGT
CGTAAACAAGTAAAGCTCCAGCAGCTCCTCTGTAGTACGACCTAGTGATGGATCTAAACG
ACTCTTGTCCAGCGGTGTCCCAAATTTGGAGTTTGATTGGGCGTCCATCGACAGTGACCA
TACGAGCACCGAACTCGACACCAATGGTGAGATCGTGGACTGGTTGGAACCTCTTGTCGG
TAAATTGCAGAAGCAAGCAAGATTTCCCCACACCTGTGTCGCCGATGATGATGTACTTGA
AGAGGTAATCGTAAGACATGG
CTCTG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2BH77JQ 747 0 0
CTATACATTCTGGTGTATCCATTTGCAGAGATTAATAAAAGCAAGAGTAGTTTCTGAATC
ACCAAATCACATGACATACATTTCGAGGTCTGTTT*AACCACAACAGCCACCTCCCTGTG
CTATCGCACCGTCTCTTCCTCCAGCTGCACCTTGAGGACGCCCGTAACCAATCTTTATGC
CCGATGACTCGTTGGATACATCAAAGACACCGTCCTGAATATTCTGGAGGATCTTTGCTG
CAGTCTTTATGAAGGCCTCCTCGACGTTCTGAGCTGTTCTTGCAGAAGCTTCCAAGAACA
AGAGTCCATGTTCTTTGGCAAACTGTTCTCCCTCCTCTTTGCTAACAGCTCTCTTGTGAC
CGAGATCGCATTTGTTCCCAATCAGCATAATACTCATGTTAGGATTAGCATGCTGCCGAG
CATCCTCTAACCAGCTCGCCAGATGGTTAAACGTCTCTCTCCTGGTGATGTCGTAGACAA
GTAAAGCTCCAGCTGCTCCTCTATAGTACGACCTAGTGATGGATCTAAACGACTCTTGTC
CAGCGGTGTCCCAAATTTGGAGTTTGATTGGGCGTCCATCGACGGTGACCATACGAGCAC
CGAACTCGACGCCAATGGTGAGATCGTGGACTGGTTGGAACCTCTTATCAGTAAATTGCA
GAAGCAAGCAAGATTTCCCCACACCTGTGTCGCCGATGATGATGTACTTGAAGAGGTAAT
CGTAAGACATGG
TTCTCTGATGAATTG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2CT94TF 718 0 0
CCTCCAGCTGCAC*TTGAGGACGCCCGTAACCAATCTTTATGCCCGATGACTCGTTGGGT
ACATCAAAGACACCGTC*TGAATATTCTGGAGGATCTTTGCTGCAGTCTTTATGAAAGCC
TCCTCAACGTTCTGAGCTGTTCTTGCAGAAGCTTCCAAGAACAAGAGTCCATGTTCTTTG
GCAAACTGTTCTCCTTCCTCTTTGCTAACAGCTCTCTTGTGAGCAAGATCGCATTTGTTC
CCAATCAGCATAATACTCATGTTAGGATTAGCATGCTGCCGAGCATCCTCTAACCAGCTC
GCCAGATGGTTAAAAGTCTCTCTCCTGGTGATGTCGTAGACAAGTAAAGCTCCAGCAGCT
CCTCTGTAGTACGACCTAGTGATGGATCTAAACGACTCTTGTCCAGCGGTGTCCCAAATT
TGGAGTTTGATTGGGCGTCCATCGACAGTGACCATACGAGCACCGAACTCGACACCAATG
GTGAGATCGTGGACTGGTTGGAACCTCTTGTCGGTAAATTGCAGAAGCAAGCAAGATTTC
CCCACACCTGTGTCGCCGATGATGATGTACTTGAAGAGGTAATCGTAAGACATGG**CTC
TGATGGATCGGGAGCAAGGTGGA****TGATTGCTTAAGAGAGGAGGAAGAAGAGATGGA
GAGTTACAAGTCACCGACGAGCTTTTTCGGTTTTTATTTTATTTTCAAGGTTTCTC
CC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2BH77TF 706 0 0
AGGACGCCCGTAACCAATCTTTATGCCCGATGACTCGTTGGATACATCAAAGACACCGTC
CTGAATATTCTGGAGGATCTTTGCTGCAGTCTTTATGAAGGCCTCCTCGACGTTCTGAGC
TGTTCTTGCAGAAGCTTCCAAGAACAAGAGTCCATGTTCTTTGGCAAACTGTTCTCCCTC
CTCTTTGCTAACAGCTCTCTTGTGACCGAGATCGCATTTGTTCCCAATCAGCATAATACT
CATGTTAGGATTAGCATGCTGCCGAGCATCCTCTAACCAGCTCGCCAGATGGTTAAACGT
CTCTCTCCTGGTGATGTCGTAGACAAGTAAAGCTCCAGCTGCTCCTCTATAGTACGACCT
AGTGATGGATCTAAACGACTCTTGTCCAGCGGTGTCCCAAATTTGGAGTTTGATTGGGCG
TCCATCGACGGTGACCATACGAGCACCGAACTCGACGCCAATGGTGAGATCGTGGACTGG
TTGGAACCTCTTATCAGTAAATTGCAGAAGCAAGCAAGATTTCCCCACACCTGTGTCGCC
GATGATGATGTACTTGAAGAGGTAATCGTAAGACATGGTTCTCTGATGAATTGAGAGCAA
GGTGGATGGATGATTGCTTA*GAGAGGAGGAAGAAGAGATGGAGAGTTACAAGTCACCGA
CGAGCTTTTTCGGTTTTTATTTTATTTTCGAGGTTTCTCGATGTCC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 3

CO CL2422Contig1 1152 3 14 U
GGTCACACACACAAATCTAAAGAGAAAAATGGCAAAGAGTGGTGAAGGTAAAACGGTGTG
TGTAACAGGAGCATCCGGTTACATCGCTTCTTGGCTTGTCAAGTTCCTCCTTAACCGTGG
CTACACCGTTAAGGCACCCGTCCGTGACCCCAGTGATCCGAAAAAGACACAGCACTTGGT
TTCGTTGGAAGGTGCGAAGGAGAGACTTCACTTGTTCAAAGCAGATCTCTTGGAACAAGG
ATCGTTCGACTCTGCTGTTGATGGATGCGAAGGTGTTTTCCACACTGCTTCCCCGTTTTA
TCATGATGTCAAAGACCCACAGGCTGAACTTATTGAACCTGCTGTCAAGGGAACACTTAA
CGTTCTGAACTCGTGCACCAAAGCATCTTCCGTCAAAAGGGTTGTTGTTACCTCCTCCAT
GGCAGCCGTTACTTACAACGGTAAACCACGCACACCTGATGTGACCGTCGATGAAACTTG
GTTCTCTGATCCCGAGATTTGCAAGACTTCAAAGATGTGGTATGTTCTCTCCAAGACCTT
GGCCGAAGATGCTGCTTGGAAATTCGCTAAAGAGAAAGGCTTGGACGTTGTAATGATCAA
CCCGGCAATGGTGATCGGTCCTCTCTTGCAGCCAACTCTGAACACGAGTGCTGCTGCTAT
ACTAAACTTTATAAATGGTGCAAAGACATTCTCCAACGCAACCTTTGGATGGGTTAACGT
AAAGGACGTAGCCAATGCACACATCCAAGCATATGAGATCCCCTCAGTTAACGGACGTTA
CTGTATGGTAGAGAGAGTCCTTCACCACTCTGAGATTGTGAACATTGTGGGTCAGCTTTA
CCCAAATCTCCAACTCCCTGAAAGGTGTGCGGATGAGAATCCGTATGTTCCGACTTATCA
AGTGTCCAAGGAGAAAATAAAGAGCCTTGGCATTGACTACATACCCTTGGAAGTTAGCAT
CAAGGAGACAGTCGAGTCCTTGAAGGAGAAAGGTTTCATAAACGTTTGAGAATGCATTTG
AGCCAAACCGGATTCAATACTTTCGTTGTTGGAATGGTTCCATCAAAACTTTTAATAAAT
TAAGCATTTGTTTCAGTTTATGACATGAGCTTTCACCATCATGTTTTATAATGAAAAAAC
TTGGGAACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET90TF U 1
AF RR2C346TF U 63
AF RR2EH47JQ C 581
BS 1 112 RR2ET90TF
BS 113 114 RR2C346TF
BS 115 438 RR2ET90TF
BS 439 439 RR2C346TF
BS 440 462 RR2ET90TF
BS 463 463 RR2C346TF
BS 464 645 RR2ET90TF
BS 646 646 RR2C346TF
BS 647 681 RR2ET90TF
BS 682 682 RR2C346TF
BS 683 697 RR2ET90TF
BS 698 698 RR2EH47JQ
BS 699 701 RR2C346TF
BS 702 1152 RR2EH47JQ

RD RR2ET90TF 701 0 0
GGTCACACACACAAATCTAAAGAGAAAAATGGCAAAGAGTGGTGAAGGTAAAACGGTGTG
TGTAACAGGAGCATCCGGTTACATCGCTTCTTGGCTTGTCAAGTTCCTCCTTGGCCGTGG
CTACACCGTTAAGGCACCCGTCCGTGACCCCAGTGATCCGAAAAAGACACAGCACTTGGT
TTCGTTGGAAGGTGCGAAGGAGAGACTTCACTTGTTCAAAGCAGATCTCTTGGAACAAGG
ATCGTTCGACTCTGCTGTTGATGGATGCGAAGGTGTTTTCCACACTGCTTCCCCGTTTTA
TCATGATGTCAAAGACCCACAGGCTGAACTTATTGAACCTGCTGTCAAGGGAACACTTAA
CGTTCTGAACTCGTGCACCAAAGCATCTTCCGTCAAAAGGGTTGTTGTTACCTCCTCCAT
GGCAGCCGTTACTTACAATGGTAAACCACGCACACCTGATGTTACCGTCGATGAAACTTG
GTTCTCTGATCCCGAGATTTGCAAGACTTCAAAGATGTGGTATGTTCTCTCCAAGACCTT
GGCCGAAGATGCTGCTTGGAAATTCGCTAAAGAGAAAGGCTTGGACGTTGTAATGATCAA
CCCGGCAATGGTGATCGGTCCTCTCTTGCAGCCAACTCTGAACACCAGTGCTGCTGCTAT
ACTAAACTTTATAAATGGTGCGAAGACATTCTCCAAC
TCAA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2C346TF 646 0 0
TAACAGGAGCATCCGGTTACATCGCTTCTTGGCTTGTCAAGTTCCTCCTTAACCGTGGCT
ACACCGTTAAGTCATCCGTCCGTGACCCCAGTGATCCGAAAAAGACACAGCACTTGGTTT
CGTTGGAAGGTGCGAAGGAGAGACTTCACTTGTTCAAAGCAGATCTCTTGGAACAAGGAT
CGTTCGACTCTGCTGTTGATGGATGCGAAGGTGTTTTCCACACTGCTTCCCCGTTTTATC
ATGATGTCAAAGACCCACAGGCTGAACTTATTGAACCTGCTGTCAAGGGAACACTTAACG
TTCTGAACTCGTGCACCAAAGCATCTTCCGTCAAAAGGGTTGTTGTTACCTCCTCCATGG
CAGCCGTTGCTTACAACGGTAAACCACGCACACCTGATGTGACCGTCGATGAAACTTGGT
TTTCTGATCCCGAGATTTGCAAGACTTCAAAGATGTGGTATGTTCTCTCCAAGACCTTGG
CCGAAGATGCTGCTTGGAAATTCGCTAAAGAGAAAGGCTTGGACGTTGTAATGATCAATC
CGGCAATGGTGATCGGTCCTCTCTTGCAGCCAACTCTGAACACGAGTGCTGCTGCTATAC
TAAACTTTATAAATGGTGCAAAGACATTCTCCAACTCAA
CTTTTGG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2EH47JQ 572 0 0
TTGGACGTTGTAATGATCAACCCGGCAATGGTGATCGGTCCTCTCTTGCAGCCAACTCTG
AACAGGAGTGCTGCTGCTATACTAAACTTTATAAATGGTGCAAAGACATTTTCCAACGCA
ACCTTTGGATGGGTTAACGTAAAGGACGTAGCCAATGCACACATCCAAGCATATGAGATC
CCCTCAGTTAACGGACGTTACTGTATGGTAGAGAGAGTCCTTCACCACTCTGAGATTGTG
AACATTGTGGGTCAGCTTTACCCAAATCTCCAACTCCCTGAAAGGTGTGCGGATGAGAAT
CCGTATGTTCCGACTTATCAAGTGTCCAAGGAGAAAATAAAGAGCCTTGGCATTGACTAC
ATACCCTTGGAAGTTAGCATCAAGGAGACAGTCGAGTCCTTGAAGGAGAAAGGTTTCATA
AACGTTTGAGAATGCATTTGAGCCAAACCGGATTCAATACTTTCGTTGTTGGAATGGTTC
CATCAAAACTTTTAATAAATTAAGCATTTGTTTCAGTTTATGACATGAGCTTTCACCATC
ATGTTTTATAATGAAAAAACTTGGGAACTTTT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 4

CO CL2423Contig1 600 4 4 U
ATGATCTACGATTTGGACAACATAGTTTCTCGTGAAGCACAAAATGTCATCGATAGCATA
TCTGTTACTCGAAGAAGGAAACTATACAATTTTAACTCTGACAAAACCAAGAAAACAAAA
TGAACGAAGAAGAACGATCACAAAGTTGCATGACAAGTAGAGGGGACATCGAACC*GCAA
GGGGAAACTAGTAAACTAATGCAAGTTAGTACTAATTAAACCTCTTTTGGTACGAGAAAC
CGACTATGATGCCAGTACCCACCCCTCTGTTTTAGTCCAATTT*GATGGTATCTCTCTCT
TCTTCTTGCTTCTTTGGAGCAGCAGGAAAATATTTGATTCCGGTAAGGTCACCTGCTTTG
CTTATAACCTGTAGAGCTTTAAGAAGATCTTCTCTTGAGTGAGATGCGGATATACAAATA
CGAGCCCTGGCTAGCAATAGAGGTGTAGCTGGGAAACCAACAACCACAACTGCCACGTTT
TCTCGCAGGCATTCCCTTGAGAAGGCTGGGATTTTCGCAGGATTGTAAAGCATTATCGGC
ATAACTGGGGAATCATTGTCTCCAAGAACCTCAAATCCCATCTTCTGCAACTCAGCCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C634TF C 1
AF RR2C634JQ U 175
AF RR2BF69JQ U 2
AF RR2BF69TF C 2
BS 1 7 RR2C634TF
BS 8 183 RR2BF69JQ
BS 184 184 RR2C634JQ
BS 185 600 RR2BF69JQ

RD RR2C634TF 308 0 0
ATGATCTACGATTTGGACAACATAGTTTCTCGTGAAGCACAAAATGTCATCGATAGCATA
TCTGTTACTCGAAGAAGGAAACTATACAATTTTAACTCTGACAAAACCAAGAAAACAAAA
TGAACGAAGAAGAACGATCACAAAGTTGCATGACAAGTAGAGGGGACATCGAACCCGCAA
GGGGAAACTAGTAAACTAATGCAAGTTAGTACTAATTAAACCTCTTTTGGTACGAGAAAC
CGACTATGATGCCAGTACCCACCCCTCTGTTTTAGTCCAATTT*GATGGTATCTCTCTCT
TCTTCTTG

QA 1 308 1 308
DS 

RD RR2C634JQ 207 0 0
ACCGCAA
GGGAAACTAGTAAACTAATGCAAGTTAGTACTAATTAAACCTCTTTTGGTACGAAAAACC
GACTATGATGCCAGTACCCACCCCTCTGTTTTAGTCCAATTTTGATGGTATCTCTCTCTT
CTTCTTGCTTCTTTGGAGCAGCAGGAAAATATTTGATTCCGGTAAGGTCACCTGCTTTGC
TTATAACCTGTAGAGCTTTA

QA 8 207 8 207
DS 

RD RR2BF69JQ 599 0 0
GATCTA
ACGATTTGGACAACATAGTTTCTCGTGAAGCACAAAATGTCATCGATAGCATATCTGTTA
CTCGAAGAAGGAAACTATACAATTTTAACTCTGACAAAACCAAGAAAACAAAATGAACGA
AGAAGAACGATCACAAAGTTGCATGACAAGTAGAGGGGACATCGAACC*GCAAGGG*AAA
CTAGTAAACTAATGCAAGTTAGTACTAATTAAACCTCTTTTGGTACGAGAAACCGACTAT
GATGCCAGTACCCACCCCTCTGTTTTAGTCCAATTT*GATGGTATCTCTCTCTTCTTCTT
GCTTCTTTGGAGCAGCAGGAAAATATTTGATTCCGGTAAGGTCACCTGCTTTGCTTATAA
CCTGTAGAGCTTTAAGAAGATCTTCTCTTGAGTGAGATGCGGATATACAAATACGAGCCC
TGGCTAGCAATAGAGGTGTAGCTGGGAAACCAACAACCACAACTGCCACGTTTTCTCGCA
GGCATTCCCTTGAGAAGGCTGGGATTTTCGCAGGATTGTAAAGCATTATCGGCATAACTG
GGGAATCATTGTCTCCAAGAACCTCAAATCCCATCTTCTGCAACTCAGCCCTC

QA 7 599 7 599
DS 

RD RR2BF69TF 599 0 0
GATCTA
ACGATTTGGACAACATAGTTTCTCGTGAAGCACAAAATGTCATCGATAGCATATCTGTTA
CTCGAAGAAGGAAACTATACAATTTTAACTCTGACAAAACCAAGAAAACAAAATGAACGA
AGAAGAACGATCACAAAGTTGCATGACAAGTAGAGGGGACATCGAACC*GCAAGGG*AAA
CTAGTAAACTAATGCAAGTTAGTACTAATTAAACCTCTTTTGGTACGAGAAACCGACTAT
GATGCCAGTACCCACCCCTCTGTTTTAGTCCAATTT*GATGGTATCTCTCTCTTCTTCTT
GCTTCTTTGGAGCAGCAGGAAAATATTTGATTCCGGTAAGGTCACCTGCTTTGCTTATAA
CCTGTAGAGCTTTAAGAAGATCTTCTCTTGAGTGAGATGCGGATATACAAATACGAGCCC
TGGCTAGCAATAGAGGTGTAGCTGGGAAACCAACAACCACAACTGCCACGTTTTCTCGCA
GGCATTCCCTTGAGAAGGCTGGGATTTTCGCAGGATTGTAAAGCATTATCGGCATAACTG
GGGAATCATTGTCTCCAAGAACCTCAAATCCCATCTTCTGCAACTCAGCCCTC

QA 7 599 7 599
DS 



AS 1 4

CO CL2424Contig1 1034 4 15 U
TTTTTTCTTTTTTCACCATCGCAGGCTTTGTGTAGTGATGGAGATTGCGTCTGTGACTTT
CTCTTGCCCAGCGTTGTTTTCAACGCCTCGTGTTTGTAGAAGCAAGCCTTTTGCTCTAAA
CTTCAATACCGATCATAGAAAGAGATTTTCATGTCGAGTAGCTTCTGGAGACACGACGAC
AGCTAAGGTCGTGGACAGTGAACTTGACTTAGAATACAAGAAACACGATCTACTCAGAGC
TGTACAAGAAACTCAACGAGGTCTCACTGCCACTTCTGATCAACGCTCTGTCATCGAGGA
GGCTCTGGTGACTGTGGAAGGGTTTAACGGCGGTGAAGCCATTGATCTAATGAAGTTAGA
TGGAACATGGAGGCTACAATATACGTCTGCTCCTGATGTTGTTGTTCTCTTTGAAGCTGC
CTCAAGATTTCCCTTCTTTCAGGTTGGTCAGATCTTTCAGAAGTTTGAGTGCAGAGATCG
ATCAGACGGTGGGATCATCCGGAACGTTGTTCAGTGGAGTGTTCCAAGCTTGCTAGAGGA
GCAAGAAGGTGCTACACTTGTTGTTACTGCCAAGTTCGACAAGGTCTCTAGTCGAAACAT
CTACCTTCAGTTTGAAGAGATAAGTGTTAGAAACATTAATATAAACGAGCAGGTTCAATC
TCTTCTCGCACCCGCAATTCTTCCACGCTCATTCTTAAACCTTCAGATTTTGCAGTTTAT
ACGTACTTTCAATGCTCAAATTCCAGTAACAGCAACCAGTCCAGGAAGGAGGAGGTCTGT
AGGTGGATTGTATTACCTCTCTTATCTCGATAATAACATGCTCTTGGGTCGATCCGTTGG
AGGTGGAGGAGTCTTTGTCTTTACTAAATCTCAACCCCTTCAGCTCTGATAATTAGAAAA
AAAATCTATAAAACCAGATTCTGAACATTATTATGTTAGCTGATTCTGTTTATGTATAAA
CAACCTATTCGGGGTTTTTTACTAGAGAGATATTGTTACAACAAAGCAAAAAAAATGTTA
CTGGATGATCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX25TF U 169
AF RR2GH75TF U 1
AF RR2GH75JQB C 134
AF RR2DX25JQ C 455
BS 1 547 RR2GH75TF
BS 548 548 RR2GH75JQB
BS 549 583 RR2GH75TF
BS 584 584 RR2GH75JQB
BS 585 650 RR2GH75TF
BS 651 651 RR2GH75JQB
BS 652 672 RR2GH75TF
BS 673 693 RR2GH75JQB
BS 694 694 RR2DX25JQ
BS 695 771 RR2GH75JQB
BS 772 774 RR2DX25JQ
BS 775 973 RR2GH75JQB
BS 974 974 RR2DX25JQ
BS 975 990 RR2GH75JQB
BS 991 1034 RR2DX25JQ

RD RR2DX25TF 284 0 0
GGGAGACC
CGACAGCTAAGGTCGTGGACAGTGAACTTGACTTAGAATACAAGAAACACGATCTACTCA
GAGCTGTACAAGAAACTCAACGAGGTCTCACTGCCACTTCTGATCAACGCTCTGTCATCG
AGGAGGCTCTGGTGACTGTGGAAGGGTTTAACGGCGGTGAAGCCATTGATCTAATGAAGT
TAGATGGAACATGGAGGCTACAATATACGTCTGCACCTGATGTTGTTGTTCTCTTTGAAG
TTGCCTCAAGGTTTCCCTTCTTTCAGGTTGGTCAGA

QA 9 284 9 284
DS 

RD RR2GH75TF 672 0 0
TTTTTTCTTTTTTCACCATCGCAGGCTTTGTGTAGTGATGGAGATTGCGTCTGTGACTTT
CTCTTGCCCAGCGTTGTTTTCAACGCCTCGTGTTTGTAGAAGCAAGCCTTTTGCTCTAAA
CTTCAATACCGATCATAGAAAGAGATTTTCATGTCGAGTAGCTTCTGGAGACACGACGAC
AGCTAAGGTCGTGGACAGTGAACTTGACTTAGAATACAAGAAACACGATCTACTCAGAGC
TGTACAAGAAACTCAACGAGGTCTCACTGCCACTTCTGATCAACGCTCTGTCATCGAGGA
GGCTCTGGTGACTGTGGAAGGGTTTAACGGCGGTGAAGCCATTGATCTAATGAAGTTAGA
TGGAACATGGAGGCTACAATATACGTCTGCTCCTGATGTTGTTGTTCTCTTTGAAGCTGC
CTCAAGATTTCCCTTCTTTCAGGTTGGTCAGATCTTTCAGAAGTTTGAGTGCAGAGATCG
ATCAGACGGTGGGATCATCCGGAACGTTGTTCAGTGGAGTGTTCCAAGCTTGCTAGAGGA
GCAAGAAAGTGCTACACTTGTTGTTACTGCCAAGTTCGACAAG*TCTCTAGTCGAAACAT
CTACCTTCAGTTTGAAGAGATAAGTGTTAGAAACATTAATATAAACGAGC*GGTTCAATC
TCTTCTCGCACC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2GH75JQB 864 0 0
CATAGAAAGAGATTT*CATGTCGAGTAGCTTCTGGAGACACGACGACAGCTAAGGTCGTG
GACAGTGAACTTGACTTAGAATACAAGAAACACGATCTACTCAGAGCTGTACAAGAAACT
CAACGAGGTCTCACTGCCACTTCTGATCAACGCTCTGTCATCGAGGAGGCTCTGGTGACT
GTGGAAGGGTTTAACGGCGGTGAAGCCATTGATCTAATGAAGTTAGATGGAACATGGAGG
CTACAATATACGTCTGCTCCTGATGTTGTTGTTCTCTTTGAAGCTGCCTCAAGATTTCCC
TTCTTTCAGGTTGGTCAGATCTTTCAGAAGTTTGAGTGCAGAGATCGATCAGACGGTGGG
ATCATCCGGAACGTTGTTCAGTGGAGTGTTCCAAGCTTGCTAGAGGAGCAAGAAGGTGCT
ACACTTGTTGTTACTGCCAAGTTCGACAAGGTCTCTAGTCGAAACATCTACCTTCAGTTT
GAAGAGATAAGTGTTAGAAACATTAATATAAACGAGCAGGTTCAATCTCTTCTCGCACCC
GCAATTCTTCCACGCTCATTTTTAAACCTTCAGATTTTGCAGTTTATACGTACTTTCAAT
GCTCAAATTCCAGTAACAGCAACCAGTCCAGGAAGGAG***GTCTGTAGGTGGATTGTAT
TACCTCTCTTATCTCGATAATAACATGCTCTTGGGTCGATCCGTTGGAGGTGGAGGAGTC
TTTGTCTTTACTAAATCTCAACCCCTTCAGCTCTGATAATTAGAAAAAAAATCTATAAAA
CCAGATTCTGAACATTATTATGTTAGCTGATTCTGTTTATGTATAAACAACCTATTCGGG
TTTTTTTACTAGAGAGA
GATATTG

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR2DX25JQ 580 0 0
TTTCAGAAGTTTGAGTGCAGAGATCGATCAGACGGTGGGGTCATCCGGAACGTTGTTCAG
TGGAGTGTTCCAAGCTTGCTAGAGGAGCAAGAAGGTGCTACACTTGTTGTTACTGCCAAG
TTCGACAAGGTCTCTAGTCGAAACATCTACCTTCAGTTTGAAGAGATAAGTGTTAGAAAC
ATTAATATCAATGAGCAGGTTCAATCTCTTCTCGCACCTGCAATTCTTCCACGCTCGTTC
TTAAACCTTCAGATTTTGCAGTTTATACGTACTTTCAATGCTCAGATTCCAGTAACAGCA
ACCAGTCCAGGAAGGAGGAGGTCTGTAGGTGGATTGTATTACCTCTCTTATCTCGATAAT
AACATGCTCTTGGGTCGATCCGTTGGAGGTGGAGGAGTCTTTGTCTTTACTAAATCTCAA
CCCCTTCAGCTCTGATAATTAGAAAAAAA*TCTATAAAACCAGATTCTGAACATTATTAT
GTTAGCTGATTCTGTTTATGTATAAACAACCTATTCGGGGTTTTT*ACTAGAGAGATATT
GTTACAACAAAGCAAAAAAAATGTTACTGGATGATCAACC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 4

CO CL2425Contig1 808 4 3 U
AAGTTCAAAAAAAGTGTACTTAATGATAACATAGTTAATTAAGTGAAAACCATCACTTTC
AAAATTTCCATAAACCCCAAAGTTTTTGACAATAGAGATAAAAAGATCACTTTCACATTA
CATGATAAAAATTAACAAAAGGAACAATAATATAGAAAGGAAACAAACAAAAAAGAAAGC
TGCAAGAAGAGGGGAAAATGGTACACATTAATTATTAAAGAGAATATTAATTGAAATGGT
TCACAAGTTTCTCCAGACTCTCAGAAATTCTACCACTAGCTCCATAATCACAATCTTCCA
CCTTGCAATGAAGAGTGTGGAAGACGGTATCATCAACGGTTGAGGATCCAGCATGAGTGA
TCTCAGCTCCTGATTCCTCACTGACAGCACGAATGATCTCATGAAACATAAACTTGTGTT
CCAAGCTTGTGACAAGAAAGATGTGAAGAATCGGACCGGTTTCTTGAATCTCGATTTTCG
GCGACCTTCTAGCCACAGAGACATCAACACTCGAAGACATGGATGAAGATCCAGTCGCAG
CAAGTTTCCTCTTCCTTTCTCTCATTTTCTCCACGTTCACTTGCAGCTTCTTGATGTAGT
TTGCAGCTTCATCAAGCTGATCAGGAAGTGTTAAAGGCGCCCTAGAAGTTTGATCAGGAA
GAAGAGAGTTGAGTTCTGAATAAAGAGATTTCATCTGAATCCTTCTATTTTTCTCAATCG
TTTTCCGATCTACAGATCTTGACTGACTTGTGTTTGAAGGGCTCTGATCCATTTTGTTTT
TCCTAGTCTTGAAGTGTTTCACATATCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2B409JQ U 1
AF RR2B409TF C 2
AF RR2AT90JQ U 94
AF RR2AT90TF C 94
BS 1 184 RR2B409JQ
BS 185 185 RR2AT90JQ
BS 186 808 RR2B409JQ

RD RR2B409JQ 808 0 0
AAGTTCAAAAAAAGTGTACTTAATGATAACATAGTTAATTAAGTGAAAACCATCACTTTC
AAAATTTCCATAAACCCCAAAGTTTTTGACAATAGAGATAAAAAGATCACTTTCACATTA
CATGATAAAAATTAACAAAAGGAACAATAATATAGAAAGGAAACAAACAAAAAAGAAAGC
TGCAGGAAGAGGGGAAAATGGTACACATTAATTATTAAAGAGAATATTAATTGAAATGGT
TCACAAGTTTCTCCAGACTCTCAGAAATTCTACCACTAGCTCCATAATCACAATCTTCCA
CCTTGCAATGAAGAGTGTGGAAGACGGTATCATCAACGGTTGAGGATCCAGCATGAGTGA
TCTCAGCTCCTGATTCCTCACTGACAGCACGAATGATCTCATGAAACATAAACTTGTGTT
CCAAGCTTGTGACAAGAAAGATGTGAAGAATCGGACCGGTTTCTTGAATCTCGATTTTCG
GCGACCTTCTAGCCACAGAGACATCAACACTCGAAGACATGGATGAAGATCCAGTCGCAG
CAAGTTTCCTCTTCCTTTCTCTCATTTTCTCCACGTTCACTTGCAGCTTCTTGATGTAGT
TTGCAGCTTCATCAAGCTGATCAGGAAGTGTTAAAGGCGCCCTAGAAGTTTGATCAGGAA
GAAGAGAGTTGAGTTCTGAATAAAGAGATTTCATCTGAATCCTTCTATTTTTCTCAATCG
TTTTCCGATCTACAGATCTTGACTGACTTGTGTTTGAAGGGCTCTGATCCATTTTGTTTT
TCCTAGTCTTGAAGTGTTTCACATATCC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2B409TF 807 0 0
AAG
TCAAAAAAAGTGTACTTAATGATAACATAGTTAATTAAGTGAAAACCATCACTTTCAAAA
TTTCCATAAACCCCAAAGTTTTTGACAATAGAGATAAAAAGATCACTTTCACATTACATG
ATAAAAATTAACAAAAGGAACAATAATATAGAAAGGAAACAAACAAAAAAGAAAGCTGCA
GGAAGAGGGGAAAATGGTACACATTAATTATTAAAGAGAATATTAATTGAAATGGTTCAC
AAGTTTCTCCAGACTCTCAGAAATTCTACCACTAGCTCCATAATCACAATCTTCCACCTT
GCAATGAAGAGTGTGGAAGACGGTATCATCAACGGTTGAGGATCCAGCATGAGTGATCTC
AGCTCCTGATTCCTCACTGACAGCACGAATGATCTCATGAAACATAAACTTGTGTTCCAA
GCTTGTGACAAGAAAGATGTGAAGAATCGGACCGGTTTCTTGAATCTCGATTTTCGGCGA
CCTTCTAGCCACAGAGACATCAACACTCGAAGACATGGATGAAGATCCAGTCGCAGCAAG
TTTCCTCTTCCTTTCTCTCATTTTCTCCACGTTCACTTGCAGCTTCTTGATGTAGTTTGC
AGCTTCATCAAGCTGATCAGGAAGTGTTAAAGGCGCCCTAGAAGTTTGATCAGGAAGAAG
AGAGTTGAGTTCTGAATAAAGAGATTTCATCTGAATCCTTCTATTTTTCTCAATCGTTTT
CCGATCTACAGATCTTGACTGACTTGTGTTTGAAGGGCTCTGATCCATTTTGTTTTTCCT
AGTCTTGAAGTGTTTCACATATCC

QA 4 807 4 807
DS 

RD RR2AT90JQ 715 0 0
AGAGATAAAAAGATCACTTTCACATTACATGATAAAAATTAACAAAAGGAACAATAATAT
AGAAAGGAAACAAACAAAAAAGAAAGCTGCAAGAAGAGGGGAAAATGGTACACATTAATT
ATTAAAGAGAATATTAATTGAAATGGTTCACAAGTTTCTCCAGACTCTCAGAAATTCTAC
CACTAGCTCCATAATCACAATCTTCCACCTTGCAATGAAGAGTGTGGAAGACGGTATCAT
CAACGGTTGAGGATCCAGCATGAGTGATCTCAGCTCCTGATTCCTCGCTGACAGCACGAA
TGATCTCATGAAACATAAACTTGTGTTCCAAGCTTGTGACAAGAAAGATGTGAAGAATCG
GACCGGTTTCTTGAATCTCGATTTTCGGCGACCTTCTAGCCACAGAGACATCAACACTCG
AAGACATGGATGAAGATCCAGTCGCAGCAAGTTTCCTCTTCCTTTCTCTCATTTTCTCCA
CGTTCACTTGCAGCTTCTTGATGTAGTTTGCAGCTTCATCAAGCTGATCAGGAAGTGTTA
AAGGCGCCCTAGAAGTTTGATCAGGAAGAAGAGAGTTGAGTTCTGAATAAAGAGATTTCA
TCTGAATCCTTCTATTTTTCTCAATCGTTTTCCGATCTACAGATCTTGACTGACTTGTGT
TTGAAGGGCTCTGATCCATTTTGTTTTTCCTAGTCTTGAAGTGTTTCACATATCC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2AT90TF 715 0 0
AGAGATAAAAAGATCACTTTCACATTACATGATAAAAATTAACAAAAGGAACAATAATAT
AGAAAGGAAACAAACAAAAAAGAAAGCTGCAAGAAGAGGGGAAAATGGTACACATTAATT
ATTAAAGAGAATATTAATTGAAATGGTTCACAAGTTTCTCCAGACTCTCAGAAATTCTAC
CACTAGCTCCATAATCACAATCTTCCACCTTGCAATGAAGAGTGTGGAAGACGGTATCAT
CAACGGTTGAGGATCCAGCATGAGTGATCTCAGCTCCTGATTCCTCGCTGACAGCACGAA
TGATCTCATGAAACATAAACTTGTGTTCCAAGCTTGTGACAAGAAAGATGTGAAGAATCG
GACCGGTTTCTTGAATCTCGATTTTCGGCGACCTTCTAGCCACAGAGACATCAACACTCG
AAGACATGGATGAAGATCCAGTCGCAGCAAGTTTCCTCTTCCTTTCTCTCATTTTCTCCA
CGTTCACTTGCAGCTTCTTGATGTAGTTTGCAGCTTCATCAAGCTGATCAGGAAGTGTTA
AAGGCGCCCTAGAAGTTTGATCAGGAAGAAGAGAGTTGAGTTCTGAATAAAGAGATTTCA
TCTGAATCCTTCTATTTTTCTCAATCGTTTTCCGATCTACAGATCTTGACTGACTTGTGT
TTGAAGGGCTCTGATCCATTTTGTTTTTCCTAGTCTTGAAGTGTTTCACATATCC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 4

CO CL2426Contig1 1385 4 5 U
GGATGGGCAGCACCAAAGATACGGCAACGATGTAGCTCCATGGCTCAACCATAGCTGCGT
TCCTACAGAAACAAGAGATGTGTGGGATCGTCTTTTCAACGACGGATACAAAGCTGATGT
TGTCATTTACACTGATAATGGCGGCATCGTCTATGCTCATGCTAATATCATTGGGACTGC
TTCGAGTGTGATCAAAGGAATGTTGAAGCAAGCCAAAAAACATGGAAAGTGGTATACAAT
CTCAATCCGTGGCGTCCCTCATGAAGCTGTCCGAGCTTTCATTCGTTTCCTCTACTCTTC
TTGCTATAAGAAAGAAGAGATGAATGAGTATATCATGCACTTGCTGCTTATGTCTCACGC
GTACGTGGTTCCTCAGCTGAAACGGGTCTGTGAATGGCATCTAGAACATGGTCTGCTTAC
CACTGAGAACGTAATCGATGTCTTCCAGCTCGCCCTGCTCTGTGATTTCCCTCGGCTCAG
CGTCATATCTCACCGTATGATCATGAAACACTTCAAGGAGCTTTACGCGACAGAAGCATG
GACGGCTATGAAGAAAA*GCCATCCCTTCCTCGAGAAAGAACTTAGAGACTCTGTCTTCA
TCGAAGAAAATGTAAAAAAAAGTTAATCACATTATTTTTTGTAATTCAAAATTTTCTAAA
AAAGTGGTTGTAACATATTATTATTATTATTATTGTGTGCAGACGCGGAAAGAGAGGATC
AGAAAACGCAATGAACAGAGGATATACTCGGAGCTGTACGAAGCGATGGAAGCGCTTGTT
CACATATGCAGGGACGGGTGTAAAACAATAGGACCGCACGATAAAGATTTAAAACCCAAC
CACGCTGCGTGTCACTACGAGTCTTGCAAAGGGTTGGAATCGCTGATCAGGCATTTCGCT
GGATGTAAGCTTAGGGTTCCAGGAGGTTGCGTGCATTGCAAGAGAATGTGGCAGCTCCTT
GAGTTGCATTCTCGTGTTTGCGCTGATTCTGATCAGTGTCGAGTCCCACTATGCAGGTAA
CATTAGTGTTTAGGAGACCGACATTTTTACTGTGAAATTGTGGGACTTGTATGTTGATAT
TTTTGCTTGTGTTGGAACAGAAACTTTAAGGAGAAGATGGAGAAACAGAGCAAGAAGGAT
GAGGTTAGATGGAAACTTCTGGTGAAGAATGTGTTAGGGTCTAAGAAAATCGGAGCCTCT
CCTTTCTTTTTACCTGTGATGTGACCAGCTCTTCCTCCACCACCATGTCTTAATCCGTGA
GTCGTTTTCTTCAATCCCAAGAATGGCGAGTTTTAAGCATTTCTTGTGATCTTCTCCCTA
AAAAAATGTAACATAATAAAATGAGATGAAATGAAAGAAACATTTGGTGGTCAAAGTCTA
AGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2DG84TF U 1
AF RR2DG84JQ C 168
AF RR2AE42JQ U 298
AF RR2AE42TF C 570
BS 1 557 RR2DG84TF
BS 558 558 RR2AE42JQ
BS 559 664 RR2DG84TF
BS 665 951 RR2AE42JQ
BS 952 1385 RR2AE42TF

RD RR2DG84TF 678 0 0
GGATGGGCAGCACCAAAGATACGGCAACGATGTAGCTCCATGGCTCAACCATAGCTGCGT
TCCTACAGAAACAAGAGATGTGTGGGATCGTCTTTTCAACGACGGATACAAAGCTGATGT
TGTCATTTACACTGATAATGGCGGCATCGTCTATGCTCATGCTAATATCATTGGGACTGC
TTCGAGTGTGATCAAAGGAATGTTGAAGCAAGCCAAAAAACATGGAAAGTGGTATACAAT
CTCAATCCGTGGCGTCCCTCATGAAGCTGTCCGAGCTTTCATTCGTTTCCTCTACTCTTC
TTGCTATAAGAAAGAAGAGATGAATGAGTATATCATGCACTTGCTGCTTATGTCTCACGC
GTACGTGGTTCCTCAGCTGAAACGGGTCTGTGAATGGCATCTAGAACATGGTCTGCTTAC
CACTGAGAACGTAATCGATGTCTTCCAGCTCGCCCTGCTCTGTGATTTCCCTCGGCTCAG
CGTCATATCTCACCGTATGATCATGAAACACTTCAAGGAGCTTTACGCGACAGAAGCATG
GACGGCTATGAAGAAAAAGCCATCCCTTCCTCGAGAAAGAACTTAGAGACTCTGTCTTCA
TCGAAGAAAATGTAAAAAAAAGTTAATCACATTATTTTTTGTAATTCAAAATTTTCTAAA
AAAG
AAATGGTTGTAACG

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2DG84JQ 511 0 0
TCATTGGGACTGCTTCGAGTGTGATCAAAGGAATGTTGAAGCAAGCCAAAAAACATGGAA
AGTGGTATACAATCTCAATCCGTGGCGTCCCTCATGAAGCTGTCCGAGCTTTCATTCGTT
TCCTCTACTCTTCTTGCTATAAGAAAGAAGAGATGAATGAGTATATCATGCACTTGCTGC
TTATGTCTCACGCGTACGTGGTTCCTCAGCTGAAACGGGTCTGTGAATGGCATCTAGAAC
ATGGTCTGCTTACCACTGAGAACGTAATCGATGTCTTCCAGCTCGCCCTGCTCTGTGATT
TCCCTCGGCTCAGCGTCATATCTCACCGTATGATCATGAAACACTTCAAGGAGCTTTACG
CGACAGAAGCATGGACGGCTATGAAGAAAA*GCCATCCCTTCCTCGAGAAAGAACTTAGA
GACTCTGTCTTCATCGAAGAAAATGTAAAAAAAAGTTAATCACATTATTTTTTGTAATTC
AAAATTTTCTAAAAAAG
AAATGGTTGTAACG

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2AE42JQ 654 0 0
GTTTA
GCTATAAGAAAGAAGAGATGAATGAGTATATCATGCACTTGCTGCTTATGTCACACGCGT
ACGTGGTACCTCAGCTGAAACGGGTCTGTGAATGTCATCTAGAACATGGTCTGCTTACCA
CTGAGAACGTAATCGATGTCTTCCAACTCGCCCTGCTCTGTGATTTCCCTCGGCTCAGCG
TCTTATCTCACCGTATGATCATGAAACACTTCAAGGAGCTTTACGCCACAGAAGCATGGA
CGGCTATGAAGAAAA*GCCACCCCTTTCTCGAGAAAGAACTTAGAGACTCTGTCTTCATC
GAAGAAAATGTAAAAAAAAGTTAATTACATTATTTTTTGTAATTCAAAATTTTCTAAAAA
AGTGGTTGTAACATATTATTATTATTATTATTGTGTGCAGACGCGGAAAGAGAGGATCAG
AAAACGCAATGAACAGAGGATATACTCGGAGCTGTACGAAGCGATGGAAGCGCTTGTTCA
CATATGCAGGGACGGGTGTAAAACAATAGGACCGCACGATAAAGATTTAAAACCCAACCA
CGCTGCGTGTCACTACGAGTCTTGCAAAGGGTTGGAATCGCTGATCAGGCATTTCGCTGG
ATGTAAGCTTAGGGTTCCAGGAGGTTGCGTGCATTGCAAGAGAATGTGG

QA 6 654 6 654
DS 

RD RR2AE42TF 816 0 0
CTCGAGAAAGAACTTAGAGACTCTGTCTTCATCGAAGAAAATGTAAAAAAAAGTTAATTA
CATTATTTTTTGTAATTCAAAATTTTCTAAAAAAGTGGTTGTAACATATTATTATTATTA
TTATTGTGTGCAGACGCGGAAAGAGAGGATCAGAAAACGCAATGAACAGAGGATATACTC
GGAGCTGTACGAAGCGATGGAAGCGCTTGTTCACATATGCAGGGACGGGTGTAAAACAAT
AGGACCGCACGATAAAGATTTAAAACCCAACCACGCTGCGTGTCACTACGAGTCTTGCAA
AGGGTTGGAATCGCTGATCAGGCATTTCGCTGGATGTAAGCTTAGGGTTCCAGGAGGTTG
CGTGCATTGCAAGAGAATGTGGCAGCTCCTTGAGTTGCATTCTCGTGTTTGCGCTGATTC
TGATCAGTGTCGAGTCCCACTATGCAGGTAACATTAGTGTTTAGGAGACCGACATTTTTA
CTGTGAAATTGTGGGACTTGTATGTTGATATTTTTGCTTGTGTTGGAACAGAAACTTTAA
GGAGAAGATGGAGAAACAGAGCAAGAAGGATGAGGTTAGATGGAAACTTCTGGTGAAGAA
TGTGTTAGGGTCTAAGAAAATCGGAGCCTCTCCTTTCTTTTTACCTGTGATGTGACCAGC
TCTTCCTCCACCACCATGTCTTAATCCGTGAGTCGTTTTCTTCAATCCCAAGAATGGCGA
GTTTTAAGCATTTCTTGTGATCTTCTCCCTAAAAAAATGTAACATAATAAAATGAGATGA
AATGAAAGAAACATTTGGTGGTCAAAGTCTAAGTTC

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 4

CO CL2427Contig1 1187 4 12 U
GGATCTAACTAAGACTCTTATTAATAAGATATACAGAGAGCGATGGCGATTAACGGCGAA
GATCGCATCTCCGGTGACCGCCCGATCATAATGATCAACAATGACGACGGAATAGACGCG
CCTGGTCTCCGCTCTCTCGTTAGCGCCCTCGTCTCCACCAATCTCTACGAAGTCCGCGTC
TGCGCTCCCGATTCGGAGAAGTCTGCTGTAAGTCACAGTATCATATGGAGCAGGCCTCTC
ACTGCAAAACGAGTTGAGATTGAAGGAGCTGAGGCCTATGCCGTTTCTGGAACCCCTGCG
GATTGCACTGGTTTGGGCATATCGGAAGCACTCTTCCCTTCTCTTCCTGACCTGGTTCTT
AGTGGTATAAACGTGGGTAGCAACTGTGGATATAACATCGTCTACTCTGGAACTGTTGCT
GGTGCTCGTGAAGCCTTCATTTATGATGTCCCTTCTGCCTCCATTTCTTATGACTGGAAA
CGTGGGGACATCAATGCTAATGATTTTGTCCTCGCTGCCCAAGCTTGTTTGCCTATTATC
AACGGCATGCTCACTGCCATCAAGAACAAAACTCACCCAACTAACTGCTTTCTCAATATC
GATTTGCCTACTGATATTGCTAACCATAAGGGATACAAGCTAACTAGACAAGGAAAAAGC
TTGGGTAGGATGGGATGGAGACAAGTGGAGGAGGAAGCACAAGGTGCTAAGATGTTGTCA
ACAATGTCAATGGAAACAGATTCAGGAGTAGTTTCAGACAACAACAACGACACATCAGCT
CATTATTCAAAAGATAATAGCCGTTTGTTCAAGAGAGAGCTAAGGACTGTGATAGTTGAA
GAAGGCACTGATCTTCACTTCCTGCGAGAAGGATATATTACAGTGACGCCAATAGGAGCT
CTGTCTCAGGTTGATGCGGATTGCCAGAACTACTACAAAGAATGGCTTCCCAAGATTTCT
TCATCCTTGTGATGCCACCAAATGAAAAAAAAGAAAAAGAACCATTTTAATAATTTGATC
ATTGTTGACCACCACAGTTTGTGGTAGACCTATTATCCTTAAGTTATTTATGTTGTGAGC
AGCTAAATCTCTGGCAACAAGTTTTGTTGCAAGTCGATGATTGCCACACATGTTTCTTTT
GCTTTTTGTTAATGGAACTCCTATGCAGTAGCCAGTAGCTTTACACG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB69TF U 1
AF RR2BU93TF U 5
AF RR2EB69JQ C 357
AF RR2BU93JQ C 472
BS 1 145 RR2EB69TF
BS 146 146 RR2BU93TF
BS 147 317 RR2EB69TF
BS 318 318 RR2BU93TF
BS 319 320 RR2EB69TF
BS 321 321 RR2BU93TF
BS 322 627 RR2EB69TF
BS 628 650 RR2BU93TF
BS 651 974 RR2EB69JQ
BS 975 975 RR2BU93JQ
BS 976 1080 RR2EB69JQ
BS 1081 1187 RR2BU93JQ

RD RR2EB69TF 627 0 0
GGATCTAACTAAGACTCTTATTAATAAGATATACAGAGAGCGATGGCGATTAACGGCGAA
GATCGCATCTCCGGTGACCGCCCGATCATAATGATCAACAATGACGACGGAATAGACGCG
CCTGGTCTCCGCTCTCTCGTTAGCGTCCTCGTCTCCACCAATCTCTACGAAGTCCGCGTC
TGCGCTCCCGATTCGGAGAAGTCTGCTGTAAGTCACAGTATCATATGGAGCAGGCCTCTC
ACTGCAAAACGAGTTGAGATTGAAGGAGCTGAGGCCTATGCCGTTTCTGGAACCCCTGCG
GATTGCACTGGTTTGGGGATTTCGGAAGCACTCTTCCCTTCTCTTCCTGACCTGGTTCTT
AGTGGTATAAACGTGGGTAGCAACTGTGGATATAACATCGTCTACTCTGGAACTGTTGCT
GGTGCTCGTGAAGCCTTCATTTATGATGTCCCTTCTGCCTCCATTTCTTATGACTGGAAA
CGTGGGGACATCAATGCTAATGATTTTGTCCTCGCTGCCCAAGCTTGTTTGCCTATTATC
AACGGCATGCTCACTGCCATCAAGAACAAAACTCACCCAACTAACTGCTTTCTCAATATC
GATTTGCCTACTGATATTGCTAACCAT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2BU93TF 646 0 0
GG
AACTAAGACTCTTATTAATAAGATATACAGAGAGCGATGGCGATTAACGGCGAAGATCGC
ATCTCCGGTGACCGCCCGATCATAATGATCAACAATGACGACGGAATAGACGCGCCTGGT
CTCCGCTCTCTCGTTAGCGCCCTCGTCTCCACCAATCTCTACGAAGTCCGCGTCTGCGCT
CCCGATTCGGAGAAGTCTGCTGTAAGTCACAGTATCATATGGAGCAGGCCTCTCACTGCA
AAACGAGTTGAGATTGAAGGAGCTGAGGCCTATGCCGTTTCTGGAACCCCTGCGGATTGC
ACTGGTTTGGGCATATCGGAAGCACTCTTCCCTTCTCTTCCTGACCTGGTTCTTAGTGGT
ATAAACGTGGGTAGCAACTGTGGATATAACATCGTCTACTCTGGAACTGTTGCTGGTGCT
CGTGAAGCCTTCATTTATGATGTCCCTTCTGCCTCCATT*CTTATGACTGGAAACGTGGG
GACATCAATGCTAATGATTTTGTCCTCGCTGCCCAAGCTTGTTTGCCTATTATCAACGGC
ATGCTCACTGCCATCAAGAACAAAACTCACCCAACTAACTGCTTTCTCAATATCGATTTG
CCTACTGATATTGCTAACCATAAGGGATACAAGCTAACTAGACA

QA 3 646 3 646
DS 

RD RR2EB69JQ 724 0 0
TCTTAGTGGTATAAACGTGGGTAGCAACTGTGGATATAACATCGTCTACTCTGGAACTGT
TGCTGGTGCTCGTGAAGCCTTCATTTATGATGTCCCTTCTGCCTCCATTTCTTATGACTG
GAAACGTGGGGACATCAATGCTAATGATTTTGTCCTCGCTGCCCAAGCTTGTTTGCCTAT
TATCAACGGCATGCTCACTGCCATCAAGAACAAAACTCACCCAACTAACTGCTTTCTCAA
TATCGATTTGCCTACTGATATTGCTAACCATAAGGGATACAAGCTAACTAGACAAGGAAA
AAGCTTGGGTAGGATGGGATGGAGACAAGTGGAGGAGGAAGCACAAGGTGCTAAGATGTT
GTCAACAATGTCAATGGAAACAGATTCAGGAGTAGTTTCAGACAACAACAACGACACATC
AGCTCATTATTCAAAAGATAATAGCCGTTTGTTCAAGAGAGAGCTAAGGACTGTGATAGT
TGAAGAAGGCACTGATCTTCACTTCCTGCGAGAAGGATATATTACAGTGACGCCAATAGG
AGCTCTGTCTCAGGTTGATGCGGATTGCCAGAACTACTACAAAGAATGGCTTCCCAAGAT
TTCTTCATCCTTGTGATGTCACCAAATGAAAAAAAAGAAAAAGAACCATTTTAATAATTT
GATCATTGTTGACCACCACAGTTTGTGGTAGACCTATTATCCTTAAGTTATTTATGTTGT
GAGC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2BU93JQ 716 0 0
GACTGGAAACGTGGGGACATCAATGCTAATGATTTTGTCCTCGCTGCCCAAGCTTGTTTG
CCTATTATCAACGGCATGCTCACTGCCATCAAGAACAAAACTCACCCAACTAACTGCTTT
CTCAATATCGATTTGCCTACTGATATTGCTAACCATAAGGGATACAAGCTAACTAGACAA
GGAAAAAGCTTGGGTAGGATGGGATGGAGACAAGTGGAGGAGGAAGCACAAGGTGCTAAG
ATGTTGTCAACAATGTCAATGGAAACAGATTCAGGAGTAGTTTCAGACAACAACAACGAC
ACATCAGCTCATTATTCAAAAGATAATAGCCGTTTGTTCAAGAGAGAGCTAAGGACTGTG
ATAGTTGAAGAAGGCACTGATCTTCACTTCCTGCGAGAAGGATATATTACAGTGACGCCA
ATAGGAGCTCTGTCTCAGGTTGATGTGGATTGCCAGAACTACTACAAAGAATGGCTTCCC
AAGATTTCTTCATCCTTGTGATGCCACCAAATGAAAAAAAAGAAAAAGAACCATTTTAAT
AATTTGATCATTGTTGACCACCACAGTTTGTGGTAGACCTATTATCCTTAAGTTATTTAT
GTTGTGAGCAGCTAAATCTCTGGCAACAAGTTTTGTTGCAAGTCGATGATTGCCACACAT
GTTTCTTTTGCTTTTTGTTAATGGAACTCCTATGCAGTAGCCAGTAGCTTTACACG

QA 1 716 1 716
DS 



AS 2 4

CO CL2428Contig1 1159 2 4 U
GGAGTTCAGTTTTGTTCTCTTCTGTTTTCTTTTCTTGTTTTTTTCATCAACGAAAATAAA
TAAGAGTTCTTGACGTATTCTACTGATTTCCACATTAATACCCCCAATCAATCGGTCTCG
TTTCGCCAAGGAAACAAGAAAATAATTTTTTTTTCTTCTTATTTATTTCTCTTGGGGTTA
AGAAGCAAAATGGCGACGAACATCGGAATCATGGACAGTGCTTACTTTGTCGGAAGAAAC
GAGATTCTGACTTGGATCAACGACCGCCTTCATCTCAGTCTCTCTCGCGTGGAAGAGGCT
GCATCTGGTGCTGTTCAATGTCAGATGCTTGATGTGACCTTTCCTGGAGTTGTGCCAATG
CACAAGGTTAATTTTGATGCAAAGAACGAATATGATATGATACAAAACTACAAGGTCCTG
CAAGATGTGTTCAATAAGCTGAAAATTACAAAGCCATTGGAAATTAACAGGCTAGTCAAA
GGCCGACCCCTGGATAACTTGGAGTTTCTACAGTGGCTGAAACGTTTCTGTGATTCTATT
AATGGTGGCATTATGAATGAGAACTATAATCCAGTGGAAAGAAGATCAAAAGGTGGTAAA
GAGAGGAGTTTAAAGGGATCTAATAAGATGCCCAACAATAATCATCATCCTCCACCCAAT
CCAGGGCAGCCCAAGCCAGCAAAATCAGCTCAAGTACAGGTTTTGTCGAAGGAGCTTGCA
GATTTCAAGATTTTTTTTGACCTCTTGGAAAGAGAAAGAGACTTTTACTTTTCCAAGCTC
CGGGATGTAGAGTTTTTTTGCCAAACTCCTCAAGTAGAGGATCTTCCTATAGTGGTAGCA
GTGAAGAAGATACTGTATGCAACAGATGCAAATGAATTTGCACTAGAAGACGCTCAGGAG
TTTTTAGACCAATCCTTAGGTGTGGAAGCTGAAGATGAAGGTAACGGAGAACAAGAAGAA
GATGAAGAAAAGACACAATCCTAAGCTCTGACTATTTATAATCCTAAGTAGAAGACATTT
TCGGATCAGTTTTTTTTTTTCTAGAGTTGTTGAACAATGGCTTGGACATGGCCTCCTCTT
CAAAAGTTTCCTTTGTTAAAGGGGACTTGGCGAAACGTGAAGATGAATGAGCTTTTCTAT
TAGAGAGCTTTAGTTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D644TF U 1
AF RR2D644JQ C 534
BS 1 683 RR2D644TF
BS 684 684 RR2D644JQ
BS 685 695 RR2D644TF
BS 696 1159 RR2D644JQ

RD RR2D644TF 695 0 0
GGAGTTCAGTTTTGTTCTCTTCTGTTTTCTTTTCTTGTTTTTTTCATCAACGAAAATAAA
TAAGAGTTCTTGACGTATTCTACTGATTTCCACATTAATACCCCCAATCAATCGGTCTCG
TTTCGCCAAGGAAACAAGAAAATAATTTTTTTTTCTTCTTATTTATTTCTCTTGGGGTTA
AGAAGCAAAATGGCGACGAACATCGGAATCATGGACAGTGCTTACTTTGTCGGAAGAAAC
GAGATTCTGACTTGGATCAACGACCGCCTTCATCTCAGTCTCTCTCGCGTGGAAGAGGCT
GCATCTGGTGCTGTTCAATGTCAGATGCTTGATGTGACCTTTCCTGGAGTTGTGCCAATG
CACAAGGTTAATTTTGATGCAAAGAACGAATATGATATGATACAAAACTACAAGGTCCTG
CAAGATGTGTTCAATAAGCTGAAAATTACAAAGCCATTGGAAATTAACAGGCTAGTCAAA
GGCCGACCCCTGGATAACTTGGAGTTTCTACAGTGGCTGAAACGTTTCTGTGATTCTATT
AATGGTGGCATTATGAATGAGAACTATAATCCAGTGGAAAGAAGATCAAAAGGTGGTAAA
GAGAGGAGTTTAAAGGGATCTAATAAGATGCCCAACAATAATCATCATCCTCCACCCAAT
CCAGGGCAGCCCAAGCCAGCAAA*TCAGCTCAAGT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2D644JQ 626 0 0
TTCT
ATTAATGGTGGCATTATGAATGAGAACTATAATCCAGTGGAAAGAAGATCAAAAGGTGGT
AAAGAGAGGAGTTTAAAGGGATTTAATAAGATGCCCAACAATAATCATCATCCTCCACCC
AATCCAGGGCAGCCCAAGCCAGCAAAATCAGCTCAAGTACAGGTTTTGTCGAAGGAGCTT
GCAGATTTCAAGATTTTTTTTGACCTCTTGGAAAGAGAAAGAGACTTTTACTTTTCCAAG
CTCCGGGATGTAGAGTTTTTTTGCCAAACTCCTCAAGTAGAGGATCTTCCTATAGTGGTA
GCAGTGAAGAAGATACTGTATGCAACAGATGCAAATGAATTTGCACTAGAAGACGCTCAG
GAGTTTTTAGACCAATCCTTAGGTGTGGAAGCTGAAGATGAAGGTAACGGAGAACAAGAA
GAAGATGAAGAAAAGACACAATCCTAAGCTCTGACTATTTATAATCCTAAGTAGAAGACA
TTTTCGGATCAGTTTTTTTTTTTCTAGAGTTGTTGAACAATGGCTTGGACATGGCCTCCT
CTTCAAAAGTTTCCTTTGTTAAAGGGGACTTGGCGAAACGTGAAGATGAATGAGCTTTTC
TATTAGAGAGCTTTAGTTTGAT

QA 5 626 5 626
DS 



CO CL2428Contig2 579 2 6 U
TTTTTCTTCTCTTCTTCTTATTTCTTTTGGAGTTAAGAAGCAAAATGGCGACGAACATCG
GAATTATGGACAGTGCTTACTTTGTCGGAAGAAACGAGATTCTGACTTGGATCAACGATT
GCCTTCATCTCAATCTCTCTCGCGTGGAAGAGGCTGCATCTGGTGCTGCTCAATGTCAGA
TGCTTGATGTGACCTTTCCTGGAGTTGTGCCAATGCACAAGGTTAATTTTGATGCAAAGA
ACGAATATGATATGATACAAAACTACAAGGTCCTGCAAGATGTGTTCAATAAGCTGAAAA
TTACAAAGCCATTGGAAATTAACAGACTAGTCAAAGGCCGACCCCTGGATAACTTGGAGT
TTCTACAGTGGCTGAAACGTTTCTGTGATTCCATTAATGGTGGCAATATGAATGAGAACT
ATAATCCAGTGGAAAGAAGATCAAAAGGTGGTAAAGAGAGGACTGTAAAGGGATCTAATA
AGATGCCCAGCAATAATCATCCTCCACCCAATCCAGGGCAGCCCAAGCCAGCAAAATCAG
CTCAAGTGCAGGTTTTGTCGAAGGAGCTTGCAGATCTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT01TF U 1
AF RR2CB06TF U 7
BS 1 44 RR2DT01TF
BS 45 45 RR2CB06TF
BS 46 323 RR2DT01TF
BS 324 324 RR2CB06TF
BS 325 573 RR2DT01TF
BS 574 579 RR2CB06TF

RD RR2DT01TF 573 0 0
TTTTTCTTCTCTTCTTCTTATTTCTTTTGGAGTTAAGAAGCAAAGTGGCGACGAACATCG
GAATTATGGACAGTGCTTACTTTGTCGGAAGAAACGAGATTCTGACTTGGATCAACGATT
GCCTTCATCTCAATCTCTCTCGCGTGGAAGAGGCTGCATCTGGTGCTGCTCAATGTCAGA
TGCTTGATGTGACCTTTCCTGGAGTTGTGCCAATGCACAAGGTTAATTTTGATGCAAAGA
ACGAATATGATATGATACAAAACTACAAGGTCCTGCAAGATGTGTTCAATAAGCTGAAAA
TTACAAAGCCATTGGAAATTAACGGACTAGTCAAAGGCCGACCCCTGGATAACTTGGAGT
TTCTACAGTGGCTGAAACGTTTCTGTGATTCCATTAATGGTGGCAATATGAATGAGAACT
ATAATCCAGTGGAAAGAAGATCAAAAGGTGGTAAAGAGAGGACTGTAAAGGGATCTAATA
AGATGCCCAGCAATAATCATCCTCCACCCAATCCAGGGCAGCCCAAGCCAGCAAAATCAG
CTCAAGTGCAGGTTTTGTCGAAGGAGCTTGCAG

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2CB06TF 573 0 0
TTCTCTTCTTC
TTATTTCTTTTGGAGTTAAGAAGCAAAATGGCGACGAACATCGGAATTATGGACAGTGCT
TACTTTGTCGGAAGAAACGAGATTTTGACTTGGATCAACGATTGCCTTCATCTCAATCTC
TCTCGCGTGGAGGAGGCTGCATCTGGTGCTGTTCAATGTCAGATGCTTGATGTGACCTTT
CCTGGAGTTGTGCCAATGCACAAGGTTAATTTTGATGCAAAGAACGAATATGATATGATA
CAAAACTACAAGGTCCTGCAAGATGTGTTCAATAAGCTGAAAATTACAAAGCCATTGGAA
ATTAACAGACTAGTCAAAGGCCGACCCCTGGATAACTTGGAGTTTCTACAGTGGCTGAAA
CGTTTCTGTGATTCCATTAATGGTGGCAATATGAATGAGAACTATAATCCAGTGGAAAGA
AGATCAAAAGGTGGTAAAGAGAGGACTGTAAAGGGATCTAATAAGATGCCCAGCAATAAT
CATCCTCCACCCAATCCAGGGCAGCCCAAGCCAGCAAAATCAGCTCAAGTGCAGGTTTTG
TCGAAGGAGCTTGCAGATCTCA

QA 12 573 12 573
DS 



AS 2 4

CO CL2429Contig1 792 2 2 U
GGACAGACAGAAGGTGAAGCAAAAAATGGTGTCGGGATCAGGTATATGCTCGAAGCGCGT
GGTCGTCGACGCGCGCCACCACATGCTGGGGCGTCTGGCGTCGATCGTGGCCAAAGAGCT
GCTCAATGGACAGAAGGTCGTCATCGTTAGGTGCGAGGAGATTTGTCTCCCCGGTGGACT
CGTTCGCCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTTCGCAAACGTATGAACACGAAGCCTTC
TCACGGACCCATTCACTTCCGTGCTCCCTCCAAGATCTTCTGGCGTACTGTTCGCGGTAT
GATTCCACACAAAACAAAGCGTGGAGCAGCTGCACTTGCACGCATGAAGGTGTTTGAAGG
TGTGCCTCCACCATATGACAAGGTCAAGAGGATGGTCATCCCCGATGCTCTCAAGGTCTT
GAGGCTTCAAGCTGGTCACAAATACTGTCTGTTGGGACGTCTTTCTTCTGAAGTCGGGTG
GAACCACTATGACACCATCAAGGAGCTGGAGACGAAGAGGAAGGAGAGATCCCAAGTTGT
TTACGAGCGTAAGAAGCAGCTTAACAAACTTAGAGCTAAGGCTGAGAAGGTGGCTGAAGA
GAAGCTTGGAGCACAGCTCGAGATTCTTGCACCAGTCAAGTACTGAGATGAGCACTAGTA
GTTTGTCGTCTTTGCATGTTTTGAGCCGTTCTATAATACTTTTTTCACTTTCACTTAGGT
GTTGTATCGGATTTTGCCCTAATGTTTTCTTTCTTGAGTTACAATTTATTTATATCCCAT
GTCTTTCTACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E646TF U 1
AF RR2E646JQ C 144
BS 1 472 RR2E646TF
BS 473 792 RR2E646JQ

RD RR2E646TF 479 0 0
GGACAGACAGAAGGTGAAGCAAAAAATGGTGTCGGGATCAGGTATATGCTCGAAGCGCGT
GGTCGTCGACGCGCGCCACCACATGCTGGGGCGTCTGGCGTCGATCGTGGCCAAAGAGCT
GCTCAATGGACAGAAGGTCGTCATCGTTAGGTGCGAGGAGATTTGTCTCCCCGGTGGACT
CGTTCGCCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTTCGCAAACGTATGAACACGAAGCCTTC
TCACGGACCCATTCACTTCCGTGCTCCCTCCAAGATCTTCTGGCGTACTGTTCGCGGTAT
GATTCCACACAAAACAAAGCGTGGAGCAGCTGCACTTGCACGCATGAAGGTGTTTGAAGG
TGTGCCTCCACCATATGACAAGGTCAAGAGGATGGTCATCCCCGATGCTCTCAAGGTCTT
GAGGCTTCAAGCTGGTCACAAATACTGTCTGTTGGGACGTCTTTCTTCTGAA
TCGGTGG

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2E646JQ 649 0 0
TCGTTAGGTGCGAGGAGATTTGTCTCCCCGGTGGACTCGTTCGCCAGAAAATGAAGTACA
TGAGGTTCCTTCGCAAACGTATGAACACGAAGCCTTCTCACGGACCCATTCACTTCCGTG
CTCCCTCCAAGATCTTCTGGCGTACTGTTCGCGGTATGATTCCACACAAAACAAAGCGTG
GAGCAGCTGCACTTGCACGCATGAAGGTGTTTGAAGGTGTGCCTCCACCATATGACAAGG
TCAAGAGGATGGTCATCCCCGATGCTCTCAAGGTCTTGAGGCTTCAAGCTGGTCACAAAT
ACTGTCTGTTGGGACGTCTTTCTTCTGAAGTCGGGTGGAACCACTATGACACCATCAAGG
AGCTGGAGACGAAGAGGAAGGAGAGATCCCAAGTTGTTTACGAGCGTAAGAAGCAGCTTA
ACAAACTTAGAGCTAAGGCTGAGAAGGTGGCTGAAGAGAAGCTTGGAGCACAGCTCGAGA
TTCTTGCACCAGTCAAGTACTGAGATGAGCACTAGTAGTTTGTCGTCTTTGCATGTTTTG
AGCCGTTCTATAATACTTTTTTCACTTTCACTTAGGTGTTGTATCGGATTTTGCCCTAAT
GTTTTCTTTCTTGAGTTACAATTTATTTATATCCCATGTCTTTCTACGC

QA 1 649 1 649
DS 



CO CL2429Contig2 784 2 3 U
GGAACACACAGACAGAAGGTGAAGCAAAAATGGTATCGGGATCAGGTATATGCTCGAAGC
GCGTGGTCGTGGACGCGCGCCACCACATGCTGGGGCGTCTGGCGTCGATCGTGGCCAAGG
AGCTGCTCAACGGGCAGAAGGTCGTCATCGTTAGATGCGAGGAGATTTGCCTCTCCGGTG
GACTCGTCCGCCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTTCGCAAACGTATGAACACCAAGC
CTTCTCACGGACCCATTCACTTCCGTGCTCCTTCCAAGATCTTCTGGCGTACTGTTCGCG
GTATGATTCCACACAAAACGAAGCGTGGAGCAGCTGCACTTGCACGCATGAAGGTGTTTG
AAGGTGTGCCTCCACCGTATGACAAGGTCAAGAGGATGGTCATCCCCGATGCTCTGAAGG
TCTTGAGGCTTCAAGCTGGTCACAAATACTGTCTTTTGGGCCGTCTTTCTTCTGAAGTCG
GGTGGAACCACTATGACACCATCAAGGAGCTGGAGACGAAGAGGAAGGAGAGATCTCAAG
TTGTTTACGAGCGTAAGAAGCAGCTAAACAAACTTAGAGCTAAGGCTGAGAAGGTGGCTG
AAGAGAAGCTTGGAGCACAGCTCGAGATTCTTGCACCAGTCAAGTACTGAGATGACCACT
AGTAGTTTGTCTTTGCATGTTTTGTGCCGACCTTCAATACTTTTTTCACTTTCACTTAGG
TGTTGTATCGGATTTTGCCCTAATGTTTTCTTTCCTGAGTTACAATCTATTTATATTTCA
TGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2FO82TF U 1
AF RR2FO82JQ C 1
BS 1 7 RR2FO82JQ
BS 8 601 RR2FO82TF
BS 602 784 RR2FO82JQ

RD RR2FO82TF 601 0 0
GGAACAC
ACAGACAGAAGGTGAAGCAAAAATGGTATCGGGATCAGGTATATGCTCGAAGCGCGTGGT
CGTGGACGCGCGCCACCACATGCTGGGGCGTCTGGCGTCGATCGTGGCCAAGGAGCTGCT
CAACGGGCAGAAGGTCGTCATCGTTAGATGCGAGGAGATTTGCCTCTCCGGTGGACTCGT
CCGCCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTTCGCAAACGTATGAACACCAAGCCTTCTCA
CGGACCCATTCACTTCCGTGCTCCTTCCAAGATCTTCTGGCGTACTGTTCGCGGTATGAT
TCCACACAAAACGAAGCGTGGAGCAGCTGCACTTGCACGCATGAAGGTGTTTGAAGGTGT
GCCTCCACCGTATGACAAGGTCAAGAGGATGGTCATCCCCGATGCTCTGAAGGTCTTGAG
GCTTCAAGCTGGTCACAAATACTGTCTTTTGGGCCGTCTTTCTTCTGAAGTCGGGTGGAA
CCACTATGACACCATCAAGGAGCTGGAGACGAAGAGGAAGGAGAGATCTCAAGTTGTTTA
CGAGCGTAAGAAGCAGCTAAACAAACTTAGAGCTAAGGCTGAGAAGGTGGCTGA

QA 8 601 8 601
DS 

RD RR2FO82JQ 784 0 0
GGAACACACAGACAGAAGGTGAAGCAAAAATGGTATCGGGATCAGGTATATGCTCGAAGC
GCGTGGTCGTGGACGCGCGCCACCACATGCTGGGGCGTCTGGCGTCGATCGTGGCCAAGG
AGCTGCTCAACGGGCAGAAGGTCGTCATCGTTAGATGCGAGGAGATTTGCCTCTCCGGTG
GACTCGTCCGCCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTTCGCAAACGTATGAACACCAAGC
CTTCTCACGGACCCATTCACTTCCGTGCTCCTTCCAAGATCTTCTGGCGTACTGTTCGCG
GTATGATTCCACACAAAACGAAGCGTGGAGCAGCTGCACTTGCACGCATGAAGGTGTTTG
AAGGTGTGCCTCCACCGTATGACAAGGTCAAGAGGATGGTCATCCCCGATGCTCTGAAGG
TCTTGAGGCTTCAAGCTGGTCACAAATACTGTCTTTTGGGCCGTCTTTCTTCTGAAGTCG
GGTGGAACCACTATGACACCATCAAGGAGCTGGAGACGAAGAGGAAGGAGAGATCTCAAG
TTGTTTACGAGCGTAAGAAGCAGCTAAACAAACTTAGAGCTAAGGCTGAGAAGGTGGCTG
AAGAGAAGCTTGGAGCACAGCTCGAGATTCTTGCACCAGTCAAGTACTGAGATGACCACT
AGTAGTTTGTCTTTGCATGTTTTGTGCCGACCTTCAATACTTTTTTCACTTTCACTTAGG
TGTTGTATCGGATTTTGCCCTAATGTTTTCTTTCCTGAGTTACAATCTATTTATATTTCA
TGTC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 4

CO CL2430Contig1 786 4 6 U
GTAAGGAATGAACAATTAAACACATTTTTTCTCACTCTGATGTTCACACAAAAAGTCAAT
ATACAAACAAATATTACAACAAAGCCACTGAATAGGAGAAAGAGTGAAATGTTTACACTT
TACAGTTTGAAAAAAAATCATTTGAAAGCAAATTTATAAAGATCAGAAACAACCACAGGT
TGCCTTGGGGACAATACCAGTGGCTCTGTGTTTAGCAACCATCTCTTCAGCTTTGAGAAC
ATCTTCTCCACGCTTAGCTTCAATCATGGCTCTTCTCTCTTCTGCTTCTTTGTGAATTGC
TGCAACTTTGTTCTTCATCTTCTCTGCATACTCTGCTTTCATTATTCTCAAGTTGCTCCT
CGATTTTCTTGAGTTGGGCTTCAACAGCTGCTTTCTTGCTGTTTTCCCAAGCAAGAATAT
CAGAAATCTTCTTCTCAGCTTTGTTCTCGGCTTTGGTCTTTTCGCTATCTTCCCATGCTT
TGACATAAGCCAATGTCTTCTCCTTTGACAAATCAGCTAGCTTAATATCTCTATCGATCG
AACCACCAGACGAAGCTTTCTTTGGCGAAGGCTCTACAGGTTTCTCAACGATGGCAAGGG
CTTTGGAGTCATCAGAAGTTTTTTCCGGAGCCGGAGTTGGAGCAGGAGTCTCAGCTGCAG
CCGGAGGTGGAGCAAGAGTCTCAGACGGAGCCGGAGACGGGGCCGGAGGTGCTGTGTCCA
ACGTTATCTTCTGTTCCTCAGCCATAGTCTCTCTCAGCCAAATATGAAAACAGCGAATTA
GAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS24JQ U 38
AF RR2DK88JQ U 1
AF RR2DK88TF C 188
AF RR2AS24TF C 35
BS 1 217 RR2DK88JQ
BS 218 218 RR2AS24JQ
BS 219 339 RR2DK88JQ
BS 340 340 RR2AS24JQ
BS 341 779 RR2DK88JQ
BS 780 786 RR2AS24TF

RD RR2AS24JQ 645 0 0
TGATGTTCACACAAAAAGTCAATATACAAACAAATATTACAACAAAGCCACTGAATAGGA
GAAAGAGTGAAATGTTTACACTTTACAGTTTGAAAAAAAATCATTTGAAAGCAAATTTAT
AAAGATCAGAAACAACCACAGGTTGCCTTGGGGACAATACCAGTGGCTCTGTGTTTAGCA
ACCATCTCTTCAGCTTTGAGAACATCTTCTCCACGCTTAGCTTCAATCATGGCTCTTCTC
TCTTCTGCTTCTTTGTGAATTGCTGCAACTTTGTTCTTCATCTTCTCTGCATACTCTGCT
TTC*TTATTCTCAAGTTGCTCCTCGATTTTCTTGAGTTGGGCTTCAACAGCTGCTTTCTT
GCTGTTTTCCCAAGCAAGAATATCAAAAATCTTCTTCTCAGCTTTGTTCTCGGCTTTGGT
CTTTTCGCTATCTTCCCATGCTTTGACATAAGCCAATGTCTTCTCCTTTGACAAATCAGC
TAGCTTAATATCTCTATCGATCGAACCACCAGACGAAGCTTTCTTTGGCGAAGGCTCTAC
AGGTTTCTCAACGATGGCAAGGGCTTTGGAGTCATCAGAAGTTTTTTCCGGAGCCGGAGT
TGGAGCAGGAGTCTCAGCTGCAGCCGGAGGTGGAGCAAGAGTCTC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2DK88JQ 780 0 0
GTAAGGAATGAACAATTAAACACATTTTTTCTCACTCTGATGTTCACACAAAAAGTCAAT
ATACAAACAAATATTACAACAAAGCCACTGAATAGGAGAAAGAGTGAAATGTTTACACTT
TACAGTTTGAAAAAAAATCATTTGAAAGCAAATTTATAAAGATCAGAAACAACCACAGGT
TGCCTTGGGGACAATACCAGTGGCTCTGTGTTTAGCAGCCATCTCTTCAGCTTTGAGAAC
ATCTTCTCCACGCTTAGCTTCAATCATGGCTCTTCTCTCTTCTGCTTCTTTGTGAATTGC
TGCAACTTTGTTCTTCATCTTCTCTGCATACTCTGCTTTTATTATTCTCAAGTTGCTCCT
CGATTTTCTTGAGTTGGGCTTCAACAGCTGCTTTCTTGCTGTTTTCCCAAGCAAGAATAT
CAGAAATCTTCTTCTCAGCTTTGTTCTCGGCTTTGGTCTTTTCGCTATCTTCCCATGCTT
TGACATAAGCCAATGTCTTCTCCTTTGACAAATCAGCTAGCTTAATATCTCTATCGATCG
AACCACCAGACGAAGCTTTCTTTGGCGAAGGCTCTACAGGTTTCTCAACGATGGCAAGGG
CTTTGGAGTCATCAGAAGTTTTTTCCGGAGCCGGAGTTGGAGCAGGAGTCTCAGCTGCAG
CCGGAGGTGGAGCAAGAGTCTCAGACGGAGCCGGAGACGGGGCCGGAGGTGCTGTGTCCA
ACGTTATCTTCTGTTCCTCAGCCATAGTCTCTCTCAGCCAAATATGAAAACAGCGAATT
C

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2DK88TF 593 0 0
GGGACAATACCAGTGGCTCTGTGTTTAGCAGCCATCTCTTCAGCTTTGAGAACATCTTCT
CCACGCTTAGCTTCAATCATGGCTCTTCTCTCTTCTGCTTCTTTGTGAATTGCTGCAACT
TTGTTCTTCATCTTCTCTGCATACTCTGCTTTTATTATTCTCAAGTTGCTCCTCGATTTT
CTTGAGTTGGGCTTCAACAGCTGCTTTCTTGCTGTTTTCCCAAGCAAGAATATCAGAGAT
CTTCTTCTCAGCTTTGTTCTCGGCTTTGGTCTTTTCGCTATCTTCCCATGCTTTGACATA
AGCCAATGTCTTCTCCTTTGACAAATCAGCTAGCTTAATATCTCTATCGATCGAACCACC
AGACGAAGCTTTCTTTGGCGAAGGCTCTACAGGTTTCTCAACGATGGCAAGGGCTTTGGA
GTCATCAGAAGTTTTTTCCGGAGCCGGAGTTGGAGCAGGAGTCTCAGCTGCAGCCGGAGG
TGGAGCAAGAGTCTCAGACGGAGCCGGAGACGGGGCCGGAGGTGCTGTGTCCAACGTTAT
CTTCTGTTCCTCAGCCATAGTCTCTCTCAGCCAAATATGAAAACAGCGAATT
C

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2AS24TF 752 0 0
TTC
TGATGTTCACACAAAAAGTCAATATACAAACAAATATTACAACAAAGCCACTGAATAGGA
GAAAGAGTGAAATGTTTACACTTTACAGTTTGAAAAAAAATCATTTGAAAGCAAATTTAT
AAAGATCAGAAACAACCACAGGTTGCCTTGGGGACAATACCAGTGGCTCTGTGTTTAGCA
ACCATCTCTTCAGCTTTGAGAACATCTTCTCCACGCTTAGCTTCAATCATGGCTCTTCTC
TCTTCTGCTTCTTTGTGAATTGCTGCAACTTTGTTCTTCATCTTCTCTGCATACTCTGCT
TTC*TTATTCTCAAGTTGCTCCTCGATTTTCTTGAGTTGGGCTTCAACAGCTGCTTTCTT
GCTGTTTTCCCAAGCAAGAATATCAGAGATCTTCTTCTCAGCTTTGTTCTCGGCTTTGGT
CTTTTCGCTATCTTCCCATGCTTTGACATAAGCCAATGTCTTCTCCTTTGACAAATCAGC
TAGCTTAATATCTCTATCGATCGAACCACCAGACGAAGCTTTCTTTGGCGAAGGCTCTAC
AGGTTTCTCAACGATGGCAAGGGCTTTGGAGTCATCAGAAGTTTTTTCCGGAGCCGGAGT
TGGAGCAGGAGTCTCAGCTGCAGCCGGAGGTGGAGCAAGAGTCTCAGACGGAGCCGGAGA
CGGGGCCGGAGGTGCTGTGTCCAACGTTATCTTCTGTTCCTCAGCCATAGTCTCTCTCAG
CCAAATATGAAAACAGCGAATTAGAGACC

QA 4 752 4 752
DS 



AS 1 4

CO CL2431Contig1 692 4 13 U
GTACATTTACAGTAGGTGTGACTTAGTTATTAGATGATGGAATCTGGTACAAATTGAAAC
AAAAGATTCATGTGAAATACTTCTCAAGTACTTGCTTTTGTGATTCTCCAGTGAAGATTG
AATCACAGGGACATGGTATGGATCTTTAAAGTTGGTTTCCTTTCTTCAGTTACAAGATGA
TCTCGTCTTGAACACTGACGTTGAGTGTCTTATTTGGAAGAACAATACTGCTGGTCACCA
CAACCTCGTCTTCAACTGCAACCGAGTCTCCGAGAATAGTAACTCCTAGTTTGGAGTTGT
AGACTCCCTCAGCCTGGACACGAGACCATCTCCCAATAGAAGATTTCCACCCAACAATTG
CGTTAGTCACCACTGCATTCTCCATGATCTCAACGTTGTCAAGGATGATACAGCTGATGA
GCCTGACACCAGGCCCAACACGAGCATTTGCAGAGATCGATACGTTGGGACCAATCTTTG
CAGTTGGGTGTATTTTTGCAGAAGGATGTATGTAAACATCACCAATCACTATTGCACTCT
TTGTTCCATCACCACTACTAACCAGCACTTGCGGAGAAGTCAACCGGAACTGGGAAAGAT
ATAGCTCCGAGCACCTCAGTGACATTCCAGGAGATTTGATTTGCTCCCAGAAATCCATGG
TCTCGTAAGTATATAGCTGCTTCTTCCCAGCT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN30TF C 1
AF RR2G210JQ U 1
AF RR2GA26JQ U 1
AF RR2C855JQ U 22
BS 1 219 RR2G210JQ
BS 220 220 RR2GA26JQ
BS 221 273 RR2G210JQ
BS 274 274 RR2GA26JQ
BS 275 301 RR2G210JQ
BS 302 302 RR2GA26JQ
BS 303 338 RR2G210JQ
BS 339 339 RR2GA26JQ
BS 340 341 RR2G210JQ
BS 342 342 RR2GA26JQ
BS 343 451 RR2G210JQ
BS 452 626 RR2GA26JQ
BS 627 692 RR2C855JQ

RD RR2GN30TF 231 0 0
GTACATTTACAGTAGGTGTGACTTAGTTATTAGATGATGGAATCTGGTACAAATTGAAAC
AAAAGATTCATGTGAAATACTTCTCAAGTACTTGCTTTTGTGATTCTCCAGTGAAGATTG
AATCACAGGGACATGGTATGGATCTTTAAAGTTGGTTTCCTTTCTTCAGTTACAAGATGA
TCTCGTCTTGAACACTGACGTTGAGTGTCTTATTTGGAAGAACAATACTGC

QA 1 231 1 231
DS 

RD RR2G210JQ 451 0 0
GTACATTTACAGTAGGTGTGACTTAGTTATTAGATGATGGAATCTGGTACAAATTGAAAC
AAAAGATTCATGTGAAATACTTCTCAAGTACTTGCTTTTGTGATTCTCCAGTGAAGATTG
AATCACAGGGACATGGTATGGATCTTTAAAGTTGGTTTCCTTTCTTCAGTTACAAGATGA
TCTCGTCTTGAACACTGACGTTGAGTGTCTTATTTGGAAAAACAATACTGCTGGTCACCA
CAACCTCGTCTTCAACTGCAACCGAGTCTCCGAAAATAGTAACTCCTAGTTTGGAGTTGT
AAACTCCCTCAGCCTGGACACGAGACCATCTCCCAATAAAAAATTTCCACCCAACAATTG
CGTTAGTCACCACTGCATTCTCCATGATCTCAACGTTGTCAAGGATGATACAGCTGATGA
GCCTGACACCAGGCCCAACACGAGCATTTGC

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR2GA26JQ 626 0 0
GTACATTTACAGTAGGTGTGACTTAGTTATTAGATGATGGAATCTGGTACAAATTGAAAC
AAAAGATTCATGTGAAATACTTCTCAAGTACTTGCTTTTGTGATTCTCCAGTGAAGATTG
AATCACAGGGACATGGTATGGATCTTTAAAGTTGGTTTCCTTTCTTCAGTTACAAGATGA
TCTCGTCTTGAACACTGACGTTGAGTGTCTTATTTGGAAGAACAATACTGCTGGTCACCA
CAACCTCGTCTTCAACTGCAACCGAGTCTCCGAGAATAGTAACTCCTAGTTTGGAGTTGT
AGACTCCCTCAGCCTGGACACGAGACCATCTCCCAATAGAAGATTTCCACCCAACAATTG
CGTTAGTCACCACTGCATTCTCCATGATCTCAACGTTGTCAAGGATGATACAGCTGATGA
GCCTGACACCAGGCCCAACACGAGCATTTGCAGAGATCGATACGTTGGGACCAATCTTTG
CAGTTGGGTGTATTTTTGCAGAAGGATGTATGTAAACATCACCAATCACTATTGCACTCT
TTGTTCCATCACCACTACTAACCAGCACTTGCGGAGAAGTCAACCGGAACTGGGAAAGAT
ATAGCTCCGAGCACCTCAGTGACATT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2C855JQ 671 0 0
CTTAGTTATTAGATGATGGAATCTGGTACAAATTGAAACAAAAGATTCATGTGAAATACT
CCTCAAGTACTTGCTTTTGTGATTCTCCAGTGAAGATTGAATCACAGGGACATGGTATGG
ATCTTTAAAGTTGGTTTCCTTTCTTCAGTTACAAGATGATCTCGTCTTGAACACTGACGT
TGAGTGTCTTATTTGGAAGAACAATACTGCTGGTCACCACAACCTCGTCTTCAACTGCAA
CCGAGTCTCCGAGAATAGTAACTCCTAGTTTGGAGTTGTAGACTCCCTCAGCCTGGACAC
GAGACCATCTCCCAATAGAAGATTTCCACCCAACAATTGCGTTAGTCACCACTGCATTCT
CCATGATCTCAACGTTGTCAAGGATGATACAGCTGATGAGCCTGACACCAGGCCCAACAC
GAGCATTTGCAGAGATCGATACGTTGGGACCAATCTTTGCAGTTGGGTGTATTTTTGCAG
AAGGATGTATGTAAACATCACCAATCACTATTGCACTCTTTGTTCCATCACCACTACTAG
CCAGCACTTGCGGAGAAGTCAACCGGAACTGGGAAAGATATAGCTCCGAGCACCTCAGTG
ACATTCCAGGAGATTTGATTTGCTCCCAGAAATCCATGGTCTCGTAAGTATATAGCTGCT
TCTTCCCAGCT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL2432Contig1 1024 2 2 U
GGGTAGCTTACCCAAATACAAGAAGATAAACCAATGTCTTCCATGTGAATCCTTCCTTCC
TCGATTCTCATCTTCTGGCTTCTTTGGTGTTAAGAAAAGGAATCTTCCAAAAACGATGTC
GCTTTTGTCGAAGCTACGGTGTATCACAGTAGATGTAACTGGCACGCTCATAGCTTACAA
AGGGGAGCTTGGTGATTACTATTGTATGGCTGCTAAAGCCGTTGGCTTGCCTTGTCCTGA
TTACACACGAGTCCATGAAGGTTTCAAAATTGCTTACACAGACATGGCTCAGAAGTATCC
TAGTTTCGGTTTCTCCAAAATGTCAAACATTGTTTGGTGGAAAACCTGCGTGAGAGATTC
ATTTGTCAAGGCAGGGTATGACTATGATGAGGAGACGTTTGAGAAAGTGTTTAGAAGAAT
CTATTCGGCGTTTGGTTCTGCTGCACCTTACTCTATCTTTCAAGACTCTCGACCTTTCTT
GAGATGGGCACGCGAGAAAGGGCTCATCGTTGGACTCGTTAGCAACGCCGAGTATCGTTA
TCAAGAAGTTATTTTACCAGCCTTAGATTTGAACAAGGGAGAGTGGGACTTCGGTGTGTT
CTCTGGTATGGAAGGGATAGAGAAGCCAGATCCGAGGATATACAAGCTGGCGTTAGAGAG
AGCGGGGAACAACATTGCGCCTGGAGAGGTTCTGCATATTGGAGATAGTATGCGTAAAGA
TTATGTTCCGGCAAAGAGTATTGGGATGCATTCTTTGTTGCTTGATAGGTTTAAGACAGA
AGCTGCTAAAGACTGGAGAGAAGCTGGAGCTGTTGTGCTTCCTGATTTAGTTGCTGTTCA
ACAGCTTTTGGAGTCTGACAAGTTGAAATGTTAATGAAGAGACCTCTCTCTAATGTATTG
TAGTTTGCACATTTTGGCTCTTTCTTCTTATGAGTAAAAAGAGTTTCAAAGGCCTATGAT
TTAATCTAAGTCCAACAAGGTGAAGTTTATAATAGTTTACATGAGTAAGAAAGTACATTT
CTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2AS49TF U 1
AF RR2AS49JQ C 241
BS 1 620 RR2AS49TF
BS 621 1024 RR2AS49JQ

RD RR2AS49TF 620 0 0
GGGTAGCTTACCCAAATACAAGAAGATAAACCAATGTCTTCCATGTGAATCCTTCCTTCC
TCGATTCTCATCTTCTGGCTTCTTTGGTGTTAAGAAAAGGAATCTTCCAAAAACGATGTC
GCTTTTGTCGAAGCTACGGTGTATCACAGTAGATGTAACTGGCACGCTCATAGCTTACAA
AGGGGAGCTTGGTGATTACTATTGTATGGCTGCTAAAGCCGTTGGCTTGCCTTGTCCTGA
TTACACACGAGTCCATGAAGGTTTCAAAATTGCTTACACAGACATGGCTCAGAAGTATCC
TAGTTTCGGTTTCTCCAAAATGTCAAACATTGTTTGGTGGAAAACCTGCGTGAGAGATTC
ATTTGTCAAGGCAGGGTATGACTATGATGAGGAGACGTTTGAGAAAGTGTTTAGAAGAAT
CTATTCGGCGTTTGGTTCTGCTGCACCTTACTCTATCTTTCAAGACTCTCGACCTTTCTT
GAGATGGGCACGCGAGAAAGGGCTCATCGTTGGACTCGTTAGCAACGCCGAGTATCGTTA
TCAAGAAGTTATTTTACCAGCCTTAGATTTGAACAAGGGAGAGTGGGACTTCGGTGTGTT
CTCTGGTATGGAAGGGATAG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2AS49JQ 784 0 0
TTA
CACACGAGTCCATGAAGGTTTCAAAATTGCTTACACAGACATGGCTCAGAAGTATCCTAG
TTTCGGTTTCTCCAAAATGTCAAACATTGTTTGGTGGAAAACCTGCGTGAGAGATTCATT
TGTCAAGGCAGGGTATGACTATGATGAGGAGACGTTTGAGAAAGTGTTTAGAAGAATCTA
TTCGGCGTTTGGTTCTGCTGCACCTTACTCTATCTTTCAAGACTCTCGACCTTTCTTGAG
ATGGGCACGCGAGAAAGGGCTCATCGTTGGACTCGTTAGCAACGCCGAGTATCGTTATCA
AGAAGTTATTTTACCAGCCTTAGATTTGAACAAGGGAGAGTGGGACTTCGGTGTGTTCTC
TGGTATGGAAGGGATAGAGAAGCCAGATCCGAGGATATACAAGCTGGCGTTAGAGAGAGC
GGGGAACAACATTGCGCCTGGAGAGGTTCTGCATATTGGAGATAGTATGCGTAAAGATTA
TGTTCCGGCAAAGAGTATTGGGATGCATTCTTTGTTGCTTGATAGGTTTAAGACAGAAGC
TGCTAAAGACTGGAGAGAAGCTGGAGCTGTTGTGCTTCCTGATTTAGTTGCTGTTCAACA
GCTTTTGGAGTCTGACAAGTTGAAATGTTAATGAAGAGACCTCTCTCTAATGTATTGTAG
TTTGCACATTTTGGCTCTTTCTTCTTATGAGTAAAAAGAGTTTCAAAGGCCTATGATTTA
ATCTAAGTCCAACAAGGTGAAGTTTATAATAGTTTACATGAGTAAGAAAGTACATTTCTC
C

QA 4 784 4 784
DS 



AS 1 4

CO CL2433Contig1 906 4 2 U
GCTTCTCGGTCGAGGAAGACGGCATCTTCGCTGATGACGACGCTCCTCCTCCTCCCCCGC
GGAGGGAGCAATCCTTCTCTTCTGACCTCAAGCTCTTCGTTGGTAACCTTCCCTTCAACG
TCGACAGCGCTCAGCTCGCTCAGCTCTTCGAGAGCGCCGGGAACGTCGAGATGGTTGAGG
TAATCTACGACAAGGTGACAGGAAGAAGCAGAGGATTTGGGTTTGTGACTATGTCTTCAG
CTTCTGAAGTCGAGACAGCTGAACAGCAGTTCGATGGTTATGAGTTGGATGGTAGACAGT
TGAGAGTTAATGCGGGCCCTCCTCCACCGAAGAGGGAAGACTCCTTCTCCAGAGGACCTA
GAAGCAGCTTTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTTCTGGTGCTGGTTCGGGAAACCGTG
TTTATGTGGGTAATCTCTCGTGGGGTGTCGATGACATGGCTCTCGAGAGTTTGTTTGGGG
AGCAAGGGAAGGTTGTTGAGGCTAGAGTCATCTACGACAGGGACAGTGGTCGTTCCAAGG
GGTTTGGGTTTGTGACGTACAACTCTGCTCAAGAGGTTCAGAATGCTATCAGAACCTTGG
ATGGTGCTGATTTGGATGGGAGACAGATTAGAGTCTCTGAAGCTGAGGCTAGGCCTCCAA
GGCGCCAGTTTTGAGCACCTCTTCGTTATTCTCAAAAACGCATGTTGTGGTGGAGGGCGC
TTTGAAGCAGTTTTGTGTCAGAGGATGGTGGCAGTTTCGGACCTTACTTATGTGTTGTTG
TGCCTTGGATGAACGGATGGTCTTATGTTTGAGAAATCTTATATATTAAAATAGTAATCA
TGATTTATTTCATGTGTTGACATTTTATTTTGGATCATCACTTTTAATTATTGTATCATT
TAGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 

AF RR2GJ20TF U 1
AF RR2FY10TF U 1
AF RR2GJ20JQB C 217
AF RR2FY10JQ C 263
BS 1 647 RR2FY10TF
BS 648 906 RR2GJ20JQB

RD RR2GJ20TF 579 0 0
GCTTCTCGGTCGAGGAAGACGGCATCTTCGCTGATGACGACGCTCCTCCTCCTCCCCCGC
GGAGGGAGCAATCCTTCTCTTCTGACCTCAAGCTCTTCGTTGGTAACCTTCCCTTCAACG
TCGACAGCGCTCAGCTCGCTCAGCTCTTCGAGAGCGCCGGGAACGTCGAGATGGTTGAGG
TAATCTACGACAAGGTGACAGGAAGAAGCAGAGGATTTGGGTTTGTGACTATGTCTTCAG
CTTCTGAAGTCGAGACAGCTGAACAGCAGTTCGATGGTTATGAGTTGGATGGTAGACAGT
TGAGAGTTAATGCGGGCCCTCCTCCACCGAAGAGGGAAGACTCCTTCTCCAGAGGACCTA
GAAGCAGCTTTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTTCTGGTGCTGGTTCGGGAAACCGTG
TTTATGTGGGTAATCTCTCGTGGGGTGTCGATGACATGGCTCTCGAGAGTTTGTTTGGGG
AGCAAGGGAAGGTTGTTGAGGCTAGAGTCATCTACGACAGGGACAGTGGTCGTTCCAAAG
GGTTTGGGTT*GTGACGTACAACTCTGCTCAAGAG
TTCA

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2FY10TF 648 0 0
GCTTCTCGGTCGAGGAAGACGGCATCTTCGCTGATGACGACGCTCCTCCTCCTCCCCCGC
GGAGGGAGCAATCCTTCTCTTCTGACCTCAAGCTCTTCGTTGGTAACCTTCCCTTCAACG
TCGACAGCGCTCAGCTCGCTCAGCTCTTCGAGAGCGCCGGGAACGTCGAGATGGTTGAGG
TAATCTACGACAAGGTGACAGGAAGAAGCAGAGGATTTGGGTTTGTGACTATGTCTTCAG
CTTCTGAAGTCGAGACAGCTGAACAGCAGTTCGATGGTTATGAGTTGGATGGTAGACAGT
TGAGAGTTAATGCGGGCCCTCCTCCACCGAAGAGGGAAGACTCCTTCTCCAGAGGACCTA
GAAGCAGCTTTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTTCTGGTGCTGGTTCGGGAAACCGTG
TTTATGTGGGTAATCTCTCGTGGGGTGTCGATGACATGGCTCTCGAGAGTTTGTTTGGGG
AGCAAGGGAAGGTTGTTGAGGCTAGAGTCATCTACGACAGGGACAGTGGTCGTTCCAAGG
GGTTTGGGTTTGTGACGTACAACTCTGCTCAAGAGGTTCAGAATGCTATCAGAACCTTGG
ATGGTGCTGATTTGGATGGGAGACAGATTAGAGTCTCTGAAGCTGAG
C

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2GJ20JQB 690 0 0
TTGGGTTTGTGACTATGTCTTCAGCTTCTGAAGTCGAGACAGCTGAACAGCAGTTCGATG
GTTATGAGTTGGATGGTAGACAGTTGAGAGTTAATGCGGGCCCTCCTCCACCGAAGAGGG
AAGACTCCTTCTCCAGAGGACCTAGAAGCAGCTTTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTT
CTGGTGCTGGTTCGGGAAACCGTGTTTATGTGGGTAATCTCTCGTGGGGTGTCGATGACA
TGGCTCTCGAGAGTTTGTTTGGGGAGCAAGGGAAGGTTGTTGAGGCTAGAGTCATCTACG
ACAGGGACAGTGGTCGTTCCAAGGGGTTTGGGTTTGTGACGTACAACTCTGCTCAAGAGG
TTCAGAATGCTATCAGAACCTTGGATGGTGCTGATTTGGATGGGAGACAGATTAGAGTCT
CTGAAGCTGAGGCTAGGCCTCCAAGGCGCCAGTTTTGAGCACCTCTTCGTTATTCTCAAA
AACGCATGTTGTGGTGGAGGGCGCTTTGAAGCAGTTTTGTGTCAGAGGATGGTGGCAGTT
TCGGACCTTACTTATGTGTTGTTGTGCCTTGGATGAACGGATGGTCTTATGTTTGAGAAA
TCTTATATATTAAAATAGTAATCATGATTTATTTCATGTGTTGACATTTTATTTTGGATC
ATCACTTTTAATTATTGTATCATTTAGTTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2FY10JQ 644 0 0
ACAGCAGTTCGATGGTTATGAGTTGGATGGTAGACAGTTGAGAGTTAATGCGGGCCCTCC
TCCACCGAAGAGGGAAGACTCCTTCTCCAGAGGACCTAGAAGCAGCTTTGGAGGTGGAGG
TGGAGGTGGAGGTTCTGGTGCTGGTTCGGGAAACCGTGTTTATGTGGGTAATCTCTCGTG
GGGTGTCGATGACATGGCTCTCGAGAGTTTGTTTGGGGAGCAAGGGAAGGTTGTTGAGGC
TAGAGTCATCTACGACAGGGACAGTGGTCGTTCCAAGGGGTTTGGGTTTGTGACGTACAA
CTCTGCTCAAGAGGTTCAGAATGCTATCAGAACCTTGGATGGTGCTGATTTGGATGGGAG
ACAGATTAGAGTCTCTGAAGCTGAGGCTAGGCCTCCAAGGCGCCAGTTTTGAGCACCTCT
TCGTTATTCTCAAAAACGCATGTTGTGGTGGAGGGCGCTTTGAAGCAGTTTTGTGTCAGA
GGATGGTGGCAGTTTCGGACCTTACTTATGTGTTGTTGTGCCTTGGATGAACGGATGGTC
TTATGTTTGAGAAATCTTATATATTAAAATAGTAATCATGATTTATTTCATGTGTTGACA
TTTTATTTTGGATCATCACTTTTAATTATTGTATCATTTAGTTT

QA 1 644 1 644
DS 



AS 2 4

CO CL2434Contig1 938 2 2 U
GGAACTCTCGTCACCTGTCTCTTACCTCTACTCTAGGGCTCTCAACCTTCCCTCTCTCTG
ATCCGTTTTCCTCTCCAAGCTCAGGTAAAAAAAAGATGCAAGCTGTGATTCGTTCGTTCG
TGTCCGGTGGAATCGTTGTCAGATCGTCTCTGCTGCAGCATCTCCGTGTGATCAACCCTG
CGATTCAACCTTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACCCAGCCTGCTCGTATGG
AGGAGCATGGATTCAAGAGCACTACCATATCTGATGTTATGAACGCTAAAGGCAAAAGCG
CTGATGGATCTTGGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTCTACGATGCTGTTAAATCCA
TGACGCAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAATCTCTTG
CTGGTATAATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATTATAGTGCAAGGTAGATCATCCA
AATCAACGAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAG
AGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCAGGCACATTCCGG
TGATCAAAGACAAGGGTATGATAGGAATGGTGTCCATAGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGG
TGACTGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCCTAAATGCCTTTATTCAGGGAGGTTACTAGA
CGCTAGCTACCCTTTGCGTGTGGTGGTTGTTGATGAATCTCGAAAGCTTTTAAGATGTAT
GTATATATATGGAGTCTTGGTTGTTTGTCTCATGTTTGTTTGTTGTTTCTAAATCTGCTG
TTTCAATTGGTTAACTTGTCAAGACTAAGCTCTTGTGCTTTCCCTTTTTTTTTATGCTGC
TACTTCTGCAAGATAATAAAACCAAAGACTCCCCATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG83TF U 1
AF RR2AG83JQ C 194
BS 1 690 RR2AG83TF
BS 691 938 RR2AG83JQ

RD RR2AG83TF 690 0 0
GGAACTCTCGTCACCTGTCTCTTACCTCTACTCTAGGGCTCTCAACCTTCCCTCTCTCTG
ATCCGTTTTCCTCTCCAAGCTCAGGTAAAAAAAAGATGCAAGCTGTGATTCGTTCGTTCG
TGTCCGGTGGAATCGTTGTCAGATCGTCTCTGCTGCAGCATCTCCGTGTGATCAACCCTG
CGATTCAACCTTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACCCAGCCTGCTCGTATGG
AGGAGCATGGATTCAAGAGCACTACCATATCTGATGTTATGAACGCTAAAGGCAAAAGCG
CTGATGGATCTTGGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTCTACGATGCTGTTAAATCCA
TGACGCAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAATCTCTTG
CTGGTATAATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATTATAGTGCAAGGTAGATCATCCA
AATCAACGAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAG
AGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCAGGCACATTCCGG
TGATCAAAGACAAGGGTATGATAGGAATGGTGTCCATAGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGG
TGACTGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2AG83JQ 745 0 0
TGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACCCAGCCTGCTCGTATGGAGGAGCATGGATT
CAAGAGCACTACCATATCTGATGTTATGAACGCTAAAGGCAAAAGCGCTGATGGATCTTG
GCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTCTACGATGCTGTTAAATCCATGACGCAACACAA
TGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAATCTCTTGCTGGTATAATTAC
AGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATTATAGTGCAAGGTAGATCATCCAAATCAACGAAAGT
AGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTT
GGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCAGGCACATTCCGGTGATCAAAGACAA
GGGTATGATAGGAATGGTGTCCATAGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACTGAGCATCG
TGAGGAGCTTAACCGCCTAAATGCCTTTATTCAGGGAGGTTACTAGACGCTAGCTACCCT
TTGCGTGTGGTGGTTGTTGATGAATCTCGAAAGCTTTTAAGATGTATGTATATATATGGA
GTCTTGGTTGTTTGTCTCATGTTTGTTTGTTGTTTCTAAATCTGCTGTTTCAATTGGTTA
ACTTGTCAAGACTAAGCTCTTGTGCTTTCCCTTTTTTTTTATGCTGCTACTTCTGCAAGA
TAATAAAACCAAAGACTCCCCATCT

QA 1 745 1 745
DS 



CO CL2434Contig2 945 2 6 U
GGACTCCACTCAACTCTCGTCACCTGTCTCTTACCTCTACTCTTGGGCTCTCAACCTTTC
CCTCTTTGATCCGTTTTCTTCTCCAACCTCAGGCAAAAAAAGATGCAAGCTGTGATTCGT
TCGTTCGTGTCCGGTGGAAATGTTGTCAGATCGTCTCTGCTACAACATCTCCGTGTGATC
AACCCTGCGATTCAGCCTTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACTCAGCCTGCT
CGTATGGAGGAGCATGGATTCGAGAGCACGACCATATCTGATGTTATGAACGCTAAAGGC
AAAAGCGCTGATGGATCTTGGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTCTACGATGCTGTT
AAATCCATGACACAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAA
TCTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGTAGA
TCATCCAAATCAACGAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTG
ACACCAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCAGGCAC
ATTCCGGTGATCAAAGACAAGGGTATGATAGGAATGGTGTCCATAGGAGATGTGCTCCGT
GCAGTGGTGACTGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCCTAAATGCCTTTATTCAGGGAGGT
TACTAGACGCTACTCTTTGCGTGTGGTGGTTTGATGAATCTCGAAAGCTTTTATGATGTA
TGTATATATATGGAGTCTTGGTTGTTTGCTGATGTTTGTTTGTTGTTTTCAAATCTGCTG
TTTCAATTGGTTAACTTGTCAAGACTAAGCTCTTGTGCTTTCCCTTTTTTTTATGCTGCT
ACTTCTGCAAGATAATAAAACCAAAGACTCCCCATCTCTTTATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ76TF U 1
AF RR2GZ76JQ C 144
BS 1 622 RR2GZ76TF
BS 623 623 RR2GZ76JQ
BS 624 646 RR2GZ76TF
BS 647 647 RR2GZ76JQ
BS 648 704 RR2GZ76TF
BS 705 945 RR2GZ76JQ

RD RR2GZ76TF 709 0 0
GGACTCCACTCAACTCTCGTCACCTGTCTCTTACCTCTACTCTTGGGCTCTCAACCTTTC
CCTCTTTGATCCGTTTTCTTCTCCAACCTCAGGCAAAAAAAGATGCAAGCTGTGATTCGT
TCGTTCGTGTCCGGTGGAAATGTTGTCAGATCGTCTCTGCTACAACATCTCCGTGTGATC
AACCCTGCGATTCAGCCTTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACTCAGCCTGCT
CGTATGGAGGAGCATGGATTCGAGAGCACGACCATATCTGATGTTATGAACGCTAAAGGC
AAAAGCGCTGATGGATCTTGGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTCTACGATGCTGTT
AAATCCATGACACAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAA
TCTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGTAGA
TCATCCAAATCAACGAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTG
ACACCAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCAGGCAC
ATTCCGGTGATCAAAGACAAGG*TATGATAGGAATGGTGTCCATAG*AGATGTGCTCCGT
GCAGTGGTGACTGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCCTAAATGC
TTATT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2GZ76JQ 802 0 0
TGTCAGATCGTCTCTGCTACAACATCTCCGTGTGATCAACC*TGCGATTCAGC*TTCTGT
GTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACTCAGCCTGCTCGTATGGAGGAGCATGGATTCGA
GAGCACGACCATATCTGATGTTATGAACGCTAAAGGCAAAAGCGCTGATGGATCTTGGCT
TTGGTGTACCACTGATGACACTGTCTACGATGCTGTTAAATCCATGACACAACACAATGT
TGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAATCTCTTGCTGGTATCATTACAGA
GAGAGATTATCTGCGAAAGATCATAGTGCAAGGTAGATCATCCAAATCAACGAAAGTAGG
AGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTTGGT
CGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCAGGCACATTCCGGTGATCAAAGACAAGGG
TATGATAGGAATGGTGTCCATAGGAGATGTGCTCCGTGCAGTGGTGACTGAGCATCGTGA
GGAGCTTAACCGCCTAAATGCCTTTATTCAGGGAGGTTACTAGACGCTACTCTTTGCGTG
TGGTGGTTTGATGAATCTCGAAAGCTTTTATGATGTATGTATATATATGGAGTCTTGGTT
GTTTGCTGATGTTTGTTTGTTGTTTTCAAATCTGCTGTTTCAATTGGTTAACTTGTCAAG
ACTAAGCTCTTGTGCTTTCCCTTTTTTTTATGCTGCTACTTCTGCAAGATAATAAAACCA
AAGACTCCCCATCTCTTTATGG

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL2435Contig1 1033 2 2 U
TTTTTTTAACAATGGCTTCTTGTGTTGTGACGACGACAAGCAGTTTCTGTACTCTTTCAA
ATTTTTCTAGCATTCGTTTGAAGTCCTCCAAGCTTGTCCCTCTGAGTAATCAGCAGCAGA
GAAGACGCTCTCTTCGGTCAAGAGGTGGTTTAAAGGTTGAAGCTTACTATGGTCTGAAGA
CCTCTCCTTATCCTCTTGATGCTTTGGAACCGTATATGAGTCAGAGAACACTAGAAGTGC
ATTGGGGTAAACACCACCGAGGCTATGTGGACAATCTTAATAAACAGTTAGGGAAAGACG
ATAAACTCTATGGATACACCATGGAAGAGCTTATCAAGGCCACATACAACAACGGGAATC
CTTTGCCTGAGTTCAACAACGCTGCGCAGGTCTATAACCATGATTTCTTCTGGGAGTCGA
TGCAACCTGGTGGTGGAGACATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTGAGCAGATTGAGAAAGATT
TTGGGTCGTTTACGAATTTCAGAGAGAAGTTCACTAATGCGGCTCTTACTCAGTTTGGTT
CTGGCTGGGTCTGGCTTGTTTTGAAGAGAGAAGAGAGAAGACTTGAAGTGGTCAAAACCT
CAAACGCCATTAACCCACTAGTGTGGGACGATATTCCAATCATCTGCTTGGATGTGTGGG
AGCACTCTTATTATCTGGACTACAAGAACGAGAGGGCTAGGTACATAAACACGTTTCTGA
ACCATTTGGTGTCGTGGAACGCTGCAATGAGTAGGATGGCCCGTGCTGAGGCGTTTGTGA
ACCTTGGTGAACCCAACATCCCAGTTGCCTAAGCTAATAAAAGAAGAACTCTTTCTCGAG
AGTCCATGTGAAAGCGTATCCTGGACAGCTTGAGCAGTCTCATTTTTGCAACAGGGGTCC
CAAACAAGAAACAATTGCTGCTTCTTCCCTCATGTGACCCATCTTTTTGTCATGTGTAGT
TGAGAGAGTCTAATATAACATAGACTTGTTTGTTTGTTATATCCCAAAACGATTTTGCTA
GTGTTAAAATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV19TF U 1
AF RR2EV19JQ C 371
BS 1 670 RR2EV19TF
BS 671 1033 RR2EV19JQ

RD RR2EV19TF 672 0 0
TTTTTTTAACAATGGCTTCTTGTGTTGTGACGACGACAAGCAGTTTCTGTACTCTTTCAA
ATTTTTCTAGCATTCGTTTGAAGTCCTCCAAGCTTGTCCCTCTGAGTAATCAGCAGCAGA
GAAGACGCTCTCTTCGGTCAAGAGGTGGTTTAAAGGTTGAAGCTTACTATGGTCTGAAGA
CCTCTCCTTATCCTCTTGATGCTTTGGAACCGTATATGAGTCAGAGAACACTAGAAGTGC
ATTGGGGTAAACACCACCGAGGCTATGTGGACAATCTTAATAAACAGTTAGGGAAAGACG
ATAAACTCTATGGATACACCATGGAAGAGCTTATCAAGGCCACATACAACAACGGGAATC
CTTTGCCTGAGTTCAACAACGCTGCGCAGGTCTATAACCATGATTTCTTCTGGGAGTCGA
TGCAACCTGGTGGTGGAGACATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTGAGCAGATTGAGAAAGATT
TTGGGTCGTTTACGAATTTCAGAGAGAAGTTCACTAATGCGGCTCTTACTCAGTTTGGTT
CTGGCTGGGTCTGGCTTGTTTTGAAGAGAGAAGAGAGAAGACTTGAAGTGGTCAAAACCT
CAAACGCCATTAACCCACTAGTGTGGGACGATATTCCAATCATCTGCTTGGATGTGTGGG
AGCACTCTTA
TT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2EV19JQ 663 0 0
GTTCAACAACGCTGCGCAGGTCTATAACCATGATTTCTTCTGGGAGTCGATGCAACCTGG
TGGTGGAGACATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTGAGCAGATTGAGAAAGATTTTGGGTCGTT
TACGAATTTCAGAGAGAAGTTCACTAATGCGGCTCTTACTCAGTTTGGTTCTGGCTGGGT
CTGGCTTGTTTTGAAGAGAGAAGAGAGAAGACTTGAAGTGGTCAAAACCTCAAACGCCAT
TAACCCACTAGTGTGGGACGATATTCCAATCATCTGCTTGGATGTGTGGGAGCACTCTTA
TTATCTGGACTACAAGAACGAGAGGGCTAGGTACATAAACACGTTTCTGAACCATTTGGT
GTCGTGGAACGCTGCAATGAGTAGGATGGCCCGTGCTGAGGCGTTTGTGAACCTTGGTGA
ACCCAACATCCCAGTTGCCTAAGCTAATAAAAGAAGAACTCTTTCTCGAGAGTCCATGTG
AAAGCGTATCCTGGACAGCTTGAGCAGTCTCATTTTTGCAACAGGGGTCCCAAACAAGAA
ACAATTGCTGCTTCTTCCCTCATGTGACCCATCTTTTTGTCATGTGTAGTTGAGAGAGTC
TAATATAACATAGACTTGTTTGTTTGTTATATCCCAAAACGATTTTGCTAGTGTTAAAAT
TGC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 4

CO CL2436Contig1 822 4 24 U
GATCTCTCCGGCTGGAAACATTCAGAAGACTAGTCCTGCTGCAAAGTTTTTAATGGACCG
TGGCGTGAGTCAAACTGACTTCAACTCGTATGGAAGCCGTAGGGGAAACGATGAAGTGAT
GGCTCGTGGTACCTTTGCCAACATTCGTCTTGTTAACAAGCTCTTGAAAGGAGAAGTTGG
TCCCAAGACTGTTCACGTTCCAACTGGTGAAAAACTTAGCGTTTTTGATGCAGCAAGTAG
ATACATGAACGCTGGACAGGATACGGTTATCCTGGCTGGTGCTGAGTATGGAAGTGGTAG
CTCTAGGGATTGGGCTGCAAAGGGTCCTTTGCTTTTGGGAGTGAAAGCTGTGATTTCAAA
GAGCTTTGAGAGAATCCACCGCAGCAACTTGGCTGGTATGGGGATCATTCCTCTGTGTTT
CAAGGCCGGGGAGGACGCAGACACTCTTGGACTGACTGGTCATGAACGCTACACAGTCCA
TCTTCCTACCAAAGTCAGTGACATTAAGCCTGGTCAAGACGTCACTGTGACC*ACTGACA
CTGGCAAATCCTTTGTTTGCACTCTTCGGTTTGATACAGAGG*TGGAACTGGCATACTAT
GACCATGGTGGTATTCTTCCCTACGTCATTCGAAGCTTGAGCGCCAAGTGATCAAAGTTT
TTCTCAAGTTTTTGTCTTTTTTTTTT*AAGAGTTTCCTTAGTTCCAAATAAAAGCAAATT
TTGTGAGCAACTTTTATTCTTTCAGGTTACACTGAACCGTTTTCAGACAAAGAGTTGTTT
ACGGAAACACTTCATTACATTATATAACATTGGTTTTGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GN68TF U 1
AF RR2ED34JQ C 267
AF RR2ED34TF U 267
AF RR2GN68JQ C 503
BS 1 273 RR2GN68TF
BS 274 274 RR2ED34TF
BS 275 285 RR2GN68TF
BS 286 286 RR2ED34TF
BS 287 355 RR2GN68TF
BS 356 356 RR2ED34TF
BS 357 402 RR2GN68TF
BS 403 403 RR2ED34TF
BS 404 414 RR2GN68TF
BS 415 415 RR2ED34TF
BS 416 453 RR2GN68TF
BS 454 454 RR2ED34TF
BS 455 474 RR2GN68TF
BS 475 475 RR2ED34TF
BS 476 490 RR2GN68TF
BS 491 491 RR2ED34TF
BS 492 506 RR2GN68TF
BS 507 507 RR2ED34TF
BS 508 649 RR2GN68TF
BS 650 650 RR2ED34TF
BS 651 745 RR2GN68TF
BS 746 746 RR2ED34TF
BS 747 757 RR2GN68TF
BS 758 822 RR2ED34TF

RD RR2GN68TF 757 0 0
GATCTCTCCGGCTGGAAACATTCAGAAGACTAGTCCTGCTGCAAAGTTTTTAATGGACCG
TGGCGTGAGTCAAACTGACTTCAACTCGTATGGAAGCCGTAGGGGAAACGATGAAGTGAT
GGCTCGTGGTACCTTTGCCAACATTCGTCTTGTTAACAAGCTCTTGAAAGGAGAAGTTGG
TCCCAAGACTGTTCACGTTCCAACTGGTGAAAAACTTAGCGTTTTTGATGCAGCAAGTAG
ATACATGAACGCTGGACAGGATACGGTTATCCTTGCTGGTGCTGAATATGGAAGTGGTAG
CTCTAGGGATTGGGCTGCAAAGGGTCCTTTGCTTTTGGGAGTGAAAGCTGTGATTGCAAA
GAGCTTTGAGAGAATCCACCGCAGCAACTTGGCTGGTATGGGAATCATTCCTCTATGTTT
CAAGGCCGGGGAGGACGCAGACACTCTTGGACTCACTGGTCATGAACGCTACACGGTCCA
TCTTCCTACCGAAGTCAGTGACATTAGGCCTGGTCAAGACGTCACTGTGACC*ACTGACA
CTGGCAAATCCTTTGTTTGCACTCTTCGGTTTGATACAGAGG*TGGAACTGGCATACTAT
GACCATGGTGGTATTCTTCCCTACGTCATTCGAAGCTTGAGCGCCAAGT*ATCAAAGTTT
TTCTCAAGTTTTTGTCTTTTTTTTTT*AAGAGTTTCCTTAGTTCCAAATAAAAGCAAATT
TTGTGAGCAACTTTTATTCTTTCAG*TTACACTGAAC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2ED34JQ 556 0 0
GG
ATCCTGGCTGGTGCTGAGTATGGAAGTGGTAGCTCTAGGGATTGGGCTGCAAAGGGTCCT
TTGCTTTTGGGAGTGAAAGCTGTGATTTCAAAGAGCTTTGAGAGAATCCACCGCAGCAAC
TTGGCTGGTATGGGGATCATTCCTCTGTGTTTCAAGGCCGGGGAGGACGCAGACACTCTT
GGACTGACTGGTCATGAACGCTACACAGTCCATCTTCCTACCAAAGTCAGTGACATTAAG
CCTGGTCAAGACGTCACTGTGACC*ACTGACACTGGCAAATCCTTTGTTTGCACTCTTCG
GTTTGATACAGAGG*TGGAACTGGCATACTATGACCATGGTGGTATTCTTCCCTACGTCA
TTCGAAGCTTGAGCGCCAAGTGATCAAAGTTTTTCTCAAGTTTTTGTCTTTTTTTTT**A
AGAGTTTCTTTAGTTCCAAATAAAAGCAAATTTTGTGAGCAACTTTTATTCTTTCAGGTT
ACACTGAACCGTTTTCAGACAAAGAGTTGTTTACGGAAACACTTCATTACATTATATAAC
ATTGGTTTTGTACC

QA 3 556 3 556
DS 

RD RR2ED34TF 556 0 0
GG
ATCCTGGCTGGTGCTGAGTATGGAAGTGGTAGCTCTAGGGATTGGGCTGCAAAGGGTCCT
TTGCTTTTGGGAGTGAAAGCTGTGATTTCAAAGAGCTTTGAGAGAATCCACCGCAGCAAC
TTGGCTGGTATGGGGATCATTCCTCTGTGTTTCAAGGCCGGGGAGGACGCAGACACTCTT
GGACTGACTGGTCATGAACGCTACACAGTCCATCTTCCTACCAAAGTCAGTGACATTAAG
CCTGGTCAAGACGTCACTGTGACC*ACTGACACTGGCAAATCCTTTGTTTGCACTCTTCG
GTTTGATACAGAGG*TGGAACTGGCATACTATGACCATGGTGGTATTCTTCCCTACGTCA
TTCGAAGCTTGAGCGCCAAGTGATCAAAGTTTTTCTCAAGTTTTTGTCTTTTTTTTT**A
AGAGTTTCCTTAGTTCCAAATAAAAGCAAATTTTGTGAGCAACTTTTATTCTTTCAGGTT
ACACTGAACCGTTTTCAGACAAAGAGTTGTTTACGGAAACACTTCATTACATTATATAAC
ATTGGTTTTGTACC

QA 3 556 3 556
DS 

RD RR2GN68JQ 303 0 0
ATTAGGCCTGGTCAAGACGTCACTGTGACCCACTGACACTGGCAAATCCTTTGTTTGCAC
TCTTCGGTTTGATACAGAGGGTGGAACTGGCATACTATGACCATGGTGGTATTCTTCCCT
ACGTCATTCGAAGCTTGAGCGCCAAGT*ATCAAAGTTTTTCTCAAGTTTTTGTCTTTTTT
TTTTTAAGAGTTTCCTTAGTTCCAAATAAAAGCAAATTTTGTGAGCAACTTTTATTCTTT
CAGGTTACACTGAACCGTTTTCAGACAAAGAGTTGTTTACGGAAACACTTCATTACATTA
TAT

QA 1 303 1 303
DS 



AS 1 4

CO CL2437Contig1 1215 4 14 U
GCAATGAATGAATGAAATTTTCATACAAAAGTGGAGATTCAAAAATCTATAGTATACAAT
CTGAATTCAATCGCAAAATAGTCACAAATTTATCATTTCTTCATGCTGGACCGATGACCT
AATCGGTCAAGAAGAGACTACGTCGTCGAGACACATTCCGGTTAGCTCCAAATCGGAAAC
TCATCATTAGTTTAACACTCACTTCCCTCCTAATCAATTAATGTAATAATTACAAGTCAT
TTATTACTTGCGTCACACACAATCACACGACTGTTACAGCTGCATGACGGCCCATACCAG
TGGACAAACTACCAACCAGACCATCGTAGTTCAACATAGAAACCCTAGGCTTTACCCGCG
GCACCCAATTCTCCGGCTCTGTTGTCTCTGAGACCGCCGCTTCCAAGGAGTTCGATCTAT
CGCACGTGCCAAGCCACTTGGCTTGCATGTACTTGTGTTTTCTCCATGGTCCCATATGCA
TTTTATTGTCTCTTAGACATTTTTTCCCCGCGGTGCATAATATCTTGATCAAAGATCGGA
GCCTATCGGTTTTTCCGACGTAAACCTCCGGCAATCGGCTGATAAGCCTTTTGTACTCTT
CACCGCCTTTTGCAATCTCGAACTCTGCCCTGAATGATAACTCGACCACGACTCGCATCT
CGCCTTTCTTGGAATCAGATCGGTCCACGATCTCTATGTATTCGTGTTCCCCTGCGGGGA
TGTCTTGAGAGCTTCTCCATTTGGATTTGGAGATGACGCAGTCGTAGCCGGCCACATCTC
GGAGGTGTCGAGAGATTTCTCCACGTAAGCAGCTCCGGCAACCGCCAGCAACAGGTCGCT
GGCAGACACAATGAAGACCCTTTGATGTAACTTGTTTCAAAGCTTCCTTTGTCGCTTGTC
TAATCTTTGTCTCAATCGAACTTGTTCTATACAGTGTCCCCTGGAGAAGTTGTTCTTGTT
CCTGCCAGAAAACTTTGTTTTCTTCAGAATTGCAATTACTATTGTCGTCGACGTTTTCTA
TATCTGAGCCGCCGTTGAGGTTGAAGTCTTCCGGTGACTGGTTTCCTTCATCGAGGAAGC
CGAAGAGAACGTCGTCAGAGCTAGCCATTCCATCGAGAAATCTCATGATGTCATCGGAAC
TTTGCCGATCCATCTGTTTAAAAGTTTAAAGAATAGGAGGAAAAGAAATGTATTTTTTGT
TTGTATTTATTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ25JQ U 1
AF RR2AV56JQ U 36
AF RR2FQ25TF C 349
AF RR2AV56TF C 572
BS 1 130 RR2FQ25JQ
BS 131 133 RR2AV56JQ
BS 134 179 RR2FQ25JQ
BS 180 180 RR2AV56JQ
BS 181 222 RR2FQ25JQ
BS 223 223 RR2AV56JQ
BS 224 391 RR2FQ25JQ
BS 392 392 RR2AV56JQ
BS 393 634 RR2FQ25JQ
BS 635 780 RR2AV56JQ
BS 781 803 RR2FQ25TF
BS 804 804 RR2AV56TF
BS 805 1093 RR2FQ25TF
BS 1094 1215 RR2AV56TF

RD RR2FQ25JQ 634 0 0
GCAATGAATGAATGAAATTTTCATACAAAAGTGGAGATTCAAAAATCTATAGTATACAAT
CTGAATTCAATCGCAAAATAGTCACAAATTTATCATTTCTTCATGCTGGACCGATGACCT
AATCGGTCAA***GAGACTACGTCGTCGAGACACATTCCGGTTAGCTCCAAATCGGAAAT
TCATCATTAGTTTAACACTCACTTCCCTCCTAATCAATTAATTTAATAATTACAAGTCAT
TTATTACTTGCGTCACACACAATCACACGACTGTTACAGCTGCATGACGGCCCATACCAG
TGGACAAACTACCAACCAGACCATCGTAGTTCAACATAGAAACCCTAGGCTTTACCCGCG
GCACCCAATTCTCCGGCTCTGTTGTCTCTGAAACCGCCGCTTCCAAGGAGTTCGATCTAT
CGCACGTGCCAAGCCACTTGGCTTGCATGTACTTGTGTTTTCTCCATGGTCCCATATGCA
TTTTATTGTCTCTTAGACATTTTTTCCCCGCGGTGCATAATATCTTGATCAAAGATCGGA
GCCTATCGGTTTTTCCGACGTAAACCTCCGGCAATCGGCTGATAAGCCTTTTGTACTCTT
CACCGCCTTTTGCAATCTCGAACTCTGCCCTGAA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2AV56JQ 745 0 0
GATTCAAAAATCTATAGTATACAATCTGAATTCAATCGCAAAATAGTCACAAATTTATCA
TTTCTTCATGCTGGACCGATGACCTAATCGGTCAAGAAGAGACTACGTCGTTGAGACACA
TTCCGGTTAGCTCCAAATCGGAAACTCATCATTAGTTTAACACTCACTTCCCTCCTAATC
AATTAATGTAATAATTACAAGTCATTTATTACTTGCGTCACACACAATCACACGACTGTT
ACAGCTGCATGACGGCCCATACCAGTGGGCAAACTACCAACCAGACCATCGTAGTTCAAC
ATAGAAACCCTAGGCTTTGCCCGCGGCACCCAATTCTCCGCCTCTGTTGTCTCTGAGACC
GTCGCTTCCAAGGAGTTCGATCTATCGCACGTGCCAAGCCACTTGGCTTGCATGTACTTG
TGTTTTCTCCATGGTCCCATATGCATTTTATTGTCTCTTAGACATTTTTTCCCCGCGGTG
CATAATATCTTGATCAAAGATCGGAGCCTATCGGTTTTTCCGACGTAAACCTCCGGCAAT
CGGCTGATAAGCCTTTTGTACTCTTCACCGCCTTTTGCGATCTCGAACTCTGCCCTGAAT
GATAACTCGACCACGACTCGCATCTCGCCTTTCTTGGAATCAGATCGGTCCACGATCTCT
ATGTATTCGTGTTCCCCTGCGGGGATGTCTTGAGAGCTTCTCCATTTGGATTTGGAGATG
ACGCAGTCGTAGCCGGCCACATCTC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2FQ25TF 746 0 0
GCTTTACCCGCGGCACCCAATTCTC*GGCTCTGTTGTCTCTGAGACCGCCGCTTCCAAGG
AGTTCGATCTATCGCACGTGCCAAGCCACTTGGCTTGCATGTACTTGTGTTTTCTCCATG
GTCCCATATGCATTTTATTGTCTCTTAGACATTTTTTCCCCGCGGTGCATAATATCTTGA
TCAAAGATCGGAGCCTATCGGTTTTTCCGACGTAAACCTCCGGCAATCGGCTGATAAGCC
TTTTGTACTCTTCACCGCCTTTTGCAATCTCGAACTCTGCCCTGAATGATAACTCGACCA
CGACTCGCATCTCGCCTTTCTTGGAATCAGATCGGTCCACGATCTCTATGTATTTGTGTT
CCCCTGCAGGGATGTCTTGAGAGCTTCTCCATTTGGATTTGGAGATGACGCAGTCGTAGC
CGGCCACATCTCGGAGGTGTCGAGAGATTTCTCCATGTAAGCAGCTCCGGCAACCGCCAG
CAACAGGTCGCTGGCAGACACAATGAAGACCCTTTGATGTAACTTGTTTCAAAGCTTCCT
TTGTCGCTTGTCTAATCTTTGTCTCAATCGAACTTGTTCTATACAGTGTCCCCTGGAGAA
GTTGTTCTTGTTCCTGCCAGAAAACTTTGTTTTCTTCAGAATTGCAATTACTATTGTCGT
CGACGTTTTCTATATCTGAGCCGCCGTTGAGGTTGAAGTCTTCCGGTGACTGGTTTCCTT
CATCGAGGAAGCCGAAGAGAACGTC
C

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2AV56TF 644 0 0
CAATCGGCTGATAAGC*TTTTGTACTCTTCACCGC*TTTTGCGATCTCGAACTCTGCCCT
GAATGATAACTCGACCACGACTCGCATCTCGCCTTTCTTGGAATCAGATCGGTCCACGAT
CTCTATGTATTCGTGTTCCCCTGCGGGGATGTCTTGAGAGCTTCTCCATTTGGATTTGGA
GATGACGCAGTCGTAGCCGGCCACATCTCGGAGGTGTCGAGAGATTTCTCCACGTAAGCA
GCTCCGGCAACCGCCAGCAACAGGTCGCTGGCAGACACAATGAAGACCCTTTGATGTAAC
TTGTTTCAAAGCTTCCTTTGTCGCTTGTCTAATCTTTGTCTCAATCGAACTTGTTCTATA
CAGTGTCCCCTGGAGAAGTTGTTCTTGTTCCTGCCAGAAAACTTTGTTTTCTTCAGAATT
GCAATTACTATTGTCGTCGACGTTTTCTATATCTGAGCCGCCGTTGAGGTTGAAGTCTTC
CGGTGACTGGTTTCCTTCATCGAGGAAGCCGAAGAGAACGTCGTCAGAGCTAGCCATTCC
ATCGAGAAATCTCATGATGTCATCGGAACTTTGCCGATCCATCTGTTTAAAAGTTTAAAG
AATAGGAGGAAAAGAAATGTATTTTTTGTTTGTATTTATTTATC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 3

CO CL2438Contig1 845 3 11 U
GACATGAAGTGTAATATACTCTTTACTTTAAACAAATAAATTAACATATTCAAAAAGGTA
GAGAAACAAATAAATTAAAACGCGATAAAGTTATATATTCTCCACATACAAATAACCAAC
CACTCAAGTAAATTAAAGCCACCGACGATGGTTCTTTCCTTCGGGCACCTTCCACGCGCT
GCCCCCAACAACCAGAAAAGCTGCCCGTTGAGCTGTAAATCACGTTACCCTATATGCTCA
ATTTTCGTCACTAAACATGTATATTTCCTTCTTCAAACAGTAGTGACGGTGCAATTCTTG
GTGATGGCTATATGCTTATTGAGAAGTTTGTGTTCGAAGTTGATGTCACATTCGATTTTC
TTGAGGAACTTGGGCTTCACTAACTTCCCCAACACGTAAGCTCGTGATCGAACCACAAAG
CTGAGCTTCATTGGCACTGGTGCAAGAGGCGCGGGCGGGTCAGGAATAACGGTATCAAGG
TCGCGCCACTTCCATATAACGGAATCTTCTCTCCAGTTATATGTACTAATACCGTTCTCT
GGCTCTTCCTTGACTGATAAAACTTCTTAATGGATCCAGAGCCGATTTTCATCTGAGAGA
AACCGAGATCGATTGGAGTTGAAGTAACATGGACACCGAAGAAAGTTCCCGTGTTCCGAT
ACAACATTCTCAGAGTCGCGTTCATCGTGATCATATCCGTTCCTACACCACCAGCATCTT
GACCAGCTTGGACCTTAAGCGTCTCGAATGTTATACTCTTGACAGTGATCTTTGGTTTCT
GAGGTTTAGCAGCTCCGTATAGAATCAAAGAGAAGAGACCAAGAAGTATAAAGAACCCAA
CGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2D194JQ U 1
AF RR2FX87JQ U 58
AF RR2FX87TF C 175
BS 1 82 RR2D194JQ
BS 83 83 RR2FX87JQ
BS 84 246 RR2D194JQ
BS 247 247 RR2FX87JQ
BS 248 260 RR2D194JQ
BS 261 261 RR2FX87JQ
BS 262 262 RR2D194JQ
BS 263 263 RR2FX87JQ
BS 264 424 RR2D194JQ
BS 425 705 RR2FX87JQ
BS 706 845 RR2FX87TF

RD RR2D194JQ 424 0 0
GACATGAAGTGTAATATACTCTTTACTTTAAACAAATAAATTAACATATTCAAAAAGGTA
GAGAAACAAATAAATTAAAACGTGATAAAGTTATATATTCTCCACATACAAATAACCAAC
CACTCAAGTAAATTAAAGCCACCGACGATGGTTCTTTCCTTCGGGCACCTTCCACGCGCT
GCCCCCAACAACCAGAAAAGCTGCCCGTTGAGCTGTAAATCACGTTACCCTATATGCTCA
ATTTTCCTCACTAAACATGTTTCTTTCCTTCTTCAAACAGTAGTGACGGTGCAATTCTTG
GTGATGGCTATATGCTTATTGAGAAGTTTGTGTTCGAAGTTGATGTCACATTCGATTTTC
TTGAGGAACTTGGGCTTCACTAACTTCCCCAACACGTAAGCTCGTGATCGAACCACAAAG
CTGA

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR2FX87JQ 648 0 0
GGAAGAGAAACAAGT
AATTATAACGCGATAAAGTTATATATTCTCCACATACAAATAACCAACCACTCAAGTAAA
TTAACGCCACCGATGATGGTTCTTTCCTTCGGGCACCTTCCACGCGCTGCCCCCAACAAC
CAGAAAAGCTGCCCGTTGAGCTGTAAATCACGTTACCCTATATGCTCAATTTTCGTCACT
AAACATGTATATTTCCTTCTTCAAACAGTAGTGACGGTGCAATTCTTGGTGATGGCTATA
TGCTTATTGAGAAGTTTGTGTTCGAAGTTGATGTCACATTCGATTTTCTTGAGGAACTTG
GGCTTCACTAACTTCCCCAACACGTAAGCTCGTGATCGAACCACAAAGCTGAGCTTCATT
GGCACTGGTGCAAGAGGCGCGGGCGGGTCAGGAATAACGGTATCAAGGTCGCGCCACTTC
CATATAACGGAATCTTCTCTCCAGTTATATGTACTAATACCGTTCTCTGGCTCTTCCTTG
ACTGATAAAACTTCTTAATGGATCCAGAGCCGATTTTCATCTGAGAGAAACCGAGATCGA
TTGGAGTTGAAGTAACATGGACACCGAAGAAAGTTCCCGTGTTCCGATACAACATTCTCA
GAGTCGCGTTCATCGTGATCATATCCGTTCCTA

QA 16 648 16 648
DS 

RD RR2FX87TF 671 0 0
CGCGCTGCCCCCAACAACCAGAAAAGCTGCCCGTTGAGCTGTAAATCACGTTACCCTATA
TGCTCAATTTTCGTCACTAAACATGTATATTTCTTTCTTCAAACAGTAGTGACGGTGCAA
TTCTTGGTGATGGCTATATGCTTATTGAGAAGTTTGTGTTCGAAGTTGATGTCACATTCG
ATTTTCTTGAGGAACTTGGGCTTCACTAACTTCCCCAACACGTAAGCTCGTGATCGAACC
ACAAAGCTGAGCTTCATTGGCACTGGTGCAAGAGGCGCGGGCGGGTCAGGAATAACGGTA
TCAAGGTCGCGCCACTTCCATATAACGGAATCTTCTCTCCAGTTATATGTACTAATACCG
TTCTCTGGCTCTTCCTTGACTGATAAAACTTCTTAATGGATCCAGAGCCGATTTTCATCT
GAGAGAAACCGAGATCGATTGGAGTTGAAGTAACATGGACACCGAAGAAAGTTCCCGTGT
TCCGATACAACATTCTCAGAGTCGCGTTCATCGTGATCATATCCGTTCCTACACCACCAG
CATCTTGACCAGCTTGGACCTTAAGCGTCTCGAATGTTATACTCTTGACAGTGATCTTTG
GTTTCTGAGGTTTAGCAGCTCCGTATAGAATCAAAGAGAAGAGACCAAGAAGTATAAAGA
ACCCAACGATC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL2439Contig1 760 2 7 U
CGATTAAACCATAACTATGTTTATGAAAAGGTCTAGACTTTACATGATCTTGCTACACCT
CTCTGTGACTTTTTCACTCCACAAGAGCAAAGCCTATGCAAAAATACAACTAAAAAAGAT
TTAGATATGTTTGTTTCTTTCTTTCTTTTTTGCAGTTTTAGAGTTTCAGAGAACAACCAA
GAGTACAGATTTAATGAAGCTTTAGTGATGATAACATCACTCAGGTAGTTAACTGCAAGT
GACATCTGAGTAGAATCCTATTGTCCTCCTCTCACAGCTCTGGATACTAACCAGCTCCAC
GTCAAAAACTTCAAACTGCTTCGAGCTGAAGAATGTCGAAGGTCCCACCGGAGGTCCCAG
TTCTGGAGGGATAATGATCCTTCTACGTCCACCAGGCTTCATGTCACGAATGCCCATCTC
AAATCCTGGAACAAGTGCATTGGTTCCCATGCGGATCTTAGCAGGAGATCCTTGTATGTA
AGTACTGTCTATTCTTCTTCCAGACTCATTATATCCAATATAATGAAAAGTCACCTGCTG
ACCATCTTTAGGGCAATCACCTTGACCAACATCGAAATCTCGATATATAAGACCTGAATC
AGCCTTTATGTAATTATCCGAAGCCACTACCTTAACCTCAAAACCTTCTCTAACAAAGTT
GGGAAACTCATCAGGAGCATTGTTCTCTCTCTGTATCCTCTTGTTCTGTTCTAGTAACCT
TCTCTCGTCATAAGGGCTCTTTGATTTAGTCTTCGCATAC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG68JQ U 2
AF RR2BP36JQ U 1
BS 1 153 RR2BP36JQ
BS 154 154 RR2FG68JQ
BS 155 591 RR2BP36JQ
BS 592 592 RR2FG68JQ
BS 593 618 RR2BP36JQ
BS 619 619 RR2FG68JQ
BS 620 760 RR2BP36JQ

RD RR2FG68JQ 663 0 0
GG
TTAAACCATAACTATGTTTATGAAAAGGTCTAGACTTTACATGATCTTGCTACACCTCTC
TGTGACTTTTTCACTCCACAAGAGCAAAGCCTATGCAAAAATACAACTAAAAAAGATTTA
GATATGTTTGTTTCTTTCTTTCTTTTTTGCAGTTTTAGAGTTTCAGAGAACAACCAAGAG
TACAGATTTAATGAAGCTTTAGTGATGATAACATCACTCAGGTAGTTAACTGCAAGTGAC
ATCTGAGTAGAATCCTATTGTCCTCCTCTCACAGCTCTGGATACTAACCAGCTCCACGTC
AAAAACTTCAAACTGCTTCGAGCTGAAGAATGTCGAAGGTCCCACCGGAGGTCCCAGTTC
TGGAGGGATAATGATCCTTCTACGTCCACCAGGCTTCATGTCACGAATGCCCATCTCAAA
TCCTGGAACAAGTGCATTGGTTCCCATGCGGATCTTAGCAGGAGATCCTTGTATGTAAGT
ACTGTCTATTCTTCTTCCAGACTCATTGTATCCAATATAATGAAAAGTCACCTGCTGACC
ATCTTTAGGGGAATCACCTTGACCAACATCGAAATCTCGATATATAAGACCTGAATCAGC
CTTTATGTAATTATCCGAAGCTACTACCTTAACCTCAAAACCT
GCACTATCATCAACAACC

QA 3 645 3 645
DS 

RD RR2BP36JQ 760 0 0
CGATTAAACCATAACTATGTTTATGAAAAGGTCTAGACTTTACATGATCTTGCTACACCT
CTCTGTGACTTTTTCACTCCACAAGAGCAAAGCCTATGCAAAAATACAACTAAAAAAGAT
TTAGATATGTTTGTTTCTTTCTTTCTTTTTTGCCGTTTTAGAGTTTCAGAGAACAACCAA
GAGTACAGATTTAATGAAGCTTTAGTGATGATAACATCACTCAGGTAGTTAACTGCAAGT
GACATCTGAGTAGAATCCTATTGTCCTCCTCTCACAGCTCTGGATACTAACCAGCTCCAC
GTCAAAAACTTCAAACTGCTTCGAGCTGAAGAATGTCGAAGGTCCCACCGGAGGTCCCAG
TTCTGGAGGGATAATGATCCTTCTACGTCCACCAGGCTTCATGTCACGAATGCCCATCTC
AAATCCTGGAACAAGTGCATTGGTTCCCATGCGGATCTTAGCAGGAGATCCTTGTATGTA
AGTACTGTCTATTCTTCTTCCAGACTCATTATATCCAATATAATGAAAAGTCACCTGCTG
ACCATCTTTAGGGCAATCACCTTGACCAACATCGAAATCTCGATATATAAGTCCTGAATC
AGCCTTTATGTAATTATCTGAAGCCACTACCTTAACCTCAAAACCTTCTCTAACAAAGTT
GGGAAACTCATCAGGAGCATTGTTCTCTCTCTGTATCCTCTTGTTCTGTTCTAGTAACCT
TCTCTCGTCATAAGGGCTCTTTGATTTAGTCTTCGCATAC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 4

CO CL2440Contig1 629 4 2 U
ATAAAAGTTCATAAATATTAAAACTTTCCGATACCATCAAACACGTAAAGATAGCAAAAC
ATAAGTTCTTAGATATCCAAACAAAACATGAATCCTGAAAATGAAACCTTGCAACGATCC
GAAACAAAAACAACACAAACCAGCATTTAACGGTAACTCTTCTGGAAACGGGAACGAGCA
CCACGACCACCAAACTTCTTCGGCTCGCACCTCCTCGGATCCGCCACGAGCAGAGTCCTA
TCGTACCTAACCAGGATATCCTTCACCTCCTTCTTCGACTGCTCGTCCACGTACTTCTGG
TAGAAAGCCACGAGCGCCTTGGCGATACTCTGACGGATGGCGTAAACCTGGGAAGTGTGA
CCACCGCCCTTGACGCGGATCCTCATGTCGACGCCTGCGAAACGGTGCTTCCCGAGGAGG
AGGACCGGCTCGTAGATCTTGTACCGGAGGATATCAGGCTGGAAGAGCTCGATCGGGGCA
CCGTTGAGCTTGATGAGACCGCATCCACGCTTGCAGTGGGTGACAGCCACCGCTGTCTTC
TTCCTTCCGAAGCATTGCACGGATGCTTTAGCAGTTTGTGTCGCCATGGTTGGGGGTTTG
CTCTTTCGTCCGCCGCTGAAAATGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2H589TF C 1
AF RR2H389JQ U 10
AF RR2H389TF C 10
AF RR2H589JQB U 12
BS 1 11 RR2H589TF
BS 12 629 RR2H389JQ

RD RR2H589TF 629 0 0
ATAAAAGTTCATAAATATTAAAACTTTCCGATACCATCAAACACGTAAAGATAGCAAAAC
ATAAGTTCTTAGATATCCAAACAAAACATGAATCCTGAAAATGAAACCTTGCAACGATCC
GAAACAAAAACAACACAAACCAGCATTTAACGGTAACTCTTCTGGAAACGGGAACGAGCA
CCACGACCACCAAACTTCTTCGGCTCGCACCTCCTCGGATCCGCCACGAGCAGAGTCCTA
TCGTACCTAACCAGGATATCCTTCACCTCCTTCTTCGACTGCTCGTCCACGTACTTCTGG
TAGAAAGCCACGAGCGCCTTGGCGATACTCTGACGGATGGCGTAGACCTGGGAAGTGTGA
CCACCGCCCTTGACGCGGATCCTCATGTCGACGCCTGCGAAACGGTGCTTCCCGAGGAGG
AGGACCGGCTCGTAGATCTTGTACCGGAGGATATCAGGCTGGAAGAGCTCGATCGGGGCA
CCGTTGAGCTTGATGAGACCGCATCCACGCTTGCAGTGGGTGACAGCCACCGCTGTCTTC
TTCCTTCCGAAGCATTGCACGGATGCTTTAGCAGTTTGTGTCGCCATGGTTGGGGGTTTG
CTCTTTCGTCCGCCGCTGAAAATGAAAAA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2H389JQ 620 0 0
CG
TAAATATTAAAACTTTCCGATACCATCAAACACGTAAAGATAGCAAAACATAAGTTCTTA
GATATCCAAACAAAACATGAATCCTGAAAATGAAACCTTGCAACGATCCGAAACAAAAAC
AACACAAACCAGCATTTAACGGTAACTCTTCTGGAAACGGGAACGAGCACCACGACCACC
AAACTTCTTCGGCTCGCACCTCCTCGGATCCGCCACGAGCAGAGTCCTATCGTACCTAAC
CAGGATATCCTTCACCTCCTTCTTCGACTGCTCGTCCACGTACTTCTGGTAGAAAGCCAC
GAGCGCCTTGGCGATACTCTGACGGATGGCGTAAACCTGGGAAGTGTGACCACCGCCCTT
GACGCGGATCCTCATGTCGACGCCTGCGAAACGGTGCTTCCCGAGGAGGAGGACCGGCTC
GTAGATCTTGTACCGGAGGATATCAGGCTGGAAGAGCTCGATCGGGGCACCGTTGAGCTT
GATGAGACCGCATCCACGCTTGCAGTGGGTGACAGCCACCGCTGTCTTCTTCCTTCCGAA
GCATTGCACGGATGCTTTAGCAGTTTGTGTCGCCATGGTTGGGGGTTTGCTCTTTCGTCC
GCCGCTGAAAATGAAAAA

QA 3 620 3 620
DS 

RD RR2H389TF 620 0 0
CG
TAAATATTAAAACTTTCCGATACCATCAAACACGTAAAGATAGCAAAACATAAGTTCTTA
GATATCCAAACAAAACATGAATCCTGAAAATGAAACCTTGCAACGATCCGAAACAAAAAC
AACACAAACCAGCATTTAACGGTAACTCTTCTGGAAACGGGAACGAGCACCACGACCACC
AAACTTCTTCGGCTCGCACCTCCTCGGATCCGCCACGAGCAGAGTCCTATCGTACCTAAC
CAGGATATCCTTCACCTCCTTCTTCGACTGCTCGTCCACGTACTTCTGGTAGAAAGCCAC
GAGCGCCTTGGCGATACTCTGACGGATGGCGTAGACCTGGGAAGTGTGACCACCGCCCTT
GACGCGGATCCTCATGTCGACGCCTGCGAAACGGTGCTTCCCGAGGAGGAGGACCGGCTC
GTAGATCTTGTACCGGAGGATATCAGGCTGGAAGAGCTCGATCGGGGCACCGTTGAGCTT
GATGAGACCGCATCCACGCTTGCAGTGGGTGACAGCCACCGCTGTCTTCTTCCTTCCGAA
GCATTGCACGGATGCTTTAGCAGTTTGTGTCGCCATGGTTGGGGGTTTGCTCTTTCGTCC
GCCGCTGAAAATGAAAAA

QA 3 620 3 620
DS 

RD RR2H589JQB 618 0 0
TAAATATTAAAACTTTCCGATACCATCAAACACGTAAAGATAGCAAAACATAAGTTCTTA
GATATCCAAACAAAACATGAATCCTGAAAATGAAACCTTGCAACGATCCGAAACAAAAAC
AACACAAACCAGCATTTAACGGTAACTCTTCTGGAAACGGGAACGAGCACCACGACCACC
AAACTTCTTCGGCTCGCACCTCCTCGGATCCGCCACGAGCAGAGTCCTATCGTACCTAAC
CAGGATATCCTTCACCTCCTTCTTCGACTGCTCGTCCACGTACTTCTGGTAGAAAGCCAC
GAGCGCCTTGGCGATACTCTGACGGATGGCGTAAACCTGGGAAGTGTGACCACCGCCCTT
GACGCGGATCCTCATGTCGACGCCTGCGAAACGGTGCTTCCCGAGGAGGAGGACCGGCTC
GTAGATCTTGTACCGGAGGATATCAGGCTGGAAGAGCTCGATCGGGGCACCGTTGAGCTT
GATGAGACCGCATCCACGCTTGCAGTGGGTGACAGCCACCGCTGTCTTCTTCCTTCCGAA
GCATTGCACGGATGCTTTAGCAGTTTGTGTCGCCATGGTTGGGGGTTTGCTCTTTCGTCC
GCCGCTGAAAATGAAAAA

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 3

CO CL2441Contig1 1482 3 5 U
TTTTGAATGAGAAAGGCAAAGGCTCTGGGAGCAATGAGATGAGTTATGTCGAGAGAACCA
TCGGTTTTCGGACACGCGATTTGGATGACAGGGATCTTAGACTGGTTACTGATGTTGTTG
GAGGAACAATAAGGTGGAGGAGGTACCTTGATCACCTCATTGGTTCCCTTTGCCACAACG
AAAGGACTTTTCGAAATATGGAACCTCTTCTCTTGCAGATTCTCCGCATTGGTTTCTATG
AGATCATTAAGCTTGATATGCCAGCATACGCTGTTGTAGATGAGAACGTAAGGCTTGCAA
AGATTGCACTAAGACCTGGTGCTGGAAATCTTGTCAATGGGATTCTTCGTAAGCTTGTCA
CTCTTAAGGAAAAAGATGCCCTTCCGTTACCCAAAGTGGAAGGGGATGATCGTGCACAAG
CACGTGCACTTGCTACGCTTCATTCCCACCCCGTTTGGATGGTTAGGCGATGGGTAAAGT
ATCTTGGGTTGGATGAAGCCACTAAGCTGATGACATGGAACAACACTGATCCTGGATTCA
GCTTAAGGGCCAATACGGGAAGGGGCATTACAAGATCAGACCTTGTGGAGCGTCTAGACT
CTTTAAATGTTCCACACGAACTGTCCTTACACTTGGAGGAGTTTGTCCGCATCAAAACAG
GATTGCAGATCGTTGTGCAAGCTGGCTTACTCAAAGAAGGCATATGTTCTGTTCAGGATG
AGAGTGCAGGACTAGTAGTCTCAGTGGTGAAACCTCAGCCAGGAGATAGGATACTGGACG
CATGTGCTGCTCCTGGAGGGAAGACCCTTTTCATGGCCTCTTGCTTGAAACGCCAAGGTA
TGATATATGCTATGGATGTGAATGAAGGACGGTTAAGAATTCTTGGGGAGACAGCAAAAT
CACACCAAGTTGCTGGACTTGTTACAACCATTCATTCCGATCTACGTGTCTTCGCTGAAA
CAAAAGAGGTACAATATGATAAAGTGTTGCTTGATGCCCCGTGTTCTGGACTCGGTGTCC
TCTCCAAGAGAGCGTATTTGCGTTGGAATCGTAAACTAGAGGACATGGAAGAGCTTACGA
ATCTACAGGATGAGCTTCTTGATTCTGCCTCCAAACTGGTGAAGCCTGGTGGGTTCTTGA
TATACAGTACTTGCTCGATAGACCCTGAAGAAAATCAAGGAAGAGTGGACGCGTTTCTCC
TAAGACATCCTGAGTTCTCTGTAGATCCAGTGGACAGATTAGTACCATCAAGTTTTGTAA
CGTCGCAAGGCTTCTTTTTATCCAACCCTGTGAAACACTCCTTGGATGGAGCGTTTGCAG
CTCGTCTGGTTCGAGCCTTATGATGTAAAACAAATTAAATTGTTAAAACGACATCGTTAC
TAGAAATAGTTTTGAAAATGACTAATCAAACCAAGTAATCAGCTGTTTAACTGTAAGGTT
TTACTATCATTTTAAAACAATCAATAAAATCAATTAAAAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C080TF U 1
AF RR2BJ32TF U 279
AF RR2BJ32JQ C 655
BS 1 350 RR2C080TF
BS 351 968 RR2BJ32TF
BS 969 969 RR2BJ32JQ
BS 970 1119 RR2BJ32TF
BS 1120 1482 RR2BJ32JQ

RD RR2C080TF 350 0 0
TTTTGAATGAGAAAGGCAAAGGCTCTGGGAGCAATGAGATGAGTTATGTCGAGAGAACCA
TCGGTTTTCGGACACGCGATTTGGATGACAGGGATCTTAGACTGGTTACTGATGTTGTTG
GAGGAACAATAAGGTGGAGGAGGTACCTTGATCACCTCATTGGTTCCCTTTGCCACAACG
AAAGGACTTTTCGAAATATGGAACCTCTTCTCTTGCAGATTCTCCGCATTGGTTTCTATG
AGATCATTAAGCTTGATATGCCAGCATACGCTGTTGTAGATGAGAACGTAAGGCTTGCAA
AGATTGCACTAAGACCTGGTGCTGGAAATCTTGTCAATGGGATTCTTCGT

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR2BJ32TF 841 0 0
GATGAGAACGTAAGGCTTGCAAAGATTGCACTAAGACCTGGTGCTGGAGATCTTGTCAAT
GGGATTCTTCGTAAGCTTGTCACTCTTAAGGAAAAAGATGCCCTTCCGTTACCCAAAGTG
GAAGGGGATGATCGTGCACAAGCACGTGCACTTGCTACGCTTCATTCCCACCCCGTTTGG
ATGGTTAGGCGATGGGTAAAGTATCTTGGGTTGGATGAAGCCACTAAGCTGATGACATGG
AACAACACTGATCCTGGATTCAGCTTAAGGGCCAATACGGGAAGGGGCATTACAAGATCA
GACCTTGTGGAGCGTCTAGACTCTTTAAATGTTCCACACGAACTGTCCTTACACTTGGAG
GAGTTTGTCCGCATCAAAACAGGATTGCAGATCGTTGTGCAAGCTGGCTTACTCAAAGAA
GGCATATGTTCTGTTCAGGATGAGAGTGCAGGACTAGTAGTCTCAGTGGTGAAACCTCAG
CCAGGAGATAGGATACTGGACGCATGTGCTGCTCCTGGAGGGAAGACCCTTTTCATGGCC
TCTTGCTTGAAACGCCAAGGTATGATATATGCTATGGATGTGAATGAAGGACGGTTAAGA
ATTCTTGGGGAGACAGCAAAATCACACCAAGTTGCTGGACTTGTTACAACCATTCATTCC
GATCTACGTGTCTTCGCTGAAACAAAAGAG*TACAATATGATAAAGTGTTGCTTGATGCC
CCGTGTTCTGGACTCGGTGTCCTCTCCAAGAGAGCGTATTTGCGTTGGAATCGTAAACTA
GAGGACATGGAAGAGCTTACGAATCTACAGGATGAGCTTCTTGATTCTGCCTCCAAACTG
G

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR2BJ32JQ 828 0 0
AAACAGGATTGCAGATCGTTGTGCAAGCTGGCTTACTCAAAGAAGGCATATGTTCTGTTC
AGGATGAGAGTGCAGGACTAGTAGTCTCAGTGGTGAAACCTCAGCCAGGAGATAGGATAC
TGGACGCATGTGCTGCTCCTGGAGGGAAGACCCTTTTCATGGCCTCTTGCTTGAAACGCC
AAGGTATGATATATGCTATGGATGTGAATGAAGGACGGTTAAGAATTCTTGGGGAGACAG
CAAAATCACACCAAGTTGCTGGACTTGTTACAACCATTCATTCCGATCTACGTGTCTTCG
CTGAAACAAAAGAGGTACAATATGATAAAGTGTTGCTTGATGCCCCGTGTTCTGGACTCG
GTGTCCTCTCCAAGAGAGCGTATTTGCGTTGGAATCGTAAACTAGAGGACATGGAAGAGC
TTACGAATCTACAGGATGAGCTTCTTGATTCTGCCTCCAAACTGGTGAAGCCTGGTGGGT
TCTTGATATACAGTACTTGCTCGATAGACCCTGAAGAAAATCAAGGAAGAGTGGACGCGT
TTCTCCTAAGACATCCTGAGTTCTCTGTAGATCCAGTGGACAGATTAGTACCATCAAGTT
TTGTAACGTCGCAAGGCTTCTTTTTATCCAACCCTGTGAAACACTCCTTGGATGGAGCGT
TTGCAGCTCGTCTGGTTCGAGCCTTATGATGTAAAACAAATTAAATTGTTAAAACGACAT
CGTTACTAGAAATAGTTTTGAAAATGACTAATCAAACCAAGTAATCAGCTGTTTAACTGT
AAGGTTTTACTATCATTTTAAAACAATCAATAAAATCAATTAAAAGAC

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 4

CO CL2442Contig1 764 4 2 U
AGCTGAGAAAACTTCTCTTTTATTCAATTCAAAGCTTCACAGAGATTCTCATTTTTCTGT
CTCCAATCCAGGAAAGTAAAGGACTTAAAAACACACACACACTTTTCATTCCACTTAAGC
CTTAATACGAACTGAATCAAACAGACCAAACTTAAAAACAAGAGAAAACACAAGCAAGGT
TATGCGATTGCATCAATGTTGTTATTCATAACAGAAGAAAGATAAAAAGGAACGACTTTT
AAGCTCACTATTTCATTAACAGGTCATCCCCACACAAAGATGATTCCTTTGCTCAGAAGA
AAAGAAACACGACGACGTCTTTGATAACGATGATCTGGAACAAGCCAAGAGAGATCACCA
TCAGATTCCTGGTCAGCTCTTGGTGAACGTAATCCGCCAAAACCTCCTCCATTCCCGCGT
TGATGTGAAACAGAACAGGGATCTTCCGTACGAGAGACGCGTTGCTGTAGCCTCTGGAAG
ATGGGAGACGACCCAATTGAGATTGCCCGAGAGAAGCATCGGTGGCGAGACTCCCAGAGA
ACGGTTTGAGTTTCTGGGTTAGTGAAAATGGGATCGAGGAGATTTCTCTTCCGATTAGGT
TCCTCGCGGCGGCGGACGGGGAGGAGATGTTATTGGTTATCGAGAAAGGTGAAGACTTTG
AGAGAGAGAGGTTGTGGGTTTGGCGGTGGAGGCCGAGGATGGAACGGCGGAGAGACATCG
CGCAGGGTAGGGAATGCGAATTTACTTTTTGGATCTGATCGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO67JQ U 1
AF RR2C058JQ U 84
AF RR2C058TF C 127
AF RR2DO67TF C 311
BS 1 722 RR2DO67JQ
BS 723 764 RR2C058JQ

RD RR2DO67JQ 722 0 0
AGCTGAGAAAACTTCTCTTTTATTCAATTCAAAGCTTCACAGAGATTCTCATTTTTCTGT
CTCCAATCCAGGAAAGTAAAGGACTTAAAAACACACACACACTTTTCATTCCACTTAAGC
CTTAATACGAACTGAATCAAACAGACCAAACTTAAAAACAAGAGAAAACACAAGCAAGGT
TATGCGATTGCATCAATGTTGTTATTCATAACAGAAGAAAGATAAAAAGGAACGACTTTT
AAGCTCACTATTTCATTAACAGGTCATCCCCACACAAAGATGATTCCTTTGCTCAGAAGA
AAAGAAACACGACGACGTCTTTGATAACGATGATCTGGAACAAGCCAAGAGAGATCACCA
TCAGATTCCTGGTCAGCTCTTGGTGAACGTAATCCGCCAAAACCTCCTCCATTCCCGCGT
TGATGTGAAACAGAACAGGGATCTTCCGTACGAGAGACGCGTTGCTGTAGCCTCTGGAAG
ATGGGAGACGACCCAATTGAGATTGCCCGAGAGAAGCATCGGTGGCGAGACTCCCAGAGA
ACGGTTTGAGTTTCTGGGTTAGTGAAAATGGGATCGAGGAGATTTCTCTTCCGATTAGGT
TCCTCGCGGCGGCGGACGGGGAGGAGATGTTATTGGTTATCGAGAAAGGTGAAGACTTTG
AGAGAGAGAGGTTGTGGGTTTGGCGGTGGAGGCCGAGGATGGAACGGCGGAGAGACATCG
CG

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2C058JQ 681 0 0
GACTTAAAA
ACACACACACTTTTCATTCCACTTAAGCCTTAATACGAACTGAATCAAACAGACCAAACT
TAAAAACAAGAGAAAACACAAGCAAGGTTATGCGATTGCATCAATGTTGTTATTCATAAC
AGAAGAAAGATAAAAAGGAACGACTTTTAAGCTCACTATTTCATTAACAGGTCATCCCCA
CACAAAGATGATTCCTTTGCTCAAAAGAAAAGAAACACGACGACGTCTTTGATAACGATG
ATCTGGAACAAGCCAAGAGAGATCACCATCAGATTCCTGGTCAGCTCTTGGTGAACGTAA
TCCGCCAAAACCTCCTCCATTCCCGCGTTGATGTGAAACAGAACAGGGATCTTCCGTACG
AAAGACGCGTTGCTGTAGCCTCTGGAAGATGGGAGACGACCCAATTGAGATTGCCCGAGA
GAAGCATCGGTGGCGAGACTCCCAGAAAACGGTTTGAGTTTCTGGGTTAGTGAAAATGGG
ATCGAGGAAATTTCTCTTCCGATTAGGTTCCTCGCGGCGGCGGACGGGGAGGAAATGTTA
TTGGTTATCGAGAAAGGTGAAGACTTTGAGAGAGAGAGGTTGTGGGTTTGGCGGTGGAGG
CCGAGGATGGAACGGCGGAGAGACATCGCGCAGGGTAGGGAATGCGAATTTACTTTTTGG
ATCTGATCGGAG

QA 10 681 10 681
DS 

RD RR2C058TF 638 0 0
ACGAACTGAATCAAACAGACCAAACTTAAAAACAAGAGAAAACACAAGCAAGGTTATGCG
ATTGCATCAATGTTGTTATTCATAACAGAAGAAAGATAAAAAGGAACGACTTTTAAGCTC
ACTATTTCATTAACAGGTCATCCCCACACAAAGATGATTCCTTTGCTCAGAAGAAAAGAA
ACACGACGACGTCTTTGATAACGATGATCTGGAACAAGCCAAGAGAGATCACCATCAGAT
TCCTGGTCAGCTCTTGGTGAACGTAATCCGCCAAAACCTCCTCCATTCCCGCGTTGATGT
GAAACAGAACAGGGATCTTCCGTACGAGAGACGCGTTGCTGTAGCCTCTGGAAGATGGGA
GACGACCCAATTGAGATTGCCCGAGAGAAGCATCGGTGGCGAGACTCCCAGAGAACGGTT
TGAGTTTCTGGGTTAGTGAAAATGGGATCGAGGAGATTTCTCTTCCGATTAGGTTCCTCG
CGGCGGCGGACGGGGAGGAGATGTTATTGGTTATCGAGAAAGGTGAAGACTTTGAGAGAG
AGAGGTTGTGGGTTTGGCGGTGGAGGCCGAGGATGGAACGGCGGAGAGACATCGCGCAGG
GTAGGGAATGCGAATTTACTTTTTGGATCT
GATCGGAG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2DO67TF 448 0 0
GACGACGTCTTTGATAACGATGATCTGGAACAAGCCAAGAGAGATCACCATCAGATTCCT
GGTCAGCTCTTGGTGAACGTAATCCGCCAAAACCTCCTCCATTCCCGCGTTGATGTGAAA
CAGAACAGGGATCTTCCGTACGAGAGACGCGTTGCTGTAGCCTCTGGAAGATGGGAGACG
ACCCAATTGAGATTGCCCGAGAGAAGCATCGGTGGCGAGACTCCCAGAGAACGGTTTGAG
TTTCTGGGTTAGTGAAAATGGGATCGAGGAGATTTCTCTTCCGATTAGGTTCCTCGCGGC
GGCGGACGGGGAGGAGATGTTATTGGTTATCGAGAAAGGTGAAGACTTTGAGAGAGAGAG
GTTGTGGGTTTGGCGGTGGAGGCCGAGGATGGAACGGCGGAGAGACATCGCGCAGGGTAG
GGAATGCGAATTTACTTTTTGGATCT
CC

QA 1 446 1 446
DS 



AS 2 4

CO CL2443Contig1 838 2 2 U
GAGGAGCTCTTGAAGGAGCACATTTTCTGGCGACTAAAGAGCTTGTTAGCCTCAGTGAGC
AGCAGCTCGTGGATTGCGACCATGAGTGTGATCCAGAAGAAGCCAATTCATGTGACTCCG
GTTGCAATGGAGGACTAATGAACAACGCTTTTGAGTACACTCTCAAAGCTGGTGGCCTTA
TGAAAGAAACAGACTATCCTTATACAGGACATGACAATTCCGGTTGCAAGTTCGACAAGA
GCAAGATCGCAGCAAGAGTGTCTAATTTCAGCGTTGTCTCTGCCGATGAAGACCAAATAG
CTGCAAATCTAGTCCACCACGGTCCTCTTGCTATTGCTATCAATGCAATGTGGATGCAAA
CTTACATTGGAGGAGTCTCGTGCCCGTATGTATGTTCTAAGAGCCAAGACCATGGAGTGC
TCTTGGTTGGGTTTGGCTCGTCGGGTTATGCACCAATCCGTCTAAAGGAGAAGCCTTACT
GGATCATAAAGAACTCATGGGGAGAGATGTGGGGGGAGCATGGTTACTACAAAATTTGCA
GGGGACGTCATAACATCTGTGGTATGGACACAATGGTATCTACTGTTGCTGCTGTTCATA
CCTCAACTCAGTAGAACTATTAGGACACTACTGGGTTTTACCTGTCCTTGTGTGTATATT
ATATATATGTGTATCTGAATAACAACTATGGACTGTTATTTTTAGTATTATCGTCAATTT
GTTTCAGTTTTAATGTAAAATATAGCCTTGGGGTGTCGTTATCCTTGTAGCATCGAATGC
TAAAGAAAAGTGATATGATGATCAGTTTATAAGTATGTAATAATGGAAGTTTTACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR01TF U 1
AF RR2BR01JQ C 111
BS 1 619 RR2BR01TF
BS 620 838 RR2BR01JQ

RD RR2BR01TF 619 0 0
GAGGAGCTCTTGAAGGAGCACATTTTCTGGCGACTAAAGAGCTTGTTAGCCTCAGTGAGC
AGCAGCTCGTGGATTGCGACCATGAGTGTGATCCAGAAGAAGCCAATTCATGTGACTCCG
GTTGCAATGGAGGACTAATGAACAACGCTTTTGAGTACACTCTCAAAGCTGGTGGCCTTA
TGAAAGAAACAGACTATCCTTATACAGGACATGACAATTCCGGTTGCAAGTTCGACAAGA
GCAAGATCGCAGCAAGAGTGTCTAATTTCAGCGTTGTCTCTGCCGATGAAGACCAAATAG
CTGCAAATCTAGTCCACCACGGTCCTCTTGCTATTGCTATCAATGCAATGTGGATGCAAA
CTTACATTGGAGGAGTCTCGTGCCCGTATGTATGTTCTAAGAGCCAAGACCATGGAGTGC
TCTTGGTTGGGTTTGGCTCGTCGGGTTATGCACCAATCCGTCTAAAGGAGAAGCCTTACT
GGATCATAAAGAACTCATGGGGAGAGATGTGGGGGGAGCATGGTTACTACAAAATTTGCA
GGGGACGTCATAACATCTGTGGTATGGACACAATGGTATCTACTGTTGCTGCTGTTCATA
CCTCAACTCAGTAGAACTA

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2BR01JQ 728 0 0
TGTGACTCCGGTTGCAATGGAGGACTAATGAACAACGCTTTTGAGTACACTCTCAAAGCT
GGTGGCCTTATGAAAGAAACAGACTATCCTTATACAGGACATGACAATTCCGGTTGCAAG
TTCGACAAGAGCAAGATCGCAGCAAGAGTGTCTAATTTCAGCGTTGTCTCTGCCGATGAA
GACCAAATAGCTGCAAATTTAGTCCACCACGGTCCTCTTGCTATTGCTATCAATGCAATG
TGGATGCAAACTTACATTGGAGGAGTCTCGTGCCCGTATGTATGTTCTAAGAGCCAAGAC
CATGGAGTGCTCTTGGTTGGGTTTGGCTCGTCGGGTTATGCACCAATCCGTCTAAAGGAG
AAGCCTTACTGGATCATAAAGAACTCATGGGGAGAGATGTGGGGGGAGCATGGTTACTAC
AAAATTTGCAGGGGACGTCATAACATCTGTGGTATGGACACAATGGTATCTACTGTTGCT
GCTGTTCATACCTCAACTCAGTAGAACTATTAGGACACTACTGGGTTTTACCTGTCCTTG
TGTGTATATTATATATATGTGTATCTGAATAACAACTATGGACTGTTATTTTTAGTATTA
TCGTCAATTTGTTTCAGTTTTAATGTAAAATATAGCCTTGGGGTGTCGTTATCCTTGTAG
CATCGAATGCTAAAGAAAAGTGATATGATGATCAGTTTATAAGTATGTAATAATGGAAGT
TTTACATT

QA 1 728 1 728
DS 



CO CL2443Contig2 705 2 3 U
TTGTAAACTTCCATTATTACATACTTATAAACTGATCATCATATCACTTTTCTTTAGCAT
TCGATGCTACAAGGATAACGACACCCCAAGGCTATATTTTACATTAAAACTGAAACAAAT
TGACGATAATACTAAAAATAACAGTCCATAGTTGTTATTCAGATACACATATATATAATA
TACACACAAGGACAGGTAAAACCCAGTAGTGTCCTAATAGTTCTACTGAGTTGAGGTATG
AACAGCAGCAACAGTAGATACCATTGTGTCCATACCACAGATGTTATGACGTCCCCTGCA
GATTTTGTAGTAACCATGCTCCCCCCACGTCTCTCCCCATGAGTTCTTTATGATCCAGTA
AGGCTTCTCCTTTAGACGGATTGGTGCATAACCAGACGAGCCAAACCCAACCAAGAGCAC
TCCATGGTCTTGGCTCTTAAAACATACATACGGGCAAGAAACTCCTCCTATGTAAGTTTG
CATCCACATTGCATTGATAGCAATAGCAAGAGGACCGTGGTGGACTAGATTTGCAGCGAT
TTGATCTTCATCCGCAGAGACAACGCTGAAGTTAGACACTTTGGCAGCGATCATGCTCTT
GTCGAACTTGCAGCCGGAATTGTCATGTCCTGTATAAGGATAGTCTGCTTCTTTCATAAG
ACCACCAGCTTTGAGGGTGTACTCAAAAGCGTTGTTCATTAGTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR77JQ U 2
AF RR2CR77TF C 1
BS 1 4 RR2CR77TF
BS 5 552 RR2CR77JQ
BS 553 705 RR2CR77TF

RD RR2CR77JQ 554 0 0
GTA
AAACTTCCATTATTACATACTTATAAACTGATCATCATATCACTTTTCTTTAGCATTCGA
TGCTACAAGGATAACGACACCCCAAGGCTATATTTTACATTAAAACTGAAACAAATTGAC
GATAATACTAAAAATAACAGTCCATAGTTGTTATTCAGATACACATATATATAATATACA
CACAAGGACAGGTAAAACCCAGTAGTGTCCTAATAGTTCTACTGAGTTGAGGTATGAACA
GCAGCAACAGTAGATACCATTGTGTCCATACCACAGATGTTATGACGTCCCCTGCAGATT
TTGTAGTAACCATGCTCCCCCCACGTCTCTCCCCATGAGTTCTTTATGATCCAGTAAGGC
TTCTCCTTTAGACGGATTGGTGCATAACCAGACGAGCCAAACCCAACCAAGAGCACTCCA
TGGTCTTGGCTCTTAAAACATACATACGGGCAAGAAACTCCTCCTATGTAAGTTTGCATC
CACATTGCATTGATAGCAATAGCAAGAGGACCGTGGTGGACTAGATTTGCAGCGATTTGA
TCTTCATC
CGC

QA 4 551 4 551
DS 

RD RR2CR77TF 705 0 0
TTGTAAACTTCCATTATT*CATACTTATAAACTGATCATCATATCACTTT*CTTTAGCAT
TCGATGCTACAAGGATAACGACACCCCAAGGCTATATTTTACATTAAAACTGAAACAAAT
TGACGATAATACTAAAAATAACAGTCCATAGTTGTTATTCAGATACACATATATATAATA
TACACACAAGGACAGGTAAAACCCAGTAGTGTCCTAATAGTTCTACTGAGTTGAGGTATG
AACAGCAGCAACAGTAGATACCATTGTGTCCATACCACAGATGTTATGACGTCCCCTGCA
GATTTTGTAGTAACCATGCTCCCCCCACGTCTCTCCCCATGAGTTCTTTATGATCCAGTA
AGGCTTCTCCTTTAGACGGATTGGTGCATAACCAGACGAGCCAAACCCAACCAAGAGCAC
TCCATGGTCTTGGCTCTTAGAACATACATACGGGCAAGAGACTCCTCCTATGTAAGTTTG
CATCCACATTGCATTGATAGCAATAGCAAGAGGACCGTGGTGGACTAGATTTGCAGCGAT
TTGATCTTCATCCGCAGAGACAACGCTGAAGTTAGACACTTTGGCAGCGATCATGCTCTT
GTCGAACTTGCAGCCGGAATTGTCATGTCCTGTATAAGGATAGTCTGCTTCTTTCATAAG
ACCACCAGCTTTGAGGGTGTACTCAAAAGCGTTGTTCATTAGTCC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 3

CO CL2444Contig1 851 3 15 U
GGAATCATTATAAGCGACCAAGGAGGACGAGGAGGAGAAGAAGAAGCTTCTCTTTTTGAG
GCAGATCTGACATCTGTTTCCGAATCTCTTATTGAAGTTCTTCAGTGAATCAGCTGTTCA
ATGGGTTTGTGGGAAGCTTTTCTCAATTGGCTTCGTAGCCTCTTCTTCAAGCAAGAAATG
GGACTTTCTTTGATAGGGCTTCAGAATGCAGGGAAGACATCTCTTGTCAATGTTGTTGCA
ACTGGTGGTTATAGTGAGGACATGATTCCTACGGTGGGTTTTAACATGAGGAAAGTGACA
AAAGGAAATGTTACTATCAAGCTATGGGATCTTGGTGGTCAACCTAGGTTCCGGAGCATG
TGGGAACGCTATTGCCGCGCTGTTTCCGCTATTGTGTATGTAGTTGATGCCGCAGATCCT
GACAACCTAAGTGTCTCCAAAAGCGAACTCCATGATTTGTTGAACAAGACTTCGCTTAAC
GGTATCCCTCTTCTGGTTCTTGGGAACAAGATCGACAAACCTGGAGCTCTCTCTAAAGAA
GCCTTAACCCACGAAATGGAGCTTCAGTCGCTTACAGATAGAGAAGTTTGCTGTTTCATG
ATATCTTGCAAGAACTCTACCAACATTGATCAGGTCATTGATTGGCTGGTAAAGCATTCA
AAATCAAAGAACTAAAAAACTTCACCAAGAAGAACACACATTCTCTCTTCTCAAGTCCTC
TTCCTGTATTGTTTGCCTGATGAAGACTATTTTTAAACTCGTGTGGAAACAAGAGTTTGT
CTCTATATTCTCCAGTCTTGTCTCTGTATATTAGATGTGGGATGGTATTCTATTCTAAAG
CATTTGCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D402TF U 1
AF RR2FQ19TF U 7
AF RR2FQ19JQ C 89
BS 1 20 RR2D402TF
BS 21 21 RR2FQ19TF
BS 22 154 RR2D402TF
BS 155 155 RR2FQ19TF
BS 156 181 RR2D402TF
BS 182 182 RR2FQ19TF
BS 183 189 RR2D402TF
BS 190 190 RR2FQ19TF
BS 191 203 RR2D402TF
BS 204 204 RR2FQ19TF
BS 205 221 RR2D402TF
BS 222 222 RR2FQ19TF
BS 223 282 RR2D402TF
BS 283 708 RR2FQ19TF
BS 709 851 RR2FQ19JQ

RD RR2D402TF 282 0 0
GGAATCATTATAAGCGACCAGGGAGGACGAGGAGGAGAAGAAGAAGCTTCTCTTTTTGAG
GCAGATCTGACATCTGTTTCCGAATCTCTTATTGAAGTTCTTCAGTGAATCAGCTGTTCA
ATGGGTTTGTGGGAAGCTTTTCTCAATTGGCTTC*TAGCCTCTTCTTCAAGCAAGAAATG
GAACTTTCTCTGATAGGGCTTCAAAATGCAGGGAAGACATCCCTTGTCAATGTTGTTGCA
ACTGGTGGTTATAGTGAGGACATGATTCCTACGGTGGGTTTT

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR2FQ19TF 706 0 0
GGAG
TAAGCGACCAAGGAGGACGAGGAGGAGAAGAAGAAGCTTCTCTTTTTGCGGCAGATCTGA
CATCTGTTTCCGAATCTCTTTTTGAAGTTCTTCAGTGAATCAGCTGTTCAATGGGTTTGT
GGGAAGCTTTTCTCAATTGGCTTCGTAGCCTCTTCTTCAAGCAAGAAATGGGACTTTCTT
TGATAGGGCTTCAGAATGCAGGGAAGACATCTCTTGTCAATGTTGTTGCAACTGGTGGTT
ATAGTGAGGACATGATTCCTACGGTGGGTTTTAACATGAGGAAAGTGACAAAAGGAAATG
TTACTATCAAGCTATGGGATCTTGGTGGTCAACCTAGGTTCCGGAGCATGTGGGAACGCT
ATTGCCGCGCTGTTTCCGCTATTGTGTATGTAGTTGATGCCGCAGATCCTGACAACCTAA
GTGTCTCCAAAAGCGAACTCCATGATTTGTTGAACAAGACTTCGCTTAACGGTATCCCTC
TTCTGGTTCTTGGGAACAAGATCGACAAACCTGGAGCTCTCTCTAAAGAAGCCTTAACCC
ACGAAATGGAGCTTCAGTCGCTTACAGATAGAGAAGTTTGCTGTTTCATGATATCTTGCA
AGAACTCTACCAACATTGATCAGGTCATTGATTGGCTGGTAAAGCATTCAAAATCAAAGA
ACTAAAAAACTTCACCAAGAAGAACACACATTCTCTCT
CTCA

QA 5 702 5 702
DS 

RD RR2FQ19JQ 763 0 0
CTT
TTGAAGTTCTTCAGTGAATCAGCTGTTCAATGGGTTTGTGGGAAGCTTTTCTCAATTGGC
TTCGTAGCCTCTTCTTCAAGCAAGAAATGGGACTTTCTTTGATAGGGCTTCAGAATGCAG
GGAAGACATCTCTTGTCAATGTTGTTGCAACTGGTGGTTATAGTGAGGACATGATTCCTA
CGGTGGGTTTTAACATGAGGAAAGTGACAAAAGGAAATGTTACTATCAAGCTATGGGATC
TTGGTGGTCAACCTAGGTTCCGGAGCATGTGGGAACGCTATTGCCGCGCTGTTTCCGCTA
TTGTGTATGTAGTTGATGCCGCAGATCCTGACAACCTAAGTGTCTCCAAAAGCGAACTCC
ATGATTTGTTGAACAAGACTTCGCTTAACGGTATCCCTCTTCTGGTTCTTGGGAACAAGA
TCGACAAACCTGGAGCTCTCTCTAAAGAAGCCTTAACCCACGAAATGGAGCTTCAGTCGC
TTACAGATAGAGAAGTTTGCTGTTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCAACATTGATC
AGGTCATTGATTGGCTGGTAAAGCATTCAAAATCAAAGAACTAAAAAACTTCACCAAGAA
GAACACACATTCTCTCTTCTCAAGTCCTCTTCCTGTATTGTTTGCCTGATGAAGACTATT
TTTAAACTCGTGTGGAAACAAGAGTTTGTCTCTATATTCTCCAGTCTTGTCTCTGTATAT
TAGATGTGGGATGGTATTCTATTCTAAAGCATTTGCAATT

QA 4 763 4 763
DS 



AS 1 4

CO CL2445Contig1 908 4 10 U
GGACTGACCAAAGTGTAACTTCCCCTCATTATAACACAGACACGATCTAAAGGGATCCTT
ATAATAACGAGACTGAGAGATGGCGAATGAAATACCTACCAAAGGGATCCTCAAGACCGA
AGCTCTGAAACATTACATCTTGGAAACGTCAGCATATCCAAGAGAGCATGGGCTGCTTAA
GGAACTCCGTAAAGCCACAGTCCAGAAATATGGCAATTTAAGCGAGATGGAAGTTCCGGT
TGATGAGGGCCTTCTTCTATCGATGCTTTTAAAGATCGCCAACGCTAAGAACACACTCGA
GCTCGGTGTTTTCACCGGTTACTCTCTTCTCTCCACGGCACTTGCTTTGCCTGAAGATGG
CCGCATTACTGCAATAGATATTGACAAAGAAGCCTACGAAGTGGGACTAGAGTTTATCAA
GAAGGCAGGTGTTGATCACAAGATCAATTTCATTCACTCCGATGGTATTAAGGCCTTAGA
CCAATTGGTGAAAGACAAAAAGGAGTTTGATTTCGCATTTGCGGATGCTGACAAGTCGAA
CTACGTCAACTTCCATGAGAGGCTTCTGAAATTGGTTAAGGTTGGAGGAATCATTGCGTT
CGACAACACCTTGTGGTTTGGTTTCGTGGCTGAGGACGAAGAGGGAGTTCCTGAACATAT
GAGGGAATATAGAAAGGCTCTTATAGAGTTCAATAAGAAACTGGCTTTGGATACACGAGT
TGAGGTCTCTCAGATTTCCATTAGAGATGGTTTCACGCCCTGTAGACGCCTTGTATGATC
AACAAATTCAAGACCAAGAGCAATTGGGAGTTTAGAATAAAACTGTTAGATCCTCCAATA
ATGACTTTTTCTTTGGTGTTACTATAAGTTTAATTAGTGCTTTTAATAAGATGTTTTAAC
TTTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2GQ54TF U 1
AF RR2GH96TF U 276
AF RR2GQ54JQ C 256
AF RR2GH96JQB C 276
BS 1 601 RR2GQ54TF
BS 602 633 RR2GH96TF
BS 634 634 RR2GQ54JQ
BS 635 682 RR2GH96TF
BS 683 742 RR2GQ54JQ
BS 743 743 RR2GH96JQB
BS 744 758 RR2GQ54JQ
BS 759 759 RR2GH96JQB
BS 760 907 RR2GQ54JQ
BS 908 908 RR2GH96JQB

RD RR2GQ54TF 601 0 0
GGACTGACCAAAGTGTAACTTCCCCTCATTATAACACAGACACGATCTAAAGGGATCCTT
ATAATAACGAGACTGAGAGATGGCGAATGAAATACCTACCAAAGGGATCCTCAAGACCGA
AGCTCTGAAACATTACATCTTGGAAACGTCAGCATATCCAAGAGAGCATGGGCTGCTTAA
GGAACTCCGTAAAGCCACAGTCCAGAAATATGGCAATTTAAGCGAGATGGAAGTTCCGGT
TGATGAGGGCCTTCTTCTATCGATGCTTTTAAAGATCGCCAACGCTAAGAACACACTCGA
GCTCGGTGTTTTCACCGGTTACTCTCTTCTCTCCACGGCACTTGCTTTGCCTGAAGATGG
CCGCATTACTGCAATAGATATTGACAAAGAAGCCTACGAAGTGGGACTAGAGTTTATCAA
GAAGGCAGGTGTTGATCACAAGATCAATTTCATTCACTCCGATGGTATTAAGGCCTTAGA
CCAATTGGTGAAAGACAAAAAGGAGTTTGATTTCGCATTTGCGGATGCTGACAAGTCGAA
CTACGTCAACTTCCATGAGAGGCTTCTGAAATTGGTTAAGGTTGGAGGAATCATTGCGTT
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2GH96TF 407 0 0
G
CGCCAACGCTAAGAACACACTCGAGCTCGGTGTTTTCACCGGTTACTCTCTTCTCTCCAC
GGCACTTGCTTTGCCTGAAGATGGCCGCATTACTGCAATAGATATTGACAAAGAAGCCTA
CGAAGTGGGACTAGAGTTTATCAAGAAGGCAGGTGTTGATCACAAGATCAATTTCATTCA
CTCCGATGGTATTAAGGCCTTAGACCAATTGGTGAAAGACAAAAAGGAGTTTGATTTCGC
ATTTGCGGATGCTGACAAGTCGAACTACGTCAACTTCCATGAGAGGCTTCTGAAATTGGT
TAAGGTTGGAGGAATCATTGCGTTCGACAACACCTTGTGGTTTGGTTTCGTGGCTGAAGA
CGAAGAGGGAGTTCCTGAACATATGAGGGAATATAGAAAGGCTCTT

QA 2 407 2 407
DS 

RD RR2GQ54JQ 653 0 0
TCTATCGATGCTTTTAAAGATCGCCAACGCTAAGAACACACTCGAGCTCGGTGTTTTCAC
CGGTTACTCTCTTCTCTCCACGGCACTTGCTTTGCCTGAAGATGGCCGCATTACTGCAAT
AGATATTGACAAAGAAGCCTACGAAGTGGGACTAGAGTTTATCAAGAAGGCAGGTGTTGA
TCACAAGATCAATTTCATTCACTCCGATGGTATTAAGGCCTTAGACCAATTGGTGAAAGA
CAAAAAGGAGTTTGATTTCGCATTTGCGGATGCTGACAAGTCGAACTACGTCAACTTCCA
TGAGAGGCTTCTGAAATTGGTTAAGGTTGGAGGAATCATTGCGTTCGACAACACCTTGTG
GTTTGGTTTCGTGGCTGAGGACGAAGAGGGAGTCCCTGAACATATGAGGGAATATAGAAA
GGCTCTTATAGAGTTCAATAAGAAACTGGCTTTGGATACACGAGTTGAGGTCTCTCAGAT
TTCCATTGGAGATGGTTTCACGCTCTGTAGACGCCTTGTATGATCAACAAATTCAAGACC
AAGAGCAATTGGGAGTTTAGAATAAAACTGTTAGATCCTCCAATAATGACTTTTTCTTTG
GTGTTACTATAAGTTTAATTAGTGCTTTTAATAAGATGTTTTAACTTTTAAG
T

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2GH96JQB 633 0 0
G
CGCCAACGCTAAGAACACACTCGAGCTCGGTGTTTTCACCGGTTACTCTCTTCTCTCCAC
GGCACTTGCTTTGCCTGAAGATGGCCGCATTACTGCAATAGATATTGACAAAGAAGCCTA
CGAAGTGGGACTAGAGTTTATCAAGAAGGCAGGTGTTGATCACAAGATCAATTTCATTCA
CTCCGATGGTATTAAGGCCTTAGACCAATTGGTGAAAGACAAAAAGGAGTTTGATTTCGC
ATTTGCGGATGCTGACAAGTCGAACTACGTCAACTTCCATGAGAGGCTTCTGAAATTGGT
TAAGGTTGGAGGAATCATTGCGTTCGACAACACCTTGTGGTTTGGTTTCGTGGCTGAGGA
CGAAGAGGGAGTTCCTGAACATATGAGGGAATATAGAAAGGCTCTTATAGAGTTCAATAA
GAAACTGGCTTTGGATACACGAGTTGAGGTCTCTCAGATTTCCATTAGAGATGGTTTCAC
GCCCTGTAGACGCCTTGTATGATCAACAAATTCAAGACCAAGAGCAATTGGGAGTTTAGA
ATAAAACTGTTAGATCCTCCAATAATGACTTTTTCTTTGGTGTTACTATAAGTTTAATTA
GTGCTTTTAATAAGATGTTTTAACTTTTAAGC

QA 2 633 2 633
DS 



AS 1 4

CO CL2446Contig1 1193 4 14 U
GGGAGAAGAAAATCTTATAAAATTCATTGCGTTTTTACCATATCTCTCTTTTTGTTAAGT
TTTGCAAAAGTGCACTTTATACCCAAAATCGAATCGAAAGGAGAAGGAAGGAAGGAAGGA
TGTGGGCGGAGATAATCTGCGCTCTGGCGATCTACAAACTCGTTCGCCTTTTCTTCTCCA
ACGACGACTTCTCCGACGTCGAAACCTCCGACTCCACTGCTCTCTTCTCCGTTGCTCACA
GACTGGAGAAGGTATATGGGGGAAAAGCATATGTAGGGCTTCGAATTCCAGATGCAGACA
CTTCTTCTAGACAGGACATCGATCTTGTCCTCGTCACTAATGGACAAGTTGAGGTGATCG
GTGTTAAGAATCTACATGGAATTGTTACGGTAACTAGGGATGGAAGCTGGGTCTGTGAAG
GTGGCAAGCATCATCATTCCACCCACACTTACCCTGATCCTCTGGCTGAAGTGAAGAAGC
AAGCTTCAGTTCTTGCGTCATATCTTGAACAGAGGGGCGTTACTTTACTTGAAGAAAATA
TCTCTTGCAAAGTTGTCATTCCCAACCCAAATTTTCGTACAATGCATGCATTTCCGAGTG
AGGTAATAACCTACGAAGAGTGGCAACATCTGAAACCAGTCTCAAGAAACATTCTTTCTG
GTTGGGTCAAAGGCGCCTTCAGCAGCACAGGAAAAGAGACGCAAGACTCTCCGCATCAAA
AACTTAACTTCATCCTTGGCTCGGCACCAGTCTGGGATAGGGTGGAGCTTAAAAACAGCA
AGATTGTGTTAGGGGAATTCCTGGAGTTTAAAGGAAAGGAGGAAGACACTTCGGCTTTGA
GACATATCAAAAGATCAAAAGTTGACCGTATCTCTATTCAGCAAACTAGCATGCTTGGAT
TCGCTCCAACAAGGTTACAAGTTCTGTACTCGTATAGGGACTACAGAAGTGAAGGAAGTT
CAGGATCAGAGACAAAGGAAGTGACTGTAAGGTCGAGCACCGAGGTTGTGTTCCAGCCCC
GAGACTCTGAAAAGATTAAGAAGTTCAAGCTATCGTCCATCATCTCCGTTTCACTAAGTG
CCTAACTGTTCTGTCAACAAATAAAAAGGCTGTTAATGTCTACTATATTATGACTTACAT
AGACCAATCCTGAAAATGAGCATATATTATTAAGAGAACTGTTTTTTTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ32TF U 1
AF RR2BC69TF U 54
AF RR2BC69JQ C 386
AF RR2CQ32JQ C 495
BS 1 118 RR2CQ32TF
BS 119 119 RR2BC69TF
BS 120 313 RR2CQ32TF
BS 314 314 RR2BC69TF
BS 315 672 RR2CQ32TF
BS 673 673 RR2BC69TF
BS 674 690 RR2CQ32TF
BS 691 815 RR2BC69TF
BS 816 968 RR2BC69JQ
BS 969 969 RR2CQ32JQ
BS 970 1136 RR2BC69JQ
BS 1137 1137 RR2CQ32JQ
BS 1138 1173 RR2BC69JQ
BS 1174 1193 RR2CQ32JQ

RD RR2CQ32TF 702 0 0
GGGAGAAGAAAATCTTATAAAATTCATTGCGTTTTTACCATATCTCTCTTTTTGTTAAGT
TTTGCAAAAGTGCACTTTATACCCAAAATCGAATCGAAAGGAGAAGGAAGGAAGGAAGTA
TGTGGGCGGAGATAATCTGCGCTCTGGCGATCTACAAACTCGTTCGCCTTTTCTTCTCCA
ACGACGACTTCTCCGACGTCGAAACCTCCGACTCCACTGCTCTCTTCTCCGTTGCTCACA
GACTGGAGAAGGTATATGGGGGAAAAGCATATGTAGGGCTTCGAATTCCAGATGCAGACA
CTTCTTCTAGACATGACATCGATCTTGTCCTCGTCACTAATGGACAAGTTGAGGTGATCG
GTGTTAAGAATCTACATGGAATTGTTACGGTAACTAGGGATGGAAGCTGGGTCTGTGAAG
GTGGCAAGCATCATCATTCCACCCACACTTACCCTGATCCTCTGGCTGAAGTGAAGAAGC
AAGCTTCAGTTCTTGCGTCATATCTTGAACAGAGGGGCGTTACTTTACTTGAAGAAAATA
TCTCTTGCAAAGTTGTCATTCCCAACCCAAATTTTCGTACAATGCATGCATTTCCGAGTG
AGGTAATAACCTACGAAGAGTGGCAACATCTGAAACCAGTCTCAAGAAACATTCTTTCTG
GTTGGGTCAAAG*CGCCTTCAGCAGCACAG
AAAGAGACGCAG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2BC69TF 762 0 0
GGG
AAGTTTTGCAAAAGTGCACTTTATACCCAAAATCGAATCGAAAGGAGAAGGAAGGAAGGA
AGGATGTGGGTGGAGATAATCTGCGCTCTGGCGATCTACAAACTCGTTCGCCTTTTCTTC
TCCAACGACGACTTCTCCGACGTCGAAACCTCCGACTCCACTGCTCTCTTCTCCGTTGCT
CACAGACTGGAGAAGGTATATGGGGGAAAAGCATATGTAGGGCTTCGAATTCCAGATGCA
GACACTTCTTCTAGACAGGACATCGATCTTGTCCTCGTCACTAATGGACAAGTTGAGGTG
ATCGGTGTTAAGAATCTACATGGAATTGTTACGGTAACTAGGGATGGAAGCTGGGTCTGT
GAAGGTGGCAAGCATCATCATTCCACCCACACTTACCCTGATCCTCTGGCTGAAGTGAAG
AAGCAAGCTTCAGTTCTTGCGTCATATCTTGAACAGAGGGGCGTTACTTTACTTGAAGAA
AATATCTCTTGCAAAGTTGTCATTCCCAACCCAAATTTTCGTACAATGCATGCATTTCCG
AGTGAGGTAATAACCTATGAAGAGTGGCAACATCTGAAACCAGTCTCAAGAAACATTCTT
TCTGGTTGGGTCAAAGGCGCCTTCAGCAGCACAGGAAAAGAGACGCAAGACTCTCCGCAT
CAAAAACTTAACTTCATCCTTGGCTCGGCACCAGTCTGGGATAGGGTGGAGCTTAAAAAC
AGCAAGATTGTGTTAGGGGAATTCCTGGAGTTTAAAGGA

QA 4 762 4 762
DS 

RD RR2BC69JQ 790 0 0
TACGGTAACTAGGGATGGAAGCTGGGTCTGTGAAGGTGGCAAGCATCATCATTCCACCCA
CACTTACCCTGATCCTCTGGCTGAAGTGAAGAAGCAAGCTTCAGTTCTTGCGTCATATCT
TGAACAGAGGGGCGTTACTTTACTTGAAGAAAATATCTCTTGCAAAGTTGTCATTCCCAA
CCCAAATTTTCGTACAATGCATGCATTTCCGAGTGAGGTAATAACCTATGAAGAGTGGCA
ACATCTGAAACCAGTCTCAAGAAACATTCTTTCTGGTTGGGTCAAAGGCGCCTTCAGCAG
CACAGGAAAAGAGACGCAAGACTCTCCGCATCAAAAACTTAACTTCATCCTTGGCTCGGC
ACCAGTCTGGGATAGGGTGGAGCTTAAAAACAGCAAGATTGTGTTAGGGGAATTCCTGGA
GTTTAAAGGAAAGGAGGAAGACACTTCGGCTTTGAGACATATCAAAAGATCAAAAGTTGA
CCGTATCTCTATTCAGCAAACTAGCATGCTTGGATTCGCTCCAACAAGGTTACAAGTTCT
GTACTCGTATAGGGACTACAGAAGTGAAGGAAGTTCAGGATCATAGACAAAGGAAGTGAC
TGTAAGGTCGAGCACCGAGGTTGTGTTCCAGCCCCGAGACTCTGAAAAGATTAAGAAGTT
CAAGCTATCGTCCATCATCTCCGTTTCACTAAGTGCCTAACTGTTCTGTCAACAAATAAA
AAGGCTGTTAATGTCTACTATATTATGACTTGCATAGACCAATCCTGAAAATGAGCATAT
ATTATTAA
AC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2CQ32JQ 699 0 0
GCGTCATATCTTGAACAGAGGGGCGTTACTTTACTTGAAGAAAATATCTCTTGCAAAGTT
GTCATTCCCAACCCAAATTTTCGTACAATGCATGCATTTCCGAGTGAGGTAATAACCTAC
GAAGAGTGGCAACATCTGAAACCAGTCTCAAGAAACATTCTTTCTGGTTGGGTCAAAGGC
GCCTTCAGCAGCACAGGAAAAGAGACGCAAGACTCTCCGCATCAAAAACTTAACTTCATC
CTTGGCTCGGCACCAGTCTGGGATAGGGTGGAGCTTAAAAACAGCAAGATTGTGTTAGGG
GAATTCCTGGAGTTTAAAGGAAAGGAGGAAGACACTTCGGCTTTGAGACATATCAAAAGA
TCAAAAGTTGACCGTATCTCTATTCAGCGAACTAGCATGCTTGGATTCGCTCCAACAAGG
TTACAAGTTCTGTACTCGTATAGGGACTACAGAAGTGAAGGAAGTTCAGGATCAGAGACA
AAGGAAGTGACTGTAAGGTCGAGCACCGAGGTTGTGTTCCAGCCCCGAGACTCTGAAAAG
ATTAAGAAGTTCAAGCTATCGTCCATCATCTCCGTTTCACTAAGTGCCTAACTGTTCTGT
CAACAGATAAAAAGGCTGTTAATGTCTACTATATTATGACTTACATAGACCAATCCTGAA
AATGAGCATATATTATTAAGAGAACTGTTTTTTTTTCTT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 4

CO CL2447Contig1 874 4 12 U
GGACCAAACATCTCTCTAAAACTATTTCTCTCTCTACAGTGAGTCAAACGGAGGAGGACG
ATGATGAAGGCTTCCGTCAAAGGCAAGTACGATGGCGGTAAGAGCACTGGAGTAGGCTCA
GTGGCCTTCAACGCCGGCGATATTAAGCTACGGCCTCTCTCTGGCCGTGGAGAAGCCTGG
TTTCTTCATCGTCGAGTATAACGTCCCTAAGAAAGATGTTAGGTTTCAGTTTATGAACAC
GGTGAGGGTTGCTGAGAAGCCATTGAATCTGACTTACATTCATAGCAGAGCTGATAACAG
AACAATCGTGGACGGGAGCCTTGTGGTTGATTCTGCGAACAAAGTCTCTGCTAATTACAT
GGTGGGAACGAACAACTGTAAGCTTAAGTATACTTATGCGCACGGAAGGATCGCTACATT
CGAGCCTTGCTACGACTTTGCCAAGAACGCTTGGGATTTTGCGGTTTCTAGGAGAGTTTA
TGGAGATGATGTTGTCAAGGCCACTTATCAAACGTCTACTAAGTTGCTTGGTGTAGAATG
GTCAAGGAGCTCCAAATCCACTGGATCTTTCAAGGTATGTGCGTCTGTGAATTTGGCGGA
GGAAGTGAAAACGCCGAAATTGATAGCAGAAACAACTTGGAACCTTGAAATCTAATGTCC
TTTTACGATTATTCAAATTCAAGTTTCCACCTGAATTGTTCGCTTGTTACCAACGATTTT
AATTAGACCTTTTTGCCAACCTTTTTTGTTGCAACATGACAACCCCCTTGTCGTTCTCAT
GTCTGGTCTCTCTTAAAAAATAATTTGTTGTAAGGGAAAAATGTACCCTAAACCTCTCTT
TTGAATGCGTAATAAAAATATGCAAATGGTTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BQ33JQ C 1
AF RR2BQ33TF U 1
AF RR2B185TF U 244
AF RR2B185JQ C 293
BS 1 411 RR2BQ33TF
BS 412 412 RR2B185TF
BS 413 417 RR2BQ33TF
BS 418 418 RR2B185TF
BS 419 447 RR2BQ33TF
BS 448 448 RR2B185TF
BS 449 518 RR2BQ33TF
BS 519 519 RR2B185TF
BS 520 676 RR2BQ33TF
BS 677 682 RR2B185TF
BS 683 721 RR2BQ33TF
BS 722 874 RR2B185TF

RD RR2BQ33JQ 741 0 0
GGACCAAACATCTCTCTAAAACTATTTCTCTCTCTACAGTGAGTCAAACGGAGGAGGACG
ATGATGAAGGCTTCCGTCAAAGGCAAGTACGATGGCGGTAAGAGCACTGGAGTAGGCTCA
GTGGCCTTCAACGCCGGCGATATTAAGCTACGGCCTCTCTCTGGCCGTGGAGAAGCCTGG
TTTCTTCATCGTCGAGTATAACGTCCCTAAGAAAGATGTTAGGTTTCAGTTTATGAACAC
GGTGAGGGTTGCTGAGAAGCCATTGAATCTGACTTACATTCATAGCAGAGCTGATAACAG
AACAATCGTGGACGGGAGCCTTGTGGTTGATTCTGCGAACAAAGTCTCTGCTAATTACAT
GGTGGGAACGAACAACTGTAAGCTTAAGTATACTTATGCGCACGGAAGGATTGCTACGTT
CGAGCCTTGCTACGACTTTGCCAAGAATGCTTGGGATTTTGCGGTTTCTAGGAGAGTTTA
TGGAGATGATGTTGTCAAGGCCACTTATCAAACGTCTAGTAAGTTGCTTGGTGTAGAATG
GTCAAGGAGCTCCAAATCCACTGGATCTTTCAAGGTATGTGCGTCTGTGAATTTGGCGGA
GGAAGTGAAAACGCCGAAATTGATAGCAGAAACAACTTGGAACCTTGAAATCTAATGTCC
TTTTACGATTATTCAA******GTTTCCACCTGAATTGTTCGCTTGTTACCAACGATTTT
AATTAGACCTTTTTGCCAACC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2BQ33TF 721 0 0
GGACCAAACATCTCTCTAAAACTATTTCTCTCTCTACAGTGAGTCAAACGGAGGAGGACG
ATGATGAAGGCTTCCGTCAAAGGCAAGTACGATGGCGGTAAGAGCACTGGAGTAGGCTCA
GTGGCCTTCAACGCCGGCGATATTAAGCTACGGCCTCTCTCTGGCCGTGGAGAAGCCTGG
TTTCTTCATCGTCGAGTATAACGTCCCTAAGAAAGATGTTAGGTTTCAGTTTATGAACAC
GGTGAGGGTTGCTGAGAAGCCATTGAATCTGACTTACATTCATAGCAGAGCTGATAACAG
AACAATCGTGGACGGGAGCCTTGTGGTTGATTCTGCGAACAAAGTCTCTGCTAATTACAT
GGTGGGAACGAACAACTGTAAGCTTAAGTATACTTATGCGCACGGAAGGATTGCTACGTT
CGAGCCTTGCTACGACTTTGCCAAGAATGCTTGGGATTTTGCGGTTTCTAGGAGAGTTTA
TGGAGATGATGTTGTCAAGGCCACTTATCAAACGTCTAGTAAGTTGCTTGGTGTAGAATG
GTCAAGGAGCTCCAAATCCACTGGATCTTTCAAGGTATGTGCGTCTGTGAATTTGGCGGA
GGAAGTGAAAACGCCGAAATTGATAGCAGAAACAACTTGGAACCTTGAAATCTAATGTCC
TTTTACGATTATTCAA******GTTTCCACCTGAATTGTTCGCTTGTTACCAACGATTTT
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2B185TF 631 0 0
GAGGGTTGCTGAGAAGCCATTGAATCTGACTTACATTCATAGCAGAGCTGATAACAGAAC
AATCGTTGACGGGAGCCTTGTGGTTGATTCTGCGAACAAAGTCTCTGCTAATTACATGGT
GGGAACGAACAACTGTAAGCTTAAGTATACTTATGCGCACGGAAGGATCGCTACATTCGA
GCCTTGCTACGACTTTGCCAAGAACTCTTGGGATTTTGCGGTTTCTAGGAGAGTTTATGG
GGATGATGTTGTCGAGGCCACTTATCAAACGTCTACTAAGTTGCTTGGTGTGGAATGGTC
AAGGAGCTCCAAATCCACTGGATCTTTCAAGGTATTTGCGTCTGTGAATTTGGCGGAGGA
AGTGAAAACGCCGAAATTGATAGCAGAAACAACTTGGAACCTTGAAATCTAATGTTCTTT
*ACGATTATTCAAATTCAAGTTTCCACCTGAATTGTTCGCTTGTTACCAACGATTTTAAT
TAGACCTTTTTGCCAACCTTTTTTGTTGCAACATGACAACCCCCTTGTCGTTCTCATGTC
TGGTCTCTCTTAAAAAATAATTTGTTGTAAGGGAAAAATGTACCCTAAACCTCTCTTTTG
AATGCGTAATAAAAATATGCAAATGGTTCCC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2B185JQ 582 0 0
GATAACAGAACAATCGTTGACGGGAGCCTTGTGGTTGATTCTGCGAACAAAGTCTCTGCT
AATTACATGGTGGGAACGAACAACTGTAAGCTTAAGTATACTTATGCGCACGGAAGGATC
GCTACATTCGAGCCTTGCTACGACTTTGCCAAGAACTCTTGGGATTTTGCGGTTTCTAGG
AGAGTTTATGGGGATGATGTTGTCGAGGCCACTTATCAAACGTCTACTAAGTTGCTTGGT
GTGGAATGGTCAAGGAGCTCCAAATCCACTGGATCTTTCAAGGTATTTGCGTCTGTGAAT
TTGGCGGAGGAAGTGAAAACGCCGAAATTGATAGCAGAAACAACTTGGAACCTTGAAATC
TAATGTTCTTT*ACGATTATTCAAATTCAAGTTTCCACCTGAATTGTTCGCTTGTTACCA
ACGATTTTAATTAGACCTTTTTGCCAACCTTTTTTGTTGCAACATGACAACCCCCTTGTC
GTTCTCATGTCTGGTCTCTCTTAAAAAATAATTTGTTGTAAGGGAAAAATGTACCCTAAA
CCTCTCTTTTGAATGCGTAATAAAAATATGCAAATGGTTCCC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 4

CO CL2448Contig1 490 4 3 U
GGATAGACACAACCGACGAGGAGGAGCTCAGAAGAGAGAGTGAGAGAGA**TCAGATAGT
GAGAAAAAATGCCGGTGATGGAGAAACTGAGGATGTTCGTGGCGCAGGAGCCTGTTGTCG
CCGCCTCCTGTTTAATCGGCGGTGTTGGACTCTTTCTGCCTGCTGTTGTGAGGCCTATTC
TAGACTCACTCGAGGCTTCTAAGCAAGTTAAAGCGCCTCCTCTTGCCGATGTTATTGCTG
GTGTCACAGGGAAGAAACAGACCTAATCCAAGCAATGATTTCCTCTGTTTTCTTACATTC
AGATCATCATTTTTCCTTTTTGTCTTTTAACTCTTTCTATTTGCAAATGAAATAAGCCAA
ACTTCATTGTTTTTTTTTGTTTTGAAACTTATATAAAGGCATATGTGCTTGTACACACTC
TCTTCGTCTTTTTATCACATGTATTCATTTCCTAATGACAAATCGAAAAGCTTGCAACTT
TTTGTTTGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB69JQ C 1
AF RR2FB69TF U 1
AF RR2BI87TF U 9
AF RR2CP94TF U 10
BS 1 416 RR2FB69TF
BS 417 459 RR2BI87TF
BS 460 490 RR2CP94TF

RD RR2FB69JQ 416 0 0
GGATAGACACAACCGACGAGGAGGAGCTCAGAAGAGAGAGTGAGAGAGA**TCAGATAGT
GAGAAAAAATGCCGGTGATGGAGAAACTGAGGATGTTCGTGGCGCAGGAGCCTGTTGTCG
CCGCCTCCTGTTTAATCGGCGGTGTTGGACTCTTTCTGCCTGCTGTTGTGAGGCCTATTC
TAGACTCACTCGAGGCTTTTAAGCAAGTTAAAGCGCCTCCTCTTGCCGATGTTATTGCTG
GTGTCACAGGGAAGAAACAGACCTAATCCAAGCAATGATTTCCTCTGTTTTCTTACATTC
AGATCATCATTTTTCCTTTTTGTCTTTTAACTCTTTCTATTTGCAAATGAAATAAGCCAA
ACTTCATTGTTTTTTTTTGTTTTGAAACTTATATAAAGGCATATGTGCTTGTACAC

QA 1 416 1 416
DS 

RD RR2FB69TF 416 0 0
GGATAGACACAACCGACGAGGAGGAGCTCAGAAGAGAGAGTGAGAGAGA**TCAGATAGT
GAGAAAAAATGCCGGTGATGGAGAAACTGAGGATGTTCGTGGCGCAGGAGCCTGTTGTCG
CCGCCTCCTGTTTAATCGGCGGTGTTGGACTCTTTCTGCCTGCTGTTGTGAGGCCTATTC
TAGACTCACTCGAGGCTTCTAAGCAAGTTAAAGCGCCTCCTCTTGCCGATGTTATTGCTG
GTGTCACAGGGAAGAAACAGACCTAATCCAAGCAATGATTTCCTCTGTTTTCTTACATTC
AGATCATCATTTTTCCTTTTTGTCTTTTAACTCTTTCTATTTGCAAATGAAATAAGCCAA
ACTTCATTGTTTTTTTTTGTTTTGAAACTTATATAAAGGCATATGTGCTTGTACAC

QA 1 416 1 416
DS 

RD RR2BI87TF 451 0 0
GGA
ACCGACGAGGAGGAGCTCAGAAGAGAGAGTGAGAGAGAGATCAGATAGTGAGAAAAAATG
CCGGTGATGGAGAAACTGAGGATGTTCGTGGCGCAGGAGCCTGTTGTCGCCGCCTCCTGT
TTAATCGGCGGTGTTGGACTCTTTCTGCCTGCTGTTGTGAGGCCTATTCTAGACTCACTC
GAGGCTTCTAAGCAAGTTAAAGCGCCTCCTCTTGCCGATGTTATTGCTGGTGTCACAGGG
AAGAAACAGACCTAATCCAAGCAATGATTTCCTCTGTTTTCTTACATTCAGATCATCATT
TTTCCTTTTTGTCTTTTAACTCTTTCTATTTGCAAATGAAATAAGCCAAACTTCATTGTT
TTTTTTTGTTTTGAAACTTATATAAAGGCATATGTGCTTGTACACACTCTCTTCGTCTTT
TTATCACATGTATTCATTTCCTAATGAC

QA 4 451 4 451
DS 

RD RR2CP94TF 481 0 0
GG
ACCGACGAGGAGGAGCTCAGAAGAGAGAGTGAGAGAGAGATCAGATAGTGAGAAAAAATG
CCGGTGATGGAGAAACTGAGGATGTTCGTGGCGCAGGAGCCTGTTGTCGCCGCCTCCTGT
TTAATCGGCGGTGTTGGACTCTTTCTGCCTGCTGTTGTGAGGCCTATTCTAGACTCACTC
GAGGCTTCTAAGCAAGTTAAAGCGCCTCCTCTTGCCGATGTTATTGCTGGTGTCACAGGG
AAGAAACAGACCTAATCCAAGCAATGATTTCCTCTGTTTTCTTACATTCAGATCATCATT
TTTCCTTTTTGTCTTTTAACTCTTTCTATTTGCAAATGAAATAAGCCAAACTTCATTGTT
TTTTTTTGTTTTGAAACTTATATAAAGGCATATGTGCTTGTACACACTCTCTTCGTCTTT
TTATCACATGTATTCATTTCCTAATGACAAATCGAAAAGCTTGCAACTTTTTGTTTGCC

QA 3 481 3 481
DS 



AS 1 4

CO CL2449Contig1 975 4 7 U
GGATAAATAAATAATAATAAAAGAGAGGAGAGGGAATAAGGAGGAGTCGAATCGAAGGTC
GATCGATCAATCAATAGAGGAGGAGGAGGAGCAGCAGATCTGTTAATTATGGGCGTTATT
AAATTTGGAGTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTGGGGCTGACCACCTGTGATGCTTCTCTT
CACCAAGCATCTGCTCATGATAACCAAGTTTGTGAGTTGTGTGATAAGTATCTCACCCTC
GCCATTGATTACCTCCAAAATGACGACAACCAGAATGCACTCGTTGAGGCCCTCCACATG
ACCTGCTCCCAGATTCCTCCTTTGCAAAAACAGTGTCTTTCCATGGTAGATCATTATACC
CAACTTTTCTTCACTCGAGTCTCTCTTCTCAACCCCCACGGCATCTGCAAAACCCTTAAC
CTCTGTCAACCACTCCTTGCTTCCCAAGGAAACTGTGAGGCTTGCCACGATACTGTCTCT
CAGCTTGTCACCAAACTCAAGGATCCTCAAACTAAGCTCAAGATAATTCGCTTGCTTCTC
AAGGAATGCAAGTCCCTCACCAATTACCAGGACAAGTGCAAGAAGATGGTGTTCGAGTAC
GGCCCACTGATGCTTGCCGATTTGGAAAATTTTCTGGAAAAGAAAGACGTCTGTTTTATC
CTTGGCGTCTGTCCACCTCCACCCACCCACAGTTTCTACCTCCTTCCTGCAGCGCTGGCA
GATTCTTAAATTTGACCACCCTTTCTTTTTCTTTTTACCTTCATTCCCTTGGTAACAATA
ACATTCTCACAGAAAGGTTTTCATGTTTTGGATAACCGTTGGGTGTTTACTATACATTGA
TGGGCTTCTCTGGCCCAGTTTCTTAATGGGCTTTGCTTAGTGTTCATTCTCGCATTGTTT
GATATGTAATGTTTGCCTCTGAAGCTTCAAATGAAGCAGGCTTGGCTTTTGTTTTTTCAT
TTTTTATTTAAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC77TF U 1
AF RR2GP63JQ C 497
AF RR2GP63TF U 499
AF RR2GC77JQ C 284
BS 1 736 RR2GC77TF
BS 737 737 RR2GP63TF
BS 738 749 RR2GC77TF
BS 750 752 RR2GP63TF
BS 753 771 RR2GC77TF
BS 772 947 RR2GP63TF
BS 948 975 RR2GC77JQ

RD RR2GC77TF 771 0 0
GGATAAATAAATAATAATAAAAGAGAGGAGAGGGAATAAGGAGGAGTCGAATCGAAGGTC
GATCGATCAATCAATAGAGGAGGAGGAGGAGCAGCAGATCTGTTAATTATGGGCGTTATT
AAATTTGGAGTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTGGGGCTGACCACCTGTGATGCTTCTCTT
CACCAAGCATCTGCTCATGATAACCAAGTTTGTGAGTTGTGTGATAAGTATCTCACCCTC
GCCATTGATTACCTCCAAAATGACGACAACCAGAATGCACTCGTTGAGGCCCTCCACATG
ACCTGCTCCCAGATTCCTCCTTTGCAAAAACAGTGTCTTTCCATGGTAGATCATTATACC
CAACTTTTCTTCACTCGAGTCTCTCTTCTCAACCCCCACGGCATCTGCAAAACCCTTAAC
CTCTGTCAACCACTCCTTGCTTCCCAAGGAAACTGTGAGGCTTGCCACGATACTGTCTCT
CAGCTTGTCACCAAACTCAAGGATCCTCAAACTAAGCTCAAGATAATTCGCTTGCTTCTC
AAGGAATGCAAGTCCCTCACCAATTACCAGGACAAGTGCAAGAAGATGGTGTTCGAGTAC
GGCCCACTGATGCTTGCCGATTTGGAAAATTTTCTGGAAAAGAAAGACGTCTGTTTTATC
CTTGGCGTCTGTCCACCTCCACCCACCCACAGTTTCTACCTCCTTCCTGCAGCGCTGGCA
GATTCTTAAATTTGAC*ACCCTTTCTTTTC**TTTTACCTTCATTCCCTTG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2GP63JQ 451 0 0
GC
AAGGATCCTCAAACTAAGCTCAAGATAATTCGCTTGCTTCTCAAGGAATGCAAGTCCCTC
ACCAATTACCAGGACAAGTGCAAGAAGATGGTGTTCGAGTACGGCCCACTGATGCTTGCC
GATTTGGAAAATTTTCTGGAAAAGAAAGACGTCTGTTTTATCCTTGGCGTCTGTCCACCT
CCACCCACCCACAGTTTCTACCTCCTTCCTGCAGCGCTGGCAGATTCTTAAATTTGACCA
CCCTTTCTTTTTCTTTTTACCTTCATTCCCTTGGTAACAATAACATTCTCACAGAAAGGT
TTTCATGTTTTGGATAACCGTTGGGTGTTTACTATACATTGATGGGCTTCTCTGGCCCAG
TTTCTTAATGGGCTTTGCTTAGTGTTCATTCTCGCATTGTTTGATATGTAATGTTTGCCT
CTGAAGCTTCAAATGAAGCAGGCTTGGCT

QA 3 451 3 451
DS 

RD RR2GP63TF 449 0 0
AAGGATCCTCAAACTAAGCTCAAGATAATTCGCTTGCTTCTCAAGGAATGCAAGTCCCTC
ACCAATTACCAGGACAAGTGCAAGAAGATGGTGTTCGAGTACGGCCCACTGATGCTTGCC
GATTTGGAAAATTTTCTGGAAAAGAAAGACGTCTGTTTTATCCTTGGCGTCTGTCCACCT
CCACCCACCCACAGTTTCTACCTCCTTCCTGCAGCGCTGGCAGATTCTTAAATTTGACCA
CCCTTTCTTTTTCTTTTTACCTTCATTCCCTTGGTAACAATAACATTCTCACAGAAAGGT
TTTCATGTTTTGGATAACCGTTGGGTGTTTACTATACATTGATGGGCTTCTCTGGCCCAG
TTTCTTAATGGGCTTTGCTTAGTGTTCATTCTCGCATTGTTTGATATGTAATGTTTGCCT
CTGAAGCTTCAAATGAAGCAGGCTTGGCT

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2GC77JQ 692 0 0
TTGAGGCCCTCCACATGAC*TGCTCCCAGATTCCTCCTTTGCAAAAACAGTGTCTTTCCA
TGGTAGATCATTATACCCAACTTTTCTTCACTCGAGTCTCTCTTCTCAACCCCCACGGCA
TCTGCAAAACCCTTAACCTCTGTCAACCACTCCTTGCTTCCCAAGGAAACTGTGAGGCTT
GCCACGATACTGTCTCTCAGCTTGTCACCAAACTCAAGGATCCTCAAACTAAGCTCAAGA
TAATTCGCTTGCTTCTCAAGGAATGCAAGTCCCTCACCAATTACCAGGACAAGTGCAAGA
AGATGGTGTTCGAGTACGGCCCACTGATGCTTGCCGATTTGGAAAATTTTCTGGAAAAGA
AAGACGTCTGTTTTATCCTTGGCGTCTGTCCACCTCCACCCACCCACAGTTTCTACCTCC
TTCCTGCAGCGCTGGCAGATTCTTAAATTTGACCACCCTTTCTTTTTCTTTTTACCTTCA
TTCCCTTGGTAACAATAACATTCTCACAGAAAGGTTTTCATGTTTTGGATAACCGTTGGG
TGTTTACTATACATTGATGGGCTTTTCTGGCCCAGTTTCTTAATGGGCTTTGCTTAGTGT
TCATTCTCGCATTGTTTGATATGTAATGTTTGCCTCTGAAGCTTCAAATGAAGCAGGCTT
GGCTTTTGTTTTTTCATTTTTTATTTAAAGTC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 4

CO CL2450Contig1 675 4 7 U
GAAGAAAAAACGCATCTCCAACTTTTCTTTATCGAAACATCTAATTTAATGGAGTCATCT
TCTTCTCTCCTTCACCACTCTTACCTCTCTTACCTCAATCCTCCAAAACTTAGAAAGCCT
TCACTTTCTTATCCATCAATGCAGAAATTTCGAAATCGCAAACCAACTCGCATTTGTTCT
AACAAGATGTACGTTCCCGGCTTTGGAGAAGCTTCACCTGAGGCTAAGGCAGCGAAGCAT
CTGCATGACTTTTTTACTTATGTTGCAGTGAGGATAGTGTCTGCTCAGCTTGAGAGTTAT
AACCCTGAGGCGTATATGGAGTTAAGAGAATCCTTAGACACAAACTCTGTTAGTGACGGT
GATAAGTTCTGTGCTGCTCTCATGCGTCGATCTTCACGTCACATGAACTTAGCCCTTCGA
ATTTTAGAGGTACGGTCTGCTTACTGTAAAAACGATTTCGAATGGGACAATTTACAGCGC
CTCGCGTTCAAGAATGTGGATAGATCCAACACAAAACTCATGCGTGAATACGTCTTGGAG
ACTAGCCATGTTGAAACTGATCCAGATAAGTGAAAGCTCAGAGTATACACACATGAAACC
GTTTGTACATACACATAAGTATATATACCATTGTTCTTGTTAAACTCAGGGTTTTAATCA
TAGACTATTTGCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BY67JQ C 61
AF RR2BY67TF U 12
AF RR2DF82TF U 1
AF RR2DF82JQ C 61
BS 1 331 RR2DF82TF
BS 332 332 RR2BY67TF
BS 333 476 RR2DF82TF
BS 477 477 RR2BY67TF
BS 478 650 RR2DF82TF
BS 651 651 RR2DF82JQ
BS 652 675 RR2DF82TF

RD RR2BY67JQ 581 0 0
TCTTCTCTCCTTCACCACTCTTACCTCTCTTACTTCAATCCTCCAAAACTTAGAAAGCCT
TCACTTTTTTATCCATCAATGCAGAAATTTCGAAATCGCAAACCAACTCGCATTTGTTCT
AACAAGATGTACGTTCCCGGCTTTGGAGAAGCTTCACCTGAGGCTAAGGCAGCGAAGCAT
CTGCATGACTTTTTTACTTATGTTGCAGTGAGGATAGTGTCTGCTCAGCTTGAGAGTTAT
AACCCTGAGGCGTATATGGAGTTAAGAGAATCCTTAGACACAAACTCTGTTAGTGACGGT
GATAAGTTCTGTGCTGCTCTCATGCGTCGATCTTCACGTCACATGAACTTAGCCCTTCGA
ATTTTAGAGGTACGGTCTGCTTACTGTAAAAACGATTTCGAATGGGACAATTTACAGCGC
CTCGCGTTCAAGAATGTGGATAGATCCAACACAAAACTCATGCGTGAATACGTCTTGGAG
ACTAGCCATGTTGAAACTGATCCAGATAAGTGAAAGCTCAGAGTATACACACATGAAACC
GTTTGTACATACACATAAGTATATATACCATTGTTCTTGTT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2BY67TF 630 0 0
GCATCTCCAACTTTTCTTTATCGAAACATCTAATTTAATGGAGTCATCTTCTTCTCTCCT
TCACCACTCTTACCTCTCTTACTTCAATCCTCCAAAACTTAGAAAGCCTTCACTTTCTTA
TCCATCAATGCAGAAATTTCGAAATCGCAAACCAACTCGCATTTGTTCTAACAAGATGTA
CGTTCCCGGCTTTGGAGAAGCTTCACCTGAGGCTAAGGCAGCGAAGCATCTGCATGACTT
TTTTACTTATGTTGCAGTGAGGATAGTGTCTGCTCAGCTTGAGAGTTATAACCCTGAGGC
GTATATGGAGTTAAGAGAATCCTTAGACACAAACTCTGTTAGTGACGGTGATAAGTTCTG
TGCTGCTCTCATGCGTCGATCTTCACGTCACATGAACTTAGCCCTTCGAATTTTAGAGGT
ACGGTCTGCTTACTGTAAAAACGATTTCGAATGGGACAATTTACAGCGCCTCGCGTTCAA
GAATGTGGATAGATCCAACACAAAACTCATGCGTGAATACGTCTTGGAGACTAGCCATGT
TGAAACTGATCCAGATAAGTGAAAGCTCAGAGTATACACACATGAAACCGTTTGTACATA
CACATAAGTATATATACCATTGTTCTTGTT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2DF82TF 675 0 0
GAAGAAAAAACGCATCTCCAACTTTTCTTTATCGAAACATCTAATTTAATGGAGTCATCT
TCTTCTCTCCTTCACCACTCTTACCTCTCTTACCTCAATCCTCCAAAACTTAGAAAGCCT
TCACTTTCTTATCCATCAATGCAGAAATTTCGAAATCGCAAACCAACTCGCATTTGTTCT
AACAAGATGTACGTTCCCGGCTTTGGAGAAGCTTCACCTGAGGCTAAGGCAGCGAAGCAT
CTGCATGACTTTTTTACTTATGTTGCAGTGAGGATAGTGTCTGCTCAGCTTGAGAGTTAT
AACCCTGAGGCGTATATGGAGTTAAGAGAATTCTTAGACACAAACTCTGTTAGTGACGGT
GATAAGTTCTGTGCTGCTCTCATGCGTCGATCTTCACGTCACATGAACTTAGCCCTTCGA
ATTTTAGAGGTACGGTCTGCTTACTGTAAAAACGATTTCGAATGGGACAATTTACATCGC
CTCGCGTTCAAGAATGTGGATAGATCCAACACAAAACTCATGCGTGAATACGTCTTGGAG
ACTAGCCATGTTGAAACTGATCCAGATAAGTGAAAGCTCAGAGTATACACACATGAAACC
GTTTGTACATACACATAAGTATATATACCATTGTTCTTGTTAAACTCAGG*TTTTAATCA
TAGACTATTTGCTTG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2DF82JQ 615 0 0
TCTTCTCTCCTTCACCACTCTTACCTCTCTTACCTCAATCCTCCAAAACTTAGAAAGCCT
TCACTTTCTTATCCATCAATGCAGAAATTTCGAAATCGCAAACCAACTCGCATTTGTTCT
AACAAGATGTACGTTCCCGGCTTTGGAGAAGCTTCACCTGAGGCTAAGGCAGCGAAGCAT
CTGCATGACTTTTTTACTTATGTTGCAGTGAGGATAGTGTCTGCTCAGCTTGAGAGTTAT
AACCCTGAGGCGTATATGGAGTTAAGAGAATTCTTAGACACAAACTCTGTTAGTGACGGT
GATAAGTTCTGTGCTGCTCTCATGCGTCGATCTTCACGTCACATGAACTTAGCCCTTCGA
ATTTTAGAGGTACGGTCTGCTTACTGTAAAAACGATTTCGAATGGGACAATTTACATCGC
CTCGCGTTCAAGAATGTGGATAGATCCAACACAAAACTCATGCGTGAATACGTCTTGGAG
ACTAGCCATGTTGAAACTGATCCAGATAAGTGAAAGCTCAGAGTATACACACATGAAACC
GTTTGTACATACACATAAGTATATATACCATTGTTCTTGTTAAACTCAGGGTTTTAATCA
TAGACTATTTGCTTG

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 4

CO CL2451Contig1 441 4 5 U
TTTTTTCCAACCCTAATCGAGAACCGCCGATACGTAAGAGATCAGGTGCCAGAATCAAAG
AAAAGGGTTTAATCATGGCCAATCAGAAAGGCGCTCTCGAAGGCTTTTACAGACTGATCA
TGCGCCGTAACTCCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGG
CTGTGGATTACGGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGGAAACGGTACGAAG
ACATCTCTGTGTTGGGTCAAAGGCCAATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTACGAATCTTC
TCAGACTAAAAGAAAGAAATGAAAATTTCCTTGCTGTTTTGCAAGTCTCTTCTCTTGTTC
AATAAATCATTGGGATGATTTTAATACTTCCACCTAAAGCACGCTTATCGTTCTGATTAA
TTGAATTTTCTTCATTGTGGC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2EG31JQ C 1
AF RR2EK89JQ C 1
AF RR2EK89TF U 1
AF RR2EG31TF U 1
BS 1 333 RR2EK89TF
BS 334 334 RR2EG31TF
BS 335 389 RR2EK89TF
BS 390 390 RR2EG31TF
BS 391 441 RR2EK89TF

RD RR2EG31JQ 441 0 0
TTTTTTCCAACCCTAATCGAGAACCGCCGATACGTAAGAGATCAGGTGCCAGAATCAAAG
AAAAGGGTTTAATCATGGCCAATCAGAAAGGCGCTCTCGAAGGCTTTTACAGACTGATCA
TGCGCCGTAACTCCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGG
CTGTGGATTACGGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGGAAACGGTACGAAG
ACATCTCTGTGTTGGGTCAAAGGCCAATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTACGAATCTTC
TCAGACTAAAAGAAAGAAATGAAAATTTCCTTGCTGTTTTGCAAGTCTCTTCTCTTGTTC
AATAAATCATTGGGATGATTTTAATACTTCCACCTAAAGCACGCTTATCGTTCTGATTAA
TTGAATTTTCTTCATTGTGGC

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR2EK89JQ 441 0 0
TTTTTTCCAACCCTAATCGAGAACCGCCGATACGTAAGAGATCAGGTGCCAGAATCAAAG
AAAAGGGTTTAATCATGGCCAATCAGAAAGGCGCTCTCGAAGGCTTTTACAGACTGATCA
TGCGCCGTAACTCCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTTTTCGGCGAACGGG
CTGTGGATTACGGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGGAAACGGTACGAAG
ACATCTCTGTGTTGGGTCAAAGGCCAATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTACGAATCTTC
TCAGACTAAAAGAAAGAAATGAAAATTTCCTTGTTGTTTTGCAAGTCTCTTCTCTTGTTC
AATAAATCATTGGGATGATTTTAATACTTTCACCTAAAGCACGCTTATCGTTCTGATTAA
TTGAATTTTCTTCATTGTGGC

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR2EK89TF 441 0 0
TTTTTTCCAACCCTAATCGAGAACCGCCGATACGTAAGAGATCAGGTGCCAGAATCAAAG
AAAAGGGTTTAATCATGGCCAATCAGAAAGGCGCTCTCGAAGGCTTTTACAGACTGATCA
TGCGCCGTAACTCCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGG
CTGTGGATTACGGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGGAAACGGTACGAAG
ACATCTCTGTGTTGGGTCAAAGGCCAATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTACGAATCTTC
TCAGACTAAAAGAAAGAAATGAAAATTTCCTTGTTGTTTTGCAAGTCTCTTCTCTTGTTC
AATAAATCATTGGGATGATTTTAATACTTTCACCTAAAGCACGCTTATCGTTCTGATTAA
TTGAATTTTCTTCATTGTGGC

QA 1 441 1 441
DS 

RD RR2EG31TF 441 0 0
TTTTTTCCAACCCTAATCGAGAACCGCCGATACGTAAGAGATCAGGTGCCAGAATCAAAG
AAAAGGGTTTAATCATGGCCAATCAGAAAGGCGCTCTCGAAGGCTTTTACAGACTGATCA
TGCGCCGTAACTCCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGG
CTGTGGATTACGGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGGAAACGGTACGAAG
ACATCTCTGTGTTGGGTCAAAGGCCAATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTACGAATCTTC
TCAGACTAAAAGAAAGAAATGAAAATTTCCTTGCTGTTTTGCAAGTCTCTTCTCTTGTTC
AATAAATCATTGGGATGATTTTAATACTTCCACCTAAAGCACGCTTATCGTTCTGATTAA
TTGAATTTTCTTCATTGTGGC

QA 1 441 1 441
DS 



AS 1 4

CO CL2452Contig1 1256 4 14 U
GGACTTCCGTCTCCGACCATCTCTCCGCCTCTGCAATGTCGACTAGATCACCGATCACTT
CCTCTCGGAACAGTCTTCTTCTTCCTTCTGTTCTGGTCATCCTTGTTGGAATAATCTCGG
CGTTGACTTATCAGTCGATACTAAAACCTCCTCCGTCGAAGCTATGTGGCTCCCCCGGAG
GTCCACCGATCACAGCACCGCGGATTAAGCTCCGAGACGGGAGGTACTTAGCGTACAAAG
AGCATGGAGTTCCAAGAGAGGAAGCTCGCCGCAAAGTTATCTTCATCCACGGATCCGATT
GTTGTCGACACGACGCTGTTTACGCCACTCGCCTCTCTCCGGGTTTAATTGAGGAGCTTG
GCATGTATCTGGTTTCGTTTGACCGACCCGGTTACGGAGAGAGCGACCCGGATCCGAACC
GTACTCCAAAGAGCTTGGCTCTAGACGTTGAAGAGCTTGCTGATCAGTTGCATCTTGGAG
AGAAGTTCTACCTGATCGGTTACTCCATGGGAGGACAAGCCACATGGGGATGTCTCAAGT
ACATCCCTCACCGGCTTGCCGGAGTGACGCTCGTCGCTCCGGTGGTTAACTACTGGTGGA
AGAACTTACCTTTGAATGTTTCCACGCAAGGTTACACCTTGCAACCAAAGAGAGATCAGT
GGGCGGTTCGTGTTGCTCACTACGCTCCTTGGCTTATCTACTGGTGGAACATGCAGAAGT
GGTTCCCGGGTTCGAGCGTGGCGAACCGAGATGGTAGTAGCTTCTCACAGCCGGATAAAG
ATATCGTTTTGAAGCTTGGTTCTTCGAGGAAACCGCATTTGGCGGAAGTGAGGCCGCAAG
GGTTGCATGAGAGTATTAACCGTGACATGGTTGTTGGGTTTGGGAGTTGGGAGTTTGATC
CTATTGATCTCGAGGACCCGTTTTTGAAGAGCCATCAAGGCTCTGTTCATCTGTGGCAAG
GAGATGATGATATGTTAGTACCTGTGGTGCCGCAGCGTTATATTGCTGAGAAGCTTTCGT
GGATTCACTATCATGAGGTTCCGGGAAGTGGCCACTTCCTCCACTACAATGAAGGTATGG
TTGATGACATTGTAAAGACGCTTTTCAAAACCGATACTGAGAATTGATGAACTATCCAAC
TACCACAATGGTCTGAAAATGAAATGTTTGTATTTTGTTGGTCTGGAAATGAAATGTTCG
TATTTTGTTGTATTTGTAAGATCCCATACTAAGTCGAGTGTTCACAGTTGCACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E832TF U 1
AF RR2CR52TF U 420
AF RR2CR52JQ C 555
AF RR2E832JQ C 578
BS 1 740 RR2E832TF
BS 741 741 RR2CR52TF
BS 742 773 RR2E832TF
BS 774 1037 RR2CR52TF
BS 1038 1038 RR2CR52JQ
BS 1039 1109 RR2CR52TF
BS 1110 1110 RR2CR52JQ
BS 1111 1138 RR2CR52TF
BS 1139 1139 RR2CR52JQ
BS 1140 1158 RR2CR52TF
BS 1159 1159 RR2CR52JQ
BS 1160 1169 RR2CR52TF
BS 1170 1210 RR2CR52JQ
BS 1211 1256 RR2E832JQ

RD RR2E832TF 784 0 0
GGACTTCCGTCTCCGACCATCTCTCCGCCTCTGCAATGTCGACTAGATCACCGATCACTT
CCTCTCGGAACAGTCTTCTTCTTCCTTCTGTTCTGGTCATCCTTGTTGGAATAATCTCGG
CGTTGACTTATCAGTCGATACTAAAACCTCCTCCGTCGAAGCTATGTGGCTCCCCCGGAG
GTCCACCGATCACAGCACCGCGGATTAAGCTCCGAGACGGGAGGTACTTAGCGTACAAAG
AGCATGGAGTTCCAAGAGAGGAAGCTCGCCGCAAAGTTATCTTCATCCACGGATCCGATT
GTTGTCGACACGACGCTGTTTACGCCACTCGCCTCTCTCCGGGTTTAATTGAGGAGCTTG
GCATGTATCTGGTTTCGTTTGACCGACCCGGTTACGGAGAGAGCGACCCGGATCCGAACC
GTACTCCAAAGAGCTTGGCTCTAGACGTTGAAGAGCTTGCTGATCAGTTGCATCTTGGAG
AGAAGTTCTACCTGATCGGTTACTCCATGGGAGGACAAGCCACATGGGGATGTCTCAAGT
ACATCCCTCACCGGCTTGCCGGAGTGACGCTCGTCGCTCCGGTGGTTAACTACTGGTGGA
AGAACTTACCTTTGAATGTTTCCACGCAAGGTTACACCTTGCAACCAAAGAGAGATCAGT
GGGCGGTTCGTGTTGCTCACTACGCTCCTTGGCTTATCTACTGGTGGAACATGCAGAAGT
GGTTCCCGGGTTCGAGCGTG*CGAACCGAGATGGTAGTAGCTTCTCACAGCCG
ATAAGATATTG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2CR52TF 750 0 0
G
GTACTCCAAAGAGCTTGGCTTTAGCCGTTGAAGAGCTTGCTGATCAGTTGCATCTTGGAG
AGAAGTTCTACCTGATCGGTTACTCCATGGGAGGACAAGCCACATGGGGATGTCTCAAGT
ACATCCCTCACCGGCTTGCCGGAGTGACGCTCGTCGCTCCGGTGGTTAACTACTGGTGGA
AGAACTTACCTTTGAATGTTTCCACGCAAGGTTACACCTTGCAACCAAAGAGAGATCAGT
GGGCGGTTCGTGTTGCTCACTACGCTCCTTGGCTTATCTACTGGTGGAACATGCAGAAGT
GGTTCCCGGGTTCGAGCGTGGCGAACCGAGATGGTAGTAGCTTCTCACAGCCGGATAAAG
ATATCGTTTTGAAGCTTGGTTCTTCGAGGAAACCGCATTTGGCGGAAGTGAGGCCGCAAG
GGTTGCATGAGAGTATTAACCGTGACATGGTTGTTGGGTTTGGGAGTTGGGAGTTTGATC
CTATTGATCTCGAGGACCCGTTTTTGAAGAGCCATCAAGGCTCTGTTCATCTGTGGCAAG
GAGATGATGATATGTTAGTACCTGTGGTGCCGCAGCGTTATATTGCTGAGAAGCTTTCGT
GGATTCACTATCATGAG*TTCCGGGAAGTGGCCACTTCCTCCACTACAATGAAGGTATGG
TTGATGACATTGTAAAGACGCTTTTCAAA*CCGATACTGAGAATTGATGAACTATCCA*C
TACCACAATGGTCTGAAA*TGAAATGTTT

QA 2 750 2 750
DS 

RD RR2CR52JQ 657 0 0
CTTGCCGGAGTGACGCTCGTCGCTCCGGTGGTTAACTACTGGTGGAAGAACTTACCTTTG
AATGTTTCCACGCAAGGTTACACCTTGCAACCAAAGAGAGATCAGTGGGCGGTTCGTGTT
GCTCACTACGCTCCTTGGCTTATCTACTGGTGGAACATGCAGAAGTGGTTCCCGGGTTCG
AGCGTGGCGAACCGAGATGGTAGTAGCTTCTCACAGCCGGATAAAGATATCGTTTTGAAG
CTTGGTTTTTCGAGGAAACCGCATTTGGCGGAAGTGAGGCCGCAAGGGTTGCATGAGAGT
ATTAACCGTGACATGGTTGTTGGGTTTGGGAGTTGGGAGTTTGATCCTATTGATCTCGAG
GACCCGTTTTTGAAGAGCCATCAAGGCTCTGTTCATCTGTGGCAAGGAGATGATGATATG
TTAGTACCTGTGGTGCCGCAGCGTTATATTGCTGAGAAGCTTTCGTGGATTCACTATCAT
GAGGTTCCGGGAAGTGGCCACTTCCTCCACTACAATGAAGGTATGGTTGATGACATTGTA
AAGACGCTTTTCAAAACCGATACTGAGAATTGATGAACTATCCAACTACCACAATGGTCT
GAAAATGAAATGTTTGTATTTTGTTGGTCTGGAAATGAAATGTTCGTATTTTGTTG
G

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2E832JQ 679 0 0
TCCGGTGGTTAACTACTGGTGGAAGAACTTACCTTTGAATGTTTCCACGCAAGGTTACAC
CTTGCAACCAAAGAGAGATCAGTGGGCGGTTCGTGTTGCTCACTACGCTCCTTGGCTTAT
CTACTGGTGGAACATGCAGAAGTGGTTCCCGGGTTCGAGCGTGGCGAACCGAGATGGTAG
TAGCTTTTCACAGCCGGATAAAGATATTGTTTTGAAGCTTGGTTCTTCGAGGAAACCGCA
TTTGGCGGAAGTGAGGCCGCAAGGGTTGCATGAGAGTATTAACCGTGACATGGTTGTTGG
GTTTGGGAGTTGGGAGTTTGATCCTATTGATCTCGAGGACCCGTTTTTGAAGAGCCATCA
AGGCTCTGTTCATCTGTGGCAAGGAGATGATGATATGTTAGTACCTGTGGTGCCGCAGCG
TTATATTGCTGAGAAGCTTCCGTGGATTCACTATCATGAGGTTCCGGGAAGTGGCCACTT
CCTCCACTACAATGAAGGTATGGTTGATGACATTGTAAAGACGCTTTTCAAAACCGATAC
TGAGAATTGATGAACTATCCAACTACCACAATGGTCTGAAAATGAAATGTTTGTATTTTG
TTGGTCTGGAAATGAAATGTTCGTATTTTGTTGTATTTGTAAGATCCCATACTAAGTCGA
GTGTTCACAGTTGCACACC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 4

CO CL2453Contig1 624 4 1 U
GGATCCTAATCCGACGTTTAGCAAACCCTCCCTTCTCAATTTTCTTCATCTTCCCTTGTC
AGCGAAACTCGTGCAATTATGGCGATCAGTTCCTTCAAGCAAGAGCATCCTCTCGAAAAG
AGACAAGCTGAAGCTTCTCGTATCAGGGACAAGTATCCAGATAGAATACCCGTCATTGTC
GAAAGAGCCGAGAAGAGTGATGTCCCTGATATTGATAAGAAAAAGTACTTGGTACCAGCT
GATCTGACTGTTGGTCAGTTTGTTTATGTTGTCCGCAAGAGGATCAAGCTCAGTCCCGAG
AAAGCCATCTTCATTTTCGTCAAGAACATTCTTCCCCCTACTGCTGCGATTATGTCGTCG
ATTTATGAAGAGCACAAGGACGAAGATGGGTTTCTCTACATGAGTTACAGTGGCGAGAAC
ACGTTCGGGATCTTCTAATGCGCTTGGAGCTCTACCATATCTCTGAACCTTGATGCCTCG
GTCTACTATGTACATTCTTACTATTTCTCGCTGCTTTGTTATGTCTGAAGCTATGGAACT
TGCTTTCTTATGAACTTATGAACATATAATCATCTCTTGTACTCTTCGCTTTGCTTTACT
TTGCTTTGCTTTGATGCTACTACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BK29JQ C 141
AF RR2BK29TF U 51
AF RR2GY31JQ C 1
AF RR2GY31TF U 1
BS 1 624 RR2GY31TF

RD RR2BK29JQ 287 0 0
TATCAGGGACAAGTATCCAGATAGAATACCCGTCATTGTCGAAAGAGCCGAGAAGAGTGA
TGTCCCTGATATTGATAAGAAAAAGTACTTGGTACCAGCTGATCTGACTGTTGGTCAGTT
TGTTTATGTTGTCCGCAAGAGGATCAAGCTCAGTCCTGAGAAAGCCATCTTCATTTTCGT
CAAGAACATTCTTCCCCCTACTGCTGCGATTATGTCGTCGATTTATGAAGAGCACAAGGA
CGAAGATGGGTTTCTCTACATGAGTTACAGTGGCGAGAACACGTTCG

QA 1 287 1 287
DS 

RD RR2BK29TF 510 0 0
TTCCCTTGTCAGCGAAACTCGTGCAATTATGGCGATCAGTTCCTTCAAGCAAGAGCATCC
TCTCGAAAAGAGACAAGCTGAAGCTTCTCGTATCAGGGACAAGTATCCAGATAGAATACC
CGTCATTGTCGAAAGAGCCGAGAAGAGTGATGTCCCTGATATTGATAAGAAAAAGTACTT
GGTACCAGCTGATCTGACTGTTGGTCAGTTTGTTTATGTTGTCCGCAAGAGGATCAAGCT
CAGTCCTGAGAAAGCCATCTTCATTTTCGTCAAGAACATTCTTCCCCCTACTGCTGCGAT
TATGTCGTCGATTTATGAAGAGCACAAGGACGAAGATGGGTTTCTCTACATGAGTTACAG
TGGCGAGAACACGTTCGGGATCTTCTAATGCGCTTGGAGCTCTACCATATCTCTGAACCT
TGATGCCTCGGTCTACTATGTACATTCTTACTATTTCTCGCTGCTTTGTTATGTCTGAAG
CTATGGAACTTGCTTTCTTATGAACTTATG

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2GY31JQ 624 0 0
GGATCCTAATCCGACGTTTAGCAAACCCTCCCTTCTCAATTTTCTTCATCTTCCCTTGTC
AGCGAAACTCGTGCAATTATGGCGATCAGTTCCTTCAAGCAAGAGCATCCTCTCGAAAAG
AGACAAGCTGAAGCTTCTCGTATCAGGGACAAGTATCCAGATAGAATACCCGTCATTGTC
GAAAGAGCCGAGAAGAGTGATGTCCCTGATATTGATAAGAAAAAGTACTTGGTACCAGCT
GATCTGACTGTTGGTCAGTTTGTTTATGTTGTCCGCAAGAGGATCAAGCTCAGTCCCGAG
AAAGCCATCTTCATTTTCGTCAAGAACATTCTTCCCCCTACTGCTGCGATTATGTCGTCG
ATTTATGAAGAGCACAAGGACGAAGATGGGTTTCTCTACATGAGTTACAGTGGCGAGAAC
ACGTTCGGGATCTTTTAATGCGCTTGGAGCTCTACCATATCTCTGAACCTTGATGCCTCG
GTCTACTATGTACATTCTTACTATTTCTCGCTGCTTTGTTATGTCTGAAGCTATGGAACT
TGCTTTCTTATGAACTTATGAACATATAATCATCTCTTGTACTCTTCGCTTTGCTTTACT
TTGCTTTGCTTTGATGCTACTACT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2GY31TF 624 0 0
GGATCCTAATCCGACGTTTAGCAAACCCTCCCTTCTCAATTTTCTTCATCTTCCCTTGTC
AGCGAAACTCGTGCAATTATGGCGATCAGTTCCTTCAAGCAAGAGCATCCTCTCGAAAAG
AGACAAGCTGAAGCTTCTCGTATCAGGGACAAGTATCCAGATAGAATACCCGTCATTGTC
GAAAGAGCCGAGAAGAGTGATGTCCCTGATATTGATAAGAAAAAGTACTTGGTACCAGCT
GATCTGACTGTTGGTCAGTTTGTTTATGTTGTCCGCAAGAGGATCAAGCTCAGTCCCGAG
AAAGCCATCTTCATTTTCGTCAAGAACATTCTTCCCCCTACTGCTGCGATTATGTCGTCG
ATTTATGAAGAGCACAAGGACGAAGATGGGTTTCTCTACATGAGTTACAGTGGCGAGAAC
ACGTTCGGGATCTTCTAATGCGCTTGGAGCTCTACCATATCTCTGAACCTTGATGCCTCG
GTCTACTATGTACATTCTTACTATTTCTCGCTGCTTTGTTATGTCTGAAGCTATGGAACT
TGCTTTCTTATGAACTTATGAACATATAATCATCTCTTGTACTCTTCGCTTTGCTTTACT
TTGCTTTGCTTTGATGCTACTACT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 2 4

CO CL2454Contig1 734 2 4 U
AATAGAATAAAGTAAAACTTGGATAGATTCATCTCATTCATTCTTCATGAAAACAGGTTT
ATAACCATGAGCAATTCACCGACACTGGATATATACTAGCTCTTCTTATATATAGTTACT
GTTTTAACTGTTACTCCTGTATTTCACTTAAGTGGTTTTCAAGAATCGGCAACCTTAGGT
GATTCGCTCACTACTCGTTCTTCCTCGTTTCTTGTTGCGTCTTCTTCCACCGGGATCAAA
TTGCAGTGGATCGTGTGTGATACTGGTTTCTCTAGCTGAAACAGCGGATGCTTGCACAAG
GTCGGGCACTGAACAGTCAGTGCGTACTTGCAAGTGGATAGCTCAGTGAGAGAAGTGACC
ATAGCCCTGGTTTCTGCGCATACAAACCTCACCTCGACTTCTCGAGGCGTTCCGGTAAGA
TCACAGGTGGTCCCATTGGTGAAAATATGAGAATGATACCTCTCTTTCATAGTAGAAGCA
TGAGATACATTTTGATTAAAAGCAGCAGTTGCCTCTGGGTCATAATTACCCAAAGAAAAC
TCTTGGACAATCTTGGTGCCATCCTCAAGGTGTAGCTGCCTTACTGACTTGAGATGACAA
AACTCATAGGACCACCAACCCTCTTGGTACTTACCCGAGAAGGCATTGGTCGTTGAGGGG
TTGAAGAAGTTGATCAGGGGTCTTGAGCTTGAGCTGTTGTTGTTTATCAGTTTCCATCAA
CACAGTGCTGATGT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK25JQ U 1
AF RR2GE81JQ U 4
BS 1 636 RR2EK25JQ
BS 637 638 RR2GE81JQ
BS 639 653 RR2EK25JQ
BS 654 734 RR2GE81JQ

RD RR2EK25JQ 653 0 0
AATAGAATAAAGTAAAACTTGGATAGATTCATCTCATTCATTCTTCATGAAAACAGGTTT
ATAACCATGAGCAATTCACCGACACTGGATATATACTAGCTCTTCTTATATATAGTTACT
GTTTTAACTGTTACTCCTGTATTTCACTTAAGTGGTTTTCAAGAATCGGCAACCTTAGGT
GATTCGCTCACTACTCGTTCTTCCTCGTTTCTTGTTGCGTCTTCTTCCACCGGGATCAAA
TTGCAGTGGATCGTGTGTGATACTGGTTTCTCTAGCTGAAACAGCGGATGCTTGCACAAG
GTCGGGCACTGAACAGTCAGTGCGTACTTGCAAGTGGATAGCTCAGTGAGAGAAGTGACC
ATAGCCCTGGTTTCTGCGCATACAAACCTCACCTCGACTTCTCGAGGCGTTCCGGTAAGA
TCACAGGTGGTCCCATTGGTGAAAATATGAGAATGATACCTCTCTTTCATAGTAGAAGCA
TGAGATACATTTTGATTAAAAGCAGCAGTTGCCTCTGGGTCATAATTACCCAAAGAAAAC
TCTTGGACAATCTTGGTGCCATCCTCAAGGTGTAGCTGCCTTACTGACTTGAGATGACAA
AACTCATAGGACCACCAACCCTCTTGGTACTTACCCTGGAAGGCATTGGTCGT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2GE81JQ 731 0 0
G
GAATAAAGTAAAACTTGGATAGATTCATCTCATTCATTCTTCATGAAAACAGGTTTATAA
CCATGAGCAATTCACCGACACTGGATATATACTAGCTCTTCTTATATATAGTTACTGTTT
TAACTGTTACTCCTGTATTTCACTTAAGTGGTTTTCAAGAATCGGCAACCTTAGGTGATT
CGCTCACTACTCGTTCTTCCTCGTTTCTTGTTGCGTCTTCTTCCACCGGGATCAAATTGC
AGTGGATCGTGTGTGATACTGGTTTCTCTAGCTGAAACAGCGGATGCTTGCACAAGGTCG
GGCACTGAACAGTCAGTGCGTACTTGCAAGTGGATAGCTCAGTGAGAGAAGTGACCATAG
CCCTGGTTTCTGCGCATACAAACCTCACCTCGACTTCTCGAGGCGTTCCGGTAAGATCAC
AGGTGGTCCCATTGGTGAAAATATGAGAATGATACCTCTCTTTCATAGTAGAAGCATGAG
ATACATTTTGATTAAAAGCAGCAGTTGCCTCTGGGTCATAATTACCCAAAGAAAACTCTT
GGACAATCTTGGTGCCATCCTCAAGGTGTAGCTGCCTTACTGACTTGAGATGACAAAACT
CATAGGACCACCAACCCTCTTG*******CCTGAGAAGGCATTGGTCGTTGAGGGGTTGA
AGAAGTTGATCAGGGGTCTTGAGCTTGAGCTGTTGTTGTTTATCAGTTTCCATCAACACA
GTGCTGATGT

QA 2 731 2 731
DS 



CO CL2454Contig2 827 2 6 U
GGGACCTTCATCGTCAACAATCTAACTAACATCGTCTCTCCTCCATTGATATTCGCTTCG
TCGAAGATGTGGATCACGCAGATCTTATTACCTCTGCTAATAGTTTCACTCTCTTCAATA
TCCTGCCATGTCTCCTCCGATCAGATCTTTCCAGCTCATCTAGTAGGAACATTCAGCCGA
AACAATCGTGAACCAAAGTACACGATCGAGTATCTCCCCGAAGATGCACCTTTTCACCCG
GGTGATAATCTGGAATCTATGGTGATGCATGACAAGCAAGGACGTAGATTCTTATGTTTC
TTACCAAAGGAGGAAGAGTCTAGTACCGGATGGACCTCCCCTCAGCAGAACATCAGCACT
GTGTTGATGGAAACTGATAAACAACAACAGCTCAAGCTCAAGACCCCTGATCAACTTCTT
CAACCCCTCAACGACCAATGCCTTCCAAGGTAAGTACCAAGAGGGTTGGTGGTCCTATGA
GTTTTGTCATCTCAAGTCAGTAAGGCAGCTACACCTTGAGGATGGCACCAAGATTGTCCA
AGAGTTTTCTTTGGGTAATTATGACCCAGAGGCAACTGCTGCTTTTAATCAAAATGTATC
TCATGCTTCTACTATGAAAGAGAGGTATCATTCTCATATTTTCACCAATGGGACCACCTG
TGATCTTACCGGAACGCCTCGAGAAGTCGAGGTGAGGTTTGTATGCGCAGAAACCAGGGC
TATGGTCACTTCTCTCACTGAGCTATCCACTTGCAAGTACGCACTGACTGTTCAGTGCCC
GACCTTGTGCAGCATCCGCTGTTTCAGCTAGAGAACCAGTATCACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE81TF U 1
AF RR2EK25TF U 22
BS 1 445 RR2GE81TF
BS 446 447 RR2EK25TF
BS 448 450 RR2GE81TF
BS 451 457 RR2EK25TF
BS 458 687 RR2GE81TF
BS 688 827 RR2EK25TF

RD RR2GE81TF 687 0 0
GGGACCTTCATCGTCAACAATCTAACTAACATCGTCTCTCCTCCATTGATATTCGCTTCG
TCGAAGATGTGGATCACGCAGATCTTATTACCTCTGCTAATAGTTTCACTCTCTTCAATA
TCCTGCCATGTCTCCTCCGATCAGATCTTTCCAGCTCATCTAGTAGGAACATTCAGCCGA
AACAATCGTGAACCAAAGTACACGATCGAGTATCTCCCCGAAGATGCACCTTTTCACCCG
GGTGATAATCTGGAATCTATGGTGATGCATGACAAGCAAGGACGTAGATTCTTATGTTTC
TTACCAAAGGAGGAAGAGTCTAGTACCGGATGGACCTCCCCTCAGCAGAACATCAGCACT
GTGTTGATGGAAACTGATAAACAACAACAGCTCAAGCTCAAGACCCCTGATCAACTTCTT
CAACCCCTCAACGACCAATGCCTTCTCAGG*******CAAGAGGGTTGGTGGTCCTATGA
GTTTTGTCATCTCAAGTCAGTAAGGCAGCTACACCTTGAGGATGGCACCAAGATTGTCCA
AGAGTTTTCTTTGGGTAATTATGACCCAGAGGCAACTGCTGCTTTTAATCAAAATGTATC
TCATGCTTCTACTATGAAAGAGAGGTATCATTCTCATATTTTCACCAATGGGACCACCTG
TGATCTTACCGGAACGCCTCGAGAAGT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2EK25TF 806 0 0
GG
AACTAACATCGTCTCTCCTCCATTGATATTCGCTTCGTCGAAGATGTGGATCACGCAGAT
CTTATTACCTCTGCTAATAGTTTCACTCTCTTCAATATCCTGCCATGTCTCCTCCGATCA
GATCTTTCCAGCTCATCTAGTAGGAACATTCAGCCGAAACAATCGTGAACCAAAGTACAC
GATCGAGTATCTCCCCGAAGATGCACCTTTTCACCCGGGTGATAATCTGGAATCTATGGT
GATGCATGACAAGCAAGGACGTAGATTCTTATGTTTCTTACCAAAGGAGGAAGAGTCTAG
TACCGGATGGACCTCCCCTCAGCAGAACATCAGCACTGTGTTGATGGAAACTGATAAACA
ACAACAGCTCAAGCTCAAGACCCCTGATCAACTTCTTCAACCCCTCAACGACCAATGCCT
TCCAGGGTAAGTACCAAGAGGGTTGGTGGTCCTATGAGTTTTGTCATCTCAAGTCAGTAA
GGCAGCTACACCTTGAGGATGGCACCAAGATTGTCCAAGAGTTTTCTTTGGGTAATTATG
ACCCAGAGGCAACTGCTGCTTTTAATCAAAATGTATCTCATGCTTCTACTATGAAAGAGA
GGTATCATTCTCATATTTTCACCAATGGGACCACCTGTGATCTTACCGGAACGCCTCGAG
AAGTCGAGGTGAGGTTTGTATGCGCAGAAACCAGGGCTATGGTCACTTCTCTCACTGAGC
TATCCACTTGCAAGTACGCACTGACTGTTCAGTGCCCGACCTTGTGCAGCATCCGCTGTT
TCAGCTAGAGAACCAGTATCACAC

QA 3 806 3 806
DS 



AS 1 4

CO CL2455Contig1 884 4 16 U
TTTTTTGAACATAACTTTTAGTGGAACACCACTTAGGACAAGTCTTCTAATCCCACCTTG
CACAAACACGCCAACGTCTCTACACATGACTTTGCAGAAGTTGCAAACAGTTGGACAAAA
CACGATCTTGTAGTCATCTTCGTACTTCTCGATCTTGAACCAGTTATCAACCGTCGCCTG
ACCCGGATTCCCTTCGACGCCACAAGCTGTAACGAACCACTGATTCGTGGTCTCATCGAA
ATTGTCTAAGTTCCAGACCGAAGCCGAACAGAACTTGAAGTTGAGATCTGTTGAGACACG
GATGATTCTTGATTTGTCTGATGGTGAGAACTCCAACGGTAGGCCTTGGGAGACTTCGTA
TTGGTCTTGGATAACGCTTTTAGGACATGTTTTGTTTTCGGGTTTGGACATGGTTAGTCC
CCCGCCGCGACCGCGAAGTACAGGTAATATGTAGTATTTGGTGCCTGATGTGAGACGTCC
ACCGTGGATGTCGGTTACTGGTTCGAGAGCCGCGGCCTCTGTGGTGGCTCCATGGTAACT
GATAAAGACGGCTAAGAGGAGGGAGATATAGAGAAGTAGTGATGACATTGTATGAAGCTT
TCTTTTTATGGAAACTTTTTTTCAGTTTTGATTTGAAAAAGAGATGAGAGATGAGATTCT
ATTTATAGGCCGTGCGTATCTCTTGCAAAGTCAAACTATATGATTTTGATCAAAATGCGG
TGTAGTATTAGCGTAGTGGTCGAGCACAAAAATAATTTCGTTGACGTGAGATTGAATTGT
CAAAGCTGCACGAGGCCTGACGTCATATTTCGATCATTCATGACGAAATCCTTTTCTTCT
TTGACTAGGGATAATGCTAGATTAGATCAAATTGACACATAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2GM39TF U 1
AF RR2GM39JQ C 223
AF RR2D703JQ C 261
AF RR2D703TF U 261
BS 1 639 RR2GM39TF
BS 640 640 RR2D703TF
BS 641 694 RR2GM39TF
BS 695 695 RR2D703TF
BS 696 706 RR2GM39TF
BS 707 707 RR2D703TF
BS 708 714 RR2GM39TF
BS 715 715 RR2D703TF
BS 716 751 RR2GM39TF
BS 752 754 RR2D703TF
BS 755 772 RR2GM39TF
BS 773 773 RR2D703TF
BS 774 783 RR2GM39TF
BS 784 784 RR2D703TF
BS 785 794 RR2GM39TF
BS 795 884 RR2D703TF

RD RR2GM39TF 801 0 0
TTTTTTGAACATAACTTTTAGTGGAACACCACTTAGGACAAGTCTTCTAATCCCACCTTG
CACAAACACGCCAACGTCTCTACACATGACTTTGCAGAAGTTGCAAACAGTTGGACAAAA
CACGATCTTGTAGTCATCTTCGTACTTCTCGATCTTGAACCAGTTATCAACCGTCGCCTG
ACCCGGATTCCCTTCGACGCCACAAGCTGTAACGAACCACTGATTCGTGGTCTCATCGAA
ATTGTCTAAGTTCCAGACCGAAGCCGAACAGAACTTGAAGTTGAGATCTGTTGAGACACG
GATGATTCTTGATTTGTCTGATGGTGAGAACTCCAACGGTAGGCCTTGGGAGACTTCGTA
TTGGTCTTGGATAACGCTTTTAGGACATGTTTTGTTTTCGGGTTTGGACATGGTTAGTCC
CCCGCCGCGACCGCGAAGTACAGGTAATATGTAGTATTTGGTGCCTGATGTGAGACGTCC
ACCGTGGATGTCGGTTACTGGTTCGAGAGCCGCGGCCTCTGTGGTGGCTCCATGGTAACT
GATAAAGACGGCTAAGAGGAGGGAGATATAGAGAAGTAGTGATGACATTGTATGAAGCTT
TCTTTTTATGGAAACTTTTTTTCAGTTTTGATTTGAAAA*GAGATGAGAGATGAGATTCT
ATTTATAGGCCGTGCGTATCTCTTGCAAAGTCAA*CTATATGATTT*GATCAAA*TGCGG
TGTAGTATTAGCGTAGTGGTCGAGCACAAAA**TATTTCGTTGACGTGAGAT*GAATTGT
CAA*GCTGCACGAG
CCTGACG

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2GM39JQ 662 0 0
ATTCGTGGTCTCATCGAAATTGTCTAAGTTCCAGACCGAAGCCGAACAGAACTTGAAGTT
GAGATCTGTTGAGACACGGATGATTCTTGATTTGTCTGATGGTGAGAACTCCAACGGTAG
GCCTTGGGAGACTTCGTATTGGTCTTGGATAACGCTTTTAGGACATGTTTTGTTTTCGGG
TTTGGACATGGTTAGTCCCCCGCCGCGACCGCGAAGTACAGGTAATATGTAGTATTTGGT
GCCTGATGTGAGACGTCCACCGTGGATGTCGGTTACTGGTTCGAGAGCCGCGGCCTCTGT
GGTGGCTCCATGGTAACTGATAAAGACGGCTAAGAGGAGGGAGATATAGAGAAGTAGTGA
TGACATTGTATGAAGCTTTCTTTTTATGGAAACTTTTTTTCAGTTTTGATTTGAAAAAGA
GATGAGAGATGAGATTCTATTTATAGGCCGTGCGTATCTCTTGCAAAGTCAAACTATATG
ATTTTGATCAAAATGCGGTGTAGTATTAGCGTAGTGGTCGAGCACAAAAATAATTTCGTT
GACGTGAGATTGAATTGTCAAAGCTGCACGAGGCCTGACGTCATATTTCGATCATTCATG
ACGAAATCCTTTTCTTCTTTGACTAGGGATAATGCTAGATTAGATCAAATTGACACATAA
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2D703JQ 624 0 0
G
AGCCGAACAGAACTTGAAGTTGAGATCTGTTGAGACACGGATGATTCTTGATTTGTCTGA
TGGTGAGAACTCCAACGGTAGGCCTTGGGAGACTTCGTATTGGTCTTGGATAACGCTTTT
AGGACATGTTTTGTTTTCGGGTTTGGACATGGTTAGTCCCCCGCCGCGACCGCGAAGTAC
AGGTAATATGTAGTATTTGGTGCCTGATGTGAGACGTCCACCGTGGATGTCGGTTACTGG
TTCGAGAGCCGCGGCTTCTGTGGTGGCTCCATGGTAACTGATAAAGACGGCTAAGAGGAG
GGAGATATAGAGAAGTAGTGATGACATTGTATGAAGCTTTCTTTTTATGGAAACTTTTTT
TCAGTTTTGGTTTGAAAAAGAGATGAGAGATGAGATTCTATTTATAGGCCGTGCGTATCT
CTTGCAAAGTCAAACTATATGATTTTGATCAAAATGCGGTGTAGTATTAGCGTAGTGGTC
GAGCACAAAAATAATTTCGTTGACGTGAGATTGAATTGTCAAAGCTGCACGAGGCCTGAC
GTCATATTTCGATCATTCATGACGAAATCCTTTTCTTCTTTGACTAGGGATAATGCTAGA
TTAGATCAAATTGACACATAACC

QA 2 624 2 624
DS 

RD RR2D703TF 624 0 0
G
AGCCGAACAGAACTTGAAGTTGAGATCTGTTGAGACACGGATGATTCTTGATTTGTCTGA
TGGTGAGAACTCCAACGGTAGGCCTTGGGAGACTTCGTATTGGTCTTGGATAACGCTTTT
AGGACATGTTTTGTTTTCGGGTTTGGACATGGTTAGTCCCCCGCCGCGACCGCGAAGTAC
AGGTAATATGTAGTATTTGGTGCCTGATGTGAGACGTCCACCGTGGATGTCGGTTACTGG
TTCGAGAGCCGCGGCTTCTGTGGTGGCTCCATGGTAACTGATAAAGACGGCTAAGAGGAG
GGAGATATAGAGAAGTAGTGATGACATTGTATGAAGCTTTCTTTTTATGGAAACTTTTTT
TCAGTTTTGGTTTGAAAAAGAGATGAGAGATGAGATTCTATTTATAGGCCGTGCGTATCT
CTTGCAAAGTCAAACTATATGATTTTGATCAAAATGCGGTGTAGTATTAGCGTAGTGGTC
GAGCACAAAAATAATTTCGTTGACGTGAGATTGAATTGTCAAAGCTGCACGAGGCCTGAC
GTCATATTTCGATCATTCATGACGAAATCCTTTTCTTCTTTGACTAGGGATAATGCTAGA
TTAGATCAAATTGACACATAACC

QA 2 624 2 624
DS 



AS 1 3

CO CL2456Contig1 1192 3 10 U
ACTAGTCTAGAGATAAAAATGCAATCACTACGAGTAATAAAATTATTACAAGGTTCATAA
GACAAGTTTGCTTTCAAATTTTGTTTAGGGATACAAATTTATTTATTTTAGCAGAAGTTT
TACAATAGAAAATGAGCCTTTTGAAGATGAGTCTGAAATGTCCTCCAAATCAATGACTGA
GGGTGAACCAGAACCAGCCAACTGCTCTCTGGATCACAATTAAGCACACAGCTTAAAAAT
AAAGCCTAAACAAAGTTACAAAATAATTACAAATAAACCCCTCCACTTATCTCCTCATAA
ATAGAAGATTCATGGAAAATATGTCATGAGACGTCTCGTCTGGACATGAACTAAGAGCTG
TCCGCATATACATAAGTAAGTAGCCTAGTTCTGCATTCACTGGTACATAATCAGTTTCGT
GGGAGTGTTATTGCCTTTCTTGTTTGGTCTTCTACTGGAAGAAGACCAAATCTAGGACCA
CATTAAGGCATACAAGTATGTTTCTCTACCATTTTAGGGTACTTAAACTTAGGGCACTGC
TCGGTGAAAGCAGGTGGTCTTTGATAAGTCACAGAAGCAGCTCTGATCAAGATCCCGGCA
GTTAAACCCCATATCGTATAATCTTTATCTCCTGTTCGGTAGTCAAAGTAGTGGATCAAA
TACTTTTCTCGCATCCACTCTCTCTCCTCGGATCTTCTGTTCTCATCCTTGAGGAACATT
TCCAAAGGTGCATCAAACACAGCTTCCACTTCGGCAGGATTTGGTTTTGGAATGAATGTG
TTTTTGTCCTTCAAGATTCCTATCACAGGTATTACTCTGAGGAGATGCTTGGACAGAAAA
GGTTCGAGAGAAGTGACAACATCAACAAGAGAAGGGTCCAAACCAATCTCTTCCTCGGCC
TCTCTGGTAGCAGTCATCCCATCATCTTTATCATCCTCCTCCGCCTTACCACCCGGCAGT
GAAACTTCTCCCGAGTGAGTAGACAATCTTGAAGACCTCTTAGTGAGGATGACGCGAAGA
TCGCCCTCGTCTCCTTCGAAGATACAGATCAAGACAGCCGCTCGCTTCGGTCTGAACCTC
TCAGGATCTTTCGGAACCGGAGTCATGGATTCCTGAAAGCCAACCTGAGAAACCACTTTC
CCTGCGCTCTCCTGATCCGCCTGCGTCTCCTCGTCATCGTTTTCGAAAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G481JQ U 70
AF RR2GE69JQ U 1
AF RR2G481TF C 471
BS 1 156 RR2GE69JQ
BS 157 157 RR2G481JQ
BS 158 248 RR2GE69JQ
BS 249 249 RR2G481JQ
BS 250 637 RR2GE69JQ
BS 638 638 RR2G481JQ
BS 639 678 RR2GE69JQ
BS 679 679 RR2G481JQ
BS 680 723 RR2GE69JQ
BS 724 1192 RR2G481TF

RD RR2G481JQ 643 0 0
GCTTTCAAATTTTGTTTAGGGATACAAATTTATTTATTTTAGCAGAAGTTTTACAATAGA
AAATGAGCCTTTTGAAGATGAGTCTGAAATGTCCTCCAAATCAATGACTGAGGGTGAACC
AGAACCAGCCAACTGCTCTCTGGATCACAATTAAGCACACAGCTTAAAAATAAAGCCTAA
ACAAAGTTACAAAATAATTACAAATAAACCCCTCCACTTATCTCCTCATAAATAGAAGAT
TCGTGGAAAATATGTCATGAGACGTCTCGTCTGGACATGAACTAAGAGCTGTCCGCATAT
ACATAAGTAAGTAGCCTAGTTCTGCATTCACTGGTACATAATCAGTTTCGTGGGAGTGTT
ATTGCCTTTCTTGTTTGGTCTTCTACTGGAAGAAGACCAAATCTAGGACCACATTAAGGC
ATACAAGTATGTTTCTCTACCATTTTAGGGTACTTAAACTTAGGGCACTGCTCGGTGAAA
GCAGGTGGTCTTTGATAAGTCACAGAAGCAGCTCTGATCAAGATCCCGGCAGTTAAACCC
CATATCGTATAATCTTTATCTCCTGTTCGGTAGTCAAAGTAGTGGATCAAATACTTTTCT
CGCATCCACTCTCTCTCCTCGGATCTTCTGTTCTCATCCTTGA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2GE69JQ 723 0 0
ACTAGTCTAGAGATAAAAATGCAATCACTACGAGTAATAAAATTATTACAAGGTTCATAA
GACAAGTTTGCTTTCAAATTTTGTTTAGGGATACAAATTTATTTATTTTAGCAGAAGTTT
TACAATAGAAAATGAGCCTTTTGAAGATGAGTCTGAGATGTCCTCCAAATCAATGACTGA
GGGTGAACCAGAACCAGCCAACTGCTCTCTGGATCACAATTAAGCACACAGCTTAAAAAT
AAAGCCTAGACAAAGTTACAAAATAATTACAAATAAACCCCTCCACTTATCTCCTCATAA
ATAGAAGATTCATGGAAAATATGTCATGAGACGTCTCGTCTGGACATGAACTAAGAGCTG
TCCGCATATACATAAGTAAGTAGCCTAGTTCTGCATTCACTGGTACATAATCAGTTTCGT
GGGAGTGTTATTGCCTTTCTTGTTTGGTCTTCTACTGGAAGAAGACCAAATCTAGGACCA
CATTAAGGCATACAAGTATGTTTCTCTACCATTTTAGGGTACTTAAACTTAGGGCACTGC
TCGGTGAAAGCAGGTGGTCTTTGATAAGTCACAGAAGCAGCTCTGATCAAGATCCCGGCA
GTTAAACCCCATATCGTATAATCTTTATCTCCTGTTCAGTAGTCAAAGTAGTGGATCAAA
TACTTTTCTCGCATCCACCCTCTCTCCTCGGATCTTCTGTTCTCATCCTTGAGGAACATT
TCC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2G481TF 722 0 0
TCTAGGACCACAT*AAGGCATACAAGTATGTTTCTCTACCATTTTAGGGTACTTAAACTT
AGGGCACTGCTCGGTGAAAGCAGGTGGTCTTTGATAAGTCACAGAAGCAGCTCTGATCAA
GATCCCGGCAGTTAAACCCCATATCGTATAATCTTTATCTCCTGTTCGGTAGTCAAAGTA
GTGGATCAAATACTTTTCTCGCATCCACTCTCTCTCCTCGGATCTTCTGTTCTCATCCTT
GAGGAACATTTCCAAAGGTGCATCAAACACAGCTTCCACTTCGGCAGGATTTGGTTTTGG
AATGAATGTGTTTTTGTCCTTCAAGATTCCTATCACAGGTATTACTCTGAGGAGATGCTT
GGACAGAAAAGGTTCGAGAGAAGTGACAACATCAACAAGAGAAGGGTCCAAACCAATCTC
TTCCTCGGCCTCTCTGGTAGCAGTCATCCCATCATCTTTATCATCCTCCTCCGCCTTACC
ACCCGGCAGTGAAACTTCTCCCGAGTGAGTAGACAATCTTGAAGACCTCTTAGTGAGGAT
GACGCGAAGATCGCCCTCGTCTCCTTCGAAGATACAGATCAAGACAGCCGCTCGCTTCGG
TCTGAACCTCTCAGGATCTTTCGGAACCGGAGTCATGGATTCCTGAAAGCCAACCTGAGA
AACCACTTTCCCTGCGCTCTCCTGATCCGCCTGCGTCTCCTCGTCATCGTTTTCGAAAGA
TC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL2457Contig1 894 2 2 U
GGACATTTTGATCGTCTCTCTAATTGGGAATTAGGTTTTTTTCTTCACCGAAGATGACGA
CTGCAGCTCGGCCAACGTGGGCTCCGGCCAAGGGAGGTAACGAGCAAGGTGGTGCTCGTA
TCTTCGGCGCGTCTCAGAAGTATTCGTCCCGTGATGTCGCTGCTCATACCACTTTAAAGC
CAAGGAGGGAAGGGCAGCACACTCAAGAGGAAGTGGAGAAGAAGAATCTTCGTGATGAGC
TTGAAGAGCGTGAGAGGAGACACTTCTCTTCTAAAGACAAATCCTACACTGGTGATGATA
GAGACCGCAGGAGAGGGAACCAACTACTACTGGAAGGCTCTAAAAGGGACCCTGAAGATC
GGATTGTTCCTCGCAGTGTAGATGCTGATGATTCTGATGTAGATATCAAAAGCGATGATA
ATGATGATAGTGATGACGAAAGTGATGATGACGACGAGGACGACACTGAAGCCCTTATGG
CCGAACTCGACCAGATAAAGAAAGAAAGAGTGGAGGAGAGGCTCAGGAAGGAAAAGCAGC
AGCAGATGGAAGAGCTAAACGCCAAAGAAGAAGAGCTTCTCAAAGGAAACCCACTGCTGA
ACAACACTCCAACTTCTTTTAGTGTCAAAAGGAGGTGGGATGATGATGTGGTATTCAAGA
ATCAGGCACGTGGGGAAATGAAAGCACCTAAGCGATTCATCGATGATACAATCAGGAATG
ACTTCCACAGAAAGTTCCTACACAGATACATGAAGTGATTTGAGCAATTTGGTGCTACAT
GATGTCTGTATTATGAATGAACTATATGAGGCTTTCGTATTCTGTCTCTTGTAAAACAGA
AGCCAATCAACGAATGTTATATGGTTTATGATTAAAATCTTATGCGCTTTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A460TF U 1
AF RR2A460JQ C 126
BS 1 661 RR2A460TF
BS 662 894 RR2A460JQ

RD RR2A460TF 661 0 0
GGACATTTTGATCGTCTCTCTAATTGGGAATTAGGTTTTTTTCTTCACCGAAGATGACGA
CTGCAGCTCGGCCAACGTGGGCTCCGGCCAAGGGAGGTAACGAGCAAGGTGGTGCTCGTA
TCTTCGGCGCGTCTCAGAAGTATTCGTCCCGTGATGTCGCTGCTCATACCACTTTAAAGC
CAAGGAGGGAAGGGCAGCACACTCAAGAGGAAGTGGAGAAGAAGAATCTTCGTGATGAGC
TTGAAGAGCGTGAGAGGAGACACTTCTCTTCTAAAGACAAATCCTACACTGGTGATGATA
GAGACCGCAGGAGAGGGAACCAACTACTACTGGAAGGCTCTAAAAGGGACCCTGAAGATC
GGATTGTTCCTCGCAGTGTAGATGCTGATGATTCTGATGTAGATATCAAAAGCGATGATA
ATGATGATAGTGATGACGAAAGTGATGATGACGACGAGGACGACACTGAAGCCCTTATGG
CCGAACTCGACCAGATAAAGAAAGAAAGAGTGGAGGAGAGGCTCAGGAAGGAAAAGCAGC
AGCAGATGGAAGAGCTAAACGCCAAAGAAGAAGAGCTTCTCAAAGGAAACCCACTGCTGA
ACAACACTCCAACTTCTTTTAGTGTCAAAAGGAGGTGGGATGATGATGTGGTATTCAAGA
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2A460JQ 769 0 0
GGC
GCGTCTCAGAAGTATTCGTCCCGTGATGTCGCTGCTCATACCACTTTAAAGCCAAGGAGG
GAAGGGCAGCACACTCAAGAGGAAGTGGAGAAGAAGAATCTTCGTGATGAGCTTGAAGAG
CGTGAGAGGAGACACTTCTCTTCTAAAGACAAATCCTACACTGGTGATGATAGAGACCGC
AGGAGAGGGAACCAACTACTACTGGAAGGCTCTAAAAGGGACCCTGAAGATCGGATTGTT
CCTCGCAGTGTAGATGCTGATGATTCTGATGTAGATATCAAAAGCGATGATAATGATGAT
AGTGATGACGAAAGTGATGATGACGACGAGGACGACACTGAAGCCCTTATGGCCGAACTC
GACCAGATAAAGAAAGAAAGAGTGGAGGAGAGGCTCAGGAAGGAAAAGCAGCAGCAGATG
GAAGAGCTAAACGCCAAAGAAGAAGAGCTTCTCAAAGGAAACCCACTGCTGAACAACACT
CCAACTTCTTTTAGTGTCAAAAGGAGGTGGGATGATGATGTGGTATTCAAGAATCAGGCA
CGTGGGGAAATGAAAGCACCTAAGCGATTCATCGATGATACAATCAGGAATGACTTCCAC
AGAAAGTTCCTACACAGATACATGAAGTGATTTGAGCAATTTGGTGCTACATGATGTCTG
TATTATGAATGAACTATATGAGGCTTTCGTATTCTGTCTCTTGTAAAACAGAAGCCAATC
AACGAATGTTATATGGTTTATGATTAAAATCTTATGCGCTTTACTC

QA 4 769 4 769
DS 



AS 1 3

CO CL2458Contig1 996 3 5 U
GACTAAGGAATCAAGATTTATTCATATGACCGGTTCAAAATTTTCAGTACAAAGCACATT
CTCTTGTTCAAAATCATTACACTTGCTCATCCATTACAAAGCTAAAAGGAATCAAAGTTT
CTGGCAGTGTTACTTTATTCCCCTATCACCTCAGTATCCATAACCTGAGTTGTCCATTGG
GTTGCCTACAGGAACTGGCTCAGGCTCCTTGATCTCAACAACGACACAGTCAGACATCAA
GAATGTCTTTGCAACCGAAGCTGCGTGTTCCAAGCAACATCTCACAACCTTAGTTGGATC
GATGATTCCTGCAGCCATTAGATCCTCGTACTTGCCGGTTGCAGCATTGTAACCGTACTT
CACATTATCGTTAGAAAGCACCTTCTCGCTAACTACGCTTCCATTGACTCCAGCGTTCTT
GGCAATCAGTTTCAGAGGATAACTCAGTGCTCTTTTCACGATATCCGCTCCAACCTTTTC
TTCATCATTGTCAAGACCGGCTTTAATGGCATCAACCTTGGAAGCAAGACGAAGCAGAGT
ACAGCCACCACCAACGACAATACCTTCCTCAACAGCGGCCTTTGTAGCATTGAGAGCATC
TTCAACTCTCAGTTTCTTCTCTTTGAGTTCTGTCTCCGTTTGTGCTCCGACCTGAATTAC
AGCAACTCCACCAGAGAGCTTTGCAATTCTCTCATTCAGTTTCTCCTTCTCATAATCTTG
CTCTGCTTGCTCAATAAGGTTCTTAATCTGTGTAACACGCTTTTGCACTGCGTCCTGTGT
GCTCCCATCACCCACAATGGTCGAAGTCTCCTTAGTGAGGACCACCTTTGCGGCATGTCC
AAGAACCTCTTTTCCAGCTTTGTCAAGTGAAAGACCAACTTCCTCACGAATCACAGTTGC
TCCAGTGAGGATGGCAATATCGTCAAGGTATTGGCTCTTGCGCTCTCCAAATCCTGGAGC
CTTGAGAGCTGCAATCTTCAGTGTGCCTCTAAGCTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO29JQ U 1
AF RR2BQ15JQ U 2
AF RR2EO29TF C 215
BS 1 142 RR2EO29JQ
BS 143 143 RR2BQ15JQ
BS 144 732 RR2EO29JQ
BS 733 771 RR2BQ15JQ
BS 772 996 RR2EO29TF

RD RR2EO29JQ 732 0 0
GACTAAGGAATCAAGATTTATTCATATGACCGGTTCAAAATTTTCAGTACAAAGCACATT
CTCTTGTTCAAAATCATTACACTTGCTCATCCATTACAAAGCTAAAAGGAATCAAAGTTT
CTGGCAGTGTTACTTTATTCCCTTATCACCTCAGTATCCATAACCTGAGTTGTCCATTGG
GTTGCCTACAGGAACTGGCTCAGGCTCCTTGATCTCAACAACGACACAGTCAGACATCAA
GAATGTCTTTGCAACCGAAGCTGCGTGTTCCAAGCAACATCTCACAACCTTAGTTGGATC
GATGATTCCTGCAGCCATTAGATCCTCGTACTTGCCGGTTGCAGCATTGTAACCGTACTT
CACATTATCGTTAGAAAGCACCTTCTCGCTAACTACGCTTCCATTGACTCCAGCGTTCTT
GGCAATCAGTTTCAGAGGATAACTCAGTGCTCTTTTCACGATATCCGCTCCAACCTTTTC
TTCATCATTGTCAAGACCGGCTTTAATGGCATCAACCTTGGAAGCAAGACGAAGCAGAGT
ACAGCCACCACCAACGACAATACCTTCCTCAACAGCGGCCTTTGTAGCATTGAGAGCATC
TTCAACTCTCAGTTTCTTCTCTTTGAGTTCTGTCTCCGTTTGTGCTCCGACCTGAATTAC
AGCAACTCCACCAGAGAGCTTTGCAATTCTCTCATTCAGTTTCTCCTTCTCATAATCTTG
CTCTGCTTGCTC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2BQ15JQ 770 0 0
ACTAAGGAATCATGATTTATTCATATGACCGGTTCAAAATTTTCAGTACAAAGCACATTC
TCTTGTTCAAAATCATTACACTTGCTCATCCATTACAAAGCTAAAAGGAATCAAAGTTTC
TGGCAGTGTTACTTTATTCCCCTATCACCTCAGTATCCATAACCTGAGTTGTCCATTGGG
TTGCCTACAGGAACTGGCTCAGGCTCCTTGATCTCAACAACGACACAGTCAGACATCAAG
AATGTCTTTGCAACCGAAGCTGCGTGTTCCAAGCAACATCTCACAACCTTAGTTGGATCG
ATGATTCCTGCAGCCATTAGATCCTCGTACTTGCCAGTTGCAGCATTGTAACCGTACTTC
ACATTATCGTTAGAAAGCACCTTCTCGCTAACTACGCTTCCATTGACTCCAGCGTTCTTG
GCAATCAGTTTCAGAGGGTAACTCAGTGCTCTTTTCACTATATCTGCTCCAACCTTTTCT
TCATCATTGTCAAGACCGGCTTTAATGGCATCCACCTTGGAAGCAAGACGAAGCAGAGTG
CAGCCACCACCAACGACAATACCTTCCTCAACAGCAGCCTTTGTAGCATTAAGAGCATCT
TCAACTCTCAGTTTCTTCTCTTTGAGTTCCGTCTCCGTTTGTGCTCCGGCCTGAATCACA
GCAACTCCACCAGAGAGCTTTGCAATTCTCTCATTCAGTTTTTCCTTCTCATAATCTTGC
TCTGCTTGCTCAATAAGGTTCTTAATCTGTGTAACACGCTTTTGCACTGC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2EO29TF 782 0 0
TCTCAC
ACGACACAGTCAGACATCAAGAATGTCTT*GCAAC*GAAGCTGCGTGTTCCA*GCAACAT
CTCACAAC*TTAGTTGGATCGATGATTC*TGCAGCCATTAGATCCTCGTACTTGCCGGTT
GCAGCATTGTAACCGTACTTCACATTATCGTTAGAAAGCACCTTCTCGCTAACTACGCTT
CCATTGACTCCAGCGTTCTTGGCAATCAGTTTCAGAGGATAACTCAGTGCTCTTTTCACG
ATATCCGCTCCAACCTTTTCTTCATCATTGTCAAGACCGGCTTTAATGGCATCAACCTTG
GAAGCAAGACGAAGCAGAGTACAGCCACCACCAACGACAATACCTTCCTCAACAGCGGCC
TTTGTAGCATTGAGAGCATCTTCAACTCTCAGTTTCTTCTCTTTGAGTTCTGTCTCCGTT
TGTGCTCCGACCTGAATTACAGCAACTCCACCAGAGAGCTTTGCAATTCTCTCATTCAGT
TTCTCCTTCTCATAATCTTGCTCTGCTTGCTCAATAAGGTTCTTAATTTGTGTAACACGC
TTTTGCACTGCGTCCTGTGTGCTCCCATCACCCACAATGGTCGAAGTCTCCTTAGTGAGG
ACCACCTTTGCGGCATGTCCAAGAACCTCTTTTCCAGCTTTGTCAAGTGAAAGACCAACT
TCCTCACGAATCACAGTTGCTCCAGTGAGGATGGCAATATCGTCAAGGTATTGGCTCTTG
CGCTCTCCAAATCCTGGAGCCTTGAGAGCTGCAATCTTCAGTGTGCCTCTAAGCTC

QA 7 782 7 782
DS 



AS 1 3

CO CL2459Contig1 909 3 18 U
AATCAAATCGCAATCATGTAAGTCTTTTTATTCAAGATTATGCTCAGTTGATGAAAAAAT
CTCCACAAGTTGCAGGTTACAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAAAGGATAGCCATAACATC
TGAAGCTCTGAGGGCGATGTAGTTGGAACCATCTTTGCCCTTGAAGTCATTGCCTGCATA
CTTGGAGTACAAAACTGTGCTTCCAGTCGATATAGGTAGTGGCTGAAGTTTACCTTCCTC
ATCTAAAGAACCTGGTCCAACCGCTATAACCGTTCCAATTGAAGGCTTCTCTTTGGTAGT
CTCGGTTAGCAACAACCCTCCAGCTGTTTTCTCCTCTGCCTCAGCAATCTTGATGAAGAC
TCGGTCATTCAAGGGTTTGAGATCTTTGATGTCATCTGTCTCGAGAAGGCCAACAATATC
ATCTTCCTTGAGAATGAGATGCTTCACATCGTTAAACTCCACCTCAGTTCCTGCGTATTT
GGAGTAAATAATCTGTGCTCCAGTAGGGACAGTGATATCGATTTTAGTCTTCCCAATAGT
TCTTCCTTCACCCACAGCAACGACTTCACCTCCTTGAGGTTTTGATTGAGCTGTGGATGG
AAGAAAGATACCTCCCATACTCTTTTCCTCTGCCTCCTTGATCTTCACCAAAACTCTATC
TCCCAATGGCTTAATCGATGTGTACTTGGGAGCAACCACAGAAGCAGCTCTAACAACCAA
AGGACGGAAGTGACTCTGCCTAAAGTTCCCTGCTTTCAAAGTTCCAAAAGATGAAAACTT
TGCGCTCGAAGCAGCACGGAGACCTTCCAGTGAGGCTAAGCTCCTAGCTGACACAGTCAC
TGGTGATGCTGTAAGCTGCGTCGCCGCCATTTCTTGAGGATAAGAAAAGGTTGTGACTTT
GGAGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G551JQ U 16
AF RR2BU06JQ U 1
AF RR2G551TF C 243
BS 1 83 RR2BU06JQ
BS 84 84 RR2G551JQ
BS 85 90 RR2BU06JQ
BS 91 91 RR2G551JQ
BS 92 100 RR2BU06JQ
BS 101 101 RR2G551JQ
BS 102 125 RR2BU06JQ
BS 126 126 RR2G551JQ
BS 127 191 RR2BU06JQ
BS 192 192 RR2G551JQ
BS 193 245 RR2BU06JQ
BS 246 246 RR2G551JQ
BS 247 383 RR2BU06JQ
BS 384 384 RR2G551JQ
BS 385 454 RR2BU06JQ
BS 455 455 RR2G551TF
BS 456 768 RR2BU06JQ
BS 769 909 RR2G551TF

RD RR2G551JQ 419 0 0
CATGTAA
TCTTTTTATTCAAGATTATGCTCAGTTGATGAAAAAATCTCCACAAGTTGCAGGTTACAA
AAAAAAAAAAAAAACTAAAAAAGGATAGCCATAACATCTGAAGCTCTGAGGGCGATGTAG
TTGGAACCATCTTTGCCCTTGAAGTCATTGCCTGCATACTTGGAGTACAAAACTGTGCTT
CCAGTCGATATAGGTAGTGGCTGAAGTTTACCTTCCTCATCTAAAGAACCTGGTCCAACC
GCTATAACCGTTCCAATTGAAGGCTTCTCTTTGGTAGTCTCGGTTAGCAACAACCCTCCA
GCTGTTTTCTCCTCTGCCTCAGCAATCTTGATGAAAACTCGGTCATTCAAGGGTTTGAAA
TCTTTGATGTCATCTGTCTCGAGAAGGCCAACAATATCATCTTCCTTGAGAA

QA 8 419 8 419
DS 

RD RR2BU06JQ 773 0 0
AATCAAATCGCAATCATGTAAGTCTTTTTATTCAAGATTATGCTCAGTTGATGAAAAAAT
CTCCACAAGTTGCAGGTTACAAAGAAAAAAGAAAAACTAAGAAAGGATAGCCATAACATC
TGAAGTTCTGAGGGCGATGTAGTTGGAACCATCTTTGCCCTTGAAGTCATTGCCTGCATA
CTTGGAGTACAGAACTGTGCTTCCAGTCGATATAGGTAGTGGCTGAAGTTTACCTTCCTC
ATCTAGAGAACCTGGTCCAACCGCTATAACCGTTCCAATTGAAGGCTTCTCTTTGGTAGT
CTCGGTTAGCAACAACCCTCCAGCTGTTTTCTCCTCTGCCTCAGCAATCTTGATGAAGAC
TCGGTCATTCAAGGGTTTGAGATATTTGATGTCATCTGTCTCGAGAAGGCCAACAATATC
ATCTTCCTTGAGAATGAGATGCTTCACATCGTTAGACTCCACCTCAGTTCCTGCGTATTT
GGAGTAAATAATCTGTGCTCCAGTAGGGACAGTGATATCGATTTTAGTCTTCCCAATAGT
TCTTCCTTCACCCACAGCAACGACTTCACCTCCTTGAGGTTTTGATTGAGCTGTGGATGG
AAGAAAGATACCTCCCATACTCTTTTCCTCTGCCTCCTTGATCTTCACCAAAACTCTATC
TCCCAATGGCTTAATCGATGTGTACTTGGGAGCAACCACAGAAGCAGCTCTAACAACCAA
AGGACGGAAGTGACTCTGCCTAAAGTTCCCTGCTTTCAAAGTTCCAAA
GATGA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2G551TF 667 0 0
TCTAGAGAA
CTGGTCCAACCGCTATAACCGTTCCAATTGAAGGCTTCTCTTTGGTAGTCTCGGTTAGCA
ACAACCCTCCAGCTGTTTTCTCCTCTGCCTCAGCAATCTTGATGAAGACTCGGTCATTCA
AGGGTTTGAGATCTTTGATGTCATCTGTCTCGAGAAGGCCAACAATATCATCTTCCTTGA
GAATGAGATGCTTCACATCGTTAAACTCCACCTCAGTTCCTGCGTATTTGGAGTAAATAA
TCTGTGCTCCAGTAGGGACAGTGATATCGATTTTAGTCTTCCCAATAGTTCTTCCTTCAC
CCACAGCAACGACTTCACCTCCTTGAGGTTTTGATTGAGCTGTGGATGGAAGAAAGATAC
CTCCCATACTCTTTTCCTCTGCCTCCTTGATCTTCACCAAAACTCTATCTCCCAATGGCT
TAATCGATGTGTACTTGGGAGCAACCACAGAAGCAGCTCTAACAACCAAAGGACGGAAGT
GACTCTGCCTAAAGTTCCCTGCTTTCAAAGTTCCAAAAGATGAAAACTTTGCGCTCGAAG
CAGCACGGAGACCTTCCAGTGAGGCTAAGCTCCTAGCTGACACAGTCACTGGTGATGCTG
TAAGCTGCGTCGCCGCCATTTCTTGAGGATAAGAAAAGGTTGTGACTTTGGAGGATCC

QA 10 667 10 667
DS 



AS 1 3

CO CL2460Contig1 930 3 4 U
GGAAGATCAGATCAATCGGAGAGGAAGAGATGGGTGGCGCGAATCTGAAAGCAGAGACGA
TGGCTCTGATGGATAAGAGAACGGCCATGGAGACTGAAATGAACTCGATCGTTGAACGTC
TATGCAATCCCGGTGGTCCTGGTCTCTCCGGCAATCTCGTCGACTCGGAGGGATTCCCTC
GGGGAGATATTGACATTCCGGCGGTTAGAGCTCAGCGCCGTCGTCTTGCTGAGTTACGGA
ATGAACACAGCGAGATAACGGACAAGATCGATGTAAACATTCAGATTCTTCATTCAGCGA
GGCCTACTACGTCCAGAGCTTCATCTATCAAAGATTCAGGTCCAGAAGAAAGAAGCTTGT
CAGGTGAAGTGACTTCTTTATCTGCCTCCATGCAGACATCTGGCATCAGTGTTACTTCCC
ATGCCATGGATGTGGATGTGGTCACTAGTATTCCCTTTGCCATGGTTGATGAGATAACCG
AGTCATCTCCAGCAGCGGAGGATGGGTTACAGCTTGGAGATCAGGTTGTGAAATTCGGCA
GCGTGGAAGGTGGTGACAACCTGTTGCAAAGGCTTGCCGCTGAAGCTCAAGCTAGCCAGG
GACAAGCTGTTTCTGTTGGAGTTATAAAGCAAGGTGCGAAATTAGATTTAGCTGTGACCC
CGAGGGTATGGCAAGGCAGAGGTCTGTTAGGGTGCCATTTCCGTTTGGTATGAGCCATGG
ATTATCATTTGGAGGCAAGCTTCTGTCCTGCAGAGTTTTTGGTTGAAGAATGATATGTCT
GTTTTTAAAAACTTGGACTTAGTATGCGTGCAAGTGTTTACCCAGTTTGGTTGTTGAAAG
TAGTCTTCTTTGTATGTTGGACCAAACTCAGAAAAAGAAACATCGTTTGGCTTGTAGCTG
ATACGACAACTGAAAGGCTTCATTTCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ10TF U 12
AF RR2H081TF U 1
AF RR2H081JQ C 152
BS 1 642 RR2H081TF
BS 643 643 RR2H081JQ
BS 644 665 RR2H081TF
BS 666 930 RR2H081JQ

RD RR2GJ10TF 553 0 0
GCAGATCAATT
GGAAGAGATGGGTGGCGCGAATCTGAAAGCGGAGACGATGGCTCTGATGGATAAGAGAGC
TGCCATGGAGACTGAAATGAACTCGATCGTTGAACGTCTATGCAATCCCGGTGGTCCTGG
TCTCTCCGGCAATCTCGTCGACTCGGAGGGATTCCCTCGGGGAGATATTGACATTCCGGC
GGTTAGAGCTCAGCGCCGTCGTCTTGCCGAGTTACGGAATGAACACAGCGAGATAACGGA
CAAGATCGATGTGAACATTCAGATTCTTCATTCAGTGAGGCCTACTACGTCAAGAGCTTC
AATTTCCAAAGATTCAGGTCCAGAAGAAAGAAGCTTGTCAGGTGAAGTGACTTCTTTATC
TGCCTCCATGCAGACATCTGGCATCAGTGTCACTTCCCGTGCTATGGATGTGGATGTGGT
CACTAGTATTCCCTTTGCCATGGTTGATGAGATAACCGAGTCATCTCCAGCAGCAGAGGA
TGGGTTACAGCTTGGAGATCAGGTTGTGAAATTCGGCAACGTGGAAGGTGGTGACAACCT
GT

QA 12 553 12 553
DS 

RD RR2H081TF 668 0 0
GGAAGATCAGATCAATCGGAGAGGAAGAGATGGGTGGCGCGAATCTGAAAGCAGAGACGA
TGGCTCTGATGGATAAGAGAACGGCCATGGAGACTGAAATGAACTCGATCGTTGAACGTC
TATGCAATCCCGGTGGTCCTGGTCTCTCCGGCAATCTCGTCGACTCGGAGGGATTCCCTC
GGGGAGATATTGACATTCCGGCGGTTAGAGCTCAGCGCCGTCGTCTTGCTGAGTTACGGA
ATGAACACAGCGAGATAACGGACAAGATCGATGTAAACATTCAGATTCTTCATTCAGCGA
GGCCTACTACGTCCAGAGCTTCATCTATCAAAGATTCAGGTCCAGAAGAAAGAAGCTTGT
CAGGTGAAGTGACTTCTTTATCTGCCTCCATGCAGACATCTGGCATCAGTGTTACTTCCC
ATGCCATGGATGTGGATGTGGTCACTAGTATTCCCTTTGCCATGGTTGATGAGATAACCG
AGTCATCTCCAGCAGCGGAGGATGGGTTACAGCTTGGAGATCAGGTTGTGAAATTCGGCA
GCGTGGAAGGTGGTGACAACCTGTTGCAAAGGCTTGCCGCTGAAGCTCAAGCTAGCCAGG
GACAAGCTGTTTCTGTTGGAGTTATAAAGCAAGGTGCGAAAT*AGATTTAGCTGTGACCC
CGAGG
TAT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2H081JQ 779 0 0
CAATCTCGTCGACTCGGAGGGATTCCCTCGGGGAGATATTGACATTCCGGCGGTTAGAGC
TCAGCGCCGTCGTCTTGCTGAGTTACGGAATGAACACAGCGAGATAACGGACAAGATCGA
TGTAAACATTCAGATTCTTCATTCAGCGAGGCCTACTACGTCCAGAGCTTCATCTATCAA
AGATTCAGGTCCAGAAGAAAGAAGCTTGTCAGGTGAAGTGACTTCTTTATCTGCCTCCAT
GCAGACATCTGGCATCAGTGTTACTTCCCATGCCATGGATGTGGATGTGGTCACTAGTAT
TCCCTTTGCCATGGTTGATGAGATAACCGAGTCATCTCCAGCAGCGGAGGATGGGTTACA
GCTTGGAGATCAGGTTGTGAAATTCGGCAGCGTGGAAGGTGGTGACAACCTGTTGCAAAG
GCTTGCCGCTGAAGCTCAAGCTAGCCAGGGACAAGCTGTTTCTGTTGGAGTTATAAGGCA
AGGTGCGAAATTAGATTTAGCTGTGACCCCGAGGGTATGGCAAGGCAGAGGTCTGTTAGG
GTGCCATTTCCGTTTGGTATGAGCCATGGATTATCATTTGGAGGCAAGCTTCTGTCCTGC
AGAGTTTTTGGTTGAAGAATGATATGTCTGTTTTTAAAAACTTGGACTTAGTATGCGTGC
AAGTGTTTACCCAGTTTGGTTGTTGAAAGTAGTCTTCTTTGTATGTTGGACCAAACTCAG
AAAAAGAAACATCGTTTGGCTTGTAGCTGATACGACAACTGAAAGGCTTCATTTCTTAC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 4

CO CL2461Contig1 1186 4 16 U
GGACAAACGATTTCTGGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAATGGAAGAAGTTA***CAGTGGTG
GAGAACAAGAAAGTGATACTAAAGAATTACGTAGATGGTATTCCTACAGAAACAGACATG
GAAGTGAAGATTGGAGACACAATTGAGCTTAAGGCACCAAAAGGATCCTCTTGCTTCCTC
GTCAAAAATCTCTACTTGTCTTGCGATCCTTACATGAGAGGTCGTATGCGCGATTTTCAC
GGCTCATATCTCCCTCCTTTTCTTCCTGGTCAACGTATTGAAGGGTTCGGTTTAGCAAAG
GTGATAGATTCTGACGATCCCAATTACACGCCCGGCGAGTTAATCTGCGGGATTACTGGT
TGGGAAGAATACAGTTTGCTTCGCGGCTCAAATGAGTTACAGTTGAGAAAGATTCAGCTA
GACGATGACATTCCACTTTCTTATCATCTTGGCCTTCTTGGAATGGCTGGATTTACAGCG
TATGCAGGGTTTTATGAGATATGCTCTCCGAAAAAAGGGGAGAGTGTTTTTGTGTCTGCA
GCTTCAGGAGCAGTAGGACAACTTGTTGGTCAGCTAGCTAAGTTGCATGGCTGCTACGTT
GTTGGGAGTGCTGGTAGTAAACAAAAGGTTGATCTTCTTAAAAACAAGCTTGGGTTTGAT
GAAACTTTTAACTACAAGGAAGAGGCTGATCTTGATGCCGCTTTAAAGAGGTATTTCCCG
GAGGGGATCAATATCTACTTTGACAACGTGGGTGGATCCATGCTTGATGCAGCGCTCCTT
AACATGAAGGTCCGTGGAAGAATCGCTCTCTGTGGAATGGTGTCTTTACAAAGCCTCTCA
AGCTCATCACAAGGAATCAACAACCTGTACAACGCGATCCCCAAATGAGTAAGATTAGAA
GGGTTCTTGCAAAGCGATTACGTCCATATTTTCCTCAATTTCTTGAACATGTCAAAGAAT
ACTACAAGGAAGGGAAGATTGTGTACATCGAAGATATGTCAGAAGGCCTAGAGCTTGCTC
CTGCTGCACTTGTCGGGTTGTTTTCCGGGAAAAATGTTGGTAAACAGGTCGTTAGGGTTG
CTAATGAGTGATTATTTTTGAAAGTATATTGCAGTGTCAGTAACACTTTTACGTTCAGAA
GAGACATTTTATGAATAAAGCGGTGTTGTGCCTAACACTTCTTGCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FE73TF U 3
AF RR2AJ57TF U 16
AF RR2A619TF U 1
AF RR2AJ57JQ C 384
BS 1 161 RR2A619TF
BS 162 162 RR2FE73TF
BS 163 355 RR2A619TF
BS 356 356 RR2FE73TF
BS 357 391 RR2A619TF
BS 392 392 RR2AJ57TF
BS 393 491 RR2A619TF
BS 492 492 RR2AJ57TF
BS 493 593 RR2A619TF
BS 594 594 RR2FE73TF
BS 595 663 RR2A619TF
BS 664 664 RR2AJ57JQ
BS 665 698 RR2A619TF
BS 699 699 RR2AJ57JQ
BS 700 789 RR2A619TF
BS 790 1186 RR2AJ57JQ

RD RR2FE73TF 642 0 0
GG
AAACGATTTCTGGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAATGGAAGAAGTTA***CAGTGGTGGAGA
ACAAGAAAGTGATACTAAAGAATTACGTAGATGGTATTCCTACAGAAACAGACATGGAAG
TGAAGATTGGAGACACAATTGAGCTTAAGGCACCAAAAGGATCCTCTTGCTTCCTCGTCA
AAAATCTCTACTTGTCTTGCGATCCTTACATGAGAGGTCGTATGCGCGATTTTCACGGCT
CATATCTCCCTCCTTTTCTTCCTGGTCAACGTATTGAAGGGTTCGGTTTAGCAAAGGTGA
TAGATTCTGACGATCCCAATTACACGCCCGGCGAGTTAATCTGCGGGATTACTGGTTGGG
AAGAATACAGTTTGCTTCGCGGCTCAAGTGAGTTACAGTTGAGAAAGATTCAGCTAGACG
ATGACATTCCACTTTCTTATCATCTTGGCCTTCTTGGAATGGCTGGATTTACAGCGTATG
CAGGGTTCTATGAGATATACTCTCCGAAAAAAGGGGAGAGTGTTTTTGTGTCTGCAGCTT
CAGGAGCAGTAGGACAACTTGTTGGTCAGCTAGCTAAGTTGCATGGCTGCTACGTTGTTG
GGAGTGCTGGTAGTAAACAAAAGGTTGATCTTCTT
AAAAA

QA 3 637 3 637
DS 

RD RR2AJ57TF 624 0 0
GGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAATGGAAAAAGTTATTACAGTGGTGGAGAACAAGAAAGTG
ATACTAAAGAATTACGTAGATGGTATTCCTACAGAAACAGACATGGAAGTGAAGATTGGA
GACACAATTGAGCTTAAGGCACCAAAAGGATCCTCTTGCTTCCTCGTCAAAAATCTCTAC
TTGTCTTGCGATCCTTACATGAGAGGTCGTATGCGCGATTTTCACGGCTCCTACCTCCCT
CCTTTTCTTCCTGGTCAACGTATTGAAGGGTTCGGTTTAGCAAGGGTGATAGATTCTGAC
GATCCCAATTACACGCCGGGCGAGTTAATCTGCGGGATTACTGGTTGGGAAGAATACAGT
TTGCTTCGCAGCTCAAATGAGTTACAGTTGAGAAAGATTCAGCTAGACGATGACATTCCA
CTTTCTTATCATCTTGGCCTTCTTGGAATGGCTGGATTTACAGCGTATGCAGGGTTTTAT
GAGATATGCTCTCCGAAAAAAGGGGAGAGTGTTTTTGTGTCTGCAGCTTCAGGAGCAGTA
GGACAACTTGTTGGTCAGCTAGCTAAGTTGCATGGCTGCTACGTTGTTGGGAGTGCTGGT
AGTAAACAAAAGGTTGATCTTCTT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2A619TF 793 0 0
GGACAAACGATTTCTGGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAATGGAAGAAGTTA***CAGTGGTG
GAGAACAAGAAAGTGATACTAAAGAATTACGTAGATGGTATTCCTACAGAAACAGACATG
GAAGTGAAGATTGGAGACACAATTGAGCTTAAGGCACCAAACGGATCCTCTTGCTTCCTC
GTCAAAAATCTCTACTTGTCTTGCGATCCTTACATGAGAGGTCGTATGCGCGATTTTCAC
GGCTCATATCTCCCTCCTTTTCTTCCTGGTCAACGTATTGAAGGGTTCGGTTTAGCAAAG
GTGATAGATTCTGACGATCCCAATTACACGCCCGGCGAGTTAATCTGCGGGATTATTGGT
TGGGAAGAATACAGTTTGCTTCGCGGCTCAAGTGAGTTACAGTTGAGAAAGATTCAGCTA
GACGATGACATTCCACTTTCTTATCATCTTGGCCTTCTTGGAATGGCTGGATTTACAGCG
TATGCAGGGTTCTATGAGATATGCTCTCCGAAAAAAGGGGAGAGTGTTTTTGTGTCTGCA
GCTTCAGGAGCAGTAGGACAACTTGTTGGTCAGCTAGCTAAGTTGCATGGCTGTTACGTT
GTTGGGAGTGCTGGTAGTAAACAAAAGGTTGATCTTCTTAAAAACAAGCTTGGGTTTGAT
GAAGCTTTTAACTACAAGGAAGAGGCTGATCTTGATGCTGCTTTAAAGAGGTATTTCCCG
GAGGGGATCAATATCTACTTTGACAACGTGGGTGGATCCATGCTTGATGCAGCGCTCCTT
AACATGAAG
TCCG

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2AJ57JQ 803 0 0
CA
GCTCAAATGAGTTACAGTTGAGAAAGATTCAGCTAGACGATGACATTCCACTTTCTTATC
ATCTTGGCCTTCTTGGAATGGCTGGATTTACAGCGTATGCAGGGTTTTATGAGATATGCT
CTCCGAAAAAAGGGGAGAGTGTTTTTGTGTCTGCAGCTTCAGGAGCAGTAGGACAACTTG
TTGGTCAGCTAGCTAAGTTGCATGGCTGCTACGTTGTTGGGAGTGCTGGTAGTAAACAAA
AGGTTGATCTTCTTAAAAACAAGCTTGGGTTTGATGAAACTTTTAACTACAAGGAAGAGG
CTGATCTTGATGCCGCTTTGAAGAGGTATTTCCCGGAGGGGATCAATATCTACTTTGACA
ACGTGGGTGGATCCATGCTTGATGCAGCGCTCCTTAACATGAAGGTCCGTGGAAGAATCG
CTCTCTGTGGAATGGTGTCTTTACAAAGCCTCTCAAGCTCATCACAAGGAATCAACAACC
TGTACAACGCGATCCCCAAATGAGTAAGATTAGAAGGGTTCTTGCAAAGCGATTACGTCC
ATATTTTCCTCAATTTCTTGAACATGTCAAAGAATACTACAAGGAAGGGAAGATTGTGTA
CATCGAAGATATGTCAGAAGGCCTAGAGCTTGCTCCTGCTGCACTTGTCGGGTTGTTTTC
CGGGAAAAATGTTGGTAAACAGGTCGTTAGGGTTGCTAATGAGTGATTATTTTTGAAAGT
ATATTGCAGTGTCAGTAACACTTTTACGTTCAGAAGAGACATTTTATGAATAAAGCGGTG
TTGTGCCTAACACTTCTTGCT

QA 3 803 3 803
DS 



AS 1 4

CO CL2462Contig1 1271 4 17 U
CTCCAGAGCAGTTTAAGCAAGCTGAAGAGACTGTAACAAAGATGGATTTAGATGGTCTTG
TGGTTATTGGTGGTGATGACTCCAATACTAATGCTTGTCTCCTCGCTGAATACTTCAGAG
GTAAAAACATGAAAACTAAGGTTATTGGCTGTCCTAAAACAATCGATGGTGATTTAAAGA
GCAAAGAAGTCCCCACCAGTTTCGGGTTTGATACTGCTTGCAAGATATACTCAGAAATGA
TTGGAAATGTTATGATCGATGCACGTTCCACGGGAAAATATTACCATTTTGTGCGTCTTA
TGGGCCGTGCTGCTTCTCATATCACACTTGAATGCGCTTTGCAAACCCATCCAAACATTA
CCATTATTGGAGAAGAGGTTTCCGAGAAGAAACTGACGTTGAAAAACGTTACGGATTATA
TTGTTGAAGTGATCTGTAAACGCGCTGAAAATGGTTATAACTATGGTGTCATTCTTGTTC
CTGAAGGTCTAATTGATTTTATCCCTGAGGTCCAAGAGCTTATTTCGGAACTGAACGAAA
TCTTAGCTCAAGGAAACGTCGATGAAGAAGGACAATGGAAGAAGAATCTAAAAGAGGAGA
CTCTAAAGCTTTTTGAGTTTCTTCCTCAAACAATTCAGGAACAACTGATGCTTGAGAGAG
ATCCACATGGAAATGTCCAGGTGGCTAAAATAGAGACTGAGAAAATGCTGATTCAAATGG
TTGAAACCGAGCTAGAGAAAAAGAGAAGGATGGTTCTTATAAACGAGAGTTCATGGGGAA
ATCACACTTCTTTGGGTATGAGGGAAGATGTGGATTGCCTACAAATTTCGATGCAACTTA
TTGTTACGCATTGGGTTACGGTGCTGGATCACTTCTCCAGAGTGGAAAGACCGGTTTAAT
CTCATCGGTTGGGAATTTGGCTGCTCCAGTTGAGAAATGGACCGTTGGTGGTACACCGCT
GACATCATTGATGGATGTTGAGAGAAGACATGGTAAATTCAAGCCTGTTATCAAGAAAGC
TATGGTTGAACTTGAAGGTGCACCGTTTAAGAAATTTGCATCGCAGCGTGAAGAATGGGC
TTTGAAGAATAGATACATTAGTCCTGGTCCGATTCAGTTCAAGGGACCGGGATCTGATGC
GATAAATCACACTTTACTGCTCGAACTCGGTGCTCAAGCCTGAAGAGTTTTGTTACTGTC
AGATTCACTCACTTTGTTTGTTAAAAGCTTTGTAGTAAGAATGTTAAATGTTGTGACTTT
TGAGTTAAGTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL71TF U 1
AF RR2GS14TF U 1
AF RR2BM24TF U 273
AF RR2BM24JQ C 509
BS 1 526 RR2GL71TF
BS 527 527 RR2BM24TF
BS 528 547 RR2GL71TF
BS 548 548 RR2BM24TF
BS 549 549 RR2GL71TF
BS 550 550 RR2BM24TF
BS 551 589 RR2GL71TF
BS 590 590 RR2BM24TF
BS 591 610 RR2GL71TF
BS 611 611 RR2BM24TF
BS 612 622 RR2GL71TF
BS 623 623 RR2BM24TF
BS 624 625 RR2GL71TF
BS 626 626 RR2BM24TF
BS 627 634 RR2GL71TF
BS 635 987 RR2BM24TF
BS 988 1271 RR2BM24JQ

RD RR2GL71TF 634 0 0
CTCCAGAGCAGTTTAAGCAAGCTGAAGAGACTGTAACAAAGATGGATTTAGATGGTCTTG
TGGTTATTGGTGGTGATGACTCCAATACTAATGCTTGTCTCCTCGCTGAATACTTCAGAG
GTAAAAACATGAAAACTAAGGTTATTGGCTGTCCTAAAACAATCGATGGTGATTTAAAGA
GCAAAGAAGTCCCCACCAGTTTCGGGTTTGATACTGCTTGCAAGATATACTCAGAAATGA
TTGGAAATGTTATGATCGATGCACGTTCCACGGGAAAATATTACCATTTTGTGCGTCTTA
TGGGCCGTGCTGCTTCTCATATCACACTTGAATGCGCTTTGCAAACCCATCCAAACATTA
CCATTATTGGAGAAGAGGTTTCCGAGAAGAAACTGACGTTGAAAAACGTTACGGATTATA
TTGTTGAAGTGATCTGTAAACGCGCTGAAAATGGTTATAACTATGGTGTCATTCTTGTTC
CTGAAGGTCTAATTGATTTTATCCCTGAGGTCCAAGAGCTTATTTCAGAACTGAACGAAA
TCTTAGCCCGAGGAAACGTCGATGAAGAAGGACAATGGAAGAAGAATCTTAAAGAGGAGA
CTCTAAAGCTGTTTGAGTTTCTCCCCCAAACAAT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2GS14TF 620 0 0
CTCCAGAGCAGTTTAAGCAAGCTGAAGAGACTGTAACAAAGATGGATTTAGATGGTCTTG
TGGTTATTGGTGGTGATGACTCCAATACTAATGCTTGTCTCCTCGCTGAATACTTCAGAG
GTAAAAACATGAAAACTAAGGTTATTGGCTGTCCTAAAACAATCGATGGTGATTTAAAGA
GCAAAGAAGTCCCCACCAGTTTCGGGTTTGATACTGCTTGCAAGATATACTCAGAAATGA
TTGGAAATGTTATGATCGATGCACGTTCCACGGGAAAATATTACCATTTTGTGCGTCTTA
TGGGCCGTGCTGCTTCTCATATCACACTTGAATGCGCTTTGCAAACCCATCCAAACATTA
CCATTATTGGAGAAGAGGTTTCCGAGAAGAAACTGACGTTGAAAAACGTTACGGATTATA
TTGTTGAAGTGATCTGTAAACGCGCTGAAAATGGTTATAACTATGGTGTCATTCTTGTTC
CTGAAGGTCTAATTGATTTTATCCCTGAGGTCCAAGAGCTTATTTCAGAACTGAACGAAA
TCTTAGCCCGAGGAAACGTCGATGAAGAAGGACAATGGAAGAAGAATCTTAAAGAGGAGA
CTCTAAAGCTGTTTGAGTTT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2BM24TF 715 0 0
GGAAAATACTACCACTTTGTGCGTCTTATGGGCCGTGCTGCTTCTCATATTACACTTGGA
TGCGCTTTGCAAACCCATCCAAACATTACCATTATTGGAGAAGAGGTTTCCGAGAAGAAA
CTAACGTTGAAAAACGTTACGGATTACATTGTTGATGTGATCCGTAAACGCGCTGAAAAT
GGTTATAACTATGGTGTCATTCTTGTTCCTGAAGGTCTAATTGATTTCATCCCTGAGGTC
CAAGAGCTTATTTCGGAACTGAACGAAATCTTAGCTCAAGGAAACGTCGATGAAGAAGGA
CAATGGAAGAAGAATCTAAAAGAGGAGACTCTAAAGCTTTTTGAGTTTCTTCCTCAAACA
ATTCAGGAACAACTGATGCTTGAGAGAGATCCACATGGAAATGTCCAGGTGGCTAAAATA
GAGACTGAGAAAATGCTGATTCAAATGGTTGAAACCGAGCTAGAGAAAAAGAGAAGGATG
GTTCTTATAAACGAGAGTTCATGGGGAAATCACACTTCTTTGGGTATGAGGGAAGATGTG
GATTGCCTACAAATTTCGATGCAACTTATTGTTACGCATTGGGTTACGGTGCTGGATCAC
TTCTCCAGAGTGGAAAGACCGGTTTAATCTCATCGGTTGGGAATTTGGCTGCTCCAGTTG
AGAAATGGACCGTTGGTGGTACACCGCTGACATCATTGATGGATGTTGAGAGAAG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2BM24JQ 763 0 0
GGTCCAAGAGCTTATTTCGGAACTGAACGAAATCTTAGCTCAAGGAAACGTCGATGAAGA
AGGACAATGGAAGAAGAATCTAAAAGAGGAGACTCTAAAGCTTTTTGAGTTTCTTCCTCA
AACAATTCAGGAACAACTGATGCTTGAGAGAGATCCACATGGAAATGTCCAGGTGGCTAA
AATAGAGACTGAGAAAATGCTGATTCAAATGGTTGAAACCGAGCTAGAGAAAAAGAGAAG
GATGGTTCTTATAAACGAGAGTTCATGGGGAAATCACACTTCTTTGGGTATGAGGGAAGA
TGTGGATTGCCTACAAATTTCGATGCAACTTATTGTTACGCATTGGGTTACGGTGCTGGA
TCACTTCTCCAGAGTGGAAAGACCGGTTTAATCTCATCGGTTGGGAATTTGGCTGCTCCA
GTTGAGAAATGGACCGTTGGTGGTACACCGCTGACATCATTGATGGATGTTGAGAGAAGA
CATGGTAAATTCAAGCCTGTTATCAAGAAAGCTATGGTTGAACTTGAAGGTGCACCGTTT
AAGAAATTTGCATCGCAGCGTGAAGAATGGGCTTTGAAGAATAGATACATTAGTCCTGGT
CCGATTCAGTTCAAGGGACCGGGATCTGATGCGATAAATCACACTTTACTGCTCGAACTC
GGTGCTCAAGCCTGAAGAGTTTTGTTACTGTCAGATTCACTCACTTTGTTTGTTAAAAGC
TTTGTAGTAAGAATGTTAAATGTTGTGACTTTTGAGTTAAGTA

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 4

CO CL2463Contig1 1053 4 7 U
GGATTCAACACCAATCTTAACCAGCAAAATTAATAACAACAAGATAAACTAAATAACATT
AGAATGGGAGCGTTTCTAGGACACTTTGTGCCTGGTCTCTCACTAGCACTTCTTGGTCTT
TGGCATCTCTTCAACACCATAAGATCTTACTGTCTTAAAGGCCCTGAAACTTTCTCTGCC
AAGTTCTGGTTCCCTTTCCCTAAACTCAAACATCTCGAGCTTGTCTTGATCCTTTTCTTC
TCCTTCTTCGCCATCATCCTCTTAACTATAGACTTCCCTGATTTCAACTTCTCCTCTTTC
AAGCCAGACAACCTAGAACATGCTTCCATGTTCCTACACCTGATTATCTTCGCATGTTTC
GCTCTCTTTTGCGAGCTAACCCTTTGCTCAGATCTCTTCTCCGGTATAATAGGTATCCTC
TCTGCTTCTGTATTTGCACAAGAACTCTTCCTCCTTCATTTCCACTCCACTGATCACTTA
GGTCTTGAAGGTCATTACCATTTCCTTCTCCAGCTCATCGCTTTTGTCTCCTTCTCCTCG
GCTCTAGCTTCTGCTTCTTTTCCGAAGTCATTTTCTGCAGCACTAATCCTCTCGGTTTCG
GTTATGTTTCAAGGATGCTGGTTCTTGAACATGGGTTTCATGCTTTGGGTCCCAAAGAAT
GTTCCTAGAGGTTGCGTAAGCAACACGACAGCATCTGATAACAGAAGTGTTATTCATGGT
AGTGCGGTCGCTTGTGAGTCCCCTGGCGCTGAGGTTCGAGCAAAGGCCTAGCGAATCTTC
AGTTTAGTTGGATTTTATCGGCTGTATTGATCATTACTTGTGCCTTATGCTTCAAGTTTT
CTGGCAAAGTTGTGTTGCCTAAGAATAGGTCGTCCTCAGAGTACGAGCGTCTTTGTCGAC
AAGGAAGTGATCGCTCTCCAGCCTTGAAGGTGGAAGTACCGGCTGGTTCCGATCAACAAT
AGATTTTCCTTACTTTGTTATTTTAGTATGATAATATGATGTATAATGCATGTAGATACA
CAAACAATAAGACCAAATAATGGCATAATTTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2H109TF U 1
AF RR2H661TF U 1
AF RR2H109JQ C 324
AF RR2H661JQB C 532
BS 1 478 RR2H109TF
BS 479 670 RR2H661TF
BS 671 671 RR2H109JQ
BS 672 742 RR2H661TF
BS 743 743 RR2H109JQ
BS 744 755 RR2H661TF
BS 756 1053 RR2H109JQ

RD RR2H109TF 478 0 0
GGATTCAACACCAATCTTAACCAGCAAAATTAATAACAACAAGATAAACTAAATAACATT
AGAATGGGAGCGTTTCTAGGACACTTTGTGCCTGGTCTCTCACTAGCACTTCTTGGTCTT
TGGCATCTCTTCAACACCATAAGATCTTACTGTCTTAAAGGCCCTGAAACTTTCTCTGCC
AAGTTCTGGTTCCCTTTCCCTAAACTCAAACATCTCGAGCTTGTCTTGATCCTTTTCTTC
TCCTTCTTCGCCATCATCCTCTTAACTATAGACTTCCCTGATTTCAACTTCTCCTCTTTC
AAGCCAGACAACCTAGAACATGCTTCCATGTTCCTACACCTGATTATCTTCGCATGTTTC
GCTCTCTTTTGCGAGCTAACCCTTTGCTCAGATCTCTTCTCCGGTATAATAGGTATCCTC
TCTGCTTCTGTATTTGCACAAGAACTCTTCCTCCTTCATTTCCACTCCACTGATCACT

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2H661TF 759 0 0
GGATTCAACACCAATCTTAACCAGCAAAATTAATAACAACAAGATAAACTAAATAACATT
AGAATGGGAGCGTTTCTAGGACACTTTGTGCCTGGTCTCTCACTAGCACTTCTTGGTCTT
TGGCATCTCTTCAACACCATAAGATCTTACTGTCTTAAAGGCCCTGAAACTTTCTCTGCC
AAGTTCTGGTTCCCTTTCCCTAAACTCAAACATCTCGAGCTTGTCTTGATCCTTTTCTTC
TCCTTCTTCGCCATCATCCTCTTAACTATAGACTTCCCTGATTTCAACTTCTCCTCTTTC
AAGCCAGACAACCTAGAACATGCTTCCATGTTCCTACACCTGATTATCTTCGCATGTTTC
GCTCTCTTTTGCGAGCTAACCCTTTGCTCAGATCTCTTCTCCGGTATAATAGGTATCCTC
TCTGCTTCTGTATTTGCACAAGAACTCTTCCTCCTTCATTTCCACTCCACTGATCACTTA
GGTCTTGAAGGTCATTACCATTTCCTTCTCCAGCTCATCGCTTTTGTCTCCTTCTCCTCG
GCTCTAGCTTCTGCTTCTTTTCCGAAGTCATTTTCTGCAGCACTAATCCTCTCGGTTTCG
GTTATGTTTCAAGGATGCTGGTTCTTGAACATGGGTTTCATGCTTTGGGTCCCAAAGAAT
GTTCCTAGAG*TTGCGTAAGCAACACGACAGCATCTGATAACAGAAGTGTTATTCATGGT
AGTGCGGTCGCTTGTGAGTCCC*TGGCGCTGAGGT
CGAG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2H109JQ 730 0 0
TTCCATGTTCCTACACCTGATTATCTTCGCATGTTTCGCTCTCTTTTGCGAGCTAACCCT
TTGCTCAGATCTCTTCTCCGGTATAATAGGTATCCTCTCTGCTTCTGTATTTGCACAAGA
ACTCTTCCTCCTTCATTTCCACTCCACTGATCACTTAGGTCTTGAAGGTCATTACCATTT
CCTTCTCCAGCTCATCGCTTTTGTCTCCTTCTCCTCGGCTCTAGCTTCTGCTTCTTTTCC
GAAGTCATTTTCTGCAGCACTAATCCTCTCGGTTTCGGTTATGTTTCAAGGATGCTGGTT
CTTGAACATGGGTTTCATGCTTTGGGTCCCAAAGAATGTTCCTAGAGGTTGCGTAAGCAA
CACGACAGCATCTGATAACAGAAGTGTTATTCATGGTAGTGCGGTCGCTTGTGAGTCCCC
TGGCGCTGAGGTTCGAGCAAAGGCCTAGCGAATCTTCAGTTTAGTTGGATTTTATCGGCT
GTATTGATCATTACTTGTGCCTTATGCTTCAAGTTTTCTGGCAAAGTTGTGTTGCCTAAG
AATAGGTCGTCCTCAGAGTACGAGCGTCTTTGTCGACAAGGAAGTGATCGCTCTCCAGCC
TTGAAGGTGGAAGTACCGGCTGGTTCCGATCAACAATAGATTTTCCTTACTTTGTTATTT
TAGTATGATAATATGATGTATAATGCATGTAGATACACAAACAATAAGACCAAATAATGG
CATAATTTAC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2H661JQB 522 0 0
TTCTCCTCGGCTCTAGCTTCTGCTTCTTTTCCGAAGTCATTTTCTGCAGCACTAATCCTC
TCGGTTTCGGTTATGTTTCAAGGATGCTGGTTCTTGAACATGGGTTTCATGCTTTGGGTC
CCAAAGAATGTTCCTAGAGGTTGCGTAAGCAACACGACAGCATCTGATAACAGAAGTGTT
ATTCATGGTAGTGCGGTCGCTTGTGAGTCCCCTGGCGCTGAGGTTCGAGCAAAGGCCTAG
CGAATCTTCAGTTTAGTTGGATTTTATCGGCTGTATTGATCATTACTTGTGCCTTATGCT
TCAAGTTTTCTGGCAAAGTTGTGTTGCCTAAGAATAGGTCGTCCTCAGAGTACGAGCGTC
TTTGTCGACAAGGAAGTGATCGCTCTCCAGCCTTGAAGGTGGAAGTACCGGCTGGTTCCG
ATCAACAATAGATTTTCCTTACTTTGTTATTTTAGTATGATAATATGATGTATAATGCAT
GTAGATACACAAACAATAAGACCAAATAATGGCATAATTTAC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 3

CO CL2464Contig1 711 3 8 U
GGACACACAAACACATGAAGGAAGATATTCATATTTCGAAAATGAAGCAACTGAAAATGA
GCACCGAACTAAACCGGACCTGATTGTAACAATTCATCTTCGAGGCGGCCTTCTCAATCT
CAAGACATCCGAGGCACATAGCTTGGCCTGCATAGACCTATCTGTCTTTGCAACGCCGTA
TAGAATCACCTGGGACTACTATTTCTCTGCCCTAGATCATACTTTGAACTCTGATTCATG
GGAAGAGACAGCTGAGTTGGGTTATGTAAGGCATTTGATTAGTTCTCTCCTTGTAAAGTG
ATGAGAACGAGAAGCTGGATCGATACTCTATCACGTAACTACCAACCTCCCCTTGATGCT
CACTTGGTAATTTCTGTCATGTCTATGCGGACTCGTGTACAACCTGCATATGCTGTTAAT
ATGTGGAACGAGGCAGTCAATAAACTACGGCTCGGTACAGAGCAACTGGATTTGTATGGG
ATTCTTGAAGAAACAATGAGGCGTGAAATGTCATTTGATGAGATAGTCGCCATCCCCAAA
CAGGACGAGTGACAACATGTGTTGCTTTTATCCTTGCAATGTACAAAGCCGCTGGTGCAT
TCGGCCCTCTGACTGATCACATTCAAGGCCCTCTAAGTGTTAGGAAAAAATATTCAACCT
GTTTGTCTCTGTAACTCTGTGTTTTATCTACTTTATGTTTATTTATTTAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FE67TF U 1
AF RR2BM32TF U 1
AF RR2CP28JQ C 202
BS 1 627 RR2BM32TF
BS 628 628 RR2CP28JQ
BS 629 649 RR2BM32TF
BS 650 650 RR2CP28JQ
BS 651 666 RR2BM32TF
BS 667 667 RR2CP28JQ
BS 668 685 RR2BM32TF
BS 686 711 RR2CP28JQ

RD RR2FE67TF 622 0 0
GGACACACAAACACATGAAGGAAGATATTCATATTTCGAAAATGAAGCAACTGAAAATGA
GCACCGAACTAAACCGGACCTGATTGTAACAATTCATCTTCGAGGCGGCCTTCTCAATCT
CAAGACATCCGAGGCACATAGCTTGGCCTGCATAGACCTATCTGTCTTTGCAACGCCGTA
TAGAATCACCTGGGACTACTATTTCTCTGCCCTAGATCATACTTTGAACTCTGATTCATG
GGAAGAGACAGCTGAGTTGGGTTATGTAAGGCATTTGATTAGTTCTCTCCTTGTAAAGTG
ATGAGAACGAGAAGCTGGATCGATACTCTATCACGTAACTACCAACCTCCCCTTGATGCT
CACTTGGTAATTTCTGTCATGTCTATGCGGACTCGTGTACAACCTGCATATGCTGTTAAT
ATGTGGAACGAGGCAGTCAATAAACTACGGCTCGGTACAGAGCAACTGGATTTGTATGGG
ATTCTTGAAGAAACAATGAGGCGTGAAATGTCATTTGATGAGATAGTCGCCATCCCCAAA
CAGGACGAGTGACAACATGTGTTGCTTTTATCCTTGCAATGTACAAAGCCGCTGGTGCAT
TCGGCCCTCTGACTGATCACA
T

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2BM32TF 688 0 0
GGACACACAAACACATGAAGGAAGATATTCATATTTCGAAAATGAAGCAACTGAAAATGA
GCACCGAACTAAACCGGACCTGATTGTAACAATTCATCTTCGAGGCGGCCTTCTCAATCT
CAAGACATCCGAGGCACATAGCTTGGCCTGCATAGACCTATCTGTCTTTGCAACGCCGTA
TAGAATCACCTGGGACTACTATTTCTCTGCCCTAGATCATACTTTGAACTCTGATTCATG
GGAAGAGACAGCTGAGTTGGGTTATGTAAGGCATTTGATTAGTTCTCTCCTTGTAAAGTG
ATGAGAACGAGAAGCTGGATCGATACTCTATCACGTAACTACCAACCTCCCCTTGATGCT
CACTTGGTAATTTCTGTCATGTCTATGCGGACTCGTGTACAACCTGCATATGCTGTTAAT
ATGTGGAACGAGGCAGTCAATAAACTACGGCTCGGTACAGAGCAACTGGATTTGTATGGG
ATTCTTGAAGAAACAATGAGGCGTGAAATGTCATTTGATGAGATAGTCGCCATCCCCAAA
CAGGACGAGTGACAACATGTGTTGCTTTTATCCTTGCAATGTACAAAGCCGCTGGTGCAT
TCGGCCCTCTGACTGATCACATTCAAG*CCCTCTAAGTGTTAGGAAAAA*TATTCAACCT
GTTTGTTTCTGTAACTCTGTGTTTT
GTC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2CP28JQ 510 0 0
TTTT
TCTGCCCGAGATCATACTTTGAACTTTGATTCATGGGAAGAGACAGCTGAGTTGGATTAT
GTAAGGCTTTTGATTAGTTCTCTCCTTGTAAAGTGATGAGAACGAGAAGCTGGATCGATA
CTCTATCACGTAACTACCAACCTCCCCTTGATGCTCACTTGGTAATTTCTGTCATGTCTA
TGCGGACTCGTGTACAACCTGCATATGCTGTTAATATGTGGAACGAGGCAGTCAATAAAC
TACGGCTCGGTACAGAGCAACTGGATTTGTATGGGATTCTTGAAGAAACAATGAGGCGTG
AAATGTCATTTGATGAGATAGTCGCCATCCCCAAACAGGACGAGTGACAACATGTGTTGC
TTTTATCCTTGCAATGTACAAAGCCGCTGGTGCATTCGGCCCTCTGACTGATCACATTCA
AGGCCCTCTAAGTGTTAGGAAAAAATATTCAACCTGTTTGTCTCTGTAACTCTGTGTTTT
ATCTACTTTATGTTTATTTATTTAGC

QA 5 510 5 510
DS 



AS 1 4

CO CL2465Contig1 908 4 2 U
GGCACACAACCACATCAGAGACGAAGCTGGACCTAAAAAATGGAGCTGGATCTCGATCTC
TCTCTATCACCTCGTACTAATTCTTCAAATTTCGGGTTTGGCTTCGACCTTAACAAGCGT
TTGAGTACCAAAGAAAAACGTTTTGAGGCGATGCTTGGGTTGGATAATATGGAAGAAGAT
TGTTATGTGCCAAAACCAAGTTCGTTTTCTTTGAATGGCCAGCCAGACGAGGAAGATGAA
GATCCTTTGGAGTCCGACTCTTCTGTTGTTTACGAGAGGATCAACATATCTAATCCAGCG
GCAACCATTGAAAGAGGTAGACGATCAGCATCATCAATGTATGTCAAGGTGAAGATGGAT
GGTGTGGCAATAACAAGAAAGGTGGACATCAAGCTTTTCGACTCTTACGAGTCTCTCACG
AACTCCTTGATCACCATGTTTAGTCAATACCAAGATTGTGATAGAGAAGATACAAACTTC
AAATTCACCTTCCAAGGGAAGGAGGGTGACTGGCTATTACCAGGAGATGCTCCATGGAAG
ATCTTTGCTGAATCTGTTCATCGTATATCAATTACTAGAGATTGTACGTGTCCATATACA
AGACTTTTGTTCTAAATGAAAAAGAAAATCAAATCGAATACTATTTAAGTATTTGTAATA
GAATGTCTATCTGATTATTTTTCTACTCGAATTCTCGTTCTGTATTCTCCTATGGACTAT
AGTATCTAGTTCATTGGCTTAGCATTTTGTCACTTATCAAGAATCACGGCTAAACATGCC
CGGTAACGTACTACTTATCAAGAATCAAGGAATTTTCTCTCTTTTTTTGAACAAACCATG
CTATTGTTAATTTCAAGTTTCAACCTCTATTAGAGGGGGAAGATGTACATAAAGAAGCAT
AAACAGGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2G894TF U 1
AF RR2H985TF U 1
AF RR2G894JQ C 59
AF RR2H985JQ C 375
BS 1 655 RR2G894TF
BS 656 908 RR2G894JQ

RD RR2G894TF 655 0 0
GGCACACAACCACATCAGAGACGAAGCTGGACCTAAAAAATGGAGCTGGATCTCGATCTC
TCTCTATCACCTCGTACTAATTCTTCAAATTTCGGGTTTGGCTTCGACCTTAACAAGCGT
TTGAGTACCAAAGAAAAACGTTTTGAGGCGATGCTTGGGTTGGATAATATGGAAGAAGAT
TGTTATGTGCCAAAACCAAGTTCGTTTTCTTTGAATGGCCAGCCAGACGAGGAAGATGAA
GATCCTTTGGAGTCCGACTCTTCTGTTGTTTACGAGAGGATCAACATATCTAATCCAGCG
GCAACCATTGAAAGAGGTAGACGATCAGCATCATCAATGTATGTCAAGGTGAAGATGGAT
GGTGTGGCAATAACAAGAAAGGTGGACATCAAGCTTTTCGACTCTTACGAGTCTCTCACG
AACTCCTTGATCACCATGTTTAGTCAATACCAAGATTGTGATAGAGAAGATACAAACTTC
AAATTCACCTTCCAAGGGAAGGAGGGTGACTGGCTATTACCAGGAGATGCTCCATGGAAG
ATCTTTGCTGAATCTGTTCATCGTATATCAATTACTAGAGATTGTACGTGTCCATATACA
AGACTTTTGTTCTAAATGAAAAAGAAAATCAAATCGAATACTATTTAAGTATTTG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2H985TF 623 0 0
GGCACACAACCACATCAGAGACGAAGCTGGACCTAAAAAATGGAGCTGGATCTCGATCTC
TCTCTATCACCTCGTACTAATTCTTCAAATTTCGGGTTTGGCTTCGACCTTAACAAGCGT
TTGAGTACCAAAGAAAAACGTTTTGAGGCGATGCTTGGGTTGGATAATATGGAAGAAGAT
TGTTATGTGCCAAAACCAAGTTCGTTTTCTTTGAATGGCCAGCCAGACGAGGAAGATGAA
GATCCTTTGGAGTCCGACTCTTCTGTTGTTTACGAGAGGATCAACATATCTAATCCAGCG
GCAACCATTGAAAGAGGTAGACGATCAGCATCATCAATGTATGTCAAGGTGAAGATGGAT
GGTGTGGCAATAACAAGAAAGGTGGACATCAAGCTTTTCGACTCTTACGAGTCTCTCACG
AACTCCTTGATCACCATGTTTAGTCAATACCAAGATTGTGATAGAGAAGATACAAACTTC
AAATTCACCTTCCAAGGGAAGGAGGGTGACTGGCTATTACCAGGAGATGCTCCATGGAAG
ATCTTTGCTGAATCTGTTCATCGTATATCAATTACTAGAGATTGTACGTGTCCATATACA
AGACTTTTGTTCTAAATGAAAAA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2G894JQ 850 0 0
TCTCTCTATCACCTCGTACTAAT*CTTCAAATTTCGGGTTTGGCTTCGAC*TTAACAAGC
GTTTGAGTACCAAAGAAAAACGTTT*GAGGCGATGCTTGGGTTGGATAATATGGAAGAAG
ATTGTTATGTGCCAAAACCAAGTTCGTTTTCTTTGAATGGCCAGCCAGACGAGGAAGATG
AAGATCCTTTGGAGTCCGACTCTTCTGTTGTTTACGAGAGGATCAACATATCTAATCCAG
CGGCAACCATTGAAAGAGGTAGACGATCAGCATCATCAATGTATGTCAAGGTGAAGATGG
ATGGTGTGGCAATAACAAGAAAGGTGGACATCAAGCTTTTCGACTCTTACGAGTCTCTCA
CGAACTCCTTGATCACCATGTTTAGTCAATACCAAGATTGTGATAGAGAAGATACAAACT
TCAAATTCCCCTTCCAAGGGAAGGAGGGTGACTGGCTATTACCAGGAGATGCTCCATGGA
AGATCTTTGCTGAATCTGTTCATCGTATATCAATTACTAGAGATTGTACGTGTCCATATA
CAAGACTTTTGTTCTAAATGAAAAAGAAAATCAAATCGAATACTATTTAAGTATTTGTAA
TAGAATGTCTATCTGATTATTTTTCTACTCGAATTCTCGTTCTGTATTCTCCTATGGACT
ATAGTATCTAGTTCATTGGCTTAGCATTTTGTCACTTATCAAGAATCACGGCTAAACATG
CCCGGTAACGTACTACTTATCAAGAATCAAGGAATTTTCTCTCTTTTTTTGAACAAACCA
TGCTATTGTTAATTTCAAGTTTCAACCTCTATTAGAGGGGGAAGATGTACATAAAGAAGC
ATAAACAGGT

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR2H985JQ 534 0 0
AAGAAAGGTGGACATCAAGCTTTTCGACTCTTACGAGTCTCTCACGAACTCCTTGATCAC
CATGTTTAGTCAATACCAAGATTGTGATAGAGAAGATACAAACTTCAAATTCACCTTCCA
AGGGAAGGAGGGTGACTGGCTATTACCAGGAGATGCTCCATGGAAGATCTTTGCTGAATC
TGTTCATCGTATATCAATTACTAGAGATTGTACGTGTCCATATACAAGACTTTTGTTCTA
AATGAAAAAGAAAATCAAATCGAATACTATTTAAGTATTTGTAATAGAATGTCTATCTGA
TTATTTTTCTACTCGAATTCTCGTTCTGTATTCTCCTATGGACTATAGTATCTAGTTCAT
TGGCTTAGCATTTTGTCACTTATCAAGAATCACGGCTAAACATGCCCGGTAACGTACTAC
TTATCAAGAATCAAGGAATTTTCTCTCTTTTTTTGAACAAACCATGCTATTGTTAATTTC
AAGTTTCAACCTCTATTAGAGGGGGAAGATGTACATAAAGAAGCATAAACAGGT

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 3

CO CL2466Contig1 895 3 11 U
CAAAAGTTCACTTAGTCAAGAAAAAATTCCAAACGTTCAGAGAACGACACTGGTACTAAA
GGTATTGCAGAAAAAAAAAAACTAAAGAAATAGCTGAACAACCACTCTTGCAACTATAGT
AACTAAAGAATTTACCTCAACACAATGGTAATATGTAATTATATTCATACGAGATGCACA
TACTTCAAACCTTTTACCCGAAAGGGAAAATTACCACCATCCTCTCTTCCTTATCTTTTT
ACTTGTTTCCCCTAAAGTAGAGGTAAATTTTCTGAAGAACCCATAGACTCAGAAGTGACT
CCAAGCAGAAGAGACCAAAGCCGATAAAGTAGAAGATCCCGGCTAATACACTGTCTGAGA
TGACATCAATTGCTGCAAGCACACCCGTTAATGATTTTCCATGAAAAAAGATCGGTGGGG
CAATGGCAGCAACGATGCAGAAGCCAATGTGAATCAAGTAGGTGAAGAAAAACCAACCAA
ACTTCAAAGCGCTGTCAGTCCTCATGGCTCGGTAGAGAGGCCTGTACCACACAACATAAG
AAAGTGGGCATCCCATCAAGGCATATATTGTGGCAAGGAAAAAGATCTTTACACCTCCGC
CTTTAATCCAGCACACCATGGTTGCAATCACATTGAATACCAGACACAAAACGATACCTA
ACCAACTAGCAAAAGCCAGATACTGCAGCTTCTGAGCATGAACTGGTATCTCATTAGCAA
TGTCATGGTGTATGATTGGAAAAAACGGTGGCCAGTTTTTCTCATCTATCTGAACACCAG
ATTTAGCAATAGCATCCTCTCTCCGTTTAATATCCATTTCTTTCTTCCTAAGCTCAGCTT
CCCAGTCAGCAAGCTTTCTCTGTTTCTGTGAAGAGTCATTCATGTTATCCAAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT22JQ U 1
AF RR2EG23JQ U 29
AF RR2BT22TF C 238
BS 1 74 RR2BT22JQ
BS 75 75 RR2EG23JQ
BS 76 99 RR2BT22JQ
BS 100 100 RR2EG23JQ
BS 101 232 RR2BT22JQ
BS 233 233 RR2EG23JQ
BS 234 358 RR2BT22JQ
BS 359 359 RR2EG23JQ
BS 360 678 RR2BT22JQ
BS 679 711 RR2EG23JQ
BS 712 895 RR2BT22TF

RD RR2BT22JQ 678 0 0
CAAAAGTTCACTTAGTCAAGAAAAAATTCCAAACGTTCAGAGAACGACACTGGTACTAAA
GGTATTGCAGAAAAGAAAAAACTAAAGAAATAGCTGAACGACCACTCTTGCAACTATAGT
AACTAAAGAATTTACCTCAACACAATGGTAATATGTAATTATATTCATACGAGATGCACA
TACTTCAAACCTTTTACCCGAAAGGGAAAATTACCACCATCCTCTCTTCCTTCTCTTTTT
ACTTGTTTCCCCTAAAGTAGAGGTAAATTTTCTGAAGAACCCATAGACTCAGAAGTGACT
CCAAGCAGAAGAGACCAAAGCCGATAAAGTAGAAGATCCCGGCTAATACACTGTCTGAAA
TGACATCAATTGCTGCAAGCACACCCGTTAATGATTTTCCATGAAAAAAGATCGGTGGGG
CAATGGCAGCAACGATGCAGAAGCCAATGTGAATCAAGTAGGTGAAGAAAAACCAACCAA
ACTTCAAAGCGCTGTCAGTCCTCATGGCTCGGTAGAGAGGCCTGTACCACACAACATAAG
AAAGTGGGCATCCCATCAAGGCATATATTGTGGCAAGGAAAAAGATCTTTACACCTCCGC
CTTTAATCCAGCACACCATGGTTGCAATCACATTGAATACCAGACACAAAACGATACCTA
ACCAACTAGCAAAAGCCA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2EG23JQ 683 0 0
CCAAACGTTCAGAGAACGACACTGGTACTAAAGGTATTGCAGAAAAAGAAATACTAAAGA
AATAGCTGAACAACCACTCTTGCAACTATAGTAACTAAAGAATTTACCTCAACACAATGG
TAATATGTAATTATATTCATACGAGATGCACATACTTCAAACCTTTTACCCGAAAGGGAA
A*TTACCACCATCCTCTCTTCCTTATCTTTTTACTTGTTTCCCCTAAAGTAGAGGTAAAT
TTTCTGAAGAACCCATAGACTCAGAAGTGACTCCAAGCAGAAGAGACCAAAGACGATAAA
GTAGAAGATCCCGGCTAATACACTGTCTGAGATGACATCAATTGCTGCAAGCACACCCGT
TAATGATTTTCCATGGAAAAAGATCGGTGGGGCAATGGCAGCAACGATGCAGAAGCCAAT
GTGAATCAAGTAGGTGAAGAAAAACCAACCAAACTTCAAAGCGCTGTCAGTCCTCATGGC
TCGGTAGAGAGGCCTGTACCATACAACATAAGAAAGTGGACATCCCATCAGCGCATATAT
CGTGGCAAGGAAAAAGATCTTCACACCTCCGCCTTTAATCCAGCAGACCATGGTTGCAAT
CACATTGAATACCAGACACAAAACGATACCTAACCAACTAGCAAAAGCCAGATACTGCAG
CTTCTGAGCATGAACTGGTATCT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2BT22TF 658 0 0
TTTACTTGTTTCCCCTAAAGTAGAGGTAAATTTTCTGAAGAACCCATAGACTCAGAAGTG
ACTCCAAGCAGAAGAGACCAAAGCCGATAAAGTAGAAGATCCCGGCTAATACACTGTCTG
AGATGACATCAATTGCTGCAAGCACACCCGTTAATGATTTTCCATGAAAAAAGATCGGTG
GGGCAATGGCAGCAACGATGCAGAAGCCAATGTGAATCAAGTAGGTGAAGAAAAACCAAC
CAAACTTCAAAGCGCTGTCAGTCCTCATGGCTCGGTAGAGAGGCCTGTACCACACAACAT
AAGAAAGTGGGCATCCCATCAAGGCATATATTGTGGCAAGGAAAAAGATCTTTACACCTC
CGCCTTTAATCCAGCACACCATGGTTGCAATCACATTGAATACCAGACACAAAACGATAC
CTAACCAACTAGCAAAAGCCAGATACTGGAGCTTCTGAGCATGAACTGGTATCTCATTAG
CAATGTCATGGTGTATGATTGGAAAAAACGGTGGCCAGTTTTTCTCATCTATCTGAACAC
CAGATTTAGCAATAGCATCCTCTCTCCGTTTAATATCCATTTCTTTCTTCCTAAGCTCAG
CTTCCCAGTCAGCAAGCTTTCTCTGTTTCTGTGAAGAGTCATTCATGTTATCCAAGGC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 4

CO CL2467Contig1 649 4 12 U
AACTCATCAATCTAGATAAGAAATCCAGAACAAAACATGTTCATCATCGAATCCATTACA
ATAAAAAAAAGAAAGAAGACAAGTTTACGAAATTACCAAAGCGAAACTAAAGATAGAGAA
AAGTGACAGCGAGATAGGGAGAGAGAGATCATGCCTCAGCTCCTTCTTTCTGGTAAACGT
AAGTAAGACCACACTTACCACAGTAATGACGATCGAAATGACTCGCCATGAACGTCCCAG
CACCGCAAGTCGCGTTAGGACACTCTTTCCTCAGCCTCTGCACCTTACCAGATCCATCAA
CCTTGTAGAACTGGAGGACGGCGAGCTTCACCTTCTTGCGCTTGTGCTTGATCTTCTTGG
GCTTGGTGTACGTCTTCTTCTTCCTATTCTTCGCACCACCGCGGAGACGGAGGACGAGAT
GAAGCGTCGACTCCTTCTGGATGTTGTAGTCGGCGAGGGTGCGGCCGTCTTCCAGCTGTT
TCCCGGCGAAGATCAGTCGCTGCTGGTCCGGTGGGATTCCTTCCTTGTCCTGGATCTTGG
CTTTGACATTGTCGATGGTGTCGGATGATTCGACCTCGAGGGTGATTGTCTTCCCCGTTA
GGGTTTTCACGAAGATCTGCATCTTTGCGGCTGAATGGAGGAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT88JQ U 12
AF RR2DT88TF C 1
AF RR2B848JQ U 12
AF RR2B848TF C 12
BS 1 11 RR2DT88TF
BS 12 283 RR2DT88JQ
BS 284 284 RR2B848JQ
BS 285 329 RR2DT88JQ
BS 330 330 RR2B848JQ
BS 331 338 RR2DT88JQ
BS 339 339 RR2B848JQ
BS 340 451 RR2DT88JQ
BS 452 452 RR2B848JQ
BS 453 491 RR2DT88JQ
BS 492 632 RR2B848JQ
BS 633 649 RR2DT88TF

RD RR2DT88JQ 480 0 0
CTAGATAAGAAATCCAGAACAAAACATGTTCATCATCGAATCCATTACAATAAAAAAAAG
AAAGAAGACAAGTTTACGAAATTACCAAAGCGAAACTAAAGATAGAGAAAAGTGACAGCG
AGATAGGGAGAGAGAGATCATGCCTCAGCTCCTTCTTTCTGGTAAACGTAAGTAAGACCA
CACTTACCACAGTAATGACGATCGAAATGACTCGCCATGAACGTCCCAGCACCGCAAGTC
GCGTTAGGACACTCTTTCCTCAGCCTCTGCACTTTACCAGATCCATCAACCTTGTAGAAC
TGGAGGACGGCGAGCTTCGCCTTCTTGTGCTTGTGCTTGATCTTCTTGGGCTTGGTGTAC
GTCTTCTTCTTCCTATTCTTCGCACCACCGCGGAGACGGAGGACGAGATGAAGCGTCGAC
TCCTTCTGGATGTTGTAGTCTGCGAGGGTGCGGCCGTCTTCCAGCTGTTTCCCGGCGAAG

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2DT88TF 649 0 0
AACTCATCAATCTAGATAAGAAATCCAGAACAAAACATGTTCATCATCGAATCCATTACA
ATAAAAAAAAGAAAGAAGACAAGTTTACGAAATTACCAAAGCGAAACTAAAGATAGAGAA
AAGTGACAGCGAGATAGGGAGAGAGAGATCATGCCTCAGCTCCTTCTTTCTGGTAAACGT
AAGTAAGACCACACTTACCACAGTAATGACGATCGAAATGACTCGCCATGAACGTCCCAG
CACCGCAAGTCGCGTTAGGACACTCTTTCCTCAGCCTCTGCACTTTACCAGATCCATCAA
CCTTGTAGAACTGGAGGACGGCGAGCTTCGCCTTCTTGTGCTTGTGCTTGATCTTCTTGG
GCTTGGTGTACGTCTTCTTCTTCCTATTCTTCGCACCACCGCGGAGACGGAGGACGAGAT
GAAGCGTCGACTCCTTCTGGATGTTGTAGTCTGCGAGGGTGCGGCCGTCTTCCAGCTGTT
TCCCGGCGAAGATCAGTCGCTGCTGGTCCGGTGGGATTCCTTCCTTGTCCTGGATCTTGG
CTTTGACATTGTCGATGGTGTCGGAAGATTCGACCTCGAGGGTGATCGTCTTCCCCGTTA
GGGTTTTCACGAAGATCTGCATCTTTGCGGCTGAATGGAGGAAAAAAAA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2B848JQ 623 0 0
CTAGATAAGAAATCCAGAACAAAACATGTTCATCATCGAATCCATTACAATAAAAAAAAG
AAAGAAGACAAGTTTACGAAATTACCAAAGCGAAACTAGAGATAGAGAAAAGTGACAGCG
AGATAGGGAGAGAGAGATCATGCCTCAGCTCCTTCTTTCTGGTAAACGTAAGTAAGACCA
CACTTACCACAGTAATGACGATCGAAATGACTCGCCATGAACGTCCCAGCACCGCAAGTC
GCGTTAGGACACTCTTTCCTCAGCCTCTGCACCTTACCAGATCCATCAACCTTGTAGAAC
TGGAGGACGGCGAGCTTCACCTTCTTGCGCTTGTGCTTGATCTTCTTGGGCTTGGTGTAC
GTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCGCACCACCGCGGAGACGGAGGACGAGATGAAGCGTCGAC
TCCTTCTGGATGTTGTAGTCGGCGAGGGTGCGGCCGTCTTCCAGCTGTTTCCCGGCGAAG
ATCAGTCGCTGCTGGTCCGGTGGGATTCCTTCCTTGTCCTGGATCTTGGCTTTGACATTG
TCGATGGTGTCGGATGATTCGACCTCGAGGGTGATTGTCTTCCCCGTTAGGGTTTTCACG
AAGATCTGCATCTTTGCGGCT
CC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2B848TF 623 0 0
CTAGATAAGAAATCCAGAACAAAACATGTTCATCATCGAATCCATTACAATAAAAAAAAG
AAAGAAGACAAGTTTACGAAATTACCAAAGCGAAACTAGAGATAGAGAAAAGTGACAGCG
AGATAGGGAGAGAGAGATCATGCCTCAGCTCCTTCTTTCTGGTAAACGTAAGTAAGACCA
CACTTACCACAGTAATGACGATCGAAATGACTCGCCATGAACGTCCCAGCACCGCAAGTC
GCGTTAGGACACTCTTTCCTCAGCCTCTGCACCTTACCAGATCCATCAACCTTGTAGAAC
TGGAGGACGGCGAGCTTCACCTTCTTGCGCTTGTGCTTGATCTTCTTGGGCTTGGTGTAC
GTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCGCACCACCGCGGAGACGGAGGACGAGATGAAGCGTCGAC
TCCTTCTGGATGTTGTAGTCGGCGAGGGTGCGGCCGTCTTCCAGCTGTTTCCCGGCGAAG
ATCAGTCGCTGCTGGTCCGGTGGGATTCCTTCCTTGTCCTGGATCTTGGCTTTGACATTG
TCGATGGTGTCGGATGATTCGACCTCGAGGGTGATTGTCTTCCCCGTTAGGGTTTTCACG
AAGATCTGCATCTTTGCGGCT
CC

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

CO CL2468Contig1 789 2 2 U
TACCTGAGGAAGTATAAACCGATATCCGCCGTGGACGCGTTTCGGAAGCTCAAGAGCGAG
CCTGATTCGCAGCTTCTGGATATCAGAGACGAGAAGACTTTGGCTTCGTTGGCGTCGCCG
AGTCTCAAGTTTCTGGGTAAGAGCTCGGTTCAGGTTCCGTATAGCGAAGAAGATGAGTCC
GGGTTCTTGAAGAGAGTTAAAGGAAGCTTCTCTGATCCGGAGAACACTGTTGTTTGTGTA
CTTGACAATTTTGATGGTAACTCCATGAAAGTGTCTGAATTGCTGGTTGAGAATGGATTC
AAGGAGGCTTACTACATCAAAGGCGGCGCGAGAGGGAAGAATGGTTGGTTGGCTATTCAA
GAAGAGCTTTTGCCTCCACCTGTTCATATGTATACTTCCAAAAATGCAAAATCTTCAAGT
AACAGTGAAGCGTCCATCGTTGGAACTGAAAACTGATTCAACACCCATAGCTAAATGGTG
TGCAGATTCACATTCATAATGCTACAAATGAGCTTTTGCCTCAGTATTGCTGCGATGATA
AATACAAGGCCATTGAAGCATTAGGAAGACAAAAGCTTCTCTAGGGTAGAAGACTTGTTT
AGATCTCAAGTCCAGTCTCTTCCAAGTTCCCCCTTTATACACAGACTCAATTCTCAGGCT
ATTACAAACACAAATGGCATTGGTTATTTTCATGTAGCTCTTCTGCTTTGAAAAGATTTA
ACTTATTTTTTTCTATCTAATTTAGTGTTGTTAAGATCCTTTGAAAAGATTAACTTGAGA
TTACTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN03TF U 1
AF RR2FN03JQ C 8
BS 1 396 RR2FN03TF
BS 397 789 RR2FN03JQ

RD RR2FN03TF 404 0 0
TACCTGAGGAAGTATAAACCGATATCCGCCGTGGACGCGTTTCGGAAGCTCAAGAGCGAG
CCTGATTCGCAGCTTCTGGATATCAGAGACGAGAAGACTTTGGCTTCGTTGGCGTCGCCG
AGTCTCAAGTTTCTGGGTAAGAGCTCGGTTCAGGTTCCGTATAGCGAAGAAGATGAGTCC
GGGTTCTTGAAGAGAGTTAAAGGAAGCTTCTCTGATCCGGAGAACACTGTTGTTTGTGTA
CTTGACAATTTTGATGGTAACTCCATGAAAGTGTCTGAATTGCTGGTTGAGAATGGATTC
AAGGAGGCTTACTACATCAAAGGCGGCGCGAGAGGGAAGAATGGTTGGTTGGCTATTCAA
GAAGAGCTTTTGCCTCCACCTGTTCATATGTATACT
TCCAAAAA

QA 1 396 1 396
DS 

RD RR2FN03JQ 782 0 0
GG
AAGTATAAACCGATATCCGCCGTGGACGCGTTTCGGAAGCTCAAGAGCGAGC*TGATTCG
CAGCTTCTGGATATCAGAGACGAGAAGACTTTGGCTTCGTTGGCGTCGCCGAGTCTCAAG
TTTCTGGGTAAGAGCTCGGTTCAGGTTCCGTATAGCGAAGAAGATGAGTCCGGGTTCTTG
AAGAGAGTTAAAGGAAGCTTCTCTGATCCGGAGAACACTGTTGTTTGTGTACTTGACAAT
TTTGATGGTAACTCCATGAAAGTGTCTGAATTGCTGGTTGAGAATGGATTCAAGGAGGCT
TACTACATCAAAGGCGGCGCGAGAGGGAAGAATGGTTGGTTGGCTATTCAAGAAGAGCTT
TTGCCTCCACCTGTTCATATGTATACTTCCAAAAATGCAAAATCTTCAAGTAACAGTGAA
GCGTCCATCGTTGGAACTGAAAACTGATTCAACACCCATAGCTAAATGGTGTGCAGATTC
ACATTCATAATGCTACAAATGAGCTTTTGCCTCAGTATTGCTGCGATGATAAATACAAGG
CCATTGAAGCATTAGGAAGACAAAAGCTTCTCTAGGGTAGAAGACTTGTTTAGATCTCAA
GTCCAGTCTCTTCCAAGTTCCCCCTTTATACACAGACTCAATTCTCAGGCTATTACAAAC
ACAAATGGCATTGGTTATTTTCATGTAGCTCTTCTGCTTTGAAAAGATTTAACTTATTTT
TTTCTATCTAATTTAGTGTTGTTAAGATCCTTTGAAAAGATTAACTTGAGATTACTTTGG

QA 3 782 3 782
DS 



AS 1 4

CO CL2469Contig1 1233 4 14 U
GCACAGACTGTAATGCAGATCATCCCAGCAGATCCAGGACAGCTCGACTCCCATGAAAGA
GTGGTTCCACAAGCAGGGCAAGTCTGGTTCCCTGATTCCGCGGCCAAGACAGCTCAAGCG
CTCATGGATTTCAACAAGGAAGAGCTTCCACTGTTTATCCTTGCCAACTGGAGAGGGTTT
TCAGGTGGGCAGAGAGATCTTTTCGAAGGAATACTTCAGGCAGGTTCGACTATTGTAGAA
AATCTGAGAACATATCGGCAGCCAGTGTTTGTGTACATCCCTAAGATGGGAGAGTTGCGA
GGGGAGCGTGGGATGTTGCTGACAGCCAAATAAATTCAGATTATGTCGAAATGTATGCTG
ATGAAACTGCTCGTGGAAATGTGCTTGAGCCAGAAGGAACGATAGAGATCAAGTTTAGAA
CGAGGGAGATGTTAGAGTGCATGGGAAGGTTAGACCCGAAGCTAATCGATCTCAAAGCAA
GACTGCAAGATGCCAAGCAAAGTGAGGCTTATGCAAATATCGAGCTCCTCCAGCAACAGA
TTAAAGCCCGAGAGAAGCTGCTCTTACCAGTTTACATCCAGATCGCCACCAAGTTTGCGG
AACTTCACGATACTTCCATGAGAATGGCCGCAAAGGGAGTGATCAAAAGTGTTGTGGAGT
GGAGCGGCTCGCGTTCCTTCTTCTATAAAAAGCTCAACCGGAGAATTGCTGAGAGCTCTC
TTGTGAAAAACGTAAGAGAAGCTTCGGGAGACAACTTATCATATAAATCTGCATTGGGTT
TAATTCAGGATTGGTTCTCCAAATCTGACATTGCAAAGGGGAAAGAAGAAGCTTGGATGG
ACGACCAAGTGTTCTTTACTTGGAAGGACAACGTCAGTAACTACGAGTTGAATCTGAGCG
AGTTGAGAGCGCAGAAACTGTTGAATCAACTTGCGGAGATTGGAAACTCGTCGGATCTTT
CGGCGCTGCCACAAGGACTTGCTAATCTTCTAAACAAGGTGGAGCCTTCAAGAAGAGAAG
AGCTGATCGATGCGCTACGAAAAGTGTTAGGTTGATATTAAAGAGGTCCAAGCTTGTGCC
CCAAGAAAGACGGTCCTTCGGTGACAGAAGCTAGTTGGAAATTAGATTTGATCTTTCTTT
CTTAAATGTATTGGCCCGAGCTGTAAATGTTGCTGTAGCGTATAAGTGAATTACGTAATA
ATTTATTCAACATGTATGTCACTATTGCTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF96TF U 1
AF RR2AW91TFB U 915
AF RR2AW91JQ C 521
AF RR2EF96JQ C 586
BS 1 622 RR2EF96TF
BS 623 628 RR2AW91JQ
BS 629 629 RR2EF96JQ
BS 630 682 RR2AW91JQ
BS 683 683 RR2EF96JQ
BS 684 694 RR2AW91JQ
BS 695 695 RR2EF96JQ
BS 696 816 RR2AW91JQ
BS 817 817 RR2EF96JQ
BS 818 914 RR2AW91JQ
BS 915 1065 RR2AW91TFB
BS 1066 1090 RR2AW91JQ
BS 1091 1091 RR2EF96JQ
BS 1092 1233 RR2AW91JQ

RD RR2EF96TF 622 0 0
GCACAGACTGTAATGCAGATCATCCCAGCAGATCCAGGACAGCTCGACTCCCATGAAAGA
GTGGTTCCACAAGCAGGGCAAGTCTGGTTCCCTGATTCCGCGGCCAAGACAGCTCAAGCG
CTCATGGATTTCAACAAGGAAGAGCTTCCACTGTTTATCCTTGCCAACTGGAGAGGGTTT
TCAGGTGGGCAGAGAGATCTTTTCGAAGGAATACTTCAGGCAGGTTCGACTATTGTAGAA
AATCTGAGAACATATCGGCAGCCAGTGTTTGTGTACATCCCTAAGATGGGAGAGTTGCGA
GGGGAGCGTGGGATGTTGCTGACAGCCAAATAAATTCAGATTATGTCGAAATGTATGCTG
ATGAAACTGCTCGTGGAAATGTGCTTGAGCCAGAAGGAACGATAGAGATCAAGTTTAGAA
CGAGGGAGATGTTAGAGTGCATGGGAAGGTTAGACCCGAAGCTAATCGATCTCAAAGCAA
GACTGCAAGATGCCAAGCAAAGTGAGGCTTATGCAAATATCGAGCTCCTCCAGCAACAGA
TTAAAGCCCGAGAGAAGCTGCTCTTACCAGTTTACATCCAGATCGCCACCAAGTTTGCGG
AACTTCACGATACTTCCATGAG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2AW91TFB 151 0 0
AAACTGTTGAATCAACTTGCGGAGATTGGAAACTCGTCGGATCTTTCGGCGCTGCCACAA
GGACTTGCTAATCTTCTAAACAAGGTGGAGCCTTCAAGAAGAGAAGAGCTGATCGATGCG
CTACGAAAAGTGTTAGGTTGATATTAAAGAG

QA 1 151 1 151
DS 

RD RR2AW91JQ 713 0 0
G
GAGCTCCTCCAGCAACAGATTAAAGCCCGAGAGAAGCTGCTCTTACCAGTTTACATCCAG
ATCGCCACCAAGTTTGCGGAACTTCACGATACTTCCATGAGAATGGCTGCAAAGGGAGTG
ATCAAAAGTGTTGTGGAGTGGAGCGGCTCGCGTTCCTTCTTTTATAAAAAGCTTAACCGG
AGAATTGCTGAGAGCTCTCTTGTGAAAAACGTAAGAGAAGCTTCGGGAGACAACTTATCA
TATAAATCTGCATTGGGTTTAATTCAGGATTGGTTCTCCAAATCTGACATTGCAATGGGG
AAAGAAGAAGCTTGGATGGACGACCAAGTGTTCTTTACTTGGAAGGACAACGTCAGTAAC
TACGAGTTGAATCTGAGCGAGTTGAGAGCGCAGAAACTGTTGAATCAACTTGCGGAGATT
GGAAACTCGTCGGATCTTTCGGCGCTGCCACAAGGACTTGCTAATCTTCTAAACAAGGTG
GAGCCTTCAAGAAGAGAAGAGCTGATCGATGCGCTACGAAAAGTGTTAGGTTGATATTAA
AGAGGTCCAAGCTTGTGCCCCAAGAAAGATGGTCCTTCGGTGACAGAAGCTAGTTGGAAA
TTAGATTTGATCTTTCTTTCTTAAATGTATTGGCCCGAGCTGTAAATGTTGCTGTAGCGT
ATAAGTGAATTACGTAATAATTTATTCAACATGTATGTCACTATTGCTTTAT

QA 2 713 2 713
DS 

RD RR2EF96JQ 638 0 0
CCACCAAGTTTGCGGAACTTCACGATACTTCCATGAGAATGGCCGCAAAGGGAGTGATCA
AAAGTGTTGTGGAGTGGAGCGGCTCGCGTTCCTTCTTCTATAAAAAGCTCAACCGGAGAA
TTGCTGAGAGCTCTCTTGTGAAAAACGTAAGAGAAGCTTCGGGAGACAACTTATCATATA
AATCTGCATTGGGTTTAATTCAGGATTGGTTCTCCAAATCTGACATTGCAAAGGGGAAAG
AAGAAGCTTGGATGGACGACCAAGTGTTCTTTACTTGGAAGGACAACGTCAGTAACTACG
AGTTGAATCTGAGCGAGTTGAGAGCGCAGAAACTGTTGAATCAACTTGCGGAGATTGGAA
ACTCGTCGGATCTTTCGGCGCTGCCACAAGGACTTGCTAATCTTCTAAACAAGGTGGAGC
CTTCAAGAAGAGAAGAGCTGGTCGATGCGCTACGAAAAGTGTTAGGTTGATATTAAAGAG
GTCCAAGCTTGTGTCCCAAGAAAGACGGTCCTTCGGTGACAGAAGCTAGTTGGAAATTAG
ATTTGATCTTTCTTTCTTAAATGTATTGGCCCGAGCTGTAAATGTTGCTGTAGCGTATAA
GTGAATTACGTAATAATTTATTCAACATGTATGTCAC
C

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 3

CO CL2470Contig1 689 3 4 U
GGACATCAAATCTCATCTTCATATCTAGTTCGTCTTGATCTGCTTTATTCAACCTAAATA
AAAGAGAGAGAGATATGGGATCATTAGTGAAAGAACTAGCGTCATCTTCGTTGATGACGG
AGTTTTTAGAGAAGTGCGGTGGTTATGCGGTGGTGGATGGAGGGTTTGCGACAGAGCTAG
AACGACACGGGGCCGATATCAAGGATCCACTTTGGAGTGCCAAGTGCCTAATTTCTTCTC
CACACCTCGTCACAAAGGTGCACTTGGATTACCTAGAGTCTGGAGCAAACATCATCATCA
CCGCATCATACCAGGCGACGATCCAAGGATTTGTTGCTAAGGGTTTATCGGTGGACGACG
CAGAGAGTTTGCTGCGGAGGAGCGTCGAACTCTCGTGTGAGGCACGTGAGATTTTCTACA
ACAGATGCAACAAGGGCTCTTGGGATTTTGACCACGTCGGAAAAGCTTCCCGACGACCGG
TTCTTGTCGCAGCTTCCGTTGGTAGCTATGGAGCTTATCTCGCCGATGGCTCGGAATACA
GTGGAGTATATGGAGAATATGTGAGCAAAGAGACATTGAAGGACTTCCATAGAAGAAGAG
TCCAAATCCTAGCAAAATCGGGAGCCGATCTAATTGCATTCGAGACCATTCCAAATAAGC
TTGAAGCTGAGCTTACGTGGATCTTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX07TF U 376
AF RR2BI63TF U 1
AF RR2CN15TF U 42
BS 1 193 RR2BI63TF
BS 194 194 RR2CN15TF
BS 195 667 RR2BI63TF
BS 668 689 RR2CN15TF

RD RR2DX07TF 283 0 0
GGAGGAGCGTCGAACTCTCGTGTGAGGCACGTGAGATTTTCTACAACAGATGCAACAAGG
GCTCTTGGGATTTTGACCACGTCGGAAAAGCCTCCCGGCGACCGGTTCTTGTCGCAGCTT
CTGTTGGTAGCTATGGAGCTTATCTCGCTGATGGCTCGGAATACAGTGGAGTATATGGAG
AATATGTGAGCAAAGAGACATTGAAGGACTTCCATAGAAGAAGAGTCCAAATCCTAGCAA
AATCGGGAGCCGATCTAATTGCATTCGAGACCAT
TCCAAATAA

QA 1 274 1 274
DS 

RD RR2BI63TF 667 0 0
GGACATCAAATCTCATCTTCATATCTAGTTCGTCTTGATCTGCTTTATTCAACCTAAATA
AAAGAGAGAGAGATATGGGATCATTAGTGAAAGAACTAGCGTCATCTTCGTTGATGACGG
AGTTTTTAGAGAAGTGCGGTGGTTATGCGGTGGTGGATGGAGGGTTTGCGACAGAGCTAG
AACGACACGGGGCTGATATCAAGGATCCACTTTGGAGTGCCAAGTGCCTAATTTCTTCTC
CACACCTCGTCACAAAGGTGCACTTGGATTACCTAGAGTCTGGAGCAAACATCATCATCA
CCGCATCATACCAGGCGACGATCCAAGGATTTGTTGCTAAGGGTTTATCGGTGGACGACG
CAGAGAGTTTGCTGCGGAGGAGCGTCGAACTCTCGTGTGAGGCACGTGAGATTTTCTACA
ACAGATGCAACAAGGGCTCTTGGGATTTTGACCACGTCGGAAAAGCTTCCCGACGACCGG
TTCTTGTCGCAGCTTCCGTTGGTAGCTATGGAGCTTATCTCGCCGATGGCTCGGAATACA
GTGGAGTATATGGAGAATATGTGAGCAAAGAGACATTGAAGGACTTCCATAGAAGAAGAG
TCCAAATCCTAGCAAAATCGGGAGCCGATCTAATTGCATTCGAGACCATTCCAAATAAGC
TTGAAGC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2CN15TF 648 0 0
GCTTTATTCAACCTAAATAAAAGAGAGAGA**TATGGGATCATTAGTGAAAGAACTAGCG
TCATCTTCGTTGATGACGGAGTTTTTAGAGAAGTGCGGTGGTTATGCGGTGGTGGATGGA
GGGTTTGCGACAGAGCTAGAACGACACGGGGCCGATATCAAGGATCCACTTTGGAGTGCC
AGGTGCCTCATTTCTTCTCCACACCTCGTCACAAAGGTGCACTTGGATTACCTAGAGTCT
GGAGCAAACATCATCATCACCGCATCATACTAGGCGACGATCCAAGGATTTGTTGCTAAG
GGTTTATCGGTGGACGACGCAGAGAGTTTGCTGCGGAGGAGCGTCGAACTCTCGTGTGAG
GCACGTGAGATTTTCTACAACAGATGCAACAAGGGCTCTTGGGATTTTGACCACGTCGGA
AAAGCTTCCCGACGACCGGTTCTTGTCGCAGCTTCCGTTGGTAGCTATGGAGCTTATCTC
GCCGATGGCTCGGAATACAGTGGAGTATATGGAGAATATGTGAGCAAAGAGACATTGAAG
GACTTCCATAGAAGAAGAGTCCAAATCCTAGCAAAATCGGGAGCCGATCTAATTGCATTC
GAGACCATTCCAAATAAGCTTGAAGCTGAGCTTACGTGGATCTTCTTG

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 4

CO CL2471Contig1 615 4 1 U
GGAGCCGAAGCTGTTGCTCGTACCACTTTGCTCTCTCACCTTCCAATCTTACCGGCGGCG
AAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTGGAGATAGGGAGAGTTGCTCTTGTCAACTACGGGAAA
GACCATGGCAAGCTCGTCGTTATCGTCGACGTTGTTGACCAGAACAGAGCTTTGGTAGAT
GCCCCTGATATGGAGAGGATCCAAATGAATTTCAAGAGGTTGTCTCTTACAGACATCGTG
ATTGAGATCAACCGAGTGCCGAAGAAGAAGGCTTTGATCGAGGCTATGGAGAAAGCTGAC
GTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTTATTGTTCAGAAGCGTAGA
GCTAGCCTCAATGATTTCGATAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCCGGT
GTTGTTAGGCAAGAACTTGCCAAGCTCAAGAAGGAGATCACTGCTTGAGTTACTATCTGC
GAATCTTTTATTGTAACTTTTTGGTTTTGGATTTACTAGCGTTTTGCAATTTATCAACTC
TGTTGAATTAGTTTCAGTTTTGAAACCTTTACAACTTTCATCTGGCGTTTAATGTCAAAG
AACCTTTACAACTCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CY86JQ C 1
AF RR2CY86TF U 1
AF RR2CA25JQ C 1
AF RR2CA25TF U 1
BS 1 615 RR2CA25TF

RD RR2CY86JQ 555 0 0
GGAGCCGAAGCTGTTGCTCGTACCACTTTGCTCTCTCACCTTCCAATCTTACCGGCGGCG
AAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTGGAGATAGGGAGAGTTGCTCTTGTCAACTACGGGAAA
GACCATGGCAAGCTCGTCGTTATCGTCGACGTTGTTGACCAGAACAGAGCTTTGGTAGAT
GCCCCTGATATGGAGAGGATCCAAATGAATTTCAAGAGGTTGTCTCTTACAGACATCGTG
ATTGAGATCAACCGAGTGCCGAAGAAGAAGGCTTTGATCGAGGCTATGGAGAAAGCTGAC
GTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTTATTGTTCAGAAGCGTAGA
GCTAGCCTCAATGATTTCGATAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCCGGT
GTTGTTAGGCAAGAACTTGCCAAGCTCAAGAAGGAGATCACTGCTTGAGTTACTATCTGC
GAATCTTTTATTGTAACTTTTTGGTTTTGGATTTACTAGCGTTTTGCAATTTATCAACTC
TGTTGAATTAGTTTC

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2CY86TF 555 0 0
GGAGCCGAAGCTGTTGCTCGTACCACTTTGCTCTCTCACCTTCCAATCTTACCGGCGGCG
AAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTGGAGATAGGGAGAGTTGCTCTTGTCAACTACGGGAAA
GACCATGGCAAGCTCGTCGTTATCGTCGACGTTGTTGACCAGAACAGAGCTTTGGTAGAT
GCCCCTGATATGGAGAGGATCCAAATGAATTTCAAGAGGTTGTCTCTTACAGACATCGTG
ATTGAGATCAACCGAGTGCCGAAGAAGAAGGCTTTGATCGAGGCTATGGAGAAAGCTGAC
GTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTTATTGTTCAGAAGCGTAGA
GCTAGCCTCAATGATTTCGATAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCCGGT
GTTGTTAGGCAAGAACTTGCCAAGCTCAAGAAGGAGATCACTGCTTGAGTTACTATCTGC
GAATCTTTTATTGTAACTTTTTGGTTTTGGATTTACTAGCGTTTTGCAATTTATCAACTC
TGTTGAATTAGTTTC

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2CA25JQ 615 0 0
GGAGCCGAAGCTGTTGCTCGTACCACTTTGCTCTCTCACCTTCCAATCTTACCGGCGGCG
AAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTGGAGATAGGGAGAGTTGCTCTTGTCAACTACGGGAAA
GACCATGGCAAGCTCGTCGTTATCGTCGACGTTGTTGACCAGAACAGAGCTTTGGTAGAT
GCCCCTGATATGGAGAGGATCCAAATGAATTTCAAGAGGTTGTTTCTTACAGACATCGTG
ATTGAGATCAACCGAGTGCCGAAGAAGAAGGCTTTGATCGAGGCTATGGAGAAAGCTGAC
GTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTTATTGTTCAGAAGCGTAGA
GCTAGCCTCAATGATTTCGATAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCCGGT
GTTGTTAGGCAAGAACTTGCCAAGCTCAAGAAGGAGATCACTGCTTGAGTTACTATCTGC
GAATCTTTTATTGTAACTTTTTGGTTTTGGATTTACTAGCGTTTTGCAATTTATCAACTC
TGTTGAATTAGTTTCAGTTTTGAAACCTTTACAACTTTCATCTGGCGTTTAATGTCAAAG
AACCTTTACAACTCC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2CA25TF 615 0 0
GGAGCCGAAGCTGTTGCTCGTACCACTTTGCTCTCTCACCTTCCAATCTTACCGGCGGCG
AAAATGGTTTTCAAGAGGTACGTGGAGATAGGGAGAGTTGCTCTTGTCAACTACGGGAAA
GACCATGGCAAGCTCGTCGTTATCGTCGACGTTGTTGACCAGAACAGAGCTTTGGTAGAT
GCCCCTGATATGGAGAGGATCCAAATGAATTTCAAGAGGTTGTCTCTTACAGACATCGTG
ATTGAGATCAACCGAGTGCCGAAGAAGAAGGCTTTGATCGAGGCTATGGAGAAAGCTGAC
GTGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTTATTGTTCAGAAGCGTAGA
GCTAGCCTCAATGATTTCGATAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCCGGT
GTTGTTAGGCAAGAACTTGCCAAGCTCAAGAAGGAGATCACTGCTTGAGTTACTATCTGC
GAATCTTTTATTGTAACTTTTTGGTTTTGGATTTACTAGCGTTTTGCAATTTATCAACTC
TGTTGAATTAGTTTCAGTTTTGAAACCTTTACAACTTTCATCTGGCGTTTAATGTCAAAG
AACCTTTACAACTCC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 3

CO CL2472Contig1 790 3 4 U
GGGTGGCTGAGACTCGTTTCACCGCTTGAGAATCTGTTTTAGACCAAAACTCTAGTGCTT
TGGTCTTCTTTGGTAACTGTAAATAGGATGGCCGCGTCTCTTCCGACCACTATATGTCTT
AGCCATGGCGATGAGTGTTGCAAACGTTCACCCAACCAAGGATATGCTCTTGCTGTGAAG
AGGAACCTAATGGGTGGTTACTCGCGGCGCTGCGTGGGTACTACAGTGAGGAGATTGGTC
GTGACGGCTGCGACTGAAGGATCTAGAAAATCTAAAGAGAGTCAACCTTCGTGGGCGAAT
CCTGACTCAGATGAGCCACCTCCTTGGGCCAGAGAGGAAGGTCGTTCTTCTTCGTCCCAA
GAGAGCTTTGAGGTTCCCTTCTATGTTTATCTGCTAGCCTCTGCAATCGCTGCCATTGCT
GCCATCGGTTCTGTTTTTGAGTACTCGAGTAAGAATCCAGTGTTCGGGGTATTGGACTCT
GACAGTATCTTTTATACTCCCGTGCTTGGATTCTTTGCTTTCACTGGAATCCCTACTTCT
GTATTCCTATGGTTCAAATCCGTTGAAGCTGCTAATAAGGAAGCTGCAGAACAAGATAAA
AGAGATGGATATCGTCGTTAAAACTGTCTTCGCAACTTTTACAGTGATTGTTGTTGTCCT
CCACATACATACATTTATGATTATATGAAGATACTTCTGCATTCTTAGGAGCTTGCTTCT
GTTCACAGTTCACTTCACTGTATATTACCTGTATGAATTGTTGTAGCTCTATCAACGTCA
TGTTCCGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE69TF U 73
AF RR2BS01TF U 1
AF RR2BS01JQ C 122
BS 1 708 RR2BS01TF
BS 709 709 RR2BS01JQ
BS 710 745 RR2BS01TF
BS 746 790 RR2BS01JQ

RD RR2CE69TF 629 0 0
GG
AACTGTAAATAGGATGGCCGCGTCTCTTCCTACCACTATATGTCTTAGCCATGGCGATGA
GTGTTGCAAACGTTCACCCAACCAAGGATATGCTCTTGCTGTGAAGAGGAACCTAATGGG
TGGTTACTCGCGGCGCTGCGTGGGTACTACAGTGAGGAGATTGGTCGTGACGGCTGCGAC
TGAAGGATCTAGAAAATCTAAAGAGAGTCAACCTTCGTGGGCGAATCCTGACTCAGATGA
GCCACCTCCTTGGGCCAGAGAGGAAGGTCGTTCTTCTTCTTCCCAAGAGAGCTTTGAGGT
TCCCTTCTATGTTTATCTGCTAGCCTCTGCAATCACTGCCATTGCTGCCATCGGTTCTGT
TTTTGAGTACTCGAGTAAGAATCCAGTGTTCGGGGTATTGGACTCTGACAGTATCTTTTA
TACTCCCGTGCTTGGATTCTTTGCTTTCACTGGAATCCCCACTTCTGTATTCCTATGGTT
CAAATCCGTTGAAGCTGCTAATAAGGAAGCTGCAGAACAAGATAAAAGAGATGGATATCG
TCGTTAAAACTGTCTTCGCAACTTTTACAGTGATTGTTGTTGTCCTCCACATACATACAT
TTATGATTATATGAAGATACTTCTGCA

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR2BS01TF 753 0 0
GGGTGGCTGAGACTCGTTTCACCGCTTGAGAATCTGTTTTAGACCAAAACTCTAGTGCTT
TGGTCTTCTTTGGTAACTGTAAATAGGATGGCCGCGTCTCTTCCGACCACTATATGTCTT
AGCCATGGCGATGAGTGTTGCAAACGTTCACCCAACCAAGGATATGCTCTTGCTGTGAAG
AGGAACCTAATGGGTGGTTACTCGCGGCGCTGCGTGGGTACTACAGTGAGGAGATTGGTC
GTGACGGCTGCGACTGAAGGATCTAGAAAATCTAAAGAGAGTCAACCTTCGTGGGCGAAT
CCTGACTCAGATGAGCCACCTCCTTGGGCCAGAGAGGAAGGTCGTTCTTCTTCGTCCCAA
GAGAGCTTTGAGGTTCCCTTCTATGTTTATCTGCTAGCCTCTGCAATCGCTGCCATTGCT
GCCATCGGTTCTGTTTTTGAGTACTCGAGTAAGAATCCAGTGTTCGGGGTATTGGACTCT
GACAGTATCTTTTATACTCCCGTGCTTGGATTCTTTGCTTTCACTGGAATCCCTACTTCT
GTATTCCTATGGTTCAAATCCGTTGAAGCTGCTAATAAGGAAGCTGCAGAACAAGATAAA
AGAGATGGATATCGTCGTTAAAACTGTCTTCGCAACTTTTACAGTGATTGTTGTTGTCCT
CCACATACATACATTTATGATTATATGAAGATACTTCTGCATTCTTAG*AGCTTGCTTCT
GTTCACAGTTCACTTCACTGTATAT
ACCTGTAT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2BS01JQ 669 0 0
GCCATGGCGATGAGTGTTGCAAACGTTCACCCAACCAAGGATATGCTCTTGCTGTGAAGA
GGAACCTAATGGGTGGTTACTCGCGGCGCTGCGTGGGTACTACAGTGAGGAGATTGGTCG
TGACGGCTGCGACTGAAGGATCTAGAAAATCTAAAGAGAGTCAACCTTCGTGGGCGAATC
CTGACTCAGATGAGCCACCTCCTTGGGCCAGAGAGGAAGGTCGTTTTTTTTCGTCCCAAG
AGAGCTTTGAGGTTCCCTTTTATGTTTATTTGCTAGCCTTTGCAATCGCTGCCATTGCTG
CCATCGGTTCTGTTTTTGAGTACTCGAGTAAGAATCCAGTGTTCGGGGTATTGGACTTTG
ACAGTATCTTTTATACTCCCGTGCTTGGATTCTTTGCTTTCACTGGAATCCCTACTTCTG
TATTCCTATGGTTCAAATCCGTTGAAGCTGCTAATAAGGAAGCTGCAGAACAAGATAAAA
GAGATGGATATCGTCGTTAAAACTGTTTTCGCAACTTTTACAGTGATTGTTGTTGTCCTC
CACATACATACATTTATGATTATATGAAGATACTTTTGCATTTTTAGGAGCTTGCTTCTG
TTCACAGTTCACTTCACTGTATATTACCTGTATGAATTGTTGTAGCTCTATCAACGTCAT
GTTCCGAGG

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 3

CO CL2473Contig1 969 3 11 U
GGAGACGACACAGATAAAGCTTTCGACTTTCGGACAATGGCGACGAAGCTGTTTTCTCCG
CCGTTGTCTTGTCCATGGCTGACTTCAAGAGACGTAGGGATCAAAAGGGTTCTTCCACGG
CGGAGACGGGAATGTGAGACGAAGCGGAACAGAGTCTCCCCCGTCACCGCCATGGTTGTG
GAGCCTCTCTCCGCTGTATCCTCTTCAGCGATTCAGATTCATCAATGGTGGGAACATAAC
CCTAGTTCGTTACTGTTGATGGCGGAGACTGGTGGTGGCTACTCGTTAGCTAGCTACTAT
ACGCCTCTGGGTTTGTTCGTTATCTCAGTTCCAGGTCTTTGGTCTCTCATCAAACGCTCT
GTTAAATCAAAGATAGTGAGAAAATCGTTTGTTGTTAGCGAAGGGATCAAGAAGGAACCG
AAGCAAGTTGCTGGAGAGATTCTTTCTTTCTTCACAAGGAAGAACTTTAATGTTACTGAT
CGTGGAGAGACAATCACGTTTGAAGGAACAATGGTTCCGAGTAGAGGACAAGCTGCTCTG
CTCACGTTTTGTACATGTATAAGCTTAGCAAGCGTGGGTCTTGTCCTAACCATTACAGTT
CCTGATTTTGGAAATAACTGGTTCTTCATTACCATTCTTAGTCCACTCGCAGGAGCGTAT
TACTGGAAGAAGGCGTCGAGGAAAGAGGAGATAAAGGTGAAGATGATGGTGGGAAGAAAG
GGGAAACTGGATGAGATTGTGGTTCAAGGAGATGATGTACAGGTTGAAGAGATGAGGAAA
GAGCTTCAGCTTAGTGAGAAAGGCATGGTTTATGTTAAAGGTCTCTTTGAGAGATCATGA
AAACATACACATTCAAATCCCATTTTTGCTTTTCTTTTTTTAGGGGGAAAGAGAATGTAC
TGTTGAATGATGAGATCAAATGACCATTTGACTCATTTCATCATACTAAATGAATTGGTT
TTCGTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF24TF U 1
AF RR2BJ24TF U 85
AF RR2BJ24JQ C 246
BS 1 169 RR2FF24TF
BS 170 170 RR2BJ24TF
BS 171 200 RR2FF24TF
BS 201 201 RR2BJ24TF
BS 202 303 RR2FF24TF
BS 304 304 RR2BJ24TF
BS 305 652 RR2FF24TF
BS 653 653 RR2BJ24TF
BS 654 664 RR2FF24TF
BS 665 798 RR2BJ24TF
BS 799 969 RR2BJ24JQ

RD RR2FF24TF 670 0 0
GGAGACGACACAGATAAAGCTTTCGACTTTCGGACAATGGCGACGAAGCTGTTTTCTCCG
CCGTTGTCTTGTCCATGGCTGACTTCAAGAGACGTAGGGATCAAAAGGGTTCTTCCACGG
CGGAGACGGGAATGTGAGACGAAGCGGAACAGAGTCTCCCCCGTCACCGTCATGGTTGTG
GAGCCTCTCTCCGCTGTATCTTCTTCAGCGATTCAGATTCATCAATGGTGGGAACATAAC
CCTAGTTCGTTACTGTTGATGGCGGAGACTGGTGGTGGCTACTCGTTAGCTAGCTACTAT
ACGTCTCTGGGTTTGTTCGTTATCTCAGTTCCAGGTCTTTGGTCTCTCATCAAACGCTCT
GTTAAATCAAAGATAGTGAGAAAATCGTTTGTTGTTAGCGAAGGGATCAAGAAGGAACCG
AAGCAAGTTGCTGGAGAGATTCTTTCTTTCTTCACAAGGAAGAACTTTAATGTTACTGAT
CGTGGAGAGACAATCACGTTTGAAGGAACAATGGTTCCGAGTAGAGGACAAGCTGCTCTG
CTCACGTTTTGTACATGTATAAGCTTAGCAAGCGTGGGTCTTGTCCTAACCATTACAGTT
CCTGATTTTGGAAATAACTGGTTCTTCATTACCATTCTTAGTCCACTCGCAG*AGCGTAT
TACT
GGAAGA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2BJ24TF 714 0 0
GCAAGAGACGTAGGG
ATCAAAAGGGTTCTTCCACGGCGGAGACGGGAATGTGAGACGAAGCGGAACAGAGTCTCC
CCCGTCACCGCCATGGTTGTGGAGCCTCTCTCCGCTGTATCCTCTTCAGCGATTCAGATT
CATCAATGGTGGGAACATAACCCTAGTTCGTTACTGTTGATGGCGGAGACTGGTGGTGGC
TACTCGTTAGCTAGCTACTATACGCCTCTGGGTTTGTTCGTTATCTCAGTTCCAGGTCTT
TGGTCTCTCATCAAACGCTCTGTTAAATCAAAGATAGTGAGAAAATCGTTTGTTGTTAGC
GAAGGGATCAAGAAGGAACCGAAGCAAGTTGCTGGAGAGATTCTTTCTTTCTTCACAAGG
AAGAACTTTAATGTTACTGATCGTGGAGAGACAATCACGTTTGAAGGAACAATGGTTCCG
AGTAGAGGACAAGCTGCTCTGCTCACGTTTTGTACATGTATAAGCTTAGCAAGCGTGGGT
CTTGTCCTAACCATTACAGTTCCTGATTTTGGAAATAACTGGTTCTTCATTACCATTCTT
AGTCCACTCGCAGGAGCGTATTACTGGAAGAAGGCGTCGAGGAAAGAGGAGATAAAGGTG
AAGATGATGGTGGGAAGAAAGGGGAAACTGGATGAGATTGTGGTTCAAGGAGATGATGTA
CAGGTTGAAGAGATGAGGAAAGAGCTTCAGCTTAGTGAG

QA 16 714 16 714
DS 

RD RR2BJ24JQ 724 0 0
TTCG
TTACTGTTGATGGCGGAGACTGGTGGTGGCTACTCGTTAGCTAGCTACTATACGCCTCTG
GGTTTGTTCGTTATCTCAGTTCCAGGTCTTTGGTCTCTCATCAAACGCTCTGTTAAATCA
AAGATAGTGAGAAAATCGTTTGTTGTTAGCGAAGGGATCAAGAAGGAACCGAAGCAAGTT
GCTGGAGAGATTCTTTCTTTCTTCACAAGGAAGAACTTTAATGTTACTGATCGTGGAGAG
ACAATCACGTTTGAAGGAACAATGGTTCCGAGTAGAGGACAAGCTGCTCTGCTCACGTTT
TGTACATGTATAAGCTTAGCAAGCGTGGGTCTTGTCCTAACCATTACAGTTCCTGATTTT
GGAAATAACTGGTTCTTCATTACCATTCTTAGTCCACTCGCAGGAGCGTATTACTGGAAG
AAGGCGTCGAGGAAAGAGGAGATAAAGGTGAAGATGATGGTGGGAAGAAAGGGGAAACTG
GATGAGATTGTGGTTCAAGGAGATGATGTACAGGTTGAAGAGATGAGGAAGGAGCTTCAG
CTTAGTGAGAAAGGCATGGTTTATGTTAAAGGTCTCTTTGAGAGATCATGAAAACATACA
CATTCAAATCCCATTTTTGCTTTTCTTTTTTTAGGGGGAAAGAGAATGTACTGTTGAATG
ATGAGATCAAATGACCATTTGACTCATTTCATCATACTAAATGAATTGGTTTTCGTTACG

QA 5 724 5 724
DS 



AS 1 4

CO CL2474Contig1 799 4 2 U
CAGCTCCTCCTTACCACGCTTATCTCCGCCGTCGTCGTCCTTAATCCTCCGGTCAACGAT
CTCCTCACCGGATCTCCCGGACTCCTCCTCTTCCTCTGCATCATCCCTTTCGTCTTGATC
TGGCCTCTGCACGTTTACCACCAGAAGCATCCTGTTAACCTCATCCTCCTTGCCCTCTTC
ACTATCTCATTGAGCTTCACCGTCGGCGTCAGCTGTGTCATGACTGAAGGAAGAATCGTC
CTTGAAGCCTTGATATTGACATTCTCCGTGGTCGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGG
GCTGCAAAGAAAGGAAAAGACTTCAGCTTCCTTGGACCCATTCTCTTCACCAGCCTTATC
ATTCTTGTGGTGACTAGCTTCATGCAGATGTTCTTCCCGCTTGGCCCGACCTCTGTTGCA
ATATATGGAGGAATCAGCGCGCTTGTGTTCTGCGGGTACATAGTCTATGATACCGACAAT
CTCATCAAGCGTTTCACATATGATGAATACATCCTTGCATCGGTGGCTCTCTACTTGGAT
ATCCTCAATCTCTTCTTGACCATTTTACGTATTCTGAGGCAAGGTGACAACTAAAGAAGC
CAGATAAGATGAAGCTTCAGTGATGGGATTTTATAAGCGCAAGGCCTTTATGTGATTTAC
ATTTGTGTGTATATCTGACTTATGTTTCGAGTTTTTTCTTTAACTATATGTTGCTGTGTG
GTTAAACGTTTGGTAAAACAAAGTCAAGCGAAATGAAATTTTCAATGTTAAATAAATTTG
TTAAACATGGCAACAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO55TF U 1
AF RR2GO55JQ C 51
AF RR2DJ55TF U 602
AF RR2CO80TF U 245
BS 1 639 RR2GO55TF
BS 640 799 RR2CO80TF

RD RR2GO55TF 639 0 0
CAGCTCCTCCTTACCACGCTTATCTCCGCCGTCGTCGTCCTTAATCCTCCGGTCAACGAT
CTCCTCACCGGATCTCCCGGACTCCTCCTCTTCCTCTGCATCATCCCTTTCGTCTTGATC
TGGCCTCTGCACGTTTACCACCAGAAGCATCCTGTTAACCTCATCCTCCTTGCCCTCTTC
ACTATCTCATTGAGCTTCACCGTCGGCGTCAGCTGTGTCATGACTGAAGGAAGAATCGTC
CTTGAAGCCTTGATATTGACATTCTCCGTGGTCGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGG
GCTGCAAAGAAAGGAAAAGACTTCAGCTTCCTTGGACCCATTCTCTTCACCAGCCTTATC
ATTCTTGTGGTGACTAGCTTCATGCAGATGTTCTTCCCGCTTGGCCCGACCTCTGTTGCA
ATATATGGAGGAATCAGCGCGCTTGTGTTCTGCGGGTACATAGTCTATGATACCGACAAT
CTCATCAAGCGTTTCACATATGATGAATACATCCTTGCATCGGTGGCTCTCTACTTGGAT
ATCCTCAATCTCTTCTTGACCATTTTACGTATTCTGAGGCAAGGTGACAACTAAAGAAGC
CAGATAAGATGAAGCTTCAGTGATGGGATTTTATAAGCG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2GO55JQ 719 0 0
GGTCAACGATCTCCTCACCGGATCTCCCGGACTCCTCCTCTTCCTCTGCATCATCCCTTT
CGTCTTGATCTGGCCTCTGCACGTTTACCACCAGAAGCATCCTGTTAACCTCATCCTCCT
TGCCCTCTTCACTATCTCATTGAGCTTCACCGTCGGCGTCAGCTGTGTCATGACTGAAGG
AAGAATCGTCCTTGAAGCCTTGATATTGACATTCTCCGTGGTCGGATCTCTAACCGCATA
CACTTTCTGGGCTGCAAAGAAAGGAAAAGACTTCAGCTTCCTTGGACCCATTCTCTTCAC
CAGCCTTATCATTCTTGTGGTGACTAGCTTCATGCAGATGTTCTTCCCGCTTGGCCCGAC
CTCTGTTGCAATATATGGAGGAATCAGCGCGCTTGTGTTCTGCGGGTACATAGTCTATGA
TACCGACAATCTCATCAAGCGTTTCACATATGATGAATACATCCTTGCATCGGTGGCTCT
CTACTTGGATATCCTCAATCTCTTCTTGACCATTTTACGTATTCTGAGGCAAGGTGACAA
CTAAAGAAGCCAGATAAGATGAAGCTTCAGTGATGGGATTTTATAAGCGCAAGGCCTTTA
TGTGATTTACATTTGTGTGTATATCTGACTTATGTTTCGAGTTTTTTCTTTAACTATATG
TTGCTGTGTGGTTAAACGTTTGGTAAAACAAAGTCAAGCGAAATGAAATTTTCAATGTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2DJ55TF 168 0 0
G
GATAAGATGAAGCTTCAGTGATGGGATTTTATAAGCGCAAGGCCTTTATGTGATTTACAT
TTGTGTGTATATCTGACTTATGTTTCGAGTTTTTTCTTTAACTATATGTTGCTGTGTGGT
TAAACGTTTGGTAAAACAAAGTCAAGCGAAATGAAATTTTCAATGTT

QA 2 168 2 168
DS 

RD RR2CO80TF 555 0 0
AAGCCTTGATATTGACATTCTCCGTGGTCGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGGGCTG
CAAAGAAAGGAAAAGACTTCAGCTTCCTTGGACCCATTCTCTTCACCAGCCTTATCATTC
TTGTGGTGACTAGCTTCATGCAGATGTTCTTCCCGCTTGGCCCGACCTCTGTTGCAATAT
ATGGAGGAATCAGCGCGCTTGTGTTCTGCGGGTACATAGTCTATGATACCGACAATCTCA
TCAAGCGTTTCACATATGATGAATACATCCTTGCATCGGTGGCTCTCTACTTGGACATCC
TCAATCTCTTCTTGACCATTTTACGTATTCTGAGGCAAGGTGACAACTAAAGAAGCCAGA
TAAGATGAAGCTTCAGTGATGGGATTTTATAAGCGCAAGGCCTTTATGTGATTTACATTT
GTGTGTATATCTGACTTATGTTTCGAGTTTTTTCTTTAACTATATGTTGCTGTGTGGTTA
AACGTTTGGTAAAACAAAGTCAAGCGAAATGAAATTTTCAATGTTAAATAAATTTGTTAA
ACATGGCAACAGTTT

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

CO CL2475Contig1 511 2 1 U
GGAGTGAAAAGTGAAAACAAACAAACAAACACAAACCGCTCTATCTCCGTCGTCTCATCG
CTTCGCCATAGTTCTCCGTCACCCGAGCAACCCTAAAAATGGATGGGCATGATTCTGAGG
ATACTAAGCAGAGCACTGCTGATATGACTGCTTTTGTCCAAAATCTCCTGCAGCAGATGC
AAAGCAGGTTCCAGACTATGTCTGACTCCATCATCACAAAATCGATGACATGGGAGGCAG
AATCAACGAGCTGGAGCAAAGCATCAATGATCTAAGAGCCGAGATGGGAGTTGAAGGCAC
TCCACCTCCTGCCTCCAAATCAGGCGATGAACCCAAAACACCGGCTAGTTAATTCCACTT
GAAAAAAAAACTAAGGTCCATTATCTTTCTGCTTGTGTCTGCAAACACTGTGAAATTTAT
TAAACGCGGTACTATGACTTTTTAAAATTTTCTGTTTCAAAAGACATGAATATCTTGTTG
AGTTCATTCAATAGATTGATGATGTGGTGGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BC71JQ C 1
AF RR2BC71TF U 1
BS 1 511 RR2BC71TF

RD RR2BC71JQ 511 0 0
GGAGTGAAAAGTGAAAACAAACAAACAAACACAAACCGCTCTATTTCCGTCGTCTCATCG
CTTCGCCATAGTTTTCCGTCACCCGAGCAACCCTAAAAATGGATGGGCATGATTCTGAGG
ATACTAAGCAGAGCACTGCTGATATGACTGCTTTTGTCCAAAATCTCCTGCAGCAGATGC
AAAGCAGGTTCCAGACTATGTCTGACTCCATCATCACAAAATCGATGACATGGGAGGCAG
AATCAACGAGCTGGAGCAAAGCATCAATGATTTAAGAGCCGAGATGGGAGTTGAAGGCAC
TCCACCTCCTGCCTCCAAATCAGGCGATGAACCCAAAACACCGGCTAGTTAATTCCACTT
GAAAAAAAAACTAAGGTCCATTATCTTTCTGCTTGTGTCTGCAAACACTGTGAAATTTAT
TAAACGCGGTACTATGACTTTTTAAAATTTTCTGTTTCAAAAGACATGAATATCTTGTTG
AGTTCATTCAATAGATTGATGATGTGGTGGT

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2BC71TF 511 0 0
GGAGTGAAAAGTGAAAACAAACAAACAAACACAAACCGCTCTATCTCCGTCGTCTCATCG
CTTCGCCATAGTTCTCCGTCACCCGAGCAACCCTAAAAATGGATGGGCATGATTCTGAGG
ATACTAAGCAGAGCACTGCTGATATGACTGCTTTTGTCCAAAATCTCCTGCAGCAGATGC
AAAGCAGGTTCCAGACTATGTCTGACTCCATCATCACAAAATCGATGACATGGGAGGCAG
AATCAACGAGCTGGAGCAAAGCATCAATGATCTAAGAGCCGAGATGGGAGTTGAAGGCAC
TCCACCTCCTGCCTCCAAATCAGGCGATGAACCCAAAACACCGGCTAGTTAATTCCACTT
GAAAAAAAAACTAAGGTCCATTATCTTTCTGCTTGTGTCTGCAAACACTGTGAAATTTAT
TAAACGCGGTACTATGACTTTTTAAAATTTTCTGTTTCAAAAGACATGAATATCTTGTTG
AGTTCATTCAATAGATTGATGATGTGGTGGT

QA 1 511 1 511
DS 



AS 2 4

CO CL2476Contig1 1041 2 4 U
GGACGCTTACACTTATCGCAGCGACTCCAAACTCTCAAAACAAAAACTCTCGAAAATGGC
GGAACGTGGCGGAGAACGTGGCGCCGTCGGAGAACGTGGTGGTTTCGGACGTGGATTCGG
AGGAGGTCGTGGCGACCGTGGTGGTCGCGGTGGTCCAAGAGGACGCGGTGGCAGACGCGG
AGGACGTCCCGCTGAGGAGGAGAAGTGGACTCCGGTGACCAAGCTCGGCCGTCTCGTGAA
AGACGGAAAGATCCAGAAGCTCGAGCAGATCTACCTCCACTCCCTCCCCGTCAAGGAGTA
CCAGATCATCGACCTCCTCGTCGGCCCTACTCTAAAAGACGAGGTGATGAAGATCATGCC
GGTTCAGAAACAGACCAGAGCCGGACAGAGGACGAGGTTCAAGGCCTTTGTTGTTGTCGG
AGACACGAACGGGCATGTCGGTTTGGGAGTGAAGTGCTCCAAGGAGGTGGCCACGGCGAT
CAGGGGTGGGATTATATTGGCGAAGCTCTCTGTGATTCCGGTGAGGAGAGGTTACTGGGG
GAACAAGATTGGGAAGCCGCATACGGTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGTTCAGT
TACGGTGAGGATGGTTCCTGCTCCTAGAGGTGCGGGGATTGTGGCGGCTAGGGTTCCTAA
GAAGGTTCTTCAGTTCGCTGGGATTGATGACGTGTTCACTTCCTCCAGGGGGTCCACCAA
AACCCTTGGAAACTTCGTAAAGGCTACATTTGATTGCCTTCAGAAGACTTATGGATTCCT
GACACCAGAGTTCTGGAAAGAGACGAGCTTTAAGAAATCACCGTACCAGGAGTACACTGA
TTTGCTGGCCTCAAAGGGAACTACGACCAAAGTCATCACCGAGGTCGAAGACCAAGCCCC
CGCCTAAATCATCACCCACATTTTGAATTTATCCTTGATTTTGGTCTCGAACTTTGTTGG
ATTGCATCTTATGTTTTACTCTCTTCCCAAACCATTACTTTTCAGTTTTATAGTTGGATA
ATATTCTATCCTTTTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ59TF U 1
AF RR2CJ59JQ C 503
BS 1 664 RR2CJ59TF
BS 665 665 RR2CJ59JQ
BS 666 702 RR2CJ59TF
BS 703 1041 RR2CJ59JQ

RD RR2CJ59TF 705 0 0
GGACGCTTACACTTATCGCAGCGACTCCAAACTCTCAAAACAAAAACTCTCGAAAATGGC
GGAACGTGGCGGAGAACGTGGCGCCGTCGGAGAACGTGGTGGTTTCGGACGTGGATTCGG
AGGAGGTCGTGGCGACCGTGGTGGTCGCGGTGGTCCAAGAGGACGCGGTGGCAGACGCGG
AGGACGTCCCGCTGAGGAGGAGAAGTGGACTCCGGTGACCAAGCTCGGCCGTCTCGTGAA
AGACGGAAAGATCCAGAAGCTCGAGCAGATCTACCTCCACTCCCTCCCCGTCAAGGAGTA
CCAGATCATCGACCTCCTCGTCGGCCCTACTCTAAAAGACGAGGTGATGAAGATCATGCC
GGTTCAGAAACAGACCAGAGCCGGACAGAGGACGAGGTTCAAGGCCTTTGTTGTTGTCGG
AGACACGAACGGGCATGTCGGTTTGGGAGTGAAGTGCTCCAAGGAGGTGGCCACGGCGAT
CAGGGGTGGGATTATATTGGCGAAGCTCTCTGTGATTCCGGTGAGGAGAGGTTACTGGGG
GAACAAGATTGGGAAGCCGCATACGGTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGTTCAGT
TACGGTGAGGATGGTTCCTGCTCCTAGAGGTGCGGGGATTGTGGCGGCTAGGGTTCCTAA
GAAG*TTCTTCAGTTCGCTGGGATTGATGACGTGTTCACTTC
CTC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2CJ59JQ 539 0 0
AAGCTCTCTGTGATTCCGGTGAGGAGAGGTTACTGGGGGAACAAGATTGGGAAGCCGCAT
ACGGTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGTTCAGTTACGGTGAGGATGGTTCCTGCT
CCTAGAGGTGCGGGGATTGTGGCGGCTAGGGTTCCTAAGAAGGTTCTTCAGTTCGCTGGG
ATTGATGACGTGTTCACTTCCTCCAGGGGGTCCACCAAAACCCTTGGAAACTTCGTAAAG
GCTACATTTGATTGCCTTCAGAAGACTTATGGATTCCTGACACCAGAGTTCTGGAAAGAG
ACGAGCTTTAAGAAATCACCGTACCAGGAGTACACTGATTTGCTGGCCTCAAAGGGAACT
ACGACCAAAGTCATCACCGAGGTCGAAGACCAAGCCCCCGCCTAAATCATCACCCACATT
TTGAATTTATCCTTGATTTTGGTCTCGAACTTTGTTGGATTGCATCTTATGTTTTACTCT
CTTCCCAAACCATTACTTTTCAGTTTTATAGTTGGATAATATTCTATCCTTTTGTTTCC

QA 1 539 1 539
DS 



CO CL2476Contig2 686 2 6 U
GACGAACGGGCATGTCGGTTTGGGAGTGAAATGCTCTAAGGAGGTGGCCACGGCTATTAG
AGGTGGGATTATATTGGCGAAGCTGTCTGTGATTCCGGTGAGGAGAGGTTACTGGGGGAA
CAAGATTGGGAAGCCGCATACGGTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGTTCAGTTAC
GGTGAGGATGGTGCCTGCTCCGAGAGGTGCGGGTATTGTGGCGGCTAGGGTTCCTAAGAA
GGTTCTTCAGTTCGCTGGGATTGATGACGTGTTCACTTCTTCCAGGGGGTCCACCAAAAC
CCTTGGAAACTTCGTAAAGGCTACATTTGATTGCCTTCAGAAGACTTATGGATTCTTGAC
ACCAGAGTTCTGGAAAGAGACGAGCTTTAAGAAATCACCGTACCAGGAGTACACTGATTT
GCTGGCCTCAAAGGGAACTACTAGCAAAGTCATCACCGAGGTCGAAGACCAAGCCGCCGC
CTAAGTCGTCACCCACATTTTGAATTATCCTTGATTTTGGTCGAACTCTGTTGGATTGCA
TCTTATGTTTTACTCTCTTCCCAAACCATTACTTTTCAGTTTTATAGATGGATAATATTC
TATCTTTTTTGTTTTCATTTCAAAACCATTTTATTTTGATTGTTATTCTACCGAGTTTTA
ACATAGTCCAAATAATGAACCAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU54TF U 1
AF RR2GU54JQB C 61
BS 1 624 RR2GU54TF
BS 625 625 RR2GU54JQB
BS 626 660 RR2GU54TF
BS 661 661 RR2GU54JQB
BS 662 677 RR2GU54TF
BS 678 686 RR2GU54JQB

RD RR2GU54TF 677 0 0
GACGAACGGGCATGTCGGTTTGGGAGTGAAATGCTCTAAGGAGGTGGCCACGGCTATTAG
AGGTGGGATTATATTGGCGAAGCTGTCTGTGATTCCGGTGAGGAGAGGTTACTGGGGGAA
CAAGATTGGGAAGCCGCATACGGTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGTTCAGTTAC
GGTGAGGATGGTGCCTGCTCCGAGAGGTGCGGGTATTGTGGCGGCTAGGGTTCCTAAGAA
GGTTCTTCAGTTCGCTGGGATTGATGACGTGTTCACTTCTTCCAGGGGGTCCACCAAAAC
CCTTGGAAACTTCGTAAAGGCTACATTTGATTGCCTTCAGAAGACTTATGGATTCTTGAC
ACCAGAGTTCTGGAAAGAGACGAGCTTTAAGAAATCACCGTACCAGGAGTACACTGATTT
GCTGGCCTCAAAGGGAACTACTAGCAAAGTCATCACCGAGGTCGAAGACCAAGCCGCCGC
CTAAGTCGTCACCCACATTTTGAATTATCCTTGATTTTGGTCGAACTCTGTTGGATTGCA
TCTTATGTTTTACTCTCTTCCCAAACCATTACTTTTCAGTTTTATAGATGGATAATATTC
TATCTTTTTTGTTTTCATTTCAAA*CCATTTTATTTTGATTGTTATTCTACCGAGTTTTA
*CATAGTCCAAATAATG

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2GU54JQB 626 0 0
A
GGTGGGATTATATTGGCGAAGCTGTCTGTGATTCCGGTGAGGAGAGGTTACTGGGGGAAC
AAGATTGGGAAGCCGCATACGGTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGTTCAGTTACG
GTGAGGATGGTGCCTGCTCCGAGAGGTGCGGGTATTGTGGCGGCTAGGGTTCCTAAGAAG
GTTCTTCAGTTCGCTGGGATTGATGACGTGTTCACTTCTTCCAGGGGGTCCACCAAAACC
CTTGGAAACTTCGTAAAGGCTACATTTGATTGCCTTCAGAAGACTTATGGATTCTTGACA
CCAGAGTTCTGGAAAGAGACGAGCTTTAAGAAATCACCGTACCAGGAGTACACTGATTTG
CTGGCCTCAAAGGGAACTACTAGCAAAGTCATCACCGAGGTCGAAGACCAAGCCGCCGCC
TAAGTCGTCACCCACATTTTGAATTATCCTTGATTTTGGTCGAACTCTGTTGGATTGCAT
CTTATGTTTTACTCTCTTCCCAAACCATTACTTTTCAGTTTTATAGATGGATAATATTCT
ATCTTTTTTGTTTTCATTTCAAAACCATTTTATTTTGATTGTTATTCTACCGAGTTTTAA
CATAGTCCAAATAATGAACCAAAGC

QA 2 626 2 626
DS 



AS 1 4

CO CL2477Contig1 813 4 11 U
GGACACTAGCAAGCATCGACATATCATAAAAGGACCACACAAAAAAAAGAGCACAAGGCA
AAGAAATCATAAGAAGAAGATGAAAACAGCCGGTGCAATCACAATATTCCCATTGATGAT
ATCTTTATTGCTCATTGCAATAACAGCTTCTGGTGTTGTTGACAGCGATGTAGTGCTTGA
TTCAAACGGGGATCCGGTACGGGCCTTTGCTCCATATTTTGTCGAGGTTCGGACTCCCCA
AGGAATAAAAGCAAATATTTCCGAGCACGGAATCGATGTAAATCATGCCTTGTCATGCCC
ACAAAGAGTGGTAGCGTACTCTGACGAAGTTATGGGCATAGCCAAACCAGTTATATTTCT
ATTTTCAACACATTTTGTGCGCGTACCGGCAGAGCTTAGCATCAGGTTCGCATGGGACAC
TGAATGCGATGAGTCCGGGGTCTGGAGAGTGGCAGATAGCAGAGATAGCTCATCGGCAAC
CAAAGAAATATTCCTGTCGGGAATGGATTCAAGCAGTGACAGCACCTTCATCATCAAGAA
ATCTGAGAACGGATCTTACAAGTTTGCTTTTATAAGTTCTAACAAACCACAAGATCTCGG
TTTAGATGAGATACGTTATGGAGTGTGGAGGTTGATTTTGTCGAACAACTCTGGATTTAG
TGTTTCTTTCGTTCCGGAGTAATGTTCACAAATTTACCGGCTACTCCTTGTGTCCTCTTC
TTTTTTTCTTCTGTTTTTTAAACTTTAGATCAAATGAATGTTTGGTTTCCCTTTTTCTTT
TGATGTAATTACGAAAAAACAATAATGATAATA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG35JQ C 1
AF RR2AG35TF U 1
AF RR2A507TF U 21
AF RR2A507JQ C 65
BS 1 269 RR2AG35TF
BS 270 270 RR2A507TF
BS 271 381 RR2AG35TF
BS 382 382 RR2A507TF
BS 383 385 RR2AG35TF
BS 386 386 RR2A507TF
BS 387 625 RR2AG35TF
BS 626 626 RR2A507TF
BS 627 734 RR2AG35TF
BS 735 791 RR2A507TF
BS 792 813 RR2A507JQ

RD RR2AG35JQ 773 0 0
GGACACTAGCAAGCATCGACATATCATAAAAGGACCACACAAAAAAAAGAGCACAAGGCA
AAGAAATCATAAGAAGAAGATGAAAACAGCCGGTGCAATCACAATATTCCCATTGATGAT
ATCTTTATTGCTCATTGCAATAACAGCTTCTGGTGTTGTTGACAGCGATGTAGTGCTTGA
TTCAAACGGGGATCCGGTACGGGCCTTTGCTCCATATTTTGTCGAGGTTCGGACTCCCCA
AGGAATAAAAGCAAATATTTCCGAGCACGTAATCGATGTAAATCATGCCTTGTCATGCCC
ACAAAGAGTGGTAGCGTACTCTGACGAAGTTATGGGCATAGCCAAACCAGTTATATTTCT
ATTTTCAACACATTTTGTGCGTGTATCGGCAGAGCTTAGCATCAGGTTCGCATGGGACAC
TGAATGCGATGAGTCCGGGGTCTGGAGAGTGGCAGATAGCAGAGATAGCTCATCGGCAAC
CAAAGAAATATTCCTGTCGGGAATGGATTCAAGCAGTGACAGCACCTTCATCATCAAGAA
ATTTGAGAACGGATCTTACAAGTTTGCTTTTATAAGTTCTAACAAACCACAAGATCTCGG
TTTAGATGAGATACGTTATGGAGTGTGGAGGTTGATTTTGTCGAACAACTCTGGATTTAG
TGTTTCTTTCGTTCCGGAGTAATGTTCACAAATTTACCGGCTACTCCTTGTGTCCTCTTC
TTTTTTTCTTCTGTTTTTTAAACTTTAGATCAAATGAATGTTTGGTTTCCCTT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2AG35TF 734 0 0
GGACACTAGCAAGCATCGACATATCATAAAAGGACCACACAAAAAAAAGAGCACAAGGCA
AAGAAATCATAAGAAGAAGATGAAAACAGCCGGTGCAATCACAATATTCCCATTGATGAT
ATCTTTATTGCTCATTGCAATAACAGCTTCTGGTGTTGTTGACAGCGATGTAGTGCTTGA
TTCAAACGGGGATCCGGTACGGGCCTTTGCTCCATATTTTGTCGAGGTTCGGACTCCCCA
AGGAATAAAAGCAAATATTTCCGAGCACGTAATCGATGTAAATCATGCCTTGTCATGCCC
ACAAAGAGTGGTAGCGTACTCTGACGAAGTTATGGGCATAGCCAAACCAGTTATATTTCT
ATTTTCAACACATTTTGTGCGTGTATCGGCAGAGCTTAGCATCAGGTTCGCATGGGACAC
TGAATGCGATGAGTCCGGGGTCTGGAGAGTGGCAGATAGCAGAGATAGCTCATCGGCAAC
CAAAGAAATATTCCTGTCGGGAATGGATTCAAGCAGTGACAGCACCTTCATCATCAAGAA
ATCTGAGAACGGATCTTACAAGTTTGCTTTTATAAGTTCTAACAAACCACAAGATCTCGG
TTTAGATGAGATACGTTATGGAGTGGGGAGGTTGATTTTGTCGAACAACTCTGGATTTAG
TGTTTCTTTCGTTCCGGAGTAATGTTCACAAATTTACCGGCTACTCCTTGTGTCCTCTTC
TTTTTTTCTTCTGT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2A507TF 771 0 0
GG
ATCATAAAAGGACCACACAAAAAAAAGAGCACAAGGCAAAGAAATCATAAGAAGAAGATG
AAAACAGCCGGTGCAATCACAATATTCCCATTGATGATATCTTTATTGCTCATTGCAATA
ACAGCTTCTGGTGTTGTTGACAGCGATGTAGTGCTTGATTCAAACGGGGATCCGGTACGG
GCCTTTGCTCCATATTTTGTCGAGGTTCGGACTCCCCAAGTAATAAAAGCAAATATTTCC
GAGCACGGAATCGATGTAAATCATGCCTTGTCATGCCCACAAAGAGTGGTAGCGTACTCT
GACGAAGTTATGGGCATAGCCAAACCAGTTATATTTCTATTTTCAACACATTTTGTGCGC
GTACCGGCAGAGCTTAGCATCAGGTTCGCATGGGGCACTGAATGCGATGAGTCCGGGGTC
TGGAGAGTGGCAGATAGCAGAGATAGCTCATCGGCAACCAAAGAAATATTCCTGTCGGGA
ATGGATTCAAGCAGTGACAGCACCTTCATCATCAAGAAATCTGAGAACGGATCTTACAAG
TTTGCTTTTATAAGTTCTAACAAACCACAAGATCTCGGTTTAGATGAGATACGTTATGGA
GTGTGGAGGTTGATTTTGTCGAACAACTCTGGATTTAGTGTTTCTTTCGTTCCGGAGTAA
TGTTCACAAATTTACCGGCTACTCCTTGTGTCCTCTTCTTTTTTTCTTCTGTTTTTTAAA
CTTTAGATCAAATGAATGTTTGGTTTCCCTTTTTCTTTTGATGTAATTA

QA 3 771 3 771
DS 

RD RR2A507JQ 749 0 0
AATCATAAGAAGAAGATGAAAACAGCCGGTGCAATCACAATATTCCCATTGATGATATCT
TTATTGCTCATTGCAATAACAGCTTCTGGTGTTGTTGACAGCGATGTAGTGCTTGATTCA
AACGGGGATCCGGTACGGGCCTTTGCTCCATATTTTGTCGAGGTTCGGACTCCCCAAGTA
ATAAAAGCAAATATTTCCGAGCACGGAATCGATGTAAATCATGCCTTGTCATGCCCACAA
AGAGTGGTAGCGTACTCTGACGAAGTTATGGGCATAGCCAAACCAGTTATATTTCTATTT
TCAACACATTTTGTGCGCGTACCGGCAGAGCTTAGCATCAGGTTCGCATGGGGCACTGAA
TGCGATGAGTCCGGGGTCTGGAGAGTGGCAGATAGCAGAGATAGCTCATCGGCAACCAAA
GAAATATTCCTGTCGGGAATGGATTCAAGCAGTGACAGCACCTTCATCATCAAGAAATCT
GAGAACGGATCTTACAAGTTTGCTTTTATAAGTTCTAACAAACCACAAGATCTCGGTTTA
GATGAGATACGTTATGGAGTGTGGAGGTTGATTTTGTCGAACAACTCTGGATTTAGTGTT
TCTTTCGTTCCGGAGTAATGTTCACAAATTTACCGGCTACTCCTTGTGTCCTCTTCTTTT
TTTCTTCTGTTTTTTAAACTTTAGATCAAATGAATGTTTGGTTTCCCTTTTTCTTTTGAT
GTAATTACGAAAAAACAATAATGATAATA

QA 1 749 1 749
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2479Contig1 1182 4 8 U
GGACACAAACCAAATCTCGACAGAAAACTAAACAAAACCAAACAATGAAGCTTCACATGT
TATGGCTCGTGTTGGTATTTATAGCTGTCCAAGCGCACGCAACAAAGCAAAGAAAGAATG
CTAAAATCCCTGCATTAATAGTTTTCGGAGATTCAATAATGGATACTGGTAACAACAACA
ATCTCTCTACTCTTCTTAAGTCCAACTTCCCTCCTTACGGCAAAGACTTTCCCGGTGGAT
TGGCTACTGGAAGATTTTCTGATGGAAGAGTTCCTACTGATCTAATTGCGGAAAATTTGG
GGTTGGCTAAGACAATACCAGCATACCTGAGCCCAAATTTGAAGCCTAGAGATCTTTTGA
AAGGTGTATCATTTGCATCTGGAGGAACTGGTTATGATCCATTGACAGCTCAAACTATGT
CGGTGGTATCAGTGTGGGATCAACTAATATATTTCAAAGAGTATATATCAACGATCAAGA
AACATTATGGAAAAAGAAAAGCTCGGTACATTTTGGACCATAGCATTTTTCTCGTGGTTT
CTAGTAGCAATGACCTTGCTCACACTTATATATCCCAATCTTATAAATATAACCCTACAT
CGTATGCTACTTTCTTGGCCAAATCAGCAATTAAATTCGTAAGAGAATTACACAAACTTG
GAGCTCGAAAAATTGGGGTGTTTAGTGCACTTCCTGTTGGATGTGTACCACTTCAAAGAT
CAGTGCGTGGAAGTGTATTAACAAGAAAATGTGTTAAACCTTTAAACAATATGGCAAAAC
AATTCAACGCTAGACTTTCTCCAGCACTGAGATCTTTGAATAGAAAGTTGGATGGTATTA
TCCTCTATGTTGATGTTTATGAGACTTTTCTTGACATGATCCAAAAGCCTAAAAAATACG
GTTTCAAGGTAGCTGATAGAGCTTGTTGCGGTACTGGTTTTCTCGAAATTTCTTATATGT
GCAACTCATTTAATCCATTCACATGTTCTAATTCGTCGGCCTATATATTTTGGGATAGCT
ACCATCCAACTGAAAGAGCTTATCAAGTTATGGTTGATAAGTTACTCAGCAAATACTTAA
GCAAACTCTTTTGATGTTAAACATTACTTACTTCTTTGCGTTTCATTGTGTATTTATCCT
TCTTATTGTTTTATGTATGTGATTAATTATTATTGAATGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GM38TF U 1
AF RR2C371TF U 418
AF RR2C371JQ C 367
AF RR2GM38JQ C 390
BS 1 646 RR2GM38TF
BS 647 647 RR2C371JQ
BS 648 671 RR2C371TF
BS 672 672 RR2C371JQ
BS 673 691 RR2C371TF
BS 692 692 RR2C371JQ
BS 693 708 RR2C371TF
BS 709 1182 RR2C371JQ

RD RR2GM38TF 647 0 0
GGACACAAACCAAATCTCGACAGAAAACTAAACAAAACCAAACAATGAAGCTTCACATGT
TATGGCTCGTGTTGGTATTTATAGCTGTCCAAGCGCACGCAACAAAGCAAAGAAAGAATG
CTAAAATCCCTGCATTAATAGTTTTCGGAGATTCAATAATGGATACTGGTAACAACAACA
ATCTCTCTACTCTTCTTAAGTCCAACTTCCCTCCTTACGGCAAAGACTTTCCCGGTGGAT
TGGCTACTGGAAGATTTTCTGATGGAAGAGTTCCTACTGATCTAATTGCGGAAAATTTGG
GGTTGGCTAAGACAATACCAGCATACCTGAGCCCAAATTTGAAGCCTAGAGATCTTTTGA
AAGGTGTATCATTTGCATCTGGAGGAACTGGTTATGATCCATTGACAGCTCAAACTATGT
CGGTGGTATCAGTGTGGGATCAACTAATATATTTCAAAGAGTATATATCAACGATCAAGA
AACATTATGGAAAAAGAAAAGCTCGGTACATTTTGGACCATAGCATTTTTCTCGTGGTTT
CTAGTAGCAATGACCTTGCTCACACTTATATATCCCAATCTTATAAATATAACCCTACAT
CGTATGCTACTTTCTTGGCCAAATCAGCAATTAAATTCGTAAGAGA
A

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2C371TF 299 0 0
TGTCGGTGGTATCAGTGTGGGATCAACTAATATATTTCAAAGAGTATATATCAACGATCA
AGAAACATTATGGAAAAAGAAAAGCTCGGTACATTTTGGACCATAGCATTTTTCTCGTGG
TTTCTAGTAGCAATGACCTTGCTCACACTTATATATCCCAATCTTATAAATATAACCCTA
CATCGTATGCTACTTTCTTGGCCAAATCATCAATTAAATTCGTAAGAGA*TTACACAAAC
TTGGAGCTCGAAAA*TTGGGGTGTTTAGTGCACT*CCTGTTGGATGTGTAC
ACTTCAAG

QA 1 291 1 291
DS 

RD RR2C371JQ 816 0 0
GTATCA
TTGCATCTGGAGGAACTGGTTATGATCCATTGACAGCTCAAACTATGTCGGTGGTATCAG
TGTGGGATCAACTAATATATTTCAAAGAGTATATATCAACGATCAAGAAACATTATGGAA
AAAGAAAAGCTCGGTACATTTTGGACCATAGCATTTTTCTCGTGGTTTCTAGTAGCAATG
ACCTTGCTCACACTTATATATCCCAATCTTATAAATATAACCCTACATCGTATGCTACTT
TCTTGGCCAAATCATCAATTAAATTCGTAAGAGAATTACACAAACTTGGAGCTCGAAAAA
TTGGGGTGTTTAGTGCACTTCCTGTTGGATGTGTACCACTTCAAAGATCAGTGCGTGGAA
GTGTATTAACAAGAAAATGTGTTAAACCTTTAAACAATATGGCAAAACAATTCAACGCTA
GACTTTCTCCAGCACTGAGATCTTTGAATAGAAAGTTGGATGGTATTATCCTCTATGTTG
ATGTTTATGAGACTTTTCTTGACATGATCCAAAAGCCTAAAAAATACGGTTTCAAGGTAG
CTGATAGAGCTTGTTGCGGTACTGGTTTTCTCGAAATTTCTTATATGTGCAACTCATTTA
ATCCATTCACATGTTCTAATTCGTCGGCCTATATATTTTGGGATAGCTACCATCCAACTG
AAAGAGCTTATCAAGTTATGGTTGATAAGTTACTCAGCAAATACTTAAGCAAACTCTTTT
GATGTTAAACATTACTTACTTCTTTGCGTTTCATTGTGTATTTATCCTTCTTATTGTTTT
ATGTATGTGATTAATTATTATTGAATGTTC

QA 7 816 7 816
DS 

RD RR2GM38JQ 793 0 0
GGTTATGATCCATTGACAGCTCAAACTATGTCGGTGGTATCAGTGTGGGATCAACTAATA
TATTTCAAAGAGTATATATCAACGATCAAGAAACATTATGGAAAAAGAAAAGCTCGGTAC
ATTTTGGACCATAGCATTTTTCTCGTGGTTTCTAGTAGCAATGACCTTGCTCACACTTAT
ATATCCCAATCTTATAAATATAACCCTACATCGTATGCTACTTTCTTGGCCAAATCAGCA
ATTAAATTCGTAAGAGAATTACACAAACTTGGAGCTCGAAAAATTGGGGTGTTTAGTGCA
CTTCCTGTTGGATGTGTACCACTTCAAAGATCAGTGCGTGGAAGTGTATTAACAAGAAAA
TGTGTTAAACCTTTAAACAATATGGCAAAACAATTCAACGCTAGACTTTCTCCAGCACTG
AGATCTTTGAATAGAAAGTTGGATGGTATTATCCTCTATGTTGATGTTTATGAGACTTTT
CTTGACATGATCCAAAAGCCTAAAAAATACGGTTTCAAGGTAGCTGATAGAGCTTGTTGC
GGTACTGGTTTTCTCGAAATTTCTTATATGTGCAACTCATTTAATCCATTCACATGTTCT
AATTCGTCGGCCTATATATTTTGGGATAGCTACCATCCAACTGAAAGAGCTTATCAAGTT
ATGGTTGATAAGTTACTCAGCAAATACTTAAGCAAACTCTTTTGATGTTAAACATTACTT
ACTTCTTTGCGTTTCATTGTGTATTTATCCTTCTTATTGTTTTATGTATGTGATTAATTA
TTATTGAATGTTC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 4

CO CL2480Contig1 675 4 2 U
GGAACCCAAATGGCTCCGAGAACCGATTCGCAAACCCAAGCCACCATGTCAGACACGTCT
AACGAATCGTCGATCGATCCGATCTTCCACATTCTCCGTCTCGTCCCTTTCTCATTCCTC
CGGCCGCCGCGTCTCCGGCTCAAGCTCCCTTCGTTCACTCTCCCCTCTCCGATGACAGTC
TTCTCGCTGATTCTCCTCACCTACTTCCTCGTCATATCCGGATTCGTCCACGACGTGATT
GTCGAGCCTCCAGGCATCGGATCGACCCAGGATCCAGTCACCGGGGCGATACGGCCCGTC
GTGTTCATGTCGGGCCGGGTCAACGGGCAGTACATCATCGAAGGTCTTTCGTCGGGATTC
ATGTTCGTGATGGGTGGGATCGGGATCATAATGCTGGATCTGGCGTTGGATAAGAATCGA
GCTAAGAGTGTGAAAGCATCGTATGCTACGGCGGGAGTGACTTCCGTTGTGATTGGTTAT
GTTATGAGTATGCTCTTCATCCGTATTAAGATCCCTGGTTATCTCCATTAGAGTTGTTTT
TGATCACTTGCATTTGGTTCTGTAATGGGCTTCTCTAGTTTACGAATTACCGTTGAGTGA
CTTTTGTGTTTCTTAAAGCTTTGTGTGTTCACTGAAACCGGATTCTCTACTTAGTTCTGA
GTTTCTTTGTTTGGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2H484TF U 1
AF RR2H223TF U 1
AF RR2H484JQB C 28
AF RR2H223JQ C 129
BS 1 636 RR2H223TF
BS 637 675 RR2H484JQB

RD RR2H484TF 564 0 0
GGAACCCAAATGGCTCCGAGAACCGATTCGCAAACCCAAGCCACCATGTCAGACACGTCT
AACGAATCGTCGATCGATCCGATCTTCCACATTCTCCGTCTCGTCCCTTTCTCATTCCTC
CGGCCGCCGCGTCTCCGGCTCAAGCTCCCTTCGTTCACTCTCCCCTCTCCGATGACAGTC
TTCTCGCTGATTCTCCTCACCTACTTCCTCGTCATATCCGGATTCGTCCACGACGTGATT
GTCGAGCCTCCAGGCATCGGATCGACCCAGGATCCAGTCACCGGGGCGATACGGCCCGTC
GTGTTCATGTCGGGCCGGGTCAACGGGCAGTACATCATCGAAGGTCTTTCGTCGGGATTC
ATGTTCGTGATGGGTGGGATCGGGATCATAATGCTGGATCTGGCGTTGGATAAGAATCGA
GCTAAGAGTGTGAAAGCATCGTATGCTACGGCGGGAGTGACTTCCGTTGTGATTGGTTAT
GTTATGAGTATGCTCTTCATCCGTATTAAGATCCCTGGTTATCTCCATTAGAGTTGTTTT
TGATCACTTGCATTTGGTTCTGTA

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2H223TF 636 0 0
GGAACCCAAATGGCTCCGAGAACCGATTCGCAAACCCAAGCCACCATGTCAGACACGTCT
AACGAATCGTCGATCGATCCGATCTTCCACATTCTCCGTCTCGTCCCTTTCTCATTCCTC
CGGCCGCCGCGTCTCCGGCTCAAGCTCCCTTCGTTCACTCTCCCCTCTCCGATGACAGTC
TTCTCGCTGATTCTCCTCACCTACTTCCTCGTCATATCCGGATTCGTCCACGACGTGATT
GTCGAGCCTCCAGGCATCGGATCGACCCAGGATCCAGTCACCGGGGCGATACGGCCCGTC
GTGTTCATGTCGGGCCGGGTCAACGGGCAGTACATCATCGAAGGTCTTTCGTCGGGATTC
ATGTTCGTGATGGGTGGGATCGGGATCATAATGCTGGATCTGGCGTTGGATAAGAATCGA
GCTAAGAGTGTGAAAGCATCGTATGCTACGGCGGGAGTGACTTCCGTTGTGATTGGTTAT
GTTATGAGTATGCTCTTCATCCGTATTAAGATCCCTGGTTATCTCCATTAGAGTTGTTTT
TGATCACTTGCATTTGGTTCTGTAATGGGCTTCTCTAGTTTACGAATTACCGTTGAGTGA
CTTTTGTGTTTCTTAAAGCTTTGTGTGTTCACTGAA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2H484JQB 648 0 0
TCGCAAACCCAAGCCACCATGTCAGACACGTCTAACGAATCGTCGATCGATCCGATCTTC
CACATTCTCCGTCTCGTCCCTTTCTCATTCCTCCGGCCGCCGCGTCTCCGGCTCAAGCTC
CCTTCGTTCACTCTCCCCTCTCCGATGACAGTCTTCTCGCTGATTCTCCTCACCTACTTC
CTCGTCATATCCGGATTCGTCCACGACGTGATTGTCGAGCCTCCAGGCATCGGATCGACC
CAGGATCCAGTCACCGGGGCGATACGGCCCGTCGTGTTCATGTCGGGCCGGGTCAACGGG
CAGTACATCATCGAAGGTCTTTCGTCGGGATTCATGTTCGTGATGGGTGGGATCGGGATC
ATAATGCTGGATCTGGCGTTGGATAAGAATCGAGCTAAGAGTGTGAAAGCATCGTATGCT
ACGGCGGGAGTGACTTCCGTTGTGATTGGTTATGTTATGAGTATGCTCTTCATCCGTATT
AAGATCCCTGGTTATCTCCATTAGAGTTGTTTTTGATCACTTGCATTTGGTTCTGTAATG
GGCTTCTCTAGTTTACGAATTACCGTTGAGTGACTTTTGTGTTTCTTAAAGCTTTGTGTG
TTCACTGAAACCGGATTCTCTACTTAGTTCTGAGTTTCTTTGTTTGGC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2H223JQ 547 0 0
GCGTCTCCGGCTCAAGCTCCCTTCGTTCACTCTCCCCTCTCCGATGACAGTCTTCTCGCT
GATTCTCCTCACCTACTTCCTCGTCATATCCGGATTCGTCCACGACGTGATTGTCGAGCC
TCCAGGCATCGGATCGACCCAGGATCCAGTCACCGGGGCGATACGGCCCGTCGTGTTCAT
GTCGGGCCGGGTCAACGGGCAGTACATCATCGAAGGTCTTTCGTCGGGATTCATGTTCGT
GATGGGTGGGATCGGGATCATAATGCTGGATCTGGCGTTGGATAAGAATCGAGCTAAGAG
TGTGAAAGCATCGTATGCTACGGCGGGAGTGACTTCCGTTGTGATTGGTTATGTTATGAG
TATGCTCTTCATCCGTATTAAGATCCCTGGTTATCTCCATTAGAGTTGTTTTTGATCACT
TGCATTTGGTTCTGTAATGGGCTTCTCTAGTTTACGAATTACCGTTGAGTGACTTTTGTG
TTTCTTAAAGCTTTGTGTGTTCACTGAAACCGGATTCTCTACTTAGTTCTGAGTTTCTTT
GTTTGGC

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 4

CO CL2481Contig1 1442 4 11 U
GGGGCAACTCCGTCTCGAAGCCGACATCCCTCTTCACCATTCCTTTCTTCATTCCCACTC
CCCCCTCCTGTTTCTATTAATTCAATCCCCTCCCCTCAAATCGAGCATTTCTTTGCTGGG
ATCGAATTCGAATTTCAAACATTCTCCGTTTGTTATTTTGATCCACCCCATGGAGAAGCA
TGAGGACGGCGTTTGCTCGGCGGAGTCTGTGGTCGACGGGAGCCTCGACGTTTGGAGTTG
CAAGAACTCCGATTCCTCTTCCGCCGATCACCTCGTCGTTATGGTCCATGGGATCTTGGG
AAGTACGGACGATTGGAAGTTTGGAGCTGAGCAATTCGTTAAAAAGCTACCTGAACAAGT
CTTCGTTCACTGGAGTGAGAAAAATGCATCTGCCCTTACTCTAGATGGTGTGGATGTAAT
GGGTGAGCGTCTTGCATCTGAGGTCCTTGAAATTATTCAATCGAGGCCAAACATCCGTAA
AATCTCCTTTGTTTCACATTCTTTGGGAGGGCTTGCCGCAAGATATGCAATTGGGAAGCT
TTACAAGCCACCTAATCAGCAGCAACATTCTAACGACTCTTCAGGGGACTGTAGTGAAGG
GCCTTCCCAAGGCACTATATGTGGCTTAGAGCCTGTCAACTTCATCACTGTTGCTACACC
CCATTTGGGTTCTATGGGTAATAGACAGGTTCCCTTTCTCTTTGGTGTTTCTTCCTTTGA
GAAAGTTGCAGGTCTCGTTATCCACTGGATATTTAAAAGAACGGGACGTCACCTTTTCTT
GAAAGATGAAGATGACGGAAAACCGCCATTACTTCGACGCATGGTGGAAGACACCGGTGA
TTGTCATTTCATATCTGCACTGCGTGCCTACAAAAGGCGGGTGGCTTATTCAAATGTGGG
CCATGATCACATCGTTGGCTGGAGGACGGCTTCTATTAGACGTGACTCTGAATTGCCTAA
GTGGGAAAATTCTCTGGACGAGAAGTATCCACATATTGTTTACGAAGAACTCTGCAAGTC
ATGTGATGCTGACGACGTACCAGATGGCGAAAATCATTCAAACGACATTGAAGAAGAAAT
GATCAAAGGACTCTCCACTGTCTCATGGGAAAAAGTTGATGTTAGCTTTCACAGTAGTAG
GCAGAGATTCGCTGCTCATAGTGTTATACAGGTTAAAAGCGAAACTATGCATATAGAAGG
AGCAGATGTCATAGAGCATATCATCGATCATTTCCATGCCTAAATCAGTATAAGTTTCAT
CCCCACAACAACTAAGGACTGATTGACGTCAGTTATGACCAGTTGACGTGATACACTGAA
AGGAAATTTTGTTCAGTTCAATTGTATCGTGTATTCATGGATGTGATGCACTGAAAGTAT
AAAGTAGCATAAACGGAAGTTTTGTGCCTATATATTCCTTCTACTTAAAAAGAACACTTC
AC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 

AF RR2FB76TF U 1
AF RR2CO72TF U 116
AF RR2CO72JQ C 698
AF RR2FB76JQ C 777
BS 1 536 RR2FB76TF
BS 537 537 RR2CO72TF
BS 538 723 RR2FB76TF
BS 724 724 RR2CO72TF
BS 725 731 RR2FB76TF
BS 732 732 RR2CO72TF
BS 733 747 RR2FB76TF
BS 748 793 RR2CO72TF
BS 794 1294 RR2CO72JQ
BS 1295 1295 RR2FB76JQ
BS 1296 1442 RR2CO72JQ

RD RR2FB76TF 747 0 0
GGGGCAACTCCGTCTCGAAGCCGACATCCCTCTTCACCATTCCTTTCTTCATTCCCACTC
CCCCCTCCTGTTTCTATTAATTCAATCCCCTCCCCTCAAATCGAGCATTTCTTTGCTGGG
ATCGAATTCGAATTTCAAACATTCTCCGTTTGTTATTTTGATCCACCCCATGGAGAAGCA
TGAGGACGGCGTTTGCTCGGCGGAGTCTGTGGTCGACGGGAGCCTCGACGTTTGGAGTTG
CAAGAACTCCGATTCCTCTTCCGCCGATCACCTCGTCGTTATGGTCCATGGGATCTTGGG
AAGTACGGACGATTGGAAGTTTGGAGCTGAGCAATTCGTTAAAAAGCTACCTGAACAAGT
CTTCGTTCACTGGAGTGAGAAAAATGCATCTGCCCTTACTCTAGATGGTGTGGATGTAAT
GGGTGAGCGTCTTGCATCTGAGGTCCTTGAAATTATTCAATCGAGGCCAAACATCCGTAA
AATCTCCTTTGTTTCACATTCTTTGGGAGGGCTTGCCGCAAGATATGCAATTGGGAGGCT
TTACAAGCCACCTAATCAGCAGCAACATTCTAACGACTCTTCAGGGGACTGTAGTGAAGG
GCCTTCCCAAGGCACTATATGTGGCTTAGAGCCTGTCAACTTCATCACTGTTGCTACACC
CCATTTGGGTTCTATGGGTAATAGACAGGTTCCCTTTCTCTTTGGTGTTTCTTCCTTTGA
GAA*GTTGCAG*TCTCGTTATCCACTG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2CO72TF 678 0 0
GG
GGGATCGAATTCGAATTTCAAACATTCTCCGTTTGTTATTTTGATCCACCCCATGGAGAA
GCATGAGGACGGCGTTTGCTCGGCGGAGTCTGTGGTCGACGGGAGCCTCGACGTTTGGAG
TTGCAAGAACTCCGATTCCTCTTCCGCCGATCACCTCGTCGTTATGGTCCATGGGATCTT
GGGAAGTACGGACGGTTGGAAGTTTGGAGCTGAGCAATTCGTTAAAAAGCTACCTGAACA
AGTCTTCGTTCACTGTAGTGAGAAAAATGCATCTGCCCTTACTCTAGATGGTGTGGATGT
AATGGGTGAGCGTCTTGCATCTGAGGTCCTTGAAATTATTCAATCGAGGCCAAACATCCG
TAAAATCTCCTTTGTTTCACATTCTTTGGGAGGGCTTGCCGCAAGATATGCAATTGGGAA
GCTTTACAAGCCACCTAATCAGCAGCAACATTCTAACGACTCTTCAGGGGACTGTAGTGA
AGGGCCTTCCCAAGGCACTATATGTGGCTTAGAGCCTGTCAACTTCATCACTGTTGCTAC
ACCCCATTTGGGTTCTATGGGTAATAGACAGGTTCCCTTTCTCTTTGGTGTTTCTTCCTT
TGAGAAAGTTGCAGGTCTCGTTATCCACTGGATATTTAAAAGAACGGGACGTCACCTTTT
CTTGAAAGATGAAGAT

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR2CO72JQ 745 0 0
CTCTTTGGTGTTTCTTCCTTTGAGAAAGTTGCAGGTCTCGTTATCCACTGGATATTTAAA
AGAACGGGACGTCACCTTTTCTTGAAAGATGAAGATGACGGAAAACCGCCATTACTTCGA
CGCATGGTGGAAGACACCGGTGATTGTCATTTCATATCTGCACTGCGTGCCTACAAAAGG
CGGGTGGCTTATTCAAATGTGGGCCATGATCACATCGTTGGCTGGAGGACGGCTTCTATT
AGACGTGACTCTGAATTGCCTAAGTGGGAAAATTCTCTGGACGAGAAGTATCCACATATT
GTTTACGAAGAACTCTGCAAGTCATGTGATGCTGACGACGTACCAGATGGCGAAAATCAT
TCAAACGACATTGAAGAAGAAATGATCAAAGGACTCTCCACTGTCTCATGGGAAAAAGTT
GATGTTAGCTTTCACAGTAGTAGGCAGAGATTCGCTGCTCATAGTGTTATACAGGTTAAA
AGCGAAACTATGCATATAGAAGGAGCAGATGTCATAGAGCATATCATCGATCATTTCCAT
GCCTAAATCAGTATAAGTTTCATCCCCACAACAACTAAGGACTGATTGACGTCAGTTGTG
ACCAGTTGACGTGATACACTGAAAGGAAATTTTGTTCAGTTCAATTGTATCGTGTATTCA
TGGATGTGATGCACTGAAAGTATAAAGTAGCATAAACGGAAGTTTTGTGCCTATATATTC
CTTCTACTTAAAAAGAACACTTCAC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2FB76JQ 666 0 0
TCTTGAAAGATGAAGATGACGGAAAACCGCCATTACTTCGACGCATGGTGGAAGACACCG
GTGATTGTCATTTCATATCTGCACTGCGTGCCTTCAAAAGGCGGGTGGCTTATTCAAATG
TGGGCCATGATCACATCGTTGGCTGGAGGACGGCTTCTATTAGACGTGACTCTGAATTGC
CTAAGTGGGAAAATTCTCTGGACGAGAAGTATCCACATATTGTTTACGAAGAACTCTGCA
AGTCATGTGATGCTGACGACGTACCAGATGGCGAAAATCATTCAAACGACATTGAAGAAG
AAATGATCAAAGGACTCTCCACTGTCTCATGGGAAAAAGTTGATGTTAGCTTTCACAGTA
GTAGGCAGAGATTCGCTGCTCATAGTGTTATACAGGTTAAAAGCGAAACTATGCATATAG
AAGGAGCAGATGTCATAGAGCATATCATCGATCATTTCCATGCCTAAATCAGTATAAGTT
TCATCCCCACAACAACTAAGGACTGATTGACGTCAGTTATGACCAGTTGACGTGATACAC
TGAAAGGAAATTTTGTTCAGTTCAATTGTATCGTGTATTCATGGATGTGATGCACTGAAA
GTATAAAGTAGCATAAACGGAAGTTTTGTGCCTATATATTCCTTCTACTTAAAAAGAACA
CTTCAC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 2 4

CO CL2482Contig1 685 2 1 U
GGAAAACAATATTCCATCTTTGTCCATCTCTCCCTCGAAGAAAACCAAAAAGAAGAAGAG
AAACCATGGCAGGTGTTGGACCGATGACTCAGGATTGGGAACCAGTTGTGATCCGTAAGA
GAGCTCCCAACTCCGCCACCAAGCGCGACGAGAAGACTGTCAACGCCGCTCGTCGTAGCG
GCGCCGATATCGAAACCGTCAGAAAATACAATGCTGCGACGAACAAGGCGGCTTCGAGCA
GCACCTCCTTGAACACAAAGAGGCTTGATGATGATACTGAGAACTTAGCTCATGAACGTG
TGCCTACTGAGTTGAAGAAAGCCATCATGCAAGCCCGAGGGGAGAAGAAGCTCACCCAGT
CCCAGCTCGCTCAACTGATCAACGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAATACGAGTCTGGGA
AAGCAATACCGAATCAGCAGATCCTTTCTAAGCTGGAGAGAGCACTTGGTGCTAAACTCC
GTGGGAAGAAGTAATCACAAAACCTCCTTTGAAGTTTTAAAACTGAAGAAAAGCTAATCA
CGGTTCTGTCTCCAGTTCATAAACTATCTATATATAAAGCCTACTGCTTCAATGGTTTAG
TATCGCTCTATGATGAATCTTTTATGGGTGTAAGAACGAAACAAAAGCTGTTTGTAACCG
ATTGTAAATCTCCTTGTTCTCTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CU74JQ C 1
AF RR2CU74TF U 1
BS 1 685 RR2CU74TF

RD RR2CU74JQ 685 0 0
GGAAAACAATATTCCATCTTTGTCCATCTCTCCCTCGAAGAAAACCAAAAAGAAGAAGAG
AAACCATGGCAGGTGTTGGACCGATGACTCAGGATTGGGAACCAGTTGTGATCCGTAAGA
GAGCTCCCAACTCCGCCACCAAGCGCGACGAGAAGACTGTCAACGCCGCTCGTCGTAGCG
GCGCCGATATCGAAACCGTCAGAAAATACAATGCTGCGACGAACAAGGCGGCTTCGAGCA
GCACCTCCTTGAACACAAAGAGGCTTGATGATGATACTGAGAACTTAGCTCATGAACGTG
TGCCTACTGAGTTGAAGAAAGCCATCATGCAAGCCCGAGGGGAGAAGAAGCTCACCCAGT
CCCAGCTCGCTCAACTGATCAACGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAATACGAGTCTGGGA
AAGCAATACCGAATCAGCAGATCCTTTTTAAGCTGGAGAGAGCACTTGGTGCTAAACTCC
GTGGGAAGAAGTAATCACAAAACCTCCTTTGAAGTTTTAAAACTGAAGAAAAGCTAATCA
CGGTTCTGTCTCCAGTTCATAAACTATCTATATATAAAGCCTACTGCTTCAATGGTTTAG
TATCGCTCTATGATGAATCTTTTATGGGTGTAAGAACGAAACAAAAGCTGTTTGTAACCG
ATTGTAAATCTCCTTGTTCTCTTTG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2CU74TF 685 0 0
GGAAAACAATATTCCATCTTTGTCCATCTCTCCCTCGAAGAAAACCAAAAAGAAGAAGAG
AAACCATGGCAGGTGTTGGACCGATGACTCAGGATTGGGAACCAGTTGTGATCCGTAAGA
GAGCTCCCAACTCCGCCACCAAGCGCGACGAGAAGACTGTCAACGCCGCTCGTCGTAGCG
GCGCCGATATCGAAACCGTCAGAAAATACAATGCTGCGACGAACAAGGCGGCTTCGAGCA
GCACCTCCTTGAACACAAAGAGGCTTGATGATGATACTGAGAACTTAGCTCATGAACGTG
TGCCTACTGAGTTGAAGAAAGCCATCATGCAAGCCCGAGGGGAGAAGAAGCTCACCCAGT
CCCAGCTCGCTCAACTGATCAACGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAATACGAGTCTGGGA
AAGCAATACCGAATCAGCAGATCCTTTCTAAGCTGGAGAGAGCACTTGGTGCTAAACTCC
GTGGGAAGAAGTAATCACAAAACCTCCTTTGAAGTTTTAAAACTGAAGAAAAGCTAATCA
CGGTTCTGTCTCCAGTTCATAAACTATCTATATATAAAGCCTACTGCTTCAATGGTTTAG
TATCGCTCTATGATGAATCTTTTATGGGTGTAAGAACGAAACAAAAGCTGTTTGTAACCG
ATTGTAAATCTCCTTGTTCTCTTTG

QA 1 685 1 685
DS 



CO CL2482Contig2 651 2 3 U
GATTCCATCTTTGTCCATCTCTCCCTCGAAGAAAACCAAAAAGAAGAAGAGAAACCATGG
CAGGTGTTGGACCGATGACTCAGGATTGGGAACCAGTTGTGATCCGTAAGAGAGCTCCCA
ACTCCGCCACCAAGCGCGACGAGAAGACTGTCAACGCCGCTCGTCGTAGCGGCGCCGATA
TCGAAACCGTCAGAAAATACAATGCTGCGACGAACAAGGCGGCTTCGAGCAGCACCTCCT
TGAACACAAAGAGGCTTGATGATGATACTGAGAACTTAGCTCATGAACGTGTGCCTACTG
AGTTGAAGAAAGCCATCATGCAAGCCCGAGGGGAGAAGAAGCTCACCCAGTCCCAGCTCG
CTCAACTGATCAACGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAATACGAGTCTGGGAAAGCAATAC
CGAATCAGCAGATCCTTTCTAAGCTGGAGAGAGCACTTGGTGCTAAACTCCGTGGAAAGA
AGTAATCACAAAACCTCCTTTGATGTTAAAAACTGAAAAAGCTAATTATAGTTCTGTCTC
CAGTTCATAAACTATCCCTACTGCTTTAATGGTTTAGTATCGCTCCATGCAATGAATCTT
TTATGGTGTAAGAACGAAACAAAAGCTGTTTGTAACCGGTTGTCATTATAC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ79JQ C 1
AF RR2DQ79TF U 1
BS 1 1 RR2DQ79JQ
BS 2 612 RR2DQ79TF
BS 613 651 RR2DQ79JQ

RD RR2DQ79JQ 651 0 0
GATTCCATCTTTGTCCATCTCTCCCTCGAAGAAAACCAAAAAGAAGAAGAGAAACCATGG
CAGGTGTTGGACCGATGACTCAGGATTGGGAACCAGTTGTGATCCGTAAGAGAGCTCCCA
ACTCCGCCACCAAGCGCGACGAGAAGACTGTCAACGCCGCTCGTCGTAGCGGCGCCGATA
TCGAAACCGTCAGAAAATACAATGCTGCGACGAACAAGGCGGCTTCGAGCAGCACCTCCT
TGAACACAAAGAGGCTTGATGATGATACTGAGAACTTAGCTCATGAACGTGTGCCTACTG
AGTTGAAGAAAGCCATCATGCAAGCCCGAGGGGAGAAGAAGCTCACCCAGTCCCAGCTCG
CTCAACTGATCAACGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAATACGAGTCTGGGAAAGCAATAC
CGAATCAGCAGATCCTTTCTAAGCTGGAGAGAGCACTTGGTGCTAAACTCCGTGGAAAGA
AGTAATCACAAAACCTCCTTTGATGTTAAAAACTGAAAAAGCTAATTATAGTTCTGTCTC
CAGTTCATAAACTATCCCTACTGCTTTAATGGTTTAGTATCGCTCCATGCAATGAATCTT
TTATGGTGTAAGAACGAAACAAAAGCTGTTTGTAACCGGTTGTCATTATAC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2DQ79TF 612 0 0
G
ATTCCATCTTTGTCCATCTCTCCCTCGAAGAAAACCAAAAAGAAGAAGAGAAACCATGGC
AGGTGTTGGACCGATGACTCAGGATTGGGAACCAGTTGTGATCCGTAAGAGAGCTCCCAA
CTCCGCCACCAAGCGCGACGAGAAGACTGTCAACGCCGCTCGTCGTAGCGGCGCCGATAT
CGAAACCGTCAGAAAATACAATGCTGCGACGAACAAGGCGGCTTCGAGCAGCACCTCCTT
GAACACAAAGAGGCTTGATGATGATACTGAGAACTTAGCTCATGAACGTGTGCCTACTGA
GTTGAAGAAAGCCATCATGCAAGCCCGAGGGGAGAAGAAGCTCACCCAGTCCCAGCTCGC
TCAACTGATCAACGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAATACGAGTCTGGGAAAGCAATACC
GAATCAGCAGATCCTTTCTAAGCTGGAGAGAGCACTTGGTGCTAAACTCCGTGGAAAGAA
GTAATCACAAAACCTCCTTTGATGTTAAAAACTGAAAAAGCTAATTATAGTTCTGTCTCC
AGTTCATAAACTATCCCTACTGCTTTAATGGTTTAGTATCGCTCCATGCAATGAATCTTT
TATGGTGTAAG

QA 2 612 2 612
DS 



AS 1 4

CO CL2483Contig1 1039 4 4 U
GCGACCGAAGTGATGAGGAATATTGTTAACTTAACCGTGAGTAGGGTCGTTGCTCTGTTC
TATCTTAGGGGGATGCAGTCTAGTACACGGTTTAGTTTCCAAAGGGCCTTGTCTCGTAAC
CTGGGGAGTGCGTGTTTGGGGTCTTTGTTTGTTCCAACGATTGAAGCCTTGAGAATATTG
GCAAGAGGGTTGAATTTGCTCAAGGGTGAAGATGAGTTCATGTTTTGCTGCGCTAATTGC
TGTCTTAAACTCATGACCTTCATATTTGAGCATGGCAATAGCTGGGCCTTTGTGCAGATA
GCAGCGTATGGGAAAGGGTTTGTGAGAGCGTCACAAGACACATGGAAACTGTTTGAGGAT
GCAGATATGGTTGAGATAGTGGATGCAGACATAACAAGCTCTATATGCTTCCTTACAGGC
ATTTGCAGTGGCTGCGTCTGTGTTATTGTGGCAGCTGCTTGGACATACACAGTTTACAAA
CCTTTTACAGCCACCATCTCCTTACTTGCCTTCTTCATTGGATACCTCATGACGAGAATC
TCAATGGCATTGCCTCACGCCTGCGTAAGTTGCTACTATGCATGCTACGCTGAGAATTCA
GAAAGCAGATTCTTCGACAAAACTATAAGAGAGAGACAAGCTTTGATCAAGAATGGCCGT
GTTGTTGTCCCCACCCCTAGAGTCCGCCGCGCTGTAGCCTAGCCCGGGCCATGGCTCTGC
TTAATCTCTTTGTTTTCCTTCCATGCTTAATTGAAATGGCTAGGTGTTAAATTTTTCAGA
AATAAATAATAGTTTTTTAATTAAAGTTGTATTTAAAACTTGAAAATTAATTTAGTTACA
GTCAGAGTGAAGTGTCAATGACTCACTATTAGTGGATAGATAGACAAGAAGAGCTCATGA
CATGGACACAATCCAACCAATGTGCCAAAATGTTTTTTCTATTTTCTTTGTTGTTGTTGG
GACCCCTCAATTCAATTACTTTCTGTACAAATTTATTTCTTCATTATTTTTTGGTTCCTT
CCTGTAAAAGGGTATATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GN32TF U 1
AF RR2GN32JQ C 434
AF RR2A404JQ C 425
AF RR2A404TF U 425
BS 1 452 RR2GN32TF
BS 453 453 RR2A404TF
BS 454 664 RR2GN32TF
BS 665 1039 RR2A404TF

RD RR2GN32TF 664 0 0
GCGACCGAAGTGATGAGGAATATTGTTAACTTAACCGTGAGTAGGGTCGTTGCTCTGTTC
TATCTTAGGGGGATGCAGTCTAGTACACGGTTTAGTTTCCAAAGGGCCTTGTCTCGTAAC
CTGGGGAGTGCGTGTTTGGGGTCTTTGTTTGTTCCAACGATTGAAGCCTTGAGAATATTG
GCAAGAGGGTTGAATTTGCTCAAGGGTGAAGATGAGTTCATGTTTTGCTGCGCTAATTGC
TGTCTTAAACTCATGACCTTCATATTTGAGCATGGCAATAGCTGGGCCTTTGTGCAGATA
GCAGCGTATGGGAAAGGGTTTGTGAGAGCGTCACAAGACACATGGAAACTGTTTGAGGAT
GCAGATATGGTTGAGATAGTGGATGCAGACATAACAAGCTCTATATGCTTCCTTACAGGC
ATTTGCAGTGGCTGCGTCTGTGTTATTGTGGCGGCTGCTTGGACATACACAGTTTACAAA
CCTTTTACAGCCACCATCTCCTTACTTGCCTTCTTCATTGGATACCTCATGACGAGAATC
TCAATGGCATTGCCTCACGCCTGCGTAAGTTGCTACTATGCATGCTACGCTGAGAATTCA
GAAAGCAGATTCTTCGACAAAACTATAAGAGAGAGACAAGCTTTGATCAAGAATGGCCGT
GTTG

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2GN32JQ 572 0 0
GCGTTTGTGTTATTGTGGGGGCTGCTTGGACATACACAGTTTACAAACCTTTTACAGCCA
CCATTTCCTTACTTGCCTTTTTCATTGGATACCTCATGACGAGAATTTCAATGGCATTGC
CTCACGCCTGGGTAAGTTGCTACTATGCATGGTACGCTGAGAATTCAGAAAGCAGATTTT
TCGACAAAACTATAAGAGAGAGACAAGCTTTGATCAAGAATGGCCGTGTTGTTGTCCCCA
CCCCTAGGGTCCTCCGCGCTGTAGCCTAGCCCGGGCCATGGCTTTGCTTAATTTTTTTGT
TTTCCTTCCATGCTTAATTGAAATGGCTAGGTGTTAAATTTTTCAGAAATAAATAATAGT
TTTTTAATTAAAGTTGTATTTAAAACTTGAAAATTAATTTAGTTACAGTCAGAGTGAAGT
GTCAATGACTCACTATTAGTGGATAGATAGACAAGAAGAGCTCATGACATGGACACAATC
CAACCAATGTGCCAAAATGTTTTTTTTATTTTTTTTGTTGTTGTTGGGACCCCTCAATTC
AATTACTTTCTGTACAAATTTATTTTTTCATT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2A404JQ 615 0 0
GCAGTGGCTGCGTCTGTGTTATTGTGGCAGCTGCTTGGACATACACAGTTTACAAACCTT
TTACAGCCACCATCTCCTTACTTGCCTTCTTCATTGGATACCTCATGACGAGAATCTCAA
TGGCATTGCCTCACGCCTGCGTAAGTTGCTACTATGCATGCTACGCTGAGAATTCAGAAA
GCAGATTCTTCGACAAAACTATAAGAGAGAGACAAGCTTTGATCAAGAATGGCCGTGTTG
TTGTCCCCACCCCTAGAGTCCGCCGCGCTGTAGCCTAGCCCGGGCCATGGCTCTGCTTAA
TCTCTTTGTTTTCCTTCCATGCTTAATTGAAATGGCTAGGTGTTAAATTTTTCAGAAATA
AATAATAGTTTTTTAATTAAAGTTGTATTTAAAACTTGAAAATTAATTTAGTTACAGTCA
GAGTGAAGTGTCAATGACTCACTATTAGTGGATAGATAGACAAGAAGAGCTCATGACATG
GACACAATCCAACCAATGTGCCAAAATGTTTTTTCTATTTTCTTTGTTGTTGTTGGGACC
CCTCAATTCAATTACTTTCTGTACAAATTTATTTCTTCATTATTTTTTGGTTCCTTCCTG
TAAAAGGGTATATTC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2A404TF 615 0 0
GCAGTGGCTGCGTCTGTGTTATTGTGGCAGCTGCTTGGACATACACAGTTTACAAACCTT
TTACAGCCACCATCTCCTTACTTGCCTTCTTCATTGGATACCTCATGACGAGAATCTCAA
TGGCATTGCCTCACGCCTGCGTAAGTTGCTACTATGCATGCTACGCTGAGAATTCAGAAA
GCAGATTCTTCGACAAAACTATAAGAGAGAGACAAGCTTTGATCAAGAATGGCCGTGTTG
TTGTCCCCACCCCTAGAGTCCGCCGCGCTGTAGCCTAGCCCGGGCCATGGCTCTGCTTAA
TCTCTTTGTTTTCCTTCCATGCTTAATTGAAATGGCTAGGTGTTAAATTTTTCAGAAATA
AATAATAGTTTTTTAATTAAAGTTGTATTTAAAACTTGAAAATTAATTTAGTTACAGTCA
GAGTGAAGTGTCAATGACTCACTATTAGTGGATAGATAGACAAGAAGAGCTCATGACATG
GACACAATCCAACCAATGTGCCAAAATGTTTTTTCTATTTTCTTTGTTGTTGTTGGGACC
CCTCAATTCAATTACTTTCTGTACAAATTTATTTCTTCATTATTTTTTGGTTCCTTCCTG
TAAAAGGGTATATTC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 2 4

CO CL2484Contig1 737 2 2 U
GGAGGAAGAAAAAAAGGAAGGAGAATAGAATCATGTTCTTGTTCGATTGGTTCTACGGAA
TCTTGGCGTCGTTAGGTCTATGGCAGAAAGAAGCGAAGATCTTGTTTCTCGGACTCGACA
ATGCTGGAAAAACCACGCTACTTCACGTGCTCAAAGACGAGAGATTGGTTCAGCACCAAC
CGACACAACATCCAACGTCCGAGGAACTTAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTG
ATTTGGGTGGCCATCAGATTGCTCGTCGAGTTTGGAAAGATTACTACGCCAAGGTTGATG
CAGTTGTCTACCTCGTGGATGCTTATGATAAGGAGAGGTTTTCGGAGTCGAAGAAAGAGC
TAGACGCTCTTTTGTCGGATGAATCCCTTTCGACCGTACCGTTTCTGATTCTCGGAAACA
AAATTGATATCCCTTACGCAGCCTCGGAGGACGAGCTTAGGTATCACTTGGGTCTCACCA
ACTTCACCACCGGTAAGGGGAAAGTGACGACGGCTGGTGGGGATTCCGGTGTTCGCCCGC
TCGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAAAATGGGATATGGCGAGGGGTTCAAATGGC
TCTCTCAGTACATCAACTGAAGACATCATTTTCATCGTCTCTGTCTTGTCTTTTTTTTTC
ACATATCAAAACCAAACCAATGAACATGTCCGTACAATTTGAATTTTTCTTTTGAGCTAA
AAGCATTTTATGAATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AC05JQ C 1
AF RR2AC05TF U 1
BS 1 9 RR2AC05JQ
BS 10 737 RR2AC05TF

RD RR2AC05JQ 737 0 0
GGAGGAAGAAAAAAAGGAAGGAGAATAGAATCATGTTCTTGTTCGATTGGTTCTACGGAA
TCTTGGCGTCGTTAGGTCTATGGCAGAAAGAAGCGAAGATCTTGTTTCTCGGACTCGACA
ATGCTGGAAAAACCACGCTACTTCACGTGCTCAAAGACGAGAGATTGGTTCAGCACCAAC
CGACACAACATCCAACGTCCGAGGAACTTAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTG
ATTTGGGTGGCCATCAGATTGCTCGTCGAGTTTGGAAAGATTACTACGCCAAGGTTGATG
CAGTTGTCTACCTCGTGGATGCTTATGATAAGGAGAGGTTTTCGGAGTCGAAGAAAGAGC
TAGACGCTCTTTTGTCGGATGAATCCCTTTCGACCGTACCGTTTTTGATTCTCGGAAACA
AAATTGATATCCCTTACGCAGCCTCGGAGGACGAGCTTAGGTATCACTTGGGTCTCACCA
ACTTCACCACCGGTAAGGGGAAAGTGACGACGGCTGGTGGGGATTCCGGTGTTCGCCCGC
TCGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAAAATGGGATATGGCGAGGGGTTCAAATGGC
TCTCTCAGTACATCAACTGAAGACATCATTTTCATCGTCTCTGTCTTGTCTTTTTTTTTC
ACATATCAAAACCAAACCAATGAACATGTCCGTACAATTTGAATTTTTCTTTTGAGCTAA
AAGCATTTTATGAATTG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2AC05TF 737 0 0
GGAGGAAGA
AAAAAAGGAAGGAGAATAGAATCATGTTCTTGTTCGATTGGTTCTACGGAATCTTGGCGT
CGTTAGGTCTATGGCAGAAAGAAGCGAAGATCTTGTTTCTCGGACTCGACAATGCTGGAA
AAACCACGCTACTTCACGTGCTCAAAGACGAGAGATTGGTTCAGCACCAACCGACACAAC
ATCCAACGTCCGAGGAACTTAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGTG
GCCATCAGATTGCTCGTCGAGTTTGGAAAGATTACTACGCCAAGGTTGATGCAGTTGTCT
ACCTCGTGGATGCTTATGATAAGGAGAGGTTTTCGGAGTCGAAGAAAGAGCTAGACGCTC
TTTTGTCGGATGAATCCCTTTCGACCGTACCGTTTCTGATTCTCGGAAACAAAATTGATA
TCCCTTACGCAGCCTCGGAGGACGAGCTTAGGTATCACTTGGGTCTCACCAACTTCACCA
CCGGTAAGGGGAAAGTGACGACGGCTGGTGGGGATTCCGGTGTTCGCCCGCTCGAGGTCT
TCATGTGCAGCATCGTCAGGAAAATGGGATATGGCGAGGGGTTCAAATGGCTCTCTCAGT
ACATCAACTGAAGACATCATTTTCATCGTCTCTGTCTTGTCTTTTTTTTTCACATATCAA
AACCAAACCAATGAACATGTCCGTACAATTTGAATTTTTCTTTTGAGCTAAAAGCATTTT
ATGAATTG

QA 10 737 10 737
DS 



CO CL2484Contig2 806 2 2 U
ATCAGTTTCTTCTGTGAGGAAGAAAAAAGGGAGGAGAATAGAATCATGTTCTTGTTCGAT
TGGTTCTACGGAATCTTGGCGTCGTTAGGTCTATGGCAGAAAGAAGCGAAGATCTTGTTT
CTCGGACTCGACAATGCAGGAAAAACCACCCTACTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTG
GTTCAGCACCAGCCGACACAGCATCCAACGTCCGAGGAACTTAGCATTGGCAAAATCAAG
TTCAAGGCTTTTGAGTTGGGTGGCCATCAGATTGCTCGTCGAGTTTGGAAAGATTACTAC
GCCAAGGTTGATGCAGTTGTCTACCTCGTGGATGCTTATGATAAGGAGAGGTTTTCGGAG
TCGAAGAAAGAGCTAGACGCTCTTTTGTCGGATGAAGCACTTGCGACCGTACCGTTTCTG
ATTCTCGGAAACAAGATTGATATCCCTTACGCAGCCTCGGAGGACGAGCTTAGGTATCAC
TTGGGTCTCACCAACTTCACCACCGGTAAGGGGAAAGTGACGACGGCTGGTGGAGATTCC
GGTGTTCGCCCGCTCGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGGAAAATGGGATATGGCGAG
GGGTTCAAATGGCTTTCTCAGTATATCAACTGAAGACATCATTTTCATCGTCTCTCTGTC
TTTTTCATATAAACCAAACCCATGAACATGTCCGTACAATTTGATTTTTTTTGAGGTAAA
AGCATTTTATGAATTGAAGATGTCACACTTCCTTTGGTGGCTTGATGTTCATTGTTTGGG
TAAATCTAATATAATGGGACATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT10TF U 1
AF RR2AT10JQ C 133
BS 1 751 RR2AT10TF
BS 752 806 RR2AT10JQ

RD RR2AT10TF 751 0 0
ATCAGTTTCTTCTGTGAGGAAGAAAAAAGGGAGGAGAATAGAATCATGTTCTTGTTCGAT
TGGTTCTACGGAATCTTGGCGTCGTTAGGTCTATGGCAGAAAGAAGCGAAGATCTTGTTT
CTCGGACTCGACAATGCAGGAAAAACCACCCTACTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTG
GTTCAGCACCAGCCGACACAGCATCCAACGTCCGAGGAACTTAGCATTGGCAAAATCAAG
TTCAAGGCTTTTGAGTTGGGTGGCCATCAGATTGCTCGTCGAGTTTGGAAAGATTACTAC
GCCAAGGTTGATGCAGTTGTCTACCTCGTGGATGCTTATGATAAGGAGAGGTTTTCGGAG
TCGAAGAAAGAGCTAGACGCTCTTTTGTCGGATGAAGCACTTGCGACCGTACCGTTTCTG
ATTCTCGGAAACAAGATTGATATCCCTTACGCAGCCTCGGAGGACGAGCTTAGGTATCAC
TTGGGTCTCACCAACTTCACCACCGGTAAGGGGAAAGTGACGACGGCTGGTGGAGATTCC
GGTGTTCGCCCGCTCGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGGAAAATGGGATATGGCGAG
GGGTTCAAATGGCTTTCTCAGTATATCAACTGAAGACATCATTTTCATCGTCTCTCTGTC
TTTTTCATATAAACCAAACCCATGAACATGTCCGTACAATTTGATTTTTTTTGAGGTAAA
AGCATTTTATGAATTGAAGATGTCACACTTC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2AT10JQ 674 0 0
AATGCAGGAAAAACCACCCTACTTCACATGCTCAAAGACGAGAGATTGGTTCAGCACCAG
CCGACACAGCATCCAACGTCCGAGGAACTTAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTT
GAGTTGGGTGGCCATCAGATTGCTCGTCGAGTTTGGAAAGATTACTACGCCAAGGTTGAT
GCAGTTGTCTACCTCGTGGATGCTTATGATAAGGAGAGGTTTTCGGAGTCGAAGAAAGAG
CTAGACGCTCTTTTGTCGGATGAAGCACTTGCGACCGTACCGTTTTTGATTCTCGGAAAC
AAGATTGATATCCCTTACGCAGCCTCGGAGGACGAGCTTAGGTATCACTTGGGTCTCACC
AACTTCACCACCGGTAAGGGGAAAGTGACGACGGCTGGTGGAGATTCCGGTGTTCGCCCG
CTCGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGGAAAATGGGATATGGCGAGGGGTTCAAATGG
CTTTCTCAGTATATCAACTGAAGACATCATTTTCATCGTCTCTCTGTCTTTTTCATATAA
ACCAAACCCATGAACATGTCCGTACAATTTGATTTTTTTTGAGGTAAAAGCATTTTATGA
ATTGAAGATGTCACACTTCCTTTGGTGGCTTGATGTTCATTGTTTGGGTAAATCTAATAT
AATGGGACATTTTG

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 4

CO CL2485Contig1 887 4 16 U
GGGACCTAGAAATACATTTTGATTCTTATCCACAATTCAATCTCTTTCTTCTTCATCATC
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCGTCATCACAGAGCGTTAATGGCGGCTTCGTTCTCAC
TCACGAGCTTCATCTCCTTCATCTCCCCATTCAAATCCCGCACCAAACCAACCCCGCCTC
CAAACCTCACTCTCCCCACTCCAACAACAGTCTCCCACAGACGTAGAAACGATCTCGCCG
TCGAAACAAAGGCCGTGGACGCGGATGAGCCTCCTTACAACGCTTCTCTCTCCTCCTCCG
AGCTCGCCTCCGTTATATGCCCGTCGCTCGCTTACTCGAACACGCTCCTCTTCAGCAGCT
CCGGGTACAACGTGCAGGTGTTCGTGGAGGATAACGAGTCGGAGGAGAGGCTGGTGAATC
GGTTCAGAAGGGAGGTGATGAGGACGGGGGTTATACAGGAATGCAAGAGGAGGAGGTACT
TTGAGAATAAGCAGGACGAGAAGAAGCGGAGGACTCGTGATGCTGCTAAGCGTAACAAGA
AAAGGCGTCCTTTTGCAAAGTTTACTCAAGAGACCAGAGAAGAAGCAGCAGCGGCAGCAA
CCAAGGGTAAGAAGAAGGATGAACAAGAAGATAACTGGGACTGGGAGATGCCTGGCGGAA
ATGTACCTTCTTGAACACGGTATCCTTTTCTGGTTACTGATCACTTTTAATTACTTGGTA
CATTGTAACTTCATATGCGTGTAACTTGCCTCTGGTAATGAGTTCTTGTTAATGTTTAAG
ACATCTATACTTGTCTTCCAATGTTTTGTAATGACTAAAATTACCATTTGGTTCGGAGTT
TTACTCAAGTGGAGATGAATTATGAATGCAGATTGTTCATCTGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2E174TF U 1
AF RR2FD22TF U 41
AF RR2FD22JQ C 156
AF RR2E174JQ C 303
BS 1 57 RR2E174TF
BS 58 58 RR2FD22TF
BS 59 679 RR2E174TF
BS 680 680 RR2FD22TF
BS 681 727 RR2E174TF
BS 728 728 RR2FD22TF
BS 729 743 RR2E174TF
BS 744 744 RR2FD22TF
BS 745 771 RR2E174TF
BS 772 772 RR2FD22TF
BS 773 778 RR2E174TF
BS 779 779 RR2FD22JQ
BS 780 810 RR2E174TF
BS 811 811 RR2FD22JQ
BS 812 821 RR2E174TF
BS 822 887 RR2FD22JQ

RD RR2E174TF 828 0 0
GGGACCTAGAAATACATTTTGATTCTTATCCACAATTCAATCTCTTTCTTCTTCATCTTC
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCGTCATCACAGAGCGTTAATGGCGGCTTCGTTCTCAC
TCACGAGCTTCATCTCCTTCATCTCCCCATTCAAATCCCGCACCAAACCAACCCCGCCTC
CAAACCTCACTCTCCCCACTCCAACAACAGTCTCCCACAGACGTAGAAACGATCTCGCCG
TCGAAACAAAGGCCGTGGACGCGGATGAGCCTCCTTACAACGCTTCTCTCTCCTCCTCCG
AGCTCGCCTCCGTTATATGCCCGTCGCTCGCTTACTCGAACACGCTCCTCTTCAGCAGCT
CCGGGTACAACGTGCAGGTGTTCGTGGAGGATAACGAGTCGGAGGAGAGGCTGGTGAATC
GGTTCAGAAGGGAGGTGATGAGGACGGGGGTTATACAGGAATGCAAGAGGAGGAGGTACT
TTGAGAATAAGCAGGACGAGAAGAAGCGGAGGACTCGTGATGCTGCTAAGCGTAACAAGA
AAAGGCGTCCTTTTGCAAAGTTTACTCAAGAGACCAGAGAAGAAGCAGCAGCGGCAGCAA
CCAAGGGTAAGAAGAAGGATGAACAAGAAGATAACTGGGACTGGGAGATGCCTGGCGGAA
ATGTACCTTCTTGAACACG*TATCCTTTTCTGGTTACTGATCACTTTTAATTACTTGGTA
CATTGTA*CTTCATATGCGTGTA*CTTGCCTCTGGTAATGAGTTCTTGTTA*TGTTTA*G
ACATCTATACTTGTCTTCCAATGTTTTGTA*TGACTAAAAT
ACATTTG

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR2FD22TF 762 0 0
GAATCTCT
TTCTTCTTCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCGTCATCACAGAGCGTTAATGGCGG
CTTCGTTCTCACTCACGAGCTTCATCTCCTTCATCTCCCCATTCAAATCCCGCACCAAAC
CAACCCCGCCTCCAAACCTCACTCTCCCCACTCCAACAACAGTCTCCCACAGACGTAGAA
ACGATCTCGCCGTCGAAACAAAGGCCGTGGACGCGGATGAGCCTCCTTACAACGCTTCTC
TCTCCTCCTCCGAGCTCGCCTCCGTTATATGCCCGTCGCTCGCTTACTCGAACACGCTCC
TCTTCAGCAGCTCCGGGTACAACGTGCAGGTGTTCGTGGAGGATAACGAGTCGGAGGAGA
GGCTGGTGAATCGGTTCAGAAGGGAGGTGATGAGGACGGGGGTTATACAGGAATGCAAGA
GGAGGAGGTACTTTGAGAATAAGTAGGACGAGAAGAAGCGGAGGACTCGTGATGCTGCTA
AGCGTAACAAGAAAAGGCGTCCTTTTGCAAAGTTTACTCAAGAGACCAGAGAAGAAGCAG
CAGCGGCAGCAACCAAGGGTAAGAAGAAGGATGAACAAGAAGATAACTGGGACTGGGAGA
TGCCTGGCGGAAATGTACCTTCTTGAACACGGTATCCTTTTCTGGTTACTGATCACTTTT
AATTACTTGGTACATTGTAACTTCATATGCGTGTAACTTGCCTCTGGTAATGAGTTCTTG
TTAATGTTTA*GACATCTATACTTGTCTTCCA
TG

QA 9 760 9 760
DS 

RD RR2FD22JQ 732 0 0
TCCCGCACCAAACCAACCCCGCCTCCAAACCTCACTCTCCCCACTCCAACAACAGTCTCC
CACAGACGTAGAAACGATCTCGCCGTCGAAACAAAGGCCGTGGACGCGGATGAGCCTCCT
TACAACGCTTCTCTCTCCTCCTCCGAGCTCGCCTCCGTTATATGCCCGTCGCTCGCTTAC
TCGAACACGCTCCTCTTCAGCAGCTCCGGGTACAACGTGCAGGTGTTCGTGGAGGATAAC
GAGTCGGAGGAGAGGCTGGTGAATCGGTTCAGAAGGGAGGTGATGAGGACGGGGGTTATA
CAGGAATGCAAGAGGAGGAGGTACTTTGAGAATAAGTAGGACGAGAAGAAGCGGAGGACT
CGTGATGCTGCTAAGCGTAACAAGAAAAGGCGTCCTTTTGCAAAGTTTACTCAAGAGACC
AGAGAAGAAGCAGCAGCGGCAGCAACCAAGGGTAAGAAGAAGGATGAACAAGAAGATAAC
TGGGACTGGGAGATGCCTGGCGGAAATGTACCTTCTTGAACACGGTATCCTTTTCTGGTT
ACTGATCACTTTTAATTACTTGGTACATTGTAACTTCATATGCGTGTAACTTGCCTCTGG
TAATGAGTTCTTGTTAATGTTTAAGACATCTATACTTGTCTTCCAATGTTTTGTAATGAC
TAAAATTACCATTTGGTTCGGAGTTTTACTCAAGTGGAGATGAATTATGAATGCAGATTG
TTCATCTGGTTT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2E174JQ 585 0 0
CTCGCCTCCGTTATATGCCCGTCGCTCGCTTACTCGAACACGCTCCTCTTCAGCAGCTCC
GGGTACAACGTGCAGGTGTTCGTGGAGGATAACGAGTCGGAGGAGAGGCTGGTGAATCGG
TTCAGAAGGGAGGTGATGAGGACGGGGGTTATACAGGAATGCAAGAGGAGGAGGTACTTT
GAGAATAAGCAGGACGAGAAGAAGCGGAGGACTCGTGATGCTGCTAAGCGTAACAAGAAA
AGGCGTCCTTTTGCAAAGTTTACTCAAGAGACCAGAGAAGAAGCAGCAGCGGCAGCAACC
AAGGGTAAGAAGAAGGATGAACAAGAAGATAACTGGGACTGGGAGATGCCTGGCGGAAAT
GTACCTTCTTGAACACGGTATCCTTTTCTGGTTACTGATCACTTTTAATTACTTGGTACA
TTGTAACTTCATATGCGTGTAACTTGCCTCTGGTAATGAGTTCTTGTTAATGTTTAAGAC
ATCTATACTTGTCTTCCAATGTTTTGTAATGACTAAAATTACCATTTGGTTCGGAGTTTT
ACTCAAGTGGAGATGAATTATGAATGCAGATTGTTCATCTGGTTT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 4

CO CL2486Contig1 937 4 27 U
GACAAATTGGTGGCTAGGGACACTGGTCTTCCATCTACAGCACCACTGCTAAGGGGATAT
GCAAAGGTTGAGCCTGTGACAATTCCTGAGCTCAATGATTTTATCATCACTGCCCTGTCA
CAGCTATCGTGTTGAGATGGTTGTAGAGGATGATACTGCTGAAGGGACATTCGTTTGTTT
CGATGGTGAGATGACGAATCTACACAACCTTAGAGCAAGTGAAGCTGGTCAGCTGTTAGT
AAGATATGCGTTTGACTCATTACATGGTTATCACATAACGGTCACTAGCTCATCTGTTAA
TTCCGTCTGACAACAAGACCGAAGGAGTGAACCCTGAGGACTCTAAGATACCTCCGTTCA
TTGCAGACATGCGTACACTTTCAAAGCCAGAGTCACTTCATATAACTTCACCGCCCATCA
TCAGACTTTCACCATATCATGCATCATCAATGAGATTGACCATGCGCCAGCCCCCAACTT
CGTCGAGAATGTGGGTGATGACGATGATGATGACGATGACCCGGATGGCAGGCTAAGTCA
TGGATCACTTACATCCGGCAGTGGCGGTTGTGAGGCATCTAAGAGTACTGGAAAAAAGCC
AGTTGGTGATGCGCATAAGACGGATGCCACGACTTCCAAGGTGGTCAAGAAGGCCTGTGT
TGCTTGAGGTGGAGTTCCAGCAATTTTGTTTTCATGCTCTGTATTTTAATAATGCATATG
CTTTTTTCTTTACTTTCGCAACTTAGCTATCTATGTTTTTGATTTTTCCTTTCTGGTTTT
TTCCTCTATGAATGTTCTGAGGTGGTTTAGCAGCCTCCTTAGATAGAGTTCTTTAATTTT
GGTGATTTCTGTATTATGTGTCTTTGACTATCAGTCAAATTCGTATTTTAAGTATTTTAT
TTTCTATGTTTGGGAAAAAAAAAGTAAACTTTTAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ40TF U 1
AF RR2CO33JQ C 106
AF RR2CO33TF U 106
AF RR2DQ40JQ C 213
BS 1 128 RR2DQ40TF
BS 129 129 RR2CO33TF
BS 130 150 RR2DQ40TF
BS 151 151 RR2CO33TF
BS 152 163 RR2DQ40TF
BS 164 164 RR2CO33TF
BS 165 168 RR2DQ40TF
BS 169 169 RR2CO33TF
BS 170 358 RR2DQ40TF
BS 359 359 RR2CO33TF
BS 360 368 RR2DQ40TF
BS 369 369 RR2CO33TF
BS 370 386 RR2DQ40TF
BS 387 387 RR2CO33TF
BS 388 424 RR2DQ40TF
BS 425 425 RR2CO33TF
BS 426 475 RR2DQ40TF
BS 476 476 RR2CO33TF
BS 477 640 RR2DQ40TF
BS 641 781 RR2CO33TF
BS 782 782 RR2CO33JQ
BS 783 791 RR2CO33TF
BS 792 792 RR2CO33JQ
BS 793 801 RR2CO33TF
BS 802 802 RR2CO33JQ
BS 803 834 RR2CO33TF
BS 835 937 RR2DQ40JQ

RD RR2DQ40TF 646 0 0
GACAAATTGGTGGCTAGGGACACTGGTCTTCCATCTACAGCACCACTGCTAAGGGGATAT
GCAAAGGTTGAGCCTGTGACAATTCCTGAGCTCAATGATTTTATCATCACTGCCCTGTCA
CAGCTATCATGTTGAGATGGTTGTAGAGGACGATACTGCTGAATGGACTTTCGTTTGTTT
CGATGGTGAGATGACGAATCTACACAACCTTAGAGCAAGTGAAGCTGGTCAGCTGTTAGT
AAGATATGCGTTTGACTCATTACATGGTTATCACATAACGGTCACTAGCTCATCTGTTAA
TTCCGTCTGACAACAAGACCGAAGGAGTGAACCCTGAGGACTCTAAGATACCTCCGTTTA
TTGCAGACTTGCGTACACTTTCAAAGTCAGAGTCACTTCATATAACTTCACCGCCCATCA
TCAGTCTTTCACCATATCATGCATCATCAATGAGATTGACCATGCGCCAGCCCCCGACTT
CGTCGAGAATGTGGGTGATGACGATGATGATGACGATGACCCGGATGGCAGGCTAAGTCA
TGGATCACTTACATCCGGCAGTGGCGGTTGTGAGGCATCTAAGAGTACTGGAAAAAAGCC
AGTTGGTGATGCGCATAAGACGGATGCCACGACTTCCAAG
TGGTCA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2CO33JQ 729 0 0
TTTTTTATTTCTCCTT
AGCTATCGTGTTGAGATGGTTGTAGAGGATGATACTGCTGAAGGGACATTCGTTTGTTTC
GATGGTGAGATGACGAATCTACACAACCTTAGAGCAAGTGAAGTTGGTCGGCTGTTAGTA
AGATATGCGTTTGACTCATTACATGGTTATCACATAACGGTCACTAGCTCATCTGTTAAT
TCCGTCTGACAACAAGGCCGAAGGAGTGAACCCTGAGGACTCTAAGATACCTCCGTTCAT
TGCAGACATGCGTACACTTTCAAAGCCAGAGTCACTTCATATAACTTCACCGCCCATCAT
CAGACTTTCACCATATCATGCATCATCAATGAGATTGACTATGCGCCAGCCCCCAACTTC
GTCGAGAATGTGGGTGATGACGATGGTGATGACGATGACCCGGATGGCAGGCTAAGTCAT
GGATCACTTACATCCGGCAGTGGCGGTTGTGAGGCATCTAAGAGTACTGGAAAAAAGCCA
GTTGGTTATGCGCATAAGACGGATGCGACGACTTCCAAGGTGGTCAAGAAGGCCTGTGTT
GCTTGAGGTGGAGTTCCAGCAATTTTGTTTTCATGCTCTGTATTTTAATAATGCATATGC
TTTTTTCTTTACTTTCGCAACTTAGCTATCTATGTTTTTGATTTTTCCTTTCTGGTTTTT
TCCTCTATGAATGTTCTGAGGTGGTTTAGCAGCCTCCTTAGATAGAGTTCTTT

QA 17 729 17 729
DS 

RD RR2CO33TF 729 0 0
TTTTTTATTTCTCCTT
AGCTATCGTGTTGAGATGGTTGTAGAGGATGATACTGCTGAAGGGACATTCGTTTGTTTC
GATGGTGAGATGACGAATCTACACAACCTTAGAGCAAGTGAAGTTGGTCGGCTGTTAGTA
AGATATGCGTTTGACTCATTACATGGTTATCACATAACGGTCACTAGCTCATCTGTTAAT
TCCGTCTGACAACAAGGCCGAAGGAGTGAACCCTGAGGACTCTAAGATACCTCCGTTCAT
TGCAGACATGCGTACACTTTCAAAGCCAGAGTCACTTCATATAACTTCACCGCCCATCAT
CAGACTTTCACCATATCATGCATCATCAATGAGATTGACTATGCGCCAGCCCCCAACTTC
GTCGAGAATGTGGGTGATGACGATGGTGATGACGATGACCCGGATGGCAGGCTAAGTCAT
GGATCACTTACATCCGGCAGTGGCGGTTGTGAGGCATCTAAGAGTACTGGAAAAAAGCCA
GTTGGTTATGCGCATAAGACGGATGCGACGACTTCCAAGGTGGTCAAGAAGGCCTGTGTT
GCTTGAGGTGGAGTTCCAGCAATTTTGTTTTCATGCTCTGTATTTTAATAATGCATATGC
TTTTTTCTTTACTTTCGCAACTTAGCTATCTATGTTTTTGATTTTTCCTTTCTGGTTTTT
*CCTCTATGA*TGTTCTGAG*TGGTTTAGCAGCCTCCTTAGATAGAGTTCTTT

QA 17 729 17 729
DS 

RD RR2DQ40JQ 725 0 0
GAGCAAGTGAAGCTGGTCAGCTGTTAGTAAGATATGCGTTTGACTCATTACATGGTTATC
ACATAACGGTCACTAGCTCATCTGTTAATTCCGTCTGACAACAAGACCGAAGGAGTGAAC
CCTGAGGACTCTAAGATACCTCCGTTTATTGCAGACTTGCGTACACTTTCAAAGTCAGAG
TCACTTCATATAACTTCACCGCCCATCATCAGTCTTTCACCATATCATGCATCATCAATG
AGATTGACCATGCGCCAGCCCCCGACTTCGTCGAGAATGTGGGTGATGACGATGATGATG
ACGATGACCCGGATGGCAGGCTAAGTCATGGATCACTTACATCCGGCAGTGGCGGTTGTG
AGGCATCTAAGAGTACTGGAAAAAAGCCAGTTGGTGATGCGCATAAGACGGATGCCACGA
CTTCCAAGGTGGTCAAGAAGGCCTGTGTTGCTTGAGGTGGAGTTCCAGCAATTACGTTTT
CATGCTCTGGATTTTAATAATGCATATGCTTTTTTCTTTACTTTCGCAACTTAGCTATCT
ATGTTTTTGATTTTTCTTTTCTGTTTTTTTCCTCTATGAATGTTCTGAGGTGGTTTAGCA
GCCTCCTTAGATAGAGTTCTTTAATTTTGGTGATTTCTGTATTATGTGTCTTTGACTATC
AGTCAAATTCGTATTTTAAGTATTTTATTTTCTATGTTTGGGAAAAAAAAAGTAAACTTT
TAACG

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 3

CO CL2487Contig1 886 3 28 U
CCGGAAACGCATTCTATGGATATAATTGCGTAAATATTATTATGACAATTATCAGCTAAG
ATAATTATACTGATATCTCCAAAAGACAGAATGATTATAATACACAGAAGAATGATTTGA
TTAAAAGAATGATGCTAGGAACACCATTAAAACTAAACATAAAAAATTATATTCTGTAAC
GGAAGAAGAACTTTTACGACCCTTAACCAAACTATCATCATCATCACTCTCAATATCTTT
AGGATGGTCAAAATTGGCGGGAACTATGGTATCTGGAGCAACTTCATCATCATCACCGGA
TTGAGATGATTGACCTGGTCCAGGGGCCGTTTCACCATCTTCATCTGGTGATGGTAGGCC
CTGGCCATGTGTTACATTTATCATGAAATGCTGTCCAAATTTACATTGCTCACCGTCATA
ATTTCCTGAGAAGAAATAATTGGAACCTTCTTTAACTAGAGGAACACTAACTGAGACCGG
AACTGGAGATGTCGCTGAAGGGTTTGCAGCCGACCACTCTGTTGTACTATTGTCTTCACC
ATTGTTGTAGTCACATCCTTTGTAAGTTTTGAAATCATATGTTTGTACCACCGAATGGTT
GCTATCTGTGTTGAAAATGAGGAAATCACCCAAAGAAAAGGTTTTGGAATCAGCCCATTT
CTGATAATTTGCAGACGGTCTCTCCTGGATATCGAACCATCCCGTGGACCCTCCCACAGT
ATAGTTCTTGTACGCATCAGCCGACAAACTCAGAAGCATAAGGAGCACGATGAGTAACAC
ATTAGCACAAGATGATGAAGATCCCGTGTAGTATGACATAACTCTTGTTCTTCCCCTCTT
TTCCACTTCCGATTTTCTTGATTCTAGACACTTTTCTTTGCTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GM36JQ U 1
AF RR2B224JQ U 100
AF RR2B224TF C 100
BS 1 106 RR2GM36JQ
BS 107 107 RR2B224JQ
BS 108 113 RR2GM36JQ
BS 114 114 RR2B224JQ
BS 115 142 RR2GM36JQ
BS 143 143 RR2B224JQ
BS 144 144 RR2GM36JQ
BS 145 145 RR2B224JQ
BS 146 162 RR2GM36JQ
BS 163 163 RR2B224JQ
BS 164 173 RR2GM36JQ
BS 174 174 RR2B224JQ
BS 175 201 RR2GM36JQ
BS 202 202 RR2B224JQ
BS 203 306 RR2GM36JQ
BS 307 307 RR2B224JQ
BS 308 334 RR2GM36JQ
BS 335 335 RR2B224JQ
BS 336 338 RR2GM36JQ
BS 339 339 RR2B224JQ
BS 340 363 RR2GM36JQ
BS 364 364 RR2B224JQ
BS 365 420 RR2GM36JQ
BS 421 421 RR2B224JQ
BS 422 556 RR2GM36JQ
BS 557 557 RR2B224JQ
BS 558 617 RR2GM36JQ
BS 618 886 RR2B224JQ

RD RR2GM36JQ 617 0 0
CCGGAAACGCATTCTATGGATATAATTGCGTAAATATTATTATGACAATTATCAGCTAAG
ATAATTATACTGATATCTCCAAAAGACAGAATGATTATAATACACACAAGAATAATTTGA
TTAAAAGAATGATGCTAGGAACCCTATTAAAACTAAACATAACAAATTATATTTTGTAAC
GGAAGAAGAACTTTTACGACCTTTAACCAAACTATCATCATCATCACTCTCAATATCTTT
AGGATGGTCAAAATTGGCGGGAACTATGGTATCTGGAGCAACTTCATCATCATCACCGGA
TTGAGAGGATTGACCTGGTCCAGGGGCCGTTTCATCATTTTCATCTGGTGATGGTAGGCC
CTGACCATGTGTTACATTTATCATGAAATGCTGTCCAAATTTACATTGCTCACCGTCATA
GTTTCCTGAGAAGAAATAATTGGAACCTTCTTTAACTAGAGGAACACTAACTGAGACCGG
AACTGGAGATGTCGCTGAAGGGTTTGCAGCCGACCACTCTGTTGTACTATTGTCTTCACC
ATTGTTGTAGTCACATTCTTTGTAAGTTTTGAAATCATATGTTTGTACCACCGAATGGTT
GCTATCTGTGTTGAAAA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2B224JQ 787 0 0
GC
ACACAGAAGAATGATTTGATTAAAAGAATGATGCTAGGAACACCATTAAAACTAAACATA
AAAAATTATATTCTGTAACGGAAGAAGAACTTTTACGACCCTTAACCAAACTATCATCAT
CATCACTCTCAATATCTTTAGGATGGTCAAAATTGGCGGGAACTATGGTATCTGGAGCAA
CTTCATCATCATCACCGGATTGAGATGATTGACCTGGTCCAGGGGCCGTTTCACCATCTT
CATCTGGTGATGGTAGGCCCTGGCCATGTGTTACATTTATCATGAAATGCTGTCCAAATT
TACATTGCTCACCGTCATAATTTCCTGAGAAGAAATAATTGGAACCTTCTTTAACTAGAG
GAACACTAACTGAGACCGGAACTGGAGATGTCGCTGAAGGGTTTGCAGCCGACCACTCTG
TTGTACTATTGTCTTCACCATTGTTGTAGTCACATCCTTTGTAAGTTTTGAAATCATATG
TTTGTACCACCGAATGGTTGCTATCTGTGTTGAAAATGAGGAAATCACCCAAAGAAAAGG
TTTTGGAATCAGCCCATTTCTGATAATTTGCAGACGGTCTCTCCTGGATATCGAACCATC
CCGTGGACCCTCCCACAGTATAGTTCTTGTACGCATCAGCCGACAAACTCAGAAGCATAA
GGAGCACGATGAGTAACACATTAGCACAAGATGATGAAGATCCCGTGTAGTATGACATAA
CTCTTGTTCTTCCCCTCTTTTCCACTTCCGATTTTCTTGATTCTAGACACTTTTCTTTGC
TATCC

QA 3 787 3 787
DS 

RD RR2B224TF 787 0 0
GC
ACACAGAAGAATGATTTGATTAAAAGAATGATGCTAGGAACACCATTAAAACTAAACATA
AAAAATTATATTCTGTAACGGAAGAAGAACTTTTACGACCCTTAACCAAACTATCATCAT
CATCACTCTCAATATCTTTAGGATGGTCAAAATTGGCGGGAACTATGGTATCTGGAGCAA
CTTCATCATCATCACCGGATTGAGATGATTGACCTGGTCCAGGGGCCGTTTCACCATCTT
CATCTGGTGATGGTAGGCCCTGGCCATGTGTTACATTTATCATGAAATGCTGTCCAAATT
TACATTGCTCACCGTCATAATTTCCTGAGAAGAAATAATTGGAACCTTCTTTAACTAGAG
GAACACTAACTGAGACCGGAACTGGAGATGTCGCTGAAGGGTTTGCAGCCGACCACTCTG
TTGTACTATTGTCTTCACCATTGTTGTAGTCACATCCTTTGTAAGTTTTGAAATCATATG
TTTGTACCACCGAATGGTTGCTATCTGTGTTGAAAATGAGGAAATCACCCAAAGAAAAGG
TTTTGGAATCAGCCCATTTCTGATAATTTGCAGACGGTCTCTCCTGGATATCGAACCATC
CCGTGGACCCTCCCACAGTATAGTTCTTGTACGCATCAGCCGACAAACTCAGAAGCATAA
GGAGCACGATGAGTAACACATTAGCACAAGATGATGAAGATCCCGTGTAGTATGACATAA
CTCTTGTTCTTCCCCTCTTTTCCACTTCCGATTTTCTTGATTCTAGACACTTTTCTTTGC
TATCC

QA 3 787 3 787
DS 



AS 1 2

CO CL2488Contig1 689 2 8 U
GGGAGCCGTGTCCGTTAAAGTCCTCTCCTTTCCGACTTTATCGCGAACGCCGAATCACAA
ATGGAAGGAGAAGATGAGCTCCGGAGACCAAACGGCGAGGTTTCGTCTCAACGAGACACA
GTCGTAGAAGATGACGATCCGTTAGTATTGAGCTCTCAAGCATTGGCGGCGCTCCAGGAG
TTTCTAGCCGACCAGAACAAGACCGTCACAGTGACGCCGCCACCTTCTTCCCTCACCGGT
GAAGATGATTCCGCTAAAGTGGAGCTAGTCACGGAGGACTGGAGACTAAGCCAGTTCTGG
TACGAACCTGAAACCGCAGAGACTGTAGCCGAGGAAGTGGTCACTCTCTCGAGTAGATTC
TCGGGCTGTAGAGTCGCTTGCATCGCTTGCCCTACTCTTTACGTGTATCTCAAGAAGAAG
GATCCGAGTCTACAGGTACAGTTGCTAGAGTACGATATGAGGTTTGAGAGATATGGAAGT
GAGTTCACCTTTTATGATTACAACGAACCCGAAGATTTGCCGCTTCAGCTGAAACATTGC
TTCCATATAATCGTTGCAGATCCTCCCTACCTGAGTAAGGAATGTTTGGAAAGAGTTACT
CAAACGGTTTCGTTTCTGGCGAGTCCAGTGGATTCTTTGTTGCTTCTTCTCACAGGAGAT
GTGCAGAGAGATAGGGCGGCTGATCTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW23TF U 1
AF RR2A536TF U 22
BS 1 196 RR2BW23TF
BS 197 197 RR2A536TF
BS 198 437 RR2BW23TF
BS 438 438 RR2A536TF
BS 439 444 RR2BW23TF
BS 445 445 RR2A536TF
BS 446 645 RR2BW23TF
BS 646 689 RR2A536TF

RD RR2BW23TF 651 0 0
GGGAGCCGTGTCCGTTAAAGTCCTCTCCTTTCCGACTTTATCGCGAACGCCGAATCACAA
ATGGAAGGAGAAGATGAGCTCCGGAGACCAAACGGCGAGGTTTCGTCTCAACGAGACACA
GTCGTAGAAGATGACGATCCGTTAGTATTGAGCTCTCAAGCATTGGCGGCGCTCCAGGAG
TTTCTAGCCGACCAGAGCAAGACCGTCACAGTGACGCCGCCACCTTCTTCCCTCACCGGT
GAAGATGATTCCGCTAAAGTGGAGCTAGTCACGGAGGACTGGAGACTAAGCCAGTTCTGG
TACGAACCTGAAACCGCAGAGACTGTAGCCGAGGAAGTGGTCACTCTCTCGAGTAGATTC
TCGGGCTGTAGAGTCGCTTGCATCGCTTGCCCTACTCTTTACGTGTATCTCAAGAAGAAG
GATCCGAGTCTACAGGTGCAGTTGTTAGAGTACGATATGAGGTTTGAGAGATATGGAAGT
GAGTTCACCTTTTATGATTACAACGAACCCGAAGATTTGCCGCTTCAGCTGAAACATTGC
TTCCATATAATCGTTGCAGATCCTCCCTACCTGAGTAAGGAATGTTTGGAAAGAGTTACT
CAAACGGTTTCGTTTCTGGCGAGTCCAGTGGATTCTTTGTTGCTT
CTTCTC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2A536TF 668 0 0
GG
TCTCCTTTCCGACTTTATCGCGAACGCCGAATCACAAATGGAAGGAGAAGATGAGCTCCG
GAGACCAAACGGCGAGGTTTCGTCTCAACGAGACACAGTCGTAGAAGATGACGATCCGTT
AGTATTGAGCTCTCAAGCATTGGCGGCGCTCCAGGAGTTTCTAGCCGACCAGAACAAGAC
CGTCACAGTGACGCCGCCACCTTCTTCCCTCACCGGTGAAGATGATTCCGCTAAAGTGGA
GCTAGTCACGGAGGACTGGAGACTAAGCCAGTTCTGGTACGAACCTGAAACCGCAGAGAC
TGTAGCCGAGGAAGTGGTCACTCTCTCGAGTAGATTCTCGGGCTGTAGAGTCGCTTGCAT
CGCTTGCCCTACTCTTTACGTGTATCTCAAGAAGAAGGATCCGAGTCTACAGGTACAGTT
GCTAGAGTACGATATGGGGTTTGAGAGATATGGAAGTGAGTTCACCTTTTATGATTACAA
CGAACCCGAAGATTTGCCGCTTCAGCTGAAACATTGCTTCCATATAATCGTTGCAGATCC
TCCCTACCTGAGTAAGGAATGTTTGGAAAGAGTTACTCAAACGGTTTCGTTTCTGGCGAG
TCCAGTGGATTCTTTGTTGCTTCTTCTCACAGGAGATGTGCAGAGAGATAGGGCGGCTGA
TCTATT

QA 3 668 3 668
DS 



AS 1 4

CO CL2489Contig1 1495 4 21 U
GTAAAAATAAGCAGAACAATAAGAAGCTACCCAAGGCCGAGACTGATAATACAGGACTTT
TTGAAGCATAGTTTGACCAAATCGACAAATTCTATAATTCAGACCAGTTCATTGAGAACA
CACGATACAAAATGAAAAATAAGACACAAACCAAACCGAAGAACATTTTAAAAAGAAAAA
GAAAAAGCAAACCACCACCCAAAACTTGATATCATATAAACTAGACCATGACTCTCCAAA
TTAAGAAACACGACCTAGTCTCAAAGACCTGACTCTTTTCTTTCTTCTTCTTCATAAATA
AGAAGCAGCTTCTTCGCCGGTAAAGAAGACTTCCTCACTGCTGCTTACACTCCGGTGGTC
TCTCACCTTGTTGACCTTCGGCAAGCTGACTTCTTCCAGACTTCTTGTGACCAGCTGATG
ACTTCTTTCCGCTCTTCTTTCCTTGTTCTTCTTCCTCGTCCTCATCCTCATCTTCGTCCT
CGTCCTCCTCATCATCTTCCTCGTCCTCATCATCATCTTCATCAATGTCATCATCATCCA
TCTCAAGGTCATCTGGGTCAACAGCTTCCCCAGTGAACCATGACACCGCATGCGAGATGA
TTTTCTCTTTAATGGTTGATCCAATATCATAGTCGTGCTCCATTTGACCTTGAAGCTCCT
CAGCCATGTCATCATCAAGATCGTCCTCGTCATCAGGAACTTGAGGTGGACTGAAAAAGT
TGAAGAAACTCTCACAGTCCTCAGTCTTAGTGATCGGCTTTGTGTTTTTAGATCCCTTCT
TCGGCTTCTTTTTAAGGATCTTCTGAGTCAAACATTTTCCAGGATACCACTCGATCTCCG
TTCCAATGGCCTTTTCGAGGATAGGCTCATCTTCATCAATCATGTGATATGTCTTGGACA
AGACAGTGTTCTTGAAGTAAGGATTCTCATCAAAGAAAAACTCGAGCTTGAACCCTTTTG
GTTCCTCAACCTTGTTCCACTTGATGTCTGTGAGATACTTGAGAGCTCCTTCATCCCGCT
CAGTTATCTCCTCAGCGGTAATTTCATTGTTCTTCAGTGAAATAAGCCAGAAATAAGGTA
CTCCTTTCTCTTCAGCGGCTTTATCTCCTCCTTGTTCAGATTTCACTTCTTCTGGTGCAC
CTTCAACTTCAACCACACCGGTGACAATTTCATATCGCTTGGTATAGAAAGGCTGATACA
ATTTCTGATATTTAGCTTCTAGAGCTGCCCTCTCCTCGAAAAACTTGGCTTCGATTTCAT
CATGTTGGTTCCGAATCTCTCTAAGAACCTCGACACGCTTCCTGACGGCAGGAAGCAAGT
TCTCAAGGACATCAGAGTGTTGTCCAGCCAAATTCTGCAACTTGTTCTTAAGAGCATTGA
CAAGTCCAGCTCTATCCTCCTCGTTAAGAGCGGCAGTGAGATCGGACATGTTCAAGTTGT
TGACCTTGTCACTGCTCATCTTGGCGAGAGTAAAAGAGAAGAGAGAGTCAGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E327JQ U 1
AF RR2A822JQ U 45
AF RR2A822TF C 794
AF RR2E327TF C 805
BS 1 331 RR2E327JQ
BS 332 332 RR2A822JQ
BS 333 544 RR2E327JQ
BS 545 848 RR2A822JQ
BS 849 922 RR2A822TF
BS 923 923 RR2E327TF
BS 924 952 RR2A822TF
BS 953 953 RR2E327TF
BS 954 989 RR2A822TF
BS 990 990 RR2E327TF
BS 991 1003 RR2A822TF
BS 1004 1004 RR2E327TF
BS 1005 1015 RR2A822TF
BS 1016 1016 RR2E327TF
BS 1017 1059 RR2A822TF
BS 1060 1060 RR2E327TF
BS 1061 1414 RR2A822TF
BS 1415 1415 RR2E327TF
BS 1416 1450 RR2A822TF
BS 1451 1451 RR2E327TF
BS 1452 1495 RR2A822TF

RD RR2E327JQ 547 0 0
GTAAAAATAAGCAGAACAATAAGAAGCTACCCAAGGCCGAGACTGATAATACAGGACTTT
TTGAAGCATAGTTTGACCAAATCGACAAATTCTATAATTCAGACCAGTTCATTGAGAACA
CACGATACAAAATGAAAAATAAGACACAAACCAAACCGAAGAACATTTTAAAAAGAAAAA
GAAAAAGCAAACCACCACCCAAAACTTGATATCATATAAACTAGACCATGACTCTCCAAA
TTAAGAAACACGACCTAGTCTCAAAGACCTGACTCTTTTCTTTCTTCTTCTTCATAAATA
AGAAGCAGCTTCTTCGCCGGTAAAGAAGACT*CCTCACTGCTGCTTACACTCCGGTGGTC
TCTCACCTTGTTGACCTTCGGCAAGCTGACTTCTTCCAGACTTCTTGTGACCAGCTGATG
ACTTCTTTCCGCTCTTCTTTCCTTGTTCTTCTTCCTCGTCCTCATCCTCATCTTCGTCCT
CGTCCTCCTCATCATCTTCCTCGTCCTCATCATCATCTTCATCAATGTCATCATCATCCA
TCTC
GAG

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2A822JQ 804 0 0
GATAATACTGGACTTTTTGAAGCATAGTTTGACCAAATCGACAAGTTCTATAATTCAGAC
CAGTTCATTGAGAACACACGATACAAAATGAAAAATAAGACACAAACCAAACCGAAGAAC
ATTTTAAAAAGAAAAA*AAAAAGCAAACCACCGCCCAAAACTTGATATCATATAAACTAG
ACCATGACTT**CAAATTAAGAAACACGACCTAGTCTCAAAGACCTGACTCTTTTCTTTC
TTCTTCTTCATAAATAAGAAGCAGCTTCTTCGCCGGTAAAGAAGTCTTCCTCACTGCTGC
TTACACTCCGGTGGTCTCTCACCTTGTTGACCTTCGGCAAGCTGACTTCTTCCAGACTTC
TTGTGACCAGCTGATGACTTCTTTCCGCTCTTCTTTCCTTGTTCTTCTTCCTCGTCCTCA
TCCTCATCTTCGTCCTCGTCCTCCTCATCATCTTCCTCGTCCTCATCATCATCTTCATCA
ATGTCATCATCATCCATCTCAAGGTCATCTGGGTCAACAGCTTCCCCAGTGAACCATGAC
ACCGCATGCGAGATGATTTTCTCTTTAATGGTTGATCCAATATCATAGTCGTGCTCCATT
TGACCTTGAAGCTCCTCAGCCATGTCATCATCAAGATCGTCCTCGTCATCAGGAACTTGA
GGTGGACTGAAAAAGTTGAAGAAACTCTCACAGTCCTCAGTCTTAGTGATCGGCTTTGTG
TTTTTAGATCCCTTCTTCGGCTTCTTTTTAAGGATCTTCTGAGTCAAACATTTTCCAGGA
TACCACTCGATCTCCGTTCCAATG

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2A822TF 702 0 0
AAGGATCTTCTGAGTCAAACATTTTCCAGGATACCACTCGATCTCCGTTCCAATGGCCTT
TTCGAGGATAGGCTCATCTTCATCAATCATGTGATATGTCTTGGACAAGACAGTGTTCTT
GAAGTAAGGGTTCTCATCAAAGAAAAACTCGAGCTTGAATCCTTTTGGTTCCTCAACCTT
GTTCCACTTGATGTCTTTGAGATACTTGAGCGCTCCTTCATCTCGCTCAGTTATCTCCTC
AGCGGTAATTTCATTGTTCTTCAGTGCAATAAGCCAGAAATAAGGTACTCCTTTCTCTTC
AGCGGCTTTATCTCCTCCTTGTTCAGATTTCACTTCTTCTGGTGCACCTTCAACTTCAAC
CACACCGGTGACAATTTCATATCGCTTGGTATAGAAAGGCTGATACAATTTCTGATATTT
AGCTTCTAGAGCTGCCCTCTCCTCGAAAAACTTGGCTTCGATTTCATCATGTTGGTTCCG
AATCTCTCTAAGAACCTCGACACGCTTCCTGACGGCAGGAAGCAAGTTCTCAAGGACATC
AGAGTGTTGTCCAGCCAAATTCTGCAACTTGTTCTTAAGAGCATTGACAAGTCCAGCTCT
ATCCTCCTCGTTAAGAGCGGCTGTGAGATCGGACATGTTCAAGTTGTTGACCTTGTCGCT
GCTCATCTTGGCGAGAGTAAAAGAGAAGAGAGAGTCAGTCTC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2E327TF 688 0 0
GAGTCAAACATTT*CCAGGATACCACTCGATCTCCGTTCCAATGGC*TTTTCGAGGATAG
GCTCATCTTCATCAATCATGTGATATGTCTTGGACAAGACAGTGTTCTTGAAGTAAGGAT
TCTCATCAAAGAAAAATTCGAGCTTGAACCCTTTTGGTTCTTCAACCTTGTTCCACTTGA
TGTCTGTGAGATACTTGAGAGCTCCTTCATCCCGCTCAGTTATCTCCTCAGCGGTAATTT
CATTGTTCTTCAGTGAAATAAGCCAGAAATAAGGTACTCCTTTCTCTTCAGCGGCTTTAT
CTCCTCCTTGTTCAGATTTCACTTCTTCTGGTGCACCTTCAACTTCAACCACACCGGTGA
CAATTTCATATCGCTTGGTATAGAAAGGCTGATACAATTTCTGATATTTAGCTTCTAGAG
CTGCCCTCTCCTCGAAAAACTTGGCTTCGATTTCATCATGTTGGTTCTGAATCTCTCTAA
GAACCTCGACACGCTTCCTGACGGCAGGACTCAAGTTCTCAAGGACATCAGAGTGTTGTC
CAGCCAAATTCTGCAACTTGTTCTTAAGAGCATTGACAAGTCCAGCTCTATCCTCCTCGT
TAAGAGCGGCAGTGAGATCGGACATGTTCAAGTTGTTGACTTTGTCACTGCTCATCTTGG
CGAGAGTAAAAGAGAAGAGAG
TCTGGCC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 4

CO CL2490Contig1 916 4 8 U
ATACAAATATAAAACATTTTATCATATAAAAAGAATAATAATGAGAAGATAAAAATGGAT
AGGTGAATGCATACAAAAGAACAAAAAACAAAGAACTTCAAAAGAAACACACACATACAC
ACAATCAATCAAGGACACATGGCAAATTAACTTATAAACGTATTGATGCACACAAATCGA
ACCATTTCAAGTTGATAAATAATCCAAACTAAAGACGAGTTTTGCATAAAACTCTCTGAA
ATCCATCCAACGAGTTCGCC*GTAACGTTGATCATTATTGGCGTACATACAGCCTTCAAC
GTACGTCTCCTTGACCGAAAAATCCACGTCTTGTAACTCACTCTAGCCGTTATATAGACT
TCCATTTCGATCAGCCCTTTGGTCGTTTCAGCCCTCAAGTCCTTAGCATTAAACTTAGAC
AATGCGACGTTGTGGGACACAAGCTATGTCTCAATCCTTGTATCGTTCTTAGGACGCTGC
TTGAAGGCAGGGATCTCCTTGTGAGCCACTGACTGGTTATGGTGAGCCGTGGAGATGCGC
ATGGAGTGATATCTCACGGAGACATGTTTCTCCGAGTTGTATGATTTGATCACATAGTTG
AATTTGGCGCTAATGTGATCGTCCTTGGCTATGGCAAAATCTTGGACCGAGGCGGCTTCT
ACCGTATAGACGAGTTTCTTTGGCCTGAGGGTGAGGTATGTGATCAATATAGCGAGACCC
ACAAGGAGTCCTAGGAGGACAAGAGCAACGATGATGCATAGGACGGGGTTCAAACCCCTA
CCTGGCAGCGGTTGCGGTTGCGTTCGCCTAGGCTGTTGGTTTTGAGGAGCCATTGCTAGA
GAGGGTTTTGATGGAGATGTATATAACTGGTTTCTAGTTAATTGGTAGGAAAAGATAGGA
GCAAAGATTAATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA75JQ U 1
AF RR2BW89JQ U 373
AF RR2AE87TF C 87
AF RR2FA75TF C 114
BS 1 540 RR2FA75JQ
BS 541 712 RR2AE87TF
BS 713 713 RR2FA75TF
BS 714 787 RR2AE87TF
BS 788 788 RR2FA75TF
BS 789 896 RR2AE87TF
BS 897 897 RR2FA75TF
BS 898 916 RR2AE87TF

RD RR2FA75JQ 540 0 0
ATACAAATATAAAACATTTTATCATATAAAAAGAATAATAATGAGAAGATAAAAATGGAT
AGGTGAATGCATACAAAAGAACAAAAAACAAAGAACTTCAAAAGAAACACACACATACAC
ACAATCAATCAAGGACACATGGCAAATTAACTTATAAACGTATTGATGCACACAAATCGA
ACCATTTCAAGTTGATAAATAATCCAAACTAAAGACGAGTTTTGCATAAAACTCTCTGAA
ATCCATCCAACGAGTTCGCC*GTAACGTTGATCATTATTGGCGTACATACAGCCTTCAAC
GTACGTCTCCTTGACCGAAAAATCCACGTCTTGTAACTCACTCTAGCCGTTATATAGACT
TCCATTTCGATCAGCCCTTTGGTCGTTTCAGCCCTCAAGTCCTTAGCATTAAACTTAGAC
AATGCGACGTTGTGGGACACAAGCTATGTCTCAATCCTTGTATCGTTCTTAGGACGCTGC
TTGAAGGCAGGGATCTCCTTGTGAGCCACTGACTGGTTATGGTGAGCCGTGGAGATGCGC

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2BW89JQ 129 0 0
AGCCCTTTGGTCGTTTCAGCCCTCAAGTCCTTAGCATTAAACTTAGACAATGCGACGTTG
TGGGACACAAGCTGTGTCTCAATCCTTGTATCGTTCTTAGGACGCTGCTTGAAGGCAGGG
ATCTCCTTG

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR2AE87TF 830 0 0
AACAAAGAACTTCAAAAGAAACACACACATACACACAATCAATCAAGGACACATGGCAAA
TTAACTTATAAACGTATTGATGCACACAAATCGAACCATTTCAAGTTGATAAATAATCCA
AACTAAAGACGAGTTTTGCATAAAACTCTCTGAAATCCATCCAACGAGTTCGCCCGTAAC
GTTGATCATTATTGGCGTACATACAGCCTTCAACGTACGTCTCCTTGACCGAAAAATCCA
CGTCTTGTAACTCACTCTAGCCGTTATATAGACTTCCATTTCGATCAGCCCTTTGGTCGT
TTCAGCCCTCAAGTCCTTAGCATTAAACTTAGACAATGCGACGTTGTGGGACACAAGCTG
TGTCTCAATCCTTGTATCGTTCTTAGGACGCTGCTTGAAGGCAGGGATCTCCTTGTGAGC
CACTGACTGGTTATGGTGAGCCGTGGAGATGCGCATGGAGTGATATCTCACGGAGACATG
TTTCTCCGAGTTGTATGATTTGATCACATAGTTGAATTTGGCGCTAATGTGATCGTCCTT
GGCTATGGCAAAATCTTGGACCGAGGCGGCTTCTACCGTATAGACGAGTTTCTTTGGCCT
GAGGGTGAGGTATGTGATCAATATAGTGAGACCCACAAGGAGTCCTAGGAGGACAAGAGC
AACGATGATGCATAGGACGGGGTTCAAACCCCTACCTGGCA*CGGTTGCGGTTGCGTTCG
CCTAGGCTGTTGGTTTTGAGGAGCCATTGCTAGAGAGGGTTTTGATGGAGATGTATATAA
CTGGTTTCTAGTTAATTGGTAGGAAAAGATGGGAGCAAAGATTAATTTCC

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR2FA75TF 791 0 0
CATACACACAATCAATCAAG*ACACATGGCAAATTAACTTATAAACGTATTGATGCACAC
AAATCGAACCATTTCAAGTTGATAAATAATCCAAACTAAAGACGAGTTTTGCATAAAACT
CTCTGAAATCCATCCAACGAGTTCGCC*GTAACGTTGATCATTATTGGCGTACATACAGC
CTTCAACGTACGTCTCCTTGACCGAAAAATCCACGTCTTGTAACTCACTCTAGCCGTTAT
ATAGACTTCCATTTCGATCAGCCCTTTGGTCGTTTCAGCCCTCAAGTCCTTAGCATTAAA
CTTAGACAATGCGACGTTGTGGGACACAAGCTATGTCTCAATCCTTGTATCGTTCTTAGG
ACGCTGCTTGAAGGCAGGGATCTCCTTGTGAGCCACTGACTGGTTATGGTGAGCCGTGGA
GATGCGCATGGAGTGATATCTCACGGAGACATGTTTCTCCGGGTTGTATGATTTGATCAC
ATAGTTGAATTTGGCGCTAATGTGATCGTCCTTGGCTATGGCAAAATCTTGGACCGAGGC
GGCTTCTACCGTATAGACGAGTTTCTTTGGCCTGAGGGTGAGGTATGTGATCAATATAGC
GAGACCCACAAGGAGTCCTAGGAGGACAAGAGCAACGATGATGCATAGGACGGGGTTCAA
ACCCCTACCTGGCAGCGGTTGCGGTTGCGTTCGCCTAGGCTGTTGGTTTTGAGGAGCCAT
TGCTAGAGAGGGTTTTGATGGAGATGTATATAACTGGTTTCTAGTTAATTGGTAGGAAAA
GATAGGAGC
CC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 4

CO CL2491Contig1 835 4 9 U
GATTCTGAAGAAACTCTCCACAAAATTGCAAAGAGTATGAATAAAATCACATTCCAGCGT
TTTAAAGTGTTGCCATTACAAGAAAGACAGACTCAGATGAAAATTTGCAGAGTTCTCATA
AAAAATGGGTTTAACCAAGGATGGGGAAGATGCGGGCAATGTGCTCCAAGGGAACATTCT
CGCTTGTGTTTTTCTTAAGCTCAGGATGATTAAACTCGTTCTGTGGTAAGACGATACTTC
CATCTTCTTTCTCAACAATCCATCCACTGTTCGCCACTTGGTGCTCAATGAACTTGTCTA
GGGATGCACCATCCATGTTAACAGCCTCAGCAAGCACAGATCTTGGAAGCTTTTGGTAGC
TTAAGCTAAGAAGGTGAGTTGCATATGCTTGGATAGCTTGTTCAAAACCTGGAACAGTCT
CGAGAATGTGACGGTTCTTGGCAGCTTCATCCCAAAACTGCTGGAACCTTCCAGTCTCAA
GGTAGTGTGAGAGGACAATGAGTGACTTGAACTGCTCCTCCATTTGCACTCTCTCCGGAA
TCAAGAAGAGGCAAAGGCTGAAGTCAGGAGATGGCATAGCCATAAGAGCCTTGATTAAGA
TGCGAGCCACAACATGAGTGTTCATGCGCTCTGGCTCAAACTGGTAGAGACGAAGCAAGC
ATAGGTTTGCATCAAGACTGTACGTCTGCGATGTAACCTGCTCGTTGACGTAGTTTTCGA
GATCAGGTAAGATCTCTGGGTTGAAGGGATTGACGGCGACGAGCTGCTCGACGGTGTATG
AGCTCTGTTCTTTCGGGGACTCCATCTCTGCCTGTCTCTTCGTGCTTTCGGTTCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX13JQ U 5
AF RR2GO61JQ U 1
AF RR2GO61TF C 117
AF RR2FX13TF C 196
BS 1 101 RR2GO61JQ
BS 102 102 RR2FX13JQ
BS 103 243 RR2GO61JQ
BS 244 244 RR2FX13JQ
BS 245 708 RR2GO61JQ
BS 709 729 RR2GO61TF
BS 730 730 RR2FX13TF
BS 731 823 RR2GO61TF
BS 824 835 RR2FX13TF

RD RR2FX13JQ 571 0 0
CTGAAGAAACTCTCCACAAAATTGCAAAGAGTATGAATAAAATCACATTCCAGCGTTTTA
AAGTGTTGCCATTACAAGAAAGACAGACTCAGATGAAAATTTGCAGAGTTCTCATAAAAA
ATGGGTTTAACCAAGGATGGGGAAGATGCGGGCAATGTGCTCCAAGGGAACATTCTCGCT
TGTGTTTTTCTTAAGCTCAGGATGATTAAACTCGTTCTGTGGTAAGACGATACTTCCATC
TTCTTTCTCAACAATCCATCCACTGTTCGCCACTTGGTGCTCAATGAACTTGTCTAGGGA
TGCACCATCCATGTTAACAGCCTCGGCAAGCACAGATCTTGGAAGCTTTTGGTAGCTTAA
GCTAAGAAGGTGAGTTGCATATGCTTGGATAGCTTGTTCAAAACCTGGAACAGTCTCGAG
AATGTGACGGTTCTTGGCAGCTTCATCCCAAAACTGCTGGAACCTTCCAGTCTCAAGGTA
GTGTGAGAGGACAATGAGTGACTTGAACTGCTCCTCCATTTGCACTCTCTCCGGAATCAA
GAAGAGGCAAAGGCTGAAGTCAGGAGATGGC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2GO61JQ 708 0 0
GATTCTGAAGAAACTCTCCACAAAATTGCAAAGAGTATGAATAAAATCACATTCCAGCGT
TTTAAAGTGTTGCCATTACAAGAAAGACAGACTCAGATGAAGATTTGCAGAGTTCTCATA
AAAAATGGGTTTAACCAAGGATGGGGAAGATGCGGGCAATGTGCTCCAAGGGAACATTCT
CGCTTGTGTTTTTCTTAAGCTCAGGATGATTAAACTCGTTCTGTGGTAAGACGATACTTC
CATTTTCTTTCTCAACAATCCATCCACTGTTCGCCACTTGGTGCTCAATGAACTTGTCTA
GGGATGCACCATCCATGTTAACAGCCTCAGCAAGCACAGATCTTGGAAGCTTTTGGTAGC
TTAAGCTAAGAAGGTGAGTTGCATATGCTTGGATAGCTTGTTCAAAACCTGGAACAGTCT
CGAGAATGTGACGGTTCTTGGCAGCTTCATCCCAAAACTGCTGGAACCTTCCAGTCTCAA
GGTAGTGTGAGAGGACAATGAGTGACTTGAACTGCTCCTCCATTTGCACTCTCTCCGGAA
TCAAGAAGAGGCAAAGGCTGAAGTCAGGAGATGGCATAGCCATAAGAGCCTTGATTAAGA
TGCGAGCCACAACATGAGTGTTCATGCGCTCTGGCTCAAACTGGTAGAGACGAAGCAAGC
ATAGGTTTGCATCAAGACTGTACGTCTGCGATGTAACCTGCTCGTTGA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2GO61TF 709 0 0
CATAAAAAATGGGTTTAACCAAGGATGGGGAAGATGCGGGCAATGTGCTCCAAGGGAACA
TTCTCGCTTGTGTTTT*CTTAAGCTCAGGATGATTAAACTCGTTCTGTGGTAAGACGATA
CTTCCATTTTCTTTCTCAACAATCCATCCACTGTTCGCCACTTGGTGCTCAATGAACTTG
TCTAGGGATGCACCATCCATGTTAACAGCCTCAGCAAGCACAGATCTTGGAAGCTTTTGG
TAGCTTAAGCTAAGAAGGTGAGTTGCATATGCTTGGATAGCTTGTTCAAAACCTGGAACA
GTCTCGAGAATGTGACGGTTCTTGGCAGCTTCATCCCAAAACTGCTGGAACCTTCCAGTC
TCAAGGTAGTGTGAGAGGACAATGAGTGACTTGAACTGCTCCTCCATTTGCACTCTCTCC
GGAATCAAGAAGAGGCAAAGGCTGAAGTCAGGAGATGGCATAGCCATAAGAGCCTTGATT
AAGATGCGAGCCACAACATGAGTGTTCATGCGCTCTGGCTCAAACTGGTAGAGACGAAGC
AAGCATAGGTTTGCATCAAGACTGTACGTCTGCGATGTAACCTGCTCGTTGACGTAGTTT
TCGAGATCAGGTAGGATCTCTGGGTTGAAGGGATTGACGGCGACGAGCTGCTCGACGGTG
TATGAGCTCTGTTCTTTCGGGGACTCCATCTCTGCCTGTCTCTTCGT
CC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2FX13TF 640 0 0
TAAGCTCAGGATGATTAAACTCGTTCTGTGGTAAGACGATACTTCCATCTTCTTTCTCAA
CAATCCATCCACTGTTCGCCACTTGGTGCTCAATGAACTTGTCTAGGGATGCACCATCCA
TGTTAACAGCCTCGGCAAGCACAGATCTTGGAAGCTTTTGGTAGCTTAAGCTAAGAAGGT
GAGTTGCATATGCTTGGATAGCTTGTTCAAAACCTGGAACAGTCTCGAGAATGTGACGGT
TCTTGGCAGCTTCATCCCAAAACTGCTGGAACCTTCCAGTCTCAAGGTAGTGTGAGAGGA
CAATGAGTGACTTGAACTGCTCCTCCATTTGCACTCTCTCCGGAATCAAGAAGAGGCAAA
GGCTGAAGTCAGGAGATGGCATAGCCATAAGAGCCTTGATTAAGATGCGAGCCACAACAT
GAGTGTTCATGCGCTCTGGCTCAAACTGGTAGAGACGAAGCAAGCATAGGTTTGCATCAA
GACTGTACGTCTGCGATGTAACCTGCTCGTTGACGTAGTTTTCGAGATCAGGTAAGATCT
CTGGGTTGAAGGGATTGACGGCGACGAGCTGCTCGACGGTGTATGAGCTCTGTTCTTTCG
GGGACTCCATCTCTGTCTGTCTCTTCGTGCTTTCGGTTCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 4

CO CL2492Contig1 1179 4 10 U
TTAACACCATTGAAAACTATGCCACTCCAGCTTTATGCGTCATTGTTGAGATCACAAGTC
ACAACAATACAAAAGGTCACACAACACAACCCATATATAATTAGGGTAAACATCAAAAGC
TTGTTCATCAGTCGGAACGTTCAACGTTCCTTAGTATTCAAAGAAACCATAAATTATACA
TATTTTAAAGCATTTAATGATTATAAATATGATGAAATAAAGGGTTTTCAAAGGAACGAT
CAAAGCATGGTCGAGGAGATGTGATCAATGGGGAAAGGATTTCCCATGACATTGTCCATG
AAGTAATGGTGAGGATGTGTTGCGTCCATTACTACAAACTGCATATCCTCCGGTGGTTTC
CAATGCCTTTTCCTCTGGTTTATGAACCAATTGTTTATCTGTTTCTGGTCCAGGCCGGTT
GATTCCGCTAGTGCTAACTTTTGCTGCTCCGAAGGGTAAGGCCATTTGTAGTGTCGGCTC
CACCAGTCAAGTAGTTGTTGGCGAGCTTCCTTAGGAAGCTTTCCTTTCTTTCTCTTCTTC
ATGAACTCTTGCTTGAGACTGCCTAAGTAACCACTGTACTTGCGCAAGAGCTGTCCTTTA
AGCTCCCTATCCTCAGCCTGCGGATCTACAAATTCATTGTTCATATCGACTTCTTCCTCA
GATGACCCATTGTTGTTTCTCTCAATAGCTGCCTCTCCATAACCAGAGAAGGAGGAAGGC
GAGGAGAGAGCAAGGGATTTGAATTGACACTCGACGTGTTGAAGGAAGACCATAGCTTCT
TTAAAAGGTTTGGATAGTTCTTGCTCGTACTTCACGAGCATTTCACAGTAAGCTTCCATG
AACTGATCAAGCCCTGGATCTTCACCTAAAGACCCTGTGGGTCCCATCGACGCTGCAGCT
GCTGCCGCAGACGAGCATGTTTCTTCCAGCCTCGTCTGCACTTCCGGTGGAGCTCCCACC
TTCTGGCAATTGACATAGGCGAGCAAGAGGCGGTGGTAGTGAGGATGAGCCATGATTTTG
GCCTTGACAGAGGCTGAAGAACAGGGATTGAGTCCTCCTGCGAGGAGTTCGTTTTGGTGA
TTGATCTCCATGAAAGAATAAGCAGGAGCACCAGAGGAAGGAGAACAAGAAGATGTAACG
TTGTTCTTCGCTTCTTGAGACGGAGGAGTTAGTGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD06JQ U 1
AF RR2FU23JQ U 75
AF RR2GD06TF C 236
AF RR2FU23TF C 467
BS 1 235 RR2GD06JQ
BS 236 236 RR2FU23JQ
BS 237 512 RR2GD06JQ
BS 513 513 RR2FU23JQ
BS 514 592 RR2GD06JQ
BS 593 594 RR2FU23JQ
BS 595 657 RR2GD06JQ
BS 658 761 RR2FU23JQ
BS 762 845 RR2GD06TF
BS 846 1179 RR2FU23TF

RD RR2GD06JQ 657 0 0
TTAACACCATTGAAAACTATGCCACTCCAGCTTTATGCGTCATTGTTGAGATCACAAGTC
ACAACAATACAAAAGGTCACACAACACAACCCATATATAATTAGGGTAAACATCAAAAGC
TTGTTCATCAGTCGGAACGTTCAACGTTCCTTAGTATTCAAAGAAACCATAAATTATACA
TATTTTAAAGCATTTAATGATTATAAATATGATGAAATAAAGGGTTTTCAAAGGATCGAT
CAAAGCATGGTCGAGGAGATGTGATCAATGGGGAAAGGATTTCCCATGACATTGTCCATG
AAGTAATGGTGAGGATGTGTTGCGTCCATTACTACAAACTGCATATCCTCCGGTGGTTTC
CAATGCCTTTTCCTCTGGTTTATGAACCAATTGTTTATCTGTTTCTGGTCCAGGCCGGTT
GATTCCGCTAGTGCTAACTTTTGCTGCTCCGAAGGGTAAGGCCATTTGTAGTGTCGGCTC
CACCAGTCAAGTAGTTGTTGGCGAGCTTCCTTGGGAAGCTTTCCTTTCTTTCTCTTCTTC
ATGAACTCTTGCTTGAGACTGCCTAAGTAACCACTGTACTTGCGCAAGAGCT**CCTTTA
AGCTCCCTATCCTCAGCCTGCGGATCTACAAATTCATTGTTCATATCGACTTCTTCC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2FU23JQ 687 0 0
GGTCACACAACACAACCCATATATAATTAGGGTAAACATCAAAAGCTTGTTCATCAGTCG
GAACGTTCAACGTTCCTTAGTATTCAAAGAAACCATAGATTATACATATTTTAAAGCATT
TAATGATTATAAATATGATGAAATAAAGGGTTTTCAAAGGAACGATCAAAGCATGGTCGA
GGAGATGTGATCAATGGGGGAAGGATTTCCCATGACATTGTCCATGAAGTAATGGTGAGG
ATGTGTTGCGTCCATTACTACAAACTGCATATCCTCCGATGGTTTCCAATGCCTTTTCCT
CTGGTTTATGAACCAATTGTTTATCTGTTTCTGGTCCAGGCCGGTTGATTCCGCTAGTGC
TAACTTTTGCTGCTCCGAAGGGTAAGGCCATTTGTAGTGTCGGCTCCACCAGTCAAGTAG
TTGTTGGCGAGCTTCCTTAGGAAGCTTTCCTTTCTTTCTCTTCTTCATGAACTCTTGCTT
GGGACTGCCTAAGTAACCACTGTACTTGCGCAAGAGCTGTCCTTTAAGCTCCCTATCCTC
AGCCTGCGGATCTACAAATTCATTGTTCATATCGACTTCTTCCTCAGATGACCCATTGTT
GTTTCTCTCAATAGCTGCCTCTCCATAACCAGAGAAGGAGGAAGGCGAGGAGAGAGCAAG
GGATTTGAATTGACACTCGACGTGTTG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2GD06TF 611 0 0
T
CGATCAAAGCATGGTCGAG*AGATGTGATCAT**GGGAAAGGATTTCCCATGACAT*GTC
CATGAAGTAATGGTGAGGATGTGTTGCGTCCATTACTACAAACTGCATATC*TCCGGTGG
TTTCCAATGC*TTTTCCTCTGGTTTATGAACCAATTGTTTATCTGTTTCTGGTCCAGGCC
GGTTGATTCCGCTAGTGCTAACTTTTGCTGCTCCGAAGGGTAAGGCCATTTGTAGTGTCG
GCTCCACCAGTCAAGTAGTTGTTGGCGAGCTTCCTTGGGAAGCTTTCCTTTCTTTCTCTT
CTTCATGAACTCTTGCTTGAGACTGCCTAAGTAACCACTGTACTTGCGCAAGAGCT**CC
TTTAAGCTCCCTATCCTCAGCCTGCGGATCTACAAATTCATTGTTCATATCGACTTCTTC
CTCAGATGACCCATTGTTGTTTCTCTCAATAGCTGCCTCTCCATAACCAGAGAAGGAGGA
AGGCGAGGAGAGAGCAAGGGATTTGAATTGACACTCGACGTGTTGAAGGAAGACCATAGC
TTCTTTAAAAGGTTTGGATAGTTCTTGCTCGTACTTCACGAGCATTTCACAGTAAGCTTC
CATGAACTG
C

QA 2 610 2 610
DS 

RD RR2FU23TF 713 0 0
TGTAGTGTCGGCTCCACCAGTCAAGTAGTTGTTGGCGAGCTTCCTTAGGAAGCTTTCCTT
TCTTTCTCTTCTTCATGAACTCTTGCTTGGGACTGCCTAAGTAACCACTGTACTTGCGCA
AGAGCTGTCCTTTAAGCTCCCTATCCTCAGCCTGCGGATCTACAAATTCATTGTTCATAT
CGACTTCTTCCTCAGATGACCCATTGTTGTTTCTCTCAATAGCTGCCTCTCCATAACCAG
AGAAGGAGGAAGGCGAGGAGAGAGCAAGGGATTTGAATTGACACTCGACGTGTTGAAGGA
AGACCATAGCTTCTTTAAAAGGTTTGGATAGTTCTTGCTCGTACTTCACGAGCATTTCAC
AGTAAGCTTCCATGAACTGATCAAGCCCTGGATCTTCACCTAAAGACCCTGTGGGTCCCA
TCGACGCTGCAGCTGCTGCCGCAGACGAGCATGTTTCTTCCAGCCTCGTCTGCACTTCCG
GTGGAGCTCCCACCTTCTGGCAATTGACATAGGCGAGCAAGAGGCGGTGGTAGTGAGGAT
GAGCCATGATTTTGGCCTTGACAGAGGCTGAAGAACAGGGATTGAGTCCTCCTGCGAGGA
GTTCGTTTTGGTGATTGATCTCCATGAAAGAATAAGCAGGAGCACCAGAGGAAGGAGAAC
AAGAAGATGTAACGTTGTTCTTCGCTTCTTGAGACGGAGGAGTTAGTGATTCC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 4

CO CL2493Contig1 1048 4 3 U
GGAAAGAGAATCAAAACACAGCTGATGATGGAGAAGTTGTTGATACCGATATGGTTGATG
ATCTTCTTGCTTTTTATAGTGAAGAGGCGAAACTAGTGAGCGAGGCAACAGAACTTCAGA
ACTCAATTAAACTTACCCGTGACAATATCAAAGCAATCATCATGGACGTTATGTTTGGAG
GAACGGAAACGGTAGCGTCAGCGATAGAGTGGGCATTAACTGAGTTATTACGGAGCCCCG
AGGATCTAAAACGAGTTCAACAAGAACTCGCTGAAGTAGTCGGACTTGACAGACATGTGG
AAGAATCAGACATCGAGAAGTTGACTTTTCTGAAATGCACACTCAAAGAAACCCTAAGGC
TACACCCACC*GATCCCACTCCTCCTCCACGAAACCGCAGAGGACACTGAGATCGACGGT
TACTTCGTTCCCAAGAAATCTCGCGTTATGATCAACGCGTTTGCGATTGGACGCGACAAG
AATTCTTGGGTCGACCCCGAAACGTTTAGACCATCTAGGTTTTTGGAACCGGGCGTACCA
GATTTCAAAGGGAGTAACTTCGAGTTTATACCATTCGGGTCGGGTCGTAGATCATGCCCG
GGTATGCAACTCGGGTTATACGCACTTGAACTAGCCGTGGCCCATATATTACATTGCTTC
ACGTGGAAATTACCTGATGGCATGAAACCAAGCGAGCTTGATATGAGCGACGTGTTTGGT
CTGACGGCTCCTAAAGCCACGCGTCCCTACGCTGTCCCGAGCACGCGCCTTATTTGTGCT
GCTTAAAGTTATGGTTCGAAGCACGTGGAGGGTGAAAGGAAAGGTGGTTGGTATGGTTCT
TGGAAGTGGTGTGAGAAGTCAAAAGAAGCCCTGAAGATTTGTGGATGTTATATAATACTA
TATGTTTATGTATGTGTGTACACTCGTGTGTTCGATGAAACATAAAGTGGCTCTTTGTTT
CGTTTTTAATTTTCTTTTGGGAAATCTTTTCCTTGCATGAAATGTAAACGCTGAAAAACA
AGATTTTTTTACAACTAATTTGCATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA71TF U 1
AF RR2G510TF U 195
AF RR2BA71JQ C 151
AF RR2G510JQ C 228
BS 1 723 RR2BA71TF
BS 724 769 RR2G510TF
BS 770 1048 RR2BA71JQ

RD RR2BA71TF 723 0 0
GGAAAGAGAATCAAAACACAGCTGATGATGGAGAAGTTGTTGATACCGATATGGTTGATG
ATCTTCTTGCTTTTTATAGTGAAGAGGCGAAACTAGTGAGCGAGGCAACAGAACTTCAGA
ACTCAATTAAACTTACCCGTGACAATATCAAAGCAATCATCATGGACGTTATGTTTGGAG
GAACGGAAACGGTAGCGTCAGCGATAGAGTGGGCATTAACTGAGTTATTACGGAGCCCCG
AGGATCTAAAACGAGTTCAACAAGAACTCGCTGAAGTAGTCGGACTTGACAGACATGTGG
AAGAATCAGACATCGAGAAGTTGACTTTTCTGAAATGCACACTCAAAGAAACCCTAAGGC
TACACCCACC*GATCCCACTCCTCCTCCACGAAACCGCAGAGGACACTGAGATCGACGGT
TACTTCGTTCCCAAGAAATCTCGCGTTATGATCAACGCGTTTGCGATTGGACGCGACAAG
AATTCTTGGGTCGACCCCGAAACGTTTAGACCATCTAGGTTTTTGGAACCGGGCGTACCA
GATTTCAAAGGGAGTAACTTCGAGTTTATACCATTCGGGTCGGGTCGTAGATCATGCCCG
GGTATGCAACTCGGGTTATACGCACTTGAACTAGCCGTGGCCCATATATTACATTGCTTC
ACGTGGAAATTACCTGATGGCATGAAACCAAGCGAGCTTGATATGAGCGACGTGTTTGGT
CTG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2G510TF 575 0 0
GCGTCAGCGATAGAGTGGGCATTAACTGAGTTATTACGGAGCCCCGAGGATCTAAAACGA
GTTCAACAAGAACTCGCTGAAGTAGTCGGACTTGACAGACATGTGGAAGAATCAGACATC
GAGAAGTTGACTTTTCTGAAATGCACACTCAAAGAAACCCTAAGGCTACACCCACC*GAT
CCCACTCCTCCTCCACGAAACCGCAGAGGACACTGAGATCGACGGTTACTTCGTTCCCAA
GAAATCTCGCGTTATGATCAACGCGTTTGCGATTGGACGCGACAAGAATTCTTGGGTCGA
CCCCGAAACGTTTAGACCATCTAGGTTTTTGGAACCGGGCGTACCAGATTTCAAAGGGAG
TAACTTCGAGTTTATACCATTCGGGTCGGGTCGTAGATCATGCCCGGGTATGCAACTCGG
GTTATACGCACTTGAACTAGCCGTGGCCCATATATTACATTGCTTCACGTGGAAATTACC
TGATGGCATGAAACCAAGCGAGCTTGATATGAGCGACGTGTTTGGTCTGACGGCTCCTAA
AGCCACGCGTCCCTACGCTGTCCCGAGCACGCGCC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2BA71JQ 898 0 0
AAAGC
ATCATCATGGACGTTATGTTTGGAGGAACGGAAACGGTAGCGTCAGCGATAGAGTGGGCA
TTAACTGAGTTATTACGGAGCCCCGAGGATCTAAAACGAGTTCAACAAGAACTCGCTGAA
GTAGTCGGACTTGACAGACATGTGGAAGAATCAGACATCGAGAAGTTGACTTTTCTGAAA
TGCACACTCAAAGAAACCCTAAGGCTACACCCACCCGATCCCACTCCTCCTCCACGAAAC
CGCAGAGGACACTGAGATCGACGGTTACTTCGTTCCCAAGAAATCTCGCGTTATGATCAA
CGCGTTTGCGATTGGACGCGACAAGAATTCTTGGGTCGACCCCGAAACGTTTAGACCATC
TAGGTTTTTGGAACCGGGCGTACCAGATTTCAAAGGGAGTAACTTCGAGTTTATACCATT
CGGGTCGGGTCGTAGATCATGCCCGGGTATGCAACTCGGGTTATACGCACTTGAACTAGC
CGTGGCCCATATATTACATTGCTTCACGTGGAAATTACCTGATGGCATGAAACCAAGCGA
GCTTGATATGAGCGACGTGTTTGGTCTGACGGCTCCTAAAGCCACGCGTCTTTACGCTGT
CCCGAGCACGCGCCTTATTTGTGCTGCTTAAAGTTATGGTTCGAAGCACGTGGAGGGTGA
AAGGAAAGGTGGTTGGTATGGTTCTTGGAAGTGGTGTGAGAAGTCAAAAGAAGCCCTGAA
GATTTGTGGATGTTATATAATACTATATGTTTATGTATGTGTGTACACTCGTGTGTTCGA
TGAAACATAAAGTGGCTCTTTGTTTCGTTTTTAATTTTCTTTTGGGAAATCTTTTCCTTG
CATGAAATGTAAACGCTGAAAAACAAGATTTTTTTACAACTAATTTGCATATT

QA 6 898 6 898
DS 

RD RR2G510JQ 809 0 0
TTACGGAGCCCCGAGGATCTAAAACGAGTTCAACAAGAACTCGCTGAAGTAGTCGGACTT
GACAGACATGTGGAAGAATCAGACATCGAGAAGTTGACTTTTCTGAAATGCACACTCAAA
GAAACCCTAAGGCTACACCCACC*GATCCCACTCCTCCTCCACGAAACCGCAGAGGACAC
TGAGATCGACGGTTACTTCGTTCCCAAGAAATCTCGCGTTATGATCAACGCGTTTGCGAT
TGGACGCGACAAGAATTCTTGGGTCGACCCCGAAACGTTTAGACCATCTAGGTTTTTGGA
ACCGGGCGTACCAGATTTCAAAGGGAGTAACTTCGAGTTTATACCATTCGGGTCGGGTCG
TAGATCATGCCCGGGTATGCAACTCGGGTTATACGCACTTGAACTAGCCGTGGCCCATAT
ATTACATTGCTTCACGTGGAAATTACCTGATGGCATGAAACCAAGCGAGCTTGATATGAG
CGACGTGTTTGGTCTGACGGCTCCTAAAGCCACGCGTCCCTACGCTGTCCCGAGCACGCG
CCTTATTTGTGCTGTTTAAAGTTATGGTTCGAAGCACGTGGAGGGTGAAAGGAAAGGTGG
TTGGTATGGTTCTTGGAAGTGGTGTGAGAAGTCAAAAGAAGCCCTGAAGATTTGTGGATG
TTATATAATACTATATGTTTATGTATGTGTGTACACTCGTGTGTTCGATGAAACATAAAG
TGGCTCTTTGTTTCGTTTTTAATTTTCTTTTGGGAAATCTTTTCCTTGCATGAAATGTAA
ACGCTGAAAAATAAGATTTTTTTACAACT

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

CO CL2494Contig1 790 2 5 U
CACCCACAAGTACTAGTTGATACATTTTAAATTAAGAATTACAAATTGTTCATTGTTCAA
CAACGTGAAATAGCTTAAGCTTCACACTTTTTTATTTGACTTAATGCGTTCATTGCTTCT
CCGTATTCAACTTTGTTCTAATGACCACTCCCATTAGCCTCCACACGAGCATTAGATAAG
TCATCAACAGAGTCTCCTCTCTCAAAAACTGCTGCAGCTCCCATTCCAGTACCTATGCAC
ATTGAAATAACTCCAAAGCGGCAGTCTTTCCCTCTCCGTTTCATCTCGTGGAGCAATGTT
GCAACACATCGAGCTCCTGTAGCACCAAGAGGATGGCCAATAGCAATGGCTCCTCCATTA
ACATTGACCTTTTCCACATCCAGCTCTAGCTTCTTGCAACAGTACACATACTGAGATGCA
AATGACTCATTGATCTCAAATAGATCAATGTCGCTAAATTTGAGTCCTGCTAGGTTGGCT
GCAGCAGGAATGGCATAAGCTGGACCGATACCCATTACAGCCGGATCCACACCAGTAACA
GCAAAGCTCCTGAATACTCCAAGAATGGGAAGTCCCTTCTTCATCGCCAAGCTCCTCTTC
ATTAGCAGTACAGCTCCAGCACCATCACTAATCTGACTAGCATTACCTGCTGTGGTTGAG
CCATCAGGTTTAAAGACTGTCTTCAGCTTTGCCAGATCCACCATGTTTGAGTTCGGACGT
ACACCATCATCAACAGAAACAACAATTGGCCTCTCTGCTTTTGTCACGGGGTCAACAATC
TTAGTAGCAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC70JQ U 1
AF RR2EC18JQ U 1
BS 1 424 RR2EC18JQ
BS 425 425 RR2FC70JQ
BS 426 457 RR2EC18JQ
BS 458 458 RR2FC70JQ
BS 459 790 RR2EC18JQ

RD RR2FC70JQ 732 0 0
CACCCACAAGTACTAGTTGATACATTTTAAATTAAGAATTACAAATTGTTCATTGTTCAA
CAACGTGAAATAGCTTAAGCTTCACACTTTTTTATTTGACTTAATGCGTTCATTGCTTCT
CCGTATTCAACTTTGTTCTAATGACCACTCCCATTAGCCTCCACACGAGCATTAGATAAG
TCATCAACAGAGTCTCCTCTCTCAAAAACTGCTGCAGCTCCCATTCCAGTACCTATGCAC
ATTGAAATAACTCCAAAGCGGCAGTCTTTCCCTCTCCGTTTCATCTCGTGGAGCAATGTT
GCAACACATCGAGCTCCTGTAGCACCAAGAGGATGGCCAATAGCAATGGCTCCTCCATTA
ACATTGACCTTTTCCACATCCAGCTCTAGCTTCTTGCAACAGTACACATACTGAGATGCA
AATGACTCATTGATCTCAAATAGATCAATGTCGCTAAATTTGAGTCCTGCTAGGTTGGCT
GCAGCAGGAATGGCATAAGCTGGACCGATACCCATTACAGCCGGATCCACACCAGTAACA
GCAAAGCTCCTGAATACTCCAAGAATGGGAAGTCCCTTCTTCATCGCCAAGCTCCTCTTC
ATTAGCAGTACAGCTCCAGCACCATCGCTAATCTGACTAGCATTACCTGCTGTGGTTGAG
CCATCAGGTTTAAAGACTGTCTTCAGCTTTGCCAGATCCACCATGTTTGAGTTCGGACGT
ACACCATCATCA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2EC18JQ 790 0 0
CACCCACAAGTACTAGTTGATACATTTTAAATTAAGAATTACAAATTGTTCATTGTTCAA
CAACGTGAAATAGCTTAAGCTTCACACTTTTTTATTTGACTTAATGCGTTCATTGCTTCT
CCGTATTCAACTTTGTTCTAATGACCACTCCCATTAGCCTCCACACGAGCATTAGATAAG
TCATCAACAGAGTCTCCTCTCTCAAAAACTGCTGCAGCTCCCATTCCAGTACCTATGCAC
ATTGAAATAACTCCAAAGCGGCAGTCTTTCCCTCTCCGTTTCATCTCGTGGAGCAATGTT
GCAACACATCGAGCTCCTGTAGCACCAAGAGGATGGCCAATAGCAATGGCTCCTCCATTA
ACATTGACCTTTTCCACATCCAGCTCTAGCTTCTTGCAACAGTACACATACTGAGATGCA
AATGCCTCATTGATCTCAAATAGATCAATGTCGCTAACTTTGAGTCCTGCTAGGTTGGCT
GCAGCAGGAATGGCATAAGCTGGACCGATACCCATTACAGCCGGATCCACACCAGTAACA
GCAAAGCTCCTGAATACTCCAAGAATGGGAAGTCCCTTCTTCATCGCCAAGCTCCTCTTC
ATTAGCAGTACAGCTCCAGCACCATCACTAATCTGACTAGCATTACCTGCTGTGGTTGAG
CCATCAGGTTTAAAGACTGTCTTCAGCTTTGCCAGATCCACCATGTTTGAGTTCGGACGT
ACACCATCATCAACAGAAACAACAATTGGCCTCTCTGCTTTTGTCACGGGGTCAACAATC
TTAGTAGCAC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 4

CO CL2495Contig1 628 4 4 U
TTTTTTTTTCGTGAAGTGAAACTTGAAGATTAACTGAACAGAGCAAAATGGCTGTTCCTT
ATAGCAAAACATGTTAACTTAAAAAAATTTCACAAACAAGATTGCATACTACAAAACAAT
AACACAACCAACCTCTTCTCATCTAAGTTTTACACCCTCTTCTTCAGGATGTGCAATCAA
GCATCCGGTTCTTGATTGGAACGTGAACTCGAGGAGCCAGGTTTCGGAGCACCGTGCTTC
TTGTTCTTCCTGATTCTAGCTTTCTTGGCTTTCATCCTGCGTTTCTTCTCAGCTGAGTCT
ACCCATGTGTAATCTGAGGGTATAAGGAAAGGGTACACCTCATCGTCCCTGAAACGGTTA
CTCTCGTAGTCACTTGACTGGCCTCCACCGCGTGTGCCTTTCATCC*ACGACACCCATGA
AGAATTATCTGATGACTTTGCATCATGAAAAACAGGGCTAGAAGGAGGCGTTGAGAATTC
CTCAGATGGTTGGAGCTCTTCGAATTTAGTGAAAGTGACAAGAACACGGACTGTTGGAAG
TTTTGTGGTTAGAAGCTCTCTGAGCCTCCTCACTGCTTTGACCTTATTGGCTAATATGTC
AAGAAGAGGAAGAAGCTCTTCTGTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G040TF C 1
AF RR2H989JQ U 10
AF RR2G040JQ U 10
AF RR2H989TF C 10
BS 1 9 RR2G040TF
BS 10 484 RR2G040JQ
BS 485 485 RR2H989JQ
BS 486 628 RR2G040JQ

RD RR2G040TF 562 0 0
TTTTTTTTTCGTGAAGTGAAACTTGAAGATTAACTGAACAGAGCAAAATGGCTGTTC*TT
ATAGCAAAACATGTTAACTTAAAAAAATTTCACAAACAAGATTGCATACTACAAAACAAT
AACACAACCAACCTCTTCTCATCTAAGTTTTACACCCTCTTCTTCAGGATGTGCAATCAA
GCATCCGGTTCTTGATTGGAACGTGAACTCGAGGAGCCAGGTTTCGGAGCACCGTGCTTC
TTGTTCTTCCTGATTCTAGCTTTCTTGGCTTTCATCCTGCGTTTCTTCTCAGCTGAGTCT
ACCCATGTGTAATCTGAGGGTATAAGGAAAGGGTACACCTCATCGTCCCTGAAACGGTTA
CTCTCGTAGTCACTTGACTGGCCTCCACCGCGTGTGCCTTTCATCCCACGACACCCATGA
AGAATTATCTGATGACTTTGCATCATGAAAAACAGGGCTAGAAGGAGGCGTTGAGAATTC
CTCAGATGGTTGGAGCTCTTCGAATTTAGTGAAAGTGACAAGAACACGGACTGTTGGAAG
TTTTGTGGTTAGAAGCTCTCTG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2H989JQ 586 0 0
CGTGAAGTGAAACTTGAAGATTAACTGAACAGAGCAAAATGGCTGTTCCTTATAGCAAAA
CATGTTAACTTAAAAAAATTTCACAAACAAGATTGCATACTACAAAACAATAACACAACC
AACCTCTTCTCATCTAAGTTTTACACCCTCTTCTTCAGGATGTGCAATCAAGCATCCGGT
TCTTGATTGGAACGTGAACTCGAGGAGCCAGGTTTCGGAGCACCGTGCTTCTTGTTCTTC
CTGATTCTAGCTTTCTTGGCTTTCATCCTGCGTTTCTTCTCAGCTGAGTCTACCCATGTG
TAATCTGAGGGTATAAGGAAAGGGTACACCTCATCGTCCCTGAAACGGTTACTCTCGTAG
TCACTTGACTGGCCTCCACCGCGTGTGCCTTTCATCC*ACGACACCCATGAAGAATTATC
TGATGACTTTGCATCATGAAAAACAGGGCTAGAAGGAGGCGTTGAGAATTCCTCAGATGG
TTGGAGCTCTTCGAATTTAGTGAAAGTGACAAGAACACGGACTGTTGGAAGTTTTGTGGT
TAGAAGCTCTCTGAGCCTCCTCACTGCTTTGACCTTATTGGCTAAT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2G040JQ 619 0 0
CGTGAAGTGAAACTTGAAGATTAACTGAACAGAGCAAAATGGCTGTTCCTTATAGCAAAA
CATGTTAACTTAAAAAAATTTCACAAACAAGATTGCATACTACAAAACAATAACACAACC
AACCTCTTCTCATCTAAGTTTTACACCCTCTTCTTCAGGATGTGCAATCAAGCATCCGGT
TCTTGATTGGAACGTGAACTCGAGGAGCCAGGTTTCGGAGCACCGTGCTTCTTGTTCTTC
CTGATTCTAGCTTTCTTGGCTTTCATCCTGCGTTTCTTCTCAGCTGAGTCTACCCATGTG
TAATCTGAGGGTATAAGGAAAGGGTACACCTCATCGTCCCTGAAACGGTTACTCTCGTAG
TCACTTGACTGGCCTCCACCGCGTGTGCCTTTCATCC*ACGACACCCATGAAGAATTATC
TGATGACTTTGCATCATGAAAAACAGGGCTAGAAGGAGGCGTTGAGAATTCCTCAAATGG
TTGGAGCTCTTCGAATTTAGTGAAAGTGACAAGAACACGGACTGTTGGAAGTTTTGTGGT
TAGAAGCTCTCTGAGCCTCCTCACTGCTTTGACCTTATTGGCTAATATGTCAAGAAGAGG
AAGAAGCTCTTCTGTCTTC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2H989TF 619 0 0
CGTGAAGTGAAACTTGAAGATTAACTGAACAGAGCAAAATGGCTGTTCCTTATAGCAAAA
CATGTTAACTTAAAAAAATTTCACAAACAAGATTGCATACTACAAAACAATAACACAACC
AACCTCTTCTCATCTAAGTTTTACACCCTCTTCTTCAGGATGTGCAATCAAGCATCCGGT
TCTTGATTGGAACGTGAACTCGAGGAGCCAGGTTTCGGAGCACCGTGCTTCTTGTTCTTC
CTGATTCTAGCTTTCTTGGCTTTCATCCTGCGTTTCTTCTCAGCTGAGTCTACCCATGTG
TAATCTGAGGGTATAAGGAAAGGGTACACCTCATCGTCCCTGAAACGGTTACTCTCGTAG
TCACTTGACTGGCCTCCACCGCGTGTGCCTTTCATCC*ACGACACCCATGAAGAATTATC
TGATGACTTTGCATCATGAAAAACAGGGCTAGAAGGAGGCGTTGAGAATTCCTCAGATGG
TTGGAGCTCTTCGAATTTAGTGAAAGTGACAAGAACACGGACTGTTGGAAGTTTTGTGGT
TAGAAGCTCTCTGAGCCTCCTCACTGCTTTGACCTTATTGGCTAATATGTCAAGAAGAGG
AAGAAGCTCTTCTGTCTTC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 4

CO CL2496Contig1 1024 4 12 U
GGGGTACTCTTCGATTTTAACGTGTGAACCCACTCGAGTTTTTGCAATCTCATCAAGTAT
GTCGACCGGAAAAGCACCGGAGAAGTCTAGTTTTTCCCGGAGATGTACTTTGCTCAGCCG
GTACTTGAAGGAGAAGGGTAGTTTCGGGAATATTGATATTAGTTTGGCTCATAAACTCGA
TCTTGATCTCGCCAGAAAATCTGATCTTAGAGGACAACAAAATGACATAAAGAAGGCAGA
CATTTCTGTAACCAGAACCTTCGATCCGACTCAGCTTTCAGTAGGTGAAGCCTCTACTTC
TCCCGGAGTCAAACCCAGCTTTGTCGATCTAAGTGAACCAGCAAGCGTAGTACCGAAGCC
TGGAAACTCCCAGTTGACCATGATCTTCCGCAATAAACTTATGGTTTACGAGTTGCCTGA
AGACAAAGCAAAGGAGATAATTGAAGCAGCGAGCGAAGCACATCGTGTTGCTGTTGTTTC
AAAGAACACTCAGAACCTAAACATGAACGTCAGCAACAAAAGCAACGTTGTGATTCCTGA
TCTGAACGAGCCAACTAGTTCCGGAACCAACAACGATGATAATGGAACCGGAGAGCAACA
TCAAGTCGTGGAACGCATTGCAAGAAGAGCCTCTCTTCATCGATTCTTTGCTAAACGAAA
AGACAGGGCTGTGGCTAGAGCTCCGTATCAAGTGAATCAAAGTGGTGGTCATCTTCCTCC
CAAGCCACAAAAGGTTGGTCCATCGGTAGAGCTAGGACAACCCTCGCGACAGCCTGAGAC
TCCCTCAAAACCAAAGAGAGATAACGATGTGTCGATGGAAGTGGACGGAGAAGAAGGGCG
GTGTTCGAAAGATCTCGAACTCAAACTTTAGGACATATAAAATGTTCATGATCGAGTTCA
CGTTTGGATTTTGACTTATTTAGGATTTGAAGTTACATAATATATGTTTAGATTCTTTGA
GGTTGTATTATTACGTAGTCATACTTTTCTATATAACTATATATACTCGTTTCCCAAAAA
AAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2C242TF U 495
AF RR2F017TF U 1
AF RR2C242JQ C 348
AF RR2F017JQ C 333
BS 1 499 RR2F017TF
BS 500 500 RR2C242TF
BS 501 594 RR2F017TF
BS 595 595 RR2C242TF
BS 596 735 RR2F017TF
BS 736 736 RR2F017JQ
BS 737 763 RR2F017TF
BS 764 861 RR2F017JQ
BS 862 862 RR2C242JQ
BS 863 913 RR2F017JQ
BS 914 914 RR2C242JQ
BS 915 1024 RR2F017JQ

RD RR2C242TF 161 0 0
ACCTAAACATGAACGTCAGCAACAAAAGCAACGTTGTGATTCCTGATCTGAACGAGCCAA
CTAGTTCCGGAACCAACAACGATGATGATGGAACCGGAGAGCAACATCAAGTCGTGGAAC
GCATTGCAAGAAGAGCCTCTCTTCATCGATTCTTTGCTAAA

QA 1 161 1 161
DS 

RD RR2F017TF 763 0 0
GGGGTACTCTTCGATTTTAACGTGTGAACCCACTCGAGTTTTTGCAATCTCATCAAGTAT
GTCGACCGGAAAAGCACCGGAGAAGTCTAGTTTTTCCCGGAGATGTACTTTGCTCAGCCG
GTACTTGAAGGAGAAGGGTAGTTTCGGGAATATTGATATTAGTTTGGCTCATAAACTCGA
TCTTGATCTCGCCAGAAAATCTGATCTTAGAGGACAACAAAATGACATAAAGAAGGCAGA
CATTTCTGTAACCAGAACCTTCGATCCGACTCAGCTTTCAGTAGGTGAAGCCTCTACTTC
TCCCGGAGTCAAACCCAGCTTTGTCGATCTAAGTGAACCAGCAAGCGTAGTACCGAAGCC
TGGAAACTCCCAGTTGACCATGATCTTCCGCAATAAACTTATGGTTTACGAGTTGCCTGA
AGACAAAGCAAAGGAGATAATTGAAGCAGCGAGCGAAGCACATCGTGTTGCTGTTGTTTC
AAAGAACACTCAGAACCTAGACATGAACGTCAGCAACAAAAGCAACGTTGTGATTCCTGA
TCTGAACGAGCCAACTAGTTCCGGAACCAACAACGATGATAATGGAACCGGAGATCAACA
TCAAGTCGTGGAACGCATTGCAAGAAGAGCCTCTCTTCATCGATTCTTTGCTAAACGAAA
AGACAGGGCTGTGGCTAGAGCTCCGTATCAAGTGAATCAAAGTGGTGGTCATCTTCCTCC
CAAGCCACAAAAGGT*GGTCCATCGGTAGAGCTAGGACAACCC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2C242JQ 642 0 0
TAGTACCAAAGCCTGGAAACTCCCAGTTGACCATGATCTTCCGCGATAAACTTATGGTTT
ACGAGTTGCCTGAAGACAAAGCAAAGGAGATAATTGAAGCAGCGAGCGAAGCACATCGTG
TTGCTGTTGTTTCAAAGAACACTCAGAACCTAAACATGAACGTCAGCAACAAAAGCAACG
TTGTGATTCCTGATCTGAACGAGCCAACTAGTTCCGGAACCAACAACGATGATAATGGAA
CCGGAGAGCAACATCAAGTCGTGGAACGCATTGCAAGAAGAGCCTCTCTTCATCGATTCT
TTGCTAAACGAAAAGACAGGGCTGTGGCTAGAGCTCCGTATCAAGTGAATCAAAGTGGTG
GTCATCTTCCTCCCAAGCCACAAAAGGTTGGTCCATCGGTAGAGCTAGGACAACCCTCGC
GACAGCCTGAGACTCCCTCAAAACCAAAGAGAGATAACGATGTGTCGATGGAAGTGGACG
GAGAAGAAGGGCGGTGTTCGAAAGATCTCGAACTCAAACTTTAGGACATATAAAATGTTC
ATGGTCGAGTTCACGTTTGGATTTTGACTTATTTAGGATTTGAAGTTACATAATATATGT
TTAGATTCTTTGAGGTTGTATTATTACGTAGTCATACTTTTC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2F017JQ 692 0 0
GTGAACCAGCAAGCGTAGTACCGAAGCCTGGAAACTCCCAGTTGACCATGATCTTCCGCA
ATAAACTTATGGTTTACGAGTTGCCTGAAGACAAAGCAAAGGAGATAATTGAAGCAGCGA
GCGAAGCACATCGTGTTGCTGTTGTTTCAAAGAACACTCAGAACCTAGACATGAACGTCA
GCAACAAAAGCAACGTTGTGATTCCTGATCTGAACGAGCCAACTAGTTCCGGAACCAACA
ACGATGATAATGGAACCGGAGATCAACATCAAGTCGTGGAACGCATTGCAAGAAGAGCCT
CTCTTCATCGATTCTTTGCTAAACGAAAAGACAGGGCTGTGGCTAGAGCTCCGTATCAAG
TGAATCAAAGTGGTGGTCATCTTCCTCCCAAGCCACAAAAGGTTGGTCCATCGGTAGAGC
TAGGACAACCCTCGCGACAGCCTGAGACTCCCTCAAAACCAAAGAGAGATAACGATGTGT
CGATGGAAGTGGACGGAGAAGAAGGGCGGTGTTCGAAAGATCTCGAACTTAAACTTTAGG
ACATATAAAATGTTCATGATCGAGTTCACGTTTGGATTTTGGCTTATTTAGGATTTGAAG
TTACATAATATATGTTTAGATTCTTTGAGGTTGTATTATTACGTAGTCATACTTTTCTAT
ATAACTATATATACTCGTTTCCCAAAAAAAAA

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 4

CO CL2497Contig1 845 4 19 U
GAATCGACGTTGCGACTTGTACCGCCACAATCGGTCGTAGATGGCTTACAGAGGAGGACG
AGGAAGAGGAAGAGGTGGGTTTGGTGGGTTTGGCGTTGAGTACGCAAAGGCAGAACCTTT
TGTTATCTTCCCTGACATTACGTTACCCGACCGTAAATCAATCTCAGACGATACCCAATT
ACTTAAGAACTTCAATTATTTTGAGAGGTTCTGGAAAAATTCGCCTTACCACTTAGGCGA
TGGTGTTTCAAAGAAAGAGAGTGAGAGTTTAGACATTGAGAGGTTCTCAGACACGTTGAA
GCCGAAGAAGACGAAGTCTAATGCGAGGGGATCTTTCTATGACTTCCTTGTTCTTAGACC
TGATAACTTCCCTAAAGAACTTCTTGGAGATAGTCGAAGAGAACGGCCTGTGAAGAGAGC
TAGATGGACTCAAGACGCAGATCTGCAGAAGCTGGAGGCCTCGGAGAAACTTGAAGCGAA
GCTTAAGGCTGACGGCAAGGAAGAGAATGAAGAAGGAGAAGGTGATGATGAAGTTGAGGA
ATCTGAGGGAGAAGATTCTGATAACGGAGACTATGATAAGAATAAAGACTTTGACGATGA
TGATGACGATTATAACGAGCCGGAGGATAACGATAATGAAGAAGTGTATATGTAAGGCTT
CTTTTTCTTTATGTCTTCCCAAAAAAAGGATCAAGTTTTGAGTGCAAGAGATGGTAGAAA
CTCAATTTTAATTACCTTCAAACCCTCTTAGAATAATACAAGCGCAATTTTGGCATTTGT
TGCTTTCATTCTTTTTTTTTTTTTTGCTTTAATCTATGGGGAATTAGCTGTAATACACAT
AAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2FF77TF U 3
AF RR2BL31TF U 1
AF RR2FF77JQ C 136
AF RR2BL31JQ C 156
BS 1 147 RR2BL31TF
BS 148 148 RR2FF77TF
BS 149 149 RR2BL31TF
BS 150 150 RR2FF77TF
BS 151 218 RR2BL31TF
BS 219 219 RR2FF77TF
BS 220 260 RR2BL31TF
BS 261 261 RR2FF77TF
BS 262 291 RR2BL31TF
BS 292 292 RR2FF77TF
BS 293 492 RR2BL31TF
BS 493 493 RR2FF77TF
BS 494 625 RR2BL31TF
BS 626 626 RR2FF77JQ
BS 627 656 RR2BL31TF
BS 657 657 RR2FF77JQ
BS 658 681 RR2BL31TF
BS 682 774 RR2FF77JQ
BS 775 845 RR2BL31JQ

RD RR2FF77TF 650 0 0
GAATCGACGTTGCT
TTGTACCTCCACAATCGGTCGTAGATGGCTTACAGAGGAGGACGAGGAAGAGGAAGAGGT
GGGTTTGGTGGGTTTGGCGTTGAGTACGCAAAGGCAGAACCTTTTGTTATCTTCCCTGAC
ATTACGTTACCCGACCGTAAATCAATCTCAGACGATACCCAATTACTTAAGAACTTTAAT
TATTTTGAGAGGTTCTGGAAAAATTCGCCTTACCACTTAGGCGATGGTGTTTCAAAGAAA
GAGAGTGAGAGTTTAGACATTGAGAGGTTCTCAGACACGTTGAAGCCGAAGAAGACGAAG
TCTAATGCGAGGGGATCTTTCTATGACTTTCTTGTTCTTAGACCTGATAACTTCCCTAAA
GAACTTCTTGGAGATAGTCGAAGAGAACGGCCTGTGAAGAGAGCTAGATGGACTCAAGAC
GCAGATCTGCAGAAGCTGGAGGCCTTGGAGAAACTTGAGGCGAAGCTTAAGGCTGACGGC
AAGGAAGAGAATGAAGAAGGAGAAGGTGATGATGAAGTTGAGGAATCTGAGGGAGAAGAT
TCTGATAACGGAGACTATGATAAGAATAAAGACTTTGACGATGATGATGACGATTATAAC
GAGCCGGAG*ATAACGATAATGAAGAAGTGTATATG

QA 15 650 15 650
DS 

RD RR2BL31TF 681 0 0
GAATCGACGTTGCGACTTGTACCGCCACAATCGGTCGTAGATGGCTTACAGAGGAGGACG
AGGAAGAGGAAGAGGTGGGTTTGGTGGGTTTGGCGTTGAGTACGCAAAGGCAGAACCTTT
TGTTATCTTCCCTGACATTACGTTACCTGGCCGTAAATCAATCTCAGACGATACCCAATT
ACTTAAGAACTTCAATTATTTTGAGAGGTTCTGGAAAAGTTCGCCTTACCACTTAGGCGA
TGGTGTTTCAAAGAAAGAGATTGAGAGTTTAGACATTGAGAGGTTCTCAGAGACGTTGAA
GCCGAAGAAGACGAAGTCTAATGCGAGGGGATCTTTCTATGACTTCCTTGTTCTTAGACC
TGATAACTTCCCTAAAGAACTTCTTGGAGATAGTCGAAGAGAACGGCCTGTGAAGAGAGC
TAGATGGACTCAAGACGCAGATCTGCAGAAGCTGGAGGCCTCGGAGAAACTTGAAGCGAA
GCTTAAGGCTGATGGCAAGGAAGAGAATGAAGAAGGAGAAGGTGATGATGAAGTTGAGGA
ATCTGAGGGAGAAGATTCTGATAACGGAGACTATGATAAGAATAAAGACTTTGACGATGA
TGATGACGATTATAACGAGCCGGAG*ATAACGATAATGAAGAAGTGTATATGTAAG*CTT
CTTTTTCTTTATGTCTTCCCA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2FF77JQ 639 0 0
CATTACGTTACCCGACCGTAAATCAATCTCAGACGATACCCAATTACTTAAGAACTTTAA
TTATTTTGAGAGGTTCTGGAAAAATTCGCCTTACCACTTAGGCGATGGTGTTTCAAAGAA
AGAGAGTGAGAGTTTAGACATTGAGAGGTTCTCAGACACGTTGAAGCCGAAGAAGACGAA
GTCTAATGCGAGGGGATCTTTCTATGACTTTCTTGTTCTTAGACCTGATAACTTCCCTAA
AGAACTTCTTGGAGATAGTCGAAGAGAACGGCCTGTGAAGAGAGCTAGATGGACTCAAGA
CGCAGATCTGCAGAAGCTGGAGGCCTTGGAGAAACTTGAGGCGAAGCTTAAGGCTGACGG
CAAGGAAGAGAATGAAGAAGGAGAAGGTGATGATGAAGTTGAGGAATCTGAGGGAGAAGA
TTCTGATAACGGAGACTATGATAAGAATAAAGACTTTGACGATGATGATGACGATTATAA
CGAGCCGGAGGATAACGATAATGAAGAAGTGTATATGTAAGGCTTCTTTTTCTTTATGTC
TTCCCAAAAAAAGGATCAAGTTTTGAGTGCAAGAGATGGTAGAAACTCAATTTTAATTAC
CTTCAAACCCTCTTAGAATAATACAAGCGCAATTTTGGC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2BL31JQ 690 0 0
AATCAATCTCAGACGATACCCAATTACTTAAGAACTTCAATTATTTTGAGAGGTTCTGGA
AAAGTTCGCCTTACCACTTAGGCGATGGTGTTTCAAAGAAAGAGATTGAGAGTTTAGACA
TTGAGAGGTTCTCAGAGACGTTGAAGCCGAAGAAGACGAAGTCTAATGCGAGGGGATCTT
TCTATGACTTCCTTGTTCTTAGACCTGATAACTTCCCTAAAGAACTTCTTGGAGATAGTC
GAAGAGAACGGCCTGTGAAGAGAGCTAGATGGACTCAAGACGCAGATCTGCAGAAGCTGG
AGGCCTCGGAGAAACTTGAAGCGAAGCTTAAGGCTGATGGCAAGGAAGAGAATGAAGAAG
GAGAAGGTGATGATGAAGTTGAGGAATCTGAGGGAGAAGATTCTGATAACGGAGACTATG
ATAAGAATAAAGACTTTGACGATGATGATGACGATTATAACGAGCCGGAGGATAACGATA
ATGAAGAAGTGTATATGTAAGGCTTCTTTTTCTTTATGTCTTCCCAAAAAAAGGATCAAG
TTTTGAGTGCAAGAGATGGTGGAAACTCAATTTTAATTACCTTCAAACCCTCTTAGAATA
ATACAAGCGCAATTTTGGCATTTGTTGCTTTCATTCTTTTTTTTTTTTTTGCTTTAATCT
ATGGGGAATTAGCTGTAATACACATAAAAA

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 3

CO CL2498Contig1 979 3 8 U
GGGACTAGAGAGAGAACAAATAAAAGAAAGTGTTCGATCTTTTGGTCTCATCTACCATTT
TTTATTTCTTTAAACTTGAGTTTGAATCTATATATCTTCCCAGTTTAGATTCACAGTTTC
TGTCTTCGGTTTCACTCTTGTTGTGATGGAAGAAGTGAAGGGACAGAGAGGAAATGGAAC
CACTGAGGCTGATTTTGTGTTGCAATGGGGGGAGAGAAAAAGAGTTAGGTGCATGAAAGT
TAAGAAAGATCAAAGCCGCAAGTCAACCGATTGTTTGTCTAATAAGCGCAAACTCATGTC
GCGAGCTGTGTCTTCTGAGAGAGGCTCTCCTTCTCGCCATCTTAACCGTCCAAACAAGAT
GGTAGATTCTCCAGGTGGTAATGTTAGGAGATCGTTTGTGGCATCCCCTGAGAAGGAAGA
TAGATACTACACAACGAGGGGTTCTATGGGTACAGATGAGAGTGGGAAAATTATAAAGGA
AACTGTGAAGGAAACCAAGAAGCATGTGTGGCCAAAGTTGTTTATAACTTTGTCAAATAA
GGAGAAGGAAGAAGATTTCTTGGCTATGAAAGGGTGCAAGCTTCCTCAGAGACCAAAGAA
ACGAGCCAAATTGGTTCAGAAGACATTGCCTCTGGTGAGTCCAGGTACTTGGTTATCAGA
TCTGTGCAAAGAGAGGTATGAAGTAAGAGAGAAGAAGACTTCAAAAAAAGCGACCAAGAG
GATTGAAGGCAATGGGGAGCATGGAAAGCGATTCAGAGTGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAC
TTGAGAAGCATTCCAGATTTTGGTGAAGGCTAGAAGAGGGAGGAGACAACGCACATGAAT
CTGTTTTGTTTTTTTAATTACATTTTGAGATATCTCTCTTCCTCTTCTCTACAGGTCAAA
CAAACTATGAGGCACTTGCATTTTTGCTTTCGAAGCTAGTCTATTAGTCTTCCTAATCGA
AATCTCGTTTTTATTGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO14TF U 1
AF RR2F917TF U 214
AF RR2GO14JQ C 203
BS 1 536 RR2GO14TF
BS 537 537 RR2GO14JQ
BS 538 558 RR2F917TF
BS 559 559 RR2GO14JQ
BS 560 563 RR2F917TF
BS 564 564 RR2GO14JQ
BS 565 764 RR2F917TF
BS 765 979 RR2GO14JQ

RD RR2GO14TF 537 0 0
GGGACTAGAGAGAGAACAAATAAAAGAAAGTGTTCGATCTTTTGGTCTCATCTACCATTT
TTTATTTCTTTAAACTTGAGTTTGAATCTATATATCTTCCCAGTTTAGATTCACAGTTTC
TGTCTTCGGTTTCACTCTTGTTGTGATGGAAGAAGTGAAGGGACAGAGAGGAAATGGAAC
CACTGAGGCTGATTTTGTGTTGCAATGGGGGGAGAGAAAAAGAGTTAGGTGCATGAAAGT
TAAGAAAGATCAAAGCCGCAAGTCAACCGATTGTTTGTCTAATAAGCGCAAACTCATGTC
GCGAGCTGTGTCTTCTGAGAGAGGCTCTCCTTCTCGCCATCTTAACCGTCCAAACAAGAT
GGTAGATTCTCCAGGTGGTAATGTTAGGAGATCGTTTGTGGCATCCCCTGAGAAGGAAGA
TAGATACTACACAACGAGGGGTTCTATGGGTACAGATGAGAGTGGGAAAATTATAAAGGA
AACTGTGAAGGAAACCAAGAAGCATGTGTGGCCAAAGTTGTTTATAACTTTGTCAA
A

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2F917TF 551 0 0
GAGAAAAAGAGTTAGGTGCATGAAAGTTAAGAAAGATCAAAGCCGCAAGTCAACTGATTG
TTTGTCTAATAAGCGCAAACTCATGTCGCGGGCTGTGTCTTCTGAGAGAGGCTCTCCTTC
TCGCCATCTTAACCGTCCAAACAAGATGGTAGATTCTCCAGGTGGTAATGTTAGGAGATC
GTTTGTGGCATCCCCTGAGAAGGAAGATAGATACTACACAACGAGGGGTTCTATGGGTAC
AGATGAGAGTGGCAAAATTATAAAGGAAACTGTGAAGGAAACCAAGAAACATGTGTGGCC
AAAGTTGTTTATAACTTTGTCAAGTAAGGAGAAGGAAGAAGATTTTTTGGTTATGAAAGG
GTGCAAGCTTCCTCAGAGACCAAAGAAACGAGCCAAATTGGTTCAGAAGACATTGCCTCT
GGTGAGTCCAGGTACTTGGTTATCAGATCTGTGCAAAGAGAGGTATGAAGTAAGAGAGAA
GAAGACTTCAAAAAAAGCGACCAAGAGGATTGAAGGCAATGGGGAGCATGGAAAGCGATT
CAGAGTGAAGA

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2GO14JQ 777 0 0
CAATGGGGGGAGAGAAAAAGAGTTAGGTGCATGAAAGTTAAGAAAGATCAAAGCCGCAAG
TCAACCGATTGTTTGTCTAATAAGCGCAAACTCATGTCGCGAGCTGTGTCTTCTGAGAGA
GGCTCTCCTTCTCGCCATCTTAACCGTCCAAACAAGATGGTAGATTCTCCAGGTGGTAAT
GTTAGGAGATCGTTTGTGGCATCCCCTGAGAAGGAAGATAGATACTACACAACGAGGGGT
TCTATGGGTACAGATGAGAGTGGGAAAATTATAAAGGAAACTGTGAAGGAAACCAAGAAG
CATGTGTGGCCAAAGTTGTTTATAACTTTGTCAAATAAGGAGAAGG**GAAGATTTCTTG
GCTATGAAAGGGTGCAAGCTTCCTCAGAGACCCAAGAAACGAGCCAAATTGGTTCAGAAG
ACATTGCTTCTGGTGAGTCCAGGTACTTGGTTATCAGATCTGTGCAAAGAGAGGTATGAA
GTAAGAGAGAAGAAGACTTCAAAAAA*GCGACCAAGAGGATTGAAGGCAATGGGGAGCAT
GGAAAGCGATTCAGAGTGAAGAAGAAGAAGAAGAGGACTTGAGAAGCATTCCAGATTTTG
GTGAAGGCTAGAAGAGGGAGGAGACAACGCACATGAATCTGTTTTGTTTTTTTAATTACA
TTTTGAGATATCTCTCTTCCTCTTCTCTACAGGTCAAACAAACTATGAGGCACTTGCATT
TTTGCTTTCGAAGCTAGTCTATTAGTCTTCCTAATCGAAATCTCGTTTTTATTGCGT

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL2499Contig1 1444 2 2 U
GGAGCGCGATTAGGGAGAGAGATCGATTTACACGTTGATACGCACGCACGACCAGAAGGT
ATCAGGTATGGTGAAGGAGAATGATTATTATGACATTTTAGCCGTCAAAACTGATGCTTC
CGAAGCTGACATTAAAAAGGCTTACTACTTAAAAGCAAGGAAAGTTCATCCTGACAAGAA
CCCTGGAGACCCTCAAGCCGCTAAAAACTTTCAGGTACTAGGCGAGGCTTATCAGGTTTT
GAGCAATCCTGAGAAGAGAGCCGCTTATGACAAATATGGCAAAGAAGGTGTTCAACAGGA
TGCAATGGTTGATCCTGCAGCTGTGTTTGGTATGCTTTTCGGAAGCGAAGTATTCGAAGA
ATACGTTGGGCAGCTTGCACTTGCTTACTTGGCATCAATTGAAGCTGACTTAGAATCATA
CGAGCCTGACATCAGAAAGCAAATGCTCCAAGACAAGATCAAAGCTCTTCAGAAGGAGAG
GGAAGACAAGCTCGCCGCTACGTTGAAAAACAAACTCGAACCGTTTGTGGAAGGACGCAC
CGACGAGTTTACCGAATGGGCGAACCAAGAGGCAAAGAGTCTTTCTTCTGCTGGTTTCGG
GGAGGCGATGATGCACACGATTGGCTACATATACACGAGAAAAGCCGCTAAAGAAATAGG
GAAAGGCAAACGGTTTTGAAAGTGCCCTTCTTGGCTGAGTGGGTGCGTGACAAAGGGCAC
CACATGAAATCTCAAGTGATGGCTGCTTCTGGTGCGGTCTCGTTGCTTCAGTTGCAGGAC
GAAGTGAACAGGTTGCATGAGCACCAAGGAGATAACAAAGAGGAGCATATTCAGAAAGCC
ATTGAGGCTAAAATGGATGCTTTGCTTCAATCTCTTTGGCAAATCAATGTTCTCGACATC
GAGTCAACTCTCTCTCACGTCTGCCAATCTGTGCTTAGAGATCCAAGTGTTTCCAAAGAT
GTTCTTCGAGCTCGAGCCGCAGGACTGAGGAAACTTGGAACGATCCTCCAGGTGAGCAAA
AAAAAAAGGGGGGCTAAGATGCCATACACCAGAGGAAGCAGCTTACGTCACGAAGTCGTG
AAACTGGACACCTGAGGTTCTTCAAACGCGACGCCTTGAAACTCACATCACCTTTCGGCA
GAAAAAAAAGAGAGAAACCTGAATTTCATAAGCCGTTTTCTTTTCTTACATATTTTGTTT
GGCTATTGGCTCAAGTTTGGATTTGTCTTTTGGTCTTTTATTTTTAATTAATTTCACAGT
TTTGTAGTGAGATTTTTTTCCTAAGTAAATGATTTATCAATAGATCAAACCTAACCTATA
TAGGCCACTGTTTAGTATTGATTTTGGCTTTGACTAAAAATTTATAAACACTTAACCTGT
AAACAAAAATCAAGTTTTGTAGGGTTAAAAAACATTATTGATTAGTGAACAAATTTTTTT
AGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2FA62TF U 1
AF RR2CR74JQ C 692
BS 1 777 RR2FA62TF
BS 778 1444 RR2CR74JQ

RD RR2FA62TF 783 0 0
GGAGCGCGATTAGGGAGAGAGATCGATTTACACGTTGATACGCACGCACGACCAGAAGGT
ATCAGGTATGGTGAAGGAGAATGATTATTATGACATTTTAGCCGTCAAAACTGATGCTTC
CGAAGCTGACATTAAAAAGGCTTACTACTTAAAAGCAAGGAAAGTTCATCCTGACAAGAA
CCCTGGAGACCCTCAAGCCGCTAAAAACTTTCAGGTACTAGGCGAGGCTTATCAGGTTTT
GAGCAATCCTGAGAAGAGAGCCGCTTATGACAAATATGGCAAAGAAGGTGTTCAACAGGA
TGCAATGGTTGATCCTGCAGCTGTGTTTGGTATGCTTTTCGGAAGCGAAGTATTCGAAGA
ATACGTTGGGCAGCTTGCACTTGCTTACTTGGCATCAATTGAAGCTGACTTAGAATCATA
CGAGCCTGACATCAGAAAGCAAATGCTCCAAGACAAGATCAAAGCTCTTCAGAAGGAGAG
GGAAGACAAGCTCGCCGCTACGTTGAAAAACAAACTCGAACCGTTTGTGGAAGGACGCAC
CGACGAGTTTACCGAATGGGCGAACCAAGAGGCAAAGAGTCTTTCTTCTGCTGGTTTCGG
GGAGGCGATGATGCACACGATTGGCTACATATACACGAGAAAAGCCGCTAAAGAAATAGG
GAAAGGCAAACGGTTTTGAAAGTGCCCTTCTTGGCTGAGTGGGTGCGTGACAAAGGGCAC
CACATGAAATCTCAAGTGATGGCTGCTTCTGGTGCGGTCTCGTTGCTTCAGTTGCAG
ACGAGT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2CR74JQ 753 0 0
TA
GCTGAGTGGGTGCGTGACAAAGGGCACCACATGAAGTCTCAAGTGATGGCTGCTTCTGGT
GCGGTCTCGTTGCTTCAGTTGCAGGACGAAGTGAACAGGTTGCATGAGCACCAAGGAGAT
AACAAAGAGGAGCATATTCAGAAAGCCATTGAGGCTAAAATGGATGCTTTGCTTCAATCT
CTTTGGCAAATCAATGTTCTCGACATCGAGTCAACTCTCTCTCACGTCTGCCAATCTGTG
CTTAGAGATCCAAGTGTTTCCAAAGATGTTCTTCGAGCTCGAGCCGCAGGACTGAGGAAA
CTTGGAACGATCCTCCAGGTGAGCAAAAAAAAAAGGGGGGCTAAGATGCCATACACCAGA
GGAAGCAGCTTACGTCACGAAGTCGTGAAACTGGACACCTGAGGTTCTTCAAACGCGACG
CCTTGAAACTCACATCACCTTTCGGCAGAAAAAAAAGAGAGAAACCTGAATTTCATAAGC
CGTTTTCTTTTCTTACATATTTTGTTTGGCTATTGGCTCAAGTTTGGATTTGTCTTTTGG
TCTTTTATTTTTAATTAATTTCACAGTTTTGTAGTGAGATTTTTTTCCTAAGTAAATGAT
TTATCAATAGATCAAACCTAACCTATATAGGCCACTGTTTAGTATTGATTTTGGCTTTGA
CTAAAAATTTATAAACACTTAACCTGTAAACAAAAATCAAGTTTTGTAGGGTTAAAAAAC
ATTATTGATTAGTGAACAAATTTTTTTAGAT

QA 3 753 3 753
DS 



AS 1 4

CO CL2500Contig1 1069 4 26 U
TTTTTTTTTGTTCTCAAGATGGATTCTGTTGGTCTCCTTCAGCCTCTCCACAATCTTTCT
TCCACCATCTTCTTTTCACAGCAGCGAAGTCCTCGTTTGATGATGGTTCATTTCTCATCC
TCTCTGAAACCGTTACCCTCGAAAAGACTCAATCTTTCGAAACCCTCTACTCTCACATTT
GCTCTTGCCGAATCAGATTCTCCTCAGCCTTTAGAAACAAGCTCGAAATCTCTTCTCCTA
CAACTCTCTAAGTGTTTCGATCTTCCATCAGATTACTTCCAGCAGCTACCAAGTGATCTT
CGTCTCGATTTAAATGATGCTGCCTTTGATCTGTCCAATGGACCCATCATCGATGAGTGT
GGTCAAGAGCTTGGGGAGACGTTACTGAATCTGTCCCGTGCTTGGGAACAAGCTGACACA
TCAACCTCTCGTACTTTAGTGAAGAAACTTCCCCAACTGGAAAGTTCATTAACGGCTGGT
GCCAAATCATCCTTTGGGAGGCGTCTGATATCTGCGGGAAAAAGGTTCAGGGGAATGGGA
CAGTATGGTCAAGGTGAATTACAGAAGATTGCTAAAGCGATGATTACAACTGGAGAGGTC
CTGTCTGCAAATACATCACCTGCCTCAGTCGGTAATGAATCCAAGTCAAATACGAGGATG
TTTAAGTTTGGGGAGCTACAGGTTGCTGTGAGTCCAGAGAAAGCATACGCTGGAGCTGCC
ATTTCATTTGTGTCTGGGATACTTTCATGGCAAATCAGTCAGGGAATCCAAAGCATACCA
GAGAGCTCATTGCAGTACGCTAATGACAATGCCTTGCAACTCGCAAAGTCTCTAAGAGGG
TCTCTTCTAGCTACGTTTTATGCGTCAGCCGTCTTGTCAGGCTTCACAACAGCTGGCCTC
CTCCTTCTCGCTAAGCAGCTTTCATCAGAGAAAGACTCATCATAATCCTTCCGGGGATAA
TCTCTAATGTTAAATCATGTACCTACTACAATCTTTAATTCTGTCTGTTAAAACTGTGGA
ATGGGTTGAGTTGTATTTTGTTTTAGAGCCAATGAAATAAATCTCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FG24TF U 1
AF RR2E854TF U 71
AF RR2E854JQ C 328
AF RR2FG24JQ C 371
BS 1 188 RR2FG24TF
BS 189 189 RR2E854TF
BS 190 190 RR2FG24TF
BS 191 192 RR2E854TF
BS 193 236 RR2FG24TF
BS 237 237 RR2E854TF
BS 238 332 RR2FG24TF
BS 333 333 RR2E854TF
BS 334 354 RR2FG24TF
BS 355 355 RR2E854TF
BS 356 387 RR2FG24TF
BS 388 388 RR2E854TF
BS 389 553 RR2FG24TF
BS 554 554 RR2E854TF
BS 555 681 RR2FG24TF
BS 682 682 RR2E854JQ
BS 683 709 RR2FG24TF
BS 710 733 RR2E854JQ
BS 734 734 RR2FG24JQ
BS 735 843 RR2E854JQ
BS 844 844 RR2FG24JQ
BS 845 872 RR2E854JQ
BS 873 873 RR2FG24JQ
BS 874 892 RR2E854JQ
BS 893 893 RR2FG24JQ
BS 894 1069 RR2E854JQ

RD RR2FG24TF 709 0 0
TTTTTTTTTGTTCTCAAGATGGATTCTGTTGGTCTCCTTCAGCCTCTCCACAATCTTTCT
TCCACCATCTTCTTTTCACAGCAGCGAAGTCCTCGTTTGATGATGGTTCATTTCTCATCC
TCTCTGAAACCGTTACCCTCGAAAAGACTCAATCTTTCGAAACCCTCTACTCTCACATTT
GCTCTTGCTGGGTCAGATTCTCCTCAGCCTTTAGAAACAAGCTCGAAATCTCTTCTTCTA
CAACTCTCTAAGTGTTTCGATCTTCCATCAGATTACTTCCAGCAGCTACCAAGTGATCTT
CGTCTCGATTTAAATGATGCTGCCTTTGATCTCTCCAATGGACCCATCATCGATAAGTGT
GGTCAAGAGCTTGGGGAGACGTTACTGGATCTGTCCCGTGCTTGGGAACAAGCTGACACA
TCAACCTCTCGTACTTTAGTGAAGAAACTTCCCCAACTGGAAAGTTCATTAACGGCTGGT
GCCAAATCATCCTTTGGGAGGCGTCTGATATCTGCGGGAAAAAGGTTCAGGGGAATGGGA
CAGTATGGTCAAGTTGAATTACAGAAGATTGCTAAAGCGATGATTACAACTGGAGAGGTC
CTGTCTGCAAATACATCACCTGCCTCAGTCGGTAATGAATCCAAGTCAAATACGAGGATG
TTTAAGTTTGGGGAGCTACAG*TTGCTGTGAGTCCAGAGAAAGCATACG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2E854TF 624 0 0
TCTTTTCACAGCAGCGAAGTCCTCGTTTGATGATGGTTCATTTCTCATCCTCTCTGAAAC
CGTTACCCTCGAAAATACTCAATCTTTCGAAACCCTCTACTCTCACATTTGCTCTTGCCG
AATCAGATTCTCCTCAGCCTTTAGAAACAAGCTCGAAATCTCTTCTCCTCCAACTCTCTA
AGTGTTTCGATCTTCCATCAGATTACTTCCAGCAGCTACCAAGTGATCTTCGTCTCGATT
TAAATGATGCTGCCTTTGATCTGTCCAATGGACCCATCATCGATGAGTGTGGTCAAGAGC
TTGGGGAGACGTTACTGAATCTGTCCCGTGCTTGGGAACAAGCTGACACATCAACCTCTC
GTACTTTAGTGAATAAACTTCCCCAACTGGAAAGTTCATTAACGGCTGGTGCCAAATCAT
CCTTTGGGAGGCGTCTGATATCTGCGGGAAAAAGGTTCAGGGGAATGGGACAGTATGGTC
AAGGTGAATTACAGAAGATTGCTAAAGCGATGATTACAACTGGAGAGGTCCTGTCTGCAA
ATACATCACCTGCCTCCGTCGGTAATGAATCCAAGTCAAATACGAGGATGTTTAAGTTTG
GGGAGCTTCAG*TTGCTGTGAGTC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2E854JQ 742 0 0
GATCTGTCCAATGGACCCATCATCGATGAGTGTGGTCAAGAGCTTGGGGAGACGTTACTG
AATCTGTCCCGTGCTTGGGAACAAGCTGACACATCAACCTCTCGTACTTTAGTGAATAAA
CTTCCCCAACTGGAAAGTTCATTAACGGCTGGTGCCAAATCATCCTTTGGGAGGCGTTTG
ATATCTGCGGGAAAAAGGTTCAGGGGAATGGGACAGTATGGTCAAGGTGAATTACAGAAG
ATTGCTAAAGCGATGATTACAACTGGAGAGGTCCTGTCTGCAAATACATCACCTGCCTCC
GTCGGTAATGAATCCAAGTCAAATACGAGGATGTTTAAGTTTGGGGAGCTTCAGGTTGCT
GTGAGTCCAGAGAAGGCATACGCTGGAGCTGCCATTTCATTTGTGTTTGGGATACTTTCA
TGGCAAATCAGTCAGGGAATCCAAAGCATACCAGAGAGCTCATTGCAGTACGCTAATGAC
AATGCCTTGCAACTCGCAAAGTCTCTAAGAGGGTCTTTTCTAGCTACGTTTTATGCGTCA
GCCGTTTTGTCAGGCTTCACAACAGTTGGCCTCCTCCTTCTCGCTAAGCAGCTTTCATCA
GAGAAAGACTCATCATAATCCTTCCGGGGATAATCTCTAATGTTAAATCATGTACCTACT
ACAATCTTTAATTCTGTCTGTTAAAACTGTGGAATGGGTTGAGTTGTATTTTGTTTTAGA
GCCAATGAAATAAATCTCTTTG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2FG24JQ 699 0 0
TTGGGGAGACGTTACTGGATCTGTCCCGTGCTTGGGAACAAGCTGACACATCAACCTCTC
GTACTTTAGTGAAGAAACTTCCCCAACTGGAAAGTTCATTAACGGCTGGTGCCAAATCAT
CCTTTGGGAGGCGTCTGATATCTGCGGGAAAAAGGTTCAGGGGAATGGGACAGTATGGTC
AAGTTGAATTACAGAAGATTGCTAAAGCGATGATTACAACTGGAGAGGTCCTGTCTGCAA
ATACATCACCTGCCTCAGTCGGTAATGAATCCAAGTCAAATACGAGGATGTTTAAGTTTG
GGGAGCTACAGGTTGCTGTGAGTCCAGAGAAAGCATACGCTGGAGCTGCCATTTCATTTG
TGTCTGGGATACTTTCATGGCAAATCAGTCAGGGAATCCAAAGCATACCAGAGAGCTCAT
TGCAGTACGCTAATGACAATGCCTTGCAACTCGCAAAGTCTCTAAGAGGGTCTCTTCTAG
CTACGTTTTATGCGTCAGCCGTCTTGTCAGGCTTCACAACAGCTGGGCTCCTCCTTCTCG
CTAAGCAGCTTTCATCAGAGAAAGACTCATCATAATCCTTCCGGGGATGATCTCTAATGT
TAAATCATGTACCTACTACAATCTTTAATTCTGTCTGTTAAAACTGTGGAATGGGTTGAG
TTGTATTTTGTTTTAGAGCCAATGAAATAAATCTCTTTG

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 4

CO CL2501Contig1 878 4 5 U
GGGACATGATGGAGTTGGGAGGATTAGTTTTGGGGATAAAGGTAGTTCTGATCAGGAAGA
GACACCCTTTAATCTCAACCCTTCACACCCAAACTACAACATCACTGTGACTCGAGTACG
TGTGGGGACAACTCTGATTGATGATGAGTTTACAGCTCTCTTTGACACTGGCACATCGTT
TACTTATTTGGTTGATCCCATGTATACATCAGTCTCAGAAAGTTTTCATTCTCAGGCCCA
AGATAAGCGCCATTCACCGGATCCAAGGATTCCCTTCGACTATTGCTATGACATGAGCTC
TGAAGCGAATGCGAGTTTGATACCGAGTTTAAGCCTGACAATGAAAGGAAACAGCCACTT
CACCATCAATGATCCTATAATCGTCATCTCTACTGAGGGTGAGCTTGTACATTGCCTGGC
CATCGTCAAAAGCTCTGAACTCAACATAATCGGACAAAACTACATGACCGGGTATCGTGT
AGTATTCGACAGAGAGAAGCTCATCTTAGCTTGGAAAAAGTTTGACTGCTATGATATCGA
AGAGACAAAGACAACTCTTGCCGGAGCAAACAAAACAGAGGCGGTGGCTCCGGCAATGGC
AGCCGGAATAAGGACTCATAATAACTCCTCAGAAGAGCTACACAAAACAAACCGAACCAA
CTCCAAAAGTAGTAGCTCTTCCTCCAACCAAAGATTTAAAACATTAAAGCTATGGTCTTT
CTTCAGATCTTTGTTCATATTACTTCCACTTTTATAGTAGAGTTTGTAGTAGTAGTAGTA
ATCTTCTTAAATTCACACTTCAAAAACACACCCATTTTGTTTGTATCATAAAAGATTATA
GAGATCAGCCTCTCCAGGAAATATATGTTCTTCCACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2AT76TF U 1
AF RR2AT76JQ C 85
AF RR2D351JQ C 303
AF RR2D351TF U 303
BS 1 467 RR2AT76TF
BS 468 469 RR2D351TF
BS 470 756 RR2AT76TF
BS 757 874 RR2D351TF
BS 875 878 RR2AT76JQ

RD RR2AT76TF 760 0 0
GGGACATGATGGAGTTGGGAGGATTAGTTTTGGGGATAAAGGTAGTTCTGATCAGGAAGA
GACACCCTTTAATCTCAACCCTTCACACCCAAACTACAACATCACTGTGACTCGAGTACG
TGTGGGGACAACTCTGATTGATGATGAGTTTACAGCTCTCTTTGACACTGGCACATCGTT
TACTTATTTGGTTGATCCCATGTATACATCAGTCTCAGAAAGTTTTCATTCTCAGGCCCA
AGATAAGCGCCATTCACCGGATCCAAGGATTCCCTTCGACTATTGCTATGACATGAGCTC
TGAAGCGAATGCGAGTTTGATACCGAGTTTAAGCCTGACAATGAAAGGAAACAGCCACTT
CACCATCAATGATCCTATAATCGTCATCTCTACTGAGGGTGAGCTTGTACATTGCCTGGC
CATCGTCAAAAGCTCTGAACTCAACATAATCGGACAAAACTACATGA**GGGTATCGTGT
AGTATTCGACAGAGAGAAGCTCATCTTAGCTTGGAAAAAGTTTGACTGCTATGATATCGA
AGAGACAAAGACAACTCTTGCCGGAGCAAACAAAACAGAGGCGGTGGCTCCGGCAATGGC
AGCCGGAATAAGGACTCATAATAACTCCTCAGAAGAGCTACACAAAACAAACCGAACCAA
CTCCAAAAGTAGTAGCTCTTCCTCCAACCAAAGATTTAAAACATTAAAGCTATGGTCTTT
CTTCAGATCTTTGTTCATATTACTTCCACTTTTATA
ATAG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2AT76JQ 794 0 0
ACACCCAAACTACAACATCACTGTGACTCGAGTACGTGTGGGGACAACTCTGATTGATGA
TGAGTTTACAGCTCTCTTTGACACTGGCACATCGTTTACTTATTTGGTTGATCCCATGTA
TACATCAGTCTCAGAAAGTTTTCATTCTCAGGCCCAAGATAAGCGCCATTCACCGGATCC
AAGGATTCCCTTCGACTATTGCTATGACATGAGCTCTGAAGCGAATGCGAGTTTGATACC
GAGTTTAAGCCTGACAATGAAAGGAAACAGCCACTTCACCATCAATGATCCTATAATCGT
CATCTCTACTGAGGGTGAGCTTGTACATTGCCTGGCCATCGTCAAAAGCTCTGAACTCAA
CATAATCGGACAAAACTACATGA**GGGTATCGTGTAGTATTCGACAGAGAGAAGCTCAT
CTTAGCTTGGAAAAAGTTTGACTGCTATGATATCGAAGAGACAAAGACAACTCTTGCCGG
AGCAAACAAAACAGAGGCGGTGGCTCCGGCAATGGCAGCCGGAATAAGGACTCATAATAA
CTCCTCAGAAGAGCTACACAAAACAAACCGAACCAACTCCAAAAGTAGTAGCTCTTCCTC
CAACCAAAGATTTAAAACATTAAAGCTATGGTCTTTCTTCAGATCTTTGTTCATATTACT
TCCACTTTTATAATAGAGTTTGTAGTAGTAGTAGTAATCTTCTTAAATTCACACTTCAAA
AACACACCCATTTTGTTTGTATCATAAAAGATTATAGAGATCAGCCTCTCCAGGAAATAT
ATGTTCTTCCACTC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2D351JQ 572 0 0
G
AGCGAATGCGAGTTTGATACCGAGTTTAAGCCTGACAATGAAAGGAAACAGCCACTTCAC
CATCAATGATCCTATAATCGTCATCTCTACTGTGGGTGAGCTTGTATATTGCCTGGCCAT
CGTCAAAAGCTCTGAACTCAACATAATCGGACAAAACTACATGACCGGGTATCGTGTAGT
ATTCGACAGAGAGGAGCTCATCTTAGCTTGGAAAAAGTTTGACTGCTATGATATCGAAGA
GACAAAGACAACTCTTGCCGGAGCAAACAAAACAGAGGCGGTGGCTCCGGCAATGGCAGC
CGGAATAAGGACTCATAATAACTCCTCAGAAGAGCTACATAAAACAAACCGGACCAACTC
CAAAAGTAGTAGCTCTTCCTCCAACCAAAGATTTAAAACATTAAAGCTATGGTCTTTCTT
CAGATCTTTGTTCATATTACTTCCACTTTTATAGTAGAGTTTGTAGTAGTAGTAGTAATC
TTCTTAAATTCACACTTCAAAAACACACCCATTTTGTTTGTATCATAAAAGATTATAGAG
ATCAGCCTCTCCAGGAAATATATGTTCTTCC

QA 2 572 2 572
DS 

RD RR2D351TF 572 0 0
G
AGCGAATGCGAGTTTGATACCGAGTTTAAGCCTGACAATGAAAGGAAACAGCCACTTCAC
CATCAATGATCCTATAATCGTCATCTCTACTGTGGGTGAGCTTGTATATTGCCTGGCCAT
CGTCAAAAGCTCTGAACTCAACATAATCGGACAAAACTACATGACCGGGTATCGTGTAGT
ATTCGACAGAGAGGAGCTCATCTTAGCTTGGAAAAAGTTTGACTGCTATGATATCGAAGA
GACAAAGACAACTCTTGCCGGAGCAAACAAAACAGAGGCGGTGGCTCCGGCAATGGCAGC
CGGAATAAGGACTCATAATAACTCCTCAGAAGAGCTACATAAAACAAACCGGACCAACTC
CAAAAGTAGTAGCTCTTCCTCCAACCAAAGATTTAAAACATTAAAGCTATGGTCTTTCTT
CAGATCTTTGTTCATATTACTTCCACTTTTATAGTAGAGTTTGTAGTAGTAGTAGTAATC
TTCTTAAATTCACACTTCAAAAACACACCCATTTTGTTTGTATCATAAAAGATTATAGAG
ATCAGCCTCTCCAGGAAATATATGTTCTTCC

QA 2 572 2 572
DS 



AS 1 4

CO CL2502Contig1 841 4 8 U
GGACTCCTCTCCGCCGTCTACACTCTCTCTCTCTCACTTATCATCATCACACACACTCTC
TGCTTCACAAGAAGAGCTTTCTGATTCGCCTCTGTTGTTTCTGCTTCTGGTTGATACTTT
CAGCTTAACCTCCAAGTCGATCAATATGTCAATGACGGAAGAAAGTAAGATGACGAAGCT
CGAATCGGCGGGAGACTCTTCGGACGTGGAGAACGGGAACTGTAGCAGTAGCGGAAGTGG
AGGAGGAGGAGGCGATACTAAGAAGACGTGCGTTGATTGCGGAACGAACAAGACTCCTCT
CTGGCGTGGTGGCCCTGCTGGTCCTAAATCATTGTGCAATGCGTGTGGGATCAAGAGCAG
GAAGAAGAGGCAAGCAGCTCTTGGGATCAAACAAGGGGATAATAATAAGATGAAGAACAA
CAAAAGTAACGATAGCTGTCTCGCTCTCGACAATCAGACGGTCAAAAACGGAAAAGGCGA
TTCAGGAAACGTTAAAAACAAGATCAAGACGGAGACCGAGGATTGTAACGACAAGAAGAG
TGTCAAAAGGGGGAGTAGATTTTTGGATTTAGGATTTAAAGTGCCGGTGATGAGGAGATC
GGTGGTGGAGAAGAAGAGGGTATGGATGAAGCTGGGTGAAGAGGAACGAGCAGCAGTACT
TCTCATGGCTCTTTCTTGTGGTTGAGCTTTTTTCTTTTCTCAACTCCCTTTTTTTGGTCG
GAATGGTTTAGGAGAAGAGATTAGGGCAAATAAAGAAATGATGAATTTTTATGTGTAATC
CTGTCTGAAGGCTAAAGCTAATGTTATGCTACTTACTAATTAATTAAATTAATCGTTTTC
G


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 

AF RR2BQ62TF U 2
AF RR2E922TF U 1
AF RR2BQ62JQ C 89
AF RR2E922JQ C 44
BS 1 33 RR2E922TF
BS 34 35 RR2BQ62TF
BS 36 204 RR2E922TF
BS 205 205 RR2BQ62TF
BS 206 626 RR2E922TF
BS 627 693 RR2E922JQ
BS 694 694 RR2BQ62JQ
BS 695 841 RR2E922JQ

RD RR2BQ62TF 347 0 0
GACTCCTCTCCGCCGTCTACACTCTCTCTCTCTCACTTATCATCATCACACACACTCTCT
GCTTCACAAGAAGAGCTTTCTGATTCGTCTCTGTTGTTTCTGCTTCTGGTTGATACTTTC
AGCTTAACCTCCAAGTCGATCAATATGTCAATGACGGAAGAAAGTAAGATGACGAAGCTC
GAATCGGCGGGAGACTCTTCGGACGTGGAGAACGGGAACTGTAGCAGTAGCGGAAGTGGA
GGAGGAGGAGGCGATACTAAGAAGACGTGCGTTGATTGCGGAACGAACAAGACTCCTCTC
TGGCGTGGTGGCCCTGCTGGTCCTAAATCATTGTGCAATGCGTGTGG

QA 1 347 1 347
DS 

RD RR2E922TF 626 0 0
GGACTCCTCTCCGCCGTCTACACTCTCTCTCTC**ACTTATCATCATCACACACACTCTC
TGCTTCACAAGAAGAGCTTTCTGATTCGCCTCTGTTGTTTCTGCTTCTGGTTGATACTTT
CAGCTTAACCTCCAAGTCGATCAATATGTCAATGACGGAAGAAAGTAAGATGACGAAGCT
CGAATCGGCGGGAGACTCTTCGGATGTGGAGAACGGGAACTGTAGCAGTAGCGGAAGTGG
AGGAGGAGGAGGCGATACTAAGAAGACGTGCGTTGATTGCGGAACGAACAAGACTCCTCT
CTGGCGTGGTGGCCCTGCTGGTCCTAAATCATTGTGCAATGCGTGTGGGATCAAGAGCAG
GAAGAAGAGGCAAGCAGCTCTTGGGATCAAACAAGGGGATAATAATAAGATGAAGAACAA
CAAAAGTAACGATAGCTGTCTCGCTCTCGACAATCAGACGGTCAAAAACGGAAAAGGCGA
TTCAGGAAACGTTAAAAACAAGATCAAGACGGAGACCGAGGATTGTAACGACAAGAAGAG
TGTCAAAAGGGGGAGTAGATTTTTGGATTTAGGATTTAAAGTGCCGGTGATGAGGAGATC
GGTGGTGGAGAAGAAGAGGGTATGGA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2BQ62JQ 752 0 0
T
CTCTGTTGTTTCTGCTTCTGGTTGATACTTTCAGCTTAACCTCCAAGTCGATCAATATGT
CAATGACGGAAGAAAGTAAGATGACGAAGCTCGAATCGGCGGGAGACTCTTCGGACGTGG
AGAACGGGAACTGTAGCAGTAGCGGAAGTGGAGGAGGAGGAGGCGATACTAAGAAGACGT
GCGTTGATTGCGGAACGAACAAGACTCCTTTCTGGCGTGGTGGCCCTGCTGGTCCTAAAT
CATTGTGCAATGCGTGTGGGATCAAGAGCAGGAAGAAGAGGCAAGCAGCTCTTGGGATCA
AACAAGAGGATAATAATAAGATGAAGAACAACAAAAGTAACGATAGCTGTCTCGCTCTCG
ACAATCAGACGGTCAAAAACGGAAAAGGCGATTCAGGAAACGTTAAAAACAAGATCAAGA
CGGAGACCGAGGATTGTAACGACAAGAAGAGTGTCAAAAGGGGGAGTAGATTTTTGGATT
TAGGATTTAAAGTGCCGGTGATGAAGAGATCGGTGGTGGAGAAGAAGAGGGTATGGATGA
AGCTGGGTGAAGAGGAACGAGCAGCAGTACTTCTCATGGCTCTTTCTTGTGGTTGAGCTT
TTTTCTTT*CTCAACTCCCTTTTTTTGGTCGGAATGGTTTAGGAGAAGAGATTAGGGCAA
ATAAAGAAATGATGAATTTTTATGTGTAATCCTGTCTGAAGGCTAAAGCTAATGTTATGC
TACTTACTAATTAATTAAATTAATCGTTTTC

QA 2 752 2 752
DS 

RD RR2E922JQ 798 0 0
TCATCACACACACTCTCTGCTTCACAAGAAGAGCTTTCTGATTCGCCTCTGTTGTTTCTG
CTTCTGGTTGATACTTTCAGCTTAACCTCCAAGTCGATCAATATGTCAATGACGGAAGAA
AGTAAGATGACGAAGCTCGAATCGGCGGGAGACTCTTCGGATGTGGAGAACGGGAACTGT
AGCAGTAGCGGAAGTGGAGGAGGAGGAGGCGATACTAAGAAGACGTGCGTTGATTGCGGA
ACGAACAAGACTCCTTTCTGGCGTGGTGGCCCTGCTGGTCCTAAATCATTGTGCAATGCG
TGTGGGATCAAGAGCAGGAAGAAGAGGCAAGCAGCTCTTGGGATCAAACAAGGGGATAAT
AATAAGATGAAGAACAACAAAAGTAACGATAGCTGTCTCGCTCTCGACAATCAGACGGTC
AAAAACGGAAAAGGCGATTCAGGAAACGTTAAAAACAAGATCAAGACGGAGACCGAGGAT
TGTAACGACAAGAAGAGTGTCAAAAGGGGGAGTAGATTTTTGGATTTAGGATTTAAAGTG
CCGGTGATGAGGAGATCGGTGGTGGAGAAGAAGAGGGTATGGATGAAGCTGGGTGAAGAG
GAACGAGCAGCAGTACTTCTCATGGCTCTTTCTTGTGGTTGAGCTTTTTTTTTTTCTCAA
CTCCCTTTTTTTGGTCGGAATGGTTTAGGAGAAGAGATTAGGGCAAATAAAGAAATGATG
AATTTTTATGTGTAATCCTGTCTGAAGGCTAAAGCTAATGTTATGCTACTTACTAATTAA
TTAAATTAATCGTTTTCG

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 4

CO CL2503Contig1 845 4 7 U
GGAAACTTCTTTACAGAGGGGTCTCTCTCTAGTTTTTAGAGAGAGAAAATTCTCTCTTGG
TGTTCCTCTTAACCGACTCCTATCTTTCAGAGGAACCAAAAGAGAATTATATTTTGTTGT
AAAATATGTTTCGATCTCTTTGATCGATTTTCATTTTCCGTTTGCGGATCTTTCAATTCG
CGTTGGCGATATTTTCACAGTTTCGCTAGGCGACTTTTGTGTTGTATCTACATAATCTTT
CGCTGTTCTTATCTAAATTCCGATGACTCTTAATCTGATATCCAATTCGCCGTTTCAACT
TCTACTCTTTCTAATGAGAATCAGTCTTTGCCATCATAAATTATAGTCGGTTTGGCTTTA
CGGTAAAGCTTCTCTACAGAAAGAGAAAAAGTTTGTTTGGATTTATTAAGTCTTTTTGAA
GTTGATTCAGTAAAGTTGGCGTCACAACGGTCCAACATAGAATCTTTCTTCAGTTTGACT
TATGTTCCACTGGTCTTAATCTCTCGGCAAATTGTAGTTCCTTGGGTTAATGGTCTTGGT
TTGTGCGAAAGGTTCTTCATAAGGGTGTACAAGATCTAGGCATTTGGAGGTGATGCGGTG
GGTCAGATGAAGAATTATTATCGCCGATACTCTCTCCGGTGACGAGTCAAAGGCGGTTGC
TCCAAGAGGTGGAGTCCAGCTGTTTTGCAAGCGCTTCAGAAATCTGACACGTAGCAGCAC
TCTCTAGATTAGTCTACACAATTGCTACATTTTGTAATAATGTTTTATGTTGAAACAATG
TGTTGGGCTTAAAAGCCTATTTTGTACCCCTTTTCAGCTCATGTGGCTTTAATAAAACGG
TTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 

AF RR2BJ09TF U 1
AF RR2A790TF U 34
AF RR2A790JQ C 34
AF RR2BJ09JQ C 84
BS 1 256 RR2BJ09TF
BS 257 257 RR2A790TF
BS 258 287 RR2BJ09TF
BS 288 288 RR2A790TF
BS 289 803 RR2BJ09TF
BS 804 835 RR2A790TF
BS 836 845 RR2A790JQ

RD RR2BJ09TF 803 0 0
GGAAACTTCTTTACAGAGGGGTCTCTCTCTAGTTTTTAGAGAGAGAAAATTCTCTCTTGG
TGTTCCTCTTAACCGACTCCTATCTTTCAGAGGAACCAAAAGAGAATTATATTTTGTTGT
AAAATATGTTTCGATCTCTTTGATCGATTTTCATTTTCCGTTTGCGGATCTTTCAATTCG
CGTTGGCGATATTTTCACAGTTTCGCTAGGCGACTTTTGTGTTGTATCTACATAATCTTT
CGCTGTTCTTATCTAA*TTCCGATGACTCTTAATCTGATATCCAATTTGCCGTTTCAACT
TCTACTCTTTCTAATGAGAATCAGTCTTTGCCATCATAAATTATAGTCGGTTTGGCTTTA
CGGTAAAGCTTCTCTACAGAAAGAGAAAAAGTTTGTTTGGATTTATTAAGTCTTTTTGAA
GTTGATTCAGTAAAGTTGGCGTCACAACGGTCCAACATAGAATCTTTCTTCAGTTTGACT
TATGTTCCACTGGTCTTAATCTCTCGGCAAATTGTAGTTCCTTGGGTTAATGGTCTTGGT
TTGTGCGAAAGGTTCTTCATAAGGGTGTACAAGATCTAGGCATTTGGAGGTGATGCGGTG
GGTCAGATGAAGAATTATTATCGCCGATACTCTCTCCGGTGACGAGTCAAAGGCGGTTGC
TCCAAGAGGTGGAGTCCAGCTGTTTTGCAAGCGCTTCAGAAATCTGACACGTAGCAGCAC
TCTCTAGATTAGTCTACACAATTGCTACATTTTGTAATAATGTTTTATGTTGAAACAATG
TGTTGGGCTTAAAAGCCTATTTT

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2A790TF 802 0 0
GGAG
AGAGAGAGAAAATTCTCTCTTGGTGTTCCTCTTAACCGACTCCTATCTTTCAGAGGAACC
AAAAGAGAATTATATTTTGTTGTAAAATATGTTTCGATCTCTTTGATCGATTTTCATTTT
CCGTTTGCGGATCTTTCAATTCGCGTTGGCGATATTTTCACAGTTTCGCTAGGCGACTTT
TGTGTTGTATCTACATAATCTTTCGCTGTTCTTATCTAAATTCCGATGACTCTTAATCTG
ATATCCAATTCGCCGTTTCAACTTCTACTCTTTCTAATGAGAATCAGTCTTTGCCATCAT
AAATTATAGTCGGTTTGGCTTTACGGTAAAGCTTCTCTACAGAAAGAGAAAAAGTTTGTT
TGGATTTATTAAGTCTTTTTGAAGTTGATTCAGTAAAGTTGGCGTCACAACGGTCCAACA
TAGAATCTTTCTTCAGTTTGACTTATGTTCCACTGGTCTTAATCTCTCGGCAAATTGTAG
TTCCTTGGGTTAATGGTCTTGGTTTGTGCGAAAGGTTCTTCATAAGGGTGTACAAGATCT
AGGCATTTGGAGGTGATGCGGTGGGTCAGATGAAGAATTATTATCGCCGATACTCTCTCC
GGTGACGAGTCAAAGGCGGTTGCTCCAAGAGGTGGAGTCCAGCTGTTTTGCAAGCGCTTC
AGAAATCTGACACGTAGCAGCACTCTCTAGATTAGTCTACACAATTGCTACATTTTGTAA
TAATGTTTTATGTTGAAACAATGTGTTGGGCTTAAAAGCCTATTTTGTACCCCTTTTCAG
CTCATGTGGCTTTAATAA

QA 5 802 5 802
DS 

RD RR2A790JQ 812 0 0
GGAG
AGAGAGAGAAAATTCTCTCTTGGTGTTCCTCTTAACCGACTCCTATCTTTCAGAGGAACC
AAAAGAGAATTATATTTTGTTGTAAAATATGTTTCGATCTCTTTGATCGATTTTCATTTT
CCGTTTGCGGATCTTTCAATTCGCGTTGGCGATATTTTCACAGTTTCGCTAGGCGACTTT
TGTGTTGTATCTACATAATCTTTCGCTGTTCTTATCTAAATTCCGATGACTCTTAATCTG
ATATCCAATTCGCCGTTTCAACTTCTACTCTTTCTAATGAGAATCAGTCTTTGCCATCAT
AAATTATAGTCGGTTTGGCTTTACGGTAAAGCTTCTCTACAGAAAGAGAAAAAGTTTGTT
TGGATTTATTAAGTCTTTTTGAAGTTGATTCAGTAAAGTTGGCGTCACAACGGTCCAACA
TAGAATCTTTCTTCAGTTTGACTTATGTTCCACTGGTCTTAATCTCTCGGCAAATTGTAG
TTCCTTGGGTTAATGGTCTTGGTTTGTGCGAAAGGTTCTTCATAAGGGTGTACAAGATCT
AGGCATTTGGAGGTGATGCGGTGGGTCAGATGAAGAATTATTATCGCCGATACTCTCTCC
GGTGACGAGTCAAAGGCGGTTGCTCCAAGAGGTGGAGTCCAGCTGTTTTGCAAGCGCTTC
AGAAATCTGACACGTAGCAGCACTCTCTAGATTAGTCTACACAATTGCTACATTTTGTAA
TAATGTTTTATGTTGAAACAATGTGTTGGGCTTAAAAGCCTATTTTGTACCCCTTTTCAG
CTCATGTGGCTTTAATAAAACGGTTGAC

QA 5 812 5 812
DS 

RD RR2BJ09JQ 762 0 0
CTTTCAGAGGAACCAAAAGAGAATTATATTTTGTTGTAAAATATGTTTCGATCTCTTTGA
TCGATTTTCATTTTCCGTTTGCGGATCTTTCAATTCGCGTTGGCGATATTTTCACAGTTT
CGCTAGGCGACTTTTGTGTTGTATCTACATAATCTTTCGCTGTTCTTATCTAA*TTCCGA
TGACTCTTAATCTGATATCCAATTTGCCGTTTCAACTTCTACTCTTTCTAATGAGAATCA
GTCTTTGCCATCATAAATTATAGTCGGTTTGGCTTTACGGTAAAGCTTCTCTACAGAAAG
AGAAAAAGTTTGTTTGGATTTATTAAGTCTTTTTGAAGTTGATTCAGTAAAGTTGGCGTC
ACAACGGTCCAACATAGAATCTTTCTTCAGTTTGACTTATGTTCCACTGGTCTTAATCTC
TCGGCAAATTGTAGTTCCTTGGGTTAATGGTCTTGGTTTGTGCGAAAGGTTCTTCATAAG
GGTGTACAAGATCTAGGCATTTGGAGGTGATGCGGTGGGTCAGATGAAGAATTATTATCG
CCGATACTCTCTCCGGTGACGAGTCAAAGGCGGTTGCTCCAAGAGGTGGAGTCCAGCTGT
TTTGCAAGCGCTTCAGAAATCTGACACGTAGCAGCACTCTCTAGATTAGTCTACACAATT
GCTACATTTTGTAATAATGTTTTATGTTGAAACAATGTGTTGGGCTTAAAAGCCTATTTT
GTACCCCTTTTCAGCTCATGTGGCTTTAATAAAACGGTTGAC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 2 4

CO CL2504Contig1 713 2 2 U
GGGATAGAGAGAAAAAAAAGGAAAAAAAACATGAACCTAGGATCGGTTACGCGGTATCTT
GAGGGAGAAGTAATTGAGAATGATCAAAAGGACAAGGAATCAAAAGTTGCGAAACTACCA
TCCAGATTCATCGAGCGATTCGTGATGAAAGGTATAAAAGTAGATTTCATGGAACCTGGT
CGAATTGTCTGCTCCATGAAAGTCCAACCACATCTCCTGAATGCTGGAAAATTCTTACAC
GGAGGAGCAATGGCGACAGTGGTGGATTTGATAGGAACAGCTGCAATTTACACAAACGTA
GATTCAGATCTGGCGGAGGGAGTGTCAGTGGAGATCAATGTTTCATACCTTGATGCTGCT
TTCCTTGACGAAGAGCTAGAGATTGAATCGAGGGCACTGCATGTGGGTAAAGCTGTTGCG
GTTGCGAGTGTTGAGGTGAGGAGGAAGAAGAATGGTAATACTATTGCTCAAGGTCGCCAT
ACTAAGTACCTTGCTCCCCGTCCTAAGCTTTGAATGAATTTTAATTATTTCTTTACTATA
TCTCTTTTTTTTATTTCATGCAAATAAGAATATCGGTTTGTTTTTTATCTGATCATGCAT
GAGTTTGCGTGAATCAGATACTTCATAATAATAATGCTAATAAAACCTCAGGGATCTACA
ATATTTGTAATGGCCATCTTTGTTGGTAACTTAGAATTTGATTATGTTGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC01TF U 1
AF RR2EC01JQ C 64
BS 1 498 RR2EC01TF
BS 499 713 RR2EC01JQ

RD RR2EC01TF 498 0 0
GGGATAGAGAGAAAAAAAAGGAAAAAAAACATGAACCTAGGATCGGTTACGCGGTATCTT
GAGGGAGAAGTAATTGAGAATGATCAAAAGGACAAGGAATCAAAAGTTGCGAAACTACCA
TCCAGATTCATCGAGCGATTCGTGATGAAAGGTATAAAAGTAGATTTCATGGAACCTGGT
CGAATTGTCTGCTCCATGAAAGTCCAACCACATCTCCTGAATGCTGGAAAATTCTTACAC
GGAGGAGCAATGGCGACAGTGGTGGATTTGATAGGAACAGCTGCAATTTACACAAACGTA
GATTCAGATCTGGCGGAGGGAGTGTCAGTGGAGATCAATGTTTCATACCTTGATGCTGCT
TTCCTTGACGAAGAGCTAGAGATTGAATCGAGGGCACTGCATGTGGGTAAAGCTGTTGCG
GTTGCGAGTGTTGAGGTGAGGAGGAAGAAGAATGGTAATACTATTGCTCAAGGTCGCCAT
ACTAAGTACCTTGCTCCC

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2EC01JQ 650 0 0
GGAGAAGTAATTGAGAATGATCAAAAGGACAAGGAATCAAAAGTTGCGAAACTACCATCC
AGATTCATCGAGCGATTCGTGATGAAAGGTATAAAAGTAGATTTCATGGAACCTGGTCGA
ATTGTTTGCTCCATGAAAGTCCAACCACATCTCCTGAATGCTGGAAAATTCTTACACGGA
GGAGCAATGGCGACAGTGGTGGATTTGATAGGAACAGCTGCAATTTACACAAACGTAGAT
TCAGATCTGGCGGAGGGAGTGTCAGTGGAGATCAATGTTTCATACCTTGATGCTGCTTTC
CTTGACGAAGAGCTAGAGATTGAATCGAGGGCACTGCATGTGGGTAAAGCTGTTGCGGTT
GCGAGTGTTGAGGTGAGGAGGAAGAAGAATGGTAATACTATTGCTCAAGGTCGCCATACT
AAGTACCTTGCTCCCCGTCCTAAGCTTTGAATGAATTTTAATTATTTCTTTACTATATCT
CTTTTTTTTATTTCATGCAAATAAGAATATCGGTTTGTTTTTTATCTGATCATGCATGAG
TTTGCGTGAATCAGATACTTCATAATAATAATGCTAATAAAACCTCAGGGATCTACAATA
TTTGTAATGGCCATCTTTGTTGGTAACTTAGAATTTGATTATGTTGGATC

QA 1 650 1 650
DS 



CO CL2504Contig2 930 2 8 U
TTTTTTTTATCTGATCATGCATGAGTTTGCGTGAATCAGATACTTCATAATAATGCTAAT
AAAACCTAAGTGATCTACAATATTTGTAATGGCCATCTTTGTTGGTAACTTAGAATTTGA
TTATGTTGGATCTCTGTTTTAGTTTTGCATCATGATTCATATTACTTTGTGTTTTTTTGT
GTTTGTTCATGTCTGCAAAATGAACAATTAGTTTTCTTCTTTTGAAAAACTCGATGTGAT
TCTTATATCACTCATAAATTATGTAATGGTTCTACTGTCTAATTAGTGCTATCTTTTGTC
ATGATAAATAGTAATGCTAGAGATAAGCAAGCCTGGAGACTAATGAAACATCCAACTTCG
TTACTAGGTATAGTCTGTAAAACTAAATATTACAGCAACACAAAAATAATAATTCTATTG
GAGGCTAGAAGCTAAACCAAATCTCTACAAGTATCCTCCAAAGCTTTCCGGTGGTTAAAG
AAGGGTCCCGTTGGCTTGTTGAGGTGGGTAATCAAAGTCAAAATTAGTGAATATGTTATC
ACATTTTTAGGACGTATCCCTTATTATTATATTTGACTAGGTTTCTTTAAAAATTAAAAA
TAAGTTTAAATAAAAAAATATTATAAGTATAAAATTATTTGCGCATCTCAAAGGTTTAGA
TATTAAAAAAATTCAAATGAAGACTTGGTTATTTTAAGACCGGCATTGTTATTTTAAAAC
TGTCGATATGTATATAAAATGCACTACATTTCGCATTTTATAATACTGGTCATATAATAA
TAGTAATTGAGTACTAGTACTACGTACTCATCCTATATAATAATGAGAAATGAAAACCAA
AGTTTGCATTATTAAGAGATATCCCCCGTTATGAAGTGCCGGCTTTGTATTGAACTCTCG
GTTTAGAAATATAATTCAGTTCGTCGCCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY87TF U 1
AF RR2GY87JQ C 230
BS 1 617 RR2GY87TF
BS 618 618 RR2GY87JQ
BS 619 653 RR2GY87TF
BS 654 654 RR2GY87JQ
BS 655 670 RR2GY87TF
BS 671 671 RR2GY87JQ
BS 672 702 RR2GY87TF
BS 703 930 RR2GY87JQ

RD RR2GY87TF 702 0 0
TTTTTTTTATCTGATCATGCATGAGTTTGCGTGAATCAGATACTTCATAATAATGCTAAT
AAAACCTAAGTGATCTACAATATTTGTAATGGCCATCTTTGTTGGTAACTTAGAATTTGA
TTATGTTGGATCTCTGTTTTAGTTTTGCATCATGATTCATATTACTTTGTGTTTTTTTGT
GTTTGTTCATGTCTGCAAAATGAACAATTAGTTTTCTTCTTTTGAAAAACTCGATGTGAT
TCTTATATCACTCATAAATTATGTAATGGTTCTACTGTCTAATTAGTGCTATCTTTTGTC
ATGATAAATAGTAATGCTAGAGATAAGCAAGCCTGGAGACTAATGAAACATCCAACTTCG
TTACTAGGTATAGTCTGTAAAACTAAATATTACAGCAACACAAAAATAATAATTCTATTG
GAGGCTAGAAGCTAAACCAAATCTCTACAAGTATCCTCCAAAGCTTTCCGGTGGTTAAAG
AAGGGTCCCGTTGGCTTGTTGAGGTGGGTAATCAAAGTCAAAATTAGTGAATATGTTATC
ACATTTTTAGGACGTATCCCTTATTATTATATTTGACTAGGTTTCTTTAAAAATTAAAAA
TAAGTTTAAATAAAAAA*TATTATAAGTATAAAATTATTTGCGCATCTCAAAG*TTTAGA
TATTAAAAAA*TTCAAATGAAGACTTGGTTATTTTAAGACCG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2GY87JQ 701 0 0
CTCGATGTGATTCTTATATCACTCATAAATTATGTAATGGTTCTACTGTCTAATTAGTGC
TATCTTTTGTCATGATAAATAGTAATGCTAGAGATAAGCAAGCCTGGAGACTAATGAAAC
ATCCAACTTCGTTACTAGGTATAGTCTGTAAAACTAAATATTACAGCAACACAAAAATAA
TAATTCTATTGGAGGCTAGAAGCTAAACCAAATCTCTACAAGTATCCTCCAAAGCTTTCC
GGTGGTTAAAGAAGGGTCCCGTTGGCTTGTTGAGGTGGGTAATCAAAGTCAAAATTAGTG
AATATGTTATCACATTTTTAGGACGTATCCCTTATTATTATATTTGACTAGGTTTCTTTA
AAAATTAAAAATAAGTTTAAATAAAAAAATATTATAAGTATAAAATTATTTGCGCATCTC
AAAGGTTTAGATATTAAAAAAATTCAAATGAAGACTTGGTTATTTTAAGACCGGCATTGT
TATTTTAAAACTGTCGATATGTATATAAAATGCACTACATTTCGCATTTTATAATACTGG
TCATATAATAATAGTAATTGAGTACTAGTACTACGTACTCATCCTATATAATAATGAGAA
ATGAAAACCAAAGTTTGCATTATTAAGAGATATCCCCCGTTATGAAGTGCCGGCTTTGTA
TTGAACTCTCGGTTTAGAAATATAATTCAGTTCGTCGCCAG

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 3

CO CL2505Contig1 1036 3 31 U
GAACTGATGGAAAGTGTACGAAGATGCCATCTACGAAGCTACTGAATGTGAAGATAAAAT
CGATACCTTGCCTTGAACAAGACGGTATGGTCTGGGTTTGGCCCGGTGATGAGCCACCTT
CACCTACACTTCCATCTTTACAACCTCCATCAGGGTTTGTAATTCATGCAGAGCTTGTAA
TGGACCTCCCAGTGGAACACGGATTGCTACTAGACAATCTCTTGGATCTTGCGCATGCTC
CATTCACTCACACTTCTACTTTTGCAAAAGGCTGGAGTGTCCCAAGCTTGGTAAAGTTCT
TAACACCATCTTCAGGTCTTCAAGGATACTGGGATCCGTATCCAATCGATATGGAATTTA
AACCGCCTTGTGTCGTGTTATCGACAATAGGAATCTCAAAACCAGGGAAGCTAGAAGGAA
AGAGCACGGAGCAGTGTGCAACACATCTTCATCAACTCCATGTTTGTTTACCTTCTTCAA
GAAACAAGACAAGACTTCTATACCGAATGTCACTAGACTTTGCTCCAATATTGAAGAATC
TCCCATTCATGGAACATCTCTGGAGACATTTCGCTGAACAGGTCTTAAATGAAGATCTAC
GGTTGGTTTTGGGACAGCAAGAAAGGATGTTGAATGGTGCAAATATATGGAACTTACCTG
TTGCTTATGACAAGCTTGGAGTTCGGTATAGACTCTGGAGGAACGCTGTAGATCGTGGTG
ATGATAAATTACCTTTCTCAGGCTAACTCTTGTTGAAGTAAATCTAATGATCGAGTGAGT
GACGTGGAAGGAAAATTTTAGCAGCTGACATTCACCAGCGACCTTACAAGAAAGTGTTAG
GTTCGTTCTCGCTGCAGAAAAGCTTGGCTGAGTAAACAATGATGGGAGTTTGGTGGGTTC
ATCTTTGGAGACGATGAAACAATAACAAAATATCCATTGTAAATCAAAAAGGATATTATA
TATTTTTGGAACTTGTTATTCATTTTTACCTGTGTACAGTTGATTCACTTTTGAGTAATT
AAATATCAGACATCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2CH26TF U 1
AF RR2G770JQ C 271
AF RR2G770TF U 271
BS 1 337 RR2CH26TF
BS 338 338 RR2G770TF
BS 339 355 RR2CH26TF
BS 356 356 RR2G770TF
BS 357 371 RR2CH26TF
BS 372 372 RR2G770TF
BS 373 388 RR2CH26TF
BS 389 389 RR2G770TF
BS 390 427 RR2CH26TF
BS 428 428 RR2G770TF
BS 429 442 RR2CH26TF
BS 443 443 RR2G770TF
BS 444 466 RR2CH26TF
BS 467 467 RR2G770TF
BS 468 514 RR2CH26TF
BS 515 515 RR2G770TF
BS 516 523 RR2CH26TF
BS 524 524 RR2G770TF
BS 525 541 RR2CH26TF
BS 542 542 RR2G770TF
BS 543 625 RR2CH26TF
BS 626 626 RR2G770TF
BS 627 682 RR2CH26TF
BS 683 683 RR2G770TF
BS 684 700 RR2CH26TF
BS 701 702 RR2G770TF
BS 703 727 RR2CH26TF
BS 728 951 RR2G770TF
BS 952 952 RR2G770JQ
BS 953 1032 RR2G770TF
BS 1033 1036 RR2G770JQ

RD RR2CH26TF 727 0 0
GAACTGATGGAAAGTGTACGAAGATGCCATCTACGAAGCTACTGAATGTGAAGATAAAAT
CGATACCTTGCCTTGAACAAGACGGTATGGTCTGGGTTTGGCCCGGTGATGAGCCACCTT
CACCTACACTTCCATCTTTACAACCTCCATCAGGGTTTGTAATTCATGCAGAGCTTGTAA
TGGACCTCCCAGTGGAACACGGATTGCTACTAGACAATCTCTTGGATCTTGCGCATGCTC
CATTCACTCACACTTCTACTTTTGCAAAAGGCTGGAGTGTCCCAAGCTTGGTAAAGTTCT
TAACACCATCTTCAGGTCTTCAAGGATACTGGGATCCATATCCAATCGATATGGAGTTTA
AACCGCCTTGTATCGTGTTATCGACAATCGGAATCTCAAAACCAGGGAAGCTAGAAGGAA
AGAGCACTGAGCAGTGTGCAACGCATCTTCATCAACTCCATGTTTGCTTACCTTCTTCAA
GAAACAAGACAAGACTTCTATACCGAATGTCACTGGACTTTGCACCAATATTGAAGAATC
TACCATTCATGGAACATCTCTGGAGACATTTCGCTGAACAGGTCTTAAATGAAGATCTAC
GGTTGGTTTTGGGACAGCAAGAAAG*ATGTTGAATGGTGCAAATATATGGAACTTACCTG
TTGCTTATGACAAGCTTGGAGT*CGGTATAGACTCTGGAG**ACGCTGTAGATCGTGGTG
ATGATAA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2G770JQ 766 0 0
GCTGGAGTGTCCCAAGCTTGGTAAAGTTCTTAACACCATCTTCAGGTCTTCAAGGATACT
GGGATCCGTATCCAATCGATATGGAATTTAAACCGCCTTGTGTCGTGTTATCGACAATAG
GAATCTCAAAACCAGGGAAGCTAGAAGGAAAGAGCACGGAGCAGTGTGCAACACATCTTC
ATCAACTCCATGTTTGTTTACCTTCTTCAAGAAACAAGACAAGACTTCTATACCGAATGT
CACTAGACTTTGCTCCAATATTGAAGAATCTCCCATTCATGGAACATCTCTGGAGACATT
TCGCTGAACAGGTCTTAAATGAAGATCTACGGTTGGTTTTGGGACAGCAAGAAAGGATGT
TGAATGGTGCAAATATATGGAACTTACCTGTTGCTTATGACAAGCTTGGAGTTCGGTATA
GACTCTGGAGGAACGCTGTAGATCGTGGTGATGATAAATTACCTTTCTCAGGCTAACTCT
TGTTGAAGTAAATCTAATGATCGAGTGAGTGACGTGGAAGGAAAATTTTAGCAGCTGACA
TTCACCAGCGACCTTACAAGAAAGTGTTAGGTTCGTTCTCGCTGCAGAAAAGCTTGGCTG
AGTAAACAATGATGGGAGTTTGGTGGGTTCATCTTTGGAGACGATGAAACAATAACAAAA
TATCCATTGTAAATCAAAAAGGATATTATATATTTTTGGAACTTGTTATTCATTTTTACC
TGTGTACAGTTGATTCACTTTTGAGTAATTAAATATCAGACATCAG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2G770TF 762 0 0
GCTGGAGTGTCCCAAGCTTGGTAAAGTTCTTAACACCATCTTCAGGTCTTCAAGGATACT
GGGATCCGTATCCAATCGATATGGAATTTAAACCGCCTTGTGTCGTGTTATCGACAATAG
GAATCTCAAAACCAGGGAAGCTAGAAGGAAAGAGCACGGAGCAGTGTGCAACACATCTTC
ATCAACTCCATGTTTGTTTACCTTCTTCAAGAAACAAGACAAGACTTCTATACCGAATGT
CACTAGACTTTGCTCCAATATTGAAGAATCTCCCATTCATGGAACATCTCTGGAGACATT
TCGCTGAACAGGTCTTAAATGAAGATCTACGGTTGGTTTTGGGACAGCAAGAAAGGATGT
TGAATGGTGCAAATATATGGAACTTACCTGTTGCTTATGACAAGCTTGGAGTTCGGTATA
GACTCTGGAGGAACGCTGTAGATCGTGGTGATGATAAATTACCTTTCTCAGGCTAACTCT
TGTTGAAGTAAATCTAATGATCGAGTGAGTGACGTGGAAGGAAAATTTTAGCAGCTGACA
TTCACCAGCGACCTTACAAGAAAGTGTTAGGTTCGTTCTCGCTGCAGAAAAGCTTGGCTG
AGTAAACAATGATGGGAGTTTGGTGGGTTCATCTTTGGAGACGATGAAACAATAACAAAA
TATCCATTGTAAATCAAAAAG*ATATTATATATTTTTGGAACTTGTTATTCATTTTTACC
TGTGTACAGTTGATTCACTTTTGAGTAATTAAATATCAGACA

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 4

CO CL2506Contig1 1249 4 15 U
GGATCACACATAGAAACCCAAAAACAAAGCATTCTAAAATCTCACAAATTTCACGAAAAT
GACCTCAACGGCAGAGACACAGTCAACTCCAGTGCAAGTCACAGACGACGAAACTGCCCT
CTTTGCCATACAGTTAGCCAGTGCCTCAGTTCTCCCTATGGCTTTAAAATCAGCTATAGA
GCTCGATCTTCTCGAGATCATGGCCAGGAACTGTTCTCCCATGTCTGCATCTGAGATCTC
TTCTCATCTTCCGACCAAAAACCCCGAAGCTCCGGCCATACTTGAACGTATCCTCCGTCT
TCTTACGGCTTACTCCGTCCTCACTTGCACCGTCCGTACGGTTCAAGACGGCGTCAACCG
GCTTTACGGGCTTGGGCCGGTTTGCAAGTATTTCACCAAGAACGAAGATGGTGTCTCGAT
AGCTGCTCTTTGTCTCCTGAATCATGACAAAGTCTTCATGGGAAGCTGGTACCATTTGAA
GGATGCAATTCTTGATGGTGGGATTCCATTCAATAAAGCTTATGGCATGAGCGCGTTTGA
GTACCATGGGACTGACCTTAGATTCAACACGGTGTTCAACAATGGAATGTCTAACCATTC
CACTATCACCATGAAGAAGATTCTTGAGACCTATAAGGGCTTTGAGGGTTTGGTCTCCTT
GGTTGATGTCGGAGGTGGCATTGGTGCTACTCTAAAAATGATTGTCTCTAAGTACCCTAA
TCCTAAAGGCGTCAACTTTGATCTCCCTCATGTCATAGTAGATGCTCCATCTCATCCCGG
TATTGAGCATGTTGGAGGAGATATGTTTGTAAGTGTCCCCAAGGGTGATGCCATTTTCAT
GAAGTGGATATGCCATGACTGGAGTGACGAACACTGTTTAAAATTATTGAAGAATTGTTA
CGAGGCGCTTCCAGAGAATGGAAAAGTGGTCTTGGCAGAGTGTATACTTCCAGAGACACT
AGACTCAAGCCTGTCGACCAAACAAGTAGTCAATATGGACTGCATTATGCTGGCTCTCAA
TCCTGGAGGCAAAGAACGGACCGAGAAAGAGTTTGAGGCATTGGCCAAAGGATCAGGCTT
CAAAGGCATCACAGTTGTTTGCAACGTTTTTGGTGTTTACGTTATTGAGCTGCTCAAGAA
GATCTGAGAAAAAAATTCCTTAATGGTGCTTTATAAATAAAAATGCATGCTCTCTTGTAC
GTCTACTTCACCAACTTAATTGTTGTAGTTATATTATTGTTTTGATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2EM53TF U 1
AF RR2DW54TF U 4
AF RR2DW54JQ C 495
AF RR2EM53JQ C 561
BS 1 28 RR2EM53TF
BS 29 29 RR2DW54TF
BS 30 62 RR2EM53TF
BS 63 63 RR2DW54TF
BS 64 148 RR2EM53TF
BS 149 149 RR2DW54TF
BS 150 618 RR2EM53TF
BS 619 850 RR2DW54JQ
BS 851 852 RR2EM53JQ
BS 853 899 RR2DW54JQ
BS 900 901 RR2EM53JQ
BS 902 941 RR2DW54JQ
BS 942 942 RR2EM53JQ
BS 943 1248 RR2DW54JQ
BS 1249 1249 RR2EM53JQ

RD RR2EM53TF 618 0 0
GGATCACACATAGAAACCCAAAAACAAATCATTCTAAAATCTCACAAATTTCACGAAAAT
GATCTCAACGGCAGAGACACAGTCAACTCCAGTGCAAGTCACAGACGACGAAACTGCCCT
CTTTGCCATACAGTTAGCCAGTGCCTCATTTCTCCCTATGGCTTTAAAATCAGCTATAGA
GCTCGATCTTCTCGAGATCATGGCCAGGAACTGTTCTCCCATGTCTGCATCTGAGATCTC
TTCTCATCTTCCGACCAAAAACCCCGAAGCTCCGGCCATACTTGAACGTATCCTCCGTCT
TCTTACGGCTTACTCCGTCCTCACTTGCACCGTCCGTACGGTTCAAGACGGCGTCAACCG
GCTTTACGGGCTTGGGCCGGTTTGCAAGTATTTCACCAAGAACGAAGATGGTGTCTCGAT
AGCTGCTCTTTGTCTCCTGAATCATGACAAAGTCTTCATGGGAAGCTGGTACCATTTGAA
GGATGCAATTCTTGATGGTGGGATTCCATTCAATAAAGCTTATGGCATGAGCGCGTTTGA
GTACCATGGGACTGACCTTAGATTCAACACGGTGTTCAACAATGGAATGTCTAACCATTC
CACTATCACCATGAAGAA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2DW54TF 598 0 0
GGACG
CATAGAAACCCAAAAACAAAGCATTCTAAAATCTCACAAATTTCACGAAAATGACCTCAA
CGGCAGAGACACAGTCAACTCCAGTGCAAGTCACGGACGACGAAACTGCCCTCTTTGCCA
TACAGTTAGCCAGTGCCTCAGTTCTCCCTATGGCTTTAAAATCAGCTATAGAGCTCGATC
TTCTCGAGATCATGGCCAGGAACTGTTCTCCCATGTCTGCATCTGAGATCTCTTCTCATC
TTCCGACCAAAAACCCCGAAGCTCCGGCCATGCTTGACCGTATCCTCCGTCTTCTTACGG
CTTACTCCGTCCTCACTTGCACCGTCCGTACGGTTCAAGACGGCGTCAACCGGCTTTACG
GGCTTGGGCCGGTTTGCAAGTATTTCACCAAGAACGAAGATGGTGTCTCGATAGCTGCTC
TTTGTCTCCTGAATCATGACAAAGTCTTCATGGGAAGCTGGTACCATTTGAAGGATGCAA
TTCTTGATGGTGGGATTCCATTCAATAAAGCTTATGGCATGAGCGCGTTTGAGTACCATG
GGACTGACCTTAGATTCAACACGGTGTTCAACAATGGAATGTCTAACCATTCC

QA 6 598 6 598
DS 

RD RR2DW54JQ 754 0 0
ATGGTGGGATTCCATTCAATAAAGCTTATGGCATGAGCGCGTTTGAGTACCATGGGACTG
ACCTTAGATTCAACACGGTGTTCAACAATGGAATGTCTAACCATTCCACTATCACCAAGA
AGAAGATTCTTGAGACCTATAAGGGCTTTGAGGGTTTGGTCTCCTTGGTTGATGTCGGAG
GTGGCATTGGTGCTACTCTAAAAATGATTGTCTCTAAGTACCCTAATCCTAAAGGCGTCA
ACTTTGATCTCCCTCATGTCATAGTAGATGCTCCATCTCATCCCGGTATTGAGCATGTTG
GAGGAGATATGTTTGTAAGTGTCCCCAAGGGTGATGCCATTTTCATGAAGTGGATA**CC
ATGACTGGAGTGACGAACACTGTTTAAAATTATTGAAGAATTGTT**GAGGCGCTTCCAG
AGAATGGAAAAGTGGTCTTGGCAGAGTTTATACTTCCAGAGACACTAGACTCAAGCCTGT
CGACCAAACAAGTAGTCAATATGGACTGCATTATGCTGGCTCTCAATCCTGGAGGCAAAG
AACGGACCGAGAAAGAGTTTGAGGCATTGGCCAAAGGATCAGGCTTCAAAGGCATCACAG
TTGTTTGCAACGTTTTTGGTGTTTACGTTATTGAGCTGCTCAAGAAGATCTGAGAAAAAA
ATTCCTTAATGGTGCTTTATAAATAAAAATGCATGCTCTCTTGTACGTCTACTTCACCAA
CTTAATTGTTGTAGTTATATTATTGTTTTGATTT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2EM53JQ 689 0 0
GATTCAACACGGTGTTCAACAATGGAATGTCTAACCATTCCACTATCACCATGAAGAAGA
TTCTTGAGACCTATAAGGGCTTTGAGGGTTTGGTCTCCTTGGTTGATGTCGGAGGTGGCA
TTGGTGCTACTCTAAAAATGATTGTCTCTAAGTACCCTAATCTTAAAGGCGTCAACTTTG
ATCTCCCTCATGTCATAGTAGATGCTCCATCTCATCCCGGTATTGAGCATGTTGGAGGAG
ATATGTTTGTAAGTGTCCCCAAGGGTGATGCCATTTTCATGAAGTGGATATGCCATGACT
GGAGTGACGAACACTGTTTAAAATTATTGAAGAATTGTTACGAGGCGCTTCCAGAGAATG
GAAAAGTGGTCTTGGCAGATTGTATACTTCCAGAGACACTAGACTCAAGCCTGTCGACCA
AACAAGTAGTCAATGTGGACTGCATTATGCTGGCTCTCAATCCTGGAGGCAAAGAACGGA
CCGAGAAAGAGTTTGAGGCATTGGCCAAAGGATCAGGCTTCAAAGGCGTCACGGTTGTTT
GCAACGTTTTTGGTGTTTACGTTATTGAGCTGCTCAAGAAGATCTGAGAACAAA*TTCCT
TAATGGTGCTTTATAAATAAAAATGCATGCTCTCTTGTACGTCTACTTCACCAACTTAAT
TGTTGTAGTTATGTTATTGTTTTGATTTC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 2 4

CO CL2507Contig1 795 2 4 U
GGGCCAAAACCTCAGATCGGAGGAACTGAACCCTAAATCGAAAGACGATGAAACCTGCCC
GTTTCGCGATTTGTTCCCTAAAAGACGTCGCTTCCCGTCAACCATGGCGTCCTCTCGCGT
CTAGAAGCTTCTCCGCCAATGCTAACGAAGATCGATCTTCGCTGGACGATTGGATGTTGT
TCGGAAACAGTGGTGGTAACGATGGAAAAAGCAGTGATTTCTACCAGCATCTTAGCAAGG
CGGAGAAAGACAAGCGCGAGTTGGGTAGATCGTACGGAAAAGACGGTTCGAGAGGTAGTA
ACAGAGACGAGACATTCGATCCTTCGTCGGATGGAGTTGATGGTAAACTGAAGGAAGCTG
CGTTGATTTACAACATCGACGACGAAGAAGGCGTCAAGGATAGTTACTCGTTTAGGCCTG
ATGTCAACAGCTGGGGAGCTAATAATCACTTCCCTAGGGATTTAGGTTATAGAAAGCAGA
TGCAAAGACCTAGACAGAACAACAAGGCGGAGATAACCACAGAGGAAGTTCTGAAGAAAG
CTGATTTCAGGAATGTTCGATTCCTTGCACAGTTCATCACCGAAGCTGGGATCCTTGTTA
AGAGGAAGCAGACTGGCATCAGTGCAAAGGCACAAAGAAAGATTGCTAGAGAAATCAAGA
CGGCCCGTGCATTTGGGCTGATGCCCTTCACAACAATGGGTACCAAGGCATTCACATTTG
GGAAAACCATGGAGAACAGAGACCAAGATTTCGAGTATGAAGTGGTTGACGATGATGATG
AGTATGACAATGCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB86TF U 1
AF RR2FB86JQ C 593
BS 1 652 RR2FB86TF
BS 653 653 RR2FB86JQ
BS 654 659 RR2FB86TF
BS 660 795 RR2FB86JQ

RD RR2FB86TF 659 0 0
GGGCCAAAACCTCAGATCGGAGGAACTGAACCCTAAATCGAAAGACGATGAAACCTGCCC
GTTTCGCGATTTGTTCCCTAAAAGACGTCGCTTCCCGTCAACCATGGCGTCCTCTCGCGT
CTAGAAGCTTCTCCGCCAATGCTAACGAAGATCGATCTTCGCTGGACGATTGGATGTTGT
TCGGAAACAGTGGTGGTAACGATGGAAAAAGCAGTGATTTCTACCAGCATCTTAGCAAGG
CGGAGAAAGACAAGCGCGAGTTGGGTAGATCGTACGGAAAAGACGGTTCGAGAGGTAGTA
ACAGAGACGAGACATTCGATCCTTCGTCGGATGGAGTTGATGGTAAACTGAAGGAAGCTG
CGTTGATTTACAACATCGACGACGAAGAAGGCGTCAAGGATAGTTACTCGTTTAGGCCTG
ATGTCAACAGCTGGGGAGCTAATAATCACTTCCCTAGGGATTTAGGTTATAGAAAGCAGA
TGCAAAGACCTAGACAGAACAACAAGGCGGAGATAACCACAGAGGAAGTTCTGAAGAAAG
CTGATTTCAGGAATGTTCGATTCCTTGCACAGTTCATCACCGAAGCTGGGATCCTTGTTA
AGAGGAAGCAGACTGGCATCAGTGCAAAGGCACAAAGAAAGATTGCTAGAGAGATCAAG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2FB86JQ 203 0 0
CCTTGTTAAGAGGAAGCAGACTGGCATCAGTGCAAAGGCACAAAGAAAGATTGCTAGAGA
AATCAAGACGGCCCGTGCATTTGGGCTGATGCCCTTCACAACAATGGGTACCAAGGCATT
CACATTTGGGAAAACCATGGAGAACAGAGACCAAGATTTCGAGTATGAAGTGGTTGACGA
TGATGATGAGTATGACAATGCAA

QA 1 203 1 203
DS 



CO CL2507Contig2 966 2 20 U
GGATCCCTCAGGCGACTCTCCCCTCTTTGCCAAAACCTCAGATCGGAGGAACTGAACCCT
AAATCGAAAACGATGAAACCTGCCCGTTTCGCGATTCGTTCCCTCAACGACGTCGCTTCC
CGTCAACCATGGCGTCCTCTCGCACCTAGAAGCTTCTCCGCCAATGCTAACGAAGATCGA
TCTTCGCTGGACGATTGGATGTTCGGCGGAAACAGTGGTGGCAACGATGGAAAAAGCAGT
GATTTCTACCAGCATCTTAGCAAGGCGGAGAAAGACAAGCGCGAGTTGGGTAGATCGTAC
GGAAAAGACGGTTCGAGAGGTAGTAACAGAGACGAGACTTTCGATCCTTCGTCCGATGGT
GTTGATGATAAATTGAAGGAAGCTGCGTTGATTTACAACATCGACGACAACGAAGAAGGA
GGCGCGAAGAAGGATGGTTACTCGTTTAGGCCTGATGTCAACAGCTGGGGAGCTAATAAC
TTCCCTAGGGATTTAGGTTATAGAAAGCAGATGCAAAGACCTAGACAGAACAACAAGGCG
GAGATAACCACCGAGGAAGTTCTGAAGAAAGCTGATTTCAGGAATGTTCGATTCCTTGCA
CAGTTCATCACCGAAGCTGGGATCCTTGTTAAGAGGAAGCAGACTGGGATCAGTGCTAAG
GCACAAAGAAAGATTGCTAGAGAGATCAAGACGGCTCGTGCATTTGGGCTGATGCCCTTC
ACAACAATGGGTACCAAGGCATTCACGTTTGGGAAAACCATGGAGAACAGAGACCAAGAT
TTCGAGTACGAAGTGGTTGACGATGATGATGAGTATGACAATGCAACTGAGTGAGATTTG
TTCCACTCTTTTATGCTTTGGCCTTAACTAGTTGGCCTTAACTAGTGCGTGCTAGTTTTC
ATTTATGGGGGGTTTTGATCGATCGATCGATAGTTGGAATAATATGTTACCAAGGGATTA
GAGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU42TF U 1
AF RR2FU42JQ C 209
BS 1 660 RR2FU42TF
BS 661 661 RR2FU42JQ
BS 662 693 RR2FU42TF
BS 694 694 RR2FU42JQ
BS 695 723 RR2FU42TF
BS 724 724 RR2FU42JQ
BS 725 734 RR2FU42TF
BS 735 735 RR2FU42JQ
BS 736 742 RR2FU42TF
BS 743 743 RR2FU42JQ
BS 744 756 RR2FU42TF
BS 757 757 RR2FU42JQ
BS 758 766 RR2FU42TF
BS 767 767 RR2FU42JQ
BS 768 774 RR2FU42TF
BS 775 775 RR2FU42JQ
BS 776 791 RR2FU42TF
BS 792 792 RR2FU42JQ
BS 793 818 RR2FU42TF
BS 819 966 RR2FU42JQ

RD RR2FU42TF 818 0 0
GGATCCCTCAGGCGACTCTCCCCTCTTTGCCAAAACCTCAGATCGGAGGAACTGAACCCT
AAATCGAAAACGATGAAACCTGCCCGTTTCGCGATTCGTTCCCTCAACGACGTCGCTTCC
CGTCAACCATGGCGTCCTCTCGCACCTAGAAGCTTCTCCGCCAATGCTAACGAAGATCGA
TCTTCGCTGGACGATTGGATGTTCGGCGGAAACAGTGGTGGCAACGATGGAAAAAGCAGT
GATTTCTACCAGCATCTTAGCAAGGCGGAGAAAGACAAGCGCGAGTTGGGTAGATCGTAC
GGAAAAGACGGTTCGAGAGGTAGTAACAGAGACGAGACTTTCGATCCTTCGTCCGATGGT
GTTGATGATAAATTGAAGGAAGCTGCGTTGATTTACAACATCGACGACAACGAAGAAGGA
GGCGCGAAGAAGGATGGTTACTCGTTTAGGCCTGATGTCAACAGCTGGGGAGCTAATAAC
TTCCCTAGGGATTTAGGTTATAGAAAGCAGATGCAAAGACCTAGACAGAACAACAAGGCG
GAGATAACCACCGAGGAAGTTCTGAAGAAAGCTGATTTCAGGAATGTTCGATTCCTTGCA
CAGTTCATCACCGAAGCTGGGATCCTTGTTAAGAGGAAGCAGACTGGGATCAGTGCTAAG
*CACAAAGAAAGATTGCTAGAGAGATCAAGACG*CTCGTGCATTTGGGCTGATGCCCTTC
ACA*CAATGGGTAC*AAGGCAT*CACGTTTGGGAAA*CCATGGAGA*CAGAGAC*AAGAT
TTCGAGTACGA*GTGGTTGACGATGATGATGAGTATGA

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2FU42JQ 758 0 0
GAAACAGTGGTGGCAACGATGGAAAAAGCAGTGATTTCTACCAGCATCTTAGCAAGGCGG
AGAAAGACAAGCGCGAGTTGGGTAGATCGTACGGAAAAGACGGTTCGAGAGGTAGTAACA
GAGACGAGACTTTCGATCCTTCGTCCGATGGTGTTGATGATAAATTGAAGGAAGCTGCGT
TGATTTACAACATCGACGACAACGAAGAAGGAGGCGCGAAGAAGGATGGTTACTCGTTTA
GGCCTGATGTCAACAGCTGGGGAGCTAATAACTTCCCTAGGGATTTAGGTTATAGAAAGC
AGATGCAAAGACCTAGACAGAACAACAAGGCGGAGATAACCACCGAGGAAGTTCTGAAGA
AAGCTGATTTCAGGAATGTTCGATTCCTTGCACAGTTCATCACCGAAGCTGGGATCCTTG
TTAAGAGGAAGCAGACTGGGATCAGTGCTAAGGCACAAAGAAAGATTGCTAGAGAGATCA
AGACGGCTCGTGCATTTGGGCTGATGCCCTTCACAACAATGGGTACCAAGGCATTCACGT
TTGGGAAAACCATGGAGAACAGAGACCAAGATTTCGAGTACGAAGTGGTTGACGATGATG
ATGAGTATGACAATGCAACTGAGTGAGATTTGTTCCACTCTTTTATGCTTTGGCCTTAAC
TAGTTGGCCTTAACTAGTGCGTGCTAGTTTTCATTTATGGGGGGTTTTGATCGATCGATC
GATAGTTGGAATAATATGTTACCAAGGGATTAGAGTGT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 2 4

CO CL2508Contig1 1165 2 4 U
GGAATTCCAAAACGCAACCGATACCTCTTCCTCACAGATCTAAAAGACCTCCCCTCCCTC
GTTCATACATACATAAGAGAGAAACGAAAAGAGAGCCAAATCACTCTCCCTTCCTTCCTT
TATAAATAAACAACCCATTTTACAAATCTTTTTTCCCTCTCCAATCCCCTCGGATCTGTA
TATAAAAGCCTCACACCATCTCGTTTTATTCCTTTGCCAAATCTCATCTGCACGAAACCC
TAGATTTCGTGTCCGAATCTCTAAAAGGCAAATGACAGATCAAGGATTGGAAGGGAGTAA
TCCAGTAGACCTAGTCGAGCATCCTTCTGGGATCGTTCCCACTCTACAAAACATTGTCTC
AACGGTGAACTTGGATTGCAAGCTAGATCTCAAAGCCATAGCTCTGCAAGCTCGTAATGC
TGAATACAATCCCAAGCGTTTTGCTGCTGTGATCATGCGGATTAGAGAACCAAAGACGAC
TGCGTTAATTTTTGCCTCTGGTAAAATGGTTTGTACTGGAGCCAAGAGTGAATATTTTTC
AAAGATGGCTGCAAGAAAATATGCTCGGATTGTCCAAAAGCTTGGGTTTCCTGCAAAGTT
CAAGGATTTCAAGATTCAGAATATAGTAGGTTCTTGTGATGTCAAGTTCCCTATCAGACT
TGAAGGTCTTGCATACTCTCACGCCGCTTTCTCAAGTTACGAGCCTGAGTTGTTTCCAGG
GCTGATCTACAGGATGAAAGTGCCTAAGATTGTTCTACTGATTTTTGTATCTGGCAAGAT
AGTCATCACTGGAGCCAAGGTAAAAATCACACTCTCTCTTTTTAGGTTTTTTTTAAATTA
TCCCCCGAGAAATGCATGATTTGTCTCTCGCTAGCTCCTCTGATAAAAATCCTGAGCTCC
ATTCACTACTAGATGAGAGGGGAGACCTATAAAGCCTTTGAGAATATATACCCGGTCCTC
ACAGAGTTCAGGAAGATCCAACAATAGTAAAGTCGCAGGGTTTGTTCTTTGCAAAACTAG
CTGTGTGGTGTTTTAGCACCTCGGAGTTGCTTAACTTGCTGAGAATTTTGTCCTTGAACA
AAGGGCTCTCGAAGTTGCCAGATTCTTCTTACTTTTGTATTACTGTTTAAGATTCTGATA
GAACATTGTAAATACTCAAATGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A674TF U 1
AF RR2A674JQ C 371
BS 1 629 RR2A674TF
BS 630 630 RR2A674JQ
BS 631 665 RR2A674TF
BS 666 1165 RR2A674JQ

RD RR2A674TF 665 0 0
GGAATTCCAAAACGCAACCGATACCTCTTCCTCACAGATCTAAAAGACCTCCCCTCCCTC
GTTCATACATACATAAGAGAGAAACGAAAAGAGAGCCAAATCACTCTCCCTTCCTTCCTT
TATAAATAAACAACCCATTTTACAAATCTTTTTTCCCTCTCCAATCCCCTCGGATCTGTA
TATAAAAGCCTCACACCATCTCGTTTTATTCCTTTGCCAAATCTCATCTGCACGAAACCC
TAGATTTCGTGTCCGAATCTCTAAAAGGCAAATGACAGATCAAGGATTGGAAGGGAGTAA
TCCAGTAGACCTAGTCGAGCATCCTTCTGGGATCGTTCCCACTCTACAAAACATTGTCTC
AACGGTGAACTTGGATTGCAAGCTAGATCTCAAAGCCATAGCTCTGCAAGCTCGTAATGC
TGAATACAATCCCAAGCGTTTTGCTGCTGTGATCATGCGGATTAGAGAACCAAAGACGAC
TGCGTTAATTTTTGCCTCTGGTAAAATGGTTTGTACTGGAGCCAAGAGTGAATATTTTTC
AAAGATGGCTGCAAGAAAATATGCTCGGATTGTCCAAAAGCTTGGGTTTCCTGCAAAGTT
CAAGGATTTCAAGATTCAGAATATAGTAG*TTCTTGTGATGTCAAGTTCCCTATCAGACT
TGAAG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2A674JQ 795 0 0
TTGGATTGCAAGCTAGATCTCAAAGCCATAGCTCTGCAAGCTCGTAATGCTGAATACAAT
CCCAAGCGTTTTGCTGCTGTGATCATGCGGATTAGAGAACCAAAGACGACTGCGTTAATT
TTTGCCTCTGGTAAAATGGTTTGTACTGGAGCCAAGAGTGAATATTTTTCAAAGATGGCT
GCAAGAAAATATGCTCGGATTGTCCAAAAGCTTGGGTTTCCTGCAAAGTTCAAGGATTTC
AAGATTCAGAATATAGTAGGTTCTTGTGATGTCAAGTTCCCTATCAGACTTGAAGGTCTT
GCATACTCTCACGCCGCTTTCTCAAGTTACGAGCCTGAGTTGTTTCCAGGGCTGATCTAC
AGGATGAAAGTGCCTAAGATTGTTCTACTGATTTTTGTATCTGGCAAGATAGTCATCACT
GGAGCCAAGGTAAAAATCACACTCTCTCTTTTTAGGTTTTTTTTAAATTATCCCCCGAGA
AATGCATGATTTGTCTCTCGCTAGCTCCTCTGATAAAAATCCTGAGCTCCATTCACTACT
AGATGAGAGGGGAGACCTATAAAGCCTTTGAGAATATATACCCGGTCCTCACAGAGTTCA
GGAAGATCCAACAATAGTAAAGTCGCAGGGTTTGTTCTTTGCAAAACTAGCTGTGTGGTG
TTTTAGCACCTCGGAGTTGCTTAACTTGCTGAGAATTTTGTCCTTGAACAAAGGGCTCTC
GAAGTTGCCAGATTCTTCTTACTTTTGTATTACTGTTTAAGATTCTGATAGAACATTGTA
AATACTCAAATGGAG

QA 1 795 1 795
DS 



CO CL2508Contig2 772 2 6 U
GGCTCTGCAAGCTCGTAATGCTGAATACAATCCCAAGCGTTTTGCTGCTGTGATCATGCG
GATTAGAGAACCAAAGACGACTGCGTTAATTTTTGCCTCTGGTAAAATGGTTTGTACTGG
AGCCAAGAGTGAATATTTTTCAAAGATGGCTGCAAGAAAATATGCTCGGATTGTCCAAAA
GCTTGGGTTTCCTGCAAAGTTCAAGGATTTCAAGATTCAGAATATAGTAGGTTCTTGTGA
TGTCAAGTTCCCTATCAGACTTGAAGGTCTTGCATACTCTCACGCCGCTTTCTCAAGTTA
CGAGCCTGAGTTGCTTCCAGGGCTGATCTACAGGATGAAATTGCCTAAGATTGTTCTACT
GATTTTTGTATCTGGCAAGATAGTCATCACTGGAGCCAAGCTCCTCTGATAAAAATCCTG
AGCTCCATTCACTACTAGATGAGAGAGGAGACCTATAAAGCCTTTGAGAATATATACCCG
GTCCTCACAGAGTTCAGGAAGATCCAACAATAAGTCGCAGGGTTTGTTCTTTGCAAAACT
AGCTGTGTGGTGTTTTAGCACCTCGGAGTTGCTTAACTTGCTGAGAATTTTGTCCTTGAA
CAAAGGGCTCTCGAAGTTGCCAGATTCTTCTTACTTTTGTATTACTGTTTAAGATTCTGA
TAGAACATTGTAAATACTCAAATGGAGACAAATTTTCTGTTGTTTTTCTCCTCCAAGATC
TATTCACACGTTGAAAAGTACAAACTCGTGGCAGTATAGTCTTGTTTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU61TF U 1
AF RR2BU61JQ C 363
BS 1 715 RR2BU61TF
BS 716 716 RR2BU61JQ
BS 717 736 RR2BU61TF
BS 737 737 RR2BU61JQ
BS 738 750 RR2BU61TF
BS 751 772 RR2BU61JQ

RD RR2BU61TF 750 0 0
GGCTCTGCAAGCTCGTAATGCTGAATACAATCCCAAGCGTTTTGCTGCTGTGATCATGCG
GATTAGAGAACCAAAGACGACTGCGTTAATTTTTGCCTCTGGTAAAATGGTTTGTACTGG
AGCCAAGAGTGAATATTTTTCAAAGATGGCTGCAAGAAAATATGCTCGGATTGTCCAAAA
GCTTGGGTTTCCTGCAAAGTTCAAGGATTTCAAGATTCAGAATATAGTAGGTTCTTGTGA
TGTCAAGTTCCCTATCAGACTTGAAGGTCTTGCATACTCTCACGCCGCTTTCTCAAGTTA
CGAGCCTGAGTTGCTTCCAGGGCTGATCTACAGGATGAAATTGCCTAAGATTGTTCTACT
GATTTTTGTATCTGGCAAGATAGTCATCACTGGAGCCAAGCTCCTCTGATAAAAATCCTG
AGCTCCATTCACTACTAGATGAGAGAGGAGACCTATAAAGCCTTTGAGAATATATACCCG
GTCCTCACAGAGTTCAGGAAGATCCAACAATAAGTCGCAGGGTTTGTTCTTTGCAAAACT
AGCTGTGTGGTGTTTTAGCACCTCGGAGTTGCTTAACTTGCTGAGAATTTTGTCCTTGAA
CAAAGGGCTCTCGAAGTTGCCAGATTCTTCTTACTTTTGTATTACTGTTTAAGATTCTGA
TAGAACATTGTAAATACTCAAATGGAGACAAATTTTCTGTTGTTTTTCTCCTCCA*GATC
TATTCACACGTTGAAA*GTACAAACTCGTG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2BU61JQ 410 0 0
TTTTTGTATCTGGCAAGATAGTCATCACTGGAGCCAAGCTCCTCTGATAAAAATCCTGAG
CTCCATTCACTACTAGATGAGAGAGGAGACCTATAAAGCCTTTGAGAATATATACCCGGT
CCTCACAGAGTTCAGGAAGATCCAACAATAAGTCGCAGGGTTTGTTCTTTGCAAAACTAG
CTGTGTGGTGTTTTAGCACCTCGGAGTTGCTTAACTTGCTGAGAATTTTGTCCTTGAACA
AAGGGCTCTCGAAGTTGCCAGATTCTTCTTACTTTTGTATTACTGTTTAAGATTCTGATA
GAACATTGTAAATACTCAAATGGAGACAAATTTTCTGTTGTTTTTCTCCTCCAAGATCTA
TTCACACGTTGAAAAGTACAAACTCGTGGCAGTATAGTCTTGTTTTTACC

QA 1 410 1 410
DS 



AS 1 3

CO CL2509Contig1 919 3 2 U
TTTTTTTTTGTCCTTCTGGTTTGGGCTGTCTGAAAAATTGATGTGGAAAAGAAGAACGAT
GAAGCAGTAAGCTTTTTAGTTGCGATGATGGTCTCATCAGGTTCATGGGTTTTGTCCCCA
TCTTCTTCTTCTTCCGTCTTTTTTAGTCGTCGCCAGAGATTACCTTTGGTGAGATCAACG
GTCGATGGTAGGAGCCAGATTGTTCCACCGGGACAAAGCCAAACGCCTAACAAAGAAGTA
TTAGAGAGCGTGAGTCTGCTAAAAACGGCTGCAAAAACACGGAAAGTTGCAGCAGAGGAG
ATTTTAGCTGCTTTTACTGCTATCGAGAAGGCTAAGGTTGATCCATCACCATTCCTCGAA
ACACTAGGTGGATCCGAGTCCCCTGGACGTACATGGATGCTCATCTTCACAGCCGAGAAG
AAACTGAAGAAAGGTCGTTATTTCCCTCTAACCGCTGTTCAGAGATTTGATGCTGCGGGG
AAGAGAATAGAGAATGGGGTGTATCTTGGTCCAATAGGAGCATTGACATTCGAAGGAAAG
TTTTCATGGAAGAACCGTATCCTAGCGTTCATCTTCGAACAGATACGCATCAAGATTGGA
CCTTTGGATCCCATAGAGATCGGATTGGGAAAGAAAGATGCAGAGTATGAGCCGAGTAAC
AAAGACCCTTTCTTCATTTGGTTTTATGTCGATGAAGAAATAGCAGTTGCTCGTGGAAGA
AGCGGCGGTACAGCTTTCTGGTGTCGTTGTCACCGCATTGCTTCATGATGATCACTCTCT
TCTTCTTCTCAAAAATACTTCCCCCTGTAAAAATCTTTGAATGTGTGAATGAATGATACA
ATATGAGTCAGCTGCAGTGTTGTGATGTAAACTAAACCCGAATGGTTTAAGGTAGTAAAA
ATTCATGGGGATTCAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C482TF U 11
AF RR2BP72TF U 1
AF RR2BP72JQ C 168
BS 1 695 RR2BP72TF
BS 696 919 RR2BP72JQ

RD RR2C482TF 595 0 0
TCCTTCTGGTTTGGGCTGTCTGAAAAATTGATGTGGAAAAGAAGAACGATGAAGCAGTAA
GCTTTTTAGTTGCGATGATGGTCTCATCAGGTTCATGGGTTTTGTCCCCATCTTCTTCTT
CTTCCGTCTTTTTTAGTCGTCGCCAGAGATTACCTTTGGTGAGATCAACGGTCGATGGTA
GGAGCCAGATTGTTCCACCGGGACAAAGCCAAACGCCTAACAAAGAAGTATTAGAGAGCG
TGAGTCTGCTAAAAACGGCTGCAAAAACACGGAAAGTTGCGGCAGAGGAGATTTTAGCTG
CTTTTTCTGCTATCGAAAAGGCTAAGGTTGATCCATCACCATTCCTTGAAACACTAGGTG
GAACCGAGTCCCCTGGACGTACATGG*TGCTCATCTTCACTGCAGAGAAGAAACTGCAGA
AAGGTCGTTATTTCCCTCTAACCGCTGTTCAGAGATTTGATGCTGCGGGGAAGAGAATAG
AGAATGGGGTGTATCTTGGTCCAATAGGAGCGTTGACATTCGAAGGAAAGTTTTCATGGA
AGAACCGTATCCTAGCCTTCATATTCGAACAGATACGCATCAAGATTGGACCTTT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2BP72TF 702 0 0
TTTTTTTTTGTCCTTCTGGTTTGGGCTGTCTGAAAAATTGATGTGGAAAAGAAGAACGAT
GAAGCAGTAAGCTTTTTAGTTGCGATGATGGTCTCATCAGGTTCATGGGTTTTGTCCCCA
TCTTCTTCTTCTTCCGTCTTTTTTAGTCGTCGCCAGAGATTACCTTTGGTGAGATCAACG
GTCGATGGTAGGAGCCAGATTGTTCCACCGGGACAAAGCCAAACGCCTAACAAAGAAGTA
TTAGAGAGCGTGAGTCTGCTAAAAACGGCTGCAAAAACACGGAAAGTTGCAGCAGAGGAG
ATTTTAGCTGCTTTTACTGCTATCGAGAAGGCTAAGGTTGATCCATCACCATTCCTCGAA
ACACTAGGTGGATCCGAGTCCCCTGGACGTACATGGATGCTCATCTTCACAGCCGAGAAG
AAACTGAAGAAAGGTCGTTATTTCCCTCTAACCGCTGTTCAGAGATTTGATGCTGCGGGG
AAGAGAATAGAGAATGGGGTGTATCTTGGTCCAATAGGAGCATTGACATTCGAAGGAAAG
TTTTCATGGAAGAACCGTATCCTAGCGTTCATCTTCGAACAGATACGCATCAAGATTGGA
CCTTTGGATCCCATAGAGATCGGATTGGGAAAGAAAGATGCAGAGTATGAGCCGAGTAAC
AAAGACCCTTTCTTCATTTGGTTTTATGTCGATGA
GAAATAG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2BP72JQ 752 0 0
GGTGAGATCAACGGTCGATGGTAGGAGCCAGATTGTTCCACCGGGACAAAGCCAAACGCC
TAACAAAGAAGTATTAGAGAGCGTGAGTCTGCTAAAAACGGCTGCAAAAACACGGAAAGT
TGCAGCAGAGGAGATTTTAGCTGCTTTTACTGCTATCGAGAAGGCTAAGGTTGATCCATC
ACCATTCCTCGAAACACTAGGTGGATCCGAGTCCCCTGGACGTACATGGATGCTCATCTT
CACAGCCGAGAAGAAACTGAAGAAAGGTCGTTATTTCCCTCTAACCGCTGTTCAGAGATT
TGATGCTGCGGGGAAGAGAATAGAGAATGGGGTGTATCTTGGTCCAATAGGAGCATTGAC
ATTCGAAGGAAAGTTTTCATGGAAGAACCGTATCCTAGCGTTCATCTTCGAACAGATACG
CATCAAGATTGGACCTTTGGATCCCATAGAGATCGGATTGGGAAAGAAAGATGCAGAGTA
TGAGCCGAGTAACAAAGACCCTTTCTTCATTTGGTTTTATGTCGATGAAGAAATAGCAGT
TGCTCGTGGAAGAAGCGGCGGTACAGCTTTCTGGTGTCGTTGTCACCGCATTGCTTCATG
ATGATCACTCTCTTCTTCTTCTCAAAAATACTTCCCCCTGTAAAAATCTTTGAATGTGTG
AATGAATGATACAATATGAGTCAGCTGCAGTGTTGTGATGTAAACTAAACCCGAATGGTT
TAAGGTAGTAAAAATTCATGGGGATTCAGATT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 4

CO CL2510Contig1 632 4 2 U
GGACGTCAAAGACTACGTGGCCTTCCTCTGCGCCGTGGGATACAGGTTCCCGGGGATCCT
AGTGTTCCTTCAGGATCCAACTCTTTACAACGCCTGCGAGACGAGCAAGCTGAGAACCGC
CGGCGATCTCAACTACCCATCGTTCTCCGTCGTTTTCGGATCGACAGTCGATGTTGTGAA
GTACAGAAGGGTTGTTAAGAACGTGGGGACCAATGCTGACGCGGTGTACGAAGTCGGAGT
CAAATCTCCGGCGAATGTGGAGATCGATGTCTCTCCGAGTAAGCTTGCGTTTAGCGAGGA
GAAGAGCGAGTTGGAATACGAAGTGACGTTTCGGAGCGTTGTGCTCGGCGGCGGCGGAGT
TGGATCCGTGCCGGGTCATGAATTCGGGTCGATCGAATGGACAGACGGTGAACACGTCGT
GAAGAGCCCGGTGGCTGTTCAGTGGGGTCAGGGCTCGGTTCAGTCATTCTGATTGATACG
TATTGGGTTTTATTAATGGGCCTAGTAGTTAATGGGCCGATATATTTTTACTCATTGTTG
AGCTCTTACTCTTGTGTTAGATCATTAAGCATGGGAGTAAATGAGCAGAAACTTCGATTT
GCATTTGTAAAATTAGTTACCTTTTTTTATTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DW87TF U 1
AF RR2H536TF U 1
AF RR2DW87JQ C 250
AF RR2H536JQB C 269
BS 1 594 RR2DW87TF
BS 595 632 RR2DW87JQ

RD RR2DW87TF 594 0 0
GGACGTCAAAGACTACGTGGCCTTCCTCTGCGCCGTGGGATACAGGTTCCCGGGGATCCT
AGTGTTCCTTCAGGATCCAACTCTTTACAACGCCTGCGAGACGAGCAAGCTGAGAACCGC
CGGCGATCTCAACTACCCATCGTTCTCCGTCGTTTTCGGATCGACAGTCGATGTTGTGAA
GTACAGAAGGGTTGTTAAGAACGTGGGGACCAATGCTGACGCGGTGTACGAAGTCGGAGT
CAAATCTCCGGCGAATGTGGAGATCGATGTCTCTCCGAGTAAGCTTGCGTTTAGCGAGGA
GAAGAGCGAGTTGGAATACGAAGTGACGTTTCGGAGCGTTGTGCTCGGCGGCGGCGGAGT
TGGATCCGTGCCGGGTCATGAATTCGGGTCGATCGAATGGACAGACGGTGAACACGTCGT
GAAGAGCCCGGTGGCTGTTCAGTGGGGTCAGGGCTCGGTTCAGTCATTCTGATTGATACG
TATTGGGTTTTATTAATGGGCCTAGTAGTTAATGGGCCGATATATTTTTACTCATTGTTG
AGCTCTTACTCTTGTGTTAGATCATTAAGCATGGGAGTAAATGAGCAGAAACTT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2H536TF 571 0 0
GGACGTCAAAGACTACGTGGCCTTCCTCTGCGCCGTGGGATACAGGTTCCCGGGGATCCT
AGTGTTCCTTCAGGATCCAACTCTTTACAACGCCTGCGAGACGAGCAAGCTGAGAACCGC
CGGCGATCTCAACTACCCATCGTTCTCCGTCGTTTTCGGATCGACAGTCGATGTTGTGAA
GTACAGAAGGGTTGTTAAGAACGTGGGGACCAATGCTGACGCGGTGTACGAAGTCGGAGT
CAAATCTCCGGCGAATGTGGAGATCGATGTCTCTCCGAGTAAGCTTGCGTTTAGCGAGGA
GAAGAGCGAGTTGGAATACGAAGTGACGTTTCGGAGCGTTGTGCTCGGCGGCGGCGGAGT
TGGATCCGTGCCGGGTCATGAATTCGGGTCGATCGAATGGACAGACGGTGAACACGTCGT
GAAGAGCCCGGTGGCTGTTCAGTGGGGTCAGGGCTCGGTTCAGTCATTCTGATTGATACG
TATTGGGTTTTATTAATGGGCCTAGTAGTTAATGGGCCGATATATTTTTACTCATTGTTG
AGCTCTTACTCTTGTGTTAGATCATTAAGCA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2DW87JQ 383 0 0
GGCGAATGTGGAGATCGATGTCTCTCCGAGTAAGCTTGCGTTTAGCGAGGAGAAGAGCGA
GTTGGAATACGAAGTGACGTTTCGGAGCGTTGTGCTCGGCGGCGGCGGAGTTGGATCCGT
GCCGGGTCATGAATTCGGGTCGATCGAATGGACAGACGGTGAACACGTCGTGAAGAGCCC
GGTGGCTGTTCAGTGGGGTCAGGGCTCGGTTCAGTCATTCTGATTGATACGTATTGGGTT
TTATTAATGGGCCTAGTAGTTAATGGGCCGATATATTTTTACTCATTGTTGAGCTCTTAC
TCTTGTGTTAGATCATTAAGCATGGGAGTAAATGAGCAGAAACTTCGATTTGCATTTGTA
AAATTAGTTACCTTTTTTTATTT

QA 1 383 1 383
DS 

RD RR2H536JQB 364 0 0
GTCTCTCCGAGTAAGCTTGCGTTTAGCGAGGAGAAGAGCGAGTTGGAATACGAAGTGACG
TTTCGGAGCGTTGTGCTCGGCGGCGGCGGAGTTGGATCCGTGCCGGGTCATGAATTCGGG
TCGATCGAATGGACAGACGGTGAACACGTCGTGAAGAGCCCGGTGGCTGTTCAGTGGGGT
CAGGGCTCGGTTCAGTCATTCTGATTGATACGTATTGGGTTTTATTAATGGGCCTAGTAG
TTAATGGGCCGATATATTTTTACTCATTGTTGAGCTCTTACTCTTGTGTTAGATCATTAA
GCATGGGAGTAAATGAGCAGAAACTTCGATTTGCATTTGTAAAATTAGTTACCTTTTTTT
ATTT

QA 1 364 1 364
DS 



AS 1 4

CO CL2511Contig1 1056 4 13 U
GGACATCGAAGAAGTCAGAGGCCCCGTGATCCAGTCTCCCATCAGAACCGAAGATGATCT
CAAGAAACTGCACCCTATCGATCTCGACAAGCTTCGGTTCGTTGGAGACTCTTTAAAGAT
TCTGAGAGGAGAGGTCGGGAGGGATGCTGCTGTTTTGGGTTTCGTTGGAGCGCCTTGGAC
GATAGCGACTTATATAGTTGAAGGAGGAACGACTCGGACGTATACGGTGATCAAGAGTAT
GTGTCACACTGCACCTAATGTGCTGAGAGCTCTCTTGTCTCATTTGACCAAAGCTATTAC
GGAGTACGTTGTGTACCAAGTCGAGCACGGAGCTCACTGCATTCAGATATTTGATTCGTG
GGGTGGACAGTTGACTCCTGAGATGTGGGAGCGTTGGTCCAAACCTTACATCGAAGAGAT
TATTCATGATGTAAAGAGAAGATGTCCAGACACGCCGATAGTTTTCTACATAAATGGAAA
CGGTGGACTTCTTGAGCGGATGAAAGGAACAGGAGCTGATGTTATTGGACTTGACTGGAC
TGTAGATATGGCTGATGGGAGGAGGAGACTGGGGAGCGATGTTAGCGTGCAGGGGAACGT
TGATCCAGCTTACCTATTCTCTCCCCTTCCTGCTTTAACCGAAGAAATCCAAAGAGTGG*
TGAAGAGTGCTGGACCAAAAGGGCATATACTCAACTTAGGACATGGTGTCTTGGTAGGGA
CGCCAGAGGAAGCCGTTGCTCATTTCTTTGAAACCGCGAGGAGCTTGGATTACAAAACGT
TTTTCCAAAACCATGTTCCTGCAGAATCTGAATTGGTTGCCTGAGGGGAGAGTAATGTTG
AATAGACAGGAATCAGAGAAAATCTTTCTGCTTCTGACTCATAATCTTATCCTAGAGTGA
GTGACTTGCTTTGAGAACATTCGACACTGTCCTAGTTTTAACTC*TTAACAGTGTCTTGA
GTTGCTCA*TTGAAAATTTTCCCTGTTTGTTTTCTCGATCTTTATTTGTTGTATCTTCTG
TGTGAAACCAAGTAGCTTGTTTTGTATCATGAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AA07TF U 1
AF RR2A419TF U 262
AF RR2AA07JQ C 279
AF RR2A419JQ C 296
BS 1 365 RR2AA07TF
BS 366 366 RR2A419TF
BS 367 414 RR2AA07TF
BS 415 415 RR2A419TF
BS 416 507 RR2AA07TF
BS 508 508 RR2A419TF
BS 509 652 RR2AA07TF
BS 653 653 RR2A419TF
BS 654 659 RR2AA07TF
BS 660 660 RR2A419TF
BS 661 695 RR2AA07TF
BS 696 1028 RR2A419TF
BS 1029 1056 RR2AA07JQ

RD RR2AA07TF 695 0 0
GGACATCGAAGAAGTCAGAGGCCCCGTGATCCAGTCTCCCATCAGAACCGAAGATGATCT
CAAGAAACTGCACCCTATCGATCTCGACAAGCTTCGGTTCGTTGGAGACTCTTTAAAGAT
TCTGAGAGGAGAGGTCGGGAGGGATGCTGCTGTTTTGGGTTTCGTTGGAGCGCCTTGGAC
GATAGCGACTTATATAGTTGAAGGAGGAACGACTCGGACGTATACGGTGATCAAGAGTAT
GTGTCACACTGCACCTAATGTGCTGAGAGCTCTCTTGTCTCATTTGACCAAAGCTATTAC
GGAGTACGTTGTGTACCAAGTCGAGCACGGAGCTCACTGCATTCAGATATTTGATTCGTG
GGGTG*ACAGTTGACTCCTGAGATGTGGGAGCGTTGGTCCAAACCTTACATCGAGGAGAT
TATTCATGATGTAAAGAGAAGATGTCCAGACACGCCGATAGTTTTCTACATAAATGGAAA
CGGTGGACTTCTTGAGCGGATGAAAGGGACAGGAGCTGATGTTATTGGACTTGACTGGAC
TGTAGATATGGCTGATGGGAGGAGGAGACTGGGGAGCGATGTTAGCGTGCAGGGGAACGT
TGATCCAGCTTACCTATTCTCTCCCCTTCCTGCTTTAACCGAAGAAATCCAACGAGTGGG
TGAAGAGTGCTGGACCAAAAGGGCATATACTCAAC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2A419TF 767 0 0
GCTGAGAGCTCTCTTGTCTCATTTGACCAAAGCTATTACGGAGTATGTTGTGTACCAAGT
CGAGCACGGAGCTCACTGCATTCAGATATTTGATTCGTGGGGTGGACAGTTGACTCCTGA
GATGTGGGAGCGTTGGTCCAGACCTTACATTGAAGAGATTATTCGTGATGTAAAGAGAAG
ATGTCCAGACACGCCGATAGTTTTCTACATAAATGGAAACGGTGGACTTCTTGAGCGGAT
GAAAGGAACAGGAGCTGATGTTATTGGACTTGACTGGACTGTAGATATGGCTGATGGGAG
GAGGAGACTGGGGAGCGATGTTAGCGTGCAGGGGAACGTTGATCCAGCTTACCTATTCTC
TCCGCTTCCTGCTTTAACCGAAGAAATCCAAAGAGTGG*TGAAGAGTGCTGGACCAAAAG
GGCATATACTCAACTTAGGACATGGTGTCTTGGTAGGGACGCCAGAGGAAGCCGTTGCTC
ATTTCTTTGAAACCGCGAGGAGCTTGGATTACAAAACGTTTTTCCAAAACCATGTTCCTG
CAGAATCTGAATTGGTTGCCTGAGGGGAGAGTAATGTTGAATAGACAGGAATCAGAGAAA
ATCTTTCTGCTTCTGACTCATAATCTTATCCTAGAGTGAGTGACTTGCTTTGAGAACATT
CGACACTGTCCTAGTTTTAACTC*TTAACAGTGTCTTGAGTTGCTCA*TTGAAAATTTTC
CCTGTTTGTTTTCTCGATCTTTATTTGTTGTATCTTCTGTGTGAAAC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2AA07JQ 778 0 0
CTCATTTGACCAAAGCTATTACGGAGTACGTTGTGTACCAAGTCGAGCACGGAGCTCACT
GCATTCAGATATTTGATTCGTGGGGTG*ACAGTTGACTCCTGAGATGTGGGAGCGTTGGT
CCAAACCTTACATCGAGGAGATTATTCATGATGTAAAGAGAAGATGTCCAGACACGCCGA
TAGTTTTCTACATAAATGGAAACGGTGGACTTCTTGAGCGGATGAAAGGGACAGGAGCTG
ATGTTATTGGACTTGACTGGACTGTAGATATGGCTGATGGGAGGAGGAGACTGGGGAGCG
ATGTTAGCGTGCAGGGGAACGTTGATCCAGCTTACCTATTCTCTCCCCTTCCTGCTTTAA
CCGAAGAAATCCAACGAGTGG*TGAAGAGTGCTGGACCAAAAGGGCATATACTCAACTTA
GGACATGGTGTCTTGGTAGGGACGCCAGAGGAAGCCGTGGCTCATTTCTTTGAAACCGCA
AGGAGCTTGGATTACAAAACGTTTTTCCAAAACCATGTTCCTGCAGAATCTGAATTGGTT
GCATGAGGGGAGAGTAATGTCGAATAGACAGGAATCAGAGAAAATCTT*CTGTTTCTGAC
TCATAATCTTATCCTAGAGTGAGTGACTTGCTTTGAGAACATTCGACACTGTCCTAGTTT
TAACTCGTTAACAGTGTCTTGAGTTGCACAATTGAAAATTTTCCCTGTTTGTTTTCTCGA
TCTTTATTTATTGTATCTTCTATGTGAAACCAAGTAGCTTGTTTTGTATCATGAACTG

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2A419JQ 761 0 0
ATTACGGAGTATGTTGTGTACCAAGTCGAGCACGGAGCTCACTGCATTCAGATATTTGAT
TCGTGGGGTGGACAGTTGACTCCTGAGATGTGGGAGCGTTGGTCCAGACCTTACATTGAA
GAGATTATTCGTGATGTAAAGAGAAGATGTCCAGACACGCCGATAGTTTTCTACATAAAT
GGAAACGGTGGACTTCTTGAGCGGATGAAAGGAACAGGAGCTGATGTTATTGGACTTGAC
TGGACTGTAGATATGGCTGATGGGAGGAGGAGACTGGGGAGCGATGTTAGCGTGCAGGGG
AACGTTGATCCAGCTTACCTATTCTCTCCGCTTCCTGCTTTAACCGAAGAAATCCAAAGA
GTGG*TGAAGAGTGCTGGACCAAAAGGGCATATACTCAACTTAGGACATGGTGTCTTGGT
AGGGACGCCAGAGGAAGCCGTTGCTCATTTCTTTGAAACCGCGAGGAGCTTGGATTACAA
AACGTTTTTCCAAAACCATGTTCCTGCAGAATCTGAATTGGTTGCCTGAGGGGAGAGTAA
TGTTGAATAGACAGGAATCAGAGAAAATCTTTCTGCTTCTGACTCATAATCTTATCCTAG
AGTGAGTGACTTGCTTTGAGAACATTCGACACTGTCCTAGTTTTAACTC*TTAACAGTGT
CTTGAGTTGCTCA*TTGAAAATTTTCCCTGTTTGTTTTCTCGATCTTTATTTGTTGTATC
TTCTGTGTGAAACCAAGTAGCTTGTTTTGTATCATGAACTG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 4

CO CL2512Contig1 637 4 3 U
TTTTTTTGATCAAACTTAATTTTTTTTAGTATTACTGAGCAAGAGATACAGAGAATATAC
ACATGAAATATTCAAAAGCTTAAAGAAACACTAATCACTTGATGGATCATCACGGAACAA
ACAAAGGTCATTCACATCCAAATCCAAATTTTATGAGTACCGTATAATTAATTATAAGAA
AGCATAATGAAGAGAGAAGGAGAACTTCTTTGTGGAGCGCTAACTCCTGCAACGAGCAAT
TGAGCTGCAACCACGACTATAAGGATTAGCCTGAGCTCCGTTCTGACAATTATAATATGA
AGCTCCTCTTCTCGAACATGGCACACTGTTCCGCTTCAAAGATTGATAGCTTATGTACTT
TGTTGTCGCCAATATTCTTCTGCTGATCTCTGTGTCCATTTCCTCTTCCTCTGCCCCGAT
ACAATCTGCTATTGAACCGTGGCAGCCTGAGGAGTGGTCATGGACACCGTTCGTGGCCCA
TTCCAGACCGTCCATGTCATTGGTAAAGCCGGCTTGGATCAGAGGGGAAGAGATTATGAA
GAAACTGAGTATCATAAGGGTTGGAAACAGAGTAAAAGCCTTGGCCATTTTGTTAAGTCT
TTTTTTTTTCTTTCTTTTGTTAAGGTTTATTTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 10 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2F953JQ U 8
AF RR2F953TF C 1
AF RR2F757JQ U 20
AF RR2F757TF C 275
BS 1 7 RR2F953TF
BS 8 487 RR2F953JQ
BS 488 637 RR2F757JQ

RD RR2F953JQ 480 0 0
GATCAAACTTAATTTTTTTTAGTATTACTGAGCAAGAGATACAGAGAATATACACATGAA
ATATTCAAAAGCTTAAAGAAACACTAATCACTTGATGGATCATCACGGAACAAACAAAGG
TCATTCACATCCAAATCCAAATTTTATGAGTACCGTATAATTAATTATAAGAAAGCATAA
TGAAGAGAGAAGGAGAACTTCTTTGTGGAGCGCTAACTCCTGCAACGAGCAATTGAGCTG
CAACCACGACTATAAGGATTAGCCTGAGCTCCGTTCTGACAATTATAATATGAAGCTCCT
CTTCTCGAACATGGCACACTGTTCCGCTTCAAAGATTGATAGCTTATGTACTTTGTTGTC
GCCAATATTCTTCTGCTGATCTCTGTGTCCATTTCCTCTTCCTCTGCCCCGATACAATCT
GCTATTGAACCGTGGCAGCCTGAGGAGTGGTCATGGACACCGTTCGTGGCCCATTCCAGA

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2F953TF 637 0 0
TTTTTTTGATCAAACTTAATTTTTTTTAGTATTACTGAGCAAGAGATACAGAGAATATAC
ACATGAAATATTCAAAAGCTTAAAGAAACACTAATCACTTGATGGATCATCACGGAACAA
ACAAAGGTCATTCACATCCAAATCCAAATTTTATGAGTACCGTATAATTAATTATAAGAA
AGCATAATGAAGAGAGAAGGAGAACTTCTTTGTGGAGCGCTAACTCCTGCAACGAGCAAT
TGAGCTGCAACCACGACTATAAGGATTAGCCTGAGCTCCGTTCTGACAATTATAATATGA
AGCTCCTCTTCTCGAACATGGCACACTGTTCCGCTTCAAAGATTGATAGCTTATGTACTT
TGTTGTCGCCAATATTCTTCTGCTGATCTCTGTGTCCATTTCCTCTTCCTCTGCCCCGAT
ACAATCTGCTATTGAACCGTGGCAGCCTGAGGAGTGGTCATGGACACCGTTCGTGGCCCA
TTCCAGACCGTCCATGTCATTGGTGAAGCCGGCTTGGATCAGAGGGGAAGAGATTATGAA
GAAACTGAGTATCATAAGGCTTGGAAACAGAGTAAAAGCCTTGGCCATTTTGTTA**TTC
TTTTTTTTTCTTTCTTTTGTTAAGGTTTATTTTGTCC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2F757JQ 618 0 0
TTTTTTTTATTATTACTGTGCAAGAGATACAGAGAATATACACATGAAATATTCAAAAGC
TTAAAGAAACACTAATCACTTGATGGATTATCACGGAACAAACAAAGGTCATTCACATCC
AAATCCAAATTTTATGAGTACCGTATAATTAATTATAAGAAAGCACAATGAAGAGAGAAG
GAGAACTTCTTTGTGGAGCGCTAACTCCTGCAACGAGCAATTGAGCTGCAACCACGACTA
TAAGGATTAACCTGAGCTCCGTTCTGACAATTATAATATGACGCTCCTCTTCTCGAACAT
GGCACACTGTTCCGCTTCAAAGATTGATAGCTTATGTACTTTGTTGTCGCCAATATTCTT
CTGCTGATCTCTGTGTCCATTTCCTCTTCCTCTGCCCCGATACAATCTGCTATTGAACCG
TGGCAGCCTGAGGAGTGGTCATGGACACCGTTCGTGGCCCATTCCAGACCGTCCATGTCA
TTGGTAAAGCCGGCTTGGATCAGAGGGGAAGAGATTATGAAGAAACTGAGTATCATAAGG
GTTGGAAACAGAGTAAAAGCCTTGGCCATTTTGTTAAGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTG
TTAAGGTTTATTTTGTCC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2F757TF 363 0 0
GCTCCGTTCTGACAATTATAATATGACGCTCCTCTTCTCGAACATGGCACACTGTTCCGC
TCCAAAGATTGATAGCTTATGTACTTTGTTGTCGCCAATATTCTTCTGCTGATCTCTGTG
TCCATTTCCTCTTCCTCTGCCCCGATACAATCTGCTATTGAACCGTGGCAGCCTGAGGAG
TGGTCATGGACACCGTTCGTGGCCCATTCCAGACCGTCCATGTCATTGGTAAAGCCGGCT
TGGATCAGAGGGGAAGAGATTATGAAGAAACTGAGTATCATAAGGGTTGGAAACAGAGTA
AAAGCCTTGGCCATTTTGTTAAGTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTGTTAAGGTTTATTTTG
TCC

QA 1 363 1 363
DS 



AS 1 2

CO CL2513Contig1 383 2 10 U
TTAATTAACTTAATTTTGGGAGTTACATATATAGATAGTTTAAAAACCAACTTAAGCCGT
TTGAATAACTTTATTTTAACGGACTTACATTACACAAACATCACAATGCAATATTTATGG
CTTCCCACGCAAGCAAACTTAGGTTTAAACAGACCCAAGCCCGTAAGCACTCATATCCAA
CCTCGGCTTAGGATGCACAACCAAAGGAACCCCTCTTTGCAGAGTGATCCCATAAGTCTC
CCCCATGTTCAGCTTCCCCGGCGTAATTCCTCCGGCCAGTTCCCATTCAAATCCGTGCAC
AAGCGTCGCCGTCAGTAACTGAATCGTCCGTAACCCTAAACTCAGCCAAGCGCAAATTCT
CCTCCCGGCTCCGAACGGTATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ49JQ U 1
AF RR2EF16TF C 124
BS 1 183 RR2EQ49JQ
BS 184 184 RR2EF16TF
BS 185 306 RR2EQ49JQ
BS 307 307 RR2EF16TF
BS 308 348 RR2EQ49JQ
BS 349 349 RR2EF16TF
BS 350 366 RR2EQ49JQ
BS 367 367 RR2EF16TF
BS 368 375 RR2EQ49JQ
BS 376 383 RR2EF16TF

RD RR2EQ49JQ 375 0 0
TTAATTAACTTAATTTTGGGAGTTACATATATAGATAGTTTAAAAACCAACTTAAGCCGT
TTGAATAACTTTATTTTAACGGACTTACATTACACAAACATCACAATGCAATATTTATGG
CTTCCCACGCAAGCAAACTTAGGTTTAAACAGACCCAAGCCCGTAAGCACTCATATCCAA
CCTTGGCTTAGGATGCACAACCAAAGGAACCCCTCTTTGCAGAGTGATCCCATAAGTCTC
CCCCATGTTCAGCTTCCCCGGCGTAATTCCTCCGGCCAGTTCCCATTCAAATCCGTGCAC
AAGCGTGGCCGTCAGTAACTGAATCGTCCGTAACCCTAAACTCAGCCAGGCGCAAATTCT
CCTCCCTGCTCCGAA

QA 1 375 1 375
DS 

RD RR2EF16TF 260 0 0
CG
CACGCAAGCAAACTTAGGTTTAAACAGACCCAAGCCCGTAAGCACTCATATCCAACCTCG
GCTTAGGATGCACAACCAAAGGAACCGCTCTTTGCAGAGTGATCCCATAAGTCTCCTCCA
TGTTCAGCTTCTCCGGCGTAATTCCTCCGGCCAGTTCCCATTCAAATCCGTGCACCAGCG
TCGCCGTCAGTAACTGAATCGTCCGTAACCCTAAACTCAGCCCAGCGCAGATTCTCCTCC
CGGCTCCGAACGGTATAA

QA 3 260 3 260
DS 



AS 1 4

CO CL2514Contig1 1305 4 8 U
GGACAACATAAACCACTCAGACAAAAGAGAAACAAATGGCGAAATCTCCAGAGACAGAGC
ATCCGAACAAAGCCTTTGGCTGGGCTGCCAAAGACAAATCTGGTCTACTCTCTCCTTTCC
ATTTCTCCAGAAGAGACAATGGTGACAATGATGTGACAGTAAAAATCTTGTATTGTGGAG
TGTGCCACACTGATTTGCATACCATCAAAAACGACTGGGGTTTCTCCTATTATCCTGTAG
TTCCAGGGCATGAAATAGTTGGAATAGCTACAAAAGTTGGCAAAAACGTGACTAAATTCA
GAGAAGGAGACCGTGTAGGAGTAGGAGTGATCACTGGTTCTTGCCAGTCTTGCGAATCTT
GTGACCAAGATCTTGAAAACTACTGTCCCCAAATGTCTTTCACCTACAACTCCATTGGAT
CCGATGGAACCAAGACCTACGGTGGATATTCGGAGTCCATTGTGGTCGACCAACGGTTTG
TTTTACAGTTTCCCGAGGGATTACCTAGCGATTCTGGTGCGCCTTTGCTGTGTGCTGGAA
TCACTGTGTATAGTCCAATGAAGTACTATGGTATGACCGAGCCAGGGAAGCATTTGGGTG
TGGCTGGACTTGGTGGGCTTGGTCATGTTGCTGTCAAGATTGGTAAAGCTTTTGGTTTGA
AAGTTACTGTGATTAGTTCTTCTCCTAATAAAGAAGATGAAGCCATTAATCGTCTTGGTG
CTGATTCGTTTCTTGTCTCATCTGATCCTCAGAAGATGAAGGCTGCAATAGGAACAATGG
ACTACATTATTGATACCGTTTCAGCAGTACATGCTCTGTTTCCATTACTTGGTTTACTCA
AAGTCAATGGAAAGCTAGTCACTTTAGACTTACCTGAGAAGCCTCTTGAGCTACCAATCT
TCCCTCTTGTTCTCGGAAGGAAAATGGTGGGAGGAAGTGACATTGGAGGAATGAAGGAGA
CACAGGAGATGCTTGAGTTCTGCGCTAAGCATAACATAACGGCAGATATTGAGCTGATCA
AGATGGATGAGATTAACACTGCAATGGAGAGGCTTGCTAAGGCTGATGTTAGGTACAGGT
TCGTGATCGACGTGGCTAACTCCTTGAGCCCTCCATGACTTAGCCGAATCTAAGAGTAGA
CCATGGATGAATATGTTATCTCGTGCTTCTGTTGTGTTCGTGTTATCTTTGTTTTCTACT
ATTTATGTTTTAGTGAACTGGTTTCTTCTGAAACAAGTCACCTTAAGTTGTCAGAGAACT
TCTCTCTGTTTTTCTTTTCATGATATAATAAGTCTTTCTGATCAG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2FI14TF U 1
AF RR2BF74TF U 2
AF RR2BF74JQ C 501
AF RR2FI14JQ C 719
BS 1 203 RR2FI14TF
BS 204 759 RR2BF74TF
BS 760 867 RR2BF74JQ
BS 868 868 RR2FI14JQ
BS 869 979 RR2BF74JQ
BS 980 980 RR2FI14JQ
BS 981 1303 RR2BF74JQ
BS 1304 1305 RR2FI14JQ

RD RR2FI14TF 203 0 0
GGACAACATAAACCACTCAGACAAAAGAGAAACAAATGGCGAAATCTCCAGAGACAGAGC
ATCCGAACAAAGCCTTTGGCTGGGCTGCCAAAGACAAATCTGGTCTACTCTCTCCTTTCC
ATTTCTCCAGAAGAGACAATGGTGACAATGATGTGACAGTAAAAATCTTGTATTGTGGAG
TGTGCCACACTGATTTGCATACC

QA 1 203 1 203
DS 

RD RR2BF74TF 758 0 0
GACAACATAAACCACTCAGACAAAAGAGAAACAAATGGCGAAATCTCCAGAGACAGAGCA
TCCGAACAAAGCCTTTGGCTGGGCTGCCAAAGACAAATCTGGTCTACTCTCTCCTTTCCA
TTTCTCCAGAAGAGACAATGGTGTCAATGATGTGACAGTAAAAATCTTGTATTGTGGAGT
GTGCCACACTGATTTGCATACCATCAAAAACGACTGGGGTTTCTCCTATTATCCTGTAGT
TCCAGGGCATGAAATAGTTGGAATAGCTACAAAAGTTGGCAAAAACGTGACTAAATTCAG
AGAAGGAGACCGTGTAGGAGTAGGAGTGATCACTGGTTCTTGCCAGTCTTGCGAATCTTG
TGACCAAGATCTTGAAAACTACTGTCCCCAAATGTCTTTCACCTACAACTCCATTGGATC
CGATGGAACCAAGACCTACGGTGGATATTCGGAGTCCATTGTGGTCGACCAACGGTTTGT
TTTACAGTTTCCCGAGGGATTACCTAGCGATTCTGGTGCGCCTTTGCTGTGTGCTGGAAT
CACTGTGTATAGTCCAATGAAGTACTATGGTATGACCGAGCCAGGGAAGCATTTGGGTGT
GGCTGGACTTGGTGGGCTTGGTCATGTTGCTGTCAAGATTGGTAAAGCTTTTGGTTTGAA
AGTTACTGTGATTAGTTCTTCTCCTAATAAAGAAGATGAAGCCATTAATCGTCTTGGTGC
TGATTCGTTTCTTGTCTCATCTGATCCTCAGAAGATGA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2BF74JQ 804 0 0
TTACCTAGCGATTCTGGTGCGCCTTTGCTGTGTGCTGGAATCACTGTGTATAGTCCAATG
AAGTACTATGGTATGACCGAGCCAGGGAAGCATTTGGGTGTGGCTGGACTTGGTGGGCTT
GGTCATGTTGCTGTCAAGATTGGTAAAGCTTTTGGTTTGAAAGTTACTGTGATTAGTTCT
TCTCCTAATAAAGAAGATGAAGCCATTAATCGTCTTGGTGCTGATTCGTTTCTTGTCTCA
TCTGATCCTCAGAAGATGAAGGCTGCAATAGGAACAATGGACTACATTATTGATACCGTT
TCAGCAGTACATGCTCTGTTTCCATTACTTGGTTTACTCAAAGTCAATGGAAAGCTAGTC
ACTTTAGGCTTACCTGAGAAGCCTCTTGAGCTACCAATCTTCCCTCTTGTTCTCGGAAGG
AAAATGGTGGGAGGAAGTGACATTGGAGGAATGAAGGAGACACAGGAGATGCTTGAGTTT
TGCGCTAAGCATAACATAACGGCAGATATTGAGCTGATCAAGATGGATGAGATTAACACT
GCAATGGAGAGGCTTGCTAAGGCTGATGTTAGGTACAGGTTCGTGATCGACGTGGCTAAC
TCCTTGAGCCCTCCATGACTTAGCCGAATCTAAGAGTAGACCATGGATGAATATGTTATC
TCGTGCTTCTGTTGTGTTCGTGTTATCTTTGTTTTCTACTATTTATGTTTTAGTGAACTG
GTTTCTTCTGAAACAAGTCACCTTAAGTTGTCAGAGAACTTCTCTCTGTTTTTCTTTTCA
TGATATAATAAGTCTTTCTGATC
G

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2FI14JQ 587 0 0
TGCTGATTCGTTTCTTGTCTCATCTGATCCTCAGAAGATGAAGGCTGCAATAGGAACAAT
GGACTACATTATTGATACCGTTTCAGCAGTACATGCTCTGTTTCCATTACTTGGTTTACT
CAAAGTCAATGGAAAGCTAGTCACTTTAGACTTACCTGAGAAGCCTCTTGAGCTACCAAT
CTTCCCTCTTGTTCTCGGAAGGAAAATGGTGGGAGGAAGTGACATTGGAGGAATGAAGGA
GACACAGGAGATGCTTGAGTTCTGCGCTAAGCATAACATAACGGCAGATATTGAGCTGAT
CAAGATGGATGAGATTAACACTGCAATGGAGAGGCTTGCTAAGGCTGATGTTAGGTACAG
GTTCGTGATCGACGTGGCTAACTCCTTGAGCCCTCCATGACTTAGCCGAATCTAAGAGTA
GACCATGGATGAATATGTTATCTCGTGCTTCTGTTGTGTTCGTGTTATCTTTGTTTTCTA
CTATTTATGTTTTAGTGAACTGGTTTCTTCTGAAACAAGTCACCTTAAGTTGTCAGAGAA
CTTCTCTCTGTTTTTCTTTTCATGATATAATAAGTCTTTCTGATCAG

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 3

CO CL2515Contig1 1301 3 23 U
GGATCTCTCTCCCTCTATACATTCATAAGTTTTATTACAGAGTAAAACGGAACACGGAGG
GATCAGTCATGAAGAATTGTGAACGAATCGCTAATCTCGCTCTCGCAGGATTGACATTGG
CACCACTTGTTGTGAGGGTGAACCCAAACTTGAATGTTGTCCTTACGGCATGCCTCACTG
TTTTTGTCGGTTGCTTTCGTTCCGTCAAGGATTCTCCTCCAACTGAGACGATGTCGAAAG
AGCACGACATGCGTTTCCCATTGGTTGGGAGTGCTATGCTTCTCTCACTTTTCTTATTGT
TCAAGTTTCTCTCCAAGGACTTGGTCAATGCTGTCCTCACTGCTTACTTCTTTGTTCTTG
GCACCGTCGCCCTTTCAGCGACACTGTTACCTGCCATCAGCAGATTTCTTCCAAACCTTT
GGAATGACGTTGCTACCGTCTGGACTTTTCCTTATTTCAAATCTTTGGAGGTAGAGTTCA
CAAAGTCCCAGGTTGTTGCGGGAATCCCTGGATTCTTCTTCTGCGCCTGGTATGCTTGGA
AGAAACATTGGCTCGCTAATAACATCCTTGGCCTTTCCTTCTGCATTCAGGGAATTGAGA
TGCTCTCTCTTGGATCATTCATGACTGGTGGCATCCTTTTGGTTGGACTGTTTTTCTATG
ATATTTTCTGGGTCTTCTTTACTCCGGTTATGGTTAGTGTTGCCAAATCCTTTGATGCTC
CGATCAAGCTTTTGTTTCCTACTGGTGATGCTCTAAGACCCTACTCTATGCTTGGGCTTG
GTGATATTGTCATCCCGGGTATTTTTGTTGCACTGGCTCTAAGATTTGACGTGTCAAGAC
GCAGTAAACCACAGTACTTCACAAGTGCATTTGTGGGATACGTTGCTGGAGTTGTCCTCA
CTATTGTAGTCATGAACTGGTTTCAAGCAGCACAGCCTGCTTTGTTGTACATTGTCCCAG
CCGCCATTGGGTTCTTGGCTTCTCATTGCATTTGGAATGGTGACATCAAACCGTTGATGG
CGTTTGACGAATCGAAGAGTACAGAGGGAGAGGTTGATAAAGCTCATGAAGAATGAAGAC
AATGGAGAAAGAAGGGCTGAGGAGTAACATTTATATACACATAAAAATGTGTTTTTATAT
GTATGGAAAAAATAGAGAAGGAAAACATTTTTTTTTGTTTCCAGTGATCATCAGTCCCTT
CAAAAATAGTTCTCAGCCCTTTTTGTTCTTTTTAGATTTTCAAACATCTTGCAAAGACTT
ATGTAAGTTATACAAGTTACAACAGGTTTTTACTTTTGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F528TF U 1
AF RR2B904TF U 65
AF RR2B904JQ C 424
BS 1 74 RR2F528TF
BS 75 75 RR2B904TF
BS 76 283 RR2F528TF
BS 284 284 RR2B904TF
BS 285 341 RR2F528TF
BS 342 342 RR2B904TF
BS 343 432 RR2F528TF
BS 433 433 RR2B904TF
BS 434 445 RR2F528TF
BS 446 446 RR2B904TF
BS 447 463 RR2F528TF
BS 464 464 RR2B904TF
BS 465 490 RR2F528TF
BS 491 491 RR2B904TF
BS 492 621 RR2F528TF
BS 622 622 RR2B904TF
BS 623 688 RR2F528TF
BS 689 847 RR2B904TF
BS 848 848 RR2B904JQ
BS 849 863 RR2B904TF
BS 864 864 RR2B904JQ
BS 865 921 RR2B904TF
BS 922 1301 RR2B904JQ

RD RR2F528TF 696 0 0
GGATCTCTCTCCCTCTATACATTCATAAGTTTTATTACAGAGTAAAACGGAACACGGAGG
GATCAGTCATGAAGGATTGTGAACGAATCGCTAATCTCGCTCTCGCAGGATTGACATTGG
CACCACTTGTTGTGAGGGTGAACCCAAACTTGAATGTTGTCCTTACGGCATGCCTCACTG
TTTTTGTCGGTTGCTTTCGTTCCGTCAAGGATTCTCCTCCAACTGAGACGATGTCGAAAG
AGCACGACATGCGTTTCCCATTGGTTGGGAGTGCTATGCTTCTGTCACTTTTCTTATTGT
TCAAGTTTCTCTCCAAGGACTTGGTCAATGCTGTCCTCACTTCTTACTTCTTTGTTCTTG
GCACCGTCGCCCTTTCAGCGACACTGTTACCTGCCATCAGCAGATTTCTTCCAAACCTTT
GGAATGACGTTGTTACCGTCTGGACCTTTCCTTATTTCAAATCCTTGGAGGTAGAGTTCA
CAAAGTCCCAAGTTGTTGCGGGAATCCCTGGATTCTTCTTCTGCGCCTGGTATGCTTGGA
AGAAACATTGGCTCGCTAATAACATCCTTGGCCTTTCCTTCTGCATTCAGGGAATTGAGA
TGCTCTCTCTTGGATCATTCAAGACTGGTGGCATCCTTTTGGTTGGACTGTTTTTCTATG
ATATTTTCTGGGTCTTCTTTACTCCGGT
ATGGTAGT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2B904TF 857 0 0
AGTCATGAAGAATTGTGAACGAATCGCTAATCTCGCTCTCGCAGGATTGACATTGGCACC
ACTTGTTGTGAGGGTGAACCCAAACTTGAATGTTGTCCTTACGGCATGCCTCACTGTTTT
TGTCGGTTGCTTTCGTTCCGTCAAGGATTCTCCTCCAACTGAGACGATGTCGAAAGAGCA
TGCCATGCGTTTCCCATTGGTTGGGAGTGCTATGCTTCTCTCCCTTTTCTTATTGTTCAA
GTTTCTCTCCAAGGACTTGGTCAATGCTGTCCTCACTGCTTACTTCTTTGTTCTTGGCAC
CGTCGCTCTTTCAGCGACACTGTTACCTGCCATCAGCAGATTTCTTCCAAACCTTTGGAA
TGACGTTGCTACCGTCTGGACTTTTCCTTATTTCAAATCTTTGGAGGTAGAGTTCACAAA
GTCCCAGGTTGTTGCGGGAATCCCTGGATTCTTCTTCTGCGCCTGGTATGCTTGGAAGAA
ACATTGGCTCGCTAATAACATCCTTGGCCTTTCCTTCTGCATTCAGGGAATTGAGATGCT
CTCTCTTGGATCATTCATGACTGGTGGCATCCTTTTGGTTGGACTGTTTTTCTATGATAT
TTTCTGGGTCTTCTTTACTCCGGTTATGGTTAGTGTTGCCAAATCCTTTGATGCTCCGAT
CAAGCTTTTGTTTCCTACTGGTGATGCTCTAAGACCCTACTCTATGCTTGGGCTTGGTGA
TATTGTCATCCCGGGTATTTTTGTTGCACTGGCTCTAAGATTTGACGTGTCAAGACGCAG
TAA*CCACAGTACTTCACA*GTGCATTTGTGGGATACGTTGCTGGAGTTGTCCTCACTAT
TGTAGTCATGAACTGGT

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR2B904JQ 878 0 0
ATGACGTTGCTACCGTCTGGACTTTTCCTTATTTCAAATCTTTGGAGGTAGAGTTCACAA
AGTCCCAGGTTGTTGCGGGAATCCCTGGATTCTTCTTCTGCGCCTGGTATGCTTGGAAGA
AACATTGGCTCGCTAATAACATCCTTGGCCTTTCCTTCTGCATTCAGGGAATTGAGATGC
TCTCTCTTGGATCATTCATGACTGGTGGCATCCTTTTGGTTGGACTGTTTTTCTATGATA
TTTTCTGGGTCTTCTTTACTCCGGTTATGGTTAGTGTTGCCAAATCCTTTGATGCTCCGA
TCAAGCTTTTGTTTCCTACTGGTGATGCTCTAAGACCCTACTCTATGCTTGGGCTTGGTG
ATATTGTCATCCCGGGTATTTTTGTTGCACTGGCTCTAAGATTTGACGTGTCAAGACGCA
GTAAACCACAGTACTTCACAAGTGCATTTGTGGGATACGTTGCTGGAGTTGTCCTCACTA
TTGTAGTCATGAACTGGTTTCAAGCAGCACAGCCTGCTTTGTTGTACATTGTCCCAGCCG
CCATTGGGTTCTTGGCTTCTCATTGCATTTGGAATGGTGACATCAAACCGTTGATGGCGT
TTGACGAATCGAAGAGTACAGAGGGAGAGGTTGATAAAGCTCATGAAGAATGAAGACAAT
GGAGAAAGAAGGGCTGAGGAGTAACATTTATATACACATAAAAATGTGTTTTTATATGTA
TGGAAAAAATAGAGAAGGAAAACATTTTTTTTTGTTTCCAGTGATCATCAGTCCCTTCAA
AAATAGTTCTCAGCCCTTTTTGTTCTTTTTAGATTTTCAAACATCTTGCAAAGACTTATG
TAAGTTATACAAGTTACAACAGGTTTTTACTTTTGAAG

QA 1 878 1 878
DS 



AS 1 4

CO CL2516Contig1 578 4 4 U
GGATCAACAATTTTCACAAAGCAATTCTCCATTTCACAAACAAAAAACACAAAGCTAAGA
GTTTCTGCAATTAAGCAACAAAAAAAGAAAACAGAGAGAAAAGATGAGTTCAAGGAGCAA
AGCATGGTTAGTGGCAGCAACCATTGGAGCTGTGGAGGCCTCAAAAGACCAATTAGGTTT
ATGTAGGTGGAACTACACGATCCGGTCGGTGAATCAACGTATCCGAAATAATGTGAGATC
CGCTGCTCAGGCGAACAGGTTCTCTTCTTCGTCCGTCACCGCCGTTGCCGCTGGTAAGGA
TGGTGACAAGGCGAAGCAAGCTGAGGAGTCTCTCAGGACGGTCATGTACTTGAGCTGTTG
GGGTCCTAATTGATGAAGACAGATGGATAGAGATTTTTATTAATGCTTTGCCATCGATTG
GATCCGACAGGTTGTAGCTGTGAAATCAAAATCCTAAATAGACGTTATGAGTGTTGGGGG
GTTTTTGATGAGTAGTTTCGGGATGCAATCAAATATTGGATTCGAATTGTATAAGTCATA
AATGATACTTGTACAGAATTCAGTGATGAATATAAAAG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2G349TF U 1
AF RR2E178JQ C 1
AF RR2G349JQ C 1
AF RR2E178TF U 1
BS 1 121 RR2G349TF
BS 122 122 RR2E178TF
BS 123 484 RR2G349TF
BS 485 578 RR2E178TF

RD RR2G349TF 484 0 0
GGATCAACAATTTTCACAAAGCAATTCTCCATTTCACAAACAAAAAACACAAAGCTAAGA
GTTTCTGCAATTAAGCAACAAAAAAAGAAAACAGAGAGAAAAGATGAGTTCAAGGAGCAA
ATCATGGTTAGTGGCAGCAACCATTGGAGCTGTGGAGGCCTCAAAAGACCAATTAGGTTT
ATGTAGGTGGAACTACACGATCCGGTCGGTGAATCAACGTATCCGAAATAATGTGAGATC
CGCTGCTCAGGCGAACAGGTTCTCTTCTTCGTCCGTCACCGCCGTTGCCGCTGGTAAGGA
TGGTGACAAGGCGAAGCAAGCTGAGGAGTCTCTCAGGACGGTCATGTACTTGAGCTGTTG
GGGTCCTAATTGATGAAGACAGATGGATAGAGATTTTTATTAATGCTTTGCCATCGATTG
GATCCGACAGGTTGTAGCTGTGAAATCAAAATCCTAAATAGACGTTATGAGTGTTGGGGG
GTTT

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2E178JQ 578 0 0
GGATCAACAATTTTCACAAAGCAATTCTCCATTTCACAAACAAAAAACACAAAGCTAAGA
GTTTCTGCAATTAAGCAACAAAAAA*GAAAACAGAGAGAAAAGATGAGTTCAAGGAGCAA
AGCATGGTTAGTGGCAGCAACCATTGGAGCTGTGGAGGCCTCAAAAGACCAATTAGGTTT
ATGTAGGTGGAACTATACGATCCGGTCGGTGAATCAACGTATCCGAAATAATGTGAGATC
CGCTGCTCAGGCGAACAGGTTCTCTTCTTCGTCCGTCACCGCCGTTGCCGCTGGTAAGGA
TGGTGACAAGGCGAGGCAAGCTGAGGAGTCTCTCAGGACGGTCATGTACTTGAGCTGTTG
GGGTCCTAATTGATGAAGACAGATGGATAGAGATTTTTATTAATGCTTTGCCATCGATTG
GATCCGACAGGTTGTAGCTGTGAAATCAAAATCCTAAATAGACGTTATGAGTGTTGGGGG
GTTTTTGATGAGTAGTTTCGGGATGCAATCAAATATTGGATTCGAATTGTATAAGTCATA
AATGATACTTGTACAGAATTCAGTGATGAATATAAAAG

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2G349JQ 578 0 0
GGATCAACAATTTTCACAAAGCAATTCTCCATTTCACAAACAAAAAACACAAAGCTAAGA
GTTTCTGCAATTAAGCAACAAAAAAAGAAAACAGAGAGAAAAGATGAGTTCAAGGAGCAA
ATCATGGTTAGTGGCAGCAACCATTGGAGCTGTGGAGGCCTCAAAAGACCAATTAGGTTT
ATGTAGGTGGAACTACACGATCCGGTCGGTGAATCAACGTATCCGAAATAATGTGAGATC
CGCTGCTCAGGCGAACAGGTTTTCTTCTTCGTCCGTCACCGCCGTTGCCGCTGGTAAGGA
TGGTGACAAGGCGAAGCAAGCTGAGGAGTCTCTCAGGACGGTCATGTACTTGAGCTGTTG
GGGTCCTAATTGATGAAGACAGATGGATAGAGATTTTTATTAATGCTTTGCCATCGATTG
GATCCGACAGGTTGTAGCTGTGAAATCAAAATCCTAAATAGACGTTATGAGTGTTGGGGG
GTTTTTGATGAGTAGTTTCGGGATGCAATCAAATATTGGATTCGAATTGTATAAGTCATA
AATGATACTTGTACAGAATTCAGTGATGAATATAAAAG

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2E178TF 578 0 0
GGATCAACAATTTTCACAAAGCAATTCTCCATTTCACAAACAAAAAACACAAAGCTAAGA
GTTTCTGCAATTAAGCAACAAAAAA*GAAAACAGAGAGAAAAGATGAGTTCAAGGAGCAA
AGCATGGTTAGTGGCAGCAACCATTGGAGCTGTGGAGGCCTCAAAAGACCAATTAGGTTT
ATGTAGGTGGAACTATACGATCCGGTCGGTGAATCAACGTATCCGAAATAATGTGAGATC
CGCTGCTCAGGCGAACAGGTTCTCTTCTTCGTCCGTCACCGCCGTTGCCGCTGGTAAGGA
TGGTGACAAGGCGAGGCAAGCTGAGGAGTCTCTCAGGACGGTCATGTACTTGAGCTGTTG
GGGTCCTAATTGATGAAGACAGATGGATAGAGATTTTTATTAATGCTTTGCCATCGATTG
GATCCGACAGGTTGTAGCTGTGAAATCAAAATCCTAAATAGACGTTATGAGTGTTGGGGG
GTTTTTGATGAGTAGTTTCGGGATGCAATCAAATATTGGATTCGAATTGTATAAGTCATA
AATGATACTTGTACAGAATTCAGTGATGAATATAAAAG

QA 1 578 1 578
DS 



AS 2 4

CO CL2517Contig1 625 2 2 U
GGAAGTCATCATACTAACTATCACAGACACACACAAAAGGGACAAGTTCTCATCTAAGAT
TTGGAAAAACTGAGTTGTATGGCAACCAGATCAAAGAGCTTTCAATTGATCACCGGCTTT
AGGAAGCACCTCGTTGACGCCGTCGTCCCACGCGCCACCGCGTCTGCTCCCATCACTTCA
AGAAGTTACTCCTCGGGGTATGACAAGAACGTGGAGGACGAATTGCAGGCAAGTGCAGTT
CCTGATGATGTCATAAAGCCAGATTCTGATAAATATTGGTCTCCTCATCCTCAAACCGGA
GTCTTTGGCCCTTCCACGACTGAGCGCAGTCCAGCAGCTGAGGCTGCTTGCCAACAATCA
GCGGTGTTAGAGGAGACTGCTTGGTTTCGTCCCACAAGTCTCGAGGACTCGGACAAGACT
CGCCATGTTTAAGTCTATCTATCTTTTCTCCTTCCGTTTGTTGTACTTTCTGATGTGTAA
TGTTGTAATAAATCTCGAAGTAGACAAACTGTATGTCAAGTAACGTCCTGGAAAACTAAA
TTAAACCAGAACCAAATTGGATTTCATAGGTTCCAGTAACCATTCGTGAGCTGAAACTAA
CCGGTTTTGGGAAACTCCAACAAGT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DM50JQ C 1
AF RR2DM50TF U 1
BS 1 2 RR2DM50JQ
BS 3 625 RR2DM50TF

RD RR2DM50JQ 625 0 0
GGAAGTCATCATACTAACTATCACAGACACACACAAAAGGGACAAGTTCTCATCTAAGAT
TTGGAAAAACTGAGTTGTATGGCAACCAGATCAAAGAGCTTTCAATTGATCACCGGCTTT
AGGAAGCACCTCGTTGACGCCGTCGTCCCACGCGCCACCGCGTCTGCTCCCATCACTTCA
AGAAGTTACTCCTCGGGGTATGACAAGAACGTGGAGGACGAATTGCAGGCAAGTGCAGTT
CCTGATGATGTCATAAAGCCAGATTCTGATAAATATTGGTCTCCTCATCCTCAAACCGGA
GTCTTTGGCCCTTCCACGACTGAGCGCAGTCCAGCAGCTGAGGCTGCTTGCCAACAATCA
GCGGTGTTAGAGGAGACTGCTTGGTTTCGTCCCACAAGTCTCGAGGACTCGGACAAGACT
CGCCATGTTTAAGTCTATCTATCTTTTCTCCTTCCGTTTGTTGTACTTTCTGATGTGTAA
TGTTGTAATAAATCTCGAAGTAGACAAACTGTATGTCAAGTAACGTCCTGGAAAACTAAA
TTAAACCAGAACCAAATTGGATTTCATAGGTTCCAGTAACCATTCGTGAGCTGAAACTAA
CCGGTTTTGGGAAACTCCAACAAGT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2DM50TF 625 0 0
GG
AAGTCATCATACTAACTATCACAGACACACACAAAAGGGACAAGTTCTCATCTAAGATTT
GGAAAAACTGAGTTGTATGGCAACCAGATCAAAGAGCTTTCAATTGATCACCGGCTTTAG
GAAGCACCTCGTTGACGCCGTCGTCCCACGCGCCACCGCGTCTGCTCCCATCACTTCAAG
AAGTTACTCCTCGGGGTATGACAAGAACGTGGAGGACGAATTGCAGGCAAGTGCAGTTCC
TGATGATGTCATAAAGCCAGATTCTGATAAATATTGGTCTCCTCATCCTCAAACCGGAGT
CTTTGGCCCTTCCACGACTGAGCGCAGTCCAGCAGCTGAGGCTGCTTGCCAACAATCAGC
GGTGTTAGAGGAGACTGCTTGGTTTCGTCCCACAAGTCTCGAGGACTCGGACAAGACTCG
CCATGTTTAAGTCTATCTATCTTTTCTCCTTCCGTTTGTTGTACTTTCTGATGTGTAATG
TTGTAATAAATCTCGAAGTAGACAAACTGTATGTCAAGTAACGTCCTGGAAAACTAAATT
AAACCAGAACCAAATTGGATTTCATAGGTTCCAGTAACCATTCGTGAGCTGAAACTAACC
GGTTTTGGGAAACTCCAACAAGT

QA 3 625 3 625
DS 



CO CL2517Contig2 578 2 1 U
GGATACGTACAGGATAGAATAAACCGTGTTAAGTCATCATACTAACTATCACAGACACAC
ACAAAAGCGACAAGTTCTCATCTAAGATTTGAAAAAAACTGAGTTTTATGGCAACCAGAT
CAAGGAGCTTTCAATTGATCACCGGCTTAAGGAAGCACCTCGCTGAGGCCGTCGTCCCAC
GCGCCACCGCGTCTGCTCCCATCACTTCAAGAAGTTACTCCTCGGGGTATGACAAGAACG
TGGAGGACGAATTGCAGGCAATTGCAGTTCCTGATGATGTCATAAAGCCAGATTCTGATA
AATATTGGTCTCCTCATCCTCAAACCGGAGTCTTTGGCCCTTCCACGACTGAGCACAGTC
CAGCAGCTGAGGCTGCTTGCCAAGACTCAGCGTTGTTAGAGGAGACTGCTTGGTTTCGTC
CCACAAGTCTCGAGGACTCGGACAAGACTCACCATGTTTAAGTCTATCTATCTTTTCTCC
TTCCGTTTGTTGTACTTTCTGATGTGTAATGTTGTAATAAATCTCGAAGTAGACAAACTG
TATGTCAAGTAACGTCCTGGAAAACTAAATTAAACCAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H062JQ C 1
AF RR2H062TF U 1
BS 1 578 RR2H062TF

RD RR2H062JQ 578 0 0
GGATACGTACAGGATAGAATAAACCGTGTTAAGTCATCATACTAACTATCACAGACACAC
ACAAAAGCGACAAGTTCTCATCTAAGATTTGAAAAAAACTGAGTTTTATGGCAACCAGAT
CAAGGAGCTTTCAATTGATCACCGGCTTAAGGAAGCACCTCGCTGAGGCCGTCGTCCCAC
GCGCCACCGCGTCTGCTCCCATCACTTCAAGAAGTTACTCCTCGGGGTATGACAAGAACG
TGGAGGACGAATTGCAGGCAATTGCAGTTCCTGATGATGTCATAAAGCCAGATTCTGATA
AATATTGGTCTCCTCATCCTCAAACCGGAGTCTTTGGCCCTTCCACGACTGAGCACAGTC
CAGCAGCTGAGGCTGCTTGCCAAGACTCAGCGTTGTTAGAGGAGACTGCTTGGTTTCGTC
CCACAAGTCTCGAGGACTCGGACAAGACTCACCATGTTTAAGTCTATCTATCTTTTCTCC
TTCCGTTTGTTGTACTTTCTGATGTGTAATGTTGTAATAAATCTCGAAGTAGACAAACTG
TATGTCAAGTAACGTCCTGGAAAACTAAATTAAACCAG

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2H062TF 578 0 0
GGATACGTACAGGATAGAATAAACCGTGTTAAGTCATCATACTAACTATCACAGACACAC
ACAAAAGCGACAAGTTCTCATCTAAGATTTGAAAAAAACTGAGTTTTATGGCAACCAGAT
CAAGGAGCTTTCAATTGATCACCGGCTTAAGGAAGCACCTCGCTGAGGCCGTCGTCCCAC
GCGCCACCGCGTCTGCTCCCATCACTTCAAGAAGTTACTCCTCGGGGTATGACAAGAACG
TGGAGGACGAATTGCAGGCAATTGCAGTTCCTGATGATGTCATAAAGCCAGATTCTGATA
AATATTGGTCTCCTCATCCTCAAACCGGAGTCTTTGGCCCTTCCACGACTGAGCACAGTC
CAGCAGCTGAGGCTGCTTGCCAAGACTCAGCGTTGTTAGAGGAGACTGCTTGGTTTCGTC
CCACAAGTCTCGAGGACTCGGACAAGACTCACCATGTTTAAGTCTATCTATCTTTTCTCC
TTCCGTTTGTTGTACTTTCTGATGTGTAATGTTGTAATAAATCTCGAAGTAGACAAACTG
TATGTCAAGTAACGTCCTGGAAAACTAAATTAAACCAG

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 3

CO CL2518Contig1 915 3 25 U
GGGAAGAAAGAAGGCAACTCGCCGCTGTATTCGAGACGGAGAAGCAAAAAATGTTGAGAA
GAGTGATCGGTAACGTCGCAGTCCGGCGTCAATTTCAACGAGCCTTATCCAGCAAATCCG
GTGGAAGCGGAAAGCCAAGCGACGTTTCAGCCGCCGTCGATTCGATGCTACTCCGTTCCC
TAAAGGAACATTACCTAGAAGTCTCCAAGATGACTCCTCCTCCCAAAGTGACACCTCCTT
CACCGTTCGAGATTGTGAAAGGATCGCTCGAGGGAACCGGCGCTGTTCTGAAGAAATCTG
TCGGAAACGAAGAGATCAGCCTCTTCGTGATGAGGCTTGCTCACGGAGGTGGTGATGATG
AAGACGAGGATGGGATTAACCAGCTGTTCCTCCACGTGGCTGTGTCGAAGCCGAACCAGG
CTGAGTCTCTTCATTTCCTTTGCGGGCTTTACCCGGATGCGTTGGGTATTCACTCTGTTT
CCATGAGGCCGAAGCTCGAGGATTTGGAGTTGTCTGATGATCCTGCTCGTTACACTGGCC
CTTCTTTTGAAGAGCTGGATGAGAAGATGAGAGACGTATTCCATAGCTTCCTGGAGGAGC
GAGGTGTGAACGAGAGTCTCTTCCCGTTTCTTCAGGCATGGCTCTATGTAAAGGATCATC
GTAACTCGCTGCGGTGGTTCAAATCAGTTGGCACTTATGTGCATGAAAACCCATCTGCGG
AAAACGCCTAGGGGATGATCTCAATCAGAAAGACACATCTTTCTTTCAGTCTTTTGGTAG
AGGTTTATGCGGTTAATTGTTTTGACAAGGCACTTTACCGCTCTTATATGATGCAGTTCC
AGGGACCGAGTGACTTTTGTTTCTTTCAGAGCGTTCTTTCAAGAAACATATACATCAGTT
ATGTTCTTTAAGAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ94TF U 1
AF RR2EE54TF U 1
AF RR2EE54JQ C 250
BS 1 9 RR2BQ94TF
BS 10 10 RR2EE54TF
BS 11 61 RR2BQ94TF
BS 62 62 RR2EE54TF
BS 63 351 RR2BQ94TF
BS 352 354 RR2EE54TF
BS 355 406 RR2BQ94TF
BS 407 407 RR2EE54TF
BS 408 469 RR2BQ94TF
BS 470 470 RR2EE54TF
BS 471 509 RR2BQ94TF
BS 510 510 RR2EE54TF
BS 511 523 RR2BQ94TF
BS 524 524 RR2EE54TF
BS 525 588 RR2BQ94TF
BS 589 589 RR2EE54TF
BS 590 632 RR2BQ94TF
BS 633 635 RR2EE54TF
BS 636 636 RR2EE54JQ
BS 637 682 RR2EE54TF
BS 683 683 RR2EE54JQ
BS 684 708 RR2EE54TF
BS 709 709 RR2EE54JQ
BS 710 723 RR2EE54TF
BS 724 915 RR2EE54JQ

RD RR2BQ94TF 632 0 0
GGGAAGAAATAAGGCAACTCGCCGCTGTATTCGAGACGGAGAAGCAAAAAATGTTGAGAA
GGGTGATCGGTAACGTCGCAGTCCGGCGTCAATTTCAACGAGCCTTATCCAGCAAATCCG
GTGGAAGCGGAAAGCCAAGCGACGTTTCAGCCGCCGTCGATTCGATGCTACTCCGTTCCC
TAAAGGAACATTACCTAGAAGTCTCCAAGATGACTCCTCCTCCCAAAGTGACACCTCCTT
CACCGTTCGAGATTGTGAAAGGATCGCTCGAGGGAACCGGCGCTGTTCTGAAGAAATCTG
TCGGAAACGAAGAGATCAGCCTCTTCGTGATGAGGCTTGCTCACGGAGGTG***ATGATG
AAGACGAGGATGGGATTAACCAGCTGTTCCTCCACGTGGCTGTGTCAAAGCCGAACCAGG
CTGAGTCTCTTCATTTCCTTTGCGGGCTTTACCCGGATGCGTTGGGTATCCACTCTGTTT
CCATGAGGCCGAAGCTCGAGGATTTGGAGCTGTCTGATGATCCGGCTCGTTACACTGGCC
CTTCTTTTGAAGAGCTGGATGAGAAGATGAGAGACGTATTCCATAGCTCCCTGGAGGAGC
GAGGTGTGAACGAGAGTCTCTTCCCGTTTCTT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2EE54TF 730 0 0
GGGAAGAAAGAAGGCAACTCGCCGCTGTATTCGAGACGGAGAAGTAAAAA*TGTTGAGAA
GAGTGATCGGTAACGTCGCAGTCCGGCGTCAATTTCAACGAGCCTTATCCAGCAAATCCG
GTGGAAGCGGAAAGCCAAGCGACGTTTCAGCTGCCGTCGATTCGATGCTACTCCGTTCCC
TAAAGGAACATTACCTAGAAGTCTCCAAGATGACTCCTCCTCCCAAAGTGACACCTCCTT
CACCGTTCGAGATTGTGAAAGGATCGCTCGAGGGAACCGGCGCTGTTCTGAAGAAATCTG
TCGGAAACGAAGAGATCAGCCTCTTCGTGATGAGGCTTGCTCACGGAGGTGGTGATGATG
AAGACGAGGATGGGATTAACCAGCTGTTCCTCCACGTGGCTGTGTCGAAGCCGAACCAGG
CTGAGTCTCTTCATTTCCTTTGCGGGCTTTACCCGGATGCGTTGGGTATTCACTCTGTTT
CCATGAGGCCGAAGCTCGAGGATTTGGAGTTGTCTGATGATCCTGCTCGTTACACTGGCC
CTTCTTTTGAAGAGCTGGATGAGAAGATGAGAGACGTATTCCATAGCTTCCTGGAGGAGC
GAGGTGTGAACGAGAGTCTCTTCCCGTTTCTTCAG*CATGGCTCTATGTAAAGGATCATC
GTAACTCGCTGCGGTGGTTCAA*TCAGTTGGCACTTATGTGCATGAAA*CCCATCTGCGG
AAA
CGCCTAG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2EE54JQ 666 0 0
AGATTGTGAAAGGATCGCTCGAGGGAACCGGCGCTGTTCTGAAGAAATCTGTCGGAAACG
AAGAGATCAGCCTCTTCGTGATGAGGCTTGCTCACGGAGGTGGTGATGATGAAGACGAGG
ATGGGATTAACCAGCTGTTCCTCCACGTGGCTGTGTCGAAGCCGAACCAGGCTGAGTCTC
TTCATTTCCTTTGCGGGCTTTACCCGGATGCGTTGGGTATTCACTCTGTTTCCATGAGGC
CGAAGCTCGAGGATTTGGAGTTGTCTGATGATCCTGCTCGTTACACTGGCCCTTCTTTTG
AAGAGCTGGATGAGAAGATGAGAGACGTATTCCATAGCTTCCTGGAGGAGCGAGGTGTGA
ACGAGAGTCTCTTCCCGTTTCTTCAGGCATGGCTCTATGTAAAGGATCATCGTAACTCGC
TGCGGTGGTTCAAATCAGTTGGCACTTATGTGCATGAAAACCCATCTGCGGAAAACGCCT
AGGGGATGATCTCAATCAGAAAGACACATCTTTCTTTCAGTCTTTTGGTAGAGGTTTATG
CGGTTAATTGTTTTGACAAGGCACTTTACCGCTCTTATATGATGCAGTTCCAGGGACCGA
GTGACTTTTGTTTCTTTCAGAGCGTTCTTTCAAGAAACATATACATCAGTTATGTTCTTT
AAGAAA

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 4

CO CL2519Contig1 581 4 4 U
GGAAAGAAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAGAGAAGAAAAGCAATGGGGAGAAAGAAGGGAT
TGCCGGAGTTCGAAGAGACGGCGCCGGATGGGTTCGACCCGGCGAATCCATACAAGGATC
CGGTGGCGATGGTGGAAATGAGAGAGCACATCGTGAGGGAGAAGTGGATCCAAATCGAGA
AGGCGAAGATCTTGAGGGAGAAGGTGAAATGGTGTTACCGCGTGGAAGGCGTAAACCACT
ACCAGAAATGCCGTCTTCTCGTCCAGCAGTATCTCGACTCCACTCGCGGCGTCGGCTGGG
GAAAAGACCACCGTCCCATCTCCCTCCACGGTCCCAAGCCTGAGGCTGTTGAAGCTGAAT
AATAATGCTTTGCGTCTGATCAACCTGAGAGGTGACAGATCTTTTAGCACAAGACATGAA
AGACTCTTTAGACTGTGCAGAGCTGCTCTTGTCTTCCTTTTTTTTTTGTCTTTTGCAAAC
ATGGCAGTCTTTTGGGACTGAAGATTCATGTAACGTGTGTACGAGCTTGAGTAATGTATT
GCTTACACTCAACAGTCAACAATAGTCTCTCGTTATCAAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR2GH48JQB C 1
AF RR2GH48TF U 1
AF RR2F006JQ C 24
AF RR2F006TF U 100
BS 1 442 RR2GH48TF
BS 443 443 RR2F006TF
BS 444 577 RR2GH48TF
BS 578 581 RR2F006JQ

RD RR2GH48JQB 577 0 0
GGAAAGAAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAGAGAAGAAAAGCAATGGGGAGAAAGAAGGGAT
TGCCGGAGTTCGAAGAGACGGCGCCGGATGGGTTCGACCCGGCGAATCCATACAAGGATC
CGGTGGCGATGGTGGAAATGAGAGAGCACATCGTGAGGGAGAAGTGGATCCAAATCGAGA
AGGCGAAGATCTTGAGGGAGAAGGTGAAATGGTGTTACCGCGTGGAAGGCGTAAACCACT
ACCAGAAATGCCGTCTTCTCGTCCAGCAGTATCTCGACTCCACTCGCGGCGTCGGCTGGG
GAAAAGACCACCGTCCCATCTCCCTCCACGGTCCCAAGCCTGAGGCTGTTGAAGCTGAAT
AATAATGCTTTGCGTCTGATCAACCTGAGAGGTGACAGATCTTTTAGCACAAGACATGAA
AGACTCTTTAGACTGTGCAGAGTTGCTCTTGTCTTCCTTTTTTTTTTGTCTTTTGCAAAC
ATGGCAGTCTTTTGGGACTGAAGATTCATGTAACGTGTGTACGAGCTTGAGTAATGTATT
GCTTACACTCAACAGTCAACAATAGTCTCTCGTTATC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2GH48TF 577 0 0
GGAAAGAAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAGAGAAGAAAAGCAATGGGGAGAAAGAAGGGAT
TGCCGGAGTTCGAAGAGACGGCGCCGGATGGGTTCGACCCGGCGAATCCATACAAGGATC
CGGTGGCGATGGTGGAAATGAGAGAGCACATCGTGAGGGAGAAGTGGATCCAAATCGAGA
AGGCGAAGATCTTGAGGGAGAAGGTGAAATGGTGTTACCGCGTGGAAGGCGTAAACCACT
ACCAGAAATGCCGTCTTCTCGTCCAGCAGTATCTCGACTCCACTCGCGGCGTCGGCTGGG
GAAAAGACCACCGTCCCATCTCCCTCCACGGTCCCAAGCCTGAGGCTGTTGAAGCTGAAT
AATAATGCTTTGCGTCTGATCAACCTGAGAGGTGACAGATCTTTTAGCACAAGACATGAA
AGACTCTTTAGACTGTGCAGAGTTGCTCTTGTCTTCCTTTTTTTTTTGTCTTTTGCAAAC
ATGGCAGTCTTTTGGGACTGAAGATTCATGTAACGTGTGTACGAGCTTGAGTAATGTATT
GCTTACACTCAACAGTCAACAATAGTCTCTCGTTATC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2F006JQ 558 0 0
AGAGAGAGAAGAAAGGCAATGGGGAGAAAGAAGGGATTGCCGGAGTTAGAAGAGACGGCG
CCGGATGGGTTCGACCCGGCGAATCCATACAAGGATCCGGTGGCGATGGTGGAAATGAGA
GAGCACATCGTGAGGGAGAAGTGGATCCAAATCGAGAAGGCGAAGATCTTGAGGGAGAAG
GTGAAATGGTGTTACCGCGTGGAAGGCGTAAACCACTACCAGAAATGCCGTCTTCTCGTC
CAGCAGTATCTCGACTCCACTCGCGGCGTCGGCTGGGGAAAAGACCACCGTCCCATCTCC
CTCCACGGTCCCAAGCCTGAGGCTGTTGAAGCTGAATAATAATGCTTTGCGTCTGATCAA
CCTGAGAGGTGACAGATCTTTTAGCACAAGACATGAAAGACTCTTTAGACTGTGCAGAGC
TGCTCTTGTCTTCCTTTTTTTTTTGTCTTTTGCAAACATGGCAGTCTTTTGGGACTGAAG
ATTCATGTAACGTGTGTACGAGCTTGAGTAATGTATTGCTTACACTCAACAGTCAACAAT
AGTCTCTCGTTATCAAGT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2F006TF 482 0 0
CGGCGAATCCATACAAGGATCCGGTGGCGATGGTGGAAATGAGAGAGCACATCGTGAGGG
AGAAGTGGATCCAAATCGAGAAGGCGAAGATCTTGAGGGAGAAGGTGAAATGGTGTTACC
GCGTGGAAGGCGTAAACCACTACCAGAAATGCCGTCTTCTCGTCCAGCAGTATCTCGACT
CCACTCGCGGCGTCGGCTGGGGAAAAGACCACCGTCCCATCTCCCTCCACGGTCCCAAGC
CTGAGGCTGTTGAAGCTGAATAATAATGCTTTGCGTCTGATCAACCTGAGAGGTGACAGA
TCTTTTAGCACAAGACATGAAAGACTCTTTAGACTGTGCAGAGCTGCTCTTGTCTTCCTT
TTTTTTTTGTCTTTTGCAAACATGGCAGTCTTTTGGGACTGAAGATTCATGTAACGTGTG
TACGAGCTTGAGTAATGTATTGCTTACACTCAACAGTCAACAATAGTCTCTCGTTATC
AAGT

QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 3

CO CL2520Contig1 1523 3 4 U
GTAAAATTTTCAAAATATTGGTCACATACATGATTCTAGCCCTCACTTTGACACCCACTT
ACACGTGCAGTTTTTTGATTGAGGTCAAAAGTGAGTAAACTAGAGATGCAAAGGGATGGA
GACCGAGTAGACTAGAGATGCAAACGGCGAGTGTTGGAAGCAGGGAAGATGAGGTGTGAC
CAGACTTAAACCAAATAAGATATGCTAAAACATACATTTTCGCTGAAAATCAAATGAATT
TCGAAAGGCAATCCACAAGACTGAGAAGAAAACCATCCGAGCCATGCTTAGCCACCAATG
ATACGGATATGGGAAGATTTTCGTGCAGCCCCAATGGTATGCTAACCTGACACAATCCAG
AGACGCCAGCGATGGACAACAAGCTGAAGGCTCTGCTCCGGAAAGACTCTAGTGCAACTA
CATCAGCTTGGAGATGTGGTGGAGGACCTGGTACCGTGGGAATCATCAATACACCGTTAT
CCCCAAGCAAAGTTGAAAGAGCCGTTAGGAGTTCTGTTTTTAACAGACCGGCAAAGGTCA
ATCTTCTCGTCAGACACCCTGATAGCTTCCTCAATCCGTTCTGATATTCCAGGACCAAAC
TCTGGTTTCACCGACGAGACCCATTCACCGTGGTTCATCTTGAACTCGTACCTCTGTAAC
ATTCTCATTGAACTCGACAGAGCCATGAGAGACGGAACGCAGAACTCTTGTTGTGTCTCA
CTTGTCATGAAATGCTTAAGGCTCGGAACATTCTCTTGGGATGTATTCTCCAAGATCCAT
CTTGTTTATTAAAGTGTTGCCTCCCAATGATTTGTCCACTGATTTAACTAGAGGCTGCAC
CAACAGATCACGTGGTACACTACACAGCTTGAAGCAGTCATCAGCAATAATCAGTTGACT
TGGTTCCGTAGCGTTCAAGTCAGGCTGCTGCAGGAGAACGCTGCCTACCTGTTTCAAAGT
ACCTGTGTCCCGAGAAAACCAGCCGACTGTGTCGAAGCTCTGAGCCATTGGAGTAACTCC
GACAGTGGAAACAACTCCATGTGATGGTCTAAAACCGAAAATACCACAGTAAGACGCCGG
AACTCGTACACTCCCTCCAGTATCAGTTCCGATTGAAAAGTCAACAAGACCGGCAGCTAC
AGCTACAGCCGAGCCACTTGAAGATCCTCCAGGGACTCTATCTGAAGCAATTGGGTTTAC
CGGAGTCCCATAGTGCGCATTTTCTCCGTTTATACTGTATGCCATTTCATCCATAATGGT
AATACCCAAAGAGGTGGCACCAGCTTCCAAGAGAGATGAAACTACAGGAGCTGTGGAAGT
AGCTGCTGAATGTGTTCTTAACCAATCCGGGTTACCAAAACCGGTTACACGTCCTTCCAC
ATCAAAGATGTCTTTGATGGCGAAGGTAAGACCCTTTAGAGAAGGAAACGAGGAAGAGGC
CGTTGGAGAGATTGTAGATTTCTCAATGAAAGCTCCATAATCATTACTCATCGCCATCAC
TGTAGTAGCTTCAGTGTTCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN67JQ U 321
AF RR2AG28JQ U 1
AF RR2AN67TF C 674
BS 1 520 RR2AG28JQ
BS 521 521 RR2AN67JQ
BS 522 826 RR2AG28JQ
BS 827 1523 RR2AN67TF

RD RR2AN67JQ 232 0 0
TCGTGCAGCCCCAATGGTATGCTAACCTGACACAATCCAGAGACGCCAGCGATGGACAAC
AAGCTGAAGGCTCTGCTCCGGAAAGACTCTAGTGCAACTACATCAGCTTGGAGATGTGGT
GGAGGACCTGGTACCGTGGGAATCATCAATACACCGTTATCCCCAAGCAAAGTTGAAAGA
GCCGTTAGGAGTTCTGTTTTTAACAGACCGGCAAAGGTCAATCTTCTCGTCA

QA 1 232 1 232
DS 

RD RR2AG28JQ 826 0 0
GTAAAATTTTCAAAATATTGGTCACATACATGATTCTAGCCCTCACTTTGACACCCACTT
ACACGTGCAGTTTTTTGATTGAGGTCAAAAGTGAGTAAACTAGAGATGCAAAGGGATGGA
GACCGAGTAGACTAGAGATGCAAACGGCGAGTGTTGGAAGCAGGGAAGATGAGGTGTGAC
CAGACTTAAACCAAATAAGATATGCTAAAACATACATTTTCGCTGAAAATCAAATGAATT
TCGAAAGGCAATCCACAAGACTGAGAAGAAAACCATCCGAGCCATGCTTAGCCACCAATG
ATACGGATATGGGAAGATTTTCGTGCAGCCCCAATGGTATGCTAACCTGACACAATCCAG
AGACGCCAGCGATGGACAACAAGCTGAAGGCTCTGCTCCGGAAAGACTCTAGTGCAACTA
CATCAGCTTGGAGATGTGGTGGAGGACCTGGTACCGTGGGAATCATCAATACACCGTTAT
CCCCAAGCAAAGTTGAAAGAGCCGTTAGGAGTTCTGTTTT*AACAGACCGGCAAAGGTCA
ATCTTCTCGTCAGACACCCTGATAGCTTCCTCAATCCGTTCTGATATTCCAGGACCAAAC
TCTGGTTTCACCGACGAGACCCATTCACCGTGGTTCATCTTGAACTCGTACCTCTGTAAC
ATTCTCATTGAACTCGACAGAGCCATGAGAGACGGAACGCAGAACTCTTGTTGTGTCTCA
CTTGTCATGAAATGCTTAAGGCTCGGAACATTCTCTTGGGATGTATTCTCCAAGATCCAT
CTTGTTTATTAAAGTGTTGCCTCCCAATGATTTGTCCACTGATTTA

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2AN67TF 850 0 0
TCGACAGAGCCATGAGAGACGGAACGCAGAACTCT*GTTGTGTCTCACTTGTCATGAAAT
GTTTAAGGCTCGGAACATTCTCTTGGGATGTATTCTCCAAGATCCATCTTGTTTATTAAA
GTGTTGCCTCCCAATGATTTGTCCACTGATTTAACTAGAGGCTGCACCAACAGATCACGT
GGTACACTACACAGCTTGAAGCAGTCATCAGCAATAATCAGTTGACTTGGTTCCGTAGCG
TTCAAGTCAGGCTGCTGCAGGAGAACGCTGCCTACCTGTTTCAAAGTACCTGTGTCCCGA
GAAAACCAGCCGACTGTGTCGAAGCTCTGAGCCATTGGAGTAACTCCGACAGTGGAAACA
ACTCCATGTGATGGTCTAAAACCGAAAATACCACAGTAAGACGCCGGAACTCGTACACTC
CCTCCAGTATCAGTTCCGATTGAAAAGTCAACAAGACCGGCAGCTACAGCTACAGCCGAG
CCACTTGAAGATCCTCCAGGGACTCTATCTGAAGCAATTGGGTTTACCGGAGTCCCATAG
TGCGCATTTTCTCCGTTTATACTGTATGCCATTTCATCCATAATGGTAATACCCAAAGAG
GTGGCACCAGCTTCCAAGAGAGATGAAACTACAGGAGCTGTGGAAGTAGCTGCTGAATGT
GTTCTTAACCAATCCGGGTTACCAAAACCGGTTACACGTCCTTCCACATCAAAGATGTCT
TTGATGGCGAAGGTAAGACCCTTTAGAGAAGGAAACGAGGAAGAGGCCGTTGGAGAGATT
GTAGATTTCTCAATGAAAGCTCCATAATCATTACTCATCGCCATCACTGTAGTAGCTTCA
GTGTTCATCC

QA 1 850 1 850
DS 



AS 1 3

CO CL2521Contig1 945 3 14 U
GGAGGTTGGCTCGGGAAGAATGGGGAGTTGCGGCCGGAGCAGTCTGAACTTCATAATAGC
TTCAAGGCCATTTCATCTCCAGCACCGGTCAAGTGACCGTCTCTTGCCTTCTCTTGGCTT
AACTCATCTCAACCTCAAGCGCAGGCTCTCTCTATCCATCACCTCATTTACCACCAAGAT
TCTGTCTCCTCCTCCTCTCTCGGGCAAGGAAAAGAGAAGTAATGCCCTGCCGCGTGGGGC
AGGAGAAGGAGTTAAAGAAGATGCGAGGAGTAAGCTGCTTCAAGTAGTCTTGGTCTCTCC
CCAGATTCCTGGAAACACAGGTTGCATTGCAAGAACATGTGCAGCTTCAGCTGTTGGTCT
GCATTTAGTCGGGCCATTAGGTTTTCAAGTGGATGACGCCAAAGTAAAGCGAGCTGGTTT
GGATTATTGGCCCTATGTGGTTGTCAAAGCACACAGCTCATGGGCTGAGTTTCAAGAATA
TTTCAGTCAACAGGAGGGAGAGAAACGGATGATAGCTTTCACAAAAAGAGGAACAAAAAC
ACATTCAGACTTCTCTTACAGAAGAGGCGATTACCTCTTGTTCGGGTCAGAGACAAGTGG
TCTACCTCCTGAAGCACTGTCAGACTGCAAAGACGAGAAATACGGAGGGGGGACCATACG
TATACCGATGGTGGAAACGTATGTGAGATGTTTGAATCTGTCGGTAAGTGTAGGGGTTGC
TGTGTATGAAGCGTCCAGACAACTTAACTATGAGCAAATAGAGTGTGCACCTGAAAGGAG
ATTCTGTGAACGGTGAAGAACCATTGTTTGCAGATGATATTTTTGCTTGATACATTGAAA
CAAAAATAAAAGAGGGACAACACAGAGGCATGATAGTCATAGCCATAGGTGGATGGAAAC
TTCAATTTTTGGGCCAATTTTTTAAAGCTGATTATCCTTTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE79TF U 12
AF RR2B428TF U 1
AF RR2GG12JQB C 240
BS 1 173 RR2B428TF
BS 174 174 RR2GE79TF
BS 175 302 RR2B428TF
BS 303 308 RR2GE79TF
BS 309 411 RR2B428TF
BS 412 412 RR2GE79TF
BS 413 642 RR2B428TF
BS 643 643 RR2GG12JQB
BS 644 705 RR2B428TF
BS 706 706 RR2GG12JQB
BS 707 741 RR2B428TF
BS 742 742 RR2GG12JQB
BS 743 820 RR2B428TF
BS 821 945 RR2GG12JQB

RD RR2GE79TF 623 0 0
G
GGGAAGAATGGGGAGTTGCGGCCGGAGCAGTCTGAACTTCATAATAGCTTCAAGGCCATT
TCATCTCCAGCACCGGTCAAGTGACCGTCTCTTGCCTTCTCTTGGCTTAACTCATCTCAA
CCTCAAGCGCAGGCTCTCTCTATCCATCACCTCATTTACCACCAAGATTCTGTCTCCTCC
TCCTCTCTCGGGCAAGGAAAAGAGAAGTAATGCCCTGCCGCGTGGGGCAGGAGAAGGAGT
TAAAGAAGATGCGAGGAGTAAGCTGCTTCAAGTAGTCTTGGTCTCTCCCCAGATTCCTGG
AAACACAGGTTGCATTGCAAGAACATGTGCAGCTTCAGCTGTTGGTCTGCATTTAGTCGG
GCCATTAGGTTTTCAAGTG**TGACGCCAAAGTAAAGCGAGCTGTTTTGGATTATTGGCC
CTATGTGGTTGTCAAAGCACACAGCTCATGGGCTGAGTTTCAAGAATATTTCAGTCAACA
GGAGGGAGAGAAACGGATGATAGCTTTCACAAAAAGAGGAACAAAAACACATTCAGACTT
CTCTTACAGAAGAGGCGATTACCTCTTGTTCGGGTCAGAGACAAGTGGTCTACCTCCTGA
AGCACTGTCAGACTGCAAAGAC

QA 2 623 2 623
DS 

RD RR2B428TF 820 0 0
GGAGGTTGGCTCGGGAAGAATGGGGAGTTGCGGCCGGAGCAGTCTGAACTTCATAATAGC
TTCAAGGCCATTTCATCTCCAGCACCGGTCAAGTGACCGTCTCTTGCCTTCTCTTGGCTT
AACTCATCTCAACCTCAAGCGCAGGCTCTCTCTATCCATCACCTCATTTACCATCAAGAT
TCTGTCTCCTCCTCCTCTCTCGGGCAAGGAAAAGAGAAGTAATGCCCTGCCGCGTGGGGC
AGGAGAAGGAGTTAAAGAAGATGCGAGGAGTAAGCTGCTTCAAGTAGTCTTGGTCTCTCC
CC******CTGGAAACACAGGTTGCATTGCAAGAACATGTGCAGCTTCAGCTGTTGGTCT
GCATTTAGTCGGGCCATTAGGTTTTCAAGTGGATGACGCCAAAGTAAAGCGGGCTGGTTT
GGATTATTGGCCCTATGTGGTTGTCAAAGCACACAGCTCATGGGCTGAGTTTCAAGAATA
TTTCAGTCAACAGGAGGGAGAGAAACGGATGATAGCTTTCACAAAAAGAGGAACAAAAAC
ACATTCAGACTTCTCTTACAGAAGAGGCGATTACCTCTTGTTCGGGTCAGAGACAAGTGG
TCTACCTCCTGAAGCACTGTCAGACTGCAAAGACGAGAAATATGGAGGGGGGACCATACG
TATACCGATGGTGGAAACGTATGTGAGATGTTTGAATCTGTCGGTGAGTGTAGGGGTTGC
TGTGTATGAAGCGTCCAGACAGCTTAACTATGAGCAAATAGAGTGTGCACCTGAAAGGAG
ATTCTGTGAACGGTGAAGAACCATTGTTTGCAGATGATAT

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR2GG12JQB 706 0 0
CAGGAGAAGGAGTTAAAGAAGATGCGAGGAGTAAGCTGCTTCAAGTAGTCTTGGTCTCTC
CCCAGATTCCTGGAAACACAGGTTGCATTGCAAGAACATGTGCAGCTTCAGCCGTTGGTC
TGCATTTAGTCGGACCATTAGGTTTTCAAGTGGATGACGCCAAAGTAAAGCGAGCTGGTT
TGGATTATTGGCCCTATGTGGTTGTCAAAGCACACAGCTCATGGGCTGAGTTTCAAGAAT
ATCTCAGGCAACAGGAGGGAGAGAAACGGACGATAGCTTTCACAAAAAGAGGAACAAAAG
CACATTCAGACTTTTCTTACAGAAGAAGCGATTACCTCTTGTTCGGGTCAGAGACAAGTG
GTCTACCTCTTGAAGCGCTGTCAGACTGCAAAGACGAGAAATACGGAGGGGGGGCCATAC
GTATACCGATGGTGGAAACGTATGTGAGATGTTTGAATCTGTCGGTAAGTGTAGGGGTTG
CTGTGTATGAAGCGTCTAGACAACTTAACTATGAGCAAATAGAGTGTGCACCTGAA*GGA
GATTCTGTGAACGGTGAAGAACCATTGTTTGCAGATGATATTTTTGCTTGATACATTGAA
ACAAAAATAAAAGAGGGACAACACAGAGGCATGATAGTCATAGCCATAGGTGGATGGAAA
CTTCAATTTTTGGGCCAATTTTTTAAAGCTGATTATCCTTTTTATC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 4

CO CL2522Contig1 1023 4 7 U
GGTGTGTCACAATTTCTTATAAATAAATTTCTTGAAGAGGGTATCATCTGATCTGATGTA
ACAAAAATTATTAAATCAAAAGAGTAAAAAAGCTAGTTAAACCAAATGAAAAAAAAGGTA
TTGGCTACATAAGCAGCTTTTAAGCACATGAGATCGAAACACTGCTTGTGGAAAGGTTTA
CACATTCTCCTATATATACCTTTCATACCGACATATATCTTTCTGCTTATGATACTCTGC
TTCAGTAGCTACCTGCTGCTGCGACGAAGCTAGGTCCTTGTCAACTTCTTACTGATGAGA
TCTCTCAGCTCGATCTCTCCCGGGAATCTACCTTCTTTCAATTTAGAAAACACCAGTTCC
CCGTTGCAGAAAACTTCAAAGGCGCCTGAGCTCTGAAGGTAAGACTGGGGAAAGTTTCCG
AGAAGCCAAGTAGAAGCCATGGATCCAAACCTATTGGACCTCAAGGAGTTGAACCACGCA
GGTGGCTGCGTGATTCCAATCATGGGGAAGACGCGGTCACCTGCAACAATCATACCGATA
ACTCCCATCTGAGCAACCGGTACAACCTTAGCTAGAAGACGCTTTGGTGCTGGTGCTGGG
TAGTTCGCGAGAATCACATCCAAACCTGGAAACTCCGTCTCTAACATCTTCTTCATGGTC
ACTGCTGTTCCCTTGAAAGAACAGGAGACGCAGAAGTTGACCTCAACGGTGTTTCCATAT
CCAACAGCTCCTCCTATTCCACTTTGTTTCTTCTGAAAAGGGAAATCTAGGGTTTCGGGT
GTGAACCCAGCCGGACGCTGCTGGTGGTGAGGGACATGCGGTGGTGGTGACTGATGAGTA
GGAGGTTTAGGAGGCGGAGGAGTGAATAGGTTGAAGAGATCCGAACAAAATAAGAATATC
GGTAAACCCAACAGTATCAATTGGGCTCTGTCCATTGCCATTTTTTCCAATCTCCGATGC
TCTCAACAGAGTCGAGAGGATGTAACAAAACCCGATCCAAGTTAGACTTGTTCCGATGCT
GCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 

AF RR2G691JQ U 1
AF RR2EZ42JQ U 50
AF RR2G691TF C 455
AF RR2EZ42TF C 374
BS 1 370 RR2G691JQ
BS 371 371 RR2EZ42JQ
BS 372 408 RR2G691JQ
BS 409 409 RR2EZ42JQ
BS 410 508 RR2G691JQ
BS 509 577 RR2EZ42JQ
BS 578 1023 RR2EZ42TF

RD RR2G691JQ 508 0 0
GGTGTGTCACAATTTCTTATAAATAAATTTCTTGAAGAGGGTATCATCTGATCTGATGTA
ACAAAAATTATTAAATCAAAAGAGTAAAAAAGCTAGTTAAACCAAATGAAAAAAAAGGTA
TTGGCTACATAAGCAGCTTTTAAGCACATGAGATCGAAACACTGCTTGTGGAAAGGTTTA
CACATTCTCCTATATATACCTTTCATACCGACATATATCTTTCTGCTTATGATACTCTGC
TTCAGTAGCTACCTGCTGCTGCGACGAAGCTAGGTCCTTGTCAACTTCTTACTGATGAGA
TCTCTCAGCTCGATCTCTCCCGGGAATCTACCTTCTTTCAATTTAGAAAACACCAGTTCC
CCGTTGCAGAGAACTTCAAAGGCGCCTGAGCTCTGAAGGTAAGACTGGAGAAAGTTTCCG
AGAAGCCAAGTAGAAGCCATGGATCCAAACCTATTGGACCTCAAGGAGTTGAACCACGCA
GGTGGCTGCGTGATTCCAATCATGGGGA

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2EZ42JQ 528 0 0
GATCTGATGTAACAAAAATTATTAAATCAAAAGAGTAAAAAAGCTAGTTAAACCAAATGA
AAAAAAAGGTATTGGCTACATAAGCAGCTTTTAAGCACATGAGATCGAAACACTGCTTGT
GGAAAGGTTTACACATTCTCCTATATATACCTTTCATACCGACATATATCTTTCTGCTTG
TGATACTCTGCTTCAGTAGCTACCTGCTGCTGCGACGAAGCTAGGTCCTTGTCAACTTCT
TACTGATGAGATCTCTCAGCTCGATCTCTCCCGGGAATCTACCTTCTTTCAATTTAGAAA
ACGCCAGTTCCCCGTTGCAGAAAACTTCAAAGGCGCCTGAGCTCTGAAGGTAAGACTGGG
GAAAGTTTCCGAGAAGCCAAGTAGAAGCCATGGATCCAAACCTATTGGACCTCAAGGAGT
TGAACCACGCAGGTGGCTGCGTGATTCCAATCATGGGGAAGACGCGGTCACCTGCAACAA
TCATACCGATAACTCCCATCTGAGCAACCGGTACAACCTTAGCTAGAA

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2G691TF 568 0 0
TGGACCTCAAGGAGTTGAACCACGCAGGTGGCTGCGTGATTCCAATCATGGGGAAGACGC
GGTCACCTGCAACAATCATACCGATAACTCCCATCTGAGCAACCGGTACAACCTTAGCTA
GAAGACGCTTTGGTGCTGGTGCTGGGTAGTTCGCGAGAATCACATCCAAACCTGGAAACT
CCGTCTCTAACATCTTCTTCATGGTCACTGCTGTTCCCTTGAAAGAACAGGAGACGCAGA
AGTTGATCTCAACGGTGTTTCCATATCCAACAGCTCCTCCTATTCCGCTTTGTTTCTTCT
GAAAAGGGAAATCTAGGGTTTCGGGTGTGAACCCAGCCGGACGCTGCTGGTGGTGAGGGA
CATGCGGTGGTGGTGGCTGATGAGTAGGAGGTTTAGGAGGCGGAGGAGTGAATAGGTTGA
AGAGATCCGAACAAGATAAGAATATCGGTAAACCCAACAGTATCAATTGGGCTCTGTCCA
TTGCCATTTTTTCCAATCTCCGATGCTCTCAACAGAGTCGAGAGGATGTAACAAAACCCG
ATCCAAGTTAGACTTGTTCCGATGCT
CC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2EZ42TF 650 0 0
GACTC
AAGGCGCCTGAGCTCTGAAGGTAAGACTGGGGAAAGTTTCCGAGAAGCCAAGTAGAAGCC
ATGGATCCAAACCTATTGGACCTCAAGGAGTTGAACCACGCAGGTGGCTGCGTGATTCCA
ATCATGGGGAAGACGCGGTCACCTGCAACAATCATACCGATAACTCCCATCTGAGCAACC
GGTACAACCTTAGCTAGAAGACGCTTTGGTGCTGGTGCTGGGTAGTTCGCGAGAATCACA
TCCAAACCTGGAAACTCCGTCTCTAACATCTTCTTCATGGTCACTGCTGTTCCCTTGAAA
GAACAGGAGACGCAGAAGTTGACCTCAACGGTGTTTCCATATCCAACAGCTCCTCCTATT
CCACTTTGTTTCTTCTGAAAAGGGAAATCTAGGGTTTCGGGTGTGAACCCAGCCGGACGC
TGCTGGTGGTGAGGGACATGCGGTGGTGGTGACTGATGAGTAGGAGGTTTAGGAGGCGGA
GGAGTGAATAGGTTGAAGAGATCCGAACAAAATAAGAATATCGGTAAACCCAACAGTATC
AATTGGGCTCTGTCCATTGCCATTTTTTCCAATCTCCGATGCTCTCAACAGAGTCGAGAG
GATGTAACAAAACCCGATCCAAGTTAGACTTGTTCCGATGCTGCC

QA 6 650 6 650
DS 



AS 1 2

CO CL2523Contig1 857 2 4 U
GGGGATTTCCCTTATTATTATATCACTCTGGCGCCTCTCCACGAGCGATTTCGAGAAGCA
CTAAAGAATGATGTTAACACGTCTCTTTACTCTCCTCTGCTTCTTCTTCGTCTTCTCAAC
CTTACTCGCTGTTTCCGAATCCAAACTCTTGGAGCCTCAAGCCGCTGAGTCTTTCAATGT
CAGCCTCATCCAGAAATTTGGGGCTAGTTGTTCTTACACAGTAATCATCTCTACGAGCTG
TTCGTCATCGAGGTACACTCGCGATCAAATTAGCGTCGCTTTTGGAGATGCATACGGGAA
TCAGATATACGCACCAAGGCTTGATGACCCGTCTATAAAGACCTTTGAGCAGTGTTCATC
AGACACATTTGAGATTAACGGACCATGCACATACCAGATATGCTATGTGTATCTCTACAG
GTCTGGTCCCGACGGTTGGATCCCGGAGAGTGTCAAGATATACAGCCATGGCTCCAAAGC
GGTCACATTCCCGTATAACACGAACGTCCCTGAGAGTATATGGTACGGTTTCAACTACTG
CAACAGCGCCTCGGGTTCTAATGTCCTACCCATTGGTCTCGGAAGGATTGTGCTTATACT
GCTTGGGTTTATTCTGGCCGGTTCAACATTGATATTGTAAGATGTTGTGGTTCTGGTTTT
AATGTCGGGTTTGTGTGAACATAATATGAGTAGGACATTATGCAGAATAATATGTACTGT
TGTTATTGGAAAATTGGGTGTATTGATATCCCTCATAAGATTTCTGTAATAACTATGAAG
TTACTTACTACTGCTAATTGACAGTGTGTAGATTTTATAAACGTACCGTAATGTATTGGT
TACAGAATAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM14TF U 1
AF RR2BM14JQ C 156
BS 1 693 RR2BM14TF
BS 694 694 RR2BM14JQ
BS 695 732 RR2BM14TF
BS 733 857 RR2BM14JQ

RD RR2BM14TF 737 0 0
GGGGATTTCCCTTATTATTATATCACTCTGGCGCCTCTCCACGAGCGATTTCGAGAAGCA
CTAAAGAATGATGTTAACACGTCTCTTTACTCTCCTCTGCTTCTTCTTCGTCTTCTCAAC
CTTACTCGCTGTTTCCGAATCCAAACTCTTGGAGCCTCAAGCCGCTGAGTCTTTCAATGT
CAGCCTCATCCAGAAATTTGGGGCTAGTTGTTCTTACACAGTAATCATCTCTACGAGCTG
TTCGTCATCGAGGTACACTCGCGATCAAATTAGCGTCGCTTTTGGAGATGCATACGGGAA
TCAGATATACGCACCAAGGCTTGATGACCCGTCTATAAAGACCTTTGAGCAGTGTTCATC
AGACACATTTGAGATTAACGGACCATGCACATACCAGATATGCTATGTGTATCTCTACAG
GTCTGGTCCCGACGGTTGGATCCCGGAGAGTGTCAAGATATACAGCCATGGCTCCAAAGC
GGTCACATTCCCGTATAACACGAACGTCCCTGAGAGTATATGGTACGGTTTCAACTACTG
CAACAGCGCCTCGGGTTCTAATGTCCTACCCATTGGTCTCGGAAGGATTGTGCTTATACT
GCTTGGGTTTATTCTGGCCGGTTCAACATTGATATTGTAAGATGTTGTGGTTCTGGTTTT
AATGTCGGGTTTGTGTGAACATAATATGAGTAG*ACATTATGCAGAATAATATGTACTGT
TGTTATTGGAAA
TTGGG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2BM14JQ 702 0 0
CTCAAGCCGCTGAGTCTTTCAATGTCAGCCTCATCCAGAAATTTGGGGCTAGTTGTTCTT
ACACAGTAATCATCTCTACGAGCTGTTCGTCATCGAGGTACACTCGCGATCAAATTAGCG
TCGCTTTTGGAGATGCATACGGGAATCAGATATACGCACCAAGGCTTGATGACCCGTCTA
TAAAGACCTTTGAGCAGTGTTCATCAGACACATTTGAGATTAACGGACCATGCACATACC
AGATATGCTATGTGTATCTCTACAGGTCTGGTCCCGACGGTTGGATCCCGGAGAGTGTCA
AGATATACAGCCATGGCTCCAAAGCGGTCACATTCCCGTATAACACGAACGTCCCTGAGA
GTATATGGTACGGTTTCAACTACTGCAACAGCGCCTCGGGTTCTAATGTCCTACCCATTG
GTCTCGGAAGGATTGTGCTTATACTGCTTGGGTTTATTCTGGCCGGTTCAACATTGATAT
TGTAAGATGTTGTGGTTCTGGTTTTAATGTCGGGTTTGTGTGAACATAATATGAGTAGGA
CATTATGCAGAATAATATGTACTGTTGTTATTGGAAAATTGGGTGTATTGATATCCCTCA
TAAGATTTCTGTAATAACTATGAAGTTACTTACTACTGCTAATTGACAGTGTGTAGATTT
TATAAACGTACCGTAATGTATTGGTTACAGAATAAAAAAAAA

QA 1 702 1 702
DS 



AS 2 4

CO CL2524Contig1 792 2 2 U
GAACGGTGCGATGGTTCCGGTCCGTGTCCACACCGTCCTCATCTCGACCCAGCACGATGA
GACCGTCACCAACGACGAGATCGCACGTGACCTCAAGGAGCACGTGATCAAACCTATCAT
CCCTGAGAAGTACCTCGACGACAAAACCATCTTCCACCTCAACCCATCGGGCAGGTTCGT
GATCGGTGGACCACACGGTGACGCCGGTTTAACCGGACGTAAGATCATCATCGACACTTA
CGGAGGATGGGGAGCTCACGGAGGAGGTGCTTTCTCAGGGAAAGACCCGACCAAGGTCGA
CAGAAGCGGTGCTTACATCGTGAGGCAAGCAGCCAAGAGCGTTGTTGCTAACGGGATGGC
TCGTAGGGCTCTTGTTCAGGTCTCCTACGCCATTGGAGTTCCCGAGCCGTTGTCTGTGTT
CGTGGACACTTACGGAACAGGGTTGATTCCAGACAAGGAGATACTGAAGATCGTGAAAGA
GACCTTCGATTTAGACCAGGGATGATGACGATCAACTTGGACTTGAAGAGAGGAGGCAAT
GGGAGGTTCTTGAAAACGGCGGCGTACGGACATTTCGGAAGGGACGACCCTGACTTCACC
TGGGAGGTCGTGAAGCCACTCAAGTGGGACAAACCTCAAGCTTAAGTGATGATTTAATAT
CATTTCATGTGCTTGTTTCCCTATCTTTTTTCACTTTAAAACATTTACCATGAACAATAA
TCAATCCTTGTGTTTCTGTTTTCTTTTTCTTTTTTTTGTACTTTTGGAATGAAAGTTTCT
GGTTTGTTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D619TF U 1
AF RR2D619JQ C 42
BS 1 685 RR2D619TF
BS 686 792 RR2D619JQ

RD RR2D619TF 685 0 0
GAACGGTGCGATGGTTCCGGTCCGTGTCCACACCGTCCTCATCTCGACCCAGCACGATGA
GACCGTCACCAACGACGAGATCGCACGTGACCTCAAGGAGCACGTGATCAAACCTATCAT
CCCTGAGAAGTACCTCGACGACAAAACCATCTTCCACCTCAACCCATCGGGCAGGTTCGT
GATCGGTGGACCACACGGTGACGCCGGTTTAACCGGACGTAAGATCATCATCGACACTTA
CGGAGGATGGGGAGCTCACGGAGGAGGTGCTTTCTCAGGGAAAGACCCGACCAAGGTCGA
CAGAAGCGGTGCTTACATCGTGAGGCAAGCAGCCAAGAGCGTTGTTGCTAACGGGATGGC
TCGTAGGGCTCTTGTTCAGGTCTCCTACGCCATTGGAGTTCCCGAGCCGTTGTCTGTGTT
CGTGGACACTTACGGAACAGGGTTGATTCCAGACAAGGAGATACTGAAGATCGTGAAAGA
GACCTTCGATTTAGACCAGGGATGATGACGATCAACTTGGACTTGAAGAGAGGAGGCAAT
GGGAGGTTCTTGAAAACGGCGGCGTACGGACATTTCGGAAGGGACGACCCTGACTTCACC
TGGGAGGTCGTGAAGCCACTCAAGTGGGACAAACCTCAAGCTTAAGTGATGATTTAATAT
CATTTCATGTGCTTGTTTCCCTATC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2D619JQ 751 0 0
TCTCGACCCAGCACGATGAGACCGTCACCAACGACGAGATCGCACGTGACCTCAAGGAGC
ACGTGATCAAACCTATCATCCCTGAGAAGTACCTCGACGACAAAACCATCTTCCACCTCA
ACCCATCGGGCAGGTTCGTGATCGGTGGACCACACGGTGACGCCGGTTTAACCGGACGTA
AGATCATCATCGACACTTACGGAGGATGGGGAGCTCACGGAGGAGGTGCTTTCTCAGGGA
AAGACCCGACCAAGGTCGACAGAAGCGGTGCTTACATCGTGAGGCAAGCAGCCAAGAGCG
TTGTTGCTAACGGGATGGCTCGTAGGGCTCTTGTTCAGGTCTCCTACGCCATTGGAGTTC
CCGAGCCGTTGTCTGTGTTCGTGGACACTTACGGAACAGGGTTGATTCCAGACAAGGAGA
TACTGAAGATCGTGAAAGAGACCTTCGATTTAGACCAGGGATGATGACGATCAACTTGGA
CTTGAAGAGAGGAGGCAATGGGAGGTTCTTGAAAACGGCGGCGTACGGACATTTCGGAAG
GGACGACCCTGACTTCACCTGGGAGGTCGTGAAGCCACTCAAGTGGGACAAACCTCAAGC
TTAAGTGATGATTTAATATCATTTCATGTGCTTGTTTCCCTATCTTTTTTCACTTTAAAA
CATTTACCATGAACAATAATCAATCCTTGTGTTTCTGTTTTCTTTTTCTTTTTTTTGTAC
TTTTGGAATGAAAGTTTCTGGTTTGTTTACT

QA 1 751 1 751
DS 



CO CL2524Contig2 616 2 2 U
GGTAAACAAACCAGAAACTTTCATTCCAAAAGTACAAAAAAAGAAAAAGAAAACAGAAAC
ATAAGGATTGATTATTGTTCATGGTAAATGTTTTAAAGTGAAAAAAGATAGAGAAACAAG
CATATGAAATGATATTAAATCATTTACTTAAGCTTGAGGCTTGTCCCACTTGAGTGGCTT
CACGACCTCCCAGGTGAAGTCAGGGTCGTCCCTTCCGAAATGTCCATACGCCGCCGTTTT
CAAGAACCTACCATTGCCTCCTCTCTTCAAGTCCAAGTTGATCGTCATCATCCCTGGTCT
GAAATCGAAGGTCTCCTTCACGATCTTCAGTATCTCCTTGTCTGGAATCAACCCTGTTCC
GTACGTGTCCACGAACACAGACAACGGCTCGGGCACTCCAATGGCGTAGGAGACCTGGAC
AAGAGCCCTACGAACCATCCCGTTAGCAACGACGCTCTTGGCTGCCTGCCTCACGATGTA
AGCACCGCTTCTGTCCACCTTGGTCGGGTCTTTCCCTGAGAAAGCACCTCCTCCGTGAGC
TCCCCATCCTCCGTAAGTGTCGATGATGATCTTACGTCCGGTTAAACCGGCGTCACCGTG
TGGTCCACCGATCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2EW04TF C 1
AF RR2EW04JQ U 42
BS 1 41 RR2EW04TF
BS 42 616 RR2EW04JQ

RD RR2EW04TF 616 0 0
GGTAAACAAACCAGAAACTTTCATTCCAAAAGTACAAAAAAAGAAAAAGAAAACAGAAAC
ATAAGGATTGATTATTGTTCATGGTAAATGTTTTAAAGTGAAAAAAGATAGAGAAACAAG
CATATGAAATGATATTAAATCATTTACTTAAGCTTGAGGCTTGTCCCACTTGAGTGGCTT
CACGACCTCCCAGGTGAAGTCAGGGTCGTCCCTTCCGAAATGTCCATACGCCGCCGTTTT
CAAGAACCTACCATTGCCTCCTCTCTTCAAGTCCAAGTTGATCGTCATCATCCCTGGTCT
GAAATCGAAGGTCTCCTTCACGATCTTCAGTATCTCCTTGTCTGGAATCAACCCTGTTCC
GTACGTGTCCACGAACACAGACAACGGCTCGGGCACTCCAATGGCGTAGGAGACCTGGAC
AAGAGCCCTACGAACCATCCCGTTAGCAACGACGCTCTTGGCTGCCTGCCTCACGATGTA
AGCACCGCTTCTGTCCACCTTGGTCGGGTCTTTCCCTGAGAAAGCACCTCCTCCGTGAGC
TCCCCATCCTCCGTAAGTGTCGATGATGATCTTACGTCCGGTTAAACCGGCGTCACCGTG
TGGTCCACCGATCAC
C

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2EW04JQ 575 0 0
AGAAAAAGAAAACAGAAACATAAGGATTGATTATTGTTCATGGTAAATGTTTTAAAGTGA
AAAAAGATAGAGAAACAAGCATATGAAATGATATTAAATCATTTACTTAAGCTTGAGGCT
TGTCCCACTTGAGTGGCTTCACGACCTCCCAGGTGAAGTCAGGGTCGTCCCTTCCGAAAT
GTCCATACGCCGCCGTTTTCAAGAACCTACCATTGCCTCCTCTCTTCAAGTCCAAGTTGA
TCGTCATCATCCCTGGTCTGAAATCGAAGGTCTCCTTCACGATCTTCAGTATCTCCTTGT
CTGGAATCAACCCTGTTCCGTACGTGTCCACGAACACAGACAACGGCTCGGGCACTCCAA
TGGCGTAGGAGACCTGGACAAGAGCCCTACGAACCATCCCGTTAGCAACGACGCTCTTGG
CTGCCTGCCTCACGATGTAAGCACCGCTTCTGTCCACCTTGGTCGGGTCTTTCCCTGAGA
AAGCACCTCCTCCGTGAGCTCCCCATCCTCCGTAAGTGTCGATGATGATCTTACGTCCGG
TTAAACCGGCGTCACCGTGTGGTCCACCGATCACC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 2 4

CO CL2525Contig1 711 2 16 U
TGACTAAATAAAACAAACAAGTGTAGTCATAATAGTGGCTCTACAGCTTTTACAGCCCTT
ATTGTGTAATCACACACTATTACACAAAATGTCAAACGGTTGTATGGTCATGGTCTCACG
TAAATCTCAAATAACTTTTAGACTGGTTTACAAATAAGTTTTTGGAAAATCACAATAATA
ACGTAATGGAGAATTGTTCCATGTTTTTCCTAAGTGTGTTAGTTTGTTCCTTCACCGTCT
TTAGAGCCACCAGCATCACTCTGTTCTAGATTAACAGCTACGGCCTCTGGTCCATGCACT
CTTACCAACTCTTCCTGGATAGAGCTGTTCTCAGTCTTGAGCTTCTCACATTCGCTGGAG
AGTCTCTGTAACTCATCCCTCAGGCTTTGATTCTCACTCGTCAAACTCTCTACTCTCTGT
TGAAGCTGTTCGCACTCCGCCTGCTTCCGCAGTCTGGACCGCCTGGCGGATTCACGGTTA
GACTGTTTCCTTTTCTGCCTCTTAAGCTCTCGTTCATCCTTCACAGCTACGCCAGCCTGG
GAAGACCATAAGTCCATTCCCATATTCAGATTAGTCCCAGGGGCCAGTGGCTTCATGGGC
ACTAACTCACCAGTAGTATTACTCTGAGAACTTGCATCCGCAAGCATTTGTCCAAAGCTC
GGCTTTCTAACTGAACCTTGCTCCTGGTGGTTAGCATTCTCACCATTTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA06JQ U 1
AF RR2GA53JQ U 1
BS 1 57 RR2AA06JQ
BS 58 58 RR2GA53JQ
BS 59 247 RR2AA06JQ
BS 248 250 RR2GA53JQ
BS 251 389 RR2AA06JQ
BS 390 390 RR2GA53JQ
BS 391 488 RR2AA06JQ
BS 489 489 RR2GA53JQ
BS 490 511 RR2AA06JQ
BS 512 512 RR2GA53JQ
BS 513 611 RR2AA06JQ
BS 612 612 RR2GA53JQ
BS 613 641 RR2AA06JQ
BS 642 642 RR2GA53JQ
BS 643 687 RR2AA06JQ
BS 688 711 RR2GA53JQ

RD RR2AA06JQ 687 0 0
TGACTAAATAAAACAAACAAGTGTAGTCATAATAGTGGCTCTACAGCTTTTACAGCC*TT
ATTGTGTAATCACACACTATTACACAAAATGTCAAACGGTTGTATGGTCATGGTCTCACG
TAAATCTCAAATAACTTTTAGACTGGTTTACAAATAAGTTTTTGGAAAATCACAATAATA
ACGTAATGGAGAATTGTTCCATGTTTTTCCTAAGTGTGTTAGTTTGTTCCTTCACCGTCT
TTAGAGC***CAGCATCACTCTGTTCTAGATTAACAGCTACGGCCTCTGGTCCATGCACT
CTTACCAACTCTTCCTGGATAGAGCTGTTCTCAGTCTTGAGCTTCTCACATTCGCTGGAG
AGTCTCTGTAACTCATCCCTCAGGCTTTGGTTCTCACTCGTCAAACTCTCTACTCTCTGT
TGAAGCTGTTCGCACTCCGCCTGCTTCCGCAGTCTGGACCGCCTGGCGGATTCACGGTTA
GACTGTTTTCTTTTCTGCCTCTTAAGCTCTCTTTCATCCTTCACAGCTACGCCAGCCTGG
GAAGACCATAAGTCCATTCCCATATTCAGATTAGTCCCAGGGGCCAGTGGCTTCATGGGC
ACTAACTCACCGGTAGTATTACTCTGAGAACTTGCATCCGCGAGCATTTGTCCAAAGCTC
GGCTTTCTAACTGAACCTTGCTCCTGG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2GA53JQ 711 0 0
AAGACT
AATAAAACAAACCAGTGTAGTCATAATAG***CTCTACAGCTTTTACAGCCCTTATTGTG
TAATCACACACTATTACACAAAATGTCAAACGGTTGTATGGTCATGGTCTCACGTAAATC
TCAAATAACTTTTAGACTGGTTTACAAATAAGTTTT*GGAAAATCACAATAATAACGTAA
TGGAG**TTGTTTCATGTTT**CCTAAGTGTGTTAGTTTGTTCCTTCACCGTCTTTAGAG
CCACCAGCATCACTCTGTTCTAGATTAGCAGCTACGGCCTCTGGTCCATGCACTCTTACC
AACTCTTCCTGGATAGAGCTGTTCTCAGTCTTGAGTTTCTCACATTCGCTGGAGAGTCTC
TGTAACTCATCTCTCAGGCTTTGATTCTCACTCGTCAAACTCTCTACTCTCTGTTGAAGC
TGTTCGCATTCCGCCTGCTTCCGCAGTCTGGACCGCCTGGCGGATTCACGGTTAGACTGT
TTCCTTTTCTGCCTCTTGAGCTCTCGTTCATCCTTCACAGCTACGCCAGCCTGGGAAGAC
CATAAGTCCATTCCCATATTCAGATTAGTCCCAGGGGCCAGTGGCTTCATGGGCACTATC
TCACCAGTAGTATTACTCTGAGAACTTGCATCCGCAAGCATTTGTCCAAAGCTCGGCTTT
CTAACTGAACCTTGCTCCTGGTGGTTAGCATTCTCACCATTTTCA

QA 7 711 7 711
DS 



CO CL2525Contig2 819 2 2 U
GGGTGTAGAACCGAGTTCGTCAAATCTCGTAAACCGACGTACGAATAATCTCCGATGAGT
GGATTTGCTTCACAGATTCCATCCATGGCGTTTCTAGGATCAGGCTTCACCAGCGAGGTC
GGGTTACGTGTACTGTTCTCTCCACTTGGTTCCAATATCGTACTTCGTACCGCATGCTGT
TCCATTGGGATCGGGTTGCCAGTATACTCCACTTTCAAGGCAATCGAGAATAGAGATCAG
AGTGCACAACGAAAATGGCTTATTTACTGGGCAGCTTATGGTTCTTTCAGCCTTGTTGAA
GTGTTCACGGATAAGCTCATTTCCTGGTTTCCACTGTATTATCATGCAAAGTTTGCGTTC
CTAGTCTGGCTTCAACTTCCCACCATTGATGGTGCAAAGCAAATATACAACAACCGCCTT
CGCCCTTTCCTAATTCGACACCGAGTTAGAGTGGACCGACTCGTGGATGGAGTATATGGA
GAAATGATCAAGGTCGTTAGGACACACCAAGGAGGAGTACGAGTCGTGCGATTAATCATT
GTCAAAATCTTTGGATCAGGTAATGAGGCTGCACCACCAAGCCAAGGACAAGGAGAAACA
CCTAACTTTAGCCCCGAACAAGAACCATCAACGGCAACAATCCAAGACTTGGAAGAATCT
GAATCCGATCACGAAGACTAAATAAAACAAACAAGTGTAGTCATAATAGCTCTACAGCTT
TTACAGCCTTATTGTGTAATCACACACTATTACACAAAATGTCAAACGGTTGTATGGTCA
TGGTCTCACGTAAATCTCAAATAACTTTTAGACTGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI83TF U 1
AF RR2DI83JQ C 190
BS 1 661 RR2DI83TF
BS 662 819 RR2DI83JQ

RD RR2DI83TF 661 0 0
GGGTGTAGAACCGAGTTCGTCAAATCTCGTAAACCGACGTACGAATAATCTCCGATGAGT
GGATTTGCTTCACAGATTCCATCCATGGCGTTTCTAGGATCAGGCTTCACCAGCGAGGTC
GGGTTACGTGTACTGTTCTCTCCACTTGGTTCCAATATCGTACTTCGTACCGCATGCTGT
TCCATTGGGATCGGGTTGCCAGTATACTCCACTTTCAAGGCAATCGAGAATAGAGATCAG
AGTGCACAACGAAAATGGCTTATTTACTGGGCAGCTTATGGTTCTTTCAGCCTTGTTGAA
GTGTTCACGGATAAGCTCATTTCCTGGTTTCCACTGTATTATCATGCAAAGTTTGCGTTC
CTAGTCTGGCTTCAACTTCCCACCATTGATGGTGCAAAGCAAATATACAACAACCGCCTT
CGCCCTTTCCTAATTCGACACCGAGTTAGAGTGGACCGACTCGTGGATGGAGTATATGGA
GAAATGATCAAGGTCGTTAGGACACACCAAGGAGGAGTACGAGTCGTGCGATTAATCATT
GTCAAAATCTTTGGATCAGGTAATGAGGCTGCACCACCAAGCCAAGGACAAGGAGAAACA
CCTAACTTTAGCCCCGAACAAGAACCATCAACGGCAACAATCCAAGACTTGGAAGAATCT
G

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2DI83JQ 630 0 0
ATCGGGTTGCCAGTATACTCCACTTTCAAGGCAATCGAGAATAGAGATCAGAGTGCACAA
CGAAAATGGCTTATTTACTGGGCAGCTTATGGTTCTTTCAGCCTTGTTGAAGTGTTCACG
GATAAGCTCATTTCCTGGTTTCCACTGTATTATCATGCAAAGTTTGCGTTCCTAGTCTGG
CTTCAACTTCCCACCATTGATGGTGCAAAGCAAATATACAACAACCGCCTTCGCCCTTTC
CTAATTCGACACCGAGTTAGAGTGGACCGACTCGTGGATGGAGTATATGGAGAAATGATC
AAGGTCGTTAGGACACACCAAGGAGGAGTACGAGTCGTGCGATTAATCATTGTCAAAATC
TTTGGATCAGGTAATGAGGCTGCACCACCAAGCCAAGGACAAGGAGAAACACCTAACTTT
AGCCCCGAACAAGAACCATCAACGGCAACAATCCAAGACTTGGAAGAATCTGAATCCGAT
CACGAAGACTAAATAAAACAAACAAGTGTAGTCATAATAGCTCTACAGCTTTTACAGCCT
TATTGTGTAATCACACACTATTACACAAAATGTCAAACGGTTGTATGGTCATGGTCTCAC
GTAAATCTCAAATAACTTTTAGACTGGTTT

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 4

CO CL2526Contig1 1095 4 36 U
GGTGTTCCCAAAGTGCAAGAGATAGTCGCTGAGATCTTAGGAAAGAGCCCTTGCAAAGGT
GTGAACCCTGACGAAGCGGTTACCATGGGAGCTGCTATCCAAGGTGGTATCCTCCGTGGG
GATGTCAAGGAGTTGCTTCTTTTGGATGTGACTCCTCTCTCGCTAGGTATCGAGACGCTT
GGTGGGATCTTCACTAGGTTGATCAACAGAAACACCACCATCCCCACAAAGAAGTCTCAG
GTTTTCTCCACAGCTGCAGACAACCAGATGCAAGTGGGAATCAAAGTTCTTCAGGGAGAG
CGTGAGATGGCTGCAGACAACAAGAGTCTAGGAGAGTTTGATCTCGTTGGGATCCCACCT
GCACCTAGAGGAATGCCCCAGATCGAGGTGACCTTCGACATTGACGCAAACGGTATCGTT
ACAGTCTCAGCCAAAGACAAGGCAACAGGTAAAGAGCAACAGATCACAATCAGATCATCA
GGTGGTCTCTCAGACGATGAGATCAACAGAATGGTGAAAGAAGCTGAGCTCAACTCACAC
AAGGATCAAGAGAAGAAGCAGCTTATCGACATAAGGAACACGGCCGATACAACAATCTAC
AGCGTTGAGAAGAGCTTGAGCGAGTACAGAGAGAAGATTCCTGCTGAGATTGCCTCTGAG
ATTGAGACTGCTGTGTCTGATCTCAGGACGGCAATGGCTGGTGAAGAGGTAGAGGACATC
AAGGCTAAGCTTGAAGCTGCCAACAAGGCATTGTCGAAGATTGGAGAACACATGTCCAAG
GGATCAGGTTCGTCTGGAACCTCTGGTGGTGAAGGTTCAAGCGGGACTGACCAGCAGACC
CCTGAAGCTGAATTTGAAGAGGCGAGCGGTTCAAAGAAATGAGTTAGGTAAACTGGTTGA
ACTCGGTTTTGCTTCCAAATAAAGTTGACATGCATTTATCCTTCACAAAATTGATTAAAG
TCTTTTTTTTTTGTATGTTAAAACGTCCTTTGTGGGGGTAATTCTTGAGATATTTGATAC
TCGGATGTAGTTCTTGCTTTCTTTGCTTGGTCTTTTCTTGGAATCTATGGGTTATTATCT
TGACCGGTTAACCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A390TF U 1
AF RR2F482TF U 14
AF RR2F482JQ C 226
AF RR2A390JQ C 246
BS 1 23 RR2A390TF
BS 24 24 RR2F482TF
BS 25 71 RR2A390TF
BS 72 72 RR2F482TF
BS 73 162 RR2A390TF
BS 163 163 RR2F482TF
BS 164 224 RR2A390TF
BS 225 225 RR2F482TF
BS 226 428 RR2A390TF
BS 429 429 RR2F482TF
BS 430 572 RR2A390TF
BS 573 573 RR2F482TF
BS 574 682 RR2A390TF
BS 683 686 RR2F482TF
BS 687 687 RR2F482JQ
BS 688 747 RR2F482TF
BS 748 748 RR2F482JQ
BS 749 761 RR2F482TF
BS 762 762 RR2F482JQ
BS 763 767 RR2F482TF
BS 768 768 RR2F482JQ
BS 769 789 RR2F482TF
BS 790 797 RR2F482JQ
BS 798 798 RR2A390JQ
BS 799 851 RR2F482JQ
BS 852 852 RR2A390JQ
BS 853 884 RR2F482JQ
BS 885 885 RR2A390JQ
BS 886 911 RR2F482JQ
BS 912 912 RR2A390JQ
BS 913 969 RR2F482JQ
BS 970 972 RR2A390JQ
BS 973 1036 RR2F482JQ
BS 1037 1037 RR2A390JQ
BS 1038 1082 RR2F482JQ
BS 1083 1095 RR2A390JQ

RD RR2A390TF 682 0 0
GGTGTTCCCAAAGTGCAAGAGATTGTCGCTGAGATCTTAGGAAAGAGCCCTTGCAAAGGT
GTGAACCCTGATGAAGCGGTTACCATGGGAGCTGCTATCCAAGGTGGTATCCTCCGTGGG
GATGTCAAGGAGTTGCTTCTTTTGGATGTGACTCCTCTCTCGTTAGGTATCGAGACGCTT
GGTGGGATCTTCACTAGGTTGATCAACAGAAACACCACCATCCCTACAAAGAAGTCTCAG
GTTTTCTCCACAGCTGCAGACAACCAGATGCAAGTGGGAATCAAAGTTCTTCAGGGAGAG
CGTGAGATGGCTGCAGACAACAAGAGTCTAGGAGAGTTTGATCTCGTTGGGATCCCACCT
GCACCTAGAGGAATGCCCCAGATCGAGGTGACCTTCGACATTGACGCAAACGGTATCGTT
ACAGTCTCGGCCAAAGACAAGGCAACAGGTAAAGAGCAACAGATCACAATCAGATCATCA
GGTGGTCTCTCAGACGATGAGATCAACAGAATGGTGAAAGAAGCTGAGCTCAACTCACAC
AAGGATCAAGAGAAGAAGCAGCTTATCGACATTAGGAACACGGCCGATACAACAATCTAC
AGCGTTGAGAAGAGCTTGAGCGAGTACAGAGAGAAGATTCCTGCTGAGATTGCCTCTGAG
ATTGAGACTGCTGTGTCTGATC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2F482TF 790 0 0
GGCAG
GAGATAGTCGCTGAGATCTTTGGAAAGAGCCCTTGCAAAGGTGTGAACCCTGACGAAGCG
GTTGCTATGGGAGCTGCTATCCAAGGTGGT*TCCTCCGTGGTGATGTCAAGGAGTTGCTT
CTTTTGGATGTGACTCCTCTCTCGCTCGGTATCGAGACGCTTGGTGGGATCTTCACTAGG
TTGATCAACCGAAACACCACCATCCCCACAAAGAAGTCTCAGGTTTTCTCCACAGCTGCG
GACAACCAGATGCAAGTGGGAATCAAAGTTCTTCAGGGAGAGCGTGAGATGGCTGCTGAC
AACAAGAGTCTAGGAGAGTTTGATCTCGTTGGGATCCCACCTGCACCTAGAGGAATGCCC
CAGATCGAGGTGACCTTTGACATTGACGCAAACGGTATCGTTACAGTCTCAGCCAAAGAC
AAGGCAACAGGTAAAGAGCAGCAGATCACAATCAGATCGTCAGGTGGTCTCTCAGACGAT
GAGATCAACAGAATGGTGAAAGAAGCTGAGCTCAACTCACACAAGGATCAAGAGAAGAAG
CAGCTTATTGACTTAAGGAACACGGCTGATACAACAATCTACAGCGTTGAGAAGAGCTTG
AGCGATTACAGAGAGAAGATTCCTGCTGAGATTGCCTCTGAGATTGAGACTGCTGTGTCT
GATCTCAG*ACGGCAATGGCTGGTGAAGAGGTAGAGGACATCAAGGCTAAGCTTGAAGCT
GCCAACAAG*CATTGTCGAAGAT*GGAGA*CACATGTCCAAGGGATCAGGT
CGTCTGGGACCTCT

QA 6 776 6 776
DS 

RD RR2F482JQ 857 0 0
ACAAAGAAGTCTCAGGTTTTCTCCACAGCTGCGGACAACCAGATGCAAGTGGGA*TCAAA
GTTCTTCAGGGAGAGCGTGAGATGGCTGCTGACAACAAGAGTCTAGGAGAGTTTGATCTC
GTTGGGATCCCACCTGCACCTAGAGGAATGCCCCAGATCGAGGTGACCTTTGACATTGAC
GCAAACGGTATCGTTACAGTCTCAGCCAAAGACAAGGCAACAGGTAAAGAGCAGCAGATC
ACAATCAGATCGTCAGGTGGTCTCTCAGACGATGAGATCAACAGAATGGTGAAAGAAGCT
GAGCTCAACTCACACAAGGATCAAGAGAAGAAGCAGCTTATTGACTTAAGGAACACGGCT
GATACAACAATTTACAGCGTTGAGAAGAGCTTGAGCGATTACAGAGAGAAGATTCCTGCT
GAGATTGCCTTTGAGATTGAGACTGCTGTGTCTGATCTCAGGACGGCAATGGCTGGTGAA
GAGGTAGAGGACATCAAGGCTAAGCTTGAAGCTGCCAACAAGGCATTGTCGAAGATTGGA
GAACACATGTCCAAGGGATCAGGTTCGTCTGGGACCTCTGGTGGTGAAGGTTCAAGCGGG
ACTGACCAGCAGACCCCTGAAGCTGAGTTTGAAGAGGCGAGCGGTTCAAAGAAATGAGT*
AGGTAAACTGGTTGAACTCGGTTTTGTTTCCAAATAAAGTTGACATGCATTTATCCTTCA
CAAAATTGATTAAAGTCTTTTTTT***GTATGTTAAAACGTCCTTTGTGGGGGTAATTCT
TGAGATATTTGATACTCGGATGTAGTTCTTGGTTTCTTTGCTTGGTCTTTTCTTGGAATC
TATGGGTTATTATCTTG

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR2A390JQ 850 0 0
CTCCACAGCTGCAGACAACCAGATGCAAGTGGGAATCAAAGTTCTTCAGGGAGAGCGTGA
GATGGCTGCAGACAACAAGAGTCTAGGAGAGTTTGATCTCGTTGGGATCCCACCTGCACC
TAGAGGAATGCCCCAGATCGAGGTGACCTTCGACATTGACGCAAACGGTATCGTTACAGT
CTCGGCCAAAGACAAGGCAACAGGTAAAGAGCAACAGATCACAATCAGATCATCAGGTGG
TCTCTCAGACGATGAGATCAACAGAATGGTGAAAGAAGCTGAGCTCAACTCACACAAGGA
TCAAGAGAAGAAGCAGCTTATCGACATTAGGAACACGGCCGATACAACAATCTACAGCGT
TGAGAAGAGCTTGAGCGAGTACAGAGAGAAGATTCCTGCTGAGATTGCCTCTGAGATTGA
GACTGCTGTGTCTGATCTCAGGACGGCAATGGCTGGTGAAGAGGTAGAGGACATCAAGGC
CAAGCTTGAAGCTGCCAACAAGGCAGTGTCGAAGATTGGAGAGCACATGTCCAAGGGATC
AGGTTCGTCTGGAAGCTCTGGTGGTGAAGGTTCAAGCGGGACTGACCAGCAGACCCCTGA
AGCTGAATTTGAAGAGGCGAGCGGTTCAAAGAAATGAGTTAGGTAAACTGGTTGAACTCG
GTTTTGCTTCCAAATAAAGTTGACATGCATTTATCCTTCACAAAATTGATTAAAGTCTTT
TTTTTTTGTATGTTAAAACGTCCTTTGTGGGGGTAATTCTTGAGATATTTGATACTCGGA
TGTAGTTCTTGCTTTCTTTGTTTGGTCTTTTCTTGGAATCTATGG*TTATTATCTTGACC
GGTTAACCGG

QA 1 850 1 850
DS 



AS 1 3

CO CL2527Contig1 1231 3 2 U
GGATGCGATAGAATCTTTAGTCTATCTTCATCATCACTCATCATCATCTTTCTCTGTCTA
TAGCTTCTTCCTCTCCAATGGCAGACTCCAAGGAACTCGGCACAGCGAGCCGCCGTATCT
CCGTCGTCTCAAATCATCTCATCCCCGTCGAACCGGTTCCAACTGGCGTTGACTCAGTGA
AACTCTCAACTACTTCGTCGATGAATGACAAGTACCATAAGGTCCACGGTGAAGTGCCGA
CTCACCAAGTCGTTTGGAGAAAAGCTGATCTCGTCGGTGACGACGGAGAAACAAAAGAGT
TCGTTGACATTATATATGAGAAAGCCGTCGGTGAAGATATTGCAAAGATTACTATAAACC
GGCCGGAGAGAAGAAACGCGTTCCGGCCTCAGACTGTGAAGGAGCTTATGCGCGCGTTTA
ACGACGCCAGAGACGATAGCTCTGTAGGTGTCACCATACTCACCGGCAAGGGAACGAAAG
CGTTTTGCAGTGGTGGTGATCAAGCGTTGAGGACATCAGATGGTTATGCTGATCCCAATG
ATGTTGGTCGACTTAATGTCCTTGATCTCCAGGTTCAAATCCGGAGACTGCCAAAACCAG
TAATTGCAATGGTTGCTGGTTATGCTGTTGGAGGAGGACATATCTTGCACACGGTCTGTG
ATCTAACCATTGCAGCTGACAATGCTATTTTCGGTCAGACTGGTCCTAAGGTTGGAAGTT
TTGATGCTGGTTATGGAAGTTCCATCATGTCTCGTCTGGTTGGTCCTAAAAAGGCACGAG
AAATGTGGTTCATGACGAGATTCTACACAGCTTCAGAAGCAGACAAAATGGGACTCATCA
ATACAGTTGTACCGCTAGAGGATTTGGAGAAAGAAACTGTGAAATGGTGCAGAGAAATCT
TGAGGAACAGCCCTACTGCAATCCGTGTTCTTAAGGCAGCACTCAATGCGGTCGATGATG
GTCATGCTGGACTTCAGGAGCTAGGAGGTAATGCGACCCTCTTATTCTATGGTACCGAAG
AAGGTATAGAAGGAAGAACGGCTTATATGCAACGCCGCCCACCAGACTTCTCTAAGTTTC
CCCGTCGACCTTGAACTCACTATTAAGCTAAGTTCAGGTGTTTTCCATACAATTGTTTGT
CCTCATTTCAATCAATCCCTTTGTTTTGTTTGCCAGATTTAATTCCAGACTTCCAACTAT
GATAAACAATGAAGAATAATAATAATCCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB62TF U 45
AF RR2C175TF U 1
AF RR2C175JQ C 489
BS 1 689 RR2C175TF
BS 690 1231 RR2C175JQ

RD RR2EB62TF 109 0 0
CATCTTTCTCTGTCTATAGCTTCTTCCTCTCCAATGGCGGACTCCAAGGAACTCGGCACA
GCGAGCCGCCGTATCTCCGTCGTCTCAAATCATCTCATCCCCGTCGAAC

QA 1 109 1 109
DS 

RD RR2C175TF 689 0 0
GGATGCGATAGAATCTTTAGTCTATCTTCATCATCACTCATCATCATCTTTCTCTGTCTA
TAGCTTCTTCCTCTCCAATGGCAGACTCCAAGGAACTCGGCACAGCGAGCCGCCGTATCT
CCGTCGTCTCAAATCATCTCATCCCCGTCGAACCGGTTCCAACTGGCGTTGACTCAGTGA
AACTCTCAACTACTTCGTCGATGAATGACAAGTACCATAAGGTCCACGGTGAAGTGCCGA
CTCACCAAGTCGTTTGGAGAAAAGCTGATCTCGTCGGTGACGACGGAGAAACAAAAGAGT
TCGTTGACATTATATATGAGAAAGCCGTCGGTGAAGATATTGCAAAGATTACTATAAACC
GGCCGGAGAGAAGAAACGCGTTCCGGCCTCAGACTGTGAAGGAGCTTATGCGCGCGTTTA
ACGACGCCAGAGACGATAGCTCTGTAGGTGTCACCATACTCACCGGCAAGGGAACGAAAG
CGTTTTGCAGTGGTGGTGATCAAGCGTTGAGGACATCAGATGGTTATGCTGATCCCAATG
ATGTTGGTCGACTTAATGTCCTTGATCTCCAGGTTCAAATCCGGAGACTGCCAAAACCAG
TAATTGCAATGGTTGCTGGTTATGCTGTTGGAGGAGGACATATCTTGCACACGGTCTGTG
ATCTAACCATTGCAGCTGACAATGCTATT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2C175JQ 743 0 0
AGTGGTGGTGATCAAGCGTTGAGGACATCAGATGGTTATGCTGATCCCAATGATGTTGGT
CGACTTAATGTCCTTGATCTCCAGGTTCAAATCCGGAGACTGCCAAAACCAGTAATTGCA
ATGGTTGCTGGTTATGCTGTTGGAGGAGGACATATCTTGCACACGGTCTGTGATCTAACC
ATTGCAGCTGACAATGCTATTTTCGGTCAGACTGGTCCTAAGGTTGGAAGTTTTGATGCT
GGTTATGGAAGTTCCATCATGTCTCGTCTGGTTGGTCCTAAAAAGGCACGAGAAATGTGG
TTCATGACGAGATTCTACACAGCTTCAGAAGCAGACAAAATGGGACTCATCAATACAGTT
GTACCGCTAGAGGATTTGGAGAAAGAAACTGTGAAATGGTGCAGAGAAATCTTGAGGAAC
AGCCCTACTGCAATCCGTGTTCTTAAGGCAGCACTCAATGCGGTCGATGATGGTCATGCT
GGACTTCAGGAGCTAGGAGGTAATGCGACCCTCTTATTCTATGGTACCGAAGAAGGTATA
GAAGGAAGAACGGCTTATATGCAACGCCGCCCACCAGACTTCTCTAAGTTTCCCCGTCGA
CCTTGAACTCACTATTAAGCTAAGTTCAGGTGTTTTCCATACAATTGTTTGTCCTCATTT
CAATCAATCCCTTTGTTTTGTTTGCCAGATTTAATTCCAGACTTCCAACTATGATAAACA
ATGAAGAATAATAATAATCCACC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 4

CO CL2528Contig1 1043 4 19 U
GGAGACCTAAATAAACTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGAAATT
GGAACAAAAAAGAAAATATCAGGGCTTCTCTGCATGCGAGAATTGCGACCAACCATGCCC
ATGGTGAATCTTGATTTCTCTGACGGAGCATCTCCGCCTTCACATATTCTCAGAAAATCC
CCACGGAAACAAGCTTCAGAGCCTTCTCCTCCACAACCAGCAGCAGCAGCAGAACAAGTG
ACAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACATTGGCGAGCAGCAGCAGCAGCAGAATCTGG
AACGAGGAAGATGAGCTCACTGTCTTAAAAGGGTTAGTGGATTATCGAGCCAAGACAGGG
AACGAGCCCAACAGTAACTGGGCTGACTTTTACCGTTTCCTCGGTGATTCCATCACTGCG
ATATACTCGAAGGATCAGGTTTTGACTAAGATCCGCAAGCTGAAAGGTAAGTTCATTGTT
AGCATGCGGAAAGGAAACACCAGCAAATCTGAAGCCTTCCTACTTTCCAAAAGGATATGG
GCCCCCCAAAATGAACCTGATCAGTCTGTTAATCACAGCAGCAAGAATGGTGATGAAATG
GGTAATGAATCATTACCAAAAGCTGACTTTGAAGGCAATGACGAGACATGGGCTGTGCGG
GATGCGTTCGAGACCATAGTGTCTAAAGGTTTAAGTGATTATCAAAAGAAATTGCAGCTT
GAGAAGTTGATGAACCTTGGATCTGGTAAAAGAAAAGAGCTGAGCGATGAGTGGAAAGAG
TTATGTGCTGAGGAAGTTAAACTCAATATCAAGAGGTTTAAGTTTTCTGCTTTGCTTGCA
GAGGCTGCTAAATGGTAACTCTTTGTGAAAAAAATATATCTGCTTCAGTGTGTGTGTAAT
AGAAGCACTATGTTTTCTGTGGTGTCTAAAAAAGAATCATGTTTCTCGGCTTTTATGTAA
TCTTAATGTTAATGTAATAAAAAATATCGGCTTTTATGTAATCTTAATGTTAATGTAATA
AAACAGAGGTTGCCTCTTCATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2H451TF U 1
AF RR2D470TF U 51
AF RR2D470JQ C 233
AF RR2H451JQB C 512
BS 1 96 RR2H451TF
BS 97 97 RR2D470TF
BS 98 235 RR2H451TF
BS 236 236 RR2D470TF
BS 237 378 RR2H451TF
BS 379 379 RR2D470TF
BS 380 487 RR2H451TF
BS 488 488 RR2D470TF
BS 489 630 RR2H451TF
BS 631 688 RR2D470TF
BS 689 689 RR2D470JQ
BS 690 755 RR2D470TF
BS 756 756 RR2D470JQ
BS 757 794 RR2D470TF
BS 795 915 RR2D470JQ
BS 916 916 RR2H451JQB
BS 917 920 RR2D470JQ
BS 921 921 RR2H451JQB
BS 922 1043 RR2D470JQ

RD RR2H451TF 630 0 0
GGAGACCTAAATAAACTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGAAATT
GGAACAAAAAAGAAAATATCAGGGCTTCTCTGCATGTGAGAATTGCGACCAACCATGCCC
ATGGTGAATCTTGATTTCTCTGACGGAGCATCTCCGCCTTCACATATTCTCAGAAAATCC
CCACGGAAACAAGCTTCAGAGCCTTCTCCTCCACAACCAGCAGCAGCAGCAGAACGAGTG
ACAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACATTGGCGAGCAGCAGCAGCAGCAGAATCTGG
AACGAGGAAGATGAGCTCACTGTCTTAAAAGGGTTAGTGGATTATCGAGCCAAGACAGGG
AACGAGCCCAACAGTAACAGGGCTGACTTTTACCGTTTCCTCGGTGATTCCATCACTGCG
ATATACTCGAAGGATCAGGTTTTGACTAAGATCCGCAAGCTGAAAGGTAAGTTCATTGTT
AGCATGCAGAAAGGAAACACCAGCAAATCTGAAGCCTTCCTACTTTCCAAAAGGATATGG
GCCCCCCAAAATGAACCTGATCAGTCTGTTAATCACAGCAGCAAGAATGGTGATGAAATG
GGTAATGAATCATTACCAAAAGCTGACTTT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2D470TF 758 0 0
G
CTCGAAATTGGAACAAAAAAGAAAATATCAGGGCTTCTCTGCATGCGAGAATTGCGACCA
ACCATGCCCATGGTGAATCTTGATTTCTCTGACGGAGCATCTCCGCCTTCACATATTCTC
AGAAAATCCCCACGGAAACAAGCTTCAGAGCCTTCTCCTCCACAACCAGCAGCAGCAGCA
GAACAAGTGACAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACATTGGCGAGCAGCAGCAGCAGC
AGAATCTGGAACGAGGAAGATGAGCTCACTGTCTTAAAAGGGTTAGTGGATTATCGAGCC
AAGACAGGGAACGAGCCCAACAGTAACTGGGCTGACTTTTACCGTTTCCTCGGTGATTCC
ATCACTGCGATATACTCGAAGGATCAGGTTTTGACTAAGATCCGCAAGCTGAAAGGTAAG
TTCATTGTTAGCATGCGGAAAGGAAACACCAGCAAATCTGAAGCCTTCCTACTTTCCAAA
AGGATATGGGCCCCCCAAAATGAACCTGATCAGTCTGTTAATCACAGCAGCAAGAGTGGT
GATGAAATGGGTAATGAATCATTACCAAAAGCTGACTTTGAAGGCAATGACGAGACATGG
GCTGTGCGGGATGCGTTCGAGACCATAGTGTCTAAAG*TTTAAGTGATTATCAAAAGAAA
TTGCAGCTTGAGAAGTTGATGAACCTTGGATCTGGTAAAAGAAA*GAGCTGAGCGATGAG
TGGAAAGAGTTATGTGCTGAGGA
GTAAACTCAATATC

QA 2 744 2 744
DS 

RD RR2D470JQ 811 0 0
AACA
AGTGACAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACATTGGCGAGCAGCAGCAGCAGCAGAAT
CTGGAACGAGGAAGATGAGCTCACTGTCTTAAAAGGGTTAGTGGATTATCGAGCCAAGAC
AGGGAACGAGCCCAACAGTAACTGGGCTGACTTTTACCGTTTCCTCGGTGATTCCATCAC
TGCGATATACTCGAAGGATCAGGTTTTGACTAAGATCCGCAAGCTGAAAGGTAAGTTCAT
TGTTAGCATGCGGAAAGGAAACACCAGCAAATCTGAAGCCTTCCTACTTTCCAAAAGGAT
ATGGGCCCCCCAAAATGAACCTGATCAGTCTGTTAATCACAGCAGCAAGAGTGGTGATGA
AATGGGTAATGAATCATTACCAAAAGCTGACTTTGAAGGCAATGACGAGACATGGGCTGT
GCGGGATGCGTTCGAGACCATAGTGTCTAAAGGTTTAAGTGATTATCAAAAGAAATTGCA
GCTTGAGAAGTTGATGAACCTTGGATCTGGTAAAAGAAAAGAGCTGAGCGATGAGTGGAA
AGAGTTATGTGCTGAGGAAGTTAAACTCAATATCAAGAGGTTTAAGTTTTCTGCTTTGCT
TGCAGAGGCTGCTAAATGGTAACTCTTTGTGAAAAAAATATATCTGCTTCAGTGTGTGTG
TAATAGAAGCACTATGTTT*CTGTTGTGTCTAAAAAAGAATCATGTTTCTCGGCTTTTAT
GTAATCTTAATGTTAATGTAATAAAAAATATCGGCTTTTATGTAATCTTAATGTTAATGT
AATAAAACAGAGGTTGCCTCTTCATTG

QA 5 811 5 811
DS 

RD RR2H451JQB 528 0 0
AAGCCTTCCTACTTTCCAAAAGGATATGGGCCCCCCAAAATGAACCTGATCAGTCTGTTA
ATCACAGCAGCAAGAATGGTGATGAAATGGGTAATGAATCATTACCAAAAGCTGACTTTG
AAGGCAATGACGAGTCATGGGCTGTGCGGGATGCGTTCGAGACCATGGTGTCTAAAGGTT
TAAGTGATTATCAAAAGAAATTGCAGCTTGAGAAGTTGATGAACCTTGGATCTGGTAAAA
GAAAAGAGCTGAGCGATGAGTGGAAAGAGTTATGTGCTGAGGAAGTTAAACTCAATATCA
AGAGGTTTAAGTTTTCTGCTTTGCTTGCAGAGGCTGCTAAATGGTAACTCTTTGTGAAAA
AAATATATCTGCTTCAGTGTGTGTGTAATAGAAGCACTATGTTTTCTGTGGTGTCTAAAA
AAGAAT*ATGTTTCTCGGCTTTTATGTAATCTTAATGTTAATGTAATAAAAAC*ATCGGC
TTTTATGTAATCTTAATGTTAATGTAATAAA*CAGAGGTTGCCTCTTC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL2529Contig1 787 2 2 U
GCTCGAACTCGAGTTATCTTCAAGACTCCACCAGCAAAGAGATGCAGTGGTGGTGGTGGT
GGTTTTGTGACTATGTCTTTGAATTCAAACCCAGAGAAGAGCTCTACTAGTTCTGGAAGC
CTCATTTCTAGGGCGTCGATCAGTGTCTTGGAAGATCAATCCATCAACGGTTTTAAAATG
CAACTTGGGCTTTGTCTCTCCTCCGCGTTTAATCAATCCATTAGGCAAGACGATGAGTAG
AGGCGATCAGGCGTTTCTTCTCTTGGCCTTCGCTGCTTGCACGACTTCAGTTGCTTTTAC
AAGTTTTGTGATTACAGCAGTTCCCACACTTCTGGCCATGGGTAGAGCTGCGTCTTCCTT
TGCTAAGTTAGCCGACACGGCCCGCCAAGAACTCCCCAGTACCTTGGCAGCCATTAGGCT
CTCCGGCATGGAAATTAGCGATCTTACTCTTGAATTAAGTGAGTTAAGCCATGAAGTAAG
TGATGGGGTAAACAAATCAGCTAAAGCGGTCCAAGCAGCTGAAGCTGGAATCCGACAGAT
TGGAACTCTTGCACGCCAGCAAACTCTCTCAATGATTGATGAGAGAGCAAGTTTACCAGA
AATATCGCTGCAACCTGTTGTGGCTGGTGCAGCGAAGAAGACTACTACCGCAATAGGCAG
AGCATCCAGGACAGTCATGAACATTATAACCGGAGGAGGTGACAAGGACGAAGAAGACTC
CTAAGACGTTTAAAAACTCTCTCACTTTAATTCTTTGTTCCTTTTTTTTGCAAGCTATGA
GAATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D932TF U 1
AF RR2D932JQ C 9
BS 1 590 RR2D932TF
BS 591 787 RR2D932JQ

RD RR2D932TF 590 0 0
GCTCGAACTCGAGTTATCTTCAAGACTCCACCAGCAAAGAGATGCAGTGGTGGTGGTGGT
GGTTTTGTGACTATGTCTTTGAATTCAAACCCAGAGAAGAGCTCTACTAGTTCTGGAAGC
CTCATTTCTAGGGCGTCGATCAGTGTCTTGGAAGATCAATCCATCAACGGTTTTAAAATG
CAACTTGGGCTTTGTCTCTCCTCCGCGTTTAATCAATCCATTAGGCAAGACGATGAGTAG
AGGCGATCAGGCGTTTCTTCTCTTGGCCTTCGCTGCTTGCACGACTTCAGTTGCTTTTAC
AAGTTTTGTGATTACAGCAGTTCCCACACTTCTGGCCATGGGTAGAGCTGCGTCTTCCTT
TGCTAAGTTAGCCGACACGGCCCGCCAAGAACTCCCCAGTACCTTGGCAGCCATTAGGCT
CTCCGGCATGGAAATTAGCGATCTTACTCTTGAATTAAGTGAGTTAAGCCATGAAGTAAG
TGATGGGGTAAACAAATCAGCTAAAGCGGTCCAAGCAGCTGAAGCTGGAATCCGACAGAT
TGGAACTCTTGCACGCCAGCAAACTCTCTCAATGATTGATGAGAGAGCAA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2D932JQ 779 0 0
TCGAGTTATCTTCAAGACTCCACCAGCAAAGAGATGCAGTGGTGGTGGTGGTGGTTTTGT
GACTATGTCTTTGAATTCAAACCCAGAGAAGAGCTCTACTAGTTCTGGAAGCCTCATTTC
TAGGGCGTCGATCAGTGTCTTGGAAGATCAATCCATCAACGGTTTTAAAATGCAACTTGG
GCTTTGTCTCTCCTCCGCGTTTAATCAATCCATTAGGCAAGACGATGAGTAGAGGCGATC
AGGCGTTTCTTCTCTTGGCCTTCGCTGCTTGCACGACTTCAGTTGCTTTTACAAGTTTTG
TGATTACAGCAGTTCCCACACTTCTGGCCATGGGTAGAGCTGCGTCTTCCTTTGCTAAGT
TAGCCGACACGGCCCGCCAAGAACTCCCCAGTACCTTGGCAGCCATTAGGCTTTCCGGCA
TGGAAATTAGCGATCTTACTCTTGAATTAAGTGAGTTAAGCCATGAAGTAAGTGATGGGG
TAAACAAATCAGCTAAAGCGGTCCAAGCAGCTGAAGCTGGAATCCGACAGATTGGAACTC
TTGCACGCCAGCAAACTCTCTCAATGATTGATGAGAGAGCAAGTTTACCAGAAATATCGC
TGCAACCTGTTGTGGCTGGTGCAGCGAAGAAGACTACTACCGCAATAGGCAGAGCATCCA
GGACAGTCATGAACATTATAACCGGAGGAGGTGACAAGGACGAAGAAGACTCCTAAGACG
TTTAAAAACTCTCTCACTTTAATTCTTTGTTCCTTTTTTTTGCAAGCTATGAGAATATT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL2530Contig1 706 2 2 U
CATTCAATTCAACACACTCAAGTAAACATAGTTTGCGGAACAAGTTTCACACAACTCTTA
TTATTATTCAAAACAAACCAAAAGGGAAACAAAATCAAAGTACTCAAACATCTCCATGTC
CGAAAAAAGCAACAAGCATGTCCTCATAATCACCAAAAGTGTCTTTGGCGACGGCACGGT
CCAAAGGAACGCTGTTCCTACCCTGATACTCCTCTTTGATGCGTTCCATGTCAACTTCAG
TTCTCGTTGTCACGACTCTGGTTAGTCCCCACTCGTCAGTTCCCATTTTGTTGATGGCTA
AACGCAACACTTTCTCAAAATGCTTCTCAGGGTATGTCAAACAAGTGATTGCAGCTCTCA
GTAGTTTCAGGTAATCATCATCCGAACCTTCCTTCAAGTTCTTGTTGATGGAGTTACCAT
GTTCATTGTTGTAGTGGTTGAAAGTAGCACCGAGCTGAGCTTTGCTTCTCGTAGTCAAGA
TTCTGATGAAGTCATCATCGTTGAAAGCTTTCTCGGAGACTTTCTCGTGAAGCAGCTTGG
CTTCGGATCTCGCGAACATCATGTTCACGTCGTCTCCTTCGTACCTGAAAGTGCTGACCA
GAGGAAGCAGGAGCTTGCGGAGGTCACCGGATGTGTGCTGAGCGACGTCTTCCTCGAGTG
ATTTCTTGTAACGAGCTTGGTAAGCTTGCTTGACCTTGAAAAGCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED90JQ U 1
AF RR2FN77JQ U 1
BS 1 478 RR2ED90JQ
BS 479 706 RR2FN77JQ

RD RR2ED90JQ 478 0 0
CATTCAATTCAACACACTCAAGTAAACATAGTTTGCGGAACAAGTTTCACACAACTCTTA
TTATTATTCAAAACAAACCAAAAGGGAAACAAAATCAAAGTACTCAAACATCTCCATGTC
CGAAAAAAGCAACAAGCATGTCCTCATAATCACCAAAAGTGTCTTTGGCGACGGCACGGT
CCAAAGGAACGCTGTTCCTACCCTGATACTCCTCTTTGATGCGTTCCATGTCAACTTCAG
TTCTCGTTGTCACGACTCTGGTTAGTCCCCACTCGTCAGTTCCCATTTTGTTGATGGCTA
AACGCAACACTTTCTCAAAATGCTTCTCAGGGTATGTCAAACAAGTGATTGCAGCTCTCA
GTAGTTTCAGGTAATCATCATCCGAACCTTCCTTCAAGTTCTTGTTGATGGAGTTACCAT
GTTCATTGTTGTAGTGGTTGAAAGTAGCACCGAGCTGAGCTTTGCTTCTCGTAGTCAA

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2FN77JQ 706 0 0
CATTCAATTCAACACACTCAAGTAAACATAGTTTGCGGAACAAGTTTCACACAACTCTTA
TTATTATTCAAAACAAACCAAAAGGGAAACAGAATCAGAGTACTCAGACATCTCCATGTC
CGAGAAGAGCAACAAGCATGTCCTCATAATCACCAGAAGTGTCTTTGGTGACGGCACGGT
CCAAAGGAACGCTGTTCCTACGCTGATACTCCTCTTTGATGCGTTCCATGTCAACTTCAG
TTCTCGTTGTCACGACTCTGGTTAGTCCCCACTCGTCAGTTCCCATTTTGTTGATGGTTA
GACGCAACACTTTCTCAAAATGCTTCTCAGGGTATGTCAAACAAGTGATTGCAGCTCTCA
GTAGTTTCAGGTAATCATCATCCGAACCTTCCTTCAAGTTCTTGTTGATGGAGTTACCAT
GTTCATTGTTGTAGTGGTTGAGAGTAGCACCGAGCTGAGCTTTGCTTCTCGTAGTCAAGA
TTCTGATGAAGTCATCATCGTTGAAAGCTTTCTCGGAGACTTTCTCGTGAAGCAGCTTGG
CTTCGGATCTCGCGAACATCATGTTCACGTCGTCTCCTTCGTACCTGAAAGTGCTGACCA
GAGGAAGCAGGAGCTTGCGGAGGTCACCGGATGTGTGCTGAGCGACGTCTTCCTCGAGTG
ATTTCTTGTAACGAGCTTGGTAAGCTTGCTTGACCTTGAAAAGCTC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 4

CO CL2531Contig1 1046 4 2 U
GGGTTGCTCTGTTGTTGTTGTTGTTCCTTCCCCCTCATTGGAGAGAAGCAAGCGAGTCTC
TTACAATCCCAGAGAGAGAGAGAGAGACGCGTTTGTTCTTCCTCTAAGCCAAGAGTCTCG
GTTGGGTGGCAAAGATGGTCGCAGAACGCTTCACTGTCGATTTGGATAAGCCACTTGTCT
TTCAGGTTGGTCATCTTGGGGAAGAATATCAGGAATGGATTCATCAACCTATTGTATGCG
TAGAGGGTCCTCGTTTTTTCCAGAGTGATTTTTGGGAGTTCTTGACTCGCACTGTTTGGT
GGGCAATCCCAACAATCTGGCTTCCAGTTGTCTGCTACGTTCTTTCAATCTCCGCGGCGA
GGGGACTGACATTTCCCCAGATGGGTTTAATTGTTGCATTTGGCGTATTCACCTGGACAC
TTCTCGAGTACACACTTCATCGTTTCCTTTTCCACATAGAAACCAAGAGCTACTGGGCAA
ACACTGCACACTATCTTCTTCATGGATGCCATCACAAGCACCCACAAGACGGTCTTCGTC
TTGTTTTCCCTCCTACCGCAACAGCCATCCTCTTGGTTCCACTATGGAAGCTTCTGCACC
TCATAGCTACTCCTGCTACAGCTCCTGCTATGCTTGGAGGCATTTTGTTTGGCTATGTGA
TGTATGATTGTACTCATTTCTATCTACACCACGGTCAACCTAAAGAACCAACCTTCAAGC
ATCTCAAGAAATACCATCTGAACCATCACTTCAGAATCCAGGACAAAGGATATGGAATCA
CTTTCTCTCTGGGATAGAGTCTTTGGAACACTTCCCGGTACGAAAGCTGCTCAGAAGAAG
CTTTAAACCGGATATCGATTTGCCATTTTCTGATTCATCATGTGATTCAATGACACTGTT
TAACTGATGTTGTATACGATCTGTCACCATATTTTGAACATATCTAGTGGTGTGTGAACC
GGTTTTATGGTGTGGTCATAGAAAATTAAAATCAAACTGGTTTATTTGCTATTCAATTTG
GTCTTTTAATCGACTGTTATTTGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA75JQ C 475
AF RR2CA75TF U 147
AF RR2BG03TF U 1
AF RR2BG03JQ C 260
BS 1 824 RR2BG03TF
BS 825 1046 RR2BG03JQ

RD RR2CA75JQ 208 0 0
GGGCAAACACTGCACACTATTTTCTTCATGGATGCCATCACAAGCACCCACAAGACGGTC
TTCGTCTTGTTTTCCCTCCTACCGCAACAGCCATTCTCTTGGTTCCTCTATGGAAGCTTT
TGCACCTCATAGCTACTCCTGCTACAGCTCCTGCTATGCTTGGAGGCATTTTGTTTGGCT
ATGTGATGTATGATTGTACTCATTTCTA

QA 1 208 1 208
DS 

RD RR2CA75TF 536 0 0
CGCTTCACTGTCGATTTGGATAAGCCACTTGTCTTTCAGGTTGGTCATCTTGGGGAAGAA
TATCAGGA*TGGATTCATCAACCTATTGTATGCGTAGAGGGTCCTCGTTTTTTCCAGAGT
GATTTTTGGGAGCTCTTGACTCGCACGGTTTGGTGGGCTATCCCAACAATCTGGCTTCCA
GTTGTCTGCTACGTTCTTTCAATCTCCGCGGCGAGGGGACTGACATTTCCCCAGATCGGT
TTAATTGTTGCATTTGGCGTATTCACCTGGACATTGCTCGAGTACACACTTCATCGTTTC
CTTTTCCACATAGAAACCAAGAGCTACTGGGCAAACACTGCACACTATCTTCTTCATGGA
TGCCATCACAAGCACCCACAAGACGGTCTTCGTCTTGTTTTCCCTCCTACCGCAACAGCC
ATTCTCTTGGTTCCTCTATGGAAGCTTCTGCACCTCATAGCTACTCCTGCTACAGCTCCT
GCTATGCTTGGAGGCATTTTGTTTGGCTATGTGATGTATGATTGTACTCATTTCTA

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2BG03TF 829 0 0
GGGTTGCTCTGTTGTTGTTGTTGTTCCTTCCCCCTCATTGGAGAGAAGCAAGCGAGTCTC
TTACAATCCCAGAGAGAGAGAGAGAGACGCGTTTGTTCTTCCTCTAAGCCAAGAGTCTCG
GTTGGGTGGCAAAGATGGTCGCAGAACGCTTCACTGTCGATTTGGATAAGCCACTTGTCT
TTCAGGTTGGTCATCTTGGGGAAGAATATCAGGAATGGATTCATCAACCTATTGTATGCG
TAGAGGGTCCTCGTTTTTTCCAGAGTGATTTTTGGGAGTTCTTGACTCGCACTGTTTGGT
GGGCAATCCCAACAATCTGGCTTCCAGTTGTCTGCTACGTTCTTTCAATCTCCGCGGCGA
GGGGACTGACATTTCCCCAGATGGGTTTAATTGTTGCATTTGGCGTATTCACCTGGACAC
TTCTCGAGTACACACTTCATCGTTTCCTTTTCCACATAGAAACCAAGAGCTACTGGGCAA
ACACTGCACACTATCTTCTTCATGGATGCCATCACAAGCACCCACAAGACGGTCTTCGTC
TTGTTTTCCCTCCTACCGCAACAGCCATCCTCTTGGTTCCACTATGGAAGCTTCTGCACC
TCATAGCTACTCCTGCTACAGCTCCTGCTATGCTTGGAGGCATTTTGTTTGGCTATGTGA
TGTATGATTGTACTCATTTCTATCTACACCACGGTCAACCTAAAGAACCAACCTTCAAGC
ATCTCAAGAAATACCATCTGAACCATCACTTCAGAATCCAGGACAAAGGATATGGAATCA
CTTTCTCTCTGGGATAGAGTCTTTGGAACACTTCCCGGTACGAA
GCTGC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2BG03JQ 787 0 0
CCAGAGTGATTTTTGGGAGTTCTTGACTCGCACTGTTTGGTGGGCAATCCCAACAATCTG
GCTTCCAGTTGTCTGCTACGTTCTTTCAATCTCCGCGGCGAGGGGACTGACATTTCCCCA
GATGGGTTTAATTGTTGCATTTGGCGTATTCACCTGGACACTTCTCGAGTACACACTTCA
TCGTTTCCTTTTCCACATAGAAACCAAGAGCTACTGGGCAAACACTGCACACTATCTTCT
TCATGGATGCCATCACAAGCACCCACAAGACGGTTTTCGTCTTGTTTTCCCTCCTACCGC
AACAGCCATCCTCTTGGTTCCACTATGGAAGCTTCTGCACCTCATAGCTACTCCTGCTAC
AGCTCCTGCTATGCTTGGAGGCATTTTGTTTGGCTATGTGATGTATGATTGTACTCATTT
CTATCTACACCACGGTCAACCTAAAGAACCAACCTTCAAGCATCTCAAGAAATACCATCT
GAACCATCACTTCAGAATCCAGGACAAAGGATATGGAATCACTTTCTCTCTGGGATAGAG
TCTTTGGAACACTTCCCGGTACGAAAGCTGCTCAGAAGAAGCTTTAAACCGGATATCGAT
TTGCCATTTTCTGATTCATCATGTGATTCAATGACACTGTTTAACTGATGTTGTATACGA
TCTGTCACCATATTTTGAACATATCTAGTGGTGTGTGAACCGGTTTTATGGTGTGGTCAT
AGAAAATTAAAATCAAACTGGTTTATTTGCTATTCAATTTGGTCTTTTAATCGACTGTTA
TTTGGGT

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 3

CO CL2532Contig1 1382 3 17 U
GGATTGATCGAGTTTCTTCGAGAAGAACGTACCGTAAAATGGCTATGTCTATGGATCGGA
TCGTCGTCTCTCCTTCACCTTACGTCTATCGTCCTAGTCAAGCTCGAGGATCCAGATCTT
CCATAGTCTCCATGGCTTCTACGATCCGCTCCGCTTCTACAGAGGTTACGAATGGAAGGA
AACTCTACATCCCTCCACGTGAGGTGCACGTGCAAGTGAAACACTCCATGCCACCACAGA
AGCTGGAGATCTAAGTCCCTAGAAGGATGGGCCGACCAGACCCTCTTGACTTACTTAAAA
CCCGTTGAGAAATCGTGGCAGCCTACCGATTTTCTCCCCGAAGCTGAGTCTGAAGGGTTC
TATGAACAAGTCAAGGAGCTGAGGGAACGGTGTAAGGAGCTTCCGGATGAATATTTCGTG
GTGCTTGTCGGTGATATGATCACTGAAGAAGCGCTCCCGACTTACCAGACCATGTTGAAC
ACCTTGGATGGTGTTAGGGATGAGACGGGAGCTAGTCCTACTCCTTGGGCGGTGTGGACT
AGGGCTTGGACTGCTGAAGAGAATAGGCATGGGGATTTACTTAATAAGTATCTTTATTTG
TCTGGGAGAGTTGACATGAGGCAGATTGAAAAGACTATTCAGTACCTCATTGGCTCTGGA
ATGGATCCAAAAACTGAGAACAACCCTTACTTGGGCTTCATCTACACTTCCTTCCAAGAA
AGAGCCACCTTCATCTCCCACGGAAACACTGCTAGACACGCGAAAGATCTTGGAGATTTG
AAACTTGCACAGATATGCGGGACCATTGCTGCTGACGAGAAGCGGCGCGAGACTGCTTAC
ACCAAGATTGTCGAGAAGCTCTTTGAGATTGACGCTGATGGCACGATCTTGGGATTGGCT
GATATGATGAAGAAAAAGATCTCCATGCCTGCGCATTTGATGTATGATGGCCAAGATGAT
AACCTGTTTGAGCACTTCTCAACTGTTGCCCAGAGGCTTGGTGTTTACACTGCCAAGGAC
TATGCTGATATTCTGGAGTTTCTTGTCGAACGGTGGAACGTTGAGACTTTGTCAGGGCTT
TCTAGTGAAGGAAATAGGGCACAGGACTTTGTTTGCGGATTACCTGCAAGAATCCGCAAA
ATTGAAGAGAGAGCTCAAGGAAGAGCCAAAGAAGCAGCCAAAAACGTACCATTCAGCTGG
ATCTTTGGTCGAGAGATTAGGGCTTAAAGTAAAACAGTTGTCTTTCAAATTATCCCCAAC
CCAAAGTAAGCCAATAAATTTCTTCACCTATGAAGAAGCCACTTTTAAGACCACGAAAGT
TCATTTGAAGATGTTTTGTTTTACACGGAACGTTGTAGATAAAGTCATGCTGTTTTGAGT
GG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2F303TF U 1
AF RR2AT86TF U 261
AF RR2AT86JQ C 650
BS 1 293 RR2F303TF
BS 294 294 RR2AT86TF
BS 295 311 RR2F303TF
BS 312 312 RR2AT86TF
BS 313 410 RR2F303TF
BS 411 411 RR2AT86TF
BS 412 608 RR2F303TF
BS 609 609 RR2AT86TF
BS 610 670 RR2F303TF
BS 671 672 RR2AT86TF
BS 673 695 RR2F303TF
BS 696 696 RR2AT86TF
BS 697 735 RR2F303TF
BS 736 1076 RR2AT86TF
BS 1077 1077 RR2AT86JQ
BS 1078 1087 RR2AT86TF
BS 1088 1382 RR2AT86JQ

RD RR2F303TF 735 0 0
GGATTGATCGAGTTTCTTCGAGAAGAACGTACCGTAAAATGGCTATGTCTATGGATCGGA
TCGTCGTCTCTCCTTCACCTTACGTCTATCGTCCTAGTCAAGCTCGAGGATCCAGATCTT
CCATAGTCTCCATGGCTTCTACGATCCGCTCCGCTTCTACAGAGGTTACGAATGGAAGGA
AACTCTACATCCCTCCACGTGAGGTGCACGTGCAAGTGAAACACTCCATGCCACCACAGA
AGCTGGAGATCTAAGTCCCTAGAAGGATGGGCCGACCAGACCCTCTTGACTTATTTAAAA
CCCGTTGAGAAGTCGTGGCAGCCTACCGATTTTCTCCCCGAAGCTGAGTCTGAAGGGTTC
TATGAACAAGTCAAGGAGCTGAGGGAACGGTGTAAGGAGCTTCCGGATGAGTATTTCGTG
GTGCTTGTCGGTGATATGATCACTGAAGAAGCGCTCCCGACTTACCAGACCATGTTGAAC
ACCTTGGATGGTGTTAGGGATGAGACGGGAGCTAGTCCTACTCCTTGGGCGGTGTGGACT
AGGGCTTGGACTGCTGAAGAGAATAGGCATGGGGATTTACTTAATAAGTATCTTTATTTG
TCTGGGAGGGTTGACATGAGGCAGATTGAAAAGACTATTCAGTACCTCATTGGCTCTGGA
ATGGATCCAAGGACTGAGAACAACCCTTACTTGGGTTTCATCTACACTTCCTTCCAAGAA
AGAGCCACCTTCATC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2AT86TF 827 0 0
G
GAAGGATGGGCCGACCAGACCCTCTTGACTTACTTAAAACCCGTTGAGAAATCGTGGCAG
CCTACCGATTTTCTCCCCGAAGCTGAGTCTGAAGGGTTCTATGAACAAGTCAAGGAGCTG
AGGGAACGGTGTAAGGAGCTTCCGGATGAATATTTTGTTGTGCTTGTTGGTGATATGATC
ACTGAAGAAGCGCTTCCGACTTACCAGACCATGTTGAACACCTTGGATGGTGTTAGGGAT
GAGACGGGAGCTAGTCCTACTCCTTGGGCGGTTTGGACTAGGGCTTGGACTGCTGAAGAG
AATAGGCATGGGGATTTGCTTAATAAGTATCTTTATTTGTCTGGGAGAGTTGACATGAGG
CAGATTGAAAAGACTATTCAGTACCTTATTGGCTCTGGAATGGATCCAAAAACTGAGAAC
AACCCTTACTTGGGCTTCATCTACACTTCCTTCCAAGAAAGAGCCACCTTCATCTCCCAC
GGAAACACTGCTAGACACGCGAAAGATCTTGGAGATTTGAAACTTGCACAGATATGCGGG
ACCATTGCTGCTGACGAGAAGCGGCGCGAGACTGCTTACACCAAGATTGTCGAGAAGCTC
TTTGAGATTGACGCTGATGGCACGATCTTGGGATTGGCTGATATGATGAAGAAAAAGATC
TCCATGCCTGCGCATTTGATGTATGATGGCCAAGATGATAACCTGTTTGAGCACTTCTCA
ACTGTTGCCCAGAGGCTTGGTGTTTACACTGCCAAGGACTATGCTGATATTCTGGAGTTT
CTTGTCGAACGGTGGAACGTTGAGACTTTGTCAGG*CTTTCTAGTG

QA 2 827 2 827
DS 

RD RR2AT86JQ 733 0 0
TTGGCTCTGGAATGGATCCAAAAACTGAGAACAACCCTTACTTGGGCTTCATCTACACTT
CCTTCCAAGAAAGAGCCACCTTCATCTCCCACGGAAACACTGCTAGACACGCGAAAGATC
TTGGAGATTTGAAACTTGCACAGATATGCGGGACCATTGCTGCTGACGAGAAGCGGCGCG
AGACTGCTTACACCAAGATTGTCGAGAAGCTCTTTGAGATTGACGCTGATGGCACGATCT
TGGGATTGGCTGATATGATGAAGAAAAAGATCTCCATGCCTGCGCATTTGATGTATGATG
GCCAAGATGATAACCTGTTTGAGCACTTCTCAACTGTTGCCCAGAGGCTTGGTGTTTACA
CTGCCAAGGACTATGCTGATATTCTGGAGTTTCTTGTCGAACGGTGGAACGTTGAGACTT
TGTCAGGGCTTTCTAGTGAAGGAAATAGGGCACAGGACTTTGTTTGCGGATTACCTGCAA
GAATCCGCAAAATTGAAGAGAGAGCTCAAGGAAGAGCCAAAGAAGCAGCCAAAAACGTAC
CATTCAGCTGGATCTTTGGTCGAGAGATTAGGGCTTAAAGTAAAACAGTTGTCTTTCAAA
TTATCCCCAACCCAAAGTAAGCCAATAAATTTCTTCACCTATGAAGAAGCCACTTTTAAG
ACCACGAAAGTTCATTTGAAGATGTTTTGTTTTACACGGAACGTTGTAGATAAAGTCATG
CTGTTTTGAGTGG

QA 1 733 1 733
DS 



AS 2 4

CO CL2533Contig1 646 2 5 U
AAGTGATATCTCAATTCATAAAAGTTTAGATAAACGAAAAGCAAAAGAAAGTAAACATAA
CATCGCAACAAAAGAAAACAGAAGAGCATATAGATATGCATTTTTAGTAGTAACATCTCT
CAGAAGAATGCAAAAGCTAATTAATTGGAGGATTTAACAACAAAAACAAAGCTGAAATGA
GTTTTCACTTGGTGTACAACACATCTTCCCATGGGTGACGGTACAGTGGCTGCTTCAACC
TCTTCTGATCAAATGTGTGCCCAATCAGACCAATGGAGCGAGCAAGCACAAAGAGACCGT
TGAGGTAACCGATCTGAACAATCTCATCGATCTCTTGCTTAGTGAACATCCCACTTCCAG
CTAGAAGGTCCAAGAAGAGAGACCCAATGGCTCCATCAACGTTGAGTACGAGGTTGTTGG
CCTTTGAGAGCGTGTAGCTCTCCACAGTTACTGCGTACTCCATGTACTTCACTGATGGGA
AGTTAGACCTAGCAAATTTCTGGAGCAGCTCCACTCTCTTGTCTCTGTTGTCTCTGCTCT
TGATCCTGTGTCCAATCCCAGGGACTCTGATTCCCTTCTTCTTCATTCCCTCAACGAACT
CATAAGGTGTGAGGTTCCTGTCACAAGCGTCCTTGAAGTATCTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM94JQ U 125
AF RR2EM94TF C 1
BS 1 124 RR2EM94TF
BS 125 210 RR2EM94JQ
BS 211 211 RR2EM94TF
BS 212 244 RR2EM94JQ
BS 245 646 RR2EM94TF

RD RR2EM94JQ 120 0 0
AGAATGCAAAAGCTAATTAATTGGAGGATTTAACAACAAAAACAAAGCTGAAATGAGTTT
TCACTTGGTGTACAACACATCTTCCCCTGGGTGACGGTACAGTGGCTGCTTCAACCTCTT

QA 1 120 1 120
DS 

RD RR2EM94TF 646 0 0
AAGTGATATCTCAATTCATAAAAGTTTAGATAAACGAAAAGCAAAAGAAAGTAAACATAA
CATCGCAACAAAAGAAAACAGAAGAGCATATAGATATGCATTTTTAGTAGTAACATCTCT
CAGAAGAATGCAAAAGCTAATTAATTGGAGGATTTAACAACAAAAACAAAGCTGAGATGA
GTTTTCACTTGGTGTACAACACATCTTCCCATGGGTGACGGTACAGTGGCTGCTTCAACC
TCTTCTGATCAAATGTGTGCCCAATCAGACCAATGGAGCGAGCAAGCACAAAGAGACCGT
TGAGGTAACCGATCTGAACAATCTCATCGATCTCTTGCTTAGTGAACATCCCACTTCCAG
CTAGAAGGTCCAAGAAGAGAGACCCAATGGCTCCATCAACGTTGAGTACGAGGTTGTTGG
CCTTTGAGAGCGTGTAGCTCTCCACAGTTACTGCGTACTCCATGTACTTCACTGATGGGA
AGTTAGACCTAGCAAATTTCTGGAGCAGCTCCACTCTCTTGTCTCTGTTGTCTCTGCTCT
TGATCCTGTGTCCAATCCCAGGGACTCTGATTCCCTTCTTCTTCATTCCCTCAACGAACT
CATAAGGTGTGAGGTTCCTGTCACAAGCGTCCTTGAAGTATCTAGC

QA 1 646 1 646
DS 



CO CL2533Contig2 561 2 3 U
GGGACACAGGATCAGGAGCAGAGACAACAGAGACAAGAGAGTGGAGCTGCTCCAGAAATT
TGCTAGGTCTAACTTCCCATCAGTGAAGTACATGGCGTACGCAGTAACAGTGGAGAGCTA
CACGCTCTCAAAGGCCAACAACCTTGTACTCAACGTTGATGGAGCCATTGGTTCTCTCTT
CTTGGACCTTATAGCTGGAAGTGGGATGTTTACTAAGCAAGAGATTGATGAGATTGTTCA
GATCGGTTACCTCAACGGTCTCTTTGTTCTTGCTCGTTCCATTGGTCTGATTGGGCACAC
CTTTGATCAGAAGAGGTTGAAGCAGCCATTGTACCATCACCCATGGGAAGATGTGTTGTA
CACCAAGTGAAAAACTCATCTCAGCTTTGTTTTGGTTGTTAAATTCCTCCGATTAATTAG
CTTTTGCATTCTTATGAGAGATGTTACTACCAAAAATGCATATCTATCTATGCTCTTCTG
TTTCTTTTGTTGCGATGTTATGTTTACCTTCTTTTGCTTTTCATTTATCTAAACTTTTAT
CAATTGAGATATTCACTTGTT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER42JQ C 1
AF RR2ER42TF U 1
BS 1 1 RR2ER42JQ
BS 2 552 RR2ER42TF
BS 553 561 RR2ER42JQ

RD RR2ER42JQ 561 0 0
GGGACACAGGATCAGGAGCAGAGACAACAGAGACAAGAGAGTGGAGCTGCTCCAGAAATT
TGCTAGGTCTAACTTCCCATCAGTGAAGTACATGGCGTACGCAGTAACAGTGGAGAGCTA
CACGCTCTCAAAGGCCAACAACCTTGTACTCAACGTTGATGGAGCCATTGGTTCTCTCTT
CTTGGACCTTATAGCTGGAAGTGGGATGTTTACTAAGCAAGAGATTGATGAGATTGTTCA
GATCGGTTACCTCAACGGTCTCTTTGTTCTTGCTCGTTCCATTGGTCTGATTGGGCACAC
CTTTGATCAGAAGAGGTTGAAGCAGCCATTGTACCATCACCCATGGGAAGATGTGTTGTA
CACCAAGTGAAAAACTCATCTCAGCTTTGTTTTGGTTGTTAAATTCCTCCGATTAATTAG
CTTTTGCATTCTTATGAGAGATGTTACTACCAAAAATGCATATCTATCTATGCTCTTCTG
TTTCTTTTGTTGCGATGTTATGTTTACCTTCTTTTGCTTTTCATTTATCTAAACTTTTAT
CAATTGAGATATTCACTTGTT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2ER42TF 561 0 0
G
GGACACAGGATCAGGAGCAGAGACAACAGAGACAAGAGAGTGGAGCTGCTCCAGAAATTT
GCTAGGTCTAACTTCCCATCAGTGAAGTACATGGCGTACGCAGTAACAGTGGAGAGCTAC
ACGCTCTCAAAGGCCAACAACCTTGTACTCAACGTTGATGGAGCCATTGGTTCTCTCTTC
TTGGACCTTATAGCTGGAAGTGGGATGTTTACTAAGCAAGAGATTGATGAGATTGTTCAG
ATCGGTTACCTCAACGGTCTCTTTGTTCTTGCTCGTTCCATTGGTCTGATTGGGCACACC
TTTGATCAGAAGAGGTTGAAGCAGCCATTGTACCATCACCCATGGGAAGATGTGTTGTAC
ACCAAGTGAAAAACTCATCTCAGCTTTGTTTTGGTTGTTAAATTCCTCCGATTAATTAGC
TTTTGCATTCTTATGAGAGATGTTACTACCAAAAATGCATATCTATCTATGCTCTTCTGT
TTCTTTTGTTGCGATGTTATGTTTACCTTCTTTTGCTTTTCATTTATCTAAACTTTTATC
AATTGAGATAT
TCACTTGTT

QA 2 552 2 552
DS 



AS 1 4

CO CL2534Contig1 847 4 15 U
GGCCGATCGTCTTTACCTTTTGATCCTCCTTCTCCGCTAGGTTTCTCTCAAACGAACAGA
TCCTCCATTCGTCTCAAAGTTACCTTGTGCGATGAAGACAGCTAAGGGGAAAGGTAAAGC
TAAGACCACTAAGGAAGCCTCGAAGCCAGTTGATGACAGAAAGGTGGGGAAGAGGAAGGC
ACCGGCTGAGAAGCCTAGCAAGAGGGAGACTCGTAAAGAGAAGAAGGCCAAGAAGGACCC
TAACAAACCCAAGAGAGCTCCTAGTGCCTTCTTTGTCTTCTTAGAAGATTTTAGGCAAAC
GTTCAAGAAAGAGAATCCAGATGTGAAGGCTGTCTCTGCTGTTGGGAAAGCAGGAGGACA
GAAATGGAAGTCAATGTCTCAGGCTGAAAAAGCTCCATATGAAGAGAAAGCTGCAAAGAG
GAAAGCTGAATACGAAAAGCTTATGGATGCATACAACAAAAGCATGGAGGAAGGGAGTGA
TGAATCTGAAAATTCTTTATCAGAAGTAAATGATGAAGATGAAGCTAGTGAAGAGGAAGA
GAAGGTAAAGAAGGGAAAGGCAGGTGAGGATGACGATGACGATGATGATGAAGATGACGA
TGATGAAGATGAAGAGGACGAGGAAGAAGACTAAACTGGAGATAGAGATCAGAGTTTGGA
TCTCGAGGATAACTACAGGTTCAGAAGGCAGAAGTAAGTATATTTTGTATTTTGTGTGTT
GACAACTATAGATCGAAATGG*TGTGTTGTGCTCTCCTTTTCTTTTCTTTTCCTAAGAAA
GCCAAACAGTTTCTTAGCGGTTCATGTAAGTTTATTTCATCTTTCTATCCACAACGTACA
CTGTACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 

AF RR2BB39JQ C 1
AF RR2AG11JQ C 126
AF RR2AG11TF U 37
AF RR2BB39TF U 1
BS 1 27 RR2BB39TF
BS 28 28 RR2BB39JQ
BS 29 38 RR2BB39TF
BS 39 507 RR2AG11TF
BS 508 508 RR2BB39TF
BS 509 573 RR2AG11TF
BS 574 576 RR2BB39TF
BS 577 606 RR2AG11TF
BS 607 609 RR2BB39TF
BS 610 615 RR2AG11TF
BS 616 616 RR2BB39TF
BS 617 761 RR2AG11TF
BS 762 762 RR2BB39TF
BS 763 846 RR2AG11TF
BS 847 847 RR2BB39JQ

RD RR2BB39JQ 847 0 0
GGCCGATCGTCTTTAC*TTTTGATCTTCTTTCTCCGCTAGGTTTCTCTCAAACGAACAGA
TCCTCCATTCGTCTCAAAGTTACCTTGTGCGATGAAGACAGCTAAGGGGAAAGGTAAAGC
TAAGACCACTAAGGAAGCCTTGAAGCCAGTTGATGACAGAAAGGTGGGGAAGAGGAAGGC
ACCGGCTGAGAAGCCTAGCAAGAGGGAGACTCGTAAAGAGAAGAAGGCCAAGAAGGACCC
TAACAAACCCAAGAGAGCTCCTAGTGCCTTCTTTGTCTTCTTAGAAGATTTTAGGCAAAC
GTTCAAGAAAGAGAATCCAGATGTGAAGGCTGTTTCTGCTGTTGGGAAAGCAGGAGGACA
GAAATGGAAGTCAATGTCTCAGGCTGAAAAAGCTCCATATGAAGAGAAAGCTGCAAAGAG
GAAAGCTGAATACGAAAAGCTTATGGATGCATACAACAAAAGCATGGAGGAAGGGAGTGA
TGAATCTGAAAATTCTTTATCAGAAGTAAATGATGAAGATGAAGCTAGTGAAGAGGAAGA
GAAGGTAAAGAAGGGAAAGGCAGGTGAGGATGACGATGATGATGATGATGAAGATGACGA
TGATGAAGATGACGAGGACGAGGAAGAAGACTAAACTGGAGATAGAGATCAGAGTTTGGA
TCTCGAGGATAACTACAGGTTCAGAAGGCAGAAGTAAGTATATTTTGTATTTTGTGTGTT
GACAACTATAGATCGAAATGG*TGTGTTGTGCTTTT*TTTTCTTTTCTTTTCCTAAGAAA
GCCAAACAGTTTCTTAGCGGTTCATGTAAGTTTATTTCATCTTTCTATCCACAACGTACA
CTGTACC

QA 1 847 1 847
DS 

RD RR2AG11JQ 721 0 0
CCACTAAGGAAGCCTCGAAGCCAGTTGATGACAGAAAGGTGGGGAAGAGGAAGGCACCGG
CTGAGAAGCCTAGCAAGAGGGAGACTCGTAAAGAGAAGAAGGCCAAGAAGGACCCTAACA
AACCCAAGAGAGCTCCTAGTGCCTTCTTTGTCTTCTTAGAAGATTTTAGGCAAACGTTCA
AGAAAGAGAATCCAGATGTGAAGGCTGTCTCTGCTGTTGGGAAAGCAGGAGGACAGAAAT
GGAAGTCAATGTCTCAGGCTGAAAAAGCTCCATATGAAGAGAAAGCTGCAAAGAGGAAAG
CTGAATACGAAAAGCTTATGGATGCATACAACAAAAGCATGGAGGAAGGGAGTGATGAAT
CTGAAAATTCTTTATCAGAAGTGAATGATGAAGATGAAGCTAGTGAAGAGGAAGAGAAGG
TAAAGAAGGGAAAGGCAGGTGAGGATGA***TGACGATGATGATGAAGATGACGATGATG
A***TGAAGATGACGAGGAAGAAGACTAAACTGGAGATAGAGATCAGAGTTTGGATCTCG
AGGATAACTACAGGTTCAGAAGGCAGAAGTAAGTATATTTTGTATTTTGTGTGTTGACAA
CTATAGATCGAAATGG*TGTGTTGTGCTCTCCTTTTTTTTTCTTTTCCTAAGAAAGCCAA
ACAGTTTCTTAGCGGTTCATGTAAGTTTATTTCATCTTTCTATCCACAACGTACACTGTA
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2AG11TF 810 0 0
GG
AGGTTTCTCTCAAACGAACAGATCCTCCATTCGTCTCAAAGTTACCTTGTGCGATGAAGA
CAGCTAAGGGGAAAGGTAAAGCTAAGACCACTAAGGAAGCCTCGAAGCCAGTTGATGACA
GAAAGGTGGGGAAGAGGAAGGCACCGGCTGAGAAGCCTAGCAAGAGGGAGACTCGTAAAG
AGAAGAAGGCCAAGAAGGACCCTAACAAACCCAAGAGAGCTCCTAGTGCCTTCTTTGTCT
TCTTAGAAGATTTTAGGCAAACGTTCAAGAAAGAGAATCCAGATGTGAAGGCTGTCTCTG
CTGTTGGGAAAGCAGGAGGACAGAAATGGAAGTCAATGTCTCAGGCTGAAAAAGCTCCAT
ATGAAGAGAAAGCTGCAAAGAGGAAAGCTGAATACGAAAAGCTTATGGATGCATACAACA
AAAGCATGGAGGAAGGGAGTGATGAATCTGAAAATTCTTTATCAGAAGTGAATGATGAAG
ATGAAGCTAGTGAAGAGGAAGAGAAGGTAAAGAAGGGAAAGGCAGGTGAGGATGA***TG
ACGATGATGATGAAGATGACGATGATGA***TGAAGATGACGAGGAAGAAGACTAAACTG
GAGATAGAGATCAGAGTTTGGATCTCGAGGATAACTACAGGTTCAGAAGGCAGAAGTAAG
TATATTTTGTATTTTGTGTGTTGACAACTATAGATCGAAATGG*TGTGTTGTGCTCTCCT
TTTTTTTTCTTTTCCTAAGAAAGCCAAACAGTTTCTTAGCGGTTCATGTAAGTTTATTTC
ATCTTTCTATCCACAACGTACACTGTAC

QA 3 810 3 810
DS 

RD RR2BB39TF 847 0 0
GGCCGATCGTCTTTACCTTTTGATCCTTCTTCTCCGCTAGGTTTCTCTCAAACGAACAGA
TCCTCCATTCGTCTCAAAGTTACCTTGTGCGATGAAGACAGCTAAGGGGAAAGGTAAAGC
TAAGACCACTAAGGAAGCCTTGAAGCCAGTTGATGACAGAAAGGTGGGGAAGAGGAAGGC
ACCGGCTGAGAAGCCTAGCAAGAGGGAGACTCGTAAAGAGAAGAAGGCCAAGAAGGACCC
TAACAAACCCAAGAGAGCTCCTAGTGCCTTCTTTGTCTTCTTAGAAGATTTTAGGCAAAC
GTTCAAGAAAGAGAATCCAGATGTGAAGGCTGTCTCTGCTGTTGGGAAAGCAGGAGGACA
GAAATGGAAGTCAATGTCTCAGGCTGAAAAAGCTCCATATGAAGAGAAAGCTGCAAAGAG
GAAAGCTGAATACGAAAAGCTTATGGATGCATACAACAAAAGCATGGAGGAAGGGAGTGA
TGAATCTGAAAATTCTTTATCAGAAGTAAATGATGAAGATGAAGCTAGTGAAGAGGAAGA
GAAGGTAAAGAAGGGAAAGGCAGGTGAGGATGACGATGATGATGATGATGAAGATGACGA
TGATGAAGATGACGAGGACGAGGAAGAAGACTAAACTGGAGATAGAGATCAGAGTTTGGA
TCTCGAGGATAACTACAGGTTCAGAAAGCAGAAGTAAGTATATTTTGTATTTTGTGTGTT
GACAACTATAGATCGAAATGGGTGTGTTGTGCTTTT*TTTTCTTTTCTTTTCCTAAGAAA
GCCAAACAGTTTCTTAGCGGTTCATGTAAGTTTATTTCATCTTTCTATCCACAACGTACA
CTGTAC
C

QA 1 846 1 846
DS 



AS 1 4

CO CL2535Contig1 601 4 18 U
GGAGAGCTTCAGCGATCTTCTTCCTCCTCTGGTTTCGTATCTAAATCTTGCAGTGATTTG
GGGAAAGAGATGGGTTTCATAATGGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGATGGAG
GATCCGGAGGTGAGAGACAGGAAAGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAGGTGC
AAGAAGATTAAGGAGATGTGGGCTTTGCCTATTCGTCCTTATGGTTTCTGGACGTTTGAG
CGTCACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAGGGAC
CCTTATGATGATCTCCTCCAGGACCATCCTTCTTCTTCATCTTCAAACTGATCCAACAGT
GAACGAAGACATCTTATGATACTGTCTGGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTT
TGTTCTTCAGGTGCCTGGAAGCTTGGTACAAACTCAAATAATAACACTCTTGAAGACTTG
TTTTGAGAGAGTGCTCATTGTTTCTTAGTAAAGCTGTTTTGATTCTCTATTTGCATCTTT
GATGTGAATATACTTTTCTGAAATGTGATAATTTTTTTAATGTTTAAAAAAGTTGGTTGC
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
10 

AF RR2GN53JQ C 19
AF RR2GN53TF U 8
AF RR2DO04TF U 1
AF RR2DO04JQ C 1
BS 1 9 RR2DO04JQ
BS 10 44 RR2GN53TF
BS 45 45 RR2DO04TF
BS 46 48 RR2GN53TF
BS 49 54 RR2DO04TF
BS 55 143 RR2GN53TF
BS 144 144 RR2DO04TF
BS 145 338 RR2GN53TF
BS 339 339 RR2DO04TF
BS 340 353 RR2GN53TF
BS 354 354 RR2DO04TF
BS 355 496 RR2GN53TF
BS 497 497 RR2DO04TF
BS 498 578 RR2GN53TF
BS 579 585 RR2DO04TF
BS 586 586 RR2DO04JQ
BS 587 598 RR2DO04TF
BS 599 601 RR2DO04JQ

RD RR2GN53JQ 582 0 0
TCTTCCTCCTCTGGTTTCGTATCTAA*TCT******GATTTGGGGAAAGAGATGGGTTTC
ATAATGGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGATGGAGGATCCGGAGGTGAGAGAC
AGGAAGGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAGGTGCAAGAAGATTAAGGAGATG
TGGGCTTTGCCTATTCGTCCTTATGGTTTCTGGACGTTTGAGCGTCACAACGCTCAGCTT
CGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAGGGACCCTTATGATGATCTCCTC
CAGGACCATCCTTCTTCTTTTTCTTCAAACTGATCGAACAGTGAACGAAGACATCTTATG
ATACTGTCTGGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTTTGTTCTTCAGGTGCCTGG
AAGCTTGGTACAAACTCAAATAATAACACTCTTGAAGACTTGTTTTGAGAGAGTGCTCGT
TGTTTCTTAGTAAAGCTGTTTTGATTCTCTATTTGCATCTTTGATGTGAATATACTTTTC
TGAAATGTGATAATTTTTTTAATGTTTTAAAAAGTTGGTT
AC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2GN53TF 585 0 0
GG
CAGCGATCTTCTTCCTCCTCTGGTTTCGTATCTAA*TCT******GATTTGGGGAAAGAG
ATGGGTTTCATAATGGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGATGGAGGATCCGGAG
GTGAGAGACAGGAAGGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAGGTGCAAGAAGATT
AAGGAGATGTGGGCTTTGCCTATTCGTCCTTATGGTTTCTGGACGTTTGAGCGTCACAAC
GCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAGGGACCCTTATGAT
GATCTCCTCCAGGACCATCCTTCTTCTTCTTCTTCAAACTGATCGAACAGTGAACGAAGA
CATCTTATGATACTGTCTGGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTTTGTTCTTCA
GGTGCCTGGAAGCTTGGTACAAACTCAAATAATAACACTCTTGAAGACTTGTTTTGAGAG
AGTGCTCGTTGTTTCTTAGTAAAGCTGTTTTGATTCTCTATTTGCATCTTTGATGTGAAT
ATACTTTTCTGAAATGTGATAATTTTTTT
TAATGTTTTAAAAA

QA 3 571 3 571
DS 

RD RR2DO04TF 601 0 0
GGAGAGCTT
CAGCGATCTTCTTCCTCCTCTGGTTTCGTATCTAAATCTTGCAGTGATTTGGGGAAAGAG
ATGGGTTTCATAATGGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGATGGAGGATCCGGAG
GTGAGAGACAGGAAAGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAGGTGCAAGAAGATT
AAGGAGATGTGGGCTTTGCCTATTCGTCCTTATGGTTTCTGGACTTTTGAGCGTCACAAC
GCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAGGGACCCTTATGAT
GATCTCCTCCAGGACCATCCTTCTTCTTCATCTTCAAACTGATCCAACAGTGAACGAAGA
CGTCTTATGATACTGTCTGGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTTTGTTCTTCA
GGTGCCTGGAAGCTTGGTACAAACTCAAATAATAAC**TCTTGAAGACTTGTTTTGAGAG
AGTGCTCATTGTTTCTTAGTAAAGCTGTTTTGATTCTCTATTTGCATCTTTGATGTGAAT
ATACTTTTCTGAAATGTGATAATTTTTTTAATGTTT*AAAAAGTTGGTT
GCT

QA 10 598 10 598
DS 

RD RR2DO04JQ 601 0 0
GGAGAGCTTCAGCGATCTTCTTCCTCCTCTGGTTTCGTATCTAAATCTTGCAGTGATTTG
GGGAAAGAGATGGGTTTCATAATGGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGATGGAG
GATCCGGAGGTGAGAGACAGGAAAGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAGGTGC
AAGAAGATTAAGGAGATGTGGGCTTTGCCTATTCGTCCTTATGGTTTCTGGACTTTTGAG
CGTCACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAGGGAC
CCTTATGATGATCTCCTCCAGGACCATCCTTCTTCTTCATCTTCAAACTGATCCAACAGT
GAACGAAGACGTCTTATGATACTGTCTGGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTT
TGTTCTTCAGGTGCCTGGAAGCTTGGTACAAACTCAAATAATAAC**TCTTGAAGACTTG
TTTTGAGAGAGTGCTCATTGTTTCTTAGTAAAGCTGTTTTGATTCTCTATTTGCATCTTT
GATGTGAATATACTTTTCTGAAATGTGATAATTTTTTTAATGTTTAAAAAAGTTGGTTGC
T

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 4

CO CL2536Contig1 1414 4 4 U
GGAAACGACAAGACATCTTAACATAAAATATAAAATAAAAAACGGCAACAAGTCTACAAC
TAAAAAAAAAAGCAGACAAGATCGGTGAATCATACAATTACTATGTACACAAACCAAAGA
ACCATTAGAATATATAAAACTTTCTGTATACAAAACTAAGGCTTACTTACTTTTTAGAAG
GCATTACTACTTGCAATCTTACATGAAAAAACAAACAAACGTAGAACTACCAGAAACAAG
AGAGAGAGCAAAGAGGGATGATGATGATAAACTGCGAATCTCACCTTTTGAAAACGATAA
GGACAGTGATTCGGAGGAAGGGAAAGGCACACCGTGTTAGCAAATCTGTTCTTGGTGAGA
ATAGTTGTTGTTGTTGTTGTAGTAGTCAAAAAGAACAAATCTGTACTGTTGAGGAAGATC
AGTTTTTTTTTCTTTCTACAGTTGTGGTGAAGTCAAGCTGCTTGTGATTGGTCTTAGTTG
TATTATGTGCGTCTTCATGCTACAATCCGTAACCTGCATAGCTGCTACTCTTGATAAGAA
GCCTTGACATCTTTCAAGCAAAACCTTTTCCTTTGCAGTTACATTCACCGCTTCCACCAT
TACAGAATTCATTTCATCAACCTTCAACGTAAGTGAGAATATGGAAGACGACATAGCTTG
CATTACATCGACCGCTGAACTAACAGCATGCTTAAGATCTTGGATATCAACCACGGTTTT
TCCAACAATTGGTAGACGAAGCGTGCTGGCTTTCAAAGCTTCGGTCGCTCCAGAGAA*GA
ACTTGAATGATCTCTGTCCATAAGAGACCATTCTTCTAGATATCCCATCTGTCCCCTGAG
AATAGAAGCCAGTTTCAGTTTCTGCCTTAGCAAAAGCAACTTGATTCGCTTTAACGTGAC
GCTGTGTCGCAGTTCTGAGATTGATACCCATGCATTCCACAGGTTTTTCTCTGCATTTAA
TCTTTGCACCATTAAAGTATACTCAGTCCTCGCATTGACAAACCGCCACTGCAGATAACG
GTTATACAGAAGCCTCAACAAATGCGCATCCATAACACGATCTTCCCCAATCTTCCCTCT
CCTTACATCAGCAGAGAAGCTAAGAATCGAAGGCGTGTTGATGTTGCGGTTGTAAGCGTT
CATCTGAGCAGAAACCTCATTCCTCACTCGAGAAGGGCTAGAAAGCGCTCTAGCTGGAGA
AGACGAAGTAGTCGTCGCCCAAAGCTTGCTCGGCGAAGCAGACCGTATAGCATCAGCAGA
AGCAACTCTCACAGGAGAGGCCATACCACGAGGAGACGATGAAGGAACAGCATCGCTACT
AGAGAATCTTTTAGAATGACCAAACTTCGATGATGACACATTAGTTTTCAAACCGGGGGA
AGAGGATAGAGGAGAGCCAGGATCCTGCAACCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D386JQ U 1
AF RR2AF93JQ U 107
AF RR2D386TF C 526
AF RR2AF93TF C 625
BS 1 635 RR2D386JQ
BS 636 868 RR2AF93JQ
BS 869 1195 RR2D386TF
BS 1196 1414 RR2AF93TF

RD RR2D386JQ 635 0 0
GGAAACGACAAGACATCTTAACATAAAATATAAAATAAAAAACGGCAACAAGTCTACAAC
TAAAAAAAAAAGCAGACAAGATCGGTGAATCATACAATTACTATGTACACAAACCAAAGA
ACCATTAGAATATATAAAACTTTCTGTATACAAAACTAAGGCTTACTTACTTTTTAGAAG
GCATTACTACTTGCAATCTTACATGAAAAAACAAACAAACGTAGAACTACCAGAAACAAG
AGAGAGAGCAAAGAGGGATGATGATGATAAACTGCGAATCTCACCTTTTGAAAACGATAA
GGACAGTGATTCGGAGGAAGGGAAAGGCACACCGTGTTAGCAAATCTGTTCTTGGTGAGA
ATAGTTGTTGTTGTTGTTGTAGTAGTCAAAAAGAACAAATCTGTACTGTTGAGGAAGATC
AGTTTTTTTTTCTTTCTACAGTTGTGGTGAAGTCAAGCTGCTTGTGATTGGTCTTAGTTG
TATTATGTGCGTCTTCATGCTACAATCCGTAACCTGCATAGCTGCTACTCTTGATAAGAA
GCCTTGACATCTTTCAAGCAAAACCTTTTCCTTTGCAGTTACATTCACCGCTTCCACCAT
TACAGAATTCATTTCATCAACCTTCAACGTAAGTG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2AF93JQ 762 0 0
ACACAAACCAAAGAACCATTAGAATATATAAAACTTTCTGTATACAAAACTAAGGCTTAC
TTACTTTTTAGAAGGCATTACTACTTGCAATCTTACATGAAAAAACAAACAAACGTAGAA
CTACCAGAAACAAGAGAGAGAGCAAAGAGGGATGATGATGATAAACTGCGAATCTCACCT
TTTGAAAACGATAAGGACAGTGATTCGGAGGAAGGGAAAGGCACACCGTGTTAGCAAATC
TGTTCTTGGTGAGAATAGTTGTTGTTGTTGTTGTAGTAGTCAAAAAGAACAAATCTGTTC
TGTTGAGGAAGATCAGTTTTTTTTTCTTTCTACAGTTGTGGTGAAGTCAAGCTGCTTGTG
ATTGGTCTTAGTTGTATTATGTGCGTCTTCATGCTACAATCCGTAACCTGCATAGCTGCT
ACTCTTGATAAGAAGCCTTGACATCTTTCAAGCAAAACCTTTTCCTTTGCAGTTACATTC
ACCGCTTCCACCATTACAGAATTCATTTCATCAACCTTCAACGTAAGTGAGAATATGGAA
GACGACATAGCTTGCATTACATCGACCGCTGAACTAACAGCATGCTTAAGATCTTGGATA
TCAACCACGGTTTTTCCAACAATTGGTAGACGAAGCGTGCTGGCTTTCAAAGCTTCGGTC
GCTCCAGAGAA*GAACTTGAATGATCTCTGTCCATAAGAGACCATTCTTCTAGATATCCC
ATCTGTCCCCTGAGAATAGAAGCCAGTTTCAGTTTCTGCCTT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2D386TF 673 0 0
TACTCTTGATAAGAAGCCTTGACATCTTTCAAGCAAAACCTTTTCCTTTGCAGTTACATT
CACCGCTTCCACCATTACAGAATTCATTTCATCAACCTTCAACGTAAGTGAGAATATGGA
AGACGACATAGCTTGCATTACATCGACCGCTGAACTAACAGCATGCTTAAGATCTTGGAT
ATCAACCACGGTTTTTCCAACAATTGGTAG*CGAAGCGTGCTGGCTTTCAAAGCTTCGGT
CGCTCCAGACAAAGAACTTGAATGATCTCTGTCCATAAGAGACCATTCTTCTAGATATCC
CATCTGTCCCCTGAGAATAGAAGCCAGTTTCAGTTTCTGCCTTAGCAAAAGCAACTTGAT
TCGCTTTAACGTGACGCTGTGTCGCAGTTCTGAGATTGATACCCATGCATTCCACAGGTT
TTTCTCTGCATTTAATCTTTGCACCATTAAAGTATACTCAGTCCTCGCATTGACAAACCG
CCACTGCAGATAACGGTTATACAGAAGCCTCAACAAATGCGCATCCATAACACGATCTTC
CCCAATCTTCCCTCTCCTTACATCAGCAGAGAAGCTAAGAATCGAAGGCGTGTTGATGTT
GCGGTTGTAAGCGTTCATCTGAGCAGAAACCTCATTCCTCACTCGAGAAGGGCTAGAAAG
CGCTCTAGCT
CCT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2AF93TF 790 0 0
CAACGTAAGTGAGAATATGGAAGACGACATAGCTTGCATTACATCGACCGCTGAACTAAC
AGCATGCTTAAGATCTTGGATATCAACCACGGTTTTTCCAACAATTGGTAGACGAAGCGT
GCTGGCTTTCAAAGCTTCGGTCGCTCCAGAGAA*GAACTTGAATGATCTCTGTCCATAAG
AGACCATTCTTCTAGATATCCCATCTGTCCCCTGAGAATAGAAGCCAGTTTCAGTTTCTG
CCTTAGCAAAAGCAACTTGATTCGCTTTAACGTGACGCTGTGTCGCAGTTCTGAGATTGA
TACCCATGCATTCCACAGGTTTTTCTCTGCATTTAATCTTTGCACCATTAAAGTATACTC
AGTCCTCGCATTGACAAACCGCCACTGCAGATAACGGTTATACAGAAGCCTCAACAAATG
CGCATCCATAACACGATCTTCCCCAATCTTCCCTCTCCTTACATCAGCAGAGAAGCTAAG
AATCGAAGGCGTGTTGATGTTGCGGTTGTAAGCGTTCATCTGAGCAGAAACCTCATTCCT
CACTCGAGAAGGGCTAGAAAGCGCTCTAGCTGGAGAAGACGAAGTAGTCGTCGCCCAAAG
CTTGCTCGGCGAAGCAGACCGTATAGCATCAGCAGAAGCAACTCTCACAGGAGAGGCCAT
ACCACGAGGAGACGATGAAGGAACAGCATCGCTACTAGAGAATCTTTTAGAATGACCAAA
CTTCGATGATGACACATTAGTTTTCAAACCGGGGGAAGAGGATAGAGGAGAGCCAGGATC
CTGCAACCGC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 2 4

CO CL2537Contig1 356 2 3 U
GAAGCACAAGCACAAGAAGGTGAAGCTCGCGGTGCTTCAGTTCTACAAGGTCGATGGATC
GGGCAAGGTGCAGAGGCTGAGGAAGGAGTGTCCTAACGCGACTTGCGGTGCTGGCACTTT
CATGGCGAGTCATTTTGATCGTCATTACTGTGGTAAGTGTGGGCTTACTTACGTTTACCA
GAAGGAGGGTGCCGAGGCTTGATCTCTCTTTTTTCTCTTTTCTCTATCTTTAAGAAATGG
TTTTTTTTTGGTAATTTCGTAAGCTTCTTGTAATGGATTCGATGTTGGACATGTTATTGT
TTCTGGATTTCTTATCTAGATTTCATGAAAGTTATTACATTTTGACTTATGTTGGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2B049JQ C 1
AF RR2B049TF U 1
BS 1 1 RR2B049JQ
BS 2 355 RR2B049TF
BS 356 356 RR2B049JQ

RD RR2B049JQ 356 0 0
GAAGCACAAGCACAAGAAGGTGAAGCTCGCGGTGCTTCAGTTCTACAAGGTCGATGGATC
GGGCAAGGTGCAGAGGCTGAGGAAGGAGTGTCCTAACGCGACTTGCGGTGCTGGCACTTT
CATGGCGAGTCATTTTGATCGTCATTACTGTGGTAAGTGTGGGCTTACTTACGTTTACCA
GAAGGAGGGTGCCGAGGCTTGATCTCTCTTTTTTCTCTTTTCTCTATCTTTAAGAAATGG
TTTTTTTTTGGTAATTTCGTAAGCTTCTTGTAATGGATTCGATGTTGGACATGTTATTGT
TTCTGGATTTCTTATCTAGATTTCATGAAAGTTATTACATTTTGACTTATGTTGGC

QA 1 356 1 356
DS 

RD RR2B049TF 356 0 0
G
AAGCACAAGCACAAGAAGGTGAAGCTCGCGGTGCTTCAGTTCTACAAGGTCGATGGATCG
GGCAAGGTGCAGAGGCTGAGGAAGGAGTGTCCTAACGCGACTTGCGGTGCTGGCACTTTC
ATGGCGAGTCATTTTGATCGTCATTACTGTGGTAAGTGTGGGCTTACTTACGTTTACCAG
AAGGAGGGTGCCGAGGCTTGATCTCTCTTTTTTCTCTTTTCTCTATCTTTAAGAAATGGT
TTTTTTTTGGTAATTTCGTAAGCTTCTTGTAATGGATTCGATGTTGGACATGTTATTGTT
TCTGGATTTCTTATCTAGATTTCATGAAAGTTATTACATTTTGACTTATGTTGG
C

QA 2 355 2 355
DS 



CO CL2537Contig2 666 2 2 U
GGGTTTCAGCTGTTTTGTTCCCCCACCGCCGCAAAAATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTA
ACGGGTAAGACGATAACCCTCGAGGTCGAGTCCTCCGACACCATCGACAACGTCAAGGCC
AAGATCCAAGACAAGGAAGGCATCCCTCCGGACCAGCAGCGTCTCATTTTCGCCGGCAAA
CAGCTCGAAGACGGACGCACGCTCGCCGACTACAACATCCATAAGGAGTCGACGCTTCAC
CTTGTTCTCCGTCTGAGAGGAGGAGCAAAGAAGAGGAAGAAGAAGACGTACACGAAGCCG
AAGAAGATCAAGCACAAGCACAAGAAGGTGAAGCTCGCGGTGCTCCAGTTCTACAAGGTT
GATGGTTCCGGCAAGGTGCAGAGGCTGAGGAAGGAGTGTCCTAACGCGACTTGCGGTGCT
GGGACTTTCATGGCGAGTCATTTCGATCGTCATTACTGTGGTAAGTGTGGACTTACTTAC
GTTTACCAGAAGGAGGGTGCCGAGGCTTGATCTCTCTTTTTTCTCTTTTCTCTATCTTTA
AGAAATGGTTTTGGTTTGGTAATTTCGTAAGCTTCTTGTAATGGATTCGATGTTGAACAT
GTTTTGTTTCTGGATTTCTTATCTAGACTTCATGAAAGTTGTTACATTTTTACTTATGTT
GGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 

AF RR2EY50TF U 1
AF RR2EY50JQ C 108
BS 1 662 RR2EY50TF
BS 663 666 RR2EY50JQ

RD RR2EY50TF 666 0 0
GGGTTTCAGCTGTTTTGTTCCCCCACCGCCGCAAAAATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTA
ACGGGTAAGACGATAACCCTCGAGGTCGAGTCCTCCGACACCATCGACAACGTCAAGGCC
AAGATCCAAGACAAGGAAGGCATCCCTCCGGACCAGCAGCGTCTCATTTTCGCCGGCAAA
CAGCTCGAAGACGGACGCACGCTCGCCGACTACAACATCCATAAGGAGTCGACGCTTCAC
CTTGTTCTCCGTCTGAGAGGAGGAGCAAAGAAGAGGAAGAAGAAGACGTACACGAAGCCG
AAGAAGATCAAGCACAAGCACAAGAAGGTGAAGCTCGCGGTGCTCCAGTTCTACAAGGTT
GATGGTTCCGGCAAGGTGCAGAGGCTGAGGAAGGAGTGTCCTAACGCGACTTGCGGTGCT
GGGACTTTCATGGCGAGTCATTTCGATCGTCATTACTGTGGTAAGTGTGGACTTACTTAC
GTTTACCAGAAGGAGGGTGCCGAGGCTTGATCTCTCTTTTTTCTCTTTTCTCTATCTTTA
AGAAATGGTTTTGGTTTGGTAATTTCGTAAGCTTCTTGTAATGGATTCGATGTTGAACAT
GTTTTGTTTCTGGATTTCTTATCTAGACTTCATGAAAGTTGTTACATTTTTACTTATGTT
GG
TACC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2EY50JQ 559 0 0
CAACGTCAAGGCCAAGATCCAAGACAAGGAAGGCATCCCTCCGGACCAGCAGCGTCTCAT
TTTCGCCGGCAAACAGCTCGAAGACGGACGCACGCTCGCCGACTACAACATCCATAAGGA
GTCGACGCTTCACCTTGTTCTCCGTCTGAGAGGAGGAGCAAAGAAGAGGAAGAAGAAGAC
GTACACGAAGCCGAAGAAGATCAAGCACAAGCACAAGAAGGTGAAGCTCGCGGTGCTCCA
GTTCTACAAGGTTGATGGTTCCGGCAAGGTGCAGAGGCTGAGGAAGGAGTGTCCTAACGC
GACTTGCGGTGCTGGGACTTTCATGGCGAGTCATTTCGATCGTCATTACTGTGGTAAGTG
TGGACTTACTTACGTTTACCAGAAGGAGGGTGCCGAGGCTTGATCTCTCTTTTTTCTCTT
TTCTCTATCTTTAAGAAATGGTTTTGGTTTGGTAATTTCGTAAGCTTCTTGTAATGGATT
CGATGTTGAACATGTTTTGTTTCTGGATTTCTTATCTAGACTTCATGAAAGTTGTTACAT
TTTTACTTATGTTGGTACC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL2538Contig1 1178 2 2 U
TTGTTATCCTTAAACCCTTTTCATGGCTTCTATCTCTAGAATTCTTCAAACAGATGGCAG
ATTAATAAGTCACTGCACTTCATGGGTTTCGGCTCCTATGAGGAGAGCTCAAACTCAGCT
TGATTCTCTCCCGTTGTTTACTGTTGGTAAAGCTGGAGTAAGTTCGAGGATTCAGAAAAG
TAGTAGACAGTTATGCTCTGTCTTTGCTCTTGATTCAGCTTCCTCCAGCAAATCATCGCT
CTCACATCTTGCTCCATTAGAAGCCATTCTGCTTGATGTTGATGGAACACTCTGTGATTC
TGATCCCATCCACCTTATCGCCTTCCAAGAACTCCTTCAACAGATTGGTTTTAACAATGG
TGTCCCAATCGACGAGAAGTTCTTTATTGCCAATATTGCTGGAAAACACAACTCCGAGAT
TGCTCTCGGTCTCTTCCCTGATGATGTTGCTAGAGGGTTAACATTCTGTGACGAAAAGGA
AGCTCTCTTCCGCAAACTAGTAGCAGAAAAGGTAAAGCCACTCGATGGACTTCTAAAACT
GACCAAATGGATCGAAGACCGTGGACTGAAACGAGCCGCAGTCACAAACGCACCAAAAGA
AAACGCAGAGCTCATCATATCGAAACTCGGTCTGACTGATTTCTTCCAGGCAGTGATTCT
CGGCTCTGAATGTGAGTACCCGAAACCACACCCGGCGGCTTACTTGAAGGCTCTCGAAGT
GCTTAACGTGTCGAAGGAGCATACGCTAGTGTTCGAGGACTCGGTCTCTGGGATCAAAGC
TGGAGTTGCGGCTGGGATGCCTGTGGTTGGACTTACCACAGGTAATCCAGCAAGCGTGCT
GATGCAAGCTAAACCTGCTTTTCTTATAGAGAACTATGCTGATCCGGAACTGTTGGGTGT
GTTGGAGGAGCTTGATAACAAGAAGAGTTCTTAGAAGTCTTGTTGTTGTCGTCTCGCTTG
TCTTAGCTCATGAAGCCTACGCACGCATGAGCAGCAGAACCTTTCTTAGAAGTCTTGTTG
TTGTCGTCTCGCTTGTCTTAGCTCATGAAGCCTACGCACGCATGAGCAGCAGAACTTTTT
TTTTTTATCTTTTGTTGAATATTATTCTTTTGGGGATTTTATGACAATGGGAGGAGGAGC
TTCCAAGTTATCAAATTTAGCTTGTCTTTTTCAATCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF84TF U 1
AF RR2AP35JQ C 442
BS 1 678 RR2EF84TF
BS 679 1178 RR2AP35JQ

RD RR2EF84TF 678 0 0
TTGTTATCCTTAAACCCTTTTCATGGCTTCTATCTCTAGAATTCTTCAAACAGATGGCAG
ATTAATAAGTCACTGCACTTCATGGGTTTCGGCTCCTATGAGGAGAGCTCAAACTCAGCT
TGATTCTCTCCCGTTGTTTACTGTTGGTAAAGCTGGAGTAAGTTCGAGGATTCAGAAAAG
TAGTAGACAGTTATGCTCTGTCTTTGCTCTTGATTCAGCTTCCTCCAGCAAATCATCGCT
CTCACATCTTGCTCCATTAGAAGCCATTCTGCTTGATGTTGATGGAACACTCTGTGATTC
TGATCCCATCCACCTTATCGCCTTCCAAGAACTCCTTCAACAGATTGGTTTTAACAATGG
TGTCCCAATCGACGAGAAGTTCTTTATTGCCAATATTGCTGGAAAACACAACTCCGAGAT
TGCTCTCGGTCTCTTCCCTGATGATGTTGCTAGAGGGTTAACATTCTGTGACGAAAAGGA
AGCTCTCTTCCGCAAACTAGTAGCAGAAAAGGTAAAGCCACTCGATGGACTTCTAAAACT
GACCAAATGGATCGAAGACCGTGGACTGAAACGAGCCGCAGTCACAAACGCACCAAAAGA
AAACGCAGAGCTCATCATATCGAAACTCGGTCTGACTGATTTCTTCCAGGCAGTGATTCT
CGGCTCTGAATGTGAGTA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2AP35JQ 737 0 0
TGATGTTGCTAGAGGGTTAACATTCTGTGACGAAAAGGAAGCTCTCTTCCGCAAACTAGT
AGCAGAAAAGGTAAAGCCACTCGATGGACTTCTAAAACTGACCAAATGGATCGAAGACCG
TGGACTGAAACGAGCCGCAGTCACAAACGCACCAAAAGAAAACGCAGAGCTCATCATATC
GAAACTCGGTCTGACTGATTTCTTCCAGGCAGTGATTTTCGGCTCTGAATGTGAGTACCC
GAAACCACACCCGGCGGCTTACTTGAAGGCTCTCGAAGTGCTTAACGTGTCGAAGGAGCA
TACGCTAGTGTTCGAGGACTCGGTCTCTGGGATCAAAGCTGGAGTTGCGGCTGGGATGCC
TGTGGTTGGACTTACCACAGGTAATCCAGCAAGCGTGCTGATGCAAGCTAAACCTGCTTT
TCTTATAGAGAACTATGCTGATCCGGAACTGTTGGGTGTGTTGGAGGAGCTTGATAACAA
GAAGAGTTCTTAGAAGTCTTGTTGTTGTCGTCTCGCTTGTCTTAGCTCATGAAGCCTACG
CACGCATGAGCAGCAGAACCTTTCTTAGAAGTCTTGTTGTTGTCGTCTCGCTTGTCTTAG
CTCATGAAGCCTACGCACGCATGAGCAGCAGAACTTTTTTTTTTTATCTTTTGTTGAATA
TTATTCTTTTGGGGATTTTATGACAATGGGAGGAGGAGCTTCCAAGTTATCAAATTTAGC
TTGTCTTTTTCAATCGC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL2539Contig1 870 2 12 U
CAAGTAAAATGTAGTTCGGTTTCTGATTATTAGAGTCTAGTTATATAATTATCAAATCCA
GAGACAGATTACAAGTTAAATGAGTGGAAAAAAAAAAGATTTACACTATGAGTTCAAAAG
AGTGTTGTTATAAGAAGAAAGCAAAGGAAAGTGTTGGTTTCTAGTGTCCGTCCGTCCATG
GATCATCCCTCACCTGATCTAAATAAGCTTCTTCCTTTCAAAGTATTGCTTCAAATACAA
AATCTGCAAACCAGAGACCACAATGCAGATGCCTAACGACATGATACTGAACCATGCGAC
TCGCGAGTTTGTTTTTTCACTCACAATCCTCATCTCCGCTTCTCTGTCTTTAAGGTAAAG
TAGATTGTCATGTATGCCCTCAACTGCACCTTCGAGTTTCCTTAGCTCCAGCTCCACACC
CTCGATTTTCTCTTTTCTAGCAATGGAGTCCCAATCCTTGGCGGCGATACCAGTTTTCCA
GTCAAGGTTGATGCTAATATCTTTGTTACCATGACTGTTTCCAACGGGGTCAAAACAAGC
CAAGTAGGTTCCTGATTCTTGGGTTGTAAACGCAAACTGACCATGCGTTGCGTTTGCGTT
ATGGTGCAAAACATTTCCATATGGTGATGTAACCTTAACGGAGACAGTAGGGAAGATGGA
ATGCTCGTCGGAGATGACGAGGTAATCTGCCAAGACGACGACCTTGCTCTGGATTTCCTC
CGACACACACTTTGTTCCCTTCTTGGGTATTTTGAGCCACACGGCTTCACTCACTGGAAT
TAGCTCCGGCGTTAGAAACAAGAAAAGAGCCGAAAGGAGCGAGAACGTTGTCGCAAATCC
GAGCTTCATCGTCTTCTTTGAGCTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP55JQ U 1
AF RR2BI24TF C 198
BS 1 275 RR2DP55JQ
BS 276 276 RR2BI24TF
BS 277 282 RR2DP55JQ
BS 283 283 RR2BI24TF
BS 284 522 RR2DP55JQ
BS 523 523 RR2BI24TF
BS 524 531 RR2DP55JQ
BS 532 532 RR2BI24TF
BS 533 612 RR2DP55JQ
BS 613 613 RR2BI24TF
BS 614 698 RR2DP55JQ
BS 699 870 RR2BI24TF

RD RR2DP55JQ 698 0 0
CAAGTAAAATGTAGTTCGGTTTCTGATTATTAGAGTCTAGTTATATAATTATCAAATCCA
GAGACAGATTACAAGTTAAATGAGTGGAAAAAAAAAAGATTTACACTATGAGTTCAAAAG
AGTGTTGTTATAAGAAGAAAGCAAAGGAAAGTGTTGGTTTCTAGTGTCCGTCCGTCCATG
GATCATCCCTCACCTGATCTAAATAAGCTTCTTCCTTTCAAAGTATTGCTTCAAATACAA
AATCTGCAAACCAGAGACCACAATGCAGATGCCTAGCGACATTATACTGAACCATGCGAC
TCGCGAGTTTGTTTTTTCACTCACAATCCTCATCTCCGCTTCTCTGTCTTTAAGGTAAAG
TAGATTGTCATGTATGCCCTCAACTGCACCTTCGAGTTTCCTTAGCTCCAGCTCCACACC
CTCGATTTTCTCTTTTCTAGCAATGGAGTCCCAATCCTTGGCGGCGATACCAGTTTTCCA
GTCAAGGTTGATGCTAATATCTTTGTTACCATGACTGTTTCCTACGGGGTCGAAACAAGC
CAAGTAGGTTCCTGATTCTTGGGTTGTAAACGCAAACTGACCATGCGTTGCGTTTGCGTT
ATGGTGCAAAACGTTTCCATATGGTGATGTAACCTTAACGGAGACAGTAGGGAAGATGGA
ATGCTCGTCGGAGATGACGAGGTAATCTGCCAAGACGA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2BI24TF 673 0 0
TCTAAATAAGCTTCTTCCTTTCAAAGTATTGCTTCAGATACAAAATCTGCAAACCAGAGA
CCACAATGCAGATGCCTAACGACATGATACTGAACCATGCGACTCGCGAGTTTGTTTTTT
CACTCACAATCCTCATCTCCGCTTCTCTGTCTTTAAGGTAAAGTAGATTGTCATGTGTGC
CCTCAACTGCACCTTCGAGTTTCCTTAGCTCCAGCTCCACACCCTCGATTTTCTCTTTTC
TAGCAATGGAGTCCCAATCCTTGGCGGCGATACCAGTTTTCCAGTCAAGGTTGATGCTAA
TATCTTTGTTACCATGACTGTTTCCAACGGGGTCAAAACAAGCCAAGTAGGTTCCTGATT
CTTGGGTTGTAAACGCAAACTGACCATGCGTTGCGTTTGCGTTATGGTGCAAAACATTTC
CATATGGTGATGTAACCTTAACGGAGACAGTAGGGAAGATGGAATGCTCTTCGGAGATGA
CGAGGTAATCTGCCAAGACGACGACCTTGCTCTGGATTTCCTCCGACACACACTTTGTTC
CCTTCTTGGGTATTTTGAGCCACACGGCTTCACTCACTGGAATTAGCTCCGGCGTTAGAA
ACAAGAAAAGAGCCGAAAGGAGCGAGAACGTTGTCGCAAATCCGAGCTTCATCGTCTTCT
TTGAGCTTTTCCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 4

CO CL2540Contig1 642 4 10 U
TTTTTAGTTTAGGTTTATAACGAACTCAGTTCTTCGATCTGCAATGGCGGACGCGTCTAA
TTCCGACAACGGCGGAGAGCAACAGACACTCAAGATCCGAAGACTGGAGATCTCCGACAA
GAGGAAGGGATACATGGAGCTTCTCGGTCAACTCACCGTCACCGGATCAGTAACCGACGA
CGAATTCGATCAGCGTTTCGAGGAGATCAGGTCCCGCGGAGACGACCATTTGATCTGCGT
GATCGAAGACGAGACATCAGGGAGAATCGCGGCGACGGGGAGCGTGATGATAGAGAAGAA
GTTCTTGAGAAACTGCGGGAAAGTTGGGCACATCGAGGACGTCGTCGTGGATACAGAGTT
TCGCGGGAAACATCTCGGGAAGCAAGTGGTTGAGTTTCTATCGGATCATTGTCGAGCCAT
GGGTTGCTACAAGGTGATTCTTGATTGTGGCGTGGAGAAGAAAGTGTTTTATGAGAAATG
TGGGTTGGTTAATAAAGGGATTCAGATGTCCAAGTACTTTGATTGATCTTGTTTTCTTGT
CCGAATCTAAGCTTTGGTTTGAATCTTGACATTGATCTGTGAACATTAAGTACTAAAGGA
GGCAACTTGTTTTTGATTTCTCTATTGTAAAAGGTTTGATAT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2B516JQ C 6
AF RR2B516TF U 6
AF RR2DJ43TF U 1
AF RR2DJ43JQ C 307
BS 1 79 RR2DJ43TF
BS 80 80 RR2B516TF
BS 81 305 RR2DJ43TF
BS 306 306 RR2B516TF
BS 307 404 RR2DJ43TF
BS 405 405 RR2B516TF
BS 406 417 RR2DJ43TF
BS 418 418 RR2B516TF
BS 419 639 RR2DJ43TF
BS 640 642 RR2DJ43JQ

RD RR2B516JQ 560 0 0
AGTTTAGGTTTATAACGAACTCAGTTCTTCGATCTGCAATGGCGGACGCGTCTAATTCCG
ACAACGGCGGAGAGCAACAGACACTCAAGATCCGAAGACTGGAGATCTCCGACAAGAGGA
AGGGATACATGGAGCTTCTCGGTCAACTCACCGTCACCGGATCAGTAACCGACGACGAAT
TCGATCAGCGTTTCGAGGAGATCAGGTCCCGCGGAGACGACCATTTGATCTGCGTGATCG
AAGACGAGACATCAGGGAGAATCGCGGCGACGGGGAGCGTGATGATAGAGAAGAAGTTCT
TGAGAAACTGCGGGAAAGTTGGGCACATCGAGGACGTCGTCGTGGATACAGAGTTTCGCG
GGAAACATCTCGGGAAGCAAGTGGTTGAGTTTCTATCGGATCATTGTCGAGCCATGGGTT
GCTACAAGGTGATTCTTGATTGTGGCGTGGAGAAGAAAGTGTTTTATGAGAAATGTGGGT
TGGTTAATAAAGGGATTCAGATGTCCAAGTACTTTGATTGATCTTGTTTTCTTGTCCGAA
TCTAAGCTTTGGTTTGAATC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2B516TF 560 0 0
AGTTTAGGTTTATAACGAACTCAGTTCTTCGATCTGCAATGGCGGACGCGTCTAATTCCG
ACAACGGCGGAGAGCAACAGACACTCAAGATCCGAAGACTGGAGATCTCCGACAAGAGGA
AGGGATACATGGAGCTTCTCGGTCAACTCACCGTCACCGGATCAGTAACCGACGACGAAT
TCGATCAGCGTTTCGAGGAGATCAGGTCCCGCGGAGACGACCATTTGATCTGCGTGATCG
AAGACGAGACATCAGGGAGAATCGCGGCGACGGGGAGCGTGATGATAGAGAAGAAGTTCT
TGAGAAACTGCGGGAAAGTTGGGCACATCGAGGACGTCGTCGTGGATACAGAGTTTCGCG
GGAAACATCTCGGGAAGCAAGTGGTTGAGTTTCTATCGGATCATTGTCGAGCCATGGGTT
GCTACAAGGTGATTCTTGATTGTGGCGTGGAGAAGAAAGTGTTTTATGAGAAATGTGGGT
TGGTTAATAAAGGGATTCAGATGTCCAAGTACTTTGATTGATCTTGTTTTCTTGTCCGAA
TCTAAGCTTTGGTTTGAATC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2DJ43TF 639 0 0
TTTTTAGTTTAGGTTTATAACGAACTCAGTTCTTCGATCTGCAATGGCGGACGCGTCTAA
TTCCGACAACGGCGGAGAGAAACAGACACTCAAGATCCGAAGACTGGAGATCTCCGACAA
GAGGAAGGGATACATGGAGCTTCTCGGTCAACTCACCGTCACCGGATCAGTAACCGACGA
CGAATTCGATCAGCGTTTCGAGGAGATCAGGTCCCGCGGAGACGACCATTTGATCTGCGT
GATCGAAGACGAGACATCAGGGAGAATCGCGGCGACGGGGAGCGTGATGATAGAGAAGAA
GTTCTCGAGAAACTGCGGGAAAGTTGGGCACATCGAGGACGTCGTCGTGGATACAGAGTT
TCGCGGGAAACATCTCGGGAAGCAAGTGGTTGAGTTTCTATCGGGTCATTGTCGAGCTAT
GGGTTGCTACAAGGTGATTCTTGATTGTGGCGTGGAGAAGAAAGTGTTTTATGAGAAATG
TGGGTTGGTTAATAAAGGGATTCAGATGTCCAAGTACTTTGATTGATCTTGTTTTCTTGT
CCGAATCTAAGCTTTGGTTTGAATCTTGACATTGATCTGTGAACATTAAGTACTAAAGGA
GGCAACTTGTTTTTGATTTCTCTATTGTAAAAGGTTTGA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2DJ43JQ 336 0 0
GAGAAACTGCGGGAAAGTTGGGCACATCGAGGACGTCGTCGTGGATACAGAGTTTCGCGG
GAAACATTTCGGGAAGCAAGTGGTTGAGTTTCTATCGGGTCATTGTCGAGCTATGGGTTG
CTACAAGGTGATTTTTGATTGTGGCGTGGAGAAGAAAGTGTTTTATGAGAAATGTGGGTT
GGTTAATAAAGGGATTCAGATGTCCAAGTACTTTGATTGATCTTGTTTTTTTGTCCGAAT
TTAAGCTTTGGTTTGAATCTTGACATTGATCTGTGAACATTAAGTACTAAAGGAGGCAAC
TTGTTTTTGATTTTTTTATTGTAAAAGGTTTGATAT

QA 1 336 1 336
DS 



AS 2 4

CO CL2541Contig1 1116 2 2 U
GCGTTGGACTACGCGCTGTTCCAGCCTCTCCAGGCCAACAAAGAAGCTGTGGACGCCAAC
ACGTTGCTGCATTACACCAACGTGTTCGATGCGATCGTAGACGCGGCTTACTTCGCTATG
TCTTATCTCAACTTCACCAACATTCCTATAGTGGTCACCGAGTCCGGCTGGCCGTCTAAA
GGAGACGGTCCGGAGCACGATGCGACGGTTGAGAATGCCAACACTTACAATAGCAACTTG
ATACAGCACGTGATCAACAAGACCGGGACGCCGAAACACCCGGGAGTTCCCGTTGCCACC
TACATATACGAGCTTTACAATGAGGATACGAGGCCTGGACCTTTGTCTGAGAAGAACTGG
GGGCTGTTTCATACTAACGGGACTCCGGTCTACACGCTGCGTTTGGCTGGCGCGGGTGCT
ATTCTTGCGAATGATACAACGAACCAGACGTTTTGTGTGGCGAAGGAGAGGGTTGATAAG
AAGATGCTTCAGGCGGCTCTTGATTGGGCTTGCGGTCCAGGGAAGGTTGATTGTTCGGAG
TTGATGCAGGGTGAAGCTTGCTATGAGCCTGATGATGTGGTTGCGCATTCTAGTTATGCG
TTTAATGCTTATTACCAGAAGATGGGGAAAGCTTCAGGGAGCTGTGACTTCAAAGGAGTC
GCTACTGTTACTTCCACTGATCCAAGTAGAGGAACGTGTGTGTTCCCTGGAAGTGCTAAA
AGCAATCAGACACTTGGACACAACACAACGGCGTTGGCTCCTTCAGCGAACTCCACAACC
TCTGGCTGCATCCCACAGTACTATCACCCGCACGCTTCCTTTGTTAACTTAACATTCATG
TCCCTTTTACTCCTCATTGCCTTAGTATTCTTGTAGAAACTCGGAGAAGAAGAAGAACGA
CTCCTAGTTCTTGTTTCTTAATTTTAGCTTCTTTCCTTTGCAGCAGTTGAGTGGTTCTGT
TCTCTCCTTGTTTTAGTTGTCTACCCGGTTTTGTCCATCATCTCCTTCAAAGAGGAGTTC
ATTTAAAGGGTAGCGTGTAGGTTCCTCTTCAGGAGATCATCTATGACTGTAACTAATCTA
TGTGTTGAAAAGCTTGATTCTTTTTTTTATCTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT27TF U 1
AF RR2CT27JQ C 377
BS 1 633 RR2CT27TF
BS 634 1116 RR2CT27JQ

RD RR2CT27TF 633 0 0
GCGTTGGACTACGCGCTGTTCCAGCCTCTCCAGGCCAACAAAGAAGCTGTGGACGCCAAC
ACGTTGCTGCATTACACCAACGTGTTCGATGCGATCGTAGACGCGGCTTACTTCGCTATG
TCTTATCTCAACTTCACCAACATTCCTATAGTGGTCACCGAGTCCGGCTGGCCGTCTAAA
GGAGACGGTCCGGAGCACGATGCGACGGTTGAGAATGCCAACACTTACAATAGCAACTTG
ATACAGCACGTGATCAACAAGACCGGGACGCCGAAACACCCGGGAGTTCCCGTTGCCACC
TACATATACGAGCTTTACAATGAGGATACGAGGCCTGGACCTTTGTCTGAGAAGAACTGG
GGGCTGTTTCATACTAACGGGACTCCGGTCTACACGCTGCGTTTGGCTGGCGCGGGTGCT
ATTCTTGCGAATGATACAACGAACCAGACGTTTTGTGTGGCGAAGGAGAGGGTTGATAAG
AAGATGCTTCAGGCGGCTCTTGATTGGGCTTGCGGTCCAGGGAAGGTTGATTGTTCGGAG
TTGATGCAGGGTGAAGCTTGCTATGAGCCTGATGATGTGGTTGCGCATTCTAGTTATGCG
TTTAATGCTTATTACCAGAAGATGGGGAAAGCT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2CT27JQ 740 0 0
ACGGGACTCCGGTCTACACGCTGCGTTTGGCTGGCGCGGGTGCTATTCTTGCGAATGATA
CAACGAACCAGACGTTTTGTGTGGCGAAGGAGAGGGTTGATAAGAAGATGCTTCAGGCGG
CTCTTGATTGGGCTTGCGGTCCAGGGAAGGTTGATTGTTCGGAGTTGATGCAGGGTGAAG
CTTGCTATGAGCCTGATGATGTGGTTGCGCATTCTAGTTATGCGTTTAATGCTTATTACC
AGAAGATGGGGAAAGCTTCAGGGAGCTGTGACTTCAAAGGAGTCGCTACTGTTACTTCCA
CTGATCCAAGTAGAGGAACGTGTGTGTTCCCTGGAAGTGCTAAAAGCAATCAGACACTTG
GACACAACACAACGGCGTTGGCTCCTTCAGCGAACTCCACAACCTCTGGCTGCATCCCAC
AGTACTATCACCCGCACGCTTCCTTTGTTAACTTAACATTCATGTCCCTTTTACTCCTCA
TTGCCTTAGTATTCTTGTAGAAACTCGGAGAAGAAGAAGAACGACTCCTAGTTCTTGTTT
CTTAATTTTAGCTTCTTTCCTTTGCAGCAGTTGAGTGGTTCTGTTCTCTCCTTGTTTTAG
TTGTCTACCCGGTTTTGTCCATCATCTCCTTCAAAGAGGAGTTCATTTAAAGGGTAGCGT
GTAGGTTCCTCTTCAGGAGATCATCTATGACTGTAACTAATCTATGTGTTGAAAAGCTTG
ATTCTTTTTTTTATCTACCC

QA 1 740 1 740
DS 



CO CL2541Contig2 651 2 2 U
GCCAGACGTTTTGTGTGGCTAAGGAGAGGGTTGATAAGAAGATGCTTCAGGCGGCTCTTG
ATTGGGCTTGCGGTCCAGGGAAGGTTGATTGCTCGGAGTTGATGCAGGGTGAGGCGTGTT
ATGAGCCTGATGATGTGGTTGCGCATTCTAGTTATGCGTTTAATGCTTATTACCAGAAGA
TGGGGAAAGCTTCAGGGAGCTGTGACTTCAAAGGAGTTGCTACTGTTACTTCCACTGATC
CAAGTAGAGGAACGTGTGTGTTCCCTGGAAGTGCTAAAAGCAATCAGACACTTGGACACA
ACACAACCGCATTGGCTCCTTCAGCGAACTCCACAACTTCTGGCTGCATCCCACAGTACT
ATCACCCGGAAGCTTCCTTTGTTAGATTAACATTCCTGTCCCTTCTACTCCTCATTGCCT
TAGTATTCTTGTAGAAACTCAGAGAAGAAGAAGAAGAAGAACAAGTCCTAGTTCTTGTTT
CTTAATTTTAGCTTTCTTTCCTTGAAACAGTTGAGTGGTTCTGTTCTCTCCTTGTTTTAG
TTGTCTACCCGGTTTTGTCCATCATCTCCTTTAAGAGGAGTTCATTTAAAGGGTAGCGTG
TAGGTTCCGCCTTCAGGAGATCATCAATGACTGTAACTAATCTATGTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F696TF U 1
AF RR2F696JQ C 50
BS 1 608 RR2F696TF
BS 609 651 RR2F696JQ

RD RR2F696TF 612 0 0
GCCAGACGTTTTGTGTGGCTAAGGAGAGGGTTGATAAGAAGATGCTTCAGGCGGCTCTTG
ATTGGGCTTGCGGTCCAGGGAAGGTTGATTGCTCGGAGTTGATGCAGGGTGAGGCGTGTT
ATGAGCCTGATGATGTGGTTGCGCATTCTAGTTATGCGTTTAATGCTTATTACCAGAAGA
TGGGGAAAGCTTCAGGGAGCTGTGACTTCAAAGGAGTTGCTACTGTTACTTCCACTGATC
CAAGTAGAGGAACGTGTGTGTTCCCTGGAAGTGCTAAAAGCAATCAGACACTTGGACACA
ACACAACCGCATTGGCTCCTTCAGCGAACTCCACAACTTCTGGCTGCATCCCACAGTACT
ATCACCCGGAAGCTTCCTTTGTTAGATTAACATTCCTGTCCCTTCTACTCCTCATTGCCT
TAGTATTCTTGTAGAAACTCAGAGAAGAAGAAGAAGAAGAACAAGTCCTAGTTCTTGTTT
CTTAATTTTAGCTTTCTTTCCTTGAAACAGTTGAGTGGTTCTGTTCTCTCCTTGTTTTAG
TTGTCTACCCGGTTTTGTCCATCATCTCCTTTAAGAGGAGTTCATTTAAAGGGTAGCGTG
TAGGTTCC
GCCT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2F696JQ 602 0 0
GGCGGCTCTTGATTGGGCTTGCGGTCCAGGGAAGGTTGATTGCTCGGAGTTGATGCAGGG
TGAGGCGTGTTATGAGCCTGATGATGTGGTTGCGCATTCTAGTTATGCGTTTAATGCTTA
TTACCAGAAGATGGGGAAAGCTTCAGGGAGCTGTGACTTCAAAGGAGTTGCTACTGTTAC
TTCCACTGATCCAAGTAGAGGAACGTGTGTGTTCCCTGGAAGTGCTAAAAGCAATCAGAC
ACTTGGACACAACACAACCGCATTGGCTCCTTCAGCGAACTCCACAACTTCTGGCTGCAT
CCCACAGTACTATCACCCGGAAGCTTCCTTTGTTAGATTAACATTCCTGTCCCTTCTACT
CCTCATTGCCTTAGTATTCTTGTAGAAACTCAGAGAAGAAGAAGAAGAAGAACAAGTCCT
AGTTCTTGTTTCTTAATTTTAGCTTTCTTTCCTTGAAACAGTTGAGTGGTTCTGTTCTCT
CCTTGTTTTAGTTGTCTACCCGGTTTTGTCCATCATCTCCTTTAAGAGGAGTTCATTTAA
AGGGTAGCGTGTAGGTTCCGCCTTCAGGAGATCATCAATGACTGTAACTAATCTATGTGT
TG

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 3

CO CL2542Contig1 635 3 2 U
GGGGGTTATAGCTTACAAGATAGCCGCTCATGCAGCTGATCTAGCCAAACAGCATCCGCA
TGCACAGGCGTGGGACGATGCGCTGAGCAAGGCGAGGTTTGAGTTTAGGTGGATGGATCA
GTTTGCTCTGTCGTTGGACCCTATGACCGCGATGTCTTTTCATGATGAGACGCTTCCGGC
TGATGGAGCCAAGGTTGCACACTTCTGCTCCATGTGTGGACCAAAGTTCTGCTCCATGAA
GATAACTGAAGACATCAGGAAGTATGCAGAGGAGAATGGTTATGGCACTGCTGAGGAAGC
TCTCAGGAAAGGGATGGAGGCTATGAGTCAAGAGTTCAATGTTGCAAAGAAAACCATCAG
CGGAGAGCAGCATGGTGAAGTTGGTGGTGAAATCTACTTGCCAGAGAGCTATGTCAAGGC
TGCTAAGAAGTAAAAAGGGAAAGGGTGGGAACAAGACCTCGCTTACACAAGTCTTGGTGC
CTGTTGGACTATACCTGAATAAGGCACAAAATGTTTGTAAGCTTTAGTAGTCTCTCTGTC
TGTTAAACTTTAGAACTATCTATGGTTTATGTTTCTTCTGTTTGTTCCTTTGAGTCTGAG
TCAGTAATAAAAAAGACAAACTGAGTTGACGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C221JQ C 1
AF RR2C221TF U 44
AF RR2EQ48TF U 71
BS 1 43 RR2C221JQ
BS 44 635 RR2C221TF

RD RR2C221JQ 635 0 0
GGGGGTTATAGCTTACAAGATAGCCGCTCATGCAGCTGATCTAGCCAAACAGCATCCGCA
TGCACAGGCGTGGGACGATGCGCTGAGCAAGGCGAGGTTTGAGTTTAGGTGGATGGATCA
GTTTGCTCTGTCGTTGGACCCTATGACCGCGATGTTTTTTCATGATGAGACGCTTCCGGC
TGATGGAGCCAAGGTTGCACACTTTTGCTCCATGTGTGGACCAAAGTTTTGCTCCATGAA
GATAACTGAAGACATCAGGAAGTATGCAGAGGAGAATGGTTATGGCACTGCTGAGGAAGC
TTTCAGGAAAGGGATGGAGGCTATGAGTCAAGAGTTCAATGTTGCAAAGAAAACCATCAG
CGGAGAGCAGCATGGTGAAGTTGGTGGTGAAATCTACTTGCCAGAGAGCTATGTCAAGGC
TGCTAAGAAGTAAAAAGGGAAAGGGTGGGAACAAGACCTCGCTTACACAAGTCTTGGTGC
CTGTTGGACTATACCTGAATAAGGCACAAAATGTTTGTAAGCTTTAGTAGTCTCTCTGTC
TGTTAAACTTTAGAACTATCTATGGTTTATGTTTTTTCTGTTTGTTCCTTTGAGTTTGAG
TCAGTAATAAAAAAGACAAACTGAGTTGACGTTTT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2C221TF 592 0 0
GCCAAACAGCATCCGCATGCACAGGCGTGGGACGATGCGCTGAGCAAGGCGAGGTTTGAG
TTTAGGTGGATGGATCAGTTTGCTCTGTCGTTGGACCCTATGACCGCGATGTCTTTTCAT
GATGAGACGCTTCCGGCTGATGGAGCCAAGGTTGCACACTTCTGCTCCATGTGTGGACCA
AAGTTCTGCTCCATGAAGATAACTGAAGACATCAGGAAGTATGCAGAGGAGAATGGTTAT
GGCACTGCTGAGGAAGCTCTCAGGAAAGGGATGGAGGCTATGAGTCAAGAGTTCAATGTT
GCAAAGAAAACCATCAGCGGAGAGCAGCATGGTGAAGTTGGTGGTGAAATCTACTTGCCA
GAGAGCTATGTCAAGGCTGCTAAGAAGTAAAAAGGGAAAGGGTGGGAACAAGACCTCGCT
TACACAAGTCTTGGTGCCTGTTGGACTATACCTGAATAAGGCACAAAATGTTTGTAAGCT
TTAGTAGTCTCTCTGTCTGTTAAACTTTAGAACTATCTATGGTTTATGTTTCTTCTGTTT
GTTCCTTTGAGTCTGAGTCAGTAATAAAAAAGACAAACTGAGTTGACGTTTT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2EQ48TF 544 0 0
G
GGGACGGTGCGCTGAGCAAGGCGAGGTTTGAGTTTAGGTGGATGGATCAGTTTGCTCTGT
CGTTGGACCCTATGACCGCGATGTCTTTCCATGATGAGACGCTTCCGGCTGATGGAGCCA
AGGTTGCACATTTCTGCTCCATGTGTGGACCAAAGTTCTGCTCCATGGAGATAACTGAAG
ACATCAGGAAGTATGCGGAGGAGAATGGTTATGGCACTGCTGAGGAAGCGCTCAGAAAAG
GAATGGAGGCTATGAGTCAAGAGTTCAATGTTGCAAAGAAAACAATCAGCGGAGAGCAGC
ACGGTGAAGTTGGTGGTGAAATCTACTTGCCAGAGAGCTATGTCAAGGCTGCTAAGAAGT
AAAAAGGGAAAGGGTGGGAACAAGACCTCGCTTACACAAGTCTTGGTGCCTGTTGGACTA
TACCTGAATAAGGCACAAAATGTTGGTAAGCTTTAGTAGTCTCTCTGTCTGTTAAACTTT
AGAACTATCTATGGTTTATGTTTCTTCTGTTTGTTCCTTTGAGTCAAAGTCAGTAATAAA
AAA

QA 2 544 2 544
DS 



AS 1 3

CO CL2543Contig1 550 3 23 U
GGGAATCTAGAGACATCTCTAAAGGAAGACTGACTCAGACTCGAAACATATCTGTAGGGT
TCGTCGTCTCCTTCAGGTCTCGATCTCCGTTCCAGGACAGTTTTACAAGCTTCAGATTTG
ACTTTTCGCCATGGCAGAGGATGAAGTTGTTGATCCAAAGAAGTACCTCGAGGAATCTTG
CAAACCAAAATGTGTGAAGCCACTGCTTGAATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGG
TGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACCGGGCAGTACTTCGACTACTGGCATTGCATTGA
CAAATGTGTTGCACCCAAGCTTTTTGCAAAACTGAAATGAAAACAAGGCGATTTTGGACA
CAGTATCTTCTTGAGTCTGGTTCATGTTATTTGTAAGAGGATGTATAAAACGCAGTGGAT
GTTGTCATAACTGCAAACCTGAATATGCCAAATGGCTCTTCTTCTCGGTTTTGTTTCTAT
CGCTT*TTTGCGGTTATTACATTTTTTTTTTGCTACAGATCTTATGCCTAATAACAAGAA
TTTCTCATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B711JQ C 28
AF RR2B711TF U 28
AF RR2AD71TF U 1
BS 1 48 RR2AD71TF
BS 49 49 RR2B711TF
BS 50 64 RR2AD71TF
BS 65 65 RR2B711TF
BS 66 92 RR2AD71TF
BS 93 93 RR2B711TF
BS 94 111 RR2AD71TF
BS 112 112 RR2B711TF
BS 113 138 RR2AD71TF
BS 139 139 RR2B711TF
BS 140 240 RR2AD71TF
BS 241 241 RR2B711TF
BS 242 291 RR2AD71TF
BS 292 292 RR2B711TF
BS 293 350 RR2AD71TF
BS 351 351 RR2B711TF
BS 352 485 RR2AD71TF
BS 486 486 RR2B711TF
BS 487 500 RR2AD71TF
BS 501 502 RR2B711TF
BS 503 507 RR2AD71TF
BS 508 508 RR2B711TF
BS 509 550 RR2AD71TF

RD RR2B711JQ 507 0 0
GGTG
GACTCAGACTCGAAACATATCTGTAGGGTTCGTCGTCTCCTTCAGGTCTCGATCTCCGTT
CCAGGACAGTTTTACAAGCTTCAGATTTGACTTTTCGCCATGGCAGAGGATGAAGTTGTT
GATCCAAAGAAGTACCTCGAGGAATCTTGCAAACCAAAATGTGTGAAGCCACTGCTTGAA
TATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACCGGG
CAGTACTTCGACTACTGGCATTGCATTGACAAATGTGTTGCACCCAAGCTTTTTGCAAAA
CTGAAATGAAAACAAGGCGATTTTGGACACAGTATCTTCTTGAGTCTGGTTCATGTTATT
TGTAAGAGGATGTATAAAACGCAGTGGATGTTGTCATAACTGCAAACCTGAATATGCCAA
ATGGCTCTTCTTCTCGGTTTTGTTTCTATCGCTT*TTTGCGGTTATTACATTTTTTTTTT
GCTACAGATCTTATGCCTAATAA

QA 5 507 5 507
DS 

RD RR2B711TF 507 0 0
GGTG
GACTCAGACTCGAAACATATCTGTAGGGTTCGTCGTCTCCTTCAGGTCTCGATCTCCGTT
CCAGGACAGTTTTACAAGCTTCAGATTTGACTTTTCGCCATGGCAGAGGATGAAGTTGTT
GATCCAAAGAAGTACCTCGAGGAATCTTGCAAACCAAAATGTGTGAAGCCACTGCTTGAA
TATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACCGGG
CAGTACTTCGACTACTGGCATTGCATTGACAAATGTGTTGCACCCAAGCTTTTTGCAAAA
CTGAAATGAAAACAAGGCGATTTTGGACACAGTATCTTCTTGAGTCTGGTTCATGTTATT
TGTAAGAGGATGTATAAAACGCAGTGGATGTTGTCATAACTGCAAACCTGAATATGCCAA
ATGGCTCTTCTTCTCGGTTTTGTTTCTATCGCTT*TTTGCGGTTATTACATTTTTTTTTT
GCTACAGATCTTATGCCTAATAA

QA 5 507 5 507
DS 

RD RR2AD71TF 550 0 0
GGGAATCTAGAGACATCTCTAAAGGAAGACTGACTCAGACTCGAAACAAATCTGTAGGGT
TCGTTGTCTCCTTCAGGTCTCGATCTCCGTTCTAGGACAGTTTTACAAGCTCCAGATTTG
ACTTTTCGCCATGGCAGATGATGAAGTTGTTGATCCAAAGAAGTACCTCGAGGAATCTTG
CAAACCAAAATGTGTGAAGCCACTGCTTGAATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGG
CGATGACTCTGGCCACAAGCATTGCACCGGGCAGTACTTCGACTACTGGCAGTGCATTGA
CAAATGTGTTGCACCCAAGCTTTTTGCAAAACTGAAATGAAAACAAGGCGGTTTTGGACA
CAGTATCTTCTTGAGTCTGGTTCATGTTATTTGTAAGAGGATGTATAAAACGCAGTGGAT
GTTGTCATAACTGCAAACCTGAATATGCCAAATGGCTCTTCTTCTCGGTTTTGTTTCTAT
CGCTTATTTGCGGTTATTAC**TTTTTCTTTGCTACAGATCTTATGCCTAATAACAAGAA
TTTCTCATTG

QA 1 550 1 550
DS 



AS 2 4

CO CL2544Contig1 809 2 2 U
GGGGTTCCAATCTACGAGGGTTATGCTCTTCCACACGCAATCTTGCGTCTCGACCTTGCA
GGTCGTGATCTGACGGCCTACCTCATGAAAATCTTAACAGAGCGTGGTTACTCTTTCACC
ACAACTGCTGAGCGTGAAATCGTCAGAGACATGAAGGAGAAGCTCTCTTACATTGCCCTT
GACTACGAGCAAGAGCTCGAGACTTCCAACACCAGCTCATCTGTCGAAAAGAGCTTCGAG
CTGCCGGACGGTCAGGTGATTACCATTGGGGCAGAGCGTTTCCGATGTCCTGAAGTTTTG
TTCCAGCCATCGATGATCGGAATGGAAAATCCAGGGATCCATGAAACTACTTACAACTCG
ATCATGAAATGTGACGTGGATATCAGGAAGGATCTTTATGGGAACATTGTGCTCAGTGGT
GGAACCACAATGTTCGGTGGGATTGGTGATAGGATGAGTAAAGAGATCACCGCGTTGGCT
CCAAGCAGTATGAAGATCAAAGTGGTGGCTCCACCGGAAAGGAAGTACAGTGTCTGGATC
GGTGGCTCTATCTTGGCTTCCCTCAGTACTTTCCAGCAGATGTGGATTGCAAAGGCTGAG
TATGACGAATCTGGACCGTCGATTGTCCACAGAAAGTGCTTCTGATCAAATTCACCAAAG
TGATGATTAATCATTTTTTTCACCCTTAAAGCCAGTTTCCATCATTGTTTACCTGTCTTC
TCTGTGTTTTCGGTTATTCTTTTTCTTCATTGTTTACTATTATATAATCTTGCTTTTGAA
GTAAACCATTTAAAAAAACACATATCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH93TF U 1
AF RR2CH93JQ C 62
BS 1 680 RR2CH93TF
BS 681 809 RR2CH93JQ

RD RR2CH93TF 680 0 0
GGGGTTCCAATCTACGAGGGTTATGCTCTTCCACACGCAATCTTGCGTCTCGACCTTGCA
GGTCGTGATCTGACGGCCTACCTCATGAAAATCTTAACAGAGCGTGGTTACTCTTTCACC
ACAACTGCTGAGCGTGAAATCGTCAGAGACATGAAGGAGAAGCTCTCTTACATTGCCCTT
GACTACGAGCAAGAGCTCGAGACTTCCAACACCAGCTCATCTGTCGAAAAGAGCTTCGAG
CTGCCGGACGGTCAGGTGATTACCATTGGGGCAGAGCGTTTCCGATGTCCTGAAGTTTTG
TTCCAGCCATCGATGATCGGAATGGAAAATCCAGGGATCCATGAAACTACTTACAACTCG
ATCATGAAATGTGACGTGGATATCAGGAAGGATCTTTATGGGAACATTGTGCTCAGTGGT
GGAACCACAATGTTCGGTGGGATTGGTGATAGGATGAGTAAAGAGATCACCGCGTTGGCT
CCAAGCAGTATGAAGATCAAAGTGGTGGCTCCACCGGAAAGGAAGTACAGTGTCTGGATC
GGTGGCTCTATCTTGGCTTCCCTCAGTACTTTCCAGCAGATGTGGATTGCAAAGGCTGAG
TATGACGAATCTGGACCGTCGATTGTCCACAGAAAGTGCTTCTGATCAAATTCACCAAAG
TGATGATTAATCATTTTTTT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2CH93JQ 748 0 0
GTCGTGATCTGACGGCCTACCTCATGAAAATCTTAACAGAGCGTGGTTACTCTTTCACCA
CAACTGCTGAGCGTGAAATCGTCAGAGACATGAAGGAGAAGCTCTCTTACATTGCCCTTG
ACTACGAGCAAGAGCTCGAGACTTCCAACACCAGCTCATCTGTCGAAAAGAGCTTCGAGC
TGCCGGACGGTCAGGTGATTACCATTGGGGCAGAGCGTTTCCGATGTCCTGAAGTTTTGT
TCCAGCCATCGATGATCGGAATGGAAAATCCAGGGATCCATGAAACTACTTACAACTCGA
TCATGAAATGTGACGTGGATATCAGGAAGGATCTTTATGGGAACATTGTGCTCAGTGGTG
GAACCACAATGTTCGGTGGGATTGGTGATAGGATGAGTAAAGAGATCACCGCGTTGGCTC
CAAGCAGTATGAAGATCAAAGTGGTGGCTCCACCGGAAAGGAAGTACAGTGTCTGGATCG
GTGGCTCTATCTTGGCTTCCCTCAGTACTTTCCAGCAGATGTGGATTGCAAAGGCTGAGT
ATGACGAATCTGGACCGTCGATTGTCCACAGAAAGTGCTTCTGATCAAATTCACCAAAGT
GATGATTAATCATTTTTTTCACCCTTAAAGCCAGTTTCCATCATTGTTTACCTGTCTTCT
CTGTGTTTTCGGTTATTCTTTTTCTTCATTGTTTACTATTATATAATCTTGCTTTTGAAG
TAAACCATTTAAAAAAACACATATCAGT

QA 1 748 1 748
DS 



CO CL2544Contig2 579 2 1 U
GAACACCAGCTCATCTGTCGAAAAGAGCTTCGAGCTGCCAGACGGTCAGGTGATAACCAT
CGGGGCAGATCGTTTCCGATGTCCCGAAGTTTTGTTCCAGCCATCGATGATCGGAATGGA
AAATCCAGGGATCCATGAAACTACTTACAACTCGATCATGAAATGTGACGCGGATATCAG
GAAGGATCTGTATGGGAACATTGTGCTCAGTGGTGGAACTACAATGTTCGGTGGGATTGG
TGATAGGATGAGTAAAGAGATCACCGCGTTGGCTCCAAGCAGTATGAAGATCAAAGTGGT
GGCTCCACCGGAAAGGAAGTACAGTGTCTGGATCGGTGGCTCTATCTTGGCTTCCCTCAG
TACTTTCCAGCAGATGTGGATTGCAAAGGCAGAGTATGACGAATCTGGACCTTCAATTGT
CCACAGAAAGTGCTTCTGATCAAATTCACCAAAGTGATGATTAATCATTTTTTTCACCCT
TAAAGCCAGTTTCCATCATTGTTTACCTGTCTTCTCTGTGTTTTCGGTTATTCTTCTTCT
TCTTCATTGTTTACTATTATATAATCTTGCTTTTGAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G945TF U 1
AF RR2G945JQ C 14
BS 1 579 RR2G945TF

RD RR2G945TF 579 0 0
GAACACCAGCTCATCTGTCGAAAAGAGCTTCGAGCTGCCAGACGGTCAGGTGATAACCAT
CGGGGCAGATCGTTTCCGATGTCCCGAAGTTTTGTTCCAGCCATCGATGATCGGAATGGA
AAATCCAGGGATCCATGAAACTACTTACAACTCGATCATGAAATGTGACGCGGATATCAG
GAAGGATCTGTATGGGAACATTGTGCTCAGTGGTGGAACTACAATGTTCGGTGGGATTGG
TGATAGGATGAGTAAAGAGATCACCGCGTTGGCTCCAAGCAGTATGAAGATCAAAGTGGT
GGCTCCACCGGAAAGGAAGTACAGTGTCTGGATCGGTGGCTCTATCTTGGCTTCCCTCAG
TACTTTCCAGCAGATGTGGATTGCAAAGGCAGAGTATGACGAATCTGGACCTTCAATTGT
CCACAGAAAGTGCTTCTGATCAAATTCACCAAAGTGATGATTAATCATTTTTTTCACCCT
TAAAGCCAGTTTCCATCATTGTTTACCTGTCTTCTCTGTGTTTTCGGTTATTCTTCTTCT
TCTTCATTGTTTACTATTATATAATCTTGCTTTTGAAGT

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2G945JQ 566 0 0
TCTGTCGAAAAGAGCTTCGAGCTGCCAGACGGTCAGGTGATAACCATCGGGGCAGATCGT
TTCCGATGTCCCGAAGTTTTGTTCCAGCCATCGATGATCGGAATGGAAAATCCAGGGATC
CATGAAACTACTTACAACTCGATCATGAAATGTGACGCGGATATCAGGAAGGATCTGTAT
GGGAACATTGTGCTCAGTGGTGGAACTACAATGTTCGGTGGGATTGGTGATAGGATGAGT
AAAGAGATCACCGCGTTGGCTCCAAGCAGTATGAAGATCAAAGTGGTGGCTCCACCGGAA
AGGAAGTACAGTGTCTGGATCGGTGGCTCTATCTTGGCTTCCCTCAGTACTTTCCAGCAG
ATGTGGATTGCAAAGGCAGAGTATGACGAATCTGGACCTTCAATTGTCCACAGAAAGTGC
TTCTGATCAAATTCACCAAAGTGATGATTAATCATTTTTTTCACCCTTAAAGCCAGTTTC
CATCATTGTTTACCTGTCTTCTCTGTGTTTTCGGTTATTCTTCTTCTTCTTCATTGTTTA
CTATTATATAATCTTGCTTTTGAAGT

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 4

CO CL2545Contig1 801 4 5 U
CCACAAAGCTAATTATATAACTTCGTTTAGTATAGTAAAACCATTGCATGAACCTATCAG
CTTTATAGTATAGTAAAACCATTGCATGAACCTAATCAGCTTTATACAATACAGTAGCAG
CTGGGCCATATTCACTAAGGTATATAAATTTTATGATGATAAAATTAAAAAATATGAGAT
ATCCGCAACATTCTCTAAGCAGAGCATTTGTTCAGGACAACAGATTCAATAGGAATCTTA
TCAACAGGAAAAGCACAGTCAATGGGAGATTTCTCTGGTAACAAGCTACACGGTTTTGGC
GTCACCTTGCTCGAAATTCCGGAAATGGCCGTACAATTCCACAGCAACTTCTTGGGCTCA
GCAGCCAAAGCAATGTTTATATTCGACATACATATCTTTGTGAAAGGATCGTTGGTGAAC
CCATCGAGCCTAGCGGGCTGCGTAACGTTATCCGCGGTCATGTCACGGTAATTAATATTC
GTAATCTCGGGCATAGCCTTGGGGTCATAACCTGAAGCAGGGTGTTGGTTATAGGCACCA
CTCATCCAGAAAACGTATTTCATTGTCTTCATTGTGAACCTTCGAGCAAAGATATCTTTA
ACGTAACCTCCACGACCAACAGCTGTTTTGATTCGGATAGCGGATTGTGTCTGAAGCAAC
GTTATGCCTTCCATCCTAACGTCTTTGATTCCTCCGGACATTTCACTTCCGAGTGCTATT
CCAGCACTATCGGGAGATATGCATGTAAGCCTTCGGATCGAGAGTTGCTGAGTTGGCATG
CCGACTTTGATACCGAACTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI52JQ U 1
AF RR2EO68JQ U 62
AF RR2FW08JQ U 46
AF RR2DI52TF C 20
BS 1 201 RR2DI52JQ
BS 202 202 RR2EO68JQ
BS 203 467 RR2DI52JQ
BS 468 634 RR2EO68JQ
BS 635 801 RR2DI52TF

RD RR2DI52JQ 467 0 0
CCACAAAGCTAATTATATAACTTCGTTTAGTATAGTAAAACCATTGCATGAACCTATCAG
CTTTATAGTATAGTAAAACCATTGCATGAACCTAATCAGCTTTATACAATACAGTAGCAG
CTGGGCCATATTCACTAAGGTATATAAATTTTATGATGATAAAATTAAAAAATATGAGAT
ATCCGCAACATTCTCTAAGCAAAGCATTTGTTCAGGACAACAGATTCAATAGGAATCTTA
TCAACAGGAAAAGCACAGTCAATGGGAGATTTCTCTGGTAACAAGCTACACGGTTTTGGC
GTCACCTTGCTCGAAATTCCGGAAATGGCCGTACAATTCCACAGCAACTTCTTGGGCTCA
GCAGCCAAAGCAATGTTTATATTCGACATACATATCTTTGTGAAAGGATCGTTGGTGAAC
CCATCGAGCCTAGCGGGCTGCGTAACGTTATCCGCGGTCATGTCACG

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2EO68JQ 577 0 0
TTTATAGTATAGTAAAACCATTGCATGAACCTAATCAGCTTTATACAATACAGTAGCAGC
TGGGCCATGTTCACTAGGGTATATAAATTTTATGATGATAAAATTAAAAAATATGAGATA
TCCGCAACATTCTCTAAGCAGAACATTTGTTCAGGACAACAGATTCAATAGGAATCTTAT
CAACAGGAAAAGCACAGTCAATGGGAGATTTCTCTGGTAACAAGCTACACGGTTTTGGCG
TCACCTTGCTCGAAATTCCGGAAATGGCCGTACAATTCCACAGCAACTTCTTGGGCTCAG
CAGCCAAAGCAATGTTTATATTCGACATACATATCTTTGTGAAAGGATCGTTGATGAACC
CATCGAGCCTAGCGGGCTGCGTAACGTTATCTGCGGTCATGTCACGGTAATTAATATTCG
TAATCTCGGGCATAGCCTTGGGGTCATAACCTGAAGCAGGGTGTTGGTTATAGGCACCAC
TCATCCAGAAAACGTATTTCATTGTCTTCATTGTGAACCTTCGAGCAAAGATATCTTTAA
CGTAACCTCCACGACCAACAGCTGTTTTGATTC
CGAT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2FW08JQ 593 0 0
GTATGAAC
CTATCAGCTTTATAGTATAGTAAAACCATTGCATGAACCTAATCAGCTTTATACAATACA
GTAGCAGCTGGGCCATGTTCACTAAGGTATATAAATTTTATGATGATAAAATTAAAAAAT
ATGAGATATCCGCAACATTCTCTAAGCAGAGCATTTGTTCAGGACAACAGATTCAATAGG
AATCTTATCAACAGGAAAAGCACAGTCAATGGGAGATTTCTCTGGTAACAAGCTACACGG
TTTTGGCGTCACCTTGCTCGAAATTCCGGAAATGGCCGTACAATTCCACAGCAACTTCTT
GGGCTCAGCAGCCAAAGCAATGTTTATATTCGACATACATATCTTTGTGAAAGGATCGTT
GGTGAACCCATCGAGCCTAGCGGGCTGCGTAACGTTATCCGCGGTCATGTCACGGTAATT
AATATTCGTAATCTCGGGCATAGCCTTGGGGTCATAACCTGAAGCAGGGTGTTGGTTATA
GGCACCACTCATCCAGAAAACGTATTTCATTGTCTTCATTGTGAACCTTCGAGCAAAGAT
ATCTTTAACGTAACCTCCACGACCAACAGCTGTTTTGATTC
GGAT

QA 9 589 9 589
DS 

RD RR2DI52TF 782 0 0
ATACTCG
TTAGTATAGTAAA*CCATTGCATGA**CTATCAGCTTTATAGTATAGTAAA*CCATTGCA
TGAAC*TAATCAGCTTTATACAATACAGTAGCAGCTGGGCCATATTCACTAAGGTATATA
AATTTTATGATGATAAAATTAAAAAATATGAGATATCCGCAACATTCTCTAAGCAGAGCA
TTTGTTCAGGACAACAGATTCAATAGGAATCTTATCAACAGGAAAAGCACAGTCAATGGG
AGATTTCTCTGGTAACAAGCTACACGGTTTTGGCGTCACCTTGCTCGAAATTCCGGAGAT
GGCCGTACAATTCCACAGCAACTTCTTGGGCTCAGCAGCCAAAGCAATGTTTATATTCGA
CATACATATCTTTGTGAAAGGATCGTTGGTGAACCCATCGAGCCTAGCGGGCTGCGTAAC
GTTATCCGCGGTCATGTCACGGTAATTAATATTCGTAATCTCGGGCATAGCCTTGGGGTC
ATAACCTGAAGCAGGGTGTTGGTTATAGGCACCACTCATCCAGAAAACGTATTTCATTGT
CTTCATTGTGAACCTTCGAGCAAAGATATCTTTAACGTAACCTCCACGACCAACAGCTGT
TTTGATTCGGATAGCGGATTGTGTCTGAAGCAACGTTATGCCTTCCATCCTAACGTCTTT
GATTCCTCCGGACATTTCACTTCCGAGTGCTATTCCAGCACTATCGGGAGATATGCATGT
AAGCCTTCGGATCGAGAGTTGCTGAGTTGGCATGCCGACTTTGATACCGAACTGC

QA 8 782 8 782
DS 



AS 1 4

CO CL2546Contig1 1233 4 26 U
ATCTGCAAGAATAAGAACAAGAAGAAGAGAGAAACTGATAAGAGAAAGAAAGATAAAGGA
AACTGAAGAAGAACAAGAAGAAGATTGGCCACGTTTTCTAGTGGTTTTGATTCGTTTCTT
CCTAGCTGATTAACGATGCCGAGTTCTATGGAGTGCTCTGCAAAACGGAGATCGTCCTCA
GGGAAGCCGAGCTTCTCGCTAACGTGTAGTCGATTGAGTCAGTATTTGAAGGAGAACGGT
AGCTTTGGAGATCTTAGCTTAGGGATGTCATGCATGCCTGAGACCAACGTCATCTCACGT
AAGCCTACAACAACCATGAGTTTATTCCCTTGTGAAGCTTCCAACGTGGATTCCATGGCC
CCTGCTCAAGACGTAAAACCCAAGAATCTGTTTCCTAGGCAACCAAGCTTTTCTTCCTCA
TCTTCCTCTCTCCCCAAGGAAGATGTCCCCAAAATGACACAGACTACTTCTTCTAGATCT
GTGAAACCAGAACGTCAAACTGCTCCGTTGACTATATTCTACGGTGGGCAAGTGATTGTG
TTCAATGACTTTTCTGCTGAGAAAGCCAAAGAAGTTATGAACTTGGCTAGCAAAGGAACC
GCTAATACCTTCACGGGTTTCACATCTACTGTTAACAACAACAACAACAACATCGCTCCT
ACACCAAACCAAGTTCCTCATTTCATGAAAACCGTAACACAAGAGCCAATCAAATCCTCC
TCAGCTGCAATGGCATGCGAACTTCCAATTGCTAGAAGAGCTTCACTTCATCGGTTCTTG
GCAAAGAGAAAGGATAGGGTTACATCAAAGGCACCATACCAGTTAAACGATCCAGCCAAA
GCGTCCACAAAGCCTCAAACCGGAAACAACACCACCTCTTGGCTTGGTTTATCAGCTGAA
ATGTGACGTGATACCGCTAAACCACAATAAACCGTACCGGGCTATTCTTTTGACGTTGCA
TCAATAAAACAAGAAGAACAAAACTCCTGCGTCCATGGTTCTTAATTATATTCATTTCAC
AACTATTTAATTAGTAGGAAATTTCATATATTTGTATGTATGTGATTAGTATATGATTAG
CGATCAATTCTTGTTAGCGTCTGTCGTTACTAGGTACTTAGTATCATGTCTGTCTAAATC
CCCTATCTCTGGGTTATGTCAAGATTAGTCTCGTATGTTACTGGTTTTGTAAGAACAACA
AATTTTGTTTACGACTACACTAAACTTTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F459TF U 1
AF RR2D980TF U 172
AF RR2F459JQ C 443
AF RR2D980JQ C 511
BS 1 359 RR2F459TF
BS 360 361 RR2D980TF
BS 362 367 RR2F459TF
BS 368 368 RR2D980TF
BS 369 371 RR2F459TF
BS 372 372 RR2D980TF
BS 373 374 RR2F459TF
BS 375 375 RR2D980TF
BS 376 419 RR2F459TF
BS 420 420 RR2D980TF
BS 421 746 RR2F459TF
BS 747 747 RR2D980TF
BS 748 759 RR2F459TF
BS 760 868 RR2D980TF
BS 869 869 RR2F459JQ
BS 870 922 RR2D980TF
BS 923 949 RR2F459JQ
BS 950 951 RR2D980JQ
BS 952 1013 RR2F459JQ
BS 1014 1014 RR2D980JQ
BS 1015 1116 RR2F459JQ
BS 1117 1117 RR2D980JQ
BS 1118 1119 RR2F459JQ
BS 1120 1124 RR2D980JQ
BS 1125 1173 RR2F459JQ
BS 1174 1233 RR2D980JQ

RD RR2F459TF 759 0 0
ATCTGCAAGAATAAGAACAAGAAGAAGAGAGAAACTGATAAGAGAAAGAAAGATAAAGGA
AACTGAAGAAGAACAAGAAGAAGATTGGCCACGTTTTCTAGTGGTTTTGATTCGTTTCTT
CCTAGCTGATTAACGATGCCGAGTTCTATGGAGTGCTCTGCAAAACGGAGATCGTCCTCA
GGGAAGCCGAGCTTCTCGCTAACGTGTAGTCGATTGAGTCAGTATTTGAAGGAGAACGGT
AGCTTTGGAGATCTTAGCTTAGGGATGTCATGCATGCCTGAGACCAACGTCATCTCACGT
AAGCCTACAACAACCATGAGTTTATTCCCTTGTGAAGCTTCCAACGTGGATTCCATGGCT
GCTGCTCCAGATGTTAAACCCAAGAATCTGTTTCCTAGGCAACCAAGCTTTTCTTCCTCG
TCTTCCTCTCTCCCCAAGGAAGATGTCCCCAAAATGACACAGACTACTTCTTCTAGATCT
GTGAAACCAGAACGTCAAACTGCTCCGTTGACTATATTCTACGGTGGGCAAGTGATTGTG
TTCAATGACTTTTCTGCTGAGAAAGCCAAAGAAGTTATGAACTTGGCTAGCAAAGGAACC
GCTAATACCTTCACGGGTTTCACATCTACTGTTAACAACAACAACAACAACATCGCTCCT
ACACCAAACCAAGTTCCTCATTTCATGAAAACCGTAACACAAGAGCCAATCAAATCCTCC
TCAGCTGCAATGGCATGCGAACTTCCGATTGCTAGAAGA

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2D980TF 764 0 0
G
CGTCCTCAGGGAAGCCGAGCTTCTCGCTAACGTGTAGTCGATTGAGTCAGTATTTGAAGG
AGAACGGTAGCTTTGGAGATCTTAGCTTAGGGATGTCATGCATGCCTGAGACCAACGTCA
TCTCACGTAAGCCTACAACAACCATGAGTTTATTCCCTTGTGAAGCTTCCAACGTGGATT
CCATGGCCCCTGCTCAAGACGTAAAACCCAAGAATCTGTTTCCTAGGCAACCAAGCTTTT
CTTCCTCATCTTCCTCTCTCCCCAAGGAAGATGTCCCCAAAATGACACAGACTACTTCTT
CTAGATCTGTGAAACCAGAACGTCAAACTGCTCCGTTGACTATATTCTACGGTGGGCAAG
TGATTGTGTTCAATGACTTTTCTGCTGAGAAAGCCAAAGAAGTTATGAACTTGGCTAGCA
AAGGAGCCGCTAATACCTTCACGGGTTTCACATCTACTGTTAACAACAACAACAACA***
TCGCTCCTACACCAAACCAAGTTCCTCATTTCATGAAAACCGTAACACAAGAGCCAATCA
AATCCTCCTCATCTGCAATGGCATGCGAACTTCCAATTGCTAGAAGAGCTTCACTTCATC
GGTTCTTGGCAAAGAGAAAGGATAGGGTTACATCAAAGGCACCATACCAGTTAAACGATC
CAGCCAAAGCGTCCACAAAGCCTCAAACCGGAAACA*CACCACCTCTTGGCTTGGTTTAT
CAGCTGAAATGTGACGTGATACCGCTAAAC
ACAATAACCGTAC

QA 2 751 2 751
DS 

RD RR2F459JQ 733 0 0
ATGTCCCCAAAATGACACAGACTACTTCTTCTAGATCTGTGAAACCAGAACGTCAAACTG
CTCCGTTGACTATATTCTACGGTGGGCAAGTGATTGTGTTCAATGACTTTTCTGCTGAGA
AAGCCAAAGAAGTTATGAACTTGGCTAGCAAAGGAACCGCTAATACCTTCACGGGTTTCA
CATCTACTGTTAACAACAACAACAACAACATCGCTCCTACACCAAACCAAGTTCCTCATT
TCATGAAAACCGTAACACAAGAGCCAATCAAATCCTCCTCAGCTGCAATGGCATGCGAAC
TTCCGATTGCTAGAAGAGCTTCACTTCATCGGTTCTTGGCAAAGAGAAAGGATAGGGTTA
CATCAAAGGCACCATACCAGTTAAACGATCCAGCCAAAGCGTCCACAAAGCCTCAAACCG
GAAACAACACCACTTCTTGGCTTGGTTTATCAGCCGAAATGTGACGTGATACCGCTAAAC
CACAATAAACCGTACCGGGCTATTCTT**GACGTTGCATCAATAAAACAAGAAGAACAAA
ACTCCTGCGTCCATGGTTCTTAATTATATTCTTTTCACAACTATTTAATTAGTAGGAAAT
TTCATATATTTGTATGTATGTGATTAGTATATGATTAGCGATCAATTCTTGTTAGCGTCT
GTCGTTACTAGGTATTTG****CATGTCTGTCTAAATCCCCTATCTCTGGGTTATGTCAA
GATTAGTCTCG
AG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2D980JQ 723 0 0
ACTATATTCTACGGTGGGCAAGTGATTGTGTTCAATGACTTTTCTGCTGAGAAAGCCAAA
GAAGTTATGAACTTGGCTAGCAAAGGAGCCGCTAATACCTTCACGGGTTTCACATCTACT
GTTAACAACAACAACAACA***TCGCTCCTACACCAAACCAAGTTCCTCATTTCATGAAA
ACCGTAACACAAGAGCCAATCAAATCCTCCTCATCTGCAATGGCATGCGAACTTCCAATT
GCTAGAAGAGCTTCACTTCATCGGTTCTTGGCAAAGAGAAAGGATAGGGTTACATCAAAG
GCACCATACCAGTTAAACGATCCAGCCAAAGCGTCCACAAAGCCTCAAACCGGAAACAAC
ACCACCTCTTGGCTTGGTTTATCAGCTGAAATGTGACGTGATACCGCTAAACCACAATAA
ACCGTACCGGGCTATTCTTTTGACGTTGCATCAATAAAACAAGAA***CAAAACTCCTGC
GTCCATGGTTCTTAATTATATTCATTTCACAACTATTTAATTAGTAGGAAATTTCATATA
TTTGTATGTATGTGATTAGTATATGATTAGCGATCAATTCTTGTTAGCGTCTGTCGTTTC
TAGGTACTTAGTATCATGTCTGTCTAAATCCCCTGTTTCTGGGTTATGTCAAGATTAGTC
TCGTATGTTACTGGTTTTGTAAGAACAACAAATTTTGTTTACGACTACACTAAACTTTGT
TTC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 2 4

CO CL2547Contig1 837 2 2 U
GACGACCATTGCAGTAAGAGATAGAAGAATGTCTGGAATGGTGGTAGATGCGAGCTCGTG
GGGAGCAGCGTTGGTGAGAATCTCCCCGTACACATTCTCCGCAATCGGAATCGCCATCTC
GATCGGCGTCTCAGTCCTCGGTGCCGCTTGGGGAATTTACATAACGGGAAGTAGTTTGAT
CGGTGCTGCCATTGAAGCCCCTCGTATCACTTCCAAAAATCTCATCAGTGTAATCTTTTG
CGAAGCTGTAGCTATATATGGCGTTATTGTTGCAATCATACTGCAAACGAAGTTGGAGAG
TGTCCCAACTTCAAAGATGTATGACGCTGAGTCTCTTAGAGCTGGTTATGCAATCTTCGC
ATCTGGAGTCATTGTTGGATTCGCTAACCTTGTATGCGGGTTATGTGTAGGAATCATTGG
AAGCAGCTGCGTATTGTCAGATGCTCAGAACTCAACCCTCTTTGTGAAGATTCTTGTGAT
TGAGATCTTTGGAAGCGCTCTCGGGTTGTTTGGAGTTATTGTGGGGATCATTATGTCCGC
ACAAGCAACGTGGCCAACCAAGTAGATATGAACCTGTCTGAAACTGTTGTGATCTCTGGG
TATCTTCATTGTAATATGGATATTTTCATTAGTGTCTAGAAGAAAAATCTGTGTGAGAGA
ACTCAGAATCTTTTTTGGGATTCCTGATTTTTTTGTATTGTTTAAAACTTTGTAATAATT
GGAGAACATCTTCTTCATCATGTTTGTATTCTCGTTGTGTTTTTTCTTTGAAACTAAGAC
AAGAGTTTGTATATGATTTGTTGGTTAATTATTGAAATTTAATGTTTCATCCAGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E749TF U 1
AF RR2E749JQ C 91
BS 1 687 RR2E749TF
BS 688 837 RR2E749JQ

RD RR2E749TF 687 0 0
GACGACCATTGCAGTAAGAGATAGAAGAATGTCTGGAATGGTGGTAGATGCGAGCTCGTG
GGGAGCAGCGTTGGTGAGAATCTCCCCGTACACATTCTCCGCAATCGGAATCGCCATCTC
GATCGGCGTCTCAGTCCTCGGTGCCGCTTGGGGAATTTACATAACGGGAAGTAGTTTGAT
CGGTGCTGCCATTGAAGCCCCTCGTATCACTTCCAAAAATCTCATCAGTGTAATCTTTTG
CGAAGCTGTAGCTATATATGGCGTTATTGTTGCAATCATACTGCAAACGAAGTTGGAGAG
TGTCCCAACTTCAAAGATGTATGACGCTGAGTCTCTTAGAGCTGGTTATGCAATCTTCGC
ATCTGGAGTCATTGTTGGATTCGCTAACCTTGTATGCGGGTTATGTGTAGGAATCATTGG
AAGCAGCTGCGTATTGTCAGATGCTCAGAACTCAACCCTCTTTGTGAAGATTCTTGTGAT
TGAGATCTTTGGAAGCGCTCTCGGGTTGTTTGGAGTTATTGTGGGGATCATTATGTCCGC
ACAAGCAACGTGGCCAACCAAGTAGATATGAACCTGTCTGAAACTGTTGTGATCTCTGGG
TATCTTCATTGTAATATGGATATTTTCATTAGTGTCTAGAAGAAAAATCTGTGTGAGAGA
ACTCAGAATCTTTTTTGGGATTCCTGA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2E749JQ 747 0 0
CACATTCTCCGCAATCGGAATCGCCATCTCGATCGGCGTCTCAGTCCTCGGTGCCGCTTG
GGGAATTTACATAACGGGAAGTAGTTTGATCGGTGCTGCCATTGAAGCCCCTCGTATCAC
TTCCAAAAATCTCATCAGTGTAATCTTTTGCGAAGCTGTAGCTATATATGGCGTTATTGT
TGCAATCATACTGCAAACGAAGTTGGAGAGTGTCCCAACTTCAAAGATGTATGACGCTGA
GTCTCTTAGAGCTGGTTATGCAATCTTCGCATCTGGAGTCATTGTTGGATTCGCTAACCT
TGTATGCGGGTTATGTGTAGGAATCATTGGAAGCAGCTGCGTATTGTCAGATGCTCAGAA
CTCAACCCTCTTTGTGAAGATTCTTGTGATTGAGATCTTTGGAAGCGCTCTCGGGTTGTT
TGGAGTTATTGTGGGGATCATTATGTCCGCACAAGCAACGTGGCCAACCAAGTAGATATG
AACCTGTCTGAAACTGTTGTGATCTCTGGGTATCTTCATTGTAATATGGATATTTTCATT
AGTGTCTAGAAGAAAAATCTGTGTGAGAGAACTCAGAATCTTTTTTGGGATTCCTGATTT
TTTTGTATTGTTTAAAACTTTGTAATAATTGGAGAACATCTTCTTCATCATGTTTGTATT
CTCGTTGTGTTTTTTCTTTGAAACTAAGACAAGAGTTTGTATATGATTTGTTGGTTAATT
ATTGAAATTTAATGTTTCATCCAGTCG

QA 1 747 1 747
DS 



CO CL2547Contig2 782 2 4 U
GGACGACCATTGCAGTAAGAGATAGAAGAATGTCTGGAATGGTGGTAGATGCGAGCTCGT
GGGGAGCAGCGTTGGTGAGAATCTCTCCGTACACATTCTCCGCAATCGGAATCGCCATCT
CGATCGGCGTCTCAGTCCTCGGTGCCGCCTGGGGGATTTACATAACGGGAAGTAGTTTGA
TCGGTGCGGCCATTGAAGCTCCTCGTATCACTTCCAAGAATCTCATCAGTGTAATCTTTT
GCGAAGCTGTAGCTATATATGGCGTTATTGTTGCAATCATACTGCAAACGAAGTTGGAGA
GTGTCCCAACCTCGAAGATGTATGACGCTGAGTCTCTTAGAGCTGGTTATGCAATCTTCG
CATCTGGAATCATTGTTGGATTCGCCAACCTTGTATGCGGGTTATGTGTAGGAATCATTG
GAAGCAGCTGCGCATTGTCAGATGCTCAGAACTCCACACTCTTTGTGAAGATTCTTGTGA
TTGAGATCTTTGGAAGCGCTCTCGGGTTGTTTGGTGTTATTGTGGGGATCATTATGTCCG
CACAAGCAACGTGGCCAACCAAGTAGATATAAACCTGTTGTGATCTCTGGTATCTTCATT
GTTATATGGATACTCTCATTAGTGTCTAGAAGAAAAATCTGTGTGAGAACTCAGAAATCT
TTTTTGGGATTCCTGAAGTTTTTTTTGTATTGTTTAAAACTTTGTAATAATTGGAGAACA
TCTTCTTCATCGTGTTTGTATTCTCGTTGTTTTTTCTTTGAAACAAAGACAAGAGTTTGT
AT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2ES29TF U 1
AF RR2ES29JQ C 49
BS 1 614 RR2ES29TF
BS 615 615 RR2ES29JQ
BS 616 620 RR2ES29TF
BS 621 782 RR2ES29JQ

RD RR2ES29TF 620 0 0
GGACGACCATTGCAGTAAGAGATAGAAGAATGTCTGGAATGGTGGTAGATGCGAGCTCGT
GGGGAGCAGCGTTGGTGAGAATCTCTCCGTACACATTCTCCGCAATCGGAATCGCCATCT
CGATCGGCGTCTCAGTCCTCGGTGCCGCCTGGGGGATTTACATAACGGGAAGTAGTTTGA
TCGGTGCGGCCATTGAAGCTCCTCGTATCACTTCCAAGAATCTCATCAGTGTAATCTTTT
GCGAAGCTGTAGCTATATATGGCGTTATTGTTGCAATCATACTGCAAACGAAGTTGGAGA
GTGTCCCAACCTCGAAGATGTATGACGCTGAGTCTCTTAGAGCTGGTTATGCAATCTTCG
CATCTGGAATCATTGTTGGATTCGCCAACCTTGTATGCGGGTTATGTGTAGGAATCATTG
GAAGCAGCTGCGCATTGTCAGATGCTCAGAACTCCACACTCTTTGTGAAGATTCTTGTGA
TTGAGATCTTTGGAAGCGCTCTCGGGTTGTTTGGTGTTATTGTGGGGATCATTATGTCCG
CACAAGCAACGTGGCCAACCAAGTAGATATAAACCTGTTGTGATCTCTGGTATCTTCATT
GTTATATGGATACTTTCATT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2ES29JQ 734 0 0
ATGCGAGCTCGTGGGGAGCAGCGTTGGTGAGAATCTCTCCGTACACATTCTCCGCAATCG
GAATCGCCATCTCGATCGGCGTCTCAGTCCTCGGTGCCGCCTGGGGGATTTACATAACGG
GAAGTAGTTTGATCGGTGCGGCCATTGAAGCTCCTCGTATCACTTCCAAGAATCTCATCA
GTGTAATCTTTTGCGAAGCTGTAGCTATATATGGCGTTATTGTTGCAATCATACTGCAAA
CGAAGTTGGAGAGTGTCCCAACCTCGAAGATGTATGACGCTGAGTCTCTTAGAGCTGGTT
ATGCAATCTTCGCATCTGGAATCATTGTTGGATTCGCCAACCTTGTATGCGGGTTATGTG
TAGGAATCATTGGAAGCAGCTGCGCATTGTCAGATGCTCAGAACTCCACACTCTTTGTGA
AGATTCTTGTGATTGAGATCTTTGGAAGCGCTCTCGGGTTGTTTGGTGTTATTGTGGGGA
TCATTATGTCCGCACAAGCAACGTGGCCAACCAAGTAGATATAAACCTGTTGTGATCTCT
GGTATCTTCATTGTTATATGGATACTCTCATTAGTGTCTAGAAGAAAAATCTGTGTGAGA
ACTCAGAAATCTTTTTTGGGATTCCTGAAGTTTTTTTTGTATTGTTTAAAACTTTGTAAT
AATTGGAGAACATCTTCTTCATCGTGTTTGTATTCTCGTTGTTTTTTCTTTGAAACAAAG
ACAAGAGTTTGTAT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 3

CO CL2548Contig1 865 3 12 U
CGGTTTAAATAATTCATTACAAAACAAGAACAGGAAAAATCTGTGACAGGGACATAATCT
ACTGCTTGGAGAACTTTAGAACAGCAAGGTAAAGTCCTTGTTCATCAACAAACTGAGTTA
ACTCAAACGAATGCTTCTCAGCAACACTCCTCAAGGGGGAGTCATCAGGTAAATCAGAGA
CGACCACATCTGAAAACTCCTTCCTTTGCTGCTTTAAACCTTCTCTACCTTGCGGGTGAC
TGATCACTACTCGTGCACCTGAGGAACAACATTGAGACAGTGTCTTGAACACCTCGTCCA
GACCGAAAGGCAGAGCTGGAAGAAAGTAGAGAAACACGACATCTAAGGGAGACCATTTCT
CTGGAACATAGATCAACTCTCCCTGCCAACACTTGACTTTGTCGTATTTTTCTTTGACAC
AGGCTAACACGAAAAGAGAGTCGTGGACTATAAGCAAGAGCTGGGAAGGTGAAGATTCCA
CCAGACGATCAACGAACCCTTCTGAGCTGATAGAAACTAAAACCCTCGAAGACTCTGTTA
CTTCTCCAGCCTTGATGATCTTTTCGAGCTTCTGGTTCTGTTCGGTTTCCATGGATTCGA
GAAAGGACCAATCTTTCTCATGGAAATCGACCATCGAGACTGTTTCCTCTGGTGTGGAAG
AAGAGGAAACGGAAAATGCTCTGTGACGAGAGACATCAGACTGTTTAGTGGAGAACGAAA
GAAGCTTAGGAGAAAGGTAGTGACTTTGAAGACGAGTTAGCTTCTCTGGTTTCGAAGAAT
TGAAGACAGACAGAGAAGGTAGAAGGGTCGAAGAAGAAGATGGAAACGAAAGGGAATGCA
TTGGTAACTGCAGCTTCTGTACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC89JQ U 11
AF RR2EC58JQ U 1
AF RR2EC58TF C 226
BS 1 61 RR2EC58JQ
BS 62 62 RR2EC89JQ
BS 63 64 RR2EC58JQ
BS 65 65 RR2EC89JQ
BS 66 84 RR2EC58JQ
BS 85 85 RR2EC89JQ
BS 86 156 RR2EC58JQ
BS 157 157 RR2EC89JQ
BS 158 195 RR2EC58JQ
BS 196 196 RR2EC89JQ
BS 197 710 RR2EC58JQ
BS 711 865 RR2EC58TF

RD RR2EC89JQ 456 0 0
AAC
TCATTACAAAACAAGAAGAGGAAAAATCTGTGACAGGGACATAATCTACTGCTTGGAGAA
CTTTAGAACAGCAAGGTAAAGTCCTTGTTCATCAACAAACTGAGTTAACTCAAACGAATG
CTTCTTAGCAACACTCCTCAAGGGGGAGTCATCAGGTAAATCAGAGACGACCACATCTGA
AAACTCCTTCCTTTGCTGCTTTAACCCTTCTCTACCTTGCGGATGACTGATCACTACTCG
TGCACCTGAGGAACAAAGTTGAGACAGTGTCTTAAACACCTCGTCCAGACCGAAAGGCAG
AGCTGGAAGAAAGTAGAGAAACACGACATCTAAGGGAGACCATTTCTCTGGAACATAGAT
CAGTTCTCCCTGCCAACACTTGACTTTGTCGTATTTTTCTTTGACACAGGCTAACACGAA
AAGAGAGTCGTGGACTATAAGCAAGAGCTGGGA

QA 4 456 4 456
DS 

RD RR2EC58JQ 710 0 0
CGGTTTAAATAATTCATTACAAAACAAGAACAGGAAAAATCTGTGACAGGGACATAATCT
ATTGTTTGGAGAACTTTAGAACAGTAAGGTAAAGTCCTTGTTCATCAACAAACTGAGTTA
ACTCAAACGAATGCTTCTCAGCAACACTCCTCAAGGTGGAGTCATCAGGTAAATCAGAGA
CGACCACATCTGAAAGCTCCTTCCTTTGCTGCTTTAAACCTTCTCTACCTTGCGGGTGAC
TGATCACTACTCGTGCACCTGAGGAACAACATTGAGACAGTGTCTTGAACACCTCGTCCA
GACCGAAAGGCAGAGCTGGAAGAAAGTAGAGAAACACGACATCTAAGGGAGACCATTTCT
CTGGAACATAGATCAACTCTCCCTGCCAACACTTGACTTTGTCGTATTTTTCTTTGACAC
AGGCTAACACGAAAAGAGAGTCGTGGACTATAAGCAAGAGCTGGGAAGGTGAAGATTCCA
CCAGACGATCAACGAACCCTTCTGAGCTGATAGAAACTAAAACCCTCGAAGACTCTGTTA
CTTCTCCAGCCTTGATGATCTTTTCGAGCTTCTGGTTCTGTTCGGTTTCCATGGATTCGA
GAAAGGACCAATCTTTCTCATGGAAATCGACCATCGAGACTGTTTCCTCTGGTGTGGAAG
AAGAGGAAACGGAAAATGCTCTGTGACGAGAGACATCAGACTGTTTAGTG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2EC58TF 640 0 0
TACCTTGCGGGTGACTGATCACTACTCGTGCAC*TGAGGAACAACATTGAGACAGTGTCT
TGAACACCTCGTCCAGACCGAAAGGCAGAGCTGGAAGAAAGTAGAGAAACACGACATCTA
AGGGAGACCATTTCTCTGGAACATAGATCAACTCTCCCTGCCAACACTTGACTTTGTCGT
ATTTTTCTTTGACACAGGCTAACACGAAAAGAGAGTCGTGGACTATAAGCAAGAGCTGGG
AAGGTGAAGATTCCACCAGACGATCAACGAACCCTTCTGAGCTGATAGAAACTAAAACCC
TCGAAGACTCTGTTACTTCTCCAGCCTTGATGATCTTTTCGAGCTTCTGGTTCTGTTCGG
TTTCCATGGATTCGAGAAAGGACCAATCTTTCTCATGGAAATCGACCATCGAGACTGTTT
CCTCTGGTGTGGAAGAAGAGGAAACGGAAAATGCTCTGTGACGAGAGACATCAGACTGTT
TAGTGGAGAACGAAAGAAGCTTAGGAGAAAGGTAGTGACTTTGAAGACGAGTTAGCTTCT
CTGGTTTCGAAGAATTGAAGACAGACAGAGAAGGTAGAAGGGTCGAAGAAGAAGATGGAA
ACGAAAGGGAATGCATTGGTAACTGCAGCTTCTGTACTCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL2549Contig1 1424 2 2 U
GGACCACCACATCGATCACGAAATCTTGGGTCGTCTCCTCCCATAAAACATCTCGCCAGA
TACATAGATAGATAAACTCCGATCTCTCTCTCTCTCTCTGCACGTCGACTTCTTGTTTTT
TTTTGTAAAGATGAAAGCTTTCTGCATATTCGTCGTCTCATTGCTTCTCACCCTTCACTC
CAGGGGAGAAGCTACCTCTTCTGTTTTCTTTATTGATGGATCCAACAACCAATATCTTCG
TCCACCATCAGCCGAGGCGCTTCCCATGTCGCTCTCTGAGGTATCTGCATCAGTATCTGC
CTTGTTGGGTTTTGCACCTCCATCTACTTTGACTGCCCTTGGCTCCTCCAAGCTGAACAA
GATTCTAAAGCCCAATCCGTTTGAGAGGCCTCGTGCTGCTTTTGTTCTAGAAATCGCCGG
AGCTCATGATGCGCTTGTGGGCCTACACTAGTCATTCTTTCTTGGGCAATTCCATAAGAG
GCAGTATCAGTTCTGACTCTTACAATGCTGATATTGAACTTCCAGGAAGTGGAGTTGCTG
TTGTGTCTATTAACGAACCCTCATCTGATGTGACTGACAATGACATGAATGAGTTTGCAT
CTTGGTTGGGTGGGTCCTATGTTACTGGCTCTGCTGAACCATTGACTGGATTGCTGAGTA
TCTCTCTGGCTGATGGTGCTAATGTGGAGTTCCATTTGGAAAAGGAAGCAGAGAGGAAAT
TTGCATTGAACCTTTTGGATCTATACAAGAATATCAGAGGAGCAGTCAACCTTCATGGTA
TTGAGAGACCTGCTGAACTAACGGTTGGACGCTTTGGCGGTATTAATGCTTTAGCACAGG
AGTATGGGCAAGGTATGGCTAAGCAAGGGATGGATGTATTGCTTGCCACACTATCAAAGC
TATTTGATTTGTTGGAGACATCTCACAAAGGCCAAATTGTTGGAGTGATCGTCCTTGATG
AGAGAGTAAATCAAGAATCAGCTAATCTGCTGAGCGTTGAGTCTTCATCTCGTTCATCTG
CAAGGTCTATGGCTGAGGTAGAGGGAGTTCCAAGTGCAGCCATTATTGCTCAAGTTATAC
TCGTTAGGCTGACGCTTGCATGGTTAACTGGAATTATCCTTCTCATTGCAACTATCCTTG
GGGTGTACTTCCTTATGTACATGCCTTTGACCCAGGACACGCTCCTATACTCAAACGTGA
AGCTCGATTAAGACATAAATGTACAACTTCACAAAACGTCAAGTGAATCTTCAGATCGAT
CGTTTACATCTTTTGTGTGTATCAAGCCGTGTTTTTTAAACTGGCTGCATTAAACCAGTA
TTATTTTGAATGTTTCAAGAGAAGGTTGACACTTTTTTGTGGCCAAAACCAGTTGATGTG
TTATCTGTATATTTGTTGCAATAAGGTTTCATTCTTGATTTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A690TF U 1
AF RR2A690JQ C 680
BS 1 749 RR2A690TF
BS 750 1424 RR2A690JQ

RD RR2A690TF 749 0 0
GGACCACCACATCGATCACGAAATCTTGGGTCGTCTCCTCCCATAAAACATCTCGCCAGA
TACATAGATAGATAAACTCCGATCTCTCTCTCTCTCTCTGCACGTCGACTTCTTGTTTTT
TTTTGTAAAGATGAAAGCTTTCTGCATATTCGTCGTCTCATTGCTTCTCACCCTTCACTC
CAGGGGAGAAGCTACCTCTTCTGTTTTCTTTATTGATGGATCCAACAACCAATATCTTCG
TCCACCATCAGCCGAGGCGCTTCCCATGTCGCTCTCTGAGGTATCTGCATCAGTATCTGC
CTTGTTGGGTTTTGCACCTCCATCTACTTTGACTGCCCTTGGCTCCTCCAAGCTGAACAA
GATTCTAAAGCCCAATCCGTTTGAGAGGCCTCGTGCTGCTTTTGTTCTAGAAATCGCCGG
AGCTCATGATGCGCTTGTGGGCCTACACTAGTCATTCTTTCTTGGGCAATTCCATAAGAG
GCAGTATCAGTTCTGACTCTTACAATGCTGATATTGAACTTCCAGGAAGTGGAGTTGCTG
TTGTGTCTATTAACGAACCCTCATCTGATGTGACTGACAATGACATGAATGAGTTTGCAT
CTTGGTTGGGTGGGTCCTATGTTACTGGCTCTGCTGAACCATTGACTGGATTGCTGAGTA
TCTCTCTGGCTGATGGTGCTAATGTGGAGTTCCATTTGGAAAAGGAAGCAGAGAGGAAAT
TTGCATTGAACCTTTTGGATCTATACAAG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2A690JQ 745 0 0
TAATGTGGAGTTCCATTTGGAAAAGGAAGCAGAGAGGAAATTTGCATTGAACCTTTTGGA
TCTATACAAGAATATCAGAGGAGCAGTCAACCTTCATGGTATTGAGAGACCTGCTGAACT
AACGGTTGGACGCTTTGGCGGTATTAATGCTTTAGCACAGGAGTATGGGCAAGGTATGGC
TAAGCAAGGGATGGATGTATTGCTTGCCACACTATCAAAGCTATTTGATTTGTTGGAGAC
ATCTCACAAAGGCCAAATTGTTGGAGTGATCGTCCTTGATGAGAGAGTAAATCAAGAATC
AGCTAATCTGCTGAGCGTTGAGTCTTCATCTCGTTCATCTGCAAGGTCTATGGCTGAGGT
AGAGGGAGTTCCAAGTGCAGCCATTATTGCTCAAGTTATACTCGTTAGGCTGACGCTTGC
ATGGTTAACTGGAATTATCCTTCTCATTGCAACTATCCTTGGGGTGTACTTCCTTATGTA
CATGCCTTTGACCCAGGACACGCTCCTATACTCAAACGTGAAGCTCGATTAAGACATAAA
TGTACAACTTCACAAAACGTCAAGTGAATCTTCAGATCGATCGTTTACATCTTTTGTGTG
TATCAAGCCGTGTTTTTTAAACTGGCTGCATTAAACCAGTATTATTTTGAATGTTTCAAG
AGAAGGTTGACACTTTTTTGTGGCCAAAACCAGTTGATGTGTTATCTGTATATTTGTTGC
AATAAGGTTTCATTCTTGATTTAAC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 2 4

CO CL2550Contig1 657 2 3 U
GGTGATAATAAGCTAGCCAGAGACAACACGTCGACAAAGAACATTCATTCACACAAGATT
CACACAAGAAGACGCTGGGAGAAACGTTTAGAAATCAGACAGACAGACAAACAAATAAAA
AAGAAGTGAGGTGATATGAAATGTTATTACATAAAAAATTGGTGAGGAGGGAGAATCAGG
AGTCGGGTAGTCTCATCTGTACGATCTCAGCAGGTGGACGCAGCGTGCAAACCATCTCTC
TCGTCTTGCCAAAGTAAACCTGATCAAGTGAGTTTCTAAGTTTGCCTTCCAATTCTTCAA
TCATTCCCCCCATATTGCACAAATGTCCCTCTGCTACAGCGAGCTCCATTTTCATTTGTC
TTCTAATTGATCCGGATAAGCCGAATTTACCAGAGGGTTCGTCATCGGTGGTCAGAGAGA
GCATTATAGTACTTGTTAAGCAGTACTGCGCCATTTCCTCCTCCTCTGGACCAACCTGGA
TAACATGTATGGCATCCCAAGCTCCTTCTTCCAGGCATCCCCTCCGACCATGTCCCGACT
TTGACCCATCTTTCTTGATAAGGAAACATGCCACAAAGCCTTCATTATCATCCTCCTCCC
ACATGTACACTGAAGATATTCCTCCTTCATAATACTGGTCACGATAGATAGCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F601JQ U 1
AF RR2E245JQ U 32
BS 1 156 RR2F601JQ
BS 157 157 RR2E245JQ
BS 158 657 RR2F601JQ

RD RR2F601JQ 657 0 0
GGTGATAATAAGCTAGCCAGAGACAACACGTCGACAAAGAACATTCATTCACACAAGATT
CACACAAGAAGACGCTGGGAGAAACGTTTAGAAATCAGACAGACAGACAAACAAATAAAA
AAGAAGTGAGGTGATATGAAATGTTATTACATAAAAGATTGGTGAGGAGGGAGAATCAGG
AGTCGGGTAGTCTCATCTGTACGATCTCAGCAGGTGGACGCAGCGTGCAAACCATCTCTC
TCGTCTTGCCAAAGTAAACCTGATCAAGTGAGTTTCTAAGTTTGCCTTCCAATTCTTCAA
TCATTCCCCCCATATTGCACAAATGTCCCTCTGCTACAGCGAGCTCCATTTTCATTTGTC
TTCTAATTGATCCGGATAAGCCGAATTTACCAGAGGGTTCGTCATCGGTGGTCAGAGAGA
GCATTATAGTACTTGTTAAGCAGTACTGCGCCATTTCCTCCTCCTCTGGACCAACCTGGA
TAACATGTATGGCATCCCAAGCTCCTTCTTCCAGGCATCCCCTCCGACCATGTCCCGACT
TTGACCCATCTTTCTTGATAAGGAAACATGCCACAAAGCCTTCATTATCATCCTCCTCCC
ACATGTACACTGAAGATATTCCTCCTTCATAATACTGGTCACGATAGATAGCAAAAA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2E245JQ 578 0 0
CGACAAAGAACATTCATTCACACAAGATTCACACAAGAAGACGCTGGGAGAAACGTTTAG
AAATCAGACAGACAGACAAACAAATAAAAAAGAAGTGAGGTGATATGAAATGTTATTACA
TAAAAAATTGGTGAGGAGGGAGAATCAGGAGTCGGGTAGTCTCATCTGTACGATCTCAGC
AGGTGGACGCAGCGTGCAAACCATCTCTCTCGTCTTGCCAAAGTAAACCTGATCAAGTGA
GTTTCTAAGTTTGCCTTCCAATTCTTCAATCATTCTCCCCATATTGCGCAAATGTCCCTC
TGCTACAGCGAGCTCCATTTTCATTTGTCTTCTAATTGATCCGGATAAGCCGAATTTACC
AGAGGGTTCGTCATCGGTGGTCAGAGAGAGCATTATAGTACTTGTTAAGCAGTACTGCGC
CATTTCCTCCTCCTCTGGACCAACCTGGATAACATGTATGGCATCCCAAGCTCCTTCTTC
CAGGCATCCCCTCCGACCATGTCCCGACTTTGACCCATCTTTCTTGATAAGGAAACATGC
CACAAAGCCTTCATTATCATCCTCCTCCCACATGTA
AA

QA 1 576 1 576
DS 



CO CL2550Contig2 791 2 4 U
TTTTTTTTTCACATCCATCGGAGAGATTGATATCTCCGGCGCGACAGAGGTTGAAGAAAC
AAAATGGAGGCAGCTTTGGGGCTTCTAAGAAGAATGCCGCCGAAGCAATCGGAAACGGCT
CTATCAGCACTACTCAGCCTCTTGCCTCAACATTCTTCCGATCTCCTCTCTCAAGTCGAT
CTCCCTCTCCAGGTGTTACGTGATGCTGAAAGCAGGAAAGATTTCATCTTGTGTGAGTAC
AACAGAGATGCAGATTCCTACAGGTCACCTTGGTCAAACAAGTACCATCCTCCGCTAGAG
GATGCTCTGTACCCATCATCAGAATTGAGGAAGCTCGAAGTTGAAGCCAACGACATTTTT
GCTATCTATCGTGACCAGTATTATGAAGGAGGAATATCTTCAGTGTACATGTGGGAGGAG
GATGATAATGAAGGCTTTGTGGCATGTTTCCTTATCAAGAAAGATGGGTCAAAGTCGGGA
CATGGTCGGAGGGGATGCCTGGAAGAAGGAGCTTGGGATGCCATACATGTTATCCAGGTT
GGTCCAGAGGAGGAGGAAATGGCGCAGTACTGCTTAACAAGTACTATAATGCTCTCTCTG
ACCACCGATGACGAACCCTCTGGTAAATTCGGCTTATCCGGATCAATTAGAAGACAAATG
AAAATGGAGCTCGCTGTAGCAGAGGGACATTTGCGCAATATGGGGAGAATGATTGAAGAA
TTGGAAGCAAACTTAGAACTCACTTGATCAGTTTACTTTGGCAGACGAGAGAGATGGTTG
CACGCTGCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F601TF U 1
AF RR2E245TF U 10
BS 1 299 RR2F601TF
BS 300 300 RR2E245TF
BS 301 592 RR2F601TF
BS 593 791 RR2E245TF

RD RR2F601TF 592 0 0
TTTTTTTTTCACATCCATCGGAGAGATTGATATCTCCGGCGCGACAGAGGTTGAAGAAAC
AAAATGGAGGCAGCTTTGGGGCTTCTAAGAAGAATGCCGCCGAAGCAATCGGAAACGGCT
CTATCAGCACTACTCAGCCTCTTGCCTCAACATTCTTCCGATCTCCTCTCTCAAGTCGAT
CTCCCTCTCCAGGTGTTACGTGATGCTGAAAGCAGGAAAGATTTCATCTTGTGTGAGTAC
AACAGAGATGCAGATTCCTACAGGTCACCTTGGTCAAACAAGTACCATCCTCCGCTAGAT
GATGCTCTGTACCCATCATCAGAATTGAGGAAGCTCGAAGTTGAAGCCAACGACATTTTT
GCTATCTATCGTGACCAGTATTATGAAGGAGGAATATCTTCAGTGTACATGTGGGAGGAG
GATGATAATGAAGGCTTTGTGGCATGTTTCCTTATCAAGAAAGATGGGTCAAAGTCGGGA
CATGGTCGGAGGGGATGCCTGGAAGAAGGAGCTTGGGATGCCATACATGTTATCCAGGTT
GGTCCAGAGGAGGAGGAAATGGCGCAGTACTGCTTAACAAGTACTATAATGC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2E245TF 782 0 0
CACATCCATCGGAGATATTGATATCTCCGGCGCGACAGAGGTTGAAGAAACAAAATGGAG
GCAGCTTTGGGGCTTCTAAGAAGAATGCCGCCGAAGCAATCGGAAACGGCTCTATCAGCA
CTACTCAGCCTCTTGCCTCAACATTCTTCCGATCTCCTCTCTCAAGTCGATCTCCCTCTC
CAGGTGTTACGTGATGCTGAAAGCAGGAAAGATTTCATCTTGTGTGAGTACAACAGAGAT
GCAGATTCCTACAGGTCACCTTGGTCAAACAAGTACCATCCTCCGCTAGAGGATGCTCTG
TACCCATCATCAGAATTGAGGAAGCTCGAAGTTGAAGCCAACGACATTTT*GCTATCTAT
CGTGACCAGTATTATGAAGGAGGAATATCTTCAGTTTACATGTGGGAGGAGGATGATAAT
GAAGGCTTTGTGGCATGTTTCCTTATCAAGAAAGATGGGTCAAAGTCGGGACATGGTCGG
AGGGGATGCCTGGAAGAAGGAGCTTGGGATGCCATACATGTTATCCAGGTTGGTCCAGAG
GAGGAGGAAATGGCGCAGTACTGCTTAACAAGTACTATAATGCTCTCTCTGACCACCGAT
GACGAACCCTCTGGTAAATTCGGCTTATCCGGATCAATTAGAAGACAAATGAAAATGGAG
CTCGCTGTAGCAGAGGGACATTTGCGCAATATGGGGAGAATGATTGAAGAATTGGAAGCA
AACTTAGAACTCACTTGATCAGTTTACTTTGGCAGACGAGAGAGATGGTTGCACGCTGCG
TC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 0 0

AS 2 4

CO CL2552Contig1 734 2 2 U
TTTGACCAAATGATAACGAGTTTATTAAACATAAGCTGACTCAATGACTTCACACACACA
CACACACAAAAGAGATGGCTTCATCATCATCAACAATATAGATGAGTGTTGGTGCCAATA
GAATATAAACTCCAAGAAGTTAAGTAACATGGAGTTTAATTACACAGTTAATAAGAAGGA
ATGTTGCAGAGAAGAGATTACACTCAGAACCATATTGATACATCTTGCTGCTGCTTCCCC
ATTCCTTCCATAACTCCAGCTTGCCAGTCATTTTTGTAATCGAATGATGCAATATCAAAC
GAGGTCGAATCAAACACAATCTGAGACTGATTGTTAATCTCACTGTTCCCTTGTTGCATA
AACATCTGATTGCGGTTGAAACTAAGCTGCTGTTCTTGGTAATTCTGAGCTGCTGTTGAA
TCAACGATCATGCTTTGATTTGAAGCTTGGCTGCTCTGGACATTTCTGTCGTACATAGCC
ATTAGGTCAGTGATCATCTTTTGCCCATTTTTGGGAACTCCATAGCCTGATAGGTCGATC
GGTTGGACTGGCTGAGGAAAGTGTTGTGATACAACTACTGGTTTCACTTCACTCGTATGA
AACTTCGGTGCTGCTCCATACGCTAAACAATTATCTCTATAAGGACAAACCATTTGGTGA
TTGTCCCTTGAGCTCCTGTCCTGGAATCCAAGATTGATTTTGCTGTGAGGACACTGACCA
TTCTCACAAGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2AI81TF C 1
AF RR2AI81JQ U 4
BS 1 6 RR2AI81TF
BS 7 734 RR2AI81JQ

RD RR2AI81TF 734 0 0
TTTGACCAAATGATAACGAGTTTATTAAACATAAGCTGACTCAATGACTTCACACACACA
CACACACAAAAGAGATGGCTTCATCATCATCAACAATATAGATGAGTGTTGGTGCCAATA
GAATATAAACTCCAAGAAGTTAAGTAACATGGAGTTTAATTACACAGTTAATAAGAAGGA
ATGTTGCAGAGAAGAGATTACACTCAGAACCATATTGATACATCTTGCTGCTGCTTCCCC
ATTCCTTCCATAACTCCAGCTTGCCAGTCATTTTTGTAATCGAATGATGCAATATCAAAC
GAGGTCGAATCAAACACAATCTGAGACTGATTGTTAATCTCACTGTTCCCTTGTTGCATA
AACATCTGATTGCGGTTGAAACTAAGCTGCTGTTCTTGGTAATTCTGAGCTGCTGTTGAA
TCAACGATCATGCTTTGATTTGAAGCTTGGCTGCTCTGGACATTTCTGTCGTACATAGCC
ATTAGGTCAGTGATCATCTTTTGCCCATTTTTGGGAACTCCATAGCCTGATAGGTCGATC
GGTTGGACTGGCTGAGGAAAGTGTTGTGATACAACTACTGGTTTCACTTCACTCGTATGA
AACTTCGGTGCTGCTCCATACGCTAAACAATTATCTCTATAAGGACAAACCATTTGGTGA
TTGTCCCTTGAGCTCCTGTCCTGGAATCCAAGATTGATTTTGCTGTGAGGACACTGACCA
TTCTCACAAGTGA
C

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2AI81JQ 731 0 0
GAC
CAAATGATAACGAGTTTATTAAACATAAGCTGACTCAATGACTTCACACACACACACACA
CAAAAGAGATGGCTTCATCATCATCAACAATATAGATGAGTGTTGGTGCCAATAGAATAT
AAACTCCAAGAAGTTAAGTAACATGGAGTTTAATTACACAGTTAATAAGAAGGAATGTTG
CAGAGAAGAGATTACACTCAGAACCATATTGATACATCTTGCTGCTGCTTCCCCATTCCT
TCCATAACTCCAGCTTGCCAGTCATTTTTGTAATCGAATGATGCAATATCAAACGAGGTC
GAATCAAACACAATCTGAGACTGATTGTTAATCTCACTGTTCCCTTGTTGCATAAACATC
TGATTGCGGTTGAAACTAAGCTGCTGTTCTTGGTAATTCTGAGCTGCTGTTGAATCAACG
ATCATGCTTTGATTTGAAGCTTGGCTGCTCTGGACATTTCTGTCGTACATAGCCATTAGG
TCAGTGATCATCTTTTGCCCATTTTTGGGAACTCCATAGCCTGATAGGTCGATCGGTTGG
ACTGGCTGAGGAAAGTGTTGTGATACAACTACTGGTTTCACTTCACTCGTATGAAACTTC
GGTGCTGCTCCATACGCTAAACAATTATCTCTATAAGGACAAACCATTTGGTGATTGTCC
CTTGAGCTCCTGTCCTGGAATCCAAGATTGATTTTGCTGTGAGGACACTGACCATTCTCA
CAAGTGAC

QA 4 731 4 731
DS 



CO CL2552Contig2 885 2 6 U
CCTGAGACAGTATGAGTATGATCATCCAACAAGCTTTGGGATTTGTAAATGCACATTTCC
TGTAAAGGAAGAATCGTGGGAAACTTGGATTTTGCGAGGAAGAGGAAGCAGAACAATGAT
CTGAATGTGTTGATGATGGAGAGACCAGGTTTCACTTGTGAGAATGGTCAGTGTCCTCAC
AACAAAGTCAATCTTGGATTCCAGGACAGGAGCTCAAGGGACAATCACCAAATGGTTTGT
CCACATAGAGATAATTGTTTAGCGTATGGAGCAGCACCGAAGTTTCATACGAGTGAAGTG
AAACCAGTAGTTGTATCACAACAGTCACAACACTTTCCTCAGCCAGTCCAACCGATCGAC
CTATCAGGCTATGGAGTTCCCAAAAATGGGCAAAAGATGATCACTGAGCTAATGGCTATG
TACGACAGAAACGTCCAGAGCAGCCAAGCTTCAAATCAAAGCATGATCGTTGATTCAACA
GCAGCCCAGAATTATCAAGAACAGCAGCTTAGTTTCAACCACAATCAGATGTTTATGCAA
CAAGGGAACAGGGAGACTAACAATCAGTCTCAGATTGTGTTTGATTCGACCTCGTTTGAT
ATTGCATCATTTGATTACAAAAATGACTGGCAAGCTGGAGTTATGGAAGGAATGGGGAAG
CAGCAGCAAGATGTATCAATATGGTTCTGAGTTTAATCTCTTCTCTGCAACATTCTTTCT
TATTAACTGTGTTATTAAACTCCATGTTACTTAACTTCTTGGAGTTTATATTCTATTGGC
ACCAACACTCATCTATATTGTTGATGATGATGAAGCCATCTCTTTTGTGTGTGTGTGTGT
GAAGTCATTGAGTCAGCTTATGTTTAATAAACTCGTTATCATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE92TF U 1
AF RR2CE92JQ C 79
BS 1 151 RR2CE92TF
BS 152 152 RR2CE92JQ
BS 153 199 RR2CE92TF
BS 200 200 RR2CE92JQ
BS 201 237 RR2CE92TF
BS 238 885 RR2CE92JQ

RD RR2CE92TF 237 0 0
CCTGAGACAGTATGAGTATGATCATCCAACAAGCTTTGGGATTTGTAAATGCACATTTCC
TGTAAAGGAAGAATCGTGGGAAACTTGGATTTTGCGAGGAAGAGGAAGCAGAACAATGAT
CTGAATGTGTTGATGATGGAGAGACCAGGTT*CACTTGTGAGAATGGTCAGTGTCCTCAC
AACAAAGTCAATCTTGGAT*CCAGGACAGGAGCTCAAGGGACAATCACCAAATGGTT

QA 1 237 1 237
DS 

RD RR2CE92JQ 807 0 0
TGGGAACTTGGA
TTTGCGAGGAAGAGGAAGCAGAACAATGATCTGAATGTGTTGATGATGGAGAGACCAGGT
TTCACTTGTGAGAATGGTCAGTGTCCTCACAACAAAGTCAATCTTGGATTCCAGGACAGG
AGCTCAAGGGACAATCACCAAATGGTTTGTCCACATAGAGATAATTGTTTAGCGTATGGA
GCAGCACCGAAGTTTCATACGAGTGAAGTGAAACCAGTAGTTGTATCACAACAGTCACAA
CACTTTCCTCAGCCAGTCCAACCGATCGACCTATCAGGCTATGGAGTTCCCAAAAATGGG
CAAAAGATGATCACTGAGCTAATGGCTATGTACGACAGAAACGTCCAGAGCAGCCAAGCT
TCAAATCAAAGCATGATCGTTGATTCAACAGCAGCCCAGAATTATCAAGAACAGCAGCTT
AGTTTCAACCACAATCAGATGTTTATGCAACAAGGGAACAGGGAGACTAACAATCAGTCT
CAGATTGTGTTTGATTCGACCTCGTTTGATATTGCATCATTTGATTACAAAAATGACTGG
CAAGCTGGAGTTATGGAAGGAATGGGGAAGCAGCAGCAAGATGTATCAATATGGTTCTGA
GTTTAATCTCTTCTCTGCAACATTCTTTCTTATTAACTGTGTTATTAAACTCCATGTTAC
TTAACTTCTTGGAGTTTATATTCTATTGGCACCAACACTCATCTATATTGTTGATGATGA
TGAAGCCATCTCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAAGTCATTGAGTCAGCTTATGTTTAATAA
ACTCGTTATCATTTG

QA 13 807 13 807
DS 



AS 1 2

CO CL2553Contig1 1440 2 2 U
GGATCGAAGCAACGAAACCTAAACTCACAAAAACCTAAAAGCAAACCTAGTGGACGACGG
CGAGAGGAGGAGAAGAGAGAAACTCAGATCTTTTGTCATGGCACCGAAACAGTCTGACAA
GATCGATAACCCTCCTCCGGCTGCCTCTTCCAGCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTCCGG
CTCATCCGGAGAAGAAGAAGAATCCGGATCTTCCGACGACGAAGCTGGAGATATCCAGTC
CAAGCTCACTCAGAAACCTCCTCCTCCTCCTGCTACAAAGAAGACTCCCGAATCCGATTC
CGAAGAAGACGAATCCGATTCCGATTCCGATTCCGAACCTCCCACCAAAACCAAGCCTCT
CAACACCGTCACCTCCAAACCAAAGCCAGAGACCTCCGGATCCGTCGCTACGTCTCTCCC
CGAGAGCTCCACTGCAGCCAAACGCTCCCTAAAGCAAGCATACGACGAAGAGCCTAAGAA
GAAGGCGAAGACGACAACAGAGAATGTAAAGAAGAAGAAGGATGAAGAGGTTAAGAAGAT
CTCCGGAGAAGACGCGAAGAAGATGTTCCAGAGACTGTTCAGCGAGACAGACGAGATCGC
CATGCTTCGTGGCTTTCTCGACTTCACCTCCACTAGAGGCGACCCTTACGAGAACATGGA
CGCCTTCTGCGATTACGTCAAGACCTTGATCGATTTCAACGCTTCCAAGGCTCAGATTGT
CACTAAGCTACAGAGGTGTAAGAAGAAGTTTGTGAACATAGTGAAGAACGCGCTTAAGAA
AGGCAAGACCGAGGATAAGGTCACGTGTTCCAAGGATCTTGACCAGAAAGCTTTCGACTT
GTCAAGGAAGATTTGGGGAGCTAGCGGTGTTCTCCCTGCCAAACCGAGGAAGAAGTCTTC
GAAAGAGGATGTGAAGTCTCCTCCTTCGCCTTCGCACACGCCTAAGAAACTGGAGAAGCA
GAAGGGGGTTGTTATTGTGGATGATGCTCAGCTCTCGTCGAGTAGAGAGATGGCGTTGTT
CTTCAAGGCGGAGAATGTGAGTTGTTTTGGTTTGGATGAGTCTACGGTGAGTGCGGTTTG
GGATATGGTTGAGGATGGACCGAAGAAGAGGGAGATGGAGGAGAAGCTGAAGAATCTCAA
GGCTATGCAGGTGGAGCTTTGTTTGCAGAGAACTGCATTGTTGGACACCACTGCAAAGAT
GATATTCAAAGACAATGCGTCGTCCTCATATTGATGGTTTGTTCTTTTTTTTTCTTACTC
TTTTTTTTTAGTATGCATAGCTTGTGGAACTAATGCTATCGTTAAGTCTTAGTCGATATT
TTTATTCTTACACCCTTTATGTTGTTGGATGCTTGGTTTGGGTATAAATTCCCTTATGTG
GAATGAATATTTATTCCCTTTGTTATATGCTTTTGTGCTAATAGTTTCTTTTTCTATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG37TF U 1
AF RR2BG37JQ C 651
BS 1 863 RR2BG37TF
BS 864 1440 RR2BG37JQ

RD RR2BG37TF 864 0 0
GGATCGAAGCAACGAAACCTAAACTCACAAAAACCTAAAAGCAAACCTAGTGGACGACGG
CGAGAGGAGGAGAAGAGAGAAACTCAGATCTTTTGTCATGGCACCGAAACAGTCTGACAA
GATCGATAACCCTCCTCCGGCTGCCTCTTCCAGCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTCCGG
CTCATCCGGAGAAGAAGAAGAATCCGGATCTTCCGACGACGAAGCTGGAGATATCCAGTC
CAAGCTCACTCAGAAACCTCCTCCTCCTCCTGCTACAAAGAAGACTCCCGAATCCGATTC
CGAAGAAGACGAATCCGATTCCGATTCCGATTCCGAACCTCCCACCAAAACCAAGCCTCT
CAACACCGTCACCTCCAAACCAAAGCCAGAGACCTCCGGATCCGTCGCTACGTCTCTCCC
CGAGAGCTCCACTGCAGCCAAACGCTCCCTAAAGCAAGCATACGACGAAGAGCCTAAGAA
GAAGGCGAAGACGACAACAGAGAATGTAAAGAAGAAGAAGGATGAAGAGGTTAAGAAGAT
CTCCGGAGAAGACGCGAAGAAGATGTTCCAGAGACTGTTCAGCGAGACAGACGAGATCGC
CATGCTTCGTGGCTTTCTCGACTTCACCTCCACTAGAGGCGACCCTTACGAGAACATGGA
CGCCTTCTGCGATTACGTCAAGACCTTGATCGATTTCAACGCTTCCAAGGCTCAGATTGT
CACTAAGCTACAGAGGTGTAAGAAGAAGTTTGTGAACATAGTGAAGAACGCGCTTAAGAA
AGGCAAGACCGAGGATAAGGTCACGTGTTCCAAGGATCTTGACCAGAAAGCTTTCGACTT
GTCAAGGAAGATTTGGGGAGCTA
G

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR2BG37JQ 790 0 0
AGAACATGGACGCTTTCTGCGATTACGTCAAGACCTTGATCGATTTCAACGCTTCCAAGG
CTCAGATTGTCACTAAGCTACAGAGGTGTAAGAAGAAGTTTGTGAACATAGTGAAGAACG
CGCTTAAGAAAGGCAAGACCGAGGATAAGGTCACGTGTTCCAAGGATCTTGACCAGAAAG
CTTTCGACTTGTCAAGGAAGATTTGGGGAGCTAGCGGTGTTCTCCCTGCCAAACCGAGGA
AGAAGTCTTCGAAAGAGGATGTGAAGTCTCCTCCTTCGCCTTCGCACACGCCTAAGAAAC
TGGAGAAGCAGAAGGGGGTTGTTATTGTGGATGATGCTCAGCTCTCGTCGAGTAGAGAGA
TGGCGTTGTTCTTCAAGGCGGAGAATGTGAGTTGTTTTGGTTTGGATGAGTCTACGGTGA
GTGCGGTTTGGGATATGGTTGAGGATGGACCGAAGAAGAGGGAGATGGAGGAGAAGCTGA
AGAATCTCAAGGCTATGCAGGTGGAGCTTTGTTTGCAGAGAACTGCATTGTTGGACACCA
CTGCAAAGATGATATTCAAAGACAATGCGTCGTCCTCATATTGATGGTTTGTTCTTTTTT
TTTCTTACTCTTTTTTTTTAGTATGCATAGCTTGTGGAACTAATGCTATCGTTAAGTCTT
AGTCGATATTTTTATTCTTACACCCTTTATGTTGTTGGATGCTTGGTTTGGGTATAAATT
CCCTTATGTGGAATGAATATTTATTCCCTTTGTTATATGCTTTTGTGCTAATAGTTTCTT
TTTCTATGCC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 3

CO CL2554Contig1 1047 3 5 U
TGTTTATCCATGAAATTATATTCATGGTCATAACAACTATACAAATATTGACGAGATGCT
ATGCAAATGCCACCAACGAGACTATCAACAACGCATCAATGTTCCCGGCGATTCTTGTGT
TCGGAGACTCCACAATCGACACCGGAAACAACAACTACATTAGTACAATCATCCGGGCTA
ACTTTCCTCCTTACGGCTGCAACTTCCCCGGCCATCACGCGACCGGAAGATTCTCTAACG
GTAGACTCATCCCTGACTTCATTGCATCCCTTATGGGAATAAAAGACACGGTTCCTCCAT
TCCTTGACCCGCATTTGTCGGATTCAGATATTCTCACCGGAGTGTGCTTTGCCTCGGCCG
GTTCAGGTTACGACAACTACACAGATCTCGCTACTTTAAGTCTATCCGTAGACAAACAGG
CAGACATGTTCAGAAGTTACGTGGCAAGGCTGAGCAGGATCGTTGGTGAAGAGAAAGCGG
CTAAGATAGTCAGTGAGGCTCTGGTCATAGTAAGCTCGGGAACTAACGATTTTGATATAA
ATCTATACGATACACCTTCTCCTCGTATCAAGCTCGGTGTTGAAGGTTATCAAGATTTCA
TTCTCTCGGGTGTACACAACTTCGTTCAAGTAAACAACAATTCCTTCATATACATTTTTT
TGTTAATTTGGAGAAGTTTGGACCATGCCCTAATCTCTGTTTACGTCCTGAGACCAGCAG
CTGTTAATGCCTTTATAACGTGGCGTAAAGCTTCCTTTCGAATGAAAATTGAACTGGAGG
CATGACAAAACTAACTTTTTATACCAAACCATTATTCCAACGCACTGTTGGTTTTCTTTT
TGAATAATTAATATTCAAATCAGAGGTGTTGTGGAAATGCAGGAGCTGGTTGTCCAATGC
ATATGGATCACGATTATATTTTTTAATTGTCTTTAACATATGGATTTGGACTCCTATTTT
TATTTTTTCTTTGACAATATAATATATTTTTATGTTTGTATAATATTAAGTGTGTTATGT
GGATATAGGAACTATATAATATTGGCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D001TF U 1
AF RR2AN60TF U 6
AF RR2AN60JQ C 395
BS 1 540 RR2D001TF
BS 541 730 RR2AN60TF
BS 731 731 RR2AN60JQ
BS 732 754 RR2AN60TF
BS 755 1047 RR2AN60JQ

RD RR2D001TF 545 0 0
TGTTTATCCATGAAATTATATTCATGGTCATAACAACTATACAAATATTGACGAGATGCT
ATGCAAATGCCACCAACGAGACTATCAACAACGCATCAATGTTCCCGGCGATTCTTGTGT
TCGGAGACTCCACAATCGACACCGGAAACAACAACTACATTAGTACAATCATCCGGGCTA
ACTTTCCTCCTTACGGCTGCAACTTCCCCGGCCATCACGCGACCGGAAGATTCTCTAACG
GTAGACTCATCCCTGACTTCATTGCATCCCTTATGGGAATAAAAGACACGGTTCCTCCAT
TCCTTGACCCGCATTTGTCGGATTCAGATATTCTCACCGGAGTGTGCTTTGCCTCGGCCG
GTTCAGGTTACGACAACTACACAGATCTCGCTACTTTAAGTCTATCCGTAGACAAACAGG
CAGACATGTTCAGAAGTTACGTGGCAAGGCTGAGCAGGATCGTTGGTGAAGAGAAAGCGG
CTAAGATAGTCAGTGAGGCTCTGGTCATAGTAAGCTCGGGAACTAACGATTTTGATATAA
TCTAT

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2AN60TF 752 0 0
ATCCATGAAATTATATTCATGGTCATAACAACTATACAAATATTGACGAGATGCTATGCA
AATGCCACCAACGAGACTATCAACAACGCATCAATGTTCCCGGCGATTCTTGTGTTCGGA
GACTCCACAATCGACACCGGAAACAACAACTACATTAGTACAATCATCCGGGCTAACTTT
CCTCCTTACGGCTGCAACTTCCCCGGCCATCACGCGACCGGAAGATTCTTTAACGGTAGA
CTCATCCCTGACTTCATTGCATCCCTTATGGGAATAAAAGACACGGTTCCTCCATTCCTT
GACCCGCATTTGTCGGATTCAGATATTCTCACCGGAGTGTGCTTTGCCTCGGCCGGTTCA
GGTTACGACAACTACACAGATCTCGCTACTTTAAGTCTATCCGTAGACAAACAGGCAGAC
ATGTTCAGAAGTTACGTGGCAAGGCTGAGCAGGATCGTTGGTGAAGAGAAAGCGGCTAAG
ATAGTCAGTGAGGCTCTGGTCATAGTAAGCTCGGGAACTAACGATTTTGATATAAATCTA
TACGATACACCTTCTCCTCGTATCAAGCTCGGTGTTGAAGGTTATCAAGATTTCATTCTC
TCGGGTGTACACAACTTCGTTCAAGTAAACAACAATTCCTTCATATACATTTTTTTGTTA
ATTTGGAGAAGTTTGGACCATGCCCTAATCTCTGTTTACGTCCTGAGACCAGCAGCTGTT
AATGC*TTTATAACGTGGCGTAAAGCTTC
TTT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2AN60JQ 653 0 0
TTTAAGTCTATCCGTAGACAAACAGGCAGACATGTTCAGAAGTTACGTGGCAAGGCTGAG
CAGGATCGTTGGTGAAGAGAAAGCGGCTAAGATAGTCAGTGAGGCTCTGGTCATAGTAAG
CTCGGGAACTAACGATTTTGATATAAATCTATACGATACACCTTCTCCTCGTATCAAGCT
CGGTGTTGAAGGTTATCAAGATTTCATTCTTTCGGGTGTACACAACTTCGTTCAAGTAAA
CAACAATTCCTTCATATACATTTTTTTGTTAATTTGGAGAAGTTTGGACCATGCCCTAAT
TTCTGTTTACGTCCTGAGACCAGCAGCTGTTAATGCCTTTATAACGTGGGGTAAAGCTTC
CTTTCGAATGAAAATTGAACTGGAGGCATGACAAAACTAACTTTTTATACCAAACCATTA
TTCCAACGCACTGTTGGTTTTCTTTTTGAATAATTAATATTCAAATCAGAGGTGTTGTGG
AAATGCAGGAGCTGGTTGTCCAATGCATATGGATCACGATTATATTTTTTAATTGTCTTT
AACATATGGATTTGGACTCCTATTTTTATTTTTTCTTTGACAATATAATATATTTTTATG
TTTGTATAATATTAAGTGTGTTATGTGGATATAGGAACTATATAATATTGGCT

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 4

CO CL2555Contig1 638 4 11 U
GAGGAGAAACGAGAAGAAACAGAGAGAAGACAAAAAAGGTAGTAGTTTGAATCAAATATG
GCTGGGAGAGCTTCGATTCCTGCTCGCAACTCTGCCCTCATCGCTATGATCGCTGACGAG
GACACTGTTGTTGGATTCTTGATGGCTGGAGTTGGTAATGTTGACATAAAGAGGAAGACT
AATTACCTTATTGTGGATTCAAAGACAACGGTGAGACAAATTGAGGATGCTTTCAAGGAA
TTCTCATCAAGAGATGATATTGCTATCATCCTCATCAGCCAATATGTTGCCAATATGATC
AGGTTCTTGGTGGATAGCTACAACAAGCCAGTTCCTGCAATCCTGGAGATCCCTTCCAAG
GACCATCCTTATGATCCTGCTCATGACTCTGTTCTCTCCCGTGTCAAGTACCTCTTCTCT
GCGGAATCTGTCTCACAGCGTTAAAACATATACATCCTGCAAAAGCTTGCTGAGCTTTTT
ATATTATTTGTTTGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCAGTTTTCAATAATGTATCTCTTG
ATTTTTATTTGGAAATGGATGTTATAATCAGTAAGAAGCAATGATAACACCATCTGGTTC
TTTTTGCATTAAATAAAGAGAGTGAGTCTGTTGTGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FV14JQ C 27
AF RR2FV14TF U 27
AF RR2ED29TF U 1
AF RR2ED29JQ C 183
BS 1 77 RR2ED29TF
BS 78 78 RR2FV14TF
BS 79 169 RR2ED29TF
BS 170 170 RR2FV14TF
BS 171 431 RR2ED29TF
BS 432 432 RR2FV14TF
BS 433 566 RR2ED29TF
BS 567 567 RR2FV14TF
BS 568 578 RR2ED29TF
BS 579 579 RR2FV14TF
BS 580 638 RR2ED29TF

RD RR2FV14JQ 565 0 0
GGGGAAGACAAAAA
AGTAGTTTGAATCAAATATGGCTGGGAGAGCTTCGATTCCTGCTCGCAACTCTGCCCTCA
TCGCTATGATCGCTGACGAGGACACTGTTGTTGGATTCTTGATGGCTGGAGTTGGTAATG
TTGACATAAAGAGGAAGACTAATTACCTTATTGTGGATTCAAAGACAACGGTGAGACAAA
TTGAGGATGCTTTCAAGGAATTCTCATCAAGAGATGATATTGCTATCATCCTCATCGGCC
AATATGTTGCCAATATGATCAGGTTCTTGGTGGATAGCTACAACAAGCCAGTTCCTGCGA
TCCTGGAGATCCCTTCCAAGGACCATCCTTATGATCCTGCTCATGACTCTGTTCTCTCCC
GTGTCAAGTACCTCTTCTCTGCGGAATCTGTCTCACAGCGTTAAAACATATACATCCTGC
AAAAGCTTGCTGAGCTTTTTATATTATTTGTTTGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCAGT
TTTCAATAATGTATCTCTTGATTTTTATTTGGAAATGGATGTTATAATCAGTAAGAAGCA
ATGATAAC
GCC

QA 15 562 15 562
DS 

RD RR2FV14TF 565 0 0
GGGGAAGACAAAAA
AGTAGTTTGAATCAAATATGGCTGGGAGAGCTTCGATTCCTGCTCGCAACTCTGCCCTCA
TCGCTATGATCGCTGACGAGGACACTGTTGTTGGATTCTTGATGGCTGGAGTTGGTAATG
TTGACATAAAGAGGAAGACTAATTACCTTATTGTGGATTCAAAGACAACGGTGAGACAAA
TTGAGGATGCTTTCAAGGAATTCTCATCAAGAGATGATATTGCTATCATCCTCATCGGCC
AATATGTTGCCAATATGATCAGGTTCTTGGTGGATAGCTACAACAAGCCAGTTCCTGCGA
TCCTGGAGATCCCTTCCAAGGACCATCCTTATGATCCTGCTCATGACTCTGTTCTCTCCC
GTGTCAAGTACCTCTTCTCTGCGGAATCTGTCTCACAGCGTTAAAACATATACATCCTGC
AAAAGCTTGCTGAGCTTTTTATATTATTTGTTTGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCAGT
TTTCAATAATGTATCTCTTGATTTTTATTTGGAAATGGATGTTATAATCAGTAAGAAGCA
ATGATAAC
GCC

QA 15 562 15 562
DS 

RD RR2ED29TF 638 0 0
GAGGAGAAACGAGAAGAAACAGAGAGAAGACAAAAAAGGTAGTAGTTTGAATCAAATATG
GCTGGGAGAGCTTCGATCCCTGCTCGCAACTCTGCCCTCATCGCTATGATCGCTGACGAG
GACACTGTTGTTGGATTCTTGATGGCTGGAGTTGGTAATGTTGACATAAGGAGGAAGACT
AATTACCTTATTGTGGATTCAAAGACAACGGTGAGACAAATTGAGGATGCTTTCAAGGAA
TTCTCATCAAGAGATGATATTGCTATCATCCTCATCAGCCAATATGTTGCCAATATGATC
AGGTTCTTGGTGGATAGCTACAACAAGCCAGTTCCTGCAATCCTGGAGATCCCTTCCAAG
GACCATCCTTATGATCCTGCTCATGACTCTGTTCTCTCCCGTGTCAAGTACCTCTTCTCT
GCGGAATCTGTGTCACAGCGTTAAAACATATACATCCTGCAAAAGCTTGCTGAGCTTTTT
ATATTATTTGTTTGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCAGTTTTCAATAATGTATCTCTTG
ATTTTTATTTGGAAATGGATGTTATA*TCAGTAAGAAGGAATGATAACACCATCTGGTTC
TTTTTGCATTAAATAAAGAGAGTGAGTCTGTTGTGTAT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2ED29JQ 456 0 0
TTACCTTATTGTGGATTCAAAGACAACGGTGAGACAAATTGAGGATGCTTTCAAGGAATT
CTCATCAAGAGATGATATTGCTATCATCCTCATCAGCCAATATGTTGCCAATATGATCAG
GTTCTTGGTGGATAGCTACAACAAGCCAGTTCCTGCAATCCTGGAGATCCCTTCCAAGGA
CCATCCTTATGATCCTGCTCATGACTCTGTTCTCTCCCGTGTCAAGTACCTCTTTTTTGC
GGAATCTGTGTCACAGCGTTAAAACATATACATCCTGCAAAAGCTTGCTGAGCTTTTTAT
ATTATTTGTTTGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCAGTTTTCAATAATGTATCTCTTGAT
TTTTATTTGGAAATGGATGTTATA*TCAGTAAGAAGGAATGATAACACCATCTGGTTCTT
TTTGCATTAAATAAAGAGAGTGAGTCTGTTGTGTAT

QA 1 456 1 456
DS 



AS 2 4

CO CL2556Contig1 873 2 8 U
GGAGTGATTGTTTCGAGCTTTGCTGTCAAGTTTCTGCTTCTTCCGTGGAAATGGGGGATG
AAGTATTTTTGGGATACTCTTCTGGATGCTGATTTGGAATGTGACATCATTGGGTGGCAG
TATATCTCCGGGAGCTTACCTGATGGCCACGAGCTTGATCGCTTGGACAATCCCGCGATA
CAAGGTGCAAAGTATGATCCGGAAGGCGAGTACATAAGGCAATGGCTTCCCGAGCTGGCG
AGAATGCCAACAGAATGGATCCATCATCCATGGGACGCTCCATCAACTGTACTGAAAGCT
TCCGGAGTAGAACTCGGAGCAAACTATGCGAAACCCATTGTAGATATCGACACAGCTAGT
GAGCTGCTTACCAAAGCCATATCAAGAACCCGTGAGGCACAGATCATGATTGGAGCAGCA
CCTGATGAGGTTGTAGCTGATAGCTACGAGGTCTTAGAGGGTAATACTGTGAAAGTACCC
GGTGTTTGCCCGTCTGCGTCTTCTAATGACCAGCGCGTACCTTCGGATGTTCGTTACAAT
GGGTCAAGAGAGTGAAACCTGCAGAAGAAGAAGAAGAGAGGGAGATTAAGAGATGTAGAG
AAGAAAGGGACTTGTTTTCCACTGCCGAGTCTTCTTCTTCTGATGGTTAGAAGCGTGTTC
TTGGGTTCGCATTCTTGCTCGTTGGTATCAGAAGGAAAGAACTTGGAATTACTACTAGAA
GCTTTGTAAGAAATGGTTAAAAGCTGTTATTACAAAACCTAACACGTTGTATATCAAGTG
TGTATGTGTGTCTTGATTCGTTATTACATCGCTGATAACTACGGTCAGTCAACGGATATG
TAAGGATGAAAATATAGAAGTTGTTTTATGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM67TF U 1
AF RR2FM67JQ C 164
BS 1 694 RR2FM67TF
BS 695 695 RR2FM67JQ
BS 696 700 RR2FM67TF
BS 701 701 RR2FM67JQ
BS 702 709 RR2FM67TF
BS 710 710 RR2FM67JQ
BS 711 750 RR2FM67TF
BS 751 873 RR2FM67JQ

RD RR2FM67TF 769 0 0
GGAGTGATTGTTTCGAGCTTTGCTGTCAAGTTTCTGCTTCTTCCGTGGAAATGGGGGATG
AAGTATTTTTGGGATACTCTTCTGGATGCTGATTTGGAATGTGACATCATTGGGTGGCAG
TATATCTCCGGGAGCTTACCTGATGGCCACGAGCTTGATCGCTTGGACAATCCCGCGATA
CAAGGTGCAAAGTATGATCCGGAAGGCGAGTACATAAGGCAATGGCTTCCCGAGCTGGCG
AGAATGCCAACAGAATGGATCCATCATCCATGGGACGCTCCATCAACTGTACTGAAAGCT
TCCGGAGTAGAACTCGGAGCAAACTATGCGAAACCCATTGTAGATATCGACACAGCTAGT
GAGCTGCTTACCAAAGCCATATCAAGAACCCGTGAGGCACAGATCATGATTGGAGCAGCA
CCTGATGAGGTTGTAGCTGATAGCTACGAGGTCTTAGAGGGTAATACTGTGAAAGTACCC
GGTGTTTGCCCGTCTGCGTCTTCTAATGACCAGCGCGTACCTTCGGATGTTCGTTACAAT
GGGTCAAGAGAGTGAAACCTGCAGAAGAAGAAGAAGAGAGGGAGATTAAGAGATGTAGAG
AAGAAAGGGACTTGTTTTCCACTGCCGAGTCTTCTTCTTCTGATGGTTAGAAGCGTGTTC
TTGGGTTCGCATTCTTGCTCGTTGGTATCAGAAG*AAAGA*CTTGGAAT*ACTACTAGAA
GCTTTGTAAGAAATGGTTAAAAGCTGTTAT
ACAAACTAACACGTGTATA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2FM67JQ 710 0 0
TGGACAATCCCGCGATACAAGGTGCAAAGTATGATCCGGAAGGCGAGTACATAAGGCAAT
GGCTTCCCGAGCTGGCGAGAATGCCAACAGAATGGATCCATCATCCATGGGACGCTCCAT
CAACTGTACTGAAAGCTTCCGGAGTAGAACTCGGAGCAAACTATGCGAAACCCATTGTAG
ATATCGACACAGCTAGTGAGCTGCTTACCAAAGCCATATCAAGAACCCGTGAGGCACAGA
TCATGATTGGAGCAGCACCTGATGAGGTTGTAGCTGATAGCTACGAGGTCTTAGAGGGTA
ATACTGTGAAAGTACCCGGTGTTTGCCCGTCTGCGTCTTCTAATGACCAGCGCGTACCTT
CGGATGTTCGTTACAATGGGTCAAGAGAGTGAAACCTGCAGAAGAAGAAGAAGAGAGGGA
GATTAAGAGATGTAGAGAAGAAAGGGACTTGTTTTCCACTGCCGAGTCTTCTTCTTCTGA
TGGTTAGAAGCGTGTTCTTGGGTTCGCATTCTTGCTCGTTGGTATCAGAAGGAAAGAACT
TGGAATTACTACTAGAAGCTTTGTAAGAAATGGTTAAAAGCTGTTATTACAAAACCTAAC
ACGTTGTATATCAAGTGTGTATGTGTGTCTTGATTCGTTATTACATCGCTGATAACTACG
GTCAGTCAACGGATATGTAAGGATGAAAATATAGAAGTTGTTTTATGTGC

QA 1 710 1 710
DS 



CO CL2556Contig2 591 2 1 U
GGAAAGCTTCCGGAGTAGAACTCGGAGCAAACTATGCGAAACCCATTGTAGATATCGACA
CAGCTCGTGAGCTGCTTACCAAAGCCATATCAAGAACCCGTGAGGCACAGATCATGATTG
GAGCAGCACCTGCTGAGGTTGTAGCTGATAGCTACGAGGTCTTAGAGGGTAATACTGTGA
AAGTACCCGGTGTTTGCCCGTCTGCGTCTTCTAATGACCAGCGCGTACCTTCGGATGTTC
GTTACAATGGGTCAAAGAGAGTGAAACCTGCAGAAGAAGAAGAAGAGAGGGAGATTAAGA
GATGTAGAGAAGAAAGGGACTTGTTTTCCACTGCCGAGTCTTCTTCTTCTGATGGTTAGA
AGCGTGTTCTTGGGTTCGCATTCTTGCTCGTTGGTATCAGAAGGAAAGAACTTGGAATTA
CTACTAGAAGCTTTGTAAGAAATGGTTAAAAGCTGTTATTACAAAACCTAACACGTTGTA
TATCTTTAGGTGTGTATGTGTCGTGTCTCTTGATTCGTTATTACATCGCTGATAACTACG
GTCTGTCAACGGATATGTAAGGATGAAGACATAAAAGGTTGTTTTATGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GU83TF U 1
AF RR2GU83JQB C 207
BS 1 591 RR2GU83TF

RD RR2GU83TF 591 0 0
GGAAAGCTTCCGGAGTAGAACTCGGAGCAAACTATGCGAAACCCATTGTAGATATCGACA
CAGCTCGTGAGCTGCTTACCAAAGCCATATCAAGAACCCGTGAGGCACAGATCATGATTG
GAGCAGCACCTGCTGAGGTTGTAGCTGATAGCTACGAGGTCTTAGAGGGTAATACTGTGA
AAGTACCCGGTGTTTGCCCGTCTGCGTCTTCTAATGACCAGCGCGTACCTTCGGATGTTC
GTTACAATGGGTCAAAGAGAGTGAAACCTGCAGAAGAAGAAGAAGAGAGGGAGATTAAGA
GATGTAGAGAAGAAAGGGACTTGTTTTCCACTGCCGAGTCTTCTTCTTCTGATGGTTAGA
AGCGTGTTCTTGGGTTCGCATTCTTGCTCGTTGGTATCAGAAGGAAAGAACTTGGAATTA
CTACTAGAAGCTTTGTAAGAAATGGTTAAAAGCTGTTATTACAAAACCTAACACGTTGTA
TATCTTTAGGTGTGTATGTGTCGTGTCTCTTGATTCGTTATTACATCGCTGATAACTACG
GTCTGTCAACGGATATGTAAGGATGAAGACATAAAAGGTTGTTTTATGTGC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2GU83JQB 385 0 0
TCTTCTAATGACCAGCGCGTACCTTCGGATGTTCGTTACAATGGGTCAAAGAGAGTGAAA
CCTGCAGAAGAAGAAGAAGAGAGGGAGATTAAGAGATGTAGAGAAGAAAGGGACTTGTTT
TCCACTGCCGAGTCTTCTTCTTCTGATGGTTAGAAGCGTGTTCTTGGGTTCGCATTCTTG
CTCGTTGGTATCAGAAGGAAAGAACTTGGAATTACTACTAGAAGCTTTGTAAGAAATGGT
TAAAAGCTGTTATTACAAAACCTAACACGTTGTATATCTTTAGGTGTGTATGTGTCGTGT
CTCTTGATTCGTTATTACATCGCTGATAACTACGGTCTGTCAACGGATATGTAAGGATGA
AGACATAAAAGGTTGTTTTATGTGC

QA 1 385 1 385
DS 



AS 1 4

CO CL2557Contig1 848 4 12 U
GGGGGGGCAAGTGTTCTTCGGAATGACTAGGCGTAAAGGGCACGTAGGCGGTTCATCGGG
TTGAAAGTGAAAGTCGTCAAAAAGTGGCGGAATGCTTTCGAAACCACTGAACTTGAGTGA
GACAGAGGAGAGTGGAATTTCGTGTCGAGGGGTGAAATCTACGGATCTACGAAGGAACGC
CAAAAGCGAAGGCAGCTCTCTGGGCCTCTACCGACGCTGGTGTGCGAAAGCATGGGGAGC
GAACGGGATTAGATACCCTGGTAGTCCATGCCGTAAACGATGAGTGTTCGCCCTTGGTCT
ATTCTGATCTGGGGCTCAGCTAACGCGTTAAACACTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAG
ACCGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCTGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTC
GATACAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATATGAACGAGAAACCCTATCCTTAAC
GGGATGGTACTGACTTTCATACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGAT
GTTTGGTTAAGTCCTATAACGAGCGAAACCCTCGCCTTGTGTTGCTCAGACATGCGCCTA
AGGAGAAAGGTTGTGCAAACCGAAGTAAGCCAAGTAGCCGAGTGATGTGCCAGACTTAGG
AATTGAGTGACAGCAACTAGCTCTGCTCTCAGTAACAAGGGGTTCCTCCTTTAGGGGAGA
AGCTGGGTTCCTCCGGCGCCTTTCCAAGCCCTAACTAGTCGGCGGAGAAAGACTCGGCAT
TCAGGTGAGCCGAACGGTGGTGTGGGACGAAGGAAGTGGGTTTAGTACGCCCTGACAAAA
CCGCTCCG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DW20TF U 2
AF RR2D226TF U 1
AF RR2D226JQ C 338
AF RR2DW20JQ C 477
BS 1 145 RR2D226TF
BS 146 146 RR2DW20TF
BS 147 204 RR2D226TF
BS 205 205 RR2DW20TF
BS 206 567 RR2D226TF
BS 568 568 RR2DW20TF
BS 569 695 RR2D226TF
BS 696 769 RR2D226JQ
BS 770 770 RR2DW20JQ
BS 771 806 RR2D226JQ
BS 807 807 RR2DW20JQ
BS 808 848 RR2D226JQ

RD RR2DW20TF 598 0 0
GGGGGGCAAGTGTTCTTCGGAATGACTAGGCGTAAAGGGCACGTAGGCGGTTCATCGGGT
TGAAAGTGAAAGTCGTCAAAAAGTGGCGGAATGCTTTCGAAACCACTGAACTTGAGTGAG
ACAGAGGAGAGTGGAATTTCGT*TCGAGGGGTGAAATCTACGGATCTACGAAGGAACGCC
AAAAGCGAAGGCAGCTCTCTGGGCCTCTACCGACGCTGGTGTGCGAAAGCATGGGGAGCG
AACGGGATTAGATACCCTGGTAGTCCATGCCGTAAACGATGAGTGTTCGCCCTTGGTCTA
TTCTGATCTGGGGCTCAGCTAACGCGTTAAACACTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGA
CCGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCTGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCG
ATACAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATATGAACGAGAAACCCTATCCTTAACG
GGATGGTACTGACTTTCATACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATG
TTTGGTTAAGTCCTATAACGAGCGAAACCCTCGCCTTGTGTTGCTCAGACATGCGCCT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2D226TF 695 0 0
GGGGGGGCAAGTGTTCTTCGGAATGACTAGGCGTAAAGGGCACGTAGGCGGTTCATCGGG
TTGAAAGTGAAAGTCGTCAAAAAGTGGCGGAATGCTTTCGAAACCACTGAACTTGAGTGA
GACAGAGGAGAGTGGAATTTCGTGTGGAGGGGTGAAATCTACGGATCTACGAAGGAACGC
CAAAAGCGAAGGCAGCTCTCTGGGTCTCTACCGACGCTGGTGTGCGAAAGCATGGGGAGC
GAACGGGATTAGATACCCTGGTAGTCCATGCCGTAAACGATGAGTGTTCGCCCTTGGTCT
ATTCTGATCTGGGGCTCAGCTAACGCGTTAAACACTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAG
ACCGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCTGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTC
GATACAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATATGAACGAGAAACCCTATCCTTAAC
GGGATGGTACTGACTTTCATACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGAT
GTTTGGTTAAGTCCTATAACGAGCGAAGCCCTCGCCTTGTGTTGCTCAGACATGCGCCTA
AGGAGAAAGGTTGTGCAAACCGAAGTAAGCCAAGTAGCCGAGTGATGTGCCAGACTTAGG
AATTGAGTGACAGCAACTAGCTCTGCTCTCAGTAA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2D226JQ 511 0 0
CGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGACCGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCTGCACAAG
CGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATACAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATAT
GAACGAGAAACCCTATCCTTAACGGGATGGTACTGACTTTCATACAGGTGCTGCATGGCT
GTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTTGGTTAAGTCCTATAACGAGCGAAGCCCTCGCCT
TGTGTTGTTCAGACATGCGCCTAAGGAGAAAGGTTGTGCAAACCGAAGTAAGCCAAGTAG
CCGAGTGATGTGCCAGACTTAGGAATTGAGTGACAGCAACTAGCTCTGCTCTCAGTAACA
AGGGGTTCCTCCTTTAGGGGAGAAGCTGGGTTCCTCCGGCGCCTTTCCAAGCCCTAACTA
GTCGGCGGAGAAGGACTCGGCATTCAGGTGAGCCGAACGGTGGTGTGGGGCGAAGGAAGT
GGGTTTAGTACGCCCTGACAAAACCGCTCCG

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2DW20JQ 372 0 0
TAACGGGATGGTACTGACTTTCATACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTG
AGATGTTTGGTTAAGTCCTATAACGAGCGAAACCCTCGCCTTGTGTTGTTCAGACATGCG
CCTAAGGAGAAAGGTTGTGCAAACCGAAGTAAGCCAAGTAGCCGAGTGATGTGCCAGACC
TAGGAATTGAGTGACAGCAACTAGCTCTGCTCTCAGTAACAAGGGGTTCCTCCTTTAGGG
GAGAAGCTGGGTTCCTCCGGCGCCTTTCCAAGCCCTAACTAGTCGGCGGAGAAAGACTCG
GCATTCAGGTGAGCCGAACGGTGGTGTGGGACGGAGGAAGTGGGTTTAGTACGCCCTGAC
AAAACCGCTCCG

QA 1 372 1 372
DS 



AS 1 2

CO CL2558Contig1 617 2 16 U
AAATGAAAATGTTTAATATTGTGTTAATTCAAAAACCTTTAAAGTTTGACTGTTTAAAAG
GTACAAAAACGTTGTAGCTCGGTTTATTGAAAACTAAAACAAACCAAACCGAAAACGCTT
ATTTGGGTAACACAAGATGGCCGGTACAATTTTACAATCCGGTTCACTTCTCAAAGTTAT
AAAATTTCAGTGTTGTCACACACATAGCAAAAACATGTTGGAACTCAGGTACAGCTTGAG
ACTTGAGATTATGACCGGTTTAACGTTTCTTCTCAGTCTCTGCGTTCTCCGGGAAAGGGT
ATGGAAGCACAGCAACGGTAATAACCGCTCTGGTCAAACACAAAACGCTGCGAGAGATGA
GCTTCTTGGATAAAATACTCTCCCCAGTCTTCATTTCCAAACTGTTTATGTATCTCCCTT
GCATCAAACGTATCCATCTTCTTTCTTTTGTCCTTTCTTTTCCTGTGCCTAGCGTTCATC
ACAGTCGCGTGCAGCTTCAAGCTTTGGTTTGCATCTTTTTCAAGAACAAGTCCAGCTTTC
ACAAATGCATCAGTGATAACTTTACAAGCACGTAAAAGCCTGCCTTCATCACCAATTTCT
TCAACAGGAATGTAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F251JQ U 1
AF RR2DV66JQ U 30
BS 1 208 RR2F251JQ
BS 209 210 RR2DV66JQ
BS 211 221 RR2F251JQ
BS 222 222 RR2DV66JQ
BS 223 250 RR2F251JQ
BS 251 251 RR2DV66JQ
BS 252 371 RR2F251JQ
BS 372 372 RR2DV66JQ
BS 373 392 RR2F251JQ
BS 393 393 RR2DV66JQ
BS 394 416 RR2F251JQ
BS 417 417 RR2DV66JQ
BS 418 437 RR2F251JQ
BS 438 438 RR2DV66JQ
BS 439 611 RR2F251JQ
BS 612 617 RR2DV66JQ

RD RR2F251JQ 611 0 0
AAATGAAAATGTTTAATATTGTGTTAATTCAAAAACCTTTAAAGTTTGACTGTTTAAAAG
GTACAAAAACGTTGTAGCTCGGTTTATTGAAAACTAAAACAAACCAAACCGAAAACGCTT
ATTTGGGTAACACAAGATGGCCGGTACAATTTTACAATCCGGTTCACTTCTCAAAGTTAT
AAAATTTCAGTGTTGTCACACACATAGCTGAAACATGTTGGGACTCAGGTACAGCTTGAG
ACTTGAGATTCTGACCGGTTTAACGTTTCTTCTCAGTCTCTGCGTTCTCCGGGAAAGGGT
ATGGAAGCACAGCAACGGTAATAACCGCTCTGGTCAAACACAAAACGCTGCGAGAGATGA
GCTTCTTGGATCAAATACTCTCCCCAGTCTTCGTTTCCAAACTGTTTATGTATCTCTCTT
GCATCAAACGTATCCATGTTCTTTCTTTTGTCCTTTCTTTTCCTGTGCCTAGCGTTCATC
ACAGTCGCGTGCAGCTTCAAGCTTTGGTTTGCATCTTTTTCAAGAACAAGTCCAGCTTTC
ACAAATGCATCAGTGATAACTTTACAAGCACGTAAAAGCCTGCCTTCATCACCAATTTCT
TCAACAGGAAT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2DV66JQ 588 0 0
CAAAAACCTTTAAAGTTTGACTGTTTAAAAGGTACAAGAACGTTGTAGCTCGGTTTATTG
AAGACTAAGACAAACCAAACCGAAGACGCTTATTTGGGTAACACAAGATGGCCGGTACAA
TTTTACAATCCGGTTCACTTCTCACAGTTATAAAATTTCAGTGTTGTCACACACATAGCA
AAGACATGTTGGAACTCAGGTACAGCTTGAGACTTGAGATTATGACCGGTTTAACGTTTC
TTCTCAGTCTCTGTGTTCTCCGGGAAAGGGTATGGAAGCACAGCAACGGTAATAACCGGT
CTGGTCAAACACAAAACGCTGGGAGAGATGAGCTTCTTGGATAAAATACTCTCCCCAGTC
TTCATTTCCAAACTGTTTATGTATCTCCCTTGCATCAAACGTATCCATCTTCTTTCTTTT
GTCCTTTCTTTTCCTGTGCCTAGCGTTCATCACAGTCGCGTGCAGCTTCAAGCTTTGGTT
TGCATCTTTTTCAAGAACAAGTCCAGCTTTCACAAATGCATCAGTGATAACTTTACAAGC
ACGTAAAAGCCTGCCTTCATCACCAATTTCTTCAACAGGAATGTAGAG

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL2559Contig1 691 2 17 U
GTCGACAAAATTTCAATACGTCATTAATCTAAGAGTGAGAGAACGAAACAAGTTGGTTTT
CCAAGTCTAAGCCATAACAAACTCCATAAGACGTCCAAATACACTGAAAATAAAGAAAAG
AAAGAGGCAAATGTTTGGAGCCAAACCCTTTCCCTAAGGGTTACTTAATTACTGCTGGGC
ACATTGCACCCTCTACGCACCTCCAGGATGGTCATCATCGCCTTCGTCATCATCATAAGC
CTCTCTTTGAGCTTGTGCTTTCCTTCTCATCTCATCCTCAATGTCGACATCGTGCAGCGT
CGTCTCCTCGCACTCATCAATCTCCATGTCGCTCAGCTGAGTAGTCGAAGGCTTGGGAAG
AATAGCTTCAAATGCTTTGGTCTGGTCAGGGGTTAGCGAGTCCGGGAAATCCACAGTGAA
GTGGATGTAGAGCTTGCCCTTCATGAATGGCCTCTGATATATCGGCATCCCTTCATCGCT
TATTGCCTTGTATGAATCAGGTTTAACGACGTCCCCGGGATGAGATTTGATGAGAAGATT
CCTGCCATCCAAGTGGGTGAGGACGAAGGAGAAGCCGCATAGAGCTTCGGTGAGAGAGAG
TGTGTGTTCTACAAAGAGGTCTTCTCCTTTTCTCTTGAACTTTGGGTGCTCTTTCTGCTG
AATGACAAACACTATATCTCCAGTGACGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 0 0 0 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2EE44JQ U 1
AF RR2EU62JQ U 53
BS 1 148 RR2EE44JQ
BS 149 151 RR2EU62JQ
BS 152 157 RR2EE44JQ
BS 158 158 RR2EU62JQ
BS 159 194 RR2EE44JQ
BS 195 195 RR2EU62JQ
BS 196 284 RR2EE44JQ
BS 285 285 RR2EU62JQ
BS 286 300 RR2EE44JQ
BS 301 301 RR2EU62JQ
BS 302 318 RR2EE44JQ
BS 319 319 RR2EU62JQ
BS 320 476 RR2EE44JQ
BS 477 477 RR2EU62JQ
BS 478 540 RR2EE44JQ
BS 541 541 RR2EU62JQ
BS 542 691 RR2EE44JQ

RD RR2EE44JQ 691 0 0
GTCGACAAAATTTCAATACGTCATTAATCTAAGAGTGAGAGAACGAAACAAGTTGGTTTT
CCAAGTCTAAGCCATAACAAACTCCATAAGACGTCCAAATACACTGAAAATAAAGAAAAG
AAAGAGGCAAATGTTTGGAGCCAAACCC***CCCTAATGGTTACTTAATTACTGCTGGGC
ACATTGCACCCTCTGCGCACCTCCAGGATGGTCATCATCGCCTTCGTCATCATCATAAGC
CTCTCTTTGAGCTTGTGCTTTCCTTCTCATCTCATCCTCAATGTTGACATCGTGCAGCGT
TGTCTCCTCGCACTCATCTATCTCCATGTCGCTCAGCTGAGTAGTCGAAGGCTTGGGAAG
AATAGCTTCAAATGCTTTGGTCTGGTCAGGGGTTAGCGAGTCCGGGAAATCCACAGTGAA
GTGGATGTAGAGCTTGCCCTTCATGAATGGCCTCTGATATATCGGCATCCCTTCATTGCT
TATTGCCTTGTATGAATCAGGTTTAACGACGTCCCCGGGATGAGATTTGATGAGAAGATT
TCTGCCATCCAAGTGGGTGAGGACGAAGGAGAAGCCGCATAGAGCTTCGGTGAGAGAGAG
TGTGTGTTCTACAAAGAGGTCTTCTCCTTTTCTCTTGAACTTTGGGTGCTCTTTCTGCTG
AATGACAAACACTATATCTCCAGTGACGGTG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2EU62JQ 639 0 0
TTGGTTTCAAAGTCTTAAA
CCATAGCAAACTCCATAAGACTTCCAAATACACTGAAAATAAAGAAAAGGAAGAGGCAAA
TGTT*GGAGCCACGTCCTTTCTCTAAGGGTTACTTAGTTACTGCTGGGCACATTGCACCC
TCTACGCACCTCCAGGATGGTCATCATCGCCTTCGTCATCATCATAAGCCTCTCTTTGAG
CTTGTGCTTTCCTTCTCATCTCATCCTCAATGTCGACATCGTGCAGCGTCGTCTCCTCGC
ACTCATCAATCTCCATGTCGCTCAGCTGAGTAGTCGAAGGCTTGGGAAGAATAGCTTCAA
ATGCTTTGGTCTGGTCAGGGGTTAGCGAGTCCGGGAAATCCACCGTGAAGTGGATGTAGA
GCTTGCCCTTCATGAATGGCCTCTGGTATATCGGCATCCCTTCATCGCTTATTGCCTTGT
ATGAATCAGGTTTAACGACGTCCCCGGGATGAGATTTGATGAGAAGATTCCTGCCATCCA
AGTGGGTGAGGACGAAGGAGAAGCCGCATAGAGCTTCGGTGAGAGAGAGTGTGT**TCTA
CAAAGAGGTCTTCTCCTTTTCTCTTGAACTTTGGGTGCTCTTTCTGCTGAATGACAAACA
CTATATCTCCAGTGACGGTG

QA 20 639 20 639
DS 



AS 1 3

CO CL2560Contig1 733 3 44 U
GGATCACGCAGAGAGACTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCATCTCATCTTTCCTCA
ATCGCTTGGTTTCTTAACTCAAAACAATAGATTGAACCATGAGTTTCTGCAAATGGGTTT
CCTTTCTTTTGATCGTTCACTTACTCAACTCCTCTCACCTTTCATCTTCATCTTCCTTAA
CCTCAAATGGGTTTTCACAAATCCCTTCAAAGTTTCTTGCTTTAGCTAAAAGGAACGATT
TTTATGATTGGATGGTTGGGATCAGAAGGAATATCCACGAGAACCCGGAGTTAGGTTACG
AGGAAGTAGAGACATCTAGGCTCGTTAGGACAGAACTGGAGAAGATGGGTGTGTCTTATA
AGTACCCAGTTGCTGTTACTGGTGTTGTCGGATATGTTGGAACTGGTCAAGCTCCTTTTG
TTGCATTGAGAGCAGATATGGATGCACTTGCTATGCAGGAAATGGTGGAATGGGAACACA
AGAGTAAGGTTCCAGGGAAGATGCACGCTTGTGGACATGACGCTCACACTACCATGCTCC
TAGGTGCTGCCAAGTTGCTCAAAGAACACCAAGATGAGCTACAGGGGAACTGTGATTCTA
GTGTTCCAACCAGCTGAGGAAGGAGGAGGAGGTGCAAAGAAGATTGTGGAAGCTGGAATG
TTGGAGGATGTGAGTGCAATCTTTGGTTTACATGTCACAAATCAATTGGGGTTAGGTCTA
GTGAGCTCAAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ84TF U 16
AF RR2A669TF U 1
AF RR2BB21TF U 10
BS 1 64 RR2A669TF
BS 65 65 RR2BB21TF
BS 66 72 RR2A669TF
BS 73 73 RR2BB21TF
BS 74 74 RR2A669TF
BS 75 75 RR2BB21TF
BS 76 77 RR2A669TF
BS 78 78 RR2BB21TF
BS 79 134 RR2A669TF
BS 135 135 RR2BB21TF
BS 136 169 RR2A669TF
BS 170 170 RR2BB21TF
BS 171 206 RR2A669TF
BS 207 207 RR2BB21TF
BS 208 214 RR2A669TF
BS 215 215 RR2BB21TF
BS 216 270 RR2A669TF
BS 271 272 RR2BB21TF
BS 273 382 RR2A669TF
BS 383 383 RR2BB21TF
BS 384 388 RR2A669TF
BS 389 389 RR2BB21TF
BS 390 430 RR2A669TF
BS 431 431 RR2BB21TF
BS 432 433 RR2A669TF
BS 434 434 RR2BB21TF
BS 435 449 RR2A669TF
BS 450 450 RR2BB21TF
BS 451 520 RR2A669TF
BS 521 521 RR2BB21TF
BS 522 538 RR2A669TF
BS 539 539 RR2BB21TF
BS 540 541 RR2A669TF
BS 542 542 RR2BB21TF
BS 543 586 RR2A669TF
BS 587 587 RR2BB21TF
BS 588 588 RR2A669TF
BS 589 589 RR2BB21TF
BS 590 695 RR2A669TF
BS 696 696 RR2BB21TF
BS 697 704 RR2A669TF
BS 705 705 RR2BB21TF
BS 706 716 RR2A669TF
BS 717 733 RR2BB21TF

RD RR2BZ84TF 599 0 0
AAACTCT
CTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTCATCTCATCTTTCCTCAATCGCTTGGTTTCTTAACTCAA
AACAATAGATTGAACCATGAGTTTCTGCAAATGGGTTTCCTTTCTTTTGATCGTTCACTT
ACTCAACTCCTCTCACCTTTCATCTTCATCTTCCTTAACCTCAAATGGGTTTTCACAAAT
CCCTTCAAAGTTTCTTGCTTTAGCTAAAAGGAACGATTTTTATGATTGGATGGTTGGGAT
CAGAAGGAATATCCACGAGAACCCGGAGTTAGGTTACGAGGAAGTAGAGACATCTAGGCT
CGTTAGGACAGAACTGGAGAAGATGGGTGTGTCTTATAAGTACCCAGTTGCTGTTACTGG
TGTTGTCGGATATGTTGGAACTGGTCAAGCTCCTTTTGTTGCATTGAGAGCAGATATGGA
TGCACTTGCTATGCAGGAAATGGTGGAATGGGAACACAAGAGTAAGGTTCCAGGGAAGAT
GCACGCTTGTGGACATGACGCTCACACTACCATGCTCCTAGGTGCTGCCAAGTTGCTCAA
AGAACACCAAGATGAGCTACAGGG*AACTGTGATTCTAGTGTTCCAACCAGC

QA 8 599 8 599
DS 

RD RR2A669TF 719 0 0
GGATCACGCAGAGAGACTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCATCTCATCTTTCCTCA
ATCGTTTGGTTTTTGAATTCAAAACAATAGATTGAACCATGAGTTTCTGCAAATGGGTTT
CCTTTCTTTTGATCATTCACTTACTCAACTCCTCTCACCTTTCATCTTCCTCTTCCTTAA
CCTCAAATGGGTTTTCACAAATCCCTCCAAAGTTCCTTGCTTTAGCTAAAAGGAACGATT
TTTATGATTGGATGGTTGGGATCAGAAGGAGAATCCACGAGAACCCGGAGTTAGGTTACG
AGGAAGTAGAGACATCTAGGCTCGTTAGGACAGAACTGGAGAAGATGGGTGTGTCTTATA
AGTACCCAGTTGCTGTTACTGGGGTTGTTGGATATGTTGGAACTGGTCAAGCTCCTTTTG
TTGCATTGAGGGCTGATATGGATGCACTTTCTATGCAGGAAATGGTGGAATGGGAACACA
AGAGTAAGGTTCCAGGGAAGATGCACGCTTGTGGACATGATGCTCACACTACCATGCTTC
TTGGTGCTGCCAAGTTGCTCAAAGAACACCAAGATGAGCTACAGGGTA*CTGTGATTCTA
GTGTTCCAACCAGCTGAGGAAGGAGGAGGAGGTGCAAAGAAGATTGTGGAAGCTGGAATG
TTGGAGGATGTGAGTGCAATCTTTGGTTTACATGTTACAAATCAGTTGGGGTTAGG
CCT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2BB21TF 724 0 0
AAACTCTCTCTTT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCATCTCGTCTTTCCTCAATCGCTTGGTTTCTTAACTCAA
AACAATAGATTGGACCATGAGTTTCTGCAAATGGGTTTCCTTTCTTTTGATCGTTCACTT
ACTCAACTCCTCTCACCTTTCATCTTCATCTTCCTTAACCTCAAATGGGTTTTCACAAAT
CCCTTCAAAGTTTCTTGCTTTAGCTAAAAGGAACGATTTTTATGATTGGATGGTTGGGAT
CAGAAGGAATATCCACGAGAACCCGTAGTTAGGTTACGAGGAAGTAGAGACATCTAGGCT
CGTTAGGACAGAACTGGAGAAGATGGGTGTGTCTTATAAGTACCCAGTTGCTGTTACTGG
TGTTGTCGGATATGTTGGAACTGGTCAAGCTCCTTTTGTTGCATTGAGAGCAGATATGGA
TGCACTTGCTATGCAGGAAATGGTGGAATGGGAACACAAGAGTAAGGTTCCAGGGAAGAT
GCACGCTTGTGGACATGACGCTCACACTACCATGCTCCTAGGTGCTGCCAAGTTGCTCAA
AGAACACCAAGATGAGCTACAGGGGAACTGTGATTCTAGTGTTCCAACCAGCTGAGGAAG
GAGGAGGAGGTGCAA*GAAGATTGTGGAAGCTGGAATGTTGGAGGATGTGAGTGCAATCT
TTGGTTTACATGTCACAAATCAATTGGGGTTAGGTCTAGTGAGCTCAAGAG

QA 14 724 14 724
DS 



AS 1 4

CO CL2561Contig1 659 4 2 U
GGAGCCAATTACATACTTCTTTCCAACCAGAAACCTTTTTAGTTTGTGTTTGAATAATAA
TTTGGGATTCATCATCATCGGAGGAGATGGGCGGAGACGGCAAAGTGTTCACCTTGGAGG
AGGTTACTCAGCACAGTAGCAGCAAGGATTGTTGGATCGCCATCGACGGCAAGGTTTATG
ATGTGACCAAGTTCTTGGACGACCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTCTACAG
GGAAAGACGCGACGGATGATTTTGAGGATGTGGGACACAGTTCCACTGCAAAAGCCATGC
TTGATGAGTACTACGTCGGTGATATTGACTCCGCTACTGTCCCTGCCAAAACCAAGTTTG
TTCCTCCTCCTCCTAACCAGACCACCCAGTCTAACCAGAGCTCCGATTTTCTCATCAAGG
TTCTTCAGTTCCTTGTTCCTCTTCTTATCTTAGGCTTGGCTCTCGGTATCCGCTCTTACA
CCAAGACCCCTTCCTCTTGAGGAGTGTCTTTGAGTGTGTTACTACGTGTTTGCCCCCCTT
TATCTCTGCCTGTCTTTGTAAGACTTCAGATTATTATATTCTCTTTTTGCAACCAACTGG
ATTATGCAAGAGACCTTTTGTTTTGTCTTTTTAATCAAATCAAATCCATTTTACAAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FQ82JQ C 1
AF RR2FQ82TF U 1
AF RR2EV31TF U 39
AF RR2EV31JQ C 442
BS 1 590 RR2FQ82TF
BS 591 659 RR2EV31TF

RD RR2FQ82JQ 590 0 0
GGAGCCAATTACATACTTCTTTCCAACCAGAAACCTTTTTAGTTTGTGTTTGAATAATAA
TTTGGGATTCATCATCATCGGAGGAGATGGGCGGAGACGGCAAAGTGTTCACCTTGGAGG
AGGTTACTCAGCACAGTAGCAGCAAGGATTGTTGGATCGCCATCGACGGCAAGGTTTATG
ATGTGACCAAGTTCTTGGACGACCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTCTACAG
GGAAAGACGCGACGGATGATTTTGAGGATGTGGGACACAGTTCCACTGCAAAAGCCATGC
TTGATGAGTACTACGTCGGTGATATTGACTCCGCTACTGTCCCTGCCAAAACCAAGTTTG
TTCCTCCTCCTCCTAACCAGACCACCCAGTCTAACCAGAGCTCCGATTTTCTCATCAAGG
TTCTTCAGTTCCTTGTTCCTCTTCTTATCTTAGGCTTGGCTCTCGGTATCCGCTCTTACA
CCAAGACCCCTTCCTCTTGAGGAGTGTCTTTGAGTGTGTTACTACGTGTTTGCCCCCCTT
TATCTCTGCCTGTCTTTGTAAGACTTCAGATTATTATATTCTCTTTTTGC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2FQ82TF 590 0 0
GGAGCCAATTACATACTTCTTTCCAACCAGAAACCTTTTTAGTTTGTGTTTGAATAATAA
TTTGGGATTCATCATCATCGGAGGAGATGGGCGGAGACGGCAAAGTGTTCACCTTGGAGG
AGGTTACTCAGCACAGTAGCAGCAAGGATTGTTGGATCGCCATCGACGGCAAGGTTTATG
ATGTGACCAAGTTCTTGGACGACCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTCTACAG
GGAAAGACGCGACGGATGATTTTGAGGATGTGGGACACAGTTCCACTGCAAAAGCCATGC
TTGATGAGTACTACGTCGGTGATATTGACTCCGCTACTGTCCCTGCCAAAACCAAGTTTG
TTCCTCCTCCTCCTAACCAGACCACCCAGTCTAACCAGAGCTCCGATTTTCTCATCAAGG
TTCTTCAGTTCCTTGTTCCTCTTCTTATCTTAGGCTTGGCTCTCGGTATCCGCTCTTACA
CCAAGACCCCTTCCTCTTGAGGAGTGTCTTTGAGTGTGTTACTACGTGTTTGCCCCCCTT
TATCTCTGCCTGTCTTTGTAAGACTTCAGATTATTATATTCTCTTTTTGC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2EV31TF 621 0 0
GG
AGTTTGTGTTTGAATAATAATTTGGGATTCATCATCATCGGAGGAGATGGGCGGAGACGG
CAAAGTGTTCACCTTGGAGGAGGTTACTCAGCGCAGTAGCAGCAAGGATTGTTGGATCGT
CATCGACGGCAAGGTTTATGATGTGACCAAGTTCTTGGACGACCATCCTGGTGGTGACGA
GGTCATCTTGACTTCTACAGGGAAAGACGCGACGGATGATTTTGAGGATGTGGGACACAG
TTCCACTGCAAAAGCCATGCTTGATGAGTACTACGTCGGTGATATTGACTCCGCTACTGT
CCCTGCCAAAACCAAGTTTGTTCCTCCTCCTCCTAACCAGACCACCCAGTCTAACCAGAG
CTCCGATTTTCTCATCAAGGTTCTTCAGTTCCTTGTTCCTCTTCTTATCTTAGGCTTGGC
TCTCGGTATCCGCTCTTACACCAAGACCCCTTCCTCTTGAGGAGTGTCTTTGAGTGTGTT
ACTACGTGTTTGCCCCCCTTTATCTCTGCCTGTCTTTGTAAGACTTCAGATTATTATATT
CTCTTTTTGCAACCAACTGGATTATGCAAGAGACCTTTTGTTTTGTCTTTTTAATCAAAT
CAAATCCATTTTACAAGAC

QA 3 621 3 621
DS 

RD RR2EV31JQ 218 0 0
TTT
TTATCTTAGGCTTGGCTCTCGGTATCCGCTCTTACACCAAGACCCCTTCCTCTTGAGGAG
TGTCTTTGAGTGTGTTACTACGTGTTTGCCCCCCTTTATTTCTGCCTGTCTTTGTAAGAC
TTCAGATTATTATATTTTCTTTTTGCAACCAACTGGATTATGCAAGAGACCTTTTGTTTT
GTCTTTTTAATCAAATCAAATCCATTTTACAAGAC

QA 4 218 4 218
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2563Contig1 1049 4 9 U
TTTTTTCCTATGAATCGAATTGTTCCATTATTACTAACAGAATAGAACAAATATTAATCC
TTTCTCCGAAATAATTACCTAAAAAGGGGGGGTCCATAACATAGTTTTTTTCCAATGCAA
TAAAGTTACATAGTGTCTATTTTTCATTGATAAAGGGGTATTTCCATGGGTTTGCCTTGG
TATCGTGTTCATACTGTTGTATTGAATGATCCCGGTCGTTTACTTTCGGTTCATATAATG
CATACTGCTCTGGTTGCTGGTTGGGCCGGTTCCATGGCTCTATATGAATTAACTGTTTTT
GATCCCTCCGACCCTGTTCTTGATCCAATGTGGAGACAAAGTATGTTCGTTATACCTTTC
ATGACTCGTTTAGGAATAACCAATTCATGGGGCGGTTGGAATATTACAGGAGGGACTATA
ACGAATCCGGGTCTTTGGAGTTACGAAGGGGTAGCCGGAGCACATATCGTGTTTTCTGGC
TTGCGCTTCTTGGCAGCTATTTGGCATTGGGTATATTGGGATCTAGAAATTTTTTGTGAT
GAACGTACAGGAAAACCTTCTTTGGATTTGCCCAAGATTTTTGGAATTCATTTATTTCTT
TCAGGAGTGGCTTGCTTTGGTTTTGGCGCATTTCATGTAACAGGATTATATGGTCCTGGA
ATATGGGTATCCGACCCTTATGGACTAACCGGAAAGGTCCAACCCGTAAATCCGGCGTGG
GGCGTGGAGGGTTTTGACCCTTTTGTTCCGGGAGGAATAGCCTCTCATCATATTGCAGCA
GGGACGTTGGGTATATTAGCGGGCTTATTCCATCTTAGCGTTCGTCCGCCTCAACGTCTA
TACAAAGGATTACGTATGGGAAATATTGAAACCGTCCTTTCCAGTAGTATTGCTGCTGTC
TTTTTTGCAGCTTTTATTGTTGCTGGAACTATGTGGTATGGTTCTGCAACTACTCCCATC
GAATTATTTGGTCCTACTCGTTATCAATGGGATCAGGGATACTTTCAACAAGAAATATAT
CGAAGAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C285TF U 1
AF RR2EI02TF U 1
AF RR2FL65TF U 402
AF RR2EI02JQ C 428
BS 1 370 RR2C285TF
BS 371 604 RR2EI02TF
BS 605 605 RR2FL65TF
BS 606 639 RR2EI02TF
BS 640 818 RR2FL65TF
BS 819 819 RR2EI02JQ
BS 820 882 RR2FL65TF
BS 883 883 RR2EI02JQ
BS 884 1049 RR2FL65TF

RD RR2C285TF 370 0 0
TTTTTTCCTATGAATCGAATTGTTCCATTATTACTAACAGAATAGAACAAATATTAATCC
TTTCTCCGAAATAATTACCTAAAAAGGGGGGGTCCATAACATAGTTTTTTTCCAATGCAA
TAAAGTTACATAGTGTCTATTTTTCATTGATAAAGGGGTATTTCCATGGGTTTGCCTTGG
TATCGTGTTCATACTGTTGTATTGAATGATCCCGGTCGTTTACTTTCGGTTCATATAATG
CATACTGCTCTGGTTGCTGGTTGGGCCGGTTCCATGGCTCTATATGAATTAACTGTTTTT
GATCCCTCCGACCCTGTTCTTGATCCAATGTGGAGACAAAGTATGTTCGTTATACCTTTC
ATGACTCGTT

QA 1 370 1 370
DS 

RD RR2EI02TF 639 0 0
TTTTTTCCTATGAATCGAATTGTTCCATTATTACTAACAGAATAGAACAAATATTAATCC
TTTCTCCGAAATAATTACCTAAAAAGGGGGGGTCCATAACATAGTTTTTTTCCAATGCAA
TAAAGTTACATAGTGTCTATTTTTCATTGATAAAGGGGTATTTCCATGGGTTTGCCTTGG
TATCGTGTTCATACTGTTGTATTGAATGATCCCGGTCGTTTACTTTCGGTTCATATAATG
CATACTGCTCTGGTTGCTGGTTGGGCCGGTTCCATGGCTCTATATGAATTAGCTGTTTTT
GATCCCTCCGACCCTGTTCTTGATCCAATGTGGAGACAAGGTATGTTCGTTATACCTTTC
ATGACTCGTTTAGGAATAACCAATTCATGGGGCGGTTGGAATATTACAGGAGGGACTATA
ACGAATCCGGGTCTTTGGAGTTACGAAGGGGTAGCCGGAGCACATATCGTGTTTTCTGGC
TTGCGCTTCTTGGCAGCTATTTGGCATTGGGTATATTGGGATCTAGAAATTTTTTGTGAT
GAACGTACAGGAAAACCTTCTTTGGATTTGCCCAAGATTTTTGGAATTCATTTATTTCTT
TCAG*AGTGGCTTGCTTTGGTTTTGGCGCATTTCATGTA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2FL65TF 648 0 0
G
ATTACAGGAGGGACTATAACGAATCCGGGTCTTTGGAGTTACGAAGGGGTAGCCGGAGCA
CATATCGTGTTTTCTGGCTTGTGCTTCTTGGCAGCTATTTGGCATTGGGTATATTGGGAT
CTAGAAATTTTTTGTGATGAACGTACAGGAAAACCTTCTTTGGATTTGCCCAAGATTTTT
GGAATTCATTTATTTCTTTCAGGAGTGGCTTGCTTTGGTTTTGGCGCATTTCATGTAACA
GGATTATATGGTCCTGGAATATGGGTATCCGACCCTTATGGACTAACCGGAAAGGTCCAA
CCCGTAAATCCGGCGTGGGGCGTGGAGGGTTTTGACCCTTTTGTTCCGGGAGGAATAGCC
TCTCATCATATTGCAGCAGGGACGTTGGGTATATTAGCGGGCTTATTCCATCTTAGTGTT
CGTCCGCCTCAACGTCTATACAAAGGATTACGTATGGGAAATATTGAAACCGTCCTTTCC
GGTAGTATTGCTGCTGTCTTTTTTGCAGCTTTTATTGTTGCTGGAACTATGTGGTATGGT
TCTGCAACTACTCCCATCGAATTATTTGGTCCTACTCGTTATCAATGGGATCAGGGATAC
TTTCAACAAGAAATATATCGAAGAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGAGA

QA 2 648 2 648
DS 

RD RR2EI02JQ 612 0 0
CGGGTCTTTGGAGTTACGAAGGGGTAGCCGGAGCACATATCGTGTTTTCTGGCTTGCGCT
TCTTGGCAGCTATTTGGCATTGGGTATATTGGGATCTAGAAATTTTTTGTGATGAACGTA
CAGGAAAACCTTCTTTGGATTTGCCCAAGATTTTTGGAATTCATTTATTTCTTTCAGGAG
TGGCTTGCTTTGGTTTTGGCGCATTTCATGTAACAGGATTATATGGTCCTGGAATATGGG
TATCCGACCCTTATGGACTAACCGGAAAGGTCCAACCCGTAAATCCGGCGTGGGGCGTGG
AGGGTTTTGACCCTTTTGTTCCGGGAGGAATAGCCTCTCATCATATTGCAGCAGGGACGT
TGGGTATATTAGCGGGCTTATTCCATCTTAGCGTTCGTCCGCCTCAACGTCTATACAAAG
GATTACGTATGGGAAATATTGAAACCGTCCTTTCCAGTAGTATTGCTGCTGTCTTTTTTG
CAGCTTTTATTGTTGCTGGAACTATGTGGTATGGTTCTGCAACTACTCCCATCGAATTAT
TTGGTCCTACTCGTTATCAATGGGATCAGGGATACTTTCAACAAGAAATATATCGAAGAG
TT
AGCGCTGGAC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 4

CO CL2564Contig1 1243 4 2 U
GGCCAAGGCTGAGCCAGTATTCGGATTGCCACTTACCGCAATGGAGTATAGATTATTCTT
TGAGACCCCAAATCTTAAGCCAGAAGCAGAACACGTCTTAGGTCTACCGCATCCAACACT
GTGGAGAGATTTTAATAGGATTATGTTTTGGATTGCTATAATCGGAGGAAGTTTAGTACT
ACTCCATATATTCCTCTCTCTGATACTAAAGTTCAAGAAAGCACACACTGAGAAGATGAG
GAGCTTCGGTGCGTTTGTCTTCCCAAGATTCGAACTCTTTCTTCTCATTCTTGCTTTACC
CTCAATCTGCAAATCTGCAAGGAGCCTCATACAAGGGTATTTCAAACATCATGGAGCTGC
AGAAGCCAATGTCATAGTTGGTATCCTTGTTCTATGCATAGTAGCTGTTCTGCTTCTGGC
TTTGTTTCTCTTCCTCTCGGTGGGGATCACTTTTGGGAAGCTGTTACAGTACAAAGAGAT
TCATCAAGAAGAAAGTACAGCTCGTTGAGATCATCTCAGTAGCATGTCAAGTCGGTGTAT
TCGCCTCGTGTCTAGTGCTCTTGGCCAAAGACTTTCCAGAGACGAGCGGACAGAAACTTG
GGATATTCATGGTTATACTGTTCTTGATTGGGTTCATTACACAGATGTGCAACGAATGGT
ACTCACTGTACAAACAGACAAAGAGGTTAGACCAGATCAACAGGTCCTTCTTGAGCGGTC
TCAAGATGTTTATCATCGGACTTGCCGCGTTAATCTTGCCTCAGAAACTGATGAAGAGCA
AGATCTCTGCGGCTCAACTAGAAGGGAGAAGCAGCAGCAGCAATGTAGGGATTGCATTCT
CAACACCAGAGAACAGGTATATAAATTCTTCTGGGAGCCGAAGCTCGGGTAGTTTGGACA
AGCCATGGTTGAGACAGATACGAGAAATGGCGAAGGCTAGCTTCACGAGAGACAGGAGCA
GTAGTAAGGTTCCTAGTGATCCTTCAGGGAGCAAGAGTGGCTGGAGCAGTAGTATATGGG
GAACAAAGACAAGTGGAAGCTCTTCTAAAGACTCATCCTCAGACTACAAATCAAGACCTA
AAGGACTTTACAAAGATTTAGAAGCCATTTTTGCTTCCAAGTGAATAAAATATTAATGTA
ACAT******TCTCTGGTTTT*AAATAAATTCGAAGCTGTTGTATTGT**AATATTGAGT
ACTACTTGGATACATTT*AAGTTTTCACTGTATTTTTGTGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FF40TF U 1
AF RR2FF40JQ C 515
AF RR2CR70JQ C 642
AF RR2CR70TF U 642
BS 1 665 RR2FF40TF
BS 666 1243 RR2CR70TF

RD RR2FF40TF 665 0 0
GGCCAAGGCTGAGCCAGTATTCGGATTGCCACTTACCGCAATGGAGTATAGATTATTCTT
TGAGACCCCAAATCTTAAGCCAGAAGCAGAACACGTCTTAGGTCTACCGCATCCAACACT
GTGGAGAGATTTTAATAGGATTATGTTTTGGATTGCTATAATCGGAGGAAGTTTAGTACT
ACTCCATATATTCCTCTCTCTGATACTAAAGTTCAAGAAAGCACACACTGAGAAGATGAG
GAGCTTCGGTGCGTTTGTCTTCCCAAGATTCGAACTCTTTCTTCTCATTCTTGCTTTACC
CTCAATCTGCAAATCTGCAAGGAGCCTCATACAAGGGTATTTCAAACATCATGGAGCTGC
AGAAGCCAATGTCATAGTTGGTATCCTTGTTCTATGCATAGTAGCTGTTCTGCTTCTGGC
TTTGTTTCTCTTCCTCTCGGTGGGGATCACTTTTGGGAAGCTGTTACAGTACAAAGAGAT
TCATCAAGAAGAAAGTACAGCTCGTTGAGATCATCTCAGTAGCATGTCAAGTCGGTGTAT
TCGCCTCGTGTCTAGTGCTCTTGGCCAAAGACTTTCCAGAGACGAGCGGACAGAAACTTG
GGATATTCATGGTTATACTGTTCTTGATTGGGTTCATTACACAGATGTGCAACGAATGGT
ACTCA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2FF40JQ 717 0 0
CTCAGTAGCATGTCAAGTCGGTGTATTCGCCTCGTGTCTAGTGCTCTTGGCCAAAGACTT
TCCAGAGACGAGCGGACAGAAACTTGGGATATTCATGGTTATACTGTTCTTGATTGGGTT
CATTACACAGATGTGCAACGAATGGTACTCACTGTACAAACAGACAAAGAGGTTGGACCA
GATCAACAGGTCCATCTTGAGCGGTCTCAAGATGTTCATCATCGGACTTGCCGCGTTAAT
CTTGCCTCAGAAACTGATGAAGAGCAAGATCCCTGCGGCTCAACTAGAAGGGAGAAGCAG
CAGCAGCAATGTAGGGATTGCATTCTCAACACCAGAGAACAGGTATATAAATTCTTCTGG
GAGCCGAAGCTCCGGTAGTTTGGACAAGCCATGGTTGAAACAGATACGAGAGATGGCAAA
GGCTAGCTTCACGAGAGACAGGAGCAGTAGTAAGGTTCCTAGTGATCCTTCAGGGAGCAA
GAGTGGCTGGAGCAGTAGTATATGGGGAACAAAGACAAGCGGAAGCTCTTCTAAAGACTC
ATCCTCAGACTACAAATCAAGACCTAAAGGACTTTACAAAGATTTAGAAGCCATTTTTGC
TTCCAAGTGAATAAAATATTAATGTAATATATTTATTCTCTGGTTTTTAAATAAATTCGA
AGCTGTTGTATTGTGTAATATTGAGTACTACTAAGATACATTTTAAGTTTTCACTG
G

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2CR70JQ 602 0 0
G
AGATGTGCAACGAATGGTACTCGCTGTACAAACAGACAAAGAGGTTAGACCAGATCAACA
GGTCCTTCTTGAGCGGTCTCAAGATGTTTATCATCGGACTTGCCGCGTTAATCTTGCCTC
AGAAACTGATGAAGAGCAAGATCTTTGCGGCTCAACTAGAAGGGAGAAGCAGCAGCAGCA
ATGTAGGGATTGCATTCTCAACACCAGAGAACAGGTATATAAATTCTTCTGGGAGCCGAA
GCTCGGGTAGTTTGGACAAGCCATGGTTGAGACAGATACGAGAAATGGCGAAGGCTAGCT
TCACGAGAGACAGGAGCAGTAGTAAGGTTCCTAGTGATCCTTCAGGGAGCAAGAGTGGCT
GGAGCAGTAGTATATGGGGAACAAAGACAAGTGGAAGCTCTTCTAAAGACTCATCCTCAG
ACTACAAATCAAGACCTAAAGGACTTTACAAAGATTTAGAAGCCATTTTTGCTTCCAAGT
GAATAAAATATTAATGTAACAT******TCTCTGGTTTT*AAATAAATTCGAAGCTGTTG
TATTGT**AATATTGAGTACTACTTGGATACATTT*AAGTTTTCACTGTATTTTTGTGGT
G

QA 2 602 2 602
DS 

RD RR2CR70TF 602 0 0
G
AGATGTGCAACGAATGGTACTCGCTGTACAAACAGACAAAGAGGTTAGACCAGATCAACA
GGTCCTTCTTGAGCGGTCTCAAGATGTTTATCATCGGACTTGCCGCGTTAATCTTGCCTC
AGAAACTGATGAAGAGCAAGATCTCTGCGGCTCAACTAGAAGGGAGAAGCAGCAGCAGCA
ATGTAGGGATTGCATTCTCAACACCAGAGAACAGGTATATAAATTCTTCTGGGAGCCGAA
GCTCGGGTAGTTTGGACAAGCCATGGTTGAGACAGATACGAGAAATGGCGAAGGCTAGCT
TCACGAGAGACAGGAGCAGTAGTAAGGTTCCTAGTGATCCTTCAGGGAGCAAGAGTGGCT
GGAGCAGTAGTATATGGGGAACAAAGACAAGTGGAAGCTCTTCTAAAGACTCATCCTCAG
ACTACAAATCAAGACCTAAAGGACTTTACAAAGATTTAGAAGCCATTTTTGCTTCCAAGT
GAATAAAATATTAATGTAACAT******TCTCTGGTTTT*AAATAAATTCGAAGCTGTTG
TATTGT**AATATTGAGTACTACTTGGATACATTT*AAGTTTTCACTGTATTTTTGTGGT
G

QA 2 602 2 602
DS 



AS 1 4

CO CL2565Contig1 962 4 16 U
CGAGGAGAACACTTTTTATTTCCTGATATAGCACTTATTCAAACATCAAACAAAGGGCTC
CCACAAACAGTTTTAAGTTCTAAAAAAAGGGTAAAGCTCAAATCTTGCATTACAGCTTCT
ACACAAATATCTAACTCCTTGTTTTTCATGGCCACAGAATGGACGCTCATTGATAAGCCA
ATCTAGACACACAAAGCAACCGTTCCCAGATAACTCGTCCGTACATTGCATCATTCCATA
AAGCTCCTTTCTCTCGATCATCATCTCCCCC*GTTGCGTACACTGGTCTATTCCCGTCTT
TGCCCAACTTTTTGACTTCAGACAATAGCTTTTTGGTGAAAGCGCTCTTCTTCTTATCGA
ACATCTCCGTATCTCCGCTCAGGTCCTTTGGGTTCTCCATACATAAATAATTATCGTAAA
GGATTCTGGTGTCACCGGAATTGTATGTAGCAATATCCAGAGTGCATTGGTCGTACCATA
TTGTTGCTGCTCTGTTTCTCGGACATTTCTTGCGAAGCCCAGAGAGGGCTTTGGCGAGGC
AAGAGTGACACTTAGGCCCGTAGGAGTCGCCACGACATTGGAGCATGACGAAGACGGCGG
CAGGAGGTATAAATTTGTAGGGTCTATCCATATTGGACTCAAGGGCGTAACCGTTGCGCA
GATCAAAGGTGGATATGTTTTTGAGGACAATGTTGAGATTTTTTTCGAACACACCCCCTG
GCACGTATTTCCCTTGGGTGTTGTTGCATGAGTGGTGGAGATACTCATTGGTAATGTTGA
GGGACGAAACACTGGATATAAGGAGTTGAATGGCCACCGCAGCCAAGATAGGGACCGATC
CAAAAATTAAAGGCATTGTTTGTGATCTTTGAGGAGTGGAGATGTTTATATAAGAGGCTT
TGTGAGAATTTTAGATTTGAAGTGATTATGATTCCTTTTTTCTTGTACTTTGTTTACCTT
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2A923JQ U 110
AF RR2BJ93JQ U 1
AF RR2BJ93TF C 147
AF RR2A923TF C 147
BS 1 153 RR2BJ93JQ
BS 154 154 RR2A923JQ
BS 155 156 RR2BJ93JQ
BS 157 157 RR2A923JQ
BS 158 289 RR2BJ93JQ
BS 290 290 RR2A923JQ
BS 291 320 RR2BJ93JQ
BS 321 321 RR2A923JQ
BS 322 328 RR2BJ93JQ
BS 329 329 RR2A923JQ
BS 330 362 RR2BJ93JQ
BS 363 363 RR2A923JQ
BS 364 521 RR2BJ93JQ
BS 522 522 RR2A923JQ
BS 523 783 RR2BJ93JQ
BS 784 962 RR2A923TF

RD RR2A923JQ 554 0 0
TTACAGCTTCTACACAAATATCTAACTCCTTGTTTTTCATGGCCACAGAATGGACGCTCA
TTGATAAGCCAATCTAGACACACAAAGCAACCGTTCCCAGATAACTCGTCCGTACATTGC
ATCATTCCATAAAGCTTCTTTCTCTCGAACATCATCTCCCCC*GTTGCGTACACTGGTCT
ATTCCCGTCTTTGCCCAACTTTTTGACTTCAGACAATAGCTTTTTGGTGAAAGCGCTCTT
CTTCTTATCGAACATCTCCGTATCTCCGCTCAGGTCCTTTGGGTTCTCCATACATAAATA
ATTATCGTAAAGGATTCTGGTGTCACCGGAATTGTATGTAGCAATATCCAGAGTGCATTG
GTCGTACCATATTGTTGCTGCTCTGTTTCTCGGACATTTCTTGCGAAGCCCAGAGAGGGC
TTTGGCGAGGCAAGAGTGACACTTAGGCCCGTAGGAGTCGCCACGACATTGGAGCATGAC
GAAGACGGCGGCAGGAGGTATAAATTTGTAGGGTCTATCCATATTGGACTCAAGGGCGTA
ACCGTTGCGCAGAT

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2BJ93JQ 783 0 0
CGAGGAGAACACTTTTTATTTCCTGATATAGCACTTATTCAAACATCAAACAAAGGGCTC
CCACAAACAGTTTTAAGTTCTAAAAAAAGGGTAAAGCTCAAATCTTGCATTACAGCTTCT
ACACAAATATCTAACTCCTTGTTTTTCATGGCCGCAAAATGGACGCTCATTGATAAGCCA
ATCTAGACACACAAAGCAACCGTTCCCAGATAACTCGTCCGTACATTGCATCATTCCATA
AAGCTCCTTTCTCTCGATCATCATCTCCCCC*GTTGCGTACACTGGTCTCTTCCCGTCTT
TGCCCAACTTTTTGACTTCAAACAATAGTTTTTTGGTGAAAGCGCTCTTCTTCTTATCGA
ACGTCTCCGTATCTCCGCTCAGGTCCTTTGGGTTCTCCATACATAAATAATTATCGTAAA
GGATTCTGGTGTCACCGGAATTGTATGTAGCAATATCCAGAGTGCATTGGTCGTACCATA
TTGTTGCTGCTCTGTTTCTCGGACATTTCTTGCGAAGCCCAAAGAGGGCTTTGGCGAGGC
AAGAGTGACACTTAGGCCCGTAGGAGTCGCCACGACATTGGAGCATGACGAAGACGGCGG
CAGGAGGTATAAATTTGTAGGGTCTATCCATATTGGACTCAAGGGCGTAACCGTTGCGCA
GATCAAAGGTGGATATGTTTTTGAGGACAATGTTGAGATTTTTTTCGAACACACCCCCTG
GCACGTATTTCCCTTGGGTGTTGTTGCATGAGTGGTGGAGATACTCATTGGTAATGTTGA
GGG

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2BJ93TF 787 0 0
CATGGCCGCAGAATGGACGCTCATTGATAAGCCAATCTAGACACACAAAGCAACCGTTCC
CAGATAACTCGTCCGTACATTGCATCATTCCATAAAGCTCCTTTCTCTCGATCATCATCT
CCCCC*GTTGCGTACACTGGTCTCTTCCCGTCTTTGCCCAACTTTTTGACTTCAGACAAT
AGTTTTTTGGTGAAAGCGCTCTTCTTCTTATCGAACGTCTCCGTATCTCCGCTCAGGTCC
TTTGGGTTCTCCATACATAAATAATTATCGTAAAGGATTCTGGTGTCACCGGAATTGTAT
GTAGCAATATCCAGAGTGCATTGGTCGTACCATATTGTTGCTGCTCTGTTTCTCGGACAT
TTCTTGCGAAGCCCAGAGAGGGCTTTGGCGAGGCAAGAGTGACACTTAGGCCCGTAGGAG
TCGCCACGACATTGGAGCATGACGAAGACGGCGGCAGGAGGTATAAATTTGTAGGGTCTA
TCCATATTGGACTCAAGGGCGTAACCGTTGCGCAGATCAAAGGTGGATATGTTTTTGAGG
ACAATGTTGAGATTTTTTTCGAACACACCCCCTGGCACGTATTTCCCTTGGGTGTTGTTG
CATGAGTGGTGGAGATACTCATTGGTAATGTTGAGGGACGAAACACTGGATATAAGGAGT
TGAATGGCCACCGCAGCCAAGATAGGGACCGATCCAAAAATTAAAGGCATTGTTTGTGAT
CTTTGAGGAGTGGAGATGTTTATATAAGAGGCTTTGTGAGAATTTTAGATTTGAAGTGAT
TATGATT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2A923TF 816 0 0
CATGGCCACAGAATGGACGCTCATTGATAAGCCAATCTAGACACACAAAGCAACCGTTCC
CAGATAACTCGTCCGTACATTGCATCATTCCATAAAGCTTCTTTCTCTCGATCATCATCT
CCCCCCGTTGCGTACACTGGTCTATTCCCGTCTTTGCCCAACTTTTTGACTTCAGACAAT
AGCTTTTTGGTGAAAGCGCTCTTCTTCTTATCGAACATCTCCGTTTCTCCGCTCAGGTCC
TTTGGGTTCTCCATACATAAATAATTATCGTAAAGGATTCTGGTGTCACCGGAATTGTAT
GTAGCAATATCCAGAGTGCATTGGTCGTACCATATTGTTGCTGCTCTGTTTCTCGGACAT
TTCTTGCGAAGCCCAGAGAGGGCTTTGGCGAGGCAAGAGTGACACTTAGGCCCGTAGGAG
TCGCCACGACATTGGAGCATGACGAAGACGGCGGCAGGAGGTATAAATTTGTAGGGTCTA
TCCATATTGGACTCAAGGGCGTAACCGTTGCGCAGATCAAAGGTGGATATGTTTTTGAGG
ACAATGTTGAGATTTTTTTCGAACACACCCCCTGGCACGTATTTCCCTTGGGTGTTGTTG
CATGAGTGGTGGAGATACTCATTGGTAATGTTGAGGGACGAAACACTGGATATAAGGAGT
TGAATGGCCACCGCAGCCAAGATAGGGACCGATCCAAAAATTAAAGGCATTGTTTGTGAT
CTTTGAGGAGTGGAGATGTTTATATAAGAGGCTTTGTGAGAATTTTAGATTTGAAGTGAT
TATGATTCCTTTTTTCTTGTACTTTGTTTACCTTCC

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 4

CO CL2566Contig1 809 4 4 U
GGTGATACAGCATCCAAATGCTCGGCAGTCTGAAAATGCCATGGCATATGATAATGCTGT
ATCCGCTGTGGGAAAGATCTGCCAATTTCACCGTGATAGTATCGATTCTTCTCAGGTACT
TCCTGCGTGGTTGAACTGTTTGCCTATAAGTAATGATGTCATGGAAGCCAAAGTTGTTCA
TGATCAGCTCTGCTCAATGGTTGAGAGGCAAGATGTGGACCTTTTAGGCCCCAATAACCA
GTATCTGCCAAAAATCTTAACAGTATTTGCTGAGGTGCTTACAAGGAAAGATGTGGTGAC
AGAAGAGACGGCAGGTCGTATGGTTAATATAATAAGGCAACTTCAGCAAACACTGCCACA
ATCGGCCTTGGCCTCAGTATGGTCAACATTGAAACCAGAGCAGCAGGTCGCTCTCCAGTC
CATGCTTTCCTCCTAAAATTCATTCCAAAAATGGGGTCTCAGTCTTGTGAGCGTCGTCAG
TTTTGCATTTTATGTGTTTACTACATTTCTTTTGCATTTTCAACATTTGTTTTTTTTTGG
GAGGGATGAATGGGTCTTATCTATCCTTCATACATTATGAACTGAAATGTATATTAGGAG
GAAGGAGAGATTGTTAGTGAAAAGAGTGTCAACTGGGGAATGGTTCCCCCAAAATCACAA
AGGGTTTGGTGTTGGCTTCTGAGTTTGGGGGAGTGATGAAGATTTTGGTGCTTATACGAT
AAACTGAAATGGTCTCGATTTTTTTGGAGTTTTGTTTTTGTATGCATGTGAGAATTTTGG
AGGAATGATTCTTTTCTCTCAAAAAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H302TF U 1
AF RR2H302JQ C 1
AF RR2FA81TF U 89
AF RR2FA81JQ C 121
BS 1 583 RR2H302TF
BS 584 784 RR2FA81TF
BS 785 785 RR2FA81JQ
BS 786 809 RR2FA81TF

RD RR2H302TF 587 0 0
GGTGATACAGCATCCAAATGCTCGGCAGTCTGAAAATGCCATGGCATATGATAATGCTGT
ATCCGCTGTGGGAAAGATCTGCCAATTTCACCGTGATAGTATCGATTCTTCTCAGGTACT
TCCTGCGTGGTTGAACTGTTTGCCTATAAGTAATGATGTCATGGAAGCCAAAGTTGTTCA
TGATCAGCTCTGCTCAATGGTTGAGAGGCAAGATGTGGACCTTTTAGGCCCCAATAACCA
GTATCTGCCAAAAATCTTAACAGTATTTGCTGAGGTGCTTACAAGGAAAGATGTGGTGAC
AGAAGAGACGGCAGGTCGTATGGTTAATATAATAAGGCAACTTCAGCAAACACTGCCACA
ATCGGCCTTGGCCTCAGTATGGTCAACATTGAAACCAGAGCAGCAGGTCGCTCTCCAGTC
CATGCTTTCCTCCTAAAATTCATTCCAAAAATGGGGTCTCAGTCTTGTGAGCGTCGTCAG
TTTTGCATTTTATGTGTTTACTACATTTCTTTTGCATTTTCAACATTTGTTTTTTTTTGG
GAGGGATGAATGGGTCTTATCTATCCTTCATACATTATGAACT
TAAA

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2H302JQ 658 0 0
GGTGATACAGCATCCAAATGCTCGGCAGTCTGAAAATGCCATGGCATATGATAATGCTGT
ATCCGCTGTGGGAAAGATCTGCCAATTTCACCGTGATAGTATCGATTCTTCTCAGGTACT
TCCTGCGTGGTTGAACTGTTTGCCTATAAGTAATGATGTCATGGAAGCCAAAGTTGTTCA
TGATCAGCTCTGCTCAATGGTTGAGAGGCAAGATGTGGACCTTTTAGGCCCCAATAACCA
GTATCTGCCAAAAATCTTAACAGTATTTGCTGAGGTGCTTACAAGGAAAGATGTGGTGAC
AGAAGAGACGGCAGGTCGTATGGTTAATATAATAAGGCAACTTCAGCAAACACTGCCACA
ATCGGCCTTGGCCTCAGTATGGTCAACATTGAAACCAGAGCAGCAGGTCGCTCTCCAGTC
CATGCTTTCCTCCTAAAATTCATTCCAAAAATGGGGTCTCAGTCTTGTGAGCGTCGTCAG
TTTTGCATTTTATGTGTTTACTACATTTCTTTTGCATTTTCAACATTTGTTTTTTTTTGG
GAGGGATGAATGGGTCTTATCTATCCTTCATACATTATGAACTTAAATGTATATTAGGAG
GAAGGAGAGATTGTTAGTGAAAAGAGTGTCAACTGGGGAATGGTTCCCCCAAAATCA
G

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2FA81TF 721 0 0
G
ACCGTGATAGTATCGATTCTTCTCAGGTACTTCCTGCGTGGTTGAACTGTTTGCCTATAA
GTAATGATGTCATGGAAGCCAAAGTTGTTCATGATCAGCTCTGCTCAATGGTTGAGAGGC
GAGATGTGGACCTTTTAGGCCCCAATAACCAGTATCTGCCAAAAATCTTAACAGTATTTG
CTGAGGTGCTTACAAGGAAAGATGTGGTGACAGAAGAGACGGCAGGTCGTATGGTTAATA
TAATAAGGCAACTTCAGCAAACACTGCCACAATCGGCCTTGGCCTCAGTATGGTCAACAT
TGAAACCAGAGCAGCAGGTCGCTCTCCAGTCCATGCTTTCCTCCTAAAATTCATTCCAAA
AATGGGGTCTCAGTCTTGTGAGCGTCGTCAGTTTTGCATTTTATGTGTTTACTACATTTC
TTTTGCATTTTCAACATTTGTTTTTTTTTGGGAGGGATGAATGGGTCTTATCTATCCTTC
ATACATTATGAACTGAAATGTATATTAGGAGGAAGGAGAGATTGTTAGTGAAAAGAGTGT
CAACTGGGGAATGGTTCCCCCAAAATCACAAAGGGTTTGGTGTTGGCTTCTGAGTTTGGG
GGAGTGATGAAGATTTTGGTGCTTATACGATAAACTGAAATGGTCTCGATTTTTTTGGAG
TTTTGTTTTTGTATGCATGTGAGAATTTTGGAGGA*TGATTCTTTTCTCTCAAAAAAAAA

QA 2 721 2 721
DS 

RD RR2FA81JQ 680 0 0
TCCTGCGTGGTTGAACTGTTTGCCTATAAGTAATGATGTCATGGAAGCCAAAGTTGTTCA
TGATCAGCTCTGCTCAATGGTTGAGAGGCGAGATGTGGACCTTTTAGGCCCCAATAACCA
GTATCTGCCAAAAATCTTAACAGTATTTGCTGAGGTGCTTACAAGGAAAGATGTGGTGAC
AGAAGAGACGGCAGGTCGTATGGTTAATATAATAAGGCAACTTCAGCAAACACTGCCACA
ATCGGCCTTGGCCTCAGTATGGTCAACATTGAAACCAGAGCAGCAGGTCGCTCTCCAGTC
CATGCTTTCCTCCTAAAATTCATTCCAAAAATGGGGTCTCAGTCTTGTGAGCGTCGTCAG
TTTTGCATTTTATGTGTTTACTACATTTCTTTTGCATTTTCAACATTTGTTTTTTTTTGG
GAGGGATGAATGGGTCTTATCTATCCTTCATACATTATGAACTGAAATGTATATTAGGAG
GAAGGAGAGATTGTTAGTGAAAAGAGTGTCAACTGGGGAATGGTTCCCCCAAAATCACAA
AGGGTTTGGTGTTGGCTTCTGAGTTTGGGGGAGTGATGAAGATTTTGGTGCTTATACGAT
AAACTGAAATGGTCTCGATTTTTTTGGAGTTTTGTTTTTGTATGCATGTGAGAATTTTGG
AGGAATGATTCTTTTCTCTC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 3

CO CL2567Contig1 866 3 7 U
GGTTTGAGGGAGTTGTTCATTTAAGTTTGATTTAGCAGCATAATACTAAACAGAAATCAT
TATGTTTTCTTCGATTACATATATTATTAGTTCAAACCCAAACTAAAATGCGAATATATA
TAATAAGATCACTTCTGCTCATCATCATTCTGAGGTGGGGCCGTAAGAACCAAGCGTCGG
GATTGTTTTAGTGCCTGTATGTTGTTCTTAAAATACTCGAACTGCTCCGCATGCATGGCC
TGCGATTTCTCCAGTGCATCCACCCTCACGGCCTGAACCCCCCTCATCTCTGCTATCACC
CTTTTTGCTGTCCGCAACTCATCCTCGAGATCTGCGATACGTGAAGAGGGGCCAGCGGGG
GTCGATCCTTGCTGCTCGCCGTCGACTTCAGGATCCTCATCTGTCTTCATTGACGCTGGC
TTGAGTTGAGATTTGAGATCACGGATAGCTAACTTCATCTGTGCAATTTCCAACTCTTCT
TTCAAAGACTTGTCGGAAGATCTTAGAGTTTGGATGTAGTCAATCACAAACTTAGGTTCA
GGAATTGTTCTAGCAGGTACAAAGGATTCCTTCATGAAAGCTAAGATCCACTTACCAATC
TCTGTTTTTGCTGATTCAAGCTCACTTTGACATGAAGCAAGCTTAGCTTCACAGTTCTGA
AGACTCTCAGTGAGTGACACAATCATGGCAGCTGCAACACCTTCTTCATCCCCTTTCGTG
CAAGTGCAACACTTCTTTGACGCGGGGGAGATGTCATTTTCATCCCCTTCGAAGCTTCTT
TTGGTACCTGAAGCGGAATGATCACCGTCCATCAGATTTCTGCGGGATGTCGATGGGAAT
TGGGGAATTTAGGGTTTTACTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN92JQ U 1
AF RR2AI31JQ U 29
AF RR2AI31TF C 263
BS 1 326 RR2EN92JQ
BS 327 327 RR2AI31JQ
BS 328 388 RR2EN92JQ
BS 389 764 RR2AI31JQ
BS 765 765 RR2AI31TF
BS 766 854 RR2AI31JQ
BS 855 866 RR2AI31TF

RD RR2EN92JQ 388 0 0
GGTTTGAGGGAGTTGTTCATTTAAGTTTGATTTAGCAGCATAATACTAAACAGAAATCAT
TATGTTTTCTTCGATTACATATATTATTAGTTCAAACCCAAACTAAAATGCGAATATATA
TAATAAGATCACTTCTGCTCATCATCATTCTGAGGTGGGGCCGTAAGAACCAAGCGTCGG
GATTGTTTTAGTGCCTGTATGTTGTTCTTAAAATACTCGAACTGCTCCGCATGCATGGCC
TGCGATTTCTCCAGTGCATCCACCCTCACGGCCTGAACCCCCCTCATCTCTGCTATCACC
CTTTTTGCTGTCCGCAACTCATCCTCCAGATCTGCGATACGTGAAGAGGGGCCAGCGGGG
GTCGATCCTTGCTGCTCGCCGTCGACTT

QA 1 388 1 388
DS 

RD RR2AI31JQ 826 0 0
GATTTGGCAGCATAATACTAAACAGAAATCATTATGTTTTCTTCGATTACATATATTATT
AGTTCAAACTCAAACTAAAATGCGAATATATATAATAAGATCACTTCTGCTCATCATCAT
TCTGAGGTGGGGCCGTAAGAACCAAGCGTCGGGATTGTTTTAGTGCCTGTATGTTGTTCT
TAAGATACTCGAACTGCTCCGCATGCATGGCCTGCGCTTTCTCCAGTGCATCCACCCTCA
CGGCCTGAACCCCCCTCATCTCTGCTATCACCCTTTTTGCTGTCCGCAACTCATCCTCGA
GATCTGCGATACGTGAAGAGGGGCCAGCGGGGGTCGATCCTTGCTGCTCGCCGTCGACTT
CAGGATCCTCATCTGTCTTCATTGACGCTGGCTTGAGTTGAGATTTGAGATCACGGATAG
CTAACTTCATCTGTGCAATTTCCAACTCTTCTTTCAAAGACTTGTCGGAAGATCTTAGAG
TTTGGATGTAGTCAATCACAAACTTAGGTTCAGGAATTGTTCTAGCAGGTACAAAGGATT
CCTTCATGAAAGCTAAGATCCACTTACCAATCTCTGTTTTTGCTGATTCAAGCTCACTTT
GACATGAAGCAAGCTTAGCTTCACAGTTCTGAAGACTCTCAGTGAGTGACACAATCATGG
CAGCTGCAACACCTTCTTCATCCCCTTTCGTGCAAGTGCAACACTTCTTTGACGCGGGGG
AGATGTCATTTTCATCGCCTTCGAAGCTTCTTTTGGTACCTGAAGCGGAATGATCACCGT
CCATCAGATTTCTGCGGGATGTCGATGGGAATTGGGGAATTTAGGG

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2AI31TF 604 0 0
CCCTCACGGCCTGAACCCCCCTCATCTCTGCTATCACCCTTTTTGCTGTCCGCAACTCAT
CCTCGAGATCTGCGATACGTGAAGAGGGGCCAGCGGGGGTCGATCCTTGCTGCTCGCCGT
CGACTTCAGGATCCTCATCTGTCTTCATTGACGCTGGCTTGAGTTGAGATTTGAGATCAC
GGATAGCTAACTTCATCTGTGCAATTTCCAACTCTTCTTTCAAAGACTTGTCGGAAGATC
TTAGAGTTTGGATGTAGTCAATCACAAACTTAGGTTCAGGAATTGTTCTAGCAGGTACAA
AGGATTCCTTCATGAAAGCTAAGATCCACTTACCAATCTCTGTTTTTGCTGATTCAAGCT
CACTTTGACATGAAGCAAGCTTAGCTTCACAGTTCTGAAGACTCTCAGTGAGTGACACAA
TCATGGCAGCTGCAACACCTTCTTCATCCCCTTTCGTGCAAGTGCAACACTTCTTTGACG
CGGGGGAGATGTCATTTTCATCCCCTTCGAAGCTTCTTTTGGTACCTGAAGCGGAATGAT
CACCGTCCATCAGATTTCTGCGGGATGTCGATGGGAATTGGGGAATTTAGGGTTTTACTT
TTCC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 4

CO CL2568Contig1 1263 4 12 U
GGATATGAATTCACCACCAACTGCTGTTGTATTGGAAGAACAGCAAACTTAGTAGCTTTC
ATGTCCTCCTCAACTTCCTCAATCATTCACATTCTTTTCTCCTACATTATACAATAACTC
CTCTATATATGTATTATACATTTCTCATTATTTTCAGAACCCTTCATTGTTGCATTTATT
CATCGAGAAAATGAGGACCAAATCCCAATCTTCTGTTAATCTGAAGGCCATATTCACATG
TTGCTCAATCTTGATCTTTCTTGTCATCTTCTTTGCAAGATCAAACATCTCTTCTTCAAA
GCCCATCTCCAAAACCAATCTCTCTCAAGAGAAAGAAGAGCAAAACCAGGCTACACCAGA
AGGATGTCCAACAACACAACAATGCACGAAGATGCCAATTTCTTTATCCGACGCGTTGGT
TCACTACGCCACCAGTAACGTCACTCCACAACAGACATTCGATGAAATCTCTGTCTCAAA
GAGAGTCTTGGACAAGAAGTCACCATGTAACTTCCTCGTCTTTGGTTTAGGTCACGACAG
CCCGATGTGGGCTTCTCTTAACCATGGTGGTCGTACCTTGTTTATTGAGGAAGACAAGGC
TTGGATTGAGATAGTGACTAAGAAATTCCCAAGCTTGGAAGCTTACCACGTCGTTTACGA
CACGAAACTGAAACATTCAGACAAACTGATGGAGCTGGGAAGATCAGAGGAGTGTAGATC
CGTGACCGATCCAAGAAACTCGAAATGTGAACTATCGTTGAAAGATTTCCCGGCCGATTT
TTACGAGACGAAATGGGATCTGATCATGGTGGATGCTCCGACTGGTTACCACGAGGAAGC
TCCGGGGAGGATGAGTGCTATTTACACGGCGGGGCTTTTGGCTCGTAACCGCGAAGACGG
AGAAACAGACGTTTTTGTTCATGACGTTAACCGTCCGGTGGAAGATGAGTTCTCGGCGAC
TTTCTTGTGTAAAGGCTACATGAGGGAGCAAAACGGGAGGCTAAGGCATTTCACCATCCC
TAGCCATCGGGCACGTGCTGGCAGACCGTTTTGTCCGGTGGATGTTAATCGCCGCCGTTG
ATTTTGTGCCGGGAAATATCTCTGCGTTGCGGACCAAGAGTGACTATGCTTAGCTGGCTT
TTTGTTTGTTTGTTTTTGCTTTTATCTTGATGATTACGTTTTTTTATGGATTCAGTGCAT
TTACTGAAACGCTATAGTAAAATAGTATTCTTCATATAATTATTTGAATACAAAATAATG
AAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2E889TF U 1
AF RR2AZ28TFB U 164
AF RR2E889JQ C 425
AF RR2AZ28JQ C 619
BS 1 227 RR2E889TF
BS 228 228 RR2AZ28TFB
BS 229 596 RR2E889TF
BS 597 903 RR2AZ28TFB
BS 904 975 RR2E889JQ
BS 976 976 RR2AZ28JQ
BS 977 982 RR2E889JQ
BS 983 983 RR2AZ28JQ
BS 984 1101 RR2E889JQ
BS 1102 1102 RR2AZ28JQ
BS 1103 1237 RR2E889JQ
BS 1238 1263 RR2AZ28JQ

RD RR2E889TF 596 0 0
GGATATGAATTCACCACCAACTGCTGTTGTATTGGAAGAACAGCAAACTTAGTAGCTTTC
ATGTCCTCCTCAACTTCCTCAATCATTCACATTCTTTTCTCCTACATTATACAATAACTC
CTCTATATATGTATTATACATTTCTCATTATTTTCAGAACCCTTCATTGTTGCATTTATT
CATCGAGAAAATGAGGACCAAATCCCAATCTTCTGTTAATCTGAAGGTCATATTCACATG
TTGCTCAATCTTGATCTTTCTTGTCATCTTCTTTGCAAGATCAAACATCTCTTCTTCAAA
GCCCATCTCCAAAACCAATCTCTCTCAAGAGAAAGAAGAGCAAAACCAGGCTACACCAGA
AGGATGTCCAACAACACAACAATGCACGAAGATGCCAATTTCTTTATCCGACGCGTTGGT
TCACTACGCCACCAGTAACGTCACTCCACAACAGACATTCGATGAAATCTCTGTCTCAAA
GAGAGTCTTGGACAAGAAGTCACCATGTAACTTCCTCGTCTTTGGTTTAGGTCACGACAG
CCCGATGTGGGCTTCTCTTAACCATGGTGGTCGTACCTTGTTTATTGAGGAAGACA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2AZ28TFB 740 0 0
GG
ATTGTTGCATTTATTCATCGAGAAAATGAGGACCAAATCCCAATCTTCTGTTAATCTGAA
GGCCATATTCACATGTTGCTCAATCTTGATCTTTCTTGTCATCTTCTTTGCAAGATCAAA
CATCTCTTCTTCAAAGCCCATCTCCAAAACCAATCTCTCTCAAGAGAAAGAAGAGCAAAA
CCAGGCTACACCAGAAGGATGTCCAACAACACAACAATGCACGAAGATGCCAATTTCTTT
ATCCGACGCGTTGGTTCACTACGCCACCAGTAACGTCACTCCACAACAGACATTCGATGA
AATCTCTGTCTCAAAGAGAGTCTTGGACAAGAAGTCACCATGTAACTTCCTCGTCTTTGG
TTTAGGTCACGACAGCCCGATGTGGGCTTCTCTTAACCATGGTGGTCGTACCTTGTTTAT
TGAGGAAGACAAGGCTTGGATTGAGATAGTGACTAAGAAATTCCCAAGCTTGGAAGCTTA
CCACGTCGTTTACGACACGAAACTGAAACATTCAGACAAACTGATGGAGCTGGGAAGATC
AGAGGAGTGTAGATCCGTGACCGATCCAAGAAACTCGAAATGTGAACTATCGTTGAAAGA
TTTCCCGGCCGATTTTTACGAGACGAAATGGGATCTGATCATGGTGGATGCTCCGACTGG
TTACCACGAGGAAGCTCCGGGGAGGATGAGTGCTATTTACACGGCGGGGCTTTTGGCTCG
TAACCGCGAAGACGGAGA

QA 3 740 3 740
DS 

RD RR2E889JQ 813 0 0
TACGCCACCAGTAACGTCACTCCACAACAGACATTCGATGAAATCTCTGTCTCAAAGAGA
GTCTTGGACAAGAAGTCACCATGTAACTTCCTCGTCTTTGGTTTAGGTCACGACAGCCCG
ATGTGGGCTTCTCTTAACCATGGTGGTCGTACCTTGTTTATTGAGGAAGACAAGGCTTGG
ATTGAGATAGTGACTAAGAAATTCCCAAGCTTGGAAGCTTACCACGTCGTTTACGACACG
AAACTGAAACATTCAGACAAACTGATGGAGCTGGGAAGATCAGAGGAGTGTAGATCCGTG
ACCGATCCAAGAAACTCGAAATGTGAACTATCGTTGAAAGATTTCCCGGCCGATTTTTAC
GAGACGAAATGGGATCTGATCATGGTGGATGCTCCGACTGGTTACCACGAGGAAGCTCCG
GGGAGGATGAGTGCTATTTACACGGCGGGGCTTTTGGCTCGTAACCGCGAAGACGGAGAA
ACAGACGTTTTTGTTCATGACGTTAACCGTCCGGTGGAAGATGAGTTCTCGGCGACTTTC
TTGTGTAAAGGTTACATGGGGGAGCAAAACGGGAGGCTAAGGCATTTCACCATCCCTAGC
CATCGGGCACGTGCTGGCAGACCGTTTTGTCCGGTGGATGTTAATCGCCGCCGTTGATTT
TGTGCCGGGAAATATCTTTGCGTTGCGGACCAAGAGTGACTATGCTTAGCTGGCTTTTTG
TTTGTTTGTTTTTGCTTTTATCTTGATGATTACGTTTTTTTATGGATTCAGTGCATTTAC
TGAAACGCTATAGTAAAATAGTATTCTTCATAT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2AZ28JQ 645 0 0
AAGAAATTC
CCCAAGCTTGGAAGCTTACCACGTCGTTTACGACACGAAACTGAAACATTCAGACAAACT
GATGGAGCTGGGAAGATCAGAGGAGTGTAGATCCGTGACCGATCCAAGAAACTCGAAATG
TGAACTATCGTTGAAAGATTTCCCGGCCGATTTTTACGAGACGAAATGGGATCTGATCAT
GGTGGATGCTCCGACTGGTTACCACGAGGAAGCTCCGGGGAGGATGAGTGCTATTTACAC
GGCGGGGCTTTTGGCTCGTAACCGCGAAGACGGAGAAACAGACGTTTTTGTTCATGACGT
TAACCGTCCGGTGGAAGATGAGTTTTCGGCGACTTTCTTGTGTAAAGGCTACATGAGGGA
GCAAAACGGGAGGCTAAGGCATTTCACCATCCCTAGCCATCGGGCACGTGCTGGCAGACC
GTTTTGTCCGGTGGATGTTAATCGCCGCCGTTGATTTTGTGCCGGGAAATATCTCTGCGT
TGCGGACCAAGAGTGACTATGCTTAGCTGGCTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCTTTTATCT
TGATGATTACGTTTTTTTATGGATTCAGTGCATTT**TGAAACGCTATAGTAAAATAGTA
TTCTTCATATAATTATTTGAATACAAAATAATGAAT

QA 10 645 10 645
DS 



AS 1 4

CO CL2569Contig1 817 4 2 U
GCTCCGGAAACCATACGTTATCAATCTCATGGATCAACTCACGCTAATGGGTGTCACACA
ATATTACGCTTTTGTTGAAGAGAGACAGAAGGTTCACTGTCTCAACACACTTTTCTCTAA
GCTGCAAATAAACCAATCCATAATCTTTTGCAACTCTGTTAATCGCGTCGAACTGTTGGC
TAAGAAAATTACAGAACTCGGTTACTCGTGCTTCTACATTCATGCGAAGATGGTTCAAGA
CCATAGGAACAGAGTGTTCCATGAGTTTCGCAATGGTGCTTGCAGAAATCTCGTCTGCAC
TGATCTGTTCACTCGTGGAATTGATATTCAAGCTGTGAATGTAGTGATTAACTTTGATTT
TCCGAGGACTTCTGAGTCGTATCTACACAGGGTGGGCCGATCAGGACGGTTTGGACACCT
TGGGTTGGCTGTGAATTTGGTAACATATGAGGACCGTTTCAAAATGTATCAGACTGAGCA
AGAACTTGGCACTGAAATCAAACCAATTCCTTCTCAGATCGATCAAGCAATCTACTGTCA
GTAAACCTGTAACCGCACGAGAAAATGTTACCACCCGACGAGTCACAATGTTGATGAAAA
TGGTCATCAGGTGTTTCTCAAGCTAGGAGGTGAGGCAACTGATACTTGGCGGTTTATGTA
CAATACAATTCGTTACGGATACGAACCAGAGTGGTTTGGTTTATAATCTTTCTCTAGACT
TTGTTTCGTGTTTTACTTGAAATATGTTAACGTTGCACATTTATCTTTGACTTGGCAGTC
AAGTAATAAAGACAAAATAAGTAAGACTCTCCTACTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2CY85TF U 1
AF RR2CQ57TF U 1
AF RR2CY85JQ C 9
AF RR2CQ57JQ C 56
BS 1 673 RR2CQ57TF
BS 674 817 RR2CY85JQ

RD RR2CY85TF 606 0 0
GCTCCGGAAACCATACGTTATCAATCTCATGGATCAACTCACGCTAATGGGTGTCACACA
ATATTACGCTTTTGTTGAAGAGAGACAGAAGGTTCACTGTCTCAACACACTTTTCTCTAA
GCTGCAAATAAACCAATCCATAATCTTTTGCAACTCTGTTAATCGCGTCGAACTGTTGGC
TAAGAAAATTACAGAACTCGGTTACTCGTGCTTCTACATTCATGCGAAGATGGTTCAAGA
CCATAGGAACAGAGTGTTCCATGAGTTTCGCAATGGTGCTTGCAGAAATCTCGTCTGCAC
TGATCTGTTCACTCGTGGAATTGATATTCAAGCTGTGAATGTAGTGATTAACTTTGATTT
TCCGAGGACTTCTGAGTCGTATCTACACAGGGTGGGCCGATCAGGACGGTTTGGACACCT
TGGGTTGGCTGTGAATTTGGTAACATATGAGGACCGTTTCAAAATGTATCAGACTGAGCA
AGAACTTGGCACTGAAATCAAACCAATTCCTTCTCAGATCGATCAAGCAATCTACTGTCA
GTAAACCTGTAACCGCACGAGAAAATGTTACCACCCGACGAGTCACAATGTTGATGAAAA
TGGTCA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2CQ57TF 673 0 0
GCTCCGGAAACCATACGTTATCAATCTCATGGATCAACTCACGCTAATGGGTGTCACACA
ATATTACGCTTTTGTTGAAGAGAGACAGAAGGTTCACTGTCTCAACACACTTTTCTCTAA
GCTGCAAATAAACCAATCCATAATCTTTTGCAACTCTGTTAATCGCGTCGAACTGTTGGC
TAAGAAAATTACAGAACTCGGTTACTCGTGCTTCTACATTCATGCGAAGATGGTTCAAGA
CCATAGGAACAGAGTGTTCCATGAGTTTCGCAATGGTGCTTGCAGAAATCTCGTCTGCAC
TGATCTGTTCACTCGTGGAATTGATATTCAAGCTGTGAATGTAGTGATTAACTTTGATTT
TCCGAGGACTTCTGAGTCGTATCTACACAGGGTGGGCCGATCAGGACGGTTTGGACACCT
TGGGTTGGCTGTGAATTTGGTAACATATGAGGACCGTTTCAAAATGTATCAGACTGAGCA
AGAACTTGGCACTGAAATCAAACCAATTCCTTCTCAGATCGATCAAGCAATCTACTGTCA
GTAAACCTGTAACCGCACGAGAAAATGTTACCACCCGACGAGTCACAATGTTGATGAAAA
TGGTCATCAGGTGTTTCTCAAGCTAGGAGGTGAGGCAACTGATACTTGGCGGTTTATGTA
CAATACAATTCGT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2CY85JQ 809 0 0
AACCATACGTTATCAATCTCATGGATCAACTCACGCTAATGGGTGTCACACAATATTACG
CTTTTGTTGAAGAGAGACAGAAGGTTCACTGTCTCAACACACTTTTCTCTAAGCTGCAAA
TAAACCAATCCATAATCTTTTGCAACTCTGTTAATCGCGTCGAACTGTTGGCTAAGAAAA
TTACAGAACTCGGTTACTCGTGCTTCTACATTCATGCGAAGATGGTTCAAGACCATAGGA
ACAGAGTGTTCCATGAGTTTCGCAATGGTGCTTGCAGAAATCTCGTCTGCACTGATCTGT
TCACTCGTGGAATTGATATTCAAGCTGTGAATGTAGTGATTAACTTTGATTTTCCGAGGA
CTTCTGAGTCGTATCTACACAGGGTGGGCCGATCAGGACGGTTTGGACACCTTGGGTTGG
CTGTGAATTTGGTAACATATGAGGACCGTTTCAAAATGTATCAGACTGAGCAAGAACTTG
GCACTGAAATCAAACCAATTCCTTCTCAGATCGATCAAGCAATCTACTGTCAGTAAACCT
GTAACCGCACGAGAAAATGTTACCACCCGACGAGTCACAATGTTGATGAAAATGGTCATC
AGGTGTTTCTCAAGCTAGGAGGTGAGGCAACTGATACTTGGCGGTTTATGTACAATACAA
TTCGTTACGGATACGAACCAGAGTGGTTTGGTTTATAATCTTTCTCTAGACTTTGTTTCG
TGTTTTACTTGAAATATGTTAACGTTGCACATTTATCTTTGACTTGGCAGTCAAGTAATA
AAGACAAAATAAGTAAGACTCTCCTACTC

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2CQ57JQ 762 0 0
ACACAATATTACGCTTTTGTTGAAGAGAGACAGAAGGTTCACTGTCTCAACACACTTTTC
TCTAAGCTGCAAATAAACCAATCCATAATCTTTTGCAACTCTGTTAATCGCGTCGAACTG
TTGGCTAAGAAAATTACAGAACTCGGTTACTCGTGCTTCTACATTCATGCGAAGATGGTT
CAAGACCATAGGAACAGAGTGTTCCATGAGTTTCGCAATGGTGCTTGCAGAAATTTCGTC
TGCACTGATCTGTTCACTCGTGGAATTGATATTCAAGCTGTGAATGTAGTGATTAACTTT
GATTTTCCGAGGACTTCTGAGTCGTATCTACACAGGGTGGGCCGATCAGGACGGTTTGGA
CACCTTGGGTTGGCTGTGAATTTGGTAACATATGAGGACCGTTTCAAAATGTATCAGACT
GAGCAAGAACTTGGCACTGAAATCAAACCAATTCCTTCTCAGATCGATCAAGCAATCTAC
TGTCAGTAAACCTGTAACCGCACGAGAAAATGTTACCACCCGACGAGTCACAATGTTGAT
GAAAATGGTCATCAGGTGTTTCTCAAGCTAGGAGGTGAGGCAACTGATACTTGGCGGTTT
ATGTACAATACAATTCGTTACGGATACGAACCAGAGTGGTTTGGTTTATAATCTTTCTCT
AGACTTTGTTTCGTGTTTTACTTGAAATATGTTAACGTTGCACATTTATCTTTGACTTGG
CAGTCAAGTAATAAAGACAAAATAAGTAAGACTCTCCTACTC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 3

CO CL2570Contig1 602 3 3 U
GGGCCTCTGAGATCTCCACCATCCCTGACGCAAAGAAGCAAAAATGGCGGTACCGTTGCT
TACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGTAG
AATCACCGTCAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGATTCTCGGGTGAGGAGGAA
GTTCAAAGGTGTCACTTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGTTCGGACAAGAAGACCCGTCA
CTATCTCCCCAATGGATTCAAGAAATTCGTCGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTGCT
CATGATGCACAACAGGACTTACTGTGCGGAGATTGCTCACAATGTTTCGACGAAGAAGAG
GAAAGCAATTGTGGAGAGAGCTTCTCAGCTAGACATTGTCGTTACCAACAGGCTCGCTAG
GTTGCGTAGCCAGGAAGACGAGTAAAAAATTAAGCCCTAGGGTTTACTTTTTATCTGTTA
TTGACAATTTCTCAGTTTTTTCTTTTTGCGTATTAAGTTGTTTTATTCATGAATCTGTTT
TACATTGATCGATACAGTTTCATATAATTAAAGTAAAACATTGAACCGAGCTTCAAACTT
TT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2FR06JQ C 1
AF RR2FR06TF U 1
AF RR2CF77TF U 1
BS 1 136 RR2CF77TF
BS 137 137 RR2FR06TF
BS 138 602 RR2CF77TF

RD RR2FR06JQ 592 0 0
GGGCCTCTGAGATCTCCACCATCCCTGACGCAAAGAAGCAAAAATGGCGGTACCGTTGCT
TACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGTAG
AATCACCGTCAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGATTCTCGGGTGAGGAGGAA
GTTCAAAGGTGTCACTTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGTTCGGACAAGAAGACCCGTCA
CTATCTCCCCAATGGATTCAAGAAATTCGTCGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTGCT
CATGATGCACAACAGGACTTACTGTGCGGAGATTGCTCACAATGTTTCGACGAAGAAGAG
GAAAGCAATTGTGGAGAGAGCTTCTCAGCTAGACATTGTCGTTACCAACAGGCTCGCTAG
GTTGCGTAGCCAGGAAGACGAGTAAAAAATTAAGCCCTAGGGTTTACTTTTTATCTGTTA
TTGACAATTTCTCAGTTTTTTCTTTTTGCGTATTAAGTTGTTTTATTCATGAATCTGTTT
TACATTGATCGATACAGTTTCATATAATTAAAGTAAAACATTGAACCGAGC
T

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2FR06TF 591 0 0
GGGCCTCTGAGATCTCCACCATCCCTGACGCAAAGAAGCAAAAATGGCGGTACCGTTGCT
TACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGTAG
AATCACCGTCAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGATTCTCGGGTGAGGAGGAA
GTTCAAAGGTGTCACTTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGTTCGGACAAGAAGACCCGTCA
CTATCTCCCCAATGGATTCAAGAAATTCGTCGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTGCT
CATGATGCACAACAGGACTTACTGTGCGGAGATTGCTCACAATGTTTCGACGAAGAAGAG
GAAAGCAATTGTGGAGAGAGCTTCTCAGCTAGACATTGTCGTTACCAACAGGCTCGCTAG
GTTGCGTAGCCAGGAAGACGAGTAAAAAATTAAGCCCTAGGGTTTACTTTTTATCTGTTA
TTGACAATTTCTCAGTTTTTTCTTTTTGCGTATTAAGTTGTTTTATTCATGAATCTGTTT
TACATTGATCGATACAGTTTCATATA*TTAAAGTAAA*CATTGAACCGAGC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2CF77TF 602 0 0
GGGCCTCTGAGATCTCCACCATCCCTGACGCAAAGAAGCAAAAATGGCGGTACCGTTGCT
TACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGTAG
AATCACCGTCAAGGAAGGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGATTCTCGGGTGAGGAGGAA
GTTCAAAGGTGTCACTTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGTTCGGACAAGAAGACCCGTCA
CTATCTCCCCAATGGATTCAAGAAATTCGTCGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTGCT
CATGATGCACAACAGGACTTACTGTGCGGAGATTGCTCACAATGTTTCGACGAAGAAGAG
GAAAGCAATTGTGGAGAGAGCTTCTCAGCTAGACATTGTCGTTACCAACAGGCTCGCTAG
GTTGCGTAGCCAGGAAGACGAGTAAAAAATTAAGCCCTAGGGTTTACTTTTTATCTGTTA
TTGACAATTTCTCAGTTTTTTCTTTTTGCGTATTAAGTTGTTTTATTCATGAATCTGTTT
TACATTGATCGATACAGTTTCATATAATTAAAGTAAAACATTGAACCGAGCTTCAAACTT
TT

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 4

CO CL2571Contig1 878 4 9 U
GGCTTGTGAAATAAAAACAATCGGAGCAGCGAAGTCAGAAAGAATGGAGAAAGTGATGAA
CCTGATAAAGCCGAAGCCTGATCCGAAGCAACTCTTGCGTGATTGGCAACGCAAGCTTCG
TCAAGAGTGCCGTAACATCGAACGCCAAATCCGAGATATACAGAAAGAAGAGAAAACAGT
TCAGAAGGCTATTAAAGAAGCTGCTAAGCGTAACGATATGGTCTCAGCAAAGGCGCTTGC
TAAGGAGATTGTGAGTGCGAGGAGAACAGTTAACCGTTTATATGAAAACAAGGCCCAGAT
GAATTCCATATCAATGCACCTCGGAGAAAGTGTTGCTGTTGCTAGAACAGTTGGACATCT
GTCCAAGAGCGCAGAGGCTATGAAGCTTGTCAATAATCTCATGAAGGCTCCTCAAATGGC
TGCTACTATGCAAGAGTTCAGCAAAGAGATGACTAAGGCTGGAGTTATTGAGGAGTTTGT
GAACGAGGCCATTGACAATGCACTAGATTCAGAGGACATGGAAGAAGAGATCGACGAAGA
GGTCGATAAAGTGTTGACAGCTATCGCTGGAGAAACCGCTGCTGAGCTTCCAGAAGCTGT
CAGGAAGGAAAGGATAAAGGTACCTGCACAGAAGGCCAGCACTTCCCGCGAGGAAGAGGC
AATTGCAGAAGGTGTTGATGATGAGGAAGAACTGGAGGAGATTCGAGCTCGCCTCGCTAA
AGTTAGATCCTAATAACTT*GATTCGGTTTACTCTTTTTACATACGATTTTTATTGATTC
GAAAGGTGATGAGAACATAAAAGAAGATTGATGTGTATTGTATAATATATAATTGAATTA
CAGTATACATTGTAATCACAAGCTGTCTTTTGGTAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2G065TF U 1
AF RR2B629JQ C 44
AF RR2G065JQ C 428
AF RR2B629TF U 44
BS 1 377 RR2G065TF
BS 378 378 RR2B629TF
BS 379 541 RR2G065TF
BS 542 542 RR2B629TF
BS 543 603 RR2G065TF
BS 604 739 RR2B629TF
BS 740 740 RR2B629JQ
BS 741 866 RR2B629TF
BS 867 878 RR2B629JQ

RD RR2G065TF 603 0 0
GGCTTGTGAAATAAAAACAATCGGAGCAGCGAAGTCAGAAAGAATGGAGAAAGTGATGAA
CCTGATAAAGCCGAAGCCTGATCCGAAGCAACTCTTGCGTGATTGGCAACGCAAGCTTCG
TCAAGAGTGCCGTAACATCGAACGCCAAATCCGAGATATACAGAAAGAAGAGAAAACAGT
TCAGAAGGCTATTAAAGAAGCTGCTAAGCGTAACGATATGGTCTCAGCAAAGGCGCTTGC
TAAGGAGATTGTGAGTGCGAGGAGAACAGTTAACCGTTTATATGAAAACAAGGCCCAGAT
GAATTCCATATCAATGCACCTCGGAGAAAGTGTTGCTGTTGCTAGAACAGTTGGACATCT
GTCCAAGAGCGCAGAGGTTATGAAGCTTGTCAATAATCTCATGAAGGCTCCTCAAATGGC
TGCTACTATGCAAGAGTTCAGCAAAGAGATGACTAAGGCTGGAGTTATTGAGGAGTTTGT
GAACGAGGCCATTGACAATGCACTAGATTCAGAGGACATGGAAGAAGAGATCGACGAAGA
G*TCGATAAAGTGTTGACAGCTATCGCTGGAGAAACCGCTGCTGAGCTTCCAGAAGCTGT
CAG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2B629JQ 835 0 0
GG
GGAGAAAGTGATGAAC*TGATAAAGCCGAAGCCTGATCCGAAGCAACTCTTGCGTGATTG
GCAACGCAAGCTTCGTCAAGAGTGCCGTAACATCGAACGCCAAATCCGAGATATACAGAA
AGAAGAGAAAACAGTTCAGAAGGCTATTAAAGAAGCTGCTAAGCGTAACGATATGGTCTC
AGCAAAGGCGCTTGCTAAGGAGATTGTGAGTGCGAGGAGAACAGTTAACCGTTTATATGA
AAACAAGGCCCAGATGAATTCCATATCAATGCACCTCGGAGAAAGTGTTGCTGTTGCTAG
AACAGTTGGACATCTGTCCAAGAGCGCAGAGGCTATGAAGCTTGTCAATAATTTCATGAA
GGCTCCTCAAATGGCTGCTACTATGCAAGAGTTCAGCAAAGAGATGACTAAGGCTGGAGT
TATTGAGGAGTTTGTGAACGAGGCCATTGACAATGCACTAGATTCAGAGGACATGGAAGA
AGAGATCGACGAAGAGGTCGATAAAGTGTTGACAGCTATCGCTGGAGGAACCGCTGTTGA
GCTTCCAGAAGCTGTCAGGAAGGAAAGGATAAAGGTACCTGCACAGAAGGCCAGCACTTC
CCGCGAGGAAGAGGCAATTGCAGAAGGTGTTGATGATGAGGAAGAACTGGAGGAGATTCG
AGCTCGCCTCGCTAAAGTTAGATCCTAATAACTT*GATTCGGTTTACTCTTTTTACATAC
GATTTTTATTGATTCGAAAGGTGATGAGAACATAAAAGAAGATTGATGTGTATTGTATAA
TATATAATTGAATTACAGTATACATTGTAATCACAAGCTGTCTTTTGGTAACG

QA 3 835 3 835
DS 

RD RR2G065JQ 447 0 0
ATGCAAGAGTTCAGCAAAGAGATGACTAAGGCTGGAGTTATTGAGGAGTTTGTGAACGAG
GCCATTGACAATGCACTAGATTCAGAGGACATGGAAGAAGAGATCGACGAAGAGGTCGAT
AAAGTGTTGACAGCTATCGCTGGAGAAACCGCTGCTGAGCTTCCAGAAGCTGTCAGGAAG
GAAAGGATAAAGGTACCTGCACAGAAGGCCAGCACTTCCCGCGAGGAAGAGGCAATTGCA
GAAGGTGTTGATGATGAGGAAGAACTGGAGGAGATTCGAGCTCGCCTCGCTAAAGTTAGA
TCCTAATAACTT*GATTCGGTTTACTCTTTTTACATACGATTTTTATTGATTCGAAAGGT
GATGAGAACATAAAAGAAGATTGATGTGTATTGTATAATATATAATTGAATTACAGTATA
CATTGTAATCACAAGCTGTCTTTTGGT

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR2B629TF 823 0 0
GG
GGAGAAAGTGATGAACCTGATAAAGCCGAAGCCTGATCCGAAGCAACTCTTGCGTGATTG
GCAACGCAAGCTTCGTCAAGAGTGCCGTAACATCGAACGCCAAATCCGAGATATACAGAA
AGAAGAGAAAACAGTTCAGAAGGCTATTAAAGAAGCTGCTAAGCGTAACGATATGGTCTC
AGCAAAGGCGCTTGCTAAGGAGATTGTGAGTGCGAGGAGAACAGTTAACCGTTTATATGA
AAACAAGGCCCAGATGAATTCCATATCAATGCACCTCGGAGAAAGTGTTGCTGTTGCTAG
AACAGTTGGACATCTGTCCAAGAGCGCAGAGGCTATGAAGCTTGTCAATAATCTCATGAA
GGCTCCTCAAATGGCTGCTACTATGCAAGAGTTCAGCAAAGAGATGACTAAGGCTGGAGT
TATTGAGGAGTTTGTGAACGAGGCCATTGACAATGCACTAGATTCAGAGGACATGGAAGA
AGAGATCGACGAAGAGGTCGATAAAGTGTTGACAGCTATCGCTGGAGGAACCGCTGTTGA
GCTTCCAGAAGCTGTCAGGAAGGAAAGGATAAAGGTACCTGCACAGAAGGCCAGCACTTC
CCGCGAGGAAGAGGCAATTGCAGAAGGTGTTGATGATGAGGAAGAACTGGAGGAGATTCG
AGCTCGCCTCGCTAAAGTTAGATCCTAATAACTTTGATTCGGTTTACTCTTTTTACATAC
GATTTTTATTGATTCGAAAGGTGATGAGAACATAAAAGAAGATTGATGTGTATTGTATAA
TATATAATTGAATTACAGTATACATTGTAATCACAAGCTGT

QA 3 823 3 823
DS 



AS 1 4

CO CL2572Contig1 1233 4 3 U
GAACGAGAAGAGAGAGAGAAGTCGATGGCGGGGATGATGATGCTTGCGAACAGTGTCCTC
CTCCTCCCTCCTAAACCTCCGAGCTTCCTTCCGGTTTCTTCTTCTCGAAGCAGCAGATCA
ATCCGAAGAACGACCCTACTAGTCATGGCCAAATCTTCCTCCGAACCTTCCGACTCCCTC
TCAGTGTCCACCAAATTCACTGCTCCTCCGGGGTTCAAGCCTCCCGAGCCGAAGCGGTTC
GCCGTTAAACCGGGGAAGCTCTTAGATGTGTTGGGTGCAGCTATCGGAGTGCTTCTCCGA
TTCGGCACTGGAGTGTTCGTTTCTGGGTATTCTGCTTCTTTCGTCTCCAAGGACGTGATT
CCAGCTGATCAGTATGCGTTGCGAATTGGCGGAATCACGGTGAAGGAAACCTCAAAGCTC
GGGCCTCTTCCTCAGAAACCAATTGAGATATATGAGTTTGAAGGCTGTCCCTTTTGCCGG
AAGGTCAGAGAGATGGTCACAGTGTTGGATCTTGATATTCTCTACTATCCTTGCCCAAGA
GGGAGTCCTAATTTCCGCCCCATGGTTAATCAGATGGGTGGCAAACAACAGTTTCCCTAC
ATGGTTGATCCAAACACCGGAGTGTCCATGTATGAATCAGATGGTATCATCAAATATCTA
TCCGAGAAATATGGAGATGGAACAGTTCCTTTAAGTCTATCACTTGGTCCATTAACGGCT
ATAGCAGCTGCCTTTGCAACGATTGGTCGTCTAGGAAAGGGTAACTTGTACACACCAGCA
AAACTACCACCTAAGCCACTCGTATTCTGGGCATACGAGGGTTCTCCGTTTTGCAAGCTT
GTACGCGAAGTTCTTGTGGAACTAGAGTTACCACACATTCAACGCAGCTGTGCTCGTGGT
AGTCCCAAACGGCAGGAATTGCTTATGAAAGCTGGTCACTTTCAGGTGCCTTACCTGGAA
GATCCAAACACTGGAGTAAATATGTTTGAGAGTGCAGAAATCATAGAGTATCTGAAGCAA
ACTTATGCTGCGTAGTTCAGCTACTTTCGGGTAATAAACTCAACTTAGTTATGAGTAAGT
GCAGGGTTTAATGATCAAGAAATGTTTCTATATACAAACCAAATATTATCGTGACATGAT
TCTCCAAGATTTGATCTTCTTTCTTGTTGTCATTTTTTGTATAAAATATACAATTTGCAC
TTAAAAACTCAGTTAATAAACTTTTTAAAACCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY05TF U 1
AF RR2GY13TF U 1
AF RR2D751TF U 26
AF RR2D751JQ C 557
BS 1 728 RR2GY05TF
BS 729 738 RR2D751TF
BS 739 1233 RR2D751JQ

RD RR2GY05TF 729 0 0
GAACGAGAAGAGAGAGAGAAGTCGATGGCGGGGATGATGATGCTTGCGAACAGTGTCCTC
CTCCTCCCTCCTAAACCTCCGAGCTTCCTTCCGGTTTCTTCTTCTCGAAGCAGCAGATCA
ATCCGAAGAACGACCCTACTAGTCATGGCCAAATCTTCCTCCGAACCTTCCGACTCCCTC
TCAGTGTCCACCAAATTCACTGCTCCTCCGGGGTTCAAGCCTCCCGAGCCGAAGCGGTTC
GCCGTTAAACCGGGGAAGCTCTTAGATGTGTTGGGTGCAGCTATCGGAGTGCTTCTCCGA
TTCGGCACTGGAGTGTTCGTTTCTGGGTATTCTGCTTCTTTCGTCTCCAAGGACGTGATT
CCAGCTGATCAGTATGCGTTGCGAATTGGCGGAATCACGGTGAAGGAAACCTCAAAGCTC
GGGCCTCTTCCTCAGAAACCAATTGAGATATATGAGTTTGAAGGCTGTCCCTTTTGCCGG
AAGGTCAGAGAGATGGTCACAGTGTTGGATCTTGATATTCTCTACTATCCTTGCCCAAGA
GGGAGTCCTAATTTCCGCCCCATGGTTAATCAGATGGGTGGCAAACAACAGTTTCCCTAC
ATGGTTGATCCAAACACCGGAGTGTCCATGTATGAATCAGATGGTATCATCAAATATCTA
TCCGAGAAATATGGAGATGGAACAGTTCCTTTAAGTCTATCACTTGGTCCATTAACGGCT
ATAGCAGC
T

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2GY13TF 728 0 0
GAACGAGAAGAGAGAGAGAAGTCGATGGCGGGGATGATGATGCTTGCGAACAGTGTCCTC
CTCCTCCCTCCTAAACCTCCGAGCTTCCTTCCGGTTTCTTCTTCTCGAAGCAGCAGATCA
ATCCGAAGAACGACCCTACTAGTCATGGCCAAATCTTCCTCCGAACCTTCCGACTCCCTC
TCAGTGTCCACCAAATTCACTGCTCCTCCGGGGTTCAAGCCTCCCGAGCCGAAGCGGTTC
GCCGTTAAACCGGGGAAGCTCTTAGATGTGTTGGGTGCAGCTATCGGAGTGCTTCTCCGA
TTCGGCACTGGAGTGTTCGTTTCTGGGTATTCTGCTTCTTTCGTCTCCAAGGACGTGATT
CCAGCTGATCAGTATGCGTTGCGAATTGGCGGAATCACGGTGAAGGAAACCTCAAAGCTC
GGGCCTCTTCCTCAGAAACCAATTGAGATATATGAGTTTGAAGGCTGTCCCTTTTGCCGG
AAGGTCAGAGAGATGGTCACAGTGTTGGATCTTGATATTCTCTACTATCCTTGCCCAAGA
GGGAGTCCTAATTTCCGCCCCATGGTTAATCAGATGGGTGGCAAACAACAGTTTCCCTAC
ATGGTTGATCCAAACACCGGAGTGTCCATGTATGAATCAGATGGTATCATCAAATATCTA
TCCGAGAAATATGGAGATGGAACAGTTCCTTTAAGTCTATCACTTGGTCCATTAACGGCT
ATAGCAGC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2D751TF 714 0 0
GGATGGCGGG
GATGATGCTTGCGAACAGTGTCCTCCTCC***CTCCTAAACCTCCGAGCTTCCTTCCGGT
TTCTTCTTCTCGAAGCAGCAGATCAATCCGAAGAACGACCCTACTAGTCATGGCCAAATC
TTCCTCCGAACCTTCCGACTCCCTCTCAGTGTCCACCAAATTCACTGCTCCTCCGGGGTT
CAAGCCTCCCGAGCCGAAGCGGTTCGCCGTTAAACCGGGGAAGCTCTTAGATGTGTTGGG
TGCAACTATCGGAGTGCTTCTCCGATTCGGCACTGGAGTGTTCGTTTCTGGGTATTCTGC
TTCTTTCGTCTCCAAGGACGTGATTCCAGCTGATCAGTATGCGTTGCGAACTGGCGGAAT
CACGGTGAAGGAAACCTCAAAGCTCGGGCCTCGTCCTCAGAAACCAATTGAGATATATGA
GTTTGAAGGCTGTCCCTTTTGCCGGAAGGTCAGAGAGATGGTCACAGTGTTGGATCTTGA
TATTCTCTACTATCCTTGCCCAAGAGGGAGTCCTAATTTCCGCCCCATGGTTAATCAGAT
GGGTGGCAAACAACAGTTTCCCTACATGGTTGATCCAAACACCGGAGTGTCCATGTATGA
ATCAGATGGTATCATCAAATATCTATCCGAGAAATATGGAGATGGAACAGTTCCTTTAAG
TCTATCACTTGGTC*ATTAACGGCTATAGCAGCTGCCTTTGCA
C

QA 11 713 11 713
DS 

RD RR2D751JQ 677 0 0
GCCCCATGGTTAATCAGATGGGTGGCAAACAACAGTTTCCCTACATGGTTGATCCAAACA
CCGGAGTGTCCATGTATGAATCAGATGGTATCATCAAATATCTATCCGAGAAATATGGAG
ATGGAACAGTTCCTTTAAGTCTATCACTTGGTCCATTAACGGCTATAGCAGCTGCCTTTG
CAACGATTGGTCGTCTAGGAAAGGGTAACTTGTACACACCAGCAAAACTACCACCTAAGC
CACTCGTATTCTGGGCATACGAGGGTTCTCCGTTTTGCAAGCTTGTACGCGAAGTTCTTG
TGGAACTAGAGTTACCACACATTCAACGCAGCTGTGCTCGTGGTAGTCCCAAACGGCAGG
AATTGCTTATGAAAGCTGGTCACTTTCAGGTGCCTTACCTGGAAGATCCAAACACTGGAG
TAAATATGTTTGAGAGTGCAGAAATCATAGAGTATCTGAAGCAAACTTATGCTGCGTAGT
TCAGCTACTTTCGGGTAATAAACTCAACTTAGTTATGAGTAAGTGCAGGGTTTAATGATC
AAGAAATGTTTCTATATACAAACCAAATATTATCGTGACATGATTCTCCAAGATTTGATC
TTCTTTCTTGTTGTCATTTTTTGTATAAAATATACAATTTGCACTTAAAAACTCAGTTAA
TAAACTTTTTAAAACCC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 3

CO CL2573Contig1 1155 3 5 U
GGTCAACATACTTTGAATTATATAGTTCTAGTTTAAACAACTTGGGCACAAAATTTAACA
TATTTTCGAAAAAACAAAACCTTAATGAAGTGAAATTCTTTGTTAAATATCCGTCCGACC
ACCAGAAAACAAACACAAACTGAGTCTACCGATGGTCCGGTGACGGCATTCATACATGCC
AAAAGACACTTAAGTCTTACATTAATACCCCAAATGTAACATAGTGAAAAATCCAAAAGA
TCGAAATCCAATTCAATGAAAAATCTCGGGTGTTTTTTTCCATTCAAAAAGTGACAATCA
TTGAAAAGTCTTTTCAGCCTTCGAGGCCGAGGGTGGATGTCAACCACGAGCACAAATCAT
CCGTCTCCTGTGGGATCGTGTAGTGACCAAGTCCACTGTAAGCTTTGAAAATCGTCTTCT
TAAACCCATGTGCTATCAAGGCCTGTGATGATTTCTCACCAAACTTGAACGGTACAACAT
CATCACCTTTTCCATGACAAACTAAGATGGGTAACGATGCAGCTCGGTTCTTGATCTGCT
CCTCTTCTAGTTTACCAGTTAGTGTCTTGGCACAAGGAAGCCACCCGCTCAAGCCAATGA
CCGCGCTTAAATTGATAGGGTAAGGATTGCCATTTCCATATTTACCGAGTGCAAAACAGG
TCGCAGAATATAGAGACGTCCCCGCACCCATGCTGAACCCTCCAACGCCTAACTTAATGT
CAGCAGGCTCGTTTGACAAGAGTTTTGCAACATGTTCGGCAGTCACATCCAGTCCTTCTA
CATCGTCAGGTCCATCTTCAGTCAGGTCCACAACATCAAACCAAGCTGTGGAGGGAAAAC
CACCAAACAAACTTATAGGTTGAGAAGGAGCAGTCGGGCATATCCATTTGATATTTGGAA
GGGGAAGCGTCTCCAACATCTGGGACCAGCTTGAGCCATTGTCGCCGAGGCCATGTAGCC
AGACAATAGTAGCTTGATGCTTCCCTTTGGGCCTAACCACATGAGTTTTCCCAAACTCCA
CCGCTCTTCTCAAATTTCTGCTTGAACCAACTGCAGCAGCACCAGAGAGACTCATTCTGA
GATGACAAGAAACTGGCTCTCGGCAAAAGGTGAAGCGAGTCTACGGAAGCCACCAAAAGA
TTAGAAGAGCTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD52JQ U 1
AF RR2FU82JQ U 178
AF RR2FU82TF C 427
BS 1 370 RR2FD52JQ
BS 371 371 RR2FU82JQ
BS 372 657 RR2FD52JQ
BS 658 665 RR2FU82JQ
BS 666 1155 RR2FU82TF

RD RR2FD52JQ 657 0 0
GGTCAACATACTTTGAATTATATAGTTCTAGTTTAAACAACTTGGGCACAAAATTTAACA
TATTTTCGAAAAAACAAAACCTTAATGAAGTGAAATTCTTTGTTAAATATCCGTCCGACC
ACCAGAAAACAAACACAAACTGAGTCTACCGATGGTCCGGTGACGGCATTCATACATGCC
AAAAGACACTTAAGTCTTACATTAATACCCCAAATGTAACATAGTGAAAAATCCAAAAGA
TCGAAATCCAATTCAATGAAAAATCTCGGGTGTTTTTTTCCATTCAAAAAGTGACAATCA
TTGAAAAGTCTTTTCAGCCTTCGAGGCCGAGGGTGGATGTCAACCACGAGCACAAATCAT
CCGTCTCCTG*GGGATCGTGTAGTGACCAAGTCCACTGTAAGCTTTGAAAATCGTCTTCT
TAAACCCATGTGCTATCAAGGCCTGTGATGATTTCTCACCAAACTTGAACGGTACAACAT
CATCACCTTTTCCATGACAAACTAAGATGGGTAACGATGCAGCTCGGTTCTTGATCTGCT
CCTCTTCTAGTTTACCAGTTAGTGTCTTGGCACAAGGAAGCCACCCGCTCAAGCCAATGA
CCGCGCTTAAATTGATAGGGTAAGGATTGCCATTTCCATATTTACCGAGTGCAAAAC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2FU82JQ 491 0 0
GG
CAAAAGACACTTAAGTCTTACATTAATACCCCAAATGTAACATAGTGAAAAATCCAAAAG
ATCGAAATCCAATTCAATGAAAAATCTCGGGTGTTTTTTTCCATTCAGAAAGTGACAATC
ATTGAAAAGTCTTTTCAGCCTTCGAGGCCGAGGGTGGATGTCAACCACGAGCACAAATCC
TCCGTCTCCTGTGGGATCGTGTAGTGACCAAGTCCACTGTAAGCTTTGAAGATCGTCTTC
TTAAACCCATGTGCTATCAAGGCCTGTGATGATTTCTCACCAAACTTGAACGGTACAACA
TCATCACCTTTTCCATGACAAACTAAGATGGGTAACGATGCAGCTCGGTTCTTGATCTGC
TCCTCTTCTAGTTTACCAGTTAGTGTCTTGGCACAAGGAAGCCACCCGCTCAAGCCAATG
ACCGCGCTTAAATTGATAGGGTAAGGATTGCCATTTCCATATTTACCGAGTGCAAAACAG
GTCGCA
AAA

QA 3 488 3 488
DS 

RD RR2FU82TF 729 0 0
CATGTGCTATCAAGGCCTGTGATGATTTCTCACCAAACTTGAACGGTACAACATCATCAC
CTTTTCCATGACAAACTAAGATGGGTAACGATGCAGCTCGGTTCTTGATCTGCTCCTCTT
CTAGTTTACCAGTTAGTGTCTTGGCACAAGGAAGCCACCCGCTCAAGCCAATGACCGCGC
TTAAATTGATAGGGTAAGGATTGCCATTTCCATATTTACCGAGTGCAAAACAGGTCGCAG
AATATAGAGACGTCCCCGCACCCATGCTGAACCCTCCAACGCCTAACTTAATGTCAGCAG
GCTCGTTTGACAAGAGTTTTGCAACATGTTCGGCAGTCACATCCAGTCCTTCTACATCGT
CAGGTCCATCTTCAGTCAGGTCCACAACATCAAACCAAGCTGTGGAGGGAAAACCACCAA
ACAAACTTATAGGTTGAGAAGGAGCAGTCGGGCATATCCATTTGATATTTGGAAGGGGAA
GCGTCTCCAACATCTGGGACCAGCTTGAGCCATTGTCGCCGAGGCCATGTAGCCAGACAA
TAGTAGCTTGATGCTTCCCTTTGGGCCTAACCACATGAGTTTTCCCAAACTCCACCGCTC
TTCTCAAATTTCTGCTTGAACCAACTGCAGCAGCACCAGAGAGACTCATTCTGAGATGAC
AAGAAACTGGCTCTCGGCAAAAGGTGAAGCGAGTCTACGGAAGCCACCAAAAGATTAGAA
GAGCTCCCC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 4

CO CL2574Contig1 874 4 4 U
GGGCTTATAAATTGGATCACAAGTTGCTCTCTTCAATCTGTCTGTCCTCCCTAATGTTTG
CTTCCGAAAAAAATATTAAATAAAATGAAGTTCTTCCTTTATCTCGTTGGGTTCTTTGTC
CTTTTTAATGGAATCACGGCCGACAAAGTAGAAGATTCTGTTATTCAAGATTCTTGCAAA
AAAATAACAAGTTTATACGACTTCTGCGTAGCATCTATCAAAGAAAATCCGGAGAGTCAG
AGAGTGAAAAATATCGATGATTTGATCATAGTAGCACTGAAAAATGCTATGTCGAACATG
ACACATGTGAAAGGAATTGTAGATAAGATTCTGAAGGACAGGAAGTATAAGAGTAAGGCA
ATTATTAAGCCGTTACGCAATTGCATCAAATATTATTCTGAGGGCACTGACTTGTTAGCC
AAAGTTTTAGAGAATGCGAAGTTGAGGAATTACAATAAAGTTTTAGGTAGTATTACTGAT
GCAGTAGATGTTCCGTTACATTGCGAATATGGATTCGAGGGCAAAAATGAGCTGAAATCT
CCGCTGAAGAAAGAGAACCGAGTTCTCACGTTTCTGACAGGCATTTGTGAATCTATTATT
TATTCAACTGCCCGTAGAAACTAGTCCACCAACGTATAGCGTCTAGCTGAAGCAGTCCAT
TGGTTTAAAGCGTTGAATAGTTCTTCTCGCGTTCCAGGGACCGTTCGTTTCTCTATTTGT
CAGGGACCGTTCGTTTCTCTATTTGTCATTTCAATTCAGCTGCTCCATCTATATGATCTA
GATGATTCATTCAGATTTTAGAGATTGTTCGTTTTTTCATCCAAATGAACCATCTAGATG
AATCATTTCAATGG*ATTTTATGTTTGTTTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2BN41TF U 37
AF RR2B414TF U 1
AF RR2BN41JQ C 206
AF RR2DY31TF U 566
BS 1 854 RR2B414TF
BS 855 855 RR2DY31TF
BS 856 871 RR2B414TF
BS 872 874 RR2DY31TF

RD RR2BN41TF 750 0 0
GGG
GTCTGTCCTCCCTAATGTTTGCTTCCGAAAAAAATATTAAATAAAATGAAGTTCTTCCTT
TATCTCGTTGGGTTCTTTGTCCTTTTTAATGGAATCACGGCCGACAAAGTAGAAGATTCT
GTTATTCAAGATTCTTGCAAAAAAATAACAAGTTTATACGACTTCTGCGTAGCATCTATC
AAAGAAAATCCGGAGAGTCAGAGAGTGAAAAATATCGATGATTTGATCATAGTAGCACTG
AAAAATGCTATGTCGAACATGACACATGTGAAAGGAATTGTAGATAAGATTCTGAAGGAC
AGGAAGTATAAGAGTAAGGCAATTATTAAGCCGTTACGCAATTGCATCAAATATTATTCT
GAGGGCACTGACTTGTTAGCCAAAGTTTTAGAGAATGCGAAGTTGAGGAATTACAATAAA
GTTTTAGGTAGTATTACTGATGCAGTAGATGTTCCGTTACATTGCGAATATGGATTCGAG
GGCAAAAATGAGCTGAAATCTCCGCTGAAGAAAGAGAACCGAGTTCTCACGTTTCTGACA
GGCATTTGTGAATCTATTATTTATTCAACTGCCCGTAGAAACTAGTCCACCAACGTATAG
CGTCTAGCTGAAGCAGTCCATTGGTTTAAAGCGTTGAATAGTTCTTCTCGCGTTCCAGG*
ACCGTTCGTTTCTCTATTTGTCAGG*ACCGTTCGTTTCTCTATTTGTCATTTCA*TTCAG
CTGCTC*ATCTATATGATCTAGATGAT

QA 4 750 4 750
DS 

RD RR2B414TF 873 0 0
GGGCTTATAAATTGGATCACAAGTTGCTCTCTTCAATCTGTCTGTCCTCCCTAATGTTTG
CTTCCGAAAAAAATATTAAATAAAATGAAGTTCTTCCTTTATCTCGTTGGGTTCTTTGTC
CTTTTTAATGGAATCACGGCCGACAAAGTAGAAGATTCTGTTATTCAAGATTCTTGCAAA
AAAATAACAAGTTTATACGACTTCTGCGTAGCATCTATCAAAGAAAATCCGGAGAGTCAG
AGAGTGAAAAATATCGATGATTTGATCATAGTAGCACTGAAAAATGCTATGTCGAACATG
ACACATGTGAAAGGAATTGTAGATAAGATTCTGAAGGACAGGAAGTATAAGAGTAAGGCA
ATTATTAAGCCGTTACGCAATTGCATCAAATATTATTCTGAGGGCACTGACTTGTTAGCC
AAAGTTTTAGAGAATGCGAAGTTGAGGAATTACAATAAAGTTTTAGGTAGTATTACTGAT
GCAGTAGATGTTCCGTTACATTGCGAATATGGATTCGAGGGCAAAAATGAGCTGAAATCT
CCGCTGAAGAAAGAGAACCGAGTTCTCACGTTTCTGACAGGCATTTGTGAATCTATTATT
TATTCAACTGCCCGTAGAAACTAGTCCACCAACGTATAGCGTCTAGCTGAAGCAGTCCAT
TGGTTTAAAGCGTTGAATAGTTCTTCTCGCGTTCCAGGGACCGTTCGTTTCTCTATTTGT
CAGGGACCGTTCGTTTCTCTATTTGTCATTTCAATTCAGCTGCTCCATCTATATGATCTA
GATGATTCATTCAGATTTTAGAGATTGTTCGTTTTTTCATCCAAATGAACCATCTAGATG
AATCATTTCAATGGGATTTTATGTTTGTTTC
TC

QA 1 871 1 871
DS 

RD RR2BN41JQ 666 0 0
GCGTAGCATCTATCAAAGAAAATCCGGAGAGTCAGAGAGTGAAAAATATCGATGATTTGA
TCATAGTAGCACTGAAAAATGCTATGTCGAACATGACACATGTGAAAGGAATTGTAGATA
AGATTCTGAAGGACAGGAAGTATAAGAGTAAGGCAATTATTAAGCCGTTACGCAATTGCA
TCAAATATTATTCTGAGGGCACTGACTTGTTAGCCAAAGTTTTAGAGAATGCGAAGTTGA
GGAATTACAATAAAGTTTTAGGTAGTATTACTGATGCAGTAGATGTTCCGTTACATTGCG
AATATGGATTCGAGGGCAAAAATGAGCTGAAATTTCCGCTGAAGAAAGAGAACCGAGTTC
TCACGTTTCTGACAGGCATTTGTGAATCTATTATTTATTCAACTGCCCGTAGAAACTAGT
CCACCAACGTATAGCGTCTAGCTGAAGCAGTCCATTGGTTTAAAGCGTTGAATAGTTCTT
CTCGCGTTCCAGGGACCGTTCGTTTCTCTATTTGTCAGGGACCGTTCGTTTCTCTATTTG
TCATTTCAATTCAGCTGCTCCATCTATATGATCTAGATGATTCATTCAGATTTTAGAGAT
TGTTCGTTTTTTCATCCAAATGAACCATCTAGATGAATCATTTCAATGG*ATTTTATGTT
TGTTTC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2DY31TF 309 0 0
G
CACGTTTCTGACAGGCATTTGTGAATCTATTATTTATTCAACTGCCCGTAGAAACTAGTC
CACCAACGTATAGCGTCTAGCTGAAGCAGTCCATTGGTTTAAAGCGTTGAATAGTTCTTC
TCGCGTTCCAGGGACCGTTCGTTTCTCTATTTGTCAGGGACCGTTCGTTTCTCTATTTGT
CATTTCAATTCAGCTGCTCCATCTATATGATCTAGATGATTCATTCAGATTTTAGAGATT
GTTCGTTTTTTCATCCAAATGAACCATCTAGATGAATCATTTCAATGG*ATTTTATGTTT
GTTTCTCT

QA 2 309 2 309
DS 



AS 2 4

CO CL2575Contig1 492 2 2 U
GAAGAAGATCTTGGAGGAAGTCGCAATCATCCCTTCCAAAAGATTACGCAACAAGATCGC
TGGATTCTCCACCCACTTGATGAAGCGTATCCAGAAGGGACCGGTGCGTGGGATCTCGCT
CAAGCTACAGGAGGAGGAGCGCGAAAGGAGAATGGACTTCGTCCCCGACGAGTCGGCGAT
CAAGACCGATGATGTGAAGGTGGACAAGGAGACGCTAGAGATGCTTGCGTCTTTGGGAAT
GTCTGACGTTTCCGGGTTTTCTCAAGTGGAGACACAAGCGGCCGTGGCGCCAGGCAATGC
GTTTGGTCGTGGTGGAAGAAGATTCTAAGGCATTGAGTTTTGTTTTTTTTGTTGGAGTGT
TATGGATTGATTCAACATTGTGTTTCCTTCGGTTCAGAGATTAATCTCTTTCGTATATTC
TTGCAGTACTGTTTCCATTCATGTGTCACAAGTGTTGAATTAAATCTTTGAATCACAGCA
AATGAGTTAATC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CN96JQ C 1
AF RR2CN96TF U 1
BS 1 1 RR2CN96JQ
BS 2 492 RR2CN96TF

RD RR2CN96JQ 492 0 0
GAAGAAGATCTTGGAGGAAGTCGCAATCATCCCTTCCAAAAGATTACGCAACAAGATCGC
TGGATTCTCCACCCACTTGATGAAGCGTATCCAGAAGGGACCGGTGCGTGGGATCTCGCT
CAAGCTACAGGAGGAGGAGCGCGAAAGGAGAATGGACTTCGTCCCCGACGAGTCGGCGAT
CAAGACCGATGATGTGAAGGTGGACAAGGAGACGCTAGAGATGCTTGCGTCTTTGGGAAT
GTCTGACGTTTCCGGGTTTTCTCAAGTGGAGACACAAGCGGCCGTGGCGCCAGGCAATGC
GTTTGGTCGTGGTGGAAGAAGATTTTAAGGCATTGAGTTTTGTTTTTTTTGTTGGAGTGT
TATGGATTGATTCAACATTGTGTTTCCTTCGGTTCAGAGATTAATCTCTTTCGTATATTC
TTGCAGTACTGTTTCCATTCATGTGTCACAAGTGTTGAATTAAATCTTTGAATCACAGCA
AATGAGTTAATC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR2CN96TF 492 0 0
G
AAGAAGATCTTGGAGGAAGTCGCAATCATCCCTTCCAAAAGATTACGCAACAAGATCGCT
GGATTCTCCACCCACTTGATGAAGCGTATCCAGAAGGGACCGGTGCGTGGGATCTCGCTC
AAGCTACAGGAGGAGGAGCGCGAAAGGAGAATGGACTTCGTCCCCGACGAGTCGGCGATC
AAGACCGATGATGTGAAGGTGGACAAGGAGACGCTAGAGATGCTTGCGTCTTTGGGAATG
TCTGACGTTTCCGGGTTTTCTCAAGTGGAGACACAAGCGGCCGTGGCGCCAGGCAATGCG
TTTGGTCGTGGTGGAAGAAGATTCTAAGGCATTGAGTTTTGTTTTTTTTGTTGGAGTGTT
ATGGATTGATTCAACATTGTGTTTCCTTCGGTTCAGAGATTAATCTCTTTCGTATATTCT
TGCAGTACTGTTTCCATTCATGTGTCACAAGTGTTGAATTAAATCTTTGAATCACAGCAA
ATGAGTTAATC

QA 2 492 2 492
DS 



CO CL2575Contig2 610 2 2 U
GGATCTTCTGTGCATTTACAGTCGCTTCAATCTTCTCTCCAGCTCCGACGAGGACGTAAT
AGGTAAGTACAAAAGAGGGTGGTGAAAGATGGGTCGCGTTCGTACCAAAACAGTGAAGAA
ATCGTCACGTCAGGTGATCGAGAAGTACTACTCGAGGATGACACTCGACTTCCACACGAA
CAAGAAGATCTTGGAGGAAGTCGCAATCATCCCTTCCAAAAGACTACGCAACAAGATCGC
TGGATTCTCCACGCACTTGATGAAGCGTATCCAGAAGGGACCGGTGCGTGGGATCTCGCT
CAAGCTGCAGGAGGAGGAGCGCGAACGGAGAATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCGGCGAT
CAAGATCGATGATGTGAAGGTGGACAAGGAGACGCTAGAGATGCTCGCTTCTTTGGGTAT
GTCTGACGTTTCCGGGTTTTCTCAAGTGGAGACACAAGCGGCCGTGGCGCCAGGCAATGC
GTTTGGCCGCGGTGGAAGAAGATTCTAAGGCATATGAGTTTTGTTTTTTTGTTGGAGTGT
TATGGATTTATTCAACATTGTTTCCTTCTTCAAAGATTAATCTCTTTAGTATATTTGCAG
TAAAAAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV81TF U 1
AF RR2EV81JQ C 1
BS 1 595 RR2EV81TF
BS 596 610 RR2EV81JQ

RD RR2EV81TF 601 0 0
GGATCTTCTGTGCATTTACAGTCGCTTCAATCTTCTCTCCAGCTCCGACGAGGACGTAAT
AGGTAAGTACAAAAGAGGGTGGTGAAAGATGGGTCGCGTTCGTACCAAAACAGTGAAGAA
ATCGTCACGTCAGGTGATCGAGAAGTACTACTCGAGGATGACACTCGACTTCCACACGAA
CAAGAAGATCTTGGAGGAAGTCGCAATCATCCCTTCCAAAAGACTACGCAACAAGATCGC
TGGATTCTCCACGCACTTGATGAAGCGTATCCAGAAGGGACCGGTGCGTGGGATCTCGCT
CAAGCTGCAGGAGGAGGAGCGCGAACGGAGAATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCGGCGAT
CAAGATCGATGATGTGAAGGTGGACAAGGAGACGCTAGAGATGCTCGCTTCTTTGGGTAT
GTCTGACGTTTCCGGGTTTTCTCAAGTGGAGACACAAGCGGCCGTGGCGCCAGGCAATGC
GTTTGGCCGCGGTGGAAGAAGATTCTAAGGCATATGAGTTTTGTTTTTTTGTTGGAGTGT
TATGGATTTATTCAACATTGTTTCCTTCTTCAAAGATTAATCTCTTTAGTATATT
TGCAGT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2EV81JQ 610 0 0
GGATCTTCTGTGCATTTACAGTCGCTTCAATCTTCTCTCCAGCTCCGACGAGGACGTAAT
AGGTAAGTACAAAAGAGGGTGGTGAAAGATGGGTCGCGTTCGTACCAAAACAGTGAAGAA
ATCGTCACGTCAGGTGATCGAGAAGTACTACTCGAGGATGACACTCGACTTCCACACGAA
CAAGAAGATCTTGGAGGAAGTCGCAATCATCCCTTCCAAAAGACTACGCAACAAGATCGC
TGGATTCTCCACGCACTTGATGAAGCGTATCCAGAAGGGACCGGTGCGTGGGATCTCGCT
CAAGCTGCAGGAGGAGGAGCGCGAACGGAGAATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCGGCGAT
CAAGATCGATGATGTGAAGGTGGACAAGGAGACGCTAGAGATGCTCGCTTCTTTGGGTAT
GTCTGACGTTTCCGGGTTTTTTCAAGTGGAGACACAAGCGGCCGTGGCGCCAGGCAATGC
GTTTGGCCGCGGTGGAAGAAGATTTTAAGGCATATGAGTTTTGTTTTTTTGTTGGAGTGT
TATGGATTTATTCAACATTGTTTCCTTCTTCAAAGATTAATCTCTTTAGTATATTTGCAG
TAAAAAAAAA

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 4

CO CL2576Contig1 283 4 5 U
GGGACCATCCGAGTTCGGCGATTTCACTATGAGAACCAAGTGGAAGAAGAAGCGCATGAG
GAGATTGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGAGATCTAAGTAGTCTGTTGTCATACT
TATCCATAATTCTCTGTTATTGCTTTTATTCAGTTTCTTGGAACCTTTTATGTTTTGTGT
TGTTACATTTAAGTTTGAACAATCTTCTATAGATTATGTTTGGCTTACTCTATTTTATTA
TCTACAACTTACAAGTTTATGAAATAAGTGAAAAATTAGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BO10JQ C 1
AF RR2B587JQ C -2
AF RR2B587TF U -2
AF RR2BO10TF U 1
BS 1 5 RR2BO10JQ
BS 6 34 RR2B587TF
BS 35 35 RR2BO10TF
BS 36 265 RR2B587TF
BS 266 283 RR2BO10TF

RD RR2BO10JQ 283 0 0
GGGACCATCCGAGTTCGGCGATTTCACTATGAGAACCAAGTGGAAGAAGAAGCGCATGAG
GAGATTGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGAGATCTAAGTAGTCTGTTGTCATACT
TATCCATAATTCTCTGTTATTGCTTTTATTTAGTTTCTTGGAACCTTTTATGTTTTGTGT
TGTTACATTTAAGTTTGAACAATCTTCTATAGATTATGTTTGGCTTACTCTATTTTATTA
TCTACAACTTACAAGTTTATGAAATAAGTGAAAAATTAGTTGC

QA 1 283 1 283
DS 

RD RR2B587JQ 268 0 0
GAGCCGAC
CATCCGAGTTCGGCGATTTCACTATGAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGCATGAGGAGAT
TGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGAGATCTAAGTAGTCTGTTGTCATACTTATCC
ATAATTCTCTGTTATTGCTTTTATTCAGTTTCTTGGAACCTTTTATGTTTTGTGTTGTTA
CATTTAAGTTTGAACAATCTTCTATAGATTATGTTTGGCTTACTCTATTTTATTATCTAC
AACTTACAAGTTTATGAAAT

QA 9 268 9 268
DS 

RD RR2B587TF 268 0 0
GAGCCGAC
CATCCGAGTTCGGCGATTTCACTATGAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGCATGAGGAGAT
TGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGAGATCTAAGTAGTCTGTTGTCATACTTATCC
ATAATTCTCTGTTATTGCTTTTATTCAGTTTCTTGGAACCTTTTATGTTTTGTGTTGTTA
CATTTAAGTTTGAACAATCTTCTATAGATTATGTTTGGCTTACTCTATTTTATTATCTAC
AACTTACAAGTTTATGAAAT

QA 9 268 9 268
DS 

RD RR2BO10TF 283 0 0
GGGAG
CATCCGAGTTCGGCGATTTCACTATGAGAACCAAGTGGAAGAAGAAGCGCATGAGGAGAT
TGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGAGATCTAAGTAGTCTGTTGTCATACTTATCC
ATAATTCTCTGTTATTGCTTTTATTTAGTTTCTTGGAACCTTTTATGTTTTGTGTTGTTA
CATTTAAGTTTGAACAATCTTCTATAGATTATGTTTGGCTTACTCTATTTTATTATCTAC
AACTTACAAGTTTATGAAATAAGTGAAAAATTAGTTGC

QA 6 283 6 283
DS 



AS 1 4

CO CL2577Contig1 597 4 4 U
GGGTTGTTGTTTGTTGTGGTTGGTAAGGAAGGGAATGGCGATGGTTGGGCAGCGTCCTCG
GCGTGTTGAAGTCACGGCGGCGTACATGATACTGGTAATAATAGTGGTGGTAGTCAGCGA
TCTGTCAAACTGTGTGAGAGCCGAGAAGTCGGTGTCGGCATTCGTGCAGAACGCCATATT
GTCCAACAAGATTGTCATCTTCTCCAAGTCCTACTGCCCGTATTGCTTGCGCTCGAAACG
AATTTTCAGCCAACTTAAGGAACAGCCTTTTGTTGTGGAGCTTGATCTCAGAGAGGACGG
AGATCAAATACAGTACGAGCTTCTGGAGTTTGTTGGTCGCCGTACTGTCCCGCAAGTTTT
TGTAAACGGCAAGCATATTGGTGACTCTGATGATCTTGCAGATGCTGTGGAGAATGGCCA
GTTGCAAAAGCTTCTTGCTGCTAGTTAGACTTTTTTTAAGAAGCTGGAATGGATTTGATC
ATGGAACCTTATGTGTTTGTTATTTAGGGGAATCTTTGGTAGTAAACTGAATCAATGAAT
TGCTCTTCACTGACTTTTAATAGCTCCTTCCTTATATAATAAAAAAGTTATGATGAC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RR2CG04JQ C 1
AF RR2FU03JQ C 1
AF RR2FU03TF U 1
AF RR2CG04TF U 1
BS 1 417 RR2FU03TF
BS 418 418 RR2CG04TF
BS 419 595 RR2FU03TF
BS 596 597 RR2CG04JQ

RD RR2CG04JQ 597 0 0
GGGTTGTTGTTTGTTGTGGTTGGTAAGGAAGGGAATGGCGATGGTTGGGCAGCGTCCTCG
GCGTGTTGAAGTCACGGCGGCGTACATGATACTGGTAATAATAGTGGTGGTAGTCAGCGA
TCTGTCAAACTGTGTGAGAGCCGAGAAGTCGGTGTCGGCATTCGTGCAGAACGCCGTATT
GTCCAACAAGATTGTCATCTTCTCCAAGTCCTACTGCCCGTATTGCTTGCGCTCGAAACG
AATTTTCAGCCAACTTAAGGAACAGCCTTTTGTTGTGGAGCTTGATCTCAGAGAGGACGG
AGATCAAATACAGTACGAGCTTCTGGAGTTTGTTGGTCGCCGTACTGTCCCGCAAGTTTT
TGTAAACGGCAAGCATATTGGTGGCTCTGATGATCTTGCAGATGCTGTGGAGAATGGCCA
GTTGCAAAAGCTTCTTGCTGCTAGTTAGACTTTTTTTAAGAAGCTGGAATGGATTTGATC
ATGGAACCTTATGTGTTTGTTATTTAGGGGAATCTTTGGTAGTAAACTGAATCAATGAAT
TGCTCTTCACTGACTTTTAATAGCTCCTTCCTTATATAATAAAAAAGTTATGATGAC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2FU03JQ 596 0 0
GGGTTGTTGTTTGTTGTGGTTGGTAAGGAAGGGAATGGCGATGGTTGGGCAGCGTCCTCG
GCGTGTTGAAGTCACGGCGGCGTACATGATACTGGTAATAATAGTGGTGGTAGTCAGCGA
TCTGTCAAACTGTGTGAGAGCCGAGAAGTCGGTGTCGGCATTCGTGCAGAACGCCATATT
GTCCAACAAGATTGTCATCTTCTCCAAGTCCTACTGCCCGTATTGCTTGCGCTCGAAACG
AATTTTCAGCCAACTTAAGGAACAGCCTTTTGTTGTGGAGCTTGATTTCAGAGAGGACGG
AGATCAAATACAGTACGAGCTTTTGGAGTTTGTTGGTCGCCGTACTGTCCCGCAAGTTTT
TGTAAACGGCAAGCATATTGGTGACTTTGATGATCTTGCAGATGCTGTGGAGAATGGTCA
GTTGCAAAAGCTTCTTGCTGCTAGTTAGACTTTTTTTAAGAAGCTGGAATGGATTTGATC
ATGGAACCTTATGTGTTTGTTATTTAGGGGAATCTTTGGTAGTAAACTGAATCAATGAAT
TGCTCTTCACTGACTTTTAATAGCTCCTTCCTTATATAATAAAAAAGTTATGATG
G

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2FU03TF 596 0 0
GGGTTGTTGTTTGTTGTGGTTGGTAAGGAAGGGAATGGCGATGGTTGGGCAGCGTCCTCG
GCGTGTTGAAGTCACGGCGGCGTACATGATACTGGTAATAATAGTGGTGGTAGTCAGCGA
TCTGTCAAACTGTGTGAGAGCCGAGAAGTCGGTGTCGGCATTCGTGCAGAACGCCATATT
GTCCAACAAGATTGTCATCTTCTCCAAGTCCTACTGCCCGTATTGCTTGCGCTCGAAACG
AATTTTCAGCCAACTTAAGGAACAGCCTTTTGTTGTGGAGCTTGATCTCAGAGAGGACGG
AGATCAAATACAGTACGAGCTTCTGGAGTTTGTTGGTCGCCGTACTGTCCCGCAAGTTTT
TGTAAACGGCAAGCATATTGGTGACTCTGATGATCTTGCAGATGCTGTGGAGAATGGTCA
GTTGCAAAAGCTTCTTGCTGCTAGTTAGACTTTTTTTAAGAAGCTGGAATGGATTTGATC
ATGGAACCTTATGTGTTTGTTATTTAGGGGAATCTTTGGTAGTAAACTGAATCAATGAAT
TGCTCTTCACTGACTTTTAATAGCTCCTTCCTTATATAATAAAAAAGTTATGATG
G

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2CG04TF 597 0 0
GGGTTGTTGTTTGTTGTGGTTGGTAAGGAAGGGAATGGCGATGGTTGGGCAGCGTCCTCG
GCGTGTTGAAGTCACGGCGGCGTACATGATACTGGTAATAATAGTGGTGGTAGTCAGCGA
TCTGTCAAACTGTGTGAGAGCCGAGAAGTCGGTGTCGGCATTCGTGCAGAACGCCGTATT
GTCCAACAAGATTGTCATCTTCTCCAAGTCCTACTGCCCGTATTGCTTGCGCTCGAAACG
AATTTTCAGCCAACTTAAGGAACAGCCTTTTGTTGTGGAGCTTGATCTCAGAGAGGACGG
AGATCAAATACAGTACGAGCTTCTGGAGTTTGTTGGTCGCCGTACTGTCCCGCAAGTTTT
TGTAAACGGCAAGCATATTGGTGGCTCTGATGATCTTGCAGATGCTGTGGAGAATGGCCA
GTTGCAAAAGCTTCTTGCTGCTAGTTAGACTTTTTTTAAGAAGCTGGAATGGATTTGATC
ATGGAACCTTATGTGTTTGTTATTTAGGGGAATCTTTGGTAGTAAACTGAATCAATGAAT
TGCTCTTCACTGACTTTTAATAGCTCCTTCCTTATATAATAAAAAAGTTATGATG
AC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 4

CO CL2578Contig1 741 4 12 U
TTGTTTTATAAACTAAATTGGGTTTACAAACTAAATAAATTTACAAATTAAATTGGTTTA
CAAAAATAAACTAAATAAAAATAAAAAACTAAACTAAATAAAAAATCCTAAACCTAAAAC
AAGGCTCTATCTTCTATGCATCTTCTCCACCGCCTCTTCATTTGGAGCTACAGTAACGGC
TACCGCGACCACCACCCGGTGACTGCGAGTACCACCGTTGTACTGCGACTGCGGAGAGAA
GTCCGACTGTCAGGCTTCCAGAACGTAATTCTCTTTAGCATATCTCATTGTCTCAGGTCA
AAGCGATTCTCTTGAGCCGTATTCAGAGCAGGCCGTAAATGTTAACAAGTACCACAAAGC
CAGATGGCATGAAGCCGTAAAGGTCATCAAGGATTCGCGCTCCACCACAAGGTTCCTCTT
CTCCACCGAACATTATCTTATTCTGACTCATCCACCTTCCTCCCAAGAACAAAAAAAATC
ATAAACAAAAGAGAGAGAGAGAAGAGATAGAGAAGCCAGAAGAGAGACAGAGAGAGATAG
AGAAGCCATATCTGTTTCTTCATTTCTTCTCCCGCCAGTACTGGCAGTACACCACCGATT
CCGAACAATTCTCCAGGAAAGGATTCCACTACAGATGCGGTGGCATCTTTAAAAGATGTA
ATAGGAAGCTTTGCATATACAAATTAAAAATTTTGAGTCTGTATACGAAGAAAAGGGGAA
GTGATTGTTAGGGTAAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H312JQ U 15
AF RR2H312TF C 15
AF RR2AZ66TFB C 1
AF RR2AZ66JQ U 15
BS 1 14 RR2AZ66TFB
BS 15 25 RR2AZ66JQ
BS 26 26 RR2H312JQ
BS 27 436 RR2AZ66JQ
BS 437 437 RR2H312JQ
BS 438 439 RR2AZ66JQ
BS 440 440 RR2H312JQ
BS 441 488 RR2AZ66JQ
BS 489 489 RR2H312JQ
BS 490 604 RR2AZ66JQ
BS 605 605 RR2H312JQ
BS 606 741 RR2AZ66JQ

RD RR2H312JQ 597 0 0
AAATTGGGTTTACAAACTAAATAAATTTACAAATTAAATTGGTTTACAAAAATAAACTAA
ATAAAAATAAAAAACTAAAC**AATAAAAAATCCTAAACCTAAAACAAGGCTCTATCTTC
TATGCATCTTCTCCACCGCCTCTTCATTTGGAGCTACAGTAACGGCTACCGCGACCACCA
CCCGGTGACTGCGAGTACCACCGTTGTACTGCGACTGCGGAGAGAAGTCCGACTGTCAGG
CTTCCAGAACGTAATTCTCTT*AGCATATCTCATTGTCTCAGGTCAAAGTGATTCTCTTG
AGCCGTATTCAGAGCAGGCCGTAAATGTTAACAAGTACCACAAAGCCAGATGGCATGAAG
CCGTAAAGGTCATCAAGGATTCGCGCTCCACCACAAGGTTCCTCTTCTCCACCGAACATT
ATCTTATTCTGACTCATCCACCTTCCTCCCAAGAACAAAAAAA*TCATAAACAAAAGAGA
GAGAGAGAAGAGATAGAGAAGCCAGAAGAGAGACAGAGAGAGATAGAGAAGCCATATCTG
TTTCTTCATTTCTTCTCCCGCCAGTACTGGCAGTACACCACCGATTCCGAACAATTC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2H312TF 618 0 0
AAATTGGGTTTACAAACTAAATAAATTTACAAATTAAATTGGTTTACAAAAATAAACTAA
ATAAAAATAAAAAACTAAAC**AATAAAAAATCCTAAACCTAAAACAAGGCTCTATCTTC
TATGCATCTTCTCCACCGCCTCTTCATTTGGAGCTACAGTAACGGCTACCGCGACCACCA
CCCGGTGACTGCGAGTACCACCGTTGTACTGCGACTGCGGAGAGAAGTCCGACTGTCAGG
CTTCCAGAACGTAATTCTCTT*AGCATATCTCATTGTCTCAGGTCAAAGTGATTCTCTTG
AGCCGTATTCAGAGCAGGCCGTAAATGTTAACAAGTACCACAAAGCCAGATGGCATGAAG
CCGTAAAGGTCATCAAGGATTCGCGCTCCACCACAAGGTTCCTCTTCTCCACCGAACATT
ATCTTATTCTGACTCATCCACCTTCCTCCCAAGAACAAAAAAA*TCATAAACAAAAGAGA
GAGAGAGAAGAGATAGAGAAGCCAGAAGAGAGACAGAGAGAGATAGAGAAGCCATATCTG
TTTCTTCATTTCTTCTCCCGCCAGTACTGGCAGTACACCACCGATTCCGAACAATTCTCC
AGGAAAGGATTCCACT
CC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2AZ66TFB 741 0 0
TTGTTTTATAAACTAAATTGGGTTTGCAAACTAAATAAATTTACAAATTAAATTGGTTTA
CAAAAATAAACTAAATAAAAATAAAAAACTAAACTAAATAAAAAATCCTAAACCTAAAAC
AAGGCTCTATCTTCTATGCATCTTCTCCACCGCCTCTTCATTTGGAGCTACAGTAACGGC
TACCGCGACCACCACCCGGTGACTGCGAGTACCACCGTTGTACTGCGACTGCGGAGAGAA
GTCCGACTGTCAGGCTTCCAGAACGTAATTCTCTTTAGCATATCTCATTGTCTCAGGTCA
AAGCGATTCTCTTGAGCCGTATTCAGAGCAGGCCGTAAATGTTAACAAGTACCACAAAGC
CAGATGGCATGAAGCCGTAAAGGTCATCAAGGATTCGCGCTCCACCACAAGGTTCCTCTT
CTCCACCGAACATTATTTTCTTCTGACTCATCCACCTTCCTCCCAAGAACAAAAAAAATC
ATAAACAAGAGAGAGAGAGAGAAGAGATAGAGAAGCCAGAAGAGAGACAGAGAGAGATAG
AGAAGCCATATCTGTTTCTTCATTTCTTCTCCCGCCAGTACTGGCAGTACACCACCGATT
CCGACCAATTCTCCAGGAAAGGATTCCACTACAGATGCGGTGGCATCTTTAAAAGATGTA
ATAGGAAGCTTTGCATATACAAATTAAAAATTTTGAGTCTGTATACGAAGAAAAGGGGAA
GTGATTGTTAGGGTAAGATCC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2AZ66JQ 727 0 0
AAATTGGGTTTGCAAACTAAATAAATTTACAAATTAAATTGGTTTACAAAAATAAACTAA
ATAAAAATAAAAAACTAAACTAAATAAAAAATCCTAAACCTAAAACAAGGCTCTATCTTC
TATGCATCTTCTCCACCGCCTCTTCATTTGGAGCTACAGTAACGGCTACCGCGACCACCA
CCCGGTGACTGCGAGTACCACCGTTGTACTGCGACTGCGGAGAGAAGTCCGACTGTCAGG
CTTCCAGAACGTAATTCTCTTTAGCATATCTCATTGTCTCAGGTCAAAGCGATTCTCTTG
AGCCGTATTCAGAGCAGGCCGTAAATGTTAACAAGTACCACAAAGCCAGATGGCATGAAG
CCGTAAAGGTCATCAAGGATTCGCGCTCCACCACAAGGTTCCTCTTCTCCACCGAACATT
ATTTTCTTCTGACTCATCCACCTTCCTCCCAAGAACAAAAAAAATCATAAACAAGAGAGA
GAGAGAGAAGAGATAGAGAAGCCAGAAGAGAGACAGAGAGAGATAGAGAAGCCATATCTG
TTTCTTCATTTCTTCTCCCGCCAGTACTGGCAGTACACCACCGATTCCGACCAATTCTCC
AGGAAAGGATTCCACTACAGATGCGGTGGCATCTTTAAAAGATGTAATAGGAAGCTTTGC
ATATACAAATTAAAAATTTTGAGTCTGTATACGAAGAAAAGGGGAAGTGATTGTTAGGGT
AAGATCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL2579Contig1 828 2 21 U
CGTGAAAAAACTTCTCCAAATATGCATTGTAATATCCATTCATAAGTCTTATTTTCTGAA
AAAAAAACTCATGTTATGAACAGTACATGGATATCTTCAATTCTGAAACACTGATATAAG
AACACTATAAAGAGTGCGAAACCTGATGAAAACCCAAAAAAAACAAATCAATCCTCGTCT
TCATCACTGCCATAGTTCTGGAACAAAGATGCCAACCCGGCGTTAGCCACAACGTCACTC
TTCTTCTCCTCTGGTTTTGCAGGAGCTGGAGTCGTAAAAGTTGTTGGTTGAGTTTGCTTC
TTGATGACTGTTATGTGAATGGATTTGAAGGGTTGCTTGCTGGTAGCTTGCTTCTTGGGC
TGCTTCGGGTTATCTGCAGATGAATTAGTTAAAATATCTGTGGGGTTGCTTGGACTTTCT
TCTGATGCCTCTCTCTTCTTTGAAAGATCTGAAGATGATCCTTCTTTCTTCTCCTTCTGA
AAGCTGTCATCATCATCCTCATCATCATCATCATCATCATCTACATCGTCTTCATCTACA
ATTCTCCTAACAACTTCTTTCTGTTTACCAAATATCGACTTAATAACTGCTTCATCCTCT
TCTTCTATTCGTTTGACCTTCTCAGCGCCAGTTCTTTGCAAGGCCTCCAGCATCGCATCT
ACGCTCACAGTAGCGTGTCTAGACTTCATCGATTTCATTTCATCAAGAGCGGCTATAATG
TCCATTTCCCTTTTGGAATCCAAAGTCCGGTTCTACAAAGACTTCATAGCGTCCCCCATC
TCCTCCGCATCTCTTCTCTGTTGTTCCTTATCAACCTCCTCGTCTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G081JQ U 1
AF RR2E513JQ U 24
BS 1 66 RR2G081JQ
BS 67 67 RR2E513JQ
BS 68 149 RR2G081JQ
BS 150 150 RR2E513JQ
BS 151 172 RR2G081JQ
BS 173 173 RR2E513JQ
BS 174 430 RR2G081JQ
BS 431 431 RR2E513JQ
BS 432 596 RR2G081JQ
BS 597 597 RR2E513JQ
BS 598 709 RR2G081JQ
BS 710 710 RR2E513JQ
BS 711 733 RR2G081JQ
BS 734 734 RR2E513JQ
BS 735 746 RR2G081JQ
BS 747 747 RR2E513JQ
BS 748 795 RR2G081JQ
BS 796 796 RR2E513JQ
BS 797 801 RR2G081JQ
BS 802 802 RR2E513JQ
BS 803 828 RR2G081JQ

RD RR2G081JQ 828 0 0
CGTGAAAAAACTTCTCCAAATATGCATTGTAATATCCATTCATAAGTCTTATTTTCTGAA
AAAAAATCTCATGTTATGAACAGTACATGGATATCTTCAATTCTGAAACACTGATATAAG
AACACTATAAAGAGTGCGAAACCTGATGAGAACCCAAAAAAAACAAATCAATGCTCGTCT
TCATCACTGCCATAGTTCTGGAACAAAGATGCCAACCCGGCGTTAGCCACAACGTCACTC
TTCTTCTCCTCTGGTTTTGCAGGAGCTGGAGTCGTAAAAGTTGTTGGTTGAGTTTGCTTC
TTGATGACTGTTATGTGAATGGATTTGAAGGGTTGCTTGCTGGTAGCTTGCTTCTTGGGC
TGCTTCGGGTTATCTGCAGATGAATTAGTTAAAATATCTGTGGGGTTGCTTGGACTTTCT
TCTGATGCCTTTCTCTTCTTTGAAAGATCTGAAGATGATCCTTCTTTCTTCTCCTTCTGA
AAGCTGTCATCATCATCCTCATCATCATCATCATCATCATCTACATCGTCTTCATCTACA
ATTCTCCTAACAACTTCTTTCTGTTTACCAAATATCGACTTAATAACTGCTTCATCTTCT
TCTTCTATTCGTTTGACCTTCTCAGCGCCAGTTCTTTGCAAGGCCTCCAGCATCGCATCT
ACGCTCACAGTAGCGTGTCTAGACTTCATCGATTTCATTTCATCAAGAGTGGCTATAATG
TCCATTTCCCTTT*GGAATCCAAAGTTCGGTTCTACAAAGACTTCATAGCGTCCCCCATC
TCCTCCGCATCTCTTTTCTGT*GTTCCTTATCAACCTCCTCGTCTCAG

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2E513JQ 797 0 0
GCATTGTAATATCCATTCATAAGTCTTATTTTCTGAAAAAAAAACTCATGTTATGAACAG
TACATGGATATCTTCAATTCTGAAACACTGATATAAGAACACTATAAAGAGTGCGAAACC
TGATGAAAACCCAAAAAAAA*AAATCAATCCTCGTCTTCATCACTGCCATAGTTCTGGAA
CAAAGATGCCAACCCGGCGTTAGCCACAACGTCACTCTTCTTCTCCTCTGGTTTTGCAGG
AGCTGGAGTCGTAAAAGTTGTTGGTTGAGTTTGCTTCTTGATGACTGTTATGTGAATGGA
TTTGAAGGGTTGCTTGCTGGTAGCTTGCTTCTTGGGCTGCTTCGGGTTATCTGCAGATGA
ATTAGTTAAAATATCTGTGGGGTTGCTTGGACTTTCTTCTGATGCCTCTCTCTTCTTTGA
AAGATCTGAAGATGATCCTTCTTTCTTCTCCTTCTGAAAGCTGTCATCATCATCCTCATC
ATCATCATCATCTTCATC******GTCTTCATCTACAATTCTCCTAACAACTTCTTTCTG
TTTACCAAATATCGACTTAATAACTGCTTCATCCTCTTCTTCTATTCGTTTGACCTTCTC
AGCGCCAGTTCTTTGCAAGGCCTCCAGCATCGCATCTACGCTCACAGTAGCGTGTCTAGA
CTTCATTGATTTCATTTCATCAAGAGCGGCTGTAATGTCCATTTCCCTTTTGGAATCCAA
AGTCCGGTTCTCCAAAGACTTCATAGCGTCCCCCATCTCCTCCGCATCTCTTCTCTGTTG
TTCCTTATCAACCTCCT

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 4

CO CL2580Contig1 591 4 11 U
GGACATCAACAAAACCCTAAACCCATTTGCACACTCTCTCTCTCTCAACAGTCCCACCGT
TCTTCTCCAAATTCTCCGACGGGCGACCATTGATATAGGATAGCGAGGATGACGCTAGGG
TTGTTATCGGCGATTGGAAGATCTTTTCGGCGGAAGAGAGCGTCGTCGCTTGATATTCTC
TCTCCCAAACGAGCTCCAAGAAACTTCTACAAGGGCAAAAACTGCAAATCTACTGGTTTC
AACACCTCAAAAGGAGGATATGTTGTGCAGCAAGATAAATTGCCAAACTACGTAATCCCT
GATCTGACGGGCTTTAAGCTGAAACCATATGTATCTCAGTGTCCTGTAGAGGTCAACAAA
ACTACTGGGTCAACTGAAGCTTCCAAGTGAATAAGTCAGAAGAAATATGTTCCAGGTCTT
ATTAAGCTTGAGCAGTGTGTTCTGAGAAATTCGTCTTCTACTTCTTTAGTCCTTTTTTGT
TTTTACAAGGACTTCAAGCAATTTATCACAACTTTTAGGTTATGATACATATAAGGATTG
CTTCAGAGCGCCATCGATCCAAATTTCCCATTGCTCTCCACTCCAGTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AM32JQ C 1
AF RR2F179JQ C 60
AF RR2F179TF U 45
AF RR2AM32TF U 1
BS 1 46 RR2AM32TF
BS 47 87 RR2F179TF
BS 88 88 RR2AM32TF
BS 89 328 RR2F179TF
BS 329 329 RR2AM32TF
BS 330 413 RR2F179TF
BS 414 414 RR2AM32TF
BS 415 460 RR2F179TF
BS 461 461 RR2AM32TF
BS 462 569 RR2F179TF
BS 570 591 RR2AM32TF

RD RR2AM32JQ 591 0 0
GGACATCAACAAAACCCTAAACCCATTTGCACACTCTCTCTCTCTCAACAGTCCCACCGT
TCTTCTCCAAATTCTCCGACGGGCGACCATTGATATAGGATAGCGAGGATGACGCTAGGG
TTGTTATCGGCGATTGGAAGATCTTTTCGGCGGAAGAGAGCGTCGTCGCTTGATATTCTC
TCTCCCAAACGAGCTCCAAGAAACTTCTACAAGGGCAAAAACTGCAAATCTACTGGTTTC
AACACCTCAAAAGGAGGATATGTTGTGCAGCAAGATAAATTGCCAAACTACGTAATCCCT
GATCTGACGGGCTTTAAGCTGAAACCATATGTATCTCAGTGTCCTGTAGAGGTCAACAAA
ACTACTGGGTCAACTGAAGCTTCCAAGTGAATAAGTCAGAAGAAATATGTTCCAGGTCTT
ATTAAGCTTGAGCAGTGTGTTCTGAGAAATTCGTCTTCTACTTCTTTAGTCCTTTTTTGT
TTTTACAAGGACTTCAAGCAATTTATCACAACTTTTAGGTTATGATACATATAAGGATTG
CTTCAGAGCGCCATCGATCCAAATTTCCCATTGCTCTCCACTCCAGTTTCC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2F179JQ 510 0 0
TTT
TTCTCCAAATTTTCCGACGGGCGACGATTGATATAGGATAGCGAGGATGACGCTAGGGTT
GTTATCGGCGATTGGAAGATCTTTTCGGCGGAAGAGAGCGTCGTCGCTTGATATTCTCTC
TCCCAAACGAGCTCCAAGAAACTTCTACAAGGGCAAAAACTGCAAATCTACTGGTTTCAA
CACCTCAAAAGGAGGATATGTTGTGCAGCAAGATAAATTGCCAAACTACGTAATCCCTGA
TCTGACGGGCTTTAAGCTGAAACCATGTGTATCTCAGTGTCCTGTAGAGGTCAACAAAAC
TACTGGGTCAACTGAAGCTTCCAAGTGAATAAGTCAGAAGAAATATGTTCCGGGTCTTAT
TAAGCTTGAGCAGTGTGTTCTGAGAAATTCGTCTTCTATTTCTTTAGTCCTTTTTTGTTT
TTACAAGGACTTCAAGCAATTTATCACAACTTTTAGGTTATGATACATATAAGGATTGCT
TCAGAGCGCCATCGATCCAAATTTCCC

QA 4 510 4 510
DS 

RD RR2F179TF 525 0 0
GG
AACAGTCCCACCGTTCTTCTCCAAATTCTCCGACGGGCGACGATTGATATAGGATAGCGA
GGATGACGCTAGGGTTGTTATCGGCGATTGGAAGATCTTTTCGGCGGAAGAGAGCGTCGT
CGCTTGATATTCTCTCTCCCAAACGAGCTCCAAGAAACTTCTACAAGGGCAAAAACTGCA
AATCTACTGGTTTCAACACCTCAAAAGGAGGATATGTTGTGCAGCAAGATAAATTGCCAA
ACTACGTAATCCCTGATCTGACGGGCTTTAAGCTGAAACCATGTGTATCTCAGTGTCCTG
TAGAGGTCAACAAAACTACTGGGTCAACTGAAGCTTCCAAGTGAATAAGTCAGAAGAAAT
ATGTTCCGGGTCTTATTAAGCTTGAGCAGTGTGTTCTGAGAAATTCGTCTTCTATTTCTT
TAGTCCTTTTTTGTTTTTACAAGGACTTCAAGCAATTTATCACAACTTTTAGGTTATGAT
ACATATAAGGATTGCTTCAGAGCGCCATCGATCCAAATTTCCC

QA 3 525 3 525
DS 

RD RR2AM32TF 591 0 0
GGACATCAACAAAACCCTAAACCCATTTGCACACTCTCTCTCTCTCAACAGTCCCACCGT
TCTTCTCCAAATTCTCCGACGGGCGACCATTGATATAGGATAGCGAGGATGACGCTAGGG
TTGTTATCGGCGATTGGAAGATCTTTTCGGCGGAAGAGAGCGTCGTCGCTTGATATTCTC
TCTCCCAAACGAGCTCCAAGAAACTTCTACAAGGGCAAAAACTGCAAATCTACTGGTTTC
AACACCTCAAAAGGAGGATATGTTGTGCAGCAAGATAAATTGCCAAACTACGTAATCCCT
GATCTGACGGGCTTTAAGCTGAAACCATATGTATCTCAGTGTCCTGTAGAGGTCAACAAA
ACTACTGGGTCAACTGAAGCTTCCAAGTGAATAAGTCAGAAGAAATATGTTCCAGGTCTT
ATTAAGCTTGAGCAGTGTGTTCTGAGAAATTCGTCTTCTACTTCTTTAGTCCTTTTTTGT
TTTTACAAGGACTTCAAGCAATTTATCACAACTTTTAGGTTATGATACATATAAGGATTG
CTTCAGAGCGCCATCGATCCAAATTTCCCATTGCTCTCCACTCCAGTTTCC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 4

CO CL2581Contig1 1291 4 5 U
GGAGAAACAAACATAAAATGCATTCAAATGGTTCATTCACATGATTCATCCAAATGGAGA
AACAAACATGACCAAAAATTTGAATGGATCATTTAGATGGATCACACAAATGGAACAGCT
GAATGGAGATTAGAAATAGAAAAACAAACAGGGCCTAAGAATCTGAAATCAATTAAGATT
CACCACTCAGAAGGATATGAGATAAAAGTGATGAACTAAGCAAGGGAGAAAATAGCATAC
ATGAGGAAATGTCTCACACAACAGCTTATTCACATGAGATGTTGTCTTCTCTAACCATTC
CTTTGTACGTTCAACACGAAAGGAGTCACCACTCAGTTTCTGACTGGATTTTTCGTGTAC
ATTGTTGGTTTTAACAATCTCTCGGCTTATAGTTTCTGTCAGGCCGTCGCTCTGTCCTTG
AGATTTCACTGTCATAGAACGAAGCTCGTCCAAAACTGAGTGTGTGTGTGTGTGACTTAC
ACCAGCTTCAATGAAGTTATCATTCTTAATCCCAATCATCTGAGCAATCTGATGAGAGTA
ATCTTCAACCTCATCAAACATAGGAGACGCGGAACGGAAAGAGATCTGATCATCATCCAT
CATCA***TCCTCTTGTTGATGCTACCAGAGGTCAACACCTCATCAGCAGTGATCTTCAC
ATTATGATACCATATCACATCTTTACCGGTAGGCCACCTAAGAGGAACCTTGTAATCCAC
AGGAGGTGAGACCAAACACTCCTGTCTCGACCCACAGAACCGATCAAGACTCTCAGAGAG
ATTAAAGCAAGGAACATAGTTCTCAGACTCTTCTATACTATTACAATACTCCAACTCTTT
CCATTTACTAGGACCAGCAGAGATCTCTCCAATATCCAACAAGTCTGAAACGAGCTGCTC
CGGTAACCTCCTGTAGTTGTGAAACACGTGGCCTCTCGAGGAGGTGGAGATGGAGACCGT
CCACCAGAAGGAACCGGCTAGAGCGAGGATCACGATTAGGACCAAACTGATCTTGAGAGA
CAGAAGCATCAACCTGTGTCTGCTCCTTGCGTTGTAAGGTTCGGTTTTGGGAGGAGATTG
AGTATTATTATTAAAGAGGAAAGCGAAAGGGAACCTCAAGGTTAAGTGACTTTCCTTCTC
TTTGTCTTTCATTTGGGAGTCTCTGAGATCGTCGCTGCTGTCGGAGACTCGTACTCCTCC
TGAGGTGCCACGTTGCAGTGGCATTGACATTTTTTTTAGATCCCTTGTTTGTTTTGTGTT
TTGTGTTATTTACAAAACGATGATTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 15 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD30JQ U 293
AF RR2BF54JQ U 1
AF RR2BF54TF C 24
AF RR2BD30TF C 416
BS 1 472 RR2BF54JQ
BS 473 474 RR2BD30JQ
BS 475 847 RR2BF54JQ
BS 848 865 RR2BF54TF
BS 866 1291 RR2BD30TF

RD RR2BD30JQ 289 0 0
AACCATTCCTTTGTACGTTCAACACGAAAGGAGTCACCACTCAGTTTCTGACTGGATTTT
TCGTGTACATTGTTGGTTTTAACAATCTCTCGGCTTATAGTTTCTGTCAGGCCGTCGCTC
TGTCCTTGAGATTTCACTGTCATAGAACGAAGCTCGTCCAAAACTGAGTGTGTGTGTGTG
TGACTTGCACCAGCTTCAATGAAGTTATCATTCTTAATCCCAATCATCTGAGCAATCTGA
TGAGAGTAATTTTCAACCTCATCAAACATAGGAGACGCGGAACGGAAAG

QA 1 289 1 289
DS 

RD RR2BF54JQ 847 0 0
GGAGAAACAAACATAAAATGCATTCAAATGGTTCATTCACATGATTCATCCAAATGGAGA
AACAAACATGACCAAAAATTTGAATGGATCATTTAGATGGATCACACAAATGGAACAGCT
GAATGGAGATTAGAAATAGAAAAACAAACAGGGCCTAAGAATCTGAAATCAATTAAGATT
CACCACTCAGAAGGATATGAGATAAAAGTGATGAACTAAGCAAGGGAGAAAATAGCATAC
ATGAGGAAATGTCTCACACAACAGCTTATTCACATGAGATGTTGTCTTCTCTAACCATTC
CTTTGTACGTTCAACACGAAAGGAGTCACCACTCAGTTTCTGACTGGATTTTTCGTGTAC
ATTGTTGGTTTTAACAATCTCTCGGCTTATAGTTTCTGTCAGGCCGTCGCTCTGTCCTTG
AGATTTCACTGTCATAGAACGAAGCTCGTCCAAAACTGAGTGTGTGTGTGTG**ACTTAC
ACCAGCTTCAATGAAGTTATCATTCTTAATCCCAATCATCTGAGCAATCTGATGAGAGTA
ATCTTCAACCTCATCAAACATAGGAGACGCGGAACGGAAAGAGATCTGATCATCATCCAT
CATCA***TCCTCTTGTTGATGCTACCAGAGGTCAACACCTCATCAGCAGTGATCTTCAC
ATTATGATACCATATCACATCTTTACCGGTAGGCCACCTAAGAGGAACCTTGTAATCCAC
AGGAGGTGAGACCAAACACTCCTGTCTCGACCCACAGAACCGATCAAGACTCTCAGAGAG
ATTAAAGCAAGGAACATAGTTCTCAGACTCTTCTATACTATTACAATACTCCAACTCTTT
CCATTTA

QA 1 847 1 847
DS 

RD RR2BF54TF 843 0 0
TCAAATGGTTCATTCACATGAT*CATCCAAATGGAGAAACAAACATGACCAAAAATTTGA
ATGGATCATTTAGATGGATCACACAAATGGAACAGCTGAATGGAGATTAGAAATAGAAAA
ACAAACAGGGC*TAAGAATCTGAAATCAATTAAGATTCACCACTCAGAAGGATATGAGAT
AAAAGTGATGAACTAAGCAAGGGAGAAAATAGCATACATGAGGAAATGTCTCACACAACA
GCTTATTCACATGAGATGTTGTCTTCTCTAACCATTCCTTTGTACGTTCAACACGAAAGG
AGTCACCACTCAGTTTCTGACTGGATTTTTCGTGTACATTGTTGGTTTTAACAATCTCTC
GGCTTATAGTTTCTGTCAGGCCGTCGCTCTGTCCTTGAGATTTCACTGTCATAGAACGAA
GCTCGTCCAAAACTGAGTGTGTGTGTGTG**ACTTACACCAGCTTCAATGAAGTTATCAT
TCTTAATCCCAATCATCTGAGCAATCTGATGAGAGTAATCTTCAACCTCATCAAACATAG
GAGACGCGGAACGGAAAGAGATCTGATCATCATCCATCATCA***TCCTCTTGTTGATGC
TACCAGAGGTCAACACCTCATCAGCAGTGATCTTCACATTATGATACCATATCACATCTT
TACCGGTAGGCCACCTAAGAGGAACCTTGTAATCCACAGGAGGTGAGACCAAACACTCCT
GTCTCGACCCACAGAACCGATCAAGACTCTCAGAGAGATTAAAGCAAGGAACATAGTTCT
CAGACTCTTCTATACTATTACAATACTCCAACTCTTTCCATTTACTAGGACCAGCAGAGA
TC
C

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR2BD30TF 876 0 0
TGTCTGAGA
TTCACTGTCATAGAACGAAGCTCGTCCAAA*CTGAGTGTGTGTGTGTGTGACT*GCACCA
GCTTCAATGAAGTTATCATTCTTAATCCCAATCATCTGAGCAATCTGATGAGAGTAATCT
TCAACCTCATCAAACATAGGAGACGCGGAACGGAAAGAGATCTGATCATCATCCATCATC
ATCATCCTCTTGTTGATGCTACCAGAGGTCAACACCTCATCAGCAGTGATCTTCACATTA
TGATACCATATCACATCTTTACCGGTAGGCCACCTAAGAGGAACCTTGTAATCCACAGGA
GGTGAGACCAAACACTCCTGTCTCGACCCACAGAACCGATCAAGACTCTCAGAGAGATTA
AAGCAAGGAACATAGTTCTCAGACTCTTCTATACTATTACAATACTCCAACTCTTTCCAT
TTACTAGGACCAGCAGAGATCTCTCCAATATCCAACAAGTCTGAAACGAGCTGCTCCGGT
AACCTCCTGTAGTTGTGAAACACGTGGCCTCTCGAGGAGGTGGAGATGGAGACCGTCCAC
CAGAAGGAACCGGCTAGAGCGAGGATCACGATTAGGACCAAACTGATCTTGAGAGACAGA
AGCATCAACCTGTGTCTGCTCCTTGCGTTGTAAGGTTCGGTTTTGGGAGGAGATTGAGTA
TTATTATTAAAGAGGAAAGCGAAAGGGAACCTCAAGGTTAAGTGACTTTCCTTCTCTTTG
TCTTTCATTTGGGAGTCTCTGAGATCGTCGCTGCTGTCGGAGACTCGTACTCCTCCTGAG
GTGCCACGTTGCAGTGGCATTGACATTTTTTTTAGATCCCTTGTTTGTTTTGTGTTTTGT
GTTATTTACAAAACGATGATTCTTTCC

QA 10 876 10 876
DS 



AS 2 4

CO CL2582Contig1 629 2 2 U
GGGTCGCCGCAAAGAAGAGGGGAGTACGCAAAACAGGGTTGAGAAACTCTTTCCTGCAAC
ATGACTTTCAAGCGCAGGAACGGTGGTAGGAACAAGCACAACCGTGGTCACGTGAACCCA
ATCAGGTGTTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCTAAGGATAAGGCGATTAAGAGATTCATC
GTCAGGAACATCGTTGAGCAAGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCTAGTGTCTACGAT
GGTTACACTCTCCCAAAGTTGTACGCCAAGACGCAGTACTGTGTTTCGTGTGCTATCCAC
TCTCACGTTGTCAGAGTTCGATCCCGCACCAACCGTAGAGTTCGCACCCCTCCTCCCCGT
TTTGTCAGACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGACAGCCTGGTCAGGCTCCTCGCCCT
GCTGGTGGTGCTCCAGCTGCTCCTCGTACCTGAAGACTGCAAGAAGCTGGCTATCAAAAA
CTTTCTATATTCTAGTCTCAGTCTTGTCTTGGAGTTTTTGAAGATTTTTTTGGTGTTTGG
TTAAAGATAATTTTGAATGCTTTGAGACTTTTTTTATTTTTGACATTGGCATTTCCTCCC
TGTTCTATTCAATTTTTGTGCGTCTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BI18JQ C 1
AF RR2BI18TF U 1
BS 1 19 RR2BI18JQ
BS 20 629 RR2BI18TF

RD RR2BI18JQ 629 0 0
GGGTCGCCGCAAAGAAGAGGGGAGTACGCAAAACAGGGTTGAGAAACTCTTTCCTGCAAC
ATGACTTTCAAGCGCAGGAACGGTGGTAGGAACAAGCACAACCGTGGTCACGTGAACCCA
ATCAGGTGTTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCTAAGGATAAGGCGATTAAGAGATTCATC
GTCAGGAACATCGTTGAGCAAGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCTAGTGTCTACGAT
GGTTACACTCTCCCAAAGTTGTACGCCAAGACGCAGTACTGTGTTTCGTGTGCTATCCAC
TCTCACGTTGTCAGAGTTCGATCCCGCACCAACCGTAGAGTTCGCACCCCTCCTCCCCGT
TTTGTCAGACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGACAGCCTGGTCAGGCTCCTCGCCCT
GCTGGTGGTGCTCCAGCTGCTCCTCGTACCTGAAGACTGCAAGAAGCTGGCTATCAAAAA
CTTTCTATATTCTAGTCTCAGTCTTGTCTTGGAGTTTTTGAAGATTTTTTTGGTGTTTGG
TTAAAGATAATTTTGAATGCTTTGAGACTTTTTTTATTTTTGACATTGGCATTTCCTCCC
TGTTCTATTCAATTTTTGTGCGTCTTACC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2BI18TF 629 0 0
GGGTCGCCGCAAAGAAGAG
GGGAGTACGCAAAACAGGGTTGAGAAACTCTTTCCTGCAACATGACTTTCAAGCGCAGGA
ACGGTGGTAGGAACAAGCACAACCGTGGTCACGTGAACCCAATCAGGTGTTCCAACTGCG
GGAAATGCTGTCCTAAGGATAAGGCGATTAAGAGATTCATCGTCAGGAACATCGTTGAGC
AAGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCTAGTGTCTACGATGGTTACACTCTCCCAAAGT
TGTACGCCAAGACGCAGTACTGTGTTTCGTGTGCTATCCACTCTCACGTTGTCAGAGTTC
GATCCCGCACCAACCGTAGAGTTCGCACCCCTCCTCCCCGTTTTGTCAGACGCAAGGAGG
ATGCTCCCAAGCCTGGACAGCCTGGTCAGGCTCCTCGCCCTGCTGGTGGTGCTCCAGCTG
CTCCTCGTACCTGAAGACTGCAAGAAGCTGGCTATCAAAAACTTTCTATATTCTAGTCTC
AGTCTTGTCTTGGAGTTTTTGAAGATTTTTTTGGTGTTTGGTTAAAGATAATTTTGAATG
CTTTGAGACTTTTTTTATTTTTGACATTGGCATTTCCTCCCTGTTCTATTCAATTTTTGT
GCGTCTTACC

QA 20 629 20 629
DS 



CO CL2582Contig2 595 2 1 U
GGACACTGTCGCCGCAAACAAGCGGGAGTACGCAAAACAGGCTTGAGAAACTCTTTCCTG
CAACATGACTTTCAAGCGCAGGAACGGTGGTAGGAACAAGCACAACCGTGGGCACGTGAA
CCCAATCAGGTGTTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCTAAGGATAAGGCGATTAAGAGACT
CATCGTCAGGAACATCGTTGAGCAAGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCTAGTGTCTA
CGATGGTTACACTCTCCCAAAGTTGTACGCCAAGACGCAGTACTGCGTTTCGTGTGCTAT
CCACTCTCACGTTGTGAGAGTTCGATCCCGCACCAACCGTAGAGTTCGTACCCCTCCTCC
CCGTTTTGTCAGACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGGCAGCCTGGCCAGGCTCCTCG
CCCTGCTGGTGGTGCTCCAGCTGCTCCTCGTACCTGAAGACTGCAAGAAGCTCGCTATCA
AAAACTTTCTTTTTCTAGTCTCAGTCTTGTCTGGAGTTTTTTGAAGATTTTTTTGGTGTT
TGGTTAAAGATAATTTTGAATGCTTTGAGACTTTTTTTTATTTGACATTGGCATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DF84JQ C 1
AF RR2DF84TF U 1
BS 1 595 RR2DF84TF

RD RR2DF84JQ 595 0 0
GGACACTGTCGCCGCAAACAAGCGGGAGTACGCAAAACAGGCTTGAGAAACTCTTTCCTG
CAACATGACTTTCAAGCGCAGGAACGGTGGTAGGAACAAGCACAACCGTGGGCACGTGAA
CCCAATCAGGTGTTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCTAAGGATAAGGCGATTAAGAGACT
CATCGTCAGGAACATCGTTGAGCAAGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCTAGTGTTTA
CGATGGTTACACTCTCCCAAAGTTGTACGCCAAGACGCAGTACTGCGTTTCGTGTGCTAT
CCACTCTCACGTTGTGAGAGTTCGATCCCGCACCAACCGTAGAGTTCGTACCCCTCCTCC
CCGTTTTGTCAGACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGGCAGCCTGGCCAGGCTCCTCG
CCCTGCTGGTGGTGCTCCAGCTGCTCCTCGTACCTGAAGACTGCAAGAAGCTCGCTATCA
AAAACTTTCTTTTTCTAGTCTCAGTCTTGTCTGGAGTTTTTTGAAGATTTTTTTGGTGTT
TGGTTAAAGATAATTTTGAATGCTTTGAGACTTTTTTTTATTTGACATTGGCATT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2DF84TF 595 0 0
GGACACTGTCGCCGCAAACAAGCGGGAGTACGCAAAACAGGCTTGAGAAACTCTTTCCTG
CAACATGACTTTCAAGCGCAGGAACGGTGGTAGGAACAAGCACAACCGTGGGCACGTGAA
CCCAATCAGGTGTTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCTAAGGATAAGGCGATTAAGAGACT
CATCGTCAGGAACATCGTTGAGCAAGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCTAGTGTCTA
CGATGGTTACACTCTCCCAAAGTTGTACGCCAAGACGCAGTACTGCGTTTCGTGTGCTAT
CCACTCTCACGTTGTGAGAGTTCGATCCCGCACCAACCGTAGAGTTCGTACCCCTCCTCC
CCGTTTTGTCAGACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGGCAGCCTGGCCAGGCTCCTCG
CCCTGCTGGTGGTGCTCCAGCTGCTCCTCGTACCTGAAGACTGCAAGAAGCTCGCTATCA
AAAACTTTCTTTTTCTAGTCTCAGTCTTGTCTGGAGTTTTTTGAAGATTTTTTTGGTGTT
TGGTTAAAGATAATTTTGAATGCTTTGAGACTTTTTTTTATTTGACATTGGCATT

QA 1 595 1 595
DS 



AS 2 4

CO CL2583Contig1 988 2 2 U
GACATTCCTCACCAAACTCCAAACACATACACCCACACGTACGCACACACAACCATGTCT
CCTTTCAAAATATTCTTCTTCACAGCTCTCCTCGCGGCGGCGTTTTCAGCCTCCACCGCT
GACTTCAACAGCGACGTCAACGTGGCTTGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATACTCAACAAC
GGCCAGCTTCTTACTCTCACCTTAGACAAATCATCTGGTTCTGGTTTTCAATCCAAAACA
GAGTATTTGTTTGGTAAGATTGATATGCAGATTAAGCTTGTTCCTGGTAACTCAGCAGGC
ACAGTCACAACTTTCTATTTGAAATCGGAAGGAACGACTTGGGATGAGATTGATTTTGAG
TTCTTGGGTAATATGAGTGGAGATCCTTATACTCTACACACCAATGTTTACACTCAAGGT
AAAGGTGATAAAGAGCAACAGTTCCATCTCTGGTTCGACCCAACAGCCAATTTCCACACT
TACTCAATCCTCTGGAATCCTCAAAGAATCATATTAACCGTCGATAACACGCCAATTAGA
GAGTTTAAGAACTCGGAGTCTCTCGGTGTCTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGGATG
TACGCAAGTTTATGGAACGCAGACGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACGGAT
TGGTCCAAAGCTCCATTCACTGCTTCTTACAGGAACATCAAGATCGACGGGTGTGCTCAT
TCAAACGGAAAGTCGTCTTGTACCACACAAAACCAAGCTCTAATTGGTACACGCAAGAAA
TGGATTCAACGAGCCAAGCTAGACTCAGATGGGTTCAGAAGAACTACATGATCTACAATT
ACTGTACGGATACTAAGAGGTTTCCACAGGGAATCCCTCGGGAATGTGCAACACGGTCAT
AGAGGGATCATATACATTTTATCTATTTATCCTCCTCCTCTGCTTTCTTTTTCTTCTATA
TGTATAATGCTCTCCTTCCTCTTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ52TF U 1
AF RR2AJ52JQ C 205
BS 1 741 RR2AJ52TF
BS 742 988 RR2AJ52JQ

RD RR2AJ52TF 746 0 0
GACATTCCTCACCAAACTCCAAACACATACACCCACACGTACGCACACACAACCATGTCT
CCTTTCAAAATATTCTTCTTCACAGCTCTCCTCGCGGCGGCGTTTTCAGCCTCCACCGCT
GACTTCAACAGCGACGTCAACGTGGCTTGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATACTCAACAAC
GGCCAGCTTCTTACTCTCACCTTAGACAAATCATCTGGTTCTGGTTTTCAATCCAAAACA
GAGTATTTGTTTGGTAAGATTGATATGCAGATTAAGCTTGTTCCTGGTAACTCAGCAGGC
ACAGTCACAACTTTCTATTTGAAATCGGAAGGAACGACTTGGGATGAGATTGATTTTGAG
TTCTTGGGTAATATGAGTGGAGATCCTTATACTCTACACACCAATGTTTACACTCAAGGT
AAAGGTGATAAAGAGCAACAGTTCCATCTCTGGTTCGACCCAACAGCCAATTTCCACACT
TACTCAATCCTCTGGAATCCTCAAAGAATCATATTAACCGTCGATAACACGCCAATTAGA
GAGTTTAAGAACTCGGAGTCTCTCGGTGTCTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGGATG
TACGCAAGTTTATGGAACGCAGACGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACGGAT
TGGTCCAAAGCTCCATTCACTGCTTCTTACAGGAACATCAAGATCGACGGGTGTGCTCAT
TCAAACGGAAAGTCGTCTTGT
ACCAC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2AJ52JQ 784 0 0
GACAAATCATCTGGTTCTGGTTTTCAATCCAAAACAGAGTATTTGTTTGGTAAGATTGAT
ATGCAGATTAAGCTTGTTCCTGGTAACTCAGCAGGCACAGTCACAACTTTCTATTTGAAA
TCGGAAGGAACGACTTGGGATGAGATTGATTTTGAGTTCTTGGGTAATATGAGTGGAGAT
CCTTATACTCTACACACCAATGTTTACACTCAAGGTAAAGGTGATAAAGAGCAACAGTTC
CATCTCTGGTTCGACCCAACAGCCAATTTCCACACTTACTCAATCCTCTGGAATCCTCAA
AGAATCATATTAACCGTCGATAACACGCCAATTAGAGAGTTTAAGAACTCGGAGTCTCTC
GGTGTCTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGGATGTACGCAAGTTTATGGAACGCAGAC
GATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACGGATTGGTCCAAAGCTCCATTCACTGCT
TCTTACAGGAACATCAAGATCGACGGGTGTGCTCATTCAAACGGAAAGTCGTCTTGTACC
ACACAAAACCAAGCTCTAATTGGTACACGCAAGAAATGGATTCAACGAGCCAAGCTAGAC
TCAGATGGGTTCAGAAGAACTACATGATCTACAATTACTGTACGGATACTAAGAGGTTTC
CACAGGGAATCCCTCGGGAATGTGCAACACGGTCATAGAGGGATCATATACATTTTATCT
ATTTATCCTCCTCCTCTGCTTTCTTTTTCTTCTATATGTATAATGCTCTCCTTCCTCTTT
TGTC

QA 1 784 1 784
DS 



CO CL2583Contig2 1052 2 4 U
GGACATTCCTCACCAAACTCCAAACACACACACCCACACGTACGCACACACAACCATGTC
TCCTTTCAAAATATTCTTCTTCACAGCTCTCCTCGCGGCGGCGTTTTCAGCCTCCACCGC
TGACTTCAACAGCGACGTCAACGTGGCTTGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATACTTAGCAA
CGGCCAGCTTCTTACTCTCACCTTAGACAAATCATCTGGTTCTGGTTTTCAATCCAAAAC
AGAGTATTTGTTCGGTAAGATTGATATGCAGATTAAGCTTGTTCCTGGCAACTCAGCAGG
CACAGTCACAACTTTCTATTTGAAATCGGAAGGAACGACTTGGGATGAGATTGATTTTGA
GTTCTTGGGTAATATGAGTGGAGATCCTTATACTCTACACACCAATGTTTACACTCAAGG
CAAAGGTGATAAAGAGCAACAGTTCCATCTCTGGTTCGACCCAACAGCAAATTTCCACAC
TTACTCAATCCTCTGGAACCCTCAAAGAATCATACTAACTGTTGATAACACGCCAATAAG
AGAGTTTAAAAACTCGGAGTCTCTCGGTGTCTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGGAT
GTACGCAAGTCTATGGAACGCAGACGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACGGA
TTGGTCCAAAGCTCCATTCACAGCTTCTTACAGGAACATTAAGATCGACGGGTGTGCTCA
TTCAAACGGGAAGTCGGCTTGTGCCTCGACGAAACCAAGCTCTAATTGGTACGCTCAAGA
AATGGATTCAACGAGCCAAGCTAGACTCAGATGGGTTCAGAAGAACTACATGATCTACAA
TTACTGTACGGATACTAAGAGGTTTCCACAGGGAATCCCTAGGGAATGTGCAACAAGGTC
GTAGAGGGATCATATACATTTTATCTATTTATCCTCCTCCTCTGCTTTCTTTCTCTTCTA
TATGTATAATGCTCTCCTTCCTCTTTTGTCAATTGTGTTCGATTCTTTCGATTGTATATC
TTTGTCCAATAAAGCAAATATAAGGTGTGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE43TF U 1
AF RR2EE43JQ C 394
BS 1 505 RR2EE43TF
BS 506 506 RR2EE43JQ
BS 507 654 RR2EE43TF
BS 655 1052 RR2EE43JQ

RD RR2EE43TF 654 0 0
GGACATTCCTCACCAAACTCCAAACACACACACCCACACGTACGCACACACAACCATGTC
TCCTTTCAAAATATTCTTCTTCACAGCTCTCCTCGCGGCGGCGTTTTCAGCCTCCACCGC
TGACTTCAACAGCGACGTCAACGTGGCTTGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATACTTAGCAA
CGGCCAGCTTCTTACTCTCACCTTAGACAAATCATCTGGTTCTGGTTTTCAATCCAAAAC
AGAGTATTTGTTCGGTAAGATTGATATGCAGATTAAGCTTGTTCCTGGCAACTCAGCAGG
CACAGTCACAACTTTCTATTTGAAATCGGAAGGAACGACTTGGGATGAGATTGATTTTGA
GTTCTTGGGTAATATGAGTGGAGATCCTTATACTCTACACACCAATGTTTACACTCAAGG
CAAAGGTGATAAAGAGCAACAGTTCCATCTCTGGTTCGACCCAACAGCAAATTTCCACAC
TTACTCAATCCTCTGGAACCCTCAA*GAATCATACTAACTGTTGATAACACGCCAATAAG
AGAGTTTAAAAACTCGGAGTCTCTCGGTGTCTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGGAT
GTACGCAAGTCTATGGAACGCAGACGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2EE43JQ 659 0 0
TCTACACACCAATGTTTACACTCAAGGCAAAGGTGATAAAGAGCAACAGTTCCATCTCTG
GTTCGACCCAACAGCAAATTTCCACACTTACTCAATCCTCTGGAACCCTCAAAGAATCAT
ACTAACTGTTGATAACACGCCAATAAGAGAGTTTAAAAACTCGGAGTCTCTCGGTGTCTT
GTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGGATGTACGCAAGTCTATGGAACGCAGACGATTGGGC
AACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACGGATTGGTCCAAAGCTCCATTCACAGCTTCTTACAG
GAACATTAAGATCGACGGGTGTGCTCATTCAAACGGGAAGTCGGCTTGTGCCTCGACGAA
ACCAAGCTCTAATTGGTACGCTCAAGAAATGGATTCAACGAGCCAAGCTAGACTCAGATG
GGTTCAGAAGAACTACATGATCTACAATTACTGTACGGATACTAAGAGGTTTCCACAGGG
AATCCCTAGGGAATGTGCAACAAGGTCGTAGAGGGATCATATACATTTTATCTATTTATC
CTCCTCCTCTGCTTTCTTTCTCTTCTATATGTATAATGCTCTCCTTCCTCTTTTGTCAAT
TGTGTTCGATTCTTTCGATTGTATATCTTTGTCCAATAAAGCAAATATAAGGTGTGCCT

QA 1 659 1 659
DS 



AS 2 4

CO CL2584Contig1 751 2 18 U
GGACTTTCCCAAGCTCCACCTACCATTCAGTGAAGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAAGCAA
AAACGATGTCGTCTGAGGCGGAAAAGTCAACAAATTCAGCTCCTCCGGCGACACCGCCGC
CGTATTTCTGGGGAAACATGCCGGAGGAAGAGTACTACACTTCTCAAGGTGTGCGCAACA
CCAAATCCTACTTCGAAACACCCAACGGCAAGCTCTTCACGCAGAGCTTCCTTCCCTTAG
ATGGTGACATCAAAGGAACGGTTTACATGTCTCACGGGTACGGATCCGACACGAGCTGGA
TGTTCCAGAAGATCTGCATGAGTTTCTCCAATTGGGGCTACGCCGTTTTCGCCGCCGATC
TTCTCGGTCACGGCCGTTCCGATGGCATCCGCTGCTACTTGGGTGATATGGAGAAAGTTG
CAGCAACATCATTGTCATTCTTTAAGCATGTCCGTTACAGCGAGCCATATAAGCACCTCC
CTGCTTTCCTCTTTGGTGAATCTATGGGAGGTCTCGCCACACTTCTCATGTACTTTCAAT
CCGAACCGGATACTTGGACCGGTTTGATCTTTTCGGCTCCTCTCTTTGTTATCCCGGAGG
ATATGAAACCAAGCAAGACTCATCTTTTCGCCTACGGTCTCCTCTTTGGCTTGGCTGACA
CGTGGGCTGCAATGCCGGATAACAAGATGGTTGGCAAAGCTATCCATGACCCGGAAAGCT
CAAAATCATCGCAGCTGATCCACAAAGATAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT08TF U 1
AF RR2C157TF U 1
BS 1 134 RR2BT08TF
BS 135 135 RR2C157TF
BS 136 196 RR2BT08TF
BS 197 197 RR2C157TF
BS 198 355 RR2BT08TF
BS 356 356 RR2C157TF
BS 357 386 RR2BT08TF
BS 387 387 RR2C157TF
BS 388 422 RR2BT08TF
BS 423 423 RR2C157TF
BS 424 460 RR2BT08TF
BS 461 461 RR2C157TF
BS 462 607 RR2BT08TF
BS 608 608 RR2C157TF
BS 609 634 RR2BT08TF
BS 635 635 RR2C157TF
BS 636 671 RR2BT08TF
BS 672 751 RR2C157TF

RD RR2BT08TF 671 0 0
GGACTTTCCCAAGCTCCACCTACCATTCAGTGAAGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAAGCAA
AAACGATGTCGTCTGAGGCGGAAAAGTCAACAAATTCAGCTCCTCCGGCGACACCGCCGC
CGTATTTCTGGGGAGACATGCCGGAGGAAGAGTACTACACTTCTCAAGGTGTGCGCAACA
CCAAATCCTACTTCGAGACACCCAACGGCAAGCTCTTCACGCAGAGCTTCCTTCCCTTAG
ATGGTGACATCAAAGGAACGGTTTACATGTCTCACGGGTACGGATCCGACACGAGCTGGA
TGTTCCAGAAGATCTGCATGAGTTTCTCCAATTGGGGCTACGCCGTTTTCGCCGCTGATC
TTCTCGGTCACGGCCGTTCCGATGGCGTCCGCTGCTACTTGGGTGATATGGAGAAAGTTG
CATCAACATCATTGTCATTCTTTAAGCATGTCCGTTACAGTGAGCCATATAAGCACCTCC
CTGCTTTCCTCTTTGGTGAATCTATGGGAGGTCTCGCCACACTTCTCATGTACTTTCAAT
CCGAACCGGATACTTGGACCGGTTTGATCTTTTCGGCTCCTCTCTTTGTTATCCCGGAGG
ATATGAAGCCAAGCAAGACTCATCTTTTCGCCTATGGTCTCCTCTTTGGCTTGGCTGACA
CGTGGGCTGCA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2C157TF 751 0 0
GGACTTTCCCGAGCTCCACCTACCATTCAGTGAAGAAGAA**AAAAGAAGAAGAAAGCGA
AAACGATGTCGTCTGAGGCGGAAAAGTCAACAAATTCAGCTCC***GGCGACACCGCCGC
CGTATTTCTGGGGAAACATGCCGGAGGAAGAGTACTACACTTCTCAAGGTGTGCGCAACA
CCAAATCCTACTTCGAAACACCCAACGGCAAGCTCTTCACGCAGAGCTTTCTTCCCTTAG
ATGGTGACATCAAAGGAACGGTTTACATGTCTCACGGGTACGGATCCGACACGAGCTGGA
TGTTCCAGAAGATCTGCATGAGTTTCTCCAATTGGGGCTACGCCGTTTTCGCCGCCGATC
TTCTCGGTCACGGCCGTTCCGATGGCATCCGCTGCTACTTGGGTGATATGGAGAAAGTTG
CAGCAACATCATTGTCATTCTTTAAGCATGTCCGTTACAGCGAGCCGTATAAGCATCTCC
CTGCTTTCCTCTTTGGTGAATCTATGGGAGGTCTTGCCACACTTCTCATGTACTTTCAAT
CCGAACCGGATACTTGGACCGGTTTGATCTTTTCGGCTCCTCTCTTTGTTATCCCGGAGG
ATATGAAACCAAGCAAGACTCATCTTTTCGCCTACGGTCTCCTCTTTGGCTTGGCTGACA
CGTGGGCTGCAATGCCGGATAACAAGATGGTTGGCAAAGCTATCCATGACCCGGAAAGCT
CAAAATCATCGCAGCTGATCCACAAAGATAC

QA 1 751 1 751
DS 



CO CL2584Contig2 831 2 20 U
CAAAAGGGATTCTGTAATCCATGATATATATGTTTTTATTACATCCCAAAAGTCATGTTC
TTGGATTAAACACAAACAACATAACAACTCGAATCAACAACCACTATGAACCATGATATC
ATCAACGCACATTTCTCTTCACAAAATGTAACTTTCAAGCTGCTTTTACTTAGATCCATA
CCTCTCAACCCTCTCATCAATCCACTCACGCATATCCTTCAACACGATCGCAACATTCTC
ATCTGGCTCTCCTTGAATCAAAGAATGGTACATCCCATCATAAAGCTTCAGTGTTTTATC
AGAGCTAGATGCCTTCTCATATAGTAGCTTTGACGATGAAGGACACGTCACTCCATCAGC
TGTCCCGTGCACCGTCAGAAACGGAATAGTTACTCTCCCGAAATTCTCCTGCACGTATAG
AGTCTTCCTTAGTAACTCTCTCATTGTTCCCACTCTAGGCTTCCCTGTGTATCTTTGTGG
ATCAGCTGCGATGATCTTGAGCTTTTCCGGGTCATGGATAGCTTTGCCAACCATCTTGTT
ATCCGGCATTGCAGCCCACGTGTCAGCCAAGCCAAAGAGGAGACCATAGGCGAAAAGATG
AGTCTTGCTTGGCTTCATATCCTCCGGGATAACAAAGAGAGGAGCCGAAAAGATCAAACC
GGTCCAAGTATCCGGTTCGGATTGAAAGTACATGAGAAGTGTGGCAAGACCTCCCATAGA
TTCACCAAAGAGGAAAGCAGGGAGGTGCTTATATGGCTCACTGTAACGGACATGCTTAAA
GATGACAATGATGTTGATGCAACTTTCTCCATATCACCCAAGTAGCAGCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C157JQ U 1
AF RR2BT08JQ U 17
BS 1 121 RR2C157JQ
BS 122 124 RR2BT08JQ
BS 125 207 RR2C157JQ
BS 208 208 RR2BT08JQ
BS 209 261 RR2C157JQ
BS 262 262 RR2BT08JQ
BS 263 302 RR2C157JQ
BS 303 303 RR2BT08JQ
BS 304 357 RR2C157JQ
BS 358 358 RR2BT08JQ
BS 359 434 RR2C157JQ
BS 435 435 RR2BT08JQ
BS 436 495 RR2C157JQ
BS 496 496 RR2BT08JQ
BS 497 585 RR2C157JQ
BS 586 586 RR2BT08JQ
BS 587 612 RR2C157JQ
BS 613 613 RR2BT08JQ
BS 614 730 RR2C157JQ
BS 731 831 RR2BT08JQ

RD RR2C157JQ 730 0 0
CAAAAGGGATTCTGTAATCCATGATATATATGTTTTTATTACATCCCAAAAGTCATGTTC
TTGGATTAAACACAAACAACATAACAACTCGAATCAACAACCACTATGAACCATGATATC
A***ACGCACATTTCTCTTCACAAAATGTAACTTTCAAGCTGCTTTTACTTAGATCCATA
CCTCTCAACCCTCTCATCAATCCACTCTCGCATATCCTTCAACACGATCGCAACATTCTC
ATCTGGCTCTCCTTGAATCAATGAATGGTACATCCCATCATAAAGCTTCAGTGTTTTATC
AGCGCTAGATGCCTTCTCATATAGTAGCTTTGACGATGAAGGACACGTCACTCCATCTGC
TGTCCCGTGCACCGTCAGAAACGGAATAGTTACTCTCCCGAAATTCTCCTGCACGTATAG
AGTCTTCCTTAGTATCTCTCTCATTGTTCCCACTCTAGGCTTCCCTGTGTATCTTTGTGG
ATCAGCTGCGATGATTTTGAGCTTTTCCGGGTCATGGATAGCTTTGCCAACCATCTTGTT
ATCCGGCATTGCAGCCCACGTGTCAGCCAAGCCAAAGAGGAGACCGTAGGCGAAAAGATG
AGTCTTGCTTGGTTTCATATCCTCCGGGATAACAAAGAGAGGAGCCGAAAAGATCAAACC
GGTCCAAGTATCCGGTTCGGATTGAAAGTACATGAGAAGTGTGGCAAGACCTCCCATAGA
TTCACCAAAG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2BT08JQ 815 0 0
CCTGATATATATAAGTTTA
TTATTACATCCCAAAAGTCATGTTCTTGGATTAAACACAAACAACATAACAACTCGAATC
AACAACGACTATGAACCATGATATCATCAATGCACATTTCTCTTCACAAAATGTAACTTT
CAAGCTGCTTTTACTTAGATCCATACCTCTCAACCCTCTCATCAATCCACTCACTCATAT
CCTTCAACACGATCGCAACATTCTCATCTGGCTCTCCTTGAATCAGAGAATGGTACATCC
CATCATACAGCTTCAGTGTTTTATCAGAGCTAGATGCCTTCTCATATAGTAGCTTTGACG
ATGAAGGACACGTCACTCCATCAGCTGTCCCGTGCACCGTCAGAAACGGAATAGTTACTC
TCCCGAAGTTCTCCTGCACGTATAGAGTCTTCCTTAGTAACTCTCTCATTGTTCCCACTC
TAGGCTTCCCTGTGTATCTTTGTGGGTTAGCTGTGATGATCTTGAGCTTTTCCGGGTCAT
GGATAGCTTTGCCAACCATCTTGTTATCCGGCATTGCAGCCCACGTGTCAGCCAAGCCAA
AGAGGAGACCATAGGCGAAAAGATGAGTCTTGCTTGGCTTCATATCCTCCGGGATAACAA
AGAGAGGAGCCGAAAAGATCAAACCGGTCCAAGTATCCGGTTCGGATTGAAAGTACATGA
GAAGTGTGGCGAGACCTCCCATAGATTCACCAAAGAGGAAAGCAGGGAGGTGCTTATATG
GCTCACTGTAACGGACATGCTTAAAGATGACAATGATGTTGATGCAACTTTCTCCATATC
ACCCAAGTAGCAGCGG

QA 20 815 20 815
DS 



AS 1 4

CO CL2585Contig1 1355 4 19 U
TTTTTTTCAATAAACAAACAACAATAATATTACGAAACCCAAAAACCCTAAGGTTACTTG
CATAATAAAAAACATGAAAGAATTGTTAAAGTGAGAATTGAAGATAGAGGACGAACACAC
AAAATATACAGAAGAAAACAAACAAATTTAGGGGGTTTTTGAAGAATTCTCATTCATCAA
CGTCCATCTACGGAAGTGAAAGACTCTGCGAATCCGTAAGGTCTAGAGGGAATACTCATC
TGCGTGTTACCCAAGCTAGGTAAAAGCGAGGAAGTAGATGATTCAAGATCACTTCTTCCT
TCATAAGCTTGCCATTTCTTAAGAGCCTGAGGCAAAGACATGTCGAGATCGATGCCGTAA
ATGTCCTCTGGATTCTGATCAGCCGGTTTCCATAGCTCGACGAGCGAGGACAGAATGTTG
ACTGCGTGTCCCATGTCTGGTCTCTGGTATGGCTCACGTGCACAGCAATGGCCCGCTAGC
TCAGCAACGGTGTGAACGCTGGCCAGGGTTTCTTCGTCGAGGTCTATTGTCGGGTCGATC
GCTTTCTTGAATGATGATTCCTTGTTGATGAACATTCGTTTGAAATAGGAGACCAAGTGA
ATGCTCTCTTCCGGTTGCGATTCGTCTAGAGACTTCCTTCCTGTTATGAGTTCCATCAGA
ATCACTCCAAAGCTGTACACGTCGACCTTTGTGGTTACTCGACCCGTAACTGCATATTCG
GGTGCCAAGTAACCAAATGTTCCAGCAATTCTAGTCTCAATAGATCCTTTCCCTTCAGGA
GCAAGACGAACAAGTCCAAAATCTGCAACCTTAGCCCTCATATCATCTCCAAGAAGAATG
TTTGAAGGCTTAAGATCTCTGTGGATAAAGCTCTGATGAGCTAATCCATGTAGATACTCC
ACACCTCTCGCCACATCCAACGCCAAAGTCAACCTCTGTTTCCACAACAGAGGCTTAAGC
CCTTCCTCCGACCACTCGAACAGATGCCTACTCAACGTACCTTGAGGCATATACTCGTAC
ACAAGCAACTTCTCATTCCCACCAAGACAATAACCGAGAAGCGTAACCAAATGTCGATGC
CTAACCTTCGTCAAAACCGCGATCTCCGACTTGAACTCCGCGAAACCTTTGCCAGCAATC
ACTCCGTTCTCCATCCTCTTAACCGCAATCTTCGTTCCATCGTGCAGTTCGCCTTTATAC
ACGACCCCGAAACCTCCTTGTCCGAGAATGTTGTCCTGGCTGAAGTTGTTAGTCACGGAA
CGAAGCACTTGGATTGAGATCAACATGTTTCCGCTTCCACCATCTGTATATTATCTCCCA
CCTCGCTCGTACCGGGAAGCGTGTAGGTCTCGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DB79JQ U 7
AF RR2DB79TF C 1
AF RR2BL45JQ U 88
AF RR2BL45TF C 645
BS 1 11 RR2DB79TF
BS 12 133 RR2DB79JQ
BS 134 134 RR2BL45JQ
BS 135 163 RR2DB79JQ
BS 164 164 RR2BL45JQ
BS 165 225 RR2DB79JQ
BS 226 226 RR2BL45JQ
BS 227 276 RR2DB79JQ
BS 277 277 RR2BL45JQ
BS 278 322 RR2DB79JQ
BS 323 323 RR2BL45JQ
BS 324 336 RR2DB79JQ
BS 337 337 RR2BL45JQ
BS 338 401 RR2DB79JQ
BS 402 402 RR2BL45JQ
BS 403 632 RR2DB79JQ
BS 633 633 RR2DB79TF
BS 634 843 RR2BL45JQ
BS 844 1355 RR2BL45TF

RD RR2DB79JQ 629 0 0
CAATA
AAACAAACAACAATAATATTACGAAACCCAAAAACCCTAAGGTTACTTGCATAATAAAAA
ACATGAAAGAATTGTTAAAGTGAGAATTGAAGATAGAGGACGAACACACAAAATATACAG
AAAAAAACAAACAAATTTAGGGGGTTTTTGAAAAATTCTCATTCATCAACGTCCATCTAC
GGAAGTGAAAGACTCTGCGAATCCGTAAGGTCTAAAGGGAATACTCATCTGCGTGTTACC
CAAGCTAGGTAAAAGCGAGGAAGTAAATGATTCAAGATCACTTCTTCCTTCATAAGCTTG
CCATTTCTTAAAAGCCTGAGGCAAAAACATGTCGAGATCGATGCCGTAAATGTCCTCTGG
ATTCTGATCAGCCGGTTTCCATAGCTCGACAAGCGAGGACAGAATGTTGACTGCGTGTCC
CATGTCTGGTCTCTGGTATGGCTCACGTGCACAGCAATGGCCCGCTAGCTCAGCAACGGT
GTGAACGCTGGCCAGGGTTTCTTCGTCGAGGTCTATTGTCGGGTCGATCGCTTTCTTGAA
TGATGATTCCTTGTTGATGAACATTCGTTTGAAATAGGAGACCAAGTGAATGCTCTCTTC
CGGTTGCGATTCGTCTAGAGA
CTT

QA 6 626 6 626
DS 

RD RR2DB79TF 712 0 0
TTTTTTTCAATAAACAAACAACAATAATATTACGAAACCCAAAAACCCTAAGGTTACTTG
CATAATAAGAAACATGAAAGAATTGTTAAAGTGAGAATTGAAGATAGAGGACGAACACAC
AAAATATACAGAAGAAAACAAACAAATTTAGGGGGTTTTTGAAGAATTCTCATTCATCAA
CGTCCATCTACGGAAGTGAAAGACTCTGCGAATCCGTAAGGTCTAGAGGGAATACTCATC
TGCGTGTTACCCAAGCTAGGTAAAAGCGAGGAAGTAGATGATTCAAGATCACTTCTTCCT
TCATAAGCTTGCCATTTCTTAAGAGCCTGAGGCAAAGACATGTCGAGATCGATGCCGTAA
ATGTCCTCTGGATTCTGATCAGCCGGTTTCCATAGCTCGACGAGCGAGGACAGAATGTTG
ACTGCGTGTCCCATGTCTGGTCTCTGGTATGGCTCACGTGCACAGCAATGGCCCGCTAGC
TCAGCAACGGTGTGAACGCTGGCCAGGGTTTCTTCGTCGAGGTCTATTGTCGGGTCGATC
GCTTTCTTGAATGATGATTCCTTGTTGATGAACATTCGTTTGAAATAGGAGACCAAGTGA
ATGCTCTCTTCCGGTTGCGATTCGTCTAGAGACTTCCTTCCTGTTATGAGTTCCATCAGA
ATCACTCCAAAGCTGTACACATCGACCTTTGTGGTTACTCGACCCGTAAC
CC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2BL45JQ 756 0 0
AAAGTGAGAATTGAAGATAGAGGACGAACACACAAA*TATACAGAAGAAAACAAACAAAT
TTGGGGGGGTTTTGAAGAATTCTCATTCATCAACGTCCATCTACGGAAGTGAAAGACTCT
GCGAATCCATAAGGTCTAGAGGGAATACTCATCTGCGTGTTACCCAAGCTAGGTAAAAGC
GACGAAGTAGATGATTCAAGATCACTTCTTCCTTCATAAGCTTGCCATTTCTTAAGAGCC
TGAGGCAAAGACATGTCGAGATCGATGCCGTAAATGTCCTCCGGATTCTGATCAGCCGGT
TTCCACAGCTCGACGAGCGAGGACAGAATGTTGACTGCGTGTCCCATGTCTGGTCTCTGG
TAAGGCTCACGTGCACAGCAATGGCCCGCTAGCTCAGCAACGGTGTGAACGCTGGCCAGG
GTTTCTTCGTCGAGGTCTCTTGTCGGGTCGATCGCTTTCTTGAATGATGATTCCTTGTTG
ATGAACATTCGTTTGAAATAGGAGACCAAGTGAATGCTCTCTTCTGGTTGCGATTCGTCT
AGAGATTTCCTTCCTGTTATGAGTTCCATCAGAATCACTCCAAAGCTGTACACGTCGACC
TTTGTGGTTACTCGACCCGTAACTGCATATTCGGGTGCCAAGTAACCAAATGTTCCAGCA
ATTCTAGTCTCAATAGATCCTTTCCCTTCAGGAGCAAGACGAACAAGTCCAAAATCTGCA
ACCTTAGCCCTCATATCATCTCCAAGAAGAATGTTT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2BL45TF 711 0 0
TATGAGTTCCATCAGAATCACTCCAAAGCTGTACACGTCGACCTTTGTGGTTACTCGACC
CGTAACTGCATATTCGGGTGCCAAGTAACCAAATGTTCCAGCAATTCTAGTCTCAATAGA
TCCTTTCCCTTCAGGAGCAAGACGAACAAGTCCAAAATCTGCAACCTTAGCCCTCATATC
ATCTCCAAGAAGAATGTTTGAAGGCTTAAGATCTCTGTGGATAAAGCTCTGATGAGCTAA
TCCATGTAGATACTCCACACCTCTCGCCACATCCAACGCCAAAGTCAACCTCTGTTTCCA
CAACAGAGGCTTAAGCCCTTCCTCCGACCACTCGAACAGATGCCTACTCAACGTACCTTG
AGGCATATACTCGTACACAAGCAACTTCTCATTCCCACCAAGACAATAACCGAGAAGCGT
AACCAAATGTCGATGCCTAACCTTCGTCAAAACCGCGATCTCCGACTTGAACTCCGCGAA
ACCTTTGCCAGCAATCACTCCGTTCTCCATCCTCTTAACCGCAATCTTCGTTCCATCGTG
CAGTTCGCCTTTATACACGACCCCGAAACCTCCTTGTCCGAGAATGTTGTCCTGGCTGAA
GTTGTTAGTCACGGAACGAAGCACTTGGATTGAGATCAACATGTTTCCGCTTCCACCATC
TGTATATTATCTCCCACCTCGCTCGTACCGGGAAGCGTGTAGGTCTCGCTC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 4

CO CL2586Contig1 638 4 7 U
CTACAAAATCTGGAAAATAGATTGATTGAGAAACTCATACTAGTTATAAAATATAATCTC
ATGACTTTATTACAAAAGAAAGATTGGTGACTAACAAAACCTATTCGTGTGTGATCTCCA
CACTACAAACTCTCACAACTTCTCCTTTGTTATTAGTAAGGACTAACATATCGAGTGACA
TCGGCAGTAACGCTTGATCTTACGTATCATGTAGACGTTGTCACATGTGCAATTAAAATA
GTTCTCGTTATAAGTTGACGAAAAATACTTCGCACACGCTTTCGGTCCATCAACTTTGCA
GTTTCCTTCGATATCTTCTATTCTTGGACACACATTATTTTGATCAACTTCAACAAAAAA
AATTGTCTGTATCAACCTCTTCAATAATTTTATATCAACCACACACATCAAGAAAAATGT
TATCTGCTGGTTAAAGATATTTAGATTAAAAAATTGGAATGCAACATTTTGCGACTTGTG
ACAAAAACATTATCGAAAGGAAATGAATAGAGCATACATACCTTTAGGTCCTTCACCAGC
AGCTATTACGAGAAAGATGAGAAGACAAGAAACTATACACCAAGTAGCAGATCTCATGGT
TAAAGATAGAGATACTATAACTTGTGACAAGTATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA38JQ U 34
AF RR2DY55JQ U 24
AF RR2GA38TF C 1
AF RR2DY55TF C 24
BS 1 23 RR2GA38TF
BS 24 453 RR2DY55JQ
BS 454 516 RR2GA38TF
BS 517 517 RR2DY55TF
BS 518 538 RR2GA38TF
BS 539 539 RR2DY55TF
BS 540 638 RR2GA38TF

RD RR2GA38JQ 232 0 0
CTCATACTAGTTATAAAATATAATCTCATGACTTTATTACAAAAGAAAGATTGGTGACTA
ACAAAACCTATTCGTGTGTGATCTCCACACTACAAACTCTCACAACTTCTCCTTTGTTAT
TAGTAAGGACTAACATATCGAGTGACATCGGCAGTAACGCTTGATCTTACGTATCATGTA
AACGTTGTCACATGTGCAATTAAAATAGTTCTCGTTATAAGTTGACGAAAAA

QA 1 232 1 232
DS 

RD RR2DY55JQ 430 0 0
GATTGAGAAACTCATACTAGTTATAAAATATAATCTCATGACTTTATTACAAAAGAAAGA
TTGGTGACTAACAAAACCTATTCGTGTGTGATCTCCACACTACAAACTCTCACAACTTCT
CCTTTGTTATTAGTAAGGACTAACATATCGAGTGACATCGGCAGTAACGCTTGATCTTAC
GTATCATGTAGACGTTGTCACATGTGCAATTAAAATAGTTCTCGTTATAAGTTGACGAAA
AATACTTCGCACACGCTTTCGGTCCATCAACTTTGCAGTTTCCTTCGATATCTTCTATTC
TTGGACACACATTATTTTGATCAACTTCAACAAAAAAAATTGTCTGTATCAACCTCTTCA
ATAATTTTATATCAACCACACACATCAAGAAAAATGTTATCTGCTGGTTAAAGATATTTA
GATTAAAAAA

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2GA38TF 638 0 0
CTACAAAATCTGGAAAATAGATTGATTGAGAAACTCATACTAGTTATAAAATATAATCTC
ATGACTTTATTACAAAAGAAAGATTGGTGACTAACAAAACCTATTCGTGTGTGATCTCCA
CACTACAAACTCTCACAACTTCTCCTTTGTTATTAGTAAGGACTAACATATCGAGTGACA
TCGGCAGTAACGCTTGATCTTACGTATCATGTAGACGTTGTCACATGTGCAATTAAAATA
GTTCTCGTTATAAGTTGACGAAAAATACTTCGCACACGCTTTCGGTCCATCAACTTTGCA
GTTTCCTTCGATATCTTCTATTCTTGGCCACACATTATTTTGATCAACTTCAACAAAAAA
A*TTGTCTGTATCAACTTCTTCAATAATTTTATATCAACCACACACATCAAGAAAAATGT
TATCTGCTGGTTAAAGATATTTAGATTAAAAAATTGGAATGCAACATTTTGCGACTTGTG
ACAAAAACATTATCGAAAGGAAATGAATAGAGCATATATACCTTTAGGTCCTTCACCATC
AGCTATTACGAGAAAGATGAGAAGACAAGAAACTATACACCAAGTAGCAGATCTCATGGT
TAAAGATAGAGATACTATAACTTGTGACAAGTATTTCC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2DY55TF 607 0 0
GATTGAGAAACTCATACTAGTTATAAAATATAATCTCATGACTTTATTACAAAAGAAAGA
TTGGTGACTAACAAAACCTATTCGTGTGTGATCTCCACACTACAAACTCTCACAACTTCT
CCTTTGTTATTAGTAAGGACTAACATATCGAGTGACATCGGCAGTAACGCTTGATCTTAC
GTATCATGTAGACGTTGTCACATGTGCAATTAAAATAGTTCTCGTTATAAGTTGACGAAA
AATACTTCGCACACGCTTTCGGTCCATCAACTTTGCAGTTTCCTTCGATATCTTCTATTC
TTGGACACACATTATTTTGATCAACTTCAACAAAAAAAATTGTCTGTATCAACCTCTTCA
ATAATTTTATATCAACCACACACATCAAGAAAAATGTTATCTGCTGGTTAAAGATATTTA
GATTAAAAAATTGGAATGCAACATTTTGCGACTTGTGACAAAAACATTATCGAAAGGAAA
TGAATAGAGCATACATACCTTTAGGTCCTTTACCAGCAGCTATTACGAGAAAGATGAGAA
GACAAGAAACTATACACCAAGTAGCAGATCTCATGGTTAAAGATAGAGATACTATAACTT
GTGAC
CC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 2 4

CO CL2587Contig1 977 2 2 U
GCAGTCATACCTTCCTTGAGAGGTCATGCAAGACCATGTTTGAGCAAGTAGACACAGCCT
TCCAGAAAGGGATGGCCGAGCACACAAACGCAGCCCAGCAAAGGTTTGACGGTGGGCACT
CCCCGCTTGCTCATACATTAAAGGAAACCATTACTTCTGCTACGTCAGTTACTCAAGCCT
TGAGCCGTGAATTAGCGGAGAGCCAAAGGAATCGCTTAGCTCTCGCAGCTGCTGGAGCAA
ATTCTAGTGGATCAAACGCCTTGGTTTCTCAACGAAGTAGTGGACCTTTGGGTGCTATTC
TTGAAAAGGTTGAAGCAGACCCAATAGCAGAACTATCCAGGTTGATATCTGAACGCAAAT
ACGAGGAATCTTTTACGTCAGCTTTACAAAGAAGCGATGTCTCCATAGTATCATGGCTCT
GCTCACAGGTGGATCTGCGTGGACTACTGGCGATGAATCCACTTCCTCTAAGCCAAGGCG
TACTTCTGTCACTACTGCAGCAGCTAGCCTGCGACATCAGCAAGGACACATCCCGTAAGC
TTGCGTGGATGACTGATGTGGTTGCAGCAATTAACCCATCAGACCCTATGGTAGCGGCCC
ACGGTCGGCCAATCTTTGAGCAAGTGTATCAGATTCTGCACCACCACCGCAACGTACCAG
GCAGCGACGTCTCTGCCACAAGACTTATAATGCATGTGATAAACTCCATGCTTATGGCCT
GCAAATGATCCTCTCACGCTTTTGTTCGCTGCTTATATTAAAAAAAGAACATAGGAACAC
CAACATCGTCTACTCGTGTCTGTGTTCTACCTTTGTCGGATTTTTGATCATCTTTTCATT
TTTGATTTGAATTTTGCATTTTTCCCTTTTCATCAATTTCCTTCTAAATGTAAAATCTGG
TTGTTTCATATGCGTTGCCTGTACTTCCTCAAGTTGATCTTATGTAAAAAAAACAAACCT
AATGTTTGGAGTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH85TF U 1
AF RR2BH85JQ C 176
BS 1 759 RR2BH85TF
BS 760 977 RR2BH85JQ

RD RR2BH85TF 759 0 0
GCAGTCATACCTTCCTTGAGAGGTCATGCAAGACCATGTTTGAGCAAGTAGACACAGCCT
TCCAGAAAGGGATGGCCGAGCACACAAACGCAGCCCAGCAAAGGTTTGACGGTGGGCACT
CCCCGCTTGCTCATACATTAAAGGAAACCATTACTTCTGCTACGTCAGTTACTCAAGCCT
TGAGCCGTGAATTAGCGGAGAGCCAAAGGAATCGCTTAGCTCTCGCAGCTGCTGGAGCAA
ATTCTAGTGGATCAAACGCCTTGGTTTCTCAACGAAGTAGTGGACCTTTGGGTGCTATTC
TTGAAAAGGTTGAAGCAGACCCAATAGCAGAACTATCCAGGTTGATATCTGAACGCAAAT
ACGAGGAATCTTTTACGTCAGCTTTACAAAGAAGCGATGTCTCCATAGTATCATGGCTCT
GCTCACAGGTGGATCTGCGTGGACTACTGGCGATGAATCCACTTCCTCTAAGCCAAGGCG
TACTTCTGTCACTACTGCAGCAGCTAGCCTGCGACATCAGCAAGGACACATCCCGTAAGC
TTGCGTGGATGACTGATGTGGTTGCAGCAATTAACCCATCAGACCCTATGGTAGCGGCCC
ACGGTCGGCCAATCTTTGAGCAAGTGTATCAGATTCTGCACCACCACCGCAACGTACCAG
GCAGCGACGTCTCTGCCACAAGACTTATAATGCATGTGATAAACTCCATGCTTATGGCCT
GCAAATGATCCTCTCACGCTTTTGTTCGCTGCTTATATT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2BH85JQ 802 0 0
AGCCTTGAGCCGTGAATTAGCGGAGAGCCAAAGGAATCGCTTAGCTCTCGCAGCTGCTGG
AGCAAATTCTAGTGGATCAAACGCCTTGGTTTCTCAACGAAGTAGTGGACCTTTGGGTGC
TATTCTTGAAAAGGTTGAAGCAGACCCAATAGCAGAACTATCCAGGTTGATATCTGAACG
CAAATACGAGGAATCTTTTACGTCAGCTTTACAAAGAAGCGATGTCTCCATAGTATCATG
GCTCTGCTCACAGGTGGATCTGCGTGGACTACTGGCGATGAATCCACTTCCTTTAAGCCA
AGGCGTACTTCTGTCACTACTGCAGCAGCTAGCCTGCGACATCAGCAAGGACACATCCCG
TAAGCTTGCGTGGATGACTGATGTGGTTGCAGCAATTAACCCATCAGACCCTATGGTAGC
GGCCCACGGTCGGCCAATCTTTGAGCAAGTGTATCAGATTCTGCACCACCACCGCAACGT
ACCAGGCAGCGACGTCTCTGCCACAAGACTTATAATGCATGTGATAAACTCCATGCTTAT
GGCCTGCAAATGATCCTCTCACGCTTTTGTTCGCTGCTTATATTAAAAAAAGAACATAGG
AACACCAACATCGTCTACTCGTGTCTGTGTTCTACCTTTGTCGGATTTTTGATCATCTTT
TCATTTTTGATTTGAATTTTGCATTTTTCCCTTTTCATCAATTTCCTTCTAAATGTAAAA
TCTGGTTGTTTCATATGCGTTGCCTGTACTTCCTCAAGTTGATCTTATGTAAAAAAAACA
AACCTAATGTTTGGAGTTTTTC

QA 1 802 1 802
DS 



CO CL2587Contig2 576 2 2 U
TTTACGTCAGCTTTACAAAGAAGCGATGTCTCCATAGTATCATGGCTTTGCTCACAGGTG
GATCTGCGTGGACTACTGGCGATGAATCCACTTCCTCTAAGCCAAGGCGTACTTCTGTCA
CTACTGCAGCAGCTAGCCTGCGACATCAGCAAGGACACATCCCGTAAGCTTGCGTGGATG
ACTGATGTGGTTACAGCAATTAACCCATCGGACCCGATGGTAGCGGCCCACGGTCGGCCA
ATCTTTGAGCAAGTGTATCAGATTCTGCACCACCACCGCAACATACCAGGCAGCGACGTC
TCTGCCACAAGACTTATAATGCATGTGATAAACTCCATGCTTATGGCCTGCAAATGATTC
TCTCACTCTTTTGTTCGTTGCTTATATTAAAAAAAAAAACATAGGAACACGAACATCATC
TACTCGTGTCTGTGTTCTATCTTTGTCAGATTTTTGATCATCTTTTCATTTTTGATTTGA
ATTTTGCATTTTCCCCTTTTTACCAATTTTCCTTTTAAATGTAAAATCTGGTTGTTTCAT
ATGCGTTGCCTATATTTCCTCAAGTTGATCTTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CL10JQ C 1
AF RR2CL10TF U 187
BS 1 186 RR2CL10JQ
BS 187 576 RR2CL10TF

RD RR2CL10JQ 576 0 0
TTTACGTCAGCTTTACAAAGAAGCGATGTCTCCATAGTATCATGGCTTTGCTCACAGGTG
GATCTGCGTGGACTACTGGCGATGAATCCACTTCCTCTAAGCCAAGGCGTACTTCTGTCA
CTACTGCAGCAGCTAGCCTGCGACATCAGCAAGGACACATCCCGTAAGCTTGCGTGGATG
ACTGATGTGGTTACAGCAATTAACCCATCGGACCCGATGGTAGCGGCCCACGGTCGGCCA
ATCTTTGAGCAAGTGTATCAGATTTTGCACCACCACCGCAACATACCAGGCAGCGACGTT
TTTGCCACAAGACTTATAATGCATGTGATAAACTCCATGCTTATGGCCTGCAAATGATTC
TCTCACTCTTTTGTTCGTTGCTTATATTAAAAAAAAAAACATAGGAACACGAACATCATC
TACTCGTGTCTGTGTTCTATCTTTGTCAGATTTTTGATCATCTTTTCATTTTTGATTTGA
ATTTTGCATTTTCCCCTTTTTACCAATTTTCCTTTTAAATGTAAAATCTGGTTGTTTCAT
ATGCGTTGCCTATATTTCCTCAAGTTGATCTTATGT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2CL10TF 390 0 0
GTGGTTACAGCAATTAACCCATCGGACCCGATGGTAGCGGCCCACGGTCGGCCAATCTTT
GAGCAAGTGTATCAGATTCTGCACCACCACCGCAACATACCAGGCAGCGACGTCTCTGCC
ACAAGACTTATAATGCATGTGATAAACTCCATGCTTATGGCCTGCAAATGATTCTCTCAC
TCTTTTGTTCGTTGCTTATATTAAAAAAAAAAACATAGGAACACGAACATCATCTACTCG
TGTCTGTGTTCTATCTTTGTCAGATTTTTGATCATCTTTTCATTTTTGATTTGAATTTTG
CATTTTCCCCTTTTTACCAATTTTCCTTTTAAATGTAAAATCTGGTTGTTTCATATGCGT
TGCCTATATTTCCTCAAGTTGATCTTATGT

QA 1 390 1 390
DS 



AS 1 4

CO CL2588Contig1 629 4 19 U
ACGGATAATGAGAGTACTTAAATGTGAATCCAAATAAATATTTCAAGAAAGTTACCACAA
AAATTCAAAAGACAAAGTTTCAAAGAAAATTGATAACAATAGTTAAACATAATAGAATGA
AAAGTCTCTTTTCCCCATAGAAAACTTCAATAGAAGAAACCGAGGACCTTGCCTCCAACA
TTCTTTCTCCTCGCTTCTTCATGGTCCATAATCCCAACTGAAGTAGTCAACACGATGTAC
CCAAACTGTCTGGAAGGGAGCAAACGAGCAGTCCAACTTTCAATCTCCTTAACACCAACA
TCAAAACGAGGACTGATAACACCACACTTGTTCAACCTCCCGTTCAATTCCACAACGATT
TTGCCGGATCGGTGGTCATCGACGTACTCAAACTCACCAATGTAACCGTGCTTCTGCATG
ACGATGAGAAACTTGATGATGACTTTTGAGGAAGGCCTGATCATGACCTGCCTCTTGCCA
CGTTTCTCGGCATTGAACATGCTCTTGAGAGCATCGTTGAGCACACTGATTCTCACCATT
TTCTCCTTAAGCTCAAGCCTCTTCTTAGATTGGCAGCTCGGGAGGCAGGTCGCTCAGTGA
CGGAGGAGAAGCAAAGAGACGGAGAAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2A084JQ U 146
AF RR2FR26JQ U 59
AF RR2A084TF C 1
AF RR2FR26TF C 29
BS 1 58 RR2A084TF
BS 59 145 RR2FR26JQ
BS 146 155 RR2A084JQ
BS 156 156 RR2FR26JQ
BS 157 224 RR2A084JQ
BS 225 225 RR2FR26JQ
BS 226 422 RR2A084JQ
BS 423 423 RR2FR26JQ
BS 424 427 RR2A084JQ
BS 428 428 RR2FR26JQ
BS 429 467 RR2A084JQ
BS 468 468 RR2FR26JQ
BS 469 520 RR2A084JQ
BS 521 521 RR2FR26JQ
BS 522 537 RR2A084JQ
BS 538 538 RR2FR26JQ
BS 539 554 RR2A084JQ
BS 555 565 RR2FR26JQ
BS 566 629 RR2A084TF

RD RR2A084JQ 409 0 0
TTCAATAGAAAAAACCGAGGACCTTGCCTCCAACATTCTTTCTCCTCGCTTCTTCATGGT
CCATAATCCCAACTGAAGTTGTCAACACGATGTACCCAAACTGTCTGGAAGGGAGCAAAC
GAGCAGTCCAACTTTCAATCTCCTTAACACCAACATCAAAACGAGGACTGATAACACCAC
ACTTGTTCAACCTCCCGTTCAATTCCACAACGATTTTGCCGGATCGGTGGTCATCGACGT
ACTCAAACTCACCAATGTAACCGTGCTTCTGCATGACAATGAAAAACTTGATGATGACTT
TTGAGGAAGGCCTGATCATGACTTGCCTCTTGCCACGTTTCTCGGCATTGAACATGCTCT
TGAGAGCATCGTTGAACACACTGATTCTCACCGTTTTCTCCTTAAGCTC

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR2FR26JQ 507 0 0
AAAAATTCAAAAGACAAAGTTTCAAAGAAAATTGATAACAATAGTTAAACATAATAGAAT
GAAAAGTCTCTTTTCCCCATAGAAAACTTCAATAGAAGAAACCGAGGACCTTGCCTCCAA
CATTCTTTCTCCTCGCTTCTTCATGGTCCATAATCCCAGCTGAAGTAGTCAACACGATGT
ACCCAAACTGTCTGGAAGGGAGCAAACGAGCAGTCCAACTTTCAATCTCCTTAACACCAA
CATCAAAACGAGGACTGATAACACCACACTTGTTCAACCTCCCGTTCAATTCCACAACGA
TTTTGCCGGATCGGTGGTCATCGACGTACTCAAACTCACCAATGTAACCGTGCTTCTGCA
TGACGATGAGAAACTTGATGATGACTTTTGAGGAAGGCCTGATCATGACCTGCCTCTTGC
CACGTTTCTCGGCATTGAACATGCTCTTGAGAGCATCGTTGAGCACACTGATTCTCACCA
TTTTCTCCTTAAGCTCAAGCCTCTTCT

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2A084TF 629 0 0
ACGGATAATGAGAGTACTTAAATGTGAATCCAAATAAATATTTCAAGAAAGTTACCACAA
AAATTCAAAAGACAAAGTTTCAAAGAAAATTGATAACAATAGTTAAACATAATAGAATGA
AAAGTCTCTTTTCCCCATAGAAAACTTCAATAGAAGAAACCGAGGACCTTGCCTCCAACA
TTCTTTCTCCTCGCTTCTTCATGGTCCATAATCCCAACTGAAGTTGTCAACACGATGTAC
CCAAACTGTCTGGAAGGGAGCAAACGAGCAGTCCAACTTTCAATCTCCTTAACACCAACA
TCAAAACGAGGACTGATAACACCACACTTGTTCAACCTCCCGTTCAATTCCACAACGATT
TTGCCGGATCGGTGGTCATCGACGTACTCAAACTCACCAATGTAACCGTGCTTCTGCATG
ACGATGAGAAACTTGATGATGACTTTTGAGGAAGGCCTGATCATGACTTGCCTCTTGCCA
CGTTTCTCGGCATTGAACATGCTCTTGAGAGCATCGTTGAGCACACTGATTCTCACCGTT
TTCTCCTTAAGCTCAAGCCTCTTCTTAGATTGGCAGCTCGGGAGGCAGGTCGCTCAGTGA
CGGAGGAGAAGCAAAGAGACGGAGAAGAG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2FR26TF 598 0 0
TCCAAATAAATATTTCAAGAAAGTTACCACAAAAATTCAAAAGACAAAGTTTCAAAGAAA
ATTGATAACAATAGTTAAACATAATAGAATGAAAAGTCTCTTTTCCCCATAGAAAACTTC
AATAGAAGAAACCGAGGACCTTGCCTCCAACATTCTTTCTCCTCGCTTCTTCATGGTCCA
TAATCCCAGCTGAAGTAGTCAACACGATGTACCCAAACTGTCTGGAAGGGAGCAAACGAG
CAGTCCAACTTTCAATCTCCTTAACACCAACATCAAAACGAGGACTGATAACACCACACT
TGTTCAACCTCCCGTTCAATTCCACAACGATTTTGCCGGATCGGTGGTCATCGACGTACT
CAAACTCACCAATGTAACCGTGCTTCTGCATGACGATGAGAAACTTGATGATGACTTTTG
AGGAAGGCCTGATCATGACCTGCCTCTTGCCACGTTTCTCGGCATTGAACATGCTCTTGA
GAGCATCGTTGAGCACACTGATTCTCACCATTTTCTCCTTAAGCTCAAGCCTCTTCTTAG
ATTGGCAGCTCGGGAGGCAGGTCGCTCAGTGACGGAGGAGAAGCAAAGAGACGGAG
CC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL2589Contig1 723 2 2 U
GGACCCACAAACCTTATCGAGTGAAAGTGAAGATTGGGAAGGGGGTAGTAGCGAAAAAAT
GGCGTCGATTGCAGCTTCTTCTACTTTCCATTCCTTTTCAACAACCAAAAGCCCTAACCT
TTCTTCGACCCATCTCCTTCCTCTCTCCAAAAACCTCACCTTTCCAACCAAACCCATCGG
AAACACCAGAGTTTGCAGCTTCACGAAACAGAACAACCGCCTTGGGTTGAGGAAGAGGAA
GCTTTCGTCCGTTGGCGAAGGAGGAGGAGGAGAAGCCGTCGCAGTTGCAGATGAAGAGCT
GCAACAGACTGTCTCTGTCCCTGTCTCTCCTTCAGACATGCTCACCATGTTTTTTCAGGC
TGATGGAACTTTGAATGAAGCAGCTATTCCTAATGTGACAAAGGCCTTACAGGACATGGA
TGGAGTTTCCAATTTAAAGGTTCAAGTTGCTGAAGGTGTTGCTGTTGTTGAGCTATCAAA
GCAAACAACGGTTCAAGCAACAGGAGTGGCGTCAACCTTGGTAGAGACTATACAAAGAGC
TGGCTTTAAGTTACAAACCTTGAACCTGAGCTTTGAAGACGAAGATGAAGTTCTTGTCTA
ATTAATATCATCTTTCTTCTCAAGCACAACCTTTTGTGATTAAAGAAACACATTAATTTT
CGATTTTGTTACAACAATTACAATGTGCCATATTACAAAAGTAATGAACTCTCACTTTCT
TAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2E727TF U 1
AF RR2E727JQ C 1
BS 1 588 RR2E727TF
BS 589 723 RR2E727JQ

RD RR2E727TF 588 0 0
GGACCCACAAACCTTATCGAGTGAAAGTGAAGATTGGGAAGGGGGTAGTAGCGAAAAAAT
GGCGTCGATTGCAGCTTCTTCTACTTTCCATTCCTTTTCAACAACCAAAAGCCCTAACCT
TTCTTCGACCCATCTCCTTCCTCTCTCCAAAAACCTCACCTTTCCAACCAAACCCATCGG
AAACACCAGAGTTTGCAGCTTCACGAAACAGAACAACCGCCTTGGGTTGAGGAAGAGGAA
GCTTTCGTCCGTTGGCGAAGGAGGAGGAGGAGAAGCCGTCGCAGTTGCAGATGAAGAGCT
GCAACAGACTGTCTCTGTCCCTGTCTCTCCTTCAGACATGCTCACCATGTTTTTTCAGGC
TGATGGAACTTTGAATGAAGCAGCTATTCCTAATGTGACAAAGGCCTTACAGGACATGGA
TGGAGTTTCCAATTTAAAGGTTCAAGTTGCTGAAGGTGTTGCTGTTGTTGAGCTATCAAA
GCAAACAACGGTTCAAGCAACAGGAGTGGCGTCAACCTTGGTAGAGACTATACAAAGAGC
TGGCTTTAAGTTACAAACCTTGAACCTGAGCTTTGAAGACGAAGATGA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2E727JQ 723 0 0
GGACCCACAAACCTTATCGAGTGAAAGTGAAGATTGGGAAGGGGGTAGTAGCGAAAAAAT
GGCGTCGATTGCAGCTTCTTCTACTTTCCATTCCTTTTCAACAACCAAAAGCCCTAACCT
TTCTTCGACCCATCTCCTTCCTCTCTCCAAAAACCTCACCTTTCCAACCAAACCCATCGG
AAACACCAGAGTTTGCAGCTTCACGAAACAGAACAACCGCCTTGGGTTGAGGAAGAGGAA
GCTTTCGTCCGTTGGCGAAGGAGGAGGAGGAGAAGCCGTCGCAGTTGCAGATGAAGAGCT
GCAACAGACTGTTTCTGTCCCTGTCTCTCCTTCAGACATGCTCACCATGTTTTTTCAGGC
TGATGGAACTTTGAATGAAGCAGCTATTCCTAATGTGACAAAGGCCTTACAGGACATGGA
TGGAGTTTCCAATTTAAAGGTTCAAGTTGCTGAAGGTGTTGCTGTTGTTGAGCTATCAAA
GCAAACAACGGTTCAAGCAACAGGAGTGGCGTCAACCTTGGTAGAGACTATACAAGGAGC
TGGCTTTAAGTTACAAACCTTGAACCTGAGCTTTGAAGACGAAGATGAAGTTCTTGTCTA
ATTAATATCATCTTTCTTCTCAAGCACAACCTTTTGTGATTAAAGAAACACATTAATTTT
CGATTTTGTTACAACAATTACAATGTGCCATATTACAAAAGTAATGAACTCTCACTTTCT
TAC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 4

CO CL2590Contig1 1100 4 12 U
GGAGTAGTGTTCTCTTCTGACTTCGGAGGAGAAAGAAGAAGGAAAAAAAAAAAGTCAGTT
ACAATAATGGCGCTCTCGAATACTATCTTCTCTGCTACTCATCCTCTCCCTTCTTCCGCG
ATCAGCCGGCGAACTCGTTTTCCCGCTCAAATTCCACCTCCGGATCTATCGCCTGCTTTG
TTCGGTGATCGCCGCAAGTTCGTAATGCCTCTATTGACGATGAGTATGAGAAACCGTGTG
TATGCTTCGATTAACAGCACTGATGATGCCTCAGCTCCTTATCCGAAATCAGAAGACAAC
GACGATGACTCTGTTCCAATGCCAATGGTTTTTATAGACCAGGATGCTGACCCTGAAGCT
ACTATTGTACAACTCAGTTTTGGAGATCGTCTTGGGGCTCTCATTGACACTATGAGGGCG
CTGAAAGATTTGGGATTGGATGTAATAAAAGGAACTGTCACAACTGAAGGATCTGTTAAA
CAGACAAGGTTTTCTATAACGAAACTAGACACTGGTCGGAAAGTGGAAGATCCTGACTTG
TTGGAGCAAATTCGGTTAACAATCATCAACAATCTCTTGAAATACCATCCGGAATGTAGC
GAACAACTTGCAATGGGTGAGACATTTGGAATAAAGGCTCCAGAAAATAAGGTTGATGTT
GATATCGCGACTCACATACATGTGAAGGAAGACGGACCAAAGAGGAGCCTGCTTTGCATA
GAGACAGCGGACAGGCCAGGTCTGGTTGTAGAGATGATCAAAGTGATGGCTGATATCAAC
ATAGACGTGGAATCCGCAGAGATAGACACAGAAGGACTGGTTGCGAAAGACAAATTTCAT
GTAAGCTACCAAGGGCAAGCACTAAACAGTTCTTTGTCACAGGAGCTGGTGAACTGTCTG
CGTTACTTCCTGAGAAGGCCTGAAACTGACATCGATAGCTACTAAGTGAACTTTGTCTGT
TCAAAAATATAAACAGCTTTCTATCCTTCTTCACGAAACTTTCAAGTCTTCTGTTTCGAA
GATGATGTGGAAGTTCCTAAACTACAACTGAACCATTGTGGCTAAAAATAAATAAAGAGA
TGGGATTTTGAGCCCTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH32TF U 1
AF RR2CK50TF U 14
AF RR2D207TF U 40
AF RR2DH32JQ C 364
BS 1 51 RR2DH32TF
BS 52 53 RR2CK50TF
BS 54 294 RR2DH32TF
BS 295 295 RR2CK50TF
BS 296 320 RR2DH32TF
BS 321 321 RR2CK50TF
BS 322 405 RR2DH32TF
BS 406 636 RR2CK50TF
BS 637 673 RR2D207TF
BS 674 674 RR2DH32JQ
BS 675 687 RR2D207TF
BS 688 1100 RR2DH32JQ

RD RR2DH32TF 405 0 0
GGAGTAGTGTTCTCTTCTGACTTCGGAGGAGAAAGAAGAAGGAAAAAAAAA**GTCAGTT
ACAATAATGGCGCTCTCGAATACTATCTTCTCTGCTACTCATCCTCTCCCTTCTTCCGCG
ATCAGCCGGCGAACTCGTTTTCCCGCTCAAATTCCACCTCCGGATCTATCGCCTGCTTTG
TTCGGTGATCGCCGCAAGTTCGTAATGCCTCTATTGACGATGAGTATGAGAAACCGTGTG
TATGCTTCGATTAACAGCACTGATGATGCCTCAGCTCCTTATCCGAAATCAGAATACAAC
GACGATGACTCTGTTCCAATTCCAATGGTTTTTATAGACCAGGATGCTGACCCTGAAGCT
ACTATTGTACAACTCAGTTTTGGAGATCGTCTTGGGGCTCTCATT

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR2CK50TF 628 0 0
CTTCTGACTTCGGAGGAGAAAGAAGAAGGAAAAAAAAAAAGTCAGTTACAATAATGGCGC
TCTCGAATACTATCTTCTCTGCTACTCATCCTCTCCCTTCTTCCGCGATCAGCCGGCGAA
CTCGTTTTCCCGCTCAAATTCCACCTCCGGATCTATCGCCTGCTTTGTTCGGTGATCGCC
GCAAGTTCGTAATGCCTCTATTGACGATGAGTATGAGAAACCGTGTGTATGCTTCGATTA
ACAGCACTGATGATGCCTCAGCTCCTTATCCGAAATCAGAAGACAACGACGATGACTCTG
TTCCAATGCCAATGGTTTTTATAGACCAGGATGCTGACCCTGAAGCTACTATTGTACAAC
TCAGTTTTGGAGATCGTCTTGGGGCTCTCATTGACACTATGAGGGCGCTGAAAGATTTGG
GATTGGATGTAATAAAAGGAACTGTCACAACTGAAGGATCTGTTAAACAGACAAGGTTTT
CTATAACGAAACTAGACACTGGTCGGAAAGTGGAAGATCCTGACTTGTTGGAGCAAATTC
GGTTAACAATCATCAACAATCTCTTGAAATACCATCCGGAATGTAGCGAACAACTTGCAA
TGGGTGAGACATTTGGAATAAAG
CTCCA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2D207TF 650 0 0
GGGAA
AAAAAAAAAGTCAGTTACAATAATGGCGCTCTCGAATACTATCTTCTCTGCTACTCATCC
TCTCCCTTCTTCCGCGATCAGCCGGCGAACTCGTTTTCCCGCTCAAATTCCACCTCCGGA
TCTATCGCCTGCTTTGCTCAGTGATCGCCGCAAGTTCGTAATGCCTCTATTGACGATGAG
TATGAGAAACCGTGTGTATGCTTCGATTAACAGCACTGATGATGCCTCAGCTCCTTATCC
GAAATCAGAAGACAACGACGATGACTCTGTTCCAATGCCAATGGTTTTTATAGACCAGGA
TGCTGACCCTGAAGCTACTATTGTACAACTCAGTTTTGGAGATCGTCTTGGGGCTCTCAT
TGACACTATGAGGGCGCTGAAAGATTTGGGATTGGATGTAATAAAAGGAACTGTTACAAC
TGAAGGATCTGTTAAACAGACAAGGTTTTCTATAACGAAACTAGACACTGGTCGGAAAGT
GGAAGATCCTGACTTGTTGGAGCAAATTCGGTTAACAATCATCAACAATCTCTTGAAATA
CCATCCGGAATGTAGCGAACAACTTGCAATGGGTGAGACATTTGGGATAAAGGCTCCAGA
AAATAAGGTTGATGTTGATATCGCGACTCGCATACATGTGAAG
AA

QA 6 648 6 648
DS 

RD RR2DH32JQ 737 0 0
ATTGTACAACTCAGTTTTGGAGATCGTCTTGGGGCTCTCATTGACACTATGAGGGCGCTG
AAAGATTTGGGATTGGATGTAATAAAAGGAACTGTCACAACTGAAGGATCTGTTAAACAG
ACAAGGTTTTCTATAACGAAACTAGACACTGGTCGGAAAGTGGAAGATCCTGACTTGTTG
GAGCAAATTCGGTTAACAATCATCAACAATCTCTTGAAATACCATCCGGAATGTAGCGAA
CAACTTGCAATGGGTGAGACATTTGGAATAAAGGCTCCAGAAAATAAGGTTGATGTTGAT
ATCGCGACTCACATACATGTGAAGGAAGACGGACCAAAGAGGAGCCTGCTTTGCATAGAG
ACAGCGGACAGGCCAGGTCTGGTTGTAGAGATGATCAAAGTGATGGCTGATATCAACATA
GACGTGGAATCCGCAGAGATAGACACAGAAGGACTGGTTGCGAAAGACAAATTTCATGTA
AGCTACCAAGGGCAAGCACTAAACAGTTCTTTGTCACAGGAGCTGGTGAACTGTCTGCGT
TACTTCCTGAGAAGGCCTGAAACTGACATCGATAGCTACTAAGTGAACTTTGTCTGTTCA
AAAATATAAACAGCTTTCTATCCTTCTTCACGAAACTTTCAAGTCTTCTGTTTCGAAGAT
GATGTGGAAGTTCCTAAACTACAACTGAACCATTGTGGCTAAAAATAAATAAAGAGATGG
GATTTTGAGCCCTTTCG

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 4

CO CL2591Contig1 821 4 8 U
GGAGCTGGAAGCTGGAAACAGTCGGGGATTTAGGGTTTCAACGGGGGACTCAGTACTCGA
CTCTCCGATCCCTTCTTCTCCGGCCAAACTCCGTCGAAAATTCTCCTCCGTTGCATTTGA
TTGACTCGTCTCAGCTCAATTCTCTGCCGTTTTCACGTCACAGCTTCGTTTAGTTAAAGG
CGTTGGCCAAAGACTTGGGATTAAGTAGTCTGGTTTGCGGGAGAGATGAATAATCACGGC
CAACATTCTGGCGAAGCAAAGCATGAAGATGATGCTGCTCTTACTGAGTTCCTTGCGTCT
CTCATGGATTATACTCCTACTATTCCTGATGATCTAGTGGAGCACTACTTGGCTAAGAGT
GGGTTTCAGTGCCCCGACGTACGATTAATAAGGCTAGTTGCTGTGGCTACACAAAAGTTT
GTTGCAGATGTTGCCAGCGATGCTCTTCAGCACTGCAAGGCTAGACCAGCACCAGTTGTG
AAAGACAAAAAACAGCAAAAGGATAAGCGTTTAGTATTGACAATGGAAGACCTTTCAAAA
GCTTTGCGTGAGTATGGTGTGAATGTGAAGCATCCAGAATATTTTGCTGATAGCCCTTCG
ACCGGAATGGACCCTGCGTCAAGAGATGAATAGCAACCAGCAAGTCTTGATCCTCTTTCC
CAGTATGGATGATCGTGTGTGAGTTACTTGATTTTCTATTGTGTTTTAGTTGAAAA*CTC
TCTTCTCCTCTTCCTAGTCATTAATTACATGTATATTATTCCTCCTGTTGTCTGTTTCTT
GACTTGTCTCTCGTGTTATTGAGTTTCATACCGTACTTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT50JQ C 456
AF RR2CT50TF U 1
AF RR2C503TF U 8
AF RR2C503JQ C 110
BS 1 314 RR2CT50TF
BS 315 315 RR2C503TF
BS 316 374 RR2CT50TF
BS 375 375 RR2C503TF
BS 376 738 RR2CT50TF
BS 739 739 RR2C503TF
BS 740 756 RR2CT50TF
BS 757 821 RR2C503JQ

RD RR2CT50JQ 101 0 0
CAAGGGTAGACCAGCACCAGTTGTGAAAGACAAAAAACAGCAAAAGGATAAGGGTTTAGT
ATTGACAATGGAAGACCTTTCAAAAGCTTTGGGGGAGTATG

QA 1 101 1 101
DS 

RD RR2CT50TF 759 0 0
GGAGCTGGAAGCTGGAAACAGTCGGGGATTTAGGGTTTCAACGGGGGACTCAGTACTCGA
CTCTCCGATCCCTTCTTCTCCGGCCAAACTCCGTCGAAAATTCTCCTCCGTTGCATTTGA
TTGACTCGTCTCAGCTCAATTCTCTGCCGTTTTCACGTCACAGCTTCGTTTAGTTAAAGG
CGTTGGCCAAAGACTTGGGATTAAGTAGTCTGGTTTGCGGGAGAGATGAATAATCACGGC
CAACATTCTGGCGAAGCAAAGCATGAAGATGATGCTGCTCTTACTGAGTTCCTTGCGTCT
CTCATGGATTATACCCCTACTATTCCTGATGATCTAGTGGAGCACTACTTGGCTAAGAGT
GGGTTTCAGTGCCCTGACGTACGATTAATAAGGCTAGTTGCTGTGGCTACACAAAAGTTT
GTTGCAGATGTTGCCAGCGATGCTCTTCAGCACTGCAAGGCTAGACCAGCACCAGTTGTG
AAAGACAAAAAACAGCAAAAGGATAAGCGTTTAGTATTGACAATGGAAGACCTTTCAAAA
GCTTTGCGTGAGTATGGTGTGAATGTGAAGCATCCAGAATATTTTGCTGATAGCCCTTCG
ACCGGAATGGACCCTGCGTCAAGAGATGAATAGCAACCAGCAAGTCTTGATCCTCTTTCC
CAGTATGGATGATCGTGTGTGAGTTACTTGATTTTCTATTGTGTTTTAGTTGAAAA*CTC
TCTTCTCCTCTTCCTAGTTATTAATTACATGTATAT
TAT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2C503TF 749 0 0
GG
AGCTGGAAACAGTCGGGGATTTAGGGTTTCAACGGGGGACTCAGTACTCGACTCTCCGAT
CCCTTCTTCTCCGGCCAAACTCCGTCGAAAATTCTCCTCCGTTGCATTTGATTGACTCGT
CTCAGCTCAATTCTCTGCCGTTTTCACGTCACAGCTTCGTTTAGTTAAAGGCGTTGGCCA
AAGACTTGGGATTAAGTAGTCTGGTTTGCGGGAGAGATGAATAATCACGGCCAACATTCT
GGCGAAGCAAAGCATGAAGATGATGCTGCTCTTACTGAGTTCCTTGCGTCTCTCATGGAT
TATACTCCTACTATTCCTGATGATCTAGTGGAGCACTACTTGGCTAAGAGTGGGTTTCAG
TGCCCCGACGTACGATTAATAAGGCTAGTTGCTGTGGCTACACAAAAGTTTGTTGCAGAT
GTTGCCAGCGATGCTCTTCAGCACTGCAAGGCTAGACCAGCACCAGTTGTGAAAGACAAA
AAACAGCAAAAGGATAAGCGTTTAGTATTGACAATGGAAGACCTTTCAAAAGCTTTGCGT
GAGTATGGTGTGAATGTGAAGCATCCAGAATATTTTGCTGATAGCCCTTCGACCGGAATG
GACCCTGCGTCAAGAGATGAATAGCAACCAGCAAGTCTTGATCCTCTTTCCCAGTATGGA
TGATCGTGTGTGAGTTACTTGATTTTCTATTGTGTTTTAGTTGAAAA*CTCTCTTCTCCT
CTTCCTAGTCAT*AATTACATGTATAT

QA 3 749 3 749
DS 

RD RR2C503JQ 712 0 0
GTTGCATTTGATTGACTCGTCTCAGCTCAATTCTCTGCCGTTTTCACGTCACAGCTTCGT
TTAGTTAAAGGCGTTGGCCAAAGACTTGGGATTAAGTAGTCTGGTTTGCGGGAGAGATGA
ATAATCACGGCCAACATTCTGGCGAAGCAAAGCATGAAGATGATGCTGCTCTTACTGAGT
TCCTTGCGTCTCTCATGGATTATACTCCTACTATTCCTGATGATCTAGTGGAGCACTACT
TGGCTAAGAGTGGGTTTCAGTGCCCCGACGTACGATTAATAAGGCTAGTTGCTGTGGCTA
CACAAAAGTTTGTTGCAGATGTTGCCAGCGATGCTCTTCAGCACTGCAAGGCTAGACCAG
CACCAGTTGTGAAAGACAAAAAACAGCAAAAGGATAAGCGTTTAGTATTGACAATGGAAG
ACCTTTCAAAAGCTTTGCGTGAGTATGGTGTGAATGTGAAGCATCCAGAATATTTTGCTG
ATAGCCCTTCGACCGGAATGGACCCTGCGTCAAGAGATGAATAGCAACCAGCAAGTCTTG
ATCCTCTTTCCCAGTATGGATGATCGTGTGTGAGTTACTTGATTTTCTATTGTGTTTTAG
TTGAAAAACTCTCTTCTCCTCTTCCTAGTCATTAATTACATGTATATTATTCCTCCTGTT
GTCTGTTTCTTGACTTGTCTCTCGTGTTATTGAGTTTCATACCGTACTTTTA

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 3

CO CL2592Contig1 751 3 3 U
GTTAATAACGCAGAGATGTCGTATCCTTACGCGAAGTACTTTCACGAGGTTGATGAGGAG
TTGGTTAGGGGGTTGATTAAGATTAATGTGGAGGGGACGACGAAGGTGACGCAGGCTGTG
TTGCCTGGGATGTTGGAGAGGAAGCGTGGGGCGATTGTTAATATGGGGTCTGGTGCTGCT
GCGCTTATTCCTTCGTATCCTTTCTACTCTGTTTACGCCGGTGCTAAGACGTATGTGGAT
CAGTTCACGAGGTGTCTACATGTTGAGTACAA***GAGTGGGATTGATGTTCAATGCCAG
GTACCCTTGTATGTAGCGACAAAGATGACATCGATAAGAAGAGCATCGTTCTTAGTGGCG
TCTCCAGAGGGTTACGCAAAGGCAGCAATGCGTTTTATAGGGTATGAAGCACGCTGCACA
CCTTACTGGCCTCACGCCCTCATGGGTTATGTTGTCTCCGCATTGCCCGAGAGCGTTTTT
GAATCCTTTAACATTAAGAGGTGCCTCCAGATCAGGAAGAAGGGTATGCTTAAAGACTCC
AGGAAAAAGGAATGAAACTTTTCCGAGGGTGCAAGATTTTCTTCTGCCACTTGCAACTTT
CTGTTTAGACATTGTAAGACTTGTACGCTTTAGCTTCCGATATTTCCAAGGTTGTTTCCT
TCTTTTTTAAAATTAAAAACCATAACGTCCATTGATCATTCATGTCCTCTCTGTTTTTAT
TTATTTATTTAAATAAAACTGAGTGTTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP80TF U 1
AF RR2BP80JQ C 45
AF RR2DK71TF U 220
BS 1 628 RR2BP80TF
BS 629 745 RR2DK71TF
BS 746 751 RR2BP80JQ

RD RR2BP80TF 628 0 0
GTTAATAACGCAGAGATGTCGTATCCTTACGCGAAGTACTTTCACGAGGTTGATGAGGAG
TTGGTTAGGGGGTTGATTAAGATTAATGTGGAGGGGACGACGAAGGTGACGCAGGCTGTG
TTGCCTGGGATGTTGGAGAGGAAGCGTGGGGCGATTGTTAATATGGGGTCTGGTGCTGCT
GCGCTTATTCCTTCGTATCCTTTCTACTCTGTTTACGCCGGTGCTAAGACGTATGTGGAT
CAGTTCACGAGGTGTCTACATGTTGAGTACAA***GAGTGGGATTGATGTTCAATGCCAG
GTACCCTTGTATGTAGCGACAAAGATGACATCGATAAGAAGAGCATCGTTCTTAGTGGCG
TCTCCAGAGGGTTACGCAAAGGCAGCAATGCGTTTTATAGGGTATGAAGCACGCTGCACA
CCTTACTGGCCTCACGCCCTCATGGGTTATGTTGTCTCCGCATTGCCCGAGAGCGTTTTT
GAATCCTTTAACATTAAGAGGTGCCTCCAGATCAGGAAGAAGGGTATGCTTAAAGACTCC
AGGAAAAAGGAATGAAACTTTTCCGAGGGTGCAAGATTTTCTTCTGCCACTTGCAACTTT
CTGTTTAGACATTGTAAGACTTGTACGC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2BP80JQ 707 0 0
CGAGGTTGATGAGGAGTTGGTTAGGGGGTTGATTAAGATTAATGTGGAGGGGACGACGAA
GGTGACGCAGGCTGTGTTGCCTGGGATGTTGGAGAGGAAGCGTGGGGCGATTGTTAATAT
GGGGTCTGGTGCTGCTGCGCTTATTCCTTCGTATCCTTTCTACTCTGTTTACGCCGGTGC
TAAGACGTATGTGGATCAGTTCACGAGGTGTCTACATGTTGAGTACAA***GAGTGGGAT
TGATGTTCAATGCCAGGTACCCTTGTATGTAGCGACAAAGATGACATCGATAAGAAGAGC
ATCGTTCTTAGTGGCGTCTCCAGAGGGTTACGCAAAGGCAGCAATGCGTTTTATAGGGTA
TGAAGCACGCTGCACACCTTACTGGCCTCACGCCCTCATGGGTTATGTTGTCTCCGCATT
GCCCGAGAGCGTTTTTGAATCCTTTAACATTAAGAGGTGCCTCCAGATCAGGAAGAAGGG
TATGCTTAAAGACTCCAGGAAAAAGGAATGAAACTTTTCCGAGGGTGCAAGATTTTCTTC
TGCCACTTGCAACTTTCTGTTTAGACATTGTAAGACTTGTACGCTTTAGCTTCCGATATT
TCCAAGGTTGTTTCCTTCTTTTTTAAAATTAAAAACCATAACGTCCATTGATCATTCATG
TCCTCTCTGTTTTTATTTATTTATTTAAATAAAACTGAGTGTTTGAG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2DK71TF 526 0 0
GGTGCTAAGACGTATGTGGATCAGTTCACGAGGTGTCTACATGTTGAGTACAAGAAGAGT
GGGATTGATGTTCAATGCCAGGTACCCTTGTATGTAGCGACAAAGATGACATCGATAAGA
AGAGCATCGTTCTTAGTGGCGTCTCCAGAGGGTTACGCAAAGGCAGCAATGCGTTTTATA
GGGTATGAAGCACGCTGCACACCTTACTGGCCTCACGCCCTCATGGGTTATGTTGTCTCC
GCATTGCCCGAGAGCGTTTTTGAATCCTTTAACATTAAGAGGTGCCTCCAGATCAGGAAG
AAGGGTATGCTTAAAGACTCCAGGAAAAAGGAATGAAACTTTTCCGAGGGTGCAAGATTT
TCTTCTGCCACTTGCAACTTTCTGTTTAGACATTGTAAGACTTGTACGCTTTAGCTTCCG
ATATTTCCAAGGTTGTTTCCTTCTTTTTTAAAATTAAAAACCATAACGTCCATTGATCAT
TCATGTCCTCTCTGTTTTTATTTATTTATTTAAATAAAACTGAGTG

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 4

CO CL2593Contig1 968 4 10 U
TCTGTTATTGATCAACTGAAAAGCGCAGAGAGAGAGACGAGAGATTGTGGAGGACTTGAT
TGAGAAATCGGCGTCGTTCTTCGGAGACTAATCAATCTCTCTTTCTGCTTGATAGTTGGA
TTGGAAAAGGGAAGAAAGATGGGGAATATGTTCGTGAAGAAACCACAGATCACGGACGTT
GATCGAGCGATTCTCTCTCTCAAAACCCAGAGACGCAAGCTCGCCCAATACCAGCAGCAG
CTTGAGAAAGTAATAGAAGCTGAGAAGCAAGCTGCAAGAGACTTAATCCGAGAAAATCGA
AAAGAGAGGGCTTTGTTAGCTTTGAGGAAGAAACGGACGCAAGAAGACTTGTTGAAGCAA
GTTGATCAGTGGGTCATCAATGTTGAACAGCAATTGGCAGATATTGAACTTACGAGCAAG
CAAAAGGCAGTGTTTGAGAGCTTAAAGCAGGGTAGCAGTGCCATTAAAGCCATTCAAAGC
GAAGTGGAGCTTGATGATGTTCAGAAACTTATGGATGATACCGCTGATGCTAAAGCCTAT
CAAGATGAGTTGAATGCTATATTGGGAGAGAAACTATCAGCAGAGGATGAAGAAGATATA
TTAGCAGAATTTGACAACCTAGAAAGTCAGCTTGCTGTGGATGAGATGCCTGATGTGCCT
ACAACGGAGCCCCAAGAGTCTGAAA*GATAGATCTTCCAGATGTACCAACGGGAAAACCC
ATCGCTTCCAACGCGGAGATCACACCAGCTGAATCCGCCACAAAGAGAAAAGTTCTCGAA
GAACCTTTGCCAGCTTGAGCTAGAAGAAACTAGTCAACAAAACGAGATTATATCATTCTT
TTAGCACTTCTCTTTTATGCTCTTTAAGTTTTCTGTACAATTTAAGTCTCTTGTTGTAAA
GAACAAAGATTTGTGGGATCCCACTGTATGAAAGGATTCAAATTTCAATAATGAAAGAAA
ATCCAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FQ10TF U 23
AF RR2CN76TF U 1
AF RR2FQ10JQ C 191
AF RR2CN76JQ C 207
BS 1 39 RR2CN76TF
BS 40 40 RR2FQ10TF
BS 41 407 RR2CN76TF
BS 408 408 RR2FQ10TF
BS 409 663 RR2CN76TF
BS 664 664 RR2FQ10JQ
BS 665 674 RR2CN76TF
BS 675 675 RR2FQ10JQ
BS 676 706 RR2CN76TF
BS 707 968 RR2FQ10JQ

RD RR2FQ10TF 430 0 0
GG
GCAGAGAGAGAGGCGAGAGATTGTGGAGGACTTGATTGAGAAATCGGCGTCGTTCTTCGG
AGACTAATCAATCTCTCTTTCTGCTTGATAGTTGGATTGGAAAAGGGAAGAAAGATGGGG
AATATGTTCGTGAAGAAACCACCGATCACGGACGTTGATCGAGCGATTCTCTCTCTCAAA
ACCCAGAGACGCAAGCTCGCCCAATACCGGCAGCAGCTTGAGAAAGTAATAGAAGCTGAG
AAGCAAGCTGCAAGAGACTTAATCCGAGAAAATCGAAAAGAGAGGGCTTTGTTAGCTTTG
AGGAAGAAACGGACGCAAGAAGACTTGTTGAAGCAAGTTGATCAGTGGGTCATCAATGTT
GAACAGCAATTGTCAGATATTGAACTTACGAGCAAGCAAAAGGCAGTGTTTGAGAGCTTA
AAGCAGGG

QA 3 430 3 430
DS 

RD RR2CN76TF 710 0 0
TCTGTTATTGATCAACTGAAAAGCGCAGAGAGAGAGACGGGAGATTGTGGAGGACTTGAT
TGAGAAATCGGCGTCGTTCTTCGGAGACTAATCAATCTCTCTTTCTGCTTGATAGTTGGA
TTGGAAAAGGGAAGAAAGATGGGGAATATGTTCGTGAAGAAACCACAGATCACGGACGTT
GATCGAGCGATTCTCTCTCTCAAAACCCAGAGACGCAAGCTCGCCCAATACCAGCAGCAG
CTTGAGAAAGTAATAGAAGCTGAGAAGCAAGCTGCAAGAGACTTAATCCGAGAAAATCGA
AAAGAGAGGGCTTTGTTAGCTTTGAGGAAGAAACGGACGCAAGAAGACTTGTTGAAGCAA
GTTGATCAGTGGGTCATCAATGTTGAACAGCAATTGGCAGATATTGAGCTTACGAGCAAG
CAAAAGGCAGTGTTTGAGAGCTTAAAGCAGGGTAGCAGTGCCATTAAAGCCATTCAAAGC
GAAGTGGAGCTTGATGATGTTCAGAAACTTATGGATGATACCGCTGATGCTAAAGCCTAT
CAAGATGAGTTGAATGCTATATTGGGAGAGAAACTATCAGCAGAGGATGAAGAAGATATA
TTAGCAGAATTTGACAACCTAGAAAGTCAGCTTGCTGTGGATGAGATGCCTGATGTGCCT
ACA*CGGAGCCCCA*GAGTCTGAAA*GATAGATCTTCCAGATGTAC
AACG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2FQ10JQ 778 0 0
TTCTCTCTCTCAAAACCCAGAGACGCAAGCTCGCCCAATACCGGCAGCAGCTTGAGAAAG
TAATAGAAGCTGAGAAGCAAGCTGCAAGAGACTTAATCCGAGAAAATCGAAAAGAGAGGG
CTTTGTTAGCTTTGAGGAAGAAACGGACGCAAGAAGACTTGTTGAAGCAAGTTGATCAGT
GGGTCATCAATGTTGAACAGCAATTGTCAGATATTGAACTTACGAGCAAGCAAAAGGCAG
TGTTTGAGAGCTTAAAGCAGGGTAGCAGTGCCATTAAAGCCATTCAAAGCGAAGTGGAGC
TTGATGATGTTCAGAAACTTATGGATGATACCGCTGATGCTAAAGCCTATCAAGATGAGT
TGAATGCTATATTGGGAGAGAAACTATCAGCAGAGGATGAAGAAGATATATTAGCAGAAT
TTGACAACCTGGAAAGTCAGCTTGCTGTGGATGAGATGCCTGATGTGCCTACAACGGAGC
CCCAAGAGTCA*AAA*GATAGATCTTCCAGGTGTACCAACGGGAAAACCCATCGCTTCCA
ACGCGGAGATCACACCAGCTGAATCCGCCACAAAGAGAAAAGTTCTCGAAGAACCTTTGC
CAGCTTGAGCTAGAAGAAACTAGTCAACAAAACGAGATTATATCATTCTTTTAGCACTTC
TCTTTTATGCTCTTTAAGTTTTCTGTACAATTTAAGTCTCTTGTTGTAAAGAACAAAGAT
TTGTGGGATCCCACTGTATGAAAGGATTCAAATTTCAATAATGAAAGAAAATCCAGAC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2CN76JQ 762 0 0
CCAGAGACGCAAGCTCGCCCAATACCAGCAGCAGCTTGAGAAAGTAATAGAAGCTGAGAA
GCAAGCTGCAAGAGACTTAATCCGAGAAAATCGAAAAGAGAGGGCTTTGTTAGCTTTGAG
GAAGAAACGGACGCAAGAAGACTTGTTGAAGCAAGTTGATCAGTGGGTCATCAATGTTGA
ACAGCAATTGGCAGATATTGAGCTTACGAGCAAGCAAAAGGCAGTGTTTGAGAGCTTAAA
GCAGGGTAGCAGTGCCATTAAAGCCATTCAAAGCGAAGTGGAGCTTGATGATGTTCAGAA
ACTTATGGATGATACCGCTGATGCTAAAGCCTATCAAGATGAGTTGAATGCTATATTGGG
AGAGAAACTATCAGCAGAGGATGAAGAAGATATATTAGCAGAATTTGACAACCTAGAAAG
TCAGCTTGCTGTGGATGAGATGCCTGATGTGCCTACAACGGAGCCCCAAGAGTCTGAAAA
GATAGATCTTCCAGATGTACCAACGGGAAAACCCATCGCTTCCAACGCGGAGATCACACC
AGCTGAATCCGCCACAAAGAGAAAAGTTCTCGAAGAACCTTTGCCAGCTTGAGCTAGAAG
AAACTAGTCAACAAAACGAGATTATATCATTCTTTTAGCACTTCTCTTTTATGCTCTTTA
AGTTTTCTGTACAATTTAAGTCTCTTGTTGTAAAGAACAAAGATTTGTGGGATCCCACTG
TGTGAAAGGATTCAAATTTCAATAATGAAAGAAAATCCAGAC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 4

CO CL2594Contig1 1238 4 6 U
GGGTTCAAAAAAGAAATATCCTCTCTAAAATGCGATTCATAAGGCGATATCTCTCTCTGC
TCCGGTGGTCGGCTTCTCTGTCGTCACCGGAAGCTTCTCCTTTCCACCCTCCTGTTTTTA
TATTTGCTCCCGCTCCTCTCATCTATCTCGACTCCGATATGTTTGACAACCTAGAGGTTG
GTTTCGCGGCGGATCCCTAGCTCTTCTCCGGGGAGAGTAACATCCGGCGATATGGGACTC
CCCTCTTGTAGGTCTACGAGGCGTCAATGGTTGGGTTGAACGGCGAGTCGGTTTTTAGAT
TTCGAATCTGACAGATCTCGTTTTGCGGCGTGTGAGGGATTGTGTTTTCCGTTCACTAGG
GGTGGCAGTGGTTGCTGTTGGTGCGTTCTCAGTTCCTTCTGTAGTCGTGTGGTTGTGGAA
GCATGGAATTAGTACGTAAGTATCTAAAGGCGTGGGGGTTTTCGTCGTCTATGGCGGACT
CATCCTCTTCGTCGACAGCTACCTTCCAGTTGTTTTGTCATCCTCTCGTATTGGGTTTAT
GTACTCAGGCCATCTTGTTATGGGTTTTGGGTGATTCGTTAGCGGCTCTGGTTTGCATCG
GGGTGGTTCAAGCCACCTTGGTTTCGTGTGTTAAGCTTTGGCCCGTGGTAGTGTTAAAGC
TTGAATTCTGTGTAAGGCTAAGTAGTAGATTTGTTTCGTATGGTGGTGTCTCAATGGTCG
TTGGCCGTTTGTTTATTATTCCGTGAGTCTATCTGGAGTGGTTCATCGATTAAAGCTTCG
TGTTGGTTGAAAGTATGTGTGGACTTCTATCTAAAAGTAAGTGGGTGCTAACGCGTCGCA
TCCGTATCCGAAGGTTGTGTGGACCGAGTAGAGTTCCCTCATGTTGAGTTATGAAGTCGT
GGAGTTTGGTTCTGTGGACGTTATCGTTTGGCGGGCGTGAGCAGCAACGAAGAGTCAAGA
TGCACTTGGTGTAAGAAGTGGATATTGTCGCGTGGCGAGCTATAGGCAGCAGCGAAAATT
CCCGATCGTTGAACACTACTTGGATTTAAATTTTCTTATTTAGCTTGGTAAGTTGTTAAG
TTTTTAAGTTGGCATGATTGTTTTGTTGCTTTAAGTTATCCCGGAGTGGGTTCCAGCTGC
CGTCTTCATGTGGATTCTTGTATTTGGAGATTGTTGGTTCATCTGCCAGTTTATGTATCT
TGTACGTTTCTTTGAAATAAAATGGTACTCTTCCTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DO89TF U 32
AF RR2E335TF U 1
AF RR2DO89JQ C 507
AF RR2E335JQ C 562
BS 1 298 RR2E335TF
BS 299 299 RR2DO89TF
BS 300 676 RR2E335TF
BS 677 974 RR2DO89JQ
BS 975 977 RR2E335JQ
BS 978 1238 RR2DO89JQ

RD RR2DO89TF 589 0 0
GG
GATTCATAAGGCGATATCTCTCTCTGCTCCGGTGGTCGGCTTCTCTGTCGTCACCGGAAG
CTTCTCCTTTCCACCCTCCTGTTTTTATATTTGCTCCCGCTCCTCTCATCTATCTCGACT
CCGATATGTTTGACAACCTAGAGGTTGGTTTCGCGGCGGATCCCTAGCTCTTCTCCGGGG
AGAGTAACATCCGGCGATATGGGATTCCCCTCTTGTAGGTCTACGAGGCGTCAATGGTTG
GGTTGAACGGCGAGTCGGTTTTTAGATTTCGAATCTGACAGATCTCGTTTTGCGGCGTGT
GAGGGATTGTGTTTTCCGTTCACTAGGGGTGGCAGTGGTTGCTGTTGGTGCGTTCTCAGT
TCCTTCTGTAGTCGTGTGGTTGTGGAAGCATGGAATTAGTACGTAAGTATCTAAAGGCGT
GGGGGTTTTCGTCGTCTATGGCGGACTCATCCTCTTCGTCGACAGCTACCTTCCAGTTGT
TTTGTCATCCTCTCGTATTGGGTTTATGTACTCAGGCCATCTTGTTATGGGTTTTGGGTG
ATTCGTTAGCGGCTCTGGTTTGCATCGGGGTGGTTCAAGCCACCTTG

QA 3 589 3 589
DS 

RD RR2E335TF 680 0 0
GGGTTCAAAAAAGAAATATCCTCTCTAAAATGCGATTCATAAGGCGATATCTCTCTCTGC
TCCGGTGGTCGGCTTCTCTGTCGTCACCGGAAGCTTCTCCTTTCCACCCTCCTGTTTTTA
TATTTGCTCCCGCTCCTCTCATCTATCTCGACTCCGATATGTTTGACAACCTAGAGGTTG
GTTTCGCGGCGGATCCCTAGCTCTTCTCCGGGGAGAGTAACATCCGGCGATATGGGACTC
CCCTCTTGTAGGTCTACGAGGCGTCAATGGTTGGGTTGAACGGCGAGTCGGTTTTTAGGT
TTCGAATCTGACAGATCTCGTTTTGCGGCGTGTGAGGGATTGTGTTTTCCGTTCACTAGG
GGTGGCAGTGGTTGCTGTTGGTGCGTTCTCAGTTCCTTCTGTAGTCGTGTGGTTGTGGAA
GCATGGAATTAGTACGTAAGTATCTAAAGGCGTGGGGGTTTTCGTCGTCTATGGCGGACT
CATCCTCTTCGTCGACAGCTACCTTCCAGTTGTTTTGTCATCCTCTCGTATTGGGTTTAT
GTACTCAGGCCATCTTGTTATGGGTTTTGGGTGATTCGTTAGCGGCTCTGGTTTGCATCG
GGGTGGTTCAAGCCACCTTGGTTTCGTGTGTTAAGCTTTGGCCCGTGGTAGTGTTAAAGC
TTGAATTCTGTGTAAG
CTAA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2DO89JQ 732 0 0
CAGTTGTTTTGTCATCCTCTCGTATTGGGTTTATGTACTCAGGCCATCTTGTTATGGGTT
TTGGGTGATTCGTTAGCGGCTCTGGTTTGCATCGGGGTGGTTCAAGCCACCTTGGTTTCG
TGTGTTAAGCTTTGGCCCGCGGTAGTGTTAAAGCTTGAATTCTGTGTAAGGCTAAGTAGT
AGATTTGTTTCGTATGGTGGTGTCTCAATGGTCGTTGGCCGTTTGTTTATTATTCCGTGA
GTCTATCTGGAGTGGTTCATCGATTAAAGCTTCGTGTTGGTTGAAAGTATGTGTGGACTT
CTATCTAAAAGTAAGTGGGTGCTAACGCGTCGCATCCGTATCCGAAGGTTGTGTGGACCG
AGTAGAGTTCCCTCATGTTGAGTTATGAAGTCGTGGAGTTTGGTTCTGTGGACGTTATCG
TTTGGCGGGCGTGAGCAGCAACGAAGAGTCAAGATGCACTTGGTGTAA***GTGGATATT
GTCGCGTGGCGAGCTATAGGCAGCAGCGAAAATTCCCGATCGTTGAACACTACTTGGATT
TAAATTTTCTTATTTAGCTTGGTAAGTTGTTAAGTTTTTAAGTTGGCATGATTGTTTTGT
TGCTTTAAGTTATCCCGGAGTGGGTTCCAGCTGCCGTCTTCATGTGGATTCTTGTATTTG
GAGATTGTTGGTTCATCTGCCAGTTTATGTATCTTGTACGTTTCTTTGAAATAAAATGGT
ACTCTTCCTGTG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2E335JQ 677 0 0
GGGTTTTGGGTGATTCGTTAGCGGCTCTGGTTTGCATCGGGGTGGTTCAAGCCCCCTTGG
TTTCGTGTGTTAAGCTTTGGCCCGTGGTAGTGTTAAAGCTTGAATTCTGTGTAAGGCTAA
GTAGTAGATTTGTTTCGTATGGTGGTGTCTCAATGGTCGTTGGTCGTTTGTTTATTATTC
CGTGAGTCTATCTGGAGTGGTTCATCGATTAAAGCTTCGTGTTGGTTGAAAGTATGTGTG
GACTTCTATCTAAAAGTAAGTGGGTGCTAACGCGTCGCATCCGTATCCGAAGGTTGTGTG
GACCGAGTAGAGTTCCCTCATGTTGAGTTATGAAGTCGTGGAGTTTGGTTCTGTGGACGT
TATCGTTTGGCGGGCGTGAGCAGCAACGAAGAGTCAAGATGCACTTGGTGTAAGAAGTGG
ATATTGTCGCGTGGCGAGCTATAGGCAGCAGCGAAAATTCCCGATCGTTGAACACTACTT
GGATTTAAATTTTCTTATTTAGCTTGGTAAGTTGTTAAGTTTTTAAGTTGGCATGATTGT
TTTGTTGCTTTAAGTTATCCCGGAGTGGGTTCCAGCTGCCGTCTTCATGTGGATTCTTGT
ATTTGGAGATTGTTGGTTCATCTGCCAGTTTATGTATCTTGTACGTTTCTTTGAAATAAA
ATGGTACTCTTCCTGTG

QA 1 677 1 677
DS 



AS 2 4

CO CL2595Contig1 761 2 1 U
CTAATAATACAAACATCTGTTCATCTGCATATCTTGGAATAAAGGTTAAATCTTCCATGA
CACCAAAAAAAAACAATAATGTTACAGATGGGTCAACTAAAAAGAGAGAGGCCTTGATAT
ATGATACAAATGAAAGAAAACACAACGTTCAAATAACACAATACACAAGAGGAAATAAGG
CAGTTTAATAGTAGCTATTTGCCTTCCTCCAGGTAGAGCTAGGTTCCTCTTCTGCTTCGG
CTACCAAAACCATGAACCAAACGAGATGGTCCTCCACTCGTCTCCGCTCCTTTAAGTTTC
TGTGCTTCCAGAGCCTCTGCTTCACTCATCAGCATTGCTAACCGGATCTTGTTTTCCCTC
AGCCTATCTTGAAGTGCATTTACAGCAGGACTCAAGCAGTACTCAATCAGCTTGCACATG
GAAGCCTGATACGTTGATGTGTTGTGAATGAAAGCAAGGGGATGAACTTTTCCATTTCTC
ATGCTTTGCAGGACGGATTGGTGGTATGCTGCTCGTTCCTCCTCGTAGAGCACTCGTTGC
AGATCTTTAAAAGAGGCTAAAGGTGAACTGAGCTGAAGAAGTGATGAAGTCGGTAAAACA
TGAAGCGGGACTTCTTTTCTAGTATACCCTACACCACTAGTTTCCAAGTTGGAACGGAGC
ATGGCCTCTTGCATGCTTTCCGACATGTCCATTGGATCAATTTCCACAACTGAGCTGCTG
GCATTGCCTGAGCTGTAGTTCCACTCGTCCCGGTGGTGTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW49JQ U 1
AF RR2GE64JQ U 1
BS 1 761 RR2GE64JQ

RD RR2GW49JQ 709 0 0
CTAATAATACAAACATCTGTTCATCTGCATATCTTGGAATAAAGGTTAAATCTTCCATGA
CACCAAAAAAAAACAATAATGTTACAGATGGGTCAACTAAAAAGAGAGAGGCCTTGATAT
ATGATACAAATGAAAGAAAACACAACGTTCAAATAACACAATACACAAGAGGAAATAAGG
CAGTTTAATAGTAGCTATTTGCCTTCCTCCAGGTAGAGCTAGGTTCCTCTTCTGCTTCGG
CTACCAAAACCATGAACCAAACGAGATGGTCCTCCACTCGTCTCCGCTCCTTTAAGTTTC
TGTGCTTCCAGAGCCTCTGCTTCACTCATCAGCATTGCTAACCGGATCTTGTTTTCCCTC
AGCCTATCTTGAAGTGCATTTACAGCAGGACTCAAGCAGTACTCAATCAGCTTGCACATG
GAAGCCTGATACGTTGATGTGTTGTGAATGAAAGCAAGGGGATGAACTTTTCCATTTCTC
ATGCTTTGCAGGACGGATTGGTGGTATGCTGCTCGTTCCTCCTCGTAGAGCACTCGTTGC
AGATCTTTAAAAGAGGCTAAAGGTGAACTGAGCTGAAGAAGTGATGAAGTCGGTAAAACA
TGAAGCGGGACTTCTTTTCTAGTATACCCTACACCACTAGTTTCCAAGTTGGAACGGAGC
ATGGCCTCTTGCATGCTTTCCGACATGTCCATTGGATCAATTTCCACAA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2GE64JQ 761 0 0
CTAATAATACAAACATCTGTTCATCTGCATATCTTGGAATAAAGGTTAAATCTTCCATGA
CACCAAAAAAAAACAATAATGTTACAGATGGGTCAACTAAAAAGAGAGAGGCCTTGATAT
ATGATACAAATGAAAGAAAACACAACGTTCAAATAACACAATACACAAGAGGAAATAAGG
CAGTTTAATAGTAGCTATTTGCCTTCCTCCAGGTAGAGCTAGGTTCCTCTTCTGCTTCGG
CTACCAAAACCATGAACCAAACGAGATGGTCCTCCACTCGTCTCCGCTCCTTTAAGTTTC
TGTGCTTCCAGAGCCTCTGCTTCACTCATCAGCATTGCTAACCGGATCTTGTTTTCCCTC
AGCCTATCTTGAAGTGCATTTACAGCAGGACTCAAGCAGTACTCAATCAGCTTGCACATG
GAAGCCTGATACGTTGATGTGTTGTGAATGAAAGCAAGGGGATGAACTTTTCCATTTCTC
ATGCTTTGCAGGACGGATTGGTGGTATGCTGCTCGTTCCTCCTCGTAGAGCACTCGTTGC
AGATCTTTAAAAGAGGCTAAAGGTGAACTGAGCTGAAGAAGTGATGAAGTCGGTAAAACA
TGAAGCGGGACTTCTTTTCTAGTATACCCTACACCACTAGTTTCCAAGTTGGAACGGAGC
ATGGCCTCTTGCATGCTTTCCGACATGTCCATTGGATCAATTTCCACAACTGAGCTGCTG
GCATTGCCTGAGCTGTAGTTCCACTCGTCCCGGTGGTGTGG

QA 1 761 1 761
DS 



CO CL2595Contig2 754 2 1 U
TTTTTTTGTCTACTTTAGATTTGGTTATTAAAGAGAAAAATAAAAAAAGAGAGTTCCTTG
ACCTTAAAATCGACACGGAATGAGCATATCAACGGGCAGAACAACACGTGTGATTGGATG
GTATCACTCCCATCCTCATATAACCGTCCTTCCTTCCCATGTCGATGTTCGGACACAAGC
AATGTATCAGCTTCTTGATTCTGGTTTTATTGGCCTCATTTTCTCCTGTTTTAGTGAAGA
TGCTAACAAGGTTGGTAGGATCCAAGTTATTGCTTTCCAGTCCTCTGATGGAAACCCCAA
TACTCCTCCTAAATCAATGAGCCTGGTTCTTTCAAATAAAGACTCTGTTATCGATCTAGA
ATCCTCTTTAAGTTCTTCAGACTCAGTATACCAGAGTTCCTCTTCTGCTGGGAGACACAA
TCCTGACCGAGACACAACTGATACAGCTTCAACTTCCGGACCTAAGAGTGGGGGACGAGT
TTCAGATTTTGGGGCTTTCTTTGTTAACAATGCTGAGGCCAACACCACCGGGACGAGTGG
AAACTACAGCTCAGGCAATGCCAGCAGCTCAGTTGTGGAAATTGATCCAATGGACATGTC
GGAAAGCATGCAAGAGGCCATGCTCCGTTCCAACTTGGAAACTAGTGGTGTAGGTATACT
AGAAAAGAAGTCCCGCTTCATGTTTTACCGACTTCATCACTTCTTCAGCTCAGTCACCTT
TAGCTCTTTTAAGATCTGCACGAGTGCTCTACGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW49TF U 1
AF RR2GE64TF U 1
BS 1 754 RR2GE64TF

RD RR2GW49TF 550 0 0
TTTTTTTGTCTACTTTAGATTTGGTTATTAAAGAGAAAAATAAAAAAAGAGAGTTCCTTG
ACCTTAAAATCGACACGGAATGAGCATATCAACGGGCAGAACAACACGTGTGATTGGATG
GTATCACTCCCATCCTCATATAACCGTCCTTCCTTCCCATGTCGATGTTCGGACACAAGC
AATGTATCAGCTTCTTGATTCTGGTTTTATTGGCCTCATTTTCTCCTGTTTTAGTGAAGA
TGCTAACAAGGTTGGTAGGATCCAAGTTATTGCTTTCCAGTCCTCTGATGGAAACCCCAA
TACTCCTCCTAAATCAATGAGCCTGGTTCTTTCAAATAAAGACTCTGTTATCGATCTAGA
ATCCTCTTTAAGTTCTTCAGACTCAGTATACCAGAGTTCCTCTTCTGCTGGGAGACACAA
TCCTGACCGAGACACAACTGATACAGCTTCAACTTCCGGACCTAAGAGTGGGGGACGAGT
TTCAGATTTTGGGGCTTTCTTTGTTAACAATGCTGAGGCCAACACCACCGGGACGAGTGG
AAACTACAGC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2GE64TF 754 0 0
TTTTTTTGTCTACTTTAGATTTGGTTATTAAAGAGAAAAATAAAAAAAGAGAGTTCCTTG
ACCTTAAAATCGACACGGAATGAGCATATCAACGGGCAGAACAACACGTGTGATTGGATG
GTATCACTCCCATCCTCATATAACCGTCCTTCCTTCCCATGTCGATGTTCGGACACAAGC
AATGTATCAGCTTCTTGATTCTGGTTTTATTGGCCTCATTTTCTCCTGTTTTAGTGAAGA
TGCTAACAAGGTTGGTAGGATCCAAGTTATTGCTTTCCAGTCCTCTGATGGAAACCCCAA
TACTCCTCCTAAATCAATGAGCCTGGTTCTTTCAAATAAAGACTCTGTTATCGATCTAGA
ATCCTCTTTAAGTTCTTCAGACTCAGTATACCAGAGTTCCTCTTCTGCTGGGAGACACAA
TCCTGACCGAGACACAACTGATACAGCTTCAACTTCCGGACCTAAGAGTGGGGGACGAGT
TTCAGATTTTGGGGCTTTCTTTGTTAACAATGCTGAGGCCAACACCACCGGGACGAGTGG
AAACTACAGCTCAGGCAATGCCAGCAGCTCAGTTGTGGAAATTGATCCAATGGACATGTC
GGAAAGCATGCAAGAGGCCATGCTCCGTTCCAACTTGGAAACTAGTGGTGTAGGTATACT
AGAAAAGAAGTCCCGCTTCATGTTTTACCGACTTCATCACTTCTTCAGCTCAGTCACCTT
TAGCTCTTTTAAGATCTGCACGAGTGCTCTACGA

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL2596Contig1 1333 2 4 U
GGGCGGACAAAACAGAGAGCGAGTCGAACTCCGAGTCACACGGCGAGTTATTCTCCTCCA
CTCACTCTTTATCTCAATATATCCCTCATCTTCTCCTCGTTACTCTGCTCTCCTCTCCTC
AAGATCTTGAACCCTCTCGTTAATTTAACAGTATTTCAAGAAATGGAAACGTTCCTATTC
ACATCTGAATCAGTCAACGAGGGACATCCCGACAAGCTCTGCGACCAGGTTTCCGACGCC
ATCCTCGATGCTTGTTTAGAACAAGACCCTGAAAGCAAAGTCGCTTGCGAGACATGCACA
AAGACCAACATGGTGATGGTGTTCGGTGAGATCACAACCTCTGCTAAAGTAGACTACGAG
AAGATCGTTAGATCCACTTGCAGAGAGATCGGTTTCATCTCAGCTGATGTTGGTCTTGAC
GCTGACAAGTGCAATGTCTTGGTCAACATTGAGCAACAGAGTCCCGACATTGCTCAGGGA
GTTCACGGTCATTTGACCAAGAAGCCTGAAGATATCGGAGCTGGTGATCAGGGACATATG
TTCGGTTACGCTACCGATGAGACACCTGAGCTTATGCCTTTGACTCATGTCTTGGCCACC
AAGCTTGGTGCTAAGCTTACTGAAGTGAGGAAGAACAAGACTTGTCCCTGGTTGAGACCT
GATGGTAAGACACAAGTCACGGTCGAGTACAAGAACGATGGTGGAGCTATGATTCCCATT
AGAGTCCACACGGTTTTGATCTCAACTCAACATGATGAAACTGTCACCAACGATGAGATT
GCTGCTGACTTGAAGGAGCATGTGATCAAGCCGGTTATTCCTGCCAAGTACCTTGATGAG
AACACCATTTTTCACCTTAACCCATCTGGTCGTTTTGTCATCGGAGGGCCTCATGGTGAT
GCTGGACTCACGGGGAGGAAGATCATCATCGACACTTATGGTGGTTGGGGTGCTCATGGT
GGAGGTGCTTTCTCAGGGAAAGACCCCACCAAGGTTGATAGAAGCGGTGCCTACATCGTT
AGGCAAGCTGCAAAGAGTGTGGTTGCTGCTGGACTTGCACGCCGCTGTATAGTCCAGGTG
TCATACGCCATTGGTGTCCCTGAGCCTCTCTCGGTGTTTGTTGATACCTACAAGACCGGG
ACCATACCAGACAAGGACATACTTGTGTTGATCAAGGAGGCCTTTGACTTCAGGCCGGGC
ATGATGGCTATTAACCTTGACTTGAAGAGAGGAGGTAACTTCAGGTTCCAGAAAACAGCT
GCTTATGGCCATTTTGGACGTGAAGACCCTGATTTCACTTGGGAGGTCATCAAGCCACTT
AAGCCAAAGGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD42TF U 1
AF RR2CD42JQ C 582
BS 1 691 RR2CD42TF
BS 692 692 RR2CD42JQ
BS 693 749 RR2CD42TF
BS 750 1333 RR2CD42JQ

RD RR2CD42TF 757 0 0
GGGCGGACAAAACAGAGAGCGAGTCGAACTCCGAGTCACACGGCGAGTTATTCTCCTCCA
CTCACTCTTTATCTCAATATATCCCTCATCTTCTCCTCGTTACTCTGCTCTCCTCTCCTC
AAGATCTTGAACCCTCTCGTTAATTTAACAGTATTTCAAGAAATGGAAACGTTCCTATTC
ACATCTGAATCAGTCAACGAGGGACATCCCGACAAGCTCTGCGACCAGGTTTCCGACGCC
ATCCTCGATGCTTGTTTAGAACAAGACCCTGAAAGCAAAGTCGCTTGCGAGACATGCACA
AAGACCAACATGGTGATGGTGTTCGGTGAGATCACAACCTCTGCTAAAGTAGACTACGAG
AAGATCGTTAGATCCACTTGCAGAGAGATCGGTTTCATCTCAGCTGATGTTGGTCTTGAC
GCTGACAAGTGCAATGTCTTGGTCAACATTGAGCAACAGAGTCCCGACATTGCTCAGGGA
GTTCACGGTCATTTGACCAAGAAGCCTGAAGATATCGGAGCTGGTGATCAGGGACATATG
TTCGGTTACGCTACCGATGAGACACCTGAGCTTATGCCTTTGACTCATGTCTTGGCCACC
AAGCTTGGTGCTAAGCTTACTGAAGTGAGGAAGAACAAGACTTGTCCCTGGTTGAGACCT
GATGGTAAGACACAAGTCACGGTCGAGTACA*GAACGATGGTGGAGCTATGATTCCCATT
AGAGTCCACACGGTTTTGATCTCAACTCA
CATGATGA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2CD42JQ 752 0 0
GACTCATGTCTTGGCCACCAAGCTTGGTGCTAAGCTTACTGAAGTGAGGAAGAACAAGAC
TTGTCCCTGGTTGAGACCTGATGGTAAGACACAAGTCACGGTCGAGTACAAGAACGATGG
TGGAGCTATGATTCCCATTAGAGTCCACACGGTTTTGATCTCAACTCAACATGATGAAAC
TGTCACCAACGATGAGATTGCTGCTGACTTGAAGGAGCATGTGATCAAGCCGGTTATTCC
TGCCAAGTACCTTGATGAGAACACCATTTTTCACCTTAACCCATCTGGTCGTTTTGTCAT
CGGAGGGCCTCATGGTGATGCTGGACTCACGGGGAGGAAGATCATCATCGACACTTATGG
TGGTTGGGGTGCTCATGGTGGAGGTGCTTTCTCAGGGAAAGACCCCACCAAGGTTGATAG
AAGCGGTGCCTACATCGTTAGGCAAGCTGCAAAGAGTGTGGTTGCTGCTGGACTTGCACG
CCGCTGTATAGTCCAGGTGTCATACGCCATTGGTGTCCCTGAGCCTCTCTCGGTGTTTGT
TGATACCTACAAGACCGGGACCATACCAGACAAGGACATACTTGTGTTGATCAAGGAGGC
CTTTGACTTCAGGCCGGGCATGATGGCTATTAACCTTGACTTGAAGAGAGGAGGTAACTT
CAGGTTCCAGAAAACAGCTGCTTATGGCCATTTTGGACGTGAAGACCCTGATTTCACTTG
GGAGGTCATCAAGCCACTTAAGCCAAAGGCTT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 3

CO CL2597Contig1 1214 3 16 U
GGGAAGCTAAGAATCTGATTGTCCGAATTTCCGTGCGTGCTCAAACGACAACGCTTTTGA
AGTTTTTGGCTATGGCGGAATCATCTTCGTCTTCATCGTCGTCGCCATCGCCTACCGAAG
AGATTGTTCGATTGATCAAACGGTTAAGCGCTTACGTAACTTTCAAGATGTCTAGCCTCT
TCTCTACATCTATTCCCAATCTGGATTCAAGATCTATTGGTGCAATCGCGGGGCTTGCGA
TAGCTGTGATATTCACATGGAGGGCTATAAGAAGACCACCAGGGGAGCCTCGAAGAAGGC
AGCCAAAACGCAGGATGCAGCAGTCAGCTGAATCCTCCTCCTCCACTACTGCTGCTGCTG
CTCAGTCAGATGTTTCTTTGCCTCATGAGGATAACGGAGTGCAAGATGTTGTTGATCACT
TCTTTCAGCCTGTCAAACCTACACTGGGGCAGATTGTTAGGCAGAAGCTTAGTGAAGGAA
GGAAGGTAACATGCCGTCTTCTTGGAGTCATTCTTGAGGAATCAAGTCCAGAAGAACTCC
AAAAACAAGCAACAGTGAGGTCATCGGTTCTGGAAGTTCTCCTAGAGATTACAAAGTATT
CTGATTTATATCTCATGGAAAGAGTTCTTGACGACGAAAGTGAAGCCAGAGTTCTACAGG
CTTTAGAGACTGCAGGCGTTTTCACCTCTGGTGGTTTGGTCAAAGATAAGGTCCTGTTTT
GTAGTACAGAGATCGGAAGAACATCCTTTGTTAGACAAATAGAACCTGACTGGCATATTG
ATACAAACCCAGAGATCAGCACACAACTAGCTCGGTTCATCAAATACCAGCTTCACGTGT
CTGCATTGAAACCAGAGCGAACGGCTCCCAACGTGTTCACATCGCAGTCTATAGAGCAGT
TCTTTGGATGTGCTTAATCAAAAAAGAGAGGTGAAAGATAAGCAACAAAACCTACAAACT
CACAATGTTCAGTTTGATCATCTTCTTGTTCTGACAGAAGCAGAGAGGCGTAAATGGTCT
CGTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTGTGTTGTTGTTTGGTCATTAAGAATGTACTGCGAGTGT
TATCCGGCGGAAGTAAAGAAACTTGTAATTTCTGTATCAACAACATAATCGTGTTTTCTT
CTTGCATCAATAGGATCTTGTAATGCGAAGTTGTAGACACCTCCTTCATAGATACATTTC
AATAAATTTTCAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E157TF U 1
AF RR2A374TF U 1
AF RR2A374JQ C 564
BS 1 49 RR2A374TF
BS 50 50 RR2E157TF
BS 51 82 RR2A374TF
BS 83 83 RR2E157TF
BS 84 88 RR2A374TF
BS 89 89 RR2E157TF
BS 90 94 RR2A374TF
BS 95 95 RR2E157TF
BS 96 343 RR2A374TF
BS 344 344 RR2E157TF
BS 345 345 RR2A374TF
BS 346 346 RR2E157TF
BS 347 347 RR2A374TF
BS 348 348 RR2E157TF
BS 349 724 RR2A374TF
BS 725 1214 RR2A374JQ

RD RR2E157TF 655 0 0
GGGAAGCTAAGAATCTGATTGTCCGAATTTCCGTGC****TCAAACGACAACGCTTTTGA
AGTTTT*GGCTATGGCGGAATCATCTTCGTCTTCATCGTCG***CCATCGCCTACCGAAG
AGATTGTTCGATTGATCAAACGGTTAAGCGCTTACGTAACTTTCAAGATGTCTAGCCTCT
TCTCTACATCTATTCCCAATCTGGATTCAAGATCTATTGGTGCAATCGCGGGGCTTGCGA
TAGCTGTGATATTCACATGGAGGGCTATAAGAAGACCACCAGGGGAGCCTCGAAGAAGTC
AGCCAAAACGCAGGATGCAGCAGTCAGCTGAATCTTCCTCCTCCTCTAGTGCTGCTGCTG
CTCAGTCAGATGTTTCTTTGCCTCATGAGGATAACGGAGTGCAAGATGTTGTTGATCACT
TCTTTCAGCCTGTCAAACCTACACTGGGGCAGATTGTTAGGCAGAAGCTTAGTGAAGGAA
GGAAGGTAACGTGCCGTCTTCTTGGAGTCATTCTTGAGGAATCAAGTCCAGAAGAACTCC
AAAAACAAGCAACAGTGAGGTCATCGGTTCTGGAAGTTCTCCTAGAGATTACAAAGTATT
CTGATTTATATCTCATGGAAAGAGTTCTTGACGACGAAAGTGAAGCCAGAGTTCT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2A374TF 724 0 0
GGGAAGCTAAGAATCTGATTGTCCGAATTTCCGTGCGTGCTCAAACGACGACGCTTTTGA
AGTTTTTGGCTATGGCGGAATCGTCTTCTTCTTCGTCGTCGTCGCCATCGCCTACCGAAG
AGATTGTTCGATTGATCAAACGGTTAAGCGCTTACGTAACTTTCAAGATGTCTAGCCTCT
TCTCTACATCTATTCCCAATCTGGATTCAAGATCTATTGGTGCAATCGCGGGGCTTGCGA
TAGCTGTGATATTCACATGGAGGGCTATAAGAAGACCACCAGGGGAGCCTCGAAGAAGGC
AGCCAAAACGCAGGATGCAGCAGTCAGCTGAATCCTCCTCCTCTAGTGCTGCTGCTGCTG
CTCAGTCAGATGTTTCTTTGCCTCATGAGGATAACGGAGTGCAAGATGTTGTTGATCACT
TCTTTCAGCCTGTCAAACCTACACTGGGGCAGATTGTTAGGCAGAAGCTTAGTGAAGGAA
GGAAGGTAACATGCCGTCTTCTTGGAGTCATTCTTGAGGAATCAAGTCCAGAAGAACTCC
AAAAACAAGCAACAGTGAGGTCATCGGTTCTGGAAGTTCTCCTAGAGATTACAAAGTATT
CTGATTTATATCTCATGGAAAGAGTTCTTGACGACGAAAGTGAAGCCAGAGTTCTACAGG
CTTTAGAGACTGCAGGCGTTTTCACCTCTGGTGGTTTGGTCAAAGATAAGGTCCTGTTTT
GTAG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2A374JQ 651 0 0
TCGGTTCTGGAAGTTCTCCTAGAGATTACAAAGTATTCTGATTTATATCTCATGGAAAGA
GTTCTTGACGACGAAAGTGAAGCCAGAGTTCTACAGGCTTTAGAGACTGCAGGCGTTTTC
ACCTCTGGTGGTTTGGTCAAAGATAAGGTCCTGTTTTGTAGTACAGAGATCGGAAGAACA
TCCTTTGTTAGACAAATAGAACCTGACTGGCATATTGATACAAACCCAGAGATCAGCACA
CAACTAGCTCGGTTCATCAAATACCAGCTTCACGTGTCTGCATTGAAACCAGAGCGAACG
GCTCCCAACGTGTTCACATCGCAGTCTATAGAGCAGTTCTTTGGATGTGCTTAATCAAAA
AAGAGAGGTGAAAGATAAGCAACAAAACCTACAAACTCACAATGTTCAGTTTGATCATCT
TCTTGTTCTGACAGAAGCAGAGAGGCGTAAATGGTCTCGTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTG
TGTTGTTGTTTGGTCATTAAGAATGTACTGCGAGTGTTATCCGGCGGAAGTAAAGAAACT
TGTAATTTCTGTATCAACAACATAATCGTGTTTTCTTCTTGCATCAATAGGATCTTGTAA
TGCGAAGTTGTAGACACCTCCTTCATAGATACATTTCAATAAATTTTCAAC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 3

CO CL2598Contig1 648 3 11 U
GAAGAAAGAGATCGAAACAATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAGCACTTAATGTGCGA
TGTCGATGACGGCCAAGGTCACCACCTCACCGCTGCCGCCATCATCGGCCATGTCGGTAG
CGTTTGGGCTCAGAGCGCTAATTTTCCTCAGTTCAAGCCTCAAGAGATGACAGATATCAT
GAAAGATTTCGATGAGCCGGGTCACCTTGCTCCCACTGGTATGTTTCTTGCAGGACTAAA
GTATATGGTCATCCAAGGCGAGCCTGGTGCAGTCATCCGTGGCAGGAAGGGAGCTGGAGG
AATAACGATCAAGTAAACAGGACAATCAATGGTGTTTGGTTTGTACGAAGAACCGGTGAC
TCCAGGACAATGTAACATGGTCGTCGAGAGGTTGGGTGATTACTTGATCGAACAGGACCT
CTGAGCTTTCTAGAATGCTCCATTGCTGTTATTCAAATCCTTTAAACTATTGTTTCACCT
TTGTTTTTCTTTTGGTTGGGTGCATGGGTTTCTTTTTTTTTACTAATTTAATTTTGGTAT
TTCTGGTTTCTACTTAGCAAAGTTTAAAACAAGCCTAAGGTTGCAGATAATAACACAAAA
GAAGAAACCTTCATCTTTTTCTTGTTTTTTTCATTAATTTTTTAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D452TF U 8
AF RR2D452JQ C 8
AF RR2FP83TF U 1
BS 1 65 RR2FP83TF
BS 66 66 RR2D452TF
BS 67 108 RR2FP83TF
BS 109 109 RR2D452TF
BS 110 113 RR2FP83TF
BS 114 114 RR2D452TF
BS 115 284 RR2FP83TF
BS 285 285 RR2D452TF
BS 286 313 RR2FP83TF
BS 314 314 RR2D452TF
BS 315 648 RR2FP83TF

RD RR2D452TF 582 0 0
GAGATCGAAACAATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAGCACTTAATGTGCGATGTCGAT
GACGGCCAAGGTCACCACCTCACCGCTGCCGCCATCATCGGCCATGTCGGTAGCGTTTGG
GCTCAGAGCGCTAATTTTCCTCAGTTCAAGCCTCAAGAGATGACAGATATCATGAAAGAT
TTCGATGAGCCGGGTCACCTTGCTCCCACTGGTATGTTTCTTGCAGGACTAAAGTATATG
GTCATCCAAGGCGAGCCTGGTGCAGTCATCCGTGGCAGGAAGGGAGCTGGAGGAATAACG
ATCAAGTAAACAGGACAATCAATGGTGTTTGGTTTGTACGAAGAACCGGTGACTCCAGGA
CAATGTAACATGGTCGTCGAGAGGTTGGGTGATTACTTGATCGAACAGGACCTCTGAGCT
TTCTAGAATGCTCCATTGCTGTTATTCAAATCCTTTAAACTATTGTTTCACCTTTGTTTT
TCTTTTGGTTGGGTGCATGGGTTTCTTTTTTTTTACTAATTTAATTTTGGTATTTCTGGT
TTCTACTTAGCAAAGTTTAAAACAAGCCTAAGGTTGCAG
AAA

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2D452JQ 579 0 0
GAGATCGAAACAATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAGCACTTAATGTGCGATGTCGAT
GACGGCCAAGGTCACCACCTCACCGCTGCCGCCATCATCGGCCATGTCGGTAGCGTTTGG
GCTCAGAGCGCTAATTTTCCTCAGTTCAAGCCTCAAGAGATGACAGATATCATGAAAGAT
TTCGATGAGCCGGGTCACCTTGCTCCCACTGGTATGTTTCTTGCAGGACTAAAGTATATG
GTCATCCAAGGCGAGCCTGGTGCAGTCATCCGTGGCAGGAAGGGAGCTGGAGGAATAACG
ATCAAGTAAACAGGACAATCAATGGTGTTTGGTTTGTACGAAGAACCGGTGACTCCAGGA
CAATGTAACATGGTCGTCGAGAGGTTGGGTGATTACTTGATCGAACAGGACCTCTGAGCT
TTCTAGAATGCTCCATTGCTGTTATTCAAATCCTTTAAACTATTGTTTCACCTTTGTTTT
TCTTTTGGTTGGGTGCATGGGTTTCTTTTTTTTTACTAATTTAATTTTGGTATTTCTGGT
TTCTACTTAGCAAAGTTTAAAACAAGCCTAAGGTTGCAG

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2FP83TF 648 0 0
GAAGAAAGAGATCGAAACAATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAGCACTTAATGTGCGA
TGTCGGTGACGGCCAAGGTCACCACCTCACCGCTGCCGCCATCATCGGTCATGACGGTAG
CGTTTGGGCTCAGAGCGCTAATTTTCCTCAGTTCAAGCCTCAAGAGATGACAGATATCAT
GAAAGATTTCGATGAGCCGGGTCACCTTGCTCCCACTGGTATGTTTCTTGCAGGACTAAA
GTATATGGTCATCCAAGGCGAGCCTGGTGCAGTCATCCGTGGCAAGAAGGGAGCTGGAGG
AATAACGATCAAGAAAACAGGACAATCAATGGTGTTTGGTTTGTACGAAGAACCGGTGAC
TCCAGGACAATGTAACATGGTCGTCGAGAGGTTGGGTGATTACTTGATCGAACAGGACCT
CTGAGCTTTCTAGAATGCTCCATTGCTGTTATTCAAATCCTTTAAACTATTGTTTCACCT
TTGTTTTTCTTTTGGTTGGGTGCATGGGTTTCTTTTTTTTTACTAATTTAATTTTGGTAT
TTCTGGTTTCTACTTAGCAAAGTTTAAAACAAGCCTAAGGTTGCAGATAATAACACAAAA
GAAGAAACCTTCATCTTTTTCTTGTTTTTTTCATTAATTTTTTAATTT

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 4

CO CL2599Contig1 773 4 4 U
GGACACACACCCCTTTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTTCTTCACAAGCCCTC
CTTT*GCTCACACTGTCTATGGTGTTAATCCCCTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATG
GCTCCTTCTGGCTCAATGTCCATGCCACCAATGCCTAGCGGTGGCTCTCCAATGCCAATG
ATGACTCCACCACCTATGCCTATGATGACTCCACCACCTATGCCTATGGCGCCACCACCT
ATGATGACTCCACCACCTATGCCTATGGCACCACCACCTATGCCCATGACTCCACCACCT
ATGCCTATGGCTCCACCACCAATGTCCATGGCTACACCACCTATGACGCCAATGACTCCA
TCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTACTCCTATGAGCCCAGGTCCTAGCCCAGCAACT
GTCCCCGATATGGCTTCGCCACCGATGCCACCAGCAATGGAATCTTCTCCTTCTCCAGGA
CCGGGACCCATGCCACCGGCTACGGCCTCGCCGGGGGATTCTGGAGCTTTCAATGTAAGA
ATCGACGTCGTGGCACTTTCTTTCCTCTTTGCAGCCCATTTGCTCCTCGTTTGAGATTAT
TACTGAGCGTCGTTTTCGTGTAATTTACTTTAATTATTCTTGGAGCCATAGTTTTCATCG
TTTTATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGATTCAGACATTTGTTTGCTTTATCA
ATCTATCGTTGACTCTAGTTGGTGTATGTGATGTAAACTTATATTGTCTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E571TF U 3
AF RR2ES30TF U 1
AF RR2ES30JQ C 2
AF RR2E571JQ C 130
BS 1 254 RR2ES30TF
BS 255 255 RR2E571TF
BS 256 736 RR2ES30TF
BS 737 773 RR2E571JQ

RD RR2E571TF 308 0 0
GGACACAC
CCCTTTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTTCTTCACAAGCCCTCCTTTTGCTCA
CACTGTCTATGGTGTTAATCCCCTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTG
GCTCAATGTCCATGCCACCAATGCCTAGCGGTGGCTCTCCAATGCCAATGATGACTCCAC
CACCTATGCCTATGATGACTCCACCACCTATGCCTATGGCGCCACCACCTATGATGACTC
CACCACCTATGCCTATGGCACCACCACCTATGCCCATGACTCCACCACCTATGCCTATGG

QA 9 308 9 308
DS 

RD RR2ES30TF 736 0 0
GGACACACACCCCTTTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTTCTTCACAAGCCCTC
CTTT*GCTCACACTGTCTATGGTGTTAATCCCCTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATG
GCTCCTTCTGGCTCAATGTCCATGCCACCAATGCCTAGCGGTGGCTCTCCAATGCCAATG
ATGACTCCACCACCTATGCCTATGATGACTCCACCACCTATGCCTATGGCGCCACCACCT
ATGATGACTCCACC*CCTATGCCTATGGCACCACCACCTATGCCCATGACTCCACCACCT
ATGCCTATGGCTCCACCACCAATGTCCATGGCTACACCACCTATGACGCCAATGACTCCA
TCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTACTCCTATGAGCCCAGGTCCTAGCCCAGCAACT
GTCCCCGATATGGCTTCGCCACCGATGCCACCAGCAATGGAATCTTCTCCTTCTCCAGGA
CCGGGACCCATGCCACCGGCTACGGCCTCGCCGGGGGATTCTGGAGCTTTCAATGTAAGA
ATCGACGTCGTGGCACTTTCTTTCCTCTTTGCAGCCCATTTGCTCCTCGTTTGAGATTAT
TACTGAGCGTCGTTTTCGTGTAATTTACTTTAATTATTCTTGGAGCCATAGTTTTCATCG
TTTTATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGATTCAGACATTTGTTTGCTTTATCA
ATCTATCGTTGACTCT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2ES30JQ 735 0 0
GGACACACA
CCCTTTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTTCTTCACAAGCCCTCCTTT*GCTCA
CACTGTCTATGGTGTTAATCCCCTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTG
GCTCAATGTCCATGCCACCAATGCCTAGCGGTGGCTCTCCAATGCCAATGATGACTCCAC
CACCTATGCCTATGATGACTCCACCACCTATGCCTATGGCGCCACCACCTATGATGACTC
CACC*CCTATGCCTATGGCACCACCACCTATGCCCATGACTCCACCACCTATGCCTATGG
CTCCACCACCAATGTCCATGGCTACACCACCTATGACGCCAATGACTCCATCTTCAAGCC
CAATGAGCCCACCAACTACTCCTATGAGCCCAGGTCCTAGCCCAGCAACTGTCCCCGATA
TGGCTTCGCCACCGATGCCACCAGCAATGGAATCTTCTCCTTCTCCAGGACCGGGACCCA
TGCCACCGGCTACGGCCTCGCCGGGGGATTCTGGAGCTTTCAATGTAAGAATCGACGTCG
TGGCACTTTCTTTCCTCTTTGCAGCCCATTTGCTCCTCGTTTGAGATTATTACTGAGCGT
CGTTTTCGTGTAATTTACTTTAATTATTCTTGGAGCCATAGTTTTCATCGTTTTATCATA
TTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGATTCAGACATTTGTTTGCTTTATCAATCTATCGTT
GACTCT

QA 10 735 10 735
DS 

RD RR2E571JQ 644 0 0
GGCTCAATGTCCATGCCACCAATGCCTAGCGGTGGCTCTCCAATGCCAATGATGACTCCA
CCACCTATGCCTATGATGACTCCACCACCTATGCCTATGGCGCCACCACCTATGATGACT
CCACCACCTATGCCTATGGCACCACCACCTATGCCCATGACTCCACCACCTATGCCTATG
GCTCCACCACCAATGTCCATGGCTACACCACCTATGACGCCAATGACTCCATCTTCAAGC
CCAATGAGCCCACCAACTACTCCTATGAGCCCAGGTCCTAGCCCAGCAACTGTCCCCGAT
ATGGCTTCGCCACCGATGCCACCAGCAATGGAATCTTCTCCTTTTCCGGGACCGGGACCC
ATGCCACCGGCTACGGCCTCGCCGGGGGATTCTGGAGCTTTCAATGTAAGAATCGACGTC
GTGGCACTTTCTTTCCTCTTTGCAGCCCATTTGCTCCTCGTTTGAGATTATTACTGAGCG
TCGTTTTCGTGTAATTTACTTTAATTATTCTTGGAGCCATAGTTTTCATCGTTTTATCAT
ATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGATTCAGACATTTGTTTGCTTTATCAATCTATCGT
TGACTCTAGTTGGTGTATGTGATGTAAACTTATATTGTCTATCC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 4

CO CL2600Contig1 1202 4 22 U
GGACCCTTAAGGGTTACGTTTTGCTGTGTTCCCTTTTTGTCGGAGAATTCGGCTTTTCTG
TTTTTTTTTGTTTGCTTGGCTGAGAGAACAATCCATAGATCCAAGCAAGACCTGTGTAAG
AAGTTAAGGGAGGCGATATACCCGTCGTAATAACGGTCGCCTAGTCGATGGCGTTAACGT
GGGGATCTGCTCTCAGGATTTCAGTTCTTTTGATCCTTGTAGCTGCAATTGTCTTAGCTT
GCTATTTTCTCCCCGTTGAGCAGCTGTTGAAGGACTTTTTGTTATGGGTTGAACAAGATC
CAGGGCCTTGGGGACCTCTTGCCCTAGCTGTTGCGTACATTCCTCTAACAGTTTTGGCTG
TTCCCGCCTCTGTTCTAACGATCGGTGGTAGCTATCTTTTTGGACTGCCAATTGGTTTTG
TGGCGGACTCGGTAGGTGCTACGCTTGGCTCAGGCGCAGCGTTTCTTCTAGGCCGTACCA
TTGGAAAGCCTTTTGTAGTAGCAAAACTGAAGGACTATCCTCAGTTTCAGTCAGTGGCAC
TCGCGATTGAGAAATCAGGTTTCAAGATATGCTTGTTGCTCCGGCTTGCCCCTCTTCTCC
CCTTCAGCATGTTGAACTACCTCTTATCTGTAACGCCGATAACGCTGGGCCCATACTTGC
TTTCTTCATGGTTAGGGATGATGCCAATAACGCTTGCGTTAGTGTATGCTGGAACAACAC
TAAAAGACCTTTCTGATGTGACTCACAAGTGGAGCGAGTTCTCTATAGGTCGCTGGGCGT
TCTTGATTTCGAGCCTTGTAATATCCGTGATATTAATGGTGTGTGTAACGAAGGTAGCAC
AGAACGCTCTAAGAAAAGCATTAGCAGAGCACGGAGGAGACATGAACGGAGCGGTTGCAG
CCTCGCCCGAGCTGAACGTTACCGCCGATACTCCAAGTGATTTGAACGAGCCTCTGTTAA
TAAAGATAGAGCCTCAATCACCCCAGAACCAAGAAAACAATAGTCATTAAAGAAGCTCCT
GTTTAATTACTTTGTACAATAATCTTATCTTTGTTAACTTACAAAACACACAAAAGCATA
GGTTCTTTGGAGTCAGCCCGTTAATGCACAGATAAAATTAATATGGTTGTCCTAGTTTTT
CGATTTCTTGGTTTTGTATAATAACATAGATTAAATAAATTATTCAAAAATGTTCTTTTT
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2E975TF U 1
AF RR2A575TF U 74
AF RR2E975JQ C 397
AF RR2A575JQ C 453
BS 1 79 RR2E975TF
BS 80 80 RR2A575TF
BS 81 141 RR2E975TF
BS 142 142 RR2A575TF
BS 143 162 RR2E975TF
BS 163 163 RR2A575TF
BS 164 193 RR2E975TF
BS 194 194 RR2A575TF
BS 195 300 RR2E975TF
BS 301 301 RR2A575TF
BS 302 389 RR2E975TF
BS 390 390 RR2A575TF
BS 391 499 RR2E975TF
BS 500 500 RR2A575TF
BS 501 544 RR2E975TF
BS 545 545 RR2A575TF
BS 546 626 RR2E975TF
BS 627 818 RR2A575TF
BS 819 991 RR2E975JQ
BS 992 992 RR2A575JQ
BS 993 1123 RR2E975JQ
BS 1124 1202 RR2A575JQ

RD RR2E975TF 626 0 0
GGACCCTTAAGGGTTACGTTTTGCTGTGTTCCCTTTTTGTCGGAGAATTCGGCTTTTCTG
TTTTTTTTTGTTTGCTTGGGTGAGAGAACAATCCATAGATCCAAGCAAGACCTGTGTAAG
AAGTTAAGGGAGGCGATATACGCGTCGTAATAACGGTCGCCTCGTCGATGGCGTTAACGT
GGGGATCTGCTCTGAGGATTTCAGTTCTTTTGATCCTTGTAGCTGCAATTGTCTTAGCTT
GCTATTTTCTCCCCGTTGAGCAGCTGTTGAAGGACTTTTTGTTATGGGTTGAACAAGATC
TAGGGCCTTGGGGACCTCTTGCCCTAGCTGTTGCGTACATTCCTCTAACAGTTTTGGCTG
TTCCCGCCTCTGTTCTAACGATCGGTGGTGGCTATCTTTTTGGACTGCCAATTGGTTTTG
TGGCGGACTCGGTAGGTGCTACGCTTGGCTCAGGCGCAGCGTTTCTTCTAGGCCGTACCA
TTGGAAAGCCTTTTGTAGTTGCAAAACTGAAGGACTATCCTCAGTTTCAGTCAGTGGCAC
TCGCTATTGAGAAATCAGGTTTCAAGATATGCTTGTTGCTCCGGCTTGCCCCTCTTCTCC
CCTTCAGCATGTTGAACTACCTCTTA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2A575TF 745 0 0
GCTTGGCTGAGAGAACAATCTATAGATCCAAGCAAGACCTGTGTAAGAAGTTAAGGGAGG
CGATATACCCGTCGTAATAACGGTCGCCTAGTCGATGGCGTTAACGTGGGGATCTGCTCT
CAGGATTTCAGTTCTTTTGATCCTTGTAGCTGCAATTGTCTTAGCTTGCTATTTTCTCCC
CGTTGAGCAGCTGTTGAAGGATTTTTTGTTATGGGTTGAACAAGATCCAGGGCCTTGGGG
ACCTCTTGCCCTAGCTGTTGCGTACGTTCCTCTAACAGTTTTGGCTGTTCCTGCCTCTGT
TCTAACGATCGGTGGTAGCTATCTTTTTGGACTGCCAATTGGTTTTGTGGCGGACTCGGT
CGGTGCTACGCTTGGCTCAGGCGCAGCGTTTCTTCTAGGCCGTACCATTGGAAAGCCTTT
TGTAGTAGCAAAACTGAAGGACTATCCTCAGTTTCAGTCAGTGGCACTCGCGATTGAGAA
ATCAGGTTTCAAGATATGCTTGTTGCTCCGGCTTGCTCCTCTTCTCCCCTTCAGCATGTT
GAACTACCTCTTATCTGTAACGCCGATAACGCTGGGCCCATACTTGCTTTCTTCATGGTT
AGGGATGATGCCAATAACGCTTGCGTTAGTGTATGCTGGAACAACACTAAAAGACCTTTC
TGATGTGACTCACAAGTGGAGCGAGTTCTCTATAGGTCGCTGGGCGTTCTTGATTTCGAG
CCTTGTAATATCCGTGATATTAATG

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2E975JQ 730 0 0
TTTTTGGACTGCCAATTGGTTTTGTGGCGGACTCGGTAGGTGCTACGCTTGGCTCAGGCG
CAGCGTTTCTTCTAGGCCGTACCATTGGAAAGCCTTTTGTAGTTGCAAAACTGAAGGACT
ATCCTCAGTTTCAGTCAGTGGCACTCGCTATTGAGAAATCAGGTTTCAAGATATGCTTGT
TGCTCCGGCTTGCCCCTCTTCTCCCCTTCAGCATGTTGAACTACCTCTTATCTGTAACGC
CGATAACGCTGGGCCCATACTTGCTTTCATCTTGGCTAGGGATGATGCCAATAACACTTG
CGTTAGTGTATGCTGGAACAACACTAAAAGACCTTTCTGATGTGACTCACAAGTGGAGCG
AGTTCTCTATAGGCCGATGGGCGTTCTTGATTTCAAGCCTCGTAATATCCGTGATATTAA
TGGTGTGTGTAACGAAGGTAGCACAGAACGCTCTAAGAAAAGCATTAGCAGAGCACGGAG
GAGACATGAACGGAGCGGTTGCAGCCTCGCCCGAGCTGAACGTTACCGCCGATACTCCAA
GTGATTTGAACGAGCCTCTGTTAATAAAGATAGAGCCTCAATCACCCCAGAACCAGGAAA
ACAATAGTCATTAAAGAAGCTCCTGTTTAATTACTTTGTACAATAATCTTATCTTTGTTA
ACTTACAAAACACACAAAAGCATAGGTTCTTTGGAGTCAGCCCGTTAATGCACAGATAAA
ATTAATA
AGG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2A575JQ 750 0 0
GGCGCAGCGTTTCTTCTAGGCCGTACCATTGGAAAGCCTTTTGTAGTAGCAAAACTGAAG
GACTATCCTCAGTTTCAGTCAGTGGCACTCGCGATTGAGAAATCAGGTTTCAAGATATGC
TTGTTGCTCCGGCTTGCTCCTCTTCTCCCCTTCAGCATGTTGAACTACCTCTTATCTGTA
ACGCCGATAACGCTGGGCCCATACTTGCTTTCTTCATGGTTAGGGATGATGCCAATAACG
CTTGCGTTAGTGTATGCTGGAACAACACTAAAAGACCTTTCTGATGTGACTCACAAGTGG
AGCGAGTTCTCTATAGGTCGCTGGGCGTTCTTGATTTCGAGCCTTGTAATATCCGTGATA
TTAATGGTGTGTGTAACGAAGGTAGCACAGAACGCTCTAAGAAAAGCGTTAGCAGAGCAC
GGAGGTGACATGAACGGAGCGGTTGCAGCCTCGCCCGAGCTGAACGTTGCCGCCGATACT
CCAAGTGATTTGAATGAGCCTCTGTTAATAAAGATAGAGCCTCAATCACCTCAGAACCAA
GAAAACAATAGTCATTAAAGAAGCTCCTGTTTAATTACTTTGTACTATAATCTTATCTTT
TTTAACTTACAAAACACA**AAAGCATAGGTTCTTTGGAGTCAGCC*GTTAATGCACAGA
TAAAATTAATATGGTTGTCCTAGTTTTTCGATTTCTTGGTTTTGTATAATAACATAGATT
AAATAAATTATTCAAAAATGTTCTTTTTCC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 2 4

CO CL2601Contig1 561 2 3 U
AGGGGGCCGTCTTCAAAAACACTCGTGAGCTTTCCTCCTCCGTCGAGATCTCCATCAAAC
TTCTGCTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCATACTTGCTCGCCGCTTTGAGCGGGAAAGCTTC
CCCAACCAGTGCCGATGTCAAGAGTATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTC
TCAGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTGAACGGGAAAGACTTGTGCGAATTGATCGCTGC
TGGTAGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGCGGTGGTGGTGTTGCCATGGCCTCTGCTCC
ATCTGCAGGTGGTGGAGGAGGTGCAGCTCCTGCGGCTGAGGCTAAGAAGGAAGAGAAGAA
AGAAGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGATTCAGTCTTTTCGAGTAAGGGCAGTA
GTCATGCTTGTCCGCATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTTATTTTGTGTTAAACCCTTTGGA
ACCTTTATGTTGTTTTTTCTTAGTTTGTACCCAATGGCTATCTTTTTGATATTCCTGCAA
TTCTCAAGAGATTTTTTTAGC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2FW65JQ C 1
AF RR2FW65TF U 1
BS 1 4 RR2FW65JQ
BS 5 558 RR2FW65TF
BS 559 561 RR2FW65JQ

RD RR2FW65JQ 561 0 0
AGGGGGCCGTCTTCAAAAACACTCGTGAGCTTTCCTCCTCCGTCGAGATCTCCATCAAAC
TTCTGCTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCATACTTGCTCGCCGCTTTGAGCGGGAAAGCTTC
CCCAACCAGTGCCGATGTCAAGAGTATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTC
TCAGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTGAACGGGAAAGACTTGTGCGAATTGATCGCTGC
TGGTAGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGCGGTGGTGGTGTTGCCATGGCCTCTGCTCC
ATCTGCAGGTGGTGGAGGAGGTGCAGCTCCTGCGGCTGAGGCTAAGAAGGAAGAGAAGAA
AGAAGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGATTCAGTCTTTTCGAGTAAGGGCAGTA
GTCATGCTTGTCCGCATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTTATTTTGTGTTAAACCCTTTGGA
ACCTTTATGTTGTTTTTTCTTAGTTTGTACCCAATGGCTATCTTTTTGATATTCCTGCAA
TTCTCAAGAGATTTTTTTAGC

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2FW65TF 561 0 0
AGGG
GGCCGTCTTCAAAAACACTCGTGAGCTTTCCTCCTCCGTCGAGATCTCCATCAAACTTCT
GCTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCATACTTGCTCGCCGCTTTGAGCGGGAAAGCTTCCCCA
ACCAGTGCCGATGTCAAGAGTATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTCTCAG
ATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTGAACGGGAAAGACTTGTGCGAATTGATCGCTGCTGGT
AGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGCGGTGGTGGTGTTGCCATGGCCTCTGCTCCATCT
GCAGGTGGTGGAGGAGGTGCAGCTCCTGCGGCTGAGGCTAAGAAGGAAGAGAAGAAAGAA
GAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGATTCAGTCTTTTCGAGTAAGGGCAGTAGTCA
TGCTTGTCCGCATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTTATTTTGTGTTAAACCCTTTGGAACCT
TTATGTTGTTTTTTCTTAGTTTGTACCCAATGGCTATCTTTTTGATATTCCTGCAATTCT
CAAGAGATTTTTTT
AGC

QA 5 558 5 558
DS 



CO CL2601Contig2 564 2 2 U
GGCCGTCTTCAAAAACACTCGTGAGCTTTCCTCTTCCTTCGAGATCTCCATCAACTTCTG
CTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCCTACCTGCTCGCCGCATTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAA
CCAGTGCCGATGTCAAGAGTATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTCTCAGA
TTGAGCTTTTGTTGAAAGAAGTGAACGGGAAAGACTTGTGCGAACTGATCGCTGCTGGTA
GGGAGAAGTTGGCTTCCGTTCCAAGCGGTGGTGGTGTTGCCATGGCCTCTGCTCCATCTG
CTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGGCCAAGAAGGAAGAGAAGAAAGAAG
AGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGATTCAGTCTTTTCGAGTAAAGGGTAGTAGTCA
TGCTTGTCCGCATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTTATTTTGTGTTAAACCCTTTGGAACCT
TTATGTTGTTTTTTCTTAGTTTGTACCCAATGGCTATCTTTTTGATATTCCTGCAATTCT
CAAGAGATTTTTTTCGTTATAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD67TF U 1
AF RR2GD67JQ C 1
BS 1 533 RR2GD67TF
BS 534 564 RR2GD67JQ

RD RR2GD67TF 533 0 0
GGCCGTCTTCAAAAACACTCGTGAGCTTTCCTCTTCCTTCGAGATCTCCATCAACTTCTG
CTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCCTACCTGCTCGCCGCATTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAA
CCAGTGCCGATGTCAAGAGTATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTCTCAGA
TTGAGCTTTTGTTGAAAGAAGTGAACGGGAAAGACTTGTGCGAACTGATCGCTGCTGGTA
GGGAGAAGTTGGCTTCCGTTCCAAGCGGTGGTGGTGTTGCCATGGCCTCTGCTCCATCTG
CTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGGCCAAGAAGGAAGAGAAGAAAGAAG
AGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGATTCAGTCTTTTCGAGTAAAGGGTAGTAGTCA
TGCTTGTCCGCATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTTATTTTGTGTTAAACCCTTTGGAACCT
TTATGTTGTTTTTTCTTAGTTTGTACCCAATGGCTATCTTTTTGATATTCCTG

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2GD67JQ 564 0 0
GGCCGTCTTCAAAAACACTCGTGAGCTTTCCTCTTCCTTCGAGATCTCCATCAACTTCTG
CTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCCTACCTGCTCGCCGCATTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAA
CCAGTGCCGATGTCAAGAGTATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTCTCAGA
TTGAGCTTTTGTTGAAAGAAGTGAACGGGAAAGACTTGTGCGAACTGATCGCTGCTGGTA
GGGAGAAGTTGGCTTCCGTTCCAAGCGGTGGTGGTGTTGCCATGGCCTCTGCTCCATCTG
CTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGGCCAAGAAGGAAGAGAAGAAAGAAG
AGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGATTCAGTCTTTTCGAGTAA*GGGTAGTAGTCA
TGCTTGTCCGCATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTTATTTTGTGTTAAACCCTTTGGAACCT
TTATGTTGTTTTTTCTTAGTTTGTACCCAATGGCTATCTTTTTGATATTCCTGCAATTCT
CAAGAGATTTTTTTCGTTATAACC

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 4

CO CL2602Contig1 607 4 10 U
TTTTTTTTCAAAGCAAATGTTTTAGTATATTATTAAACCAAACACCAATTTGAACCAGGA
CCATACAACGATACTTGAAAAAAACTTTATTTCTAGCGACTAGTTCTTAAACATTGCTTT
TTTTTTAAATCCACCCCCACAAGCTAAAACAGTAAAAAAACCCTTTGAAAGACATAAATT
GAGCCTGATTCAAAGGGGCCATTCTTATTGTGTTCACAGCTTTGAAGGCTTGGGGAAAAT
GTCAGGGGTGAACTTCTGTGCAGCACTGAAACTACCCTTGATCTTCATTGCACCCCTAAT
GAAAGCAATCTGAGGATTCATCTTGCCAGTAGCAACTTTGACAAAGTCATCATCTTTGAA
GGAAAAAGTAGCATCCACTTTCCCTCCTTCGTATTTTCCTTTGGTGACTTCTCCTTTCTT
CAAATCAACGATGTAGGTAACCTCTTCAAACCCCAATTTCTTGGGAGCGACGTTGATCTG
ATAAACGAGGCCGATCTTCTCAGTGAGCTCTTTACCGGCGTCGGTGGAGAGATGCTCCTT
CATCATATCCATGATCGCATCTGATTTGAGCTGGGTCGTTGCCATTTTTTCTTTTTCGAT
TGGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG30JQ U 9
AF RR2DK11JQ U 9
AF RR2DK11TF C 1
AF RR2AG30TF C 9
BS 1 8 RR2DK11TF
BS 9 24 RR2AG30JQ
BS 25 25 RR2DK11JQ
BS 26 132 RR2AG30JQ
BS 133 133 RR2DK11JQ
BS 134 404 RR2AG30JQ
BS 405 405 RR2DK11JQ
BS 406 527 RR2AG30JQ
BS 528 597 RR2DK11TF
BS 598 607 RR2AG30TF

RD RR2AG30JQ 519 0 0
CAAAGCAAATGTTTTATTATATTATTAAACCAAACACCAATTTGAACCAGGACCATACAA
CGATACTTGAAAAAAACTTTATTTCTAGCGACTAGTTCTTAAACATTGCTTTTTTTTTAA
ATCCCCCCCCACAAGCTAAAACAGTAAAAAAACCCTTTGAAAGACATAAATTGAGCCTGA
TTCAAAGGGGCCATTCTTATTGTGTTCACAGCTTTGAAGGCTTGGGGAAAATGTCAGGGG
TGAACTTCTGTGCAGCACTGAAACTACCCTTGATCTTCATTGCACCCCTAATGAAAGCAA
TCTGAGGATTCATCTTGCCAGTAGCAACTTTGACAAAGTCATCATCTTTGAAGGAAAAAG
TAGCATCCACTTTCCCTCCTTCGTATTTTCCTTTGGGGACTTCTCCTTTCTTCAAATCAA
CGATGTAGGTAACCTCTTCAAACCCCAATTTCTTGGGAGCGACGTTGATCTGATAAACGA
GGCCGATCTTCTCAGTGAGCTCTTTACCGGCGTCGGTGG

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2DK11JQ 506 0 0
CAAAGCAACTGTTTTAGTATATTATTAAACCAAACACCAATTTGAACCAGGACCATACAA
CGATACTTGAAAAAAACTTTATTTCTAGCGACTAGTTCTTAAACATTGCTTTTTTTTTAA
ATCCACCCCCACAAGCTAAAACAGTAAAAAAACCCTTTGAAAAACATAAATTGAGCCTGA
TTCAAAGGGGCCATTCTTATTGTGTTCACAGCTTTGAAGGCTTGGGGAAAATGTCAGGGG
TGAACTTCTGTGCAGCACTGAAACTACCCTTGATCTTCATTGCACCCCTAATGAAAGCAA
TCTGAGGATTCATCTTGCCAGTAGCAACTTTGACAAAGTCATCATCTTTGAAGGAAAAAG
TAGCATCCACTTTCCCTCCTTCGTATTTTCCTTTGGTGACTTCCCCTTTCTTCAAATCAA
CGATGTAGGTAACCTCTTCAAACCCCAATTTCTTGGGAGCGACGTTGATCTGATAAACAA
GGCCAATCTTCTCAGTGAGCTCTTTA

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2DK11TF 599 0 0
TTTTTTTTCAAAGCAACTGTTTTAGTATATTATTAAACCAAACACCAATTTGAACCAGGA
CCATACAACGATACTTGAAGAGAACTTTATTTCTAGCGACTAGTTCTTAAACATTGCTTT
TTTTTTAAATCCACCCCCACAAGCTAAAACAGTAAAGAAACCCTTTGAAAGACATAAATT
GAGCCTGATTCAAAGGGGCCATTCTTATTGTGTTCACAGCTTTGAAGGCTTGGGGAAAAT
GTCAGGGGTGAACTTCTGTGCAGCACTGAGACTACCCTTGATCTTCATTGCACCCCTAAT
GAAAGCAATCTGAGGATTCATCTTGCCAGTAGCAACTTTGACAAAGTCATCATCTTTGAA
GGAGAAAGTAGCATCCACTTTCCCTCCTTCGTATTTTCCTTTGGTGACTTCTCCTTTCTT
CAGATCAACGATGTAGGTAACCTCTTCAAACCCCAATTTCTTGGGAGCGACGTTGATCTG
ATAAACGAGGCCGATCTTCTCAGTGAGCTCTTTACCGGCGTCGGTGGAGAGATGCTCCTT
CATCATATCCATGATCGCATCTGATTTGAGCTGGGTCGTTGCCATTTTTTCTTTTTC
CC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2AG30TF 599 0 0
CAAAGCAAATGTTTTAGTATATTATTAAACCAAACACCAATTTGAACCAGGACCATACAA
CGATACTTGAAGAGAACTTTATTTCTAGCGACTAGTTCTTAAACATTGCTTTTTTTTTAA
ATCCACCCCCACAAGCTAAAACAGTAAAGAAACCCTTTGAAAGACATAAATTGAGCCTGA
TTCAAAGGGGCCATTCTTATTGTGTTCACAGCTTTGAAGGCTTGGGGAAAATGTCAGGGG
TGAACTTCTGTGCAGCACTGAGACTACCCTTGATCTTCATTGCACCCCTAATGAAAGCAA
TCTGAGGATTCATCTTGCCAGTAGCAACTTTGACAAAGTCATCATCTTTGAAGGAGAAAG
TAGCATCCACTTTCCCTCCTTCGTATTTTCCTTTGGTGACTTCTCCTTTCTTCAGATCAA
CGATGTAGGTAACCTCTTCAAACCCCAATTTCTTGGGAGCGACGTTGATCTGATAAACGA
GGCCGATCTTCTCAGTGAGCTCTTTACCGGCGTCGGTGGAGAGATGCTCCTTCATCATAT
CCATGATCGCATCTGATTTGAGCTGGGTCGTTGCCATTTTTTCTTTTTCGATTGGAGCC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 4

CO CL2603Contig1 881 4 7 U
AGGGGAAGACATCAGTCTATGGCCACCGATCTCTTCCCGGTTATTATAACTTCGCCGCTT
CTTCTCAGTCGCTTCTTCCGTAACGGTATCGTATCGGAGACTGTTCGTCTTTCCTTGAAT
CAGGTTTCTTTGAAGGTATGGGGGATGAGATTGATTTGAGTGGAGATGGAGGCGTCTTGA
AACAGATTGTAAGGAGAGCTAAACCTGATGCTATTGCACCTTCTGATGATTTTCCTGTAG
TCGATGTTCACTATGAGGGTATATTGGCTGAAGATGGAAAGGTCTTTGACACTACACGCG
AAGACAATCTGGTTTTCTCCTTTGAGTTGGGTTCAGGCAGTGTTATCCGGTCATGGGACA
TTGCGCTTAAGACCATGAAGGTTGGGGAAGTTGCGAAAGTCACATGTAAGCCAGAGTATG
CTTACGGAAGTGGAGGATCTCCTCCTGACATCCCACCTGATGCAACTCTTATATTTGAAG
TGGAATTGGTTGCTTGTAAACCGAGGAAAGGTGCTAGTGTTGGAAGTGTTTCTGAGGATA
GAGCTAGGCTAGAAGATCTGAAGAAGCAGAGAGAGATTGCTGCAGCTGCTAAAGAGGATG
ATAAGAAAAATAGGGAAGAAGCAAAAGCAGCTGCAGCTGCTAGGATTCAAGCTAAGCTAG
ACGCTAAGAA*GGGTCAAGGCAAGGGAAAAGGCAAAGGCAAATCTAAATAAGTGACAAAG
GATGATGAGTCCAACGTTGTTGTAAACTCCTAAAGATTACGTAAGTTCATGATTCTAAGC
TTGTTGTTAAGTGGCACTCATCAATTATCATAATGACCAATACATGAGTTGTTTTGGGTC
TAAGATATTTCTGATCTTTATTCTTACACATTGAATAACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G221TF U 1
AF RR2AH45TF U 35
AF RR2AH45JQ C 77
AF RR2G221JQ C 96
BS 1 380 RR2G221TF
BS 381 381 RR2AH45TF
BS 382 610 RR2G221TF
BS 611 670 RR2AH45TF
BS 671 671 RR2AH45JQ
BS 672 688 RR2AH45TF
BS 689 881 RR2AH45JQ

RD RR2G221TF 610 0 0
AGGGGAAGACATCAGTCTATGGCCACCGATCTCTTCCCGGTTATTATAACTTCGCCGCTT
CTTCTCAGTCGCTTCTTCCGTAACGGTATCGTATCGGAGACTGTTCGTCTTTCCTTGAAT
CAGGTTTCTTTGAAGGTATGGGGGATGAGATTGATTTGAGTGGAGATGGAGGCGTCTTGA
AACAGATTGTAAGGAGAGCTAAACCTGATGCTATTGCACCTTCTGATGATTTTCCTGTAG
TCGATGTTCACTATGAGGGTATATTGGCTGAAGATGGAAAGGTCTTTGACACTACACGCG
AAGACAATCTGGTTTTCTCCTTTGAGTTGGGTTCAGGCAGTGTTATCCGGTCATGGGACA
TTGCGCTTAAGACCATGAAGTTTGGGGAAGTTGCGAAAGTCACATGTAAGCCAGAGTATG
CTTACGGAAGTGGAGGATCTCCTCCTGACATCCCACCTGATGCAACTCTTATATTTGAAG
TGGAATTGGTTGCTTGTAAACCGAGGAAAGGTGCTAGTGTTGGAAGTGTTTCTGAGGATA
GAGCTAGGCTAGAAGATCTGAAGAAGCAGAGAGAGATTGCTGCAGCTGCTAAAGAGGATG
ATAAGAAAAA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2AH45TF 654 0 0
GG
CCGGTTATTATAACTTCGCCGCTTCTTCTCAGTCGCTTCTTCCGTAACGGTATCGTATCG
GAGATTGTTCGTCTTTCCTTGAATCAGGTTTCTTTGAAGGTATGGGGGATGAGATTGATT
TGAGTGGAGATGGAGGCGTCTTGAAACAGATTGTAAGGAGAGCTAAACCTGATGCTATTG
CACCTTCTGATGATTTTCCTGTAGTCGATGTTCACTATGAGGGTATATTGGCTGAAGATG
GAAAGGTCTTTGACACTACACGCGAAGACAATCTGGTTTTCTCCTTTGAGTTGGGTTCAG
GCAGTGTTATCCGGTCATGGGACATTGCGCTTAAGACCATGAAGGTTGGGGAAGTTGCGA
AAGTCACATGTAAGCCAGAGTATGCTTACGGAAGTGGAGGATCTCCTCCTGACATCCCAC
CTGATGCAACTCTTATATTTGAAGTGGAATTGGTTGCTTGTAAACCGAGTAAAGGTGCTA
GTGTTGGAAGTGTTTCTGAGGATAGAGCTAGGCTAGAAGATCTGAAGAAGCAGAGAGAGA
TTGCTGCAGCTGCTAAAGAGGATGATAAGAAAAATAGGGAAGAAGCAAAAGCAGCTGCAG
CTGCTAGGATTCAAGCTAAGCTAGACGCTAAGAAAGGGTCAAGGCAAGGGAA

QA 3 654 3 654
DS 

RD RR2AH45JQ 805 0 0
TCCGTAACGGTATCGTATCGGAGATTGTTCGTCTTTCCTTGAATCAGGTTTCTTTGAAGG
TATGGGGGATGAGATTGATTTGAGTGGAGATGGAGGCGTCTTGAAACAGATTGTAAGGAG
AGCTAAACCTGATGCTATTGCACCTTCTGATGATTTTCCTGTAGTCGATGTTCACTATGA
GGGTATATTGGCTGAAGATGGAAAGGTCTTTGACACTACACGCGAAGACAATCTGGTTTT
CTCCTTTGAGTTGGGTTCAGGCAGTGTTATCCGGTCATGGGACATTGCGCTTAAGACCAT
GAAGGTTGGGGAAGTTGCGAAAGTCACATGTAAGCCAGAGTATGCTTACGGAAGTGGAGG
ATCTCCTCCTGACATCCCCCCTGATGCAACTCTTATATTTGAAGTGGAATTGGTTGCTTG
TAAACCGAGTAAAGGTGCTAGTGTTGGAAGTGTTTCTGAGGATAGAGCTAGGCTAGAAGA
TCTGAAGAAGCAGAGAGAGATTGCTGCAGCTGCTAAAGAGGATGATAAGAAAAATAGGGA
AGAAGCAAAAGCAGCTGCAGCTGCTAGGATTCAAGCTAAGCTAGACGCTAAGAA*GGGTC
AAGGCAAGGGAAAAGGCAAAGGCAAATCTAAATAAGTGACAAAGGATGATGAGTCCAACG
TTGTTGTAAACTCCTAAAGATTACGTAAGTTCATGATTCTAAGCTTGTTGTTAAGTGGCA
CTCATCAATTATCATAATGACCAATACATGAGTTGTTTTGGGTCTAAGATATTTCTGATC
TTTATTCTTACACATTGAATAACGG

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2G221JQ 746 0 0
GGAGACTGTTCGTCTTTCCTTGAATCAGGTTTCTTTGAAGGTATGGGGGATGAGATTGAT
TTGAGTGGAGATGGAGGCGTCTTGAAACAGATTGTAAGGAGAGCTAAACCTGATGCTATT
GCACCTTCTGATGATTTTCCTGTAGTCGATGTTCACTATGAGGGTATATTGGCTGAAGAT
GGAAAGGTCTTTGACACTACACGCGAAGACAATCTGGTTTTCTCCTTTGAGTTGGGTTCA
GGCAGTGTTATCCGGTCATGGGACATTGCGCTTAAGACCATGAAGTTTGGGGAAGTTGCG
AAAGTCACATGTAAGCCAGAGTATGCTTACGGAAGTGGAGGATCTCCTCCTGACATCCCC
CCTGATGCAACTCTTATATTTGAAGTGGAATTGGTTGCTTGTAAACCGAGGAAAGGTGCT
AGTGTTGGAAGTGTTTCTGAGGATAGAGCTAGGCTAGAAGATCTGAAGAAGCAGAGAGAG
ATTGCTGCAGCTGCTAAAGAGGATGATAAGAAAAAGAGGGAAGAAGCAAAAGCAGCTGCA
GCTGCTAGGATTCAAGCTAAGCTAGACGCTAAGAA*GGGTCAAGGCAAGGGAAAAGGCAA
AGGCAAATCTAAATAAGTGACAAAGGATGATGAGTCCAACGTTGTTGTAAACTCCTAAAG
ATTACGTAAGTTCATGATTCTAAGCTTGTTGTTAAGTGGCACTCATCAATTATCATAATG
ACCAATACATGAGTTGTTTTGGGTCT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 4

CO CL2604Contig1 593 4 5 U
GGACCTTTGAACTTTCTCGATTGAAATAAAATCTCAAAATTCGATCAAAGAAATGCAAAC
ATCATCATCTGCTCCTCCTGCAAGAAGAAGTCTCTACCTGACCCTCCTTGTCTTAACTCT
CCTTTCATCGATCACCATGTCTGAATCCACGGGAGAAGCATCGTCCGAAGCTAAGGTTCA
CATCGTCTACACAGAGAAACCCACCGACGAGGAACCTAAAGAGTATCATCTCCGTACCCT
TTCCTCCGCTCTCGGCAGCGAGGAAGCTGCGAAGGATGCTTTGATTTACTGTTACAAGGA
AGCTGCTTCTGGTTTCTCTGCTAAGCTCACACCTGCGCAAGTTGAAGAGATATATAAACA
ACCAGGAGTGATTCAAGTTGTGCCGAGCCAGACCTACCAGCTGCACAAACCTGTTGGTGC
TGGTGGTTTCAAGCTGACCTAACTTAAATGTAGCTTGTTGTTGTTGTTGTAAATGTCGTG
GCTTTGAAAACTGGTATCTAAACTACAATAATGCCATGAATTTGCTTAGAGTTGTTCTGT
GTTGTTGAGAAATTGGGTTTTATAAATAATATTATTTTAAGCTAATTGCTATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GF16JQ C 1
AF RR2DD13JQ C 53
AF RR2DD13TF U 53
AF RR2GF16TF U 1
BS 1 54 RR2GF16TF
BS 55 207 RR2DD13TF
BS 208 208 RR2GF16TF
BS 209 582 RR2DD13TF
BS 583 593 RR2GF16TF

RD RR2GF16JQ 593 0 0
GGACCTTTGAACTTTCTCGATTGAAATAAAATCTCAAAATTCGATCAAAGAAATGCAAAC
ATCATCATCTGCTCCTCCTGCAAGAAGAAGTCTCTACCTGACCCTCCTTGTCTTAACTCT
CCTTTCATCGATCACCATGTCTGAATCCACGGGAGAAGCATCGTCCGAAGCTAAGGTTCA
CATCGTCTACACAGAGAAACCCACCGACGAGGAACCTAAAGAGTATCATCTCCGTACCCT
TTCCTCCGCTCTCGGCAGCGAGGAAGCTGCGAAGGATGCTTTGATTTACTGTTACAAGGA
AGCTGCTTCTGGTTTTTTTGCTAAGCTCACACCTGCGCAAGTTGAAGAGATATCTAAACA
ACCAGGAGTGATTCAAGTTGTGCCGAGCCAGACCTACCAGTTGCACAAACCTGTTGGTGC
TGGTGGTTTCAAGCTGACCTAACTTAAATGTAGCTTGTTGTTGTTGTTGTAAATGTCGTG
GCTTTGAAAACTGGTATCTAAACTACAATAATGCCATGAATTTGCTTAGAGTTGTTCTGT
GTTGTTGAGAAATTGGGTTTTATAAATAATATTATTTTAAGCTAATTGCTATT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2DD13JQ 530 0 0
GG
GCAAACATCATCATCTGCTCCTCCTGCAAGAAGAAGTCTCTACCTGACCCTCCTTGTCTT
AACTCTCCTTTCATCGATCACCATGTCTGAATCCACGGGAGAAGCATCGTCCGAAGCTAA
GGTTCACATCGTCTACACAGAGAAACCCACCGATGAGGAACCTAAAGAGTATCATCTCCG
TACCCTTTCCTCCGCTCTCGGCAGCGAGGAAGCTGCGAAGGATGCTTTGATTTACTGTTA
CAAGGAAGCTGCTTCTGGTTTTTCTGCTAAGCTCACACCTGCGCAAGTTGAAGAGATATA
TAAACAACCAGGAGTGATTCAAGTTGTGCCGAGCCAGACCTACCAGCTGCACAAACCTGT
TGGTGCTGGTGGTTTCAAGCTGACCTAACTTAAATGTAGCTTGTTGTTGTTGTTGTAAAT
GTCGTGGCTTTGAAAACTGGTATCTAAACTACAATAATGCCATGAATTTGCTTAGAGTTG
TTCTGTGTTGTTGAGAAATTGGGTTTTATAAATAATATTATTTTAAGC

QA 3 530 3 530
DS 

RD RR2DD13TF 530 0 0
GG
GCAAACATCATCATCTGCTCCTCCTGCAAGAAGAAGTCTCTACCTGACCCTCCTTGTCTT
AACTCTCCTTTCATCGATCACCATGTCTGAATCCACGGGAGAAGCATCGTCCGAAGCTAA
GGTTCACATCGTCTACACAGAGAAACCCACCGATGAGGAACCTAAAGAGTATCATCTCCG
TACCCTTTCCTCCGCTCTCGGCAGCGAGGAAGCTGCGAAGGATGCTTTGATTTACTGTTA
CAAGGAAGCTGCTTCTGGTTTCTCTGCTAAGCTCACACCTGCGCAAGTTGAAGAGATATA
TAAACAACCAGGAGTGATTCAAGTTGTGCCGAGCCAGACCTACCAGCTGCACAAACCTGT
TGGTGCTGGTGGTTTCAAGCTGACCTAACTTAAATGTAGCTTGTTGTTGTTGTTGTAAAT
GTCGTGGCTTTGAAAACTGGTATCTAAACTACAATAATGCCATGAATTTGCTTAGAGTTG
TTCTGTGTTGTTGAGAAATTGGGTTTTATAAATAATATTATTTTAAGC

QA 3 530 3 530
DS 

RD RR2GF16TF 593 0 0
GGACCTTTGAACTTTCTCGATTGAAATAAAATCTCAAAATTCGATCAAAGAAATGCAAAC
ATCATCATCTGCTCCTCCTGCAAGAAGAAGTCTCTACCTGACCCTCCTTGTCTTAACTCT
CCTTTCATCGATCACCATGTCTGAATCCACGGGAGAAGCATCGTCCGAAGCTAAGGTTCA
CATCGTCTACACAGAGAAACCCACCGACGAGGAACCTAAAGAGTATCATCTCCGTACCCT
TTCCTCCGCTCTCGGCAGCGAGGAAGCTGCGAAGGATGCTTTGATTTACTGTTACAAGGA
AGCTGCTTCTGGTTTCTCTGCTAAGCTCACACCTGCGCAAGTTGAAGAGATATCTAAACA
ACCAGGAGTGATTCAAGTTGTGCCGAGCCAGACCTACCAGTTGCACAAACCTGTTGGTGC
TGGTGGTTTCAAGCTGACCTAACTTAAATGTAGCTTGTTGTTGTTGTTGTAAATGTCGTG
GCTTTGAAAACTGGTATCTAAACTACAATAATGCCATGAATTTGCTTAGAGTTGTTCTGT
GTTGTTGAGAAATTGGGTTTTATAAATAATATTATTTTAAGCTAATTGCTATT

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 4

CO CL2605Contig1 729 4 9 U
GGGACAACAATCCACACAACTTTCAAAGCAAGACAACAAACCCGTTTGTTTCAAACATCA
ACTCTTTGTTTCTTTTAAAAAAATGGAGGCCGTTAGATTCGCCGTCGCCATCGTTTTTGT
GTTTTTCTCTGTTTCTTCGTCTAACGCTGAACCTACACCGACAACAGGTGGAGCTGGAGG
AAAAGGAGATGCTCACTCAATGCCGTGTATACAGAAACTGATGCCATGTCAGCCTTATCT
TCACTCGGTGACTCCTCCACCTCCTGCGTCGTGTTGCCTGCCGTTGAATGAGATCGTGGC
GAAAGACGCGACGTGTCTTTGCTCCGTATTCAACAATGTCGACATGCTCAGATCGCTTAA
CCTCACTAAAGAAAACGCTCTCGTTCTCCCTAAAGCTTGTGGCGCCAAGGCTGACATCTC
GCTATGCAAAGCCAGCAATGGCACCACTACACCTTCGACCTCGCCGGCAACTACCACAAC
TCCTCCGGCATCTTCCACTGGAACCGGAGCTTCTTCAACTGCCAAACCAACAAACTCGGC
TCCGGCCATCAACTTCGCCGGAGCTAGCTTCGCATCAGCTTTTGTGGCCTTGGCTACAAT
CTTCTTCTGATCTACTACTATATTGCATTATGTCTTTTTATTCATTGTTCTGTAGGTTTG
CAATTGAAAATTGTTTGGTTATTTATTATTAATATGCACTTGAAATTTCTAATAATAATA
ATTTCCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EL69TF U 12
AF RR2BK23TF U 7
AF RR2B171JQ C 1
AF RR2B171TF U 1
BS 1 8 RR2B171JQ
BS 9 13 RR2B171TF
BS 14 106 RR2EL69TF
BS 107 107 RR2BK23TF
BS 108 568 RR2EL69TF
BS 569 569 RR2BK23TF
BS 570 629 RR2EL69TF
BS 630 709 RR2BK23TF
BS 710 729 RR2B171TF

RD RR2EL69TF 618 0 0
GG
ACACAACTTTCAAAGCAAGACAACAAACCCGTTTGTTTCAAACATCAACTCTTTGTTTCT
TTTAAAAAAATGGAGGCCGTTAGATTCGCCGTCACCATCGTTTTTGTGTTTTTCTCTGTT
TCTTCGTCTAACGCTGAACCTACACCGACAACAGGTGGAGCTGGAGGAAAAGGAGATGCT
CACTCAATGCCGTGTATACAGAAACTGATGCCATGTCAGCCTTATCTTCACTCGGTGACT
CCTCCACCTCCTGCGTCGTGTTGCCTGCCGTTGAATGAGATCGTGGCGAAAGACGCGACG
TGTCTTTGCTCCGTATTCAACAATGTCGACATGCTCAGATCGCTTAACCTCACTAAAGAA
AACGCTCTCGTTCTCCCTAAAGCTTGTGGCGCCAAGGCTGACATCTCGCTATGCAAAGCC
AGCAATGGCACCACTACACCTTCGACCTCGCCGGCAACTACCACAACTCCTCCGGCATCT
TCCACTGGAACCGGAGCTTCTTCAACTGCCAAACCAACAAACTCGGCTCCGGCCATCAAC
TTCGCCGGAGCTAGCCTCGCATCAGCTTTTGTGGCCTTGGCTACAATCTTCTTCTGATCT
ACTACTATATTGCATT

QA 3 618 3 618
DS 

RD RR2BK23TF 703 0 0
GGAATCC
ACACAACTTTCAAAGCAAGACAACAAACCCGTTTGTTTCAAACATCAACTCTTTGTTTCT
TTTAAAAAAATGGAGGCCGTTAGATTCGCCGTCGCCATCGTTTTTGTGTTTTTCTCTGTT
TCTTCGTCTAACGCTGAACCTACACCGACAACAGGTGGAGCTGGAGGAAAAGGAGATGCT
CACTCAATGCCGTGTATACAGAAACTGATGCCATGTCAGCCTTATCTTCACTCGGTGACT
CCTCCACCTCCTGCGTCGTGTTGCCTGCCGTTGAATGAGATCGTGGCGAAAGACGCGACG
TGTCTTTGCTCCTTATTCAACAATGTCGACATGCTCAGATCGCTTAACCTCACTAAAGAA
AACGCTCTCGTTCTCCCTAAAGCTTGTGGCGCCAAGGCTGACATCTCGCTATGCAAAGCC
AGCAATGGCACCACTACACCTTCGACCTCGCCGGCAACTACCACAACTCCTCCGGCATCT
TCCACTGGAACCGGAGCTTCTTCAACTGCCAAACCAACAAACTCGGCTCCGGCCATCAAC
TTCGCCGGAGCTAACTTCGCATCAGCTTTTGTGGCCTTGGCTACAACCTTCTTCTGATCT
ACTACTATATTGCATTATGTCTTTTTATTCATTGTTCTGTAGGTTTGCAATTGAAAATTG
TTTGGTTATTTATTATTAATATGCACTTGAAATTTC

QA 8 703 8 703
DS 

RD RR2B171JQ 729 0 0
GGGACAACAATCCACACAACTTTCAAAGCAAGACAACAAACCCGTTTGTTTCAAACATCA
ACTCTTTGTTTCTTTTAAAAAAATGGAGGCCGTTAGATTCGCCGTCGCCATCGTTTTTGT
GTTTTTCTCTGTTTCTTCGTCTAACGCTGAACCTACACCGACAACAGGTGGAGCTGGAGG
AAAAGGAGATGCTCACTCAATGCCGTGTATACAGAAACTGATGCCATGTCAGCCTTATCT
TCACTCGGTGACTCCTCCACCTCCTGCGTCGTGTTGCCTGCCGTTGAATGAGATCGTGGC
GAAAGACGCGACGTGTCTTTGCTCCGTATTCAACAATGTCGACATGCTCAGATCGCTTAA
CCTCACTAAAGAAAACGCTCTCGTTCTCCCTAAAGCTTGTGGCGCCAAGGCTGACATCTC
GCTATGCAAAGCCAGCAATGGCACCACTACACCTTCGACCTCGCCGGCAACTACCACAAC
TCCTCCGGCATCTTCCACTGGAACCGGAGCTTCTTCAACTGCCAAACCAACAAACTCGGC
TCCGGCCATCAACTTCGCCGGAGCTAGCTTCGCATCAGCTTTTGTGGCCTTGGCTACAAT
CTTCTTCTGATCTACTACTATATTGCATTATGTCTTTTTATTCATTGTTCTGTAGGTTTG
CAATTGAAAATTGTTTGGTTATTTATTATTAATATGCACTTGAAATTTCTAATAATAATA
ATTTCCAAC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2B171TF 729 0 0
GGGACAAC
AATCCACACAACTTTCAAAGCAAGACAACAAACCCGTTTGTTTCAAACATCAACTCTTTG
TTTCTTTTAAAAAAATGGAGGCCGTTAGATTCGCCGTCGCCATCGTTTTTGTGTTTTTCT
CTGTTTCTTCGTCTAACGCTGAACCTACACCGACAACAGGTGGAGCTGGAGGAAAAGGAG
ATGCTCACTCAATGCCGTGTATACAGAAACTGATGCCATGTCAGCCTTATCTTCACTCGG
TGACTCCTCCACCTCCTGCGTCGTGTTGCCTGCCGTTGAATGAGATCGTGGCGAAAGACG
CGACGTGTCTTTGCTCCGTATTCAACAATGTCGACATGCTCAGATCGCTTAACCTCACTA
AAGAAAACGCTCTCGTTCTCCCTAAAGCTTGTGGCGCCAAGGCTGACATCTCGCTATGCA
AAGCCAGCAATGGCACCACTACACCTTCGACCTCGCCGGCAACTACCACAACTCCTCCGG
CATCTTCCACTGGAACCGGAGCTTCTTCAACTGCCAAACCAACAAACTCGGCTCCGGCCA
TCAACTTCGCCGGAGCTAGCTTCGCATCAGCTTTTGTGGCCTTGGCTACAATCTTCTTCT
GATCTACTACTATATTGCATTATGTCTTTTTATTCATTGTTCTGTAGGTTTGCAATTGAA
AATTGTTTGGTTATTTATTATTAATATGCACTTGAAATTTCTAATAATAATAATTTCCAA
C

QA 9 729 9 729
DS 



AS 2 4

CO CL2606Contig1 589 2 3 U
GGACTGTCGTCTCCTTCAACCTCTCTATCGTTCGTCTCTGTAGCCTACCCGCCGATTGTT
ACCCGTCTCCGTCGATAACACCATGGCGCCAAAGAAGGATAAGGTTCCACCGCCGTCGTC
AAAGCCGGCTAAATCCGGAGGTGGAAAACAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCA
AAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTAAC
CGAGGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACCCCTTCCATTCTCTCTGACCGTATGAGGATCAA
CGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGGAGCTAATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGT
CGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCGTGCCACCAACACCTAAACAAAACAGAT
CGACCTTTGTCAATGTTTTGGTTCTCCAGTCTTAATCTCTTTTGATGTATACGTTAGTCA
TCAGAGCTCTTTATAGTTCTTTATGTTATGAACTCCTTCGTACTCGAGAAACTCTTTAGA
AGTCTGTTTTGAGATATTATGTCTACTTAATATTCCGAATTGATTTTAT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2B645JQ C 1
AF RR2B645TF U 1
BS 1 3 RR2B645JQ
BS 4 587 RR2B645TF
BS 588 589 RR2B645JQ

RD RR2B645JQ 589 0 0
GGACTGTCGTCTCCTTCAACCTCTCTATCGTTCGTCTCTGTAGCCTACCCGCCGATTGTT
ACCCGTCTCCGTCGATAACACCATGGCGCCAAAGAAGGATAAGGTTCCACCGCCGTCGTC
AAAGCCGGCTAAATCCGGAGGTGGAAAACAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCA
AAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTAAC
CGAGGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACCCCTTCCATTCTCTCTGACCGTATGAGGATCAA
CGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGGAGCTAATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGT
CGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCGTGCCACCAACACCTAAACAAAACAGAT
CGACCTTTGTCAATGTTTTGGTTCTCCAGTCTTAATCTCTTTTGATGTATACGTTAGTCA
TCAGAGCTCTTTATAGTTCTTTATGTTATGAACTCCTTCGTACTCGAGAAACTCTTTAGA
AGTCTGTTTTGAGATATTATGTCTACTTAATATTCCGAATTGATTTTAT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2B645TF 589 0 0
GGA
CTGTCGTCTCCTTCAACCTCTCTATCGTTCGTCTCTGTAGCCTACCCGCCGATTGTTACC
CGTCTCCGTCGATAACACCATGGCGCCAAAGAAGGATAAGGTTCCACCGCCGTCGTCAAA
GCCGGCTAAATCCGGAGGTGGAAAACAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAA
GGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTAACCGA
GGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACCCCTTCCATTCTCTCTGACCGTATGAGGATCAACGG
GTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGGAGCTAATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGC
TGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCGTGCCACCAACACCTAAACAAAACAGATCGA
CCTTTGTCAATGTTTTGGTTCTCCAGTCTTAATCTCTTTTGATGTATACGTTAGTCATCA
GAGCTCTTTATAGTTCTTTATGTTATGAACTCCTTCGTACTCGAGAAACTCTTTAGAAGT
CTGTTTTGAGATATTATGTCTACTTAATATTCCGAATTGATTTT
AT

QA 4 587 4 587
DS 



CO CL2606Contig2 589 2 3 U
GGACTGTCGTCTCCGTCAACCTCTCTATCTTTCGTCTCTATAGCCTGCCCGCCGATTGTT
ACCTGTCTCCGTCGATAACACCATGGCGCCAAAGAAGGATAAGGTTCCACCGCCGTCGTC
AAAGCCGGCTAAATCCGGAGGTGGAAAACAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCA
AAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCAC
TGAGGCCCCCAAGTTCAAGCTCATCACCCCTTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAA
CGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGGAGCTAATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGT
CGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCGTGCCACCAACACCTAAACAAAACAGAT
CGACCTTTGTCAATGTTTTTGTTCTCCAGTCTAATCTCTTTTGACGTATACGTTACCTCA
TCAGAGCTCTTATAGTTTTTTTATGTTTGAACTCCTTCGTACCTCGAGAAACTCTTTAGA
AGGCTGTTTTGAGATATTATGTCTACTTAATATTCCGAATTGATTTTTT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2FT21JQ C 1
AF RR2FT21TF U 1
BS 1 3 RR2FT21JQ
BS 4 587 RR2FT21TF
BS 588 589 RR2FT21JQ

RD RR2FT21JQ 589 0 0
GGACTGTCGTCTCCGTCAACCTCTCTATCTTTCGTCTCTATAGCCTGCCCGCCGATTGTT
ACCTGTCTCCGTCGATAACACCATGGCGCCAAAGAAGGATAAGGTTCCACCGCCGTCGTC
AAAGCCGGCTAAATCCGGAGGTGGAAAACAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCA
AAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCAC
TGAGGCCCCCAAGTTCAAGCTCATCACCCCTTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAA
CGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGGAGCTAATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGT
CGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCGTGCCACCAACACCTAAACAAAACAGAT
CGACCTTTGTCAATGTTTTTGTTCTCCAGTCTAATCTCTTTTGACGTATACGTTACCTCA
TCAGAGCTCTTATAGTTTTTTTATGTTTGAACTCCTTCGTACCTCGAGAAACTCTTTAGA
AGGCTGTTTTGAGATATTATGTCTACTTAATATTCCGAATTGATTTTTT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2FT21TF 589 0 0
GGG
CTGTCGTCTCCGTCAACCTCTCTATCTTTCGTCTCTATAGCCTGCCCGCCGATTGTTACC
TGTCTCCGTCGATAACACCATGGCGCCAAAGAAGGATAAGGTTCCACCGCCGTCGTCAAA
GCCGGCTAAATCCGGAGGTGGAAAACAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAA
GGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACTGA
GGCCCCCAAGTTCAAGCTCATCACCCCTTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGG
GTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGGAGCTAATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGC
TGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCGTGCCACCAACACCTAAACAAAACAGATCGA
CCTTTGTCAATGTTTTTGTTCTCCAGTCTAATCTCTTTTGACGTATACGTTACCTCATCA
GAGCTCTTATAGTTTTTTTATGTTTGAACTCCTTCGTACCTCGAGAAACTCTTTAGAAGG
CTGTTTTGAGATATTATGTCTACTTAATATTCCGAATTGATTTT
TT

QA 4 587 4 587
DS 



AS 1 2

CO CL2607Contig1 1085 2 6 U
GGAAGAGTCCTCAGATCGTGTTTGATTCTTGAGTCGAGAGAGAAGATCTCACAAAAGTAG
GGAAGAAGATAACTAGGGTTTTGGAAGAGAATGGCAGAGGATCTGGTTCTAGATACGGCG
ATAAGAGATTGGGTTCTAATCCCTCTCTCCGTTGTGATGGTTCTCATCGGTATCCTCCGA
TACTTGGTCTCCAAGCTCATGCGTTCTTCTCCATCTCCCGATGCTAAGATGGTCAAAGAA
GGACAAGTTATTATCAGAGCTCGAAATCTAAAAGCCGCCGCCAATTTCATCCCACTGAGA
TCATTCCGCACTCGTAGACTCTACTTTAGCAACGAGGAGAATGGTTTGCTACATGTTCCC
AAGGGCCAAGCCACAAACCCCCAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCTAACATGGCCATGGAT
ATGATGAAGAAGAACCTTTCCATGATTATTCCCCAGACGCTCACTTTTGCATGGGTCAAC
TTCTTCTTCTCTGGATTTGTTGCAGCCAAAATACCGTTCCCACTGACCCAGAGGTTCAGA
TCAATGTTACAAAATGGCATCGACTTGAGTACTGTCGATGTTAGCTATGTGAGTAGTCGT
TCCTGGTACTTTTTAAACTTGTTTGGATTAAGAGGCTTGTTCAGTCTCATTCTCGGGGAT
GAAAATGCCATTGATGACACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGGTTTGGATTTGATGCA
TCAAAGAGCTTGGGTGCGGAGAAAGATGGTCTCGACATAATTCAGCACGATTGGGCTCTA
CCTCGATTCGAGCAGCGTGCAGAGTCCGTATTGAGAAAATTCGTGAAGTAGAGACCAATG
ACGATATAGTTTTCTGACACAAAACGTTGAGACAACTCTGTAGAAGCTTCGACATAAAAC
CAAATCTTCTGTTTTGCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTTATAACTGTGGTCTCTGTAAAATC
TTCTTCGGAACAGTATCTGGTTTACTTTTGTACGGATAGATTTAGCGTGTTCTACAAAAT
TGGAATGCTTCGTTTAAGTTTTGGATATTTTGACATGTTTTAGTAGGGCAACTTAATTGT
GACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2E567TF U 1
AF RR2DD57JQ C 243
BS 1 293 RR2E567TF
BS 294 294 RR2DD57JQ
BS 295 498 RR2E567TF
BS 499 499 RR2DD57JQ
BS 500 529 RR2E567TF
BS 530 1085 RR2DD57JQ

RD RR2E567TF 529 0 0
GGAAGAGTCCTCAGATCGTGTTTGATTCTTGAGTCGAGAGAGAAGATCTCACAAAAGTAG
GGAAGAAGATAACTAGGGTTTTGGAAGAGAATGGCAGAGGATCTGGTTCTAGATACGGCG
ATAAGAGATTGGGTTCTAATCCCTCTCTCCGTTGTGATGGTTCTCATCGGTATCCTCCGA
TACTTGGTCTCCAAGCTCATGCGTTCTTCTCCATCTCCCGATGCTAAGATGGTCAAAGAA
GGACAAGTTATTATCAGAGCTCGAAATCTAAAAGCCGCCGCCAATTTCATCCCGCTGAGA
TCATTCCGCACTCGTAGACTCTACTTTAGCAACGAGGAGAATGGTTTGCTACATGTTCCC
AAGGGCCAAGCCACAAACCCCCAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCTAACATGGCCATGGAT
ATGATGAAGAAGAACCTTTCCATGATTATTCCCCAGACGCTCACTTTTGCATGGGTCAAC
TTCTTCTTCTCTGGATTTTTTGCAGCCAAAATACCGTTCCCACTGACCC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2DD57JQ 843 0 0
G
CAAGTTATTATCAGAGCTCGAAATCTAAAAGCCGCCGCCAATTTCATCCCATTGAGATCA
TTCCGCACTCGTAGACTCTACTTTAGCAACGAGGAGAATGGTTTGCTACATGTTCCCAAG
GGCCAAGCCACAAACCCCCAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCTAACATGGCCATGGATATG
ATGAAGAAGAACCTTTCCATGATTATTCCCCAGACGCTCACTTTTGCATGGGTCAACTTC
TTCTTCTCTGGATTTGTTGCAGCCAAAATACCGTTCCCACTGACCCAGAGGTTCAGATCA
ATGTTACAAAATGGCATCGACTTGAGTACTGTCGATGTTAGCTATGTGAGTAGTCGTTCC
TGGTACTTTTTAAACTTGTTTGGATTAAGAGGCTTGTTCAGTCTCATTCTCGGGGATGAA
AATGCCATTGATGACACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGGTTTGGATTTGATGCATCA
AAGAGCTTGGGTGCGGAGAAAGATGGTCTCGACATAATTCAGCACGATTGGGCTCTACCT
CGATTCGAGCAGCGTGCAGAGTCCGTATTGAGAAAATTCGTGAAGTAGAGACCAATGACG
ATATAGTTTTCTGACACAAAACGTTGAGACAACTCTGTAGAAGCTTCGACATAAAACCAA
ATCTTCTGTTTTGCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTTATAACTGTGGTCTCTGTAAAATCTTC
TTCGGAACAGTATCTGGTTTACTTTTGTACGGATAGATTTAGCGTGTTCTACAAAATTGG
AATGCTTCGTTTAAGTTTTGGATATTTTGACATGTTTTAGTAGGGCAACTTAATTGTGAC
TT

QA 2 843 2 843
DS 



AS 1 3

CO CL2608Contig1 684 3 10 U
TTTTTTAAGATCTGTGTGAAAATCGAATCGGAGAAGATGACTGACGAACATAAACACGAC
GAACCTGTAACCGTTTCGGAGCCAGCTGTTGAGATTGTGGAGAGAGAATCGCTGATGGAC
AAGATATCGGATAAGCTCCACCACGACGGCGGCGATTCTTCGTCGTCGTCAGATGACGAA
GACGACAAGAAGAAGAAGAAGAAGTCTTCGGAGAGCTCTCCTTTGAAATCGAAAGTTTAC
CGCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCTGTCCACAAGGTCCTCGGCGGTGGAAAACCGGCGGAT
ATATTCATGTGGAAGAACAAGAAGATGTCTGGGGGTGTACTCGGTGGTGCTACAGCCGCA
TGGGTTCTCCTTGAGCTGATGGAGTATCATCTCCTCACTCTGCTCTGCCACGTCATGATT
GTTGTGCTCGCTGTGCTCTTTCTCTGGTCTAATGCCACCGTGTTCATCAACAAGTCTCCA
CCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTATTCTCCAGCTTGCGTCCGGGCTC
AGGATCGAGATCAATAGAGGGTTCTCTTCTCTTCGTGAGATTGCCTCTGGAAGGGATCTC
AAGAAGTTTGTTACTGCTGTTGCTGGCTTGTGGGTTTTGTCGATCTTGGGTGGCTGGTTC
AATTTCTTGACATTGGCATACATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2GR83TF U 1
AF RR2D352TF U 1
AF RR2EF20TF U 63
BS 1 332 RR2D352TF
BS 333 333 RR2EF20TF
BS 334 359 RR2D352TF
BS 360 360 RR2EF20TF
BS 361 375 RR2D352TF
BS 376 376 RR2EF20TF
BS 377 533 RR2D352TF
BS 534 534 RR2EF20TF
BS 535 681 RR2D352TF
BS 682 684 RR2EF20TF

RD RR2GR83TF 175 0 0
TTTTTTAAGATCTGTGTGAAAATCGAATCGGAGAAGATGACTGACGAACATAAACACGAC
GAACCTGTAACCGTTTCGGAGCCAGCTGTTGAGATTGTGGAGAGAGAATCGCTGATGGAC
AAGATATCGGATAAGCTCCACCACGACGGCGGCGATTCTTCGTCGTCGTCAGATG

QA 1 175 1 175
DS 

RD RR2D352TF 681 0 0
TTTTTTAAGATCTGTGTGAAAATCGAATCGGAGAAGATGACTGACGAACATAAACACGAC
GAACCTGTAACCGTTTCGGAGCCAGCTGTTGAGATTGTGGAGAGAGAATCGCTGATGGAC
AAGATATCGGATAAGCTCCACCACGACGGCGGCGATTCTTCGTCGTCGTCAGATGACGAA
GACGACAAGAAGAAGAAGAAGAAGTCTTCGGAGAGCTCTCCTTTGAAATCGAAAGTTTAC
CGCTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCTGTCCACAAGGTCCTCGGCGGTGGAAAACCGGCGGAT
ATATTCATGTGGAAGAACAAGAAGATGTCTGGTGGTGTACTCGGTGGTGCTACAGCCGCT
TGGGTTCTCCTTGAGTTGATGGAGTATCATCTCCTCACTCTGCTCTGCCACGTCATGATT
GTTGTGCTCGCTGTGCTCTTTCTCTGGTCTAATGCCACCGTGTTCATCAACAAGTCTCCA
CCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTATTCTCCAGCTTGCGTCTGGGCTC
AGGATCGAGATCAATAGAGGGTTCTCTTCTCTTCGTGAGATTGCCTCTGGAAGGGATCTC
AAGAAGTTTGTTACTGCTGTTGCTGGCTTGTGGGTTTTGTCGATCTTGGGTGGCTGGTTC
AATTTCTTGACATTGGCATAC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2EF20TF 622 0 0
ACCTGTAACCGTTTCGGAGCCAGCTGTTGAGATTGTGGAGAGAGAATCGCTGATGGACAA
GATATCGGATAAGCTCCACCACGACGGCGGCGATTCTTCGTCGTCGTCAGATGACGAAGA
CGACAAGAAGAAGAAGAAGAAGTCTTCGGAGAGCTCTCCTTTGAAATCGAAAGTTTACCG
CTTGTTCGGAAGGGAGAAGCCTGTCCACAAGGTCCTCGGCGGTGGAAAACCGGCGGATAT
ATTCATGTGGAAGAACAAGAAGGTGTCTGGGGGTGTACTCGGTGGTGCTACAGCCGCATG
GGTTCTCTTTGAGCTGATGGAGTATCATCTCCTCACTCTGCTCTGCCACGTCATGATTGT
TGTGCTCGCTGTGCTCTTTCTCTGGTCTAATGCCACCGTGTTTATTAACAAGTCTCCACC
GAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTATTCTCCAGCTTGCGTCCGGTCTCAG
GATCGAGATCAATAGAGGGTTCTCTTCTCTTCGTGAGATTGCCTCTGGAAGGGATCTCAA
GAAGTTTGTTACTGCTGTTGCTGGCTTGTGGGTTTTGTCGATCTTGGGTGGCTGGTTCAA
TTTCTTGACATTGGCATACATT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 3

CO CL2609Contig1 1172 3 9 U
TTTTTAAATTTCTTTACAAATAAACAAAAGAGATTTTAAAAAAAAAGAAGGTGATTCAAA
AACGATTCCTCAGAAACAAGATCGAGAAGGAATCTGAATCGTTTTTTTCTTTCCCGAAGA
GATGAGAATTGGCGGCGCGGAGATTATGAAATACGCGTCGGAGATGATGACGTCTTCGTC
GGCGGTGGAAGCGTTGAATCTCAAGGAAGCATCGAGTTGGTGGTCGCACGTGAACGAGTC
TCCGATTTGGCAGGATCGTATCTTCCACGCTCTCGCTGTTCTCTACGGCGTCGTTTCCAT
CGTCGCTGTGATTCAACTTGTGAGAATCCAATTGAGAGTTCCAGAGTACGGATGGACGAC
GCAGAAGGTCTTTCACTTCCTCAATTTCGTGGTGAATGGAGTCAGGGCTGTGGTTTTCGT
ATTTAGACGAGATGTGCAGTTCATGTATCCAGAGATTCTGCAACATATATTGCTTGATAT
CCCAAGTCTTGCTTTCTTCACCACCTATGCTCTTCTGGTTCTCTTCTGGGCGGAGATATA
CTATCAGGCGCGGGCTGTATCCACTGATGGACTGAGACCAGGCTTCTTCCCAATCAATGC
TGTTGTCTATGTTGTTCAGATTGCTCTTTGGTTGGTTTTGTGGTGGAAGCCTGTTCGTGT
TATGGTAATCCTATCTAAGATGTTCTTCGCAGGTGCTTCATTGTTCGCTGCCCTTGGATT
TTTACTTTACGGTGGAAGGCTTTTCCTGATGTTGCAACGGTTTCCAGTTGAATCTAAAGG
ACGGCGCAAGAAGCTGCAAGAGGTTGGTTACGTGACAACCATATGCTTTACGTGTTTCCT
CATCAGATGTATCATGGGGGCAAACCTTGATGTGCTGGATCATCCCATTCTCAACTTCAT
ATATTACCTGTTGGTAGAGATATTACCTTCCTCTTTAGTCCTCTTCATATTGAGAAAGCT
ACCACCAAAGCGAGGCATCACACAATACCATCAGATCCGCTGAAAAATGTAAAGACACGA
CAACTACTGATCAGACGAAGACAAGACCATATATGTTTCTTTATCGGATGTGATCAGTCT
TTTTGGTTGATGTGGCCCAAGGGCTTGTTCCCTTTATATAGGTAATGTTGTAAAAAATGT
TAAAAAGTCGCTATGAAAGTAATTATTAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC04TF U 1
AF RR2H712TF U 119
AF RR2CC04JQ C 387
BS 1 692 RR2CC04TF
BS 693 693 RR2H712TF
BS 694 718 RR2CC04TF
BS 719 739 RR2H712TF
BS 740 740 RR2CC04JQ
BS 741 814 RR2H712TF
BS 815 815 RR2CC04JQ
BS 816 856 RR2H712TF
BS 857 1172 RR2CC04JQ

RD RR2CC04TF 718 0 0
TTTTTAAATTTCTTTACAAATAAACAAAAGAGATTTTAAAAAAAAAGAAGGTGATTCAAA
AACGATTCCTCAGAAACAAGATCGAGAAGGAATCTGAATCGTTTTTTTCTTTCCCGAAGA
GATGAGAATTGGCGGCGCGGAGATTATGAAATACGCGTCGGAGATGATGACGTCTTCGTC
GGCGGTGGAAGCGTTGAATCTCAAGGAAGCATCGAGTTGGTGGTCGCACGTGAACGAGTC
TCCGATTTGGCAGGATCGTATCTTCCACGCTCTCGCTGTTCTCTACGGCGTCGTTTCCAT
CGTCGCTGTGATTCAACTTGTGAGAATCCAATTGAGAGTTCCAGAGTACGGATGGACGAC
GCAGAAGGTCTTTCACTTCCTCAATTTCGTGGTGAATGGAGTCAGGGCTGTGGTTTTCGT
ATTTAGACGAGATGTGCAGTTCATGTATCCAGAGATTCTGCAACATATATTGCTTGATAT
CCCAAGTCTTGCTTTCTTCACCACCTATGCTCTTCTGGTTCTCTTCTGGGCGGAGATATA
CTATCAGGCGCGGGCTGTATCCACTGATGGACTGAGACCAGGCTTCTTCCCAATCAATGC
TGTTGTCTATGTTGTTCAGATTGCTCTTTGGTTGGTTTTGTGGTGGAAGCCTGTTCGTGT
TATGGTAATCCTATCTAAGATGTTCTTCGCAG*TGCTTCATTGTTCGCTGCCCTTGGA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2H712TF 754 0 0
GAGATGAGAATTGGCGGCGCGGAGATTATGAAATACGCGTCGGAGATGATGACGTCTTCG
TCGGCGGTGGAAGCGTTGAATCTCAAGGAAGCATCGAGTTGGTGGTCGCACGTGAACGAG
TCTCCGATTTGGCAGGATCGTATCTTCCACGCTCTCGCTGTTCTCTACGGCGTCGTTTCC
ATCGTCGCTGTGATTCAACTTGTGAGAATCCAATTGAGAGTTCCAGAGTACGGATGGACG
ACGCAGAAGGTCTTTCACTTCCTCAATTTCGTGGTGAATGGAGTCAGGGCTGTGGTTTTC
GTATTTAGACGAGATGTGCAGTTCATGCATCCAGAGATTCTGCAACATATATTGCTTGAT
ATCCCAAGTCTTGCTTTCTTCACCACCTATGCTCTTCTGGTTCTCTTCTGGGCGGAGATA
TACTATCAGGCGCGGGCTGTATCCACTGATGGACTGAGACCAGGCTTCTTCACAATCAAT
GCTGTTGTCTATGTTGTTCAGATTGCTCTTTGGTTGGTTTTGTGGTGGAAGCCTGTTCGT
GTTATGGTAATCATATCTAAGATGTTCTTCGCAGGTGCTTCATTGTTCGCTGCCCTTGGA
TTTTTACTTTACGGTGGAAGGTTTTTCCTGATGTTGCAACGGTTTCCAGTTGAATCTAAA
GGACGGCGCAAGAAGCTGCAAGAGGTTGGTTACGTGGCAACCATATGCTTTACGTGTTTC
CTCATCAGATGTATCATG
ATGTGTTTTGCTGCTT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2CC04JQ 786 0 0
TCGTGGTGAATGGAGTCAGGGCTGTGGTTTTCGTATTTAGACGAGATGTGCAGTTCATGT
ATCCAGAGATTCTGCAACATATATTGCTTGATATCCCAAGTCTTGCTTTCTTCACCACCT
ATGCTCTTCTGGTTCTCTTCTGGGCGGAGATATACTATCAGGCGCGGGCTGTATCCACTG
ATGGACTGAGACCAGGCTTCTTCCCAATCAATGCTGTTGTCTATGTTGTTCAGATTGCTC
TTTGGTTGGTTTTGTGGTGGAAGCCTGTTCGTGTTATGGTAATCCTATCTAAGATGTTCT
TCGCAGGTGCTTCATTGTTCGCTGCCCTTGGATTTTTACTTTACGGTGGAAGGCTTTTCC
TGATGTTGCAACGGTTTCCAGTTGAATCTAAAGGACGGCGCAAGAAGCTGCAAGAGGTTG
GTTACGTGACAACCATATGCTTTACGTGTTTCCTCATCAGATGTATCATGGGGGCAAACC
TTGATGTGCTGGATCATCCCATTCTCAACTTCATATATTACCTGTTGGTAGAGATATTAC
CTTCCTCTTTAGTCCTCTTCATATTGAGAAAGCTACCACCAAAGCGAGGCATCACACAAT
ACCATCAGATCCGCTGAAAAATGTAAAGACACGACAACTACTGATCAGACGAAGACAAGA
CCATATATGTTTCTTTATCGGATGTGATCAGTCTTTTTGGTTGATGTGGCCCAAGGGCTT
GTTCCCTTTATATAGGTAATGTTGTAAAAAATGTTAAAAAGTCGCTATGAAAGTAATTAT
TAATAT

QA 1 786 1 786
DS 



AS 2 4

CO CL2610Contig1 1123 2 6 U
GGATTATTCATCTTCGTTACTTTTATCTCAAAATCTACTTCAAACCCTAGCAAGCCAGTT
TTCTTCGATCTAACTCATGTCTACGATGGCGGGAATTCAAGGCCAGATCCTCGAGGTCAC
TGTGGTTGGGGACCAGAAGTTGAAAGACACGGAATGGTTCTCGAGGCAAGATCCGTACGT
TGTCCTCGAGTACAGCGGCGCTAGGCACCGGACCCGAACCTGCACAGATGGTGGGAAGAA
CGCAGTGTTTCAAGAGAAGTTTATGTTCACTCTGCTTGAAGGACTTAGGGATCTTAAAGT
TGCGGTTTGGAACAGCAATACGCTCTCCACTGATGACTTCATTGGCAATGCTACGATTCA
GTTGCAGAAGGTTCTTTCTCAGGGATACGACGACTGTACCTGGACTCTCCGGAGCAAAAC
TGGCAGATTTGCGGGAGAAGTAAGACTAATACTGCACTATGCAGGCGCAAAGAAACAAAA
TTACGGGTCTGCGCCATCAGCACCACCGTATGCTCCTCAAGTACCTCAATACTCAGCACC
GCCTGCTCCATCTCCGTATTCATCACCACCATACTCTGGACCATCTATGTACCCACAAGT
ACAATACTCTCAGCCGCAATCAGCTTACCCACCAGCTTCAGCTTATCCTCCTCAACCATC
TGCGTATCCTCCTCCTCCTTCGACTGCTTACCCTCCCGGTCCTTCAGCTTACCCTCCCGG
TCCTTCGGCGTACCCTCCAGGTCCTTCAGCTTACCCTCCTCCTCCATACCCTCCTCAACC
ATCAGCTTATTACCCGCAAGGTCCATATCCAGGACAATACCCACCCCCTCCGTACTAAAG
CTCCGGGCATTTAGAATCTGACGAGAAGATGCTAATTCTATGATGCTATTCCTAGAACTT
GATGACGATTTTTTTTGTTCTTTCTTTTATCTTCTGTGTGATCTTGTTATAGCTTAATGG
TTAGTTTTATGCGATGGTCAGTGAGACTCATTAGGAAGTTTGGATATGTTCAACATTAAG
CCAGCTTGCAGATTATGTTGCAGAAAAATCTAATTATAACCTTAAAAAGACATATATTGT
GGTGTGTGTAGTTACAATTTCTTAAGAGCTGGTTTATGTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ75TF U 1
AF RR2BJ75JQ C 251
BS 1 800 RR2BJ75TF
BS 801 801 RR2BJ75JQ
BS 802 816 RR2BJ75TF
BS 817 817 RR2BJ75JQ
BS 818 841 RR2BJ75TF
BS 842 1123 RR2BJ75JQ

RD RR2BJ75TF 841 0 0
GGATTATTCATCTTCGTTACTTTTATCTCAAAATCTACTTCAAACCCTAGCAAGCCAGTT
TTCTTCGATCTAACTCATGTCTACGATGGCGGGAATTCAAGGCCAGATCCTCGAGGTCAC
TGTGGTTGGGGACCAGAAGTTGAAAGACACGGAATGGTTCTCGAGGCAAGATCCGTACGT
TGTCCTCGAGTACAGCGGCGCTAGGCACCGGACCCGAACCTGCACAGATGGTGGGAAGAA
CGCAGTGTTTCAAGAGAAGTTTATGTTCACTCTGCTTGAAGGACTTAGGGATCTTAAAGT
TGCGGTTTGGAACAGCAATACGCTCTCCACTGATGACTTCATTGGCAATGCTACGATTCA
GTTGCAGAAGGTTCTTTCTCAGGGATACGACGACTGTACCTGGACTCTCCGGAGCAAAAC
TGGCAGATTTGCGGGAGAAGTAAGACTAATACTGCACTATGCAGGCGCAAAGAAACAAAA
TTACGGGTCTGCGCCATCAGCACCACCGTATGCTCCTCAAGTACCTCAATACTCAGCACC
GCCTGCTCCATCTCCGTATTCATCACCACCATACTCTGGACCATCTATGTACCCACAAGT
ACAATACTCTCAGCCGCAATCAGCTTACCCACCAGCTTCAGCTTATCCTCCTCAACCATC
TGCGTATCCTCCTCCTCCTTCGACTGCTTACCCTCCCGGTCCTTCAGCTTACCCTCCCGG
TCCTTCGGCGTACCCTCCAGGTCCTTCAGCTTACCCTCCTCCTCCATACCCTCCTCAACC
ATCAGCTTATTACCCGCAAG*TCCATATCCAGGACA*TACCCACCCCCTCCGTACTAAAG
C

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR2BJ75JQ 873 0 0
CAAGAGAAGTTTATGTTCACTCTGCTTGAAGGACTTAGGGATCTTAAAGTTGCGGTTTGG
AACAGCAATACGCTCTCCACTGATGACTTCATTGGCAATGCTACGATTCAGTTGCAGAAG
GTTCTTTCTCAGGGATACGACGACTGTACCTGGACTCTCCGGAGCAAAACTGGCAGATTT
GCGGGAGAAGTAAGACTAATACTGCACTATGCAGGCGCAAAGAAACAAAATTACGGGTCT
GCGCCATCAGCACCACCGTATGCTCCTCAAGTACCTCAATACTCAGCACCGCCTGCTCCA
TCTCCGTATTCATCACCACCATACTCTGGACCATCTATGTACCCACAAGTACAATACTCT
CAGCCGCAATCAGCTTACCCACCAGCTTCAGCTTATCCTCCTCAACCATCTGCGTATCCT
CCTCCTCCTTCGACTGCTTACCCTCCCGGTCCTTCAGCTTACCCTCCCGGTCCTTCGGCG
TACCCTCCAGGTCCTTCAGCTTACCCTCCTCCTCCATACCCTCCTCAACCATCAGCTTAT
TACCCGCAAGGTCCATATCCAGGACAATACCCACCCCCTCCGTACTAAAGCTCCGGGCAT
TTAGAATCTGACGAGAAGATGCTAATTCTATGATGCTATTCCTAGAACTTGATGACGATT
TTTTTTGTTCTTTCTTTTATCTTCTGTGTGATCTTGTTATAGCTTAATGGTTAGTTTTAT
GCGATGGTCAGTGAGACTCATTAGGAAGTTTGGATATGTTCAACATTAAGCCAGCTTGCA
GATTATGTTGCAGAAAAATCTAATTATAACCTTAAAAAGACATATATTGTGGTGTGTGTA
GTTACAATTTCTTAAGAGCTGGTTTATGTTCCG

QA 1 873 1 873
DS 



CO CL2610Contig2 1063 2 2 U
TTTTTTTTCTCAAATCTACTTCAAGCCCTAGCAAGCAAGTTTTCTTCTATCCAATTCATG
CCGACGATGATGGCGGGAATTCAAGGCCAGATCCTCGAGGTCACTGTGGTTGGGTGCCAG
AAACTGAAAGACACGGAGTGGTTCTCAAGGCAAGATCCGTACGTTGTCCTCGAGTACAGC
AGCACTAGGCACCGTACCCGAACCTGCACAGATGGTGGGAAAAACGCAGTGTTTCAAGAG
AAGTTTATGTTCACTCTGCTTGAAGGCCTTAGGGATGTTAAAGTTGCTGTTTGGAACAGC
AATACTCTCTCCACTGATGACTTCATTGGCAATGCTACGATTCAGTTGCAGAAGGTTCTT
TCTCAGGGATACGACGACTGTACCTGGACTCTTCAGACCAAAACTGGCAGATATGCTGGA
GAAGTAAGACTAATACTGCACTATGCAGGCGCAAAGAAACAAAATTACGAGTCTGCGCCA
TCAGCACCACCGTATGCGCCTCAAGTACCTCAATACTCAGCACCGCCTGCTCCATCTCCA
TATTCATCACCACCATACTCTGGACCATCTATGTACCCACAAGTACAATACTCTCAGCCC
CAATCGGCATACCCACCAGCTTCAGCTTATCCTCCTCAGCCATCTGCGTATCCTCCTCCT
CCCTCAACTGCTTATCCTCCCGCTCCTTCAGCTTACCCTCCCGGTCCTTCGGCGTACCCT
CCAGGTCCTTCGGCTTACCCTCCTCCTCCATACCCTCCTCAACCATCAGCTTACTACCCG
CAAGGTCCATATCAGGACAATACCCACCCCCTCCCTACTAAAGCTCCGGCATTTAGAATT
TGACGTGAAGATGCTAATACTATGATGCTTGATGACGATTTTTTTTTTGTTCTTTCTCTT
ATCTTCTGTGTGATCTTGTTAGCTTAATGGTTAGTTTTATGCGATGGTCCGTGAGACTCA
TTAGGAAGTTTGGATATGTTCAACATTAAGTCAGCTTGCAGACTGTGTTGCGGAAAAATC
TAATTATAACCTGAAAAAGACATATTGTGGTGTGTTAGTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV02TF U 1
AF RR2BV02JQ C 477
BS 1 699 RR2BV02TF
BS 700 1063 RR2BV02JQ

RD RR2BV02TF 699 0 0
TTTTTTTTCTCAAATCTACTTCAAGCCCTAGCAAGCAAGTTTTCTTCTATCCAATTCATG
CCGACGATGATGGCGGGAATTCAAGGCCAGATCCTCGAGGTCACTGTGGTTGGGTGCCAG
AAACTGAAAGACACGGAGTGGTTCTCAAGGCAAGATCCGTACGTTGTCCTCGAGTACAGC
AGCACTAGGCACCGTACCCGAACCTGCACAGATGGTGGGAAAAACGCAGTGTTTCAAGAG
AAGTTTATGTTCACTCTGCTTGAAGGCCTTAGGGATGTTAAAGTTGCTGTTTGGAACAGC
AATACTCTCTCCACTGATGACTTCATTGGCAATGCTACGATTCAGTTGCAGAAGGTTCTT
TCTCAGGGATACGACGACTGTACCTGGACTCTTCAGACCAAAACTGGCAGATATGCTGGA
GAAGTAAGACTAATACTGCACTATGCAGGCGCAAAGAAACAAAATTACGAGTCTGCGCCA
TCAGCACCACCGTATGCGCCTCAAGTACCTCAATACTCAGCACCGCCTGCTCCATCTCCA
TATTCATCACCACCATACTCTGGACCATCTATGTACCCACAAGTACAATACTCTCAGCCC
CAATCGGCATACCCACCAGCTTCAGCTTATCCTCCTCAGCCATCTGCGTATCCTCCTCCT
CCCTCAACTGCTTATCCTCCCGCTCCTTCAGCTTACCCT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2BV02JQ 587 0 0
GCCATCAGCACCACCGTATGCGCCTCAAGTACCTCAATACTCAGCACCGCCTGCTCCATC
TCCATATTCATCACCACCATACTCTGGACCATCTATGTACCCACAAGTACAATACTTTCA
GCCCCAATCGGCATACCCACCAGCTTCAGCTTATCCTCCTCAGCCATCTGCGTATCCTCC
TCCTCCCTCAACTGCTTATCCTCCCGCTCCTTCAGCTTACCCTCCCGGTCCTTCGGCGTA
CCCTCCAGGTCCTTCGGCTTACCCTCCTCCTCCATACCCTCCTCAACCATCAGCTTACTA
CCCGCAAGGTCCATATCAGGACAATACCCACCCCCTCCCTACTAAAGCTCCGGCATTTAG
AATTTGACGTGAAGATGCTAATACTATGATGCTTGATGACGATTTTTTTTTTGTTCTTTC
TCTTATCTTCTGTGTGATCTTGTTAGCTTAATGGTTAGTTTTATGCGATGGTCCGTGAGA
CTCATTAGGAAGTTTGGATATGTTCAACATTAAGTCAGCTTGCAGACTGTGTTGCGGAAA
AATCTAATTATAACCTGAAAAAGACATATTGTGGTGTGTTAGTTACT

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 3

CO CL2611Contig1 937 3 15 U
GGAAAATCACCCTTTACTGAAAAACAATAAAATCTAAAAGAATGACATTTTCATATTCTC
TACCCAAAAGATTTGTTTCCTCTATTTTGGCTATGCAATTCTTCATCATACATAGTGTTT
CTTCGTTGAACCTTACCAATGATTATCTCAACCACAAATGCTTCCTTGATCAAGGGATAT
ATAATTCTGGAAGTGAGTACCAGGACAACCTCAACATTATTTTGCGCAGTGTTCGTAATG
GTAATTATTATAACAACGGTTTTGTGCGCGCAAGCTTGGGTCGTGAACCTGCTCCTGATG
CTGTTACCGTCATGTTCCAGTGCCGTGGTGACTCTTATGGGTCTAAATGTCGTTCATGTG
CTGACACTGCAGTTGCAGGGTTTCGTAGAAGATGTCTAAGAAACAAAGGAGGAATAATAT
GGTATGGCCAATGTTTTCTCTGGGTTAGTGCGATCGGTGAAGAAATGCCAATCAATACTG
ACTACAAGAATATTTTTTCTATGTACAACCCAAATAACGTGAGGGGAAATGCAAAATTGT
TTGTTAAGAAGGTGTTGGATTTTTTCTCTGAGCTAACACTTAAAGTTGATAAAAATAGCG
AGGCTGGTGACCTCGTCATACTTTACGCAGAAAGGAAAAAGAAGCTTGGGAAAAATACAT
TGTATGCAATGGTGCAGTGTGTAGAGTTAACAATAGATTGTAAAAGTTGTTTGATATGGA
GCATCGCAAAGCTTTTCAAGAACGACAACATTAAACAAGGAGGAAGAGTTTTAGGTTCGA
ACTGTGAAGTAAGATATGAGCTATACCCTTTTATTAGGAGTTGAACATTTTTTGTGGTGG
TGATGAATATATCCGCTTCGTAACTTCTAATTATGTTTTAGTTTTGTTTACTTTTTTTGC
TGAAGTTTAATACATATATTAATAAATAGTGTTTAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG58TF U 1
AF RR2GE83TF U 1
AF RR2GE83JQ C 153
BS 1 154 RR2DG58TF
BS 155 155 RR2GE83TF
BS 156 295 RR2DG58TF
BS 296 296 RR2GE83TF
BS 297 349 RR2DG58TF
BS 350 350 RR2GE83TF
BS 351 426 RR2DG58TF
BS 427 427 RR2GE83TF
BS 428 486 RR2DG58TF
BS 487 487 RR2GE83TF
BS 488 497 RR2DG58TF
BS 498 654 RR2GE83TF
BS 655 655 RR2GE83JQ
BS 656 744 RR2GE83TF
BS 745 937 RR2GE83JQ

RD RR2DG58TF 497 0 0
GGAAAATCACCCTTTACTGAAAAACAATAAAATCTAAAAGAATGACATTTTCATATTCTC
TACCCAAAAGATTTGTTTCCTCTATTTTGGCTATGCAATTCTTCATCATACATAGTGTTT
CTTCGTTGAACCTTACCAATGATTATCTCAACCATAAATGCTTCCTTGATCAAGGGATAT
ATAATTCTGGAAGTGAGTACCAGGACAACCTCAACATTATTTTGCGCAGTGTTCGTAATG
GTAATTATTATAACAACGGTTTTGTGCGCGCAAGCTTGGGTCGTGAACCTGCTCCCGATG
CTGTTACCGTCATGTTCCAGTGCCGTGGTGACTCTTATGGGTCTAAATGCCGTTCATGTG
CTGACACTGCAGTTGCAGGGTTTCGTAGAAGATGTCTAAGAAACAAAGGAGGAATAATAT
GGTATGACCAATGTTTTCTCTGGGTTAGTGCGATCGGTGAAGAAATGCCAATCAATACTG
ACTACAGGAATATTTTT

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2GE83TF 744 0 0
GGAAAATCACCCTTTACTGAAAAACAATAAAATCTAAAAGAATGGCATTTTCATATTCTC
TACCCAAAAGATTTGTTTCCTCTATTTTGGCTATGCAATTCTTCATCATACATAGTGTTT
CTTCGTTGAACCTTACCAATGATTATCTCAACCACAAATGCTTCCTTGATCAAGGGATAT
ATAATTCTGGAAGTGAGTACCAGGACAACCTCAACATTATTTTGCGCAGTGTTCGTAATG
GTAATTATTATAACAACGGTTTTGTGCGCGCAAGCTTGGGTCGTGAACCTGCTCCTGATG
CTGTTACCGTCATGTTCCAGTGCCGTGGTGACTCTTATGGGTCTAAATGTCGTTCATGTG
CTGACACTGCAGTTGCAGGGTTTCGTAGAAGATGTCTAAGAAACAAAGGAGGAATAATAT
GGTATGGCCAATGTTTTCTCTGGGTTAGTGCGATCGGTGAAGAAATGCCAATCAATACTG
ACTACAAGAATATTTTTTCTATGTACAACCCAAATAACGTGAGGGGAAATGCAAAATTGT
TTGTTAAGAAGGTGTTGGATTTTTTCTCTGAGCTAACACTTAAAGTTGATAAAAATAGCG
AGGCTGGTGACCTCGTCATACTTTACGCAGAAAGGAAAAAGAAGCTTGGGAAAA*TACAT
TGTATGCAATGGTGCAGTGTGTAGAGTTAACAATAGATTGTAAAAGTTGTTTGATATGGA
GCATCGCAAAGCTTTTCAAGAACG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2GE83JQ 785 0 0
CAC
AAATGCTTCCTTGATCAAGGGATATATAATTCTGGAAGTGAGTACCAGGACAACCTCAAC
ATTATTTTGCGCAGTGTTCGTAATGGTAATTATTATAACAACGGTTTTGTGCGCGCAAGC
TTGGGTCGTGAACCTGCTCCTGATGCTGTTACCGTCATGTTCCAGTGCCGTGGTGACTCT
TATGGGTCTAAATGTCGTTCATGTGCTGACACTGCAGTTGCAGGGTTTCGTAGAAGATGT
CTAAGAAACAAAGGAGGAATAATATGGTATGGCCAATGTTTTCTCTGGGTTAGTGCGATC
GGTGAAGAAATGCCAATCAATACTGACTACAAGAATATTTTTTCTATGTACAACCCAAAT
AACGTGAGGGGAAATGCAAAATTGTTTGTTAAGAAGGTGTTGGATTTTTTCTCTGAGCTA
ACACTTAAAGTTGATAAAAATAGCGAGGCTGGTGACCTCGTCATACTTTACGCAGAAGGG
AAAAAGAAGCTTGGGAAAAATACATTGTATGCAATGGTGCAGTGTGTAGAGTTAACAATA
GATTGTAAAAGTTGTTTGATATGGAGCATCGCAAAGCTTTTCAAGAACGACAACATTAAA
CAAGGAGGAAGAGTTTTAGGTTCGAACTGTGAAGTAAGATATGAGCTATACCCTTTTATT
AGGAGTTGAACATTTTTTGTGGTGGTGATGAATATATCCGCTTCGTAACTTCTAATTATG
TTTTAGTTTTGTTTACTTTTTTTGCTGAAGTTTAATACATATATTAATAAATAGTGTTTA
GC

QA 4 785 4 785
DS 



AS 1 2

CO CL2612Contig1 621 2 19 U
ACTTATTATCTTGATTTCATATATAACTTAATATCCAAAGTTCCATACTTATATGAAACA
AAACCAATAGACCCAAAACAAGAAACACTACAAACAGAAAATAAACAAGAAAAATAGATA
AAGCTAAACAAGCTTGAGTAAGTCTCTTGTCTTATTTAAATAATTCTCCTGACCGGTGCT
TGAGGCACGAACCACCGTGTCTGAAGCCAACCTCCATTTTTCCGGTCACTGGAACCTTAC
TCCATGTTTAACAACCGGAGGTGGTCCTTTCTTTCCTCCTCCTCCTCCTCTCTTGTTATC
AAACCCAAACTCAATGTCTCCACCGTTACGACCAGATGGTTTGCTCATAGGGCCAAAAGG
TTTGCTCGTTGGACCAGGACGCTTTATATCAAACCCAAACTCCAAATCATCACCTCTCTC
TCTTGGCTCACGCTCCACAGGTCTGATCTCACGGCTCTTCTTTGACGACGGCTTCTCATG
CTTTGATGCTTTGTTCTTGTTTTTGTGTTCTTTGGGACCGCGGTTGCATAGCCTTCCAAA
AACACAAGCCAGTGCTGCTAAAATAAGGATCGCAGCTATAACTATGAAAGCTGTACCGAA
TGAGCCACTTGAACCAGATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU62JQ U 1
AF RR2CD87JQ U 18
BS 1 132 RR2DU62JQ
BS 133 133 RR2CD87JQ
BS 134 158 RR2DU62JQ
BS 159 159 RR2CD87JQ
BS 160 161 RR2DU62JQ
BS 162 162 RR2CD87JQ
BS 163 175 RR2DU62JQ
BS 176 176 RR2CD87JQ
BS 177 185 RR2DU62JQ
BS 186 186 RR2CD87JQ
BS 187 355 RR2DU62JQ
BS 356 356 RR2CD87JQ
BS 357 366 RR2DU62JQ
BS 367 367 RR2CD87JQ
BS 368 561 RR2DU62JQ
BS 562 562 RR2CD87JQ
BS 563 603 RR2DU62JQ
BS 604 604 RR2CD87JQ
BS 605 621 RR2DU62JQ

RD RR2DU62JQ 621 0 0
ACTTATTATCTTGATTTCATATATAACTTAATATCCAAAGTTCCATACTTATATGAAACA
AAACCAATAGACCCAAAACAAGAAACACTACAAACAGAAAATAAACAAGAAAAATAGATA
AAGCTAAACAAGGTTGAGTAAGTCTCTTGTCTTATTTAGATCATTCTCCTGACCG*TGCT
TGAGGTACGAACCACCGTGTCTGAAGCCAACCTCCATTTTTCCGGTCACTGGAACCTTAC
TCCATGTTTAACAACCGGAGGTGGTCCTTTCTTTCCTCCTCCTCCTCCTCTCTTGTTATC
AAACCCAAACTCAATGTCTCCACCGTTACGACCAGATGGTTTGCTCATAGGGCCAGAAGG
TTTGCTGGTTGGACCAGGACGCTTTATATCAAACCCAAACTCCAAATCATCACCTCTCTC
TCTTGGCTCACGCTCCACAGGTCTGATCTCACGGCTCTTCTTTGACGACGGCTTCTCATG
CTTTGATGCTTTGTTCTTGTTTTTGTGTTCTTTGGGACCGCGGTTGCATAGCCTTCCAAA
AACACAAGCCAGTGCTGCTAAGATAAGGATCGCAGCTATAACTATGAAAGCTGTACCGAA
TGATCCACTTGAACCAGATGA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2CD87JQ 596 0 0
CATATATAACTTAATATCCAAAGTTCCATACTTATATGAAACAAAACCAATAGACCCAAA
ACAAGAAACACTACAAACAGAAAATAAACAAGAAA**TAGATAAAGCTAAACAAGCTTGA
GTAAGTCTCTTGTCTTATTTAAATAATTCTCCTGACCGGTGCTTGAGGCACGAACCACCG
TGTCTGAAGCCAATCTCCATTTTTCCGGTCACTGGAACCTTACTCCATGTTTAACAACCG
GAGGTGGTCCTTTCTTTCCTCCTCCTCCTCCTCTCTTGTTATCAAACCCAAACTCAATGT
CTCCACCGTTTCGACCAGATGGTTTGCTCATAGGGCCAAAAGGTTTGCTCGTTGGACCAG
GACGCTTTATATCAAACCCGAACTCCAAATCATCACCTCTCTCTCTTGGCTCACGCTCCA
CAGGTCTGATCTCACGGCTCTTCTTTGACGACGGCTTCTCATGCTTTGATGCTTTTTTGT
TGTTTTTGTGTTCTTTGGGACCGCGGTTGCATAGTCTTCCAAACACACAAGCCAGTGCTG
CTAAAATAAGGATCGCAGCTATAACTATGAAAGCTGTACCGAATGAGCCACTTGAA

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 4

CO CL2613Contig1 1127 4 38 U
GGGTTCGGTAGGATTGGTAGGAACTTCTTGAGGTGTTGGCATGGTCGCAAAGACTCTCCT
CTTGATGTCATTGCCATCAACGACACTGGTGGTGTCAAACAAGCAACCCATCTCCTCAAA
TACGACTCTACTCTTGGAATCTTTGACGCTGACGTCAAACCCTCTGGAGACTCTGCTCTC
TCTGTTGATGGAAAGATCATCAAGATTGTATCTGATCGTAACCCATCTAATCTCCCCTGG
GGGGAACTAGGCATTGACCTTGTCATCGAAGGAACCGGAGTGTTCGTGGACAGAGAAGGT
GCTGGAAAACACATTCAAGCTGGAGCCAAGAAGGTCTTGATTACTGCTCCTGGTAAAGGA
GACATCCCAACATATGTTGTTGGTGTTAATGCTGAACTTTACAGCCATGAAGATACCATC
ATCAGCAACGCCTCTTGTACTACTAACTGTCTCGCTCCATTCGTCAAGGTTCTTGACCAG
AAATTCGGGATCATAAAGGGTACAATGACAACCACTCACTCATACACTGGTGACCAGAGG
CTGTTGGATGCAAGCCACCGTGATCTGAGGAGAGCAAGAGCAGCAGCTTTGAACATCGTT
CCAACATCGACAGGAGCAGCCAAGGCCGTGGCGCTAGTGCTCCCTAACCTCAAAGGAAAA
CTCAACGGAATCGCATTGCGTGTGCCAACTCCCAACGTCTCAGTGGTTGACTTGGTCGTG
CAGGTCTCCAAGAAGACTTTTGCTGAGGAAGTCAACGCTGCTTTCAGGGATGCAGCTGAG
AAAGAGCTTAAAGGTATACTCGATGTCTGCGATGAGCCTCTTGTCTCTGTTGACTTCAGG
TGCTCTGATGTTTCCTCAACCATTGACTCTTCTCTCACAATGGTCATGGGAGATGATATG
GTTAAAGTGATTGCTTGGTATGATAATGAATGGGGTTACTCTCAGAGAGTTGTTGATTCG
GCTGACATTGTTGCCAATAACTGGAAGTGAACAAGACTCAACTTTTGATATCTTGGCTCC
ATTTTTTTTCTTTAAACAGTTTTTATATGATTCGGAATGTAGAATTGTAGTTCCCGAGTT
TATGTATTTGTGATCTACAATTTTATACTAATAAACTTTATTCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2EQ42TF U 1
AF RR2CN60TF U 150
AF RR2EQ42JQ C 320
AF RR2CN60JQ C 335
BS 1 198 RR2EQ42TF
BS 199 199 RR2CN60TF
BS 200 284 RR2EQ42TF
BS 285 285 RR2CN60TF
BS 286 362 RR2EQ42TF
BS 363 363 RR2CN60TF
BS 364 537 RR2EQ42TF
BS 538 538 RR2CN60TF
BS 539 632 RR2EQ42TF
BS 633 633 RR2CN60TF
BS 634 635 RR2EQ42TF
BS 636 636 RR2CN60TF
BS 637 723 RR2EQ42TF
BS 724 724 RR2CN60TF
BS 725 749 RR2EQ42TF
BS 750 750 RR2CN60TF
BS 751 754 RR2EQ42TF
BS 755 755 RR2CN60TF
BS 756 768 RR2EQ42TF
BS 769 769 RR2CN60TF
BS 770 788 RR2EQ42TF
BS 789 789 RR2EQ42JQ
BS 790 791 RR2EQ42TF
BS 792 793 RR2EQ42JQ
BS 794 819 RR2EQ42TF
BS 820 884 RR2EQ42JQ
BS 885 885 RR2CN60JQ
BS 886 958 RR2EQ42JQ
BS 959 959 RR2CN60JQ
BS 960 1009 RR2EQ42JQ
BS 1010 1010 RR2CN60JQ
BS 1011 1068 RR2EQ42JQ
BS 1069 1069 RR2CN60JQ
BS 1070 1074 RR2EQ42JQ
BS 1075 1075 RR2CN60JQ
BS 1076 1110 RR2EQ42JQ
BS 1111 1111 RR2CN60JQ
BS 1112 1127 RR2EQ42JQ

RD RR2EQ42TF 819 0 0
GGGTTCGGTAGGATTGGTAGGAACTTCTTGAGGTGTTGGCATGGTCGCAAAGACTCTCCT
CTTGATGTCATTGCCATCAACGACACTGGTGGTGTCAAACAAGCAACCCATCTCCTCAAA
TACGACTCTACTCTTGGAATCTTTGACGCTGACGTCAAACCCTCTGGAGACTCTGCTCTC
TCTGTTGATGGAAAGATCGTCAAGATTGTATCTGATCGTAACCCATCTAATCTCCCCTGG
GGGGAACTAGGCATTGACCTTGTCATCGAAGGAACCGGAGTGTTTGTGGACAGAGAAGGT
GCTGGAAAACACATTCAAGCTGGAGCCAAGAAGGTCTTGATTACTGCTCCTGGTAAAGGA
GATATCCCAACATATGTTGTTGGTGTTAATGCTGAACTTTACAGCCATGAAGATACCATC
ATCAGCAACGCCTCTTGTACTACTAACTGTCTCGCTCCATTCGTCAAGGTTCTTGACCAG
AAATTCGGGATCATAAAGGGTACAATGACAACCACTCACTCATACACTGGTGACCAGCGG
CTGTTGGATGCAAGCCACCGTGATCTGAGGAGAGCAAGAGCAGCAGCTTTGAACATCGTT
CCAACATCGACAGGAGCAGCCAAGGCCGTGGCTCTCGTGCTCCCTAACCTCAAAGGAAAA
CTCAACGGAATCGCATTGCGTGTGCCAACTCCCAACGTCTCAGTGGTTGACTTGGTCGTG
CAG*TCTCCAAGAAGACTTTTGCTGAGGA*GTCA*CGCTGCTTTCAGG*ATGCAGCTGAG
AAAGAGCTAAA**GTATACTCGATGTCTGCGATGAGCCT

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2CN60TF 640 0 0
G
GACGTCAAACCCTCTGGAGACTCTGCTCTCTCTGTTGATGGAAAGATCATCAAGATTGTA
TCTGATCGTAACCCATCTAATCTCCCCTGGGGGGAACTAGGCATTGACCTTGTCATCGAA
GGAACCGGAGTGTTCGTGGACAGAGAAGGTGCTGGAAAGCACATTCAAGCTGGAGCCAAG
AAGGTCTTGATTACTGCTCCTGGTAAAGGAGACATCCCAACATATGTTGTTGGTGTTAAT
GCTGAACTTTACAGCCATGAAGATACCATCATCAGCAACGCCTCTTGTACTACTAACTGT
CTCGCTCCATTCGTCAAGGTTCTTGACCAGAAATTCGGGATCATAAAGGGTACAATGACA
ACCACTCACTCATACACTGGTGACCAGAGGCTGTTGGATGCAAGCCACCGTGATCTGAGG
AGAGCAAGAGCAGCTGCTTTGAACATCGTTCCAACATCGACAGGAGCAGCCAAGGCCGTG
GCGCTAGTGCTCCCTAACCTCAAAGGAAAGCTCAACGGAATCGCATTGCGTGTGCCAACT
CCCAACGTCTCAGTGGTTGACTTGGTCGTGCAGGTCTCCAAGAAGACTTTTGCTGAGGAA
GTCAACGCTGCTTTCAGGGATGCAGCTGAGAAAGAGCT
T

QA 2 639 2 639
DS 

RD RR2EQ42JQ 808 0 0
CTGGAGCCAAGAAGGTCTTGATTACTGCTCCTGGTAAAGGAGATATCCCAACATATGTTG
TTGGTGTTAATGCTGAACTTTACAGCCATGAAGATACCATCATCAGCAACGCCTCTTGTA
CTACTAACTGTCTCGCTCCATTCGTCAAGGTTCTTGACCAGAAATTCGGGATCATAAAGG
GTACAATGACAACCACTCACTCATACACTGGTGACCAGCGGCTGTTGGATGCAAGCCACC
GTGATCTGAGGAGAGCAAGAGCAGCAGCTTTGAACATCGTTCCAACATCGACAGGAGCAG
CCAAGGCCGTGGCTCTCGTGCTCCCTAACCTCAAAGGAAAACTCAACGGAATCGCATTGC
GTGTGCCAACTCCCAACGTCTCAGTGGTTGACTTGGTCGTGCAGGTCTCCAAGAAGACTT
TTGCTGAGGAAGTCAACGCTGCTTTCAGGGATGCAGCTGAGAAAGAGCTTAAAGGTATAC
TCGATGTCTGCGATGAGCCTCTTGTCTCTGTTGACTTCAGGTGCTCTGATGTTTCCTCAA
CCATTGACTCTTCTCTCACAATGGTTATGGGAGATGATATGGTTAAAGTGATTGCTTGGT
ATGATAATGAATGGGGTTACTCTCAGAGAGTTGTTGATTTGGCTGACATTGTTGCCAATA
ACTGGAAGTGAACAAGACTCAACTTTTGATGTCTTGGCTCCATTTTTTTTCTTTAAACAG
TTTTTATATGATTCGGAATGTAGAATTGTGGTTCCTGAGTTTATGTATTTGTGATCTACA
ATTTTATACTAGTAAACTTTATTCAAGC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2CN60JQ 789 0 0
TCTTGATTACTGCTCCTGGTAAAGGAGACATCCCAACATATGTTGTTGGTGTTAATGCTG
AACTTTACAGCCATGAAGATACCATCATCAGCAACGCCTCTTGTACTACTAACTGTCTCG
CTCCATTCGTCAAGGTTCTTGACCAGAAATTCGGGATCATAAAGGGTACAATGACAACCA
CTCACTCATACACTGGTGACCAGAGGCTGTTGGATGCAAGCCACCGTGATCTGAGGAGAG
CAAGAGCAGCTGCTTTGAACATCGTTCCAACATCGACAGGAGCAGCCAAGGCCGTGGCGC
TAGTGCTCCCTAACCTCAAAGGAAAGCTCAACGGAATCGCATTGCGTGTGCCAACTCCCA
ACGTCTCAGTGGTTGACTTGGTCGTGCAGGTCTCCAAGAAGACTTTTGCTGAGGAAGTCA
ACGCTGCTTTCAGGGATGCAGCTGAGAAAGAGCTTAAAGGTATACTCGATGTCTGCGATG
AGCCTCTTGTCTCTGTTGACTTTAGGTGCTCTGATGTTTCCTCAACCATTGATTCTTCTC
TCACAATGGTCATGGGAGATGATATGGTTAAAGTGATTGCTTGGTATGATAATGAATGGG
GTTACTCTCAGAGAGTTGTTGATTCGGCTGACATTGTTGCCAATAACTGGAAGTGAACAA
GACTCAACTTTTGATATCTTGGCTCCATTTTTTTTCTTTAAACAGTTTTTATATGATTCG
GAATGTAGAATTGTAGTTCCCGAGTTTATGTATTTGTGATCTACAATTTTATAGTAATAA
ACTTTATTC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 2 4

CO CL2614Contig1 764 2 2 U
GGCACCTTCAAAGCAGAGAAAAACCACAAGACTTGTTATTGAAGAACAACAAACTATGGA
GTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTCTCAT
CATGGATGAAGATGAACAGTTAAAACCTGTTAATCTCTCTTCCTCCTCCCCCGCTCTCGC
ATCCCAGGGTATGTACAGAGGAGGCTACCAAACGGCTCCATATATGTATCATCTGGAACA
GAGCAAAGGGACTGGTGTGTTCATCCCTAAATGTTATCAGTCCAGAAGAAGACCTCTTCA
TCCGAAACAAGGTAGGTTTAGTTCCTTCACCGCCAAGCAACAGCACTCTTTTCACCAAAA
CAAACAACAGTATCAGCGGAATCAGGACAACTTAAGAAGTAACCTCACCAGTCACACCAA
TAAGAACAACAATAGCAGCATGATCACTGGTAATATTCATGCTTCTATTCCAAGAAGAAC
CTACAGAGATGCAGCATCTATCTACACTTGATTGATTTTTTACATCTATCTACACTTGAT
TCATGGTTTATGTGTGATTGATTCATATAACTATATATAAATTTTTATAGATGCATAAGA
TTTATTTGTTTGTAAATCAGCAGATAGTAAGGATTTTTCTATAAGGAAGGTTCTTGGAGA
TTTGTTCCACGTTTTGTTCTTGATTTAATGTTACTCTTTCTTAGTCACTGGCTTCTCCAT
TTGTAAAGTATTTTTTTTAAGAATTAAATTAGAATCAGTTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ63TF U 1
AF RR2CJ63JQ C 42
BS 1 628 RR2CJ63TF
BS 629 764 RR2CJ63JQ

RD RR2CJ63TF 628 0 0
GGCACCTTCAAAGCAGAGAAAAACCACAAGACTTGTTATTGAAGAACAACAAACTATGGA
GTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTCTCAT
CATGGATGAAGATGAACAGTTAAAACCTGTTAATCTCTCTTCCTCCTCCCCCGCTCTCGC
ATCCCAGGGTATGTACAGAGGAGGCTACCAAACGGCTCCATATATGTATCATCTGGAACA
GAGCAAAGGGACTGGTGTGTTCATCCCTAAATGTTATCAGTCCAGAAGAAGACCTCTTCA
TCCGAAACAAGGTAGGTTTAGTTCCTTCACCGCCAAGCAACAGCACTCTTTTCACCAAAA
CAAACAACAGTATCAGCGGAATCAGGACAACTTAAGAAGTAACCTCACCAGTCACACCAA
TAAGAACAACAATAGCAGCATGATCACTGGTAATATTCATGCTTCTATTCCAAGAAGAAC
CTACAGAGATGCAGCATCTATCTACACTTGATTGATTTTTTACATCTATCTACACTTGAT
TCATGGTTTATGTGTGATTGATTCATATAACTATATATAAATTTTTATAGATGCATAAGA
TTTATTTGTTTGTAAATCAGCAGATAGT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2CJ63JQ 723 0 0
AAGAACAACAAACTATGGAGTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCA
AACAGATCTCTCTTCTCATCATGGATGAAGATGAACAGTTAAAACCTGTTAATCTCTCTT
CCTCCTCCCCCGCTCTCGCATCCCAGGGTATGTACAGAGGAGGCTACCAAACGGCTCCAT
ATATGTATCATTTGGAACAGAGCAAAGGGACTGGTGTGTTCATCCCTAAATGTTATCAGT
CCAGAAGAAGACCTCTTCATCCGAAACAAGGTAGGTTTAGTTCCTTCACCGCCAAGCAAC
AGCACTCTTTTCACCAAAACAAACAACAGTATCAGCGGAATCAGGACAACTTAAGAAGTA
ACCTCACCAGTCACACCAATAAGAACAACAATAGCAGCATGATCACTGGTAATATTCATG
CTTCTATTCCAAGAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTATCTACACTTGATTGATTTTTT
ACATCTATCTACACTTGATTCATGGTTTATGTGTGATTGATTCATATAACTATATATAAA
TTTTTATAGATGCATAAGATTTATTTGTTTGTAAATCAGCAGATAGTAAGGATTTTTCTA
TAAGGAAGGTTCTTGGAGATTTGTTCCACGTTTTGTTCTTGATTTAATGTTACTCTTTCT
TAGTCACTGGCTTCTCCATTTGTAAAGTATTTTTTTTAAGAATTAAATTAGAATCAGTTT
ATG

QA 1 723 1 723
DS 



CO CL2614Contig2 763 2 2 U
GGCACCTTCAAAGCAAAGAAAAACCACAAGACTTGTAACTAAAGAACAACAAACTATGGA
GTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTCTCAT
CATGGATGAAGACGAACAGTTAAAACCTGTTACTCTCTCTTCCTCCTCCCCCTCTCTCTC
ATCCCAGGGTATGTACAGAGGAGCCTACCAAACGGCTCCATATATGTATCATCTGGAACA
GAGCAAAGGGACTGGTGTTTTCATCCCTAAATGTTATCAGTCCAGAAGAAGACCTCGTCA
TCCGAAGCAAGGTAGGTTTAGTTCCTTCACCGCCAAGCAACAACACTCTTTTCATCAAAA
CAAACAACAGTATCAGCAGAATCAGGACAACTTAAGAAGTAACCTGACCAGTCACACTAA
CAACAACAACAAGAGTAGCAAGAACACTGGTAATGTTCATGTTTCTATCCCAAGAAGAAC
CTACAGAGATGCAGCGTCTATCTACACTTGATTGATTTTTCACATCTGTCTACACTTGAT
TCATGGTTTATGTGTGATTGATTCATATAACTATATATAAATTTTTATAGATGCAATAAG
ATTTATTTGTTTGTAAATCAGCAGATAGTGAGGATTCTTTATAAGGAAGGTCTTGGAGAT
TTTTCCACGTTTTGTTCTTGATTTAATGTTACTCTTTCTTAGTCACTGGCTTCTCCATTT
GTAAAGTATTTTTTTTAAGAATTAAATTAGAATCAGTTTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY27TF U 1
AF RR2GY27JQ C 161
BS 1 722 RR2GY27TF
BS 723 763 RR2GY27JQ

RD RR2GY27TF 722 0 0
GGCACCTTCAAAGCAAAGAAAAACCACAAGACTTGTAACTAAAGAACAACAAACTATGGA
GTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTCTCAT
CATGGATGAAGACGAACAGTTAAAACCTGTTACTCTCTCTTCCTCCTCCCCCTCTCTCTC
ATCCCAGGGTATGTACAGAGGAGCCTACCAAACGGCTCCATATATGTATCATCTGGAACA
GAGCAAAGGGACTGGTGTTTTCATCCCTAAATGTTATCAGTCCAGAAGAAGACCTCGTCA
TCCGAAGCAAGGTAGGTTTAGTTCCTTCACCGCCAAGCAACAACACTCTTTTCATCAAAA
CAAACAACAGTATCAGCAGAATCAGGACAACTTAAGAAGTAACCTGACCAGTCACACTAA
CAACAACAACAAGAGTAGCAAGAACACTGGTAATGTTCATGTTTCTATCCCAAGAAGAAC
CTACAGAGATGCAGCGTCTATCTACACTTGATTGATTTTTCACATCTGTCTACACTTGAT
TCATGGTTTATGTGTGATTGATTCATATAACTATATATAAATTTTTATAGATGCAATAAG
ATTTATTTGTTTGTAAATCAGCAGATAGTGAGGATTCTTTATAAGGAAGGTCTTGGAGAT
TTTTCCACGTTTTGTTCTTGATTTAATGTTACTCTTTCTTAGTCACTGGCTTCTCCATTT
GT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2GY27JQ 603 0 0
TCCTCCTCCCCCTCTCTCTCATCCCAGGGTATGTACAGAGGAGCCTACCAAACGGCTCCA
TATATGTATCATCTGGAACAGAGCAAAGGGACTGGTGTTTTCATCCCTAAATGTTATCAG
TCCAGAAGAAGACCTCGTCATCCGAAGCAAGGTAGGTTTAGTTCCTTCACCGCCAAGCAA
CAACACTCTTTTCATCAAAACAAACAACAGTATCAGCAGAATCAGGACAACTTAAGAAGT
AACCTGACCAGTCACACTAACAACAACAACAAGAGTAGCAAGAACACTGGTAATGTTCAT
GTTTTTATCCCAAGAAGAACCTACAGAGATGCAGCGTCTATTTACACTTGATTGATTTTT
CACATCTGTTTACACTTGATTCATGGTTTATGTGTGATTGATTCATATAACTATATATAA
ATTTTTATAGATGCAATAAGATTTATTTGTTTGTAAATCAGCAGATAGTGAGGATTCTTT
ATAAGGAAGGTCTTGGAGATTTTTCCACGTTTTGTTCTTGATTTAATGTTACTCTTTCTT
AGTCACTGGCTTCTCCATTTGTAAAGTATTTTTTTTAAGAATTAAATTAGAATCAGTTTA
AGG

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 4

CO CL2615Contig1 1328 4 21 U
GAATACGGGTTAGACCAAAAAGTTAGCCAACAGACCTCTCTCTTGCAGACACTGCTCGTG
AAACACCATCAGCTCCGGCGGCCGTGAATCGGCTCCGGAGGCGTCTTTTCTTCTCCCCTT
CCTTGTTTTTTATTTGCTTTAGTCCTCTCCTTCTCGCCTGGGTCAATATATTTGCCGTTC
TGCGCTGCCGTGGTCACTCCAGAAACTCTCTTTGCGGTGGTTAGAGCCGGCTTCGGACTT
CTTATGGAGGGGCGGTGAGACTTTAGGTGATACGGCGGAGGCGAGAGTCGGATTTTAGGG
TTTCAGCTTTAGCCAGATCCAGTTTTCCCTTTTGGAGATCTACCGCTAAAGCTGGTTGAT
TTTGGCGCATGACGAGATGTGACAGTTCCTCTACCATGGATCTATCGTTCCCCGGCGGCG
GTGTGACTGTAGGAGGAAAGACATAATTGGCGGCAAAAAAGAGGTTTCGATCTCCGAGAT
TGACGCGCTGTTTGGAACCCAACGACGGACTCATCCTCCGGAGAAGTGGTCCTCGCCGGA
AACGCGTGGTGGAGAAGTGCGTACTGAAGACGGTTCAGCCGGTGGCTGGTCCAAGTTCCG
ATCTCTCCACTCTTTCAAGCTGTGATGTGGTTTCCTCGTTCCGTTTTAGCTAATGTCAAA
GCCCGCTTTCCATTCC*GGACAGTCACGTTTGACTTCAGGTTTAAGGTCGGGATGGTGTG
ATTGAAGGGCTGGATTTGCGGTCGGTATGTGCCTTATGGTGAGTTTCTGCTGGTCCATGT
GCTGCAATCATATTATGTGGAGGCTGATAGTTCTGGAAGTTTCACTCGATCCGACTCCGG
TTCATAACTCGTCAACTCAACTCCATCCTCGTGCTTCCAAGTCACTATTGCTTCGACCAG
CCTGTCATTACGGAACTGTCCCGTCTTTTGGCTTAGGAGCGGAGCTTTTCAACCGGCAGT
GACATCTCTATTCAAGGAATGCATCGAAAGGTGAGGAGTGTTGGTTCCGCGCCCCACTCT
TATCGTGTTGAGACCAATGCCATGTTTTCAATCCAGATCCTTGGATAGTTCTTGTCATCT
AAAGGGCACGAAGCTTTCGTCTCGTAGGGTTTAATTAGTTAGTTTAAGAACCTACTCCTT
CTGTGTCTTAGTAGGAGTTTGTGTTCATTGGGGTGAAAATACAACAAAGAATAGCATTTG
GTAGTGTAGGATCCAAGCAATGATCTTAGATGTTACTAAATCTCTTTGTTTGTAAGTGAG
GTTTCAAACACTTTTGTGGTGTAAAATCTTTGTACCCATCCTTGGTGAATTAAAAGTTGA
TGTTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2AE34TF U 1
AF RR2B115TF U 20
AF RR2AE34JQ C 518
AF RR2B115JQ C 543
BS 1 187 RR2AE34TF
BS 188 188 RR2B115TF
BS 189 222 RR2AE34TF
BS 223 223 RR2B115TF
BS 224 319 RR2AE34TF
BS 320 320 RR2B115TF
BS 321 669 RR2AE34TF
BS 670 670 RR2B115TF
BS 671 676 RR2AE34TF
BS 677 677 RR2B115TF
BS 678 692 RR2AE34TF
BS 693 693 RR2B115TF
BS 694 698 RR2AE34TF
BS 699 699 RR2AE34JQ
BS 700 769 RR2B115TF
BS 770 770 RR2B115JQ
BS 771 836 RR2AE34JQ
BS 837 837 RR2B115JQ
BS 838 839 RR2AE34JQ
BS 840 840 RR2B115JQ
BS 841 1328 RR2AE34JQ

RD RR2AE34TF 701 0 0
GAATACGGGTTAGACCAAAAAGTTAGCCAACAGACCTCTCTCTTGCAGACACTGCTCGTG
AAACACCATCAGCTCCGGCGGCCGTGAATCGGCTCCGGAGGCGTCTTTTCTTCTCCCCTT
CCTTGTTTTTTATTTGCTTTAGTCCTCTCCTTCTCGCCTGGGTCAATATATTTGCCGTTC
TGCGCTGTCGTGGTCACTCCAGAAACTCTCTTTGCGGTGGTTGGAGCCGGCTTCGGACTT
CTTATGGAGGGGCGGTGAGACTTTAGGTGATACGGCGGAGGCGAGAGTCGGATTTTAGGG
TTTCAGCTTTAGCCAGATCTAGTTTTCCCTTTTGGAGATCTACCGCTAAAGCTGGTTGAT
TTTGGCGCATGACGAGATGTGACAGTTCCTCTACCATGGATCTATCGTTCCCCGGCGGCG
GTGTGACTGTAGGAGGAAAGACATAATTGGCGGCAAAAAAGAGGTTTCGATCTCCGAGAT
TGACGCGCTGTTTGGAACCCAACGACGGACTCATCCTCCGGAGAAGTGGTCCTCGCCGGA
AACGCGTGGTGGAGAAGTGCGTACTGAAGACGGTTCAGCCGGTGGCTGGTCCAAGTTCCG
ATCTCTCCACTCTTTCAAGCTGTGATGTGGTTTCCTCGTTCCGTTTTAGCTAATGTCAAA
GCCCGCTTTTCATTCCCGGACAGTCACGTTTGGCTTCA
CGT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2B115TF 750 0 0
AGGGG
AGCCAACAGACCTCTCTCTTGCAGACACTGCTCGTGAAACACCATCAGCTCCGGCGGCCG
TGAATCGGCTCCGGAGGCGTCTTTTCTTCTCCCCTTCCTTGTTTTTTATTTGCTTTAGTC
CTCTCCTTCTCGCCTGGGTCAATATATTTGCCGTTCTGTGCTGCCGTGGTCACTCCAGAA
ACTCTCTTTGCGGTGGTTAGAGCCGGCTTCGGACTTCTTATGGAGGGGCGGTGAGACTTT
AGGTGATACGGCGGAGGCGAGAGTCGGATTTTAGGGTTTCAGCTTTAGCCAGATCCAGTT
TTCCCTTTTGGAGATCTACCGCTAAAGCTGGTTGATTTTGGCGCATGACGAGATGTGACA
GTTCCTCTACCATGGATCTATCGTTCCCCGGCGGCGGTGTGACTGTAGGAGGAAAGACAT
AATTGGCGGCAAAAAAGAGGTTTCGATCTCCGAGATTGACGCGCTGTTTGGAACCCAACG
ACGGACTCATCCTCCGGAGAAGTGGTCCTCGCCGGAAACGCGTGGTGGAGAAGTGCGTAC
TGAAGACGGTTCAGCCGGTGGCTGGTCCAAGTTCCGATCTCTCCACTCTTTCAAGCTGTG
ATGTGGTTTCCTCGTTCCGTTTTAGCTAATGTCAAAGCCCGCTTTCCATTCC*GGACAGT
CACGTTTGACTTCATGTTTAAGGTCGGGATGGTGTGATTGAAGGGCTGGATTTGCGGTCG
GTATGTGCCTTATGGTGAGTTTCTG

QA 6 750 6 750
DS 

RD RR2AE34JQ 811 0 0
CCGGAGAAGTGGTCCTCGCCGGAAACGCGTGGTGGAGAAGTGCGTACTGAAGACGGTTCA
GCCGGTGGCTGGTCCAAGTTCCGATCTCTCCACTCTTTCAAGCTGTGATGTGGTTTCCTC
GTTCCGTTTTAGCTAATGTCAAAGCCCGCTTTTCATTCC*GGACAGTCACGTTTGGCTTC
AGGTTTAAGGTCGGGATGGTGTGATTGAAGGGCTGGATTTGCGGTCGGTATGTGCCTTAT
GGTGAGTTTCTGTTGGTCCATGTGCTGCAATCATATTATGTGGAGGCTGATAGTTCTGGA
AGTTTCACTCGATCCGACTTCGTTTCATAACTCGTCAACTCAACTCCATCCTCGTGCTTC
CAAGTCACTATTGCTTCGACCAGCCTGTCATTACGGAACTGTCCCGTCTTTTGGCTTAGG
AGCGGAGCTTTTCAACCGGCAGTGACATCTCTATTCAAGGAATGCATCGAAAGGTGAGGA
GTGTTGGTTCCGCGCCCCACTCTTATCGTGTTGAGACCAATGCCATGTTTTCAATCCAGA
TCCTTGGATAGTTCTTGTCATCTAAAGGGCACGAAGCTTTCGTCTCGTAGGGTTTAATTA
GTTAGTTTAAGAACCTACTCCTTCTGTGTCTTAGTAGGAGTTTGTGTTCATTGGGGTGAA
AATACAACAAAGAATAGCATTTGGTAGTGTAGGATCCAAGCAATGATCTTAGATGTTACT
AAATCTCTTTGTTTGTAAGTGAGGTTTCAAACACTTTTGTGGTGTAAAATCTTTGTACCC
ATCCTTGGTGAATTAAAAGTTGATGTTGAGC

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2B115JQ 785 0 0
CGCGTGGTGGAGAAGTGCGTACTGAAGACGGTTCAGCCGGTGGCTGGTCCAAGTTCCGAT
CTCTCCACTCTTTCAAGCTGTGATGTGGTTTCCTCGTTCCGTTTTAGCTAATGTCAAAGC
CCGCTTTCCATTCC*GGACAGTCACGTTTGACTTCAGGTTTAAGGTCGGGATGGTGTGAT
TGAAGGGCTGGATTTGCGGTCGGTATGTGCCTTATGGTGAGTTTCTGCTGGTCCATGTGC
TGCAATCATATTATGTGGAGGCTGATAGTTCTGGAAGTTTCACTCGATCCGACTCCGGTT
CATAACTCGTCAACTCAACTCCATCCTCGTGCTTCCAAGTCACTATTGCTTCGACCAGCC
TGTCATTACGGAACTGTCCCGTCTTTTGGCTTAGGAGCGGAGCTTTTCAACCGGCAGTGA
CATCTCTATTCAAGGAATGCATCGAAAGGTGAGGAGTGTTGGTTCCGTGCCCCACTCTTA
TCGTGTTGAGACCAATGCCATGTTTTCAATCCAGATCCTTGGATAGTTCTTGTCATCTAA
AGGGCACGGAGCTTTCGTCTCGTAGGGTTTAATTAGTTAGTTTAAGAACCTACTCCTTCT
GTGTCTTAGTAGGAGTTTGTGTTCATTGGGGTGAAAATACAACAAAGAATAGCATTTGGT
AGTGTAGGATCCAAGCAATGATCTTAGATGTTACTAAATCTCTTTGTTTGTAAGTGAGGT
TTCAAACACTTTTGTGGTGTAAAATCTTTGTACCCATCCTTGGTGAATTAAAAGTTGATG
TTGA
C

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 4

CO CL2616Contig1 695 4 5 U
GGATCGCAATTCTGAATCTGAAAGCAGAAAGATTCCCCACCCTTTTGATTTGAGAAGAGA
GAGATGGCTTCAGAGAAGAAGGTTCTAGCTTTCGAAGAAGTTTCACAGCGCAACAAAACC
AAGGATTGTTGGCTTATTATCTCTGGCAAGGTCTATGATGTGACCCCTTTCATGGATGAT
CATCCTGGTGGCGACGAAGTCTTATTGTCCTCAACAGGGAAAGATGCTACGAATGACTTT
GAAGACGTTGGTCACAGCGACACCGCAAGGGACATGATGGAGAAGTACTACATTGGCGAG
ATCGATTCGTCTACTGTTCCAGCGACAAGGACATACGTTGCACCGGTGCAACCGGCGTAC
AACCAAGACAAGACACCAGAATTCATCATCAAGATTCTCCAGTTCCTTGTTCCGATCGTG
ATCTTGGGTCTTGCTCTCCTCGTCCGTCAGTATACCAAGAAAGAGTAAGAAGCAGAGAGG
CTTCAACTTTTGCTTCCCCATTTGATAACTCTTTCTGATCTCTCTGTATTTGCAAAAAAT
AGATTTACGGTTGTTTGGTCCTAGTCTAGACTGCATCGTTGTCCTTAAAATGATTCTTGT
TGAAGCTACTTCGAACCAATAATTAATGTGTTGTTTGAGATGTTTTCAACTTTGATGATT
TGTTGGTGCTAAAATGTAGAAACGAGAAATTGAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CQ14TF U 12
AF RR2GZ36JQ C 145
AF RR2FD48JQ C 1
AF RR2FD48TF U 1
BS 1 13 RR2FD48TF
BS 14 109 RR2CQ14TF
BS 110 110 RR2FD48TF
BS 111 645 RR2CQ14TF
BS 646 695 RR2FD48TF

RD RR2CQ14TF 639 0 0
GG
GAATCTGAAAGCAGAAAGATTCCCCACCCTTTTGATTTGAGAAGAGAGAGATGGCTTCAG
AGAAGAAGGTTCTAGCTTTCGAAGAAGTTTCACAGCACAACAAAACCAAGGATTGTTGGC
TTATTATCTCTGGCAAGGTCTATGATGTGACCCCTTTCATGGATGATCATCCTGGTGGCG
ACGAAGTCTTATTGTCCTCAACAGGGAAAGATGCTACGAATGACTTTGAAGACGTTGGTC
ACAGCGACACCGCAAGGGACATGATGGAGAAGTACTACATTGGCGAGATCGATTCGTCTA
CTGTTCCAGCGACAAGGACATACGTTGCACCGGTGCAACCGGCGTACAACCAAGACAAGA
CACCAGAATTCATCATCAAGATTCTCCAGTTCCTTGTTCCGATCGTGATCTTGGGTCTTG
CTCTCCTCGTCCGTCAGTATACCAAGAAAGAGTAAGAAGCAGAGAGGCTTCAACTTTTGC
TTCCCCATTTGATAACTCTTTCTGATCTCTCTGTATTTGCAAAAAATAGATTTACGGTTG
TTTGGTCCTAGTCTAGACTGCATCGTTGTCCTTAAAATGATTCTTGTTGAAGCTACTTCG
AACCAATAATTAATGTGTTGTTTGAGATGTTT
TCAAC

QA 3 634 3 634
DS 

RD RR2GZ36JQ 504 0 0
GGCAAGGTCTATGATGTGACCCCTTTCATGGATGATCATCCTGGTGGCGACGAAGTCTTA
TTGTCCTCAACAGGGAAAGATGCT**GAATGACTTTGAAGACGTTGGTCACAGCGACACC
GCAAGGGACATGATGGAGAAGTACTACATTGGCGAGATCGATTCGTCTACTGTTCCAGCG
ACAAGGACATACGTTGCACCGGTGCAACCGGCGTACAACCAAGACAAGACACCAGAATTC
ATCATCAAGATTCTCCAGTTCCTTGTTCCGATCGTGATCTTGGGTCTTGCTCTCCTCGTC
CGTCAGTATACCAAGAAAGAGTAAGAAGCAGAGAGGCTTCAACTTTTGCTTCCCCATTTG
ATAACTCTTTCTGATCTCTCTGTATTTGCAAAAAATAGATTTACGGTTGTTTGGTCCTAG
TCTAGACTGCATCGTTGTCCTTAAAATGATTCTTGTTGAAGCTACTTCGAACCAATAATT
AATGTGTTGTTTGAGATGTTT
CCG

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR2FD48JQ 695 0 0
GGATCGCAATTCTGAATCTGAAAGCAGAAAGATTCCCCACCCTTTTGATTTGAGAAGAGA
GAGATGGCTTCAGAGAAGAAGGTTCTAGCTTTCGAAGAAGTTTCACAGCGCAACAAAACC
AAGGATTGTTGGCTTATTATCTCTGGCAAGGTCTATGATGTGACCCCTTTCATGGATGAT
CATCCTGGTGGCGACGAAGTCTTATTGTCCTCAACAGGGAAAGATGCTACGAATGACTTT
GAAGACGTTGGTCACAGCGACACCGCAAGGGACATGATGGAGAAGTACTACATTGGCGAG
ATCGATTCGTCTACTGTTCCAGCGACAAGGACATACGTTGCACCGGTGCAACCGGCGTAC
AACCAAGACAAGACACCAGAATTCATCATCAAGATTCTCCAGTTCCTTGTTCCGATCGTG
ATCTTGGGTCTTGCTCTCCTCGTCCGTCAGTATACCAAGAAAGAGTAAGAAGCAGAGAGG
CTTCAACTTTTGCTTCCCCATTTGATAACTCTTTCTGATCTCTCTGTATTTGCAAAAAAT
AGATTTACGGTTGTTTGGTCCTAGTCTATACTGCATCGTTGTCCTTAAAATGATTCTTGT
TGAAGCTACTTCGAACCAATAATTAATGTGTTGTTTGAGATGTTTTCAACTTTGATGATT
TGTTGGTGCTAAAATGTAGAAACGAGAAATTGAGT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2FD48TF 695 0 0
GGATCGCAATTCTGAATCTGAAAGCAGAAAGATTCCCCACCCTTTTGATTTGAGAAGAGA
GAGATGGCTTCAGAGAAGAAGGTTCTAGCTTTCGAAGAAGTTTCACAGCGCAACAAAACC
AAGGATTGTTGGCTTATTATCTCTGGCAAGGTCTATGATGTGACCCCTTTCATGGATGAT
CATCCTGGTGGCGACGAAGTCTTATTGTCCTCAACAGGGAAAGATGCTACGAATGACTTT
GAAGACGTTGGTCACAGCGACACCGCAAGGGACATGATGGAGAAGTACTACATTGGCGAG
ATCGATTCGTCTACTGTTCCAGCGACAAGGACATACGTTGCACCGGTGCAACCGGCGTAC
AACCAAGACAAGACACCAGAATTCATCATCAAGATTCTCCAGTTCCTTGTTCCGATCGTG
ATCTTGGGTCTTGCTCTCCTCGTCCGTCAGTATACCAAGAAAGAGTAAGAAGCAGAGAGG
CTTCAACTTTTGCTTCCCCATTTGATAACTCTTTCTGATCTCTCTGTATTTGCAAAAAAT
AGATTTACGGTTGTTTGGTCCTAGTCTATACTGCATCGTTGTCCTTAAAATGATTCTTGT
TGAAGCTACTTCGAACCAATAATTAATGTGTTGTTTGAGATGTTTTCAACTTTGATGATT
TGTTGGTGCTAAAATGTAGAAACGAGAAATTGAGT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 2 4

CO CL2617Contig1 650 2 3 U
GGAACATAAACTTGATCCTTGCTAACCATCCTCAGTGACTTAAAGAGAACGAGTGAAATA
AAACATGACGATCACTGTCTCCATATTCTTTGTTGCCTCACTTCTTATCACTTCATCTCT
TGCTTCCCTAACAATCTCAGGTGGTGGTACTGGAGCGGTAGCTCCAGCGCCGGAGATCAA
AGATGGTGCAGATTTAGAGAAGTGGTGTGGAGGGAAGTGTGAAGTGAGATGCGAAGAAGC
AGGTATGAAGGATAGGTGTTTGAAGTATTGTGGGATATGCTGCAAAGAGTGTAAGTGTGT
TCCTTCAGGAACTTACGGGAACAAGCATGAGTGTGCTTGCTATCGTGACAAGCTCAGCAG
CAAAAAGACTCCCAAGTGTCCTTGATTATACATCTCGATCTCCATCCATTTTTTTAAATA
AATAAAAAAGAGAGATCCGGTGAACTATATATGGATCTTTTTCTTATGAGTTTATATATT
CCTTCAATTGTCCTTTGTAATTCCCGATGTTTTTTTTTGATAAGTGATTCCCGGTGTTAA
TTTGGTTTTAAACTTACCAATCAATCGGAGCTATCTATGACTCCACATATGATGCTGTTT
CGTATTTCACCGATTATAAAAAAATTGAAGCAAGTAAAAATAGTTAAAAC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV07TF U 1
AF RR2AV07JQ C 1
BS 1 3 RR2AV07JQ
BS 4 596 RR2AV07TF
BS 597 650 RR2AV07JQ

RD RR2AV07TF 596 0 0
GGA
ACATAAACTTGATCCTTGCTAACCATCCTCAGTGACTTAAAGAGAACGAGTGAAATAAAA
CATGACGATCACTGTCTCCATATTCTTTGTTGCCTCACTTCTTATCACTTCATCTCTTGC
TTCCCTAACAATCTCAGGTGGTGGTACTGGAGCGGTAGCTCCAGCGCCGGAGATCAAAGA
TGGTGCAGATTTAGAGAAGTGGTGTGGAGGGAAGTGTGAAGTGAGATGCGAAGAAGCAGG
TATGAAGGATAGGTGTTTGAAGTATTGTGGGATATGCTGCAAAGAGTGTAAGTGTGTTCC
TTCAGGAACTTACGGGAACAAGCATGAGTGTGCTTGCTATCGTGACAAGCTCAGCAGCAA
AAAGACTCCCAAGTGTCCTTGATTATACATCTCGATCTCCATCCATTTTTTTAAATAAAT
AAAAAAGAGAGATCCGGTGAACTATATATGGATCTTTTTCTTATGAGTTTATATATTCCT
TCAATTGTCCTTTGTAATTCCCGATGTTTTTTTTTGATAAGTGATTCCCGGTGTTAATTT
GGTTTTAAACTTACCAATCAATCGGAGCTATCTATGACTCCACATATGATGCT

QA 4 596 4 596
DS 

RD RR2AV07JQ 650 0 0
GGAACATAAACTTGATCCTTGCTAACCATCCTCAGTGACTTAAAGAGAACGAGTGAAATA
AAACATGACGATCACTGTCTCCATATTCTTTGTTGCCTCACTTCTTATCACTTCATCTCT
TGCTTCCCTAACAATCTCAGGTGGTGGTACTGGAGCGGTAGCTCCAGCGCCGGAGATCAA
AGATGGTGCAGATTTAGAGAAGTGGTGTGGAGGGAAGTGTGAAGTGAGATGCGAAGAAGC
AGGTATGAAGGATAGGTGTTTGAAGTATTGTGGGATATGCTGCAAAGAGTGTAAGTGTGT
TCCTTCAGGAACTTACGGGAACAAGCATGAGTGTGCTTGCTATCGTGACAAGCTCAGCAG
CAAAAAGACTCCCAAGTGTCCTTGATTATACATCTCGATCTCCATCCATTTTTTTAAATA
AATAAAAAAGAGAGATCCGGTGAACTATATATGGATCTTTTTCTTATGAGTTTATATATT
CCTTCAATTGTCCTTTGTAATTCCCGATGTTTTTTTTTGATAAGTGATTCCCGGTGTTAA
TTTGGTTTTAAACTTACCAATCAATCGGAGCTATCTATGACTCCACATATGATGCTGTTT
CGTATTTCACCGATTATAAAAAAATTGAAGCAAGTAAAAATAGTTAAAAC

QA 1 650 1 650
DS 



CO CL2617Contig2 548 2 2 U
GGACATAAACTTGATCCTTGCTAACCATCCTCAGTGACTTAAAGAGAACGAGTGAAATAA
AACATGAAGATCACTGTCTCCATATTCTTTGTTGCCTCACTTCTTATCACTTCATCTCTT
GCTTCCCTAACAATCTCAGGTGGTAGTACTGGAGCGGTAGCTCCAGCGCCGGAGATCAAA
GATGGTGCAGATTTAGAGAAGTGGTGTGGAGGGAAGTGTGAAGTGAGATGCGAAGAAGCA
GGTATGAAGGATAGGTGTTTGAAGTATTGTGGGATATGCTGCAAAGAGTGTAAGTGTGTT
CCTTCAGGAACTTACGGGAATAAGCATGAGTGTGCTTGCTATCGTGACAAGCTCAGCAGC
AAAAAGACTCCCAAGTGTCCTTGATTATACATCTCGATCTCCATCCATTTTTTTAAATAA
AATAAAAAAAGAAAGATCCGGTGAACTACTGTATATATGGATCTTTTTCTTACTACGAGT
TTATATATTCCTTCAATTGTCCTTTGTAATTCCCGATGTTTTTTTTTTGATAAGTGATTC
CCGGTGTT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CH64JQ C 1
AF RR2CH64TF U 1
BS 1 2 RR2CH64JQ
BS 3 548 RR2CH64TF

RD RR2CH64JQ 548 0 0
GGACATAAACTTGATCCTTGCTAACCATCCTCAGTGACTTAAAGAGAACGAGTGAAATAA
AACATGAAGATCACTGTCTCCATATTCTTTGTTGCCTCACTTCTTATCACTTCATCTCTT
GCTTCCCTAACAATCTCAGGTGGTAGTACTGGAGCGGTAGCTCCAGCGCCGGAGATCAAA
GATGGTGCAGATTTAGAGAAGTGGTGTGGAGGGAAGTGTGAAGTGAGATGCGAAGAAGCA
GGTATGAAGGATAGGTGTTTGAAGTATTGTGGGATATGCTGCAAAGAGTGTAAGTGTGTT
CCTTCAGGAACTTACGGGAATAAGCATGAGTGTGCTTGCTATCGTGACAAGCTCAGCAGC
AAAAAGACTCCCAAGTGTCCTTGATTATACATCTCGATCTCCATCCATTTTTTTAAATAA
AATAAAAAAAGAAAGATCCGGTGAACTACTGTATATATGGATCTTTTTCTTACTACGAGT
TTATATATTCCTTCAATTGTCCTTTGTAATTCCCGATGTTTTTTTTTTGATAAGTGATTC
CCGGTGTT

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2CH64TF 548 0 0
GG
ACATAAACTTGATCCTTGCTAACCATCCTCAGTGACTTAAAGAGAACGAGTGAAATAAAA
CATGAAGATCACTGTCTCCATATTCTTTGTTGCCTCACTTCTTATCACTTCATCTCTTGC
TTCCCTAACAATCTCAGGTGGTAGTACTGGAGCGGTAGCTCCAGCGCCGGAGATCAAAGA
TGGTGCAGATTTAGAGAAGTGGTGTGGAGGGAAGTGTGAAGTGAGATGCGAAGAAGCAGG
TATGAAGGATAGGTGTTTGAAGTATTGTGGGATATGCTGCAAAGAGTGTAAGTGTGTTCC
TTCAGGAACTTACGGGAATAAGCATGAGTGTGCTTGCTATCGTGACAAGCTCAGCAGCAA
AAAGACTCCCAAGTGTCCTTGATTATACATCTCGATCTCCATCCATTTTTTTAAATAAAA
TAAAAAAAGAAAGATCCGGTGAACTACTGTATATATGGATCTTTTTCTTACTACGAGTTT
ATATATTCCTTCAATTGTCCTTTGTAATTCCCGATGTTTTTTTTTTGATAAGTGATTCCC
GGTGTT

QA 3 548 3 548
DS 



AS 1 4

CO CL2618Contig1 1307 4 8 U
GACATAGAAAAGCACCAACTTTTCATTATTAAACAGATACAACAAAACAGTGAACCATAT
TGAAAGTAATTCACTTGGCCACTGCGGAATTATTACATAGTGGAGATATTCGGTTTAAAC
GGAAAAAGAGTGATTGTGGAATCATCTTAAACCCTAGAAAGAGTCAACTTTAGAGAAGGA
CAAGATCTGAGCCTCGAATTTGATTATGTCGTTGAAAATGAAACCTTTAGCTGGGTTTTT
GATATCTTGGAGTGGTATAAACTTCTCAAAACCCCATCCGTTCTCAGTTGAATTGGGCCA
TCCTTCCACCTGTTTCTCCTCATGTTGGGATCGGATCTGGTCAATAACCCTCAACTTGGC
TTTCACGTAACCTCTTTCATTTGATGCACTCAACAAAAAGAGTGATAACGAATTGCCCGT
TCCCGACCCAACTCCGTTAAGATACACTTTAAATGCCCAGTCTCTTCCTCATGAAGAAAA
CGGAGGAGAAGCGTAAAAGCGAGCAGCACGTGTAGAGACGTTGGTGATCCTCCAATTGAT
AAGAGGGTCAGGAATGTTTTCTTCGTAAGAGAAGACTTCCCAATTCTCAAAAGGATTAGT
AACGAGGATGTCAACGCCAAACACACTTTGTCCCCCGTTGAAAATGAATCCAGAATTCAC
ATCTCTGTAGTACCCAATCTCAAGAAACCTTGACTGTCCCCATTCTTGTTTAAACAAATG
AAATCGCTGCACATCAGTCTCCTGGAGATAATGGTACTTGTCTATAGTGGCTTTGTAGGT
GAGGAATGTGATCTCTGCATACACATTTCTTGGATTGTCGATGAGGGTTGAGTTATCGAT
TCTTACGTACATCGAAACGAATCCACCCGACCCCTGTGGTTTATTCTCGTTCGGGTAGAT
TATTAACGTCCAGTTGTAACCACCGACGGTGAAAGGACGTGACCCGTACTTGTCACCGTT
TTGTTTGACCAGGTTCGCCAGAGTGGCAAAATTCTGGAACTTCACGCAGTACGAAGATGG
AGGACGAGTTCTATCCTCTCGCCTTATTAGACCCGATAGCTTCTCGTGGTTTCGAGCAGC
AACAGAGGCAGGTTTCCGGTAGGAACATGGAAGCATCTCTGAGTTCTCCACGTCCATGAA
TCCTTCTTCTACTACAAGTGCTGCCGTCCCCATGACGTTCTGAAGGTTGTTGTAGTAAGG
TTTTGCCAATCTTGCGACTTCCGCAACGAGTACGAAACAGACGAAGCAGTACAAAAGGAT
TGATCCATAATTTGGTTTTCTCTTTTCCTCTGAAGACATTTTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2B389JQ U 15
AF RR2BO82JQ U 1
AF RR2B389TF C 559
AF RR2BO82TF C 658
BS 1 68 RR2BO82JQ
BS 69 69 RR2B389JQ
BS 70 80 RR2BO82JQ
BS 81 81 RR2B389JQ
BS 82 746 RR2BO82JQ
BS 747 1030 RR2B389TF
BS 1031 1031 RR2BO82TF
BS 1032 1307 RR2B389TF

RD RR2B389JQ 370 0 0
CCAACTTTTCATTATTAAACAGATACAACAAAACAGTGAACCATATTGAAAGTAATTCAC
TTGGCCACTGCGGAATTATTACATAGTGGAGATATTCGGTTTAAACGGAAAAAGAGTGAT
TGTGGAATCATCTTAAACCCTAGAAAGAGTCAACTTTAGAGAAGGACAAGATCTGAGCCT
CGAATTTGATTATGTCGTTGAAAATGAAACCTTTAGCTGGGTTTTTGATATCTTGGAGTG
GTATAAACTTCTCAAAACCCCATCCGTTCTCAGTTGAATTGGGCCATCCTTCCACCTGTT
TCTCCTCATGTTGGGATCGGATCTGGTCAATAACTCTCAACTTGGCTTTCACGTAACCTC
TTTCATTTGA

QA 1 370 1 370
DS 

RD RR2BO82JQ 746 0 0
GACATAGAAAAGCACCAACTTTTCATTATTAAACAGATACAACAAAACAGTGAACCATAT
TGAAAGTACTTCACTTGGCCGCTGCGGAATTATTACATAGTGGAGATATTCGGTTTAAAC
GGAAAAAGAGTGATTGTGGAATCATCTTAAACCCTAGAAAGAGTCAACTTTAGAGAAGGA
CAAGATCTGAGCCTCGAATTTGATTATGTCGTTGAAAATGAAACCTTTAGCTGGGTTTTT
GATATCTTGGAGTGGTATAAACTTCTCAAAACCCCATCCGTTCTCAGTTGAATTGGGCCA
TCCTTCCACCTGTTTCTCCTCATGTTGGGATCGGATCTGGTCAATAACCCTCAACTTGGC
TTTCACGTAACCTCTTTCATTTGATGCACTCAACAAAAAGAGTGATAACGAATTGCCCGT
TCCCGACCCAACTCCGTTAAGATACACTTTAAATGCCCAGTCTCTTCCTCATGAAGAAAA
CGGAGGAGAAGCGTAAAAGCGAGCAGCACGTGTAGAGACGTTGGTGATCCTCCAATTGAT
AAGAGGGTCAGGAATGTTTTCTTCGTAAGAGAAGACTTCCCAATTCTCAAAAGGATTAGT
AACGAGGATGTCAACGCCAAACACACTTTGTCCCCCGTTGAAAATGAATCCAGAATTCAC
ATCTCTGTAGTACCCAATCTCAAGAAACCTTGACTGTCCCCATTCTTGTTTAAACAAATG
AAATCGCTGCACATCAGTCTCCTGGA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2B389TF 749 0 0
TTCTTCGTAAGAGAAGACTTCCCAATTCTCAAAAGGATTAGTAACGAGGATGTCAACGCC
AAACACACTTTGTCCCCCGTTGAAAATGAATCCAGAATTCACATCTCTGTAGTACCCAAT
CTCAAGAAACCTTGACTGTCCCCATTCTTGTTTAAACAAATGAAATCGCTGCACATCAGT
CTCCTGGAGATAATGGTACTTGTCTATAGTGGCTTTGTAGGTGAGGAATGTGATCTCTGC
ATACACATTTCTTGGATTGTCGATGAGGGTTGAGTTATCGATTCTTACGTACATCGAAAC
GAATCCACCCGACCCCTGTGGTTTATTCTCGTTCGGGTAGATTATTAACGTCCAGTTGTA
ACCACCGACGGTGAAAGGACGTGACCCGTACTTGTCACCGTTTTGTTTGACCAGGTTCGC
CAGAGTGGCAAAATTCTGGAACTTCACGCAGTACGAAGATGGAGGACGAGTTTTATCCTC
TCGCCTTATTAGACCCGATAGCTTCTCGTGGTTTCGAGCAGCAACAGAGGCAGGTTTCCG
GTAGGAACATGGAAGCATCTCTGAGTTCTCCACGTCCATGAATCCTTCTTCTACTACAAG
TGCTGCCGTCCCCATGACGTTCTGAAGGTTGTTGTAGTAAGGTTTTGCCAATCTTGCGAC
TTCCGCAACGAGTACGAAACAGACGAAGCAGTACAAAAGGATTGATCCATAATTTGGTTT
TCTCTTTTCCTCTGAAGACATTTTTTCTT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2BO82TF 650 0 0
CACATCTCTGTAGTACCCAATCTCAAGAAACTTTGACTGTCCCCATTCTTGTTTAAACAA
ATGAAATCGCTGCACATCAGTCTCCTGGAGATAATGGTACTTGTCTATAGTGGCTTTGTA
GGTGAGGAATGTGATCTCTGCATACACATTTCTTGGATTGTCGATGAGGGTTGAGTTATC
GATTCTTACGTACATCGAAACGAATCCACCCGACCCCTGTGGTTT**TCTCGTTCGGGTA
G*TTATTAACGTCCAGTTGTAACCACCGACGGTGAAAGGACGTGACTCGTACTTGTCACC
GTTTTGTTTGACCAGGTTCGCCAGAGTGGCAAAATTCTGGAACTTCACGCAGTACGAAGA
TGGAGGACGAGTTCTATCCTCTCGCCTTATTAGACCCGATAGCTTCTCGTGGTTTCGAGC
AGCAACAGAGGCAGGTTTCCGGTAGGAACATGGAAGCATCTCTGGGTTCTCCACGTCCAT
GAATCCTTCTTCTACTACAAGTGCTGCCGTCCCCATGACGTTCTGAAGGTTGTTGTAGTA
AGGTTTTGCCAATCTTGCGACTTCCGCAACGAGTACGAAACAGACGAAGCAGTACAAAAG
GATTGATCCATAATTTGGTTTTCTCTTTTCCTCTGAAGACATTTTTTCTT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 4

CO CL2619Contig1 1130 4 8 U
GGGTGATCACAGTAGGGCAAAAGACTAACTTTAAAGATTTATCGATCTAGTCATCTGGGT
CTTCTTCTATAGTGGTTCTGAGAATGGATCAAGCTTCGTCTTCATCGAATGTTAAGGATC
ATGTGACCGTCGATGATAACGAGGAGAGAGAAGCTATAGAGATTCCTCTCTTCCAAGTGC
CTGAATGCTATGTTTATTTGATACCTCCAAGGAAAAGCGCAGCTTCCTACAGAGCGGATG
AATGGGACGTGAACAAATGGGCATGGGAAGGAGCATTGAAAGTGGTGAGCAAAGGAGAAG
AATGCATTATCAAACTTTTAGATAAAACCACTGGAGAACTTTACGCTCAGGCCTTTCTCC
GAGATGGTGAACTTCATCCAGTAGAAGCTGTAATCGACAGTAGCAGATATTTTGTTCTCC
GTGTGGAAGAAAACATAGGTGGTCGTGCTCGTCATGCTTTTATTGGACTCGGATTCAGGG
AGAGAACTGAAGCATATGATTTCCAAGCAGCACTACATGACCACATGAAGTACTTGAACA
AGAAGAAAACAGCAGAAGAGATGGAACAACACTTTCAGCACACATCATCTGTTGATTACT
CCTTAAAGGAAGGAGAAACCATTGTCCTCCAACTCAAAAACATGAGCGAAAAAGACACAA
AGTCTAAGTTGGTAGAGAAGAGTCTGAGCAATCTGTCCTTGGAGGATAAGGGAAAGTCGA
TAGAAACTACCATTCCTCCAATCATCCCTCCGCCTCCACCTCCTGGACCGCTTTCTCCTG
TTACAACAGCACAGAAGTCCCCATCAAGCCTCACCTTCCAAAGATCATCTGAACAACAAG
ATGTGGATACAAAGCGAGAAGAAGTAGAGAAGAAAGAAGACCAAGAAGCTAAAGAAACAG
GGGTTGAAGATGCACCAGATGATGACTTTGGAGATTTCCAAGCCGCAGGCTGATTTAGCC
TAGCCATTAAGTATTTTTCACCATACAGAAAGCATCGTTTTATATAAGTAATGTGACTGA
TCAAAGTTTGGATTGTTTGCTTTTGAGAGAGAGCCCACCTCCTGTGCAATTGCATACAAA
TGCTATTTTTCTGAACTTGTGATTAGATAGTTAAACTTTGAATCATTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF44TF U 1
AF RR2B653TF U 12
AF RR2B653JQ C 246
AF RR2BF44JQ C 398
BS 1 317 RR2BF44TF
BS 318 318 RR2B653TF
BS 319 625 RR2BF44TF
BS 626 626 RR2B653TF
BS 627 707 RR2BF44TF
BS 708 828 RR2B653TF
BS 829 1088 RR2B653JQ
BS 1089 1130 RR2BF44JQ

RD RR2BF44TF 707 0 0
GGGTGATCACAGTAGGGCAAAAGACTAACTTTAAAGATTTATCGATCTAGTCATCTGGGT
CTTCTTCTATAGTGGTTCTGAGAATGGATCAAGCTTCGTCTTCATCGAATGTTAAGGATC
ATGTGACCGTCGATGATAACGAGGAGAGAGAAGCTATAGAGATTCCTCTCTTCCAAGTGC
CTGAATGCTATGTTTATTTGATACCTCCAAGGAAAAGCGCAGCTTCCTACAGAGCGGATG
AATGGGACGTGAACAAATGGGCATGGGAAGGAGCATTGAAAGTGGTGAGCAAAGGAGAAG
AATGCATTATCAAACTTGTAGATAAAACCACTGGAGAACTTTACGCTCAGGCCTTTCTCC
GAGATGGTGAACTTCATCCAGTAGAAGCTGTAATCGACAGTAGCAGATATTTTGTTCTCC
GTGTGGAAGAAAACATAGGTGGTCGTGCTCGTCATGCTTTTATTGGACTCGGATTCAGGG
AGAGAACTGAAGCATATGATTTCCAAGCAGCACTACATGACCACATGAAGTACTTGAACA
AGAAGAAAACAGCAGAAGAGATGGAACAACACTTTCAGCACACATCATCTGTTGATTACT
CCTTAAAGGAAGGAGAAACCATTGTTCTCCAACTCAAAAACATGAGCGAAAAAGACACAA
AGTCTAAGTTGGTAGAGAAGAGTCTGAGCAATCTGTCCTTGGAGGAT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2B653TF 817 0 0
GG
AGGGCAAAAGACTAACTTTAAAGATTTATCGATCTAGTCATCTGGGTCTTCTTCTATAGT
GGTTCTGAGAATGGATCAAGCTTCGTCTTCATCGAATGTTAAGGATCATGTGACCGTCGA
TGATAACGAGGAGAGAGAAGCTATAGAGATTCCTCTCTTCCAAGTGCCTGAATGCTATGT
TTATTTGATACCTCCAAGGAAAAGCGCAGCTTCCTACAGAGCGGATGAATGGGACGTGAA
CAAATGGGCATGGGAAGGAGCATTGAAAGTGGTGAGCAAAGGAGAAGAATGCATTATCAA
ACTTTTAGATAAAACCACTGGAGAACTTTACGCTCAGGCCTTTCTCCGAGATGGTGAACT
TCATCCAGTAGAAGCTGTAATCGACAGTAGCAGATATTTTGTTCTCCGTGTGGAAGAAAA
CATAGGTGGTCGTGCTCGTCATGCTTTTATTGGACTCGGATTCAGGGAGAGAACTGAAGC
ATATGATTTCCAAGCAGCACTACATGACCACATGAAGTACTTGAACAAGAAGAAAACAGC
AGAAGAGATGGAACAACACTTTCAGCACACATCATCTGTTGATTACTCCTTAAAGGAAGG
AGAAACCATTGTCCTCCAACTCAAAAACATGAGCGAAAAAGACACAAAGTCTAAGTTGGT
AGAGAAGAGTCTGAGCAGTCTGTCCTTGGAGGATAAGGGAAAGTCGATAGAAACTACCAT
TCCTCCAATCATCCCTCCGCCTCCACCTCCTGGACCGCTTTCTCCTGTTACAACAGCACA
GAAGTCCCCATCAAGCCTCACCTTCCAAAGATCAT

QA 3 817 3 817
DS 

RD RR2B653JQ 848 0 0
GACGTGAACAAATGGGCATGGGAAGGAGCATTGAAAGTGGTGAGCAAAGGAGAAGAATGC
ATTATCAAACTTTTAGATAAAACCACTGGAGAACTTTACGCTCAGGCCTTTCTCCGAGAT
GGTGAACTTCATCCAGTAGAAGCTGTAATCGACAGTAGCAGATATTTTGTTCTCCGTGTG
GAAGAAAACATAGGTGGTCGTGCTCGTCATGCTTTTATTGGACTCGGATTCAGGGAGAGA
ACTGAAGCATATGATTTCCAAGCAGCACTACATGACCACATGAAGTACTTGAACAAGAAG
AAAACAGCAGAAGAGATGGAACAACACTTTCAGCACACATCATCTGTTGATTACTCCTTA
AAGGAAGGAGAAACCATTGTCCTCCAACTCAAAAACATGAGCGAAAAAGACACAAAGTCT
AAGTTGGTAGAGAAGAGTCTGAGCAGTCTGTCCTTGGAGGATAAGGGAAAGTCGATAGAA
ACTACCATTCCTCCAATCATCCCTCCGCCTCCACCTCCTGGACCGCTTTCTCCTGTTACA
ACAGCACAGAAGTCCCCATCAAGCCTCACCTTCCAAAGATCATCTGAACAACAAGATGTG
GATACAAAGCGAGAAGAAGTAGAGAAGAAAGAAGACCAAGAAGCTAAAGAAACAGGGGTT
GAAGATGCACCAGATGATGACTTTGGAGATTTCCAAGCCGCAGGCTGATTTAGCCTAGCC
ATTAAGTATTTTTCACCATACAGAAAGCATCGTTTTATATAAGTAATGTGACTGATCAAA
GTTTGGATTGTTTGCTTTTGAGAGAGAGCCCACCTCCTGTGCAATTGCATACAAATGCTA
TTT
CTCCG

QA 1 843 1 843
DS 

RD RR2BF44JQ 733 0 0
CAGTAGCAGATATTTTGTTCTCCGTGTGGAAGAAAACATAGGTGGTCGTGCTCGTCATGC
TTTTATTGGACTCGGATTCAGGGAGAGAACTGAAGCATATGATTTCCAAGCAGCACTACA
TGACCACATGAAGTACTTGAACAAGAAGAAAACAGCAGAAGAGATGGAACAACACTTTCA
GCACACATCATCTGTTGATTACTCCTTAAAGGAAGGAGAAACCATTGTTTTCCAACTCAA
AAACATGAGCGAAAAAGACACAAAGTCTAAGTTGGTAGAGAAGAGTCTGAGCAATCTGTC
CTTGGAGGATAAGGGAAAGTCGATAGAAACTACCATTCCTCCAATCATCCCTCCGCCTCC
ACCTCCTGGACCGCTTTCTCCTGTTACAACAGCACAGAAGTCCCCATCAAGCCTCACCTT
CCAAAGATCATCTGAACAACAAGATGTGGATACAAAGCGAGAAGAAGTAGAGAAGAAAGA
AGACCAAGAAGCTAAAGAAACAGGGGTTGAAGATGCACCAGATGATGACTTTGGAGATTT
CCAAGCCGCAGGCTGATTTAGCCTAGCCATTAAGTATTTTTCACCATACAGAAAGCATCG
TTTTATATAAGTAATGTGACTGATCAAAGTTTGGATTGTTTGCTTTTGAGAGAGAGCCCA
CCTCCTGTGCAATTGCATACAAATGCTATTTTTCTGAACTTGTGATTAGATAGTTAAACT
TTGAATCATTAAC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 4

CO CL2620Contig1 1094 4 9 U
GATTCAGGGAATTCTTACTTTCAAAGGGTTTTCTTGAAATCCACACACCGAAATTGATTG
CTGGTAGTAGTGAAGGTGGTGCTGCTGTGTTTAGGTTGGAGTACAAAGGGTAGCCTGCTT
GTCTGGCTCAGTCTCCTCAGCTTCATAAGCAGATGGCAATATGTGGTGACTTGGAACGCG
TCTTTGAGGTTGGTGCTGTTTACAGAGCAGAAGACTCGTTCACTCATAGACATCTGTGTG
AGTTTATTGGTCTTGATGTGGAGATGGCGATTCACAAGCACTATTCTGAGGTAATGGATA
TTGTGGGCGAGTTGTTTCCGTTCATATTCACTAAATTGGAAGAGAGGTGCTCGAAGGAAC
TTGAAGCTATTAGAAAGCAATACCCATTTCAGCCATTGAAGTTTCTTCCAAAAACATTGA
TTCTACCCTTTGCAGAAGGGATTCAAATGCTTAAGGAAGCTGGTGTCGAGGCTGATCCTC
TTGGAGATTTAAATACAGAAGTTGAGAGAAAGCTTGGCCAGCTCGTTCTGGAGAAGTACA
ACACAGAGTTCTACATCCTGCATCGCTATCCTTCGGCGATTAGGCCATTTTACACTATGC
CTTGTGCGGACGATCCTAACTACAGCAACTCATTCGATGTCTTTATAAGAGGTGAGGAGA
TCATATCAGGAGCTCAACGTGTCCATGACCCGGAACTTTTGAAGGAACAGGCAACACGAG
TTGGCATTGACGTCGAGACAATAAAAACATACATTGATTCATTCAGGTACGGTGCACCAC
CTCACGGTGGATTCGGAGTGGGTCTGGAGCGAGTGGTAATGCTCTTCTGTGGCCTCAACA
ACATCCGCAAAACATCGCTCTTCCCTCGTGACCCTCTAAGACTCGCTCCCTAATATCTTT
CCATCTCAAAGCTAAAGCGGTGGATCATTGCCAAACTCTGCTGATTTTTCTCATGAATAC
TTTTAAGAGTTTTAATGGCTGATATTTGTCTTTTCCTCTCATTCTTGCCCTTTCGAGCAA
GTGAATCTTGTTTTAGTTCTGTGATACTAGTGTTTCTGTCACATTACCGAGTAAAGTAAA
CCCCTTTTCTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2BM80TF U 1
AF RR2AJ20TF U 148
AF RR2AJ20JQ C 240
AF RR2BM80JQ C 411
BS 1 313 RR2BM80TF
BS 314 314 RR2AJ20TF
BS 315 627 RR2BM80TF
BS 628 628 RR2AJ20TF
BS 629 647 RR2BM80TF
BS 648 742 RR2AJ20TF
BS 743 1048 RR2AJ20JQ
BS 1049 1049 RR2BM80JQ
BS 1050 1094 RR2AJ20JQ

RD RR2BM80TF 647 0 0
GATTCAGGGAATTCTTACTTTCAAAGGGTTTTCTTGAAATCCACACACCGAAATTGATTG
CTGGTAGTAGTGAAGGTGGTGCTGCTGTGTTTAGGTTGGAGTACAAAGGGTAGCCTGCTT
GTCTGGCTCAGTCTCCTCAGCTTCATAAGCAGATGGCAATATGTGGTGACTTGGAACGCG
TCTTTGAGGTTGGTGCTGTTTACAGAGCAGAAGACTCGTTCACTCATAGACATCTGTGTG
AGTTTATTGGTCTTGATGTGGAGATGGCGATTCACAAGCACTATTCTGAGGTAATGGATA
TTGTGGGCGAGTTATTTCCGTTCATATTCACTAAATTGGAAGAGAGGTGCTCGAAGGAAC
TTGAAGCTATTAGAAAGCAATACCCATTTCAGCCATTGAAGTTTCTTCCAAAAACATTGA
TTCTACCCTTTGCAGAAGGGATTCAAATGCTTAAGGAAGCTGGTGTCGAGGCTGATCCTC
TTGGAGATTTAAATACAGAAGTTGAGAGAAAGCTTGGCCAGCTCGTTCTGGAGAAGTACA
ACACAGAGTTCTACATCCTGCATCGCTATCCTTCGGCGATTAGGCCATTTTACACTATGC
CTTGTGCGGACGATCCTAACTACAGCA*CTCATTCGATGTCTTTATA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2AJ20TF 595 0 0
G
GCAGATGGCAATATGTGGTGACTTGGAACGCGTCTTTGAGGTTGGTGCTGTTTACAGAGC
AGAAGACTCGTTCACTCATAGACATCTGTGTGAGTTTATTGGTCTTGATGTGGAGATGGC
GATTCACAAGCACTATTCTGAGGTAATGGATATTGTGGGCGAGTTGTTTCCGTTCATATT
CACTAAATTGGAAGAGAGGTGCTCGAAGGAACTTGAAGCTATTAGAAAGCAATACCCATT
TCAGCCATTGAAGTTTCTTCCAAAAACATTGATTCTACCCTTTGCAGAAGGGATTCAAAT
GCTTAAGGAAGCTGGTGTCGAGGCTGATCCTCTTGGAGATTTAAATACAGAAGTTGAGAG
AAAGCTTGGCCAGCTCGTTCTGGAGAAGTACAACACAGAGTTCTACATCCTGCATCGCTA
TCCTTCGGCGATTAGGCCATTTTACACTATGCCTTGTGCGGACGA*CCTAACTACAGCAA
CTCATTCGATGTCTTTATAAGAGGTGAGGAGATCATATCAGGAGCTCAACGTGTCCATGA
CCCGGAACTTTTGAAGGAACAGGCAACACGAGTTGGCATTGACGTCGAGACAAT

QA 2 595 2 595
DS 

RD RR2AJ20JQ 855 0 0
GAGTTTATTGGTCTTGATGTGGAGATGGCGATTCACAAGCACTATTCTGAGGTAATGGAT
ATTGTGGGCGAGTTGTTTCCGTTCATATTCACTAAATTGGAAGAGAGGTGCTCGAAGGAA
CTTGAAGCTATTAGAAAGCAATACCCATTTCAGCCATTGAAGTTTCTTCCAAAAACATTG
ATTCTACCCTTTGCAGAAGGGATTCAAATGCTTAAGGAAGCTGGTGTCGAGGCTGATCCT
CTTGGAGATTTAAATACAGAAGTTGAGAGAAAGCTTGGCCAGCTCGTTCTGGAGAAGTAC
AACACAGAGTTCTACATCCTGCATCGCTATCCTTCGGCGATTAGGCCATTTTACACTATG
CCTTGTGCGGACGA*CCTAACTACAGCAACTCATTCGATGTCTTTATAAGAGGTGAGGAG
ATCATATCAGGAGCTCAACGTGTCCATGACCCGGAACTTTTGAAGGAACAGGCAACACGA
GTTGGCATTGACGTCGAGACAATAAAAACATACATTGATTCATTCAGGTACGGTGCACCA
CCTCACGGTGGATTCGGAGTGGGTCTGGAGCGAGTGGTAATGCTCTTCTGTGGCCTCAAC
AACATCCGCAAAACATCGCTCTTCCCTCGTGACCCTCTAAGACTCGCTCCCTAATATCTT
TCCATCTCAAAGCTAAAGCGGTGGATCATTGCCAAACTCTGCTGATTTTTCTCATGAATA
CTTTTAAGAGTTTTAATGGCTGATATTTGTCTTTTCCTCTCATTCTTGCCCTTTCGAGCA
AGTGAATCTTGTTTTAGTTCTGTGATACTTGTGTTTCTGTCACATTACCGAGTAAAGTAA
ACCCCTTTTCTTTTC

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR2BM80JQ 684 0 0
AAAACATTGATTCTACCCTTTGCAGAAGGGATTCAAATGCTTAAGGAAGCTGGTGTCGAG
GCTGATCCTCTTGGAGATTTAAATACAGAAGTTGAGAGAAAGCTTGGCCAGCTCGTTCTG
GAGAAGTACAACACAGAGTTCTACATCCTGCATCGCTATCCTTCGGCGATTAGGCCATTT
TACACTATGCCTTGTGCGGACGATCCTAACTACAGCAACTCATTCGATGTCTTTATAAGA
GGTGAGGAGATCATATCAGGAGCTCAACGTGTCCATGACCCGGAACTTTTGAAGGAACAG
GCAACACGAGTTGGCATTGACGTCGAGACAATAAAAACATACATTGATTCATTCAGGTAC
GGTGCACCACCTCACGGTGGATTCGGAGTGGGTCTGGAGCGAGTGGTAATGCTCTTCTGT
GGCCTCAACAACATCCGCAAAACATCGCTCTTCCCTCGTGACCCTCTAAGACTCGCTCCC
TAATATCTTTCCATCTCAAAGCTAAAGCGGTGGATCATTGCCAAACTCTGCTGATTTTTC
TCATGAATACTTTTAAGAGTTTTAATGGCTGATATTTGTCTTTTCCTCTCATTCTTGCCC
TTTCGAGCAAGTGAATCTTGTTTTAGTTCTGTGATACTAGTGTTTCTGTCACATTACCGA
GTAAAGTAAACCCCTTTTCTTTT
T

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

CO CL2621Contig1 1403 4 5 U
AAGCTGAAACACTTAAAAGTTTTTATTTATGAAAAATAGATTGCCCCAATAGAGTGCTAC
ACCAAAGCAACTATAAGTTTTTTT*CTTCTTCTTAAATATAATAACCAAATAGAAGTCAC
TGAGAGAACCAAATCTTGATGCTTCCATTACAAATAAAAATGAAGCTATAGATGGCATAT
ATAAGTATATATGTAAGTTCCATCGAATTTACTTGAGGATTTGGCTACCATAATCATCGT
TGAACTTGTCATACAGATGTGCATGCAGATGAGCCGATGGTCGAGTGTTGCTGAAAGCTC
TGTCAATATCTTCTGGTAGTATAGGTCCCACTTTTGGCAACTCATCTTCAGGTACAATCT
CTTCTGTGTCTTCCAGTGCAGCCAACGTACGTCTCAATGGTTGCATTGCAGCTTCCTTGC
AAAGTATCCTAATGTCTGAGCCCGAGTAACCCTCGGATTTCTCAACCAGCACATCATGAG
GCAATGGCTCAGCACCTGGTTGTGACGGTAAGAGCATGTCAAACATTCCTCTTCTTGCTT
CCGGATCCGGTAATGGTACAAGAATTCTCTTCTCTAGACGCCTGAGCATAGCTGCATCAA
GCTCCCAGGGGAGATTTGTTGCTGCTAAAACGAACACGAGCTCATTCGTTTTCTGTAACC
CATCCATCTGGATCAGAAGCTCGGTTTTGAGACGCCTACTTGCTTCATGTTCACTGCGTC
CTTCACCGCCACGCTGGCTTATGATCGCGTCTATTTCATCAAGAAATATAGTAGAAGGAG
CGTGATGCTTAGCTAGATCGAACAGCACTCTTATCAACTTCTCAGAATCACCTCTCCATT
TGCTAACAACAGATGATGCAGAGATATTGAAAAACGTTGTGTTGCACTCTGTAGCAACAG
CCTTTGCAAGCATAGTCTTTCCGGTACCAGGTGGGCCAAAAAGAAGAATCCCTTTCCATG
GAGATAGCAGACCATTAAAGTACGAGGGGTATTTGATAGGCATGACCACAGCTTCTTTGA
GCAACCTTTTAGCGTTCTCTAAACCCTTTATGCTTTCCCACTTCACATTTGGGTTCCCAC
GGATGATATCCCTGCTTAGACTCTCAGCGAGAGCACGAGTTTCTGCAGATTCAAAAGGTG
GGAACATTGACTTCTTCGGCTTCTCACGGATCCCATTGGCCAAGCCAGTGTTACCCCCCT
GAGCTGGATTGGTGACGACTTGGGAAGAATCTTCTTCCTTGTTGCTGGATGATCCATCTT
CTGGTTTTGCTTCCTGGGGTTCTTCAGGCAGCTTCTTCCTCCCAAACAGGAAGCTCCAGC
GAGTGAGAGAAGGCTCATCAGTCGCCATCGTTGATGGATCTCGAAGATCAAGAAGAGGAG
GAGGAGAAGCAAAGAGAGATTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ57JQ U 1
AF RR2FQ57TF C 1
AF RR2EA62JQ U 10
AF RR2EA62TF C 624
BS 1 84 RR2FQ57JQ
BS 85 85 RR2EA62JQ
BS 86 699 RR2FQ57JQ
BS 700 770 RR2EA62JQ
BS 771 1403 RR2EA62TF

RD RR2FQ57JQ 699 0 0
AAGCTGAAACACTTAAAAGTTTTTATTTATGAAAAATAGATTGCCCCAATAGAGTGCTAC
ACCAAAGCAACTATAAGTTTTTTTTCTTCTTCTTAAATATAATAACCAAATAGAAGTCAC
TGAGAGAACCAAATCTTGATGCTTCCATTACAAATAAAAATGAAGCTATAGATGGCATAT
ATAAGTATATATGTAAGTTCCATCGAATTTACTTGAGGATTTGGCTACCATAATCATCGT
TGAACTTGTCATACAGATGTGCATGCAGATGAGCCGATGGTCGAGTGTTGCTGAAAGCTC
TGTCAATATCTTCTGGTAGTATAGGTCCCACTTTTGGCAACTCATCTTCAGGTACAATCT
CTTCTGTGTCTTCCAGTGCAGCCAACGTACGTCTCAATGGTTGCATTGCAGCTTCCTTGC
AAAGTATCCTAATGTCTGAGCCCGAGTAACCCTCGGATTTCTCAACCAGCACATCATGAG
GCAATGGCTCAGCACCTGGTTGTGACGGTAAGAGCATGTCAAACATTCCTCTTCTTGCTT
CCGGATCCGGTAATGGTACAAGAATTCTCTTCTCTAGACGCCTGAGCATAGCTGCATCAA
GCTCCCAGGGGAGATTTGTTGCTGCTAAAACGAACACGAGCTCATTCGTTTTCTGTAACC
CATCCATCTGGATCAGAAGCTCGGTTTTGAGACGCCTAC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2FQ57TF 699 0 0
AAGCTGAAACACTTAAAAGTTTT*ATTTATGAAAAATAGATTGCCCCAATAGAGTGCTAC
ACCAAAGCAACTATAAGTTTTTTT*CTTCTTCTTAAATATAATAACCAAATAGAAGTCAC
TGAGAGAACCAAATCTTGATGCTTCCATTACAAATAAAAATGAAGCTATAGATGGCATAT
ATAAGTATATATGTAAGTTCCATCGAATTTACTTGAGGATTTGGCTACCATAATCATCGT
TGAACTTGTCATACAGATGTGCATGCAGATGAGCCGATGGTCGAGTGTTGCTGAGAGCTC
TGTCAATATCTTCTGGTAGTATAGGTCCCACTTTTGGCAACTCATCTTCAGGTACAATCT
CTTCTGTGTCTTCCAGTGCAGCCAACGTACGTCTCAATGGTTGCATTGCAGCTTCCTTGC
AAAGTATCCTAATGTCTGAGCCCGAGTAACCCTCGGATTTCTCAACCAGCACATCATGAG
GCAATGGCTCAGCACCTGGTTGTGACGGTAAGAGCATGTCAAACATTCCTCTTCTTGCTT
CCGGATCCGGTAATGGTACAAGAATTCTCTTCTCTAGACGCCTGAGCATAGCTGCATCAA
GCTCCCAGGGGAGATTTGTTGCTGCTAAAACGAACACGAGCTCATTCGTTTTCTGTAACC
CATCCATCTGGATCAGAAGCTCGGTTTTGAGACGCCTAC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2EA62JQ 761 0 0
CACTTAAAAGTTTTTATCTATGAAAAATAGATTGCCCCAATAGAGTGCTACACCAAAGCA
ACTATAAGTTTTTTT*CTTCTTCTTAAATATAATAACCAAATAGAAGTCACTGAGAGAAC
CAAATCTTGATGCTTCCATTACAAATAAAAATGAAGCTATAGATGGCATATATAAGTATA
TATGTAAGTTCCATCGAATTTACTTGAGGATTTGGCTACCATAATCATCGTTGAACTTGT
CATACAGATGTGCATGCAGATGAGCCGATGGTCGAGTGTTGCTGAAAGCTCTGTCAATAT
CTTCTGGTAGTATAGGTCCCACTTTTGGCAACTCATCTTCAGGTACAATCTCTTCTGTGT
CTTCCAGTGCAGCCAACGTACGTCTCAATGGTTGCATTGCAGCTTCCTTACAAAGTATCC
TAATGTCTGAGCCCGAGTAACCCTCGGATTTCTCAACCAGCACATCATGAGGCAATGGCT
CATCACCTGGTTGTGACGGTAAGAGCATGTCAAACATTCCTCTTCTTGCTTCCGGATCCG
GTAATGGTACAAGAATTCTCTTCTCTAGACGCCTGAGCATAGCTGCATCAAGCTCCCAGG
GGAGATTTGTTGCTGCTAAAACGAACACGAGCTCATTCGTTTTCTGTAACCCATCCATCT
GGATCAGAAGCTCGGTTTTGAGACGCCTACTTGCTTCATGTTCACTGCGTCCTTCACCGC
CACGCTGGCTTATGATCGCGTCTATTTCATCAAGAAATATA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2EA62TF 780 0 0
TGCT
AAACGAACACGAGCTCAT*CGTTT*CTGTAACCCATCCATCTGGATCAGAAGCTCGGTTT
*GAGACGC*TACTTGCTTCATGTTCACTGCGTC*TTCACCGCCACGCTGGCTTATGATCG
CGTCTATTTCATCAAGAAATATAGTAGAAGGAGCGTGATGCTTAGCTAGATCGAACAGCA
CTCTTATCAACTTCTCAGAATCACCTCTCCATTTGCTAACAACAGATGATGCAGAGATAT
TGAAAAACGTTGTGTTGCACTCTGTAGCAACAGCCTTTGCAAGCATAGTCTTTCCGGTAC
CAGGTGGGCCAAAAAGAAGAATCCCTTTCCATGGAGATAGCAGACCATTAAAGTACGAGG
GGTATTTGATAGGCATGACCACAGCTTCTTTGAGCAACCTTTTAGCGTTCTCTAAACCCT
TTATGCTTTCCCACTTCACATTTGGGTTCCCACGGATGATATCCCTGCTTAGACTCTCAG
CGAGAGCACGAGTTTCTGCAGATTCAAAAGGTGGGAACATTGACTTCTTCGGCTTCTCAC
GGATCCCATTGGCCAAGCCAGTGTTACCCCCCTGAGCTGGATTGGTGACGACTTGGGAAG
AATCTTCTTCCTTGTTGCTGGATGATCCATCTTCTGGTTTTGCTTCCTGGGGTTCTTCAG
GCAGCTTCTTCCTCCCAAACAGGAAGCTCCAGCGAGTGAGAGAAGGCTCATCAGTCGCCA
TCGTTGATGGATCTCGAAGATCAAGAAGAGGAGGAGGAGAAGCAAAGAGAGATTCC

QA 5 780 5 780
DS 



AS 1 2

CO CL2622Contig1 1324 2 4 U
GGAAGACGACGACGCCGTAGAGAAACCCGCCTCTTCTTCTTCTATCATCGCCACTAGCAT
GAATACTAGTGACATAGTGTTACAGACATCATCTCCCAAACTCTCACAGAGGCAAGACTA
CATCTTCCATGGAGGGAGACGCCATGTGAGGCCGTACTACTTCGAGTTCATCTCTCATGT
GAATAAACGCTGGACTGGGAAAACAATCGTGGACTTGTTCGCTGATGAATTCAAAGGCAG
ACAACGTGACTACTATGTTGGGGCAGTCAAAAGTGGAAGAATCAAAGTTGATGGAGAAAC
TGTACCTGTTTCATACATTGTTAAATCGTCTCAAAAAATCACTCATTTCGTCCACAGGCA
TGAACCACCGGTGATGACTGATGATGTAGAGATCCTTGTGAATGAACCTGATGTTGTTAC
TGTCTGCAAACCCGCTTCTATTCCCGTTCATCCATGTGGTCAATATCGTAAGAACACGGT
TGTTGGAATCCTTGATGCTGAGCATGACCTCGGCCCTCTTTTTCCTATTCACCGATTAGA
CCGTTTGGTTTCTGGATTGCTCATCATAGCTAGAACTGCTGCCAAAGCTGATTTTTTCAG
GCAACAGATTGAGGGTGGAATGGTGAAGAAACGTTATATTGCAAAGGTTATTGGCGTGTT
CCCAGAAGATGAGAAAGTAGTCGACGCCAACATAAACTATAATGGTAGTGAAGGAAGGAG
TACAGCAGAGGACGCCAATTCAAGTGGTGATGATAAGAAGGTGAAGGGGAAGCCTGCGTG
TACCAAGTTCACCAGAATCGACACAAATGGGACTCATAGCCTCGTCTTGTGTGAACCAGT
GACAGGACGAACTCATCAAATACGAGTGCATCTACAATATACAGGGCATCCCATAGGGAA
TGACCCGCTTTATCTCAATCAACAAGTGGATAATCTGGTGACCAAGATTGCTAAGAGGAT
TGATGCGGGTGAGAGAAAGATGGTGTCCCCAGACGACTACGTGTATTCTAGTGATGATTT
CAGCATCGATCCAATGTGCACAAACTGCCCAAAGTTGATCCCACAAGGGTATGAGGAGCA
TGATGAGGCTCTTTGGTTGCATTGCGTTCGATACTCTGGAACAGGATGGGAATACGATTG
TCCTTATCCATCTTGGGCATCTCTTTAACCACATTTTACTTGCCATTTGCTTTAGACAAT
ATAAACTGTAATTCTTATTACCAACATTTGTAGCAACTGGATTGTAAAGGAGTTTTGCAG
TTATGATCTGATCAAGTTTGAACTCAAAAAGATTCTCAAAACTCTATAAAATGAACTTTT
TGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2FD75TF U 1
AF RR2FD75JQ C 627
BS 1 646 RR2FD75TF
BS 647 647 RR2FD75JQ
BS 648 710 RR2FD75TF
BS 711 1324 RR2FD75JQ

RD RR2FD75TF 710 0 0
GGAAGACGACGACGCCGTAGAGAAACCCGCCTCTTCTTCTTCTATCATCGCCACTAGCAT
GAATACTAGTGACATAGTGTTACAGACATCATCTCCCAAACTCTCACAGAGGCAAGACTA
CATCTTCCATGGAGGGAGACGCCATGTGAGGCCGTACTACTTCGAGTTCATCTCTCATGT
GAATAAACGCTGGACTGGGAAAACAATCGTGGACTTGTTCGCTGATGAATTCAAAGGCAG
ACAACGTGACTACTATGTTGGGGCAGTCAAAAGTGGAAGAATCAAAGTTGATGGAGAAAC
TGTACCTGTTTCATACATTGTTAAATCGTCTCAAAAAATCACTCATTTCGTCCACAGGCA
TGAACCACCGGTGATGACTGATGATGTAGAGATCCTTGTGAATGAACCTGATGTTGTTAC
TGTCTGCAAACCCGCTTCTATTCCCGTTCATCCATGTGGTCAATATCGTAAGAACACGGT
TGTTGGAATCCTTGATGCTGAGCATGACCTCGGCCCTCTTTTTCCTATTCACCGATTAGA
CCGTTTGGTTTCTGGATTGCTCATCATAGCTAGAACTGCTGCCAAAGCTGATTTTTTCAG
GCAACAGATTGAGGGTGGAATGGTGAAGAAACGTTATATTGCAAAG*TTATTGGCGTGTT
CCCAGAAGATGAGAAAGTAGTCGACGCCAACATAAACTATAATGGTAGTG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2FD75JQ 698 0 0
AGAAACGTTATATTGCAAAGGTTATTGGCGTGTTCCCAGAAGATGAGAAAGTAGTCGACG
CCAACATAAACTATAATGGTAGTGAAGGAAGGAGTACAGCAGAGGACGCCAATTCAAGTG
GTGATGATAAGAAGGTGAAGGGGAAGCCTGCGTGTACCAAGTTCACCAGAATCGACACAA
ATGGGACTCATAGCCTCGTCTTGTGTGAACCAGTGACAGGACGAACTCATCAAATACGAG
TGCATCTACAATATACAGGGCATCCCATAGGGAATGACCCGCTTTATCTCAATCAACAAG
TGGATAATCTGGTGACCAAGATTGCTAAGAGGATTGATGCGGGTGAGAGAAAGATGGTGT
CCCCAGACGACTACGTGTATTCTAGTGATGATTTCAGCATCGATCCAATGTGCACAAACT
GCCCAAAGTTGATCCCACAAGGGTATGAGGAGCATGATGAGGCTCTTTGGTTGCATTGCG
TTCGATACTCTGGAACAGGATGGGAATACGATTGTCCTTATCCATCTTGGGCATCTCTTT
AACCACATTTTACTTGCCATTTGCTTTAGACAATATAAACTGTAATTCTTATTACCAACA
TTTGTAGCAACTGGATTGTAAAGGAGTTTTGCAGTTATGATCTGATCAAGTTTGAACTCA
AAAAGATTCTCAAAACTCTATAAAATGAACTTTTTGCC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 0 0

AS 2 4

CO CL2624Contig1 472 2 3 U
GGATACAACGTTTTAGTTTATTTCCACCACAAGTGTTGAGAGCAAACAGATCCAAATGTA
ATAAGGTTCGTTTATTTCCACCACAAGTGTTGAGAGTAAAGAGATGCAAAAGTAATAAGT
TTTCTTCAGGCTAAAATGGTAATACAGGACAGACGAGAAACATTTTTTTTTCAGAGGAAA
TCTTTCATCGGGTCATCGTAGTGAACTCTCTTCATTCTGTAAGCTTCCATTTCTTCCAGT
GTCACATCGTTGGTGTGTTTGACATTGTATTTGCGCTTCCTCTCATCTTTTTCTTCTCTC
TTACGCTCATCCTCCTTTTTCAAAACATTAACAAGTGCCTCCTCGTTCAATTCCAAATCT
TCAGGAACATCGGTTCCCCAAGTGGCCATCTTCTTCTCTTCAACCTTCTTTGGGCTCTCT
TCACATGCTTCTTTGCGAGCAATATTAGCCTTCATCAGATCAAGGGAAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL46TF C 1
AF RR2BL46JQ U 316
BS 1 315 RR2BL46TF
BS 316 441 RR2BL46JQ
BS 442 472 RR2BL46TF

RD RR2BL46TF 472 0 0
GGATACAACGTTTTAGTTTATTTCCACCACAAGTGTTGAGAGCAAACAGATCCAAATGTA
ATAAGGTTCGTTTATTTCCACCACAAGTGTTGAGAGTAAAGAGATGCAAAAGTAATAAGT
TTTCTTCAGGCTAAAATGGTAATACAGGACAGACGAGAAACATTTTTTTTTCAGAGGAAA
TCTTTCATCGGGTCATCGTAGTGAACTCTCTTCATTCTGTAAGCTTCCATTTCTTCCAGT
GTCACATCGTTGGTGTGTTTGACATTGTATTTGCGCTTCCTCTCATCTTTTTCTTCTCTC
TTACGCTCATCCTCCTTTTTCAGAGCATTAGCAAGTGCCTCCTCGTTCAATTCCAAATCT
TCAGGAACATCGGTTCCCCAAGTGGCCATCTTCTTCTCTTCAACCTTCTTTGGGCTCTCT
TCACATGCTTCTTTGCGAGCAATATTAGCCTTCATCAGATCAAGGGAAGCCC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2BL46JQ 126 0 0
TTTTTCAAAACATTAACAAGTGCCTCCTCGTTCAATTCCAAATCTTCAGGAACATCGGTT
CCCCAAGTGGCCATCTTCTTCTCTTCAACCTTCTTTGGGCTCTCTTCACATGCTTCTTTG
CGAGCA

QA 1 126 1 126
DS 



CO CL2624Contig2 673 2 2 U
TAATAAGGTTCGTTTATTTCCACCACAAGTGTTGAGAGTAAACAGATGCAAAAGTAATAA
GTTTTCTTCAGGCTAAAATGGTAAATACAAAACAAACGAGAAACGTACAAACGAGAAACG
TTTTTTTTCAGAGGAAATCTTTCATCGGGTCATCGTAGTGAACTCTCTTCATTCTGTAAG
CTTCCATTTCTTCCAGTGTCACATCGTTGGTGTGTTTGACATTGTATTTGCGCTTCCTCT
CATCTTTTTCTTCTCTCTTACGCTCATCCTCCTTTTTCAGAGCATTAGCAAGTGCCTCCT
CGTTCAATTCCAAATCTTCAGGAACATCGGTTCCCCAAGTGGCCATCTTCTTCTCTTCAA
CCTTCTTTGGGCTCTCTTCACATGCTTCTTTGCGAGCAATATTAGCCTTCATCAGATCAA
GGGAAGCCTCTGCAGCCTCAATACCAGCAGAGCCTGTGCAGTAACTATTGCGAATCGTCT
GCTGGCAACATCTATATCCCCATTGATGGTCTTTCCACCACGAGCCCCAAACACTAGTGT
GATTGTTAGTAAGAACATCTTCCTCGTATTTGCTCTTTGGCAGTATAACCTCCTGTCCCT
TTATAATCCTCCCTGCTCGGTCATACTCAACTTGTCTTTCGCTCTGTCCAAGCAAAAGCT
CCATTGGAATTTC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H735TF C 1
AF RR2GE45JQ U 2
BS 1 1 RR2H735TF
BS 2 673 RR2GE45JQ

RD RR2H735TF 490 0 0
TAATAAGGTTCGTTTATTTCCACCACAAGTGTTGAGAGTAAACAGATGCAAAAGTAATAA
GTTTTCTTCAGGCTAAAATGGTAAATACAAAACAAACGAGAAACGTACAAACGAGAAACG
TTTTTTTTCAGAGGAAATCTTTCATCGGGTCATCGTAGTGAACTCTCTTCATTCTGTAAG
CTTCCATTTCTTCCAGTGTCACATCGTTGGTGTGTTTGACATTGTATTTGCGCTTCCTCT
CATCTTTTTCTTCTCTCTTACGCTCATCCTCCTTTTTCAGAGCATTAGCAAGTGCCTCCT
CGTTCAATTCCAAATCTTCAGGAACATCGGTTCCCCAAGTGGCCATCTTCTTCTCTTCAA
CCTTCTTTGGGCTCTCTTCACATGCTTCTTTGCGAGCAATATTAGCCTTCATCAGATCAA
GGGAAGCCTCTGCAGC*TCAATACCAGCAGAGCCTGTGCAGTAACTATTGCGAATCGTCT
GCTGGCAAC
C

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2GE45JQ 672 0 0
AATAAGGTTCGTTTATTTCCACCACAAGTGTTGAGAGTAAACAGATGCAAAAGTAATAAG
TTTTCTTCAGGCTAAAATGGTAAATACAAAACAAACGAGAAACGTACAAACGAGAAACGT
TTTTTTTCAGAGGAAATCTTTCATCGGGTCATCGTAGTGAACTCTCTTCATTCTGTAAGC
TTCCATTTCTTCCAGTGTCACATCGTTGGTGTGTTTGACATTGTATTTGCGCTTCCTCTC
ATCTTTTTCTTCTCTCTTACGCTCATCCTCCTTTTTCAGAGCATTAGCAAGTGCCTCCTC
GTTCAATTCCAAATCTTCAGGAACATCGGTTCCCCAAGTGGCCATCTTCTTCTCTTCAAC
CTTCTTTGGGCTCTCTTCACATGCTTCTTTGCGAGCAATATTAGCCTTCATCAGATCAAG
GGAAGCCTCTGCAGCCTCAATACCAGCAGAGCCTGTGCAGTAACTATTGCGAATCGTCTG
CTGGCAACATCTATATCCCCATTGATGGTCTTTCCACCACGAGCCCCAAACACTAGTGTG
ATTGTTAGTAAGAACATCTTCCTCGTATTTGCTCTTTGGCAGTATAACCTCCTGTCCCTT
TATAATCCTCCCTGCTCGGTCATACTCAACTTGTCTTTCGCTCTGTCCAAGCAAAAGCTC
CATTGGAATTTC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 4

CO CL2625Contig1 704 4 5 U
GGAGATCAGCGCCTTCGGATAGTTGAGAGAGTGATGGCTACCGGAGAGGAGAAACCAGTG
ATGGTAGTTGGTGTGGACGAAAGTGAGCAGAGCACCTACGCGTTGGAGTGGACTCTCGAT
CGTTTCTTCGCTCCCTACGCCCCCAATTTCCCTTTCAAGCTCATCATCGTCCACGCCAAA
CCTAACGCCGTCTCCGCCGTTGGTCTCGCTGGCCCCGGAACTGCGGAGGTTGTGCCTTAT
GTTGATGCTGATTTGAAGCATACCGCTGTTAAGGTTGTCGAGAAAGCCAAAGCACTCTGT
CAGAGCAAGTCGGTTCATGGCGCAATGATAGAAGTTTTTGAAGGCGATGCAAGGAACATC
CTTTGCGAGGTTGTTGATAAACACCATGCTTCTCTTCTCGTTGTTGGAAGCCATGGTTAT
GGAGCTATCAAGAGGGCGGTTCTAGGTAGCGTCAGTGATTACTGTGCTCATCATGCTCAT
TGCTCGGTGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGATCAAGGTCTGAATCAATTATCTCACTCAA
AGCATTGTCAGACTCGGTGAGAAGTGAAATAATGTTAGCTTCCATGTGTGAAGTAATCCA
AGACAATCCATTTGTGTGTGTAATTGTGTTATTACATGAGCTCTTGTTTTAGTATACCTC
CTAAACTATAACTTCATGTTTAATAATATCGTGGGTTATCTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RR2AM61JQ C 1
AF RR2CS46TF U 37
AF RR2CS46JQ C 21
AF RR2AM61TF U 1
BS 1 36 RR2AM61TF
BS 37 682 RR2CS46TF
BS 683 683 RR2AM61TF
BS 684 700 RR2CS46TF
BS 701 704 RR2AM61JQ

RD RR2AM61JQ 704 0 0
GGAGATCAGCGCCTTCGGATAGTTGAGAGAGTGATGGCTACCGGAGAGGAGAAACCAGTG
ATGGTAGTTGGTGTGGACGAAAGTGAGCAGAGCACCTACGCGTTGGAGTGGACTCTCGAT
CGTTTCTTCGCTCCCTACGCCCCCAATTTCCCTTTCAAGCTCATCATCGTCCACGCCAAA
CCTAACGCCGTTTCCGCCGTTGGTCTCGCTGGCCCCGGAACTGCGGAGGTTGTGCCTTAT
GTTGATGCTGATTTGAAGCATACCGCTGTTAAGGTTGTCGAGAAAGCCAAAGCACTCTGT
CAGAGCAAGTCGGTTCATGGCGCAATGATAGAAGTTTTTGAAGGCGATGCAAGGAACATC
CTTTGCGAGGTTGTTGATAAACACCATGCTTCTCTTCTCGTTGTTGGAAGCCATGGTTAT
GGAGCTATCAAGAGGGCGGTTCTAGGTAGCGTCAGTGATTACTGTGCTCATCATGCTCAT
TGCTCGGTGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGATCAAGGTCTGAATCAATTATCTCACTCAA
AGCATTGTCAGACTCGGTGAGAAGTGAAATAATGTTAGCTTCCATGTGTGAAGTAATCCA
AGACAATCCATTTGTGTGTGTAATTGTGTTATTACATGAGCTCTTGTTTTAGTATACCTC
CTAAACTATAACTTCATGTTTAATAATATCGTGGGTTATCTTTC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2CS46TF 666 0 0
GCTACCGGAGAGGAGAAACCAGTGATGGTAGTTGGTGTGGACGAAAGTGAGCAGAGCACC
TACGCGTTGGAGTGGACTCTCGATCGTTTCTTCGCTCCCTACGCCCCCAATTTCCCTTTC
AAGCTCATCATCGTCCACGCCAAACCTAACGCCGTCTCCGCCGTTGGTCTCGCTGGCCCC
GGAACTGCGGAGGTTGTGCCTTATGTTGATGCTGATTTGAAGCATACCGCTGTTAAGGTT
GTCGAGAAAGCCAAAGCACTCTGTCAGAGCAAGTCGGTTCATGGCGCAATGATAGAAGTT
TTTGAAGGCGATGCAAGGAACATCCTTTGCGAGGTTGTTGATAAACACCATGCTTCTCTT
CTCGTTGTTGGAAGCCATGGTTATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTCTAGGTAGCGTCAGT
GATTACTGTGCTCATCATGCTCATTGCTCGGTGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGATCAAG
GTCTGAATCAATTATCTCACTCAAAGCATTGTCAGACTCGGTGAGAAGTGAAATAATGTT
AGCTTCCATGTGTGAAGTAATCCAAGACAATCCATTTGTGTGTGTAATTGTGTTATTACA
TGAGCTCTTGTTTTAGTATACCTCCTAAACTATAACTTCATGTTTA*TAATATCGTGGGT
TATC
TT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2CS46JQ 682 0 0
AGTTGAGAGAGTGATGGCTACCGGAGAGGAGAAACCAGTGATGGTAGTTGGTGTGGACGA
AAGTGAGCAGAGCACCTACGCGTTGGAGTGGACTCTCGATCGTTTTTTCGCTCCCTACGC
CCCCAATTTCCCTTTCAAGCTCATCATCGTCCACGCCAAACCTAACGCCGTTTCCGCCGT
TGGTCTCGCTGGCCCCGGAACTGCGGAGGTTGTGCCTTATGTTGATGCTGATTTGAAGCA
TACCGCTGTTAAGGTTGTCGAGAAAGCCAAAGCACTCTGTCAGAGCAAGTCGGTTCATGG
CGCAATGATAGAAGTTTTTGAAGGCGATGCAAGGAACATCCTTTGCGAGGTTGTTGATAA
ACACCATGCTTCTTTTCTCGTTGTTGGAAGCCATGGTTATGGAGCTATCAAGAGGGCGGT
TTTAGGTAGCGTCAGTGATTACTGTGCTCATCATGCTCATTGCTCGGTGATGATCGTGAA
GAAGCCTAAGATCAAGGTTTGAATCAATTATCTCACTCAAAGCATTGTCAGACTCGGTGA
GAAGTGAAATAATGTTAGCTTCCATGTGTGAAGTAATCCAAGACAATCCATTTGTGTGTG
TAATTGTGTTATTACATGAGCTCTTGTTTTAGTATACCTCCTAAACTATAACTTCATGTT
TAATAATATCGTGGGTTATC
TT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2AM61TF 700 0 0
GGAGATCAGCGCCTTCGGATAGTTGAGAGAGTGATGGCTACCGGAGAGGAGAAACCAGTG
ATGGTAGTTGGTGTGGACGAAAGTGAGCAGAGCACCTACGCGTTGGAGTGGACTCTCGAT
CGTTTCTTCGCTCCCTACGCCCCCAATTTCCCTTTCAAGCTCATCATCGTCCACGCCAAA
CCTAACGCCGTCTCCGCCGTTGGTCTCGCTGGCCCCGGAACTGCGGAGGTTGTGCCTTAT
GTTGATGCTGATTTGAAGCATACCGCTGTTAAGGTTGTCGAGAAAGCCAAAGCACTCTGT
CAGAGCAAGTCGGTTCATGGCGCAATGATAGAAGTTTTTGAAGGCGATGCAAGGAACATC
CTTTGCGAGGTTGTTGATAAACACCATGCTTCTCTTCTCGTTGTTGGAAGCCATGGTTAT
GGAGCTATCAAGAGGGCGGTTCTAGGTAGCGTCAGTGATTACTGTGCTCATCATGCTCAT
TGCTCGGTGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGATCAAGGTCTGAATCAATTATCTCACTCAA
AGCATTGTCAGACTCGGTGAGAAGTGAAATAATGTTAGCTTCCATGTGTGAAGTAATCCA
AGACAATCCATTTGTGTGTGTAATTGTGTTATTACATGAGCTCTTGTTTTAGTATACCTC
CTAAACTATAACTTCATGTTTAATAATATCGTGGGTTATC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 4

CO CL2626Contig1 1201 4 18 U
AAAAGAAAGAATCTATTATTTTACATTTTCGCCTCAAAGATTCCGTTTCTGAACATTTAC
ACCCTCACGCCATGTGTGGAGGAGCTATAATCTCCGACTTCATCCCGCCGCCGAGGTCTC
GCCGCGTCACCAGCGAGTTTCTCTGGCCGGATCTGAAGAAGAACGCGAAGAAGAGCTCGA
GGAAACGCTCGAGTTTCTTCGATCTTGACGATGAATTCGAGGCTGACTTCCAGGGCTTCA
ACGACGATTCCTCCATCGACTGCGATGATGCGAAACCGTTCGTTTTCGCCGGGGCTCGTA
AACCCGCCGTATCCGCCGCCGCCACTTCCGCCGATTCAGCTTTTGGCAAGAAAGTTGCTG
ACGGAGAAGGTGAGAGATCTGCAAAGAGGAAGAGGAAGAGCCAGTACCGAGGTATAAGAC
AACGTCCTTGGGGAAAATGGGCTGCTGAGATTCGTGATCCAAGGGAAGGTTCAAGAGTCT
GGCTTGGAACTTTCAAAACTGCCGAGGAAGCTGCAAGAGCTTACGATGCTGCAGCTCGTA
GAATCCGTGGTTCCAAAGCTAAGGTGAATTTCCCAGAGGAGAACCCACTTGCCAAGAAGG
TGGCTAAACCGAACCCAAACCCAACTCTGGTTCAGAACGTGGACAACTCCTTTGACAATA
TGTGTTTCATGGAGGAGAAACAACAAGTTAACAGCAGCAACAACAACAGTCAATTTGGTA
ATGCGTATCATCAGTTATTCAGCTCAGACCAGGGTAGTAACTCATTCGGTTGTTCTGAGT
TTGGTTGGAACGATCAAGCTCCTATAACTCCTGAGATCTTTTCTGCGTTTATCAACAACA
ACAACTTTGCTCTATTCGTTGAGGAAGCTGATCCAGCCAAGAAGCTCAAGTCCATGGATT
TCGAGACACCTTACAACAACACTGAATGGGATTCTTCACTTGATTTCTTCAACGAAGACG
CCGTGGCGACTCAGGACAATGGTGCAAACCCTATGGAACTATGGAGCATTGATGAGATCG
ATTCCATGATTGGAGGAGTCTTCTGAAGAGATCCATTGTCATTTAAAACATTTTGAACTC
TTTCTGGTGGTCTTTTGCATTCGCTTGTGTTTTGGTTCTTTCACTTTGTGCACCCAAGCG
TCTCCTTTAAACATTGTCATAACTCATAAGTTAATATGTTGAACTAATGTTCTGTTTTAT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2ED10TF U 1
AF RR2CU58TF U 356
AF RR2CU58JQ C 434
AF RR2ED10JQ C 487
BS 1 486 RR2ED10TF
BS 487 487 RR2CU58TF
BS 488 563 RR2ED10TF
BS 564 564 RR2CU58TF
BS 565 598 RR2ED10TF
BS 599 599 RR2CU58TF
BS 600 618 RR2ED10TF
BS 619 619 RR2CU58TF
BS 620 641 RR2ED10TF
BS 642 819 RR2CU58TF
BS 820 820 RR2CU58JQ
BS 821 846 RR2CU58TF
BS 847 847 RR2CU58JQ
BS 848 973 RR2CU58TF
BS 974 1042 RR2CU58JQ
BS 1043 1043 RR2ED10JQ
BS 1044 1184 RR2CU58JQ
BS 1185 1201 RR2ED10JQ

RD RR2ED10TF 641 0 0
AAAAGAAAGAATCTATTATTTTACATTTTCGCCTCAAAGATTCCGTTTCTGAACATTTAC
ACCCTCACGCCATGTGTGGAGGAGCTATAATCTCCGACTTCATCCCGCCGCCGAGGTCTC
GCCGCGTCACCAGCGAGTTTCTCTGGCCGGATCTGAAGAAGAACGCGAAGAAGAGCTCGA
GGAAACGCTCGAGTTTCTTCGATCTTGACGATGAATTCGAGGCTGACTTCCAGGGCTTCA
ACGACGATTCCTCCATCGACTGCGATGATGCGAAACCGTTCGTTTTCGCCGGGGCTCGTA
AACCCGCCGTATCCGCCGCCGCCACTTCCGCCGATTCAGCTTTTGGCAAGAAAGTTGCTG
ACGGAGAAGGTGAGAGATCTGCAAAGAGGAAGAGGAAGAGCCAGTACCGAGGTATAAGAC
AACGTCCTTGGGGAAAATGGGCTGCTGAGATTCGTGATCCAAGGGAAGGTTCAAGAGTCT
GGCTTGTAACTTTCAAAACTGCCGAGGAAGCTGCAAGAGCTTACGATGCTGCAGCTCGTA
GAATCCGTGGTTCCAAAGCTAAG*TGAATTTCCCAGAGGAGAACCCACTTGCCAAGAAAG
TGGCTAAACCGAACCCAA*CCCAACTCTGGTTCAGAACGTG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2CU58TF 618 0 0
G
GCTGACGGAGAAGGTGAGAGATCTGCAAAGAGGAAGAGGAAGAGCCAGTACCGAGGTATA
AGACAACGTCCTTGGGGAAAATGGGCTGCTGAGATTCGTGATCCAAGGGAAGGTTCAAGA
GTCTGGCTTGGAACTTTCAAAACTGCCTAGGAAGCTGCAAGAGCTTACGATGCTGCAGCT
CGTAGAATCCGTGGTTCCAAAGCTAAGGTGAATTTCCCAGAGGAGAACCCACTTGCCAAG
AAGGTGGCTAAACCGAACCCAAACCCAACTCTGGTTCAGAACGTGGACAACTCCTTTGAC
AATATGTGTTTCATGGAGGAGAAACAACAAGTTAACAGCAGCAACAACAACAGTCAATTT
GGTAATGCGTATCATCAGTTATTCAGCTCAGACCAGGGTAGTAACTCATTCGGTTGTTCT
GAGTTTGGTTGGAACGATCAAGCTCCTATAACTCCTGAGATCTCTTCTGCGTTTATCAAC
AACAACAACTCTGCTCTATTCGTTGAGGAAGCTGATCCAGCCAAGAAGCTCAAGTCCATG
GATTTCGAGACACCTTACAACAACACTGAATGGGATTCTTCACTTGATTTCTTCAACGAA
GACGCCGTGGCGACTCA

QA 2 618 2 618
DS 

RD RR2CU58JQ 752 0 0
G
AAATGGGCTGCTGAGATTCGTGATCCAAGGGAAGGTTCAAGAGTCTGGCTTGGAACTTTC
AAAACTGCCTAGGAAGCTGCAAGAGCTTACGATGCTGCAGCTCGTAGAATCCGTGGTTCC
AAAGCTAAGGTGAATTTCCCAGAGGAGAACCCACTTGCCAAGAAGGTGGCTAAACCGAAC
CCAAACCCAACTCTGGTTCAGAACGTGGACAACTCCTTTGACAATATGTGTTTCATGGAG
GAGAAACAACAAGTTAACAGCAGCAACAACAACAGTCAATTTGGTAATGCGTATCATCAG
TTATTCAGCTCAGACCAGGGTAGTAACTCATTCGGTTGTTCTGAGTTTGGTTGGAACGAT
CAAGCTCCTATAACTCCTGAGATCTTTTCTGCGTTTATCAACAACAACAACTTTGCTCTA
TTCGTTGAGGAAGCTGATCCAGCCAAGAAGCTCAAGTCCATGGATTTCGAGACACCTTAC
AACAACACTGAATGGGATTCTTCACTTGATTTCTTCAACGAAGACGCCGTGGCGACTCAG
GACAATGGTGCAAACCCTATGGAACTATGGAGCATTGATGAGATCGATTCCATGATTGGA
GGAGTCTTTTGAAGAGATCCATTGTCATTTAAAACATTTTGAACTCTTTCTGGTGGTCTT
TTGCATTCGCTTGTGTTTTGGTTCTTTCACTTTGTGCACCCAAGCGTCTCCTTTAAACAT
TGTCATAACTCATAAGTTAATATGTTGAAC
G

QA 2 751 2 751
DS 

RD RR2ED10JQ 715 0 0
T
AACTTTCAAAACTGCCGAGGAAGCTGCAAGAGCTTACGATGCTGCAGCTCGTAGAATCCG
TGGTTCCAAAGCTAAGGTGAATTTCCCAGAGGAGAACCCACTTGCCAAGAAGGTGGCTAA
ACCGAACCCAAACCCAACTCTGGTTCAGAACGTGGACAACTCCTTTGACAATATGTGTTT
CATGGAGGAGAAACAACAAGTTAACAGCAGCAACAACAACAGTCAATTTGGTAATGCGTA
TCATCAGTTATTCAGCTCAGACCAGGGTAGTAACTCATTCGGTTGTTCTGAGTTTGGTTG
GAACGATCAAGCTCCTATAACTCCTGAGATCTTTTCTGCGTTTATCAACAACAACAACTT
TGCTCTATTCGTTGAGGAAGCTGATCCAGCCAAGAAGCTCAAGTCCATGGATTTCGAGAC
ACCTTACAACAACACTGAATGGGATTCTTCACTTGATTTCTTCAACGAAGACGCCGTGGC
GACTCAGGACAATGGTGCAAACCCTATGGAACTATGGAGCATTGATGAGATCGATTCCAT
GATTGGAGGAGTCTTCTGAAGAGATCCATTGTCATTTAAAACATTTTGAACTCTTTCTGG
TGGTCTTTTGCATTCGCTTGTGTTTTGGTTCTTTCACTTTGTGCACCCAAGCGTCTCCTT
TAAACATTGTCATAACTCATAAGTTAATATGTTGAACTAATGTTCTGTTTTATG

QA 2 715 2 715
DS 



AS 1 4

CO CL2627Contig1 857 4 3 U
GGGCTAATGCATTTCACCGGTAAATAAACACCACCGACAGAACCCGAGTGGGCGATATAG
ACAATCAGAGTCTCCAATCCAGTTCTGTCTCCACTGAAAGAGCTGAATCCATTTCGAAAC
ATAAAATCTTTTGCAAGATCTACTCGGTAATGGCGAAGCACACGGCGGCTTTGAAAGTTG
GACTGACTTTGCTTGCTCTGAGCATGATCGGTTACATACTCGGTCCTCCTCTCTACTGGC
ACCTCACCGAGGCACTTGTCGCTTCCGCCTCTTCTTGCTCCCCTTGCGTCTGCGACTGCT
CCTCCGTGCCTCTTCTCACCATCCCCAAAGGACTCAGCAATGGATCTTTTGGAGATTGTG
CAAAGCATGACTCAGAGGTGAACGAAGACACAGAGAAGAACTACGCTGAGCTATTAACAG
AGGAACTGAAGCAACGCGAAGCAGCATCCATGGAGAAACACAAACGAGTAGACACAGGTC
TGTTAGAGGCCAAGAAGATCACATCCTCTTTCCAGAAGGAGGCGGATAAGTGCAACTCCG
GTATGGAGACTTGTGAAGAAGCAAGAGAGAAGTCGGAGAAGGCACTTGTGGAGCAGAAGA
AGCTGACTTCTATGTGGGAACTCAGAGCTCGTCAAAAAGGGTGGAAAGAAGGAGCCACCA
AGTCATCTGGTAAATCCAAAAGCAGTGTCCAGGCTTCTTAGAGTGCATACCCTAAGTAAC
TTTTATATTACACGAAAGAATGTATTTTATGGATTTTGATTTATAATATTGTCTTGTAGT
TTTCTGATGGAACAGATATTGAATGAAACAGTGTACCAAAACAACAATGTATTAATGGAT
TCTGAACAAATTTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FA18TF U 51
AF RR2FA18JQ C 305
AF RR2AK23TF U 1
AF RR2AK23JQ C 126
BS 1 637 RR2AK23TF
BS 638 638 RR2FA18TF
BS 639 857 RR2AK23TF

RD RR2FA18TF 767 0 0
GGG
GATATAGACAATCAGAGTCTCCAATCCAGTTCTGTCTCCACTGAAAGAGCTGAATCCATT
TCGAAACATAAAATCTTTTGCAAGATCTACTCGGTAATGGCGAAGCACACGGCGGCTTTG
AAAGTTGGACTGACTTTGCTTGCTCTGAGCATGATCGGTTACATACTCGGTCCTCCTCTC
TACTGGCACCTCACCGAGGCACTTGTCGCTTCCGCCTCTTCTTGCTCCCCTTGCGTCTGC
GACTGCTCCTCCGTGCCTCTTCTCACCATCCCCAAAGGACTCAGCAATGGATCTTTTGGA
GATTGTGCAAAGCATGACTCAGAGGTGAACGAAGACACAGAGAAGAACTACGCTGAGCTA
TTAACAGAGGAACTGAAGCAACGCGAAGCAGCATCCATGGAGAAACACAAACGAGTAGAC
ACAGGTCTGTTAGAGGCCAAGAAGATCACATCCTCTTTCCAGAAGGAGGCGGATAAGTGC
AACTCCGGTATGGAGACTTGTGAAGAAGCAAGAGAGAAGTCGGAGAAGGCACTTGTGGAG
CAGAAGAAGCTGACTTCTATGTGGGAACTCAGAGCTCGTCAAAAAGGGTGGAAAGAAGGA
GCCACCAAGTCATCTGGTAAATCCAAAAGCAGTGTCCAGGCTTCTTAGAGTGCATACCCT
AAGTAACTTTTATATTACACGAAAGA*TGTATTTTATGGATTTTGATTTATAATATTGTC
TTGTAGTTT*CTGATGGA*CAGATATTGAATGAAACAGTGTACC

QA 4 767 4 767
DS 

RD RR2FA18JQ 513 0 0
CGTGCCTCTTCTCACCATCCCCAAAGGACTCAGCAATGGATCTTTTGGAGATTGTGCAAA
GCATGACTCAGAGGTGAACGAAGACACAGAGAAGAACTACGCTGAGCTATTAACAGAGGA
ACTGAAGCAACGCGAAGCAGCATCCATGGAGAAACACAAACGAGTAGACACAGGTCTGTT
AGAGGCCAAGAAGATCACATCCTCTTTCCAGAAGGAGGCGGATAAGTGCAACTCCGGTAT
GGAGACTTGTGAAGAAGCAAGAGAGAAGTCGGAGAAGGCACTTGTGGAGCAGAAGAAGCT
GACTTCTATGTGGGAACTCAGAGCTCGTCAAAAAGGGTGGAAAGAAGGAGCCACCAAGTC
ATCTGGTAAATCCAAAAGCAGTGTCCAGGCTTCTTAGAGTGCATACCCTAAGTAACTTTT
ATATTACACGAAAGAATGTATTTTATGGATTTTGATTTATAATATTGTCTTGTAGTTTTC
TGATGGAACAGATATTGAATGAAACAGTGTACC

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2AK23TF 857 0 0
GGGCTAATGCATTTCACCGGTAAATAAACACCACCGACAGAACCCGAGTGGGCGATATAG
ACAATCAGAGTCTCCAATCCAGTTCTGTCTCCACTGAAAGAGCTGAATCCATTTCGAAAC
ATAAAATCTTTTGCAAGATCTACTCGGTAATGGCGAAGCACACGGCGGCTTTGAAAGTTG
GACTGACTTTGCTTGCTCTGAGCATGATCGGTTACATACTCGGTCCTCCTCTCTACTGGC
ACCTCACCGAGGCACTTGTCGCTTCCGCCTCTTCTTGCTCCCCTTGCGTCTGCGACTGCT
CCTCCGTGCCTCTTCTCACCATCCCCAAAGGACTCAGCAATGGATCTTTTGGAGATTGTG
CAAAGCATGACTCAGAGGTGAACGAAGACACAGAGAAGAACTACGCTGAGCTATTAACAG
AGGAACTGAAGCAACGCGAAGCAGCATCCATGGAGAAACACAAACGAGTAGACACAGGTC
TGTTAGAGGCCAAGAAGATCACATCCTCTTTCCAGAAGGAGGCGGATAAGTGCAACTCCG
GTATGGAGACTTGTGAAGAAGCAAGAGAGAAGTCGGAGAAGGCACTTGTGGAGCAGAAGA
AGCTGACTTCTATGTGGGAACTCAGAGCTCGTCAAAA*GGGTGGAAAGAAGGAGCCACCA
AGTCATCTGGTAAATCCAAAAGCAGTGTCCAGGCTTCTTAGAGTGCATACCCTAAGTAAC
TTTTATATTACACGAAAGAATGTATTTTATGGATTTTGATTTATAATATTGTCTTGTAGT
TTTCTGATGGAACAGATATTGAATGAAACAGTGTACCAAAACAACAATGTATTAATGGAT
TCTGAACAAATTTTACT

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR2AK23JQ 732 0 0
ATCTTTTGCAAGATCTACTCGGTAATGGCGAAGCACACGGCGGCTTTGAAAGTTGGACTG
ACTTTGCTTGCTCTGAGCATGATCGGTTACATACTCGGTCCTCCTCTCTACTGGCACCTC
ACCGAGGCACTTGTCGCTTCCGCCTCTTCTTGCTCCCCTTGCGTCTGCGACTGCTCCTCC
GTGCCTCTTCTCACCATCCCCAAAGGACTCAGCAATGGATCTTTTGGAGATTGTGCAAAG
CATGACTCAGAGGTGAACGAAGACACAGAGAAGAACTACGCTGAGCTATTAACAGAGGAA
CTGAAGCAACGCGAAGCAGCATCCATGGAGAAACACAAACGAGTAGACACAGGTCTGTTA
GAGGCCAAGAAGATCACATCCTCTTTCCAGAAGGAGGCGGATAAGTGCAACTCCGGTATG
GAGACTTGTGAAGAAGCAAGAGAGAAGTCGGAGAAGGCACTTGTGGAGCAGAAGAAGCTG
ACTTCTATGTGGGAACTCAGAGCTCGTCAAAA*GGGTGGAAAGAAGGAGCCACCAAGTCA
TCTGGTAAATCCAAAAGCAGTGTCCAGGCTTCTTAGAGTGCATACCCTAAGTAACTTTTA
TATTACACGAAAGAATGTATTTTATGGATTTTGATTTATAATATTGTCTTGTAGTTTTCT
GATGGAACAGATATTGAATGAAACAGTGTACCAAAACAACAATGTATTAATGGATTCTGA
ACAAATTTTACT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 4

CO CL2628Contig1 807 4 15 U
CCGATATTTTTTTCCATTATAACTAAGAATTGGAACAAGACTAATGAATTACAAACTTAC
AACTTAAAAAGCCTAAGTAAATTAATGCAAAGAGCTGAGATTAAATAACATTAATCAGAA
CCAATTCCCTTTTTTCTAGTTTTGACTATATAGCTATAAATCTCATCATGTAGAGCTCTG
ACCCGACCGACCCGATCCGAATACCAGAAGCAACCGGGTCAGATGCAAACAGTTATCATG
AACTGTTCACCTAAGACGAGCCTCTGTTTTTCTTTCTCTTCATATCTCAATGCGTCGCAC
CGTTACTCTCAGTACTCCGCCGCACCACCTGATCACCAGCCTTCACGTCATCATCACCAT
CTTCATCATCGTCACAAGTACAGCTCTTCTCAGCCGGCGTCGCCAAGTAAGTGGGTTTGA
CGTCTCCGGCCATAATCACCAAGAACTTCTCCGGCAAAGGTACAGCCTTCACCGCTTTAT
CGGGTTTCACATCTCCGGCCTCAAGATCTCTGTCTCTGCTCTGCTCCTCCTCACCGTCGA
GATAACCGGAGAGACGCCAGTAAGAGCAGGCGAGGATCAGAAGAGCGAAAGCTATGAGAC
CAAGCATCGCCGCTAAACCACCGAAAAGATAAGGAACAGGTGAATGCCACGGCGAGTGAG
GTCCTCCCATGGCTGTTCTGTTCCCGTCGACGTTTTCTCTTGGAGGGTAATATTGTCTTC
CTTCCATTTTCTTATGAACTTAGAGAAAGAGAAAAAGGTGGTTTTGAGTTTTTTCTTTTC
TAGATAGAAAATGTTTTTGGTCTCCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB23JQ U 37
AF RR2H938JQ U 1
AF RR2H938TF C 72
AF RR2FB23TF C 150
BS 1 299 RR2H938JQ
BS 300 300 RR2FB23JQ
BS 301 397 RR2H938JQ
BS 398 398 RR2FB23JQ
BS 399 433 RR2H938JQ
BS 434 434 RR2FB23JQ
BS 435 457 RR2H938JQ
BS 458 458 RR2FB23JQ
BS 459 481 RR2H938JQ
BS 482 482 RR2FB23JQ
BS 483 541 RR2H938JQ
BS 542 542 RR2FB23JQ
BS 543 753 RR2H938JQ
BS 754 798 RR2H938TF
BS 799 807 RR2FB23TF

RD RR2FB23JQ 576 0 0
AAGACTGATGAATTACAAACTTACAACTTAAAAAGCCTAAGTAAATTAATGCAAAAAGCT
GAGATTAAATAACATTAATCAGAACCAATTCCCTTTTTTCTAGTTTTGACTATATAGCTA
TAAATCTCATCATGTAGAGCTCTGACCCGACCGACCCGATCCGAATACCAGAAGCAACCG
GGTCAGATGCAAACAGTTA*CATGAACTGTTCGCCTAAGACGAGCCTCTGTTTTTCTTTC
TCTTCATCTCTCAATGTGTCGCACCGTTACTCTCAGTACTCGGCCGCACCACCTGATCAC
CAGCCTTCACGTCATCATCACCATCTTCATCATCGTCACAAGTACAGCTCTTTTCAGCCG
GCGTCGCCAAGTAAGTGGGTTTGACGTCTCCGGCCATAATCACCAAGAACTTCTCCGGCA
AAGGTACAGCCTTCACCGCTTTATCGGGTTTCACATCTCCGGCCTCAAGATCTCTGTCTC
TGCTCTGCTCCTCCTCACCGTCGAGATAACCGGAGAGACGCCAGTAAGAGCAGGCGAGGA
TCAGAAGAGCGAAAGCTATGAGACCAAGCATCGC
TG

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2H938JQ 753 0 0
CCGATATTTTTTTCCATTATAACTAAGAATTGGAACAAGACTAATGAATTACAAACTTAC
AACTTAAAAAGCCTAAGTAAATTAATGCAAAGAGCTGAGATTAAATAACATTAATCAGAA
CCAATTCCCTTTTTTCTAGTTTTGACTATATAGCTATAAATCTCATCATGTAGAGCTCTG
ACCCGACCGACCCGATCCGAATACCAGAAGCAACCGGGTCAGATGCAAACAGTTATCATG
AACTGTTCACCTAAGACGAGCCTCTGTTTTTCTTTCTCTTCATATCTCAATGCGTCGCAG
CGTTACTCTCAGTACTCCGCCGCACCACCTGATCACCAGCCTTCACGTCATCATCACCAT
CTTCATCATCGTCACAAGTACAGCTCTTCTCAGCCGGGGTCGCCAAGTAAGTGGGTTTGA
CGTCTCCGGCCATGATCACCAAGAACTTCTCCGGCAAGGGTACAGCCTTCACCGCTTTAT
CTGGTTTCACATCTCCGGCCTCAAGATCTCTGTCTCTGCTCTGCTCCTCCTCACCGTCGA
GGTAACCGGAGAGACGCCAGTAAGAGCAGGCGAGGATCAGAAGAGCGAAAGCTATGAGAC
CAAGCATCGCCGCTAAACCACCGAAAAGATAAGGAACAGGTGAATGCCACGGCGAGTGAG
GTCCTCCCATGGCTGTTCTGTTCCCGTCGACGTTTTCTCTTGGAGGGTAATATTGTCTTC
CTTCCATTTTCTTATGAACTTAGAGAAAGAGAA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2H938TF 735 0 0
CCTAAGTAAATTAATGCAAAGAGCTGAGATTAAATAACATTAATCAGAACCAATTCCCTT
TTT*CTAGTTTTGACTATATAGCTATAAATCTCATCATGTAGAGCTCTGACCCGACCGAC
CCGATCCGAATACCAGAAGCAACCGGGTCAGATGCAAACAGTTATCATGAACTGTTCACC
TAAGACGAGCCTCTGTTTTTCTTTCTCTTCATATCTCAATGCGTCGCAGCGTTACTCTCA
GTACTCCGCCGCACCACCTGATCACCAGCCTTCACGTCATCATCACCATCTTCATCATCG
TCACAAGTACAGCTCTTCTCAGCCGGGGTCGCCAAGTAAGTGGGTTTGACGTCTCCGGCC
ATGATCACCAAGAACTTCTCCGGCAAGGGTACAGCCTTCACCGCTTTATCTGGTTTCACA
TCTCCGGCCTCAAGATCTCTGTCTCTGCTCTGCTCCTCCTCACCGTCGAGGTAACCGGAG
AGACGCCAGTAAGAGCAGGCGAGGATCAGAAGAGCGAAAGCTATGAGACCAAGCATCGCC
GCTAAACCACCGAAAAGATAAGGAACAGGTGAATGCCACGGCGAGTGAGGTCCTCCCATG
GCTGTTCTGTTCCCGTCGACGTTTTCTCTTGGAGGGTAATATTGTCTTCCTTCCATTTTC
TTATGAACTTAGAGAAAGAGAAAAAGGTGGTTTTGAGTTTTTTCTTTTCTAGATAGAAAA
TGTTTTT
TGTGAGCC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2FB23TF 658 0 0
ATAGCTATAAATCTCATCATGTAGAGCTCTGACCCGACCGACCCGATCCGAATACCAGAA
GCAACCGGGTCAGATGCAAACAGTTA*CATGAACTGTTCGCCTAAGACGAGCCTCTGTTT
TTCTTTCTCTTCATCTCTCAATGTGTCGCACCGTTACTCTCAGTACTCGGCCGCACCACC
TGATCACCAGCCTTCACGTCATCATCACCATCTTCATCATCGTCACAAGTACAGCTCTTT
TCAGCCGGCGTCGCCAAGTAAGTGGGTTTGACGTCTCCGGCCATAATCACCAAGAACTTC
TCCGGCAAAGGTACAGCCTTCACCGCTTTATCGGGTTTCACATCTCCGGCCTCAAGATCT
CTGTCTCTGCTCTGCTCCTCCTCACCGTCGAGATAACCGGAGAGACGCCAGTAAGAGCAG
GCGAGGATCAGAAGAGCGAAAGCTATGAGACCAAGCATCGCTGCCAAACCACCAAAAAGA
TAAGGAACAGGTGAATGCCACGGCGAGTGAGGTCCTCCCATGGCTGTTCTGTTCCCGTCG
ACGTTTTCTCTTGGAGGGTAATATTGTCTTCCTTCCATTTTCTTATGAACTTAGAGAAAG
AGAAAAAGGTGGTTTTGAGTTTTTTCTTTTCTAGATAGAAAATGTTTTTGGTCTCCCA

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 4

CO CL2629Contig1 913 4 14 U
GGATAAATAGCTTTTGATTCAACAAAAATCTCTCAAGAACACAAACACATATATATAAAA
GGGAAAATAAAAACAGAGGACACAACAAAAAGACAAAACGGAGCACTGAAAAATTGGGCA
ATGAGGCAGCCACTTATTTACTTTGAGCATATTATTATTACTGTGACTGAAGCAAAATCA
TTTTCTTTTCCCTTCTTCAAAAATTTCTCACTGAAGGATCTTCTGGGAAGCTGGCCTGTT
GGTGATCTCTTCCATCCACTCGTTGACATGTGGACGCTCGGCGAAAAGCTTTTTGGTAGG
AGTTCCAAGCAAGTATTGAATAACGGGAATGTGGTGAAGATCGGTCAAAGTAAAAGTTTC
ACCAGCCAAATACTTGAACTCCTTGAGCCTAGCCTCGTACACATCAAGGACCGCGGCTAA
CTTAGCCTCTTCTTCTTCAACAACGGCTTGGTCTGTGGTCATGCCATAAAAGACCTTGAA
CACTTGTTCCCAGGCAAGCTTTGAAGCCACTGGGTCGAAGTGGTGAGCTTCTACTTCCAT
TCCAATGGCCATGATTGCGTAGTGGGATATGTTCTTGGAGTCGGCTGGGAGAAGGTTGGT
TCCTTCCTCTTCATATCGGTGAGCTATGTACTGAGTAATCGCTCTTGATTCGAAGAGCTT
GAGGTCTCCATCTTCAAAGGCGGGAACTTTACCAAAAGGGTTACGGGAGAGGAAGGGCTC
TTTCTTGTGCTCACCGTCTTTGAGCTCGACATGAACGAGCTCAAAGTCGAGGTTTTTCTC
GTGGAGGGTGAGGAGGACTCTCCTGGTGGCAGTGGAAGCAGGGTGTCCGAAAACTTTGAT
ACCTGCCATTGGATTGATCACAAAGAAAGTCTTTGAAATGTGATTTGTTTGCTGTTGAAT
GTGAAGGTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2AI73JQ U 30
AF RR2EB26JQ U 1
AF RR2AI73TF C 198
AF RR2EB26TF C 233
BS 1 64 RR2EB26JQ
BS 65 65 RR2AI73JQ
BS 66 79 RR2EB26JQ
BS 80 80 RR2AI73JQ
BS 81 87 RR2EB26JQ
BS 88 88 RR2AI73JQ
BS 89 109 RR2EB26JQ
BS 110 110 RR2AI73JQ
BS 111 174 RR2EB26JQ
BS 175 175 RR2AI73JQ
BS 176 199 RR2EB26JQ
BS 200 200 RR2AI73JQ
BS 201 765 RR2EB26JQ
BS 766 913 RR2AI73TF

RD RR2AI73JQ 516 0 0
CCCCCAAA
AACACAAACACATATATATAAAAGGGAAAATAAAAACAGAGGACACAACAAAAAGACAAA
ACGGAGCACTGAAAAATTGGGCAATGAGGCAGCCACTTATTTACTTTGAGCATATTATTA
TTACTGTGACTGAAGCAAAATCTTTTTCTTTTCCCTTCTTCAAAAATTTCTCACTGAAGG
ATCTTCTGGGAAGCTGGCCTGTTGGTGATCTCTTCCATCCACTCGTTGACATGTGGACCC
TCGGCAAAAAGCTTTTTGGTAGGAGTTCCAAGCAAGTATTGAATAACGGGAATGTGGTGA
AAATCGGTCAAAGTAAAAGTTTCACCACCCAAATACTTGAACTCCTTGAGCCTACCCTCG
TACACATCAAGGACCGCGGCTAACTTACCCTCTTCTTCTTCAACAACGGCTTGGTCTGTG
GTCATGCCATAAAAAACCTTGAACACTTGTTCCCAGGCAAGCTTTGAAGCCACTGGGTCG
AAGTGGTGAGCTTCTACTTCCATTCCAA

QA 9 516 9 516
DS 

RD RR2EB26JQ 765 0 0
GGATAAATAGCTTTTGATTCAACAAAAATCTCTCAAGAACACAAACACATATATATAAAA
GGGAGAATAAAAACAGAGGGCACAACAGAAAGACAAAACGGAGCACTGAGAAATTGGGCA
ATGAGGCAGCCACTTATTTACTTTGAGCATATTATTATTACTGTGACTGAAGCAGAATCA
TTTTCTTTTCCCTTCTTCAGAAATTTCTCACTGAAGGATCTTCTGGGAAGCTGGCCTGTT
GGTGATCTCTTCCATCCACTCGTTGACATGTGGACGCTCGGCGAAAAGCTTTTTGGTAGG
AGTTCCAAGCAAGTATTGAATAACGGGAATGTGGTGAAGATCGGTCAAAGTAAAAGTTTC
ACCAGCCAAATACTTGAACTCCTTGAGCCTAGCCTCGTACACATCAAGGACCGCGGCTAA
CTTAGCCTCTTCTTCTTCAACAACGGCTTGGTCTGTGGTCATGCCATAAAAGACCTTGAA
CACTTGTTCCCAGGCAAGCTTTGAAGCCACTGGGTCGAAGTGGTGAGCTTCTACTTCCAT
TCCAATGGCCATGATTGCGTAGTGGGATATGTTCTTGGAGTCGGCTGGGAGAAGGTTGGT
TCCTTCCTCTTCATATCGGTGAGCTATGTACTGAGTAATCGCTCTTGATTCGAAGAGCTT
GAGGTCTCCATCTTCAAAGGCGGGAACTTTACCAAAAGGGTTACGGGAGAGGAAGGGCTC
TTTCTTGTGCTCACCGTCTTTGAGCTCGACATGAACGAGCTCAAA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2AI73TF 716 0 0
CAG
AAATTTCTCACTGAAGGATCTTCTGGGAAGCTGGCCTGTTGGTGATCTCTTCCATCCACT
CGTTGACATGTGGACGCTCGGCGAAGAGCTTTTTGGTAGGAGTTCCAAGCAAGTATTGAA
TAACGGGAATGTGGTGAAGATCGGTCAAAGTAAAAGTTTCACCAGCCAAATACTTGAACT
CCTTGAGCCTAGCCTCGTACACATCAAGGACCGCGGCTAACTTAGCCTCTTCTTCTTCAA
CAACGGCTTGGTCTGTGGTCATGCCATAGAAGACCTTGAACACTTGTTCCCAGGCAAGCT
TTGAAGCCACTGGGTCGAAGTGGTGAGCTTCTACTTCCATTCCAATGGCCATGATTGCGT
AGTGGGATATGTTCTTGGAGTCGGCTGGGAGAAGGTTGGTTCCTTCCTCTTCATATCGGT
GAGCTATGTACTGAGTAATCGCTCTTGATTCGAAGAGCTTGAGGTCTCCATCTTCAAAGG
CGGGAACTTTACCAAAAGGGTTACGGGAGAGGAAGGGCTCTTTCTTGTGCTCACCGTCTT
TGAGCTCGACATGAACGAGCTCAAAGTCGAGGTTTTTCTCGTGGAGGGTGAGGAGGACTC
TCCTGGTGGCAGTGGAAGCAGGGTGTCCGAAAACTTTGATACCTGCCATTGGATTGATCA
CAAAGAAAGTCTTTGAAATGTGATTTGTTTGCTGTTGAATGTGAAGGTGATCC

QA 4 716 4 716
DS 

RD RR2EB26TF 678 0 0
GGCCTGTTGGTGATCTCT*CCATCCACTCGTTGACATGTGGACGCTCGGCGAAGAGCTTT
TTGGTAGGAGTTCCAAGCAAGTATTGAATAACGGGAATGTGGTGAAGATCGGTCAAAGTA
AAAGTTTCACCAGCCAAATACTTGAACTCCTTGAGCCTAGCCTCGTACACATCAAGGACC
GCGGCTAACTTAGCCTCTTCTTCTTCAACAACGGCTTGGTCTGTGGTCATGCCATAGAAG
ACCTTGAACACTTGTTCCCAGGCAAGCTTTGAAGCCACTGGGTCGAAGTGGTGAGCTTCT
ACTTCCATTCCAATGGCCATGATTGCGTAGTGGGATATGTTCTTGGAGTCGGCTGGGAGA
AGGTTGGTTCCTTCCTCTTCATATCGGTGAGCTATGTACTGAGTAATCGCTCTTGATTCG
AAGAGCTTGAGGTCTCCATCTTCAAAGGCGGGAACTTTACCAAAAGGGTTACGGGAGAGG
AAGGGCTCTTTCTTGTGCTCACCGTCTTTGAGCTCGACATGAACGAGCTCAAAGTCGAGG
TTTTTCTCGTGGAGGGTGAGGAGGACTCTCCTGGTGGCAGTGGAAGCAGGGTGTCCGAAA
ACTTTGATACCTGCCATTGGATTGATCACAAAGAAAGTCTTTGAAATGTGATTTGTTTGC
TGTTGAATGTGAAGGT
CC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 4

CO CL2630Contig1 1047 4 4 U
GAAGTCAAGCTAGAGACTTCAAACAAGCTCACTTGGGAGGAAGTCCCATGACTATCCATG
TACATATGTCTTTTGGATTTTCATTTCAAAGACCCATGGAAGAAGTAGGGCGACCAGACT
CAACTCCGAGGCATCAGCCTCTTCTCACGCTCCATAGAGGTACTCCACCACCTTCCATTG
TATATACCATTTTCATCTGCATTTAGACTTTGTTTTGGTCATCTCTCTCCACTTTTCACA
CAAGAGACTGTGTGAATTAAGTGTGGGGGAGGTGCAAGTTGCTGATGATCTTGTGTTTCT
TGTCATTAGCATGCATTGTAGATAGTTATTTGCATATAAAAAAAAATTGAAAATTTTGAA
AACACACAAAAAGAAGCATTTAGTTGCATCATTTGCATTTTAGGATTGAGTCTAGAAGCA
TTCATATAGGTTGCATTCATGCATAAGGTGATGATTTTACCTTGTAAATATGCTCATGCT
AAGTTCTCATTTTGGCAACCTTTGTAATCATGACAATTAGATTGAGCATTCTCTTGATAG
CTTGTAGACTTTGTGCCTTGAATTCTCTTCTTGAAACTCATTGGATTGTTTGAAACTCTC
TCTTTGAAGATGCTCCCGTCTTATTTAAACTTAATATCTCTTGTTTATGGTCCTTTGTGT
GCTGAGTCATGGCTTATATACACTTGAATTGTCTTATCCTTCTTGTCCAATATTTTTGAC
AATTTCAAGTGGCACTCCACACCCTTAACCCAAAGCTTTCTTTCAAGCCTTCATTGTTTG
TTGAGTGAGGTCTTTTTGGAAAGCTTTGCATGTGCATAATGTTGAGAGTATCGGGGTCGA
CAATGCTTAGTCTCCATTCTAGCTAGATTAGACACATCTTTGTCTAGCACTTAGGATTGG
GTGGTGAGTGTTGTTGACTTTACCTTTGGGAGTATGGTTTGGTTAAGAAAGAGAAGATTA
AACTTTTAGAACTCTAAGAGTGATTATCTTGTCTCAAGGGATTATAATTTGTGATCCTTA
GCTCAAAGCATTAATGTTTTGGCCCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GW53TF U 1
AF RR2G456TF U 1
AF RR2G456JQ C 208
AF RR2GW53JQ C 359
BS 1 709 RR2G456TF
BS 710 710 RR2G456JQ
BS 711 744 RR2G456TF
BS 745 1047 RR2G456JQ

RD RR2GW53TF 695 0 0
GAAGTCAAGCTAGAGACTTCAAACAAGCTCACTTGGGAGGAAGTCCCATGACTATCCATG
TACATATGTCTTTTGGATTTTCATTTCAAAGACCCATGGAAGAAGTAGGGCGACCAGACT
CAACTCCGAGGCATCAGCCTCTTCTCACGCTCCATAGAGGTACTCCACCACCTTCCATTG
TATATACCATTTTCATCTGCATTTAGACTTTGTTTTGGTCATCTCTCTCCACTTTTCACA
CAAGAGACTGTGTGAATTAAGTGTGGGGGAGGTGCAAGTTGCTGATGATCTTGTGTTTCT
TGTCATTAGCATGCATTGTAGATAGTTATTTGCATATAAAAAAAAATTGAAAATTTTGAA
AACACACAAAAAGAAGCATTTAGTTGCATCATTTGCATTTTAGGATTGAGTCTAGAAGCA
TTCATATAGGTTGCATTCATGCATAAGGTGATGATTTTACCTTGTAAATATGCTCATGCT
AAGTTCTCATTTTGGCAACCTTTGTAATCATGACAATTAGATTGAGCATTCTCTTGATAG
CTTGTAGACTTTGTGCCTTGAATTCTCTTCTTGAAACTCATTGGATTGTTTGAAACTCTC
TCTTTGAAGATGCTCCCGTCTTATTTAAACTTAATATCTCTTGTTTATGGTCCTTTGTGT
GCTGAGTCATGGCTTATATACACTTGAATTGTCTT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2G456TF 744 0 0
GAAGTCAAGCTAGAGACTTCAAACAAGCTCACTTGGGAGGAAGTCCCATGACTATCCATG
TACATATGTCTTTTGGATTTTCATTTCAAAGACCCATGGAAGAAGTAGGGCGACCAGACT
CAACTCCGAGGCATCAGCCTCTTCTCACGCTCCATAGAGGTACTCCACCACCTTCCATTG
TATATACCATTTTCATCTGCATTTAGACTTTGTTTTGGTCATCTCTCTCCACTTTTCACA
CAAGAGACTGTGTGAATTAAGTGTGGGGGAGGTGCAAGTTGCTGATGATCTTGTGTTTCT
TGTCATTAGCATGCATTGTAGATAGTTATTTGCATATAAAAAAAAATTGAAAATTTTGAA
AACACACAAAAAGAAGCATTTAGTTGCATCATTTGCATTTTAGGATTGAGTCTAGAAGCA
TTCATATAGGTTGCATTCATGCATAAGGTGATGATTTTACCTTGTAAATATGCTCATGCT
AAGTTCTCATTTTGGCAACCTTTGTAATCATGACAATTAGATTGAGCATTCTCTTGATAG
CTTGTAGACTTTGTGCCTTGAATTCTCTTCTTGAAACTCATTGGATTGTTTGAAACTCTC
TCTTTGAAGATGCTCCCGTCTTATTTAAACTTAATATCTCTTGTTTATGGTCCTTTGTGT
GCTGAGTCATGGCTTATATACACTTGAATTGTCTTATCCTTCTTGTCCA*TATTTTTGAC
AATTTCAAGTGGCACTCCACACCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2G456JQ 840 0 0
GACTTG
TTTGGTCATCTCTCTCCACTTT*CACACAAGAGACTGTGTGAATTAAGTGTGGGGGAGGT
GCAAGTTGCTGATGATCTTGTGTTTCTTGTCATTAGCATGCATTGTAGATAGTTATTTGC
ATATAAAAAAAAATTGAAAATTTTGAAAACACACAAAAAGAAGCATTTAGTTGCATCATT
TGCATTTTAGGATTGAGTCTAGAAGCATTCATATAGGTTGCATTCATGCATAAGGTGATG
ATTTTACCTTGTAAATATGCTCATGCTAAGTTCTCATTTTGGCAACCTTTGTAATCATGA
CAATTAGATTGAGCATTCTCTTGATAGCTTGTAGACTTTGTGCCTTGAATTTTCTTCTTG
AAACTCATTGGATTGTTTGAAACTCTCTCTTTGAAGATGCTCCCGTCTTATTTAAACTTA
ATATCTCTTGTTTATGGTCCTTTGTGTGCTGAGTCATGGCTTATATACACTTGAATTGTC
TTATCCTTCTTGTCCAATATTTTTGACAATTTCAAGTGGCACTCCACACCCTTAACCCAA
AGCTTTCTTTCAAGCCTTCATTGTTTGTTGAGTGAGGTCTTTTTGGAAAGCTTTGCATGT
GCATAATGTTGAGAGTATCGGGGTCGACAATGCTTAGTCTCCATTCTAGCTAGATTAGAC
ACATCTTTGTCTAGCACTTAGGATTGGGTGGTGAGTGTTGTTGACTTTACCTTTGGGAGT
ATGGTTTGGTTAAGAAAGAGAAGATTAAACTTTTAGAACTCTAAGAGTGATTATCTTGTC
TCAAGGGATTATAATTTGTGATCCTTAGCTCAAAGCATTAATGTTTTGGCCCCC

QA 7 840 7 840
DS 

RD RR2GW53JQ 689 0 0
AAAACACACAAAAAGAAGCATTTAGTTGCATCATTTGCATTTTAGGATTGAGTCTAGAAG
CATTCATATAGGTTGCATTCATGCATAAGGTGATGATTTTACCTTGTAAATATGCTCATG
CTAAGTTCTCATTTTGGCAACCTTTGTAATCATGACAATTAGATTGAGCATTCTCTTGAT
AGCTTGTAGACTTTGTGCCTTGAATTCTCTTCTTGAAACTCATTGGATTGTTTGAAACTC
TCTCTTTGAAGATGCTCCCGTCTTATTTAAACTTAATATCTCTTGTTTATGGTCCTTTGT
GTGCTGAGTCATGGCTTATATACACTTGAATTGTCTTATCCTTCTTGTCCAATATTTTTG
ACAATTTCAAGTGGCACTCCACACCCTTAACCCAAAGCTTTCTTTCAAGCCTTCATTGTT
TGTTGAGTGAGGTCTTTTTGGAAAGCTTTGCATGTGCATAATGTTGAGAGTATCGGGGTC
GACAATGCTTAGTCTCCATTCTAGCTAGATTAGACACATCTTTGTCTAGCACTTAGGATT
GGGTGGTGAGTGTTGTTGACTTTACCTTTGGGAGTATGGTTTGGTTAAGAAAGAGAAGAT
TAAACTTTTAGAACTCTAAGAGTGATTATCTTGTCTCAAGGGATTATAATTTGTGATCCT
TAGCTCAAAGCATTAATGTTTTGGCCCCC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 3

CO CL2631Contig1 1178 3 5 U
GTGGTCCACCAAGTCCCTGAAGGACACGTTGGAGCGTATTGGAGAGGTGGTGCTCTTCTC
AACAGCATTACAGAGCCTGGTTTTCATTTGAAGCTGCCTTTCATTACCAACTACGAGCCT
GTTCAAGTTACTCTCCAAACTGACCAAGTGAAGGATATACCATGTGGTACCAAAGGAGGT
GTCATGATTACCTTTGAGAAGATTGAAGTTGTTAATCGTCTGCGTAAGGACTATGTTTAC
GACACTTTGCTCAACTACGGTGTCGACTATGATAACACATGGATTTACGACAAGATTCAC
CACGAGATCAACCAGTTCTGCAGCTCTCATTCCCTTCAGCAAGTCTACATTGATATCTTT
GACCAGATTGACGAGCGAATGAAAGACGCTCTTCAGGCTGATTGCACACGTTATGCTCCA
GGAATCGAGATCATTAGTGTCCGTGTCACTAAGCCTAAAATTCCAGAGAGTGTAAGGCGC
AACTTTGAGCAGATGGAAGAAGAACGCACTAAGGTCTTGATTGCTATTGAGAAACAAAGA
GTTGCTGAGAAAGAGGCAGAGACAAGGAAGATAATGGCCATTAGTGAAGCCGAGAAGAAT
GCCAATGTTAGTAAGATTCTCATGGAGCAGAAGCTGACTGAGAAAGACAGTGCACGGAGA
GAAGCTGACATCGAGAATCAGATGTATCTTGATCGTCAAAAGAGTCTTGCTGATGCAGAT
TACTGCCGTGTACTGAAAGAAGCTGAAGCAAACAAGTTGAAGCTCACTCCTGAATTTCTC
GAACTTAAGTTCATCGATGCCATTGCACGTAACACCAAAATGTTCTTCGGGGACAAGGTA
CCTAACATGGTGTTGGATCAAAGGCTACTTGGGAACTTCCTCAGTCAATCGGTAGAAGAC
AAATCTGATGATGGAAACTTGGAAACGGCCACTGATTCATAGAACGTGTTCAGTCCCCCA
CCCAATTCAAAAACTTCCTTGTGTTATTGCTTGCTTAGTAGTGAAAAACTTGGACGCTTC
TCTTGTGGTGATCATTTTACTGCAACTTAATCTCTTAATAAACATGTTTTTTTTGGTTCG
AAAATCAATCTCTTTGGTACTAAGACCAGACCTATTCGTATTAGTACTTTATCCTATGTA
TTAGATTCAACGAGCAACATAGTAAACAGACATGTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FV38TF U 1
AF RR2DZ20TF U 425
AF RR2DZ20JQ C 526
BS 1 565 RR2FV38TF
BS 566 566 RR2DZ20TF
BS 567 693 RR2FV38TF
BS 694 1067 RR2DZ20TF
BS 1068 1178 RR2DZ20JQ

RD RR2FV38TF 693 0 0
GTGGTCCACCAAGTCCCTGAAGGACACGTTGGAGCGTATTGGAGAGGTGGTGCTCTTCTC
AACAGCATTACAGAGCCTGGTTTTCATTTGAAGCTGCCTTTCATTACCAACTACGAGCCT
GTTCAAGTTACTCTCCAAACTGACCAAGTGAAGGATATACCATGTGGTACCAAAGGAGGT
GTCATGATTACCTTTGAGAAGATTGAAGTTGTTAATCGTCTGCGTAAGGACTATGTTTAC
GACACTTTGCTCAACTACGGTGTCGACTATGATAACACATGGATTTACGACAAGATTCAC
CACGAGATCAACCAGTTCTGCAGCTCTCATTCCCTTCAGCAAGTCTACATTGATATCTTT
GACCAGATTGACGAGCGAATGAAAGACGCTCTTCAGGCTGATTGCACACGTTATGCTCCA
GGAATCGAGATCATTAGTGTCCGTGTCACTAAGCCTAAAATTCCAGAGAGTGTAAGGCGC
AACTTTGAGCAGATGGAAGAAGAACGCACTAAGGTCTTGATTGCTATTGAGAAACAAAGA
GTTGCTGAGAAAGAGGCAGAGACAAAGAAGATAATGGCCATTAGTGAAGCCGAGAAGAAT
GCCAATGTTAGTAAGATTCTCATGGAGCAGAAGCTGACTGAGAAAGACAGTGCACGGAGA
GAAGCTGACATCGAGAATCAGATGTATCTTGAT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2DZ20TF 643 0 0
G
CGAGATCATTAGTGTCCGTGTCACTAAGCCTAAAATTCCAGAGAGTGTAAGGCGCAACTT
TGAGCAGATGGAAGAAGAACGCACTAAGGTCTTGATTGCTATTGAGAAACAAAGAGTTGC
TGAGAAAGAGGCAGAGACAAGGAAGATAATGGCCATTAGTGAAGCCGAGAAGAATGCCAA
TGTTAGTAAGATTCTCATGGAGCAGAAGCTGACTGAGAAAGACAGTGCACGGAGAGAAGC
TGACATCGAGAATCAGATGTATCTTGATCGTCAAAAGAGTCTTGCTGATGCAGATTACTG
CCGTGTACTGAAAGAAGCTGAAGCAAACAAGTTGAAGCTCACTCCTGAATTTCTCGAACT
TAAGTTCATCGATGCCATTGCACGTAACACCAAAATGTTCTTCGGGGACAAGGTACCTAA
CATGGTGTTGGATCAAAGGCTACTTGGGAACTTCCTCAGTCAATCGGTAGAAGACAAATC
TGATGATGGAAACTTGGAAACGGCCACTGATTCATAGAACGTGTTCAGTCCCCCACCCAA
TTCAAAAACTTCCTTGTGTTATTGCTTGCTTAGTAGTGAAAAACTTGGACGCTTCTCTTG
TGGTGATCATTTTACTGCAACTTAATCTCTTAATAAACATGT

QA 2 643 2 643
DS 

RD RR2DZ20JQ 653 0 0
ATTGAGAAACAAAGAGTTGCTGAGAAAGAGGCAGAGACAAGGAAGATAATGGCCATTAGT
GAAGCCGAGAAGAATGCCAATGTTAGTAAGATTCTCATGGAGCAGAAGCTGACTGAGAAA
GACAGTGCACGGAGAGAAGCTGACATCGAGAATCAGATGTATCTTGATCGTCAAAAGAGT
CTTGCTGATGCAGATTACTGCCGTGTACTGAAAGAAGCTGAAGCAAACAAGTTGAAGCTC
ACTCCTGAATTTCTCGAACTTAAGTTCATCGATGCCATTGCACGTAACACCAAAATGTTC
TTCGGGGACAAGGTACCTAACATGGTGTTGGATCAAAGGCTACTTGGGAACTTCCTCAGT
CAATCGGTAGAAGACAAATCTGATGATGGAAACTTGGAAACGGCCACTGATTCATAGAAC
GTGTTCAGTCCCCCACCCAATTCAAAAACTTCCTTGTGTTATTGCTTGCTTAGTAGTGAA
AAACTTGGACGCTTCTCTTGTGGTGATCATTTTACTGCAACTTAATCTCTTAATAAACAT
GTTTTTTTTGGTTCGAAAATCAATCTCTTTGGTACTAAGACCAGACCTATTCGTATTAGT
ACTTTATCCTATGTATTAGATTCAACGAGCAACATAGTAAACAGACATGTGGT

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 4

CO CL2632Contig1 1554 4 9 U
CTAAAAAAAATCCGATGATGAATAAAAGGGTAGGTAAACACAACGTCAGTCCCCCAAAAA
CGTTCCACAGAATTAAAGAAAACATTACGATAGAAATTTTTCATCAAAGTTGTAATCAAG
TAAATTCACAATCAAGCTTTGGACTTTTTGCCTTTGGTGTCTGCAGCTACTGGCTTAACC
TTGAAGGGCAAAAACGTCTCTCCGCCCATAAACGCCTGCAACACCTCAGGGATCTCCACA
CCGTCCTCGCGCTGGTAGTTCTCCAGAATGCAGCAAATGGTCCTCTCTGTGGCGGTGAGA
GTCGAGTTCAGCATGTGCACGTACTGCTTCGCCTGCTCATTGCTCTTCTTCTGACCGTAT
CTGATCTCAAGTCTTCGAGCTTGGTAGTCTGTGCAGTTGGAGCAGGACACGAGCTCTCTG
TAAGTCCCCGACGAAGGAAACCAAGCTTCCAAGTCGTACTTCTTTGCAGCCGCATCGTTC
AATGCTCCAGAGACTATGGAAACGATTTGGTATGGAAGTTTCAGCGCTTGGTAAAAATCT
TCAGAGTTGTTCATCATCTCTTCAAGCATGTCCCACGAATGATTCTCGTTAGGACCCGTG
ATGCAGAACTGTTCAATCTTCTCAAACTGGTGAACACGGAAAATGCCGAGTGTATCTCTT
CCGTGGGAACCAGCTTCCTTTCTAAAACAGGACGAGTAACCAGCATATCTTTTGGGAACC
TCCGTCGGATGGATCCATTCATCAATATGGTAAGCACAGAGAGGTTGCTCCGCAGTAGCA
ATAAGGTACTTGTCATCACCTTCACCCAGTCACCTTGTAAAGCTCTTCATCGAACTGCGC
CAGCTGTGCGCACTTGGCCATGACATCCTTCCTCATGAAAAACGGAGGCTGCAGTCCAGT
GAACCCTCTCTTTTTCAAGAAGGTCAGCCCAAAGTTGATAAGAGCTTGGTTAAGCAGCAG
ACCATCTCCTTTCAAGAAAAAGCCTCTTGCTCCAGCAATCTCAGCACCTCTCTTGGTATC
TGCAATGTCGAGAAGCTCGACAAGATCCACGTGGTTCTTCAGCTTCAGACCAGGAGAAGC
AACGAGCTTCTCACCCCAAACTTTAGTCACAGCATTGTTCGCCTCATCGTTGCTAACGGG
AACAGAGTCGTGGACGAGATTGCCAACAGTCTCCAACTTGGCCTTCAAAGCAGCGTAAGC
TTCACGAACCTCAGCCTCCTTCTCAGTAGCGTCACGTTTGTTCTTCTCCGTTTGCTCAAT
CACCTCGCTTGCATCAGCACCAGAGATCTTGAGCTTGGCGACTTGCTTGTTCAGCTTGTT
GAACTCCTTGCGGAAGTTATCTACTTCGAATTGACGTTGGCGCCATTCTTTGTCGAGCTT
GATGATCTCGTCGACGACTTCGACGCTGGCGAATCTCCGGCGTTGCGATTCGCGGATGAT
CTCGGGGTTGTTCCCCTTCTCTTCTCGGAATAGATTGATGTCCAACATCGTTAGTGTGTG
TGCTCTTTATTATCTCTTTGCGACTGTAGATGGGAGTATCAGTAGCGGCGTTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2D995JQ U 1
AF RR2BA70JQ U 3
AF RR2BA70TF C 726
AF RR2D995TF C 847
BS 1 669 RR2D995JQ
BS 670 785 RR2BA70JQ
BS 786 786 RR2BA70TF
BS 787 806 RR2BA70JQ
BS 807 807 RR2BA70TF
BS 808 852 RR2BA70JQ
BS 853 1044 RR2BA70TF
BS 1045 1045 RR2D995TF
BS 1046 1554 RR2BA70TF

RD RR2D995JQ 669 0 0
CTAAAAAAAATCCGATGATGAATAAAAGGGTAGGTAAACACAACGTCAGTCCCCCAAAAA
CGTTCCACAGAATTAAAGAAAACATTACGATAGAAATTTTTCATCAAAGTTGTAATCAAG
TAAATTCACAATCAAGCTTTGGACTTTTTGCCTTTGGTGTCTGCAGCTACTGGCTTAACC
TTGAAGGGCAAAAACGTCTCTCCGCCCATAAACGCCTGCAACACCTCAGGGATCTCCACA
CCGTCCTCGCGCTGGTAGTTCTCCAGAATGCAGCAAATGGTCCTCTCTGTGGCGGTGAGA
GTCGAGTTCAGCATGTGCACGTACTGCTTCGCCTGCTCATTGCTCTTCTTCTGACCGTAT
CTGATCTCAAGTCTTCGAGCTTGGTAGTCTGTGCAGTTGGAGCAGGACACGAGCTCTCTG
TAAGTCCCCGACGAAGGAAACCAAGCTTCCAAGTCGTACTTCTTTGCAGCCGCATCGTTC
AATGCTCCAGAGACTATGGAAACGATTTGGTATGGAAGTTTCAGCGCTTGGTAAAAATCT
TCAGAGTTGTTCATCATCTCTTCAAGCATGTCCCACGAATGATTCTCGTTAGGACCCGTG
ATGCAGAACTGTTCAATCTTCTCAAACTGGTGAACACGGAAAATGCCGAGTGTATCTCTT
CCGTGGGAA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2BA70JQ 850 0 0
AAAAAAAATCCGATGATGAATAAAAGGGTAGGTAAACACAACGTCAGTCCCCCAAAAACG
TTCCACAGAATTAAAGAAAACATTACGATAGAAATTTTTCATCAGAGTTGTAATCAAGTA
AATTCACAATCAAGCTTTGGACTTTTTGCCTTTGGTGTCTGCAGCTACTGGCTTAACCTT
GAAGGGCAAAAACGTCTCTCCGCCCATAAACGCCTGCAACACCTCAGGGATCTCCACACC
GTCCTCGCGCTGGTAGTTCTCCAGAATGCAGCAAATGGTCCTCTCTGTGGCGGTGAGAGT
CGAGTTCAGCATGTGCACGTACTGCTTCGCCTGCTCATTGCTCTTCTTCTGACCGTATCT
GATCTCAAGTCTTCGAGCTTGGTAGTCTGTGCAGTTGGAGCAGGACACGAGCTCTCTGTA
AGTCCCCGACGAAGGAAACCAAGCTTCCAAGTCGTACTTCTTTGCAGCCGCATCGTTCAA
TGCTCCAGAGACTATGGAAACGATTTGGTATGGAAGTTTCAGCGCTTGGTAAAAATCTTC
AGAGTTGTTCATCATCTCTTCAAGCATGTCCCACGAATGATTCTCGTTAGGACCCGTGAT
GCAGAACTGTTCAATCTTCTCAAACTGGTGAACACGGAAAATGCCGAGTGTATCTCTTCC
GTGGGAACCAGCTTCCTTTCTAAAACAGGACGAGTAACCAGCATATCTTTTGGGAACCTC
CGTCGGATGGATCCATTCATCAATATGGTAAGCACAGAGAGGTTGCTCCGCAGTAGCAAT
AAG*TACTTGTCATCACCTTCACC*AGTCACCTTGTAAAGCTCTTCATCGAACTGCGCCA
GCTGTGCGCA

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR2BA70TF 829 0 0
CGGATGGATCCATTCATCAATATGGTAAGCACAGAGAGGTTGCTCCGCAGTAGCAATAAG
GTACTTGTCATCACCTTCACCCAGTCACCTTGTAAAGCTCTTCATCGAACTGCGCCAGCT
GTGCGCACTTGGCCATGACATCCTTCCTCATGAAAAACGGAGGCTGCAGTCCAGTGAACC
CTCTCTTTTTCAAGAAGGTCAGCCCAAAGTTGATAAGAGCTTGGTTAAGCAGCAGACCAT
CTCCTTTCAAGAAAAAGCCTCTTGCTCCAGCAATCTCAGCACCTCTCTTGGTATCTGCAA
TGTCGAGAAGCTCGACAAGGTCCACGTGGTTCTTCAGCTTCAGACCAGGAGAAGCAACGA
GCTTCTCACCCCAAACTTTAGTCACAGCATTGTTCGCCTCATCGTTGCTAACGGGAACAG
AGTCGTGGACGAGATTGCCAACAGTCTCCAACTTGGCCTTCAAAGCAGCGTAAGCTTCAC
GAACCTCAGCCTCCTTCTCAGTAGCGTCACGTTTGTTCTTCTCCGTTTGCTCAATCACCT
CGCTTGCATCAGCACCAGAGATCTTGAGCTTGGCGACTTGCTTGTTCAGCTTGTTGAACT
CCTTGCGGAAGTTATCTACTTCGAATTGACGTTGGCGCCATTCTTTGTCGAGCTTGATGA
TCTCGTCGACGACTTCGACGCTGGCGAATCTCCGGCGTTGCGATTCGCGGATGATCTCGG
GGTTGTTCCCCTTCTCTTCTCGGAATAGATTGATGTCCAACATCGTTAGTGTGTGTGCTC
TTTATTATCTCTTTGCGACTGTAGATGGGAGTATCAGTAGCGGCGTTCC

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2D995TF 708 0 0
TGCGCACTTGGCCATGACATC*TTCCTCATGAAAAACGGAGGCTGCAGTCCAGTGAACCC
TCTCTTTTTCAAGAAGGTCAGCCCAAAGTTGATAAGAGCTTGGTTAAGCAGCAGACCATC
TCCTTTCAAGAAAAAGCCTCTTGCTCCAGCAATCTCAGCACCTCTCTTGGTATCTGCAAT
GTCGAGAAGCTCGACAAGATCCCCGTGGTTCTTCAGCTTCAGACCAGGAGAAGCAACGAG
CTTCTCACCCCAAACTTTAGTCACAGCATTGTTCGCCTCATCGTTGCTAACGGGAACAGA
GTCGTGGACGAGATTGCCAACAGTCTCCAACTTGGCCTTCAAAGCAGCGTAAGCTTCACG
AACCTCAGCCTCCTTCTCAGTAGCGTCACGTTTGTTCTTCTCCGTTTGCTCAATCACCTC
GCTTGCATCAGCACCAGAGATCTTGAGCTTGGCGACTTGCTTGTTCAGCTTGTTGAACTC
CTTGCGGAAGTTATCTACTTCGAATTGACGTTGGCGCCATTCTTTGTCGAGCTTGATGAT
CTCGTCGACGACTTCGACGCTGGCGAATCTCCGGCGTTGCGATTCGCGGATGATCTCGGG
GTTGTTCCCCTTCTCTTCTCGGAATAGATTGATGTCCAACATCGTTAGTGTGTGTGCTCT
TTATTATCTCTTTGCGACTGTAGATGGGAGTATCAGTAGCGGCGTTCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 4

CO CL2633Contig1 1216 4 11 U
GGGCACTTCAACCGAAAAGCTAATAAACAACAAAAAAAACATATTTTGTGGCCTATAAAG
TTGTTTAAATTCCACTCTATAAACCCTAACGAATCACATCTAGCTAGAGAATCAATGGAT
AACCAAGAAGTTGTCAAGAGAAGACTAGCCGTTCTCGTTGGCTGCAACTACCCTAACACA
AAGAACGAGCTTCACGGCTGCGTCAACGATGTTTTAGCCATGCAAGAAGCTCTTCTAACC
CGTTTCGGATTCAAACAAGAAGACATGGAGGTGCTAACGGACGAGCCAGACTCAAAACTA
AAGCCTACTGGAGCCAACATCAAGGCTGCTTTACGTAGGATAGTGGACAAAGCTCAAACC
GGATCTGAAAACGTCTTGTTCTTCCACTATAGTGGCCATGGAACTCGGATTCCTTCGGTT
AAACCTGCTCGTCCTTTTAAACAAGACGAAGCTATAGTTCCTTGTGATTTCAATCTCATC
ACAGATGTCGATTTCAGAGAACTTGTTAATCAACTTCCCAAGGGAACGAGCTTTACCATG
ATCTCAGATTCTTGCCACAGTGGTGGTCTCATTGATAAGGAGAAAGAACAAATCGGACCC
TTCTCTGGAGTTAGATCTCCGGCCATGGAGACAACGACGACAATAACATCACGTGCCTTA
CCCTACAAGGAGGTTCTCGACCACTTGAGTTCTCGCACCGGAATCTCAACTTCAGACATC
GGTACACACCTACTGGAGCTCTTTGGTAGCGACGCCGGTCTAAAGTTCC*GGCTACCGGC
TATGGATTTGATGGAACTTTTGGAGAACATGAAGGCGCGTGAAAGACACGTTGACTCAGG
GATACTGTTGAGCGGGTGTCAGGCCGATGAAACGTCTGCTGACGTTGTAAGTGGCGGTGG
GAAGGCGTATGGAGCGTTTAGCAACGCGATTCAGACGGTTCTGAAGGAAAACGGAGGTGC
CTTGAAGAACAAGGAACTAGTGATAATGGCAAGAGAAGTGCTTGAGAGACTAGGGTTTCA
GCAACACCCTTGTCTTTACTGCAGCGACCAGAACGCGGACGCAACGTTCCTGTCTCAACC
TTGATGCGATTATATTTAATGAATAAAAGCGTTGTCGTTGTGTTTCTTTTATTTGTGTTT
GATGTGTATTTTCACTCTTTCATGGTGTGTGTGTTCCATAATTAAAAGGAAGAATAAATT
GCTACGAATTTAAAAC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG64TF U 3
AF RR2B931TF U 1
AF RR2B931JQ C 450
AF RR2FG64JQ C 480
BS 1 296 RR2B931TF
BS 297 297 RR2FG64TF
BS 298 341 RR2B931TF
BS 342 342 RR2FG64TF
BS 343 769 RR2B931TF
BS 770 770 RR2B931JQ
BS 771 814 RR2B931TF
BS 815 815 RR2B931JQ
BS 816 827 RR2B931TF
BS 828 829 RR2FG64JQ
BS 830 1216 RR2B931JQ

RD RR2FG64TF 751 0 0
GG
ACTTCAACCGAAAAGCTAATAAACAA***AAAAAACATATTTTGTGGCCTATAAAGTTGT
TTAAATTCCACTCTATAAACCCTAACGAATCACATCTAGCTAGAGAATCAATGGATAACC
AAGAAGTTGTCAAGAGAAGACTAGCCGTTCTCGTTGGCTGCAACTACCCTAACACAAAGA
ACGAGCTTCACGGCTGCGTCAACGATGTTTTAGCCATGCAAGAAGCTCTTTTAACCCGTT
TCGGATTCAAACAAGAAGACATGGAGGTGCTAACGGACGAGCCAGATTCAAAACTAAAGC
CTACTGGAGCCAACATCAAGGCTGCTTTACGTAGGATAGTGGACAAAGCTCAAACCGGAT
CTGAAAACGTCTTGTTCTTCCACTATAGTGGCCATGGAACTCGGATTCCTTCGGTTAAAC
CTGCTCGTCCTTTTAAACAAGACGAAGCTATAGTTCCTTGTGATTTCAATCTCATCACAG
ATGTTGATTTCAGAGAACTTGTTAATCAACTTCCCAAGGGAACGAGCTTTACCATGATCT
CAGATTCTTGCCACAGTGGTGGTCTCATTGATAAGGAGAAAGAACAAATCGGACCCTTCT
CTGGAGTTAGATCTCCGGCCATGGAGACAACGACGACAATAACATCACGTGCCTTACCCT
ACAAGGAGGTTCTCGACCACTTGAGTTCTCGCACCGGAATCTCAACTTCAGACATCGGTA
CACAC*TACTGGAGCTCTTTGGTAGCGAC

QA 3 751 3 751
DS 

RD RR2B931TF 833 0 0
GGGCACTTCAACCGAAAAGCTAATAAACAACAAAAAAAACATATTTTGTGGCCTATAAAG
TTGTTTAAATTCCACTCTATAAACCCTAACGAATCACATCTAGCTAGAGAATCAATGGAT
AACCAAGAAGTTGTCAAGAGAAGACTAGCCGTTCTCGTTGGCTGCAACTACCCTAACACA
AAGAACGAGCTTCACGGCTGCGTCAACGATGTTTTAGCCATGCAAGAAGCTCTTCTAACC
CGTTTCGGATTCAAACAAGAAGACATGGAGGTGCTAACGGACGAGCCAGACTCAAAGCTA
AAGCCTACTGGAGCCAACATCAAGGCTGCTTTACGTAGGATGGTGGACAAAGCTCAAACC
GGATCTGAAAACGTCTTGTTCTTCCACTATAGTGGCCATGGAACTCGGATTCCTTCGGTT
AAACCTGCTCGTCCTTTTAAACAAGACGAAGCTATAGTTCCTTGTGATTTCAATCTCATC
ACAGATGTCGATTTCAGAGAACTTGTTAATCAACTTCCCAAGGGAACGAGCTTTACCATG
ATCTCAGATTCTTGCCACAGTGGTGGTCTCATTGATAAGGAGAAAGAACAAATCGGACCC
TTCTCTGGAGTTAGATCTCCGGCCATGGAGACAACGACGACAATAACATCACGTGCCTTA
CCCTACAAGGAGGTTCTCGACCACTTGAGTTCTCGCACCGGAATCTCAACTTCAGACATC
GGTACACACCTACTGGAGCTCTTTGGTAGCGACGCCGGTCTAAAGTTCCCGGCTACCGGC
TATGGATTTGATGGAACTTTTGGAGAACATGAAG*CGCGTGAAAGAC
GTTGAC

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2B931JQ 767 0 0
AGCTATAGTTCCTTGTGATTTCAATCTCATCACAGATGTCGATTTCAGAGAACTTGTTAA
TCAACTTCCCAAGGGAACGAGCTTTACCATGATCTCAGATTCTTGCCACAGTGGTGGTCT
CATTGATAAGGAGAAAGAACAAATCGGACCCTTCTCTGGAGTTAGATCTCCGGCCATGGA
GACAACGACGACAATAACATCACGTGCCTTACCCTACAAGGAGGTTCTCGACCACTTGAG
TTCTCGCACCGGAATCTCAACTTCAGACATCGGTACACACCTACTGGAGCTCTTTGGTAG
CGACGCCGGTCTAAAGTTCC*GGCTACCGGCTATGGATTTGATGGAACTTTTGGAGAACA
TGAAGGCGCGTGAAAGAC**GTTGACTCAGGGATACTGTTGAGCGGGTGTCAGGCCGATG
AAACGTCTGCTGACGTTGTAAGTGGCGGTGGGAAGGCGTATGGAGCGTTTAGCAACGCGA
TTCAGACGGTTCTGAAGGAAAACGGAGGTGCCTTGAAGAACAAGGAACTAGTGATAATGG
CAAGAGAAGTGCTTGAGAGACTAGGGTTTCAGCAACACCCTTGTCTTTACTGCAGCGACC
AGAACGCGGACGCAACGTTCCTGTCTCAACCTTGATGCGATTATATTTAATGAATAAAAG
CGTTGTCGTTGTGTTTCTTTTATTTGTGTTTGATGTGTATTTTCACTCTTTCATGGTGTG
TGTGTTCCATAATTAAAAGGAAGAATAAATTGCTACGAATTTAAAAC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2FG64JQ 726 0 0
CACAGATGTTGATTTCAGAGAACTTGTTAATCAACTTCCCAAGGGAACGAGCTTTACCAT
GATCTCAGATTCTTGCCACAGTGGTGGTCTCATTGATAAGGAGAAAGAACAAATCGGACC
CTTCTCTGGAGTTAGATCTCCGGCCATGGAGACAACGACGACAATAACATCACGTGCCTT
ACCCTACAAGGAGGTTCTCGACCACTTGAGTTCTCGCACCGGAATCTCAACTTCAGACAT
CGGTACACACCTACTGGAGCTCTTTGGTAGCGACGTCGGTCTAAAGTTCC*GGCTACCGG
CTATGGATTTGATGGAACTTTTGGAGAACATGAAGGCGCGTGAAAGACACGTTGACTCAG
GGATACTGTTGAGCGGGTGTCAGGCCGATGAAACGTCTGCTGACGTTGTAAGTGGCGGTG
GGAAGGCGTATGGAGCGTTTAGCAACGCGATTCAGACGGTTCTGAAGGAAAACGGAGGTG
CCTTGAAGAACAAGGAACTAGTGATAATGGCAAGAGAAGTGCTTGAGAGACTAGGGTTTC
AGCAACACCCTTGTCTTTACTGCAGCGACCAGAACGCGGACGCAACGTTCCTGTCTCAAC
CTTGATGCGATTATATTTAATGAATAAAAGCGTTGTCGTTGTGTTTCTTTTATTTGTGTT
TGATGTGTATTTTCACTCTTTCATGGTGTGTGTGTTCCATAATTAAAAGGAAGAATAAAT
TGCTAC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 4

CO CL2634Contig1 770 4 48 U
GGAGATTCGCTGTCTTAAATTTCACTAACCTCTCATCTCTCTCTCTCACTTGTACGTCTT
CTCTTTGGCAAAAATGGCGAAACTAGCGATGCTGATGGCTCTCTGTATCTTGCCGGCGAT
AGCCATGGCGACGAAGGTGCCACGTATCGGTAAGAACACGTTGGTGGTTCAAGGTATCAC
TTACTGCGACACTTGCAAGTTCGGCTTCGAGACTGCTGAATCCTCCTACCCCGTCCCCGG
TGCGACGGTGAAGCTTTCGTGCAGAGACAGGAAGACAATGAAAGAGTTATACACAGACGT
GGCTGTATCAAACAGGAAGGGAAAGTACATGTTCGTTGTCCACGAGGACCATAAAGACGA
GATGTGCGATGTGATGCTCGTTAAAAGCTCAGACAAGGGTTGTTCTAAAATCTCTAAGGG
ACGTGAACAGTCGCGTGTGATATTGAACCATTACAATGGCATTGCGTCGCAGATCAGGCA
CGCTAACAACATGGGGTTTGAGAAAGATGTTTCGGATGTGTTTTGCTCTGAGTTGATTAA
GAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAGGTTTAGAGAGACCCATCTTTAATCAGTGTCATTAT
GGTCTGTTGTTTTTTCTATTTGGTTATGGGAGAGATATATTTGTATTTTCTTGATATAAT
ATTATTTGTTCTTAGATGATGATGATGACTCCAGTGATGGGAATTCTTGTTTGTGTAAGT
TTCTTCTATTGATGATATATGTTCACTTCCCTTGCTTGGGAAGTGTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AI64TF U 1
AF RR2FF58TF U 7
AF RR2C275JQ C 35
AF RR2C275TF U 35
BS 1 44 RR2AI64TF
BS 45 45 RR2C275TF
BS 46 47 RR2AI64TF
BS 48 48 RR2C275TF
BS 49 67 RR2AI64TF
BS 68 68 RR2C275TF
BS 69 98 RR2AI64TF
BS 99 99 RR2C275TF
BS 100 105 RR2AI64TF
BS 106 106 RR2C275TF
BS 107 130 RR2AI64TF
BS 131 132 RR2C275TF
BS 133 186 RR2AI64TF
BS 187 187 RR2C275TF
BS 188 204 RR2AI64TF
BS 205 205 RR2C275TF
BS 206 256 RR2AI64TF
BS 257 258 RR2C275TF
BS 259 280 RR2AI64TF
BS 281 281 RR2C275TF
BS 282 321 RR2AI64TF
BS 322 322 RR2C275TF
BS 323 372 RR2AI64TF
BS 373 373 RR2C275TF
BS 374 378 RR2AI64TF
BS 379 379 RR2C275TF
BS 380 381 RR2AI64TF
BS 382 382 RR2C275TF
BS 383 414 RR2AI64TF
BS 415 415 RR2C275TF
BS 416 420 RR2AI64TF
BS 421 421 RR2C275TF
BS 422 465 RR2AI64TF
BS 466 466 RR2C275TF
BS 467 498 RR2AI64TF
BS 499 499 RR2C275TF
BS 500 513 RR2AI64TF
BS 514 514 RR2C275TF
BS 515 597 RR2AI64TF
BS 598 598 RR2C275TF
BS 599 612 RR2AI64TF
BS 613 614 RR2C275TF
BS 615 616 RR2AI64TF
BS 617 617 RR2C275TF
BS 618 676 RR2AI64TF
BS 677 682 RR2FF58TF
BS 683 743 RR2C275TF
BS 744 770 RR2C275JQ

RD RR2AI64TF 676 0 0
GGAGATTCGCTGTCTTAAATTTCACTAACCTCTCATCTCTCTCTGTCGCTTGTACGTCTT
CTCTTTG*CAAAAATGGCGAAACTAGCGATGCTGATGGTTCTCTGCATCTTGCCGGCGAT
AGCCATGGCGGGGAAGGTGCCACGTATCGGTAAGAACACGTTGGTGGTTCAAGGTATCAC
TTACTGTGACACTTGCAAGTTCGGGTTCGAGACTGCTGAATCCTCCTACCCCGTCCCCGG
TGCGACGGTGAAGCTTGTGTGCAGAGACAGGAAGACAATGGAAGAGTTATACACAGACGT
GGCTGTATCAAACAGGAAGGGGAAGTACATGTTCGTTGTCCACGAGGACCATAAAGACGA
GATGTGCGATGTTATGCTTGTCAAAAGCTCAGACAAGGGTTGTTCTAAAATCTCGAAGGG
GCGTGAACAGTCGCGTGTGATATTGAACCATTACAATGGCATTGCCTCGCAGATCAGGCA
CGCTAACAACATGGGGTTCGAGAAAGATGTTTCTGATGTGTTTTGCTCTGAGTTGATTAA
GAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAGGTTTAGAGAGACCCATCTTTAATCAGTGTCATGAT
GGTCTGTTGTTT**TCAATTTGGTTATGGGAGAGATATATTTGTATTTTCTTGATATAAT
ATTATTTGTTCTTAGA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2FF58TF 693 0 0
TCGCTGTCTTAAATTTCACTAACCTCTCATCTCTCTCTGTCGCTTGTACGTCTTCTCTTT
G*CAAAAATGGCGAAACTAGCGATGCTGATGGTTCTCTGCATCTTGCCGGCGATAGCCAT
GGCGGGGAAGGTGCCACGTATCGGTAAGAACACGTTGGTGGTTCAAGGTATCACTTACTG
TGACACTTGCAAGTTCGGGTTCGAGACTGCTGAATCCTCCTACCCCGTCCCCGGTGCGAC
GGTGAAGCTTGTGTGCAGAGACAGGAAGACAATGGAAGAGTTATACACAGACGTGGCTGT
ATCAAACAGGAAGGGGAAGTACATGTTCGTTGTCCACGAGGACCATAAAGACGAGATGTG
CGATGTTATGCTTGTCAAAAGCTCAGACAAGGGTTGTTCTAAAATCTCGAAGGGGCGTGA
ACAGTCGCGTGTGATATTGAACCATTACAATGGCATTGCCTCGCAGATCAGGCACGCTAA
CAACATGGGGTTCGAGAAAGATGTTTCTGATGTGTTTTGCTCTGAGTTGATTAAGAAGTA
TCAGGTTGATGAAGATGAGGTTTAGAGAGGCCCATCTTTAATCAGTGTCATGATGGTCTG
TTGTTT**TCAATTTGGTTATGGGAGAGATATATTTGTATTTTCTTGATATAATATTATT
TGTTCTTAGATGATGA
AAGAAGAACTAATATAC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2C275JQ 736 0 0
GGA
TCTCTCTCTCACTTGTACGTCTTCTCTTTGGCAAAAATGGCGAAACTAGCGATGCTGATG
GCTCTCTGTATCTTGCCGGCGATAGCCATGGCGACGAAGGTGCCACGTATCGGTAAGAAC
ACGTTGGTGGTTCAAGGTATCACTTACTGCGACACTTGCAAGTTCGGCTTCGAGACTGCT
GAATCCTCCTACCCCGTCCCCGGTGCGACGGTGAAGCTTTCGTGCAGAGACAGGAAGACA
ATGAAAGAGTTATACACAGACGTGGCTGTATCAAACAGGAAGGGAAAGTACATGTTCGTT
GTCCACGAGGACCATAAAGACGAGATGTGCGATGTGATGCTCGTTAAAAGCTCAGACAAG
GGTTGTTCTAAAATCTCTAAGGGACGTGAACAGTCGCGTGTGATATTGAACCATTACAAT
GGCATTGCGTCGCAGATCAGGCACGCTAACAACATGGGGTTTGAGAAAGATGTTTCGGAT
GTGTTTTGCTCTGAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAGGTTTAGAGAGAC
CCATCTTTAATCAGTGTCATTATGGTCTGTTGTTTTTTCTATTTGGTTATGGGAGAGATA
TATTTGTATTTTCTTGATATAATATTATTTGTTCTTAGATGATGATGATGACTCCAGTGA
TGGGAATTCTTGTTTGTGTAAGTTTCTTCTATTGATGATATATGTTCACTTCCCTTGCTT
GGGAAGTGTCTTC

QA 4 736 4 736
DS 

RD RR2C275TF 709 0 0
GGA
TCTCTCTCTCACTTGTACGTCTTCTCTTTGGCAAAAATGGCGAAACTAGCGATGCTGATG
GCTCTCTGTATCTTGCCGGCGATAGCCATGGCGACGAAGGTGCCACGTATCGGTAAGAAC
ACGTTGGTGGTTCAAGGTATCACTTACTGCGACACTTGCAAGTTCGGCTTCGAGACTGCT
GAATCCTCCTACCCCGTCCCCGGTGCGACGGTGAAGCTTTCGTGCAGAGACAGGAAGACA
ATGAAAGAGTTATACACAGACGTGGCTGTATCAAACAGGAAGGGAAAGTACATGTTCGTT
GTCCACGAGGACCATAAAGACGAGATGTGCGATGTGATGCTCGTTAAAAGCTCAGACAAG
GGTTGTTCTAAAATCTCTAAGGGACGTGAACAGTCGCGTGTGATATTGAACCATTACAAT
GGCATTGCGTCGCAGATCAGGCACGCTAACAACATGGGGTTTGAGAAAGATGTTTCGGAT
GTGTTTTGCTCTGAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAGGTTTAGAGAGAC
CCATCTTTAATCAGTGTCATTATGGTCTGTTGTTTTTTCTATTTGGTTATGGGAGAGATA
TATTTGTATTTTCTTGATATAATATTATTTGTTCTTAGATGATGATGATGACTCCAGTGA
TGGGAATTCTTGTTTGTGTAAGTTTCTTCTATTGATGATATATGTT

QA 4 709 4 709
DS 



AS 1 2

CO CL2635Contig1 748 2 2 U
ATTCACAACTATAATAACCAAACAAATCTCATAAGGCAGAGGGTTTTACGATCACTCCGA
CAAAATATGAAAGAAAGGAAATCTGCCAAGTTGAATCATCAAGACAACGATGAACAACTG
ATCCACCACGAAAACAGTCACCTGGGTTCCTTCAAATTCGCCAAATTGTTCGACTCAGAA
GCTTCCTGGGACAAGGATCAACTAGGAGATGTGTTGCATTGGATCAGGCAAGTGGTTGGG
TTGCTCTGCGGATTGGTTTGGGGTGCTATACCTTTGGTTGGTGGCATTTGGTTACTTCTG
TTTCTGGCGATCTCCTCAGGCATAGTATATGGTTACTATGCGTTGATTCTAAAGGTTGAT
GAAGAAGACTATGGGGGTCATGCAGCTCTGCTCCAGGATGGGTTATTTGCTTCTCTAAGT
GTATTCCTGCTTGCGTGGATTCTGGTGTATAGCTTGTCTAGCTTCTGATAGAGACACTAC
TGTCTTGCGCTTCAGTGTTGCTTTAGCTTCTGCTCGGAAGAAGTATAGAAGAATGTGCCT
TTCATGGTTTCTCCGATTACAGTCTTCTTTTACGCTGCTCTTGATGCTTTTGTGTGTTTA
TTAAGATGGGAACTAGCATTGGTAGATCTTGCGGGTTTGCTTTAGTTTTGTCTACTATTT
TCTTTTTTTTCAAAAACTAAACCAAGTATTATATGAATTTATGCTACAAAATGGTAATTT
TTTCCAGGGTTTATCTTATATTTTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR02TF U 1
AF RR2CR02JQ C 21
BS 1 659 RR2CR02TF
BS 660 748 RR2CR02JQ

RD RR2CR02TF 671 0 0
ATTCACAACTATAATAACCAAACAAATCTCATAAGGCAGAGGGTTTTACGATCACTCCGA
CAAAATATGAAAGAAAGGAAATCTGCCAAGTTGAATCATCAAGACAACGATGAACAACTG
ATCCACCACGAAAACAGTCACCTGGGTTCCTTCAAATTCGCCAAATTGTTCGACTCAGAA
GCTTCCTGGGACAAGGATCAACTAGGAGATGTGTTGCATTGGATCAGGCAAGTGGTTGGG
TTGCTCTGCGGATTGGTTTGGGGTGCTATACCTTTGGTTGGTGGCATTTGGTTACTTCTG
TTTCTGGCGATCTCCTCAGGCATAGTATATGGTTACTATGCGTTGATTCTAAAGGTTGAT
GAAGAAGACTATGGGGGTCATGCAGCTCTGCTCCAGGATGGGTTATTTGCTTCTCTAAGT
GTATTCCTGCTTGCGTGGATTCTGGTGTATAGCTTGTCTAGCTTCTGATAGAGACACTAC
TGTCTTGCGCTTCAGTGTTGCTTTAGCTTCTGCTCGGAAGAAGTATAGAAGAATGTGCCT
TTCATGGTTTCTCCGATTACAGTCTTCTTTTACGCTGCTCTTGATGCTTTTGTGTGTTTA
TTAAGATGGGAACTAGCATTGGTAGATCTTGCGGGTTTGCTTTAGTTTTGTCTACTATT
TTCTTTTTTTCA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2CR02JQ 728 0 0
AACAAATCTCATAAGGCAGAGGGTTTTACGATCACTCCGACAAAATATGAAAGAAAGGAA
ATCTGCCAAGTTGAATCATCAAGACAACGATGAACAACTGATCCACCACGAAAACAGTCA
CCTGGGTTCCTTCAAATTCGCCAAATTGTTCGACTCAGAAGCTTCCTGGGACAAGGATCA
ACTAGGAGATGTGTTGCATTGGATCAGGCAAGTGGTTGGGTTGCTCTGCGGATTGGTTTG
GGGTGCTATACCTTTGGTTGGTGGCATTTGGTTACTTCTGTTTCTGGCGATCTCCTCAGG
CATAGTATATGGTTACTATGCGTTGATTCTAAAGGTTGATGAAGAAGACTATGGGGGTCA
TGCAGCTTTGCTCCAGGATGGGTTATTTGCTTCTCTAAGTGTATTCCTGCTTGCGTGGAT
TCTGGTGTATAGCTTGTCTAGCTTCTGATAGAGACACTACTGTCTTGCGCTTCAGTGTTG
CTTTAGCTTCTGCTCGGAAGAAGTATAGAAGAATGTGCCTTTCATGGTTTCTCCGATTAC
AGTCTTCTTTTACGCTGCTCTTGATGCTTTTGTGTGTTTATTAAGATGGGAACTAGCATT
GGTAGATCTTGCGGGTTTGCTTTAGTTTTGTCTACTATTTTCTTTTTTTTCAAAAACTAA
ACCAAGTATTATATGAATTTATGCTACAAAATGGTAATTTTTTCCAGGGTTTATCTTATA
TTTTGGTC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 4

CO CL2636Contig1 731 4 3 U
TTTTTAACAAATTATAGTTAGATCTATTTCAAAATAAGTTGAGGGAAAAGAATAATAAAA
CATGGCCAAGATCTCCTTTGTGCTTCTCCTTCTCGCTCTTATTGTCTTTCTACATGTCTC
TGAGGCTCAACGTTCGACAGATAAAGACGAAAAAGTAACTGAAAACGACATAGGCAAAGA
AACAGATAAAGATGAAAAAATACTTGAAAACGAACAAGACAAAGAAAGAGATAAAGGCGA
AAAAGTAGTTGAAAACGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGAAAGAGATAAAGAGGAAAA
AGTACTTGAAGAGGACCTTGATGAAGCCAAAAGCCTGATCGCAGAGGATTTGAAAGAAAA
GAAAGCCAACCTTAAGAACTTGGAAACCGAGGTGAATGTGTTAACCAAATCTGAGACGGC
GTTGGATGAGCTCGGAGAAGCTCACAAAAAGGGTGAGAGTCTAAAACCTTATGAGAAAAA
GCTTAAGAAATTCAACAGAAAGCTTAAGCGGACACCAAAGAAAAAGAGATATGGCATAAT
TCAGAGCATTTTGAAGGATTTGGGATTAAACAGAGGGAGATACTGAAACATGAACTAGGG
TTTCATGAACGTTATAAGGAGGTTTCATATTGGGCCCATGAAGTTTGGCTTTGCAAATGA
GAGGAGCTAATAATTTACCCATTGTATGTATATATTTTAATTGCACATAAATTTAATATT
AAATCTGATAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO27TF U 1
AF RR2FL49TF U 24
AF RR2FL49JQ C 435
AF RR2DO27JQ C 1
BS 1 525 RR2DO27TF
BS 526 647 RR2FL49TF
BS 648 731 RR2DO27JQ

RD RR2DO27TF 525 0 0
TTTTTAACAAATTATAGTTAGATCTATTTCAAAATAAGTTGAGGGAAAAGAATAATAAAA
CATGGCCAAGATCTCCTTTGTGCTTCTCCTTCTCGCTCTTATTGTCTTTCTACATGTCTC
TGAGGCTCAACGTTCGACAGATAAAGACGAAAAAGTAACTGAAAACGACATAGGCAAAGA
AACAGATAAAGATGAAAAAATACTTGAAAACGAACAAGACAAAGAAAGAGATAAAGGCGA
AAAAGTAGTTGAAAACGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGAAAGAGATAAAGAGGAAAA
AGTACTTGAAGAGGACCTTGATGAAGCCAAAAGCCTGATCGCAGAGGATTTGAAAGAAAA
GAAAGCCAACCTTAAGAACTTGGAAACCGAGGTGAATGTGTTAACCAAATCTGAGACGGC
GTTGGATGAGCTCGGAGAAGCTCACAAAAAGGGTGAGAGTCTAAAACCTTATGAGAAAAA
GCTTAAGAAATTCAACAGAAAGCTTAAGCGGACACCAAAGAAAAA

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2FL49TF 624 0 0
GG
ATTTCAAAATAAGTTGAGGGAAAAGAATAATAAAACATGGCCAAGATCTCCTTTGTGCTT
CTCCTTCTCGCTCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCAACGTTCGACAGATAAA
GACGAAAAAGTAACTAAAAACGACATAGGCAAAGAAACAGATAAAGAAAAAAAAATACTT
GAAAACGAACAAGACAAAGAAAGAGATAAAGGCGAAAAAGTAGTTGAAAACGACAAAGAC
AAAGACAAAGACAAAGAAAGAGATAAAGAGGAAAAAGTACTTGAAGAGGACCTTGATGAA
GCCAAAAGCCTGATCGCAGAGGATTTGAAAGAAAAGAAAGCCAACCTTAAGAACTTGGAA
ACCGAGGTGAATGTGTTAACCAAATCTGAGACGGCGTTGGATGAGCTCGGAGAAGCTCAC
AAAAAGGGTGAGAGTCTAAAACCTTATGAGAAAAAGCTTAAGAAATTCAACAGAAAGCTT
AAGCGGACACCAAAGAAAAAGAGATATGGCATAATTCAGAGCATTTTGAAGGATTTGGGA
TTAAACAGAGGGAGATACTGAAACATGAACTAGGGTTTCATGAACGTTATAAGGAGGTTT
CATATTGGGCCCATGAAGTTTG

QA 3 624 3 624
DS 

RD RR2FL49JQ 262 0 0
GAGAAGCTCACAAAAAGGGTGAGAGTCTAAAACCTTATGAGAAAAAGCTTAAGAAATTCA
ACAGAAAGCTTAAGCGGACACCAAAGAAAAAGAGATATGGCATAATTCAGAGCATTTTGA
AGGATTTGGGATTAAACAGAGGGAGATACTGAAACATGAACTAGGGTTTCATGAACGTTA
TAAGGAGGTTTCATATTGGGCCCATGAAGTTTGGCTTTGCAAATGAGAGGAGCTAATAAT
TTACCCATTGTATGTATATATT

QA 1 262 1 262
DS 

RD RR2DO27JQ 731 0 0
TTTTTAACAAATTATAGTTAGATCTATTTCAAAATAAGTTGAGGGAAAAGAATAATAAAA
CATGGCCAAGATCTCCTTTGTGCTTCTCCTTCTCGCTCTTATTGTCTTTCTACATGTCTC
TGAGGCTCAACGTTCGACAGATAAAGACGAAAAAGTAACTGAAAACGACATAGGCAAAGA
AACAGATAAAGATGAAAAAATACTTGAAAACGAACAAGACAAAGAAAGAGATAAAGGCGA
AAAAGTAGTTGAAAACGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGAAAGAGATAAAGAGGAAAA
AGTACTTGAAGAGGACCTTGATGAAGCCAAAAGCCTGATCGCAGAGGATTTGAAAGAAAA
GAAAGCCAACCTTAAGAACTTGGAAACCGAGGTGAATGTGTTAACCAAATTTGAGACGGC
GTTGGATGAGCTCGGAGAAGCTCACAAAAAGGGTGAGAGTCTAAAACCTTATGAGAAAAA
GCTTAAGAAATTCAACAGAAAGCTTAAGCGGACACCAAAGAAAAAGAGATATGGCATAAT
TCAGAGCATTTTGAAGGATTTGGGATTAAACAGAGGGAGATACTGAAACATGAACTAGGG
TTTCATGAACGTTATAAGGAGGTTTCATATTGGGCCCATGAAGTTTGGCTTTGCAAATGA
GAGGAGCTAATAATTTACCCATTGTATGTATATATTTTAATTGCACATAAATTTAATATT
AAATCTGATAG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 3

CO CL2637Contig1 1167 3 4 U
GTCATCTATTAGATTAATAGAAAGTTCAAGCATGAACTTACACACAAAGTCAGCAAAGGT
ATACTACCTTTCTGAAACCATAAGCCGGCGTAGATACAAGTTACTACCCGGAAACAAAGA
CTGAAGCAGACACTTACCACAACAAACTAGTTTAAACTAACAGGAACAAGATAGCTAAGC
GCCAAAGGAGAAGCAATAATACAATCGAGAAAGGAGAAGCAACCAGCACTTGAAGCAGGA
TTGATCGAAAAAGCGTAGCAGGCCCATATTATTGGGGTTGAAGGAGGAACCACGAACAAA
CACCACACTTACCTTTGCTTCACCTCAAAGAAGCCAAGAACCATCAAATTCCAACCCGAG
CAGCCAACGAAGAAACAGGTTTGGCTATCGACTACTCCAAGACCTCACGCGATTGAGCAT
AAGCTCCACAGTCCCTTACCAAGTAATCCGGAAGAACCCGTCGGTTGCAGACCAAGGGAC
AGCACAACTTCACAACACTGGCACTTCACCCACGCAGCTCCGAGAGAAGACACCCTCCAC
ACTTGCCGCAAGACCATACAAGCTCCCAGGCGCTTAAGAAATCTGATTCACATATTAGAA
CTAGGACCACGAAGATATAAAAACAGAGCAAAGAAGGCTTTTGATGCATAAACGAAAGGG
CCGAGCTGGAGAAACTAGCATAGCGCACCATCACTGACCAATCAATCCGATAGAAACACA
GACACACGCTCTCACAACAAAGCCTTTCAAAAACATCAGAAGCCCCACAACAGACCTAAG
AATTAAATTAAAAGATCAACCGAAGCTCAACACCAACTTTATGGCCAGAAGCGGGAGAAA
TCAGAAAGTATACAACTATAGAGCTTCACCGGAGACGGGATCTACCCATCGCAACCGCAC
CGAAGCCATCCAGCCCTATACCGTTCCCCATCTGAACAAAGGCAAGCATGAACCAACCAT
CACTTACCCTAAGCTCAGATCTGAATCCACAGTGAACAGATGATGTCGGAAGCTTGTGAT
TGACACCGAAAGGGACTAAAGACAGATACGACGGGACCGCTCCCGGCGGCGGTGAGATCC
ACCGACCACCGGAGCAGCAGGCAAACGGACGGCGACTTCTTTCTTCTTCTAGGGTTTTAA
ATTCTTTATTCCTCAAAATTTTCTCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP71JQ U 1
AF RR2C330JQ U 1
AF RR2C330TF C 411
BS 1 262 RR2C330JQ
BS 263 263 RR2GP71JQ
BS 264 748 RR2C330JQ
BS 749 1167 RR2C330TF

RD RR2GP71JQ 623 0 0
GTCATCTATTAGATTAATAGAAAGTTCAAGCATGAACTTACACACAAAGTCAGCAAAGGT
ATACTACCTTTCTGAAACCATAAGCCGGCGTAGATACAAGTTACTACCCGGAAACAAAGA
CTGAAGCAGACACTTACCACAACAAACTAGTTTAAACTAACAGGAACAAGATAGCTAAGC
GCCAAAGGAGAAGCAATAATACAATCGAGAAAGGAGAAGCAACCAGCACTTGAAGCAGGA
TTGATCGAAAAAGCGTAGCAGGCCCATATTATTGGGGTTGAAGGAGGAACCACGAACAAA
CACCACACTTACCTTTGCTTCACCTCAAAGAAGCCAAGAACCATCAAATTCCAACCCGAG
CGGCCAACGAAGATACAGGTTTGGCTATCGACTACTCCAAGACCTCACGCGATTGAGCAT
AAGCTCCACAGTCCCTTACCAAGTAATCCGGAAGAACCCGTCGGTTGCAGACCAAGGGAC
AGCACAACTTCACAACACTGGCACTTCACCCACGCAGCTCCGAGAGAAGACACCCTCCAC
ACTTGCCGCAAGACCATACAAGCTCCCAGGCGCTTAAGAAATCTGATTCACATATTAGAA
CTAGGACCACGAAGATATAAAAA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2C330JQ 748 0 0
GTCATCTATTAGATTAATAGAAAGTTCAAGCATGAACTTACACACAAAGTCAGCAAAGGT
ATACTACCTTTCTGAAACCATAAGCCGGCGTAGATACAAGTTACTACCCGGAAACAAAGA
CTGAAGCAGACACTTACCACAACAAACTAGTTTAAACTAACAGGAACAAGATAGCTAAGC
GCCAAAGGAGAAGCAATAATACAATCGAGAAAGGAGAAGCAACCAGCACTTGAAGCAGGA
TTGATCGAAAAAGCGTAGCAGGTCCATATTATTGGGGTTGAAGGAGGAACCACGAACAAA
CACCACACTTACCTTTGCTTCACCTCAAAGAAGCCAAGAACCATCAAATTCCAACCCGAG
CAGCCAACGAAGAAACAGGTTTGGCTATCGACTACTCCAAGACCTCACGCGATTGAGCAT
AAGCTCCACAGTCCCTTACCAAGTAATCCGGAAGAACCCGTCGGTTGCAGACCAAGGGAC
AGCACAACTTCACAACACTGGCACTTCACCCACGCAGCTCCGAGAGAAGACACCCTCCAC
ACTTGCCGCAAGACCATACAAGCTCCCAGGCGCTTAAGAAATCTGATTCACATATTAGAA
CTAGGACCACGAAGATATAAAAACAGAGCAAAGAAGGCTTTTGATGCATAAACGAAAGGG
CCGAGCTGGAGAAACTAGCATAGCGCACCATCACTGACCAATCAATCCGATAGAAACACA
GACACACGCTCTCACAACAAAGCCTTTC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2C330TF 757 0 0
CGA
TGAGCATAAGCTCCACAGTCC*TTACCAAGTAT**CGGAAGAACCCGTCGGTTGCAGACC
AAGGGACAGCACAACTTCACAACACTGGCACTTCACCCACGCAGCTCCGAGAGAAGACAC
CCTCCACACTTGCCGCAAGACCATACAAGCTCCCAGGCGCTTAAGAAATCTGATTCACAT
ATTAGAACTAGGACCACGAAGATATAAAAACAGAGCAAAGAAGGCTTTTGATGCATAAAC
GAAAGGGCCGAGCTGGAGAAACTAGCATAGCGCACCATCACTGACCAATCAATCCGATAG
AAACACAGACACACGCTCTCACAACAAAGCCTTTCAAAAACATCAGAAGCCCCACAACAG
ACCTAAGAATTAAATTAAAAGATCAACCGAAGCTCAACACCAACTTTATGGCCAGAAGCG
GGAGAAATCAGAAAGTATACAACTATAGAGCTTCACCGGAGACGGGATCTACCCATCGCA
ACCGCACCGAAGCCATCCAGCCCTATACCGTTCCCCATCTGAACAAAGGCAAGCATGAAC
CAACCATCACTTACCCTAAGCTCAGATCTGAATCCACAGTGAACAGATGATGTCGGAAGC
TTGTGATTGACACCGAAAGGGACTAAAGACAGATACGACGGGACCGCTCCCGGCGGCGGT
GAGATCCACCGACCACCGGAGCAGCAGGCAAACGGACGGCGACTTCTTTCTTCTTCTAGG
GTTTTAAATTCTTTATTCCTCAAAATTTTCTCCC

QA 4 757 4 757
DS 



AS 1 4

CO CL2638Contig1 1214 4 4 U
GAGTCGTAATCGTCGTCACTGTTCTCGAGATTCTCTCTGTGTTCGATACTCTCTCTCTCG
TTTTTCATTCCTCGGATTAGCTTTTTTTCT*TTTTTTTGTTGTTGTCTGGATCGAAGAAG
GATGGTATCTGATAGCAAATCTGACCTTTCATTGCCTAAAACATTCGCCTGCAGTGCTTT
CGCTGCCTGCGTCGGCGAGGTATGTACGATTCCATTGGACACTGCGAAAGTGAGGCTTCA
GCTCCAAAAGTCTGCCATTGCTGGAGATGTTACTCTCCCTAAGTATCGTGGATTGCTCGG
GACTGTTGGTACCATAGCAAGGGAAGAAGGGCTTCGTTCACTATGGAAAGGTGTTGTTCC
TGGCTTGCATCGTCAATGCCTCTTTGGAGGTCTTAGGATCGGAATGTATGAGCCGGTCAA
AAACTTGTACGTTGGGAAAGACCATGTAGGCGATGTTCCTTTGAGCAAGAAGATCCTTGC
TGGTTTGACCACAGGTGCTCTGGGTATCATGGTAGCCAATCCCACTGATCTTGTGAAAGT
TAGACTTCAGGCTGAAGGGAAACTAGCTGCAGGTGTGCCAAGACGGTATACTGGATCTTT
GAATGCCTATTCAACCATTGTCAGACAAGAAGGAGTCAGAGCACTTTGGACTGGTCTTGG
ACCTAATGTTGCTAGAAACGCAATCATCAATGCTGCTGAATTAGCGAGTTACGATCAAGT
GAAGCAGACAATCTTGAAGATTCCGGGGTTCACTGATAACATTGTCACGCATATTTTATC
TGGACTGGGAGCAGGATTCTTTGCTGTCTGCATTGGTTCCCCTGTCGACGTGGTTAAGTC
GAGAATGATGGGAGATCCTTCTTACAAAGGCACTATCGACTGCTTCGTCAAAACTCTGAA
GGCTGACGGTCCTATGGCATTTTACAAGGGTTTCATCCCCAACTTTGGACGCCTTGGCTC
ATGGAACGTCATCATGTTTTTGACCCTTGAACAGGCAAAGAAGTATGTCCGGGAACTAGA
ATCGTCCAATAAATAATAGTAAGACGAAATAATATTTTTATGCAGAGAATAAAAACAACA
TTGTTTTCTTCTTAATTTCGGTGATCGAGAGAGAGAGGCCAAGAACATCATCGAATATTG
TTTTGGAATGGAGACCTGATTTCAAGCAAACTGTGAAATAAATTTCTATGGGTGGCTGTA
CCATTCAAACAATC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DE23TF U 4
AF RR2CW41TF U 27
AF RR2DN57TF U 1
AF RR2DE23JQ C 512
BS 1 90 RR2DN57TF
BS 91 91 RR2DE23TF
BS 92 730 RR2DN57TF
BS 731 1214 RR2DE23JQ

RD RR2DE23TF 543 0 0
GG
GTAATCGTCGTCACTGTTCTCGAGATTCTCTCTGTGTTCGATACTCTCTCTCTCGTTTTT
CATTCCTCGGATTAGCTTTTTTTCT*TTTTTTTGTTGTTGTCTGGATCGAAGAAGGATGG
TATCTGATAGCAAATCTGACCTTTCAGTGCCTAAAACATTCGCCTGCAGTGCTTTCGCTG
CCTGCGTCGGCGAGGTATGTACGATTCCATTGGACACTGCGAAAGTGTGGCTTCAGCTCC
AAAAGTCTGCCATTGCTGGAGATGTTACTCTCCCTAAGTATCGTGGATTGCTCGGGACTG
TTGGTACCATAGCAAGGGAAGAAGGGCTTCGTTCACTATGGAAAGGTGTTGTTCCTGGCT
TGCATCGTCAATGCCTCTTTGGAGGTCTTAGGATCGGAATGTGTGAGCCGGTCAAAAACT
TGTACGTTGGGAAAGACCATGTAGGCGATGTTCCTTTGAGCAAGAAGATCCTTGCTGGTT
TGACCACAGGTGCTCTGGGTATCATGGTAGCCAATCCCACTGATCTTGTGAAAGTTAGAC
T

QA 3 543 3 543
DS 

RD RR2CW41TF 676 0 0
GG
GATTCTCTCTGTGTTCGATACTCTCTCTCTCGTTTTTCATTCCTCGGATTAGCTTTTTTT
CT*TTTTTTTGTTGTTGTCTGGATCGAAGAAGGATGGTATCTGATAGCAAATCTGACCTT
TCATTGCCTAAAACATTCGCCTGCAGTGCTTTCGCTGCCTGCGTCGGCGAGGTATGTACG
ATTCCATTGGACACTGCGAAAGTGAGGCTTCAGCTCCAAAAGTCTGCCATTGCTGGAGAT
GTTACTCTCCCTAAGTATCGTGGATTGCTCGGGACTGTTGGTACCATAGCAAGGGAAGAA
GGGCTTCGTTCACTATGGAAAGGTGTTGTTCCTGGCTTGCATCGTCAATGCCTCTTTGGA
GGTCTTAGGATCGGAATGTATGAGCCGGTCAAAAACTTGTACGTTGGGAAAGACCATGTA
GGCGATGTTCCTTTGAGCAAGAAGATCCTTGCTGGTTTGACCACAGGTGCTCTGGGTATC
ATGGTAGCCAATCCCACTGATCTTGTGAAAGTTAGACTTCAGGCTGAAGGGAAACTAGCT
GCAGGTGTGCCAAGACGGTATACTGGATCTTTGAATGCCTATTCAACCATTGTCAGACAA
GAAGGAGTCAGAGCACTTTGGACTGGTCTTGGACCTAATGTTGCTAGAAACGCAATCATC
AATGCTGCTGAAT
A

QA 3 675 3 675
DS 

RD RR2DN57TF 734 0 0
GAGTCGTAATCGTCGTCACTGTTCTCGAGATTCTCTCTGTGTTCGATACTCTCTCTCTCG
TTTTTCATTCCTCGGATTAGCTTTTTTTCTCTTTTTTTGTTGTTGTCTGGATCGAAGAAG
GATGGTATCTGATAGCAAATCTGACCTTTCATTGCCTAAAACATTCGCCTGCAGTGCTTT
CGCTGCCTGCGTCGGCGAGGTATGTACGATTCCATTGGACACTGCGAAAGTGAGGCTTCA
GCTCCAAAAGTCTGCCATTGCTGGAGATGTTACTCTCCCTAAGTATCGTGGATTGCTCGG
GACTGTTGGTACCATAGCAAGGGAAGAAGGGCTTCGTTCACTATGGAAAGGTGTTGTTCC
TGGCTTGCATCGTCAATGCCTCTTTGGAGGTCTTAGGATCGGAATGTATGAGCCGGTCAA
AAACTTGTACGTTGGGAAAGACCATGTAGGCGATGTTCCTTTGAGCAAGAAGATCCTTGC
TGGTTTGACCACAGGTGCTCTGGGTATCATGGTAGCCAATCCCACTGATCTTGTGAAAGT
TAGACTTCAGGCTGAAGGGAAACTAGCTGCAGGTGTGCCAAGACGGTATACTGGATCTTT
GAATGCCTATTCAACCATTGTCAGACAAGAAGGAGTCAGAGCACTTTGGACTGGTCTTGG
ACCTAATGTTGCTAGAAACGCAATCATCAATGCTGCTGAATTAGCGAGTTACGATCAAGT
GAAGCAGACA
TCTT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2DE23JQ 703 0 0
GTAGCCAATCCCACTGATCTTGTGAAAGTTAGACTTCAGGCTGAAGGGAAACTAGCTGCA
GGTGTGCCAAGACGGTATACTGGATCTTTGAATGCCTATTCAACCATTGTCAGACAAGAA
GGAGTCAGAGCACTTTGGACTGGTCTTGGACCTAATGTTGCTAGAAACGCAATCATCAAT
GCTGCTGAATTAGCGAGTTATGATCAAGTGAAGCAGACAATCTTGAAGATTCCGGGGTTC
ACTGATAACATTGTCACGCATATTTTATCTGGACTGGGAGCAGGATTCTTTGCTGTCTGC
ATTGGTTCCCCTGTCGACGTGGTTAAGTCGAGAATGATGGGAGATCCTTCTTACAAAGGC
ACTATCGACTGCTTCGTCAAAACTCTGAAGGCTGACGGTCCTATGGCATTTTACAAGGGT
TTCATCCCCAACTTTGGACGCCTTGGCTCATGGAACGTCATCATGTTTTTGACCCTTGAA
CAGGCAAAGAAGTATGTCCGGGAACTAGAATCGTCCAATAAATAATAGTAAGACGAAATA
ATATTTTTATGCAGAGAATAAAAACAACATTGTTTTCTTCTTAATTTCGGTGATCGAGAG
AGAGAGGCCAAGAACATCATCGAATATTGTTTTGGAATGGAGACCTGATTTCAAGCAAAC
TGTGAAATAAATTTCTATGGGTGGCTGTACCATTCAAACAATC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL2639Contig1 862 2 2 U
GGAAAAGCAGGAATCTTTTGTTTATCAAGAAGTAACTTAGAAGAAGAGAAAAATGGAGAT
ATCAACAACATCCCAGTTGTGCTCACGGGTTAAGTGCTCAATCTCTTCATCATCACTCTC
CTGCTTAAATGGTAAGAGGAACCAAGACGGAACTGTTTCAGTCAATTGCTTGAAAGAGAT
CAAACAGTTCAGTAACATTAGCTTCATTGCCAAGAAGAAACACAGAAGCCATGCACCGGT
GGTGAGGACAACAACAACACGCGCCTCCGCCTCCGTGGATGGGAATCAACCCCCAGCTTC
TGCCACCAAACGAGAACGGTGGCTTCTCCAACCAGTTGGAGATGGAGACACAAGACACAT
TGGTTACAAAGTGGAAATGCCTGCTCCTTTCGAGATCTCTTCCGGTCAAGTTACCATCGG
ACGGCTACCTGAAAAGGCTGACGTTGTGATTCCCGTGGCCACCGTCTCGGGAGTACATGC
GACAATTGATACACAAAGAGACAACCTTCTTGTAACGGATATGAACAGTACAAACGGCAC
ATTCATCGAAGACAAACGCCTGATCCCTGGTGTTGCTGCTCCTGCCTTTCCCGGAACCCG
AATCACCTTTGGAGATACGAATCTAGCAATTTTCCGTGTTTTCAAGCTCCAAGATAGTCA
AGAAGAAAATGAACCCTCCGAGAAACCAGCCACTGAGTAACCAACCAAACCCCAAACCTG
TTGGGTTGTTCTACAACCATTGTTGAGCTATATAACTCTATATAAACAATATTTTTATAT
ATCTATCTTATTAAAGCTGAAGTACAAATTCGGTGTGTTTGGATACTTGGATAAGAATAT
TAAAAATATTTGGTGTGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ44TF U 1
AF RR2BQ44JQ C 125
BS 1 699 RR2BQ44TF
BS 700 862 RR2BQ44JQ

RD RR2BQ44TF 703 0 0
GGAAAAGCAGGAATCTTTTGTTTATCAAGAAGTAACTTAGAAGAAGAGAAAAATGGAGAT
ATCAACAACATCCCAGTTGTGCTCACGGGTTAAGTGCTCAATCTCTTCATCATCACTCTC
CTGCTTAAATGGTAAGAGGAACCAAGACGGAACTGTTTCAGTCAATTGCTTGAAAGAGAT
CAAACAGTTCAGTAACATTAGCTTCATTGCCAAGAAGAAACACAGAAGCCATGCACCGGT
GGTGAGGACAACAACAACACGCGCCTCCGCCTCCGTGGATGGGAATCAACCCCCAGCTTC
TGCCACCAAACGAGAACGGTGGCTTCTCCAACCAGTTGGAGATGGAGACACAAGACACAT
TGGTTACAAAGTGGAAATGCCTGCTCCTTTCGAGATCTCTTCCGGTCAAGTTACCATCGG
ACGGCTACCTGAAAAGGCTGACGTTGTGATTCCCGTGGCCACCGTCTCGGGAGTACATGC
GACAATTGATACACAAAGAGACAACCTTCTTGTAACGGATATGAACAGTACAAACGGCAC
ATTCATCGAAGACAAACGCCTGATCCCTGGTGTTGCTGCTCCTGCCTTTCCCGGAACCCG
AATCACCTTTGGAGATACGAATCTAGCAATTTTCCGTGTTTTCAAGCTCCAAGATAGTCA
AGAAGAAAATGAACCCTCCGAGAAACCAGCCACTGAGTA
ACCA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2BQ44JQ 738 0 0
TTAAATGGTAAGAGGAACCAAGACGGAACTGTTTCAGTCAATTGCTTGAAAGAGATCAAA
CAGTTCAGTAACATTAGCTTCATTGCCAAGAAGAAACACAGAAGCCATGCACCGGTGGTG
AGGACAACAACAACACGCGCCTCCGCCTCCGTGGATGGGAATCAACCCCCAGCTTCTGCC
ACCAAACGAGAACGGTGGCTTCTCCAACCAGTTGGAGATGGAGACACAAGACACATTGGT
TACAAAGTGGAAATGCCTGCTCCTTTCGAGATCTCTTCCGGTCAAGTTACCATCGGACGG
CTACCTGAAAAGGCTGACGTTGTGATTCCCGTGGCCACCGTCTCGGGAGTACATGCGACA
ATTGATACACAAAGAGACAACCTTCTTGTAACGGATATGAACAGTACAAACGGCACATTC
ATCGAAGACAAACGCCTGATCCCTGGTGTTGCTGCTCCTGCCTTTCCCGGAACCCGAATC
ACCTTTGGAGATACGAATCTAGCAATTTTCCGTGTTTTCAAGCTCCAAGATAGTCAAGAA
GAAAATGAACCCTCCGAGAAACCAGCCACTGAGTAACCAACCAAACCCCAAACCTGTTGG
GTTGTTCTACAACCATTGTTGAGCTATATAACTCTATATAAACAATATTTTTATATATCT
ATCTTATTAAAGCTGAAGTACAAATTCGGTGTGTTTGGATACTTGGATAAGAATATTAAA
AATATTTGGTGTGTTTAC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 4

CO CL2640Contig1 672 4 28 U
TTTTTTCTTTTCTCTCCCAGATTTTCTCTCTCCTCCTGCGGATCATATTTTTCTTTTTCG
TTCACTTTCCTTTGGTTTTCTCGGCGGCTTCATTTGAATCGTTTTTTCCTTTTTTTTCTC
TCTCTCTAGGGGGGTAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCATGTCGGACAAAGGA
CGTCCCTTGCCCAAGTTTGGAGAATGGGATGTGAATGATCCAGCATCAGCAGAAGGTTTC
ACAGTCATATTCAACAAAGCTAGGGATGAGAAGATGACCGGTGGCAAGCCAGGCTCGCCT
GGTAAATCCACTGACGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGATCCTAGTAAACCCCAGCCT
AAAAAATGGCTCTGCTGCATGCAGTCTCCAGCAGTGGACTCTTGACGGACACAAAGATTG
GATTTGCTTGCTGCCAAGTAAAAAAAAAA*AAGAAGGTTACATTGCTTAGACATGTAAAA
GCAATGTTCCTTTTTTATGTTTTATTGTCTTTCTTGAAAGTATCCACACACAAA***AAA
AAAATTCTTAAGATGATTTGGAGCCCCCTTTTTAGTATTCACGATTATGATTTTCCTTCT
TCTTCTTTTGAAGTCGTTTGTTATTCTAAAAATGCTGTAAAATCGTGTTGCCACTTTTAT
TGGAAAACCAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 0 5 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H270TF U 1
AF RR2FT31TF U 47
AF RR2DH79TF U 105
AF RR2FT31JQ C 130
BS 1 173 RR2H270TF
BS 174 174 RR2FT31TF
BS 175 224 RR2H270TF
BS 225 225 RR2FT31TF
BS 226 232 RR2H270TF
BS 233 233 RR2FT31TF
BS 234 274 RR2H270TF
BS 275 275 RR2FT31TF
BS 276 293 RR2H270TF
BS 294 294 RR2FT31TF
BS 295 434 RR2H270TF
BS 435 435 RR2FT31TF
BS 436 446 RR2H270TF
BS 447 447 RR2FT31TF
BS 448 449 RR2H270TF
BS 450 450 RR2FT31TF
BS 451 479 RR2H270TF
BS 480 480 RR2FT31TF
BS 481 516 RR2H270TF
BS 517 517 RR2FT31TF
BS 518 534 RR2H270TF
BS 535 537 RR2FT31TF
BS 538 547 RR2H270TF
BS 548 548 RR2FT31TF
BS 549 631 RR2H270TF
BS 632 632 RR2DH79TF
BS 633 660 RR2H270TF
BS 661 672 RR2DH79TF

RD RR2H270TF 660 0 0
TTTTTTCTTTTCTCTCCCAGATTTTCTCTCTCCTCCTGCGGATCATATTTTTCTTTTTCG
TTCACTTTCCTTTGGTTTTCTCGGCGGCTTCATTTGAATCGTTTTTTCCTTTTTTTTCTC
TCTCTCTAGGGGGGTAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCATGTCGGAAAAAGGA
CGTCCCTTGCCCAAGTTTGGAGAATGGGATGTGAATGATCCAGCTTCAGCAGGAGGTTTC
ACAGTCATATTCAACAAAGCTAGGGATGAGAAGAAGACCGGTGGCAAGCCAGGATCGCCT
GGTAAATCCACTGACGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGATCCTAGTAAACCCCAGCCT
AAAAAATGGCTCTGCTGCATGCAGTCTCCAGCAGTGGACTCTTGACGGACACAAAGATTG
GATTTGCTTGCTGCAAAGTAAAAAAAGAAGAAGAAGGTTACATTGCTTAGACATGTAAA*
GCAATGTTCCTTTTTTATGTTTTATTGTCTTTCTTGGAAGTATCCACACACAAACAAAAA
AAAATTCCTAAGATGATTTGGAGCCCCCTTTTTAGTATTCACGATTATGATTTTCCTTCT
TCTTCTTTTGAAGTCGTTTGTTATTCTAAAA*TGCTGTAAAATCGTGTTGCCACTTTTAT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2FT31TF 586 0 0
T
TTTTTCTTTTTCTTTCACTTTCCTTTGGTTTTCTCGGCGGCTTCATTTGAATCGTTTTTT
CCTTTTTTTT***TCTCTCTAGGGGGGTAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCAT
GTCGGACAAAGGACGTCCCTTGCCCAAGTTTGGAGAATGGGATGTGAATGATCCAGCATC
AGCAGAAGGTTTCACAGTCATATTCAACAAAGCTAGGGATGAGAAGATGACCGGTGGCAA
GCCAGGCTCGCCTGGTAAATCCACTGACGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGATCCTAG
TAAACCCCAGCCTAAAAAATGGCTCTGCTGCATGCAGTCTCCAGCAGTGGACTCTTGACG
GACACAAAGATTGGATTTGCTTGCTGCCAAGTAAAAAAAAAA*AAGAAGGTTACATTGCT
TAGACATGTAAAAGCAATGTTCCTTTTTTATGTTTTATTGTCTTTCTTGAAAGTATCCAC
ACACAAA***AAAAAAATTCTTAAGATGATTTGGAGCCCCCTTTTTAGTATTCACGATTA
TGATTTTCCTTCTTCTTCTTTTGAAGTCGTTTGTTATTCTAAAA
A

QA 2 585 2 585
DS 

RD RR2DH79TF 568 0 0
TTTTTTCC
TTTTTTTCTCTCTCTAGGGGGGTAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCATGTCGG
AAAAAGGACGTCCCTTGCCCAAGTTTGGAGAATGGGATGTGAATGATCCAGCTTCAGCAG
AAGGTTTCACAGTCATATTCAACAAAGCTAGGGATGAGAAGAAGACCGGTGGCAAGCCAG
GATCGCCTGGTAAATCCACTGACGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGATCCTAGTAAAC
CCCAGCCTAAAAAATGGCTCTGCTGCATGCAGTCTCCAGCAGTGGACTCTTGACGGACAC
AAAGATTGGATTTGCTTGCTGCAAAGTAAAAAAAGAAGAAGAAGGTTACATTGCTTAGAC
ATGTAAA*GCAATGTTCCTTTTTTATGTTTTATTGTCTTTCTTGGAAGTATCCACACACA
AACAAAAAAAAATTCCTAAGATGATTTGGAGCCCCCTTTTTAGTATTCACGATTATGATT
TTCCTTCTTCTTCTTTTGAAGTCGTTTGTTATTCTAAAAATGCTGTAAAATCGTGTTGCC
ACTTTTATTGGAAAACCAGG

QA 9 568 9 568
DS 

RD RR2FT31JQ 543 0 0
GGGGGTAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCATGTCGGACAAAGGACGTCCCTTG
CCCAAGTTTGGAGAATGGGATGTGAATGATCCAGCATCAGCAGAAGGTTTCACAGTCATA
TTCAACAAAGCTAGGGATGAGAAGATGACCGGTGGCAAGCCAGGCTCGCCTGGTAAATCC
ACTGACGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGATCCTAGTAAACCCCAGCCTAAAAAATGG
TTTTGCTGCATGCAGTCTCCAGCAGTGGACTCTTGACGGACACAAAGATTGGATTTGCTT
GCTGCCAAGTAAAAAAAAAA*AAGAAGGTTACATTGCTTAGACATGTAAAAGCAATGTTC
CTTTTTTATGTTTTATTGTCTTTCTTGAAAGTATCCACACACAAA***AAAAAAATTCTT
AAGATGATTTGGAGCCCCCTTTTTAGTATTCACGATTATGATTTTCCTTCTTCTTCTTTT
GAAGTCGTTTGTTATTCTAAAAATGCTGTAAAATCGTGTTGCCACTTTTATTGGAAAACC
AGG

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 4

CO CL2641Contig1 794 4 7 U
GCTCTTCTACTTCAACAAGTTATATTAAAAATTTAAAACAAGAAACGTCCACAATAGAGC
ACACAACAGAGCAGCAGAATCATGAAGTCTCTCCTACGTTAACTACTACATAAAAGTTCA
ACGGTACTAAGATAAAATGCTGCTTCATACCGGGAGCTACACCTAGTCTCCCTGGAAGAG
AACATGAATAAACACCACTTATTACATAGTTTGTCCAAAATCGAAAAGAAAGGTAAGTTA
TTATTCCCTCGGAGATAGAAAAGATCTCTAGTTCATCTCCATTCCATCTCCTGCCTGGCC
GCAAATTGGGCTCACGGCAGCAAAAGACCTCTCGAAAGGAGAAGAAAGAAA*CTGAGCGT
CACGTCGGCGGCGCTTGACGCAGCTTTCAGAGGTTTGACTCTCATCATCAAGCTTCCTCC
GGACTCCTCTAACCGCCTGTTCCTCAGCCGGTGATAGTGGGAATATCCGGCCACTGGCTC
GGCACAAAGAGTTGTGGTTATCATACAGGATCCGCTGGTTGCAGTTCTTGTCACAGACAT
GGTTCAACCCGGTTAGCTTGCAACGGTACATATTTCCACACACATTTTCGTTCTCGCATT
TCCAGTCACATTTGTGACATGGATTGGGTCCATCGCGACCAAGTAACGCAGACAAGTAGA
TAACATTGGCGGAACCAACCACGGGTGAGTTTCCATATACCTCCATTGTTTGTTTTCTCG
TACGTCGTCTTCACACTGAGAGAAATTTTGTAACCCTAGTTTTGATTCGAAACTATATGG
TAGCTGAAGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG94JQ U 38
AF RR2FC05JQ U 1
AF RR2DG94TF C 56
AF RR2BE58TF C 98
BS 1 73 RR2FC05JQ
BS 74 74 RR2DG94JQ
BS 75 351 RR2FC05JQ
BS 352 352 RR2DG94JQ
BS 353 703 RR2FC05JQ
BS 704 737 RR2DG94TF
BS 738 794 RR2BE58TF

RD RR2DG94JQ 414 0 0
ACAAGAAACGTCCACAATAGAGCACACAACAGAGCAGCAGAATCATGAAGTCTCTCCTAC
GTTAACTATTACATAAAAGTTCAACGGTACTAAAATAAAATGCTGCTTCATACCGGGAGC
TACACCTAGTCTCCCTGGAAGAAAACATGAATAAACACCACTTATTACATAGTTTGTCCA
AAATCGAAAAAAAAGGTAAGTTATTATTCCCTCGGAAATAGAAAAAATCTCTAGTTCATC
TCCATTCCATCTCCTGCCTGGCCGCAAATTGGGCTCACGGCAGCAAAAAACCTCTCGAAA
GGAAAAAAAAGAAA*CTGAGCGTCACGTCGGCGGCGCTTGACGCAGCTTTCAAAGGTTTG
ACTCTCATCATCAAGCTTCCTCCGGACTCCTCTAACCGCCTGTTCCTCAGCCGG

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR2FC05JQ 703 0 0
GCTCTTCTACTTCAACAAGTTATATTAAAAATTTAAAACAAGAAACGTCCACAATAGAGC
ACACAACAGAGCAACAGAATCATGAAGTCTCTCCTACGTTAACTACTACATAAAAGTTCA
ACGGTACTAAGATAAAATGCTGCTTCATACCGGGAGCTACACCTAGTCTCCCTGGAAGAG
AACATGAATAAACACCACTTATTACATAGTTTGTCCAAAATCGAAAAGAAAGGTAAGTTA
TTATTCCCTCGGAGATAGAAAAGATCTCTAGTTCATCTCCATTCCATCTCCTGCCTGGCC
GCAAATTGGGCTCACGGCAGCAAAAGACCTCTCGAAAGGAGAAGAAAGAAAACTGAGCGT
CACGTCGGCGGCGCTTGACGCAGCTTTCAGAGGTTTGACTCTCATCATCAAGCTTCCTCC
GGACTCCTCTAACCGCCTGTTCCTCAGCCGGTGATAGTGGGAATATCCGGCCACTGGCTC
GGCACAAAGAGTTGTGGTTATCATACAGGATCCGCTGGTTGCAGTTCTTGTCACAGACAT
GGTTCAACCCGGTTAGCTTGCAACGGTACATATTTCCACACACATTTTCGTTCTCGCATT
TCCAGTCACATTTGTGACATGGATTGGGTCCATCGCGACCAAGTAACGCAGACAAGTAGA
TAACATTGGCGGAACCAACCACGGGTGAGTTTCCATATACCTC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2DG94TF 683 0 0
AGAGCACACAACAGAGCAGCAGAATCATGAAGTCTCTC*TACGTTAACTATTACATAAAA
GTTCAACGGTACTAAGATAAAATGCTGCTTCATACCGGGAGCTACACCTAGTCTCCCTGG
AAGAGAACATGAATAAACACCACTTATTACATAGTTTGTCCAAAATCGAAAAGAAAGGTA
AGTTATTATTCCCTCGGAGATAGAAAAGATCTCTAGTTCATCTCCATTCCATCTCCTGCC
TGGCCGCAAATTGGGCTCACGGCAGCAAAAGACCTCTCGAAAGGAGAAGAAAGAAA*CTG
AGCGTCACGTCGGCGGCGCTTGACGCAGCTTTCAGAGGTTTGACTCTCATCATCAAGCTT
CCTCCGGACTCCTCTAACCGCCTGTTCCTCAGCCGGTGATAGTGGGAATATCCGGCCACT
GGCTCGGCACAAAGAGTTGTGGTTATCATACAGGATCCGCTGGTTGCAGTTCTTGTCACA
GACATGGTTCAACCCGGTTAGCTTGCAACGGTACATATTTCCACACACATTTTCGTTCTC
GCATTTCCAGTCACATTTGTGACATGGATTGGGTCCATCGCGACCAAGTAACGCAGACAA
GTAGATAACATTGGCGGAACCAACCACGGGTGAGTTTCCATATACCTCCATTGTTTGTTT
TCTCGTACGTCGTCTTCACACT
C

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2BE58TF 697 0 0
GTTAACTACTACATAAAAGTTCAACGGTACTAAGATAAAATGCTGCTTCATACCGGGAGC
TACACCTAGTCTCCCTGGAAGAGAACATGAATAAACACCACTTATTACATAGTTTGTCCA
AAATCGAAAAGAAAGGTAAGTTATTATTCCCTCGGAGATAGAAAAGATCTCTAGTTCATC
TCCATTCCATCTCCTGCCTGGCCGCAAATTGGGCTCACGGCAGCAAAAGACCTCTCGAAA
GGAGAAGAAAGAAA*CTGAGCGTCACGTCGGCGGCGCTTGACGCAGCTTTCAGAGGTTTG
ACTCTCATCATCAAGCTTCCTCCGGACTCCTCTAACCGCCTGTTCCTCAGCCGGTGATAG
TGGGAATATCCGGCCACTGGCTCGGCACAAAGAGTTGTGGTTATCATACAGGATCCGCTG
GTTGCAGTTCTTGTCACAGACATGGTTCAACCCGGTTAGCTTGCAACGGTACATATTTCC
ACACACATTTTCGTTCTCGCATTTCCAGTCACATTTGTGACATGGATTGGGTCCATCGCG
ACCAAGTAACGCAGACAAGTAGATAACATTGGCGGAACCAACCACGGGTGAGTTTCCATA
TACCTCCATTGTTTGTTTTCTCGTACGTCGTCTTCACACTGAGAGAAATTTTGTAACCCT
AGTTTTGATTCGAAACTATATGGTAGCTGAAGAACCC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 4

CO CL2642Contig1 791 4 26 U
GGAAGGTTCAGATATAAATACGGACCTCAGCAATAACAAAAGAGAGGGTGTCGATTTAGT
TCGCTAACTACCGAAGAAGCAACCACCTACCTCTCTCTCTCTC**AACGCTCAGAAGAAA
TGGCAAGGAAGAAGATCAGAGAGTACGACTCAAAGAGACTCGTGAAGGAACACTTCAAAA
GGCTTTCCGGTAAAGAACTCCCTATCAGATCCGTTCAGATTAACCAAGAGACTGATCTCA
ATGAGCTAGTTGAGAAGGAGCCATGGCTCTCTTCCGAGAAGCTGGTCGTCAAACCCGACA
TGTTGTTTGGTAAGCGTGGCAAGAGCGGTTTGGTTGCCTTGAAACTCGATTTCGCTGAAG
TCGCGACCTTTGTCAAAGAGCGCTTAGGCAAAGAGGTGGAGATGAGTGGATGCAAAGGAC
CCATCACGACTTTCATTGTTGAACCCTTTGTCCCACACAATGAGGAGTTTTATCTCAACA
TTGTTTCGGATAGGCTTGGCTGCAGCATTAGCTTTTCTGAGTGTGGAGGGATTGACATCG
AGGAGAACTGGGACAAGGTCAAGACCATCTCTGTGCCGACTGGTTCTTCCTTGACACCTG
AGATATGTGCACCTCTTGTTGCTACCCTTCCTCTTGAGATCAAAGGGGAACTTGAAGATT
TTATTCAAGTTATTTTCACCCTTTTCCAAGATCTTGATTTCACTTTCTTGGAGATGAATC
CTTTTGCACTGGTTGATGGAAAGCCTTATCCTCTGGATATGAGGGGTGAGCTTGATGACA
CCGCTGCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 0 0 0 10 10 25 10 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW78TF U 1
AF RR2AK06TF U 45
AF RR2BX75TF U 44
AF RR2AR14TF U 41
BS 1 60 RR2DW78TF
BS 61 61 RR2AR14TF
BS 62 97 RR2DW78TF
BS 98 98 RR2AR14TF
BS 99 100 RR2DW78TF
BS 101 103 RR2AK06TF
BS 104 105 RR2DW78TF
BS 106 107 RR2AR14TF
BS 108 108 RR2DW78TF
BS 109 109 RR2AR14TF
BS 110 110 RR2DW78TF
BS 111 113 RR2AR14TF
BS 114 125 RR2DW78TF
BS 126 126 RR2AR14TF
BS 127 134 RR2DW78TF
BS 135 135 RR2AR14TF
BS 136 262 RR2DW78TF
BS 263 263 RR2AK06TF
BS 264 283 RR2DW78TF
BS 284 284 RR2AK06TF
BS 285 565 RR2DW78TF
BS 566 566 RR2AR14TF
BS 567 641 RR2DW78TF
BS 642 739 RR2AR14TF
BS 740 740 RR2AK06TF
BS 741 791 RR2AR14TF

RD RR2DW78TF 641 0 0
GGAAGGTTCAGATATAAATACGGACCTCAGCAATAACAAAAGAGAGGGTGTCGATTTAGT
CCGCTAACTACCGAAGAAGCAACCACCTACCTCTCTCCCT*******CTCAACGAAGAAA
TGGCACGGAAGAAGGTCAGAGAGTACGACTCAAAGAGACTCGTGAAGGAACACTTCAAAA
GGCTTTCCGGTAAAGAACTCCCTATCAGATCCGTTCAGATTAACCAAGAGACTGATCTCA
ATGAGCTAGTTGAGAAGGAGCCTTGGCTCTCTTCCGAGAAGCTTGTCGTCAAACCCGACA
TGTTGTTTGGTAAGCGTGGCAAGAGCGGTTTGGTTGCCTTGAAACTCGATTTCGCTGAAG
TCGCGACCTTTGTCAAAGAGCGCTTAGGCAAAGAGGTGGAGATGAGTGGATGCAAAGGAC
CCATCACGACTTTCATTGTTGAACCCTTTGTCCCACACAATGAGGAGTTTTATCTCAACA
TTGTTTCGGATAGGCTTGGCTGCAGCATTAGCTTTTCTGAGTGTGGAGGGATTGACATCG
AGGAGAACTGGGACAAGGTCAAGACGATCTCTGTGCCGACTGGTTCTTCCTTGACACCTG
AGATATGTGCACCTCTTGTTGCTACCCTTCCTCTTGAGATC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2AK06TF 715 0 0
GG
GGTGTCGATTTAGTTCGCTAACTACCGAAGAAGCAACCACCTACCTCTCTCTCTCTCTCA
ACGCTCAGAAGAAATGGCAAGGAAGAAGATCAGAGAGTACGACTCAAAGAGACTCGTGAA
GGAACACTTCAAAAGGCTTTCCGGTAAAGAACTCCCTATCAGATCCGTTCAGATTAACCA
AGAGACTGATCTCAATGAGCTAGTTGAGAAGGAGCCATGGCTCTCTTCCGAGAAGCTGGT
CGTCAAACCCGACATGTTGTTTGGTAAGCGTGGCAAGGGCGGTTTGGTTGCCTTGAAACT
CGATTTCGCTGAAGTTGCGACCTTTGTCAAAGAGCGCTTAGGCAAAGAGGTGGAGATGAG
TGGATGCAAAGGACCCATCACGACTTTCATTGTTGAGCCCTTTGTCCCACACAATGAGGA
GTTTTATCTCAACATTGTTTCGGATAGGCTTGGCTGCAGCATTAGCTTTTCTGAGTGTGG
AGGGATTGACATCGAGGAGAACTGGGACAAGGTCAAGACCATCTCTGTGCCGACTGGTTC
TTCCTTGACACCTGAGATATGTGCACCTCTTGTTGCTACCCTTCCTCTTGAGATCAAAGG
GGAACTTGAAGATTTTATTCAAGTTATTTTCACCCTTTTCCAAGATCTTGATTTCACTTT
CTTGGAGATGAATCCTTTTGCACTGGTTGATGGAAAGCCTTATCCTCTGGATA

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR2BX75TF 716 0 0
GGG
GGTGTCGATTTAGTTCGCTAACTACCGAAGAAGCAACCACTCACCTCTCTCTCTCTC**A
ACGCTCAGAAGAAATGGCAAGGAAGAAGATCAGAGAGTACGACTCAAAGAGACTCGTGAA
GGAACACTTCAAAAGGCTTTCCGGTAAAGAACTCCCTATCAGATCCGTTCAGATTAACCA
AGAGACTGATCTCAATGAGCTAGTTGAGAAGGAGCCATGGCTCTCTTCCGAGAAGCTGGT
CGTCAAACCCGACATGTTGTTTGGTAAGCGTGGCAAGAGCGGTTTGGTTGCCTTGAAACT
CGATTTCGCTGAAGTTGCGACCTTTGTCAAAGAGCGCTTAGGCAAAGAGGTGGAGATGAG
TGGATGCAAAGGACCCATCACGACTTTCATTGTTGAGCCCTTTGTCCCACACAATGAGGA
GTTTTATCTCAACATTGTTTCGGATAGGCTTGGCTGCAGCATTAGCTTTTCTGAGTGTGG
AGGGATTGACATCGAGGAGAACTGGGACAAGGTCAAGACCATCTCTGTGCCGACTGGTTC
TTCCTTGACACCTGAGATATGTGCACCTCTTGTTGCTACCCTTCCCCTTGAGATCAAAGG
GGAACTTGAAGATTTTATTCAAGTTATTTTCACCCTTTTCCAAGATCTTGATTTCACTTT
CTTGGAGATGAATCCTTTTGCACTGGTTGATGGAAAGCCTTATCCTCTGGATA

QA 4 716 4 716
DS 

RD RR2AR14TF 751 0 0
GGGAGA
GGTGTCGATTTAGTTCGCTAACTACCGAAGAAGCAACCACCTACCTCTCTCTCTA****A
ACGCTCAGAAGAAATGGCAAGGAAGAAGATCAGAGAGTACGACTCAAAGAGACTCGTGAA
GGAACACTTCAAAAGGCTTTCCGGTAAAGAACTCCCTATCAGATCCGTTCAGATTAACCA
AGAGACTGATCTCAATGAGCTAGTTGAGAAGGAGCCTTGGCTCTCTTCCGAGAAGCTTGT
CGTCAAACCTGACATGTTGTTTGGTAAGCGTGGCAAGAGCGGTTTGGTCTCCTTGAAACT
CGATTTCGCTGAAGTCGCGACCTTTGTCAAAGACCGCTTAGGCAAAGAGGTGGAGATGAG
TGGATGCAAAGGACCCATCACAACTTTCATTGTTGAACCCTTTGTCCCACACAATGAGGA
GTTTTATCTCAACATTGTTTCGGATAGGCTTGGCTGCAGCATTAGCTTTTCTGAGTGTGG
AGGGATTGACATCGAGGAGAACTGGGACAAGGTCAAGACCATCTCTGTGCCGACTGGCTC
TTCCTTGACACCTGAGATATGCGCACCTCTTGTTGCTACCCTTCCTCTTGAGATCAAAGG
GGAACTTGAAGATTTTATTCAAGTTATTTTCACCCTTTTCCAAGATCTTGATTTCACTTT
CTTGGAGATGAATCCTTTTGCACTGGTTGATGGGAAGCCTTATCCTCTGGATATGAGGGG
TGAGCTTGATGACACCGCTGCTTTC

QA 7 751 7 751
DS 



AS 1 4

CO CL2643Contig1 728 4 13 U
TTTTTCATAAAATCTAACTGAAAATTGAAATTGAAGTTTCCAGATTCCTCAAGATGGCGC
TTCGTGCTGCTACTCATCAAGGAACCAGCCGTATCGCGGCGACGCTACGGCGCGTCGCTC
GGCCATTCTCGACGGACGCGGTGGTAGAGTCGGATTACAAGCGTGGGGAGATCGGCAAGG
TCTCCGGAATCCCTGAGGAGCATCTTTCCCGCAAGGTGATAATATACTCACCAGCTAGAA
GTGCTACACAGCAAGGATCTGGCAAACTCGGCAAATGGAAGATTAACTTCGTCTCCACCT
TAAAATGGGAGAACCCGTTGATGGGATGGACTTCTACAGGTGACCCTTATGCCAATGTAG
GCGACTCTGCTCTTTCTTTTGATTCTGAAGTTGCTGCCAAGTCCTTTGCTCAGCGTCACG
GCTGGGATTATGTGGTCAAGAAGCCCAAAACACCCCTATTGAAGCCTAAGTCTTACTCGG
ACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAACCTCAACCAGATCACTGATCTTCTTCCATTTCTCGAG
AAAAAAAGGAGAAACTTCATCTGATAAATAAAAAGAAACCTCTCATGGTTTCTTTCTTGT
TTTAGCATCTCTGAGCTTGTTCTCTGAACTATGTATTATACATGTTTGGATTCTTTTTTT
GTCTGTTTCCTTATTTTAACAATAATATGATATGATGGTAATGATAAACACTCTTATGAG
GTTTCGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2GF44TF U 1
AF RR2GF44JQ C 1
AF RR2F008TF U 165
AF RR2F008JQ C 169
BS 1 388 RR2GF44TF
BS 389 389 RR2F008TF
BS 390 451 RR2GF44TF
BS 452 452 RR2F008TF
BS 453 455 RR2GF44TF
BS 456 456 RR2F008TF
BS 457 659 RR2GF44TF
BS 660 660 RR2F008TF
BS 661 691 RR2GF44TF
BS 692 696 RR2F008TF
BS 697 716 RR2GF44TF
BS 717 726 RR2F008TF
BS 727 728 RR2F008JQ

RD RR2GF44TF 716 0 0
TTTTTCATAAAATCTAACTGAAAATTGAAATTGAAGTTTCCAGATTCCTCAAGATGGCGC
TTCGTGCTGCTACTCATCAAGGAACCAGCCGTATCGCGGCGACGCTACGGCGCGTCGCTC
GGCCATTCTCGACGGACGCGGTGGTAGAGTCGGATTACAAGCGTGGGGAGATCGGCAAGG
TCTCCGGAATCCCTGAGGAGCATCTTTCCCGCAAGGTGATAATATACTCACCAGCTAGAA
GTGCTACACAGCAAGGATCTGGCAAACTCGGCAAATGGAAGATTAACTTCGTCTCCACCT
TAAAATGGGAGAACCCGTTGATGGGATGGACTTCTACAGGTGACCCTTATGCCAATGTAG
GCGACTCTGCTCTTTCTTTTGATTCTGAGGTTGCTGCCAAGTCCTTTGCTCAGCGTCACG
GCTGGGATTATGTGGTCAAGAAGCCCAAAACGCCCTTATTGAAGCCTAAGTCTTACTCGG
ACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAACCTCAACCAGATCACTGATCTTCTTCCATTTCTCGAG
AAAAAAAGGAGAAACTTCATCTGATAAATAAAAAGAAACCTCTCATGGTTTCTTTCTTGT
TTTAGCATCTCTGAGCTTGTTCTCTGAACTATGTATTATACATGTTTGGATTCTTTTTT*
GTCTGTTTCCTTATTTTAACAATAATATGAT*****GGTAATGATAAACACTCTTA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2GF44JQ 728 0 0
TTTTTCATAAAATCTAACTGAAAATTGAAATTGAAGTTTCCAGATTCCTCAAGATGGCGC
TTCGTGCTGCTACTCATCAAGGAACCAGCCGTATCGCGGCGACGCTACGGCGCGTCGCTC
GGCCATTCTCGACGGACGCGGTGGTAGAGTCGGATTACAAGCGTGGGGAGATCGGCAAGG
TCTCCGGAATCCCTGAGGAGCATCTTTCCCGCAAGGTGATAATATACTCACCAGCTAGAA
GTGCTACACAGCAAGGATCTGGCAAACTCGGCAAATGGAAGATTAACTTCGTCTCCACCT
TAAAATGGGAGAACCCGTTGATGGGATGGACTTCTACAGGTGACCCTTATGCCAATGTAG
GCGACTCTGCTCTTTCTTTTGATTCTGAGGTTGCTGCCAAGTCCTTTGCTCAGCGTCACG
GCTGGGATTATGTGGTCAAGAAGCCCAAAACGCCCTTATTGAAGCCTAAGTCTTACTCGG
ACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAACCTCAACCAGATCACTGATCTTCTTCCATTTCTCGAG
AAAAAAAGGAGAAACTTCATCTGATAAATAAAAAGAAACCTCTCATGGTTTCTTTCTTGT
TTTAGCATCTCTGAGCTTGTTCTCTGAACTATGTATTATACATGTTTGGATTCTTTTTT*
GTCTGTTTCCTTATTTTAACAATAATATGAT*****GGTAATGATAAACACTCTTATGAG
GTTTCG
TC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2F008TF 564 0 0
GGGG
AGATCGGCAAGGTCTCCGGGATCCCTGAGGAGCATCTTTCTCGCAAGGTGATAATATACT
CACCAGCTCGAAGTGCTACACAGCAAGGATCTGGCAAACTCGGCAAATGGAAGATTAACT
TCGTCTCCACCTTAAAGTGGGAGAACCCGTTGATGGGATGGACTTCTACGGGTGACCCTT
ATGCCAATGTTGGCGACTCTGCTCTTTCTTTTGATTCTGAAGTTGCTGCCAAGTCCTTTG
CTCAGCGTCATGGCTGGGATTTTGTGGTCAAGAAGCCCAAAACACCCCTATTGAAGCCTA
AGTCTTACTCGGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAACCTCAACCAGATCACTGATCTTCTT
CCATTTCTCGAGAAAAAAAGGAGAAACTTCATCTGATAAATAAAAAGAAACCTCTCATGG
TTTCTTTCTTGTTTTAGCATCTCTGAGCTTGTTCTCTGAACTATGTATTATACATGTTTG
GATTTTTTTTTTGTCTGTTTCCTTATTTTAACAATAATATGATATGATGGTAATGATAAA
CACTCTTATGAGGTTTCG
CC

QA 5 562 5 562
DS 

RD RR2F008JQ 560 0 0
AGATCGGCAAGGTCTCCGGGATCCCTGAGGAGCATCTTTCTCGCAAGGTGATAATATACT
CACCAGCTCGAAGTGCTACACAGCAAGGATCTGGCAAACTCGGCAAATGGAAGATTAACT
TCGTCTCCACCTTAAAGTGGGAGAACCCGTTGATGGGATGGACTTCTACGGGTGACCCTT
ATGCCAATGTTGGCGACTCTGCTCTTTCTTTTGATTCTGAAGTTGCTGCCAAGTCCTTTG
CTCAGCGTCATGGCTGGGATTTTGTGGTCAAGAAGCCCAAAACACCCCTATTGAAGCCTA
AGTCTTACTCGGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAACCTCAACCAGATCACTGATCTTCTT
CCATTTCTCGAGAAAAAAAGGAGAAACTTCATCTGATAAATAAAAAGAAACCTCTCATGG
TTTCTTTCTTGTTTTAGCATCTCTGAGCTTGTTCTCTGAACTATGTATTATACATGTTTG
GATTTTTTTTTTGTCTGTTTCCTTATTTTAACAATAATATGATATGATGGTAATGATAAA
CACTCTTATGAGGTTTCGCC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 3

CO CL2644Contig1 779 3 2 U
AGAAAGAAGAATTGGGATTTGAATAAATTGGGATTCAAGAAAGAAAACATCTGAAACAAC
ACCTACGTAAAGGTAAAACAAAAGTATGATAGGTCGGCTCAAAACTTGCATAAGACAAAC
CCTGATGATGATCTCAGTACTTGACTGGTGCAAGAATCTCCAGCTGTGCTCCAAGCTTCT
CTTCAGCGACCTTCTCGGCCTTGGCTCTAAGTTTGTTAAGTTGCTTCTTCCTCTCGTAAA
CCACTTGAGATCTCTCCTTCCTCTTTGCCTCCAGCTCCTTGATGGTGTCATAGTGATTCC
ACCCAACTTCAGAAGAAAGACGACCCAACAGACAGTACTTGTGGCCAGCCTGAAGCCTCA
ACACCTTTAGAGCGTCGGGGATAACCATCCTCTTGACTTTGTCATACGGTGGAGGCACAC
CTTCAAAAACCTTCATGCGTGCAAGTGCAGCGGCTCCACGCTTCGTTTTATGTGGAATCA
TACCGCGAACAGTACGCCAGAAGATCTTGGAGGGAGCACGGAAGTGAATGGGACCGTGCG
AGGGCTTGGTGTTCATGCGTTTGCGGAGGAACCTCATGTACTTCATTTTCTGACGCACGA
GTCCACCGGAGAGGCATATCTCCTCGCACCGCACGATGACGACCTTCTGGCCGTTGAGGA
GCTCCTTCGCGACGATCGACGCTAGGCGACCGAGCATGTGGTGCCGCGCGTCGACGACCA
CGCGCTTCGAGCAGATGCCTGATCCCGACACCATTTTTGTTTCTGCTTTGTGTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL24JQ U 139
AF RR2GN82JQ U 1
AF RR2GN82TF C 48
BS 1 586 RR2GN82JQ
BS 587 779 RR2GN82TF

RD RR2FL24JQ 103 0 0
ACTTGACTGGTGCAAGAATCTCCGGCTGTGCTCCAAGCTTCTCTTCACCGACCTTCTCGG
CTTTGGCTCTAAGTTTGTTAAGTTGCTTCTTCCTCTCGTAAAC

QA 1 103 1 103
DS 

RD RR2GN82JQ 586 0 0
AGAAAGAAGAATTGGGATTTGAATAAATTGGGATTCAAGAAAGAAAACATCTGAAACAAC
ACCTACGTAAAGGTAAAACAAAAGTATGATAGGTCGGCTCAAAACTTGCATAAGACAAAC
CCTGATGATGATCTCAGTACTTGACTGGTGCAAGAATCTCCAGCTGTGCTCCAAGCTTCT
CTTCAGCGACCTTCTCGGCCTTGGCTCTAAGTTTGTTAAGTTGCTTCTTCCTCTCGTAAA
CCACTTGAGATCTCTCCTTCCTCTTTGCCTCCAGCTCCTTGATGGTGTCATAGTGATTCC
ACCCAACTTCAGAAGAAAGACGACCCAACAGACAGTACTTGTGGCCAGCCTGAAGCCTCA
ACACCTTTAGAGCGTCGGGGATAACCATCCTCTTGACTTTGTCATACGGTGGAGGCACAC
CTTCAAAAACCTTCATGCGTGCAAGTGCAGCGGCTCCACGCTTCGTTTTATGTGGAATCA
TACCGCGAACAGTACGCCAGAAGATCTTGGAGGGAGCACGGAAGTGAATGGGACCGTGCG
AGGGCTTGGTGTTCATGCGTTTGCGGAGGAACCTCATGTACTTCAT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2GN82TF 732 0 0
CATCTGAAACAACAC*TACGTAAAGGTAAA*CAAAAGTATGATAGGTCGGCTCAAAACTT
GCATAAGACAAACCGTGATGATGATCTCAGTACTTGACTGGTGCAAGAATCTCCAGCTGT
GCTCCAAGCTTCTCTTCAGCGACCTTCTCGGCCTTGGCTCTAAGTTTGTTAAGTTGCTTC
TTCCTCTCGTAAACCACTTGAGATCTCTCCTTCCTCTTTGCCTCCAGCTCCTTGATGGTG
TCATAGTGATTCCACCCAACTTCAGAAGAAAGACGACCCAACAGACAGTACTTGTGGCCA
GCCTGAAGCCTCAACACCTTTAGAGCGTCGGGGATAACCATCCTCTTGACTTTGTCATAC
GGTGGAGGCACACCTTCAAAAACCTTCATGCGTGCAAGTGCAGCGGCTCCACGCTTCGTT
TTATGTGGAATCATACCGCGAACAGTACGCCAGAAGATCTTGGAGGGAGCACGGAAGTGA
ATGGGACCGTGCGAGGGCTTGGTGTTCATGCGTTTGCGGAGGAACCTCATGTACTTCATT
TTCTGACGCACGAGTCCACCGGAGAGGCATATCTCCTCGCACCGCACGATGACGACCTTC
TGGCCGTTGAGGAGCTCCTTCGCGACGATCGACGCTAGGCGACCGAGCATGTGGTGCCGC
GCGTCGACGACCACGCGCTTCGAGCAGATGCCTGATCCCGACACCATTTTTGTTTCTGCT
TTGTGTGTTTCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 4

CO CL2645Contig1 825 4 6 U
GGATCCTCGGTATTCACCTCACTATCCGTGGCCACCGTCCTCCTCCTCCTTCCCCCGGCA
CACCTGGAAACCTCTACGTCCTTAACCACCGTACTGCTCTTGACCCCATTATCATCGCCA
TTGCTCTCGGCCGTAAGATCTCTTGCGTCACTTATAGTGTTTCTCGCCTCTCCCGGATGC
TCTCACCCATCCCTGCCGTCGCTCTTACCCGAGACCGCGCCGCTGATGCTGCCCGCATGA
GAAAACTCCTCGAGAAAGGTGATTTGGTGATCTGCCCTGAAGGCACCACTTGTAGAGAAC
CGTATCTACTACGATTTAGTGCTCTATTTGCTGAGCTAAGCGACCGGATCGTGCCTGTGG
CCATGAACTGCAAGCAAGGGATGTTCAATGGAACGACAGTCAGAGGTGTAAAATTCTGGG
ACCCTTACTTCTTCTTCATGAACCCCAGACCTAGCTACGAAGCCACTTTCTTGGACCGTC
TGCCTGAAGAAATGACAGTAAACGGCGGCGGTAAAACGCCAATAGAGGTGGCAAATTACG
TGCAGAAGGTGATCGGTGGAGTATTGGGATTCGAGTGCACTGAGCTTACAAGGAAGGATA
AGTATCTTTTGCTTGGAGGCAACGACGGGAAGGTTGAGTCTATCAATAAGAGCAAGTCCA
AGGAGTAATAAATCCATCTAGCTTGTTACTCTGCTTTCTGCTATTTTACTTGGGAGTCAA
GTTAGGCATTTCTGGTTTTCACTTTTACTTTTTTTTTTCCGATTGATTTGTTGGAAGAAA
AGATTTACTAGTATTACATTTGAATCAACGAACCGTACGTTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2DL37TF U 1
AF RR2E446JQ C 136
AF RR2DL37JQ C 146
AF RR2C246TF U 556
BS 1 603 RR2DL37TF
BS 604 604 RR2C246TF
BS 605 757 RR2DL37TF
BS 758 758 RR2C246TF
BS 759 770 RR2DL37TF
BS 771 825 RR2C246TF

RD RR2DL37TF 770 0 0
GGATCCTCGGTATTCACCTCACTATCCGTGGCCACCGTCCTCCTCCTCCTTCCCCCGGCA
CACCTGGAAACCTCTACGTCCTTAACCACCGTACTGCTCTTGACCCCATTATCATCGCCA
TTGCTCTCGGCCGTAAGATCTCTTGCGTCACTTATAGTGTTTCTCGCCTCTCCCGGATGC
TCTCACCCATCCCTGCCGTCGCTCTTACCCGAGACCGCGCCGCTGATGCTGCCCGCATGA
GAAAACTCCTCGAGAAAGGTGATTTGGTGATCTGCCCTGAAGGCACCACTTGTAGAGAAC
CGTATCTACTACGATTTAGTGCTCTATTTGCTGAGCTAAGCGACCGGATCGTGCCTGTGG
CCATGAACTGCAAGCAAGGGATGTTCAATGGAACGACAGTCAGAGGTGTAAAATTCTGGG
ACCCTTACTTCTTCTTCATGAACCCCAGACCTAGCTACGAAGCCACTTTCTTGGACCGTC
TGCCTGAAGAAATGACAGTAAACGGCGGCGGTAAAACGCCAATAGAGGTGGCAAATTACG
TGCAGAAGGTGATCGGTGGAGTATTGGGATTCGAGTGCACTGAGCTTACAAGGAAGGATA
AGTTTCTTTTGCTTGGAGGCAACGACGGGAAGGTTGAGTCTATCAATAAGAGCAAGTCCA
AGGAGTAATAAATCCATCTAGCTTGTTACTCTGCTTTCTGCTATTTTACTTGGGAGTCAA
GTTAGGCATTTCTGGTTTTCACTTTTACTTTTTTTTT*CCGATTGATTTG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2E446JQ 690 0 0
AGATCTCTTGCGTCACTTATAGTGTTTCTCGTCTCTCCCGGATGCTCTCACCCATCCCTG
CCGTCGCTCTTACCCGAGACCGCGCCGCTGATGCTGCCCGCATGAGAAAACTCCTCGAGA
AAGGTGATTTGGTGATCTGCCCTGAAGGCACCACTTGTAGAGAACCGTATCTACTACGAT
TTAGTGCTCTATTTGCTGAGCTAAGCGACCGGATCGTGCCTGTGGCCATGAACTGCAAGC
AAGGGATGTTCAATGGAACGACAGTCAGAGGTGTAAAATTCTGGGACCCTTACTTCTTCT
TCATGAACCCCAGACCTAGCTACGAAGCCACTTTCTTGGACCGTCTGCCTGAAGAAATGA
CAGTAAACGGCGGCGGTAAAACGCCAATAGAGGTGGCAAATTACGTGCAGAAGGTGATCG
GTGGAGTATTGGGATTCGAGTGCACTGAGCTTACAAGGAAGGATAAGTATCTTTTGCTTG
GAGGCAACGACGGGAAGGTTGAGTCTATCAATAAGAGCAAGTCCAAGGAGTAATAAATCC
ATCTAGCTTGTTACTCTGCTTTCTGCTATTTTACTTGGGAGTCAAGTTAGGCATTTCTGG
TTTTCACTTTTACTTTTTTTTTTCCGATTGATTTGTTGGAAGAAAAGATTTACTAGTATT
ACATTTGAATCAACGAACCGTACGTTTAC
T

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2DL37JQ 680 0 0
CGTCACTTATAGTGTTTCTCGCCTCTCCCGGATGCTCTCACCCATCCCTGCCGTCGCTCT
TACCCGAGACCGCGCCGCTGATGCTGCCCGCATGAGAAAACTCCTCGAGAAAGGTGATTT
GGTGATCTGCCCTGAAGGCACCACTTGTAGAGAACCGTATCTACTACGATTTAGTGCTCT
ATTTGCTGAGCTAAGCGACCGGATCGTGCCTGTGGCCATGAACTGCAAGCAAGGGATGTT
CAATGGAACGACAGTCAGAGGTGTAAAATTCTGGGACCCTTACTTCTTCTTCATGAACCC
CAGACCTAGCTACGAAGCCACTTTCTTGGACCGTCTGCCTGAAGAAATGACAGTAAACGG
CGGCGGTAAAACGCCAATAGAGGTGGCAAATTACGTGCAGAAGGTGATCGGTGGAGTATT
GGGATTCGAGTGCACTGAGCTTACAAGGAAGGATAAGTTTCTTTTGCTTGGAGGCAACGA
CGGGAAGGTTGAGTCTATCAATAAGAGCAAGTCCAAGGAGTAATAAATCCATCTAGCTTG
TTACTCTGCTTTCTGCTATTTTACTTGGGAGTCAAGTTAGGCATTTCTGGTTTTCACTTT
TACTTTTTTTTTTCCGATTGATTTGTTGGAAGAAAAGATTTACTAGTATTACATTTGAAT
CAACGAACCGTACGTTTAC
C

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2C246TF 270 0 0
GTGGAGTATTGGGATTCGAGTGCACTGAGCTTACAAGGAAGGATAAGTATCTTTTGCTTG
GAGGCAACGACGGGAAGGTTGAGTCTATCAATAAGAGCAAGTCCAAGGAGTAATAAATCC
ATCTAGCTTGTTACTCTGCTTTCTGCTATTTTACTTGGGAGTCAAGTTAGGCATTTCTGG
TTTTCACTTTTACTTTTTTTTTTCCGATTGATTTGTTGGAAGAAAAGATTTACTAGTATT
ACATTTGAATCAACGAACCGTACGTTTACT

QA 1 270 1 270
DS 



AS 1 4

CO CL2646Contig1 1002 4 10 U
GGGTTGAATACATCTCTTTGCTTTCATCTCCTTCATCACCAAGCCAAGTCTCCTCCTCAA
GATCTGATCGTACGAGTTCGTTGACTTCGTCTCTAGAGAAATGAGTCAGCAGAAAGGTTT
GATTTACAGCTTCGTAGCCAAAGGAACCGTCGTTCTAGCCGAGCATACTCCTTACTCAGG
AAACTTCAGCACCATCGCTGTTCAATGTCTCCGAAAGCTTCCCACTAACAGCAGCAAGTA
TACTTACTCCTGCGATGGCCACACCTTCAACTTCCTTGTCGAAAACAATGGCTTTGTGTT
TCTTGTGGTTGCTGATGAGTCTACTGGAAGAAGTGTTCCTTTCGTGTTCCTTGAACGGGT
CAAAGAAGATTTCAAGAAACGGTATGAGGCGAGTATAAAGAACGATGAGCCACACCCTCT
TGCTGATGATGATGACGAAGACGATGATTTGTTTGGGGATCGGTTTAGCATCGCTTACAA
TCTTGACAGGGAGTTCGGGCCTATACTTAAGGAGCATATGCAGTATTGTATGAGCCATCC
TGAAGAGATGAGCAAACTTTCAAAGATGAAGGCTCAAATAAATGATGTCAAGGGGATCAT
GATGGACAACATTGAGAAGGTTCTGGACAGGGGAGAGAAGATAGAACTTCTGGTTGACAA
AACGGAGAACCTTCAGTTCCAGGCAGATAGCTTCCAGAGGCAAGGAAGTCAACTTAGAAG
GAAGATGTGGATACAGAGCCTGCAGATGAAGCTGATGGT**GGGAGGTGCTGTTTTGTCC
TTTATTCTCATCGTTTGGGTTGTTGCTTGTGGTGGTTTTAAATGCTCGTCTTGATTGTCT
GTATCTGTTTGATCGCCACCACCTTGTTTTACCACGTAAAACGCATGCTCATGTTTGTAC
ATGTTATGATCAATCATCATCATTCCCAGAAGCTTATCTATTATGCTTATATGTAAACAA
ATAAAAATTAAGTTTTGGCGTTCGCTTGTTTTCAGGAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC61TF U 1
AF RR2B085TF U 29
AF RR2B085JQ C 266
AF RR2EC61JQ C 281
BS 1 326 RR2EC61TF
BS 327 327 RR2B085TF
BS 328 558 RR2EC61TF
BS 559 719 RR2B085TF
BS 720 720 RR2B085JQ
BS 721 758 RR2B085TF
BS 759 761 RR2B085JQ
BS 762 864 RR2B085TF
BS 865 988 RR2B085JQ
BS 989 1002 RR2EC61JQ

RD RR2EC61TF 558 0 0
GGGTTGAATACATCTCTTTGCTTTCATCTCCTTCATCACCAAGCCAAGTCTCCTCCTCAA
GATCTGATCGTACGAGTTCGTTGACTTCGTCTCTAGAGAAATGAGTCAGCAGAAAGGTTT
GATTTACAGCTTCGTAGCCAAAGGAACCGTCGTTCTAGCCGAGCATACTCCTTACTCAGG
AAACTTCAGCACCATCGCTGTTCAATGTCTCCGAAAGCTTCCCACTAACAGCAGCAAGTA
TACTTACTCCTGCGATGGCCACACCTTCAACTTCCTTGTCGAAAACAATGGCTTTGTGTT
TCTTGTGGTTGCTGATGAGTCTACTGTAAGAAGTGTTCCTTTCGTGTTCCTTGAACGGGT
CAAAGAAGATTTCAAGAAACGGTATGAGGCGAGTATAAAGAACGATGAGCCACACCCTCT
TGCTGATGATGATGACGAAGACGATGATTTGTTTGGGGATCGGTTTAGCATCGCTTACAA
TCTTGACAGGGAGTTCGGGCCTATACTTAAGGAGCATATGCAGTATTGTATGAGCCATCC
TGAAGAGATGAGCAAACT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2B085TF 836 0 0
GG
CTTCATCACCAAGCCAAGTCTCCTCCTCAAGATCTGATCGTACGAGTTCGTTGACTTCGT
CTCTAGAGAAATGAGTCAGCAGAAAGGTTTGATTTACAGCTTCGTAGCCAAAGGAACCGT
CGTTCTAGCCGAGCATACTCCTTACTCAGGAAACTTCAGCACCATCGCTGTTCAATGTCT
CCGAAAGCTTCCCACTAACAGCAGCAAGTATACTTACTCCTGCGATGGCCACACCTTCAA
CTTCCTTGTCGAAAACAATGGCTTTGTGTTTCTTGTGGTTGCTGATGAGTCTACTGGAAG
AAGTGTTCCTTTCGTGTTCCTTGAACGGGTCAAAGAAGATTTCAAGAAACGGTATGAGGC
GAGTATAAAGAACGATGAGCCACACCCTCTTGCTGATGATGATGACGAAGACGATGATTT
GTTTGGGGATCGGTTTAGCATCGCTTACAATCTTGACAGGGAGTTCGGGCCTATACTTAA
GGAGCATATGCAGTATTGTATGAGCCATCCTGAAGAGATGAGCAAACTTTCAAAGATGAA
GGCTCAAATAAATGATGTCAAGGGGATCATGATGGACAACATTGAGAAGGTTCTGGACAG
GGGAGAGAAGATAGAACTTCTGGTTGACAAAACGGAGAACCTTCAGTTCCAGGCAGATAG
CTTCCAGAGGCAAGGAAGTCAACTTAGAAAGAAGATGTGGATACAGAGCCTGCAGATGAA
GCTGATGGGTGGGGAGGTGCTGTTTTGTCCTTTATTCTCATCGTTTGGGTTGTTGCTTGT
GGTGGTTTTAAATGCTCGTCTTGATTGTCTGTATCTGTTTGATCGCCACCACCT

QA 3 836 3 836
DS 

RD RR2B085JQ 724 0 0
TTCAACTTCCTTGTCGAAAACAATGGCTTTGTGTTTCTTGTGGTTGCTGATGAGTCTACT
GGAAGAAGTGTTCCTTTCGTGTTCCTTGAACGGGTCAAAGAAGATTTCAAGAAACGGTAT
GAGGCGAGTATAAAGAACGATGAGCCACACCCTCTTGCTGATGATGATGACGAAGACGAT
GATTTGTTTGGGGATCGGTTTAGCATCGCTTACAATCTTGACAGGGAGTTCGGGCCTATA
CTTAAGGAGCATATGCAGTATTGTATGAGCCATCCTGAAGAGATGAGCAAACTTTCAAAG
ATGAAGGCTCAAATAAATGATGTCAAGGGGATCATGATGGACAACATTGAGAAGGTTCTG
GACAGGGGAGAGAAGATAGAACTTCTGGTTGACAAAACGGAGAACCTTCAGTTCCAGGCA
GATAGCTTCCAGAGGCAAGGAAGTCAACTTAGAAGGAAGATGTGGATACAGAGCCTGCAG
ATGAAGCTGATGGT**GGGAGGTGCTGTTTTGTCCTTTATTCTCATCGTTTGGGTTGTTG
CTTGTGGTGGTTTTAAATGCTCGTCTTGATTGTCTGTATCTGTTTGATCGCCACCACCTT
GTTTTACCACGTAAAACGCATGCTCATGTTTGTACATGTTATGATCAATCATCATCATTC
CCAGAAGCTTATCTATTATGCTTATATGTAAACAAATAAAAATTAAGTTTTGGCGTTCGC
TTG
C

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2EC61JQ 722 0 0
GAAAACAATGGCTTTGTGTTTCTTGTGGTTGCTGATGAGTCTACTGTAAGAAGTGTTCCT
TTCGTGTTCCTTGAACGGGTCAAAGAAGATTTCAAGAAACGGTATGAGGCGAGTATAAAG
AACGATGAGCCACACCCTCTTGCTGATGATGATGACGAAGACGATGATTTGTTTGGGGAT
CGGTTTAGCATCGCTTACAATCTTGACAGGGAGTTCGGGCCTATACTTAAGGAGCATATG
CAGTATTGTATGAGCCATCCTGAAGAGATGAGCAAACTTTCAAAGTTGAAGGCTCAAATA
AATGATGTCAAGGGGATCATGATGGACAACATTGAGAAGGTTCTGGACAGGGGAGAGAAG
ATAGAACTTCTGGTTGACAAAACGGAGAACCTTCAGTTCCAGGCAGATAGCTTCCAGAGG
CAAGGAAGGCAACTTAGAAGGAAGATGTGGATACAGAGCCTGCAGATGAAGCTGATGGT*
*GGGAGGTGCTGTTTTGTCCTTTATTCTCATCGTTTGGGTTGTTGCTTGTGGTGGTTTTA
AATGCTCGTCTTGATTGTCTGTATCTGTTTGATCGCCACCACCTTGTTTTACCACGTAAA
ACGCATGCTCATGTTTGTACATGTTATGATCAATCATCATCATTCCCAGAAGCTTATCTA
TTATGCTTATATGTAAACAAATAAAAATTAAGTTTTGGCGTTCGCTTGTTTTCAGGAGTT
CC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 4

CO CL2647Contig1 1192 4 4 U
GGACCAGAGCGTATTCGTTCACTCTGTCTCCGCCTCTCTCTCTCGGGCTTCACAGTTTGT
TCAGTCTCGAAGATGTCGTTGACGGAGCTAGACGACGGAATGGTACGCAGGATGGCCATC
GGAGCAGTCTTCTCTGATTTCGGAGGGAAGATACGTTCGTTGGGTTTCCATAGGACTGAT
GATCTACTAGTAACATCTAGCGAGGACGATTCACTTCGCCCCTTCGATATCGCCAACGCT
AAACAGGTGAAGATTACATACCATAAGAAACATGGTACCGATCGTGTATGCTTTACTCAT
CATCCCAGCTCTCTTATTTGCTCTTCTCTTTACAATCTTGAGTCCACTGGAGAATCTTTG
AGATATCTCTCAATGTACGATAATAGGATTCTTCGCTACTTTAAAGGCCACAAAGACAGG
GTTGTATCCCTTTGTATGTCTCCTATTAATGATAGCTTCATGTCCGGTTCTCTCGACCGA
AGTGTCAGACTCTGGGATCTTCGTGTTAATGCCTGCCAGGGAATTCTACACCTACGTGGG
AGACCTGCAGTAGCTTATGACCAACAAGGCCTGGTTTTTGCAATTGCAATGGAAGGAGGT
GCTGTTAAATTGTTTGATTCCAGATGTTATGACAAGGGTCCCTTTGATACGTTTCTGGTG
GGTGGTGATACTGCTGAGGTCAATGATATAAAATTCAGCAACGATGGAAAATCTATGCTT
CTTACTACCACAAATAACAATATCTATGTTCTTGATGCTTATCATGGAGAGAAGAAATGC
GGTTTTAGTTTGGAGGCTTCGCAGGGTACATCCATAGAAGCCACCTTCACACCAGATGGC
AAGTATGTTCTGTCAGGTTCAGGAGACGGAACCTTACATGCGTGGAACATCGAGAACCCG
TTTGAGGTGGCGAGGTGGGAGAACAACATAGGAGTAGTGTCGTGTCTGAAATGGGCACCG
CGTAGAGCAATGTTCGTTGCTGCCTCCTCGGTTCTCACTTTTTGGATCCCCAACGACGGT
GAGGCACCAGCCCCCGCTGATCTTCCTGCCGACCAACAACCTCCTCAGTGACGACTTCAT
TGTTTGTTTCCGTTATGCAATATACACTTGATAACATTATCGGAAGTATTAGTACATTTA
ATCACAATATACACTATTGAAATTTTGTTAACCACAAAATACAAAATTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR64TF U 43
AF RR2B022TF U 1
AF RR2B022JQ C 527
AF RR2GR64JQ C 959
BS 1 464 RR2B022TF
BS 465 465 RR2GR64TF
BS 466 792 RR2B022TF
BS 793 1192 RR2B022JQ

RD RR2GR64TF 734 0 0
GG
GGGCTTCACAGTTTGTTCAGTCTCGAAGATGTCGTTGACGGAGCTAGACGACGGAATGGT
ACGCAGGATGGCCATCGGAGCAGTCTTCTCTGATTTCGGAGGGAAGATACGTTCGTTGGG
TTTCCATAGGACTGATGATCTACTAGTAACATCTAGCGAGGACGATTCACTTCGCCTCTT
CGATATCTCCAACGCTAAACAGGTGAAGATTACATACCATAAGAAACATGGTACCGATCG
TGTATGCTTTACTCATCATCCCAGCTCTCTTATTTGCTCTTCTCTTTACAATCTTGAGTC
CACTGGAGAATCTTTGAGATATCTCTCAATGTACGATAATAGGATTCTTCGCTACTTTAA
AGGCCACAAAGACAGGGTTGTATCCCTTTGTATGTCTCCTATTAATGATAGCTTCATGTC
CGGTTCTCTCGACCGAAGTGTCAGACTCTGGGATCTTCGTGTTAATGCCTGCCAGGGAAT
TCTACACCTACGTGGGAGACCTGCAGTAGCTTATGACCAACAAGGCCTGGTTTTTGCAAT
TGCAATGGAAGGAGGTGCTGTTAAATTGTTTGATTCCAGATGTTATGACAAGGGTCCCTT
TGATACGTTTCTGGTGGGTGGTGATACTGCTGAGGTCAATGATATAAAATTCAGCAACGA
TGGAAA*TCTATGCTTCTTACTACCACAAATAACAATATCTATGTTCTTGATGCTTATCA
TG*AGAGAAGAA

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR2B022TF 792 0 0
GGACCAGAGCGTATTCGTTCACTCTGTCTCCGCCTCTCTCTCTCGGGCTTCACAGTTTGT
TCAGTCTCGAAGATGTCGTTGACGGAGCTAGACGACGGAATGGTACGCAGGATGGCCATC
GGAGCAGTCTTCTCTGATTTCGGAGGGAAGATACGTTCGTTGGGTTTCCATAGGACTGAT
GATCTACTAGTAACATCTAGCGAGGACGATTCACTTCGCCCCTTCGATATCGCCAACGCT
AAACAGGTGAAGATTACATACCATAAGAAACATGGTACCGATCGTGTATGCTTTACTCAT
CATCCCAGCTCTCTTATTTGCTCTTCTCTTTACAATCTTGAGTCCACTGGAGAATCTTTG
AGATATCTCTCAATGTACGATAATAGGATTCTTCGCTACTTTAAAGGCCACAAAGACAGG
GTTGTATCCCTTTGTATGTCTCCTATTAATGATAGCTTCATGTCTGGTTCTCTCGACCGA
AGTGTCAGACTCTGGGATCTTCGTGTTAATGCCTGCCAGGGAATTCTACACCTACGTGGG
AGACCTGCAGTAGCTTATGACCAACAAGGCCTGGTTTTTGCAATTGCAATGGAAGGAGGT
GCTGTTAAATTGTTTGATTCCAGATGTTATGACAAGGGTCCCTTTGATACGTTTCTGGTG
GGTGGTGATACTGCTGAGGTCAATGATATAAAATTCAGCAACGATGGAAAATCTATGCTT
CTTACTACCACAAATAACAATATCTATGTTCTTGATGCTTATCATGGAGAGAAGAAATGC
GGTTTTAGTTTG

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2B022JQ 666 0 0
TACACCTACGTGGGAGACCTGCAGTAGCTTATGACCAACAAGGCCTGGTTTTTGCAATTG
CAATGGAAGGAGGTGCTGTTAAATTGTTTGATTCCAGATGTTATGACAAGGGTCCCTTTG
ATACGTTTCTGGTGGGTGGTGATACTGCTGAGGTCAATGATATAAAATTCAGCAACGATG
GAAAATCTATGCTTCTTACTACCACAAATAACAATATCTATGTTCTTGATGCTTATCATG
GAGAGAAGAAATGCGGTTTTAGTTTGGAGGCTTCGCAGGGTACATCCATAGAAGCCACCT
TCACACCAGATGGCAAGTATGTTCTGTCAGGTTCAGGAGACGGAACCTTACATGCGTGGA
ACATCGAGAACCCGTTTGAGGTGGCGAGGTGGGAGAACAACATAGGAGTAGTGTCGTGTC
TGAAATGGGCACCGCGTAGAGCAATGTTCGTTGCTGCCTCCTCGGTTCTCACTTTTTGGA
TCCCCAACGACGGTGAGGCACCAGCCCCCGCTGATCTTCCTGCCGACCAACAACCTCCTC
AGTGACGACTTCATTGTTTGTTTCCGTTATGCAATATACACTTGATAACATTATCGGAAG
TATTAGTACATTTAATCACAATATACACTATTGAAATTTTGTTAACCACAAAATACAAAA
TTTTCG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2GR64JQ 201 0 0
CGG
GTAGAGCAATGTTCGTTGCTGCCTCCTCGGTTTTCACTTTTTGGATCCCCAACGACGGTG
AGGCCCCAGCCCCCGCTGATTTTCCTGCCGACCAACAACCTCCTCAG*GAGGACTTCATT
GTTTGTTTCCGTTATGCAATATACACTTGATAACATTATCGGAAGTATTAGTACATTTAA
TCACAATATACACTATTG

QA 4 201 4 201
DS 



AS 1 4

CO CL2648Contig1 1224 4 10 U
GGGCATTGATATATATCAATGTTGACAGGGTCAAAGGCATCGTCTCCCTCGTTTCTCCCG
TTTCTCCTAGGGTTTCTTATCAGTTTGGCCGCCGCTCTTCGTCTCCGGTGGCTTCCATAG
CACCGGAGGCGGCGAGTCTCTGTATCTTGTCTCGGTTTAGCGTTCCTGGCTCTTGCTATT
TTCTATGGTTTAGATCCTCTTTGTTCCGGGGTGGGTCTGGTCCTTGGCTGGGAGGCGAGT
GGAGGCGCGTGGAGAGCTACTCTGTCATGTGGCGATGATAAGTCATCATCTGTCAAAGGT
TTAGATATGCTTCGGTTAATTTCTGGTCGTAGTTGTCCGGATCTCTGTGCTGACTTTTGG
ATCTGAGATTCTTTTCTCTTTGACGCTTGGATACATGGTGTGTTAGTCTCTTCTTTTCGT
TTTGGCTCATCTCCTTTGTCTTGCCTCCACTCAACGGAGAGGGTAAATCCTCTAAATCCT
TTTTTGACTCAAAGATTGACCTTTAGTCTCTCTTCATCTCTGGTACGGCAGTGGCGTTTT
GGCGACCGTGAGCAGAACAGGTTTAGCATCGTTGTTGTGATGAAGTTGGTTGTGTCACCT
CTCCATTCCTAGTTGTGGAGGAGTCCTTGCTGCATCTTTTAATAAGAGTTTGGTTTGTTC
CCGAATTGTTCGATGATCTCTGTTAATTCCTCGGTGGCTTCTCCTTGGATGTTTGAAGCA
GTAAAATGAGGTTGAGGCGTTGGTTCATTCGGAAGAAGATGCGGTTGGGAAGGTTTGTTC
CAGGTGTTTCCGGTTCAGGGTTACTTGTTTCAGGGGCGGTATGTGTGTTTGATGCTATTC
GGCGTGGTTCTGGCTTTGCACCGTGGACAGGAGAGTTCAGGTGAATTTCGGTTATGTTAA
ATCGCCGCTTGTTCGTTTGGCTAACCGTGGTCTCTTGCTAGACATCCGGTTCTCTTAGGC
CTTGTCTTTGTCATCTTTGGTCTTTTTAAGGTTCATATGAGGATCTCGTTGTAGGAAATT
GGTTTGAGTTTTAAAGTTATGTTTCAGGTTTTCCTGGATGCCCTTGTGATGGGTTTTAGT
CTCCTGTTGTTTGGGATTGTGTCTCCGGGGATATCAACGTGTTCCGCCGGCTTTTGTGTA
ACAAGTTGTATTGCATCCAGTGTTTAATATAAATCATTTGATGGGAAAAAAAAAATATAT
CAATGTTGAATTGTGTTACAGTTT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS60TF U 4
AF RR2AS28TF U 1
AF RR2CS60JQ C 696
AF RR2AS28JQ C 435
BS 1 232 RR2AS28TF
BS 233 233 RR2CS60TF
BS 234 272 RR2AS28TF
BS 273 273 RR2CS60TF
BS 274 730 RR2AS28TF
BS 731 731 RR2AS28JQ
BS 732 753 RR2AS28TF
BS 754 940 RR2AS28JQ
BS 941 941 RR2CS60JQ
BS 942 1224 RR2AS28JQ

RD RR2CS60TF 684 0 0
CATTGATATATATCAATGTTGACAGGGTCAAAGGCATCGTCTCCCTCGTTTCTCCCGTTT
CTCCTAGGGTTTCTTATCAGTTTGGCCGCCGCTCTTCGTCTCCGGTGGCTTCCATAGCAC
CTGAGGCGGCGAGTCTCTGTATCTTGTCTCGGTTTAGCGTTCCTGGCTCTTGCTATTTTC
TATGGTTTAGATCCTCTTTGTTCCGGGGTGGGTCTGGTCCTTGGCTGGGAGGCGAGTGGA
GGCGCGTGGAGAGCTACTCTGTCATGTGGCGATGATAAGTCATCATCTGTCAAAGGTTTA
GATATGCTTCGGTTAATTTCTGGTCGTAGTTGTCCGGATCTCTGTGCTGACTTTTGGATC
TGAGATTCTTTTCTCTTTGACGCTTGGATACGTGGTGTGTTAGTCTCTTCTTTTCGTTTT
GGCTCATCTCCTTTGTCTTGCCTCCACTCAACGGAGAGGGTAAATCCTCTAAATCCTTTT
TTGACTCAAAGATTGACCTTTAGTCTCTCTTCATCTCTGGTACGGCAGTGGCGTTTTGGC
GACCGTGAGCAGAACAGGTTTAGCATCGTTGTTGTGATGAAGTTGGTTGTGTCACCTCTC
CATTCCTAGTTGTGGAGGAGTCCTTGCTGCATCTTTTAATAAGAGTTTGGTTTGTTCCCG
AATTGTTCGATGATCTCTGTTAAT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2AS28TF 764 0 0
GGGCATTGATATATATCAATGTTGACAGGGTCAAAGGCATCGTCTCCCTCGTTTCTCCCG
TTTCTCCTAGGGTTTCTTATCAGTTTGGCCGCCGCTCTTCGTCTCCGGTGGCTTCCATAG
CACCGGAGGCGGCGAGTCTCTGTATCTTGTCTCGGTTTAGCGTTCCTGGCTCTTGCTATT
TTCTATGGTTTAGATCCTCTTTGTTCCGGGGTGGGTCTGGTCCTTGGCTGGGTGGCGAGT
GGAGGCGCGTGGAGAGCTACTCTGTCATGTGGTGATGATAAGTCATCATCTGTCAAAGGT
TTAGATATGCTTCGGTTAATTTCTGGTCGTAGTTGTCCGGATCTCTGTGCTGACTTTTGG
ATCTGAGATTCTTTTCTCTTTGACGCTTGGATACATGGTGTGTTAGTCTCTTCTTTTCGT
TTTGGCTCATCTCCTTTGTCTTGCCTCCACTCAACGGAGAGGGTAAATCCTCTAAATCCT
TTTTTGACTCAAAGATTGACCTTTAGTCTCTCTTCATCTCTGGTACGGCAGTGGCGTTTT
GGCGACCGTGAGCAGAACAGGTTTAGCATCGTTGTTGTGATGAAGTTGGTTGTGTCACCT
CTCCATTCCTAGTTGTGGAGGAGTCCTTGCTGCATCTTTTAATAAGAGTTTGGTTTGTTC
CCGAATTGTTCGATGATCTCTGTTAATTCCTCGGTGGCTTCTCCTTGGATGTTTGAAGCA
GTAAAATGAG*TTGAGGCGTTGGTTCATTCGGA
GAGATGCGGTT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2CS60JQ 403 0 0
GGCTTCTCCTTGGATGTTTGAAGCAGTAAAATGAGGTTGAGGCGTTGGTTCATTCGGAAG
AAGATGCGGTTGGGAAGGTTTGTTCCAGGTGTTTCCGGTTCAGGGTTACTTGTTTCAGGG
GCGGTATGTGTGTTTGATGCTATTCGGCGTGGTTCTGGCTTTGCACCGTGGACAGGAGAG
TTCAGGTTAATTTCGGTTATGTTAAATCGCCGCTTGTTCGTTTGGCTAACCGTGGTTTCT
TGCTAGACATCCGGTTTTTTTAGGCCTTGTTTTTGTCATCTTTGGTCTTTTTAAGGTTCA
TATGAGGATCTCGTTGTAGGAAATTGGTTTGAGTTTTAAAGTTATGTTTCAGGTTTTTTT
GGATGCCCTTGTGATGGGTTTTAGTCTCCTGTTGTTTGGGATT

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2AS28JQ 790 0 0
TTTGTCTTGCCTCCACTCAACGGAGAGGGTAAATCCTCTAAATCCTTTTTTGACTCAAAG
ATTGACCTTTAGTCTCTCTTCATCTCTGGTACGGCAGTGGCGTTTTGGCGACCGTGAGCA
GAACAGGTTTAGCATCGTTGTTGTGATGAAGTTGGTTGTGTCACCTCTCCATTCCTAGTT
GTGGAGGAGTCCTTGCTGCATCTTTTAATAAGAGTTTGGTTTGTTCCCGAATTGTTCGAT
GATCTCTGTTAATTCCTCGGTGGCTTCTCCTTGGATGTTTGAAGCAGTAAAATGAGGTTG
AGGCGTTGGTTCATTCGGAAGAAGATGCGGTTGGGAAGGTTTGTTCCAGGTGTTTCCGGT
TCAGGGTTACTTGTTTCAGGGGCGGTATGTGTGTTTGATGCTATTCGGCGTGGTTCTGGC
TTTGCACCGTGGACAGGAGAGTTCAGGTGAATTTCGGTTATGTTAAATCGCCGCTTGTTC
GTTTGGCTAACCGTGGTCTCTTGCTATACATCCGGTTCTCTTAGGCCTTGTCTTTGTCAT
CTTTGGTCTTTTTAAGGTTCATATGAGGATCTCGTTGTAGGAAATTGGTTTGAGTTTTAA
AGTTATGTTTCAGGTTTTCCTGGATGCCCTTGTGATGGGTTTTAGTCTCCTGTTGTTTGG
GATTGTGTCTCCGGGGATATCAACGTGTTCCGCCGGCTTTTGTGTAACAAGTTGTATTGC
ATCCAGTGTTTAATATAAATCATTTGATGGGAAAAAAAAAATATATCAATGTTGAATTGT
GTTACAGTTT

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 4

CO CL2649Contig1 775 4 3 U
AAGTGCCCGAAATCCTTTGTTTATATGAACTTTGGAGTAAGTGAATAACTTTTATTGGTT
TAATTTCTATCTATCAAACGGTACACAGAGCATTCTTTGGTTTACATGTTTTGTACATGA
TATATATGACTCGCGTTGTGTGTGTCCTTTCTCTCTTCTTCCTCCGAGACGCAGAAACCT
CAGGGTGAGAGCGCTCATGGCGGTGCAAGACTTTAAGCTTCCCGACCAATGGGAACCGAG
CAAAAGTGTTGATTCTGATTTCTAAGGACACAAAAACTTAGAGGTCTCTAAAAATGGAAC
CAATTGGGAGCAAGGCATTCTTATGGGAGAGAATACAACGGTTAGTCTGGCGTGATCTGA
GAGAGAGTAATTTTCTGGCCACACTCCTTTCTCCAATTCAGGAGGAAACAATACTGCGTT
CTTGACGCTGAAACCAACTGTTTGTTCTTGGTTACCTTTTGCATCTCCGTCCTCTGCATC
TCTTTGTTCACTCCACGTCGGATTCCAAATTCTTTGCTGAAACTCCTTGTAATCGAGAAG
ACCGTTTCCATCGCTGTCAGCTTGAATCCACAGATCCTTAATCTCTTTTGTCGTGAGTCC
ATTGCAGTGACCCGTTAGATTGAGCTGTCGAAGAGTCTCGCAGAAGCCCATGAATGTAAT
GTGGTCACCATCATTGTCGGTTTTAAGAAAGGCAAACGCATCTTCAGCTGTTAGTGAAGC
TCTTCTCAGTAGATACCTGAACATGCCAAACACTGCCTCGCTCCAACTTGTTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK42JQ U 1
AF RR2EK42TF C 12
AF RR2EJ30JQ U 38
AF RR2EJ30TF C 332
BS 1 687 RR2EK42JQ
BS 688 743 RR2EJ30JQ
BS 744 775 RR2EJ30TF

RD RR2EK42JQ 687 0 0
AAGTGCCCGAAATCCTTTGTTTATATGAACTTTGGAGTAAGTGAATAACTTTTATTGGTT
TAATTTCTATCTATCAAACGGTACACAGAGCATTCTTTGGTTTACATGTTTTGTACATGA
TATATATGACTCGCGTTGTGTGTGTCCTTTCTCTCTTCTTCCTCCGAGACGCAGAAACCT
CAGGGTGAGAGCGCTCATGGCGGTGCAAGACTTTAAGCTTCCCGACCAATGGGAACCGAG
CAAAAGTGTTGATTCTGATTTCTAAGGACACAAAAACTTAGAGGTCTCTAAAAATGGAAC
CAATTGGGAGCAAGGCATTCTTATGGGAGAGAATACAACGGTTAGTCTGGCGTGATCTGA
GAGAGAGTAATTTTCTGGCCACACTCCTTTCTCCAATTCAGGAGGAAACAATACTGCGTT
CTTGACGCTGAAACCAACTGTTTGTTCTTGGTTACCTTTTGCATCTCCGTCCTCTGCATC
TCTTTGTTCACTCCACGTCGGATTCCAAATTCTTTGCTGAAACTCCTTGTAATCGAGAAG
ACCGTTTCCATCGCTGTCAGCTTGAATCCACAGATCCTTAATCTCTTTTGTCGTGAGTCC
ATTGCAGTGACCCGTTAGATTGAGCTGTCGAAGAGTCTCGCAGAAGCCCATGAATGTAAT
GTGGTCACCATCATTGTCGGTTTTAAG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2EK42TF 688 0 0
ATCCTTTGTTTATATGAACTTTGGAGTAAGTGAATAACTTTTATTGGTTTAATTTCTATC
TATCAAACGGTACACAGAGCATTCTTTGGTTTACATGTTTTGTACATGATATATATGACT
CGCGTTGTGTGTGTCCTTTCTCTCTTCTTCCTCCGAGACGCAGAAACCTCAGGGTGAGAG
CGCTCATGGCGGTGCAAGACTTTAAGCTTCCCGACCAATGGGAACCGAGCAAAAGTGTTG
ATTCTGATTTCTAAGGACACAAAAACTTAGAGGTCTCTAAAAATGGAACCAATTGGGAGC
AAGGCATTCTTATGGGAGAGAATACAACGGTTAGTCTGGCGTGATCTGAGAGAGAGTAAT
TTTCTGGCCACACTCCTTTCTCCAATTCAGGAGGAAACAATACTGCGTTCTTGACGCTGA
AACCAACTGTTTGTTCTTGGTTACCTTTTGCATCTCCGTCCTCTGCATCTCTTTGTTCAC
TCCACGTCGGATTCCAAATTCTTTGCTGAAACTCCTTGTAATCGAGAAGACCGTTTCCAT
CGCTGTCAGCTTGAATCCACAGATCCTTAATCTCTTTTGTCGTGAGTCCATTGCAGTGAC
CCGTTAGATTGAGCTGTCGAAGAGTCTCGCAGAAGCCCATGAATGTAATGTGGTCACCAT
CATTGTCGGTTTTAAGAAAGGCAAACGC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2EJ30JQ 706 0 0
CAG
GTGAATAACTTTTATTGGTTTAATTTCTATCTATCAAACGGTACACAGAGCATTCTTTGG
TTTACATGTTTTGTACATGATATATATGACTCGTGTTGTGTGTGTCCTTTCTCCCTTCTT
CCTCCGAGGCGCAAAAACCTCAGGGTGAGAGCGCTCATGGCGGTGCAAGACTTTAAGCTT
CCCGACCAATGGGAACCGAGCAAAAGTGTTGATTCTGATTTCTAAGGACACAAAAACTTA
AAGGTCTCTAAAAATGGAACCAATTGGGAGCAAGGCATTCTTATGGGAGAGAATACAACG
GTTAGTCTGGCGTGATCTGAGAGAGAGTAATTTTCTGGCCACACTCCTTTCTCCACTTCA
GGAGGAAACAATGCTGCGTTCTTGACGCTGAAACCAACTGTTTGTTCTTGGTTACCTTTT
GCATCTCCGTCCTCTGCATCTCTTTGTTCACTCCACGTCGGATTCCAAATTCTTTGCTGA
AACTCCTTGTAATCGAGAAGACCGTTTCCATCGCTGTCAGCTTGAATCCACAGATCCTTA
ATCTCTTTTGTTGTGAGTCCATTGCAGTGACCCGTTAGATTGAGCTGTCGAAGAGTCTCG
CAGAAGCCCATGAATGTAATGTGGTCACCATCATTGTCGGTTTTAAGAAAGGCAAACGCA
TCTTCAGCTGTTAGTGAAGCTCTTCTCAGTAGATACCTGAACA

QA 4 706 4 706
DS 

RD RR2EJ30TF 444 0 0
AATACAACGGTTAGTCTGGCGTGATCTGAGAGAGAGTAATTTTCTGGCCACACTCCTTTC
TCCACTTCAGGAGGAAACAATGCTGCGTTCTTGACGCTGAAACCAACTGTTTGTTCTTGG
TTACCTTTTGCATCTCCGTCCTCTGCATCTCTTTGTTCACTCCACGTCGGATTCCAAATT
CTTTGCTGAAACTCCTTGTAATCGAGAAGACCGTTTCCATCGCTGTCAGCTTGAATCCAC
AGATCCTTAATCTCTTTTGTTGTGAGTCCATTGCAGTGACCCGTTAGATTGAGCTGTCGA
AGAGTCTCGCAGAAGCCCATGAATGTAATGTGGTCACCATCATTGTCGGTTTTAAGAAAG
GCAAACGCATCTTCAGCTGTTAGTGAAGCTCTTCTCAGTAGATACCTGAACATGCCAAAC
ACTGCCTCGCTCCAACTTGTTTTA

QA 1 444 1 444
DS 



AS 1 4

CO CL2650Contig1 765 4 15 U
GCAGGTAAGTGGGCCAAATACGGTGAGTTCCAGCTTGGAATCAAGTTAAGTGGGAAGCGA
GTTGGGATACTTGGACTAGGGAGTATAGGATCACTTATCGCTAAAAGACTCGAACCCTTT
GGCTGCATCATCTCTTACAACTCGACATGTAAGAAACAGAGCATCCCCTACCTTTACTAC
CCGGACGTTGTCTCCTTAGCAGCAAACAACGATGTCATAATCCTCTGCTGCGCTCTGAAT
GATCAGACTCGTCACATTGTGAACAGACAAGTGATGGAGTCTCTTGGGAAGAACGGGGTT
ATAATCAATGTGGGACGAGGAGGACTGATTGATAAGAAGGAATTGGTTAAGTGTCTGGTC
GAAGGTGTGATTGGTGGTGCCGGTTTAGATGCGTTTGAGAAAGAACCTGGAGTTCCTGCC
GAGTTGTTTGGTTTGGACAATGTTGTCTTGTCTCCGCATACTGCTATAGCCACGCCAGGG
TCTTTCAACAATGTTGTGGAGCTTGCTTTAGGTAACTTGAAGGCGTTTTTCTTGAACCAG
CCTTTGATTTCCCCGGTTCGGTTAGATTGAGATATCGTCCGATTTGATCTAAGCGGCTAA
TTATCAATCTATATTTTTTTTTTTATTGAACTACATTTGAGGAAAAAAAGAGAAGAAAGA
GAGGTTATTGTTGATCATTGGACAAGGCATAGAGAATATCAAAATCAAGATGCTAATGTA
TGTGTATGGGAGCGATCTGTGGAGGAATTAAATTAATTTTAATGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AA46JQ U 39
AF RR2AA46TF C 39
AF RR2B666JQ C 1
AF RR2B666TF U 1
BS 1 43 RR2B666TF
BS 44 167 RR2AA46JQ
BS 168 168 RR2B666TF
BS 169 218 RR2AA46JQ
BS 219 219 RR2B666TF
BS 220 221 RR2AA46JQ
BS 222 222 RR2B666TF
BS 223 267 RR2AA46JQ
BS 268 268 RR2B666TF
BS 269 341 RR2AA46JQ
BS 342 342 RR2B666TF
BS 343 362 RR2AA46JQ
BS 363 363 RR2B666TF
BS 364 470 RR2AA46JQ
BS 471 765 RR2B666TF

RD RR2AA46JQ 432 0 0
GTTGC
AGTTAAGTGGGAAGCGAGTTGGGATACTTGGACTAGGGAGTATAGGATCACTTATCGCTA
AAAGACTCGAACCCTTTGGCTGCATCATCTCTTACAACTCGACATGTAAGAAACAGAGCA
TCCCTTACCTTTACTACCCGGACGTTGTCTCCTTAGCAGCAAACAACGATGTCATCATTC
TCTGCTGCGCTCTGAATGATCAGACTCGTCACATTGTGAACAGAGAAGTGATGGAGTCTC
TTGGGAAGAACGGGGTTATAATCAATGTGGGACGAGGAGGACTGATTGATAAGAAGGAGT
TGGTTAAGTGTCTGGTCGATGGTGTGATTGGTGGTGCCGGTTTAGATGCGTTTGAGAAAG
AACCTGGAGTTCCTGCCGAGTTGTTTGGTTTGGACAATGTTGTCTTGTCTCCGCATACTG
CTATAGC

QA 6 432 6 432
DS 

RD RR2AA46TF 432 0 0
GTTGC
AGTTAAGTGGGAAGCGAGTTGGGATACTTGGACTAGGGAGTATAGGATCACTTATCGCTA
AAAGACTCGAACCCTTTGGCTGCATCATCTCTTACAACTCGACATGTAAGAAACAGAGCA
TCCCTTACCTTTACTACCCGGACGTTGTCTCCTTAGCAGCAAACAACGATGTCATCATTC
TCTGCTGCGCTCTGAATGATCAGACTCGTCACATTGTGAACAGAGAAGTGATGGAGTCTC
TTGGGAAGAACGGGGTTATAATCAATGTGGGACGAGGAGGACTGATTGATAAGAAGGAGT
TGGTTAAGTGTCTGGTCGATGGTGTGATTGGTGGTGCCGGTTTAGATGCGTTTGAGAAAG
AACCTGGAGTTCCTGCCGAGTTGTTTGGTTTGGACAATGTTGTCTTGTCTCCGCATACTG
CTATAGC

QA 6 432 6 432
DS 

RD RR2B666JQ 765 0 0
GCAGGTAAGTGGGCCAAATACGGTGAGTTCCAGCTTGGAATCAAGTTAAGTGGGAAGCGA
GTTGGGATACTTGGACTAGGGAGTATAGGATCACTTATCGCTAAAAGACTCGAACCCTTT
GGCTGCATCATCTCTTACAACTCGACATGTCAGAAACAGAGCATCCCCTACCTTTACTAC
CCGGACGTTGTCTCCTTAGCAGCAAACAACGATGTCATAATCCTCTGCTGCGCTCTGAAT
GATCAGACTCGTCACATTGTGAACAGACAAGTGATGGAGTCTCTTTGTAAGAACGGGGTT
ATAATCAATGTGGGACGAGGAGGACTGATTGATGAGAAGGAATTGGTTAAGTGTCTGGTG
GAAGGTGTGATTGGTGGTGCCGGTTTAGATGCGTTTGAGAAAGAACCTGGAGTTCCTGCC
GAGTTGTTTGGTTTGGACAATGTTGTTTTGTCTCCGCATACTGCTATAGCCACGCCAGGG
TCTTTCAACAATGTTGTGGAGCTTGCTTTAGGTAACTTGAAGGCGTTTTTCTTGAACCAG
CCTTTGATTTCCCCGGTTCGGTTAGATTGAGATATCGTCCGATTTGATCTAAGCGGCTAA
TTATCAATCTATATTTTTTTTTTTATTGAACTACATTTGAGGAAAAAAAGAGAAGAAAGA
GAGGTTATTGTTGATCATTGGACAAGGCATAGAGAATATCAAAATCAAGATGCTAATGTA
TGTGTATGGGAGCGATCTGTGGAGGAATTAAATTAATTTTAATGT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2B666TF 765 0 0
GCAGGTAAGTGGGCCAAATACGGTGAGTTCCAGCTTGGAATCAAGTTAAGTGGGAAGCGA
GTTGGGATACTTGGACTAGGGAGTATAGGATCACTTATCGCTAAAAGACTCGAACCCTTT
GGCTGCATCATCTCTTACAACTCGACATGTCAGAAACAGAGCATCCCCTACCTTTACTAC
CCGGACGTTGTCTCCTTAGCAGCAAACAACGATGTCATAATCCTCTGCTGCGCTCTGAAT
GATCAGACTCGTCACATTGTGAACAGACAAGTGATGGAGTCTCTTTGTAAGAACGGGGTT
ATAATCAATGTGGGACGAGGAGGACTGATTGATGAGAAGGAATTGGTTAAGTGTCTGGTG
GAAGGTGTGATTGGTGGTGCCGGTTTAGATGCGTTTGAGAAAGAACCTGGAGTTCCTGCC
GAGTTGTTTGGTTTGGACAATGTTGTTTTGTCTCCGCATACTGCTATAGCCACGCCAGGG
TCTTTCAACAATGTTGTGGAGCTTGCTTTAGGTAACTTGAAGGCGTTTTTCTTGAACCAG
CCTTTGATTTCCCCGGTTCGGTTAGATTGAGATATCGTCCGATTTGATCTAAGCGGCTAA
TTATCAATCTATATTTTTTTTTTTATTGAACTACATTTGAGGAAAAAAAGAGAAGAAAGA
GAGGTTATTGTTGATCATTGGACAAGGCATAGAGAATATCAAAATCAAGATGCTAATGTA
TGTGTATGGGAGCGATCTGTGGAGGAATTAAATTAATTTTAATGT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL2651Contig1 769 2 4 U
GGACGTCCAAGACTCTCCCATTCTCAGCCATGGCGTCATCTTACGTCACCTTCTCAACGG
TCACTCCGGCGATCACCGGAAAGAACAGTGTTTCCGACATTCGAGGCTTCTCGCAATCCG
CCTTCACGCGCCGCCGTGTAACTCCATTTCGGAATGCTCAGAGGAGGAGAGTATTGAGAA
CTTCGGTTATGGCGAAAACGGCGACCGAGAAGACGACGGCGAAGAAAGCTATGGAGTACA
GGAAGTTAGGGGATTCGGAGCTCAATATCAGCGAGATTACGATGGGCACTATGACATTTG
GGGAGCAGAATACTGAGAAAGAATCTCATGAGATGCTGAGTTATGCAGCTGAGCATGGCA
TCAACTGCATTGACACTGCTGAAGCCTATCCTGTCCCGATGAAGAAGGAGACCCAAGGGA
AAACTGATCTTTATATCAGTAGCTGGTTGAAGTCTCAGAGCCGTGACAAGATTGTTTTGG
CAACTAAATTATGTGGGTACTCAGAAAGAACAGCATACCTGCGGGAGAATGCGGAGGTTA
CGCGTGTAGATGCAGCTAATATCAAAGACAGCGTCGAGAAAAGTCTCAAACGCCTTGGCA
CTGACTACATTGATTTGCTTCAAATACACTGGCCAGATCGGTATGTACCACTCTTTGGTG
ATAACTACTATGATCCATCAAAATGGAGAAATAGTGTGCCATTTGTGGAGCAGCTAAGAG
CCTTCCAGGATCTCATTAACGAAGGAAAGGTCGCTACATCGGTGTCTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A354TF U 1
AF RR2EM76TF U 20
BS 1 616 RR2A354TF
BS 617 617 RR2EM76TF
BS 618 742 RR2A354TF
BS 743 769 RR2EM76TF

RD RR2A354TF 742 0 0
GGACGTCCAAGACTCTCCCATTCTCAGCCATGGCGTCATCTTACGTCACCTTCTCAACGG
TCACTCCGGCGATCACCGGAAAGAACAGTGTTTCCGACATTCGAGGCTTCTCGCAATCCG
CCTTCACGCGCCGCCGTGTAACTCCATTTCGGAATGCTCAGAGGAGGAGAGTATTGAGAA
CTTCGGTTATGGCGAAAACGGCGACCGAGAAGACGACGGCGAAGAAAGCTATGGAGTACA
GGAAGTTAGGGGATTCGGAGCTCAATATCAGCGAGATTACGATGGGCACTATGACATTTG
GGGAGCAGAATACTGAGAAAGAATCTCATGAGATGCTGAGTTATGCAGCTGAGCATGGCA
TCAACTGCATTGACACTGCTGAAGCCTATCCTGTCCCGATGAAGAAGGAGACCCAAGGGA
AAACTGATCTTTATATCAGTAGCTGGTTGAAGTCTCAGAGCCGTGACAAGATTGTTTTGG
CAACTAAATTATGTGGGTACTCAGAAAGAACAGCATACCTGCGGGAGAATGCGGAGGTTA
CGCGTGTAGATGCAGCTAATATCAAAGACAGCGTCGAGAAAAGTCTCAAACGCCTTGGCA
CTGACTACATTGATTTTCTTCAAATACACTGGCCAGATCGGTATGTACCACTCTTTGGTG
ATAACTACTATGATCCATCAAAATGGAGAAATAGTGTGCCATTTGTGGAGCAGCTAAGAG
CCTTCCAGGATCTCATTAACGA

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2EM76TF 750 0 0
GG
TCTCAGCCATGGCGTCATCTTACGTCACCTTCTCAACGGTCACTCCGGCGATCACCGGAA
AGAACAGTGTTTCCGACATTCGAGTCTTCTCGCAATCCGCCTTCACGCGCCGCCGTGTAA
CTCCATTTCGGAATGCTCAGAGGAGGAGAGTATTGAGAACTTCGGTTATGGCGAAAACGG
CGACCGAGAAGACGACGGCGAAGAAAGCTATGGAGTACAGGAAGTTAGGGGATTCGGAGC
TCAATATCAGCGAGATTACGATGGGCACTATGACATTTGGGGAGCAGAATACTGAGAAAG
AATCTCATGAGATGCTGAGTTATGCAGCTGAGCATGGCATCAACTGCATTGACACTGCTG
AAGCCTATCCTGTCCCGATGAAGAAGGAGACCCAGGGGAAAACTGATCTTTATATCAGTA
GCTGGTTGAAGTCTCAGAGCCGTGACAAGATTGTTTTGGCAACTAAATTATGTGGGTACT
CAGAAAGAACAGTATACCTGCGGGAGAATGCGGAGGTTACGCGTGTAGATGCAGCTAATA
TCAAAGACATCGTCGAGAAAAGTCTCAAACGCCTTGGCACTGACTACATTGATTTGCTTC
AAATACACTGGCCAGATCGGTATGTACCACTCTTTGGTGATAACTACTATGATCCATCAA
AATGGAGAAGTAGTGTGCCATTTGTGGAGCAGCTAAGAGCCTTCCAGGATCTCATTAACG
AAGGAAAGGTCGCTACATCGGTGTCTCA

QA 3 750 3 750
DS 



AS 1 4

CO CL2652Contig1 837 4 14 U
TCTCATCAGATCTCAGATCTCTCAAGCTCCTCGACGACAGGCTCGTCCCTGCAGCTGGTT
CGGGAGATTCGAAGGTGTTTTATCTGAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACTTGGCTG
AGTTTAAGACTGGTCAGGAGAGGAAGGACGCTGCTGAGAATACTCTCTCTGCTTATAAGT
CTGCTCAGGATATTGCGAACGCAGAGCTAGCTCCAACTCACCCGATTCGTCCTGGTCTTG
CATTGAACTTCTCTGTGTTCTACTACGAGATCCTCAACTCTCCTGATCGTGCCTGCAGCC
TCGCTAAACAGGCTTTTGATGACGCGATAGCAGAGTTGGACACTCTAGGTGAAGAGTCGT
ACAAAGACAGCACCTTGATCACGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCG
ACATGCAGGATGATGATGCTGGGGAGGAGATCAAGGAAGCATCAGCTCCAAAGCCAACTG
AGGAACAGTAGTAGTAACAATCTTTTTTGATTGAACTGCTAAGTTTCTAGGGGGTTTCGT
CCATATGTCTCCTTAAGATGTCGTTCGCTTGCTTGCCAATTTAGCTTTATCTCCAAAAGC
TTTTTTATTCATTCATCATATTTCTGGCGAGTCGAACCACATCAATCATCTTTTATCTCT
TTGCTTGATTTTCTTTTCTTTGTTTCTTTTTGTTCTGTCTTTTTTACTTTTTGGTTTGTG
TTATCCATTTCAATGTCTGCTATATACCTGCTTTGTGTTTTCTTATCAATTTGAAGATCA
TAAAGTCTTCCTGTCTCCCTTTATCTTGTTCCAACTTAAAAACGGGGCTACTTTACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C906TF U 1
AF RR2AT19TF U 69
AF RR2C906JQ C 1
AF RR2AT19JQ C 69
BS 1 92 RR2C906TF
BS 93 93 RR2AT19TF
BS 94 378 RR2C906TF
BS 379 380 RR2AT19TF
BS 381 514 RR2C906TF
BS 515 515 RR2AT19TF
BS 516 548 RR2C906TF
BS 549 549 RR2AT19TF
BS 550 626 RR2C906TF
BS 627 627 RR2AT19TF
BS 628 670 RR2C906TF
BS 671 708 RR2AT19TF
BS 709 729 RR2C906JQ
BS 730 837 RR2AT19JQ

RD RR2C906TF 670 0 0
TCTCATCAGATCTCAGATCTCTCAAGCTCCTCGACGACAGGCTCGTCCCTGCAGCTGGTT
CGGGAGATTCGAAGGTGTTTTATCTGAAGATGTAGGGGGATTACCATAGGTACTTGGCTG
AGTTTAAGACTGGTCAGGAGAGGAAGGACGCTGCTGAGAATACTCTCTCTGCTTATAAGT
CTGCTCAGGATATTGCGAACGCAGAGCTAGCTCCAACTCACCCGATTCGTCCTGGTCTTG
CATTGAACTTCTCTGTGTTCTACTACGAGATCCTCAACTCTCCTGATCGTGCCTGCAGCC
TCGCTAAACAGGCTTTTGATGACGCGATAGCAGAGTTGGACACTCTAGGTGAAGAGTCGT
ACAAAGACAGCACCTTGA**ACGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCG
ACATGCAGGATGATGATGCTGGGGAGGAGATCAAGGAAGCATCAGCTCCAAAGCCAACTG
AGGAACAGTAGTAGTAACAATCTTTTTTGATTGAGCTGCTAAGTTTCTAGGGGGTTTCGT
CCATATGTTTCCTTAAGATGTCGTTCGCTTGCTTGCCAATTTAGCTTTATCTCCAAAAGC
TTTTTTATTCATTCATCATATTTCTGTCGAGTCGAACCACATCAATCATCTTTTATCTCT
TTGCTTGATT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2AT19TF 640 0 0
G
CGAAGGTGTTTTATCTGAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACTTGGCTGAGTTTAAGA
CTGGTCAGGGGAGGAAGGACGCTGCTGAGAATACTCTCTCTGCTTATAAGTCTGCTCAGG
ATATTGCGAACGCAGAGCTAGCTCCAACTCACCCGATTCGTCTTGGTCTTGCATTGAACT
TCTCTGTGTTCTACTACGAGATCCTCAACTCTCCTGATCGTGCCTGCAGCCTCGCTAAAC
AGGCTTTTGATGACGCGATAGCAGAGTTGGACACTCTAGGTGAAGAGTCGTACAAAGACA
GCACCTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATGCAGG
ATGATGATGCTGGGGAGGAGATCAAGGAAGCATCAGCTCCAAAGCCAACTGAGGAACAGT
AGTAGTAACAATCTTTTTTGATTGAACTGCTAAGTTTCTAGGGGGTTTCGTCCATATGTC
TCCTTAAGATGTCGTTCGCTTGCTTGCCAATTTAGCTTTATCTCCAAAAGCTTTTTTATT
CATTCATCATATTTCTGGCGAGTCGAACCACATCAATCATCTTTTATCTCTTTGCTTGAT
TTTCTTTTCTTTGTTTCTTTTTGTTCTGTCTTTTTTACT

QA 2 640 2 640
DS 

RD RR2C906JQ 729 0 0
TCTCATCAGATCTCAGATCTCTCAAGCTCCTCGACGACAGGCTCGTCCCTGCAGCTGGTT
CGGGAGATTCGAAGGTGTTTTATCTGAAGATGTAGGGGGATTACCATAGGTACTTGGCTG
AGTTTAAGACTGGTCAGGAGAGGAAGGACGCTGCTGAGAATACTCTCTCTGCTTATAAGT
CTGCTCAGGATATTGCGAACGCAGAGCTAGCTCCAACTCACCCGATTCGTCCTGGTCTTG
CATTGAACTTCTCTGTGTTCTACTACGAGATCCTCAACTCTCCTGATCGTGCCTGCAGCC
TCGCTAAACAGGCTTTTGATGACGCGATAGCAGAGTTGGACACTCTAGGTGAAGAGTCGT
ACAAAGACAGCACCTTGA**ACGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCG
ACATGCAGGATGATGATGCTGGGGAGGAGATCAAGGAAGCATCAGCTCCAAAGCCAACTG
AGGAACAGTAGTAGTAACAATCTTTTTTGATTGAGCTGCTAAGTTTCTAGGGGGTTTCGT
CCATATGTTTCCTTAAGATGTCGTTCGCTTGCTTGCCAATTTAGCTTTATCTCCAAAAGC
TTTTTTATTCATTCATCATATTTCTGTCGAGTCGAACCACATCAATCATCTTTTATCTCT
TTGCTTGATTTTCTTTTCTTTGTTTCTTTTTGTTCTGTCTTTTTTACTTTTTGGTTTGTG
TTATCCATT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2AT19JQ 769 0 0
G
CGAAGGTGTTTTATCTGAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACTTGGCTGAGTTTAAGA
CTGGTCAGGGGAGGAAGGACGCTGCTGAGAATACTCTCTCTGCTTATAAGTCTGCTCAGG
ATATTGCGAACGCAGAGCTAGCTCCAACTCACCCGATTCGTCTTGGTCTTGCATTGAACT
TCTCTGTGTTCTACTACGAGATCCTCAACTCTCCTGATCGTGCCTGCAGCCTCGCTAAAC
AGGCTTTTGATGACGCGATAGCAGAGTTGGACACTCTAGGTGAAGAGTCGTACAAAGACA
GCACCTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATGCAGG
ATGATGATGCTGGGGAGGAGATCAAGGAAGCATCAGCTCCAAAGCCAACTGAGGAACAGT
AGTAGTAACAATCTTTTTTGATTGAACTGCTAAGTTTCTAGGGGGTTTCGTCCATATGTC
TCCTTAAGATGTCGTTCGCTTGCTTGCCAATTTAGCTTTATCTCCAAAAGCTTTTTTATT
CATTCATCATATTTCTGGCGAGTCGAACCACATCAATCATCTTTTATCTCTTTGCTTGAT
TTTCTTTTCTTTGTTTCTTTTTGTTCTGTCTTTTTTACTTTTTGGTTTGTGTTATCCATT
TCAATGTCTGCTATATACCTGCTTTGTGTTTTCTTATCAATTTGAAGATCATAAAGTCTT
CCTGTCTCCCTTTATCTTGTTCCAACTTAAAAACGGGGCTACTTTACT

QA 2 769 2 769
DS 



AS 1 4

CO CL2653Contig1 1190 4 19 U
TTTTTTTCTTCTTCTCCCTAGAATCTGAAGTGGAAGCTTTAGTTTTGTTCTAGCTTCAGT
TAAAGTGGAAGAGAGAGAGAGTTAAAGGAAACGACTTTGGTTGTTGAAGGGTCTGTATGG
GTACCTAGGAGAAGAAGGAACTTGTTGTGGCAGGAGGCAAGGATCAGATGCATAGTATTA
GCTCCAACCCCGCTGGTGACCTTGAGAAGCAGCAGCAGGACAAGGCTCAAGAGAAGCAGA
GCGAGTCAGTAGTACATGAGTCTGCCAAGGAAGTGAACCACCTCACCATTGTTTTCTGCA
ATGGAGATTCAAGTGGGGCACATGAAACCGTAGAATTGGCTCAGATCTATGGGCCAGCAG
CTGAGAGGGAAGAGTCCCCCAAAAAGGTTTGCTTGTCCAGAAACTCCAGCTCTCACGAGC
AGTGTAGGGTTTGTCAGCAAGAGAAAGAAGAGGCTTTGATAGAACTGGGGTGCCTATGTC
GTGGTGGCCTTGCTAAATCCCATAGGTCATGCATAGATGCTTGGTTTCGCACAAAAGGCT
CTAATCAGTGCGAGATCTGCCAGGCAGTGGCTGTCAACGTGCCACCTCCAGAGACCCATC
CAACTACAAATTACTGGGTTTGGAGGATTGATCCCAGCTATAGACAAGAGCAGCGCGAGA
GAGGATGTTTCAATCCTCTATGGGTAGCATTCTCAATTCTGATAGGCGGTCTAATGCTGG
ATGTGTTAATATCCATCACACTTGGTGTGTCTGCGCTCCCGGTTAACATAATCATCGGAG
TGATAGTGGTGCTAGGGCTAGGAACAGCACTAAGGCTGACATTGGAGTTCTGCTACGAGT
GGAGCTTGAGAAGAGCGGTTCAGAGGGCAGTGCAGAGGAGTGAAACAGCCTTTAATAACA
TTGCATATCCACCTGCCTTGTAAGAGATAAATGTCAAGCTGGGAACATCTTGTGTGTTAT
GTAAAAAAGTTGTGTGAAGACAAAAGTGTGATTGTTTTTACATGCAATGCTGAATTTGTT
GGGAGCATCATCTTTTGTGTAGCTAAAAACTTTTACAAAAGTTAGTATTAACCCCAAAAT
ATTTGTCAGAATTTCTCTATATATGTCATCGAGTGAAAAAAACTCCATGTTTGATCTACT
AATAATAGGAATCCCAAACAATGTTGAAAAGTTATGAATTTTTGTAGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H771TF U 1
AF RR2AL86TF U 349
AF RR2AL86JQ C 295
AF RR2H771JQB C 477
BS 1 453 RR2H771TF
BS 454 454 RR2AL86TF
BS 455 589 RR2H771TF
BS 590 590 RR2AL86TF
BS 591 691 RR2H771TF
BS 692 705 RR2AL86TF
BS 706 706 RR2AL86JQ
BS 707 755 RR2AL86TF
BS 756 757 RR2AL86JQ
BS 758 758 RR2H771JQB
BS 759 775 RR2AL86JQ
BS 776 776 RR2H771JQB
BS 777 919 RR2AL86JQ
BS 920 920 RR2H771JQB
BS 921 1117 RR2AL86JQ
BS 1118 1118 RR2H771JQB
BS 1119 1128 RR2AL86JQ
BS 1129 1129 RR2H771JQB
BS 1130 1190 RR2AL86JQ

RD RR2H771TF 691 0 0
TTTTTTTCTTCTTCTCCCTAGAATCTGAAGTGGAAGCTTTAGTTTTGTTCTAGCTTCAGT
TAAAGTGGAAGAGAGAGAGAGTTAAAGGAAACGACTTTGGTTGTTGAAGGGTCTGTATGG
GTACCTAGGAGAAGAAGGAACTTGTTGTGGCAGGAGGCAAGGATCAGATGCATAGTATTA
GCTCCAACCCCGCTGGTGACCTTGAGAAGCAGCAGCAGGACAAGGCTCAAGAGAAGCAGA
GCGAGTCAGTAGTACATGAGTCTGCCAAGGAAGTGAACCACCTCACCATTGTTTTCTGCA
ATGGAGATTCAAGTGGGGCACATGAAACCGTAGAATTGGCTCAGATCTATGGGCCAGCAG
CTGAGAGGGAAGAGTCCCCCAAAAAGGTTTGCTTGTCCAGAAACTCCAGCTCTCACGAGC
AGTGTAGGGTTTGTCAGCAAGAGAAAGAAGAGGTTTTGATAGAACTGGGGTGCCTATGTC
GTGGTGGCCTTGCTAAATCCCATAGGTCATGCATAGATGCTTGGTTTCGCACAAAAGGCT
CTAATCAGTGCGAGATCTGCCAGGCAGTGGCTGTCAACGTGCCACCTCCGGAGACCCATC
CAACTACAAATTACTGGGTTTGGAGGATTGATCCCAGCTATAGACAAGAGCAGCGCGAGA
GAGGATGTTTCAATCCTCTATGGGTAGCATT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2AL86TF 407 0 0
ATGGGCCAGCAGCTGAGAGGGAAGAGTCCCCCAAAAAGGTTTGCTTGTCCAGAAACTCCA
GCTCTCACGAGCAGTGTAGGGTTTGTCAGCAAGAGAAAGAAGAGGCTTTGATAGAACTGG
GGTGCCTATGTCGTGGTGGCCTTGCTAAATCCCATAGGTCATGCATAGATGCTTGGTTTC
GCACAAAAGGCTCTAATCAGTGCGAGATCTGCCAGGCAGTGGCTGTCAACGTGCCACCTC
CAGAGACCCATCCAACTACAAATTACTGGGTTTGGAGGATTGATCCCAGCTATAGACAAG
AGCAGCGCGAGAGAGGATGTTTCAATCCTCTATGGGTAGCATTCTCAATTCTGATAG*CG
GTCTAATGCTGGATGTGTTAATATCCATCACACTTGGTGTGTCTGCG

QA 1 407 1 407
DS 

RD RR2AL86JQ 896 0 0
TCTGCAATGGAGATTCAAGTGGGGCACATGAAACCGTAGAATTGGCTCAGATCTATGGGC
CAGCAGCTGAGAGGGAAGAGTCCCCCAAAAAGGTTTGCTTGTCCAGAAACTCCAGCTCTC
ACGAGCAGTGTAGGGTTTGTCAGCAAGAGAAAGAAGAGGCTTTGATAGAACTGGGGTGCC
TATGTCGTGGTGGCCTTGCTAAATCCCATAGGTCATGCATAGATGCTTGGTTTCGCACAA
AAGGCTCTAATCAGTGCGAGATCTGCCAGGCAGTGGCTGTCAACGTGCCACCTCCAGAGA
CCCATCCAACTACAAATTACTGGGTTTGGAGGATTGATCCCAGCTATAGACAAGAGCAGC
GCGAGAGAGGATGTTTCAATCCTCTATGGGTAGCATTCTCAATTCTGATAGGCGGTCTAA
TGCTGGATGTGTTAATATCCATCACACTTGGTGTGTCTGCGCTTCCGGTTAACATAATCA
TTGGAGTGATAGTGGTGCTAGGGCTAGGAACAGCACTAAGGCTGACATTGGAGTTCTGCT
ACGAGTGGAGCTTGAGAAGAGCGGTTCAGAGGGCAGTGCAGAGGAGTGAAACAGCCTTTA
ATAACATTGCATATCCACCTGCCTTTTAAGAGATAAATGTCAAGCTGGGAACATCTTGTG
TGTTATGTAAAAAAGTTGTGTGAAGACAAAAGTGTGATTGTTTTTACATGCAATGCTGAA
TTTGTTGGGAGCATCATCTTTTGTGTAGCTAAAAACTTTTACAAAAGTTAGTATTAACCC
CAAAATATTTGTCAGAATTTCTCTATATATGTCATCGAGTGAAGAAAACTCCATTTTTGA
TCTACTAATAATAGGAATCCCAAACAATGTTGAAAAGTTATGAATTTTTGTAGAAA

QA 1 896 1 896
DS 

RD RR2H771JQB 679 0 0
TGTCGTGGTGGCCTTGCTAAATCCCATAGGTCATGCATAGATGCTTGGTTTCGCACAAAA
GGCTCTAATCAGTGCGAGATCTGCCAGGCAGTGGCTGTCAACGTGCCACCTCCGGAGACC
CATCCAACTACAAATTACTGGGTTTGGAGGATTGATCCCAGCTATAGACAAGAGCAGCGC
GAGAGAGGATGTTTCAATCCTCTATGGGTAGCATTCTCAATTCTGATAGGCGGTCTAATG
CTGGATGTGTTAATATCCATCACACTTGGTGTGTCTGCGCTCCCGGTTAACATAATCATC
GGAGTGATAGTGGTGCTAGGGCTAGGAACAGCACTAAGGCTGACATTGGAGTTCTGCTAC
GAGTGGAGCTTGAGAAGAGCGGTTCAGAGGGCAGTGCAGAGGAGTGAAACAGCCTTTAAT
AACATTGCATATCCACCTGCCTTGTAAGAGATAAATGTCAAGCTGGGAACATCTTGTGTG
TTATGTAAAAAAGTTGTGTGAAGACAAAAGTGTGATTGTTTTTACATGCAATGCTGAATT
TGTTGGGAGCATCATCTTTTGTGTAGCTAAAAACTTTTACAAAAGTTAGTATTAACCCCA
AAATATTTGTCAGAATTTCTCTATATATGTCATTGAGTGAAAAAAACTCCATGTTTGATC
TACTAATAAT
TGAAAAGTT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 4

CO CL2654Contig1 849 4 6 U
CTTTTAACTCACAAAACCTGCTAATGAAGCAGTGAACAAAATAATAATGATTATGTATAG
TTCAAACATAACAACCAGAATAAATCATAAAACTATGTTTTAAGAACTTGAATTTGTAAA
AATCTACGAGCTACAACACATGTTACTCTTTGGTGGTATCACCTGACCAGGACCAGGAAC
AATATCGATCTTCTTACCAGCAAGCGACCCATGTTGCTCTTCTTCACTCACAGCAAGACT
CTTCTTGTTCACAATGTTGAAAATCTCGTTCAGAACCGTTGAGAAAGCGCTCTCAACATT
GGTTGCGTTAAACGCAGACGTCTCCAAGAAGAATAAACCTTCTTTCTCTGCAAACTCTTT
AGCGTCTTCGGTTGGGATAGCCCTTTGGTCTTCAAGATCTGACTTGTTCCCTATAAGGAT
GATCACAATGTTCTTGTCCGCATGAGCACGCAGTTCTTCTAGCCATCTTGGGATGTGATC
AAATGTTTGGCGTCTGGTTATGTCGTAAACCAACATCGCCCCAACCGCTCCTCGGTAGTA
TGCACTTGTTACCGCTCTGTATCGTTCTTGGCCGGCGGTATCCCAGATCTGAGCCTTAAC
ACTCTTGTGATCGATCACAAGCGTCCGAGTCTGGAACTCCACCCCGATGGTTGCCTTGGA
ATCCAAACTGAACTCGTCCCTCGCGTAACGAGCAAGTATCTGCGACTTCCCAACCGCCGA
ATCGCCGATCAGAACAACCTTGAACACGTAGTCTATCTTCTGCGACGGGTCTCCGTATCC
TCCTCCTCCACTCGCCATCTTCAAAACTCTTAAGATCAGATCCTCTACTTTAACTATAAA
AGCCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AU26JQ U 6
AF RR2A183JQ U 57
AF RR2A183TF C 1
AF RR2AU26TF C 117
BS 1 5 RR2A183TF
BS 6 760 RR2AU26JQ
BS 761 805 RR2A183JQ
BS 806 806 RR2A183TF
BS 807 825 RR2A183JQ
BS 826 849 RR2A183TF

RD RR2AU26JQ 755 0 0
AACTCACAAAACCTGCTAATGAAGCAGTGAACAAAATAATAATGATTATGTATAGTTCAA
ACATAACAACCAGAATAAATCATAAAACTATGTTTTAAGAACTTGAATTTGTAAAAATCT
ACGAGCTACAACACATGTTACTCTTTGGTGGTATCACCTGACCAGGACCAGGAACAATAT
CGATCTTCTTACCAGCAAGCGACCCATGTTGCTCTTCTTCACTCACAGCAAGACTCTTCT
TGTTCACAATGTTGAAAATCTCGTTCAGAACCGTTGAGAAAGCGCTCTCAACATTGGTTG
CGTTAAACGCAGACGTCTCCAAGAAGAATAAACCTTCTTTCTCTGCAAACTCTTTAGCGT
CTTCGGTTGGGATAGCCCTTTGGTCTTCAAGATCTGACTTGTTCCCTATAAGGATGATCA
CAATGTTCTTGTCCGCATGAGCACGCAGTTCTTCTAGCCATCTTGGGATGTGATCAAATG
TTTGGCGTCTGGTTATGTCGTAAACCAACATCGCCCCAACCGCTCCTCGGTAGTATGCAC
TTGTTACCGCTCTGTATCGTTCTTGGCCGGCGGTATCCCAGATCTGAGCCTTAACACTCT
TGTGATCGATCACAAGCGTCCGAGTCTGGAACTCCACCCCGATGGTTGCCTTGGAATCCA
AACTGAACTCGTCCCTCGCGTAACGAGCAAGTATCTGCGACTTCCCAACCGCCGAATCGC
CGATCAGAACAACCTTGAACACGTAGTCTATCTTC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2A183JQ 769 0 0
ATAGTTCAAACATAACAACCAGAATAAATCATAAAACTATGTTTTAAGAACTTGAATTTG
TAAAAATCTACGAGCTACAACACATGTTACTCTTTGGTGGTATCACCTGACCAGGACCAG
GAACAATATCGATCTTCTTACCAGCAAGCGACCCATGTTGCTCTTCTTCACTCACAGCAA
GACTCTTCTTGTTCACAATGTTGAAAATCTCGTTCAAAACCGTTGAGAAAGCGCTCTCAA
CATTGGTTGCGTTAAACGCAGACGTCTCCAAGAAGAATAAACCTTCTTTCTCTGCAAACT
CTTTAGCGTCTTCGGTTGGGATAGCCCTTTGGTCTTCAAGATCTGACTTGTTCCCTATAA
GGATGATCACAATGTTCTTGTCCGCATGAGCACGCAGTTCTTCTAGCCATCTTGGGATGT
GATCAAATGTTTGGCGTCTGGTTATGTCGTAAACCAACATCGCCCCAACCGCTCCTCGGT
AGTATGCACTTGTTACCGCTCTGTATCGTTCTTGGCCGGCGGTATCCCAAATCTGAGCCT
TAACACTCTTGTGATCGATCACAAGCGTCCGAGTCTGGAACTCCACCCCGATGGTTGCCT
TGGAATCCAAACTGAACTCGTCCCTCGCGTAACGAGCAAGTATCTGCGACTTCCCAACCG
CCGAATCGCCGATCAGAACAACCTTGAACACGTAGTCTATCTTCTGCGACGGGTCTCCGT
ATCCTCCTCCTCCACTCGCCATCTTCAAA*CTCTTAAGATCAGATCCTC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2A183TF 849 0 0
CTTTTAACTCACAAAAC*TGCTAATGAAGCAGTGAACAAAATAATAATGATTATGTATAG
TTCAAACATAACAACCAGAATAAATCATAAAACTATGTTTTAAGAACTTGAATTTGTAAA
AATCTACGAGCTACAACACATGTTACTCTTTGGTGGTATCAC*TGACCAGGACCAGGAAC
AATATCGATCTTCTTACCAGCAAGCGACCCATGTTGCTCTTCTTCACTCACAGCAAGACT
CTTCTTGTTCACAATGTTGAAAATCTCGTTCAGAACCGTTGAGAAAGCGCTCTCAACATT
GGTTGCGTTAAACGCAGACGTCTCCAAGAAGAATAAACCTTCTTTCTCTGCAAACTCTTT
AGCGTCTTCGGTTGGGATAGCCCTTTGGTCTTCAAGATCTGACTTGTTCCCTATAAGGAT
GATCACAATGTTCTTGTCCGCATGAGCACGCAGTTCTTCTAGCCATCTTGGGATGTGATC
AAATGTTTGGCGTCTGGTTATGTCGTAAACCAACATCGCCCCAACCGCTCCTCGGTAGTA
TGCACTTGTTACCGCTCTGTATCGTTCTTGGCCGGCGGTATCCCAGATCTGAGCCTTAAC
ACTCTTGTGATCGATCACAAGCGTCCGAGTCTGGAACTCCACCCCGATGGTTGCCTTGGA
ATCCAAACTGAACTCGTCCCTCGCGTAACGAGCAAGTATCTGCGACTTCCCAACCGCCGA
ATCGCCGATCAGAACAACCTTGAACACGTAGTCTATCTTCTGCGACGGGTCTCCGTATCC
TCCTCCTCCACTCGCCATCTTCAAAACTCTTAAGATCAGATCCTCTACTTTAACTATAAA
AGCCTTTCC

QA 1 849 1 849
DS 

RD RR2AU26TF 733 0 0
TAAAAATCTACGAGCTACAACACATGTTACTCTTTGGTGGTATCAC*TGACCAGGACCAG
GAACAATATCGATCTTCTTACCAGCAAGCGACCCATGTTGCTCTTCTTCACTCACAGCAA
GACTCTTCTTGTTCACAATGTTGAAAATCTCGTTCAGAACCGTTGAGAAAGCGCTCTCAA
CATTGGTTGCGTTAAACGCAGACGTCTCCAAGAAGAATAAACCTTCTTTCTCTGCAAACT
CTTTAGCGTCTTCGGTTGGGATAGCCCTTTGGTCTTCAAGATCTGACTTGTTCCCTATAA
GGATGATCACAATGTTCTTGTCCGCATGAGCACGCAGTTCTTCTAGCCATCTTGGGATGT
GATCAAATGTTTGGCGTCTGGTTATGTCGTAAACCAACATCGCCCCAACCGCTCCTCGGT
AGTATGCACTTGTTACCGCTCTGTATCGTTCTTGGCCGGCGGTATCCCAGATCTGAGCCT
TAACACTCTTGTGATCGATCACAAGCGTCCGAGTCTGGAACTCCACCCCGATGGTTGCCT
TGGAATCCAAACTGAACTCGTCCCTCGCGTAACGAGCAAGTATCTGCGACTTCCCAACCG
CCGAATCGCCGATCAGAACAACCTTGAACACGTAGTCTATCTTCTGCGACGGGTCTCCGT
ATCCTCCTCCTCCACTCGCCATCTTCAAAACTCTTAAGATCAGATCCTCTACTTTAACTA
TAAAAGCCTTTCC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL2655Contig1 906 2 12 U
CGCTCGTAACATGGTTAAGATTCTCAGTGGTCTGACTCTGAGGTGCTTATATCAAAAGTG
TGACCCACAGAGACTTCAACGAAATGATAAAGACTATACCAAACCCTGTCTATCTTTCCA
AGGAATTGTCCTACGCAGAGGTGCCAAAGGAACAGGGATGAAATCCATTGAACTTGCACT
GTCCATGTGCGATATCGTCGACATATATGGCTTCACCGTCGATCCTGGATACACAGAGTG
GACGCGTTACTTCTCCACGCCAAGGAAAGGGCATAACCCACTACAAGGAAGAGCATACTA
CCAACTTCTAGAATGCCTTGGTGTAATCCGGATCCATTCTCCCATGAGGTCCGAGAGAAA
GGAAGACTGGTCGAGCGTGCCAAGTCGTGAAACGATAACCCGAGCTCACGCCTCCGCCTT
ACGCCTACAAAGGAGCCAACAGACAACTAGTTTAAAGAGTGATGGGTTAGGACAGTTCGG
TAATTGCAAGGTGTGGGGCGATGCAGACCCTAGAAAAGGACCCGTGTCGGGATCTCCAGA
CATGAGTGAGGTTAGGAAGAAGTCAGATTACAAGAAGTGGGAAGTGATGCCATTTAAGAG
CTTGAGAAAAGAAGCAAGGGATCACTATGTACAAATGCAAGGCGTGTCACAGTACAAGAT
GGATGGGAATAAACTTGACGATCTTGTTTGCGTGAGGCATCGTCCGCTAGAATCAGAGAC
TTAAATGTTGTTTTTTCAATACCATCGTTGGCTGATAAAAGTAGAATGTAATGTTTTTTG
TTGAAGCAGTCTCTTCGTTAATATCATTTTATTCCTTCACGGAACTTTTCATTACTAGTC
TTCAAGTTTTGTTGATGTCATCGCTGTTACAATGGTAGTAATGTCATAGCAGTGCGTCAC
CGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK75JQ C 1
AF RR2AD03TF U 406
BS 1 406 RR2CK75JQ
BS 407 453 RR2AD03TF
BS 454 454 RR2CK75JQ
BS 455 504 RR2AD03TF
BS 505 505 RR2CK75JQ
BS 506 722 RR2AD03TF
BS 723 723 RR2CK75JQ
BS 724 735 RR2AD03TF
BS 736 736 RR2CK75JQ
BS 737 787 RR2AD03TF
BS 788 788 RR2CK75JQ
BS 789 906 RR2AD03TF

RD RR2CK75JQ 818 0 0
CGCTCGTAACATGGTTAAGATTCTCAGTGGTCTGACTCTGAGGTGCTTATATCAAAAGTG
TGACCCACAGAGACTTCAACGAAATGATAAAGACTATACCAAACCCTGTCTATCTTTCCA
AGGAATTGTCCTACGCAGAGGTGCCAAAGGAACAGGGATGAAATCCATTGAACTTGCACT
GTCCATGTGCGATATCGTCGACATATATGGCTTCACCGTCGATCCTGGATACACAGAGTG
GACGCGTTACTTCTCCACGCCAAGGAAAGGGCATAACCCACTACAAGGAAGAGCATACTA
CCAACTTCTAGAATGCCTTGGTGTAATCCGGATCCATTCTCCCATGAGGTCCGAGAGAAA
GGAAGACTGGTCGAGCGTGCCAAGTCGTGAAACGATAACCCGAGCTCACGCCTCCGCCTT
ACGCCTACAAAGGAGCCAACAGGCAACTAGTTTAAAGAGTGATGGGTTAGGACAGTTCGG
TAATTGCAAGGTGTGGGGCGATGCAGACCCTAGAAAAGGACCCGTGTCGGGATCTCCAGA
CATGAGTGAGGTTAGGAAGAAGTCAGATTACAAGAAGTGGGAAGTGATGCCGTTTAAGAG
CTTGAGAAAAGAAGCAAGGGATCACTATGTACAAATGCAAGGCGTGTCACAGTACAAGAT
GGATGGGAATAAACTTGACGATCTTGTTTGCGTGAGGCATCGTCCGCTAGAATCAGAGAC
TTAAATGTTGTTTTTTCAATACCATCGTTGGCTGATAAAAGTAGAATGTAATGTTTTTTG
TTGAAGCAGTCTCTTCGTTAATATCATTTTATTCCTTC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2AD03TF 501 0 0
G
CACGCCTCCGCCTTACGCCTACAAAGGAGCCAACAGACAACTAGTTTGAAGAGTGATGGG
TTAGGACAGTTCGGTAATTGCAAGGTGTGGGGCGATGCTGACCCTAGAAAAGGACCCGTG
TCGGGATCTCCAGACATGAGTGAGGTTAGGAAGAAGTCAGATTACAAGAAGTGGGAAGTG
ATGCCATTTAAGAGCTTGAGAAAAGAAGCAAGGGATCACTATGTACAAATGCAAGGCGTG
TCACAGTACAAGATGGATGGGAATAAACTTGACGATCTTGTTTGCGTGAGGCATCGTCCG
CTAGAATCAGAGACTTGAATGTTGTTTTT*CAATACCATCGTTGGCTGATAAAAGTAGAA
TGTAATGTTTTTTGTTGAAGCTGTCTCTTCGTTAATATCATTTTATTCCTTCACGGAACT
TTTCATTACTAGTCTTCAAGTTTTGTTGATGTCATCGCTGTTACAATGGTAGTAATGTCA
TAGCAGTGCGTCACCGTTTG

QA 2 501 2 501
DS 



AS 1 4

CO CL2656Contig1 970 4 10 U
GGGTGCGAGTGTAATAACTAAAAGACATCATTGTTCTGCAGGATCTAAGCAAAAAGTCTC
TCTTTTTCACTCTCTTCAGTGCAGTGTCTCTCTCTCCATCTCTTTTCTCACAGCTATTGT
TAGCTTCAAAACCTTCTACAATCACTTCCATTCTCTCTCCGCTTCAGAGGAACAGGCTGC
ACCCAAATCCTGTGGTGTGCAAAGCCATGGCGACTGTTGTTGTTGTTCTTGCTGTGATTT
TCTTGGCTATGGTTGGTCACTCAAGTGGGACATGGTGTGTATGCAGAGAAGGACTAAGTG
AAGCAATGCTGCAGAAGACATTGGACTACGCATGTGGTGCAGGAGCCGACTGTAAACCCA
TTCACCAGAACGGACCTTGCTTTAACCCAAACACAGTCAAGTCCCACTGCTCCTACGCCG
TCAACAGCTTCTTTCAAAAGAAAGGTCAGTCTCAGGGAACTTGTGACTTCGCCGGCACAG
CCACCGTTTCAGCCTCTGATCCTAGCTACACATCTTGTCCTTTTCCTGCAAGTGCAAGTG
GTAGTGGGACAACGACACCAGTGACGACAACACCTTCGACAAGAGTCCCAACGACAACTA
ATACAAGACCCTACACATCATCATCAACAGGAGGAGGAGGTTTGGGAATCCCGTCTGGAA
TCCCAGATTACACAGATCCATCCTCTGGATTCAAACTCCAAAACCCAAGAACCACGTTCT
TTGTATCCTTAGTAATCTTAGTTTTCTTCATCTTCACCTCCTAGGCTCCTTCCTACTCGT
TGGGCTAGTAGTAAACAACAACTAATTAAGATGGAAGGTAGATCATGTGAGTGTGGGTCT
CTCTCTCGCAGTAGTGATGGGAGAGACATTTAGTTGCACGTGTTTTGTTTTCCTAGCTGT
TATCCACTTGGCTCTGAATCAAAAATGTACATTTTTTAATTTTTAAATTAAGAAGACGGC
AATATTTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC84TF U 1
AF RR2BC87TF U 107
AF RR2CC84JQ C 137
AF RR2BC87JQ C 296
BS 1 694 RR2CC84TF
BS 695 742 RR2BC87TF
BS 743 743 RR2CC84JQ
BS 744 764 RR2BC87TF
BS 765 765 RR2CC84JQ
BS 766 816 RR2BC87TF
BS 817 817 RR2CC84JQ
BS 818 913 RR2BC87TF
BS 914 937 RR2CC84JQ
BS 938 970 RR2BC87JQ

RD RR2CC84TF 694 0 0
GGGTGCGAGTGTAATAACTAAAAGACATCATTGTTCTGCAGGATCTAAGCAAAAAGTCTC
TCTTTTTCACTCTCTTCAGTGCAGTGTCTCTCTCTCCATCTCTTTTCTCACAGCTATTGT
TAGCTTCAAAACCTTCTACAATCACTTCCATTCTCTCTCCGCTTCAGAGGAACAGGCTGC
ACCCAAATCCTGTGGTGTGCAAAGCCATGGCGACTGTTGTTGTTGTTCTTGCTGTGATTT
TCTTGGCTATGGTTGGTCACTCAAGTGGGACATGGTGTGTATGCAGAGAAGGACTAAGTG
AAGCAATGCTGCAGAAGACATTGGACTACGCATGTGGTGCAGGAGCCGACTGTAAACCCA
TTCACCAGAACGGACCTTGCTTTAACCCAAACACAGTCAAGTCCCACTGCTCCTACGCCG
TCAACAGCTTCTTTCAAAAGAAAGGTCAGTCTCAGGGAACTTGTGACTTCGCCGGCACAG
CCACCGTTTCAGCCTCTGATCCTAGCTACACATCTTGTCCTTTTCCTGCAAGTGCAAGTG
GTAGTGGGACAACGACACCAGTGACGACAACACCTTCGACAAGAGTCCCAACGACAACTA
ATACAAGACCCTACACATCATCATCAACAGGAGGAGGAGGTTTGGGAATCCCGTCTGGAA
TCCCAGATTACACAGATCCATCCTCTGGATTCAA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2BC87TF 809 0 0
CTCACAGCTATTGTTAGCTTCAAAACCTTCTACAATCACTTCCATTCTCCCTCCGCTTCA
GAGGAACAGGCTGCACCCAAATCCTGTGGTGTGCAAAGCCATGGCGACTGTTGTTGTTGT
TCTTGCTGTGATTTTCTTGGCTATGGTTGGTCACTCAAGTGGGACATGGAGTGTATGCAG
AGAAGGGCTAAGTGAAGCAATGCTGCAGAAGACATTGGACTACGCATGTGGTGCAGGAGC
CGACTGTAAACCCATTCACCAGAACGGACCTTGCTTTAACCCAAACACAGTCAAGTCCCA
CTGCTCCTACGCCGTCAACAGCTTCTTTCAAAAGAAAGGTCAGTCTCAGGGAACTTGTGA
CTTCGCCGGCACAGCCACCGTTTCAGCCTCTGATCCTAGCTACACATCTTGTCCTTTTCC
TGCAAGTGCAAGTGGTAGTGGGACAACGACACCAGTGGCGACAACACCTTCGACAAGAGT
CCCAACGACAACTAATACAAGACCCTACACATCATCATCAACAGGAGGAGGAGGTTTGGG
AATCCCGTCTGGAATCCCAGATTACACAGATCCATCCTCTGGATTCAAACTCCAAAACCC
AAGAACCACGTTCTTTGTATCCTTAGTAATCTTAGTCTTCTTCATCTTCACCTCCTAG*C
TCCTTCCTACTCGTTGGGCTAGTAGTAAACAACAACTAATTAAGATGGAAAGTAGATCAT
GTGAGTGTGGGTCTCTCTCTCGCAGTAGTGATGGGAGAGACATTTAGTTGCACGTGTTTT
GTTTTCCTAGCTGTTATCCACTTGGCT
CT

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2CC84JQ 801 0 0
TACAATCACTTCCATTCTCTCTCCGCTTCAGAGGAACAGGCTGCACCCAAATCCTGTGGT
GTGCAAAGCCATGGCGACTGTTGTTGTTGTTCTTGCTGTGATTTTCTTGGCTATGGTTGG
TCACTCAAGTGGGACATGGTGTGTATGCAGAGAAGGACTAAGTGAAGCAATGCTGCAGAA
GACATTGGACTACGCATGTGGTGCAGGAGCCGACTGTAAACCCATTCACCAGAACGGACC
TTGCTTTAACCCAAACACAGTCAAGTCCCACTGCTCCTACGCCGTCAACAGCTTCTTTCA
AAAGAAAGGTCAGTCTCAGGGAACTTGTGACTTCGCCGGCACAGCCACCGTTTCAGCCTC
TGATCCTAGCTACACATCTTGTCCTTTTCCTGCAAGTGCAAGTGGTAGTGGGACAACGAC
ACCAGTGACGACAACACCTTCGACAAGAGTCCCAACGACAACTAATACAAGACCCTACAC
ATCATCATCAACAGGAGGAGGAGGTTTGGGAATCCCGTCTGGAATCCCAGATTACACAGA
TCCATCCTCTGGATTCAAACTCCAAAACCCAAGAACCACGTTCTTTGTATCCTTAGTAAT
CTTAGTTTTCTTCATCTTCACCTCCTAGGCTCCTTCCTACTCGTTGGGCTAGTAGTAAAC
AACAACTAATTAAGATGGAAGGTAGATCATGTGAGTGTGGGTCTCTCTCTCACAGTAGTG
ATGGGAGAGACATTTAGTTGCACGTGTTTTGTTTTCCTAGCTGTTATCCACTTGGCTCTG
AATCAAAAATGTACATTTTTT

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2BC87JQ 675 0 0
AAGTGAAGCAATGCTGCAGAAGACATTGGACTACGCATGTGGTGCAGGAGCCGACTGTAA
ACCCATTCACCAGAACGGACCTTGCTTTAACCCAAACACAGTCAAGTCCCACTGCTCCTA
CGCCGTCAACAGCTTTTTTCAAAAGAAAGGTCAGTCTCAGGGAACTTGTGACTTCGCCGG
CACAGCCACCGTTTCAGCCTTTGATCCTAGCTACACATTTTGTCCTTTTCCTGCAAGTGC
AAGTGGTAGTGGGACAACGACACCAGTGGGGACAACACCTTCGACAAGAGTCCCAACGAC
AAATAATACAAGACCCTACACATCATCATCAACAGGAGGAGGAGGTTTGGGAATCCCGTT
TGGAATCCCAGATTACACAGATCCATCCTCTGGATTCAAACTCCAAAACCCAAGAACCAC
GTTCTTTGTATCCTTAGTAATTTTAGTTTTTTTCATCTTCACCTCCTAGGCTCCTTCCTA
CTCGTTGGGCTAGTAGTAAACAACAACTAATTAAGATGGAAGGTAGATCATGTGAGTGTG
GGTCTTTCTCTCGCAGTAGTGATGGGAGAGACATTTAGTTGCACGTGTTTTGTTTTCCTA
GCTGTTATCCACTTGGCTTTGAATCAAAAATGTACATTTTTTAATTTTTAAATTAAGAAG
ACGGCAATATTTAAG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 4

CO CL2657Contig1 880 4 6 U
GGGATTCACTCTAACACTTGTGCCCCTTCTCTTCTTTGTCCTCTTCCCTCCTTTCTCCGT
CCTCAAATTTGCTTCGTTCACTTACAGATTCTCTAATCAGACACAAACTCCAGATTCACT
TCGACAATGGAAACATTCCGAACATTTCATCTTTTCCTTTTTCTCTCTCACTTTATCTTC
TTGACGACACACACTACGCTTACGTCCGCAAACTCTCAGATCGTTGACTGTACAATGTGC
ACGTCTTGTGACAATCCTTGTCAGCCAAATCCCTCTCCTCCACCACCCACTCCATCTCCG
CCACCTCCAACCACGACCACCGCATGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGAAGTGGTGGTGGT
GGTGG***TCCTTACTACTACTACCCACCTCCTTCTCAGTCTAGCTCTTACCGTCCACCA
CCGTCTTCCTCCGGCGATGGTGGCTACGTTTATCCACCGCCTAAAAGTGGAGGAAACTAC
CCTTTTACGCCGCCGCCGAACCCGATCGTTCCTTACTTTCCGTTTTACTACTACAACCCT
CCGCCGCAATCTGTTGTGTTGTCTGGATCCGTTGGGAAAACAAGTTTCTCTTACGGGTTT
TCAATTGCGTTAGTTTTTGCTCTTTGTTTCAGTACGTTGCTTCTAAATAATACAGGTTGA
AGAAGATGACAGAGGTTACTTGTAACAACAAGAAAAATCCTCATCTCTTTGCAGAGAAGA
TGACTTATGCATGAGAGATCTTTACGCTACATTGAATGTTGTTTCTTCATTTTTCTTTTC
TTTTTCTTCACTTGTCTTTACTTGTATAAGTAAAAATATAGAAAAATATATTTGTAATTC
CATCTCTTTTACCAATTTTATGAATGTAGTTTCTTCCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW88TF U 6
AF RR2CD74TF U 1
AF RR2CW88JQ C 308
AF RR2CD74JQ C 279
BS 1 12 RR2CD74TF
BS 13 13 RR2CW88TF
BS 14 646 RR2CD74TF
BS 647 669 RR2CD74JQ
BS 670 670 RR2CW88JQ
BS 671 880 RR2CD74JQ

RD RR2CW88TF 350 0 0
GG
ACTCTAACACTTGTGCCCCTTCTCTTCTTTGTCCTCTTCCCTCCTTTCTCCGTCCTCAAA
TTTGCTTCGTTCACTTACAGATTCTCTAATCAGACACAAACTCCAGATTCACTTCGACAA
TGGAAACATTCCGAACATTTCATCTTTTCCTTTTTCTCTCTCACTTTATCTTCTTGACGA
CACACACTACGCTTACGTCCGCAAACTCTCAGATCGTTGACTGTACAATGTGCACGTCTT
GTGACAATCCTTGTCAGCCAAATCCCTCTCCTCCACCACCCACTCCATCTCCGCCACCTC
CAACCACGACCACCGCATGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGAAGTGGTG

QA 3 350 3 350
DS 

RD RR2CD74TF 650 0 0
GGGATTCACTCTGACACTTGTGCCCCTTCTCTTCTTTGTCCTCTTCCCTCCTTTCTCCGT
CCTCAAATTTGCTTCGTTCACTTACAGATTCTCTAATCAGACACAAACTCCAGATTCACT
TCGACAATGGAAACATTCCGAACATTTCATCTTTTCCTTTTTCTCTCTCACTTTATCTTC
TTGACGACACACACTACGCTTACGTCCGCAAACTCTCAGATCGTTGACTGTACAATGTGC
ACGTCTTGTGACAATCCTTGTCAGCCAAATCCCTCTCCTCCACCACCCACTCCATCTCCG
CCACCTCCAACCACGACCACCGCATGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGAAGTGGTGGTGGT
GGTGG***TCCTTACTACTACTACCCACCTCCTTCTCAGTCTAGCTCTTACCGTCCACCA
CCGTCTTCCTCCGGCGATGGTGGCTACGTTTATCCACCGCCTAAAAGTGGAGGAAACTAC
CCTTTTACGCCGCCGCCGAACCCGATCGTTCCTTACTTTCCGTTTTACTACTACAACCCT
CCGCCGCAATCTGTTGTGTTGTCTGGATCCGTTGGGAAAACAAGTTTCTCTTACGGGTTT
TCAATTGCGTTAGTTTTTGCTCTTTGTTTCAGTACGTTGCTTCTAA
TAAT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2CW88JQ 378 0 0
CAACCACGACCACCGCATGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGAAGTGGTGGTGGTGGTGGTG
GTCCTTACTACTACTACCCACCTCCTTTTCAGTCTAGCTCTTACCGTCCACCACCGTCTT
CCTCCGGCGATGGTGGCTACGTTTATCCACCGCCTAAAAGTGGAGGAAACTACCCTTTTA
CGCCGCCGCCGAACCCGATCGTTCCTTACTTTCCGTTTTACTACTACAACCCTCCGCCGC
AATCTGTTGTGTTGTCTGGATCCGTTGGGAAAACAAGTTTTTCTTACGGGTTTTCAATTG
CGTTAGTTTTTGCTCTTTGTTTCAGTACGTTGCTTCTAAATAATACAGGTTGAAGAAGAT
GACAGAGGTTACTTGTAA

QA 1 378 1 378
DS 

RD RR2CD74JQ 602 0 0
TCCACCACCCACTCCATCTCCGCCACCTCCAACCACGACCACCGCATGTCCTCCGCCTCC
TAGCTCTGGAAGTGGTGGTGGTGGTGG***TCCTTACTACTACTACCCACCTCCTTCTCA
GTCTAGCTCTTACCGTCCACCACCGTCTTCCTCCGGCGATGGTGGCTACGTTTATCCACC
GCCTAAAAGTGGAGGAAACTACCCTTTTACGCCGCCGCCGAACCCGATCGTTCCTTACTT
TCCGTTTTACTACTACAACCCTCCGCCGCAATCTGTTGTGTTGTCTGGATCCGTTGGGAA
AACAAGTTTCTCTTACGGGTTTTCAATTGCGTTAGTTTTTGCTCTTTGTTTCAGTACGTT
GCTTCTAAATAATACAGGTTGAAGAAGATGATAGAGGTTACTTGTAACAACAAGAAAAAT
CCTCATCTCTTTGCAGAGAAGATGACTTATGCATGAGAGATCTTTACGCTACATTGAATG
TTGTTTCTTCATTTTTCTTTTCTTTTTCTTCACTTGTCTTTACTTGTATAAGTAAAAATA
TAGAAAAATATATTTGTAATTCCATCTCTTTTACCAATTTTATGAATGTAGTTTCTTCCC
CT

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 3

CO CL2658Contig1 1402 3 16 U
ACCGTGAGATTCCACTGAACATATATATATAGGAAAGAAAGAGAGTGGAGACACCAATTA
TTTATCGTAATCATCGATAGTGCTATTAAACATAATACACACAATAAAATTCACAGGAAT
TGATACGTTAAATGCACAAATAGTTGTGGACTCAACCTGTCTCGTCTTCACAGGATTATT
ACAGAATCAGATTTTTGTTCTGCTAGAACATTTTTCCAACACCTTCTTTTCTTGGGACGG
ATTCTTGAACATCCATCCGGCTCCAGTTTCCCATCATAGAAGCCATTTGATCAACTTTAT
CATACAACCCAAGAAGCCCACCAGTGTGTATGAACAATATCTTCTTTCCCTCCCAACTTT
TGGGAACCTTAGTCATCTCATTTACCAAACCGTACGCAGCTTTCCCACTGTAAACAGGAT
CAAGAATAACACTTGTTGCACTTGCTAGGTCCTTTAAAAACTTAAGCTCCTCTGCAGTGT
TCATGGCATAACCTTTTCCCTTGGCATTGTGGATGCTAACAATATCGCGAGAGTTAACAC
CAGCTTGAAGTCCATCCAGAAGGCCTTGAACAAAGTCATAAAAGTAATCAGGATCATCGC
ATACCGAGAAAGCATGAACCTTGGCTTTTAGAGCTCCCAACCAAGACCCCAATGAGATAC
CAGCAATTGTACCACCACTGCCACATGCTACCACATATCATCAAACTTCAAGCCATCGGT
TCTACATTTTAGCTGCTCTCAATTTCCCTTGCTGCTTCAATATAACCCCAAGTTCCCAAA
GAGTTGGATCCACCAACGGGAATAACATAAGGCTTTTTCCCTTCTTTCTCCAACTTCTCT
TTAAGGGCACTAGTTAGAGCCTCGCTCCCAATGGAGGAATACTCTTCCTTAGAGATGAGA
TGAACGTTAGCTCCAACGAGACGCTCAACAAGGAGATTCCCAACTAACCCTGGATCTCCA
TCCGCAAGAAGCTTGGAGGTGCGGAGGATAAGATGAGTGTCGAGATTGAGATAGTTCGAA
GCGACGGTGGTGGCGCGGCAGTGATTGCTCTGATACCTCCGATGGTGATGACGGTGTCGG
CTTGTTGCTCCACGGCGTCGGCCATTAGGAACTCGAGCTTCCGGACTTTGTTTCCGCTCA
GTTCCATTCCCGTGAAGTCATCTCGCTTGATCCAGAGTTCAGTGCCGTTGGGGAGATTGG
GAACGTTCCATCGATGGATCGGAGTAGGACGGTGAGCGAGGGAGAAGGTGTGAGAAGGAA
GCGGACGAAGATGTGAAGCCCAGGAAGGAGGAGAGTAAGGGCTTTTTGTCAGAAAATCCG
CCATCGATGTTCCAGACATTCTTCTTCTGCTTGTTCTTCTTTCGCTGAGGGCTACTCTTG
AGAGTGTCAAGAGCCGTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B542JQ U 295
AF RR2CL74JQ U 1
AF RR2CL74TF C 628
BS 1 298 RR2CL74JQ
BS 299 299 RR2B542JQ
BS 300 306 RR2CL74JQ
BS 307 307 RR2B542JQ
BS 308 365 RR2CL74JQ
BS 366 366 RR2B542JQ
BS 367 384 RR2CL74JQ
BS 385 385 RR2B542JQ
BS 386 388 RR2CL74JQ
BS 389 389 RR2B542JQ
BS 390 517 RR2CL74JQ
BS 518 518 RR2B542JQ
BS 519 577 RR2CL74JQ
BS 578 578 RR2B542JQ
BS 579 695 RR2CL74JQ
BS 696 1402 RR2CL74TF

RD RR2B542JQ 296 0 0
CTTTATCATACAACCCAAGAAGCCCACCAGTGTGTATGAACAATATCTTCTTTCCCTCCC
AACTTTTGGGAACCTTAGTCATCTCATTTACCAAACCGTACGCAGCTTTCCCACTGTAAA
CAGGATCAAGAATAACACTTGTTGCACTTGCTAGGTCCTTTAAAAATTTAAGCTCCTCTG
CAGTGTTCATGGCATAACCTTTTCCCTTGGCATTGTGGATGGTAACAATATCGCGAGAGT
TAACACCAGCTTGAAGTCCATCCAGGAGGCCTTGGACAAAGTCATAGAAGTAATCA

QA 1 296 1 296
DS 

RD RR2CL74JQ 702 0 0
ACCGTGAGATTCCACTGAACATATATATATAGGAAAGAAAGAGAGTGGAGACACCAATTA
TTTATCGTAATCATCGATAGTGCTATTAAACATAATACACACAATAAAATTCACAGGAAT
TGATACGTTAAATGCACAAATAGTTGTGGACTCAACCTGTCTCGTCTTCACAGGATTATT
ACAGAATCAGATTTTTGTTCTGCTAGAACATTTTTCCAACACCTTCTTTTCTTGGGACGG
ATTCTTGAACATCCATCCGGCTCCAGTTTCCCATCATAGAAGCCATTTGATCAACTTTGT
CATACAGCCCAAGAAGCCCACCAGTGTGTATGAACAATATCTTCTTTCCCTCCCAACTTT
TGGGATCCTTAGTCATCTCATTTATCAACCCGTACGCAGCTTTCCCACTGTAAACAGGAT
CAAGAATAACACTTGTTGCACTTGCTAGGTCCTTTAAAAACTTAAGCTCCTCTGCAGTGT
TCATGGCATAACCTTTTCCCTTGGCATTGTGGATGCTGACAATATCGCGAGAGTTAACAC
CAGCTTGAAGTCCATCCAGAAGGCCTTGAACAAAGTCGTAAAAGTAATCAGGATCATCGC
ATACCGAGAAAGCATGAACCTTGGCTTTTAGAGCTCCCAACCAAGACCCCAATGAGATAC
CAGCAATTGTACCACCACTGCCACATGCTACCACA
ATATCAT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2CL74TF 775 0 0
TTAGAGCTCCCAACCAAGACCCCAATGAGATACCAGCAATTGTACCACCACTGCCACATG
CTACCACATATCATCAAACTTCAAGCCATCGGTTCTACATTTTAGCTGCTCTCAATTTCC
CTTGCTGCTTCAATATAACCCCAAGTTCCCAAAGAGTTGGATCCACCAACGGGAATAACA
TAAGGCTTTTTCCCTTCTTTCTCCAACTTCTCTTTAAGGGCACTAGTTAGAGCCTCGCTC
CCAATGGAGGAATACTCTTCCTTAGAGATGAGATGAACGTTAGCTCCAACGAGACGCTCA
ACAAGGAGATTCCCAACTAACCCTGGATCTCCATCCGCAAGAAGCTTGGAGGTGCGGAGG
ATAAGATGAGTGTCGAGATTGAGATAGTTCGAAGCGACGGTGGTGGCGCGGCAGTGATTG
CTCTGATACCTCCGATGGTGATGACGGTGTCGGCTTGTTGCTCCACGGCGTCGGCCATTA
GGAACTCGAGCTTCCGGACTTTGTTTCCGCTCAGTTCCATTCCCGTGAAGTCATCTCGCT
TGATCCAGAGTTCAGTGCCGTTGGGGAGATTGGGAACGTTCCATCGATGGATCGGAGTAG
GACGGTGAGCGAGGGAGAAGGTGTGAGAAGGAAGCGGACGAAGATGTGAAGCCCAGGAAG
GAGGAGAGTAAGGGCTTTTTGTCAGAAAATCCGCCATCGATGTTCCAGACATTCTTCTTC
TGCTTGTTCTTCTTTCGCTGAGGGCTACTCTTGAGAGTGTCAAGAGCCGTCTTCC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 4

CO CL2659Contig1 835 4 2 U
AAGCTTCTGATCAAATACGAACTGTTCATTCTCTTACTACAAACAAAAAAACAAAAATAT
TACATAACAAAATGAGAAAAAAGGAGCATGATACTATTTGGTGCTTTATCTAATATTGTT
ACCGACATGGTTGATTGAATACAACACGATGGATTACAAAACATATTATATTAAGAAAGA
AACACACATTTATGAAAAGGTCCATAAGTTTTATTTTCCATTGAATGATGAATTTTACCA
GATGCGGATTCCGAAGCAAGAGGTGGATTGTGATCTGCGAATGGTGGGGTAGTGATCAAT
AGAAGAGTCGAAGGATGAAAATCTTTTTTACGACCTTCCCTTTTGTCTGAAACTTGAACA
AATGGTACTCGTTATCATCGATCAGCACCCTCTCCGACAGAGACTGTGACGAAGCGGACA
TTTTCTTGACCTTATCGTTATGACCACCTGATGATAGCCAGAAGAGCCTTGCGGGGATTA
GTGCGAGGATTTTCTTGATGGGTTTTTTCGAACCACGGCGGAATATTTGGTCGCTGGAGA
AGGAGAAATGAGACGGCGGAGGGGTGAGAGGAAGTGACGGAGGCAGCTCGGAGGAGGGAT
GTTTGGGAGTACCAGGATGAGATTCCCAGTCGAAAGGGATGGAACCGGCAGCTCCATCGT
AGTAATAGATTCTAAAAGAAGGACAAGCTGATGCCGGCGAGGAGAAGCGTTGTTTGGTCG
ACGGTATCTTGTGTGAGAAGGTATTAGTGTCTTGCTTTCTCAGCGATACAGGACGCTCAG
ATCCGCCGTTTGTCATTATTGTCTTGTGAGACTGAGAGAGAGGAAGGCTTTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2FS19JQ U 1
AF RR2FS19TF C 40
AF RR2A830TF C 64
AF RR2A830JQ U 140
BS 1 714 RR2FS19JQ
BS 715 835 RR2A830JQ

RD RR2FS19JQ 714 0 0
AAGCTTCTGATCAAATACGAACTGTTCATTCTCTTACTACAAACAAAAAAACAAAAATAT
TACATAACAAAATGAGAAAAAAGGAGCATGATACTATTTGGTGCTTTATCTAATATTGTT
ACCGACATGGTTGATTGAATACAACACGATGGATTACAAAACATATTATATTAAGAAAGA
AACACACATTTATGAAAAGGTCCATAAGTTTTATTTTCCATTGAATGATGAATTTTACCA
GATGCGGATTCCGAAGCAAGAGGTGGATTGTGATCTGCGAATGGTGGGGTAGTGATCAAT
AGAAGAGTCGAAGGATGAAAATCTTTTTTACGACCTTCCCTTTTGTCTGAAACTTGAACA
AATGGTACTCGTTATCATCGATCAGCACCCTCTCCGACAGAGACTGTGACGAAGCGGACA
TTTTCTTGACCTTATCGTTATGACCACCTGATGATAGCCAGAAGAGCCTTGCGGGGATTA
GTGCGAGGATTTTCTTGATGGGTTTTTTCGAACCACGGCGGAATATTTGGTCGCTGGAGA
AGGAGAAATGAGACGGCGGAGGGGTGAGAGGAAGTGACGGAGGCAGCTCGGAGGAGGGAT
GTTTGGGAGTACCAGGATGAGATTCCCAGTCGAAAGGGATGGAACCGGCAGCTCCATCGT
AGTAATAGATTCTAAAAGAAGGACAAGCTGATGCCGGCGAGGAGAAGCGTTGTT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2FS19TF 796 0 0
ACAAAC
AAAAAACAAAAATATTACATAACAAAATGAGAAAAA*GGAGCATGATACTATTTGGTGCT
TTATCTAATATTGTTACCGACATGGTTGATTGAATACAACACGATGGATTACAAAACATA
TTATATTAAGAAAGAAACACACATTTATGAAAAGGTCCATAAGTTTTATTTTCCATTGAA
TGATGAATTTTACCAGATGCGGATTCCGAAGCAAGAGGTGGATTGTGATCTGCGAATGGT
GGGGTAGTGATCAATAGAAGAGTCGAAGGATGAAAATCTTTTTTACGACCTTCCCTTTTG
TCTGAAACTTGAACAAATGGTACTCGTTATCATCGATCAGCACCCTCTCCGACAGAGACT
GTGACGAAGCGGACATTTTCTTGACCTTATCGTTATGACCACCTGATGATAGCCAGAAGA
GCCTTGCGGGGATTAGTGCGAGGATTTTCTTGATGGGTTTTTTCGAACCACGGCGGAATA
TTTGGTCGCTGGAGAAGGAGAAATGAGACGGCGGAGGGGTGAGAGGAAGTGACGGAGGCA
GCTCGGAGGAGGGATGTTTGGGAGTACCAGGATGAGATTCCCAGTCGAAAGGGATGGAAC
CGGCAGCTCCATCGTAGTAATAGATTCTAAAAGAAGGACAAGCTGATGCCGGCGAGGAGA
AGCGTTGTTTGGTCGACGGTATCTTGTGTGAGAAGGTATTAGTGTCTTGCTTTCTCAGCG
ATACAGGACGCTCAGATCCGCCGTTTGTCATTATTGTCTTGTGAGACTGAGAGAGAGGAA
GGCTTTCCCT

QA 7 796 7 796
DS 

RD RR2A830TF 772 0 0
ATAACAAAATGAGAAAAAAGGAGCATGATACTATTTGGTGCTTTATCTAATATTGTTACC
GACATGGTTGATTGAATACAACACGATGGATTACAAAACATATTATATTAAGAAAGAAAC
ACACATTTATGAAAAGGTCCATAAGTTTTATTTTCCATTGAATGATGAATTTTACCAGAT
GCGGATTCCGAAGCAAGAGGTGGATTGTGATCTGCGAATGGTGGGGTAGTGATCAATAGA
AGAGTCGAAGGATGAAAATCTTTTTTACGACCTTCCCTTTTGTCTGAAACTTGAACAAAT
GGTACTCGTTATCATCGATCAGCACCCTCTCCGACAGAGACTGTGACGAAGCGGACATTT
TCTTGACCTTATCGTTATGACCACCTGATGATAGCCAGAAGAGCCTTGCGGGGATTAGTG
CGAGGATTTTCTTGATGGGTTTTTTCGAACCACGGCGGAATATTTGGTCGCTGGAGAAGG
AGAAATGAGACGGCGGAGGGGTGAGAGGAAGTGACGGAGGCAGCTCGGAGGAGGGATGTT
TGGGAGTACCAGGATGAGATTCCCAGTCGAAAGGGATGGAACCGGCAGCTCCATCGTAGT
AATAGATTCTAAAAGAAGGACAAGCTGATGCCGGCGAGGAGAAGCGTTGTTTGGTCGACG
GTATCTTGTGTGAGAAGGTATTAGTGTCTTGCTTTCTCAGCGATACAGGACGCTCAGATC
CGCCGTTTGTCATTATTGTCTTGTGAGACTGAGAGAGAGGAAGGCTTTCCCT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2A830JQ 696 0 0
TACAACACGATGGATTACAAAACATATTATATTAAGAAAGAAACACACATTTATGAAAAG
GTCCATAAGTTTTATTTTCCATTGAATGATGAATTTTACCAGATGCGGATTCCGAAGCAA
GAGGTGGATTGTGATCTGCGAATGGTGGGGTAGTGATCAATAGAAGAGTCGAAGGATGAA
AATCTTTTTTACGACCTTCCCTTTTGTCTGAAACTTGAACAAATGGTACTCGTTATCATC
GATCAGCACCCTCTCCGACAGAGACTGTGACGAAGCGGACATTTTCTTGACCTTATCGTT
ATGACCACCTGATGATAGCCAGAAGAGCCTTGCGGGGATTAGTGCGAGGATTTTCTTGAT
GGGTTTTTTCGAACCACGGCGGAATATTTGGTCGCTGGAGAAGGAGAAATGAGACGGCGG
AGGGGTGAGAGGAAGTGACGGAGGCAGCTCGGAGGAGGGATGTTTGGGAGTACCAGGATG
AGATTCCCAGTCGAAAGGGATGGAACCGGCAGCTCCATCGTAGTAATAGATTCTAAAAGA
AGGACAAGCTGATGCCGGCGAGGAGAAGCGTTGTTTGGTCGACGGTATCTTGTGTGAGAA
GGTATTAGTGTCTTGCTTTCTCAGCGATACAGGACGCTCAGATCCGCCGTTTGTCATTAT
TGTCTTGTGAGACTGAGAGAGAGGAAGGCTTTCCCT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 3

CO CL2660Contig1 815 3 14 U
GGAATGACAATCAACCAACACGGATAAACTAAAGAAGCAGAGCAGAGCTAGAGAGAGACG
ACGATGAGAGCTCTGACATGGACAGGATTATCTCCGCCGCCGCCGGCTATGGTGGCGCGA
ATGACGATGACTCCGAAGATAGTCGCCTTACGACGGATGATCCCCCGAAAAGATCGTGTC
TGTGCTAGAGCCACGGCGTCGTCTGGCGCGGCGGTTTCAGGCGGAGGAGTAGTGGAAGCG
GTGGAATTGGCTGAGATAGGAGAGAAGAGTAAGAAATGGAAGTGGAAGGGAGAGTACTCG
ATCAATTACTTTCTCAAGAGTTCGCCGGAGGAAGTAACTCCGGCGAGTCAGACTGTTCTC
TTAGTTCACGGCTTTGGCGCCTCTATTCCTCACTGGCGAAGGAATATAAATGCTCTGTCC
AAACACCATACAGTTTATGCCATTGATCTTCTTGGGTTTGGTGCTTCCGAGAAGCCACCT
GGTTTTAGCTACACCATGGAGTCATGGGCTGAGTTGATACTAAACTTCTTGGAGGAAGTG
GTTCAGAAACCGACAGTTTTGATTGGAAACTCTGTTGGAAGCCTTGCTTGCGTTATAGCT
GCTTCAGAAGAATCGCAGCGAGATCTGGTTAAAGGTCTTGTTCTGTTGAATTGTGCTGGT
GGTATGAACAACAAAGCCGTGTTTGACGACTGGAGAATCAAGCTGCTGATGCCATTGCTC
TTGCTTATCGACTTCTTACTCAAGCAAAGAGGATTGCTTCTGCACTCTTTACCGTGTTAA
AGACAGGAGAATCTCAGACATCTTGACAATGTATA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H927TF U 1
AF RR2AM94TF U 1
AF RR2GU46TF U 1
BS 1 219 RR2AM94TF
BS 220 220 RR2GU46TF
BS 221 229 RR2AM94TF
BS 230 230 RR2GU46TF
BS 231 434 RR2AM94TF
BS 435 435 RR2GU46TF
BS 436 467 RR2AM94TF
BS 468 468 RR2GU46TF
BS 469 494 RR2AM94TF
BS 495 495 RR2GU46TF
BS 496 608 RR2AM94TF
BS 609 611 RR2GU46TF
BS 612 745 RR2AM94TF
BS 746 815 RR2GU46TF

RD RR2H927TF 630 0 0
GGAATGACAATCAACCAACACGGATAAACTAAAGAAGCAGAGCAGAGCTAGAGAGAGACG
ACGATGAGAGCTCTGACATGGACAGGATTATCTCCGCCGCCGCCGGCTATGGTGGCGCGA
ATGACGATGACTCCGAAGATAGTCGCCTTACGACGGATGATCCCCCGAAAAGATCGTGTC
TGTGCTAGAGCCACGGCGTCGTCTGGCGCGGCGGTTTCAGGCGGAGGAGTAGTGGAAGCG
GTGGAATTGGCTGAGATAGGAGAGAAGAGTAAGAAATGGAAGTGGAAGGGAGAGTACTCG
ATCAATTACTTTCTCAAGAGTTCGCCGGAGGAAGTAACTCCGGCGAGTCAGACTGTTCTC
TTAGTTCACGGCTTTGGCGCCTCTATTCCTCACTGGCGAAGGAATATAAATGCTCTGTCC
AAACACCATACAGTTTATGCCATTGATCTTCTTGGGTTTGGTGCTTCCGAGAAGCCACCT
GGTTTTAGCTACACCATGGAGTCATGGGCTGAGTTGATACTAAACTTCTTGGAGGAAGTG
GTTCAGAAACCGACAGTTTTGATTGGAAACTCTGTTGGAAGCCTTGCTTGCGTTATAGCT
GCTTCAGAAGAATCGCAGCGAGATCTGGTT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2AM94TF 745 0 0
GGAATGACAATCAACCAACACGGATAAACTAAAGAAGCAGAGCAGAGCTAGAGAGAGACG
ACGATGAGAGCTCTGACATGGACAGGATTATCTCCGCCGCCGCCGGCTATGGTGGCGCGA
ATGACGATGACTCCGAAGATAGTCGCCTTACGACGGATGATCCCCCGAAAAGATCGTGTC
TGTGCTAGAGCCACGGCGTCGTCTGGCGCGGCGGTTTCAAGCGGAGGAGCAGTGGAAGCG
GTGGAATTGGCTGAGATAGGAGAGAAGAGTAAGAAATGGAAGTGGAAGGGAGAGTACTCG
ATCAATTACTTTCTCAAGAGTTCGCCGGAGGAAGTAACTCCGGCGAGTCAGACTGTTCTC
TTAGTTCACGGCTTTGGCGCCTCTATTCCTCACTGGCGAAGGAATATAAATGCTCTGTCC
AAACACCATACAGTGTATGCCATTGATCTTCTTGGGTTTGGTGCTTCGGAGAAGCCACCT
GGTTTTAGCTACACTATGGAGTCATGGGCTGAGTTGATACTAAACTTCTTGGAGGAAGTG
GTTCAGAAACCGACAGTTTTGATTGGAAACTCTGTTGGAAGCCTTGCTTGCGTTATAGCT
GCTTCAGA***ATCGCAGCGAGATCTGGTTAAAGGTCTTGTTCTGTTGAATTGTGCTGGT
GGTATGAACAACAAAGCCGTGTTTGACGACTGGAGAATCAAGCTGCTGATGCCATTGCTC
TTGCTTATCGACTTCTTACTCAAGC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2GU46TF 815 0 0
GGAATGACAATCAACCAACACGGATAAACTAAAGAAGCAGAGCAGAGCTAGAGAGAGACG
ACGATGAGAGCTCTGACATGGACAGGATTATCTCCGCCGCCGCCGGCTATGGTGGCGCGA
ATGACGATGACTCCGAAGATAGTCGCCTTACGACGGATGATCCCCCGAAAAGATCGTGTC
TGTGCTAGAGCCACGGCGTCGTCTGGCGCGGCGGTTTCAGGCGGAGGAGTAGTGGAAGCG
GTGGAATTGGCTGAGATAGGAGAGAAGAGTAAGAAATGGAAGTGGAAGGGAGAGTACTCG
ATCAATTACTTTCTCAAGAGTTCGCCGGAGGAAGTAACTCCGGCGAGTCAGACTGTTCTC
TTAGTTCACGGCTTTGGCGCCTCTATTCCTCACTGGCGAAGGAATATAAATGCTCTGTCC
AAACACCATACAGTTTATGCCATTGATCTTCTTGGGTTTGGTGCTTCCGAGAAGCCACCT
GGTTTTAGCTACACCATGGAGTCATGGGCTGAGTTGATACTAAACTTCTTGGAGGAAGTG
GTTCAGAAACCGACAGTTTTGATTGGAAACTCTGTTGGAAGCCTTGCTTGCGTTATAGCT
GCTTCAGAAGAATCGCAGCGAGATCTGGTTAAAGGTCTTGTTCTGTTGAATTGTGCTGGT
GGTATGAACAACAAAGCCGTGTTTGACGACTGGAGAATCAAGCTGCTGATGCCATTGCTC
TTGCTTATCGACTTCTTACTCAAGCAAAGAGGATTGCTTCTGCACTCTTTACCGTGTTAA
AGACAGGAGAATCTCAGACATCTTGACAATGTATA

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 3

CO CL2661Contig1 1252 3 17 U
GGGATCAAATTCTGAAAAGTCGGTAGAGAACTTGCGGCTAATAGATCTCTTTCTCTCGCT
CGCTCGCTCGCTCAAAGTTGCAGGAAACCCTAACTTTAGGATCAAATTCGTTGCGATATG
GAAGGAGGAGGTGATGGGTGGTATCGACCGCCGATGACGGGAGTGTGGTGGGACATGAAC
ACGTGTCCGGTTCCCGCTGATGTTGACCCTCGTTATGTCCGTCAGTGTATAGTATCTGGG
TTGGAAAAGCAGATTCGTCGTCCGACTAAAACGATCATTTATGCCATGGGCAACCTAGAA
TACATATCTAGTGACATCTTGGAAAAGATCGCCTCCTCTGGAATCATTCTTATTCACGCC
CCTTGCGGTGCGAACCACTTAATTAGTTATCTGCACGAATGGTGTGATGATGAGAAGCTT
CAACCCCAACGTCCAGGTTCTAGGAACATAATGGTTATATCCGGTGATGGTTTTATGAGT
CCGTGTATTCAGGAATTTTCCGAATTCAACAAGTTTTGTGCATATCCAAAAGATGTTGGG
CCATTAACAATCTTTGGCAATCAACGTGAGAAAGTGTTTGTCAAAGAGTTTGTGTGGGAA
ACTTTATGTAGTTACACCAAACCACCAAGTGGCGGCTATGCCCCGGTAGTAGATAAACCT
CTCTGCATTTGCCAAGTATGCGATGCTGTTTACCATACATGTAACGACTTCATCACTCAT
CTCAAGAGTCAACAACACAGAGAGGGGTTGTTTGGAATTGCGGCCCGTGGCGGCGATGGT
AATATGCCTAGATTTTTTTGCACAGTTTGCAATTATCCCGCCTACGACGAATTCAACATG
TCCCTCCATAACGAAAGCAAAGATCATAAGCAGAAGGTACGCAGCATTGCCTCTCTTTGC
TTGTACATTGTAACCAACTCTGCCCCTCTTAAAATTTGATCCCATTTTGGTTTGTTTTCA
AGCTGGCTGAGAAAGAGCCTCCTCCTCAAGCAGAGGATTGCGAGAGCAGGAAGAGAAATC
CACAAGTGTATCTCTTTAACGAGATAAACAAGAAGCAATCTCTTGAACGAGCGCCCATGG
AACTAGACTTAGTTGCCTAAGAGTGCGTGTGCATCGGTCTTTGTGTTAAAGAGTTTTACT
AAATAATACTTATTTGTTATTATGGTGAATGCTTGGTTCTTCTACCTCTGTGATATTTTG
GGTGACTCTCAATTTGATGAAACAAACATCAGGAGACGATTCGAATTAACGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI66TF U 1
AF RR2B083TF U 320
AF RR2B083JQ C 478
BS 1 384 RR2CI66TF
BS 385 385 RR2B083TF
BS 386 481 RR2CI66TF
BS 482 482 RR2B083TF
BS 483 641 RR2CI66TF
BS 642 642 RR2B083TF
BS 643 672 RR2CI66TF
BS 673 673 RR2B083TF
BS 674 693 RR2CI66TF
BS 694 694 RR2B083TF
BS 695 704 RR2CI66TF
BS 705 705 RR2B083TF
BS 706 707 RR2CI66TF
BS 708 708 RR2B083TF
BS 709 724 RR2CI66TF
BS 725 1144 RR2B083TF
BS 1145 1252 RR2B083JQ

RD RR2CI66TF 736 0 0
GGGATCAAATTCTGAAAAGTCGGTAGAGAACTTGCGGCTAATAGATCTCTTTCTCTCGCT
CGCTCGCTCGCTCAAAGTTGCAGGAAACCCTAACTTTAGGATCAAATTCGTTGCGATATG
GAAGGAGGAGGTGATGGGTGGTATCGACCGCCGATGACGGGAGTGTGGTGGGACATGAAC
ACGTGTCCGGTTCCCGCTGATGTTGACCCTCGTTATGTCCGTCAGTGTATAGTATCTGGG
TTGGAAAAGCAGATTCGTCGTCCGACTAAAACGATCATTTATGCCATGGGCAACCTAGAA
TACATATCTAGTGACATCTTGGAAAAGATCGCCTCCTCTGGAATCATTCTTATTCACGCC
CCTTGCGGTGCGAACCACTTAATTGGTTATCTGCACGAATGGTGTGATGATGAGAAGCTT
CAACCCCAACGTCCAGGTTCTAGGAACATAATGGTTATATCCGGTGATGGTTTTATGAGT
CTGTGTATTCAGGAATTTTCCGAATTCAACAAGTTTTGTGCATATCCAAAAGATGTTGGG
CCATTAACAATCTTTGGCAATCAACGTGAGAAAGTGTTTGTCAAAGAGTTTGTGTGGGAA
ACTTTATGTAGTTACACCAAACCACCAAGTGGCGGCTATGCGCCGGTAGTAGATAAACCT
CTCTGCATTTGC*AAGTATGCGATGCTGTTTAC*ATACATGTAATGATTTCATCACTCAT
CTCA
GAGTCACACACA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2B083TF 825 0 0
G
GGAAAAGATCGCTTCCTCTGGAATCATTCTTATTCACGCCCCTTGCGGTGCGAACCACTT
AATTAGTTATCTGCACGAATGGTGTGATGATGAGAAGCTTCAACCCCAACGTCCAGGTTC
TAGGAACATAATGGTTATATCCGGTGATGGTTTTATGAGTCCGTGTATTCAGGAATTTTC
CGAATTCAACAAGTTTTGTGCATATCCAAAAGATGTTGGGCCATTAACAATCTTTGGCAA
TCAACGTGAGAAAGTGTTTGTCAAAGAGTTTGTGTGGGAAACTTTATGTAGTTACACCAA
ACCACCAAGTGGCGGCTATGCCCCGGTAGTAGATAAACCTCTCTGCATTTGCCAAGTATG
CGATGCTGTTTACCATACATGTAACGACTTCATCACTCATCTCAAGAGTCAACAACACAG
AGAGGGGTTGTTTGGAATTGCGGCCCGTGGCGGCGATGGTAATATGCCTAGATTTTTTTG
CACAGTTTGCAATTATCCCGCCTACGACGAATTCAACATGTCCCTCCATAACGAAAGCAA
AGATCATAAGCAGAAGGTACGCAGCATTGCCTCTCTTTGCTTGTACATTGTAACCAACTC
TGCCCCTCTTAAAATTTGATCCCATTTTGGTTTGTTTTCAAGCTGGCTGAGAAAGAGCCT
CCTCCTCAAGCAGAGGATTGCGAGAGCAGGAAGAGAAATCCACAAGTGTATCTCTTTAAC
GAGATAAACAAGAAGCAATCTCTTGAACGAGCGCCCATGGAACTAGACTTAGTTGCCTAA
GAGTGCGTGTGCATCGGTCTTTGTGTTAAAGAGTTTTACTAAAT

QA 2 825 2 825
DS 

RD RR2B083JQ 775 0 0
AGTCCGTGTATTCAGGAATTTTCCGAATTCAACAAGTTTTGTGCATATCCAAAAGATGTT
GGGCCATTAACAATCTTTGGCAATCAACGTGAGAAAGTGTTTGTCAAAGAGTTTGTGTGG
GAAACTTTATGTAGTTACACCAAACCACCAAGTGGCGGCTATGCCCCGGTAGTAGATAAA
CCTCTCTGCATTTGCCAAGTATGCGATGCTGTTTACCATACATGTAACGACTTCATCACT
CATCTCAAGAGTCAACAACACAGAGAGGGGTTGTTTGGAATTGCGGCCCGTGGCGGCGAT
GGTAATATGCCTAGATTTTTTTGCACAGTTTGCAATTATCCCGCCTACGACGAATTCAAC
ATGTCCCTCCATAACGAAAGCAAAGATCATAAGCAGAAGGTACGCAGCATTGCCTCTCTT
TGCTTGTACATTGTAACCAACTCTGCCCCTCTTAAAATTTGATCCCATTTTGGTTTGTTT
TCAAGCTGGCTGAGAAAGAGCCTCCTCCTCAAGCAGAGGATTGCGAGAGCAGGAAGAGAA
ATCCACAAGTGTATCTCTTTAACGAGATAAACAAGAAGCAATCTCTTGAACGAGCGCCCA
TGGAACTAGACTTAGTTGCCTAAGAGTGCGTGTGCATCGGTCTTTGTGTTAAAGAGTTTT
ACTAAATAATACTTATTTGTTATTATGGTGAATGCTTGGTTCTTCTACCTCTGTGATATT
TTGGGTGACTCTCAATTTGATGAAACAAACATCAGGAGACGATTCGAATTAACGT

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 4

CO CL2662Contig1 1358 4 2 U
GGGACATCCCCGAACATACTTTGGTAAAGAGTTCGCCCTAGCTGTTTCTCTCTCGGGCAC
GGAGTCCAAGACAGCCGCACAGCAAATTTCTCCACCAGAATGAAGGCCTCTCTCCGGCGT
AGCTCTTCTGTCTCCTAGACACGAGCCTCTCTGCCGCTCCGACGACGACGTCCTGCTCAC
CATCACGAAGCTTTCCCTGTTTTCCAACCATGGAGTCTTCAGCAACTGTTTCATCTGGGT
TTCCAATGGATTCTCCGGTCCCTCCTGACCCTCCACCTGATTTCCGTCTCAAACTCACGC
TCTATCCTCGGAGAGCTCTGTCGATTAGGGATCTGAACCCTCGACCCCCGCCAGAACCTC
CAGACCCACCGGATCGAGCCACCCCTTCACAACCTAAATCCTTCACCATCTTCACCGAAC
GCTTCTTCCCTCATATCGAGCTCGCTTTGGTAGATTCAAATTACCTTTTGGTTCTTTCGG
TCTCCCACTCCTCGAGGGCTCCTTCGTGCGACTTCATCAACCTCTTCGTTACAACTATAC
TCAAGCCGAGGACTCTTGAAGTTTTTGTTGTCTCGTTTGATGTTTTTTGTCTCACCGGAG
CCGGGTCTAGCGTCATCTCTCTTCCATGCTCCATCCTTTCCATCCTCCATGTTTGGTCTC
TTTCGCCCTCCAGATCGTTTAAACTCGGTTTAAAACGATCTCCGGAAGATCCATGCCATC
AATCACCACAAACATACCTTTTCTCACAACTAGTTGTAATTTTGGCGTCCAATGTAGGTG
GGAATCCACTCCGGCGTCCATCTTTGAGCTGTTTGTTTGTGAAGCTGGCGTCCGATGTAG
GTGGGAATCCACTCCGGCGTCCAACTTTGAGCTATCTATTTGTGAATCGGGTGTCCGATG
CAGGTGGGAATCCACTCCGGCGTCCAGTTCTGAGCCATCAAAAGCTAGTAAGGTCATGTT
CCTTGATTGTGGAGAGTACTTCACTACCATGTCTCTTTTCTATGAATGGAGAAAACTTCT
CGGATTCTTTTCCGAGCTCTAGTTTCAGTTTACTCACCGGTTTGTTACCTTGTGGAGCGG
TCTGTACGGGGCCTGAAGGTGCAATCGAGATCACTCCGGTTTTTCTCGTTGGTGAGGACT
GTCTCTCAACATCACTTGTGACTATCTCTCGGCTGTCCGACTTTGTCGTGGAAGCTTTAT
CGACGCATTCAAACTTGGTGTTGAATTCGCTGTCAACTTCATATGAAGATTTATCATGCT
TGTTTCTATTGACTTTTGTAGTTTATGAATTGTTTTCAAGAGGATGTTTAATTCCCTCAT
GTAGTCCTTGAATTTGAAGTAATGGAAGTTTGTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2BP26TF U 4
AF RR2A119TF U 1
AF RR2A119JQ C 526
AF RR2BP26JQ C 606
BS 1 773 RR2A119TF
BS 774 1358 RR2A119JQ

RD RR2BP26TF 700 0 0
GG
ATCCCCGAACATACTTTGGTAAAGAGTTCGCCCTAGCTGTTTCTCTCTCGGGCACGGAGT
CCAAGACAGCCGCACCGCAAATTTCTCCACCAGAATGAAGGCCTCTCTCCGGCGTAGCTC
TTCTGTCTCCTAGACACGAGCCTCTCTGCCGCTCCGACGACGACGTCCTGCTCACCATCA
CGAAGCTTTCCCTGTTTTCCAACCATGGAGTCTTCAGCAACTGTTTCATCTGGGTTTCCA
ATGGATTCTCCGGTCCCTCCTGACCCTCCACCTGATTTCCGTCTCAAACTCACGCTCTAT
CCTCGGAGAGCTCTGTCGATTAGGGATCTGAACCCTCGACCCCCGCCAGAACCTCCAGAC
CCACCGGATCGAGCCACCCCTTCACAACCTAAATCCTTCACCATCTTCACCGAACGCTTC
TTCCCTCATATCGAGCTCGCTTTGGTAGATTCAAATTACCTTTTGGTTCTTTCGGTCTCC
CACTCCTCGAGGGCTCCTTCGTGCGACTTCATCAACCTCTTCGTTACAACTATACTCAAG
CCGAGGACTCTTGAAGTTTTTGTTGTCTCGTTTGATGTTTTTTGTCTCACCGGAGCCGGG
TCTAGCGTCATCTCTCTTCCATGCTCCATCCTTTCCATCCTCCATGTTTGGTCTCTTTCG
CCCTCCAGATCGTTTAAACTCGGTT*AAAACGATCTCC

QA 3 700 3 700
DS 

RD RR2A119TF 773 0 0
GGGACATCCCCGAACATACTTTGGTAAAGAGTTCGCCCTAGCTGTTTCTCTCTCGGGCAC
GGAGTCCAAGACAGCCGCACAGCAAATTTCTCCACCAGAATGAAGGCCTCTCTCCGGCGT
AGCTCTTCTGTCTCCTAGACACGAGCCTCTCTGCCGCTCCGACGACGACGTCCTGCTCAC
CATCACGAAGCTTTCCCTGTTTTCCAACCATGGAGTCTTCAGCAACTGTTTCATCTGGGT
TTCCAATGGATTCTCCGGTCCCTCCTGACCCTCCACCTGATTTCCGTCTCAAACTCACGC
TCTATCCTCGGAGAGCTCTGTCGATTAGGGATCTGAACCCTCGACCCCCGCCAGAACCTC
CAGACCCACCGGATCGAGCCACCCCTTCACAACCTAAATCCTTCACCATCTTCACCGAAC
GCTTCTTCCCTCATATCGAGCTCGCTTTGGTAGATTCAAATTACCTTTTGGTTCTTTCGG
TCTCCCACTCCTCGAGGGCTCCTTCGTGCGACTTCATCAACCTCTTCGTTACAACTATAC
TCAAGCCGAGGACTCTTGAAGTTTTTGTTGTCTCGTTTGATGTTTTTTGTCTCACCGGAG
CCGGGTCTAGCGTCATCTCTCTTCCATGCTCCATCCTTTCCATCCTCCATGTTTGGTCTC
TTTCGCCCTCCAGATCGTTTAAACTCGGTTTAAAACGATCTCCGGAAGATCCATGCCATC
AATCACCACAAACATACCTTTTCTCACAACTAGTTGTAATTTTGGCGTCCAAT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2A119JQ 833 0 0
TCGTTACAACTATACTCAAGCCGAGGACTCTTGAAGTTTTTGTTGTCTCGTTTGATGTTT
TTTGTCTCACCGGAGCCGGGTCTAGCGTCATCTCTCTTCCATGCTCCATCCTTTCCATCC
TCCATGTTTGGTCTCTTTCGCCCTCCAGATCGTTTAAACTCGGTTTAAAACGATCTCCGG
AAGATCCATGCCATCAATCACCACAAACATACCTTTTCTCACAACTAGTTGTAATTTTGG
CGTCCAATGTAGGTGGGAATCCACTCCGGCGTCCATCTTTGAGCTGTTTGTTTGTGAAGC
TGGCGTCCGATGTAGGTGGGAATCCACTCCGGCGTCCAACTTTGAGCTATCTATTTGTGA
ATCGGGTGTCCGATGCAGGTGGGAATCCACTCCGGCGTCCAGTTCTGAGCCATCAAAAGC
TAGTAAGGTCATGTTCCTTGATTGTGGAGAGTACTTCACTACCATGTCTCTTTTCTATGA
ATGGAGAAAACTTCTCGGATTCTTTTCCGAGCTCTAGTTTCAGTTTACTCACCGGTTTGT
TACCTTGTGGAGCGGTCTGTACGGGGCCTGAAGGTGCAATCGAGATCACTCCGGTTTTTC
TCGTTGGTGAGGACTGTCTCTCAACATCACTTGTGACTATCTCTCGGCTGTCCGACTTTG
TCGTGGAAGCTTTATCGACGCATTCAAACTTGGTGTTGAATTCGCTGTCAACTTCATATG
AAGATTTATCATGCTTGTTTCTATTGACTTTTGTAGTTTATGAATTGTTTTCAAGAGGAT
GTTTAATTCCCTCATGTAGTCCTTGAATTTGAAGTAATGGAAGTTTGTGTTTC

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2BP26JQ 753 0 0
TCTAGCGTCATCTCTCTTCCATGCTCCATCCTTTCCATCCTCCATGTTTGGTCTCTTTCG
CCCTCCAGATCGTTTAAACTCGGTTTAAAACGATCTCCGGAAGATCCATGCCATCAATCA
CCACAAACATACCTTTTCTCACAACTAGCTGTAATTTTGGCGTCCAATGTAGGTGGGAAT
CCACTCCGGCGTCCATCTTTGAGCTGTTTGTTTGTGAAGCTGGCGTCCGATGTAGGTGGG
AATCCACTCCGGCGTCCAACTTTGAGCTATCTATTTGTGAATCGGGTGTCCGATGCAGGT
GGGAATCCACTCCGGCGTCCAGTTCTGAGCCATCAAAAGCTAGTAAGGTCATGTTCCTTG
ATTGTGGAGAGTACTTCACTACCATGTCTCTTTTCTATGAATGGAGAAAACTTCTCGGAT
TCTTTTCCGAGCTCTAGTTTCAGTTTACTCACCGGTTTGTTACCTTGTGGAGCGGTCTGT
ACGGGGCCTGAAGGTGCAATCGAGATCACTCCGGTTTTTCTCGTTGGTGAGGACTGTCTC
TCAACGTCACTTGTGACTATCTCTCGGCTGTCCGACTTTGTCGTGGAAGCTTTATCGACG
CATTCAAA*TTGGTGTTGAATTCGCTGTCAACTTCATATGAAGATTTATCATGCTTGTTT
CTATTGACTTTTGTAGTTTATGAATTGTTTTCAAGAGGATGTTTAATTCCCTCATGTAGT
CCTTGAATTTGAAGTAATGGAAGTTTGTGTT
CC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 4

CO CL2663Contig1 958 4 8 U
GGATTCTCCAAACAAAAATCAATATGTTGACTCACGCTATATCTAAACCCATCCTTATAC
TAACCATTCTATTAGCTCTACAAGCTTTTTATACAACAGCAAAGGCTCAAAACTGTGGTT
GTTCGTCAGACCTATGTTGTAGCCAGTTCGGTTTCTGCGGTATCACTTCAGATTATTGTG
GTGTAGGTTGTCAACAAGGGCCTTGTTTTGCCCCTCCTCCGGCGAACGGTGTCTCGGTTG
ATGAGATTGTCACACAAGAATTCTTCAGTGGGATCATCAACCAAGCTGAGTCTAGTTGCG
CTGGTAATGGATTTTACAGCCGAGGAGCTTTTCTTGAGGCCTTAGAGTCATATTCTCGTT
TCGGTAGGATTGGTTCGGTCGATGATTCTAGGCGTGAGATCGCAGCCTTCTTTGCCCATG
TCACGCATGAAACTGGACATTTTTGCTACATAGAAGAAATAAACGGACCCTCAAGGGATT
ATTGCGACGAGAACGCAACGCAGTATCCATGCAACCCCAACAAAGGCTATTACGGCCGAG
GACCCATCCAACTCTCTTGGAACTTTAACTACGGGCCAGCGGGAACCGCCATTGGTTTCG
ACGGTCTCAATGCACCAGAAACAGTAGCCACGGATCCAGTCATATCCTTCAAGACCGCCT
TGTGGTACTGGACCAACAGAGTTCAGCCTGTTATCTCACAAGGCTTTGGTGCAACAATCC
GAGCCATCAACGTTGCTTTAGAATGCGACGGAGCCAACTCAGCAACCGTTCAAGCCAGAG
TTCGTTACTACACCGATTATTGCCGTCAGTTGGGTGTTGACCCCGGAAACAACCTCACTT
GCTAACCAAAAAAAGAACATCTAGTAGTAATCTATTTTATTTGTATACACACATTAAAGA
AATAAAGACAATGCTTAAGAATCATGTAAATGACCCATTAATGTTTTGAATTTCTATG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR60TF U 1
AF RR2AX44TFB U 1
AF RR2AX44JQ C 221
AF RR2AR60JQ C 267
BS 1 11 RR2AR60TF
BS 12 12 RR2AX44TFB
BS 13 519 RR2AR60TF
BS 520 520 RR2AX44TFB
BS 521 705 RR2AR60TF
BS 706 754 RR2AX44TFB
BS 755 887 RR2AX44JQ
BS 888 958 RR2AR60JQ

RD RR2AR60TF 705 0 0
GGATTCTCCAATCAAAAATCAATATGTTGACTCACGCTATATCTAAACCCATCCTTATAC
TAACCATTCTATTAGCTCTACAAGCTTTTTATACAACAGCAAAGGCTCAAAACTGTGGTT
GTTCGTCAGACCTATGTTGTAGCCAGTTCGGTTTCTGCGGTATCACTTCAGATTATTGTG
GTGTAGGTTGTCAACAAGGGCCTTGTTTTGCCCCTCCTCCGGCGAACGGTGTCTCGGTTG
ATGAGATTGTCACACAAGAATTCTTCAGTGGGATCATCAACCAAGCTGAGTCTAGTTGCG
CTGGTAATGGATTTTACAGCCGAGGAGCTTTTCTTGAGGCCTTAGAGTCATATTCTCGTT
TCGGTAGGATTGGTTCGGTCGATGATTCTAGGCGTGAGATCGCAGCCTTCTTTGCCCATG
TCACGCATGAAACTGGACATTTTTGCTACATAGAAGAAATAAACGGACCCTCAAGGGATT
ATTGCGACGAGAACGCAACGCAGTATCCATGCAACCCCAGCAAAGGCTATTACGGCCGAG
GACCCATCCAACTCTCTTGGAACTTTAACTACGGGCCAGCGGGAACCGCCATTGGTTTCG
ACGGTCTCAATGCACCAGAAACAGTAGCCACGGATCCAGTCATATCCTTCAAGACCGCCT
TGTGGTACTGGACCAACAGAGTTCAGCCTGTTATCTCACAAGGCT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2AX44TFB 754 0 0
GGATTCTCCAAACAAAAATCAATATGTTGACTCACGCTATATCTAAACCCATCCTTATAC
TAACCATTCTATTAGCTCTACAGGCTTTTTATACAACAGCAAAGGCTCAAAACTGTGGTT
GTTCGTCAGACCTATGTTGTAGCCAGTTCGGTTTCTGCGGTATCACTTCAGATTATTGTG
GTGTAGGTTGTCAACAAGGGCCTTGTTTTGCCCCTCCTCCGGCGAACGGTGTCTCGGTTG
ATGAGATTGTCACACAAGAATTCTTCAGTGGGATCATCAACCAAGCTGAGTCTAGTTGCG
CTGGTAATGGATTTTACAGCCGAGGAGCTTTTCTTGAGGCTTTAGAGTCATATTCTCGTT
TCGGTAGGATTGGTTCGGTCGATGATTCTAGGCGTGAGATTGCAGCCTTCTTTGCCCATG
TCACGCATGAAACTGGACATTTTTGCTACATAGAAGAAATAAACGGACCCTCAAGGGATT
ATTGCGACGAGAACGCAACGCAGTGTCCATGCAACCCCAACAAAGGCTATTACGGCCGAG
GACCCATCCAACTCTCTTGGAACTTTAACTACGGGCCAGCGGGAACCGCCATTGGTTTCG
ACGGTCTCAATGCACCAGAAACAGTAGCCACGGATCCAGTCATATCCTTCAAGACCGCCT
TGTGGTACTGGACCAACAGAGTTCAGCCTGTTATCTCACAAGGCTTTGGTGCAACAATCC
GAGCCATCAACGTTGCTTTAGAATGCGACGGAGC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2AX44JQ 667 0 0
GGCGAACGGTGTCTCGGTTGATGAGATTGTCACACAAGAATTCTTCAGTGGGATCATCAA
CCAAGCTGAGTCTAGTTGCGCTGGTAATGGATTTTACAGCCGAGGAGCTTTTCTTGAGGC
TTTAGAGTCATATTCTCGTTTCGGTAGGATTGGTTCGGTCGATGATTCTAGGCGTGAGAT
TGCAGCCTTCTTTGCCCATGTCACGCATGAAACTGGACATTTTTGCTACATAGAAGAAAT
AAACGGACCCTCAAGGGATTATTGCGACGAGAACGCAACGCAGTGTCCATGCAACCCCAA
CAAAGGCTATTACGGCCGAGGACCCATCCAACTTTCTTGGAACTTTAACTACGGGCCAGC
GGGAACCGCCATTGGTTTCGACGGTCTCAATGCACCAGAAACAGTAGCCACGGATCCAGT
CATATCCTTCAAGACCGCCTTGTGGTACTGGACCAACAGAGTTCAGCCTGTTATCTCACA
AGGCTTTGGTGCAACAATCCGAGCCATCAACGTTGCTTTAGAATGCGACGGAGCCAACTC
AGCAACCGTTCAAGCCAGAGTTCGTTACTACACCGATTATTGCCGTCAGTTGGGTGTTGA
CCCCGGAAACAACCTCACTTGCTAACCAAAAAAAGAACATCTAGTAGTAATCTATTTTAT
TTGTATA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2AR60JQ 692 0 0
AGTGGGATCATCAACCAAGCTGAGTCTAGTTGCGCTGGTAATGGATTTTACAGCCGAGGA
GCTTTTCTTGAGGCCTTAGAGTCATATTCTCGTTTCGGTAGGATTGGTTCGGTCGATGAT
TCTAGGCGTGAGATCGCAGCCTTCTTTGCCCATGTCACGCATGAAACTGGACATTTTTGC
TACATAGAAGAAATAAACGGACCCTCAAGGGATTATTGCGACGAGAACGCAACGCAGTAT
CCATGCAACCCCAGCAAAGGCTATTACGGCCGAGGACCCATCCAACTCTCTTGGAACTTT
AACTACGGGCCAGCGGGAACCGCCATTGGTTTTGACGGTCTCAATGCACCAGAAACAGTA
GCCACGGATCCAGTCATATCCTTCAAGACCGCCTTGTGGTACTGGACCAACAGAGTTCAG
CCTGTTATCTCACAAGGCTTTGGTGCAACAATCCGAGCCATCAACGGCGCTTTAGAATGC
GACGGAGCCAACTCAGCAACCGTTCAAGCCAGAGTTCGTTACTACACCGATTATTGCCGT
CAGTTGGGTGTTGACCCCGGAAACAACCTCACTTGCTAACCAAAAAAAGAACATCTAGTA
GTAATTTATTTTATTTGTATACACACATTAAAGAAATAAAGACAATGCTTAAGAATCATG
TAAATGACCCATTAATGTTTTGAATTTCTATG

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 4

CO CL2664Contig1 1762 4 8 U
GGACGTCTTCGTTACCCTCTACGAACGAAGGAAAGGCTGAGGAGCAGTTAGGCGATGAGG
CTGATAGTACCTCTCCAGGGAGTGGTTCAAGACCGCGGAGGTCTCTTCGTCGGCTCTCTC
ATCCCTTGCTGCCTCTTCTACTTTCTCCAGCTTTACCTCAAACGACGCCGTTCCCCTCCT
CCTCCTCCTCCTCCACCTCCCGATTCCGACTCCTCCTCGGAGTTACCGAGGACCTCGTCT
CGGTCCAGCCTCTTCACCCGAGGGAACTCAATCGGACGCGTTCGAGTCTCCTCCAGAGCG
GCTTCTCTCGCCAAGTCTCCCGATTCGCCTTACTATATAGGGCTTGAGAGAGTCAAGACC
GATCCCTACGATCGGGTTAGTAATAGGGATGGGATTATCCAGCTTGGTTTGGCTGAGAGT
ACGAGATGGATGTCTGATAATCTAATGGATTCGTTGATGATTCAATCTGGTGGTGGATTC
GATGTCAGTAGCATCGCCATGTATCAACCTTTCGAAGGCTTGCTCGAGGTCAGAGTGGCT
TTTGCTGATTTCATGTCACGAATAATGGGAGGTAACGTCTCGTTTGACCCTTCGAACATG
GTGATCACAGCTGGTGGGACTCCTGCTGTCGAAGTACTGGCCTTCTGCTTGGCTGATCAT
GGGAACGCTTTTCTCATTCCCTCTCCCTATTATCCAGGCTTTGACAGAGATATTAAGTTC
AGGACAGGAATCGAGCTTTTACCAGTACACTGCCGTACTCTGACAATTTCACTGTTACCG
TTTCCGCGTTGGAACAAGCTTTGAATCAAGCTAGAAAGCGAGGGAGTAAGGTGTCTGGCA
TCCTCTTTTCAAACCCTTCGAACCCTGTTGGAAACATACTCTCAAGAGAGACGCTACATG
CTATTCTGAGCTTTGCTCAGGGGAAGAACATCCATGTCATCTCCGATGAAATATTCGCGG
GTTCTGTTTACGGGGAGGACAAAGAGTTTGTTAGCATGGCGGAGGTAGCTGCTGCCTCTA
CCTCCTCGGGGGATTTCGATAAGAGTAGGGTTCATATCATCTACGGCTTGTCCAACGACC
TTTCCCTTCCCGGTTTTAGAACTGGAGTTATCTATTCCTTTCATGAAGACGTTGTGAGCG
CGGCCAAGAAGCTGATGAGGTTTTCGTCTATGCCAGTTCCAGTCCAGAGGATACTTATCT
CTCTGCTGTCGGATACAAGGTTTATCGAGGAATACATGGCAGCCCACAGGCAGAGGATCA
GGGATAAGCATTTTCTCTTTGTGGAAGGTTTGAAGCAATTAGGGATACCGTGTGCTGAGG
GTGGCGGTGGGTTGTATTGTTGGGTTGACATGAGCAGTTTACTCACATCTTACAGCGAGA
AAGGCGAACTCGAGCTGTTTGAGAAGCTACTGAGTGTTGCTAAGATTAATGCCACTCCTG
GAACAGCTTGTTATTGTATAGAACCGGGTTGGTTCAGGTGCTGTTTTACGGCTTTAGCTG
ATGAAGACATTCCAGTGATCATGGAACGGATCAAACTGCTTGCTGAACCATCCACATCTT
GAGGCCAAGCCATATTTTGGGTTAGTAAGCCATTGTAACACATTCTTTTCGCAAGTTAGT
TCTTTAGAAGTTTGGAAGATGGGAATGAATTAGAAGATGTAACTTTATCGTTTGCAGAAG
AAAGAGTTTGGTATTCAAACTCACGCTCTGTTTGTACAAAAACAAGTTTCTACTTCTATG
AAAAGAGAACAACTTTGCAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK96TF U 1
AF RR2ES89TF U 615
AF RR2ES89JQ C 884
AF RR2GK96JQ C 1028
BS 1 671 RR2GK96TF
BS 672 1287 RR2ES89TF
BS 1288 1288 RR2ES89JQ
BS 1289 1379 RR2ES89TF
BS 1380 1507 RR2ES89JQ
BS 1508 1508 RR2GK96JQ
BS 1509 1740 RR2ES89JQ
BS 1741 1762 RR2GK96JQ

RD RR2GK96TF 671 0 0
GGACGTCTTCGTTACCCTCTACGAACGAAGGAAAGGCTGAGGAGCAGTTAGGCGATGAGG
CTGATAGTACCTCTCCAGGGAGTGGTTCAAGACCGCGGAGGTCTCTTCGTCGGCTCTCTC
ATCCCTTGCTGCCTCTTCTACTTTCTCCAGCTTTACCTCAAACGACGCCGTTCCCCTCCT
CCTCCTCCTCCTCCACCTCCCGATTCCGACTCCTCCTCGGAGTTACCGAGGACCTCGTCT
CGGTCCAGCCTCTTCACCCGAGGGAACTCAATCGGACGCGTTCGAGTCTCCTCCAGAGCG
GCTTCTCTCGCCAAGTCTCCCGATTCGCCTTACTATATAGGGCTTGAGAGAGTCAAGACC
GATCCCTACGATCGGGTTAGTAATAGGGATGGGATTATCCAGCTTGGTTTGGCTGAGAGT
ACGAGATGGATGTCTGATAATCTAATGGATTCGTTGATGATTCAATCTGGTGGTGGATTC
GATGTCAGTAGCATCGCCATGTATCAACCTTTCGAAGGCTTGCTCGAGGTCAGAGTGGCT
TTTGCTGATTTCATGTCACGAATAATGGGAGGTAACGTCTCGTTTGACCCTTCGAACATG
GTGATCACAGCTGGTGGGACTCCTGCTGTCGAAGTACTGGCCTTCTGCTTGGCTGATCAT
GGGAACGCTTT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2ES89TF 765 0 0
G
GGGACTCCTGCTGTCGAAGTACTGGCCTTCTGCTTGGCTGATCATGGGAACGCTTTTCTC
ATTCCCTCTCCCTATTATCCAGGCTTTGACAGAGATATTAAGTTCAGGACAGGAATCGAG
CTTTTACCAGTACACTGCCGTACTCTGACAATTTCACTGTTACCGTTTCCGCGTTGGAAC
AAGCTTTGAATCAAGCTAGAAAGCGAGGGAGTAAGGTGTCTGGCATCCTCTTTTCAAACC
CTTCGAACCCTGTTGGAAACATACTCTCAAGAGAGACGCTACATGCTATTCTGAGCTTTG
CTCAGGGGAAGAACATCCATGTCATCTCCGATGAAATATTCGCGGGTTCTGTTTACGGGG
AGGACAAAGAGTTTGTTAGCATGGCGGAGGTAGCTGCTGCCTCTACCTCCTCGGGGGATT
TCGATAAGAGTAGGGTTCATATCATCTACGGCTTGTCCAACGACCTTTCCCTTCCCGGTT
TTAGAACTGGAGTTATCTATTCCTTTCATGAAGACGTTGTGAGCGCGGCCAAGAAGCTGA
TGAGGTTTTCGTCTATGCCAGTTCCAGTCCAGAGGATACTTATCTCTCTGCTGTCGGATA
CAAGGTTTATCGAGGAATACATGGCAGCCCACAGGCAGAGGATCAGGGATAAGCATTTTC
TCTTTGTGGAAG*TTTGAAGCAATTAGGGATACCGTGTGCTGAGGGTGGCGGTGGGTTGT
ATTGTTGGGTTGACATGAGCAGTTTACTCACATCTTACAGCGAG

QA 2 765 2 765
DS 

RD RR2ES89JQ 857 0 0
AAGAGAGACGCTACATGCTAT*CTGAGCTT*GCTCAGGG*AAGAACATCCATGTCATCTC
CGATGAAATATTCGCGGGTTCTGTTTACGGGGAGGACAAAGAGTTTGTTAGCATGGCGGA
GGTAGCTGCTGCCTCTACCTCCTCGGGGGATTTCGATAAGAGTAGGGTTCATATCATCTA
CGGCTTGTCCAACGACCTTTCCCTTCCCGGTTTTAGAACTGGAGTTATCTATTCCTTTCA
TGAAGACGTTGTGAGCGCGGCCAAGAAGCTGATGAGGTTTTCGTCTATGCCAGTTCCAGT
CCAGAGGATACTTATCTCTCTGCTGTCGGATACAAGGTTTATCGAGGAATACATGGCAGC
CCACAGGCAGAGGATCAGGGATAAGCATTTTCTCTTTGTGGAAGGTTTGAAGCAATTAGG
GATACCGTGTGCTGAGGGTGGCGGTGGGTTGTATTGTTGGGTTGACATGAGCAGTTTACT
CACATCTTACAGCGAGAAAGGCGAACTCGAGCTGTTTGAGAAGCTACTGAGTGTTGCTAA
GATTAATGCCACTCCTGGAACAGCTTGTTATTGTATAGAACCGGGTTGGTTCAGGTGCTG
TTTTACGGCTTTAGCTGATGAAGATATTCCAGTGATCATGGAACGGATCAAACTGCTTGC
TGAACCATCCACATCTTGAGGCCAAGCCATATTTTGGGTTAGTAAGCCATTGTAACACAT
TCTTTTCGCAAGTTAGTTCTTTAGAAGTTTGGAAGATGGGAATGAATTAGAAGATGTAAC
TTTATCGTTTGCAGAAGAAAGAGTTTGGTATTCAAACTCACGCTCTGTTTGTACAAAAAC
AAGTTTCTACTTCTATG

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR2GK96JQ 735 0 0
GGGGGATTTCGATAAGAGTAGGGTTCATATCATCTACGGCTTGTCCAAAGACCTTTCCCT
TCCCGGTTTTAGAACTGGAGTTATCTATTCCTTTCATGAAGACGTTGTAAGCGCGGCCAA
GAAGCTGATGAGGTTTTCGTCTATGCCAGTTCCAGTCCAGAGGATACTTATCTCTCTGCT
GTCGGATACAAGGTTTATCGAGGAATACATGGCAGCCCACAGGCAGAGGATCAGGGATAA
GCATTTTCTCTTTGTGGAAGGTTTGAAGCAATTAGGGATACCGTGTGCTGAGGGTGGCGG
TGGGTTGTATTGTTGGGTTGACATGAGCAGTTTACTCACATCTTACAGCGAGAAAGGCGA
ACTCGAGCTGTTTGAGAAGCTACTGAGTGTTGCTAAGATTAATGCCACTCCTGGAACAGC
TTGTTATTGTATAGAACCGGGTTGGTTCAGGTGCTGTTTTACGGCTTTAGCTGATGAAGA
CATTCCAGTGATCATGGAACGGATCAAACTGCTTGCTGAACCATCCACATCTTGAGGCCA
AGCCATATTTTGGGTTAGTAAGCCATTGTAACACATTCTTTTCGCAAGTTAGTTCTTTAG
AAGTTTGGAAGATGGGAATGAATTAGAAGGTGTAACTTTATCGTTTGCAGAAGAAAGAGT
TTGGTATTCAAACTCACGCTCTGTTTGTACAAAAACAAGTTTCTACTTCTATGAAAAGAG
AACAACTTTGCAACG

QA 1 735 1 735
DS 



AS 2 4

CO CL2665Contig1 529 2 1 U
CACCGGTACTGCCAAACAAGGCTGTGCTGGGCCACCCCTTGGTCTTGTCGATATTGGTGT
GAGCGACATTGCCTACATCTTCAGAGTCTCTCTCCCTGGCATGGCCAAAAATCAAGACAA
GATCAAATGTGAGATTCAGAGAGAGGGAAGAGTATGCATACAAGGAGTAGTTCCTGAGAT
TGCCATTCCAAGTGATTCAGGGTGCTTATACAGAATGCAAGTGCAGCAGCTCACACCACC
TGGTCCATTTTCTATCACGTTTAATCTCCCTGGACAAGTGGATCCTCGCTTGTTTTCTCC
AAAGTTTAGACCTGATGGGATCTTCGAAGTTGTTGTCGTCAAGCTCGGTGTACGCATCCC
CACGTCATAGCTCGGTTCTTTTTTCCATTAACTAAGTTATGTTCGATTGTTTTGTGTAGA
AACATGTTCACAGTGTTCCCGATTTCTCGAAGATGCTCTTGAACTGTGAAAGTAGTTAGA
TGTGAAACTGGTACTGTTTTGAGCAATTTAATACTCCCTCCATTTTGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BF72JQ C 1
AF RR2BF72TF U 1
BS 1 529 RR2BF72TF

RD RR2BF72JQ 529 0 0
CACCGGTACTGCCAAACAAGGCTGTGCTGGGCCACCCCTTGGTCTTGTCGATATTGGTGT
GAGCGACATTGCCTACATCTTCAGAGTCTCTCTCCCTGGCATGGCCAAAAATCAAGACAA
GATCAAATGTGAGATTCAGAGAGAGGGAAGAGTATGCATACAAGGAGTAGTTCCTGAGAT
TGCCATTCCAAGTGATTCAGGGTGCTTATACAGAATGCAAGTGCAGCAGCTCACACCACC
TGGTCCATTTTCTATCACGTTTAATCTCCCTGGACAAGTGGATCCTCGCTTGTTTTCTCC
AAAGTTTAGACCTGATGGGATCTTCGAAGTTGTTGTCGTCAAGCTCGGTGTACGCATCCC
CACGTCATAGCTCGGTTCTTTTTTCCATTAACTAAGTTATGTTCGATTGTTTTGTGTAGA
AACATGTTCACAGTGTTCCCGATTTCTCGAAGATGCTCTTGAACTGTGAAAGTAGTTAGA
TGTGAAACTGGTACTGTTTTGAGCAATTTAATACTCCCTCCATTTTGAC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2BF72TF 529 0 0
CACCGGTACTGCCAAACAAGGCTGTGCTGGGCCACCCCTTGGTCTTGTCGATATTGGTGT
GAGCGACATTGCCTACATCTTCAGAGTCTCTCTCCCTGGCATGGCCAAAAATCAAGACAA
GATCAAATGTGAGATTCAGAGAGAGGGAAGAGTATGCATACAAGGAGTAGTTCCTGAGAT
TGCCATTCCAAGTGATTCAGGGTGCTTATACAGAATGCAAGTGCAGCAGCTCACACCACC
TGGTCCATTTTCTATCACGTTTAATCTCCCTGGACAAGTGGATCCTCGCTTGTTTTCTCC
AAAGTTTAGACCTGATGGGATCTTCGAAGTTGTTGTCGTCAAGCTCGGTGTACGCATCCC
CACGTCATAGCTCGGTTCTTTTTTCCATTAACTAAGTTATGTTCGATTGTTTTGTGTAGA
AACATGTTCACAGTGTTCCCGATTTCTCGAAGATGCTCTTGAACTGTGAAAGTAGTTAGA
TGTGAAACTGGTACTGTTTTGAGCAATTTAATACTCCCTCCATTTTGAC

QA 1 529 1 529
DS 



CO CL2665Contig2 748 2 2 U
AGGGAATCCACTGACGATAGTCAAGGCCGAAACAACATCATCGAAGACTCACCGGAGATC
GCTACGATTGGTTTGTGTTCTGTCCCTTGTGGAAAGCACAGACTCAACACTATGAACCCT
GAGAATCATCAGACGACCACCACTCACTCGAAAGTGATCTCACATGTCTTTTTCACCGGT
ACTGCCAAACAAGGCTGTGCTGGGCCACCCCTTGGTCTTGTCGATATTGGTGTGAGCGAC
ATTGCCTACATCTTCAGAGTCTCTCTCCCTGGCATGGCCAAAAATCAAGATAAGATCAAA
TGTGAGATTCAGAGAGAGGGAAGAGTATGCATACATGGAGTAGTACCTGAGATTGCCATT
CCAAGCGATTCAGGGTGCTTATACAGAATGCAAGTGCAGCAGCTCACCCCACCTGGTCCA
TTTTCTATCACGTTTAATCTCCCTGGACAAGTGGATCCTCGCTTGTTTTCTCCAAAGTTT
AGACCTGATGGGATCTTCGAAGTTGTTGTCGTCAAGCTCGGTGTACGCGTCCCAACGTCA
TAGCTCGGTTCTTTTTCCATTAACTAAGTGATGTTCGATTGTGTTGTGTAGAAACATGTT
CACAGTGTTCCCAATTTCTTGAACATGCTCTTGAACTGTGAAAGTAGTTAGATTGAAACT
GGTAATGTTTTGAGCAATTTAATACTCCCTCCATTTTGACATTTTAAATTTGCTTATAAA
TTAAAAAATATTCAATTTTATACATTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP83TF U 1
AF RR2BP83JQ C 1
BS 1 284 RR2BP83TF
BS 285 748 RR2BP83JQ

RD RR2BP83TF 284 0 0
AGGGAATCCACTGACGATAGTCAAGGCCGAAACAACATCATCGAAGACTCACCGGAGATC
GCTACGATTGGTTTGTGTTCTGTCCCTTGTGGAAAGCACAGACTCAACACTATGAACCCT
GAGAATCATCAGACGACCACCACTCACTCGAAAGTGATCTCACATGTCTTTTTCACCGGT
ACTGCCAAACAAGGCTGTGCTGGGCCACCCCTTGGTCTTGTCGATATTGGTGTGAGCGAC
ATTGCCTACATCTTCAGAGTCTCTCTCCCTGGCATGGCCAAAAA

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2BP83JQ 748 0 0
AGGGAATCCACTGACGATAGTCAAGGC*GAAACAACATCATCGAAGACTCACCGGAGATC
GCTACGATTGGTTTGTGTTCTGTCCCTTGTGGAAAGCACAGACTCAACACTATGAACCCT
GAGAATCATCAGACGACCACCACTCACTCGAAAGTGATCTCACATGTCTTTTTCACCGGT
ACTGCCAAACAAGGCTGTGCTGGGCCACCCCTTGGTCTTGTCGATATTGGTGTGAGCGAC
ATTGCCTACATCTTCAGAGTCTCTCTCCCTGGCATGGCCAAAAATCAAGATAAGATCAAA
TGTGAGATTCAGAGAGAGGGAAGAGTATGCATACATGGAGTAGTACCTGAGATTGCCATT
CCAAGCGATTCAGGGTGCTTATACAGAATGCAAGTGCAGCAGCTCACCCCACCTGGTCCA
TTTTCTATCACGTTTAATCTCCCTGGACAAGTGGATCCTCGCTTGTTTTCTCCAAAGTTT
AGACCTGATGGGATCTTCGAAGTTGTTGTCGTCAAGCTCGGTGTACGCGTCCCAACGTCA
TAGCTCGGTTCTTTTTCCATTAACTAAGTGATGTTCGATTGTGTTGTGTAGAAACATGTT
CACAGTGTTCCCAATTTCTTGAACATGCTCTTGAACTGTGAAAGTAGTTAGATTGAAACT
GGTAATGTTTTGAGCAATTTAATACTCCCTCCATTTTGACATTTTAAATTTGCTTATAAA
TTAAAAAATATTCAATTTTATACATTTT

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 3

CO CL2666Contig1 749 3 28 U
CTAAAAGGATTTGGAGTGAGGAGATGGCAGGGAAAATAGCAAACCCGAAGGTCTTCTTTG
ACATCTTGGTAGGAAAGAGCAAAGCGGGTCGTGTTGTGATGGAGCTATTCGCTGACGTGA
CGCCTAAAACCGCTGAAAACTTTCGTGCTCTATGCACTGGTGAGAAGGGTCTCGGGGCAG
CAGGGAAGGCGTTGCACTACAAAGGCTCTGCCTTTCACCGTATCATCCCGGGGTTCATGT
GCCAGGGAGGAGATTTCACCCGTGGGAATGGAACCGGAGGGGAATCGATCTACGGTGCTA
AGTTTCAGGACGAGAACTTCAAGCTGAAGCACACTGGTCCGGGGATTTTGTCCATGGCTA
ATTCGGGTCCCAACACGAATGGTTCACAGTTCTTTATCTGCACTGCGAAGACGCCGTGGC
TTGATGGGAAGCACGTGGTGTTTGGGAAGGTGGTTGATGGGTACAATGTGGTGGAGAAAA
TGGAGAAGGTCGGGTCTGAGAGGGGGAATACCTCTGAGCCAGTTGTGATTGAAGATTGTG
GTGAGCTGAAGAACGAAAGTTCATAAATCTCAACATTAAATATGTTGTGAAGTGTTTATG
TTTTGAGATCGATAACACTAGTTGGGGTTTGGCAATACCTTATGAAGTGATTGAACCTTC
TGATTTTGATTTTATTTTATTTTTCAAAAAAATCCCATGTAAAAGAGTAGGGGGTGGATA
ATAAAATGGAAGGACACTCCTTTGTTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2EX09TF U 1
AF RR2EA40JQ C 160
AF RR2EA40TF U 160
BS 1 208 RR2EX09TF
BS 209 209 RR2EA40TF
BS 210 221 RR2EX09TF
BS 222 222 RR2EA40TF
BS 223 268 RR2EX09TF
BS 269 269 RR2EA40TF
BS 270 295 RR2EX09TF
BS 296 297 RR2EA40TF
BS 298 385 RR2EX09TF
BS 386 386 RR2EA40TF
BS 387 430 RR2EX09TF
BS 431 431 RR2EA40TF
BS 432 449 RR2EX09TF
BS 450 450 RR2EA40TF
BS 451 451 RR2EX09TF
BS 452 452 RR2EA40TF
BS 453 467 RR2EX09TF
BS 468 468 RR2EA40TF
BS 469 476 RR2EX09TF
BS 477 477 RR2EA40TF
BS 478 530 RR2EX09TF
BS 531 531 RR2EA40TF
BS 532 547 RR2EX09TF
BS 548 548 RR2EA40TF
BS 549 596 RR2EX09TF
BS 597 597 RR2EA40TF
BS 598 608 RR2EX09TF
BS 609 749 RR2EA40TF

RD RR2EX09TF 608 0 0
CTAAAAGGATTTGGAGTGAGGAGATGGCAGGGAAAATAGCAAACCCGAAGGTCTTCTTTG
ACATCTTGGTAGGAAAGAGCAAAGCGGGTCGTGTTGTGATGGAGCTATTCGCTGACGTGA
CGCCTAAAACCGCTGAAAACTTTCGTGCTCTATGCACTGGTGAGAAGGGTCTCGGGGCAG
CAGGGAAGGCGTTGCACTACAAAGGCTCGGCCTTTCACCGTGTCATCCCGGGGTTCATGT
GCCAGGGAGGAGATTTCACCCGTGGGAACGGAACCGGAGGGGAATCGATCTACGGGTCTA
AGTTTCAGGACGAGAACTTCAAGCTGAAGCACACTGGTCCGGGGATTTTGTCCATGGCTA
ATTCGGGTCCCAACACGAATGGTTCTCAGTTCTTTATCTGCACTGCGAAGACGCCGTGGC
TTGATGGGAAACACGTGGTGTTTGGGAAGTTTGTTGATGGGTACAATATGGTGGAGGAAA
TGGAGAAGGTCGGGTCTGAGAGGGGGAATACCTCTGAGCCAGTTGTGATTAAAGATTGTG
GTGAGCTCAAGAACGAAAGTTCATAAATCTCAACATTAAATATGTTGTGAAGTGTT*ATG
TTTTGAGA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2EA40JQ 589 0 0
GA
GAGAAGGGTCTCGGGGCAGCAGGGAAGGCGTTGCACTACAAAGGCTCTGCCTTTCACCGT
ATCATCCCGGGGTTCATGTGCCAGGGAGGAGATTTCACCCGTGGGAATGGAACCGGAGGG
GAATCGATTTACGGTGCTAAGTTTCAGGACGAGAACTTCAAGCTGAAGCACACTGGTCCG
GGGATTTTGTCCATGGCTAATTCGGGTCCCAACACGAATGGTTCACAGTTCTTTATTTGC
ACTGCGAAGACGCCGTGGCTTGATGGGAAGCACGTGGTGTTTGGGAAGGTGGTTGATGGG
TACAATGTGGTGGAGAAAATGGAGAAGGTCGGGTCTGAGAGGGGGAATACCTTTGAGCCA
GTTGTGATTGAAGATTGTGGTGAGCTGAAGAACGAAAGTTCATAAATCTCAACATTAAAT
ATGTTGTGAAGTGTTTATGTTTTGAGATCGATAACACTAGTTGGGGTTTGGCAATACCTT
ATGAAGTGATTGAACCTTCTGATTTTGATTTTATTTTATTTTTCAAAAAAATCCCATGTA
AAAGAGTAGGGGGTGGATAATAAAATGGAAGGACACTCCTTTGTTTG

QA 3 589 3 589
DS 

RD RR2EA40TF 590 0 0
GA
GAGAAGGGTCTCGGGGCAGCAGGGAAGGCGTTGCACTACAAAGGCTCTGCCTTTCACCGT
ATCATCCCGGGGTTCATGTGCCAGGGAGGAGATTTCACCCGTGGGAATGGAACCGGAGGG
GAATCGATCTACGGTGCTAAGTTTCAGGACGAGAACTTCAAGCTGAAGCACACTGGTCCG
GGGATTTTGTCCATGGCTAATTCGGGTCCCAACACGAATGGTTCACAGTTCTTTATCTGC
ACTGCGAAGACGCCGTGGCTTGATGGGAAGCACGTGGTGTTTGGGAAGGTGGTTGATGGG
TACAATGTGGTGGAGAAAATGGAGAAGGTCGGGTCTGAGAGGGGGAATACCTCTGAGCCA
GTTGTGATTGAAGATTGTGGTGAGCTGAAGAACGAAAGTTCATAAATCTCAACATTAAAT
ATGTTGTGAAGTGTTTATGTTTTGAGATCGATAACACTAGTTGGGGTTTGGCAATACCTT
ATGAAGTGATTGAACCTTCTGATTTTGATTTTATTTTATTTTTCAAAAAAATCCCATGTA
AAAGAGTAGGGGGTGGATAATAAAATGGAAGGACACTCCTTTGTTTGA

QA 3 590 3 590
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL2668Contig1 882 3 24 U
GGACAAAAGACTCAAGACAACAATGGCAGCACTCATCGTTGACGCCGAGTACCTTAAGGA
AATTGACAAGGCTCGCCGTGAACTCCGTGCTCTCATAGCCAAGAAGAACTGCGCTCCGAT
CATGCTCCGTTTGGCGTGGCATGATGCTGGAACCTATGATGCTGAATCCAAGACCGGTGG
ACCTAATGGCTCTATTAGGAACGAAGCAGAGTACAGTCATGGTGCCAACAGCGGTTTGAA
GATAGCGCTTGATCTATGTGAGGACGTGAAAACTAAGCATCCCAAGATCAGTTATGCGGA
CCTGTACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCGGTTGAAGTGACCGGTGGACCTGACATCAGTTT
TGTTCCTGGCAGAAAAGATTCAAATGCCTGCACCAACGAAGGAAGACTTCCTGATGCTAA
TCAAGGTTTCAAACATCTGAAAGATGTCTTCTACAGGATGGGTTTGTCTGACAAAGATAT
TGTCGCACTGTCAGGGGCACATACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGATCAGGTTTCGA
TGGACCATGGACTGAAGATCCTCTAAAGTTTGATAACTCATACTTTGTGGAATTGCTGAA
AGAAGAAGAATCAGAGGGCTTGCTGAAACTTTCAACGGACAAATCTTTGTTGGAAGTCCC
GGAGTTCCGTCAGTATGTTGAGCTTTACGCAAAGAACGAAGATGCATTCTTCAGAGACTA
TGCAGAGTCACACAAGAAACTTTCAGAACTTGGGTTCACACCAACGTCTACAGTCACTAT
GGCGATACAGACTGCGCCGCACTGGCACATACTGCAGTTGGGAGTAGCGTGGCTTCTGCT
GTTGTGGCCTTTAGCTACTTCTATGAAATTCGCAGAAAGATG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL57JQ C 187
AF RR2GO19TF U 1
AF RR2AL57TF U 3
BS 1 27 RR2GO19TF
BS 28 28 RR2AL57TF
BS 29 76 RR2GO19TF
BS 77 77 RR2AL57TF
BS 78 118 RR2GO19TF
BS 119 119 RR2AL57TF
BS 120 206 RR2GO19TF
BS 207 207 RR2AL57TF
BS 208 246 RR2GO19TF
BS 247 247 RR2AL57TF
BS 248 255 RR2GO19TF
BS 256 256 RR2AL57TF
BS 257 394 RR2GO19TF
BS 395 395 RR2AL57TF
BS 396 450 RR2GO19TF
BS 451 451 RR2AL57TF
BS 452 454 RR2GO19TF
BS 455 455 RR2AL57TF
BS 456 471 RR2GO19TF
BS 472 472 RR2AL57TF
BS 473 634 RR2GO19TF
BS 635 635 RR2AL57TF
BS 636 741 RR2GO19TF
BS 742 882 RR2AL57TF

RD RR2AL57JQ 188 0 0
TGGCTCTATTAGGAACGAAGCAGAGTACAGTCATGGTGCCAACAGCGGTTTGAAGATAGC
GCTTGATCTATGTGAGGACGTGAAAACTAAGCATCCCAAAATCAGTTATGCGGACCTGTA
CCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCGGTTGAAGTGACCGGTGGACCTGACATCAGTTTTGTTCC
TGGCAGAA

QA 1 188 1 188
DS 

RD RR2GO19TF 741 0 0
GGACAAAAGACTCAAGACAACAATGGCGGCACTCATCGTTGACGCCGAGTACCTTAAGGA
AATTGACAAGGCTCGCTGTGAACTCCGTGCTCTCATAGCCAAGAAGAACTGCGCTCCGGT
CATGCTCCGTTTGGCGTGGCATGATGCTGGAACCTATGATGCTGAATCCAAGACCGGTGG
ACCTAATGGCTCTATTAGGAACGAAGTAGAGTACAGTCATGGTGCCAACAGCGGTTTGAA
GATAGCACTTGATCTCTGTGAGGACGTGAAAACTAAGCATCCCAAGATCAGTTATGCGGA
CCTGTACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCGGTTGAAGTGACCGGTGGACCTGACATCAGTTT
TGTTCCTGGCAGAAAAGATTCAAATGCCTGCACCGACGAAGGAAGACTTCCTGATGCTAA
TCAAGGTTTCAAACATCTGAAAGATGTCTTTTACCGGATGGGTTTGTCTGATAAAGATAT
TGTCGCACTGTCAGGGGCACATACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGATCAGGTTTCGA
TGGACCATGGACTGAAGATCCTCTAAAGTTTGATAACTCATACTTTGTGGAATTGCTGAA
AGAAGAAGAATCAGAGGGCTTGCTGAAACTTTCA*CGGACAAATCTTTGTTGGAAGTCCC
GGAGTTCCGTCAGTATGTTGAGCTTTACGCAAAGAACGAAGATGCATTCTTCAGAGACTA
TGCAGAGTCACACAAGAAACT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2AL57TF 880 0 0
GG
AAAAGACTCAAGACAACAATGGCAGCACTCATCGTTGACGCCGAGTACCTTAAGGAAATT
GACAAGGCTCGCCGTGAACTCCGTGCTCTCATAGCCAAGAAGAACTGCGCTCCGATCATG
CTCCGTTTGGCGTGGCATGATGCTGGAACCTATGATGCTGAATCCAAGACCGGTGGACCT
AATGGCTCTATTAGGAACGAAGCAGAGTACAGTCATGGTGCCAACAGCGGTTTGAAGATA
GCGCTTGATCTATGTGAGGACGTGAAAACTAAGCATCCCAAGATCAGTTATGCGGACCTG
TACCAGCTTGCTGGTGTGGTAGCGGTTGAAGTGACCGGTGGACCTGACATCAGTTTTGTT
CCTGGCAGAAAAGATTCAGATGCTTGCACCAACGAAGGAAGACTTCCTGATGCTAATCAA
GGTTTCAGACATCTGAAAGATGTCTTCTACAGGATGGGTTTGTCTGACAAAGATATTGTG
GCACTGTCAGGGGCACATACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGATCAGGTTTCGATGGA
CCATGGACTGAAGATCCTCTAAAGTTTGATAACTCATACTTTGTGGAATTGCTGAAAGAA
GAAGAATCAGAGGGCTTGCTGAGACTTTCAACGGACAAATCTTTGTTGGAAGTCCCGGAG
TTCCGTCAGTATGTTGAGCTTTACGCAAAGAACGAAGATGCATTCTTCAGAGACTATGCA
GAGTCACACAAGAAACTTTCAGAACTTGGGTTCACACCAACGTCTACAGTCACTATGGCG
ATACAGACTGCGCCGCACTGGCACATACTGCAGTTGGGAGTAGCGTGGCTTCTGCTGTTG
TGGCCTTTAGCTACTTCTATGAAATTCGCAGAAAGATG

QA 3 880 3 880
DS 



AS 1 2

CO CL2669Contig1 921 2 22 U
AATTTGACCAATTCCAAAGCTCCACTGTCTCTTCTTTCAAAATACAAAGGTTAAAATAGT
AGAAATGGGGTGAGAGATGTTCGAACTCTCGACCTCAGTATCACTCACTAGCCCATTGTG
TGATGTGAAACCAAAAAGATCTAAAACATGAGAGAACACAAAGAACACTTCTCACAATGT
AGTACCACCTCCATCCGACATAAGAGATGCAGCAGCCGCAGCAGCGGTCGGCACAACTCC
AGTAGAGATGAATGGTTTCGACAAGTGCACAAGCGGAGCGAGAAATTCACAGAAAGATGA
AACAGCAGCTGCAACTTCACCGTAGTTCTCAGGTGTTGCTGGAGCTGTAACAACAACAAT
CTGCATCCCAGGCGTTACAGGGACAGCCTCATCAATGGCATGAATCTTAGGCATCTTGTT
CACCGAAGACACAGAGACGCTTATGTGCGCGGACCGTTGGAAGTGAAAAGCGAAGCCAAC
TTTGAGAAGCTCGTGGTCTAGTTTGTAACCGAGGGAGTAGAACATACGCAGAGCGTTCTT
GCTGACTTTACTCTCAATCATGGTTCTTACCATAACAGAGATCTGATCAGCTCCTGCACC
TCTCATCGCACCACCAACATGCTTAACCGTCCATGTGGGCTCTGGTTGTTGGTCAAGGTC
ACATAAAAGCCTAACTTCTGAAGATACAGTACCAAGATTAGGGACGCTTTTCAAGGTAAG
CTCATGAACTCTCAAGCGTTCGCGTTGAACACCACAAAGACCTTGAAGGAGGATCTCAAG
AGCTTCAACATGCTGTCTCTCAATGATTCCTTGAACAACACACTCCATTGAATTGCTTTT
TTCTTCAGTTCATACAAACCCTTACGAATCTGATAGCGAAATCAGTCCCCAGACTCTGAA
CCTCGTTCGCCCTCACCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B659JQ U 1
AF RR2AZ17TFB C 199
BS 1 231 RR2B659JQ
BS 232 232 RR2AZ17TFB
BS 233 312 RR2B659JQ
BS 313 313 RR2AZ17TFB
BS 314 435 RR2B659JQ
BS 436 436 RR2AZ17TFB
BS 437 465 RR2B659JQ
BS 466 466 RR2AZ17TFB
BS 467 555 RR2B659JQ
BS 556 556 RR2AZ17TFB
BS 557 561 RR2B659JQ
BS 562 562 RR2AZ17TFB
BS 563 632 RR2B659JQ
BS 633 633 RR2AZ17TFB
BS 634 753 RR2B659JQ
BS 754 754 RR2AZ17TFB
BS 755 796 RR2B659JQ
BS 797 797 RR2AZ17TFB
BS 798 819 RR2B659JQ
BS 820 820 RR2AZ17TFB
BS 821 836 RR2B659JQ
BS 837 921 RR2AZ17TFB

RD RR2B659JQ 836 0 0
AATTTGACCAATTCCAAAGCTCCACTGTCTCTTCTTTCAAAATACAAAGGTTAAAATAGT
AGAAATGGGGTGAGAGATGTTCGAACTCTCGACCTCAGTATCACTCACTAGCCCATTGTG
TGATGTGAAACCAAAAAGATCTAAAACATGAGAGAACACAAAGAACACTTCTCACAATGT
AGTACCACCTCCATCCGACATAAGAGATGCAGCAGCCGCAGCAGCGGTCGGGACAACTCC
AGTAGAGATGAATGGTTTCGACAAGTGCACAAGCGGAGCGAGAAATTCACAGAAAGATGA
AACAGCAGCTGCGACTTCACCGTAGTTCTCAGGTGTTGCTGGAGCTGTAACAACAACAAT
CTGCATCCCAGGCGTTACAGGGACAGCCTCATCAATGGCATGAATCTTAGGCATCTTGTT
CACCGAAGACACAGATACGCTTATGTGCGCGGACCGTTGGAAGTGGAAAGCGAAGCCAAC
TTTGAGAAGCTCGTGGTCTAGTTTGTAACCGAGGGAGTAGAACATACGCAGAGCGTTCTT
GCTGACTTTACTCTCGATCATTGTTCTTACCATAACAGAGATCTGATCAGCTCCTGCACC
TCTCATCGCACCACCAACATGCTTAACCGTCCGTGTGGGCTCTGGTTGTTGGTCAAGGTC
ACATAAAAGCCTAACTTCTGAAGATACAGTACCAAGATTAGGGACGCTTTTCAAGGTAAG
CTCATGAACTCTCAAGCGTTCGCGTTGAACACCGCAAAGACCTTGAAGGAGGATCTCAAG
AGCTTCAACATGCTGTGTCTCAATGATTCCTTGAACAACGCACTCCATTGAATTGC

QA 1 836 1 836
DS 

RD RR2AZ17TFB 723 0 0
CATAAGAGATGCAGCAGCCGCAGCAGCGGTCGGCACAACTCCCGTAGAGATGAATGGTTT
CGACAAGTGCACAAGCGGAGCGAGAAATTCACAGAAAGATGAAACAGCAGCTGCAACTTC
ACCGTAGTTCTCAGGTGTTGCTGGAGCTGTAACAACAACAATCTGCATCCCAGGCGTTAC
AGGGACAGCCTCATCTATGGCATGGATCTTAGGCATCTTGTTCACCGAAGACACAGAGAC
GCTTATGTGCGCGGCCCGTTGGAAGTGAAAAGCGAAGCCAACTTTGAGAAGCTCGTGGTC
TAGTTTGTAACCGAGGGAGTAGAACATACGGAGAGCGTTCTTGCTGACTTTACTTTCAAT
CATGGTTCTTACCATAACAGAGATCTGATCAGCTCCTGCACCTCTCATCGCACCACCAAC
ATGCTTAACCGTCCATGTGGGCTCTGGTTGTTGGTCAAGGTCACATAAAAGCCTAACTTC
TGAAGATACAGTACCAAGATTAGGGACGCTTTTCAAGGTAAGCTCATGAACTCTCAAGCG
TTCGCGTTGAACACCACAAAGACCTTGAAGGAGGATCTCAAGAGCTTCAACATGCTGTCT
CTCAATGATTCCTTGAACAACACACTCCATTGAATTGCTTTTTTCTTCAGTTCATACAAA
CCCTTACGAATCTGATAGCGAAATCAGTCCCCAGACTCTGAACCTCGTTCGCCCTCACCC
CCC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 2 4

CO CL2670Contig1 536 2 5 U
GGATTTCTCAAACGATCGATCAATATGAATCTTCTCATTTTCCCCCTTTTCTCCGTTTCA
TAGCTAGCTAGGGTTTCGAGATGGGCCAGATCCAGTACTCTGACAAATACTTCGACGATA
CTTTCGAGTACAGGCACGTCGTGCTTCCTCCTGAAGTCGCTAATCTTCTTCCCAAGAATC
GTCTTCTCTCCGAAAATGAGTGGCGTGCGATTGGTGTCCAGCAGAGCCGTGGATGGGTTC
ATTACTCGATCCATCGTCCAGAGCCACACATCATGCTGTTCAGGAGGACTCTCAATTACC
AGCAGCAGCAGCAGGAGAACCAAGCTCAAAACCTGCTTGCTAAGTGAATCTGAATTGTGC
TGCGCTACAAACATTGGTTTGTTGTTAGCTATTATGTTTCTTGTAAACATGGGTTTGTGA
ACCACAACCTCTAATAACTTTGTGTTCATGTTATCATCCTTGGTTGGAGAAAAAAACATG
CGAGTGAATGAGTGATAATCTGACTACTTTGATGTTATGCATTGTCTTGGTTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2B556JQ C 1
AF RR2B556TF U 1
BS 1 9 RR2B556JQ
BS 10 24 RR2B556TF
BS 25 25 RR2B556JQ
BS 26 534 RR2B556TF
BS 535 536 RR2B556JQ

RD RR2B556JQ 536 0 0
GGATTTCTCAAACGATCGATCAATATGAATCTTCTCATTTTCCCCCTTTTCTCCGTTTCA
TAGCTAGCTAGGGTTTCGAGATGGGCCAGATCCAGTACTCTGACAAATACTTCGACGATA
CTTTCGAGTACAGGCACGTCGTGCTTCCTCCTGAAGTCGCTAATCTTCTTCCCAAGAATC
GTCTTCTTTCCGAAAATGAGTGGCGTGCGATTGGTGTCCAGCAGAGCCGTGGATGGGTTC
ATTACTCGATCCATCGTCCAGAGCCACACATCATGCTGTTCAGGAGGACTCTCAATTACC
AGCAGCAGCAGCAGGAGAACCAAGCTCAAAACCTGCTTGCTAAGTGAATCTGAATTGTGC
TGCGCTACAAACATTGGTTTGTTGTTAGCTATTATGTTTCTTGTAAACATGGGTTTGTGA
ACCACAACCTCTAATAACTTTGTGTTCATGTTATCATCCTTGGTTGGAGAAAAAAACATG
CGAGTGAATGAGTGATAATCTGACTACTTTGATGTTATGCATTGTCTTGGTTCACT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2B556TF 536 0 0
GGATTTCTC
AAACGATCGATCAATCTGAATCTTCTCATTTTCCCCCTTTTCTCCGTTTCATAGCTAGCT
AGGGTTTCGAGATGGGCCAGATCCAGTACTCTGACAAATACTTCGACGATACTTTCGAGT
ACAGGCACGTCGTGCTTCCTCCTGAAGTCGCTAATCTTCTTCCCAAGAATCGTCTTCTCT
CCGAAAATGAGTGGCGTGCGATTGGTGTCCAGCAGAGCCGTGGATGGGTTCATTACTCGA
TCCATCGTCCAGAGCCACACATCATGCTGTTCAGGAGGACTCTCAATTACCAGCAGCAGC
AGCAGGAGAACCAAGCTCAAAACCTGCTTGCTAAGTGAATCTGAATTGTGCTGCGCTACA
AACATTGGTTTGTTGTTAGCTATTATGTTTCTTGTAAACATGGGTTTGTGAACCACAACC
TCTAATAACTTTGTGTTCATGTTATCATCCTTGGTTGGAGAAAAAAACATGCGAGTGAAT
GAGTGATAATCTGACTACTTTGATGTTATGCATTGTCTTGGTTCA
CT

QA 10 534 10 534
DS 



CO CL2670Contig2 573 2 2 U
GGCACTCCAAAAACGATCGATCTATCTGAATCTTCTCATTTTCCCCCTTTTCTCCGTTTC
ATAGCTAGCTAGGGTTTTCGAGATGGGTCAGATCCAGTACTCTGACAAATACTTCGACGA
TACTTTCGAGTACAGGCACGTCGTACTTCCTCCTGAAGTCGCCAAGCTTCTTCCCAAGAA
TCGTCTTCTCTCCGAAAATGAGTGGCGTGCGATTGGGGTGCAGCAGAGCCGTGGATGGGT
CCATTACGCCATTCATCGTCCAGAGCCACACATCATGTTGTTCAGGAGGACTCTCAATTA
CCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGAACCAAGCTCAAAACCTGCTCGCTAAGTGAATCTGAGT
TGTGCTGCGCTACAAACATTGGTTCTTGTTAGCTATTATGTTTCTTGTAAACATGGGTTT
GTGAACCACAACCTCTAATAACTTTGTGTTCATGTTATCTATCCTTGGTTGGAGAAAAAC
ATGCGAGTGAATGAGTGATAATCTGACTACTTTGATGTTATGCATTGTCTTTGTTCATCA
TGGATTATATCTTCTTCTTTCTGCCTCTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX09TF U 1
AF RR2CB17TF U 2
BS 1 520 RR2GX09TF
BS 521 573 RR2CB17TF

RD RR2GX09TF 525 0 0
GGCACTCCAAAAACGATCGATCTATCTGAATCTTCTCATTTTCCCCCTTTTCTCCGTTTC
ATAGCTAGCTAGGGTTTTCGAGATGGGTCAGATCCAGTACTCTGACAAATACTTCGACGA
TACTTTCGAGTACAGGCACGTCGTACTTCCTCCTGAAGTCGCCAAGCTTCTTCCCAAGAA
TCGTCTTCTCTCCGAAAATGAGTGGCGTGCGATTGGGGTGCAGCAGAGCCGTGGATGGGT
CCATTACGCCATTCATCGTCCAGAGCCACACATCATGTTGTTCAGGAGGACTCTCAATTA
CCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGAACCAAGCTCAAAACCTGCTCGCTAAGTGAATCTGAGT
TGTGCTGCGCTACAAACATTGGTTCTTGTTAGCTATTATGTTTCTTGTAAACATGGGTTT
GTGAACCACAACCTCTAATAACTTTGTGTTCATGTTATCTATCCTTGGTTGGAGAAAAAC
ATGCGAGTGAATGAGTGATAATCTGACTACTTTGATGTTA
AAAAA

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2CB17TF 572 0 0
GGACTCCAA
AAACGATCGATCTATCTGAATCTTCTCATTTTCCCCCTTTTCTCCGTTTCATAGCTAGCT
AGGGTTTTCGAGATGGGTCAGATCCAGTACTCTGACAAATACTTCGACGATACTTTCGAG
TACAGGCACGTCGTACTTCCTCCTGAAGTCGCCAAGCTTCTTCCCAAGAATCGTCTTCTC
TCCGAAAATGAGTGGCGTGCGATTGGGGTGCAGCAGAGCCGTGGATGGGTCCATTACGCC
ATTCATCGTCCAGAGCCACACATCATGTTGTTCAGGAGGACTCTCAATTACCAGCAGCAG
CAGCAGCAGGAGAACCAAGCTCAAAACCTGCTCGCTAAGTGAATCTGAGTTGTGCTGCGC
TACAAACATTGGTTCTTGTTAGCTATTATGTTTCTTGTAAACATGGGTTTGTGAACCACA
ACCTCTAATAACTTTGTGTTCATGTTATCTATCCTTGGTTGGAGAAAAACATGCGAGTGA
ATGAGTGATAATCTGACTACTTTGATGTTATGCATTGTCTTTGTTCATCATGGATTATAT
CTTCTTCTTTCTGCCTCTTTGTT

QA 10 572 10 572
DS 



AS 1 4

CO CL2671Contig1 863 4 7 U
GGAGTTCCGTCTTAAGTCAGAGATTTTGCTCCCTTTCTCCATTCATCTCTTCACCAGAAA
CAAAAAAAAATGGCTTTGCAAATACAGAACTCAGCGACGATCTTCAAAACCCCCACGCCA
TCTACTGCCGCCGATGCGTTCCCCGGAAGATTCTTTCCAGGAACCGTCGCGGTTCGCCGG
GAAATGCTAACAGTGTGGCGAGGAGTCAGATGCAGCAACGGTGGAGTTGGTGGAGACGCC
GGGAAGAAAAAGGCTGTTCCTAACTCGAACTATGTAGTGCCTTTGGACAAGTTCTCGTCC
TCTTCTTCCATCACTCGTCCTCTGATTGAGATACTTCGAGATCTCAACAAGAAGATCCCT
GATAACATCGTCAAGAGCCATGATCCTGGATCCAGTGCAGCTTCCTCTGGTTTCATCCCT
TGGTTTCATGCAAATCGGATGCTCAGCTTCTACGCACCTGGTTGGTGTGGGGAGGTTCGT
GACGTCATTTTCTCAGAGAATGGTAATGTCACTGTTGTTTATCGTCTTACCATTCGTGGC
TCTGATGGTGAGGCACACCGAGAATCGACTGGGACAGTAACGATCACTGATGATCACATC
GAGGATCCGGTTGCTGCAGCTGAGGAAATTGCATTTTGCAGAGCATGTGCTCGTTTTGGT
CTCGGCTTGTATCTCTATCACGAAGAGTAGGCTAAGAGTGCTTACCTTTTTTGGTTGAAC
AAGTCTCTATCAACTTGTTGAAAGACCCTTGTGCGTTCTAGAGTGCTAAATATATGTAAT
GATGTCTACAAACAAAACTATAATAATATATATAAACAAATGATAATTCCATCAACTTTT
ATGTATACATTTTTACCTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET08TF U 39
AF RR2F146TF U 1
AF RR2F146JQ C 169
AF RR2ET08JQ C 177
BS 1 133 RR2F146TF
BS 134 134 RR2ET08TF
BS 135 207 RR2F146TF
BS 208 208 RR2ET08TF
BS 209 796 RR2F146TF
BS 797 831 RR2F146JQ
BS 832 863 RR2ET08JQ

RD RR2ET08TF 656 0 0
GG
ATTCATCTCTTCACCAGAAACAAAAAAAA*TGGCTTTGCAAATACAGAACTCAGCGACGA
TCTTCAAAACCCCCACGCCATCTACTGCCGCCGATGCGTTCCCCGGAAGATTCTTTCCAG
GAACCGTCGCGGTTCGCCGAGAAATGCTAACAGTGTGGCGAGGAGTCAGATGCAGCAACG
GTGGAGTTGGTGGAGACGCCGGGAAGAAAAAGGCTGTTCCTAACTCGAACTATGT**TGC
CTTTGGACAAGTTCTCGTCCTCTTCTTCCATCACTCGTCCTCTGATTGAGATACTTCGAG
ATCTCAACAAGAAGATCCCTGATAACATCGTCAAGAGCCATGATCCTGGATCCAGTGCAG
CTTCCTCTGGTTTCATCCCTTGGTTTCATGCAAATCGGATGCTCAGCTTCTACGCACCTG
GTTGGTGTGGGGAGGTTCGTGACGTCATTTTCTCAGAGAATGGTAATGTCACTGTTGTTT
ATCGTCTTACCATTCGTGGCTCTGATGGTGAGGCACACCGAGAATCGACTGGGACAGTAA
CGATCACTGATGATCACATCGAGGATCCGGTTGCTGCAGCTGAGGAAATTGCATTTTGCA
GAGCATGTGCTCGTTTTGGTCTCGGCTTGTATCTCTATCACGAAGAGTAG
CTAA

QA 3 652 3 652
DS 

RD RR2F146TF 800 0 0
GGAGTTCCGTCTTAAGTCAGAGATTTTGCTCCCTTTCTCCATTCATCTCTTCACCAGAAA
CAAAAAAAAATGGCTTTGCAAATACAGAACTCAGCGACGATCTTCAAAACCCCCACGCCA
TCTACTGCCGCCGTTGCGTTCCCCGGAAGATTCTTTCCAGGAACCGTCGCGGTTCGCCGG
GAAATGCTAACAGTGTGGCGAGGAGTCGGATGCAGCAACGGTGGAGTTGGTGGAGACGCC
GGGAAGAAAAAGGCTGTTCCTAACTCGAACTATGTAGTGCCTTTGGACAAGTTCTCGTCC
TCTTCTTCCATCACTCGTCCTCTGATTGAGATACTTCGAGATCTCAACAAGAAGATCCCT
GATAACATCGTCAAGAGCCATGATCCTGGATCCAGTGCAGCTTCCTCTGGTTTCATCCCT
TGGTTTCATGCAAATCGGATGCTCAGCTTCTACGCACCTGGTTGGTGTGGGGAGGTTCGT
GACGTCATTTTCTCAGAGAATGGTAATGTCACTGTTGTTTATCGTCTTACCATTCGTGGC
TCTGATGGTGAGGCACACCGAGAATCGACTGGGACAGTAACGATCACTGATGATCACATC
GAGGATCCGGTTGCTGCAGCTGAGGAAATTGCATTTTGCAGAGCATGTGCTCGTTTTGGT
CTCGGCTTGTATCTCTATCACGAAGAGTAGGCTAAGAGTGCTTACCTTTTTTGGTTGAAC
AAGTCTCTATCAACTTGTTGAAAGACCCTTGTGCGTTCTAGAGTGCTAAATATATGTAAT
GATGTCTACAAACAAA
CTAT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2F146JQ 665 0 0
GCGGTTCGCCGGGAAATGCTAACAGTGTGGCGAGGAGTCGGATGCAGCAACGGTGGAGTT
GGTGGAGACGCCGGGAAGAAAAAGGCTGTTCCTAACTCGAACTATGTAGTGCCTTTGGAC
AAGTTCTCGTCCTCTTCTTCCATCACTCGTCCTCTGATTGAGATACTTCGAGATCTCAAC
AAGAAGATCCCTGATAACATCGTCAAGAGCCATGATCCTGGATCCAGTGCAGCTTCCTCT
GGTTTCATCCCTTGGTTTCATGCAAATCGGATGCTCAGCTTCTACGCACCTGGTTGGTGT
GGGGAGGTTCGTGACGTCATTTTCTCAGAGAATGGTAATGTCACTGTTGTTTATCGTCTT
ACCATTCGTGGCTCTGATGGTGAGGCACACCGAGAATCGACTGGGACAGTAACGATCACT
GATGATCACATCGAGGATCCGGTTGCTGCAGCTGAGGAAATTGCATTTTGCAGAGCATGT
GCTCGTTTTGGTCTCGGCTTGTATCTCTATCACGAAGAGTAGGCTAAGAGTGCTTACCTT
TTTTGGTTGAACAAGTCTCTATCAACTTGTTGAAAGACCCTTGTGCGTTCTAGAGTGCTA
AATATATGTAATGATGTCTACAAACAAAACTATAATAATATATATAAACAAATGATAATT
CCA
CC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2ET08JQ 687 0 0
CCGA
GAAATGCTAACAGTGTGGCGAGGAGTCAGATGCAGCAACGGTGGAGTTGGTGGAGACGCC
GGGAAGAAAAAGGCTGTTCCTAACTCGAACTATGT**TGCCTTTGGACAAGTTCTCGTCC
TCTTCTTCCATCACTCGTCCTCTGATTGAGATACTTCGAGATCTCAACAAGAAGATCCCT
GATAACATCGTCAAGAGCCATGATCCTGGATCCAGTGCAGCTTCCTCTGGTTTCATCCCT
TGGTTTCATGCAAATCGGATGCTCAGCTTCTACGCACCTGGTTGGTGTGGGGAGGTTCGT
GACGTCATTTTCTCAGAGAATGGTAATGTCACTGTTGTTTATCGTCTTACCATTCGTGGC
TCTGATGGTGAGGCACACCGAGAATCGACTGGGACAGTAACGATCACTGATGATCACATC
GAGGATCCGGTTGCTGCAGCTGAGGAAATTGCATTTTGCAGAGCATGTGCTCGTTTTGGT
CTCGGCTTGTATCTCTATCACGAAGAGTAGGCTAAGAGTGCTTACCTTTTTTGGTTGAAC
AAGTCTCTATCAACTTGTTGAAAGACCCTTGTGCGTTCTAGAGTGCTAAATATATGTAAT
GATGTCTACAAACAAAACTATAATAATATATATAAACAAATGATAATTCCATCAACTTTT
ATGTATACATTTTTACCTGTGTT

QA 5 687 5 687
DS 



AS 1 4

CO CL2672Contig1 1493 4 15 U
AAAAAAATATCTGTTTCTATGATTAAACCGAACAACCAACGTGATTCGACAATTAGTTCA
TGACTATCTAAGGCCACCGATATTTTTTTGGACAAACTAATAACGTTACAAAAAAGCGAG
AGAACGAACAAGGTCACAAGGCAAAAAGATTAATACAAGAGTTCTTCTTCATCAGTCCCA
ATATGATCTCTCTAACAAAACCAAACCAAAGAGATAAAACATGAATTTTATTGAAAGCCA
TCAGGATATGTCCGTCTCTTTCTTCACTTCTTCTCATCCTCACCTTTGCCACCACCCTCT
TCCTCGTTCCGATTTGATTCGTCTGGCAAAAACCCTAGCAGCGCTTGAACCGCTGGATCA
TTTGGATCCACCCCTGGAAGCGATGAAAGAACAAATGATATGAAAGCTTGATTTCCTAGG
AGGTTTCCAGCACCCGTAGCCTCACTTGACTCCTCCCCACTCATTGACATTTGCAAAGCT
AAAGCCAAGTCCTGGTCCTCATCCGCGGCTTCTGACATGTTTACATCACCTACGGACATA
GCAATTGCCTGATTTAGCAATGCGTTGTCCTCATCCATTGGTTAAGCGTTCTTATCAGTT
GTCCTAGCAACCGTCTCCTGGGAGGCAGAAGCTGAAGCCCCATCTTGGTCTTTCTGACCA
GCGTCATCAGCTGCCTTCTTAGCAGCAGCCTCTTGCCTTGCTCTCTCCTCCTCCATGGAG
ACCCGAAGGGCGAGAGCAAGCTCTGGATCGATATTTGGATCAACACCAAAATCAAAGTCA
CCACCCCC*AGCAGCAGCAGCAGCTGCCGCAGAAACATACCCACTTGCACCCTCATCACC
AGTGAATACAGGTGTGCTGAGGAGGACATCAGAGAGAGCATTGGCACCGGAAGGAACATG
GACAATGTGGCTACCATCATTGTTATTGACGGCAGAAAGGAGGGCCTCAAGTTTGAGAGG
TTTGTCCACATCGTCATCATCACCAAAATTGACAATGTCAAGAGAGACACAGTTCTTTTT
AAGCCTTTTGCCAACAACCTCCAAGGCCTTCTTTTCATACTTGATTGGGCTTCCAGCGAA
AACAATGATACGTTGGCGTTGATTCTTGTTTTGCCGATGCTTGAGAGAAAGCTGAGCAAT
CTGGATGGCTGCCGTTAAGTTAGTCTCTCCTCCAACATCGAGTCCGTGCATACAGGCCAA
AATCTTGCCAAGATCAGAGGTAGGCGTCGTCAAAACTCTAACTCCTTTGCCTGCCATTGT
CAAGATCCCCACCGTGTTCTCTGGATTCGACTGGGTTTTGGCACCACATAGAAGATTAAC
AGCTTCGGTTTGAGCCTGTAACCTAGAGGGAGAGTAATCTCCGTTTCGCATCCACTCCGA
GTTGTCGATGCATATCATTGTCGCCTCGAGAACCATTGTTAGAGAGATTGTTTCGTAGAG
AGAAAGTCAGGCAGGCAGGCACACTTGTGAGAGAGAGAGAGATTTAGACCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY03JQ U 1
AF RR2AH50JQ U 62
AF RR2AH50TF C 719
AF RR2GY03TF C 771
BS 1 289 RR2GY03JQ
BS 290 290 RR2AH50JQ
BS 291 295 RR2GY03JQ
BS 296 296 RR2AH50JQ
BS 297 312 RR2GY03JQ
BS 313 314 RR2AH50JQ
BS 315 583 RR2GY03JQ
BS 584 584 RR2AH50JQ
BS 585 593 RR2GY03JQ
BS 594 839 RR2AH50JQ
BS 840 1010 RR2AH50TF
BS 1011 1011 RR2GY03TF
BS 1012 1113 RR2AH50TF
BS 1114 1114 RR2GY03TF
BS 1115 1493 RR2AH50TF

RD RR2GY03JQ 593 0 0
AAAAAAATATCTGTTTCTATGATTAAACCGAACAACCAACGTGATTCGACAATTAGTTCA
TGACTATCTAAGGCCACCGATATTTTTTTGGACAAACTAATAACGTTACAAAAAAGCGAG
AGAACGAACAAGGTCACAAGGCAAAAAGATTAATACAAGAGTTCTTCTTCATCAGTCCCA
ATATGATCTCTCTAACAAAACCAAACCAAAGAGATAAAACATGAATTTTATTGAAAGCCA
TCAGGATATGTCCGTCTCTTTCTTCACTTCTTCTCATCCTCACCTTTGCTACCACTCTCT
TCCTCGTTCCGA**TGATTCGTCTGGCAAAAACCCTAGCAGCGCTTGAACCGCTGGATCA
TTTGGATCCACCCCTGGAAGCGATGAAAGAACAAATGATATGAAAGCTTGATTTCCTAGG
AGGTTTCCAGCACCCGTAGCCTCACTTGACTCCTCCCCACTCATTGACATTTGCAAAGCT
AAAGCCAAGTCCTGGTCCTCATCCGCGGCTTCTGACATGTTTACATCACCTACGGACATA
GCAATTGCCTGATTTAGCAATGCGTTGTCCTCATCCATTGGTTCAGCGTTCTT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2AH50JQ 778 0 0
GG
CTATCTAAGGCCACCGATATTTTTT*GGACAAACTAATAACGTTACAAAAGAGCGAGAGA
ACGAACAAGGTCACAAGGCAGAAAGATTAATACAAGAGTTCTTCTTCATCAGTCCCAATA
TGATCTCTCTAACAAAACCAAACCAAAGAGATAAAACATGAATTTTATTGAGAGCCATCA
GGATATGTCCGTCTCTTTCTTCACTTCTTCTCATCCTCACCTTTGCCACCACCCTCTTCC
TCGTTCCGCTTTGATTCGTCTGGCAGAAACGCTAGCAGCGCTTGAACCGCTGGATCATTT
GGATCCACCCCTGGAAGCGATGAGAGAACAGATGATATGAAAGCTTGATTTCCTAGGAGG
TTTCCAGCACCCGTAGCCTCACTTGACTCCTCCCCACTCATTGACATTTGCAGAGCTAAA
GCCAAGTCCTGGTCCTCATCCGCGGCTTCTGACATGTTTACATTACCTACGGACATAGCA
ATTGCCTGATTTAGCAATGCGTTGTCCTCATCCATTGGTTAAGCGTTCTTATCAGTTGTC
CTAGCAACCGTCTCCTGGGAGGCAGAAGCTGAAGCCCCATCTTGGTCTTTCTGACCAGCG
TCATCAGCTGCCTTCTTAGCAGCAGCCTCTTGCCTTGCTCTCTCCTCCTCCATGGAGACC
CGAAGGGCGAGAGCAAGCTCTGGATCGATATTTGGATCAACACCAAAATCAAAGTCACCA
CCCCC*AGCAGCAGCAGCAGCTGCCGCAGAAACATACCCACTTGCACCCTCATCAC

QA 3 778 3 778
DS 

RD RR2AH50TF 775 0 0
AGACCCGAAGGGCGAGAGCAAGCTCTGGATCGATATTTGGATCAACACCAAAATCAAAGT
CACCACCCCCCAGCAGCAGCAGCAGCTGCCGCAGAAACATACCCACTTGCACCCTCATCA
CCAGTGAATACAGGTGTGCTGAGGAGGACATCAGAGAGAGCATTGGCACCGGAAGGAACA
TGGACAATGTGGCTACCATCATTGTTATTGACGGCAGAAAGGAGGGCCTCAAGTTTGAGA
GGTTTGTCCACATCGTCATCATCACCAAAATTGACAATGTCAAGAGAGACACTGTTCTTT
TTAAGCCTTTTGCCAACAACCTCCAAGGCCTTCTTTTCATACTTGATTGGGCTTCCAGCG
AAAACAATGATACGTTGGCGTTGATTCTTGTTTTGGCGATGCTTGAGAGAAAGCTGAGCA
ATCTGGATGGCTGCCGTTAAGTTAGTCTCTCCTCCAACATCGAGTCCGTGCATACAGGCC
AAAATCTTGCCAAGATCAGAGGTAGGCGTCGTCAAAACTCTAACTCCTTTGCCTGCCATT
GTCAAGATCCCCACCGTGTTCTCTGGATTCGACTGGGTTTTGGCACCACATAGAAGATTA
ACAGCTTCGGTTTGAGCCTGTAACCTAGAGGGAGAGTAATCTCCGTTTCGCATCCACTCC
GAGTTGTCGATGCATATCATTGTCGCCTCGAGAACCATTGTTAGAGAGATTGTTTCGTAG
AGAGAAAGTCAGGCAGGCAGGCACACTTGTGAGAGAGAGAGAGATTTAGACCCCC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2GY03TF 702 0 0
ATCAAAGTCACCACCCCC*AGCAGCAGCAGCAGCTGC*GCAGAAACATACCCACTTGCAC
CCTCATCACCAGTGAATACAGGTGTGCTGAGGAGGACATCAGAGAGAGCATTGGCACGGG
AAGGAACATGGACAATGTGGCTACCATCATTGTTATTGACGGCAGAAAGGAGGGCCTCAA
GTTTGAGAGGTTTGTCCACATCGTCATCATCACCAAAATTGACAATGTCAAGAGAGACAC
AGTTCTTTTTAAGCCTTTTGCCAACAACCTCCAAGGCCTTCTTTTCATACTTGATTGGGC
TTCCAGCGAAAACAATGATACGTTGGCGTTGATTCTTGTTTTGCCGATGCTTGAGAGAAA
GCTGAGCAATCTGGATGGCTGCCGTTAAGTTAGTCTCTCCTCCAACATCGAGTCCGTGCA
TACAGGCCAAAATCTTGCCAAGATCAGAGGTAGGCGTCGTCAAAACTCTAACTCCTTTGC
CTGCCATTGTCAAGATCCCCACCGTGTTCTCTGGATTCGACTGGGTTTTGGCACCACATA
GAAGATTAACAGCTTCGGTTTGAGCCTGTAACCTAGAGGGAGAGTAATCTCCGTTTCGCA
TCCACTCCGAGTTGTCGATGCATATCATTGTCGCCTCGAGAACCATTGTTAGAGAGATTG
TTTCGTAGAGAGAAAGTCAGGTAGGCAGGC*CACTTGTGAGA

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 3

CO CL2673Contig1 872 3 2 U
GGACCCAGAAACAAACACAATCGAACTTGGGCTAAGAATCCGAGTGTTTAATCGTCGAAA
GATCAATTCTTTGGGAGATGGGTCTATGGGATTCTCTTCTAAACTGGCTCAGGAGCTTGT
TCTTCAAACAAGAGATGGAGCTCTCACTCGTTGGCCTTCAGAATGCTGGAAAGACTTCTC
TTGTCAATGCCATCGCTACTGGAGGTTACAGCGAAGATATGATACCAACTGTGGGGTTTA
ACATGAGGAAAGTCACTAAAGGAAACGTTACCATCAAGATTTGGGATCTTGGAGGCCAAC
GAAGGTTCCGCACCATGTGGGAGCGTTACTGTCGTGGAGTTTCCGCCATTGTATATGTGA
TTGATGCTGCAGACCGAGACAGTGTACCGATATCAAGAAGTGAGTTGCATGATCTGTTAA
CGAAACCGTCCTTGAACGGTATTCCTCTTTTGATCCTAGGCAACAAGATTGATAAGTCTG
AAGCTCTCTCCAAGCAAGCTTTGGTTGATCAACTAGGGCTTGATTCCGTAGCTGACAGAG
AGGTCTGTTGTTACACGATCTCGTGTAAGGACTCGATCAACATCGATGCGGTCATTGATT
GGCTCATTAAGCACTCGAGAACCGCTAAATAAACAGCAGACGCAGTCATCGGTGCAGTGG
AGGAGACAGGCTTTGTGTGTTTGGTTTCTTGATGTTGTTTATTTGTCGAGAATCAATCAG
ATGTAAATCACCCAGCTTTTGGTTTCTTCTTCGTCTTTATTATATCTTAAACCTTGTTTT
ACAATTCTTCAGAGTTCAAACACTTTCTTTAATACATTCGGTTACGCATATCCTTGTTGT
ACTTGTGAAAATAAGAGACCCGGTTTCCGGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AU53TF U 1
AF RR2AU53JQ C 1
AF RR2G119TF U 282
BS 1 672 RR2AU53TF
BS 673 872 RR2G119TF

RD RR2AU53TF 672 0 0
GGACCCAGAAACAAACACAATCGAACTTGGGCTAAGAATCCGAGTGTTTAATCGTCGAAA
GATCAATTCTTTGGGAGATGGGTCTATGGGATTCTCTTCTAAACTGGCTCAGGAGCTTGT
TCTTCAAACAAGAGATGGAGCTCTCACTCGTTGGCCTTCAGAATGCTGGAAAGACTTCTC
TTGTCAATGCCATCGCTACTGGAGGTTACAGCGAAGATATGATACCAACTGTGGGGTTTA
ACATGAGGAAAGTCACTAAAGGAAACGTTACCATCAAGATTTGGGATCTTGGAGGCCAAC
GAAGGTTCCGCACCATGTGGGAGCGTTACTGTCGTGGAGTTTCCGCCATTGTATATGTGA
TTGATGCTGCAGACCGAGACAGTGTACCGATATCAAGAAGTGAGTTGCATGATCTGTTAA
CGAAACCGTCCTTGAACGGTATTCCTCTTTTGATCCTAGGCAACAAGATTGATAAGTCTG
AAGCTCTCTCCAAGCAAGCTTTGGTTGATCAACTAGGGCTTGATTCCGTAGCTGACAGAG
AGGTCTGTTGTTACACGATCTCGTGTAAGGACTCGATCAACATCGATGCGGTCATTGATT
GGCTCATTAAGCACTCGAGAACCGCTAAATAAACAGCAGACGCAGTCATCGGTGCAGTGG
AGGAGACAGGCT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2AU53JQ 827 0 0
GGACCCAGAAACAAACACAATCGAACTTGGGCTAAGAATCCGAGTGTTTAATCGTCGAAA
GATCAATTCTTTGGGAGATGGGTCTATGGGATTCTCTTCTAAACTGGCTCAGGAGCTTGT
TCTTCAAACAAGAGATGGAGCTCTCACTCGTTGGCCTTCAGAATGCTGGAAAGACTTCTC
TTGTCAATGCCATCGCTACTGGAGGTTACAGCGAAGATATGATACCAACTGTGGGGTTTA
ACATGAGGAAAGTCACTAAAGGAAACGTTACCATCAAGATTTGGGATCTTGGAGGCCAAC
GAAGGTTCCGCACCATGTGGGAGCGTTACTGTCGTGGAGTTTCCGCCATTGTATATGTGA
TTGATGCTGCAGACCGAGACAGTGTACCGATATCAAGAAGTGAGTTGCATGATCTGTTAA
CGAAACCGTCCTTGAACGGTATTCCTCTTTTGATCCTAGGCAACAAGATTGATAAGTCTG
AAGCTCTCTCCAAGCAAGCTTTGGTTGATCAACTAGGGCTTGATTCCGTAGCTGACAGAG
AGGTCTGTTGTTACACGATCTCGTGTAAGGACTCGATCAACATCGATGCGGTCATTGATT
GGCTCATTAAGCACTCGAGAACCGCTAAATAAACAGCAGACGCAGTCATCGGTGCAGTGG
AGGAGACAGGCTTTGTGTGTTTGGTTTCTTGATGTTGTTTATTTGTCGAGAATCAATCAG
ATGTAAATCACCCAGCTTTTGGTTTCTTCTTCGTCTTTATTATATCTTAAACCTTGTTTT
ACAATTCTTCAGAGTTCAAACACTTTCTTTAATACATTCGGTTACGC

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2G119TF 591 0 0
A
GGGATCTTGGAGGCCAACGAAGGTTCCGCACCATGTGGGAGCGTTACTGTCGTGGAGTTT
CCGCCATTGTATATGTGATTGATGCTGCAGACCGAGACAGTGTACCGATATCAAGAAGTG
AGTTGCATGATCTGTTAACGAAACCGTCCTTGAACGGTATTCCTCTTTTGATCCTAGGCA
ACAAGATTGATAAGTCTGAAGCTCTCTCCAAGCAAGCTTTGGTTGATCAACTAGGGCTTG
ATTCCGTAGCTGACAGAGAGGTCTGTTGTTACATGATCTCGTGTAAGGACTCGATCAACA
TCGATGCAGTCATTGATTGGCTCATTAAGCACTCGAGAACCGCTAAATAAACAGCAGACG
CAGTCATCGGTGCAGTGGAGGAGACAGGCTTTGTGTGTTTGGTTTCTTGATGTTGTTTAT
TTGTCGAGAATCAATCAGATGTAAATCACCCAGCTTTTGGTTTCTTCTTCGTCTTTATTA
TATCTTAAACCTTGTTTTACAATTCTTCAGAGTTCAAACACTTTCTTTAATACATTCGGT
TACGCATATCCTTGTTGTACTTGTGAAAATAAGAGACCCGGTTTCCGGTT

QA 2 591 2 591
DS 



AS 1 4

CO CL2674Contig1 895 4 13 U
GAGACTAAGAACAGGGGAGAAGATTTGATCGGCATCCACGACGGCGGCGGCGGAGTAAGT
CATGGCGAACCTAGAACCCGAAGCAGTCGATTTCGAGCCGGAGGAGGATGACCTGATGGA
CGAAGACAGTGCAGCAGCTGATCTCTCCCCACGCGCAGCCAATCCGCGGCTTAGGTCTAC
AATCGCCGGAGCAAACGACGATTCAGCTCAGAGGAAAACCAAAGGCCGTGGCTTTCGCGA
GGAGAAAGATTCCGATCGCCAGCGCCGCCTTTCCTCGCGAGATTTCGACTCACTCGGTTC
CGATGGTGGTCCTGGCCCTCAACGATCCATCGAGGGGTGGATCATTTTGGTCACTGGAGT
TCATGAGGAGGCACAGGAAGATGATATATCCAATGCGTTTGGTGATTTTGGGGAGATTAA
GAGTTTGCATCTCAATCTCGATCGCCGTACTGGTTTTGTCAAGGGCTATGCTTTGATTGA
ATATGAGAAGAGCGAAGAAGCACAGAATGCTATCAAGGCAATGAATGGTGCCGAGCTTCT
TACACAGAACGTCAGCGTTGACTGGGCCTTCAGCAACGGACCCAATGCTGGATCTTACAG
GAGAAGGAACATGAGGTCTGGGAGGTCACAGCGTTCAAGAAGCCCGAGAAGACGTTTCTG
ATTGTGTTTCATTTGGTTCGGGAGTTGTCTCCACATCTCTCGGTATTTGAGATTCTGTCT
CTTTATCTGTAAGCCGCTGAGTGTTTCTGACTCTTTTCTTATGGGTTGCGTAGGTTTGGT
TGTTGTGTATGGTGTGTAGTCTTATGCATTTGCATAGGATTGTTGCGTTTTTTATAAACA
CCATGAGAGATATGGTTCAATGCTTCTGGTTTGGTAGAAGAAAAAACATTGGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT89TF U 1
AF RR2E048JQ C 442
AF RR2E048TF U 4
AF RR2BT89JQ C 205
BS 1 36 RR2BT89TF
BS 37 37 RR2E048TF
BS 38 60 RR2BT89TF
BS 61 61 RR2E048TF
BS 62 144 RR2BT89TF
BS 145 145 RR2E048TF
BS 146 168 RR2BT89TF
BS 169 169 RR2E048TF
BS 170 691 RR2BT89TF
BS 692 692 RR2E048TF
BS 693 713 RR2BT89TF
BS 714 770 RR2E048TF
BS 771 895 RR2BT89JQ

RD RR2BT89TF 720 0 0
GAGACTAAGAACAGGGGAGAAGATTTGATCGGCATCGACGACGGCGGCGGCGGAGTAAGT
TATGGCGAACCTAGAACCCGAAGCAGTCGATTTCGAGCCGGAGGAGGATGACCTGATGGA
CGAAGACAGTGCAGCAGCTGATCTTTCCCCACGCGCAGCCAATCCGCGTCTTAGGTCTAC
AATCGCCGGAGCAAACGACGATTCAGCTCAGAGGAAAACCAAAGGCCGTGGCTTTCGCGA
GGAGAAAGATTCCGATCGCCAGCGCCGCCTTTCCTCGCGAGATTTCGACTCACTCGGTTC
CGATGGTGGTCCTGGCCCTCAACGATCCATCGAGGGGTGGATCATTTTGGTCACTGGAGT
TCATGAGGAGGCACAGGAAGATGATATATCCAATGCGTTTGGTGATTTTGGGGAGATTAA
GAGTTTGCATCTCAATCTCGATCGCCGTACTGGTTTTGTCAAGGGCTATGCTTTGATTGA
ATATGAGAAGAGCGAAGAAGCACAGAATGCTATCAAGGCAATGAATGGTGCCGAGCTTCT
TACACAGAACGTCAGCGTTGACTGGGCCTTCAGCAACGGACCCAATGCTGGATCTTACAG
GAGAAGGAACATGAGGTCTGGGAGGTCACAGCGTTCAAGAAGCCCGAGAAGACGTTTCTG
ATTGTGTTTCATTTGGTTCGGGAGTTGTCTC*ACATCTCTCGGTATTTGAGAT
TCTGTCT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2E048JQ 272 0 0
TCGCCGTACTGGTTTTGTCAAGGGCTATGCTTTGATTGAATATGAGAAGAGGGAAGAAGC
ACAGAATGCTATCAAGGCAATGAATGGTGCCGAGCTTTTTACACAGAACGTCAGCGTTGA
CTGGGCCTTCAGCAACGGACCCAATGCTGGATTTTACAGGAGAAGGAACATGAGGTTTGG
GAGGTCACAGCGTTCAAGAAGCCCGAGAAGACGTTTTTGATTGTGTTTCATTTGGTTCGG
GAGTTGTCTCCACATCTCTCGGTGTTTGAGAT

QA 1 272 1 272
DS 

RD RR2E048TF 767 0 0
GGGAAA
AACAGGGGAGAAGATTTGATCGGCATCCACGACGGCGGCGGCGGAGTAAGTCATGGCGAA
CCTAGAACCCGAAGCAGTCGATTTCGAGCCGGAGGAGGATGACCTGATGGACGAAGACAG
TGCAGCAGCTGATCTCTCCCCACGCGCAGCCAATCCGCGGCTTAGGTCTACAATCGCCGG
AGCAAACGACGATTCAGCTCAGAGGAAAACCAAAGGCCGTGGCTTTCGCGAGGAGAAAGA
TTCCGATCGCCAGCGCCGCCTTTCCTCGCGAGATTTCGACTCACTCGGTTCCGATGGTGG
TCCTGGCCCTCAGCGATCGATCGAGGGGTGGATCATTTTGGTCACTGGAGTTCATGAGGA
GGCACAGGAAGATGATATATCGAACGCTTTTGGTGATTTTGGGGAGATTAAGAGTTTGCA
TCTCAATCTCGATCGCCGTACTGGTTTTGTCAAGGGCTATGCTTTGATTGAATATGAGAA
GAGCGAAGAAGCACAGAATGCTATCAAGGCAATGAATGGTGCCGAGCTTCTTACACAGAA
CGTCAGCGTTGACTGGGCCTTCAGCAACGGACCCAATGCTGGATCTTACAGGAGAAGGAA
CATGAGGTCTGGGAGGTCACAGCGTTCAAGAAGCCCGAGAAGACGTTTCTGATTGTGTTT
CATTTGGTTCGGGAGTTGTCTCCACATCTCTCGGTGTTTGAGATTCTGTCTCTTTATCTG
TAAGCCGCTGAGTGTTTCTGACTCTTTTCTTATGGGTTGCG

QA 7 767 7 767
DS 

RD RR2BT89JQ 691 0 0
AGCTCAGAGGAAAACCAAAGGCCGTGGCTTTCGCGAGGAGAAAGATTCCGATCGCCAGCG
CCGCCTTTCCTCGCGAGATTTCGACTCACTCGGTTCCGATGGTGGTCCTGGCCCTCAACG
ATCCATCGAGGGGTGGATCATTTTGGTCACTGGAGTTCATGAGGAGGCACAGGAAGATGA
TATATCCAATGCGTTTGGTGATTTTGGGGAGATTAAGAGTTTGCATTTCAATCTCGATCG
CCGTACTGGTTTTGTCAAGGGCTATGCTTTGATTGAATATGAGAAGAGCGAAGAAGCACA
GAATGCTATCAAGGCAATGAATGGTGCCGAGCTTTTTACACAGAACGTCAGCGTTGACTG
GGCCTTCAGCAACGGACCCAATGCTGGATCTTACAGGAGAAGGAACATGAGGTCTGGGAG
GTCACAGCGTTCAAGAAGCCCGAGAAGACGTTTCTGATTGTGTTTCATTTGGTTCGGGAG
TTGTCTCCACATCTCTCGGTATTTGAGATTCTGTCTCTTTATCTGTAAGCCGCTGAGTGT
TTCTGACTCTTTTCTTATGGGTTGCGTAGGTTTGGTTGTTGTGTATGGTGTGTAGTCTTA
TGCATTTGCATAGGATTGTTGCGTTTTTTATAAACACCATGAGAGATATGGTTCAATGCT
TCTGGTTTGGTAGAAGAAAAAACATTGGTTG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 4

CO CL2675Contig1 736 4 9 U
TCTAATGACACCAACCAAATTAATGCCAAATTTTTATCTCCTTTTTGAAGCATCAAAACA
TGAGACAAGACAAAAAGATTTAATGAAAAAATGGAGAGAGATTTTATATAGATCTAAAAG
GTATTTTTCTTTTTCTTTTTTTCCACATGAAAATGAACCTGAATTCTAATAAAGAATAAC
GAATCCCACTCATAGAAAAACATTCCTTTTGCTTTCTTTCTCCCCTCTTTTTTCTTGGAC
AACAAGCAAAACTACAAAGCTTTGCCTGTTTGTTGGAAGGGGACAAAATGGTAGTTTTGA
TCAGCATGATGTACCCGGCTTGCAGCCAAGTACTCCCGCATCCATGGTGAGTTTACGGAC
CATTTTTCCCGGTTGAGGTCGTATGGCAAACTTTCTTGGGACAGGGTTAACCGGTTTAGG
GCTCCATGCATTTTGTCTTCCGGATTGCACAAAGTAAGCCCCATTCAAGAAGTAATCTCC
TTCTGATTGCCAATTCCACATTTTCCAAGCACTGTAAGGCGTGTACTCTCTCTTTGTAAC
CTGTCTGGCTCGTTCATTAGGAGGAGCAATGAAACGGTTGCCTTGACTAATGATTGTAGG
GTTCATGTTTCCACCAATTGCATACATTTCCCAATGTGTGTAGTCATTGTTCACCACATG
GATCGTTCCGAATCTGCAACGAGGCATCCTTTGATCCAATCTCTTGCCAAAGTGGTTGAA
CGCAACTGTTATTTGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A136JQ U 110
AF RR2A136TF C 110
AF RR2DN04JQ U 2
AF RR2DN04TF C 1
BS 1 1 RR2DN04TF
BS 2 110 RR2DN04JQ
BS 111 244 RR2A136JQ
BS 245 245 RR2DN04JQ
BS 246 308 RR2A136JQ
BS 309 309 RR2DN04JQ
BS 310 618 RR2A136JQ
BS 619 695 RR2DN04JQ
BS 696 736 RR2DN04TF

RD RR2A136JQ 510 0 0
G
GATCTAAAAGGTATTTTTCTTTTTCTTTTTTTCCACATGAAAATGAACCTGAATTCTAAT
AAAGAATAACGAATCCCACTCATAGAAAAACATTCCTTTTGCTTTCTTTCTCCCCTCTTT
TTTCTTGGACAACAGGCAAAACTACAAAGCTTTGCCTGTTTGTTGGAAGGGGACAAAATG
GTAGTTTTGATCAGCATGCTGTACCCGGCTTGCAGCCAAGTACTCCCGCATCCATGGTGA
GTTTACGGACCATTTTTCCCGGTTGAGGTCGTATGGCAAACTTTCTTGGGACAGGGTTAA
CCGGTTTAGGGCTCCATGCATTTTGTCTTCCGGATTGCACAAAGTAAGCCCCATTCAAGA
AGTAATCTCCTTCTGATTGCCAATTCCACATTTTCCAAGCACTGTAAGGCGTGTACTCTC
TCTTTGTAACCTGTCTGGCTCGTTCATTAGGAGGAGCAATGAAACGGTTGCCTTGACTAA
TGATTGTAGGGTTCATGTTTCCACCAAT
C

QA 2 509 2 509
DS 

RD RR2A136TF 510 0 0
G
GATCTAAAAGGTATTTTTCTTTTTCTTTTTTTCCACATGAAAATGAACCTGAATTCTAAT
AAAGAATAACGAATCCCACTCATAGAAAAACATTCCTTTTGCTTTCTTTCTCCCCTCTTT
TTTCTTGGACAACAGGCAAAACTACAAAGCTTTGCCTGTTTGTTGGAAGGGGACAAAATG
GTAGTTTTGATCAGCATGCTGTACCCGGCTTGCAGCCAAGTACTCCCGCATCCATGGTGA
GTTTACGGACCATTTTTCCCGGTTGAGGTCGTATGGCAAACTTTCTTGGGACAGGGTTAA
CCGGTTTAGGGCTCCATGCATTTTGTCTTCCGGATTGCACAAAGTAAGCCCCATTCAAGA
AGTAATCTCCTTCTGATTGCCAATTCCACATTTTCCAAGCACTGTAAGGCGTGTACTCTC
TCTTTGTAACCTGTCTGGCTCGTTCATTAGGAGGAGCAATGAAACGGTTGCCTTGACTAA
TGATTGTAGGGTTCATGTTTCCACCAAT
C

QA 2 509 2 509
DS 

RD RR2DN04JQ 694 0 0
CTAATGACACCAACCAAATTAATGCCAAATTTTTATCTCCTTTTTGAAGCATCAAAACAT
GAGACAAGACAAAAAGATTTAATGAAAAAATGGAGAGAGATTTTATATAGATCTAAAAGG
TATTTTTCTTTTTCTTTTTT*CCACATGAAAATGAACCTGAATTCTAATAAAGAATAATG
AATCCCACTCATAGAAAAACATTCCTTTTGCTTTCTTTCTCCCCTCTTTTTTCTTGGACA
ACAAGCAAAACTACAAAGCTTTGCCTGTTTGTTGGAAGGGGACAAAATGGTAGTTTTGAT
CAGCATGATGTACCCGGCTTGCAGCCAAGTACTCCTGCATCCATGGTTAGTTTACGGACC
ATTTTTCCCGGTTGAGGTCGTATGGCAAACTTTCTTGGGACAGGGTTTACCGGTTTAGGG
CTCCATGCATTTTGTCTTCCGGATTGCACAAAGTAAGCCCCATTCAAGAAGTAATCTCCT
TCTGATTGCCAATTCCACATTTTCCAAGCAGTGTAAGGCGTGTACTCTCTCTTTGTAACC
TGTCTGGCTCGTTCATTAGGAGGAGCAATGAAACGGTTGCCTTGACTAATGATTGTAGGG
TTCATGTTTCCACCAATTGCATACATTTCCCAATGTGTGTAGTCATTGTTCACCACATGG
ATCGTTCCGAATCTGCAACGAGGCATCCTTTGAT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2DN04TF 736 0 0
TCTAATGACACCAACCAAATTAATGCCAAATTTT*ATCTC*TTTTTGAAGCATCAAAACA
TGAGACAAGACAAAAAGATTTAATGAAAAAATGGAGAGAGATTTTATATAGATCTAAAAG
GTATTTTTCTTTTTCTTTTTT*CCACATGAAAATGAACCTGAATTCTAATAAAGAATAAT
GAATCCCACTCATAGAAAAACATTCCTTTTGCTTTCTTTCTCCCCTCTTTTTTCTTGGAC
AACAAGCAAAACTACAAAGCTTTGCCTGTTTGTTGGAAGGGGACAAAATGGTAGTTTTGA
TCAGCATGATGTACCCGGCTTGCAGCCAAGTACTCCTGCATCCATGGTTAGTTTACGGAC
CATTTTTCCCGGTTGAGGTCGTATGGCAAACTTTCTTGGGACAGGGTTTACCGGTTTAGG
GCTCCATGCATTTTGTCTTCCGGATTGCACAAAGTAAGCCCCATTCAAGAAGTAATCTCC
TTCTGATTGCCAATTCCACATTTTCCAAGCAGTGTAAGGCGTGTACTCTCTCTTTGTAAC
CTGTCTGGCTCGTTCATTAGGAGGAGCAATGAAACGGTTGCCTTGACTAATGATTGTAGG
GTTCATGTTTCCACCAATTGCATACATTTCCCAATGTGTGTAGTCATTGTTCACCACATG
GATCGTTCCGAATCTGCAACGAGGCATCCTTTGATCCAATCTCTTGCCAAAGTGGTTGAA
CGCAACTGTTATTTGC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 4

CO CL2676Contig1 829 4 4 U
TTAAAACAAACATTATTTAATAAAATGGTCTAGAAATCCTATGTGAATCCAAAAATAAAA
TTAAAAATCCCCATGTAAACCACAATAATCTTTTTTTTTTAACCCACAATAATCTTGAGC
CAGCCGTTGTGCTAAGCAAACATGATAAGTTAATAATTAAGATATAAACCTTGTAGTCTT
CGGTGTACCAATCCCCGATGAGGAGGGTGAAGTCTCCGGCTGGTTGCGGGAAAGGGACGG
GAATGCCAGGGCGACTGAGGATACGGATGGCACCAAAACCACCGGCGGCTTTTTGAACGC
CCAGTGAAGGGAAGTAGAAGAAACTTCCGATCTGGTCTCCGACATGGAAGTCATAAGTAT
AATTCTTTCCAGGTGGGATTGGACAAGTCGTCCCATACACTCCATCTTGGTAAGAGTTTC
TCTTTAGATGCAAGCCGTTCCAAGACAAGAGAAAAGGCTCGTCCAGATCATTGTGAACAT
TGATTATCAAATTATCATTGGTGACTAAGGAAAGCTCCGGTCCGGGAAATTTTCCGTTTA
TTAGAATTACCCTTTCTGGAGGATTGCGCTTATTCAAAGAGATGTTGCCGTAAGTGACCC
TCAGGTCGAAGAAGCGGAAGGAATCTTCAGCTTGAACAAAAGAAATGATGGTCATCGTCA
TCATCATCCAAACACCGCCGTCAGGACACCACGCCATAATCGTCTCGTAGCTGCCTTAGA
TCCTGATGAAACTTGGTAGCGAGAAGGGACAAGAAGCAAACGTTGGAAGAAAAAGCTTGA
AGGTTGTAATAACCCAACTATAGGACTCGGTGACGTATTGAAAGTCTCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2A877JQ U 3
AF RR2AQ02JQ U 3
AF RR2AQ02TF C 1
AF RR2A877TF C 101
BS 1 2 RR2AQ02TF
BS 3 742 RR2A877JQ
BS 743 769 RR2AQ02JQ
BS 770 829 RR2AQ02TF

RD RR2A877JQ 740 0 0
AAAACAAACATTATTTAATAAAATGGTCTAGAAATCCTATGTGAATCCAAAAATAAAATT
AAAAATCCCCATGTAAACCACAATAATCTTTTTTTTTTAACCCACAATAATCTTGAGCCA
GCCGTTGTGCTAAGCAAACATGATAAGTTAATAATTAAGATATAAACCTTGTAGTCTTCG
GTGTACCAATCCCCGATGAGGAGGGTGAAGTCTCCGGCTGGTTGCGGGAAAGGGACGGGA
ATGCCAGGGCGACTGAGGATACGGATGGCACCAAAACCACCGGCGGCTTTTTGAACGCCC
AGTGAAGGGAAGTAGAAGAAACTTCCGATCTGGTCTCCGACATGGAAGTCATAAGTATAA
TTCTTTCCAGGTGGGATTGGACAAGTCGTCCCATACACTCCATCTTGGTAAGAGTTTCTC
TTTAGATGCAAGCCGTTCCAAGACAAGAGAAAAGGCTCGTCCAGATCATTGTGAACATTG
ATTATCAAATTATCATTGGTGACTAAGGAAAGCTCCGGTCCGGGAAATTTTCCGTTTATT
AGAATTACCCTTTCTGGAGGATTGCGCTTATTCAAAGAGATGTTGCCGTAAGTGACCCTC
AGGTCGAAGAAGCGGAAGGAATCTTCAGCTTGAACAAAAGAAATGATGGTCATCGTCATC
ATCATCCAAACACCGCCGTCAGGACACCACGCCATAATCGTCTCGTAGCTGCCTTAGATC
CTGATGAAACTTGGTAGCGA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2AQ02JQ 767 0 0
AAAACAAACATTATTTAATAAAATGGTCTAGAAATCCTATGTGAATCCAAAAATAAAATT
AAAAATCCCCATGTAAACCACAATAATCTTTTTTTTTTAACCCACAATAATCTTGAGCCA
GCCGTTGTGCTAAGCAAACATGATAAGTTAATAATTAAGATATAAACCTTGTAGTCTTCG
GTGTACCAATCCCCGATGAGGAGGGTGAAGTCTCCGGCTGGTTGCGGGAAAGGGACGGGA
ATGCCAGGGCGACTGAGGATACGGATGGCACCAAAACCACCGGCGGCTTTTTGAACGCCC
AGTGAAGGGAAGTAGAAGAAACTTCCGATCTGGTCTCCGACATGGAAGTCATAAGTATAA
TTCTTTCCAGGTGGGATTGGACAAGTCGTCCCATACACTCCATCTTGGTAAGAGTTTCTC
TTTAGATGCAAGCCGTTCCAAGACAAGAGAAAAGGCTCGTCCAGATCATTGTGAACATTG
ATTATCAAATTATCATTGGTGACTAAGGAAAGCTCCGGTCCGGGAAATTTTCCGTTTATT
AGAATTACCCTTTCTGGAGGATTGCGCTTATTCAAAGAGATGTTGCCGTAAGTGACCCTC
AGGTCGAAGAAGCGGAAGGAATCTTCAGCTTGAACAAAAGAAATGATGGTCATCGTCATC
ATCATCCAAACACCGCCGTCAGGACACCACGCCATAATCGTCTCGTAGCTGCCTTAGATC
CTGATGAAACTTGGTAGCGAGAAGGGACAAGAAGCAAACGTTGGAAG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2AQ02TF 829 0 0
TTAAAACAAACATTATTTAATAAA*TGGTCTAGAAATC*TATGTGAATCCAAAAATAAAA
TTAAAAATCCCCATGTAAACCACAATAATCTTTTTTTTT*AACCCACAATAATCTTGAGC
CAGCCGTTGTGCTAAGCAAACATGATAAGTTAATAATTAAGATATAAAC*TTGTAGTCTT
CGGTGTACCAATCCCCGATGAGGAGGGTGAAGTCTCCGGCTGGTTGCGGGAAAGGGACGG
GAATGCCAGGGCGACTGAGGATACGGATGGCACCAAAACCACCGGCGGCTTTTTGAACGC
CCAGTGAAGGGAAGTAGAAGAAACTTCCGATCTGGTCTCCGACATGGAAGTCATAAGTAT
AATTCTTTCCAGGTGGGATTGGACAAGTCGTCCCATACACTCCATCTTGGTAAGAGTTTC
TCTTTAGATGCAAGCCGTTCCAAGACAAGAGAAAAGGCTCGTCCAGATCATTGTGAACAT
TGATTATCAAATTATCATTGGTGACTAAGGAAAGCTCCGGTCCGGGAAATTTTCCGTTTA
TTAGAATTACCCTTTCTGGAGGATTGCGCTTATTCAAAGAGATGTTGCCGTAAGTGACCC
TCAGGTCGAAGAAGCGGAAGGAATCTTCAGCTTGAACAAAAGAAATGATGGTCATCGTCA
TCATCATCCAAACACCGCCGTCAGGACACCACGCCATAATCGTCTCGTAGCTGCCTTAGA
TCCTGATGAAACTTGGTAGCGAGAAGGGACAAGAAGCAAACGTTGGAAGAAAAAGCTTGA
AGGTTGTAATAACCCAACTATAGGACTCGGTGACGTATTGAAAGTCTCC

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2A877TF 729 0 0
AACCCACAATAATCTTGAGCCAGCCGTTGTGCTAAGCAAACATGATAAGTTAATAATTAA
GATATAAACTTTGTAGTCTTCGGTGTACCAATCCCCGATGAGGAGGGTGAAGTCTCCGGC
TGGTTGCGGGAAAGGGACGGGAATGCCAGGGCGACTGAGGATACGGATGGCACCAAAACC
ACCGGCGGCTTTTTGAACGCCCAGTGAAGGGAAGTAGAAGAAACTTCCGATCTGGTCTCC
GACATGGAAGTCATAAGTATAATTCTTTCCAGGTGGGATTGGACAAGTCGTCCCATACAC
TCCATCTTGGTAAGAGTTTCTCTTTAGATGCAAGCCGTTCCAAGACAAGAGAAAAGGCTC
GTCCAGATCATTGTGAACATTGATTATCAAATTATCATTGGTGACTAAGGAAAGCTCCGG
TCCGGGAAATTTTCCGTTTATTAGAATTACCCTTTCTGGAGGATTGCGCTTATTCAAAGA
GATGTTGCCGTAAGTGACCCTCAGGTCGAAGAAGCGGAAGGAATCTTCAGCTTGAACAAA
AGAAATGATGGTCATCGTCATCATCATCCAAACACCGCCGTCAGGACACCACGCCATAAT
CGTCTCGTAGCTGCCTTAGATCCTGATGAAACTTGGTAGCGAGAAGGGACAAGAAGCAAA
CGTTGGAAGAAAAAGCTTGAAGGTTGTAATAACCCAACTATAGGACTCGGTGACGTATTG
AAAGTCTCC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 3

CO CL2677Contig1 805 3 9 U
TTCGCGATTACTTTTATTTCTAACACAATAAGATACACTCTTGAAAAAAATATAAAAGAA
CAAAGTCCACTAGACTCGAATGAAGTGAAACATTATTCAGAATAAACATATCCATAAACT
TCAACTTGTAGATGGTCTATGTTACATCTTTTATCACATGGCATCTTCTGGACCAAAAGC
GAAGTCGGCCTGAAACCTTTGCTTATGCAGCGGCTGCAGGGTCGTTTATGACTCCCAAAA
AATCGTCTTTGATGGTACCCACACAAAAGATTTCAGTGGCATCGACTCTTGTTCCAATAA
TCTTTAGCCTTACTTCACATTCTTTCTGGATCTTAACTGATCCATCAGATGTCGTGTAGT
TAGGCATGTCTCCAGCCTGAAACTCCATATCATCTGGAATCAAATGCTTGGACACAAAAA
TCTGAACAGGTCCAGCTTCAGCGAAGAAACCCATCTTATTGACGAGAGTGACAACAGCTT
CCAAAATCTCGCCTTTGAAAGGTCTGAAAACAACGCACTGGTACTTAACGGGGAAGGTGA
CGAAGGCAGTCCCATCTCGGATCAATCCTTTCCCTACGCTTTCTATTCCTGTTATCGCCA
CTACAAACCCATGTCGCCCACTGCAAGTGCCCTCGACATCTTTCATGAGCTTAGAGACGA
GATTTTCACGAAGGTTGCGACCAAAGAATCGAGGATGTAATTGCACGTTTCGCTCCAAAA
CTATGTGGAAGAACATCCTTCTTGTCTCTCTCTCTCTGCCTTTTTCGCTCTCTCTCTCAC
TCCGCGCGGCGCTAGTTTAATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK38JQ U 1
AF RR2DM93JQ U 49
AF RR2FM69TF C 406
BS 1 253 RR2AK38JQ
BS 254 254 RR2DM93JQ
BS 255 445 RR2AK38JQ
BS 446 446 RR2DM93JQ
BS 447 657 RR2AK38JQ
BS 658 718 RR2DM93JQ
BS 719 719 RR2FM69TF
BS 720 724 RR2DM93JQ
BS 725 805 RR2FM69TF

RD RR2AK38JQ 657 0 0
TTCGCGATTACTTTTATTTCTAACACAATAAGATACACTCTTGAAAAAAATATAAAAGAA
CAAAGTCCACTAGACTCGAATGAAGTGAAACATTATTCAGAATAAACATATCCATAAACT
TCAACTTGTAGATGGTCTATGTTACATCTTTTATCACATGGCATCTTCTGGACCAAAAGC
GAAGTCGGCCTGAAACCTTTGCTTATGCAGCGGCTGCAGGGTCGTTTATGACTCCCAAAA
AATCGTCTTTGATTGTACCCACACAAAAGATTTCAGTGGCATCGACTCTTGTTCCAATAA
TCTTTAGCCTTACTTCACATTCTTTCTGGATCTTAACTGATCCATCAGATGTCGTGTAGT
TAGGCATGTCTCCAGCCTGAAACTCCATATCATCTGGAATCAAATGCTTGGACACAAAAA
TCTGAACAGGTCCAGCTTCAGCGAAAAAACCCATCTTATTGACGAGAGTGACAACAGCTT
CCAAAATCTCGCCTTTGAAAGGTCTGAAAACAACGCACTGGTACTTAACGGGGAAGGTGA
CGAAGGCAGTCCCATCTCGGATCAATCCTTTCCCTACGCTTTCTATTCCTGTTATCGCCA
CTACAAACCCATGTCGCCCACTGCAAGTGCCCTCGACATCTTTCATGAGCTTAGAGA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2DM93JQ 676 0 0
AATATAAAAGAACAAAGTCCACTAGACTCGAATGAAGTGAAACATTATTCAGAATAAACA
TATCCATAAACTTCAACTTGTAGATGGTCTATGTTACATCTTTTATCACATGGCATCTTC
TGGACCAAAAGCGAAGTCGGCCTGAAACCTTTGCTTATGCAGTGGCTGCAGGGTCGTTTA
TGACTCCCAAAAAATCGTCTTTGATGGTACCCACACAAAAGATTTCAGTGGCATCGACTC
TTGTTCCAATAATCTTTAGCCTTACTTCACATTCTTTCTGGATCTTAACTGATCCATCAG
ATGTCGTGTAGTTAGGCATGTCTCCAGCCTGAAACTCCATATCATCTGGAATCAAATGCT
TGGACGCAAAAATCTGAACAGGTCCAGCTTCAGCGAAGAAACCCATCTTATTGACGAGAG
TGACAACAGCTTCCAAAATCTCGCCTTTGAAAGGTCTGAAAACAACGCACTGGTACTTAA
CGGGGAAGGTGACGAAGGCAGTCCCATCTCGGATCAATCCTTTCCCTACGCTTTCTATTC
TTGTTATCGCCTCTACAAACCCATGTCGCCCACTGCAAGTGCCCTCGACATCTTTCATGA
GCTTAGAGACGAGATTTTCACGAAGGTTGCGACCAAAGAATCGAGGATGTAATTGCACGT
TTCGCTCCAATACTAT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2FM69TF 400 0 0
GCTTGGACACAAAAATCTGAACAGGTCCAGCTTCAGCGAAGAAACCCATCTTATTGACCA
AAGTGACAACAGCTTCCAAAATCTCGCCTTTGAAAGGTCTGAAAACAACGCACTGGTACT
TAACGGGGAAGGTGACGAAGGCAGTCCCATCTCGGATCAATCCTTTCCCTACGCTTTCTA
TTCCTGTTATCGCCACTACAAACCCATGTCGGCCACTGCAAGTGCCCTTGACATCTTTCA
TGAGCTTAGAGACGAGATTTTCACGAAGGTTGCGACCAAAGAATCGAGGATGTAATTGCA
TGTTTCGCTCCAAAACTATGTGGAAGAACATCCTTCTTGTCTCTCTCTCTCTGCCTTTTT
CGCTCTCTCTCTCACTCCGCGCGGCGCTAGTTTAATGTCC

QA 1 400 1 400
DS 



AS 1 4

CO CL2678Contig1 758 4 9 U
GGACATATCCACACAAAAAAAAATGGCTCTCACCGTGAGCACCGGTGGGGGAGGAGCTAG
CCTCCGCTCCATAGACCTCACCGATTCTTCTCGTAATCCCTTCTCCACCTCCAGACTCCA
TTACCCGTCGAGAGCCCGTTTTCACATAGTCTCCACTGCCAAGAAAACATCCTCCCAAAC
CGGTCGGTTCGACAGCAAGAAGCGTCGAACCCTCGTCCCGACAACAACAACCAAAGAACA
GACAGAAGAAAGCAACGGTCTTTACGACGAGAACTCGCCGTCTCAGCTCGAAACCGCCTA
CGACGATGACGACGAAGATAGGTTTGCGGTGAACACTCGCTTCAGAGGCGATCCAAAAGA
CGCGCCAAAGATTTCGGTTAAGGATCTTCCCGGGCTTGAACCGGATCCATTCGAAGGTCC
TCAGTGGGATGGTTTAGGGTTCTTCGTTCAATACCTATGGGCTTTCGGGATCCTCTTCGC
GTTAATCTCCGGTGCTATTGCGGCGGGGACGTACAACGAAGGTGCGACGGACTTCAAAGA
GACGCCAGTGTATAAGGAAGCGATGGAGTCACGTGACCTTCTTGATGAAGCAGAGGGTTC
GAACTCCGAAGATGTGTTCGAGTCTAATCCGACAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGAATAGTT
TTAAGTTCTATGTGTTTTAGATGTGTTTAAAAGTATATCATGAACTTCTTGTGTTCATAA
ATGTTACAGAATCAAAAAGCTAAAGTGATTACTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GU56TF U 1
AF RR2H458TF U 5
AF RR2H458JQB C 96
AF RR2GU56JQB C 291
BS 1 154 RR2GU56TF
BS 155 155 RR2H458TF
BS 156 711 RR2GU56TF
BS 712 720 RR2H458TF
BS 721 721 RR2H458JQB
BS 722 731 RR2H458TF
BS 732 737 RR2H458JQB
BS 738 738 RR2GU56JQB
BS 739 758 RR2H458JQB

RD RR2GU56TF 711 0 0
GGACATATCCACACAAAAAAAAATGGCTCTCACCGTGAGCACCGGTGGGGGAGGAGCTAG
CCTCCGCTCCATAGACCTCACCGATTCTTCTCGTAATCCCTTCTCCACCTCCAGACTCCA
TTACCCGTCGAGAGCCCGTTTTCACATAGTCTCCGCTGCCAAGAAAACATCCTCCCAAAC
CGGTCGGTTCGACAGCAAGAAGCGTCGAACCCTCGTCCCGACAACAACAACCAAAGAACA
GACAGAAGAAAGCAACGGTCTTTACGACGAGAACTCGCCGTCTCAGCTCGAAACCGCCTA
CGACGATGACGACGAAGATAGGTTTGCGGTGAACACTCGCTTCAGAGGCGATCCAAAAGA
CGCGCCAAAGATTTCGGTTAAGGATCTTCCCGGGCTTGAACCGGATCCATTCGAAGGTCC
TCAGTGGGATGGTTTAGGGTTCTTCGTTCAATACCTATGGGCTTTCGGGATCCTCTTCGC
GTTAATCTCCGGTGCTATTGCGGCGGGGACGTACAACGAAGGTGCGACGGACTTCAAAGA
GACGCCAGTGTATAAGGAAGCGATGGAGTCACGTGACCTTCTTGATGAAGCAGAGGGTTC
GAACTCCGAAGATGTGTTCGAGTCTAATCCGACAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGAATAGTT
TTAAGTTCTATGTGTTTTAGATGTGTTTAAAAGTATATCATGAACTTCTTG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2H458TF 727 0 0
GG
ATCCACACAAAAAAAAATGGCTCTCACCGTGAGCACCGGTGGGGGAGGAGCTAGCCTCCG
CTCCATAGACCTCACCGATTCTTCTCGTAATCCCTTCTCCACCTCCAGACTCCATTACCC
GTCGAGAGCCCGTTTTCACATAGTCTCCACTGCCAAGAAAACATCCTCCCAAACCGGTCG
GTTCGACAGCAAGAAGCGTCGAACCCTCGTCCCGACAACAACAACCAAAGAACAGACAGA
AGAAAGCAACGGTCTTTACGACGAGAACTCGCCGTCTCAGCTCGAAACCGCCTACGACGA
TGACGACGAAGATAGGTTTGCGGTGAACACTCGCTTCAGAGGCGATCCAAAAGACGCGCC
AAAGATTTCGGTTAAGGATCTTCCCGGGCTTGAACCGGATCCATTCGAAGGTCCTCAGTG
GGATGGTTTAGGGTTCTTCGTTCAATACCTATGGGCTTTCGGGATCCTCTTCGCGTTAAT
CTCCGGTGCTATTGCGGCGGGGACGTACAACGAAGGTGCGACGGACTTCAAAGAGACGCC
AGTGTATAAGGAAGCGATGGAGTCACGTGACCTTCTTGATGAAGCAGAGGGTTCGAACTC
CGAAGATGTGTTCGAGTCTAATCCGACAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGAATAGTTTTAAGT
TCTATGTGTTTTAGATGTGTTTAAA*GTATATCATGAACTTCTTGTGTTCATAA*TGTTA
CAGAA

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR2H458JQB 663 0 0
ATCCCTTCTCCACCTCCAGACTCCATTACCCGTCGAGAGCCCGTTTTCACATAGTCTCCA
CTGCCAAGAAAACATCCTCCCAAACCGGTCGGTTCGACAGCAAGAAGCGTCGAACCCTCG
TCCCGACAACAACAACCAAAGAACAGACAGAAGAAAGCAACGGTCTTTACGACGAGAACT
CGCCGTCTCAGCTCGAAACCGCCTACGACGATGACGACGAAGATAGGTTTGCGGTGAACA
CTCGCTTCAGAGGCGATCCAAAAGACGCGCCAAAGATTTCGGTTAAGGATCTTCCCGGGC
TTGAACCGGATCCATTCGAAGGTCCTCAGTGGGATGGTTTAGGGTTCTTCGTTCAATACC
TATGGGCTTTCGGGATCCTCTTCGCGTTAATCTCCGGTGCTATTGCGGCGGGGACGTACA
ACGAAGGTGCGACGGACTTCAAAGAGACGCCAGTGTATAAGGAAGCGATGGAGTCACGTG
ACCTTCTTGATGAAGCAGAGGGTTCGAACTCCGAAGATGTGTTCGAGTCTAATCCGACAG
AAGTGGCGCCTAGTTTGGAATAGTTTTAAGTTCTATGTGTTTTAGATGTGTTTAAAAGTA
TATCATGAACTTCTTGTGTTCATAAATGTTACAGAATCAAAATGCTAAAGTGATTACTAA
ACC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2GU56JQB 468 0 0
AAACCGCCTACGACGATGACGACGAAGATAGGTTTGCGGTGAACACTCGCTTCAGAGGCG
ATCCAAAAGACGCGCCAAAGATTTCGGTTAAGGATCTTCCCGGGCTTGAACCGGATCCAT
TCGAAGGTCCTCAGTGGGATGGTTTAGGGTTCTTCGTTCAATACCTATGGGCTTTCGGGA
TCCTCTTCGCGTTAATCTCCGGTGCTATTGCGGCGGGGACGTACAACGAAGGTGCGACGG
ACTTCAAAGAGACGCCAGTGTATAAGGAAGCGATGGAGTCACGTGACCTTCTTGATGAAG
CAGAGGGTTCGAACTCCGAAGATGTGTTCGAGTCTAATCCGACAGAAGTGGCGCCTAGTT
TGGAATAGTTTTAAGTTCTATGTGTTTTAGATGTGTTTAAAAGTATATCATGAACTTCTT
GTGTTCATAAATGTTACAGAATCAAAAAGCTAAAGTGATTACTAAACC

QA 1 468 1 468
DS 



AS 1 4

CO CL2679Contig1 687 4 7 U
GGACTCACAATCAAACCCCAAAATACACACAAACCCCTCCTCTCTCTCTCTCT****AGC
AACAACAACTCAAACAAATCCCAAAAATGGCTTCTTGGTTATCATTTCTTGTCATTGCAG
TGACATTCACAAGCTTGTTCACCGGTCTATCTGCTCGTCGCCATCTTCTCCAATCAACAC
CAGCGACTCAGCCACCGGTTACAACAACATTCCCACCTCTTCCCAAACCCACAATGCCAC
CACCAATGCCTTCTTCGCTCCCTCAACCAACTCTTCCTCAACCAACAGCGCTTCCACCAT
TACAGAGCACACAGATACCTTCATTGCCTAACCCAACACAGCCCATTAATATCCCAAACT
TTCCACAAATCAATATTCCTAATTTCCCATTTAACATTCCAAACAACTTCCCCTTTAATA
TTCCCACCAGCATTCCTACCATCCCTTTCTTCACTCCACCACCTTCCAAATGAGAAAGCT
ACGCTCTTCAGCTGCTGTCACACAACACTTTACGGTCTTTTTCTCAGACACTTTGTTTGC
ACATGTTTGTAATGTTTCTTATTCTTTTGCTGTTGCTTGATGAATGTGCTCCTTGTTGTT
GGTGTTGTGTGTTTCTGGCGTGATTTAGTTGCTTTTGTAATATCTATACGGCTTATTATT
GTTCTAATGAATTCTTGCTTTCTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2E228TF U 1
AF RR2FM28TF U 2
AF RR2GW32TF U 7
AF RR2E228JQ C 274
BS 1 53 RR2E228TF
BS 54 57 RR2FM28TF
BS 58 101 RR2E228TF
BS 102 102 RR2FM28TF
BS 103 646 RR2E228TF
BS 647 683 RR2GW32TF
BS 684 687 RR2E228JQ

RD RR2E228TF 646 0 0
GGACTCACAATCAAACCCCAAAATACACACAAACCCCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGC
AACAACAACTCAAACAAATCCCAAAAATGGCTTCTTGGTTACCATTTCTTGTCATTGCAG
TGACATTCACAAGCTTGTTCACCGGTCTATCTGCTCGTCGCCATCTTCTCCAATCAACAC
CAGCGACTCAGCCACCGGTTACAACAACATTCCCACCTCTTCCCAAACCCACAATGCCAC
CACCAATGCCTTCTTCGCTCCCTCAACCAACTCTTCCTCAACCAACAGCGCTTCCACCAT
TACAGAGCACACAGATACCTTCATTGCCTAACCCAACACAGCCCATTAATATCCCAAACT
TTCCACAAATCAATATTCCTAATTTCCCATTTAACATTCCAAACAACTTCCCCTTTAATA
TTCCCACCAGCATTCCTACCATCCCTTTCTTCACTCCACCACCTTCCAAATGAGAAAGCT
ACGCTCTTCAGCTGCTGTCACACAACACTTTACGGTCTTTTTCTCAGACACTTTGTTTGC
ACATGTTTGTAATGTTTCTTATTCTTTTGCTGTTGCTTGATGAATGTGCTCCTTGTTGTT
GGTGTTGTGTGTTTCTGGCGTGATTTAGTTGCTTTTGTAATATCTA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2FM28TF 650 0 0
GACTCAC
AATCAAACCCCAAAATACACACAAACCCCTCCTCTCTCTCTCTCT****AGCAACAACAA
CTCAAACAAATCCCAAAAATGGCTTCTTGGTTATCATTTCTTGTCATTGCAGTGACATCC
ACAAGCTTGTTCACCGGTCTATCTGCTCGTCGCCATCTTCTCCAATCAACACCAGCGACT
CAGCCACCGGTTACAACAACATTCCCACCTCTTCCCAAACCCACAATGCCACCACCAATG
CCTTCTTCGCTCCCTCAACCAACTCTTCCTCAACCAACAGCGCTTCCACCATTACAGAGC
ACACAGATACCTTCATTGCCTAACCCAACACAGCCCATTAATATCCCAAACTTTCCACAA
ATCAATATTCCTAATTTCCCATTTAACATTCCAAACAACTTCCCCTTTAATATTCCCACC
AGCATTCCTACCATCCCTTTCTTCACTCCACCACCTTCCAAATGAGAAAGCTACGCTCTT
CAGCTGCTGTCACGCAACACTTTACGGTCTTTTTCTCAGACACTTTGTTTGCACATGTTT
GTAATGTTTCTTATTCTTTTGCTGTTGCTTGATGAATGTACTCCTTGTTGTTGGTGTTGT
GTGTTTCTGGCGTGATTTAGTTGCTTTTGTAATATCTA
TACAG

QA 8 645 8 645
DS 

RD RR2GW32TF 677 0 0
GG
AATCAAACCCCAAAATACACACAAACCCCTCCTCTCTCTCTCTCT****AGCAACAACAA
CTCAAACAAATCCCAAAAATGGCTTCTTGGTTATCATTTCTTGTCATTGCAGTGACATTC
ACAAGCTTGTTCACCGGTCTATCTGCTCGTCGCCATCTTCTCCAATCAACACCAGCGACT
CAGCCACCGGTTACAACAACATTCCCACCTCTTCCCAAACCCACAATGCCACCACCAATG
CCTTCTTCGCTCCCTCAACCAACTCTTCCTCAACCAACAGCGCTTCCACCATTACAGAGC
ACACAGATACCTTCATTGCCTAACCCAACACAGCCCATTAATATCCCAAACCTTCCACAA
ATCAATATTCCTAATTTCCCATTTAACATTCCAAATAACTTCCCCTTTAATATTCCCACC
AGCATTCCTACCATCCCTTTCTTCACTCCACCACCTTCCAAATGAGAAAGCTACGCTCTT
CAGCTGCTGTCACACAACACTTTACGGTCTTTTTCTCAGACACTTTGTTTGCACATGTTT
GTAATGTTTCTTATTCTTTTGCTGTTGCTTGATGAATGTACTCCTTGTTGTTGGTGTTGT
GTGTTTCTGGCGTGATTTAGTTGCTTTTGTAATATCTATACGGCTTATTATTGTTCTAAT
GAATTCTTGCTTTCT

QA 3 677 3 677
DS 

RD RR2E228JQ 414 0 0
TTCCTCAACCAACAGCGCTTCCACCATTACAGAGCACACAGATACCTTCATTGCCTAACC
CAACACAGCCCATTAATATCCCAAACTTTCCACAAATCAATATTCCTAATTTCCCATTTA
ACATTCCAAACAACTTCCCCTTTAATATTCCCACCAGCATTCCTACCATCCCTTTCTTCA
CTCCACCACCTTCCAAATGAGAAAGCTACGCTCTTCAGCTGCTGTCACACAACACTTTAC
GGTCTTTTTTTCAGACACTTTGTTTGCACATGTTTGTAATGTTTCTTATTCTTTTGCTGT
TGCTTGATGAATGTGCTCCTTGTTGTTGGTGTTGTGTGTTTCTGGCGTGATTTAGTTGCT
TTTGTAATATCTATACGGCTTGTTATTGTTCTAATGAATTCTTGCTTTCTTCTT

QA 1 414 1 414
DS 



AS 1 4

CO CL2680Contig1 793 4 14 U
AGTTAGCAACTGATTTTTCATAATCTCTTTAGAAGTTCGTCTAATATATTCGGAAATACA
CCATTGTCAAATAGGCCAAAAGAACTTTAAACGAATCTCATTCTCATGGGGGAGAAAGGA
ATATAAAAGCAGAGATGAAAATCTAAACAGAGGCTACTGGTAAAATCAGAGGCAGAGCAA
AACAACTGCTGCTAATCCAACAAATCCCAAAACTCCAATTCGTCTGGTCAAAGAATTAGC
AGAACCAGTTGCAGGGGGAAGAGCTGGAGCTCCCAAAAGAGCATGAGAAGAAGGTGCGGG
AGAAGGAGCTGAACCCCCGGTGAAGAAACCACCGGTGTGGCCACCACCACGAGAGGAGGA
CATGACAACAATGTGAAGCTTCTCGCCTTCCACACAGTTGCTCTTGGTGCCGCTGATGAA
GAAGAAAGAACCAGATCTATCTAGCTTCACCTTGGTGTCTCCATTGCTGTAATTGGCTGC
TGGATTTGTGGTGTTGCAATTAATGTAGGCTTCTTTAGACACTTGCAGAACCGAGTCTTT
TTCCCCATCGTACTTCCACACAAGAGAATCGCCGACGTGAAACCGCAAACTCTCAGCCCA
TTTGTTGAGGGAATCAGAAGGTGAAGAAGGGATTTTCCAGGCGCTGGGTTTGCCCCCGAC
CAGAATCTCTTTGCAACATGCCAGATCAGCCAACAAGAAGAAGAAGAAGAATAACAGACA
GGAAGTGTGAACTAGAGTTGTCCGAGCCATGAGAGTTAAGTTGTGTAGAAAAGATGAGAC
TTGTGTGGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 0 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO26JQ U 1
AF RR2CO26TF C 14
AF RR2B962TF C 75
AF RR2B962JQ U 79
BS 1 312 RR2CO26JQ
BS 313 313 RR2B962JQ
BS 314 428 RR2CO26JQ
BS 429 429 RR2B962JQ
BS 430 483 RR2CO26JQ
BS 484 484 RR2B962JQ
BS 485 543 RR2CO26JQ
BS 544 544 RR2B962JQ
BS 545 561 RR2CO26JQ
BS 562 562 RR2B962JQ
BS 563 703 RR2CO26JQ
BS 704 709 RR2B962JQ
BS 710 711 RR2CO26JQ
BS 712 793 RR2B962JQ

RD RR2CO26JQ 715 0 0
AGTTAGCAACTGATTTTTCATAATCTCTTTAGAAGTTCGTCTAATATATTCGGAAATACA
CCATTGTCAAATAGGCCAAAAGAACTTTAAACGAATCTCATTCTCATGGGGGAGAAAGGA
ATATAAAAGCAGAGATGAAAATCTAAACAGAGGCTACTGGTAAAATCAGAGGCAGAGCAA
AACAACTGCTGCTAATCCAACAAATCCCAAAACTCCAATTCGTCTGGTCAAAGAATTAGC
AGAACCAGTTGCAGGGGGAAGAGCTGGAGCTCCCAAAAGAGCATGAGAAGAAGGTGCGGG
AGAAGGAGCTGACCCCCCGGTGAAGAAACCACCGGTGTGGCCACCACCACGAGAGGAGGA
CATGACAACAATGTGAAGCTTCTCGCCTTCCACACAGTTGCTCTTGGTGCCGCTGATGAA
GAAGAAAGGACCAGATCTATCTAGCTTCACCTTGGTGTCTCCATTGCTGTAATTGGCTGC
TGGGTTTGTGGTGTTGCAATTAATGTAGGCTTCTTTAGACACTTGCAGAACCGAGTCTTT
TTCTCCATCGTACTTCCACACGAGAGAATCGCCGACGTGAAACCGCAAACTCTCAGCCCA
TTTGTTGAGGGAATCAGAAGGTGAAGAAGGGATTTTCCAGGCGCTGGGTTTGCCCCCGAC
CAGAATCTCTTTGCAACATGCCAGATCAGCCAACAAGAAGAAG******AA
TAAC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2CO26TF 774 0 0
A
TTTTCATAATCTCTT*AGAAGT*CGTCTAATATAT*CGGAAATACACCATTGTCAAATAG
GCCAAAAGAACTTTAAACGAATCTCATTCTCATGGGG*AGAAAGGAATATAAAAGCAGAG
ATGAAAATCTAAACAGAGGCTACTGGTAAAATCAGAGGCAGAGCAAAACAACTGCTGCTA
ATCCAACAAATCCCAAAACTCCAATTCGTCTGGTCAAAGAATTAGCAGAACCAGTTGCAG
GGGGAAGAGCTGGAGCTCCCAAAAGAGCATGAGAAGAAGGTGCGGGAGAAGGAGCTGACC
CCCCGGTGAAGAAACCACCGGTGTGGCCACCACCACGAGAGGAGGACATGACAACAATGT
GAAGCTTCTCGCCTTCCACACAGTTGCTCTTGGTGCCGCTGATGAAGAAGAAAGGACCAG
ATCTATCTAGCTTCACCTTGGTGTCTCCATTGCTGTAATTGGCTGCTGGGTTTGTGGTGT
TGCAATTAATGTAGGCTTCTTTAGACACTTGCAGAACCGAGTCTTTTTCTCCATCGTACT
TCCACACGAGAGAATCGCCGACGTGAAACCGCAAACTCTCAGCCCATTTGTTGAGGGAAT
CAGAAGGTGAAGAAGGGATTTTCCAGGCGCTGGGTTTGCCCCCGACCAGAATCTCTTTGC
AACATGCCAGATCAGCCAACAAGAAGAAG******AATAACAGACAGGAAGTGTGAACTA
GAGTTGTCCGAGCCATGAGAGTTAAGTTGTGTAGAAGAGATGAGACTTGTGTG

QA 2 774 2 774
DS 

RD RR2B962TF 719 0 0
GCCA
AAAGAACTTTAAACGAATCTCATTCTCATGGGGGAGAAAGGAATATAAAAGCAGAGATGA
AAATCTAAACAGAGGCTACTGGTAAAATCAGAGGCAGAGCAAAACAACTGCTGCTAATCC
AACAAATCCCAAAACTCCAATTCGTCTGGTCAAAGAATTAGCAGAACCAGTTGCAGGGGG
AAGAGCTGGAGCTCCCAAAAGAGCATGAGAAGAAGGTGCGGGAGAAGGAGCTGAACC***
GGTGAAGAAACCACCGGTGTGGCCACCACCACGAGAGGAGGACATGACGACAATGTGAAG
CTTCTCGCCTTCCACACAGTTGCTCTTGGTGCCGCTGATGAAGAAGAAAGAACCAGATCT
ATCTAGCTTCACCTTGGTGTCTCCATTGCTGTAATTGGCTGCTGGATTTGTGGTGTTGCA
ATTAATGTAGGCTTCTTTAGTCACTTGCAGAACCGAGTCTTTTTCCCCGTCGTACTTCCA
CACAAGAGAATCGCCGACGTGAAACCGCAAACTCTCAGCCCATTTGTTGAGGGAATCAGA
AGGTGAAGAAGGGATTTTCCAGGCGCTGGGTTTGCCCCCGACCAGAATCTCTTTGCAACA
TGCGAGATCAGCCAACAAGAAGAAGAAGAAGAATAACAGACAGGAAGTGTGAACTAGAGT
TGTCCGAGCCATGAGAGTTAAGTTGTGTAGAAAAGATGAGACTTGTGTG
GCTTCC

QA 5 713 5 713
DS 

RD RR2B962JQ 715 0 0
AAAGAACTTTAAACGAATCTCATTCTCATGGGGGAGAAAGGAATATAAAAGCAGAGATGA
AAATCTAAACAGAGGCTACTGGTAAAATCAGAGGCAGAGCAAAACAACTGCTGCTAATCC
AACAAATCCCAAAACTCCAATTCGTCTGGTCAAAGAATTAGCAGAACCAGTTGCAGGGGG
AAGAGCTGGAGCTCCCAAAAGAGCATGAGAAGAAGGTGCGGGAGAAGGAGCTGAACC***
GGTGAAGAAACCACCGGTGTGGCCACCACCACGAGAGGAGGACATGACGACAATGTGAAG
CTTCTCGCCTTCCACACAGTTGCTCTTGGTGCCGCTGATGAAGAAGAAAGAACCAGATCT
ATCTAGCTTCACCTTGGTGTCTCCATTGCTGTAATTGGCTGCTGGATTTGTGGTGTTGCA
ATTAATGTAGGCTTCTTTAGTCACTTGCAGAACCGAGTCTTTTTCCCCGTCGTACTTCCA
CACAAGAGAATCGCCGACGTGAAACCGCAAACTCTCAGCCCATTTGTTGAGGGAATCAGA
AGGTGAAGAAGGGATTTTCCAGGCGCTGGGTTTGCCCCCGACCAGAATCTCTTTGCAACA
TGCGAGATCAGCCAACAAGAAGAAGAAGAAGAATAACAGACAGGAAGTGTGAACTAGAGT
TGTCCGAGCCATGAGAGTTAAGTTGTGTAGAAAAGATGAGACTTGTGTGGCTTCC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 4

CO CL2681Contig1 970 4 4 U
GGTTCGCAGCCAGAAACGTTCATTTCCGTTAGCGCCGAGAGAAAATCACGATGCCGGCGA
AACAGAGGACGCCTAAGGTCAGCCGAAACCCTGATCTGATCAGGGGAGTAGGTAAATACT
CAAGGTCTCAGATGTACCATAAGAGAGGCCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCG
TTTTCCCCCGCCACGACGCTAAATCCAAACTTGATACTCCGGCGGAGAAGCCCCCGAAGT
TCTATCCTGCTGAAGACGTGAAGAAACCTCTCGCCAACAGACGCAAACCAAAGCCTACCA
AGCTCAGATCCAGCATTACGCCAGGGACAGTGCTGATCATTCTTGCTGGTAGGTTCAAGG
GCAAGAGAGTTGTCTTCTTAAAGCAGCTTACTTCCGGTTTACTTCTAGTGTCCGGACCAT
TCAAGATCAATGGTGTTCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGCACTTCCA
CAAAGGTTGACATTTCCGGAGTCAGCGTCGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAAG
TTGCTGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAGGCTGAGAAAGAGGAGA
AGAAGGAGATTCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAGGCCGTTGATGCAGCTTTGATCA
AAGCTATTGAAGCGGTTCCAGAGTTGAAGACTTACTTGGGCGCAAGGTTCTCATTGAAAC
AGGGGATGAAGCCCCATGAGCTTGTTTTCTAAATTTCCATAACTGAGGTTTCTAGAGTGT
CTATCACCTTTAGTTTAATACCCTATGAACGGTTGGTCTTGTTCACCGGTCAAATACAAT
TTTTGGCCTCGATCTTGTTTTTGAACGTTAGTTTTGTAGCAATGGACTATCTTTTTTTCT
TTGCAAGACCTTCGAATTTTCACAACAGTTCACATGGTGATTGTAGAAGGAATAAGACAC
TACGATTAAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS09TF U 4
AF RR2B747TF U 1
AF RR2FS09JQ C 253
AF RR2B747JQ C 183
BS 1 761 RR2B747TF
BS 762 800 RR2B747JQ
BS 801 801 RR2FS09JQ
BS 802 970 RR2B747JQ

RD RR2FS09TF 699 0 0
GG
GCAGCCGGAAACGTTCATTTCCGTTAGCGCCGAGAGAAAATCACGATGCCGGCGAAACAG
AGGACGCCTAAGGTCAGCCGAAACCCTGATCTGATCAGGGGAGTAGGTAAATACTCAAGG
TCTCAGATGTACCATAAGAGAGGCCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTC
CCCCGCCACGACGCTAAATCCAAACTTGATACTCCGGCGGAGAAGCCCCCGAAGTTCTAT
CCTGCTGAAGACGTGAAGAAACCTCTCGCCAACAGACGCAAACCAAAGCCTACCAAGCTC
AGATCCAGCATTACGCCAGGGACAGTGCTGATCATTCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAG
AGAGTTGTCTTCTTAAAGCAGCTTACTTCCGGTTTACTTCTAGTGTCCGGACCATTCAAG
ATCAATGGTGTTCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGCACTTCCACAAAG
GTTGACATTTCCGGAGTCAGCGTCGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAAGTTGCT
GAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAGGCTGAGAAAGAGGAGAAGAAG
GAGATTCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAACGCCGTTGATGCAGCTTTGATCAAAGCT
ATTGAAGCGGTTCCAGAGTTGAAGACTTACTTGGGCG

QA 3 699 3 699
DS 

RD RR2B747TF 761 0 0
GGTTCGCAGCCAGAAACGTTCATTTCCGTTAGCGCCGAGAGAAAATCACGATGCCGGCGA
AACAGAGGACGCCTAAGGTCAGCCGAAACCCTGATCTGATCAGGGGAGTAGGTAAATACT
CAAGGTCTCAGATGTACCATAAGAGAGGCCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCG
TTTTCCCCCGCCACGACGCTAAATCCAAACTTGATACTCCGGCGGAGAAGCCCCCGAAGT
TCTATCCTGCTGAAGACGTGAAGAAACCTCTCGCCAACAGACGCAAACCAAAGCCTACCA
AGCTCAGATCCAGCATTACGCCAGGGACAGTGCTGATCATTCTTGCTGGTAGGTTCAAGG
GCAAGAGAGTTGTCTTCTTAAAGCAGCTTACTTCCGGTTTACTTCTAGTGTCCGGACCAT
TCAAGATCAATGGTGTTCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGCACTTCCA
CAAAGGTTGACATTTCCGGAGTCAGCGTCGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAAG
TTGCTGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAGGCTGAGAAAGAGGAGA
AGAAGGAGATTCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAGGCCGTTGATGCAGCTTTGATCA
AAGCTATTGAAGCGGTTCCAGAGTTGAAGACTTACTTGGGCGCAAGGTTCTCATTGAAAC
AGGGGATGAAGCCCCATGAGCTTGTTTTCTAAATTTCCATA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2FS09JQ 648 0 0
AAGACGTGAAGAAACCTCTCGCCAACAGACGCAAACCAAAGCCTACCAAGCTCAGATCCA
GCATTACGCCAGGGACAGTGCTGATCATTCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTG
TCTTCTTAAAGCAGCTTACTTCCGGTTTACTTCTAGTGTCCGGACCATTCAAGATCAATG
GTGTTCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGCACTTCCACAAAGGTTGACA
TTTCCGGAGTCAGCGTCGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAAGTTGCTGAGAAGA
AGAACAAGAAGGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAGGCTGAGAAAGAGGAGAAGAAGGAGATTC
CACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAGGCCGTTGATGCAGCTTTGATCAAAGCTATTGAAG
CGGTTCCAGAGTTGAAGACTTACTTGGGCGCAAGGTTCTCATTGAAACAGGGGATGAAGC
CCCATGAGCTTGTTTTCTAAATTTCCATAACTGAGGTTTCTAGAGTGTCTATCACCTTTA
GTTTAATACCCTATGAACGGTTGGTCTTGTTCACCGGTCAAATACAATTTTTGGCGTCGA
TCTTGTTTTTGAACGTTAGTTTTGTAGCAATGGACTATCTTTTTTTC
C

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2B747JQ 788 0 0
TTCCCCCGCCACGACGCTAAATCCAAACTTGATACTCCGGCGGAGAAGCCCCCGAAGTTC
TATCCTGCTGAAGACGTGAAGAAACCTCTCGCCAACAGACGCAAACCAAAGCCTACCAAG
CTCAGATCCAGCATTACGCCAGGGACAGTGCTGATCATTCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGC
AAGAGAGTTGTCTTCTTAAAGCAGCTTACTTCCGGTTTACTTCTAGTGTCCGGACCATTC
AAGATCAATGGTGTTCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGCACTTCCACA
AAGGTTGACATTTCCGGAGTCAGCGTCGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAAGTT
GCTGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAGGAGAGTTCTTTGAGGCTGAGAAAGAGGAGAAG
AAGGAGATTCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAGGCCGTTGATGCAGCTTTGATCAAA
GCTATTGAAGCGGTTCCAGAGTTGAAGACTTACTTGGGCGCAAGGTTCTCATTGAAACAG
GGGATGAAGCCCCATGAGCTTGTTTTCTAAATTTCCATAACTGAGGTTTCTAGAGTGTCT
ATCACCTTTAGTTTAATATCCTATGAACGGTTGGTCTTGTTCACCGGTCAAATACAATTT
TTGGCCTCGATCTTGTTTTTGAACGTTAGTTTTGTAGCAATGGACTATCTTTTTTTCTTT
GCAAGACCTTCGAATTTTCACAACAGTTCACATGGTGATTGTAGAAGGAATAAGACACTA
CGATTAAC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 4

CO CL2682Contig1 1148 4 6 U
GAAAAGGGGAAATAAACAGCCAATAAAAAAAACAATCTGAAGAATCAGAACTCCATAAGA
TTTGATCTCCGGTGACCCTACGTTCGATATCCCGATCACCGTTGAAAAATGGATTCCTGA
GTTTCTTTGTTCTGAGTAAACTCACACGGAGAAGAAGAAAGCTTAAAATGGATTCGGAAG
ATGCGAAGAAGCAAAAGAGGGTTTTCTCTTTGTTAGCTTTACGATTCTGTACAGTGATAG
GAATCTCGATCATCGTCTTCGTCGTCTTGTCGTTTCTGTTAGGAGTGTTGGTGATTATAC
TCGGTGAATTGTGGGTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCGCCTCTCTTGCTTCCCGCT
GCAAGATTCTTTTCAGCTCTGTTGATCTTAGGTCTTCTAAAGTGTGCGGCATTGGACTTT
TGAACAGTAAAGCACAACATGTGTTTCACCCTTTTGAGAGAGATAAATTCAGATGTCGCT
ATGATTACTATTGGGCTTCTGTCTTCAAGGTAGAATATAAAGATCACTTAATGGGTCAAA
CGAGGCTAGCCTTCTCAGAAGCACCAAATGAAGCCCTTCCTCCTGAGTGCAGACCTAACT
TTGGTGCTGCTTTGCTTACCAAAGATAACTTCAAGGTGAATGAGACTTACGATTGCTGGT
ACACATTAGGGATTCCAAAAATCAAGCTTTATCAGGACGGCTTTTTCGGTTGCCAAGCCA
ATGATCTTTCTTTCACCGACATTTTTAAACAATACGCTGTCTTAGTCTCCAAGTTATTAC
AGTCCTGGTTCAATGGAAAAAAAAGACCAAAGTACTGGAGATATGATGTGATCGCTGGCG
TTGTATCTGGCTTCTCAACTTCCATAATCACAGTCTTCATCGTCCGGATCTTAAGTAATG
CAAAATCTTGGTTCCCTCGAGCTTGTTGTTCGGTTAAGAGCCAGCTGTCTGAAGTGAATC
TCCTGGTACAAATGAAGCGTGCGTGTTTGGTCATTGTTTACTTCTACATTCTCGGATGGA
TGGTTACACAGTACTTGAAAATTCTGTTTCCACAGGCCTAGAAGAAACACATGTATAAAG
AGTTGTGTGATGTAATCTTTAAACCATTTACAGCAAAAATAAGCAATGCAGAGAACAGTT
TTAGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2GS96TF U 13
AF RR2GD16TF U 1
AF RR2GD16JQ C 363
AF RR2GS96JQB C 570
BS 1 333 RR2GD16TF
BS 334 336 RR2GS96TF
BS 337 666 RR2GD16TF
BS 667 1057 RR2GD16JQ
BS 1058 1058 RR2GS96JQB
BS 1059 1148 RR2GD16JQ

RD RR2GS96TF 619 0 0
GG
AACAGCCAATAAAAAAAACAATCTGAAGAATCAGAACTCCATAAGATTTGATCTCCGGTG
ACCCTACGTTCGATATCCCGATCACCGTTGAAAAATGGATTCCTGAGTTTCTTTGTTCTG
AGTAAACTCACACGGAGAAGAAGAAAGCTTAAAATGGATTCGGAAGATGCGAAGAAGCAA
AAGAGGGTTTTCTCTTTGTTAGCTTTACGATTCTGTACAGTGATAGGAATCTCGATCATC
GTCTTCGTCGTCTTGTCGTTTCTGTTAGGAGTGTTGGTGATTATACTCGGTGAATTGTGG
GTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCGCCTCTCTTGCTTCCCGCTGCAAGATTCTTTCC
AGCTCTGTTGATCTTAGGTCTTCTAAAGTGTGCGGCATTGGACTTTTGAACAGTAAAGCA
CAACATGTGTTTCACCCTTTTGAGAGAGATAAATTCAGATGTCGCTATGATTACTATTGG
GCTTCTGTCTTCAAGGTAGAATATAAAGATCACTTAATGGGTCAAACGAGGCTAGCCTTC
TCAGAAGCACCAAATGAAGCCCTTCCTCCTGAGTGCAGACCTAACTTTGGTGCTGCTTTG
CTTACCAAAGATAACTT

QA 3 619 3 619
DS 

RD RR2GD16TF 666 0 0
GAAAAGGGGAAATAAACAGCCAATAAAAAAAACAATCTGAAGAATCAGAACTCCATAAGA
TTTGATCTCCGGTGACCCTACGTTCGATATCCCGATCACCGTTGAAAAATGGATTCCTGA
GTTTCTTTGTTCTGAGTAAACTCACACGGAGAAGAAGAAAGCTTAAAATGGATTCGGAAG
ATGCGAAGAAGCAAAAGAGGGTTTTCTCTTTGTTAGCTTTACGATTCTGTACAGTGATAG
GAATCTCGATCATCGTCTTCGTCGTCTTGTCGTTTCTGTTAGGAGTGTTGGTGATTATAC
TCGGTGAATTGTGGGTTTCTTCTTCTTCTTCTT***CCTCCGCCTCTCTTGCTTCCCGCT
GCAAGATTCTTTTCAGCTCTGTTGATCTTAGGTCTTCTAAAGTGTGCGGCATTGGACTTT
TGAACAGTAAAGCACAACATGTGTTTCACCCTTTTGAGAGAGATAAATTCAGATGTCGCT
ATGATTACTATTGGGCTTCTGTCTTCAAGGTAGAATATAAAGATCACTTAATGGGTCAAA
CGAGGCTAGCCTTCTCAGAAGCACCAAATGAAGCCCTTCCTCCTGAGTGCAGACCTAACT
TTGGTGCTGCTTTGCTTACCAAAGATAACTTCAAGGTGAATGAGACTTACGATTGCTGGT
ACACAT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2GD16JQ 786 0 0
AAGATTCTTTTCAGCTCTGT*GATCTTAGGTCTTCTAAAGTGTGCGGCATTGGACTTT*G
AACAGTAAAGCACAACATGTGTTTCACC*TTTTGAGAGAGATAAATTCAGATGTCGCTAT
GATTACTATTGGGCTTCTGTCTTCAAGGTAGAATATAAAGATCACTTAATGGGTCAAACG
AGGCTAGCCTTCTCAGAAGCACCAAATGAAGCCCTTCCTCCTGAGTGCAGACCTAACTTT
GGTGCTGCTTTGCTTACCAAAGATAACTTCAAGGTGAATGAGACTTACGATTGCTGGTAC
ACATTAGGGATTCCAAAAATCAAGCTTTATCAGGACGGCTTTTTCGGTTGCCAAGCCAAT
GATCTTTCTTTCACCGACATTTTTAAACAATACGCTGTCTTAGTCTCCAAGTTATTACAG
TCCTGGTTCAATGGAAAAAAAAGACCAAAGTACTGGAGATATGATGTGATCGCTGGCGTT
GTATCTGGCTTCTCAACTTCCATAATCACAGTCTTCATCGTCCGGATCTTAAGTAATGCA
AAATCTTGGTTCCCTCGAGCTTGTTGTTCGGTTAAGAGCCAGCTGTCTGAAGTGAATCTC
CTGGTACAAATGAAGCGTGCGTGTTTGGTCATTGTTTACTTCTACATTCTCGGATGGATG
GTTACACAGTACTTGAAAATTCTGTTTCCACAGGCTTAGAAGAAACACATGTATAAAGAG
TTGTGTGATGTAATCTTTAAACCATTTACAGCAAAAATAAGCAATGCAGAGAACAGTTTT
AGAATC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2GS96JQB 575 0 0
GAAGCCCTTCCTCCTGAGTGCAGACCTAACTTTGGTGCTGCTTTGCTTACCAAAGATAAC
TTCAAGGTGAATGAGACTTACGATTGCTGGTACACATTAGGGATTCCAAAAATCAAGCTT
TATCAGGACGGCTTTTTCGGTTGCCAAGCCAATGATCTTTCTTTCACCGACATTTTTAAA
CAATACGCTGTCTTAGTCTCCAAGTTATTACAGTCCTGGTTCAATGGAAAAAAAAGACCA
AAGTACTGGAGATATGATGTGATCGCTGGCGTTGTATCTGGCTTCTCAACTTCCATAATC
ACAGTCTTCATCGTCCGGATCTTAAGTAATGCAAAATCTTGGTTCCCTCGAGCTTGTTGT
TCGGTTAAGAGCCAGCTGTCTGAAGTGAATCTCCTGGTACAAATGAAGCGTGCGTGTTTG
GTCATTGTTTACTTCTACATTCTCGGATGGATGGTTACACAGTACTTGAAAATTCTGTTT
CCACAGGCCTAGAAGAAACACATGTATAAAGAGTTGTGTGATGTAATCTTTAAACCATTT
ACAGCAAAAATAAGCAATGCAGAGAACAGTTTTAG

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 4

CO CL2683Contig1 708 4 5 U
GCGAAATAATATTTTTTGTCTCATGAAAATGTTAAATTTACATAATATGTTTCCAATAGA
ATGAAAAATTAATGATGTTTATGTTTCACATTCAAACCAAGTAACTCGCCGGCTTCTTAC
GTCATCACTTCTCAGCCAACGACCGCCAGCAAACTCTGTCGGACGGCAGGGATAGAACAC
AGTAACGATCCGAAGATTCCAGTGAGTGCATAAGCAATTGCACAGAAGGGAAGAGCCTCT
GGCTCCTTAGCCGACAAAGCTGCTGTTCCAAGTCCATGAGCACTTGAAGCAGTTGCGATT
CCTCGAGCAATAGGATCATTTAAACGCAGTTTATCAAGAACGACTTGTACAAAGTTAGCT
CCAATCAGACCAGTCACAACCACTACAGCTGCTGTAAGCGACGAATTGGTCCCTTCAAAG
AGTGATACAATGCTAAGGGCTAACGCAACCGTGATACAGCGAGGTAGGATTGAAACAGTT
AAAGATGGCTCTAAACCGACCAAACGTCCAACAAGAGCAGTGGAGTAGAGCGAGAATACC
GTTGAAACAATCACAGACGTAAAGATCTCAGCTGCATGCCGCTTCACAAGCTTTCTCTGT
TTGAACATGGAGAAAGCGAAAGAGAGAATGACAGAACCAAGAAAACCCATTAAGATGTCA
CCAGCACCAGGATCCGATGCTACTTTAGTAAGGTAGTTTCCTAGAACA


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL23TF C 12
AF RR2AN16JQ U 1
AF RR2EX63JQ U 1
AF RR2GI41JQB U 1
BS 1 261 RR2AN16JQ
BS 262 262 RR2EX63JQ
BS 263 668 RR2AN16JQ
BS 669 682 RR2EX63JQ
BS 683 708 RR2GI41JQB

RD RR2BL23TF 638 0 0
TTTTTTGTCTCATGAAAATGTTAAATCTACATAATATGTTTCCAATAGAATGAAAAATTA
ATGATGTTTATGTTTCACATTCAAACCAAGTAACTCGCCGGCTTCTTACGTCATCACTTC
TCAGCCAACGACCGCCAGCAAACTCTGTCGGACGGCAGGGATAGAACACAGTAACGATCC
GAAGATTCCAGTGAGTGCATAAGCAATTGCACAGAAGGGAAGAGCCTCTGGCTCCTTAGC
CGACAAAGCTGCTGTTCCAAGTCCATGAGCACTTGAAGCAGTTGCGATTCCTCGAGCAAT
AGGATCATTTAAACGCAGTTTATCAAGAACGACTTGTACAAAGTTAGCTCCAATCAGACC
AGTCACAACCACTACAGCTGCTGTAAGCGACGAATTGGTCCCTTCAAAGAGTGATACAAT
GCTAAGGGCTAACGCAACCGTGATACAGCGAGGTAGGATTGAAACAGTTAAAGATGGCTC
TAAACCGACCAAACGTCCAACAAGAGCAGTGGAGTAGAGCGAGAATACCGTTGAAACAAT
CACAGACGTAAAGATCTCAGCTGCATGCCGCTTCACAAGCTTTCTCTGTTTGAACATGGA
GAAAGCGAAAGAGAGAATGACAGAACCAAGAAAACCC
C

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2AN16JQ 668 0 0
GCGAAATAATATTTTTTGTCTCATGAAAATGTTAAATTTACATAATATGTTTCCAATAGA
ATGAAAAATTAATGATGTTTATGTTTCACATTCAAACCAAGTAACTCGCCGGCTTCTTAC
GTCATCACTTCTCAGCCAACGACCGCCAGCAAACTCTGTCGGACGGCAGGGATAGAACAC
AGTAACGATCCGAAGATTCCAGTGAGTGCATAAGCAATTGCACAGAAGGGAAGAGCCTCT
GGCTCCTTAGCCGACAAAGCTACTGTTCCAAGTCCATGAGCACTTGAAGCAGTTGCGATT
CCTCGAGCAATAGGATCATTTAAACGCAGTTTATCAAGAACGACTTGTACAAAGTTAGCT
CCAATCAGACCAGTCACAACCACTACAGCTGCTGTAAGCGACGAATTGGTCCCTTCAAAG
AGTGATACAATGCTAAGGGCTAACGCAACCGTGATACAGCGAGGTAGGATTGAAACAGTT
AAAGATGGCTCTAAACCGACCAAACGTCCAACAAGAGCAGTGGAGTAGAGCGAGAATACC
GTTGAAACAATCACAGACGTAAAGATCTCAGCTGCATGCCGCTTCACAAGCTTTCTCTGT
TTGAACATGGAGAAAGCGAAAGAGAGAATGACAGAACCAAGAAAACCCATTAAGATGTCA
CCAGCACC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2EX63JQ 682 0 0
GA
GAAATAATATTTTTTGTCTCATGAAAATGTTAAATTTACATAATATGTTTCCAATGGAAT
GAAAAATTAATGATGTTTATGTTTCACATTCAAACCAAGTAACCCGCCGGCTTCTTACGT
CATCACTTCTCAGCCAACGACCGCCAGCAAACTCTGTCGGACGGCAGGGATAGAACACAG
TAACGATCCGAAGATTCCAGTGAGTGCATAAGCAATTGCACAGAAGGGAAGAGCCTCTGG
CTCCTTAGCCGACAAAGCTGCTGTTCCAAGTCCATGAGCACTTGAAGCAGTTGCGATTCC
TCGAGCAATAGGATCATTTAAACGCAGTTTATCAAGAACGACTTGTACAAAGTTAGCTCC
AATCAGACCAGTCACAACCACTACAGCTGCTGTAAGCGACGAATTGGTCCCTTCAAAGAG
TGATACAATGCTAAGGGCTAACGCAACCGTGATACAGCGAGGTAGGATTGAAACAGTTAA
AGATGGCTCTAAACCGACCAAACGTCCAACAAGAGCAGTGGAGTAGAGCGAGAATACCGT
TGAAACAATCACAGACGTAAAGATCTCAGCTGCATGCCGCTTCACAAGCTTTCTCTGTTT
GAACATGGAGAAAGCGAAAGAGAGAATGACAGAACCAAGAAAACCCATTAAGATGTCACC
AGCACCAGGATCCGATGCTA

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR2GI41JQB 708 0 0
GA
GAAATAATATTTTTTGTCTCATGAAAATGTTAAATTTACATAATATGTTTCCAATAGAAT
GAAAAATTAATGATGTTTATGTTTCACATTCAAACCAAGTAACTCGCCGGCTTCTTACGT
CATCACTTCTCAGCCAACGACCGCCAGCAAACTCTGTCGGACGGCAGGGATAGAACACAG
TAACGATCCGAAGATTCCAGTGAGTGCATAAGCAATTGCACAGAAGGGAAGAGCCTCTGG
CTCCTTAGCCGACAAAGCTGCTGTTCCAAGTCCATGAGCACTTGAAGCAGTTGCGATTCC
TCGAGCAATAGGATCATTTAAACGCAGTTTATCAAGAACGACTTGTACAAAGTTAGCTCC
AATCAGGCCAGTCACAACCACTACAGCCGCTGTAAGCGACGAATTGGTCCCTTCAAAGAG
TGATACAATGCTAAGGGCTAACGCAACCGTGATACAGCGAGGTAGGATTGAAACAGTTAA
AGATGGCTCTAAACCGACCAAACGTCCAACAAGAGCAGTGGAGTAGAGCGAGAATACCGT
TGAAACAATCACAGACGTAAAGATCTCAGCTGCATGCCGCTTCACAAGCTTTCTCTGTTT
GAACATGGAGAAAGCGAAAGAGAGAATGACAGAACCAAGAAAACCCATTAAGATGTCACC
AGCACCAGGATCCGATGCTACTTTAGTAAGGTAGTTTCCTAGAACA

QA 3 708 3 708
DS 



AS 1 2

CO CL2684Contig1 875 2 24 U
GGAAACGACAATAAAAAGTTCTAAGAAAAACACGCTTCTTGTCTGGGAAACAAAAAAAAG
AAGGAAATTACAAGAAAAGAGATCAATGGAGGAAGAATACATAAGAGTGATTAACATAAC
AGTGATTGGAGTTATCTCATGGGGTTTGATTTTCATCCTCGTGCGACGAATCTTCTCAAA
CTACTCCTTCGACTTCAGCACTCGTATTGTCTCGACCCTTCACGCCACAGTCGCGGTCGT
TTTAGCAACTCTTACGATTCAAGATTGGTCTTGTCCAGTTTATCCCATCGCTTCCACGTC
ATCTCTCCAGCAGATGGAAACGATTGCGTTTTCTTTGTCTTACACGATCTACGATCTCAT
TTGTAGTCACTTTGATCAAGTCCTAAGCATCGATAATGCCGTTCATCATTCTGTCTGCAT
TCTTGGTTTTGTAGCTGGACTTTGCTACCGAAAGTGCGCATCTGAGATGGTTGCAGCAAT
TTGGATTACAGAGATCTCAAGTCCATTCCTACACCTCAGGGAGATTCTTAAAGAGATTGG
TTACAGAAACACCGATCTCAATCTTGCCGCCGATGTGTGTTTTGCAACAATCTTCTCACT
CGCGAGAATGGTCGGTGGACCTTACCTTGTTTACGTCACGATAACTGCTGATAACCCCAT
CCTCATCAAGGCAATGGCGTTGGGATTACAACTCGTGAGCGCTTTCTGGTTTTACAAAAT
ACTCAAAATGATGAGATACAAAATTGTGAAAAGATCAATGCTCAATACAAAATCAGATTA
GTTGAAGTTAGTTTATTATTTTATCGATTATAATATCGGTGAATTCTGATATGTTTTTTT
TCATTTTAAGAATACTTGGTTTTTATTACATGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ15TF U 1
AF RR2B971TF U 5
BS 1 60 RR2EZ15TF
BS 61 61 RR2B971TF
BS 62 344 RR2EZ15TF
BS 345 345 RR2B971TF
BS 346 510 RR2EZ15TF
BS 511 511 RR2B971TF
BS 512 547 RR2EZ15TF
BS 548 548 RR2B971TF
BS 549 654 RR2EZ15TF
BS 655 655 RR2B971TF
BS 656 718 RR2EZ15TF
BS 719 719 RR2B971TF
BS 720 742 RR2EZ15TF
BS 743 743 RR2B971TF
BS 744 749 RR2EZ15TF
BS 750 750 RR2B971TF
BS 751 757 RR2EZ15TF
BS 758 759 RR2B971TF
BS 760 765 RR2EZ15TF
BS 766 766 RR2B971TF
BS 767 771 RR2EZ15TF
BS 772 772 RR2B971TF
BS 773 788 RR2EZ15TF
BS 789 875 RR2B971TF

RD RR2EZ15TF 789 0 0
GGAAACGACAATAAAAAGTTCTAAGAAAAACACGCTTCTTGTCTGGGAAACAAAAAAAAG
GAGGAAATTACAAGAAAAGAGATCAATGGAGGAAGAATACATAAGAGTGATTAACATAAC
AGTGATTGGAGTTATCTCATGGGGTTTGATTTTCATCCTCGTGCGACGAATCTTCTCAAA
CTACTCCTTCGACTTCAGCACTCGTATTGTCTCGACCCTTCACGCCACAGTCGCGGTCGT
TTTAGCAACTCTTACGATTCAAGATTGGTCTTGTCCAGTTTATCCCATCGCTTCCACGTC
ATCTCTCCAGCAGATGGAAACGATTGCGTTTTCTTTGTCTTACATGATCTACGATCTCAT
TTGTAGTCACTTTGATCAAGTCCTAAGCATCGATAATGCCGTTCATCATTCTGTCTGCAT
TCTTGGTTTTGTAGCTGGACTTTGCTACCGAAAGTGCGCATCTGAGATGGTTGCAGCAAT
TTGGATTACAGAGATCTCAAGTCCATTCCTTCACCTCAGGGAGATTCTTAAAGAGATTGG
TTACAGAGACACCGATCTCAATCTTGCCGCCGATGTGTGTTTTGCAACAATCTTCTCACT
CGCGAGAATGGTCGGTGGACCTTACCTTGTTTACGTCACGATAACTGCTGATAATCCCAT
CCTCATCAAGGCAATGGCGTTGGGATTACAACTCGTGAGCGCTTTCTGGTTTTACAAA*T
ACTCAAAATGATGAGATACAAA*TTGTGAGAAGATCAC*GCTCAA*ACAAA*TCAGATTA
GTTGAAGT
A

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2B971TF 871 0 0
GG
GACAATAAAAAGTTCTTAGAAAAACACGCTTCTTGTCTGGGAAACAAAAAAAAGAAGGAA
ATTACAAGAAAAGAGATCAATGGAGGAAGAATACATAAGAGTGATTAACATAACAGTGAT
TGGAGTTATCTCATGGGGTTTGATTTTCATCCTCGTGCGACGAATCTTCTCAAACTACTC
CTTCGACTTCAGCACTCGTATTGTCTCGACCCTTCACGCCACAGTCGCGGTCGTTTTAGC
AACTCTTACGATTCAAGATTGGTCTTGTCCAGTTTATCCCATCGCTTCCACGTCATCTCT
CCAGCAGATGGAAACGATTGCGTTTTCTTTGTCTTACACGATCTACGATCTCATTTGTAG
TCACTTTGATCAAGTCCTAAGCATCGATAATGCCGTTCATCATTCTGTCTGCATTCTTGG
TTTTGTAGCTGGACTTTGCTACCGAAAGTGCGCATCTGAGATGGTTGCAGCAATTTGGAT
TACAGAGATCTCAAGTCCATTCCTACACCTCAGGGAGATTCTTAAAGAGATTGGTTACAG
AAACACCGATCTCAATCTTGCCGCCGATGTGTGTTTTGCAACAATCTTCTCACTCGCGAG
AATGGTGGGTGGACCTTACCTTGTTTACGTCACGATAACTGCTGATAACCCCTTCCTCAT
CAAG*CAATGGCGTTGGGATTACAACTCGTGAGCGCTTTCTGGTTTTACAAAATACTCAA
GATGATGAGATACAAAATTGTGAAAAGATCAATGCTCAATACAAAATCAGATTAGTTGAA
GTTAGTTTATTATTTTATCGATTATAATATCGGTGAATTCTGATATGTTTTTTTTCATTT
TAAGAATACTTGGTTTTTATTACATGAAT

QA 3 871 3 871
DS 



AS 1 2

CO CL2685Contig1 909 2 2 U
GAAACTTGTCATTCTCTCAAAGAGTTAAAGTGAGAAAGAGAGAGGGGATGGCAATTCAGG
AAATCAAAGATGTGGAGAGGGGTGAAACACTAAATAGGGTGGAGGATCTAGGGAATCCAC
TGTTGAAGAAAGCGGTTGAGCAAGATAATCCAGAAGAGAGTGAGACTAACGAATCTTACT
TTATGGTTCTCTTCAGCACTTTTGTTGCTGTCTGTGGCTCCTTTGAGTTTGGCTCTTGTG
TTGGATACTCGGCTCCTACACAATCATCTATAAGACAAGATCTCAATCTCTCACTTGCAG
AGTTCTCCATGTTTGGGTCCATTTTAACAATCGGTGCAATGCTTGGTGCTGTTATGAGTG
GACATATTTCAGATTCGACTGGCCGAAAAGGGGCGATGAGAACTTCAGCTTGCTTTTGCA
TAACTGGTTGGCTCGCTGTCTTCTTCTCTAAGAGTGCTCTGTTACTCGATGTGGGAAGGT
TCTTCACAGGATATGGCATTGGAGTTTTTTCCTATGTGGTGCCTGTGTACATTGCCGAGA
TATCTCCAAAAAATTTACGAGGTGCACTCACAACACTGAACCAACTCATGATTGTGATAG
GCTGATAGGCTCCGTCAAGTATACGTGAGGAAGAAGTCAAGAGTGGAAGAGAAGGTGACG
ACTAAATGAAGTGAAGAAGGTTGTGGAGAATTAAAGATGACGTGGAGGAAGTCGTTACAG
AATAACCGTAAAGAGTCTAGTATAAATAATAGCATTGATGTAAAGGATCAGTTGTGCAAT
TTGTTAATTGTTTCCTTGGTCCTTGAAGAATAGTTCTTCAGGAAGTTGGCTCTACACTGA
GTTTGTCAGTTAGAGATTGTATTCGTTCTTGATAAGTGAATAAAGTACATCTTTGAGCTT
AAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB54TF U 1
AF RR2CB54JQ C 158
BS 1 225 RR2CB54TF
BS 226 909 RR2CB54JQ

RD RR2CB54TF 225 0 0
GAAACTTGTCATTCTCTCAAAGAGTTAAAGTGAGAAAGAGAGAGGGGATGGCAATTCAGG
AAATCAAAGATGTGGAGAGGGGTGAAACACTAAATAGGGTGGAGGATCTAGGGAATCCAC
TGTTGAAGAAAGCGGTTGAGCAAGATAATCCAGAAGAGAGTGAGACTAACGAATCTTACT
TTATGGTTCTCTTCAGCACTTTTGTTGCTGTCTGTGGCTCCTTTG

QA 1 225 1 225
DS 

RD RR2CB54JQ 752 0 0
GAGTGAGACTAACGAATCTTACTTTATGGTTCTCTTCAGCACTTTTGTTGCTGTCTGTGG
CTCCTTTGAGTTTGGCTCTTGTGTTGGATACTCGGCTCCTACACAATCATCTATAAGACA
AGATCTCAATCTCTCACTTGCAGAGTTCTCCATGTTTGGGTCCATTTTAACAATCGGTGC
AATGCTTGGTGCTGTTATGAGTGGACATATTTCAGATTCGACTGGCCGAAAAGGGGCGAT
GAGAACTTCAGCTTGCTTTTGCATAACTGGTTGGCTCGCTGTCTTCTTCTCTAAGAGTGC
TCTGTTACTCGATGTGGGAAGGTTCTTCACAGGATATGGCATTGGAGTTTTTTCCTATGT
GGTGCCTGTGTACATTGCCGAGATATCTCCAAAAAATTTACGAGGTGCACTCACAACACT
GAACCAACTCATGATTGTGATAGGCTGATAGGCTCCGTCAAGTATACGTGAGGAAGAAGT
CAAGAGTGGAAGAGAAGGTGACGACTAAATGAAGTGAAGAAGGTTGTGGAGAATTAAAGA
TGACGTGGAGGAAGTCGTTACAGAATAACCGTAAAGAGTCTAGTATAAATAATAGCATTG
ATGTAAAGGATCAGTTGTGCAATTTGTTAATTGTTTCCTTGGTCCTTGAAGAATAGTTCT
TCAGGAAGTTGGCTCTACACTGAGTTTGTCAGTTAGAGATTGTATTCGTTCTTGATAAGT
GAATAAAGTACATCTTTGAGCTTAAAAAAAAA

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL2686Contig1 790 2 2 U
CAAAACCATATGATAAAACAAACTCAAGGCTATGAAGAGTTAGAATAATGATATTTTGTC
AACACACAACGGCAAAGAAAGGTGTCTCTGATGATTCTCAAAACTATGAAAGACAACAAT
CCTAATTAAAATTGAGATGGTTACTAGTCACTCATCACCAAACTGATCGGTTTTTAACAG
CAATCCCACTGCCTTCCTTTTTGCCGCCTCTGCTTCCTTCATAATCAACGGTCCATTTCT
CAAATGTACAGTTTACAAAGTCATAGTAGCCACCATGGAGTGAGAGTGATCCATTCCGCA
CTTTCTCTTCTATCCACGGATAACCAAGCAGTCTTTCTAATGAATGATTAATCGACATCT
TTTCACAATGTTGACACTGATGATCAAAATGAAGGTTTGAAGCAACAGCTTTTGTGCTCT
CCTTTGCCTTTTTCCCCACAATCACCCAGTTATGTATGAAACTTCTGGAGTCTCCTTCAT
CTTCCATGCTCATTAAAGCTTGAATTCCTCCACAGCGGCTATGACCAACAACTAAAATGT
TCTCCACTTCAAGAGTATTCACAGAGAACTGGAGAGCAGCTTTTGTTTCAGTAGGTCCAG
ACTCGTATGGAGGTACTAAATTAGCAATGTTACGAACAGTGAATGCTTCACCAAGTTGAA
ATCCGAGGACGGCAGAAGGACAAACACTAGAGTCTGCGCAAGCAATCACCAGAAACTTTG
GAGCTTGAGCATCTGCTAGTTTCTTGAAGTGCTCTAAGTTATCCATGTACTTAAGCTTCT
TGAACGCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A059TF C 1
AF RR2A059JQ U 86
BS 1 85 RR2A059TF
BS 86 790 RR2A059JQ

RD RR2A059TF 790 0 0
CAAAACCATATGATAAAACAAACTCAAGGCTATGAAGAGTTAGAATAATGATATTTTGTC
AACACACAACGGCAAAGAAAGGTGTCTCTGATGATTCTCAAAACTATGAAAGACAACAAT
CCTAATTAAGATTGAGATGGTTACTAGTCACTCATCACCAAACTGATCGGTTTTTAACAG
CAATCCCACTGCCTTCCTTTTTGCCGCCTCTGCTTCCTTCATAATCAACGGTCCATTTCT
CAAATGTACAGTTTACAAAGTCATAGTAGCCACCATGGAGTGAGAGTGATCCATTCCGCA
CTTTCTCTTCTATCCACGGATAACCAAGCAGTCTTTCTAATGAATGATTAATCGACATCT
TTTCACAATGTTGACACTGATGATCAAAATGAAGGTTTGAAGCAACAGCTTTTGTGCTCT
CCTTTGCCTTTTTCCCCACAATCACCCAGTTATGTATGAAACTTCTGGAGTCTCCTTCAT
CTTCCATGCTCATTAAAGCTTGAATTCCTCCACAGCGGCTATGACCAACAACTAAGATGT
TCTCCACTTCAAGAGTATTCACAGAGAACTGGAGAGCAGCTTTTGTTTCAGTAGGTCCAG
ACTCGTATGGAGGTACTAAATTAGCAATGTTACGAACAGTGAATGCTTCACCAAGTTGAA
ATCCGAGGACGGCAGAAGGACAAACACTAGAGTCTGCGCAAGCAATCACCAGAAACTTTG
GAGCTTGAGCATCTGCTAGTTTCTTGAAGTGCTCTAAGTTATCCATGTACTTAAGCTTCT
TGAA
CGCCCT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2A059JQ 705 0 0
CTCTGATGATTCTCAAAACTATGAAAGACAACAATCCTAATTAAAATTGAGATGGTTACT
AGTCACTCATCACCAAACTGATCGGTTTTTAACAGCAATCCCACTGCCTTCCTTTTTGCC
GCCTCTGCTTCCTTCATAATCAACGGTCCATTTCTCAAATGTACAGTTTACAAAGTCATA
GTAGCCACCATGGAGTGAGAGTGATCCATTCCGCACTTTCTCTTCTATCCACGGATAACC
AAGCAGTCTTTCTAATGAATGATTAATCGACATCTTTTCACAATGTTGACACTGATGATC
AAAATGAAGGTTTGAAGCAACAGCTTTTGTGCTCTCCTTTGCCTTTTTCCCCACAATCAC
CCAGTTATGTATGAAACTTCTGGAGTCTCCTTCATCTTCCATGCTCATTAAAGCTTGAAT
TCCTCCACAGCGGCTATGACCAACAACTAAAATGTTCTCCACTTCAAGAGTATTCACAGA
GAACTGGAGAGCAGCTTTTGTTTCAGTAGGTCCAGACTCGTATGGAGGTACTAAATTAGC
AATGTTACGAACAGTGAATGCTTCACCAAGTTGAAATCCGAGGACGGCAGAAGGACAAAC
ACTAGAGTCTGCGCAAGCAATCACCAGAAACTTTGGAGCTTGAGCATCTGCTAGTTTCTT
GAAGTGCTCTAAGTTATCCATGTACTTAAGCTTCTTGAACGCCCT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 4

CO CL2687Contig1 911 4 6 U
GGATTAGCATCCCGAAAGACAAAAAAAAATCTCAAGGAAAAATACAAAGGATGATGATCT
CATCCTATTTACGTGTAATATTACTCTTATTATGCGCCACTGATCTCTACGCTTCAACAT
CAATAACCAGAACTAGAACCAGAACAATAACCAAAAGCAGCAGATCTAGAAGCAGATCGA
GAACTGTATCATTACATCATGTGTTCCAAACCAGTAGGTCCAAGTGTCTGGGATGTCACC
ACGACTCGTTACAGTTCTTGTTCCGACAAAATTTGGTTCGTGCCCAAAGACTCGAAGCTC
CTTTGATTTGGGACCGCAGACTCGAGCACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAAG
GAGATTGTGCTTTAAGACATTCTTTCCAAAACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAAAACGTTT
TCCAAGGTTACGGCAAAGACTGGTCCCCGGCCGACGCAGTGGTCGCGTGGGCCAGCGAGA
AGAGGTTTTATAATTACGGTTCCAATACGTGCGACCCTGGGAAGGTGTGTGGGCATTACA
CACAGATGGTGTGGAAGAACACGAGGAGGG*TCGGGTGCGCACGTGTAAAGTGCGACAGT
GGTGCGATTTTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACTACGTCGGCCAGAAACCC
TATTGAGCGATCATTCATCTACTCTTTGATCTTAATTTTAGAAATTGTAATATGACTTTT
TGAAGGAAGTTAAGTGGATGTATATATTGGGTATTTTACTAGAAAATAGGCCCCTTTTGC
GTGGCTTGTGATATTGGTTATGTTTGCATCTCTAAACGTGATTATTTCACTTTTGATGGC
TGTAATTGCATTTACGATTACTTTATATATATCCGTCCAATTATAAAATATATATAATAT
GTTTTCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI89TF U 1
AF RR2BK84TF U 2
AF RR2BK84JQ C 8
AF RR2C916JQ C 200
BS 1 640 RR2EI89TF
BS 641 649 RR2BK84TF
BS 650 650 RR2BK84JQ
BS 651 687 RR2BK84TF
BS 688 762 RR2BK84JQ
BS 763 911 RR2C916JQ

RD RR2EI89TF 640 0 0
GGATTAGCATCCCGAAAGACAAAAAAAAATCTCAAGGAAAAATACAAAGGATGATGATCT
CATCCTATTTACGTGTAATATTACTCTTATTATGCGCCACTGATCTCTACGCTTCAACAT
CAATAACCAGAACTAGAACCAGAACAATAACCAAAAGCAGCAGATCTAGAAGCAGATCGA
GAACTGTATCATTACATCATGTGTTCCAAACCAGTAGGTCCAAGTGTCTGGGATGTCACC
ACGACTCGTTACAGTTCTTGTTCCGACAAAATTTGGTTCGTGCCCAAAGACTCGAAGCTC
CTTTGATTTGGGACCGCAGACTCGAGCACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAAG
GAGATTGTGCTTTAAGACATTCTTTCCAAAACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAAAACGTTT
TCCAAGGTTACGGCAAAGACTGGTCCCCGGCCGACGCAGTGGTCGCGTGGGCCAGCGAGA
AGAGGTTTTATAATTACGGTTCCAATACGTGCGACCCTGGGAAGGTGTGTGGGCATTACA
CACAGATGGTGTGGAAGAACACGAGGAGGG*TCGGGTGCGCACGTGTAAAGTGCGACAGT
GGTGCGATTTTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2BK84TF 686 0 0
GATTAG
CATCCCGAAAGACAAAAAAAAATCTCAAGGAAAAATACAAAGGATGATGATCTCATCCTA
TTTACGTGTAATATTACTCTTATTATGCGCCACTGATCTCTACGCTTCAACATCAATAAC
CAGAACTAGAACCAGAACAATAACCAAAAGCAGCAGATCTAGAAGCAGATCGAGAACTGT
ATCATTACATCATGTGTTCCAAACCAGTAGGTCCAAGTGTCTGGGATGTCACCACGACTC
GTTACAGTTCTTGTTCCGACAAAATTTGGTTCGTGCCCAAAGACTCGAAGCTCCTTTGAT
TTGGGACCGCAGACTCGAGCACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAAGGAGATTG
TGCTTTAAGACATTCTTTCCAAAACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAAAACGTTTTCCAAGG
TTACGGCAAAGACTGGTCCCCGGCCGACGCAGTGGTCGCGTGGGCCAGCGAGAAGAGGTT
TTATAATTACGGTTCCAATACGTGCGACCCTGGGAAGGTGTGTGGGCATTACACACAGAT
GGTGTGGAAGAACACGAGGAGGGGTCGGGTGCGCACGTGTAAAGTGCGACAGTGGTGCGA
TTTTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACTACGTCG*CCAGAAACCCTATTGAG
CGATCATTCATCTACTCTTT

QA 7 686 7 686
DS 

RD RR2BK84JQ 755 0 0
CATCCCGAAAGACAAAAAAAAATCTCAAGGAAAAATACAAAGGATGATGATCTCATCCTA
TTTACGTGTAATATTACTCTTATTATGCGCCACTGATCTCTACGCTTCAACATCAATAAC
CAGAACTAGAACCAGAACAATAACCAAAAGCAGCAGATCTAGAAGCAGATCGAGAACTGT
ATCATTACATCATGTGTTCCAAACCAGTAGGTCCAAGTGTTTGGGATGTCACCACGACTC
GTTACAGTTCTTGTTCCGACAAAATTTGGTTCGTGCCCAAAGACTCGAAGCTCCTTTGAT
TTGGGACCGCAGACTCGAGCACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAAGGAGATTG
TGCTTTAAGACATTCTTTCCAAAACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAAAACGTTTTCCAAGG
TTACGGCAAAGACTGGTCCCCGGCCGACGCAGTGGTCGCGTGGGCCAGCGAGAAGAGGTT
TTATAATTACGGTTCCAATACGTGCGACCCTGGGAAGGTGTGTGGGCATTACACACAGAT
GGTGTGGAAGAACACGAGGAGGG*TCGGGTGCGCACGTGTAAAGTGCGACAGTGGTGCGA
TTTTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACTACGTCGGCCAGAAACCCTATTGAG
CGATCATTCATCTACTCTTTGATCTTAATTTTAGAAATTGTAATATGACTTTTTGAAGGA
AGTTAAGTGGATGTATATATTGGGTATTTTACTAG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2C916JQ 712 0 0
TGTGTTCCAAACCAGTAGGTCCAAGTGTCTGGGATGTCACCACGACTCGTTACAGTTCTT
GTTCCGACAAAATTTGGTTCGTGCCCAAAGACTCGAAGCTCCTTTGATTTGGGACCGCAG
ACTCGAGCACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAAGGAGATTGTGCTTTAAGACA
TTCTTTCCAAAACGGAGAGTTTACTTTCGGCGAAAACGTTTTCCAAGGTTACGGCAAAGA
CTGGTCCCCGGCCGACGCAGTGGTCGCGTGGGCCAGCGAGAAGAGGTTTTATAATTACGG
TTCCAATACGTGCGACCCTGGGAAGGTGTGTGGGCATTACACACAGATGGTGTGGAAGAA
CACGAGGAGGG*TCGGGTGCGCACGTGTAAAGTGCGACAGTGGTGCGATTTTCATGACTT
GTAACTATGATCCTCCCGGTAACTACGTCGGCCAGAAACCCTATTGAGCGATCATTCATC
TACTCTTTGATCTTAATTTTAGAAATTGTAATATGACTTTTTGAAGGAAGTTAAGTGGAT
GTATATATTGGGTATTTTACTAGAAAATAGGCCCCTTTTGCGTGGCTTGTGATATTGGTT
ATGTTTGCATCTCTAAACGTGATTATTTCACTTTTGATGGCTGTAATTGCATTTACGATT
ACTTTATATATATCCGTCCAATTATAAAATATATATAATATGTTTTCTTTTT

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 3

CO CL2688Contig1 725 3 29 U
TTTTGCAGGACATAAAATAAAAAGCTCTCAAGTAAGAAACAAAACAACACAGGTGAATTG
TCTGAGTAGCACAAACACACAAGAAACTCCTTTTTTT*CTTTAGTACTGATCAAAATCTG
GATACAGAGTTGAGAATCAAACAGCAACAAAATAAATGGCCTTACGAGCTCTTCGATACT
TCCTTGAAGATGCGAGGGAGAATCTCATGTGCACCGATATCTAGACCTTGAGGCTCCCTG
CATAATGTTTGCCCCTTTTCTTTCGAGCTAGGAATGAACCAAACATTTCGAATAGATGGA
GACTCAAACTGAACAAAGATTCCGTCGTTTTGTCCGAGCTTCCACTTCCTTGAGCCTTGA
CCTTTCCACACCTGCGGGTAAGATATACTACTCTTTGATGTCACTAGGCAAGCAGCTTTG
GAAAAGGATTCTTCTGCGTACTGCCTCAGATACGTAAAGCAGTTACTGTGCGTGTGTGGT
GACTCAAACGCCTTATCGATGTTGACTACTGGTGCGTACTTATCGGTTTGTGTTTTTTCT
TTGTCAAGAAGGAAATAGACTCTACTATCCACTTTAGATGTCTCGTGCCACGACTTGACA
GCTGTTTCCATGGTCTCAACAAGAAAAGAGAACATCTCTTTCCAACACTCTTCAGCTCCA
TAGTTTGCAGACAGTTCAGATTTAAAGCTGTCAAGATGCTTGGCCATGTTGACATTAGAC
CTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 

AF RR2E026JQ U 14
AF RR2H014TF C 1
AF RR2H014JQ U 20
BS 1 19 RR2H014TF
BS 20 76 RR2E026JQ
BS 77 77 RR2H014JQ
BS 78 146 RR2E026JQ
BS 147 147 RR2H014JQ
BS 148 248 RR2E026JQ
BS 249 249 RR2H014JQ
BS 250 302 RR2E026JQ
BS 303 303 RR2H014JQ
BS 304 374 RR2E026JQ
BS 375 375 RR2H014JQ
BS 376 428 RR2E026JQ
BS 429 429 RR2H014JQ
BS 430 440 RR2E026JQ
BS 441 441 RR2H014JQ
BS 442 452 RR2E026JQ
BS 453 453 RR2H014JQ
BS 454 455 RR2E026JQ
BS 456 456 RR2H014JQ
BS 457 470 RR2E026JQ
BS 471 471 RR2H014JQ
BS 472 488 RR2E026JQ
BS 489 489 RR2H014JQ
BS 490 536 RR2E026JQ
BS 537 537 RR2H014JQ
BS 538 561 RR2E026JQ
BS 562 563 RR2H014JQ
BS 564 702 RR2E026JQ
BS 703 725 RR2H014JQ

RD RR2E026JQ 689 0 0
AAAATA
AAAAGCTCTCAAGTAAGAAACAAAACAACACAGGTGAATTGTCTGAGTAGCACAAACTCA
CAAGAAACTCCTTTTTTT*CTTTAGTACTGATCAAAATCTGGATACAGAGTTGAGAATCA
AACAGCAGCAAAATAAATGGCCTTACGAGCTCTTCGATACTTCCTTGAAGATGCGAGGGA
GAATCTCATGTGCACCGATATCTAGACCTTGAGGCTCCCTGCATAATGTCTGCCCCTTTT
CTTTCGAGCTAGGAATGAACCAAACATTTCGAATAGATGGAGATTCAAACTGAACAAAGA
TTCCGTCGTTTTGTCCGAGCTTCCACTTCCTTGAGCCTTGACCTTTCCACACCTGGGGGT
AAGATATACTACTCTTTGATGTCACTAGGCAAGCAGCTTTGGAAAAGGACTCTTCTGCGT
ATTGCCTCAGATATGTGAAGCAGTTACTGTGTGTGTGTGGTGACTCAAAAGCCTTATCGA
TGTTGACTACTGGTGCGTACTTATCGGTTTGTGTTTTGTCTTTGTCAAGAAGGAAATAGA
CT**ACTATCCACTTTAGATGTCTCGTGCCACGACTTGACAGCTGTTTCCATGGTCTCAA
CAAGAAAAGAGAACATCTCTTTCCAACACTCTTCAGCTCCATAGTTTGCAGACAGTTCAG
ATTTAAAGCTGTCAAGATGCTTG

QA 7 689 7 689
DS 

RD RR2H014TF 725 0 0
TTTTGCAGGACATAAAATAAAAAGCTCTCAAGTAAGAAACAAAACAACACAGGTGAATTG
TCTGAGTAGCACAAACACACAAGAAACTCTTTTTTTT*CTTTAGTACTGATCAAAATCTG
GATACAGAGTTGAGAATCAAACAGCAACAAAATAAATGGCCTTACGAGCTCTTCGATACT
TCCTTGAAGATGCGAGGGAGAATCTCATGTGCACCGATATCTAGACCTTGAGGCTCCCTG
CATAATGTTTGCCCCTTTTCTTTCGAGCTAGGAATGAACCAAACATTTCGAATAGATGGA
GACTCAAACTGAACAAAGATTCCGTCGTTTTGTCCGAGCTTCCACTTCCTTGAGCCTTGA
CCTTTCCACACCTGCGGGTAAGATATACTACTCTTTGATGTCACTAGGCAAGCAGCTTTG
GAAAAGGATTCTTCTGCGTACTGCCTCAGATACGTAAAGCAGTTACTGTGCGTGTGTGGT
GACTCAAACGCCTTATCGATGTTGACTACTGGTGCGTACTTATCGGTTTGTGTTTTTTCT
TTGTCAAGAAGGAAATAGACTCTACTATCCACTTTAGATGTCTCGTGCCACGACTTGACA
GCTGTTTCCATGGTCTCAACAAGAAAAGAGAACATCTCTTTCCAACACTCTTCAGCTCCA
TAGTTTGCAGACAGTTCAGATTTAAAGCTGTCAAGATGCTTGGCCATGTTGACATTAGAC
CTCA
C

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2H014JQ 706 0 0
AAAAGCTCTCAAGTAAGAAACAAAACAACACAGGTGAATTGTCTGAGTAGCACAAACACA
CAAGAAACTCCTTTTTTTTCTTTAGTACTGATCAAAATCTGGATACAGAGTTGAGAATCA
AACAGCAACAAAATAAATGGCCTTACGAGCTCTTCGATACTTCCTTGAAGATGCGAGGGA
GAATCTCATGTGCACCGATATCTAGACCTTGAGGCTCCCTGCATAATGTTTGCCCCTTTT
CTTTCGAGCTAGGAATGAACCAAACATTTCGAATAGATGGAGACTCAAACTGAACAAAGA
TTCCGTCGTTTTGTCCGAGCTTCCACTTCCTTGAGCCTTGACCTTTCCACACCTGCGGGT
AAGATATACTACTCTTTGATGTCACTAGGCAAGCAGCTTTGGAAAAGGATTCTTCTGCGT
ACTGCCTCAGATACGTAAAGCAGTTACTGTGCGTGTGTGGTGACTCAAACGCCTTATCGA
TGTTGACTACTGGTGCGTACTTATCGGTTTGTGTTTTTTCTTTGTCAAGAAGGAAATAGA
CTCTACTATCCACTTTAGATGTCTCGTGCCACGACTTGACAGCTGTTTCCATGGTCTCAA
CAAGAAAAGAGAACATCTCTTTCCAACACTCTTCAGCTCCATAGTTTGCAGACAGTTCAG
ATTTAAAGCTGTCAAGATGCTTGGCCATGTTGACATTAGACCTCAC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 4

CO CL2689Contig1 1013 4 7 U
GAGATCAAATACAATTTCACAAGTTGAACGATACATAAGACATAAATAAGGTACATAAAG
ACCACAAAGTTACATCATCACCATGTCATTGTACGAATATAAAACCAAAGGAGTACAAAA
GTGCATATCATCACACCAATTTATTAGTTGTAAAGGTAAATAGATAGAGAGAGAGAGAGA
TACTCGTTTTATTCAAAGCTACAGCAGCAGCAATGTAGAGACAGTGAACTTAGGTTGTAA
GGATTGGAGGCAGGTAGTCTACTTTGTTTCCGAGGATACGAGCCTTTGTGTCCGGGAAGA
ACTCAAATCCTGGAACCTCACTGATGTTACCTTCATTGTCCACACTAATCGGGTAGCGCA
GCAA*GTGGCCAGGAAGGTCATGTTCCAGTGACTCGCTTGAGTAAAAGTCCCAGTACTTC
TCAGCAATACGGTTAACTTTCTCAATGCATTCCAAGCTTGAGGGATCTAGGAACGTCTCA
TCAAGCATTCCCAAGTGTTCGTACCAGAGTGACATACGGAAACCATGGACTTGGCCACGA
GCTGGTTGTCTATGTGACAAGTGATGTGGTTGATACCCTCCCATTGCTATCTCAGAGTCC
CTTGCACCATCCATTGACCTCTGGTTGATGTTAGCAGACCCGACGATAATGTATTCATCG
TCAACGATCATCATTTTGCTATGGACGTAGATCATGAAGCGACGTGCTTCTTGGGCCCTC
ATATAGTCCGTGTCACGGTCTGGTCTCTCCGCAGGCTCATACTCTCCTTCCTTCTTGACC
TCACGGTTTCCAAGGCAGAAGAGCGTCAGATAGTTTCTAAGATCCTCCTCCAACCCCTGC
GCCTTAAGAGCCTGAGTAACATCCTTGTACATCATCTCCAAGGTCCTCCTCTGCCAATCC
AATATAGCTTGCACCGACGCACTCTCCGGGATACCTTCAGGCCACATCGGAACCACAACA
TAAACCCTAAACTTCTCTCCTTTCTCGATCTTGTCAACGATCTTGAGAGACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C266TF C 30
AF RR2C266JQ U 1
AF RR2BY92JQ U 50
AF RR2BY92TF C 195
BS 1 211 RR2C266JQ
BS 212 212 RR2BY92JQ
BS 213 300 RR2C266JQ
BS 301 301 RR2BY92JQ
BS 302 747 RR2C266JQ
BS 748 786 RR2BY92JQ
BS 787 1013 RR2BY92TF

RD RR2C266TF 433 0 0
GATACATAAGACATAAATAAGGTACATAAAGACCACAAAGTTACATCATCACCATGTCAT
TGTACGAATATAAAACCAAAGGAGTACAAAAGTGCATATCATCACACCAATTTATTAGTT
GTAAAGGTAAATAGATAGAGAGAGAGAGAGATACTCGTTTTATTCAAAGCTACAGCAGCA
GCTATGTAGAGACAGTGAACTTAGGTTGTAAGGATTGGAGGCAGGTAGTCTACTTTGTTT
CCGAGGATACGAGCCTTTGTGTCCGGGAAGAGCTCAAATCCTGGAACCTCACTGATGTTA
CCTTCATTGTCCACACTAATCGGGTAGCGCAGCAAAGTGGCCAGGAAGGTCATGTTCCAG
TGACTCGCTTGAGTAAAAGTCCCAGTACTTCTCAGCAATACGGTTAACTTTCTCAATGCA
TTCCAAGCTTGAG

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR2C266JQ 748 0 0
GAGATCAAATACAATTTCACAAGTTGAACGATACATAAGACATAAATAAGGTACATAAAG
ACCACAAAGTTACATCATCACCATGTCATTGTACGAATATAAAACCAAAGGAGTACAAAA
GTGCATATCATCACACCAATTTATTAGTTGTAAAGGTAAATAGATAGAGAGAGAGAGAGA
TACTCGTTTTATTCAAAGCTACAGCAGCAGCTATGTAGAGACAGTGAACTTAGGTTGTAA
GGATTGGAGGCAGGTAGTCTACTTTGTTTCCGAGGATACGAGCCTTTGTGTCCGGGAAGA
GCTCAAATCCTGGAACCTCACTGATGTTACCTTCATTGTCCACACTAATCGGGTAGCGCA
GCAA*GTGGCCAGGAAGGTCATGTTCCAGTGACTCGCTTGAGTAAAAGTCCCAGTACTTC
TCAGCAATACGGTTAACTTTCTCAATGCATTCCAAGCTTGAGGGATCTAGGAACGTCTCA
TCAAGCATTCCCAAGTGTTCGTACCAGAGTGACATACGGAAACCATGGACTTGGCCACGA
GCTGGTTGTCTATGTGACAAGTGATGTGGTTGATACCCTCCCATTGCTATCTCAGAGTCC
CTTGCACCATCCATTGACCTCTGGTTGATGTTAGCAGACCCGACGATAATGTATTCATCG
TCAACGATCATCATTTTGCTATGGACGTAGATCATGAAGCGACGTGCTTCTTGGGCCCTC
ATATAGTCCGTGTCACGGTCTGGTCTC
C

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2BY92JQ 737 0 0
GGTACATAAAGACCACAAAGTTACATCATCACCATGTCATTGTACGAATATAAAACCAAA
GGAGTACAAAAGTGCATATCATCACACCAATTTATTAGTTGTAAAGGTAAATAGATAGAG
AGAGAGAGAGATACTCGTTTTATTCAAAGCTACAGCAGCAGCAATGTAGAGACAGTGAAC
TTAGGTTGTAAGGATTGGAGGCAGGTAGTCTACTTTGTTTCCGAGGATACGAGCCTTTGT
GTCCGGGAAGAACTCAAATCCTGGAACCTCACTGATGTTACCTTCATTGTCCACACTAAT
CGGGTAGCGCAGCAA*GTGGCCAGGAAGGTCGTGTTCCAGTGACTCGCTTGAGTAAAAGT
CCCAGTACTTCTCAGCAATACGGTTAACTTTCTCAATGCATTCCAAGCTTGAGGGATCTA
GGAACGTCTCATCAAGCATTCCCAAGTGTTCGTACCAGAGTGACATACGGAAACCATGGA
CTTGGCCACGAGCTGGTTGTCTATGTGACAAGTGATGTGGTTGATACCCTCCCATTGCTA
TCTCAGAGTCCCTTGCACCATCCATTGACCTCTGGTTGATGTTAGCAGACCCGACGATAA
TGTATTCATCGTCAACGATCATCATTTTGCTATGGACGTAGATCATGAAGCGACGTGCTT
CTTGGGCCCTCATATAGTCCGTGTCACGGTCTGGTCTCTCCGCAGGCTCATACTCTCCTT
CCTTCTTGACCTCACGG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2BY92TF 819 0 0
C
AAGCTACAGCAGCAGCAATGTAGAGACAGTGAACTTAGGT*GTAAGGAT**GAG*CAGGT
AGTCTACTTTGTT*CCGAGGATACGAGCCTTTGTGTCCGGGAAGAACTCAAATCCTGGAA
C*TCACTGATGTTAC*TTCATTGTCCACACTAATCGGGTAGCGCAGCAA*GTGGCCAGGA
AGGTCGTGTTCCAGTGACTCGCTTGAGTAAAAGTCCCAGTACTTCTCAGCAATACGGTTA
ACTTTCTCAATGCATTCCAAGCTTGAGGGATCTAGGAACGTCTCATCAAGCATTCCCAAG
TGTTCGTACCAGAGTGACATACGGAAACCATGGACTTGGCCACGAGCTGGTTGTCTATGT
GACAAGTGATGTGGTTGATACCCTCCCATTGCTATCTCAGAGTCCCTTGCACCATCCATT
GACCTCTGGTTGATGTTAGCAGACCCGACGATAATGTATTCATCGTCAACGATCATCATT
TTGCTATGGACGTAGATCATGAAGCGACGTGCTTCTTGGGCCCTCATATAGTCCGTGTCA
CGGTCTGGTCTCTCCGCAGGCTCATACTCTCCTTCCTTCTTGACCTCACGGTTTCCAAGG
CAGAAGAGCGTCAGATAGTTTCTAAGATCCTCCTCCAACCCCTGCGCCTTAAGAGCCTGA
GTAACATCCTTGTACATCATCTCCAAGGTCCTCCTCTGCCAATCCAATATAGCTTGCACC
GACGCACTCTCCGGGATACCTTCAGGCCACATCGGAACCACAACATAAACCCTAAACTTC
TCTCCTTTCTCGATCTTGTCAACGATCTTGAGAGACAC

QA 2 819 2 819
DS 



AS 1 4

CO CL2690Contig1 1106 4 13 U
GGAGCTTTTCACTATCTATCACACAAGATGGGTCTCAACGCCTCCTTTTCTCTCCTCTCG
CTAACCCTCTTACTCCTCTTCTCTACCCTTGTTACAGCCGATAACATCACACACGCGTTT
GAGAAATACTCCAATTTCAGCACAATGAGTGACCTCTTCACCAGTACCAAGCTCACTACA
CTCATAAGCAAATACCAAACCATAACCCTACTCGCTGTTAACAACAGCGCCATCGGTTCT
ATCACTAACAAATCCGCCATTGAGCTCAAGAACATCCTCATGACTCATGTCATTCTTGAC
TACTACGACGAGCTCAAGCTCAAGGGGATGAAGGAGACGAGCATGATGCTCACTACCCTG
TACCAAACAACCGGTTTGGGTGAAGAGATGAACGGTTTCCTCAACTGTACCAAATCTAAA
GGAAGAGTTTACTTTGGATCCGGAGTAAAGGGCTCGCCTCTAAACGCTGAGTATGTTACC
ACGTTGTATCACAACCCTTTTAACCTGTCTATAATCCAGATTAGCATGCCCATTGTGGCT
CCTGGACTCAGCTTAGCAGTTCTCCCACCTCCACCACCACCCGTTCCTTTGGCTCCAGCT
CCAGCTCCGGCTCCATCTCCTATGCATGCTGCAATGGCTCCAGGTCCATATCCCATCAGT
GGTGCAACCCCTTCAGCTCCAGCTCCTGGACCAGGGGATGAAGACAATGCCTCAGATAGT
AATGATCCAAAACTTACACCTGAAGCAGAGACACCTGAAGCAGAGACACCTGAAGTTGAT
TCTCCTGCACCTACTCCAAGCGCTGATAATGAGAAGATTGAAGCTGCTGATAAGGCTGGG
AAGACCTCTTCTGCTTGTAAGGCACGTTTTAGCTTTGAAGTTGTTCTCTTGCTAGTATTT
TTTGTTAGCTTTGCTTGGTTTTAAGTTGGAGTTTAGATGATGTAGTCTGATGACAATAAT
GGTAGATGAGATTCAAAACATTCATTCATTCATTCATTCAGTCTGTAGTTTTCTTTACCA
AGAAGAGAGACGAGTGTGATCATTGTTCTGTTGAACTTGTTACACAGTTCTAATTCCAAG
TGTGTAATATAGAGCATAGATTAACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH71TF U 1
AF RR2BZ12TF U 1
AF RR2CH71JQ C 145
AF RR2BZ12JQ C 452
BS 1 251 RR2BZ12TF
BS 252 252 RR2CH71TF
BS 253 680 RR2BZ12TF
BS 681 681 RR2CH71TF
BS 682 706 RR2BZ12TF
BS 707 707 RR2CH71JQ
BS 708 731 RR2BZ12TF
BS 732 732 RR2CH71JQ
BS 733 769 RR2BZ12TF
BS 770 770 RR2CH71JQ
BS 771 800 RR2BZ12TF
BS 801 938 RR2CH71JQ
BS 939 1106 RR2BZ12JQ

RD RR2CH71TF 706 0 0
GGAGCTTTTCACTATCTATCACACAAGATGGGTCTCAACGCCTCCTTTTCTCTCCTCTCG
CTAACCCTCTTACTCCTCTTCTCTACCCTTGTTACAGCCGATAACATCACACACGCGTTT
GAGAAATACTCCAATTTCAGCACAATGAGTGACCTCTTCACCAGTACCAAGCTCACTACA
CTCATAAGCAAATACCAAACCATAACCCTACTCGCTGTTAACAACAGCGCCATCGGTTCT
ATCACTAACAAATCCGCCATTGAGCTCAAGAACATCCTCATGACTCATGTCATTCTTGAC
TACTACGACGAGCTCAAGCTCAAGGGGATGAAGGAGACGAGCATGATGCTCACTACCCTG
TACCAAACAACCGGTTTGGGTGAAGAGATGAACGGTTTCCTCAACTGTACCAAATCTAAA
GGAAGAGTTTACTTTGGATCCGGAGTAAAGGGCTCGCCTCTAAACGCTGAGTATGTTACC
ACGTTGTATCACAACCCTTTTAACCTGTCTATAATCCAGATTAGCATGCCCATTGTGGCT
CCTGGACTCAGCTTAGCAGTTCTCCCACCTCCACCACCACCCGTTCCTTTGGCTCCAGCT
CCAGCTCCGGCTCCATCTCCTATGCATGCTGCAATGGCTCCAGGTCCATATCCCATCAGT
GGTGCAACCCCTTCAGCTCCAGCTCCTGGACCAGGGGATGAAGACA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2BZ12TF 800 0 0
GGAGCTTTTCACTATCTATCACACAAGATGGGTCTCAACGCCTCCTTTTCTCTCCTCTCG
CTAACCCTCTTACTCCTCTTCTCTACCCTTGTTACAGCCGATAACATCACACACGCGTTT
GAGAAATACTCCAATTTCAGCACAATGAGTGACCTCTTCACCAGTACCAAGCTCACTACA
CTCATAAGCAAATACCAAACCATAACCCTACTCGCTGTTAACAACAGCGCCATCGGTTCT
ATCACTAACAAGTCCGCCATTGAGCTCAAGAACATCCTCATGACTCATGTCATTCTTGAC
TACTACGACGAGCTCAAGCTCAAGGGGATGAAGGAGACGAGCATGATGCTCACTACCCTG
TACCAAACAACCGGTTTGGGTGAAGAGATGAACGGTTTCCTCAACTGTACCAAATCTAAA
GGAAGAGTTTACTTTGGATCCGGAGTAAAGGGCTCGCCTCTAAACGCTGAGTATGTTACC
ACGTTGTATCACAACCCTTTTAACCTGTCTATAATCCAGATTAGCATGCCCATTGTGGCT
CCTGGACTCAGCTTAGCAGTTCTCCCACCTCCACCACCACCCGTTCCTTTGGCTCCAGCT
CCAGCTCCGGCTCCATCTCCTATGCATGCTGCAATGGCTCCAGGTCCATATCCCATCAGT
GGTGCAACCCCTTCAGCTCC*GCTCCTGGACCAGGGGATGAAGACA*TGCCTCAGATAGT
AATGATCCAAA*CTTACACCTGAAGCAGAGACACCTGAAGCAGAGACAC*TGAAGTTGAT
TCTCCTGCACCTACTCCAAG

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2CH71JQ 794 0 0
ATGAGTGACCTCTTCACCAGTACCAAGCTCACTACACTCATAAGCAAATACCAAACCATA
ACCCTACTCGCTGTTAACAACAGCGCCATCGGTTCTATCACTAACAAATCCGCCATTGAG
CTCAAGAACATCCTCATGACTCATGTCATTCTTGACTACTACGACGAGCTCAAGCTCAAG
GGGATGAAGGAGACGAGCATGATGCTCACTACCCTGTACCAAACAACCGGTTTGGGTGAA
GAGATGAACGGTTTCCTCAACTGTACCAAATCTAAAGGAAGAGTTTACTTTGGATCCGGA
GTAAAGGGCTCGCCTCTAAACGCTGAGTATGTTACCACGTTGTATCACAACCCTTTTAAC
CTGTCTATAATCCAGATTAGCATGCCCATTGTGGCTCCTGGACTCAGCTTAGCAGTTCTC
CCACCTCCACCACCACCCGTTCCTTTGGCTCCAGCTCCAGCTCCGGCTCCATCTCCTATG
CATGCTGCAATGGCTCCAGGTCCATATCCCATCAGTGGTGCAACCCCTTCAGCTCCAGCT
CCTGGACCAGGGGATGAAGACAATGCCTCAGATAGTAATGATCCAAAACTTACACCTGAA
GCAGAGACACCTGAAGCAGAGACACCTGAAGTTGATTCTCCTGCACCTACTCCAAGCGCT
GATAATGAGAAGATTGAAGCTGCTGATAAGGCTGGGAAGACCTCTTCTGCTTGTAAGGCA
CGTTTTAGCTTTGAAGTTGTTCTCTTGCTAGTATTTTTTGTTAGCTTTGCTTGGTTTTAA
GTTGGAGTTTAGAT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2BZ12JQ 655 0 0
GCTCGCCTCTAAACGCTGAGTATGTTACCACGTTGTATCACAACCCTTTTAACCTGTCTA
TAATCCAGATTAGCATGCCCATTGTGGCTCCTGGACTCAGCTTAGCAGTTCTCCCACCTC
CACCACCACCCGTTCCTTTGGCTCCAGCTCCAGCTCCGGCTCCATCTCCTATGCATGCTG
CAATGGCTCCAGGTCCATATCCCATCAGTGGTGCAACCCCTTCAGCTCCGGCTCCTGGAC
CAGGGGATGAAGACAATGCCTCAGATAGTAATGATCCAAAACTTACACCTGAAGCAGAGA
CACCTGAAGCAGAGACACCTGAAGTTGATTCTCCTGCACCTACTCCAAGCGCTGATAATG
AGAAGATTGAAGCTGCTGATAAGGCTGGGAAGACCTCTTCTGCTTGTAAGGCACGTTTTA
GCTTTGAAGTTGTTCTCTTGCTAGTATTTTTTGTTAGCTTTGCTTGGTTTTAAGTTGGAG
TTTAGATGATGTAGTCTGATGACAATAATGGTAGATGAGATTCAAAACATTCATTCATTC
ATTCATTCAGTCTGTAGTTTTCTTTACCAAGAAGAGAGACGAGTGTGATCATTGTTCTGT
TGAACTTGTTACACAGTTCTAATTCCAAGTGTGTAATATAGAGCATAGATTAACC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 4

CO CL2691Contig1 1352 4 15 U
GGATCTCTCTCTATCTATCTCCTTCATTTGCTCTGTCCGCTGTGATCTTTTTTTTCTCTT
CTGCTTTGCTTTTATCCAAAAGGGATAGTTTAAAAGTGCCGATCTTGCTCTGATAACTTC
TCGAGTTCGTGGAAATGGGTTCTTCCGTGGAGCAGAACATTCTTGTTACGGGTGGTGCTG
GATTTATTGGGACACATACTGTTGTTCAGCTTCTGAAAGAGGGTTTCAAGGTTTCGATCA
TCGATAATCTTGATAACTCTGTTATCGAAGCCGTCGATAGGGTTAGGGAGCTCGTTGGTC
CTGATCTCTCCAAGAAGCTTGAGTTTAATCTGGGTGATCTAAGAAACAAAGGGGATATTG
AGAAACTCTTTTCCAAGCAGAGATTTGATGCTGTGATCCATTTTGCGGGTCTTAAAGCTG
TGGGTGAAAGTGTTGGCAACCCTCGTCGCTACTTTGACAATAACTTGGTCGGAACAATCA
ATCTATATGAGACCATGGCAAAGTACAACTGCAAAATGATGGTGTTTTCATCATCTGCAA
CTGTTTATGGACAACCTGAGAAAATTCCATGCGTGGAAGACTTTGAATTGAAAGCAATGA
ATCCTTATGGCCGTACTAAGCTGTTTCTTGAAGAAATAGCTAGAGATATCCACGCAGCGG
AACCAGAATGGAGGATTGTTCTGCTGAGGTACTTCAATCCTGTGGGAGCGCATGAGAGTG
GCAGAATTGGTGAGGATCCAAAGGGAATCCCCAATAACCTCATGCCTTATATCCAACAAG
TGGCTGTGGGACGTCTACCTGAGCTCAATGTCTACGGACATGACTACCCTACCGAGGATG
GTAGTGCGGTAAGAGACTACATCCATGTGATGGATTTGGCAGATGGCCATATCGCTGCGC
TAAGGAAGCTATTTGCTGATCCGACTATCGGCTGTACTGCTTACAATCTAGGGACTGGAC
GAGGAACGTCTGTGTTAGAAATGGTTGCAGCTTTTGAAAAAGCTTCCGGCAAGAAAATAC
CTATCAAGCTCTGTCCAAGAAGGGCAGGAGATGCAACTGCAGTTTATGCCTCAACAGAGA
GAGCTGAGAAAGAACTAGGCTGGAAGGCAAAATACGGAGTTGATGAGATGTGCAGAGATC
AGTGGAACTGGGCAAACAACAATCCATGGGGCTACCAGAAGAAGCTTTGAGTGCTCACAT
TTCTCTCTCTGTTTTTCTTAGTTACCATGTCTAATCACCCAATATAAAAGAAAAGTGTGT
ATACACATCATATAGTGTTTACTTTGTTTTCTATGTATCAAACCAGTCTCCTACTTCATT
GAATAAATAGCTTTATACACATCAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG25TF U 1
AF RR2EH74TF U 436
AF RR2DG25JQ C 597
AF RR2EH74JQ C 623
BS 1 469 RR2DG25TF
BS 470 470 RR2EH74TF
BS 471 688 RR2DG25TF
BS 689 689 RR2EH74TF
BS 690 725 RR2DG25TF
BS 726 726 RR2EH74TF
BS 727 739 RR2DG25TF
BS 740 1043 RR2EH74TF
BS 1044 1132 RR2DG25JQ
BS 1133 1133 RR2EH74JQ
BS 1134 1299 RR2DG25JQ
BS 1300 1300 RR2EH74JQ
BS 1301 1316 RR2DG25JQ
BS 1317 1317 RR2EH74JQ
BS 1318 1352 RR2DG25JQ

RD RR2DG25TF 739 0 0
GGATCTCTCTCTATCTATCTCCTTCATTTGCTCTGTCCGCTGTGATCTTTTTTTTCTCTT
CTGCTTTGCTTTTATCCAAAAGGGATAGTTTAAAAGTGCCGATCTTGCTCTGATAACTTC
TCGAGTTCGTGGAAATGGGTTCTTCCGTGGAGCAGAACATTCTTGTTACGGGTGGTGCTG
GATTTATTGGGACACATACTGTTGTTCAGCTTCTGAAAGAGGGTTTCAAGGTTTCGATCA
TCGATAATCTTGATAACTCTGTTATCGAAGCCGTCGATAGGGTTAGGGAGCTCGTTGGTC
CTGATCTCTCCAAGAAGCTTGAGTTTAATCTGGGTGATCTAAGAAACAAAGGGGATATTG
AGAAACTCTTTTCCAAGCAGAGATTTGATGCTGTGATCCATTTTGCGGGTCTTAAAGCTG
TGGGTGAAAGTGTTGGCAACCCTCGTCGCTACTTTGACAATAACTTGGTTGGAACAATCA
ATCTATATGAGACCATGGCAAAGTACAACTGCAAAATGATGGTGTTTTCATCATCTGCAA
CTGTTTATGGACAACCTGAGAAAATTCCATGCGTGGAAGACTTTGAATTGAAAGCAATGA
ATCCTTATGGCCGTACTAAGCTGTTTCTTGAAGAAATAGCTAGAGATATCCACGCAGCGG
AACCAGAATGGAGGATTGTTCTGCTGAG*TACTTCAATCCTGTGGGAGCGCATGAGAGTG
GCAGA*TTGGTGAGGATCC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2EH74TF 608 0 0
GCAACCCTCGTCGCTACTTTGACAATAACTTGGTCGGAACAATCAATCTATATGAGACCA
TGGCAAAGTACAACTGCAAAATGATGGTGTTTTCATCATCTGCAACTGTTTATGGACAAC
CTGAGAAAATTCCATGCGTGGAAGACTTTGAATTGAAAGCAATGAATCCTTATGGCCGTA
CTAAGCTATTTCTTGAAGAAATAGCTAGAGATATCCACGCAGCGGAACCAGAATGGAGGA
TTGTTCTGCTGAGGTACTTCAATCCTGTGGGAGCGCATGAGAGTGGCAGAATTGGTGAGG
ATCCAAAGGGAATCCCCAATAACCTCATGCCTTATATCCAACAAGTGGCTGTGGGACGTC
TACCTGAGCTCAATGTCTACGGACATGACTACCCTACCGAGGATGGTAGTGCGGTAAGAG
ACTACATCCATGTGATGGATTTGGCAGATGGCCATATCGCTGCGCTAAGGAAGCTATTTG
CTGATCCGACTATCGGCTGTACTGCTTACAATCTAGGGACTGGACGAGGAACGTCTGTGT
TAGAAATGGTTGCAGCTTTTGAAAAAGCTTCCGGCAAGAAAATACCTATCAAGCTCTGTC
CAAGAAGG

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2DG25JQ 756 0 0
AATGAAT
CTTATGGCCGTACTAAGCTGTTTCTTGAAGAAATAGCTAGAGATATCCACGCAGCGGAAC
CAGAATGGAGGATTGTTCTGCTGAGGTACTTCAATCCTGTGGGAGCGCATGAGAGTGGCA
GAATTGGTGAGGATCCAAAGGGAATCCCCAATAACCTCATGCCTTATATCCAACAAGTGG
CTGTGGGACGTCTACCTGAGCTCAATGTCTACGGACATGACTACCCTACCGAGGATGGTA
GTGCGGTAAGAGATTACATCCATGTGATGGATTTGGCAGATGGCCATATCGCTGCGCTAA
GGAAGCTATTTGCTGATCCGACTATCGGCTGTACTGCTTACAATCTAGGGACTGGACGAG
GAACGTCTGTGTTAGAAATGGTTGCAGCTTTTGAAAAAGCTTCCGGCAAGAAAATACCTA
TCAAGCTCTGTCCAAGAAGGGCAGGAGATGCAACTGCAGTTTATGCCTCAACAGAGAGAG
CTGAGAAAGAACTAGGCTGGAAGGCAAAATACGGAGTTGATGAGATGTGTAGAGATCAGT
GGAACTGGGCAAACAACAATCCATGGGGCTACCAGAAGAAGCTTTGAGTGCTCACATTTC
TCTCTCTGTTTTTCTTAGTTACCATGTCTAATCACCCAATATAAAAGAAAAGTGTGTATA
CACATCATATAGTGTTTACTTTGTTTTCTATGTATCGAACCAGTCTCCTACTTGATTGAA
TAAATAGCTTTATACACATCAAAAAAAAA

QA 8 756 8 756
DS 

RD RR2EH74JQ 719 0 0
A
TTTCTTGAAGAAATAGCTAGAGATATCCACGCAGCGGAACCAGAATGGAGGATTGTTCTG
CTGAGGTACTTCAATCCTGTGGGAGCGCATGAGAGTGGCAGAATTGGTGAGGATCCAAAG
GGAATCCCCAATAACCTCATGCCTTATATCCAACAAGTGGCTGTGGGACGTCTACCTGAG
CTCAATGTCTACGGACATGACTACCCTACCGAGGATGGTAGTGCGGTAAGAGACTACATC
CATGTGATGGATTTGGCAGATGGCCATATCGCTGCGCTAAGGAAGCTATTTGCTGATCCG
ACTATCGGCTGTACTGCTTACAATCTAGGGACTGGACGAGGAACGTCTGTGTTAGAAATG
GTTGCAGCTTTTGAAAAAGCTTCCGGCAAGAAAATACCTATCAAGCTCTGTCCAAGAAGG
GCAGGAGATGCAACTGCAGTTTATGCCTCAACAGAGAGAGCTGAGAAAGAACTAGGCTGG
AAGGCAAAATACGGAGTTGATGAGATGTGCAGAGATCAGTGGAACTGGGCAAACAACAAT
CCATGGGGCTACCAGAAGAAGCTTTGAGTGCTCACATTTCTCTCTCTGTTTTTCTTAGTT
ACCATGTCTAATCACCCAATATAAAAGAAAAGTGTGTATACACATCATATAGTGTTTACT
TTGTTTTCTATGTATCAAACCAGTCTCCTACTTCATTGAATAAATAGCTTT
TATACAC

QA 2 712 2 712
DS 



AS 1 4

CO CL2692Contig1 1155 4 8 U
GGAAACACTAAGAATCTCCACTAATATCCCCCACTACCTTAAAGCAACCGTTCCCTCTTG
CTCCCAATAACCACGACGCCACATTCACTAAAACGTTGCAGAAAACAATCATCAAATTCG
AATAACAAACCTCTCTTTCTCTATATAATATCCGATTCCATCCATTAGAGTGAGAAACAA
AAAGAGATCACGAAATGATTCGAGTAAGCAACTTCGTTGTGGGTCTAGCCAACACGTTGA
TAATGTTAGCGGGCGCATCAGCCATTGGTTATTCGATTTACATGTTCGCTCACCAAGACG
TGACCAATTGTGAAACCGCGATTCGGACACCACTTCTCACGACCGGTGTCGTCCTCTTCG
CGGTGTCGTTGCTAGGAGTGATAGGATCTTGCTGCAAAGAGAATCTCGCCATGGTCTCGT
ACTTGATCGTACTCCTTGCGGGCATTGTTGCGTTAATGGGTTTCTCGATATTTCTAGTCT
TCGTGACTAACAAAGGAGCCGGTCGTGTGGTCTCTGGTCGAGGCTATAGAGAGTACCAGA
CCATGGATTTCTCGACATGGCTTAACAGTTTCGTCGATGGGAAGAGATGGGTTGGTATAA
GATCTTGTTTGGCTGAAGCTAGCGTTTGTGATGATTTGAATGATGGTCCTGTTAGTCAGA
TCGCTGATGAGTCTTATCACAAGAACTTGTCTCCACTCCAGTCTGGTTGTTGTAAGCCAC
CGTCAGATTGCAACTTTGAGTTCAAAAACGCAACGTTCTGGACACCACCAGCGAAAAACG
AAACGGTTGTCGCGACCAATAACGGTGACTGCGGTGCATGGAGTAACGTGCAAACGGAGT
TATGTTTTAACTGCAACGCATGCAAAGCTGGAGCGTTGGCGAATATTAGAGAGAAGTGGA
GGAACCTTTTGATTTTCAACGTTTGTCTCATCATCCTCCTCATCACCGTCTATTCATGCG
GTTGTTGTGCTCGTCGTAACAATCGTATGGTTGGGAAAAGTGGTTTTGCCTGATCACTGA
CTACATTTTCATTTGTAGCTTTTAAGTGTTATTTTTGTTTGTTGGTTTGTTTCAGTTAAT
TTATCTTTTGGATTCTTAGGACAAAGTCATGTTTGTTTCCGACCATTCATCATGAATCTA
TCACATTTCACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2D412TF U 1
AF RR2G101TF U 67
AF RR2D412JQ C 441
AF RR2G101JQ C 458
BS 1 185 RR2D412TF
BS 186 187 RR2G101TF
BS 188 672 RR2D412TF
BS 673 673 RR2G101TF
BS 674 747 RR2D412TF
BS 748 748 RR2D412JQ
BS 749 765 RR2D412TF
BS 766 1155 RR2D412JQ

RD RR2D412TF 772 0 0
GGAAACACTAAGAATCTCCACTAATATCCCCCACTACCTTAAAGCAACCGTTCCCTCTTG
CTCCCAATAACCACGACGCCACATTCACTAAAACGTTGCAGAAAACAATCATCAAATTCG
AATAACAAACCTCTCTTTCTCTATATAATATCCGATTCCATCCATTAGAGTGAGAAACAA
AAAGA**TCACGAAATGATTCGAGTAAGCAACTTCGTTGTGGGTCTAGCCAACACGTTGA
TAATGTTAGCGGGCGCATCAGCCATTGGTTATTCGATTTACATGTTCGCTCACCAAGACG
TGACCAATTGTGAAACCGCGATTCGGACACCACTTCTCACGACCGGTGTCGTCCTCTTCG
CGGTGTCGTTGCTAGGAGTGATAGGATCTTGCTGCAAAGAGAATCTCGCCATGGTCTCGT
ACTTGATCGTACTCCTTGCGGGCATTGTTGCGTTAATGGGTTTCTCGATATTTCTAGTCT
TCGTGACTAACAAAGGAGCCGGTCGTGTGGTCTCTGGTCGAGGCTATAGAGAGTACCAGA
CCATGGATTTCTCGACATGGCTTAACAGTTTCGTCGATGGGAAGAGATGGGTTGGTATAA
GATCTTGTTTGGCTGAAGCTAGCGTTTGTGATGATTTGAATGATGGTCCTGTTAGTCAGA
TCGCTGATGAGTTTTATCACAAGAACTTGTCTCCACTCCAGTCTGGTTGTTGTAAGCCAC
CGTCAGATTGCAACTTTGAGTTCAAAA*CGCAACGTTCTGGACAC
CACCAGC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2G101TF 711 0 0
GG
AACCACGACGCCACATTCACTAAAACGTTGCAGAAAACAATCATCAAATTCGAATAACAA
ACCTCTCTTTCTCTATATAATATCCGATTCCATCCATTAGAGTGAGAAACAAAAAGAGAT
CACGAAATGATTCGAGTAAGCAACTTCGTTGTGGGTCTAGCCAACACGTTGATAATGTTA
GCGGGCGCATCAGCCATTGGTTATTCGATTTACATGTTCGCTCACCAAGACGTGACCAAT
TGTGAAACCGCGATTCGGACACCACTTCTCACGACCGGTGTCGTCCTCTTCGCGGTGTCG
TTGCTAGGAGTGATAGGATCTTGCTGCAAAGAGAATCTCGCCATGGTCTCGTACTTGATC
GTACTCCTTGCGGGCATTGTTGCGTTAATGGGTTTCTCGATATTTCTAGTCTTCGTGACT
AACAAAGGAGCCGGTCGTGTGGTCTCTGGTCGAGGCTATAGAGAGTACCAGACCATGGAT
TTCTCGACATGGCTTAACAGTTTCGTCGATGGTAAGAGATGGGTTGGTATAAGATCTTGT
TTGGCTGAAGCTAGCGTTTGTGATGATTTGAATGATGGTCCTGTTAGTCAGATTGCTGAT
GAGTCTTATCACAAGAACTTGTCTCCACTCCAGTCTGGTTGTTGTAAGCCACCGTCAGAT
TGCAACTTTGAGTTCAAAA*CGCAACGTTCTGGACAC
ACCAGCGAAAAA

QA 3 699 3 699
DS 

RD RR2D412JQ 715 0 0
GGCATTGTTGCGTTAATGGGTTTCTCGATATTTCTAGTCTTCGTGACTAACAAAGGAGCC
GGTCGTGTGGTCTCTGGTCGAGGCTATAGAGAGTACCAGACCATGGATTTCTCGACATGG
CTTAACAGTTTCGTCGATGGGAAGAGATGGGTTGGTATAAGATCTTGTTTGGCTGAAGCT
AGCGTTTGTGATGATTTGAATGATGGTCCTGTTAGTCAGATCGCTGATGAGTTTTATCAC
AAGAACTTGTCTCCACTCCAGTCTGGTTGTTGTAAGCCACCGTCAGATTGCAACTTTGAG
TTCAAAAACGCAACGTTCTGGACACCACCAGCGAAAAACGAAACGGTTGTCGCGACCAAT
AACGGTGACTGCGGTGCATGGAGTAACGTGCAAACGGAGTTATGTTTTAACTGCAACGCA
TGCAAAGCTGGAGCGTTGGCGAATATTAGAGAGAAGTGGAGGAACCTTTTGATTTTCAAC
GTTTGTCTCATCATCCTCCTCATCACCGTCTATTCATGCGGTTGTTGTGCTCGTCGTAAC
AATCGTATGGTTGGGAAAAGTGGTTTTGCCTGATCACTGACTACATTTTCATTTGTAGCT
TTTAAGTGTTATTTTTGTTTGTTGGTTTGTTTCAGTTAATTTATCTTTTGGATTCTTAGG
ACAAAGTCATGTTTGTTTCCGACCATTCATCATGAATCTATCACATTTCACTTTT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2G101JQ 695 0 0
GGGTTTCTCGATATTTCTAGTCTTCGTGACTAACAAAGGAGCCGGTCGTGTGGTCTCTGG
TCGAGGCTATAGAGAGTACCAGACCATGGATTTCTCGACATGGCTTAACAGTTTCGTCGA
TGGTAAGAGATGGGTTGGTATAAGATCTTGTTTGGCTGAAGCTAGCGTTTGTGATGATTT
GAATGATGGTCCTGTTAGTCAGATTGCTGATGAGTCTTATCACAAGAACTTGTCTCCACT
CCAGTCTGGTTGTTGTAAGCCACCGTCAGATTGCAACTTTGAGTTCAAAAACGCAACGTT
CTGGACACCACCAGCGAAAAACGAAACGGTTGTCGCGACCAATAACGGTGACTGCGGTGC
ATGGAGTAACGTGCAAACGGAGTTATGTTTTAACTGCAACGCATGCAAAGCTGGAGCGTT
GGCGAATATTAGAGAGAAGTGGAGGAACCTTTTGATTTTCAACGTTTGTCTCATCATCCT
CCTCATCACCGTCTATTCATGCGGTTGTTGTGCTCGTCGTAACAATCGTATGGTTGGGAA
AAGTGGTTTTGCCTGATCACTGACTACATTTTCATTTGTAGCTTTTAAGTGTTATTTTTG
TTTGTTGGTTTGTTTCAGTTAATTTATCTTTTGGATTCTTAGGACAAAGTCATGTTTGTT
TCCGACCATTCATCATGAATCTATCACATTTCACT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL2693Contig1 1089 2 8 U
TTTTTCTTGGTTGGATAATGTCAGCCCCCTCCTCCTGCTTCGCAATTCCCTTATCTTCTT
CTCGATCATCTTCAAATGCCATCCCCAAATGCAAAACGTTAACCTCTTCTTGCTTTTACG
TAGCTTCTCTGAAAGCTTCTTCCACCTCTTTCTACATATCTTCTTTTCCTCGCCAACGAC
TGCAACTCAAGGTCTCTTCTTCTTCTTCATCAGAATTATCAGTTCTGGATGAAGAGAAAG
TAGAAGAAGAAGTTAAAGTTAAAGTTGATGGAGAGACATGAGAAGAAACCGAAGCGGAGC
CAGTGGTGACGAAGAAACCCAGACCTTGCGAGCTATACGTTTGTAATATCCCAAGAAGCT
ATGACATTACTCAGCTTCTCGAAATGTTTCAGTCTTTTGGAACTGTCATCTCCGTCGAGG
TATCTCGAAATCCAGAGACTGGAGAGAGCCGTGGAAGCGGTTATGTCACAATGGGTTCTA
TCAACTCTGCCAAAAACGCCATTGCTTCTCTTGATGGAAATGAAGTAGGTGGTCGGGAGA
TGCGGGTTAGGTACTCTGTTGACATGAATCCAGGAACCAGAAAAAACACATCAGCCTTGA
ACTCAACACCTAAGAAGATTCTCATATACGAAAGCCCATACAAGGTTTATGTCGGAAACC
TCCCTTGGCTCACGCAGCCTGATGGTTTGAGAGACCACTTTAGCCAGTTTGGTACAGTCG
TTAGCACCAGAGTGTTGCACGACCGCAAGACTGGGAAAAACAGAGTCTTTGCCTTTCTTT
CCTTTGCAAGCCTTGACGAACGTGATGCTGCTCTTTCGCTCAATGGAACAGAGTATGAAG
GTCGCAGAATCATAGTCAGACAAGGTATCGAGAGGACCGAGTCTTAAAAACCACCAGTTC
CCCTTTTGCTGCGAAAACATTCTCTTCAAAACAAGTAACCCCTTTTTATTTCGCTCTGTT
TTTTTTTTTCTTGAAGTTCCTTATTACTCTTCAATTGTAACTTTCCATCTACATTTACTT
TTACCAATGAAGTGTAATCGTCACTGTCAGTCAATCTCCTCAAGCGTCTAAGTGCAGTGC
TTTGTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C024TF U 1
AF RR2C024JQ C 257
BS 1 642 RR2C024TF
BS 643 643 RR2C024JQ
BS 644 695 RR2C024TF
BS 696 696 RR2C024JQ
BS 697 747 RR2C024TF
BS 748 748 RR2C024JQ
BS 749 760 RR2C024TF
BS 761 1089 RR2C024JQ

RD RR2C024TF 760 0 0
TTTTTCTTGGTTGGATAATGTCAGCCCCCTCCTCCTGCTTCGCAATTCCCTTATCTTCTT
CTCGATCATCTTCAAATGCCATCCCCAAATGCAAAACGTTAACCTCTTCTTGCTTTTACG
TAGCTTCTCTGAAAGCTTCTTCCACCTCTTTCTACATATCTTCTTTTCCTCGCCAACGAC
TGCAACTCAAGGTCTCTTCTTCTTCTTCATCAGAATTATCAGTTCTGGATGAAGAGAAAG
TAGAAGAAGAAGTTAAAGTTAAAGTTGATGGAGAGACATGAGAAGAAACCGAAGCGGAGC
CAGTGGTGACGAAGAAACCCAGACCTTGCGAGCTATACGTTTGTAATATCCCAAGAAGCT
ATGACATTACTCAGCTTCTCGAAATGTTTCAGTCTTTTGGAACTGTCATCTCCGTCGAGG
TATCTCGAAATCCAGAGACTGGAGAGAGCCGTGGAAGCGGTTATGTCACAATGGGTTCTA
TCAACTCTGCCAAAAACGCCATTGCTTCTCTTGATGGAAATGAAGTAGGTGGTCGGGAGA
TGCGGGTTAGGTACTCTGTTGACATGAATCCAGGAACCAGAAAAAACACATCAGCCTTGA
ACTCAACACCTAAGAAGATTCTCATATACGAAAGCCCATACA*GGTTTATGTCGGAAACC
TCCCTTGGCTCACGCAGCCTGATGGTTTGAGAGAC*ACTTTAGCCAGTTTGGTACAGTCG
TTAGCACCAGAGTGTTGCACGACCGCA*GACTGGGAAAAA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2C024JQ 833 0 0
AGTTAAAGTTGATGGAGAGACATGAGAAGAAACCGAAGCGGAGCCAGTGGTGACGAAGAA
ACCCAGACCTTGCGAGCTATACGTTTGTAATATCCCAAGAAGCTATGACATTACTCAGCT
TCTCGAAATGTTTCAGTCTTTTGGAACTGTCATCTCCGTCGAGGTATCTCGAAATCCAGA
GACTGGAGAGAGCCGTGGAAGCGGTTATGTCACAATGGGTTCTATCAACTCTGCCAAAAA
CGCCATTGCTTCTCTTGATGGAAATGAAGTAGGTGGTCGGGAGATGCGGGTTAGGTACTC
TGTTGACATGAATCCAGGAACCAGAAAAAACACATCAGCCTTGAACTCAACACCTAAGAA
GATTCTCATATACGAAAGCCCATACAAGGTTTATGTCGGAAACCTCCCTTGGCTCACGCA
GCCTGATGGTTTGAGAGACCACTTTAGCCAGTTTGGTACAGTCGTTAGCACCAGAGTGTT
GCACGACCGCAAGACTGGGAAAAACAGAGTCTTTGCCTTTCTTTCCTTTGCAAGCCTTGA
CGAACGTGATGCTGCTCTTTCGCTCAATGGAACAGAGTATGAAGGTCGCAGAATCATAGT
CAGACAAGGTATCGAGAGGACCGAGTCTTAAAAACCACCAGTTCCCCTTTTGCTGCGAAA
ACATTCTCTTCAAAACAAGTAACCCCTTTTTATTTCGCTCTGTTTTTTTTTTTCTTGAAG
TTCCTTATTACTCTTCAATTGTAACTTTCCATCTACATTTACTTTTACCAATGAAGTGTA
ATCGTCACTGTCAGTCAATCTCCTCAAGCGTCTAAGTGCAGTGCTTTGTTATT

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 4

CO CL2694Contig1 1018 4 9 U
ACGACAATAACACAAGTACACACGGTAATAATATTATTCCCCCCATTACGGGCACACACA
ACACATACCACTGTAATCAGCTCTGTTTCTCACGATTAAAAACGTGTTTGGAGACAAGTA
AAAAACAAACGATGTTTACTTGAAGCCACCAAACCCTTTATTCTAATTTGCAAGAAAAAC
TGAAACTTTTATTTCCTACGAATGAGAGATGTAGAAGAATTAAGCTTCAGCAATGTCAAT
GGTGAGAAAAGAACAAAAAAAAACAAAAACATAGAAGTTGAATCTTTAATTCAATGGGTG
GAGACTCTGAGGCTGAAGGACTTGTTGATCCAAGCCTTAAAGCTTCCTCCTTTTCTAGCT
CCATCACCTCCCTT*AACCACCTTATTCTTCTCCTCTGGCTTTCTACACAGAGTAAAGTT
CCTCGCACCAAGCGTTCCAATCCCTTTCCACGCGCTTAAAGCTTCAGGTCCAACCATGGG
ACAATAGAGAATAAAATCATTAAAGTCGGATCCTAGAAGAGGGAGACGACCTTCACGAGC
GTAGCACTTGAGAGCAGTGTCGATAACAGAAGCGACTAAATCTTCTTGGTACGCAAGGAA
CCGGATCGGACCGGCGCTACCGAGAACCGTAATGCTGACAAGGATTCTTTGTCCCTTAGC
GTTCTTCTTCTGCTTGTTGTACAACAACATCTTCGAAAGCTTTCAAGAAAAACAGAACAA
AGCAAAACCCTAAATCTACGTAAAGTTGTTGATGGGAGATTCACGGGTCGAGGCCGAGGC
AGCGGAAGTACCAGCCTTCTTTGCAGGAACCGAAAGAGGAAGCAGTGAGGAGGAGTCTCG
CTCTTTGGATGGGAAGGGAGAAAGTAAACTTATCACCGATCGGATTCGTTTCCACCATTC
ACAAAACTATTCCACAGAGAAAATATGATCGAGACCGAAAGGGAGAAGCAGTTTTTTGGT
TTTGCAGATGGGATAAGGCAGAGAAGATTGTTGTGAGGAAGAGGGAGAATGAATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FT14JQ U 1
AF RR2DL88JQ U 32
AF RR2FT14TF C 351
AF RR2DL88TF C 353
BS 1 673 RR2FT14JQ
BS 674 778 RR2DL88JQ
BS 779 779 RR2FT14TF
BS 780 806 RR2DL88JQ
BS 807 964 RR2FT14TF
BS 965 965 RR2DL88TF
BS 966 1005 RR2FT14TF
BS 1006 1006 RR2DL88TF
BS 1007 1018 RR2FT14TF

RD RR2FT14JQ 673 0 0
ACGACAATAACACAAGTACACACGGTAATAATATTATTCCCCCCATTACGGGCACACACA
ACACATACCACTGTAATCAGCTCTGTTTCTCACGATTAAAAACGTGTTTGGAGACAAGTA
AAAAACAAACGATGTTTACTTGAAGCCACCAAACCCTTTATTCTAATTTGCAAGAAAAAC
TGAAACTTTTATTTCCTACGAATGAGAGATGTAGAAGAATTAAGCTTCAGCAATGTCAAT
GGTGAGAAAAGAACAAAAAAAAACAAAAACATAGAAGTTGAATCTTTAATTCAATGGGTG
GAGACTCTGAGGCTGAAGGACTTGTTGATCCAAGCCTTAAAGCTTCCTCCTTTTCTAGCT
CCATCACCTCCCTT*AACCACCTTATTCTTCTCCTCTGGCTTTCTACACAGAGTAAAGTT
CCTCGCACCAAGCGTTCCAATCCCTTTCCACGCGCTTAAAGCTTCAGGTCCAACCATGGG
ACAATAGAGAATAAAATCATTAAAGTCGGATCCTAGAAGAGGGAGACGACCTTCACGAGC
GTAGCACTTGAGAGCAGTGTCGATAACAGAAGCGACTAAATCTTCTTGGTACGCAAGGAA
CCGGATCGGACCGGCGCTACCGAGAACCGTAATGCTGACAAGGATTCTTTGTCCCTTAGC
GTTCTTCTTCTGC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2DL88JQ 782 0 0
TATTATTCCCCCCATTACGGGCACACACAACACATACCACTGTAATCAGCTCTGTTTCTC
ACGATTAAAAACGTGTTTGGAGACAAGTAAAAAACAAACGATGTTTACTTGAAGCCACCA
AACCCTTTATTCTAATTTGCAAGAAAAACTGAAACTTTTATTTCCTACGAATGAGAGATG
TAGAAGAATTAAGCTTCAGCAATGTCAATGGTGAGAAAAGAACAAAAAAAAACAAAAACA
TAGAAGTTGAATCTTTAATTCAATGGGTGGAGACTCTGAGGCTGAAGGACTTGTTGATCC
AAGCCTTAAAGCTTCCTCCTTTTCTAGCTCCATCACCTCCCTT*AACCACCTTATTCTTC
TCCTCTGGCTTTCTACACAGAGTAAAGTTCCTCGCACCAAGCGTTCCAATCCCTTTCCAC
GCGCTTAAAGCTTCAGGTCCAACCATGGGACAATAGAGAATAAAATCATTAAAGTCGGAT
CCTAGAAGAGGGAGACGACCTTCACGAGCGTAGCACTTGAGAGCAGTGTCGATAACAGAA
GCGACTAAATCTTCTTGGTACGCAAGGAACCGGATCGGACCGGCGCTACCGAGAACCGTA
ATGCTGACAAGGATTCTTTGTCCCTTAGCGTTCTTCTTCTGCTTGTTGTACAACAACATC
TTCGAAAGCTTTCAAGAAAAACAGAACAAAGCAAAACCCTAAATCTACGTAAAGTTGTTG
ATGGGAGATTCACGGGTCGAGGCCGAG*CAGCGGAAGTACCAGCCTTCTTTGCAG
AACCGAA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2FT14TF 668 0 0
TT
TTCTAGCTCCATCACCTCCCTT*AACCACCTTATTCTTCTCCTCTGGCTTTCTACACAGA
GTAAAGTTCCTCGCACCAAGCGTTCCAATCCCTTTCCACGCGCTTAAAGCTTCAGGTCCA
ACCATGGGACAATAGAGAATAAAATCATTAAAGTCGGATCCTAGAAGAGGGAGACGACCT
TCACGAGCGTAGCACTTGAGAGCAGTGTCGATAACAGAAGCGACTAAATCTTCTTGGTAC
GCAAGGAACCGGATCGGACCGGCGCTACCGAGAACCGTAATGCTGACAAGGATTCTTTGT
CCCTTAGCGTTCTTCTTCTGCTTGTTGTACAACATCATCTTCGAAAGCTTTCAAGAAAAA
CAGAACAAAGCAAAACCCTAAATCTACGTAAAGTTGTTGATGGGAGATTCACGGGTCGAG
GCCGAGGCAGCGGAAGTACCAGCCTTCTTTGCAGGAACCGAAAGAGGAAGCAGTGAGGAG
GAGTCTCGCTCTTTGGATGGGAAGGGAGAAAGTAAACTTATCACCGATCGGATTCGTTTC
CACCATTCACAAAACTATTCCACAGAGAAAATATGATCGAGACCGAAAGGGAGAAGCAGT
TTTTTGGTTTTGTAGATGGGATAAGGCAGAGAAGATTGTTGTGAGGAAGAGGGGGAATGA
ATGTCC

QA 3 668 3 668
DS 

RD RR2DL88TF 666 0 0
TTCTAGCTCCATCACCTCCCTTTAACCACCTTATTCTTCTCCTCTGGCTTTCTACACAGA
GTAAAGTTCCTCGCACCAAGCGTTCCAATCCCTTTCCACGCGCTTAAAGCTTCAGGTCCA
ACCATGGGACAATAGAGAATAAAATCATTAAAGTCGGATCCTAGAAGAGGGAGACGACCT
TCACGAGCGTAGCACTTGAGAGCAGTGTCGATAACAGAAGCGACTAAATCTTCTTGGTAC
GCAAGGAACCGGATCGGACCGGCGCTACCGAGAACCGTAATGCTGACAAGGATTCTTTGT
CCCTTAGCGTTCTTCTTCTGCTTGTTGTACAACAACATCTTCGAAAGCTTTCAAGAAAAA
CAGAACAAAGCAAAACCCTAAATCTACGTAAAGTTGTTGATGGGAGATTCACGGGTCGAG
GCCGAGGCAGCGGAAGTACCAGCCTTCTTTGCAGGAACCGAAAGAGGAAGCAGTGAGGAG
GAGTCTCGCTCTTTGGATGGGAAGGGAGAAAGTAAACTTATCACCGATCGGATTCGTTTC
CACCATTCACAAAACTATTCCACAGAGAAAATATGATCGAGACCGAAAGGGAGAAGCAGT
TTTTTGGTTTTGCCGATGGGATAAGGCAGAGAAGATTGTTGTGAGGAAGAGGGAGAATGA
ATGTCC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 3

CO CL2695Contig1 1160 3 2 U
CGCAACTTGTATATGGTTCTGATTCATTCAATAAAAGGACAAGTTACATTCAGTTCTGAT
CTGAGTTAACATTTACACACTGAACTCATGGAGAGAGACACAGACAGGAGCAGTTTTACA
GATTTGGTGACAAAGTTCATAATGTAATCAAAGCAAGTAAACTCTAGAATGTATAGTATT
CGAGTAAGATGACATATTATCCACTTGTACTGCGTCAGTGAGGCGATCGGTATCAGTAAT
TTGGCGTATTAATCCAAACGCACCAAGCCAGGGTCTGCATTGCAAGATATTGGAGGCTGT
CAAACATAAGATAGATTTCTCAGTTCTGTTAAGCATCAAGAACATTGTTTTTTCCTTTTA
TACCATAGTATGCTACAACAATCTACTTAATATTGTTCTCTTATTTGAGTTACAAAAAAT
ATAAAATAGCTCTCTTAGTTGTAATCTTTTACTTAACTTGAAACCATGTTACAGATCAAT
AATACCTGGTCTACGCTTCAGTTTGAGCCGTATTTTCATCTCCTTGAGGTGAATTGCTGC
TACTAGGCTTATCATTTCCACCATACCTCTTTCTTCCAAAATCGAAAGGAACGTATCTGT
ACTTGATCATGTGCACGATCTGTCGTTTCATAGTAAGAAAATACAGAAACAACCAGTAGC
AAAGCAAGATTGGCCAGAACACAGGCACATCCAAAAACGAGAAGAAGGTCATCACAAACG
CTACAACAAAAGCCTTAGTAGCTGCATACCAGAACTTGAACTCAGGAAGACGACGAACAA
AAGGCTTGAACTCATCAGAATCTTTACTAGTCTCAGAAGAAGCAGAAGCATGATCCAAGG
CTTCGAGCTCTGGATCGACTTTGGGAGAGAGGAAACCGATCAAGAGGTTTAAGATGTACG
TCGCGAGACCATACGAGACGACGAAGAATCCGTAAGCGTAGTAAACTCTGTAGATGTAGA
TCACGGCGGCGATTAGCGTCACTAGCCATCTTCGAACGAGGTGTGGAGCCGATTTGTCGA
GGCGATTCTGAAACGATTTCGAGAATTCGATTCTCCATCGAGCAAGCGGTGAATCGCTCA
CTGTGTATCCGTCTCCTTCGTTTCCTGATTCGTCTTCCATGGTTAAACCCTAATTCAATC
ACTGATTAAGATCACAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB66JQ U 501
AF RR2A402JQ U 1
AF RR2A402TF C 359
BS 1 779 RR2A402JQ
BS 780 1160 RR2A402TF

RD RR2FB66JQ 167 0 0
GTTTGAGCCGTATTTTCATCTCCTTGAGGGGAATTGCTGCTACTAGGCTTATCATTTCCA
CCATACCTCTTTTTTCCAAAATCGAAAGGAACGTATCTGTACTTGATCATGTGCACGATC
TGTCGTTTCATAGTAAGAAAATACAGAAACAACCAGTAGCAAAGCAA

QA 1 167 1 167
DS 

RD RR2A402JQ 779 0 0
CGCAACTTGTATATGGTTCTGATTCATTCAATAAAAGGACAAGTTACATTCAGTTCTGAT
CTGAGTTAACATTTACACACTGAACTCATGGAGAGAGACACAGACAGGAGCAGTTTTACA
GATTTGGTGACAAAGTTCATAATGTAATCAAAGCAAGTAAACTCTAGAATGTATAGTATT
CGAGTAAGATGACATATTATCCACTTGTACTGCGTCAGTGAGGCGATCGGTATCAGTAAT
TTGGCGTATTAATCCAAACGCACCAAGCCAGGGTCTGCATTGCAAGATATTGGAGGCTGT
CAAACATAAGATAGATTTCTCAGTTCTGTTAAGCATCAAGAACATTGTTTTTTCCTTTTA
TACCATAGTATGCTACAACAATCTACTTAATATTGTTCTCTTATTTGAGTTACAAAAAAT
ATAAAATAGCTCTCTTAGTTGTAATCTTTTACTTAACTTGAAACCATGTTACAGATCAAT
AATACCTGGTCTACGCTTCAGTTTGAGCCGTATTTTCATCTCCTTGAGGTGAATTGCTGC
TACTAGGCTTATCATTTCCACCATACCTCTTTCTTCCAAAATCGAAAGGAACGTATCTGT
ACTTGATCATGTGCACGATCTGTCGTTTCATAGTAAGAAAATACAGAAACAACCAGTAGC
AAAGCAAGATTGGCCAGAACACAGGCACATCCAAAAACGAGAAGAAGGTCATCACAAACG
CTACAACAAAAGCCTTAGTAGCTGCATACCAGAACTTGAACTCAGGAAGACGACGAACA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2A402TF 802 0 0
TATACCATAGTATGCTACAACAATCTACTTAATATTGTTCTCTTATTTGAGTTACAAAAA
ATATAAAATAGCTCTCTTAGTTGTAATCTTTTACTTAACTTGAAACCATGTTACAGATCA
ATAATACCTGGTCTACGCTTCAGTTTGAGCCGTATTTTCATCTCCTTGAGGTGAATTGCT
GCTACTAGGCTTATCATATCCACCATACCTCTTTCTTCCAAAATCGAAAGGAACGTATCT
GTACTTGATCATGTGCACGATCTGTCGTTTCATAGTAAGAAAATACAGAAACAACCAGTA
GCAAAGCAAGATTGGCCAGAACACAGGCACATCCAAAAACGAGAAGAAGGTCATCACAAA
CGCTACAACAAAAGCCTTAGTAGCTGCATACCAGAACTTGAACTCAGGAAGACGACGAAC
AAAAGGCTTGAACTCATCAGAATCTTTACTAGTCTCAGAAGAAGCAGAAGCATGATCCAA
GGCTTCGAGCTCTGGATCGACTTTGGGAGAGAGGAAACCGATCAAGAGGTTTAAGATGTA
CGTCGCGAGACCATACGAGACGACGAAGAATCCGTAAGCGTAGTAAACTCTGTAGATGTA
GATCACGGCGGCGATTAGCGTCACTAGCCATCTTCGAACGAGGTGTGGAGCCGATTTGTC
GAGGCGATTCTGAAACGATTTCGAGAATTCGATTCTCCATCGAGCAAGCGGTGAATCGCT
CACTGTGTATCCGTCTCCTTCGTTTCCTGATTCGTCTTCCATGGTTAAACCCTAATTCAA
TCACTGATTAAGATCACAATCC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 4

CO CL2696Contig1 1176 4 3 U
GGACTTGTTAACATTCCTACAAACTGTAGCCGAGAAAGACCATTCATTCCTTTTGTGCTA
TGATGATCATGTGATATCTCTTACTAGCTTCTTCTTTGTTCTGTAATAAAAATTAGAAAG
AAAAGATGGGTAGATCACCGTGCTGTGACAAGATGGGTTTGAAGAAAGGACCATGGACAT
CAGAAGAAGATCAGAAACTTTTGGCTTATATTGAATAACATGGGCATGGAAGTTGGCGTT
CACTGCCTGAGAAGGCTGGTCTCCATCGATGCGGCAAAAGTTGTAGACTTAGATGGACAA
ACTACCTAAGACCAGACATCAAAAGAGGCAAATTCAACTTGCAAGAAGAACAAACCATTA
TTCAACTCCACGCTCTCTTAGGAAACAGGTGGTCGGCGATAGCCACTCATTTGCCAAAGA
GAACAGACAACGAGATAAAGAACTACTGGAACACGCACTTGAAGAAACGGTTAGTTAAAA
TGGGGATAGATCCAGTGACTCATAAACCCAAAAACGAGACTCCTCTGTCTTCTTCTCTTG
GTGGTTTATCAAAGAACGCAGCCACACTTAGCCACATGGCTCAATGGGAAAGTGCTAGGC
TTGAAGCTGAAGCAAGGCTAGCTAGAGAGTCAAAGCTTCTTCTTTACCAAACCAAAGTAT
CATCATCATCATCATCTTCTCATCATCATCATCATCAGCAGCAGCTTGAATCTCCGACAT
CTACAGTGTCATTCTCGGAAGCCAAGACAGAGTTCGTCGGATCATCATCATCAGCATCAA
CGTGTCTAAATATGATCAAAGAAGCTGAAAACGATTGGATCAGTTCAACGATTCACGAGT
TCCAAGGAGTCGAAGAAAGCCTCACGGGTCTCTTGCTAGGTGGCGGTGATTCACTAGGCC
GGAGTTTTTCAGCCGATAAAAATGAGACGGCTGGCGAGACTAGTGGTGACTGTAACAACG
GTTACCATGAGGACAACAAGAACTATTTGGACAGCATTTTCAGCTTTGTGGATCCTTCGC
CGTCCGATTCAGCTCCTTTGTTCTGAATCAAGGGCTGATATCTCTCTAGGGGAATGTTTT
GGATTCTTTTTTTTTTGTCAACGAATGTTTTGGATTCTTTTAGTTCTTAATTTGTGGGGT
GTGTAAACTCTCTGATTAGATAAAAAAAAGTTTTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GW52TF U 1
AF RR2H947TF U 1
AF RR2GW52JQ C 344
AF RR2H947JQ C 439
BS 1 738 RR2GW52TF
BS 739 761 RR2H947TF
BS 762 1176 RR2GW52JQ

RD RR2GW52TF 738 0 0
GGACTTGTTAACATTCCTACAAACTGTAGCCGAGAAAGACCATTCATTCCTTTTGTGCTA
TGATGATCATGTGATATCTCTTACTAGCTTCTTCTTTGTTCTGTAATAAAAATTAGAAAG
AAAAGATGGGTAGATCACCGTGCTGTGACAAGATGGGTTTGAAGAAAGGACCATGGACAT
CAGAAGAAGATCAGAAACTTTTGGCTTATATTGAATAACATGGGCATGGAAGTTGGCGTT
CACTGCCTGAGAAGGCTGGTCTCCATCGATGCGGCAAAAGTTGTAGACTTAGATGGACAA
ACTACCTAAGACCAGACATCAAAAGAGGCAAATTCAACTTGCAAGAAGAACAAACCATTA
TTCAACTCCACGCTCTCTTAGGAAACAGGTGGTCGGCGATAGCCACTCATTTGCCAAAGA
GAACAGACAACGAGATAAAGAACTACTGGAACACGCACTTGAAGAAACGGTTAGTTAAAA
TGGGGATAGATCCAGTGACTCATAAACCCAAAAACGAGACTCCTCTGTCTTCTTCTCTTG
GTGGTTTATCAAAGAACGCAGCCACACTTAGCCACATGGCTCAATGGGAAAGTGCTAGGC
TTGAAGCTGAAGCAAGGCTAGCTAGAGAGTCAAAGCTTCTTCTTTACCAAACCAAAGTAT
CATCATCATCATCATCTTCTCATCATCATCATCATCAGCAGCAGCTTGAATCTCCGACAT
CTACAGTGTCATTCTCGG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2H947TF 761 0 0
GGACTTGTTAACATTCCTACAAACTGTAGCCGAGAAAGACCATTCATTCCTTTTGTGCTA
TGATGATCATGTGATATCTCTTACTAGCTTCTTCTTTGTTCTGTAATAAAAATTAGAAAG
AAAAGATGGGTAGATCACCGTGCTGTGACAAGATGGGTTTGAAGAAAGGACCATGGACAT
CAGAAGAAGATCAGAAACTTTTGGCTTATATTGAATAACATGGGCATGGAAGTTGGCGTT
CACTGCCTGAGAAGGCTGGTCTCCATCGATGCGGCAAAAGTTGTAGACTTAGATGGACAA
ACTACCTAAGACCAGACATCAAAAGAGGCAAATTCAACTTGCAAGAAGAACAAACCATTA
TTCAACTCCACGCTCTCTTAGGAAACAGGTGGTCGGCGATAGCCACTCATTTGCCAAAGA
GAACAGACAACGAGATAAAGAACTACTGGAACACGCACTTGAAGAAACGGTTAGTTAAAA
TGGGGATAGATCCAGTGACTCATAAACCCAAAAACGAGACTCCTCTGTCTTCTTCTCTTG
GTGGTTTATCAAAGAACGCAGCCACACTTAGCCACATGGCTCAATGGGAAAGTGCTAGGC
TTGAAGCTGAAGCAAGGCTAGCTAGAGAGTCAAAGCTTCTTCTTTACCAAACCAAAGTAT
CATCATCATCATCATCTTCTCATCATCATCATCATCAGCAGCAGCTTGAATCTCCGACAT
CTACAGTGTCATTCTCGGAAGCCAAGACAGAGTTCGTCGGA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2GW52JQ 833 0 0
AGAAGAACAAACCATTATTCAACTCCACGCTCTCTTAGGAAACAGGTGGTCGGCGATAGC
CACTCATTTGCCAAAGAGAACAGACAACGAGATAAAGAACTACTGGAACACGCACTTGAA
GAAACGGTTAGTTAAAATGGGGATAGATCCAGTGACTCATAAACCCAAAAACGAGACTCC
TCTGTCTTCTTCTCTTGGTGGTTTATCAAAGAACGCAGCCACACTTAGCCACATGGCTCA
ATGGGAAAGTGCTAGGCTTGAAGCTGAAGCAAGGCTAGCTAGAGAGTCAAAGCTTCTTCT
TTACCAAACCAAAGTATCATCATCATCATCATCTTCTCATCATCATCATCATCAGCAGCA
GCTTGAATTTCCGACATCTACAGTGTCATTCTCGGAAGCCAAGACAGAGTTCGTCGGATC
ATCATCATCAGCATCAACGTGTCTAAATATGATCAAAGAAGCTGAAAACGATTGGATCAG
TTCAACGATTCACGAGTTCCAAGGAGTCGAAGAAAGCCTCACGGGTCTCTTGCTAGGTGG
CGGTGATTCACTAGGCCGGAGTTTTTCAGCCGATAAAAATGAGACGGCTGGCGAGACTAG
TGGTGACTGTAACAACGGTTACCATGAGGACAACAAGAACTATTTGGACAGCATTTTCAG
CTTTGTGGATCCTTCGCCGTCCGATTCAGCTCCTTTGTTCTGAATCAAGGGCTGATATCT
CTCTAGGGGAATGTTTTGGATTCTTTTTTTTTTGTCAACGAATGTTTTGGATTCTTTTAG
TTCTTAATTTGTGGGGTGTGTAAACTCTCTGATTAGATAAAAAAAAGTTTTTC

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2H947JQ 738 0 0
AGAACTACTGGAACACGCACTTGAAGAAACGGTTAGTTAAAATGGGGATAGATCCAGTGA
CTCATAAACCCAAAAACGAGACTCCTCTGTCTTCTTCTCTTGGTGGTTTATCAAAGAACG
CAGCCACACTTAGCCACATGGCTCAATGGGAAAGTGCTAGGCTTGAAGCTGAAGCAAGGC
TAGCTAGAGAGTCAAAGCTTCTTCTTTACCAAACCAAAGTATCATCATCATCATCATCTT
CTCATCATCATCATCATCAGCAGCAGCTTGAATTTCCGACATCTACAGTGTCATTCTCGG
AAGCCAAGACAGAGTTCGTCGGATCATCATCATCAGCATCAACGTGTCTAAATATGATCA
AAGAAGCTGAAAACGATTGGATCAGTTCAACGATTCACGAGTTCCAAGGAGTCGAAGAAA
GCCTCACGGGTCTCTTGCTAGGTGGCGGTGATTCACTAGGCCGGAGTTTTTCAGCCGATA
AAAATGAGACGGCTGGCGAGACTAGTGGTGACTGTAACAACGGTTACCATGAGGACAACA
AGAACTATTTGGACAGCATTTTCAGCTTTGTGGATCCTTCGCCGTCCGATTCAGCTCCTT
TGTTCTGAATCAAGGGCTGATATCTCTCTAGGGGAATGTTTTGGATTCTTTTTTTTTTGT
CAACGAATGTTTTGGATTCTTTTAGTTCTTAATTTGTGGGGTGTGTAAACTCTCTGATTA
GATAAAAAAAAGTTTTTC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 4

CO CL2697Contig1 949 4 9 U
GAATAATGACAGTAAGCAAGATTCCAATTGATTTCTTCGTTAGCCTCCAGAAAAGGATTC
TAAAATGTGTTCACACTAGGAATGTAGTAGTATTATAATGTTACATGGAATGTTCACATG
TCCATTCACCCAATAAGGAGAGAAATCTGGGAAACTATTATGAGCATTAAGCATATAACT
CCTCAGGAGATCCAGATTGTTACTGATATTTTCTGTTCCGTTCAGCCATCCTCTTCATCT
GAATCCTGCAGAAGAGCACCTCGTTTTCGTGTTCTCCGGTGAGCAGGTACTCGTTTAGAA
GGTTTAGATTGCTTGGCGGGAGAGTCTTTCCGGTTATCTAGTGATGGAGGCATCATAACA
TCTAGTTTACCAGAGGAGTACCGTTCCAGTTGGTTATGAGTAGCATCATCCCTCTTATCC
TTTTCATCAATTGCCTCAGATAAAGTACTCGTTTCCCCTTGTAAGTGTTGCTTTCTCTTG
AATGCTCTGAACAACTCGAGAGACAGAGTTGCCATGGCCTCACTAGCAGCAGATGAGTCA
GCCATCTTTGTTAGAGGAACTACTATGCGAGGCATTCCTTTCGCCTTCTGACAAACTAAT
CTCACCCTCTCTACACCATTTGAAATTGAATAATCAGCAAGGAGAAGCTTCACGTTATCG
GATTTCAAGGAAGCAACAGTGTAATCGAGGAACTCGGACCACGATCCACCAACGCCCACA
GTATCCCTCATATCGTCTAGCTGAGAGACGGAGAGGATCGTCTCCCAGGCGCCGGAGATA
AAGTCCGTCGCATGGACGGTGAGGTGAAACGAATCGGAAGCGTAGACGTGGAAGAGACAC
CGCCGTAGTAGACCCGGACCCGGATCCGAGCGTTCCGGTACGACTTCTCCGAATACGGGT
TCGAATGCCTCGAAACTCGCCATGTTCTAGAATAAGTCCACTCCTCTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX19JQ U 1
AF RR2A840JQ U 4
AF RR2A840TF C 242
AF RR2EX19TF C 250
BS 1 26 RR2EX19JQ
BS 27 27 RR2A840JQ
BS 28 253 RR2EX19JQ
BS 254 254 RR2A840JQ
BS 255 297 RR2EX19JQ
BS 298 438 RR2A840JQ
BS 439 439 RR2A840TF
BS 440 764 RR2A840JQ
BS 765 949 RR2A840TF

RD RR2EX19JQ 300 0 0
GAATAATGACAGTAAGCAAGATTCCATTTGATTTCTTCGTTAGCCTCCAGAAAAGGATTC
TAAAATGTGTTCACACTAGGAATGTAGTAGTATTATAATGTTACATGGAATGTTCACATG
TCCATTCACCCAATAAGGAGAGAAATCTGGGAAACTATTATGAGCATTAAGCATATAACT
CCTCAGGAGATCCAGATTGTTACTGATATTTTCTGTTCCGTTCAGCCATCCTCTTCATCT
GAATCCTGCAGAAAAGCACCTCGTTTTCGTGTTCTCCGGTGAGCAGGTACTCGTTTA
AAA

QA 1 297 1 297
DS 

RD RR2A840JQ 761 0 0
TAATGACAGTAAGCAAGATTCCAAT*GATTTCTTCGTTAGCCTCCAGAAAAGGATTCTAA
AATGTGTTCACACTAGGAATGTAGTAGTATTATAATGTTACATGGAATGTTCACATGTCC
ATTCACCCAATAAGGAGAGAAATCTGGGAAACTATTATGAGCATTAAGCATATAACTCCT
CAGGAGATCCAGATTGTTACTGATATTTTCTGTTCCGTTCAGCCATCCTCTTCATCTGAA
TCCTGCAGAAGAGCACCTCGTTTTCGTGTTCTCCGGTGAGCAGGTACTCGTTTAGAAGGT
TTAGATTGCTTGGCGGGAGAGTCTTTCCGGTTATCTAGTGATGGAGGCATCATAACATCT
AGTTTACCAGAGGAGTACCGTTCCAGTTGGTTATGAGTAGCATCATCCCTCTTATCCTTT
TCATCAATTGCCTCAAATAAAGTACTCGTTTCCCCTTGTAAGTGTTGCTTTCTCTTGAAT
GCTCTGAACAACTCGAGAGACAGAGTTGCCATGGCCTCACTAGCAGCAGATGAGTCAGCC
ATCTTTGTTAGAGGAACTACTATGCGAGGCATTCCTTTCGCCTTCTGACAAACTAATCTC
ACCCTCTCTACACCATTTGAAATTGAATAATCAGCAAGGAGAAGCTTCACGTTATCGGAT
TTCAAGGAAGCAACAGTGTAATCGAGGAACTCGGACCACGATCCACCAACGCCCACAGTA
TCCCTCATATCGTCTAGCTGAGAGACGGAGAGGATCGTCTC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2A840TF 708 0 0
GAAT
CTGCAGAAGAGCACCTCGTTTTCGTGTTCTCCGGTGAGCAGGTACTCGTTTAGAAGGTTT
AGATTGCTTGGCGGGAGAGTCTTTCCGGTTATCTAGTGATGGAGGCATCATAACATCTAG
TTTACCAGAGGAGTACCGTTCCAGTTGGTTATGAGTAGCATCATCCCTCTTATCCTTTTC
ATCAATTGCCTCAGATAAAGTACTCGTTTCCCCTTGTAAGTGTTGCTTTCTCTTGAATGC
TCTGAACAACTCGAGAGACAGAGTTGCCATGGCCTCACTAGCAGCAGATGAGTCAGCCAT
CTTTGTTAGAGGAACTACTATGCGAGGCATTCCTTTCGCCTTCTGACAAACTAATCTCAC
CCTCTCTACACCATTTGAAATTGAATAATCAGCAAGGAGAAGCTTCACGTTATCGGATTT
CAAGGAAGCAACAGTGTAATCGAGGAACTCGGACCACGATCCACCAACGCCCACAGTATC
CCTCATATCGTCTAGCTGAGAGACGGAGAGGATCGTCTCCCAGGCGCCGGAGATAAAGTC
CGTCGCATGGACGGTGAGGTGAAACGAATCGGAAGCGTAGACGTGGAAGAGACACCGCCG
TAGTAGACCCGGACCCGGATCCGAGCGTTCCGGTACGACTTCTCCGAATACGGGTTCGAA
TGCCTCGAAACTCGCCATGTTCTAGAATAAGTCCACTCCTCTCC

QA 5 708 5 708
DS 

RD RR2EX19TF 690 0 0
AGAAGAGCACCTCGTTTTCGTGTTCTCCGGTGAGCAGGTACTCGTTTAGAAGGTTTAGAT
TGCTTGGCGGGAGAGTCTTTCCGGTTATCTAGTGATGGAGGCATCATAACATCTAGTTTA
CCAGAGGAGTACCGTTCCAGTTGGTTATGAGTAGCATCATCCCTCTTATCCTTTTCATCA
ATTGCCTCAGATAAAGTACTCGTTTCCCCTTGTAAGTGTTGCTTTCTCTTGAATGCTCTG
AACAACTCGAGAGACAGAGTTGCCATGGCCTCACTAGCAGCAGATGAGTCAGCCATCTTT
GTTAGAGGAACTACTATGCGAGGCGTTCCTTTCGCCTTCTGACAAACTAATCTCGCCCTC
TCTACACCATTTGAAATTGAATAATCAGCAAGGAGAAGCTTCACGTTATCGGATTTCAAG
GAAGCAACAGTGTAATCGAGGAACTCGGACCACGATCCACCAACGCCCACAGTATCCCTT
ATATCGTCTAGCTGAGAGACGGAGAGGATCGTCTCCCAGGCGCCGGAGATAAAGTCCGTC
GCATGGACGGTGAGGTGAAACGAATCGGAAGCGTAGACGTGGAAGAGACACCGCCGTAGT
AGACCCGGACCCGGATCCGAGCGTTCCGGTACGACTTCTCCGAATACGGGTTCGAATGCC
TCGAAACTCGCCATGTTCTAGAATAAGTCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 4

CO CL2698Contig1 968 4 10 U
GGAGGCTTGAAGAAACGGGTCTAGCTCTCCTTCTCTGCTAGTGGTAGAAGAAGAAGAAAA
AAAAAATCTAAAGTAAGGTGTATATGAGATTGAGAAGATAAAAGGGATCGGATCTAGCTC
TCGTCTTCTCCTACCTCGTCGATCGAGGAGCTTAAGGCAAATATGGACAAAGGCAAAGCA
GTGATGGGTACTGGTCGGAGATGGGCCGTGGATTTCTCCGACCAATCTACTGTTCCATCA
TCCCGCGACATCCTCGACCCACCTGGCCTCTCTCGTGCTTCTCCCGAACAGGATGATTCA
GCAACGAGCCGCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAATTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAA
GTAGCGCAGTCTCCGTTTAAAAATCTGATGATGATGGGGTTCATGATGTGGATGGCTGGG
AACACTGTTCATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCTGCTCTCTGGCAGCCTCTCAGC
GCCCTACAGAGTGTTGGCAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAACAAGGTGGAACTACTT
ATGCCCAAACTAGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAG
CTCAACACTTTGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCAGACTGGGTTTCATCTCTACCCCCT
CCTCAGGAGGTTGAACACTCTGGTGGAGGATTTGTTTTCCACTGATAAGCAAGTCTCTCT
GTCTCTGTCTTGTATTTTAAATAATCCGCCAAAACTGGGATGATGATGAAGACATTTTGT
GAGATAACCGCCAGAGAAACTTAAATTGATTTGTTTAAACCTGTCATGAGGGGAAGATTC
ACATAGCTTTTTCAAAAACATTCAGAAACCATTTAGCTTTTTTTTCACTTTTTAAGTATG
ATGTTCATTATTCATCATCATTACTGTGAACTGTATTATTGACGCTGAAGGGACCTAGTT
CTCCCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU10TF U 1
AF RR2BN83TF U 129
AF RR2BN83JQ C 129
AF RR2EU10JQ C 381
BS 1 146 RR2EU10TF
BS 147 147 RR2BN83TF
BS 148 267 RR2EU10TF
BS 268 268 RR2BN83TF
BS 269 300 RR2EU10TF
BS 301 301 RR2BN83TF
BS 302 367 RR2EU10TF
BS 368 811 RR2BN83TF
BS 812 853 RR2BN83JQ
BS 854 968 RR2EU10JQ

RD RR2EU10TF 367 0 0
GGAGGCTTGAAGAAACGGGTCTAGCTCTCCTTCTCTGCTAGTGGTAGAAGAAGAAGAAAA
AAAAAATCTAAAGTAAGGTGTATATGAGATTGAGAAGATAAAAGGGATCGGATCTAGCTC
TCGTCTTCTCCTACCTCGTCGATCGAAGAGCTTAAGGCAAATATGGACAAAGGCAAAGCA
GTGATGGGTACTGGTCGGAGATGGGCCGTGGATTTCTCCGACCAATCTACTGTTCCATCA
TCCCGCGACATCCTCGACCCACCTGGCTTCTCTCGTGCTTCTCCCGAACAGGATGATTCA
ACAACGAGCCGCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAATTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAA
GTAGCGC

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR2BN83TF 683 0 0
GG
CTACCTCGTCGATCGAGGAGCTTAAGGCAAATATGGACAAAGGCAAAGCAGTGATGGGTA
CTGGTCGGAGATGGGCCGTGGATTTCTCCGACCAATCTACTGTTCCATCATCCCGCGACA
TCCTCGACCCACCTGGCCTCTCTCGTGCTTCTCCCGAACAGGATGATTCAGCAACGAGCC
GCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAATTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAAGTAGCGCAGT
CTCCGTTTAAAAATCTGATGATGATGGGGTTCATGATGTGGATGGCTGGGAACACTGTTC
ATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCTGCTCTCTGGCAGCCTCTCAGCGCCCTACAGA
GTGTTGGCAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAACAAGGTGGAACTACTTATGCCCAAAC
TAGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTCAACACTT
TGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCAGACTGGGTTTCATCTCTACCCCCTCCTCAGGAGG
TTGAACACTCTGGTGGAGGATTTGTTTTCCACTGATAAGCAAGTCTCTCTGTCTCTGTCT
TGTATTTTAAATAATCCGCCAAAACTGGGATGATGATGAAGACATTTTGTGAGATAACCG
CCAGAGAAACTTAAATTGATT

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2BN83JQ 725 0 0
GG
CTACCTCGTCGATCGAGGAGCTTAAGGCAAATATGGACAAAGGCAAAGCAGTGATGGGTA
CTGGTCGGAGATGGGCCGTGGATTTCTCCGACCAATCTACTGTTCCATCATCCCGCGACA
TCCTCGACCCACCTGGCCTCTCTCGTGCTTCTCCCGAACAGGATGATTCAGCAACGAGCC
GCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAATTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAAGTAGCGCAGT
CTCCGTTTAAAAATCTGATGATGATGGGGTTCATGATGTGGATGGCTGGGAACACTGTTC
ATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTTTCTGCTCTCTGGCAGCCTCTCAGCGCCCTACAGA
GTGTTGGCAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAACAAGGTGGAACTACTTATGCCCAAAC
TAGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTCAACACTT
TGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCAGACTGGGTTTCATCTCTACCCCCCCCTCAGGAGG
TTGAACACTCTGGTGGAGGATTTGTTTTCCACTGATAAGCAAGTCTCTCTGTCTCTGTCT
TGTATTTTAAATAATCCGCCAAAACTGGGATGATGATGAAGACATTTTGTGAGATAACCG
CCAGAGAAACTTAAATTGATTTGTTTAAACCTGTCATGAGGGGAAGATTCACATAGCTTT
TTC

QA 3 725 3 725
DS 

RD RR2EU10JQ 588 0 0
AAATCTGATGATGATGGGGTTCATGATGTGGATGGCTGGGAACACTGTTCATCTCTTTAG
CATTGGTATTACTTTCTCTGCTCTCTGGCAGCCTCTCAGCGCCCTACAGAGTGTTGGCAA
GATTTTTGAGCCATTCAAGGATAACAAGGTGGAACTACTTATGCCCAAACCAGTGTTTCT
TGCCCTTAACCTTGGAAGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTCAACACTTTGGGGCTTCT
TCCAACACATGCATCAGACTGGGTTTCATCTCTACCCCCTCCTCAGGAGGTTGAACACTC
TGGTGGAGGATTTGTTTTCCACTGATAAGCAAGTCTCTCTGTCTCTGTCTTGTATTTTAA
ATAATCCGCCAAAACTGGGATGATGATGAAGACATTTTGTGAGATAACCGCCAGAGAAAC
TTAAATTGATTTGTTTAAACCTGTCATGAGGGGAAGATTCATATAGCTTTTTCAAAAACA
TTCAGAAACCATTTAGCTTTTTTTTCACTTTTTAAGTATGATGTTCATTATTCATCATCA
TTACTGTGAACTGTATTATTGACGCTGAAGGGACCTAGTTCTCCCAGC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL2699Contig1 723 2 1 U
GGGAATGCATAAAAGGCTCTCGTTCAGAAAACCCTAGAAAAAAAAAAGATTTGAAATCGG
TTTTCAATCTCTCTCTCTTGCGTGCTAAATCATGACGGAGTGTAGTGATGCCGGAGCTTC
CATGGCTAGTAAGATCGGAACCTTACGGCTGGCGAGTGACATCGATATTAATGACTACAT
CGACCCCTCTGGGAAACCCTGCAGGGTGATTAGTACCTACACGAAGAGAGGCCTTTGTCA
CTTTCACACCATAAATATATTAACTGGCTACTCCGTCCGGAAAATTGTTCCCATTTCCAC
AGAGTTTGTTATTCCAGATGTGAGCCGTGATCTTTACCAGTTGACGGGTATCTCCTACAA
GGATGATACTGTTACCCTTCTGCATCGTAGCGGCGCCTACACTAGGGACGATATCTTTCT
TCCCGAGAACGAGAACCTCAGGACCATGATGGTTGATGGATTCAACGATGGTAACAGCGT
TGTTGTGGGTATCGTCACTTCATTGGGGCAGGATGCTGTTTATGCCGTCGATGTCTACCA
GAAATGTTGGCTTCTAAGAAATAACTAGTCCCTAATTGTCTTGCCATGGGCACAATGCCA
GACAATTACTGAACCCGAACCCTGATATTAAGCCTTTGGTTATCCTAGTATTGTAACAAC
AACACTCAGGAAGATAAAACATTATGTAGTTGTTTTTTGTGTGTTGTTGTTTTATTTCTC
TTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2EH88TF U 46
AF RR2BH29TF U 1
BS 1 723 RR2BH29TF

RD RR2EH88TF 394 0 0
GG
GATTTGAAATCGGTTTTCAATCTCTCTCTCTTGCGTGCTAAATCATGACGGAGTGTAGTG
ATGCCGGAGCTTCCATGGCTAGTAAGATCGGAACCTTACGGCTGGCGAGTGACATCGATA
TTAATGACTGCATCGACTTTTCTGGGAAACCCTGCAGGGTGATTAGTACCTACACGAAGA
GAGGCCTTTGTCACTTTCACACCATAAATATATTAACTGGCTACTCCGTCCGGAAAATTG
TTCCCATTTCCACAGAGTT*GTTATTCCAGATGTGAGCCGTGATCTTTACCAGTTGACGG
GTATCTCCTACAAGGATGATACTGTTACCCTTCTGCATCGTA*CGGCGCCTACACTAGGG
ACGATATCTTT*TTCCCGAGAACGAGAACCTC

QA 3 394 3 394
DS 

RD RR2BH29TF 723 0 0
GGGAATGCATAAAAGGCTCTCGTTCAGAAAACCCTAGAAAAAAAAAAGATTTGAAATCGG
TTTTCAATCTCTCTCTCTTGCGTGCTAAATCATGACGGAGTGTAGTGATGCCGGAGCTTC
CATGGCTAGTAAGATCGGAACCTTACGGCTGGCGAGTGACATCGATATTAATGACTACAT
CGACCCCTCTGGGAAACCCTGCAGGGTGATTAGTACCTACACGAAGAGAGGCCTTTGTCA
CTTTCACACCATAAATATATTAACTGGCTACTCCGTCCGGAAAATTGTTCCCATTTCCAC
AGAGTTTGTTATTCCAGATGTGAGCCGTGATCTTTACCAGTTGACGGGTATCTCCTACAA
GGATGATACTGTTACCCTTCTGCATCGTAGCGGCGCCTACACTAGGGACGATATCTTTCT
TCCCGAGAACGAGAACCTCAGGACCATGATGGTTGATGGATTCAACGATGGTAACAGCGT
TGTTGTGGGTATCGTCACTTCATTGGGGCAGGATGCTGTTTATGCCGTCGATGTCTACCA
GAAATGTTGGCTTCTAAGAAATAACTAGTCCCTAATTGTCTTGCCATGGGCACAATGCCA
GACAATTACTGAACCCGAACCCTGATATTAAGCCTTTGGTTATCCTAGTATTGTAACAAC
AACACTCAGGAAGATAAAACATTATGTAGTTGTTTTTTGTGTGTTGTTGTTTTATTTCTC
TTC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 4

CO CL2700Contig1 721 4 5 U
GGAAACTCCATGAAACTTGGAGTGAGAGAGAGAGAGAGCCAACCAACCAACCAAACCAAA
CAAACAACAATGTCTTCTTC***TTCTCCGATCTTGTCCGAGACGACGAAGATATCCAAA
GAAATCGATCCCAAAAACGTATCCCTATTCGAAAACTTCCTTCACTCCTTCACCCACCCA
GACTCCTCCCTCGACGATTTCGCCTCCTTCGACTCATTCTCCGTCTTGTTCCAGAACAAC
ATCAGAGCTCTCTCCGTCTCACGTGGCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGCCACGCCTGCC
CTTACCAATTACTTTAATGGGTCACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTA
TCAATGGCTTGCGCGAGAACCATCGCGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTGGGTGAATTG
AGTATGTCTTATCTCTCTGCTGCTCCAGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTG
GTGAGGAGTGGGAGGAACCCGACGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGATGAAGGATACCATG
AAAGTCACTTACCTATCTCGTGCTACTTTTTACCAATCTCTCGTCTCCAAGCTTTAAGCA
AGATCTGAACTTTTGTTGATTCTTTATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTAT
GTATACAGATTAGTGTATGGACCTACGAGATATATAATGAGCATTAATACTTCTCCTTAG
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT38TF U 1
AF RR2BU17JQ C 18
AF RR2BU17TF U 18
AF RR2DT38JQ C 251
BS 1 80 RR2DT38TF
BS 81 83 RR2BU17TF
BS 84 527 RR2DT38TF
BS 528 706 RR2BU17TF
BS 707 721 RR2DT38JQ

RD RR2DT38TF 527 0 0
GGAAACTCCATGAAACTTGGAGTGAGAGAGAGAGAGAGCCAACCAACCAACCAAACCAAA
CAAACAACAATGTCTTCTTCCTCTTCTCCGATCTTGTCCGAGACGACGAAGATATCCAAA
GAAATCGATCCCAAAAACGTATCCCTATTCGAAAACTTCCTTCACTCCTTCACCCACCCA
GACTCCTCCCTCGACGATTTCGCCTCCTTCGACTCATTCTCCGTCTTGTTCCAGAACAAC
ATCAGAGCTCTCTCCGTCTCACGTGGCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGCCACGCCTGCC
CTTACCAATTACTTTAATGGGTCACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTA
TCAATGGCTTGCGCGAGAACCATCGCGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTGGGTGAATTG
AGTATGTCTTATCTCTCTGCTGCTCCAGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTG
GTGAGGAGTGGGAGGAACCCGACGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGAT

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2BU17JQ 694 0 0
G
GGAGTGAGAGAGAGAGAGAGCCAACCAACCAACCAAACCAAACAAACAACAATGTCTTCT
TC***TTCTCCGATCTTGTCCGAGACGACGAAGATATCCAAAGAAATCGATCCCAAAAAC
GTATCCCTATTCGAAAACTTCCTTCACTCCTTCACCCACCCAGACTCCTCCCTCGACGAT
TTCGCCTCCTTCGACTCATTCTCCGTCTTGTTCCAGAACAACATCAGAGCTCTCTCCGTC
TCACGTGGCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGTCACGCCTGCCCTTACCAATTACTTTAAT
GGGTTACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTATCAATGGCTTGCGCGAGA
ACCATCGTGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTGGGTGAATTGAGTATGTCTTATCTCTCT
GCTGCTCCAGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTGGTGAGGAGTGGGAGGAAC
CTGACGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGATGAAGGATACCATGAAAGTCACTTACCTATCT
CGTGCTACTTTTTACCAATCTCTCGTCTCCAAGCTTTAAGCAAGATCTGAACTTTTGTTG
ATTCTTTATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTATGTATACAGATTAGTGTAT
GGACCTACGAGATATATAATGAGCATTA
CTACG

QA 2 689 2 689
DS 

RD RR2BU17TF 694 0 0
G
GGAGTGAGAGAGAGAGAGAGCCAACCAACCAACCAAACCAAACAAACAACAATGTCTTCT
TC***TTCTCCGATCTTGTCCGAGACGACGAAGATATCCAAAGAAATCGATCCCAAAAAC
GTATCCCTATTCGAAAACTTCCTTCACTCCTTCACCCACCCAGACTCCTCCCTCGACGAT
TTCGCCTCCTTCGACTCATTCTCCGTCTTGTTCCAGAACAACATCAGAGCTCTCTCCGTC
TCACGTGGCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGTCACGCCTGCCCTTACCAATTACTTTAAT
GGGTTACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTATCAATGGCTTGCGCGAGA
ACCATCGTGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTGGGTGAATTGAGTATGTCTTATCTCTCT
GCTGCTCCAGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTGGTGAGGAGTGGGAGGAAC
CTGACGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGATGAAGGATACCATGAAAGTCACTTACCTATCT
CGTGCTACTTTTTACCAATCTCTCGTCTCCAAGCTTTAAGCAAGATCTGAACTTTTGTTG
ATTCTTTATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTATGTATACAGATTAGTGTAT
GGACCTACGAGATATATAATGAGCATTA
CTACG

QA 2 689 2 689
DS 

RD RR2DT38JQ 471 0 0
TCTCCGTCTCACGTGGCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGCCACGCCTGCCCTTACCAATT
ACTTTAATGGGTCACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTATCAATGGCTT
GCGCGAGAACCATCGCGTCGGAAGAGAAACAGCTGTTCCTGGGTGAATTGAGTATGTTTT
ATCTCTTTGCTGCTCCAGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTGGTGAGGAGTG
GGAGGAACCCGACGGTGGTGAATGTTGAGTTCAAGATGAAGGATACCATGAAAGTCACTT
ACCTATCTCGTGCTACTTTTTACCAATCTCTCGTTTCCAAGCTTTAAGCAAGATTTGAAC
TTTTGTTGATTCTTTATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTATGTATACAGAT
TAGTGTATGGACCTACGAGATATATAATGAGCATTAATACTTCTCCTTAGG

QA 1 471 1 471
DS 



AS 1 3

CO CL2701Contig1 812 3 8 U
GGGGAACAACCAAAAAAAAAAAAAAAAACTCTCCGATCTAAAAATATCACAAAATGGCAG
TTTCATCGCGCAACGACGACCGCGTCAAGACGATCCGCGACTACAAGG*GAAGATCGAGA
CGGAGCTAGCCGGGATCTGCGACGGGATCCTGAAGCTGCTCGACTCCACGCTCGTCCCTT
CCGCCGCCTCCGAGGACTCCAAGGTGTTCTACCTCAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGT
ACTTGGCTGAGTTCAAGATCGGCAAGGAGAGGGACGACGCCGCTGATAACACCTTATCGG
CTTACGAATCTGCTCAGGACAATGCGAAGGGGCTTGCTCCAACTCACCCAATCCGTCTTG
GTTTGGCGTTGAACTTCTCTGTGTTCTATTACGAGATCCTTAATTCTCCTGATCGTGCTT
GCAACCTCGCCAAAACGGCTTTTGATGCTGCGATTGCTGAGTTGGATACACTAGGGGAAG
AGTCGTACAAGGATAGCACTTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGA
CATCCGACATGCAGGATGAAACTGCAGATGAGATAAAGGAAGCAGCAAAGCCAACAGAAG
AGCAGAAATGATGAATCTTCTTCGTCAATTCTGTGTGTCTATTCAAGAGAGATGTCACTC
TCTTTTCTTTTCCTATGTTGAAGTTAACACTCTTTTATCTCCTTTTTTTCTTTTGCCCTT
TTGGATTGAGCAGAATTAAATTGATCTTGCTCCGTTTCAAATCATGAAAGGTTTTTTCAT
GTGATTTGCGAAATAAATAACAGTTTAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA10TF U 1
AF RR2BO04TF U 4
AF RR2BO04JQ C 23
BS 1 71 RR2HA10TF
BS 72 74 RR2BO04TF
BS 75 108 RR2HA10TF
BS 109 109 RR2BO04TF
BS 110 592 RR2HA10TF
BS 593 593 RR2BO04TF
BS 594 703 RR2HA10TF
BS 704 812 RR2BO04JQ

RD RR2HA10TF 704 0 0
GGGGAACAACCAAAAAAAAAAAAAAAAACTCTCCGATCTAAAAATATCACAAAATGGCAG
TTTCATCGCGC***GACGACCGCGTCAAGACGATCCGCGACTACAAGGCGAAGATCGAGA
CGGAGCTAGCCGGGATCTGCGACGGGATCCTGAAGCTGCTCGACTCCACGCTCGTCCCTT
CCGCCGCCTCCGAGGACTCCAAGGTGTTCTACCTCAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGT
ACTTGGCTGAGTTCAAGATCGGCAAGGAGAGGGACGACGCCGCTGATAACACCTTATCGG
CTTACGAATCTGCTCAGGACAATGCGAAGGGGCTTGCTCCAACTCACCCAATCCGTCTTG
GTTTGGCGTTGAACTTCTCTGTGTTCTATTACGAGATCCTTAATTCTCCTGATCGTGCTT
GCAACCTCGCCAAAACGGCTTTTGATGCTGCGATTGCTGAGTTGGATACACTAGGGGAAG
AGTCGTACAAGGATAGCACTTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGA
CATCCGACATGCAGGATGAAACTGCAGATGAGATAAAGGAAGCAGCAAAGCCGACAGAAG
AGCAGAAATGATGAATCTTCTTCGTCAATTCTGTGTGTCTATTCAAGAGAGATGTCACTC
TCTTTTCTTTTCCTATGTTGAAGTTAACACTCTTTTATCTCCT
T

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2BO04TF 700 0 0
GGGAACAACC
AAAAAAAAAAAAAAACTCTCCGATCTAAAAATATCACAAAATGGCAGTTTCATCGCGCAA
CGACGACCGCGTCAAGACGATCCGCGACTACAAGG*GAAGATCGAGACGGAGCTAGCCGG
GATCTGCGACGGGATCCTGAAGCTGCTCGACTCCACGCTCGTCCCTTCCGCCGCCTCCGA
GGACTCCAAGGTGTTCTACCTCAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGTACTTGGCTGAGTT
CAAGATCGGCAAGGAGAGGGACGACGCCGCTGATAACACCTTATCGGCTTACGAATCTGC
TCAGGACAATGCGAAGGGGCTTGCTCCAACTCACCCAATCCGTCTTGGTTTGGCGTTGAA
CTTCTCTGTGTTCTATTACGAGATCCTTAATTCTCCTGATCGTGCTTGCAACCTCGCCAA
AACGGCTTTTGATGCTGCGATTGCTGAGTTGGATACACTAGGGGAAGAGTCGTACAAGGA
TAGCACTTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATGCA
GGATGAAACTGCAGATGAGATAAAGGAAGCAGCAAAGCCAACAGAAGAGCAGAAATGATG
AATCTTCTTCGTCAATTCTGTGTGTCTATTCAAGAGAGATGTCACTCTCTTT*CTTTTCC
TATGTTGAAGTTAACACTCTTTTATCTCCT

QA 11 700 11 700
DS 

RD RR2BO04JQ 790 0 0
AAAAAACTCTCCGATCTAAAAATATCACAAAATGGCAGTTTCATCGCGCAACGACGACCG
CGTCAAGACGATCCGCGACTACAAGG*GAAGATCGAGACGGAGCTAGCCGGGATCTGCGA
CGGGATCCTGAAGCTGCTCGACTCCACGCTCGTCCCTTCCGCCGCCTCCGAGGACTCCAA
GGTGTTCTACCTCAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGTACTTGGCTGAGTTCAAGATCGG
CAAGGAGAGGGACGACGCCGCTGATAACACCTTATCGGCTTACGAATCTGCTCAGGACAA
TGCGAAGGGGCTTGCTCCAACTCACCCAATCCGTCTTGGTTTGGCGTTGAACTTCTCTGT
GTTCTATTACGAGATCCTTAATTCTCCTGATCGTGCTTGCAACCTCGCCAAAACGGCTTT
TGATGCTGCGATTGCTGAGTTGGATACACTAGGGGAAGAGTCGTACAAGGATAGCACTTT
GATCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATGCAGGATGAAAC
TGCAGATGAGATAAAGGAAGCAGCAAAGCCAACAGAAGAGCAGAAATGATGAATCTTCTT
CGTCAATTCTGTGTGTCTATTCAAGAGAGATGTCACTCTCTTTTCTTTTCCTATGTTGAA
GTTAACACTCTTTTATCTCCTTTTTTTCTTTTGCCCTTTTGGATTGAGCAGAATTAAATT
GATCTTGCTCCGTTTCAAATCATGAAAGGTTTTTTCATGTGATTTGCGAAATAAATAACA
GTTTAATTCC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 2 4

CO CL2702Contig1 1463 2 2 U
ATTTTATCTCTTTACCATTCGCTTCAGATCCGAGCTTGGACGATTTCAAGCTCTCTCTCT
AAGAAGAAAGAAGAAAGTCTTTCACTTTTGTTTCTCAATCTCCCAAGTCATGGCAGGATC
AGCACCTGAAGGCACCCAGTTTGATACTCGTCAGTTTGACCAGAGACTCAATGAAGTCCT
TGAGGGACAGGATGAGTTCTTCACCTCCTATGATGAGGTCCACGAGAGCTTTGATGCCAT
GGGTTTGCAAGAGAACCTTCTTAGGGGTATCTATGCCTATGGTTTTGAAAAGCCTTCTGC
TATTCAGCAAAGAGGAATCGTTCCCTTTTGCAAGGGACTTGATGTGATCCAGCAGGCTCT
CGTCTTGGCTCCCACCAGAGAGCTTGCTCAGCAGATCGAGAAGGTCATGCGTGCTCTCGG
AGATTACCTTGGCGTCAAGGTCCACGCCTGTGTCGGTGGTACCAGTGTTCGTGAAGATCA
GCGCATTCTCCAGGCCGGTGTTCACGTTGTCGTTGGAACTCCAGGTCGTGTCTTTGACAT
GCTCAGAAGACAGTCACTTCGCTCTGACAGCATCAAGATGTTTGTCCTCGACGAAGCTGA
TGAAATGCTCTCCCGTGGTTTCAAGGATCAGATCTACGACATATTCCAGCTTCTCCCACC
AAAGATTCAGGTCGGTGTGTTCTCAGCTACGATGCCACCAGAGGCTCTCGAGATCACGAG
GAAGTTCATGAGCAAACCGGTGAGAATCTTGGTGAAGCGTGACGAGCTAACTCTCGAAGG
TATCAAGCAGTTCTACGTGAACGTGGAGAAAGAAGAGTGGAAGCTCGAAACTCTCTGTGA
CCTTTACGAGACGTTAGCCATCACTCAGAGTGTCATCTTCGTCAACACTCGTCGCAAGGT
GGACTGGCTCACTGACAAAATGAGGAGCCGCGACCACACGGTTTCGGCCACCCACGGAGA
CATGGACCAGAACACGAGAGACATCATCATGAGAGAGTTCAGGTCTGGTTCTTCCCGTGT
TCTCATCACGACCGATCTCTTGGCTCGTGGTATCGATGTGCAGCAAGTCTCTCTGGTCAT
CAACTTCGACCTCCCAACTCAGCCGGAGAACTACCTTCACCGTATCGGAAGAAGTGGAAG
GTTTGGGAGGAAAGGTGTGGCGATTAACTTTGTGACTCGTCGATGAGAGAATGCTATTTG
ATATTCAGAAATTCTACAATGTGGTTGTTGAGGAGCTTCCCTCAAACGTCGCCGACCTGC
TTTGAAGAAGAAGAACAGAAAACCACCGTTGTTCGCCGCCGGAGAAGAAGTAAAAGGTTA
CTTGTTTCGCAAGCTTCTTGTTTTGATTTTTGACCCATCTTTCTCTGTTTCTCTCTTTGC
TCATCGACACCTCTTTCTCATTTTCGAACATATGTCTCATCTGAACATGTTTCTTCTTAA
TCTCATGCAATATTTATTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE27TF U 1
AF RR2AE27JQ C 579
BS 1 666 RR2AE27TF
BS 667 1463 RR2AE27JQ

RD RR2AE27TF 666 0 0
ATTTTATCTCTTTACCATTCGCTTCAGATCCGAGCTTGGACGATTTCAAGCTCTCTCTCT
AAGAAGAAAGAAGAAAGTCTTTCACTTTTGTTTCTCAATCTCCCAAGTCATGGCAGGATC
AGCACCTGAAGGCACCCAGTTTGATACTCGTCAGTTTGACCAGAGACTCAATGAAGTCCT
TGAGGGACAGGATGAGTTCTTCACCTCCTATGATGAGGTCCACGAGAGCTTTGATGCCAT
GGGTTTGCAAGAGAACCTTCTTAGGGGTATCTATGCCTATGGTTTTGAAAAGCCTTCTGC
TATTCAGCAAAGAGGAATCGTTCCCTTTTGCAAGGGACTTGATGTGATCCAGCAGGCTCT
CGTCTTGGCTCCCACCAGAGAGCTTGCTCAGCAGATCGAGAAGGTCATGCGTGCTCTCGG
AGATTACCTTGGCGTCAAGGTCCACGCCTGTGTCGGTGGTACCAGTGTTCGTGAAGATCA
GCGCATTCTCCAGGCCGGTGTTCACGTTGTCGTTGGAACTCCAGGTCGTGTCTTTGACAT
GCTCAGAAGACAGTCACTTCGCTCTGACAGCATCAAGATGTTTGTCCTCGACGAAGCTGA
TGAAATGCTCTCCCGTGGTTTCAAGGATCAGATCTACGACATATTCCAGCTTCTCCCACC
AAAGAT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2AE27JQ 885 0 0
TGTTTGTCCTCGACGAAGCTGATGAAATGCTCTCCCGTGGTTTCAAGGATCAGATCTACG
ACATATTCCAGCTTCTCCCACCAAAGATTCAGGTCGGTGTGTTCTCAGCTACGATGCCAC
CAGAGGCTCTCGAGATCACGAGGAAGTTCATGAGCAAACCGGTGAGAATCTTGGTGAAGC
GTGACGAGCTAACTCTCGAAGGTATCAAGCAGTTCTACGTGAACGTGGAGAAAGAAGAGT
GGAAGCTCGAAACTCTCTGTGACCTTTACGAGACGTTAGCCATCACTCAGAGTGTCATCT
TCGTCAACACTCGTCGCAAGGTGGACTGGCTCACTGACAAAATGAGGAGCCGCGACCACA
CGGTTTCGGCCACCCACGGAGACATGGACCAGAACACGAGAGACATCATCATGAGAGAGT
TCAGGTCTGGTTCTTCCCGTGTTCTCATCACGACCGATCTCTTGGCTCGTGGTATCGATG
TGCAGCAAGTCTCTCTGGTCATCAACTTCGACCTCCCAACTCAGCCGGAGAACTACCTTC
ACCGTATCGGAAGAAGTGGAAGGTTTGGGAGGAAAGGTGTGGCGATTAACTTTGTGACTC
GTCGATGAGAGAATGCTATTTGATATTCAGAAATTCTACAATGTGGTTGTTGAGGAGCTT
CCCTCAAACGTCGCCGACCTGCTTTGAAGAAGAAGAACAGAAAACCACCGTTGTTCGCCG
CCGGAGAAGAAGTAAAAGGTTACTTGTTTCGCAAGCTTCTTGTTTTGATTTTTGACCCAT
CTTTCTCTGTTTCTCTCTTTGCTCATCGACACCTCTTTCTCATTTTCGAACATATGTCTC
ATCTGAACATGTTTCTTCTTAATCTCATGCAATATTTATTTTTAC

QA 1 885 1 885
DS 



CO CL2702Contig2 685 2 2 U
GGAGCTAACTCTCGAAGGTATCAAGCAGTTCTACGTGAACGTGGAGAAAGAAGAGTGGAA
GCTCGAAACTCTCTGCGACCTCTACGAGACGTTAGCCATCACTCAGAGTGTCATCTTCGT
CAACACTCGTCGCAAGGTGGACTGGCTCACCGACAAAATGAGGAGCCGTGGCCACACTGT
CTCAGCGACCCACGGAGACATGGACCAGAACACGAGAGACATCATCATGAGAGAGTTCAG
GTCTGGTTCTTCCCGCGTTCTCATCACGACCGATCTCTTGGCTCGTGGTATCGATGTGCA
GCAAGTCTCTCTGGTCATCAACTTCGACCTCCCGACTCAGCCGGAGAACTACCTTCACCG
TATCGGAAGAAGTGGAAGGTTTGGGAGGAAAGGTGTGGCGATTAACTTCGTGACTCGTGA
CGATGAGAGAATGCTTTTTGATATTCAGAAATTCTACAATGTGGTCGTTGAGGAGCTTCC
CTCAAACGTCGCCGACCTGCTTTGAAGAAGAAGAAGAACAGAAAAACCACCGTTGTTCAC
CGCCGGAGAAGAAGTAAAAAGGTTACTTGTTTCGCAAGCTTCTTGTTTTGATTTTTGACC
CATCTGTCTCTGTATCTCTCTTTGCTCATCGACACCTCTTTCTCATTTTCGAACATATAT
GTCTTATCTGAACATGTTTCTTCTT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AH41JQ C 1
AF RR2AH41TF U 1
BS 1 3 RR2AH41JQ
BS 4 685 RR2AH41TF

RD RR2AH41JQ 685 0 0
GGAGCTAACTCTCGAAGGTATCAAGCAGTTCTACGTGAACGTGGAGAAAGAAGAGTGGAA
GCTCGAAACTCTTTGCGACCTCTACGAGACGTTAGCCATCACTCAGAGTGTCATCTTCGT
CAACACTCGTCGCAAGGTGGACTGGCTCACCGACAAAATGAGGAGCCGTGGCCACACTGT
CTCAGCGACCCACGGAGACATGGACCAGAACACGAGAGACATCATCATGAGAGAGTTCAG
GTCTGGTTCTTCCCGCGTTCTCATCACGACCGATCTCTTGGCTCGTGGTATCGATGTGCA
GCAAGTCTCTCTGGTCATCAACTTCGACCTCCCGACTCAGCCGGAGAACTACCTTCACCG
TATCGGAAGAAGTGGAAGGTTTGGGAGGAAAGGTGTGGCGATTAACTTCGTGACTCGTGA
CGATGAGAGAATGCTTTTTGATATTCAGAAATTCTACAATGTGGTCGTTGAGGAGCTTCC
CTCAAACGTCGCCGACCTGCTTTGAAGAAGAAGAAGAACAGAAAAACCACCGTTGTTCAC
CGCCGGAGAAGAAGTAAAAAGGTTACTTGTTTCGCAAGCTTCTTGTTTTGATTTTTGACC
CATCTGTCTCTGTATCTCTCTTTGCTCATCGACACCTCTTTCTCATTTTCGAACATATAT
GTCTTATCTGAACATGTTTCTTCTT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2AH41TF 685 0 0
GGG
GCTAACTCTCGAAGGTATCAAGCAGTTCTACGTGAACGTGGAGAAAGAAGAGTGGAAGCT
CGAAACTCTCTGCGACCTCTACGAGACGTTAGCCATCACTCAGAGTGTCATCTTCGTCAA
CACTCGTCGCAAGGTGGACTGGCTCACCGACAAAATGAGGAGCCGTGGCCACACTGTCTC
AGCGACCCACGGAGACATGGACCAGAACACGAGAGACATCATCATGAGAGAGTTCAGGTC
TGGTTCTTCCCGCGTTCTCATCACGACCGATCTCTTGGCTCGTGGTATCGATGTGCAGCA
AGTCTCTCTGGTCATCAACTTCGACCTCCCGACTCAGCCGGAGAACTACCTTCACCGTAT
CGGAAGAAGTGGAAGGTTTGGGAGGAAAGGTGTGGCGATTAACTTCGTGACTCGTGACGA
TGAGAGAATGCTTTTTGATATTCAGAAATTCTACAATGTGGTCGTTGAGGAGCTTCCCTC
AAACGTCGCCGACCTGCTTTGAAGAAGAAGAAGAACAGAAAAACCACCGTTGTTCACCGC
CGGAGAAGAAGTAAAAAGGTTACTTGTTTCGCAAGCTTCTTGTTTTGATTTTTGACCCAT
CTGTCTCTGTATCTCTCTTTGCTCATCGACACCTCTTTCTCATTTTCGAACATATATGTC
TTATCTGAACATGTTTCTTCTT

QA 4 685 4 685
DS 



AS 1 4

CO CL2703Contig1 683 4 12 U
TAAAAGCTCCACAACATTCATATAAAGTCAGAAAATGTCAGCAAAAACATTCTCTTATTC
ACATAGAGATGATGTCATTGTTTGAAAAATAAAACATCAATGCAGTTTGTTTCCATTTAC
TTTAAAAAATATGCTTCACATTGTTTATCTATCGATCAATCCCTTCAATCTTGTCTTCGA
CCTGAGAGTACAAGTCCTTGAGCTTCTCGATGTTGTCCTCCGAAGTCTCCCAGTAGCCAC
GACCATTGGCTTCCAAGAACGTCTGGATCATCTTCCTGAAGGAGTTTGGATTAGTGTTCA
TGAGACGGTTAAGCATCTCCTCGTCTTTGATGAAAGTCGTGTTGGCCTCTTCGTAGACCA
AGTTGTCTACTTGACCTGAGGTTGCACTCCATCCCACAGTGTTGGTCAGTCTCTTCTCTA
TCTCACGAACACCTTCGCATCCGCTTGAAATCATTCCTTCGTAACACTTTGGGTTCAGCA
GCTTTGTTCTTGCGTCCAGCCTCACTGTCTCAGACAGTGACCTCACCTGTGCGTTTGCGG
TTGTTGTATCAGCAATGTAAGCGCTAGGCTTCTTCTTGTCTTTCCTCAAACTCTGAACCA
AGTTTGTCGGGTCAGAGTCAAAGTAATGGCTCACATCGGTCAACGAAATCTCGGAAGAAT
CGAGGTTCTGGAACGTGACTTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI22JQ U 2
AF RR2AB30JQ U 88
AF RR2AB30TF C 88
AF RR2DI22TF C 1
BS 1 1 RR2DI22TF
BS 2 278 RR2DI22JQ
BS 279 279 RR2AB30JQ
BS 280 358 RR2DI22JQ
BS 359 359 RR2AB30JQ
BS 360 437 RR2DI22JQ
BS 438 438 RR2AB30JQ
BS 439 505 RR2DI22JQ
BS 506 512 RR2AB30JQ
BS 513 513 RR2DI22TF
BS 514 645 RR2AB30JQ
BS 646 683 RR2DI22TF

RD RR2DI22JQ 508 0 0
AAAAGCTCCACAACATTCATATAAAGTCAGAAAATGTCAGCAAAAACATTCTCTTATTCA
CATAGAGATGATGTCATTGTTTGAAAAATAAAACATCAATGCAGTTTGTTTCCATTTACT
TTAAAAAATATGCTTCACATTGTTTATCTATCGATCAATCCCTTCAATCTTGTCTTCGAC
CTGAGAGTACAAGTCCTTGAGCTTCTCGATGTTGTCCTCCGAAGTCTCCCAGTAGCCACG
ACCATTGGCTTCCAAGAACGTCTGGATCATCTTCCTGGAGGAGTTTGGATTAGTGTTCAT
GAGACGGTTAAGCATCTCCTCGTCTTTGATGAAAGTCGTGTTGGCCTCTTCGTAGACGAA
GTTGTCTACTTGACCTGAGGTTGCACTCCATCCCACAGTGTTGGTCAGTCTCTTCTCTAT
CTCACGAACACCTTCGTATCCGCTTGAAATCATTCCTTCGTAACACTTTGGGTTCAGCAG
CTTTGTTCTTGCGTCCAGCCTCAC
GGTC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2AB30JQ 559 0 0
AATAAAACATCAATGCAGTTTGTTTCCATTTACTTTAAAAAATATGCTTCACATTGTTTA
TCTATCGATCGATCCCTTCAATCTTGTCTTCGACCTGAGAGTACAAGTCCTTGAGCTTCT
CGATGTTGTCCTCCGAAGTCTCCCAGTAGCCACGACCATTGGCTTCCAAGAACGTCTGGA
TCATCTTCCTGAAGGAGTTTGGATTAGTGTTCATGAGACGGTTAAGCATCTCCTCGTCTT
TGATGAAAGTCGTGTTGGCCTCTTCGTAGACCCAGTTGTCTACTTGACCTGAGGTTGCAC
TCCATCCCACAGTGTTGGTCAGTCTCTTCTCTATCTCACGAACACCTTCGCATCCGCTTG
ACATCATTCCTTCGTACCACTTTGGGTTCAGCAGCTTTGTTCTTGCGTCCAGCCTCACTG
TCTCAAACAGTGACCTCACCTGTGCGTTTGCGGTTGTTGTATCAGCAATGTAAGCGCTAG
GCTTCTTCTTGTCTTTCCTCAAACTCTGAACCAAGTTTGTCGGGTCAGAGTCAAAGTAAT
GGCTCACATCGGTCAACG
C

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2AB30TF 559 0 0
AATAAAACATCAATGCAGTTTGTTTCCATTTACTTTAAAAAATATGCTTCACATTGTTTA
TCTATCGATCGATCCCTTCAATCTTGTCTTCGACCTGAGAGTACAAGTCCTTGAGCTTCT
CGATGTTGTCCTCCGAAGTCTCCCAGTAGCCACGACCATTGGCTTCCAAGAACGTCTGGA
TCATCTTCCTGAAGGAGTTTGGATTAGTGTTCATGAGACGGTTAAGCATCTCCTCGTCTT
TGATGAAAGTCGTGTTGGCCTCTTCGTAGACCCAGTTGTCTACTTGACCTGAGGTTGCAC
TCCATCCCACAGTGTTGGTCAGTCTCTTCTCTATCTCACGAACACCTTCGCATCCGCTTG
ACATCATTCCTTCGTACCACTTTGGGTTCAGCAGCTTTGTTCTTGCGTCCAGCCTCACTG
TCTCAGACAGTGACCTCACCTGTGCGTTTGCGGTTGTTGTATCAGCAATGTAAGCGCTAG
GCTTCTTCTTGTCTTTCCTCAAACTCTGAACCAAGTTTGTCGGGTCAGAGTCAAAGTAAT
GGCTCACATCGGTCAACG
C

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2DI22TF 683 0 0
TAAAAGCTCCACAACATTCATATAAAGTCAGAAAATGTCAGCAAAAACATTCTCTTATTC
ACATAGAGATGATGTCATTGTTTGAAAAATAAAACATCAATGCAGTTTGTTTCCATTTAC
TTTAAAAAATATGCTTCACATTGTTTATCTATCGATCAATCCCTTCAATCTTGTCTTCGA
CCTGAGAGTACAAGTCCTTGAGCTTCTCGATGTTGTCCTCCGAAGTCTCCCAGTAGCCAC
GACCATTGGCTTCCAAGAACGTCTGGATCATCTTCCTGGAGGAGTTTGGATTAGTGTTCA
TGAGACGGTTAAGCATCTCCTCGTCTTTGATGAAAGTCGTGTTGGCCTCTTCGTAGACGA
AGTTGTCTACTTGACCTGAGGTTGCACTCCATCCCACAGTGTTGGTCAGTCTCTTCTCTA
TCTCACGAACACCTTCGTATCCGCTTGAAATCATTCCTTCGTAACACTTTGGGTTCAGCA
GCTTTGTTCTTGCGTCCAGCCTCACGGTCTCAGATAGTGACCTCACCTGTGCGTTTGCGG
TTGTTGTATCAGCAATGTAAGCGCTAGGCTTCTTCTTGTCTTTCCTCAAACTCTGAACCA
AGTTTGTCGGGTCAGAGTCAAAGTAATGGCTCACGTCGGTCAACGAAATCTCGGAAGAAT
CGAGGTTCTGGAACGTGACTTCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

CO CL2704Contig1 672 4 3 U
TATAACAAACTGATCCAAATAAATGCAGAAAAATATACACAAGACTCAACTGACAAGTTC
AGAAAACACTTGCTTATTATGAAGACAAACTCAGATGACTTGAAACTCGAAAACCTTGAA
ATGATACTACGATATTGCCATGTAAAAACCCTAATACCCTGAACTAGCACTGCTACAAAA
CTTGCATGCTACTTATACTATATAGTCTATAACTGCAGACGACGCTGATGATGGAGATGA
TCATGAACGGCGATGAAGGCAAACTTAATATGAACAGGAGACGGAGAAGCGAAACGAAAG
CGTCTTGACTGTAGCAAAAGCATAATCACTGAAGGTTGTTCTGAGGAACAGCTTGACATA
ACTCATCTTCATAGAAGAGCACACGAGGGTGCTTTGGAGCCAGTGGCTTGAACAGAGTCG
GCCTCAGGCTTTAGGTATTTGTTATTCGAACTCTTCAGCTTCTTCTTCCTCGTCGAGATC
TTGGAATCTGAATCCTTCGGTGATACCTTCCCCATATGGCAGTCACAGCTCAGATAAACA
GAGACCTTCTACTTCGGGAAAGATTCAGCTTCCGGAATAGATAATCCGGAGAAGCTCGAG
AACCTAGAGAGCGAAAATGGAGGGAGAAGTGACGAGAGAGCGAGGGAAGAGATTTGAGTG
AAAGACAGATCC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2GL35TF C 2
AF RR2GL35JQ U 2
AF RR2G025TF C 1
AF RR2G025JQ U 2
BS 1 1 RR2G025TF
BS 2 670 RR2G025JQ
BS 671 672 RR2G025TF

RD RR2GL35TF 486 0 0
ATAACAAACTGATCCAAATAAATGCAGAAAAATATACACAAGACTCAACTGACAAGTTCA
GAAAACACTTGCTTATTATGAAGACAAACTCAGATGACTTGAAACTCGAAAACCTTGAAA
TGATACTACGATATTGCCATGTAAAAACCCTAATACCCTGAACTAGCACTGCTACAAAAC
TTGCATGCTACTTATACTATATAGTCTATAACTGCAGACGACGCTGATGATGGAGATGAT
CATGAACGGCGATGAAGGCAAACTTAATATGAACAGGAGACGGAGAAGCGAAACGAAAGC
GTCTTGACTGTAGCAAAAGCATAATCACTGAAGGTTGTTCTGAGGAACAGCTTGACATAA
CTCATCTTCATAGAAGAGCACACGAGGGTGCTTTGGAGCCAGTGGCTTGAACAGAGTCGG
CCTCAGGCTTTAGGTATTTGTTATTCGAACTCTTCAGCTTCTTCTTCCTCGTCGAGATCT
TGGAAT

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR2GL35JQ 658 0 0
ATAACAAACTGATCCAAATAAATGCAGAAAAATATACACAAGACTCAACTGACAAGTTCA
GAAAACACTTGCTTATTATGAAGACAAACTCAGATGACTTGAAACTCGAAAACCTTGAAA
TGATACTACGATATTGCCATGTAAAAACCCTAATACCCTGAACTAGCACTGCTACAAAAC
TTGCATGCTACTTATACTATATAGTCTATAACTGCAGACGACGCTGATGATGGAGATGAT
CATGAACGGCGATGAAGGCAAACTTAATATGAACAGGAGACGGAGAAGCGAAACGAAAGC
GTCTTGACTGTAGCAAAAGCATAATCACTGAAGGTTGTTCTGAGGAACAGCTTGACATAA
CTCATCTTCATAGAAGAGCACACGAGGGTGCTTTGGAGCCAGTGGCTTGAACAGAGTCGG
CCTCAGGCTTTAGGTATTTGTTATTCGAACTCTTCAGCTTCTTCTTCCTCGTCGAGATCT
TGGAATCTGAATCCTTCGGTGATACCTTCCCCATATGGCAGTCACAGCTCAGATAAACAG
AGACCTTCTACTTCGGGAAAGATTCAGCTTCCGGAATAGATAATCCGGAGAAGCTCGAGA
ACCTAGAGAGCGAAAATGGAGGGAGAAGTGACGAGAGAGCGAGGGAAGAGATTTGAGT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2G025TF 672 0 0
TATAACAAACTGATCCAAATAAATGCAGAAAAATATACACAAGACTCAACTGACAAGTTC
AGAAAACACTTGCTTATTATGAAGACAAACTCAGATGACTTGAAACTCGAAAACCTTGAA
ATGATACTACGATATTGCCATGTAAAAACCCTAATACCCTGAACTAGCACTGCTACAAAA
CTTGCATGCTACTTATACTATATAGTCTATAACTGCAGACGACGCTGATGATGGAGATGA
TCATGAACGGCGATGAAGGCAAACTTAATATGAACAGGAGACGGAGAAGCGAAACGAAAG
CGTCTTGACTGTAGCAAAAGCATAATCACTGAAGGTTGTTCTGAGGAACAGCTTGACATA
ACTCATCTTCATAGAAGAGCACACGAGGGTGCTTTGGAGCCAGTGGCTTGAACAGAGTCG
GCCTCAGGCTTTAGGTATTTGTTATTCGAACTCTTCAGCTTCTTCTTCCTCGTCGAGATC
TTGGAATCTGAATCCTTCGGTGATACCTTCCCCATATGGCAGTCACAGCTCAGATAAACA
GAGACCTTCTACTTCGGGAAAGATTCAGCTTCCGGAATAGATAATCCGGAGAAGCTCGAG
AACCTAGAGAGCGAAAATGGAGGGAGAAGTGACGAGAGAGCGAGGGAAGAGATTTGAGTG
AAAGACAGATCC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2G025JQ 669 0 0
ATAACAAACTGATCCAAATAAATGCAGAAAAATATACACAAGACTCAACTGACAAGTTCA
GAAAACACTTGCTTATTATGAAGACAAACTCAGATGACTTGAAACTCGAAAACCTTGAAA
TGATACTACGATATTGCCATGTAAAAACCCTAATACCCTGAACTAGCACTGCTACAAAAC
TTGCATGCTACTTATACTATATAGTCTATAACTGCAGACGACGCTGATGATGGAGATGAT
CATGAACGGCGATGAAGGCAAACTTAATATGAACAGGAGACGGAGAAGCGAAACGAAAGC
GTCTTGACTGTAGCAAAAGCATAATCACTGAAGGTTGTTCTGAGGAACAGCTTGACATAA
CTCATCTTCATAGAAGAGCACACGAGGGTGCTTTGGAGCCAGTGGCTTGAACAGAGTCGG
CCTCAGGCTTTAGGTATTTGTTATTCGAACTCTTCAGCTTCTTCTTCCTCGTCGAGATCT
TGGAATCTGAATCCTTCGGTGATACCTTCCCCATATGGCAGTCACAGCTCAGATAAACAG
AGACCTTCTACTTCGGGAAAGATTCAGCTTCCGGAATAGATAATCCGGAGAAGCTCGAGA
ACCTAGAGAGCGAAAATGGAGGGAGAAGTGACGAGAGAGCGAGGGAAGAGATTTGAGTGA
AAGACAGAT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 4

CO CL2705Contig1 717 4 3 U
TTTTTTTTTGAGAAAACAGAAACATTTTATTCTACATCAGCAAGTTTCAACACCATACAC
AGATCCAAGGTTAATAATTCAGAAAGCGACAACTTACTAAACGTAATTATGCAAGGATAC
TTAATTACTAACATCATTATTTTTAATGTACTAATTAAAACATTAATCATTTCATGAAAC
CTTGAGCCATCTTAGCATAGTCTCCAAACCCATGGCTACCACCTCCTGATTTCCCATCCC
CTTTCTTACCCGCTGGTTCTCCAGCTCCACCACCGTGACTGCCACCGCCACCGACACCAC
CGTGACTGCCACCGCCGGAGGAGTGAGAGTGTGAAGATTCATACTTGTAGAGATAATTTT
CAGCCTTTTCGAGGTACTGACCCACACCGCTTTTTTCATCGAACTTGCCGTATCTAGAAG
CGGCGTCAAGAATATCTGCCGTGGCTCCGGCAACTTTAGCTTTGTCAAGCTTGGCAGTCT
CATTGCGAGCAGCGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACAATCTTGGCACTAGCCATGAGCTCGG
CGTTGGTAGCTGGCCTATGTCCGCTATGAGTTGTTGGACCGGTATGACCGGGTTTGTTTT
TGTTGTGGTTCGGCTCCGGTTCAGAACTTTCCGGCTTCTTCTCGGAGAACTTCTTTTTTT
AGTTGATCGGAGAGAAAATCCATTTTTTTGTTTGTCTTGTCAAAATCTTGAACCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK48JQ U 52
AF RR2FS44TF C 1
AF RR2FS44JQ U 10
AF RR2F678TF C 13
BS 1 12 RR2FS44TF
BS 13 709 RR2FS44JQ
BS 710 717 RR2F678TF

RD RR2FK48JQ 505 0 0
ACCATACACAGATCCAAGGTTAATAATTCAAAAAGCGACAACTTACTAAACGTAATTATG
CAAGGATACTTAATTACTAACATCATTATTTTTAATGTACTAATTAAAACATTAATCATT
TCATGAAACCTTGAGCCATCTTAGCATAGTCTCCAAACCCATGGCTACCACCTCCTGATT
TCCCATCCCCTTTCTTACCCGCTGGTTCTCCAGCTCCGCCACCGTGACTGCCTCCGCCAC
CGACACCAACGTGACTGCCACCGCCGGAGGAGTGAGAGTGTGAAGATTCATACTTGTAGA
GATAATTTTCAGCCTTTTCGAGGTACTGACCCACACCGCTTTTTTCATCGAACTTGCCGT
ATCTAGAAGCGGCGTCAAGAATATCTGCCGTGGCTCCGGCAACTTTAGCTTTGTCAAGCT
TGGCAGTCTCATTGCGAGCAGCGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACAATCTTGGCACTAGCCA
TGAGCTCGGCGTTGGTAGCTGGCC
C

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2FS44TF 711 0 0
TTTTTTTTTGAGAAAACAGAAACATTTTATTCTACATCAGCAAGTTTCAACACCATACAC
AGATCCAAGGTTAATAATTCAGAAAGCGACAACTTACTAAACGTAATTATGCAAGGATAC
TTAATTACTAACATCATTATTTTTAATGTACTAATTAAAACATTAATCATTTCATGAAAC
CTTGAGCCATCTTAGCATAGTCTCCAAACCCATGGCTACCACCTCCTGATTTCCCATCCC
CTTTCTTACCCGCTGGTTCTCCAGCTCCACCACCGTGACTGCCACCGCCACCGACACCAC
CGTGACTGCCACCGCCGGAGGAGTGAGAGTGTGAAGATTCATACTTGTAGAGATAATTTT
CAGCCTTTTCGAGGTACTGACCCACACCGCTTTTTTCATCGAACTTGCCGTATCTAGAAG
CGGCGTCAAGAATATCTGCCGTGGCTCCGGCAACTTTAGCTTTGTCAAGCTTGGCAGTCT
CATTGCGAGCAGCGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACAATCTTGGCACTAGCCATGAGCTCGG
CGTTGGTAGCTGGCCTATGTCCGCTATGAGTTGTTGGACCGGTATGACCGGGTTTGTTTT
TGTTGTGGTTCGGCTCCGGTTCAGAACTTTCCGGCTTCTTCTCGGAGAACTTCTTTTTTT
AGTTGATCGGAGAGAAAATCCATTTTTTTGTTTGTCTTGTCAAAATCTT
CC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2FS44JQ 702 0 0
GAG
AAAACAGAAACATTTTATTCTACATCAGCAAGTTTCAACACCATACACAGATCCAAGGTT
AATAATTCAGAAAGCGACAACTTACTAAACGTAATTATGCAAGGATACTTAATTACTAAC
ATCATTATTTTTAATGTACTAATTAAAACATTAATCATTTCATGAAACCTTGAGCCATCT
TAGCATAGTCTCCAAACCCATGGCTACCACCTCCTGATTTCCCATCCCCTTTCTTACCCG
CTGGTTCTCCAGCTCCACCACCGTGACTGCCACCGCCACCGACACCACCGTGACTGCCAC
CGCCGGAGGAGTGAGAGTGTGAAGATTCATACTTGTAGAGATAATTTTCAGCCTTTTCGA
GGTACTGACCCACACCGCTTTTTTCATCGAACTTGCCGTATCTAGAAGCGGCGTCAAGAA
TATCTGCCGTGGCTCCGGCAACTTTAGCTTTGTCAAGCTTGGCAGTCTCATTGCGAGCAG
CGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACAATCTTGGCACTAGCCATGAGCTCGGCGTTGGTAGCTG
GCCTATGTCCGCTATGAGTTGTTGGACCGGTATGACCGGGTTTGTTTTTGTTGTGGTTCG
GCTCCGGTTCAGAACTTTCCGGCTTCTTCTCGGAGAACTTCTTTTTTTAGTTGATCGGAG
AGAAAATCCATTTTTTTGTTTGTCTTGTCAAAATCTT
CC

QA 4 700 4 700
DS 

RD RR2F678TF 705 0 0
AAAACAGAAACATTTTATTCTACATCAGCAAGTTTCAACACCATACACAGATCCAAGGTT
AATAATTCAGAAAGCGACAACTTACTAAACGTAATTATGCAAGGATACTTAATTACTAAC
ATCATTATTTTTAATGTACTAATTAAAACATTAATCATTTCATGAAACCTTGAGCCATCT
TAGCATAGTCTCCAAACCCATGGCTACCACCTCCTGATTTCCCATCCCCTTTCTTACCCG
CAGGTTCTCCAGCTCCACCACCGTGACTGCCTCCGCCACCGACACCACCGTGACTGCCAC
CGCCGGAGGAGTGAGAGTGTGAAGATTCATACTTGTAGAGATAATTTTCAGCCTTTTCGA
GGTACTGACCCACACCGCTTTTTTCATCGAACTTGCCGTATCTAGAAGCGGCGTCAAGAA
TATCTGCCGTGGCTCCGGCAACTTTAGCTTTGTCAAGCTTGGCAGTCTCATTGCGAGCAG
CGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACAATCTTGGCACTAGCCATGAGCTCGGCGTTGGTAGCTG
GCCTATGTCCGCTATGAGTTGTTGGACCGGTATGACCGGGTTTGTTTTTGTTGTGGTTCG
GCTCCGGTTCAGAACTTTCCGGCTTCTTCTCGGAGAACTTCTTTTTT*AGTTGATCGGAG
AGAAAATCCATTTTTTTGTTTGTCTTGTCAAAATCTTGAACCGCC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 3

CO CL2706Contig1 1137 3 6 U
GCTTCAAACTTGAATTCATGATTTTGATCTAAAACCACTACATTTATATGTTCCTTTTTT
TCGTGTTTACAGAACACTGATGTCTCTCAAAGATAGATAAGAAACTAAACAAAGACAGCT
AAAACAAAGAGCAAGTTTGAATATCCTCCTATAGTTCAGATTTCCCGGATTTAGGTTTCT
TCGAAGAAGAGGATCCTTTCCACCATCTCCTGACCCGGTTCGACACCATCTTCATCTTTC
CCCTCAGAGACTCACCTTTCTTCTTGAGTAGCTTAGTGACTGTCTTCTTCCACTCTTCCT
TTTTATTCTCTTTCTCTCTCAGAACTTTTCCCAAGTTCTTGGGGAACTTGTCGTCCTCTT
CCTCATCTTCATCATCGTCGTCAGCACCTTCATCTTCAGTACCGAATTTTTCAGGGTTTG
CTTTGTACTTCTCTAAATCTTCCCTAGAGTATACCTTCATGCCAGGTGCTCCTGGCATGC
CCTGCATAGATCTCATGATCTTGTCCATTTCAGCATCTTTCGATGGTTTTGCCACAAATG
GTTCTCCAGGAACTCGATCCTTGGGAAGAGGAGGAGGGGTCTTGGTACAAGCATCGGTAA
GGTCTTTGCAAAGATGGTAAACAAGTGAAGCAAGATCAGGCTTAGACTTGTATATATACT
CCGCAACATCAGTGTCTGAGTAACCAATGACCTTTTGACAAGCGGCCTCGATCGTCTTGC
ACTCTGAATTGCACATCCCTTCTTCTTCTTGTTCAATCAGCTGAAGCTTATCACCTTTCT
CGACAATATCAATCTTAAGCATCCAATCAGCTTCCTCTTTCTTCAAGTTACACACGTTTT
CAGCAATCTCAATGATCTCATACTCCGAGATCTTCTTGGGAGAGATCTCAGCTTGCTTCT
CCTTCACTAGCTTGTGCAGCCGCGACGCTAGCTTCTCGCACACCTCACACTTGATATACG
GAACATCCTCCTTTCTCGGAGCAGACGACAAGGGCTTCTTCCCTTCCACCGGTAATAACG
CCGACGAAGCTGCAAGAGCTAATGCTACTACTACAGCTATCACAATTCGATTCATCATCT
ACACCGTTTAAATGAATGTGAAAGACAGAGACTTTCTCGTAAAGCTGGAGACTTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA86JQ U 1
AF RR2A793JQ U 1
AF RR2A793TF C 393
BS 1 37 RR2A793JQ
BS 38 38 RR2AA86JQ
BS 39 212 RR2A793JQ
BS 213 213 RR2AA86JQ
BS 214 794 RR2A793JQ
BS 795 1137 RR2A793TF

RD RR2AA86JQ 695 0 0
GCTTCAAACTTGAATTCATGATTTTGATCTAAAACCACTACATTTATATGTTCCTTTTTT
TCGTGTTTACAGAACACTGATGTCTCTCAAAGATAGATAAGAAACTAAACAAAGACAGCT
AAAACAAAGAGCAAGTTTGAATATCCTCCTATAGTTCAGATTTCCCGGATTTAGGTTTCT
TCGAAGAAGAGGATCCTTTCCACCATCTCCTGACCCGGTTCGACACCATCTTCATCTTTC
CCCTCAGAGACTCACCTTTCTTCTTGAGTAGCTTAGTGACTGTCTTCTTCCACTCTTCCT
TTTTATTCTCTTTCTCTCTCAGAACTTTTCCCAAGTTCTTGGGGAACTTGTCGTCCTCTT
CCTCATCTTCATCATCGTCGTCAGCATCTTCATCTTCAGTACCGAATTTTTCAGGGTTTG
CTTTGTACTTCTCTAAATCTTCCCTAGAGTATACCTTCATGCCAGGTGCTCCTGGCATGC
CCTGCATAGATCTCATGATCTTGTCCATTTCAGCATCTTTCGATGGTTTTGCCACAAATG
GTTCTCCAGGAACTCGATCCTTGGGGAGAGGAGGAGGGGTCTTGGTACAAGCATCGGTAA
GGTCTTTGCAAAGATGGTAAACAAGTGAAGCAAGATCAGGCTTAGACTTGTATATATACT
CCGCAACATCAGTGTCTGAGTAACCAATGACCTT
G

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2A793JQ 794 0 0
GCTTCAAACTTGAATTCATGATTTTGATCTAAAACCATTACATTTATATGTTCCTTTTTT
TCGTGTTTACAGAACACTGATGTCTCTCAAAGATAGATAAGAAACTAAACAAAGACAGCT
AAAACAAAGAGCAAGTTTGAATATCCTCCTATAGTTCAGATTTCCCGGATTTAGGTTTCT
TCGAAGAAGAGGATCCTTTCCACCATCTCCTGGCCCGGTTCGACACCATCTTCATCTTTC
CCCTCAGAGACTCACCTTTCTTCTTGAGTAGCTTAGTGACTGTCTTCTTCCACTCTTCCT
TTTTATTCTCTTTCTCTCTCAGAACTTTTCCCAAGTTCTTGGGGAACTTGTCGTCCTCTT
CCTCATCTTCATCATCGTCGTCAGCACCTTCATCTTCAGTACCGAATTTTTCAGGGTTTG
CTTTGTACTTCTCTAAATCTTCCCTAGAGTATACCTTCATGCCAGGTGCTCCTGGCATGC
CCTGCATAGATCTCATGATCTTGTCCATTTCAGCATCTTTCGATGGTTTTGCCACAAATG
GTTCTCCAGGAACTCGATCCTTGGGAAGAGGAGGAGGGGTCTTGGTACAAGCATCGGTAA
GGTCTTTGCAAAGATGGTAAACAAGTGAAGCAAGATCAGGCTTAGACTTGTATATATACT
CCGCAACATCAGTGTCTGAGTAACCAATGACCTTTTGACAAGCGGCCTCGATCGTCTTGC
ACTCTGAATTGCACATCCCTTCTTCTTCTTGTTCAATCAGCTGAAGCTTATCACCTTTCT
CGACAATATCAATC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2A793TF 745 0 0
TCTTCAGTACCGAATTTT*CAGGGTTTGCTTTGTACTTCTCTAAATCTTCCCTAGAGTAT
ACTTTCATGCCAGGTGCTCCTGGCATGCCCTGCATAGATCTCATGATCTTGTCCATTTCA
GCATCTTTCGATGGTTTTGCCACAAATGGTTCTCCAGGAACTCGATCCTTGGGAAGAGGA
GGAGGGGTCTTGGTACAAGCATCGGTAAGGTCTTTGCAAAGATGGTAAACAAGTGAAGCA
AGATCAGGCTTAGACTTGTATATATACTCCGCAACATCAGTGTCTGAGTAACCAATGACC
TTTTGACAAGCGGCCTCGATCGTCTTGCACTCTGAATTGCACATCCCTTCTTCTTCTTGT
TCAATCAGCTGAAGCTTATCACCTTTCTCGACAATATCAATCTTAAGCATCCAATCAGCT
TCCTCTTTCTTCAAGTTACACACGTTTTCAGCAATCTCAATGATCTCATACTCCGAGATC
TTCTTGGGAGAGATCTCAGCTTGCTTCTCCTTCACTAGCTTGTGCAGCCGCGACGCTAGC
TTCTCGCACACCTCACACTTGATATACGGAACATCCTCCTTTCTCGGAGCAGACGACAAG
GGCTTCTTCCCTTCCACCGGTAATAACGCCGACGAAGCTGCAAGAGCTAATGCTACTACT
ACAGCTATCACAATTCGATTCATCATCTACACCGTTTAAATGAATGTGAAAGACAGAGAC
TTTCTCGTAAAGCTGGAGACTTTCC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 3

CO CL2707Contig1 793 3 14 U
GGATTTCATTGCCATTGAAAGAAGGTGATGAGTTCTCTCATTCTCTTCTATATCTCTTTA
CTAATACATGATTAAAGCCCTCTTCTTCCTTTT*TTTTTGATAATCCCTATTCAATACCT
GAGAACAAATTGTATCAAGATCTCTCTTTAAAAGAGCTTAGGTCACCCTGTCTGACTGGA
TCGGTGACAACAGTGATAACCGGAGCCAGGA**GCAGTTCTTTGGGTGCTAAGTAGATAG
TTATCCATTCATGGCTTCCAAGTCTAGTCCTGGAGAACATAATAAGGAAAAGGGCGATGA
AAAAACCTCGGAAGCATCTGTTTCCAGTTCCAGCCAAAGTATCTCAGTCAGCACTTTGGC
AGATCAAGTATCTTCAACTCTGTCTTTTGCTCAAAGCTGTGGAAGTAAATCCAGTGGAGA
AGTTAAACTTAATGAGCTGTCTGATCTTGCCGAGACCGGAAAGCGTAACACTTATAGACC
AAGCACAAGCAGTGATATCAGTGACGAGAGCACATGCAGCGGTTTAAGTACCAACAAGCC
TCACAAGGCGAATGACGTGAGATGGGAAGCGATACAAGTTGTTCGAGCGAAACATGGCTC
TTTGGGTTTGAACCATTTTAG*CTCTTGAAGAGGGTAGGTGGTGGAGATATCGGAACTGT
CCACCTTGCTGAGCTGCACGGGACAAGGTGTTATTTCGCAATGAAGTTATGGACAAAGGA
GCTTTGGCTAGCCGTAAAAGCTTCTTAGAGTCAGACGAGAGGAGATATGCAGTCTCTGAC
ACCTTTCTCCTAC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL27TF U 37
AF RR2CS16TF U 1
AF RR2EJ38TF U 1
BS 1 98 RR2CS16TF
BS 99 99 RR2EJ38TF
BS 100 578 RR2CS16TF
BS 579 579 RR2EJ38TF
BS 580 621 RR2CS16TF
BS 622 622 RR2EJ38TF
BS 623 687 RR2CS16TF
BS 688 688 RR2EJ38TF
BS 689 707 RR2CS16TF
BS 708 708 RR2EJ38TF
BS 709 718 RR2CS16TF
BS 719 719 RR2EJ38TF
BS 720 741 RR2CS16TF
BS 742 793 RR2EJ38TF

RD RR2CL27TF 598 0 0
CTCATTCTCTTCTATCTCTCTTTACTAATACATGATTAAAGCCCTCTTCTTCCTTTTCTT
ATTGATAATCCCTATTCAATACCTGAGAACAAATTGTATCAAGACCTCTCTTTAAA*GAG
CTTAGGTCACACTGTCTGAGTGGATCGGTGACAACAGTGATAACCGGAGCCAGGAGAGCA
GTTCTTTGGGTGCTAAGTAGATAGTTATCCATTCATGGCTTCCAAGTCTAGTCCTAGAGA
ACATAATAAGGAAAAGGGCGATGAGAAAACCTCGGAAGCATCTGTTTCCAGTTCCAGCCA
AAGTATCTCAGTCAGCACTTTGGCAGATCAAGTATCTTCAACTCTGTCTTTTGCTCAAAG
CTGTGGCAGTAAATCCAGTGGAGAAGTTAAACTTAATGAGCTGTCTGATCTTGCCGAAAC
CGGAAAGCGTAACACTTACAGACCAAGCACAAGCAGTGATATCAGTGACGAGAGCACATG
CAGCGGTTTAAGTACCAACAAGCCTCACAAGGCGAATGACGTGAGATGGGAAGCGATACA
AGTTGTCCGAGCGAAACATGGCTCTTTGGGTTTGAACCATTTTAG*CTCTTGAAGAGG

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2CS16TF 741 0 0
GGATTTCATTGCCATTGAAAGAAGGTGATGAGTTCTCTCATTCTCTTCTATATCTCTTTA
CTAATACATGATTAAAGCCCTCTTCTTCCTTTT*TTTT*GATAATCCCTATTCAATACCT
GAGAACAAATTGTATCAAGATCTCTCTTTAAAAGAGCTTAGGTCACCCTGTCTGACTGGA
TCGGTGACAACAGTGATAACCGGAGCCAGGA**GCAGTTCTTTGGGTGCTAAGTAGATAG
TTATCCATTCATGGCTTCCAAGTCTAGTCCTGGAGAACATAATAAGGAAAAGGGCGATGA
AAAAACCTCGGAAGCATCTGTTTCCAGTTCCAGCCAAAGTATCTCAGTCAGCACTTTGGC
AGATCAAGTATCTTCAACTCTGTCTTTTGCTCAAAGCTGTGGAAGTAAATCCAGTGGAGA
AGTTAAACTTAATGAGCTGTCTGATCTTGCCGAGACCGGAAAGCGTAACACTTATAGACC
AAGCACAAGCAGTGATATCAGTGACGAGAGCACATGCAGCGGTTTAAGTACCAACAAGCC
TCACAAGGCGAATGACGTGAGATGGGAAGCGATACAAGCTGTTCGAGCGAAACATGGCTC
TTTGGGTTTGAACCATTTTAGGCTCTTGAAGAGGGTAGGTGGTGGAGATATCGGAACTGT
CCACCTTGCTGAGCTGCACGGGACAAG*TGTTATTTCGCAATGAAGT*ATGGACAAAG*A
GCTTTGGCTAGCCGTAAAAGC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2EJ38TF 793 0 0
GG
ATTTCATTGCCATTGAAAGAAGGTGATGAGTTCTCTCATTCTCTTCTATATCTCTTTACT
AATACATGATTAAAGCCCTCTTCTTCCTTTT*TTTTTGATAATCCCTATTCAATACCTGA
GAACAAATTGTATCAAGATCTCTCTTTAAAAGAGCTTAGGTCACCCTGTCTGACTGGATC
GGTGACAACAGTGATAACCGGAGCCAGGA**GCAGTTCTTTGGGTGCTAAGTAGATAGTT
ATCCATTCATGGCTTCCAAGTCTAGTCCTGGAGAACATAATAAGGAAAAGGGCGATGAAA
AAACCTCGGAAGCATCTGTTTCCAGTTCCAGCCAAAGTATCTCAGTCAGCACTTTGGCAG
ATCAAGTATCTTCAACTCTGTCTTTTGCTCAAAGCTGTGGAAGTAAATCCAGTGGAGAAG
TTAAACTTAATGAGCTGTCTGATCTTGCCGAGACCGGAAAGCGTAACACTTATAGACCAA
GCACAAGCAGTGATATCAGTGACGAGAGCACATGCAGCGGTTTAAGTACCAACAAGCCTC
ACAAGGCGAATGACGTGAGATGGGAAGCGATACAAGTTGTTCGAGCGAAACATGGCTCTT
TGGGTTTGAACCATTTTAG*CTCTTGAAGAGGGTAG*TGGTGGAGATATCGGAACTGTCC
ACCTTGCTGAGCTGCACGGGACAAGGTGTTATTTCGCAATGAAGTTATGGACAAAGGAGC
TTTGGCTAGCCGTAAAAGCTTCTTAGAGTCAGACGAGAGGAGATATGCAGTCTCTGACAC
CTTTCTCCTAC

QA 3 793 3 793
DS 



AS 1 4

CO CL2708Contig1 1300 4 22 U
CTTTCATGGTTGGCCTTCTTGTCGCCTCTCCTATCTTTGCTTCTGTTGCCAAGAGTGTTA
ACCCGTTTAGGCTTATTGGAATTGGGTTATCCATCTGGACTCTGGCTGTGATTGGCTGCG
GTTTATCCTTTGATTTTTGGTCCATCACGTTCTGTCGAATGTTTGTTGGTGTTGGTGAGG
CATCATTTGTAAGCCTCGCCCCCCATTTATCGACGATAATGCCCCTCAAGCTCAGAAATC
AGCGTGGCTTGCAATGTTCTACATGTGTATTCCGACTGGGTATGCTCTTGGCTATGTATA
TGGTGGACTGGTGGGGAGTGTTCTGCCCTGGCGTGCTGCATTTTGGGGAGAAGCAATACT
TATGCTTCCTTTCGCTGTTCTAGGTTTTGTTATCAAACCCTTGCACTTGAAAGGTTTCGC
TCCTGATGATAAAGGAAAACCCCGGACAGATAGCTTAAACGTTTTGCCAACTGGTTATGG
GTTCTCAGCTGTCTTGAAAGATTTGAAACTGCTTCTGGTAGATAAGGTTTATGTTACAAA
CATCCTCGGGTATATTGCTTACAACTTTGTCTTAGGCGCATATTCTTATTGGGGTCCAAA
GGCTGGTTATAACATATACAAGATGGAAAACGCTGATTTGATATTTGGAGGGGTTACAGT
TATCTGTGGAATCGTTGGCACATTGTCTGGTGGATTTGTCTTAGATTTCATGGATGCTAC
TATCTCAAATGCTTTCAAGCTTCTGTCAGTTTCAACATTTATAGGAGGCCTGTTCTGCTT
TGTTGCTTTCTGTTTCAAGAGCATGTATGCATTTCTAGCTTTCTTTGCTGTTGGTGAACT
TCTCGTCTTTGCCACACAGGGTCCTGTGAATTTCATAGTTCTCCACTGTGTCAAACCAAG
TTTGAGACCACTTGCAATGGCCATGTCTACTGTCTCTATCCATATCTTTGGAGATGTTCC
TTCCTCACCACTCGTTGGAGTTCTTCAGGACTACGTGAACAATTGGAGAGTGACTGCTCT
TGTTCTTACATTTGTTCTCTTTCCAGCTGCTGCAATTTGGTCCATAGGGATCTTCCTAAA
CAGTGTGGATCGTTATAACGAAGATTCAGAGTCTGATGCTGTGACCAGAGAATCAGCCGT
TGCACCTCTTCTCGAGGAAGCATGAGACAGCAACAAAGAGAGAGAAACTAACAATGTCAC
AGTGTACTAAGGAATCAGTCTATGTACGGTTTATTCATTATCTCTTTTCTCTACTTTCTT
GTACAAAGATATGTACTTAAACATAAACAATTACCTTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2CK14TF U 1
AF RR2BN34TF U 232
AF RR2CK14JQ C 517
AF RR2BN34JQ C 548
BS 1 327 RR2CK14TF
BS 328 328 RR2BN34TF
BS 329 354 RR2CK14TF
BS 355 355 RR2BN34TF
BS 356 364 RR2CK14TF
BS 365 940 RR2BN34TF
BS 941 941 RR2CK14JQ
BS 942 963 RR2BN34TF
BS 964 964 RR2BN34JQ
BS 965 1074 RR2CK14JQ
BS 1075 1075 RR2BN34JQ
BS 1076 1077 RR2CK14JQ
BS 1078 1078 RR2BN34JQ
BS 1079 1182 RR2CK14JQ
BS 1183 1184 RR2BN34JQ
BS 1185 1211 RR2CK14JQ
BS 1212 1212 RR2BN34JQ
BS 1213 1226 RR2CK14JQ
BS 1227 1227 RR2BN34JQ
BS 1228 1248 RR2CK14JQ
BS 1249 1249 RR2BN34JQ
BS 1250 1300 RR2CK14JQ

RD RR2CK14TF 364 0 0
CTTTCATGGTTGGCCTTCTTGTCGCCTCTCCTATCTTTGCTTCTGTTGCCAAGAGTGTTA
ACCCGTTTAGGCTTATTGGAATTGGGTTATCCATCTGGACTCTGGCTGTGATTGGCTGCG
GTTTATCCTTTGATTTTTGGTCCATCACGTTCTGTCGAATGTTTGTTGGTGTTGGTGAGG
CATCATTTGTAAGCCTCGCCCCCCATTTATCGACGATAATGCCCCTCAAGCTCAGAAATC
AGCGTGGCTTGCAATGTTCTACATGTGTATTCCGACTGGGTATGCTCTTGGCTATGTATA
TGGTGGACTGGTGGGGAGTGTTCTGCCGTGGCGTGCTGCATTTTGGGGAGAAGCTATACT
TATG

QA 1 364 1 364
DS 

RD RR2BN34TF 749 0 0
G
CAGAAATCAGCGTGGCTTGCAATGTTCTACATGTGTATTCCGACTGGGTATGCTCTTGGC
TATGTATATGGTGGACTGGTGGGGAGTGTTCTGCCCTGGCGTGCTGCATTTTGGGGAGAA
GCAATACTTATGCTTCCTTTCGCTGTTCTAGGTTTTGTTATCAAACCCTTGCACTTGAAA
GGTTTCGCTCCTGATGATAAAGGAAAACCCCGGACAGATAGCTTAAACGTTTTGCCAACT
GGTTATGGGTTCTCAGCTGTCTTGAAAGATTTGAAACTGCTTCTGGTAGATAAGGTTTAT
GTTACAAACATCCTCGGGTATATTGCTTACAACTTTGTCTTAGGCGCATATTCTTATTGG
GGTCCAAAGGCTGGTTATAACATATACAAGATGGAAAACGCTGATTTGATATTTGGAGGG
GTTACAGTTATCTGTGGAATCGTTGGCACATTGTCTGGTGGATTTGTCTTAGATTTCATG
GATGCTACTATCTCAAATGCTTTCAAGCTTCTGTCAGTTTCAACATTTATAGGAGGCCTG
TTCTGCTTTGTTGCTTTCTGTTTCAAGAGCATGTATGCATTTCTAGCTTTCTTTGCTGTT
GGTGAACTTCTCGTCTTTGCCACACAGGGTCCTGTGAATTTCATAGTTCTCCACTGTGTC
AAACCAAGTTTGAGACCACTTGCAATGGCCATGTCTACTGTCTCTATC*ATATCTTTGGA
GATGTTCCTTC
TCACACTCGTTGGAGTC

QA 2 732 2 732
DS 

RD RR2CK14JQ 784 0 0
GGTAGATAAGGTTTATGTTACAAACATCCTCGGGTATATTGCTTACAACTTTGTCTTAGG
CGCATATTCTTATTGGGGTCCAAAGGCTGGTTATAACATATACAAGATGGAAAACGCTGA
TTTGATATTTGGAGGGGTTACAGTTATCTGTGGAATCGTTGGCACATTGTCTGGTGGATT
TGTCTTAGATTTCATGGATGCTACTATCTCAAATGCTTTCAAGCTTCTGTCAGTTTCAAC
ATTTATAGGAGGCCTGTTCTGCTTTGTTGCTTTCTGTTTCAAGAGCATGTATGCATTTCT
AGCTTTCTTTGCTGTTGGTGAACTTCTCGTCTTTGCCACACAGGGTCCTGTGAATTTCAT
AGTTCTCCATTGTGTCAAACCAAGTTTGAGACCACTTGCAATGGCCATGTCTACTGTCTC
TATCCATATCTTTGGAGATGTTCCTTCTTCACCACTCGTTGGAGTTCTTCAGGACTACGT
GAACAATTGGAGAGTGACTGCTCTTGTTCTTACATTTGTTCTCTTTCCAGCTGCTGCAAT
TTGGTCCATAGGGATCTTTCTGAACAGTGTGGATCGTTATAACGAAGATTCAGAGTCTGA
TGCTGTGACCAGAGAATCAGCCGTTGCACCTCTTCTCGAGGAAGCATGAGACAGCAACAA
AGAGAG**AAACTAACAATGTCACAGTGTACTAAG*AATCAGTCTATGTATGGTTTATTC
ATTATCTCTTTTGTCTACTTTCTTGTACAAAGATATGTACTTAAACATAAACAATTACCT
TGAA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2BN34JQ 751 0 0
GGGTATATTGCTTACAACTTTGTCTTAGGCGCATATTCTTATTGGGGTCCAAAGGCTGGT
TATAACATATACAAGATGGAAAACGCTGATTTGATATTTGGAGGGGTTACAGTTATCTGT
GGAATCGTTGGCACATTGTCTGGTGGATTTGTCTTAGATTTCATGGATGCTACTATCTCA
AATGCTTTCAAGCTTCTGTCAGTTTCAACATTTATAGGAGGCCTGTTCTGCTTTGTTGCT
TTCTGTTTCAAGAGCATGTATGCATTTCTAGCTTTCTTTGCTGTTGGTGAACTTCTCGTC
TTTGCCACACAGGGTCCTGTGAATTTCATAGTTCTCCACTGTGTCAAACCAAGTTTGAGA
CCACTTGCAATGGCCATGTCTACTGTCTCTATCCATATCTTTGGAGATGTTCCTTCCTCA
CCACTCGTTGGAGTTCTTCAGGACTACGTGAACAATTGGAGAGTGACTGCTCTTGTTCTT
ACATTTGTTCTCTTTCCAGCTGCTGCAATTTGGTCCATAGGGATCTTCCTAAACAGTGTG
GATCGTTATAACGAAGATTCAGAGTCTGATGCTGTGACCAGAGAATCAGCCGTTGCACCT
CTTCTCGAGGAAGCATGAGACAGCAACAAAGAGAGAGAAACTAACAATGTCACAGTGTAC
TAAGGAATCAGTCTATGTACGGTTTATTCATTATCTCTTTTCTCTACTTTCTTGTACAAA
GATATGTACTTAAACATAAACACTTACCT
AG

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 4

CO CL2709Contig1 1019 4 7 U
GGGTCGGGTTTCCAATCCGAATAGAGTCAATGGCGTTGCGTAGATCTCTTCTTCTTCTCC
TCCTCCAAGTCCTTTTGGTTACGGTTCTTTCCGTCTCGGCCTATCTAGCGGATACCGGAA
GACTTGCCGGAGACAACGTCGTCGAAGTCAATCGCTCACAGAGAGAGTTTGATTATTTCG
CTCTCTCTCTCCAATGGCCTGGAACCTACTGCCGTGGAACTCGCCATTGCTGCTCCAAAA
ACGCTTGCTGTAGAGGCTCGGACACTCCAACTCAATTCACCATCCATGGACTATGGCCCG
ACTATAACGACGGTTCCTGGCCTTCATGTTGCTACCGATCGGACTTCAATGAGAAGGAGA
TCTCAACGTTGATGGATGGCATGGAAAAGTACTGGCCCAGTCTCAGTTGTGGTTCTCCAT
CATCTTGCCATGGTGGAAAAGGATCTTTTTGGGGCCATGAGTGGGAGAAACATGGGACTT
GCTCTTCTCCTGTTATTCGTGATGAGTATAGTTACTTCGTTACCACGCTTAATATCTACT
TCAAGCATAATGTCACGGATGTCCTTTATAAAGCTGGCTATGTTGCTTCCAACAGCGAGA
AGTATCCTCTAGGAGGTATTGTCACAGCCATTCAGAATGCATTTCAT*TCACCCCTGAAG
TAGTATGCAAAAGAGATGCAATCGATGAAATACGTATATGCTTCTATAAGGATTTCAAGC
CCAGGGACTGTGTTGGTTCAAAAGACTTGACGTCGAAAAAATCATGTCCCAAGTACGTAA
GTTTGCCGGAATACACGCCATTGGATGGTGAGGCTATGGTTCTGAAGATGCCAACAGATG
AATAAGATATTTCTTCTCTTCTTAGAGGCAATATTCACATACAAAACTTTCATGTTGTAA
TTTATTTGCCAAACCTATAAACAACGAATAAAGATTGGCTTACACTTGTTCTATGGGAAT
ATGAATCCGGGCTGGTTAATACTTTTTTCCTCTTTACAGTTGCAATATTATTAAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG22TF U 4
AF RR2FE63TF U 1
AF RR2FE63JQ C 355
AF RR2DG22JQ C 466
BS 1 613 RR2FE63TF
BS 614 614 RR2DG22TF
BS 615 708 RR2FE63TF
BS 709 785 RR2FE63JQ
BS 786 786 RR2DG22JQ
BS 787 982 RR2FE63JQ
BS 983 1019 RR2DG22JQ

RD RR2DG22TF 626 0 0
GG
GGGTTTCCAATCCGAATAGAGTCAATGGCGTTGCGTAGATCTCTTCTTCTTCTCCTCCTC
CAAGTCCTTTTGGTTACGGTTCTTTCCGTCTCGGCCTATCTAGCGGATACCGGAAGACTT
GCCGGAGACAACGTCGTCGAAGTCAATCGCTCACAGAGAGAGTTTGATTATTTCGCTCTC
TCTCTCCAATGGCCTGGAACCTACTGCCGTGGAACTCGCCATTGCTGCTCCAAAAACGCT
TGCTGTAGAGGCTCGGACACTCCAACTCAATTCACCATCCATGGACTATGGCCCGACTAT
AACGACGGTTCCTGGCCTTCATGTTGCTACCGATCGGACTTCAATGAGAAGGAGATCTCA
ACGTTGATGGATGGCATGGAAAAGTACTGGCCCAGTCTCAGTTGTGGTTCTCCATCATCT
TGCCATGGTGGAAAAGGATCTTTTTGGGGCCATGAGTGGGAGAAACATGGGACTTGCTCT
TCTCCTGTTATTCGTGATGAGTATAGTTACTTCGTTACCACGCTTAATATCTACTTCAAG
CATAATGTCACGGATGTCCTTTATAAAGCTGGCTATGTTGCTTCCAACAGCGAGAAGTAT
CCTCTAGGAGGTATTGTCACAGCC

QA 3 626 3 626
DS 

RD RR2FE63TF 708 0 0
GGGTCGGGTTTCCAATCCGAATAGAGTCAATGGCGTTGCGTAGATCTCTTCTTCTTCTCC
TCCTCCAAGTCCTTTTGGTTACGGTTCTTTCCGTCTCGGCCTATCTAGCGGATACCGGAA
GACTTGCCGGAGACAACGTCGTCGAAGTCAATCGCTCACAGAGAGAGTTTGATTATTTCG
CTCTCTCTCTCCAATGGCCTGGAACCTACTGCCGTGGAACTCGCCATTGCTGCTCCAAAA
ACGCTTGCTGTAGAGGCTCGGACACTCCAACTCAATTCACCATCCATGGACTATGGCCCG
ACTATAACGACGGTTCCTGGCCTTCATGTTGCTACCGATCGGACTTCAATGAGAAGGAGA
TCTCAACGTTGATGGATGGCATGGAAAAGTACTGGCCCAGTCTCAGTTGTGGTTCTCCAT
CATCTTGCCATGGTGGAAAAGGATCTTTTTGGGGCCATGAGTGGGAGAAACATGGGACTT
GCTCTTCTCCTGTTATTCGTGATGAGTATAGTTACTTCGTTACCACGCTTAATATCTACT
TCAAGCATAATGTCACGGATGTCCTTTATAAAGCTGGCTATGTTGCTTCCAACAGCGAGA
AGTATCCTCTAGGGGGTATTGTCACAGCCATTCAGAATGCATTTCAT*TCACCCCTGAAG
TAGTATGCAAAAGAGATGCAATCGATGAAATACGTATATGCTTCTATA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2FE63JQ 629 0 0
AGGAGATCTCAACGTTGATGGATGGCATGGAAAAGTACTGGCCCAGTCTCAGTTGTGGTT
CTCCATCATCTTGCCATGGTGGAAAAGGATCTTTTTGGGGCCATGAGTGGGAGAAACATG
GGACTTGCTCTTCTCCTGTTATTCGTGATGAGTATAGTTACTTCGTTACCACGCTTAATA
TCTACTTCAAGCATAATGTCACGGATGTCCTTTATAAAGCTGGCTATGTTGCTTCCAACA
GCGAGAAGTATCCTCTAGGGGGTATTGTCACAGCCATTCAGAATGCATTTCAT*TCACCC
CTGAAGTAGTATGCAAAAGAGATGCAATCGATGAAATACGTATATGCTTCTATAAGGATT
TCAAGCCCAGGGACTGTGTTGGTTCAAAAGACTTGACGTCGAAAAAATCATGTCCCAAGT
ACGTAAGTTTGTCGGAATACACGCCATTGGATGGTGAGGCTATGGTTCTGAAGATGCCAA
CAGATGAATAAGATATTTCTTCTCTTCTTAGAGGCAATATTCACATACAAAACTTTCATG
TTGTAATTTATTTGCCAAACCTATAAACAACGAATAAAGATTGGCTTACACTTGTTCTAT
GGGAATATGAATCCGGGCTGGTTAATAC
C

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2DG22JQ 554 0 0
AGAAACATGGGACTTGCTCTTCTCCTGTTATTCGTGATGAGTATAGTTACTTCGTTACCA
CGCTTAATATCTACTTCAAGCATAATGTCACGGATGTCCTTTATAAAGCTGGCTATGTTG
CTTCCAACAGCGAGAAGTATCCTCTAGGAGGTATTGTCACAGCCATTCAGAATGCATTTC
ATATCACCCCTGAAGTAGTATGCAAAAGAGATGCAATCGATGAAATACGTATATGCTTCT
ATAAGGATTTCAAGCCCAGGGACTGTGTTGGTTCAAAAGACTTGACGTCGAAAAAATCAT
GTCCCAAGTACGTAAGTTTGCCGGAATACACGCCATTGGATGGTGAGGCTATGGTTCTGA
AGATGCCAACAGATGAATAAGATATTTCTTCTCTTCTTAGAGGCAATATTCACATACAAA
ACTTTCATGTTGTAATTTATTTGCCAAACCTATAAACAACGAATAAAGATTGGCTTACAC
TTGTTCTATGGGA*TATGAATCCGGGCTGGTTAATACTTTTTTCCTCTTTACAGTTGCAA
TATTATTAAAATCC

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 4

CO CL2710Contig1 859 4 18 U
TGCTGCTACTCACATTGTGTTTGGAACCCAAAATGGCGAAATGTTTAGATCTATCTCTGA
TTCTCTTTGTTCTGTATGTGTCCACTGCAGCAATAGCCATGGCCAGAAACCTTGGAGAGG
AATCTAGTGAAGATACAGAGTTCATTAGAGCCTCTTGTGAGACAGCAACGTACCCGAAAC
TGTGCTTTCAATCTCTGTCTTCTTACGCAAGCCAGATCAAGAAGCGGCCACTACAGCTCG
CGGAGACAGCGCTTGCCGTTAGCATGGCCCGAGCAAAGTCAGCCAAAACCTATATCTCGG
GCTTGACTGACCAGAAAGGAATCACAAAGAGGCAGCACGAGGCTGTATTGGACTGTGTTG
AAGAGATGGGAGATACTGTTGACAGGTTGAGCAAGTCGCTGAAAGAACTGAAGAATCTGG
AGGAAGGAGAGAGCAAAGAAGACTTCTGGTTCTGTTTGAGCAATGTCAGGACATGGACAA
GCGCGGCGCTTACAGATGAGACCACTTGTCTTGATGGGTTTGG*AGGGAAAGGCATGG*A
TGGGGAGCTGAAAAGCTTAGTCAGAGCACACATT*GTGCGTGTAGCGCAAGATACCAGCA
ATGCCTTGG*CTTTGATCAATGTCTATGCTTCCAAGCATTGAAAAAATGTTTGCATAAGT
TTGATCTCGATGAGGACTTGAGTTTCTTTTTATACTTTTGGATTTGGTTTGTATTGTGTT
TTCAAGAAATGTGTC*TTGGTTTTGTTCAGAGTCATACCAGTTTCTCTTGCCAGCTTGCT
ATATCATCTACGGTCTATATAGTTTGAAGCTGTTGATTTTGATGTTTGATTGGTGGTATA
ATATAGTTTTGTAATCCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA09JQ C 200
AF RR2FA09TF U 26
AF RR2BA26TF U 7
AF RR2BA26JQ C 1
BS 1 6 RR2BA26JQ
BS 7 25 RR2BA26TF
BS 26 147 RR2FA09TF
BS 148 148 RR2BA26TF
BS 149 164 RR2FA09TF
BS 165 165 RR2BA26TF
BS 166 403 RR2FA09TF
BS 404 404 RR2BA26TF
BS 405 529 RR2FA09TF
BS 530 530 RR2BA26TF
BS 531 583 RR2FA09TF
BS 584 584 RR2BA26TF
BS 585 663 RR2FA09TF
BS 664 664 RR2BA26TF
BS 665 792 RR2FA09TF
BS 793 793 RR2BA26JQ
BS 794 812 RR2BA26TF
BS 813 859 RR2BA26JQ

RD RR2FA09JQ 602 0 0
TTCTTACGCAAGCCAGATCAAGAAGCGGCCACTACAGCTCGCGGAGACAGCGCTTGCCGT
TAGCATGGCCCGAGCAAAGTCAGCCAAAACCTATATCTCGGGCTTGACTGACCAGAAAGG
AATCACAAAGAGGCAGCACGAGGCTGTATTGGACTGTGTTGAAGAGATGGGAGATACTGT
TGACAGGTTGAGCAAGTCGCTGAAGGAACTGAAGAATCTGGAGGAAGGAGAGAGCAAAGA
AGACTTCTGGTTCTGTTTGAGCAATGTCAGGACATGGACAAGCGCGGCGCTTACAGATGA
GACCACTTGTCTTGATGGGTTTGG*AGGGAGAGGCATGG*ATGGGGAGCTGAAAAGCTTA
GTCAGAGCACACATT*GTGCGTGTGGCGCAAGATACCAGCAATGCCTTGG*CTTTGATCA
ATGTCTATGCTTCCAAGCATTGAAAAAATGTTTGCATAAGTTTGGTCTCGATGAGGACTT
GAGTTTCTTTTTATACTTTTGGATTTGGTTTGTATTGTGTTTTCAAGAAATGTGTC*TTG
GTTTTGTTCAGAGTCATACCAGTTTCTCTTGCCAGCTTGCTATATCATCTACG
GTCTATATG

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2FA09TF 775 0 0
ACCCAAAATGGCGAAATGTTTAGATCTATCTCTGATTCTCTTTGTTCTGTATGTGTCCAC
TGCAGCAATAGCCATGGCCAGAAACCTTGGAGAGGAATCTAGTGAAGATACAGAGTTCAT
TAAAGCCTCTTGTGAGACAACAACGTACCCGAAACTGTGCTTTCAATCTCTGTCTTCTTA
CGCAAGCCAGATCAAGAAGCGGCCACTACAGCTCGCGGAGACAGCGCTTGCCGTTAGCAT
GGCCCGAGCAAAGTCAGCCAAAACCTATATCTCGGGCTTGACTGACCAGAAAGGAATCAC
AAAGAGGCAGCACGAGGCTGTATTGGACTGTGTTGAAGAGATGGGAGATACTGTTGACAG
GTTGAGCAAGTCGCTGAAGGAACTGAAGAATCTGGAGGAAGGAGAGAGCAAAGAAGACTT
CTGGTTCTGTTTGAGCAATGTCAGGACATGGACAAGCGCGGCGCTTACAGATGAGACCAC
TTGTCTTGATGGGTTTGG*AGGGAGAGGCATGG*ATGGGGAGCTGAAAAGCTTAGTCAGA
GCACACATT*GTGCGTGTGGCGCAAGATACCAGCAATGCCTTGG*CTTTGATCAATGTCT
ATGCTTCCAAGCATTGAAAAAATGTTTGCATAAGTTTGGTCTCGATGAGGACTTGAGTTT
CTTTTTATACTTTTGGATTTGGTTTGTATTGTGTTTTCAAGAAATGTGTC*TTGGTTTTG
TTCAGAGTCATACCAGTTTCTCTTGCCAGCTTGCTATATCATCTACG
TCTATATG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2BA26TF 806 0 0
TACTCACATTGTGTTTGGAACCCAAAATGGCGAAATGTTTAGAACTATCTCTGATTCTCT
TTGTTCTGTATGTGTCCACTGCAGCAATAGCCATGGCCAGAAACCTTGGAGAGGAATCTA
GTGAAGATACAGAGTTCATTAGAGCCTCTTGTGAGACAGCAACGTACCCGAAACTGTGCT
TTCAATCTCTGTCTTCTTACGCAAGCCAGATCAAGAAGCGGCCACTACAGCTCGCGGAGA
CAGCGCTTGCTGTTAGCATGGCCCGAGCAAAGTCAGCCAAAACCTATATCTCGGGCTTGA
CTGACCAGAAAGGAATCACAAAGAGGCAGCACGAGGCTGTGTTGGACTGTGTTGAAGAGA
TGGGAGATACTGTTGACAGGTTGAGCAAGTCGCTGAAAGAATTGAAGAATCTGGAGGAAG
GAGAGAGCAAAGAAGACTTCTGGTTCTGTTTGAGCAATGTCAGGACATGGACAAGCGCGG
CGCTTACAGATGAGACCACTTGTCTTGATGGGTTTGGGAGGGAAAGGCATGGGATGGGGA
GCTGAAAAGCTTAGTCGGAGCACACATTTGTGCGTGTAGCGCAAGATACCAGCAATGCCT
TGGGCTTTGATCAATGTCTATGCTTCCAAGCATTGAAAAA*TGTTTGCATAAGTTTGATC
TCGATGAGGACTTGAGTTTCTTTTTATACTTTTGGATTTGGTTTGTATTGTGTTTTCA*G
AAATGTGTCCTTGGTTTTGTTCAGAGTCATACCAGTTTCTCTTGCCAGCTTG*TATATCA
TCTACG*TCTATATAGTTTGAAGCTG

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2BA26JQ 859 0 0
TGCTGCTACTCACATTGTGTTTGGAACCCAAAATGGCGAAATGTTTAGATCTATCTCTGA
TTCTCTTTGTTCTGTATGTGTCCACTGCAGCAATAGCCATGGCCAGAAACCTTGGAGAGG
AATCTAGTGAAGATACAGAGTTCATTAGAGCCTCTTGTGAGACAGCAACGTACCCGAAAC
TGTGCTTTCAATCTCTGTCTTCTTACGCAAGCCAGATCAAGAAGCGGCCACTACAGCTCG
CGGAGACAGCGCTTGCTGTTAGCATGGCCCGAGCAAAGTCAGCCAAAACCTATATCTCGG
GCTTGACTGACCAGAAAGGAATCACAAAGAGGCAGCACGAGGCTGTGTTGGACTGTGTTG
AAGAGATGGGAGATACTGTTGACAGGTTGAGCAAGTCGCTGAAAGAATTGAAGAATCTGG
AGGAAGGAGAGAGCAAAGAAGACTTCTGGTTCTGTTTGAGCAATGTCAGGACATGGACAA
GCGCGGCGCTTACAGATGAGACCACTTGTCTTGATGGGTTTGG*AGGGAAAGGCATGG*A
TGGGGAGCTGAAAAGCTTAGTCGGAGCACACATT*GTGCGTGTAGCGCAAGATACCAGCA
ATGCCTTGG*CTTTGATCAATGTCTATGCTTCCAAGCATTGAAAAA*TGTTTGCATAAGT
TTGATCTCGATGAGGACTTGAGTTTCTTTTTATACTTTTGGATTTGGTTTGTATTGTGTT
TTCAGGAAATGTGTC*TTGGTTTTGTTCAGAGTCATACCAGTTTCTCTTGCCAGCTTGTT
ATATCATCTACGGTCTATATAGTTTGAAGCTGTTGATTTTGATGTTTGATTGGTGGTATA
ATATAGTTTTGTAATCCGT

QA 1 859 1 859
DS 



AS 1 4

CO CL2711Contig1 843 4 6 U
GGATCGTCTCCAAACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGGCTTGCAAGACGATTCTGCGCTC
CGTATTTCTATCGGAATCACGCCGGACCTCCGCCGCAGGAAGAAGATGCTTCTTCTTCCC
ACCTTCTCCGGCGTCTGTTACGGTCCATGGTTTGTTCCCGGCGGCGAAGAGACTAGGTTT
CAGTGGTTTCGCCTCAGTTCCGGACCGGATCCCTCGTCTCAATTGCAGTCACAACGATCA
ATCGGAACAAGGTCCGCCTCAAGAAGCTGTTCTCAAGGCGATTTCAGAAGTGTCCAAGAC
TGATGGGAGAGTTGGGAAGACTACTAATGTCATTATTGGTGGCACTGTTGCTGATGATTC
TGCTCAAGATTGGCTTGAACTTGACCAAAAGGTAAATACATACCCTACAGAGAGAGGGTT
TACTGCAATAGGGACTGGTGGAGATGACTTTGTTCATGCTATGGTGGTCGCTGTTGAATC
TGTTATTCAACGCCAGATTCCTGAGGATTGTGTGAAGCAGACATTATCAAGCAAAGGCAA
ATATGTATCGGTGAATATTAGCCCTATCCGAGTTGTCTCTAGCGAACAGGTTCAAGCAGT
GTATAATGCAATGAGGAGAGACGAAAGAATGAAATACTTCTTATAGGTTTTGGAGGTGTG
GTGGAGAATCACAGCTTTTCCCTCTTCTCTATTCTCCATTGCGACTTATGTAAATTATGC
GGGTGTAAGGCCATCATTTATTTTGTTCGTGCTATTTACACCAACTTTTAAGTCTTCCTT
CTTCAATTATTATATTAAAGATAACTTATATGCAAATGAATAGTTGGAAAAAGTTTATAG
CTG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2BQ86TF U 1
AF RR2F576TF U 4
AF RR2F576JQ C 217
AF RR2BQ86JQ C 126
BS 1 559 RR2BQ86TF
BS 560 560 RR2F576TF
BS 561 646 RR2BQ86TF
BS 647 647 RR2F576TF
BS 648 718 RR2BQ86TF
BS 719 843 RR2BQ86JQ

RD RR2BQ86TF 725 0 0
GGATCGTCTCCAAACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGGCTTGCAAGACGATTCTGCGCTC
CGTATTTCTATCGGAATCACGCCGGACCTCCGCCGCAGGAAGAAGATGCTTCTTCTTCCC
ACCTTCTCCGGCGTCTGTTACGGTCCATGGTTTGTTCCCGGCGGCGAAGAGACTAGGTTT
CAGTGGTTTCGCCTCAGTTCCGGACCGGATCCCTCGTCTCAATTGCAGTCACAACGATCA
ATCGGAACAAGGTCCGCCTCAAGAAGCTGTTCTCAAGGCGATTTCAGAAGTGTCCAAGAC
TGATGGGAGAGTTGGGAAGACTACTAATGTCATTATTGGTGGCACTGTTGCTGATGATTC
TGCTCAAGATTGGCTTGAACTTGACCAAAAGGTAAATACATACCCTACAGAGAGAGGGTT
TACTGCAATAGGGACTGGTGGAGATGACTTTGTTCATGCTATGGTGGTCGCTGTTGAATC
TGTTATTCAACGCCAGATTCCTGAGGATTGTGTGAAGCAGACATTATCAAGCAAAGGCAA
ATATGTATCGGTGAATATTGGCCCTATCCGAGTTGTCTCTAGCGAACAGGTTCAAGCAGT
GTATAATGCAATGAGGAGAGACGAAAGAATGAAATACTTCTTATAG*TTTTGGAGGTGTG
GTGGAGAATCACAGCTTTTCCCTCTTCTCTATTCTCCATTGCGACTTATGTAAATTAT
GCGGGTG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2F576TF 715 0 0
GG
GTCTCCAAACAGAGAGGGAGAGAGAGAGAATGGCTTGCAAGACGATTCTGCGCTCCGTAT
TTCTATCGGAATCACGCCGGACCTCCGCCGCAGGAAGAAGATGCTTCTTCTTCCCACCTT
CTCCGGCGTCTGTTACGGTCCATGGTTTGTTCCCGGCGGCGAAGAGACTAAGTTTCAGTG
GTTTCGCCTCAGTTCCGGACCGGATCCCTCGTCTCAATTGCAGTCACAACGATCAATCGG
AACAAGGTCCGCCTCAAGAAGCTGTTCTCAAGGCGATTTCAGAAGTGTCCAAGACTGATG
GGAGAGTTGGGAAGACTACTAATGTCATTATTGGTGGCACTGTTGCTGATGATTCTGCTC
AAGATTGGCTTGAACTTGACCAAAAGGTAAATACATACCCTACAGAGAGAGGGTTTACTG
CAATAGGGACTGGTGGAGATGACTTTGTTCATGCTATGGTGGTCGCTGTTGAATCTGTTA
TTCAACGCCAGATTCCTGAGGATTGTGTGAAGCAGACATTATCAAGCAAAGGCAAATATG
TATCGGTGAGTATTAGCCCTATCCGAGTTGTCTCTAGCGAACAGGTTCAAGCAGTGTATA
ATGCAATGAGGAGAGACGAAAGAATGAAATACTTCTTATAGGTTTTGGAGGTGTGGTGGA
GAATCACAGCTTTTCCCTCTTCTCTATTCTCCATTGCGACTTATGTAAATTAT

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR2F576JQ 472 0 0
TCTCAATTGCAGTCACAACGATCAATCGGAACAAGGTCCGCCTCAAGAAGCTGTTCTCAA
GGCGATTTCAGAAGTGTCCAAGACTGATGGGAGAGTTGGGAAGACTACTAATGTCATTAT
TGGTGGCACTGTTGCTGATGATTCTGCTCAAGATTGGCTTGAACTTGACCAAAAGGTAAA
TACATACCCTACAGAGAGAGGGTTTACTGCAATAGGGACTGGTGGAGATGACTTTGTTCA
TGCTATGGTGGTCGCTGTTGAATCTGTTATTCAACGCCAGATTCCTGAGGATTGTGTGAA
GCAGACATTATCAAGCAAAGGCAAATATGTATCGGTGAGTATTAGCCCTATCCGAGTTGT
CTCTAGCGAACAGGTTCAAGCAGTGTATAATGCAATGAGGAGAGACGAAAGAATGAAATA
CTTTTTATAGGTTTTGGAGGTGTGGTGGAGAATCACAGCTTTTCCCTCTTCT

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2BQ86JQ 718 0 0
CTCCGGCGTCTGTTACGGTCCATGGTTTGTTCCCGGCGGCGAAGAGACTAGGTTTCAGTG
GTTTCGCCTCAGTTCCGGACCGGATCCCTCGTCTCAATTGCAGTCACAACGATCAATCGG
AACAAGGTCCGCCTCAAGAAGCTGTTCTCAAGGCGATTTCAGAAGTGTCCAAGACTGATG
GGAGAGTTGGGAAGACTACTAATGTCATTATTGGTGGCACTGTTGCTGATGATTCTGCTC
AAGATTGGCTTGAACTTGACCAAAAGGTAAATACATACCCTACAGAGAGAGGGTTTACTG
CAATAGGGACTGGTGGAGATGACTTTGTTCATGCTATGGTGGTCGCTGTTGAATCTGTTA
TTCAACGCCAGATTCCTGAGGATTGTGTGAAGCAGACATTATCAAGCAAAGGCAAATATG
TATCGGTGAATATTGGCCCTATCCGAGTTGTCTCTAGCGAACAGGTTCAAGCAGTGTATA
ATGCAATGAGGAGAGACGAAAGAATGAAATACTTCTTATAGGTTTTGGAGGTGTGGTGGA
GAATCACAGCTTTTCCCTCTTCTCTATTCTCCATTGCGACTTATGTAAATTATGCGGGTG
TAAGGCCATCATTTATTTTGTTCGTGCTATTTACACCAACTTTTAAGTCTTCCTTCTTCA
ATTATTATATTAAAGATAACTTATATGCAAATGAATAGTTGGAAAAAGTTTATAGCTG

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL2712Contig1 579 2 1 U
TCAATTTATTTGGAAGTTTATGACAGATTCTGATACAATAGAGAAAACAAACAAGCCTTT
GTAGTCTTTCTTCAATCCTCAAAACAAGATACAAAGTGTACCAAACATAGTTGGAGATGT
GAGCTTTAGGGACATGGTTTCTAAGTATGAGAAATGTTCTTGCCAAAGAGTCCAGCTATG
CCTTTCTCAGGGTCGTTTTGCTTCACAATGGACTCACCAACCAATACCGCTTTAACTCCA
GCGGCTTGTACATAGGCAATATCATCAGGTGTAAACAGACCAGATTCACCAACCACAATC
ATGTCTTTCTCGCGTATTTGTCTACCATGCTCTCCTTCAAGAAGCTTCTTTGTGTTACTA
ATGTCCACCTTAAATGTTTCAAGACTTCTGTTATTAATGCCAACAAGCTCGATCCCTTCT
ATTCCAAGAACACGACCCATCTCTCTCTCATCGTGCACCTCAACAAGGGCAGCCAAACCA
AGCTTCTTGCAGAGCTTAAGCAAGTAGGTTATTTCCAGGTCAGTCAATATAGCAGCAATG
AGCAGTACTGCGTCAGCACCTTTAGTCCGAGCATAGTAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ40JQ U 1
AF RR2CH65JQ U 1
BS 1 579 RR2CH65JQ

RD RR2EZ40JQ 499 0 0
TCAATTTATTTGGAAGTTTATGACAGATTCTGATACAATAGAGAAAACAAACAAGCCTTT
GTAGTCTTTCTTCAATCCTCAAAACAAGATACAAAGTGTACCAAACATAGTTGGAGATGT
GAGCTTTAGGGACATGGTTTCTAAGTATGAGAAATGTTCTTGCCAAAGAGTCCAGCTATG
CCTTTCTCAGGGTCGTTTTGCTTCACAATGGACTCACCAACCAATACCGCTTTAACTCCA
GCGGCTTGTACATAGGCAATATCATCAGGTGTAAACAGACCAGATTCACCAACCACAATC
ATGTCTTTCTCGCGTATTTGTCTACCATGCTCTCCTTCAAGAAGCTTCTTTGTGTTGCTA
ATGTCCACCTTAAATGTTTCAAGACTTCTGTTATTAATGCCAACAAGCTCGATCCCTTCT
ATTCCAAGAACACGACCCATCTCTCTCTCATCGTGCACCTCAACAAGGGCAGCCAAACCA
AGCTTCTTGCAGAGCTTAA

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR2CH65JQ 579 0 0
TCAATTTATTTGGAAGTTTATGACAGATTCTGATACAATAGAGAAAACAAACAAGCCTTT
GTAGTCTTTCTTCAATCCTCAAAACAAGATACAAAGTGTACCAAACATAGTTGGAGATGT
GAGCTTTAGGGACATGGTTTCTAAGTATGAGAAATGTTCTTGCCAAAGAGTCCAGCTATG
CCTTTCTCAGGGTCGTTTTGCTTCACAATGGACTCACCAACCAATACCGCTTTAACTCCA
GCGGCTTGTACATAGGCAATATCATCAGGTGTAAACAGACCAGATTCACCAACCACAATC
ATGTCTTTCTCGCGTATTTGTCTACCATGCTCTCCTTCAAGAAGCTTCTTTGTGTTACTA
ATGTCCACCTTAAATGTTTCAAGACTTCTGTTATTAATGCCAACAAGCTCGATCCCTTCT
ATTCCAAGAACACGACCCATCTCTCTCTCATCGTGCACCTCAACAAGGGCAGCCAAACCA
AGCTTCTTGCAGAGCTTAAGCAAGTAGGTTATTTCCAGGTCAGTCAATATAGCAGCAATG
AGCAGTACTGCGTCAGCACCTTTAGTCCGAGCATAGTAG

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 4

CO CL2713Contig1 1073 4 4 U
GGATAGCTCCCTCCGACATTCCAATGGCGATGACAATGGCGTCTCTCTCCTTCCCATCTT
CACTCCACAAAACAACCTTATCCTCCTCATTCTCCCTCCCATCTAAAGCCTCCACCTTTC
TCGCCAAACCCTCTCCCAAACGCCGCCCCCTCACAATCACCATGTCCATGGAAGCCGGAA
TCGGCGTGATGGCCTCGAAGCTCGGCATGATGTCTTTCTTCGAGCCAGACGGAACCGTGG
TCCCCGTGACCGTCGTCGGGTTCCGCGAAGGCAACATCGTGACCCAAGTCAAGACCTTAG
CCACCGACGGATACGACGCCGTCCAGGTCGGGTACCGCCGCGTCCGCGACAAGAAGCTCA
CCAAGCCCGAGACGGGTCACCTCGAGAAGGCCGGCGTCATCCCCTTGCGGCACCTCCAGG
AGTTCAGGCTGACGAGCGTCGAAGGGTTCGAGCCGAACCAGAAGCTCGTCTTCGACGAGA
TTTTCAAGGAAGGGGATCTTGTCGACGTGGCGGGGACGACGATTGGGAAAGGGTTTCAGG
GTGGGATTAAGAGGCATAATTTTAAGAGAGGGCAGATGACTCATGGTTCTAAGAGTCATC
GTGCTTTGGGTTCGATTGGTGTGGGTACAACTCCCGGGAGGGTTTATAAAGGGAAGAAGA
TGCCTGGGAGGATGGGTGGGACGAGGACGAAGATTAGGAAGCTTAAAATTGTTAAGGTTG
ATAAGGAGTTGAATGTTGTTATGATCCAAGGTGCTTTGCCTGGTAAGCCTGGGAATCTCC
TCCGTATTACTCCCGCTAAGATCGTTGGAGTTAATATCCCCAAGAACTAGTTGATAAGAG
TCTCTATTGTGTTATGTTTGTGTTGGCGTTGCTTTTTAATTCGTTTCATTTTGTGGACTT
TTGAGTTTAAATCCTTTCTTGTGTTGTGTTTGTTGACAAGACTCACTCTTGTGTTATGTT
TCTGACTTCGCTCAGTTCACAACCATATTGTGTTATCTTGACAACAGACAAGACTCACTC
TTGTGTTAACATTCCCAAGATTGGATAAGAGGCAAAACTCAACTCTTTTGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H905TF U 1
AF RR2H907TF U 263
AF RR2H907JQ C 322
AF RR2H905JQ C 487
BS 1 589 RR2H905TF
BS 590 1028 RR2H907TF
BS 1029 1065 RR2H907JQ
BS 1066 1073 RR2H905JQ

RD RR2H905TF 589 0 0
GGATAGCTCCCTCCGACATTCCAATGGCGATGACAATGGCGTCTCTCTCCTTCCCATCTT
CACTCCACAAAACAACCTTATCCTCCTCATTCTCCCTCCCATCTAAAGCCTCCACCTTTC
TCGCCAAACCCTCTCCCAAACGCCGCCCCCTCACAATCACCATGTCCATGGAAGCCGGAA
TCGGCGTGATGGCCTCGAAGCTCGGCATGATGTCTTTCTTCGAGCCAGACGGAACCGTGG
TCCCCGTGACCGTCGTCGGGTTCCGCGAAGGCAACATCGTGACCCAAGTCAAGACCTTAG
CCACCGACGGATACGACGCCGTCCAGGTCGGGTACCGCCGCGTCCGCGACAAGAAGCTCA
CCAAGCCCGAGACGGGTCACCTCGAGAAGGCCGGCGTCATCCCCTTGCGGCACCTCCAGG
AGTTCAGGCTGACGAGCGTCGAAGGGTTCGAGCCGAACCAGAAGCTCGTCTTCGACGAGA
TTTTCAAGGAAGGGGATCTTGTCGACGTGGCGGGGACGACGATTGGGAAAGGGTTTCAGG
GTGGGATTAAGAGGCATAATTTTAAGAGAGGGCAGATGACTCATGGTTC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2H907TF 766 0 0
G
CGCGAAGGCAACATCGTGACCCAAGTCAAGACCTTAGCCACCGACGGATACGACGCCGTC
CAGGTCGGGTACCGCCGCGTCCGCGACAAGAAGCTCACCAAGCCCGAGACGGGTCACCTC
GAGAAGGCCGGCGTCATCCCCTTGCGGCACCTCCAGGAGTTCAGGCTGACGAGCGTCGAA
GGGTTCGAGCCGAACCAGAAGCTCGTCTTCGACGAGATTTTCAAGGAAGGGGATCTTGTC
GACGTGGCGGGGACGACGATTGGGAAAGGGTTTCAGGGTGGGATTAAGAGGCATAATTTT
AAGAGAGGGCAGATGACTCATGGTTCTAAGAGTCATCGTGCTTTGGGTTCGATTGGTGTG
GGTACAACTCCCGGGAGGGTTTATAAAGGGAAGAAGATGCCTGGGAGGATGGGTGGGACG
AGGACGAAGATTAGGAAGCTTAAAATTGTTAAGGTTGATAAGGAGTTGAATGTTGTTATG
ATCCAAGGTGCTTTGCCTGGTAAGCCTGGGAATCTCCTCCGTATTACTCCCGCTAAGATC
GTTGGAGTTAATATCCCCAAGAACTAGTTGATAAGAGTCTCTATTGTGTTATGTTTGTGT
TGGCGTTGCTTTTTAATTCGTTTCATTTTGTGGACTTTTGAGTTTAAATCCTTTCTTGTG
TTGTGTTTGTTGACAAGACTCACTCTTGTGTTATGTTTCTGACTTCGCTCAGTTCACAAC
CATATTGTGTTATCTTGACAACAGACAAGACTCACTCTTGTGTTA

QA 2 766 2 766
DS 

RD RR2H907JQ 744 0 0
TCCAGGTCGGGTACCGCCGCGTCCGCGACAAGAAGCTCACCAAGCCCGAGACGGGTCACC
TCGAGAAGGCCGGCGTCATCCCCTTGCGGCACCTCCAGGAGTTCAGGCTGACGAGCGTCG
AAGGGTTCGAGCCGAACCAGAAGCTCGTCTTCGACGAGATTTTCAAGGAAGGGGATCTTG
TCGACGTGGCGGGGACGACGATTGGGAAAGGGTTTCAGGGTGGGATTAAGAGGCATAATT
TTAAGAGAGGGCAGATGACTCATGGTTCTAAGAGTCATCGTGCTTTGGGTTCGATTGGTG
TGGGTACAACTCCCGGGAGGGTTTATAAAGGGAAGAAGATGCCTGGGAGGATGGGTGGGA
CGAGGACGAAGATTAGGAAGCTTAAAATTGTTAAGGTTGATAAGGAGTTGAATGTTGTTA
TGATCCAAGGTGCTTTGCCTGGTAAGCCTGGGAATCTCCTCCGTATTACTCCCGCTAAGA
TCGTTGGAGTTAATATCCCCAAGAACTAGTTGATAAGAGTCTCTATTGTGTTATGTTTGT
GTTGGCGTTGCTTTTTAATTCGTTTCATTTTGTGGACTTTTGAGTTTAAATCCTTTCTTG
TGTTGTGTTTGTTGACAAGACTCACTCTTGTGTTATGTTTCTGACTTCGCTCAGTTCACA
ACCATATTGTGTTATCTTGACAACAGACAAGACTCACTCTTGTGTTAACATTCCCAAGAT
TGGATAAGAGGCAAAACTCAACTC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2H905JQ 587 0 0
AGGAAGGGGATCTTGTCGACGTGGCGGGGACGACGATTGGGAAAGGGTTTCAGGGTGGGA
TTAAGAGGCATAATTTTAAGAGAGGGCAGATGACTCATGGTTCTAAGAGTCATCGTGCTT
TGGGTTCGATTGGTGCGGGTACAACTCCCGGGAGGGTTTATAAAGGGAAGAAGATGCCTG
GGAGGATGGGTGGGACGAGGACGAAGATTAGGAAGCTTAAAATTGTTAAGGTTGATAAGG
AGTTGAATGTTGTTATGATCCAAGGTGCTTTGCCTGGTAAGCCTGGGAATCTCCTCCGTA
TTACTCCCGCTAAGATCGTTGGAGTTAATATCCCCAAGAACTAGTTGATAAGAGTCTCTA
TTGTGTTATGTTTGTGTTGGCGTTGCTTTTTAATTCGTTTCATTTTGTGGACTTTTGAGT
TTAAATCCTTTCTTGTGTTGTGTTTGTTGACAAGACTCACTCTTGTGTTATGTTTCTGAC
TTCGCTCAGTTCACAACCATATTGTGTTATCTTGACAACAGACAAGACTCACTCTTGTGT
TAACATTCCCAAGATTGGA**ATAGGCAAAACTCAACTCTTTTGTAG

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 3

CO CL2714Contig1 727 3 6 U
GGTTAAACCCAATCTTCTTCTTCGTCTGCCCGCGTTGAAGAGAAGAAGAAGAAGAACACA
CCTCTGTGATTCTCTGGGCGATCGGAATAAAAAAATGTCAATCCTCCAGCTCTCTACCTC
TTCCCTCTCTTCTTCTACTATTCTCTCCATCTCTCCGAGAAAATCTCTCTCGTCGTCTCC
CAAGTCGTCTTCCCGAACAATTCGTTGTTCCCTCGAGGGAACCACTGTAACTGAGCGGAA
AGTCTCTGCAACCACCGAGCCTCTTCTTCTGAGAGCTGTTAAAGGTGAAGTTGTTGATAG
ACCTCCCGTTTGGCTTATGAGACAAGCTGGGAGGTACATGAAGAGTTATCAAACTCTCTG
TGAGAAGTATCCTTTATTCCGGGACAGATCAGAGAACGCAGATCTCGTGGTGGAGATTTC
TCTTCAACCCTGGAAAGTGTTCAAGCCGGATGGTGTGATTCTGTTCTCAGACATTCTCAC
TCCTTTGTCCGGAATGAACATACCTTTCGACATTGTCAAAGGAAAAGGTCCCATCATCTT
CAACCCGCCGCAGTCAGCTGCTGACGTGAACCAAGTCAGAGAGTTTGTGCCAGAGGAATC
TGTTCCTTATGTTGGAGAAGCACTCAAGAGACTAAGAAACGAGGTGGGCAACGAAGCTGC
TGTTCTTGGCTTTGTTGGAGCTCCGTTTACTCTCTCCTCATATGTTATTGAAGTGGCTCA
TCAAAGA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP30TF U 55
AF RR2FB74TF U 1
AF RR2EP48TF U 2
BS 1 132 RR2FB74TF
BS 133 133 RR2EP30TF
BS 134 256 RR2FB74TF
BS 257 257 RR2EP30TF
BS 258 710 RR2FB74TF
BS 711 727 RR2EP48TF

RD RR2EP30TF 501 0 0
AACACACCTCTGTGATTCTCTGGGCGATCGGAATAAAAAAATGTCAATCCTCCAGCTCTC
TACCTCTTCCCCCTCTTCTTCTACTATTCTCTCCATCTCTCCGAGAAAATCTCTCTCGTC
GTCTCCCAAGTCGTCTTCCCGAACAATTCGTTGTTCCCTCGAGGGAACCACTGTAACTGA
GCGGAAAGTCTCTGCAACCACCGAGCCTCTTCTTCTGAGAGCTGTTAAAGGTGGAGTTGT
TGATAGACCTCCCGTTTGGCTTATGAGACAAGCTGGGAGGTACATGAAGAGTTATCAAAC
TCTCTGTGAGAAGTATCCTTTATTCCGGGACAGATCAGAGAACGCAGATCTCGTGGTGGA
GATTTCTCTTCAACCCTGGAAAGTGTTCAAGCCGGATGGTGTGATTCTGCTCTCAGACAT
TCTCACTCCTTTGTCCGGAATGAACATACCTTTCGACATTGTCAAAGGAAAAGGTCCCAT
CATCTTCAACCCGCCGCAGTC

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR2FB74TF 711 0 0
GGTTAAACCCAATCTTCTTCTTCGTCTGCCCGCGTTGAAGAGAAGAAGAAGAAGAACACA
CCTCTGTGATTCTCTGGGCGATCGGAATAAAAAAATGTCAATCCTCCAGCTCTCTACCTC
TTCCCTCTCTTCCTCTACTATTCTCTCCATCTCTCCGAGAAAATCTCTCTCGTCGTCTCC
CAAGTCGTCTTCCCGAACAATTCGTTGTTCCCTCGAGGGAACCACTGTAACTGAGCGGAA
AGTCTCTGCAACCACCAAGCCTCTTCTTCTGAGAGCTGTTAAAGGTGAAGTTGTTGATAG
ACCTCCCGTTTGGCTTATGAGACAAGCTGGGAGGTACATGAAGAGTTATCAAACTCTCTG
TGAGAAGTATCCTTTATTCCGGGACAGATCAGAGAACGCAGATCTCGTGGTGGAGATTTC
TCTTCAACCCTGGAAAGTGTTCAAGCCGGATGGTGTGATTCTGTTCTCAGACATTCTCAC
TCCTTTGTCCGGAATGAACATACCTTTCGACATTGTCAAAGGAAAAGGTCCCATCATCTT
CAACCCGCCGCAGTCAGCTGCTGACGTGAACCAAGTCAGAGAGTTTGTGCCAGAGGAATC
TGTTCCTTATGTTGGAGAAGCACTCAAGAGACTAAGAAACGAGGTGGGCAACGAAGCTGC
TGTTCTTGGCTTTGTTGGAGCTCCGTTTACTCTCTCCTCATATGTTATTG
A

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2EP48TF 726 0 0
GGG
AAACCCAATCTTCTTCTTCGTCTGCCCGCGTTGAAGAGAAGAAGAAGAAGAACACACCTC
TGTGATTCTCTGGGCGATCGGAATAAAAAAATGTCAATCCTCCAGCTCTCTACCTCTTCC
CTCTCTTCTTCTACTATTCTCTCCATCTCCCCGAGAAAATCTCTCTCGTCGTCTCCCAAG
TCGTCTTCCCGAACAATTCGTTGTTCCCTCGAGGGAACCACTGTAACTGAGCGGAAAGTC
TCTGCAACCACCGAGCCTCTTCTTCTGAGAGCTGTTAAAGGTGAAGTTGTTGATAGACCT
CCCGTTTGGCTTATGAGACAAGCTGGGAGGTACATGAAGAGTTATCAAACTCTCTGTGAG
AATTATCCTTTATTCCGGGACAGATCAGAGAACGCAGATCTCGTGGTGGAGATTTTTCTT
CAACCCTGGAAAGTGTTCAAGCCGGATGGTGTGATTCTGTTCTCAGACATTCTCACTCCT
TTGTCCGGAATGAACATACCTTTCGACATTGTCAAAGGAAAAGGTCCCATCATCTTCAAC
CCACCGCAGTCAGCTGCTGACGTGAACCAAGTCAGAGAGTTTGTGCCAGAGGAATCTGTT
CCTTATGTTGGAGAAGCACTCAAGAGACTAAGAAACGAGGTGGGCAACGAAGCTGCTGTT
CTTGGCTTTGTTGGAGCTCCGTTTACTCTCTCCTCATATGTTATTGAAGTGGCTCATCAA
AGA

QA 4 726 4 726
DS 



AS 1 4

CO CL2715Contig1 704 4 2 U
GGGGAAAGAAATTAGACCTCAACCTCAGTTGTACTTTGCCAACGACGATTTAGACTACCA
GGTTATGGTCATCCCCATCTCCATTTATGTTGAATTTATCATATAAAGATTTATTGATGC
ATTGTGGACTCAACAGACAAAGTTTCCTACTGAACGTCTTGGCATGGGAGCTTTTAGAAT
CGCCTTGGAATCCATATTCAACAGAATCCATGATAACCCTCTGGAGTACACATCCTTTGG
GAAACCAAATCCATTCGTGTTCAAGAACGCAGAAGATGTTCTGAAAGAGATAGCCACATC
AACTCGTTCCCACTCAAACCAAGGAAGTCACCACCACTTCAAGACTCTATATATGGTCGG
AGACAACCCAAAAATTGACATCAGAGGCGCACGTCAGGCCGGGAGTCCTTGGTTCTCAAT
CTTGACAAGAACCGGAGTTTTCAAAGGGAAAGATAATCATCCTGAGTTTCCTGCTGATCT
GGTAGTTGACACAGTCGAGGAAGCGGTTGATTTCATCTTGACAAGAGAGTCCGCCAAGCT
AAGCTTGATTTGAGTTATATTTCCCTCTGATTTATTTAAGATTTTATTTTAATCACACAT
TGTCGCCGTCTTTGGCCAGTAATGATATGATATCTAACTAACATATTCATTGAGCCTCCA
ATGAGATTTTTGGAAGTTTCAATCTAAATATAAATTCGGTCGGG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2AV83TF U 1
AF RR2AP77JQ C 1
AF RR2AV83JQ C 1
AF RR2AP77TF U 1
BS 1 657 RR2AV83TF
BS 658 704 RR2AP77TF

RD RR2AV83TF 657 0 0
GGGGAAAGAAATTAGACCTCAACCTCAGTTGTACTTTGCCAACGACGATTTAGACTACCA
GGTTATGGTCATCCCCATCTCCATTTATGTTGAATTTATCATATAAAGATTTATTGATGC
ATTGTGGACTCAACAGACAAAGTTTCCTACTGAACGTCTTGGCATGGGAGCTTTTAGAAT
CGCCTTGGAATCCATATTCAACAGAATCCATGATAACCCTCTGGAGTACACATCCTTTGG
GAAACCAAATCCATTCGTGTTCAAGAACGCAGAAGATGTTCTGAAAGAGATAGCCACATC
AACTCGTTCCCACTCAAACCAAGGAAGTCACCACCACTTCAAGACTCTATATATGGTCGG
AGACAACCCAAAAATTGACATCAGAGGCGCACGTCAGGCCGGGAGTCCTTGGTTCTCAAT
CTTGACAAGAACCGGAGTTTTCAAAGGGAAAGATAATCATCCTGAGTTTCCTGCTGATCT
GGTAGTTGACACAGTCGAGGAAGCGGTTGATTTCATCTTGACAAGAGAGTCCGCCAAGCT
AAGCTTGATTTGAGTTATATTTCCCTCTGATTTATTTAAGATTTTATTTTAATCACACAT
TGTCGCCGTCTTTGGCCAGTAATGATATGATATCTAACTAACATATTCATTGAGCCT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2AP77JQ 704 0 0
GGGGAAAGAAATTAGACCTCAACCTCAGTTGTACTTTGCCAACGACGATTTAGACTACCA
GGTTATGGTCATCCCCATCTCCATTTATGTTGAATTTATCATATAAAGATTTATTGATGC
ATTGTGGACTCAACAGACAAAGTTTCCTACTGAACGTCTTGGCATGGGAGCTTTTAGAAT
CGCCTTGGAATCCATATTCAACAGAATCCATGATAACCCTCTGGAGTACACATCCTTTGG
GAAACCAAATCCATTCGTGTTCAAGAACGCAGAAGATGTTCTGAAAGAGATAGCCACATC
AACTCGTTCCCACTCAAACCAAGGAAGTCACCACCACTTCAAGACTCTATATATGGTCGG
AGACAACCCAAAAATTGACATCAGAGGCGCACGTCAGGCCGGGAGTCCTTGGTTCTCAAT
CTTGACAAGAACCGGAGTTTTCAAAGGGAAAGATAATCATCCTGAGTTTCCTGCTGATCT
GGTAGTTGACACAGTCGAGGAAGCGGTTGATTTCATCTTGACAAGAGAGTCCGCCAAGCT
AAGCTTGATTTGAGTTATATTTCCCTCTGATTTATTTAAGATTTTATTTTAATCACACAT
TGTCGCCGTCTTTGGCCAGTAATGATATGATATCTAACTAACATATTCATTGAGCCTCCA
ATGAGATTTTTGGAAGTTTCAATCTAAATATAAATTCGGTCGGG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2AV83JQ 704 0 0
GGGGAAAGAAATTAGACCTCAACCTCAGTTGTACTTTGCCAACGACGATTTAGACTACCA
GGTTATGGTCATCCCCATCTCCATTTATGTTGAATTTATCATATAAAGATTTATTGATGC
ATTGTGGACTCAACAGACAAAGTTTCCTACTGAACGTCTTGGCATGGGAGCTTTTAGAAT
CGCCTTGGAATCCATATTCAACAGAATCCATGATAACCCTCTGGAGTACACATCCTTTGG
GAAACCAAATCCATTCGTGTTCAAGAACGCAGAAGATGTTTTGAAAGAGATAGCCACATC
AACTCGTTCCCACTCAAACCAAGGAAGTCACCACCACTTCAAGACTCTATATATGGTCGG
AGACAACCCAAAAATTGACATCAGAGGCGCACGTCAGGCCGGGAGTCCTTGGTTCTCAAT
CTTGACAAGAACCGGAGTTTTCAAAGGGAAAGATAATCATCCTGAGTTTCCTGCTGATCT
GGTAGTTGACACAGTCGAGGAAGCGGTTGATTTCATCTTGACAAGAGAGTCCGCCAAGCT
AAGCTTGATTTGAGTTATATTTCCCTCTGATTTATTTAAGATTTTATTTTAATCACACAT
TGTCGCCGTCTTTGGCCAGTAATGATATGATATCTAACTAACATATTCATTGAGCCTCCA
ATGAGATTTTTGGAAGTTTCAATCTAAATATAAATTCGGTCGGG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2AP77TF 704 0 0
GGGGAAAGAAATTAGACCTCAACCTCAGTTGTACTTTGCCAACGACGATTTAGACTACCA
GGTTATGGTCATCCCCATCTCCATTTATGTTGAATTTATCATATAAAGATTTATTGATGC
ATTGTGGACTCAACAGACAAAGTTTCCTACTGAACGTCTTGGCATGGGAGCTTTTAGAAT
CGCCTTGGAATCCATATTCAACAGAATCCATGATAACCCTCTGGAGTACACATCCTTTGG
GAAACCAAATCCATTCGTGTTCAAGAACGCAGAAGATGTTCTGAAAGAGATAGCCACATC
AACTCGTTCCCACTCAAACCAAGGAAGTCACCACCACTTCAAGACTCTATATATGGTCGG
AGACAACCCAAAAATTGACATCAGAGGCGCACGTCAGGCCGGGAGTCCTTGGTTCTCAAT
CTTGACAAGAACCGGAGTTTTCAAAGGGAAAGATAATCATCCTGAGTTTCCTGCTGATCT
GGTAGTTGACACAGTCGAGGAAGCGGTTGATTTCATCTTGACAAGAGAGTCCGCCAAGCT
AAGCTTGATTTGAGTTATATTTCCCTCTGATTTATTTAAGATTTTATTTTAATCACACAT
TGTCGCCGTCTTTGGCCAGTAATGATATGATATCTAACTAACATATTCATTGAGCCTCCA
ATGAGATTTTTGGAAGTTTCAATCTAAATATAAATTCGGTCGGG

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 4

CO CL2716Contig1 711 4 4 U
GGATCCTCAAAACTCGCGAGTGAACTCTCTCATCTTCTTCTTTCGCCCATAGCCCACAAT
GCTCAGTCTCTCTATTGCCTCGCCGGGGACGGCGGTGACTTTCCTCCGAGGAAACGTTTC
CGCGACTTCGACCTCTTCTTCGTTCCACGGCGTCAGAATCCCGCGCCAAGCTTCCGCTCG
CGTGCCCGCGGCGGCGATTTCTTCGTACGGGAAACCTTCGGTGGTGATGATGTCGAAAAG
AGAGGCGGAGTTGAAAGATATCAGAGCGAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGAT
TGACCTTAAAGGAGAGCTCTTTATGCTCCGTCTCCAGAAATCTGCGAGGAACGAGTTCAA
ATCGAGCGAGTTTCGCCGTATGAAGAAACAAGTAGCTCGGATATTGACGGTGAGAAGAGA
GAGGGAGATAGAAGAAGGAATAGGGAAGAGGTTGTCGAGGAAACTTGACAGGCAATGGAA
GAAAAGCATTGTTGTCAGACCTCCTCCTTCCCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAAGAAGCTGC
TGAAGAGGCCGCTGAAGCTGCCAAATCTGCTTGATAGCAGCCATTGTATTTCTTGTTTCC
TCTCTGTTGATGGTTACTCTCTGTTGCTGGAAACCATATGCTATTTTGTTCTTTTTCTGT
TGCTGTAAAAACTTTGTTCATTGAGCAGTTTACATAATTTCTATGACAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA88JQ C 1
AF RR2CA88TF U 1
AF RR2AO31JQ C 16
AF RR2AO31TF U 16
BS 1 375 RR2CA88TF
BS 376 376 RR2AO31TF
BS 377 704 RR2CA88TF
BS 705 711 RR2AO31JQ

RD RR2CA88JQ 711 0 0
GGATCCTCAAAACTCGCGAGTGAACTCTCTCATCTTCTTCTTTCGCCCATAGCCCACAAT
GCTCAGTCTCTCTATTGCCTCGCCGGGGACGGCGGTGACTTTCCTCCGAGGAAACGTTTC
CGCGACTTCGACCTCTTCTTCGTTCCACGGCGTCAGAATCCCGCGCCAAGCTTCCGCTCG
CGTGCCCGCGGCGGCGATTTCTTCGTACGGGAAACCTTCGGTGGTGATGATGTCGAAAAG
AGAGGCGGAGTTGAAAGATATCAGAGCGAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGAT
TGACCTTAAAGGAGAGCTCTTTATGCTCCGTCTCCAGAAATCTGCGAGGAACGAGTTCAA
ATCGAGCGAGTTTCGTCGTATGAAGAAACAAGTAGCTCGGATATTGACGGTGAGAAGAGA
GAGGGAGATAGAAGAAGGAATAGGGAAGAGGTTGTCGAGGAAACTTGACAGGCAATGGAA
GAAAAGCATTGTTGTCAGACCTCCTCCTTCCCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAAGAAGCTGC
TGAAGAGGCCGCTGAAGCTGCCAAATCTGCTTGATAGCAGCCATTGTATTTCTTGTTTCC
TCTCTGTTGATGGTTACTCTCTGTTGCTGGAAACCATATGCTATTTTGTTCTTTTTCTGT
TGCTGTAAAAACTTTGTTCATTGAGCAGTTTACATAATTTCTAT
GACAACT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2CA88TF 704 0 0
GGATCCTCAAAACTCGCGAGTGAACTCTCTCATCTTCTTCTTTCGCCCATAGCCCACAAT
GCTCAGTCTCTCTATTGCCTCGCCGGGGACGGCGGTGACTTTCCTCCGAGGAAACGTTTC
CGCGACTTCGACCTCTTCTTCGTTCCACGGCGTCAGAATCCCGCGCCAAGCTTCCGCTCG
CGTGCCCGCGGCGGCGATTTCTTCGTACGGGAAACCTTCGGTGGTGATGATGTCGAAAAG
AGAGGCGGAGTTGAAAGATATCAGAGCGAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGAT
TGACCTTAAAGGAGAGCTCTTTATGCTCCGTCTCCAGAAATCTGCGAGGAACGAGTTCAA
ATCGAGCGAGTTTCGTCGTATGAAGAAACAAGTAGCTCGGATATTGACGGTGAGAAGAGA
GAGGGAGATAGAAGAAGGAATAGGGAAGAGGTTGTCGAGGAAACTTGACAGGCAATGGAA
GAAAAGCATTGTTGTCAGACCTCCTCCTTCCCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAAGAAGCTGC
TGAAGAGGCCGCTGAAGCTGCCAAATCTGCTTGATAGCAGCCATTGTATTTCTTGTTTCC
TCTCTGTTGATGGTTACTCTCTGTTGCTGGAAACCATATGCTATTTTGTTCTTTTTCTGT
TGCTGTAAAAACTTTGTTCATTGAGCAGTTTACATAATTTCTAT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2AO31JQ 696 0 0
GG
GAGTGAACTCTCTCATCTTCTTCTTTCGCCCATAGCCCACAATGCTCAGTCTCTCTATTG
CCTCGCCGGGGACGGCGGTGACTTTCCTCCGAGGAAACGTTTCCGCGACTTCGACCTCTT
CTTCGTTCCACGGCGTCAGAATCCCGCGCCAAGCTTCCGCTCGCGTGCCCGCGGCGGCGA
TTTCTTCGTACGGGAAGCCTTCGGTGGTGATGATGTCGAAAAGAGAGGCGGAGTTGAAAG
ATATCAGAGCGAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGATTGACCTTAAAGGAGAGC
TCTTTATGCTCCGTCTCCAGAAATCTGCGAGGAACGAGTTCAAATCGAGCGAGTTTCGCC
GTATGAAGAAACCAGTAGCTCGGATATTGACGGTGAGAAGAGAGAGGGAGATAGAAGAAG
GAATAGGGAAGAGGTTGTCGAGGAAACTTGACAGGCAATGGAAGAAAAGCATTGTTGTCA
GACCTCCTCCTTCTCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAAGAAGCTGCTGAAGAGGCCGCTGAAG
CTGCCAAATCTGCTTGATAGCAGCCATTGTATTTCTTGTTTCCTCTCTGTTGATGGTTAC
TCTCTGTTGCTGGAAACCATATGCTATTTTGTTCTTTTTCTGTTGCTGTAAAAACTTTGT
TCATTGAGCAGTTTACATAATTTCTATGACAACT

QA 3 696 3 696
DS 

RD RR2AO31TF 696 0 0
GG
GAGTGAACTCTCTCATCTTCTTCTTTCGCCCATAGCCCACAATGCTCAGTCTCTCTATTG
CCTCGCCGGGGACGGCGGTGACTTTCCTCCGAGGAAACGTTTCCGCGACTTCGACCTCTT
CTTCGTTCCACGGCGTCAGAATCCCGCGCCAAGCTTCCGCTCGCGTGCCCGCGGCGGCGA
TTTCTTCGTACGGGAAGCCTTCGGTGGTGATGATGTCGAAAAGAGAGGCGGAGTTGAAAG
ATATCAGAGCGAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGATTGACCTTAAAGGAGAGC
TCTTTATGCTCCGTCTCCAGAAATCTGCGAGGAACGAGTTCAAATCGAGCGAGTTTCGCC
GTATGAAGAAACCAGTAGCTCGGATATTGACGGTGAGAAGAGAGAGGGAGATAGAAGAAG
GAATAGGGAAGAGGTTGTCGAGGAAACTTGACAGGCAATGGAAGAAAAGCATTGTTGTCA
GACCTCCTCCTTCTCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAAGAAGCTGCTGAAGAGGCCGCTGAAG
CTGCCAAATCTGCTTGATAGCAGCCATTGTATTTCTTGTTTCCTCTCTGTTGATGGTTAC
TCTCTGTTGCTGGAAACCATATGCTATTTTGTTCTTTTTCTGTTGCTGTAAAAACTTTGT
TCATTGAGCAGTTTACATAATTTCTAT
GACAACT

QA 3 689 3 689
DS 



AS 1 4

CO CL2717Contig1 822 4 2 U
GGCTCCATATAATACATATTACTCTCATTTGGAGGAGCACACGAGTGAGGTAGGGGTTGA
GCTAACTATCAACAAATGGGACAAACCATTGGCACTGGGAGCAGTGGATCCACATGACTC
ACTCTCACATCCTGCAGGCGTTGCTGATGCACAGGCTGAATCAGCTGCTTGTGTAGACCC
TGACCAGTTCATTAACTTTTTGATCCCAAACTGGTTTAGCGGCGAGGAGATTGGTTCGAC
TAAAGACAATCCATTTCCATTGCCAGACCCTTATACGGCAGCTCAGCAGAGAAACCTTAA
GAACTTGGAAGAAACAAGACGATCGCTAAGAGAAACGCCTCTGGAAGAAAACCGGAAAAA
GGAGCTATCAACTGCACTCCATGT**ATTTCAAAGATTGGCTCTATGCAAGTGGAAATAT
AAGGCAACTCTACTGCTTACAAGGTGACTAAATAATGAACAAATAAACACCAAGTGGAAG
ATGTCTCGTTTCTGTAGAGCTCTCTCGATCATTTTGGCATAGTTAAGAAACCCAAGACCC
CCCTCCCAGCCTGATTTGCAGTTTGGAATCTATACGCACCACGTATCTGCACAGAACATT
CCACTAAAGCTTTCCTCTAGATTATTATTTTCTTTATTTCTGCTTTGGTCATGTTCAAGC
TTTGTTCCTTTTGACTTTTCAATCCCTCGTTTTTGTCCTCTTTTCGCTTTTTGAAAACCG
TATCTTGGGGACAAGAACATGATGTTTTCCTTGAACTGTTACTGTTTGCAGTTGCATAAG
CAGGTAGGTGAAGAATTACTCACTAAATAGTGAATTTTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DX45TF U 1
AF RR2DX45JQ C 243
AF RR2DM76JQ C 151
AF RR2DM76TF U 151
BS 1 287 RR2DX45TF
BS 288 822 RR2DM76TF

RD RR2DX45TF 289 0 0
GGCTCCATATAATACATATTACTCTCATTTGGAGGAGCACACGAGTGAGGTAGGGGTTGA
GCTAACTATCAACAAATGGGACAAACCATTGGCACTGGGAGCAGTGGATCCACATGACTC
ACTCTCACATCCTGCAGGCGTTGCTGATGCACAGGCTGAATCAGCTGCTTGTGTAGACCC
TGACCAGTTCATTAACTTTTTGATCCCAAACTGGTTTAGCGGCGAGGAGATTGGTTCGAC
TAAAGACAATCCATTTCCATTGCCAGACCCTTATACGGCAGCTCAGC
GG

QA 1 287 1 287
DS 

RD RR2DX45JQ 491 0 0
AAGACAATCCATTTCCATTGCCAGACCCTTATACGGCAGCTCAGCAGAGAAACCTTAAGA
ACTTGGAAGAAACAAGACGATCGCTAAGAGAAACGCCTCTGGAAGAAAACCGGAAAAAGG
AGCTATCAACTGCACTCCATGTGTATTTCAAAGACTGGCTCTATGCAAGTGGAAATATAA
GGCAACTCTACTGCTTACAAGGTGACTAAATAATGAACAAATAAACACCAAGTGGAAGAT
GTCTCGTTTCTGTAGAGCTCTCTCGATCATTTTGGCATAGTTAAGAAACCCAAGACCCCC
CTCCCAGCCTGATTTGCAGTTTGGAATCTATACGCACCACGTATCTGCACAGAACATTCC
ACTAAAGCTTTCCTCTAGATTATTATTTTCTTTATTTCTGCTTTGGTCATGTTCAAGCTT
TGTTCCTTTTGACTTTTCAATCCCTCGTTTTTGTCCTCTTTTCGCTTTTTGAAAACCGTA
TCTTGGGGACA

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2DM76JQ 672 0 0
G
CAGGCTGAATCAGCTGCTTGTGTAGACCCTGACCAGTTCATTAACTTTTTGATCCCAAAC
TGGTTTAGCGGCGAGGAGATTGGTTCGACTAAAGACAATCCATTTCCATTGCCAGACCCT
TATACGGCAGCTCAGCAGAGAAACCTTAAGAACTTGGAAGAAACAAGACGATCGCTAAGA
GAAACGCCTCTGGAAGAAAACCGGAAAAAGGAGCTATCAACTGCACTCCATGT**ATTTC
AAAGATTGGCTCTATGCAAGTGGAAATATAAGGCAACTCTACTGCTTACAAGGTGACTAA
ATAATGAACAAATAAACACCAAGTGGAAGATGTCTCGTTTCTGTAGAGCTCTCTCGATCA
TTTTGGCATAGTTAAGAAACCCAAGACCCCCCTCCCAGCCTGATTTGCAGTTTGGAATCT
ATACGCACCACGTATCTGCACAGAACATTCCACTAAAGCTTTCCTCTAGATTATTATTTT
CTTTATTTCTGCTTTGGTCATGTTCAAGCTTTGTTCCTTTTGACTTTTCAATCCCTCGTT
TTTGTCCTCTTTTCGCTTTTTGAAAACCGTATCTTGGGGACAAGAACATGATGTTTTCCT
TGAACTGTTACTGTTTGCAGTTGCATAAGCAGGTAGGTGAAGAATTACTCACTAAATAGT
GAATTTTAAGG

QA 2 672 2 672
DS 

RD RR2DM76TF 672 0 0
G
CAGGCTGAATCAGCTGCTTGTGTAGACCCTGACCAGTTCATTAACTTTTTGATCCCAAAC
TGGTTTAGCGGCGAGGAGATTGGTTCGACTAAAGACAATCCATTTCCATTGCCAGACCCT
TATACGGCAGCTCAGCAGAGAAACCTTAAGAACTTGGAAGAAACAAGACGATCGCTAAGA
GAAACGCCTCTGGAAGAAAACCGGAAAAAGGAGCTATCAACTGCACTCCATGT**ATTTC
AAAGATTGGCTCTATGCAAGTGGAAATATAAGGCAACTCTACTGCTTACAAGGTGACTAA
ATAATGAACAAATAAACACCAAGTGGAAGATGTCTCGTTTCTGTAGAGCTCTCTCGATCA
TTTTGGCATAGTTAAGAAACCCAAGACCCCCCTCCCAGCCTGATTTGCAGTTTGGAATCT
ATACGCACCACGTATCTGCACAGAACATTCCACTAAAGCTTTCCTCTAGATTATTATTTT
CTTTATTTCTGCTTTGGTCATGTTCAAGCTTTGTTCCTTTTGACTTTTCAATCCCTCGTT
TTTGTCCTCTTTTCGCTTTTTGAAAACCGTATCTTGGGGACAAGAACATGATGTTTTCCT
TGAACTGTTACTGTTTGCAGTTGCATAAGCAGGTAGGTGAAGAATTACTCACTAAATAGT
GAATTTTAAGG

QA 2 672 2 672
DS 



AS 1 4

CO CL2718Contig1 1020 4 25 U
GGGACTTTTGTTCTCCTTTTCCCCCCAGGTTTGAATTTGATCCCTTCTTTTTTTTTCTTC
TTTTTTGCTCTCAAAGTTTCTCTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAACAGAATCTGGAAT
TGTTTGAATTTAGCGGTTTCGAGTTATAGATCTTCTTTTTTGGTAAAGCTAAAGGAGAAA
TGAGTGGCGTTGGAGAGAATCAGCTTATCTCCATTCAACCTGATGAACTCAAATTCCTTT
TTGAACTGGAAAAGCAAAGCTACTGTGATCTTAAAGTTTCCAATAAAACCGAGAACTATG
TTGCTTTCAAGGTGAAAACAACATCTCCAAAAAAGTATTTTGTAAGGCCCAACACTGGTG
TCATTCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTAGAGTTACACTACAAGCGCAAAGGGAGTATC
CTCCAGATATGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGTACCATTGTCCCTCCTCACA
CTGATGTTGATGACCTTCCACAAGACACTTTTACCAAGGACAGTAGCAAAACATTAACAG
AGTGTAAGCTCAAGGTCTCGTATATCGCCACATCTACAACCCAAAAACCCTCTGAATCTG
GAGCAACCAGCGGCGATGCAAACGGCTCCGAATCCATCTCAGTGACTACTATACAGCGGC
TGAAGGAAGAGAGAGATGCAGCTGTTAAGCAAACACAACAGCTGCAGCATGAATTGGAGA
CATTGAAGAAACGAAAAAGGAACAGCGAAAATGGGTTATCCTTAAAGTTGGCAGCTATGG
TTGGACTCATTGGACTCATCATTGGTTTCATCCTAAAACTCGCCTTAGCTTCTCCCAAAT
AACAGCTATCAGCAGCTTCTCCGCATCATCTACCATTTCAACTTACGAGGGATAGCTGTT
AACTCT**ATTGATCTTGTTCTACTTTGTCTTTGTCCATTAAAATTTGTTTCTTTGTCAA
TTATATTTGGATGTACGTCATTGACCCAATAGAACCTATCATTATTATGTTTACTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E649TF U 1
AF RR2E649JQ C 227
AF RR2AO64JQ C 298
AF RR2AO64TF U 298
BS 1 319 RR2E649TF
BS 320 320 RR2AO64TF
BS 321 406 RR2E649TF
BS 407 407 RR2AO64TF
BS 408 499 RR2E649TF
BS 500 500 RR2AO64TF
BS 501 501 RR2E649TF
BS 502 502 RR2AO64TF
BS 503 571 RR2E649TF
BS 572 572 RR2AO64TF
BS 573 585 RR2E649TF
BS 586 586 RR2AO64TF
BS 587 587 RR2E649TF
BS 588 588 RR2AO64TF
BS 589 604 RR2E649TF
BS 605 605 RR2AO64TF
BS 606 606 RR2E649TF
BS 607 607 RR2AO64TF
BS 608 610 RR2E649TF
BS 611 611 RR2AO64TF
BS 612 622 RR2E649TF
BS 623 623 RR2AO64TF
BS 624 628 RR2E649TF
BS 629 993 RR2AO64TF
BS 994 1020 RR2E649JQ

RD RR2E649TF 628 0 0
GGGACTTTTGTTCTCCTTTTCCCCCCAGGTTTGAATTTGATCCCTTCTTTTTTTTTCTTC
TTTTTTGCTCTCAAAGTTTCTCTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAACAGAATCTGGAAT
TGTTTGAATTTAGCGGTTTCGAGTTATAGATCTTCTTTTTTGGTAAAGCTAAAGGAGAAA
TGAGTGGCGTTGGAGAGAATCAGCTTATCTCCATTCAACCTGATGAACTCAAATTCCTTT
TTGAACTGGAAAAGCAAAGCTACTGTGATCTTAAAGTTTCCAATAAAACCGAGAACTATG
TTGCTTTCAAGGTGAAAACGACATCTCCAAAAAAGTATTTTGTAAGGCCCAACACTGGTG
TCATTCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTAGAGTTACACTACAAGCTCAAAGGGAGTATC
CTCCAGATATGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGTACCATTGTCCCTCCTCACA
CTGATGTTGATGACCTTCCTCCAGACACTTTTACCAAGGACAGTAGCAAAACATTAACAG
AGTGTAAGCTCAAGGTCTCGTATATCGCCACCTCTACAACCCAAAGATCCTCTGAATCTG
GAGCTATCAGTGGCGATGCAAATGGCTC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2E649JQ 794 0 0
ACTCAAATTCCTTTT*GAACTGGAAAAGCAAAGCTACTGTGATCTTAAAGTTTCCAATAA
AACCGAGAACTATGTTGCTTTCAAGGTGAAAACGACATCTCCAAAAAAGTATTTTGTAAG
GCCCAACACTGGTGTCATTCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTAGAGTTACACTACAAGC
TCAAAGGGAGTATCCTCCAGATATGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGTACCAT
TGTCCCTCCTCACACTGATGTTGATGACCTTCCTCCAGACACTTTTACCAAGGACAGTAG
CAAAACATTAACAGAGTGTAAGCTCAAGGTCTCGTATATCGCCACCTCTACAACCCAAAG
ATCCTCTGAATCTGGAGCTATCAGTGGCGATGCAAATGGCTCCGAATCCATTTCAGTGAC
TACTATACAGCGGCTGAAGGAAGAGAGAGATGCAGCTGTTAAGCAAACACAACAGCTGCA
ACATGAATTGGAGATGTTGAAGAAACGAAAAAGGAACAGCGAAAATGGGTTATCCTTAAA
GTTGGCAGCTATGGTTGGATTCATTGGACTCATCATTGGTTTCATCCTAAAACTCGCCTT
AGCTTCTCCCACATAACAGCTATCAGCAGCTTCTCCGCATCATCTACCATTTCAACTTAC
GAGGGATAGCTGTTAACTCTCTATTGATCTTGTTCTACTTTGTTTTTGTCCATTAAAATT
TGTTTCTTTGTCAATTATATT*GGATGTACATCGTTGACCCAATAGAACCTATCATTATT
ATGTTTACTTCTCC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2AO64JQ 710 0 0
G
TGTTGCTTTCAAGGTGAAAACAACATTTCCAAAGAAGTATTTTGTAAGGCCCAACACTGG
TGTCATTCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTAGAGTTACTCTACAAGCGCAAAGGGAGTA
TCCTCCAGATATGCTGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGTACCATTGTCCCTCCTCA
CACTGATGTTGATGACCTTCCACAAGACACTTTTACCAAGGACAGTAGCAAAACATTAAC
AGAGTGTAAGCTCAAGGTCTCGTATATCGCCACATCTACACCGCAAAAACCCTCTGAATC
TGGAGCAACCAGCGGCGATGCAAACGGCTCCGAATCCATCTCAGTGACTACTATACAGCG
GCTGAAGGAAGAGAGAGATGCAGCTGTTAAGCAAACACAACAGCTGCAGCATGAATTGGA
GACATTGAAGAAACGAAAAAGGAACAGCGAAAATGGGTTATCCTTAAAGTTGGCAGCTAT
GGTTGGACTCATTGGACTCATCATTGGTTTCATCCTAAAACTCGCCTTAGCTTCTCCCAA
ATAACAGCTATCAGCAGCTTCTCCGCATCATCTACCATTTCAACTTACGAGGGATAGCTG
TTAACTCT**ATTGATCTTGTTCTACTTTGTCTTTGTCCATTAAAATTTGTTTCTTTGTC
AATTATATTTGGATGTACGTCATTGACCCAATAGA
CCCCTTTCATGATT

QA 2 696 2 696
DS 

RD RR2AO64TF 710 0 0
G
TGTTGCTTTCAAGGTGAAAACAACATTTCCAAAGAAGTATTTTGTAAGGCCCAACACTGG
TGTCATTCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTAGAGTTACTCTACAAGCGCAAAGGGAGTA
TCCTCCAGATATGCTGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGTACCATTGTCCCTCCTCA
CACTGATGTTGATGACCTTCCACAAGACACTTTTACCAAGGACAGTAGCAAAACATTAAC
AGAGTGTAAGCTCAAGGTCTCGTATATCGCCACATCTACACCGCAAAAACCCTCTGAATC
TGGAGCAACCAGCGGCGATGCAAACGGCTCCGAATCCATCTCAGTGACTACTATACAGCG
GCTGAAGGAAGAGAGAGATGCAGCTGTTAAGCAAACACAACAGCTGCAGCATGAATTGGA
GACATTGAAGAAACGAAAAAGGAACAGCGAAAATGGGTTATCCTTAAAGTTGGCAGCTAT
GGTTGGACTCATTGGACTCATCATTGGTTTCATCCTAAAACTCGCCTTAGCTTCTCCCAA
ATAACAGCTATCAGCAGCTTCTCCGCATCATCTACCATTTCAACTTACGAGGGATAGCTG
TTAACTCT**ATTGATCTTGTTCTACTTTGTCTTTGTCCATTAAAATTTGTTTCTTTGTC
AATTATATTTGGATGTACGTCATTGACCCAATAGA
CCCCTTTCATGATT

QA 2 696 2 696
DS 



AS 1 3

CO CL2719Contig1 1116 3 15 U
GAAGAGTTACCTACCTATTGCCATCTATCTCTTTCTCTCTCTATCGAGCTTTGTCTCCTC
CTCCTGTTCTCATGGAAGCCTCACCCAATGATCGCCTTCATTTCGGCATAATGGGTTTCG
GGTGCGATCATTACAACAGGAGATGCCAAATCAGAGCTCCATGTTGCAACGAAGTCTTCT
CTTGTCGCCATTGTCACAACGAGAGCACTAGCACATTGCGTAATATCTATGACCGTCACG
AGCTTGTTCGTCAAGATGTTAAACAAGTGATTTGCTCTGTTTGCGATACAGAGCAGCCGG
TAGCTAAAGTTTGCACCAACTGTGGTGTCAACATGGGAGAATACTTTTGCGACATCTGCA
AGTTCTATGATGACAATACTGAAAAAGAACAGTTCCATTGTGATGACTGTGGAATTTGCA
GAGTTGGTGGGCGTGAGAACTTCTTTCATTGCAAGAAGTGTGGTTCTTGTTATGCGATTG
GGCTGCGCAACAACCATCGCTGCGTTGAGGATTCAATGCGGCATCACTGTCCCATTTGTT
ACGAGTATCTCTTTGACTCTCTTAAAGACACAACAGTGATGAAATGCGGACACACAATGC
ACTGTGAATGCTATCAGGAGATGCTCAAGCGTGACAAATTTTGCTGTCCGATTTGCTCGA
GGTCAGTGATTGATATGTCCAAAACATGGCAGAGAATGGATGAAGAGATTGAAGCCACTT
CTATGCCTTCAGATTACCGCGACAAGAAGGTTTGGATACTGTGCAACGACTGTAACGACA
CAACAGAGGTATACTTCCATATAATCGGTCAGAAATGTGGACACTGTAGATCTTACAACA
CCAGAGCCGTCGCACCTCCTGTTCTTCCTCAATGAAAACACCAAACATCTTTCATGTATT
GCCACCAGAAAGCAACCAAAGAAAAAAAACTCTGATCAATGATTCAATATGATCATTGGT
TCACAAAAGCAAGACTCACATTTGTCTTCTTCATGATTCTATTTGTTGTTGTTCTTATAT
GATTATGTTTATTACCATTTATATTTATGTGTGAGAAAGCCAGGATAATGTATAATATAT
ATATTCTTGATCCAGGAAAAAATTACCTGTGATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H259TF U 1
AF RR2FK67TF U 259
AF RR2FK67JQ C 262
BS 1 346 RR2H259TF
BS 347 347 RR2FK67TF
BS 348 352 RR2H259TF
BS 353 353 RR2FK67TF
BS 354 421 RR2H259TF
BS 422 422 RR2FK67TF
BS 423 574 RR2H259TF
BS 575 575 RR2FK67TF
BS 576 613 RR2H259TF
BS 614 928 RR2FK67TF
BS 929 929 RR2FK67JQ
BS 930 971 RR2FK67TF
BS 972 972 RR2FK67JQ
BS 973 987 RR2FK67TF
BS 988 1116 RR2FK67JQ

RD RR2H259TF 613 0 0
GAAGAGTTACCTACCTATTGCCATCTATCTCTTTCTCTCTCTATCGAGCTTTGTCTCCTC
CTCCTGTTCTCATGGAAGCCTCACCCAATGATCGCCTTCATTTCGGCATAATGGGTTTCG
GGTGCGATCATTACAACAGGAGATGCCAAATCAGAGCTCCATGTTGCAACGAAGTCTTCT
CTTGTCGCCATTGTCACAACGAGAGCACTAGCACATTGCGTAATATCTATGACCGTCACG
AGCTTGTTCGTCAAGATGTTAAACAAGTGATTTGCTCTGTTTGCGATACAGAGCAGCCGG
TAGCTAAAGTTTGCACCAACTGTGGTGTCAACATGGGAGAATACTTCTGCGATATCTGCA
AGTTCTATGATGACAATACTGAAAAAGAACAGTTCCATTGTGATGACTGTGGAATTTGCA
GGGTTGGTGGGCGTGAGAACTTCTTTCATTGCAAGAAGTGTGGTTCTTGTTATGCGATTG
GGCTGCGCAACAACCATCGCTGCGTTGAGGATTCAATGCGGCATCACTGTCCCATTTGTT
ACGAGTATCTCTTTGACTCTCTTAAAGACACAACGGTGATGAAATGCGGACACACAATGC
ACTGTGAATGCTA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2FK67TF 730 0 0
GTA
AACAAGTGATTTGCTCTGTTTGCGATACAGAGCAGCCGGTAGCTAAAGTTTGCACCAACT
GTGGTGTCAACATGGGAGAATACTTTTGCGACATCTGCAAGTTCTATGATGACAATACTG
AAAAAGAACAGTTCCATTGTGATGACTGTGGAATTTGCAGAGTTGGTGGGCGTGAGAACT
TCTTTCATTGCAAGAAGTGTGGTTCTTGTTATGCGATTGGGCTGCGCAACAACCATCGCT
GCGTTGAGGATTCAATGCGGCATCACTGTCCCATTTGTTACGAGTATCTCTTTGACTCTC
TTAAAGACACAACAGTGATGAAATGCGGACACACAATGCACTGTGAATGCTATCAGGAGA
TGCTCAAGCGTGACAAATTTTGCTGTCCGATTTGCTCGAGGTCAGTGATTGATATGTCCA
AAACATGGCAGAGAATGGATGAAGAGATTGAAGCCACTTCTATGCCTTCAGATTACCGCG
ACAAGAAGGTTTGGATACTGTGCAACGACTGTAACGACACAACAGAGGTATACTTCCATA
TAATCGGTCAGAAATGTGGACACTGTAGATCTTACAACACCAGAGCCGTCGCACCTCCTG
TTCTTCCTCAATGAAAACACCAAACATCTTTCATGTATTGCCACCAGAAAGCAACCAAAG
AAAAAAA*CTCTGATCAATGATTCAATATGATCATTGGTTCACAAAAGCA*GACTCACAT
TTGTCT
C

QA 4 729 4 729
DS 

RD RR2FK67JQ 855 0 0
AACAAGTGATTTGCTCTGTT*GCGATACAGAGCAGCCGGTAGCTAAAGTT*GCACCAACT
GTGGTGTCAACATGGGAGAATACTTTTGCGACATCTGCAAGTTCTATGATGACAATACTG
AAAAAGAACAGTTCCATTGTGATGACTGTGGAATTTGCAGAGTTGGTGGGCGTGAGAACT
TCTTTCATTGCAAGAAGTGTGGTTCTTGTTATGCGATTGGGCTGCGCAACAACCATCGCT
GCGTTGAGGATTCAATGCGGCATCACTGTCCCATTTGTTACGAGTATCTCTTTGACTCTC
TTAAAGACACAACAGTGATGAAATGCGGACACACAATGCACTGTGAATGCTATCAGGAGA
TGCTCAAGCGTGACAAATTTTGCTGTCCGATTTGCTCGAGGTCAGTGATTGATATGTCCA
AAACATGGCAGAGAATGGATGAAGAGATTGAAGCCACTTCTATGCCTTCAGATTACCGCG
ACAAGAAGGTTTGGATACTGTGCAACGACTGTAACGACACAACAGAGGTATACTTCCATA
TAATCGGTCAGAAATGTGGACACTGTAGATCTTACAACACCAGAGCCGTCGCACCTCCTG
TTCTTCCTCAATGAAAACACCAAACATCTTTCATGTATTGCCACCAGAAAGCAACCAAAG
AAAAAAAACTCTGATCAATGATTCAATATGATCATTGGTTCACAAAAGCAAGACTCACAT
TTGTCTTCTTCATGATTCTATTTGTTGTTGTTCTTATATGATTATGTTTATTACCATTTA
TATTTATGTGTGAGAAAGCCAGGATAATGTATAATATATATATTCTTGATCCAGGAAAAA
ATTACCTGTGATCAT

QA 1 855 1 855
DS 



AS 1 4

CO CL2720Contig1 712 4 7 U
GGATCACCACTACATACACAGCCTCCTCTTCGATCTCTCTCTCAAAAAAGGAAATGGCTA
ACCCTAGAGTTTACTTCGACATGGCTCTCGACGGAACCCCCGCCGGCCGCATCGTGATGG
AGCTTTACAAAGACACGACGCCGGACACCGCCGAGAATTTCCGAGCCCTCTGCACCGGCG
AGAAAGGAGTCGGGAGGAGTGGGAAACCGCTCCACTACAAGGGATCTTCCTTCCACCGCG
TGATCCCGGGGTTCATGTGCCAAGGAGGCGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGCGGGG
AGTCGATCTACGGAGCCAAGTTCAAGGACGAGAACTTCGTGAAGAAGCACACGGGCGCTG
GGATCCTCTCCATGGCGAACTCTGGTCCCAACACTAACGGATTTCAGTTTTTTATTTGCA
CCGCGGAGACGTCGTGGCTTGATGGGAAGCACGTGGTGTTTGGGAAGGTCGTTGAAGGTA
TTGAGGTTGTGAAGGCGATTGAGAAGGTTGGATCGTCTTCCGGGACGACTAAGAAGAAGG
TGGTTGTTGCTGATTGTGGTCAGCTTTAGAGATCTGTGCGAAGATCTTTTGAATGTTATC
TTTGTTATTTGAATGTTGCTTTTGCTTCGTATCGTTCGAGTTTGTAAAACCCTCAGTGGT
TTTGGATTTGACTATCTATGAATAATTATGAATAACTATGAGCTTTTTAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF08TF U 1
AF RR2DQ42TF U 61
AF RR2CF08JQ C 140
AF RR2DQ42JQ C 312
BS 1 126 RR2CF08TF
BS 127 127 RR2DQ42TF
BS 128 327 RR2CF08TF
BS 328 402 RR2DQ42TF
BS 403 403 RR2CF08JQ
BS 404 639 RR2DQ42TF
BS 640 712 RR2CF08JQ

RD RR2CF08TF 327 0 0
GGATCACCACTACATACACAGCCTCCTCTTCGATCTCTCTCTCAAAAAAGGAAATGGCTA
ACCCTAGAGTTTACTTCGACATGGCTCTCGACGGAACCCCCGCCGGCCGCATCGTGATGG
AGCTTTTCAAAGACACGACGCCGGACACCGCCGAGAATTTCCGAGCCCTCTGCACCGGCG
AGAAAGGAGTCGGGAGGAGTGGGAAACCGCTCCACTACAAGGGATCTTCCTTCCACCGCG
TGATCCCGGGGTTCATGTGCCAAGGAGGCGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGCGGGG
AGTCGATCTACGGAGCCAAGTTCAAGG

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR2DQ42TF 579 0 0
G
CCCTAGAGTTTACTTCGACATGGCTCTCGACGGAACCCCCGCCGGCCGCATCGTGATGGA
GCTTTACAAAGACACGACGCCGGACACCGCCGAGAATTTCCGAGCCCTCTGCACCGGCGA
GAAAGGAGTCGGGAGGAGTGGGAAACCGCTCCACTACAAGGGATCTTCCTTCCACCGCGT
GATCCCGGGGTTCATGTGCCAAGGAGGCGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGCGGGGA
GTCGATCTACGGAGCCAAGTTCAAGGACGAGAACTTCGTGAAGAAGCACACGGGCGCTGG
GATCCTCTCCATGGCGAACTCTGGTCCCAACACTAACGGATCTCAGTTTTTTATTTGCAC
CGCGGAGACGTCGTGGCTTGATGGGAAGCACGTGGTGTTTGGGAAGGTCGTTGAAGGTAT
TGAGGTTGTGAAGGCGATTGAGAAGGTTGGATCGTCTTCCGGGACGACTAAGAAGAAGGT
GGTTGTTGCTGATTGTGGTCAGCTTTAGAGATCTGTGCGAAGATCTTTTGAATGTTATCT
TTGTTATTTGAATGTTGCTTTTGCTTCGTATCGTTCGA

QA 2 579 2 579
DS 

RD RR2CF08JQ 573 0 0
GCCGGACACCGCCGAGAATTTCCGAGCCCTCTGCACCGGCGAGAAAGGAGTCGGGAGGAG
TGGGAAACCGCTCCACTACAAGGGATCTTCCTTCCACCGCGTGATCCCGGGGTTCATGTG
CCAAGGAGGCGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGCGGGGAGTCGATTTACGGAGCCAA
GTTCAAGGACGAGAACTTCGTGAAGAAGCACACCGGCGCTGGGATCCTCTCCATGGCGAA
CTCTGGTCCCAACACCAACGGATTTCAGTTTTTTATTTGCACCGCGGAGACGTCGTGGCT
TGATGGGAAGCACGTGGTGTTTGGGAAGGTGGTTGAAGGTATTGAGGTTGTGAAGGCGAT
TGAGAAGGTTGGATCTTCTTCCGGGACGACTAAGTAGAAGGTGGTTGTTGCTGATTGTGG
TCAGCTTTAGAGATCTGTGCGAAGATCCTTTGAATGTTATCTTTGCTATTTGAATGTCGC
TTTTGCTTCGTATCGTTCGAGTTTGTAAAACCCTCAGTGGTTTTGGATTTGACTATCTAT
GAATAATTATGAATAACTATGAGCTTTTTAACT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2DQ42JQ 379 0 0
GGAGCCAAGTTCAAGGACGAGAACTTCGTGAAGAAGCACACGGGCGCTGGGATCCTCTCC
ATGGCGAACTCTGGTCCCAACACTAACGGATTTCAGTTTTTTATTTGCACCGCGGAGACG
TCGTGGCTTGATGGGAAGCACGTGGTGTTTGGGAAGGTCGTTGAAGGTATTGAGGTTGTG
AAGGCGATTGAGAAGGTTGGATCGTCTTCCGGGACGACTAAGAAGAAGGTGGTTGTTGCT
GATTGTGGTCAGCTTTAGAGATCTGTGCGAAGATCTTTTGAATGTTATCTTTGTTATTTG
AATGTTGCTTTTGCTTCGTATCGTTCGAGTTTGTAAAACCCTCGGTGGTTTTGGATTTGA
CTATCTATGAATAATTATG

QA 1 379 1 379
DS 



AS 1 4

CO CL2721Contig1 912 4 15 U
GGAGAGTGGTCTGCTCTGATTCGTAAAGAACGATGCCACTGTCCGCATCAATATCATCGC
CGTCTTCTCTCGCTCTTCTCTCAACCCGATCACGATCGCCTCTCTCCTTCTTCATCTCCA
CTCCCAGAACCCTAATCATCTCCAGAACCCCTGATCCTCCTCCTCTTTCTACTTCTCTTT
TCGCTTCCCGGCGACCCCGCGACTTCATCAACGGGAGGAGGGATGGTTTCGTAGACGGTG
ATCGGAGCTGGAACCGGAAGATCAGACCGGAGTATGGGATCGATGAGGATTATGGAGATG
ACGAAGACGAGCAGGAGGAGGATGAAGAAGAAGAAGACAGAAGCTTGGATCTTTTGCTTA
GGTTCGTCGAGAATGTCTTCAGAAAAGTCTCCAAGAGAGCTAGGAAAGCCGTCCGATCTG
TTTTGCCTGTTTCCATCTCCACCAAGCTGGTGGGATTCTCAGTGAACGGTGTACTTATAC
TTGCATTTCTGTGGATCTTGAAGGCCTTTCTCGAGGTAGCTTGCACGCTTGGGACTATTG
TATTTACGAGCATTCTACTTATACGAGGACTTTGGGCTGGTGTAGCATACGTACAAGAAA
GCCGCAACAACAGGATCAATGAACTTGCTGATGACCCACGTGCATGGAACGGGGTGCAAC
CAGCGTCATGATTAATTCACTATGTGCTTCAAAAAACCAAGTTTCTGACTTCTTGGAAGA
CAATAAAACCACAGATGATTATACAATCAGAAAGGAGTGAGTATATGATGTCCTTTGGCA
TTGTCTGATGATTTAGTAAGTAAAAGAATGTAATGTTTGTAGCATTGTCCAATTAAATGG
GATTCGGTGACACTGTATCTTAGTTTTCCAAATAAACAAAACCATAATACAGTATCATAC
CATTTACCTTTC


BQ
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F835TF U 1
AF RR2H392TF U 1
AF RR2FM75TF U 426
AF RR2F835JQ C 294
BS 1 5 RR2F835TF
BS 6 6 RR2H392TF
BS 7 695 RR2F835TF
BS 696 696 RR2FM75TF
BS 697 717 RR2H392TF
BS 718 718 RR2FM75TF
BS 719 722 RR2H392TF
BS 723 725 RR2FM75TF
BS 726 745 RR2H392TF
BS 746 746 RR2FM75TF
BS 747 754 RR2H392TF
BS 755 755 RR2FM75TF
BS 756 768 RR2H392TF
BS 769 896 RR2FM75TF
BS 897 912 RR2F835JQ

RD RR2F835TF 695 0 0
GGAGATTGGTCTGCTCTGATTCGTAAAGAACGATGCCACTGTCCGCATCAATATCATCGC
CGTCTTCTCTCGCTCTTCTCTCAACCCGATCACGATCGCCTCTCTCCTTCTTCATCTCCA
CTCCCAGAACCCTAATCATCTCCAGAACCCCTGATCCTCCTCCTCTTTCTACTTCTCTTT
TCGCTTCCCGGCGACCCCGCGACTTCATCAACGGGAGGAGGGATGGTTTCGTAGACGGTG
ATCGGAGCTGGAACCGGAAGATCAGACCGGAGTATGGGATCGATGAGGATTATGGAGATG
ACGAAGACGAGCAGGAGGAGGATGAAGAAGAAGAAGACAGAAGCTTGGATCTTTTGCTTA
GGTTCGTCGAGAATGTCTTCAGAAAAGTCTCCAAGAGAGCTAGGAAAGCCGTCCGATCTG
TTTTGCCTGTTTCCATCTCCACCAAGCTGGTGGGATTCTCAGTGAACGGTGTACTTATAC
TTGCATTTCTGTGGATCTTGAAGGCCTTTCTCGAGGTAGCTTGCACGCTTGGGACTATTG
TATTTACGAGCATTCTACTTATACGAGGACTTTGGGCTGGTGTAGCATACGTACAAGAAA
GCCGCAACAACAGGATCAATGAACTTGCTGATGACCCACGTGCATGGAACGGGGTGCAAC
CAGCGTCATGATTAATTCACTATGTGCTTCAAAAA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2H392TF 768 0 0
GGAGAGTGGTCTGCTCTGATTCGTAAAGAACGATGCCACTGTCCGCATCAATATCATCGC
CGTCTTCTCTCGCTCTTCTCTCAACCCGATCACGATCGCCTCTCTCCTTCTTCATCTCCA
CTCCCAGAACCCTAATCATCTCCAGAACCCCTGATCCTCCTCCTCTTTCTACTTCTCTTT
TCGCTTCCCGGCGACCCCGCGACTTCATCAACGGGAGGAGGGATGGTTTCGTAGACGGTG
ATCGGAGCTGGAACCGGAAGATCAGACCGGAGTATGGGATCGATGAGGATTATGGAGATG
ACGAAGACGAGCAGGAGGAGGATGAAGAAGAAGAAGACAGAAGCTTGGATCTTTTGCTTA
GGTTCGTCGAGAATGTCTTCAGAAAAGTCTCCAAGAGAGCTAGGAAAGCCGTCCGATCTG
TTTTGCCTGTTTCCATCTCCACCAAGCTGGTGGGATTCTCAGTGAACGGTGTACTTATAC
TTGCATTTCTGTGGATCTTGAAGGCCTTTCTCGAGGTAGCTTGCACGCTTGGGACTATTG
TATTTACGAGCATTCTACTTATACGAGGACTTTGGGCTGGTGTAGCATACGTACAAGAAA
GCCGCAACAACAGGATCAATGAACTTGCTGATGACCCACGTGCATGGAACGGGGTGCAAC
CAGCGTCATGATTAATTCACTATGTGCTTCAAAAA*CCAAGTTTCTGACTTCTTGGA*GA
CA**TAAACCACAGATGATTATACA*TCAGAAAG*AGTGAGTATATGA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2FM75TF 472 0 0
G
CTGTTTCCATCTCCACCAAGCTGGTGGGATTCTCAGTGAACGGTGTACTTATACTTGCAT
TTCTGTGGATCTTGAAGGCCTTTCTCGAGGTAGCTTGCACGCTTGGGACTATTGTATTTA
CGAGCATTCTACTTATACGAGGACTTTGGGCTGGTGTAGCATACGTACAAGAAAGCCGCA
ACAACAGGATCAATGGACTTGCTGATGACCCACGTGCATGGAACGGGGTGCAACCAGCGT
CATGATTAATTCACTATGTGCTTCAAAAAACCAAGTTTCTGACTTCTTGGAAGACAATAA
AACCACAGATGATTATACAATCAGAAAGGAGTGAGTATATGATGTCCTTTGGCATTGTCT
GATGATTTAGTAAGTAAAAGAATGTAATGTTTGTAGCATTGTCCAATTAAATGGGATTCG
GTGACACTGTATCTTAGTTTTCCAAATAAACAAAACCATAATACAGTATC
G

QA 2 471 2 471
DS 

RD RR2F835JQ 619 0 0
GGAGATGACGAAGACGAGCAGGAGGAGGATGAAGAAGAAGAAGACAGAAGCTTGGATCTT
TTGCTTAGGTTCGTCGAGAATGTCTTCAGAAAAGTCTCCAAGAGAGCTAGGAAAGCCGTC
CGATCTGTTTTGCCTGTTTCCATCTCCACCAAGCTGGTGGGATTCTCAGTGAACGGTGTA
CTTATACTTGCATTTCTGTGGATCTTGAAGGCCTTTCTCGAGGTAGCTTGCACGCTTGGG
ACTATTGTATTTACGAGCATTCTACTTATACGAGGACTTTGGGCTGGTGTAGCATACGTA
CAAGAAAGCCGCAACAACAGGATCAATGAACTTGCTGATGACCCACGTGCATGGAACGGG
GTGCAACCAGCGTCATGATTAATTCACTATGTGCTTCAAAAAACCAAGTTTCTGACTTCT
TGGAAGACAATAAAACCACAGATGATTATACAATCAGAAAGGAGTGAGTATATGATGTCC
TTTGGCATTGTCTGATGATTTAGTAAGTAAAAGAATGTAATGTTTGTAGCATTGTCCAAT
TAAATGGGATTCGGTGACACTGTATCTTAGTTTTCCAAATAAACAAAACCATAATACAGT
ATCATACCATTTACCTTTC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL2722Contig1 1210 2 2 U
CGACTTAATAAAGTTGGGCTTATAATCAAACTTAAGATAACAATGCAAGATTGTCATTAA
AAGCCCTCTCTCGAGGGAGAAGAAAAATGTAAAAAAACACCAACTTGCGAGCTCTTCTAT
TCTAGTACACTACCAAAACGTTTTCTCAAACCACAACGAATGCACTTGAAAAACCAAAAG
AAACTTCAAAGATTTTTGACAAGACCAGTGTTTAAAAAGATCATCAATACTCCCATTTCT
TAAGCTCCATGCCATCTGGTGGAGTGCTCTCCACTTTCTTAGTCCCAACCTCTTTCCAGT
TAGTAAACAGCACTGTCCCATTAAACTCCGCAAATGATTTGTTCATGGCTCGCCTCATGT
CCTCATCCGCACTCTGGTATATATCGCTGAAAAACTTGTTCATAGCTGCATCTCCATCTA
GCTTCTCATCCTTCTCCTGTTTCTTCACTTCAGCTTCTAGCTTGTACCAGTCTTTTGCCG
GCTTAAATGATGGGTAAACCGGCCTCTGAAAAACCGCTGATGCAACATTGGGTTTAGGGA
GAAAAGCTTGCCCTTTGCCATATTCAAGGGAGGCCCAAGTGACTATCTCTGCTTTTGCAA
GACGGATCTCAACTTTGGTTGACAATACTTCATACCTGCATTTCTCCGGTATTATCTTCC
CAAACAATCTTGGCTGGAAGTGATAAGCTTCCTCTCCAGCAACATCAATCACAACACTCA
GAATCTGGTCACCAAACTCGACATTCACGTTCTGCTTTGGTATCTGCTGAACCAAATCTT
TCTCTTCTTCTGCAATGTGAATATTGCATTCATCTATCATCTTGTTAAACTTCGATTCAT
TTGGTGCAACGGAAACCCCCTTTTCAAGGGCTGCTTTAGCAGTACTGTATTCCTCCAGCT
TCATACAAGCAGTGCCTTTTCTGAGGTAGGCTTTAGCCAACGTCGGCTCCAACTCTATGG
CTTTGTTGGCATCTGCAACAGCTTCCGTGAAATTAAGGATTTTGATGTTGGCCTGAGCAC
GATCGGCGAAGAAGGCGGCGCAATAGGGATCCAAGTCAATGGCTTTGGAGTATAAGTCAA
CGGCGACGTCGAAGTCGTCATCTAAGAAGGCCTCTTTCGCTTTTTCCGCTAATTCCTTCG
CCATTGATTGGATTTTCTTTTCACTCTTTCGAGGAGACGAGCCGCACAAGACAGACTAGA
AAAGAGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H952JQ U 1
AF RR2AI59TF C 508
BS 1 756 RR2H952JQ
BS 757 1210 RR2AI59TF

RD RR2H952JQ 756 0 0
CGACTTAATAAAGTTGGGCTTATAATCAAACTTAAGATAACAATGCAAGATTGTCATTAA
AAGCCCTCTCTCGAGGGAGAAGAAAAATGTAAAAAAACACCAACTTGCGAGCTCTTCTAT
TCTAGTACACTACCAAAACGTTTTCTCAAACCACAACGAATGCACTTGAAAAACCAAAAG
AAACTTCAAAGATTTTTGACAAGACCAGTGTTTAAAAAGATCATCAATACTCCCATTTCT
TAAGCTCCATGCCATCTGGTGGAGTGCTCTCCACTTTCTTAGTCCCAACCTCTTTCCAGT
TAGTAAACAGCACTGTCCCATTAAACTCCGCAAATGATTTGTTCATGGCTCGCCTCATGT
CCTCATCCGCACTCTGGTATATATCGCTGAAAAACTTGTTCATAGCTGCATCTCCATCTA
GCTTCTCATCCTTCTCCTGTTTCTTCACTTCAGCTTCTAGCTTGTACCAGTCTTTTGCCG
GCTTAAATGATGGGTAAACCGGCCTCTGAAAAACCGCTGATGCAACATTGGGTTTAGGGA
GAAAAGCTTGCCCTTTGCCATATTCAAGGGAGGCCCAAGTGACTATCTCTGCTTTTGCAA
GACGGATCTCAACTTTGGTTGACAATACTTCATACCTGCATTTCTCCGGTATTATCTTCC
CAAACAATCTTGGCTGGAAGTGATAAGCTTCCTCTCCAGCAACATCAATCACAACACTCA
GAATCTGGTCACCAAACTCGACATTCACGTTCTGCT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2AI59TF 703 0 0
GAG
AAACCGCTGATGCAACATTGGGTTTAGGGAGAAGAGCTTGCCCTTTGCCATATTCAAGGG
AGGCCCAAGTGACTATCTCTGCTTTTGCAAGACGGATCTCAACTTTGGTTGACAATACTT
CATACCTGCATTTCTCCGGTATTATCTTCCCAAACAATCTTGGCTGGAAGTGATAAGCTT
CCTCTCCAGCAACATCAATCACAACACTCAGAATCTGGTCACCAAACTCGACATTCACGT
TCTGCTTTGGTATCTGCTGAACCAAATCTTTCTCTTCTTCTGCAATGTGAATATTGCATT
CATCTATCATCTTGTTAAACTTCGATTCATTTGGTGCAACGGAAACCCCCTTTTCAAGGG
CTGCTTTAGCAGTACTGTATTCCTCCAGCTTCATACAAGCAGTGCCTTTTCTGAGGTAGG
CTTTAGCCAACGTCGGCTCCAACTCTATGGCTTTGTTGGCATCTGCAACAGCTTCCGTGA
AATTAAGGATTTTGATGTTGGCCTGAGCACGATCGGCGAAGAAGGCGGCGCAATAGGGAT
CCAAGTCAATGGCTTTGGAGTATAAGTCAACGGCGACGTCGAAGTCGTCATCTAAGAAGG
CCTCTTTCGCTTTTTCCGCTAATTCCTTCGCCATTGATTGGATTTTCTTTTCACTCTTTC
GAGGAGACGAGCCGCACAAGACAGACTAGAAAAGAGACCC

QA 4 703 4 703
DS 



AS 1 4

CO CL2723Contig1 682 4 9 U
GGACACCAAAGCGGCCTCTGCGACGACACCTAGGGTTTCACGACTGATATATCTCAAATC
AAATCCATGGCCGACGACGATTACCAAGATGTCGACGATTTGGGGTACGAGGACGAGCCA
GCAGAGCCAGAGATTGAGGAAGGAATAGAGGAGGATGCTGATATGAAGGAAAATGATGAT
GTGGATGGTGAACCTATTGAGGCAGAGGATAAGGTAGAGGAGGAAGCTGTGCCGCGTCCG
CGCAAAACATCCAAGTTCATGACCAAGTATGAACGGGCTAGGATACTAGGCACTCGTGCT
CTCCAGATAAGCATGAATGCACCTGTGATGGTTGAGCTGGAGGGTGAGACTGATCCACTT
GAGATCGCAATGAAGGAGCTTAGACAGCGTAAGATACCTTTCACGATCAGGCGTTACTTA
CCCGACGGGAGTTTTGAAGAATGGGGAGTGGATGAACTCATTGTGGAAGACTCATGGAAA
CGTCAAGTCGGTGGTGATTAATCCATAAAATTGCTCTTATTATGTAGACCTTCTATGATG
TTATATGCAAGTGAATCAACCAAAAGTGGAAACATAGATTTTCTCTTAGTGTTTCAAGTT
TTGTAGCCTGCTTTAAACAAAAGGTGTCATAAAACCTTTGATGTGATAATGCACGGGCTG
TGACGTATCCAAGTTTTCGGAC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS86TF U 1
AF RR2CV95JQ C 1
AF RR2CV95TF U 1
AF RR2AS86JQ C 20
BS 1 310 RR2AS86TF
BS 311 311 RR2CV95TF
BS 312 525 RR2AS86TF
BS 526 526 RR2CV95TF
BS 527 564 RR2AS86TF
BS 565 565 RR2CV95TF
BS 566 631 RR2AS86TF
BS 632 675 RR2CV95TF
BS 676 682 RR2AS86JQ

RD RR2AS86TF 631 0 0
GGACACCAAAGCGGCCTCTGCGACGACACCTAGGGTTTCACGACTGATATATCTCAAATC
AAATCCATGGCCGACGACGATTACCAAGATGTCGACGATTTGGGGTACGAGGACGAGCCA
GCAGAGCCAGAGATTGAGGAAGGAATAGAGGAGGATGCTGATATGAAGGAAAATGATGAT
GTGGATGGTGAACCTATTGAGGCAGAGGATAAGGTAGAGGAGGAAGCTGTGCCGCGTCCG
CGCAAAACATCCAAGTTCATGACCAAGTATGAACGGGCTAGGATACTAGGCACTCGTGCT
CTCCAGATAATCATGAATGCACCTGTGATGGTTGAGCTGGAGGGTGAGACTGATCCACTT
GAGATCGCAATGAAGGAGCTTAGACAGCGTAAGATACCTTTCACGATCAGGCGTTACTTA
CCCGACGGGAGTTTTGAAGAATGGGGAGTGGATGAACTCATTGTGGAAGACTCATGGAAA
CGTCAAGTCGGTGGTGATTAATCCATAAAATTGCTCTTATTATGT*GACCTTCTATGATG
TTATATGCAAGTGAATCAACCAAAGGTGGAAACATAGATTTTCTCTTAGTGTTTCAAGTT
TTGTAGCCTGCTTTAAACAAAAGGTGTCATA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2CV95JQ 675 0 0
GGACACCAAAGCGGCCTCTGCGACGACACCTAGGGTTTCACGACTGATATATCTCAAATC
AAATCCATGGCCGACGACGATTACCAAGATGTCGACGATTTGGGGTACGAGGACGAGCCA
GCAGAGCCAGAGATTGAGGAAGGAATAGAGGAGGATGCTGATATGAAGGAAAATGATGAT
GTGGATGGTGAACCTATTGAGGCAGAGGATAAGGTAGAGGAGGAAGCTGTGCCGCGTCCG
CGCAAAACATCCAAGTTCATGACCAAGTATGAACGGGCTAGGATACTAGGCACTCGTGCT
CTCCAGATAAGCATGAATGCACCTGTGATGGTTGAGCTGGAGGGTGAGACTGATCCACTT
GAGATCGCAATGAAGGAGCTTAGACAGCGTAAGATACCTTTCACGATCAGGCGTTACTTA
CCCGACGGGAGTTTTGAAGAATGGGGAGTGGATGAACTCATTGTGGAAGACTCATGGAAA
CGTCAAGTCGGTGGTGATTAATCCATAAAATTGCTCTTATTATGTAGACCTTCTATGATG
TTATATGCAAGTGAATCAACCAAAAGTGGAAACATAGATTTTCTCTTAGTGTTTCAAGTT
TTGTAGCCTGCTTTAAACAAAAGGTGTCATAAAACCTTTGATGTGATAATGCACGGGCTG
TGACGTATCCAAGTT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2CV95TF 675 0 0
GGACACCAAAGCGGCCTCTGCGACGACACCTAGGGTTTCACGACTGATATATCTCAAATC
AAATCCATGGCCGACGACGATTACCAAGATGTCGACGATTTGGGGTACGAGGACGAGCCA
GCAGAGCCAGAGATTGAGGAAGGAATAGAGGAGGATGCTGATATGAAGGAAAATGATGAT
GTGGATGGTGAACCTATTGAGGCAGAGGATAAGGTAGAGGAGGAAGCTGTGCCGCGTCCG
CGCAAAACATCCAAGTTCATGACCAAGTATGAACGGGCTAGGATACTAGGCACTCGTGCT
CTCCAGATAAGCATGAATGCACCTGTGATGGTTGAGCTGGAGGGTGAGACTGATCCACTT
GAGATCGCAATGAAGGAGCTTAGACAGCGTAAGATACCTTTCACGATCAGGCGTTACTTA
CCCGACGGGAGTTTTGAAGAATGGGGAGTGGATGAACTCATTGTGGAAGACTCATGGAAA
CGTCAAGTCGGTGGTGATTAATCCATAAAATTGCTCTTATTATGTAGACCTTCTATGATG
TTATATGCAAGTGAATCAACCAAAAGTGGAAACATAGATTTTCTCTTAGTGTTTCAAGTT
TTGTAGCCTGCTTTAAACAAAAGGTGTCATAAAACCTTTGATGTGATAATGCACGGGCTG
TGACGTATCCAAGTT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2AS86JQ 663 0 0
GCGACGACACCTAGGGTTTCACGACTGATATATCTCAAATCAAATCCATGGCCGACGACG
ATTACCAAGATGTCGACGATTTGGGGTACGAGGACGAGCCAGCAGAGCCAGAGATTGAGG
AAGGAATAGAGGAGGATGCTGATATGAAGGAAAATGATGATGTGGATGGTGAACCTATTG
AGGCAGAGGATAAGGTAGAGGAGGAAGCTGTGCCGCGTCCGCGCAAAACATCCAAGTTCA
TGACCAAGTATGAACGGGCTAGGATACTAGGCACTCGTGCTCTCCAGATAATCATGAATG
CACCTGTGATGGTTGAGCTGGAGGGTGAGACTGATCCACTTGAGATCGCAATGAAGGAGC
TTAGACAGCGTAAGATACCTTTCACGATCAGGCGTTACTTACCCGACGGGAGTTTTGAAG
AATGGGGAGTGGATGAACTCATTGTGGAAGACTCATGGAAACGTCAAGTCGGTGGTGATT
AATCCATAAAATTGCTCTTATTATGT*GACCTTCTATGATGTTATATGCAAGTGAATCAA
CCAAAGGTGGAAACATAGATTTTCTCTTAGTGTTTCAAGTTTTGTAGCCTGCTTTAAACA
AAAGGTGTCATAAAACCTTTGATGTGATAATGCACGGGCTGTGACGTATCCAAGTTTTCG
GAC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL2724Contig1 717 2 7 U
AAAAAAGAAATGGACTTTATATTATTCTCCACGCGGTTTTTCGTCAGCTTCTCATTGGAT
CTGACTAATCAATCAAATGATACATATGTCACTTACCGCGAAACTGAACTGTCTCACAAA
AATCTACAAAAATTAATGTGTATAATCATAACCTTCTGAGCCAGCAAGCAGGTCTGGAGC
TCATTCTCTTGTTCATTAGCTTTCCGCGGGCTTGGTCTGGTTATCACTTCCAGCTTCTGC
AGCTTTGGTCTTTGTCGAGTCATGTGGTGGTTTGATGGGAGTGCAAGCGATGTTCTTTAC
CACACAAGAGTAAAGATCAAACTCTGCCCTGAGTTTATCACAGCTTGCTTGTATCCACTT
CTCCGCCACACTTGTTGCTACGCTGTCTTGGCTATCTCTCTCATGCTCTTCTATCGCTGG
TCTTATCTCATCGTACAAGGACGAGAGACGTACCGCTGCTTCCTTCTTCACCTCCTCGTA
TTTGAGAATTTCATCTTGAGCTTCTTTGCTTGCTAGTAGCTGAACCACATGTGCTATGTC
GACGTGTTTCTGAGGAACATTCTTTGTCTTCCCGCTTGAAAGCGGCCTTCCTCTTTTCTT
CGGAAGAGACTTATCGCGAGGGCGTGATGTAACAAATGCTGTTTTCTGCGGTAAATCTTG
TGAAGTAAGCTTTGTATCTTCTTCTTCAGCTGCTTCGGTTTTAACAGTTTCTGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY13JQ U 50
AF RR2GV35JQB U 1
BS 1 121 RR2GV35JQB
BS 122 122 RR2BY13JQ
BS 123 129 RR2GV35JQB
BS 130 130 RR2BY13JQ
BS 131 169 RR2GV35JQB
BS 170 170 RR2BY13JQ
BS 171 717 RR2GV35JQB

RD RR2BY13JQ 267 0 0
TCTCATTGGATCTGACTAATCAATCAAATGATACATATGTCACTTACCGCGAAACTTAAC
TGTCTCACAAAAATCTACAAAAATTAATGTGTATAATCATAACCTTCTGAGCCAGTAAGC
AGGTCTGGAGCTCATTCTCTTGTTCATTAGCTTTCCGCGGGCTTGGTCTGGTTATCACTT
CCAGCTTCTGCAGCTTTGGTCTTTGTCGAGTCCTGTGGTGGTTTGATGGGAGTGCAAGCG
ATGTTCTTTACCAC
CCAAAAATAAAAA

QA 1 254 1 254
DS 

RD RR2GV35JQB 717 0 0
AAAAAAGAAATGGACTTTATATTATTCTCCACGCGGTTTTTCGTCAGCTTCTCATTGGAT
CTGACTAATCAATCAAATGATACATATGTCACTTACCGCGAAACTGAACTGTCTCACAAA
AGTCTACAATAATTAATGTGTATAATCATAACCTTCTGAGCCAGCAAGCGGGTCTGGAGC
TCATTCTCTTGTTCATTAGCTTTCCGCGGGCTTGGTCTGGTTATCACTTCCAGCTTCTGC
AGCTTTGGTCTTTGTCGAGTCATGTGGTGGTTTGATGGGAGTGCAAGCGATGTTCTTTAC
CACACAAGAGTAAAGATCAAACTCTGCCCTGAGTTTATCACAGCTTGCTTGTATCCACTT
CTCCGCCACACTTGTTGCTACGCTGTCTTGGCTATCTCTCTCATGCTCTTCTATCGCTGG
TCTTATCTCATCGTACAAGGACGAGAGACGTACCGCTGCTTCCTTCTTCACCTCCTCGTA
TTTGAGAATTTCATCTTGAGCTTCTTTGCTTGCTAGTAGCTGAACCACATGTGCTATGTC
GACGTGTTTCTGAGGAACATTCTTTGTCTTCCCGCTTGAAAGCGGCCTTCCTCTTTTCTT
CGGAAGAGACTTATCGCGAGGGCGTGATGTAACAAATGCTGTTTTCTGCGGTAAATCTTG
TGAAGTAAGCTTTGTATCTTCTTCTTCAGCTGCTTCGGTTTTAACAGTTTCTGTGAC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 4

CO CL2725Contig1 708 4 11 U
GGACGTTCGACCGGCTAATCGTTTCTTCTTCTCACCGTCGCTCTGCTAAACATGGTGCTC
GATGCTTACGCTTCGCCGAACCCTAATAAGGTCCACGAGGACGTTCTTCAGAAATCTAGA
GATGCTTGCTACAAGGCAAGAGATGCATTTTACACTTGTCTGGAGAAGGAATCTGGTAAG
AAACCAACTGAGATCGCGTCCGTAGGTCTTCTCTACCCTAAAGAGTGCAGCCACTCCAGA
ACAGAGTTCGTCAAGAACTGCCGCTCCTCCTGGGTGAAGCATTTCGATAGGGAGTACTGT
CGGAACAAGAGAGTCCAAAGGCTGTTAGATGATGGAGATGAGAGGAAAGGTCCAATGTCA
CTCCCTCAGCCTTACACTTTCAAGCCTTCTCCTTCTTCTTAGATCCCTTCCTTTCCTGGA
AGAGGAAGATGACTGAGTAATCCCTTTGGTAGCACTTACCGTTCCTGAAGCATTAGGACT
CATTTTCTCTGCCGACTTTTTTTTTTTTTAATATCCCTTAAAGTCTCTCTTGTCTTTATT
TGAGTTGTAAGCCTACAACATGGGAATAAAGGTGTTGTGCTTTTGAAGGAAAAGGAACCT
GGTTCTTTTGCCTATTGTCTATTGCTCACAATCTGCAAGCATTTAGTATTCAGTATGCTG
ATATATGAATGGTTATTTTGTTAGTGAATCAGTGAGTGAGTCATTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BA47JQ C 1
AF RR2BH50JQ C 5
AF RR2BH50TF U 5
AF RR2BA47TF U 1
BS 1 6 RR2BA47JQ
BS 7 75 RR2BH50TF
BS 76 76 RR2BA47TF
BS 77 240 RR2BH50TF
BS 241 241 RR2BA47TF
BS 242 349 RR2BH50TF
BS 350 350 RR2BA47TF
BS 351 629 RR2BH50TF
BS 630 630 RR2BA47TF
BS 631 684 RR2BH50TF
BS 685 708 RR2BA47TF

RD RR2BA47JQ 708 0 0
GGACGTTCGACCGGCTAATCGTTTCTTCTTCTCACCGTCGCTCTGCTAAACATGGTGCTC
GATGCTTACGCTTCGCCGAACCCTAATAAGGTCCACGAGGACGTTCTTCAGAAATCTAGA
GATGCTTGCTACAAGGCAAGAGATGCATTTTACACTTGTCTGGAGAAGGAATCTGGTAAG
AAACCAACTGAGATCGCGTCCGTAGGTCTTCTCTACCCTAAAGAGTGCAGCCACTCCAGA
ACAGAGTTCGTCAAGAACTGCCGCTCCTCCTGGGTGAAGCATTTCGATAGGGAGTACTGT
CGGAACAAGAGAGTCCAAAGGCTGTTAGATGATGGAGATGAGAGGAAAGGTCCAATGTCA
CTCCCTCAGCCTTACACTTTCAAGCCTTCTCCTTCTTCTTAGATCCCTTCCTTTCCTGGA
AGAGGAAGATGACTGAGTAATCCCTTTGGTAGCACTTACCGTTCCTGAAGCATTAGGACT
CATTTTTTCTGCCGACTTTTTTTTTTTTTAATATCCCTTAAAGTCTCTCTTGTCTTTATT
TGAGTTGTAAGCCTACAACATGGGAATAAAGGTGTTGTGCTTTTGAAGGAAAAGGAACCT
GGTTCTTTTGCCTATTGTCTATTGCTCACAATCTGCAAGCATTTAGTATTCAGTATGCTG
ATATATGAATGGTTATTTTGTTAGTGAATCAGTGAGTGAGTCATTGAC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2BH50JQ 682 0 0
GG
TCGACCGGCTAATCGTTTCTTCTTCTCACCGTCGCTCTGCTAAACATGGTGCTCGATGCT
TACGCTTCGTCGAACCCTAATAAGGTCCACGAGGACGTTCTTCAGAAATCTAGAGATGCT
TGCTACAAGGCAAGAGATGCATTTTACACTTGTCTGGAGAAGGAATCTGGTAAGAAACCA
ACTGAGATCGCGTCCGTAGGTCTTCTCTACCCTAAAGAGTGCAGCCACTCCAGAGCAGAG
TTCGTCAAGAACTGCCGCTCCTCCTGGGTGAAGCATTTCGATAGGGAGTACTGTCGGAAC
AAGAGAGTCCAAAGGCTGTTAGATGATGGAGATGAGAGGAAAGTTCCAATGTCACTCCCT
CAGCCTTACACTTTCAAGCCTTCTCCTTTTTTTTAGATCCCTTCCTTTCCTGGAAGAGGA
AGATGACTGAGTAATCCCTTTGGTAGCACTTACCGTTCCTGAAGCATTAGGACTCATTTT
TTCTGCCGACTTTTTTTTTTTTTAATATCCCTTAAAGTCTCTCTTGTCTTTATTTGAGTT
GTAAGCCTACAACATGGGAATAAAGGTGTTGTGCTTTTGAAGGAAAAGGAACCTGGTTCT
TTTGCCTATTGTCTATTGCTCACGATCTGCAAGCATTTAGTATTCAGTATGCTGATATAT
GAATGGTTATTTTGTTAG
CG

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR2BH50TF 682 0 0
GG
TCGACCGGCTAATCGTTTCTTCTTCTCACCGTCGCTCTGCTAAACATGGTGCTCGATGCT
TACGCTTCGTCGAACCCTAATAAGGTCCACGAGGACGTTCTTCAGAAATCTAGAGATGCT
TGCTACAAGGCAAGAGATGCATTTTACACTTGTCTGGAGAAGGAATCTGGTAAGAAACCA
ACTGAGATCGCGTCCGTAGGTCTTCTCTACCCTAAAGAGTGCAGCCACTCCAGAGCAGAG
TTCGTCAAGAACTGCCGCTCCTCCTGGGTGAAGCATTTCGATAGGGAGTACTGTCGGAAC
AAGAGAGTCCAAAGGCTGTTAGATGATGGAGATGAGAGGAAAGTTCCAATGTCACTCCCT
CAGCCTTACACTTTCAAGCCTTCTCCTTCTTCTTAGATCCCTTCCTTTCCTGGAAGAGGA
AGATGACTGAGTAATCCCTTTGGTAGCACTTACCGTTCCTGAAGCATTAGGACTCATTTT
CTCTGCCGACTTTTTTTTTTTTTAATATCCCTTAAAGTCTCTCTTGTCTTTATTTGAGTT
GTAAGCCTACAACATGGGAATAAAGGTGTTGTGCTTTTGAAGGAAAAGGAACCTGGTTCT
TTTGCCTATTGTCTATTGCTCACGATCTGCAAGCATTTAGTATTCAGTATGCTGATATAT
GAATGGTTATTTTGTTAG
CG

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR2BA47TF 708 0 0
GGACGT
TCGACCGGCTAATCGTTTCTTCTTCTCACCGTCGCTCTGCTAAACATGGTGCTCGATGCT
TACGCTTCGCCGAACCCTAATAAGGTCCACGAGGACGTTCTTCAGAAATCTAGAGATGCT
TGCTACAAGGCAAGAGATGCATTTTACACTTGTCTGGAGAAGGAATCTGGTAAGAAACCA
ACTGAGATCGCGTCCGTAGGTCTTCTCTACCCTAAAGAGTGCAGCCACTCCAGAACAGAG
TTCGTCAAGAACTGCCGCTCCTCCTGGGTGAAGCATTTCGATAGGGAGTACTGTCGGAAC
AAGAGAGTCCAAAGGCTGTTAGATGATGGAGATGAGAGGAAAGGTCCAATGTCACTCCCT
CAGCCTTACACTTTCAAGCCTTCTCCTTCTTCTTAGATCCCTTCCTTTCCTGGAAGAGGA
AGATGACTGAGTAATCCCTTTGGTAGCACTTACCGTTCCTGAAGCATTAGGACTCATTTT
CTCTGCCGACTTTTTTTTTTTTTAATATCCCTTAAAGTCTCTCTTGTCTTTATTTGAGTT
GTAAGCCTACAACATGGGAATAAAGGTGTTGTGCTTTTGAAGGAAAAGGAACCTGGTTCT
TTTGCCTATTGTCTATTGCTCACAATCTGCAAGCATTTAGTATTCAGTATGCTGATATAT
GAATGGTTATTTTGTTAGTGAATCAGTGAGTGAGTCATTGAC

QA 7 708 7 708
DS 



AS 1 4

CO CL2726Contig1 935 4 5 U
GGGGGATCAAAAAAGAAAGCTCAGACAGCATCCATTTTCTCTACCACAGAAGAAGAACCT
AGAACCACAGAGACACAGAGAGAGAAAGACAGAACAAGAGAGTCAGAGATCGAGGTTTTA
GTTTATAGAAGGAGAAAAATATGAAGGCAGTAGAGACGTCGCAGCCGACGGTGCAAAGCC
GACAGTTAGGAACTCAGCTGTCGGGAAGCAAGAGTTTCAGCAGCCAAATGTCGAAGGAAG
ACGAAGAGATGTCGAGGAATGCTCTGTCGGCTTTCAGGGCGAAAGAAGAGGAGATCGAGA
AGAAGA***TGGAGATTAGGGAAAGGGTTCAAGCTCAGCTTGGTCGCGTCGAAGAAGAGA
CTAAGCGTCTCGCTTTCATCCGTGAGGAACTTGAAGGTTTAGCTGACCCGATGAGGAAAG
AAGTTGCTTTGGTCAGGAAGAAGGTTGACTCTGTCAACAAAGAATTAAAGCCATTGGGTC
TTACTGTTCAGAAAAAGGAACGAGAGTACAAAGAAGCTCTTGAGGCATTCAACGAAAAGA
ACAGAGAGAAGGTGCAGCTAATCACCAAGCTTATGGAGTTGGTGGGAGAAAGCGAAAAGA
TGAGAATGAAGAAGCTAGAAGAGCTTAGCAAGAGCATAGATTCTTCTATACAACACTGAC
TTTGAGCCCAAGACAGAAGAAAGACACTTCTTGGGGGCCAGAGATCATTTCTCTGAGTCG
TTTAACTCCACGTTTAGGTTTTGTGATGGTGAATGTAATTTATACTTTGTAATCGTCGTG
TGTTATATTACTACCATTGTGTTATTGTCTTTCGTTAGGGTTTCCTGGAGATTTTATAAT
GTGTTTTAGGAAGTAACTACAAAAAAAATACTCATAGAGACAGGCTTGTAACTAAACACT
ACTCTCTTTCTTCTGTTTTATCCTTTTTCTATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DV33TF U 1
AF RR2EM47TF U 25
AF RR2BB30JQ C 165
AF RR2BB30TF U 165
BS 1 306 RR2DV33TF
BS 307 309 RR2BB30TF
BS 310 707 RR2DV33TF
BS 708 753 RR2EM47TF
BS 754 935 RR2BB30TF

RD RR2DV33TF 707 0 0
GGGGGATCAAAAAAGAAAGCTCAGACAGCATCCATTTTCTCTACCACAGAAGAAGAACCT
AGAACCACAGAGACACAGAGAGAGAAAGACAGAACAAGAGAGTCAGAGATCGAGGTTTTA
GTTTATAGAAGGAGAAAAATATGAAGGCAGTAGAGACGTCGCAGCCGACGGTGCAAAGCC
GACAGTTAGGAACTCAGCTGTCGGGAAGCAAGAGTTTCAGCAGCCAAATGTCGAAGGAAG
ACGAAGAGATGTCGAGGAATGCTCTGTCGGCTTTCAGGGCGAAAGAAGAGGAGATCGAGA
AGAAGAAGATGGAGATTAGGGAAAGGGTTCAAGCTCAGCTTGGTCGCGTCGAAGAAGAGA
CTAAGCGTCTCGCTTTCATCCGTGAGGAACTTGAAGGTTTAGCTGACCCGATGAGGAAAG
AAGTTGCTTTGGTCAGGAAGAAGGTTGACTCTGTCAACAAAGAATTAAAGCCATTGGGTC
TTACTGTTCAGAAAAAGGAACGAGAGTACAAAGAAGCTCTTGAGGCATTCAACGAAAAGA
ACAGAGAGAAGGTGCAGCTAATCACCAAGCTTATGGAGTTGGTGGGAGAAAGCGAAAAGA
TGAGAATGAAGAAGCTAGAAGAGCTTAGCAAGAGCATAGATTCTTCTATACAACACTGAC
TTTGAGCCCAAGACAGAAGAAAGACACTTCTTGGGGGCCAGAGATCA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2EM47TF 729 0 0
GG
AGCATCCATTTTCTCTACCACAGAAGAAGAACCTAGAACCACAGAGACACAGAGAGAGAA
AGACAGAACAAGAGAGTCAGAGATCGAGGTTTTAGTTTATAGAAGGAGAAAAATATGAAG
GCAGTAGAGACGTCGCAGCCGACGGTGCAAAGCCGACAGTTAGGAACTCAGCTGTCGGGA
AGCAAGAGTTTCAGCAGCCAAATGTCGAAGGAAGACGAAGAGATGTCGAGGAATGCTCTG
TCGGCTTTCAGGGCGAAAGAAGAGGAGATCGAGAAGAAGAAGATGGAGATTAGGGAAAGG
GTTCAAGCTCAGCTTGGTCGCGTCGAAGAAGAGACTAAGCGTCTCGCTTTCATCCGTGAG
GAACTTGAAGGTTTAGCTGACCCGATGAGGAAAGAAGTTGCTTTGGTCAGGAAGAAGGTT
GACTCTGTCAACAAAGAATTAAAGCCATTGGGTCTTACTGTTCAGAAAAAGGAACGAGAG
TACAAAGAAGCTCTTGAGGCATTCAACGAAAAGAACAGAGAGAAGGTGCAGCTAATCACC
AAGCTTATGGAGTTGGTGGGAGAAAGCGAAAAGATGAGAATGAAGAAGCTAGAAGAGCTT
AGCAAGAGCATAGATTCTTCTATACAACACTGACTTTGAGCCCAAGACAGAAGAAAGACA
CTTCTTGGGGGCCAGAGATCATTTCTCTGAGTCGTTTAACTCCACGTTTAGGTTTTGTGA
TGGTGAA

QA 3 729 3 729
DS 

RD RR2BB30JQ 771 0 0
G
CGACGGTGCAAAGCCGACAGTTAGGAACTCAGCTGTCGGGAAGCAAGAGTTTCAGCAGCC
AAATGTCGAAGGAAGACGAAGAGATGTCGAGGAATGCTCTGTCGGCTTTCAGGGCGAAAG
AAGAGGAGATCGAGAAGAAGA***TGGAGATTAGGGAAAGGGTTCAAGCTCAGCTTGGTC
GCGTCGAAGAAGAGACTAAGCGTCTCGCTTTCATCCGTGAGGAACTTGAAGGTTTAGCTG
ACCCGATGAGGAAAGAAGTTGCTTTGGTCAGGAAGAAGGTTGACTCTGTCAACAAAGAAT
TAAAGCCATTGGGTCTTACTGTTCAGAAAAAGGAACGAGAGTACAAAGAAGCTCTTGAGG
CATTCAACGAAAAGAACAGAGAGAAGGTGCAGCTAATCACCAAGCTTATGGAGTTGGTGG
GAGAAAGCGAAAAGATGAGAATGAAGAAGCTAGAAGAGCTTAGCAAGAGCATAGATTCTT
CTATACAACACTGACTTTGAGCCCAAGACAGAAGAAAGACACTTCTTGGGGGCCAGAGAT
CATTTCTCTGAGTCGTTTAACTCCACGTTTAGGTTTTGTGATGGTGAATGTAATTTATAC
TTTGTAATCGTCGTGTGTTATATTACTACCATTGTGTTATTGTCTTTCGTTAGGGTTTCC
TGGAGATTTTATAATGTGTTTTAGGAAGTAACTACAAAAAAAATACTCATAGAGACAGGC
TTGTAACTAAACACTACTCTCTTTCTTCTGTTTTATCCTTTTTCTATGTT

QA 2 771 2 771
DS 

RD RR2BB30TF 771 0 0
G
CGACGGTGCAAAGCCGACAGTTAGGAACTCAGCTGTCGGGAAGCAAGAGTTTCAGCAGCC
AAATGTCGAAGGAAGACGAAGAGATGTCGAGGAATGCTCTGTCGGCTTTCAGGGCGAAAG
AAGAGGAGATCGAGAAGAAGA***TGGAGATTAGGGAAAGGGTTCAAGCTCAGCTTGGTC
GCGTCGAAGAAGAGACTAAGCGTCTCGCTTTCATCCGTGAGGAACTTGAAGGTTTAGCTG
ACCCGATGAGGAAAGAAGTTGCTTTGGTCAGGAAGAAGGTTGACTCTGTCAACAAAGAAT
TAAAGCCATTGGGTCTTACTGTTCAGAAAAAGGAACGAGAGTACAAAGAAGCTCTTGAGG
CATTCAACGAAAAGAACAGAGAGAAGGTGCAGCTAATCACCAAGCTTATGGAGTTGGTGG
GAGAAAGCGAAAAGATGAGAATGAAGAAGCTAGAAGAGCTTAGCAAGAGCATAGATTCTT
CTATACAACACTGACTTTGAGCCCAAGACAGAAGAAAGACACTTCTTGGGGGCCAGAGAT
CATTTCTCTGAGTCGTTTAACTCCACGTTTAGGTTTTGTGATGGTGAATGTAATTTATAC
TTTGTAATCGTCGTGTGTTATATTACTACCATTGTGTTATTGTCTTTCGTTAGGGTTTCC
TGGAGATTTTATAATGTGTTTTAGGAAGTAACTACAAAAAAAATACTCATAGAGACAGGC
TTGTAACTAAACACTACTCTCTTTCTTCTGTTTTATCCTTTTTCTATGTT

QA 2 771 2 771
DS 



AS 2 4

CO CL2727Contig1 785 2 2 U
GAGCCAGAAGAAGTCTCCATCTACGGAGTTCCACTCCTCCAAGACGAGAGATCCGACACA
ATCCTCCTCAAGTTCCTCCGTGCGAGAGACTTCAAGGTCAAGGAAGCCTTGACCATGCTG
AAAAACACCGTCCAGTGGCGTAAAGAGAACAAAATCGACGACCTCCTCGAATCCGAATCC
GGAGAGGAAACCAGCGAGTTCGAGAAGATGGTGTTCGCTCACGGGGTCGACAAGGAAGGC
CACGTCGTGATCTACAGCTCATACGGCGAGTTCCAGAACAAGGAGCTTTTCTCCGACAAG
GAGAAGCTCAACAAGTTCCTCAACTGGAGGATTCAGCTACAAGAGAAGTGCGTAAGGGCT
CTTGACTTCAGCAGCCCTGATGCTAAGTCTTCGTTTGTGTTCGTCAGCGACTTCAGGAAC
GCTCCTGGACTCGGCAAGAGAGCCTTGTGGCAGTTCATCAGACGCGCCGTCAAGCAGTTC
GAGGACAATTATCCAGAGTTCGCCACTAGAGAGTTGTTCATTAATGTTCCATGGTGGTAC
ATTCCTTACTACAAAACATTCGGATCTATCATCACATCCCCAAAGACTAGGAGTAAGATG
GTACTTGCTGGTCCAGCCAAATCTGCCGATACTATTTTCAAATACATAACTCCTGAACAA
GTCCCTGTTAAATACGGTGGACTTAGCGATGATATTGGAGACACCGTAACCGACGCCATC
GTTAAACCAGCAGCCAAATACATAATCGAATTGCCTGCTTCTGAGGCTTGCACGCTCTCG
TGGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2CQ02TF U 1
AF RR2B149TF U 60
BS 1 673 RR2CQ02TF
BS 674 785 RR2B149TF

RD RR2CQ02TF 673 0 0
GAGCCAGAAGAAGTCTCCATCTACGGAGTTCCACTCCTCCAAGACGAGAGATCCGACACA
ATCCTCCTCAAGTTCCTCCGTGCGAGAGACTTCAAGGTCAAGGAAGCCTTGACCATGCTG
AAAAACACCGTCCAGTGGCGTAAAGAGAACAAAATCGACGACCTCCTCGAATCCGAATCC
GGAGAGGAAACCAGCGAGTTCGAGAAGATGGTGTTCGCTCACGGGGTCGACAAGGAAGGC
CACGTCGTGATCTACAGCTCATACGGCGAGTTCCAGAACAAGGAGCTTTTCTCCGACAAG
GAGAAGCTCAACAAGTTCCTCAACTGGAGGATTCAGCTACAAGAGAAGTGCGTAAGGGCT
CTTGACTTCAGCAGCCCTGATGCTAAGTCTTCGTTTGTGTTCGTCAGCGACTTCAGGAAC
GCTCCTGGACTCGGCAAGAGAGCCTTGTGGCAGTTCATCAGACGCGCCGTCAAGCAGTTC
GAGGACAATTATCCAGAGTTCGCCACTAGAGAGTTGTTCATTAATGTTCCATGGTGGTAC
ATTCCTTACTACAAAACATTCGGATCTATCATCACATCCCCAAAGACTAGGAGTAAGATG
GTACTTGCTGGTCCAGCCAAATCTGCCGATACTATTTTCAAATACATAACTCCTGAACAA
GTCCCTGTTAAAT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2B149TF 726 0 0
G
ATCCTCCTCAAGTTCCTCCGTGCGAGAGACTTCAAGGTCAAGGAAGCCTTGACCATGCTG
AAAAACACCGTCCAGTGGCGTAAAGAGAACAAAATCGACGACCTCCTCGAATCCGAATCC
GGAGAGGAAGCCAGCGAGTTCGAGAAGATGGTGTTCGCTCACGGGGTCGACAAGGAAGGC
CACGTCGTGATCTACAGCTCATACGGCGAGTTCCAGAACAAGGAGCTTTTCTCCGACAAG
GAGAAGCTCAACAAGTTCCTCAACTGGAGGATTCAGCTACAAGAGAAGTGCGTAAGGGCT
CTTGACTTCAGCAGCCCTGATGCTAAGTCTTCGTTTGTGTTCGTCAGCGACTTCAGGAAC
GCTCCTGGACTCGGCAAGAGAGCCTTGTGGCAGTTCATCAGACGCGCCGTCAAGCAGTTC
GAGGACAATTATCCAGAGTTCGCCACTAGAGAGTTGTTCATTAATGTTCCATGGTGGTAC
ATTCCTTACTACAAAACATTCGGATCTATCATCACATCCCCAAAGACTAGGAGTAAGATG
GTACTTGCTGGTCCAGCCAAATCTGCCGATACTATTTTCAAATACATAGCTCCTGAACAA
GTCCCTGTTAAATACGGTGGACTTAGCGATGATATTGGAGACACCGTAACCGACGCCATC
GTTAAACCAGCAGCCAAATACATAATCGAATTGCCTGCTTCTGAGGCTTGCACGCTCTCG
TGGGA

QA 2 726 2 726
DS 



CO CL2727Contig2 891 2 16 U
GACAAGAGAAGTGTGTGAGGGCTCTTGACTTCAGCAGCCCTGATGCTAAGTCTTCGTTTG
TGTTCGTCAGCGACTTCAGGAACGCTCCTGGACTCGGCAAGAGAGCGTTGTGGCAGTTCA
TCAGGCGCGCCGTCAAGCAGTTCGAGGACAATTATCCAGAGTTCGCCACTAGAGAGTCGT
TCATCAATGTTCCATGGTGGTACATTCCTTACTACAAAACATTCGGATCTATCATCACAT
CCCCAAAGACTAGGAGTAAGATGGTACTTGCTGGTCCAGCCAAATCTGCCGATACAATTT
TCAAATACATAGCTCCTGAACAAGTCCCTGTTAAATACGGTGGACTTAGCGATGATATTG
GAAACACCGTAACCGACGCCATCGTTAAACCAGCAGCCAAATACACAATCGAATTGCCTG
CTTCTGAGGCTTGCACGCTCTCATGGGAGATTAGGGTTTTGGGTGCAGATGTGACCTATG
GAGCACAGTTTGAGCCGACCACAGAGGGAAGCTATGATGTGATCGTCTCTAAGAACCGAA
AGATTGGGTTAACTGACGAACCGGTGATAACCGGTTCTTTTAAGGTTGGTGAACCGGGGA
AGATTGTGATCACAGTCGATAATCAGACTTCCAAGAAAAAGAAAGTGCTCTACCGGTCCA
AATCTCAACCAAGGTCCGATAATTGAAACTAAATGTGTTACCATACTTTACTTGTCAGAA
CCCAAATCAAAGGAAGAAGAATAATGGTTATTTTTGTTATCTGTGGGAACAAATCTTTAA
TTTATTTGATTTACTTTGTTATTTAATATGTAATTTTGAATGATCATAAGGTGGTTTTGT
GTTTTGCTTTGTTTATTGGGGGATTATGTGTGTGTGGTTGGTTCTATGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH93TF U 1
AF RR2B149JQ C 155
BS 1 241 RR2DH93TF
BS 242 242 RR2B149JQ
BS 243 246 RR2DH93TF
BS 247 247 RR2B149JQ
BS 248 289 RR2DH93TF
BS 290 290 RR2B149JQ
BS 291 363 RR2DH93TF
BS 364 364 RR2B149JQ
BS 365 371 RR2DH93TF
BS 372 372 RR2B149JQ
BS 373 412 RR2DH93TF
BS 413 413 RR2B149JQ
BS 414 500 RR2DH93TF
BS 501 501 RR2B149JQ
BS 502 581 RR2DH93TF
BS 582 891 RR2B149JQ

RD RR2DH93TF 583 0 0
GACAAGAGAAGTGTGTGAGGGCTCTTGACTTCAGCAGCCCTGATGCTAAGTCTTCGTTTG
TGTTCGTCAGCGACTTCAGGAACGCTCCTGGACTCGGCAAGAGAGCGTTGTGGCAGTTCA
TCAGGCGCGCCGTCAAGCAGTTCGAGGACAATTATCCAGAGTTCGCCACTAGAGAGTCGT
TCATCAATGTTCCATGGTGGTACATTCCTTACTACAAAACATTCGGATCTATCATCACAT
CGCCAAGGACTAGGAGTAAGATGGTACTTGCTGGTCCAGCCAAATCTGCTGATACAATTT
TCAAATACATAGCTCCTGAACAAGTCCCTGTTAAATACGGTGGACTTAGCGATGATATTG
GAAGCACCGTAGCCGACGCCATCGTTAAACCAGCAGCCAAATACACAATCGAGTTGCCTG
CTTCTGAGGCTTGCACGCTCTCATGGGAGATTAGGGTTTTGGGTGCAGATGTGACCTATG
GAGCACAGTTTGAGCCGACCGCAGAGGGAAGCTATGATGTGATCGTCTCTAAGAACCGAA
AGATTGGGTTAACTGACGAACCGGTGATAACCGGTTCTTTT
TA

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2B149JQ 737 0 0
TCCAGAGTTCGCCACTAGAGAGTTGTTCATTAATGTTCCATGGTGGTACATTCCTTACTA
CAAAACATTCGGATCTATCATCACATCCCCAAAGACTAGGAGTAAGATGGTACTTGCTGG
TCCAGCCAAATCTGCCGATACTATTTTCAAATACATAGCTCCTGAACAAGTCCCTGTTAA
ATACGGTGGACTTAGCGATGATATTGGAGACACCGTAACCGACGCCATCGTTAAACCAGC
AGCCAAATACATAATCGAATTGCCTGCTTCTGAGGCTTGCACGCTCTCGTGGGAGCTTAG
GGTTTTGGGTGCAGATGTGAGCTATGGAGCACAGTTTGAGCCGACCACAGAGGGAAGCTA
TGATGTGATCGTCTCTAAGAACCGAAAGATTGGTTTAACTGACGAGCCGGTGATAACTGG
TTCTTTTAAGGTTGGTGAACCGGGGAAGATTGTGATCACAGTCGATAATCAGACTTCCAA
GAAAAAGAAAGTGCTCTACCGGTCCAAATCTCAACCAAGGTCCGATAATTGAAACTAAAT
GTGTTACCATACTTTACTTGTCAGAACCCAAATCAAAGGAAGAAGAATAATGGTTATTTT
TGTTATCTGTGGGAACAAATCTTTAATTTATTTGATTTACTTTGTTATTTAATATGTAAT
TTTGAATGATCATAAGGTGGTTTTGTGTTTTGCTTTGTTTATTGGGGGATTATGTGTGTG
TGGTTGGTTCTATGTGA

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 3

CO CL2728Contig1 1157 3 6 U
GTGTGCAATATAAATATATATACAAGGTAAGAGTATCTTACACTTAACCCCATTGGCAAA
CAAAAAACACACAGAAACTGAAAAGGTAAAACGGGCGGTCTGTTTTGTTCAAACTAGATA
TAACTCTTCCGCTTCATTGTGTGTATGTTCAAGCCCACATTTGAATCAACTACCCATCTT
GTAAGCCCAGACGTGCTTCTCTAGATAAGCAGCCACTGCCTCTTTGATAGCCAGATTTGG
AACGAGTTTGGATGGATCGAGTTTCTCACGCGTTATAGGATCAAACCTTCCCACCTTGTT
AATATGTTCAAGGATGGCTGCTCTTTCATATGTAACCCCACTTGGAGAAATCACAGGATC
CCGGAATATCTCAAGAGTAATGTTGCAACACAAGTAATCTGGCACCTCAGTTGGTTTGTC
CTCTTCTGCAGCTTTCTCAAACACTCGGTCGAGAGATCTCAACTGCTCAGTATGGGAAGA
ATAGTCTTCCTCCGAAGACTCTTCCGTTCGAGACATATCTAAAGCACGTTGTTGATTAAG
AGCAGCCACGCAAGTTTCCTTCAAACTGTTCAATTCCCACGAGCGCCTAGCAGAAAGCAA
TTCCCACTCCATGTATTTTGCTTTCGACAGCTCTTCCCATATTTCTTCTACCATGTACCC
TGTTGGATTTGCGCCTCTTCCAAAATCTAAAGCCCTTTGCAACGCTTTGACTCCATCAGC
ATAATCTTCCCTCTGCAATAAAGCAAGTCCTAGCATGTAGTGAGCCTTAACGGAATCATG
GTCAAGCTGAATAGCTTTGCGAGAATCCTCTTCAACCCTAGTCCAATCCTTTCGCTTCAT
GTGGCAGAGAGCTCGATTAGTCCAGTAAACAGGAACCTTGGGTGACAAAGTTATCGCCTC
TGTATAAGCATCAATGGCGGCGCCGAAACGTTCCTTCTTGAAGCAATTGTTGCCGTCTTC
CTTTAACCGCTCGGCTTGTTTCGCCGCCATGGCGGAGACCGCGCCTGTCACCATCTCCTA
AGCCAATTCGATTGGAAAAACGAATCGATTCTCTCTTTTACTATTCCACGCTTTGTTTCT
CCGGCGGCGCGTGCGTAGAATCTTTCTGGGAAATCGAATGAATGTTTTGAGAACGAGACG
AAGCCGCGAAACTTCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H152JQ U 1
AF RR2FP19JQ U 1
AF RR2FP19TF C 438
BS 1 814 RR2FP19JQ
BS 815 815 RR2FP19TF
BS 816 823 RR2FP19JQ
BS 824 824 RR2FP19TF
BS 825 856 RR2FP19JQ
BS 857 1157 RR2FP19TF

RD RR2H152JQ 768 0 0
GG
GTGCAATATAAATATATATACAAGGTAAGAGTATCTTACACTTAACCCCATTGGCAAACA
AAAAACACACAGAAACTGAAAAGGTAAAACGGGCGGTCTGTTTTGTTCAAACTAGATATA
ACTCTTCCGCTTCATTGTGTGTATGTTCAAGCCCACATTTGAATCAACTACCCATCTTGT
AAGCCCAGACGTGCTTCTCTAGATAAGCAGCCACTGCCTCTTTGATAGCCAGATTTGGAA
CGAGTTTGGATGGATCGAGTTTCTCACGCGTTATAGGATCAAACCTTCCCACCTTGTTAA
TATGTTCAAGGATGGCTGCTCTTTCATATGTAACCCCACTTGGAGAAATCACAGGATCCC
GGAATATCTCAAGAGTAATGTTGCAACACAAGTAATCTGGCACCTCAGTTGGTTTGTCCT
CTTCTGCAGCTTTCTCAAACACTCGGTCGAGAGATCTCAACTGCTCAGTATGGGAAGAAT
AGTCTTCCTCCGAAGACTCTTCCGTTCGAGACATATCTAAAGCACGTTGTTGATTAAGAG
CAGCCACGCAAGTTTCCTTCAAACTGTTCAATTCCCACGAGCGCCTAGCAGAAAGCAATT
CCCACTCCATGTATTTTGCTTTCGACAGCTCTTCCCATATTTCTTCTACCATGTACCCTG
TTGGATTTGCGCCTCTTCCAAAATCTAAAGCCCTTTGCAACGCTTTGACTCCATCAGCAT
AATCTTCCCTCTGCAATAAAGCAAGTCCTAGCATGTAGTGAGCCT
G

QA 3 767 3 767
DS 

RD RR2FP19JQ 856 0 0
GTGTGCAATATAAATATATATACAAGGTAAGAGTATCTTACACTTAACCCCATTGGCAAA
CAAAAAACACACAGAAACTGAAAAGGTAAAACGGGCGGTCTGTTTTGTTCAAACTAGATA
TAACTCTTCCGCTTCATTGTGTGTATGTTCAAGCCCACATTTGAATCAACTACCCATCTT
GTAAGCCCAGACGTGCTTCTCTAGATAAGCAGCCACTGCCTCTTTGATAGCCAGATTTGG
AACGAGTTTGGATGGATCGAGTTTCTCACGCGTTATAGGATCAAACCTTCCCACCTTGTT
AATATGTTCAAGGATGGCTGCTCTTTCATATGTAACCCCACTTGGAGAAATCACAGGATC
CCGGAATATCTCAAGAGTAATGTTGCAACACAAGTAATCTGGCACCTCAGTTGGTTTGTC
CTCTTCTGCAGCTTTCTCAAACACTCGGTCGAGAGATCTCAACTGCTCAGTATGGGAAGA
ATAGTCTTCCTCCGAAGACTCTTCCGTTCGAGACATATCTAAAGCACGTTGTTGATTAAG
AGCAGCCACGCAAGTTTCCTTCAAACTGTTCAATTCCCACGAGCGCCTAGCAGAAAGCAA
TTCCCACTCCATGTATTTTGCTTTCGACAGCTCTTCCCATATTTCTTCTACCATGTACCC
TGTTGGATTTGCGCCTCTTCCAAAATCTAAAGCCCTTTGCAACGCTTTGACTCCATCAGC
ATAATCTTCCCTCTGCAATAAAGCAAGTCCTAGCATGTAGTGAGCCTTAACGGAATCATG
GTCAAGCTGAATAGCTTTGCGAGAATCCTCTTCA*CCCTAGTC*AATCCTTTCGCTTCAT
GTGGCAGAGAGCTCGA

QA 1 856 1 856
DS 

RD RR2FP19TF 720 0 0
CAAACACTCGGTCGAGAGATCTCAACTGCTCAGTATGGGAAGAATAGTCTTCCTCCGAAG
ACTCTTCCGTTCGAGACATATCTAAAGCACGTTGTTGATTAAGAGCAGCCACGCAAGTTT
CCTTCAAACTGTTCAATTCCCACGAGCGCCTAGCAGAAAGCAATTCCCACTCCATGTATT
TTGCTTTCGACAGCTCTTCCCATATTTCTTCTACCATGTACCCTGTTGGATTTGCGCCTC
TTCCAAAATCTAAAGCCCTTTGCAACGCTTTGACTCCATCAGCATAATCTTCCCTCTGCA
ATAAAGCAAGTCCTAGCATGTAGTGAGCCTTAACGGAATCATGGTCAAGCTGAATAGCTT
TGCGAGAATCCTCTTCAACCCTAGTCCAATCCTTTCGCTTCATGTGGCAGAGAGCTCGAT
TAGTCCAGTAAACAGGAACCTTGGGTGACAAAGTTATCGCCTCTGTATAAGCATCAATGG
CGGCGCCGAAACGTTCCTTCTTGAAGCAATTGTTGCCGTCTTCCTTTAACCGCTCGGCTT
GTTTCGCCGCCATGGCGGAGACCGCGCCTGTCACCATCTCCTAAGCCAATTCGATTGGAA
AAACGAATCGATTCTCTCTTTTACTATTCCACGCTTTGTTTCTCCGGCGGCGCGTGCGTA
GAATCTTTCTGGGAAATCGAATGAATGTTTTGAGAACGAGACGAAGCCGCGAAACTTCCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 4

CO CL2729Contig1 670 4 5 U
GGGAGCCACGGTGGCGACGATGGAGGCATCTTCTTCTTCTTCTCTGCGTCTGGTTCCGTC
TTTGTGGACCGTTGGATCAGGACCTCGTCAGAAGAAATCGACGGTTAGTTTTGTTTCTCG
GGGAAGAAGTAACGGTTTGATGGTTATAAGTAACCGACGGTTCAGAACGCCGTCAGCTCT
AGGGGAACTCGCTGACACGGTGGCGGAGACAGGCAAATCGGAGATTACGTGGCAAATCAT
AGTTGGAGCTGTCGCTGGAGTTACGCCATTCGTTGTTGCAGGTGTTGAATTCAGCAAAAG
AATAATTGAACAGAAGAGATGTGAAGAATGTAGAGGATCAGGACTTGTTTTTAGAGACAA
GAAGTACTTTCGTTGTCCAGGATGTGGTGGGTTTCTTCCATGGCAGTCATGGAGAAGATT
CTTTACAGGCTGATAATGATCTACGATGATGATCTATCTCTGCAAATATGAAGGCAAGAG
AGGATGACCACTATAACAACCACATATGTTTTTTATCTTTAATTTAAAAGCATGACTGCA
ATCGTATATATTGCAATGTAATAGACATATTCTCTCAAACATATTCCTTCCCTGTTTTAA
CTCATATTATATTTTTCGTAACTCTTTGTAAACAAAACTTATGAACAAATATATCTATAC
TATTATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DW91TF U 8
AF RR2DW91JQ C 8
AF RR2AX19JQ C 1
AF RR2AX19TFB U 1
BS 1 9 RR2AX19JQ
BS 10 175 RR2DW91TF
BS 176 176 RR2AX19TFB
BS 177 292 RR2DW91TF
BS 293 670 RR2AX19TFB

RD RR2DW91TF 288 0 0
GG
GGTGGCGACGATGGAGGCATCTTCTTCTTCTTCTCTGCGTCTGGTTCCGTCTTTGTGGAC
CGTTGGATCAGGACCTCGTCAGAAGAAATCGACGGTTAGTTTTGTTTCTCGGGGAAGAAG
TAACGGTTTGATGGTTATAAGTAACCGACGGTTCAGAACGCCGTCATCTCTAGGGGAACT
CGCTGACACGGTGGCGGAGACAGGCAAATCGGAGATTACGTGGCAAATCATAGTTGGAGC
TGTCGCTGGAGTTACGCCATTCGTTGTTGCAGGTGTTGAATTC
GGG

QA 3 285 3 285
DS 

RD RR2DW91JQ 596 0 0
GG
GGTGGCGACGATGGAGGCATCTTCTTCTTCTTCTCTGCGTCTGGTTCCGTCTTTGTGGAC
CGTTGGATCAGGACCTCGTCAGAAGAAATCGACGGTTAGTTTTGTTTCTCGGGGAAGAAG
TAACGGTTTGATGGTTATAAGTAACCGACGGTTCAGAACGCCGTCATCTCTAGGGGAACT
CGCTGACACGGTGGCGGAGACAGGCAAATCGGAGATTACGTGGCAAATCATAGTTGGAGC
TGTCGCTGGAGTTACGCCATTCGTTGTTGCAGGTGTTGAATTCAGCAAAAGAATAATTGA
ACAGAAGAGATGTGAAGAATGTAGAGGATCAGGACTTGTTTTTAGAGACAAGAAGTACTT
TCGTTGTCCAGGATGTGGTGGGTTTCTTCCATGGCAGTCATGGAGAAGATTCTTTACAGG
CTGATAATGATCTACGATGATGATCTATCTCTGCAAATATGAAGGCAAGAGAAGATGACC
ACTATAACAACCACATATGTTTTTTATCTTTAATTTAAAAGCATGACTGCAATCGTATAT
ATTGCAATGTAATAGACATATTCTCTCAAACATATTCCTTCCCTGTTTTAAC
GC

QA 3 594 3 594
DS 

RD RR2AX19JQ 670 0 0
GGGAGCCACGGTGGCGACGATGGAGGCATCTTCTTCTTCTTCTCTGCGTCTGGTTCCGTC
TTTGTGGACCGTTGGATCAGGACCTTGTCAGAAGAAATCGACGGTTAGTTTTGTTTCTCG
GGGAAGAAGTAACGGTTTGATGGTTATAAGTAACCGACGGTTCAGAACGCCGTCAGCTCT
AGGGGAACTCGCTGACACGGTGGCGGAGACAGGCAAATCGGAGATTACGTGGCAAATCAT
AGTTGGAGCTGTCGCTGGAGTTACGCCATTCGTTGTTGCAGGTGTTGAATTCAGCAAAAG
AATAATTGAACAGAAGAGATGTGAAGAATGTAGAGGATCAGGACTTGTTTTTAGAGACAA
GAAGTACTTTCGTTGTCCAGGATGTGGTGGGTTTCTTCCATGGCAGTCATGGAGAAGATT
CTTTACAGGCTGATAATGATCTACGATGATGATCTATCTCTGCAAATATGAAGGCAAGAG
AGGATGACCACTATAACAACCACATATGTTTTTTATCTTTAATTTAAAAGCATGACTGCA
ATCGTATATATTGCAATGTAATAGACATATTCTCTCAAACATATTCCTTCCCTGTTTTAA
CTCATATTATATTTTTCGTAACTCTTTGTAAACAAAACTTATGAACAAATATATCTATAC
TATTATTTGC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2AX19TFB 670 0 0
GGGAGCCAC
GGTGGCGACGATGGAGGCATCTTCTTCTTCTTCTCTGCGTCTGGTTCCGTCTTTGTGGAC
CGTTGGATCAGGACCTTGTCAGAAGAAATCGACGGTTAGTTTTGTTTCTCGGGGAAGAAG
TAACGGTTTGATGGTTATAAGTAACCGACGGTTCAGAACGCCGTCAGCTCTAGGGGAACT
CGCTGACACGGTGGCGGAGACAGGCAAATCGGAGATTACGTGGCAAATCATAGTTGGAGC
TGTCGCTGGAGTTACGCCATTCGTTGTTGCAGGTGTTGAATTCAGCAAAAGAATAATTGA
ACAGAAGAGATGTGAAGAATGTAGAGGATCAGGACTTGTTTTTAGAGACAAGAAGTACTT
TCGTTGTCCAGGATGTGGTGGGTTTCTTCCATGGCAGTCATGGAGAAGATTCTTTACAGG
CTGATAATGATCTACGATGATGATCTATCTCTGCAAATATGAAGGCAAGAGAGGATGACC
ACTATAACAACCACATATGTTTTTTATCTTTAATTTAAAAGCATGACTGCAATCGTATAT
ATTGCAATGTAATAGACATATTCTCTCAAACATATTCCTTCCCTGTTTTAACTCATATTA
TATTTTTCGTAACTCTTTGTAAACAAAACTTATGAACAAATATATCTATACTATTATTTG
C

QA 10 670 10 670
DS 



AS 1 4

CO CL2730Contig1 843 4 20 U
GGGGGTAAGGAAAGAGATGTAAGTGCAAAATGTCATCATACGGTTTTCAGATACAAAAAG
AGCCTATGATCGTCATATCATATGCTAAAACTAGACTGCTAAAAATACTTCAAAAAGCAA
GGATAAAAAACATGAAACAGAGACTTGAAAACTTTGGTCTTGAAACTTCAACCTCATAGC
TCATCATGAGCAGTGGCGTCTTTCTCTGAGGTCTCCTCGCTAACTTCTGATTTGGCTTCG
GTCTTAGCTTCAGTATCAGATTCATCTCCCTCATCGTCCTCTGCTTCATCTTCAGCATCA
GTTTCCGCAGGAGGAGCGTCCTTGGATTCCTCTTCCTCTTTCTTCTTCTCAATCTCATCG
AAAGCTGCTTTCTCCGCATCCTTGAGCTTCCCCCATGTTTCATCTGCCAACTTCTTGGCA
TAGTCTGGGTCATCGCAGATCAAAACATTGTCGAACAACGATCCTGATTTCACCTGCCAC
AATTCGATTCCAACATACTTCAGCTTGGGGAAGACGTAGAGCTCTGGGTCATCCTTAAAG
TCAGGGTTGTCAATCTCTGGAGCCTCCCACTTTCCCTTGTAGTTGGGGTTCTTAATTTGC
TTCGGTTTCCATTCACCCATGTACTCAGGGTTGGGAACGGTCGGGGCAGTCCACTCACCA
TCTTCTTCTTCATCCCAGTCCTCAGGCTGCTTTGCATCGGTATCTGGGATTTCCTTTGGG
ATATCATCGTATCCGTCAGTTTCTTGTCTTCAGGGTCGGAAATGTACTCTTGCTCGTCCC
AATCCTCAGCTTCGTGGCGCTGGGTCCTTGATCTTCTTGGGTGGTAGAGATCCCAATCAG
CGT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 0 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2EJ07JQ U 14
AF RR2BT94JQ U 1
AF RR2E637JQ U 4
AF RR2C633JQ U 35
BS 1 139 RR2BT94JQ
BS 140 140 RR2EJ07JQ
BS 141 343 RR2BT94JQ
BS 344 344 RR2EJ07JQ
BS 345 356 RR2BT94JQ
BS 357 357 RR2EJ07JQ
BS 358 476 RR2BT94JQ
BS 477 477 RR2EJ07JQ
BS 478 593 RR2BT94JQ
BS 594 594 RR2E637JQ
BS 595 602 RR2BT94JQ
BS 603 603 RR2E637JQ
BS 604 647 RR2BT94JQ
BS 648 648 RR2E637JQ
BS 649 688 RR2BT94JQ
BS 689 689 RR2E637JQ
BS 690 704 RR2BT94JQ
BS 705 705 RR2E637JQ
BS 706 739 RR2BT94JQ
BS 740 843 RR2C633JQ

RD RR2EJ07JQ 499 0 0
GAGATGTAAGTGCAAAATGTCATCATACGGTTTTCAGATACAAAAAGAGCCTATGATCGT
CATATCATATGCTAAAACTAGACTGCTAAAAATACTTCAAAAAGCAAGGATAAAAAACAT
GAAACAGAGACTTGAAAACTTTGGTCTTGAAACTTCAACCTCATAGCTCATCATGAGCAG
TGGCGTCTTTCTCTGAGGTCTCCTCGCTAACTTCTGATTTGGCTTCGGTCTTAGCTTCAG
TATCAGATTCATCTCCCTCATCGTCCTCTGCTTCATCTTCAGCATCAGTTTCCGCAGGAG
GAGCGTCCTTGGATTCCTCTTCCTCTTTCTTCTTCTCAATCTCATCGAAAGCTGCTTTCT
CCGCATCCTTGAGCTTCCCCCATGTTTCATCTGCCAACTTCTTGGCATAGTCTGGGTCAT
CGCAGATCAAAACATTGTCGAACAACGATCCTGATTTCACCTACCACAATTCGATTCCAA
CATACTTCAGCTTGGGGAA

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR2BT94JQ 739 0 0
GGGGGTAAGGAAAGAGATGTAAGTGCAAAATGTCATCATACGGTTTTCAGATACAAAAAG
AGCCTATGATCGTCATATCATATGCTAAAACTAGACTGCTAAAAATACTTCAAAAAGCAA
GGATAAAAAACATGAAACAAAGACTTGAAAACTTTGGTCTTGAAACTTCAACCTCATAGC
TCATCATGAGCAGTGGCGTCTTTCTCTGAGGTCTCCTCGCTAACTTCTGATTTGGCTTCG
GTCTTAGCTTCAGTATCAGATTCATCTCCCTCATCGTCCTCTGCTTCATCTTCAGCATCA
GTTTCCGCAGGAGGAGCGTCCTTGGATTCCTCTTCCTCTTTCTACTTCTCAATCTCGTCG
AAAGCTGCTTTCTCCGCATCCTTGAGCTTCCCCCATGTTTCATCTGCCAACTTCTTGGCA
TAGTCTGGGTCATCGCAGATCAAAACATTGTCGAACAACGATCCTGATTTCACCTGGCAC
AATTCGATTCCAACATACTTCAGCTTGGGGAAGACGTAGAGCTCTGGGTCATCCTTAAAG
TCAGGGTTGTCAATCTCTGGAGCCTCCCACTTTCCCTTGTAGTTGGGGTTCTTGATTTGC
TTGGGTTTCCATTCACCCATGTACTCAGGGTTGGGAACGGTCGGGGCCGTCCACTCACCA
TCTTCTTCTTCATCCCAGTCCTCAGGCTTCTTTGCATCGGTATCGGGGATTTCCTTTGGG
ATATCATCGTATCCGTCAG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2E637JQ 727 0 0
GGTAAGGAAAGAGATGTAAGTGCAAAATGTCATCATACGGTTTTCAG*TACAAAACGAGC
CTATGATCGTCATATCATATGCTAAAACTAGACTGCTAAAAATACTTCAAAAAGCAAGGA
TAAAAAACATGAAACAGAGACTTGAAAACTTTGGTCTTGAATCTTCAACCTCATAGCTCA
TCATGAGCAGTGGCGTCTTTCTCTGAGGTCTCCTAGCTAACTTCTGATTTGGCTTCGGTC
TTAGCTTCAGTATCAGATTCATCTCCCTCATCTTCCTCTGCTTCATCTTCAGCATCAGTT
TCCGCAGGAGGAGCGTCCTTGGATTCCTCTTCCTCTTTCTTCTTCTCAATCTCATCGAAA
GCTGCTTTCTCCGCATCCTTGAGCTTCCCCCATGTTTCATCTGCCAACTTCTTGGCATAG
TCTGGGCCATCGCAGATCAAAACATTGTCGAACAACGATCCTGATTTCACCTGCCACAAT
TCGATTCCAACATACTTCAGCTTGGGGAAGACGTAGAGCTCTGGGTCATCCTTAAAGTCA
GGGTTGTCAATCTCTGGAGCCTCCCACTTTCCCTTGTAGTTGGGGTTCTTAATTTGCTTC
GGTTTCCATTCACCCATGTACTCAGGGTTGGGAACGGTCGGGGCAGTCCACTCACCATCT
TCTTCTTCATCCCAGTCCTCAG*CTGCTTTGCATCGGTATCTGGGATTTCCTTTGGGATA
TCATCGT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2C633JQ 809 0 0
ATCATACGGTTTTCGG*TACAAAACGAGCCTATGATCGTCATATCATATGCTAAAACTAG
ACTGCTAAAAATACTTCAAAAAGCAAGGATAAAAAACATGAAACAGAGACTTGAAAACTT
TGGTCTTGAATCTTCAACCTCATAGCTCATCATGAGCAGTGGCGTCTTTCTCTGAGGTCT
CCTCGCTAACTTCTGATTTGGCTTCGGTCTTAGCTTCAGTATCAGATTCATCTCCCTCAT
CTTCCTCTGCTTCATCTTCAGCATCAGTTTCCGCAGGAGGAGCGTCCTTGGATTCCTCTT
CCTCTTTCTTCTTCTCAATCTCATCGAAAGCTGCTTTCTCCGCATCCTTGAGCTTCCCCC
ATGTTTCATCTGCCAACTTCTTGGCATAGTCTGGGTCATCGCAGATCAAAACATTGTCGA
ACAACGATCCTGATTTCACCTGCCACAATTCGATTCCAACATACTTCAGCTTGGGGAAGA
CGTAGAGCTCTGGGTCATCCTTAAAGTCAGGGTTGTCAATCTCTGGAGCCTCCCACTTTC
CCTTGTAGTTGGGGTTCTTAATTTGCTTCGGTTTCCATTCACCCATGTACTCAGGGTTGG
GAACGGTCGGGGCAGTCCACTCACCATCTTCTTCTTCATCCCAGTCCTCAGGCTGCTTTG
CATCGGTATCTGGGATTTCCTTTGGGATATCATCGTATCCGTCAGTTTCTTGTCTTCAGG
GTCGGAAATGTACTCTTGCTCGTCCCAATCCTCAGCTTCGTGGCGCTGGGTCCTTGATCT
TCTTGGGTGGTAGAGATCCCAATCAGCGT

QA 1 809 1 809
DS 



AS 2 4

CO CL2731Contig1 780 2 6 U
GGATGTGGACCTAAATTATTATTGAGCAAAAGATATTTAATTGTTTTTTTCCTGTTCGTC
TTCTTCCTCTGGCGGTGATGGCGTTCGCCGGAATCACGACTTCTTCAAATCCAAATTTTC
TTCAGCTAAGGATCTCTACGAAAAGTTTCCGTCATGTGGCTCCACGTAATTCGATTCCAT
TTCCTCGTTCTTCATACATGACTCTCAATCGGAGGAACCGTCTGTACGTTCGATCCTCCT
CTGCTCCAGTGGCATCTTCAATGGAGGGATTGAAACCGGCGATATCCCTGACGGATAGTG
CGCTTAAGCATCTGAATAAGATGAGAAGAGAGCGCGGGGAAGATTTGTGCTTGAGGATCG
GTGTGAAACAGGGAGGTTGCTCGGGGATGTCTTACACCATGGACTTTGAGAACAGAGCCA
ACGCGAGACCAGACGATTCCACCATCGAGTACCAAGGCTTCGCCATAGTTTGTGATCCAA
AGACATGCTCTTCCTTTTCGGGATGCAGCTTGATTACAGCGATGCTTTGATCGGTGGAGG
CTTCTCTTTCTCCAACCCTAACGCTACACAAACCTGTGGATGTGGCAAGTCTTTCGCTGC
CGAAATGCGAAACAGTTGTATTTGCAGTAAAAACACATGTAGTTAATAGACTTATAGGTA
ATAAAACGTTGTGTATTATGGCCTGTAGAATTTCTCAACTGAATCAGAAAACACTCTAAG
CATTTTTCATTTTTGATGTTCAATACAAAATGCTTATAAATATTCAAGTTCTGGTTACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM37TF U 1
AF RR2BM37JQ C 265
BS 1 632 RR2BM37TF
BS 633 633 RR2BM37JQ
BS 634 657 RR2BM37TF
BS 658 658 RR2BM37JQ
BS 659 726 RR2BM37TF
BS 727 780 RR2BM37JQ

RD RR2BM37TF 734 0 0
GGATGTGGACCTAAATTATTATTGAGCAAAAGATATTTAATTGTTTTTTTCCTGTTCGTC
TTCTTCCTCTGGCGGTGATGGCGTTCGCCGGAATCACGACTTCTTCAAATCCAAATTTTC
TTCAGCTAAGGATCTCTACGAAAAGTTTCCGTCATGTGGCTCCACGTAATTCGATTCCAT
TTCCTCGTTCTTCATACATGACTCTCAATCGGAGGAACCGTCTGTACGTTCGATCCTCCT
CTGCTCCAGTGGCATCTTCAATGGAGGGATTGAAACCGGCGATATCCCTGACGGATAGTG
CGCTTAAGCATCTGAATAAGATGAGAAGAGAGCGCGGGGAAGATTTGTGCTTGAGGATCG
GTGTGAAACAGGGAGGTTGCTCGGGGATGTCTTACACCATGGACTTTGAGAACAGAGCCA
ACGCGAGACCAGACGATTCCACCATCGAGTACCAAGGCTTCGCCATAGTTTGTGATCCAA
AGACATGCTCTTCCTTTTCGGGATGCAGCTTGATTACAGCGATGCTTTGATCGGTGGAGG
CTTCTCTTTCTCCAACCCTAACGCTACACAAACCTGTGGATGTGGCAAGTCTTTCGCTGC
CGAAATGCGAAACAGTTGTATTTGCAGTAAAA*CACATGTAGTTAATAGACTTATAG*TA
ATAAAACGTTGTGTATTATGGCCTGTAGAATTTCTCAACTGAATCAGAAAACACTCTAAG
CATTTT
CATCTCTG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2BM37JQ 516 0 0
AGGGATTGAAACCGGCGATATCCCTGACGGATAGTGCGCTTAAGCATCTGAATAAGATGA
GAAGAGAGCGCGGGGAAGATTTGTGCTTGAGGATCGGTGTGAAACAGGGAGGTTGCTCGG
GGATGTCTTACACCATGGACTTTGAGAACAGAGCCAACGCGAGACCAGACGATTCCCCCA
TCGAGTACCAAGGCTTCGCCATAGTTTGTGATCCAAAGACATGCTTTTCCTTTTCGGGAT
GCAGCTTGATTACAGGGATGCTTTGATCGGTGGAGGCTTTTTTTTTTCCAACCCTAACGC
TACACAAACCTGTGGATGTGGCAAGTCTTTCGCTGCCGAAATGCGAAACAGTTGTATTTG
CAGTAAAAACACATGTAGTTAATAGACTTATAGGTAATAAAACGTTGTGTATTATGGCCT
GTAGAATTTTTCAACTGAATCAGAAAACACTTTAAGCATTTTTCATTTTTGATGTTCAAT
ACAAAATGCTTATAAATATTCAAGTTCTGGTTACAG

QA 1 516 1 516
DS 



CO CL2731Contig2 675 2 2 U
GGCGCTGGAATCACGACTTGTTCGAATCCAACTTTTCTTCAGCTAAGGATATCTACCACA
AGGTTAAGTCATGTGGCTTCACGTAACTCGATTTCATTTCCTCGTTCTTCATACGTGAAT
CTAAATCGGAGAAACCGTCTCTGTGTTCGATCCTCCTCTGCTCCAGCGGCAACTGCAGTG
GAGGGATTGAAACCGGCGATATCCCTGACGGATAGTGCGCTTAAGCATCTGAATAAGATG
AGAACAGAGCGTGGGGAAGATCTGTGCTTGAGGATTGGTGTGAAACAGGGAGGTTGCTCG
GGGATGTCTTACACCATGGACTTTGAGAACAGAGCCAACGCAAGACCAGATGATTCCACC
ATTGAGTACCAAGGCTTCGCTATAGTTTGTGATCCAAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGGG
ATGCAGCTTGATTACAGCGATGCTTTGATCGGTGGAGGCTTCTCTTTCTCCAACCCTAAC
GCTACACAAACCTGTGGATGTGGCAAGTCTTTCGCTGCCGAAATGTGAAACAGTTGTATT
TGCAGTAAAAACACATGTAGTTAATAGACTTATAGGTAATAAAACGTTGTGTATTATGGC
CTGTAGAATTTCTCAACTGAATCAGAAAACACTGTAAGCATTTTTCATCTCTGATGTTCA
ATACAAAATGCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CU64JQ C 1
AF RR2CU64TF U 1
BS 1 6 RR2CU64JQ
BS 7 675 RR2CU64TF

RD RR2CU64JQ 675 0 0
GGCGCTGGAATCACGACTTGTTCGAATCCAACTTTTCTTCAGCTAAGGATATCTACCACA
AGGTTAAGTCATGTGGCTTCACGTAACTCGATTTCATTTCCTCGTTCTTCATACGTGAAT
CTAAATCGGAGAAACCGTCTCTGTGTTCGATCCTCCTCTGCTCCAGCGGCAACTGCAGTG
GAGGGATTGAAACCGGCGATATCCCTGACGGATAGTGCGCTTAAGCATCTGAATAAGATG
AGAACAGAGCGTGGGGAAGATCTGTGCTTGAGGATTGGTGTGAAACAGGGAGGTTGCTCG
GGGATGTCTTACACCATGGACTTTGAGAACAGAGCCAACGCAAGACCAGATGATTCCACC
ATTGAGTACCAAGGCTTCGCTATAGTTTGTGATCCAAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGGG
ATGCAGCTTGATTACAGCGATGCTTTGATCGGTGGAGGCTTCTCTTTCTCCAACCCTAAC
GCTACACAAACCTGTGGATGTGGCAAGTCTTTCGCTGCCGAAATGTGAAACAGTTGTATT
TGCAGTAAAAACACATGTAGTTAATAGACTTATAGGTAATAAAACGTTGTGTATTATGGC
CTGTAGAATTTCTCAACTGAATCAGAAAACACTGTAAGCATTTTTCATCTCTGATGTTCA
ATACAAAATGCTTAT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2CU64TF 675 0 0
GGCGCT
GGAATCACGACTTGTTCGAATCCAACTTTTCTTCAGCTAAGGATATCTACCACAAGGTTA
AGTCATGTGGCTTCACGTAACTCGATTTCATTTCCTCGTTCTTCATACGTGAATCTAAAT
CGGAGAAACCGTCTCTGTGTTCGATCCTCCTCTGCTCCAGCGGCAACTGCAGTGGAGGGA
TTGAAACCGGCGATATCCCTGACGGATAGTGCGCTTAAGCATCTGAATAAGATGAGAACA
GAGCGTGGGGAAGATCTGTGCTTGAGGATTGGTGTGAAACAGGGAGGTTGCTCGGGGATG
TCTTACACCATGGACTTTGAGAACAGAGCCAACGCAAGACCAGATGATTCCACCATTGAG
TACCAAGGCTTCGCTATAGTTTGTGATCCAAAGAGCATGCTCTTCCTTTTCGGGATGCAG
CTTGATTACAGCGATGCTTTGATCGGTGGAGGCTTCTCTTTCTCCAACCCTAACGCTACA
CAAACCTGTGGATGTGGCAAGTCTTTCGCTGCCGAAATGTGAAACAGTTGTATTTGCAGT
AAAAACACATGTAGTTAATAGACTTATAGGTAATAAAACGTTGTGTATTATGGCCTGTAG
AATTTCTCAACTGAATCAGAAAACACTGTAAGCATTTTTCATCTCTGATGTTCAATACAA
AATGCTTAT

QA 7 675 7 675
DS 



AS 1 4

CO CL2732Contig1 808 4 6 U
GGATAGTCGCTTTTCAGAACTCTTTTGCCGGCGATCCCCGTCTCTCTCTCTCTCCGAATA
GGCAATTGAGATGGCAACTCCAATGGTAGAAGACACGTCAAGCTTCGAAGAGGATCAGCT
CGCGTCCATGTCCACCGAAGACATCGTTAGAGCTACTCGTCTCCTCGACAACGAGATTCG
AATTCTCAAGGAAGATGCACAAAGAACAAATCTAGAATGCGATTCTTACAAGGAGAAGAT
AAAGGAGAATCAGGAGAAGATTAAACTCAACAAGCAGCTTCCTTACTTGGTTGGCAACAT
TGTTGAGATATTGGAGATGAATCCTGAAGATGATGCTGAGGAAGACGGTGCTAATATTGA
CCTTGACTCTCAAAGGAAGGGAAAGTGTGTTGTGTTGAAAACATCTACACGACAGACAAT
CTTTCTACCAGTTGTTGGTCTGGTTGACCCCGATAGCTTGAAGCCTGGTGATTTGGTTGG
AGTGAATAAAGACAGTTACCTGATCTTGGACACGTTGCCGTCAGAGTATGACTCTAGGGT
TAAAGCCATGGAGGTCGATGAGAAACCTACCGAAGATTACAATGACATTGGAGGACTGGA
GAAGCAGATACAAGAGCTTGTAGAGGCGATCGTGCTCCCCATGACGCATAAGGAGCGTTT
CGAGAAGCTGGGTGTTCGTCCACCCAAGGGAGTGCTTTTGTATGGTCCTCCAGGGACTGG
TAAAACTTTAATGGCACGTGCCTGTGCAGCACAGACTAATGCCACATTCCTAAATTGGCA
GTCCTCACTGGTCCAGATGTTTTTGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX92TF U 197
AF RR2AN79TF U 4
AF RR2FA61TF U 1
AF RR2FF33TF U 1
BS 1 503 RR2FA61TF
BS 504 504 RR2EX92TF
BS 505 652 RR2FA61TF
BS 653 653 RR2AN79TF
BS 654 770 RR2FA61TF
BS 771 808 RR2FF33TF

RD RR2EX92TF 321 0 0
GCACAAAGAACAAATCTAGAATGCGATTCTTACAAGGAGAAGATAAAGGAGAATCAGGAG
AAGATTAAACTCAACAAGCAGCTTCCTTACTTGGTTGGCAACATTGTTGAGATATTGGAG
ATGAATCCTGAAGATGATGCTGAGGAAGACGGTGCTAATATTGACCTTGACTCTCAAAGG
AAGGGAAAGTGTGTTGTGTTGAAAACATCTACACGACAGACAATCTTTCTACCAGTTGTT
GGTCTGGTTGACCCCGATAGCTTGAAGCCTGGTGATTTGGTTGGAGTGAATAAAGACAGT
TACCTGATCTTGGACACGTTG

QA 1 321 1 321
DS 

RD RR2AN79TF 680 0 0
GGGTGGCTC
TTCAGAACTCTTTTGCCGGCGATC****TCTGTCTCCCTCTCCGAATAGGCAATTGAGAT
GGCAACTCCGATGGTAGAAGACACGTCGAGCTTCGAAGAGGATCAGCTCGCGTCCATGTC
CACCGAAGGCATCGTTAGAGCTACTCGTCTCCTCGACAACGAGATTCGAATTCTCAAGGA
AGATGCACAAAGGACAAATCTAGAGTGTGATTCTTACAAGGAGAAGATTAAAGAGAATCA
GGAGAAGATTAAACTCAACAAGCAGCTTCCTTACTTGGTTGGCAACATTGTTGAGATATT
GGAGATGAATCCGGAAGATGATGCTGAGGAAGACGGTGCTAATATTGACCTTGACTCTCA
AAGGAAGGGAAAGTGTGTTGTGTTGAAAACATCTACACGACAGACAATCTTTTTACCAGT
TGTTGGTCTGGTGGACCCCGATAGCTTGAAGCCTGGTGATTTGGTTGGAGTGAATAAAGA
CAGTTACCTGATTTTGGACACGTTGCCATCAGAGTATGACTCTAGGGTTAAAGCAATGGA
GGTCGATGAGAAACCTACCGAAGATTACAATGACATTGGAGGACTGGAGAAGCAGATACA
AGAGCTTGTAGAGGCGATCGTGCTCCCCATGACGCATAAGGAGCGTTTCGAGAAGCTGGG
TGTTCGTCCAC

QA 10 680 10 680
DS 

RD RR2FA61TF 770 0 0
GGATAGTCGCTTTTCAGAACTCTTTTGCCGGCGATCCCCGTCTCTCTCTCTCTCCGAATA
GGCAATTGAGATGGCAACTCCAATGGTAGAAGACACGTCAAGCTTCGAAGAGGATCAGCT
CGCGTCCATGTCCACCGAAGACATCGTTAGAGCTACTCGTCTCCTCGACAACGAGATTCG
AATTCTCAAGGAAGATGCACAAAGAACAAATCTAGAATGCGATTCTTACAAGGAGAAGAT
AAAGGAGAATCAGGAGAAGATTAAACTCAACAAGCAGCTTCCTTACTTGGTTGGCAACAT
TGTTGAGATATTGGAGATGAATCCTGAAGATGATGCTGAGGAAGACGGTGCTAATATTGA
CCTTGACTCTCAAAGGAAGGGAAAGTGTGTTGTGTTGAAAACATCTACACGACAGACAAT
CTTTCTACCAGTTGTTGGTCTGGTTGACCCCGATAGCTTGAAGCCTGGTGATTTGGTTGG
AGTGAATAAAGACAGTTACCTGACCTTGGACACGTTGCCGTCAGAGTATGACTCTAGGGT
TAAAGCCATGGAGGTCGATGAGAAACCTACCGAAGATTACAATGACATTGGAGGACTGGA
GAAGCAGATACAAGAGCTTGTAGAGGCGATCGTGCTCCCCATGACGCATAAG*AGCGTTT
CGAGAAGCTGGGTGTTCGTCCACCCAAGGGAGTGCTTTTGTATGGTCCTCCAGGGACTGG
TAAAACTTTAATGGCACGTGCCTGTGCAGCACAGACTAATGCCACATTCC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2FF33TF 808 0 0
GGATAGTCGCTT
TTCAGAACTCTTTTGCCGGCGATCCCCGTCTCTCTCTCTCTCCGAATAGGCAATTGAGAT
GGCAACTCCAATGGTAGAAGACGCGTCAAGCTTCGAAGAGGATCAGCTCGCGTCCATGTC
CACCTAAGACATCGTTAGAGCTACTCGTCTCCTCGACAACGAGATTCGAATTCTCAAGGA
AGATGCACAAAGAACAAATCTAGAATGCGATTCTTACAAGGAGAAGATAAAGGAGAATCA
GGAGAAGATTAAACTCAACAAGCAGCTTCCTTACTTGGTTGGCAACATTGTTGGGATATT
GGAGATGAATCCTGAAGATGATGCTGAGGAAGACGGTGCTAATATTGACCTTGACTCTCA
AAGGAAGGGAAAGTGTGTTGTGTTGAAAACATCTACACGACAGACAATCTTTCTACCAGT
TGTTGGTCTGGTTGACCCCGATAGCTTGAAGCCTGGTGATTTGGTTGGAGTGAATAAAGA
CAGTTACCTGATCTTGGACACGTTGCCGTCAGAGTATGACTCTAGGGTTAAAGCCATGGA
GGTCGATGAGAAACCTACCGAAGATTACAATGACATTGGAGGACTGGAGAAGCAGATACA
AGAGCTTGTAGAGGCGATCGTGCTCCCCATGACGCATAAAGAGCGTTTCGAGAAGCTGGG
TGTTCGTCCACCCAAGGGAGTGCTTTTGTATGGTCCTCCAGGGACTGGTAAA*CTTTAAT
GGCACGTGCCTGTGCAGCACAGACTAATGCCACATTCCTAAATTGGCAGTCCTCACTGGT
CCAGATGTTTTTGGAG

QA 13 808 13 808
DS 



AS 1 4

CO CL2733Contig1 856 4 10 U
CATCATAGCATTCAAGGTTTCTTTTTAAAAAGAAAACATTGTACTTAATACATATCAAGT
CAAAACTTCAAAATGACGGTCAAATAGAAGACTACATCGCTTATTCTTGATTTAGGGATA
TGATAAGATAAGCCCCAAAACCATGGTTTGTTGTCTTTATTTGTTTTGACATCTTTCCCC
CCCACCTCTTCATAGCGTGTTTCTAGAGTGCTGCAATACATTCGATCTCGATCTTGGCGT
TCAGAGGCAAAGCCGCGACTTGATATGTTGATCGTGCTGGAGAAGGAGCTGGGAAGTATT
TGGCGTATATCTCGTTCACTTTCTTGAAGTCACCCAAGTCAGCAAGCATGATTGTTGTCT
TCACCACGGAGGAGTAATCAGTACCACTAGCTTTCAGTATCTCCCCCATGTTCTTGAGCA
CCTGTTCTGTCTGATCCTCAACGCTGTCTGAAGCAAACTTTCCGGTCTCAGGTATAAGTC
CAAGAACACCAGAGAGGAAAACAAGATTATTGGCTTTGATAGCCTGAGAGTATGGTCCCA
AAGCAGCTGGTGCTTTCTCTGTAGCCACTACTTCCTTCTTACCAGAAGCAGCGGCCGAGA
TAGTGAGTGAAGCGAAAGGAATAGATTTAGAAGACATTGACACTGACACACCAGCGTTGG
CAACCAAAGGGCAACGAGAGAAGAATCCAAGTGGTGCGGAGAAGTGGAGCTTTGGAGAGG
TTATGGACTTGAAGAGTGACGAAGTCATTTCACTATTTTACGGCGCAGGTTTACACAAAA
GCAAAAAGAAGACCAAACAGTCTTTTGAGAGAGAGAGAAAGGTAGGTAAGCAGATGATTC
TCGTGTCTGTCCCCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK33JQ U 1
AF RR2BB18JQ U 7
AF RR2BB18TF C 4
AF RR2AI45TF C 146
BS 1 182 RR2DK33JQ
BS 183 183 RR2BB18TF
BS 184 238 RR2DK33JQ
BS 239 239 RR2BB18JQ
BS 240 283 RR2DK33JQ
BS 284 284 RR2BB18JQ
BS 285 422 RR2DK33JQ
BS 423 619 RR2BB18JQ
BS 620 848 RR2BB18TF
BS 849 856 RR2AI45TF

RD RR2DK33JQ 422 0 0
CATCATAGCATTCAAGGTTTCTTTTTAAAAAGAAAACATTGTACTTAATACATATCAAGT
CAAAACTTCAAAATGACGGTCAAATAGAAGACTACATCGCTTATTCTTGATTTAGGGATA
TGATAAGATAAGCCCCAAAACCATGGTTTGTTGTCTTTATTTGTTTTGACATCTTTCCCC
CC*ACCTCTTCATAGCGTGTTTCTAGAGTGCTGCAATACATTCGATCTCGATCTTGGCAT
TCAGAGGCAAAGCCGCGACTTGATATGTTGATCGTGCTGGAGAGGGAGCTGGGAAGTATT
TGGCGTATATCTCGTTCACTTTCTTGAAGTCACCCAAGTCAGCAAGCATGATTGTTGTCT
TCACCACGGAGGAGTAATCAGTACCACTAGCTTTCAGTATCTCCCCCATGTTCTTGAGCA
CC

QA 1 422 1 422
DS 

RD RR2BB18JQ 616 0 0
G
GCATTCAAGGTTTCTTTTTAAAAAGAAAACATTGTACTTAATACATATCAAGTCAAAACT
TCAAAATGACGGTCAAATAGAAGACTACATCGCTTATTCTTGATTTAGGGATATGATAAG
ATAAGCCCCAAAACCATGGTTTGTTGTCTTTATTTGTTTTGACATCTTTCCCCCC*ACCT
CTTCATAGCGTGTTTCTAGAGTGCTGCAATACATTCGATCTCGATCTTGGCGTTCAGAGG
CAAAGCCGCGACTTGATATGTTGATCGTGCTGGAGAAGGAGCTGGGAAGTATTTGGCGTA
TATCTCGTTCACTTTCTTGAAGTCACCCAAGTCAGCAAGCATGATTGTTGTCTTCACCAC
GGAGGAGTAATCAGTACCACTAGCTTTCAGTATCTCCCCCATGTTCTTGAGCACCTGTTC
TGTCTGATCCTCAACGCTGTCTGAAGCAAACTTTCCGGTCTCAGGTATAAGTCCAAGAAC
ACCAGAGAGGAAAACAAGATTATTGGCTTTGATAGCCTGAGAGTATGGTCCCAAAGCAGC
TGGTGCTTTCTCTGTAGCCACTACTTCCTTCTTACCAGAAGCAGCGGCCGAGATAGTGAG
TGAAGCGAAAGG
GAT

QA 2 613 2 613
DS 

RD RR2BB18TF 847 0 0
TTTG
GCATTCAAGGTTTCTTTT**AAAAGAAA*CATTGTACTTA*TACATATCAAGTCAAA*CT
TCAAAATGACGGTCAAATAGAAGACTACATCGCTTATTCTTGATTTAGGGATATGATAAG
ATAAGCCCCAAAACCATGGTTTGTTGTCTTTATTTGTTTTGACATCTTTCCCCCCCACCT
CTTCATAGCGTGTTTCTAGAGTGCTGCAATACATTCGATCTCGATCTTGGCGTTCAGAGG
CAAAGCCGCGACTTGATATGTTGATCGTGCTGGAGAAGGAGCTGGGAAGTATTTGGCGTA
TATCTCGTTCACTTTCTTGAAGTCACCCAAGTCAGCAAGCATGATTGTTGTCTTCACCAC
GGAGGAGTAATCAGTACCACTAGCTTTCAGTATCTCCCCCATGTTCTTGAGCACCTGTTC
TGTCTGATCCTCAACGCTGTCTGAAGCAAACTTTCCGGTCTCAGGTATAAGTCCAAGAAC
ACCAGAGAGGAAAACAAGATTATTGGCTTTGATAGCCTGAGAGTATGGTCCCAAAGCAGC
TGGTGCTTTCTCTGTAGCCACTACTTCCTTCTTACCAGAAGCAGCGGCCGAGATAGTGAG
TGAAGCGAAAGGAATAGATTTAGAAGACATTGACACTGACACACCAGCGTTGGCAACCAA
AGGGCAACGAGAGAAGAATCCAAGTGGTGCGGAGAAGTGGAGCTTTGGAGAGGTTATGGA
CTTGAAGAGTGACGAAGTCATTTCACTATTTTACGGCGCAGGTTTACACAAAAGCAAAAA
GAAGACCAAACAGTCTTTTGAGAGAGAGAGAAAGGTAGGTAAGCAGATGATTCTCGTGTC
T
CC

QA 5 845 5 845
DS 

RD RR2AI45TF 711 0 0
GTTTGTTGTCTTTATTTGTTTTGACATCTTTCCCCCCCACCTCTTCATAGCGTGTTTCTA
GAGTGCTGCAATACGTTCGATCTCGATCTTGGCGTTCAGAGGCAAAGCCGCGACTTGATA
TGTTGATCGTGCTGGAGAAGGAGCTGGGTAGTATTTGGCGTATATCTCGTTCACTTTCTT
GAAGTCACCCAAGTCAGCAAGCATGATTGTTGTCTTCACCACGGAGGAGTAATCAGTACC
ACTAGCTTTCAGTATCTCCCCCATGTTCTTGAGCACCTGTTCTGTCTGATCCTCAACGCT
GTCTGAAGCAAACTTTCCGGTCTCAGGTATAAGTCCAAGAACACCAGAGAGGAAAACAAG
ATTATTGGCTTTGATAGCCTGAGAGTATGGTCCCAAAGCAGCTGGTGCTTTCTCTGTAGC
CACTACTTCCTTCTTACCAGAAGCAGCGGCCGAGATAGTGAGTGAAGCGAAAGGAATAGA
TTTAGAAGACATTGACACTGACACACCAGCGTTGGCAACCAAAGGGCAACGAGAGAAGAA
TCCAAGTGGTGCGGAGAAGTGGAGCTTTGGAGAGGTTATGGACTTGAAGAGTGACGAAGT
CATTTCACTATTTTACGGCGCAGGTTTACACAAAAGCAAAAAGAAGACCAAACAGTCTTT
TGAGAGAGAGAGAAAGGTAGGTAAGCAGATGATTCTCGTGTCTGTCCCCCA

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 4

CO CL2734Contig1 766 4 3 U
GGGATTCTTCTCTTCTGTTCAACAATTTGAGCACAAGTTAAAAGATAATGGCACTCGCCA
CAAACTCGGAGTCAGAGGAGCATTTGCATTCCACTTTCGCTTCCAGATATGTCCGTGCTG
TTATTCCCAGGTTCAAGATGCCTGAAAATTCCATGCCCAAAGACGCTGCTTACCAAGTAA
TCAATGATGAGCTGATGCTTGATGGCAACCCTAGGCTTAACCTAGCTTCCTTTGTAACCA
CTTGGATGGAACCTGAGTGTGACAAACTCATGATGGAAGCTGTGAACAAGAACTATGTTG
ACATGGATGAATATCCTGTCACCACCGAGCTCCAGAACCGGTGCGTAAATATGATAGCCA
ACTTGTTCCATGCACCCGTTGGAGAAGACGAGGCTGCTATTGGATGCGGAACTGTTGGTT
CATCAGAGGCTATAATGCTTGCCGGTTTAGCTTTCAAAAGAAAATGGCAACAGAGGAGAA
GAGCTCAGGGTCTCCCTACTGATAATCCTAACATTGTAACTGGTGCCAATGTTCAGGTGT
GCTGGGAGAAATTTGCAAGGTACTTTGAGGTAGAGCTCAAAGAGGTGAAACTAAGTGAAG
GCTATTACGTCCTGGACCCAACTAAAGCGGTAGAGATGGTGGATGAGAATACAATCTGCG
TTGCAGCTATTCTAGGATCCACTCTTACAGGAGAATTTGAGGACGTGAAGACACTAAACG
ATCTTTTAGCAGAGAAAACGCAGAGACTGGTTGGGATGTTGCTATT


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX23TF U 2
AF RR2CV75TF U 3
AF RR2GW74TF U 2
AF RR2EJ43TF U 1
BS 1 425 RR2EJ43TF
BS 426 426 RR2FX23TF
BS 427 766 RR2EJ43TF

RD RR2FX23TF 693 0 0
G
GATTCTTCTCTTCTGTTCAACAATTTGAGCACAAGTTAAAAGATAATGGCACTCGCCACA
AACTCGGAGCCAGAGGAGCATTTGCATTCCACTTTCGTTTCCAGATATGTCCGTGCTGTT
ATTCCCAGGTTCAAGATGCCTGAAAATTCCATGCCCAAAGACGCTGCTTACCAAGTAATC
AATGATGAGCTGATGCTTGATGGCAACCCTAGGCTTAACCTAGCTTCCTTTGTAACCACT
TGGATGGAACCTGAGTGTGACAAACTCATGATGGAAGCTGTGAACAAGAACTATGTTGAC
ATGGATGAATATCCTGTCACCACCGAGCTCCAGAACCGGTGCGTAAATATGATAGCCAAC
TTGTTCCATGCACCCGTTGGAGAAGACGAGGCTGCTATTGGATGCGGAACTGTTGGTTCA
TCAGAGGCTATAATGCTCGCCGGTTTAGCTTTCAAAAGAAAATGGCAACAGAGGAGAAGA
GCTCAGGGTCTCCCTACTGATAATCCTAACATTGTAACTGGTGCCAATGTTCAGGTGTGC
TGGGAGAAATTTGCAAGGTACTTTGAGGTAGAGCTCAAAGAGGTGAAACTAAGTGAAAGC
TATTACGTCCTGGACCCAACTAAAGCGGTAGAGATGGTGGATGAGAATACAATCTGCGTT
GCAGCTATTCTAGGATCCACTCTTACAG
AGAA

QA 2 689 2 689
DS 

RD RR2CV75TF 684 0 0
GATTCTTCTCTTCTGTTCAACAATTTGAGCACAAGTTAAAAGATAATGGCACTCGCCACA
AACTCGGAGTCAGAGGAGCATTTGCATTCCACTTTCGCTTCCAGATATGTCCGTGCTGTT
ATTCCCAGGTTCAAGATGCCTGAAAATTCCATGCCCAAAGACGCTGCTTACCAAGTAATC
AATGATGAGCTGATGCTTGATGGCAACCCTAGGCTTAACCTAGCTTCCTTTGTAACCACT
TGGATGGAACCTGAGTGTGACAAACTCATGATGGAAGCTGTGAACAAGAACTATGTTGAC
ATGGATGAATATCCTGTCACCACCGAGCTCCAGAACCGGTGCGTAAATATGATAGCCAAC
TTGTTCCATGCACCCGTTGGAGAAGACGAGGCTGCTATTGGATGCGGAACTGTTGGTTCA
TCAGAGGCTATAATGCTTGCCGGTTTAGCTTTCAAAAGAAAATGGCAACAGAGGAGAAGA
GCTCAGGGTCTCCCTACTGATAATCCTAACATTGTAACTGGTGCCAATGTTCAGGTGTGC
TGGGAGAAATTTGCAAGGTACTTTGAGGTAGAGCTCAAAGAGGTGAAACTAAGTGAAGGC
TATTACGTCCTGGACCCAACTAAAGCGGTAGAGATGGTGGATGAGAATACAATCTGCGTT
GCAGCTATTCTAG*ATCCACTCTT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2GW74TF 685 0 0
G
GATTCTTCTCTTCTGTTCAACAATTTGAGCACAAGTTAAAAGATAATGGCACTCGCCACA
AACTCGGAGTCAGAGGAGCATTTGCATTCCACTTTCGCTTCCAGATATGTCCGTGCTGTT
ATTCCCAGGTTCAAGATGCCTGAAAATTCCATGCCCAAAGACGCTGCTTACCAAGTAATC
AATGATGAGCTGATGCTTGATGGCAACCCTAGGCTTAACCTAGCTTCCTTTGTAACCACT
TGGATGGAACCTGAGTGTGACAAACTCATGATGGAAGCTGTGAACAAGAACTATGTTGAC
ATGGATGAATATCCTGTCACCACCGAGCTCCAGAACCGGTGCGTAAATATGATAGCCAAC
TTGTTCCATGCACCCGTTGGAGAAGACGAGGCTGCTATTGGATGCGGAACTGTTGGTTCA
TCAGAGGCTATAATGCTTGCCGGTTTAGCTTTCAAAAGAAAATGGCAACAGAGGAGAAGA
GCTCAGGGTCTCCCTACTGATAATCCTAACATCGTAACTGGTGCCAATGTTCAGGTGTGC
TGGGAGAAATTTGCAAGGTACTTTGAGGTAGAGCTCAAAGAGGTGAAACTAAGTGAAGGC
TATTACGTCCTGGACCCAACTAAAGCGGTAGAGATGGTGGATGAGAATACAATCTGCGTT
GCAGCTATTCTAGGATCCACTCTT

QA 2 685 2 685
DS 

RD RR2EJ43TF 766 0 0
GGGATTCTTCTCTTCTGTTCAACAATTTGAGCACAAGTTAAAAGATAATGGCACTCGCCA
CAAACTCGGAGTCAGAGGAGCATTTGCATTCCACTTTCGCTTCCAGATATGTCCGTGCTG
TTATTCCCAGGTTCAAGATGCCTGAAAATTCCATGCCCAAAGACGCTGCTTACCAAGTAA
TCAATGATGAGCTGATGCTTGATGGCAACCCTAGGCTTAACCTAGCTTCCTTTGTAACCA
CTTGGATGGAACCTGAGTGTGACAAACTCATGATGGAAGCTGTGAACAAGAACTATGTTG
ACATGGATGAATATCCTGTCACCACCGAGCTCCAGAACCGGTGCGTAAATATGATAGCCA
ACTTGTTCCATGCACCCGTTGGAGAAGACGAGGCTGCTATTGGATGCGGAACTGTTGGTT
CATCACAGGCTATAATGCTTGCCGGTTTAGCTTTCAAAAGAAAATGGCAACAGAGGAGAA
GAGCTCAGGGTCTCCCTACTGATAATCCTAACATTGTAACTGGTGCCAATGTTCAGGTGT
GCTGGGAGAAATTTGCAAGGTACTTTGAGGTAGAGCTCAAAGAGGTGAAACTAAGTGAAG
GCTATTACGTCCTGGACCCAACTAAAGCGGTAGAGATGGTGGATGAGAATACAATCTGCG
TTGCAGCTATTCTAGGATCCACTCTTACAGGAGAATTTGAGGACGTGAAGACACTAAACG
ATCTTTTAGCAGAGAAAACGCAGAGACTGGTTGGGATGTTGCTATT

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 4

CO CL2735Contig1 787 4 2 U
GGATTCCACTCTTCTTTCTCTTTCTATTTTCTTTTTTCTCTGTTTGCTTGTCGTTTCCGT
TCAACTTTGATATCTCCGACCGACGTTCAGTGGGCTTTCTCAGCCACGACGTCGGTCGGA
ATCTCTCCTTTCTTGTTTTGTAATCGGTTTCACTTTGATCTGTCCAGTCGGATTTTGATT
ATGCTCAGGTTTTAGAAAGTTCAGTTCTAGATCTCGAGCTTGAGTTGTTTCGACGGGTCT
GTGACTTGGTGTTACGGTGATAGTCTTCACCATGGCAATTCTCTGAGTTGCCTTTACCTT
TGGTTCAGATCTGATCGTTTGCAACTTGGTGTTTTCCTTTTATTCACACTGTTGAAGTTG
TTGTCGAGAGTGGAAGGTTCGATCTTCTTGCATGCATGGTTCTACGGCTCGGTTCAAAGG
ATATGGAGCTTCAGTTCATTCTCATCAGGTCGTCGGAGGCGTCAGTTTAACCGATCTCTT
ATCTGCGTCTTCCGGGAGCGTGTCCAGTGTTCTTACTCTGTCTCCATAAGTGGGTTGAAG
GTGTGTCGTTTGGAGCTTTTAATAAAAAGGGTCGCTGGGACTCCCAAATAAAATCGATCG
TTGGTGGCTAGTTCTTTCCTTTCCTTACTTTTCGATCTTCTTCATCAGTGGCGGACGCAA
GTGGAGACCTATGGGGTCACGTGCCCCCATCTATTTTTTATTTTTCCTTCACTAATTACA
GTTATTTATGTAGTGTTTTCTATTTTTACAACTAGATATAATGGAAAATTTTGATGTGCC
CCCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2EU25TF U 1
AF RR2BD58TF U 190
AF RR2BD58JQ C 38
AF RR2EU25JQ C 122
BS 1 774 RR2EU25TF
BS 775 787 RR2BD58JQ

RD RR2EU25TF 774 0 0
GGATTCCACTCTTCTTTCTCTTTCTATTTTCTTTTTTCTCTGTTTGCTTGTCGTTTCCGT
TCAACTTTGATATCTCCGACCGACGTTCAGTGGGCTTTCTCAGCCACGACGTCGGTCGGA
ATCTCTCCTTTCTTGTTTTGTAATCGGTTTCACTTTGATCTGTCCAGTCGGATTTTGATT
ATGCTCAGGTTTTAGAAAGTTCAGTTCTAGATCTCGAGCTTGAGTTGTTTCGACGGGTCT
GTGACTTGGTGTTACGGTGATAGTCTTCACCATGGCAATTCTCTGAGTTGCCTTTACCTT
TGGTTCAGATCTGATCGTTTGCAACTTGGTGTTTTCCTTTTATTCACACTGTTGAAGTTG
TTGTCGAGAGTGGAAGGTTCGATCTTCTTGCATGCATGGTTCTACGGCTCGGTTCAAAGG
ATATGGAGCTTCAGTTCATTCTCATCAGGTCGTCGGAGGCGTCAGTTTAACCGATCTCTT
ATCTGCGTCTTCCGGGAGCGTGTCCAGTGTTCTTACTCTGTCTCCATAAGTGGGTTGAAG
GTGTGTCGTTTGGAGCTTTTAATAAAAAGGGTCGCTGGGACTCCCAAATAAAATCGATCG
TTGGTGGCTAGTTCTTTCCTTTCCTTACTTTTCGATCTTCTTCATCAGTGGCGGACGCAA
GTGGAGACCTATGGGGTCACGTGCCCCCATCTATTTTTTATTTTTCCTTCACTAATTACA
GTTATTTATGTAGTGTTTTCTATTTTTACAACTAGATATAATGGAAAATTTTGA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2BD58TF 537 0 0
TTTTAGAAAGTTCAGTTCTAGATCTCCAGCTTGAGTTGTTTCGACGGGTCTGTGACTTGG
TGTTACGGTGATAGTCTTCACCATGGCAATTCTCTGAGTTGCCTTTACCTTTGGTTCAGA
TCTGATCGTTTGCAACTTGGTGTTTTCCTTTTATTCACACTGTTGAAGTTGTTGTCGAGA
GTGGAAGGTTCGATCTTCTTGCATGCATGGTTCTACGGCTCGGTTCAAAGGATATGGAGC
TTCAGTTCATTCTCATCAAGTCGTCGGAGGCGTCAGTTTAACCGATCTCTTATCTGCGTC
TTCCGGGAGCGTGTCCAGTGTTCTTACTCTGTCTCCATAAGTGGGTTGAAGGTGTGTCGT
TTGGAGCTTTTAATAAAAAGGGTCGCTGGGACTCCCAAATAAAATCGATCGTTGGTGGCT
AGTTCTTTCCTTTCCTTACTTTTCGATCTTCTTCATCAGTGGCGGACGCAAGTGGAGACC
TATGGGGTCACGTGCCCCCATCTATTTTTTATTTTTCCTTCACTAATTACAGTTATT

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2BD58JQ 750 0 0
CTCTGTTTGCTTGTCGTTTCCGTTCAACTTTGATATCTCCGACCGACGTTCAGTGGGCTT
TCTCAGCCACGACGTCGGTCGGAATCTCTCCTTTCTTGTTTTGTAATCGGTTTCACTTTG
ATCTGTCCAGTCGGATTTTGATTATGCTCAGGTTTTAGAAAGTTCAGTTCTAGATCTCGA
GCTTGAGTTGTTTCGACGGGTCTGTGACTTGGTGTTACGGTGATAGTCTTCACCATGGCA
ATTCTCTGAGTTGCCTTTACCTTTGGTTCAGATCTGATCGTTTGCAACTTGGTGTTTTCC
TTTTATTCACACTGTTGAAGTTGTTGTCGAGAGTGGAAGGTTCGATCTTCTTGCATGCAT
GGTTCTACGGCTCGGTTCAAAGGATATGGAGCTTCAGTTCATTCTCATCAGGTCGTCGGA
GGCGTCAGTTTAACCGATCTCTTATCTGCGTCTTCCGGGAGCGTGTCCAGTGTTCTTACT
CTGTCTCCATAAGTGGGTTGAAGGTGTGTCGTTTGGAGCTTTTAATAAAAAGGGTCGCTG
GGACTCCCAAATAAAATCGATCGTTGGTGGCTAGTTCTTTCCTTTCCTTACTTTTCGATC
TTCTTCATCAGTGGCGGACGCAAGTGGAGACCTATGGGGTCACGTGCCCCCATCTATTTT
TTATTTTTCCTTCACTAATTACAGTTATTTATGTAGTGTTTTCTATTTTTACAACTAGAT
ATAATGGAAAATTTTGATGTGCCCCCGTCC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2EU25JQ 665 0 0
TCTCTCCTTTCTTGTTTTGTAATCGGTTTCACTTTGATCTGTCCAGTCGGATTTTGATTA
TGCTCAGGTTTTAGAAAGTTCAGTTCTAGATCTCGAGCTTGAGTTGTTTCGACGGGTCTG
TGACTTGGTGTTACGGTGATAGTCTTCACCATGGCAATTCTCTGAGTTGCCTTTACCTTT
GGTTCAGATCTGATCGTTTGCAACTTGGTGTTTTCCTTTTATTCACACTGTTGAAGTTGT
TGTCGAGAGTGGAAGGTTCGATCTTCTTGCATGCATGGTTCTACGGCTCGGTTCAAAGGA
TATGGAGCTTCAGTTCATTCTCATCAGGTCGTCGGAGGCGTCAGTTTAACCGATCTCTTA
TCTGCGTCTTCCGGGAGCGTGTCCAGTGTTCTTACTCTGTCTCCATAAGTGGGTTGAAGG
TGTGTCGTTTGGAGCTTTTAATAAAAAGGGTCGCTGGGACTCCCAAATAAAATCGATCGT
TGGTGGCTAGTTCTTTCCTTTCCTTACTTTTCGATCTTCTTCATCAGTGGCGGACGCAAG
TGGAGACCTATGGGGTCACGTGCCCCCATCTATTTTTTATTTTTCCTTCACTAATTACAG
TTATTTATGTAGTGTTTTCTATTTTTACAACTAGATATAATGGAAAATTTTGATGTGCCC
CCGTC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 4

CO CL2736Contig1 972 4 10 U
GGATAATTTCAGTAACTAACGCGTATTCTCTCTCTAGATAAGTCTCTCCGCCTTCTCTCT
AGACCACCGCTTAAATCCTTGTCTCCGGCCGGCGGGTTGGCTTCTTTTGCCACCGCCGGT
CCGGCCAATGCGTCGCTCTTGTACTTTTCTCTTTTCTGTCTAGTTGCATATCCTTGGTTT
GACTTGTTAATATTTAGAGAGCTTTTCTAGATCTAGAATTTCAGATCTGGTTGATCAGTT
GAGGTTTCCGACGGTGGCTTGGCTGTGTGGCGTGGTTCCTCAGTTCCATCTCTGCTTCAA
CTTCTAGGGTTCTGATGGCGGGTCTCTGGAGTTTCAGCTCCTTCCTGCCTGTGGGCCTCA
ATCTCAGTTCTGCAGGTGCTTTTCTCAGGTTGTCTCTGGCTTTGTTCCCGTTGAGGTTTG
GTGGTTTTGCTCTTCCTTGTTCTTGGTAGCGACGGAATAGATTCTTTGGTGATTGGTTCT
TATCGTGGCTCGAGTTGGTTTCTCCGGCTTGATTTCAAGGAAGAGGGGTTTCGACCCTTA
TCATTGTGCCGTGGGTGGTTGAAGCTTTAATGGTGTGTCTCTTCTCCCCCCCGGGATCGA
TTCTCAGCTGCCTGTCTCATGGCTTCTGGTTTGTTTCCGAAGCAATTAGAGTGAGTTGCA
GTCTGGGTTCTTCCCCAAATAAAGTTCGGCTTTCAATGTTTCTCTAATCATTCCTCCTTC
TTCAACGGTTCATTTGTTAGGATGTTTATGGGTTGATCTTGTCTTGGTTCTCTATCTTGT
TCAAGTTAACTGTGTTATGTAATGTTTTTTGGGTTCAGAGGATCGGTTGATTCTGCTGAC
TTATGTTTCTAGAAGATGCAGTTTGATCTTGCTAGCTTTAGGCTCTGAGAGTATTTGTTA
CTCGTCAGCTTAGTATCTCAAAAATGTATTCCTCTAATGTATCCTTCCAAGTTCAATGAA
AGTTCTAGTGTG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2DI67TF U 3
AF RR2F271TF U 1
AF RR2DI67JQ C 283
AF RR2F271JQ C 283
BS 1 100 RR2F271TF
BS 101 101 RR2DI67TF
BS 102 553 RR2F271TF
BS 554 554 RR2DI67JQ
BS 555 635 RR2F271TF
BS 636 859 RR2DI67JQ
BS 860 860 RR2F271JQ
BS 861 899 RR2DI67JQ
BS 900 900 RR2F271JQ
BS 901 972 RR2DI67JQ

RD RR2DI67TF 221 0 0
ATAATTTCAGTAACTAACGCGTATTCTCTCTCTAGATAAGTCTCTCCGCCTTCTCTCTAG
ACCACCGCTTAAATCCTTGTCTCCGGCCGGCGGGTTGGCTTCTTTTGCCACCGCCGGTCC
GGCCAATGCGTCGCTCTTGTACTTTTCTCTTTTCTGTCTAGTTGCATATCCTTGGTTTGA
CTTGTTAATATTTAGAGAGCTTTTCTAG*TCTAGAATTTCA

QA 1 221 1 221
DS 

RD RR2F271TF 635 0 0
GGATAATTTCAGTAACTAACGCGTATTCTCTCTCTAGATAAGTCTCTCCGCCTTCTCTCT
AGACCACCGCTTAAATCCTTGTCTCCGGCCGGCGGGTTGGTTTCTTTTGCCACCGCCGGT
CCGGCCAATGCGTCGCTCTTGTACTTTTCTCTTTTCTGTCTAGTTGCATATCCTTGGTTT
GACTTGTTAATATTTAGAGAGCTTTTCTAGATCTAGAATTTCAGATCTGGTTGATCAGTT
GAGGTTTCCGACGGTGGCTTGGCTGTGTGGCGTGGTTCCTCAGTTCCATCTCTGCTTCAA
CTTCTAGGGTTCTGATGGCGGGTCTCTGGAGTTTCAGCTCCTTCCTGCCTGTGGGCCTCA
ATCTCAGTTCTGCAGGTGCTTTTCTCAGGTTGTCTCTGGCTTTGTTCCCGTTGAGGTTTG
GTGGTTTTGCTCTTCCTTGTTCTTGGTAGCGACGGAATAGATTCTTTGGTGATTGGTTCT
TATCGTGGCTCGAGTTGGTTTCTCCGGCTTGATTTCAAGGAAGAGGGGTTTCGACCCTTA
TCATTGTGCCGTGAGTGGTTGAAGCTTTAATGGTGTGTCTCTTCTCCCCCCCGGGATCGA
TTCTCAGCTGCCTGTCTCATGGCTTCTGGTTTGTT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2DI67JQ 690 0 0
GTTCCATCTCTGCTTCAACTTCTAGGGTTCTGATGGCGGGTCTCTGGAGTTTCAGCTCCT
TCCTGCCTGTGGGCCTCAATCTCAGTTCTGCAGGTGCTTTTCTCAGGTTGTCTCTGGCTT
TGTTCCCGTTGAGGTTTGGTGGTTTTGCTCTTCCTTGTTCTTGGTAGCGACGGAATAGAT
TCTTTGGTGATTGGTTCTTATCGTGGCTCGAGTTGGTTTCTCCGGCTTGATTTCAAGGAA
GAGGGGTTTCGACCCTTATCATTGTGCCGTGGGTGGTTGAAGCTTTAATGGTGTGTCTCT
TCTCCCCCCCGGGATCGATTCTCAACTGCCTGTCTCATGGCTTCTGGTTTGTTTCCGAAG
CAATTAGAGTGAGTTGCAGTCTGGGTTCTTCCCCAAATAAAGTTCGGCTTTCAATGTTTC
TCTAATCATTCCTCCTTCTTCAACGGTTCATTTGTTAGGATGTTTATGGGTTGATCTTGT
CTTGGTTCTCTATCTTGTTCAAGTTAACTGTGTTATGTAATGTTTTTTGGGTTCAGAGGA
TCGGTTGATTCTGCTGACTTATGTTTCTAGAAGATGCTGTTTGATCTTGCTAGCTTTAGG
CTCTGAGAGTATTTGTTGCTCGTCAGCTTAGTATCTCAAAAATGTATTCCTCTAATGTAT
CCTTCCAAGTTCAATGAAAGTTCTAGTGTG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2F271JQ 689 0 0
GTTCCATCTCTGCTTCAACTTCTAGGGTTCTGATGGCGGGTCTCTGGAGTTTCAGCTCCT
TCCTGCCTGTGGGCCTCAATCTCAGTTCTGCAGGTGCTTTTCTCAGGTTGTCTCTGGCTT
TGTTCCCGTTGAGGTTTGGTGGTTTTGCTCTTCCTTGTTCTTGGTAGCGACGGAATAGAT
TCTTTGGTGATTGGTTCTTATCGTGGCTCGAGTTGGTTTCTCCGGCTTGATTTCAAGGAA
GAGGGGTTTCGACCCTTATCATTGTGCCGTGGGTGGTTGAAGCTTTAATGGTGTGTCTCT
TCTCCCCCCCGGGATCGATTCTCAGCTGCCTGTCTCATGGCTTCTGGTTTGTTTCCGAAG
CAATTAGAGTGAGTTGCAGTCTGGGTTCTTCCCCAAATAAAGTTCGGCTTTCAATGTTTC
TCTAATCATTCCTCCTTCTTCAACGGTTCATTTGTTAGGATGTTTATGGGTTGATCTTGT
CTTGGTTCTCTATCTTGTTCAAGTTAACTGTGTTATGTAATGTTTTTTGGGTTCAGAGGA
TCGGTTGATTCTGCTGACTTATGTTTCTAGAAGATGCAGTTTGATCTTGCTAGCTTTAGG
CTCTGAGAGTATTTGTTACTCGTCAGCTTAGTATCTCAAAAATGTATTCCTCTAATGTAT
CCTTCCAAGTTCAATGAAAGTTCTAGTGT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 4

CO CL2737Contig1 951 4 13 U
ATTAATTATCATTTTCTATTTTCTCGGAAATATCTATTTTGTCACAAAGCATGCAAGTTT
ATTAATAATAAACGAAGGAAACAATTAAAATTCTACAACTTTCCACATTCAGTGGGAACA
AACGACACCTTATCCTTCTCAAGGTCATGAACTACGTTAAAATTCTGCTGCTGAAAATTT
CCAAAAACAGACATCCCATTAGATTTCCCCATAGCCAAACACAAAACACCAGCACTCGGA
TCCTCCACCATGTAATTATCACCGGGAAGCTCCAAATCCGCACCCTTAAAATGAAAAACC
AGCTTAGGAACAGCGACATTCTTAGCCTCATTAGATAACGTATAGCACAAGTCAAGTCCT
GTGGATCCTGATTCATCTACTGGTAAACTCATCCGAGAAGTAAACTCCTTCTTCAAGGTA
TTAAACACCTCCTCCTCTAGATACGTGAGGGTCGTGCCAGAGTCTATGATCATACCTCCT
GTTCCATCTTCAGCTAGTTCGAACATAGACTTCTCTATAGAAAGACGTTTTGAACCGACG
GTGATGCCTTGTAGGTCAAGGTAATAGAACGAGGGCTAACTAGGGTTTCGTAGCAAGGAA
ATGGTTTTGGTGGCTTCACCTTCTAACCTCCCACCGCTTTTCTTGACTATATTCGAGGCT
AGAGATCCAATAAACAGCGAGCTAGACGCTTTGGTATCATCAATAGCGGTCAAGCAATAA
GAGAACTTAGTCTCCTTGAGCTGAGAAATAAGCGAGAGCGGTCCACGACCAAGACCTACA
AGACCCGACCCTTGAGAGAACCCGTCTCCTTCGTTCTCATCACCACACCCAAACCCTATA
CCCGAAACAGAGTTTTCGCCACCGAAAGTGAACGTTTCCTTGGCCAAGACCCCTCTTGTG
GACGAGTAATCTCCATAGGTATACAAATACTCACAAGCTTCTTCGTCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E553JQ U 1
AF RR2E553TF C 180
AF RR2B912JQ U 41
AF RR2B912TF C 166
BS 1 201 RR2E553JQ
BS 202 202 RR2B912JQ
BS 203 279 RR2E553JQ
BS 280 280 RR2B912JQ
BS 281 311 RR2E553JQ
BS 312 312 RR2B912JQ
BS 313 333 RR2E553JQ
BS 334 334 RR2B912JQ
BS 335 396 RR2E553JQ
BS 397 397 RR2B912JQ
BS 398 432 RR2E553JQ
BS 433 898 RR2B912JQ
BS 899 951 RR2B912TF

RD RR2E553JQ 432 0 0
ATTAATTATCATTTTCTATTTTCTCGGAAATATCTATTTTGTCACAAAGCATGCAAGTTT
ATTAATAATAAACGAAGGAAACAATTAAAATTCTACAACTTTCCACATTCAGTGGGAACA
AACGACACCTTATCCTTCTCAAGGTCATGAACTACGTTAAAATTCTGCTGCTGAAAATTT
CCAAAAACAGACATCCCATTAAATTTCCCCATAGCCAAACACAAAACACCAGCACTCGGA
TCCTCCACCATGTAATTATCACCGGGAAGCTCCAAATCCCCACCCTTAAAATGAAAAACC
AGCTTAGGAACGGCGACATTCTTAGCCTCATTAAATAACGTATAGCACAAGTCAAGTCCT
GTGGATCCTGATTCATCTACTGGTAAACTCATCCGAAAAGTAAACTCCTTCTTCAAGGTA
TTAAACACCTCC

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR2E553TF 602 0 0
TTCC
AAAACAGACATCCCATTAGATT*CCCCATAGCCAA*CACAAA*CACCAGCACTCGGATCC
TCCACCATGTAATTATCACCGGGAAGCTCCAAATCCGCACC*TTAAAATGAAAAACCAGC
TTAGGAACGGCGACATTCTTAGCCTCATTAGATAACGTATAGCACAAGTCAAGTCCTGTG
GATCCTGATTCATCTACTGGTAAACTCATCCGAGAAGTAAACTCCTTCTTCAAGGTATTA
AACACCTCCTCCTCTAGATACGTGAGGGTCGTGCCAGAGTCTATGATCATACCTCCTGTT
CCATCTTCAGCTAGTTCGAACATAGACTTCTCTATAGAAAGACGTTTTGAACCGACGGTG
ATGCCTTGTAGGTCAAGGTAATAGAACGAGGGCTGACTAGGGTTTCGTAGCAAGGAAATG
GTTTTGGTGGCTTCACCTTCTAACCTCCCACCGCTTTTCTTGACTATATTCGAGGCTAGA
GATCCAATAAACAGCGAGCTAGACGCTTTGGTATCATCAATAGCGGTCAAGCAATAAGAG
AACTTAGTCTCCTTGAGCTGAGAAATAAGCGAGAGCGGTCCACGACCAAGACCTACA
C

QA 5 601 5 601
DS 

RD RR2B912JQ 858 0 0
GTCACAAAGCATGCAAGTTTATTAATAATAAACGAAGGAAACAATTAAAATTCTACAACT
TTCCACATTCAGTGGGAACAAACGACACCTTATCCTTCTCAAGGTCATGAACTACGTTAA
AATTCTGCTGCTGAAAATTTCCAAAAACAGACATCCCATTAGATTTCCCCATAGCCAAAC
ACAAAACACCAGCACTCGGATCCTCCACCATGTAATTATCACCGGGAAGCTCCAAATCCG
CACCCTTAAAATGAAAAACCAGCTTAGGAACAGCGACATTCTTAGCCTCATTAGATAACG
TATAGCACAAGTCAAGTCCTGTGGATCCTGATTCATCTACTGGTAAACTCATCCGAGAAG
TAAACTCCTTCTTCAAGGTATTAAACACCTCCTCCTCTAGATACGTGAGGGTCGTGCCAG
AGTCTATGATCATACCTCCTGTTCCATCTTCAGCTAGTTCGAACATAGACTTCTCTATAG
AAAGACGTTTTGAACCGACGGTGATGCCTTGTAGGTCAAGGTAATAGAACGAGGGCTAAC
TAGGGTTTCGTAGCAAGGAAATGGTTTTGGTGGCTTCACCTTCTAACCTCCCACCGCTTT
TCTTGACTATATTCGAGGCTAGAGATCCAATAAACAGCGAGCTAGACGCTTTGGTATCAT
CAATAGCGGTCAAGCAATAAGAGAACTTAGTCTCCTTGAGCTGAGAAATAAGCGAGAGCG
GTCCACGACCAAGACCTACAAGACCCGACCCTTGAGAGAACCCGTCTCCTTCGTTCTCAT
CACCACACCCAAACCCTATACCCGAAACAGAGTTTTCGCCACCGAAAGTGAACGTTTCCT
TGGCCAAGACCCCTCTTG

QA 1 858 1 858
DS 

RD RR2B912TF 786 0 0
TGCTGCTGAAAATTTCCAAAAACAGACATCCCATTAGATTTCCCCATAGCCAAACACAAA
ACACCAGCACTCGGATCCTCCACCATGTAATTATCACCGGGAAGCTCCAAATCCGCACCC
TTAAAATGAAAAACCAGCTTAGGAACAGCGACATTCTTAGCCTCATTAGATAACGTATAG
CACAAGTCAAGTCCTGTGGATCCTGATTCATCTACTGGTAAACTCATCCGAGAAGTAAAC
TCCTTCTTCAAGGTATTAAACACCTCCTCCTCTAGATACGTGAGGGTCGTGCCAGAGTCT
ATGATCATACCTCCTGTTCCATCTTCAGCTAGTTCGAACATAGACTTCTCTATAGAAAGA
CGTTTTGAACCGACGGTGATGCCTTGTAGGTCAAGGTAATAGAACGAGGGCTAACTAGGG
TTTCGTAGCAAGGAAATGGTTTTGGTGGCTTCACCTTCTAACCTCCCACCGCTTTTCTTG
ACTATATTCGAGGCTAGAGATCCAATAAACAGCGAGCTAGACGCTTTGGTATCATCAATA
GCGGTCAAGCAATAAGAGAACTTAGTCTCCTTGAGCTGAGAAATAAGCGAGAGCGGTCCA
CGACCAAGACCTACAAGACCCGACCCTTGAGAGAACCCGTCTCCTTCGTTCTCATCACCA
CACCCAAACCCTATACCCGAAACAGAGTTTTCGCCACCGAAAGTGAACGTTTCCTTGGCC
AAGACCCCTCTTGTGGACGAGTAATCTCCATAGGTATACAAATACTCACAAGCTTCTTCG
TCTTGC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 4

CO CL2738Contig1 1138 4 8 U
GGACTCTCCTTAAACACTTCCCCCTTTGAGTCACCAATAAGATCAAACATGTTGAAAACA
ACCACGAAGGCGACCCTTCTCTGTTTCGTTCTCGCCGCCGTGGTTCTGATGGACCAAACT
TCCTCCACCGCCACATACGACCCGACCTCCTCCGCCCCCACAGACACGTACATATTCGCA
AAGTGTTCTCCTGACAAATTCTCACCTGGCTCCGCCTACGAGACCAACCTAAAATCCCTC
CTCTCTTCCCTCGCCAGCTCCACCGTCGCCAGCCGATACAATAACCTCACCGTTGGGGTA
AAACCCGAACCGGCCGCTATCGTATAGGGTCTTTTCCAGTGCAGCGTTGACCTTGACGCA
ACATCTTGCTCATCATGCATATCACGCGCCATCGCACTGGTCGGAACCACATGTCCCAAC
TCGTACTCAGTGTTCTTGCAGATGCAAAGTTGTCTGGTCCGGTTCGACAATAACTCGTTC
TTTGGCGTTCAGGACAAAACAGAGATGCTCCAGAAATGTGGACAGCCGTTGGGATTCAAC
GACCAAGATGCGTTGACCAGAGTCAGTGACGTCATGGGTTCTTTAAGTTCAGGAACTGGA
CCCGACAGGACTGGAGGGAACGGGGATGTTCGGGGTGTGGCTCAGTGCATGGGTGATCTA
AGTTCAGCACAGTGTCAAGATTGCTTGACTGATGCAATCGGACGGCTCAGATCTGATTGT
GGAATGTCCCAGGGAGGATACGTTTACTTGTCCAAGTGTTACGCGCGTTTTAGCTACGGT
GGTAGTCACGCACGTCAGACCCCAAACTCAAACTTTGGAGAAGGCAAAGACGATAAAGAT
AATGGCGGCATCGGAAAAACATTGGCGATTATAATAGGGATCATCACCTTAGTCATCTTG
CTCGTCGTGTTTCTCGCTTTTATTGGAAAGCAATTGAGAAAACTACAAGACGAGAAATGT
TGTAAATGAATGGTAAAAGTGGGAAAGAGATCAATCAACAACTCGAGTCAAGCATGCAAT
GCTAGTTTTATTTTTGTAAAAAAGAAAATTGTGACCCGCTGTCTCACAAGATGTAGTTAT
ATAGTGTTTCAACGATTGTATTTTGGACTCGATTTTAGTATATTATCACCGGACTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG33TF U 1
AF RR2AV35TF U 26
AF RR2AV35JQ C 458
AF RR2EG33JQ C 712
BS 1 326 RR2EG33TF
BS 327 327 RR2AV35TF
BS 328 523 RR2EG33TF
BS 524 524 RR2AV35TF
BS 525 723 RR2EG33TF
BS 724 724 RR2AV35TF
BS 725 768 RR2EG33TF
BS 769 1138 RR2AV35JQ

RD RR2EG33TF 768 0 0
GGACTCTCCTTAAACACTTCCCCCTTTGAGTCACCAATAAGATCAAACATGTTGAAAACA
ACCACGAAGGCGACCCTTCTCTGTTTCGTTCTCGCCGCCGTGGTTCTGATGGACCAAACT
TCCTCCACCGCCACATACGACCCGACCTCCTCCGCCCCCACAGACACGTACATATTCGCA
AAGTGTTCTCCTGACAAATTCTCACCTGGCTCCGCCTACGAGACCAACCTAAAATCCCTC
CTCTCTTCCCTCGCCAGCTCCACCGTCGCCAGCCGATACAATAACCTCACCGTTGGGGTA
AAACCCGAACCGGCCGCTATCGTATATGGTCTTTTCCAGTGCAGCGTTGACCTTGACGCA
ACATCTTGCTCATCATGCATATCACGCGCCATCGCACTGGTCGGAACCACATGTCCCAAC
TCGTACTCAGTGTTCTTGCAGATGCAAAGTTGTCTGGTCCGGTTCGACAATAACTCGTTC
TTTGGCGTTCAGGACAAAACAGAGATGCTCCAGAAATGTGGACGGCCGTTGGGATTCAAC
GACCAAGATGCGTTGACCAGAGTCAGTGACGTCATGGGTTCTTTAAGTTCAGGAACTGGA
CCCGACAGGACTGGAGGGAACGGGGATGTTCGGGGTGTGGCTCAGTGCATGGGTGATCTA
AGTTCAGCACAGTGTCAAGATTGCTTGACTGATGCAATCGGACGGCTCAGATCTGATTGT
GGA*TGTCCCAGGGAGGATACGTTTACTTGTCCAAGTGTTACGCGCGT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2AV35TF 745 0 0
GG
GAGTCACCAATAAGATCAAACATGTTGAAAACAACCACGAAGGCGACCCTTCTCTGTTTC
GTTCTCGCCGCCGTGGTTCTGATGGACCAAACTTCCTCCACCGCCACATACGACCCGACC
TCCTCCGCCCCCACAGACACGTACATATTCGCAAAGTGTTCTCCTGACAAATTCTCACCT
GGCTCCGCCTACGAGACCAACCTAAAATCCCTCCTCTCTTCCCTCGCCAGCTCCACCGTC
GCCAGCCGATACAATAACCTCACCGTTGGGGTAAAACCCGAACCGGCCGCTATCGTATAG
GGTCTTTTCCAGTGCAGCGTTTACCTTGACGCAACATCTTGCTCATCATGCATATCACGC
GCCATCGCACTGGTCGGAACCACATGTCCCAACTCGTACTCAGTGTTCTTGCAGATGCAA
AGTTGTCTGGTCCGGTTCGACAATAACTCGTTCTTTGGCGTTCAGGACAAAACAGAGATG
CTCCAGAAATGTGGACAGCCGTTGGGATTCAACGACCAAGATGCGTTGACCAGAGTCAGT
GACGTCATGGGTTCTTTAAGTTCAGGAACTGGACCCGACAGGACTGGAGGGAACGGGGAT
GTTCGGGGTGTGGCTCAGTGCATGGGTGATCTAAGTTCAGCACAGTGTCAAGATTGCTTG
ACTGATGCAATCGGACGGCTCAGATCTGATTGTGGAATGTCCCAGGGAGGATACGTTTAC
TTGTCCAAGTGTTACGCGCGT
TT

QA 3 743 3 743
DS 

RD RR2AV35JQ 681 0 0
TCCGGTTCGACAATAACTCGTTCTTTGGCGTTCAGGACAAAACAGAGATGCTCCAGAAAT
GTGGACAGCCGTTGGGATTCAACGACCAAGATGCGTTGACCAGAGTCAGTGACGTCATGG
GTTCTTTAAGTTCAGGAACTGGACCCGACAGGACTGGAGGGAACGGGGATGTTCGGGGTG
TGGCTCAGTGCATGGGTGATTTAAGTTCAGCACAGTGTCAAGATTGCTTGACTGATGCAA
TCGGACGGCTCAGATCTGATTGTGGAATGTCCCAGGGAGGATACGTTTACTTGTCCAAGT
GTTACGCGCGTTTTAGCTACGGTGGTAGTCACGCACGTCAGACCCCAAACTCAAACTTTG
GAGAAGGCAAAGACGATAAAGATAATGGCGGCATCGGAAAAACATTGGCGATTATAATAG
GGATCATCACCTTAGTCATCTTGCTCGTCGTGTTTCTCGCTTTTATTGGAAAGCAATTGA
GAAAACTACAAGACGAGAAATGTTGTAAATGAATGGTAAAAGTGGGAAAGAGATCAATCA
ACAACTCGAGTCAAGCATGCAATGCTAGTTTTATTTTTGTAAAAAAGAAAATTGTGACCC
GCTGTCTCACAAGATGTAGTTATATAGTGTTTCAACGATTGTATTTTGGACTCGATTTTA
GTATATTATCACCGGACTTCG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2EG33JQ 383 0 0
TCTGATTGTGGAATGTCCCAGGGAGGATACGTTTACTTGTCCAAGTGTTACGCGCGTTTT
AGTTACGGTGGTAGTCACGCACGTCAGACCCCAAACTCAAACTTTGGAGAAGGCAAAGAC
GATAAAGATAATGGCGGCATCGGAAAAACATTGGGGATTATAATAGGGATCATCACCTTA
GTCATCTTGCTCGTCGTGTTTCTCGCTTTTATTGGAAAGCAATTGAGAAAACTACAAGAC
GAGAAATGTTGTAAATGAATGGTAAAAGTGGGAAAGAGATCAATCAACAACTCGAGTCAA
GCATGCAATGCTAGTTTTATTTTTGTAAAAAAGAAAATTGTGACCCGCTGTCTCACAAGA
TGTAGTTATATAGTGTTTCAACG

QA 1 383 1 383
DS 



AS 1 4

CO CL2739Contig1 855 4 3 U
GGGTCGGAGGTGTTGAATTAGAACTTATCGCAATAGCCACAGGCGGCAGAATTGTTCCAA
GATTCCAGGAGTTGACCCCAGAGAAGTTATGGAAGGCTGGCATGGTTCGTGAAAAATCAT
TTGGCACCACAAAAGAACGAATGCTGTATATTGAGCACTGTGCGAACTCAAAAGCTGTCA
CGATTTTCATCCGTGGAGGTAACAAAATGATGATAGAAGAAACTAAGCGTAGCATCCACG
ATGCTCTGTGTGTGGCGAGGAATCTCATCCGCAATAATTCAATTGTATATGGAGGTGGTG
CAGCTGAAATCACATGCTCACTTGCTGTTGATGCAGCTGCTGATAAATACCCTGGCGTCG
AGCAGTACGCAATAAGGGCATTTGCAGAAGCTTTGGACTCTGTCCCTATGGCTCTTGCAG
AGAACAGTGGATTACAGCCGATTGAGACGCTTTCTGCGGTTAAATCTCAACAAATTAAGG
AGAACATTCCTTTCTATGGAATAGATTGCAATGATGTGGGAACAAACGATATGAGGGAGC
AAAATGTGTTTGAAACATTGATAGGAAAGCAGCAGCAGATTTTGCTTGCAACACAAGTCG
TTAAGATGATTCTAAAGATCGACGACGTCATCTCTAATTCTGAATACTGATGATGTACTG
CTCTGCAACATTTGCACTTTCCTTGTGCCTCTTTTGTTTGCTTTCTATTAGCTTTTTGAT
ACTGTTCATCAATTTTTTTTCTCTTGTAAGCTTTTATTTTAGAAACATCTTCATTTGTGC
TTTTTTCGTCACTGAACAAAACAGCATGAGAGCTTCCTTGACTTGGATTTTAATGAAGTG
TTGCAATTTCTAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2AI85TF U 1
AF RR2AK62TF U 118
AF RR2AI85JQ C 50
AF RR2AK62JQ C 126
BS 1 752 RR2AI85TF
BS 753 803 RR2AK62TF
BS 804 855 RR2AI85JQ

RD RR2AI85TF 752 0 0
GGGTCGGAGGTGTTGAATTAGAACTTATCGCAATAGCCACAGGCGGCAGAATTGTTCCAA
GATTCCAGGAGTTGACCCCAGAGAAGTTATGGAAGGCTGGCATGGTTCGTGAAAAATCAT
TTGGCACCACAAAAGAACGAATGCTGTATATTGAGCACTGTGCGAACTCAAAAGCTGTCA
CGATTTTCATCCGTGGAGGTAACAAAATGATGATAGAAGAAACTAAGCGTAGCATCCACG
ATGCTCTGTGTGTGGCGAGGAATCTCATCCGCAATAATTCAATTGTATATGGAGGTGGTG
CAGCTGAAATCACATGCTCACTTGCTGTTGATGCAGCTGCTGATAAATACCCTGGCGTCG
AGCAGTACGCAATAAGGGCATTTGCAGAAGCTTTGGACTCTGTCCCTATGGCTCTTGCAG
AGAACAGTGGATTACAGCCGATTGAGACGCTTTCTGCGGTTAAATCTCAACAAATTAAGG
AGAACATTCCTTTCTATGGAATAGATTGCAATGATGTGGGAACAAACGATATGAGGGAGC
AAAATGTGTTTGAAACATTGATAGGAAAGCAGCAGCAGATTTTGCTTGCAACACAAGTCG
TTAAGATGATTCTAAAGATCGACGACGTCATCTCTAATTCTGAATACTGATGATGTACTG
CTCTGCAACATTTGCACTTTCCTTGTGCCTCTTTTGTTTGCTTTCTATTAGCTTTTTGAT
ACTGTTCATCAATTTTTTTTCTCTTGTAAGCT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2AK62TF 686 0 0
G
ATTTGGCACCACAAAAGAACGAATGCTGTATATTGAGCACTGTGCGAACTCAAAAGCTGT
CACGATTTTCATCCGTGGAGGTAACAAAATGATGATAGAAGAAACTAAGCGTAGCATCCA
CGATGCTCTGTGTGTGGCGAGGAATCTCATCCGCAATAATTCAATTGTATATGGAGGTGG
TGCAGCTGAAATCACATGCTCACTTGCTGTTGATGCAGCTGCTGATAAATACCCTGGCGT
CGAGCAGTACGCAATAAGGGCATTTGCAGAAGCTTTGGACTCTGTCCCTATGGCTCTTGC
AGAGAACAGTGGATTACAGCCGATTGAGACGCTTTCTGCGGTTAAATCTCAACAAATTAA
GGAGAACATTCCTTTCTATGGAATAGATTGCAATGATGTGGGAACAAACGATATGAGGGA
GCAAAATGTGTTTGAAACATTGATAGGAAAGCAGCAGCAGATTTTGCTTGCAACACAAGT
CGTTAAGATGATTCTAAAGATCGACGACGTCATCTCTAATTCTGAATACTGATGATGTAC
TGCTCTGCAACATTTGCACTTTCCTTGTGCCTCTTTTGTTTGCTTTCTATTAGCTTTTTG
ATACTGTTCATCAATTTTTTTTCTCTTGTAAGCTTTTATTTTAGAAACATCTTCATTTGT
GCTTTTTTCGTCACTGAACAAAACA

QA 2 686 2 686
DS 

RD RR2AI85JQ 806 0 0
AATTGTTCCAAGATTCCAGGAGTTGACCCCAGAGAAGTTATGGAAGGCTGGCATGGTTCG
TGAAAAATCATTTGGCACCACAAAAGAACGAATGCTGTATATTGAGCACTGTGCGAACTC
AAAAGCTGTCACGATTTTCATCCGTGGAGGTAACAAAATGATGATAGAAGAAACTAAGCG
TAGCATCCACGATGCTCTGTGTGTGGCGAGGAATCTCATCCGCAATAATTCAATTGTATA
TGGAGGTGGTGCAGCTGAAATCACATGCTCACTTGCTGTTGATGCAGCTGCTGATAAATA
CCCTGGCGTCGAGCAGTACGCAATAAGGGCATTTGCAGAAGCTTTGGACTCTGTCCCTAT
GGCTCTTGCAGAGAACAGTGGATTACAGCCGATTGAGACGCTTTCTGCGGTTAAATCTCA
ACAAATTAAGGAGAACATTCCTTTCTATGGAATAGATTGCAATGATGTGGGAACAAACGA
TATGAGGGAGCAAAATGTGTTTGAAACATTGATAGGAAAGCAGCAGCAGATTTTGCTTGC
AACACAAGTCGTTAAGATGATTCTAAAGATCGACGACGTCATCTCTAATTCTGAATACTG
ATGATGTACTGCTCTGCAACATTTGCACTTTCCTTGTGCCTCTTTTGTTTGCTTTCTATT
AGCTTTTTGATACTGTTCATCAATTTTTTTTCTCTTGTAAGCTTTTATTTTAGAAACATC
TTCATTTGTGCTTTTTTCGTCACTGAACAAAACAGCATGAGAGCTTCCTTGACTTGGATT
TTAATGAAGTGTTGCAATTTCTAGGC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2AK62JQ 730 0 0
ACCACAAAAGAACGAATGCTGTATATTGAGCACTGTGCGAACTCAAAAGCTGTCACGATT
TTCATCCGTGGAGGTAACAAAATGATGATAGAAGAAACTAAGCGTAGCATCCACGATGCT
CTGTGTGTGGCGAGGAATCTCATCCGCAATAATTCAATTGTATATGGAGGTGGTGCAGCT
GAAATCACATGCTCACTTGCTGTTGATGCAGCTGCTGATAAATACCCTGGCGTCGAGCAG
TACGCAATAAGGGCATTTGCAGAAGCTTTGGACTCTGTCCCTATGGCTCTTGCAGAGAAC
AGTGGATTACAGCCGATTGAGACGCTTTCTGCGGTTAAATCTCAACAAATTAAGGAGAAC
ATTCCTTTTTATGGAATAGATTGCAATGATGTGGGAACAAACGATATGAGGGAGCAAAAT
GTGTTTGAAACATTGATAGGAAAGCAGCAGCAGATTTTGCTTGCAACACAAGTCGTTAAG
ATGATTCTAAAGATCGACGACGTCATCTCTAATTCTGAATACTGATGATGTACTGCTCTG
CAACATTTGCACTTTCCTTGTGCCTCTTTTGTTTGCTTTCTATTAGCTTTTTGATACTGT
TCATCAATTTTTTTTCTCTTGTAAGCTTTTATTTTAGAAACATCTTCATTTGTGCTTTTT
TCGTCACTGAACAAAACAGCATGAGAGCTTCCTTGACTTGGATTTTAATGAAGTGTTGCA
ATTTCTAG
CC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

CO CL2740Contig1 1038 3 23 U
CTGCATCTGTCATTCCTTGTTCCTTACAGTGTGTGAGAAAATGGAGAGTGGACTAACCGA
GATCGGAAGCACGAAGATGTTCGATGGATACAACAAAAGATATAAACACAACAGTGAGAC
ACTCGGCTGTTCCATGACTTTCTCCATCTACTTCCCTCCTTCTTCCCACAAATCCCCTGT
GCTATACTGGCTCTCTGGGCTCACATGCACAGACGAGAACTTCATCATCAAGTCCGGTGC
TCAACGTGCTGCTTCTACTCACGGCATTGCTCTTGTTGTTCCCGATACTTCTCCAAGAGG
ACTCAATATTGAAGGTGAAGCAGACAGTTACGACTTCGGTGTAGGAGCTGGATTCTACCT
CAATGCTACTCAGGAGAAGTGGAAGAACTGGCGTATGTATGACTACGTTGTCAAGGAGCT
GCCAAAACTCCTGAGTGACAACTTCTCTCAGCTTGACACAGCAAGGGCATCTATCTCTGG
ACATTCCATGGGTGGACATGGTGCTCTTACTATTTACCTCAAGAACCTCGATAAGTATAA
GTCTGTGTCTGCCTTTGCACCCATTGCCAATCCCATTAATTGTCCATTGGGACAGAAAGC
ATTCACCAATTATCTTGGTGACAACAAGACTGCTTGGGAGGAATACGATGCTACTTGTCT
CATTTCAAAGTTCAACAATCTCTCTGCCACAATTCTAATTGATCAGGGAGAAAACGACCA
GTTCTACCCTGATCAGTTATTGCCCAACAAGTTTGAAGAGGCGTGCAAGAAAGTGAATGC
GCCGCTCTTAGTGCGCCTGCAGCCAGGATACGACCACTCCTACTATTTTATTGCAACTTT
CATCGAAGACCACATCAGTCACCATGCTCAAGCCCTTGAGTTGTAGCTCACTCCTGGTGC
TCGGCATCATCCAGCTTTGCCGTTGTCCAAATATTAGTTTTCAATAAAGCAAGTGGACTT
GTAATGTTTTTGTGTTCAGTGACGGCTCTGTGTGGTGTGTTATGTCTACAATAATAAAAT
AAATCGAAACTTCCAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C650TF U 1
AF RR2EH60TF U 15
AF RR2EH60JQ C 318
BS 1 51 RR2C650TF
BS 52 52 RR2EH60TF
BS 53 405 RR2C650TF
BS 406 406 RR2EH60TF
BS 407 418 RR2C650TF
BS 419 419 RR2EH60TF
BS 420 430 RR2C650TF
BS 431 431 RR2EH60TF
BS 432 460 RR2C650TF
BS 461 461 RR2EH60TF
BS 462 468 RR2C650TF
BS 469 469 RR2EH60TF
BS 470 531 RR2C650TF
BS 532 532 RR2EH60TF
BS 533 561 RR2C650TF
BS 562 562 RR2EH60TF
BS 563 587 RR2C650TF
BS 588 588 RR2EH60TF
BS 589 668 RR2C650TF
BS 669 669 RR2EH60TF
BS 670 687 RR2C650TF
BS 688 702 RR2EH60TF
BS 703 1038 RR2EH60JQ

RD RR2C650TF 687 0 0
CTGCATCTGTCATTCCTTGTTCCTTACAGTGTGTGAGAAAATGGAGAGTGGGCTAACCGA
GATCGGAAGCACGAAGATGTTCGATGGATACAACAAAAGATATAAACACAACAGTGAGAC
ACTCGGCTGTTCCATGACTTTCTCCATCTACTTCCCTCCTTCTTCCCACAAATCCCCTGT
GCTATACTGGCTCTCTGGGCTCACATGCACAGACGAGAACTTCATCATCAAGTCCGGTGC
TCAACGTGCTGCTTCTACTCACGGCATTGCTCTTGTTGTTCCCGATACTTCTCCAAGAGG
ACTCAATATTGAAGGTGAAGCAGACAGTTACGACTTCGGTGTAGGAGCTGGATTCTACCT
CAATGCTACTCAGGAGAAGTGGAAGAACTGGCGTATGTATGACTATGTTGTCAAGGAGTT
GCCAAAACTCTTGAGTGACAACTTCTCTCAGCTTGACACATCAAGGGCTTCTATCTCTGG
ACATTCCATGGGTGGACATGGTGCTCTTACTATTTACCTCAAGAACCTCGACAAGTATAA
GTCTGTGTCTGCCTTTGCACCAATTGCCAATCCCATTAATTGTCCATGGGGACAGAAAGC
ATTCACCAATTATCTTGGTGACAACAAGACTGCTTGGGAGGAATACGATGCTACTTGTCT
CATTTCAA*GTTCAACAATCTCTCTGC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2EH60TF 688 0 0
GGGTTCCT
CTTACAGTGTGTGAGAAAATGGAGAGTGGACTAAGCGAGATCGGAAGCACGAAGATGTTC
GATGGATACAACAAAAGATATAAACACAACAGTGAGACACTTGGCTGTTCCGTGACTTTC
TCCATCTACTTCCCTCCTTCTTCCCACAAATCCCCTGTGCTATACTGGCTCTCTGGGCTC
ACATGCACAGACGAGAACTTCATCATCAAGTCCGGTGCTCAACGTGTTGCTTCTACTCAC
GGCATTGCTCTTGTTGTTCCCGATACTTCTCCAAGAGGACTCAATATTGAAGGTGAAGCA
GACAGTTACGACTTCGGTGTAGGAGCTGGATTCTACCTCAATGCTACTCAGGAGAAGTGG
AAGAACTGGCGTATGTATGACTACGTTGTCAAGGAGCTGCCAAAACTCCTGAGTGACAAC
TTCTCTCAGCTTGACACAGCAAGGGCATCTATCTCTGGACATTCCATGGGTGGACATGGT
GCTCTTACTATTTACCTCAAGAACCTCGATAAGTATAAGTCTGTGTCTGCCTTTGCACCC
ATTGCCAATCCCATTAATTGTCCATTGGGACAGAAAGCATTCACCAATTATCTTGGTGAC
AACAAGACTGCTTGGGAGGAATACGATGCTACTTGTCTCATTTCAAAGTTCAACAATCTC
TCTGCCACAATTCTAATTGA

QA 9 688 9 688
DS 

RD RR2EH60JQ 721 0 0
AAGCAGACAGTTACGACTTCGGTGTAGGAGCTGGATTCTACCTCAATGCTACTCAGGAGA
AGTGGAAGAACTGGCGTATGTATGACTACGTTGTCAAGGAGCTGCCAAAACTCCTGAGTG
ACAACTTCTCTCAGCTTGACACAGCAAGGGCATCTATCTCTGGACATTCCATGGGTGGAC
ATGGTGCTCTTACTATTTACCTCAAGAACCTCGATAAGTATAAGTCTGTGTCTGCCTTTG
CACCCATTGCCAATCCCATTAATTGTCCATTGGGACAGAAAGCATTCACCAATTATCTTG
GTGACAACAAGACTGCTTGGGAGGAATACGATGCTACTTGTCTCATTTCAAAGTTCAACA
ATCTTTCTGCCACAATTCTAATTGATCAGGGAGAAAACGACCAGTTCTACCCTGATCAGT
TATTGCCCAACAAGTTTGAAGAGGCGTGCAAGAAAGTGAATGCGCCGCTCTTAGTGCGCC
TGCAGCCAGGATACGACCACTCCTACTATTTTATTGCAACTTTCATCGAAGACCACATCA
GTCACCATGCTCAAGCCCTTGAGTTGTAGCTCACTCCTGGTGCTCGGCATCATCCAGCTT
TGCCGTTGTCCAAATATTAGTTTTCAATAAAGCAAGTGGACTTGTAATGTTTTTGTGTTC
AGTGACGGCTCTGTGTGGTGTGTTATGTCTACAATAATAAAATAAATCGAAACTTCCAAT
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 3

CO CL2741Contig1 1412 3 5 U
CGACAAGAAATCTAGTGCATATATTAGACAATACACAAGTAAATACAAATAAAAGTAAAA
GAGTTGTGAAACTAGAATAAAGAAAAAAAAACCATCAACAAATGCAAGTCACTACAAAGG
ATAACAAAAACAAGTTTGCTGCATAAATATTTGATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTTG
TCAAGCAAGCTCTTACACATAAAAACACATTTATAAAAACGCAATACTATCAACGTGATG
GGGCGAGAAAGAGGCGCAGCAAATGCCAGTGAGTCCATAACGGCTCCAGAAGTCTTCAGT
ATCAGCGACTCCGTGGATCCTGACTCTTCTCATGCTCTTGGTGACAGGGTTGAAGTAAAA
AACATAAAAGGGCTGGGCACGGTCTGGCAAAGTTGCTGGGGAAAAAATGATTTCACCAGC
CTTGTTGGTTCCTTGGGAAATCATACGCTTACCCATCCCAATATTGAAGGGAAAAAACAA
GGGAAGCTCAAATGTTTGTTTGGACCACTCCTGTTTCGTCACATCCTCCAGTATCCATAG
ATTAAAACGGTCGAAAGACAAACCAGTTCGCTGACAGATTGGTACAACGACAGCAAGCTT
CCCTTTGTAATCAATCAATGATGTAAAAGCCTGCCAAAGCAGGACCTCCCTAGGCGTTGG
GATAAAACTTAGTATCGTCTCATATCTAACATCAAAGCACACAAACACAGAAGTAGGAGG
AGTCTCTTCTGGAACAGAAGCACCATAATAAATGAAACCATTGATGCATCGTCCCCTGGT
TATTGGGTCATAAGGCGGGGAGGTAATTTGGGTACGAGATACTACTCGTCCTCCTCTTCC
AAGTCTTTTAACCTCGTGCACCATGAAACTAGGGTTATGAGCATACCTAGATGTCAACAG
GGTCAATGCTTTGAATTGATCACCAACAGGATCATATCCCAAGCATGTGTCCGTTGCCTT
GCAGTGAAAGGTAATGACTTGCCCGGTGGTAGGGTTACATATAATGAACTTTAACCTATC
ATTAACAGCCATAAAGCCATGGACGGAAGAATACTTGAAGCCGCCGAAAGGCATGGTCAC
TGAGGGTATTGTCATGTCTAGATTGGCAACCAAAGAAGAAGAAGAAGTTACCTCTTCCTC
TCCCGAGAAGATGAAGAGACGCTTGGGTTCACTAAATACACTGTTGGTGAAAGTGACTGT
AAAACGGGGTGGCTTGGCAGCGTAGTAAGAAGCCACGAATCTTTGGCTTCGGATAAAGGA
ATACCAAGCCTTGGACACGCATAGGAACCTCATAAGCGACTTTCCAGGCAATCTAATCAG
TGTCTCCACCTCCATATCGTAAGGGAAGATGACTTGTAGGATCTTCTTGTCGCTTCCAAC
GCCATTGCCGTCCCTTGACTCGTCGACTTCTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV73JQ U 1
AF RR2F544JQ U 2
AF RR2CV73TF C 761
BS 1 744 RR2CV73JQ
BS 745 794 RR2F544JQ
BS 795 795 RR2CV73TF
BS 796 841 RR2F544JQ
BS 842 1412 RR2CV73TF

RD RR2CV73JQ 744 0 0
CGACAAGAAATCTAGTGCATATATTAGACAATACACAAGTAAATACAAATAAAAGTAAAA
GAGTTGTGAAACTAGAATAAAGAAAAAAAAACCATCAACAAATGCAAGTCACTACAAAGG
ATAACAAAAACAAGTTTGCTGCATAAATATTTGATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTTG
TCAAGCAAGCTCTTACACATAAAAACACATTTATAAAAACGCAATACTATCAACGTGATG
GGGCGAGAAAGAGGCGCAGCAAATGCCAGTGAGTCCATAACGGCTCCAGAAGTCTTCAGT
ATCAGCGACTCCGTGGATCCTGACTCTTCTCATGCTCTTGGTGACAGGGTTGAAGTAAAA
AACATAAAAGGGCTGGGCACGGTCTGGCAAAGTTGCTGGGGAAAAAATGATTTCACCAGC
CTTGTTGGTTCCTTGGGAAATCATACGCTTACCCATCCCAATATTGAAGGGAAAAAACAA
GGGAAGCTCAAATGTTTGTTTGGACCACTCCTGTTTCGTCACATCCTCCAGTATCCATAG
ATTAAAACGGTCGAAAGACAAACCAGTTCGCTGACAGATTGGTACAACGACAGCAAGCTT
CCCTTTGTAATCAATCAATGATGTAAAAGCCTGCCAAAGCAGGACCTCCCTAGGCGTTGG
GATAAAACTTAGTATCGTCTCATATCTAACATCAAAGCACACAAACACAGAAGTAGGAGG
AGTCTCTTCTGGAACAGAAGCACC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2F544JQ 854 0 0
GACAAGAAATCTAGTGCATATATTAGACAATACACAAGTAAATACAAATAAAAGTAAAAG
AGTTGTGAAACTAGAATAAAGAAAAAAAAACCATCAACAAATGCAAGTCACTACAAAGGA
TAACAAAAACAAGTTTGCTGCATAAATATTTGATTTAAAAAAAAAAAAA****GGTTTGT
CAAGCAAGCTCTTACACATAAAAACACATTTATAGAAACGCAATACTATCAACGTGATGG
GGCGAGAAAGAGGCGCAGCAAATGCCAGTGAGTCCATAACGGCTCCAGAAGTCTTCAGTA
TCAGCGACTCCGTGGATCCTGACTCTTCTCATGCTCTTGGTGACAGGGTTGAAGTAAAAA
ACATAAAAGGGCTGGGCACGGTCTGGCAGAGTTGCTGGGGAGAAAATGATTTCACCAGCC
TTGTTGGTTCCTTGGGAAATCATACGCTTACCCATCCCAATATTGAAGGGAAGAGACAAG
GGAAGCTCAAATGTTTGTTTGGACCACTCCTGTTTCGTCACATCCTCCAGTATCCATAGA
TTAAAACGGTCGAAAGACAAACCAGTTCGCTGACAGATTGGTACAACGACAGCAAGCTTC
CCTTTGTAATCAATCAATGATGTAAAAGCCTGCCAAAGCAGGACCTCCCTAGGCGTTGGG
ATAAAACTTAGTATCGTCTCATATCTAACATCAAAGCACACAAACACAGAAGTAGGAGGA
GTCTCTTCTGGAACAGAAGCACCATAATAAATGAAACCATTGATGCATCGTCCCCTGGTT
ATTGGGTCATAAG*CGGGGAGGTAATTTGGGTACGAGATACTACTCGTCCTCCTCTTCCA
GTCTTTTACCTCGT

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2CV73TF 652 0 0
TTGATGCATCGTCCCCTGGTTATTGGGTCATAAGGCGGGGAGGTAATTTGGGTACGAGAT
ACTACTCGTCCTCCTCTTCCAAGTCTTTTAACCTCGTGCACCATGAAACTAGGGTTATGA
GCATACCTAGATGTCAACAGGGTCAATGCTTTGAATTGATCACCAACAGGATCATATCCC
AAGCATGTGTCCGTTGCCTTGCAGTGAAAGGTAATGACTTGCCCGGTGGTAGGGTTACAT
ATAATGAACTTTAACCTATCATTAACAGCCATAAAGCCATGGACGGAAGAATACTTGAAG
CCGCCGAAAGGCATGGTCACTGAGGGTATTGTCATGTCTAGATTGGCAACCAAAGAAGAA
GAAGAAGTTACCTCTTCCTCTCCCGAGAAGATGAAGAGACGCTTGGGTTCACTAAATACA
CTGTTGGTGAAAGTGACTGTAAAACGGGGTGGCTTGGCAGCGTAGTAAGAAGCCACGAAT
CTTTGGCTTCGGATAAAGGAATACCAAGCCTTGGACACGCATAGGAACCTCATAAGCGAC
TTTCCAGGCAATCTAATCAGTGTCTCCACCTCCATATCGTAAGGGAAGATGACTTGTAGG
ATCTTCTTGTCGCTTCCAACGCCATTGCCGTCCCTTGACTCGTCGACTTCTC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 4

CO CL2742Contig1 1339 4 2 U
AGAGAAAAAGTAATGAATTACATAACATGTCGGCTTCACATAGGTAGTATTAGTGCCAGA
GTCTGTCACAAAGCATGAAACGAATTCTGATTACAAAAAAAAGAA*GGTTTTATAAAGCA
AAGGATTAAACTGTGGTTCATGCTGATCTTCAGAAATATAAACGGGTTCATTCAGATTCT
TCCTCATTATCACTGTCGTCGCCTCCAAACATAGAAGCCATTTTCATCGTTAGATTTGCA
GCTATTTCCCTCCTCTGGAAATCAGGCATGAGCCGCAAGTTGTCACGGATGTTCCCTATT
TCTGACATCAACTGTTCCACGTCTTCCGACTCATAAAATTTGTCGTGTTCTGTGCCCAAA
GGTATCTCATCTGTTGTTACTACTGCTCTGTCAGTCTCACTCTGTGTCCCTGAAGACCGC
AGCTCTACTTCCTTTGGATTCACCATATTATTTTCTACCTCCCGTGAGGTGGATCCGCCA
GCATCTGCGTATGAATGAGCGGAAACCCATCTCTCATCGATATTTTCCCATGGATCGGCT
GAGCCTGATGATAGCACTTCATACTCCAATTCATATTCAGATTCTTCTTCTGACAACTCT
TCACCATGAGGTAACACGGGTTCATTTATCTTATCACCCGATTTGAGAATCATTCCAGGC
CACATATGTGCCGAAAGAGCACCAAACAGACGTTCAACCCCTTGAGAATCCCCATCGACT
GATAAACAATTGTCAAAATCAGGATCAGACGCACAAGCCTCAATGAACTCGATGTTGTTG
TTGCGGCACCACTCAAGACAAGTTCCCCTGATATCCACTGATGTATCGTCGTCGCTCCCC
AACAAGCTACTTCCTTCACTTTGGGAGATGCCAAACTCATCATCATACAGATCTGTGGAG
GAGGAGTCAGCTGCTTTCAAAAGACGTCTTCTATATTCATCATGAGCAGGGTGATGAGGG
ACAAGATCTACTTTGTTCCCAATGCACAACAATATATCAAAACTGTTGATGTCTGGAGCA
TGAGAAACCCAGTCTTGAAGAGCAACAAGAGTTGACAGCTGAGTCAAGTCGAAGACCAAA
ACTAACGCCACAAGTGGATGTGAGTGAGGATGAGGGAGAGAGTAGTCATCGGAAATATGT
GATATCCAAACAGATACATCCGCAGAGTAATACTTGGTGTTAATCGTCCAGTCATGAACT
TCGGTTTGAGATGATGAATCCTCAAAATCGACAGAGAGCAATCGCGAGAGAAGGGTGCGC
TTGCCGACACCAGAGGAACCGACGACGAAGACTCCCGGTCTGCCTACTTCCTCCATCAAT
GTCTCCTTCTAGTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC32JQ U 55
AF RR2H179JQ U 1
AF RR2H179TF C 9
AF RR2BC32TF C 589
BS 1 684 RR2H179JQ
BS 685 1339 RR2BC32TF

RD RR2BC32JQ 433 0 0
GCCAAAGTCTGTCACAAAGCATGAAACGAATTCTGATTACAAAAAAAAAAAAGGTTTTAT
AAAGCAAAGGATTAAACTGGGGTTCATGCTGATCTTCAAAAATATAAACGGGTTCATTCA
AATTCTTCCTCATTATCACTGTCGTCCCCTCCAAACATAAAAGCCATTTTCATCGCTAGA
TTTGAAGCTATTTCCCTCCTCTGGAAATCAGGCATGAGCCGCAAGTTGTCACGGATGTTC
CCTATTTCTGACATCAACTGTTCCACGTCTTCCGACTCATAAAATTTGTCGTGTTCTGTG
CCCAAAGGTATCTCATCTGTTGTTACTACTGCTCTGTCAGTCTCACTCTGTGTCCCTGAA
AACCGCAGCTCTACTTCCTTTGGATTCACCATATTATTTTCTACCTCCCGTGAGGGGGAT
CCGCCAGCATCTG

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR2H179JQ 685 0 0
AGAGAAAAAGTAATGAATTACATAACATGTCGGCTTCACATAGGTAGTATTAGTGCCAGA
GTCTGTCACAAAGCATGAAACGAATTCTGATTACAAAAAAAAGAA*GGTTTTATAAAGCA
AAGGATTAAACTGTGGTTCATGCTGATCTTCAGAAATATAAACGGGTTCATTCAGATTCT
TCCTCATTATCACTGTCGTCGCCTCCAAACATAGAAGCCATTTTCATCGTTAGATTTGCA
GCTATTTCCCTCCTCTGGAAATCAGGCATGAGCCGCAAGTTGTCACGGATGTTCCCTATT
TCTGACATCAACTGTTCCACGTCTTCCGACTCATAAAATTTGTCGTGTTCTGTGCCCAAA
GGTATCTCATCTGTTGTTACTACTGCTCTGTCAGTCTCACTCTGTGTCCCTGAAGACCGC
AGCTCTACTTCCTTTGGATTCACCATATTATTTTCTACCTCCCGTGAGGTGGATCCGCCA
GCATCTGCGTATGAATGAGCGGAAACCCATCTCTCATCGATATTTTCCCATGGATCGGCT
GAGCCTGATGATAGCACTTCATACTCCAATTCATATTCAGATTCTTCTTCTGACAACTCT
TCACCATGAGGTAACACGGGTTCATTTATCTTATCACCCGATTTGAGAATCATTCCAGGC
CACATATGTGCCGAAAGAGCACCA
C

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2H179TF 669 0 0
AGTAATGAATTACATAACATGTCGGCTTCACATAGGTAGTATTAGTGCCAGAGTCTGTCA
CAAAGCATGAAACGAATTCTGATTACAAAAAAAAGAA*GGTTTTATAAAGCAAAGGATTA
AACTGTGGTTCATGCTGATCTTCAGAAATATAAACGGGTTCATTCAGATTCTTCCTCATT
ATCACTGTCGTCGCCTCCAAACATAGAAGCCATTTTCATCGTTAGATTTGCAGCTATTTC
CCTCCTCTGGAAATCAGGCATGAGCCGCAAGTTGTCACGGATGTTCCCTATTTCTGACAT
CAACTGTTCCACGTCTTCCGACTCATAAAATTTGTCGTGTTCTGTGCCCAAAGGTATCTC
ATCTGTTGTTACTACTGCTCTGTCAGTCTCACTCTGTGTCCCTGAAGACCGCAGCTCTAC
TTCCTTTGGATTCACCATATTATTTTCTACCTCCCGTGAGGTGGATCCGCCAGCATCTGC
GTATGAATGAGCGGAAACCCATCTCTCATCGATATTTTCCCATGGATCGGCTGAGCCTGA
TGATAGCACTTCATACTCCAATTCATATTCAGATTCTTCTTCTGACAACTCTTCACCATG
AGGTAACACGGGTTCATTTATCTTATCACCCGATTTGAGAATCATTCCAGGCCACATATG
TGCCGAAAG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2BC32TF 751 0 0
TCTGACAACTCTTCACCATGAGGTAACACGGGTTCATTTATCTTATCACCCGATTTGAGA
ATCATTCCAGGCCACATATGTGCCGAAAGAGCACCAAACAGACGTTCAACCCCTTGAGAA
TCCCCATCGACTGATAAACAATTGTCAAAATCAGGATCAGACGCACAAGCCTCAATGAAC
TCGATGTTGTTGTTGCGGCACCACTCAAGACAAGTTCCCCTGATATCCACTGATGTATCG
TCGTCGCTCCCCAACAAGCTACTTCCTTCACTTTGGGAGATGCCAAACTCATCATCATAC
AGATCTGTGGAGGAGGAGTCAGCTGCTTTCAAAAGACGTCTTCTATATTCATCATGAGCA
GGGTGATGAGGGACAAGATCTACTTTGTTCCCAATGCACAACAATATATCAAAACTGTTG
ATGTCTGGAGCATGAGAAACCCAGTCTTGAAGAGCAACAAGAGTTGACAGCTGAGTCAAG
TCGAAGACCAAAACTAACGCCACAAGTGGATGTGAGTGAGGATGAGGGAGAGAGTAGTCA
TCGGAAATATGTGATATCCAAACAGATACATCCGCAGAGTAATACTTGGTGTTAATCGTC
CAGTCATGAACTTCGGTTTGAGATGATGAATCCTCAAAATCGACAGAGAGCAATCGCGAG
AGAAGGGTGCGCTTGCCGACACCAGAGGAACCGACGACGAAGACTCCCGGTCTGCCTACT
TCCTCCATCAATGTCTCCTTCTAGTTCTCCC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 3

CO CL2743Contig1 908 3 14 U
GCAGAGGAGACATATTTATATTATTATTCGTTCACGTTTTGCTGAATAAACATACATCTG
AATAAGTAGCCAAAGACACAGGAGATTTCATCTTATATGTAGACATTGTTTTGTTCTTTT
TTTATCTATAATCTGTAAACATTTTACTAAGGAAGCTGAAGATGATGTTGTTGAGTTTGG
ATTGGGAAGGTAGCTTTCCGGTACTCAGCAAGTGCCCATAATGGGAAAGTGTTTCTGTAG
GTAGCATAGTGTATCAAGCAATTCCTCATGAACACTCCTACTATCTCCTGTTGAGGGAAA
TCTCCATTCTCCATTTGCGAATTGATGATAAGTTTTGCAGCACGGTGAAGAGGTACTGGA
TCTCTCTCAGCCTGTCCAGCGTGAATCAGACCCATTACTGCCCAAGCTGTTTGCACCAAG
TTTGATGTTTTCCCTTCTGATGGTATGTATCTCTGTTCAGGGCATGACAGATAGCTTTCG
CCCCAGCCTCCATCGTCTCTCTGTGTCCTGAGTAAAAACGCAACACCTTTACGCATAGGC
AGACTGTTTTTATATGTTTTACCAGCGGCTGCTAGGCCGGCAAGAGCAAACCATGTTCCG
TAAATGAAACAAACTCCCCAGTTCCCATACCATGAACCATCGGGCGTCTGTTCGTTTTCT
ATGAATTGCACAGCTTTCTCGATGGACCGGCTTATCTCTTTTGTCCTGTGGTCTGGATAG
AGTTTCCTGAACAGAATCAAAGCTTGTATAACAGATGAGGTGCATTCCACATACTCACGC
TCGGCCACGAGATTAGCCAGAAATTCCGTGGGATTGAGGAATTCAATCCATTCATAAGCA
CGGACGGGCTCCCATGCAGTCATACCTCCATTTTTACTCTGAAAAGATAGCAAGAGATTA
ACAGAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH49JQ U 212
AF RR2D590JQ U 1
AF RR2B644JQ U 7
BS 1 32 RR2D590JQ
BS 33 33 RR2B644JQ
BS 34 230 RR2D590JQ
BS 231 231 RR2B644JQ
BS 232 634 RR2D590JQ
BS 635 635 RR2B644JQ
BS 636 641 RR2D590JQ
BS 642 642 RR2B644JQ
BS 643 726 RR2D590JQ
BS 727 727 RR2B644JQ
BS 728 759 RR2D590JQ
BS 760 760 RR2B644JQ
BS 761 783 RR2D590JQ
BS 784 908 RR2B644JQ

RD RR2EH49JQ 180 0 0
GTGCCCATAATGGGAAAGTGTTTCTGTAGGTAGCATAGTGTATCAAGCAATTCCTCATGA
ACACTCCTACTATCTCCTGTTGAGGGAAATCTCCATTCTCCATTTGCGAATTGATGATAA
GTTTTGCAGCACGGTGAAAAGGTACTGGATCTCTCTCAGCCTGTCCAGCGTGAATCAGAC

QA 1 180 1 180
DS 

RD RR2D590JQ 783 0 0
GCAGAGGAGACATATTTATATTATTATTCGTTTACGTTTTGCTGAATAAACATACATCTG
AATAAGTAGCCAAAGACACAGGAGATTTCATCTTATATGTAGACATTGTTTTGTTCTTTT
TTTATCTATAATCTGTAAACATTTTACTAAGGAAGCTGAAGATGATGTTGTTGAGTTTGG
ATTGGGAAGGTAGCTTTCCGGTACTCAGCAAGTGCCCATAATGGGAAAGTATTTCTGTAG
GTAGCATAGTGTATCAAGCAATTCCTCATGAACACTCCTACTATCTCCTGTTGAGGGAAA
TCTCCATTCTCCATTTGCGAATTGATGATAAGTTTTGCAGCACGGTGAAGAGGTACTGGA
TCTCTCTCAGCCTGTCCAGCGTGAATCAGACCCATTACTGCCCAAGCTGTTTGCACCAAG
TTTGATGTTTTCCCTTCTGATGGTATGTATCTCTGTTCAGGGCATGACAGATAGCTTTCG
CCCCAGCCTCCATCGTCTCTCTGTGTCCTGAGTAAAAACGCAACACCTTTACGCATAGGC
AGACTGTTTTTATATGTTTTACCAGCGGCTGCTAGGCCGGCAAGAGCAAACCATGTTCCG
TAAATGAAACAAACTCCCCAGTTCCCATACCATGGACCATCTGGCGTCTGTTCGTTTTCT
ATGAATTGCACAGCTTTCTCGATGGACCGGCTTATCTCTTTTGTCCTGTGGTCTGGATAG
AGTTTCTTGAACAGAATCAAAGCTTGTATAACAGATGAG*TGCATTCCACATACTCACGC
TCG

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2B644JQ 902 0 0
GAGACATATTTATATTATTATTCGTTCACGTTTTGCTGAATAAACATACATCTGAATAAG
TAGCCAAAGACACAGGAGATTTCATCTTATATGTAGACATTGTTTTGTTCTTTTTTTATC
TATAATCTGTAAACATTTTACTAAGGAAGCTGAAGATGATGTTGTTGAGTTTGGATTGGG
AAGGTAGCTTTCCGGTACTCAGCAAGTGCCCATAATGGGAAAGTGTTTCTGTAGGTAGCA
TAGTGTATCAAGCAATTCCTCATGAACACTCCTACTATCTCCTGTTGAGGGAAATCTCCA
TTCTCCATTTGCGAATTGATGATAAGTTTTGCAGCACGGTGAAGAGGTACTGGATCTCTC
TCAGCCTGTCCAGCGTGAATCAGACCCATTACTGCCCAAGCTGTTTGCACCAAGTTTGAT
GTTTTCCCTTCTGATGGTATGTATCTCTGTTCAGGGCATGACAGATAGCTTTCGCCCCAG
CCTCCATCGTCTCTCTGTGTCCTGAGTAAAAACGCAACACCTTTACGCATAGGCAGACTG
TTTTTATATGTTTTACCAGCGGCTGCTAGGCCGGCAAGAGCAAACCATGTTCCGTAAATG
AAACAAACTCCCCAGTTCCCATACCATGAACCATCGGGCGTCTGTTCGTTTTCTATGAAT
TGCACAGCTTTCTCGATGGACCGGCTTATCTCTTTTGTCCTGTGGTCTGGATAGAGTTTC
CTGAACAGAATCAAAGCTTGTATAACAGATGAGGTGCATTCCACATACTCACGCTCGGCC
ACGAGATTAGCCAGAAATTCCGTGGGATTGAGGAATTCAATCCATTCATAAGCACGGACG
GGCTCCCATGCAGTCATACCTCCATTTTTACTCTGAAAAGATAGCAAGAGATTAACAGAG
TC

QA 1 902 1 902
DS 



AS 1 4

CO CL2744Contig1 1228 4 8 U
GGGCAAATTCTAGGGAGTTGTTGTAACAAGAGAACATAGAGAAGACACTCTTACTCTACG
TACAAGAAGAGATATGAAGTTTGGGGATATGGCATCGGCCTTTAGATCACCCACAAGGTT
GATTCTTGTATTCGGTGTATTGGTTTTGTGCTCGGTTTCTCCTGTTCAAAGTTGGAGTAA
AGAAGGTCATATTCTTACATGCCGAATTGCTCAAAAACTTTTAGAAGCAGGACCGGCACA
TATCGTAGAGAATCTATTACCGGATTACGCGAAAGGAGATTTATCGTCATTATGTGTATG
GCCAGACCAAATCCGACATTGGTACAAGTACCGTTGGACCAGCCCTCTCCATTTCATCGA
CACTCCCGACCAAGCCTGCTCTTACGAATACTCCAGGGATTGTCATGATCAACATGGGTT
AAAGGATATGTGTGTGGATGGAGCAATTCAAAATTTCACGTCTCAGCTTCAGCATTACGG
TGAAGGAACATCTGACCGTCGATATAACATGACAGAAGCCCTTTTGTTCTTGTCTCATTT
CATGGGAGACATTCATCAGCCGATGCATGTCGGATTCACAAGTGATGAAGGAGGAAACAC
GATAGATCTACGTTGGTACAGACACAAATCAAATTTACATCATGTATGGGACAGGGAGAT
CATTCTCACGGCTCTAAAAGAATACTACGACAAGGACTTGGATCTTCTCCAAGAAGATCT
TGAGAAGAACATCACCAATGGATTATGGCATGACGATCTATCTTCGTGGACAGAATGCAA
CGACCTCATCGCTTGTCCACACAAGTATGCGTCGGAGAGTATAAAGTTAGCTTGTAAATA
TGGCTACGAAGGCGTGAAGTCGGGTGAAACGTTATCAGAGGAGTATTTCGATACAAGGAT
GCCAATAGTGATGAAGAGAATTGTTCAAGGAGGAGTTAGACTAGCAATGATACTAAACCG
GGTTTTTAGTGATACTCACGCTGAAGTTGCTGCCACTTGAACCAAACCCGGACCAGACCG
GATCACCAAAGCATTTGATTAGGAGATTATTTGCCCATTTCACAAAGTTAAAATAAGACT
GATCGGATATTCTTTTCTTTGTAGCCATTTCCATTTGACAGCTACTTATTGCCCGTGGGC
TACTTTTTAAAAATAGATGTGTTTAGGATTAGAGGTCATATGCTAATTTCGTGTGTTTGT
TTAAAATAAATAAGAAATCTGAAATTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E135TF U 1
AF RR2EA03TF U 18
AF RR2B110TF U 1
AF RR2E135JQ C 676
BS 1 278 RR2B110TF
BS 279 279 RR2E135TF
BS 280 288 RR2B110TF
BS 289 289 RR2E135TF
BS 290 557 RR2B110TF
BS 558 558 RR2E135TF
BS 559 811 RR2B110TF
BS 812 1228 RR2E135JQ

RD RR2E135TF 650 0 0
GGGCAAATTCTAGGGAGTTGTTGTAACAAGAGAACATAGAGAAGACACTCTTACTCTACG
TACAAGAAGAGATATGAAGTTTGGGGATATGGCATCGGCCTTTAGATCACCCACAAGGTT
GATTCTTGTATTCGGTGTATTGGTTTTGTGCTCGGTTTCTCCTGTTCAAAGTTGGAGTAA
AGAAGGTCATATTCTTACATGCCGAATTGCTCAAAAACTTTTAGAAGCAGGACCGGCACA
TATCGTAGAGAATCTATTACCGGATTACGCGAAAGGAGATTTATCGTCATTATGTGTATG
GCCAGACCAAATCCGACATTGGTACAAGTACCGTTGGACCAGCCCTCTCCATTTCATCGA
CACTCCCGACCAAGCCTGCTCTTACGAATACTCCAGGGATTGTCATGATCAACATGGGTT
AAAGGATATGTGTGTGGATGGAGCAATTCAAAATTTCACGTCTCAGCTTCAGCATTACGG
TGAAGGAACATCTGACCGTCGATATAACATGACAGAAGCCCTTTTGTTCTTGTCTCATTT
CATGGGAGACATTCATCAGCCGATGCATGTCGGATTCACAAGTGATGAAGGAGGAAACAC
GATAGATCTACGTTGGTACAGACACAAATCAAATTTACATCATGTATGGG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2EA03TF 694 0 0
GG
GTTGTAACAAGAGAACATAGAGAAGACACTCTTACTCTACGTACAAGAAGAGATATGAAG
TTTGGGGATATGGCATCGGCCTTTAGATCACCCACAAGGTTGATTCTTGTATTCGGTGTA
TTGGTTTTGTGCTCGGTTTCTCCTGTTCAAAGTTGGAGTAAAGAAGGTCATATTCTTACA
TGCCGAATTGCTCAAAAACTTTTAGAAGCAGGACCGGCACATATCGTAGAGAATCTATTA
CCGGATTACGCGAAAGGAGATTTATCGTCATTATGAGTATGGCCAGACCAAATCCGACAT
TGGTACAAGTACCGTTGGACCAGCCCTCTCCATTTCATCGACACTCCCGACCAAGCCTGC
TCTTACGAATACTCCAGGGATTGTCATGATCAACATGGGTTAAAGGATATGTGTGTGGAT
GGAGCAATTCAAAATTTCACGTCTCAGCTTCAGCATTACGGTGAAGGAACATCTGACCGT
CGATATAACATGACAGAAGCCCTTTTGTTCTTGTCTCATTTCATGGGAGACATTCATCAG
CCGATGCATGTCGGATTCACAAGTGATGAAGGAGGAA*CACGATAGATCTACGTTGGTAC
AGACACAAATCAAATTTACATCATGTATGGGACAGGGAGATCATTCTCACGGCTCTAAAA
GAATACTACGACAAGGACTTGGATCTTCTCCA

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR2B110TF 811 0 0
GGGCAAATTCTAGGGAGTTGTTGTAACAAGAGAACATAGAGAAGACACTCTTACTCTACG
TACAAGAAGAGATATGAAGTTTGGGGATATGGCATCGGCCTTTAGATCACCCACAAGGTT
GATTCTTGTATTCGGTGTATTGGTTTTGTGCTCGGTTTCTCCTGTTCAAAGTTGGAGTAA
AGAAGGTCATATTCTTACATGCCGAATTGCTCAAAAACTTTTAGAAGCAGGACCGGCACA
TATCGTAGAGAATCTATTACCGGATTACGCGAAAGGAGGTTTATCGTCGTTATGTGTATG
GCCAGACCAAATCCGACATTGGTACAAGTACCGTTGGACCAGCCCTCTCCATTTCATCGA
CACTCCCGACCAAGCCTGCTCTTACGAATACTCCAGGGATTGTCATGATCAACATGGGTT
AAAGGATATGTGTGTGGATGGAGCAATTCAAAATTTCACGTCTCAGCTTCAGCATTACGG
TGAAGGAACATCTGACCGTCGATATAACATGACAGAAGCCCTTTTGTTCTTGTCTCATTT
CATGGGAGACATTCATCGGCCGATGCATGTCGGATTCACAAGTGATGAAGGAGGAAACAC
GATAGATCTACGTTGGTACAGACACAAATCAAATTTACATCATGTATGGGACAGGGAGAT
CATTCTCACGGCTCTAAAAGAATACTACGACAAGGACTTGGATCTTCTCCAAGAAGATCT
TGAGAAGAACATCACCAATGGATTATGGCATGACGATCTATCTTCGTGGACAGAATGCAA
CGACCTCATCGCTTGTCCACACAAGTATGCG

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2E135JQ 553 0 0
AAAAGAATACTACGACAAGGACTTGGATCTTCTCCAAGAAGATCTTGAGAAGAACATCAC
CAATGGATTATGGCATGACGATCTATCTTCGTGGACAGAATGCAACGACCTCATCGCTTG
TCCACACAAGTATGCGTCGGAGAGTATAAAGTTAGCTTGTAAATATGGCTACGAAGGCGT
GAAGTCGGGTGAAACGTTATCAGAGGAGTATTTCGATACAAGGATGCCAATAGTGATGAA
GAGAATTGTTCAAGGAGGAGTTAGACTAGCAATGATACTAAACCGGGTTTTTAGTGATAC
TCACGCTGAAGTTGCTGCCACTTGAACCAAACCCGGACCAGACCGGATCACCAAAGCATT
TGATTAGGAGATTATTTGCCCATTTCACAAAGTTAAAATAAGACTGATCGGATATTCTTT
TCTTTGTAGCCATTTCCATTTGACAGCTACTTATTGCCCGTGGGCTACTTTTTAAAAATA
GATGTGTTTAGGATTAGAGGTCATATGCTAATTTCGTGTGTTTGTTTAAAATAAATAAGA
AATCTGAAATTTT

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 4

CO CL2745Contig1 752 4 2 U
AAAGCAAAACCTTACTAAAGTGAGGAATGTTATGAACTTAAGCCAAACTAAATGATAACA
AGAACAAGAGTTTTCATTAAATTAAAAATCGAATTGTAAGTTGTAACAGATAAAAAAACT
AGAGAAAACAGATACAAAGTCCATAGTCATTGAACTTGAGTTGCAATGTTGCAACGAAAT
GGTCGCTCATGGAGGACTTTGATCTACTCTATGCTTACTTAAGCCACAAGAGTGCTTGCG
GTGGTAGACTCATATTTCCAGACGGGTGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAGTAACGAGCA
AGACGATGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAATCCTTGTCTTTCCTG
TTCCTCTCAAGGTGCTTACGGATAGCAACTGCTTTCTTGATCAAGTGATAGAGATCCTCT
GGGATCTCAGGAGCAAGACCATGAGCTTTCAAGATTCTCAAGATCTCGTTTCCGGTAACA
CTCTTCACTTGTGGGATTCCGTGAGAGTCACGAAGGATGACACCAATCTGTGATGGAGTC
AAACCCTTCTTCGCAAACTTGCAGATGGACTCATCAACATCCTGGGAGGTTGTCTTGAGC
CAGCTTGGTGGTGATCGCTTATACGGCAGAGCAGAAGCTGAGATTCCCTTACCTTTAGAG
TGGAGTCGGCCCATGTCGACGGCTGCGCACGGAGTTTACTTACTCTGAAGATCGCTCTTC
CTCGGGTTTTTTCCGGCGGCGACTGCAGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B310JQ U 1
AF RR2AN81JQ U 54
AF RR2B310TF C 84
AF RR2AN81TF C 54
BS 1 646 RR2B310JQ
BS 647 752 RR2AN81JQ

RD RR2B310JQ 646 0 0
AAAGCAAAACCTTACTAAAGTGAGGAATGTTATGAACTTAAGCCAAACTAAATGATAACA
AGAACAAGAGTTTTCATTAAATTAAAAATCGAATTGTAAGTTGTAACAGATAAAAAAACT
AGAGAAAACAGATACAAAGTCCATAGTCATTGAACTTGAGTTGCAATGTTGCAACGAAAT
GGTCGCTCATGGAGGACTTTGATCTACTCTATGCTTACTTAAGCCACAAGAGTGCTTGCG
GTGGTAGACTCATATTTCCAGACGGGTGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAGTAACGAGCA
AGACGATGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAATCCTTGTCTTTCCTG
TTCCTCTCAAGGTGCTTACGGATAGCAACTGCTTTCTTGATCAAGTGATAGAGATCCTCT
GGGATCTCAGGAGCAAGACCATGAGCTTTCAAGATTCTCAAGATCTCGTTTCCGGTAACA
CTCTTCACTTGTGGGATTCCGTGAGAGTCACGAAGGATGACACCAATCTGTGATGGAGTC
AAACCCTTCTTCGCAAACTTGCAGATGGACTCATCAACATCCTGGGAGGTTGTCTTGAGC
CAGCTTGGTGGTGATCGCTTATACGGCAGAGCAGAAGCTGAGATTC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2AN81JQ 699 0 0
GATAACAAGAACAAGAGTTTTCATTAAATTAAAAATCGAATTGTAAGTTGTAACAGATAA
AAAAACTAGAGAAAACAGATACAAAGTCCATAGTCATTGAACTTGAGTTGCAATGTTGCA
ACGAAATGGTCGCTCATGGAGGACTTTGATCTACTCTATGCTTACTTAAGCCACAAGAGT
GCTTGCGGTGGTAGACTCATATTTCCAGACGGGTGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAGTA
ACGAGCAAGACGATGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAATCCTTGTC
TTTCCTGTTCCTCTCAAGGTGCTTACGGATAGCAACTGCTTTCTTGATCAAGTGATAGAG
ATCCTCTGGGATCTCAGGAGCAAGACCATGAGCTTTCAAGATTCTCAAGATCTTGTTTCC
GGTAACACTCTTCACTTGTGGGATTCCGTGAGAGTCACGAAGGATGACACCAATCTGTGA
TGGAGTCAAACCCTTCTTCGCAAACTTGCAGATGGACTCATCAACATCCTGGGAGGTTGT
CTTGAGCCAGCTTGGTGGTGATCGCTTATACGGCAGAGCAGAAGCTGAGATTCCCTTACC
TTTAGAGTGGAGTCGGCCCATGTCGACGGCTGCGCACGGAGTTTACTTACTCTGAAGATC
GCTCTTCCTCGGGTTTTTTCCGGCGGCGACTGCAGTCCC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2B310TF 669 0 0
AAAAATCGAATTGTAAGTTGTAACAGATAAAAAAACTAGAGAAAACAGATACAAAGTCCA
TAGTCATTGAACTTGAGTTGCAATGTTGCAACGAAATGGTCGCTCATGGAGGACTTTGAT
CTACTCTATGCTTACTTAAGCCACAAGAGTGCTTGCGGTGGTAGACTCATATTTCCAGAC
GGGTGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAGTAACGAGCAAGACGATGGATTCTGCTCTCCAC
AAGAATCAACCTGAACTTGGAATCCTTGTCTTTCCTGTTCCTCTCAAGGTGCTTACGGAT
AGCAACTGCTTTCTTGATCAAGTGATAGAGATCCTCTGGGATCTCAGGAGCAAGACCATG
AGCTTTCAAGATTCTCAAGATCTCGTTTCCGGTAACACTCTTCACTTGTGGGATTCCGTG
AGAGTCACGAAGGATGACACCAATCTGTGATGGAGTCAAACCCTTCTTCGCAAACTTGCA
GATGGACTCATCAACATCCTGGGAGGTTGTCTTGAGCCAGCTTGGTGGTGATCGCTTATA
CGGCAGAGCAGAAGCTGAGATTCCCTTACCTTTAGAGTGGAGTCGGCCCATGTCGACGGC
TGCGCACGGAGTTTACTTAATCTGAAGATCGCTCTTCCTCGGGTTTTTTCCGGCGGCGAC
TGCAGTCCC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2AN81TF 690 0 0
GATAACAAGAACAAGAGTTTTCATTAAATTAAAAATCGAATTGTAAGTTGTAACAGATAA
AAAAACTAGAGAAAACAGATACAAAGTCCATAGTCATTGAACTTGAGTTGCAATGTTGCA
ACGAAATGGTCGCTCATGGAGGACTTTGATCTACTCTATGCTTACTTAAGCCACAAGAGT
GCTTGCGGTGGTAGACTCATATTTCCAGACGGGTGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAGTA
ACGAGCAAGACGATGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAATCCTTGTC
TTTCCTGTTCCTCTCAAGGTGCTTACGGATAGCAACTGCTTTCTTGATCAAGTGATAGAG
ATCCTCTGGGATCTCAGGAGCAAGACCATGAGCTTTCAAGATTCTCAAGATCTTGTTTCC
GGTAACACTCTTCACTTGTGGGATTCCGTGAGAGTCACGAAGGATGACACCAATCTGTGA
TGGAGTCAAACCCTTCTTCGCAAACTTGCAGATGGACTCATCAACATCCTGGGAGGTTGT
CTTGAGCCAGCTTGGTGGTGATCGCTTATACGGCAGAGCAGAAGCTGAGATTCCCTTACC
TTTAGAGTGGAGTCGGCCCATGTCGACGGCTGCGCACGGAGTTTACTTACTCTGAAGATC
GCTCTTCCTCGGGTTTTTTCCGGCGGCGAC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 3

CO CL2746Contig1 854 3 5 U
GAAACACGAATCGGTTTGCTTCAAGCAACAAGATGAACCAAAGTAGCCTTACACATACGA
GTTAATCCCACAAACAGAACAGATCAAACTAAGCCAATCATGCAATTGCAAAAAACAACG
AGACAGCACTTACAGCGCTCATACCGAAAAAATAAAGGGAACCTAACAAATCCGAAGTTG
CTCTAGAAAGTCTTCTACATAATCCTGATTGGTAGGAACAAAAGGGACAGATTAGGCTAA
AGAAGAGCCTATTTGCAGGTCTATAGATGTCTCTCATTTAATCTTCTTAATGATGTCCTC
GATGACTTCTTCCATATCAAGAGCCTTCATTGGAGCAAATGGACGTTTCATATCCAAAAG
ACTGATGAATGTTTCACCACCTTCCTCTCGGATCTCAAAGCAACCGCGCCTTGGCTTTTC
AGGGTTGAGAGTCACAGTGACGCCAGGAACAGCTCCCTCCAGACCTTCCTTCACCTGAAT
CGCCCTTGTCTTGAACGCATTGCATTGTTTACAGTGCTCTATAACAATCTTGGGCTTCGT
CGAGTCTCCAACCTCCTCCTCCGCAGCTTCTTCTTCCTCTTCCTCGTCCTTCTCAACTTC
CTGAGATGCTTTCTCTTCCTTCTTCGCCTTCTTAGCTCCTCTCCCAGTCTCAGTCGATGG
CTTCTTCCTCTTCGGCGGCGACGCGAGCTTCTTCACCTGCTTGGTGGTGACGGATCCAGC
GGCTTTAGCGCCGTTTTGTTGAGTCGCACTTCGAGTTCGGCGATCCATGCTCCGAGTCAC
TCTCGACGAAGTTGGTGCCTTTTCCTCTCCATCTCCCTTACTCTCCACCGGCGCCATTGT
ACGGAAAAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D077JQ U 1
AF RR2GW27JQ U 3
AF RR2GW27TF C 154
BS 1 190 RR2D077JQ
BS 191 759 RR2GW27JQ
BS 760 760 RR2GW27TF
BS 761 824 RR2GW27JQ
BS 825 854 RR2GW27TF

RD RR2D077JQ 190 0 0
GAAACACGAATCGGTTTGCTTCAAGCAACAAGATGAACCAAAGTAGCCTTACACATACGA
GTTAATCCCACAAACAGAACAGATCAAACTAAGCCAATCATGCAATTGCAAAAAACAACG
AGACAGCACTTACAGCGCTCATACCGAAAAAATAAAGGGAACCTAACAAATCCGAAGTTG
CTCTAGAAAG

QA 1 190 1 190
DS 

RD RR2GW27JQ 822 0 0
GG
CACGAATCGGTTTGCTTCAAGCAACAAGATGAACCAAAGTAGCCTTACACATACGAGTTA
ATCCCACAAACAGAACAGATCAAACTAAGCCAATCATGCAATTGCAAAAAACAACGAGAC
AGCACTTACAGCGCTCATACCGAAAAAATAAAGGGAACCTAACAAATCCGAAGTTGCTCT
AGAAAGTCTTCTACATAATCCTGATTGGTAGGAACAAAAGGGACAGATTAGGCTAAAGAA
GAGCCTATTTGCAGGTCTATAGATGTCTCTCATTTAATCTTCTTAATGATGTCCTCGATG
ACTTCTTCCATATCAAGAGCCTTCATTGGAGCAAATGGACGTTTCATATCCAAAAGACTG
ATGAATGTTTCACCACCTTCCTCTCGGATCTCAAAGCAACCGCGCCTTGGCTTTTCAGGG
TTGAGAGTCACAGTGACGCCAGGAACAGCTCCCTCCAGACCTTCCTTCACCTGAATCGCC
CTTGTCTTGAACGCATTGCATTGTTTACAGTGCTCTATAACAATCTTGGGCTTCGTCGAG
TCTCCAACCTCCTCCTCCGCAGCTTCTTCTTCCTCTTCCTCGTCCTTCTCAACTTCCTGA
GATGCTTTCTCTTCCTTCTTCGCCTTCTTAGCTCCTCTCCCAGTCTCAGTCGATGGCTTC
TTCCTCTTCGGCGGCGACGCGAGCTTCTTCACCTGCTTGGTGGTGACGGATCCAGCGGCT
TTAGCGCCGTTTTGTTGAGTCGCACTTCGAGTTCG*CGATCCATGCTCCGAGTCACTCTC
GACGAAGTTGGTGCCTTTTCCTCTCCATCTCCCTTACTCT

QA 3 822 3 822
DS 

RD RR2GW27TF 701 0 0
AAAGGGAAC
CTAACAAATCCGAAGTTGCTCTAGAAAGTCTTCTACATAATCCTGATTGGTAGGAACAAA
AGGGACAGATTAGGCTAAAGAAGAGCCTATTTGCAGGTCTATAGATGTCTCTCATTTAAT
CTTCTTAATGATGTCCTCGATGACTTCTTCCATATCAAGAGCCTTCATTGGAGCAAATGG
ACGTTTCATATCCAAAAGACTGATGAATGTTTCACCACCTTCCTCTCGGATCTCAAAGCA
ACCGCGCCTTGGCTTTTCAGGGTTGAGAGTCACAGTGACGCCAGGAACAGCTCCCTCCAG
ACCTTCCTTCACCTGAATCGCCCTTGTCTTGAACGCATTGCATTGTTTACAGTGCTCTAT
AACAATCTTGGGCTTCGTCGAGTCTCCAACCTCCTCCTCCGCAGCTTCTTCTTCCTCTTC
CTCGTCCTTCTCAACTTCCTGAGATGCTTTCTCTTCCTTCTTCGCCTTCTTAGCTCCTCT
CCCAGTCTCAGTCGATGGCTTCTTCCTCTTCGGCGGCGACGCGAGCTTCTTCACCTGCTT
GGTGGTGACGGATCCAGCGGCTTTAGCGCCGTTTTGTTGAGTCGCACTTCGAGTTCGGCG
ATCCATGCTCCGAGTCACTCTCGACGAAGTTGGTGCCTTTTCCTCTCCATCTCCCTTACT
CTCCACCGGCGCCATTGTACGGAAAAGAAAAA

QA 10 701 10 701
DS 



AS 1 2

CO CL2747Contig1 1008 2 2 U
GGGACATCACTCATTCTCATAATAACTTCTCAACTTCTCTTAAAAGCTTTACATTTACGG
TTTCAGATGACGAGTCCAGCGGTCGATCAAGAGAATATTCCTCCTCCTATGGACGGAATC
AACACGGCTGTTACGACGGAGCCTGCTGCGAAGGGAGGCAAGACGAAGAAAGCTAAGGAA
GTGAAGGCGGCGAAGAAGAAGCCTGCTGCTGCGGCTGCGAAGAAGAAGTCTGTTTCAACT
CATCCTACTTACGAAGAGATGATCAAGGATGCGATTGTATCGTTGAAGGAGAGAACTGGA
TCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCACAAGGTGCTCTCGCCTTCG
TTCAGGAAGCTCCTGCTTCTCAACCTCAAGAGACTCGTGGCCTCCGAGAAGCTCGTGAAG
GTGAAAGCCTCGTTTAAGATTCCGTCTGCTGCTGCTAAGCCGTCGTCACCGAAGGCGGCT
ACGGAGAAGAAGAAACCTGCAACCACCGCAGCGGCGGTTAAACCCAAGTCGAAGAAGGGG
AAGGTTGCCACCGCAGCAGCTTCGAAATCGAAGGTAGCGAAGAAATCCGCGGCGGTTAAG
CCCAAGGCGAAGGCAACTGTTACGGCGGCCAAGAGGAAAGCTGTTGCTGCTGCTGCGAAG
CCCAAGGCTAAGGCGGCTAAGACATCGACGGTGACATCTCCGGGTAAAAAGGCTGCTGGT
GCTAAGAAGAAGGCTACGAAGGTGGTGGCGACGAAGAAGAAGACTCCAGTGAAGAAGGTT
GTGAAGCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGCGAAGAGGGCTTCGAAGAGGGCGGTGAAGTGA
AAACTAGGGTTTTAGGAATACATGCTTGTAGCTTTCTCTGTCGTGTAGGTGGTAGTGTTT
GTATAATCCGATCTTTCATCTTGTTTGCTATGATGTTCTTGTAATCCATGGTTACTTGAG
AACCATCCTTTGAATCATATATAATAGCTTAATCTCTTTTCAATGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA15TF U 1
AF RR2HA15JQ C 217
BS 1 664 RR2HA15TF
BS 665 1008 RR2HA15JQ

RD RR2HA15TF 664 0 0
GGGACATCACTCATTCTCATAATAACTTCTCAACTTCTCTTAAAAGCTTTACATTTACGG
TTTCAGATGACGAGTCCAGCGGTCGATCAAGAGAATATTCCTCCTCCTATGGACGGAATC
AACACGGCTGTTACGACGGAGCCTGCTGCGAAGGGAGGCAAGACGAAGAAAGCTAAGGAA
GTGAAGGCGGCGAAGAAGAAGCCTGCTGCTGCGGCTGCGAAGAAGAAGTCTGTTTCAACT
CATCCTACTTACGAAGAGATGATCAAGGATGCGATTGTATCGTTGAAGGAGAGAACTGGA
TCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCACAAGGTGCTCTCGCCTTCG
TTCAGGAAGCTCCTGCTTCTCAACCTCAAGAGACTCGTGGCCTCCGAGAAGCTCGTGAAG
GTGAAAGCCTCGTTTAAGATTCCGTCTGCTGCTGCTAAGCCGTCGTCACCGAAGGCGGCT
ACGGAGAAGAAGAAACCTGCAACCACCGCAGCGGCGGTTAAACCCAAGTCGAAGAAGGGG
AAGGTTGCCACCGCAGCAGCTTCGAAATCGAAGGTAGCGAAGAAATCCGCGGCGGTTAAG
CCCAAGGCGAAGGCAACTGTTACGGCGGCCAAGAGGAAAGCTGTTGCTGCTGCTGCGAAG
CCCA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2HA15JQ 792 0 0
GCGAAGAAGAAGTCTGTT*CAACTCATCCTACTTACGAAGAGATGATCAAGGATGCGATT
GTATCGTTGAAGGAGAGAACTGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAG
AAGCACAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGGAAGCTCCTGCTTCTCAACCTCAAGAGACTC
GTGGCCTCCGAGAAGCTCGTGAAGGTGAAAGCCTCGTTTAAGATTCCGTCTGCTGCTGCT
AAGCCGTCGTCACCGAAGGCGGCTACGGAGAAGAAGAAACCTGCAACCACCGCAGCGGCG
GTTAAACCCAAGTCGAAGAAGGGGAAGGTTGCCACCGCAGCAGCTTCGAAATCGAAGGTA
GCGAAGAAATCCGCGGCGGTTAAGCCCAAGGCGAAGGCAACTGTTACGGCGGCCAAGAGG
AAAGCTGTTGCTGCTGCTGCGAAGCCCAAGGCTAAGGCGGCTAAGACATCGACGGTGACA
TCTCCGGGTAAAAAGGCTGCTGGTGCTAAGAAGAAGGCTACGAAGGTGGTGGCGACGAAG
AAGAAGACTCCAGTGAAGAAGGTTGTGAAGCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGCGAAGAGG
GCTTCGAAGAGGGCGGTGAAGTGAAAACTAGGGTTTTAGGAATACATGCTTGTAGCTTTC
TCTGTCGTGTAGGTGGTAGTGTTTGTATAATCCGATCTTTCATCTTGTTTGCTATGATGT
TCTTGTAATCCATGGTTACTTGAGAACCATCCTTTGAATCATATATAATAGCTTAATCTC
TTTTCAATGTTC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 3

CO CL2748Contig1 780 3 12 U
GGATAGCATTAGAAAAGCTTTTAAAGAAACAATGTCCAGCAACGTCATTAGTGGAGTCGA
AATGGATGGTTCGAATGAAAGAAAAGTTTTCGACGAGAAGAAAATGGGCGTAAAAGCCCT
GGCGGATGCAGGGATCAAAGAGCTCCCAGCCATGTTCCGTGCACCTCCGAGTATTTTAGA
AAGCCTGAAAGCAGCACGAGCTTCTCAGGATGCGAACCTCTTCCCGACCATTGATCTGAA
AGGAGTAAGCCTGCACAACAAGGATCAAGATTTGACGACGCGGAGGAATGTGGTGGAGCA
GATCAGAGAAGCGTCTGCGAATTGGGGTTTCTTCCGAGTGACCAATCACGGGTTCTCGAA
GGATTTGCAGGAGAGGATGCTTGAAGGGCTTCGTCGGTTTCACGCGCAAGACCCATCAGT
TAAGAGACAGTACTACACACGTGATCACACTCGGAACTTTCTTTACTACACCAACGTCGA
TCTCTTCACCTCTGACTCCGCCAGTTGGAGAGACACCACTATTTGTTACACAGCCCCGGA
TACTCCCCGACCTGAGGACCTGCCCGCCGTTTTGGGGGAGGTTATATTGGAGTACTCAAA
GGAAATGACGAGTTTAGGTGAATTGATCTTTGAGCTTCTATCAGAGCTTTGGGATTGGAC
CCTAATTATTTCAAGGATATGGATTGCGTCAAGTCTCAGATGATGTTGGGCCAGTATTAT
CCACCTTGCCCTCAGCCTGACCTTACTTTAGCTTGAGCAGCACAGTGATTTTTCTTTTCT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F713TF U 1
AF RR2A595TF U 3
AF RR2DB73TF U 3
BS 1 395 RR2F713TF
BS 396 396 RR2A595TF
BS 397 406 RR2F713TF
BS 407 407 RR2A595TF
BS 408 461 RR2F713TF
BS 462 462 RR2A595TF
BS 463 566 RR2F713TF
BS 567 567 RR2A595TF
BS 568 579 RR2F713TF
BS 580 580 RR2A595TF
BS 581 606 RR2F713TF
BS 607 780 RR2DB73TF

RD RR2F713TF 613 0 0
GGATAGCATTAGAAAAGCTTTTAAAGAAACAATGTCCAGCAACGTCATTAGTGGAGTCGA
AATGGATGGTTCGAATGAAAGAAAAGTTTTCGACGAGAAGAAAATGGGCGTAAAAGCCCT
GGCGGATGCAGGGATCAAAGAGCTCCCAGCCATGTTCCGTGCACCTCCGAGTATTTTAGA
AAGCCTGAAAGCAGCACGAGCTTCTCAGGATGCGAACCTCTTCCCGACCATTGATCTGAA
AGGAGTAAGCCTGCACAACAAGGATCAAGATTTGACGACGCGGAGGAATGTGGTGGAGCA
GATCAGAGAAGCGTCTGCGAATTGGGGTTTCTTCCGAGTGACCAATCACGGGTTCTCGAA
GGATTTGCAGGAGAGGATGCTTGAAGGGCTTCGTCTGTTTCACGCGTAAGACCCATCAGT
TAAGAGACAGTACTACACACGTGATCACACTCGGAACTTTCCTTACTACACCAACGTCGA
TCTCTTCACCTCTGACTCCGCCAGTTGGAGAGACACCACTATTTGTTACACAGCCCCGGA
TACTCCCCGACCTGAGGACCTGCCCGACGTTTTGGGGGATGTTATATTGGAGTACTCAAA
GGAAAT
GACGAGT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2A595TF 604 0 0
GG
AGCATTAGAAAAGCTTTTAAAGAAACAATGTCCAGCAACGTCATTAGTGGAGTCGAAATG
GATGGTTCGAATGAAAGAAAAGTTTTCGACGAGAAGAAAATGGGCGTAAAAGCCCTGGCG
GATGCAGGGATCAAAGAGCTCCCAGCCATGTTCCGTGCACCTCCGAGTATTTTAGAAAGC
CTGAAAGCAGCACGAGCTTCTCAGGATGCGAACCTCTTCCCGACCATTGATCTGAAAGGA
GTAAGCCTGCACAACAAGGATCAAGATTTGACGACGCGGAGGAATGTGGTGGAGCAGATC
AGAGAAGCGTCTGCGAATTGGGGTTTCTTCCGAGTGACCAATCACGGGTTCTCGAAGGAT
TTGCAGGAGAGGATGCTTGAAGGGCTTCGTCGGTTTCACGCGCAAGACCCATCAGTTAAG
AGACAGTACTACACACGTGATCACACTCGGAACTTTCTTTACTACACCAACGTCGATCTC
TTCACCTCTGACTCCGCCAGTTGGAGAGACACCACTATTTGTTACACAGCCCCGGATACT
CCCCGACCTGAGGACCTGCCCGCCGTTTTGGGGGAGGTTATATTGGAGTACTCAAAGGAA
AT

QA 3 604 3 604
DS 

RD RR2DB73TF 778 0 0
GG
AGCATTAGAAAAGCTTTTAAAGAAACAATGTCCAGCAACGTCATTAGTGGAGTCGAAATG
GATGGTTCGAATGAAAGAAAAGTTTTCGACGAGAAGAAAATGGGCGTAAAAGCCCTGGCG
GATGCAGGGATCAAAGAGCTCCCAGCCATGTTCCGTGCACCTCCGAGTATTTTAGAAAGC
CTGAAAGCAGCACGAGCTTCTCAGGATGCGAACCTCTTCCCGACCATTGATCTGAAAGGA
GTAAGCCTGCACAACAAGGATCAAGATTTGACGACGCGGAGGAATGTGGTGGAGCAGATC
AGAGAAGCGTCTGCGAATTGGGGTTTCTTCCGAGTGACCAATCACGGGTTCTCGAAGGAT
TTGCAGGAGAGGATGCTTGAAGGGCTTCGTCGGTTTCACGCGCAAGACCCATCAGTTAAG
AGACAGTACTACACACGTGATCACACTCGGAACTTTCTTTACTACACCAACGTCGATCTC
TTCACCTCTGACTCCGCCAGTTGGAGAGACACCACTATTTGTTACACAGCCCCGGATACT
CCCCGACCTGAGGACCTGCCCGCCGTTTTGGGGGAGGTTATATTGGAGTACTCAAAGGAA
ATGACGAGTTTAGGTGAATTGATCTTTGAGCTTCTATCAGAGCTTTGGGATTGGACCCTA
ATTATTTCAAGGATATGGATTGCGTCAAGTCTCAGATGATGTTGGGCCAGTATTATCCAC
CTTGCCCTCAGCCTGACCTTACTTTAGCTTGAGCAGCACAGTGATTTTTCTTTTCT

QA 3 778 3 778
DS 



AS 1 4

CO CL2749Contig1 777 4 3 U
GGGAACAAGACGAACAACAACCCAAAGAGATTATTTCCTTCATTCTCATTTCCGAATCGG
AGAGTTATGGCTTTAGCTGTCACTTCTTCCTCAACTGCCATCTCTGGTTCCAGTTTCTCA
CGCTCCGGACCTTCTTTGGATCCTAAAGCTCTTCAAATCTGTTCGTTTAGGTTATCTGAT
CTATCCCATGTCTCTCAAAGACGTTACTCTGTCAAATCCCTAAAGGCTGAGTCACATGCA
CGCAACGACTCTATGGTTACTCGTGCTTCGACCCTAATCACTGAAGTGGAAGAGAAAGAA
GAAGAGGTTGAGGATTTCGAGCAACTCGCCAAGAAGCTCGAAGAGGCTTCACCACTTGAA
ATCATGGACAAAGCTCTCCAGAAATTCGGAAGCAACATCGCTATTGCTTTCAGTGGGGCT
GAAGATGTTGCACTGATTGAATACGCTCGTTTAACCGGAAGGCCCTTCAGGGTTTTCAGC
TTAGACACGGGGAGATTAAACCCCGAAACCTACAGACTCTTCGACGCGGTGGAGAAGCAG
TACGGGATTCGGATCGAGTACACGTTCCCCGATGCGGTCGAGGTTCAAGCTTTGGTGAGG
AACAAGGGTTTGTTCTCTTTCTACGAAGATGGTCACCAAGAGTGTTGCCGTGTGAGGAAA
GTAAGACCTCTCCGTCGCGCTCTTAA*GGGTCTCAAAGCTTGGATCACAGGGCAGAGGAA
AGACCAGTCTCCGGGCACGAGATCCGAGATTCCGATCGTTCAGTCGATCCGGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2E369TF U 64
AF RR2AO72TF U 15
AF RR2A816TF U 1
AF RR2AE04TF U 5
BS 1 14 RR2A816TF
BS 15 15 RR2AE04TF
BS 16 777 RR2A816TF

RD RR2E369TF 364 0 0
GTTATGGCTTTAGCTGTCACTTCTTCCTCAACTGCCATCTCTGGTTCCAGTTTCTCACGC
TCCGGACCTTCTTTGGATCCTAAAGCTCTTCAAATCTGTTCGTTTAGGTTATCTGATCTA
TCCCACGTCTCTCAAAGACGTTACTCTGTCAAATCCCTAAAGGCTGAGTCACATGCACGC
AACGACTCTATGGTTACTCGTGCTTCGACCCTAATCACTGAAGTGGAAGAGAAAGAAGAA
GAGGTTGAGGATTTCGAGCAACTCGCCAAGAAGCTCGAAGAGGCTTCACCACTTGAAATC
ATGGACAAAGCTCTCCAGAAATTCGGAAGCAACATCGCTATTGCTTTCAG
GTAAACACTCGATT

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR2AO72TF 692 0 0
GGACAAC
CCAAGGAGATTATTTCCTTCATTCTCATTTCCGAATCGGAGAGTTATGGCTTTAGCTGTC
ACTTCTTCCTCAACTGCCATCTCTGGTTCCAGTTTCTCACGCTCCGGACCTTCTTTGGAT
CCTAAAGCTCTTCAAATCTGTTCGTTTAGGTTATCTGATCTATCCCATGTCTCTCAAAGA
CGTTACTCTGTCAAATCCCTAAAGGCTGAGTCACATGCACGCAACGACTCTATGGTTACT
CGTGCTTCGACCCTAATCACTGAAGTGGAAGAGAAAGAAGAAGAGGTTGAGGATTTCGAG
CAACTCGCCAAGAAGCTCGAAGAGGCTTCACCACTTGAAATCATGGACAAAGCTCTCCAG
AAATTCGGAAGCAACATCGCTATTGCTTTCAGTGGGGCTGAAGATGTTGCACTGATTGAA
TACGCTCGTTTAACCGGAAGGCCCTTCAGGGTTTTCAGCTTAGACACGGGGAGATTAAAC
CCCGAAACCTACAGACTCTTCGACGCGGTGGAGAAGCAGTACGGGATTCGGATCGAGTAC
ACGTTCCCCGATGCGGTCGAGGTTCAAGCTTTGGTGAGGAACAAGGGTTTGTTCTCTTTC
TACGAAGATGGTCACCAAGAGTGTTGCCGTGTGAGGAAAGTAAGACCTCTCCGTCGCGCT
CTTAAAGGGTCTCAAAGCTTGGATC

QA 8 692 8 692
DS 

RD RR2A816TF 777 0 0
GGGAACAAGACGAAGAACAACCCAAAGAGATTATTTCCTTCATTCTCATTTCCGAATCGG
AGAGTTATGGCTTTAGCTGTCACTTCTTCCTCAACTGCCATCTCTGGTTCCAGTTTCTCA
CGCTCCGGACCTTCTTTGGATCCTAAAGCTCTTCAAATCTGTTCGTTTAGGTTATCTGAT
CTATCCCATGTCTCTCAAAGACGTTACTCTGTCAAATCCCTAAAGGCTGAGTCACATGCA
CGCAACGACTCTATGGTTACTCGTGCTTCGACCCTAATCACTGAAGTGGAAGAGAAAGAA
GAAGAGGTTGAGGATTTCGAGCAACTCGCCAAGAAGCTCGAAGAGGCTTCACCACTTGAA
ATCATGGACAAAGCTCTCCAGAAATTCGGAAGCAACATCGCTATTGCTTTCAGTGGGGCT
GAAGATGTTGCACTGATTGAATACGCTCGTTTAACCGGAAGGCCCTTCAGGGTTTTCAGC
TTAGACACGGGGAGATTAAACCCCGAAACCTACAGACTCTTCGACGCGGTGGAGAAGCAG
TACGGGATTCGGATCGAGTACACGTTCCCCGATGCGGTCGAGGTTCAAGCTTTGGTGAGG
AACAAGGGTTTGTTCTCTTTCTACGAAGATGGTCACCAAGAGTGTTGCCGTGTGAGGAAA
GTAAGACCTCTCCGTCGCGCTCTTAA*GGGTCTCAAAGCTTGGATCACAGGGCAGAGGAA
AGACCAGTCTCCGGGCACGAGATCCGAGATTCCGATCGTTCAGTCGATCCGGTGTTT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2AE04TF 773 0 0
GG
AAGACGAACAACAACC*AAAGAGATTATTTCCTTCATTCTCATTTCCGAATCGGAGAGTT
ATGGCTTTAGCTGTCACTTCTTCCTCAACTGCCATCTCTGGTTCCAGTTTCTCACGCTCT
GGACCTTCTTTGGATCCTAAAGCTCTTCAAATCTGTTCGTTTAGGTTATCTGATCTATCC
CATGTCTCTCAAAGACGTTACTCTATCAAATCCCTAAAGGCTGAGTCACATACACGCAAC
GACTCTACGGTTACTCGTGCTTCGACCCTAATCACTGAAGTGGAAGAGAAAGAAGAAGAG
GTTGAGGATTTCGAGCAACTCGCCAAGAAGCTCGAAGAGGCTTCACCACTTGAAATCATG
GACAAAGCTCTCCAGAAATTCGGAAGCAACATCGCTATTGCTTTCAGTGGGGCTGAAGAT
GTTGCACTGATTGAATACGCTCGTTTAACCGGAAGGCCCTTCAGGGTTTTCAGCTTAGAC
ACGGGGAGATTAAACCCCGAAACCTACAGACTCTTCGACGCGGTGGAGAAGCAGTACGGG
ATTCGGATCGAGTACACGTTCCCCGATGCGGTCGAGGTTCAAGCTTTGGTGAGGAACAAG
GGTTTGTTCTCTTTCTACGAAGATGGTCACCAAGAGTGTTGCCGTGTGAGGAAAGTAAGA
CCTCTCCGTCGCGCTCTTAA*GGGTCTCAAAGCTTGGATCACAGGGCAGAGGAAAGATCA
GTCTCCGGGCACGAGATCCGAGATTCCGATCGTTCAGTCGATCCGGTGTTT

QA 3 773 3 773
DS 



AS 1 3

CO CL2750Contig1 721 3 5 U
GAGTAAAAAAACAATTCTTTATTATTATAAGTTATAACCAAGACCTCATCGATCTTGGTC
AATCACAAACGGATACAAAGAGAGATAGACATTAAAACATGAAAACAAATCCTCAAAACA
GCTCAAAGCTCATCCCTCTTGAGCATGGATGGACGAACACCTTGACTTAGGAAGTCTTTG
TAATACTTGCCCGATTCTTTCTCATATCGTGTGAGGTTATTCTTGAAATCAATGTAGTAG
AGTCCAAATCTGTTCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTATCCAACAAGGACCATACA
AAGTATCCAGTAACATTCACCTTGTCGATGCAAATAGCTTCATTCATACTCAAAAGATGC
CTCTGAAGATAATATTTCCTGTTGTGATCAGCTGTACCAACTGCAATTGAATCTGAAGCC
CCAAGTTCTTCTCCATATCCGTTTTCCATTATCATAATTTCGGGGTTGCCATACTTATCC
TTGATGTACTTCAAAAGACTTCTAAAGCCTCTCGCAAAAACGGGAAGTGCACCGGTGATA
GGCTTGCTACCAATGCTGTAATTGTACGCATTCTTAGTTTCCCAGTTAATGAGAGAATCT
TGCATCCATCTTGGTTTAGAAGGATCTGGCTTCTCCAGATAGTTTGAAAACATTGAAGTA
TAATAGTTGAGCCCAACGAAATCGGCTGAGTTTTTCAGTTTTGCTTTCTGTGCATCGGTA
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BH57JQ U 29
AF RR2BH57TF C 29
AF RR2F767JQ U 1
BS 1 142 RR2F767JQ
BS 143 143 RR2BH57JQ
BS 144 383 RR2F767JQ
BS 384 385 RR2BH57JQ
BS 386 721 RR2F767JQ

RD RR2BH57JQ 593 0 0
AAGTTATAACCAAGACCTCATCGATCTTGGTCAATCACAAACGGATACAAAGAGAGATAG
ACATTAAAACATGAAAACAAATCCTCAAAACAGCTCAAAGCTCATCCCTCTTGAGCATGG
ATGGACGAACACCTTGACTTAGGAAGTCTTTGTAATACTTGCCCGATTCTTTCTCATATC
GTGTGAGGTTATTCTTGAAATCAATGTAGTAAAGTCCAAATCTGTTCTTGTAACCATCTT
GCCACTCAAAGTTATCCAACAAGGACCATACAAAGTATCCAGTAACATTCACCTTGTCGA
TGCAAATAGCTTCATTCATACTCAAAAGATGCCTCTGAAAATAATATTTCCTGTTGTGAT
CAGCTGTACCAACTGCAATTGAATCTGAAGCCCCAAGTTCTTCTCCATATCCGTTTTCCA
TTATCATAATTTCGGGGTTGCCATACTTATCCTTGATGTACTTCAAAAGACTTCTAAAGC
CTCTCGCAAAAACGGGAAGTGCACCGGTGATAGGCTTGCTACCAATGCTGTAATTGTACG
CATTCTTAGTTTCCCAGTTAATGAGAGAATCTTGCATCCATCTTGGTTTAGAA

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2BH57TF 636 0 0
AAGTTATAACCAAGACCTCATCGATCTTGGTCAATCACAAACGGATACAAAGAGAGATAG
ACATTAAAACATGAAAACAAATCCTCAAAACAGCTCAAAGCTCATCCCTCTTGAGCATGG
ATGGACGAACACCTTGACTTAGGAAGTCTTTGTAATACTTGCCCGATTCTTTCTCATATC
GTGTGAGGTTATTCTTGAAATCAATGTAGTAGAGTCCAAATCTGTTCTTGTAACCATCTT
GCCACTCAAAGTTATCCAACAAGGACCATACAAAGTATCCAGTAACATTCACCTTGTCGA
TGCAAATAGCTTCATTCATACTCAAAAGATGCCTCTGAAGATAATATTTCCTGTTGTGAT
CAGCTGTACCAACTGCAATTGAATCTGAAGCCCCAAGTTCTTCTCCATATCCGTTTTCCA
TTATCATAATTTCGGGGTTGCCATACTTATCCTTGATGTACTTCAAAAGACTTCTAAAGC
CTCTCGCAAAAACGGGAAGTGCACCGGTGATAGGCTTGCTACCAATGCTGTAATTGTACG
CATTCTTAGTTTCCCAGTTAATGAGAGAATCTTGCATCCATCTTGGTTTAGAAGGATCTG
GCTTCTCCAGATAGTTTGAAAACATTGAAGTATAA
C

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2F767JQ 721 0 0
GAGTAAAAAAACAATTCTTTATTATTATAAGTTATAACCAAGACCTCATCGATCTTGGTC
AATCACAAACGGATACAAAGAGAGATAGACATTAAAACATGAAAACAAATCCTCAAAACA
GCTCAAAGCTCATCCCTCTTGATCATGGATGGACGAACACCTTGACTTAGGAAGTCTTTG
TAATACTTGCCCGATTCTTTCTCATATCGTGTGAGGTTATTCTTGAAATCAATGTAGTAG
AGTCCAAATCTGTTCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTATCCAACAAGGACCATACA
AAGTATCCAGTAACATTCACCTTGTCGATGCAAATAGCTTCATTCATACTCAAAAGATGC
CTCTGAAGATAATATTTCCTGTT**GATCAGCTGTACCAACTGCAATTGAATCTGAAGCC
CCAAGTTCTTCTCCATATCCGTTTTCCATTATCATAATTTCGGGGTTGCCATACTTATCC
TTGATGTACTTCAAAAGACTTCTAAAGCCTCTCGCAAAAACGGGAAGTGCACCGGTGATA
GGCTTGCTACCAATGCTGTAATTGTACGCATTCTTAGTTTCCCAGTTAATGAGAGAATCT
TGCATCCATCTTGGTTTAGAAGGATCTGGCTTCTCCAGATAGTTTGAAAACATTGAAGTA
TAATAGTTGAGCCCAACGAAATCGGCTGAGTTTTTCAGTTTTGCTTTCTGTGCATCGGTA
A

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 3

CO CL2751Contig1 881 3 15 U
GTACCACCACACCTCAGAAGCTAACCACCACTAGAACACCTTTCAAGCTCAAGTGTAGAG
CTACTTCATCATCTTCCATCACAGACTTCGATCTTTACGACCTCTTAGGTATCGACCGGG
GATCCAACAAGTCTCAGATCAAAGCAGCTTATCGTAACTTGCAAAAACGTTGTCATCCAG
ATATCGCAGGAGTCCCAGGCCACGACATGGCCATCATACTTAACGAGGCTTACAAGCTTC
TGTCTGATCCTATCTCACGCCAAGCCTATGATAAGGAACAAGCGAAACTGGAAGAGCTTA
GAGGCTACACAGGGAAACCTATCTACTCTGTTTGGTGTGGACCAGAGACAGAGCAACGAG
CTGTGTTTGTAGATGAGGTCAAGTGCGTTGGTTGCTTGAAGTGTGCTTTGTGTGCAGAGA
GAACGTTTGCTATCGAAACAGCTCACGGGAGAGCTAGGGTTGTCGCTCAGTGGGCTGATC
CTGAGTCTAAAATCAAAGAAGCTATCGAAGCTTGCCCCATAGACTGCATCTCAATGGTGG
AGAGATCTGACCTAGCGCCATTGGAGTTTCTTATGTCAAAGCAGCCTCGAGGAAACGTGA
GGATAGGGGTGGGGAACACGGTTGGTGAGCGTGTATCCAACGTGTTGGTTGATGTCAAGA
AGTTCCAGCAAAGATACGCTGAATCCATGAGCAGAACCACAAGAGAGAGCTCACAGGAGA
GTGACTTGCAGAGAGAAGTAAGAATGAGTGCAGTGGAAGCAATCAGGTCTATCTCCAATT
GGCTATGCTGGAGATCATCACCCTACTCAAAACCATTGAGTCCTGATTCAAACATGAGTC
TCACTTTCACCAAACGGAAGAAAGCACCAGAACCAAACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ76TF U 1
AF RR2FH88TF U 10
AF RR2EM96TF U 251
BS 1 22 RR2FQ76TF
BS 23 23 RR2FH88TF
BS 24 33 RR2FQ76TF
BS 34 34 RR2FH88TF
BS 35 125 RR2FQ76TF
BS 126 126 RR2FH88TF
BS 127 193 RR2FQ76TF
BS 194 194 RR2FH88TF
BS 195 587 RR2FQ76TF
BS 588 610 RR2FH88TF
BS 611 611 RR2EM96TF
BS 612 766 RR2FH88TF
BS 767 767 RR2EM96TF
BS 768 786 RR2FH88TF
BS 787 881 RR2EM96TF

RD RR2FQ76TF 587 0 0
GTACCACCACACCTCAGAAGCTCACCACCACTATAACACCTTTCAAGCTCAAGTGTAGAG
CTACTTCATCATCTTCCATCACAGACTTCGATCTTTACGACCTCTTAGGTATCGACCGGG
GATCCGACAAGTCTCAGATCAAAGCAGCTTATCGTAACTTGCAAAAACGTTGTCATCCAG
ATATCGCAGGAGTTCCAGGCCACGACATGGCCATCATACTTAACGAGGCTTACAAGCTTC
TGTCTGATCCTATCTCACGCCAAGCCTATGATAAGGAACAAGCGAAACTGGAAGAGCTTA
GAGGCTACACAGGGAAACCTATCTACTCTGTTTGGTGTGGACCAGAGACAGAGCAACGAG
CTGTGTTTGTAGATGAGGTCAAGTGCGTTGGTTGCTTGAAGTGTGCTTTGTGTGCAGAGA
GAACGTTTGCTATCGAAACAGCTCACGGGAGAGCTAGGGTTGTCGCTCAGTGGGCTGATC
CTGAGTCTAAAATCAAAGAAGCTATCGAAGCTTGCCCCATAGACTGCATCTCAATGGTGG
AGAGATCTGACCTAGCGCCATTGGAGTTTCTTATGTCAAAGCAGCCT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2FH88TF 779 0 0
G
ACCTCAGAAGCTAACCACCATTAGAACACCTTTCAAGCTCAAGTGTAGAGCTACTTCATC
ATCTTCCATCACAGACTTCGATCTTTACGACCTCTTAGGTATCGACCGGGGATCCAACAA
GTCTCAGATCAAAGCAGCTTATCGTAACTTGCAAAAACGTTGTCATCCAGATATCGCAGG
AGTCCCAGGCCACGACATGGCCATCATACTTAACGAGGCTTACAAGCTTCTGTCTGATCC
TATCTCACGCCAAGCCTATGATAAGGAACAAGCGAAACTGGAAGAGCTTAGAGGCTACAC
AGGGAAACCTATCTACTCTGTTTGGTGTGGACCAGAGACAGAGCAACGAGCTGTGTTTGT
AGATGAGGTCAAGTGCGTTGGTTGCTTGAAGTGTGCTTTGTGTGCAGAGAGAACGTTTGC
TATCGAAACAGCTCACGGGAGAGCTAGGGTTGTCGCTCAGTGGGCTGATCCTGAGTCTAA
AATCAAAGAAGCTATCGAAGCTTGCCCCATAGACTGCATCTCAATGGTGGAGAGATCTGA
CCTAGCGCCATTGGAGTTTCTTATGTCAAAGCAGCCTCGAGGAAACGTGAGGATAGGGGT
TGGGAACACGGTTGGTGAGCGTGTATCCAACGTGTTGGTTGATGTCAAGAAGTTCCAGCA
AAGATACGCTGAATCCATGAGCAGAACCACAAGAGAGAGCTCACAGGAGAGTGACTTGCA
GAGAGAAGTAAGAATGAGTGCAGTGGAAGCAATCAG*TCTATCTCCAATTGGCTAT
AC

QA 2 777 2 777
DS 

RD RR2EM96TF 631 0 0
G
ATCTCACGCCAAGCCTATGATAAGGAACAAGCGAAACTGGAAGAGCTTAGAGGCTACACA
GGGAAACCTATCTACTCTGTTTGGTGTGGACCAGAGACAGAGCAACGAGCTGTGTTTGTA
GATGAGGTCAAGTGCGTTGGTTGCTTGAAGTGTGCTTTGTGTGCAGAGAGAACGTTTGCT
ATCGAAACAGCTCACGGGAGAGCTAGGGTTGTCGCTCAGTGGGCTGATCCTGAGTCTAAA
ATCAAAGAAGCTATCGAAGCTTGCCCCATAGACTGCATCTCAATGGTGGAGAGATCCGAC
CTAGCGCCATTGGAGTTTCTTATGTCAAAGCAGCCTCGAGGAAACGTGAGGATAGGGGTG
GGGAACACGGTTGGTGAGCGTGTATCCAACGTGTTTGTTGATGTCAAGAAGTTCCAGCAA
AGATACGCTGAATCCATGAGCAGAACCACAAGAGAGAGCTCACAGGAGAGTGACTTGCAG
AGAGAAGTAAGAATGAGTGCAGTGGAAGCAATCAGGTCTATCTCCAATTGGCTATGCTGG
AGATCATCACCCTACTCAAAACCATTGAGTCCTGATTCAAACATGAGTCTCACTTTCACC
AAACGGAAGAAAGCACCAGAACCAAACATC

QA 2 631 2 631
DS 



AS 1 3

CO CL2752Contig1 732 3 10 U
GTGGTCTGGAAACATGATATATAATAATTTCTCAATTACTAGTTGCCTTCGGCTTGGAAA
TTTTGATAGTGTAATAATACAATAGATGATACTACTAATAAACGGGGGGGTATTGGTAGA
TGGATTCGCGTTTAGACTCTGAAGTTCTTTCCCATGAAAGTCTGTCCAAACTGCCAATGA
GCCGGAGCGATGTTCCATGACGTGGAACTTCTACGGTCGCTGCTTGTGACTCTAAAAGAA
AGTGCTTGACCAACCAATACAGAGTTAGACTGCCAGTTTTGTCCCCAGTTTCGGCTCATG
CTCATCCACGAAGTTCTTGTTCCTTTAACGCTCAGCCGCACTATGTTCCCGGCGCCGGCA
ACGTTTGTGACCAGAACCAAGTTGAAGTAACGGAAACCGTTGATCGTGAACCTAATTCCT
CCTATCTTCCGACATGGCACTCGGCGGAAAGAGACGGGGACAATTCCGGCGCGATACTCG
GCGATCTTGAGGAACATAGGCATAGCGAGATCGAAGTGAGGCCTAGGAGGGTTGCACCAT
CCGCCATTGTCGCTGGGCTGAGCAAAGTTCGGCGGGCAAAAGTTGGTCGCGGTGACGAAG
ATGGAAGGGCTACCTGAGTGACACCACTTTGGATCACTCGCGCATTTGAGCTCGAAACAA
GTGCCGCAACTGTAACCGTTGTTGAACAGAGCCGTGCTTAGAGCCGCCGTGTTCACGCCA
TAACCTTGGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D119JQ U 1
AF RR2GH18JQB U 38
AF RR2GH18TF C 39
BS 1 73 RR2D119JQ
BS 74 74 RR2GH18JQB
BS 75 109 RR2D119JQ
BS 110 110 RR2GH18JQB
BS 111 186 RR2D119JQ
BS 187 187 RR2GH18JQB
BS 188 281 RR2D119JQ
BS 282 282 RR2GH18JQB
BS 283 325 RR2D119JQ
BS 326 732 RR2GH18JQB

RD RR2D119JQ 325 0 0
GTGGTCTGGAAACATGATATATAATAATTTCTCAATTACTAGTTGCCTTCGGCTTGGAAA
TTTTGATAGTGTAGTAATACAATAGATGATACTACTAATAAACGGGGGG*TATTGGTAGA
TGGATTCGCGTTTAGACTCTGAAGTTCTTTCCCATGAAAGTCTGTCCAAACTGCCAATGA
GCCGGAACGATGTTCCATGACGTGGAACTTCTACGGTCGCTGCTTGTGACTCTAAAAGAA
AGTGCTTGACCAACCAATACAGAGTTAGACTGCCAGTTTTGCCCCCAGTTTCGGCTCATG
CTCATCCACGAAGTTCTTGTTCCTT

QA 1 325 1 325
DS 

RD RR2GH18JQB 695 0 0
ACTAGTTGC
CTTCGGCTTGGAAATTTTGATAGTGTAATAATACAATAGATGATACTACTAATAAACGGG
GGGGTATTGGTAGATGGATTCGCGTTTAGACTCTGAAGTTCTTTCCCATGAAAGTCTGTC
CAAACTGCCAATGAGCCGGAGCGATGTTCCATGACGTGGAACTTCTACGGTCGCTGCTTG
TGACTCTAAAAGAAAGTGCTTGACCAACCAATACAGAGTTAGACTGCCAGTTTTGTCCCC
AGTTTCGGCTCATGCTCATCCACGAAGTTCTTGTTCCTTTAACGCTCAGCCGCACTATGT
TCCCGGCGCCGGCAACGTTTGTGACCAGAACCAAGTTGAAGTAACGGAAACCGTTGATCG
TGAACCTAATTCCTCCTATCTTCCGACATGGCACTCGGCGGAAAGAGACGGGGACAATTC
CGGCGCGATACTCGGCGATCTTGAGGAACATAGGCATAGCGAGATCGAAGTGAGGCCTAG
GAGGGTTGCACCATCCGCCATTGTCGCTGGGCTGAGCAAAGTTCGGCGGGCAAAAGTTGG
TCGCGGTGACGAAGATGGAAGGGCTACCTGAGTGACACCACTTTGGATCACTCGCGCATT
TGAGCTCGAAACAAGTGCCGCAACTGTAACCGTTGTTGAACAGAGCCGTGCTTAGAGCCG
CCGTGTTCACGCCATAACCTTGGCTC

QA 10 695 10 695
DS 

RD RR2GH18TF 694 0 0
ACTAGTTG
CTTCGGCTTGGAAATTTTGATAGTGTAATAATACAATAGATGATACTACTAATAAACGGG
GGGGTATTGGTAGATGGATTCGCGTTTAGACTCTGAAGTTCTTTCCCATGAAAGTCTGTC
CAAACTGCCAATGAGCCGGAGCGATGTTCCATGACGTGGAACTTCTACGGTCGCTGCTTG
TGACTCTAAAAGAAAGTGCTTGACCAACCAATACAGAGTTAGACTGCCAGTTTTGTCCCC
AGTTTCGGCTCATGCTCATCCACGAAGTTCTTGTTCCTTTAACGCTCAGCCGCACTATGT
TCCCGGCGCCGGCAACGTTTGTGACCAGAACCAAGTTGAAGTAACGGAAACCGTTGATCG
TGAACCTAATTCCTCCTATCTTCCGACATGGCACTCGGCGGAAAGAGACGGGGACAATTC
CGGCGCGATACTCGGCGATCTTGAGGAACATAGGCATAGCGAGATCGAAGTGAGGCCTAG
GAGGGTTGCACCATCCGCCATTGTCGCTGGGCTGAGCAAAGTTCGGCGGGCAAAAGTTGG
TCGCGGTGACGAAGATGGAAGGGCTACCTGAGTGACACCACTTTGGATCACTCGCGCATT
TGAGCTCGAAACAAGTGCCGCAACTGTAACCGTTGTTGAACAGAGCCGTGCTTAGAGCCG
CCGTGTTCACGCCATAACCTTGGCTC

QA 9 694 9 694
DS 



AS 1 4

CO CL2753Contig1 824 4 6 U
GGATGTCGAAAGAAAAAAAAAAACCCAACTAATAAATCTTGAGCTACCTGGAGAAAAAAC
ATAACTGAGAACGAAAGAGAAAGAAGGGCAAGAATCTCTCTTTCCCGTAGGTGACGCCGT
GACGGTCCCCTGAATCTCTCAGGCAGTTTTCTTGGAGACAGGGAAAGTATTATTATGTTT
GATCAGCCACAAATATATATATTCTTTTTCACCATGAATGAGAATTTAGAGGAGGAACAA
AAGAAGGGCAAGTATGTTCTGATCCGTGATGGTGATCATAAAGAGGACAATGCGTTAGGA
GGACTCTTCTATAAGCCTCTTCCTTTCTTTGGTTTTGGAATCGGATGGTTCTCGTTTCTT
GTTGGCTTCTTCTTCCCATTTGCGTGGTACTTGGCCACATTTCTATATCTCACTAGCTAT
TACCGTAGAGATCCCAGGGAGAGATCTGGTCTTGCTGCCTCTGCCATTGCTGTGAGTCTC
TTTCTTGATCAGCTGTGATAAAGAGTATTGCTAACAAAACAGTGCGTTTTTTTTATCCAC
AGGCTTTGATATTCACTGTTGCACTGGTGATCACCGTGCTTGTTCTTCTTTTCTCGGGTC
GCTAGAGAATCCTCCCCTCCGTTGTATATTCTTTCTAAAGAAAACAACTGCAAGCCTGTT
TCAACAAGTAAAAGTTTTCTATTGTTGATGATAGAAGAGAATGTTGTGAGGGTTTCAAAG
AGAAGGTACTGCTTAGTCCTTTTATGATTTGTCTTTTTTGTACATAAACACAGTCTTTAT
ACATACTATTGGAGGCATATCTATATAGAAATGTTGTTTGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI95TF U 1
AF RR2ER12TF U 7
AF RR2GI95JQB C 33
AF RR2ER12JQ C 142
BS 1 534 RR2GI95TF
BS 535 535 RR2ER12TF
BS 536 699 RR2GI95TF
BS 700 738 RR2ER12TF
BS 739 796 RR2GI95JQB
BS 797 824 RR2ER12JQ

RD RR2GI95TF 699 0 0
GGATGTCGAAAGAAAAAAAAAAACCCAACTAATAAATCTTGAGCTACCTGGAGAAAAAAC
ATAACTGAGAACGAAAGAGAAAGAAGGGCAAGAATCTCTCTTTCCCGTAGGTGACGCCGT
GACGGTCCCCTGAATCTCTCAGGCAGTTTTCTTGGAGACAGGGAAAGTATTATTATGTTT
GATCAGCCACAAATATATATATTCTTTTTCACCATGAATGAGAATTTAGAGGAGGAACAA
AAGAAGGGCAAGTATGTTCTGATCCGTGATGGTGATCATAAAGAGGACAATGCGTTAGGA
GGACTCTTCTATAAGCCTCTTCCTTTCTTTGGTTTTGGAATCGGATGGTTCTCGTTTCTT
GTTGGCTTCTTCTTCCCATTTGCGTGGTACTTGGCCACATTTCTATATCTCACTAGCTAT
TACCGTAGAGATCCCAGGGAGAGATCTGGTCTTGCTGCCTCTGCCATTGCTGTGAGTCTC
TTTCTTGATCAGCTGTGATAAAGAGTATTGCTAACAAAACAGTGCGTTTTTTTTTTCCAC
AGGCTTTGATATTCACTGTTGCACTGGTGATCACCGTGCTTGTTCTTCTTTTCTCGGGTC
GCTAGAGAATCCTCCCCTCCGTTGTATATTCTTTCTAAAGAAAACAACTGCAAGCCTGTT
TCAACAAGTAAAAGTTTTCTATTGTTGATGATAGAAGAG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2ER12TF 732 0 0
G
GAAAGAAAAAAAAAAACCCAACTAATAAATCTTGAGCTACCTGGAGAAAAAACATAACTG
AGAACGAAAGAGAAAGAAGGGCAAGAATCTCTCTTTCCCGTAGGTGACGCCGTGACGGTC
CCCTGAATCTCTCAGGCAGTTTTCTTGGAGACAGGGAAAGTATTATTATGTTTGATCAGC
CACAAATATATATATTCTTTTTCACCATGAATGAGAATTTAGAGGAGGAACAAAAGAAGG
GCAAGTATGTTCTGATCCGTGATGGTGATCATAAAGAGGACAATGCGTTAGGAGGACTCT
TCTATAAGCCTCTTCCTTTCTTTGGTTTTGGAATCGGATGGTTCTCGTTTCTTGTTGGCT
TCTTCTTCCCATTTGCGTGGTACTTGGCCACATTTCTATATCTCACTAGCTATTACCGTA
GAGATCCCAGGGAGAGATCTGGTCTTGCTGCCTCTGCCATTGCTGTGAGTCTCTTTCTTG
ATCAGCTGTGATAAAGAGTATTGCTAACAAAACAGTGCGTTTTTTTTATTCACAGGCTTT
GATATTCACTGTTGCACTGGTGATCACCGTGCTTGTTCTTCTTTTCTCGGGTCGCTAGAG
AATCCTCCCCTCCGTTGTATATTCTTTCTAAAGAAAACAACTGCAAGCCTGTTTCAACAA
GTAAAAGTTTTCTATTGTTGATGATAGAAGAGAATGTTGTGAGGGTTTCAAAGAGAAGGT
ACTGCTTAGTC

QA 2 732 2 732
DS 

RD RR2GI95JQB 764 0 0
TAAATCTTGAGCTACCTGGAGAAAAAACATAACTGAGAACGAAAGAGAAAGAAGGGCAAG
AATCTCTCTTTCCCGTAGGTGACGCCGTGACGGTCCCCTGAATCTCTCAGGCAGTTTTCT
TGGAGACAGGGAAAGTATTATTATGTTTGATCAGCCACAAATATATATATTCTTTTTCAC
CATGAATGAGAATTTAGAGGAGGAACAAAAGAAGGGCAAGTATGTTCTGATCCGTGATGG
TGATCATAAAGAGGACAATGCGTTAGGAGGACTCTTCTATAAGCCTCTTCCTTTCTTTGG
TTTTGGAATCGGATGGTTCTCGTTTCTTGTTGGCTTCTTCTTCCCATTTGCGTGGTACTT
GGCCACATTTCTATATCTCACTAGCTATTACCGTAGAGATCCCAGGGAGAGATCTGGTCT
TGCTGCCTCTGCCATTGCTGTGAGTCTCTTTCTTGATCAGCTGTGATAAAGAGTATTGCT
AACAAAACAGTGCGTTTTTTTTTTCCACAGGCTTTGATATTCACTGTTGCACTGGTGATC
ACCGTGCTTGTTCTTCTTTTCTCGGGTCGCTAGAGAATCCTCCCCTCCGTTGTATATTCT
TTTTAAAGAAAACAACTGCAAGCCTGTTTCAACAAGTAAAAGTTTTTTATTGTTGATGAT
AGAAGAGAATGTTGTGAGGGTTTCAAAGAGAAGGTACTGCTTAGTCCTTTTATGATTTGT
CTTTTTTGTACATAAACACAGTCTTTATACATACTATTGGAGGC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2ER12JQ 683 0 0
GGCAGTTTTCTTGGAGACAGGGAAAGTATTATTATGTTTGATCAGCCACAAATATATATA
TTCTTTTTCACCATGAATGAGAATTTAGAGGAGGAACAAAAGAAGGGCAAGTATGTTCTG
ATCCGTGATGGTGATCATAAAGAGGACAATGCGTTAGGAGGACTCTTCTATAAGCCTCTT
CCTTTCTTTGGTTTTGGAATCGGATGGTTCTCGTTTCTTGTTGGCTTCTTCTTCCCATTT
GCGTGGTACTTGGCCACATTTCTATATCTCACTAGCTATTACCGTAGAGATCCCAGGGAG
AGATCTGGTCTTGCTGCCTCTGCCATTGCTGTGAGTCTCTTTCTTGATCAGCTGTGATAA
AGAGTATTGCTAACAAAACAGTGCGTTTTTTTTATTCACAGGCTTTGATATTCACTGTTG
CACTGGTGATCACCGTGCTTGTTCTTCTTTTCTCGGGTCGCTAGAGAATCCTCCCCTCCG
TTGTATATTCTTTCTAAAGAAAACAACTGCAAGCCTGTTTCAACAAGTAAAAGTTTTCTA
TTGTTGATGATAGAAGAGAATGTTGTGAGGGTTTCAAAGAGAAGGTACTGCTTAGTCCTT
TTATGATTTGTCTTTTTTGTACATAAACACAGTCTTTATACATACTATTGGAGGCATATC
TATATAGAAATGTTGTTTGAACC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

CO CL2754Contig1 686 4 11 U
GAACATAAACAAGAGTACTCATTAAATTCAAAATCGCATTATAACTGTAGCTCATCAAAA
ACTAAAAAACAGATACAAAATCCATTGTCATAGAAATTGAGTTGCAATATGCAGCAATGA
AATTGTAGTTCATCAAGGACTTTGCCAAGCTCTATGATGATTCCCTAAGCGACAAGAGTG
CTTGCGGTAGTAGATTCGTACTTCCAGACGGGAGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAATAA
CGAGCAAGACGGTGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAGTCTTTGTCC
TTCCTGTTCCTCTCAAGATGCTTGCGGATAGCAACTGCTTTCTTGATCAGGTGGTAAAGA
TCCTCAGGGATCTCAGGTGCAAGACCATGAGCTTTCAAGATTCTCAAAATCTTGTTTCCA
GTAACACTCTTCACCTGTGGGATACCGTGAGAGTCACGAAGAATGACACCAATCTGAGAC
GGAGTCAAACCCTTCTTTGCAAACTTGCAAATGGACTCATCAACATCCTGGGAGGTTGTC
TTGAGCCAACTCGGGGGTGAACGCTTGTACGGCAAAGCAGATGCTGAGATTCCCTTACCT
TTAGAGTGGAGTCGCCCCATGTCGACGGCTGTGAACGGAGTTTGCTTTCTCTAAGAACGT
TCCTCGTACGGCTGCGACTGCGCTCC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GK81JQ U 1
AF RR2DX78JQ U 2
AF RR2GK81TF C 1
AF RR2DX78TF C 2
BS 1 236 RR2GK81JQ
BS 237 237 RR2DX78JQ
BS 238 460 RR2GK81JQ
BS 461 461 RR2DX78JQ
BS 462 473 RR2GK81JQ
BS 474 474 RR2DX78JQ
BS 475 576 RR2GK81JQ
BS 577 651 RR2DX78JQ
BS 652 667 RR2GK81TF
BS 668 668 RR2DX78TF
BS 669 686 RR2GK81TF

RD RR2GK81JQ 576 0 0
GAACATAAACAAGAGTACTCATTAAATTCAAAATCGCATTATAACTGTAGCTCATCAAAA
ACTAAAAAACAGATACAAAATCCATTGTCATAGAAATTGAGTTGCAATATGCAGCAATGA
AATTGTAGTTCATCAAGGACTTTGCCAAGCTCTATGATGATTCCCTAAGCGACAAGAGTG
CTTGCGGTAGTAGATTCGTACTTCCAGACGGGAGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAGTAA
CGAGCAAGACGGTGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAGTCTTTGTCC
TTCCTGTTCCTCTCAAGATGCTTGCGGATAGCAACTGCTTTCTTGATCAGGTGGTAAAGA
TCCTCAGGGATCTCAGGTGCAAGACCATGAGCTTTCAAGATTCTCAAAATCTTGTTTCCA
GTAACACTCTTCACCTGTGGGATACCGTGAGAGTCACGAAAAATGACACCAATTTGAGAC
GGAGTCAAACCCTTCTTTGCAAACTTGCAAATGGACTCATCAACATCCTGGGAGGTTGTC
TTGAGCCAACTCGGGGGTGAACGCTTGTACGGCAAA

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2DX78JQ 650 0 0
AACATAAACAAGAGTACTCATTAAATTCAAAATCGCATTATAACTGTAGCTCATCAAAAA
CTAAAAAACAGATACAAAATCCATTGTCATAGAAATTGAGTTGCAATATGCAGCAATGAA
ATTGTAGTTCATCAAGGACTTTGCCAAGCTCTATGATGATTCCCTAAGCGACAAGAGTGC
TTGCGGTAGTAGATTCGTACTTCCAGACGGGAGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAATAAC
GAGCAAGACGGTGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAGTCTTTGTCCT
TCCTGTTCCTCTCAAGATGCTTGCGGATAGCAACTGCTTTCTTGATCAGGTGGTAAAGAT
CCTCAGGGATCTCAGGTGCAAGACCATGAGCTTTCAAGATTCTCAAAATCTTGTTTCCAG
TAACACTCTTCACCTGTGGGATACCGTGAGAGTCACGAAGAATGACACCAATCTGAGATG
GAGTCAAACCCTTCTTTGCAAACTTGCAAATGGACTCATCAACATCCTGGGAGGTTGTCT
TGAGCCAACTCGGGGGTGAACGCTTGTACGGCAAAGCAGATGCTGAGATTCCCTTACCTT
TAGAGTGGAGTCGCCCCATGTCGACGGCTGTGAACGGAGTTTGCTTTCTC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2GK81TF 686 0 0
G
AACATAAACAAGAGTACTCATTAAATTCAAAATCGCATTATAACTGTAGCTCATCAAAAA
CTAAAAAACAGATACAAAATCCATTGTCATAGAAATTGAGTTGCAATATGCAGCAATGAA
ATTGTAGTTCATCAAGGACTTTGCCAAGCTCTATGATGATTCCCTAAGCGACAAGAGTGC
TTGCGGTAGTAGATTCGTACTTCCAGACGGGAGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAGTAAC
GAGCAAGACGGTGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAGTCTTTGTCCT
TCCTGTTCCTCTCAAGATGCTTGCGGATAGCAACTGCTTTCTTGATCAGGTGGTAAAGAT
CCTCAGGGATCTCAGGTGCAAGACCATGAGCTTTCAAGATTCTCAAAATCTTGTTTCCAG
TAACACTCTTCACCTGTGGGATACCGTGAGAGTCACGAAGAATGACACCAATTTGAGACG
GAGTCAAACCCTTCTTTGCAAACTTGCAAATGGACTCATCAACATCCTGGGAGGTTGTCT
TGAGCCAACTCGGGGGTGAACGCTTGTACGGCAAAGCAGATGCTGAGATTCCCTTACCTT
TAGAGTGGAGTCGCCCCATGTCGACGGCTGTGAACGGAGTTTGCTTTCTCTAAGAACGTT
CCTCGTCCGGCTGCGACTGCGCTCC

QA 2 686 2 686
DS 

RD RR2DX78TF 685 0 0
AACATAAACAAGAGTACTCATTAAATTCAAAATCGCATTATAACTGTAGCTCATCAAAAA
CTAAAAAACAGATACAAAATCCATTGTCATAGAAATTGAGTTGCAATATGCAGCAATGAA
ATTGTAGTTCATCAAGGACTTTGCCAAGCTCTATGATGATTCCCTAAGCGACAAGAGTGC
TTGCGGTAGTAGATTCGTACTTCCAGACGGGAGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAATAAC
GAGCAAGACGGTGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAGTCTTTGTCCT
TCCTGTTCCTCTCAAGATGCTTGCGGATAGCAACTGCTTTCTTGATCAGGTGGTAAAGAT
CCTCAGGGATCTCAGGTGCAAGACCATGAGCTTTCAAGATTCTCAAAATCTTGTTTCCAG
TAACACTCTTCACCTGTGGGATACCGTGAGAGTCACGAAGAATGACACCAATCTGAGATG
GAGTCAAACCCTTCTTTGCAAACTTGCAAATGGACTCATCAACATCCTGGGAGGTTGTCT
TGAGCCAACTCGGGGGTGAACGCTTGTACGGCAAAGCAGATGCTGAGATTCCCTTACCTT
TAGAGTGGAGTCGCCCCATGTCGACGGCTGTGAACGGAGTTTGCTTTCTCTAAGAACGTT
CTTCGTACGGCTGCGACTGCGCTCC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 4

CO CL2755Contig1 695 4 7 U
GGAGATTTAGCTCTCTTCTTGGAACCGAACCATACATGGCGAGTCTAGGCCATATCGCGA
GAGAATCATCCGACGTCACACGCCTCGCTCAGTTCTACAAAGAGGTATTTGGGTTTGAGG
AGATCGAGAGCCCTGATTTTGGAGACTTAAAAGTGATATGGCTAAACTTACCAGGCGCTT
TTGCGATGCACATCATCCAGAGGAACACTTCAACAAACCTCCCTGAAGGTCCTTTCAGCG
CCACCACCTCTGCGGTTAGAGATCCTAGCCATCTCCCTATGGGTCACCATATCTGCTTCT
CCGTCTCCAACTTCGACTCCTTCCTTCGCTCTCTCAAGGAGAAAGGGATAGAAACTTTCC
AGAAGTCTCTCCCTGACGGAAAAGTCAAGCAAGTTTTCTTCTTTGATCCTGATGGAAACG
GATTAGAGGTAGCAAGTCGATCTGAATCTTGAAACCGGAAGTTTGTTTGTGGTATGAGTA
CTTGTTGAAAATTAAAATAAACAGCTTGTTTGTAACAGAGGATAATTAAAAGCTGCATAT
GTAATGAACATGTTCCTGTTCTCGTCTCTTAGCTGGAGTGTTTTGGAACAGTCTTGAGGT
CTTTATGTTGTCTAGGCTTGATGTTTACTTCGGACAATTTACACTTCATGTTTGAATGTT
GGATGTATCGCATTAATGAGTTTTTCTTGTCTACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2A424TF U 1
AF RR2FH06JQ C 90
AF RR2CC31TF U 1
AF RR2FH06TF U 1
BS 1 95 RR2A424TF
BS 96 96 RR2CC31TF
BS 97 190 RR2A424TF
BS 191 191 RR2CC31TF
BS 192 588 RR2A424TF
BS 589 693 RR2CC31TF
BS 694 695 RR2FH06TF

RD RR2A424TF 588 0 0
GGAGATTTAGCTCTCTTCTTGGAACCGAACCATACATGGCGAGTCTAGGCCATATCGCGA
GAGAATCATCCGACGTCACACGCCTCGCTCAGTTCCACAAAGAGGTATTTGGGTTTGAGG
AGATCGAGAGCCCTGATTTTGGAGACTTAAAAGTGATATGGCTAAACTTACCAGGCGCTT
TTGCGATGCATATCATCCAGAGGAACACTTCAACAAACCTCCCTGAAGGTCCTTTCAGCG
CCACCACCTCTGCGGTTAGAGATCCTAGCCATCTCCCTATGGGTCACCATATCTGCTTCT
CCGTCTCCAACTTCGACTCCTTCCTTCGCTCTCTCAAGGAGAAAGGGATAGAAACTTTCC
AGAAGTCTCTCCCTGACGGAAAAGTCAAGCAAGTTTTCTTCTTTGATCCTGATGGAAACG
GATTAGAGGTAGCAAGTCGATCTGAATCTTGAAACCGGAAGTTTGTTTGTGGTATGAGTA
CTTGTTGAAAATTAAAATAAACAGCTTGTTTGTAACAGAGGATAATTAAAAGCTGCATAT
GTAATGAACATGTTCCTGTTCTCGTCTCTTAGCTGGAGTGTTTTGGAA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2FH06JQ 470 0 0
CAGTTCTACAAAGAGGTATTTGGGTTTGAGGAGATCGAGAGCCCTGATTTTGGAGACTTA
AAAGTGATATGGCTAAACTTACCAGGCGCTTTTGCGATGCACATCATCCAGAGGAACACT
TCAACAAACCTCCCTGAAGGTCCTTTCAGCGCCACCACCTTTGCGGTTAGAGATCCTAGC
CATCTCCCTATGGGTCACCATATTTGCTTTTCCGTTTCCAACTTCGACTCCTTCCTTCGC
TCTTTCAAGGAGAAAGGGATAGAAACTTTCCAGAAGTCTCTCCCTGACGGAAAAGTCAAG
CAAGTTTTTTTTTTTGATCCTGATGGAAACGGATTAGAGGTAGCAAGTCGATTTGAATCT
TGAAACCGGAAGTTTGTTTGTGGTATGAGTACTTGTTGAAAATTAAAATAAACAGCTTGT
TTGTAACAGAGGATAATTAAAAGCTGCATATGTAATGAACATGTTCCTGT

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR2CC31TF 693 0 0
GGAGATTTAGCTCTCTTCTTGGAACCGAACCATACATGGCGAGTCTAGGCCATATCGCGA
GAGAATCATCCGACGTCACACGCCTCGCTCAGTTCTACAAAGAGGTATTTGGGTTTGAGG
AGATCGAGAGCCCTGATTTTGGAGACTTAAAAGTGATATGGCTAAACTTACCAGGCGCTT
TTGCGATGCACATCATCCAGAGGAACACTTCAACAAACCTCCCTGAAGGTCCTTTCAGCG
CCACCACCTCTGCGGTTAGAGATCCTAGCCATCTCCCTATGGGTCACCATATCTGCTTCT
CCGTCTCCAACTTCGACTCCTTCCTTCGCTCTCTCAAGGAGAAAGGGATAGAAACTTTCC
AGAAGTCTCTCCCTGACGGAAAAGTCAAGCAAGTTTTCTTCTTTGATCCTGATGGAAACG
GATTAGAGGTAGCAAGTCGATCTGAATCTTGAAACCGGAAGTTTGTTTGTGGTATGAGTA
CTTGTTGAAAATTAAAATAAACAGCTTGTTTGTAACAGAGGATAATTAAAAGCTGCATAT
GTAATGAACATGTTCCTGTTCTCGTCTCTTAGCTGGAGTGTTTTGGAACAGTCTTGAGGT
CTTTATGTTGTCTAGGCTTGATGTTTACTTCGGACAATTTACACTTCATGTTTGAATGTT
GGATGTATCGCATTAATGAGTTTTTCTTGTCTA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2FH06TF 695 0 0
GGAGATTTAGCTCTCTTCTTGGAACCGAACCATACATGGCGAGTCTAGGCCATATCGCGA
GAGAATCATCCGACGTCACACGCCTCGCTCAGTTCTACAAAGAGGTATTTGGGTTTGAGG
AGATCGAGAGCCCTGATTTTGGAGACTTAAAAGTGATATGGCTAAACTTACCAGGCGCTT
TTGCGATGCACATCATCCAGAGGAACACTTCAACAAACCTCCCTGAAGGTCCTTTCAGCG
CCACCACCTCTGCGGTTAGAGATCCTAGCCATCTCCCTATGGGTCACCATATCTGCTTCT
CCGTCTCCAACTTCGACTCCTTCCTTCGCTCTCTCAAGGAGAAAGGGATAGAAACTTTCC
AGAAGTCTCTCCCTGACGGAAAAGTCAAGCAAGTTTTCTTCTTTGATCCTGATGGAAACG
GATTAGAGGTAGCAAGTCGATCTGAATCTTGAAACCGGAAGTTTGTTTGTGGTATGAGTA
CTTGTTGAAAATTAAAATAAACAGCTTGTTTGTAACAGAGGATAATTAAAAGCTGCATAT
GTAATGAACATGTTCCTGTTCTCGTCTCTTAGCTGGAGTGTTTTGGAACAGTCTTGAGGT
CTTTATGTTGTCTAGGCTTGATGTTTACTTCGGACAATTTACACTTCATGTTTGAATGTT
GGATGTATCGCATTAATGAGTTTTTCTTGTCTACT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 2 4

CO CL2756Contig1 769 2 3 U
GGACATCATGGCGTCTTCTCACCTCCAAATCCATTCTCGGATCCACCAAACCCGGTTCTT
CTTCTCTCTCTCCAGACCTCCGTCGTCTCTCCTCTCCCGCCGTCCAGATCTCTATCCGAA
CCCAAAACAAGAAAAACCTCCAGATACAAGCTACTGGTAGCTCATATGGGACTCATTTCC
GAGTTTCCACATTTGGAGAATCACATGGAGGAGGTGTTGGTTGTATTATTGATGGATGTC
CTCCTCGGGTTCCACTCTCTGAATCCGATTTGCAATTTGACCTTGATAGGAGGAGACCGG
GTCAGAGCCGGATCACGACTCCTAGAAAAGAGACTGATACTTGCCGGATATCTTCTGGAG
TCTCCGAAGGAATGACGACAGGAACACCTATCCATGTGTTTGTGCCAAACACAGATCAGA
GAGGACTTGATTACAGTGAAATGTCGGTTGCTTATAGGCCATCACATGCTGATGCAACTT
ATGACATGAAGTATGGTGTCAGATCCGTACAGGGTGGTGGAAGATCTTCAGCTAGAGAGA
CCATAGGAAGAGTTGCTCCTGGAGCTTTGGCCAAGAAAATTTTGAAGCAATTTGCAGGAA
CTGAGATTCTTGCCTATGTCTCGCAAGTCCACCAGGTTGTACTTCCAGAGGATTTGGTAG
ACCACGAGAGTTTGACACTTGAACAGATAGAAAATAATATTGTGAGGTGCCCTAATCCCG
AGTATGCTGAAAAGATGATAGCTGTCATCGATGCTGTGAGGACTAAAGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A117TF U 1
AF RR2BT02TF U 1
BS 1 732 RR2A117TF
BS 733 733 RR2BT02TF
BS 734 769 RR2A117TF

RD RR2A117TF 769 0 0
GGACATCATGGCGTCTTCTCACCTCCAAATCCATTCTCGGATCCACCAAACCCGGTTCTT
CTTCTCTCTCTCCAGACCTCCGTCGTCTCTCCTCTCCCGCCGTCCAGATCTCTATCCGAA
CCCAAAACAAGAAAAACCTCCAGATACAAGCTACTGGTAGCTCATATGGGACTCATTTCC
GAGTTTCCACATTTGGAGAATCACATGGAGGAGGTGTTGGTTGTATTATTGATGGATGTC
CTCCTCGGGTTCCACTCTCTGAATCCGATTTGCAATTTGACCTTGATAGGAGGAGACCGG
GTCAGAGCCGGATCACGACTCCTAGAAAAGAGACTGATACTTGCCGGATATCTTCTGGAG
TCTCCGAAGGAATGACGACAGGAACACCTATCCATGTGTTTGTGCCAAACACAGATCAGA
GAGGACTTGATTACAGTGAAATGTCGGTTGCTTATAGGCCATCACATGCTGATGCAACTT
ATGACATGAAGTATGGTGTCAGATCCGTACAGGGTGGTGGAAGATCTTCAGCTAGAGAGA
CCATAGGAAGAGTTGCTCCTGGAGCTTTGGCCAAGAAAATTTTGAAGCAATTTGCAGGAA
CTGAGATTCTTGCCTATGTCTCGCAAGTCCACCAGGTTGTACTTCCAGAGGATTTGGTAG
ACCACGAGAGTTTGACACTTGAACAGATAGAAAATAATATTGTGAGGTGCCCTAATCCCG
AGTATGCTGAAA*GATGATAGCTGTCATCGATGCTGTGAGGACTAAAGG

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2BT02TF 761 0 0
GGACATCATGGCGTCTTCTCACCTCCAAATCTATTCTCGGATCCACCAAACCCGGTTCTT
CTTCTCTCTCTCCAGACCTCCGTCGTCTCTCCTCTCCCGCCGTCCAGATCTCTATCCGAA
CCCAAAACAAGAAAAACCTCCAGATACAAGCTACTGGTAGCTCATATGGGACTCATTTCC
GAGTTTCCACATTTGGAGAATCACATGGAGGAGGTGTTGGTTGTATTATTGATGGATGTC
CTCCTCGGGTTCCACTCTCTGAATCCGATTTGCAATTTGACCTTGATAGGAGGAGACCGG
GTCAGAGCCGGATCACGACTCCTAGAAAAGAGACTGATACTTGCCGGATATCTTCTGGAG
TCTCCGAAGGAATGACGACAGGAACACCTATCCATGTGTTTGTGCCAAACACAGATCAGA
GAGGACTTGATTACAGTGAAATGTCGGTTGCTTATAGGCCATCACATGCTGATGCAACTT
ATGACATGAAGTATGGTGTCAGATCCGTACAGGGTGGTGGAAGATCTTCAGCTAGAGAGA
CCATAGGAAGAGTTGCTCCTGGAGCTTTGGCCAAGAAAATTTTGAAGCAATTTGCAGGAA
CTGAGATTCTTGCCTATGTCTCGCAAGTCCACCAGGTTGTACTTCCAGAGGATTTGGTAG
ACCACGAGAGTTTGACACTTGAACAGATAGAAA*TAATATTGTGAG*TGCCCTAATCCCG
AGTATGCTGAAAAGATGATAGCTGTCATCGATGCTGTGAGG

QA 1 761 1 761
DS 



CO CL2756Contig2 839 2 4 U
CGCATTCTGCTGGAACTATATTAAGAATGGATAGTACACAGTCAAATTAGGGTATTGGGT
ATTGGGCAGCTCGGAAACTACTAGAGACAGGAAAATAAGGAGGTACTGGTAAATGCAATG
TTCTTTTAAAACGATCCGGGGCACAAAAATTTAACCTCTTTATTCAAAATAATCACACAA
CAAAAGCGAAGCCTCTCTGTCACACTTATCTTCTCAAGTTTTGCTTACAAAGCAGCAGCA
TTTTGCGGCTGCTCGAGCTCGACAGGAGAAGCTGTCCGAAAAGGTTCCTGCAGCTCTGGA
TTTATCGGGAACAAATGGCACTGTGCGTACTGCGCCATCAGCTGATCCACAAGAACTAAA
GCCACCATTGCTTCCACCATTGGCACAGCTCGTGGAACGACACAAGGATCATGACGTCCA
CGCGCAATCATCTCAGTTTCTTTCTTATCTCTGGTTACAGTATTCTGCTTCCTTCCAATT
GTGATGTTGGCTTGAAGGCTACTCTCATGTTTATTATCTCACCATTTGATATCCCTCCCT
GAATTCCACCGGATCGGTTTGTTTTTGTCCGGATTCTTCCATTTTCATCAGTGTAGAACT
CATCATTGTGTTCAAGACCAGTCAGAAAAGTACCTGAGAAGCCACTTCCAAACTCAAATC
CCTTTGTTGCAGGTAACGACATACAGGCTTTAGCCAATTCCGCTTCAAGTTTATCGAAAA
CTGGTGTTCCAAGCCCACGTGGAGCATTCCGAACGATGCAGGTCACAACACCACCAACAG
AGTTCCCTTTAGTCCTCACAGCATCGATGACAGCTATCATCTTTTCAGCATACTCGGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT02JQ U 1
AF RR2A117JQ U 65
BS 1 280 RR2BT02JQ
BS 281 281 RR2A117JQ
BS 282 708 RR2BT02JQ
BS 709 839 RR2A117JQ

RD RR2BT02JQ 708 0 0
CGCATTCTGCTGGAACTATATTAAGAATGGATAGTACACAGTCAAATTAGGGTATTGGGT
ATTGGGCAGCTCGGAAACTACTAGAGACAGGAAAATAAGGAGGTACTGGTAAATGCAATG
TTCTTTTAAAACGATCCGGGGCACAAAAATTTAACCTCTTTATTCAAAATAATCACACAA
CAAAAGCGAAGCCTCTCTGTCACACTTATCTTCTCAAGTTTTGCTTACAAAGCAGCAGCA
TTTTGCGGCTGCTCGAGCTCGACAGGAGAAGCTGTCCGAAGAGGTTCCTGCAGCTCTGGA
TTTATCGGGAACAAATGGCACTGTGCGTACTGCGCCATCAGCTGATCCACAAGAACTAAA
GCCACCATTGCTTCCACCATTGGCACAGCTCGTGGAACGACACAAGGATCATGACGTCCA
CGCGCAATCATCTCAGTTTCTTTCTTATCTCTGGTTACAGTATTCTGCTTCCTTCCAATT
GTGATGTTGGCTTGAAGGCTACTCTCATGTTTATTATCTCACCATTTGATATCCCTCCCT
GAATTCCACCGGATCGGTTTGTTTTTGTCCGGATTCTTCCATTTTCATCAGTGTAGAACT
CATCATTGTGTTCAAGACCAGTCAGAAAAGTACCTGAGAAGCCACTTCCAAACTCAAATC
CCTTTGTTGCAGGTAACGACATACAGGCTTTAGCCAATTCCGCTTCAA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2A117JQ 775 0 0
GGCAGCTCGGAAACTACTAGAGACAGGAAAATAAGGAGGTACTGGTAAATGCAATGTTCT
TTTAAAACGATCCGGGGCACAAAAATTTAACCTCTTTATTCAAAATAATCACACAACAAA
AGCGAAGCCTCTCTGTCACACTTATCTTCTCAAGTTTTGCTTACAAAGCAGCAGCATTTT
GCGGCTGCTCGAGCTCGACAGGAGAAGCTGTCCGAAAAGGTTCCTGCAGCTCTGGATTTA
TCGGGAACAAATGGCACTGTGCGTACTGCGCCATCAGCTGATCCACAAGAACTAAAGCCA
CCATTGCTTCCACCATTGGCACAGCTCGTGGAACGACACAAGGATCATGACGTCCACGCG
CAATCATCTCAGTTTCTTTCTTATCTCTGGTTACAGTATTCTGCTTCCTTCCAATTGTGA
TGTTGGCTTGAAGGCTACTCTCATGTTTATTATCTCACCATTTGATATCCCTCCCTGAAT
TCCACCGGATCGGTTTGTTTTTGTCCGGATTCTTCCATTTTCATCAGTGTAGAACTCATC
ATTGTGTTCAAGACCAGTCAGAAAAGTACCTGAGAAGCCACTTCCAAACTCAAATCCCTT
TGTTGCAGGTAACGACATACAGGCTTTAGCCAATTCCGCTTCAAGTTTATCGAAAACTGG
TGTTCCAAGCCCACGTGGAGCATTCCGAACGATGCAGGTCACAACACCACCAACAGAGTT
CCCTTTAGTCCTCACAGCATCGATGACAGCTATCATCTTTTCAGCATACTCGGGA

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 4

CO CL2757Contig1 1226 4 4 U
GGAAACTAATTTCCCAAGACAAGTCAAAGAAATGAAGGAACATCTAAAGCGCATCAATGG
GTTGTACGTTACATTGTTACTAGCGCTCTATGCGTGTGCTGTCATTGTACAACTCGAAGC
AGCGTCGGAAACAAAGACATGTTTCCAAAAGAAGAGCCCATGCTTCCTTAAGAAGCAGAC
TTGCCCAAAGCAGTGCCCTTCGTTTTCCCCTCCCTACGGTAGCTCCAAGGCATGCGTCGT
AGATTGTTTTAACCCTATATGCAAAGCCACTTGCCGAAATAGAAAGCCTAACTGCAACGG
CAGAGGATCAGCATGCTTATACCCACGATTCATAGGTGGCGACGGCGTCGTATTCTACTT
TCACGGCAAACGCGATGAGCATTTCGCACTCGTCTCTGACATCGACCTCCAAGTCAACGC
ACGCTTCATTGGTCTCAGACCCTCTGGCCGAAGCAGAGACTTCACCTGGATCCAATCTTT
GGGTCTGATCTTCGGCCCCAACAGCAAAACCTTTACACTCGAGGCCCAAAAGGCTGCAAA
ATGGGACCACCAAGTGGACCATCTCCGTCTTTCCTTCGAGGGAAAAGAGATTCTTTTACC
AAAAGGGGATTCGTCTATCTGGAGTTCCCCGAGGAGCTATATAACGATCGAGAGGACTTC
GGACATGAACTCCGTGTTGGTCACGTTACCAGACATTGCCGAGATTTGGGTCAACGTTGT
TCCGGTTACAAAGGAAGACGACACGATACATAACTACGGGAGACCTGAAAATGACTGTTT
TGCCCATCTCGAAGTCCAGTTCCGGTTCTTGAGGTTGTCCCCGAACGTGGAGGGTGTTTT
GGGAAGAACATACAGAGAGGATTTCCAGAATCCTGCGAAGCCAGGGGTGGCTATGCCGGT
CGTCGGTGGAGAAGATAAATACAGAACATCTTCGCTTCTTGAAACGAGTTGTAATGCTTG
TGTTCACTCACGTGGCTCTAGAAGTTCCGACAAGATCGAGCCGTTGTCGCTGAATCAAAA
CACTGTTGATTGCACCGGAGGATCGAGCAGTGGTATTGGAATCTTCTGCAGGAAATAAAT
GCTATGTTTAATAGTATTTTATTTGCTAGATTAATCGGAGCGTCATGTCGGTGGTGTTTA
TCATAGTTATTTTTTTTTGGTTGGCCAAATATTGAATTAGCTATGTACGTTGATGTTGTG
CATTTGTTTGGAAATGAATAATATTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GN77TF U 1
AF RR2GA22TF U 1
AF RR2GA22JQ C 579
AF RR2GN77JQ C 587
BS 1 706 RR2GA22TF
BS 707 707 RR2GA22JQ
BS 708 724 RR2GA22TF
BS 725 1226 RR2GA22JQ

RD RR2GN77TF 519 0 0
GGAAACTAATTTCCCAAGACAAGTCAAAGAAATGAAGGAACATCTAAAGCGCATCAATGG
GTTGTACGTTACATTGTTACTAGCGCTCTATGCGTGTGCTGTCATTGTACAACTCGAAGC
AGCGTCGGAAACAAAGACATGTTTCCAAAAGAAGAGCCCATGCTTCCTTAAGAAGCAGAC
TTGCCCAAAGCAGTGCCCTTCGTTTTCCCCTCCCTACGGTAGCTCCAAGGCATGCGTCGT
AGATTGTTTTAACCCTATATGCAAAGCCACTTGCCGAAATAGAAAGCCTAACTGCAACGG
CAGAGGATCAGCATGCTTATACCCACGATTCATAGGTGGCGACGGCGTCGTATTCTACTT
TCACGGCAAACGCGATGAGCATTTCGCACTCGTCTCTGACATCGACCTCCAAGTCAACGC
ACGCTTCATTGGTCTCAGACCCTCTGGCCGAAGCAGAGACTTCACCTGGATCCAATCTTT
GGGTCTGATCTTCGGCCCCAACAGCAAAACCTTTACACT

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2GA22TF 729 0 0
GGAAACTAATTTCCCAAGACAAGTCAAAGAAATGAAGGAACATCTAAAGCGCATCAATGG
GTTGTACGTTACATTGTTACTAGCGCTCTATGCGTGTGCTGTCATTGTACAACTCGAAGC
AGCGTCGGAAACAAAGACATGTTTCCAAAAGAAGAGCCCATGCTTCCTTAAGAAGCAGAC
TTGCCCAAAGCAGTGCCCTTCGTTTTCCCCTCCCTACGGTAGCTCCAAGGCATGCGTCGT
AGATTGTTTTAACCCTATATGCAAAGCCACTTGCCGAAATAGAAAGCCTAACTGCAACGG
CAGAGGATCAGCATGCTTATACCCACGATTCATAGGTGGCGACGGCGTCGTATTCTACTT
TCACGGCAAACGCGATGAGCATTTCGCACTCGTCTCTGACATCGACCTCCAAGTCAACGC
ACGCTTCATTGGTCTCAGACCCTCTGGCCGAAGCAGAGACTTCACCTGGATCCAATCTTT
GGGTCTGATCTTCGGCCCCAACAGCAAAACCTTTACACTCGAGGCCCAAAAGGCTGCAAA
ATGGGACCACCAAGTGGACCATCTCCGTCTTTCCTTCGAGGGAAAAGAGATTCTTTTACC
AAAAGGGGATTCGTCTATCTGGAGTTCCCCGAGGAGCTATATAACGATCGAGAGGACTTC
GGACATGAACTCCGTGTTGGTCACGTTACCAGACATTGCCGAGATT*GGGTCAACGTTGT
TCCG
TTACA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2GA22JQ 648 0 0
AGGGAAAAGAGATTCTTTTACCAAAAGGGGATTCGTCTATCTGGAGTTCCCCGAGGAGCT
ATATAACGATCGAGAGGACTTCGGACATGAACTCCGTGTTGGTCACGTTACCAGACATTG
CCGAGATTTGGGTCAACGTTGTTCCGGTTACAAAGGAAGACGACACGATACATAACTACG
GGAGACCTGAAAATGACTGTTTTGCCCATCTCGAAGTCCAGTTCCGGTTCTTGAGGTTGT
CCCCGAACGTGGAGGGTGTTTTGGGAAGAACATACAGAGAGGATTTCCAGAATCCTGCGA
AGCCAGGGGTGGCTATGCCGGTCGTCGGTGGAGAAGATAAATACAGAACATCTTCGCTTC
TTGAAACGAGTTGTAATGCTTGTGTTCACTCACGTGGCTCTAGAAGTTCCGACAAGATCG
AGCCGTTGTCGCTGAATCAAAACACTGTTGATTGCACCGGAGGATCGAGCAGTGGTATTG
GAATCTTCTGCAGGAAATAAATGCTATGTTTAATAGTATTTTATTTGCTAGATTAATCGG
AGCGTCATGTCGGTGGTGTTTATCATAGTTATTTTTTTTTGGTTGGCCAAATATTGAATT
AGCTATGTACGTTGATGTTGTGCATTTGTTTGGAAATGAATAATATTT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2GN77JQ 640 0 0
GAGATTCTTTTACCAAAAGGGGATTCGTCTATCTGGAGTTCCCCGAGGAGCTATATAACG
ATCGAGAGGACTTCGGACATGAACTCCGTGTTGGTCACGTTACCAGACATTGCCGAGATT
TGGGTCAACGTTGTTCCGGTTACAAAGGAAGACGACACGATACATAACTACGGGAGACCT
GAAAATGACTGTTTTGCCCATCTCGAAGTCCAGTTCCGGTTCTTGAGGTTGTCCCCGAAC
GTGGAGGGTGTTTTGGGAAGAACATACAGAGAGGATTTCCAGAATCCTGCGAAGCCAGGG
GTGGCTATGCCGGTCGTCGGTGGAGAAGATAAATACAGAACATCTTCGCTTCTTGAAACG
AGTTGTAATGCTTGTGTTCACTCACGTGGCTCTAGAAGTTCCGACAAGATCGAGCCGTTG
TCGCTGAATCAAAACACTGTTGATTGCACCGGAGGATCGAGCAGTGGTATTGGAATCTTC
TGCAGGAAATAAATGCTATGTTTAATAGTATTTTATTTGCTAGATTAATCGGAGCGTCAT
GTCGGTGGTGTTTATCATAGTTATTTTTTTTTGGTTGGCCAAATATTGAATTAGCTATGT
ACGTTGATGTTGTGCATTTGTTTGGAAATGAATAATATTT

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL2758Contig1 816 2 10 U
GGCCCAACGTCAACTTTAAAGGTCTTTGTTTCTCTCCTGACTTGTCTCCGATCTAGGGTT
TGCTCACACCGACAACGATGATCCAGCTCCTCTACTCGGTGATCTTCGCCGAAATGGCCT
TAATCCTCCTTCTCCTCTTCAAGACGCCTCTCCGGAAGCTAATCATCCTCACCTTCGATC
GCATCAAACGCGGCCGCGGCCCCGTCGTCGTCAAAACCATCGGCGCCACCGTCTTCGTCG
TTCTTATGTCCAGCGTCTACAGTTTGCTTAGTATCCAACGCCGATCCGAGGATGGTGCCG
TCCTCAATCCTACCGATCAGGTCCTCGCCTCCAAGCATCTTCTCGAGGCTTCTCTCATGG
GGTTTGTGCTATTTCTCTCGCTCATGATTGATCGGCTACACCATTACATAAGGGAGTTGC
GGTTGCTTAGGAAGACAATGGAGACTGCAAAGAAACATAACAGAAGTTTCGAGGATGGCA
AGAACACGAGCGGGGAAGAAGTTAAAGCGCTCGGGGAAGAGATCGCAGCGTTGAAGGCAA
AGATCAAGAAATTAGAATCTGAAAGTGAAAGCAAAGGCAAAGAACTGAAAAGTGCACAAG
CTGAAACAGAGGCTCTGAGAAAATCAGCTGATGGGTTTCTCATGGAGTATGATAGGCTGC
TTGAGGATAATCAGAATCTCAGGAACCAGTTGGAGTCTATCGGCCATAGCCCAGAGGGAA
AGAAGAGTATGTGAAACAGAGAAATACAATGGTATTAATGTAATATTTTCTTTTGTAGAG
CACAAAGAAACTTTAGGAAATGTGGATTTTCTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ13TF U 1
AF RR2GJ13JQB C 238
BS 1 611 RR2GJ13TF
BS 612 612 RR2GJ13JQB
BS 613 655 RR2GJ13TF
BS 656 656 RR2GJ13JQB
BS 657 682 RR2GJ13TF
BS 683 683 RR2GJ13JQB
BS 684 720 RR2GJ13TF
BS 721 723 RR2GJ13JQB
BS 724 748 RR2GJ13TF
BS 749 816 RR2GJ13JQB

RD RR2GJ13TF 755 0 0
GGCCCAACGTCAACTTTAAAGGTCTTTGTTTCTCTCCTGACTTGTCTCCGATCTAGGGTT
TGCTCACACCGACAACGATGATCCAGCTCCTCTACTCGGTGATCTTCGCCGAAATGGCCT
TAATCCTCCTTCTCCTCTTCAAGACGCCTCTCCGGAAGCTAATCATCCTCACCTTCGATC
GCATCAAACGCGGCCGCGGCCCCGTCGTCGTCAAAACCATCGGCGCCACCGTCTTCGTCG
TTCTTATGTCCAGCGTCTACAGTTTGCTTAGTATCCAACGCCGATCCGAGGATGGTGCCG
TCCTCAATCCTACCGATCAGGTCCTCGCCTCCAAGCATCTTCTCGAGGCTTCTCTCATGG
GGTTTGTGCTATTTCTCTCGCTCATGATTGATCGGCTACACCATTACATAAGGGAGTTGC
GGTTGCTTAGGAAGACAATGGAGACTGCAAAGAAACATAACAGAAGTTTCGAGGATGGCA
AGAACACGAGCGGGGAAGAAGTTAAAGCGCTCGGGGAAGAGATCGCAGCGTTGAAGGCAA
AGATCAAGAAATTAGAATCTGAAAGTGAAAGCAAAGGCAAAGAACTGAAAAGTGCACAAG
CTGAAACAGAG*CTCTGAGAAAATCAGCTGATGGGTTTCTCATGGAGTATGATAG*CTGC
TTGAGGATAATCAGAATCTCAG*AACCAGTTGGAGTCTATCGGCCATAGCCCAGAGGGAA
**GAGAGTATGTGAAACAGAGAAATACA
TGGTATT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2GJ13JQB 579 0 0
TCGTTCTTATGTCCAGCGTCTACAGTTTGCTTAGTATCCAACGCCGATCCGAGGATGGTG
CCGTCCTCAATCCTACCGATCAGGTCCTCGCCTCCAAGCATCTTCTCGAGGCTTCTCTCA
TGGGGTTTGTGCTATTTCTCTCGCTCATGATTGATCGGCTACACCATTACATAAGGGAGT
TGCGGTTGCTTAGGAAGACAATGGAGACTGCAAAGAAACATAACAGAAGTTTCGAGGATG
GCAAGAACACGAGCGGGGAAGAAGTTAAAGCGCTCGGGGAAGAGATCGCAGCGTTGAAGG
CAAAGATCAAGAAATTAGAATCTGAAAGTGAAAGCAAAGGCAAAGAACTGAAAAGTGCAC
AAGCTGAAACAGAGGCTCTGAGAAAATCAGCTGATGGGTTTCTCATGGAGTATGATAGGC
TGCTTGAGGATAATCAGAATCTCAGGAACCAGTTGGAGTCTATCGGCCATAGCCCAGAGG
GAAAGAAGAGTATGTGAAACAGAGAAATACAATGGTATTAATGTAATATTTTCTTTTGTA
GAGCACAAAGAAACTTTAGGAAATGTGGATTTTCTGACC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 4

CO CL2759Contig1 1302 4 5 U
GCTTGCCACAGACTCAGAATCTTTTATTATATATGAAAAGTTGGAAATTAATAAACAACA
TAATGATAATTTGAGTAGTAATCAAATAGATATGTTTAAATTACACTTGCACATTGGACA
TCGTGTGTCAAGTATATATACTGAAAAATATTACTTCCTTGATTATATTCTGGAATCTAA
CGCCATGATCGTGCTAAGGTTCATGGGGTTCATGTACTCAACCGAACCAGTCATGATCTG
TTGGACGATGAGTCGGGTAGCTTTCTCAGTCGGGTGGAAAGGGTCCCAAAATGCATAGGC
GTTACGGTCTGGACATAAGCTTGACAACGGGGTGCAAACACCTTGCCCGTTGTATGCCCC
TTGTCCGCAGCACGCTACCTTGGATGTCACGAAACCAAATCTCTGGGGGTTGTTTATGAA
ATCTGCATTCATATTGAACGCATTAGCCCCAATGAAAACATCAGAACCGATTTCGCGGTT
AAGTCCTTGAAGCATTTGATCCAAAAGCGGATTAAATATGGCTGCAGCCTGTTGTGCCTC
GGGAGCACATTCTCCGTTTGCGCTTCTAGATGAAGCAAGCTCTGCCGGTACGCAACCCAA
CGGTCCTGTTCCTGTAACCATGACCCTCCTCGCTCCCAACTCATACAGTCTCATGAGTAT
TTTCCTGTATTCGGAGATGAGAAGCTGGCTAAATTCGCTGAGAGATGACTGTCGACCTCT
AGCAGAGAATGGCAAGAAGTAGTTGTTGACGAAATCGTTGCCACCAAGAGTCATGAGGAC
TAAAGCTCCATTTACAAGCTGTTGTGTTTTGTCTGAACCTATAATCTCACTCACTCTCTC
TTGATACTCTTGGAACAGCTCGAATTGCCTACCGATCCTTAGTATGTTCAAAAACTGAAC
ACCGGTGTCGTTGAGAATTCCGATGCCGGCAGAGGCAAAATTAGCTCCGATCAATAACTT
CTCTCCAGTGAGCTCAGGGCTAAGGATTGGTAGCGTTGGCTCGGATCCAATTTGCTCACT
GATGATGTCAGGGAGGTTCAAGCCGTTGGAGAAACGCCCCGTTGGACGACCAGTCGGATA
ATCGATTCCGTACGGCGGAGAGTCGGCACGAGCGGTGGTGACTAAGTAATTGTTATTACC
ACTGTCCACGAGTGAGTCGCCAAAGACGTAGAACGCTCGAGCCGCGTTTGTTTTTTTGCG
GCATAAGAAATAGCATTCCCCATAACGCGGTGGACAGAAATATGGATGTTAGAAGAGTGG
ACATTATGTGAAGTGATACTTCGTAATATATGAAAAGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2GI94JQB U 1
AF RR2BR91JQ U 11
AF RR2BR91TF C 603
AF RR2GI94TF C 616
BS 1 724 RR2GI94JQB
BS 725 736 RR2BR91JQ
BS 737 1196 RR2BR91TF
BS 1197 1197 RR2GI94TF
BS 1198 1302 RR2BR91TF

RD RR2GI94JQB 724 0 0
GCTTGCCACAGACTCAGAATCTTTTATTATATATGAAAAGTTGGAAATTAATAAACAACA
TAATGATAATTTGAGTAGTAATCAAATAGATATGTTTAAATTACACTTGCACATTGGACA
TCGTGTGTCAAGTATATATACTGAAAAATATTACTTCCTTGATTATATTCTGGAATCTAA
CGCCATGATCGTGCTAAGGTTCATGGGGTTCATGTACTCAACCGAACCAGTCATGATCTG
TTGGACGATGAGTCGGGTAGCTTTCTCAGTCGGGTGGAAAGGGTCCCAAAATGCATAGGC
GTTACGGTCTGGACATAAGCTTGACAACGGGGTGCAAACACCTTGCCCGTTGTATGCCCC
TTGTCCGCAGCACGCTACCTTGGATGTCACGAAACCAAATCTCTGGGGGTTGTTTATGAA
ATCTGCATTCATATTGAACGCATTAGCCCCAATGAAAACATCAGAACCGATTTCGCGGTT
AAGTCCTTGAAGCATTTGATCCAAAAGCGGATTAAATATGGCTGCAGCCTGTTGTGCCTC
GGGAGCACATTCTCCGTTTGCGCTTCTAGATGAAGCAAGCTCTGCCGGTACGCAACCCAA
CGGTCCTGTTCCTGTAACCATGACCCTCCTCGCTCCCAACTCATACAGTCTCATGAGTAT
TTTCCTGTATTCGGAGATGAGAAGCTGGCTAAATTCGCTGAGAGATGACTGTCGACCTCT
AGCA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2BR91JQ 726 0 0
GG
CTCAGAATCTTTTATTATATATGAAAAGTTGGAAATTAATAAACAACATAATGATAATTT
GAGTAGTAATCAAATAGATATGTTTAAATTACACTTGCACATTGGACATCGTGTGTCAAG
TATATATACTGAAAAATATTACTTCCTTGATTATATTCTGGAATCTAACGCCATGATCGT
GCTAAGGTTCATGGGGTTCATGTACTCAACCGAACCAGTCATGATCTGTTGGACGATGAG
TCGGGTAGCTTTCTCAGTCGGGTGGAAAGGGTCCCAAAATGCATAGGCGTTACGGTCTGG
ACATAAGCTTGACAACGGGGTGCAAACACCTTGCCCGTTGTATGCCCCTTGTCCGCAGCA
CGCTACCTTGGATGTCACGAAACCAAATCTCTGGGGGTTGTTTATGAAATCTGCATTCAT
ATTGAACGCATTAGCCCCAATGAAAACATCAGAACCGATTTCGCGGTTAAGTCCTTGAAG
CATTTGATCCAAAAGCGGATTAAATATGGCTGCAGCCTGTTGTGCCTCGGGAGCACATTC
TCCGTTTGCGCTTCTAGATGAAGCAAGCTCTGCCGGTACGCAACCCAACGGTCCTGTTCC
TGTAACCATGACCCTCCTCGCTCCCAACTCATACAGTCTCATGAGTATTTTCCTGTATTC
GGAGATGAGAAGCTGGCTAAATTCGCTGAGAGATGACTGTCGACCTCTAGCAGAGAATGG
CAAG

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR2BR91TF 700 0 0
GGTCCTG
TCCTGTAACCATGACCCTCCTCGCTCCCAACTCATACAGTCTCATGAGTATTTTCCTGTA
TTCGGAGATGAGAAGCTGGCTAAATTCGCTGAGAGATGACTGTCGACCTCTAGCAGAGAA
TGGCAAGAAGTAGTTGTTGACGAAATCGTTGCCACCAAGAGTCATGAGGACTAAAGCTCC
ATTTACAAGCTGTTGTGTTTTGTCTGAACCTATAATCTCACTCACTCTCTCTTGATACTC
TTGGAACAGCTCGAATTGCCTACCGATCCTTAGTATGTTCAAAAACTGAACACCGGTGTC
GTTGAGAATTCCGATGCCGGCAGAGGCAAAATTAGCTCCGATCAATAACTTCTCTCCAGT
GAGCTCAGGGCTAAGGATTGGTAGCGTTGGCTCGGATCCAATTTGCTCACTGATGATGTC
AGGGAGGTTCAAGCCGTTGGAGAAACGCCCCGTTGGACGACCAGTCGGATAATCGATTCC
GTACGGCGGAGAGTCGGCACGAGCGGTGGTGACTAAGTAATTGTTATTACCACTGTCCAC
GAGTGAGTCGCCAAAGACGTAGAACGCTCGAGCCGCGTTTGTTTTTT*GCGGCATAAGAA
ATAGCATTCCCCATAACGCGGTGGACAGAAATATGGATGTTAGAAGAGTGGACATTATGT
GAAGTGATACTTCGTAATATATGAAAAGTGTCC

QA 8 700 8 700
DS 

RD RR2GI94TF 685 0 0
AACCATGACCCTCCTCGCTCCCAACTCATACAGTCTCATGAGTATTTTCCTGTATTCGGA
GATGAGAAGCTGGCTAAATTCGCTGAGAGATGACTGTCGACCTCTAGCAGAGAATGGCAA
GAAGTAGTTGTTGACGAAATCGTTGCCACCAAGAGTCATGAGGACTAAAGCTCCATTTAC
AAGCTGTTGTGTTTTGTCTGAACCTATAATCTCACTCACTCTCTCTTGATACTCTTGGAA
CAGCTCGAATTGCCTACCGATCCTTAGTATGTTCAAAAACTGAACACCGGTGTCGTTGAG
AATTCCGATGCCGGCAGAGGCAAAATTAGCTCCGATCAATAACTTCTCTCCAGTGAGCTC
AGGGCTAAGGATTGGTAGCGTTGGCTCGGATCCAATTTGCTCACTGATGATGTCAGGGAG
GTTCAAGCCGTTGGAGAAACGCCCCGTTGGACGACCAGTCGGATAATCGATTCCGTACGG
CGGAGAGTCGGCACGAGCGGTGGTGACTAAGTAATTGTTATTACCACTGTCCACGAGTGA
GTCGCCAAAGACGTAGAACGCTCGAGCCGCGTTTGTTTTTTTGCGGCATAAGAAATAGCA
TTCCCCATAACGCGGTGGACAGAAATATGGATGTTAGAAGAGTGGACATTATGTGAAGTG
ATACTTCGTAATATATGAAAAGT
CC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

CO CL2760Contig1 793 4 10 U
TTTTTGCCGTGAATTCTTGATAGACAGATGGGGCTAACTGAAGAAGAAATCAGAAGACTT
CACAGAATCCAGAAGACGGTGATGCAGATGCTCAAGGACCGTGGCTACTTCGTCGCTGAT
TCCGAGATCACGATGACCCTATCACAGTTTGTTAGGAAGTATGGTGACAACATGAAAAGG
GATGATCTCGTTACTCTCAGAGCCAAGAGAAACGATAGCAGTGATCAGCTGTATATCTTC
TTCCCTGAAGAGTCGAAAGTTGGAGTGAACACAATGAAAGTGTACACGAACCGGATGAAG
TCTGAGAATGTTCACAGAGCAATCC*TGGTGGTGCAACAGAACCTCACTCCTTTT*GCTC
GAAATTTGCATTAGTCAGATCTCTTCTATTTTCCATTTGGAAGTTTTCCAGGAGGCGGAA
ATGCTAGTGAACATTAAAGAACATGTACTTGTTCCGGAGCACCAAGTTCTCACCACTGAA
GAGAAGAAAACTTTACTGGAGAGGTACACTGTCAAGGAGACGCAGCTTCCAAGGATTCAA
GTGACTGATCCAATCGCAAGATACTTTGGACTAAAAAGTGGCCAAGTCATAAAGATCATA
CGTCCCAGTGAAACCGCTGGTCGTTATGCTACCTATCGTTATGTTGTATAATAAGCCAAA
ATTGCTTCTTGCTTTTGTGAAACATTAGAGAATAATTGTTTTTGTTCCAAACTCTTGACA
ATGTTCTTTGTGTCATTTCTTTTGAACACACAATGTTTTTTGTTAGAAGTAAGAACTGAA
AACCTTAACGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM20TF U 6
AF RR2H366TF U 82
AF RR2H366JQ C 1
AF RR2AM20JQ C 12
BS 1 11 RR2H366JQ
BS 12 339 RR2AM20TF
BS 340 340 RR2H366TF
BS 341 376 RR2AM20TF
BS 377 382 RR2H366JQ
BS 383 383 RR2AM20JQ
BS 384 628 RR2H366JQ
BS 629 629 RR2AM20JQ
BS 630 744 RR2H366JQ
BS 745 793 RR2AM20JQ

RD RR2AM20TF 371 0 0
GCCGTG
AATTCTTGATAGACAGATGGGGCTAACTGAAGAAGAAATCAGAAGACTTCACAGAATCCA
GAAGACGGTGATGCAGATGCTCAAGGACCGTGGCTACTTCGTCGCTGATTCCGAGATCAC
GATGACCCTATCACAGTTTGTTAGGAAGTATGGTGACAACATGAAAAGGGATGATCTCGT
TACTCTCAGAGCCAAGAGAAACGATAGCAGTGATCAGCTGTATATCTTCTTCCCTGAAGA
GTCGAAAGTTGGAGTGAACACAATGAAAGTGTACACGAACCGGATGAAGTCTGAGAATGT
TCACAGAGCAATCC*TGGTGGTGCAACATAACCTCACTCCTTTT*GCTCGAAATTTGCAT
TAGTC

QA 7 371 7 371
DS 

RD RR2H366TF 295 0 0
ATGCAGATGCTCAAGGACCGTGGCTACTTCGTCGCTGATTCCGAGATCACGATGACCCTA
TCACAGTTTGTTAGGAAGTATGGTGACAACATGAAAAGGGATGATCTCGTTACTCTCAGA
GCCAAGAGAAACGATAGCAGTGATCAGCTGTATATCTTCTTCCCTGAAGAGTCGAAAGTT
GGAGTGAACACAATGAAAGTGTACACGAACCGGATGAAGTCTGAGAATGTTCACAGAGCA
ATCCCTGGTGGTGCAACAGAACCTCACTCCTTTTTGCTCGAAATTTGCATTAGTC

QA 1 295 1 295
DS 

RD RR2H366JQ 744 0 0
TTTTTGCCGTGAATTCTTGATAGACAGATGGGGCTAACGGAAGAAGAAATCAGAAGACTT
CACAGAATCCAGAAGACGGTGATGCAGATGCTCAAGGACCGTGGCTACTTCGTCGCTGAT
TCCGAGATCACGATGACCCTATCACAGTTTGTTAGGAAGTATGGTGACAACATGAAAAGG
GATGATCTCGTTACTCTCAGAGCCAAGAGAAACGATAGCAGTGATCAGCTGTATATCTTC
TTCCCTGAAGAGTCGAAAGTTGGAGTGAACACAATGAAAGTGTACACGAACCGGATGAAG
TTTGAGAATGTTCACAGAGCAATCC*TGGTGGTGCAACAGAACCTCACTCCTTTT*GCTC
GAAATT*GCATTAGTCAGATCTTTTCTATTTTCCATTTGGAAGTTTTCCAGGAGGCGGAA
ATGCTAGTGAACATTAAAGAACATGTACTTGTTCCGGAGCACCAAGTTCTCACCACTGAA
GAGAAGAAAACTTTACTGGAGAGGTACACTGTCAAGGAGACGCAGCTTCCAAGGATTCAA
GTGACTGATCCAATCGCAAGATACTTTGGACTAAAAAGTGGCCAAGTCATAAAGATCATA
CGTCCCAGTGAAACCGCTGGTCGTTATGTTACCTATCGTTATGTTGTATAATAAGCCAAA
ATTGCTTCTTGCTTTTGTGAAACATTAGAGAATAATTGTTTTTGTTCCAAACTCTTGACA
ATGTTCTTTGTGTCATTTCTTTTG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2AM20JQ 782 0 0
AATTCTTGATAGACAGATGGGGCTAACTGAAGAAGAAATCAGAAGACTTCACAGAATCCA
GAAGACGGTGATGCAGATGCTCAAGGACCGTGGCTACTTCGTCGCTGATTCCGAGATCAC
GATGACCCTATCACAGTTTGTTAGGAAGTATGGTGACAACATGAAAAGGGATGATCTCGT
TACTCTCAGAGCCAAGAGAAACGATAGCAGTGATCAGCTGTATATCTTCTTCCCTGAAGA
GTCGAAAGTTGGAGTGAACACAATGAAAGTGTACACGAACCGGATGAAGTCTGAGAATGT
TCACAGAGCAATCC*TGGTGGTGCAACATAACCTCACTCCTTTT*GCTCGAAATT*GCAT
TAGTCAGATCTCTTCTATTTTCCATTTGGAAGTTTTCCAGGAGGCGGAAATGCTAGTGAA
CATTAAAGAACATGTACTTGTTCCGGAGCACCAAGTTCTCACCACTGAAGAGAAGAAAAC
TTTACTGGAGAGGTACACTGTCAAGGAGACGCAGCTTCCAAGGATTCAAGTGACTGATCC
AATCGCAAGATACTTTGGACTAAAACGTGGCCAAGTCATAAAGATCATACGTCCCAGTGA
AACCGCTGGTCGTTATGCTACCTATCGTTATGTTGTATAATAAGCCAAAATTGCTTCTTG
CTTTTGTGAAACATTAGAGAATAATTGTTTTTGTTCCAAACTCTTGACAATGTTCTTTGT
GTCATTTCTTTTGAACACACAATGTTTTTTGTTAGAAGTAAGAACTGAAAACCTTAACGA
GC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 4

CO CL2761Contig1 780 4 17 U
GGCTTGGAGATTCTACTGAGTTTGAGGAAGCTCCTATCGAGTTCCCTAGAGACATTACAA
TGGAAGAGACTGAACCGACCAGACTCAACCCAGTCAGGAGATATGAGGATCAAATGGTTC
CAAGCATTACTACTTCTTTGATCAGACCTGAAGAAGATGAAGAGTCGTCTCTGAATGTGA
GAAATTCAGTTGGAGATAGCAGAGCAGAGGTTCCGAGAAACATGGTCAACACCAACCAAG
CTCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGCAAGAGCAGACCCGGTGTCAAACCAAGTCA
CTGCAATGATTCCAGAATTCAATATTAGAATTGTTGCAGAAAGCACTGAAGACTCGACAG
CAGAATCTTCCAGCAGCAGAAGAAGAGAGAGGGACGGAGGCATAGTCCCAGAGTGGTCAG
GGTACTCTGAACAATTTGCTAGCGAAGAGAATGGGATTGGAGGAGGAAGTACAACATCTA
GCTACTTGCAGAACCACCATGAAATAGTTAACTGGAGACGGCTTTCACAAACCGGGTAAC
AAGGCACAACTGAAGGTGCACAAGGAGAGGGAACTTCATAAGGGCGGTAACTCCAGTTAA
ACGTGGGTGGACTTGTAAACCAAGTATACATTTGTTATGTAATTAATGTATTTCCGGTCA
TGGAGCTGGAGTGAAACTTTGTAGGAGCTTTATCTGATGTACATCTTGTTATGTATCGGG
TTTCATCTTGTAATAAAATACTGTATAGTATCTCGATTGTGGTAATAGACCAAATCTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS42JQ C 1
AF RR2BW02JQ C 55
AF RR2BW02TF U 55
AF RR2E336TF U 262
BS 1 59 RR2FS42JQ
BS 60 266 RR2BW02TF
BS 267 269 RR2E336TF
BS 270 280 RR2BW02TF
BS 281 281 RR2E336TF
BS 282 289 RR2BW02TF
BS 290 290 RR2E336TF
BS 291 433 RR2BW02TF
BS 434 434 RR2E336TF
BS 435 442 RR2BW02TF
BS 443 443 RR2E336TF
BS 444 460 RR2BW02TF
BS 461 461 RR2E336TF
BS 462 592 RR2BW02TF
BS 593 593 RR2E336TF
BS 594 761 RR2BW02TF
BS 762 780 RR2E336TF

RD RR2FS42JQ 771 0 0
GGCTTGGAGATTCTACTGAGTTTGAGGAAGCTCCTATCGAGTTCCCTAGAGACATTACAA
TGGAAGAGACTGAACCTACCAGACTCAACCCAGTCAGGAGATATGAGGATCAAATGGTTC
CAAGCATTACTACTTCTTTGATCAGACCTGAAGAAGACGAAGAGTCGTCTCTGAATGTGA
GAAATTCAGTTGGAGATAGCAGAGCAGAGGTTCCGAGAAACATGGTCAACACCAACCAAG
CTCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGCAAGAGCAGACCCGGTTTCAAACCAAGTCA
CTGCTATGATTCCAGAATTCAATATTAGAATTGTTGCGGAAAGCACTGAAGACTCGACAG
CAGAATCTTCCAGCAGCAGAAGAAGAGAGAGGGACGGAGGCATAGTCCCCGAGTGGTCAG
GGTACTCTGAACAATTTGCTAGCGAAGAGAATGGGATTGGAGGAGGAAGTACAACATCTA
GCTACTTGCAGAACCACCATGAAATAGTTAACTGGAGACGGCTTTCACAAACCGGGTAAC
AAGGCACAACTGAAGGTGCACAAGGAGAGGGAACTTCATAAGGGCGGTAACTCCAGTTAA
ACGTGGGTGGACTTGTAAACCAAGTATACATTTGTTATGTAATTAATGTATTTCCGGTCA
TGGAGCTGGAGTGAAACTTTGTAGGAGCTTTATCTGATGTACATCTTGTTATGTATCGGG
TTTCATCTTGTAATAAAATACTGTATAGTATCTCGATTGTGGTAATAGACC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2BW02JQ 709 0 0
GCACG
ATGGAAGAGACTGAACCGACCAGACTCAACCCAGTCAGGAGATATGAGGATCAAATGGTT
CCAAGCATTACTACTTCTTTGATCAGACCTGAAGAAGATGAAGAGTCGTCTCTGAATGTG
AGAAATTCAGTTGGAGATAGCAGAGCAGAGGTTCCGAGAAACATGGTCAACACCAACCAA
GCTCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG***GCAAGAGCAGATCCGGTGTCGAACCAAGTC
ACTGCAATGATTCCAGAATTCAATATTAGAATTGTTGCAGAAAGCACTGAAGACTCGACA
GCAGAATCTTCCAGCAGCAGAAGAAGAGAGAGGGACGGAGGCATAGTCCCAGAGTGGTCA
GGGTACTCTGAACAGTTTGCTAGTGAAGAGAATGGGATTGGTGGAGGAAGTACAACATCT
AGCTACTTGCAGAACCACCATGAAATAGTTAACTGGAGACGGCTTTCACAAACCGGGTAA
CAAGGCACAACTGAAGGTGCACAAGGAGAGGGAACTTCATAAGGGCGGTAACTTCAGTTA
AACGTGGGTGGACTTGTAAACCAAGTATACATTTGTTATGTAATTAATGTATTTCCGGTC
ATGGAGCTGGAGTGAAACTTTGTAGGAGCTTTATCTGATGTACATCTTGTTATGTATCGG
GTTTCATCTTGTAATAAAATACTGTATAGTATCTCGATTGTG
AT

QA 6 707 6 707
DS 

RD RR2BW02TF 709 0 0
GCACG
ATGGAAGAGACTGAACCGACCAGACTCAACCCAGTCAGGAGATATGAGGATCAAATGGTT
CCAAGCATTACTACTTCTTTGATCAGACCTGAAGAAGATGAAGAGTCGTCTCTGAATGTG
AGAAATTCAGTTGGAGATAGCAGAGCAGAGGTTCCGAGAAACATGGTCAACACCAACCAA
GCTCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG***GCAAGAGCAGATCCGGTGTCGAACCAAGTC
ACTGCAATGATTCCAGAATTCAATATTAGAATTGTTGCAGAAAGCACTGAAGACTCGACA
GCAGAATCTTCCAGCAGCAGAAGAAGAGAGAGGGACGGAGGCATAGTCCCAGAGTGGTCA
GGGTACTCTGAACAGTTTGCTAGTGAAGAGAATGGGATTGGTGGAGGAAGTACAACATCT
AGCTACTTGCAGAACCACCATGAAATAGTTAACTGGAGACGGCTTTCACAAACCGGGTAA
CAAGGCACAACTGAAGGTGCACAAGGAGAGGGAACTTCATAAGGGCGGTAACTTCAGTTA
AACGTGGGTGGACTTGTAAACCAAGTATACATTTGTTATGTAATTAATGTATTTCCGGTC
ATGGAGCTGGAGTGAAACTTTGTAGGAGCTTTATCTGATGTACATCTTGTTATGTATCGG
GTTTCATCTTGTAATAAAATACTGTATAGTATCTCGATTGTG
AT

QA 6 707 6 707
DS 

RD RR2E336TF 519 0 0
G
GCAGCAGGCAAGAGCAGACCCGGTTTCAAACCAAGTCACTGCTATGATTCCAGAATTCAA
TATTAGAATTGTTGCGGAAAGCACTGAAGACTCGACAGCAGAATCTTCCAGCAGCAGAAG
AAGAGAGAGGGACGGAGGCATAGTCCCCGAGTGGTCAGGGTACTCTGAACAATTTGCTAG
CGAAGAGAATGGGATTGGAGGAGGAAGTACAACATCTAGCTACTTGCAGAACCACCATGA
AATAGTTAACTGGAGACGGCTTTCACAAACCGGGTAACAAGGCACAACTGAAGGTGCACA
AGGAGAGGGAACTTCATAAGGGCGGTAACTCCAGTTAAACGTGGGTGGACTTGTAAACCA
AGTATACATTTGTTATGTAATTAATGTATTTCCGGTCATGGAGCTGGAGTGAAACTTTGT
AGGAGCTTTATCTGATGTACATCTTGTTATGTATCGGGTTTCATCTTGTAATAAAATACT
GTATAGTATCTCGATTGTGGTAATAGACCAAATCTCGT

QA 2 519 2 519
DS 



AS 1 4

CO CL2762Contig1 1386 4 11 U
TTTTTAATAAAACTAGTTTAATAAAACTAGTAATAACAATTTTCTTATATATATATTATT
ATTTTGCTTTCTTTTATCTTAAAAAAATAAAAA*TAAAAAATAAAATAAGAGATGGGTTA
CATTTTTCTGACCATGATTGCGTTTCTTGTTATTTTTGCCTTACCGGCGGTTGTCGCCAA
CGATATAACCCCGATTCCAGAAGACAAAGGCCAAGTCGAGGCATGGTTCAAGGCCAACGT
TCAACCCTATTCAGCGAGGCGAGGCACACTCGACCCTGCCCTGGATGCAGCTGAAGCATC
GCCACAGATTATTACCGTGAATCAAGGAGGAGGCGGCGATTTTAAGACAATAAATGAAGC
GATCAAGAGCATTCCGACAGGGAACACAAAGCGTGTGATCATCAAGTTGGCTCCTGGTGT
ATACCGTGAGAAAGTCACAATCGACGTAGGTCGACCATTCATTACATTGATGGGTAAACC
TGGTGCAGAAACGACCTTGACCTTCGACGGGACGGCCTCTAAATTCGGAACCATGGAGAG
TGCGACGCTTATCGTCTGGGCCCAATATTTTGTGGCAGCCAACTTACACATTAGAAATAC
TGCTCCAATGCCGAAAGCAGGATCACAAGGACAAGCGCTCGCTATGAGGATCAACGGCGA
TAAAGCGGCTTTCTACAACTGCAGATTCTATGGTTTCCAAGACACTCTTTGTGATGATAT
AGGCAACCATTTCTTCAAGGACTGTTACATCGAGTAACCTATGATTTTATCTTCGGAAGA
GGAGCTTCCCTGTACTTGAACACGCAATTGCACGCTGTTGGAGATGGATTAAGAGTGATC
ACAGCACACAATCGACAGAGTGAGAACCAGCAGAATGGGTATTCATTCGTGCATTGCAAG
ATTACTGGAGTTGGAACGGGGATCTACTTGGGTAGGGCATGGATGAGCCACCCTAAGGTC
GTCTATGCCTACACTGAGATGTCCAGTGTCGTCAACCCAACCGGATGGCAAGAGAACAAG
AACCGCGCCCATGACAAGACGGTGTTCTATGGAGAATACATGTGTACGGGACCAGGATCA
CACAAAGAGAAGAGAGTGGCCCACACACAAGACATTGACAAAAACGAATCTAACAGTTTC
CTTACCCTCGGCTACATCAAAGGCTCATTGTGGCTCCTCCCTCCTCCCACTTACTAAACC
ACACCCATCTCATAACTATTATTCTATACTTTTGACTGAAAATACATGTGTATAAATGTA
TGTCTTGCATGCATTATTTCTTCTTGAATTTATTTCGAAAGTCCTCTCTTTCTGTATGTA
ATGGAAGAGTAGAGACTTGTGTAATTTTGGTTGCACTATAATAAAATACATCAATATTCA
CAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2CJ33TF U 14
AF RR2CF73TF U 1
AF RR2BA18TF U 7
AF RR2BA18JQ C 598
BS 1 93 RR2CF73TF
BS 94 94 RR2BA18TF
BS 95 189 RR2CF73TF
BS 190 190 RR2BA18TF
BS 191 407 RR2CF73TF
BS 408 408 RR2BA18TF
BS 409 436 RR2CF73TF
BS 437 437 RR2BA18TF
BS 438 616 RR2CF73TF
BS 617 832 RR2BA18TF
BS 833 1386 RR2BA18JQ

RD RR2CJ33TF 160 0 0
TAGTTTAATAAAACTAGTAATAACAATTTTCTTATATATATATTATTATTTTGCTTTCTT
TTATCTTAAAAAAATAAAAA*TAAAAAATAAAATAAGAGATGGGTTACATTTTTCTGACC
ATGATTGCGTTTCTTGTTATTTTTGCCTTACCGGGGGTTG

QA 1 160 1 160
DS 

RD RR2CF73TF 616 0 0
TTTTTAATAAAACTAGTTTAATAAAACTAGTAATAACAATTTTCTTATATATATATTATT
ATTTTGCTTTCTTTTATCTTAAAAAAATAAAAAATAAAAAATAAAATAAGAGATGGGTTA
CATTTTTCTGACCATGATTGCGTTTCTTGTTATTTTTGCCTTACCGGCGGTTGTCGCCAA
CGATATAACTCCGATTCCAGAAGACAAAGGCCAAGTCGAGGCATGGTTCAAGGCCAACGT
TCAACCCTATTCAGCGAGGCGAGGCACACTCGACCCTGCCCTGGATGCAGCTGAAGCATC
GCCACAGATTATTACCGTGAATCAAGGAGGAGGCGGCGATTTTAAGACAATAAATGAAGC
GATCAAGAGCATTCCGACAGGGAACACAAAGCGTGTGATCATCAAGT*GGCTCCTGGTGT
ATACCGTGAGAAAGTCGCAATCGACGTAGGTCGACCATTCATTACATTGATGGGTAAACC
TGGTGCAGAAACGACCTTGACCTTCGACGGGACGGCCTCTAAATTCGGAACCATGGAGAG
TGCGACGCTTATCGTCTGGGCCCAATATTTTGTGGCAGCCAACTTACACATTAGAAATAC
TGCTCCAATGCCGAAA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2BA18TF 826 0 0
AATAAAC
TAGTTTAATAAAACTAGTAATAACAATTTTCTTATATATATATTATTATTTTGCTTTCTT
TTATCTTAAAAAAATAAAAA*TAAAAAATAAAATAAGAGATGGGTTACATTTTTCTGACC
ATGATTGCGTTTCTTGTTATTTTTGCCTTACCGGCGGTTGTCGCCAACGATATAACCCCG
ATTCCAGAAGACAAAGGCCAAGTCGAGGCATGGTTCAAGGCCAACGTTCAACCCTATTCA
GCGAGGCGAGGCACACTCGACCCTGCCCTGGATGCAGCTGAAGCATCGCCACAGATTATT
ACCGTGAATCAAGGAGGAGGCGGCGATTTTAAGACAATAAATGAAGCGATCAAGAGCATT
CCGACAGGGAACACAAAGCGTGTGATCATCAAGTTGGCTCCTGGTGTATACCGTGAGAAA
GTCACAATCGACGTAGGTCGACCATTCATTACATTGATGGGTAAACCTGGTGCAGAAACG
ACCTTGACCTTCGACGGGACGGCCTCTAAATTCGGAACCATGGAGAGTGCGACGCTTATC
GTCTGGGCCCAATATTTTGTGGCAGCCAACTTACACATTAGAAATACTGCTCCAATGCCG
AAAGCAGGATCACAAGGACAAGCGCTCGCTATGAGGATCAACGGCGATAAAGCGGCTTTC
TACAACTGCAGATTCTATGGTTTCCAAGACACTCTTTGTGATGATATAGGCAACCATTTC
TTCAAGGACTGTTACATCGAGTAACCTATGATTTTATCTTCGGAAGAGGAGCTTCCCTGT
ACTTGAACACGCAATTGCACGCTGTTGGAGATGGATTAA

QA 8 826 8 826
DS 

RD RR2BA18JQ 789 0 0
TACTGCTCCAATGCCGAAAGCAGGATCACAAGGACAAGCGCTCGCTATGAGGATCAACGG
CGATAAAGCGGCTTTCTACAACTGCAGATTCTATGGTTTCCAAGACACTCTTTGTGATGA
TATAGGCAACCATTTCTTCAAGGACTGTTACATCGAGTAACCTATGATTTTATCTTCGGA
AGAGGAGCTTCCCTGTACTTGAACACGCAATTGCACGCTGTTGGAGATGGATTAAGAGTG
ATCACAGCACACAATCGACAGAGTGAGAACCAGCAGAATGGGTATTCATTCGTGCATTGC
AAGATTACTGGAGTTGGAACGGGGATCTACTTGGGTAGGGCATGGATGAGCCACCCTAAG
GTCGTCTATGCCTACACTGAGATGTCCAGTGTCGTCAACCCAACCGGATGGCAAGAGAAC
AAGAACCGCGCCCATGACAAGACGGTGTTCTATGGAGAATACATGTGTACGGGACCAGGA
TCACACAAAGAGAAGAGAGTGGCCCACACACAAGACATTGACAAAAACGAATCTAACAGT
TTCCTTACCCTCGGCTACATCAAAGGCTCATTGTGGCTCCTCCCTCCTCCCACTTACTAA
ACCACACCCATCTCATAACTATTATTCTATACTTTTGACTGAAAATACATGTGTATAAAT
GTATGTCTTGCATGCATTATTTCTTCTTGAATTTATTTCGAAAGTCCTCTCTTTCTGTAT
GTAATGGAAGAGTAGAGACTTGTGTAATTTTGGTTGCACTATAATAAAATACATCAATAT
TCACAACTG

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 4

CO CL2763Contig1 1529 4 3 U
CCACAAATCAGTCATTTTTAGCTAAAAGTTGCATCCACTGAAATTTTTCTTGTAAATCTC
CTTTTGGTCCAATACTTATTTCAAGAAACATTTTCATAGTGAATAACAGACACAATTTGG
AATTTTGGATACAAGGAGATAGCTCAAACAAGGGACAACACCACAGTAGTGTATATAAAT
AAACACTTTTCAGTTGGCGAAAACAGAGACTAGTACTTGTTCCATGGGTTGGTGCTAACA
TCTCCTTCCCCCCAAGAAGAAGGATCATAATTTTCTTCGGACTAGACCTTTGAAAAAGTC
AAAACTATTGCCATCAGGGTGAAGCTCATACATTTGATAACCATCTCCAATAGCCAGCAG
ATATCCCGAAGATGTCAAACCCTGGATAGTCACAACGTTTTGAACAACTTGGTCCTCGAT
TTTATCTTCAACGATCACTCTTTGCCCGCTGTGAAGCCATGTCCTGTAGTAAAGCTCCTC
GAGAGATTTAAAACCTTGGTCAATGAATAGATCAAAGAATTTCTCGAATTTATGAAAGAA
GGCAGCAATAATTTCTTCTCTTTTAAGTAGAACTGATGCAGCAGGAGATATCTCTTTTAG
TACGGCGTTTAAGCATGTGGTCGGTTGATCGTTGTCCACATTCAAT**CACACCAACACT
AACGTGAAATTTTCTAGATCTATAGGTAGAGGTACACAAAATGCCTCCGAGTTTAAGGCC
ATTCAAGTAAAGATCATTGGGCCACTTTATTTTAACGTCTATATACGGTAAACCCTTCTT
GTCACAAACATCTTTGACTGCCTCAGTAACAGCAAGAGAAACAACATATTGAATCAAAGG
CACGATTCGACCATCTTCCATTTCTAACGTAAAGGAATACATCAAACAGCCCTTTGGGGA
TTCCCAGACATTCTTTGTTCTGCCTCTACCCTTAAACTGAATGTCTGAGACACAAACTGA
ACCAACCGGAAGCTCAGAAAAGTTATGAGAAACAAGATCGTGAGTGGAAGACAAGCGGGG
AGACCAAATGAGAAACCGACCGAACCGAGAAGTTGAAAGCGAGTTCATGAAAAGTGAAGG
ATTGAATGAATCATCATCATCCAGATTCGTCATCTCGGAAGCTAAAAAGAGTGAAACTTT
AGGAGAATCATCGGGGAGCTTAAGCACGTTGGAGTTCTTCAAACGCTTTGCTGTATCATT
CTCAACAGAGGACTTCCCACACAAAACCAATCTACACGAATCATTACCATCCATTGCTGC
GGCAGCGACGGAGAAAGATAGACTACGCAAAGGCCTTAAAGAGATGAAACGAGACAAGTT
CGCCACTTGCATATACGTGGAGAGAACAATGACTACCAAAGGCACCACTTAAAACCGGTT
TAATACGTGCCGTCGCGAGCTTCTGAGACGCGTTGAGGATCGTCGAGAGGAGGCTCTACG
GAAAACACCTAGAAGCTGACCAGAAATTCCCGTCACAGTTCGAAGCTGCTTGATCAAGTG
GCGATGATAACTGACACAGAAAACACTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CN43JQ U 1
AF RR2CN43TF C 1
AF RR2AE54JQ U 78
AF RR2AE54TF C 778
BS 1 681 RR2CN43JQ
BS 682 868 RR2AE54JQ
BS 869 1529 RR2AE54TF

RD RR2CN43JQ 682 0 0
CCACAAATCAGTCATTTTTAGCTAAAAGTTGCATCCACTGAAATTTTTCTTGTAAATCTC
CTTTTGGTCCAATACTTATTTCAAGAAACATTTTCATAGTGAATAACAGACACAATTTGG
AATTTTGGATACAAGGAGATAGCTCAAACAAGGGACAACACCACAGTAGTGTATATAAAT
AAACACTTTTCAGTTGGCGAAAACAGAGACTAGTACTTGTTCCATGGGTTGGTGCTAACA
TCTCCTTCCCCCCAAGAAGAAGGATCATAATTTTCTTCGGACTAGACCTTTGAAAAAGTC
AAAACTATTGCCATCAGGGTGAAGCTCATACATTTGATAACCATCTCCAATAGCCAGCAG
ATATCCCGAAGATGTCAAACCCTGGATAGTCACAACGTTTTGAACAACTTGGTCCTCGAT
TTTATCTTCAACGATCACTCTTTGCCCGCTGTGAAGCCATGTCCTGTAGTAAAGCTCCTC
GAGAGATTTAAAACCTTGGTCAATGAATAGATCAAAGAATTTCTCGAATTTATGAAAGAA
GGCAGCAATAATTTCTTCTCTTTTAAGTAGAACTGATGCAGCAGGAGATATCTCTTTTAG
TACGGCGTTTAAGCATGTGGTCGGTTGATCGTTGTCCACATTCAAT**CACACCAACACT
AACGTGAAATTTTCTAGATCT
C

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2CN43TF 682 0 0
CCACAAATCAGTCATTTT*AGCTAAAAGTTGCATCCACTGAAATTTTTCTTGTAAATCTC
CTTTTGGTCCAATACTTATTTCAAGAAACATTTTCATAGTGAATAACAGACACAATTTGG
AATTTTGGATACAAGGAGATAGCTCAAACAAGGGACAACACCACAGTAGTGTATATAAAT
AAACACTTTTCAGTTGGCGAAAACAGAGACTAGTACTTGTTCCATGGGTTGGTGCTAACA
TCTCCTTCCCCCCAAGAAGAAGGATCATAATTTTCTTCGGACTAGACCTTTGAAAAAGTC
AAAACTATTGCCATCAGGGTGAAGCTCATACATTTGATAACCATCTCCAATAGCCAGCAG
ATATCCCGAAGATGTCAAACCCTGGATAGTCACAACGTTTTGAACAACTTGGTCCTCGAT
TTTATCTTCAACGATCACTCTTTGCCCGCTGTGAAGCCATGTCCTGTAGTAAAGCTCCTC
GAGAGATTTAAAACCTTGGTCAATGAATAGATCAAAGAATTTCTCGAATTTATGAAAGAA
GGCAGCAATAATTTCTTCTCTTTTAAGTAGAACTGATGCAGCAGGAGATATCTCTTTTAG
TACGGCGTTTAAGCATGTGGTCGGTTGATCGTTGTCCACATTCAAT**CACACCAACACT
AACGTGAAATTTTCTAGATCT
C

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2AE54JQ 791 0 0
ATTTCAAGAAACATTTTCATAGTGAATAACAGACACAATTTGGAATTTTGGATACAAGGA
GATAGCTCAAACAAGGGACAACACCACAGTAGTGTATATAAATAAACACTTTTCAGTTGG
CGAAAACAGAGACTAGTACTTGTTCCATGGGTTGGTGCTAACATCTCCTTCCCCCCAAGA
AGAAGGATCATAATTTTCTTCGGACTAGACCTTTGAAAAAGTCAAAACTATTGCCATCAG
GGTGAAGCTCATACATTTGATAATCATCTCCAATAGCCAGCAGATATCCCGAAGATGTCA
AACCCTGGATAGTCACAACGTTTTGAACAACTTGGTCCTCGATTTTATCTTCAACGATCA
CTCTTTGCCCGCTGTGAAGCCATGTCCTGTAGTAAAGCTCCTCGAGAGATTTAAAACCTT
GGTCAATGAATAGATCAAAGAATTTCTCGAATTTATGAAAGAAGGCAGCAATAATTTCTT
CTCTTTTAAGTAGAACTGATGCAGCAGGAGATATCTCTTTTAGTACAGCGTTTAAGCATG
TGGTCGGTTGATCGTTGTCCACATTCAATCCCACACCAACACTAACGTGAAATTTTCTAG
ATCTATAGGTAGAGGTACACAAAATGCCTCCGAGTTTAAGGCCATTCAAGTAAAGATCAT
TGGGCCACTTTATTTTAACGTCTATATACGGTAAACCCTTCTTGTCACAAACATCTTTGA
CTGCCTCAGTAACAGCAAGAGAAACAACATATTGAATCAAAGGCACGATTCGACCATCTT
CCATTTCTAAC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2AE54TF 752 0 0
CTTGTCACAAACATCTTTGACTGCCTCAGTAACAGCAAGAGAAACAACATATTGAATCAA
AGGCACGATTCGACCATCTTCCATTTCTAACGTAAAGGAATACATCAAACAGCCCTTTGG
GGATTCCCAGACATTCTTTGTTCTGCCTCTACCCTTAAACTGAATGTCTGAGACACAAAC
TGAACCAACCGGAAGCTCAGAAAAGTTATGAGAAACAAGATCGTGAGTGGAAGACAAGCG
GGGAGACCAAATGAGAAACCGACCGAACCGAGAAGTTGAAAGCGAGTTCATGAAAAGTGA
AGGATTGAATGAATCATCATCATCCAGATTCGTCATCTCGGAAGCTAAAAAGAGTGAAAC
TTTAGGAGAATCATCGGGGAGCTTAAGCACGTTGGAGTTCTTCAAACGCTTTGCTGTATC
ATTCTCAACAGAGGACTTCCCACACAAAACCAATCTACACGAATCATTACCATCCATTGC
TGCGGCAGCGACGGAGAAAGATAGACTACGCAAAGGCCTTAAAGAGATGAAACGAGACAA
GTTCGCCACTTGCATATACGTGGAGAGAACAATGACTACCAAAGGCACCACTTAAAACCG
GTTTAATACGTGCCGTCGCGAGCTTCTGAGACGCGTTGAGGATCGTCGAGAGGAGGCTCT
ACGGAAAACACCTAGAAGCTGACCAGAAATTCCCGTCACAGTTCGAAGCTGCTTGATCAA
GTGGCGATGATAACTGACACAGAAAACACTCC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 4

CO CL2764Contig1 1397 4 2 U
GATGCCATGCATAATCTGTCAGAAGTGCTTGTTTATGAATGCCTCAACAATGGGAGCTGG
CTGATGCCGGAACAACTTGAGAACCTTGATAAAGTCGTAGAGAATCTCACCAAGTGCTTA
AAGAATATCACCAGTAACAAGACAATAGCAGGAGGGGAAGCATCGGTTCCAACTCAAGCT
ATGAATGTATCCTGTCCAAACGTGGTTGATCTTAATGAGGCCCCAAATGTAGTTGCTAAA
GACTGTCAAGGATTTAATGTCAAGCCACTAGACAGCTTTGGCTTCAAAGAACCGGAGGAT
AAGGATACGACTGAGATGACCCAGAATATTAAGAACATACTTGCTTCCAACTTTCCTGAT
GGTGAAGAAAACCACCCACAAACTCTCTTGTACAAGAATCTCTGGCTCGAAACTGAAGCG
GCCTTATGTTCCTCGACTTGCATGGCTCGCTATCATCGTATCAAGAACGAGATTGATAAT
TCCAAATTGCAGAACAGTGAGGTCTCTGCAGATGCGTCAACCTTTATGCAGGAACCTGTT
CTTAACCCGCAGAAATCGGTTTCCATCATGAAAACTGTAGAGCCGGAGACGACTGAATCA
CTCATCAAACACGGAAGCTATGGTGGGAACAATGTAGTAACAATGAGTCATGACGCACCA
CAAAGCTTTGAATTCAACTCTAATCCCGTGGATGCAGTATTTTCACTTATGTCCAGCTTT
ACCGGTGGTTCAAGACAGGAAAATCATGGGAACGTCAAGCCTGATGCTCAGAAAAAATAT
GATGATGTTATAGACAGGTTTCAGATTCTGAAGCATCTGGAAACAAAGCGCAAACTCAAA
TCTCAGAACTGCCCGGATTCAGATATTGGTGTTATAGACAGGGTTCAGATTCTGAAGCCG
CAGGAAACAGATTGCAAACTCAATTCTCAGAACTTCACAGAGATAAGAATGGAGAATCCA
GATCAAGCTTCGGAGATGGCTAAAATTGGCAGAAGCAGCCATGTGGCTGATGTAATGGAT
AGATTCCAGATACTAAAACTCCGAGAAGCTGAGCAAGTACAGAAGTCTCTCAACAGCTTG
GACATAGATTCAGATTCAGGAGACGATCAGCCAAGAAACAAGACGCAAATTTGTGATCAC
CTCTGGCCAGACTCGATGATGACACTAGGTCGAGATTCACAGATGAAGATGCACGTCGGC
GCTGAACCATCTGCATACTCGGACTGGGAACATGTCATCAAGGATGATTGAGTACTGAAA
CTTCCTTGGACAAGAAGTTTCGATCCTTTTTTTAATGGCTTTGTTTGTGTATAAATAAAA
CGGCTTAGTGTGACTGACGCTAAATGAAACTGTGTGGATTGGTTTTTGCTGTTTTTAAAT
GTGATTGTGTTGTTCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2A440TF U 1
AF RR2E393TF U 1
AF RR2A440JQ C 609
AF RR2E393JQ C 821
BS 1 771 RR2A440TF
BS 772 1397 RR2A440JQ

RD RR2A440TF 771 0 0
GATGCCATGCATAATCTGTCAGAAGTGCTTGTTTATGAATGCCTCAACAATGGGAGCTGG
CTGATGCCGGAACAACTTGAGAACCTTGATAAAGTCGTAGAGAATCTCACCAAGTGCTTA
AAGAATATCACCAGTAACAAGACAATAGCAGGAGGGGAAGCATCGGTTCCAACTCAAGCT
ATGAATGTATCCTGTCCAAACGTGGTTGATCTTAATGAGGCCCCAAATGTAGTTGCTAAA
GACTGTCAAGGATTTAATGTCAAGCCACTAGACAGCTTTGGCTTCAAAGAACCGGAGGAT
AAGGATACGACTGAGATGACCCAGAATATTAAGAACATACTTGCTTCCAACTTTCCTGAT
GGTGAAGAAAACCACCCACAAACTCTCTTGTACAAGAATCTCTGGCTCGAAACTGAAGCG
GCCTTATGTTCCTCGACTTGCATGGCTCGCTATCATCGTATCAAGAACGAGATTGATAAT
TCCAAATTGCAGAACAGTGAGGTCTCTGCAGATGCGTCAACCTTTATGCAGGAACCTGTT
CTTAACCCGCAGAAATCGGTTTCCATCATGAAAACTGTAGAGCCGGAGACGACTGAATCA
CTCATCAAACACGGAAGCTATGGTGGGAACAATGTAGTAACAATGAGTCATGACGCACCA
CAAAGCTTTGAATTCAACTCTAATCCCGTGGATGCAGTATTTTCACTTATGTCCAGCTTT
ACCGGTGGTTCAAGACAGGAAAATCATGGGAACGTCAAGCCTGATGCTCAG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2E393TF 777 0 0
GATGCCATGCATAATCTGTCAGAAGTGCTTGTTTATGAATGCCTCAACAATGGGAGCTGG
CTGATGCCGGAACAACTTGAGAACCTTGATAAAGTCGTAGAGAATCTCACCAAGTGCTTA
AAGAATATCACCAGTAACAAGACAATAGCAGGAGGGGAAGCATCGGTTCCAACTCAAGCT
ATGAATGTATCCTGTCCAAACGTGGTTGATCTTAATGAGGCCCCAAATGTAGTTGCTAAA
GACTGTCAAGGATTTAATGTCAAGCCACTAGACAGCTTTGGCTTCAAAGAACCGGAGGAT
AAGGATACGACTGAGATGACCCAGAATATTAAGAACATACTTGCTTCCAACTTTCCTGAT
GGTGAAGAAAACCACCCACAAACTCTCTTGTACAAGAATCTCTGGCTCGAAACTGAAGCG
GCCTTATGTTCCTCGACTTGCATGGCTCGCTATCATCGTATCAAGAACGAGATTGATAAT
TCCAAATTGCAGAACAGTGAGGTCTCTGCAGATGCGTCAACCTTTATGCAGGAACCTGTT
CTTAACCCGCAGAAATCGGTTTCCATCATGAAAACTGTAGAGCCGGAGACGACTGAATCA
CTCATCAAACACGGAAGCTATGGTGGGAACAATGTAGTAACAATGAGTCATGACGCACCA
CAAAGCTTTGAATTCAACTCTAATCCCGTGGATGCAGTATTTTCACTTATGTCCAGCTTT
ACCGGTGGTTCAAGACAGGAAA*TCATGGGAACGTCAAGCCTGATGCTCAG
AAAAAA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2A440JQ 789 0 0
ACACGGAAGCTATGGTGGGAACAATGTAGTAACAATGAGTCATGACGCACCACAAAGCTT
TGAATTCAACTCTAATCCCGTGGATGCAGTATTTTCACTTATGTCCAGCTTTACCGGTGG
TTCAAGACAGGAAAATCATGGGAACGTCAAGCCTGATGCTCAGAAAAAATATGATGATGT
TATAGACAGGTTTCAGATTCTGAAGCATCTGGAAACAAAGCGCAAACTCAAATCTCAGAA
CTGCCCGGATTCAGATATTGGTGTTATAGACAGGGTTCAGATTCTGAAGCCGCAGGAAAC
AGATTGCAAACTCAATTCTCAGAACTTCACAGAGATAAGAATGGAGAATCCAGATCAAGC
TTCGGAGATGGCTAAAATTGGCAGAAGCAGCCATGTGGCTGATGTAATGGATAGATTCCA
GATACTAAAACTCCGAGAAGCTGAGCAAGTACAGAAGTCTCTCAACAGCTTGGACATAGA
TTCAGATTCAGGAGACGATCAGCCAAGAAACAAGACGCAAATTTGTGATCACCTCTGGCC
AGACTCGATGATGACACTAGGTCGAGATTCACAGATGAAGATGCACGTCGGCGCTGAACC
ATCTGCATACTCGGACTGGGAACATGTCATCAAGGATGATTGAGTACTGAAACTTCCTTG
GACAAGAAGTTTCGATCCTTTTTTTAATGGCTTTGTTTGTGTATAAATAAAACGGCTTAG
TGTGACTGACGCTAAATGAAACTGTGTGGATTGGTTTTTGCTGTTTTTAAATGTGATTGT
GTTGTTCCC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2E393JQ 577 0 0
AAACAAAGCGCAAACTCAAATCTCAGAACTGCCCGGATTCAGATATTGGTGTTATAGACA
GGGTTCAGATTCTGAAGCCGCAGGAAACAGATTGCAAACTCAATTCTCAGAACTTCACAG
AGATAAGAATGGAGAATCCAGATCAAGCTTCGGAGATGGCTAAAATTGGCAGAAGCAGCC
ATGTGGCTGATGTAATGGATAGATTCCAGATACTAAAACTCCGAGAAGCTGAGCAAGTAC
AGAAGTCTCTCAACAGCTTGGACATAGATTCAGATTCAGGAGACGATCAGCCAAGAAACA
AGACGCAAATTTGTGATCACCTCTGGCCAGACTCGATGATGACACTAGGTCGAGATTCAC
AGATGAAGATGCACGTCGGCGCTGAACCATCTGCATACTCGGACTGGGAACATGTCATCA
AGGATGATTGAGTACTGAAACTTCCTTGGACAAGAAGTTTCGATCCTTTTTTTAATGGCT
TTGTTTGTGTATAAATAAAACGGCTTAGTGTGACTGACGCTAAATGAAACTGTGTGGATT
GGTTTTTGCTGTTTTTAAATGTGATTGTGTTGTTCCC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 2 4

CO CL2765Contig1 820 2 2 U
GGACCAGCCACTTGATCATTTCTCAATCCAAGATCGATCGGTCCGGAGACTCTTCTCTCA
TCATCATCTTCCCTTTAATCCCTAACCGTTTCTCGGCGCGACAAGAGATGCTTGCTTGAC
GATGACCGTTCTCGCCTCCATCTTTTAACAAGTAAGAGAAGAATGTCGACTCCAGCTAGG
AAGAGGTTGATGAGGGATTTCAAGAGGTTGCAGCAAGACCCTCCTGCTGGTATCAGCGGT
GCTCCTCAAGACAACAACATCATGCTCTGGAATGCTGTTATTTTCGGGCCTGATGACACC
CCATGGGATGGAGGTACTTTCAAACTCTCACTCCAGTTTTCTGAAGATTATCCAAACAAA
CCACCGACTGTTCGGTTTGTTTCACGGATGTTCCATCCAAACATTTATGCTGATGGGAGT
ATATGCTTAGACATCCTCCAAAACCAGTGGAGTCCTATATATGATGTCGCTGCTATACTT
ACCTCCATTCAGTCATTGCTCTGTGATCCTAATCCGAATTCTCCTGCGAATTCCGAAGCT
GCTCGAATGTTCAGTGAAAGCAAACGTGAGTACAACAGAAGAGTCCGCGAGGTTGTGGAA
CAAAGCTGGACTGCAGACTAGTTATTATAATATGCTCTAGCATTTGTCATTGAACATCCT
CTCTTTTGTGTTTGGTTCCTCTAGCTCTTTCTCTTTCTTTTTTCTGTCTTCCGTGTGTTT
TTCAAACTCTGTGATTGTTGCTTTTAATGTTCTTGTATTTCCATTGTATTCTCTCAACCA
CTTTCATCTTCATAATTATCATATCTATTTCAGTTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH02TF U 1
AF RR2EH02JQ C 80
BS 1 393 RR2EH02TF
BS 394 820 RR2EH02JQ

RD RR2EH02TF 393 0 0
GGACCAGCCACTTGATCATTTCTCAATCCAAGATCGATCGGTCCGGAGACTCTTCTCTCA
TCATCATCTTCCCTTTAATCCCTAACCGTTTCTCGGCGCGACAAGAGATGCTTGCTTGAC
GATGACCGTTCTCGCCTCCATCTTTTAACAAGTAAGAGAAGAATGTCGACTCCAGCTAGG
AAGAGGTTGATGAGGGATTTCAAGAGGTTGCAGCAAGACCCTCCTGCTGGTATCAGCGGT
GCTCCTCAAGACAACAACATCATGCTCTGGAATGCTGTTATTTTCGGGCCTGATGACACC
CCATGGGATGGAGGTACTTTCAAACTCTCACTCCAGTTTTCTGAAGATTATCCAAACAAA
CCACCGACTGTTCGGTTTGTTTCACGGATGTTC

QA 1 393 1 393
DS 

RD RR2EH02JQ 741 0 0
CCCT
AACCGTTTCTCGGCGCGACAAGAGATGCTTGCTTGACGATGACCGTTCTCGCCTCCATCT
TTTAACAAGTAAGAGAAGAATGTCGACTCCAGCTAGGAAGAGGTTGATGAGGGATTTCAA
GAGGTTGCAGCAAGACCCTCCTGCTGGTATCAGCGGTGCTCCTCAAGACAACAACATCAT
GCTCTGGAATGCTGTTATTTTCGGGCCTGATGACACCCCATGGGATGGAGGTACTTTCAA
ACTCTCACTCCAGTTTTCTGAAGATTATCCAAACAAACCACCGACTGTTCGGTTTGTTTC
ACGGATGTTCCATCCAAACATTTATGCTGATGGGAGTATATGCTTAGACATCCTCCAAAA
CCAGTGGAGTCCTATATATGATGTCGCTGCTATACTTACCTCCATTCAGTCATTGCTCTG
TGATCCTAATCCGAATTCTCCTGCGAATTCCGAAGCTGCTCGAATGTTCAGTGAAAGCAA
ACGTGAGTACAACAGAAGAGTCCGCGAGGTTGTGGAACAAAGCTGGACTGCAGACTAGTT
ATTATAATATGCTCTAGCATTTGTCATTGAACATCCTCTCTTTTGTGTTTGGTTCCTCTA
GCTCTTTCTCTTTCTTTTTTCTGTCTTCCGTGTGTTTTTCAAACTCTGTGATTGTTGCTT
TTAATGTTCTTGTATTTCCATTGTATTCTCTCAACCACTTTCATCTTCATAATTATCATA
TCTATTTCAGTTTGATC

QA 5 741 5 741
DS 



CO CL2765Contig2 818 2 2 U
GGGTTATACGAAGTTGTCACCAGCCACTTGATCATTTCTCAATCGAGGATCGATCCGGAG
ACTCTTCTCTCATCATCATCTTCCCTTTAATTCACAACCGTTTGTCGGCGCGACAAGAGA
TGCTTGCTTGACGACGACCGTTCTCGCCTCCATCTTTTAACAAGTAAAGAGAAAAATGTC
GACTCCAGCGAGGAAGAGGTTGATGAGGGATTTCAAGAGGTTGCAGCAAGACCCACCTGC
TGGTATTAGCGGTGCTCCTCAAGACAACAACATCATGCTCTGGAATGCTGTTATTTTCGG
GCCTGATGACACCCCATGGGATGGAGGTACTTTCAAACTCTCACTCCAGTTTTCTGAAGA
TTATCCAAACAAACCACCGACTGTTCGGTTTGTTTCACGGATGTTCCATCCAAACATTTA
TGCTGATGGGAGTATATGCTTGGACATCCTCCAAAACCAGTGGAGTCCTATATATGATGT
CGCTGCTATACTTACCTCCATTCAGTCATTGCTCTGTGATCCTAATCCAAATTCTCCTGC
GAATTCCGAAGCTGCACGAATGTTCAGCGAAAGCAAACGCGAGTACAACAGAAGAGTCCG
CGAGGTTGTGGAACAAAGCTGGACTGCAGACTAGTTATTATAATATGCTCTGGAACATCC
TCTCTTTTGTGTTTGGTTCTACTAGCTCTTTCCCTTTCTCTTTCCTGTCTTCCGTGTGTT
TTTCAAACTCTGTGATTGTTGCTTTTAATGTTCTTGTATTTCCATGTATTATCTCAACCA
CATTCATCATAATTATCGGTATCTATTTCAGTTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ73TF U 1
AF RR2FQ73JQ C 103
BS 1 765 RR2FQ73TF
BS 766 818 RR2FQ73JQ

RD RR2FQ73TF 776 0 0
GGGTTATACGAAGTTGTCACCAGCCACTTGATCATTTCTCAATCGAGGATCGATCCGGAG
ACTCTTCTCTCATCATCATCTTCCCTTTAATTCACAACCGTTTGTCGGCGCGACAAGAGA
TGCTTGCTTGACGACGACCGTTCTCGCCTCCATCTTTTAACAAGTAAAGAGAAAAATGTC
GACTCCAGCGAGGAAGAGGTTGATGAGGGATTTCAAGAGGTTGCAGCAAGACCCACCTGC
TGGTATTAGCGGTGCTCCTCAAGACAACAACATCATGCTCTGGAATGCTGTTATTTTCGG
GCCTGATGACACCCCATGGGATGGAGGTACTTTCAAACTCTCACTCCAGTTTTCTGAAGA
TTATCCAAACAAACCACCGACTGTTCGGTTTGTTTCACGGATGTTCCATCCAAACATTTA
TGCTGATGGGAGTATATGCTTGGACATCCTCCAAAACCAGTGGAGTCCTATATATGATGT
CGCTGCTATACTTACCTCCATTCAGTCATTGCTCTGTGATCCTAATCCAAATTCTCCTGC
GAATTCCGAAGCTGCACGAATGTTCAGCGAAAGCAAACGCGAGTACAACAGAAGAGTCCG
CGAGGTTGTGGAACAAAGCTGGACTGCAGACTAGTTATTATAATATGCTCTGGAACATCC
TCTCTTTTGTGTTTGGTTCTACTAGCTCTTTCCCTTTCTCTTTCCTGTCTTCCGTGTGTT
TTTCAAACTCTGTGATTGTTGCTTTTAATGTTCTTGTATTTCCAT
GTATTATCTCA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2FQ73JQ 716 0 0
TG
TCGGCGCGACAAGAGATGCTTGCTTGACGACGACCGTTCTCGCCTCCATCTTTTAACAAG
TAAAGAGAAAAATGTCGACTCCAGCGAGGAAGAGGTTGATGAGGGATTTCAAGAGGTTGC
AGCAAGACCCACCTGCTGGTATTAGCGGTGCTCCTCAAGACAACAACATCATGCTCTGGA
ATGCTGTTATTTTCGGGCCTGATGACACCCCATGGGATGGAGGTACTTTCAAACTCTCAC
TCCAGTTTTCTGAAGATTATCCAAACAAACCACCGACTGTTCGGTTTGTTTCACGGATGT
TCCATCCAAACATTTATGCTGATGGGAGTATATGCTTGGACATCCTCCAAAACCAGTGGA
GTCCTATATATGATGTCGCTGCTATACTTACCTCCATTCAGTCATTGCTCTGTGATCCTA
ATCCAAATTCTCCTGCGAATTCCGAAGCTGCACGAATGTTCAGCGAAAGCAAACGCGAGT
ACAACAGAAGAGTCCGCGAGGTTGTGGAACAAAGCTGGACTGCAGACTAGTTATTATAAT
ATGCTCTGGAACATCCTCTCTTTTGTGTTTGGTTCTACTAGCTCTTTCCCTTTCTCTTTC
CTGTCTTCCGTGTGTTTTTCAAACTCTGTGATTGTTGCTTTTAATGTTCTTGTATTTCCA
TGTATTATCTCAACCACATTCATCATAATTATCGGTATCTATTTCAGTTTGATC

QA 3 716 3 716
DS 



AS 1 4

CO CL2766Contig1 800 4 6 U
GGAAGGTTTTACAAAGAGAAAAAGTAGTTAAACGAAGCATCGAGATAGCAATGATCTTTC
TTTCGGTTAGTTCCTCTTCATCATCTCCGATCGCCGCCGTATTCTCCGTCGCGCTTCTTC
TGTTCTACTTCTCTGAAGCTACTCTAGGAGCGCCTTGTCCAATCAATGGGTTGCCAATCG
TGAGGAATATAAGTGAACTTCCTCAGGATAACTATGGAAGACCAGGCCTTTCTCACATGA
CTGTTACTGGCTCTGTTTTGCACGGAATGAAAGAGGTTGAGATATGGCTTCAAACATTTG
CTCCAGGTTCAGGGACACCCATTCACAGGCACTCTTGTGAAGAGGTTTTCGTTGTCCTTA
AGGGCAATGGTACTCTCTATCTCGCTGAAACACATGGTAGTTTCCCTGGGAAACCTGTTG
AGTTCCCAATCTTTGCCAACACTACTATTCATATTCCCATCAATGATGCTCATCAGGTCA
AGAACACTGGTCATGAGGACCTCCAGGTGTTGGTTATTATATCCCGGCCGCCAATTAAAG
TGTTCACATACGATGACTGGTTTATGCCACACACTGCTGCGAGGTTAAAGTTCCCTTACT
ATTGGGATGAGCAGTGCTTCCAAGAATCACAAAAAGACGAGCTTTAAAGTAAATGAATGT
TTCACTCTTTTCAAACTCTTAAGTTAAGTGAGTCTTCTTGGTTTTGAAAATATGTAACAG
A****GCTACATCTTAATTGCAATTTACCTACACTTGTTAGTTTGCAGAACAGTTAATGT
GATCTATATTTATGTTGTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL25TF U 1
AF RR2DL25JQ C 185
AF RR2B146TF U 33
AF RR2G886TF U 24
BS 1 144 RR2DL25TF
BS 145 145 RR2B146TF
BS 146 709 RR2DL25TF
BS 710 710 RR2B146TF
BS 711 792 RR2DL25TF
BS 793 800 RR2G886TF

RD RR2DL25TF 799 0 0
GGAAGGTTTTACAAAGAGAAAAAGTAGTTAAACGAAGCATCGAGATAGCAATGATCTTTC
TTTCGGTTAGTTCCTCTTCATCATCTCCGATCGCCGCCGTATTCTCCGTCGCGCTTCTTC
TGTTCTACTTCTCTGAAGCTACTCCAGGAGCGCCTTGTCCAATCAATGGGTTGCCAATCG
TGAGGAATATAAGTGAACTTCCTCAGGATAACTATGGAAGACCAGGCCTTTCTCACATGA
CTGTTACTGGCTCTGTTTTGCACGGAATGAAAGAGGTTGAGATATGGCTTCAAACATTTG
CTCCAGGTTCAGGGACACCCATTCACAGGCACTCTTGTGAAGAGGTTTTCGTTGTCCTTA
AGGGCAATGGTACTCTCTATCTCGCTGAAACACATGGTAGTTTCCCTGGGAAACCTGTTG
AGTTCCCAATCTTTGCCAACACTACTATTCATATTCCCATCAATGATGCTCATCAGGTCA
AGAACACTGGTCATGAGGACCTCCAGGTGTTGGTTATTATATCCCGGCCGCCAATTAAAG
TGTTCACATACGATGACTGGTTTATGCCACACACTGCTGCGAGGTTAAAGTTCCCTTACT
ATTGGGATGAGCAGTGCTTCCAAGAATCACAAAAAGACGAGCTTTAAAGTAAATGAATGT
TTCACTCTTTTCAAACTCTTAAGTTAAGTGAGTCTTCTTGGTTTTGAAA*TATGTAACAG
A****GCTACATCTTAATTGCAATTTACCTACACTTGTTAGTTTGCAGAACAGTTAATGT
GATCTATATTTA
TGTTTGT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2DL25JQ 608 0 0
GAATATAAGTGAACTTCCTCAGGATAACTATGGAAGACCAGGCCTTTCTCACATGACTGT
TACTGGCTCTGTTTTGCACGGAATGAAAGAGGTTGAGATATGGCTTCAAACATTTGCTCC
AGGTTCAGGGACACCCATTCACAGGCACTCTTGTGAAGAGGTTTTCGTTGTCCTTAAGGG
CAATGGTACTCTCTATCTCGCTGAAACACATGGTAGTTTCCCTGGGAAACCTGTTGAGTT
CCCAATCTTTGCCAACACTACTATTCATATTCCCATCAATGATGCTCATCAGGTCAAGAA
CACTGGTCATGAGGACCTCCAGGTGTTGGTTATTATATCCCGGCCGCCAATTAAAGTGTT
CACATACGATGACTGGTTTATGCCACACACTGCTGCGAGGTTAAAGTTCCCTTACTATTG
GGATGAGCAGTGCTTCCAAGAATCACAAAAAGACGAGCTTTAAAGTAAATGAATGTTTCA
CTCTTTTCAAACTCTTAAGTTAAGTGAGTCTTCTTGGTTTTGAAAATATGTAACAGA***
*GCTACATCTTAATTGCAATTTACCTACACTTGTTAGTTTGCAGAACAGTTAATGTGATC
TATATTTA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2B146TF 752 0 0
GGGCATCGAGATAC
AGCAATGATCCTTGTTTCGGTTAGTTCCTCTTCATCATCTCCGATCGCCGCCGTATTCTC
CGTCGCGCTTCTTCTGTTCTACTTCTCTGAAGATACTCTTGGAGCGCCTTGTCCGATCAA
TGGGTTGCCAATTGTGAGGAATATAAGTGAACTTCCTCAGGATAACTATGGAAGACCAGG
CCTTTCTCACATGACCGTTGCTGGCTCTCTTTTGCACGGAATGAAAGAAGTTGAGATATG
GCTTCAAACATTTTCTCCAGGTTCAGGGACACCCATTCACAGGCACTCTTGTGAAGAGGT
TTTCGTTGTCCTTAAGGGCAATGGTACTCTCTATCTCGCTGAAACACATGGTAGTTTCCC
TGGGAAACCTGTTGAGTTCCCAATCTTCGCCAACAGTACTATTCATATTCCCATCAATGA
TGCTCATCAGGTCAAGAACACTGGTCATGAGGACTTGCAGGTGTTAGTTATTATATCTCG
ACCGCCAATTAAAGTGTTCACATACGATGACTGGTTTATGCCACACACTGCTGCGAGGTT
AAAGTTCCCTTACTATTGGGATGAGCAATGCTTCCAAGAATCACAAAAAGACGAGCTTTA
AAGTAAATGAATGTT*CACTCTTTTCAAACTCTTAAGTGAAGTGAGTCTTCTTGGTTTTG
AAAATATGTAACAGAGAGAGCTACATCGTAATTGCAATTTACCTACACTTATTAGTTTGC
ACAACAGTTAATGTGATC

QA 15 752 15 752
DS 

RD RR2G886TF 777 0 0
GG
AGTTAAACGAAGCATCGAGATAGCAATGATCTTTCTTTCGGTTAGTTCCTCTTCATCATC
TCCGATCGCCGCCGTATTTTCCGTCGCGCTTCTTCTGTTCTACTTCTCTGAAGCTACTCT
AGGAGCGCCTTGTCCAATCAATGGGTTGGCAATCGTGAGGAATATAAGTGAACTTCCTCA
GGATAACTATGGAAGACCAGGCCTTTCTCACATGACTGTTACTGGCTCTGTTTTGCACGG
AATGAAAGAGGTTGAGATATGGCTTCAAACATTTGCTCCAGGTTCAGGGACACCCATTCA
CAGGCACTCTTGTGAAGAGGTTTTCGTTGTCCTTAAGGGCAATGGTACTCTCTATCTCGC
TGAAACACATGGTAGTTTCCCTGGGAAACCTGTTGAGTTCCCAATCTTTGCCAACACTAC
TATTCATATTCCCATCAATGATGCTCATCAGGTCAAGAACACTGGTCGTGAGGACCTCCA
GGTGTTGGTTATTATATCCCGGCCGCCAATTAAAGTGTTCACATACGATGACTGGTTTAT
GCCACACACTGCTGCGAGGTTAAAGTTCCCTTACTATTGGGATGAGCAGTGCTTCCAAGA
ATCACAAAAAGACGAGCTTTAAAGTAAATGAATGTTTCACTCTTTTCAA*CTCTTAAGTT
AAGTGAGTCTTCTTGGTTTTGAAAATATGTAACAGA****GCTACATCTTAATTGCA*TT
TACCTACACTTGTTAGTTTGCAGA*CAGTTAATGTGATCTATATTTATGTTGTTA

QA 3 777 3 777
DS 



AS 1 4

CO CL2767Contig1 984 4 6 U
AGAAGCTTAAGGAGCCAAGCCGTTATCTTTCGTTGCTCTTTAACTTTTCGCTTCATCCCC
TAGAAGAAGACATGCCTAAATCAAAGAGAGACAGACCAGTAACTTTGTCAAAGACAAAGA
AGAAAGGAAGAGCGCACAAGGAGGTTATTGTAAATGGAATCAGAGAGGCTGTCGACAAGT
ATTCATCAGTCTATGTTTCCTCGTTCGAGAACATGAGAAACATCAAGTTCAAGGAGTTCA
GACAGCAGTTTAGGCAGAACGGAAAGTTCTTCCTCGGTTCGAACAAGGTGATGCAGGTTG
CTCTAGGTCGTTCTGCTTCTGATGAAATGCGTCCTGGTATCTTCAAAGCCTCCAAGATGC
TTCATGGTGATGCTGGACTTCTTGTTACTGATATGCCAAAGGAAGAGGTCGAAAGCTTAT
TTAACGCTTATGAGGATTCAGACTTTTCAAGAACTGGAAGCACTGCTGTAGAAACGGTTG
AGCTGAAGGAAGGACCTCTAGAACAGTTCACACATGAGATGGAACCATTTCTTAGGAAGC
AGGGTATGCCTGTTCGTCTTAACAAAGGTACGGTGGAGTTACTCTCCGACTTTGTAGTTT
GTGAAGAAGGCAAACCTCTTTCACCAGAATCTTCTCGCATTCTGCGTCTGTTGGGAATCA
AGTTGGCTACTTTCAAACTCAACTTGGTCTGCAGATGGAGCCCTAGTGACTTTGAGCTTT
ACAGAGAAGGCTTGGATCTCTCAGACGTTGAAACCTCTTGAAAAAAGCCTAGATTTTGAT
GATCATCTCTTTTAAAGTTTCTGAATATCCTATTATTCACCTGCATTATGCTTGTTCTAT
TTGGTTCTTTGGTTTGCACTTGGATGTTTTATGTCAAAGTTTTGTTGCTTTAATGTCTGT
AGTATATCAAATTATCTTCATGACTTCACCTATTCTAGTATTCTTAACTGAAATACAATA
TCAAGCTTAATACTTTTTTTTCTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN18TF U 1
AF RR2DS42TF U 1
AF RR2DS42JQ C 325
AF RR2BN18JQ C 252
BS 1 176 RR2BN18TF
BS 177 177 RR2DS42TF
BS 178 198 RR2BN18TF
BS 199 199 RR2DS42TF
BS 200 712 RR2BN18TF
BS 713 984 RR2BN18JQ

RD RR2BN18TF 717 0 0
AGAAGCTTAAGGAGCCAAGCCGTTATCTTTCGTTGCTCTTTAACTTTTCGCTTCATCCCC
TAGAAGAAGACATGCCTAAATCAAAGAGAGACAGACCAGTAACTTTGTCAAAGACAAAGA
AGAAAGGAAGAGCGCACAAGGAGGTTATTGTAAATGGAATCAGAGAGGCTGTCGACTAGT
ATTCATCAGTCTATGTTTTCTCGTTCGAGAACATGAGAAACATCAAGTTCAAGGAGTTCA
GACAGCAGTTTAGGCAGAACGGAAAGTTCTTCCTCGGTTCGAACAAGGTGATGCAGGTTG
CTCTAGGTCGTTCTGCTTCTGATGAAATGCGTCCTGGTATCTTCAAAGCCTCCAAGATGC
TTCATGGTGATGCTGGACTTCTTGTTACTGATATGCCAAAGGAAGAGGTCGAAAGCTTAT
TTAACGCTTATGAGGATTCAGACTTTTCAAGAACTGGAAGCACTGCTGTAGAAACGGTTG
AGCTGAAGGAAGGACCTCTAGAACAGTTCACACATGAGATGGAACCATTTCTTAGGAAGC
AGGGTATGCCTGTTCGTCTTAACAAAGGTACGGTGGAGTTACTCTCCGACTTTGTAGTTT
GTGAAGAAGGCAAACCTCTTTCACCAGAATCTTCTCGCATTCTGCGTCTGTTGGGAATCA
AGTTGGCTACTTTCAAACTCAACTTGGTCTGCAGATGGAGCCCTAGTGACTT
GAGCT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2DS42TF 724 0 0
AGAAGCTTAAGGAGCCAAGCCGTTATCTTTCGTTGCTCTTTAACTTTTCGCTTCATCCCC
TAGAAGAAGACATGCCTAAATCAAAGAGAGACAGACCAGTTACTTTGTCAAAGACAAAGA
AGAAAGGAAGAGCGCACAAGGAGGTTATTGTAAATGGAATCAGAGAGGCTGTCGACAAGT
ATTCATCAGTCTATGTTTCCTCGTTCGAGAACATGAGAAACATCAAGTTCAAGGAGTTCA
GACAGCAGTTTAGGCAGAACGGAAAGTTCTTCCTCGGTTCGAACAAGGTGATGCAGGTTG
CTCTAGGTCGTTCTGCTTCTGATGAAATGCGTCCTGGTATCTTCAAAGCCTCCAAGATGC
TTCATGGTGATGCTGGACTTCTTGTTACTGATATGCCAAAGGAAGAGGTCGAAAGCTTAT
TTAACGCTTATGAGGATTCAGACTTTTCAAGAACTGGAAGCACTGCTGTAGAAACGGTTG
AGCTGAAGGAAGGACCTCTAGAACAGTTCACACATGAGATGGAACCATTTCTTAGGAAGC
AGGGTATGCCTGTTCGTCTTAACAAAGGTACGGTGGAGTTACTCTCCGACTTTGTAGTTT
GTGAAGAAAGCAAACCTCTTTCACCAGAATCTTCTCGCATTCTGCGTCTGTTGGGAATCA
AGTTGGCTACTTTCAA*CTCAACTTGGTCTGCAGATGGAGCCCTAGTGACTT
TGAGCTTACAGA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2DS42JQ 594 0 0
AAATGCGTCCTGGTATCTTCAAAGCCTCCAAGATGCTTCATGGTGATGCTGGACTTCTTG
TTACTGATATGCCAAAGGAAGAGGTCGAAAGCTTATTTAACGCTTATGAGGATTCAGACT
TTTCAAGAACTGGAAGCACTGCTGTAGAAACGGTTGAGCTGAAGGAAGGACCTCTAGAAC
AGTTCACACATGAGATGGAACCATTTCTTAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGTCTTAACA
AAGGTACGGTGGAGTTACTCTCCGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAGGCAAACCTCTTTCAC
CAGAATCTTCTCGCATTCTGCGTCTGTTGGGAATCAAGTTGGCTACTTTCAAACTCAACT
TGGTCTGCAGATGGAGCCCTAGTGACTTTGAGCTTTACAGAGAAGGCTTGGATCTCTCAG
ACGTTGAAACCTCTTGAAAAAAGCCTAGATTTTGATGATCATCTCTTTTAAAGTTTCTGA
ATATCCTATTATTCCCCTGCGTTATGCTTGTTCTATTTGGTTCTTTGGTTTGCACTTGGA
TGTTTTATGTCAAAGTTTTGTTGCTTTAATGTCTGTAGTATATCAAATTATCTT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2BN18JQ 733 0 0
AGGCAGAACGGAAAGTTCTTCCTCGGTTCGAACAAGGTGATGCAGGT*GCTCTAGGTCGT
TCTGCTTCTGATGAAATGCGTCCTGGTATCTTCAAAGCCTCCAAGATGCTTCATGGTGAT
GCTGGACTTCTTGTTACTGATATGCCAAAGGAAGAGGTCGAAAGCTTATTTAACGCTTAT
GAGGATTCAGACTTTTCAAGAACTGGAAGCACTGCTGTAGAAACGGTTGAGCTGAAGGAA
GGACCTCTAGAACAGTTCACACATGAGATGGAACCATTTCTTAGGAAGCAGGGTATGCCT
GTTCGTCTTAACAAAGGTACGGTGGAGTTACTCTCCGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAGGC
AAACCTCTTTCACCAGAATCTTCTCGCATTCTGCGTCTGTTGGGAATCAAGTTGGCTACT
TTCAAACTCAACTTGGTCTGCAGATGGAGCCCTAGTGACTTTGAGCTTTACAGAGAAGGC
TTGGATCTCTCAGACGTTGAAACCTCTTGAAAAAAGCCTAGATTTTGATGATCATCTCTT
TTAAAGTTTCTGAATATCCTATTATTCACCTGCATTATGCTTGTTCTATTTGGTTCTTTG
GTTTGCACTTGGATGTTTTATGTCAAAGTTTTGTTGCTTTAATGTCTGTAGTATATCAAA
TTATCTTCATGACTTCACCTATTCTAGTATTCTTAACTGAAATACAATATCAAGCTTAAT
ACTTTTTTTTCTG

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 3

CO CL2768Contig1 836 3 7 U
GGGAAACTGTTAAAGCCAGCGAGTCGCCCACCTTTCATCATCGGTATGCTTCTACAACTT
TTCCAGCAGTTTACAGGAATCAATGCCATTATGTTCTACGCACCGGTCTTGTTCCAGACC
GTTGGCTTTGGAAGCGATGCAGCTCTTCTCTCTGCGGTTATCACCGGAGTAATCAATGTT
CTCAGTACGTTCGTCGGGATTTACCTCGTCGACAGAACCGGACGGAGATTCCTTCTTCTA
CAATCTTCTGTTCACATGCTCATTTGCCAGTTGATCATTGGAATCATCCTAGCGAAAGAC
TTGGGAACCACGGGATCACTAGGGAAGCCACAAGC*CTTAGTGGTTGTGATCTTTGTGTG
CGTTTACGTGATGGGTTTCGCGTGGTCATGGGGACCTTTAGGATGGCTAATTCCTAGCGA
GACGTTTCCTCTAGAAACTCGAACTGCAGGATTCGCTGTTGCGGTCTCCTGCAACATGTT
CTTCACCTTCGTGATCGCGCAGGCTTTCTTGTCGATGCTTTGCGGGATGAGATCGGGGAT
ATTCTTCTTCTTCAGCGCTTGGATCATTGTGATGGGACTGTTTGCGATGTTCTTCGTACC
GGAAACTAAAGGAGTCGCTATTGATGACATGAGGGAGAGAGTGTGGAAGCCACATTGGTT
CTGGAAGAGGTATATGCTTGCTGAGGATGATGACGTGGAGAAGAGAACTGAATGAAACCA
CACCTGTCTTTGTGTGTTTCTTTTCCAGTTTCTTTTCTTGTTGATGTTTGAATTCTTTTG
TTAATTATTTTGTTTCGTGGGAACATAGAGTGTGTAATAAGACAAACTTGTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A182JQ C 1
AF RR2A182TF U 11
AF RR2GD51TF U 308
BS 1 10 RR2A182JQ
BS 11 685 RR2A182TF
BS 686 686 RR2GD51TF
BS 687 720 RR2A182TF
BS 721 721 RR2GD51TF
BS 722 778 RR2A182TF
BS 779 836 RR2GD51TF

RD RR2A182JQ 703 0 0
GGGAAACTGTTAAAGCCAGCGAGTCGCCCAC*TTTCATCATCGGTATGCTTCTACAACTT
TTCCAGCAGTTTACAGGAATCAATGCCATTATGTTCTACGCACCGGTCTTGTTCCAGACC
GTTGGCTTTGGAAGCGATGCAGCTCTTCTCTCTGCGGTTATCACCGGAGTAATCAATGTT
CTCAGTACGTTCGTCGGGATTTACCTCGTCGACAGAACCGGACGGAGATTCCTTCTTCTA
CAATCTTCTGTTCACATGCTCATTTGCCAGTTGATCATTGGAATCATCCTAGCGAAAGAC
TTGGGAACCACGGGATCACTAGGGAAGCCACAAGCTCTTAGTGGTTGTGATCTTTGTGTG
CGTTTACGTGATGGGTTTCGCGTGGTCATGGGGACCTTTAGGATGGCTAATTCCTAGCGA
GACGTTTCCTCTAGAAACTCGAACTGCAGGATTCGCTGTTGCGGTCTCCTGCAACATGTT
CTTCACCTTCGTGATCGCGCAGGCTTTCTTGTCGATGCTTTGCGGGATGAGATCGGGGAT
ATTCTTCTTCTTCAGCGCTTGGATCATTGTGATGGGACTGTTTGCGATGTTCTTCGTACC
GGAAACTAAAGGAGTCGCTATTGATGACATGAGGGAGAGAGTGTGGAAGCCACATTGGTT
CTGGAAGAGGTATATGCTTGCTGAGGATGATGACGTGGAGAAG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2A182TF 772 0 0
TAAAGCCAGCGAGTCGCCCACCTTTCATCATCGGTATGCTTCTACAACTTTTCCAGCAGT
TTACAGGAATCAATGCCATTATGTTCTACGCACCGGTCTTGTTCCAGACCGTTGGCTTTG
GAAGCGATGCAGCTCTTCTCTCTGCGGTTATCACCGGAGTAATCAATGTTCTCAGTACGT
TCGTCGGGATTTACCTCGTCGACAGAACCGGACGGAGATTCCTTCTTCTACAATCTTCTG
TTCACATGCTCATTTGCCAGTTGATCATTGGAATCATCCTAGCGAAAGACTTGGGAACCA
CGGGATCACTAGGGAAGCCACAAGC*CTTAGTGGTTGTGATCTTTGTGTGCGTTTACGTG
ATGGGTTTCGCGTGGTCATGGGGACCTTTAGGATGGCTAATTCCTAGCGAGACGTTTCCT
CTAGAAACTCGAACTGCAGGATTCGCTGTTGCGGTCTCCTGCAACATGTTCTTCACCTTC
GTGATCGCGCAGGCTTTCTTGTCGATGCTTTGCGGGATGAGATCGGGGATATTCTTCTTC
TTCAGCGCTTGGATCATTGTGATGGGACTGTTTGCGATGTTCTTCGTACCGGAAACTAAA
GGAGTCGCTATTGATGACATGAGGGAGAGAGTGTGGAAGCCACATTGGTTCTGGAAGAGG
TATATGCTTGCTGAG*ATGATGACGTGGAGAAGAGAACTGAATGAAACCATACCTGTCTT
TGTGTGTTTCTTTTCCAGTTTCTTTTCTTGTTGATGTTTGAATTCTTT
GTTA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2GD51TF 529 0 0
G
CACGGGATCACTAGGGAAGCCACAAGC*CTTAGTGGTTGTGATCTTTGTGTGCGTTTACG
TGATGGGTTTCGCGTGGTCATGGGGACCTTTAGGATGGCTAATTCCTAGCGAGACGTTTC
CTCTAGAAACTCGAACTGCAGGATTCGCTGTTGCGGTCTCGTGCAACATGTTCTTCACCT
TCGTGATCGCGCAGGCTTTCTTGTCGATGCTTTGCGGGATGAGATCGGGGATATTCTTCT
TCTTCAGCGCTTGGATCATTGTGATGGGACTGTTTGCGATGTTCTTCGTACCAGAAACTA
AAGGAGTCGCTATTGATGACATGAGGGAAAGAGTGTGGAAGCCACATTGGTTCTGGAAGA
GGTATATGCTTGCTGAGGATGATGACGTGGAGAAGAGAACTGAATGAAACCACACCTGTC
TTTGTGTGTTTCTTTT***********TCTTGTTGATGTTTGAATTCTTTTGTTAATTAT
TTTGTTTCGTGGGAACATAGAGTGTGTAATAAGACAAACTTGTTGATT

QA 2 529 2 529
DS 



AS 1 4

CO CL2769Contig1 826 4 21 U
GCAATGGGGTATGGTGTAGGTAGGGGCTATGGAAGTGGCGGTGGATATGGAGAAGGCATT
GGCTCTAGTGGAGGCAGTGGATATGGAGAAGGCATCGGCTCCAGTGGAGGCAGTGGCTAT
GGAGAAGGCATCGGCTCCAGTGGAGGCAGTGGATATGGAGAAGGCATCGGCTCCAGTGGA
GGCAGTGGCTATGGAGAAGGAATAGGATCCGGGTATGGCCAACCGAACTGCGGTCCTATC
ACTGGAGCTCCAGGTAGCGGATACGGTGAAGGCATTGGACAGGGTAGTGGCTCAGGCGAA
GGGATCGGTATCGGTATAGGAGGTGGCTCTAGCGGGAGTGTACCAAGTGTAGTTGTCCCA
AGCATATCAATCCCTCCCATAACGGTTCCAGGCACACAGATTCCCGGTTTTGTGATTCCA
GGAGTCAGGGTTAATCCTGGCTATGGTTCTGGGGGATGCCAAACCGGTGGTTGCACCCCA
ACCGTACCATATTACCGCCCACCTATATACGAACAACCACCAAGCTGTTCCCATTGTCAG
CCTTTCACTTCGGGGCAAGACAAGCATATGTCAGACAAAGGAACCATGACCGAAGAAGCT
CTTGCTCCCACTCCAAACGAGATGAACGTCTAAGCTTTTCAGTGTCCCATGGAAACACAA
AGTTTAATAAAATCACTCATAAGGATATATATCACTATTTTGGCTTTGAATAATCCAATG
CTACCGAAATGTAAAGTTCTAAATAAGTGAAATTTGCTTAAGAATTAAAGAAGAAGCAAC
TGTAAATGTAATTGAATTGCCTAATATATAGTGTGAGTGCAAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2BW74TF U 1
AF RR2BO06TF U 101
AF RR2BO06JQ C 101
AF RR2BW74JQ C 149
BS 1 110 RR2BW74TF
BS 111 111 RR2BO06TF
BS 112 131 RR2BW74TF
BS 132 132 RR2BO06TF
BS 133 218 RR2BW74TF
BS 219 219 RR2BO06TF
BS 220 305 RR2BW74TF
BS 306 306 RR2BO06TF
BS 307 332 RR2BW74TF
BS 333 333 RR2BO06TF
BS 334 440 RR2BW74TF
BS 441 441 RR2BO06TF
BS 442 683 RR2BW74TF
BS 684 684 RR2BO06TF
BS 685 709 RR2BW74TF
BS 710 710 RR2BO06TF
BS 711 738 RR2BW74TF
BS 739 739 RR2BO06TF
BS 740 751 RR2BW74TF
BS 752 779 RR2BO06TF
BS 780 826 RR2BO06JQ

RD RR2BW74TF 754 0 0
GCAATGGGGTATGGTGTAGGTAGGGGCTATGGAAGTGGCGGTGGATATGGAGAAGGCATT
GGCTCTAGTGGAGGCAGTGGATATGGAGAAGGCATCGGCTCCAGTGGAGGTAGTGGCTAT
GGAGAAGGCATTGGCTCCAGTGGAGGCAGTGGATATGGAGAAGGCATCGGCTCCAGTGGA
GGCAGTGGCTATGGAGAAGGAATAGGATCCGGGTATGGTCAACCGAACTGCGGTCCTATC
ACTGGAGCTCCAGGTAGCGGATACGGTGAAGGCATTGGACAGGGTAGTGGCTCAGGCGAA
GGGATTGGTATCGGTATAGGAGGTGGCTCTAGTGGGAGTGTACCAAGTGTAGTTGTCCCA
AGCATATCAATCCCTCCCATAACGGTTCCAGGCACACAGATTCCCGGTTTTGTGATTCCA
GGAGTCAGGGTTAATCCTGGTTATGGTTCTGGGGGATGCCAAACCGGTGGTTGCACCCCA
ACCGTACCATATTACCGCCCACCTATATACGAACAACCACCAAGCTGTTCCCATTGTCAG
CCTTTCACTTCGGGGCAAGACAAGCATATGTCAGACAAAGGAACCATGACCGAAGAAGCT
CTTGCTCCCACTCCAAACGAGATGAACGTCTAAGCTTTTCAGTGTCCCATGGAAACACAA
AGTTTAATAAAATCACTCATAAG*ATATATATCACTATTTTGGCTTTGA*TAATCCAATG
CTACCGAAATGTAAAGTTTTAAATAAGTGAA
GTT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2BO06TF 679 0 0
GT
AGTGGAGGCAGTGGCTATGGAGAAGGCATCGGCTCCAGTGGAGGCAGTGGATATGGAGAA
GGCATCGGCTCTATTGGAGGCAGTGGCTATGGAGAAGGAATAGGATCCGGGTATGGCCAA
CCGAACTGCGGTCCTATCACTGGAGCTCCAGGTAGCGGATATGGTGAAGGCATTGGAGAG
GGTAGTGGCTCAGGCGAAGGGATCGGTATCGGTATAGGAGGTGGCTCTAGCGGGGGTGTA
CCAAGTGTAGTTGTCCCAAGCATATCAATCCCTCCCATAACGGTTCCAGGCACACAGATT
CCCGGTTTTGTGATTCCAGGAGTCAGGGTTAATCCTGGCTATGGTTCTGGGGGATGCCAA
ACCGGTGGTTGCACCCCAACCGTACCATATTACCGCCCACCTATATACGAACAACCACCA
AGCTGTTCCCATTGTCAGCCTTTCACTTCGGGGCAAGACAAGCATATGTCAGACAAAGGA
ACCATGACCGAAGAAGCTCTTGCTCCCACTCCAAACGAGATGAACGTCTAAGCTTTTCAG
TGTCCCATGGAAACACAAAGTTTAATAAAATCACTCATAAGGATATATATCACTATTTTG
GCTTTGAATAATCCAATGTTACCGAAATGTAAAGTTCTAAATAAGTGAAATTTGCTTAAG
AATTAAAGAAGAAGCAA

QA 3 679 3 679
DS 

RD RR2BO06JQ 726 0 0
GT
AGTGGAGGCAGTGGCTATGGAGAAGGCATCGGCTCCAGTGGAGGCAGTGGATATGGAGAA
GGCATCGGCTCTATTGGAGGCAGTGGCTATGGAGAAGGAATAGGATCCGGGTATGGCCAA
CCGAACTGCGGTCCTATCACTGGAGCTCCAGGTAGCGGATATGGTGAAGGCATTGGAGAG
GGTAGTGGCTCAGGCGAAGGGATCGGTATCGGTATAGGAGGTGGCTCTAGCGGGGGTGTA
CCAAGTGTAGTTGTCCCAAGCATATCAATCCCTCCCATAACGGTTCCAGGCACACAGATT
CCCGGTTTTGTGATTCCAGGAGTCAGGGTTAATCCTGGCTATGGTTCTGGGGGATGCCAA
ACCGGTGGTTGCACCCCAACCGTACCATATTACCGCCCACCTATATACGAACAACCACCA
AGCTGTTCCCATTGTCAGCCTTTCACTTCGGGGCAAGACAAGCATATGTCAGACAAAGGA
ACCATGACCGAAGAAGCTCTTGCTCCCACTCCAAACGAGATGAACGTCTAAGCTTTTCAG
TGTCCCATGGAAACACAAAGTTTAATAAAATCACTCATAAGGATATATATCACTATTTTG
GCTTTGAATAATCCAATGTTACCGAAATGTAAAGTTCTAAATAAGTGAAATTTGCTTAAG
AATTAAAGAAGAAGCAACTGTAAATGTAATTGAATTGCCTAATATATAGTGTGAGTGCAA
GATC

QA 3 726 3 726
DS 

RD RR2BW74JQ 677 0 0
GTGGATATGGAGAAGGCATCGGCTCCAGTGGAGGCAGTGGCTATGGAGAAGGAATAGGAT
CCGGGTATGGTCAACCGAACTGCGGTCCTATCACTGGAGCTCCAGGTAGCGGATACGGTG
AAGGCATTGGACAGGGTAGTGGTTCAGGCGAAGGGATTGGTATCGGTATAGGAGGTGGCT
TTAGTGGGAGTGTACCAAGTGTAGTTGTCCCAAGCATATCAATCCCTCCCATAACGGTTC
CAGGCACACAGATTCCCGGTTTTGTGATTCCAGGAGTCAGGGTTAATCCTGGTTATGGTT
CTGGGGGATGCCAAACCGGTGGTTGCACCCCAACCGTACCATATTACCGCCCACCTATAT
ACGAACAACCACCAAGCTGTTCCCATTGTCAGCCTTTCACTTCGGGGCAAGACAAGCATA
TGTCAGACAAAGGAACCATGACCGAAGAAGCTCTTGCTCCCACTCCAAACGAGATGAACG
TTTAAGCTTTTCAGTGTCCCATGGAAACACAAAGTTTAATAAAATCACTCATAAGGATAT
ATATCACTATTTTGGCTTTGAATAATCCAATGCTACCGAAATGTAAAGTTTTAAATAAGT
GAAGTTTACTTAAGAATTAAAGAAGAAGCAACTGTAAATGTAATTGAATTGCCTAATATA
TAGTGTGAGTGCAAGA
C

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 3

CO CL2770Contig1 845 3 2 U
AAAACATAAAATTTCATTGCAATAAAAGTTTTGAGTTTTGGATCCGATGTCAAAAGTACA
ACAACGCAGATACCATACAAAAACAAAAGCTTATGCAAAATGTGTGACTAGTCTTCACTA
AACTTGATCTTCTTAGGTAATGGCTGGGTATTTCCAACAAGCTCGGGGCACTGATATTCA
ATTCCAGCAGCTTCGATTCTCTTTCTCCTTTTCTGATCACGTTTCACAACCTTGTTCAAC
ATTTTCCTATGTTCTTCCAATGTCCTTTCCTTGTTGTGTTGTTTACGCTCGATCTGAACC
CAATCAACTGGTTTGTACTGGCACTTAAAACCTTTCCACAGATTTGGTTTAACATCCTCT
GGTGGAATAACACGGACTTGAAGCATGTGCTTGAGCAACAGATAGTCATTCATTGCACCC
GCTGCAATCTCCGCCACCTCAGGGTCCTCAAACTGAATGAATCCAAAATGCTTTGATTTC
CCAGTCTTTTTGTTTCGTGCGACTCTAACTCTCTTTACTGTTCCAAACTGGGTGAAGAAA
GCTTCAATCTCAGTCTCGTAGAAACCGTGAGGGAGGCGACCGATGTACAGCACGGTGGAT
TTGTTCTCGATAGGTTTGGTCACTGGAGCTTTTCGAGCTGGACCGCCTTCTAGTGGCAAA
AAGTCATCTGAAGGTTTGGGTTTCTGGGGAACAGCTAGCTGAGATGAGGAAGCAGCAGCA
GCGGAGGCAGAGATCTTCTTCATGTTCTTCTTCAAAGCTTTCCTCGCCTTGGCACCCATG
GTTGCTGTTGTCGTCGGCGGCGAAAGAGGGAGAGAGTCGAGATTCAAAGTTAGGGTTTAT
AAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2GQ68JQ U 1
AF RR2BQ13JQ U 1
AF RR2BQ13TF C 257
BS 1 710 RR2BQ13JQ
BS 711 845 RR2BQ13TF

RD RR2GQ68JQ 555 0 0
AAAACATAAAATTTCATTGCAATAAAAGTTTTGAGTTTTGGATCCGATGTCAAAAGTACA
ACAACGCAGATACCATACAAAAACAAAAGCTTATGCAAAATGTGTGACTAGTCTTCACTA
AACTTGATCTTCTTAGGTAATGGCTGGGTATTTCCAACAAGCTCGGGGCACTGATATTCA
ATTCCAGCAGCTTCGATTCTCTTTCTCCTTTTCTGATCACGTTTCACAACCTTGTTCAAC
ATTTTCCTATGTTCTTCCAATGTCCTTTCCTTGTTGTGTTGTTTACGCTCGATCTGAACC
CAATCAACTGGTTTGTACTGGCAATTAAAACCTTTCCACAGATTTGGTTTAACATCCTCT
GGTGGAATAACACGGACTTGAAGCATGTGCTCGAGCAACAGATAGTCATTCATTGCACCC
GCTGCAATCTCCGCCACCTCAGGGTCCTCAAACTGAATGAATCCAAAATGCTTTGATTTC
CCAGTCTTTTTGTTTCGTGCGACTCTAACTCTCTTTACTGTTCCAAACTGGGTGAAGAAA
GCTTCAATCTCAGTC

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2BQ13JQ 710 0 0
AAAACATAAAATTTCATTGCAATAAAAGTTTTGAGTTTTGGATCCGATGTCAAAAGTACA
ACAACGCAGATACCATACAAAAACAAAAGCTTATGCAAAATGTGTGACTAGTCTTCACTA
AACTTGATCTTCTTAGGTAATGGCTGGGTATTTCCAACAAGCTCGGGGCACTGATATTCA
ATTCCAGCAGCTTCGATTCTCTTTCTCCTTTTCTGATCACGTTTCACAACCTTGTTCAAC
ATTTTCCTATGTTCTTCCAATGTCCTTTCCTTGTTGTGTTGTTTACGCTCGATCTGAACC
CAATCAACTGGTTTGTACTGGCACTTAAAACCTTTCCACAGATTTGGTTTAACATCCTCT
GGTGGAATAACACGGACTTGAAGCATGTGCTTGAGCAACAGATAGTCATTCATTGCACCC
GCTGCAATCTCCGCCACCTCAGGGTCCTCAAACTGAATGAATCCAAAATGCTTTGATTTC
CCAGTCTTTTTGTTTCGTGCGACTCTAACTCTCTTTACTGTTCCAAACTGGGTGAAGAAA
GCTTCAATCTCAGTCTCGTAGAAACCGTGAGGGAGGCGACCGATGTACAGCACGGTGGAT
TTGTTCTCGATAGGTTTGGTCACTGGAGCTTTTCGAGCTGGACCGCCTTCTAGTGGCAAA
AAGTCATCTGAAGGTTTGGGTTTCTGGGGAACAGCTAGCTGAGATGAGGA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2BQ13TF 589 0 0
CCAATGTCCTTTCCTTGTTGTGTTGTTTACGCTCGATCTGAACCCAATCAACTGGTTTGT
ACTGGCACTTAAAACCTTTCCACAGATTTGGTTTAACATCCTCTGGTGGAATAACACGGA
CTTGAAGCATGTGCTTGAGCAACAGATAGTCATTCATTGCACCCGCTGCAATCTCCGCCA
CCTCAGGGTCCTCAAACTGAATGAATCCAAAATGCTTTGATTTCCCAGTCTTTTTGTTTC
GTGCGACTCTAACTCTCTTTACTGTTCCAAACTGGGTGAAGAAAGCTTCAATCTCAGTCT
CGTAGAAACCGTGAGGGAGGCGACCGATGTACAGCACGGTGGATTTGTTCTCGATAGGTT
TGGTCACTGGAGCTTTTCGAGCTGGACCGCCTTCTAGTGGCAAAAAGTCATCTGAAGGTT
TGGGTTTCTGGGGAACAGCTAGCTGAGATGAGGAAGCAGCAGCAGCGGAGGCAGAGATCT
TCTTCATGTTCTTCTTCAAAGCTTTCCTCGCCTTGGCACCCATGGTTGCTGTTGTCGTCG
GCGGCGAAAGAGGGAGAGAGTCGAGATTCAAAGTTAGGGTTTATAAAAA

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 4

CO CL2771Contig1 1244 4 18 U
GGTGCGGGATGAAAATTATTACGGTTGGTTGATGCTAAGGGAAATATCAACATGGAGGAG
GTGAGAAAAGCTGCTGAAGACAACAAAGACAGCTTAGCTGCCCTCATGGTTACATACCCT
TCAACTCATGGAGTCTATGAAGAGACTATTGATGAGATTCGCAAAATAATTCACGACAAT
GGAGGTCAAGTGTACATGGATGGTGCCAACATGAATGCACAGGTTGGTTTGACCAGCCCT
GGTTTCATTGGAGCGGATGTGTGCCATCTCAATCTCCACAAGACTTTCTGTATTCCTCAT
GGAGGTGGTGGGCCTGGAATGGGTCCCATTGGTGTGAAGAAGCATTTAGCACCATTTCTT
CCTTCTCACCCTGTGATACCCACTGGTGGTTTCCCGCAACCCGAGAAGACAGAACCGCTG
GGTCCCATTGCCGCTGCACCGTGGGGATCTGCGCTTATCTTGCCAATATCTTACTCTTAC
ATTGCCATGATGGGATCTGGTGGACTCACTGAGGCCTCAAAGATTGCAATCTTGAATGCC
AATTACATGGCAAAGCGCCTAGAGAAGCACTTCCCAATTCTGTTCCGTGGTGCCAACGGA
ACAGTAGCACACGAATTCATCATAGATTTGAGAGGCTTCAAGAACACTGCTGGAATAGAA
GCAGAGGAT*TGGCGAAACGGCTAATGGACTATGGATTCCATGCACCCACAATGTCTTTC
CCTGTCTCTGGAACGCTCATGATTGAGCCGACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGTTAGAC
AGGTTCTGCGATACTCTCATTTCGATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAAT
GCAGATGTCCAGAACAACGTTCTCAAGGGAGCTCCACATTCTCCAGCTATGCTAATGTCA
GACACATGGAAGAAGCCGTATTCCCGAGAGTACGCTGCCTTCCCTACCGCATGGCTCCGA
TCTGCCAAGTTCTGGCCAACCACAGGGCGTGTGGACAATGTGTATGGAGACAGGAAGCTG
GTGTGCACTCTCCTCCCAGAAGAAGAACAAGTCGCAGCTGCAGTATCAGCTTGATTTGCA
TTCATGTCTTTATGTTATGTGTCCCCCCCCCCTCTTTCCCTCATTTCTCTTCTCTCTCTG
CTCATCCATGTTTATGTCCACAGTGTTCTTATTATCATACACTTTCTATCTAGCTGTGTA
ATGTTTACATTGGAATGTTGCTATTCACATCATCCTTCGTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ09TF U 1
AF RR2AT01TF U 130
AF RR2AT01JQ C 444
AF RR2DJ09JQ C 729
BS 1 159 RR2DJ09TF
BS 160 160 RR2AT01TF
BS 161 563 RR2DJ09TF
BS 564 564 RR2AT01TF
BS 565 669 RR2DJ09TF
BS 670 670 RR2AT01TF
BS 671 679 RR2DJ09TF
BS 680 680 RR2AT01TF
BS 681 764 RR2DJ09TF
BS 765 829 RR2AT01TF
BS 830 938 RR2AT01JQ
BS 939 939 RR2DJ09JQ
BS 940 983 RR2AT01JQ
BS 984 984 RR2DJ09JQ
BS 985 1111 RR2AT01JQ
BS 1112 1112 RR2DJ09JQ
BS 1113 1229 RR2AT01JQ
BS 1230 1244 RR2DJ09JQ

RD RR2DJ09TF 764 0 0
GGTGCGGGATGAAAATTATTACGGTTGGTTGATGCTAAGGGAAATATCAACATGGAGGAG
GTGAGAAAAGCTGCTGAAGACAACAAAGACAGCTTAGCTGCCCTCATGGTTACATACCCT
TCAACTCATGGAGTCTATGAAGAGACTATTGATGAGATTTGCAAAATAATTCACGACAAT
GGAGGTCAAGTGTACATGGATGGTGCCAACATGAATGCACAGGTTGGTTTGACCAGCCCT
GGTTTCATTGGAGCGGATGTGTGCCATCTCAATCTCCACAAGACTTTCTGTATTCCTCAT
GGAGGTGGTGGGCCTGGAATGGGTCCCATTGGTGTGAAGAAGCATTTAGCACCATTTCTT
CCTTCTCACCCTGTGATACCCACTGGTGGTTTCCCGCAACCCGAGAAGACAGAACCGCTG
GGTCCCATTGCCGCTGCACCGTGGGGATCTGCGCTTATCTTGCCAATATCTTACTCTTAC
ATTGCCATGATGGGATCTGGTGGACTCACTGAGGCCTCAAAGATTGCAATCTTGAATGCC
AATTACATGGCAAAGCGCCTAGATAAGCACTTCCCAATTCTGTTCCGTGGTGCCAACGGA
ACAGTAGCACACGAATTCATCATAGATTTGAGAGGCTTCAAGAACACTGCTGGAATAGAA
GCAGAGGATGTGGCGAAACTGCTAATGGACTATGGATTCCATGCACCCACAATGTCTTTC
CCTGTCTCTGGAACGCTCATGATTGAGCCGACCGAGAGTGAAAG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2AT01TF 700 0 0
GGAGTCTATGAAGAGACTATTGATGAGATTCGCAAAATAATTCACGACAATGGAGGTCAA
GTGTACATGGATGGTGCCAACATGAATGCACAGGTTGGTTTGACCAGCCCTGGTTTCATT
GGAGCGGATGTGTGCCATCTCAATCTCCACAAGACTTTCTGTATTCCTCATGGAGGTGGT
GGGCCTGGAATGGGTCCCATTGGTGTGAAGAAGCATTTAGCACCATTTCTTCCTTCTCAC
CCTGTGATACCCACTGGTGGTTTCCCGCAACCCGAGAAGACAGAACCGCTGGGTCCCATT
GCCGCTGCACCGTGGGGATCTGCGCTTATCTTGCCAATATCTTACTCTTACATTGCCATG
ATGGGATCTGGTGGACTCACTGAGGCCTCAAAGATTGCAATCTTGAATGCCAATTACATG
GCAAAGCGCCTAGAGAAGCACTTCCCAATTCTGTTCCGTGGTGCCAACGGAACAGTAGCA
CACGAATTCATCATAGATTTGAGAGGCTTCAAGAACACTGCTGGAATAGAAGCAGAGGAT
*TGGCGAAACGGCTAATGGACTATGGATTCCATGCACCCACAATGTCTTTCCCTGTCTCT
GGAACGCTCATGATTGAGCCGACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGTTAGACAGGTTCTGC
GATACTCTCATTTCGATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2AT01JQ 788 0 0
GGGATCTGCGCTTATCTTGCCAATATCTTACTCTTACATTGCCATGATGGGATCTGGTGG
ACTCACTGAGGCCTCAAAGATTGCAATCTTGAATGCCAATTACATGGCAAAGCGCCTAGA
GAAGCACTTCCCAATTCTGTTCCGTGGTGCCAACGGAACAGTAGCACACGAATTCATCAT
AGATTTGAGAGGCTTCAAGAACACTGCTGGAATAGAAGCAGAGGAT*TGGCGAAACGGCT
AATGGACTATGGATTCCATGCACCCACAATGTCTTTCCCTGTTTCTGGAACGCTCATGAT
TGAGCCGACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGTTAGACAGGTTCTGCGATACTCTCATTTC
GATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAATGCAGATGTCCAGAACAACGTTCT
CAAGGGAGCTCCACATTCTCCAGCTATGCTAATGTCAGACACATGGAAGAAGCCGTATTC
CCGAGAGTACGCTGCTTTCCCTACCGCATGGCTCCGATCTGCCAAGTTCTGGCCAACCAC
GGGGCGTGTGGACAATGTGTATGGAGACAGGAAGCTGGTGTGCACTCTCCTCCCAGAAGA
AGAACAAGTCGCAGCTGCAGTATCAGCTTGATTTGCATTCATGTCTTTATGTTATGTGTC
CCCCCCCC*TCTTTCCCTCATTTCTCTTCTCTCTCTGCTCATCCATGTTTATGTCCACAG
TGTTCTTATTATCATACACTTTCTATCTAGCTGTGTAATGTTTACATTGGAATGTTGCTA
TTCACA
CC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2DJ09JQ 516 0 0
TGGAACGCTCATGATTGAGCCGACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGTTAGACAGGTTCTG
CGATACTCTCATTTCGATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAATGCAGATGT
CCAGAACAACGTTCTCAAGGGAGCTCCACATTCTCCAGCTATGCTAATGTCAGACACATG
GAAGAAGCCGTATTCCCGAGAGTACGCTGCCTTCCCTACCGCATGGCTCCGATCTGCCAA
GTTCTGGCCAACCACAGGGCGTGTGGACAATGTGTATGGAGACAGGAAGCTGGTGTGCAC
TCTCCTCCCAGAAGAAGAACAAGTCGCAGCTGCAGTATCAGCTTGATTTGCATTCATGTC
TTTATGTTATGTGTCCCCCCCCCCTCTTTCCCTCATTTCTCTTCTCTCTCTGCTCATCCA
TGTTTATGTCCACAGTGTTCTTATTATCATACACTTTCTATCTAGCTGTGTAATGTTTAC
ATTGGAATGTTGCTATTCACATCATCCTTCGTTTCT

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 4

CO CL2772Contig1 1258 4 9 U
CAAGAGTTGCATTGAACTAATCTGAAACCAAAACAGTTTCAACCAAACTCAAAACATTGT
AATCAGATGAAACATAAAAACCACATATAGTCATAAAAAAGGAGCAACTGATCCGTTCAC
AGAACTGGTCCAAAAAACCTGGGCATCAATAACAAAAAGATGCTCATCATCAAGCCTCTT
CCATGTCCTAATCGATTGAACATCTCCCTTCTTCTTATTCAACTCAGCAACCACAACTCT
AGCTCTCCTCTCCCACCCAGCTTTACCATACGCATGGTAACCAAACCCACCACCATAACA
TAAGTTCAAACCTTTGAGTTTACCGCAAAAGTCGTTGACATGGTCGTGACCCACAAACAC
TGACTTCACATCTCCTCTAGTTACCAATGTCGTGAAGAAACCAGAGTTTGTGGAAGCTGA
GTATGTTCCTTCTTGTCTCACTCCTTTTGTCGCGTTCTTTGAGTCGAAACTCCAAAACTC
TGGTAATGGAATGTGGAAGTAAGCTAGTCCTGGAGCAATGCCTTGCTGAGGATTAGGCTC
TGCGTTGTACACCTTCTGGAGACGTTTTGAAGTTCTCTCAAACCAAAACTGCTGAGAAGT
CTTGACCCAATCATAACCTTCCATGTAAGGAACACTAGAGTAATCTCCACTATCAAGAAA
GTAAAGATTGAGAACAGATTTGTTCTGTAGACTGGACTCAGCAACTCCACGGATCTGGAG
ATTGTAGTTACCAAACCCATCAATGTAATGAGCAGCCTCAGGAGGGTTCACCTGAGACAA
AGTGTTGGGAAGCTTCACGATGTGTTTCATGAGCTCTTGTCGTGTCAATGTGGATTCTTG
ATCATGGTTTCCTAAGATAGCAACCCATGGGATCTTAGAGGCAATCGCTGGAGCAAAAGC
AGCGTCCATGGACTTCACAGGGTCCTTGACATCAAACCCAAAGATATTATCACCGGTGAA
GACGATGAGGTCAGGTTTCTCGGCGGCGATGATTCGAGACATGAAGAGGGTGGTGTTGAG
GTCGGAGCAGTGAGCTTTCTGGGTAGGGAGAACATCGAGACAGCGAGTAGTTGCGCCGTT
TGCGAAGTGCATATCGGCAACTTGGAGAATCTTGAACTCGCCGTTCGGACCGAACCTGAG
TTTGGGACGGTGTGACGATGTCGGAAGAGGAGCTAGACAGAGACAGAACAGGAAGAACAC
GGAGGAGAACAGGGATGTTCTTCTTCTGGTCTTGTCCGCCATTATTACAGTACACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2DY43JQ U 19
AF RR2GM96JQ U 1
AF RR2GM96TF C 557
AF RR2DY43TF C 976
BS 1 134 RR2GM96JQ
BS 135 135 RR2DY43JQ
BS 136 154 RR2GM96JQ
BS 155 155 RR2DY43JQ
BS 156 156 RR2GM96JQ
BS 157 157 RR2DY43JQ
BS 158 705 RR2GM96JQ
BS 706 1253 RR2GM96TF
BS 1254 1258 RR2DY43TF

RD RR2DY43JQ 361 0 0
AATCTGAAACCAAAACAGTTTCAACCAAACTCAAAACATTGTAATCAGATGAAACATAAA
AACCACATATAGTCATAAAAAAGGAGCAACTGATCCGTTCACAGAACTGGTCCAAAAAAC
CTGGGCATCAATAACAAAAAGATGCTCATCATCAAGCCTCTTCCATGTCCTAATCGATTG
AACATCTCCCTTCTTCTTATTCAACTCAGCAACCACAACTCTAGCTCTCCTCTCCCACCC
AGCTTTACCATACGCATGGTAACCAAACCCACCACCATAACATAAGTTCAAACCTTTGAG
TTTACCGCAAAAGTCGTTGACATGGTCGTGACCCACAAACACTGACTTCACATCTCCTCT
A

QA 1 361 1 361
DS 

RD RR2GM96JQ 705 0 0
CAAGAGTTGCATTGAACTAATCTGAAACCAAAACAGTTTCAACCAAACTCAAAACATTGT
AATCAGATGAAACATAAAAACCACATATAGTCATAAAAAAGGAGCAACTGATCCGTTCAC
AGAACTGGTCCAAAGAACCTGGGCATCAATAACAGAGAGATGCTCATCATCAAGCCTCTT
CCATGTCCTAATCGATTGAACATCTCCCTTCTTCTTATTCAACTCAGCAACCACAACTCT
AGCTCTCCTCTCCCACCCAGCTTTACCATACGCATGGTAACCAAACCCACCACCATAACA
TAAGTTCAAACCTTTGAGTTTACCGCAAAAGTCGTTGACATGGTCGTGACCCACAAACAC
TGACTTCACATCTCCTCTAGTTACCAATGTCGTGAAGAAACCAGAGTTTGTGGAAGCTGA
GTATGTTCCTTCTTGTCTCACTCCTTTTGTCGCGTTCTTTGAGTCGAAACTCCAAAACTC
TGGTAATGGAATGTGGAAGTAAGCTAGTCCTGGAGCAATGCCTTGCTGAGGATTAGGCTC
TGCGTTGTACACCTTCTGGAGACGTTTTGAAGTTCTCTCAAACCAAAACTGCTGAGAAGT
CTTGACCCAATCATAACCTTCCATGTAAGGAACACTAGAGTAATCTCCACTATCAAGAAA
GTAAAGATTGAGAACAGATTTGTTCTGTAGACTGGACTCAGCAAC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2GM96TF 699 0 0
TGGAGACGTTTTGAAGTTCTCTCAAACCAAAACTGCTGAGAAGTCTTGACCCAATCATAA
CTTTCCATGTAAGGAACACTAGAGTAATCTCCACTATCAAGAAAGTAAAGATTGAGAACA
GATTTGTTCTGTAGACTGGACTCAGCAACTCCACGGATCTGGAGATTGTAGTTACCAAAC
CCATCAATGTAATGAGCAGCCTCAGGAGGGTTCACCTGAGACAAAGTGTTGGGAAGCTTC
ACGATGTGTTTCATGAGCTCTTGTCGTGTCAATGTGGATTCTTGATCATGGTTTCCTAAG
ATAGCAACCCATGGGATCTTAGAGGCAATCGCTGGAGCAAAAGCAGCGTCCATGGACTTC
ACAGGGTCCTTGACATCAAACCCAAAGATATTATCACCGGTGAAGACGATGAGGTCAGGT
TTCTCGGCGGCGATGATTCGAGACATGAAGAGGGTGGTGTTGAGGTCGGAGCAGTGAGCT
TTCTGGGTAGGGAGAACATCGAGACAGCGAGTAGTTGCGCCGTTTGCGAAGTGCATATCG
GCAACTTGGAGAATCTTGAACTCGCCGTTCGGACCGAACCTGAGTTTGGGACGGTGTGAC
GATGTCGGAAGAGGAGCTAGACAGAGACAGAACAGGAAGAACACGGAGGAGAACAGGGAT
GTTCTTCTTCTGGTCTTGTCCGCCATTATTACAGTAC
CC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2DY43TF 283 0 0
TTTCTCGGCGGCGATGATTCGAGACATGAAGAGGGTGGTGTTGAGGTCGGAGCAGTGAGC
TTTCTGGGTAGGGAGAACATCGAGACAGCGAGTAGTTGCGCCGTTTGCGAAGTGCATATC
GGCAACTTGGAGAATCTTGAACTCGCCGTTCGGACCGAACCTGAGTTTGGGACGGTGTGA
CGATGTCGGAAGAGGAGCTAGACAGAGACAGAACAGGAAGAACACGGAGGAGAACAGGGA
TGTTCTTCTTCTGGTCTTGTCCGCCATTATTACAGTACACCCC

QA 1 283 1 283
DS 



AS 1 4

CO CL2773Contig1 894 4 7 U
GAACAGTCTAAAATGCTCCAAAAACAGTAAAACCAAACATATGACTAAACTTGAAAAATA
AATGTTCCGGTTTTGACACCTTTTACAGATAACCTAAATTCAAACGTGCATGAGGGCATA
AAACACGACAATTGAATTGCCTACTGGTCACAAGGGGCTTCACAGACCCTTTAAAGAATC
TCCAGCTTTGCCTGACCTAGCATCTGTCCAAGCTTTGGCTATCGTCTTCTTCATCTCTTC
ATCTCCTCCCTCGTACATGTTCTTCATCAAGTCCATGATTCCAGCCATTGGGTCTTTCTC
TTTCTCAAGACTAGGTTTGATCTTATCTTCTTTGTAGTGTATGTCCATCCAGTTTCCCCT
CGAAGACTTGAACATTGTGATAACAATCCTCTTAGGCTTTACAAGCACCTTACACTTCTC
GGGGACAATCTCTTTGTGCAACTTGGGGATTGCACATCGGTAGTTCTTCCCTTGAACGTC
ATGGATCTTGATATCCAAAGACATCGGCTTGAACTCAGCTTCCACCTTGTTTTCATCAAC
ACCTTCCAAAGATATGTACACCTTGACTTTTTCATTGTCTTGATCCCAGCTGAACGTTCC
GAGAGTTACGTAGTTCAATGCAGGAGAAACCGGCTTAACCGAAGAAGAAACCGGTGCGGG
AACCGGTTCGACCTCTGGCTTTACATTTGAAGCGCTTGCCGACTCTCTCAGCTTCTCCAA
ATTGCAAATCTCGGAGCTGATGAGATTGAGAACACGGGATCTCTTGGCGATGTTCTGGAG
TTGTCTGAGTTCTTCCAAATCAAACCCGAGTTCTTCAGCCATTTGGTATAAATCTTTTAA
GAGTGCTCGGAGAAGGTTGCAGATTGAGAAAGTATAAATATAGAGACCAGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D679JQ U 1
AF RR2A165TF C 98
AF RR2A165JQ U 141
AF RR2D679TF C 199
BS 1 364 RR2D679JQ
BS 365 365 RR2A165JQ
BS 366 408 RR2D679JQ
BS 409 409 RR2A165JQ
BS 410 667 RR2D679JQ
BS 668 848 RR2A165JQ
BS 849 894 RR2A165TF

RD RR2D679JQ 667 0 0
GAACAGTCTAAAATGCTCCAAAAACAGTAAAACCAAACATATGACTAAACTTGAAAAATA
AATGTTCCGGTTTTGACACCTTTTACAGATAACCTAAATTCAAACGTGCATGAGGGCATA
AAACACGACAATTGAATTGCCTACTGGTCACAAGGGGCTTCACAGACCCTTTAAAGAATC
TCCAGCTTTGCCTGACCTAGCATCTGTCCAAGCTTTGGCTATCGTCTTCTTCATCTCTTC
ATCTCCTCCCTCGTACATGTTCTTCATCAAGTCCATGATTCCAGCCATTGGGTCTTTCTC
TTTCTCAAGACTAGGTTTGATCTTATCTTCTTTGTAGTGTATGTCCATCCAGTTTCCCCT
CGAAAACTTGAACATTGTGATAACAATCCTCTTAGGCTTTACAAGCACTTTACACTTCTC
GGGGACAATCTCTTTGTGCAACTTGGGGATTGCACATCGGTAGTTCTTCCCTTGAACGTC
ATGGATCTTGATATCCAAAGACATCGGCTTGAACTCAGCTTCCACCTTGTTTTCATCAAC
ACCTTCCAAAGATATGTACACCTTGACTTTTTCATTGTCTTGATCCCAGCTGAACGTTCC
GAGAGTTACGTAGTTCAATGCAGGAGAAACCGGCTTAACCGAAGAAGAAACCGGTGCGGG
AACCGGT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2A165TF 797 0 0
GATCAG
ACGTGCATGAGGGCATAAGACACGACAATTGAATTGC*TACTGGTCACAAGGGGCTTCAC
AGACCCTTTAAAGAATCTCCAGCTTTGCCTGAC*TAGCATCTGTCCAAGCTTTGGCTATC
GTCTTCTTCATCTCTTCATCTCCTCCCTCGTACATGTTCTTCATCAAGTCCATGATTCCA
GCCATTGGGTCTTTCTCTTTCTCAAGACTAGGTTTGATCTTATCTTCTTTGTAGTGTATG
TCCATCCAGTTTCCCCTCGAAGACTTGAACATTGTGATAACAATCCTCTTAGGCTTTACA
AGCACCTTACACTTCTCGGGGACAATCTCTTTGTGCAACTTGGGGATTGCACATCGGTAG
TTCTTCCCTTGAACGTCATGGATCTTGATATCCAAAGACATCGGCTTGAACTCAGCTTCC
ACCTTGTTTTCATCAACACCTTCCAAAGATATGTACACCTTGACTTTTTCATTGTCTTGA
TCCCAGCTGAACGTTCCGAGAGTTACGTAGTTCAATGCAGGAGAAACCGGCTTAACCGAA
GAAGAAACCGGTGCGGGAACCGGTTCGACCTCTGGCTTTACATTTGAAGCGCTTGCCGAC
TCTCTCAGCTTCTCCAAATTGCAAATCTCGGAGCTGATGAGATTGAGAACACGGGATCTC
TTGGCGATGTTCTGGAGTTGTCTGAGTTCTTCCAAATCAAACCCGAGTTCTTCAGCCATT
TGGTATAAATCTTTTAAGAGTGCTCGGAGAAGGTTGCAGATTGAGAAAGTATAAATATAG
AGACCAGTCCC

QA 7 797 7 797
DS 

RD RR2A165JQ 711 0 0
CTACTGGTCACAAGGGGCTTCACAGACCCTTTAAAGAATCTCCAGCTTTGCCTGACCTAG
CATCTGTCCAAGCTTTGGCTATCGTCTTCTTCATCTCTTCATCTCCTCCCTCGTACATGT
TCTTCATCAAGTCCATGATTCCAGCCATTGGGTCTTTCTCTTTCTCAAGACTAGGTTTGA
TCTTATCTTCTTTGTAGTGTATGTCCATCCAGTTTCCCCTCGAAGACTTGAACATTGTGA
TAACAATCCTCTTAGGCTTTACAAGCACCTTACACTTCTCGGGGACAATCTCTTTGTGCA
ACTTGGGGATTGCACATCGGTAGTTCTTCCCTTGAACGTCATGGATCTTGATATCCAAAG
ACATCGGCTTGAACTCAGCTTCCACCTTGTTTTCATCAACACCTTCCAAAGATATGTACA
CCTTGACTTTTTCATTGTCTTGATCCCAGCTGAACGTTCCGAGAGTTACGTAGTTCAATG
CAGGAGAAACCGGCTTAACCGAAGAAGAAACCGGTGCGGGAACCGGTTCGACCTCTGGCT
TTACATTTGAAGCGCTTGCCGACTCTCTCAGCTTCTCCAAATTGCAAATCTCGGAGCTGA
TGAGATTGAGAACACGGGATCTCTTGGCGATGTTCTGGAGTTGTCTGAGTTCTTCCAAAT
CAAACCCGAGTTCTTCAGCCATTTGGTATAAATCTTTTAAGAGTGCTC
GGA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2D679TF 652 0 0
AGCATCTGTCCAAGCTTTGGCTATCGTCTTCTTCATCTCTTCATCTCCTCCCTCGTACAT
GTTCTTCATCAAGTCCATGATTCCAGCCATTGGGTCTTTCTCTTTCTCAAGACTAGGTTT
GATCTTATCTTCTTTGTAGTGTATGTCCATCCAGTTTCCCCTCGAAGACTTGAACATTGT
GATAACAATCCTCTTAGGCTTTACAAGCACTTTACACTTCTCGGGGACAATCTCTTTGTG
CAACTTGGGGATTGCACATCGGTAGTTCTTCCCTTGAACGTCATGGATCTTGATATCCAA
AGACATCGGCTTGAACTCAGCTTCCACCTTGTTTTCATCAACACCTTCCAAAGATATGTA
CACCTTGACTTTTTCATTGTCTTGATCCCAGCTGAACGTTCCGAGAGTTACGTAGTTCAA
TGCAGGAGAAACCGGCTTAACCGAAGAAGAAACCGGTGCGGGAACCGGTTCGACCTCTGG
CTTTACATTTGAAGCGCTTGCCGACTCTCTCAGCTTCTCCAAATTGCAAATCTCGGAGCT
GATGAGATTGAGAACACGGGATCTCTTGGCGATGTTCTGGAGTTGTCTGAGTTCTTCCAA
ATCAAACCCGAGTTCTTCAGCCATTTGGTATAAATCTTTTAAGAGTGCTC
CC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 4

CO CL2774Contig1 980 4 11 U
GGGAAGCTGCCAGAAGAAGAAACTGAAAAGAAGGAAGCAAACAAGCCTCCAGAAGCGTGG
TTTGAGCTGAAAGTAAACCCACATATCTATGTCACCGGATTGCCCAAAGATGTCACGATC
GAGGAAGTGGTTGAAGTTTTTTCTAAATGCGGCATTATTAAGGAGGATGACAGTGGCAAG
CCTCGCATAAAGCTTTACAGTGACAAGGCGACAGGAGAATTAAAAGGCGATGCTCTTATC
ACGTATATGAAGGAGCCCTCAGTGGATCTTGCAATTCAAATCTTAGACGGTGCTCCTTTA
CGTCCAGCTGACAAGCTCCTCATGTCGGTTTCTCGAGCTAAGTTCGAGCAGAAAGGGGAG
AGATTTATAACAAAGCAAACCGATAACAAGAAGAAGAAAAAGATTAAAAAGGTCGAGCAA
AAGTTGCTTGGATGGGGTGGTAGAGATGATGCTAAGATCGCAATACCTGGAACTGTTGTT
CTGCGCCACATGTTCAGTCCAGCGGAGATGAGGGCTGATGAGACTCTGTGTGCCGAGGTA
GAAGAAGACGTGAAAGAAGAGAGTATGAAGCATGGACCGTTTGATTCAGTGAAGGTGTGT
GAGCTTCATCCACAGGGTGTTGTGCTTATAAGATTCAAGGATCGCAAAGATGCACAGAAA
TGTATTGATGCAATGAACGGTCGATGGTATGCAAAGAGACAGATACATGCGAGCCTTGAC
GATGGATCAGTAAACCACGCTGCGGTTCGTGACTTTGATGCGGAAGCTGAACGGTTAGAT
CAGTTTGCAGCTGAACTCGAAGCTGAATAGAAAGAAACAAAATCACAATAATTTCTTTTG
TAGAATACGTTATGTTAGTTAATAAGTTTGAGATTTAACCTATGTTTT**CATTTTTGTT
GTTGAGAAACCTAACGTTCTTTCGTGTAGCAAAACAAATACCATATCCTTATTGATACAT
AAAAAAAAAGAGATTACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2DP69TF U 1
AF RR2FD12TF U 470
AF RR2DP69JQ C 166
AF RR2BW85JQ C 294
BS 1 480 RR2DP69TF
BS 481 481 RR2FD12TF
BS 482 729 RR2DP69TF
BS 730 730 RR2FD12TF
BS 731 733 RR2DP69TF
BS 734 735 RR2FD12TF
BS 736 758 RR2DP69TF
BS 759 871 RR2FD12TF
BS 872 872 RR2DP69JQ
BS 873 960 RR2FD12TF
BS 961 980 RR2DP69JQ

RD RR2DP69TF 758 0 0
GGGAAGCTGCCAGAAGAAGAAACTGAAAAGAAGGAAGCAAACAAGCCTCCAGAAGCGTGG
TTTGAGCTGAAAGTAAACCCACATATCTATGTCACCGGATTGCCCAAAGATGTCACGATC
GAGGAAGTGGTTGAAGTTTTTTCTAAATGCGGCATTATTAAGGAGGATGACAGTGGCAAG
CCTCGCATAAAGCTTTACAGTGACAAGGCGACAGGAGAATTAAAAGGCGATGCTCTTATC
ACGTATATGAAGGAGCCCTCAGTGGATCTTGCAATTCAAATCTTAGACGGTGCTCCTTTA
CGTCCAGCTGACAAGCTCCTCATGTCGGTTTCTCGAGCTAAGTTCGAGCAGAAAGGGGAG
AGATTTATAACAAAGCAAACCGATAACAAGAAGAAGAAAAAGATTAAAAAGGTCGAGCAA
AAGTTGCTTGGATGGGGTGGTAGAGATGATGCTAAGATCGCAATACCTGGAACTGTTGTT
TTGCGCCACATGTTCAGTCCAGCGGAGATGAGGGCTGATGAGACTCTGTGTGCCGAGGTA
GAAGAAGACGTGAAAGAAGAGAGTATGAAGCATGGACCGTTTGATTCAGTGAAGGTGTGT
GAGCTTCATCCACAGGGTGTTGTGCTTATAAGATTCAAGGATCGCAAAGATGCACAGAAA
TGTATTGATGCAATGAACGGTCGATGGTATGCAAAGAGACAGATACATGCGAGCCTTGAC
GATGGATCATTAA*TCACGCTGCGGTTCGTGACTTTGA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2FD12TF 491 0 0
GAACTGTTGTTCTGCGCCATATGTTCAGTCCGGCGGAGATGAGGGCTGATGAGACTCTGT
GTGCCGAGGTAGAGGAAGACGTGAAAGAAGAGAGTATGAAGCATGGACCGTTTGATTCAG
TGAAGGTGTGCGAGCTTCATCCACAAGGTGTTGTGCTTATAAGATTCAAGGATCGCAAAG
ATGCACAGAAATGTATTGATGCAATGAACGGTCGATGGTATGCAAAGAGACAGATACATG
CGAGCCTTGACGATGGATCAGTAAACCACGCTGCGGTTCGTGACTTTGATGCGGAAGCTG
AACGGTTAGATCAGTTTGCAGCTGAACTCGAAGCTGAATAGAAAGAAACAAAATCACAAT
AATTTCTTTTGTAGAATACGTTATGTTAGTTAATAAGTTTGAAATTTAACCTATGTTTT*
*CATTTTTGTTGTTGAGAAACCTAACGTTCTTTCGTGTAGCAAAACAAATACCATATCCT
TATTGATACAT

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2DP69JQ 815 0 0
GATGACAGTGGCAAGCCTCGCATAAAGCTTTACAGTGACAAGGCGACAGGAGAATTAAAA
GGCGATGCTCTTATCACGTATATGAAGGAGCCCTCAGTGGATCTTGCAATTCAAATCTTA
GACGGTGCTCCTTTACGTCCAGCTGACAAGCTCCTCATGTCGGTTTCTCGAGCTAAGTTC
GAGCAGAAAGGGGAGAGATTTATAACAAAGCAAACCGATAACAAGAAGAAGAAAAAGATT
AAAAAGGTCGAGCAAAAGTTGCTTGGATGGGGTGGTAGAGATGATGCTAAGATCGCAATA
CCTGGAACTGTTGTTTTGCGCCACATGTTCAGTCCAGCGGAGATGAGGGCTGATGAGACT
CTGTGTGCCGAGGTAGAAGAAGACGTGAAAGAAGAGAGTATGAAGCATGGACCGTTTGAT
TCAGTGAAGGTGTGTGAGCTTCATCCACAGGGTGTTGTGCTTATAAGATTCAAGGATCGC
AAAGATGCACAGAAATGTATTGATGCAATGAACGGTCGATGGTATGCAAAGAGACAGATA
CATGCGAGCCTTGACGATGGATCATTAAATCACGCTGCGGTTCGTGACTTTGATGCGGAA
GCTGAACGGTTAGATCAGTTTGCAGCTGAACTCGAAGCTGAATAGAAAGAAACAAAATCA
CAATAATTTCTTTTGTAGAATACGTTATGTTAGTTAATAAGTTTGAGATTTAACCTATGT
TTT**CATTTTTGTTGTTGAGAAACCTAACGTTCTTTCGTGTAGCAAAACAAATACCATG
TCCTTATTGATACATAAAAAAAAAGAGATTACATC

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR2BW85JQ 687 0 0
TCCTTTACGTCCAACTGACAAGCTCCTCATGTCAGTTTCTCGAGCTAAGTTCGAGCAGAA
AGGGGAGAGATTTATAACAAAGCAAACCGATAACAAGAAGAAGAAAAAGATTAAAAAGGT
CGAGCAAAAGTTGCTTGGATGGGGTGGTAGAGATGATGCCAAGATCGCAATACCCGGAAC
TGTTGTTCTGCGCCACATGTTCAGTCCGGCGGAGATGAGGGCTGATGAGACTCTGTGTGC
TGAGGTAGAGGAAGACGTGAAAGAAGAGAGTATGAAGCATGGACCGTTTGATTCAGTGAA
GGTGTGTGAGCTTCATCCACAGGGTGTTGTGCTTATAAGATTCAAGGATCGCAAAGATGC
ACAGAAATGTATTGATGCAATGAACGGTCGATGGTATGCAAAGAGACAGATACATGCGAG
CCTTGACGATGGATCAGTAAACCACGCTGCGGTTCGTGACTTTGATGCGGAAGCTGAACG
GTTAGATCAGTTTGCAGCTGAACTCGAAGCTGAATAGAAAGAAACAAAATCACAATAATT
TCTTTTGTAGAATACGTTATGTTAGTTAATAAGTTTGAGATTTAACCTATGTTTTTTCAC
TTTTGTTGTTGAGAAACCTAACGTTCTTTCGTGTAGTAAAACAAATACCATATCCTTATT
GATACATAAAAGAAAAGAGATTACATC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 4

CO CL2775Contig1 864 4 2 U
CGACCAATGTTTCTTTAGTATGCATGAAAAACTTGGCTTATTGTGTTCCAAGTACATTCA
AAAGAATTTATAAGCTTGTGGACATAGTGATTGAAAAAACAAAACACATAAAATGAAGAA
GAGCAACGATGTTCACATGTCTAACATTCAAACGGATGAGATAATATATATATGTAGTTA
AATGTTTCCAAAAGAGAATTAAGAAGAGCAGCAGCCTGATTGCTGGTTTACAGGTTGTCC
TCGGATCTGGACGGTTGCTGGCTTGGATCCTCCTGAAGGATTACTCGCCATTCTTGTCTT
GATAGCAGCAGTCATGGCCATGAAAGCTTCTTCGACATTAGTAGCGTTCTTGGCACTTGT
CTCCAAGAACGGGATCCCAAGTTCATCTGCAAAAGCCTTGGCAGTTTCGGTGGATACAAC
TTTCTGTGAAGTGAGATCGTTTTTGTTCCCAACAAGTAGCTTGTTCACATTCTCACTGGC
GTAGCGGTCTATTTCATTTAGCCATTGCTTGACATTGTTGAAGCTCTCTTGGTCTGTTAC
ATCATAAGTCACAATAATCCCATGAGCTCCTCTGTAGTAACTGCTGGTGATCGTTCTGAA
ACGCTCTTGACCTGCCGTGTCCCAAATCTGGAGTTTGATGGTCTTTCCATCTTGTTCAAC
AGTGCGGATTTTAAAGTCAACACCAATGGTGCTGATGTAGCTATCCAGGTAGGAATCATC
AGCAAACCTTAGAAGCAAGCATGATTTGCCAACACCAGAATCACCGATTAGCAAAAGCTT
AAACAGATAGTCATATTCAGGATTCATGGGGAGAGGAGATTCCGCCGATCTTTCGTCGGT
GAGAAGCGCGATTCAGAGACGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2EK52JQ U 1
AF RR2EK52TF C 53
AF RR2B419JQ U 92
AF RR2B419TF C 92
BS 1 775 RR2EK52JQ
BS 776 864 RR2B419JQ

RD RR2EK52JQ 778 0 0
CGACCAATGTTTCTTTAGTATGCATGAAAAACTTGGCTTATTGTGTTCCAAGTACATTCA
AAAGAATTTATAAGCTTGTGGACATAGTGATTGAAAAAACAAAACACATAAAATGAAGAA
GAGCAACGATGTTCACATGTCTAACATTCAAACGGATGAGATAATATATATATGTAGTTA
AATGTTTCCAAAAGAGAATTAAGAAGAGCAGCAGCCTGATTGCTGGTTTACAGGTTGTCC
TCGGATCTGGACGGTTGCTGGCTTGGATCCTCCTGAAGGATTACTCGCCATTCTTGTCTT
GATAGCAGCAGTCATGGCCATGAAAGCTTCTTCGACATTAGTAGCGTTCTTGGCACTTGT
CTCCAAGAACGGGATCCCAAGTTCATCTGCAAAAGCCTTGGCAGTTTCGGTGGATACAAC
TTTCTGTGAAGTGAGATCGTTTTTGTTCCCAACAAGTAGCTTGTTCACATTCTCACTGGC
GTAGCGGTCTATTTCATTTAGCCATTGCTTGACATTGTTGAAGCTCTCTTGGTCTGTTAC
ATCATAAGTCACAATAATCCCATGAGCTCCTCTGTAGTAACTGCTGGTGATCGTTCTGAA
ACGCTCTTGACCTGCCGTGTCCCAAATCTGGAGTTTGATGGTCTTTCCATCTTGTTCAAC
AGTGCGGATTTTAAAGTCAACACCAATGGTGCTGATGTAGCTATCCAGGTAGGAATCATC
AGCAAACCTTAGAAGCAAGCATGATTTGCCAACACCAGAATCACCGATTAGCAAA
GCT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2EK52TF 812 0 0
AGTACATC
AAAGAATTTATAAGCT*GTGGACATAGTGAT*GAAAAAC**AAACACATAAAATGAAGAA
GAGCAACGATGTTCACATGTCTAACATTCAAACGGATGAGATAATATATATATGTAGTTA
AATGTTTCCAAAAGAGAATTAAGAAGAGCAGCAGC*TGATTGCTGGTTTACAGGTTGTCC
TCGGATCTGGACGGTTGCTGGCTTGGATCCTCCTGAAGGATTACTCGCCATTCTTGTCTT
GATAGCAGCAGTCATGGCCATGAAAGCTTCTTCGACATTAGTAGCGTTCTTGGCACTTGT
CTCCAAGAACGGGATCCCAAGTTCATCTGCAAAAGCCTTGGCAGTTTCGGTGGATACAAC
TTTCTGTGAAGTGAGATCGTTTTTGTTCCCAACAAGTAGCTTGTTCACATTCTCACTGGC
GTAGCGGTCTATTTCATTTAGCCATTGCTTGACATTGTTGAAGCTCTCTTGGTCTGTTAC
ATCATAAGTCACAATAATCCCATGAGCTCCTCTGTAGTAACTGCTGGTGATCGTTCTGAA
ACGCTCTTGACCTGCCGTGTCCCAAATCTGGAGTTTGATGGTCTTTCCATCTTGTTCAAC
AGTGCGGATTTTAAAGTCAACACCAATGGTGCTGATGTAGCTATCCAGGTAGGAATCATC
AGCAAACCTTAGAAGCAAGCATGATTTGCCAACACCAGAATCACCGATTAGCAAAAGCTT
AAACGGATAGTCATATTCAGGATTCATGGGGAGAGGAGATTCCGCCGATCTTTCGTCGGT
GAGAAGCGCGATTCAGAGACGTCC

QA 9 812 9 812
DS 

RD RR2B419JQ 773 0 0
GGAAAAAACA
AAACACATAAAATGAAGAAGAGCAACGATGTTCACATGTCTAACATTCAAACGGATGAGA
TAATATATATATGTAGTTAAATGTTTCCAAAAGAGAATTAAGAAGAGCAGCAGCCTGATT
GCTGGTTTACAGGTTGTCCTCGGATCTGGACGGTTGCTGGCTTGGATCCTCCTGAAGGAT
TACTCGCCATTCTTGTCTTGATAGCAGCAGTCATGGCCATGAAAGCTTCTTCGACATTGG
TAGCGTTCTTGGCACTTGTCTCCAAGAACGGGATCCCAAGTTCATCTGCAAAAGCCTTGG
CAGTTTCGGTGGATACAACTTTCTGTGAAGTGAGATCGTTTTTGTTCCCAACAAGTAGCT
TGTTCACATTCTCACTGGCGTAGCGGTCTATTTCATTTAGCCATTGCTTGACATTGTTGA
AGCTCTCTTGGTCTGTTACATCATAAGTCACAATAATCCCATGAGCTCCTCTGTAGTAAC
TGCTGGTGATCGTTCTGAAACGCTCTTGACCTGCCGTGTCCCAAATCTGGAGTTTGATGG
TCTTTCCATCTTGTTCAACAGTGCGGATTTTAAAGTCAACACCAATGGTGCTGATGTAGC
TATCCAGGTAGGAATCATCAGCAAACCTTAGAAGCAAGCATGATTTGCCAACACCAGAAT
CACCGATTAGCAAAAGCTTAAACAGATAGTCATATTCAGGATTCATGGGGAGAGGAGATT
CCGCCGATCTTTCGTCGGTGAGAAGCGCGATTCAGAGACGTCC

QA 11 773 11 773
DS 

RD RR2B419TF 773 0 0
GGAAAAAACA
AAACACATAAAATGAAGAAGAGCAACGATGTTCACATGTCTAACATTCAAACGGATGAGA
TAATATATATATGTAGTTAAATGTTTCCAAAAGAGAATTAAGAAGAGCAGCAGCCTGATT
GCTGGTTTACAGGTTGTCCTCGGATCTGGACGGTTGCTGGCTTGGATCCTCCTGAAGGAT
TACTCGCCATTCTTGTCTTGATAGCAGCAGTCATGGCCATGAAAGCTTCTTCGACATTGG
TAGCGTTCTTGGCACTTGTCTCCAAGAACGGGATCCCAAGTTCATCTGCAAAAGCCTTGG
CAGTTTCGGTGGATACAACTTTCTGTGAAGTGAGATCGTTTTTGTTCCCAACAAGTAGCT
TGTTCACATTCTCACTGGCGTAGCGGTCTATTTCATTTAGCCATTGCTTGACATTGTTGA
AGCTCTCTTGGTCTGTTACATCATAAGTCACAATAATCCCATGAGCTCCTCTGTAGTAAC
TGCTGGTGATCGTTCTGAAACGCTCTTGACCTGCCGTGTCCCAAATCTGGAGTTTGATGG
TCTTTCCATCTTGTTCAACAGTGCGGATTTTAAAGTCAACACCAATGGTGCTGATGTAGC
TATCCAGGTAGGAATCATCAGCAAACCTTAGAAGCAAGCATGATTTGCCAACACCAGAAT
CACCGATTAGCAAAAGCTTAAACAGATAGTCATATTCAGGATTCATGGGGAGAGGAGATT
CCGCCGATCTTTCGTCGGTGAGAAGCGCGATTCAGAGACGTCC

QA 11 773 11 773
DS 



AS 1 4

CO CL2776Contig1 1156 4 7 U
TTTTTCTTTGGTTCTTTATATTTAGAGATCTCCTTTTTCTTCCCTCTCCTCTGTTTCTCT
CTTCCGTCATCAATAACAAAACTCAGACCGAGGAAAAACACTTAAAAACTGAAACTTTGA
TGGTCGGAAACTAATGACTCCGGTTCTCTGCGAAATCTTGCTCTCTGGGCTCACGGTTAA
ATCTGCTCTCCGCCGTAGAACCCATCTCGTTCAATCATTCTCAGTCGTCTTCCTCTACTG
GTTTTACAACGTTTCATGAATTGCTGAAAACCCTCAAATCTAATCCTTAAATTAAATTAG
TTTACATCTTATTAATTATTTTCAGAATTCAGACAATTTAAAAAAACCCACAAAAGATTT
GTCTTTTTTTTATTTTTTGTTCTTGTAATTTTCTTTTTTAAACCTTTTTGCGACGGAGTA
TAATGGCGTCATCAATCAGTACGTACCGGAGCTCTAGCTCTTCCGACGGCGGTAATCCGA
ACGCCGTCGCCGTCGACGAGCGAAAGCGTAAGAGAATGTTATCGAATCGCGAGTCTGCTC
GTAGATCAAGGATGCGTAAACAAAAACACATCGACGATCTAACGGCTCAGATCAACCAGC
TTTCAAGCGACAACCGTCAGATCTTGACGAGCCTCACCGTCACATCTCAGCTTCACATGA
AGATCCAAGCCGAGAACTCCATTCTAACGGCTCAGATGGCAGAGCTGAGCTCTAGACTCG
AGTCTTTAAACGAGATCGTCGATCTCGTGACGACGACGAACGGTGCAGGGTTCGGTGGCG
GTGTCGATCTGATCGACGGCTGTGGATTCGATGATCGTACGGTTGGGATTAGTAGCGACG
GATATTACGATGATATGATGAACGGCGTTAATCACTGGGGTGGTTCGGTTTATTATTCTA
ACCAGCCCATCATGGCTAATGATATCAATATGTATTAAATTAAAATTAATTATGAAACTA
GTATTATTGCCCGTCTATTATTTTTAAGTTTAGCTTTTTATGTTCTTGTGTTTGGTGTGG
AGATGTAATATTTGCATATGCTGCATATGCATCCTGATTGGTTGGAAGGGATAAATAAAC
TTTATATAAATAGGCTGTCATGTGTCATGTATTGTTGTGTGATTTTTGTTAATTAATAAT
ATAAATTTCTTAAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU45TF U 1
AF RR2A206TF U 240
AF RR2DU45JQ C 648
AF RR2A206JQ C 295
BS 1 552 RR2DU45TF
BS 553 553 RR2A206TF
BS 554 590 RR2DU45TF
BS 591 591 RR2A206TF
BS 592 689 RR2DU45TF
BS 690 1067 RR2A206TF
BS 1068 1156 RR2A206JQ

RD RR2DU45TF 693 0 0
TTTTTCTTTGGTTCTTTATATTTAGAGATCTCCTTTTTCTTCCCTCTCCTCTGTTTCTCT
CTTCCGTCATCAATAACAAAACTCAGACCGAGGAAAAACACTTAAAAACTGAAACTTTGA
TGGTCGGAAACTAATGACTCCGGTTCTCTGCGAAATCTTGCTCTCTGGGCTCACGGTTAA
ATCTGCTCTCCGCCGTAGAACCCATCTCGTTCAATCATTCTCAGTCGTCTTCCTCTACTG
GTTTTACAACGTTTCATGAATTGCTGAAAACCCTCAAATCTAATCCTTAAATTAAATTAG
TTTACATCTTATTAATTATTTTCAGAATTCAGACAATTTAAAAAAACCCACAAAAGATTT
GTCTTTTTTTTATTTTTTGTTCTTGTAATTTTCTTTTTTAAACCTTTTTGCGACGGAGTA
TAATGGCGTCATCAATCAGTACGTACCGGAGCTCTAGCTCTTCCGACGGCGGTAATCCGA
ACGCCGTCGCCGTCGACGAGCGAAAGCGTAAGAGAATGTTATCGAATCGCGAGTCTGCTC
GTAGATCAAGGACGCGTAAACAAAAACACATCGACGATCTAACGGCTCAGGTCAACCAGC
TTTCAAGCGACAACCGTCAGATCTTGACGAGCCTCACCGTCACATCTCAGCTTCACATGA
AGATCCAAGCCGAGAACTCCATTCTAACG
CTCA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2A206TF 828 0 0
GGTTTTACAACGTTTCATGAATTGCTGAAAACCCTCAAATCTAATCCTTAAATTAAATTA
GTTTACATCTTATTAATTATTTTCAGAATTCAGACAATTTAAAAAAACCCACAAAAGATT
TGTCTTTTTTTTATTTTTTGTTCTTGTAATTTTCTTTTTTAAACCTTTTTGCGACGGAGT
ATAATGGCGTCATCAATCAGTACGTACCGGAGCTCTAGCTCTTCCGACGGCGGTAATCCG
AACGCCGTCGCCGTCGACGAGCGAAAGCGTAAGAGAATGTTATCGAATCGCGAGTCTGCT
CGTAGATCAAGGATGCGTAAACAAAAACACATCGACGATCTAACGGCTCAGATCAACCAG
CTTTCAAGCGACAACCGTCAGATCTTGACGAGCCTCACCGTCACATCTCAGCTTCACATG
AAGATCCAAGCCGAGAACTCCATTCTAACGGCTCAGATGGCAGAGCTGAGCTCTAGACTC
GAGTCTTTAAACGAGATCGTCGATCTCGTGACGACGACGAACGGTGCAGGGTTCGGTGGC
GGTGTCGATCTGATCGACGGCTGTGGATTCGATGATCGTACGGTTGGGATTAGTAGCGAC
GGATATTACGATGATATGATGAACGGCGTTAATCACTGGGGTGGTTCGGTTTATTATTCT
AACCAGCCCATCATGGCTAATGATATCAATATGTATTAAATTAAAATTAATTATGAAACT
AGTATTATTGCCCGTCTATTATTTTTAAGTTTAGCTTTTTATGTTCTTGTGTTTGGTGTG
GAGATGTAATATTTGCATATGCTGCATATGCATCCTGATTGGTTGGAA

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2DU45JQ 412 0 0
CAGCTTCACATGAAGATCCAAGCCGAGAACTCCATTCTAACGGCTCAGATGGCAGAGCTG
AGCTCTAGACTCGAGTCTTTAAACGAGATCGTCGATCTCGTGACGACGACGAACGGTGCA
GGGTTCGGTGGCGGTGTCGATCTGATCGACGGCTGTGGATTCGATGATCGTACGGTTGGG
ATTAGTAGCGACGGATATTACGATGATATGATGAACGGCGTTAATCACTGGGGTGGTTCG
GTTTATTATTCTAACCAGCCCATCATGGCTAATGATATCAATATGTATTAAATTAAAATT
AATTATGAAACTAGTATTATTGCCCGTCTATTATTTTTAAGTTTAGCTTTTTATGTTCTT
GTGTTTGGTGTGGAGATGTAATATTTGCATATGCTGCATATGCATCCTGATT

QA 1 412 1 412
DS 

RD RR2A206JQ 862 0 0
AATTAGTTTACATCTTATTAATTATTTTCAGAATTCAGACAATTTAAAAAAACCCACAAA
AGATTTGTCTTTTTTTTATTTTTTGTTCTTGTAATTTTCTTTTTTAAACCTTTTTGCGAC
GGAGTATAATGGCGTCATCAATCAGTACGTACCGGAGCTCTAGCTCTTCCGACGGCGGTA
ATCCGAACGCCGTCGCCGTCGACGAGCGAAAGCGTAAGAGAATGTTATCGAATCGCGAGT
CTGCTCGTAGATCAAGGATGCGTAAACAAAAACACATCGACGATCTAACGGCTCAGATCA
ACCAGCTTTCAAGCGACAACCGTCAGATCTTGACGAGCCTCACCGTCACATCTCAGCTTC
ACATGAAGATCCAAGCCGAGAACTCCATTCTAACGGCTCAGATGGCAGAGCTGAGCTCTA
GACTCGAGTCTTTAAACGAGATCGTCGATCTCGTGACGACGACGAACGGTGCAGGGTTCG
GTGGCGGTGTCGATCTGATCGACGGCTGTGGATTCGATGATCGTACGGTTGGGATTAGTA
GCGACGGATATTACGATGATATGATGAACGGCGTTAATCACTGGGGTGGTTCGGTTTATT
ATTCTAACCAGCCCATCATGGCTAATGATATCAATATGTATTAAATTAAAATTAATTATG
AAACTAGTATTATTGCCCGTCTATTATTTTTAAGTTTAGCTTTTTATGTTCTTGTGTTTG
GTGTGGAGATGTAATATTTGCATATGCTGCATATGCATCCTGATTGGTTGGAAGGGATAA
ATAAACTTTATATAAATAGGCTGTCATGTGTCATGTATTGTTGTGTGATTTTTGTTAATT
AATAATATAAATTTCTTAAACG

QA 1 862 1 862
DS 



AS 1 4

CO CL2777Contig1 886 4 7 U
GGGTCATCCAGTTCCTGTCATTACATTAAAGATGGAGAAGACTATGATGTGTGGTCTCGC
AGAATCACACACCCACTTCGTCTCTACTTCCATGGCTACTCCTTTAGCCGCTCCTCTTTT
CTCTCCTTTAGCTCTTTCAACAGCAAGAAACCGCCGTTCATATCCCAAGATCCGATTCCA
GTCGAACAATGGGAACACTTTCGCATCCAATGGACTCCAGAAGCTAAATCTATCGAAATG
TAGTAAACTAGATGGACAAAGGAGTAAGTTCCTGCAAATGGGTTCTCAAGAGATGACTTC
CGGGAGAAAACTCTCAGTTCAGGCCGTAGATGGTGCAGGGACAGGGAACACATCAACGAT
CTCTAGTAACGTGTTGGCGATAGCGCACTTGTTGGTGTCACTTGGGATCATACTAGCGGC
AGACCAGTTCTTGAAAAAGGCTTTTGTAGCGGCGTCCATAAAGTTCCCAAGCGCTTTGTT
TGGGATGTTTTGTATTTTCTCTGTTCTTATGATACTAGATTCAGTTGTCCCAGCTGCTGC
AAACGGTATGATGAACTTCTTCGAGCCTGCGTTTCTGTTCATCCAGAGATGGCTTCCTTT
GTTCTACGTTCCTTCTCTTGTCGTTCTCCCTCTTTCCGTTAGAGATATTCCAGCTGCTTC
GGGCCTCAAAATCTGCTACATTGTAGCTGGTGGATGGTTGGCGTCTCTTTGTGTAGCAGG
*TACACAGCTATAGCAGTGAGAAAA*TGGTGAACACCGAGATGACGGAAGCTGAGCCCAT
GGCAAAACCTTCTCCATTCTCAACATTTGAGCTATGGAGCTGGAGTGGAATCTTTGTTGC
GTCGTTTGTTGGTGCTCTCTTTTACCCTGCTTCGTTGGGGACAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI41TF U 1
AF RR2EU71TF U 54
AF RR2EX63TF U 51
AF RR2AN16TF U 57
BS 1 568 RR2GI41TF
BS 569 569 RR2EX63TF
BS 570 657 RR2GI41TF
BS 658 768 RR2EX63TF
BS 769 769 RR2EU71TF
BS 770 786 RR2EX63TF
BS 787 886 RR2AN16TF

RD RR2GI41TF 657 0 0
GGGTCATCCAGTTCCTGTCATTACATTAAAGATGGAGAAGACTATGATGTGTGGTCTCGC
AGAATCACACACCCACTTCGTCTCTACTTCCATGGCTACTCCTTTAGCCGCTCCTCTTTT
CTCTCCTTTAGCTCTTTCAACAGCAAGAAACCGCCGTTCATATCCCAAGATCCGATTCCA
GTCGAACAATGGGAACACTTTCGCATCCAATGGACTCCAGAAGCTAAATCTATCGAAATG
TAGTAAACTAGATGGACAAAGGAGTAAGTTCCTGCAAATGGGTTCTCAAGAGATGACTTC
CGGGAGAAAACTCTCAGTTCAGGCCGTAGATGGTGCAGGGACAGGGAACACATCAACGAT
CTCTAGTAACGTGTTGGCGATAGCGCACTTGTTGGTGTCACTTGGGATCATACTAGCGGC
AGACCAGTTCTTGAAAAAGGCTTTTGTAGCGGCGTCCATAAAGTTCCCAAGCGCTTTGTT
TGGGATGTTTTGTATTTTCTCTGTTCTTATGATACTAGATTCAGTTGTCCCAGCTGCTGC
AAACGGTATGATGAACTTCTTCGAGCCTTCGTTTCTGTTCATCCAGAGATGGCTTCCTTT
GTTCTACGTTCCTTCTCTTGTCGTTCTCCCTCTTTCCGTTAGAGATATTCCAGCTGC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2EU71TF 735 0 0
GGCTC
GCAGAATCACACACCCACTTCGTCTCTACTTCCATGGCTACTCCTTTAGCCGCTCCTCTT
TTCTCTCCTTTAGCTCTTTCAACAGCAAGAAACCGCCGTTCATATCCCAAGATCCGATTC
CAGTCGAACAATGGGAACACTTTCGCATCCAATGGACTCCAGAAGCTAAATCTATCGAAA
TGTAGTAAACTAGATGGACAAAGGAGTAAGTTCCTGCAAATGGGTTCTCAAGAGATGACT
TCAGGGAGAAAACTCTCAGTTCAGGCCGTAGATGGTGCAGGGACAGGGAACACATCAACG
ATCTCTAGTAACGTGTTGGCGATAGCGCACTTGTTGGTGTCACTTGGGATCATACTAGCG
GCAGACCAGTTCTTGAAAAAGGCTTTTGTAGCGGCGTCCATAAAGTTCCCAAGCGCTTTG
TTTGGGATGTTTTGTATTTTCTCTGTTCTTATGATACTAGATTCAGTTGTCCCAGCTGCT
GCAAACGGTATGATGAACTTCTTCGAGCCTGCGTTTCTGTTCATCCAGAGATGGCTTCCT
TTGTTCTACGTTCCTTCTCTTGTCGTTCTCCCTCTTTCCGTTAGAGATATTCCAGCTGCT
TCGGGCCTCAAAATCTGCTACATTGTAGCTGGTGGATGGTTGGCGTCTCTTTGTGTAGCA
GG*TACACAGCTATAGCAGTGAGAAAA*TTGTGAACACCGAGATGGCGGAAGCTGAGCC
ATGGCAAACCT

QA 6 724 6 724
DS 

RD RR2EX63TF 738 0 0
GGGGTCTC
GCAGAATCACACACCCACTTCGTCTCTACTTCCATGGCTACTCCTTTAGCCGCTCCTCTT
TTCTCTCCTTTAGCTCTTTCAACAGCAAGAAACCGCCGTTCATATCCCAAGATCCGATTC
CAGTCGAACAATGGGAACACTTTCGCATCCAATGGACTCCAGAAGCTAAATCTATCGAAA
TGTAGTAAACTAGATGGACAAAGGAGTAAGTTCCTGCAAATGGGTTCTCAAGAGATGACT
TCCGGGAGAAAACTCTCAGTTCAGGCCGTAGATGGTGCAGGGACAGGGAACACATCAACG
ATCTCTAGTAACGTGTTGGCGATAGCGCACTTGTTGGTGTCACTTGGGATCATACTAGCG
GCAGACCAGTTCTTGAAAAAGGCTTTTGTAGCGGCGTCCATAAAGTTTCCAAGCGCTTTG
TTTGGGATGTTTTGTATTTTCTCTGTTCTTATGATACTAGATTCAGTTGTCCCAGCTGCT
GCAAACGGTATGATGAACTTCTTCGAGCCTGCGTTTCTGTTCATCCAGAGATGGCTTCCT
TTGTTCTACGTTCCTTCTCTTGTCGTTCTCCCTCTTTCCGTTAGAGATATTCCAGCTGCT
TCGGGCCTCAAAATCTGCTACATTGTAGCTGGTGGATGGTTGGCGTCTCTTTGTGTAGCA
GG*TACACAGCTATAGCAGTGAGAAAA*TGGTGAACACCGAGATGACGGA*GCTGAGCCC
ATGGCAAA
CC

QA 9 736 9 736
DS 

RD RR2AN16TF 830 0 0
GG
GCAGAATCACACACCCACTTCGTCTCTACTTCCATGGCTACTCCTTTAGCCGCTCCTCTT
TTCTCTCCTTTAGCTCTTTCAACAGCAAGAAACCGCCGTTCATATCCCAAGATCCGATTC
CAGTCGAACAATGGGAACACTTTCGCATCCAATGGACTCCAGAAGCTAAATCTATCGAAA
TGTAGTAAACTAGATGGACAAAGGAGTAAGTTCCTGCAAATGGGTTCTCAAGAGATGACT
TCCGGGAGAAAACTCTCAGTTCAGGCCGTAGATGGTGCAGGGACAGGGAACACATCAACG
ATCTCTAGTAACGTGTTGGCGATAGCGCACTTGTTGGTGTCACTTGGGATCATACTAGCG
GCAGACCAGTTCTTGAAAAAGGCTTTTGTAGCGGCGTCCATAAAGTTCCCAAGCGCTTTG
TTTGGGATGTTTTGTATTTTCTCTGTTCTTATGATACTAGATTCAGTTGTCCCAGCTGCT
GCAAACGGTATGATGAACTTCTTCGAGCCTGCGTTTCTGTTCATCCAGAGATGGCTTCCT
TTGTTCTACGTTCCTTCTCTTGTCGTTCTCCCTCTTTCCGTTAGAGATATTCCAGCTGCT
TCGGGCCTCAAAATCTGCTACATTGTAGCTGGTGGATGGTTGGCGTCTCTTTGTGTAGCA
GGGTACACAGCTATAGCAGTGAGAAAAATGGTGAACACCGAGATGACGGAAGCTGAGCCC
ATGGCAAAACCTTCTCCATTCTCAACATTTGAGCTATGGAGCTGGAGTGGAATCTTTGTT
GCGTCGTTTGTTGGTGCTCTCTTTTACCCTGCTTCGTTGGGGACAAGT

QA 3 830 3 830
DS 



AS 1 4

CO CL2778Contig1 1085 4 18 U
GGATATCCAGAAAAAAGAAAAGAAAAATGGAGTCATCATCATCATCATCATCATCATCAG
TAAAACCCAATCCTTTCCTCACCTTCCTTCACCACCACTGTAACCGCTTCACCTCCGACC
TTTCCTCCCGTTTCCAAGACACCACCAAACGTTTCGCCGAATCCCTCACCACTCGACGTT
TCTCTCTTATTATTCCTCCTCCGCCTCCTTTCGCCTCCGTCTCGCAATCCTCCTCCAAGC
CTTCGACGACTTTGAATCCATCTCACGTCGCTAAAGCTCTAGCTGGAACCTCGGTGTTTA
CGGTTAGCAACACTAACAACGAGTTCGTGCTCATCTCGGATCCTACGGGAGACAAGTCCA
TCGGTTTGCTCTGTTTCCGACAAGAGGATGCTGAAGCTCTTCTTGCTCAGGCGCGTCTGC
GGAGAAGAGGACTGAAAACCAATGCGAAGGTTGTCCCCATTAATCTTGACCAGGTGTACT
TGTTAAAAGTTGAGGGGATTTCTTTTCGCTTCTTGCCGGATCCTATCCAAATAAAGAATG
CATTGGATCTCAAGTCCTCTAGTAGTAAGAATGGGTTTGATGGAGTTCCGGTTTTCCAGT
CTGAGCTTCTTGTTGTGAGGAAGAAAAATAAACGCTACTGCCCTGTATATTTCAGTAAGG
AAGATATAGAGAGGGAACTACTTCCAAAGTATTCAAGAGCATCAAGAGGAGATCAACAAA
TCATGGTTGGAAGTTTGGAAGATGTCTTGAGGAAAATGGAGAGGAGCGAGAAGAATTCAG
GTTGGGAAGATGTGATATTCATTCCACCAGGAAGAAGCTATGCACAACACATGCAGGAGG
TGATCAAAGAGATAAAATGATAGCTGATGAGACACAGAGTATGTGTGTATTTTTCATTTG
ACAAAACGATTTCTCTTGAGATTTTGCAATAATATCATTTGCTTAAAGAACTCTCTTACA
CCAACCATTCACTCTTTTGGGTTATTCATACCATTCAAGGGTATGGTAGTTCAAGATGTA
ATCCATCTTTCATTAGCTTAAAACAGCAAAATATTATCCATAAGAGGTTGTGTGCACAAG
GCACC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2EH51TF U 1
AF RR2BB17TF U 3
AF RR2BB17JQ C 91
AF RR2EH51JQ C 407
BS 1 64 RR2EH51TF
BS 65 65 RR2BB17TF
BS 66 98 RR2EH51TF
BS 99 99 RR2BB17TF
BS 100 110 RR2EH51TF
BS 111 111 RR2BB17TF
BS 112 121 RR2EH51TF
BS 122 122 RR2BB17TF
BS 123 171 RR2EH51TF
BS 172 771 RR2BB17TF
BS 772 772 RR2BB17JQ
BS 773 780 RR2BB17TF
BS 781 781 RR2BB17JQ
BS 782 787 RR2BB17TF
BS 788 788 RR2BB17JQ
BS 789 812 RR2BB17TF
BS 813 948 RR2BB17JQ
BS 949 1085 RR2EH51JQ

RD RR2EH51TF 171 0 0
GGATATCCAGAAAAAAGAAAAGAAAAATGGAGTCATCATCATCATCATCATCATCATCAG
TAAA*CCCAATCCTTTCCTCACCTTCCTTCACCACCACCGTAACCGCTTCGCCTCCGACC
TCTCCTCCCGTTTCCAAGACACCACCAAACGTTTCGCCGAATCCCTCACCA

QA 1 171 1 171
DS 

RD RR2BB17TF 829 0 0
GG
ATCCAGAAAAAAGAAAAGAAAAATGGAGTCATCATCATCATCATCATCATCATCAGTAAA
ACCCAATCCTTTCCTCACCTTCCTTCACCACCACTGTAACCGCTTCACCTCCGACCTTTC
CTCCCGTTTCCAAGACACCACCAAACGTTTCGCCGAATCCCTCACCACTCGACGTTTCTC
TCTTATTATTCCTCCTCCGCCTCCTTTCGCCTCCGTCTCGCAATCCTCCTCCAAGCCTTC
GACGACTTTGAATCCATCTCACGTCGCTAAAGCTCTAGCTGGAACCTCGGTGTTTACGGT
TAGCAACACTAACAACGAGTTCGTGCTCATCTCGGATCCTACGGGAGACAAGTCCATCGG
TTTGCTCTGTTTCCGACAAGAGGATGCTGAAGCTCTTCTTGCTCAGGCGCGTCTGCGGAG
AAGAGGACTGAAAACCAATGCGAAGGTTGTCCCCATTAATCTTGACCAGGTGTACTTGTT
AAAAGTTGAGGGGATTTCTTTTCGCTTCTTGCCGGATCCTATCCAAATAAAGAATGCATT
GGATCTCAAGTCCTCTAGTAGTAAGAATGGGTTTGATGGAGTTCCGGTTTTCCAGTCTGA
GCTTCTTGTTGTGAGGAAGAAAAATAAACGCTACTGCCCTGTATATTTCAGTAAGGAAGA
TATAGAGAGGGAACTACTTCCAAAGTATTCAAGAGCATCAAGAGGAGATCAACAAATCAT
GGTTGGAAGTTTGGAAGATGTCTTGAGGAAAATGGAGAGGAGCGAGA*GAATTCAG*TTG
GGA*GATGTGATATTCATTCCACCAGGA
GAGCTATGCACACACATGC

QA 3 810 3 810
DS 

RD RR2BB17JQ 858 0 0
ACCACCACTGTAACCGCTTCACCTCCGACCTTTCCTCCCGTT*CCAAGACACCACCAAAC
GTTTCGCCGAATCCCTCACCACTCGACGTTTCTCTCTTATTATTCCTCCTCCGCCTCCTT
TCGCCTCCGTCTCGCAATCCTCCTCCAAGCCTTCGACGACTTTGAATCCATCTCACGTCG
CTAAAGCTCTAGCTGGAACCTCGGTGTTTACGGTTAGCAACACTAACAACGAGTTCGTGC
TCATCTCGGATCCTACGGGAGACAAGTCCATCGGTTTGCTCTGTTTCCGACAAGAGGATG
CTGAAGCTCTTCTTGCTCAGGCGCGTCTGCGGAGAAGAGGACTGAAAACCAATGCGAAGG
TTGTCCCCATTAATCTTGACCAGGTGTACTTGTTAAAAGTTGAGGGGATTTCTTTTCGCT
TCTTGCCGGATCCTATCCAAATAAAGAATGCATTGGATCTCAAGTCCTCTAGTAGTAAGA
ATGGGTTTGATGGAGTTCCGGTTTTCCAGTCTGAGCTTCTTGTTGTGAGGAAGAAAAATA
AACGCTACTGCCCTGTATATTTCAGTAAGGAAGATATAGAGAGGGAACTACTTCCAAAGT
ATTCAAGAGCATCAAGAGGAGATCAACAAATCATGGTTGGAAGTTTGGAAGATGTCTTGA
GGAAAATGGAGAGGAGCGAGAAGAATTCAGGTTGGGAAGATGTGATATTCATTCCACCAG
GAAGAAGCTATGCACAACACATGCAGGAGGTGATCAAAGAGATAAAATGATAGCTGATGA
GACACAGAGTATGTGTGTATTTTTCATTTGACAAAACGATTTCTCTTGAGATTTTGCAAT
AATATCATTTGCTTAAAG

QA 1 858 1 858
DS 

RD RR2EH51JQ 679 0 0
TCAGGCGCGTCTGCGGAGAAGAGAACTGAAAACCAATGCGAAGGTTGTCCCCATTAATCT
TGACCAGGTGTACTTGTTAAAAGTTGAGGGGATTTCTTTTCGCTTCTTGCCGGATCCTAT
CCAAATAAAGAATGCATTGGAGCTCAAGTCCTCTAGTAGTAAGAATGGGTTTGATGGAGT
TCCGGTTTTCCAGTCTGAGCTTCTTGTTGTGAGGAAGAAAAATAAACGCTACTGCCCTGT
ATATTTCAGTAAGGAAGATATAGAGAGGGAACTACTTTCAAAGTATTCAAGAGCATCAAG
AGGAGATCAACAAATCATGGTTGGAAGTTTGGAAGATGTCTTGAGGAAAATGGAGAGGAG
CGAGAAGAGTTCAGGTTGGGAAGATGTGATATTCATTCCACCAGGAAGAAGCTATGCACA
ACACATGCAGGAGGTGATCAAAGAGATAAGATGATAGCTGATGAGACACAGAGTATGTGT
GTATTTTTCATTTGACAAAACGATTTCTCTTGAGATTTTGCAATAATATCATTTGCTTAA
AGAACTCTCTTACACCAACCATTCACTCTTTTGGGTTATTCATACCATTCAAGGGTATGG
TAGTTCAAGATGTAATCCATCTTTCATTAGCTTAAAACAGCAAAATATTATCCATAAGAG
GTTGTGTGCACAAGGCACC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 3

CO CL2779Contig1 1263 3 11 U
GGGAGGCAGAAGAGGTGAAGAAGGAGAAGAGGAGAAATGGGGAAAACAAAGAAAGAAGAT
CTGAATCAATTTCTGATCACTCATCTCAACACCATCTACGATACTCTCCAGTTGTTCGAC
CGAACAGCGTCTCCGACAGAGGAGAAAGTGAACTGGAACGATGTTCTTCAGATGTCTGAT
CACCTCTCTAAACAAGCCACCATAGTGGGAATGCTGTGGAACGGAGGAGAAGCTCCAAAA
GCTGAATCACTTAAGGAGACTATGGAGTCTTACTTCAACGCTCTTCAAGGCTTCTTGCTT
TGTTGCCATGGTAACACTGTTGGTGCCGGCTCAACTCTTTCTTCACTCATTCATGTCTCC
GTCAAGAAGATCGTTGATTCCAGCTTCAGATTGTTGCAGGGCTCTGTCTCCTTATACGAG
GGATCATATGAGAAGGAGAAGAAGCCGTCTATTCCGCAGCTTTCGGGAGCAGTTTGGGAA
GCATGCTCGAGTTTCAAGAAGGTTCCTGCGACAAACATCACTGCCATTGGCAGGGCTATT
ACTCAGGTTGCTGTTTCCATGAAGGATGTTCTCAGGGAGATGAAAGAAGTGAAACCAGCT
GAGGCATCTGCTGATATGAACAACTCTGATGAAGATGATGACGACGACGATGATTTGGGG
AATGATCTGTCTCCTGAAGAAATGGAAGTTGCTCAAATGGTAGCTGAGCTCGTGTCTGAT
ACCATCACGGTGATAAAAGAACTCATCCGAGTTATCACGGGGATGATCAAGCTGGAGAAT
CCCAAGGATAACGGGTTTGTGGACTCGCTTGAGAAGCTGCTGAAGCTGTGTAAAGGAACC
GGAGATCAGATCGATGAGATTGGAGCTTGCGTTTATCCTCCGCAGGAGATTGTCAAGATG
AAGCAAGCGCTGAAGATAATACAAGGAAATCTAGGTGAAGTCGAGGCTGAAGTCGAGGGG
TTGAAAAATTCTTCAGAGGCGTTTACAGGAGCTTGCGGGAAGCTAAGAAGCTCGATGAAA
CACATGGAAGCTGAGCTAGACAAGAGATGTGAGGATGAAGTAGTTGTTGAAATGCAGAAT
GTTACTCTCGGCAGTTAAAGAGGGTTTGGGATTTTGCAAGGTTTTTTCAAAGTTAGATTT
TTGTGTGTGTTTATTACATCGTGGACTTTATGTTCCTGTCGGAAAGTAGCATGTGTGTGG
TCTAACGTTCATGTAATATGCATTGTTCATGAGAACTTCGTTTTGGAAATTAGATATTGT
GAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2AY54TFB U 1
AF RR2A748TF U 410
AF RR2AY54JQ C 332
BS 1 782 RR2AY54TFB
BS 783 787 RR2A748TF
BS 788 788 RR2AY54JQ
BS 789 790 RR2A748TF
BS 791 791 RR2AY54JQ
BS 792 915 RR2A748TF
BS 916 916 RR2AY54JQ
BS 917 959 RR2A748TF
BS 960 960 RR2AY54JQ
BS 961 1004 RR2A748TF
BS 1005 1263 RR2AY54JQ

RD RR2AY54TFB 782 0 0
GGGAGGCAGAAGAGGTGAAGAAGGAGAAGAGGAGAAATGGGGAAAACAAAGAAAGAAGAT
CTGAATCAATTTCTGATCACTCATCTCAACACCATCTACGATACTCTCCAGTTGTTCGAC
CGAACAGCGTCTCCGACAGAGGAGAAAGTGAACTGGAACGATGTTCTTCAGATGTCTGAT
CACCTCTCTAAACAAGCCACCATAGTGGGAATGCTGTGGAACGGAGGAGAAGCTCCAAAA
GCTGAATCACTTAAGGAGACTATGGAGTCTTACTTCAACGCTCTTCAAGGCTTCTTGCTT
TGTTGCCATGGTAACACTGTTGGTGCCGGCTCAACTCTTTCTTCACTCATTCATGTCTCC
GTCAAGAAGATCGTTGATTCCAGCTTCAGATTGTTGCAGGGCTCTGTCTCCTTATACGAG
GGATCATATGAGAAGGAGAAGAAGCCGTCTATTCCGCAGCTTTCGGGAGCAGTTTGGGAA
GCATGCTCGAGTTTCAAGAAGGTTCCTGCGACAAACATCACTGCCATTGGCAGGGCTATT
ACTCAGGTTGCTGTTTCCATGAAGGATGTTCTCAGGGAGATGAAAGAAGTGAAACCAGCT
GAGGCATCTGCTGATATGAACAACTCTGATGAAGATGATGACGACGACGATGATTTGGGG
AATGATCTGTCTCCTGAAGAAATGGAAGTTGCTCAAATGGTAGCTGAGCTCGTGTCTGAT
ACCATCACGGTGATAAAAGAACTCATCCGAGTTATCACGGGGATGATCAAGCTGGAGAAT
CC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2A748TF 597 0 0
GGGAACTA
GAGGGATCATATGAGAAGGAGAAGAAGCCGTCTATTCCGCAGCTTTCAGGAGCAGTTTGG
GAAGCATGCTCGAGTTTCAAGAAGGTTCCTGCGACAAACATCACTGCCATTGGAAGGGCT
ATTACTCAGGTTGCTGTTTCTATGAAGGATGTTCTCAGGGAGATGAAAGAAGTGAAACCA
GCTGAGGCTTCTACTGATATTAACAACTCAGATGAAGATGATGACGACGACGATGATTTA
GGGAATGATTTGTCCCCTGAAGAAATGGAAGTTGCTCAAATGGTAGCTGAGCTCGTGTCT
GATACCATCACGGTGATAAAAGAACTCATCCGAGTTATCACGGGGATGATCAAGCTGGAG
AATCCCAAGGGTAGCGGGTTTGTGGACTCGCTTGAGAAGCTGCTGAAGCTGTGTAAAGGA
ACCGGAGATCAGATCGATGAGATTGGAGCTTGCGTTTATCCTCCGCAGGAGATTGTCAAG
ATGAAGCAAGCGCTGAAGGTAATACAAGGAAATCTAGGTGAAGTCGAGGCTGAAGTCGAG
GGTTTGAAAAATTCTTCAGAGGCGTTTACAGGAGCTTGCGGGAAGCT
GA

QA 9 595 9 595
DS 

RD RR2AY54JQ 932 0 0
CAACTCTTTCTTCACTCATTCATGTCTC*GTCAAGAAGATCGTTGATTCCAGCTTCAGAT
TGTTGCAGGGCTCTGTCTC*TTATACGAGGGATCATATGAGAAGGAGAAGAAGC*GTCTA
TTCCGCAGCTTTCGGGAGCAGTTTGGGAAGCATGCTCGAGTTTCAAGAAGGTTC*TGCGA
CAAACATCACTGCCATTGGCAGGGCTATTACTCAGGTTGCTGTTTCCATGAAGGATGTTC
TCAGGGAGATGAAAGAAGTGAAACCAGCTGAGGCATCTGCTGATATGAACAACTCTGATG
AAGATGATGACGACGACGATGATTTGGGGAATGATCTGTCTCCTGAAGAAATGGAAGTTG
CTCAAATGGTAGCTGAGCTCGTGTCTGATACCATCACGGTGATAAAAGAACTCATCCGAG
TTATCACGGGGATGATCAAGCTGGAGAATCCCAAGGATAACGGGTTTGTGGACTCGCTTG
AGAAGCTGCTGAAGCTGTGTAAAGGAACCGGAGATCAGATCGATGAGATTGGAGCTTGCG
TTTATCCTCCTCAGGAGATTGTTAAGATGAAGCAAGCGCTGAAGATAATACAAGGAAATC
TAGGTGAAGTCGAGGCTGAGGTTGAGGGGTTGAAGAGTTCTTCAGAGGCGTTTACAGGAG
CTTGCGGGAAGCTAAGAAGCTCGATGAAACACATGGAAGCTGAGCTAGACAAGAGATGTG
AGGATGAAGTAGTTGTTGAAATGCAGAATGTTACTCTCGGCAGTTAAAGAGGGTTTGGGA
TTTTGCAAGGTTTTTTCAAAGTTAGATTTTTGTGTGTGTTTATTACATCGTGGACTTTAT
GTTCCTGTCGGAAAGTAGCATGTGTGTGGTCTAACGTTCATGTAATATGCATTGTTCATG
AGAACTTCGTTTTGGAAATTAGATATTGTGAC

QA 1 932 1 932
DS 



AS 1 4

CO CL2780Contig1 967 4 7 U
GGATACATTACACCCTTAAACGCTCTCTCGATTAGGTTTCCTTCTACACTTCTTCTTCAC
CAAACTCGCTCTCTCTCGTTTCGATTTTAACAATGGTTGACGCTAAACAAGTCCGCTTCA
TCGTCGGAGTTATCGGGAACGTGATCTCTTTCGGTCTCTTCTTCTCGCCAGCGCCAACGT
TTTGGAGGATCTACAAGAACAAGTCTGTTGAGGAGTTTCAGCCCTGGCCTTACGTGGCAA
CCATGATGAACTGTATGCTTTGGGTTTTCTACGGACTCCCTGTCGTTCACAAGGATAGTC
TACTTGTTACCACCATTAATGCGGTCGGCATGGGTTTCGAAGCCATCTACATTACCATCT
TCTTAATCTACTGTGGCGGCACGAAAAACATCAGGAGGAAGATTGGGCTGTACCTTGTGG
CTGAGGTTATTGCCGTTGCAGGGATTGTTTTGATTACCCTTTTCGCTATTCAAAATGCCT
TTGCCAAACAGACCTTCGTTGGTGTCATCTGCGATATCTTCAACATTGCTATGTATGGGG
CTCCTTCACTTGTCATCAAAAAAGTGATAAGGACAAGGAGTGTAGAGTACATGCCCTTTC
TGTTATCTTTCGTTAGTTTCGTTAACGCTGGGATTTGGACTGCCTACTCTTTGATCTACA
AACTCGATCTCTACGTTCTCATAAGCAATGGTCTTGGAACGACCTTGTGTGCATCTCAGC
TAATTGTTTACTTCATGTACCGCAACTCTACTCCCAAGGATGAGAGTAAAACGAAGCCGG
AGATTGAAATTCCTGGGACGGCCTGAGTTTCAAATTCTTGATGTTTGGATCTCCTCTTCT
ATACATTTTCATACACATTTGTGTATGTATTTTAGGAGTTTATCTTTGCAGCTTTTGTGT
TTTGTTTTGGTTTTAATAACATTACTTCTTTCTTCTGGATGGTTTTTTAGTCAAATATTG
ATTTGTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB44TF U 1
AF RR2CX38TF U 2
AF RR2CX38JQ C 188
AF RR2HB44JQ C 180
BS 1 106 RR2HB44TF
BS 107 107 RR2CX38TF
BS 108 694 RR2HB44TF
BS 695 724 RR2CX38TF
BS 725 765 RR2HB44JQ
BS 766 766 RR2CX38JQ
BS 767 967 RR2HB44JQ

RD RR2HB44TF 694 0 0
GGATACATTACACCCTTAAACGCTCTCTCGATTAGGTTTCCTTCTACACTTCTTCTTCAC
CAAACTCGCTCTCTCTCGTTTCGATTTTAACAATGGTTGACGCTAAGCAAGTCCGCTTCA
TCGTCGGAGTTATCGGGAACGTGATCTCTTTCGGTCTCTTCTTCTCGCCAGCGCCAACGT
TTTGGAGGATCTACAAGAACAAGTCTGTTGAGGAGTTTCAGCCCTGGCCTTACGTGGCAA
CCATGATGAACTGTATGCTTTGGGTTTTCTACGGACTCCCTGTCGTTCACAAGGATAGTC
TACTTGTTACCACCATTAATGCGGTCGGCATGGGTTTCGAAGCCATCTACATTACCATCT
TCTTAATCTACTGTGGCGGCACGAAAAACATCAGGAGGAAGATTGGGCTGTACCTTGTGG
CTGAGGTTATTGCCGTTGCAGGGATTGTTTTGATTACCCTTTTCGCTATTCAAAATGCCT
TTGCCAAACAGACCTTCGTTGGTGTCATCTGCGATATCTTCAACATTGCTATGTATGGGG
CTCCTTCACTTGTCATCAAAAAAGTGATAAGGACAAGGAGTGTAGAGTACATGCCCTTTC
TGTTATCTTTCGTTAGTTTCGTTAACGCTGGGATTTGGACTGCCTACTCTTTGATCTACA
AACTCGATCTCTACGTTCTCATAAGCAATGGTCT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2CX38TF 723 0 0
GATACATTACACCCTTAAACGCTCTCTCGATTAGGTTTCCTTCTACACTTCTTCTTCACC
AAACTCGCTCTCTCTCGTTTCGATTTTAACAATGGTTGACGCTAAACAAGTCCGCTTCAT
CGTCGGAGTTATCGGGAACGTGATCTCTTTCGGTCTCTTCTTCTCGCCAGCGCCAACGTT
TTGGAGGATCTACAAGAACAAGTCTGTTGAGGAGTTTCAGCCCTGGCCTTACGTGGCAAC
CATGATGAACTGTATGCTTTGGGTTTTCTACGGACTCCCTGTCGTTCACAAGGATAGTCT
ACTTGTTACCACCATTAATGCGGTCGGCATGGGTTTCGAAGCCATCTACATTACCATCTT
CTTAATCTACTGTGGCGGCACGAAAAACATCAGGAGGAAGATTGGGCTGTACCTTGTGGC
TGAGGTTATTGCCGTTGCAGGGATTGTTTTGATTACCCTTTTCGCTATTCAAAATGCCTT
TGCCAAACAGACCTTCGTTGGTGTCATCTGCGATATCTTCAACATTGCTATGTATGGGGC
TCCTTCACTTGTCATCAAAAAAGTGATAAGGACAAGGAGTGTAGAGTACATGCCCTTTCT
GTTATCTTTCGTTAGTTTCGTTAACGCTGGGATTTGGACTGCCTACTCTTTGATCTACAA
ACTCGATCTCTACGTTCTCATAAGCAATGGTCTTGGAACGACCTTGTGTGCATCTCAGCT
AAT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2CX38JQ 730 0 0
GATCTACAAGAACAAGTCTGTTGAGGAGTTTCAGCCCTGGCCTTACGTGGCAACCATGAT
GAACTGTATGCTTTGGGTTTTCTACGGACTCCCTGTCGTTCACAAGGATAGTCTACTTGT
TACCACCATTAATGCGGTCGGCATGGGTTTCGAAGCCATCTACATTACCATCTTCTTAAT
CTACTGTGGCGGCACGAAAAACATCAGGAGGAAGATTGGGCTGTACCTTGTGGCTGAGGT
TATTGCCGTTGCAGGGATTGTTTTGATTACCCTTTTCGCTATTCAAAATGCCTTTGCCAA
ACAGACCTTCGTTGGTGTCATCTGCGATATCTTCAACATTGCTATGTATGGGGCTCCTTC
ACTTGTCATCAAAAAAGTGATAAGGACAAGGAGTGTAGAGTACATGCCCTTTCTGTTATC
TTTCGTTAGTTTCGTTAACGCTGGGATTTGGACTGCCTACTCTTTGATCTACAAACTCGA
TCTCTACGTTCTCATAAGCAATGGTCTTGGAACGACCTTGTGTGCATCTCAGCTAATTGT
TTACTTCATGTACCGCAACTCTACTCCCAAGGATGAGAGTAAAACGAAGCCGGAGATTGA
AATTCCTGGGACGGCCTGAGTTTCAAATTCTTGATGTTTGGTTCTCCTCTTCTATACATT
TTCATACCCATTTGTGTATGTATTTTAGGAGTTTATCTTTGCAGCTTTTGTGTTTTGTTT
TGGTTTTAAT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2HB44JQ 788 0 0
G
TTTGGAGGATCTACAAGAACAAGTCTGTTGAGGAGTTTCAGCCCTGGCCTTACGTGGCAA
CCATGATGAACTGTATGCTTTGGGTTTTCTACGGACTCCCTGTCGTTCACAAGGATAGTC
TACTTGTTACCACCATTAATGCGGTCGGCATGGGTTTCGAAGCCATCTACATTACCATCT
TCTTAATCTACTGTGGCGGCACGAAAAACATCAGGAGGAAGATTGGGCTGTACCTTGTGG
CTGAGGTTATTGCCGTTGCAGGGATTGTTTTGATTACCCTTTTCGCTATTCAAAATGCCT
TTGCCAAACAGACCTTCGTTGGTGTCATCTGCGATATCTTCAACATTGCTATGTATGGGG
CTCCTTCACTTGTCATCAAAAAAGTGATAAGGACAAGGAGTGTAGAGTACATGCCCTTTC
TGTTATCTTTCGTTAGTTTCGTTAACGCTGGGATTTGGACTGCCTACTCTTTGATCTACA
AACTCGATCTCTACGTTCTCATAAGCAATGGTCTTGGAACGACCTTGTGTGCATCTCAGC
TAATTGTTTACTTCATGTACCGCAACTCTACTCCCAAGGATGAGATTAAAACGAAGCCGG
AGATTGAAATTCCTGGGACGGCCTGAGTTTCAAATTCTTGATGTTTGGATCTCCTCTTCT
ATACATTTTCATACACATTTGTGTATGTATTTTAGGAGTTTATCTTTGCAGCTTTTGTGT
TTTGTTTTGGTTTTAATAACATTACTTCTTTCTTCTGGATGGTTTTTTAGTCAAATATTG
ATTTGTC

QA 2 788 2 788
DS 



AS 1 4

CO CL2781Contig1 697 4 7 U
TTTTTTTTTAACACGAAACAACAACATATTCCATAAGTAGCTGATGTAAATAGTAGCGGC
TTTTGTAGCAACAAACACCAGATAAACCACCACATATAATTTGGTAAAAGCCATAGTGAA
ACAACTTAAAGTCTGACATATAGAAGTTAAAGGAACAAGATAACAGTAACCGACTTTTTA
TTCTTCCCATTCATAGAGAGCGGCAGTGGTGGAAAACATTCAAGAGGGTTTAGGCCAGCA
AGAGATAACTTGAGTATTCATAGGCAAGTAGCGAACCACTGCCTGATACTGTTTAGTCTG
ATTACCATCATTGGCTTCGAATGTGATGTAGTAGGTGACTCCAGCGGATGGGTGGTAGTT
TGCTTTCAAGACCCTGACAAACTCAAGGCTTGTTATACCCGTCTCGTTTTTGTGGTGCGT
GATAGCCAAGTGCGTCAACCTGGTGAGCAGAGCTAAGTTGGTATCATCAGGGTCAAGAAC
CAGGTTATCGTCGTTGAGATCCACAGCTCCTGTGTCGAATTTGTGACGGAGTTTCGAGAA
GTCGATATCGAAACCCCCGCTCTTATCCCACTCTTCATTATACATTCGAAGATCCTCTGA
CAAATCTTTCTCCCAACTGAAATCATCGGAATTCTTAGCTGGAATCATTGCTGATAACGA
ACCCTAACTTTCTTCTCGATTGATTGAGAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2D433JQ U 9
AF RR2FF09JQ U 10
AF RR2FF09TF C 1
AF RR2D433TF C 12
BS 1 20 RR2FF09TF
BS 21 570 RR2D433JQ
BS 571 571 RR2FF09JQ
BS 572 586 RR2D433JQ
BS 587 636 RR2FF09JQ
BS 637 696 RR2FF09TF
BS 697 697 RR2D433TF

RD RR2D433JQ 578 0 0
CAACACGAAACA
ACAACATATTCCATAAGTAGCTGATGTAAATAGTAGCGGCTTTTGTAGCAACAAACACCA
GATAAACCACCACATATAATTTGGTAAAAGCCATAGTGAAACAACTTAAAGTCTGACATA
TAGAAGTTAAAGGAACAAGATAACAGTAACCGACTTTTTATTCTTCCCATTCATAGAGAG
CGGCAGTGGTGGAAAACATTCAAGAGGGTTTAGGCCAGCAAGAGATAACTTGAGTATTCA
TAGGCAAGTAGCGAACCACTGCCTGATACTGTTTAGTCTGATTACCATCATTGGCTTCGA
ATGTGATGTAGTAGGTGACTCCAGCGGATGGGTGGTAGTTTGCTTTCAAGACCCTGACAA
ACTCAAGGCTTGTTATACCCGTCTCGTTTTTGTGGTGCGTGATAGCCAAGTGCGTCAACC
TGGTGAGCAGAGCTAAGTTGGTATCATCAGGGTCAAGAACCAGGTTATCGTCGTTGAGAT
CCACAGCTCCTGTGTCGAATTTGTGACGGAGTTTCGAGAAGTCGATATCGAAACCCCCGC
TCTTATCCCATTCTTCATTATACATT

QA 13 578 13 578
DS 

RD RR2FF09JQ 627 0 0
AACACGAAACA
ACAACATATTCCATAAGTAGCTGATGTAAATAGTAGCGGCTTTTGTAGCAACAAACACCA
GATAAACCACCACATATAATTTGGTAAAAGCCATAGTGAAACAACTTAAAGTCTGACATA
TAGAAGTTAAAGGAACAAGATAACAGTAACCGACTTTTTATTCTTCCCATTCATAGAGAG
CGGCAGTGGTGGAAAACATTCAAGAGGGTTTAGGCCAGCAAGAGATAACTTGAGTATTCA
TAGGCAAGTAGCGAACCACTGCCTGATACTGTTTAGTCTGATTACCATCATTGGCTTCGA
ATGTGATGTAGTAGGTGACTCCAGCGGATGGGTGGTAGTTTGCTTTCAAGACCCTGACAA
ACTCAAGGCTTGTTATACCCGTCTCGTTTTTGTGGTGCGTGATAGCCAAGTGCGTCAACC
TGGTGAGCAGAGCTAAGTTGGTATCATCAGGGTCAAGAACCAGGTTATCGTCGTTGAGAT
CCACAGCTCCTGTGTCGAATTTGTGACGGAGTTTCGAGAAGTCGATATCGAAACCCCCGC
TCTTATCCCACTCTTCATTATACATTCGAAGATCCTCTGACAAATCTTTCTCCCAACTGA
AATCATCGGAATTCTT

QA 12 627 12 627
DS 

RD RR2FF09TF 696 0 0
TTTTTTTTTAACACGAAACAACAACATATTCCATAAGTAGCTGATGTAAATAGTAGCGGC
TTTTGTAGCAACAAACACCAGATAAACCACCACATATAATTTGGTAAAAGCCATAGTGAA
ACAACTTAAAGTCTGACATATAGAAGTTAAAGGAACAAGATAACAGTAACCGACTTTTTA
TTCTTCCCATTCATAGAGAGCGGCAGTGGTGGAAAACATTCAAGAGGGTTTAGGCCAGCA
AGAGATAACTTGAGTATTCATAGGCAAGTAGCGAACCACTGCCTGATACTGTTTAGTCTG
ATTACCATCATTGGCTTCGAATGTGATGTAGTAGGTGACTCCAGCGGATGGGTGGTAGTT
TGCTTTCAAGACCCTGACAAACTCAAGGCTTGTTATACCCGTCTCGTTTTTGTGGTGCGT
GATAGCCAAGTGCGTCAACCTGGTGAGCAGAGCTAAGTTGGTATCATCAGGGTCAAGAAC
CAGGTTATCGTCGTTGAGATCCACAGCTCCTGTGTCGAATTTGTGACGGAGTTTCGAGAA
GTCGATATCGAAACCCCCGCTCTTATCCCACTCTTCATTATACATTCGAAGATCCTCTGA
CAAATCTTTCTCCCAACTGAAATCATCGGAATTCTTAGCTGGAATCATTGCTGATAACGA
ACCCTAACTTTCTTCTCGATTGATTGAGAAAAAAAA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2D433TF 686 0 0
CACACGAAC
ACAACATATTCCATAAGTAGCTGATGTAAATAGTAGCGGCTTTTGTAGCAACAAACACCA
GATAAACCACCACATATAATTTGGTAAAAGCCATAGTGAAACAACTTAAAGTCTGACATA
TAGAAGTTAAAGGAACAAGATAACAGTAACCGACTTTTTATTCTTCCCATTCATAGAGAG
CGGCAGTGGTGGAAAACATTCAAGAGGGTTTAGGCCAGCAAGAGATAACTTGAGTATTCA
TAGGCAAGTAGCGAACCACTGCCTGATACTGTTTAGTCTGATTACCATCATTGGCTTCGA
ATGTGATGTAGTAGGTGACTCCAGCGGATGGGTGGTAGTTTGCTTTCAAGACCCTGACAA
ACTCAAGGCTTGTTATACCCGTCTCGTTTTTGTGGTGCGTGATAGCCAAGTGCGTCAACC
TGGTGAGCAGAGCTAAGTTGGTATCATCAGGGTCAAGAACCAGGTTATCGTCGTTGAGAT
CCACAGCTCCTGTGTCGAATTTGTGACGGAGTTTCGAGAAGTCGATATCGAAACCCCCGC
TCTTATCCCATTCTTCATTATACATTCGAAGATCCTCTGACAAATCTTTCTCCCAACTGA
AATCATCGGAATTCTTAGCTGGAATCATTGCTGATAACGAACCCTAACTTTCTTCTCGAT
TGATTGAGAAAAAAAAA

QA 10 686 10 686
DS 



AS 1 4

CO CL2782Contig1 794 4 5 U
GGACCAACAACTAAAGATGGCAGAAGAGGTGATTCTTTTGGATTACTGGGCGAGCGTGTT
TGGGATGAGGACAAGGATTGCTCTGGAAGAGAAAGGAGTGAAATATGAATACAGAGAAGA
AGATCTAAGTAACAAGAGCTCTTTGCTTCTTGAGATGAACCCAATTCACAAGAAGATTCC
TGTTTTGATTCACAATGGCAAACCCATCTGCGAATCCATAATGCAGGTTCAGTACATCGA
TCAAGTCTGGCCCGGTACAAACCCTATTCTCCCATCTGATCCTTACCAGAGAGCTCAGGC
TAGATTCTGGTCAGACTACATAGACAAGAAGACGAGCGGACCCTGCAAAGGTTTACATAG
AGAAACAGGGGAGAAACAAGAGGCAGCAAAGATGGAGTTCATCGAAGTACTCAAGACCCT
TGACTCGGAGCTAGGAGACAAATCATTCTTCGGTGGAAACGAGTTTGGGCTCGTGGACAT
TGCCTTTATAGGATTCTACAGTTGGTTCCGTACGTACGAGGTGATTGCAAATTTCAGCAT
TGTGGCAGAGTATCCTAAGTTAATTGCTTGGGCAGAGAGGTGTTTGAAGAGAGAAAGTGT
GGCTAAGGTCTTGCCCGACTCTGATAAGGTGCTAAAGTCAGTCTCTGACTATCGGAAGAA
GATTTTAGGAATCAACTAGATTCATATGCAGAACGTCCCATGTTATGTTATATTTTCTTT
GAAGATGTATTTCTCCGCAATATATCACCACCAAACTATGATCTTATGTTAGATTTTTAT
GAACTGAAAATTAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES18TF U 1
AF RR2FV74TF U 5
AF RR2FV74JQ C 446
AF RR2ES18JQ C 48
BS 1 607 RR2ES18TF
BS 608 608 RR2FV74TF
BS 609 620 RR2ES18TF
BS 621 751 RR2FV74TF
BS 752 794 RR2ES18JQ

RD RR2ES18TF 623 0 0
GGACCAACAACTAAAGATGGCAGAAGAGGTGATTCTTTTGGATTACTGGGCGAGCGTGTT
TGGGATGAGGACAAGGATTGCTCTGGAAGAGAAAGGAGTGAAATATGAATACAGAGAAGA
AGATCTAAGTAACAAGAGCTCTTTGCTTCTTGAGATGAACCCAATTCACAAGAAGATTCC
TGTTTTGATTCACAATGGCAAACCCATCTGCGAATCCATAATGCAGGTTCAGTACATCGA
TCAAGTCTGGCCCGGTACAAACCCTATTCTCCCATCTGATCCTTACCAGAGAGCTCAGGC
TAGATTCTGGTCAGACTACATAGACAAGAAGACGAGCGGACCCTGCAAAGGTTTACATAG
AGAAACAGGGGAGAAACAAGAGGCAGCAAAGATGGAGTTCATCGAAGTACTCAAGACCCT
TGACTCGGAGCTAGGAGACAAATCATTCTTCGGTGGAAACGAGTTTGGGCTCGTGGACAT
TGCCTTTATAGGATTCTACAGTTGGTTCCGTACGTACGAGGTGATTGCAAATTTCAGCAT
TGTGGCAGAGTATCCTAAGTTAATTGCTTGGGCAGAGAGGTGTTTGAAGAGAGAAAGTGT
GGCTAAG*TCTTGCCCGACT
CTG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2FV74TF 747 0 0
G
AACAACTAAAGATGGCAGAAGAGGTGATTCTTTTGGATTACTGGGCGAGCATGTTTGGGA
TGAGGACAAGGATTGCTCTGGAAGAGAAGGGAGTGAAATATGAATACAGAGAAGAAGATC
TAAGTAACAAGAGCTCTTTGCTTCTTGAGATGAACCCAATTCACAAGAATATTCCTGTTT
TGATTCACAATGGCAAACCCATCTGCGAATCCATAATGCAGGTTCAGTACATCGATCAAG
TCTGGCCCGGTACAAACCCTATTCTCCCATCTGACCCTTACCAGAGAGCTCAGGCTAGAT
TCTGGTCAGACTACATAGACAAGAAGACGAGCGGACCCTGCAAAGGTTTACATAGAGAAA
CAGGGGAGAAACAAGAGGCAGCAAGGATGGAGTTCATCGAAGTACTCAAGACCCTTGACT
CGGAGCTAGGAGACAAATCATTCTTCGGTGGAAACGAGTTTGGGCTCGTGGACATTGCCT
TTATAGGATTCTACAGTTGGTTCCGTACGTACGAGGTGATTGCAAATTTCAGCATTGTGG
CAGAGTATCCTAAGTTAATTGCTTGGGTAGAGAGGTGTTTGAAGAGAGAAAGTGTGGCTA
AGGTCTTGCCCGACTCTGATAAGGTGCTAAAGTCAGTCTCTGACTATCGGAAGAAGATTT
TAGGAATCAACTAGATTCATATGCAGAACGTCCCATGTTATGTTATATTTTCTTTGAAGA
TGTATTTCTCCGCAATATATCACCAC

QA 2 747 2 747
DS 

RD RR2FV74JQ 311 0 0
TTT
TTCGGTGGAAACGAGTTTGGGCTCGTGGACATTGCCTTTATAGGATTCTACAGTTGGTTC
CGTACGTACGAGGGGATTGCAAATTTCAGCATTGTGGCAGAGTATCCTAAGTTAATTGCT
TGGGTAGAGAGGTGTTTGAAGAGAGAAAGTGTGGCTAAGGTCTTGCCCGACTTTGATAAG
GTGCTAAAGTCAGTTTTTGACTATCGGAAGAAGATTTTAGGAATCAACTAGATTCATATG
CAGAACGTCCCATGTTATGTTATATTTTCTTTGAAGATGTATTTTTCCCCAATATATCCC
CAC
CAAAC

QA 4 306 4 306
DS 

RD RR2ES18JQ 747 0 0
GGGCGAGCGTGTTTGGGATGAGGACAAGGATTGCTCTGGAAGAGAAAGGAGTGAAATATG
AATACAGAGAAGAAGATCTAAGTAACAAGAGCTCTTTGCTTCTTGAGATGAACCCAATTC
ACAAGAAGATTCCTGTTTTGATTCACAATGGCAAACCCATCTGCGAATCCATAATGCAGG
TTCAGTACATCGATCAAGTCTGGCCCGGTACAAACCCTATTCTCCCATCTGATCCTTACC
AGAGAGCTCAGGCTAGATTCTGGTCAGACTACATAGACAAGAAGACGAGCGGACCCTGCA
AAGGTTTACATAGAGAAACAGGGGAGAAACAAGAGGCAGCAAAGATGGAGTTCATCGAAG
TACTCAAGACCCTTGACTCGGAGCTAGGAGACAAATCATTCTTCGGTGGAAACGAGTTTG
GGCTCGTGGACATTGCCTTTATAGGATTCTACAGTTGGTTCCGTACGTACGAGGTGATTG
CAAATTTCAGCATTGTGGCAGAGTATCCTAAGTTAATTGCTTGGGCAGAGAGGTGTTTGA
AGAGAGAAAGTGTGGCTAAGGTCTTGCCCGACTCTGATAAGGTGCTAAAGTCAGTCTCTG
ACTATCGGAAGAAGATTTTAGGAATCAACTAGATTCATATGCAGAACGTCCCATGTTATG
TTATATTTTCTTTGAAGATGTATTTCTCCGCAATATATCACCACCAAACTATGATCTTAT
GTTAGATTTTTATGAACTGAAAATTAC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 3

CO CL2783Contig1 1605 3 10 U
GAGCAAAGAAGCCATTTTTAATAAGAAGGGAGATCAAATCACACTAAAGAAAGTAAAAAG
AGAAAAATGAAAAGAGATGCTTATTGATGTGCTAATACAAGTCTACAACACGAGACGAAG
CGATATTGGAAACAAAAAAAAAGCGGGTACAAAAGAAGAACAAGTTTCTCCATCACAAGA
GTTGTACAGACCAAAAGCTGATCCCTCCTTACTGAGGACCTCCTTTATACGTATCTATTA
TCTCCTTGAGTTTCTCGAATCCCATGCGAGTTGTGAATTCTCCAAACGATTCTTTAGTTT
GTCTCTCGACTTTCCAGTGATAAAACAATGGCTCGAAGACTTTCTCAAAGTCGTGAATCT
TCACCTTATCCATGAAACTCCTGGCTATCTGTGTCTGGTTCGGTGTTACTCCTAGCCAAA
CCTGATAGCTGTTGGGTCCATCACCGACAAGACCAAGCTCAGCCATGTACGGTCTTGCAC
AGCCGTTGGGACAACCGGTTACTCTTATCACAACAGACTCATCGTACTCCAGACCAACCT
TCTCAAACATTGCTCTAACTCGCTTTAGAATGCTGGGGATCCCGCGCTCTGCCTCGGTTA
TCGCCAGAGGGCACAGAGGAAAAGCTGGACAAGCCATTGCCGTTCGGTTTAGTGGGTCAA
CAAACCCAGGTTGCAGCAAGCCGGCCTGAGCAAGCACTGTGGTGATGGGACGCTTCCATT
CCGTTTTTATATCACACAACACAATGTTCTGGTTTGGTGTGATGCGGACATCAATTTTGT
ATTTCTCTATTACTTCTCTCAGTGTCTTCCTCATTATACCTCCAACACGACCACTGTCCA
CGTGAAGACCACAAAACCACGCACCATCTCCCTGTTCATGCCATCCCAAGTAACTCTTGA
ACTCCCACTCTGGAAGATCACGTGAAGGCTCAAACTTTTTACCATAGTACTGCTCCACAA
CACCTTTAAATTTCTCGATTCCCCAGGAGCTGATCAAATACTTCATTCTGCTATATTTAC
GATCATCTCGTCTCCCGTGTTCTCGCTGTGTGACTACAATGGCTTTCACAGCATACAAAA
TATCCTCCTTTGGAACATAACCTAGTGGTTCTGCCAGGCGGGCAAAAGTAGACTCCATTC
TGTGTGTTCTTCCCATACCGCCACCAACATAAAGATTGAAACCCTGTGGTTCCCCATTTT
CATCTGAAACAACGACAACGCCGATGTCATTGGTGAGGAGGTCGACGGAGTTATCTGTAG
GCACGGTCACAGCGACCTTGAACTTCCTAGGCAAGAACTGAGTGCCATAGATAGGCTCAG
GAGAGTCGACGAAGTTAGTTCCATGGGAGTTATCATTTCGAGCTTTCACCACCTCAGGAG
GCTCAGCAGTCATAAACTGCTCACCATCAACCCACATATCGTAATAAAACCCTGACTGAG
GAGAAAGCAGAGCCGCAATATTATCTGCCGTCTCCTGAGCAAAGAGATAGTCTTTCTTCA
CATAAGGCGCCGCAGGAGCAAGAACGTTTCTATTCAAATCACCACACGCACCCAAAGTGC
TCCCCATGTTTCTAATAATCGAGCTCATCACGGTCTTGAGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW92JQ U 74
AF RR2AU31JQ U 1
AF RR2AU31TF C 838
BS 1 186 RR2AU31JQ
BS 187 187 RR2FW92JQ
BS 188 415 RR2AU31JQ
BS 416 416 RR2FW92JQ
BS 417 665 RR2AU31JQ
BS 666 666 RR2FW92JQ
BS 667 809 RR2AU31JQ
BS 810 810 RR2FW92JQ
BS 811 898 RR2AU31JQ
BS 899 1605 RR2AU31TF

RD RR2FW92JQ 749 0 0
GAGATGCTTATTGATGTGCTAATACAAGTCTACAACACGAGACGAAGCGATATTGGAAAC
AAAAAAAAAGCGGGTACAAAAGAAGAACAAGTTTCTCCATCACAAGAGTTGTACAGACCA
AAAGCTGATCCCTCCTTACTGAGGACCTCCTTTATACGTATCTATTATCTCCTTGAGTTT
CTCGAATCCCATGCGAGTTGTGAATTCTCCAAACGATT***TAGTTTGTCTCTCGACTTT
CCAGTGATAAAACAATGGCTCGAAGACTTTCTCAAAGTCGTGAATCTTCACCTTATCCAT
GAAACTCCTGGCTATCTGTGTCTGGTTCGGTGTTCCTCCTAGCCAAACCTGATAGCTGTT
GGGTCCATCACCGACAAGACCAAGCTCAGCCATGTACGGTCTTGCACAGCCGTTGGGACA
ACCGGTTACTCTTATCACAACAGACTCATCGTACTCCAGACCAGCCTTCTCAAACATTGC
TCTAACTCGCTTTAGAATGCTGGGGATCCCGCGCTCTGCCTCGGTTATCGCCAGAGGGCA
CAGAGGAAAAGCTGGACAAGCCATTGCCGTTTGGTTTAGTGG*TCAACAAACCCAGGTTG
CAGCAAGCCGGCCTGAGCAAGCACTGTGGTGATGGGACGCTTCCATTCCGTTTTTATATC
ACACAACACAATGTTCTGGTTTGGTGTGATGCGGACATCAATTTTGTATTTCTCTATTAC
TTCTCTCAGTGTCTTCCTCATTATACCTC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2AU31JQ 898 0 0
GAGCAAAGAAGCCATTTTTAATAAGAAGGGAGATCAAATCACACTAAAGAAAGTAAAAAG
AGAAAAATGAAAAGAGATGCTTATTGATGTGCTAATACAAGTCTACAACACGAGACGAAG
CGATATTGGAAACAAAAAAAAAGCGGGTACAAAAGAAGAACAAGTTTCTCCATCACAAGA
GTTGTATAGACCAAAAGCTGATCCCTCCTTACTGAGGACCTCCTTTATACGTATCTATTA
TCTCCTTGAGTTTCTCGAATCCCATGCGAGTTGTGAATTCTCCAAACGATTCTTTAGTTT
GTCTCTCGACTTTCCAGTGATAAAACAATGGCTCGAAGACTTTCTCAAAGTCGTGAATCT
TCACCTTATCCATGAAACTCCTGGCTATCTGTGTCTGGTTCGGTGTTACTCCTAGTCAAA
CCTGATAGCTGTTGGGTCCATCACCGACAAGACCAAGCTCAGCCATGTACGGTCTTGCAC
AGCCGTTGGGACAACCGGTTACTCTTATCACAACAGACTCATCGTACTCCAGACCAACCT
TCTCAAACATTGCTCTAACTCGCTTTAGAATGCTGGGGATCCCGCGCTCTGCCTCGGTTA
TCGCCAGAGGGCACAGAGGAAAAGCTGGACAAGCCATTGCCGTTCGGTTTAGTGGGTCAA
CAAACTCAGGTTGCAGCAAGCCGGCCTGAGCAAGCACTGTGGTGATGGGACGCTTCCATT
CCGTTTTTATATCACACAACACAATGTTCTGGTTTGGTGTGATGCGGACATCAATTTTGT
ATTTCTCTATTACTTCTCTCAGTGTCTTCTTCATTATACCTCCAACACGACCACTGTCCA
CGTGAAGACCACAAAACCACGCACCATCTCCCTGTTCATGCCATCCCAAGTAACTCTT

QA 1 898 1 898
DS 

RD RR2AU31TF 768 0 0
CCACGTGAAGACCACAAAACCACGCACCATCTCCCTGTTCATGCCATCCCAAGTAACTCT
TGAACTCCCACTCTGGAAGATCACGTGAAGGCTCAAACTTTTTACCATAGTACTGCTCCA
CAACACCTTTAAATTTCTCGATTCCCCAGGAGCTGATCAAATACTTCATTCTGCTATATT
TACGATCATCTCGTCTCCCGTGTTCTCGCTGTGTGACTACAATGGCTTTCACAGCATACA
AAATATCCTCCTTTGGAACATAACCTAGTGGTTCTGCCAGGCGGGCAAAAGTAGACTCCA
TTCTGTGTGTTCTTCCCATACCGCCACCAACATAAAGATTGAAACCCTGTGGTTCCCCAT
TTTCATCTGAAACAACGACAACGCCGATGTCATTGGTGAGGAGGTCGACGGAGTTATCTG
TAGGCACGGTCACAGCGACCTTGAACTTCCTAGGCAAGAACTGAGTGCCATAGATAGGCT
CAGGAGAGTCGACGAAGTTAGTTCCATGGGAGTTATCATTTCGAGCTTTCACCACCTCAG
GAGGCTCAGCAGTCATAAACTGCTCACCATCAACCCACATATCGTAATAAAACCCTGACT
GAGGAGAAAGCAGAGCCGCAATATTATCTGCCGTCTCCTGAGCAAAGAGATAGTCTTTCT
TCACATAAGGCGCCGCAGGAGCAAGAACGTTTCTATTCAAATCACCACACGCACCCAAAG
TGCTCCCCATGTTTCTAATAATCGAGCTCATCACGGTCTTGAGATTCC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 3

CO CL2784Contig1 1158 3 15 U
GGATCTCTCTCTATCTATCTATCAGCTTCTCTCCTCCTGTTCTCATGGAAGCATCACCCA
ATGATCGACTTCGTTTTGGCAAGATGGGTTTCGGGTGTCAGCATTACAGGAGGAGGTGCC
AGATCAGAGCTCCCTGTTGCAACGAAGTCTTCGATTGTCGCCATTGTCATAACGAGTTCA
CTAGCACTTTGCGCAATATCTACGACCGTCATGAGCTTGTTCGTCAAGACGTTAAACAAG
TGATTTGTTCTGTTTGCGATACAGAGCAACCGGTAGCTCAAATACGCTCCAACTGTGGTG
TCAACATGGGAGAATACTTTTGCAATATCTGCAAGTTCTATGATGATAATACTGAGAAAC
AACAGTTCCATTGTGATGACTGTGGAATCTGCAGAGTTGGTGGACGTGAGAACTTCTTCC
ATTGCAAGAAATGTGGATCTTGTTATGCGACTGGTCTGCGGAACAACCATCGCTGCGTTG
AGGATTCAATTCGACATCACTGCCCCATTTGTTACGAGTATCTCTTTGACTCTCTTAAAG
AAACAACAGTGATGAAATGTGGACACACTATGCACTGTGAATGCTACCATGAGATGATCA
AGCGTGACAAATTTTGCTGTCCTATTTGCTCGAGGTCAGTGATTGATATGTCAAAAACAT
GGCAGAGAATGGATGAAGAGATTGAAGCCACTTCTATGCCTTCAGATTACCGCGACAAGA
AGGTGTGGATACTATGCAACGACTGTAACGACACAACAGAAGTATATTTCCACATAATAG
GACAGAAATGTGGACACTGTAGATCTTACAACACCAGAGCCGTCGCACCTCCCGTTCTTC
CTCAATGACACATCACCAAAAGATCTTTCACTTGTTTCCATCTACCAGAAAGTAAGCATG
AACTTTTTGTTGCAAAAAACTTTCTTGATGATCGGTTTATAGCGAAAAAAAGATTAATGA
TCAATATGATCATTGGTCACATAAGGAAAAACACATATCTGTCTACTTCGTGATTCTATT
TGTTGTGGGTCTTTATATGGTCAAACCATTAATGTTTGGGTGTGGTAAAGCCAGGATTAT
GTATAATATACTCTAAAAATATTCTTGATCCAGGAAAAATACCTGTGATATGAAAGGTGT
GTTTTGTATTGTTATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A928TF U 1
AF RR2ET38TF U 322
AF RR2A928JQ C 298
BS 1 718 RR2A928TF
BS 719 770 RR2ET38TF
BS 771 771 RR2A928JQ
BS 772 820 RR2ET38TF
BS 821 821 RR2A928JQ
BS 822 945 RR2ET38TF
BS 946 946 RR2A928JQ
BS 947 983 RR2ET38TF
BS 984 984 RR2A928JQ
BS 985 1026 RR2ET38TF
BS 1027 1027 RR2A928JQ
BS 1028 1030 RR2ET38TF
BS 1031 1031 RR2A928JQ
BS 1032 1033 RR2ET38TF
BS 1034 1158 RR2A928JQ

RD RR2A928TF 718 0 0
GGATCTCTCTCTATCTATCTATCAGCTTCTCTCCTCCTGTTCTCATGGAAGCATCACCCA
ATGATCGACTTCGTTTTGGCAAGATGGGTTTCGGGTGTCAGCATTACAGGAGGAGGTGCC
AGATCAGAGCTCCCTGTTGCAACGAAGTCTTCGATTGTCGCCATTGTCATAACGAGTTCA
CTAGCACTTTGCGCAATATCTACGACCGTCATGAGCTTGTTCGTCAAGACGTTAAACAAG
TGATTTGTTCTGTTTGCGATACAGAGCAACCGGTAGCTCAAATACGCTCCAACTGTGGTG
TCAACATGGGAGAATACTTTTGCAATATCTGCAAGTTCTATGATGATAATACTGAGAAAC
AACAGTTCCATTGTGATGACTGTGGAATCTGCAGAGTTGGTGGACGTGAGAACTTCTTCC
ATTGCAAGAAATGTGGATCTTGTTATGCGACTGGTCTGCGGAACAACCATCGCTGCGTTG
AGGATTCAATTCGACATCACTGCCCCATTTGTTACGAGTATCTCTTTGACTCTCTTAAAG
AAACAACAGTGATGAAATGTGGACACACTATGCACTGTGAATGCTACCATGAGATGATCA
AGCGTGACAAATTTTGCTGTCCTATTTGCTCGAGGTCAGTGATTGATATGTCAAAAACAT
GGCAGAGAATGGATGAAGAGATTGAAGCCACTTCTATGCCTTCAGATTACCGCGACAA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2ET38TF 719 0 0
GCAATATCTGCAAGTTCTATGATGATAACACTGAGAAGCAGCAGTTCCATTGTGATGACT
GTGGAATCTGCAGAGTTGGTGGACGTGAGAACTTCTTCCATTGCAAGAAATGTGGGTCTT
GTTATGCGACTGGTCTGCGCAACAACCATCGCTGCGTTGAGGATTCAATGCGACATCACT
GCCCCATTTGTTACGAGTATCTCTTTGACTCTCTTAAAGAAACAACAGTGATGAAATGTG
GACACACTATGCACTGTGAATGCTACCATGAGATGATCAAGCGTGACAAATTTTGCTGTC
CTATTTGCTCGAGGTCAGTGATTGATATGTCAAAAACATGGCAGAGAATGGATGAAGAGA
TTGAAGCCACTTCTATGCCTTCAGATTACCGCGACAAGAAGGTGTGGATACTATGCAACG
ACTGTAACGACACAACAGAAGTATATTTCTACATAATAGGACAGAAATGTGGACACTGTA
GATCTTACAACACCAGAGCGGTCGCACCTCCCGTTCTTCCTCAATGACACATCACCAAAA
GATCTTTCACTTGTTTCCATCTACCAGAAAGTAAGCATGAACTTTTTGTTGCAAAAAACT
TTCTTGATGATCGGTTTATAGCGAGAAAAAGATTAATGATCAATATGATCATTGGTCACA
TATGGAAAAACACATATCTGTCTACTTCGTGATTCTATTTGTTGTTGGTTTT
ATATGGT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2A928JQ 861 0 0
GTGTCAACATGGGAGAATACTTTTGCAATATCTGCAAGTTCTATGATGATAATACTGAGA
AACAACAGTTCCATTGTGATGACTGTGGAATCTGCAGAGTTGGTGGACGTGAGAACTTCT
TCCATTGCAAGAAATGTGGATCTTGTTATGCGACTGGTCTGCGGAACAACCATCGCTGCG
TTGAGGATTCAATTCGACATCACTGCCCCATTTGTTACGAGTATCTCTTTGACTCTCTTA
AAGAAACAACAGTGATGAAATGTGGACACACTATGCACTGTGAATGCTACCATGAGATGA
TCAAGCGTGACAAATTTTGCTGTCCTATTTGCTCGAGGTCAGTGATTGATATGTCAAAAA
CATGGCAGAGAATGGATGAAGAGATTGAAGCCACTTCTATGCCTTCAGATTACCGCGACA
AGAAGGTGTGGATACTATGCAACGACTGTAACGACACAACAGAAGTTTATTTCCACATAA
TAGGACAGAAATGTGGACACTGTAGATCTTACAACACCAGAGCCGTCGCACCTCCTGTTC
TTCCTCAATGACACATCACCAAAAGATCTTTCACTTGTTTCCATCTACCAGAAAGTAAGC
ATGAACTTTTTGTTGCAAAAAACTTTCTTGATGATCGGTTTATAGCGAAAAAAAGATTGA
TGATCAATATGATCATTGGTCACATAAGGAAAAACACATATCTGTCTACTTCGTGATTCT
ATTTGTTGTGGGTCTTTATATGGTCAAACCATTAATGTTTGGGTGTGGTAAAGCCAGGAT
TATGTATAATATACTCTAAAAATATTCTTGATCCAGGAAAAATACCTGTGATATGAAAGG
TGTGTTTTGTATTGTTATTTC

QA 1 861 1 861
DS 



AS 1 4

CO CL2785Contig1 718 4 5 U
GTACAAAACTAATAAGTCAATATTTCTTAAATCTACAGTCAATTACAAGTGTCGAAACAA
ACAAAAAAGGTAAGAGATACATACGTTTATGCAAGACTACTTACTCTTTAGACGCTGTTT
CAGTCCAATGTTTCAATACTTACCACAGACTATTATCGTTGATATGACCGGTCTTGTTTC
GTTACAGGGTCAGCTGCTCGATATTCTTTGTATTACGTGACATCACATGCCCATTTCTTT
TCTCCTCTGGCTCTTCACATGGGTTTTCTCTATAAGTGGAGCTTGCCTCCTCGTTATCTG
AAGACCCTGGCCTTTCTGTTAGGAACTGTTCCCAGAATACATCATTCACCCTAGCCGGAG
GTGCTGCATTTGCTTGTTTACCTCCTCCAGCTGCAACTTCTTGTTGACCTCGGTTTTTCT
CACTCGCAGCACTTGTTTCTATTGAGTTAAAGTTTAACTCCGTAACTCTTCCAATCTCTT
GACTTTTATGACTTGTCTTGTCTATCTGCGAAGCTGTCTTGTCTGGTAATGGAGCAGAAG
CCAAGGTAAGATTTAAATGACATGAAAAGCTACCATCAGTCTCCTCTGAAGAAGTTATCA
TCTGCTGCAAGGGCTCCGGTATTGTTTTGTCATTTAACAGTAATATCCCAGGGCATGACC
CTGTATCCGCAAGCTCTAGTGCTTCAGGTGCAAACGGTAAACCTTCTCTTCTTGTTTC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GN05JQ U 42
AF RR2GN05TF C 1
AF RR2GQ27TF C 288
AF RR2GQ27JQ U 3
BS 1 2 RR2GN05TF
BS 3 41 RR2GQ27JQ
BS 42 551 RR2GN05JQ
BS 552 701 RR2GQ27JQ
BS 702 718 RR2GN05TF

RD RR2GN05JQ 510 0 0
ATTACAAGTGTCGAAACAAACAAAAAAGGTAAGAGATACATACGTTTATGCAAGACTACT
TACTCTTTAGACGCTGTTTCAGTCCAATGTTTCAATACTTACCACAGACTATTATCGTTG
ATATGACCGGTCTTGTTTCGTTACAGGGTCAGCTGCTCGATATTCTTTGTATTACGTGAC
ATCACATGCCCATTTCTTTTCTCCTCTGGCTCTTCACATGGGTTTTCTCTATAAGTGGAG
CTTGCCTCCTCGTTATCTGAAGACCCTGGCCTTTCTGTTAGGAACTGTTCCCAGAATACA
TCATTCACCCTAGCCGGAGGTGCTGCATTTGCTTGTTTACCTCCTCCAGCTGCAACTTCT
TGTTGACCTCGGTTTTTCTCACTCGCAGCACTTGTTTCTATTGAGTTAAAGTTTAACTCC
GTAACTCTTCCAATCTCTTGACTTTTATGACTTGTCTTGTCTATCTGCGAAGCTGTCTTG
TCTGGTAATGGAGCAGAAGCCAAGGTAAGA

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2GN05TF 718 0 0
GTACAAAACTAATAAGTCAATATTTCTTAAATCTACAGTCAATTACAAGTGTCGAAACAA
ACAAAAAAGGTAAGAGATACATACGTTTATGCAAGACTACTTACTCTTTAGACGCTGTTT
CAGTCCAATGTTTCAATACTTACCACAGACTATTATCGTTGATATGACCGGTCTTGTTTC
GTTACAGGGTCAGCTGCTCGATATTCTTTGTATTACGTGACATCACATGCCCATTTCTTT
TCTCCTCTGGCTCTTCACATGGGTTTTCTCTATAAGTGGAGCTTGCCTCCTCGTTATCTG
AAGACCCTGGCCTTTCTGTTAGGAACTGTTCCCAGAATACATCATTCACCCTAGCCGGAG
GTGCTGCATTTGCTTGTTTACCTCCTCCAGCTGCAACTTCTTGTTGACCTCGGTTTTTCT
CACTCGCAGCACTTGTTTCTATTGAGTTAAAGTTTAACTCCGTAACTCTTCCAATCTCTT
GACTTTTATGACTTGTCTTGTCTATCTGCGAAGCTGTCTTGTCTGGTAATGGAGCAGAAG
CCAAGGTAAGATTTAAATGACATGAAAAGCTACCATCAGTCTCCTCTGAAGAAGTTATCA
TCTGCTGCAAGGGCTCCGGTATTGTTTTGTCATTTAACAGTAATATCCCAGGGCATGACC
CTGTATCCGCAAGCTCTAGTGCTTCAGGTGCAAACGGTAAACCTTCTCTTCTTGTTTC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2GQ27TF 431 0 0
TCCTCGTTATCTGAAGACCCTGGCCTTTCTGTTAGGAACTGTTCCCAGAATACATCATTC
ACCCTAGCCGGAGGTGCTGCATTTGCTTGTTTACCTCCTCCAGCTGCAACTTCTTGTTGA
CCTCGGTTTTTCTCACTCGCAGCACTTGTTTCTATTGAGTTAAAGTTTAACTCCGTAACT
CTTCCAATCTCTTGACTTTTATGACTTGTCTTGTCTATCTGCGAAGCTGTCTTGTCTGGT
AATGGAGCAGAAGCCAAGGTAAGATTTAAATGACATGAAAAGCTACCATCAGTCTCCTCT
GAAGAAGTTATCATCTGCTGCAAGGGCTCCGGTATTGTTTTGTCATTTAACAGTAATATC
CCAGGGCATGACCCTGTATCCGCAAGCTCTAGTGCTTCAGGTGCAAACGGTAAACCTTCT
CTTCTTGTTTC

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR2GQ27JQ 699 0 0
ACAAAACTAATAAGTCAATATTTCTTAAATCTACAGTCAATTACAAGTGTCGAAACAAAC
AAAAAAGGTAAGAGATACATACGTTTATGCAAGACTACTTACTCTTTAGACGCTGTTTCA
GTCCAATGTTTCAATACTTACCACAGACTATTATCGTTGATATGACCGGTCTTGTTTCGT
TACAGGGTCAGCTGCTCGATATTCTTTGTATTACGTGACATCACATGCCCATTTCTTTTC
TCCTCTGGCTCTTCACATGGGTTTTCTCTATAAGTGGAGCTTGCCTCCTCGTTATCTGAA
GACCCTGGCCTTTCTGTTAGGAACTGTTCCCAGAATACATCATTCACCCTAGCCGGAGGT
GCTGCATTTGCTTGTTTACCTCCTCCAGCTGCAACTTCTTGTTGACCTCGGTTTTTCTCA
CTCGCAGCACTTGTTTCTATTGAGTTAAAGTTTAACTCCGTAACTCTTCCAATCTCTTGA
CTTTTATGACTTGTCTTGTCTATCTGCGAAGCTGTCTTGTCTGGTAATGGAGCAGAAGCC
AAGGTAAGATTTAAATGACATGAAAAGCTACCATCAGTCTCCTCTGAAGAAGTTATCATC
TGCTGCAAGGGCTCCGGTATTGTTTTGTCATTTAACAGTAATATCCCAGGGCATGACCCT
GTATCCGCAAGCTCTAGTGCTTCAGGTGCAAACGGTAAA

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 3

CO CL2786Contig1 817 3 9 U
GGACATCTACTCTCACTTCTTCTCATATATCTTATTAACATTAATAAAAATATTGTTACA
AAGTTATTGTACAAAACATTTATAATGGTTGTGAAACTATACGGACAGGTAACTGCAGCT
TGTCCACAAAGAGTCTTGCTTTGTTTTTTGGAGAAAGAAATTGAGTTTGAGATTGTTCAT
GTCGACCTTGATACACTAGAGCAGAAGAAACCAGAACATCTTCTTCGTCAGCCATTTGGT
CAAGTCCCAGCCATAGAAGATGGAGATTTCAAGCTTTTTGAATCTAGAGCCATTGCGAGA
TATTACGCGACCAAGTACGCGGACCAAGGCACGAACCTTTTGGGCAAGTCTCTAGAGCAC
CGAGTCATCGTAGACCAGTGGGCCGACGTGGAGACCCATTACTTTAACGTTCTGGCCTTC
CCCATTGTGTTTAACCTACTCATTAAGCCCAGGTTAGGCGAAGAATGTGACGACGTTCTG
GTCAAGGAGACCAAGCTCAAGCTCGAGGTGGTTTTGGACATATACGAGAACCGGCTTGCT
TCGAACCGGTTTTTGGCTGGTGATGGATTCACTATGGCTGATTTGACGCACATGCCGGCG
ATGGGGCACTTGATGCATACCGATGTAAACCGGATGGTTAAGGCTAGAGTGAATATGAAC
CGGTGGTGGGAAGAGATTACGGCTAGACCGGCTTGGTAGAAGCTTATGAAGATGGCTGGT
TTTTAGTTAGCTTGGGTTTATAACGATCCAAACCAAATAAACGTTTCATACTTTCTGTTT
AATATGTTTGAGTTTTATGCATTCCAATAATTAAATC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2GK78TF U 1
AF RR2B465TF U 2
AF RR2GK78JQ C 232
BS 1 681 RR2GK78TF
BS 682 682 RR2B465TF
BS 683 723 RR2GK78TF
BS 724 724 RR2B465TF
BS 725 765 RR2GK78TF
BS 766 766 RR2B465TF
BS 767 779 RR2GK78TF
BS 780 812 RR2B465TF
BS 813 817 RR2GK78JQ

RD RR2GK78TF 787 0 0
GGACATCTACTCTCACTTCTTCTCATATATCTTATTAACATTAATAAAAATATTGTTACA
AAGTTATTGTACAAAACATTTATAATGGTTGTGAAACTATACGGACAGGTAACTGCAGCT
TGTCCACAAAGAGTCTTGCTTTGTTTTTTGGAGAAAGAAATTGAGTTTGAGATTGTTCAT
GTCGACCTTGATACACTAGAGCAGAAGAAACCAGAACATCTTCTTCGTCAGCCATTTGGT
CAAGTCCCAGCCATAGAAGATGGAGATTTCAAGCTTTTTGAATCTAGAGCCATTGCGAGA
TATTACGCGACCAAGTACGCGGACCAAGGCACGAACCTTTTGGGCAAGTCTCTAGAGCAC
CGAGTCATCGTAGACCAGTGGGCCGACGTGGAGACCCATTACTTTAACGTTCTGGCCTTC
CCCATTGTGTTTAACCTACTCATTAAGCCCAGGTTAGGCGAAGAATGTGACGACGTTCTG
GTCAAGGAGACCAAGCTCAAGCTCGAGGTGGTTTTGGACATATACGAGAACCGGCTTGCT
TCGAACCGGTTTTTGGCTGGTGATGGATTCACTATGGCTGATTTGACGCACATGCCGGCG
ATGGGGCACTTGATGCATACCGATGTAAACCGGATGGTTAAGGCTAGAGTGAATATGAAC
CGGTGGTGGGAAGAGATTACG*CTAGACCGGCTTGGTAGAAGCTTATGAAGATGGCTGGT
TTT*AGTTAGCTTGGGTTTATAACGATCCAAACCAAATAAACGTT*CATACTTTCTGTT
AATATGTT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2B465TF 811 0 0
GGG
ATCTACTCTCACTTCTTCTCATATATCTTATTAACATTAATAAAAATATTGTTACAAAGT
TATTGTACAAAACATTTATAATGGTTGTGAAACTATACGGACAGGTAACTGCAGCTTGTC
CACAAAGAGTCTTGCTTTGTTTTTTGGAGAAAGAAATTGAGTTTGAGATTGTTCATGTCG
ACCTTGATACACTAGAGCAGAAGAAACCAGAACATCTTCTTCGTCAGCCATTTGGTCAAG
TCCCAGCCATAGAAGATGGAGATTTCAAGCTTTTTGAATCTAGAGCCATTGCGAGATATT
ACGCGACCAAGTACGCGGACCAAGGCACGAACCTTTTGGGCAAGTCTCTAGAGCACCGAG
CCATCGTAGACCAGTGGGCCGACGTGGAGACCCATTACTTTAACGTTCTGGCCTTCCCCA
TTGTGTTTAACCTACTCATTAAGCCCAGGTTAGGCGAAGAATGTGACGACGTTCTGGTCA
AGGAGACCAAGCTCAAGCTCGAGGTGGTTTTGGACATATACGAGAACCGGCTTGCTTCGA
ACCGGTTTTTGGCTGGTGATGAATTCACTATGGCTGATTTGACGCACATGCCGGCGGTGG
GGCACTTGATGCATACCGATGTAAACCGGATGGTTAAGGCTAGAGTGAATATGAACCGGT
GGTGGGAAGAGATTACGGCTAGACCGGCTTGGAAGAAGCTTATGAAGATGGCTGGTTTTT
AGTTAGCTTGGGTTTACAACGATCCAAACCAAATAAACGTTTCATACTTTCTGTTTAATA
TGTTTGAGTTTTATGCATTCCAATAATT

QA 4 811 4 811
DS 

RD RR2GK78JQ 586 0 0
CCATTTGGTCAAGTCCCAGCCATAGAAGATGGAGATTTCAAGCTTTTTGAATCTAGAGCC
ATTGCGAGATATTACGCGACCAAGTACGCGGACCAAGGCACGAACCTTTTGGGCAAGTTT
CTAGAGCACCGAGTCATCGTAGACCAGTGGGCCGACGTGGAGACCCATTACTTTAACGTT
CTGGCCTTCCCCATTGTGTTTAACCTACTCATTAAGCCCAGGTTAGGCGAAGAATGTGAC
GACGTTCTGGTCAAGGAGACCAAGCTCAAGCTCGAGGTGGTTTTGGACATATACGAGAAC
CGGCTTGCTTCGAACCGGTTTTTGGCTGGTGATGGATTCACTATGGCTGATTTGACGCAC
ATGCCGGCGATGGGGCACTTGATGCATACCGATGTAAACCGGATGGTTAAGGCTAGAGTG
AATATGAACCGGTGGTGGGAAGAGATTACGGCTAGACCGGCTTGGTAGAAGCTTATGAAG
ATGGCTGGTTTTTAGTTAGCTTGGGTTTATAACGATCCAAACCAAATAAACGTTTCATAC
TTTCTGTTTAATATGTTTGAGTTTTATGCATTCCAATAATTAAATC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 4

CO CL2787Contig1 959 4 10 U
GGATGATTCCATCTAACTCAGTCATAGTCAGTCTTCTTAGTCTTCTCTCTAAAATTCTTT
CTCTGCCTTCTCACTAGACTTAACGAGCTCGTTGCCTCCGGCCGGCCGCTTGGCCGTCGG
TCCGGTCCGTTTGTTTCCTTTTGTCTTCTTTTCCTTTCTGTTAGGTTAGCCTTTGCTTCG
ATTAAATGAGATTTGAAAGCAGTTCTAGATCTAGATCTAGATTTTCAGATCCGGAATCTT
GGCCGTGGGGCTTTGATAGCGGTTCGTCCTTCTTTCAGCGAGGTGCGTTTATCTCCTTGT
CGGTGATGGTTCCTTGCCGGGTCTATGGACATCCGTTTTGCTCCTTCTGGTGGCCCTGTC
TCTGGTTTGCTTGTGCGTTCGCTGATTGCTTCTGGTGGGGTTTTCGTCGGGTTTGGAGGG
TACGCTCTTCCTTGAGTTTGTTAGCAACGGAATAGATGCGTTGGTCTTTTGGTTCTCTTG
TGGTTCGGGTTGGTTTCTCCGGCTCGATTTCAAGGAAGAGGGGCTTCGGCCCTGTTCTAC
TTTGTGCCGTGGGTGTTTGAAGTTTAATGGTTCTTCTTCTTCTCCCGGGGATGGTATCGA
GTCTCCTCGTAGCTCCTGGTGTGTTTCCGAAGCAGTAGATTGAGGATTGGTCTCTGGTTC
TCCCCAATAAAGTTCGGCTTCAATGCGTTATCCTCTCTCCTCCTTGCTCTGACGGGCTCT
ATTACTAGGGTGTCTTGTGTTTATGTTCTTAGTCTAGCTGCTTTTATCTCTTTAGTCGTT
TGTAATTTAGGCTGTTTTTGGTTACAGAGAATCAGTTGATTCTGCTGTCTTTTGGCTCCA
GTGTAGTTTAATGCTGGCTCTTGTCTCCGGGAGTATCTAATACTCGCCGGCTTTGCATCT
CATCCCCGTATCCTACCCTGTATTTTCTCTTGTTCATCAATGAAAAGATCTTTAGTGTT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2BT41TF U 1
AF RR2CV43TF U 4
AF RR2CV43JQ C 167
AF RR2BT41JQ C 239
BS 1 94 RR2BT41TF
BS 95 95 RR2CV43TF
BS 96 714 RR2BT41TF
BS 715 715 RR2CV43TF
BS 716 716 RR2CV43JQ
BS 717 741 RR2CV43TF
BS 742 742 RR2CV43JQ
BS 743 784 RR2CV43TF
BS 785 957 RR2CV43JQ
BS 958 959 RR2BT41JQ

RD RR2BT41TF 723 0 0
GGATGATTCCATCTAACTCAGTCATAGTCAGTCTTCTTAGTCTTCTCTCTAAAATTCTTT
CTCTGCCTTCTCACTAGACTTAACGAGCTCGTTGTCTCCGGCCGGCCGCTTGGCCGTCGG
TCCGGTCCGTTTGTTTCCTTTTGTCTTCTTTTCCTTTCTGTTAGGTTAGCCTTTGCTTCG
ATTAAATGAGATTTGAAAGCAGTTCTAGATCTAGATCTAGATTTTCAGATCCGGAATCTT
GGCCGTGGGGCTTTGATAGCGGTTCGTCCTTCTTTCAGCGAGGTGCGTTTATCTCCTTGT
CGGTGATGGTTCCTTGCCGGGTCTATGGACATCCGTTTTGCTCCTTCTGGTGGCCCTGTC
TCTGGTTTGCTTGTGCGTTCGCTGATTGCTTCTGGTGGGGTTTTCGTCGGGTTTGGAGGG
TACGCTCTTCCTTGAGTTTGTTAGCAACGGAATAGATGCGTTGGTCTTTTGGTTCTCTTG
TGGTTCGGGTTGGTTTCTCCGGCTCGATTTCAAGGAAGAGGGGCTTCGGCCCTGTTCTAC
TTTGTGCCGTGGGTGTTTGAAGTTTAATGGTTCTTCTTCTTCTCCCGGGGATGGTATCGA
GTCTCCTCGTAGCTCCTGGTGTGTTTCCGAAGCAGTAGATTGAGGATTGGTCTCTGGTTC
TCCCCAATAAAGTTCGGCTTCAATGCGTTATCCTCTCTCCTCCTTGCTCTGACG
TCTCTATTA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2CV43TF 786 0 0
G
GATTCCATCTAACTCAGTCATAGTCAGTCTTCTTAGTCTTCTCTCTAAAATTCTTTCTCT
GCCTTCTCACTAGACTTAACGAGCTCGTTGCCTCCGGCCGGCCGCTTGGCCGTCGGTCCG
GTCCGTTTGTTTCCTTTTGTCTTCTTTTCCTTTCTGTTAGGTTAGCCTTTGCTTCGATTA
AATGAGATTTGAAAGCAGTTCTAGATCTAGATCTAGATTTTCAGATCCGGAATCTTGGCC
GTGGGGCTTTGATAGCGGTTCGTCCTTCTTTCAGCGAGGTGCGTTTATCTCCTTGTCGGT
GATGGTTCCTTGCCGGGTCTATGGACATCCGTTTTGCTCCTTCTGGTGGCCCTGTCTCTG
GTTTGCTTGTGCGTTCGCTGATTGCTTCTGGTGGGGTTTTCGTCGGGTTTGGAGGGTACG
CTCTTCCTTGAGTTTGTTAGCAACGGAATAGATGCGTTGGTCTTTTGGTTCTCTTGTGGT
TCGGGTTGGTTTCTCCGGCTCGATTTCAAGGAAGAGGGGCTTCGGCCCTGTTCTACTTTG
TGCCGTGGGTGTTTGAAGTTTAATGGTTCTTCTTCTTCTCCCGGGGATGGTATCGAGTCT
CCTCGTAGCTTCTGGTGTGTTTCCGAAGCAGTAGATTGAGGATTGGTCTCTGGTTCTCCC
CAATAAAGTTCGGTTTCAATGCGTTATCCTCTCTCCTCCTTGCTCTGACGG*CTCTATTA
CTAGGGTGTCTTGTGTT*ATGTTCTTAGTCTAGCTGCTTTTATCTCTTTAGTCGTTTGTA
TTTAG

QA 2 781 2 781
DS 

RD RR2CV43JQ 793 0 0
TTAG
CTTTGCTTCGATTAAATGAGATTTGAAAGCAGTTCTAGATCTAGATCTAGATTTTCAGAT
CCGGAATCTTGGCCGTGGGGCTTTGATAGCGGTTCGTCCTTCTTTCAGCGAGGTGCGTTT
ATCTCCTTGTCGGTGATGGTTCCTTGCCGGGTCTATGGACATCCGTTTTGCTCCTTCTGG
TGGCCCTGTCTCTGGTTTGCTTGTGCGTTCGCTGATTGCTTCTGGTGGGGTTTTCGTCGG
GTTTGGAGGGTACGCTCTTCCTTGAGTTTGTTAGCAACGGAATAGATGCGTTGGTCTTTT
GGTTCTCTTGTGGTTCGGGTTGGTTTCTCCGGCTCGATTTCAAGGAAGAGGGGCTTCGGC
CCTGTTCTACTTTGTGCCGTGGGTGTTTGAAGTTTAATGGTTCTTCTTCTTCTCCCGGGG
ATGGTATCGAGTCTCCTCGTAGCTTCTGGTGTGTTTCCGAAGCAGTAGATTGAGGATTGG
TCTCTGGTTCTCCCCAATAAAGTTCGGTTTCAATGCGTTATCCTCTCTCCTCCTTGCTCT
GACGGGCTCTATTACTAGGGTGTCTTGTGTTTATGTTCTTAGTCTAGCTGCTTTTATCTC
TTTAGTCGTTTGTAATTTAGGCTGTTTTTGGTTACAGAGAATCAGTTGATTCTGCTGTCT
TTTGGCTCCAGTGTAGTTTAATGCTGGCTCTTGTCTCCGGGAGTATCTAATACTCGCCGG
CTTTGCATCTCATCCCCGTATCCTACCCTGTATTTTCTCTTGTTCATCAATGAAAAGATC
TTTAGTG
CG

QA 5 791 5 791
DS 

RD RR2BT41JQ 721 0 0
C
TGGCCGTGGGGCTTTGATAGCGGTTCGTCCTTCTTTCAGCGAGGTGCGTTTATCTCCTTG
TCGGTGATGGTTCCTTGCCGGGTCTATGGACATCCGTTTTGCTCCTTCTGGTGGCCCTGT
CTCTGGTTTGCTTGTGCGTTCGCTGATTGCTTCTGGTGGGGTTTTCGTCGGGTTTGGAGG
GTACGCTCTTCCTTGAGTTTGTTAGCAACGGAATAGATGCGTTGGTCTTTTGGTTCTCTT
GTGGTTCGGGTTGGTTTCTCCGGCTCGATTTCAAGGAAGAGGGGCTTCGGCCCTGTTCTA
CTTTGTGCCGTGGGTGTTTGAAGTTTAATGGTTCTTCTTCTTCTCCCGGGGATGGTATCG
AGTCTCCTCGTAGCTCCTGGTGTGTTTCCGAAGCAGTAGATTGAGGATTGGTCTCTGGTT
CTCCCCAATAAAGTTCGGCTTCAATGCGTTATCCTCTCTCCTCCTTGCTCTGACGGTCTC
TATTACTAGGGTGTCTTGTGTTTATGTTCTTAGTCTAGCTGCTTTTATCTCTTTAGTCGT
TTGTAATTTAGGCTGTTTTTGGTTACAGAGAATCAGTTGATTCTGCTGTCTTTTGGCTCC
AGTGTAGTTTAATGCTGGCTCTTGTCTCTGGGAGTATCTAATACTCGCCGGCTTTGCATC
TCATCCCCGTATCCTACCCTGTATTTTCTCTTGTTCATCAATGAAAAGATCTTTAGTGTT

QA 2 721 2 721
DS 



AS 1 3

CO CL2788Contig1 705 3 29 U
GGGAATCGCTCGATCTCTCCTTCCTTCCACCATTATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTGGGGG
TTTATAGATCGGAAGGGTCGTAGTTAGTTAGGGTTTAGAAGAGATGAGCCGAAGTCTGGG
AATACCGGTGAAGCTTCTCCACGAGGCGTCGGGTCATATAGTGACGGTGGAGCTAAAGAG
CGGAGAGCTCTACAGAGGCAGCATGATCGAGTGTGAGGATAACTGGAACTGCCAGCTCGA
GGACATTACCTTTACCGCTCAGGATGGTAAGATATCGCAGCTTGAGCATGTCTTCATTCG
AGGCAGCAAAGTCAGGTTTATGGTCATACCAGACATTCTCAAGCATGCTCCAATGTTCAA
GCGCTTGGATGCTAGAATCGAGGGAAAGAGCGGATCACTTGGTGTTGGCAGAGGTAGAGC
TGCAATGCGAGGAAAAGCTCCGGCTACTGGGCGTGGAACTGGAGGAAGGGGAGCTGTACC
ACCTGTGAGGAGATGATTGAATCTATGCTTAACATGTAAGCTTCTATCTGCAAACAACGC
CAGCGTCTGTTACGTTTGTTGTGTATTGCTTTAAAGTTCACCTGTAGAAACCAAATGCCC
TTCTCTAACAAGGAGGCAAACAAGAAAGAAAAAGAGATGTCCTGATGCACACTATTAGTT
CTGTATTTTGAGATGCTAAGATGTTAAAACATTGACAAGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H474TF U 1
AF RR2AR52JQ C 41
AF RR2AR52TF U 41
BS 1 76 RR2H474TF
BS 77 77 RR2AR52TF
BS 78 86 RR2H474TF
BS 87 90 RR2AR52TF
BS 91 98 RR2H474TF
BS 99 99 RR2AR52TF
BS 100 168 RR2H474TF
BS 169 169 RR2AR52TF
BS 170 198 RR2H474TF
BS 199 199 RR2AR52TF
BS 200 300 RR2H474TF
BS 301 301 RR2AR52TF
BS 302 366 RR2H474TF
BS 367 367 RR2AR52TF
BS 368 379 RR2H474TF
BS 380 380 RR2AR52TF
BS 381 436 RR2H474TF
BS 437 437 RR2AR52TF
BS 438 474 RR2H474TF
BS 475 475 RR2AR52TF
BS 476 476 RR2H474TF
BS 477 477 RR2AR52TF
BS 478 548 RR2H474TF
BS 549 549 RR2AR52TF
BS 550 581 RR2H474TF
BS 582 582 RR2AR52TF
BS 583 592 RR2H474TF
BS 593 692 RR2AR52TF
BS 693 705 RR2AR52JQ

RD RR2H474TF 592 0 0
GGGAATCGCTCGATCTCTCCTTCCTTCCACCATTATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTGGGGG
TTTATAGATCGGAAGG*TCGTAGTTA****GGGTTTAGCAGAGATGAGCCGAAGTCTGGG
AATACCGGTGAAGCTTCTCCACGAGGCGTCGGGTCATATAGTGACGGTAGAGCTAAAGAG
CGGAGAGCTCTACAGAGGAAGCATGATCGAGTGTGAGGATAACTGGAACTGCCAGCTCGA
GGACATTACCTTTACCGCTCAGGATGGTAAGATATCGCAGCTTGAGCATGTCTTCATTCG
TGGCAGCAAAGTCAGGTTTATGGTCATACCAGACATTCTCAAGCATGCTCCAATGTTCAA
GCGCTTAGATGCTAGAATCAAGGGAAAGAGCGGATCACTTGGTGTTGGCAGAGGTAGAGC
TGCAATGCGAGGAAAACCTCCGGCTACTGGGCGTGGAACTGGAGGAAGGGGAGCAGCACC
ACCTGTGAGGAGATGATTGAATCTATGCTTAACATGTAAGCTTCTATCTGCAAACAACGC
CAGCGTCTCTTACGTTTGTTGTGTATTGCTTTAAAGTTCACTTGTAGAAACC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2AR52JQ 665 0 0
GTTC
GTTTGTTTGTTGGGGGTTTATAGATCGGAAGGGTCGTAGTTAGTTAGGGTTTAGAAGAGA
TGAGCCGAAGTCTGGGAATACCGGTGAAGCTTCTCCACGAGGCGTCGGGTCATATAGTGA
CGGTGGAGCTAAAGAGCGGAGAGCTCTACAGAGGCAGCATGATCGAGTGTGAGGATAACT
GGAACTGCCAGCTCGAGGACATTACCTTTACCGCTCAGGATGGTAAGATATCGCAGCTTG
AGCATGTCTTCATTCGAGGCAGCAAAGTCAGGTTTATGGTCATACCAGACATTCTCAAGC
ATGCTCCAATGTTCAAGCGCTTGGATGCTAGAATCGAGGGAAAGAGCGGATCACTTGGTG
TTGGCAGAGGTAGAGCTGCAATGCGAGGAAAAGCTCCGGCTACTGGGCGTGGAACTGGAG
GAAGGGGAGCTGTACCACCTGTGAGGAGATGATTGAATCTATGCTTAACATGTAAGCTTC
TATCTGCAAACAACGCCAGCGTCTGTTACGTTTGTTGTGTATTGCTTTAAAGTTCACCTG
TAGAAACCAAATGCCCTTCTCTAACAAGGAGGCAAACAAGAAAGAAAAAGAGATGTCCTG
ATGCACACTATTAGTTCTGTATTTTGAGATGCTAAGATGTTAAAACATTGACAAGTTTTC
C

QA 5 665 5 665
DS 

RD RR2AR52TF 665 0 0
GTTC
GTTTGTTTGTTGGGGGTTTATAGATCGGAAGGGTCGTAGTTAGTTAGGGTTTAGAAGAGA
TGAGCCGAAGTCTGGGAATACCGGTGAAGCTTCTCCACGAGGCGTCGGGTCATATAGTGA
CGGTGGAGCTAAAGAGCGGAGAGCTCTACAGAGGCAGCATGATCGAGTGTGAGGATAACT
GGAACTGCCAGCTCGAGGACATTACCTTTACCGCTCAGGATGGTAAGATATCGCAGCTTG
AGCATGTCTTCATTCGAGGCAGCAAAGTCAGGTTTATGGTCATACCAGACATTCTCAAGC
ATGCTCCAATGTTCAAGCGCTTGGATGCTAGAATCGAGGGAAAGAGCGGATCACTTGGTG
TTGGCAGAGGTAGAGCTGCAATGCGAGGAAAAGCTCCGGCTACTGGGCGTGGAACTGGAG
GAAGGGGAGCTGTACCACCTGTGAGGAGATGATTGAATCTATGCTTAACATGTAAGCTTC
TATCTGCAAACAACGCCAGCGTCTGTTACGTTTGTTGTGTATTGCTTTAAAGTTCACCTG
TAGAAACCAAATGCCCTTCTCTAACAAGGAGGCAAACAAGAAAGAAAAAGAGATGTCCTG
ATGCACACTATTAGTTCTGTATTTTGAGATGCTAAGATGTTAAAACAT
TGACAAGTTTTCC

QA 5 652 5 652
DS 



AS 1 3

CO CL2789Contig1 882 3 14 U
GATAGAGCGTCTTGGTTTGGTTACAGGCGGTGAAATCGCTTCCACCTTCGACAACCCAGA
GTCTGTTAAGCTTGGGCATTGCAAGCTCATCGAAGAGATTATGATTGGTGAAGACAAGTT
GATCCATTTCTCTGGTGTAGAGATGGGCCAGGCGTGTTCAATTGTCCTAAGGGGTGCCAG
TCACCATGTTCTTGACGAGGCTGAAAGATCACTCCATGATGCCTTGTGTGTACTCTCCCA
GACAGTGAATGACAGTAGAGTGTTGCTAGGAGGTGGATGGCCAGAGATGGTGATGGCAAA
GGAAGTAGACGAGCTTGCAAGGAAAACTGCTGGCAAAAAATCGCATGCCATTGAAGCTTT
CTCACGTGCTCTAGTGGCTATACCGACAACAATCGCTGACAATGCTGGTTTAGACAGTGC
AGAATTGGTGGCTCAGCTTCGCGCAGAGCACCACAACGAAGGGTGTAACGCTGGGATCGA
TGTCATCTCTGGAGCTGTAGGGGATATGGAGGAGAGAGGAATCTATGAAGCATTCAAAGT
TAAGCAGGCCGTTTTGCTTTCAGCGACAGAAGCAGCTGAGATGATACTGCGAGTGGATGA
GATAATTACATGTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGACAGGATGTGAAATCCAACACATGCACC
TGGTGGGAGAGAGATTTCATGATGATT*ACACGATCACACCCTCCCCTGTGACATTGTTC
TTGTTCAGTTATTAGATTTGTGTTTTGTATTTGGATCACAAAAAAGCCTAAAATTGTTTT
AGTGTTTTGCTCCCTAAACTTTTCTCTATTTCTGTGTCCTCTTCGGATATTGTTTTGAAT
TTGTTATTGTGACAAAATATTAGCTCCAAGGAATTTGAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 0 20 20 0 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A707TF U 1
AF RR2AH42TF U 73
AF RR2A707JQ C 131
BS 1 721 RR2A707TF
BS 722 722 RR2A707JQ
BS 723 762 RR2AH42TF
BS 763 763 RR2A707JQ
BS 764 764 RR2AH42TF
BS 765 765 RR2A707JQ
BS 766 766 RR2AH42TF
BS 767 767 RR2A707JQ
BS 768 769 RR2AH42TF
BS 770 770 RR2A707JQ
BS 771 811 RR2AH42TF
BS 812 812 RR2A707JQ
BS 813 823 RR2AH42TF
BS 824 882 RR2A707JQ

RD RR2A707TF 724 0 0
GATAGAGCGTCTTGGTTTGGTTACAGGCGGTGAAATCGCTTCCACCTTCGACAACCCAGA
GTCTGTTAAGCTTGGGCATTGCAAGCTCATCGAAGAGATTATGATTGGTGAAGACAAGTT
GATCCATTTCTCTGGTGTAGAGATGGGCCAGGCGTGTTCAATTGTCCTAAGGGGTGCCAG
TCACCATGTTCTTGACGAGGCTGAAAGATCACTCCATGATGCCTTGTGTGTACTCTCCCA
GACAGTGAATGACAGTAGAGTGTTGCTAGGAGGTGGATGGCCAGAGATGGTGATGGCAAA
GGAAGTAGACGAGCTTGCAAGGAAAACTGCTGGCAAAAAATCGCATGCCATTGAAGCTTT
CTCACGTGCTCTAGTGGCTATACCGACAACAATCGCTGACAATGCTGGTTTAGACAGTGC
AGAATTGGTGGCTCAGCTTCGCGCAGAGCACCACAACGAAGGGTGTAACGCTGGGATCGA
TGTCATCTCTGGAGCTGTAGGGGATATGGAGGAGAGAGGAATCTATGAAGCATTCAAAGT
TAAGCAGGCCGTTTTGCTTTCAGCGACAGAAGCAGCTGAGATGATACTGCGAGTGGATGA
GATAATTACATGTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGACAGGATGTGAAATCCAACACATGCACC
TGGTGGGAGAGAGATTTCATGATGATT*ACACGATCACACCCTCCCCTGTGACATTGTTC
T
TGT

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2AH42TF 753 0 0
GGGGG
ATTGCAAGCTCATCGAAGAGATTATGATTGGTGAAGACAAGTTGATCCATTTCTCTGGTG
TAGAGATGGGCCAGGCGTGTTCAATTGTCCTAAGGGGTGCTAGTCACCATGTTCTTGACG
AGGCTGAAAGATCACTCCATGATGCCTTGTGTGTACTCTCCCAGACAGTGAATGACAGTA
GAGTGTTGCTAGGAGGTGGATGGCCAGAGATGGTGATGGCAAAGGAAGTAGACGAGCTTG
CAAGGAAAACTGCTGGCAAAAAATCGCATGCCATTGAAGCTTTCTCACGGGCTCTAGTGG
CTATACCGACAACAATCGCTGACAACGCTGGTCTAGACAGCGCAGAATTGGTGGCT**GC
TTCGTGCAGAGCACCACAACGAAGGGTGTAACGCTGGGATCGATGTCATCTCTGGAGCTG
TAGGGGATATGGAGGAGAGAGGAATCTATGAAGCATTCAAAGTGAAGCAGGCCGTTCTGC
TTTCAGCGACAGAAGCAGCTGAGATGATACTGCGAGTGGATGAGATCATTACATGTGCTC
CTAGGAGGAGAGAAGACAGGATGTGAAATCCAACACATGCACCTGGTGGGAGAGAGATTT
CATGATGATTTACACGATCACACCCTCCCCTGTGACATTGTTCT*GTTCAGTTATTAGAT
TTGTGTTTTGTATTTGGATCACAAACATGTCTTAAATTGTTTTAGTGTTTTGCTCCCTAA
ACTTTTCTCTATTTTTGTGTCCTCTT
TG

QA 6 751 6 751
DS 

RD RR2A707JQ 752 0 0
TCTGGTGTAGAGATGGGCCAGGCGTGTTCAATTGTC*TAAGGGGTGCCAGTCACCATGTT
CTTGACGAGGCTGAAAGATCACTCCATGATGCCTTGTGTGTACTCTCCCAGACAGTGAAT
GACAGTAGAGTGTTGCTAGGAGGTGGATGGCCAGAGATGGTGATGGCAAAGGAAGTAGAC
GAGCTTGCAAGGAAAACTGCTGGCAAAAAATCGCATGCCATTGAAGCTTTCTCACGTGCT
CTAGTGGCTATACCGACAACAATCGCTGACAATGCTGGTTTAGACAGTGCAGAATTGGTG
GCTCAGCTTCGCGCAGAGCACCACAACGAAGGGTGTAACGCTGGGATCGATGTCATCTCT
GGAGCTGTAGGGGATATGGAGGAGAGAGGAATTTATGAAGCATTCAAAGTTAAGCAGGCC
GTTTTGCTTTCAGCGACAGAAGCAGCTGAGATGATACTGCGAGTGGATGAGATAATTACA
TGTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGACAGGATGTGAAATCCAACACATGCACCTGGTGGGAGA
GAGATTTCATGATGATT*ACACGATCACACCCTCCCCTGTGACATTGTTCTTGTTCGGTT
ATTAGATTTGTTTTTTGTATTTGGATCACAAAACAGCCTAA***TGTTTTAGTGTTTTGC
TCCCTAGACTTTTCTCTCTTTC*GTGTCCTCTTCGGATATTGTTTTGAATTTGTTATTGT
GACAAAATATTAGCTCCAAGGAATTTGAACTT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 4

CO CL2790Contig1 1033 4 5 U
GGAGAATCTCTCGATATCATATTTCCCTCTCTTTTCCCTCACTCTTCCTTATAAATCCTT
ATTTCTCCATCCTCCTTTGCAAAATCAAATATCTCTCACTTTCTCCTCAAATCATAAGCA
GATTCTCTCTCTCGTTTAACGATCTTTGATTCATTATGGCGGAGGTTTTGCGTCCGGAGA
AGTTTGACATATCCAACGACACTTCTTCCTTGGCATCACCGGAGCTTCTTCACGTTCTCG
CTGTCGATGACAGCATCGTCGACCGGAAATTCATAGAGCGATTGCTCAGAGTATCTTCTT
GCAAAGTTACTGTTGTCGATAGCGCGACAAGAGCTTTGCAGTACCTTGGCTTAGATGGAG
ACAACAGTTCAGTTGGATTTCAGGACCTGAAGATTAATCTGATAATGACGGACTACTCTA
TGCCTGGGATGACTGGTTATGAACTACTGAAGAAGATCAAAGAATCATCAGTTTTCAGAG
AAATACCGGTTGTGATTATGTCCTCAGAGAACATCTTGCCTCGTATCGATAGATGTCTTG
AAGAAGGTGCTGAAGATTTCTTATTGAAGCCTGTGAAGTTGGCTGATGTGAAGAGACTAA
GAGATTCTTTAATGAAAGCTGAGGAAAGAGTATTCAAGAATATTATGCACAAGAGGGAGC
TAGAAGCTAATGATATCTTCTCGCAGCTAAAACGCGCAAAGATCTGAGTCTTCTTTGGTT
CTTATTCCATGATATGAACTTACAAAGGCTCAAACGTTGACAAAAAAAGGCTCAAAGATT
CAAACGCACTTCGGCATGTCCTGATTCCTTCGACTAACGATTTTTGCGAACGTCACAGCC
TTTTTAGCTGATAGAACTACAGACCGAGGAATGTTTTTTTCATAAAATAGAAATGTAAAT
TGATAGTCTGAAAAAATTGGGATTTATTAGAGAGGACAAATACATTGATTTTTTTTCTTT
ATATGAAATATGTAAAATGATGATGCTAATTTACAACTAGCTAGGCATTTTGTGCCTTTT
TGGCCTTCACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU27TF U 1
AF RR2AD50JQ C 385
AF RR2AD50TF U 385
AF RR2DU27JQ C 457
BS 1 691 RR2DU27TF
BS 692 692 RR2AD50TF
BS 693 707 RR2DU27TF
BS 708 997 RR2AD50TF
BS 998 1033 RR2DU27JQ

RD RR2DU27TF 707 0 0
GGAGAATCTCTCGATATCATATTTCCCTCTCTTTTCCCTCACTCTTCCTTATAAATCCTT
ATTTCTCCATCCTCCTTTGCAAAATCAAATATCTCTCACTTTCTCCTCAAATCATAAGCA
GATTCTCTCTCTCGTTTAACGATCTTTGATTCATTATGGCGGAGGTTTTGCGTCCGGAGA
AGTTTGACATATCCAACGACACTTCTTCCTTGGCATCACCGGAGCTTCTTCACGTTCTCG
CTGTCGATGACAGCATCGTCGACCGGAAATTCATAGAGCGATTGCTCAGAGTATCTTCTT
GCAAAGTTACTGTTGTCGATAGCGCGACAAGAGCTTTGCAGTACCTTGGCTTAGATGGAG
ACAACAGTTCAGTTGGATTTCAGGACCTGAAGATTAATCTGATAATGACGGACTACTCTA
TGCCTGGGATGACTGGTTATGAACTACTGAAGAAGATCAAAGAATCATCAGTTTTCAGAG
AAATACCGGTTGTGATTATGTCCTCAGAGAACATCTTGCCTCGTATCGATAGATGTCTTG
AAGAAGGTGCTGAAGATTTCTTATTGAAGCCTGTGAAGTTGGCTGATGTGAAGAGACTAA
GAGATTCTTTAATGAAAGCTGAGGAAAGAGTATTCAAGAATATTATGCACAAGAGGGAGC
TAGAAGCTAATGATATCTTCTCGCAGCTAAA*CGCGCAAAGATCTGA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2AD50JQ 613 0 0
G
CCTGAAGATTAATCTGATAATGACGGACTACTCTATGCCTGGGATGACTGGTTATGAACT
ACTGAAGAAGATCAAAGAATCATCAGTTTTCAGAGAAATACCGGTTGTGATTATGTCCTC
AGAGAACATCTTGCCTCGTATCGATAGATGTCTTGAAGAAGGTGCTGAAGATTTCTTATT
GAAGCCTGTGAAGTTGGCTGATGTGAAGAGACTAAGAGATTCTTTAATGAAAGCTGAGGA
AAGAGTATTCAAGAATATTATGCACAAGAGGGAGCTAGAAGCTAATGATATCTTCTCGCA
GCTAAAACGCGCAAAGATCTGAGTCTTCTTTGGTTCTTATTCCATGATATGAACTTACAA
AGGCTCAAACGTTGACAAAAAAAGGCTCAAAGATTCAAACGCACTTCGGCATGTCCTGAT
TCCTTCGACTAACGATTTTTGCGAACGTCACAGCCTTTTTAGCTGATAGAACTACAGACC
GAGGAATGTTTTTTTCATAAAATAGAAATGTAAATTGATAGTCTGAAAAAATTGGGATTT
ATTAGAGAGGACAAATACATTGATTTTTTTTCTTTATATGAAATATGTAAAATGATGATG
CTAATTTACAAC

QA 2 613 2 613
DS 

RD RR2AD50TF 613 0 0
G
CCTGAAGATTAATCTGATAATGACGGACTACTCTATGCCTGGGATGACTGGTTATGAACT
ACTGAAGAAGATCAAAGAATCATCAGTTTTCAGAGAAATACCGGTTGTGATTATGTCCTC
AGAGAACATCTTGCCTCGTATCGATAGATGTCTTGAAGAAGGTGCTGAAGATTTCTTATT
GAAGCCTGTGAAGTTGGCTGATGTGAAGAGACTAAGAGATTCTTTAATGAAAGCTGAGGA
AAGAGTATTCAAGAATATTATGCACAAGAGGGAGCTAGAAGCTAATGATATCTTCTCGCA
GCTAAAACGCGCAAAGATCTGAGTCTTCTTTGGTTCTTATTCCATGATATGAACTTACAA
AGGCTCAAACGTTGACAAAAAAAGGCTCAAAGATTCAAACGCACTTCGGCATGTCCTGAT
TCCTTCGACTAACGATTTTTGCGAACGTCACAGCCTTTTTAGCTGATAGAACTACAGACC
GAGGAATGTTTTTTTCATAAAATAGAAATGTAAATTGATAGTCTGAAAAAATTGGGATTT
ATTAGAGAGGACAAATACATTGATTTTTTTTCTTTATATGAAATATGTAAAATGATGATG
CTAATTTACAAC

QA 2 613 2 613
DS 

RD RR2DU27JQ 577 0 0
TCAAAGAATCATCAGTTTTCAGAGAAATACCGGTTGTGATTATGTCCTCAGAGAACATCT
TGCCTCGTATCGATAGATGTCTTGAAGAAGGTGCTGAAGATTTCTTATTGAAGCCTGTGA
AGTTGGCTGATGTGAAGAGACTAAGAGATTCTTTAATGAAAGCTGAGGAAAGAGTATTCA
AGAATATTATGCACAAGAGGGAGCTAGAAGCTAATGATATCTTCTCGCAGCTAAAACGCG
CAAAGATCTGAGTCTTCTTTGGTTCTTATTCCATGATATGAACTTACAAAGGCTCAAACG
TTGACAAAAAAAGGCTCAAAGATTCAAACGCACTTCAGCATGTCCTGATTCCTTCGACTA
ACGATTTTTGCGAACGTCACAGCCTTTTTAGCTGATAGAACTACAGACCGAGGAATGTTT
TTTTCATAAAATAGAAATGTAAATTGATAGTCTGAAAAAATTGGGATTCATTAGAGAGGA
CAAATACATTGATTTTTTTTCTTTATATGAAATATGTAAAATGATGATGCTAATTTACAA
CTAGCTAGGCATTTTGTGCCTTTTTGGCCTTCACTTT

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

CO CL2791Contig1 839 2 24 U
GGACAACAACAACACTTTTGTCTAAAAATGCTGAGTCATCCTTATTCCTGTTGCCAAACA
GCAACTGGATCGCGGCCACCGAGACAAGCCTTCAAGATCACGGCGGCGATGTCGTCGGAG
AGGAACCCTAGAATCCTCTGCCTCCACGGATTCAGAACAAGCGGTCTGATTCTCCGTTCC
CTCATTACATCTAAATGGCCCGACACAGTCCTCCGAAACCTCGACCTCGACTTCCTCGAC
GGTCCGTTCCCGGCCACCGGAAAATCGGACGTCGAGCGGTTCTATGACCCGCCGTATTAC
GAGTGGTACCAAGCTAGCAAGGGTTTTAGAGAATACAGGAACTTTGAAGAGTGTTTGGAT
TATGTTGAGGATTACATGATAAAGCATGGACCTTTCGATGGTCTTCTTGGTTTCTCCCAG
GGGGCTTTCCTATCTGCGGCTCTTCCTGGAATGCAAGAACAGGGAAAGGCTTTAACTAAG
GTGCCAAAGGTCAAGTTCTTGGTGCTAATATCCGCAGGAAAAATTCCTGGTTTGAGGTTT
GGACAGCCTAAAGCTGCGGTTGGTGCATTATCATCTCCTGTTCGTTGCCCCTCACTCCAC
TTCATAGGCGAGAGGGATTTTCTGAAAACGGAAGGTGAAGTTCTTGTGGAATCATTTGTA
AAGCCAGTGGTGATCCGTCATACAAGTGGACACACTATACCTAAACTTGAAACTGAAGCT
GAGGAGACTGCGCTGAGCTTCTTCCAGAGGATTAGGCAGATGCTTTCTGATGATGAATCT
TCTCTCTAAGAGCTTGATGTGATGACAGCTGCTTTAAATAGGTTCGGTGAATAGATGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS40TF U 1
AF RR2EZ94TF U 7
BS 1 23 RR2CS40TF
BS 24 24 RR2EZ94TF
BS 25 39 RR2CS40TF
BS 40 40 RR2EZ94TF
BS 41 104 RR2CS40TF
BS 105 105 RR2EZ94TF
BS 106 143 RR2CS40TF
BS 144 144 RR2EZ94TF
BS 145 230 RR2CS40TF
BS 231 231 RR2EZ94TF
BS 232 318 RR2CS40TF
BS 319 319 RR2EZ94TF
BS 320 428 RR2CS40TF
BS 429 430 RR2EZ94TF
BS 431 504 RR2CS40TF
BS 505 505 RR2EZ94TF
BS 506 521 RR2CS40TF
BS 522 522 RR2EZ94TF
BS 523 608 RR2CS40TF
BS 609 609 RR2EZ94TF
BS 610 650 RR2CS40TF
BS 651 651 RR2EZ94TF
BS 652 716 RR2CS40TF
BS 717 839 RR2EZ94TF

RD RR2CS40TF 716 0 0
GGACAACAACAACACTTTTGTCTGAAAATGCTGAGTCATTCTTATTCCTGTTGCCAAACA
GCAACTGGATCGCGGCCACCGAGACAAGCCTTCAAGATCACGGCTGCGATGTCGTCGGAG
AGGAACCCTAGAATCCTCTGCCTTCACGGATTCAGAACAAGCGGTCTGATTCTCCGTTCC
CTCATTACATCTAAATGGCCCGACACAGTCCTCCGAAACCTCGACCTCGATTTCCTCGAC
GGTCCGTTCCCGGCCACCGGAAAATCGGACGTCGAGCGGTTCTATGACCCGCCGTATTAC
GAGTGGTACCAAGCTAGCGAGGGTTTTAGAGAATACAGGAACTTTGAAGAGTGTTTGGAT
TATGTTGAGGATTACATGATAAAGCATGGACCTTTCGATGGTCTTCTTGGTTTCTCCCAG
GGGGCTTTTTTATCTGCGGCTCTTCCTGGAATGCAAGAACAGGGAAAGGCTTTAACTAAG
GTGCCAAAGGTCAAGTTCTTGGTGTTAATATCCGCAGGAAAGATTCCTGGTTTGAGGTTT
GGACAGCCTAAAGCTGCGGTTGGTGCATTATCATCTCCTGTTCGTTGCCCCTCACTCCAC
TTCATAGGTGAGAGGGATTTTCTGAAAACGGAAGGTGAAGTTCTTGTGGAGTCATTTGTA
AAGCCAGTGGTGATCCGTCATACAAGTGGACACACTATACCTAAACTTGAAACTGA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2EZ94TF 833 0 0
GGACTTTTG
TTTTGTCTAAAAATGCTGAGTCATCCTTATTCTTGTTGCCAAACAGCAACTGGATCGCGG
CCACCGAGACAAGCCTTCAAGATCACGGCGGCGATGTCGTCGGAGAGGAACCCTAGGATC
CTCTGCCTCCACGGATTCAGAACAAGCGGTCTGATTCTCCGTTCCCTCATTACATCTAAA
TGGCCCGACACAGTCCTCCGAAACCTCGACCTCGACTTCCTCGACGGTCCGTTCCCGGCC
ACCGGAAAATCGGACGTCGAGCGGTTCTATGATCCGCCGTATTACGAGTGGTACCAAGCT
AGCAAGGGTTTTAGAGAATACAGGAACTTTGAAGAGTGTTTGGATTATGTTGAGGATTAC
ATGATAAAGCATGGACCTTTTGATGGTCTTCTTGGTTTCTCCCAGGGGGCTTTCCTATCT
GCGGCTCTTCCTGGAATGCAAGAACAGGGAAAGGCTTTAACTAAGGTGCCAAAGGTCAAG
TTCTTGGTGCTAATATCCGCAGGAAAAATTCCTGGTTTGAGGTTTGGACAGCCTAAAGCT
GCGGTTGGTGCATTCTCATCTCCTGTTCGTTGCCCCTCACTCCACTTCATAGGCGAGAGG
GATTTTCTGAAAACGGAAGGTGAAGTTCTTGTGGAATCATTTGTAGAGCCAGTGGTGATC
CGTCATACAAGTGGACACACTATACCTAAACTTGAAACTGAAGCTGAGGAGACTGCGCTG
AGCTTCTTCCAGAGGATTAGGCAGATGCTTTCTGATGATGAATCTTCTCTCTAAGAGCTT
GATGTGATGACAGCTGCTTTAAATAGGTTCGGTGAATAGATGAT

QA 10 833 10 833
DS 



AS 1 4

CO CL2792Contig1 1146 4 19 U
GAGTCAAGTTTTCCGATCCGGAAAACAACGGCTCCGAGGAGAGAACTCAACAGAGATGTC
TCGTGGAGTCAATCGTCTCTCTCTTACCTTCAGACAAAGGACTTTTCCCGATCAACTTCC
TCTGTTCTCTCCTCCGTTGCGCTGACTTCGTGAACACTTCACTCGCATGCAAGAACGAGG
TCGAGACACGAATCTCCGCCGTTCTTGAACACGTCACCGTCGATGATCTCTTGATACCTT
CTTTCACCTACGACGGTGAAAGACTATTAGACCTAGACAGCGTCGGGAGAATCATCTCCG
GTTTTGCCGAAAGGGAGAAAAGCAAAGGGTTATGTTCTGTCTCGCTACAAAGAGTTGCAA
AGACCGTTGATTCTTATTTAGGGGAGATCGCTACTTGCTTGGAGCTCACGGTATCCAAGT
TCAACGCGTTAGCAAACCTTGTTCCGAAGTCCGCTAGAAAGTCAGAAGACGATCTCTACA
GAGCGGTGGACATATTCTTGAAAGCTCATCCGAACCTAGACGAGATCGAAAGAGAGAAAG
TTTGTAGCTCAATGGACTCTCTCAAGCTTTCTTGCGACGCACGTCTCCACGCTTCGCAGA
ACAAGAGGTTACCGGTGAACATCGTTCTTCACGCGCTTTACTACGATCAGCTAAAGCTAA
GAAGCGCGGTTGAAGATAAAGAAGGAGAAGTAGTTATAGTCCCTGAGGCTTTAGCGACAC
GTGGACAGGTTAAAGCTGACACTACGTTGGCTAAAGAGAACGAAGCTTTGAGGAGTGAGC
TGATGAAGATGAAGATGTATGTTTCTGATCTACAGAAAAATGGTGGTGGAGCTTCTTCTT
CGAATGCAACGGCCTTGGTGAGCAATAAGAACAGCAAACATACTTTCTTCTCATCTGTTT
CGAAGAAGCTTGGGAAGTTGAATCCGTTTAGACATGGGTCTAAGGATACTTCTAACATTG
ATGAGGATCTTGCTGGTGTTGATATTACTAAGCCAAGAAGACGAAGATTCTCAATCTCCT
AAGTTAAGGAAACGTTTGATCCTTTAAGTTTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTATAAATT
TCTTAGTCCAGTGTGCTCTCTTTTGTTTACCTTTGATGCGTGATTTCATTAAAGAAGTTT
GGAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 

AF RR2BX91TF U 1
AF RR2FD71TF U 331
AF RR2BX91JQ C 506
AF RR2FD71JQ C 586
BS 1 673 RR2BX91TF
BS 674 674 RR2FD71TF
BS 675 682 RR2BX91TF
BS 683 683 RR2FD71TF
BS 684 707 RR2BX91TF
BS 708 708 RR2FD71TF
BS 709 733 RR2BX91TF
BS 734 734 RR2FD71TF
BS 735 754 RR2BX91TF
BS 755 1028 RR2FD71TF
BS 1029 1029 RR2BX91JQ
BS 1030 1077 RR2FD71TF
BS 1078 1078 RR2BX91JQ
BS 1079 1088 RR2FD71TF
BS 1089 1089 RR2BX91JQ
BS 1090 1103 RR2FD71TF
BS 1104 1104 RR2BX91JQ
BS 1105 1125 RR2FD71TF
BS 1126 1146 RR2BX91JQ

RD RR2BX91TF 768 0 0
GAGTCAAGTTTTCCGATCCGGAAAACAACGGCTCCGAGGAGAGAACTCAACAGAGATGTC
TCGTGGAGTCAATCGTCTCTCTCTTACCTTCAGACAAAGGACTTTTCCCGATCAACTTCC
TCTGTTCTCTCCTCCGTTGCGCTGACTTCGTGAACACTTCACTCGCATGCAAGAACGAGG
TCGAGACACGAATCTCCGCCGTTCTTGAACACGTCACCGTCGATGATCTCTTGATACCTT
CTTTCACCTACGACGGTGAAAGACTATTAGACCTAGACAGCGTCGGGAGAATCATCTCCG
GTTTTGCCGAAAGGGAGAAAAGCAAAGGGTTATGTTCTGTCTCGCTACAAAGAGTTGCAA
AGACCGTTGATTCTTATTTAGGGGAGATCGCTACTTGCTTGGAGCTCACGGTATCCAAGT
TCAACGCGTTAGCAAACCTTGTTCCGAAGTCCGCTAGAAAGTCAGAAGACGATCTCTACA
GAGCGGTGGACATATTCTTGAAAGCTCATCCGAACCTAGACGAGATCGAAAGAGAGAAAG
TTTGTAGCTCAATGGACTCTCTCAAGCTTTCTTGCGACGCACGTCTCCACGCTTCGCAGA
ACAAGAGGTTACCGGTGAACATCGTTCTTCACGCGCTTTACTACGATCAGCTAAAGCTAA
GAAGCGCGGTTGA*GATAAAGA*GGAGAAGTAGTTATAGTCCCTGAG*CTTTAGCGACAC
GTGGACAGGTTAA*GCTGACACTACGTTGGCTAA
GAGACGAGCTTTGA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2FD71TF 795 0 0
G
ATGTTCTGTCTCGCTACAAAGAGTTGCGAAGACCGTTGATTCTTATTTAGGGGAGATCGC
TACTTGCTTGGGGCTCACGGTATCCAAGTTCAACGCGTTAGCAAACCTTGTTCCGAAGTC
CGCTAGAAAGTCAGAAGACGATCTCTACAGAGCGGTGGACATATTCTTGAAAGCTCATCC
GAACCTAGACGAGATCGAAAGAGAGAAAGTTTGTAGCTCAATGGACTCTCTCAAGCTTTC
TTGCGACGCACGTCTCCACGCTTCGCAGAACAAGAGGTTACCGGTGAACATCGTTCTTCA
CGCGCTTTACTACGATCAGCTAAAGCTAAGAAGCGCGGTTGAAGATAAAGAAGGAGAAGT
AGTTATAGTCCCTGAGGCTTTAGCGACACGTGGACAGGTTAAAGCTGACACTACGTTGGC
TAAAGAGAACGAAGCTTTGAGGAGTGAGCTGATGAAGATGAAGATGTATGTTTCTGATCT
ACAGAAAAATGGTGGTGGAGCTTCTTCTTCGAATGCAACGGCCTTGGTGAGCAATAAGAA
CAGCAAACATACTTTCTTCTCATCTGTTTCGAAGAAGCTTGGGAAGTTGAATCCGTTTAG
ACATGGGTCTAAGGATACTTCTAACATTGATGAGGATCTTGCTGGTGTTGATATTACTAA
GCCAAGAAGACGAAGATTCTCAATCTCCTAAGTTAAG*AAACGTTTGATCCTTTAAGTTT
GTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTATAA*TTTCTTAGTC*AGTGTGCTCTCTTT*GTTTACC
TTTGATGCGTGATT

QA 2 795 2 795
DS 

RD RR2BX91JQ 641 0 0
TCATCCGAACCTAGACGAGATCGAAAGAGAGAAAGTTTGTAGCTCAATGGACTCTCTCAA
GCTTTCTTGCGACGCACGTCTCCACGCTTCGCAGAACAAGAGGTTACCGGTGAACATCGT
TCTTCACGCGCTTTACTACGATCAGCTAAAGCTAAGAAGCGCGGTTGAAGATAAAGAAGG
AGAAGTAGTTATAGTCCCTGAGGCTTTAGCGACACGTGGACAGGTTAAAGCTGACACTAC
GTTGGCTAAAGAGAACGAAGCTTTGAGGAGTGAGCTGATGAAGATGAAGATGTATGTTTC
TGATCTACAGAAAAATGGTGGGGGAGCTTCTTCTTCGAATGCAACGGCCTTGGTGAGCAA
TAAGAACAGCAAACATACTTTCTTCTCATCTGTTTCGAAGAAGCTTGGGAAGTTGAATCC
GTTTAGACATGGGTCTAAGGATACTTCTAACATTGATGAGGATCTTGCTGGTGTTGATAT
TACTAAGCCAAGAAGACGAAGATTCTCAATCTCCTAAGTTAAGGAAACGTTTGATCTTTT
AAGTTTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTATAAATTTCTTAGTCCAGTGTGCTCTCTTTTG
TTTGCCTTTGATGCGTGATTTCATTAAAGAAGTTTGGAAGT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2FD71JQ 557 0 0
TCCACGCTTCGCAGAACAAGAGGTTACCGGTGAACATCGTTCTTCACGCGCTTTACTACG
ATCAGCTAAAGCTAAGAAGCGCGGTTGAAGATAAAGAAGGAGAAGTAGTTATAGTCCCTG
AGGCTTTAGCGACACGTGGACAGGTTAAAGCTGACACTACGTTGGCTAAAGAGAACGAAG
CTTTGAGGAGTGAGCTGATGAAGATGAAGATGTATGTTTCTGATCTACAGAAAAATGGTG
GTGGAGCTTCTTCTTCGAATGCAACGGCCTTGGTGAGCAATAAGAACAGCAAACATACTT
TCTTCTCATCTGTTTCGAAGAAGCTTGGGAAGTTGAATCCGTTTAGACATGGGTCTAAGG
ATACTTCTAACATTGATGAGGATCTTGCTGGTGTTGATATTACTAAGCCAAGAAGACGAA
GATTCTCAATCTCCTAAGTTAAGGAAACGTTTGATCCTTTAAGTTTGTGTGTGTGTGTGT
TTGTGTGTATAAATTTCTTAGTCCAGTGTGCTCTCTTTTGTTTACCTTTGATGCGTGATT
TCATTAAAGAAGTTTGG

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL2793Contig1 725 2 14 U
GTCTGAAAAATTGAATACTAATTAATAGCATCGCAGATATCATAAAGTATGACACACAAA
TCAGCAATGTGACTCAGAGAGGATAAGAGTTGCCTTCAGGAGAAAAGGGAACACAAATAT
TGTCAACAAGTTCACATCACAATGTTAAACTCACTACCATGGGCTCTCACTTTAAATTCA
AATCTTTTATACATTTCTAGACCCAAAGAATATTACTCAAAAGATGGAAATTTTCAGGCA
AATACTCTGCTTTTGCTTCAATAGTGATATTTCCATGGGGGGAGATGGATACTTTAGAGA
GCTCAAGACCGCCTCAACATAGGAGACCCATCGGTTGGTTCTTGGAGGAGCTCTCGAGCA
AGTCGCACTGGTCTGTCTTGAAGATACGCAATGTCGCTGTTTGGTGCTGTTATGAGATGA
TGATCTTGTCCTTCTCCGTCTGTCTCGTCGGAGAGAGAAGATGCAGCTGATTCTTCTGAT
CCATCATCATCATCAGAGAACTCAAGGGCTTCTGGCTGTCCAACAGTTGAGAGCTGTATG
CTTTCTGGAAGGATACAGTTACAGAACGAACCTACACGAGCCATCCGGTTAATCCATCCG
GGAATAGGCTTTCCTGTTACCTGCAAGCACACTTCTTCAGTGAAATGGTTACAGTTCTTG
GCAATCAAATGGTATGTGTCCCCATGATACTTCCTCGAAAGCTTCTCCATGAATGAGCGG
AAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2EE35JQ U 1
AF RR2ER76JQ U 79
BS 1 188 RR2EE35JQ
BS 189 189 RR2ER76JQ
BS 190 238 RR2EE35JQ
BS 239 239 RR2ER76JQ
BS 240 290 RR2EE35JQ
BS 291 291 RR2ER76JQ
BS 292 311 RR2EE35JQ
BS 312 312 RR2ER76JQ
BS 313 344 RR2EE35JQ
BS 345 345 RR2ER76JQ
BS 346 449 RR2EE35JQ
BS 450 450 RR2ER76JQ
BS 451 645 RR2EE35JQ
BS 646 725 RR2ER76JQ

RD RR2EE35JQ 645 0 0
GTCTGAAAAATTGAATACTAATTAATAGCATCGCAGATATCATAAAGTATGACACACAAA
TCAGCAATGTGACTCAGAGAGGATAAGAGTTGCCTTCAGGAGAAAAGGGAACACAAATAT
TGTCAACAAGTTCACATCACAATGTTAAACTCACTACCATGGGCTCTCACTTTAAATTCA
AATCTTTT*TACATTTCTAGACCCAAAGAATATTACTCAAAAGATGGAAATTTTCAGGGA
AATACTCTGCTTTTGCTTCAATAGTGATATTTCCATGGGGGGAGATGGATGCTTTAGAGA
GCTCAAGACCGTCTCAACATAGGAGACCCATCGGTTGGTTCTTGTAGGAGCTCTCGAGCA
AGTCGCACTGGTCTGTCTTGAAGATACGCAATGTCGCTGTTTGGTGCTGTTATGAGATGA
TGATCTTGTCCTTCTCCGTCTGTCTCGTCTGAGAGAGAAGATGCAGCTGATTCTTCTGAT
CCATCATCATCATCAGAGAACTCAAGGGCTTCTGGCTGTCCAACAGTTGAGAGCTGTATG
CTTTCTGGAAGGATACAGTTACAGAACGAACCTACACGAGCCATCCGGTTAATCCATCCG
GGAATAGGCTTTCCTGTTACCTGCAAGCACACTTCTTCAGTGAAA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2ER76JQ 647 0 0
GAGGATAAGAGTTGCCTTCAGGAGAAATGGGAACACAAATATTGTCAACAAGTTCACATC
ATAATGTTAAACTCACTACCATGGGCTCTCACTTTAAATTCAAATCTTTTATACATTTCT
AGACCCAAAGAATAT*ACTCAAAAGATGGAAATTTTCAGGCAAATACTCTGCTTTTGCTT
CAATAGTGATATTTCCATGGGGG*AGATGGATACTTTAGAGAGCTCAAGACCGCCTCAAC
ATAGGAGACCCATCGGTTGGTTCTTGGAGGAGCTCTCGAGCAAGTCGCACTGGTCTGTCT
TGAAGATACGCAATGTCGCTGTTTGGTGCTGTTATGAGATGATGATCTTGTCCTTCTCCG
TCTGTCTCGTCGGAGAGAGAAGATGCAGCTGATTCTTCTGATCCATCATCATCATCAGAG
AACTCAAGGGCTTCTGGCTGTCCAACAGTTGTGAGCTGTATGCTTTCTGGAAGGATACAG
TTACAGAACGAACCTACACGAGCCATCCGGTTAATCCATCCGGGAATAGGCTTTCCTGTT
ACCTGCAAGCATACTTCTTCAGTGAAATGGTTACAGTTCTTGGCAATCAAATGGTATGTG
TCCCCATGATACTTCCTCGAAAGCTTCTCCATGAATGAGCGGAAATC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 4

CO CL2794Contig1 1346 4 3 U
AAACAAAAAGCACGCAAGTTTGATTATTTATCCCGGATTATCGTTACAAATTAAGTAGCT
TAAAACAGTACAAAGCTTATTGTATCGTTAGTTACAATAGTATTGTGCTTTGTTGCAATA
ACATAGAGGTGGACACATCTGCGACTCGTACACAACTTCACTTTCCTGTCATCTTTTTAG
CAAAGCTGCTTATGTCAAATGCATCATTGTCATTCTTTGTTATGACCCCCTTCTCGGTTA
TGATTCCTGCAATCGGCTCAGCTGGAGTCACATCAAAAGCTGGGTTCCAAACCGAGATCC
CTGGTGCTGCAATGCGTTCACCAAGCCCTCCATGTGTGTTCAGCAACTCCTTTGCTGTTC
TTTCTTCTATCACTATCTCTTTCCCGGACGACAGAGAAAGATCAACTGAGGTGAGAGGTG
CAGCAACATAAAACGGTATCCCGTGATGTTTTGCACACAGGGCGAGACTATAAGTCCCAA
TCTTGTTAGCAGTATCACCATTTGAAGCCACACGGTCTGCTCCAACAATGACACCATCTA
CACGACCATCTTTCATAAGTGCAGCTGCAGCTGAGTCTGCAATGAGAGTTGCAGGGATCT
TTTCATGCACCAACTCAAACGCCGTAAGCCTCGATCCTTGATTGAATGGACGTGTTTCTG
TGCAGTATGCCCTTTCTAAGACTCCTTGAGTGTGGAGTGCACGGATAACACCCAGGGCAG
TTCCATATCCGGCAGTAGCAAGGCTGCCGGTGTTGCAATGGGTCAGAACAGAAAGCTTGT
CAGGATTTTTGGCTTGCTGCCTCAGTAAGCTTGAACCAAAGGCCCCTATTGCTTTGTTTG
AAGCGACATCATCTTCGAGCATATTCTCAGCAGCTTTGATATATGCCTTGAAAATGGAGT
TAGGTTCAACGGCAGAAGTAGCCAAGGCATTTGCTATAACATGTTTAAGTTTCAAAGCAG
CATCCGCAAGATTAACAGCTGTTGGCCGGCTTGAAACCAAATAATCCAACTTCTTCTCAA
GGAGAGTAACAGCTTCTGCTGATGATCCATCGAAACCACTAAAGTTGGAGACTTCAACAG
CTAAAGAGAGAGCAGCAGCAATGGCTATAGCAGGAGCACCACGTACCACCATCTCCTGTA
TCGCACTCCATCCATCAGCAGCATCACGGATCTCTAAGTAAGTAGTCTCCAAAGGAAGCT
TCCTCTGATCGAGTAGCTGGAGAGAGCCAGGCTTGTAGCAAATAGACTTGAGGGTGGTGT
CTCCTTCGCTTGACATGCTTGCAGAAGATGTCGTTTCGATCTTTGAATTGGCGTCGGAAT
AAATGAATGCGTAAGACTGTGTGTCC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FV01JQ U 1
AF RR2FV01TF C 1
AF RR2BH75JQ U 2
AF RR2BH75TF C 437
BS 1 658 RR2FV01JQ
BS 659 779 RR2BH75JQ
BS 780 1346 RR2BH75TF

RD RR2FV01JQ 659 0 0
AAACAAAAAGCACGCAAGTTTGATTATTTATCCCGGATTATCGTTACAAATTAAGTAGCT
TAAAACAGTACAAAGCTTATTGTATCGTTAGTTACAATAGTATTGTGCTTTGTTGCAATA
ACATAGAGGTGGACACATCTGCGACTCGTACACAACTTCACTTTCCTGTCATCTTTTTAG
CAAAGCTGCTTATGTCAAATGCATCATTGTCATTCTTTGTTATGACCCCCTTCTCGGTTA
TGATTCCTGCAATCGGCTCAGCTGGAGTCACATCAAAAGCTGGGTTCCAAACCGAGATCC
CTGGTGCTGCAATGCGTTCACCAAGCCCTCCATGTGTGTTCAGCAACTCCTTTGCTGTTC
TTTCTTCTATCACTATCTCTTTCCCGGACGACAGAGAAAGATCAACTGAGGTGAGAGGTG
CAGCAACATAAAACGGTATCCCGTGATGTTTTGCACACAGGGCGAGACTATAAGTCCCAA
TCTTGTTAGCAGTATCACCATTTGAAGCCACACGGTCTGCTCCAACAATGACACCATCTA
CACGACCATCTTTCATAAGTGCAGCTGCAGCTGAGTCTGCAATGAGAGTTGCAGGGATCT
TTTCATGCACCAACTCAAACGCCGTAAGCCTCGATCCTTGATTGAATGGACGTGTTTC
C

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2FV01TF 659 0 0
A
AACAAAAAGCACGCAAGTTTGATTATTTATCCCGGATTATCGTTACAAATTAAGTAGCTT
AAAACAGTACAAAGCTTATTGTATCGTTAGTTACAATAGTATTGTGCTTTGTTGCAATAA
CATAGAGGTGGACACATCTGCGACTCGTACACAACTTCACTTTCCTGTCATCTTTTTAGC
AAAGCTGCTTATGTCAAATGCATCATTGTCATTCTTTGTTATGACCCCCTTCTCGGTTAT
GATTCCTGCAATCGGCTCAGCTGGAGTCACATCAAAAGCTGGGTTCCAAACCGAGATCCC
TGGTGCTGCAATGCGTTCACCAAGCCCTCCATGTGTGTTCAGCAACTCCTTTGCTGTTCT
TTCTTCTATCACTATCTCTTTCCCGGACGACAGAGAAAGATCAACTGAGGTGAGAGGTGC
AGCAACATAAAACGGTATCCCGTGATGTTTTGCACACAGGGCGAGACTATAAGTCCCAAT
CTTGTTAGCAGTATCACCATTTGAAGCCACACGGTCTGCTCCAACAATGACACCATCTAC
ACGACCATCTTTCATAAGTGCAGCTGCAGCTGAGTCTGCAATGAGAGTTGCAGGGATCTT
TTCATGCACCAACTCAAACGCCGTAAGCCTCGATCCTTGATTGAATGGACGTGTTTC
C

QA 2 658 2 658
DS 

RD RR2BH75JQ 778 0 0
AACAAAAAGCACGCAAGTTTGATTATTTATCCCGGATTATCGTTACAAATTAAGTAGCTT
AAAACAGTACAAAGCTTATTGTATCGTTAGTTACAATAGTATTGTGCTTTGTTGCAATAA
CATAGAGGTGGACACATCTGCGACTCGTACACAACTTCACTTTCCTGTCATCTTTTTAGC
AAAGCTGCTTATGTCAAATGCATCATTGTCATTCTTTGTTATGACCCCCTTCTCGGTTAT
GATTCCTGCAATCAGCTCAGCTGGAGTCAAATCAAAAGCTGGGTTCCAAACCGAGATCCC
TGGTGCTGCAATGCGTTCACCAAGCCCTCCATGTGTGTTCAGCAACTCCTTTGCTGTTCT
TTCTTCTATCACTATCTCTTTCCCGGACGACAGAGAAAGATCAACTGAGGTGAGAGGTGC
AGCAACATAAAACGGTATCCCGTGATGTTTTGCACACAGGGCGAGACTATAAGTCCCAAT
CTTGTTAGCAGTATCACCATTTGAAGCCACACGGTCTGCTCCAACAATGACACCATCTAC
ACGACCATCTTTCATAAGTGCAGCTGCAGCTGAGTCTGCAATGAGAGTTGCAGGGATCTT
TTCATGCACCAACTCAAACGCCGTAAGCCTCGATCCTTGATTGAATGGACGTGTTTCTGT
GCAGTATGCCCTTTCTAAGACTCCTTGAGTGTGGAGTGCACGGATAACACCCAGGGCAGT
TCCATATCCGGCAGTAGCAAGGCTGCCGGTGTTGCAATGGGTCAGAACAGAAAGCTTG

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2BH75TF 910 0 0
TATCCCGTGATGTTTTGCACACAGGGCGAGACTATAAGTCCCAATCTTGTTAGCAGTATC
ACCATTTGAAGCCACACGGTCTGCTCCAACAATGACACCATCTACACGACCATCTTTCAT
AAGTGCAGCTGCAGCTGAGTCTGCAATGAGAGTTGCAGGGATCTTTTCATGCACCAACTC
AAACGCCGTAAGCCTCGATCCTTGATTGAATGGACGTGTTTCTGTGCAGTATGCCCTTTC
TAAGACTCCTTGAGTGTGGAGTGCACGGATAACACCCAGGGCAGTTCCATATCCGGCAGT
AGCAAGGCTGCCGGTGTTGCAATGGGTCAGAACAGAAAGCTTGTCAGGATTTTTGGCTTG
CTGCCTCAGTAAGCTTGAACCAAAGGCCCCTATTGCTTTGTTTGAAGCGACATCATCTTC
GAGCATATTCTCAGCAGCTTTGATATATGCCTTGAAAATGGAGTTAGGTTCAACGGCAGA
AGTAGCCAAGGCATTTGCTATAACATGTTTAAGTTTCAAAGCAGCATCCGCAAGATTAAC
AGCTGTTGGCCGGCTTGAAACCAAATAATCCAACTTCTTCTCAAGGAGAGTAACAGCTTC
TGCTGATGATCCATCGAAACCACTAAAGTTGGAGACTTCAACAGCTAAAGAGAGAGCAGC
AGCAATGGCTATAGCAGGAGCACCACGTACCACCATCTCCTGTATCGCACTCCATCCATC
AGCAGCATCACGGATCTCTAAGTAAGTAGTCTCCAAAGGAAGCTTCCTCTGATCGAGTAG
CTGGAGAGAGCCAGGCTTGTAGCAAATAGACTTGAGGGTGGTGTCTCCTTCGCTTGACAT
GCTTGCAGAAGATGTCGTTTCGATCTTTGAATTGGCGTCGGAATAAATGAATGCGTAAGA
CTGTGTGTCC

QA 1 910 1 910
DS 



AS 1 3

CO CL2795Contig1 1244 3 5 U
AAACTGGTTATTTTACTTAGATTAAGTTTGTGCACAGAGTAATGATTATACAACTGATTT
AAATAACAAAATATACATCACCATATCAAGTTTTAAACCAATACTACTTATTAGTCTCTC
ACTCTACTTCTTAGCTTACTTAACTTAAGCGATACTTACAGGAGCTGCTCTCGACTCCTC
CTTACTTGTTCTAATACTACTTACTCTCTTTCACTCTACTTCTTAGCTTACTTAACTTTG
ACGCTGCTTACAGGAGCTCATGAGCTCAGCTTAGTCTTCCCACCTGGTCCTCTTCTTCTT
CTTCTTCTCTCCACGTATCTCCTTGATCAGCTCTTCAAGCTCTTCACACAGCGGTTCTGG
AGTCAGCTGAATCATCTCATCACCATCATCATCACCATCATCTGGATCCTCATCCTCAGC
CGAATCACTTATCCATCCACCCCGTCCGGAAAGATTGGCACCTGCAGAAGGATGTTGTGC
AAAACATGCTGGTGGAAACGCTGATGGTGGTGATGTGTAATCGATCACTGATGCTTCTCC
TGCTGCTGGTGATGAGTCCAAGATGTCTGTCTCGCTAGTGGTTGATAAAGCTTCAGTCTG
ACATGCCTTTGTACCTGTCTCGGCAACACACCCCAACAGAGACGTTGAGTTGCTACCGAC
ATGGTCTCTTAGCTGCTCTTCTTGCTCCTTTTCTTCTTCTTGCTGAGGCGTGTGTTCTTG
CTCTGCCTCAACCATCATCTCATGGTTTTGTTCTGGTTCTGCCTCCTCAGCCACCATCTC
ATCGTTTTGGTCTTTCTCTGCCTCAGCCATCATCTCATCGTTTTGTTCCTCCTCCTCAGC
CCTCTCTTCTACCCTATCTTCAGGCAAATTTGGGCCTTGTTCAGCTGACTTCTCAAGGCA
TTTGTTTAACAGCACCAAGTAACTACACTCTTCGATCAGAAACCACCCCTCCGCACCATA
CACCTCAAGCAATTCCTTGATAGACACATTGATAAGACGCTCCGCAAACCCAAAAGCTCT
CATGGCATCTCGTGCTGCATCCTCTCGCATCATTCCAGCCTTCTTTTTCCTTCCTCTAGG
CGCCATTCACAATGTTCTCTGAAGAAACCCAAAGGACAAAACAAAAAAAAACGGTTACTT
TCTACAATCAAACAAACAGAGGAACAAAACAACAATCTGGAACGAAAACCCTAACTAGGA
ACCAAAAAGATCGAAACTTTTTAATGAGAGAACAATTCCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ59JQ U 1
AF RR2D666JQ U 48
AF RR2D666TF C 612
BS 1 760 RR2BZ59JQ
BS 761 853 RR2D666JQ
BS 854 854 RR2D666TF
BS 855 863 RR2D666JQ
BS 864 1244 RR2D666TF

RD RR2BZ59JQ 760 0 0
AAACTGGTTATTTTACTTAGATTAAGTTTGTGCACAGAGTAATGATTATACAACTGATTT
AAATAACAAAATATACATCACCATATCAAGTTTTAAACCAATACTACTTATTAGTCTCTC
ACTCTACTTCTTAGCTTACTTAACTTAAGCGATACTTACAGGAGCTGCTCTCGACTCCTC
CTTACTTGTTCTAATACTACTTACTCTCTTTCACTCTACTTCTTAGCTTACTTAACTTTG
ACGCTGCTTACAGGAGCTCATGAGCTCAGCTTAGTCTTCCCACCTGGTCCTCTTCTTCTT
CTTCTTCTCTCCACGTATCTCCTTGATCAGCTCTTCAAGCTCTTCACACAGCGGTTCTGG
AGTCAGCTGAATCATCTCATCACCATCATCATCACCATCATCTGGATCCTCATCCTCAGC
CGAATCACTTATCCATCCACCCCGTCCGGAAAGATTGGCACCTGCAGAAGGATGTTGTGC
AAAACATGCTGGTGGAAACGCTGATGGTGGTGATGTGTAATCGATCACTGATGCTTCTCC
TGCTGCTGGTGATGAGTCCAAGATGTCTGTCTCGCTAGTGGTTGATAAAGCTTCAGTCTG
ACATGCCTTTGTACCTGTCTCGGCAACACACCCCAACAGAGACGTTGAGTTGCTACCGAC
ATGGTCTCTTAGCTGCTCTTCTTGCTCCTTTTCTTCTTCTTGCTGAGGCGTGTGTTCTTG
CTCTGCCTCAACCATCATCTCATGGTTTTGTTCTGGTTCT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2D666JQ 816 0 0
ATACAACTGATTTAAATAACAAAGTATACATCACCATATCAAGTTTTAAACCAATACTAC
TTATTAGTCTCTCACTCTACTTCTTAGCTTACTTAACTTAAGCGATACTTACAGGAGCTG
CTCTCGACTCCTCCTTACTTGTTCTAATACTACTTACTCTCTTTCACTCTACTTCTTAGC
TTACTTAACTTTGACGCTGCTTACAGGAGCTCATGAGCTCAGCTTAGTCTTCCCACCTGG
TCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTCCACGTATCTCCTTGATCAGCTCTTCAAGCTCTTCAC
ACAGCGGTTCTGGAGTCAGCTGAATCATCTCATCATCATCATCATCACCATCATCTGGAT
CCTCATCCTCAGCCGAATCACTTATCTATCCACCCCGTCCGGAAAGATTGGCACCTGCAG
AAGGATGTTGTGCAAAACCTGCTGGTGGAAGCGCTGATGGTGGTGATGTGTAATCGATCA
CTGATGCTTCTCCTGCTGCTGGTGATGAGTCCAAGATGTCTGTCTCGCTAGTGGTTGATA
AAGCTTCAGTCTGACATGCCTTTGTACCTGTCTCGGCAACACACCCCAACAGAGACGTTG
AGTTGCTACCGACATGGTCTCTTAGCTGCTCTTCTTGCTCCTTTTCTTCTTCTTGCTGAG
GCGTGTGTTCTTGCTCTGCCTCAACCATCATCTCATGGTTTTGTTCTGGTTCTGCCTCCT
CAGCCACCATCTCATCGTTTTGGTCTTTCTCTGCCTCAGCCATCATCTCATCGTTTTGTT
CCTCCTCCTCAGCCCTCTCTTCTACC*TATCTTCAG

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR2D666TF 633 0 0
GTA
CTGTCTCGGCAACACACCCCAACAGAGACGTTGAGTTGCTACCGACATGGTCTCTTAGCT
GCTCTTCTTGCTCCTTTTCTTCTTCTTGCTGAGGCGTGTGTTCTTGCTCTGCCTCAACCA
TCATCTCATGGTTTTGTTCTGGTTCTGCCTCCTCAGCCACCATCTCATCGTTTTGGTCTT
TCTCTGCCTCAGCCATCATCTCATCGTTTTGTTCCTCCTCCTCAGCCCTCTCTTCTACCC
TATCTTCAGGCAAATTTGGGCCTTGTTCAGCTGACTTCTCAAGGCATTTGTTTAACAGCA
CCAAGTAACTACACTCTTCGATCAGAAACCACCCCTCCGCACCATACACCTCAAGCAATT
CCTTGATAGACACATTGATAAGACGCTCCGCAAACCCAAAAGCTCTCATGGCATCTCGTG
CTGCATCCTCTCGCATCATTCCAGCCTTCTTTTTCCTTCCTCTAGGCGCCATTCACAATG
TTCTCTGAAGAAACCCAAAGGACAAAACAAAAAAAAACGGTTACTTTCTACAATCAAACA
AACAGAGGAACAAAACAACAATCTGGAACGAAAACCCTAACTAGGAACCAAAAAGATCGA
AACTTTTTAATGAGAGAACAATTCCAAAAA

QA 4 633 4 633
DS 



AS 1 4

CO CL2796Contig1 1218 4 20 U
GGAACGCCTTCCTTTCTCTCTCTCTCAACGCAAAGACCTCTCCACTGGCTTCCTCCTCCC
AAAGAGCTTAGGTAAG*GATGGATCATATGTACAAGAGCCAACTGCAGTCATATGCCATG
AAACAAAATATGGAGCTTCCCGTCTATGCCGCTGAGCGACAAGGACCTGCTCATGCTCCT
CGATTCCGCTGTAAGGTCACTGTTTTCGGACAGACTTTTCAGAGCCTAGAATTCTGTCCT
ACACTAAAAGCGGCTGAACATGCTGCTGCAAAAGTAGCATTGGCTTCGTTGACTCCACTT
AATCCAGAGGGAGTTGTTGATCTTGCTTACAAGAACCTGTTACAAGAAATTGCGCAGAAA
GAAAACTCTCTTTTACCAGTTTATGCTACTTCTACATCTGGTCCCTCTCATTCACCTACG
TTCACTTCAACCGTTGAGTTTGCGGGAAATGTCTACAAAGGAGAAGAAGCAAAAACAAAA
AAATTGGCTGAAATGAATGCTGCCAAGGTTGCATTCATGTGTATCAAATATGGAGAACCA
AACCAGACTCCATCGCCTTCTTTGCCTTGTGAGAAACAAGAAGCTGCAAATTCAAATGTG
AAGAGCAGTGAACAAGTGAGCCCTTCCCTACCTTCCAAGATGGTGACCCCTGATGTCCCA
TCAAAGTGGATTGAAGTGTACGAAGATGAACTTGCAGACGTTCTTAATGCACCAGCCGAT
AGTGTTAAGAACACAAACATTGCTGCCTCGCCTATGGCTACTCATCCTACTAACGATGCT
ACTCTTACAGTCGCACCAGCTACTAAAGTTATGGAGATGAACGTTGATGCTACAGACTTG
TCGAAGAAATCCACAAACAATGCTAACGAATCATGTGAGAAGAAGCTGGTAATGGGAAGT
GGGTACCAGAGTATACCGGGTGGCCAACATGTAGTATGTCGACCATGGAACCAAGATATG
ACTCTTCCTGAAGATGCGGAGATGCTGTTTAGAGACGACAGATTCATTTCTTATCGTGTC
CTGAAGCACTAGAAACAGCTCGTGCCTCCCCTACTAGTCTACTATTTTCTGTGTGCTTTG
AGTTGTTGCGATGGATGGAATAAACTAAGGTCAGAGGCTGGTTTTTTCGGATGTGTGTGT
GACCCTAGTAACGGCGAATGTTTTTTTAAGTAGTTGGTCATCTTTGTGTCACATTTGGTT
AAATAAAATACTATTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 5 30 30 30 10 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC68TF U 25
AF RR2FL80TF U 6
AF RR2F150TF U 1
AF RR2F150JQ C 360
BS 1 27 RR2F150TF
BS 28 28 RR2FL80TF
BS 29 44 RR2F150TF
BS 45 45 RR2CC68TF
BS 46 46 RR2F150TF
BS 47 48 RR2CC68TF
BS 49 66 RR2F150TF
BS 67 67 RR2CC68TF
BS 68 71 RR2F150TF
BS 72 72 RR2CC68TF
BS 73 75 RR2F150TF
BS 76 77 RR2CC68TF
BS 78 149 RR2F150TF
BS 150 150 RR2CC68TF
BS 151 179 RR2F150TF
BS 180 180 RR2CC68TF
BS 181 293 RR2F150TF
BS 294 294 RR2CC68TF
BS 295 792 RR2F150TF
BS 793 1218 RR2F150JQ

RD RR2CC68TF 705 0 0
GGAA
CGCAAAGACCTCTCCACTGGCTTCCTCCTCCTAAAGAGCTTAGGTAAG*GATGGATCATA
TGTACAAGAGCCAACTGCAGTCATATGCCATGAAACAAAATATGGAGCTTCCCGTCTATG
CCGCTGAGCGACAAGGACCTGCTCATGCTCCTCGATTCCGCTGTAAGGTCACTGTTTTCG
GACAGACTTTTCAGAGCCTAGAATTCTGTCCTACACTAAAAGCGGCTGAACATGCTGCTG
CAAAAGTAGCATTGGCTTCGTTGACTCCACTTAATCCAGAGGGAGTTGTTGATCTTGCTT
ACAAGAACCTGTTACAAGAAATTGCGCAGAAAGAAAACTCTCTTTTACCAGTTTATGCTA
CTTCTACATCTGGTCCTTCCCATGCACCTACTTTCACCTCAACTGTTGAGTTTGCGGGAA
ATGTCTACAAAGGAGAAGAAGCAAAAACAAAAAAATTGGCTGAAATGAATGCTGCCAAAG
TTGCTTTCATGTGTATAAAATATGGACAACCAAACCAGACTCCATCCCCTTCTTTGCCTT
GTGAGAAACAAGAAGCTGCAAACTCAAATGTGAAGAGCAGTGAACAAGTGAGCCCTTCCC
TACCTTCCAAGATGGTGACCCCTGATGTCCCATCAAAGTGGATTGAAGTGTACGAAGATG
AACTTGCAGACATTCTTAATGCAC
AGCCAATAGTGTTAGGA

QA 5 688 5 688
DS 

RD RR2FL80TF 718 0 0
GGGCCTCTC
TCTCTTTCTCTCAACGCAAAGACCTCTCCACTGGCTTCCTCCTCCCAAAGAGCTTAGGTA
AG*GATGGATCATATGTACAAGAGCCAACTGCAGTCATATGCCATGAAACAAAATATGGA
GCTTCCCGTCTATGCCGCTGAGCGACAAGGACCTGCTCATGCTCCTCGATTCCGCTGTAA
GGTCACTGTTTTCGGACAGACTTTTCAAAGCCTAGAATTCTGTCCTACACTAAAAGCGGC
TGAACATGCTGCTGCAAAAGTAGCATTGGCTTCGTTGACTCCACTTAATCCAGAGGGAGT
TGTTGATCTTGCTTACAAGAACCTGTTACAAGAAATTGCGCAGAAAGAAAACTCTCTTTT
ACCAGTTTATGCTACTTCTACATCTGGTCCTTCCCATGCACCTACTTTCACCTCAACTGT
TGAGTTTGCGGGAAATGTCTACAAAGGAGAAGAAGCAAAAACAAAAAAATTGGCTGAAAT
GAATGCTGCCAAAGTTGCTTTCATGTGTATAAAATATGGACAACCAAACCAGACTCCATC
CCCTTCTTTGCCTTGTGAGAAACAAGAAGCTGCAAACTCAAATGTGAAGAGCAGTGAACA
AGTGAGCCCTTCCCTACCTTCCAAGATGGTGACCCCTGATGTCCCATCAAAGTGGATTGA
AGTGTACGAAGATGAACTTGCAGACATTCTTAATGCAC
CAGCCATAGTG

QA 10 707 10 707
DS 

RD RR2F150TF 792 0 0
GGAACGCCTTCCTTTCTCTCTCTCTCACCGCAAAGACCTCTCCAGTCTCTTCCTCCTCCC
AAAGAGATTAGATAAAAGATGGATCATATGTACAAGAGCCAACTGCAGTCATATGCCATG
AAACAAAATATGGAGCTTCCCGTCTATGCAGCTGAGCGACAAGGACCTGCTCATGCTCCG
CGATTCCGCTGTAAGGTCACTGTTTTCGGACAGACTTTTCAGAGCCTAGAATTCTGTCCT
ACACTAAAAGCGGCTGAACATGCTGCTGCAAAAGTAGCATTGGCTTCGTTGACGCCACTT
AATCCAGAGGGAGTTGTTGATCTTGCTTACAAGAACCTGTTACAAGAAATTGCGCAGAAA
GAAAACTCTCTTTTACCAGTTTATGCTACTTCTACATCTGGTCCCTCTCATTCACCTACG
TTCACTTCAACCGTTGAGTTTGCGGGAAATGTCTACAAAGGAGAAGAAGCAAAAACAAAA
AAATTGGCTGAAATGAATGCTGCCAAGGTTGCATTCATGTGTATCAAATATGGAGAACCA
AACCAGACTCCATCGCCTTCTTTGCCTTGTGAGAAACAAGAAGCTGCAAATTCAAATGTG
AAGAGCAGTGAACAAGTGAGCCCTTCCCTACCTTCCAAGATGGTGACCCCTGATGTCCCA
TCAAAGTGGATTGAAGTGTACGAAGATGAACTTGCAGACGTTCTTAATGCACCAGCCGAT
AGTGTTAAGAACACAAACATTGCTGCCTCGCCTATGGCTACTCATCCTACTAACGATGCT
ACTCTTACAGTC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2F150JQ 859 0 0
AAG
AAACTCTCTTTTACCAGTTTATGCTACTTCTACATCTG*TCCCTCTCATTCAC*TACGTT
CACTTCAACCGTTGAGTTTGCGGGAAATGTCTACAAAGGAGAAGAAGCAAAAACAAAAAA
ATTGGCTGAAATGAATGCTGCCAAGGTTGCATTCATGTGTATCAAATATGGAGAACCAAA
CCAGACTCCATCGCCTTCTTTGCCTTGTGAGAAACAAGAAGCTGCAAATTCAAATGTGAA
GAGCAGTGAACAAGTGAGCCCTTCCCTACCTTCCAAGATGGTGACCCCTGATGTCCCATC
AAAGTGGATTGAAGTGTACGAAGATGAACTTGCAGACGTTCTTAATGCACCAGCCGATAG
TGTTAAGAACACAAACATTGCTGCCTCGCCTATGGCTACTCATCCTACTAACGATGCTAC
TCTTACAGTCGCACCAGCTACTAAAGTTATGGAGATGAACGTTGATGCTACAGACTTGTC
GAAGAAATCCACAAACAATGCTAACGAATCATGTGAGAAGAAGCTGGTAATGGGAAGTGG
GTACCAGAGTATACCGGGTGGCCAACATGTAGTATGTCGACCATGGAACCAAGATATGAC
TCTTCCTGAAGATGCGGAGATGCTGTTTAGAGACGACAGATTCATTTCTTATCGTGTCCT
GAAGCACTAGAAACAGCTCGTGCCTCCCCTACTAGTCTACTATTTTCTGTGTGCTTTGAG
TTGTTGCGATGGATGGAATAAACTAAGGTCAGAGGCTGGTTTTTTCGGATGTGTGTGTGA
CCCTAGTAACGGCGAATGTTTTTTTAAGTAGTTGGTCATCTTTGTGTCACATTTGGTTAA
ATAAAATACTATTTCT

QA 4 859 4 859
DS 



AS 1 3

CO CL2797Contig1 1056 3 6 U
CAAGTGTTATGTCTAGTTTGAAGAAGCAAAATAACACAATTTGTAAAATGAGCACTTACC
ATTTAAAAGCAGACAAAACATAAGACGGGAACGCATTGTGTTTAGCAGTAAGGGTCTTGA
CCGAGTCTAGACTCGCAGTTTCATCAAAAGAAGAGAGACCAAGCCCACTACCATGAATCC
CTCCAGTGATGAACACTGATTCAATCCCTGCAACATTAGCTCCCTTTATGTCATGGTGAA
GCGAGTCTCCCACTGCAATAGCCTCCTCTGGATTCTCAACTCCTGCAATCGCCATAGCAA
ACTCATAGATCATCTTGTGAGGCTTCCCCATCCATTTCACTTCTCCTCCAAGCTCTTCAT
ACTTGGCAGCCAGCGTGCCCGGCATGATGTGGAAAGCGTTTGCTTCGACAGTCACGTAAT
CTGGATTAGCAACGATCATGGGGAGTTTTCGAGCTGCAGATTTCTCCAAGATCTTCTCGA
GCTCGTCGAGAGGCATGGGAGATACACCACCTGAAGGAAGTCCTATGGCTTCAGTGCCGT
GAGCTAAAACAAAGTCGGCTTCCTCCACGTTCTCCACAACGCTTAGATCAAGACCTTCCA
AAGAGATTGCTCCTCGGTCTTTCCAAGTGATGTGGATGCAACGGTTTCCTAGTGCAGCGA
ACCAAGGGTCATCTCTCCTCTGCAAAGATTGATGGGTGAGTTCACCACTGGTAATAGCTC
CAGAGAAGAAAGAAGGATCAAAGCCAAGTCCTTTCAGCTTTTCCATTGTAGTTAAAGCGC
GTCTAGAGGAGTTGCTTATGATCACGATCTTCGCACCCACTGTTGCTAGATTCTTTAAAG
TTGAGATAGCGCCGGGGTAAGGTTGTTTGCCATCATGAAGGACTCCATACTGATCTAACA
GCCATGCCTTAAAGTTCCGTGTCTCGGCGATGTCTTTGAGTCCATTCATTGGCTGGGAGA
GTTTAGGAGAAGAGAGCATTTTTCTTACTGCAACCACAGAAGATAGTCCCCACAAGAAAG
AAGAAGAACACCTTAGAACCAAAACTAATCTGTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F292JQ U 1
AF RR2E913JQ U 1
AF RR2E913TF C 352
BS 1 45 RR2E913JQ
BS 46 46 RR2F292JQ
BS 47 164 RR2E913JQ
BS 165 165 RR2F292JQ
BS 166 748 RR2E913JQ
BS 749 1056 RR2E913TF

RD RR2F292JQ 710 0 0
CAAGTGTTATGTCTAGTTTGAAGAAGCAAAATAACACAATTTGTAAAATGAGCACTTACC
ATTTAAAAGCAGACAAAACATAAGACGGGAACGCATTGTGTTTAGCAGTAAGGGTCTTGA
CCGAGTCTAGACTCGCAGTTTCATCAAAAGAAGAGAGACCAAGCCCACTACCATGAATCC
CTCCAGTGATGAACACTGATTCAATCCCTGCAACATTAGCTCCCTTTATGTCATGGTGAA
GCGAGTCTCCCACTGCAATAGCCTCCTCTGGATTCTCAACTCCTGCAATCGCCATAGCAG
ACTCATAGATCATCTTGTGAGGCTTCCCCATCCATTTCACTTCTCCTCCAAGCTCTTCAT
ACTTGGCAGCCAGCGTGCCCGGCATGATGTGGAAAGCGTTTGCTTCGACAGTCACGTAAT
CTGGATTAGCAACGATCATGGGGAGTTTTCGAGCTGCAGATTTCTCCAAGATCTTCTCGA
GCTCGTCGAGAGGCATGGGAGATACACCACCTGAAGGAAGTCCTATGGCTTCAGTGCCGT
GAGCTAAAACAAAGTCGGCTTCCTCCACGTTCTCCACAACGCTTAGATCAAGACCTTCCA
AAGAGATTGCTCCTCGGTCTTTCCAAGTGATGTGGATGCAACGGTTTCCTAGTGCAGCGA
ACCAAGGGTCATCTCTCCTCTGCAAAGATTGAT
AGGTAAAGTTGAGATAG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2E913JQ 748 0 0
CAAGTGTTATGTCTAGTTTGAAGAAGCAAAATAACACAATTTGTACAATGAGCACTTACC
ATTTAAAAGCAGACAAAACATAAGACGGGAACGCATTGTGTTTAGCAGTAAGGGTCTTGA
CCGAGTCTAGACTCGCAGTTTCATCAAAAGAAGAGAGACCAAGCTCACTACCATGAATCC
CTCCAGTGATGAACACTGATTCAATCCCTGCAACATTAGCTCCCTTTATGTCATGGTGAA
GCGAGTCTCCCACTGCAATAGCCTCCTCTGGATTCTCAACTCCTGCAATCGCCATAGCAA
ACTCATAGATCATCTTGTGAGGCTTCCCCATCCATTTCACTTCTCCTCCAAGCTCTTCAT
ACTTGGCAGCCAGCGTGCCCGGCATGATGTGGAAAGCGTTTGCTTCGACAGTCACGTAAT
CTGGATTAGCAACGATCATGGGGAGTTTTCGAGCTGCAGATTTCTCCAAGATCTTCTCGA
GCTCGTCGAGAGGCATGGGAGATACACCACCTGAAGGAAGTCCTATGGCTTCAGTGCCGT
GAGCTAAAACAAAGTCGGCTTCCTCCACGTTCTCCACAACGCTTAGATCAAGACCTTCCA
AAGAGATTGCTCCTCGGTCTTTCCAAGTGATGTGGATGCAACGGTTTCCTAGTGCAGCGA
ACCAAGGGTCATCTCTCCTCTGCAAAGATTGATGGGTGAGTTCACCACTGGTAATAGCTC
CAGAGAAGAAAGAAGGATCAAAGCCAAG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2E913TF 705 0 0
AGCTC
TCATACTTGGCAGCCAGCGTGCCCGGCATGATGTGGAAAGCGTTTGCTTCGACAGTCACG
TAATCTGGATTAGCAACGATCATGGGGAGTTTTCGAGCTGCAGATTTCTCCAAGATCTTC
TCGAGCTCGTCGAGAGGCATGGGAGATACACCACCTGAAGGAAGTCCTATGGCTTCAGTG
CCGTGAGCTAAAACAAAGTCGGCTTCCTCCACGTTCTCCACAACGCTTAGATCAAGACCT
TCCAAAGAGATTGCTCCTCGGTCTTTCCAAGTGATGTGGATGCAACGGTTTCCTAGTGCA
GCGAACCAAGGGTCATCTCTCCTCTGCAAAGATTGATGGGTGAGTTCACCACTGGTAATA
GCTCCAGAGAAGAAAGAAGGATCAAAGCCAAGTCCTTTCAGCTTTTCCATTGTAGTTAAA
GCGCGTCTAGAGGAGTTGCTTATGATCACGATCTTCGCACCCACTGTTGCTAGATTCTTT
AAAGTTGAGATAGCGCCGGGGTAAGGTTGTTTGCCATCATGAAGGACTCCATACTGATCT
AACAGCCATGCCTTAAAGTTCCGTGTCTCGGCGATGTCTTTGAGTCCATTCATTGGCTGG
GAGAGTTTAGGAGAAGAGAGCATTTTTCTTACTGCAACCACAGAAGATAGTCCCCACAAG
AAAGAAGAAGAACACCTTAGAACCAAAACTAATCTGTTCC

QA 6 705 6 705
DS 



AS 1 3

CO CL2798Contig1 1144 3 25 U
GGACCATTTGCGACATTCATTGTTCAGAAGGGCACTTTGAAAAGAGGGGATGTTGTTGTC
TGTGGAGAAGCTTTCGGAAAGGTACGAGCTTTATTTGATCACAGCGGGGAACGAGTTGAT
GAAGCTGGACCCTCCATACCTGTACAGGTGATTGGTTTAAACAATGTACCCATTGCTGGT
GACGAGTTTGAGATTGTGTCTTCCCTTGATGTGGCGCGTGAGATGGCAGAGGCACGTGCA
GTATCACTACGAGATGAAAGGATATCTGCAAAGGCTGGGGATGGAAAAGTCACGCTCTCA
TCCTTAGCTTCTGCTGTAACAGCCAAAAAGATGTCAGGCTTAGATTTGCATCAGCTTAAT
ATCATCTTGAAGGTCGATGTACAGGGATCCATTGAAGCTGTCAGACAAGCTCTGCAGGTG
CTTCCTCAAGAGAATGTGGCATTGAAATTTTTGCTACAAGCGACAGGGGATGTGAGCAAC
AGTGACGTTGATTTAGCGTCGGCTAGTGAAGCCATCATTTTCGGATTTAATGTCAAAGCA
TCTGGCTCCGTTAAAAAAGCTGCAGAAAACAAAGGTGTTGAAATCCGGCTATACAGAGTT
ATCTATGAGCTTATTGACGATGTACGAAACGCAATGGAAGGACTTCTCGAGTCTGTTGAG
GAACAAATCCCAATAGGGTCAGCAGAAGTTAGAGCTACTTTCAGCAGTGGAAGCGGTCGT
GTGGCTGGATGCATGGTGAATGAAGGCAAATTTGTCAAAGATTGTGGCATCAGGGTGATC
AGGAAGGGTAAAACCGTCCATGTCGGTGTCCTTGATTCTTTTAAACGTGTCAAAGAAAAT
GTGAAAGAGGTGAGTGCTGGATTAGAATGCGGTATTGGTATGGATGACTATGATGATTGG
ATTGAAGGAGACACCATTGAGGCCTTTAGCGCGGTTCAAAAGAGGAGAACGTTAGAAGAA
GCATCGGCTTCAATGTTTGCTGCAATTGAAGAGGCTGGAGTTTGAGCTGTAATTTTTAGT
CATCAAAGAAGCAAACAGGGTACAGCTTTGAGTCACACAACAGTTTGGTTGGTACATTGT
GTGTGTATGGTCTCATGTTGTATATGGTAAATGTTTTCTCTACATTCAGTTGATTAATGT
AGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2EL85TF U 1
AF RR2AL59TF U 59
AF RR2AL59JQ C 361
BS 1 296 RR2EL85TF
BS 297 297 RR2AL59TF
BS 298 416 RR2EL85TF
BS 417 417 RR2AL59TF
BS 418 438 RR2EL85TF
BS 439 439 RR2AL59TF
BS 440 482 RR2EL85TF
BS 483 483 RR2AL59TF
BS 484 485 RR2EL85TF
BS 486 486 RR2AL59TF
BS 487 524 RR2EL85TF
BS 525 525 RR2AL59TF
BS 526 548 RR2EL85TF
BS 549 549 RR2AL59TF
BS 550 629 RR2EL85TF
BS 630 630 RR2AL59TF
BS 631 639 RR2EL85TF
BS 640 640 RR2AL59TF
BS 641 647 RR2EL85TF
BS 648 648 RR2AL59TF
BS 649 666 RR2EL85TF
BS 667 745 RR2AL59TF
BS 746 746 RR2AL59JQ
BS 747 792 RR2AL59TF
BS 793 1144 RR2AL59JQ

RD RR2EL85TF 666 0 0
GGACCATTTGCGACATTCATTGTTCAGAAGGGCACTTTGAAAAGAGGGGATGTTGTTGTC
TGTGGAGAAGCTTTCGGAAAGGTACGAGCTTTATTTGATCACAGCGGGGAACGAGTTGAT
GAAGCTGGACCCTCCATACCTGTACAGGTGATTGGTTTAAACAATGTACCCATTGCTGGT
GACGAGTTTGAGATTGTGTCTTCCCTTGATGTGGCGCGTGAGATGGCAGAGGCACGTGCA
GTATCACTACGAGATGAAAGGATATCTGCAAAGGCTGGGGATGGAAAAGTCACGCTTTCA
TCCTTAGCTTCTGCTGTAACAGCCAAAAAGATGTCAGGCTTAGATTTGCATCAGCTTAAT
ATCATCTTGAAGGTCGATGTACAGGGATCCATTGAAGCTGTCAGACAAGCTCTGCAAGTG
CTTCCTCAAGAGAATGTGACATTGAAATTTTTGCTACAAGCGACAGGGGATGTGAGCAAC
AGCGATGTTGATTTAGCGTCGGCTAGTGAAGCCATCATTTTCGGGTTTAATGTCAAAGCA
TCTGGCTCTGTTAAAAAAGCTGCAGAAAACAAAGGTGTTGAAATCCGGCTATACAGAGTT
ATCTATGAGCTTATTGACGATGTACGAAATGCAATGGAAAGACTTCTTGAGTCTGTTGAG
GAACAA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2AL59TF 742 0 0
TCTGTGGAGAAGCTTTCGGAAAGGTACGAGCTTTATTTGATCACAGCGGGGAACGAGTTG
ATGAAGCTGGACCCTCCATACCTGTACAGGTGATTGGTTTAAACAATGTACCCATTGCTG
GTGACGAGTTTGAGATTGTGTCTTCCCTTGATGTGGCGCGTGAGATGGCAGAGGCACGTG
CAGTATCACTACGAGATGAAAGGATATCTGCAAAGGCTGGGGATGGAAAAGTCACGCTCT
CATCCTTAGCTTCTGCTGTATCAGCCAAAAAGATGTCAGGCTTAGATTTGCATCAGCTTA
ATATCATCTTGAAGGTCGATGTACAGGGATCCATTGAAGCTGTCAGACAAGCTCTGCAGG
TGCTTCCTCAAGAGAATGTGGCATTGAAATTTTTGCTACAAGCGACAGGGGATGTGAGCA
ACAGTGACGTTGATTTAGCGTCGGCTAGTGAAGCCATCATTTTCGGATTTAATGTCAAAG
CATCTGGCTCCGTTAAAAAAGCTGCAGAAAACAAAGGTGTTGAAATCCGGCTATACAGAG
TTATCTATGAGCTTATTGACGATGTACGAAACGCAATGGAAGGACTTCTCGAGTCTGTTG
AGGAACAAATCCCAATAGGGTCAGCAGAAGTTAGAGCTACTTTCAGCAGTGGAAGCGGTC
GTGTGGCTGGATGCATGGTGAATGAAG*CAAATTTGTCAAAGATTGTGGCATCAGGGTGA
TCAGGAAGGGTAAA
CCGTCCAT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2AL59JQ 784 0 0
ATCATCTTGAAGGTCGATGTACAGGGATCCATTGAAGCTGTCAGACAAGCTCTGCAGGTG
CTTCCTCAAGAGAATGTGGCATTGAAATTTTTGCTACAAGCGACAGGGGATGTGAGCAAC
AGTGACGTTGATTTAGCGTCGGCTAGTGAAGCCATCATTTTCGGATTTAATGTCAAAGCA
TCTGGCTCCGTTAAAAAAGCTGCAGAAAACAAAGGTGTTGAAATCCGGCTATACAGAGTT
ATCTATGAGCTTATTGACGATGTACGAAACGCAATGGAAGGACTTCTCGAGTCTGTTGAG
GAACAAATCCCAATAGGGTCAGCAGAAGTTAGAGCTACTTTCAGCAGTGGAAGCGGTCGT
GTGGCTGGATGCATGGTGAATGAAGGCAAATTTGTCAAAGATTGTGGCATCAGGGTGATC
AGGAAGGGTAAAACCGTCCATGTCGGTGTCCTTGATTCTTTTAAACGTGTCAAAGAAAAT
GTGAAAGAGGTGAGTGCTGGATTAGAATGCGGTATTGGTATGGATGACTATGATGATTGG
ATTGAAGGAGACACCATTGAGGCCTTTAGCGCGGTTCAAAAGAGGAGAACGTTAGAAGAA
GCATCGGCTTCAATGTTTGCTGCAATTGAAGAGGCTGGAGTTTGAGCTGTAATTTTTAGT
CATCAAAGAAGCAAACAGGGTACAGCTTTGAGTCACACAACAGTTTGGTTGGTACATTGT
GTGTGTATGGTCTCATGTTGTATATGGTAAATGTTTTCTCTACATTCAGTTGATTAATGT
AGGG

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 3

CO CL2799Contig1 827 3 3 U
CTTTTTAAAAATTTTATGTAAAGTTGAGATCAATCCACAATCAACACCAACAAGGGAAAA
ATCATGTTATTTATCATCATGATAAAGATGATTACAATTAAAAATACCGTCTGTTTTTTT
TTTCTCTCAAGCTCCGTATTTTGGGGCCTTCCAAAGTTTGAAAGCAACTTCGTGGATGAG
CCGATCAGCCGGTATAACAAGACTTCCAGAGAGCTTTTTCAGAGCTTCGAAAGATAATGT
ATCAACTAAGTCCTTCCGTGTCACTGCATCCTGCCACTGAGCTACCAACATAGGGCAGTA
GTCCCGAACATCATCTCGTGTCTTTTCACCTCGCATGGTGTAGCTCTGACGCGGGACTAA
TCCTTGAAACGCCGGGTTAACACGAGAATCTCGTGGAGCCTTGACAGAATAAACTGAGAC
ATCCTTGTCCGTGGCGGAACCGTAGCTGAGAACAAGCGAGAGATGCAAGCGAGGTACAAT
CTCTGAACCAGGCTGAGCCATTCTCATAACACTACCAATCAAAGAGTCGATCATTCCCAC
GTTATCACCACCACCACC***TATATGCACAAAAACGGAGTCGTATAGGCTCACATCCAA
GCACTTTCCTCCTTCAAAGCCAAGCAGCCTTGAGGAAGGCTCAAGAAGCCGCAGGTACCG
ACGGAAGCGAGAGAATGGATGTGAGTATTCGACGGGTTGACGGATCGAGCCAAGCCGTCT
CCGTAAATTACAAGCGCTCTGCTTGGTTTGTCCGCCATTCTTGTCAACAGGTAGACACGA
AGTGGGGCTGTCGGAGAGAGAGAGAGTGGGGGAATAATCTGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EC85JQ U 7
AF RR2AT06JQ U 1
AF RR2AT06TF C 124
BS 1 122 RR2AT06JQ
BS 123 123 RR2EC85JQ
BS 124 827 RR2AT06JQ

RD RR2EC85JQ 629 0 0
AAAAATTTTATGTAAAGTTGAGATCAATCCACAATCAACACCAACAAGGGAAAAATCATG
TTATTTATCATCATGATAAAGATGATTACAATTAAAAATACCGTCTGTTTTTTTTTTCTC
TCAAGCTCCGTATTTTGGGGCCTTCCAAAGTTTGAAAGCAACTTCGTGGATGAACCGATC
AGCCGGTATAACAAGACTTCCAGAGAGCTTTTTCAGAGCTTCGAAAGATAATGTATCAAC
TAAGTCCTTCCGTGTCACTGCATCCTGCCACTGAGCTACCAACATAGGGCAGTAGTCCCG
AACATCATCTCGTGTCTTTTCACCTCGCATGGTGTAGCTCTGACGCGGAACTAATCCTTG
AAACGCCGGGTTAACACGAGAATCTCGTGGAGCCT*GACAGAATAAACTGAGACATCCTT
GTCCGTGACGGAACCGTAGCTGAAAACAAGCGAGAGATGCAAGCGAGGTACAATCTCTGA
ACCAGGCTGAGCCATTCTCATAACACTACCAATCAAAGAGTCGATCATTCCCACGTTATC
ACCACCACCACCACCTATATGCACAAAAACGGAGTCGTATAGGCTCACATCCAAGCACTT
TCCTCCTTCAAAGCCAAGCAGCCT
CAGTA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2AT06JQ 827 0 0
CTTTTTAAAAATTTTATGTAAAGTTGAGATCAATCCACAATCAACACCAACAAGGGAAAA
ATCATGTTATTTATCATCATGATAAAGATGATTACAATTAAAAATACCGTCTGTTTTTTT
TT*CTCTCAAGCTCCGTATTTTGGGGCCTTCCAAAGTTTGAAAGCAACTTCGTGGATGAG
CCGATCAGCCGGTATAACAAGACTTCCAGAGAGCTTTTTCAGAGCTTCGAAAGATAATGT
ATCAACTAAGTCCTTCCGTGTCACTGCATCCTGCCACTGAGCTACCAACATAGGGCAGTA
GTCCCGAACATCATCTCGTGTCTTTTCACCTCGCATGGTGTAGCTCTGACGCGGGACTAA
TCCTTGAAACGCCGGGTTAACACGAGAATCTCGTGGAGCCTTGACAGAATAAACTGAGAC
ATCCTTGTCCGTGGCGGAACCGTAGCTGAGAACAAGCGAGAGATGCAAGCGAGGTACAAT
CTCTGAACCAGGCTGAGCCATTCTCATAACACTACCAATCAAAGAGTCGATCATTCCCAC
GTTATCACCACCACCACC***TATATGCACAAAAACGGAGTCGTATAGGCTCACATCCAA
GCACTTTCCTCCTTCAAAGCCAAGCAGCCTTGAGGAAGGCTCAAGAAGCCGCAGGTACCG
ACGGAAGCGAGAGAATGGATGTGAGTATTCGACGGGTTGACGGATCGAGCCAAGCCGTCT
CCGTAAATTACAAGCGCTCTGCTTGGTTTGTCCGCCATTCTTGTCAACAGGTAGACACGA
AGTGGGGCTGTCGGAGAGAGAGAGAGTGGGGGAATAATCTGATCTCC

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2AT06TF 704 0 0
CTCTCAAGCTCCGTATTTTGGGGCTTTCCAAAGTTTGAAAGCAACTTCGTGGATGAGCCG
ATCAGCCGGTATAACAAGACTTCCAGAGAGCTTTTTCAGAGCTTCGAAAGATAATGTATC
AACTAAGTCCTTCCGTGTCACTGCATCCTGCCACTGAGCTACCAACATAGGGCAGTAGTC
CCGAACATCATCTCGTGTCTTTTCACCTCGCATGGTGTAGCTCTGACGCGGGACTAATCC
TTGAAACGCCGGGTTAACACGAGAATCTCGTGGAGCCTTGACAGAATAAACTGAGACATC
CTTGTCCGTGGCGGAACCGTAGCTGAGAACAAGCGAGAGATGCAAGCGAGGTACAATCTC
TGAACCAGGCTGAGCCATTCTCATAACACTACCAATCAAAGAGTCGATCATTCCCACGTT
ATCACCACCACCACC***TATATGCACAAAAACGGAGTCGTATAGGCTCACATCCAAGCA
CTTTCCTCCTTCAAAGCCAAGCAGCCTTGAGGAAGGCTCAAGAAGCCGCAGGTACCGACG
GAAGCGAGAGAATGGATGTGAGTATTCGACGGGTTGACGGATCGAGCCAAGCCGTCTCCG
TAAATTACAAGCGCTCTGCTTGGTTTGTCCGCCATTCTTGTCAACAGGTAGACACGAAGT
GGGGCTGTCGGAGAGAGAGAGAGTGGGG*AATAATCTGATCTCC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 4

CO CL2800Contig1 1767 4 16 U
GGAAAATAACAATATTAAAAAAAAACAGAGAGGGGATGTGGTTGAGTGATTGCAGAAGCT
ACACAAAGAGAGAAAGCGTCAAGAAAGTCTTCTCTTTCACACCTTTCGTTTTCTCGAACC
TCTCTTTTTAATGAAAGATGGTGGAGGAATCTTCAGTTTGACAACTCATTAACAGTAACA
CTTCCCTCTTTTAAGCTTGCAAGGAACCTCCTCCGTTTTTGCTTTCACTTCCTCCTCATC
ATTCTCTCCTTTCAGTTTGATCCTCCTTTGATAAAAGCTTGTAGTATCTTTTCTTCTTCA
AGCTTTAAGAAACGCAACTTCTTCTTCTCTTTTTTTGGTGTCTCCTGTGGAGAGATGGGA
TTGTGTAAAAACGGAAACTTTACTATCTGGGTCTTTCCCATTTTGGTTTCTAATTAGTTA
TTTTCTTCTTTAGGAGGTTTATTTAGTTGTTTAACTTTTTAAGACATGGAGGATATTGAA
GGAGCAAACAGAGCAGCTGTAGAGTCTTGTCATAGAGTTCTTAACCTCTTATGTACACCA
CATCAACAAGATCATGTGAGTTTAGTGTCCGAAAGTACAGGAGCTGTGTCTAGGTTCGAG
AGAGTGGGGAGTCTGTTAAGTACTAGTGTGGGTCATGCCAGGTTTAGAAGAGACAAGAAA
CCTCAGTCTCATTTGTCTCAAACCATCTTCCTTGATCCTGTTCACCAAAGAACAGAACCT
CCACCATCTCAGAAAGCACCGGTGGTGATGCTCCGGTCTGGTTTCCATGAGTTGAGCACT
GATTCCCTCACTTTAGGGACCAGGTCCTTCAGTTTGAACTCAAATGCAAAAGCAAAAGCG
CCTCTCCTTCAGCTTAACCAGGCAATGCCTTCTTCAAATGATCTGAATATGTTTCCTGAA
CATCGACAGCAACAAGAGTTACATGAACGGTTACAGGCTCACCATCATCATCAGCAGCAG
CAGCAGCAACAACTACAGAGACGTCAAGCTGAGATGATGATGCTAAGGAAGTGCAACGGC
GGGATAAGTTTGAGTTTTGATAACTCGAGTTGTACTCAAACCATGTCATCCACAAGGTCC
TTTGTTTCATCGCTTAGCATTGATGGTAGCGTTGCTAATGTAGAAGGAAGGAACTCCTTC
CATTTGGTAGGGGACCAGAGTTTATCACACTTTAAGAGAAGATGCCTCATGAAAGGAGGC
GAGCATGGAAGCATGAAATGCGGGAGCTCTAGCCGATGCCACTGCTCTAAGAAGAGGAAA
CATAGGGTTAGGAGATCGATCAGAGTGCCTGCTATCAGTAACAA*GGTTTCAGATATCCC
TCCTGATGATTATTCGTGGGGAAAGTATGGTCAGAAACCCATCAAGGGCTCTCCTTATCC
CAGAGGATATTACAAATGCAGTAGCATGAGAGCTTGTCCAGCGAGGAAGCACGTTGAGAG
ATGCTTGGAAGATCCTGCTATGCTTATTGTTACTTATGAAGCAGAGCATAACCACCCTAA
ATTGCCATCTCAAACCGTGACAACTTAACTTTTATTGTATCATGTGTCTTCCTTTGTGTG
CTTTGCTCCATTATTATGTGATACATGATTCGGAGCAGTGCCTTTGTCTTGGGGGGGGGG
GGTTTCTGCAATAGTTGTTGGGTTTGTGTTTAGCGGGTAAAAATGTAGGATTTGTCAAGA
CTCGTCTCTCAAGTTTATTACTGCTCTTACTGATGTTTTTTTCTCTGCTTCCATTTGAGT
AGTATTAGTACAAAATAACTGGATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV26TF U 1
AF RR2A835TF U 606
AF RR2CV26JQ C 976
AF RR2A835JQ C 1022
BS 1 679 RR2CV26TF
BS 680 1002 RR2A835TF
BS 1003 1003 RR2CV26JQ
BS 1004 1171 RR2A835TF
BS 1172 1172 RR2CV26JQ
BS 1173 1304 RR2A835TF
BS 1305 1305 RR2CV26JQ
BS 1306 1339 RR2A835TF
BS 1340 1340 RR2CV26JQ
BS 1341 1425 RR2A835TF
BS 1426 1617 RR2CV26JQ
BS 1618 1620 RR2A835JQ
BS 1621 1625 RR2CV26JQ
BS 1626 1626 RR2A835JQ
BS 1627 1721 RR2CV26JQ
BS 1722 1767 RR2A835JQ

RD RR2CV26TF 679 0 0
GGAAAATAACAATATTAAAAAAAAACAGAGAGGGGATGTGGTTGAGTGATTGCAGAAGCT
ACACAAAGAGAGAAAGCGTCAAGAAAGTCTTCTCTTTCACACCTTTCGTTTTCTCGAACC
TCTCTTTTTAATGAAAGATGGTGGAGGAATCTTCAGTTTGACAACTCATTAACAGTAACA
CTTCCCTCTTTTAAGCTTGCAAGGAACCTCCTCCGTTTTTGCTTTCACTTCCTCCTCATC
ATTCTCTCCTTTCAGTTTGATCCTCCTTTGATAAAAGCTTGTAGTATCTTTTCTTCTTCA
AGCTTTAAGAAACGCAACTTCTTCTTCTCTTTTTTTGGTGTCTCCTGTGGAGAGATGGGA
TTGTGTAAAAACGGAAACTTTACTATCTGGGTCTTTCCCATTTTGGTTTCTAATTAGTTA
TTTTCTTCTTTAGGAGGTTTATTTAGTTGTTTAACTTTTTAAGACATGGAGGATATTGAA
GGAGCAAACAGAGCAGCTGTAGAGTCTTGTCATAGAGTTCTTAACCTCTTATGTACACCA
CATCAACAAGATCATGTGAGTTTAGTGTCCGAAAGTACAGGAGCTGTGTCTAGGTTCGAG
AGAGTGGGGAGTCTGTTAAGTACTAGTGTGGGTCATGCCAGGTTTAGAAGAGACAAGAAA
CCTCAGTCTCATTTGTCTC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2A835TF 820 0 0
GGGGAGTCTGTTAAGTACTAGTGTGGGTCATGCCAGGTTTAGAAGAGACAAGAAACCTCA
GTCTCATTTGTCTCAAACCATCTTCCTTGATCCTGTTCACCAAAGAACAGAACCTCCACC
ATCTCAGAAAGCACCGGTGGTGATGCTCCGGTCTGGTTTCCATGAGTTGAGCACTGATTC
CCTCACTTTAGGGACCAGGTCCTTCAGTTTGAACTCAAATGCAAAAGCAAAAGCGCCTCT
CCTTCAGCTTAACCAGGCAATGCCTTCTTCAAATGATCTGAATATGTTTCCTGAACATCG
ACAGCAACAAGAGTTACATGAACGGTTACAGGCTCACCATCATCATCAGCAGCAGCAGCA
GCAACAACTACAGAGACGTCAAGCTGAGATGATGATGTTAAGGAAGTGCAACGGCGGGAT
AAGTTTGAGTTTTGATAACTCGAGTTGTACTCAAACCATGTCATCCACAAGGTCCTTTGT
TTCATCGCTTAGCATTGATGGTAGCGTTGCTAATGTAGAAGGAAGGAACTCCTTCCATTT
GGTAGGGGACCAGAGTTTATCACACTCTAAGAGAAGATGCCTCATGAAAGGAGGCGAGCA
TGGAAGCATGAAATGCGGGAGCTCTAGCCGATGCCACTGCTCTAAGAAGAGGAAACATAG
GGTTAGGAGATCGATCAGAGTGCCTGCTATCAGTAACAAAGGTTTCAGATATCCCTCCTG
ATGATTATTCGTGGCGAAAGTATGGTCAGAAACCCATCAAGGGCTCTCCTTATCCCAGAG
GATATTACAAATGCAGTAGCATGAGAGCTTGTCCAGCGAG

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR2CV26JQ 746 0 0
CAGAGACGTCAAGCTGAGATGATGATGCTAAGGAAGTGCAACGGCGGGATAAGTTTGAGT
TTTGATAACTCGAGTTGTACTCAAACCATGTCATCCACAAGGTCCTTTGTTTCATCGCTT
AGCATTGATGGTAGCGTTGCTAATGTAGAAGGAAGGAACTCCTTCCATTTGGTAGGGGAC
CAGAGTTTATCACACTTTAAGAGAAGATGCCTCATGAAAGGAGGCGAGCATGGAAGCATG
AAATGCGGGAGCTTTAGCCGATGCCACTGCTTTAAGAAGAGGAAACATAGGGTTAGGAGA
TCGATCAGAGTGCCTGCTATCAGTAACAA*GGTTTCAGATATCCCTCCTGATGATTATTC
GTGGGGAAAGTATGGTCAGAAACCCATCAAGGGCTCTCCTTATCCCAGAGGATATTACAA
ATGCAGTAGCATGAGAGCTTGTCCAGCGAGGAAGCACGTTGAGAGATGCTTGGAAGATCC
TGCTATGCTTATTGTTACTTATGAAGCAGAGCATAACCACCCTAAATTGCCATCTCAAAC
CGTGACAACTTAACTTTTATTGTATCATGTGTCTTCCTTTGTGTGCTTTGCTCCATTATT
ATGTGATACATGATTCGGAGCAGTGCCTTTGTCTTGGGGGGG***GGTTTTTGCAATAGT
TGTTGGGTTTGTGTTTAGCGGGTAAAAATGTAGGATTTGTCAAGACTCGTCTCTCAAGTT
TATTACTGCTCTTACTGATGTTTTTT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2A835JQ 746 0 0
GGATAAGTTTGAGTTTTGATAACTCGAGTTGTACTCAAACCATGTCATCCACAAGGTCCT
TTGTTTCATCGCTTAGCATTGATGGTAGCGTTGCTAATGTAGAAGGAAGGAACTCCTTCC
ATTTGGTAGGGGACCAGAGTTTATCACACTTTAAGAGAAGATGCCTCATGAAAGGAGGCG
AGCATGGAAGCATGAAATGCGGGAGCTCTAGCCGATGCCACTGCTCTAAGAAGAGGAAAC
ATAGGGTTAGGAGATCGATCAGAGTGCCTGCTATCAGTAACAA*GGTTTCAGATATCCCT
CCTGATGATTATTCGTGGGGAAAGTATGGTCAGAAACCCATCAAGGGCTCTCCTTATCCC
AGAGGATATTACAAATGCAGTAGCATGAGAGCTTGTCCAGCGAGGAAGCACGTTGAGAGA
TGCTTGGAAGATCCTGCTATGCTTATTGTTACTTATGAAGCAGAGCATAACCACCCTAAA
TTGCCATCTCAAACCGTGACAACTTAACTTTTATTGTATCATGTGTCTTCCTTTGTGTGC
TTTGCTCCATTATTATGTGATACATGATTCGGAGCAGTGCCTTTGTCTTGGGGGGGGGGG
GTTTCTGCAATAGTTGTTGGGTTTGTGTTTAGCGGGTAAAAATGTAGGATTTGTCAAGAC
TCGTCTCTCAAGTTTATTACTGCTCTTACTGATGTTTTTTTCTCTGCTTCCATTTGAGTA
GTATTAGTACAAAATAACTGGATTCT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 3

CO CL2801Contig1 806 3 2 U
TTTTTATTTTATTGAGATTTTCTTATCTGGATATTATTATTATAATTCGTACACTTGGGA
TTAGGAGGATCGCTCCTGCTTCTCTCTCTCTCTTAGCCATGGCTGCTGCTTTCACCTGCA
CCCCTCTCCCTCCGCTTTCTCTCCGTTCAGAGACGAGAATCGCATCCTCCCCATCGGCCT
CACTCTCAGCTCGTCGGCTCTTCGCCGTGTCACCAGAATCAGGAAGATTGAGAATCCGTC
ATTCTCAGTCGTTGACCTCGATTAAACCTAGGGTTCCTCGATTACGAAGAGGCGTCGTCT
GCGAAGCTCAGGAAACTACTACCGACATAGTTTCAATAGTCAACGACTCGACGTGGGAAT
CTCTAGTTCTCAAGGCAGACGGGCTTGTGCTTGTCGACTTCTGGGCACCATGGTGTGGAC
CTTGCAAAATGATTGACCCTCTTGTGAATGAGGTAGCGCAACAGTACACCGGGAAGGTCA
AGTTCTACAAACTAAACACCGACGATTCTCCTTTAACCCCGTGCGAGTACAAAGTTAGAA
ACATCCCAACGATCGTGATCTTTGTCGACGGCGAGAAGAAGGACGCTCTCATAGGTACAG
TGCCCAAATCCGCACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGATTGTGAGTCTG
TATTGATCACACTCTCTCTCCCCCTCTGTTCCGTATTCTCATTCTCTCTGTTAACTTGCG
CTTTCTCTATAGCTATCTGCTTCCGCTGTATCTTTTCTTCATCACTGAACATCTAGACAT
GGATCAATAATACTATAATATAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G308TF U 1
AF RR2GM43TF U 188
AF RR2G308JQ C 196
BS 1 636 RR2G308TF
BS 637 806 RR2G308JQ

RD RR2G308TF 636 0 0
TTTTTATTTTATTGAGATTTTCTTATCTGGATATTATTATTATAATTCGTACACTTGGGA
TTAGGAGGATCGCTCCTGCTTCTCTCTCTCTCTTAGCCATGGCTGCTGCTTTCACCTGCA
CCCCTCTCCCTCCGCTTTCTCTCCGTTCAGAGACGAGAATCGCATCCTCCCCATCGGCCT
CACTCTCAGCTCGTCGGCTCTTCGCCGTGTCACCAGAATCAGGAAGATTGAGAATCCGTC
ATTCTCAGTCGTTGACCTCGATTAAACCTAGGGTTCCTCGATTACGAAGAGGCGTCGTCT
GCGAAGCTCAGGAAACTACTACCGACATAGTTTCAATAGTCAACGACTCGACGTGGGAAT
CTCTAGTTCTCAAGGCAGACGGGCTTGTGCTTGTCGACTTCTGGGCACCATGGTGTGGAC
CTTGCAAAATGATTGACCCTCTTGTGAATGAGGTAGCGCAACAGTACACCGGGAAGGTCA
AGTTCTACAAACTAAACACCGACGATTCTCCTTTAACCCCGTGCGAGTACAAAGTTAGAA
ACATCCCAACGATCGTGATCTTTGTCGACGGCGAGAAGAAGGACGCTCTCATAGGTACAG
TGCCCAAATCCGCACTCACATCTAGCATTGACAAGT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2GM43TF 457 0 0
G
GCTCGTCGGCTCTTCGCCGTGTCACCAGAATCAGGAAGATTGAGAATCCGTCATTCTCAG
TCGTTGACCTCGATTAAACCTAGGGTTCCTCGATTACGAAGAGGCGTCGTCTGCGAAGCT
CAGGAAACTACTACCGACATAGTTTCAATAGTCAACGACTCGACGTGGGAATCTCTAGTT
CTCAAGGCAGACGGGCTTGTGCTTGTCGACTTCTGGGCACCATGGTGTGGACCTTGCAAA
ATGATTGACCCTCTTGTGAATGAGGTAGCGCAACAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTAC
AAACTAAACACCGACGATTCTCCTTTAACCCCGTGCGAGTACAAAGTTAGAAACATCCCA
ACGATCGTGATCTTTGTCGACGGCGAGAAGAAGGACGCTCTCATAGGTACAGTGCCCAAA
TCCGCACTCACATCTAGCATTGACAAGT
CTTGCAAT

QA 2 449 2 449
DS 

RD RR2G308JQ 611 0 0
GGCTCTTCGCCGTGTCACCAGAATCAGGAAGATTGAGAATCCGTCATTCTCAGTCGTTGA
CCTCGATTAAACCTAGGGTTCCTCGATTACGAAGAGGCGTCGTCTGCGAAGCTCAGGAAA
CTACTACCGACATAGTTTCAATAGTCAACGACTCGACGTGGGAATCTCTAGTTCTCAAGG
CAGACGGGCTTGTGCTTGTCGACTTCTGGGCACCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTG
ACCCTCTTGTGAATGAGGTAGCGCAACAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTAA
ACACCGACGATTCTCCTTTAACCCCGTGCGAGTACAAAGTTAGAAACATCCCAACGATCG
TGATCTTTGTCGACGGCGAGAAGAAGGACGCTCTCATAGGTACAGTGCCCAAATCCGCAC
TCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGATTGTGAGTCTGTATTGATCACACTCT
CTCTCCCCCTCTGTTCCGTATTCTCATTCTCTCTGTTAACTTGCGCTTTCTCTATAGCTA
TCTGCTTCCGCTGTATCTTTTCTTCATCACTGAACATCTAGACATGGATCAATAATACTA
TAATATAATAT

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 4

CO CL2802Contig1 1350 4 11 U
GCGTGTTGGGATTCTTGACGTTAGGATCCTGAACACGGATAGGCACTCGGGGAATCTTTT
GGTTAGGAAGCTTGGGATGTTTGGACAAGTGGAGTTGATTCCGATTGATCACGGTCTTTC
CTTGCCAGAGACGATGGAGGATCCTTACTTCGAGTGGATTCACTGGCCTCAGGCGTCGAT
ACCGTTCTCTGAAGAGGAGGTGAAGTACATAGCGAGTCTTAATCCTTTTGAGGATTGTGA
GATGCTGAGGAGGGAGCTTCCTATGGTGCGTGAAGGGAGTCTACGTGTTCTGGTTCTGTG
TACTGTTTTGCTGAAGGAAGCTGCTGCGTATGGGTTGTGTTTGGCTGAGATTGGTGAGAT
GATGACGAGAGAGGTTCGTCCTGGAGACGAGGAGCCGAGTGAGATTGAAGTGGTGTGTCT
TGAGGCTATGAGTTTGATAGGAGAGAAGGAAGCTGAGTCTCCGAGATCAGACTTGGGTGG
TGGTGGTGATGTTCAGTTCCAGTTTGATTTAGACTGTGAGGAAGCGTTCCCACTAGGGTT
GGCTCTTGGAAACGCTCGTAGTCATCTGCCAAAGGTGGAAGAAGAGGAAGAAGATGATGA
AGAGGAGGAAGAAGAAGAAGGCAAGGAGAAGGTAGAGAAGATGCAGGCGATAACCAAGCT
TTCAATGTCTCTGAAAAGCACTCTTCTAGGAGAGAAGAGCCAGAAGTATCAGAAGCATCC
AGGAGGGAGAGCAGAGAGCGCGTATGCGTCGTCTGGACACAGGAGTGCAGAAGAACAGAT
CCCAGCAAGCACTAGCTTTGTGAAGCTCTCGGATATGAGTGAAGAGGAGTGGACTGTGTT
CCTGGAGAAGTATCAAGAGCTGCTTTATCCAGCATTTGCTAAGCGTAAGGCCATAACTTT
AGGACAGAATCTGAGGCAGAGGATGGGAACTTCGTGTCAGTTTTGAGGATGTCAGAGACT
GAAGAAGAAGGAAGAATAAAGGATCGTGTAGAGTCTCGTTACTAAGGGCTCTTGCTTGAG
ACTAGACTTGGTGGAAAAAAGATGGTCAGGGAGTGGTAATGGATTTAGTGTAAATATCCG
TTGATTTCAGCTTTTAGTGTGGAGGAGACTCGAGAGTAGTTAAGTCACGTGTCTTTTAAT
TTTCTTTGCATTTTTTTAAAAATCTTCTTAAGCTCTCTCTAGGTTCTTGTTTGTTTCTGC
TGTCTCGTTTAGAGCCATGTATAGCCCCTCTTATGTTTTATAAGTCACTTGTAGATTAGA
AAAATAAGTGAGATAAAAGCTTTGTTTCATATCATCGTCTACGTTTCATATGTTTGTAAA
CAGTGAAGTTAATCATCTTTGACGAGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO64TF U 1
AF RR2AA66TF U 41
AF RR2FO64JQ C 685
AF RR2AA66JQ C 430
BS 1 239 RR2FO64TF
BS 240 240 RR2AA66TF
BS 241 493 RR2FO64TF
BS 494 494 RR2AA66TF
BS 495 643 RR2FO64TF
BS 644 763 RR2AA66TF
BS 764 825 RR2AA66JQ
BS 826 826 RR2FO64JQ
BS 827 997 RR2AA66JQ
BS 998 998 RR2FO64JQ
BS 999 1350 RR2AA66JQ

RD RR2FO64TF 643 0 0
GCGTGTTGGGATTCTTGACGTTAGGATCCTGAACACGGATAGGCACTCGGGGAATCTTTT
GGTTAGGAAGCTTGGGATGTTTGGACAAGTGGAGTTGATTCCGATTGATCACGGTCTTTC
CTTGCCAGAGACGATGGAGGATCCTTACTTCGAGTGGATTCACTGGCCTCAGGCGTCGAT
ACCGTTCTCTGAAGAGGAGGTGAAGTACATAGCGAGTCTTAATCCTTTTGAGGATTGTGG
GATGCTGAGGAGGGAGCTTCCTATGGTGCGTGAAGGGAGTCTACGTGTTCTGGTTCTGTG
TACTGTTTTGCTGAAGGAAGCTGCTGCGTATGGGTTGTGTTTGGCTGAGATTGGTGAGAT
GATGACGAGAGAGGTTCGTCCTGGAGACGAGGAGCCGAGTGAGATTGAAGTGGTGTGTCT
TGAGGCTATGAGTTTGATAGGAGAGAAGGAAGCTGAGTCTCCGAGATCAGACTTGGGTGG
TGGTGGTGATGTTGAGTTCCAGTTTGATTTAGACTGTGAGGAAGCGTTCCCACTAGGGTT
GGCTCTTGGAAACGCTCGTAGTCATCTGCCAAAGGTGGAAGAAGAGGAAGAAGATGATGA
AGAGGAGGAAGAAGAAGAAGGCAAGGAGAAGGTAGAGAAGATG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2AA66TF 723 0 0
G
GGCACTCGGGGAATCTTTTGGTTAGGAAGCTTGGGATGTTTGGACAAGTGGAGTTGATTC
CGATTGATCACGGTCTTTCCTTGCCAGAGACGATGGAGGATCCTTACTTCGAGTGGATTC
ACTGGCCTCAGGCGTCGATACCGTTCTCTGAAGAGGAGGTGAAGTACATAGCGAGTCTTA
ATCCTTTTGAGGATTGTGAGATGCTGAGGAGGGAGCTTCCTATGGTGCGTGAAGGGAGTC
TACGTGTTCTGGTTCTGTGTACTGTTTTGCTGAAGGAAGCTGCTGCGTATGGGTTGTGTT
TGGCTGAGATTGGTGAGATGATGACGAGAGAGGTTCGTCCTGGAGACGAGGAGCCGAGTG
AGATTGAAGTGGTGTGTCTTGAGGCTATGAGTTTGATAGGAGAGAAGGAAGCTGAGTCTC
CGAGATCAGACTTGGGTGGTGGTGGTGATGTTCAGTTCCAGTTTGATTTAGACTGTGAGG
AAGCGTTCCCACTAGGGTTGGCTCTTGGAAACGCTCGTAGTCATCTGCCAAAGGTGGAAG
AAGAGGAAGAAGATGATGAAGAGGAGGAAGAAGAAGAAGGCAAGGAGAAGGTAGAGAAGA
TGCAGGCGATAACCAAGCTTTCAATGTCTCTGAAAAGCACTCTTCTAGGAGAGAAGAGCC
AGAAGTATCAGAAGCATCCAGGAGGGAGAGCAGAGAGCGCGTATGCGTCGTCTGGACACA
GG

QA 2 723 2 723
DS 

RD RR2FO64JQ 604 0 0
TCTAGGAGAGAAGAGCCAGAAGTATCAGAAGCATCCAGGAGGGAGAGCAGAGAGCGCGTA
TGCGTCGTCTGGACACAGGAGTGCAGAAGAACAGATCCCAGCAAGCACTAGCTTTGTGAA
GCTTTCGGATATGAGTGAAGAGGAGTGGACTGTGTTCCTGGAGAAGTATCAAGAGCTGCT
TTATCCAGCATTTGCTAAGCGTAAGGCCATAACTTTAGGACAGAATCTGAGGCAGAGGAT
GGGAACTTCGTGTCAGTTTTGAGGATGTCAGAGACTGAAGAAGAAGGAAGAATAAAGGAT
CGTGTAGAGTCTTGTTACTAAGGGCTCTTGCTTGAGACTAGACTTGGTGGAAAAAAGATG
GTCAGGGAGTGGTAATGGATTTAGTGTAAATATCCGTTGATTTCAGCTTTTAGTGTGGAG
GAGACTCGAGAGTAGTTAAGTCACGTGTCTTTTAATTTTCTTTGCATTTTTTTAAAAATC
TTCTTAAGCTCTCTCTAGGTTCTTGTTTGTTTCTGCTGTCTCTTTTAGAGCCATGTATAG
CCCCTCTTATGTTTTATAAGTCACTTGTAGATTAGAAAAATAAGTGAGATAAAAGCTTTG
TT
CC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2AA66JQ 921 0 0
GAGTTTGATAGGAGAGAAGGAAGCTGAGTCTCCGAGATCAGACTTGGGTGGTGGTGGTGA
TGTTCAGTTCCAGTTTGATTTAGACTGTGAGGAAGCGTTCCCACTAGGGTTGGCTCTTGG
AAACGCTCGTAGTCATCTGCCAAAGGTGGAAGAAGAGGAAGAAGATGATGAAGAGGAGGA
AGAAGAAGAAGGCAAGGAGAAGGTAGAGAAGATGCAGGCGATAACCAAGCTTTCAATGTC
TCTGAAAAGCACTCTTCTAGGAGAGAAGAGCCAGAAGTATCAGAAGCATCCAGGAGGGAG
AGCAGAGAGCGCGTATGCGTCGTCTGGACACAGGAGTGCAGAAGAACAGATCCCAGCAAG
CACTAGCTTTGTGAAGCTCTCGGATATGAGTGAAGATGAGTGGACTGTGTTCCTGGAGAA
GTATCAAGAGCTGCTTTATCCAGCATTTGCTAAGCGTAAGGCCATAACTTTAGGACAGAA
TCTGAGGCAGAGGATGGGAACTTCGTGTCAGTTTTGAGGATGTCAGAGACTGAAGAAGAA
GGAAGAATAAAGGATCGTGTAGAGTCTC*TTACTAAGGGCTCTTGCTTGAGACTAGACTT
GGTGGAAAAAAGATGGTCAGGGAGTGGTAATGGATTTAGTGTAAATATCCGTTGATTTCA
GCTTTTAGTGTGGAGGAGACTCGAGAGTAGTTAAGTCACGTGTCTTTTAATTTTCTTTGC
ATTTTTTTAAAAATCTTCTTAAGCTCTCTCTAGGTTCTTGTTTGTTTCTGCTGTCTCGTT
TAGAGCCATGTATAGCCCCTCTTATGTTTTATAAGTCACTTGTAGATTAGAAAAATAAGT
GAGATAAAAGCTTTGTTTCATATCATCGTCTACGTTTCATATGTTTGTAAACAGTGAAGT
TAATCATCTTTGACGAGGTTC

QA 1 921 1 921
DS 



AS 1 4

CO CL2803Contig1 843 4 6 U
GCCAAAAAAAAACTGCAACAAAAAGGTTGGTAATAACAATATCCACACCTTGCACGAACC
AGTGTTCTCGAGCATCATATATTCTCTCGAATTGTACAGGTTTTTCAAGACAAACACTGC
AATAGCTTAATTCTTTATTGGGTTTCATGTAAGCTTTTTATAGAGAAGACCATCCGCCTC
AAAAATTTATGAGTTCAGCTATAACTGACAAACACAACCTCAAACTCTGAGATAGATAGA
CTTAAGATTCAGCAGAGGAGGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAATCATGCCGGAGTCCA
CAAGGATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCATGGAGCAAGCCCCAAACAAAGTGCATGTGCTA
TACCAAACCTAGGACAGTTTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGAACGGTCAGGCAAATCT
TCCCACCTCGATACATCTTTTGGGTTTTGCCGTCAATCTGAGGCAACTCAAGCTCGGGAG
CAGTTGCAGGGTAGGTGACGGGGATATCGAATTGGAGATCGAACTCGTATTTGAGGAGGT
TGTGAACGTACCAACACTTGCCTGTCCAACGCGTACCTTCGGGATTGGAAGCGGAGATGC
GGAACCAGTCATTGTCGTTGGATTTGTTCATCTGTGTATACGCGATCAGTGACTTGTACT
CCTCTTTAAGCCTCTGTTTCCATGCATCGCCGTCTCTTGGTCCCGCTTTTGTTGTCAGAA
GAGGGATCCGTGTTAGCGTCGACTTCGTGCTCGGATCCCATCCCTCCATTTTTCTCTCTC
CCTCGACGATTTGGATGTGAGTTTTCAACCCTAAATGTGTTTTTTCTTTCTTTTGATTCT
CAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 

AF RR2FP81JQ U 1
AF RR2FP81TF C 70
AF RR2AP73JQ U 105
AF RR2AP73TF C 107
BS 1 229 RR2FP81JQ
BS 230 230 RR2AP73JQ
BS 231 763 RR2FP81JQ
BS 764 764 RR2AP73JQ
BS 765 786 RR2FP81JQ
BS 787 843 RR2AP73JQ

RD RR2FP81JQ 786 0 0
GCCAAAAAAAAACTGCAACAAAAAGGTTGGTAATAACAATATCCACACCTTGCACGAACC
AGTGTTCTCGAGCATCATATATTCTCTCGAATTGTACAGGTTTTTCAAGACAAACACTGC
AATAGCTTAATTCTTTATTGGGTTTCATGTAAGCTTTTTATAGAGAAGACCATCCGCCTC
AAAAATTTATGAGTTCAGCTATAACTGACAAACACAACCTCAAACTCTGTGATAGATAGA
CTTAAGATTCAGCAGAGGAGGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAATCATGCCGGAGTCCA
CAAGGATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCATGGAGCAAGCCCCAAACAAAGTGCATGTGCTA
TACCAAACCTAGGACAGTTTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGAACGGTCAGGCAAATCT
TCCCACCTCGATACATCTTTTGGGTTTTGCCGTCAATCTGAGGCAACTCAAGCTCGGGAG
CAGTTGCAGGGTAGGTGACGGGGATATCGAATTGGAGATCGAACTCGTATTTGAGGAGGT
TGTGAACGTACCAACACTTGCCTGTCCAACGCGTACCTTCGGGATTGGAAGCGGAGATGC
GGAACCAGTCATTGTCGTTGGATTTGTTCATCTGTGTATACGCGATCAGTGACTTGTACT
CCTCTTTAAGCCTCTGTTTCCATGCATCGCCGTCTCTTGGTCCCGCTTTTGTTGTCAGAA
GAGGGATCCGTGTTAGCGTCGACTTCGTGCTCGGATCCCATCCTTCCATTTTTCTCTCTC
CCTCGA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2FP81TF 773 0 0
GAGCATCATATATTCTCTCGAATTGTACAGGTTTT*CAAGACAAACACTGCAATAGCTTA
ATTCTTTATTGGGTTTCATGTAAGCTTTT*ATAGAGAAGACCATCCGCCTCAGAAATTTA
TGAGTTCAGCTATAACTGACAAACACAACCTCAAACTCTGTGATAGATAGACTTAAGATT
CAGCAGAGGAGGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAATCATGCCGGAGTCCACAAGGATTG
GAATCTCTGCAGCAAGCCATGGAGCAAGCCCCAAACAAAGTGCATGTGCTATACCAAACC
TAGGACAGTTTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGAACGGTCAGGCAAATCTTCCCACCTC
GATACATCTTTTGGGTTTTGCCGTCAATCTGAGGCAACTCAAGCTCGGGAGCAGTTGCAG
GGTAGGTGACGGGGATATCGAATTGGAGATCGAACTCGTATTTGAGGAGGTTGTGAACGT
ACCAACACTTGCCTGTCCAACGCGTACCTTCGGGATTGGAAGCGGAGATGCGGAACCAGT
CATTGTCGTTGGATTTGTTCATCTGTGTATACGCGATCAGTGACTTGTACTCCTCTTTAA
GCCTCTGTTTCCATGCATCGCCGTCTCTTGGTCCCGCTTTTGTTGTCAGAAGAGGGATCC
GTGTTAGCGTCGACTTCGTGCTCGGATCCCATCCTTCCATTTTTCTCTCTCCCTCGACGA
TTTGGATGTGAGTTTTCAACCCTAAATGTGTTTTTTCTTTCTTTTGATTCTC
C

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2AP73JQ 739 0 0
CCG
AGACAAACACTGCAATAGCTTAATTCTTTATTGGGTTTCATGTAAGCTTTTTATAGAGAA
GACCATCCGCCTCAAAAATTTATGAGTTCAGCTATAACTGACAAACACAACCTCAAACTC
TGAGATAGATAGACTTAAGATTCAGCAAAGGCGGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAATC
ATGCCGGAGTCCACAAGGATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCATGGAGCAAGCCCCAAACAA
AGTGCATGTGCTATACCAAACCTAGGACAGTTTTTAGCCCAAAGCGGCTTGAAATGAACG
GTCAGGCAAATCTTCCCACCTCGATACATCTTTTGGGTTTTGCCGTCAATCTGAGGCAAC
TCAAGCTCGGGAGCAGTTGCAGGGTAGGTGACGGGGATATCGAATTGGAGATCGAACTCG
TATTTGAGGAGGTTGTGAACGTACCAACACTTGCCTGTCCAACGCGTACCTTCGGGATTG
GAAGCGGAGATGCGGAACCAGTCATTGTCGTTGGATTTGTTCATCTGTGTATACGCGATC
AGTGACTTGTACTCCTCTTTAAGCCTCTGTTTCCATGCATCGCCGTCTCTTGGTCCCGCT
TTTGTTGTCAGAAGAGGGATCCGTGTTAGCGTCGACTTCGTGCTCGGATCCCATCCCTCC
ATTTTTCTCTCTCCCTCGACGATTTGGATGTGAGTTTTCAACCCTAAATGTGTTTTTTCT
TTCTTTTGATTCTCAC

QA 4 739 4 739
DS 

RD RR2AP73TF 737 0 0
G
AGACAAACACTGCAATAGCTTAATTCTTTATTGGGTTTCATGTAAGCTTTTTATAGAGAA
GACCATCCGCCTCAGAAATTTATGAGTTCAGCTATAACTGACAAACACAACCTCAAACTC
TGAGATAGATAGACTTAAGATTCAGCAGAGGCGGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAATC
ATGCCGGAGTCCACAAGGATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCATGGAGCAAGCCCCAAACAA
AGTGCATGTGCTATACCAAACCTAGGACAGTTTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGAACG
GTCAGGCAAATCTTCCCACCTCGATACATCTTTTGGGTTTTGCCGTCAATCTGAGGCAAC
TCAAGCTCGGGAGCAGTTGCAGGGTAGGTGACGGGGATATCGAATTGGAGATCGAACTCG
TATTTGAGGAGGTTGTGAACGTACCAACACTTGCCTGTCCAACGCGTACCTTCGGGATTG
GAAGCGGAGATGCGGAACCAGTCATTGTCGTTGGATTTGTTCATCTGTGTATACGCGATC
AGTGACTTGTACTCCTCTTTAAGCCTCTGTTTCCATGCATCGCCGTCTCTTGGTCCCGCT
TTTGTTGTCAGAAGAGGGATCCGTGTTAGCGTCGACTTCGTGCTCGGATCCCATCCCTCC
ATTTTTCTCTCTCCCTCGACGATTTGGATGTGAGTTTTCAACCCTAAATGTGTTTTTTCT
TTCTTTTGATTCTC
AC

QA 2 735 2 735
DS 



AS 1 4

CO CL2804Contig1 740 4 5 U
GGCCTTTAGCTCCGTCTCTCTCGTCTGTCGGCACGATCAGAGCTCAGATCTCAAAACTCA
AAATCGAATCAAATCCACAACCCGATCGAACATGACTCTTGGCTCTGGTGGATCGAGTGT
CGTCGTACCGAGAAACTTCAGGTTGCTGGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATTGG
AGATGGAACTGTTAGCTATGGAATGGACGATGGTGACGACATCTACATGCGCTCTTGGAC
TGGCACTATCATCGGTCCTCACAACGTAACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAA
GCTCTTTTGCGACAAAGATTACCCGGAGAAACCCCCAACTGTCCGGTTCCATTCACGTGT
CAACATGACTTGTGTCAACCATGAAACAGGAGTGGTGGATCCAAAGAAGTTCGGGCTTCT
TGCGAACTGGCAAAGGGAGTACACGATGGAGAATATACTGATACAACTGAAGAAAGAAAT
GGCTGCGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGCT
TCTGGAATCTTGGTTCTTGTTTGCTGAAAAAATCTTTGCCCCTTCTATTACTAACGTATG
TATCTGGGGGCAGTTCATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTTATTTTCTTCCGAATTTATGA
TAAAAATGGTATGTGGATGGTGATGATGTTGATGTTGTTCGATTAATCATCTCGAGTTTA
TCCTTTGTGTGCAAATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI84TF U 1
AF RR2EI84JQ C 126
AF RR2GA52TF U 6
AF RR2B373TF U 21
BS 1 533 RR2EI84TF
BS 534 557 RR2GA52TF
BS 558 558 RR2B373TF
BS 559 734 RR2GA52TF
BS 735 740 RR2B373TF

RD RR2EI84TF 533 0 0
GGCCTTTAGCTCCGTCTCTCTCGTCTGTCGGCACGATCAGAGCTCAGATCTCAAAACTCA
AAATCGAATCAAATCCACAACCCGATCGAACATGACTCTTGGCTCTGGTGGATCGAGTGT
CGTCGTACCGAGAAACTTCAGGTTGCTGGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATTGG
AGATGGAACTGTTAGCTATGGAATGGACGATGGTGACGACATCTACATGCGCTCTTGGAC
TGGCACTATCATCGGTCCTCACAACGTAACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAA
GCTCTTTTGCGACAAAGATTACCCGGAGAAACCCCCAACTGTCCGGTTCCATTCACGTGT
CAACATGACTTGTGTCAACCATGAAACAGGAGTGGTGGATCCAAAGAAGTTCGGGCTTCT
TGCGAACTGGCAAAGGGAGTACACGATGGAGAATATACTGATACAACTGAAGAAAGAAAT
GGCTGCGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCT

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2EI84JQ 594 0 0
TACCGAGAAACTTCAGGTTGCTGGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATTGGAGATG
GAACTGTTAGCTATGGAATGGACGATGGTGACGACATCTACATGCGCTCTTGGACTGGCA
CTATCATCGGTCCTCACAACGTAACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCT
TTTGCGACAAAGATTACCCGGAGAAACCCCCAACTGTCCGGTTCCATTCACGTGTCAACA
TGACTTGTGTCAACCATGAAACAGGAGTGGTGGATCCAAAGAAGTTCGGGCTTCTTGCGA
ACTGGCAAAGGGAGTACACGATGGAGAATATACTGATACAACTGAAGAAAGAAATGGCTG
CGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGCTTCTGG
AATCTTGGTTCTTGTTTGCTGAAAAAATCTTTGCCCCTTCTATTACTAACGTATGTATCT
GGGGGCAGTTCATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTTATTTCCTTCCGAATTTATGATAAAA
ATGGTATGTGGATGGTGATGATGTTGATGTTGTTCGATTAATCATCTCGAGTTT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2GA52TF 732 0 0
GG
AGCTCCGTCTCTCTCGTCTGTCGGCACGATCAGAGCTCAGATCTCAAAACTCAAAATCGA
ATCAAATCCACAACCCGATCGAACATGACTCTTGGCTCTGGTGGATCGAGTGTCGTCGTA
CCGAGAAACTTCAGGTTGCTGGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATTGGAGATGGA
ACTGTTAGCTATGGAATGGACGATGGTGACGACATCTACATGCGCTCTTGGACTGGCACT
ATCATCGGTCCTCACAAC***ACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTT
TGCGACAAAGATTACCCGGAGAAACCCCCAACTGTCCGGTTCCATTCATGTGTCAACATG
ACTTGTGTCAACCATGAAACAGGAGAGGTGGATCCAAAGAAGTTCGGGCTTCTTGCGAAC
TGGCAAAGGGAGTACACGATGGAGAATATACTGATACAACTGAAGAAAGAAATGGCTGCG
TCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGCTTCTGGAA
TCTTGGTTCTCGTTTGCTGAAAAAATCTTTGCCCCTTCTATTACTAACGTATGTATCTGG
GGGCAGTTCATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTTATTTTCTTCCGAATTTATGATAAAAAT
GGTATGTGGATGGTGATGATGTTGATGTTGTTCGATTAATCATCTCGAGTTTATCCTTTG
TGTGCAA
TTA

QA 3 729 3 729
DS 

RD RR2B373TF 720 0 0
GG
GTCTGTCGGCACGATCAGAGCTCAGATCTCAAAACTCAAAATCGAATCAAATCCACAACC
CGATCGAACATGACTCTTGGCTCTGGTGGATCGAGTGTCGTCGTACCGAGAAACTTCAGG
TTGCTGGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATTGGAGATGGAACTGTTAGCTATGGA
ATGGACGATGGTGACGACATCTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGGTCCTCAC
AAC***ACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTTTGCGACAAAGATTAC
CCGGAGAAACCCCCAACTGTCCGGCTCCATTCACGTGTCAACATGACTTGTGTCAACCAT
GAAACAGGAGTGGTGGATCCAAAGAAGTTCGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGAGTAC
ACGATGGAGAATATACTGATACAACTGAAGAAAGAAATGGCTGCGTCGCATAACCGTAAG
CTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGCTTCTGGAATCTTGGTTCTTGTTT
GCTGAAAAAATCTTTGCCCCTTCTATTACTAACGTATGTATCTGGGGGCAGTTCATTGTC
GTTCTCAAGCTTTTTTTTATTTTCTTCCGAATTTATGATAAAAATGGTATGTGGATGGTG
ATGATGTTGATGTTGTTCGATTAATCATCTCGAGTTTATCCTTTGTGTGCAAATTATC

QA 3 720 3 720
DS 



AS 1 2

CO CL2805Contig1 969 2 2 U
GAACTTGGAGATGGATCAGGGTGAGGTCCTTCTATCAGCAACCAGACTTCTACAGGCGAT
GGTGGATGTGATATCAAGCAATGGCTGGCTGAATCTTGCTCTGTTAGCAATGGAAGCAAG
CCAGATGGTGACTCAAGGCATGTGGGAGCGTGACTCCATACTTTTGCAGCTGCCTCACTT
CACAAAGGAATTAGCAAAAAGATGCCAGGAGAATAACATTGAAACCGTGTTTGATCTTGT
GGAGATGGAGGATGAAGAGCGCCAAGAGCTGCTCGGGATGAAGGACACTGAGCTTTTAGA
CATTGCCAGATTCTGCAACCGCTCCCCAAACATTGATCTGACTTACGAGGTTGTGGGAAG
TGAAGATGTGACTCCAGGGAAAGAGGTGACATTGCAGTTGATGCTTGAGAGAGACATGGA
GGGAAGGACAGAAGTGGGAGCCGTAGATGCACCTAGGTATCCCAAGACCAAAGAAGAAGG
GTGGTGGCAGGTTGTGGGGGACACCAAGGCGAACCAGTTGGTGGCTATCAAGAGAGTCTC
GTTGCAGAAGAAAGCAAAGGTGAAGCTGGATTTCCAAGTACCGAGTGAAGCAGGAGTGAA
GTCTTACACACTGTACTTCATGTGCGACTCTTACTTGGGTTGTGACCAAGAGTATGCTTT
CACTGTTGATGTCAAAGAATCTGGCACTGAAGATCAGATGGAAGAGTGATCTTGTGTTTC
AGGCGTGCTGGATTTGGAGAAGAGCATTCTCACTTTTATGTAATATGGCGTCTTTGTGTG
TTTAGACCAAAATGTGTGGGTTCTGTACTGTTCCTTTCTTTTGTTTTGTCTGGACCAAAA
TCGAAACAGTAGACGTTTCATAAACTTGTAGAGACGTGGGGCCAAAGGATGTTGTAGAGA
CGTATTGAAAGCAGCACTGAGCGGTGACTGAAGTAGTCAACTCTTATATGAATCTTTCTT
TGCTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE85TF U 1
AF RR2GE85JQ C 333
BS 1 589 RR2GE85TF
BS 590 969 RR2GE85JQ

RD RR2GE85TF 589 0 0
GAACTTGGAGATGGATCAGGGTGAGGTCCTTCTATCAGCAACCAGACTTCTACAGGCGAT
GGTGGATGTGATATCAAGCAATGGCTGGCTGAATCTTGCTCTGTTAGCAATGGAAGCAAG
CCAGATGGTGACTCAAGGCATGTGGGAGCGTGACTCCATACTTTTGCAGCTGCCTCACTT
CACAAAGGAATTAGCAAAAAGATGCCAGGAGAATAACATTGAAACCGTGTTTGATCTTGT
GGAGATGGAGGATGAAGAGCGCCAAGAGCTGCTCGGGATGAAGGACACTGAGCTTTTAGA
CATTGCCAGATTCTGCAACCGCTCCCCAAACATTGATCTGACTTACGAGGTTGTGGGAAG
TGAAGATGTGACTCCAGGGAAAGAGGTGACATTGCAGTTGATGCTTGAGAGAGACATGGA
GGGAAGGACAGAAGTGGGAGCCGTAGATGCACCTAGGTATCCCAAGACCAAAGAAGAAGG
GTGGTGGCAGGTTGTGGGGGACACCAAGGCGAACCAGTTGGTGGCTATCAAGAGAGTCTC
GTTGCAGAAGAAAGCAAAGGTGAAGCTGGATTTCCAAGTACCGAGTGAA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2GE85JQ 637 0 0
TTGATCTGACTTACGAGGTTGTGGGAAGTGAAGATGTGACTCCAGGGAAAGAGGTGACAT
TGCAGTTGATGCTTGAGAGAGACATGGAGGGAAGGACAGAAGTGGGAGCCGTAGATGCAC
CTAGGTATCCCAAGACCAAAGAAGAAGGGTGGTGGCAGGTTGTGGGGGACACCAAGGCGA
ACCAGTTGGTGGCTATCAAGAGAGTCTCGTTGCAGAAGAAAGCAAAGGTGAAGCTGGATT
TCCAAGTACCGAGTGAAGCAGGAGTGAAGTCTTACACACTGTACTTCATGTGCGACTCTT
ACTTGGGTTGTGACCAAGAGTATGCTTTCACTGTTGATGTCAAAGAATCTGGCACTGAAG
ATCAGATGGAAGAGTGATCTTGTGTTTCAGGCGTGCTGGATTTGGAGAAGAGCATTCTCA
CTTTTATGTAATATGGCGTCTTTGTGTGTTTAGACCAAAATGTGTGGGTTCTGTACTGTT
CCTTTCTTTTGTTTTGTCTGGACCAAAATCGAAACAGTAGACGTTTCATAAACTTGTAGA
GACGTGGGGCCAAAGGATGTTGTAGAGACGTATTGAAAGCAGCACTGAGCGGTGACTGAA
GTAGTCAACTCTTATATGAATCTTTCTTTGCTTAAGC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL2806Contig1 911 2 8 U
GCAAAAGGAGCAACATAGAAATAGCAAAATGTCGTTTCACAAAGATTCATACTGCTCAAT
GTGTCCAAACTAAAAAGACTTAACAATACTTTCAAGGATAAAAGTAAAATGATTTGTTGA
TCAAAAAAAAGTAAAATGATTCAGACTCAATACAACTCTTCACGGGAGAGGAAAGAGTAG
ACTACAGTCCTGAAACTTTAATAGGTGGCTGGCAAAAATGCACTTCCCGGCTGACGGTTA
GCCAAAGGTCCATGACATGAGAGGAACTTAGCATTAACACCATCAGGGACAACACGCTTC
TCTTGCCTCAACTTGGTAAAGTCTGCTCTGTTAAACTTAGTAAAACCCCATTTCCTGCTG
ACGATAATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTTAGCCCTCCTCAGAGCCTCTTGAGCA
TGGTGACCATGAGCATCCTTACACCTCACAGACAAAAGCACCTGACCAATCGCAACACGA
GCACAAGTACCCAACGCCTTTCCAAAAGCACCTCTCATACCAGTCTGAAGCCTATCAGCT
CCAGCACACGAAAGCATCTTGTTGATCCTCAAAACATGGAAAGGGTGAACCCTAATCCTC
AGATGGAACGCATCTTTCCCAGCGGATTTCACCATGTACTTGTTGCAAGCGATACGCGCA
GCTTCGAGTGCTTCGCTTGAGACGTTCTCCTTCTCCCATGAGACGAGGTGGACGCAGAAA
GGGAACTCATCGACACCCTTCCTCTTCATGCCGACATCGTAGATCCTGATTTTGGGGTCA
GGAACACCACGGCAGTAGCGAGATTTAGGGTATGGCTTACCCTTGATCTGACGGTAACAC
CTAGCCGGTCTTCTTCCCATGGCGTCTCAATCTGACAACAGGGCTGCTGCTGCTGCTCGA
TGAAGACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED46JQ U 1
AF RR2AY18TFB C 177
BS 1 431 RR2ED46JQ
BS 432 432 RR2AY18TFB
BS 433 506 RR2ED46JQ
BS 507 507 RR2AY18TFB
BS 508 591 RR2ED46JQ
BS 592 595 RR2AY18TFB
BS 596 669 RR2ED46JQ
BS 670 911 RR2AY18TFB

RD RR2ED46JQ 669 0 0
GCAAAAGGAGCAACATAGAAATAGCAAAATGTCGTTTCACAAAGATTCATACTGCTCAAT
GTGTCCAAACTAAAAAGACTTAACAATACTTTCAAGGATAAAAGTAAAATGATTTGTTGA
TCAAAAAAAAGTAAAATGATTCAGACTCAATACAACTCTTCACGGGAGAGGAAAGAGTAG
ACTACAGTCCTGAAACTTTAATAGGTGGCTGGCAAAAATGCACTTCCCGGCTGACGGTTA
GCCAAAGGTCCATGACATGAGAGGAACTTAGCATTAACACCATCAGGGACAACACGCTTC
TCTTGCCTCAACTTGGTAAAGTCTGCTCTGTTAAACTTAGTAAAACCCCATTTCCTGCTG
ACGATAATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTTAGCCCTCCTCAGAGCCTCTTGAGCA
TGGTGACCATGCGCATCCTTACACCTCACAGACAAAAGCACCTGACCAATCGCAACACGA
GCACAAGTACCCAACGCCTTTCCAAAGGCACCTCTCATACCAGTCTGAAGCCTATCAGCT
CCAGCACACGAAAGCATCTTGTTGATCCTCAAAACATGGAAAGGGTGAACC****TCCTC
AGATGGAACGCATCTTTCCCAGCGGATTTCACCATGTACTTGTTGCAAGCGATACGCGCA
GCTTCGAGT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2AY18TFB 735 0 0
GTAGACTACAGTCCTGAAACTTTAATAGGTGGCTGGCAAAAATGCACTTCCCGGCTGACG
GTTAGCCAAAGGTCCATGACATGAGAGGAACTTAGCATTAACACCATCAGGGACAACACG
CTTCTCTTGCCTCAACTTGGTAAGGTCTGCTCTGTTAAACTTAGTAAAACCCCATTTCCT
GCTGACGATAATCTTTTGACGACCAGGGAACTTAAACTTAGCCCTCCTCAGAGCCTCTTG
AGCATGGTGACCATGAGCATCCTTGCACCTCACAGACAAAAGCACCTGACCAATCGCAAC
ACGAGCACAAGTACCCAACGCCTTTCCAAAAGCACCTCTCATACCAGTCTGAAGCCTATC
AGCTCCAGCACACGAAAGCATCTTGTTGATCCTCAAAACATGGAAAGGGTGAACCCTAAT
CCTCAGATGGAACGCATCTTTCCCAGCGGATTTCACCATGTACTTGTTGCAAGCGATACG
CGCAGCTTCGAGTGCTTCGCTTGAGACGTTCTCCTTCTCCCATGAGACGAGGTGGACGCA
GAAAGGGAACTCATCGACACCCTTCCTCTTCATGCCGACATCGTAGATCCTGATTTTGGG
GTCAGGAACACCACGGCAGTAGCGAGATTTAGGGTATGGCTTACCCTTGATCTGACGGTA
ACACCTAGCCGGTCTTCTTCCCATGGCGTCTCAATCTGACAACAGGGCTGCTGCTGCTGC
TCGATGAAGACTTCC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 4

CO CL2807Contig1 735 4 5 U
GCCCTAGAAAGTAATGTTTATTGCCTAAAGACCGTAGATACAACACACTATTTGTCGATA
TCACTCAGAAAGTAGGGATTTATAAAGCACAAAATACATAACACAACACCACACTACACT
TCATATTCAATAGAGACTAGTAAAGAATATGCCTATCAAAGAGGCCAAAAGCTTTGTGGT
TTCTAACGAAAAAGGTCAGTATTTTGAGCATATAATGTAGGAAGCTGTGGATAGGATGGC
AAGAAGAGGGAACGAGAGCTTGATAGAATTCCCATCAGACGACGACCCAACTCTTGGACC
TGAAGGGCTTGATGATCCTGCATGCGAATTAACATTGCAGCTACTTGCAGGAGGAGTTTG
AACATTACAAGCTTTAGGCAAAGCAAGAGCTTGTGTTTGATTAACATTGATCCCAAACTG
GGAACCTCCACCTTTGGGAACCTCACACAAACACTCAGGAGACGACCTGACAGCATTAGT
CAACTGATTGCAACATTGCTGGGAAGGAGTAGAAGAGTTCCCAGTGATGTAGCCAAGACA
CAGCACCATGCTTATAAGAACATTTGTGCAGTAAGATTGAGCAGAAACCGTCGTTGTGGA
CCATATCACTGCCACTGAAACTGTAAGCAGCAGCAGTGAACACATTCCATGTTTCATGTT
TTTCTTGTGGTGTTCTGAATCTCTTAAAGAATTTGTTTAATTGTTTATTAGTTGCTGAGT
TTAATGGTTTGTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH20JQ U 1
AF RR2BH20TF C 1
AF RR2AL72JQ U 96
AF RR2AL72TF C 96
BS 1 572 RR2BH20JQ
BS 573 573 RR2AL72JQ
BS 574 694 RR2BH20JQ
BS 695 710 RR2AL72JQ
BS 711 735 RR2AL72TF

RD RR2BH20JQ 699 0 0
GCCCTAGAAAGTAATGTTTATTGCCTAAAGACCGTAGATACAACACACTATTTGTCGATA
TCACTCAGAAAGTAGGGATTTATAAAGCACAAAATACATAACACAACACCACACTACACT
TCATATTCAATAGAGACTAGTAAAGAATATGCCTATCAAAGAGGCCAAAAGCTTTGTGGT
TTCTAACGAAAAAGGTCAGTATTTTGAGCATATAATGTAGGAAGCTGTGGATAGGATGGC
AAGAAGAGGGAACGAGAGCTTGATAGAATTCCCATCAGACGACGACCCAACTCTTGGACC
TGAAGGGCTTGATGATCCTGCATGCGAATTAACATTGCAGCTACTTGCAGGAGGAGTTTG
AACATTACAAGCTTTAGGCAAAGCAAGAGCTTGTGTTTGATTAACATTGATCCCAAACTG
GGAACCTCCACCTTTGGGAACCTCACACAAACACTCAGGAGACGACCTGACAGCATTAGT
CAACTGATTGCAACATTGCTGGGAAGGAGTAGAAGAGTTCCCAGTGATGTAGCCAAGACA
CAGCACCATGCTTATAAGAACATTTGTGCAGTCAGATTGAGCAGAAACCGTCGTTGTGGA
CCATATCACTGCCACTGAAACTGTAAGCAGCAGCAGTGAACACATTCCATGTTTCATGTT
TTTCTTGTGGTGTTCTGAATCTCTTAAAGAATTT
CCCCT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2BH20TF 699 0 0
GCCCTAGAAAGTAATGTTTATTGCCTAAAGACCGTAGATACAACACACTATTTGTCGATA
TCACTCAGAAAGTAGGGATTTATAAAGCACAAAATACATAACACAACACCACACTACACT
TCATATTCAATAGAGACTAGTAAAGAATATGCCTATCAAAGAGGCCAAAAGCTTTGTGGT
TTCTAACGAAAAAGGTCAGTATTTTGAGCATATAATGTAGGAAGCTGTGGATAGGATGGC
AAGAAGAGGGAACGAGAGCTTGATAGAATTCCCATCAGACGACGACCCAACTCTTGGACC
TGAAGGGCTTGATGATCCTGCATGCGAATTAACATTGCAGCTACTTGCAGGAGGAGTTTG
AACATTACAAGCTTTAGGCAAAGCAAGAGCTTGTGTTTGATTAACATTGATCCCAAACTG
GGAACCTCCACCTTTGGGAACCTCACACAAACACTCAGGAGACGACCTGACAGCATTAGT
CAACTGATTGCAACATTGCTGGGAAGGAGTAGAAGAGTTCCCAGTGATGTAGCCAAGACA
CAGCACCATGCTTATAAGAACATTTGTGCAGTCAGATTGAGCAGAAACCGTCGTTGTGGA
CCATATCACTGCCACTGAAACTGTAAGCAGCAGCAGTGAACACATTCCATGTTTCATGTT
TTTCTTGTGGTGTTCTGAATCTCTTAAAGAATTT
CCCCT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2AL72JQ 615 0 0
G
CATAACACAACACCACACTACACTTCATATTCAATAGAGACTAGTAAAGAATATGCCTAT
CAAAGAGGCCAAAAGCTTTGTGGTTTCTAACGAAAAAGGTCAGTATTTTGAGCATATAAT
GTAGGAAGCTGTGGATAGGATGGCAAGAAGAGGGAACGAGAGCTTGATAGAATTCCCATC
AAACGACGACCCAACTCTTGGACCTGAAGGGCTTGATGATCCTGCATGCGAATTAACATT
GCAGCTACTTGCAGGAGGAGTTTGAACATTACAAGCTTTAGGCAAAGCAAGAGCTTGTGT
TTGATTAACATTGATCCCAAACTGGGAACCTCCACCTTTGGGAACCTCACACAAACACTC
AGGAGACGACCTGACAGCAT*AGTCAACTGATTGCAACATTGCTGGGAAGGAGTAGAAGA
GTTCCCAGTGATGTAGCCAAGACACAGCACCATGCTTATAAGAACATTTGTGCAGTAAGA
TTGAGCAGAAACCGTCGTTGTGGACCATATCACTGCCACTGAAACTGTAAGCAGCAGCAG
TGAACACATTCCATGTTTCATGTTTTTCTTGTGGTGTTCTGAATCTCTTAAAGAATTTGT
TTAATTGTTTATTA

QA 2 615 2 615
DS 

RD RR2AL72TF 640 0 0
G
CATAACACAACACCACACTACACTTCATATTCAATAGAGACTAGTAAAGAATATGCCTAT
CAAAGAGGCCAAAAGCTTTGTGGTTTCTAACGAAAAAGGTCAGTATTTTGAGCATATAAT
GTAGGAAGCTGTGGATAGGATGGCAAGAAGAGGGAACGAGAGCTTGATAGAATTCCCATC
AGACGACGACCCAACTCTTGGACCTGAAGGGCTTGATGATCCTGCATGCGAATTAACATT
GCAGCTACTTGCAGGAGGAGTTTGAACATTACAAGCTTTAGGCAAAGCAAGAGCTTGTGT
TTGATTAACATTGATCCCAAACTGGGAACCTCCACCTTTGGGAACCTCACACAAACACTC
AGGAGACGACCTGACAGCAT*AGTCAACTGATTGCAACATTGCTGGGAAGGAGTAGAAGA
GTTCCCAGTGATGTAGCCAAGACACAGCACCATGCTTATAAGAACATTTGTGCAGTAAGA
TTGAGCAGAAACCGTCGTTGTGGACCATATCACTGCCACTGAAACTGTAAGCAGCAGCAG
TGAACACATTCCATGTTTCATGTTTTTCTTGTGGTGTTCTGAATCTCTTAAAGAATTTGT
TTAATTGTTTATTAGTTGCTGAGTTTAATGGTTTGTCCC

QA 2 640 2 640
DS 



AS 1 2

CO CL2808Contig1 739 2 1 U
GGTCCACCGCACTGCCTCCATCGAGACGAAAATGGGTGCCTTCAGGTTTCACCAGTACCA
GGTTGTCGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTTCAACCCAAGATTTACCGGATGAA
GCTCTGGGCCACGAACGAGGTTCGCGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAGAAAGCT
CAAGAAGGTCAAGAAGAGTAACGGTCAGATGCTCGCCATCAACGAGATCTTTGAGAAGAA
CCCGACAACGATCAAGAACTTTGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGGATACCA
CAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACCACCTTGAACGGTGCCGTTGAGCAGATGTACAC
CGAGATGGCGTCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATTCAGATCATCAAGACGGCGAC
CGTTCCGGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTTCACAATAGTAAGATCAA
GTTCCCGTTGGTGTTCCGTAAGGTGAGACCACCTACCAGGAAGCTCAAGACCACTTACAA
GGCCTCTAAGCCCAACTTGTTTATGTAATTTGGGTGAAGTTATTCTATCTGCTGCTGCTT
TCGCTCTTGTCGGATATTTTTGTTTTTTAGGCATTTCCATGGAACTAAAACTCGACTTTC
TTTGGATTTTGTGGTTCTTGTTACTTCTTCATGCTTATGGAAACACCTTTTTGTTTCTTA
ATTATATGTATCTTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA95TF U 146
AF RR2D826TF U 1
BS 1 739 RR2D826TF

RD RR2EA95TF 292 0 0
GCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAGAAAGCTCAAGAAGGTCAAGAAGAGTAACGGT
CAGATGCTCGCCATCAACGAGATCTTTGAGAAGAACCCGACAACGATCAAGAACTTTGGA
ATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGGATACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGAC
ACCACCTTGAACGGTGCCGTTGAGCAGATGTACACCGAGATGGCGTCCCGACACCGTGTC
AGGTTCCCTTGCATTCAGATCATCAAGACGGCGACCGTTCCGGCCGAGCTTT

QA 1 292 1 292
DS 

RD RR2D826TF 739 0 0
GGTCCACCGCACTGCCTCCATCGAGACGAAAATGGGTGCCTTCAGGTTTCACCAGTACCA
GGTTGTCGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTTCAACCCAAGATTTACCGGATGAA
GCTCTGGGCCACGAACGAGGTTCGCGCCAAGTCCAAGTTCTGGTACTTCTTGAGAAAGCT
CAAGAAGGTCAAGAAGAGTAACGGTCAGATGCTCGCCATCAACGAGATCTTTGAGAAGAA
CCCGACAACGATCAAGAACTTTGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGGACTGGATACCA
CAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACCACCTTGAACGGTGCCGTTGAGCAGATGTACAC
CGAGATGGCGTCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATTCAGATCATCAAGACGGCGAC
CGTTCCGGCCAAGCTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAGCAGTTTCACAATAGTAAGATCAA
GTTCCCGTTGGTGTTCCGTAAGGTGAGACCACCTACCAGGAAGCTCAAGACCACTTACAA
GGCCTCTAAGCCCAACTTGTTTATGTAATTTGGGTGAAGTTATTCTATCTGCTGCTGCTT
TCGCTCTTGTCGGATATTTTTGTTTTTTAGGCATTTCCATGGAACTAAAACTCGACTTTC
TTTGGATTTTGTGGTTCTTGTTACTTCTTCATGCTTATGGAAACACCTTTTTGTTTCTTA
ATTATATGTATCTTTTTAT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 3

CO CL2809Contig1 1390 3 29 U
GGATACTAACTTACCTACAGATCTTTTATCGACGGACCTGGGACTGAGTGAGTGAGCAAT
TCTTCCTCTCTGATACATTCTCTAAGAGATGAATTGCCTTCAGAATCTTCCTAGATCTTC
AGTCTCACCTCTGTTGAGCTTTGGAGGCAATCACAGAGATCCTTCTTGGTCTTCCTTGAA
GATGATGCTACCAATCAAAGCCAATGATCCTAAATGTCGACTTGTATTACAGGCTGTATC
AGACAGCGCAGAGATGAGTGGTGTTTCAAAGAAGGAGGAAGAGAAATCTGATGAATATAG
CCAAGACATGACTCAAGCTATGGGTGCTGTATTAACATACAGGCACGAGCTAGGAATGAA
CTACAACTTCCTTCGTCCAGATTTAATCGTCGGATCTTGCTTACAGACTCCTGAAGATGT
TGACAAGCTCCGTAAGATTGGTGTTAAAACCATATTCTGCTTGCAACAAGATCCTGACTT
GGAATATTTTGGAGTAGATATAAACAGCATTCAAGCATACGCTAAGACATTTACTGATAT
TGAGCATATTCGCTGTGAAATAAGAGACTTCGATGCATTTGATCTGAGAATGCGTCTTCC
TGCTGTGCTTAGTACACTGTACAAAGCTGTTAAGCGAAATGGAGGAGTTACATACGTCCA
CTGCACTGCTGGTATGGGAAGGGCTCCTGCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCA
AGGCTATAAACTTATGGATGCTCATAAAATACTTATGAGCAAACGAACGTGCTTCCCGAA
GCTTGATGCTATCAGAA*TGCAACTATTGATATTCTTACAG*ACTCAAGAGGAAGTCTGT
TACTCTGACACTGAAAGACAAGGGTTTCTCCACTGTAGAAATTTCTGGCCTTGACATCGG
ATGGGGACAGAGGATACCTCTGACACTGGACAAGGGAACAGGATTCTGGAGCCTGAAGAG
GGAATTGCCTGAGGGACAGTTTGAATATAAATATATCATAGATGGGGAATGGACACACAA
TGAGCTCGAGCCGTTTATAGGACCTAACAAAGATGGTCATACCAATAATTACGCAAAAGT
GGTGTATGATCCAACGAGCGTTGATGGTGCAACCCGGGAGAGGTTAACAAAGGAAGACCC
TGAGCTTTTGGAGGACGAACGCTCGAAGCTAATCCAGTTCTTGGAGACTTCTTCTGAGGC
AGAAGTTTGAGAGCTGAGAGCGTCCTTGTAACTCTGTGAATGTACCCCTTACTAGTAACA
ATAAAATGCTTTATGTAGGTCATGCATAAAGTTATGTTTATAGGGAAAAAGAAACATAAA
GCTAGTTGTATTGTACCATGTTCAAGTATAATAATATTACATAAGACTTTAATCTCTGTT
CTTGTTAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A155TF U 1
AF RR2B367TF U 29
AF RR2B367JQ C 605
BS 1 390 RR2A155TF
BS 391 391 RR2B367TF
BS 392 503 RR2A155TF
BS 504 504 RR2B367TF
BS 505 519 RR2A155TF
BS 520 520 RR2B367TF
BS 521 729 RR2A155TF
BS 730 730 RR2B367TF
BS 731 748 RR2A155TF
BS 749 749 RR2B367TF
BS 750 783 RR2A155TF
BS 784 784 RR2B367TF
BS 785 804 RR2A155TF
BS 805 805 RR2B367TF
BS 806 813 RR2A155TF
BS 814 814 RR2B367TF
BS 815 826 RR2A155TF
BS 827 829 RR2B367TF
BS 830 831 RR2A155TF
BS 832 833 RR2B367TF
BS 834 857 RR2A155TF
BS 858 860 RR2B367TF
BS 861 861 RR2B367JQ
BS 862 870 RR2B367TF
BS 871 871 RR2B367JQ
BS 872 889 RR2B367TF
BS 890 890 RR2B367JQ
BS 891 901 RR2B367TF
BS 902 1390 RR2B367JQ

RD RR2A155TF 857 0 0
GGATACTAACTTACCTACAGATCTTTTATCGACGGACCTGGGACTGAGTGAGTGAGCAAT
TCTTCCTCTCTGATACATTCTCTAAGAGATGAATTGCCTTCAGAATCTTCCTAGATCTTC
AGTCTCACCTCTGTTGAGCTTTGGAGGCAATCACAGAGATCCTTCTTGGTCTTCCTTGAA
GATGATGCTACCAATCAAAGCCAATGATCCTAAATGTCGACTTGTATTACAGGCTGTATC
AGACAGCGCAGAGATGAGTGGTGTTTCAAAGAAGGAGGAAGAGAAATCTGATGAATATAG
CCAAGACATGACTCAAGCTATGGGTGCTGTATTAACATACAGGCACGAGCTAGGAATGAA
CTACAACTTCCTTCGTCCAGATTTAATCGTTGGATCTTGCTTACAGACTCCTGAAGATGT
TGACAAGCTCCGTAAGATTGGTGTTAAAACCATATTCTGCTTGCAACAAGATCCTGACTT
GGAATATTTTGGAGTAGATATAAGCAGCATTCAAGCATATGCTAAGACATTTACTGATAT
TGAGCATATTCGCTGTGAAATAAGAGACTTCGATGCATTTGATCTGAGAATGCGTCTTCC
TGCTGTGCTTAGTACACTGTACAAAGCTGTTAAGCGAAATGGAGGAGTTACATACGTCCA
CTGCACTGCTGGTATGGGAAGGGCTCCTGCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCA
AGGCTATAA*CTTATGGATGCTCATAAA*TACTTATGAGCAAACGAACGTGCTTCCCGAA
GCTGGATGCTATCAGAA*TGCAACAATTGATAT*CTTACAG*ACTC***AGATAGTCTGT
TACTCTGACACTGAAAG

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR2B367TF 873 0 0
GG
GACGGACCTGGGACTGAGTGAGTGAGCAATTCTTCCTCTCTGATACATTCTCTAAGAGAT
GAATTGCCTTCAGAATCTTCCTAGATCTTCAGTCTCACCTCTGTTGAGCTTTGGAGGCAA
TCACAGAGATCCTTCTTGGTCTTCCTTGAAGATGATGCTACCAATCAAAGCCAATGATCC
TAATTGTCGACTTGTTTTACAGGCTGTATCAGACAGCGCAGAGATGAGTGGTGTTTCAAA
GAAGGAGGAAGAGAAATCTGATGAATATAGTCAAGACATGACTCAAGCTATGGGTGCTGT
ATTAACATACAGGCACGAGCTAGGAATGAACTACAACTTCCTTCGTCCAGATTTAATCGT
CGGATCTTGCTTACAGACTCCTGAAGATGTTGACAAGCTCCGTAAGATTGGTGTTAAAAC
CATATTCTGCTTGCAACAAGATCCTGACTTGGAATATTTTGGAGTAGATATAAAGAGCAT
TCAAGCATACGCTAAGACATTTACTGATATTGAGCATATTCGCTGTGAAATAAGAGACTT
TGATGCATTTGATTTGAGAATGCGTCTTCCTGCTGTGCTTAGTACACTGTACAAAGCTGT
TAAGCGAAATGGAGGAGTTACATACGTCCACTGCACTGCTGGTATGGGAAGGGCTCCTGC
TGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCAAGGCTATAAACTTATGGATGCTCATAAAAT
ACTTATGAGCAAACGAACGTGCTTCCCGAAGCTTGATGCTATCAGAA*TGCAACTATTGA
TATTCTTACAG*ACTCAAGAGGAAGTCTGTTACTCTGACACTGAAAGACA*GGGTTTCTC
*ACTGTAGAAATTTCTGGC*TTGACATCGGA

QA 3 873 3 873
DS 

RD RR2B367JQ 786 0 0
GTGCTTAGTACACTGTACAAAGCTGTTAAGCGAAATGGAGGAGTTACATACGTCCACTGC
ACTGCTGGTATGGGAAGGGCTCCTGCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCAAGGC
TATAAACTTATGGATGCTCATAAAATACTTATGAGCAAACGAACGTGCTTCCCGAAGCTT
GATGCTATCAGAAATGCAACTATTGATATTCTTACAGGACTCAAGAGGAAGTCTGTTACT
CTGACACTGAAAGACAAGGGTTTCTCCACTGTAGAAATTTCTGGCCTTGACATCGGATGG
GGACAGAGGATACCTCTGACACTGGACAAGGGAACAGGATTCTGGAGCCTGAAGAGGGAA
TTGCCTGAGGGACAGTTTGAATATAAATATATCATAGATGGGGAATGGACACACAATGAG
CTCGAGCCGTTTATAGGACCTAACAAAGATGGTCATACCAATAATTACGCAAAAGTGGTG
TATGATCCAACGAGCGTTGATGGTGCAACCCGGGAGAGGTTAACAAAGGAAGACCCTGAG
CTTTTGGAGGACGAACGCTCGAAGCTAATCCAGTTCTTGGAGACTTCTTCTGAGGCAGAA
GTTTGAGAGCTGAGAGCGTCCTTGTAACTCTGTGAATGTACCCCTTACTAGTAACAATAA
AATGCTTTATGTAGGTCATGCATAAAGTTATGTTTATAGGGAAAAAGAAACATAAAGCTA
GTTGTATTGTACCATGTTCAAGTATAATAATATTACATAAGACTTTAATCTCTGTTCTTG
TTAAAG

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 3

CO CL2810Contig1 577 3 3 U
GAAGATAAAAAAGATTCATCGCAGGGTCTACATAGTAAATGAGTCTTTCCAATAATAAGC
TGCAACTGTGACTTTTTTGAACGAAAACCAACAAGAAAATTAAGAGAAAAACACCAAAAC
TTGTCTAAGCCACAGACTAGTAGTCCCTTCTCAATCCTCCTCATCGATGACCTTTGTGCC
GACCACTTAGTCCTTCAGCAGGTACTTCGGCAACGGTGACAAGTGAGAAAAACTCTTCCT
TTGCGTCTTCATCGTCGTTCCTCTTACGTGCAACGCGGACCCTGATCCTCCTTGGGGGAC
CTCTGATACCTTTGCTCCATATCTGCTTGTTCAACTTCACGTCTACCCTAACGTCCTTGG
TTCCCATGGCTTTCTCTGCAAACTTCCTTATCTCCTTAATGGCCTTTGGTGCCTTCTTCT
TAAAGGTGCAGCTGTGGAGACGTCTGTGGAGATTGATGGTGTACTCTCTAGTCACCACTT
CCTCTTTCCTTCCCTTTTTCTCAAACATCTTCTCTTTGTTGTCTGTCTTGTACTTCTTCA
CACTCTTACCTTTGCGGCTCGAAGAACGTCGACAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK31JQ U 1
AF RR2DK31TF C 299
AF RR2AC60JQ U 433
BS 1 501 RR2DK31JQ
BS 502 570 RR2AC60JQ
BS 571 577 RR2DK31TF

RD RR2DK31JQ 501 0 0
GAAGATAAAAAAGATTCATCGCAGGGTCTACATAGTAAATGAGTCTTTCCAATAATAAGC
TGCAACTGTGACTTTTTTGAACGAAAACCAACAAGAAAATTAAGAGAAAAACACCAAAAC
TTGTCTAAGCCACAGACTAGTAGTCCCTTCTCAATCCTCCTCATCGATGACCTTTGTGCC
GACCACTTAGTCCTTCAGCAGGTACTTCGGCAACGGTGACAAGTGAGAAAAACTCTTCCT
TTGCGTCTTCATCGTCGTTCCTCTTACGTGCAACGCGGACCCTGATCCTCCTTGGGGGAC
CTCTGATACCTTTGCTCCATATCTGCTTGTTCAACTTCACGTCTACCCTAACGTCCTTGG
TTCCCATGGCTTTCTCTGCAAACTTCCTTATCTCCTTAATGGCCTTTGGTGCCTTCTTCT
TAAAGGTGCAGCTGTGGAGACGTCTGTGGAGATTGATGGTGTACTCTCTAGTCACCACTT
CCTCTTTCCTTCCCTTTTTCT

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR2DK31TF 279 0 0
ACCTCTGAT*CCTTTGCTCCATATCTGCTTGTTCAACTTCACGTCTACCCTAACGTCCTT
GGTTCCCATGGCTTTCTCTGCAAACTTCCTTATCTCCTTAATGGCCTTTGGTGCCTTCTT
CTTAAAGGTGCAGCTGTGGAGACGTCTGTGGAGATTGATGGTGTACTCTCTAGTCACCAC
TTCCTCTTTCCTTCCCTTTTTCTCAGACATCTTCTCTTTGTTGTCTGTCTTGTACTTCTT
CACACTCTTACCTTTGCGGCTCGAAGAACGTCGACAGCC

QA 1 279 1 279
DS 

RD RR2AC60JQ 143 0 0
TGTGGAGACGTCTGTGGAGATTGATGGTGTACTCTCTAGTCACCACTTCCTCTTTCCTTC
CCTTTTTCTCAAACATCTTCTCTTTGTTGTCTGTCTTGTACTTCTTCACACTCTTACCTT
TGCGGCTCGAAGAACGTC
GACCC

QA 1 138 1 138
DS 



AS 2 4

CO CL2811Contig1 721 2 2 U
AGGGACTTCCCACCACCACCATTCTCATTCTCTCTTGCTCCAAAACTTTCGTTTCTTCTT
CATCATCTCTCTTTCTCTCTACACAAGTAAAAAAAAGCAATGAGCTCAATGATGGAAACT
CTCCAGATTCGCAAACCTACTTCTCTCCCCGTCTCTCAACGCCTTAGTAGTCCCACTAAA
GATGACCAGCCTGGTGTTATACGCCGGCGTCTCTCTTCTCTCTCACTCAATCTCCTAAAC
CAACCGTCAGAGATCGCATCTCGGTTCCCCAAGTCCAAATCCGTTTCGGATATGGGAAAG
CAAGTAGGAAGCTCGGCGAAAGAATGGTGGGAGTGGGGCTGGTCATGGATCCTCTCGAGG
AAACCCATCTTCATCAGAGACCTCGAGCTTAGCAGAGAGGAAGCTAAAACAATTGGTTCT
CACAACAAAGGAAGCATAATGCACGTCTTCTTCAAGCTCCGTTCTCAGATCCGCACCCTC
ATGGGATCGTCTTCCGACACTCTTCCTCTCTCATGCAAACAGAAGCGTCAACGATGATGA
TGATTCTCTGTTTTGTCATTTGTCTAAGAATATTATTCGTTTCCATTTTGTTGAATTGGA
GGTATAATCAAATCATATACAAGCGATGTGTTCATTTTTAAAAATGATGATGTATTTTGT
TGCTATAATTAATTTGCCTAGTTTTTTTTAAAAGAAAATATTCATTAGTTTGGTTTGTTT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 

AF RR2AM67TF U 1
AF RR2AM67JQ C 21
BS 1 719 RR2AM67TF
BS 720 721 RR2AM67JQ

RD RR2AM67TF 719 0 0
AGGGACTTCCCACCACCACCATTCTCATTCTCTCTTGCTCCAAAACTTTCGTTTCTTCTT
CATCATCTCTCTTTCTCTCTACACAAGTAAAAAAAAGCAATGAGCTCAATGATGGAAACT
CTCCAGATTCGCAAACCTACTTCTCTCCCCGTCTCTCAACGCCTTAGTAGTCCCACTAAA
GATGACCAGCCTGGTGTTATACGCCGGCGTCTCTCTTCTCTCTCACTCAATCTCCTAAAC
CAACCGTCAGAGATCGCATCTCGGTTCCCCAAGTCCAAATCCGTTTCGGATATGGGAAAG
CAAGTAGGAAGCTCGGCGAAAGAATGGTGGGAGTGGGGCTGGTCATGGATCCTCTCGAGG
AAACCCATCTTCATCAGAGACCTCGAGCTTAGCAGAGAGGAAGCTAAAACAATTGGTTCT
CACAACAAAGGAAGCATAATGCACGTCTTCTTCAAGCTCCGTTCTCAGATCCGCACCCTC
ATGGGATCGTCTTCCGACACTCTTCCTCTCTCATGCAAACAGAAGCGTCAACGATGATGA
TGATTCTCTGTTTTGTCATTTGTCTAAGAATATTATTCGTTTCCATTTTGTTGAATTGGA
GGTATAATCAAATCATATACAAGCGATGTGTTCATTTTTAAAAATGATGATGTATTTTGT
TGCTATAATTAATTTGCCTAGTTTTTTTTAAAAGAAAATATTCATTAGTTTGGTTTGTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2AM67JQ 701 0 0
AT
TCTCATTCTCTCTTGCTCCAAAACTTTCGTTTCTTCTTCATCATCTCTCTTTCTCTCTAC
ACAAGTAAAAAAAAGCAATGAGCTCAATGATGGAAACTCTCCAGATTCGCAAACCTACTT
CTCTCCCCGTCTCTCAACGCCTTAGTAGTCCCACTAAAGATGACCAGCCTGGTGTTATAC
GCCGGCGTCTCTCTTCTCTCTCACTCAATCTCCTAAACCAACCGTCAGAGATCGCATCTC
GGTTCCCCAAGTCCAAATCCGTTTCGGATATGGGAAAGCAAGTAGGAAGCTCGGCGAAAG
AATGGTGGGAGTGGGGCTGGTCATGGATCCTCTCGAGGAAACCCATCTTCATCAGAGACC
TCGAGCTTAGCAGAGAGGAAGCTAAAACAATTGGTTCTCACAACAAAGGAAGCATAATGC
ACGTCTTCTTCAAGCTCCGTTCTCAGATCCGCACCCTCATGGGATCGTCTTCCGACACTC
TTCCTCTCTCATGCAAACAGAAGCGTCAACGATGATGATGATTCTCTGTTTTGTCATTTG
TCTAAGAATATTATTCGTTTCCATTTTGTTGAATTGGAGGTATAATCAAATCATATACAA
GCGATGTGTTCATTTTTAAAAATGATGATGTATTTTGTTGCTATAATTAATTTGCCTAGT
TTTTTTTAAAAGAAAATATTCATTAGTTTGGTTTGTTTT

QA 3 701 3 701
DS 



CO CL2811Contig2 783 2 2 U
GGACTACTTCCCACCACCACCAATCTCATTCTCTCTTGCTCCAAAACTTTCATTCTTCTT
CACCATCTCTCTTTCTCTCTACAGAAATCAAAAAAGCAATGAGCTCAATGATGGAAACTC
TCCAGATTCGCAAACCTACTTCTCTCCCCGTCTCTCAACGCCTTAGTAGTCCCACTAAAG
ATGACCAACCTGGTGTTATACGCCGTCGTCTCTCTTCTCTCTCACTCAATCTCCTAAACC
AACCATCAGAGATCGCATCTCGGTTCCCCAAGTCCAAATCCGTTTCAGATATGGGAAAGC
AAGTAGGAAGCTCGGCGAAAGAATGGTGGCAGTGGGGCTGGTCATGGATCCTCTCGAGGA
AACCTATCTTCATCAGAGACCTTGAGCTTAACAGAGAGGAAGCTAAAACAATTGGTTCTC
ACAACAAAGGAAGCATAATGCACGTCTTCTTCAAGCTCCGTTCTCAGATCCGCACCCTCA
TGGGATCTTCTTCCGACACTCTTCCTCTTTCATGCAAACAGAAGCGTCAACGATGATGAT
GATTCTCTGTTTTGTCATTTGTCTCAAAGAATATTATTCGTTTCCATTTTGTTGAATTGG
AGGTATAATCAAAATCATATACAAAGCTATGTGTTCATTTTTAAAAGATGATGTTGTATT
TTGTTGCTATAATTAATTTGCCTAGTTTTAAAAAAAAATATTTATTAGTTTAATTTGTTT
TTACATGTTGTTTGTGCAGTTGTATTTTTGTATTTAATAACCATGCAATTTTGTAAAGTC
TGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2DU40TF U 1
AF RR2DU40JQ C 153
BS 1 688 RR2DU40TF
BS 689 783 RR2DU40JQ

RD RR2DU40TF 696 0 0
GGACTACTTCCCACCACCACCAATCTCATTCTCTCTTGCTCCAAAACTTTCATTCTTCTT
CACCATCTCTCTTTCTCTCTACAGAAATCAAAAAAGCAATGAGCTCAATGATGGAAACTC
TCCAGATTCGCAAACCTACTTCTCTCCCCGTCTCTCAACGCCTTAGTAGTCCCACTAAAG
ATGACCAACCTGGTGTTATACGCCGTCGTCTCTCTTCTCTCTCACTCAATCTCCTAAACC
AACCATCAGAGATCGCATCTCGGTTCCCCAAGTCCAAATCCGTTTCAGATATGGGAAAGC
AAGTAGGAAGCTCGGCGAAAGAATGGTGGCAGTGGGGCTGGTCATGGATCCTCTCGAGGA
AACCTATCTTCATCAGAGACCTTGAGCTTAACAGAGAGGAAGCTAAAACAATTGGTTCTC
ACAACAAAGGAAGCATAATGCACGTCTTCTTCAAGCTCCGTTCTCAGATCCGCACCCTCA
TGGGATCTTCTTCCGACACTCTTCCTCTTTCATGCAAACAGAAGCGTCAACGATGATGAT
GATTCTCTGTTTTGTCATTTGTCTCAAAGAATATTATTCGTTTCCATTTTGTTGAATTGG
AGGTATAATCAAAATCATATACAAAGCTATGTGTTCATTTTTAAAAGATGATGTTGTATT
TTGTTGCTATAATTAATTTGCCTAGTTT
AAAAAAAA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2DU40JQ 631 0 0
TCTCAACGCCTTAGTAGTCCCACTAAAGATGACCAACCTGGTGTTATACGCCGTCGTCTC
TCTTCTCTCTCACTCAATCTCCTAAACCAACCATCAGAGATCGCATCTCGGTTCCCCAAG
TCCAAATCCGTTTCAGATATGGGAAAGCAAGTAGGAAGCTCGGCGAAAGAATGGTGGCAG
TGGGGCTGGTCATGGATCCTCTCGAGGAAACCTATCTTCATCAGAGACCTTGAGCTTAAC
AGAGAGGAAGCTAAAACAATTGGTTCTCACAACAAAGGAAGCATAATGCACGTCTTCTTC
AAGCTCCGTTCTCAGATCCGCACCCTCATGGGATCTTCTTCCGACACTCTTCCTCTTTCA
TGCAAACAGAAGCGTCAACGATGATGATGATTCTCTGTTTTGTCATTTGTCTCAAAGAAT
ATTATTCGTTTCCATTTTGTTGAATTGGAGGTATAATCAAAATCATATACAAAGCTATGT
GTTCATTTTTAAAAGATGATGTTGTATTTTGTTGCTATAATTAATTTGCCTAGTTTTAAA
AAAAAATATTTATTAGTTTAATTTGTTTTTACATGTTGTTTGTGCAGTTGTATTTTTGTA
TTTAATAACCATGCAATTTTGTAAAGTCTGT

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 3

CO CL2812Contig1 1503 3 2 U
AACTTTCGATAGAATACAACTTCAGCCGGCGGACTACAACGAAATCCCCGAAAACTTATC
CCATAACAGGGAGACTTAAACCCAAACATGGGTATCAAAAAGACACAAACATAACTTTAA
TCTAACGCAAGTTTCTACAACTAGACCTTTTTATAACCCTCAAGAAAACAAAGATAAAAG
CTGAAGCTTAAACCAACCCGAAGTCCATTGAAAGACCATAGTCAGCCAAACGGACAAGCA
GCGGAAAGGACAAAAGACCGAAACTCACCTGAACCTCCTGTTCAAGATGAAAAGCCAGAA
CCACGCCGAATAGCATCAACCACACACACACCAACACCGAACCAAGGAACCAAGAACCAA
GAACCAACACCTGGGACAAACCCTCCTGACAACTGCATCTTCATCGGAATGGACCCAAAC
CTCTACCTCATTATACTGCTTCAAACATCCAAGAAGAAGCCATAGAGGAACTAAGAAGTC
AACGAACAAACCGAAAAACAAACACTTATTAAAAGATGCAGCAAGGACTCCTTCACGACT
GAGAATGGAGAGGTGACACCAACCAACTTCTTCACAACAGAGATGCTAACTCTGGTCTGC
TCACGGACTCGCCAAAACACCACTGTCACACTGAAGATGAAGAGCGGCTAGATAAATCAA
TGTCAATCAAGTATTTAGAGGATACATCCTCTCCGTTGAATGGGGTAAGACAAGGCAAAA
CAGATGAGGTGAACCAAAACAGAGAGGGGAGAGATTTATCACATAAACCATCAAACACTC
AAGGGAAAGAATCGCAGATCTAAAAGCCAGCATATAAATCAGATCACCGACGACCTAAAA
CTGACCAATGAACATCTGAACCTCTGAAAAACGACGATTCAACACCACCACAGGAAGGAA
AAGCTCTCCACACGCCTCTACACGCTTCCACTCGACTCCAAGTCAACGAAATAACCCACC
CCGGAACAAGAAGGATCTATAAAGCAGAAAGGAGCAAACGGGATCACGAACTGAGCAACA
CCAGTGGCCATGGAAACTGAACCAATGCTCTTGACAGGTGCTGCTTTCGGTGGAGGAGGA
AGCTTCTCGACTTTAACAGCGAGCTTCATGCCGCCGTAACAGCCACCCCTTCCGTCGAGT
AGATAGTAATGTTTGGTCACGTTGAGAGTGACAATGTCTCTCCCAGCTCCACGCGTCCAG
TTTACGAGAGGATGGTCGGCGTTACAGTTTTCGTAGTCGGTCTTGTTTACTTCAAGAATG
TTGTGTTGGTTCCTGTCGAACACGAAATAGAGCCAGTCTCCGAGGTAGAAATGCTTTCCC
TGAGCCCAAATGGTATAGTTGATGTTGGGGTTCCAAAACTTGTTCTCGCCGACTGTGTAC
TTCTTCGCAGTTACTTCAGGCACCGCCACTACAATGGCCAGTACCACTGCCGCAATCAAC
ACCGTGAATCTCGCCATTTTTTTCTCTCTCTCTGTCTAAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2AP08JQ U 1
AF RR2C961JQ U 1
AF RR2AP08TF C 617
BS 1 778 RR2AP08JQ
BS 779 1503 RR2AP08TF

RD RR2AP08JQ 778 0 0
AACTTTCGATAGAATACAACTTCAGCCGGCGGACTACAACGAAATCCCCGAAAACTTATC
CCATAACAGGGAGACTTAAACCCAAACATGGGTATCAAAAAGACACAAACATAACTTTAA
TCTAACGCAAGTTTCTACAACTAGACCTTTTTATAACCCTCAAGAAAACAAAGATAAAAG
CTGAAGCTTAAACCAACCCGAAGTCCATTGAAAGACCATAGTCAGCCAAACGGACAAGCA
GCGGAAAGGACAAAAGACCGAAACTCACCTGAACCTCCTGTTCAAGATGAAAAGCCAGAA
CCACGCCGAATAGCATCAACCACACACACACCAACACCGAACCAAGGAACCAAGAACCAA
GAACCAACACCTGGGACAAACCCTCCTGACAACTGCATCTTCATCGGAATGGACCCAAAC
CTCTACCTCATTATACTGCTTCAAACATCCAAGAAGAAGCCATAGAGGAACTAAGAAGTC
AACGAACAAACCGAAAAACAAACACTTATTAAAAGATGCAGCAAGGACTCCTTCACGACT
GAGAATGGAGAGGTGACACCAACCAACTTCTTCACAACAGAGATGCTAACTCTGGTCTGC
TCACGGACTCGCCAAAACACCACTGTCACACTGAAGATGAAGAGCGGCTAGATAAATCAA
TGTCAATCAAGTATTTAGAGGATACATCCTCTCCGTTGAATGGGGTAAGACAAGGCAAAA
CAGATGAGGTGAACCAAAACAGAGAGGGGAGAGATTTATCACATAAACCATCAAACAC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2C961JQ 723 0 0
AACTTTCGATAGAATACAACTTCAGCCGGCGGACTACAACGAGATCCCCGAAAACTTATC
CCATAACAGGGAGACTTAAACCCAAACATGGGTATCAAAAAGACACAAACATAACTTTAA
TCTAACGCAAGTTTCTACAACTAGACCTTTTTATAACCCTCAAGAAAACAAAGATAAAAG
CTGAAGCTTAAACCAACCCGAAGTCCATTGAAAGACCATAGTCAGCCAAACGGACAAGCA
GCGGAAAGGACAAAAGACCGAAACTCACCTGAACCTCCTGTTCAAGATGAAAAGCCAGAA
CCACGCCGAATAGCATCAACCACACACACACCAACACCGAACCAAGGAACCAAGAACCAA
GAACCAACACCTGGGACAAACCCTCCTGACAACTGCATCTTCATCGGAATGGACCCAAAC
CTCTACCTCATTATACTGCTTCAAACATCCAAGAAGAAGCCATAGAGGAACTAAGAAGTC
AACGAACAAACCGAAAAACAAACACTTATTAAAAGATGCAGCAAGGACTCCTTCACGACT
GAGAATGGAGAGGTGACACCAACCAACTTCTTCACAACAGAGATGCTAACTCTGGTCTGC
TCACGGACTCGCCAAAACACCACTGTCACACTGAAGATGAAGAGCGGCTAGATAAATCAA
TGTCAATCAAGTATTTAGAGGATACATCCTCTCCGTTGAATGGGGTAAGACAAGGCAAAA
CAG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2AP08TF 887 0 0
ACACCACTGTCACACTGAAGATGAAGAGCG*CTAGATAAATCAATGTCAATCAAGTATT*
AGAGGATACATCCTCTCCGTTGAATGGGGTAAGACAAGGCAAAACAGATGAGGTGAACCA
AAACAGAGAGGGGAGAGATTTATCACATAAACCATCAAACACTCAAGGGAAAGAATCGCA
GATCTAAAAGCCAGCATATAAATCAGATCACCGACGACCTAAAACTGACCAATGAACATC
TGAACCTCTGAAAAACGACGATTCAACACCACCACAGGAAGGAAAAGCTCTCCACACGCC
TCTACACGCTTCCACTCGACTCCAAGTCAACGAAATAACCCACCCCGGAACAAGAAGGAT
CTATAAAGCAGAAAGGAGCAAACGGGATCACGAACTGAGCAACACCAGTGGCCATGGAAA
CTGAACCAATGCTCTTGACAGGTGCTGCTTTCGGTGGAGGAGGAAGCTTCTCGACTTTAA
CAGCGAGCTTCATGCCGCCGTAACAGCCACCCCTTCCGTCGAGTAGATAGTAATGTTTGG
TCACGTTGAGAGTGACAATGTCTCTCCCAGCTCCACGCGTCCAGTTTACGAGAGGATGGT
CGGCGTTACAGTTTTCGTAGTCGGTCTTGTTTACTTCAAGAATGTTGTGTTGGTTCCTGT
CGAACACGAAATAGAGCCAGTCTCCGAGGTAGAAATGCTTTCCCTGAGCCCAAATGGTAT
AGTTGATGTTGGGGTTCCAAAACTTGTTCTCGCCGACTGTGTACTTCTTCGCAGTTACTT
CAGGCACCGCCACTACAATGGCCAGTACCACTGCCGCAATCAACACCGTGAATCTCGCCA
TTTTTTTCTCTCTCTCTGTCTAAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCC

QA 1 887 1 887
DS 



AS 1 3

CO CL2813Contig1 881 3 14 U
GGGACACTCTATCACCCTTGCCGATATCGTCACTGTCTGCAACTTGAGTCTGGGATTTAC
TACTATCATGACCAAGAGCTTCACCTCTGCATTCCCCCATGTTGAGAGATACTTCTGGAC
CTTGATTAACCAGCCAAACTTCAAGAAGGTGGTGGGTGATGTCAAACAGACTGAAGCTGT
CCCCCCTGTTACTTCCAAGAAAGCTGCTGCCCAGCCTGCAAAGGCCAAGGAAGAGCCTAA
GAAAAAGGCTGCCCCTGTTGCAGAGGCACCTAAGCCTGTTGAAGAGGAAGAGGCACCAAA
GCCCAAAGCAAAGAACCCTCTTGACTTGCTACCACCAAGCCCAATGGTTCTCGATGAGTG
GAAGAGGCTGTACTCAAACACCAAGTCTAACTTCCGTGAGGTTGCTATTAAAGGATTCTG
GGACATGTATGACCCAGAGGGATACTCACTGTGGTTCTGCGACTACAAATACAATGACGA
GAACACTGTGTCATTCGTCACCCTCAACAAGGTTGGTGGATTCCTGCAGAGAATGGATTT
GGCACGCAAGTACGCCTTTGGAAAGATGCTGATTTGCGGGGCAGAAGGTCCGTTCAAGGT
GAAGGGTTTGTGGCTGTTCCGTGGACCAGAGATCCCCAAGTTCGTTATGGATGAGGTGTA
CGACATGGAGCTGTACGAGTGGACTAAGGTCGACATCTCCGATGAAGCCCAGAAGGAGCG
TGTTAGCCAGATGATCGAGGACGCAGAGCCGTTTGAAGGTGAAGCTCTCTTGGACGCCAA
GTGCTTCAAGTGAAAAAGATTATTGGTTTTGGTTTGATACGCTCTCTCATATGAGTTTTG
CTTCGGTGACTTGTGTTTTGATGATCCTATGGGTCGCTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO30TF U 12
AF RR2D428TF U 1
AF RR2CO30JQ C 327
BS 1 655 RR2D428TF
BS 656 656 RR2CO30TF
BS 657 687 RR2D428TF
BS 688 688 RR2CO30JQ
BS 689 715 RR2D428TF
BS 716 716 RR2CO30JQ
BS 717 739 RR2D428TF
BS 740 740 RR2CO30JQ
BS 741 758 RR2D428TF
BS 759 759 RR2CO30JQ
BS 760 775 RR2D428TF
BS 776 776 RR2CO30JQ
BS 777 788 RR2D428TF
BS 789 881 RR2CO30JQ

RD RR2CO30TF 691 0 0
G
CACCCTTGCCGATATCGTCACTGTCTGCAACTTGAGTCTGGGATTTACTACTATCATGAC
CAAGAGCTTCACCTCTGCATTCCCCCATGTTGAGAGATACTTCTGGACCTTGATTAACCA
GCCAAACTTCAAGAAGGTGGTGGGTGATGTCAAACAGACTGAAGCTGTCCCCCCTGTTAC
TTCCAAGAAAGCTGCTGCCCAGCCTGCAAAGGCCAAGGAAGAGCCTAAGAAAAAGGCTGC
CCCTGTTGCAGAGGCACCTAAGCCTGTTGAAGAGGAAGAGGCACCAAAGCCCAAAGCAAA
GAACCCTCTTGACTTGCTACCACCAAGCCCAATGGTTCTCGATGAGTGGAAGAGGCTGTA
CTCAAACACCAAGTCTAACTTCCGTGAGGTTGCTATTAAAGGATTCTGGGACATGTATGA
CCCAGAGGGATACTCACTGTGGTTCTGCGACTACAAATACAATGACGAGAACACTGTGTC
ATTCGTCACCCTCAACAAGGTTGGTGGATTCCTGCAGAGAATGGATTTGGCACGCAAGTA
CGCCTTTGGAAAGATGCTGATTTGCGGGGCAGAAGGTCCGTTCAAGGTGAAGGGTTTGTG
GCTGTTCCGTGGACCAGAGATCCCCAAGTTCGTTATGGATGAGGTGTACGACATGGAGCT
GTACGAGTGGACTAATGTCGACATCTCCGA

QA 2 691 2 691
DS 

RD RR2D428TF 796 0 0
GGGACACTCTATCACCCTTGCCGATATCGTCACTGTCTGCAACTTGAGTCTGGGATTTAC
TACTATCATGACCAAGAGCTTCACCTCTGCATTCCCCCATGTTGAGAGATACTTCTGGAC
CTTGATTAACCAGCCAAACTTCAAGAAGGTGGTGGGTGATGTCAAACAGACTGAAGCTGT
CCCCCCTGTTACTTCCAAGAAAGCTGCTGCCCAGCCTGCAAAGGCCAAGGAAGAGCCTAA
GAAAAAGGCTGCCCCTGTTGCAGAGGCACCTAAGCCTGTTGAAGAGGAAGAGGCACCAAA
GCCCAAAGCAAAGAACCCTCTTGACTTGCTACCACCAAGCCCAATGGTTCTCGATGAGTG
GAAGAGGCTGTACTCAAACACCAAGTCTAACTTCCGTGAGGTTGCTATTAAAGGATTCTG
GGACATGTATGACCCAGAGGGATACTCACTGTGGTTCTGCGACTACAAATACAATGACGA
GAACACTGTGTCATTCGTCACCCTCAACAAGGTTGGTGGATTCCTGCAGAGAATGGATTT
GGCACGCAAGTACGCCTTTGGAAAGATGCTGATTTGCGGGGCAGAAGGTCCGTTCAAGGT
GAAGGGTTTGTGGCTGTTCCGTGGACCAGAGATCCCCAAGTTCGTTATGGATGAG*TGTA
CGACATGGAGCTGTACGAGTGGACTAA*GTCGACATCTCCGATGAAGCCCAGAAG*AGCG
TGTTAGCCAGATGATCGAG*ACGCAGAGCCGTTTGAAG*TGAAGCTCTCTTGGAC*CCAA
GTGCTTCA
GTGAAAAG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2CO30JQ 555 0 0
TGCTACCACCAAGCCCAATGGTTCTCGATGAGTGGAAGAGGCTGTACTCAAACACCAAGT
CTAACTTCCGTGAGGTTGCTATTAAAGGATTCTGGGACATGTATGACCCAGAGGGATACT
CACTGTGGTTCTGCGACTACAAATACAATGACGAGAACACTGTGTCATTCGTCACCCTCA
ACAAGGTTGGTGGATTCCTGCAGAGAATGGATTTGGCACGCAAGTACGCCTTTGGAAAGA
TGCTGATTTGCGGGGCAGAAGGTCCGTTCAAGGTGAAGGGTTTGTGGCTGTTCCGTGGAC
CAGAGATCCCCAAGTTCGTTATGGATGAGGTGTACGACATGGAGCTGTACGAGTGGACTA
AGGTCGACATCTCCGATGAAGCCCAGAAGGAGCGTGTTAGCCAGATGATCGAGGACGCAG
AGCCGTTTGAAGGTGAAGCTCTCTTGGACGCCAAGTGCTTCAAGTGAAAAAGATTATTGG
TTTTGGTTTGATACGCTCTCTCATATGAGTTTTGCTTCGGTGACTTGTGTTTTGATGATC
CTATGGGTCGCTTAG

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 4

CO CL2814Contig1 989 4 6 U
CACTTAGAATCCAATTTTTCACATATACATATCCAACAAGTATTTTCTTTCTCATTACAC
AAAGCGGTTTTAGTTTTACTTATGTTTCAACAAACCAACGACGCTTTTACTTATTTGCAA
CACACATCTGTTGCAGCATGCATATCCCCATCACCCTCTTTTATCTTCGGTGTTTATGTC
ATCAGTCAGTGCTCCGCTGCACTCGAATGGTAAGCTCGACGCCTCAACTGAGACTCCCCA
GATGGCTGCTGTAGGTATATCTTCGTTGGATCGTTAGGGTCCACGTACGCATGTCTCATC
ATTTCATCAACGGGGGTCTGTGCGGCTTGAAGAGGATCAACACGTGGTGCTGCCGCTGCT
TGTTGCATTTGTCTGTTGTACTGCCTCACTGATGATATGAGATTCAAGAAGAGAGGAACA
AACGTCCCGCAGCCACCTTCCTTGAATAAGATCTTAAAACTGTGTGTTGAATACAGTGCT
CTGTGCTCGTTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGAAT
ATTGGCTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAG
TTCTCAACAGGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTCCC
TTGGCCTTAACATGGCCTCCATGTCCTCCAGGAATCTTGTCGACTTCAAACTCGACGCCA
TCTCGGACAAGAACAAACATTTCATTAACAAAGAGAACAGGCATCCCATTGGGCATCAAC
TGAGGGTTAAGCGCCATGGCTGCAAGTTTCAATTTGATCAAGCCGAGTAAAAGGTCCCTT
CTTGTTCTGTTGTTGTGCTTCTCAAACCTAGCTTCTTCCCTTGCTGTGTAACCTGATCAC
TCTAGCGACTTTTTGATCGGAGAGAAGATAATTTGAAAGGTGGAAGGGACTCGCTTTGTT
AATTAGAGCTTCTCGCTTGTTCCAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FV70JQ U 1
AF RR2CI51JQ U 36
AF RR2FV70TF C 190
AF RR2CI51TF C 236
BS 1 487 RR2FV70JQ
BS 488 488 RR2CI51JQ
BS 489 685 RR2FV70JQ
BS 686 802 RR2CI51JQ
BS 803 964 RR2FV70TF
BS 965 989 RR2CI51TF

RD RR2FV70JQ 685 0 0
CACTTAGAATCCAATTTTTCACATATACATATCCAACAAGTATTTTCTTTCTCATTACAC
AAAGCGGTTTTAGTTTTACTTATGTTTCAACAAACCAACGACGCTTTTACTTATTTGCAA
CACACATCTGTTGCAGCATGCATATCCCCATCACCCTCTTTTATCTTCGGTGTTTATGTC
ATCAGTCAGTGCTCCGCTGCACTCGAATGGTAAGCTCGACGCCTCAACTGAGACTCCCCA
GATGGCTGCTGTAGGTATATCTTCGTTGGATCGTTAGGGTCCACGTACGCATGTCTCATC
ATTTCATCAACGGGGGTCTGTGCGGCTTGAAGAGGATCAACACGTGGTGCTGCCGCTGCT
TGTTGCATTTGTCTGTTGTACTGCCTCACTGATGATATGAGATTCAAGAAGAGAGGAACA
AACGTCCCGCAGCCACCTTCCTTGAATAAGATCTTAAAACTGTGTGTTGAATACAGTGCT
CTGTGCTTGTTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGAAT
ATTGGCTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAG
TTCTCAACAGGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTCCC
TTGGCCTTAACATGGCCTCCATGTC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2CI51JQ 767 0 0
ACAAGTATTTTCTTTCTCATTACACAAAGCGGTTTTAGTTTTACTTATGTTTCAACAAAC
CAACGACGCTTTTACTTATTTGCAACACACATCTGTTGCAGCATGCATATCCCCATCACC
CTCTTTTATCTTCGGTGTTTATGTCATCAGTCAGTGCTCCGCTGCACTCGAATGGTAAGC
TCGACGCCTCAACTGAAACTCCCCAGATGGCTGCTGTAGGTATATCTTCGTTGGATCGTT
AGGGTCCACGTACGCATGTCTCATCATTTCATCAACGGGGGTCTGTGCGGCTTGAAGAGG
ATCAACACGTGGTGCTGCCGCTGCTTGTTGCATTTGTCTGTTGTACTGCCTCACTGATGA
TATGAGATTCAAGAAGAGAGGAACAAACGTCCCGCAGCCACCTTCCTTGAATAAAATCTT
AAAACTGTGTGTTGAATACAGTGCTCTGTGCTCGTTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTG
TCCAAATATATTGTTGCAGTGGAATATTGGCTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAG
CATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAGTTCTCAACAGGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCG
AATGTTAGACAAGTATATCACTCCCTTGGCCTTAACATGGCCTCCATGTCCTCCAGGAAT
CTTGTCGACTTCAAACTCGACGCCATCTCGGACAAGAACAAACATTTCATTAACAAAGAG
AACAGGCATCCCATTGGGCATCAACTGAGGGTTAAGCGCCATGGCTG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2FV70TF 777 0 0
TGCTCCGCTGCACTCGAATGGTAAGCTCGACGC*TCAACTGAGACTCCCCAGATGGCTGC
TGTAGGTATATCTTCGTTGGATCGTTAGGGTCCACGTACGCATGTCTCATCATTTCATCA
ACGGGGGTCTGTGCGGCTTGAAGAGGATCAACACGTGGTGCTGCCGCTGCTTGTTGCATT
TGTCTGTTGTACTGCCTCACTGATGATATGAGATTCAAGAAGAGAGGAACAAACGTCCCG
CAGCCACCTTCCTTGAATAAGATCTTAAAACTGTGTGTTGAATACAGTGCTCTGTGCTTG
TTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGAATATTGGCTGG
TTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAGTTCTCAACA
GGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTCCCTTGGCCTTA
ACATGGCCTCCATGTCCTCCAGGAATCTTGTCGACTTCAAACTCGACGCCATCTCGGACA
AGAACAAACATTTCATTAACAAAGAGAACAGGCATCCCATTGGGCATCAACTGAGGGTTA
AGCGCCATGGCTGCAAGTTTCAATTTGATCAAGCCGAGTAAAAGGTCCCTTCTTGTTCTG
TTGTTGTGCTTCTCAAACCTAGCTTCTTCCCTTGCTGTGTAACCTGATCACTCTAGCGAC
TTTTTGATCGGAGAGAAGATAATTTGAAAGGTGGAAGGGACTCGCTTTGTTAATT
CC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2CI51TF 754 0 0
T
CCCAGATGGCTGCTGTAGGTATATCT*CGTTGGATCGTTAGGGTCCACGTACGCATGTCT
CATCATTTCATCAACGGGGGTCTGTGCGGCTTGAAGAGGATCAACACGTGGTGCTGCCGC
TGCTTGTTGCATTTGTCTGTTGTACTGCCTCACTGATGATATGAGATTCAAGAAGAGAGG
AACAAACGTCCCGCAGCCACCTTCCTTGAATAAGATCTTAAAACTGTGTGTTGAATACAG
TGCTCTGTGCTCGTTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTG
GAATATTGGCTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAAC
AAAGTTCTCAACAGGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCGAATGTTAGACAAGTATATCAC
TCCCTTGGCCTTAACATGGCCTCCATGTCCTCCAGGAATCTTGTCGACTTCAAACTCGAC
GCCATCTCGGACAAGAACAAACATTTCATTAACAAAGAGAACAGGCATCCCATTGGGCAT
CAACTGAGGGTTAAGCGCCATGGCTGCAAGTTTCAATTTGATCAAGCCGAGTAAAAGGTC
CCTTCTTGTTCTGTTGTTGTGCTTCTCAAACCTAGCTTCTTCCCTTGCTGTGTAACCTGA
TCACTCTAGCGACTTTTTGATCGGAGAGAAGATAATTTGAAAGGTGGAAGGGACTCGCTT
TGTTAATTAGAGCTTCTCGCTTGTTCCAGATCC

QA 2 754 2 754
DS 



AS 1 3

CO CL2815Contig1 772 3 6 U
GGGCTTAAACAAGTTTGGTTATCGAAATCTCTCAACAAGTATGAATCCAAAATTAAATAT
AACTTTTGCATAGTGTGTAGACATGTTTCCGAAGAAAAAGAAATTTTTAAAGCAGAACAC
AACTGATTCCAGTGACAAACAAAGCAAAGATTATCAAGACAAACGGGCAAAATAAGGTGT
GATTACCGAGCTGCTTGCCCCTGTGAATGTTCTAAGAGCTGAGTAACTAACTTGTAAGTC
CTTCCTGACAAGGCTTTGGTGTGGTTAACCAACTGCTCATGCACGTTGGGCTGAGTAGGC
TCCATTATAACGGTTCCTGACTCGGAATCAATCTTGGCATCAAGTTTTGAGGTACGGATA
AGGTTCACAATCCATCTCTCTGCCTCCTCATAGTTCAGGTTCAGTTTCTCAGCAAGCACC
CCCATGTCGATTCTCTGATGAATTCTGCAATAGGTTTCGAAGATAAACAGGCGGGCATTC
TCAAGAAACTCATCTTTCAGCGGCACAGTTGAAAAGTTCCCATCATCAACTCGCTTTCCA
AGGAATGGATCATTCACAATGACCTCTTCACACTCTTTCATCTTCTTTTGAGCTCCGTCA
AAGTCATAATTGACAAACACACATGCCAGGAACTCCACAATGGGATCTTTGTAGGAGTAG
TGTTCTTGTTGAATGACCTTGATGAATTCTTTCAGCTGAGGCCTTCTCCTTTTGTTGACA
ATGAAAGCTGTTGCCAAGTAACGCAGCAAGTGTGGAGCACTAGTTTGTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CN26JQ U 1
AF RR2D169JQ U 38
AF RR2D169TF C 109
BS 1 232 RR2CN26JQ
BS 233 233 RR2D169JQ
BS 234 601 RR2CN26JQ
BS 602 602 RR2D169JQ
BS 603 681 RR2CN26JQ
BS 682 772 RR2D169JQ

RD RR2CN26JQ 681 0 0
GGGCTTAAACAAGTTTGGTTATCGAAATCTCTCAACAAGTATGAATCCAAAATTAAATAT
AACTTTTGCATAGTGTGTAGACATGTTTCCGAAGAAAAAGAAATTTTTAAAGCAGAACAC
AACTGATTCCAGTGACAAACAAAGCAAAGATTATCAAGACAAACGGGCAAAATAAGGTGT
GATTACCGAGCTGCTTGCCCCTGTGAATGTTCTAAGAGCTGAGTAACTAACTCGTAAGTC
CTTCCTGACAAGGCTTTGGTGTGGTTAACCAACTGCTCATGCACGTTGGGCTGAGTAGGC
TCCATTATAACGGTTCCTGACTCGGAATCAATCTTGGCATCAAGTTTTGAGGTACGGATA
AGGTTCACAATCCATCTCTCTGCCTCCTCATAGTTCAGGTTCAGTTTCTCAGCAAGCACC
CCCATGTCGATTCTCTGATGAATTCTGCAATAGGTTTCGAAGATAAACAGGCGGGCATTC
TCAAGAAACTCATCTTTCAGCGGCACAGTTGAAAAGTTCCCATCATCAACTCGCTTTCCA
AGGAATGGATCATTCACAATGACCTCTTCACACTCTTTCATCTTCTTTTGAGCTCCGTCA
AGGTCATAATTGACAAACACACATGCCAGGAACTCCACAATGGGATCTTTGTAGGAGTAG
TGTTCTTGTTGAATGACCTTG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2D169JQ 735 0 0
AGTATGAATCCAAAATTAAATATAACTTTTGCATAGTGTGTAGACATGTTTCCGAAGAAA
AAGAAATTTTTAAAGCAGAACACAACTGATTCCAGTGACAAACAAAGCAAAGATTATCAA
GACAAACGGGCAAAATAAGGTGTGATTACCGAGCTGCTTGCCCCTGTGAATGTTCTAAGA
GCTGAGTAACTAACTTGTAAGTCCTTCCTGACAAGGCTTTGGTGTGGTTAACCAACTGCT
CATGCACGTTGGGCTGAGTAGGCTCCATTATAACGGTTCCTGACTCGGAATCAATCTTGG
CATCAAGTTTTGAGGTACGGATAAGGTTCACAATCCATCTCTCTGCCTCCTCATAGTTCA
GGTTCAGTTTCTCAGCAAGCACCCCCATGTCGATTCTCTGATGAATTCTGCAATAGGTTT
CGAAAATAAACAGGCGGGCATTCTCAAGAAACTCATCTTTCAGCGGCACAGTTGAAAAGT
TCCCATCATCAACTCGCTTTCCAAGGAATGGATCATTCACAATGACCTCTTCACACTCTT
TCATCTTCTTTTGAGCTCCGTCAAAGTCATAATTGACAAACACACATGCCAGGAACTCCA
CAATGGGATCTTTGTAGGAGTAGTGTTCTTGTTGAATGACCTTGATGAATTCTTTCAGCT
GAGGCCTTCTCCTTTTGTTGACAATGAAAGCTGTTGCCAAGTAACGCAGCAAGTGTGGAG
CACTAGTTTGTATGC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2D169TF 664 0 0
AAAGCAGAACACAACTGATTCCAGTGACAAACAAAGCAAAGATTATCAAGACAAACGGGC
AAAATAAGGTGTGATTACCGAGCTGCTTGCCCCTGTGAATGTTCTAAGAGCTGAGTAACT
AACTTGTAAGTCCTTCCTGACAAGGCTTTGGTGTGGTTAACCAACTGCTCATGCACGTTG
GGCTGAGTAGGCTCCATTATAACGGTTCCTGACTCGGAATCAATCTTGGCATCAAGTTTT
GAGGTACGGATAAGGTTCACAATCCATCTCTCTGCCTCCTCATAGTTCAGGTTCAGTTTC
TCAGCAAGCACCCCCATGTCGATTCTCTGATGAATTCTGCAATAGGTTTCGAAGATAAAC
AGGCGGGCATTCTCAAGAAACTCATCTTTCAGCGGCACAGTTGAAAAGTTCCCATCATCA
ACTCGCTTTCCAAGGAATGGATCATTCACAATGACCTCTTCACACTCTTTCATCTTCTTT
TGAGCTCCGTCAAAGTCATAATTGACAAACACACATGCCAGGAACTCCACAATGGGATCT
TTGTAGGAGTAGTGTTCTTGTTGAATGACCTTGATGAATTCTTTCAGCTGAGGCCTTCTC
CTTTTGTTGACAATGAAAGCTGTTGCCAAGTAACGCAGCAAGTGTGGAGCACTAGTTTGT
ATGC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 4

CO CL2816Contig1 870 4 9 U
GGACAACTCAACTCACTCAAAATCCTAAAAAAAAATCAAAAATGAAGAAGCCCTCGGTGA
CCCCTTTTCTCATAACTCTCCTCTTGTCTGCAGCTGTTTGCGCCAACGGCACTGTAGATT
CCAACGGAGATCCAGTTAAGGTCGGAGAAAAATACTTCATGCAGCCGGTTAAGACAGAGA
GTAGCATTGGAGGTGGTCTTGTTCCAGCCTCCCCC*GTCTTATTTCCTTCTTGTCCACTC
ACCATCGCTAAGACACGTCTTCCGAACGAACCGGGCCTGCCCGTTAGCTTCCGATATACA
GAAACTAGTATCGACAGAGACTTCATTACCACAAACACCTCTATAAGCATCGAGTTCAGG
AACTACGTCTGGCCAGTCTGCGACGAGTTCTCCAAGTTATGGGCAGTGGATGACTCCTCA
TCACACCCCATTATCATCGGTGGCAAACAAATGAGCCCAGATAGCGCGTTTCAGATACAA
AATGTTACAGTAGAAGAACACACTTATAAGTTGACCACCTCATACGGAACCGTTGGAAGT
ACCCCGCGGGATTGGTTAGGTCCACAGCAGCTACTTGTCACCGATGATGAGTCTAAGACC
TTAGTCGTCAAGTTCGTGAAGGTTGATGATGATGCTACTAAGGCTACTACTTCTTCTCGT
GTTGAAAAGTTAGGTCTAAGGATGTTCCCGTTCACTAATCAAGATCAATATCATGAAATG
TAAAAATCCTTTGTATGTGAACTCGTCTTTACTTTCATAAAAAAAA*TCAAATGAATTTG
TGTGT*TTTCAGCGTTTCATGTAATAAAGGCTCTGTTTTTATGTTTATGGGGCATCAAGA
GTTACTAATAAGGTTACTTTTACCTCAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL54TF U 1
AF RR2CL54JQ C 148
AF RR2B515JQ C 157
AF RR2B515TF U 157
BS 1 239 RR2CL54TF
BS 240 240 RR2B515TF
BS 241 425 RR2CL54TF
BS 426 426 RR2B515TF
BS 427 492 RR2CL54TF
BS 493 493 RR2B515TF
BS 494 637 RR2CL54TF
BS 638 851 RR2B515TF
BS 852 870 RR2CL54JQ

RD RR2CL54TF 637 0 0
GGACAACTCAACTCACTCAAAATCCTAAAAAAAAATCAAAAATGAAGAAGCCCTCGGTGA
CCCCTTTTCTCATAACTCTCCTCTTGTCTGCAGCTGTTTGCGCCAACGGCACTGTAGATT
CCAACGGAGATCCAGTTAAGGTCGGAGAAAAATACTTCATGCAGCCGGTTAAGACAGAGA
GTAGCATTGGAGGTGGTCTTGTTCCAGCCTCCCCC*GTCTTATTTCCTTCTTGTCCACTT
ACCATCGCTAAGACACGTCTTCCGAACGAACCGGGCCTGCCCGTTAGCTTCCGATATACA
GAAACTAGTATCGACAGAGACTTCATTACCACAAACACCTCTATAAGCATCGAGTTCAGG
AACTACGTCTGGCCAGTCTGCGACGAGTTCTCCAAGTTATGGGCAGTGGATGACTCCTCA
TCACATCCCATTATCATCGGTGGCAAACAAATGAGCCCAGATAGCGCGTTTCAGATACAA
AATGTTACAGTATAAGAACACACTTATAAGTTGACCACCTCATACGGAACCGTTGGAAGT
ACCCCGCGGGATTGGTTAGGTCCACAGCAGCTACTTGTCACCGATGATGAGTCTAAGACC
TTAGTCGTCAAGTTCGTGAAGGTTGATGATGATGCTA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2CL54JQ 723 0 0
AAAAATACTTCATGCAGCCGGTTAAGACAGAGAGTAGCATTGGAGGTGGTCTTGTTCCAG
CCTCCCCCCGTCTTATTTCCTTCTTGTCCACTTACCATCGCTAAGACACGTCTTCCGAAC
GAACCGGGCCTGCCCGTTAGCTTCCGATATACAGAAACTAGTATCGACAGAGACTTCATT
ACCACAAACACCTCTATAAGCATCGAGTTCAGGAACTACGTCTGGCCAGTTTGCGACGAG
TTCTCCAAGTTATGGGCAGTGGATGACTCCTCATCACATCCCATTATCATCGGTGGCAAA
CAAATGAGCCCAGATAGCGCGTTTCAGATACAAAATGTTACAGTATAAGAACACACTTAT
AAGTTGACCACCTCATACGGAACCGTTGGAAGTACCCCGCGGGATTGGTTAGGTCCACAG
CAGCTACTTGTCACCGATGATGAGTCTAAGACCTTAGTCGTCAAGTTCGTGAAGGTTGAT
GATGATGCTACTAAGGCTACTACTTCTTCTCGTGTTGAAAAGTTAGGTCTAAGGATGTTC
CCGTTCACTAATCAAGATCAATATCATGAAATGTAAAAATCCTTTGTATGTGAACTCGTC
TTTACTTTCATAAAAAAAAATCAAATGAATTTGTGTGTGTTTCAGCGTTTCATGTAATAA
AGGCTCTGTTTTTATGTTTATGGGGCATCAAGAGTTACTAATAAGGTTACTTTTACCTCA
AGG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2B515JQ 708 0 0
G
CATGCAGCCGGTTAAGACAGAGAGTAGCATTGGAGGTGGTCTTGTTCCAGCCTCCCCC*G
TTTTATTTCCTTCTTGTCCACTCACCATCGCTAAGACACGTCTTCCGAACGAACCGGGCC
TGCCCGTTAGCTTCCGATATACAGAAACTAGTATCGACAGAGACTTCATTACCACAAACA
CCTCTATAAGCATCGAGTTCAGGAACTACGTCTGGCCAGTCTGCGACGAGTTCTCCAAGT
TATGGGCAGTGGATGACTCCTCATCACACCCCATTATCATCGGTGGCAAACAGATGAGCC
CAGATAGCGCGTTTCAGATACAAAATGTTACAGTAGAAGAACACACTTATAAGTTGACCA
CCTCATACGGAACCGTTGGAAGTACCCCGCGGGATTGGTTAGGTCCACAGCAGCTACTTG
TCACCGATGATGAGTCTAAGACCTTAGTCGTCAAGTTCGTGAAGGTTGATGATGATGCTA
CTAAGGCTACTACTTCTTCTCGTGTTGAAAAGTTAGGTCTAAGGATGTTCCCGTTCACTA
ATCAAGATCAATATCATGAAATGTAAAAATCCTTTGTATGTGAACTCGTCTTTACTTTCA
TAAAAAAAA*TCAAATGAATTTGTGTGT*TTTCAGCGTTTCATGTAATAAAGGCTCTGTT
TTTATGTTTATGGGGCATCAAGAGTTACTAATAAGGTTACTTTTACC

QA 2 708 2 708
DS 

RD RR2B515TF 695 0 0
G
CATGCAGCCGGTTAAGACAGAGAGTAGCATTGGAGGTGGTCTTGTTCCAGCCTCCCCC*G
TTTTATTTCCTTCTTGTCCACTCACCATCGCTAAGACACGTCTTCCGAACGAACCGGGCC
TGCCCGTTAGCTTCCGATATACAGAAACTAGTATCGACAGAGACTTCATTACCACAAACA
CCTCTATAAGCATCGAGTTCAGGAACTACGTCTGGCCAGTCTGCGACGAGTTCTCCAAGT
TATGGGCAGTGGATGACTCCTCATCACACCCCATTATCATCGGTGGCAAACAGATGAGCC
CAGATAGCGCGTTTCAGATACAAAATGTTACAGTAGAAGAACACACTTATAAGTTGACCA
CCTCATACGGAACCGTTGGAAGTACCCCGCGGGATTGGTTAGGTCCACAGCAGCTACTTG
TCACCGATGATGAGTCTAAGACCTTAGTCGTCAAGTTCGTGAAGGTTGATGATGATGCTA
CTAAGGCTACTACTTCTTCTCGTGTTGAAAAGTTAGGTCTAAGGATGTTCCCGTTCACTA
ATCAAGATCAATATCATGAAATGTAAAAATCCTTTGTATGTGAACTCGTCTTTACTTTCA
TAAAAAAAA*TCAAATGAATTTGTGTGT*TTTCAGCGTTTCATGTAATAAAGGCTCTGTT
TTTATGTTTATGGGGCATCAAGAGTTACTAATAA

QA 2 695 2 695
DS 



AS 1 2

CO CL2817Contig1 998 2 2 U
GAAATGTGGTGGGTGTCAGGGTACAGGTATGAAGGTGACAATGAGGCAGCTTGGACCTGG
AATGATCCAGCAGATGCAGCATGCTTGTAACGAGTGCAAAGGCACGGGTGAGACTATCAA
CGATCGGGACAGGTGTCCACAATGCAAAGGAGACAAGGTCGTCCCCGAGAAGAAGGTGCT
TGAATTCAATGTGGAGAAAGGAATGCTACACAGTCAGAAGATCACTTTCCAAGGACAAGC
AGATGAAGCGCCTGACACTGTCACTGGAGATATAGTCTTCGTCATTCAGCAGAAAGAGCA
TCCAAAGTTCAAAAGAAAGGGAGAAGACCTCTTTGTTGAGCACACTCTTTCTCTCACCGA
AGCTCTTTGTGGCTTCTCATTCGTCCTTACCCACTTGGATGGCAGAAACCTTCTCATCAA
ATCTAATCCCGGGGAGGTCGTGAAACCTGATTCATACAAGGCCATTAGCGATGAGGGAAT
GCCGATATACCAGAGGCCATTCATGAAGGGTAAGCTCTACATCCACTTCACCGTGGAGTT
CCCGGACTCGCTGAGCCCCGACCAGACCAAAGCGCTTGAATCTGTGCTGCCTAAGCCTTC
GACTACTCAGCTCAGCGACATGGAGATCGATGAGTGCGAGGAAACTACGCTGCACGATGT
CAACATCGAAGATGAGATGAGAAGGAAAGCGCAAGCTCAAAGGGAGGCTTATGATGATGA
AGACGACGATGATGACCATCCTGGAGGCGCGCAAAGGGTGCAATGTGCTCAGCAGTAACA
TTAGAGAGAGAGACTTTGGTCACATGGTTTTTGGTTCCTTTTCTTATTTTCAGTGTATTA
GAGCCTTATGGAGTTTGGTGTGGTTTAATACTTTGGCCACTTCGGTGGAAAACCTACTTG
TTTTTCGTTCTCATAAACTGATTCCGTGTTACAATTTTGTATTTTCCATTTTAAATTTGT
AGTAATCTCAATATCTTGAAGAAGTATTTTGTGTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B429TF U 1
AF RR2B429JQ C 62
BS 1 825 RR2B429TF
BS 826 998 RR2B429JQ

RD RR2B429TF 825 0 0
GAAATGTGGTGGGTGTCAGGGTACAGGTATGAAGGTGACAATGAGGCAGCTTGGACCTGG
AATGATCCAGCAGATGCAGCATGCTTGTAACGAGTGCAAAGGCACGGGTGAGACTATCAA
CGATCGGGACAGGTGTCCACAATGCAAAGGAGACAAGGTCGTCCCCGAGAAGAAGGTGCT
TGAATTCAATGTGGAGAAAGGAATGCTACACAGTCAGAAGATCACTTTCCAAGGACAAGC
AGATGAAGCGCCTGACACTGTCACTGGAGATATAGTCTTCGTCATTCAGCAGAAAGAGCA
TCCAAAGTTCAAAAGAAAGGGAGAAGACCTCTTTGTTGAGCACACTCTTTCTCTCACCGA
AGCTCTTTGTGGCTTCTCATTCGTCCTTACCCACTTGGATGGCAGAAACCTTCTCATCAA
ATCTAATCCCGGGGAGGTCGTGAAACCTGATTCATACAAGGCCATTAGCGATGAGGGAAT
GCCGATATACCAGAGGCCATTCATGAAGGGTAAGCTCTACATCCACTTCACCGTGGAGTT
CCCGGACTCGCTGAGCCCCGACCAGACCAAAGCGCTTGAATCTGTGCTGCCTAAGCCTTC
GACTACTCAGCTCAGCGACATGGAGATCGATGAGTGCGAGGAAACTACGCTGCACGATGT
CAACATCGAAGATGAGATGAGAAGGAAAGCGCAAGCTCAAAGGGAGGCTTATGATGATGA
AGACGACGATGATGACCATCCTGGAGGCGCGCAAAGGGTGCAATGTGCTCAGCAGTAACA
TTAGAGAGAGAGACTTTGGTCACATGGTTTTTGGTTCCTTTTCTT

QA 1 825 1 825
DS 

RD RR2B429JQ 937 0 0
ATGATCCAGCAGATGCAGCATGCTTGTAACGAGTGCAAAGGCACGGGTGAGACTATCAAC
GATCGGGACAGGTGTCCACAATGCAAAGGAGACAAGGTCGTCCCCGAGAAGAAGGTGCTT
GAATTCAATGTGGAGAAAGGAATGCTACACAGTCAGAAGATCACTTTCCAAGGACAAGCA
GATGAAGCGCCTGACACTGTCACTGGAGATATAGTCTTCGTCATTCAGCAGAAAGAGCAT
CCAAAGTTCAAAAGAAAGGGAGAAGACCTCTTTGTTGAGCACACTCTTTCTCTCACCGAA
GCTCTTTGTGGCTTCTCATTCGTCCTTACCCACTTGGATGGCAGAAACCTTCTCATCAAA
TCTAATCCCGGGGAGGTCGTGAAACCTGATTCATACAAGGCCATTAGCGATGAGGGAATG
CCGATATACCAGAGGCCATTCATGAAGGGTAAGCTCTACATCCACTTCACCGTGGAGTTC
CCGGACTCGCTGAGCCCCGACCAGACCAAAGCGCTTGAATCTGTGCTGCCTAAGCCTTCG
ACTACTCAGCTCAGCGACATGGAGATCGATGAGTGCGAGGAAACTACGCTGCACGATGTC
AACATCGAAGATGAGATGAGAAGGAAAGCGCAAGCTCAAAGGGAGGCTTATGATGATGAA
GACGACGATGATGACCATCCTGGAGGCGCGCAAAGGGTGCAATGTGCTCAGCAGTAACAT
TAGAGAGAGAGACTTTGGTCACATGGTTTTTGGTTCCTTTTCTTATTTTCAGTGTATTAG
AGCCTTATGGAGTTTGGTGTGGTTTAATACTTTGGCCACTTCGGTGGAAAACCTACTTGT
TTTTCGTTCTCATAAACTGATTCCGTGTTACAATTTTGTATTTTCCATTTTAAATTTGTA
GTAATCTCAATATCTTGAAGAAGTATTTTGTGTCTTT

QA 1 937 1 937
DS 



AS 1 4

CO CL2818Contig1 1226 4 11 U
GCATAGCACCACTAGCTTCGATATTTAATGGGCTGGGCTACATTTTAGGCCTGATTTGAA
GTTAAGTGGTCTAGACTTCTAAAACGTAATCAATTCCTTTTTAATGCCATATCAATAAAT
ATTTTTCATCATTAGATGTTGAAACTTGAAACCACTCAAACTAGACAGACAATTATTTTC
ATCATCATGATGAACAATTTAAACATTATGCTAACAAAAAGTACCACTTTGTTACAACAT
TTTTAGAGACATTAAATGTAGATACGGTAAAGTAAGTTTAGTTTAATAAATTTGAAATGG
AGTTGACAAAAAAAGAGAGAAAGAAAGAGAGGCTTCAGCTTTAAGACGCGAAGACGCATG
CAAAGAAGGTAATGATGGTGTCTCTGCCTCTCTACGCAGACCTCTCTCTCTCACAGTCCC
ACGCCCTTTGCTTATTTTTATACACTTCTGACCTTTTCCCATTGCCGCTTTGATCTTACC
CTTCATTCCCCCGCTTTATTACACTTTATGCCACTCTCCTACTTTCCTCGTAGCAACTAC
TCATTGGTCGGGGGTAATGGAAGATTTTACTATACAGTTTGCTTACAATCTTCATTCATT
TTCATAATTAGAGTATCTGTATATATTGTTTGACAAAAAAA*GTATCTGTATAACTTTGA
CCCAAAAA*GTATCTGTATAACTAACGTAATTTTCAACTACTTTGGGAAATAGTTTGATT
AAGAAAACCATTATTTAGTATTTGAATTATAAGAAAAAACTCATAATTTAGAATCGTATT
TTAAAAGTCTGAATGACCAATACAATTCTCTTCGTTTTTTCATATTTATTAATTATGGGT
TTGAGTGAGAAATACATGAAAATTAATATGATTTTAGAATTTCCCGTTTAATGATTCAAT
AAAAGATTTATATCCAAAACTAAATAAATATTAGAAAATAAAAGATTTTAGCAATTCTCT
TTATAAATTGCTTTTAAATAAGAAACTTATAAAAATGTAACTTCTTTTTTTTTTTGCATT
TTTGAGTTAAAAGTAAGTTTGTCAATGTTTTTGTATTAGTTTGGGTGGAGTGAACGTTTT
GACAATTAATTCACATGTAGAGGGGGGCACTTTAGACAAACCAAAAGAGAGATTTGCAAG
GTGAGCTATGCAAGGTGCCAATCAGCAAAAGAGAAAAGAGAATGCCAACGAGAAAGTTAA
TTCACAAACGCAACTCGAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D588TF U 57
AF RR2CG87TF U 1
AF RR2D588JQ C 474
AF RR2CG87JQ C 487
BS 1 192 RR2CG87TF
BS 193 193 RR2D588TF
BS 194 200 RR2CG87TF
BS 201 201 RR2D588TF
BS 202 667 RR2CG87TF
BS 668 668 RR2D588JQ
BS 669 701 RR2CG87TF
BS 702 1011 RR2D588JQ
BS 1012 1014 RR2CG87JQ
BS 1015 1217 RR2D588JQ
BS 1218 1226 RR2CG87JQ

RD RR2D588TF 208 0 0
G
GAAGTTAAGTGGTCTAGACTTCTAAAACGTAATCAATTCCTTTTTAATGCCATATCAATA
AATATTTTTCATCATTAGATGTTGAAACTTGAAACCACTCAAACTAGACAGACAATTATT
TTCATCATCATGATGAACAATTTAAACATTATGCTAACAAAAAGTACCACTTTGTTACAA
CATTTTTAGAGACATTAAATGTAGATA

QA 2 208 2 208
DS 

RD RR2CG87TF 701 0 0
GCATAGCACCACTAGCTTCGATATTTAATGGGCTGGGCTACATTTTAGGCCTGATTTGAA
GTTAAGTGGTCTAGACTTCTAAAACGTAATCAATTCCTTTTTAATGCCATATCAATAAAT
ATTTTTCATCATTAGATGTTGAAACTTGAAACCACTCAAACTAGACAGACAATTATTTTC
ATCATCATGATGGACAATTTGAACATTATGCTAACAAAAAGTACCACTTTGTTACAACAT
TTTTAGAGACATTAAATGTAGATACGGTAAAGTAAGTTTAGTTTAATAAATTTGAAATGG
AGTTGACAAAAAAAGAGAGAAAGAAAGAGAGGCTTCAGCTTTAAGACGCGAAGACGCATG
CAAAGAAGGTAATGATGGTGTCTCTGCCTCTCTACGCAGACCTCTCTCTCTCACAGTCCC
ACGCCCTTTGCTTATTTTTATACACTTCTGACCTTTTCCCATTGCCGCTTTGATCTTACC
CTTCATTCCCCCGCTTTATTACACTTTATGCCACTCTCCTACTTTCCTCGTAGCAACTAC
TCATTGGTCGGGGGTAATGGAAGATTTTACTATACAGTTTGCTTACAATCTTCATTCATT
TTCATAATTAGAGTATCTGTATATATTGTTTGACAAAAAAA*GTATCTGTATAACTTTGA
CCCAAAA**GTATCTGTATAACTAACGTAATTTTCAACTAC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2D588JQ 744 0 0
TCTTACCCTTCATTCCCCCGCTTTATTACACTTTATGCCACTCTCCTACTTTCCTCGTAG
CAACTACTCATTGGTCGGGGGTAATGGAAGATTTTACTATACAGTTTGCTTACAATCTTC
ATTCATTTTCATAATTAGAGTATCTGTATATATTGTTTGACAAAAAAA*GTATCTGTATA
ACTTTGACCCAAAAAAGTATCTGTATAACTAACGTAATTTTCAACTACTTTGGGAAATAG
TTTGATTAAGAAAACCATTATTTAGTATTTGAATTATAAGAAAAAACTCATAATTTAGAA
TCGTATTTTAAAAGTCTGAATGACCAATACAATTCTCTTCGTTTTTTCATATTTATTAAT
TATGGGTTTGAGTGAGAAATACATGAAAATTAATATGATTTTAGAATTTCCCGTTTAATG
ATTCAATAAAAGATTTATATCCAAAACTAAATAAATATTAGAAAATAAAAGATTTTAGCA
ATTCTCTTTATAAATTGCTTTTAAATAAGAAACTTATAAAAATGTAACTTCTTTTTTT**
*TGCATTTTTGAGTTAAAAGTAAGTTTGTCAATGTTTTTGTATTAGTTTGGGTGGAGTGA
ACGTTTTGACAATTAATTCACATGTAGAGGGGGGCACTTTAGACAAACCAAAAGAGAGAT
TTGCAAGGTGAGCTATGCAAGGTGCCAATCAGCAAAAGAGAAAAGAGAATGCCAACGAGA
AAGTTAATTCACAAACGCAACTCG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2CG87JQ 740 0 0
TCCCCCGCTTTATTACACTTTATGCCACTCTCCTACTTTCCTCGTAGCAACTACTCATTG
GTCGGGGGTAATGGAAGATTTTACTATACAGTTTGCTTACAATCTTCATTCATTTTCATA
ATTAGAGTATCTGTATATATTGTTTGACAAAAAAAAGTATCTGTATAACTTTGACCCAAA
AA*GTATCTGTATAACTAACGTAATTTTCAACTACTTTGGGAAATAGTTTGATTAAGAAA
ACCATTATTTAGTATTTGAATTATAAGAAAAAACTCATAATTTAGAATCGTATTTTAAAA
GTTTGAATGACCAATACAATTCTCTTCGTTTTTTCATATTTATTAATTATGGTTTTGAGT
GAGAAATACATGAAAATTAATATGATTTTAGAATTTCCCGTTTAATGATTCAATAAAAGA
TTTATATCCAAAACTAAATAAATATTAGAAAATAAAAGATTTTAGCAATTCTCTTTATAA
ATTGCTTTTAAATAAGAAACTTATAAAAATGTAACTTCTTTTTTTTTTTGCATTTTTGAG
TTAAAAGTAAGTTTGTCAATGTTTTTGTATTAGTTTGGGTGGAGTGAACGTTTTGACAAT
TAATTCACATGTAGAGGGGGGCACTTTAGACAAACCAAAAGAGAGATTTGCAAGGTGAGC
TATGCAAGGTGCCAATCAGCAAAAGAGAAAAGAGAATGCCAACGAGAAAGTTAATTCACA
AACGCAACTCGAAAAAAAAA

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 3

CO CL2819Contig1 696 3 9 U
GGATCCTAAAGCTTTTGCAGTGTTTCTCCCTATAGTAAAAAGAACAAAAAACCAAAAAAA
CATAATAATAGTACTGCTTTAGCTTTTGGAATATCCTCTTATTAATCTCAATAAAAACAA
AAATAAAAATGGCACGCCAGTTTATCGTATTTGCTCTATTGGCTTTGACTGTTGCCACCG
CTTTCGCCGCCGATGCTCCCTCAGCTTCCCCGAAGAAGTCTCCGTCTCCGACCACCGCAC
CAGCAACCAAGACTCCTACTGCCCCAACGAAGGCTCCTACCGCCACTCCAAAATCTTCCT
CCGCTGATGCGCCTAAGTCATCTTCAGGCGCCGCTTCTCCCAAAGCATCTTCCCCTGCTG
CAGGAGGTCCCACCGCCGAGGATGACTACTCTGCCTCTAGTCCCGGTGACAGCTCCGATG
CACCTACCGTGTCCTCTCCGCCCGCTCCCACACCCGACAGCACATCCACTGCTGATGGAC
CAAGCGATGGACCCAGCGCAGAGTCGCCAACCAGCGGTGCCGTGTCCACCGTCAAGCTCT
CTGTTGCAGGCATAACAGCCGCCATCAGCTTGTTCTTTTTTTCTTTCTAAGTTAAATTAG
TACATATTTTGCATAGACGGATTGTCGCCTAATCTTTCAACATGAGTCGTGAACTTATTA
TATATATACGTTTATAAGTTGAGATTTGTTTGATCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW12TF U 1
AF RR2B879JQ C 1
AF RR2B879TF U 1
BS 1 128 RR2FW12TF
BS 129 129 RR2B879TF
BS 130 214 RR2FW12TF
BS 215 215 RR2B879TF
BS 216 229 RR2FW12TF
BS 230 230 RR2B879TF
BS 231 266 RR2FW12TF
BS 267 686 RR2B879TF
BS 687 696 RR2B879JQ

RD RR2FW12TF 266 0 0
GGATCCTAAAGCTTTTGCAGTGTTTCTCCCTATAGTAAAAAGAACAAAAAACCAAAAAAA
CATAATAATAGTACTGCTTTAGCTTTTGGAATATCCTCTTATTAATCTCAATAAAAACAA
AAATAAAA*TGGCACGCCAGTTTATCGTATTTGCTCTATTGGCTTTGACTGTTGCCACCG
CTTTCGCCGCCGATGCTCCCTCAGCTTCCCCGAA*AAGTCTCCGTCTCCAACCACCGCAC
CAGCAACCAAGACTCCTACTGCCCCA

QA 1 266 1 266
DS 

RD RR2B879JQ 696 0 0
GGATCCTAAAGCTTTTGCAGTGTTTCTCCCTATAGTAAAAAGAACAAAAAACCAAAAAAA
CATAATAATAGTACTGCTTTAGCTTTTGGAATATCCTCTTATTAATCTCAATAAAAACAA
AAATAAAAATGGCACGCCAGTTTATCGTATTTGCTCTATTGGCTTTGACTGTTGCCACCG
CTTTCGCCGCCGATGCTCCCTCAGCTTCCCCGAAGAAGTCTCCGTCTCCGACCACCGCAC
CAGCAACCAAGACTCCTACTGCCCCAACGAAGGCTCCTACCGCCACTCCAAAATCTTCCT
CCGCTGATGCGCCTAAGTCATCTTCAGGCGCCGCTTCTCCCAAAGCATCTTCCCCTGCTG
CAGGAGGTCCCACCGCCGAGGATGACTACTCTGCCTCTAGTCCCGGTGACAGCTCCGATG
CACCTACCGTGTCCTCTCCGCCCGCTCCCACACCCGACAGCACATCCACTGCTGATGGAC
CAAGCGATGGACCCAGCGCAGAGTCGCCAACCAGCGGTGCCGTGTCCACCGTCAAGCTTT
CTGTTGCAGGCATAACAGCCGCCATCAGCTTGTTCTTTTTTTCTTTTTAAGTTAAATTAG
TACATATTTTGCATAGACGGATTGTCGCCTAATCTTTCAACATGAGTCGTGAACTTATTA
TATATATACGTTTATAAGTTGAGATTTGTTTGATCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2B879TF 694 0 0
GGATCCTAAAGCTTTTGCAGTGTTTCTCCCTATAGTAAAAAGAACAAAAAACCAAAAAAA
CATAATAATAGTACTGCTTTAGCTTTTGGAATATCCTCTTATTAATCTCAATAAAAACAA
AAATAAAAATGGCACGCCAGTTTATCGTATTTGCTCTATTGGCTTTGACTGTTGCCACCG
CTTTCGCCGCCGATGCTCCCTCAGCTTCCCCGAAGAAGTCTCCGTCTCCGACCACCGCAC
CAGCAACCAAGACTCCTACTGCCCCAACGAAGGCTCCTACCGCCACTCCAAAATCTTCCT
CCGCTGATGCGCCTAAGTCATCTTCAGGCGCCGCTTCTCCCAAAGCATCTTCCCCTGCTG
CAGGAGGTCCCACCGCCGAGGATGACTACTCTGCCTCTAGTCCCGGTGACAGCTCCGATG
CACCTACCGTGTCCTCTCCGCCCGCTCCCACACCCGACAGCACATCCACTGCTGATGGAC
CAAGCGATGGACCCAGCGCAGAGTCGCCAACCAGCGGTGCCGTGTCCACCGTCAAGCTCT
CTGTTGCAGGCATAACAGCCGCCATCAGCTTGTTCTTTTTTTCTTTCTAAGTTAAATTAG
TACATATTTTGCATAGACGGATTGTCGCCTAATCTTTCAACATGAGTCGTGAACTTATTA
TATATATACGTTTATAAGTTGAGATT
TGTTTGAT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 4

CO CL2820Contig1 1031 4 15 U
GGAATGGAAACATGGCTACTTCCTCCTCTTCCTCCTTCCTAGTCCCTTGTGCTTCTCCTC
CCTCCTCAGTCCTTCTCCGGCGCTTCTTCCGCCCCTCTTTGCTTTCTTCTAAGAACCTCC
ACCGTCTCCCCCGAGACAGTGGACTCTCAGTCCTGAATAGTTCGAGCAGGACTGAAGTGT
CCGTTGATAAATCAGAAGCGGACAAGCTTGTGGATAAAATTGACTTTGGAGAACTATGCA
ATGAGTTTGAGTGCACAAGTAGCCCCCAGGTCGAATCCACTGCCAGGCAACTTGCTCGCG
ACATTCTTGAAATCAGAGAAGGCAATCGCGCCTTTGCTTGCTACGCTGTCTCTGTTAAAT
ATAAGGACTCGGTCAGAAGTTTTACAGGTCGTGAGAAGTATAAAAGACCAATGTGGATCA
CTACTGGGTTAGAGACTCCCACTGTGACGATACAGGAGATGGTGATGTTATCGACCAGCG
TCTTGCGTATTAGATGGACAGTCAAAGGAAAACCCAAATCTATTCTTGCTGCTCTAAGTG
GAGATCTGGTCATCAAAGTTAAATCTGAATTCACTCTTAACCAGATCAGTGGCCAAGTGA
TTGAGCATGAAGAGTCTTGGGACTCGTCCTCGTCTTCCCCTATCGCTCAAGCCTATTTCT
GGACATCCCGCCGCCTCTTCGCTGCTTCTGAATCAGCTAAAGACTTGGCCGATGCCACCA
AAGACATAACCGCCAATTTCACAGCTCGGAAAGAGGATACAGAGATATATCGTGATCCAA
CCGATCCAACTAAGTATTTCCAAAGAGACGACAGCTTCGAAAGAGATTCCTATCAGGTTG
CATTGTTTCTGGCAATTGTTTACTTTGTTGTTCAGTTCTTGAGGAACACTCTCTAATTCT
CCCCCCCTCTCTCTCTCCTCTCTCCCCTTTCTCTAATAGCATATAGTGTAAGTGTCTATA
CATTGTTGTATATGATCTGTACAAAGAAAAAAACAGAACAAGAAAATAGAGATTTGTTTG
TGTTTCTGTTG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK67JQ C 230
AF RR2ET20TF U 1
AF RR2AK67TF U 2
AF RR2ET20JQ C 249
BS 1 94 RR2ET20TF
BS 95 95 RR2AK67TF
BS 96 114 RR2ET20TF
BS 115 115 RR2AK67TF
BS 116 271 RR2ET20TF
BS 272 272 RR2AK67TF
BS 273 779 RR2ET20TF
BS 780 821 RR2AK67TF
BS 822 822 RR2ET20JQ
BS 823 828 RR2AK67TF
BS 829 829 RR2ET20JQ
BS 830 836 RR2AK67TF
BS 837 837 RR2ET20JQ
BS 838 857 RR2AK67TF
BS 858 1031 RR2ET20JQ

RD RR2AK67JQ 280 0 0
AGAACTATGCAATGAGTTTGAGTGCACAAGTAGCCCCCAGGTCGAATCCACTGCCAGGCA
ACTTGCTCGCTACATTCTTGAAATCAGAGAAGGCAATCGCGCCTTTGCTTGCTACGCTGT
CTCTGTTAAATATAAGGACTCGGTCAGAAGTTTTACAGGTCGTGAGAAGTATAAAAGACC
AATGTGGATCACTACTGGGTTAGAGACTCCCACTGTGACGATACAGGAGATGGTGATGTT
ATCGACCAGCGTCTTGCGTATTAGATGGACAGTCAAA
AGG

QA 1 277 1 277
DS 

RD RR2ET20TF 783 0 0
GGAATGGAAACATGGCTACTTCCTCCTCTTCCTCCTTCCTAGTCCCTTGTGCTTCTCCTC
CCTCCTCAGTCCTTCTCCGGCGCTTCTTCCGCCCTTCTTTGCTTTCTTCTAAGATCCTCC
ACCGTCTCCCCCGAGACAGTGGACTCTCAGTCCTGAATAGTTCGAGCAGGACTGAAGTGT
CCGTTGATAAATCAGAAGCGGACAAGCTTGTGGATAAAATTGACTTTGGAGAACTATGCA
ATGAGTTTGAGTGCACAAGTAGCCCCCAGGTGGAATCCACTGCCAGGCAACTTGCTCGCG
ACATTCTTGAAATCAGAGAAGGCAATCGCGCCTTTGCTTGCTACGCTGTCTCTGTTAAAT
ATAAGGACTCGGTCAGAAGTTTTACAGGTCGTGAGAAGTATAAAAGACCAATGTGGATCA
CTACTGGGTTAGAGACTCCCACTGTGACGATACAGGAGATGGTGATGTTATCGACCAGCG
TCTTGCGTATTAGATGGACAGTCAAAGGAAAACCCAAATCTATTCTTGCTGCTCTAAGTG
GAGATCTGGTCATCAAAGTTAAATCTGAATTCACTCTTAACCAGATCAGTGGCCAAGTGA
TTGAGCATGAAGAGTCTTGGGACTCGTCCTCGTCTTCCCCTATCGCTCAAGCCTATTTCT
GGACATCCCGCCGCCTCTTCGCTGCTTCTGAATCAGCTAAAGACTTGGCCGATGCCACCA
AAGACATAACCGCCAATTTCACAGCTCGGAAAGAGGATACAGAGATATATCGTGATCCA
CCGA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2AK67TF 856 0 0
GG
ATGGAAACATGGCTACTTCCTCCTCTTCCTCCTTCCTAGTCCCTTGTGCTTCTCCTCCCT
CCTCAGTCCTTCTCCGGC**TTCTTCCGCCCCTCTTTGCTTTCTTCTAAGAACCTCCACC
GTCTCCCCCGAGACAGTGGACTCTCAGTCCTGAATAGTTCGAGCAGGACTGAAGTGTCCG
TTGATAAATCAGAAGCGGACAAGCTTGTGGATAAAATTGACTTTGGAGAACTATGCAATG
AGTTTGAGTGCACAAGTAGCCCCCAGGTCGAATCCACTGCCAGGCAACTTGCTCGCTACA
TTCTTGAAATCAGAGAAGGCAATCGCGCCTTTGCTTGCTACGCTGTCTCTGTTAAATATA
AGGACTCGGTCAGAAGTTTTACAGGTCGTGAGAAGTATAAAAGACCAATGTGGATCACTA
CTGGGTTAGAGACTCCCACTGTGACGATACAGGAGATGGTGATGTTATCGACCAGCGTCT
TGCGTATTAGATGGACAGTCAAAGGAAAACCCAAATCTATTCTTGCTGCTCTAAGTGGAG
ATCTGGTCATCAAAGTTAAATCTGAATTCACTCTTAACCAGATCAGTGGCCAAGTGATTG
AGCATGAAGAGTCTTGGGACTCGTCCTCGTCTTCCCCTATCGCTCAAGCCTATTTCTGGA
CATCCCGCCGCCTCTTCGCTGCTTCTGAATCAGCTAAAGACTTGGCCGATGCCACCAAAG
ACATAACCGCCAATTTCACAGCTCGGAAAGAGGATACAGAGATATATCGTGATCCAACCG
ATCCAACTAAGTATTTCCAAAGAGACGACAGCTTCGAA*GAGATTTCTATCAG*TTGCAT
TGTTTCTGGCAATT

QA 3 856 3 856
DS 

RD RR2ET20JQ 783 0 0
GAGTGCACAAGTAGCCCCCAGGTGGAATCCACTGCCAGGCAACTTGCTCGCGACATTCTT
GAAATCAGAGAAGGCAATCGCGCCTTTGCTTGCTACGCTGTCTCTGTTAAATATAAGGAC
TCGGTCAGAAGTTTTACAGGTCGTGAGAAGTATAAAAGACCAATGTGGATCACTACTGGG
TTAGAGACTCCCACTGTGACGATACAGGAGATGGTGATGTTATCGACCAGCGTCTTGCGT
ATTAGATGGACAGTCAAAGGAAAACCCAAATCTATTCTTGCTGCTCTAAGTGGAGATCTG
GTCATCAAAGTTAAATCTGAATTCACTCTTAACCAGATCAGTGGCCAAGTGATTGAGCAT
GAAGAGTCTTGGGACTCGTCCTCGTCTTCCCCTATCGCTCAAGCCTATTTCTGGACATCC
CGCCGCCTTTTCGCTGCTTTTGAATCAGCTAAAGACTTGGCCGATGCCACCAAAGACATA
ACCGCCAATTTCACAGCTCGGAAAGAGGATACAGAGATATATCGTGATCCAACCGATCCA
ACTAAGTATTTCCAAAGAGACGACAGCTTCGAAAGAGATTCCTATCAGGTTGCATTGTTT
CTGGCAATTGTTTACTTTGTTGTTCAGTTCTTGAGGAACACTCTCTAATTCTCCCCCCCT
CTCTCTCTCCTCTCTCCCCTTTCTCTAATAGCATATAGTGTAAGTGTCTATACATTGTTG
TATATGATCTGTACAAAGAAAAAAACAGAACAAGAAAATAGAGATTTGTTTGTGTTTCTG
TTG

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 4

CO CL2821Contig1 790 4 5 U
GGGCATTAGAAGGGTTCTTTGGTAATTCAGCTTTGGTATAAAATATCAAGACAGATGTGT
CCTGTTTGTCTTCCCAGTGTTCATCATCAGATCTCTTGGTTTTACATATCTAAATGGCGT
CCTGTGTTGCTCATCTTACTCTCTCAGGTTGGTCTCAATCTCATCATGTGAAAGCAAATA
GACTGTCTACTACAAAGCTCAATTCCATTTGTAACACTTCTGAGTTGACTCTTCTGAAGA
AATCAAACCGGAGTCGCAAGTTTACAGTTTCTGCACGGTATGGAGACGAAGGGAGTAGGA
GCGGAAGTGGTGGTGGTGGTGGTGATTTCATAGCTGGTTTTATTTTAGGAGGTGCTGTGT
TTGGCGCTGTCGCTTATATCTTTGCTCCACAGATCAGAAGATCGATAATGAGTGAAGAAG
ATGAGTATGGTTTCAAGAAGCCACAAGAACCAACGTACTACGATGAAGGTTTGGAGAAAA
CAAGAGAGACATTGAATAAGAAAATCGAACAGCTTAACTCAGCAATTGACAATGTTTCTT
CACGGTTAAGAGGTCGAGAAAAGAACACTTCTTCTTCTCCCAATGTACCGGTGGAAACTG
ACCCGGAAGTTGAAGCTACGACTTAAAAAAAGAAACAGACTCTCTGTTTTTTCATTTTGT
AACCAGAGTTCAAACACAGTTATGATTTGGTGTTAGTGCTTCACTTCTTTTTTTCTGGTT
GCTTCTGTGCTCAGAGGCCTCTGTAGTAACACACTCTTGCAAAGCGAATTATACACTTCT
TTGTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2B633TF U 1
AF RR2G405TF U 77
AF RR2AJ15TF U 66
AF RR2B633JQ C 145
BS 1 625 RR2B633TF
BS 626 626 RR2AJ15TF
BS 627 731 RR2B633TF
BS 732 786 RR2AJ15TF
BS 787 790 RR2B633JQ

RD RR2B633TF 731 0 0
GGGCATTAGAAGGGTTCTTTGGTAATTCAGCTTTGGTATAAAATATCAAGACAGATGTGT
CCTGTTTGTCTTCCCAGTGTTCATCATCAGATCTCTTGGTTTTACATATCTAAATGGCGT
CCTGTGTTGCTCATCTTACTCTCTCAGGTTGGTCTCAATCTCATCATGTGAAAGCAAATA
GACTGTCTACTACAAAGCTCAATTCCATTTGTAACACTTCTGAGTTGACTCTTCTGAAGA
AATCAAACCGGAGTCGCAAGTTTACAGTTTCTGCACGGTATGGAGACGAAGGGAGTAGGA
GCGGAAGTGGTGGTGGTGGTGGTGATTTCATAGCTGGTTTTATTTTAGGAGGTGCTGTGT
TTGGCGCTGTCGCTTATATCTTTGCTCCACAGATCAGAAGATCGATAATGAGTGAAGAAG
ATGAGTATGGTTTCAAGAAGCCACAAGAACCAACGTACTACGATGAAGGTTTGGAGAAAA
CAAGAGAGACATTGAATAAGAAAATCGAACAGCTTAACTCAGCAATTGACAATGTTTCTT
CACGGTTAAGAGGTCGAGAAAAGAACACTTCTTCTTCTCCCAATGTACCGGTGGAAACTG
ACCCGGAAGTTGAAGCTACGACTTAGAAAAAGAAACAGACTCTCTGTTTTTTCATTTTGT
AACCAGAGTTCAAACACAGTTATGATTTGGTGTTAGTGCTTCACTTCTTTTTTTCTGGTT
GCTTCTGTGCT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2G405TF 699 0 0
GG
GTTCATCATCAGATCTCTTGGTTTTACATATCTAAATGGCGTCCTGTGTTGCTCATCTTT
CTCTCTCAGGTTGGTCTCAATCTCATCATGTGAAAGCAAATAGACTGTCTACTACAAAGC
TCAATTCCATTTGTAACACTTCTGAGTTGACTCTTCTGAAGAAATCAAACCGGAGTCGCA
AGTTTACAGTTTCTGCACGGTATGGAGACGAAGGGAGTAGGAGAGGAAGTGGTGGTGGTG
GTGGTGATTTCATAGCTGGTTTTATTTTAGGAGGTGCTGTGTTTGGCGCTGTCGCTTATA
TCTTTGCTCCACAGATCAGAAGATCGATAATGAGTGAAGAAGATGAGTATGGTTTCAAGA
AGCCACAAGAACCAACGTACTACGATGAAGGTTTGGAGAAAACAAGAGAGACATTGAATA
AGAAAATCGAACAGCTTAACTCAGCAATTGACAATGTTTCTTCACGGTTAAGAGGTCGAG
AAAAGAACACTTCTTCTTCTCCCAATGTACCGGTGGAAACTGACCCGGAAGTTGAAGCTA
CGACTTAAAAAAAGAAACAGACTCTCTGTTTTT*CATTTTGTAACCAGAGTTCAAACACA
GTTATGATTTGGTGT*AGTGCTTCACTTCTTTTTT*CTGGTTGCTTCTGTGCTCAGAGGC
CTCTCTAGTA*CACACTCTTGCAA
GCGATTATACACT

QA 3 686 3 686
DS 

RD RR2AJ15TF 721 0 0
GG
GTCTTCCCAGTGTTCATCATCAGATCTCTTGGTTTTACATATCTAAATGGCGTCCTGTGT
TGCTCATCTTACTCTCTCAGGTTGGTCTCAATCTCATCATGTGAAAGCAAATAGACTGTC
TACTACAAAGCTCAATTCCATTTGTAACACTTCTGAGTTGACTCTTCTGAAGAAATCAAA
CCGGAGTCGCAAGTTTACAGTTTCTGCACGGTATGGAGACGAAGGGAGTAGGAGAGGAAG
TGGTGGTGGTGGTGGTGATTTCATAGCTGGTTTTATTTTAGGAGGTGCTGTGTTTGGCGC
TGTCGCTTATATCTTTGCTCCACAGATCAGAAGATCGATAATGAGTGAAGAAGATGAGTA
TGGTTTCAAGAAGCCACAAGAACCAACGTACTACGATGAAGGTTTGGAGAAAACAAGAGA
GACATTGAATAAGAAAATCGAACAGCTTAACTCAGCAATTGACAATGTTTCTTCACGGTT
AAGAGGTCGAGAAAAGAACACTTCTTCTTCTCCCAATGTACCGGTGGAAACTGACCCGGA
AGTTGAAGCTACGACTTAAAAAAAGAAACAGACTCTCTGTTTTTTCATTTTGTAACCAGA
GTTCAAACACAGTTATGATTTGGTGTTAGTGCTTCACTTCTTTTTTTCTGGTTGCTTCTG
TGCTCAGAGGCCTCTGTAGTAACACACTCTTGCAAAGCGAATTATACACTTCTTTGTGT

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR2B633JQ 646 0 0
CAGGTTGGTCTCAATCTCATCATGTGAAAGCAAATAGACTGTCTACTACAAAGCTCAATT
CCATTTGTAACACTTCTGAGTTGACTCTTCTGAAGAAATCAAACCGGAGTCGCAAGTTTA
CAGTTTCTGCACGGTATGGAGACGAAGGGAGTAGGAGCGGAAGTGGTGGTGGTGGTGGTG
ATTTCATAGCTGGTTTTATTTTAGGAGGTGCTGTGTTTGGCGCTGTCGCTTATATCTTTG
CTCCACAGATCAGAAGATCGATAATGAGTGAAGAAGATGAGTATGGTTTCAAGAAGCCAC
AAGAACCAACGTACTACGATGAAGGTTTGGAGAAAACAAGAGAGACATTGAATAAGAAAA
TCGAACAGCTTAACTCAGCAATTGACAATGTTTCTTCACGGTTAAGAGGTCGAGAAAAGA
ACACTTCTTCTTCTCCCAATGTACCGGTGGAAACTGACCCGGAAGTTGAAGCTACGACTT
AAAAAAAGAAACAGACTCTCTGTTTTTTCATTTTGTAACCAGAGTTCAAACACAGTTATG
ATTTGGTGTTAGTGCTTCACTTCTTTTTTTCTGGTTGCTTCTGTGCTCAGAGGCCTCTGT
AGTAACACACTCTTGCAAAGCGAATTATACACTTCTTTGTGTTTCC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 0 0

AS 2 4

CO CL2823Contig1 657 2 4 U
GGAAAGAAAAATCAATGGCTGCTACCTTATCCACCTCCGTTGTAGCTTCGGCTTCGTCGC
GTTTGTGGCACCCTTCTTCCAACGCCGGGAAGATTAGCGTCCCTTCGGCTTCGCTTTCTC
TCCGCTCCGGTTCGAGACGGAGTCAGTTTTCTCTCGGCTGCTCTTCCGCCTCAGCTTCTT
CTCAGCTGCTCCATTGCTCCTTCCTCTCTTCATCTCTCTCCCTATCCTCTACATTTTCTG
GTTTGTCGATAGCATTTGATGTCAGCAGTGGAACGAGTGGGTTGAACGGGCAGAAACGAA
GAGGGCTTGTTGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACAAAGAGAAGCAGGTCAA
GAAAATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTCTGAGGATGAGAACCACTAGTGGTCGAG
CCACCATCAAGCGCAGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTA
GCAGCGGCAAACGCGCTTGAAGACTCTTTCCTTTCCCTCCTCCTTCTCTCTCTCTCTCTC
TGTATTCTTGTTTTTTTTCCGCCAGATGGTACAATGACACGAACAGATGAGCTATTTTCT
GTATTTTATTTAACTCCTTATGTATTCTTGATTCTTTATAGAATCAATGTTCTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2AA92TF U 1
AF RR2BB07TF U 11
BS 1 468 RR2AA92TF
BS 469 469 RR2BB07TF
BS 470 655 RR2AA92TF
BS 656 657 RR2BB07TF

RD RR2AA92TF 655 0 0
GGAAAGAAAAATCAATGGCTGCTACCTTATCCACCTCCGTTGTAGCTTCGGCTTCGTCGC
GTTTGTGGCACCCTTCTTCCAACGCCGGGAAGATTAGCGTCCCTTCGGCTTCGCTTTCTC
TCCGCTCCGGTTCGAGACGGAGTCAGTTTTCTCTCGGCTGCTCTTCCGCCTCAGCTTCTT
CTCAGCTGCTCCATTGCTCCTTCCTCTCTTCATCTCTCTCCCTATCCTCTACATTTTCTG
GTTTGTCGATAGCATTTGATGTCAGCAGTGGAACGAGTGGGTTGAACGGGCAGAAACGAA
GAGGGCTTGTTGTGAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACAAAGAGAAGCAGGTCAA
GAAAATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTCTGAGGATGAGAACCACTAGTGGTCGAG
CCACCATCAAGCGCAGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAGGTCCAACCCTA
GCAGCGGCAAACGCGCTTGAAGACTCTTTCCTTTCCCTCCTCCTTCTCTCTCTCTCTCTC
TGTATTCTTGTTTTTTTTCCGCCAGATGGTACAATGACACGAACAGATGAGCTATTTTCT
GTATTTTATTTAACTCCTTATGTATTCTTGATTCTTTATAGAATCAATGTTCTTG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2BB07TF 647 0 0
GGA
AATGGCTGCTACCTTATCCACCTCCGTTGTAGCTTCGGCTTCGTCGCGTTTGTGGCACCC
TTCTTCCAACGCCGGGAAGATTAGCGTCCCTTCGGCTTCGCTTTCTCTCCGCTCTGGTTC
GAGACGGAGTCAGTTTTCTCTCGGCTGCTCTTCCGCCTCAGCTTCTTCTCAGCTGCTCCA
TTGCTCCTTCCTCTCTTCATCTCTCTCCCTATCCTCTACATTTTCTGGTTTGTCGATAGC
ATTTGATGTCAGCAGTGGAACGAGTGGGTTGAACGGGCAGAAACGAAGAGGGCTTGTTGT
GAGAGCTGGAAAAGCTGCTCTGTGTCAAACAAAGAGAAGCAGGTCAAGAAAATCTCTGGC
TAGGACTCATGGTTTCCGTCTGAGGATGAGAACCACTAGTGGTCGAGCCACCATCAAGCG
CAGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGTCCTAAGTCCAACCCTAGCAGCGGCAAACG
CGCTTGAAGACTCTTTCCTTTCCCTCCTCCTTCTCTCTCTCTCT****GTATTCTTGTTT
TTTT*CCGCCAGATGGTACAATGACACGAACAGATGAGCTATTTTCTGTATTTTATTTAA
CTCCTTATGTATTCTTGATTCTTTATAGAATCAATGTTCTTGAG

QA 4 647 4 647
DS 



CO CL2823Contig2 692 2 3 U
TTTTTTCTTTTTTAAACGAATCAAGAATACATAAGGAGTTAAATAAAATACAGAAAATAG
CTCATCTGTTCGTGTCATTGTATCATCTGGCGGAAAAAAGCCAAGAATACAGAGAGAGAG
AGAGAACGAGGAGGGAAAGGAAACAGTCTTCAAGCCCGTTTGCCGCTGCTAGGGTTGGAC
TTAGGACAGAGATTCCAACGTCCCTTGGCACGTCTGCGCTTGATGGTGGCTCGACCACTA
GTGGTTCTCATCCTCAGACGGAAACCATGAGTCCTAGCCAGAGATTTTCTTGACCTGCTT
CTCTTTGTTTGACACAGAGCAGCTTTTCCAGCTCTCACAACAAGCCCTCTACGTTTCTTC
TGCCCGTTCAAGCCACTGGTTCCACTGCTGACATCAAATGCTATGGACAAACCAGAAAAT
GTAGAGGATAGGGAGAGAGATGAAGAGAGGAAGGAGCAATGGAGCAGCTGAGAAGAAGCT
GAGGCGGAAAAGCCGCCGAGAGAAAACTGACTCCGTCTCGAACCAGAGCGGAGAGAAAGC
GAAGCCGAAGGGACGCTAATCTTCCCGGCGTTGGAAGCAGGGTGCCACAAACGCGACGAA
GCCGAAGCTACAACGGAGGTGGATAAGGAAGCAGCCATTTATTTTTTTTATCTTCTTCCT
TTCCGATTTTTTTTTTAATACAGGGGTGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E008TF C 1
AF RR2E008JQ U 14
BS 1 17 RR2E008TF
BS 18 673 RR2E008JQ
BS 674 692 RR2E008TF

RD RR2E008TF 692 0 0
TTTTTTCTTTTTTAAACGAATCAAGAATACATAAGGAGTTAAATAAAATACAGAAAATAG
CTCATCTGTTCGTGTCATTGTATCATCTGGCGGAAAAAAGCCAAGAATACAGAGAGAGAG
AGAGAACGAGGAGGGAAAGGAAACAGTCTTCAAGCCCGTTTGCCGCTGCTAGGGTTGGAC
TTAGGACAGAGATTCCAACGTCCCTTGGCACGTCTGCGCTTGATGGTGGCTCGACCACTA
GTGGTTCTCATCCTCAGACGGAAACCATGAGTCCTAGCCAGAGATTTTCTTGACCTGCTT
CTCTTTGTTTGACACAGAGCAGCTTTTCCAGCTCTCACAACAAGCCCTCTACGTTTCTTC
TGCCCGTTCAAGCCACTGGTTCCACTGCTGACATCAAATGCTATGGACAAACCAGAAAAT
GTAGAGGATAGGGAGAGAGATGAAGAGAGGAAGGAGCAATGGAGCAGCTGAGAAGAAGCT
GAGGCGGAAAAGCCGCCGAGAGAAAACTGACTCCGTCTCGAACCAGAGCGGAGAGAAAGC
GAAGCCGAAGGGACGCTAATCTTCCCGGCGTTGGAAGCAGGGTGCCACAAACGCGACGAA
GCCGAAGCTACAACGGAGGTGGATAAGGAAGCAGCCATTTATTTTTTTTATCTTCTTCCT
TTCCGATTTTTTTTTTAATACAGGGGTGGTCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2E008JQ 660 0 0
AAAC
GAATCAAGAATACATAAGGAGTTAAATAAAATACAGAAAATAGCTCATCTGTTCGTGTCA
TTGTATCATCTGGCGGAAAAAAGCCAAGAATACAGAGAGAGAGAGAGAACGAGGAGGGAA
AGGAAACAGTCTTCAAGCCCGTTTGCCGCTGCTAGGGTTGGACTTAGGACAGAGATTCCA
ACGTCCCTTGGCACGTCTGCGCTTGATGGTGGCTCGACCACTAGTGGTTCTCATCCTCAG
ACGGAAACCATGAGTCCTAGCCAGAGATTTTCTTGACCTGCTTCTCTTTGTTTGACACAG
AGCAGCTTTTCCAGCTCTCACAACAAGCCCTCTACGTTTCTTCTGCCCGTTCAAGCCACT
GGTTCCACTGCTGACATCAAATGCTATGGACAAACCAGAAAATGTAGAGGATAGGGAGAG
AGATGAAGAGAGGAAGGAGCAATGGAGCAGCTGAGAAGAAGCTGAGGCGGAAAAGCCGCC
GAGAGAAAACTGACTCCGTCTCGAACCAGAGCGGAGAGAAAGCGAAGCCGAAGGGACGCT
AATCTTCCCGGCGTTGGAAGCAGGGTGCCACAAACGCGACGAAGCCGAAGCTACAACGGA
GGTGGATAAGGAAGCAGCCATTTATTTTTTTTATCTTCTTCCTTTCCGATTTTTTT

QA 5 660 5 660
DS 



AS 1 3

CO CL2824Contig1 954 3 40 U
TAAGTGCAAATATTCTTTTATATATGTATAGTTTGATCAAAAGAACATATAATATACAAG
ATGAAACATAAAATCCCAACAAACAAAAAGAAAGAAATGTAACCCCTCTTATAAAACATC
AAAGAAACCTATTTTCACCAAGCTACCTCTCTCACTCATTCATGCTGAGGAATCTCTCTA
ACAAGTCTTTTCCGTTTTGTCTGACAAATCAATCAAATCATATTATCTTC**TTTTTCCA
AGTCATTTGATGATTTATTTTATCTAATTCTAAGCAGAGACAAATCCTCCTCCCACACTG
TTCTTGGGCTGCATCCCCAGGCCGGTACCTTTTGGTTGAGGAATTTGATCGACAAAGAAA
CATGCGGCGATGATGACATAGCACAACACTAGGACAAGTCCCTTCATGTAGTGAGATGTT
CCATCCTGTAAAGTGAATGCTGTGATGATAATTGCCAGGGCTAGACAGCTTGTTTCAAGG
ATGTTGAAGTTGAGATCCATTTTGATTCCCTTGATCCACGCAACAATAACACTCAAAGGG
ACCACAAACAAAGAAATCTGAGTTGCAGAGCCCAACGGCACCCCTAGAGATATATCAAGC
TTGTTTTTGAAAGCGAAGATGATGGCTCCAGCATGCTCAGCCGCATTTCCAACAATGGGA
AGCAATATGATACTTATGAAACTCACTGATAGTCCCCATGAATCCGATGCATCCTCGATT
GTGGCCACAACATACTCTGATAGCAATGCGATGACGAGTGTCATTCCAGCGAGCCAAGCA
AATCCGCTCCAAAATCCTATCACCGGAGTTTCCTCAACAGTAACTTCATCATTATACGCA
TCATCCTCATCATCCTCTTGTGCTTCAAACAATTGGCGGTGAGTCCAGAGCTGGAAGATG
AGATAAGCAATGTAAGCAATAAGCATAACGATGCTGCTTGTTCTGGACAGGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G103JQ U 78
AF RR2AE33JQ U 1
AF RR2G103TF C 189
BS 1 130 RR2AE33JQ
BS 131 131 RR2G103JQ
BS 132 144 RR2AE33JQ
BS 145 145 RR2G103JQ
BS 146 264 RR2AE33JQ
BS 265 266 RR2G103JQ
BS 267 308 RR2AE33JQ
BS 309 309 RR2G103JQ
BS 310 410 RR2AE33JQ
BS 411 411 RR2G103JQ
BS 412 458 RR2AE33JQ
BS 459 459 RR2G103JQ
BS 460 485 RR2AE33JQ
BS 486 486 RR2G103JQ
BS 487 510 RR2AE33JQ
BS 511 511 RR2G103JQ
BS 512 524 RR2AE33JQ
BS 525 525 RR2G103JQ
BS 526 575 RR2AE33JQ
BS 576 576 RR2G103JQ
BS 577 577 RR2AE33JQ
BS 578 578 RR2G103JQ
BS 579 611 RR2AE33JQ
BS 612 612 RR2G103JQ
BS 613 656 RR2AE33JQ
BS 657 657 RR2G103JQ
BS 658 701 RR2AE33JQ
BS 702 702 RR2G103JQ
BS 703 710 RR2AE33JQ
BS 711 711 RR2G103JQ
BS 712 812 RR2AE33JQ
BS 813 813 RR2G103TF
BS 814 839 RR2AE33JQ
BS 840 840 RR2G103TF
BS 841 876 RR2AE33JQ
BS 877 877 RR2G103TF
BS 878 899 RR2AE33JQ
BS 900 900 RR2G103TF
BS 901 939 RR2AE33JQ
BS 940 954 RR2G103TF

RD RR2G103JQ 711 0 0
CAAACAA
AAAAAGAAAGAAATGTAACCC*TCTTATAAAACATCAAAGAAACCTATTTTCACCGAGCT
ACCTCTCTCACTCATTCATGCTGAGGAATCTCTCTAACAAGTCTTTTCCGTTTTGTCTGA
CAAATCAATCAAATCATATTATCTTTCTTTTTTCCAAGTCATTTGATGATTTATTTTATC
TAATTCTAAGCAGAGACAAATCCTCCTCCCACACTGTTCTTGGGCTGCATCCCCAGGCCG
GTACCTTTTGGTTGAGGAATTTGATCGACAAAGAAACATGCGGCGATGATGACATAGCAC
AACACTAGGACAAGTCCCTTCATGTAGTGAGATGTTCCATCCTGTAAAGTGAATGCTGTG
ATGATAATTGCCAGGGCTAGACAGCTTGTTTCAAGGATGTTGAAGTTGAGATCCATTTTG
ATTCCCTTGATCCACGCAACAATAACACTCAAAGGGACCACAAACAAAGAAATCTGAGTT
GCAGAGCCCAACGGCACCCCTAGAGATATATCAAGCTTGTTTTTGAAAGCGAAGATGATG
GCTCCAGCATGCTCAGCCGCATTTCCAACAATGGGAAGCAATATGATACTTATGAAACTC
ACTGATAGTCCCCATGAATCCGATGCATCCTCGATTGTGGCCACAACATACTCTGATAGC
AATGCGATGACGAGTGTCATTCCAGCGAGCCAAGCAAATCCGCT

QA 8 711 8 711
DS 

RD RR2AE33JQ 939 0 0
TAAGTGCAAATATTCTTTTATATATGTATAGTTTGATCAAAAGAACATATAATATACAAG
ATGAAACATAAAATCCCAACAAACAAAAAGAAAGAAATGTAACCCCTCTTATAAAACATC
AAAGAAACCTGTTTTCACCAAGCTGCCTCTCTCACTCATTCATGCTGAGGAATCTCTCTA
ACAAGTCTTTTCCGTTTTGTCTGACAAATCAATCAAATCATATTATCTTC**TTTTTCCA
AGTCATTTGATGATTTATTTTATCCTATTCTAAGCAGAGACAAATCCTCCTCCCACACTG
TTCTTGGGTTGCATCCCCAGGCCGGTACCTTTTGGTTGAGGAATTTGATCGACAAAGAAA
CATGCGGCGATGATGACATAGCACAACACTAGGACAAGTCCCTTCATGTAATGAGATGTT
CCATCCTGTAAAGTGAATGCTGTGATGATAATTGCCAGAGCTAGACAGCTTGTTTCAAGG
ATGTTAAAGTTGAGATCCATTTTGATTCCCATGATCCACGCAACGATAACACTCAAAGGG
ACCACAAACAAAGAAATCTGAGTTGCAGAGCCCAAGGCCACCCCTAGAGATATATCAAGC
TTGTTTTTGAATGCGAAGATGATGGCTCCAGCATGCTCAGCCGCATTTCCAACAATTGGA
AGCAATATGATACTTATGAAACTCACTGATAGTCCCCATGAGTCCGATGCGTCCTCGATT
GTGGCCACAACATACTCTGATAGCAATGCGATGACGAGTGTCATTCCAGCGAGCCAAGCA
AATCCGCTCCAAAATCCTATCACCGGAGTTTCTTCAACAGTAACTTCATCATTATACGCG
TCATCCTCATCATCCTCTTGTGCTTCAAACAATTGGTGGTGAGTCCAGAGCTGGAAGATT
AGATAAGCAATGTAAGCAATAAGCATAACGATGCTGCTT

QA 1 939 1 939
DS 

RD RR2G103TF 766 0 0
TTTCCGTTTTGTCTGACAAATCAATCAAATCATAT*ATCTTC**TTTTTCCAAGTCATTT
GATGATTTATTT*ATCTAATTCTAAGCAGAGACAAATCCTCCTCCCACACTGTTCTTGGG
CTGCATCCCCAGGCCGGTACCTTTTGGTTGAGGAATTTGATCGACAAAGAAACATGCGGC
GATGATGACATAGCACAACACTAGGACAAGTCCCTTCATGTAGTGAGATGTTCCATCCTG
TAAAGTGAATGCTGTGATGATAATTGCCAGGGCTAGACAGCTTGTTTCAAGGATGTTGAA
GTTGAGATCCATTTTGATTCCCTTGATCCACGCAACAATAACACTCAAAGGGACCACAAA
CAAAGAAATCTGAGTTGCAGAGCCCAACGGCACCCCTAGAGATATATCAAGCTTGTTTTT
GAAAGCGAAGATGATGGCTCCAGCATGCTCAGCCGCATTTCCAACAATGGGAAGCAATAT
GATACTTATGAAACTCACTGATAGTCCCCATGAATCCGATGCATCCTCGATTGTGGCCAC
AACATACTCTGATAGCAATGCGATGACGAGTGTCATTCCAGCGAGCCAAGCAAATCCGCT
CCAAAATCCTATCACCGGAGTTTCCTCAACGGTCACTTCATCATTATACGCATCATCCTC
ATCATCCTCTTGTGCTTCAAACAATTGGCGGTGAGTCCAGAGCTGGAAGATGAGATAAGC
AATGTAAGCAATAAGCATAACGATGCTGCTTGTTCTGGACAGGCTC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 2 4

CO CL2825Contig1 1260 2 2 U
GGCCGTCTTGTCTTCCTCCTCCACATTTCTCTCTTTACACAACTTTCAACGAAGCAAGAA
AAAAGCCCCCCTAAAATTCTGTCGCACAAACTTTCATGGTGTCTAGAAATATGAATCCTG
CAGACGGATCTTTCTTGGATCCGAAGGGTACTATGGCCGTCCCTGCAATTGGACCCTTCT
CCGTCCCTCCTCGCCTACGACCGCTGTGGATGCGACGACGTCGGAGGAAGATCTGAGCAA
GAAGATAAGGAAGCCTTATACCATTACCAAGTCCAGGGAGAGCTGGACGGAGCCTGAGCA
CGACAAATTCCTCGAAGCTCTTCACCTGTTTGACAGAGACTGGAAAAAGATCGAAGCTTT
CATTGGCTCAAAGACTGTGATTCAGATAAGAAGTCATGCTCAGAAGTACTTTCTCAAGGT
ACAAAAGAGTGGAACGGGTGAACATCTCCCTCCTCCTCGACCTAAAAGGAAAGCTTCTCA
TCCATATCCTCAGAAGGTTCACAAGAACGTTCAGCCTCAAGTACCGGGGTCCTTCAAATC
AACAGCTGAACCAAATGACCCTAGTTATATGTTTAGGCCCGAGTCTTCTTCGATGCTGAT
GACTTCTCCACCCACTGCTGCTGCTGCGGCAGCTCCCTGGACTAATAATGTGCCAACAGT
TAGCTTCACACCCCTGCCCAAAGAAACATCAGGAGCAGGAGCTAATAACAACTGTTCTAG
TAGCTCTGAAGATACTCCAAGACCACGATCCAACAAGGACACAAGTGTGCAAGGAAATCT
TGGCCATTCGTTAAGAGTTTTGCCGGACTTTGGCCAAGTATACAGCTTCATTGGAAGTGT
TTTTGACCCATATGCAAGTAATCATCTTCAGAAGCTGAAGAAGATGGACCCCATAGATGT
TGACACAGTGCTACTGTTGATGAGAAATCTATCAATCAACTTGTCTAGCCCTGATTTTGA
GGATCATAGACGGCTTCTTTCGTCGTATGATATCGGCTCTGAGACAGCAATTGATCATGG
TGGAGTGTTTAAAACCTTAAACAAAGAACCACCAGAAATCTCTACATGAAGTTAAATATA
AAGAGGGGAAAGATTATGATGAAACGTCTCAGGTGCCAAACCCAGATTGGTCAACAGAAT
ACAGAGTGTTTGGTGTTGTGGGTTTTGTTTGTAAATATTAAGAAGATGAAGCTGAGAGTT
GAGCAGTTTTATATATTACTTCTTTTGGATAATCTATGTTATATATGTATAGTGTAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY46TFB U 1
AF RR2AY46JQ C 441
BS 1 688 RR2AY46TFB
BS 689 1260 RR2AY46JQ

RD RR2AY46TFB 688 0 0
GGCCGTCTTGTCTTCCTCCTCCACATTTCTCTCTTTACACAACTTTCAACGAAGCAAGAA
AAAAGCCCCCCTAAAATTCTGTCGCACAAACTTTCATGGTGTCTAGAAATATGAATCCTG
CAGACGGATCTTTCTTGGATCCGAAGGGTACTATGGCCGTCCCTGCAATTGGACCCTTCT
CCGTCCCTCCTCGCCTACGACCGCTGTGGATGCGACGACGTCGGAGGAAGATCTGAGCAA
GAAGATAAGGAAGCCTTATACCATTACCAAGTCCAGGGAGAGCTGGACGGAGCCTGAGCA
CGACAAATTCCTCGAAGCTCTTCACCTGTTTGACAGAGACTGGAAAAAGATCGAAGCTTT
CATTGGCTCAAAGACTGTGATTCAGATAAGAAGTCATGCTCAGAAGTACTTTCTCAAGGT
ACAAAAGAGTGGAACGGGTGAACATCTCCCTCCTCCTCGACCTAAAAGGAAAGCTTCTCA
TCCATATCCTCAGAAGGTTCACAAGAACGTTCAGCCTCAAGTACCGGGGTCCTTCAAATC
AACAGCTGAACCAAATGACCCTAGTTATATGTTTAGGCCCGAGTCTTCTTCGATGCTGAT
GACTTCTCCACCCACTGCTGCTGCTGCGGCAGCTCCCTGGACTAATAATGTGCCAACAGT
TAGCTTCACACCCCTGCCCAAAGAAACA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2AY46JQ 820 0 0
ACATCTC
CCCTCCTCCTCGAC*TAAAAGGAAAGCTTCTCATCCATATCCTCAGAAGGTTCACAAGAA
CGTTCAGCCTCAAGTACCGGGGTCCTTCAAATCAACAGCTGAACCAAATGACCCTAGTTA
TATGTTTAGGCCCGAGTCTTCTTCGATGCTGATGACTTCTCCACCCACTGCTGCTGCTGC
GGCAGCTCCCTGGACTAATAATGTGCCAACAGTTAGCTTCACACCCCTGCCCAAAGAAAC
ATCAGGAGCAGGAGCTAATAACAACTGTTCTAGTAGCTCTGAAGATACTCCAAGACCACG
ATCCAACAAGGACACAAGTGTGCAAGGAAATCTTGGCCATTCGTTAAGAGTTTTGCCGGA
CTTTGGCCAAGTATACAGCTTCATTGGAAGTGTTTTTGACCCATATGCAAGTAATCATCT
TCAGAAGCTGAAGAAGATGGACCCCATAGATGTTGACACAGTGCTACTGTTGATGAGAAA
TCTATCAATCAACTTGTCTAGCCCTGATTTTGAGGATCATAGACGGCTTCTTTCGTCGTA
TGATATCGGCTCTGAGACAGCAATTGATCATGGTGGAGTGTTTAAAACCTTAAACAAAGA
ACCACCAGAAATCTCTACATGAAGTTAAATATAAAGAGGGGAAAGATTATGATGAAACGT
CTCAGGTGCCAAACCCAGATTGGTCAACAGAATACAGAGTGTTTGGTGTTGTGGGTTTTG
TTTGTAAATATTAAGAAGATGAAGCTGAGAGTTGAGCAGTTTTATATATTACTTCTTTTG
GATAATCTATGTTATATATGTATAGTGTAGTGC

QA 8 820 8 820
DS 



CO CL2825Contig2 752 2 4 U
AACCTCAAGTACAAGGGTCCTTCAAATCAACCGCTGAACCAAATGACCCTAGTTATATGT
TTAGGCCCGAGTCTTCTTCGATGCTGATGACTTCTCCACCCACTGCTGCTGCTGCAGCTC
CCTGGACTAATAATGTGCCAACAATTAGCTTCACACCCCTGCCCAAAGAAACAGCAGGAG
CAGGAGCTAATAACAACTGTTCTAGTATCTCTGAAAATACTGCAAGACCACGATCCAACA
AGGACGCAAATGGGCAAGGAAATCTTGGCCATTCGTTAAGAGTTTTGCCGGACTTTGGCC
AAGTATACAGCTTCATTGGAAGTGTTTTTGACCCATATGCAAGTAATCATCTTCAGAAGC
TGAAGAAGATGGACCCCATAGATGTTGACACTGTGCTACTGTTGATGAGAAATCTATCAA
TCAACTTGTCTAGCCCTGATTTTGAGGATCATAGACGGCTTCTTTCGTCGTATGATATCG
GCTCTGAGACAGCAAATGATCATGGTGGAGTGTTTAAAACCTTAAACAAAGAACCACCAG
AAATCTCTACTTGAAGTTAGTATAGAGGGGAAAGATTATGATGAAACATCTCAGGTGCAA
AACCCAGATTTGGTTAACAGAATACAGAGTGTTTGGTGTTGTGGGTTTTGTTTGTAAATA
TTAAGAAGATGAAGCTGAGAGTTGAGCAGTTTTATATATATACTTCTTTTGGATAATCTA
TGTTAGATGTATAGTGTAGTGTTAAAATACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI74TF U 1
AF RR2EI74JQ C 114
BS 1 594 RR2EI74TF
BS 595 595 RR2EI74JQ
BS 596 671 RR2EI74TF
BS 672 752 RR2EI74JQ

RD RR2EI74TF 671 0 0
AACCTCAAGTACAAGGGTCCTTCAAATCAACCGCTGAACCAAATGACCCTAGTTATATGT
TTAGGCCCGAGTCTTCTTCGATGCTGATGACTTCTCCACCCACTGCTGCTGCTGCAGCTC
CCTGGACTAATAATGTGCCAACAATTAGCTTCACACCCCTGCCCAAAGAAACAGCAGGAG
CAGGAGCTAATAACAACTGTTCTAGTATCTCTGAAAATACTGCAAGACCACGATCCAACA
AGGACGCAAATGGGCAAGGAAATCTTGGCCATTCGTTAAGAGTTTTGCCGGACTTTGGCC
AAGTATACAGCTTCATTGGAAGTGTTTTTGACCCATATGCAAGTAATCATCTTCAGAAGC
TGAAGAAGATGGACCCCATAGATGTTGACACTGTGCTACTGTTGATGAGAAATCTATCAA
TCAACTTGTCTAGCCCTGATTTTGAGGATCATAGACGGCTTCTTTCGTCGTATGATATCG
GCTCTGAGACAGCAAATGATCATGGTGGAGTGTTTAAAACCTTAAACAAAGAACCACCAG
AAATCTCTACTTGAAGTTAGTATAGAGGGGAAAGATTATGATGAAACATCTCAG*TGCAA
AACCCAGATTTGGTTAACAGAATACAGAGTGTTTGGTGTTGTGGGTTTTGTTTGTAAATA
TTAAGAAGATG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2EI74JQ 639 0 0
GCAGCTCCCTGGACTAATAATGTGCCAACAATTAGCTTCACACCCCTGCCCAAAGAAACA
GCAGGAGCAGGAGCTAATAACAACTGTTCTAGTATCTCTGAAAATACTGCAAGACCACGA
TCCAACAAGGACGCAAATGGGCAAGGAAATCTTGGCCATTCGTTAAGAGTTTTGCCGGAC
TTTGGCCAAGTATACAGCTTCATTGGAAGTGTTTTTGACCCATATGCAAGTAATCATCTT
CAGAAGCTGAAGAAGATGGACCCCATAGATGTTGACACTGTGCTACTGTTGATGAGAAAT
CTATCAATCAACTTGTCTAGCCCTGATTTTGAGGATCATAGACGGCTTCTTTCGTCGTAT
GATATCGGCTTTGAGACAGCAAATGATCATGGTGGAGTGTTTAAAACCTTAAACAAAGAA
CCACCAGAAATCTCTACTTGAAGTTAGTATAGAGGGGAAAGATTATGATGAAACATCTCA
GGTGCAAAACCCAGATTTGGTTAACAGAATACAGAGTGTTTGGTGTTGTGGGTTTTGTTT
GTAAATATTAAGAAGATGAAGCTGAGAGTTGAGCAGTTTTATATATATACTTCTTTTGGA
TAATCTATGTTAGATGTATAGTGTAGTGTTAAAATACCG

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 4

CO CL2826Contig1 733 4 10 U
GGAAAGAGAGCGAGAGTAAGGTGAACCCATGGCGTCGAAGATTGTCTCAGCCATAGTCTT
TGTATTCAACCTTGTCGCCTTTGGTCTAGCCGTTGCTGCTGAACAAAGAAGAAGCACTGC
AACGGTTGTGCAGGACACTGAGGTGCAATACAACTATTGTGTGTATGATTCTGACAGAGC
CACAGGGTATGGAATTGGAGCCTTTTTCTTCTCAGTTGCTAGTCAACTCCTTATCATGCT
CGTTAGCCGTTGCTTCTGTTGTGGGAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCACGCGGTCTTGC
CCTTGTTCTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTGATAGCGGAGACATGCCTATTAGC
TGGATCAGTAGAGAATGCATACCACACAAAGTATAGGACTATGTTCATGGACAATCCTCC
AGACTGTCAGACTCTTCGTAAGGGAGTATTCGCTGCGGGTGCTTCTTTCGTCTTCTTCAA
CGCTATTGTCTCTCAATTTTATTATTTCTTTTACTCCTCTGCTGCTCAGGCCTCCCCCAT
GCCTTACTAGAGGACTTCTATTCCACAAAATATTGTTTTT*ATTTCTTATATGCTATGTG
ATATATACTATTGTCATACTTTTGGGGTGTTATCTTTTTATTGTGTGACAGCAAAATGAT
ATGAAGCTGAGGGTAAAACTATGAGTTTTGTAGATTGATTTGTATGGATTATTGCATTGA
AATGTTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI36TF U 1
AF RR2F957TF U 6
AF RR2DV58TF U 7
AF RR2DV58JQ C 311
BS 1 277 RR2DI36TF
BS 278 278 RR2F957TF
BS 279 580 RR2DI36TF
BS 581 581 RR2F957TF
BS 582 600 RR2DI36TF
BS 601 601 RR2F957TF
BS 602 680 RR2DI36TF
BS 681 682 RR2DV58JQ
BS 683 707 RR2DI36TF
BS 708 733 RR2DV58JQ

RD RR2DI36TF 707 0 0
GGAAAGAGAGCGAGAGTAAGGTGAACCCATGGCGTCGAAGATTGTCTCAGCCATAGTCTT
TGTATTCAACCTTGTCGCCTTTGGTCTAGCCGTTGCTGCTGAACAAAGAAGAAGCACTGC
AACGGTTGTGCAGGACACTGAGGTGCAATACAACTATTGTGTGTATGATTCTGACAGAGC
CACAGGGTATGGAATTGGAGCCTTTTTCTTCTCAGTTGCTAGTCAACTCCTTATCATGCT
CGTTAGCCGTTGCTTCTGTTGTGGGAAGCCTCTCAAGTCTGGTGGTTCACGCGGTCTTGC
CCTTGTTCTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTGATAGCGGAGACATGCCTATTAGC
TGGATCAGTAGAGAATGCATACCACACAAAGTATAGGACTATGTTCATGGACAATCCTCC
AGACTGTCAGACTCTTCGTAAGGGAGTATTCGCTGCGGGTGCTTCTTTCGTCTTCTTCAA
CGCTATTGTCTCTCAATTTTATTATTTCTTTTACTCCTCTGCTGCTCAGGCCTCCCCCAT
GCCTTACTAGAGGACTTCTATTCCACAAAATATTGTTTTTTATTTCTTATATGCTATGTG
GTATATACTATTGTCATACTTTTGGGGTGTTATCTTTTTATTGTGTGACAGCAAAATGAT
ATGAAGCTGAGGGTAAAACT**GAGTTTTGTAGATTGATTTGTATGG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2F957TF 674 0 0
GG
GAGCGAGAGTAAGGTGAACCCATGGCGTCGAAGATCGTCTCAGCCATAGTCTTTGTATTC
AACCTTGTCGCCTTTGGTCTAGCCGTTGCTGCTGAACAAAGAAGAAGCACTGCAACGGTT
GTGCAGGACACTGAGGTGCAATACAACTATTGTGTGTATGATTCTGACAGAGCCACAGGG
TATGGAATTGGAGCCTTTTTCTTCTCAGTTGCTAGTCAACTCCTTATCATGCTCGTTAGC
CTGTGCTTCTGTTGTGGGAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCACGCGCTCTTGCCCTCGTT
CTCTTCATCGTCAGCTGGATGTTCTTCTTGATAGCGGAGACATGCTTATTAGCTGGATCA
GTAGAGAATGCATACCACACAAAGTATAGGACTATGTTCATGGACAATCCTCCAGATTGT
CAGACTCTTCGTAAGGGAGTATTCGCTGCGGGTGCTTCTTTCGTCTTCTTCAACGCTATT
GTCTCTCAATTTTATTATTTCTTTTACTCCTCTGCTGCTCAGGCCTCCCCCATGCCTTAC
TAGAGGACTTCTATTCCACAAAATATTGTTTTT*ATTTCTTATATGCTATGTGATATATA
CTACTGTCATACTTTTGGGGTGTTATCTTTTTATTGTGTGACAGTAAAATGATATGGAGC
TGAGGGCAAAA
A

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR2DV58TF 660 0 0
G
GAGCGAGAGTAAGGTGAACCCATGGCGTCGAAGATTGTCTCAGCCATAGTCTTTGTATTC
AACCTTGTCGCCTTTGGTCTAGCCGTTGCTGCTGAACAAAGAAGAAGCACTGCAACGGTT
GTGCAGGACACTGAGGTGCAATACAACTATTGTGTGTATGATTCTGACAGAGCCACAGGG
TATGGAATTGGAGCCTTTTTCTTCTCAGTTGCTAGTCAACTCCTTATCATGCTCGTTAGC
CGTTGCTTCTGTTGTGGGAAGCCTCTCAAGCCTGGTGGTTCACGCGGTCTTGCCCTTGTT
CTCTTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTGATAGCGGAGACATGCCTATTAGCTGGATCA
GTAGAGAATGCATACCACACAAAGTATAGGACTATGTTCATGGACAATCCTCCAGACTGT
CAGACTCTTCGTAAGGGAGTATTCGCTGCGGGTGCTTCTTTCGTCTTCTTCAACGCTATT
GTCTCTCAATTTTATTATTTCTTTTACTCCTCTGCTGCTCAGGCCTCCCCCATGCCTTAC
TAGAGGACTTCTATTCCACAAAATATTGTTTTT*ATTTCTTATATGCTATGTGATATATA
CTATTGTCATACTTTTGGGGTGTTATCTTTTTATTGTGTGACAGCAAAATGATATG
AAG

QA 2 657 2 657
DS 

RD RR2DV58JQ 423 0 0
TTCATTGTCAGCTGGATGTTCTTCTTGATAGCGGAGACATGCCTATTAGCTGGATCAGTA
GAGAATGCATACCACACAAAGTATAGGACTATGTTCATGGACAATCCTCCAGACTGTCAG
ACTCTTCGTAAGGGAGTATTCGCTGCGGGTGCTTCTTTCGTCTTCTTCAACGCTATTGTC
TCTCAATTTTATTATTTCTTTTACTCCTCTGCTGCTCAGGCCTCCCCCATGCCTTACTAG
AGGACTTCTATTCCACAAAATATTGTTTTT*ATTTCTTATATGCTATGTGATATATACTA
TTGTCATACTTTTGGGGTGTTATCTTTTTATTGTGTGACAGCAAAATGATATGAAGCTGA
GGGTAAAACTATGAGTTTTGTAGATTGATTTGTATGGATTATTGCATTGAAATGTTTTTT
TTT

QA 1 423 1 423
DS 



AS 2 4

CO CL2827Contig1 601 2 2 U
GGAATCAAAAGAGTTCACAAATTTTCTTCTCTCCTTATGGAACCACCAAGCAAGAAACCT
CTTGTACTAGAAACTACTACTACTAGTACGAAGATGGAGACCAAATATGAAGATATGTTA
CCGATCATGGCAGAGAAAATGGACGTTGAAGAGTTTGTATCAGAGCTATGCAAAGGTTTC
GAATTGCTAGCGGATCCAGAGAGAGATCTGATAACAGCTGAGAGTCTAAGGAGAAACTCG
AGGGTACTTGGGATTGAAGGAATGAGCGAGGAAGATGCGCAAGGAATGGTTAGAGAAGGA
GACCTCGACGGAGATGGTGCTCTTAACCAAACCGAGTTCTGTGTTCTCATGGTTCGGTTA
AGCCCCGAGATGATGGAAGATGCAGAAACTTGGCTGGAGAAAGCTATCAGCCAAGAACTT
AATAATCACAATCATTCTTCTCTGCCTTGATGAATAACCTTTTCTTGTGCATTCTCTTTC
TTTCTCCTAAACTTTTGAATGTTTCTGAATATTTTCAAAGCTCTTTTGGCATGAACAATT
GAATGATTTAGAGAGAATCCAACCTTTTGTCATTATTTTCATTATAAGCTATTAAAACTT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2DE93TF U 1
AF RR2DE93JQ C 62
BS 1 594 RR2DE93TF
BS 595 601 RR2DE93JQ

RD RR2DE93TF 594 0 0
GGAATCAAAAGAGTTCACAAATTTTCTTCTCTCCTTATGGAACCACCAAGCAAGAAACCT
CTTGTACTAGAAACTACTACTACTAGTACGAAGATGGAGACCAAATATGAAGATATGTTA
CCGATCATGGCAGAGAAAATGGACGTTGAAGAGTTTGTATCAGAGCTATGCAAAGGTTTC
GAATTGCTAGCGGATCCAGAGAGAGATCTGATAACAGCTGAGAGTCTAAGGAGAAACTCG
AGGGTACTTGGGATTGAAGGAATGAGCGAGGAAGATGCGCAAGGAATGGTTAGAGAAGGA
GACCTCGACGGAGATGGTGCTCTTAACCAAACCGAGTTCTGTGTTCTCATGGTTCGGTTA
AGCCCCGAGATGATGGAAGATGCAGAAACTTGGCTGGAGAAAGCTATCAGCCAAGAACTT
AATAATCACAATCATTCTTCTCTGCCTTGATGAATAACCTTTTCTTGTGCATTCTCTTTC
TTTCTCCTAAACTTTTGAATGTTTCTGAATATTTTCAAAGCTCTTTTGGCATGAACAATT
GAATGATTTAGAGAGAATCCAACCTTTTGTCATTATTTTCATTATAAGCTATTA

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2DE93JQ 540 0 0
TTGTACTAGAAACT
ACTACTACTAGTACGAAGATGGAGACCAAATATGAAGATATGTTACCGATCATGGCAGAG
AAAATGGACGTTGAAGAGTTTGTATCAGAGCTATGCAAAGGTTTCGAATTGCTAGCGGAT
CCAGAGAGAGATCTGATAACAGCTGAGAGTCTAAGGAGAAACTCGAGGGTACTTGGGATT
GAAGGAATGAGCGAGGAAGATGCGCAAGGAATGGTTAGAGAAGGAGACCTCGACGGAGAT
GGTGCTTTTAACCAAACCGAGTTCTGTGTTCTCATGGTTCGGTTAAGCCCCGAGATGATG
GAAGATGCAGAAACTTGGCTGGAGAAAGCTATCAGCCAAGAACTTAATAATCACAATCAT
TTTTTTCTGCCTTGATGAATAACCTTTTCTTGTGCATTCTCTTTCTTTCTCCTAAACTTT
TGAATGTTTCTGAATATTTTCAAAGCTCTTTTGGCATGAACAATTGAATGATTTAGAGAG
AATCCAACCTTTTGTCATTATTTTCATTATAAGCTATTAAAACTTC

QA 15 540 15 540
DS 



CO CL2827Contig2 557 2 1 U
GGAATCAAACCAGTTCACAAATTTTCTTCTCCCCTTATGGAACCACCAAGCAAGAAACCT
CTCGTACTAGAAACTACCACTAGTACGAAGATGGAGACCAAATACGAAGATGTGTTACCG
ATCATGGCAGAGAAAATGGACGTTGAAGAGTTTGTATCAGAGCTATGCAAAGGTTTCAGT
CTGCTAGCGGATCCAAAGAGAGATCTGATAACAGCTGAGAGTCTAAGGAGAAACTCGAGG
GTGCTTGGGATTGAAGGAATGAGCGAGGAAGATGCGCAAGGAATGGTTAGAGAAGGAGAC
CTCGACGGAGATGGTGCTCTTAACCAAACCGAGTTCTGTGTTCTCATGGTTCGTTTAAGC
CCTGAGATGATGGAAGATGCAGAAACTTGGCTGGAGAAAGCTATCAGCCAAGAACTTTAT
AATCACAATCATTCTTCTCTGCCTTGATGAAGAACCTTTTCTTGTGCATTCTCTTTCTTT
CTCCTAAACTTCTAAATGTTTCTGAATATTTTCAAAGCTCTTTTGGCATGAACAATTGAA
TGATTTAGAGAGAATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DV02JQ C 1
AF RR2DV02TF U 1
BS 1 557 RR2DV02TF

RD RR2DV02JQ 557 0 0
GGAATCAAACCAGTTCACAAATTTTCTTCTCCCCTTATGGAACCACCAAGCAAGAAACCT
CTCGTACTAGAAACTACCACTAGTACGAAGATGGAGACCAAATACGAAGATGTGTTACCG
ATCATGGCAGAGAAAATGGACGTTGAAGAGTTTGTATCAGAGCTATGCAAAGGTTTCAGT
CTGCTAGCGGATCCAAAGAGAGATCTGATAACAGCTGAGAGTCTAAGGAGAAACTCGAGG
GTGCTTGGGATTGAAGGAATGAGCGAGGAAGATGCGCAAGGAATGGTTAGAGAAGGAGAC
CTCGACGGAGATGGTGCTCTTAACCAAACCGAGTTCTGTGTTCTCATGGTTCGTTTAAGC
CCTGAGATGATGGAAGATGCAGAAACTTGGCTGGAGAAAGCTATCAGCCAAGAACTTTAT
AATCACAATCATTCTTTTCTGCCTTGATGAAGAACCTTTTCTTGTGCATTCTCTTTCTTT
CTCCTAAACTTCTAAATGTTTCTGAATATTTTCAAAGCTCTTTTGGCATGAACAATTGAA
TGATTTAGAGAGAATCC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2DV02TF 557 0 0
GGAATCAAACCAGTTCACAAATTTTCTTCTCCCCTTATGGAACCACCAAGCAAGAAACCT
CTCGTACTAGAAACTACCACTAGTACGAAGATGGAGACCAAATACGAAGATGTGTTACCG
ATCATGGCAGAGAAAATGGACGTTGAAGAGTTTGTATCAGAGCTATGCAAAGGTTTCAGT
CTGCTAGCGGATCCAAAGAGAGATCTGATAACAGCTGAGAGTCTAAGGAGAAACTCGAGG
GTGCTTGGGATTGAAGGAATGAGCGAGGAAGATGCGCAAGGAATGGTTAGAGAAGGAGAC
CTCGACGGAGATGGTGCTCTTAACCAAACCGAGTTCTGTGTTCTCATGGTTCGTTTAAGC
CCTGAGATGATGGAAGATGCAGAAACTTGGCTGGAGAAAGCTATCAGCCAAGAACTTTAT
AATCACAATCATTCTTCTCTGCCTTGATGAAGAACCTTTTCTTGTGCATTCTCTTTCTTT
CTCCTAAACTTCTAAATGTTTCTGAATATTTTCAAAGCTCTTTTGGCATGAACAATTGAA
TGATTTAGAGAGAATCC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 4

CO CL2828Contig1 876 4 11 U
GGGACTCACTCTCTGTCGTTCATCGGAGATTTTATAATAATTCACAATGGACAGATCACA
ATTGCTGTTGATAGGTTTACCGATTTTCTTGTT**GTTCCGATCTCTTCAACCTTTTCAC
CCCTCCGCCTCCGAAACCTCCGAGTCACCGTCCCAATCAGCCACCTCACATCCCTCACCA
GCAGCCTCCGCCTGCGTTCGTTCCTGATTTTCCCTCACAGAAGCAGGCAAGTGGCTTAGG
AGGAGCAGTTGGATATGGAAACACTGTGGAAATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAA
GGGAACTGCAGTGACTATGAAGAAGATGTTAGAGACGGCTTTTCCCGGTTTAGATGTGGT
TCTCGCGAACTACCCACCACCACCACCAAAGCGTCTTCTAGCTAAGGTTGTGCCTGTTGC
TCAGATGGGAGTTATTGGGATGATAGTCGCGGGTGATCGTATCTTTCCCATGATTGGTAT
TGCGCAGCCACCTGCATGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGGTTTGGATCCATGGCCTC
CACTTGGCTTATCGGTAACTTTCTGCAGTCTTACCTTCAAAGCTCAGGCGCCTTTGAAGT
TCTCTGCAACGGTGAACTGGTGTTCTCTAAGTTGAAAGAGGGTAGATTCCCTGGAGAGAT
CGAGCTGAGAGATCTCATCAGTAAAACTTTGACAAAACCTAGCATGGTTGCAGGTAGCTT
ACTGAAGTAGTTTCATCAGAAGAAGATGGGTGTTTCGATCTCTTGTGCCGAAAAAAAAGC
AAACGTTGTGTTTTTAGTTAACATCCTGCTTTGAACATTCCTGGTTTGTCTGATGATGAT
GATGTAGCAGTTTAATTAAACTTTACGCTTTGATCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B756TF U 1
AF RR2B091TF U 1
AF RR2B756JQ C 1
AF RR2B091JQ C 135
BS 1 93 RR2B091TF
BS 94 95 RR2B756TF
BS 96 117 RR2B091TF
BS 118 118 RR2B756TF
BS 119 120 RR2B091TF
BS 121 121 RR2B756TF
BS 122 213 RR2B091TF
BS 214 214 RR2B756TF
BS 215 738 RR2B091TF
BS 739 770 RR2B756JQ
BS 771 876 RR2B091JQ

RD RR2B756TF 709 0 0
GGGACTCACTCTCTGTCGTTCATCGGAGATTTTATAATAATTCACAATGGACAGATCACA
ATTGCTGTTGATAGGTTTACCGATTTTCTTGTT**GTTCCGATCTCTTCAACCTTTTCAC
CCCTCCGCCTCCGAAACCTCCGAGTCACCGTCCCAATCAGCCACCTCACATCCCTCACCA
GCAGCCTCCGCCTGCGTTCGTTCCTGATTTTCCCTCACAG******GCAAGTGGCTTAGG
AGGAGCAGTTGGATATGGAAACACTGTGGAAATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAA
GGGAACTGCAGTGACTATGAAGAAGATGTTAGAGACGGCTTTTCCCGGTTTAGATGTGGT
TCTCGCGAACTACCCACCACCACCACCAAAGCGTCTTCTAGCTAAGGTTGTGCCTGTTGC
TCAGATGGGAGTTATTGGGATGATAGTCGCGGGTGATCGTATCTTTCCCATGATTGGTAT
TGCGCAGCCACCTGCATGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGGTTTGGATCCATGGCTTC
CACTTGGCTTATCGGTAACTTTCTGCAGTCTTACCTTCAAAGCTCAGGCGCCTTTGAAGT
TCTCTGCAACGGTGAACTGGTGTTCTCTAAGTTGAAAGAGGGTAGATTCCCTGGAGAGAT
CGAGCTGAGAGATCTCATCAGTAAAACTTTGACAAAACCTAGCATGGTT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2B091TF 738 0 0
GGGACTCACTCTCTGTCGTTCATCGGAGATTTTATAATAATTCACAATGGACAGATCACA
ATTGCTGTTGATAGGTTTACCGATTTTCTTGTTCTGTTCCGATCTCTTCAACCTTTTAAC
TCCTCCGCCTCCGAAACCTCCGAGTCACCGTCCCAATCAGCCACCTCACATCCCTCACCA
GCAGCCTCCGCCTGCGTTCGTTCCTGATTTTCCTTCACAGAAGCAGGCAAGTGGCTTAGG
AGGAGCAGTTGGATATGGAAACACTGTGGAAATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAA
GGGAACTGCAGTGACTATGAAGAAGATGTTAGAGACGGCTTTTCCCGGTTTAGATGTGGT
TCTCGCGAACTACCCACCACCACCACCAAAGCGTCTTCTAGCTAAGGTTGTGCCTGTTGC
TCAGATGGGAGTTATTGGGATGATAGTCGCGGGTGATCGTATCTTTCCCATGATTGGTAT
TGCGCAGCCACCTGCATGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGGTTTGGATCCATGGCCTC
CACTTGGCTTATCGGTAACTTTCTGCAGTCTTACCTTCAAAGCTCAGGCGCCTTTGAAGT
TCTCTGCAACGGTGAACTGGTGTTCTCTAAGTTGAAAGAGGGTAGATTCCCTGGAGAGAT
CGAGCTGAGAGATCTCATCAGTAAAACTTTGACAAAACCTAGCATGGTTGCAGGTAGCTT
ACTGAAGTAGTTTCATCA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2B756JQ 770 0 0
GGGACTCACTCTCTGTCGTTCATCGGAGATTTTATAATAATTCACAATGGACAGATCACA
ATTGCTGTTGATAGGTTTACCGATTTTCTTGTT**GTTCCGATCTCTTCAACCTTTTCAC
CCCTCCGCCTCCGAAACCTCCGAGTCACCGTCCCAATCAGCCACCTCACATCCCTCACCA
GCAGCCTCCGCCTGCGTTCGTTCCTGATTTTCCCTCACAG******GCAAGTGGCTTAGG
AGGAGCAGTTGGATATGGAAACACTGTGGAAATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAA
GGGAACTGCAGTGACTATGAAGAAGATGTTAGAGACGGCTTTTCCCGGTTTAGATGTGGT
TCTCGCGAACTACCCACCACCACCACCAAAGCGTCTTCTAGCTAAGGTTGTGCCTGTTGC
TCAGATGGGAGTTATTGGGATGATAGTCGCGGGTGATCGTATCTTTCCCATGATTGGTAT
TGCGCAGCCACCTGCATGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGGTTTGGATCCATGGCTTC
CACTTGGCTTATCGGTAACTTTCTGCAGTCTTACCTTCAAAGCTCAGGCGCCTTTGAAGT
TCTCTGCAACGGTGAACTGGTGTTCTCTAAGTTGAAAGAGGGTAGATTCCCTGGAGAGAT
CGAGCTGAGAGATCTCATCAGTAAAACTTTGACAAAACCTAGCATGGTTGCAGGTAGCTT
ACTGAAGTAGTTTCATCAGAAGAAGATGGGTGTTTCGATCTCTTGTGCCG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2B091JQ 742 0 0
AACCTCCGAGTCACCGTCCCAATCAGCCACCTCACATCCCTCACCAGCAGCCTCCGCCTG
CGTTCGTTCCTGATTTTCCTTCACAGAAGCAGGCAAGTGGCTTAGGAGGAGCAGTTGGAT
ATGGAAACACTGTGGAAATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAAGGGAACTGCAGTGA
CTATGAAGAAGATGTTAGAGACGGCTTTTCCCGGTTTAGATGTGGTTCTCGCGAACTACC
CACCACCACCACCAAAGCGTCTTCTAGCTAAGGTTGTGCCTGTTGCTCAGATGGGAGTTA
TTGGGATGATAGTCGCGGGTGATCGTATCTTTCCCATGATTGGTATTGCGCAGCCACCTG
CATGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGGTTTGGATCCATGGCCTCCACTTGGCTTATCG
GTAACTTTCTGCAGTCTTACCTTCAAAGCTCAGGCGCCTTTGAAGTTCTCTGCAACGGTG
AACTGGTGTTCTCTAAGTTGAAAGAGGGTAGATTCCCTGGAGAGATCGAGCTGAGAGATC
TCATCAGTAAAACTTTGACAAAACCTAGCATGGTTGCAGGTAGCTTACTGAAGTAGTTTC
ATCAGAAGAAGATGGGTGTTTCGATCTCTTGTGCCGAAAAAAAAGCAAACGTTGTGTTTT
TAGTTAACATCCTGCTTTGAACATTCCTGGTTTGTCTGATGATGATGATGTAGCAGTTTA
ATTAAACTTTACGCTTTGATCC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 4

CO CL2829Contig1 1281 4 21 U
CATCGTACGTAGGATCAATGTAAGCACCATTTTATACATAGTTTACCATTTGTAAACATC
TTACAATAGAATCAGACAAGCCCAAATCAGAAAAAAAAACCTTCAATAATCATAAAATCA
CAACTGTTTTAAACTCTGATTTCTAGTTTAATCAGTTGTTTTGCTCACGCCTATTCTTTC
TCCAGTCCCATGGCTTTTCTGGATTTGAAGAAGCCCACAAGCCAATACGCTTCTGTCTTG
CTTCCTTCTCCCACTTTGCAAGAACCATGCGCTTGTCATAAGCTACATAATGCCAAGCAA
GACCTTTCTTTAGCATTGCCTCCTGAACAAAAACTCCATTGCAGTATAAATCTCCAACAC
ACCTCCCATACCGATCTTCTCCATAAACCAACACCTTCAAGCTTTTCCATTGAACAATCT
TAAGCAGCTCTTCTTGTGCCTCTTTCCCAAACGGCATCTGGCTTTCTGGTGCATCTATTC
CCCTT*AGTCTAATTCTGAACTTGCGAGCAAGCACTTCTTCATT*CTGAATGTTCAGCAC
TCTGTAACCAGAATCAATGATCTTCTGGTGAAGCGCATCTGCTTTTGTGTAATCTTTCCT
CTCTCTCGCCTTTGCTCTTTTAACCGCTGCAACATTCACTTCCCTTGGAACAGAAGATGA
CACAACCGGGTCCGAACTACTAACATAGACTGTGATGGTGTCTCCATCTGCCACAGCTTT
TGGATCCACCGGGAGGGTTTGAAACTCAAAAAGAACTCCTTCGGGTAAAGATACAGGAGG
AGCCTCAGTAGAGAGCTCAACGAGAGTGTGAGGCAAAGGGAGTCCATAGAAAGACAAAAG
CCCCTCAACATCTGCTTTCTGATGCCTTTTCAAGATCTCAATAACAAGCCTAGAAGCATC
CTCTGCTGTCTGTGGTGGAGGTTTTGCTTGCTTCCATGCCTCAAGTATTTTTCTATACCA
GTTTGCTTGAGCTTTTCTTGATGACACAACGTACCTCCCAAGTCCTTCAGGAACTTGGGA
AGTGATCTCGAAGTTGAAGAGATCGTGAGCGAGAGCTGAAAGACCGACGGTGGAGACGCC
GTGAGGACCGAGAGAGTCGTCGTCCGTGGTGGGTTTGCAGCATTTTCCGTAGAGATATCC
AAGAGCGTTACCCATCTTTCAGGAAATCTAATAAAGTTTCGATCTTTTCCTGAAAGACAA
TCCCTACTGCAGAGGGAAGACGAAGAGGAGGACCAAACTCTTTCTGAAGAAACTGTACTC
TCAGTTAATATCTTTGGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI81JQ U 1
AF RR2B166JQ U 52
AF RR2DI81TF C 446
AF RR2B166TF C 448
BS 1 80 RR2DI81JQ
BS 81 81 RR2B166JQ
BS 82 247 RR2DI81JQ
BS 248 248 RR2B166JQ
BS 249 285 RR2DI81JQ
BS 286 286 RR2B166JQ
BS 287 388 RR2DI81JQ
BS 389 389 RR2B166JQ
BS 390 534 RR2DI81JQ
BS 535 535 RR2B166JQ
BS 536 576 RR2DI81JQ
BS 577 577 RR2B166JQ
BS 578 672 RR2DI81JQ
BS 673 673 RR2B166JQ
BS 674 747 RR2DI81JQ
BS 748 1086 RR2DI81TF
BS 1087 1087 RR2B166TF
BS 1088 1140 RR2DI81TF
BS 1141 1141 RR2B166TF
BS 1142 1244 RR2DI81TF
BS 1245 1281 RR2B166TF

RD RR2DI81JQ 747 0 0
CATCGTACGTAGGATCAATGTAAGCACCATTTTATACATAGTTTACCATTTGTAAACATC
TTACAATAGAATCAGACAAGTCCAAATCAGAAAAAAAAACCTTCAATAATCATAAAATCA
CAACTGTTTTAAACTCTGATTTCTAGTTTAATCAGTTGTTTTGCTCACGCCTATTCTTTC
TCCAGTCCCATGGCTTTTCTGGATTTGAAGAAGCCCACAAGCCAATACGCTTCTGTCTTG
CTTCCTTTTCCCACTTTGCAAGAACCATGCGCTTGTCATAAGCTATATAATGCCAAGCAA
GACCTTTCTTTAGCATTGCCTCCTGAACAAAAACTCCATTGCAGTATAAATCTCCAACAC
ACCTCCCATACCGATCTTCTCCATAAACTAACACCTTCAAGCTTTTCCATTGAACAATCT
TAAGCAGCTCTTCTTGTGCCTCTTTCCCAAACGGCATCTGGCTTTCTGGTGCATCTATTC
CCCTT*AGTCTAATTCTGAACTTGCGAGCAAGCACTTCTTCATT*CTGAATGTTGAGCAC
TCTGTAACCAGAATCAATGATCTTCTGGTGAAGCGCGTCTGCTTTTGTGTAATCTTTCCT
CTCTCTCGCCTTTGCTCTTTTAACCGCTGCAACATTCACTTCCCTTGGAACAGAAGATGA
CACAACCGGGTCTGAACTACTAACATAGACTGTGATGGTGTCTCCATCTGCCACAGCTTT
TGGATCCACCGGGAGGGTTTGAAACTC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2B166JQ 696 0 0
A
TAAACATCTTACAATAGAATCAGATAAGCCCAAATCAGAAAAAAAAACCTTCAATAATCA
TAAAATCACAACTGTTTTAAACTCTGATTTCTAGTTTAATCAGTTGTTTTGCTCACGCCT
ATTCTTTCTCCAGTCCCATGGCTTTTCTGGATTTGAAGAAGCCCACAAGCCAATACGCTT
CTGTCTTGCTTCTTTCTCCCACTTTGCAAGAACCATGCGCTTGTCATAAGCTACATAATG
CCAAGCAAGACCTTTCTTTAGCATTGCCTCCTGAACAAAAACTCCATTGCAGTATAAATC
TCCAACACACCTCCCATACCGATCTTCTCCATAAACCAACACCTTCAAGCTTTTCCATTG
AACAATCTTAAGCAGCTCTTCTTGTGCCTCTTTCCCAAACGGCATCTGGCTTTCTGGTGC
ATCTATTCCCCTT*AGTCTAATTCTGAACTTGCGAGCAAGCACTTCTTCATT*CTGAATG
TTCAGCACTCTGTAACCAGAATCAATGATCTTCTGGTGAAGCGCATCTGCTTTTGTGTAA
TCTTTCCTCTCTCTCGCCTTTGCTCTTTTAACCGCTGCAACATTCACTTCCCTTGGAACA
GAAGATGACACAACCGGGTCCGAACTACTGACGTAGACTGTGATGGTGTCTCCATCTGCC
ACAGCTTTTGGATCCACCGGGAGGGTTTGAAACTC

QA 2 696 2 696
DS 

RD RR2DI81TF 800 0 0
CC
CAAACGGCATCTGGCTTTCTGGTGCATCTTTTCCCCTT*AGTCTAATTCTGAACTTGCGA
GCAAGCACTTCTTCATT*CTGAATGTTGAGCACTCTGTAACCAGAATCAATGATCTTCTG
GTGAAGCGCGTCTGCTTTTGTGTAATCTTTCCTCTCTCTCGCCTTTGCTCTTTTAACCGC
TGCAACATTCACTTCCCTTGGAACAGAAGATGACACAACCGGGTCTGAACTACTAACATA
GACTGTGATGGTGTCTCCATCTGCCACAGCTTTTGGATCCACCGGGAGGGTTTGAAACTC
AAAAAGAACTCCTTCGGGTAAAGATACAGGAGGAGCCTCAGTAGAGAGCTCAACGAGAGT
GTGAGGCAAAGGGAGTCCATAGAAAGACAAAAGCCCCTCAACATCTGCTTTCTGATGCCT
TTTCAAGATCTCAATAACAAGCCTAGAAGCATCCTCTGCTGTCTGTGGTGGAGGTTTTGC
TTGCTTCCATGCCTCAAGTATTTTTCTATACCAGTTTGCTTGAGCTTTTCTTGATGACAC
AACGTACCTCCCAAGTCCTTCAGGAACTTGGGAAGTGATCTCGAAGTTGAAGAGATCGTG
AGCGAGAGCTGAAAGACCGACGGTGGAGACGCCGTGAGGGCCGAGAGAGTCGTCGTCCGT
GGTGGGTTTGCAGCATTTTCCGTAGAGATATCCGAGAGCGTTACCCATCTTTCAGGAAAT
CTAATAAAGTTTCGATCTTTTCCTGAAAGACAATCCCTACTGCAGAGGGAAGACGAAGAG
GAGGACCAAACTCTTTC
C

QA 3 799 3 799
DS 

RD RR2B166TF 834 0 0
CAAACGGCATCTGGCTTTCTGGTGCATCTATTCCCCTTTAGTCTAATTCTGAACTTGCGA
GCAAGCACTTCTTCATTTCTGAATGTTCAGCACTCTGTAACCAGAATCAATGATCTTCTG
GTGAAGCGCATCTGCTTTTGTGTAATCTTTCCTCTCTCTCGCCTTTGCTCTTTTAACCGC
TGCAACATTCACTTCCCTTGGAACAGAAGATGACACAACCGGGTCCGAACTACTGACGTA
GACTGTGATGGTGTCTCCATCTGCCACAGCTTTTGGATCCACCGGGAGGGTTTGAAACTC
AAAAAGAACTCCTTCGGGTAAAGATACAGGAGGAGCTTCAGTAGAGAGCTCAACGAGAGT
GTGAGGCAAAGGGAGTCCATAGAAAGACAAAAGTCCCTCAACATCTGCTTTCTGATGCCT
TTTCAAGATCTCAGTAACAAGCCTAGAAGCATCCTCTGCTGTCTGTGGTGGAGGTTTTGC
TTGCTTCCATGCCTCAAGTATTTTTCTATACCAGTTTGCTTGAGCTTTTCTTGATGACAC
AACGTACCTCCCAAGTCCTTCAGGAACTTGGGAAGTGATCTCGAAGTTGAAGAGGTCGTG
AGCGAGAGCTGAAAGACCGACGGTGGAGACGCCGTGAGGACCGAGAGAGTCGTCGTCCGT
GGTGGGTTTGCAGCATTTTCCGTAGAGATATCCAAGAGCGTTACCCATCTTTCAGGAAAT
CTAATAAAGTTTCGATCTTTTCCTGAAAGACAATCCCTACTGCAGAGGGAAGACGAAGAG
GAGGACCAAACTCTTTCTGAAGAAACTGTACTCTCAGTTAATATCTTTGGCTCC

QA 1 834 1 834
DS 



AS 2 4

CO CL2830Contig1 633 2 2 U
GGGCCGTCGAACGATCTGTTTCACCGGACTTCTCGCATCCATTTCTTCCAGAAAGTAAGG
ATGAGTGGTTTTAGAGCATTCAAAGCGCAAGTGCCCATTGAATGGAGCCAGAGCTTGTAC
ATAACCTTAGTGAGAGGTCTCCCTGGAACGAGGAAGCTTCACAGGCGTACACTCGAGGCT
ATGGGACTCCGGAGATGCCACCGCACTGTTTTGCACTCCAACACTTCTTCCATTAGAGGA
ATGATTCAACAGGTTAAAAGGATGGTTGTTGTTGAAACGGAGGAGATGTACAAAGCTCGC
AAGGAAGCTGAAGCTAACCATAAAGCTCTGCGTCCGCCACTTGTTGTCAGTCATTCAATC
CCTCCTGCAACAGGCTCGTCCGGCATGTCTTGAGTTTTTTCAAGAAGATGGGTAAAGCCT
CTTCGAATCGTCACTTATGCTTAAGATCCACTTGTAATCTCTCCTTACTTTAAGATTCCG
ACAAGGTGTGAGGGAAGTCATAAGTAGTCTAGACACAATAACAAGTGTTGGTATTGGTGA
ATTGGTGCCTCTTAATGTTTCTGGTGTATGCACTGGATCCTTTTATGTATGTTTGCTCTC
ATTTTATCAAATCTCAAACCCATAAGTTTGGTT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BF52JQ C 1
AF RR2BF52TF U 1
BS 1 2 RR2BF52JQ
BS 3 633 RR2BF52TF

RD RR2BF52JQ 633 0 0
GGGCCGTCGAACGATCTGTTTCACCGGACTTCTCGCATCCATTTCTTCCAGAAAGTAAGG
ATGAGTGGTTTTAGAGCATTCAAAGCGCAAGTGCCCATTGAATGGAGCCAGAGCTTGTAC
ATAACCTTAGTGAGAGGTCTCCCTGGAACGAGGAAGCTTCACAGGCGTACACTCGAGGCT
ATGGGACTCCGGAGATGCCACCGCACTGTTTTGCACTCCAACACTTCTTCCATTAGAGGA
ATGATTCAACAGGTTAAAAGGATGGTTGTTGTTGAAACGGAGGAGATGTACAAAGCTCGC
AAGGAAGCTGAAGCTAACCATAAAGCTCTGCGTCCGCCACTTGTTGTCAGTCATTCAATC
CCTCCTGCAACAGGCTCGTCCGGCATGTCTTGAGTTTTTTCAAGAAGATGGGTAAAGCCT
CTTCGAATCGTCACTTATGCTTAAGATCCACTTGTAATCTCTCCTTACTTTAAGATTCCG
ACAAGGTGTGAGGGAAGTCATAAGTAGTCTAGACACAATAACAAGTGTTGGTATTGGTGA
ATTGGTGCCTCTTAATGTTTCTGGTGTATGCACTGGATCCTTTTATGTATGTTTGCTCTC
ATTTTATCAAATCTCAAACCCATAAGTTTGGTT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2BF52TF 633 0 0
GG
GCCGTCGAACGATCTGTTTCACCGGACTTCTCGCATCCATTTCTTCCAGAAAGTAAGGAT
GAGTGGTTTTAGAGCATTCAAAGCGCAAGTGCCCATTGAATGGAGCCAGAGCTTGTACAT
AACCTTAGTGAGAGGTCTCCCTGGAACGAGGAAGCTTCACAGGCGTACACTCGAGGCTAT
GGGACTCCGGAGATGCCACCGCACTGTTTTGCACTCCAACACTTCTTCCATTAGAGGAAT
GATTCAACAGGTTAAAAGGATGGTTGTTGTTGAAACGGAGGAGATGTACAAAGCTCGCAA
GGAAGCTGAAGCTAACCATAAAGCTCTGCGTCCGCCACTTGTTGTCAGTCATTCAATCCC
TCCTGCAACAGGCTCGTCCGGCATGTCTTGAGTTTTTTCAAGAAGATGGGTAAAGCCTCT
TCGAATCGTCACTTATGCTTAAGATCCACTTGTAATCTCTCCTTACTTTAAGATTCCGAC
AAGGTGTGAGGGAAGTCATAAGTAGTCTAGACACAATAACAAGTGTTGGTATTGGTGAAT
TGGTGCCTCTTAATGTTTCTGGTGTATGCACTGGATCCTTTTATGTATGTTTGCTCTCAT
TTTATCAAATCTCAAACCCATAAGTTTGGTT

QA 3 633 3 633
DS 



CO CL2830Contig2 664 2 2 U
GGCTTTGCCAAACGCGAAAGCTCAACGATTGTTCCGAGCTCTGGTTCGCCGTCGAACGAT
CTGTTTCACCGGACTTCTCGCATCCATTTCTTCCAGAGAGTAAGGATGAGTGGTTTTAGA
GCATTCAAAGCTAAAGTGCCCATCGAATGGAGCCAGAGCTTGTACATAACCTTAGTGAGA
GGTCTCCCTGGAACGAGGAAGCTTCACAGGCGTACACTCGAGGCTATGGGACTCCGGAGA
TGCCACCGCACTGTTTTGCACTCCAACACTTCTTCCATTAGAGGAATGATTCAACAGGTT
AAAAGGATGGTTGTTGTTGAAACAGAGGAGACGTACAAAGCTCGCAAGGAAGCTGAAGGT
AACCACAAAGCTCTGCGTCCGCCACTTGTTGCCAGTCATTCAAGCCCTGCAACAGGCTCC
TCCAACATGTCTTAGAGTTTTTTTCAAGAAGATGGGTAAAGGCTATTCAAATCGTCACTT
TTGCTTAAGATCCACTTGTAATCTCTCCTTACTTTAAGATTCCGACAAGGTGTGAGGGAA
GTCATAAGTAGTCTAGACACAATAACAAGGGTTGGTATTAGTGAATTGGTGCCTCTTAAT
GTTTCTCGTGTGTACACTGGATCCTTTATGTATGTTTGCTCTCATTTTATCAAATCTCAA
ACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 

AF RR2BS79TF U 1
AF RR2BS79JQ C 1
BS 1 660 RR2BS79TF
BS 661 664 RR2BS79JQ

RD RR2BS79TF 663 0 0
GGCTTTGCCAAACGCGAAAGCTCAACGATTGTTCCGAGCTCTGGTTCGCCGTCGAACGAT
CTGTTTCACCGGACTTCTCGCATCCATTTCTTCCAGAGAGTAAGGATGAGTGGTTTTAGA
GCATTCAAAGCTAAAGTGCCCATCGAATGGAGCCAGAGCTTGTACATAACCTTAGTGAGA
GGTCTCCCTGGAACGAGGAAGCTTCACAGGCGTACACTCGAGGCTATGGGACTCCGGAGA
TGCCACCGCACTGTTTTGCACTCCAACACTTCTTCCATTAGAGGAATGATTCAACAGGTT
AAAAGGATGGTTGTTGTTGAAACAGAGGAGACGTACAAAGCTCGCAAGGAAGCTGAAGGT
AACCACAAAGCTCTGCGTCCGCCACTTGTTGCCAGTCATTCAAGCCCTGCAACAGGCTCC
TCCAACATGTCTTAGAGTTTTTTTCAAGAAGATGGGTAAAGGCTATTCAAATCGTCACTT
TTGCTTAAGATCCACTTGTAATCTCTCCTTACTTTAAGATTCCGACAAGGTGTGAGGGAA
GTCATAAGTAGTCTAGACACAATAACAAGGGTTGGTATTAGTGAATTGGTGCCTCTTAAT
GTTTCTCGTGTGTACACTGGATCCTTTATGTATGTTTGCTCTCATTTTATCAAATCTCAA
CCC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2BS79JQ 664 0 0
GGCTTTGCCAAACGCGAAAGCTCAACGATTGTTCCGAGCTCTGGTTCGCCGTCGAACGAT
CTGTTTCACCGGACTTCTCGCATCCATTTCTTCCAGAGAGTAAGGATGAGTGGTTTTAGA
GCATTCAAAGCTAAAGTGCCCATCGAATGGAGCCAGAGCTTGTACATAACCTTAGTGAGA
GGTCTCCCTGGAACGAGGAAGCTTCACAGGCGTACACTCGAGGCTATGGGACTCCGGAGA
TGCCACCGCACTGTTTTGCACTCCAACACTTCTTCCATTAGAGGAATGATTCAACAGGTT
AAAAGGATGGTTGTTGTTGAAACAGAGGAGACGTACAAAGCTCGCAAGGAAGCTGAAGGT
AACCACAAAGCTCTGCGTCCGCCACTTGTTGCCAGTCATTCAAGCCCTGCAACAGGCTCC
TCCAACATGTCTTAGAGTTTTTTTCAAGAAGATGGGTAAAGGCTATTCAAATCGTCACTT
TTGCTTAAGATCCACTTGTAATCTCTCCTTACTTTAAGATTCCGACAAGGTGTGAGGGAA
GTCATAAGTAGTCTAGACACAATAACAAGGGTTGGTATTAGTGAATTGGTGCCTCTTAAT
GTTTCTCGTGTGTACACTGGATCCTTTATGTATGTTTGCTCTCATTTTATCAAATCTCAA
ACCC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL2831Contig1 744 2 3 U
GTTGGTGGCAACATTCTCGTTAACTATCTCGGTCAGGAATCTCATAACTGCACACTCTCT
GCTGCTGTGTCCTTGTGTAATCCTTTTGATTTGGTTATAGCGGATGAAGATTTCCACAAG
GGTTTTAACAATGTTTATGATAAGGCTCTCTCCAGATCTCTTCGTAGAATCTTTAGCAAA
CATTCTCTTCTTTTTGAAGATATAGGAGGTGGATTCAACATTCCCATGGCTGCTAATGCT
GAGACTGTTAGGGATTTCGATGAAGGCTTAACCCGAGTGTCATTTGGTTTCAAGACAGTA
GACGAGTACTATTCCAAGTCTAGCAGCTCCAAAGCGATCAAACATGTCCGTATTCCCTTG
CTTTGCATTCAGGCAGCAAATGACCCGATTGCTCCGATAGAGGGATCCCTCGCGATGACA
TCAAGGCAAACCCAAACTGCATGCTGATAGTAACACCAAGAGGAGGGCACTTGGGGTGGG
TGGCAGGTGAAGGAGCTCCAAATGGAGCTCCGTGGACCGACCCGGTGGTTATGGAGTTTC
TGCAACATGTCGAGAGTTGTCAAACCATTAATGGGGAGAGATTGTTGGAGGATGTTCACC
AAATTCAAGTCTAGTTCTGTTGATTAGTATCTTTCACTTGTATTTATACATTATTATTGT
TGTGACCAAGAATTATAAACACGCAAAGAATTATGGTATAGAAGAGTTCTTGCACAAAAT
AACAAAAATTATTTGTTATTCAAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AD49JQ C 1
AF RR2AD49TF U 1
BS 1 725 RR2AD49TF
BS 726 726 RR2AD49JQ
BS 727 744 RR2AD49TF

RD RR2AD49JQ 744 0 0
GTTGGTGGCAACATTCTCGTTAACTATCTCGGTCAGGAATCTCATAACTGCACACTCTCT
GCTGCTGTGTCCTTGTGTAATCCTTTTGATTTGGTTATAGCGGATGAAGATTTCCACAAG
GGTTTTAACAATGTTTATGATAAGGCTCTCTCCAGATCTCTTCGTAGAATCTTTAGCAAA
CATTCTCTTCTTTTTGAAGATATAGGAGGTGGATTCAACATTCCCATGGCTGCTAATGCT
GAGACTGTTAGGGATTTCGATGAAGGCTTAACCCGAGTGTCATTTGGTTTCAAGACAGTA
GACGAGTACTATTCCAAGTCTAGCAGCTCCAAAGCGATCAAACATGTCCGTATTCCCTTG
CTTTGCATTCAGGCAGCAAATGACCCGATTGCTCCGATAGAGGGATCCCTCGCGATGACA
TCAAGGCAAACCCAAACTGCATGCTGATAGTAACACCAAGAGGAGGGCACTTGGGGTGGG
TGGCAGGTGAAGGAGCTCCAAATGGAGCTCCGTGGACCGACCCGGTGGTTATGGAGTTTC
TGCAACATGTCGAGAGTTGTCAAACCATTAATGGGGAGAGATTGTTGGAGGATGTTCACC
AAATTCAAGTCTAGTTCTGTTGATTAGTATCTTTCACTTGTATTTATACATTATTATTGT
TGTGACCAAGAATTATAAACACGCAAAGAATTATGGTATAGAAGAGTTCTTGCACAAAAT
AACAAAAATTATTTGTTATTCAAC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2AD49TF 744 0 0
GTTGGTGGCAACATTCTCGTTAACTATCTCGGTCAGGAATCTCATAACTGCACACTCTCT
GCTGCTGTGTCCTTGTGTAATCCTTTTGATTTGGTTATAGCGGATGAAGATTTCCACAAG
GGTTTTAACAATGTTTATGATAAGGCTCTCTCCAGATCTCTTCGTAGAATCTTTAGCAAA
CATTCTCTTCTTTTTGAAGATATAGGAGGTGGATTCAACATTCCCATGGCTGCTAATGCT
GAGACTGTTAGGGATTTCGATGAAGGCTTAACCCGAGTGTCATTTGGTTTCAAGACAGTA
GACGAGTACTATTCCAAGTCTAGCAGCTCCAAAGCGATCAAACATGTCCGTATTCCCTTG
CTTTGCATTCAGGCAGCAAATGACCCGATTGCTCCGATAGAGGGATCCCTCGCGATGACA
TCAAGGCAAACCCAAACTGCATGCTGATAGTAACACCAAGAGGAGGGCACTTGGGGTGGG
TGGCAGGTGAAGGAGCTCCAAATGGAGCTCCGTGGACCGACCCGGTGGTTATGGAGTTTC
TGCAACATGTCGAGAGTTGTCAAACCATTAATGGGGAGAGATTGTTGGAGGATGTTCACC
AAATTCAAGTCTAGTTCTGTTGATTAGTATCTTTCACTTGTATTTATACATTATTATTGT
TGTGACCAAGAATTATAAACACGCAAAGAATTATGGTATAGAAGAGTTCTTGCACAAAAT
AACAAGAATTATTTGTTATTCAAC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 3

CO CL2832Contig1 1486 3 7 U
AAAAAGCCATAAAACTGGCTAGTGGCACAAATTTCTTCATATATATTTACCAGTAGATTT
ATGAAACCATATCTACATGAAACCAAAAAAAAAAACATGAAAAAACCAACAAATAATACA
TGTACCAGAAACGAAGCAATAACTTGGAAGGAGGAAAGAAGATGACTCAATAATTCACAA
CATTGCTTAAGACTATAAATGGAATATTATATGAAGATAATTAAAATGAAGAATTTTCTT
TTTAAAAAGTTTCATAAATCAAGTGGTGTATCAAGCCAAGATAATGTTCCAACATGAACA
ACAGTGTGAAACCAATTAGGCATACCATGGACAAGAAGATCTTTGAACTTACCCAATTTT
GGATCATATGACACAAGAACCCTACTCTTATACTCCAACAAGATCTCACCATTCTCCAAC
ACGCACAAAACCCTAACCACTTTACCATTCTCAGCGTTCTTCCAAATCCACATTGGTCGG
TCCAAACTCTGCTTCAGCCCCTTTGGCACGTAAGTCCCAATGCTATACTCTTTACCCCAA
GACTCCTTTACTCCATAACTCTTCATAACCCATATATCTAACTTCCCATAGTTTCCATAA
ACAACCGCACAAAGACACCCTTTAAGGTTCACTAGTCTATGGTTGATCCGGTTTAGCCCA
CCGCAATCCGGTTTAGGAATTTCTCTAAACTCTTCATCTTCAAGATCAAATGATACAAAC
TTGCGATCAGGCACGTGCCTACGAGGCCTTGTAACAAAATGTAACCTCCCGTTGACTAAA
GCCTCTGTTGGACGTTTCATAAACTTGTAAGGAGCTTTCCCTAAGCTCCTCCAAGATAAA
GATTGATCTCTTCTTGTTGGTAAGGTTAAGATCTGAACCTCTGATTGCTTGTATTGGATC
CGACCACGACCTCTGTAGGCACTACTAGTACTACCTCTGAAGTAAACTATCTTCACAACT
TTGTACTCCTTTGTCTTTTTATGGAACCCAAAGCCGAATACGAGTTCTTGATCGTGGTAC
TTGTTGGAACACTCGGGAAGCTCTAAGGAGTTTGTAGTGAAAGGGTTGTAGAGGTAGAGA
GAATCGTTATAGAGAGAATCAGACAAACAGAGCAAACCGTTGCAAGAACCTACCACGTCG
AACTCAGGCATGGAAGATGAGAATCTTAAGGTGAACTTCTTGGTCTTGATACGTTTCTCT
TCTTCTGATAAGTCCAAGAAGTGGAGACCGTTGCGTATTGGTGAATCGCAGTGAAGGAGA
AGACATGGCTTCTTGTCGGAAGAACAAGAAGAAGAGACAAGACCGTGTTGTGTCGTCAAA
ATGGATCTCCAAGATCTGCAAACGAACATAAGCTTAGCTAAGGAGGAGATGGGAAGGCGA
GAGAATATGTCGGTGAGGATATCTCCGGGAAGGGATTCTAAAAGTCCTCCACAGTCGTCC
ACGGTGGTGATCTTTCTCTTCTTGAAACTGTTCTCTGAAGCCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT39JQ U 1
AF RR2DH78JQ U 244
AF RR2DH78TF C 825
BS 1 293 RR2FT39JQ
BS 294 294 RR2DH78JQ
BS 295 494 RR2FT39JQ
BS 495 495 RR2DH78JQ
BS 496 807 RR2FT39JQ
BS 808 914 RR2DH78JQ
BS 915 1486 RR2DH78TF

RD RR2FT39JQ 807 0 0
AAAAAGCCATAAAACTGGCTAGTGGCACAAATTTCTTCATATATATTTACCAGTAGATTT
ATGAAACCATATCTACATGAAACCAAAAAAAAAAACATGAAAAAACCAACAAATAATACA
TGTACCAGAAACGAAGCAATAACTTGGAAGGAGGAAAGAAGATGACTCAATAATTCACAA
CATTGCTTAAGACTATAAATGGAATATTATATGAAGATAATTAAAATGAAGAATTTTCTT
TTTAAAAAGTTTCATAAATCAAGTGGTGTATCAAGCCAAGATAATGTTCCAACGTGAACA
ACAGTGTGAAACCAATTAGGCATACCATGGACAAGAAGATCTTTGAACTTACCCAATTTT
GGATCATATGACACAAGAACCCTACTCTTATACTCCAACAAGATCTCACCATTCTCCAAC
ACGCACAAAACCCTAACCACTTTACCATTCTCAGCGTTCTTCCAAATCCACATTGGTCGG
TCCAAACTCTGCTTTAGCCCCTTTGGCACGTAAGTCCCAATGCTATACTCTTTACCCCAA
GACTCCTTTACTCCATAACTCTTCATAACCCATATATCTAACTTCCCATAGTTTCCATAA
ACAACCGCACAAAGACACCCTTTAAGGTTCACTAGTCTATGGTTGATCCGGTTTAGCCCA
CCGCAATCCGGTTTAGGAATTTCTCTAAACTCTTCATCTTCAAGATCAAATGATACAAAC
TTGCGATCAGGCACGTGCCTACGAGGCCTTGTAACAAAATGTAACCTCCCGTTGACTAAA
GCCTCTGTTGGACGTTTCATAAACTTG

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2DH78JQ 671 0 0
AAAAAGTTTCATAAATCAAGTGGTGTATCAAGCCAAGATAATGTTCCAACATGAACAACA
GTGTGAAACCAATTAGGCATACCATGGACAAGAAGATCTTTGAACTTACCCAATTTTGGA
TCATATGACACAAGAACCCTACTCTTATACTCCAACAAGATCTCACCATTCTCCAACACG
CACAAAACCCTAACCACTTTACCATTCTCAGCGTTCTTCCAAATCCACATTGGTCGGTCC
AAACTCTGCTTCAGCCCCTTTGGCACGTAAGTCCCAATGCTATACTCTTTACCCCAAGAC
TCCTTTACTCCATAACTCTTCATAACCCATATATCTAACTTCCCATAGTTTCCATAAACA
ACCGCACAAAGACACCCTTTAAGGTTCACTAGTCTATGGTTGATCCGGTTTAGCCCACCG
CAATCCGGTTTAGGAATTTCTCTAAACTCTTCATCTTCAAGATCAAATGATACAAACTTG
CGATCAGGCACGTGCCTACGAGGCCTTGTAACAAAATGTAACCTCCCGTTGACTAAAGCC
TCTGTTGGACGTTTCATAAACTTGTAAGGAGCTTTCCCTAAGCTCCTCCAAGATAAAGAT
TGATCTCTTCTTGTTGGTAAGGTTAAGATCTGAACCTCTGATTGCTTGTATTGGATCCGA
CCACGACCTCT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2DH78TF 662 0 0
GCTCCTCCAAGATAAAGATTGATCTCTTCTTGTTGGTAAGGTTAAGATCTGAACCTCTGA
TTGCTTGTATTGGATCCGACCACGACCTCTGTAGGCACTACTAGTACTACCTCTGAAGTA
AACTATCTTCACAACTTTGTACTCCTTTGTCTTTTTATGGAACCCAAAGCCGAATACGAG
TTCTTGATCGTGGTACTTGTTGGAACACTCGGGAAGCTCTAAGGAGTTTGTAGTGAAAGG
GTTGTAGAGGTAGAGAGAATCGTTATAGAGAGAATCAGACAAACAGAGCAAACCGTTGCA
AGAACCTACCACGTCGAACTCAGGCATGGAAGATGAGAATCTTAAGGTGAACTTCTTGGT
CTTGATACGTTTCTCTTCTTCTGATAAGTCCAAGAAGTGGAGACCGTTGCGTATTGGTGA
ATCGCAGTGAAGGAGAAGACATGGCTTCTTGTCGGAAGAACAAGAAGAAGAGACAAGACC
GTGTTGTGTCGTCAAAATGGATCTCCAAGATCTGCAAACGAACATAAGCTTAGCTAAGGA
GGAGATGGGAAGGCGAGAGAATATGTCGGTGAGGATATCTCCGGGAAGGGATTCTAAAAG
TCCTCCACAGTCGTCCACGGTGGTGATCTTTCTCTTCTTGAAACTGTTCTCTGAAGCCAT
CC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 4

CO CL2833Contig1 1113 4 6 U
GTATTGATTCTTTTCGGATCGAGATGTATGGATCCACGGATCTATGTGTCTATATAGATC
CTGTTCATGGATTAACGAAAATGTGCAAACGCTCTATTTGCCTCTGCCATTCTATGAGTC
TCTTCCTTTTTGCGTATGGCATCGCCACTCCCTTTGGCAGCATCCACTAATTCGGAACTT
AATTTGAAAGCCATATTTCGACCCGGACGTTTTCGGGATGCCCCTAATAACCAACGAATG
GCAAGTGCTTTTCCTTGCGTGGATCCTATTTCAATGGGAACTTGATGAGTTGATCCGCCT
ACAAGTCTTGCTTTTACTGCTATATCGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAAACA
GATAGTGGATTTGTTTCTGTCTTTTGTTGAATCTTTTTCAAGGCTCGATAGATAATTTGA
TAAGCCAATGATTTTTTTCCGTGTTTCAGAATACGGTTAACCAACATGTTAACTAATCGA
TTACGATAAATTGGATCGGATTTTGCAGTTTTTTTCTTCTGCAGTACCTCGACGTGACAT
GAGCGTGAAAGGGGTTCAAGAATCTGTTTTCTTTTTATAAGGGCTCAAATCTTTTATTTT
GGCTTTTTGACCCCATATTGTAGGGTGGATCTCGAAAGATATGAAAGATCTCCCTCCAAA
CCGTACATACGACTTTCATCGAATACGGCTTTCCACAGAATTCTATATGTATCTATGAAA
TCGAGAATGGAATTCTGTTTACTCACTTTTAAATTGAGTATCCGTTTCCCTCCTTTTCCT
GCTAGGATTGGAAATCCTGTATTTTACATATCCATACGATTGAGTCCTTGGGTTTCCGAA
ATAGTGTAAAAATAAGTGCTTCGAATCATTGCTATTTGACCCGGACCTGTTCTAAAAAAG
TCGAGGCATTTCGAATTGTTTGTTGACACGGACAAAGTCAGGGAAAACCTCTGAAATTAT
TTCAATATTGAACTTGGACATATAAGAGTTCCGAATCGAATCTCTTTTGAAAGAAGATCT
TTTGTCTCATGGTAGCCTGCTTCAGTCCCCTTACGAAACTTTCGTTATTGGGTTAGCCAT
ACACTTCACATGTTTCTAGCGATTCACATGGCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G820JQ U 1
AF RR2B107JQ U 3
AF RR2G820TF C 113
AF RR2B107TF C 303
BS 1 625 RR2G820JQ
BS 626 626 RR2B107JQ
BS 627 681 RR2G820JQ
BS 682 838 RR2B107JQ
BS 839 893 RR2G820TF
BS 894 1113 RR2B107TF

RD RR2G820JQ 681 0 0
GTATTGATTCTTTTCGGATCGAGATGTATGGATCCACGGATCTATGTGTCTATATAGATC
CTGTTCATGGATTAACGAAAATGTGCAAACGCTCTATTTGCCTCTGCCATTCTATGAGTC
TCTTCCTTTTTGCGTATGGCATCGCCACTCCCTTTGGCAGCATCCACTAATTCGGAACTT
AATTTGAAAGCCATATTTCGACCCGGACGTTTTCGGGATGCCCCTAATAACCAACGAATG
GCAAGTGCTTTTCCTTGCGTGGATCCTATTTCAATGGGAACTTGATGAGTTGATCCGCCT
ACAAGTCTTGCTTTTACTGCTATATCGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAAACA
GATAGTGGATTTGTTTCTGTCTTTTGTTGAATCTTTTTCAAGGCTCGATAGATAATTTGA
TAAGCCAATGATTTTTTTCCGTGTTTCAGAATACGGTTAACCAACATGTTAACTAATCGA
TTACGATAAATTGGATCGGATTTTGCAGTTTTTTTCTTCTGCAGTACCTCGACGTGACAT
GAGCGTGAAAGGGGTTCAAGAATCTGTTTTCTTTTTATAAGGGCTCAAATCTTTTATTTT
GGCTTTTTGACCCCATATTGTAGGGGGGATCTCGAAAGATATGAAAGATCTCCCTCCAAA
CCGTACATACGACTTTCATCG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2B107JQ 836 0 0
ATTGATTCTTTTCGGATCGAGATGTATGGATCCACGGATCTATGTGTCTATATAGATCCT
GTTCATGGATTAACGAAAATGTGCAAACGCTCTATTTGCCTCTGCCATTCTATGAGTCTC
TTCCTTTTTGCGTATGGCATCGCCACTCCCTTTGGCAGCATCCACTAATTCGGAACTTAA
TTTGAAAGCCATATTTCGACCCGGACGTTTTCGGGATGCCCCTAATAACCAACGAATGGC
AAGTGCTTTTCCTTGCGTGGATCCTATTTCAATGGGAACTTGATGAGTTGATCCGCCTAC
ACGTCTTGCTTTTACTGCTATATCGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAAACAGA
TAGTGGATTTGTTTCTGTCTTTTGTTGAATCTTTTTCAAGGCTCGATAGATAATTTGATA
AGCCAATGATTTTTTTTCGTGTTTCAGAATACGGTTAACCAACATGTTAACTAATCGATT
ACGATAAATTGGATCGGATTTTGCAGTTTTTT*CTTCTGCAGTACCTCGACGTGACATGA
GCGTGAAAGGGGTTCAAGAATCTGTTTTCTTTTTATAAGGGCTCAAATCTTTTATTTTGG
CTTTTTGACCCCATATTGTAGGGTGGATCTCGAAAGATATGAAAGATCTCCCTCCAAACC
GTACATACGACTTTCATCGAATACGGCTTTCCACAGAATTCTATATGTATCTATGAAATC
GAGAATGGAATTCTGTTTACTCACTTTTAAATTGAGTATCCGTTTCCCTCCTTTTCCTGC
TAGGATTGGAAATCCTGTATTTTACATATCCATACGATTGAGTCCTTGGGTTTCCG

QA 1 836 1 836
DS 

RD RR2G820TF 782 0 0
TCTATGAGTCTCTCC
TTTTGCGTATGGCATCGCCACTCC*TTTGGCAGCATCCACTAATTCGGAACTTAATT*GA
AAGCCATATTTCGACCCGGACGTTTTCGGGATGCCCCTAATAACCAACGAATGGCAAGTG
CTTTTCCTTGCGTGGATCCTATTTCAATGGGAACTTGATGAGTTGATCCGCCTACAAGTC
TTGCTTTTACTGCTATATCGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAAACAGATAGTG
GATTTGTTTCTGTCTTTTGTTGAATCTTTTTCAAGGCTCGATAGATAATTTGATAAGCCA
ATGATTTTTTTCCGTGTTTCAGAATACGGTTAACCAACATGTTAACTAATCGATTACGAT
AAATTGGATCGGATTTTGCAGTTTTTTTCTTCTGCAGTACCTCGACGTGACATGAGCGTG
AAAGGGGTTCAAGAATCTGTTTTCTTTTTATAAGGGCTCAAATCTTTTATTTTGGCTTTT
TGACCCCATATTGTAGGGTGGATCTCGAAAGATATGAAAGATCTCCCTCCAAACCGTACA
TACGACTTTCATCGAATACGGCTTTCCACAGAATTCTATATGTATCTATGAAATCGAGTA
TGGAATTCTGTTTACTCACTTTTAAATTGAGTATCCGTTTCCCTCCTTTTCCTGCTAGGA
TTGGAAATCCTGTATTTTACATATCCATACGATTGAGTCCTTGGGTTTCCGAAATAGTGT
AAAAATAAGTGCTTCGAATCATTGCTATTTGACCCGGACCTGTTCT
C

QA 16 781 16 781
DS 

RD RR2B107TF 811 0 0
AC
GTCTTGCTTTTACTGCTATATCGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAAACAGATA
GTGGATTTGTTTCTGTCTTTTGTTGAATCTTTTTCAAGGCTCGATAGATAATTTGATAAG
CCAATGATTTTTTTTCGTGTTTCAGAATACGGTTAACCAACATGTTAACTAATCGATTAC
GATAAATTGGATCGGATTTTGCAGTTTTTT*CTTCTGCAGTACCTCGACGTGACATGAGC
GTGAAAGGGGTTCAAGAATCTGTTTTCTTTTTATAAGGGCTCAAATCTTTTATTTTGGCT
TTTTGACCCCATATTGTAGGGTGGATCTCGAAAGATATGAAAGATCTCCCTCCAAACCGT
ACATACGACTTTCATCGAATACGGCTTTCCACAGAATTCTATATGTATCTATGAAATCGA
GAATGGAATTCTGTTTACTCACTTTTAAATTGAGTATCCGTTTCCCTCCTTTTCCTGCTA
GGATTGGAAATCCTGTATTTTACATATCCATACGATTGAGTCCTTGGGTTTCCGAAATAG
TGTAAAAATAAGTGCTTCGAATCATTGCTATTTGACCCGGACCTGTTCTAAAAAAGTCGA
GGCATTTCGAATTGTTTGTTGACACGGACAAAGTCAGGGAAAACCTCTGAAATTATTTCA
ATATTGAACTTGGACATATAAGAGTTCCGAATCGAATCTCTTTTGAAAGAAGATCTTTTG
TCTCATGGTAGCCTGCTTCAGTCCCCTTACGAAACTTTCGTTATTGGGTTAGCCATACAC
TTCACATGTTTCTAGCGATTCACATGGCC

QA 3 811 3 811
DS 



AS 1 4

CO CL2834Contig1 970 4 11 U
AAAACTTGTAATCAATTATATTTACAAACAGAAATTATGTCAAAAAGGTAAATCAATATT
CTTTCATCTTGTTTTATAACATAGGAACATGTTTCTACACAAGAAAAGAAAAAATAAATA
GAGTTGCAAGTTCAAAAAAAAAGAAAAGGAAGATCAAGGATTCTTCTGCTGCTTCTCTAT
ATCATACAGTACACAGACATCTGCAGCTGTTTTCATCTGAATGATATTGACTGTTTGTTT
CATCGACCAACCGAATATTGACAAAGCTAGAAGAAGAGAGAGTGGTGAAATCTGAGTTAA
TGTGGAAACTACGACATTCAGGAGACTTTCGGTTTGGTTCTTTGCAATGAGAAGAAGGAT
GATATACAGAACCTCGCAAGAAACACAGCAATAACACATGAAGATCCGGTTTCCATAGTA
GAGTCTGAAAAGCCAGCTTGTGCCGTCTTTCACATCCTTATGGCTGCTCTTCCCTGCTAG
AAACGTACTGTACATCTGCAGCCAATGACTAGCAATATCTAAAGCCAGCAATGAAAGGAA
GACCAAGCTAGGCCTGTAGACTTGAGAGAGAATCACGAGTAGACACGCCGTGCTAACTCT
ATCTGTGACCATATCGAGAACAGCCCCAAACGTAGAAACTTGGTTGAATCTACGAGCACA
CCAGCCATCCACAGCATCACAACAAAAGCTGAAGAAATAGAGGAGGGAGAAAAGTGTTTT
GTTAGAGAAACAGACAGCAAAGGCAACACAGTTCAAGAGAACTCTCATGTACCCAACAAT
GTTAGGTATATAAAGGTAAACAGACAACTTCTCTGGTCTTGGTCTCTCCTTCTTCCCCAT
TTTTTTGACTCTGATGTTGTTACACAATCTCTCTAACGATCCCACACTTGGAAACGGGTT
AGAGTTGTGGCGATCTTGAAGTGACCGAGAGGAAGAGATCTGTAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGTCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 10 25 10 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2EX65JQ U 1
AF RR2EI64JQ U 39
AF RR2EI64TF C 217
AF RR2EX65TF C 272
BS 1 272 RR2EX65JQ
BS 273 273 RR2EI64JQ
BS 274 275 RR2EX65JQ
BS 276 276 RR2EI64JQ
BS 277 277 RR2EX65JQ
BS 278 278 RR2EI64JQ
BS 279 323 RR2EX65JQ
BS 324 324 RR2EI64JQ
BS 325 353 RR2EX65JQ
BS 354 701 RR2EI64JQ
BS 702 970 RR2EI64TF

RD RR2EX65JQ 356 0 0
AAAACTTGTAATCAATTATATTTACAAACAGAAATTATGTCAAAAAGGTAAATCAATATT
CTTTCATCTTGTTTTATAACATAGGAACATGTTTCTACACAAGAAAAGAAAAAATAAATA
GAGTTGCAAGTTCAAAAAAAAAGAAAAGGAAGATCAAGGATTCTTCTGCTGCTTCTCTAT
ATCATACAGTACACAGACATCTGCAGCTGTTTTCATCTGAATGATATTGACTGTTTGTTT
CATCGACCAACCGAATATTGACAAAGCTAGAAAAAAAAAGAGTGGTGAAATCTGAGTTAA
TGTGGAAACTACGACATTCAGGAAACTTTCGGTTTGGTTCTTTGCAATGAGAA
AAA

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR2EI64JQ 663 0 0
GTCAAAAAGGTAAATCAATATTCTTTCATCTTGTTTTATAACATAGGAACATGTTTCTAC
ACAAGAAAAGAAAAAATAAATAGAGTTGCAAGTTCAGAAAAAAAGAGAAGGAAGATCAAG
GATTCTTCTGCTGCTTCTCTATATCATACAGTACACAGACATCTGCAGCTGTTTTCATCT
GAATGATATTGACTGTTTGTTTCATCGACCAACCGAATATTGACAAAGCTAGAAGAAGAG
AGAGTGGTGAAATCTGAGTTAATGTGGAAACTACGACATTCAGGAGACTTTCGGTTTGGT
TCTTTGCAATGAGAAGAAGGATGATATACAGAACCTCGCAAGAAACACAGCAATAACACA
TGAAGATCCGGTTTCCATAGTAGAGTCTGAAAAGCCAGCTTGTGCCGTCTTTCACATCCT
TATGGCTGCTCTTCCCTGCTAGAAACGTACTGTACATCTGCAGCCAATGACTAGCAATAT
CTAAAGCCAGCAATGAAAGGAAGACCAAGCTAGGCCTGTAGACTTGAGAGAGAATCACGA
GTAGACACGCCGTGCTAACTCTATCTGTGACCATATCGAGAACAGCCCCAAACGTAGAAA
CTTGGTTGAATCTACGAGCACACCAGCCATCCACAGCATCACAACAAAAGCTGAAGAAAT
AGA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2EI64TF 754 0 0
CATCTGATGATATGACTG
TTGTTTCATCGACCA*CCGAATAT*GACAA*GCTAGA*GAAGAGAGAGTG*TGAAATCTG
AGTTAATGTGGAAACTACGACATTCAG*AGACTTTCGGTTTGGTTCTTTGCAATGAGAAG
AAGGATGATATACAGAACCTCGCAAGAAACACAGCAATAACACATGAAGATCCGGTTTCC
ATAGTAGAGTCTGAAAAGCCAGCTTGTGCCGTCTTTCACATCCTTATGGCTGCTCTTCCC
TGCTAGAAACGTACTGTACATCTGCAGCCAATGACTAGCAATATCTAAAGCCAGCAATGA
AAGGAAGACCAAGCTAGGCCTGTAGACTTGAGAGAGAATCACGAGTAGACACGCCGTGCT
AACTCTATCTGTGACCATATCGAGAACAGCCCCAAACGTAGAAACTTGGTTGAATCTACG
AGCACACCAGCCATCCACAGCATCACAACAAAAGCTGAAGAAATAGAGGAGGGAGAAAAG
TGTTTTGTTAGAGAAACAGACAGCAAAGGCAACACAGTTCAAGAGAACTCTCATGTACCC
AACAATGTTAGGTATATAAAGGTAAACAGACAACTTCTCTGGTCTTGGTCTCTCCTTCTT
CCCCATTTTTTTGACTCTGATGTTGTTACACAATCTCTCTAACGATCCCACACTTGGAAA
CGGGTTAGAGTTGTGGCGATCTTGAAGTGACCGAGAGGAAGAGATCTGTAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGTCAAAAA

QA 19 754 19 754
DS 

RD RR2EX65TF 699 0 0
AGAAGAG
AGAGTGGTGAAATCTGAGTTAATGTGGAAACTACGACATTCAGGAGACTTTCGGTTTGGT
*CTTTGCAATGAGAAGAAGGATGATATACAGAACCTCGCAAGAAACACAGCAATAACACA
TGAAGATCCGGTTTCCATAGTAGAGTCTGAAAAGCCAGCTTGTGCTGTCTTTCACATCCT
TATGGCTGCTCTTCCCTGCTAGAAACGTACTGTACATCTGCAGCCAATGACTAGCAATAT
CTAAAGCCAGCAATGAAAGGAAGACAAAGCTAGGCCTGTAGACTTGAGAGAGAATCACGA
GTAGACACGCCGTGCTAACTCTATCTGTGACCATGTCGAGAACAGCCCCAAACGTAGAAA
CTTGGTTGAATCTACGAGCACACCAGCCATCCACAGCATCACAACAAAAGCTGAAGAAAT
AGAGGAGGGAGAAAAGTGTTTTGTTAGAGAAACAGACAGCAAAGGCAACACAGTTCAAGA
GAACTCTCATGTACCCAACAATGTTAGGTATATAAAGGTAAACAGACAACTTCTCTGGTC
TTGGTCTCTCCTTCTTCCCCATTTTTTTGACTCTGATGTTGTTACACAATCTCTCTAACG
ATCCCACACTTGGAAACGGGTTAGAGTTGTGGCGATCTTGAAGTGACCGAGAGGAAGAGA
TCTGTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCAAAAA

QA 8 699 8 699
DS 



AS 1 4

CO CL2835Contig1 681 4 10 U
TTTTTAGGGCTTTTTTCCCATTCCCTCAGTAACCAATGGCTCTTAAAGACTCTCTTGCTC
TCTTCCTTCTCTTCAACATCCGTTTCTTCACCCTCACTACAGCCACCCGAAGTACCAATT
GTCCTCCTCCACCACGCAAACACAACAAACACAAACCTAGCCCACCATCTACACCAACCA
CCACGGGAGCTTGCCCTAAAGACGCCTTAAAGCTTGGTGTTTGTGTTGACGCCCTAAACT
TGTTGAACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTGACTCCATGTTGTAACCTCATCAGGG
GTTTGGTCGATCTTGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGCACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTG
GCATCAAACTTAACCTTCCCATCAACCTAAGTTTGCTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGT
CCCCAGCTGGCTTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGCGACGTCAATCGGATAAATTAAAGCT
TGAATCTTTTATTGTAATGTTTTCTTTTGTACTCGCTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAG
ATGAACATCAGAACATCAATGAGTTTGTGTTGTTTACTTTT*GTTGTATGGCGAGAGCGC
CTTGCCTGAGTGTTACTCCCTTTATTGTAATTTGTTCATTTGTCGTATTGAATAAAATAC
CAATGATTGTTTTTTTTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GM15TF U 2
AF RR2C934JQ C 1
AF RR2GM15JQ C 318
AF RR2C934TF U 6
BS 1 11 RR2C934JQ
BS 12 81 RR2GM15TF
BS 82 82 RR2C934TF
BS 83 172 RR2GM15TF
BS 173 173 RR2C934TF
BS 174 515 RR2GM15TF
BS 516 516 RR2C934TF
BS 517 565 RR2GM15TF
BS 566 665 RR2C934TF
BS 666 681 RR2C934JQ

RD RR2GM15TF 564 0 0
TTTTTAGGGC
TTTTTCCCATTCCCTCAGTAACCAATGGCTCTTAAAGACTCTCTTGCTCTCTTCCTTCTC
TTCAACATCCTTTTCTTCACCCTCACTACAGCCACCCGAAGTACCAATTGTCCTCCTCCA
CCACGCAAACACAACAAACACAAACCTAGCCCACCATCTACCCCAACCACCACGGGAGCT
TGCCCTAAAGACGCCTTAAAGCTTGGTGTTTGTGTTGACGCCCTAAACTTGTTGAACGAT
GTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTGACTCCATGTTGTAACCTCATCAGGGGTTTGGTCGAT
CTTGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGCACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTGGCATCAAACTT
AACCTTCCCATCAACCTAAGTTTGCTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCCCCAGCTGGC
TTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGCGACGTCAATCGGATAAATTAAAGCTTGAATCTTTTA
TTGTAATGTTTTCTTTTGTACTCGTTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATCAG
AACATCAATGAGTT

QA 11 564 11 564
DS 

RD RR2C934JQ 681 0 0
TTTTTAGGGCTTTTTTCCCATTCCCTCAGTAACCAATGGCTCTTAAAGACTCTCTTGCTC
TCTTCCTTCTCTTCAACATCCGTTTCTTCACCCTCACTACAGCCACCCGAAGTACCAATT
GTCCTCCTCCACCACGCAAACACAACAAACACAAACCTAGCCCACCATCTACACCAACCA
CCACGGGAGCTTGCCCTAAAGACGCCTTAAAGCTTGGTGTTTGTGTTGACGCCCTAAACT
TGTTGAACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTGACTCCATGTTGTAACCTCATCAGGG
GTTTGGTCGATCTTGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGCACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTG
GCATCAAACTTAACCTTCCCATCAACCTAAGTTTGCTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGT
CCCCAGCTGGCTTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGCGACGTCAATCGGATAAATTAAAGCT
TGAATCTTTTATTGTAATGTTTTCTTTTGTACTCGCTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAG
ATGAACATCAGAACATCAATGAGTTTGTGTTGTTTACTTTT*GTTGTATGGCGAGAGCGC
CTTGCCTGAGTGTTACTCCCTTTATTGTAATTTGTTCATTTGTCGTATTGAATAAAATAC
CAATGATTGTTTTTTTTAGCC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2GM15JQ 364 0 0
GCTGCGGTTTGTCTTTGCACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTGGCATCAAACTTAACCTT
CCCATCAACCTAAGTTTGCTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCCCCAGCTGGCTTCCAA
TGCCCTTAAACTCAAAGGGACGTCAATCGGATAAATTAAAGCTTGAATCTTTTATTGTAA
TGTTTTCTTTTGTACTCGTTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATCAGAACATC
AATGAGTTTGTGTTGTTTACTTTTTGTTGTATGGCGAGAGCGCCTTGCTTGAGTGTTACT
CCCTTTATTGTAATTTGTTCATTTGTCGTATTGAATAAAATATCAATGGTTGTTTTTTTT
AGCC

QA 1 364 1 364
DS 

RD RR2C934TF 662 0 0
AGGGCT
TTTTTCCCATTCCCTCAGTAACCAATGGCTCTTAAAGACTCTCTTGCTCTCTTCCTTCTC
TTCAACATCCGTTTCTTCACCCTCACTACAGCCACCCGAAGTACCAATTGTCCTCCTCCA
CCACGCAAACACAACAAACACAAACCTAGCCCACCATCTACACCAACCACCACGGGAGCT
TGCCCTAAAGACGCCTTAAAGCTTGGTGTTTGTGTTGACGCCCTAAACTTGTTGAACGAT
GTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTGACTCCATGTTGTAACCTCATCAGGGGTTTGGTCGAT
CTTGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGCACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTGGCATCAAACTT
AACCTTCCCATCAACCTAAGTTTGCTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCCCCAGCTGGC
TTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGCGACGTCAATCGGATAAATTAAAGCTTGAATCTTTTA
TTGTAATGTTTTCTTTTGTACTCGCTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATCAG
AACATCAATGAGTTTGTGTTGTTTACTTTT*GTTGTATGGCGAGAGCGCCTTGCCTGAGT
GTTACTCCCTTTATTGTAATTTGTTCATTTGTCGTATTGAATAAAATACCAATG
AT

QA 7 660 7 660
DS 



AS 1 4

CO CL2836Contig1 757 4 10 U
TCGAAAGACTAATAGCTCTTTATTCATAAGCAAGAAAGTAAAGAGATGATGAAATCTAGA
TTGTCACCAAGCACACAAGAAGCTAAGTTGATTTTCATCAAGTGGTAGAAGGCTGCTCTT
ATGGCAGCCAAGATAAGTTTTACAAAGCCTTAAACTACTAAACTTTTTTTTTTTTAAACA
CACTCTTAAACTACTATTTATATAAATCTAAATGGTCCCTAATTACATGGGCTTCTATGG
ACTTCTCCAATGACATATAGTCTTGGGCTTGCTGTTGGGCTTAAAACCTCTTGATATGGA
TCAAGTATCAAAAGCCTTGCCCCTGGTGGAAAGTTCACTTCTTTCTCTGATTGTTTCCTT
CACCTTATGAAATGTTTCTCCCGCAACAGCGTAGCAAGCAGCCAAGGAGAGTGCGGGCTT
TACTTTCAAGCCTTGGCTCACAAAAGAGTATGCTAACCCACCACCTGATGCTCCGACCAT
GGCAGTCGTAAGATCATCCTTGCCTCTGATTCCTTTCATTACGTACTCTGTTCCAGTCCA
TGCAGCGAAAGATGCTGAGCAGTCCCGAGCACACCTTAGAGCGTACTGAGTTACGGCTCG
AGGGTTACGCCGGCAGCGGCAGGACATGACCATGACCGTTCCAGCTAGACCGCCAACAGC
AGCTCCGGTGACACCGTCAGTTGCGATGGCGATGATGGCTTCTTTCAGCTTGGTCATTGT
CTGTTCGCCTTTCATTCTCTCTTTCTTTCTTCGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI89JQ U 17
AF RR2BN72JQ U 40
AF RR2DI89TF C 1
AF RR2BN72TF C 32
BS 1 16 RR2DI89TF
BS 17 445 RR2DI89JQ
BS 446 446 RR2DI89TF
BS 447 491 RR2BN72JQ
BS 492 492 RR2DI89TF
BS 493 578 RR2BN72JQ
BS 579 579 RR2DI89TF
BS 580 611 RR2BN72JQ
BS 612 738 RR2DI89TF
BS 739 757 RR2BN72TF

RD RR2DI89JQ 431 0 0
TCTTTATTCATAAGCAAGAAAGTAAAGAGATGATGAAATCTAGATTGTCACCAAGCACAC
AAGAAGCTAAGTTGATTTTCATCAAGTGGTAGAAGGCTGCTCTTATGGCAGCCAAGATAA
GTTTTACAAAGCCTTAAACTACTAAACTTTTTTTTTTTTAAACACACTCTTAAACTACTA
TTTATATAAATCTAAATGGTCCCTAATTACATGGGCTTCTATGGACTTCTCCAATGACAT
ATAGTCTTGGGCTTGCTGTTGGGCTTAAAACCTCTTGATATGGATCAAGTATCAAAAGCC
TTGCCCCTGGTGGAAAGTTCACTTCTTTCTCTGATTGTTTCCTTCACCTTATGAAATGTT
TCTCCCGCAACAGCGTAGCAAGCAGCCAAGGAGAGTGCGGGCTTTACTTTCAAGCCTTGG
CTCACAAAA
GA

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR2BN72JQ 572 0 0
AAAGAGATGATGAAATCTAGATTGTCACCAAGCACACAAGAAGCTAAGTTGATTTTCATC
AAGTGGTAGAAGGCTGCTCTTATGGCAGCCAAGATAAGTTTTACAAAGCCTTAAACTACT
AAACTTTTTTTTTTTTAAACACACTCTTAAACTACTATTTATATAAATCTAAATGGTCCC
TAATTACATGGGCTTCTATGGACTTCTCCAATGACATATAGTCTTGGGCTTGCTGTTGGG
CTTAAAACCTCTTGATATGGATCAAGTATCAAAAGCCTTGCCCCTGGTGGAAAGTTCACT
TCTTTCTCTGATTGTTTCCTTCACCTTATGAAATGTTTCTCCCGCAACAGCGTAGCAAGC
AGCCAAGGAGAGTGCGGGCTTTACTTTCAAGCCTTGGCTCACAAAAAAGTATGCTAACCC
ACCACCTGATGCTCCGACCATGGCAGTCGTAAAATCATCCTTGCCTCTGATTCCTTTCAT
TACGTACTCTGTTCCAGTCCATGCAGCGAAAGATGCTGAGCAGTCCCGAGCACACCTTAA
AGCGTACTGAGTTACGGCTCGAGGGTTACGCC

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2DI89TF 738 0 0
TCGAAAGACTAATAGCTCTTTATTCATAAGCAAGAAAGTAAAGAGATGATGAAATCTAGA
TTGTCACCAAGCACACAAGAAGCTAAGTTGATTTTCATCAAGTGGTAGAAGGCTGCTCTT
ATGGCAGCCAAGATAAGTTTTACAAAGCCTTAAACTACTAAACTTTTTTTTTTTTAAACA
CACTCTTAAACTACTATTTATATAAATCTAAATGGTCCCTAATTACATGGGCTTCTATGG
ACTTCTCCAATGACATATAGTCTTGGGCTTGCTGTTGGGCTTAAAACCTCTTGATATGGA
TCAAGTATCAGAAGCCTTGCCCCTGGTGGAAAGTTCACTTCTTTCTCTGATTGTTTCCTT
CACCTTATGAAATGTTTCTCCCGCAACAGCGTAGCAAGCAGCCAAGGAGAGTGCGGGCTT
TACTTTCAAGCCTTGGCTCACAAAAGAGTATGCTAACCCACCACCTGATGCTCCGACCAT
GGCAGTCGTAAGATCATCCTTGCCTCTGATTCCTTTCATTACGTACTCTGTTCCAGTCCA
TGCAGCGAAAGATGCTGAACAGTCCCGAGCACACCTTAGAGCGTACTGAGTTAAGGCTCG
AGGGTTACGCCGGCAGCGGCAGGACATGACCATGACCGTTCCAGCTAGACCGCCAACAGC
AGCTCCGGTGACACCGTCAGTTGCGATGGCGATGATGGCTTCTTTCAGCTTGGTCATTGT
CTGTTCGCCTTTCATTCT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2BN72TF 726 0 0
TTTTTTT
TAAAGAGATGATGAAATCTAGATTGTCACCAAGCACACAAGAAGCTAAGTTGATTTTCAT
CAAGTGGTAGAAGGCTGCTCTTATGGCAGCCAAGATAAGTTTTACAAAGCCTTAAACTAC
TAAACTTTTTTTTTTTTAAACACACTCTTAAACTACTATTTATATAAATCTAAATGGTCC
CTAATTACATGGGCTTCTATGGACTTCTCCAATGACATATAGTCTTGGGCTTGCTGTTGG
GCTTAAAACCTCTTGATATGGATCAAGTATCAGAAGCCTTGCCCCTGGTGGAAAGTTCAC
TTCTTTCTCTGATTGTTTCCTTCACCTTATGAAATGTTTCTCCCGCAACAGCGTAGCAAG
CAGCCAAGGAGAGTGCGGGCTTTACTTTCAAGCCTTGGCTCACAAAAGAGTATGCTAACC
CACCACCTGATGCTCCGACCATGGCAGTCGTAAGATCATCCTTGCCTCTGATTCCTTTCA
TTACGTACTCTGTTCCAGTCCATGCAGCGAAAGATGCTGAGCAGTCCCGAGCACACCTTA
GAGCGTACTGAGTTACGGCTCGAGGGTTACGCCGGCAGCGGCAGGACATGACCATGACCG
TTCCAGCTAGACCGCCAACAGCAGCTCCGGTGACACCGTCAGTTGCGATGGCGATGATGG
CTTCTTTCAGCTTGGTCATTGTCTGTTCGCCTTTCATTCTCTCTTTCTTTCTTCGTCCC

QA 8 726 8 726
DS 



AS 1 3

CO CL2837Contig1 823 3 2 U
GAGCATATAACAGAACACACTAGCTTATTTGGCTGTTCGAAATCTTCCAAAGACAAATAT
TCAAAGACACAAGCTGAAGAGCTAAGTCTGGGGGATACCGAGAGTATATAAGTAACTCCA
TTATTTTACATCATTTAAAGCTCCTCAATCTCAGTTATTAAATACACATAAAAGCTTAAC
CATTCCTTCTACTTCCTCCCGCATCCTTCAGGTTCTTTTGCGTTTCACAGTTTTGGTCGT
TCGAAATGAAGTTAATCACTTCCTTCAGTGTTGCTTTCCTACCTTCTTTGAAGTTCCAAA
GTTCTGGGGTGGTGTATCGACCACTTGCATTGTACTCATTCATCTCCTCGAGAGCTGTTT
TAACAGCGTTATGCACCTCTTCTCCCCACTCTCCTCTAAGCTTCTTCAGCTGCTCATCAT
CTTCGTCTACCACTTCCTTTGCTTTGTCCCCGGTTCCTTCACGTTTGAACGGTTGCCACG
AGGAGTCCTTGAGGTTCTCTTGCCATGTAAAGCAAAGGGTGGCAGCTTCAACCGTAGCTT
CATCTTCCGAAAATCTCTTCTTGCAAACATTCAGGAAGGGCTTCTCATCAAGTTCACCCA
TCCTCTTGACACCGATATCAGTTTCGGCACCCAACAATCCCGTCTGACCCGCAATGAGTT
TCTTCCGTGCTGCTTGTACCTCATCATTGCTTTGACGTTCTTTTGTCATCAGGGCTGAGT
TCATCTGCTCCAGCCCTTCTAACTCAGACTTCTTATCCTCCAGCTCATCGTTCATCTCCT
TCATTTTCTGCTTGACCGCCTCGTCATCATCATCCCCCAAATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H706JQB U 1
AF RR2GK52JQ U 1
AF RR2H706TF C 94
BS 1 708 RR2GK52JQ
BS 709 823 RR2H706TF

RD RR2H706JQB 481 0 0
GAGCATATAACAGAACACACTAGCTTATTTGGCTGTTCGAAATCTTCCAAAGACAAATAT
TCAAAGACACAAGCTGAAGAGCTAAGTCTGGGGGATACCGAGAGTATATAAGTAACTCCA
TTATTTTACATCATTTAAAGCTCCTCAATCTCAGTTATTAAATACACATAAAAGCTTAAC
CATTCCTTCTACTTCCTCCCGCATCCTTCAGGTTCTTTTGCGTTTCACAGTTTTGGTCGT
TCGAAATGAAGTTAATCACTTCCTTCAGTGTTGCTTTCCTACCTTCTTTGAAGTTCCAAA
GTTCTGGGGTGGTGTATCGACCACTTGCATTGTACTCATTCATCTCCTCGAGAGCTGTTT
TAACAGCGTTATGCACCTCTTCTCCCCACTCTCCTCTAAGCTTCTTCAGCTGCTCATCAT
CTTCGTCTACCACTTCCTTTGCTTTGTCCCCGGTTCCTTCACGTTTGAACGGTTGCCACG
A

QA 1 481 1 481
DS 

RD RR2GK52JQ 708 0 0
GAGCATATAACAGAACACACTAGCTTATTTGGCTGTTCGAAATCTTCCAAAGACAAATAT
TCAAAGACACAAGCTGAAGAGCTAAGTCTGGGGGATACCGAGAGTATATAAGTAACTCCA
TTATTTTACATCATTTAAAGCTCCTCAATCTCAGTTATTAAATACACATAAAAGCTTAAC
CATTCCTTCTACTTCCTCCCGCATCCTTCAGGTTCTTTTGCGTTTCACAGTTTTGGTCGT
TCGAAATGAAGTTAATCACTTCCTTCAGTGTTGCTTTCCTACCTTCTTTGAAGTTCCAAA
GTTCTGGGGTGGTGTATCGACCACTTGCATTGTACTCATTCATCTCCTCGAGAGCTGTTT
TAACAGCGTTATGCACCTCTTCTCCCCACTCTCCTCTAAGCTTCTTCAGCTGCTCATCAT
CTTCGTCTACCACTTCCTTTGCTTTGTCCCCGGTTCCTTCACGTTTGAACGGTTGCCACG
AGGAGTCCTTGAGGTTCTCTTGCCATGTAAAGCAAAGGGTGGCAGCTTCAACCGTAGCTT
CATCTTCCGAAAATCTCTTCTTGCAAACATTCAGGAAGGGCTTCTCATCAAGTTCACCCA
TCCTCTTGACACCGATATCAGTTTCGGCACCCAACAATCCCGTCTGACCCGCAATGAGTT
TCTTCCGTGCTGCTTGTACCTCATCATTGCTTTGACGTTCTTTTGTCA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2H706TF 730 0 0
GATACCGAGAGTATATA*GTA*CTCCATTATTTTACATCATTTAAAGCTC*TCAATCTCA
GTTATTAAATACACATAAAAGCTTA*CCATTCTTTCTACTTCCTCCCGCATCTTTCAGGT
TCTTTTGCGTTTCACAGTTTTGGTCGTTCGAAATGAAGTTAATCACTTCCTTCAGTGTTG
CTTTCCTACCTTCTTTGAAGTTCCAAAGTTCTGGGGTGGTGTATCGACCACTTGCATTGT
ACTCATTCATCTCCTCGAGAGCTGTTTTAACAGCGTTATGCACCTCTTCTCCCCACTCTC
CTCTAAGCTTCTTCAGCTGCTCATCATCTTCGTCTACCACTTCCTTTGCTTTGTCCCCGG
TTCCTTCACGTTTGAACGGTTGCCACGAGGAGTCCTTGAGGTTCTCTTGCCATGTAGAGC
AAAGGGTGGCAGCTTCAACCGTAGCTTCATCTTCCGAAAATCTCTTCTTGCAAACATTCA
GGAAGGGCTTCTCATCAAGTTCACCCATCCTCTTGACACCGATATCAGTTTCGGCACCCA
ACAATCCCGTCTGACCCGCAATGAGTTTCTTCCGTGCTGCTTGTACCTCATCATTGCTTT
GACGTTCTTTTGTCATCAGGGCTGAGTTCATCTGCTCCAGCCCTTCTAACTCAGACTTCT
TATCCTCCAGCTCATCGTTCATCTCCTTCATTTTCTGCTTGACCGCCTCGTCATCATCAT
CCCCCAAATC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 4

CO CL2838Contig1 1899 4 6 U
GAGCGTTGATGTCATTGCTGAGGATGACTTGGTTGACTCTTGCAAGCCAGGAGATCGAGT
GGCTATTGTCGGCATTTACAAAGCTCTTCCAGGCAAAAGCAAGGGTAGCGTAAATGGAGT
CTTTAGGACTATCCTCATAGCCAATAATATCTCTCTGCTCAACAAAGAAGCGAATGCACC
TATATACACCCCACGAGACTTACAGGAGATTAAAAAGATTGCAGCAAGAGGTGATGCATT
TGATCTCCTTTCTCGTTCCTTGGCACCTTCTATTTATGGGCACGCTTGGATCAAAAAAGC
AGTAATACTACTGATGCTTGGCGGTATGGAAAAGAACCTCAAGAACGGAACCCGCTTAAG
AGGGGACATCAACATGATGATGGTTGGTGATCCATCTGTTGCCAAATCTCAACTTCTTAG
AGCAATAATGAATATTGCACCATTGGCTATATCAACTACAGGCCGTGGTTCTTCCGGTGT
TGGTTTAACTGCTGCGGTGACTTCTGACCAAGAAACAGGGGAAAGAAGACTGGAAGCTGG
TGCAATGGTCCTCGCTGATAAAGGTATCGTCTGCATTGACGAGTTTGATAAGATGAACGA
TCAGGACCGAGTTGCTATACACGAAGTGATGGAGCAACAGACTGTAACAATCGCCAAAGC
CCGTATCCATGCATCACTAAATGCTAGATGCAGTGTGGTTGCAGCAGCAAATCCCATCTA
CGGAACCTATGACAGATCATTAACTCCAACAAAGAACATTGGACTTCCAGACTCGCTGCT
CTCTCGTTTTGATCTGCTGTTTATCGTGTTGGACCAAATGGATGCTGGTATAGATAGCAT
GATATCAGAACACGTCTTGCGCATGCATCGTTACCAAAACGATAGAGGGGAGGCAGGGCC
AGATGGGAACTTGCCGTATGGGAGAGAGGAAGATGGTGAAAGTGAAGTGTTTGTTAAGTA
TAACCGAATGTTGCATGGGGAAGAAGAAGAAAAGAGGCCAAACAAATGAGAAAACTCTTA
CGATTAAGTTCCTGAAGAAGTACATTCACTATGCCAAACATCGAATTCAGCCAGAGCTTA
CTGATGAAGCATCTGAACGTATTGCAGAAGCATATGCAGATCTCAGAAATGCAGGTTCTG
ATACCAAGACTGGAGGTACGCTTCCAATAACAGCAAGAACTCTAGAGACAATAATCCGTC
TTGCCACCGCACATGCCAAACTGAAGTTGAGCAGAAAGGTTACTAAAGTCGACGCAGAGG
CTGCCTTGAAGCTGATGAACTTTGCAATATATCATCAAGAACTGACAGAGATGGATGAAC
GGGAACAAGAAGAACGTCAAAGGGAACAATCAGAACAAGAAAGAACACCAAGTGGTCACA
GAGGCAATCAAGAGAACGTCTCTGTAAACGTCGAAAGTGAAGCAGCAGATCCGATGGACG
TCGATGAACCTCCCTCGGAGCAATTTAGCGGGACTGTCTTTGCAGCAAGGATTGAATCGT
TTGAGCGAGTGTTCGGGCAGCACATGAGGACAAACAGGCTGGACGACATTTCTATTGCAG
ATATAGAGACAGTAGTCAACAACAATGGTGTTGGAGCTTCTCGTTACTCGGCAGATGAGA
TTATGGCTCTATTAGAGAAACTGCAAGATGATAACAAAGTGATGATCAGCGACGGAAAAG
TCCATATCATTTGATCCTTCATGCAGACATGCACTTAAAGAAGTAGTTTCCTCTTATTAG
AGAACTCAAAAGTAGTGTAGTACTGGGAGAAGAGAAGCTATTGGGGACCAAAGTATCTTT
TCTTTTTAATTCGTCTTTGCATCTATTATTTAAGTAAGAAACACAAATCTATTGCTAGTC
AGTGTCGCTTTCTTCCTAAAGATCTTGTGTACTTGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI08TF U 1
AF RR2B888TF U 554
AF RR2CI08JQ C 1036
AF RR2B888JQ C 1140
BS 1 722 RR2CI08TF
BS 723 1123 RR2B888TF
BS 1124 1297 RR2CI08JQ
BS 1298 1298 RR2B888JQ
BS 1299 1820 RR2CI08JQ
BS 1821 1899 RR2B888JQ

RD RR2CI08TF 735 0 0
GAGCGTTGATGTCATTGCTGAGGATGACTTGGTTGACTCTTGCAAGCCAGGAGATCGAGT
GGCTATTGTCGGCATTTACAAAGCTCTTCCAGGCAAAAGCAAGGGTAGCGTAAATGGAGT
CTTTAGGACTATCCTCATAGCCAATAATATCTCTCTGCTCAACAAAGAAGCGAATGCACC
TATATACACCCCACGAGACTTACAGGAGATTAAAAAGATTGCAGCAAGAGGTGATGCATT
TGATCTCCTTTCTCGTTCCTTGGCACCTTCTATTTATGGGCACGCTTGGATCAAAAAAGC
AGTAATACTACTGATGCTTGGCGGTATGGAAAAGAACCTCAAGAACGGAACCCGCTTAAG
AGGGGACATCAACATGATGATGGTTGGTGATCCATCTGTTGCCAAATCTCAACTTCTTAG
AGCAATAATGAATATTGCACCATTGGCTATATCAACTACAGGCCGTGGTTCTTCCGGTGT
TGGTTTAACTGCTGCGGTGACTTCTGACCAAGAAACAGGGGAAAGAAGACTGGAAGCTGG
TGCAATGGTCCTCGCTGATAAAGGTATCGTCTGCATTGACGAGTTTGATAAGATGAACGA
TCAGGACCGAGTTGCTATACACGAAGTGATGGAGCAACAGACTGTAACAATCGCCAAAGC
CCGTATCCATGCATCACTAAATGCTAGATGCAGTGTGGTTGCAGCAGCAAATCCCATCTA
CG
AACTATGACAGAT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2B888TF 570 0 0
GCTGATAAAGGTATCGTCTGCATTGACGAGTTTGATAAGATGAACGATCAGGACCGAGTT
GCTATACACGAAGTGATGGAGCAACAGACTGTAACAATCGCCAAAGCCGGTATCCATGCA
TCACTAAATGCTAGATGCAGTGTGGTTGCAGCAGCAAATCCCATCTACGGAACCTATGAC
AGATCATTAACTCCAACAAAGAACATTGGACTTCCAGACTCGCTGCTCTCTCGTTTTGAT
CTGCTGTTTATCGTGTTGGACCAAATGGATGCTGGTATAGATAGCATGATATCAGAACAC
GTCTTGCGCATGCATCGTTACCAAAACGATAGAGGGGAGGCAGGGCCAGATGGGAACTTG
CCGTATGGGAGAGAGGAAGATGGTGAAAGTGAAGTGTTTGTTAAGTATAACCGAATGTTG
CATGGGGAAGAAGAAGAAAAGAGGCCAAACAAATGAGAAAACTCTTACGATTAAGTTCCT
GAAGAAGTACATTCACTATGCCAAACATCGAATTCAGCCAGAGCTTACTGATGAAGCATC
TGAACGTATTGCAGAAGCATATGCAGATCT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2CI08JQ 785 0 0
AGAAGTACATTCACTATGCCAAACATCGAATTCAGCCAGAGCTTACTGATGAAGCATCTG
AACGTATTGCAGAAGCATATGCAGATCTCAGAAATGCAGGTTCTGATACCAAGACTGGAG
GTACGCTTCCAATAACAGCAAGAACTCTAGAGACAATAATCCGTCTTGCCACCGCACATG
CCAAACTGAAGTTGAGCAGAAAGGTTACTAAAGTCGACGCAGAGGCTGCCTTGAAGCTGA
TGAACTTTGCAATATATCATCATGAACTGACAGAGATGGATGAACGGGAACAAGAAGAAC
GTCAAAGGGAACAATCAGAACAAGAAAGAACACCAAGTGGTCACAGAGGCAATCAAGAGA
ACGTCTCTGTAAACGTCGAAAGTGAAGCAGCAGATCCGATGGACGTCGATGAACCTCCCT
CGGAGCAATTTAGCGGGACTGTCTTTGCAGCAAGGATTGAATCGTTTGAGCGAGTGTTCG
GGCAGCACATGAGGACAAACAGGCTGGACGACATTTCTATTGCAGATATAGAGACAGTAG
TCAACAACAATGGTGTTGGAGCTTCTCGTTACTCGGCAGATGAGATTATGGCTCTATTAG
AGAAACTGCAAGATGATAACAAAGTGATGATCAGCGACGGAAAAGTCCATATCATTTGAT
CCTTCATGCAGACATGCACTTAAAGAAGTAGTTTCCTCTTATTAGAGAACTCAAAAGTAG
TGTAGTACTGGGAGAAGAGAAGCTATTGGGGACCAAAGTATCTTTTCTTTTTAATTCGTC
TTTGC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2B888JQ 760 0 0
GATACCAAGACTGGAGGTACGCTTCCAATAACAGCAAGAACTCTAGAGACAATAATCCGT
CTTGCCACCGCGCATGCCAAACTGAAGTTGAGCAGAAAGGTTACTAAAGTCGACGCAGAG
GCTGCCTTGAAGCTGATGAACTTTGCAATATATCATCAAGAACTGACAGAGATGGATGAA
CGGGAGCAAGAAGAACGTCAAAGGGAACAATCAGAACAAGAAAGAACACCAAGTGGTCAC
AGAGGCAATCAAGAGAATGTCTCTGTAAACGTCGAAAGTGAAGCAGCAGATCCGATGGAC
GTCGATGAACCTCCCTCGGAGCAATTTAGCGGGACTGTCTTTGCAGCAAGGATTGAATCG
TTTGAGCGAGTGTTCGGGCAGCACATGAGGACAAACAGGCTGGACGACATTTCTATTGCA
GATATAGAGACAGTAGTCAACAACAATGGTGTTGGAGCTTCTCGTTACTCGGCAGATGAG
ATTATGGCTCTATTAGAGAAACTGCAAGATGATAACAAAGTGATGATCAGCGACGGAAAA
GTCCATATCATTTGATCCTTCATGCAGACATGCACTTAAAGAAGTAGTTTCCTCTTATTA
GAGAACTCAAAAGTAGTGTAGTACTGGGAGAAGAGAAGCTATTGGGGACCAAAGTATCTT
TTCTTTTTAATTCGTCTTTGCATCTATTATTTAAGTAAGAAACACAAATCTATTGCTAGT
CAGTGTCGCTTTCTTCCTAAAGATCTTGTGTACTTGAACC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 4

CO CL2839Contig1 1237 4 9 U
CGGGATATGCTAAACATGATTAAGAAAATGGGAGGTGGAAGATAGACATGATGTTTGTTA
ATGTGGAGAAGACTCAAAGACGAAAGCGCTCTTCATGTTCGTCTGCTCTCAGACACAAAA
CAACAGACAGACCTAAAGTTAACTTAAACGCCACGGAAAAAGTCTATACAACTGAATCTG
CCACCATAACTTTGTCTTCATCATTTCTCTCTTTTTTCCCCATCTGTCTTAGTTTTGGAA
CGTACCATACAGACACACCATCACAACCACGACGACACAGACAAGAAAACTCTAACTTAG
ACTAAAAATATGCACCAAAGAGAGCTTCCAAGTTTGTAACTTGCTATCCCTTGTGGCTTT
CACCCCTGAGAACCTCGCGATTATCTTTTCCTGCGCTTTGGTTCCACCTTAACATCATCA
GCTGGAGATGCGGTAAACCCGTTCTGTGATTTCTTGACATTGTCATCAGAACTGCATTCA
GCACATGCGAAGTGATCAAGCAGCTTTGCTTCTTCAATCGTCATGCCAACACATGCAGGA
TGATACCAGTCTTTGCAGCCTTCACATTGCACCATGAGATCGTCTGGATTATAAGGCATC
TCACATTTGCAGTACACAGCAACACGGTCAGGGGTAAACGCGCCAGTAGCAGCCTTGTAC
TCAAACCTACAATAATAATCCTCTGCCCCAACGTTCTCAAGCCTAGTGTAGCTCTTGAAG
GTGTGAACAATGCATTTCCCCTCAATGGTGTGTGCGCTTTGAACATCGAAATGGTCAGAC
AGGAAAAGCTCTTTAGCTCCGTGGAACTGTCTCCTACCACCAAGAGACTCCTCAGGGCGG
TAATACCACCGACAGTGCACCTTCACATTGTTCCTAGCATCCGCTTCGATCTTCTCAACA
CGGGCCACGTATGGTGGCTTACCAGCATCTGATGGGCGCATCAACACATAGTCTCCAGCT
CTCACAACTTTGTTGGTGCCTTTAATGGTATACATGTCGAGCTCCTTCCTCCCTGTTTTG
ATCTTTGAGGGCACACCTGGTCGAGTTTTCGCCATGGGTTAGTGCTTAGCTCGAATAAAG
GTGGGGGCTTTTCTGTGTTTGTCTCTGTTACCTTGCAAATGTATAGAGATTGATGGGTTG
TGAAGATCTAAGGATGTGCAGATGAAGAAGGAGACGAGGATGGAGTTTCAGAGGGAGATG
AAGAGTAAATCTGGAACCCTAGATTCTCTCTAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2CG02JQ U 1
AF RR2A730JQ U 130
AF RR2A730TF C 374
AF RR2CG02TF C 550
BS 1 289 RR2CG02JQ
BS 290 290 RR2A730JQ
BS 291 330 RR2CG02JQ
BS 331 331 RR2A730JQ
BS 332 460 RR2CG02JQ
BS 461 461 RR2A730JQ
BS 462 766 RR2CG02JQ
BS 767 980 RR2A730JQ
BS 981 1237 RR2A730TF

RD RR2CG02JQ 766 0 0
CGGGATATGCTAAACATGATTAAGAAAATGGGAGGTGGAAGATAGACATGATGTTTGTTA
ATGTGGAGAAGACTCAAAGACGAAAGCGCTCTTCATGTTCGTCTGCTCTCAGACACAAAA
CAACAGACAGACCTAAAGTTAACTTAAACGCCACGGAAAAAGTCTATACAACTGAATCTG
CCACCATAACTTTGTCTTCATCATTTCTCTCTTTTTTCCCCATCTGTCTTAGTTTTGGAA
CGTACCATACAGACACACCATCACAACCACGACGACACAGACAAGAAAATTCTAACTTAG
ACTAAAAATATGCACCAAAGAGAGCTTCCAGGTTTGTAACTTGCTATCCCTTGTGGCTTT
CACCCCTGAGAACCTCGCGATTATCTTTTCCTGCGCTTTGGTTCCACCTTAACATCATCA
GCTGGAGATGCGGTAAACCCGTTCTGTGATTTCTTGACATCGTCATCAGAACTGCATTCA
GCACATGCGAAGTGATCAAGCAGCTTTGCTTCTTCAATCGTCATGCCAACACATGCAGGA
TGATACCAGTCTTTGCAGCCTTCACATTGCACCATGAGATCGTCTGGATTATAAGGCATC
TCACATTTGCAGTACACAGCAACACGGTCAGGGGTAAACGCGCCAGTAGCAGCCTTGTAC
TCAAACCTACAATAATAATCCTCTGCCCCAACGTTCTCAAGCCTAGTGTAGCTCTTGAAG
GTGTGAACAATGCATTTCCCCTCAATGGTGTGTGCGCTTTGAACAT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2A730JQ 851 0 0
GG
CCTAAAGTTAACTTAAACGCCACGGAAAAAGTCTATACAACTGAATCTGCCACCATAACT
TTGTCTTCATCATTTCTCTCTTTTTTCCCCATCTGTCTTAGTTTTGGAACGTACCATACA
GACACACCATCACAACCACGACGACACAGACAAGAAAACTCTAACTTAGACTAAAAATAT
GCACCAAAGAGAGCTTCCAAGTTTGTAACTTGCTATCCCTTGTGGCTTTCACCCCTGAGA
ACCTCGCGATTATCTTTTCCTGCGCTTTGGTTCCACCTTAACATCATCAGCTGGAGATGC
GGTAAACCCGTTCTGTGATTTCTTGACATTGTCATCAGAACTGCATTCAGCACATGCGAA
GTGATCAAGCAGCTTTGCTTCTTCAATCGTCATGCCAACACATGCAGGATGATACCAGTC
TTTGCAGCCTTCACATTGCACCATGAGATCGTCTGGATTATAAGGCATCTCACATTTGCA
GTACACAGCAACACGGTCAGGGGTAAACGCGCCAGTAGCAGCCTTGTACTCAAACCTACA
ATAATAATCCTCTGCCCCAACGTTCTCAAGCCTAGTGTAGCTCTTGAAGGTGTGAACAAT
GCATTTCCCCTCAATGGTGTGTGCGCTTTGAACATCGAAATGGTCAGACAGGAAAAGCTC
TTTAGCTCCGTGGAACTGTCTCCTACCACCAAGAGACTCCTCAGGGCGGTAATACCACCG
ACAGTGCACCTTCACATTGTTCCTAGCATCCGCTTCGATCTTCTCAACACGGGCCACGTA
TGGTGGCTTACCAGCATCTGATGGGCGCATCAACACATAGTCTCCAGCTCTCACAACTTT
GTTGGTGCC

QA 3 851 3 851
DS 

RD RR2A730TF 864 0 0
GAACTCGCGATATCTTT
CTGCGCTTTGGTTCCAC*TTAACATCATCAGCTGGAGATGCGGTAAACCCGTTCTGTGAT
TTCTTGACATTGTCATCAGAACTGCATTCAGCACATGCGAAGTGATCAAGCAGCTTTGCT
TCTTCAATCGTCATGCCAACACATGCAGGATGATACCAGTCTTTGCAGCTTTCACATTGC
ACCATGAGATCGTCTGGATTATAAGGCATCTCACATTTGCAGTACACAGCAACACGGTCA
GGGGTAAACGCGCCAGTAGCAGCCTTGTACTCAAACCTACAATAATAATCCTCTGCCCCA
ACGTTCTCAAGCCTAGTGTAGCTCTTGAAGGTGTGAACAATGCATTTCCCCTCAATGGTG
TGTGCGCTTTGAACATCGAAATGGTCAGACAGGAAAAGCTCTTTAGCTCCGTGGAACTGT
CTCCTACCACCAAGAGACTCCTCAGGGCGGTAATACCACCGACAGTGCACCTTCACATTG
TTCCTAGCATCCGCTTCGATCTTCTCAACACGGGCCACGTATGGTGGCTTACCAGCATCT
GATGGGCGCATCAACACATAGTCTCCAGCTCTCACAACTTTGTTGGTGCCTTTAATGGTA
TACATGTCGAGCTCCTTCCTCCCTGTTTTGATCTTTGAGGGCACACCTGGTCGAGTTTTC
GCCATGGGTTAGTGCTTAGCTCGAATAAAGGTGGGGGCTTTTCTGTGTTTGTCTCTGTTA
CCTTGCAAATGTATAGAGATTGATGGGTTGTGAAGATCTAAGGATGTGCAGATGAAGAAG
GAGACGAGGATGGAGTTTCAGAGGGAGATGAAGAGTAAATCTGGAACCCTAGATTCTCTC
TAGATCC

QA 18 864 18 864
DS 

RD RR2CG02TF 688 0 0
GTCTTTGCAGCC
TCACATTGCACCATGAGATCGTCTGGATTATAAGGCATCTCACATTTGCAGTACACAGCA
ACACGGTCAGGGGTAAACGCGCCAGTAGCAGCCTTGTACTCAAACCTACAATAATAATCC
TCTGCCCCAACGTTCTCAAGCCTAGTGTAGCTCTTGAAGGTGTGAACAATGCATTTCCCC
TCAATGGTGTGTGCGCTTTGAACATCGAAATGGTCAGACAGGAAAAGCTCTTTAGCTCCG
TGGAACTGTCTCCTACCACCAAGAGACTCCTCAGGGCGGTAATACCACCGACAGTGCACC
TTCACATTGTTCCTAGCATCCGCTTCGATCTTCTCAACACGGGCCACGTATGGTGGCTTA
CCAGCATCTGATGGGCGCATCAACACATAGTCTCCAGCTCTCACAACTTTGTTGGTGCCT
TTAATGGTATACATGTCGAGCTCCTTCCTCCCTGTTTTGATCTTTGAGGGCACACCTGGT
CGAGTTTTCGCCATGGGTTAGTGCTTAGCTCGAATAAAGGTGGGGGCTTTTCTGTGTTTG
TCTCTGTTACCTTGCAAATGTATAGAGATTGATGGGTTGTGAAGATCTAAGGATGTGCAG
ATGAAGAAGGAGACGAGGATGGAGTTTCAGAGGGAGATGAAGAGTAAATCTGGAACCCTA
GATTCTCTCTAGATCC

QA 13 688 13 688
DS 



AS 1 4

CO CL2840Contig1 909 4 15 U
GGAATCTATATATCATCAAAAGTCCCTGACACCATATATAGTACAGTTATACTTATCGTC
AATTCTCTCTGTCTAGGTAAATGGGTATATTTCCTGGATCTGGTGCCTGGATCAGTGAGA
ACACTCCACAGCCACGAAAATCTCAAAATGTTGAATCCAAGAAAGTGAGAGAGATGAAAA
GTCACGAGGATAGAGATGACACAAAGGAGCAATTGAAACTATGGAGAGAAGCAGAAAAGA
AAAAACAATGGCGTGAACCTTCCCCTAAAGTGACGAAGATGGAAGTAGTGAATGAATTAG
AATGGGGCTATTGCCATATGAAAATGGATTTCGAACTAGGATTGCCACCTCAGACAGCTA
AAGAAATGTTAACTAATCCAAACAATCGATCATTCACCAGAATTACCAAACACCACGAGA
ATGGGAAGTCGAGAACGACTGACAAAGTTTTGGCATGGAAGTTCCTTAGGTGGTCGCGAA
CTATCCCGATAGGTGTTCGTGTACCTAAAATCGCAGACCGAAAATCAATTGTTGTACGTT
ATGACATAGAGAAAAAAGACATGATGAGGTTCATGGAAATGTTTGAGGTTAGCTGTACAC
TGGAGCCAATGTATGTAGATTCAAAACGCTTGTGCAAGAACATGCAGCCGAAGAGGCGAG
AAGAATACAAAAAATGTAGTGGTGGACAAGGAAAGATTGCGTCAAAGGTGGAACTGG*AA
ATGGTTTTTAAGCCTTCATTTTTTTTCAATGTGCCTCC*GGTTTCTTGGTACATTCGCTG
GCTTACTAAAGTTGATAAAATAATCGTGGTTCTGTTTGTTTTGGTTTAATTAATTCCATT
CAATTGTTGTTTGTATGGATAGTTATTGTTTCATCTTTGAAATTGGAAGTATAACACTAA
TGACAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD84TF U 36
AF RR2B692TF U 1
AF RR2B692JQ C 79
AF RR2AD84JQ C 186
BS 1 268 RR2B692TF
BS 269 269 RR2AD84TF
BS 270 405 RR2B692TF
BS 406 406 RR2AD84TF
BS 407 437 RR2B692TF
BS 438 438 RR2AD84TF
BS 439 687 RR2B692TF
BS 688 688 RR2AD84TF
BS 689 717 RR2B692TF
BS 718 718 RR2AD84TF
BS 719 758 RR2B692TF
BS 759 759 RR2B692JQ
BS 760 822 RR2B692TF
BS 823 864 RR2B692JQ
BS 865 909 RR2AD84JQ

RD RR2AD84TF 721 0 0
GG
ATAGTACAGTTATACTTATCGTCAATTCTCTCTGTCTAGGTAAATGGGTATATTTCCTGG
ATCTGGTGCCTGGATCAGTGAGAACACTCAACAGCCACGAAAATCTCAAAATGTTGAATC
CAAGAAAGTGAGAGAGATGAAAAGTCACGAGGATAGAGATGACACAAAGGAGCAATTGAA
ACTATGGAGAGAAGCAGAAAAGAAAAAACAATGGCGTGAACCTTCCCCTAAAGTGACGAA
GATGGAAGTAGTGAATGAATTAGAATGGGGCTATTGCCATATGAAAATGGATTTCGAACT
AGGATTGCCACCTCAGACAGCTAAAGAAATGTTAACTAATCCAAACAATCGATCATTCAC
CAGAATTACCAAACACCACGAGAATGGGAAGTCGAGAACGACTGACAAAGTTTTGGCATG
GAAGTTCCTTAGGTGGTCGCGAACTATCCCGATAGGTGTTCGTGTACCTAAAATCGCAGA
CCGAAAATCAATTGTTGTACGTTATGACATAGAGAAAAAAGACATGATGAGGTTCATGGA
AATGTTTGAGGTTAGCTGTACACTGGAGCCAATGTATGTAGATTCAAAACGCTTGTGCAA
GAACATGCAGCCGAAGAGGCGAGAAGAATACAAAAAATGTAGTGGTGGACAAGGAAAGAT
TGCGTCAAAGGTGGAACTGG*AAATGGTTTTTAAGCCTTCATTTTTTTTCAATGTGCCT

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR2B692TF 822 0 0
GGAATCTATATATCATCAAAAGTCCCTGACACCATATATAGTACAGTTATACTTATCGTC
AATTCTCTCTGTCTAGGTAAATGGGTATATTTCCTGGATCTGGTGCCTGGATCAGTGAGA
ACACTCCACAGCCACGAAAATCTCAAAATGTTGAATCCAAGAAAGTGAGAGAGATGAAAA
GTCACGAGGATAGAGATGACACAAAGGAGCAATTGAAACTATGGAGAGAAGCAGAAAAGA
AAAAACAATGGCGTGAACCTTCCCCTAAGGTGACGAAGATGGAAGTAGTGAATGAATTAG
AATGGGGCTATTGCCATATGAAAATGGATTTCGAACTAGGATTGCCACCTCAGACAGCTA
AAGAAATGTTAACTAATCCAAACAATCGATCATTCACCAGAATTATCAAACACCACGAGA
ATGGGAAGTCGAGAACGGCTGACAAAGTTTTGGCATGGAAGTTCCTTAGGTGGTCGCGAA
CTATCCCGATAGGTGTTCGTGTACCTAAAATCGCAGACCGAAAATCAATTGTTGTACGTT
ATGACATAGAGAAAAAAGACATGATGAGGTTCATGGAAATGTTTGAGGTTAGCTGTACAC
TGGAGCCAATGTATGTAGATTCAAAACGCTTGTGCAAGAACATGCAGCCGAAGAGGCGAG
AAGAATACAAAAAATGTAGTGGTGGACGAGGAAAGATTGCGTCAAAGGTGGAACTGGGAA
ATGGTTTTTAAGCCTTCATTTTTTTTCAATGTGCCTCCCGGTTTCTTGGTACATTCGCTG
GCTTACTAAAGTTGATAAAATAATCGTGGTTCTGTTTGTTTT

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR2B692JQ 786 0 0
AAATGGGTATATTTCCTGGATCTGGTGCCTGGATCAGTGAGAACACTCCACAGCCACGAA
AATCTCAAAATGTTGAATCCAAGAAAGTGAGAGAGATGAAAAGTCACGAGGATAGAGATG
ACACAAAGGAGCAATTGAAACTATGGAGAGAAGCAGAAAAGAAAAAACAATGGCGTGAAC
CTTCCCCTAAGGTGACGAAGATGGAAGTAGTGAATGAATTAGAATGGGGCTATTGCCATA
TGAAAATGGATTTCGAACTAGGATTGCCACCTCAGACAGCTAAAGAAATGTTAACTAATC
CAAACAATCGATCATTCACCAGAATTATCAAACACCACGAGAATGGGAAGTCGAGAACGG
CTGACAAAGTTTTGGCATGGAAGTTCCTTAGGTGGTCGCGAACTATCCCGATAGGTGTTC
GTGTACCTAAAATCGCAGACCGAAAATCAATTGTTGTACGTTATGACATAGAGAAAAAAG
ACATGATGAGGTTCATGGAAATGTTTGAGGTTAGCTGTACACTGGAGCCAATGTATGTAG
ATTCAAAACGCTTGTGCAAGAACATGCAGCCGAAGAGGCGAGAAGAATACAAAAAATGTA
GTGGTGGACGAGGAAAGATTGCGTCAAAGGTGGAACTGG*AAATGGTTTTTAAGCCTTCA
TTTTTTTTCAATGTGCCTCC*GGTTTCTTGGTACATTCGCTGGCTTACTAAAGTTGATAA
AATAATCGTGGTTCTGTTTGTTTTGGTTTAATTAATTCCATTCAATTGTTGTTTGTATGG
ATAGTT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2AD84JQ 724 0 0
GAGGATAGAGATGACACAAAGGAGCAATTGAAACTATGGAGAGAAGCAGAAAAGAAAAAA
CAATGGCGTGAACCTTCCCCTAAAGTGACGAAGATGGAAGTAGTGAATGAATTAGAATGG
GGCTATTGCCATATGAAAATGGATTTCGAACTAGGATTGCCACCTCAGACAGCTAAAGAA
ATGTTAACTAATCCAAACAATCGATCATTCACCAGAATTACCAAACACCACGAGAATGGG
AAGTCGAGAACGACTGACAAAGTTTTGGCATGGAAGTTCCTTAGGTGGTCGCGAACTATC
CCGATAGGTGTTCGTGTACCTAAAATCGCAGACCGAAAATCAATTGTTGTACGTTATGAC
ATAGAGAAAAAAGACATGATGAGGTTCATGGAAATGTTTGAGGTTAGCTGTACACTGGAG
CCAATGTATGTAGATTCAAAACGCTTGTGCAAGAACATGCAGCCGAAGAGGCGAGAAGAA
TACAAAAAATGTAGTGGTGGACAAGGAAAGATTGCGTCAAAGGTGGAACTGG*AAATGGT
TTTTAAGCCTTCATTTTTTTTCAATGTGCCTCC*GGTTTCTTGGTACATTCGCTGGCTTA
CTAAAGTTGATAAAATAATCGTGGTTCTGTTTGTTTTGGTTTAATTAATTCCATTCAATT
GTTGTTTGTATGGATAGTTATTGTTTCATCTTTGAAATTGGAAGTATAACACTAATGACA
AATC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 4

CO CL2841Contig1 1019 4 9 U
GTGTCATGTTGTAAGCCACATGAATCAGTTCTTTTTGTTGTACATGTTTGAAAGTTCAAC
CGTAGAGAGATAAATCCGGAACAGAGCGTGACTGATTGATGCCTGCAGTTAATGTTGTTA
GTTCAGGTGAGTCCCACGTGGATATTTCAATAAGACACAAAGCATTTATACGTATCCATT
AAACTCTGATCAGAAAACAAACAAACACAGGAGGATGAAGATCTTCTTCATCTTTTTCTT
TGTTTTATTCTCCTTCCTTGTCCATTCTTGTTTGTCCAATAACATGATCATGAGAACACA
GTCCATGAGAGATGGTGATGTTATATACTCTGAAGGAAAGAGATTCGCTTTTGGATTCTT
CAGCCTGGGGGCTTCAAAGCTCAGGTACGTTGGGATTTGGTATGCTCAAGTCTCTGAGCA
GACTGTTGTATGGGTTGCAAACAGAGACCATCCTATTAATGACACATCTGGTGTGATAAG
GTTCAGCAGCAGAAGGAATCTCTGCATCTATACATCAGTCAACGGAACAGAACCTATCTG
GTCCACTGATGTTTTGGATACCATCTCAGAACCGGCTTTAGTTGCGAAGCTATCTGATCT
AGGCAACCTTGTTCTGCTTGATCCTGTGATAAGATCATAACCATAAATCATAACCAAAGT
AAACCAAGAGTGACGTGGTCTGAGATGTGTCTCCTATATTCTGGGATTGTTTCCCACTTC
TTCACGTTCCCTATTTATTTAGTAGGCAGTTATCAGTTGTACTTTCTATTGTATTTAAGA
GATTATTGTCTTATGAAAAGTTATGAAAGAAAAATTGCAGTAAACTTTGTGTTCTTGTTC
TCTTAAGTCTTTGGGACCTATTATTTGGTATCAGAGCAAATTTTCTTAGCTTTGAAGAGG
GGTCTTCACCGGCATCAAAGCACATTTTCGTTTTTGATCCGGACCACTTTGTGGTATCAA
AAACTCCTATCCTTGTTTTGATTTGAACCACAATTTGTGGTATCAAAATTTCTTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H183TF U 1
AF RR2EE81TF U 186
AF RR2EE81JQ C 190
AF RR2H183JQ C 416
BS 1 206 RR2H183TF
BS 207 207 RR2EE81TF
BS 208 493 RR2H183TF
BS 494 494 RR2EE81TF
BS 495 602 RR2H183TF
BS 603 603 RR2EE81TF
BS 604 714 RR2H183TF
BS 715 865 RR2EE81TF
BS 866 1019 RR2H183JQ

RD RR2H183TF 714 0 0
GTGTCATGTTGTAAGCCACATGAATCAGTTCTTTTTGTTGTACATGTTTGAAAGTTCAAC
CGTAGAGAGATAAATCCGGAACAGAGCGTGACTGATTGATGCCTGCAGTTAATGTTGTTA
GTTCAGGTGAGTCCCACGTGGATATTTCAATAAGACACAAAGCATTTATACGTATCCATT
AAACTCTGATCAGAAAACAAACAAACTCAGGAGGATGAAGATCTTCTTCATCTTTTTCTT
TGTTTTATTCTCCTTCCTTGTCCATTCTTGTTTGTCCAATAACATGATCATGAGAACACA
GTCCATGAGAGATGGTGATGTTATATACTCTGAAGGAAAGAGATTCGCTTTTGGATTCTT
CAGCCTGGGGGCTTCAAAGCTCAGGTACGTTGGGATTTGGTATGCTCAAGTCTCTGAGCA
GACTGTTGTATGGGTTGCAAACAGAGACCATCCTATTAATGACACATCTGGTGTGATAAG
GTTCAGCAGCAGAGGGAATCTCTGCATCTATACATCAGTCAACGGAACAGAACCTATCTG
GTCCACTGATGTTTTGGATACCATCTCAGAACCGGCTTTAGTTGCGAAGCTATCTGATCT
AG*CAACCTTGTTCTGCTTGATCCTGTGATAAGATCATAACCATAAATCATAACCAAAGT
AAACCAAGAGTGACGTGGTCTGAGATGTGTCTCCTATATTCTGGGATTGTTTCC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2EE81TF 682 0 0
GGGA
TCAGAAAACAAACAAACACAGGAGGATGAAGATCTTCTTCATCTTTTTCTTTGTTTTATT
CTCCTTCCTTGTCCATTCTTGTTTGTCCAATAACATGATCATGAGAACACAGTCCATGAG
AGATGGTGATGTTATATACTCTGAAGGAAAGAGATTCGCTTTTGGATTCTTCAGCCTGGG
GGCTTCAAAGCTCAGGTACGTTGGGATTTGGTATGCTCAAGTCTCTGAGCAGACTGTTGT
ATGGGTTGCAAACAGAGACCATCCTATTAATGACACATCTGGTGTGATAAGGTTCAGCAG
CAGAAGGAATCTCTGCATCTATACATCAGTCAACGGATCAGAACCTATCTGGTCCACTGA
TGTTTTGGATACCATCTCAGAACCGGCTTTAGTTGCGAAGCTATCTGATCTAGGCAACCT
TGTTCTGCTTGATCCTGTGATAAGATCATAACCATAAATCATAACCAAAGTAAACCAAGA
GTGACGTGGTCTGAGATGTGTCTCCTATATTCTGGGATTGTTTCCCACTTCTTCACGTTC
CCTATTTATTTAGTAGGCAGTTATCAGTTGTACTTTCTATTGTATTTAAGAGATTATTGT
CTTATGAAAAGTTATGAAAGAAAAATTGCAGTAAACTTTGTGTTCTTGTTCTCTTAAGTC
TTTGGGACCTATTATT
AA

QA 5 680 5 680
DS 

RD RR2EE81JQ 676 0 0
TCAGAAAACAAACAAACACAGGAGGATGAAGATCTTCTTCATCTTTTTCTTTGTTTTATT
CTCCTTCCTTGTCCATTCTTGTTTGTCCAATAACATGATCATGAGAACACAGTCCATGAG
AGATGGTGATGTTATATACTCTGAAGGAAAGAGATTCGCTTTTGGATTCTTCAGCCTGGG
GGCTTCAAAGCTCAGGTACGTTGGGATTTGGTATGCTCAAGTCTCTGAGCAGACTGTTGT
ATGGGTTGCAAACAGAGACCATCCTATTAATGACACATCTGGTGTGATAAGGTTCAGCAG
CAGAAGGAATCTCTGCATCTATACATCAGTCAACGGATCAGAACCTATCTGGTCCACTGA
TGTTTTGGATACCATCTCAGAACCGGCTTTAGTTGCGAAGCTATCTGATCTAGGCAACCT
TGTTCTGCTTGATCCTGTGATAAGATCATAACCATAAATCATAACCAAAGTAAACCAAGA
GTGACGTGGTCTGAGATGTGTCTCCTATATTCTGGGATTGTTTCCCACTTCTTCACGTTC
CCTATTTATTTAGTAGGCAGTTATCAGTTGTACTTTCTATTGTATTTAAGAGATTATTGT
CTTATGAAAAGTTATGAAAGAAAAATTGCAGTAAACTTTGTGTTCTTGTTCTCTTAAGTC
TTTGGGACCTATTATT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2H183JQ 604 0 0
GAGCAGACTGTTGTATGGGTTGCAAACAGAGACCATCCTATTAATGACACATCTGGTGTG
ATAAGGTTCAGCAGCAGAGGGAATCTCTGCATCTATACATCAGTCAACGGAACAGAACCT
ATCTGGTCCACTGATGTTTTGGATACCATCTCAGAACCGGCTTTAGTTGGGAAGCTATCT
GATCTAGGCAACCTTGTTCTGCTTGATCCTGTGATAAGATCATAACCATAAATCATAACC
AAAGTAAACCAAGAGTGACGTGGTCTGAGATGTGTCTCCTATATTCTGGGATTGTTTCCC
ACTTCTTCACGTTCCCTATTTATTTAGTAGGCAGTTATCAGTTGTACTTTCTATTGTATT
TAAGAGATTATTGTCTTATGAAAAGTTATGAAAGAAAAATTGCAGTAAACTTTGTGTTCT
TGTTCTCTTAAGTCTTTGGGACCTATTATTTGGTATCAGAGCAAATTTTCTTAGCTTTGA
AGAGGGGTCTTCACCGGCATCAAAGCACATTTTCGTTTTTGATCCGGACCACTTTGTGGT
ATCAAAAACTCCTATCCTTGTTTTGATTTGAACCACAATTTGTGGTATCAAAATTTCTTT
ATAC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 3

CO CL2842Contig1 829 3 8 U
AATTAACAAAGCTTAATATAATTATTTTAACTTAAAGGACAAGGAAAATGCAACCGATAC
ATTTTTATTTGTAACAAAAAGGTTTATTTAAACAATACAACAACATTGGATGAAGGAAAC
AAGAAAATACAAAAAACACAATAATTTCTTTAGGCCATCATAAACACTAAAATTTATAAA
AAACCCCCAACAACTTTGTTTTGGTTTGATATTTGTTTTTAGTGTTTAGGACCGTTACAC
CTTAACAAAGAACACACTTTGGCAGCATCTTAAGCTTTAACTCCAGTCTTCTTGTTTGGC
TCAAACACAAACTTGATCAGAGATTCTTTGATAGACAACATCTCAGGGAACTCAGTCTTC
AACTTAGTAGCATCGAGCTCGTTGTTACTCCTTGGAGCCACAATCACTTTAGCTTGTTCC
TCCAACGTGAAGTTCTTCCAGGTGAAGCTCGGGTCAATGTACTCTCTGTACATCTCCAAG
ATCTCGTTGTGGCTCACGACACCCGGGTTTGTGAAGTTGTAGATCCCGGTTAAGTTCCTC
TTTGCCATCTCGAT****ATGGGAAGGAGCTCGTCGAGGATGGTCATGGAGTTTGGGATG
TCAACGACTTTCTCGTACCGAGCAATCTTGGTGATGAAGTTTCTTGGGTTTGATAGATCC
GAAGAGATGGGCATCCGCACTCTTAGTGTGCATACGTTTTCATAGTTCTTGAGCAACTCC
TCCACCATAGCTTTGGTCTTGGAGTAGAAAGACCCGGTGAAGTTAGGAGTATCCTCCTCC
TCGAATCCGACACCCGACCCGGGAGTATGACCCGCATCGTACTCGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ73JQB U 1
AF RR2F617JQ U 71
AF RR2F617TF C 245
BS 1 554 RR2GJ73JQB
BS 555 558 RR2F617JQ
BS 559 781 RR2GJ73JQB
BS 782 782 RR2F617JQ
BS 783 801 RR2GJ73JQB
BS 802 802 RR2F617JQ
BS 803 816 RR2GJ73JQB
BS 817 829 RR2F617TF

RD RR2GJ73JQB 824 0 0
AATTAACAAAGCTTAATATAATTATTTTAACTTAAAGGACAAGGAAAATGCAACCGATAC
ATTTTTATTTGTAACAAAAAGGTTTATTTAAACAATACAACAACATTGGATGAAGGAAAC
AAGAAAATACAAAAAACACAATAATTTCTTTAGGCCATCATAAACACTAAAATTTATAAA
AAACCCCCAACAACTTTGTTTTGGTTTGATATTTGTTTTTAGTGTTTAGGACCGTTACAC
CTTAACAAAGAACACACTTTGGCAGCATCTTAAGCTTTAACTCCAGTCTTCTTGTTTGGC
TCAAACACAAACTTGATCAGAGATTCTTTGATAGACAACATCTCAGGGAACTCAGTCTTC
AACTTAGTAGCATCGAGCTCGTTGTTACTCCTTGGAGCCACAATCACTTTAGCTTGTTCC
TCCAACGTGAAGTTCTTCCAGGTGAAGCTCGGGTCAATGTACTCTCTGTACATCTCCAAG
ATCTCGTTGTGGCTCACGACACCCGGGTTTGTGAAGTTGTAGATCCCGGTTAAGTTCCTC
TTTGCCATCTCGATCGATATGGGAAGGAGCTCGTCGAGGATGGTCATGGAGTTTGGGATG
TCAACGACTTTCTCGTACCGAGCAATCTTGGTGATGAAGTTTCTTGGGTTTGATAGATCC
GAAGAGATGGGCATCCGCACTCTTAGTGTGCATACGTTTTCATAGTTCTTGAGCAACTCC
TCCACCATAGCTTTGGTCTTGGAGTAGAAAGACCCGGTGAAGTTAGGAGTATCCTCCTCC
TTGAATCCGACACCCGACCCGAGAGTATGACCCGCA
CCGTACTC

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR2F617JQ 747 0 0
GTAACAAAAAGGTTTATTTAAACAATACAACAACATTGGATGAAGGAAACAAGAAAATAC
AAAAAACACAATAATTTCTTTAGGCCATCATAAACACTAAAATTTATAAAAAACCCCCAA
CAACTTTGTTTTGGTTTGATATTTGTTTTTAGTGTTTAGGACTGTTACACCTTAACAAAG
AACACACTTTGGCAGCATCTTAAGCTTTAACTCCAGTCTTCTTGTTTGGCTCAAACACAA
ACTTGATCAGAGATTCTTTGATAGACAACATCTCAGGGAACTCAGTCTTCAACTTAGTAG
CATCGAGCTCGTTGTTACTCCTTGGAGCCACAATCACTTTAGCTTGTTCCTCCAACGTGA
AGTTCTTCCAGGTGAAGCTCGGGTCAATGTACTCTCTGTACATCTCCAAGATCTCGTTGT
GGCTCACGACACCCGGGTTTGTGAAGTTGTAGATCCCGGTTAAGTTCCTCTTTGCCATCT
CGAT****ATGGGAAGGAGCTCGTCGAGGATGGTCATGGAGTTTGGGATGTCAACGACTT
TCTCGTACCGAGCAATCTTGGTGATGAAGTTTCTTGGGTTTGATAGATCCGAAGAGATGG
GCATCCGCACTCTTAGTGTGCATACGTTTTCATAGTTCTTGAGCAACTCCTCCACCATAG
CTTTGGTCTTGGAGTAGAAAGACCCGGTGAAGTTAGGAGTATCCTCCTCCTCGAATCCGA
CACCCGACCCGGGAGTATGACCCGCA
T

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2F617TF 585 0 0
ACAAAGAACACACTTTGGCAGCATCTTAAGCTTTAACTCCAGTCTTCTTGTTTGGCTCAA
ACACAAACTTGATCAGAGATTCTTTGATAGACAACATCTCAGGGAACTCAGTCTTCAACT
TAGTAGCATCGAGCTCGTTGTTACTCCTTGGAGCCACAATCACTTTAGCTTGTTCCTCCA
ACGTGAAGTTCTTCCAGGTGAAGCTCGGGTCAATGTACTCTCTGTACATCTCCAAGATCT
CGTTGTGGCTCACGACACCCGGGTTTGTGAAGTTGTAGATCCCGGTTAAGTTCCTCTTTG
CCATCTCGAT****ATGGGAAGGAGCTCGTCGAGGATGGTCATGGAGTTTGGGATGTCAA
CGACTTTCTCGTACCGAGCAATCTTGGTGATGAAGTTTCTTGGGTTTGATAGATCCGAAG
AGATGGGCATCCGCACTCTTAGTGTGCATACGTTTTCATAGTTCTTGAGCAACTCCTCCA
CCATAGCTTTGGTCTTGGAGTAGAAAGACCCGGTGAAGTTAGGAGTATCCTCCTCCTCGA
ATCCGACACCCGACCCGGGAGTATGACCCGCATCGTACTCGAATC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 4

CO CL2843Contig1 700 4 9 U
TTTTTCGTATAAGTAAAAAAAGCTTAAAAATCGACCATCTCTTGGGTACAAGAAACATAC
AGTACATATCATATGGAGTGATCCGGTCAACGAAACAGATGCAAGACGAGACACAATGTA
TGTTTCAGGTCTAAGATAAGCAAATATGATTCTCAAAAAAAGAAACACTAATCCAATGAA
GTATACACATCATCATCGTCTTCTGCTCCCTCGGTAATCCTCCTCACCCTCTTTGTCCTT
CAATAAACCCAAGAAAGCGAGAAAACCAAAGAAGAAGAAGCCACCAGACCAGTTGCCTCC
ACCCCCTCCTCCTCCACCTCCATCTCCGTCATCTCGCGGTGGGAACCCGTCTCCTCCATC
ATCCAAGCTTGGTGATTTCTCCTTAGAGTGGACAGGAGCTTGTGTTATTGTCGGAGACTC
CCGAATAACGGTCTGTGTTTGACCTTGACTTTCACTGCATTTAGCGTTAGCGGCGGAGTT
GCATATCAAAAGAGATCGCTTTCGACGACTATCCAATCCCAATCCCATCCCCACGGCACT
TAACGAGGAGACTCTATCTCGCCTTTTGATTCCTCCTCCCACCAACCCTGAGCTACGAAT
CCGCACGTTTTTGTTGATATTCACCGAAAGCGGAGAAGCTTGGAGGATAGACGCCGCCAT
CGCCATGGTTTTAGCAGCTTGACGACGGTGGATTACCCCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD07JQ U 190
AF RR2FL41TF C 1
AF RR2FD07TF C 506
AF RR2FL41JQ U 5
BS 1 5 RR2FL41TF
BS 6 189 RR2FL41JQ
BS 190 365 RR2FD07JQ
BS 366 366 RR2FL41JQ
BS 367 503 RR2FD07JQ
BS 504 504 RR2FL41JQ
BS 505 523 RR2FD07JQ
BS 524 670 RR2FL41JQ
BS 671 700 RR2FL41TF

RD RR2FD07JQ 334 0 0
TCATCATCGTCTTCTGCTCCCTCGGTAATCCTCCTCACCCTCTTTGTCCTTCAATAAACC
CAAGAAAGCGAGAAAACCAAAGAAGAAGAAGCCACCAGACCAGTTGCCTCCACCCCCTCC
TCCTCCACCTCCATCTCCGTCATCTCGCGGTGGGAACCCGTCTCCTCCATCATCCAGGCT
TGGTGATTTCTCCTTAGAGTGGACAGGAGCTTGTGTTATTGTCGGAGACTCCCGAATAAC
GGTCTGTGTTTGACCTTGACTTTCACTGCATTTAGCGTTAGCGGCGGAGTTGCATATCAA
AAGAGATCGCTTTCCACGACTATCCAATCCCAAT

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR2FL41TF 700 0 0
TTTTTCGTATAAGTAAAAAA*GCTTAAAAATCGACCATCTCTTGGGTACAAGAAACATAC
AGTACATATCATATGGAGTGATCCGGTCAACGAAACAGATGCAAGACGAGACACAATGTA
TGTTTCAGGTCTAAGATAAGCAAATATGATTCTCAAAAAAAGAAACACTAATCCAATGAA
GTATACACATCATCATCGTCTTCTGCTCCCTCGGTAATCCTCCTCACCCTCTTTGTCCTT
CAATAAACCCAAGAAAGCGAGAAAACCAAAGAAGAAGAAGCCACCAGACCAGTTGCCTCC
ACCCCCTCCTCCTCCACCTCCATCTCCGTCATCTCGCGGTGGGAACCCGTCTCCTCCATC
ATCCAAGCTTGGTGATTTCTCCTTAGAGTGGACAGGAGCTTGTGTTATTGTCGGAGACTC
CCGAATAACGGTCTGTGTTTGACCTTGACTTTCACTGCATTTAGCGTTAGCGGCGGAGTT
GCATATCAAAAGAGATCGCTTTCGACGACTATCCAATCCCAATCCCATCCCCACGGCACT
TAACGAGGAGACTCTATCTCGCCTTTTGATTCCTCCTCCCACCAACCCTGAGCTACGAAT
CCGCACGTTTTTGTTGATATTCACCGAAAGCGGAGAAGCTTGGAGGATAGACGCCGCCAT
CGCCATGGTTTTAGCAGCTTGACGACGGTGGATTACCCCC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2FD07TF 191 0 0
CGACTATCCAATCCCAATCCCATCCCCACGGCACTTAACGAGGAGACTCTATCTCGTCTT
TTGATTCCTCCTCCCACCAACCCTGAGCTACGAATCCGCACGTTTTTGTTGATATTCACT
GAAAGCGGAGAAGCTTGGAGGATAGACGCCGCCATCGCCATGGTTTTAGCAGCTTGACGA
CGGTGGATT
CC

QA 1 189 1 189
DS 

RD RR2FL41JQ 666 0 0
C
CGTATAAGTAAAAAAAGCTTAAAAATCGACCATCTCTTGGGTACAAGAAACATACAGTAC
ATATCATATGGAGTGATCCGGTCAACGAAACAGATGCAAGACGAGACACAATGTATGTTT
CAGGTCTAAGATAAGCAAATATGATTCTCAAAAAAAGAAACACTAATCCAATGAAGTATA
CACATCATCATCGTCTTCTGCTCCCTCGGTAATCCTCCTCACCCTCTTTGTCCTTCAATA
AACCCAAGAAAGCGAGAAAACCAAAGAAGAAGAAGCCACCAGACCAGTTGCCTCCACCCC
CTCCTCCTCCACCTCCATCTCCGTCATCTCGCGGTGGGAACCCGTCTCCTCCATCATCCA
AGCTTGGTGATTTCTCCTTAGAGTGGACAGGAGCTTGTGTTATTGTCGGAGACTCCCGAA
TAACGGTCTGTGTTTGACCTTGACTTTCACTGCATTTAGCGTTAGCGGCGGAGTTGCATA
TCAAAAGAGATCGCTTTCGACGACTATCCAATCCCAATCCCATCCCCACGGCACTTAACG
AGGAGACTCTATCTCGCCTTTTGATTCCTCCTCCCACCAACCCTGAGCTACGAATCCGCA
CGTTTTTGTTGATATTCACCGAAAGCGGAGAAGCTTGGAGGATAGACGCCGCCATCGCCA
TGGTT

QA 2 666 2 666
DS 



AS 1 3

CO CL2844Contig1 1016 3 2 U
GGATATTAAGGCACTGGATCCCTTCTCTTTGGAAATTCGATTACTTTCTATCTTTAATCT
TTGTGGGTTTACGTTTTTGAAAGCTGAATTGATCTCATTTGTATAATCTCCAGGTTCCTA
ATAGAGATCATTAAGAGAGAAGATGACAACGTTAGATTTGACCAGAGCCGAGCTAGCTCT
AGTAGTCCTTTACTTGAACAAAGCTGAGGCTAGAGATAAGATATGCAGAGCTATACAATA
TGGTTCCAAATTCGTGAGCGGTGGGCAGCCTGGTACTGCTCAAACTGTTGACAAAAACAC
CAGCTTGGCTAGAAAAGTCTTTCGTCTTTTCAAGTTTGTCAATGATTTTCACGGTCTTAT
TAGCCCTGTGCCTAAAGGGACCCCACTTCCTCTTGTCTTACTCGGGAAGTCCAAGAATGC
GCTCTTGTCTACCTTCTTGTTTCTTGATCAAATCGTCTGGCTTGGTAGATCCGGCATATA
CAAGAACAAAGAACGAACTGAGTTGCTTGGACGTATATCACTTTTCTGCTGGCTTGGGTC
ATCTGTCTGTACAACAGCAGTCGAGATTGGTGAGCTTGGAAGGCTCTCTTCATCTATCAA
GAAGATGGAGAAGGAACTCAAAGGTGCTGAAAAGCAGCATGATGAGGTGTATCGTGCTAA
GCTTCAGAAATCAAACGACCGAACGCTAGCTTTGGTTAAAACAAGCATAGACATCGTTGT
AGCCATTGGTCTGCTTCAGTTAGCTCCAAAGACTGTTACTCCTCGCGTCACTGGCGCTCT
CGGTTTTACCACCTCTCTTATCTCTTGTTATCAGCTACTCCCTGCACGTCCCAAGGTCAA
GACACCTTGAAGCAGGAAGAAGATGGTTCTCTAGGGCCTGCAGAATAATTGTTTCATATT
CATATTTCATCTCTCAGAAGTCTGTTTCTCCTTTCAAAGAATTTGCACTTCCTATGATTC
TATACACGAATAATGATAACTCTTAAAATAAGATTTCTATATGTGATATTTCTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET12TF U 1
AF RR2CF67TF U 6
AF RR2CF67JQ C 311
BS 1 698 RR2ET12TF
BS 699 1016 RR2CF67JQ

RD RR2ET12TF 698 0 0
GGATATTAAGGCACTGGATCCCTTCTCTTTGGAAATTCGATTACTTTCTATCTTTAATCT
TTGTGGGTTTACGTTTTTGAAAGCTGAATTGATCTCATTTGTATAATCTCCAGGTTCCTA
ATAGAGATCATTAAGAGAGAAGATGACAACGTTAGATTTGACCAGAGCCGAGCTAGCTCT
AGTAGTCCTTTACTTGAACAAAGCTGAGGCTAGAGATAAGATATGCAGAGCTATACAATA
TGGTTCCAAATTCGTGAGCGGTGGGCAGCCTGGTACTGCTCAAACTGTTGACAAAAACAC
CAGCTTGGCTAGAAAAGTCTTTCGTCTTTTCAAGTTTGTCAATGATTTTCACGGTCTTAT
TAGCCCTGTGCCTAAAGGGACCCCACTTCCTCTTGTCTTACTCGGGAAGTCCAAGAATGC
GCTCTTGTCTACCTTCTTGTTTCTTGATCAAATCGTCTGGCTTGGTAGATCCGGCATATA
CAAGAACAAAGAACGAACTGAGTTGCTTGGACGTATATCACTTTTCTGCTGGCTTGGGTC
ATCTGTCTGTACAACAGCAGTCGAGATTGGTGAGCTTGGAAGGCTCTCTTCATCTATCAA
GAAGATGGAGAAGGAACTCAAAGGTGCTGAAAAGCAGCATGATGAGGTGTATCGTGCTAA
GCTTCAGAAATCAAACGACCGAACGCTAGCTTTGGTTA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2CF67TF 671 0 0
GG
AAGGCACTGGATCCCTTCTCTTTGGAAATTCGATTACTTTCTATCTTTAATCTTTGTGGG
TTTACGTTTTTGAAAGCTGAATTGATCTCATTTGTATAATCTCCAGGTTCCTAATGGAGA
TCATTAAGAGAGAAGATGACAACGTTAGATTTGACCAGAGCCGAGCTAGCTCTAGTAGTC
CTTTACTTGAACAAAGCTGAGGCTAGAGATAAGATATGCAGAGCTATACAATATGGTTCC
AAATTCGTGAGCGGTGGGCAGCCTGGTACTGCTCAAACTGTTGACAAAAACACCAGCTTG
GCTAGAAAAGTCTTTCGTCTTTTCAAGTTTGTCAATGATTTTCACGGTCTTATTAGCCCT
GTGCCTAAAGGGACCCCACTTCCTCTTGTCTTACTCGGGAAGTCCAAGAATGCGCTCTTG
TCTACCTTCTTGTTTCTTGATCAAATCGTCTGGCTTGGTAGATCCGGCATATACAAGAAC
AAAGAACGAACTGAGTTGCTTGGACGTATATCACTTTTCTGCTGGCTTGGGTCATCTGTC
TGTACAACAGCAGTCGAGATTGGTGAGCTTGGAAGGCTCTCTTCATCTATCAAGAAGATG
GAGAAGGAACTCAAAGGTGCTGAAAAGCAGCATGATGAGGTGTATCGTGCTAAGCTTCAG
AAATCAAA
C

QA 3 670 3 670
DS 

RD RR2CF67JQ 706 0 0
AGAAAAGTCTTTCGTCTTTTCAAGTTTGTCAATGATTTTCACGGTCTTATTAGCCCTGTG
CCTAAAGGGACCCCACTTCCTCTTGTCTTACTCGGGAAGTCCAAGAATGCGCTCTTGTCT
ACCTTCTTGTTTCTTGATCAAATCGTCTGGCTTGGTAGATCCGGCATATACAAGAACAAA
GAACGAACTGAGTTGCTTGGACGTATATCACTTTTCTGCTGGCTTGGGTCATCTGTCTGT
ACAACAGCAGTCGAGATTGGTGAGCTTGGAAGGCTCTCTTCATCTATCAAGAAGATGGAG
AAGGAACTCAAAGGTGCTGAAAAGCAGCATGATGAGGTGTATCGTGCTAAGCTTCAGAAA
TCAAACGACCGAACGCTAGCTTTGGTTAAAACAAGCATAGACATCGTTGTAGCCATTGGT
CTGCTTCAGTTAGCTCCAAAGACTGTTACTCCTCGCGTCACTGGCGCTCTCGGTTTTACC
ACCTCTCTTATCTCTTGTTATCAGCTACTCCCTGCACGTCCCAAGGTCAAGACACCTTGA
AGCAGGAAGAAGATGGTTCTCTAGGGCCTGCAGAATAATTGTTTCATATTCATATTTCAT
CTCTCAGAAGTCTGTTTCTCCTTTCAAAGAATTTGCACTTCCTATGATTCTATACACGAA
TAATGATAACTCTTAAAATAAGATTTCTATATGTGATATTTCTTCA

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 4

CO CL2845Contig1 1235 4 14 U
GGGGAGCGGGAACGTTGGTCCCGAGGTTTCGCATCTGGGATGGGGAAGGTGGTATACACT
GAGGGAGCTGGAGGCGGCGACGAATGGGCTGTGTGAAGAGAACGTGATCGGCGAAGGTGG
TTACGGGATTGTGTATCGTGGGGTTTTAACTGACGGTACTAAAGTCGCCGTCAAGAACTT
GCTTAATAACAGGGGACAGGCAGAGAAGGAATTCAAAGTAGAAGTGGAAGTGATTGGGCG
TGTACGTCACAAGAATCTCGTTAGGCTTTTAGGTTATTGCGTTGAAGGTGCTTACAGGAT
GCTGGTGTATGACTTTGTGGATAATGGCAATTTGGAGCAATGGATTCACGGTGATGTTGG
TGATGTCAGCCCTCTTACTTGGGATATCCGTATGAACATTATACTCGGGATGGCTAAAGG
ATTGGCATATCTGCACGAGGGTCTTGAACCAAAAGTGGTTCACCGGGACATAAAATCGGG
AAATATATTGCTTGATCGCCAATGGAATGCTAAGGTTTCGGATTTTGGACTTGCTAAGCT
CTTGGGTTCCGACAGCAGTTATGTGACAACCCGTGTCATGGGAACCTTCGGTTATGTAGC
ACCGGAATATGCATGCACCGGAATGTTGAACGAGAAGAGTGACAT*TACAGCTTTGGAAT
ATTAATCATGGAGATCATCACTGGGAGAAACCCTGTTGATTATAGTCGCCCTCAAGGAGA
GACGAATCTAGTGGACTGGTTGAAAACAATGGTAGGAAACAGAAGATCAGAAGAAGTAGT
TGATCCCAAAATAGTGGAACCACCGTCCTCAAAGGCTCTTAAACGAGTGTTGCTAGTTGC
TTTGCGTTGTGTGGATCCAGATGCAAACAAGAGACCTAAAATGGGGCATATCATTCATAT
GCTTGAAGCTGAAGACTCACTCTATCGCGATGAACGCCGAACAACGAGGGACCATGGAAA
CAGAGATAAGCAAGAGACAGCGGCTAGTGAAAGCGGGGAGAGCGGTTCACGGCATCATCA
GCAAAAGCTAAGATGAAAAAGAGGATCATTTTAAGTGACTTTGCTTCTCACACACACGAC
CCCATTCCATTTCAATTGATTCTTATTATTGTTGTTGTTGTGTTACTTTCACTCACATAA
TATTTTTCATTCTTTGGCTCTTGAGTTACGTCTGATTAACCTCTCTTTTTTTTTGTTTTT
TCTCTTTTGTAATCTGTTGTCAACGATCACATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2EG20TF U 1
AF RR2G423TF U 479
AF RR2EG20JQ C 552
AF RR2G423JQ C 649
BS 1 589 RR2EG20TF
BS 590 590 RR2G423TF
BS 591 658 RR2EG20TF
BS 659 659 RR2G423TF
BS 660 700 RR2EG20TF
BS 701 701 RR2G423TF
BS 702 714 RR2EG20TF
BS 715 715 RR2G423TF
BS 716 716 RR2EG20TF
BS 717 717 RR2G423TF
BS 718 745 RR2EG20TF
BS 746 1193 RR2G423TF
BS 1194 1194 RR2EG20JQ
BS 1195 1235 RR2G423TF

RD RR2EG20TF 764 0 0
GGGGAGCGGGAACGTTGGTCCCGAGGTTTCGCATCTGGGATGGGGAAGGTGGTATACACT
GAGGGAGCTGGAGGCGGCGACGAATGGGCTGTGTGAAGAGAACGTGATCGGCGAAGGTGG
TTACGGGATTGTGTATCGTGGGGTTTTAACTGACGGTACTAAAGTCGCCGTCAAGAACTT
GCTTAATAACAGGGGACAGGCAGAGAAGGAATTCAAAGTAGAAGTGGAAGTGATTGGGCG
TGTACGTCACAAGAATCTCGTTAGGCTTTTAGGTTATTGCGTTGAAGGTGCTTACAGGAT
GCTGGTGTATGACTTTGTGGATAATGGCAATTTGGAGCAATGGATTCACGGTGATGTTGG
TGATGTCAGCCCTCTTACTTGGGATATCCGTATGAACATTATACTCGGGATGGCTAAAGG
ATTGGCATATCTGCACGAGGGTCTTGAACCAAAAGTGGTTCACCGGGACATAAAATCGGG
AAATATATTGCTTGATCGCCAATGGAATGCTAAGGTTTCGGATTTTGGACTTGCTAAGCT
CTTGGGTTCCGACAGCAGTTATGTGACAACCCGTGTCATGGGAACCTTCTGTTATGTAGC
ACCGGAATATGCATGCACCGGAATGTTGAACGAGAAGAGTGACAT*TACAGCTTTGGA*T
ATTAATCATGGAGATCATCACTGGGAGAAACCCTGTTGAT*ATAGTCGCCCTCACG*AGA
GACGAATCTAGTGGACTGGTTGAAA
CATGGTAGGAACAGAGATC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2G423TF 757 0 0
GGAAATATATTGCTTGATCGCCAATGGAATGCTAAGGTTTCGGATTTTGGACTTGCTAAG
CTCTTGGGTTCCGACAGCAGTTATGTGACAACCCGTGTCATGGGAACCTTCGGTTATGTA
GCACCGGAATATGCATGCACCGGAATGTTGAACGAGAAGAGTGACATCTACAGCTTTGGA
ATATTAATCATGGAGATCATCACTGGGAGAAACCCTGTTGATTATAGTCGCCCTCAAGGA
GAGACGAATCTAGTGGACTGGTTGAAAACAATGGTAGGAAACAGAAGATCAGAAGAAGTA
GTTGATCCCAAAATAGTGGAACCACCGTCCTCAAAGGCTCTTAAACGAGTGTTGCTAGTT
GCTTTGCGTTGTGTGGATCCAGATGCAAACAAGAGACCTAAAATGGGGCATATCATTCAT
ATGCTTGAAGCTGAAGACTCACTCTATCGCGATGAACGCCGAACAACGAGGGACCATGGA
AACAGAGATAAGCAAGAGACAGCGGCTAGTGAAAGCGGGGAGAGCGGTTCACGGCATCAT
CAGCAAAAGCTAAGATGAAAAAGAGGATCATTTTAAGTGACTTTGCTTCTCACACACACG
ACCCCATTCCATTTCAATTGATTCTTATTATTGTTGTTGTTGTGTTACTTTCACTCACAT
AATATTTTTCATTCTTTGGCTCTTGAGTTACGTCTGATTAACCTCTCTTTTTTTT*GTTT
TTTCTCTTTTGTAATCTGTTGTCAACGATCACATGTC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2EG20JQ 684 0 0
ACAGCAGTTATGTGACAACCCGTGTCATGGGAACCTTCGGTTATGTAGCACCGGAATATG
CATGCACCGGAATGTTGAACGAGAAGAGTGACAT*TACAGCTTTGGAATATTAATCATGG
AGATCATCACTGGGAGAAACCCTGTTGATTATAGTCGCCCTCAAGGAGAGACGAATCTAG
TGGACTGGTTGAAAACAATGGTAGGAAACAGAAGATCAGAAGAAGTAGTTGATCCCAAAA
TAGCGGAACCACCGTCCTCAAAGGTTTTTAAACGAGTGTTGCTAGTTGCTTTGCGTTGTG
TGGATCCAGATGCAAACAAGAGACCTAAAATGGGGCATATCATTCATATGCTTGAAGCTG
AAGACTCACTCTATCGCGATGAACGCCGAACAACGAGGGACCATGGAAACAGAGATAAGC
AAGAGACAGCGGCTAGTGAAAGCGGGGAGAGCGGTTCACGGCATCATCAGCAAAAGCTAA
GATGAAAAAGAGGATCATTTTAAGTGACTTTGCTTCTCACACACACGACCCCATTCCATT
TCAATTGATTCTTATTATTGTTGTTGTTGTGTTACTTTCACTCACATAATATTTTTCATT
CTTTGGCTCTTGAGTTACGTCTGATTAACCTCTCTTTTTTTTTGTTTTTTCTCTTTTGTA
ATCTGTTGTCAACGCTCACATGTC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2G423JQ 587 0 0
CAGCTTTGGAATATTAATCATGGAGATCATCACTGGGAGAAACCCTGTTGATTATAGTCG
CCCTCAAGGAGAGACGAATCTAGTGGACTGGTTGAAAACAATGGTAGGAAACAGAAGATC
AGAAGAAGTAGTTGATCCCAAAATAGTGGAACCACCGTCCTCAAAGGCTCTTAAACGAGT
GTTGCTAGTTGCTTTGCGTTGTGTGGATCCAGATGCAAACAAGAGACCTAAAATGGGGCA
TATCATTCATATGCTTGAAGCTGAAGACTCACTCTATCGCGATGAACGCCGAACAACGAG
GGACCATGGAAACAGAGATAAGCAAGAGACAGCGGCTAGTGAAAGCGGGGAGAGCGGTTC
ACGGCATCATCAGCAAAAGCTAAGATGAAAAAGAGGATCATTTTAAGTGACTTTGCTTCT
CACACACACGACCCCATTCCATTTCAATTGATTCTTATTATTGTTGTTGTTGTGTTACTT
TCACTCACATAATATTTTTCATTCTTTGGCTCTTGAGTTACGTCTGATTAACCTCTCTTT
TTTTTTGTTTTTTCTCTTTTGTAATCTGTTGTCAACGATCACATGTC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL2846Contig1 683 2 5 U
ATCCTCCTCGTCATACTGTCAAGATCTCTTGCTCTTTCCAACATTCTCGTCTACTCCACT
AAGCGTATCCCCGGCACGTAGGAGAGATTGTCTCTGACCGTGCAAGTCTTGGAGGATTGA
AACGCCAATCTCTTCAGTCTCCATCATTGTTCTACGACTGTCCTTGAGTCTGTCTGAAGT
ACGGCCCAAACGTTCTGTTGACATCATCAGTCTTGATCTTTGATCAGCTGAAGCCGTTTT
TGTGTCAACCAGACCAGCTTCAAGCAACTCGTCTCGAGCAGCAGCGTTCAAGTTTCCAGA
TGTGATTCTCTTAACTTCGGTTTTGAAGTTGTTAAGATCAGACTTGAACTCTCTTAACTC
GACAAGGAGGCTGGATTTAACACCCGGGTGGGAGGCTCCTCGCCTCAAGATCCATTTTCC
TAATCAATGCTTCTGCAAGTTCAAGGCCAGATTTGATTTCAGAGAGCTTCTGCTTCTTTT
GTTCTCCATCAAGGGAAACAGCAGAGGAACATTTCTTGGAAAGACTGGCAGATAGGTCGC
AGTATTGGCGCTCGTATCCGTTAAACACCTCACTCATTGTTCCGATACTCTCTGAGAAAC
GAACGGGGAAGAAGAACTACGGTGTCAGAATCGATCGGAGGAGCAATGAATTGATGATGA
ATAATTATTATTTTCGTCGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A129JQ U 92
AF RR2GO33TF C 1
BS 1 91 RR2GO33TF
BS 92 204 RR2A129JQ
BS 205 205 RR2GO33TF
BS 206 409 RR2A129JQ
BS 410 683 RR2GO33TF

RD RR2A129JQ 318 0 0
CTCTGACCGTGCAAGTCTTGGAGGATTGAAACGCCAATCTCTTCAGTCTCCATCATTGTT
CTACGACTGTCCTTGAGTCTGTCTGAAGTACGGCCCAAACGTTCTGTTGACATTATCAGT
CTTGATCTTTGATCAGCTGAAGCCGTTTTTGTGTCAACCAGACCAGCTTCAAGCAACTCG
TCTCGAGCAGCAGCGTTCAAGTTTCCAGATGTGATTCTCTTAACTTCGGTTTTGAAGTTG
TTAAGATCAGACTTGAACTCTCTTAACTCGACAAGGAGGCTGGATTTAACACCCGGGTGG
GAGGCTCCTCGCCTCAAG

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR2GO33TF 683 0 0
ATCCTCCTCGTCATACTGTCAAGATCTCTTGCTCTTTCCAACATTCTCGTCTACTCCACT
AAGCGTATCCCCGGCACGTAGGAGAGATTGTCTCTGACCGTGCAAGTCTTGGAGGATTGA
AACGCCAATCTCTTCAGTCTCCATCATTGTTCTACGACTGTCCTTGAGTCTGTCTGAAGT
ACGGCCCAAACGTTCTGTTGACATCATCAGTCTTGATCTTTGATCAGCTGAAGCCGTTTT
TGTGTCAGCCAGACCAGCTTCAAGCAACTCGTCTCGTGCAGCAGCGTTCAAGTTTCCAGA
TGTGATTCTCTTAACTTCGGTTTTGAAGTTGTTAAGATCAGACTTGAACTCTCTTAACTC
GACAAGGAGGCTGGATTTAACACCCGG*TGGGAGGCTCCTCGCCTCAAGATCCATTTTCC
TAATCAATGCTTCTGCAAGTTCAAGGCCAGATTTGATTTCAGAGAGCTTCTGCTTCTTTT
GTTCTCCATCAAGGGAAACAGCAGAGGAACATTTCTTGGAAAGACTGGCAGATAGGTCGC
AGTATTGGCGCTCGTATCCGTTAAACACCTCACTCATTGTTCCGATACTCTCTGAGAAAC
GAACGGGGAAGAAGAACTACGGTGTCAGAATCGATCGGAGGAGCAATGAATTGATGATGA
ATAATTATTATTTTCGTCGGACC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

CO CL2847Contig1 1292 4 39 U
GGAGAGGATCTTTTGTTAAAAAAAAAACAACCTTTGATCTGAGAGAGTGGGAGCGGCGAT
TGTAGAATTGGAGAGTCGATCTCTGAGTTAGCTAAATCGCAGGGAGGGACGTTTACTGAG
ATTGAGGCGAAGTCATCATGTCTTCGGATCCTGAAAAGATGATGTCCAAAGCCGACAAGA
TGACAAAACTCACGCTTACTAGATGGAGTGCTGACTGGAGAGGTGCTACTGAGTTGTATG
AGCAAGCAGCAAATGGCTTCAGGGCATCAAGCAAATATGAAAAAGCTAAAGTGGCTCTCG
AGAAAGCTTCCAAAGGACAAGAGATGCAAGCATCTCCCTGGGATGCTGCAAAGCATATGG
AGTCTGCCGCTGCCCTAGCGCAGAAGCTAAGTATCTGGAACGAAGTTGCTGATTTTTATA
GAAAGGTGTCTGAGCTGTATGTTGAGTGTGGAAGGGCACAACCCGCATCAGATGCTCTTG
GAAAGGCTGCTCGTGCTTTGGAAGAAGTCAAACCTGAAGATGCCATCCAACTGTACACCG
ATGCTTGTGAAATTCTTGAAGAGGATGGAAGGGACCAGATGGCCTTTGATCTGTACCGTG
CTTGTGCTAGTGTTTACATAAAGCTCGAGAAGTTCACAGATGCTACAACCTTTTTCTTAA
GATTGGGTGTAGCAGCTGACAAGTGTGACGCCACAAATAGCCAGTGTAAGGCATATCTTA
GTGCAATCATTGTATATCTGTATGGCCATGACCTGAAGCAGGCTGAAAAATGCTACAACG
ATTGTTCTCAGATTGATGCTTTTCTGAAGAGTGATCAGAACCGAACTGCTAGCAGACTGC
TCACAGCCTATAATGAAGGTGACATCGAAGAAATCAAGAAAGTGGCGTGTTCAAGCACTG
TCAACAATTTGGATCATGCGATCATCAAGTTGGCGAGAAAGCTACCCACAGGAGATGTCA
CTGCAGTTCAGATGAATGCTGGCGATGATCTCGACGAGGATGATCTCACTTGAAGATTCT
TCTCTTTGTACAGATTTCAGATTCCTACACTTTGCTTATGTTCAAGCCAAACTACTTTAA
ACAAAGTTATCATTTTAGTCCAAACCTTCCTTGTGCGAATGAATGATTGGCTATAAAGGC
TCTGAGTTGTGTGCATTGTTTCTCCACTAAATCCACAGTGGGTTACCACTTGAATGAACA
CTCTTGTCTTTCGTTAAATTCTTCTGCTCACACAGGTTATTACAGGCTGGTATATTTCTT
CCTTGAACAATAAATATGATACAGTTTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BB74TF U 42
AF RR2ET17TF U 1
AF RR2BB74JQ C 413
AF RR2ET17JQ C 603
BS 1 202 RR2ET17TF
BS 203 203 RR2BB74TF
BS 204 329 RR2ET17TF
BS 330 330 RR2BB74TF
BS 331 331 RR2ET17TF
BS 332 332 RR2BB74TF
BS 333 367 RR2ET17TF
BS 368 368 RR2BB74TF
BS 369 400 RR2ET17TF
BS 401 401 RR2BB74TF
BS 402 426 RR2ET17TF
BS 427 427 RR2BB74TF
BS 428 562 RR2ET17TF
BS 563 563 RR2BB74TF
BS 564 644 RR2ET17TF
BS 645 645 RR2BB74TF
BS 646 710 RR2ET17TF
BS 711 711 RR2BB74TF
BS 712 746 RR2ET17TF
BS 747 747 RR2BB74JQ
BS 748 761 RR2ET17TF
BS 762 762 RR2BB74JQ
BS 763 769 RR2ET17TF
BS 770 770 RR2ET17JQ
BS 771 793 RR2ET17TF
BS 794 803 RR2BB74JQ
BS 804 804 RR2ET17JQ
BS 805 879 RR2BB74JQ
BS 880 880 RR2ET17JQ
BS 881 952 RR2BB74JQ
BS 953 953 RR2ET17JQ
BS 954 969 RR2BB74JQ
BS 970 970 RR2ET17JQ
BS 971 982 RR2BB74JQ
BS 983 983 RR2ET17JQ
BS 984 1057 RR2BB74JQ
BS 1058 1058 RR2ET17JQ
BS 1059 1148 RR2BB74JQ
BS 1149 1292 RR2ET17JQ

RD RR2BB74TF 714 0 0
AGAGAGTGGGAGCGGCGATTGTAGAATTGGAGAGTCGATCTCTGAGTTAGCTAAATCGCA
GGGAGGGACGTTTACTGAGATTGAGGCGAAGTCATCATGTCTTCGGATCCTGAAAAGATG
ATGTCCAAAGCCGACAAGATGACAAAACTCACGCTTACTAGATGGAGTGCTGACTGGAGA
GGTGCTACTGAGTTGTATGAGCAAGCAGCAAATGGCTTTAGGGCATCAAGCAAATATGAA
AGAGCTAAAGTGGCTCTCGAGAAAGCTTCCAAAGGACAAGAGATGCAAGCATCTCCCTGG
GATGCTGCAAAGCATATGGAGTCTGCCGCTGCCCTAGCGCGGAAGCTAAGTATCTGGAAC
GAAGTTGCTGATTTTTATAGAAAGGTGTCTGAGCTGTATGTTGAGTGTGGAAGGGCACAA
CCCGCATCAGATGCTCTTGGAAAGGCTGCTCGTGCTTTGGAAGAAGTCAAACCTGAAGAT
GCCATCCAACTGTACACCGATGCTTGTGAAATTCTTGAAGAGGATGGAAGGGACCAGATG
GCCTTTGATCTGTACCGTGCTTGTGCTAGTGTTTACATAAAGCTCGAGAAGTTCACAGAT
GCTACAACCTTTTTCTTAAGATTGGGTGTAGCAGCTGACAAGTGTGACGCCACAAATAGC
CAGTGTAAGGCATATCTTAGTGCAATCATTGTATATCTGTATGGC
CATGACCTG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2ET17TF 801 0 0
GGAGAGGATCTTTTGTTAAAAAAAAAACAACCTTTGATCTGAGAGAGTGGGAGCGGCGAT
TGTAGAATTGGAGAGTCGATCTCTGAGTTAGCTAAATCGCAGGGAGGGACGTTTACTGAG
ATTGAGGCGAAGTCATCATGTCTTCGGATCCTGAAAAGATGATGTCCAAAGCCGACAAGA
TGACAAAACTCACGCTTACTAGGTGGAGTGCTGACTGGAGAGGTGCTACTGAGTTGTATG
AGCAAGCAGCAAATGGCTTCAGGGCATCAAGCAAATATGAAAAAGCTAAAGTGGCTCTCG
AGAAAGCTTCCAAAGGACAAGAGATGCAATCTTCTCCCTGGGATGCTGCAAAGCATATGG
AGTCTGCTGCTGCCCTAGCGCAGAAGCTAAGTATCTGGAATGAAGTTGCTGATTTTTATA
GAAAGGCGTCTGAGCTGTATGTTGAGTGTGGAAGGGCACAACCCGCATCAGATGCTCTTG
GAAAGGCTGCTCGTGCTTTGGAAGAAGTCAAACCTGAAGATGCCATCCAACTGTACACCG
ATGCTTGTGAAATTCTTGAAGAAGATGGAAGGGACCAGATGGCCTTTGATCTGTACCGTG
CTTGTGCTAGTGTTTACATAAAGCTCGAGAAGTTCACAGATGCTGCAACCTTTTTCTTAA
GATTGGGTGTAGCAGCTGACAAGTGTGACGCCACAAATAGCCAGTGTAAG*CATATCTTA
GTGCAATCATTGTATATCTGTATGGC*ATGACCTGAAGCAG*CTGAAAA*TGCTACAACG
ATTGTTCTCAGAT
GATGCTTT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2BB74JQ 747 0 0
TTTTATAGA
AAAGGTGTCTGAGCTGTATGTTGAGTGTGGAAGGGCACAACCCGCATCAGATGCTCTTGG
AAAGGCTGCTCGTGCTTTGGAAGAAGTCAAACCTGAAGATGCCATCCAACTGTACACCGA
TGCTTGTGAAATTCTTGAAGAGGATGGAAGGGACCAGATGGCCTTTGATCTGTACCGTGC
TTGTGCTAGTGTTTACATAAAGCTCGAGAAGTTCACAGATGCTACAACCTTTTTTTTAAG
ATTGGGTGTAGCAGCTGACAAGTGTGACGCCACAAATAGCCAGTGTAAGGCATATCTTAG
TGCAATCATTGTATATCTGTATGGCCATGACCTGAAGCAGGCTGAAAAGTGCTACAACGA
TTGTTCTCAGATTGATGCTTTTTTGAAGAGTGATCAGAACCGAACTGCTAGCAGACTGCT
CACAGCCTATAATGAAGGTGACATCGAAGAAATCAAGAGAGTGGCGTGTTCAAGCACTGT
CAACAATTTGGATCATGCGATCATCAAGTTGGCGAGAAAGCTACCCACAGGGGATGTCAC
TGCAGTTCGGATGAATGCTGGTGATGATCTCGACGAGGATGATCTCACTTGAAGATTCTT
CTCTTTGTACAGATTTCAGATTCCTACACTTTGCTTTTGTTCAAGCCAAACTACTTTAAA
CAAAGTTATCATTTTAGTCCAAACCTTCCTTGTGCGAATGAATGATTGGCTATAAAGGCT
CTGAGTT
CAGATGTGTGC

QA 10 736 10 736
DS 

RD RR2ET17JQ 690 0 0
TGTGCTAGTGTTTACATAAAGCTCGAGAAGTTCACAGATGCTGCAACCTTTTTCTTAAGA
TTGGGTGTAGCAGCTGACAAGTGTGACGCCACAAATAGCCAGTGTAAGGCATATCTTAGT
GCAATCATTGTATATCTGTATGGCCATGACCTGAAGCAGGCTGAAAAATGCTACAACGAT
TGTTCTCAGATTGATGCTTTTCTGAAGAGTGATCAGAACCGAACTGCTAGCAGACTGCTC
ACAGCCTATAATGAAGGTGACATCGAAGAAATCAAGAAAGTGGCGTGTTCAAGCACTGTC
AACAATTTGGATCATGCGATCATCAAGTTGGCGAGAAAGCTACCCACAGGAGATGTCACT
GCAGTTCAGATGAATGCTGGCGATGATCTCGACGAGGATGATCTCACTTGAAGATTCTTC
TCTTTGTACAGATT*CAGATTCCTACACTTTGCTTATTTTCAAGCCAAACTACTT*AAAC
AAAGTTATCATTTTAGTCCAAACCTTCGTTGTGTGAATGAATGATTGGCTATAAAGGCTC
TGAGTTGTGTGCATTGTTTCTCCACTAAATCCACAGTGGGTTACCACTTGAATGAACACT
CTTGTCTTTCGTTAAATTCTTCTGCTCACACAGGTTATTACAGGCTGGTATATTTCTTCC
TTGAACAATAAATATGATACAGTTTTTACC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 3

CO CL2848Contig1 927 3 13 U
TTATTTCCGCACATGGGCGAAAACCTCGCAGAGATCAAAAGAAGTTGATTCAAATAATTG
ATTCAACATCAAAAACTGTAGAAAATTCACATATCTAGAACAACATAATCAAGAAAATCC
CATTACATGGATCCTTTTTCTTTTCGAGTAAAACTCAAAAAAGAAA*GAACAAAAA*CAT
ATTTAACGACAAGAAGACAGAAAAAGAGTATAAACCCTACAATACCATATAGAACAGAAC
ACATAGCTTTTGCTTATTCTTCTAGATCCACAATCCCAAGATGAAATCATTCCTTCATCT
CAGTTTTCTTCATTCTTCATCACACTGTTTTAACTTCCCAATCTCACAACTCACCGGAGA
AGATTCACAAATGACATAAGCGAATCAACATCTCTATGCTCTGACGGGTACTTAATCGCC
CGTGGAGCGCTTTTTGGGAAGAGCAGGATGGTCGGGAAGCTTCCTAATTGAAGCTCTTGC
TTAGCAAACTCCTTCTGGTCACCATCCGCACGGAATTTCGCCACCTTAATCCCTTTCACC
GCTAGTTTCTCAGCCAATTCCACGTAAGATGCCTCCATAGCCTGGCAAAACGGACACCAA
GGAGCGTAAAGCACAACCAACCACGGCTCTTTGCGGTTATTACCAAGCTTCAACAGATTC
TCAATCCCTCCTCTGGTCAATGAAACCACATCGTTGCTCTCGAATATATCATGCACAATA
GCAGGTGCTAAATCCGCGGTGGTGTCATCTTCCTTCTTAATGTTCCCTTTGTGGAGGCCA
CATTCTTTAGCTTTAGCATCTTCCCACCACCACCTTTCCTTCTCTCTCGTGCTGACCCGG
AAGCACTGGTCTAGTACACGGCTCACACCCAATAGAAACATATCCTTGAGCATGCAATGC
ATTCACAGGAACATCCATCGTCCTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E369JQ U 88
AF RR2BA53TF C 1
AF RR2A816JQ U 93
BS 1 93 RR2BA53TF
BS 94 145 RR2E369JQ
BS 146 146 RR2A816JQ
BS 147 159 RR2E369JQ
BS 160 160 RR2A816JQ
BS 161 162 RR2E369JQ
BS 163 163 RR2A816JQ
BS 164 519 RR2E369JQ
BS 520 520 RR2A816JQ
BS 521 588 RR2E369JQ
BS 589 602 RR2A816JQ
BS 603 603 RR2BA53TF
BS 604 927 RR2A816JQ

RD RR2E369JQ 501 0 0
CACATA
TCTAGAACAACATAATCAAGAAAATCCCATTACATGGATCCTTTTTCTTTTCAAGTAAAA
CTCAAAGAAAAAA*GAACAAAAA*CATATTTAACGACAAGAAGACAGAAAAAGAGTATAA
ACCCTACAATACCATATAGAACAGAACACATAGCTTTTGCTTATTCTTCTAGATCCACAA
TCCCAAGATGAAATCATTCCTTCATCTCAGTTTTCTTCATTCTTCATCACACTGTTTTAA
CTTCCCAATCTCACAACTCACCGGAGAAGATTCACAAATGACATAAGCGAATCAACATCT
CTATGCTCTGACGGGTACTTAATCGCCCGTGGAGCGCTTTTTGGGAAGAGCAGGATGGTC
GGGAAGCTTCCTAATTGAAGCTCTTGCTTAGCAAACTCCTTCTGGTCACCATCCGCACGG
AATTTCCCCACCTTAATCCCTTTCACCGCTAGTTTCTCAGCCAATTCCACGTAAGATGCC
TCCATAGCCTGGCAA

QA 7 501 7 501
DS 

RD RR2BA53TF 810 0 0
TTATTTCCGCACATGGGCGAAAACCTCGCAGAGATCAAAAGAAGTTGATTCAAATAATTG
ATTCAACATCAAAAACTGTAGAAAATTCACATATCTAGAACAACATAATCAAGAAAATCC
CATTACATGGATCCTTTTTCTTTTCGAGTAAAACTCAAAAAAGAAA*GAACAAAAAACAT
ATTTAACGACAAGAAGACAGAAAAAGAGTATAAACCCTACAATACCATATAGAACAGAAC
ACATAGCTTTTGCTTATTCTTCTAGATCCACAATCCCAAGATGAAATCATTCCTTCATCT
CAGTTTTCTTCATTCTTCATCACACTGTTTTAACTTCCCAATCTCACAACTCACCGGAGA
AGATTCACAAATGACATAAGCGAATCAACATCTCTATGCTCTGACGGGTACTTAATCGCC
CGTGGAGCGCTTTTTGGGAAGAGCAGGATGGTCGGGAAGCTTCCTAATTGAAGCTCTTGC
TTAGCAAACTCCTTCTGGTCACCATCCGCACGGAATTTCGCCACCTTAATCCCTTTCACC
GCTAGTTTCTCAGCCAATTCCACGTAAGATGCCTCCATAGCCTGGCAAAACGGACACCAA
GGAGCGTAAAGCACAACCAACCACGGCTCTTTGCGGTTATTACCAAGCTTCAACAGATTC
TCAATCCCTCCTCTGGTCAATGAAACCACATCGTTGCTCTCGAATATATCATGCACAATA
GCAGGTGCTAAATCCGCGGTGGTGTCATCTTCCTTCTTAATGTTCCCTTTGTGGAGGCCA
CATTCTTTAGCTTTAGCATCTTCCCACCAC

QA 1 810 1 810
DS 

RD RR2A816JQ 835 0 0
G
TCTAGAACAACATAATCAAGAAAATCCCATTACATGGATCCTTTTTCTTTTCGAGTAAAA
CTCAAAAAAGAAAAGAACAAAAA*CATATTTAACGACAAGAAGACAGAAAAAGAGTATAA
ACCCTACAATACCATATAGAACAGAACACATAGCTTTTGCTTATTCTTCTAGATCCACAA
TCCCAAGATGAAATCATTCCTTCATCTCAGTTTTCTTCATTCTTCATCACACTGTTTTAA
CTTCCCAATCTCACAACTCACCGGAGAAGATTCACAAATGACATAAGCGAATCAACATCT
CTATGCTCTGACGGGTACTTAATCGCCCGTGGAGCGCTTTTTGGGAAGAGCAGGATGGTC
GGGAAGCTTCCTAATTGAAGCTCTTGCTTAGCAAACTCCTTCTGGTCACCATCCGCACGG
AATTTCGCCACCTTAATCCCTTTCACCGCTAGTTTCTCAGCCAATTCCACGTAAGATGCC
TCCATAGCCTGGCAAAACGGACACCAAGGGGCGTAAAGCACAACCAACCACGGCTCTTTG
CGGTTATTACCAAGCTTCAACAGATTCTCAATCCCTCCTCTGGTCAATGAAACCACATCG
TTGCTCTCGAATATATCATGCACAATAGCAGGTGCTAAATCCGCGGTGGTGTCATCTTCC
TTCTTAATGTTCCCTTTGTGGAGGCCACATTCTTTAGCTTTAGCATCTTCCCACCACCAC
CTTTCCTTCTCTCTCGTGCTGACCCGGAAGCACTGGTCTAGTACACGGCTCACACCCAAT
AGAAACATATCCTTGAGCATGCAATGCATTCACAGGAACATCCATCGTCCTCAA

QA 2 835 2 835
DS 



AS 1 4

CO CL2849Contig1 964 4 6 U
GGTGTATCAGATTTATATTAATACATACATTTAACAATGCCACAAAATGGTCAATGGAGT
TTACAAACAGGAATGCCAGATTACTGAACCAAAAACCTTTTGTGTTCATCAACTTTTTCT
TTAACAAAAAAAAAAATTGTTCATTAACAGTATGTAAAATATGCACAAACCAGACGCAGG
GATATAGACGAAATCGGAATTGATCTTTTAGATCAATCATTCTTAAAAAGTTATTTTTGG
CCTGTTGTCACTCCAACCACAACGTTGCTCACCAACTTTCCACTTCCATTAACGGACATT
GGGTTCTCTACTACAACAGTTTGTGTCTGAAACGGTGGTGTTGACTGAGTGGATGTAGAA
GGCATAGTCCCGGGAGATGCTGTTCCATTTGGCCGGTTACTTGCTAAAGGCACCCTT*CC
ATTGCTCATGTTAACGTTAGTAACAAACTGGCAAATAGCGCATTTAACAGATGATGCACC
GTAAGGGTACATGAGTGTCGTCCTACAGTTCCCACAGTTGATATGAGCAACCTGATTAGA
CGGCGGGGGTCCTGGGACAAGGTTGACAGTCTGACAGCAAGAGCATCTTACACTAGTAGC
CCCACGGGTATACATGAGCATTGTTCGACAACCACCACACACAATGTGAGCCATGTCCAT
CCCATGGTGATGAGGAGGAGGAG***GATGAAGAGGAACCATGTTGACAATGTGACATAA
CGCACAACGGACGTTCGTAGCTCCTCTAGGATACATCAATGTATTTCTACAGCCATGACA
CACTAGCTGGTCCTGCATATCTCTCTTGATTTCTCCACAGGGATGATGATAAGAAGATAA
AGGAGGTGGCTTTGAAACCCCAAATCCAATTCAAAGCCAAAAAGCTTCGATGGAGAAGAG
GGGATCCGATTGCAAAACCGGACAACTCTAAGAGCAGATATGCAAAGAGGCCAATCCAAA
TTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F015JQ U 15
AF RR2FR68JQ U 1
AF RR2FR68TF C 248
AF RR2F015TF C 246
BS 1 285 RR2FR68JQ
BS 286 286 RR2F015JQ
BS 287 815 RR2FR68JQ
BS 816 929 RR2F015TF
BS 930 930 RR2FR68TF
BS 931 964 RR2F015TF

RD RR2F015JQ 523 0 0
ATATTAATACATACATTTAACAATGCCACAAAATGGTCAATGGAGTTTACAAACAGGAAT
GCCAGATTACTGAACCAAAAACCTTTTGTGTTCATCAACTTTTTCTTTAACAAAAAAAAA
**TTGTTCATTAACAGTATGTAAAATATGCACAAACCAGACGCAGGGATATAGACGAAAT
CGGAATTGATCTTTTAGATCAATCATTCTTAAAAAGTTATTTTTGGCCTGTTGTCACTCC
AACCACAACGTTGCTCACCAACTTTCCACTTCCATTAACGGACATTGGGTTCTCTACTAC
AACAGTTTGTGTCTGAAACGGTGGTGTTGACTGAGTGGATGTAGAAGGCATAGTCCCGGG
AGATGCTGTTCCATTTGGCCGGTTACTTGCTAAAGGCACCCTT*CCATTGCTCATGTTAA
CGTTAGTAACAAACTGGCAAATAGCGCATTTAACAGATGATGCACCGTAAGGGTACATGA
GTGTCGTCCTACAGTTCCCACAGTTGATATGAGCAACCTGATT

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2FR68JQ 815 0 0
GGTGTATCAGATTTATATTAATACATACATTTAACAATGCCACAAAATGGTCAATGGAGT
TTACAAACAGGAATGCCAGATTACTGAACCAAAAACCTTTTGTGTTCATCAACTTTTTCT
TTAACAAAAAAAAAAATTGTTCATTAACAGTATGTAAAATATGCACAAACCAGACGCAGG
GATATAGACGAAATCGGAATTGATCTTTTAGATCAATCATTCTTAAAAAGTTATTTTTGG
CCTGTTGTCACTCCAACCACAACGTTGCTCACCAACTTTCCACTTTCATTAACGGACATT
GGGTTCTCTACTACAACAGTTTGTGTCTGAAACGGTGGTGTTGACTGAGTGGATGTAGAA
GGCATAGTCCCGGGAGATGCTGTTCCATTTGGCCGGTTACTTGCTAAAGGCACCCTT*CC
ATTGCTCATGTTAACGTTAGTAACAAACTGGCAAATAGCGCATTTAACAGATGATGCACC
GTAAGGGTACATGAGTGTCGTCCTACAGTTCCCACAGTTGATATGAGCAACCTGATTAGA
CGGCGGGGGTCCTGGGACAAGGTTGACAGTCTGACAGCAAGAGCATCTTACACTAGTAGC
CCCACGGGTATACATGAGCATTGTTCGACAACCACCACACACAATGTGAGCCATGTCCAT
CCCATGGTGATGAGGAGGAGGAG***GATGAAGAGGAACCATGTTGACAATGTGACATAA
CGCACAACGGACGTTCGTAGCTCCTCTAGGATACATCAATGTATTTCTACAGCCATGACA
CACTAGCTGGTCCTGCATATCTCTCTTGATTTCTC

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR2FR68TF 712 0 0
TCACTCCAAC*ACAACGTTGCTCACCAACTTTCCACTTTCATTAACGGACATTGGGTTCT
CTACTACAACAGTTTGTGTCTGAGACGGTGGTGT*GACTGAGTGGATGTAGAAGGCATAG
TCCCGGGAGATGCTGTTCCATTTGGCCGGTTACTTGCTAAAGGCACCCTTTCCATTGCTC
ATGTTAACGTTAGTAACAAACTGGCAAATAGCGCATTTAACAGATGATGCACCGTAAGGG
TACATGAGTGTCGTCCTACAGTTCCCACAGTTGATATGAGCAACCTGATTAGACGGCGGG
GGTCCTGGGACAAGGTTGACAGTCTGACAGCAAGAGCATCTTACACTAGTAGCCCCACGG
GTATACATGAGCATTGTTCGACAACCACCACACACAATGTGAGCCATGTCCATCCCATGG
TGATGAGGAGGAGGAG***GATGAAGAGGAACCATGTTGACAATGTGACATAACGCACAA
CGGACGTTCGTAGCTCCTCTAGGATACATCAATGTATTTCTACAGCCATGACACACTAGC
TGGTCCTGCATATCTCTCTTGATTTCTCCACAGGGATGATGATAAGAAGATAAAGGAGGT
GGCTTTGAAACCCCAAATCCAATTCAAAGCCAAAAAGCTTCGATGGAGAAGAGGGGATCC
GATTGCAAAACCGGACAGCTCTAAGAGCAGATATGCAAAGAGGCCAATCC
CC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2F015TF 719 0 0
TG
TCACTCCAACCACAACGTTGCTCACCAACTTTCCACTTCCATTAACGGACATTGGGTTCT
CTACTACAACAGTTTGTGTCTGAGACGGTGGTGTTGACTGAGTGGATGTAGAAGGCATAG
TCCCGGGAGATGCTGTTCCATTTGGCCGGTTACTTGCTAAAGGCACCCTT*CCATTGCTC
ATGTTAACGTTAGTAACAAACTGGCAAATAGCGCATTTAACAGATGATGCACCGTAAGGG
TACATGAGTGTCGTCCTACAGTTCCCACAGTTGATATGAGCAACCTGATTAGACGGCGGG
GGTCCTGGGACAAGGTTGACAGTCTGACAGCAAGAGCATCTTACACTAGTAGCCCCACGG
GTATACATGAGCATTGTTCGACAACCACCACACACAATGTGAGCCATGTCCATCCCATGA
TGATGAGGAGGAGGAGGAGGATGAAGAGGAACCATGTTGACAATGTGACATAACGCACAA
CGGACATTGGTAGCTCCTCTAGGATACATCAATGTATTTCTACAGCCATGACACACTAGC
TGGTCCTGCATATCTCTCTTGATTTCTCCACAGGGATGATGATAAGAAGATAAAGGAGGT
GGCTTTGAAACCCCAAATCCAATTCAAAGCCAAAAAGCTTCGATGGAGAAGAGGGGATCC
GATTGCAAAACCGGACAACTCTGAGAGCAGATATGCAAAGAGGCCAATCCAAATTCC

QA 3 719 3 719
DS 



AS 1 3

CO CL2850Contig1 815 3 2 U
ATTAATACAGAAATTTATATAGCTCTCCCTTTTGATTGTTTCCTCTGATTCGTAAACATA
ATGTGATTTGATTAAGTTCTTGTTACTAAAAAGACAAAACATTATCTGATTGTTACACGC
AATTTCAACCGCATCAAACGCTTGACAATTTTCAAAAGAAACAAACACAAATCCCTCTTT
AACTACCGCGTGCTCTTGATCCCTCTTGCTTTTCTCTTCTTATCCCTTTTCTTCATAGTT
TTGGTGCTAGACCTTCGGTTCTTCTTCGAGGGTTTGGATTTCCTCAAAGGCGCCGGCTGT
GATGTGGAAGCTTTGGCAGTAGAACCGGATTCTGTCGATTGGGTCTTTTCCCTGCGAACA
GGCTCATCCTCTTCACGAGATATCTCGCTCGTTGTCACAGTTACTTTCAGCTCCCCTGTA
TCATACATTGTCGTTCCAGAAGTTGAAGCATCAGGCTCTGCTTCTTCATTCTCTGCATCC
TTCTCATCAGCTTCTCCAACTTCAATCTCCTCACCAATACCCACCACCATCATCTCTTCC
AACTTCCTCTTCTTACGAGCCTCGATACGCTTCCGCCTCAGACATTCCTCCTGCTGCTTC
TGAACTTCCTTTCTCCTTTTCTTCTTCCTCTTGTGAAACCCAGTCACAAAATCCTTGAGA
TCTTTCTCATCAAAAGAGACGGTGATGCTTTTGTTCTTTAGAGCTCTCTTCCCGATATGC
CTAGCTCTCGTCGGCGGAGCCAATCCCCCCGCCGCACCCTCATCGTCTACGTTCATCGCG
AGATGCTTCGTCGGGTCGGAGACGAAGCGATTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B061JQ U 1
AF RR2BT81JQ U 70
AF RR2B061TF C 107
BS 1 738 RR2B061JQ
BS 739 815 RR2BT81JQ

RD RR2B061JQ 738 0 0
ATTAATACAGAAATTTATATAGCTCTCCCTTTTGATTGTTTCCTCTGATTCGTAAACATA
ATGTGATTTGATTAAGTTCTTGTTACTAAAAAGACAAAACATTATCTGATTGTTACACGC
AATTTCAACCGCATCAAACGCTTGACAATTTTCAAAAGAAACAAACACAAATCCCTCTTT
AACTACCGCGTGCTCTTGATCCCTCTTGCTTTTCTCTTCTTATCCCTTTTCTTCATAGTT
TTGGTGCTAGACCTTCGGTTCTTCTTCGAGGGTTTGGATTTCCTCAAAGGCGCCGGCTGT
GATGTGGAAGCTTTGGCAGTAGAACCGGATTCTGTCGATTGGGTCTTTTCCCTGCGAACA
GGCTCATCCTCTTCACGAGATATCTCGCTCGTTGTCACAGTTACTTTCAGCTCCCCTGTA
TCATACATTGTCGTTCCAGAAGTTGAAGCATCAGGCTCTGCTTCTTCATTCTCTGCATCC
TTCTCATCAGCTTCTCCAACTTCAATCTCCTCACCAATACCCACCACCATCATCTCTTCC
AACTTCCTCTTCTTACGAGCCTCGATACGCTTCCGCCTCAGACATTCCTCCTGCTGCTTC
TGAACTTCCTTTCTCCTTTTCTTCTTCCTCTTGTGAAACCCAGTCACAAAATCCTTGAGA
TCTTTCTCATCAAAAGAGACGGTGATGCTTTTGTTCTTTAGAGCTCTCTTCCCGATATGC
CTAGCTCTCGTCGGCGGA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2BT81JQ 746 0 0
GG
TTAAGTTCTTGTTACTAAAAAGACAAAACATTATCTGATTGTTACACGCAATTTCAACCG
CATCAAACGCTTGACAATTTTCAAAAGAAACAAACACAAATCCCTCTTTAACTACCGCGT
GCTCTTGATCCCTCTTGCTTTTTTCTTCTTATCCCTTTTCTTCATAGTTTTGGTGCTAGA
CCTTCGGTTCTTCTTCGAGGGTTTGGATTTCCTCAAAGGCGCCGGCTGTGATGTGGAAGC
TTTGGCAGTAGAACCGGATTCTGTCGATTGGGTCTTTTCCCTGCGAACAGGCTCATCCTC
TTCACGAAATATCTCGCTCGTTGTCACAGTTACTTTCAGCTCCCCCGTATCATACATTGT
CGTTCCAGAAGTTGAAGCATCAGGCTCTGCTTCTTCATTCTCTGCATCCTTCTCATCAGC
TTCTCCAACTTCAATCTCCTCACCAATACCCGCCACCATCATCTCTTCCAACTTCCTCTT
CTTACGAGCCTCGATACGCTTCCGCCTCAGACATTCCTCCTGCTGCTTCTGAGCTTCCTT
TCTCCTTTTCTTCTTCCTCTTGTGAAACCCAGTCACAAAATCCTTGAGATCTTTCTCATC
AAAAGAGACGGTGATGCTTTTGTTCTTTAGAGCTCTCTTCCCGATATGCCTAGCTCTCGT
CGGCGGAGCCAATCCCCCCGCCGCACCCTCATCGTCTACGTTCATCGCGAGATGCTTCGT
CGGGTCGGAGACGAAGCGATTCCC

QA 3 746 3 746
DS 

RD RR2B061TF 709 0 0
TGATTGT
TACACGCAATTTCAACCGCATCAAACGCTTGACAATTTTCAAAAGAAACAA*CACAAATC
CCTCTTTAACTACCGCGTGCTCTTGATCCCTCTTGCTTTTCTCTTCTTATCCCTTTTCTT
CATAGTTTTGGTGCTAGACCTTCGGTTCTTCTTCGAGGGTTTGGATTTCCTCAAAGGCGC
CGGCTGTGATGTGGAAGCTTTGGCAGTAGAACCGGATTCTGTCGATTGGGTCTTTTCCCT
GCGAACAGGCTCATCCTCTTCACGAGATATCTCGCTCGTTGTCACAGTTACTTTCAGCTC
CCCTGTATCATACATTGTCGTTCCAGAAGTTGAAGCATCAGGCTCTGCTTCTTCATTCTC
TGCATCCTTCTCATCAGCTTCTCCAACTTCAATCTCCTCACCAATACCCACCACCATCAT
CTCTTCCAACTTCCTCTTCTTACGAGCCTCGATACGCTTCCGCCTCAGACATTCCTCCTG
CTGCTTCTGAACTTCCTTTCTCCTTTTCTTCTTCCTCTTGTGAAACCCAGTCACAAAATC
CTTGAGATCTTTCTCATCAAAAGAGACGGTGATGCTTTTGTTCTTTAGAGCTCTCTTCCC
GATATGCCTAGCTCTCGTCGGCGGAGCCAATCCCCCCGCCGCACCCTCATCGTCTACGTT
CATCGCGAGATGCTTCGTCGGGTCGGAGACGAAGCGATTCCC

QA 8 709 8 709
DS 



AS 1 4

CO CL2851Contig1 1028 4 7 U
GCTCTGAACCATTTTCACTGGTCGCTGAAGAGGACTCAGCTGATCTACGAAAGGATGGTT
CTCAGGATATTCTTGAGCGCATCACAAAACTCGTCAACGACACTTTGGCTAATGAGGATC
CACTCAAACCCATTGACTCTGCTTTGTCAACAGATGATCTTCTCAGAGCCATTGACTGCG
GCACATCCGAAGGTGGTCCTAACGGTCGACACTGGGTCTTGGACCCCATTGATGGCACTA
AAGGATTTTTGAGGGGAGATCAGTACGCAGTAGCGCTAGGGTTGCTAGAGGAAGGGAAAG
TAGTGTTGGGTGTCCTTGCTTGTCCAAACTTGCCATTGGCTTCCATAGCAGGAAGCAGCC
AACAAGAACTCTTCTTCTTCTTCTTCAGAGGAAAAAGGATGTCTCTTCTATGCTACAATT
GGTTCAGGGACATACATGCAGCCCTTGGATTCGAAATCTGATCCAGTCAAAGTACATGCC
TCTAGCGTTGAGAATCCTGAAGATGCATCCTTCTTTGAATCATTTGAAGGAGCTCACTCT
CTTCATGATCTATCCAGCTCCATTGCCAATAAACCTGGTGTGAAAGCGCCACCAGTGCGT
ATCGATAGCCAAGCGAAGTATGGAGCTTTATCTAGAGGAGATGGAGCTATATACTTAAGG
TTCCCTCATAAAGGATGCCGCGAGAAGATTTGGGACCATGTAGCTGGTGCAATAGTTGTT
ACAGAGGCTGGTGGGATCGTGACGGATGCAGGTGGGAAGGCATTGGATTTCTCGAAAGGG
AAGTATCTTGACTTGGACACAGGTATTATAGTTGCTAATGAGAAGCTAATGCCTCTGCTC
TTGAAAGCAGTTCGTGACTCCATTGCTGAGCAAGAGAAAGAAGCTTCATCTCTCTGATTC
TTTCCTTTGTTTTCTTTTGTAACTCTTTGTGTCCTTTCACCTCCACCACAAGGAATAATG
TTTCGTTACACACTGAGAGTGTCTTCTATTTATGTGCAATAATATTTCTCTCAATAGAGG
TTAACTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2A659TF U 1
AF RR2AL75TF U 1
AF RR2AL75JQ C 203
AF RR2A659JQ C 406
BS 1 272 RR2A659TF
BS 273 273 RR2AL75TF
BS 274 583 RR2A659TF
BS 584 584 RR2AL75TF
BS 585 720 RR2A659TF
BS 721 726 RR2AL75TF
BS 727 1028 RR2AL75JQ

RD RR2A659TF 720 0 0
GCTCTGAACCATTTTCACTGGTCGCTGAAGAGGACTCAGCTGATCTACGAAAGGATGGTT
CTCAGGATATTCTTGAGCGCATCACAAAACTCGTCAACGACACTTTGGCTAATGAGGATC
CACTCAAACCCATTGACTCTGCTTTGTCAACAGATGATCTTCTCAGAGCCATTGACTGCG
GCACATCCGAAGGTGGTCCTAACGGTCGACACTGGGTCTTGGACCCCATTGATGGCACTA
AAGGATTTTTGAGGGGAGATCAGTACGCAGTACCGCTAGGGTTGCTAGAGGAAGGGAAAG
TAGTGTTGGGTGTCCTTGCTTGTCCAAACTTGCCATTGGCTTCCATAGCAGGAAGCAGCC
AACAAGAACTCTTCTTCTTCTTCTTCAGAGGAAAAAGGATGTCTCTTCTATGCTACAATT
GGTTCAGGGACATACATGCAGCCCTTGGATTCGAAATCTGATCCAGTCAAAGTACATGCC
TCTAGCGTTGAGAATCCTGAAGATGCATCCTTCTTTGAATCATTTGAAGGAGCTCACTCT
CTTCATGATCTATCCAGCTCCATTGCCAATAAACCTGGTGTGAGAGCGCCACCAGTGCGT
ATCGATAGCCAAGCGAAGTATGGAGCTTTATCTAGAGGAGATGGAGCTATATACTTAAGG
TTCCCTCATAAAGGATGCCGCGAGAAGATTTGGGACCATGTAGCTGGTGCAATAGTTGTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2AL75TF 732 0 0
GCTCTGAACCATTTTCACTGGTCGCTGAAGAGGACTCAGCTGATCTACGAAAGGATGGTT
CTCAGGATATTCTTGAGCGCATCACAAAACTCGTCAACGACACTTTGGCTAATGAGGATC
CACTCAAACCCATTGACTCTGCTTTGTCAACAGATGATCTTCTCAGAGCCATTGACTGCG
GCACATCCGAAGGTGGTCCTAACGGTCGACACTGGGTCTTGGACCCCATTGATGGCACTA
AAGGATTTTTGAGGGGAGATCAGTACGCAGTAGCGCTAGGGTTGCTAGAGGAAGGGAAAG
TAGTGTTGGGTGTCCTTGCTTGTCCAAACTTGCCATTGGCTTCCATAGCAGGAAGCAGCC
AACAAGAACTCTTCTTCTTCTTCTTCAGAGGAAAAAGGATGTCTCTTCTATGCTACAATT
GGTTCAGGGACATACATGCAGCCCTTGGATTCGAAATCTGATCCAGTCAAAGTACATGCC
TCTAGCGTTGAGAATCCTGAAGATGCATCCTTCTTTGAATCATTTGAAGGAGCTCACTCT
CTTCATGATCTATCCAGCTCCATTGCCAATAAACCTGGTGTGAAAGCGCCACCAGTGCGT
ATCGATAGCCAAGCGAAGTATGGAGCTTTATCTAGAGGAGATGGAGCTATATACTTAAGG
TTCCCTCATAAAGGATGCCGCGAGAAGATTTGGGACCATGTAGCTGGTGCAATAGTTGTT
ACAGAG
CTGGTG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2AL75JQ 826 0 0
CGGTCGACACTGGGTCTTGGACCCCATTGATGGCACTAAAGGATTTTTGAGGGGAGATCA
GTACGCAGTAGCGCTAGGGTTGCTAGAGGAAGGGAAAGTAGTGTTGGGTGTCCTTGCTTG
TCCAAACTTGCCATTGGCTTCCATAGCAGGAAGCAGCCAACAAGAACTCTTCTTCTTCTT
CTTCAGAGGAAAAAGGATGTCTCTTCTATGCTACAATTGGTTCAGGGACATACATGCAGC
CCTTGGATTCGAAATCTGATCCAGTCAAAGTACATGCCTCTAGCGTTGAGAATCCTGAAG
ATGCATCCTTCTTTGAATCATTTGAAGGAGCTCACTCTCTTCATGATCTATCCAGCTCCA
TTGCCAATAAACCTGGTGTGAAAGCGCCACCAGTGCGTATCGATAGCCAAGCGAAGTATG
GAGCTTTATCTAGAGGAGATGGAGCTATATACTTAAGGTTCCCTCATAAAGGATGCCGCG
AGAAGATTTGGGACCATGTAGCTGGTGCAATAGTTGTTACAGAGGCTGGTGGGATCGTGA
CGGATGCAGGTGGGAAGGCATTGGATTTCTCGAAAGGGAAGTATCTTGACTTGGACACAG
GTATTATAGTTGCTAATGAGAAGCTAATGCCTCTGCTCTTGAAAGCAGTTCGTGACTCCA
TTGCTGAGCAAGAGAAAGAAGCTTCATCTCTCTGATTCTTTCCTTTGTTTTCTTTTGTAA
CTCTTTGTGTCCTTTCACCTCCACCACAAGGAATAATGTTTCGTTACACACTGAGAGTGT
CTTCTATTTATGTGCAATAATATTTCTCTCAATAGAGGTTAACTTT

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2A659JQ 623 0 0
TTCTATGCTACAATTGGTTCAGGGACATACATGCAGCCCTTGGATTCGAAATCTGATCCA
GTCAAAGTACATGCCTCTAGCGTTGAGAATCCTGAAGATGCATCCTTCTTTGAATCATTT
GAAGGAGCTCACTCTCTTCATGATCTATCCAGCTCCATTGCCAATAAACCTGGTGTGAAA
GCGCCACCAGTGCGTATCGATAGCCAAGCGAAGTATGGAGCTTTATCTAGAGGAGATGGA
GCTATATACTTAAGGTTCCCTCATAAAGGATGCCGCGAGAAGATTTGGGACCATGTAGCT
GGTGCAATAGTTGTTACAGAGGCTGGTGGGATCGTGACGGATGCAGGTGGGAAGGCATTG
GATTTCTCGAAAGGGAAGTATCTTGACTTGGACACAGGTATTATAGTTGCTAATGAGAAG
CTAATGCCTCTGCTCTTGAAAGCAGTTCGTGACTCCATTGCTGAGCAAGAGAAAGAAGCT
TCATCTCTCTGATTCTTTCCTTTGTTTTCTTTTGTAACTCTTTGTGTCCTTTCACCTCCA
CCACAAGGAATAATGTTTCGTTACACACTGAGAGTGTCTTCTATTTATGTGCAATAATAT
TTCTCTCAATAGAGGTTAACTTT

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 4

CO CL2852Contig1 1473 4 5 U
GGAAGAACCAGCTCATCATCTCGACTGTTATCATGACTGTTGGTATTGCTGTTGTGTCAT
ACGTTGTCTTGCCTACTTCCTTCACCATCTTCAACTTTGGAACACAAAAAGTCGTTCAGA
ACTGGCAGCTTTTCTTGTGTGTTTGTGTTGGTCTTTGGGCTGGACTCATCATTGGTTTCG
TCACTGAGTACTACACTAGCAACGCCTACAGCCCTGTGCAAGATGTTGCAGATTCATGCA
GAACTGGTGCAGCCACCAATGTTATATTCGGACTGGCTCTTGGTTACAAATCCGTCATCA
TTCCCATCTTTGCGATTGCTGTCAGCATATTCGTTAGCTTCAGCTTTGCTGCTATGTATG
GTGTTGCCGTTGCTGCTCTTGGGATGCTCAGCACCATCGCAACTGGTTTGGCGATCGATG
CTTACGGTCCCATCAGTGACAACGCTGGTGGTATTGCTGAAATGGCTGGGATGAGCCACC
GTATCCGTGAAAGAACCGATGCTCTTGATGCAGCTGGAAACACCACTGCCGCTATCGGAA
AAGGGTTTGCTATCGGCTCTGCTGCGTTGGTCTCGTTGGCTCTGTTTGGTGCCTTTGTGA
GCCGTGCGGGTGTCCACACCGTTGATGTTTTGACACCTAAGGTTATCATTGGGCTGCTTG
TCGGTGCTATGCTTCCTTACTGGTTCTCGGCCATGACGATGAAGAGTGTGGGAAGTGCGG
CTCTTAAGATGGTTGAAGAAGTTCGCAGGCAGTTCAACACCATCCCTGGACTCATGGAAG
GTACCGCGAAACCTGACTACGCCACGTGCGTCAAGATCTCCACTGATGCTTCCATCAAGG
AGATGATTCCTCCGGGTTGCCTTGTCATGCTCACACCTCTCATTGTTGGTTTCTTCTTTG
GTGTTGAGACTCTCTCTGGTGTTCTCGCCGGCTCTCTTGTTTCCGGTGTCCAGATTGCTA
TCTCTGCGTCTAACACTGGTGGTGCTTGGGACAACGCCAAGAAATACATCGAGGCTGGTG
TGTCAGAGCACGCAAAGAGTCTTGGACCAAAGGGTTCAGAGCCACACAAGGCAGCTGTGA
TTGGAGACACTATTGGAGACCCATTGAAAGATACTTCAGGACCTTCGTTGAACATCCTGA
TCAAGCTCATGGCTGTTGAGTCTCTCGTCTTTGCTCCCTTCTTTGCCACTCACGGTGGCA
TCCTTTTCAAGTACCTCTGAACTCAACCCTGAGTGAAGAAGAAAGATGATGATGAAGATG
GTTACAATGCCTCTTTTTACCATTCTTGTTTTCATTTTGCGTAGGTGGTTTTAAAACATT
TAGTTTGGACTCATTCCAAAGAACCAAACCAAAAGAAGTTTCTCTCTCTTTTTGTGCTGT
CTAGATTTTAGAAATCCACCAAGTACTTTGAGTTATGTTTTGGTCTTCTTCGAGACGAAT
GAGGTTTAAGTATCAGTCTTTTGTCGGCATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G511TF U 1
AF RR2CJ80TF U 536
AF RR2G511JQ C 1170
AF RR2CJ80JQ C 657
BS 1 635 RR2G511TF
BS 636 1194 RR2CJ80TF
BS 1195 1356 RR2CJ80JQ
BS 1357 1357 RR2G511JQ
BS 1358 1473 RR2CJ80JQ

RD RR2G511TF 635 0 0
GGAAGAACCAGCTCATCATCTCGACTGTTATCATGACTGTTGGTATTGCTGTTGTGTCAT
ACGTTGTCTTGCCTACTTCCTTCACCATCTTCAACTTTGGAACACAAAAAGTCGTTCAGA
ACTGGCAGCTTTTCTTGTGTGTTTGTGTTGGTCTTTGGGCTGGACTCATCATTGGTTTCG
TCACTGAGTACTACACTAGCAACGCCTACAGCCCTGTGCAAGATGTTGCAGATTCATGCA
GAACTGGTGCAGCCACCAATGTTATATTCGGACTGGCTCTTGGTTACAAATCCGTCATCA
TTCCCATCTTTGCGATTGCTGTCAGCATATTCGTTAGCTTCAGCTTTGCTGCTATGTATG
GTGTTGCCGTTGCTGCTCTTGGGATGCTCAGCACCATCGCAACTGGTTTGGCGATCGATG
CTTACGGTCCCATCAGTGACAACGCTGGTGGTATTGCTGAAATGGCTGGGATGAGCCACC
GTATCCGTGAAAGAACCGATGCTCTTGATGCAGCTGGAAACACCACTGCCGCTATCGGAA
AAGGGTTTGCTATCGGCTCTGCTGCGTTGGTCTCGTTGGCTCTGTTTGGTGCCTTTGTGA
GCCGTGCGGGTGTCCACACCGTTGATGTTTTGACA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2CJ80TF 662 0 0
G
GGAAAAGGGTTTGCTATCGGCTCTGCTGCGTTGGTCTCGTTGGCTCTGTTTGGTGCCTTT
GTGAGCCGTGCGGGTGTCCACACCGTTGATGTTTTGACACCTAAGGTTATCATTGGGCTG
CTTGTCGGTGCTATGCTTCCTTACTGGTTCTCGGCCATGACGATGAAGAGTGTGGGAAGT
GCGGCTCTTAAGATGGTTGAAGAAGTTCGCAGGCAGTTCAACACCATCCCTGGACTCATG
GAAGGTACCGCGAAACCTGACTACGCCACGTGCGTCAAGATCTCCACTGATGCTTCCATC
AAGGAGATGATTCCTCCGGGTTGCCTTGTCATGCTCACACCTCTCATTGTTGGTTTCTTC
TTTGGTGTTGAGACTCTCTCTGGTGTTCTCGCCGGCTCTCTTGTTTCCGGTGTCCAGATT
GCTATCTCTGCGTCTAACACTGGTGGTGCTTGGGACAACGCCAAGAAATACATCGAGGCT
GGTGTGTCAGAGCACGCAAAGAGTCTTGGACCAAAGGGTTCAGAGCCACACAAGGCAGCT
GTGATTGGAGACACTATTGGAGACCCATTGAAAGATACTTCAGGACCTTCGTTGAACATC
CTGATCAAGCTCATGGCTGTTGAGTCTCTCGTCTTTGCTCCCTTCTTTGCCACTCACG
TGG

QA 2 659 2 659
DS 

RD RR2G511JQ 192 0 0
TTTGCTCCCTTCTTTGCCACTCACGGTGGCATCCTTTTCAAGTACCTCTGAACTCAACCC
TGAGTGAAGAAGAAAGATGATGATGAAGATGGTTACAATGCCTCTTTTTACCATTTTTGT
TTTCATTTTGCGTAGGTGGTTTTAAAACATTTAGTTTGGACTCATTCCAAAGAACCAAAC
CAAAAGAAGTTT

QA 1 192 1 192
DS 

RD RR2CJ80JQ 817 0 0
CTTGTCGGTGCTATGCTTC*TTACTGGTTCTCGGCCATGACGATGAAGAGTGTGGGAAGT
GCGGCTCTTAAGATGGTTGAAGAAGTTCGCAGGCAGTTCAACACCATCCCTGGACTCATG
GAAGGTACCGCGAAACCTGACTACGCCACGTGCGTCAAGATCTCCACTGATGCTTCCATC
AAGGAGATGATTCCTCCGGGTTGCCTTGTCATGCTCACACCTCTCATTGTTGGTTTCTTC
TTTGGTGTTGAGACTCTCTCTGGTGTTCTCGCCGGCTCTCTTGTTTCCGGTGTCCAGATT
GCTATCTCTGCGTCTAACACTGGTGGTGCTTGGGACAACGCCAAGAAATACATCGAGGCT
GGTGTGTCAGAGCACGCAAAGAGTCTTGGACCAAAGGGTTCAGAGCCACACAAGGCAGCT
GTGATTGGAGACACTATTGGAGACCCATTGAAAGATACTTCAGGACCTTCGTTGAACATC
CTGATCAAGCTCATGGCTGTTGAGTCTCTCGTCTTTGCTCCCTTCTTTGCCACTCACGGT
GGCATCCTTTTCAAGTACCTCTGAACTCAACCCTGAGTGAAGAAGAAAGATGATGATGAA
GATGGTTACAATGCCTCTTTTTACCATTCTTGTTTTCATTTTGCGTAGGTGGTTTTAAAA
CATTTAGTTTGGACTCATTCCAAAGAACCAAACCAAAAGATGTTTCTCTCTCTTTTTGTG
CTGTCTAGATTTTAGAAATCCACCAAGTACTTTGAGTTATGTTTTGGTCTTCTTCGAGAC
GAATGAGGTTTAAGTATCAGTCTTTTGTCGGCATTGG

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 4

CO CL2853Contig1 1022 4 4 U
GTGGGAAAAGGTCAGATATGGATTAACGGGCAGAGCATTGGGCGTCACTGGACTGCTTAT
AAAGCAGTCGGTTCTTGCGGCGAGTGTTCTTATACCGGAACATTCAACGAGAACAAGTGC
TTAAGAAACTGTGGAGAGGCTTCTCAGAGATGGTACCATGTCCCAAGGTCGTGGCTGAAA
CCAACTGGGAATCTATTGGTTGTCTTCGAGGAATGGGGAGGAGATCCGAACGGAATCTCG
TTTGTCAGAAGGGAGGTGGACAGTGTCTGTGCAGATATCTATGAATGGCAATCAACGCTT
GTGAACTACCAATTGCGTTCTTCGGGGAAAGTTAACAAGCCGCTGCATCCCAAAGTGCAT
TTGCAATGTGGGCCTGGGCAGAAGATGACCGCAGTGAAGTTTGCTAGCTTCGGTACACCT
GAAGGAACTTGTGGTAGTTACCGTCAAGGAAGCTGTCATGCTCATCACTCTTATGATGCT
TTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGTTCTGTAACCGTAGCACCTGAGATGTTT
GGTGGAGATCCGTGTCCAAATGTAATGAAGAAACTAGCCGTGGAAGCGGTTTGCGCTTAA
AAATGAAAACCTGAGTTGGTTACTTTTGCATTCTTACAGGTTTTCTTGTCCGTATTAGTA
TGTTATGTCTATTTATTCCGGTGGAAGTTGTACAAAGGGACACAACACACACCGTTCAAC
TATTTTCAGAGTTGTGATTTATATGTAAATAAGCTTGGGATGGATTTGGTAACTGCAGAA
GAGGCACATTGAGACTGGAGAATTTGAGTCGATGTGTGGATTCTTTGCTAGAAACTTTTG
AAGGCAGAACTGAGATTAGACTGTTCTCCTGGGGTTTGCTGTTGTTGTCATTGATGCTAA
ATAGATGAGACACTTTCTGCAACTATCTCATTGTTTAATCAATGTCAACTATTGCTAGTT
CGTCACATCTGTTATGTACTTGTCTCTATTATCAACTAGTATATATAAATTTAGCCCAAA
AT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2AN69TF U 1
AF RR2FA16TF U 2
AF RR2FA16JQ C 207
AF RR2AN69JQ C 216
BS 1 675 RR2AN69TF
BS 676 685 RR2FA16TF
BS 686 759 RR2FA16JQ
BS 760 1022 RR2AN69JQ

RD RR2AN69TF 675 0 0
GTGGGAAAAGGTCAGATATGGATTAACGGGCAGAGCATTGGGCGTCACTGGACTGCTTAT
AAAGCAGTCGGTTCTTGCGGCGAGTGTTCTTATACCGGAACATTCAACGAGAACAAGTGC
TTAAGAAACTGTGGAGAGGCTTCTCAGAGATGGTACCATGTCCCAAGGTCGTGGCTGAAA
CCAACTGGGAATCTATTGGTTGTCTTCGAGGAATGGGGAGGAGATCCGAACGGAATCTCG
TTTGTCAGAAGGGAGGTGGACAGTGTCTGTGCAGATATCTATGAATGGCAATCAACGCTT
GTGAACTACCAATTGCGTTCTTCGGGGAAAGTTAACAAGCCGCTGCATCCCAAAGTGCAT
TTGCAATGTGGGCCTGGGCAGAAGATGACCGCAGTGAAGTTTGCTAGCTTCGGTACACCT
GAAGGAACTTGTGGTAGTTACCGTCAAGGAAGCTGTCATGCTCATCACTCTTATGATGCT
TTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGTTCTGTAACCGTAGCACCTGAGATGTTT
GGTGGAGATCCGTGTCCAAATGTAATGAAGAAACTAGCCGTGGAAGCGGTTTGCGCTTAA
AAATGAAAACCTGAGTTGGTTACTTTTGCATTCTTACAGGTTTTCTTGTCCGTATTAGTA
TGTTATGTCTATTTA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2FA16TF 684 0 0
G
GGGAAAAGGTCAGATATGGATTAACGGGCAGAGCATTGGGCGTCACTGGACTGCTTATAA
AGCAGTCGGTTCTTGCGGCGAGTGTTCTTATACCGGAACATTCAACGAGAACAAGTGCTT
AAGAAACTGTGGAGAGGCTTCTCAGAGATGGTACCATGTCCCAAGGTCGTGGCTGAAACC
AACTGGGAATCTATTGGTTGTCTTCGAGGAATGGGGAGGAGATCCGAACGGAATCTCGTT
TGTCAGAAGGGAGGTGGACAGTGTCTGTGCAGATATCTATGAATGGCAATCAACGCTTGT
GAACTACCAATTGCGTTCTTCGGGGAAAGTTAACAAGCCGCTGCATCCCAAAGTGCATTT
GCAATGTGGGCCTGGGCAGAAGATGACCGCAGTGAAGTTTGCTAGCTTCGGTAC**CTGA
AGGAACTTGTGGTAGTTACCGTCAAGGAAGCTGTCATGCTCATCACTCTTATGATGCTTT
CAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGTTCTGTAACCGTAGCACCTGAGATGTTTGG
TGGAGATCCGTGTCCAAATGTAATGAAGAAACTAGCCGTGGAAGCGGTTTGCGCTTAAAA
ATGAAAACCTGAGTTGGTTACTTTTGCATTCTTACAGGTTTTCTTGTCCGTATTAGTATG
TTATGTCTATTTATTCCGGTGGA

QA 2 684 2 684
DS 

RD RR2FA16JQ 553 0 0
CGAGGAATGGGGAGGAGATCCGAACGGAATCTCGTTTGTCAGAAGGGAGGTGGACAGTGT
CTGTGCAGATATCTATGAATGGCAATCAACGCTTGTGAACTACCAATTGCGTTCTTCGGG
GAAAGTTAACAAGCCGCTGCATCCCAAAGTGCATTTGCAATGTGGGCCTGGGCAGAAGAT
GACCGCAGTGAAGTTTGCTAGCTTCGGTAC**CTGAAGGAACTTGTGGTAGTTACCGTCA
AGGAAGCTGTCATGCTCATCACTCTTATGATGCTTTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAA
CTGGTGTTCTGTAACCGTAGCACCTGAGATGTTTGGTGGAGATCCGTGTCCAAATGTAAT
GAAGAAACTAGCCGTGGAAGCGGTTTGCGCTTAAAAATGAAAACCTGAGTTGGTTACTTT
TGCATTCTTACAGGTTTTCTTGTCCGTATTAGTATGTTATGTCTATTTATTCCGGTGGAA
GTTGTACAAAGGGACACAACACACACCGTTCAACTATTTTCAGAGTTGTGATTTATATGT
AAATAAGCTTGGG

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2AN69JQ 807 0 0
GGGAGGAGATCCGAACGGAATCTCGTTTGTCAGAAGGGAGGTGGACAGTGTCTGTGCAGA
TATCTATGAATGGCAATCAACGCTTGTGAACTACCAATTGCGTTCTTCGGGGAAAGTTAA
CAAGCCGCTGCATCCCAAAGTGCATTTGCAATGTGGGCCTGGGCAGAAGATGACCGCAGT
GAAGTTTGCTAGCTTCGGTACACCTGAAGGAACTTGTGGTAGTTACCGTCAAGGAAGCTG
TCATGCTCATCACTCTTATGATGCTTTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGTTC
TGTAACCGTAGCACCTGAGATGTTTGGTGGAGATCCGTGTCCAAATGTAATGAAGAAACT
AGCCGTGGAAGCGGTTTGCGCTTAAAAATGAAAACCTGAGTTGGTTACTTTTGCATTCTT
ACAGGTTTTTTTGTCCGTATTAGTATGTTATGTCTATTTATTCCGGTGGAAGTTGTACAA
AGGGACACAACACACACCGTTCAACTATTTTCAGAGTTGTGATTTATATGTAAATAAGCT
TGGGATGGATTTGGTAACTGCAGAAGAGGCACATTGAGACTGGAGAATTTGAGTCGATGT
GTGGATTCTTTGCTAGAAACTTTTGAAGGCAGAACTGAGATTAGACTGTTCTCCTGGGGT
TTGCTGTTGTTGTCATTGATGCTAAATAGATGAGACACTTTCTGCAACTATCTCATTGTT
TAATCAATGTCAACTATTGCTAGTTCGTCACATCTGTTATGTACTTGTCTCTATTATCAA
CTAGTATATATAAATTTAGCCCAAAAT

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 4

CO CL2854Contig1 1082 4 2 U
GGAAGGAGGAGGAGGAGGAGCCATGAGTTCGCTGTTCACTCCTTTTTCTGCTCTCCCTTT
GCGCAATACCAGAGCTACTGTCTCCTGTTGCTCTTCTGGGCATGTATCATTTATCAAAGA
TGTAGCTGTCACTGAACCACCAATGCGTCTTCAACACTTACTCAAAGTTCTTCAAACAAG
AGGTGAAACCATCATGTCTCCTGGAGCTAAGCAGGGACTCATCCCTCTTGCTATTCCCCT
TTCTAAGGACTCTTCCGGCTCTGTTACTGCGCTTCTGAGATGGCCTACTGCTCCACCAGG
AATGGATATGCCTGTTGTTGAAGTTTGGAGGAGTGGTGTCCGGCTAATAGCTAGAAATGT
AGATGAGTATATTCACCGGATTCTTGTTGAAAAAGATGCTCAAGAGTTGTCAGAACTTTA
CATTGCTTCAGCGGAGGCAGGCGAGAAGCTTTACAAAAAGGGTGCTTTTGCTGAATCTCA
GATTGAAAACCTCAATGTCTATGTCTTAAAAAAGGTTGGTCTGTTTCCTGATGTGTTGGA
GCGAAAAGTATTACGGCATTTCGATGAAGGAGATCATGTTTCAGCTATGGTGACAGGAGA
ATTCTACACGAAGAAAGATCTGTTTCCAGGATTTGGACGGCCTTTTGTATATTATGCAAA
CATACTGCAGAAGGTAGGACGCAATTCAGAAGCAAAAGAATCGGCCAGAGTATCACTAAA
ATCACCTTGGTGGACATTAGGATGTCCTTATGAGGAGGTTGCTAGTATTGCACAATGGGA
CGATGAGCAAATCGAATTCATAAGAGAGAAGGTGAGTGATGAAGGTCGTTTTGAGGATTT
GAAGAAAGGTAAAGACCCAATGCAAGTTGCTGTGGATGTTGCCGCTTTTCTCTTGGACTT
GGCATCTATTGAAGGAACATGGTCTGAATCTTTGCCCCATATTGCTAAATGTTATGAATA
GGCTGGATTAAGGGACATATCTAACTTCATTTTGTACACAGATGACAAATGAAAAAAAAA
CTCTATGTTGTGTATGATACAAGATTGTTTCATTGTAATAAATATCAAAAGTTTTGGTTT
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 

AF RR2G202TF U 1
AF RR2G166TF U 88
AF RR2G202JQ C 316
AF RR2G166JQ C 349
BS 1 673 RR2G202TF
BS 674 1082 RR2G202JQ

RD RR2G202TF 686 0 0
GGAAGGAGGAGGAGGAGGAGCCATGAGTTCGCTGTTCACTCCTTTTTCTGCTCTCCCTTT
GCGCAATACCAGAGCTACTGTCTCCTGTTGCTCTTCTGGGCATGTATCATTTATCAAAGA
TGTAGCTGTCACTGAACCACCAATGCGTCTTCAACACTTACTCAAAGTTCTTCAAACAAG
AGGTGAAACCATCATGTCTCCTGGAGCTAAGCAGGGACTCATCCCTCTTGCTATTCCCCT
TTCTAAGGACTCTTCCGGCTCTGTTACTGCGCTTCTGAGATGGCCTACTGCTCCACCAGG
AATGGATATGCCTGTTGTTGAAGTTTGGAGGAGTGGTGTCCGGCTAATAGCTAGAAATGT
AGATGAGTATATTCACCGGATTCTTGTTGAAAAAGATGCTCAAGAGTTGTCAGAACTTTA
CATTGCTTCAGCGGAGGCAGGCGAGAAGCTTTACAAAAAGGGTGCTTTTGCTGAATCTCA
GATTGAAAACCTCAATGTCTATGTCTTAAAAAAGGTTGGTCTGTTTCCTGATGTGTTGGA
GCGAAAAGTATTACGGCATTTCGATGAAGGAGATCATGTTTCAGCTATGGTGACAGGAGA
ATTCTACACGAAGAAAGATCTGTTTCCAGGATTTGGACGGCCTTTTGTATATTATGCAAA
CATACTGCAGAAG
TAGACGCAATTCA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2G166TF 603 0 0
TTGCTCTTCTGGGCATGTATCATTTATCAAAGATGTAGCTGTCACTGAACCACCAATGCG
TCTTCAACACTTACTCAAAGTTCTTCAAACAAGAGGTGAAACCATCATGTCTCCTGGAGC
TAAGCAGGGACTCATCCCTCTTGCTATTCCCCTTTCTAAGGACTCTTCCGGCTCTGTTAC
TGCGCTTCTGAGATGGCCTACTGCTCCACCAGGAATGGATATGCCTGTTGTTGAAGTTTG
GAGGAGTGGTGTCCGGCTAATAGCTAGAAATGTAGATGAGTATATTCACCGGATTCTTGT
TGAAAAAGATGCTCAAGAGTTGTCAGAACTTTACATTGCTTCAGCGGAGGCAGGCGAGAA
GCTTTACAAAAAGGGTGCTTTTGCTGAATCTCAGATTGAAAACCTCAATGTCTATGTCTT
AAAAAAGGTTGGTCTGTTTCCTGATGTGTTGGAGCGAAAAGTATTACGGCATTTCGATGA
AGGAGATCATGTTTCAGCTATGGTGACAGGAGAATTCTACACGAAGAAAGATCTGTTTCC
AGGATTTGGACGGCCTTTTGTATATTATGCAAACATACTGCAGAAG
GTAGGACGCAATTCAGA

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2G202JQ 767 0 0
TGTTGAAGTTTGGAGGAGTGGTGTCCGGCTAATAGCTAGAAATGTAGATGAGTATATTCA
CCGGATTCTTGTTGAAAAAGATGCTCAAGAGTTGTCAGAACTTTACATTGCTTCAGCGGA
GGCAGGCGAGAAGCTTTACAAAAAGGGTGCTTTTGCTGAATCTCAGATTGAAAACCTCAA
TGTCTATGTCTTAAAAAAGGTTGGTCTGTTTCCTGATGTGTTGGAGCGAAAAGTATTACG
GCATTTCGATGAAGGAGATCATGTTTCAGCTATGGTGACAGGAGAATTCTACACGAAGAA
AGATCTGTTTCCAGGATTTGGACGGCCTTTTGTATATTATGCAAACATACTGCAGAAGGT
AGGACGCAATTCAGAAGCAAAAGAATCGGCCAGAGTATCACTAAAATCACCTTGGTGGAC
ATTAGGATGTCCTTATGAGGAGGTTGCTAGTATTGCACAATGGGACGATGAGCAAATCGA
ATTCATAAGAGAGAAGGTGAGTGATGAAGGTCGTTTTGAGGATTTGAAGAAAGGTAAAGA
CCCAATGCAAGTTGCTGTGGATGTTGCCGCTTTTCTCTTGGACTTGGCATCTATTGAAGG
AACATGGTCTGAATCTTTGCCCCATATTGCTAAATGTTATGAATAGGCTGGATTAAGGGA
CATATCTAACTTCATTTTGTACACAGATGACAAATGAAAAAAAAACTCTATGTTGTGTAT
GATACAAGATTGTTTCATTGTAATAAATATCAAAAGTTTTGGTTTCT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2G166JQ 734 0 0
AGCTAGAAATGTAGATGAGTATATTCACCGGATTCTTGTTGAAAAAGATGCTCAAGAGTT
GTCAGAACTTTACATTGCTTCAGCGGAGGCAGGCGAGAAGCTTTACAAAAAGGGTGCTTT
TGCTGAATCTCAGATTGAAAACCTCAATGTCTATGTCTTAAAAAAGGTTGGTCTGTTTCC
TGATGTGTTGGAGCGAAAAGTATTACGGCATTTCGATGAAGGAGATCATGTTTCAGCTAT
GGTGACAGGAGAATTCTACACGAAGAAAGATCTGTTTCCAGGATTTGGACGGCCTTTTGT
ATATTATGCAAACATACTGCAGAAGGTAGGACGCAATTCAGAAGCAAAAGAATCGGCCAG
AGTATCACTAAAATCACCTTGGTGGACATTAGGATGTCCTTATGAGGAGGTTGCTAGTAT
TGCACAATGGGACGATGAGCAAATCGAATTCATAAGAGAGAAGGTGAGTGATGAAGGTCG
TTTTGAGGATTTGAAGAAAGGTAAAGACCCAATGCAAGTTGCTGTGGATGTTGCCGCTTT
TCTCTTGGACTTGGCATCTATTGAAGGAACATGGTCTGAATCTTTGCCCCATATTGCTAA
ATGTTATGAATAGGCTGGATTAAGGGACATATCTAACTTCATTTTGTACACAGATGACAA
ATGAAAAAAAAACTCTATGTTGTGTATGATACAAGATTGTTTCATTGTAATAAATATCAA
AAGTTTTGGTTTCT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 2 4

CO CL2855Contig1 758 2 3 U
GGGGTCTTCGAGAGAACGGAGAAAGAAAGAGAAACAATCTTTCGTTGAAAAAGATATCTG
AGAGAGAGAGAGAGAGATAATGGCGGAGATCAATGGTCGGAGGATCGGAGTAGCAGTGGA
TTTCTCGGAGTGCAGCAAGAAGGCTCTGAACTGGGCGATCGACAACGTGGTTCGCGATGG
CGATTATCTAATACTCATCACCGTAGCTCATGATATGCATTACGAGGAAGGCGAGATGCA
GCTCTGGGAGACCGTTGGTTCTCCTCTGATTCCGCTGAGTGAATTCTCGGAAGCTGCTGT
GATGAAGAAGTATGGAGTGAAGCCAGATGCTGAAACCCTTGACATTGCCAACACTGCCGC
TAGGCAGAAATCGATAACAGTAGTGATGAAGATATATTGGGGAGATCCTCGTGAGAAGAT
TTGCGAAGCTGTTGAACATATTCCTCTCTCTAGCCTTGTCATCGGTAACCGAGGCCTTGG
TGGCCTTAAGAGGATGATAATGGGAAGTGTAAGCAACCATGTTGTGAACAACGTGGCATG
CCCTGTGACCGTCGTGAAGGCTCATCACTGAGCTCTGTGTTGATACTGCTCCGGAGAAGC
TGATAACCTACCGGTGTATATCCTAAGATTTGTGTGCCGTTCTGTCTTAATATGTATTTA
TAACTCTTGCGTCACTTGTATGTTGTTTATTCTTGTGCATCTTTTTCTTTTCACTGGGTA
AAAATATTTCTACCTTCTAATAATAATTACTCGTTTTG


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB90TF U 1
AF RR2CB90JQ C 1
BS 1 3 RR2CB90JQ
BS 4 402 RR2CB90TF
BS 403 758 RR2CB90JQ

RD RR2CB90TF 402 0 0
GGG
GTCTTCGAGAGAACGGAGAAAGAAAGAGAAACAATCTTTCGTTGAAAAAGATATCTGAGA
GAGAGAGAGAGAGATAATGGCGGAGATCAATGGTCGGAGGATCGGAGTAGCAGTGGATTT
CTCGGAGTGCAGCAAGAAGGCTCTGAACTGGGCGATCGACAACGTGGTTCGCGATGGCGA
TTATCTAATACTCATCACCGTAGCTCATGATATGCATTACGAGGAAGGCGAGATGCAGCT
CTGGGAGACCGTTGGTTCTCCTCTGATTCCGCTGAGTGAATTCTCGGAAGCTGCTGTGAT
GAAGAAGTATGGAGTGAAGCCAGATGCTGAAACCCTTGACATTGCCAACACTGCCGCTAG
GCAGAAATCGATAACAGTAGTGATGAAGATATATTGGGG

QA 4 402 4 402
DS 

RD RR2CB90JQ 758 0 0
GGGGTCTTCGAGAGAACGGAGAAAGAAAGAGAAACAATCTTTCGTTGAAAAAGATATCTG
AGAGAGAGAGAGAGAGATAATGGCGGAGATCAATGGTCGGAGGATCGGAGTAGCAGTGGA
TTTCTCGGAGTGCAGCAAGAAGGCTCTGAACTGGGCGATCGACAACGTGGTTCGCGATGG
CGATTATCTAATACTCATCACCGTAGCTCATGATATGCATTACGAGGAAGGCGAGATGCA
GCTCTGGGAGACCGTTGGTTCTCCTCTGATTCCGCTGAGTGAATTCTCGGAAGCTGCTGT
GATGAAGAAGTATGGAGTGAAGCCAGATGCTGAAACCCTTGACATTGCCAACACTGCCGC
TAGGCAGAAATCGATAACAGTAGTGATGAAGATATATTGGGGAGATCCTCGTGAGAAGAT
TTGCGAAGCTGTTGAACATATTCCTCTCTCTAGCCTTGTCATCGGTAACCGAGGCCTTGG
TGGCCTTAAGAGGATGATAATGGGAAGTGTAAGCAACCATGTTGTGAACAACGTGGCATG
CCCTGTGACCGTCGTGAAGGCTCATCACTGAGCTCTGTGTTGATACTGCTCCGGAGAAGC
TGATAACCTACCGGTGTATATCCTAAGATTTGTGTGCCGTTCTGTCTTAATATGTATTTA
TAACTCTTGCGTCACTTGTATGTTGTTTATTCTTGTGCATCTTTTTCTTTTCACTGGGTA
AAAATATTTCTACCTTCTAATAATAATTACTCGTTTTG

QA 1 758 1 758
DS 



CO CL2855Contig2 782 2 2 U
GGAGTCTCCTAGTCTATACCACTTGTCTTCGAGAGAGCGGAGAAAGAAAGAGAAACAATC
TTTCGTTGAAAAAGATATCTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAATGGCGGAGATCAATG
GTCGGAGGATCGGAGTAGCAGTGGATTTCTCGGAGTGCAGCAAGAAGGCTCTGAACTGGG
CGATCGACAACGTGGTTCGCGATGGCGATTATCTAATACTCATCACCGTAGCTCATGATA
TGCATTACGAGGAAGGCGAGATGCAGCTCTGGGAGACCGTTGGTTCTCCTCTGATTCCGC
TGAGTGAATTCTCGGAAGCTGCTGTGATGAAGAAGTATGGAGTGAAGCCAGATGCTGAAA
CCCTTGACATTGCCAACACTGCCGCTAGGCAGAAATCGATAACAGTAGTGATGAAGATAT
ATTGGGGAGATCCTCGTGAGAAGATTTGCGAAGCTGTTGAACATATTCCTCTCTCTAGCC
TTGTCATCGGTAACCGAGGCCTTGGTGGCCTTAAGAGGATGATAATGGGAAGTGTAAGCA
ACCATGTTGTGAACAACGTGGCATGCCCTGCCACCGTCGTGAAGGCTCACCACTGAGCTC
TCTGTTGATACTGCTCCGGAGAAGCTGATAACCTACCGGTGTTATATCCTAAGATTTGTG
TGTCGTTGTTGTCTTAATATGGATTTATAACTCTTGTGTCACTTGTATGTTGTTTATTCT
TGTGCATCTTTGTCTTTTCACCGGGTAAAAATATTTCTACCTTCTAATAATAATTACTCG
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2F458TF U 1
AF RR2F458JQ C 91
BS 1 612 RR2F458TF
BS 613 782 RR2F458JQ

RD RR2F458TF 612 0 0
GGAGTCTCCTAGTCTATACCACTTGTCTTCGAGAGAGCGGAGAAAGAAAGAGAAACAATC
TTTCGTTGAAAAAGATATCTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAATGGCGGAGATCAATG
GTCGGAGGATCGGAGTAGCAGTGGATTTCTCGGAGTGCAGCAAGAAGGCTCTGAACTGGG
CGATCGACAACGTGGTTCGCGATGGCGATTATCTAATACTCATCACCGTAGCTCATGATA
TGCATTACGAGGAAGGCGAGATGCAGCTCTGGGAGACCGTTGGTTCTCCTCTGATTCCGC
TGAGTGAATTCTCGGAAGCTGCTGTGATGAAGAAGTATGGAGTGAAGCCAGATGCTGAAA
CCCTTGACATTGCCAACACTGCCGCTAGGCAGAAATCGATAACAGTAGTGATGAAGATAT
ATTGGGGAGATCCTCGTGAGAAGATTTGCGAAGCTGTTGAACATATTCCTCTCTCTAGCC
TTGTCATCGGTAACCGAGGCCTTGGTGGCCTTAAGAGGATGATAATGGGAAGTGTAAGCA
ACCATGTTGTGAACAACGTGGCATGCCCTGCCACCGTCGTGAAGGCTCACCACTGAGCTC
TCTGTTGATACT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2F458JQ 692 0 0
GAGAGAGAGAGATAATGGCGGAGATCAATGGTCGGAGGATCGGAGTAGCAGTGGATTTCT
CGGAGTGCAGCAAGAAGGCTCTGAACTGGGCGATCGACAACGTGGTTCGCGATGGCGATT
ATCTAATACTCATCACCGTAGCTCATGATATGCATTACGAGGAAGGCGAGATGCAGCTCT
GGGAGACCGTTGGTTCTCCTCTGATTCCGCTGAGTGAATTCTCGGAAGCTGCTGTGATGA
AGAAGTATGGAGTGAAGCCAGATGCTGAAACCCTTGACATTGCCAACACTGCCGCTAGGC
AGAAATCGATAACAGTAGTGATGAAGATATATTGGGGAGATCCTCGTGAGAAGATTTGCG
AAGCTGTTGAACATATTCCTCTCTCTAGCCTTGTCATCGGTAACCGAGGCCTTGGTGGCC
TTAAGAGGATGATAATGGGAAGTGTAAGCAACCATGTTGTGAACAACGTGGCATGCCCTG
CCACCGTCGTGAAGGCTCACCACTGAGCTCTCTGTTGATACTGCTCCGGAGAAGCTGATA
ACCTACCGGTGTTATATCCTAAGATTTGTGTGTCGTTGTTGTCTTAATATGGATTTATAA
CTCTTGTGTCACTTGTATGTTGTTTATTCTTGTGCATCTTTGTCTTTTCACCGGGTAAAA
ATATTTCTACCTTCTAATAATAATTACTCGTT

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 4

CO CL2856Contig1 711 4 3 U
CAAACACCCAAAAACATAAAATACTGATATATAACTTGATAGATATTTATGATAACACAC
TTTCATATCACTCACATCTCTTTTGATCTAGAGAGAGCATTATTTGATACAGACCACCCA
AATACATAAAGATAGATACATATTATAGAGATATTCGACGAGTATCTATTCCTCAAGGAG
AAGCATTTCGTCAATGTCTTTGAACATTTCGACACCAGTTTGGAGCAAAGTCTCTGGGTG
AGCCACGTTTTCATCAATCCTCTCATATATCATTTTCAATTTCGCCACGCCTCCAGATCC
TCCTTGATTTGGAGTCACCTGGATCGTGACTAAAAAGCTCTTGAACTCTTCTGTAAGATC
TCCCTCTATCACTTTCAGCTTTATCATATTCTTCTTCGGATCCACTGCCTCGATCCTCTG
CTTGGCCACATTTGGCTTCCCATCAAGAACATAGTTCCAAGTGATGAGAGTGCCAACTCT
TCCCATCTCTCCCCCTTGCACACGACATCCCTGGACGGTTCCAGGAGAGGCTTTAGAAAC
ACCTTGTGGTCTCACTGCGAACATGTGAAAGAATTTCTTGGCCGGAGCTTTAATCTCCAC
ATCTGCCTCAACCATTCCGTGTAAAGAAGAATTCATCATCGCATGTGCCAGTTTTCTCCA
GATGATTAAATGCTTATCTAGTTTACTTTTATAATGAGAGTAAGTGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2F651JQ U 1
AF RR2F651TF C 323
AF RR2D284TF C 17
AF RR2D284JQ U 18
BS 1 260 RR2F651JQ
BS 261 261 RR2D284JQ
BS 262 711 RR2F651JQ

RD RR2F651JQ 711 0 0
CAAACACCCAAAAACATAAAATACTGATATATAACTTGATAGATATTTATGATAACACAC
TTTCATATCACTCACATCTCTTTTGATCTAGAGAGAGCATTATTTGATACAGACCACCCA
AATACATAAAGATAGATACATATTATAGAGATATTCGACGAGTATCTATTCCTCAAGGAG
AAGCATTTCGTCAATGTCTTTGAACATTTCGACACCAGTTTGGAGCAAAGTCTCTGGGTG
AGCCACGTTTTCATCAATCCCCTCATATATCATTTTCAATTTCGCCACGCCTCCAGATCC
TCCTTGATTTGGAGTCACCTGGATCGTGACTAAAAAGCTCTTGAACTCTTCTGTAAGATC
TCCCTCTATCACTTTCAGCTTTATCATATTCTTCTTCGGATCCACTGCCTCGATCCTCTG
CTTGGCCACATTTGGCTTCCCATCAAGAACATAGTTCCAAGTGATGAGAGTGCCAACTCT
TCCCATCTCTCCCCCTTGCACACGACATCCCTGGACGGTTCCAGGAGAGGCTTTAGAAAC
ACCTTGTGGTCTCACTGCGAACATGTGAAAGAATTTCTTGGCCGGAGCTTTAATCTCCAC
ATCTGCCTCAACCATTCCGTGTAAAGAAGAATTCATCATCGCATGTGCCAGTTTTCTCCA
GATGATTAAATGCTTATCTAGTTTACTTTTATAATGAGAGTAAGTGAGTCC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2F651TF 389 0 0
ATCGTGACTAAAAAGCTCTTGAA*TCTTCTGTAAGATCTCCCTCTATCACTTTCAGCTTT
ATCATATTCTTCTTCGGATCCACTGCCTCGATCCTCTGCTTGGCCACATTTGGCTTCCCA
TCAAGAACATAGTTCCAAGTGATGAGAGTGCCAACTCTTCCCATCTCTCCCCCTTGCACA
CGACATCCCTGGACGGTTCCAGGAGAGGCTTTAGAAACACCTTGTGGTCTCACTGCGAAC
ATGTGAAAGAATTTCTTGGCCGGAGCTTTAATCTCCACATCTGCCTCAACCATTCCGTGT
AAAGAAGAATTCATCATCGCATGTGCCAGTTTTCTCCAGATGATTAAATGCTTATCTAGT
TTACTTTTATAATGAGAGTAAGTGAGTCC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2D284TF 695 0 0
T
AAAATACTGATATATAACTTGATAGATATTTATGATAACACACTTTCATATCACTCACAT
CTCTTTTGATCTAGAGAGAGCATTATTTGATACAGACCACCCAAATACATAAAGATAGAT
ACATATTATAGAGATATTCGACGAGTATCTATTCCTCAAGGAGAAGCATTTCGTCAATGT
CTTTGAACATTTCGACACCAGTTTGGAGCAAAGTCTCTGGGTGAGCCACGTTTTCATCAA
TCCTCTCATATATCATTTTCAATTTCGCCACGCCTCCAGATCCTCCTTGATTTGGAGTCA
CCTGGATCGTGACTAAAAAGCTCTTGAACTCTTCTGTAGGATCTCCCTCTATCACTTTCA
GCTTTATCATATTCTTCTTCGGATCCACTGCCTCGATCCTCTGCTTGGCCACATTTGGCT
TCCCATCAAGAACATAGTTCCAAGTGATGAGAGTGCCAACTCTTCCCATCTCTCCCCCTT
GCACACGACATCCCTGGACGGTTCCAGGAGAGGCTTTAGAAACATCTTGTGGTCTCACTG
CGAACATGTGAAAGAATTTCTTGGCCGGAGCTTTAATCTCCACATCTGCCTCAACCATTC
CGTGTAAAGAAGAATTCATCATCGCATGTGCCAGTTTTCTCCAGATGATTAAATGCTTAT
CTAGTTTACTTTTATAATGAGAGTAAGTGAGTCC

QA 2 695 2 695
DS 

RD RR2D284JQ 681 0 0
AAAATACTGATATATAACTTGATAGATATTTATGATAACACACTTTCATATCACTCACAT
CTCTTTTGATCTAGAGAGAGCATTATTTGATACAGACCACCCAAATACATAAAGATAGAT
ACATATTATAGAGATATTCGACGAGTATCTATTCCTCAAGGAGAAGCATTTCGTCAATGT
CTTTGAACATTTCGACACCAGTTTGGAGCAAAGTCTCTGGGTGAGCCACGTTTTCATCAA
TCCTCTCATATATCATTTTCAATTTCGCCACGCCTCCAGATCCTCCTTGATTTGGAGTCA
CCTGGATCGTGACTAAAAAGCTCTTGAACTCTTCTGTAGGATCTCCCTCTATCACTTTCA
GCTTTATCATATTCTTCTTCGGATCCACTGCCTCGATCCTCTGCTTGGCCACATTTGGCT
TCCCATCAAGAACATAGTTCCAAGTGATGAGAGTGCCAACTCTTCCCATCTCTCCCCCTT
GCACACGACATCCCTGGACGGTTCCAGGAGAGGCTTTAGAAACATCTTGTGGTCTCACTG
CGAACATGTGAAAGAATTTCTTGGCCGGAGCTTTAATCTCCACATCTGCCTCAACCATTC
CGTGTAAAGAAGAATTCATCATCGCATGTGCCAGTTTTCTCCAGATGATTAAATGCTTAT
CTAGTTTACTTTTATAATGAG

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 4

CO CL2857Contig1 1032 4 4 U
CCAATCAATCGCATAAAACTTCTTCGAAGAAAGATAAAGAGAGAGAGAAAGATGTCGGCA
GAGGAAGAAACCGTTCCAACCAACGTCGAAGAGACGGTGACTGCACCGGCGGCGAGTGAG
AAGAAAGCGAAGAAGACGAAGGAAGCTAAAGCTCCGAAGAAGAAGCCTGCAGCGAAAGCT
CCAAGGAAGAGATCTTCTTCATCTCACCCTACCTACGAAGAGATGATTAAAGACGCGATC
ACGACGTTGAAGGAGAGAACCGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATAGAGGAG
AAGCAGAAGACGCTTCCTCCGACGTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTCAATCTCAAGAGACTC
GTCGCTTCAGGGAAGCTCGTCAAAGTCAAAGGCTCCTTCAAGCTCCCCTCCTCCGCTACT
AAATCAACCGCCGTTGCTGCTCCTGCTCCTAAACCGGCTCCGGTTAAGAAGAAGAAGGCG
ACCGTAGCTAAACCGAAGGCTGCTAAACCGGCTGCGAAAGGATCCAAGAAGACCAAAGCT
GCTGTAGCTGTGAAGCCCAAGGCGGCTAAAGTAGTCGCTGCTAAACCTAAACCGAAGACG
AAGACAGTGGCTGCTGTGTCCAAGACTAAAGCTGTTGCTGCTAAGCCCAAG*CTAAAGAG
AGACCTGCTAAAGCGGCGAGGACTTCGACTAGAACTTCTCCAGGGAAGAAGGTTGCTCCT
GCTGCTAAGAAAGCAGCGGCTGTAACTAAGAAGGCCAAGGCAAAAGCTCCGGCTGCTAAG
AGCGCGAAGGCGAAGGCTGTAAAGTCTCCGGCGAAGAGGGCTTCGACGAGGAAGGTGAAG
AAGTGAAAGAAGATTTGGGTTTAGGGTAGTGAATTGGGGAGATTGAATGAATGAATGAAT
ACATGTGTTGTAATGGTGGTTAGAGCTTCTCTTAGGGTGTAGTCTTTGTATAATTTGAAT
CATATCCTTTGAAGAAGCTTTTTGCTTTTATCTTCGTTTCTGGTTTCTTCTTGAAACCCT
TTTGTTGTAATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC19TF U 1
AF RR2B263TF U 1
AF RR2FJ62TF U 1
AF RR2FJ62JQ C 454
BS 1 158 RR2B263TF
BS 159 159 RR2FC19TF
BS 160 693 RR2B263TF
BS 694 1032 RR2FJ62JQ

RD RR2FC19TF 645 0 0
CCAATCAATCGCATAAAACTTCTTCGAAGAAAGATAAAGAGAGAGAGAAAGATGTCGGCA
GAGGAAGAAACCGTTCCAACCAACGTCGAAGAGACGGTGACTGCACCGGCGGCGAGTGAG
AAGAAAGCGATGAAGACGAAGGAAGCTAAAGCTCCGAAGAAGAAGCCTGCAGCGAAAGCT
CCAAGGAAGAGATCTTCTTCATCTCACCCTACCTACGAAGAGATGATTAAAGACGCGATC
ACGACGTTGAAGGAGAGAACCGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATAGAGGAG
AAGCAGAAGACGCTTCCTCCGACGTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTCAATCTCAAGAGACTC
GTCGCTTCAGGGAAGCTCGTCAAAGTCAAAGGCTCCTTCAAGCTCCCCTCCTCCGCTACT
AAATCAACCGCCGTTGCTGCTCCTGCTCCTAAACCGGCTCCGGTTAAGAAGAAGAAGGCG
ACCGTAGCTAAACCGAAGGCTGCTAAACCGGCTGCGAAAGGATCCAAGAAGACCAAAGCT
GCTGTAGCTGTGAAGCCCAAGGCGGCTAAAGTAGTCGCTGCTAAACCTAAACCGAAGACG
AAGACAGTGGCTGCTGTGTCCGAGACTAAAGCTGTTGCTGCTAAG

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2B263TF 700 0 0
CCAATCAATCGCATAAAACTTCTTCGAAGAAAGATAAAGAGAGAGAGAAAGATGTCGGCA
GAGGAAGAAACCGTTCCAACCAACGTCGAAGAGACGGTGACTGCACCGGCGGCGAGTGAG
AAGAAAGCGAAGAAGACGAAGGAAGCTAAAGCTCCGAATAAGAAGCCTGCAGCGAAAGCT
CCAAGGAAGAGATCTTCTTCATCTCACCCTACCTACGAAGAGATGATTAAAGACGCGATC
ACGACGTTGAAGGAGAGAACCGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATAGAGGAG
AAGCAGAAGACGCTTCCTCCGACGTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTCAATCTCAAGAGACTC
GTCGCTTCAGGGAAGCTCGTCAAAGTCAAAGGCTCCTTCAAGCTCCCCTCCTCCGCTACT
AAATCAACCGCCGTTGCTGCTCCTGCTCCTAAACCGGCTCCGGTTAAGAAGAAGAAGGCG
ACCGTAGCTAAACCGAAGGCTGCTAAACCGGCTGCGAAAGGATCCAAGAAGACCAAAGCT
GCTGTAGCTGTGAAGCCCAAGGCGGCTAAAGTAGTCGCTGCTAAACCTAAACCGAAGACG
AAGACAGTGGCTGCTGTGTCCAAGACTAAAGCTGTTGCTGCTAAGCCCAAG*CTAAAGAG
AGACCTGCTAAAGCGGCGAGGACTTCGACTAGA
ACTTCTC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2FJ62TF 704 0 0
CCAATCAATCGCATAAAACTTCTTCGAAGAAAGATAAAGAGAGAGAGAAAGATGTCGGCA
GAGGAAGAAACCGTTCCAACCAAC*TCGAAGAGACGGTGACTGCACCGGCGGCGAGTGAG
AAGAAAGCGAAGAAGACGAAGGAAGCTAAAGCTCCGAAGAAGAAGCCTGCAGCGAAAGCT
CCAAGGAAGAGATCTTCTTCATCTCACCCTACCTACGAAGAGATGATTAAAGACGCGATC
ACGACGTTGAAGGAGAGAACCGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATAGAGGAG
AAGCAGAAGACGCTTCCTCCGACGTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTCAATCTCAAGAGACTC
GTCGCTTCAGGGAAGCTCGTCAAAGTCAAAGGCTCCTTCAAGCTCCCCTCCTCCGCTACT
AAATCAACCGCCGTTGCTGCTCCTGCTCCTAAACCGGCTCCGGTTAAGAAGAAGAAGGCG
ACCGTAGCTAAACCGAAGGCTGCTAAACCGGCTGCGAAAGGATCCAAGAAGACCAAAGCT
GCTGTAGCTGTGAAGCCCAAGGCGGCTAAAGTAGTCGCTGCTAAACCTAAACCGAAGACG
AAGACAGTGGCTGCTGTGTCCAAGACTAAAGCTGTTGCTGCTAAGCCCAAG*CTAAAGAG
AGACCTGCTAAAGCGGCGAGGACTTCGACTAGA
CTCTCCAGGGA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2FJ62JQ 579 0 0
CCGGCTCCGGTTAAGAAGAAGAAGGCGACCGTAGCTAAACCGAAGGCTGCTAAACCGGCT
GCGAAAGGATCCAAGAAGACCAAAGCTGCTGTAGCTGTGAAGCCCAAGGCGGCTAAAGTA
GTCGCTGCTAAACCTAAACCGAAGACGAAGACAGTGGCTGCTGTGTCCAAGACTAAAGCT
GTTGCTGCTAAGCCCAAGGCTAAAGAGAGACCTGCTAAAGCGGCGAGGACTTCGACTAGA
ACTTCTCCAGGGAAGAAGGTTGCTCCTGCTGCTAAGAAAGCAGCGGCTGTAACTAAGAAG
GCCAAGGCAAAAGCTCCGGCTGCTAAGAGCGCGAAGGCGAAGGCTGTAAAGTCTCCGGCG
AAGAGGGCTTCGACGAGGAAGGTGAAGAAGTGAAAGAAGATTTGGGTTTAGGGTAGTGAA
TTGGGGAGATTGAATGAATGAATGAATACATGTGTTGTAATGGTGGTTAGAGCTTCTCTT
AGGGTGTAGTCTTTGTATAATTTGAATCATATCCTTTGAAGAAGCTTTTTGCTTTTATCT
TCGTTTCTGGTTTCTTCTTGAAACCCTTTTGTTGTAATT

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 4

CO CL2858Contig1 1306 4 22 U
GGATATCATCTGCTATCTCCTCTAGTAATAACTATTATCAGCTACGATACGAATCCGATT
ATGAGGATACTACCGGGACGCGGGGGAGGTGCTTTCTGCCTCCTCTTTGTGCTTGTTCTT
TGTTCAGCGGTTCGTTCTCTCGGCCGTGACGTCGATGTCGTTGGCTACGCCGAAAGTAAC
AAGAAGATCAAGAGCCCCCATGCATACTTAGGACTCCGAGTAACCATAGAATGCAAGACT
GCCGAGACAAAAGATCACTTTGTTACAAGAGGAAGCGGAGAAGTTGACGAGACAGGAAAG
TTTAGTCTCAGTATTCCACACGATGACATAGTTGGAGAAGACGGAAACCTAAAAGAAGCT
TGCTATGCTCAGCTTCACAGCGCTTCAGGGAACCCTTGTCCAGCCCACGACGGCCTCGAG
GCCTCTAAGATCGTGATCTTATCGAAGGATGGAGAAAAACACGTTTTGGGGATCAAACAA
AATCTTAAATTCTCACCAGAGATTTGCTTCTCAAAGTTCTTGTGGGATATGCCTAAGTTC
CCTTTGCCCCCACCGCTTAAACTTCCTCCATTTCCTAAGATCAAAAAGCCTTGTCCCCCA
AAGATAAAGCTTCCACCATTGCTCCCTATTTACAAGCCACCAGTGGTGATCCCCAAGAAG
CCGTTCCCACCAAAGATCGCACACAAGCCTTCAGTGCCCATCTACAAGCCGCCAGTACCT
ATCTACAAGCCACCAGTACCTATCTACAAGCCACCAGTACCTATCTACAAGCCACCGGTG
GTGATTCCAAAGAAGCCGTGTCCGCCACTTCACAAGCCGATCTACAAGCCCCCAGTGCCT
ATCTACAAGCCACCGGTGGTGATTCCAAAGAAGCCGTGTCCGCCAAAAGTCCCGCTGCCT
AAATACAAGCCGATCTACAAGCCCCCGGTGCCAATCTACAAGCCACCGGTGGTGATTCCA
AAGAAGCCGTGTCCGCCTAAAGCTAAGGTGCCAATCTACAAGCCGCCGGTGCCCATATAC
AAACCAATCTACAAGCCACCAGTGGTGATTCCAAAGAAACCGTGTCCACCACTTCCTAAG
CTTCCGCCTTTCCCACCTAAATACATTCCACACCCTAAGTTTGGGAAATGGCCTCCTTTC
CCTTCTCATCCTTGAAGTGAATGATGCCAGAAAAATAATATTTGGTTGCATGTTGCTTTG
TTAAATTCTACGTAGATGTTCCATGTTTCTATTTTTACGTTCTAGCCAACAAACTCTGTA
TTTTTCTCTATATGTTTTAATAAAAAACTAGATCTTGATCCGTGCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 5 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ47TF U 1
AF RR2DK69TF U 1
AF RR2CQ47JQ C 594
AF RR2DK69JQ C 600
BS 1 237 RR2CQ47TF
BS 238 238 RR2DK69TF
BS 239 241 RR2CQ47TF
BS 242 242 RR2DK69TF
BS 243 727 RR2CQ47TF
BS 728 728 RR2DK69TF
BS 729 748 RR2CQ47TF
BS 749 821 RR2CQ47JQ
BS 822 822 RR2DK69JQ
BS 823 842 RR2CQ47JQ
BS 843 843 RR2DK69JQ
BS 844 914 RR2CQ47JQ
BS 915 915 RR2DK69JQ
BS 916 935 RR2CQ47JQ
BS 936 936 RR2DK69JQ
BS 937 995 RR2CQ47JQ
BS 996 996 RR2DK69JQ
BS 997 1028 RR2CQ47JQ
BS 1029 1029 RR2DK69JQ
BS 1030 1144 RR2CQ47JQ
BS 1145 1145 RR2DK69JQ
BS 1146 1306 RR2CQ47JQ

RD RR2CQ47TF 765 0 0
GGATATCATCTGCTATCTCCTCTAGTAATAACTATTATCAGCTACGATACGAATCCGATT
ATGAGGATACTACCGGGACGCGGGGGAGGTGCTTTCTGCCTCCTCTTTGTGCTTGTTCTT
TGTTCAGCGGTTCGTTCTCTCGGCCGTGACGTCGATGTCGTTGGCTACGCCGAAAGTAAC
AAGAAGATCAAGAGCCCCCATGCATACTTAGGACTCCGAGTAACCATAGAATGCAAGGCT
GTCGAGACAAAAGATCACTTTGTTACAAGAGGAAGCGGAGAAGTTGACGAGACAGGAAAG
TTTAGTCTCAGTATTCCACACGATGACATAGTTGGAGAAGACGGAAACCTAAAAGAAGCT
TGCTATGCTCAGCTTCACAGCGCTTCAGGGAACCCTTGTCCAGCCCACGACGGCCTCGAG
GCCTCTAAGATCGTGATCTTATCGAAGGATGGAGAAAAACACGTTTTGGGGATCAAACAA
AATCTTAAATTCTCACCAGAGATTTGCTTCTCAAAGTTCTTGTGGGATATGCCTAAGTTC
CCTTTGCCCCCACCGCTTAAACTTCCTCCATTTCCTAAGATCAAAAAGCCTTGTCCCCCA
AAGATAAAGCTTCCACCATTGCTCCCTATTTACAAGCCACCAGTGGTGATCCCCAAGAAG
CCGTTCCCACCAAAGATCGCACACAAGCCTTCAGTGCCCATCTACAAGCCGCCAGTACCT
ATCTACA*GCCACCAGTACCTATCTACA
GCACAGTACTATCTACA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2DK69TF 765 0 0
GGATATCATCTGCTATC*CCTCTAGTAATAACTATTATCAGCTACGATACGAATCCGATT
ATGAGGATACTACCGGGACGCGGGGGAGGTGCTTTCTGCCTCCTCTTTGTGCTTGTTCTT
TGTTCAGCGGTTCGTTCTCTCGGCCGTGACGTCGATGTCGTTGGCTACGCCGAAAGTAAC
AAGAAGATCAAGAGCCCCCATGCATACTTAGGACTCCGAGTAACCATAGAATGCAAGACT
GCCGAGACAAAAGATCACTTTGTTACAAGAGGAAGCGGAGAAGTTGACGAGACAGGAAAG
TTTAGTCTCAGTATTCCACACGATGACATAGTTGGAGAAGACGGAAACCTAAAAGAAGCT
TGCTATGCTCAGCTTCACAGCGCTTCAGGGAACCCTTGTCCAGCCCACGACGGCCTCGAG
GCCTCTAAGATCGTGATCTTATCGAAGGATGGAGAAAAACACGTTTTGGGGATCAAACAA
AATCTTAAATTCTCACCAGAGATTTGCTTCTCAAAGTTCTTGTGGGATATGCCTAAGTTC
CCTTTGCCCCCACCGCTTAAACTTCCTCCATTTCCTAAGATCAAAAAGCCTTGTCCCCCA
AAGATAAAGCTTCCACCATTGCTCCCTATTTACAAGCCACCAGTGGTGATCCCCAAGAAG
CCGTTCCCACCAAAGATCGCACACAAGCCTTCAGTGCCCATCTACAAGCCGCCAGTACCT
ATCTACAAGCCACCAGTACCTATCTACAGC
CACCAGTACCTATCT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2CQ47JQ 713 0 0
TCCCCC
AAAGATAAAGCTTCCACCATTGCTCCCTATTTACAAGCCACCAGTGGTGATCCCCAAGAA
GCCGTTCCCACCAAAGATCGCACACAAGCCTTCAGTGCCCATCTACAAGCCGCCAGTACC
TATCTACAAGCCACCAGTACCTATTTACAAGCCACCAGTACCTATCTACAAGCCACCGGT
GGTGATTCCAAAGAAGCCGTGTCCGCCACTTCACAAGCCGATTTACAAGCCCCCAGTGCC
TATTTACAAGCCACCGGTGGTGATTCCAAAGAAGCCGTGTCCGCCAAAAGTCCCGCTGCC
TAAATACAAGCCGATTTACAAGCCCCCGGTGCCAATTTACAAGCCACCGGTGGTGATTCC
AAAGAAGCCGTGTCCGCCTAAAGCTAAGGTGCCAATTTACAAGCCGCCGGTGCCCATATA
CAAACCAATTTACAAGCCACCAGTGGTGATTCCAAAGAAACCGTGTCCACCACTTCCTAA
GCTTCCGCCTTTCCCACCTAAATACATTCCACACCCTAAGTTTGGGAAATGGCCTCCTTT
CCCTTTTCATCCTTGAAGTGAATGATGCCAGAAAAATAATATTTGGTTGCATGTTGCTTT
GTTAAATTCTACGTAGATGTTCCATGTTTCTATTTTTACGTTCTAGCCAACAAACTCTGT
ATTTTTCTCTATATGTTTTAATAAAAAACTAGATCTTGATCCGTGCG

QA 7 713 7 713
DS 

RD RR2DK69JQ 701 0 0
AAAGATAAAGCTTCCACCATTGCTCCCTATTTACAAGCCACCAGTGGTGATCCCCAAGAA
GCCGTTCCCACCAAAGATCGCACACAAGCCTTCAGTGCCCATCTACAAGCCGCCAGTACC
TATTTACAAGCCACCAGTACCTATCTACAAGCCACCAGTACCTATCTACAAGCCACCGGT
GGTGATTCCAAAGAAGCCGTGTCCGCCACTTCACAAGCCGATCTACAAGCCCCCAGTGCC
TATCTACAAGCCACCGGTGGTGATTCCAAAGAAGCCGTGTCCGCCAAAAGTCCCGCTGCC
TAAATACAAGCCGATCTACAAGCCCCCGGTGCCAATCTACAAGCCACCGGTGGTGATTCC
AAAGAAGCCGTGTCCGCCTAAAGCTAAGGTGCCAATCTACAAGCCGCCGGTGCCCATATA
CAAACCAATCTACAAGCCACCAGTGGTGATTCCAAAGAAACCGTGTCCACCACTTCCTAA
GCTTCCGCCTTTCCCACCTAAATACATTCCACACCCTAAGTTTGGGAAATGGCCTCCTTT
CCCTTCTCATCCTTGAAGTGAATGATGCCAGAAAAATAATATTTGGTTGCATGTTGCTTT
GTTAAATTCTACGTAGATGTTCCATGTTTCTATTTTTACGTTCTAGCCAACAAACTCTGT
ATTTTTCTCTATATGTTTTAATAAAAAACTAGATCTTGATC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 2 4

CO CL2859Contig1 851 2 12 U
TAGCCGTATCATTCATTATTATTTTGTATCATAGCTCAATGCATACTAGTGCAATACACA
GAGTCCTTTTATTTTATTTGTGTTTTACTTTTATATGATACAAGATTTACGAGATGGGAA
ATGGTCACATGAGAGACCACCAGCTTCCACATACTCCATGTCAGAAAACCCGAGTTCTGA
CAACTTGAGATGAGCTTTAGAATAGTCTTCAAAGAACGCATCCTCATCTGCAGCATATCT
CTCAACGAGAGGACGAAAGAGAGGATCCTCGAGGAGAGCCTTGTCGGTTGGAAGTTGAAG
AAGTCCTTCTTTCTCTCCGCTTAGTATCTCTTTGAAATAAGAGTTGTCGAAAATGAGAGG
ATTTTGTGTCCATGGCCCCTCGAATCCGGAGCGTTCCTTGTGACACCGACCCAAGGTGTG
TCCACCAGACAATGCAACGATATCTTTGTCATTTAGTCCCATCCGACCAAATATCTCTCT
CAGATGATCCACGCCTTTGGTGGCCTGAGGTAGACGACCATCAGGAGCTGGCACAACTTT
GTCCACTCTACCAGGATGAAATCTAATCTCGGGTCCTCCAGTGATCTCAACAGCAACAAC
TCCAGCTAGCTGGTAAAAATCAGCGTAAGACAAGATGGGGAACAACTCTTTGATAGGCTC
AAGAAGCCTGACAGCAATATCAAGACCTTTGTTAGCATCATGAGCTAGCTCTTCTGGAAG
CCTTATCGTCCCGAACGGTCCTCCCGTCTTCGTCTTCACGTCAAATGTCCCCGCCGAGTG
CCATGCAAGACGGAGACGATGGGAGCATAGTGCTTCTCCGCATAAGACCACGGAGCTTTC
TCTTGCATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT88JQ U 1
AF RR2BV91JQ U 26
BS 1 238 RR2AT88JQ
BS 239 239 RR2BV91JQ
BS 240 402 RR2AT88JQ
BS 403 403 RR2BV91JQ
BS 404 535 RR2AT88JQ
BS 536 536 RR2BV91JQ
BS 537 713 RR2AT88JQ
BS 714 714 RR2BV91JQ
BS 715 719 RR2AT88JQ
BS 720 720 RR2BV91JQ
BS 721 732 RR2AT88JQ
BS 733 851 RR2BV91JQ

RD RR2AT88JQ 733 0 0
TAGCCGTATCATTCATTATTATTTTGTATCATAGCTCAATGCATACTAGTGCAATACACA
GAGTCCTTTTATTTTATTTGTGTTTTACTTTTATATGATACAAGATTTACGAGATGGGAA
ATGGTCACATGAGAGACCACCAGCTTCCACATACTCCATGTCAGAAAACCCGAGTTCTGA
CAACTTGAGATGAGCTTTAGAATAGTCTTCAAAGAACGCATCCTCATCTGCAGCATATTT
CTCAACGAGAGGACGAAAGAGAGGATCCTCGAGGAGAGCCTTGTCGGTTGGAAGTTGAAG
AAGTCCTTCTTTCTCTCCGCTTAGTATCTCTTTGAAATAAGAGTTGTCGAAAATGAGAGG
ATTTTGTGTCCATGGCCCCTCGAATCCGGAGCGTTCCTTGTGGCACCGACCCAAGGTGTG
TCCACCAGACAATGCAACGATATCTTTGTCATTTAGTCCCATCCGACCAAATATCTCTCT
CAGATGATCCACGCCTTTGGTGGCCTGAGGTAGACGACCATCAGGAGCTGGCACAGCTTT
GTCCACTCTACCAGGATGAAATCTAATCTCGGGTCCTCCAGTGATCTCAACAGCAACAAC
TCCAGCTAGCTGGTAAAAATCAGCGTAAGACAAGATGGGGAACAACTCTTTGATAGGCTC
AAGAAGCCTGACAGCAATATCAAGACCTTTGTTAGCATCATGAGCTAGCTCTTGTGGAAT
CCTTATCGTCCC
A

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2BV91JQ 826 0 0
GTATCATAGCTCAATGCATACTAGTGCAATACACAGAGTCCTTTTATTTTATTTGTGTTT
TACTTTTATATGATACAAGATTTACGAGATGGGAAATGGTCACATGAGAGACCACCAGCT
TCCACATACTCCATGTCAGAAAACCCGAGTTCTGACAACTTGAGATGAGCTTTAGCATAG
TCTTCGAAGAAGGCATCCTCATCTGCAGCATATCTCTCAACGAGAGGACGAAAGAGAGGA
TCCTCGAGGAGGGCCTTGTCGGTTGGAAGTTGAAGAAGTCCTTCTTTCTCTCCGCTTAGT
ATCTCTTTGAAATAAGAGTTGTCGAAAATGAGAGGATTTTGTGTCCATGGCCCCTCGAAT
CCGGAGCGTTCCTTGTGACACCGACCCAAGGTGTGTCCACCAGACAATGCAACGATATCT
TTGTCATTTAGTCCCATCCGACCAAATATCTCTCTCAGATGATCCACGCCTTTGGTGGCC
TGGGGTAGACGACCATCAGGAGCTGGCACAACTTTGTCCACTCTACCAGGATGAAATCTA
ATCTCGGGTCCTCCAGTGATCTCAACAGCAACAACTCCAGCTAGCTGGTAAAAATCAGCG
TAAGACAAGATGGGGAACAAGTCTTTGATAGGCTCAAGAAGCCTGACAGCAATATCAAGA
CCTTTGTTAGCATCATGAGCTAGCTCTTCTTGAAGCCTTATCGTCCCGAACGGTCCTCCC
GTCTTCGTCTTCACGTCAAATGTCCCCGCCGAGTGCCATGCAAGACGGAGACGATGGGAG
CATAGTGCTTCTCCGCATAAGACCACGGAGCTTTCTCTTGCATCTC

QA 1 826 1 826
DS 



CO CL2859Contig2 807 2 18 U
TTTTTTTTCTGGGTTATACATACAAACATGTCTTTCTTGGTTTGCAGAGAGAGGGAGAGA
GAGAAAATGGTGAAGAAGAGTTACCCGGAAGTGGAGGAAGATTACAAGAAAGCTGTTAAG
AGATGCAAGAGAAAGCTCCGTGGTCTTATTGCGGAGAAGCACTATGCTCCCATCGTTCTC
CGTCTTGCATGGCACTCGGCGGGGACATTTGACGTGAAGACGAAGACGGGAGGACCGTTC
GGGACGATAAGGATTCAACAAGAGCTAGCTCATGATGCTAACAAAGGTCTTGATATTGCT
GTCAGGCTTCTTGAGCCTATCAAAGACTTGTTCCCCATCTTGTCTTACGCTGATTTTTAC
CAGCTAGCTGGAGTTGTTGCTGTTGAGATCACTGGAGGACCCGAGATTAGATTTCATCCT
GGTAGAGTGGACAAAGCTGTGCCAGCTCCTGATGGTCGTCTACCCCAGGCCACCAAAGGC
GTGGATCATCTGAGAGAGATATTTGGTCGGATGGGACTAAATGACAAAGATATCGTTGCA
TTGTCTGGTGGACACACCTTGGGTCGGTGCCACAAGGAACGCTCCGGATTCGAGGGGCCA
TGGACACAAAATCCTCTCATTTTCGACAACTCTTATTTCAAAGAGATACTAAGCGGAGAG
AAAGAAAGACTTCTTCAACTTCCAACCGACAAGCCCTCCTCGAGGATCCTCTCTTTCGTC
CTCTCGTTGAGAAATATGCTGCAGATGAGATGCCTTCTTCGAAGACTATGCTAAAGCTCA
TCTCAAGTTGTCAGAACTCGGGTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV91TF U 1
AF RR2AT88TF U 12
BS 1 252 RR2BV91TF
BS 253 253 RR2AT88TF
BS 254 258 RR2BV91TF
BS 259 259 RR2AT88TF
BS 260 436 RR2BV91TF
BS 437 437 RR2AT88TF
BS 438 569 RR2BV91TF
BS 570 570 RR2AT88TF
BS 571 666 RR2BV91TF
BS 667 667 RR2AT88TF
BS 668 720 RR2BV91TF
BS 721 721 RR2AT88TF
BS 722 732 RR2BV91TF
BS 733 733 RR2AT88TF
BS 734 774 RR2BV91TF
BS 775 775 RR2AT88TF
BS 776 785 RR2BV91TF
BS 786 807 RR2AT88TF

RD RR2BV91TF 787 0 0
TTTTTTTTCTGGGTTATACATACAAACATGTCTTTCTTGGTTTGCAGAGAGAGGGAGAGA
GAGAAAATGGTGAAGAAGAGTTACCCGGAAGTGGAGGAAGATTACAAGAAAGCTGTTAAG
AGATGCAAGAGAAAGCTCCGTGGTCTTATTGCGGAGAAGCACTATGCTCCCATCGTTCTC
CGTCTTGCATGGCACTCGGCGGGGACATTTGACGTGAAGACGAAGACGGGAGGACCGTTC
GGGACGATAAGGCTTCAAGAAGAGCTAGCTCATGATGCTAACAAAGGTCTTGATATTGCT
GTCAGGCTTCTTGAGCCTATCAAAGACTTGTTCCCCATCTTGTCTTACGCTGATTTTTAC
CAGCTAGCTGGAGTTGTTGCTGTTGAGATCACTGGAGGACCCGAGATTAGATTTCATCCT
GGTAGAGTGGACAAAGTTGTGCCAGCTCCTGATGGTCGTCTACCCCAGGCCACCAAAGGC
GTGGATCATCTGAGAGAGATATTTGGTCGGATGGGACTAAATGACAAAGATATCGTTGCA
TTGTCTGGTGGACACACCTTGGGTCGGTGTCACAAGGAACGCTCCGGATTCGAGGGGCCA
TGGACACAAAATCCTCTCATTTTCGACAACTCTTATTTCAAAGAGATACTAAGCGGAGAG
AAAGAA*GACTTCTTCAACTTCCAACCGACAAGCCCTCCTCGAGGATCCTCTCTTTCGTC
*TCTCGTTGAGAGATATGCTGCAGATGAGATGCCTTCTTCGAAGACTATGCTAA*GCTCA
TCTCA
GT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2AT88TF 796 0 0
CTGGTTAT
ATACAAACATGTCTTTCTTGGTTTGCAGAGAGAGGGAGAGAGAGAAAATGGTGAAGAAGA
GTTACCCGGAAGTGGAGGAAGATTACAAGAAAGCTGTTAAGAGATGCAAGAGAAAGCTCC
GTGGTCTTATTGCGGAGAAGCACTGTGCTCCCATCGTTCTCCGTCTTGCATGGCACTCGG
CTGGTACATTTGACGTGAAGACGAAGACGGGAGGACCGTTTGGGACGATAAGGATTCCAC
AAGAGCTAGCTCATGATGCTAACAAAGGTCTTGATATTGCTGTCAGGCTTCTTGAGCCTA
TCAAAGAGTTGTTCCCCATCTTGTCTTACGCTGATTTTTACCAGCTAGCTGGAGTTGTTG
CTGTTGAGATCACTGGAGGACCCGAGATTAGATTTCATCCTGGTAGAGTGGACAAAGCTG
TGCCAGCTCCTGATGGTCGTCTACCTCAGGCCACCAAAGGCGTGGATCATCTGAGAGAGA
TATTTGGTCGGATGGGACTAAATGACAAAGATATCGTTGCATTGTCTGGTGGACACACCT
TGGGTCGGTGCCACAAGGAACGCTCCGGATTCGAGGGGCCATGGACACAAAATCCTCTCA
TTTTCGACAACTCTTATTTCAAAGAGATACTAAGCGGAGAGAAAGAAAGACTTCTTCAAC
TTCCAACCGACAAGCTCTCCTCGAGGATCCTCTCTTTCGTCCTCTCGTTGAGAAATATGC
TGCAGATGAGATGCGTTCTTTGAAGACTATTCTAAAGCTCATCTCAAGTTGTCAGAACTC
GGGTTTTC

QA 9 796 9 796
DS 



AS 1 4

CO CL2860Contig1 1070 4 14 U
GGGATTCTCAAATCTGCACCTGAAAAATCTCAAACTCTCAGATCTGCCAATACCTCTCTC
TTATCGTGACGGTGAAGAGAGAGAGAGAGATATCTCTCGAGACCGAGAAAAAAATGGCGG
CGGTGACACCATTAGCAAAGTTCAAGCTCGTCTTCCTGGGAGATCAATCCGTCGGCAAGA
CCAGCATCATCACTCGTTTCATGTACGACAAATTCGATACCACCTACCAGGCAACAATTG
GGATTGATTTCTTGTCAAAGACAATGTACCTTGAGGATAGGACTCTTCGTCTCCAGCTTT
GGGATACTGCCGGGCAGGAAAGGTTTCGAAGTCTGATACCAAGTTATATCAGAGATTCCT
CTGTTGCTGTCATTGTTTATGATGTTGCTAATAGGCAGTCGTTCTTGAACACCTCGAAGT
GGGTTGAGGATGTTCGTACAGAGAGAGGTAACGATGTCATAATTGTTCTCGTGGGTAACA
AAACTGATCTCGTTGACAAGAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGGGGATAACAAAGCTCGTG
ATTTTGGAGTTATATTCATAGAGACGAGTGCAAAAGCAGGATTTAACATCAAGCCACTAT
TCCGGAAGATTTCAGCAGCATTACCAGGAATGGATACACTTTCTTCAGCGAAACAAGGCG
ATATGGTTGATGTCAACCTTAAGTCATCGAACCATTCGTCTCAAGCGGACCAACAAAGTG
GTGGCTGTGCGTGTTAATTAATCTTTATTGAAAAAAA*TATACTTTTAACAGCAACAGAG
TATGGAGATTTTTTTAAATGATTCATAACTTGATGGAGTAAAATAAACTCTGGTATAA*G
GTAAGAGATTTTTACTTGGAGTCTTTAGTATTCTTTAAGATGTTTTGAGTTCAATATGGA
GATGTGTAATAATGACACGCTTGCAAGCTTAAGAAGAATGTTTCGCTCTGTTCTGGTTAG
TGATTCCTCAGTTTTCTTTTTACAGCATACACTGTCAATCTCTGTCTCGACATTGTAAGA
GAAAGTTCGAAAAGATATTTGTATATCTCATATTAATTTTGTTTATTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D333TF U 1
AF RR2A642TF U 83
AF RR2A642JQ C 230
AF RR2D333JQ C 257
BS 1 658 RR2D333TF
BS 659 659 RR2A642TF
BS 660 708 RR2D333TF
BS 709 709 RR2A642TF
BS 710 740 RR2D333TF
BS 741 741 RR2A642TF
BS 742 757 RR2D333TF
BS 758 838 RR2A642TF
BS 839 839 RR2A642JQ
BS 840 937 RR2A642TF
BS 938 938 RR2A642JQ
BS 939 949 RR2A642TF
BS 950 1047 RR2A642JQ
BS 1048 1070 RR2D333JQ

RD RR2D333TF 757 0 0
GGGATTCTCAAATCTGCACCTGAAAAATCTCAAACTCTCAGATCTGCCAATACCTCTCTC
TTATCGTGACGGTGAAGAGAGAGAGAGAGATATCTCTCGAGACCGAGAAAAAAATGGCGG
CGGTGACACCATTAGCAAAGTTCAAGCTCGTCTTCCTGGGAGATCAATCCGTCGGCAAGA
CCAGCATCATCACTCGTTTCATGTACGACAAATTCGATACCACCTACCAGGCAACAATTG
GGATTGATTTCTTGTCAAAGACAATGTACCTTGAGGATAGGACTCTTCGTCTCCAGCTTT
GGGATACTGCCGGGCAGGAAAGGTTTCGAAGTCTGATACCAAGTTATATCAGAGATTCCT
CTGTTGCTGTCATTGTTTATGATGTTGCTAATAGGCAGTCGTTCTTGAACACCTCGAAGT
GGGTTGAGGATGTTCGTACAGAGAGAGGTAACGATGTCATAATTGTTCTCGTGGGTAACA
AAACTGATCTCGTTGACAAGAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGGGGATAACAAAGCTCGTG
ATTTTGGAGTTATATTCATAGAGACGAGTGCAAAAGCAGGATTTAACATCAAGCCACTAT
TCCGGAAGATTTCAGCAGCATTACCAGGAATGGATACACTTTCTTCAGCGAAACAAGGTG
ATATGGTTGATGTCAACCTTAAGTCATCGAACCATTCGTCTCAAGCGGTCCAACAAAGTG
GTGGCTGTGCGTGTTAATTA*TCTTTATTGAAAAAAA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2A642TF 867 0 0
GG
GAGAGATATCTCTCGAGACCGAGAAAAAAATGGCGGCGGTGACACCATTAGCAAAGTTCA
AGCTCGTCTTCCTGGGAGATCAATCCGTCGGCAAGACCAGCATCATCACTCGTTTCATGT
ACGACAAATTCGATACCACCTACCAGGCAACAATTGGGATTGATTTCTTGTCAAAGACAA
TGTACCTTGAGGATAGGACTCTTCGTCTCCAGCTTTGGGATACTGCCGGGCAGGAAAGGT
TTCGAAGTCTGATACCAAGTTATATCAGAGATTCCTCTGTTGCTGTCATTGTTTATGATG
TTGCTAATAGGCAGTCGTTCTTGAACACCTCGAAGTGGGTTGAGGATGTTCGTACAGAGA
GAGGTAACGATGTCATAATTGTTCTCGTGGGTAACAAAACTGATCTCGTTGACAAGAGGC
AAGTGTCGATAGAGGAAGGGGATAACAAAGCTCGTGATTTTGGAGTTATATTCATAGAGA
CGAGTGCAAAAGCAGGATTTAACATCAAGCCACTATTCCGGAAGATTTCAGCAGCATTAC
CAGGAATGGATACACTTTCTTCAGCGAAACAAGGCGATATGGTTGATGTCAACCTTAAGT
CATCGAACCATTCGTCTCAAGCGGACCAACAAAGTGGTGGCTGTGCGTGTTAATTAATCT
TTATTGAAAAAAA*TATACTTTTAACAGCAACAGAGTATGGAGATTTTTTTAAATGATTC
ATAACTTGATGGAGTAAAATAAACTCTGGTATAAAGGTAAGAGATTTTTACTTGGAGTCT
TTAGTATTCTTTAAGATGTTTTGAGTTCAATATGGAGATGTGTAATAATGACACGCTTGC
AAGCTTAAGAAGA*TGTTTCGCTCT

QA 3 867 3 867
DS 

RD RR2A642JQ 820 0 0
GGCAACAATTGGGATTGATTTCTTGTCAAAGACAATGTAC*TTGAGGATAGGACTCTTCG
TCTCCAGCTTTGGGATACTGCCGGGCAGGAAAGGTTTCGAAGTCTGATACCAAGTTATAT
CAGAGATTCCTCTGTTGCTGTCATTGTTTATGATGTTGCTAATAGGCAGTCGTTCTTGAA
CACCTCGAAGTGGGTTGAGGATGTTCGTACAGAGAGAGGTAACGATGTCATAATTGTTCT
CGTGGGTAACAAAACTGATCTCGTTGACAAGAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGGGGATAA
CAAAGCTCGTGATTTTGGAGTTATATTCATAGAGACGAGTGCAAAAGCAGGATTTAACAT
CAAGCCACTATTCCGGAAGATTTCAGCAGCATTACCAGGAATGGATACACTTTCTTCAGC
GAAACAAGGCGATATGGTTGATGTCAACCTTAAGTCATCGAACCATTCGTCTCAAGCGGA
CCAACAAAGTGGTGGCTGTGCGTGTTAATTAATCTTTATTGAAAAAAA*TATACTTTTAA
CAGCAACAGAGTATGGAGATTTTTTTAAATGATTCATAACTTGATGGAGTAAAATAAACT
CTGGTATAA*GGTAAGAGATTTTTACTTGGAGTCTTTAGTATTCTTTAAGATGTTTTGAG
TTCAATATGGAGATGTGTAATAATGACACGCTTGCAAGCTTAAGAAGAATGTTTCGCTCT
GTTCTGGTTAGTGATTCCTCAGTTTTCTTTTTACAGCATACACTGTCAATCTCTGTCTCG
ACATTGTAAGAGAAAGTTCGAAAAGATATTTGTATATC
CC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2D333JQ 814 0 0
AAAGACAATGTAC*TTGAGGATAG*ACTCTTCGTCTCCAGCTTTGGGATACTGCCGGGCA
GGAAAGGTTTCGAAGTCTGATACCAAGTTATATCAGAGATTCCTCTGTTGCTGTCATTGT
TTATGATGTTGCTAATAGGCAGTCGTTCTTGAACACCTCGAAGTGGGTTGAGGATGTTCG
TACAGAGAGAGGTAACGATGTCATAATTGTTCTCGTGGGTAACAAAACTGATCTCGTTGA
CAAGAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGGGGATAACAAAGCTCGTGATTTTGGAGTTATATT
CATAGAGACGAGTGCAAAAGCAGGATTTAACATCAAGCCACTATTCCGGAAGATTTCAGC
AGCATTACCAGGAATGGATACACTTTCTTCAGCGAAACAAGGTGATATGGTTGATGTCAA
CCTTAAGTCATCGAACCATTCGTCTCAAGCGGTCCAACAAAGTGGTGGCTGTGCGTGTTA
ATTAATCTTTATTGAAAAAAAATATACTTTTAACAGCAACAGAGTATGGAGATTTTTTTA
AATGATTCATAACTTGATGGAGTAAAATAACCTCTGGTATAA*GGTAAGAGATTTTTACT
TGGAGTCTTTAGTATTCTTTAAGATGTTTTGAGTTCAATATGTAGATGTGTAATAATGAC
ACGCTTGCAAGCTTAAGAAGAATGTTTCGCTCTGTTCTGGTTAGTGATTCCTCAGTTTTC
TTTTTACAGCATACACTGTCAATCTCTGTCTCGACATTGTAAGAGAAAGTTCGAAAAGAT
ATTTGTATATCTCATATTAATTTTGTTTATTACC

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 3

CO CL2861Contig1 769 3 3 U
TTTTTCTCCTCTTTGTGATCTTTTGAGCTACTTGTGTTGTGCATATACTTAAAAGTGTTT
TTTAGCTGTTAAATATGAAGAAGCAGATTGTGGATGAATCTGAGAATTTTTGTTTCAAGA
AGCCACTGATGTCGCCTCCTCCTCCTCCACCGCTTCCTCCATCTCCAGGATATGGATCAA
GAAAGATCGATGGAGACAGCATAACCAATATACAGATCAAGAAGTTCTGGAGGCAGAAGC
AGATCATTG**GAGTAGCATCTCTTTGCTGCTATTAAGGCTGCAGCTCGTGTCAGAGCCC
GTAATCTCTCTGATGAGGACTACAAACGCTTTGAAGAAAGCTTGGACATGGAGGACCCGG
AAATCGAAGTTCATGAGGGAATAAAAGACTGGTGGATGAAGAGCAAGTACGCATACTTGA
ACCAGCCTGCTCTTGGATCTTCTGATTCACTGAAGAGAAAAAGGTTTTCATCTTATGTAC
CAAACTATTTCTCATTCAAGCCTTGCATTCCACTCTATGCAACGTCGCTCAATGTCTTTT
AGATATGAGCAAAATCTCTTTCAAGATCAATTGCTTGTGTATATGTCTACATATATGTGC
GTGTTTGTATCTATGTACATTCATGTGTTACTGTTTCCTTGTTAATGGACTTTGTTGTGT
GGTTGTTGATTTGTAACTATTGAATAAAATTCAATATTACTATGGAACATTAATTTCTTC
TTGTTCCATAGATGATAAGGTTATTGTACTTTGGTGTTTATATTCTACC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL12TF U 1
AF RR2AI13TF U 6
AF RR2CL12JQ C 62
BS 1 688 RR2CL12TF
BS 689 715 RR2AI13TF
BS 716 769 RR2CL12JQ

RD RR2CL12TF 688 0 0
TTTTTCTCCTCTTTGTGATCTTTTGAGCTACTTGTGTTGTGCATATACTTAAAAGTGTTT
TTTAGCTGTTAAATATGAAGAAGCAGATTGTGGATGAATCTGAGAATTTTTGTTTCAAGA
AGCCACTGATGTCGCCTCCTCCTCCTCCACCGCTTCCTCCATCTCCAGGATATGGATCAA
GAAAGATCGATGGAGACAGCATAACCAATATACAGATCAAGAAGTTCTGGAGGCAGAAGC
AGATCATTG**GAGTAGCATCTCTTTGCTGCTATTAAGGCTGCAGCTCGTGTCAGAGCCC
GTAATCTCTCTGATGAGGACTACAAACGCTTTGAAGAAAGCTTGGACATGGAGGACCCGG
AAATCGAAGTTCATGAGGGAATAAAAGACTGGTGGATGAAGAGCAAGTACGCATACTTGA
ACCAGCCTGCTCTTGGATCTTCTGATTCACTGAAGAGAAAAAGGTTTTCATCTTATGTAC
CAAACTATTTCTCATTCAAGCCTTGCATTCCACTCTATGCAACGTCGCTCAATGTCTTTT
AGATATGAGCAAAATCTCTTTCAAGATCAATTGCTTGTGTATATGTCTACATATATGTGC
GTGTTTGTATCTATGTACATTCATGTGTTACTGTTTCCTTGTTAATGGACTTTGTTGTGT
GGTTGTTGATTTGTAACTATTGAATAAA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2AI13TF 710 0 0
CTCCTCTTTGTGATCTTTTGAGCTACTTGTGTTGTGCATATACTTAAAAGTGTTTTTTAG
CTGTTAAATATGAAGAAGCAGATTGTGGATGAGTCTGAGAATTTTTGTTTCAAGAAGCCA
CTGATGTCGCCTCCTCCTCCTCCACCGCTTCCTCCATCTCCAGGATATGGATCAAGAAAG
ATCGATGGAGACAGCATAACCAATATACAGATCAAGAAGTTCTGGAGGCAGAAGCAGATC
ATTGAAGAGGAGCATCTCTTTGCTGCTATTAAGGCTGCAGCTCGTGTCAGAGCCCGTAAT
CTCTCTGATGAGGACTACAAACGCTTTGAAGAAAGCTTGGACATGGAGGACCCGGAAATC
GAAGTTCATGAGGGAATAAAAGACTGGTGGATGAAGAGCAAGTACGCATACTTGAACCAG
CCTGCTCTTGGATCTTCTGATTCACTGAAGAGAAAAAGGTTTTCATCTTATGTACCAAAC
TATTTCTCATTCAAGCCTTGCATTCCACTCTATGCAACGTCGCTCAATGTCTTTTAGATA
TGAGCAAAATCTCTTTCAAGATCAATTGCTTGTGTATATGTCTACATATATGTGCGTGTT
TGTATCTATGTACATTCATGTGTTACTGTTTCCTTGTTAATGGACTTTGTTGTGTGGTTG
TTGATTTGTAACTATTGAATAAAATTCAATATTACTATGGAACATTAATT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2CL12JQ 708 0 0
TTAGCTGT
TAAATATGAAGAAGCAGATTGTGGATGAATCTGAGAATTTTTGTTTCAAGAAGCCACTGA
TGTCGCCTCCTCCTCCTCCACCGCTTCCTCCATCTCCAGGATATGGATCAAGAAAGATCG
ATGGAGACAGCATAACCAATATACAGATCAAGAAGTTCTGGAGGCAGAAGCAGATCATTG
**GAGTAGCATCTCTTTGCTGCTATTAAGGCTGCAGCTCGTGTCAGAGCCCGTAATCTTT
CTGATGAGGACTACAAACGCTTTGAAGAAAGCTTGGACATGGAGGACCCGGAAATCGAAG
TTCATGAGGGAATAAAAGACTGGTGGATGAAGAGCAAGTACGCATACTTGAACCAGCCTG
CTCTTGGATCTTCTGATTCACTGAAGAGAAAAAGGTTTTCATCTTATGTACCAAACTATT
TCTCATTCAAGCCTTGCATTCCACTCTATGCAACGTCGCTCAATGTCTTTTAGATATGAG
CAAAATCTCTTTCAAGATCAATTGCTTGTGTATATGTCTACATATATGTGCGTGTTTGTA
TCTATGTACATTCATGTGTTACTGTTTCCTTGTTAATGGACTTTGTTGTGTGGTTGTTGA
TTTGTAACTATTGAATAAAATTCAATATTACTATGGAACATTAATTTCTTCTTGTTCCAT
AGATGATAAGGTTATTGTACTTTGGTGTTTATATTCTACC

QA 9 708 9 708
DS 



AS 1 4

CO CL2862Contig1 1356 4 11 U
GGAGTGCTCCACTCAATCTTCTTCTTTCACCAAAACAACAGCTGCTAGGGGGAGAGAGAG
AGAGCCAAACTCCATCCCTCAAGCTCTCAAGAGAATCAAGCTCCAAATATGAGCAGTTTC
TACGAGCATTACGAGTTCCCATACGATACCAACCAGGTTAATCATCTCTATGATCATAAC
TATTATGATAACAATCAACGTCAGCAGTTTGGTTTTGACCCAATGAGTTACAATAATAGT
TATGATAACTGGAATGGATCCGAGTATGAGTACGAGTATGAGACAGCCTCTGCATCTGTT
GCTTACTCTGTCTCCACCATGTCTGAGCCGAAGCACTTGTTCTATGATCCGAGTTACTAC
ACAACAACGACAACCTACGAGTCTCCTCCCCAGTTTAGTATCTATTGCAATGTTCAAGGC
TTCAACGAGCCGGAGTTCGAGGAGTACGATCCGACGCCGTACGGTGGCGGCTACGATATA
GTTGCAACTTACGGGAAACCTCTTCCTCCGTCGGTAAAAACTTGTTATCCTTCTTCAACC
GCTGATCAGGGTAATCCTCCTTCTCCTCCGGAGATCATCACTCCGGTTCCTCTTGGAATC
TACGGTGGTGGTGAAGAAAAGAAAGCTGTCAAGAAACGTGTGACTTTCTCTGAGCCGTTA
GAGGAAGCTAAACCATTAGAAACCATTAAAGAAGAAGAACATGATCATCAAGAAGAGGCA
GAGGAAGAGGATGAAGAAGGTGAGGATGAAGAGGAAGAAGAAGATCACGGTTCAAGCAAT
GAAACTGTAGACAAAGTTGAAGTGAAAGCTCTGTATGTTCCGTCTGGTTACGGCTTAGAA
GCTACGGATCTCTGCGAGGTTATATTCGGAGGCTATTTTCCTTGCGTCTTACGTAACAAA
AGACGCCAGGAGGATGAGAATCGTGCGGCTGAAGTTACTTGCTGGGAGAGCACAGATTCT
GATCCTTGGAAGACGACTTCAGACTACCTTTTCGGGGATCCGTATCCGTATGGTTATGAG
GATGGAGTTGGAAGAAGACAGTTCGAGATCTCCTCTTGTGGTTATCTGAGGTATTAACTG
GAGTTATCACGATCATCAGATGTGTCAAAGTTATGTGGTGAGAGCAATATTTTTTTGATA
ATTGATGAAGCTGATTCGTTTTAGTATATACAATGACCTTTCTTGTATGGTTGGTCCAAC
GTTATTATGAAAAGATATTCCAGGTTGATCGATCAATAAATGTTACAAAAACATCTCCTA
ATTCTGCCATCTCTACCATTTAAATATCTTAGTATTGTTTTATTGTAATGTTTTAAAGTA
AACTATTGCAAGAAAGAATTTTATAGTTTGTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN01TF U 1
AF RR2BU25TF U 4
AF RR2DN01JQ C 652
AF RR2BU25JQ C 589
BS 1 218 RR2DN01TF
BS 219 219 RR2BU25TF
BS 220 470 RR2DN01TF
BS 471 471 RR2BU25TF
BS 472 694 RR2DN01TF
BS 695 695 RR2BU25TF
BS 696 698 RR2BU25JQ
BS 699 714 RR2BU25TF
BS 715 851 RR2BU25JQ
BS 852 852 RR2DN01JQ
BS 853 1356 RR2BU25JQ

RD RR2DN01TF 694 0 0
GGAGTGCTCCACTCAATCTTCTTCTTTCACCAAAACAACAGCTGCTAGGGGGAGAGAGAG
AGAGCCAAACTCCATCCCTCAAGCTCTCAAGAGAATCAAGCTCCAAATATGAGCAGTTTC
TACGAGCATTACGAGTTCCCATACGATACCAACCAGGTTAATCATCTCTATGATCATAAC
TATTATGATAACAATCAACGTCAGCAGTTTGGTTTTGATCCAATGAGTTACAATAATAGT
TATGATAACTGGAATGGATCCGAGTATGAGTACGAGTATGAGACAGCCTCTGCATCTGTT
GCTTACTCTGTCTCCACCATGTCTGAGCCGAAGCACTTGTTCTATGATCCGAGTTACTAC
ACAACAACGACAACCTACGAGTCTCCTCCCCAGTTTAGTATCTATTGCAATGTTCAAGGC
TTCAACGAGCCGGAGTTCGAGGAGTACGATCCGACGCCGTACGGTGGCGGTTACGATATA
GTTGCAACTTACGGGAAACCTCTTCCTCCGTCGGTAAAAACTTGTTATCCTTCTTCAACC
GCTGATCAGGGTAATCCTCCTTCTCCTCCGGAGATCATCACTCCGGTTCCTCTTGGAATC
TACGGTGGTGGTGAAGAAAAGAAAGCTGTCAAGAAACGTGTGACTTTCTCTGAGCCGTTA
GAGGAAGCTAAACCATTAGAAACCATTAAAGAAG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2BU25TF 711 0 0
GG
GCTCCACTCAATCTTCTTCTTTCACCAAAACAACAGCTGCTAGGGGGAGAGAGAGAGAGC
CAAACTCCATCCCTCAAGCTCTCAAGGGAATCAAGCTCCAAATATGAGCAGTTTCTACGA
GCATTACGAGTTCCCATACGATACCAACCAGGTTAATCATCTCTATGATCATAACTATTA
TGATAACAATCAACGTCAGCAGTTTGGTTTTGACCCAATGAGTTACAATAATAGTTATGA
TAACTGGAATGGATCCGAGTATGAGTACGAGTATGAGACAGCCTCTGCATCTGTTGCTTA
CTCTGTCTCCACCATGTCTGAGCCGAAGCACTTGTTCTATGATCCGAGTTACTACACAAC
AACGACAACCTACGAGTCTCCTCCCCAGTTTAGTATCTATTGCAATGTTCAAGGCTTCAA
CGAGCCGGAGTTCGAGGAGTACGATCCGACGCCGTACGGTGGCGGCTACGATATAGTTGC
AACTTACGGGAAACCTCTTCCTCCGTCGGTAAAAACTTGTTATCCTTCTTCAACCGCTGA
TCAGGGTAATCCTCCTTCTCCTCCGGAGATCATCACTCCGGTTCCTCTTGGAATCTACGG
TGGTGGTGAAGAAAAGAAAGCTGTCAAGAAACGTGTGACTTTCTCTGAGCCGTTAGAGGA
AGCTAAACCATTAGAAACCATTAAAGAAGAG**ACATGATCATCAAGAA

QA 3 711 3 711
DS 

RD RR2DN01JQ 583 0 0
GAGCCGTTAGAGGAAGCTAAACCATTAGAAACCATTAAAGAAGAAGAACATGATCATCAA
GAAGAGGCAGAGGAAGAGGATGAAGAAGGTGAGGATGAAGAGGAAGAAGAAGATCACGGT
TCAAGCAATGAAACTGTAGACAAAGTTGAAGTGAAAGCTCTGTATGTTCCGTCTGGTTAC
GGCTTAGAAGCTACGGATCTCTGCGAGGTTATATTCGGAGGCTATTTTCCTTGCGTCTTA
CGTAACAAAAGACGCCAGGAGGATGAGAATCGTGCGGCTGAAGTTACTTGCTGGGAGAGC
ACAGATTCTGATCCTTGGAAGACGACTTCAGACTACCTTTTCGGGGATCCGTATCCGTAT
GGTTATGAGGATGGAGTTGGAAGAAGACAGTTCGAGATCTCCTCTTGTGGTTATCTGAGG
TATTAACTGGAGTTATCACGATCATCAGATGTGTCAAAGTTATGTGGTGAGAGCAATATT
TTTTTGATAATTGATGAAGCTGATTCGTTTTAGTATATACAATGACCTTTCTTGTATGGT
TGGTCCAACGTTATTATGAAAAGATATTCCAGGTTGATCGA
CC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2BU25JQ 768 0 0
CCTCTTGGAATCTACGGTGGTGGTGAAGAAAAGAAAGCTGTCAAGAAACGTGTGACTTTC
TCTGAGCCGTTAGAGGAAGCTAAACCATTAGAAACCATTAAAGAAGAAGAACATGATCAT
CAAGAAGAGGCAGAGGAAGAGGATGAAGAAGGTGAGGATGAAGAGGAAGAAGAAGATCAC
GGTTCAAGCAATGAAACTGTAGACAAAGTTGAAGTGAAAGCTCTGTATGTTCCGTCTGGT
TACGGCTTAGAAGCTACGGATCTTTGCGAGGTTATATTCGGAGGCTATTTTCCTTGCGTC
TTACGTAACAAAAGACGCCAGGAGGATGAGAATCGTGCGGCTGAAGTTACTTGCTGGGAG
AGCACAGATTCTGATCCTTGGAAGACGACTTCAGACTACCTTTTCGGGGATCCGTATCCG
TATGGTTATGAGGATGGAGTTGGAAGAAGACAGTTCGAGATCTCCTCTTGTGGTTATCTG
AGGTATTAACTGGAGTTATCACGATCATCAGATGTGTCAAAGTTATGTGGTGAGAGCAAT
ATTTTTTTGATAATTGATGAAGCTGATTCGTTTTAGTATATACAATGACCTTTCTTGTAT
GGTTGGTCCAACGTTATTATGAAAAGATATTCCAGGTTGATCGATCAATAAATGTTACAA
AAACATCTCCTAATTCTGCCATCTCTACCATTTAAATATCTTAGTATTGTTTTATTGTAA
TGTTTTAAAGTAAACTATTGCAAGAAAGAATTTTATAGTTTGTTTCTT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 4

CO CL2863Contig1 1143 4 30 U
AAATAACACTTGATGTTTACTGTTTGTCTTGTCTTGTCTAAACATCAACGTATCGGACCA
AAAGTCAAGAAGACAAAAGAGTGTTTACCCTAAGTTTGTTACAATGGACTGACTAATAAT
ATTGCAATAACAGGTTTGAAACAAATGAACTTTAATTGAGTTAACAATAATCGTAAGCTC
TCTACTCTCTCTGTTTCTCTCTTCAATGTAAACTATTTTGATTGATTAGAGACTAATAAT
CTTTCTTCCACGACTCCATCTACATATATATATATGTCTCTCACTTATCACACAAACTCA
AAAGTGAAATTTAAGACCAACATCATCAATGCCGAGTCACCATCCTTCCACACAGAATGT
TTGATAAACATCCGTGAGTTGACTTTTGCTTCTTCTTTTTCTTAGTCTTCTCTTTTTGTT
TAACCACAGGTTTGATCACTTCCTT*GATCGCAGAATCAAAAACTGCTTTCACGTTCTGT
TGAGTTTTTGAGCTACATTCAATGTAATATGTTGCACCAATTAGCTTACGCAGTTCCTCT
CCCTGTGCAGTGGTTACAGGGGATAGTCCAGGATGGTCAGCCAAATAATGCTTATCTTCA
CGGAGATCTAATTTAGTACCAACAAGAACCAAAGGAACTCCTGGGGCAAAGTGCTGGAGC
TCAGGGATCCACTTTTTGAAAACATTCTCGTAGCTAGCTCGGCTAACCAATGAGAAAGAC
AAGACGAAAACATCTGCTCCTCTGTAACTTAAAGGCCTCAATCTGTTATAGTCTTCCTGC
CCAGCAGTATCCCATAGTACTAAATTAACAGTGGTGCCTTCAACAACAACGTTTGCACTA
AAGTTGTCAAAAACTGTTGGTATGTAGTCGGTAGGGAATTTGTTGCTGGTGTAGCAGATG
AGCATACATGTTTTACCAACGGCGCCATCTCCAACAGTCACACATTTTATGAACTTTGAA
GCACTTGAAGCCATTAAATCTTCAATACATATACGAAAAGCAAAACAACAAGAGCAGACG
GAGAAGAATAGAGTAGAGAGATTAAATGAAGTGATTTACTTTAGAAGAGGAGTAGAAAGA
CAACAAACACCACAATACAACATAGAAGGTAGGGTTCGTTGCACAACTTTATGGCTTCTT
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2AS82JQ U 1
AF RR2AF90JQ U 70
AF RR2AS82TF C 255
AF RR2AF90TF C 425
BS 1 73 RR2AS82JQ
BS 74 74 RR2AF90JQ
BS 75 172 RR2AS82JQ
BS 173 173 RR2AF90JQ
BS 174 262 RR2AS82JQ
BS 263 266 RR2AF90JQ
BS 267 449 RR2AS82JQ
BS 450 450 RR2AF90JQ
BS 451 653 RR2AS82JQ
BS 654 654 RR2AF90JQ
BS 655 704 RR2AS82JQ
BS 705 705 RR2AF90JQ
BS 706 755 RR2AS82JQ
BS 756 756 RR2AF90JQ
BS 757 758 RR2AS82JQ
BS 759 759 RR2AF90JQ
BS 760 798 RR2AS82JQ
BS 799 799 RR2AF90JQ
BS 800 802 RR2AS82JQ
BS 803 803 RR2AF90JQ
BS 804 806 RR2AS82JQ
BS 807 807 RR2AF90JQ
BS 808 848 RR2AS82JQ
BS 849 955 RR2AF90JQ
BS 956 1000 RR2AS82TF
BS 1001 1001 RR2AF90TF
BS 1002 1008 RR2AS82TF
BS 1009 1009 RR2AF90TF
BS 1010 1015 RR2AS82TF
BS 1016 1143 RR2AF90TF

RD RR2AS82JQ 848 0 0
AAATAACACTTGATGTTTACTGTTTGTCTTGTCTTGTCTAAACATCAACGTATCGGACCA
AAAGTCAAGAAGATAAAAGAGTGTTTACCCTAAGTTTGTTACAATGGACTGACTAATAAT
ATTGCAATAACAGGTTTGAAACAAATGAACTTTAATTGAGTTAACAATAATCTTAAGCTC
TCTACTCTCTCTGTTTCTCTCTTCAATGTAAACTATTTTGATTGATTAGAGACTAATAAT
CTTTCTTCCACGACTCCATCTA****TATATATATGTCTCTCACTTATCACACAAACTCA
AAAGTGAAATTTAAGACCAACATCATCAATGCCGAGTCACCATCCTTCCACACAGAATGT
TTGATAAACATCCGTGAGTTGACTTTTGCTTCTTCTTTTTCTTAGTCTTCTCTTTTTGTT
TAACCACAGGTTTGATCACTTCCTT*GATTGCAGAATCAAAAACTGCTTTCACGTTCTGT
TGAGTTTTTGAGCTACATTCAATGTAATATGTTGCACCAATTAGCTTACGCAGTTCCTCT
CCCTGTGCAGTGGTTACAGGGGATAGTCCAGGATGGTCAGCCAAATAATGCTTATCTTCA
CGGAGATCTAATTTAGTACCAACAAGAACCAAAGGAACTCCTGGGGCAAAGTGTTGGAGC
TCAGGGATCCACTTTTTGAAAACATTCTCGTAGCTAGCTCGGCTGACCAATGAGAAAGAC
AAGACGAAAACATCTGCTCCTCTGTAACTTAAAGGTCTTAATCTGTTATAGTCTTCCTGC
CCAGCAGTATCCCATAGTCCTAGATTGACAGTGGTGCCTTCAACAACAACGTTTGCACTA
AAGTTGTC

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR2AF90JQ 886 0 0
AAGACAAAAGAGTGTTTACCCTAAGTTTGTTACAATGGACTGACTAATAATATTGCAATA
ACAGGTTTGAAACAAATGAACTTTAATTGAGTTAACAATAATTGTAAGCTCTCTACTCTC
TCTGTT*CTCTCTTCAATGTAAACTATTTTGATTGATTAGAGACTAATAATCTTTCTTCC
ACGACTCCATCTACATATATATATATGTCTCTCACTTACCACACAAACTCAAAAGTGAAA
TTTAAGACCAACATCATCAATGCCGAGTCACCATCCTTCCACACAGAATGTTTGATAAAC
ATCCGTGAGTTGACTTTTGCTTCTTCTTTTTCTTTGTCTTCTCCTTTTGTTTAACCACAG
GTTTGATCACTTCCTT*GATCGCAGAATCAAAAACTGCTTTCACGTTCTGTTGAGTTTTT
GAGCTGCATTCAATGTAATATGTTGCGCCAATTAGCTTACGCAGTTCCTCTCCCTGTGCA
GTGGTTACAGGGGATAGTCCAGGATGGTCAGCCAAATAATGCTTATCTTCACGGAGATCT
AATTTGGTACCAACAAGGACCAAAGGAACTCCTGGGGCAAAGTGCTGGAGCTCAGGGATC
CACTTTTTGAAAACATTCTCGTAGCTAGCTCGGCTAACCAATGAGAAAGACAAGACGAAA
ACATCTGCTCCTCTGTAACTTAAAGGCCTCAATCTGTTATAGTCTTCCTGCCCAGCAGTA
TCCCATAGTACTAAATTAACAGTGGTGCCTTCAACAACAACGTTTGCACTAAAGTTGTCA
AAAACTGTTGGTATGTAGTCGGTAGGGAATTTGTTGCTGGTGTAGCAGATGAGCATACAT
GTTTTACCAACGGCGCCATCTCCAACAGTCACACATTTTATGAACT

QA 1 886 1 886
DS 

RD RR2AS82TF 763 0 0
CGACTCCATC
TATATATATATGTCTCTCACTTATCACACAAACTCAAAAGTGAAATTTAAGACCAACATC
ATCAATGCCGAGTCACCATCTTTCCACACAGAATGTTTGATAAACATCCGTGAGTTGACT
TTTGCTTCTTCTTTTTCTTAGTCTTCTCTTTTTGTTTAACCACAGGTTTGATCACTTCCT
T*GATTGCAGAATCAAAAACTGCTTTCACGTTCTGTTGAGTTTTTGAGCTACATTCAATG
TAATATGTTGCACCAATTAGCTTACGCAGTTCCTCTCCCTGTGCAGTGGTTACAGGGGAT
AGTCCAGGATGGTCAGCCAAATAATGCTTATCTTCACGGAGATCTAATTTAGTACCAACA
AGAACCAAAGGAACTCCTGGGGCAAAGTGTTGGAGCTCAGGGATCCACTTTTTGAAAACA
TTCTCGTAGCTAGCTCGGCTGACCAATGAGAAAGACAAGACGAAAACATCTGCTCCTCTG
TAACTTAAAGGTCTTAATCTGTTATAGTCTTCCTGCCCAGCAGTATCCCATAGTCCTAGA
TTGACAGTGGTGCCTTCAACAACAACGTTTGCACTAAAGTTGTCAAAAACTGTTGGTATG
TAGTCGGTAGGGAATTTGTTGCTGGTGTAGCAGATGAGCATACAGGTTTTACCAACGGCG
CCATCTCCAACAGTCACGCATTTTATGAACTTTGAAGCACTTGAAGCCATTAAATCTTCA
ATACATATACGAAAAGTAAAACAAGAAGAGC
CC

QA 11 761 11 761
DS 

RD RR2AF90TF 719 0 0
CACAGGTTTGATCACTTCCTTTGATCGCAGAATCAAAAACTGCTTTCACGTTCTGTTGAG
TTTTTGAGCTGCATTCAATGTAATATGTTGCGCCAATTAGCTTACGCAGTTCCTCTCCCT
GTGCAGTGGTTACAGGGGATAGTCCAGGATGGTCAGCCAAATAATGCTTATCTTCACGGA
GATCTAATTTGGTACCAACAAGGACCAAAGGAACTCCTGGGGCAAAGTGCTGGAGCTCAG
GGATCCACTTTTTGAAAACATTCTCGTAGCTAGCTCGGCTAACCAATGAGAAAGACAAGA
CGAAAACATCTGCTCCTCTGTAACTTAAAGGCCTCAATCTGTTATAGTCTTCCTGCCCAG
CAGTATCCCATAGTACTAAATTAACAGTGGTGCCTTCAACAACAACGTTTGCACTAAAGT
TGTCAAAAACTGTTGGTATGTAGTCGGTAGGGAATTTGTTGCTGGTGTAGCAGATGAGCA
TACATGTTTTACCAACGGCGCCATCTCCAACAGTCACACATTTTATGAACTTTGAAGCAC
TTGAAGCCATTAAATCTTCAATACGTATACGAAAAGCAAAACAACAAGAGCAGACGGAGA
AGAATAGAGTAGAGAGATTAAATGAAGTGATTTACTTTAGAAGAGGAGTAGAAAGACAAC
AAACACCACAATACAACATAGAAGGTAGGGTTCGTTGCACAACTTTATGGCTTCTTCCC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL2864Contig1 1018 2 2 U
GGAAAGATGAGACGGCGACCAGGAATCGGAGGTCTTCAAAAGGCAGCAGCTGCTCGGGAT
CAGTACCGGTTATTAGGAGAAAATGTGGCAAAGTTAAGGACTGATATGATGAAAGAACAG
CTCGCCACTTTCAAGTCTCAGCTTGAAGAGTTCGCTCGTAAACACAAGAGTGACATACGT
AAAAATCCAGCCTTTAGAGCTCAGTTCCATGAAATGTGTGCTAAAGTTGGTGTGGATCCA
CTTGCTTCCAACAAGGGCTTCTGGGCTGAGCTCCTTGGAATTGGTGACTTCTACTATGAA
CTTGGTGTTCAGATCATTGAAGTGTGCATGCTTACAAGGTCACTCAATGGAGGTTTGATC
AGCTTGCAAGAGCTCTGCAGCCATCTTCGCCAGAGGAGGAAGAAAGACCGTGAAGCTGTC
ACCGAAGATGATTGTCTTCGTGCTATTAGCAAGCTTAAGGTATTGGGTAGCGGATTTGAG
GTTATCACGATTGGCAAGAAAAAGCTTGTCCGTTCAGTCCCCACTGAGCTCAACAAAGAC
CACAACCAAATCTTGGAGCTTGCTCAGGGTCAAGGCTTTGTTACTGTGGAAGAGGTACAA
AGACGGCTCTCGTGGACATCTGGTCGGGTCATAGATGCTCTCGAAACTTTGTTAGAGGTT
TGCATTTGCCCCAGTTGATTTATGTGATTCAGTACATATGGTAAATGCAGTGCAACAAAG
ATAGGTCCTCAAACTTCTTAAATTTACAATTTATTTTCAGGAGGGCCTCGCAATGATCGA
CAATGGCAGCAAAGACGGAAAGTGTCAGTACTGGTTCCCCTGTGTTTCTTCTGTTTACTC
ATTCGTTGGATCTGATACTTAAAAGCTGGTGCATTCTCTCTTTTGTACTTTTTGTTTCAT
ACTCAATACACTCTGTATTGCATATAAATTGCTAAATATTATTTATCAGTATATTTGTCA
AATAAATTCTTGTGCATGTAATACATGCCATGTATTAATAATTGTTTTCAAGTACGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS95TF U 1
AF RR2GS95JQB C 359
BS 1 653 RR2GS95TF
BS 654 1018 RR2GS95JQB

RD RR2GS95TF 654 0 0
GGAAAGATGAGACGGCGACCAGGAATCGGAGGTCTTCAAAAGGCAGCAGCTGCTCGGGAT
CAGTACCGGTTATTAGGAGAAAATGTGGCAAAGTTAAGGACTGATATGATGAAAGAACAG
CTCGCCACTTTCAAGTCTCAGCTTGAAGAGTTCGCTCGTAAACACAAGAGTGACATACGT
AAAAATCCAGCCTTTAGAGCTCAGTTCCATGAAATGTGTGCTAAAGTTGGTGTGGATCCA
CTTGCTTCCAACAAGGGCTTCTGGGCTGAGCTCCTTGGAATTGGTGACTTCTACTATGAA
CTTGGTGTTCAGATCATTGAAGTGTGCATGCTTACAAGGTCACTCAATGGAGGTTTGATC
AGCTTGCAAGAGCTCTGCAGCCATCTTCGCCAGAGGAGGAAGAAAGACCGTGAAGCTGTC
ACCGAAGATGATTGTCTTCGTGCTATTAGCAAGCTTAAGGTATTGGGTAGCGGATTTGAG
GTTATCACGATTGGCAAGAAAAAGCTTGTCCGTTCAGTCCCCACTGAGCTCAACAAAGAC
CACAACCAAATCTTGGAGCTTGCTCAGGGTCAAGGCTTTGTTACTGTGGAAGAGGTACAA
AGACGGCTCTCGTGGACATCTGGTCGGGTCATAGATGCTCTCGAAACTTTGTT
A

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2GS95JQB 660 0 0
TCAGCTTGCAAGAGCTCTGCAGCCATCTTCGCCAGAGGAGGAAGAAAGACCGTGAAGCTG
TCACCGAAGATGATTGTCTTCGTGCTATTAGCAAGCTTAAGGTATTGGGTAGCGGATTTG
AGGTTATCACGATTGGCAAGAAAAAGCTTGTCCGTTCAGTCCCCACTGAGCTCAACAAAG
ACCACAACCAAATCTTGGAGCTTGCTCAGGGTCAAGGCTTTGTTACTGTGGAAGAGGTAC
AAAGACGGCTCTCGTGGACATCTGGTCGGGTCATAGATGCTCTCGAAACTTTGTTAGAGG
TTTGCATTTGCCCCAGTTGATTTATGTGATTCAGTACATATGGTAAATGCAGTGCAACAA
AGATAGGTCCTCAAACTTCTTAAATTTACAATTTATTTTCAGGAGGGCCTCGCAATGATC
GACAATGGCAGCAAAGACGGAAAGTGTCAGTACTGGTTCCCCTGTGTTTCTTCTGTTTAC
TCATTCGTTGGATCTGATACTTAAAAGCTGGTGCATTCTCTCTTTTGTACTTTTTGTTTC
ATACTCAATACACTCTGTATTGCATATAAATTGCTAAATATTATTTATCAGTATATTTGT
CAAATAAATTCTTGTGCATGTAATACATGCCATGTATTAATAATTGTTTTCAAGTACGGC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 3

CO CL2865Contig1 1131 3 3 U
ATCGGCTTCATCTCTGAGGTTAACAGCTGGATTAGTATCCTCCAATGGCTCCTCCTCTTT
CGATTCTCAGAAGCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCGTTCAAGAAAGAGGAGGAACAAGTT
AGTAAGCGAGAGAAAGAAGAGGTCATCTCCGAAGGGTGTAGTATACTCCCAAGGCACTCT
CTGGACACCGGAGACTCCCTCTCCTCCTCAAGGTGTTTGGTCCATCGGGACAAGGACAAG
GACAAGGACCTCCTCCTATGGTGCAAGAGCGTTTCCAGAGCATCATTAGCCAGCTCTTCC
AATATGGACCTCTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTATGATTGATTTATTATCCAAAATGTTTT
TGATTATTAAATTGGTTTCTTTTTTTATCTTAAAAGAGGATTATTCGGTGTGGTGGTGCT
GTGGATGATGATATGGCCAACATCATCGTAGCTCAGCTTCTCTACCTTGATCCTACTAAG
CTCACATCTTTCTTACTACTCCAAATTTCATCTCTTAGTTCCTTGATTCTTTGCTTCCTT
ATTATTGGACAGGATATTGTCATGTATGTGAATTCTCCTGCTGGATCTGTTACTGCTGGC
ATGGCTATATTCGATACCATGAGGCATATCCGACCTCATGTCTCCACTGTTTGTGTTGCT
CTTGCTGCTAGTATGGGAGCTTTTCTGCTTAGTCCTGGAACCAAAGGAAAAAGATACAGT
CTACCAAACTCTAGGATAATGATCCATCAGCCTCTTGGTGGAGCTCAAGGTGGCCAGACT
GATATCGACATTCAGGCGAATGAAATGCTGCACCACAAGGCTAACCTAAACGGTTACCTC
GCTTACCAGACTGGTCAAAGCCTCGGTGATAAACCAAGACACTGACCGCGATTTCTTCAT
GAGTGCTAAAGAGGCTCAAGATTATGGACTTATCGATGGTGTCATCATGAACCCTCTTAA
AGCTCTTCAGCCACTTGCAGCAGCTTAAGAGTTTGAAGGTAAGGAATACTTCAGCTTAGC
ACTTTTAGTGGGTGGGCCTTTTATGAACTGATGGAAATCAAATTTGTTTGGGATCTAAAT
CAATTGTAGCTGTGATACATTTATTTATGAAGAATAAAGTAAAGTTTAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2AY50TFB U 1
AF RR2GC69TF U 386
AF RR2GC69JQ C 391
BS 1 643 RR2AY50TFB
BS 644 1127 RR2GC69TF
BS 1128 1131 RR2GC69JQ

RD RR2AY50TFB 643 0 0
ATCGGCTTCATCTCTGAGGTTAACAGCTGGATTAGTATCCTCCAATGGCTCCTCCTCTTT
CGATTCTCAGAAGCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCGTTCAAGAAAGAGGAGGAACAAGTT
AGTAAGCGAGAGAAAGAAGAGGTCATCTCCGAAGGGTGTAGTATACTCCCAAGGCACTCT
CTGGACACCGGAGACTCCCTCTCCTCCTCAAGGTGTTTGGTCCATCGGGACAAGGACAAG
GACAAGGACCTCCTCCTATGGTGCAAGAGCGTTTCCAGAGCATCATTAGCCAGCTCTTCC
AATATGGACCTCTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTATGATTGATTTATTATCCAAAATGTTTT
TGATTATTAAATTGGTTTCTTTTTTTATCTTAAAAGAGGATTATTCGGTGTGGTGGTGCT
GTGGATGATGATATGGCCAACATCATCGTAGCTCAGCTTCTCTACCTTGATCCTACTAAG
CTCACATCTTTCTTACTACTCCAAATTTCATCTCTTAGTTCCTTGATTCTTTGCTTCCTT
ATTATTGGACAGGATATTGTCATGTATGTGAATTCTCCTGCTGGATCTGTTACTGCTGGC
ATGGCTATATTCGATACCATGAGGCATATCCGACCTCATGTCT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2GC69TF 742 0 0
GATCT
TAAAAGAGGATTATTCGGTGTGGTGGTGCTGTGGATGATGATATGGCCAACATCATCGTA
GCTCAGCTTCTCTACCTTGATCCTACTAAGCTCACATCTTTCTTACTACTCCAAATTTCA
TCTCTTAGTTCCTTGATTCTTTGCTTCCTTATTATTGGACAGGATATTGTCATGTATGTG
AATTCTCCTGCTGGATCTGTTACTGCTGGCATGGCTATATTCGATACCATGAGGCATATC
CGACCTCATGTCTCCACTGTTTGTGTTGCTCTTGCTGCTAGTATGGGAGCTTTTCTGCTT
AGTCCTGGAACCAAAGGAAAAAGATACAGTCTACCAAACTCTAGGATAATGATCCATCAG
CCTCTTGGTGGAGCTCAAGGTGGCCAGACTGATATCGACATTCAGGCGAATGAAATGCTG
CACCACAAGGCTAACCTAAACGGTTACCTCGCTTACCAGACTGGTCAAAGCCTCGGTGAT
AAACCAAGACACTGACCGCGATTTCTTCATGAGTGCTAAAGAGGCTCAAGATTATGGACT
TATCGATGGTGTCATCATGAACCCTCTTAAAGCTCTTCAGCCACTTGCAGCAGCTTAAGA
GTTTGAAGGTAAGGAATACTTCAGCTTAGCACTTTTAGTGGGTGGGCCTTTTATGAACTG
ATGGAAATCAAATTTGTTTGGGATCTAAATCAATTGTAGCTGTGATACATTTATTTATGA
AGAATAAAGTAAAGTTT

QA 6 742 6 742
DS 

RD RR2GC69JQ 741 0 0
TAAAAGAGGATTATTCGGTGTGGTGGTGCTGTGGATGATGATATGGCCAACATCATCGTA
GCTCAGCTTCTCTACCTTGATCCTACTAAGCTCACATCTTTCTTACTACTCCAAATTTCA
TCTCTTAGTTCCTTGATTCTTTGCTTCCTTATTATTGGACAGGATATTGTCATGTATGTG
AATTCTCCTGCTGGATCTGTTACTGCTGGCATGGCTATATTCGATACCATGAGGCATATC
CGACCTCATGTCTCCACTGTTTGTGTTGCTCTTGCTGCTAGTATGGGAGCTTTTCTGCTT
AGTCCTGGAACCAAAGGAAAAAGATACAGTCTACCAAACTCTAGGATAATGATCCATCAG
CCTCTTGGTGGAGCTCAAGGTGGCCAGACTGATATCGACATTCAGGCGAATGAAATGCTG
CACCACAAGGCTAACCTAAACGGTTACCTCGCTTACCAGACTGGTCAAAGCCTCGGTGAT
AAACCAAGACACTGACCGCGATTTCTTCATGAGTGCTAAAGAGGCTCAAGATTATGGACT
TATCGATGGTGTCATCATGAACCCTCTTAAAGCTCTTCAGCCACTTGCAGCAGCTTAAGA
GTTTGAAGGTAAGGAATACTTCAGCTTAGCACTTTTAGTGGGTGGGCCTTTTATGAACTG
ATGGAAATCAAATTTGTTTGGGATCTAAATCAATTGTAGCTGTGATACATTTATTTATGA
AGAATAAAGTAAAGTTTAAGT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 2 4

CO CL2866Contig1 1149 2 2 U
CTCTCGAAATCTTACCAAAAAGAAAATTCGACCAAGAGAAGTTGGAGTTGGTCTCGCGAA
GATCAAATTACTCTCAGAAATCTGAACAGGCTTTGTGATGGGTGCTCCGAAGCAGAAATG
GACTCAAGAAGAAGAGACAGCTTTAAGGTCTGGCGTTATCAAGCATGGACCTGGCAAATG
GCGCACCATTCTCAAAGACCCTGACTTTAGTGAAGTCTTGTTCCTCCGTTCCAATGTTGA
TCTTAAGGACAAATGGAGGAACATGAGTGTCATGTCGAATGGGTGGGGATCGCGCGAGAA
GTCTAGGGTTGGTGTTAGAAGGACGCCCTCTCTTCCTAAACAGGAAGATACCTCGCTTGC
CGCCGATTCTAGCCCGCCGCAGAGTGATGGAGAAATGGCAGAAGAAGATGCCACTGGCAC
TTCTGCACCTAATGTAAGGCTGGATAGCCTCATAATGGAAGCAATATCTACCATAAAAGA
GCCTGGTGGCTCTAACAAAACATCAATTGGTACCTACATTGAGGAACAATATCACGCTCC
ACCAGACTTCAAACGGTTGCTGTCAGCCAAGCTAAAGTACTTGACAGCTCGCCGGAAACT
TATCAAGGTTAAGCGCAAGTATAGGATTCCAAACTCCACTCCATTGTCTCCCCACAGAAG
AAAACAGTTGGAGTCATCTTCTGGAAAACAGAGAAATCTCTCTTTGCCTTCCCCTAAAAC
AGACGGAGATGAAGTCAGCGTTGTGGCAAACGCACAGATTGATCCGGAGTTAGACAGGAT
GAAGACTATGAACGTACAAGAAGCGGCAGCGATTGCAGCACAGGCAGGGGAAGCTATGAA
GACACTGAAAGGAAGATACAACAACTGCAAAGTGATGATCCGTGCCTAAGATGATGGAGA
GAGAAGTAGTGTGTTGTGTTTGTTGATGGATTCTCTACTGGGGAACTCTTTTTGGTTGTA
AGCAGTGATGATTGTATGTGTCTACTATTACTTGTTTACTTGTTCCTTACAGTTTTTTTT
TACAATTGTTGTGAAGTCAAGCTGCTTGTGATACGTATCCGACTTAGTTGTATTATGTGC
GTCTTCATGCTACAATCTGTAACCTGTTTGTTTGCGTTTACCCCAAATTAATATCAGAAG
ATATTGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF58TF U 1
AF RR2AF58JQ C 679
BS 1 769 RR2AF58TF
BS 770 1149 RR2AF58JQ

RD RR2AF58TF 769 0 0
CTCTCGAAATCTTACCAAAAAGAAAATTCGACCAAGAGAAGTTGGAGTTGGTCTCGCGAA
GATCAAATTACTCTCAGAAATCTGAACAGGCTTTGTGATGGGTGCTCCGAAGCAGAAATG
GACTCAAGAAGAAGAGACAGCTTTAAGGTCTGGCGTTATCAAGCATGGACCTGGCAAATG
GCGCACCATTCTCAAAGACCCTGACTTTAGTGAAGTCTTGTTCCTCCGTTCCAATGTTGA
TCTTAAGGACAAATGGAGGAACATGAGTGTCATGTCGAATGGGTGGGGATCGCGCGAGAA
GTCTAGGGTTGGTGTTAGAAGGACGCCCTCTCTTCCTAAACAGGAAGATACCTCGCTTGC
CGCCGATTCTAGCCCGCCGCAGAGTGATGGAGAAATGGCAGAAGAAGATGCCACTGGCAC
TTCTGCACCTAATGTAAGGCTGGATAGCCTCATAATGGAAGCAATATCTACCATAAAAGA
GCCTGGTGGCTCTAACAAAACATCAATTGGTACCTACATTGAGGAACAATATCACGCTCC
ACCAGACTTCAAACGGTTGCTGTCAGCCAAGCTAAAGTACTTGACAGCTCGCCGGAAACT
TATCAAGGTTAAGCGCAAGTATAGGATTCCAAACTCCACTCCATTGTCTCCCCACAGAAG
AAAACAGTTGGAGTCATCTTCTGGAAAACAGAGAAATCTCTCTTTGCCTTCCCCTAAAAC
AGACGGAGATGAAGTCAGCGTTGTGGCAAACGCACAGATTGATCCGGAG

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2AF58JQ 471 0 0
TTCTGGAAAACAGAGAAATCTCTCTTTGCCTTCCCCTAAAACAGACGGAGATGAAGTCAG
CGTTGTGGCAAACGCACAGATTGATCCGGAGTTAGACAGGATGAAGACTATGAACGTACA
AGAAGCGGCAGCGATTGCAGCACAGGCAGGGGAAGCTATGAAGACACTGAAAGGAAGATA
CAACAACTGCAAAGTGATGATCCGTGCCTAAGATGATGGAGAGAGAAGTAGTGTGTTGTG
TTTGTTGATGGATTCTCTACTGGGGAACTCTTTTTGGTTGTAAGCAGTGATGATTGTATG
TGTCTACTATTACTTGTTTACTTGTTCCTTACAGTTTTTTTTTACAATTGTTGTGAAGTC
AAGCTGCTTGTGATACGTATCCGACTTAGTTGTATTATGTGCGTCTTCATGCTACAATCT
GTAACCTGTTTGTTTGCGTTTACCCCAAATTAATATCAGAAGATATTGAAC

QA 1 471 1 471
DS 



CO CL2866Contig2 802 2 2 U
GAGCCTCATAATGGAAGCAATATCTACCATAAAAGAGCCTGGTGGCTCTAACAAAACATC
AATTGGTACCTACATTGAGGAACAATATCACGCTCCACCAGACTTCAAACGGTTGCTGTC
AGCCAAGCTAAAGTACTTGACAGCTCGCCGGAAACTTATCAAGGTTAAGCGCAAGTATAG
GATTCCAAACTCCACTCCATTGTCTCCCCACAGAAGAAAGCATTTGGGGTCATCTTCTGG
AAAACAGAGAAGTCTCTCCTTGCCTTCCACTAAAACAGACGGAGATGAAGTCAGTGTTGA
GGCAAACGCACAGATTGATCCGGAGTTAGACAGAATGAAGACTATGAACGTACAAGAAGC
GGCAGCGATTGCAGCACAGGCAGTTGCAGAGGCAGAGGCTGCCACGGCAGCGGCTGAAGA
AGCTGCAAAGGATGCAGAGTTAGCAGAAGCGGAAGCAGAAGTAGCACAAGCTTTTGCAGA
GGAAGCTATAAAGACACTGAAAGGAAGATACACCAACTGCAAAGTGATGATCCGTGCCTA
AGATGATGGAGAGAGAAGTAGTGTGTTGTGTTTGTTGATGGATTCTCTACTGGGGAACTC
TTTTTGGTTGTAAGCAGTGATGATTGTATGTGTCTACTATTACTTGTTTACTTGTTCCTT
ACAGTTTTTTTCTACAGTTGTTGTGAAGTCAAGCTGCTTGTGATACGTATCCGACTTAGT
TGTATTATGTGCGTCTTCATGCTACAATCTGTAACCTGTTTGTTTGCGTTTACCCCAAAA
TTAATATCAGAAGATAGTGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B203TF U 1
AF RR2B203JQ C 74
BS 1 771 RR2B203TF
BS 772 802 RR2B203JQ

RD RR2B203TF 771 0 0
GAGCCTCATAATGGAAGCAATATCTACCATAAAAGAGCCTGGTGGCTCTAACAAAACATC
AATTGGTACCTACATTGAGGAACAATATCACGCTCCACCAGACTTCAAACGGTTGCTGTC
AGCCAAGCTAAAGTACTTGACAGCTCGCCGGAAACTTATCAAGGTTAAGCGCAAGTATAG
GATTCCAAACTCCACTCCATTGTCTCCCCACAGAAGAAAGCATTTGGGGTCATCTTCTGG
AAAACAGAGAAGTCTCTCCTTGCCTTCCACTAAAACAGACGGAGATGAAGTCAGTGTTGA
GGCAAACGCACAGATTGATCCGGAGTTAGACAGAATGAAGACTATGAACGTACAAGAAGC
GGCAGCGATTGCAGCACAGGCAGTTGCAGAGGCAGAGGCTGCCACGGCAGCGGCTGAAGA
AGCTGCAAAGGATGCAGAGTTAGCAGAAGCGGAAGCAGAAGTAGCACAAGCTTTTGCAGA
GGAAGCTATAAAGACACTGAAAGGAAGATACACCAACTGCAAAGTGATGATCCGTGCCTA
AGATGATGGAGAGAGAAGTAGTGTGTTGTGTTTGTTGATGGATTCTCTACTGGGGAACTC
TTTTTGGTTGTAAGCAGTGATGATTGTATGTGTCTACTATTACTTGTTTACTTGTTCCTT
ACAGTTTTTTTCTACAGTTGTTGTGAAGTCAAGCTGCTTGTGATACGTATCCGACTTAGT
TGTATTATGTGCGTCTTCATGCTACAATCTGTAACCTGTTTGTTTGCGTTT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2B203JQ 729 0 0
ATTGAGGAACAATATCACGCTCCACCAGACTTCAAACGGTTGCTGTCAGCCAAGCTAAAG
TACTTGACAGCTCGCCGGAAACTTATCAAGGTTAAGCGCAAGTATAGGATTCCAAACTCC
ACTCCATTGTCTCCCCACAGAAGAAAGCATTTGGGGTCATCTTCTGGAAAACAGAGAAGT
CTCTCCTTGCCTTCCACTAAAACAGACGGAGATGAAGTCAGTGTTGAGGCAAACGCACAG
ATTGATCCGGAGTTAGACAGAATGAAGACTATGAACGTACAAGAAGCGGCAGCGATTGCA
GCACAGGCAGTTGCAGAGGCAGAGGCTGCCACGGCAGCGGCTGAAGAAGCTGCAAAGGAT
GCAGAGTTAGCAGAAGCGGAAGCAGAAGTAGCACAAGCTTTTGCAGAGGAAGCTATAAAG
ACACTGAAAGGAAGATACACCAACTGCAAAGTGATGATCCGTGCCTAAGATGATGGAGAG
AGAAGTAGTGTGTTGTGTTTGTTGATGGATTCTCTACTGGGGAACTCTTTTTGGTTGTAA
GCAGTGATGATTGTATGTGTCTACTATTACTTGTTTACTTGTTCCTTACAGTTTTTTTCT
ACAGTTGTTGTGAAGTCAAGCTGCTTGTGATACGTATCCGACTTAGTTGTATTATGTGCG
TCTTCATGCTACAATCTGTAACCTGTTTGTTTGCGTTTACCCCAAAATTAATATCAGAAG
ATAGTGAAC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL2867Contig1 750 2 2 U
GCAAGAACTGATTTACTTCAATTATATTTATTACACTATAATAATGTTTAAAATACATCA
AAAAGAAAGAAATAAATAAAAAAAAAAAGACTAAAGAGGAGCAGCTGAAAAGTAAGGTAC
CTGCACATTGACAAAAACAGAACTTTTTTGACCAAATTGCTCAAATCCAGTTAGCATTAG
TGAGTGTACACATTGCAATCTAGACCAAAGTAAAAGGTGTGTAAAGAATCAAGAGATACT
AAAACATGAATGCTCTGCAAATGAGATTGCATCGTCTAACAACCAACCAACTTAGATATT
AAATACATGACCAGGCCAACTAGTTTTATTAGTTATATAACTAGTAATTGTACATCACAC
ACACCATTTATTCTTTTAGTCTTAACAATTTAGGTAATGAGATTTGACTAATTTACTTTT
AATAAATTAAGTCGGCAATCTTCTTGAATCTCACCGTCAAAAACCTATTCAAAAGAACCA
GGGAACCTGAGTAGAACCAAAAGTAAAACCAACCAGAAACCTAAGATTCTCAAGAACAGA
GCTCTTTGTTATCATCATCTCTACCCTTATAAATAAGAGGACCATAAGAATTAACTTTTG
GAACAGATTGAATCAAGAAGTGATTACACCAACACTAACTTAAGATCTTGAATTTAAACG
TTCTTCAGATTCTAACAAAATCTGAAGTTTGTTAAACCATAGGGCAATATCACGGAGCTT
TACTATAGATACTTCAACTTTTACGCAAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE06JQ U 1
AF RR2HB50JQ U 1
BS 1 698 RR2GE06JQ
BS 699 750 RR2HB50JQ

RD RR2GE06JQ 698 0 0
GCAAGAACTGATTTACTTCAATTATATTTATTACACTATAATAATGTTTAAAATACATCA
AAAAGAAAGAAATAAATAAAAAAAAAAAGACTAAAGAGGAGCAGCTGAAAAGTAAGGTAC
CTGCACATTGACAAAAACAGAACTTTTTTGACCAAATTGCTCAAATCCAGTTAGCATTAG
TGAGTGTACACATTGCAATCTAGACCAAAGTAAAAGGTGTGTAAAGAATCAAGAGATACT
AAAACATGAATGCTCTGCAAATGAGATTGCATCGTCTAACAACCAACCAACTTAGATATT
AAATACATGACCAGGCCAACTAGTTTTATTAGTTATATAACTAGTAATTGTACATCACAC
ACACCATTTATTCTTTTAGTCTTAACAATTTAGGTAATGAGATTTGACTAATTTACTTTT
AATAAATTAAGTCGGCAATCTTCTTGAATCTCACCGTCAAAAACCTATTCAAAAGAACCA
GGGAACCTGAGTAGAACCAAAAGTAAAACCAACCAGAAACCTAAGATTCTCAAGAACAGA
GCTCTTTGTTATCATCATCTCTACCCTTATAAATAAGAGGACCATAAGAATTAACTTTTG
GAACAGATTGAATCAAGAAGTGATTACACCAACACTAACTTAAGATCTTGAATTTAAACG
TTCTTCAGATTCTAACAAAATCTGAAGTTTGTTAAACC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2HB50JQ 750 0 0
GCAAGAACTGATTTACTTCAATTATATTTATTACACTATAATAATGTTTAAAATACATCA
AAAAGAAAGAAATAAATAAAAAAAAAAAGACTAAAGAGGAGCAGCTGAAAAGTAAGGTAC
CTGCACATTGACAAAAACAGAACTTTTTTGACCAAATTGCTCAAATCCAGTTAGCATTAG
TGAGTGTACACATTGCAATCTAGACCAAAGTAAAAGGTGTGTAAAGAATCAAGAGATACT
AAAACATGAATGCTCTGCAAATGAGATTGCATCGTCTAACAACCAACCAACTTAGATATT
AAATACATGACCAGGCCAACTAGTTTTATTAGTTATATAACTAGTAATTGTACATCACAC
ACACCATTTATTCTTTTAGTCTTAACAATTTAGGTAATGAGATTTGACTAATTTACTTTT
AATAAATTAAGTCGGCAATCTTCTTGAATCTCACCGTCAAAAACCTATTCAAAAGAACCA
GGGAACCTGAGTAGAACCAAAAGTAAAACCAACCAGAAACCTAAGATTCTCAAGAACAGA
GCTCTTTGTTATCATCATCTCTACCCTTATAAATAAGAGGACCATAAGAATTAACTTTTG
GAACAGATTGAATCAAGAAGTGATTACACCAACACTAACTTAAGATCTTGAATTTAAACG
TTCTTCAGATTCTAACAAAATCTGAAGTTTGTTAAACCATAGGGCAATATCACGGAGCTT
TACTATAGATACTTCAACTTTTACGCAAGA

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 3

CO CL2868Contig1 1081 3 14 U
GCTTATACACAGGTGACAATGAGTAACAAATAGTATAACAACAATAAACTCAAAATATTA
GTAGCAACAACACACATACAACAGTACGGATACAAGGCACAACCGGGCAAAAGGATAACA
ACACTTAACGGATGATCAAAGTTTGAAAACAGAGAGACGAGAGGACTCATGACAACATTA
CTAATTCTAGCCCTTCCCTTCAGCGACCAGAGAGACTAATCTGTTCACAGTTTTTATCAA
CAGACTCCTTAACAGCATCAACCACTAGCTGTGTCTTCCGGCTAATGCTCGGCCAAAACC
CATCAGGCTTTGCACCTTTGTTCTTGATTTCACCAACCAACCGAGCAAACTCTCTCACCA
TACATGCCTCTTGCGGAAGCTCCGTCTTAACCGTGTGCTCGCTCGGGGGATTAACCCACG
CGGTCACGAACTCATTAAACCAAGCTTTAGTGCTCGTTGTGAACGATGCCTCGGTCTCCT
TAAACGGGATAATGAAATCATGAACACTAAGCGTGCCGTTAGTTCCAATGGCGTTTATCT
CCATTGTCAAGTTTGCCAAGAAGGAACAGTATATGGTAGCGGTTCGTCCGTCTTCCCAAG
TCAGAGAAGCTCCACATGAGAGAATCACTCCTGCTTCGTTAAGCACAGCGCCGGGAAAGG
CTGTGACGATATTGGGAAGCTCGAAGTTGTTGGCTAAGAGAGTTGCTCGGATGGTGTACC
ATCCAGCGTCTCCGAGCGCACCAAGCCCATCAAGACCTGGCTTCACACGGATGTCGTTCT
TGAGGAAATCTTCGTCTCCAGCAAATGAGAAGCAACTCTGTACGGTTTTGAGCTGACCAA
AGCGGTCGGAATCAGACAGAAACTCCTTAAGCTTAGCAGTTCTAGGATTATGAACCCACA
TAGTGCCATCCATAATCTGAACACCATTAGCTTCACAAGCCGCAACGATCTTATCAAACT
CAGCTACATTCAACGCGACGGGCTTCTCAAGAAGGATGTGTTTCCCTTTCTCGGCGGCGC
GTATGGCCCACTCGACGTGGAGACTAGTGGGTAGAGGAACGTAGAGCGCGTCTACCTCCG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2DR06JQ U 37
AF RR2FU17JQ U 1
AF RR2DR06TF C 395
BS 1 43 RR2FU17JQ
BS 44 44 RR2DR06JQ
BS 45 109 RR2FU17JQ
BS 110 110 RR2DR06JQ
BS 111 505 RR2FU17JQ
BS 506 506 RR2DR06TF
BS 507 547 RR2FU17JQ
BS 548 548 RR2DR06TF
BS 549 649 RR2FU17JQ
BS 650 650 RR2DR06TF
BS 651 676 RR2FU17JQ
BS 677 677 RR2DR06TF
BS 678 698 RR2FU17JQ
BS 699 1081 RR2DR06TF

RD RR2DR06JQ 101 0 0
AACAACAATAAACTCAAAATATTAGTAGCAACAACACACATACAACAGTACGGATACAAG
GGACAACCGGGCAAAAGGATAACAACACTTAACGGATGATC

QA 1 101 1 101
DS 

RD RR2FU17JQ 698 0 0
GCTTATACACAGGTGACAATGAGTAACAAATAGTATAACAACATTAAACTCAAAATATTA
GTAGCAACAACACACATACAACAGTACGGATACAAGGCACAACCGGGCAGAAGGATAACA
ACACTTAACGGATGATCAAAGTTTGAAAACAGAGAGACGAGAGGACTCATGACAACATTA
CTAATTCTAGCCCTTCCCTTCAGCGACCAGAGAGACTAATCTGTTCACAGTTTTTATCAA
CAGACTCCTTAACAGCATCAACCACTAGCTGTGTCTTCCGGCTAATGCTCGGCCAAAACC
CATCAGGCTTTGCACCTTTGTTCTTGATTTCACCAACCAACCGAGCAAACTCTCTCACCA
TACATGCCTCTTGCGGAAGCTCCGTCTTAACCGTGTGCTCGCTCGGGGGATTAACCCACG
CGGTCACGAACTCATTAAACCAAGCTTTAGTGCTCGTTGTGAACGATGCCTCGGTCTCCT
TAAACGGGATAATGAAATCATGAACTCTAAGCGTGCCGTTAGTTCCAATGGCGTTTATCT
CCATTGTTAAGTTTGCCAAGAAGGAACAGTATATGGTAGCGGTTCGTCCGTCTTCCCAAG
TCAGAGAAGCTCCACATGAGAGAATCACTCCTGCTTCGTTAAGCACAGCTCCGGGAAAGG
CTGTGACGATATTGGGGAGCTCGAAGTTGTTGGCTAAG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2DR06TF 687 0 0
GTGCTCGCTCGGGGGATTAACCCACGCGGTCACGAACTCATTGAACCAAGCTTTAGTGCT
CGTTGTGAACGATGCCTCGGTCTC*TTAAACGGGATAATGAAATCATGAACACTAAGCGT
GCCGTTGGTTCCAATGGCGTTTATCTCCATTGTCAAGTTTGCCAAGAAGGAACAGTATAT
GGTAGCGGTTCGTCCGTCTTCCCAAGTCAGAGAAGCTCCACATGAGAGAATCACTCCTGC
TTCGTTAAGCACAGCGCCGGGAAAGGCTGTGACGGTATTGGGAAGCTCGAAGTTGTTGGC
TAAGAGAGTTGCTCGGATGGTGTACCATCCAGCGTCTCCGAGCGCACCAAGCCCATCAAG
ACCTGGCTTCACACGGATGTCGTTCTTGAGGAAATCTTCGTCTCCAGCAAATGAGAAGCA
ACTCTGTACGGTTTTGAGCTGACCAAAGCGGTCGGAATCAGACAGAAACTCCTTAAGCTT
AGCAGTTCTAGGATTATGAACCCACATAGTGCCATCCATAATCTGAACACCATTAGCTTC
ACAAGCCGCAACGATCTTATCAAACTCAGCTACATTCAACGCGACGGGCTTCTCAAGAAG
GATGTGTTTCCCTTTCTCGGCGGCGCGTATGGCCCACTCGACGTGGAGACTAGTGGGTAG
AGGAACGTAGAGCGCGTCTACCTCCGC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 3

CO CL2869Contig1 874 3 7 U
ATATTCAAACTCGATCAAATCTCATTCCTTTTCTGGAATTGTTTTTTTTCTTAACCAACC
AAGTCCAAGCATCTATGGCAGCAGCAACATACAAACGCTTTCGACTATATGACACTCTCA
CTCAACCTTGCCAAACTCTCCAACATTCGAGCTGCTTTCCACAACCGTCTCTCTTACAAA
CCTCGCCAGCTTCTCTCTTGAAGATTGTAAGACGTAAATGGAGAGTACGAAAGAAAATGT
GAGAGCTGAACCAAAGAGGACATAAAATCCTGAGGAAACATCAATCTCTGACTGTTCCTT
CCATGTGTATCTAACAAGAACATGTTTTGGCCAGTGTTGAGGGTCCCAGAACTGCTTGCG
GATCTCCGGGTGTGTATTCAAATAGCTAAGAGGCATATCGACGACTTGAGCTGTAACTCC
AAGGAAATCTCCTCCAGAATATCTCAAATTGACATCGATCATTGGAACTTCTGAACTCTT
CCGGTTTATCACCAAAAGCCAGTGTATTAGAAATTTCTCACTTCCAACTTGGAATTTTAT
CTTATAAGGATCTGTGCCAGTGTAGCCAACTGGTTTCGCTATGGGGATTAGCACCTCGCG
ATTAACGGCGAAGATCGGGCAATGCTTTCCGATCACATCATGCCAAGTCGTTCTCGAGGA
ATGGTACTGTCCCATCTTGCTCATCGCCACGATGTCTCCTGGTCGGTAAGCGCTGCAAAG
ATGCGGGAATGATAGTGATACCACAAGTAGAGCTTCAATTAACCATTTCCACGCTCGCGA
TCCTGCTTCCGTAACCATGCCCGCCGCCATAACTTGATTCTTCGGTGAGGTTTCTCCGCC
GGTGATTTTGGTCGGAGGTAGAAAGATGCAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G757JQ U 1
AF RR2GA10JQ U 12
AF RR2G757TF C 302
BS 1 69 RR2G757JQ
BS 70 70 RR2GA10JQ
BS 71 234 RR2G757JQ
BS 235 235 RR2GA10JQ
BS 236 593 RR2G757JQ
BS 594 649 RR2GA10JQ
BS 650 874 RR2G757TF

RD RR2G757JQ 593 0 0
ATATTCAAACTCGATCAAATCTCATTCCTTTTCTGGAATTGTTTTTTTTCTTAACCAACC
AAGTCCAAGTATCTATGGCAGCAGCAACATACAAACGCTTTCGACTATATGACACTCTCA
CTCAACCTTGCCAAACTCTCCAACATTCGAGCTGCTTTCCACAACCGTCTCTCTTACAAA
CCTCGCCAGCTTCTCTCTTGAAGATTGTAAGACGTAAATGGAGAGTACGAAAGAGAATGT
GAGAGCTGAACCAAAGAGGACATAAAATCCTGAGGAAACATCAATCTCTGACTGTTCCTT
CCATGTGTATCTAACAAGAACATGTTTTGGCCAGTGTTGAGGGTCCCAGAACTGCTTGCG
GATCTCCGGGTGTGTATTCAAATAGCTAAGAGGCATATCGACGACTTGAGCTGTAACTCC
AAGGAAATCTCCTCCAGAATATCTCAAATTGACATCGATCATTGGAACTTCTGAACTCTT
CCGGTTTATCACCAAAAGCCAGTGTATTAGAAATTTCTCACTTCCAACTTGGAATTTTAT
CTTATAAGGATCTGTGCCAGTGTAGCCAACTGGTTTCGCTATGGGGATTAGCA

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2GA10JQ 638 0 0
CGATCAAATCTCATTCCTTTTCTGGAATTGTTTTTTTTCTTAACCAACCAAGTCCAAGCA
TCTATGGCAGCAGCAACATACAAACGCTTTCGACTGTATGACACTCTCACTCAACCTTGC
CAAACTCTCCAACATTCGAGCTGCTTTCCACAACCGTCTCTCTTACAAACCTCGCCAGCT
TCTCTCTTGAAGATTGTAAGACGTAAATGGAGAGTACGAAAGAAAATGTGAGAGCTGAAC
CAAAGAGGACATAAAATCCTGAGGAAACATCAATCTCTGACTGTTCCTTCCATGTGTATC
TAACAAGAACATGTTTTGGCCAGTGTTGAGGGTCCCAGAACTGCTTGCGGATCTCCGGGT
GTGTATTCAAATAGGTAAGAGGCATATCGACAACTTGAGCTGTAACTCCAAGCAAATCTC
CTCCAGAATATCTCAAATTGACATCGATCATTGGAACTTCTGAACTCTTCCGGTTTATCA
CCAAAAGCCAGTGTATTAGAAATTTCTCACTTCCAACTTGGAATTTTATCTTATAAGGAT
CTGTGCCAGTGTAGCCAACTGGTTTCGCTATGGGGATTAGCACCTCGCGATTAACGGCGA
AGATCGGGCAATGCTTTCCGATCACATCATGCCAAGTC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2G757TF 573 0 0
CATGTGTATCTAACAAGAACATGTTTTGGCCAGTGTTGAGGGTCCCAGAACTGCTTGCGG
ATCTCCGGGTGTGTATTCAAATAGCTAAGAGGCATATCGACGACTTGAGCTGTAACTCCA
AGGAAATCTCCTCCAGAATATCTCAAATTGACATCGATCATTGGAACTTCTGAACTCTTC
CGGTTTATCACCAAAAGCCAGTGTATTAGAAATTTCTCACTTCCAACTTGGAATTTTATC
TTATAAGGATCTGTGCCAGTGTAGCCAACTGGTTTCGCTATGGGGATTAGCACCTCGCGA
TTAACGGCGAAGATGGGGCAATGCTTTCCGATCACATCATGCCAAGTCGTTCTCGAGGAA
TGGTACTGTCCCATCTTGCTCATCGCCACGATGTCTCCTGGTCGGTAAGCGCTGCAAAGA
TGCGGGAATGATAGTGATACCACAAGTAGAGCTTCAATTAACCATTTCCACGCTCGCGAT
CCTGCTTCCGTAACCATGCCCGCCGCCATAACTTGATTCTTCGGTGAGGTTTCTCCGCCG
GTGATTTTGGTCGGAGGTAGAAAGATGCAATCC

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 4

CO CL2870Contig1 1052 4 10 U
GGAAGCTAACATATTCGCTATTGGAGCGTACAGCGAAGGAATTTTGCCGCCAGGACATTG
TTCTACTAGCAAATATGTCAAGTGCGCCACTGGAAACTCTTCTACTGAACCATATATTGC
AGGCCATAACATATTGCTGGCTCATGCCTCTGCTTCAAACTTGTATAGACTCAAGTACAA
GAGCAAGCAGAGAGGATCCGTAGGTCTTTGCATATACACATATGGGTTGTTTCCTTATAC
TAACTCCAAGCAGGATGAAGTAGCAACTCAGAGAGCTAAAGATTTCTACTTTGGCTGGTT
GTTAAAGCCATTGTTCTTTGGGGATTATCCGGATGTAATGAAGAGAGTGGTGGGACCTAG
GTTACCTGTTTTCTCCGAGGAAGAGTCAGAGCAAGTTAAAGGTTCTTCTGACTTTATAGG
AGTCATCCATTACACGACATTGTATGTCACAGAGAGTAAACCATCACCTTCTATCCTTCC
TGGCAACCAAGATTTTTCCACAGACATGGGGGTAGAGACTATCACCATTGGGAACACTGT
TCCATGGGGTTTTGAAGGTGTCTTGGAGTATTTGAAACAGAGCTTTAACAATCCTCCTCT
CTACATTCTTGAAAATGGTTTTGCGACGAAACACGATTCAACGCTACAAGATACAGCAAG
AGTTGAATACATTCAATCTTACATTCGTGCTATGTTGAACGCCATCAGGAATGGATCGGA
CACAAGAGGTTATTTTTATTGGTCGATGATAGACTTGTACGAGCTATTGGCTGGATACAG
GGTCAGCTTTGGACTGTACTATGTGAATTTCAGTGATGATGGTCTCAAGAGGTCTCCAAA
ACTCTCTGCTTCTTGGTACACTGGTTTTCTCAATGGTACGGTTGATGTTTCTCCTCAGGA
CATTACTCAGCAGCAGAGCCACTTCTCTGGTTCGTCTTCTTTGTGATGTATCTAAGATTT
ACTTGTTTTGGTGGTTTGAGAGTTCGTCTTGTCAATGACAAGACTCAAGTCATTTTCCAA
ATGGTTTAATAGAAAGGTCGCATAATTCTTGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GX92TF U 1
AF RR2GT85TF U 1
AF RR2GX92JQ C 294
AF RR2GT85JQB C 383
BS 1 698 RR2GT85TF
BS 699 699 RR2GX92JQ
BS 700 710 RR2GT85TF
BS 711 711 RR2GX92JQ
BS 712 728 RR2GT85TF
BS 729 729 RR2GX92JQ
BS 730 771 RR2GT85TF
BS 772 843 RR2GX92JQ
BS 844 844 RR2GT85JQB
BS 845 1052 RR2GX92JQ

RD RR2GX92TF 706 0 0
GGAAGCTAACATATTCGCTATTGGAGCGTACAGCGAAGGAATTTTGCCGCCAGGACATTG
TTCTACTAGCAAATATGTCAAGTGCGCCACTGGAAACTCTTCTACTGAACCATATATTGC
AGGCCATAACATATTGCTGGCTCATGCCTCTGCTTCAAACTTGTATAGACTCAAGTACAA
GAGCAAGCAGAGAGGATCCGTAGGTCTTTGCATATACACATATGGGTTGTTTCCTTATAC
TAACTCCAAGCAGGATGAAGTAGCAACTCAGAGAGCTAAAGATTTCTACTTTGGCTGGTT
GTTAAAGCCATTGTTCTTTGGGGATTATCCGGATGTAATGAAGAGAGTGGTGGGACCTAG
GTTACCTGTTTTCTCCGAGGAAGAGTCAGAGCAAGTTAAAGGTTCTTCTGACTTTATAGG
AGTCATCCATTACACGACATTGTATGTCACAGAGAGTAAACCATCACCTTCTATCCTTCC
TGGCAACCAAGATTTTTCCACAGACATGGGGGTAGAGACTATCACCATTGGGAACACTGT
TCCATGGGGTTTTGAAGGTGTCTTGGAGTATTTGAAACAGAGCTTTAACAATCCTCCTCT
CTACATTCTTGAAAATGGTTTTGCGACGAAACACGATTCAACGCTACAAGATACAGCAAG
AGTTGAATACATTCAATCTTACATTCGTGCTATGTTGA
ACGCCATC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2GT85TF 771 0 0
GGAAGCTAACATATTCGCTATTGGAGCGTACAGCGAAGGAATTTTGCCGCCAGGACATTG
TTCTACTAGCAAATATGTCAAGTGCGCCACTGGAAACTCTTCTACTGAACCATATATTGC
AGGCCATAACATATTGCTGGCTCATGCCTCTGCTTCAAACTTGTATAGACTCAAGTACAA
GAGCAAGCAGAGAGGATCCGTAGGTCTTTGCATATACACATATGGGTTGTTTCCTTATAC
TAACTCCAAGCAGGATGAAGTAGCAACTCAGAGAGCTAAAGATTTCTACTTTGGCTGGTT
GTTAAAGCCATTGTTCTTTGGGGATTATCCGGATGTAATGAAGAGAGTGGTGGGACCTAG
GTTACCTGTTTTCTCCGAGGAAGAGTCAGAGCAAGTTAAAGGTTCTTCTGACTTTATAGG
AGTCATCCATTACACGACATTGTATGTCACAGAGAGTAAACCATCACCTTCTATCCTTCC
TGGCAACCAAGATTTTTCCACAGACATGGGGGTAGAGACTATCACCATTGGGAACACTGT
TCCATGGGGTTTTGAAGGTGTCTTGGAGTATTTGAAACAGAGCTTTAACAATCCTCCTCT
CTACATTCTTGAAAATGGTTTTGCGACGAAACACGATTCAACGCTACAAGATACAGCAAG
AGTTGAATACATTCAATCTTACATTCGTGCTATGTTGA*CGCCATCAGGA*TGGATCGGA
CACAAGAG*TTATTTTTATTGGTCGATGATAGACTTGTACGAGCTATTGGC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2GX92JQ 759 0 0
GCTGGTTGTTAAAGCCATTGTTCTTTGGGGATTATCCGGATGTAATGAAGAGAGTGGTGG
GACCTAGGTTACCTGTTTTCTCCGAGGAAGAGTCAGAGCAAGTTAAAGGTTCTTCTGACT
TTATAGGAGTCATCCATTACACGACATTGTATGTCACAGAGAGTAAACCATCACCTTCTA
TCCTTCCTGGCAACCAAGATTTTTCCACAGACATGGGGGTAGAGACTATCACCATTGGGA
ACACTGTTCCATGGGGTTTTGAAGGTGTCTTGGAGTATTTGAAACAGAGCTTTAACAATC
CTCCTCTCTACATTCTTGAAAATGGTTTTGCGACGAAACACGATTCAACGCTACAAGATA
CAGCAAGAGTTGAATACATTCAATCTTACATTCGTGCTATGTTGAACGCCATCAGGAATG
GATCGGACACAAGAGGTTATTTTTATTGGTCGATGATAGACTTGTACGAGCTATTGGCTG
GATACAGGGTCAGCTTTGGACTGTACTATGTGAATTTCAGTGATGATGGTCTCAAGAGGT
CTCCAAAACTTTCTGCTTCTTGGTACACTGGTTTTCTCAATGGTACGGTTGATGTTTCTC
CTCAGGACATTACTCAGCAGCAGAGCCACTTCTCTGGTTCGTCTTCTTTGTGATGTATCT
AAGATTTACTTGTTTTGGTGGTTTGAGAGTTCGTCTTGTCAATGACAAGACTCAAGTCAT
TTTCCAAATGGTTTAATAGAAAGGTCGCATAATTCTTGC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2GT85JQB 670 0 0
GAGTCAGAGCAAGTTAAAGGTTCTTCTGACTTTATAGGAGTCATCCATTACACGACATTG
TATGTCACAGAGAGTAAACCATCACCTTCTATCCTTCCTGGCAACCAAGATTTTTCCACA
GACATGGGGGTAGAGACTATCACCATTGGGAACACTGTTCCATGGGGTTTTGAAGGTGTC
TTGGAGTATTTGAAACAGAGCTTTAACAATCCTCCTCTCTACATTCTTGAAAATGGTTTT
GCGACGAAACACGATTCAACGCTACAAGATACAGCAAGAGTTGAATACATTCAATCTTAC
ATTCGTGCTATGTTGAACGCCATCAGGAATGGATCGGACACAAGAGGTTATTTTTATTGG
TCGATGATAGACTTGTACGAGCTATTGGCTGGATACAGGGTCAGCTTTGGACTGTACTAT
GTGAATTTCAGTGATGATGGTCTCAAGAGGTCTCCAAAACTCTCTGCTTCTTGGTACACT
GGTTTTCTCAATGGTACGGTTGATGTTTCTCCTCAGGACATTACTCAGCAGCAGAGCCAC
TTCTCTGGTTCGTCTTCTTTGTGATGTATCTAAGATTTACTTGTTTTGGTGGTTTGAGAG
TTCGTCTTGTCAATGACAAGACTCAAGTCATTTTCCAAATGGTTTAATAGAAAGGTCGCA
TAATTCTTGC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL2871Contig1 666 2 1 U
GGACAATCTACAGGAAAACAAAAAAAGAACAGAGGCAGGGTATTAAGTGACCTTCCAGCT
TACTTAAACTTCCTAGGATATATATAACAAATGGCGTCTTGGCTTCTCTTTGCTGTGTTC
TCTTGTGTTCTTCTTCTTCCTGAAACTGTATTTGGGAAAACAAGGCATTACACGCTGGAC
ATACAAATGCACAACGTGACACGTCTTTGCCACACAAAAAGCCTTGTTTCTGTAAACGGG
AAGTTTCCAGGGCCTAAGATTATAGCTAGAGAAGGTGACCAGCTTCTGATCAAAGTTGTT
AACCATGTGCCAAATAATATCTCTCTCCACTGGCATGGGATCAGGCAATTACGGTCTGGT
TGGGCTGATGGACCAGCTTACATAACCCAATGTCCTATTCAGACAGGGCAAAGCTATGTA
TACAACTATACCATTGTTGGTCAAAGAGGCACTCTATGGTACCATGCACACATCTCATGG
CTCAGAGCAACAGTCTATGGTCCTCTTATCATACTTCCCAAACACGGTGTTCCTTACCCG
TTTCCTAAACCTCACAAAGAAGTTCCCATGGTCTTTGGGGAGTGGTTCAATGCAGACACT
GAGGCAATCATCCGCCAAGCCACCCTGACAGGAGGTGGTCCTAATGTCTCTGATGCTTAC
ACAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW60TFB U 456
AF RR2GM85TF U 1
BS 1 666 RR2GM85TF

RD RR2AW60TFB 115 0 0
ATGGTACCATGCACACATCTCATGGCTCAGAGCAACAGTCTATGGTCCTCTTATCATACT
TCCCAAACACGGTGTTCCTTACCCGTTTCCTAAACCTCACAAAGAAGTTCCCATG

QA 1 115 1 115
DS 

RD RR2GM85TF 666 0 0
GGACAATCTACAGGAAAACAAAAAAAGAACAGAGGCAGGGTATTAAGTGACCTTCCAGCT
TACTTAAACTTCCTAGGATATATATAACAAATGGCGTCTTGGCTTCTCTTTGCTGTGTTC
TCTTGTGTTCTTCTTCTTCCTGAAACTGTATTTGGGAAAACAAGGCATTACACGCTGGAC
ATACAAATGCACAACGTGACACGTCTTTGCCACACAAAAAGCCTTGTTTCTGTAAACGGG
AAGTTTCCAGGGCCTAAGATTATAGCTAGAGAAGGTGACCAGCTTCTGATCAAAGTTGTT
AACCATGTGCCAAATAATATCTCTCTCCACTGGCATGGGATCAGGCAATTACGGTCTGGT
TGGGCTGATGGACCAGCTTACATAACCCAATGTCCTATTCAGACAGGGCAAAGCTATGTA
TACAACTATACCATTGTTGGTCAAAGAGGCACTCTATGGTACCATGCACACATCTCATGG
CTCAGAGCAACAGTCTATGGTCCTCTTATCATACTTCCCAAACACGGTGTTCCTTACCCG
TTTCCTAAACCTCACAAAGAAGTTCCCATGGTCTTTGGGGAGTGGTTCAATGCAGACACT
GAGGCAATCATCCGCCAAGCCACCCTGACAGGAGGTGGTCCTAATGTCTCTGATGCTTAC
ACAATC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL2872Contig1 821 2 5 U
AGAGATAATTTAGTTGAAATTCAATTCAAAGTAACAAGAAAAGCCACAAAATTGATATCT
AAAAGGGTCTTAATGAGAAACAATTGAAAAGAAAACAAAAAGCTACAACTCTTGAAATCT
CAAACATGACCAAAAAAGTTTTAATCCCAACCAGCAGCTGGAACTGCTGCTGGGGGTGGC
ACAGCTGTGTCCCATCCATCTGCACCTGGAGCAGCACTGGCATCATTCCAAGAAGCCGCT
GCAGGAGCAGCACTGATTGGCTGCTGAGCATCTCCTGTCCACGAAGCATCAGGAATCTGA
ACAGTGGTCCATTCTCCACCGGCAGCTCCATATTCAGGTGCAGGGAGTCCAAAATCTGCC
AGAGGTGCAGCTTCTTCGTCTTCAGATTGCTTAGCCTCTTCGGGCTCTCTGTAAAAGAAC
AGGTCCACCATGACATCCCACTTTTGTGCAGGACGGATGGTTCCACGCATCTGAAGGACC
ATGCGAGCAAGAAGCCAGAAAAGACAACCAATGCTGTGCTTTCCCTTGTTGTTAGCAGGG
ATCCCAATGTCGACAAATCTCATGGGAGAGTCAGTGTCACAGAAAGCAATGATTGGGATG
TTTCCCAAAGCACCTTCCTTGATTGGCTGATGGTCAGTCCTAGGGTCAGTAAGAATGAGC
AACCTAGGCTCACTGAAGGAAGTCTGCATCTGATTGGTGAAAGTACCAGGAGTGTGTCTT
CCAGCAATGGCGTTAGCACCAGTGTACTGAGCAAACTTGAGAACAGCTCTCTGTCCATAA
GGTCTAGCAGACTGAACAATAATGTCTTGTGGGTTCTCAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E865JQ U 93
AF RR2E617JQ U 1
BS 1 98 RR2E617JQ
BS 99 99 RR2E865JQ
BS 100 300 RR2E617JQ
BS 301 301 RR2E865JQ
BS 302 821 RR2E617JQ

RD RR2E865JQ 277 0 0
AAACAAAAAGCTACAACTCTTGAAATCTCAAACATGACCAAAAAAGTTTTAATCCCAACC
AGCAGCTGGAACTGCTGCTGGGGGTGGCACAGCTGTGTCCCATCCATCTGCACCTGGAGC
AGCACTGGCATCATTCCAAGAAGCCGCTGCAGGAGCAGCACTGATTGGCTGCTGAGCATC
TCCTGTCCACGAAGCATCAGGAATCTGAACAGTGGTCCATTCTCCACCGGCAGCTCCATA
TTCAGGTGCAGGGAGTCCAAAATCTGCCA
AAAGTGCA

QA 1 269 1 269
DS 

RD RR2E617JQ 821 0 0
AGAGATAATTTAGTTGAAATTCAATTCAAAGTAACAAGAAAAGCCACAAAATTGATATCT
AAAAGGGTCTTAATGAGAAACAATTGAAAAGAAAACAAGAAGCTACAACTCTTGAAATCT
CAAACATGACCAAAAAAGTTTTAATCCCAACCAGCAGCTGGAACTGCTGCTGGGGGTGGC
ACAGCTGTGTCCCATCCATCTGCACCTGGAGCAGCACTGGCATCATTCCAAGAAGCCGCT
GCAGGAGCAGCACTGATTGGCTGCTGAGCATCTCCTGTCCACGAAGCATCAGGAATCTGA
GCAGTGGTCCATTCTCCACCGGCAGCTCCATATTCAGGTGCAGGGAGTCCAAAATCTGCC
AGAGGTGCAGCTTCTTCGTCTTCAGATTGCTTAGCCTCTTCGGGCTCTCTGTAAAAGAAC
AGGTCCACCATGACATCCCACTTTTGTGCAGGACGGATGGTTCCACGCATCTGAAGGACC
ATGCGAGCAAGAAGCCAGAAAAGACAACCAATGCTGTGCTTTCCCTTGTTGTTAGCAGGG
ATCCCAATGTCGACAAATCTCATGGGAGAGTCAGTGTCACAGAAAGCAATGATTGGGATG
TTTCCCAAAGCACCTTCCTTGATTGGCTGATGGTCAGTCCTAGGGTCAGTAAGAATGAGC
AACCTAGGCTCACTGAAGGAAGTCTGCATCTGATTGGTGAAAGTACCAGGAGTGTGTCTT
CCAGCAATGGCGTTAGCACCAGTGTACTGAGCAAACTTGAGAACAGCTCTCTGTCCATAA
GGTCTAGCAGACTGAACAATAATGTCTTGTGGGTTCTCAAT

QA 1 821 1 821
DS 



AS 2 4

CO CL2873Contig1 540 2 3 U
GGATGTGTCGCAGTGGAACGTTTTGCAGTTCAACACAGGCTCTTCAGACCCGTTCATCAT
AAAATGTGGAGGCAACGCAAACTCGGAGCTGGTGATCAAGGCCGATGCACGAGTTCAAGA
GCCCAAAGGAGGTGAGCTAGTCAGAGTTGTCCCAAGACCTTCTGTTTTGGTAAACATGAG
CTTAGAGGAAATGAAACAAATGTTTACTCAGTTGCCCGAAGCTCTGAGCGTGCTGGCTTT
AGCTAAAAATGCTGATGCCACGAGAGCTCGCTACTCTAGGCTCTACAAAACTCTGGCCAT
GAAGGTTCCATCTCTCAGGGATGTTGTTGCTGATCTTGAGAAAGATACCTAAGTCATGAA
AACGGCTCTAGAGATGTTGCAGAGATGGCTCCCAGCTACGGACGTTTCCTTGTGTATTTA
TTTATCTTATTTTTTCTGGTGACTGGCCAAATCTGGCGCATTTATGCTACCTTTTGGGTC
CAGATTCGTTGTCTGTGTGTAGTATGTAACTTTACTTTGTATCTTGCTATCATTCACACG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI42JQ C 1
AF RR2CI42TF U 1
BS 1 1 RR2CI42JQ
BS 2 534 RR2CI42TF
BS 535 540 RR2CI42JQ

RD RR2CI42JQ 540 0 0
GGATGTGTCGCAGTGGAACGTTTTGCAGTTCAACACAGGCTCTTCAGACCCGTTCATCAT
AAAATGTGGAGGCAACGCAAACTCGGAGCTGGTGATCAAGGCCGATGCACGAGTTCAAGA
GCCCAAAGGAGGTGAGCTAGTCAGAGTTGTCCCAAGACCTTCTGTTTTGGTAAACATGAG
CTTAGAGGAAATGAAACAAATGTTTACTCAGTTGCCCGAAGCTCTGAGCGTGCTGGCTTT
AGCTAAAAATGCTGATGCCACGAGAGCTCGCTACTCTAGGCTCTACAAAACTCTGGCCAT
GAAGGTTCCATCTCTCAGGGATGTTGTTGCTGATCTTGAGAAAGATACCTAAGTCATGAA
AACGGCTCTAGAGATGTTGCAGAGATGGCTCCCAGCTACGGACGTTTCCTTGTGTATTTA
TTTATCTTATTTTTTCTGGTGACTGGCCAAATCTGGCGCATTTATGCTACCTTTTGGGTC
CAGATTCGTTGTCTGTGTGTAGTATGTAACTTTACTTTGTATCTTGCTATCATTCACACG

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2CI42TF 540 0 0
G
GATGTGTCGCAGTGGAACGTTTTGCAGTTCAACACAGGCTCTTCAGACCCGTTCATCATA
AAATGTGGAGGCAACGCAAACTCGGAGCTGGTGATCAAGGCCGATGCACGAGTTCAAGAG
CCCAAAGGAGGTGAGCTAGTCAGAGTTGTCCCAAGACCTTCTGTTTTGGTAAACATGAGC
TTAGAGGAAATGAAACAAATGTTTACTCAGTTGCCCGAAGCTCTGAGCGTGCTGGCTTTA
GCTAAAAATGCTGATGCCACGAGAGCTCGCTACTCTAGGCTCTACAAAACTCTGGCCATG
AAGGTTCCATCTCTCAGGGATGTTGTTGCTGATCTTGAGAAAGATACCTAAGTCATGAAA
ACGGCTCTAGAGATGTTGCAGAGATGGCTCCCAGCTACGGACGTTTCCTTGTGTATTTAT
TTATCTTATTTTTTCTGGTGACTGGCCAAATCTGGCGCATTTATGCTACCTTTTGGGTCC
AGATTCGTTGTCTGTGTGTAGTATGTAACTTTACTTTGTATCTTGCTATCATT
CACACG

QA 2 534 2 534
DS 



CO CL2873Contig2 663 2 2 U
TTTTTCGAGAATGTGGAAGTCCTTATGACTCTCCGTGGAAGTAAACACTTATCTCTGTCT
AATGATAGCAAGATACAAAGTAAAGTTACATACTACTACACACAATGAATCTGGACCCAA
AAGGTAGCATAAATGCGCCAGATTTGGCCAGTCACAGAAAAATAATATAAATACCACAAA
GGAACGTCCGTAGCTGGGAATCATCTCTGCAACATCCCTAAGCCGTTTTCATGACTTAGG
TATCTTTCTCAAGATCAGCAACAACGTCCCTGAGAGAGGGAACCTTCATGGCCAGAGTTT
TGTAGAGCCTAGAGTAGCGAGCTCTCGTGGCATCAGCATTTTTAGCTAAAGCCAGTACAC
TCAGAGCTTCGGGCAACTGAGTAAACATTTGTTTCATTTCCTCTAAGCTCATGTTCACCA
GAACAGAAGGTCTTGGGACAACTCTGACTAGCTCACCTCCTTTGGGCTCTTGGACACGTG
CATCGGCCTTGATCACCAGCTCCGAGTTTGTGTTGCCTCCACATTTTATGATGAACGGGT
CTGAAGAGCCTGTGTTGAACTGCAAAACGTTCCACTGCGACACATCGGCTTCACCTGAGG
ATATCGACTCAAACGAGGGTCTCCGGCCGTGTGAATATTCCAGAAGAAGATTATTGTTCT
CTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2CL20TF C 1
AF RR2CL20JQ U 6
BS 1 5 RR2CL20TF
BS 6 663 RR2CL20JQ

RD RR2CL20TF 663 0 0
TTTTTCGAGAATGTGGAAGTCCTTATGACTCTCCGTGGAAGTAAACACTTATCTCTGTCT
AATGATAGCAAGATACAAAGTAAAGTTACATACTACTACACACAATGAATCTGGACCCAA
AAGGTAGCATAAATGCGCCAGATTTGGCCAGTCACAGAAAAATAATATAAATACCACAAA
GGAACGTCCGTAGCTGGGAATCATCTCTGCAACATCCCTAAGCCGTTTTCATGACTTAGG
TATCTTTCTCAAGATCAGCAACAACGTCCCTGAGAGAGGGAACCTTCATGGCCAGAGTTT
TGTAGAGCCTAGAGTAGCGAGCTCTCGTGGCATCAGCATTTTTAGCTAAAGCCAGTACAC
TCAGAGCTTCGGGCAACTGAGTAAACATTTGTTTCATTTCCTCTAAGCTCATGTTCACCA
GAACAGAAGGTCTTGGGACAACTCTGACTAGCTCACCTCCTTTGGGCTCTTGGACACGTG
CATCGGCCTTGATCACCAGCTCCGAGTTTGTGTTGCCTCCACATTTTATGATGAACGGGT
CTGAAGAGCCTGTGTTGAACTGCAAAACGTTCCACTGCGACACATCGGCTTCACCTGAGG
ATATCGACTCAAACGAGGGTCTCCGGCCGTGTGAATATTCCAGAAGAAGATTATTGTTCT
CTC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2CL20JQ 658 0 0
CGAGAATGTGGAAGTCCTTATGACTCTCCGTGGAAGTAAACACTTATCTCTGTCTAATGA
TAGCAAGATACAAAGTAAAGTTACATACTACTACACACAATGAATCTGGACCCAAAAGGT
AGCATAAATGCGCCAGATTTGGCCAGTCACAGAAAAATAATATAAATACCACAAAGGAAC
GTCCGTAGCTGGGAATCATCTCTGCAACATCCCTAAGCCGTTTTCATGACTTAGGTATCT
TTCTCAAGATCAGCAACAACGTCCCTGAGAGAGGGAACCTTCATGGCCAGAGTTTTGTAG
AGCCTAGAGTAGCGAGCTCTCGTGGCATCAGCATTTTTAGCTAAAGCCAGTACACTCAGA
GCTTCGGGCAACTGAGTAAACATTTGTTTCATTTCCTCTAAGCTCATGTTCACCAGAACA
GAAGGTCTTGGGACAACTCTGACTAGCTCACCTCCTTTGGGCTCTTGGACACGTGCATCG
GCCTTGATCACCAGCTCCGAGTTTGTGTTGCCTCCACATTTTATGATGAACGGGTCTGAA
GAGCCTGTGTTGAACTGCAAAACGTTCCACTGCGACACATCGGCTTCACCTGAGGATATC
GACTCAAACGAGGGTCTCCGGCCGTGTGAATATTCCAGAAGAAGATTATTGTTCTCTC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 2 4

CO CL2874Contig1 914 2 4 U
GGTATCAACACAACTTCTAAACAAACCAAAACTGATTCGGTTTGATGTGCCAGCTGAGGT
AAAAACTAGCGTCCCTAAATAAAACTACATTTTTTAGTAACCAACTGAAAGTTGTAACCT
CAATAAGAAAAAGAAAGATTTCACCCGAGTAAAAAGCCAAAGTACTTGGGACATAGACTG
ACTTTTAAACTCAGTATGGGAACTTTGACACAAAGAGCTAAAGACGACACATTTATAACC
AACACCTTGTTATTTGTAAATCAAACTCTAACACCCTCACTTGCTCACATTTCCATTGGT
GCAGCATCCTGATCACCTGCACCACCTTGTTACGCAGGTGCAGCAGCAGCAGCTTCAGCT
TCGGCCTCACCCTTACCACCATCCTCCTCTTCCTCGGGAACCTTCTCAAACGTATCAATC
ACCTTCTGTATGCTTTCCTGGTCCAAGAAATGGAATGGTTCATCGACTCCTAGAACGGAA
ACCGTGCAGAGCGAGCTCTTGAGTGTCTCTCCTTGCAAAGTTTCCCTTATGGCCAAAATA
GCATCTTTTATCAGATCTTCTCTTGATGACTCATTGAAGCTCTCGAATCTTCGTTCTAGA
TAAGTTTTCGCAGCTTGTGAACGAGAACAAATAGCGAAAGCTTGGTATTCAAAGTAGTTT
CCGCTGGGGCAGTTGTAGTAGAGATGGGCTCCTGACTCGTCCAGCCCACCAACCAGTAAA
CCAACGCCATAAGGTCGTTTCCATGACCGTTGGGTACATACCTGGGCCTTATCAGCAAGA
CGAACGACGAGACGGCCAACGGGGAGAGGAGACTCGTAGGTGAAAGAGTGATTGATCGTT
TCAGATCCCATGTAACGAGACAGAACACGCCATCGGCGGTGAGACAGCGATGGCGACACC
GATGTGGTCATCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B109JQ U 1
AF RR2G289JQ U 96
BS 1 226 RR2B109JQ
BS 227 227 RR2G289JQ
BS 228 777 RR2B109JQ
BS 778 914 RR2G289JQ

RD RR2B109JQ 777 0 0
GGTATCAACACAACTTCTAAACAAACCAAAACTGATTCGGTTTGATGTGCCAGCTGAGGT
AAAAACTAGCGTCCCTAAATAAAACTACATTTTTTAGTAACCAACTGAAAGTTGTAACCT
CAATAAGAAAAAGAAAGATTTCACCCGAGTAAAAAGCCAAAGTACTTGGGACATAGACTG
ACTTTTAAACTCAGTATGGGAACTTTGACACAAAGAGCTAAAGACGCCACATTTATAACC
AACACCTTGTTATTTGTAAATCAAACTCTAACACCCTCACTTGCTCACATTTCCATTGGT
GCAGCATCCTGATCACCTGCACCACCTTGTTACGCAGGTGCAGCAGCAGCAGCTTCAGCT
TCGGCCTCACCCTTACCACCATCCTCCTCTTCCTCGGGAACCTTCTCAAACGTATCAATC
ACCTTCTGTATGCTTTCCTGGTCCAAGAAATGGAATGGTTCATCGACTCCTAGAACGGAA
ACCGTGCAGAGCGAGCTCTTGAGTGTCTCTCCTTGCAAAGTTTCCCTTATGGCCAAAATA
GCATCTTTTATCAGATCTTCTCTTGATGACTCATTGAAGCTCTCGAATCTTCGTTCTAGA
TAAGTTTTCGCAGCTTGTGAACGAGAACAAATAGCGAAAGCTTGGTATTCAAAGTAGTTT
CCGCTGGGGCAGTTGTAGTAGAGATGGGCTCCTGACTCGTCCAGCCCACCAACCAGTAAA
CCAACGCCATAAGGTCGTTTCCATGACCGTTGGGTACATACCTGGGCCTTATCAGCA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2G289JQ 819 0 0
AGTAACCAACTGAAAGTTGTAACCTCAATAAGAAAAAGAAAGATTTCACCCGAGTAAAAA
GCCAAAGTACTTGGGACATAGACTGACTTTTAAACTCAGTATGGGAACTTTGACACAAAG
AGCTAAAGACGACACATTTATAACCAACACCTTGTTATTTGTAAATCAAACTCTAACGCC
CTCACTTGCTCACATTTCCATTGGTGCAGCATCCTGATCACCTGCACCACCTTGTTCCGC
AGGTGCAGCAGCAGCAGCTTCAGCTTCGGCCTCACCCTTACCACCATCCTCCTCTTCCTC
GGGAACCTTCTCAAACGTATCAATCACCTTCTGTATGCTTTCCTGGTCCAAGAAATGGAA
TGGTTCATCGACTCCTAGAACGGAAACCGTGCAGAGCGAGCTCTTGAGTGTCTCTCCTTG
CAAAGTTTCCCTTATGGCCAAAATAGCATCTTTTATCAGATCTTCTCTTGATGACTCATT
GAAGCTCTCGAATCTTCGTTCTAGATAAGTTTTCGCAGCTTGTGAACGAGAACCAATAGC
GAAAGCTTGGTATTCAAAGTAGTTTCCGCTGGGGCAGTTGTAGTAGAGATGGGCTCCTGA
CTCGTCCAGCCCACCAACCAGTAAACCAACGCCATAAGGTCGTTTCCATGACCGTTGGGT
ACATACCTGGGCCTTATCAGCAAGACGAACGACGAGACGGCCAACGGGGAGAGGAGACTC
GTAGGTGAAAGAGTGATTGATCGTTTCAGATCCCATGTAACGAGACAGAACACGCCATCG
GCGGTGAGACAGCGATGGCGACACCGATGTGGTCATCGA

QA 1 819 1 819
DS 



CO CL2874Contig2 745 2 5 U
GGGACCAAACCATCCAAACGAAAAAGCGTTTCCTCTTCACTGCGTCTTTCTCTGTATCTC
TCTCGACGAACAAAGAAGAAGAAGCGAAGCAAAGATGTTCAGGAACCAGTACGACACAGA
CGTGACAACATGGAGTCCCACTGGTCGTCTTTTCCAAGTAGAGTACGCCATGGAAGCCGT
CAAGCAAGGCTCCGCCGCAATCGGACTCAGATCTCGCTCCCATGTCGTCCTCGCCTCTGT
CAATAAAGCCCAATCCGAGCTCTCTTCTCACCAGAGAAAGATCTTCAAAGTCGATGACCA
CATCGGTGTCGCCATCGCTGGTCTCACCGCCGATGGCCGTGTTCTGTCTCGTTACATGAG
ATCTGAAACGATCAATCACTCTTTCACCTACGAGTCTCCTCTCCCCGTTGGCCGTCTCGT
CGTTCGTCTTGCTGATAAGGCCCAGGTATGTACCCAACGGTCATGGAAACGACCTTATGG
CGTTGGTTTACTGGTTGGTGGGCTGGACGAGTCAGGAGCCCATCTCTACTACAACTGCCC
CAGCGGAAACTACTTTGAATACCAAGCTTTCGCTATTGGTTCTCGTTCACAAGCTGCGAA
AACTTATCTAGAACGAAGATTCGAGAGCTTCAATGAGTCATCAAGAGAAGATCTGATAAA
AGATGCTATTTTGGCCATAAGGGAAACTTTGCAAGGAGAGACACTCAAGAGCTCGCTCTG
CACGGTTTCCGTTCTAGGAGTCGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G289TF U 25
AF RR2B109TF U 1
BS 1 367 RR2B109TF
BS 368 368 RR2G289TF
BS 369 577 RR2B109TF
BS 578 578 RR2G289TF
BS 579 745 RR2B109TF

RD RR2G289TF 653 0 0
GGGT
TTTCCTCTTCACTGCGTCTTTCTCTGTATCTCTCTCGACGAACAAAGAAGAAGAAGCGAA
GCAAAGATGTTCAGGAACCAGTACGACACAGACGTGACAACATGGAGTCCCACTGGTCGT
CTTTTCCAAGTAGAGTACGCCATGGAAGCCGTCAAGCAAGGCTCCGCCGCAATCGGACTC
AGATCTCGCTCCCATGTCGTCCTCGCCTCTGTCAATAAAGCCCAATCCGAGCTCTCTTCT
CACCAGAGAAAGATCTTCAAAGTCGATGACCACATCGGTGTCGCCATCGCTGGTCTCACC
GCCGATGGCCGTGTTCTGTCTCGTTACATGGGATCTGAAACGATCAATCACTCTTTCACC
TACGAGTCTCCTCTCCCCGTTGGCCGTCTCGTCGTTCGTCTTGCTGATAAGGCCCAGGTA
TGTACCCAACGGTCATGGAAACGACCTTATGGCGTTGGTTTACTGGTTGGTGGGCTGGAC
GAGTCAGGAGCCCATCTCTACTACAACTGCCCCAGCGGAAACTACTTTGAATACCAAGCT
TTCGCTATTGGTTCTCGTTCACAAGCTGCGAAAACTTATCTAGAACGAAGATTCGAGAGC
TTCAATGAGTCATCAAGAGAAGATCTGATAAA*GATGCTATTTTGGCCA

QA 5 653 5 653
DS 

RD RR2B109TF 745 0 0
GGGACCAAACCATCCAAACGAAAAAGCGTTTCCTCTTCACTGCGTCTTTCTCTGTATCTC
TCTCGACGAACAAAGAAGAAGAAGCGAAGCAAAGATGTTCAGGAACCAGTACGACACAGA
CGTGACAACATGGAGTCCCACTGGTCGTCTTTTCCAAGTAGAGTACGCCATGGAAGCCGT
CAAGCAAGGCTCCGCCGCAATCGGACTCAGATCTCGCTCCCATGTCGTCCTCGCCTCTGT
CAATAAAGCCCAATCCGAGCTCTCTTCTCACCAGAGAAAGATCTTCAAAGTCGATGACCA
CATCGGTGTCGCCATCGCTGGTCTCACCGCCGATGGCCGTGTTCTGTCTCGTTACATGAG
ATCTGAATCGATCAATCACTCTTTCACCTACGAGTCTCCTCTCCCCGTTGGCCGTCTCGT
CGTTCGTCTTGCTGATAAGGCCCAGGTATGTACCCAACGGTCATGGAAACGACCTTATGG
CGTTGGTTTACTGGTTGGTGGGCTGGACGAGTCAGGAGCCCATCTCTACTACAACTGCCC
CAGCGGAAACTACTTTGAATACCAAGCTTTCGCTATTTGTTCTCGTTCACAAGCTGCGAA
AACTTATCTAGAACGAAGATTCGAGAGCTTCAATGAGTCATCAAGAGAAGATCTGATAAA
AGATGCTATTTTGGCCATAAGGGAAACTTTGCAAGGAGAGACACTCAAGAGCTCGCTCTG
CACGGTTTCCGTTCTAGGAGTCGAT

QA 1 745 1 745
DS 



AS 2 4

CO CL2875Contig1 215 2 4 U
ATTGAACATGATTTAAAAAACTTGAAAAAAAGTATAGCAACAACTCTAAAATTATTACAC
AAGGGTGTAAACAACTTAAAATGATTATTACACAAGTCTGTAAACAACTTGCAAGGACTG
GATCCAAAAGTTCATGAACAAACACAGAAAACCATCAACCTCACAAAAAACTGGCTTAAC
CTCCACGGATCAAACTAACTCCAAACGAAATGGGG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH69JQ U 1
AF RR2D884JQ U 4
BS 1 58 RR2BH69JQ
BS 59 59 RR2D884JQ
BS 60 145 RR2BH69JQ
BS 146 215 RR2D884JQ

RD RR2BH69JQ 145 0 0
ATTGAACATGATTTAAAAAACTTGAAAAAAAGTATAGCAACAACTCTAAAATTATTACCC
AAGGGTGTAAACAACTTAAAATGATTATTACACAAGTCTGTAAACAACTTGCAAGGACTG
GATCCAAAAGTTCATGAACAAACAC

QA 1 145 1 145
DS 

RD RR2D884JQ 212 0 0
GAACATGATTTAATAAACTTGAAAAAAAGTATAGCAACAACTCTAAAATTATTACACAAG
GGTGTAAACAACTTAAAATGATTATTACACAAGTCTGTAAACAACTTGCAAGGACTGGAT
CCAAAAGTTCATGAACAAACACAGAAAACCATCAACCTCACAAAAAACTGGCTTAACCTC
CACGGATCAAACTAACTCCAAACGAAATGGGG

QA 1 212 1 212
DS 



CO CL2875Contig2 701 2 10 U
GGATTCCGCATTTTACATTTTGCAATCAATCCATTAGACAAACTATCTCCCGAGTTTCAA
GAAGCCCATCGCCGAAATCAACATCCATGGCGCTCACCGACTTCCTACCTAACGAGTACG
GATACGTGGCTCTCGTCCTCGTCTTCTACTGCTTCCTCAACCTCTGGATGGGAGCTCAAG
TCGGCATGGCTCGCAAAAGGTATAATGTGCCGTATCCAACTCTATACGCTATAGAATCAG
AAAACAAAGATGCTAAACACTTCAACTGCGTCCAGAGAGGTCATCAAAACTCTCTGGAGA
TGATGCCAATGTACTTCATACTGATGATCCTTGGTGGAATGAAACACCCTTGTGTCTGCG
CTGGTTTGGGTTTGCTCTACAATATCTCTCGGTTCTTCTACTTCAAAGGCTACTCTACTG
GAGATCCAATGAAACGCCTCACCATCGGGAAATACGGTTTCTTGGGATTGCTTGGTCTCA
TGATCTGCACCATCTCGTTTGGAGTTAGTCTGATCCGTGGAGGTTAAGCCAGTCTTTTGT
GAGGTTGATGGTTCTCTGTGTTTGTTCATGAACTTTTGGATCCAGTCCTTGCAAGTTGTC
TACAGACTTGTGTAATAATCATCTTAAGTTGTCTACAGCCTTGTGTAATAATCTTAGAGT
TGTTGCTATACTTTTTTTCAAGTTTATTAAATCATGTTCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2BH69TF U 1
AF RR2D884TF U 1
BS 1 40 RR2BH69TF
BS 41 41 RR2D884TF
BS 42 65 RR2BH69TF
BS 66 66 RR2D884TF
BS 67 391 RR2BH69TF
BS 392 392 RR2D884TF
BS 393 487 RR2BH69TF
BS 488 488 RR2D884TF
BS 489 699 RR2BH69TF
BS 700 701 RR2D884TF

RD RR2BH69TF 699 0 0
GGATTCCGCATTTTACATTTTGCAATCAATCCATTAGACAGACTATCTCCCGAGTTTCAA
GAAGCTCATCGCCGAAATCAACATCCATGGCGCTCACCGACTTCCTACCTAACGAGTACG
GATACGTGGCTCTCGTCCTCGTCTTCTACTGCTTCCTCAACCTCTGGATGGGAGCTCAAG
TCGGCATGGCTCGCAAAAGGTATAATGTGCCGTATCCAACTCTATACGCTATAGAATCAG
AAAACAAAGATGCTAAACACTTCAACTGCGTCCAGAGAGGTCATCAAAACTCTCTGGAGA
TGATGCCAATGTACTTCATACTGATGATCCTTGGTGGAATGAAACACCCTTGTGTCTGCG
CTGGTTTGGGTTTGCTCTACAATATCTCTCGTTTCTTCTACTTCAAAGGCTACTCTACTG
GAGATCCAATGAAACGCCTCACCATCGGGAAATACGGTTTCTTGGGATTGCTTGGTCTCA
TGATCTGTACCATCTCGTTTGGAGTTAGTCTGATCCGTGGAGGTTAAGCCAGTCTTTTGT
GAGGTTGATGGTTCTCTGTGTTTGTTCATGAACTTTTGGATCCAGTCCTTGCAAGTTGTC
TACAGACTTGTGTAATAATCATCTTAAGTTGTCTACAGCCTTGTGTAATAATCTTAGAGT
TGTTGCTATACTTTTTTTCAAGTTTATTAAATCATGTTC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2D884TF 701 0 0
GGATTCCGCATTTTACATTTTGCAATCAATCCATTAGACAAACTATCTCCCGAGTTTCAA
GAAGCCCATCGCCGAAATCAACATCCATGGCGCTCACCGACTTCCTACCTAACGAGTACG
GATACGTGGCTCTCGTCCTCGTCTTCTACTGCTTCCTCAACCTCTGGATGGGAGCTCAAG
TCGGCATGGCTCGCAAAAGGTATAATGTGCCGTATCCAACTCTATACGCTATAGAATCAG
AAAACAAAGATGCTAAACACTTCAACTGCGTCCAGAGAGGTCATCAAAACTCTCTGGAGA
TGATGCCAATGTACTTCATACTGATGATCCTTGGTGGAATGAAACACCCTTGTGTCTGCG
CTGGTTTGGGTTTGCTCTACAATATCTCTCGGTTCTTCTACTTCAAAGGCTACTCTACTG
GAGATCCAATGAAACGCCTCACCATCGGGAAATACGGTTTCTTGGGATTGCTTGGTCTCA
TGATCTGCACCATCTCGTTTGGAGTTAGTCTGATCCGTGGAGGTTAAGCCAGTCTTTTGT
GAGGTTGATGGTTCTCTGTGTTTGTTCATGAACTTTTGGATCCAGTCCTTGCAAGTTGTC
TACAGACTTGTGTAATAATCATCTTAAGTTGTCTACAGCCTTGTGTAATAATCTTAGAGT
TGTTGCTATACTTTTTTTCAAGTTTATTAAATCATGTTCAT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 2 4

CO CL2876Contig1 733 2 2 U
GGAAAGACAAGTGGAGAGAGGCGAGAAAGATGGAGAAAGTGGTAGATCTCTTCGGAGTGG
GAGAAGCCAATACACAGAAGCTACTCGAAGGAGGCAACGATCTCAGCCAAATCCAACAGG
GACTGTTCATAGGCTCAGTAGCTGAAGCGAACAACAAGGATTTGCTCAAAACCTCCAACG
TCACTCATGTCCTAACCATAGCTGTCGCTCCCTCTCCTCCTTACCCTGACGACTTTGTCT
ATAAAGTCATCGAAGTCGTGGACAGATCCGAGACAGATTTGACTGTGTATTTCGATGAGT
GCTATGGATTCATCGACCAAGCTATTCAATCTGGAGGTGGTGTTTTGGTTCATTGCTTCA
TGGGGATATCAAGGAGTGTGACTATAGTTGTGGCTTATTTGATGAGAAAGCATGGTATGG
GTTTCTCTAAAGCTATGGAGCTCGTAAAGAGTAGACGTTCTCAAGCATTCCCTAACTTTG
GTTTCGTTTCTCAGCTTCAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGGTTACATGCAGTACATGA
TGCGAGTTCTTCTTCAGCTGATAAGAAGATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATTATG
AAGAAGTCTCATGAGCCCCATGATGACCAAAAAAATTAAACTCATTGTTTCGTTTTCTTG
TGAACTATTATTGATGGTGAGCTATTTGCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAATAAAA
ACGCAGATACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV17TF U 1
AF RR2BV17JQ C 25
BS 1 628 RR2BV17TF
BS 629 733 RR2BV17JQ

RD RR2BV17TF 628 0 0
GGAAAGACAAGTGGAGAGAGGCGAGAAAGATGGAGAAAGTGGTAGATCTCTTCGGAGTGG
GAGAAGCCAATACACAGAAGCTACTCGAAGGAGGCAACGATCTCAGCCAAATCCAACAGG
GACTGTTCATAGGCTCAGTAGCTGAAGCGAACAACAAGGATTTGCTCAAAACCTCCAACG
TCACTCATGTCCTAACCATAGCTGTCGCTCCCTCTCCTCCTTACCCTGACGACTTTGTCT
ATAAAGTCATCGAAGTCGTGGACAGATCCGAGACAGATTTGACTGTGTATTTCGATGAGT
GCTATGGATTCATCGACCAAGCTATTCAATCTGGAGGTGGTGTTTTGGTTCATTGCTTCA
TGGGGATATCAAGGAGTGTGACTATAGTTGTGGCTTATTTGATGAGAAAGCATGGTATGG
GTTTCTCTAAAGCTATGGAGCTCGTAAAGAGTAGACGTTCTCAAGCATTCCCTAACTTTG
GTTTCGTTTCTCAGCTTCAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGGTTACATGCAGTACATGA
TGCGAGTTCTTCTTCAGCTGATAAGAAGATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATTATG
AAGAAGTCTCATGAGCCCCATGATGACC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2BV17JQ 709 0 0
GAAAGATGGAGAAAGTGGTAGATCTCTTCGGAGTGGGAGAAGCCAATACACAGAAGCTAC
TCGAAGGAGGCAACGATCTCAGCCAAATCCAACAGGGACTGTTCATAGGCTCAGTAGCTG
AAGCGAACAACAAGGATTTGCTCAAAACCTCCAACGTCACTCATGTCCTAACCATAGCTG
TCGCTCCCTCTCCTCCTTACCCTGACGACTTTGTCTATAAAGTCATCGAAGTCGTGGACA
GATCCGAGACAGATTTGACTGTGTATTTCGATGAGTGCTATGGATTCATCGACCAAGCTA
TTCAATCTGGAGGTGGTGTTTTGGTTCATTGCTTCATGGGGATATCAAGGAGTGTGACTA
TAGTTGTGGCTTATTTGATGAGAAAGCATGGTATGGGTTTCTCTAAAGCTATGGAGCTCG
TAAAGAGTAGACGTTCTCAAGCATTCCCTAACTTTGGTTTCGTTTTTCAGCTTCAGCAAT
TTGAAAATTCCATCAAAGGTTACATGCAGTACATGATGCGAGTTCTTCTTCAGCTGATAA
GAAGATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATTATGAAGAAGTCTCATGAGCCCCATGAT
GACCAAAAAAATTAAACTCATTGTTTCGTTTTCTTGTGAACTATTATTGATGGTGAGCTA
TTTGCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAATAAAAACGCAGATACTAC

QA 1 709 1 709
DS 



CO CL2876Contig2 705 2 7 U
GGGAGGCGAGAAAGATGGAGAAAGTGGTAGATCTCTTCGGAGTGGGAGAAGCCAATACAC
AGAAGCTACTCGAAGGAGGCAACGATCTCAGCCAAATCCAACAGGGACTGTTCATAGGCT
CAGTAGCTGAAGCGAACAACAAGGATTTGCTCAAAACCTCCAACGTCACTCATGTCCTAA
CCATAGCTGTCGCTCTCTCTCCTCCTTACCCTGACGACTTTGTCTATAAAGTCATCGAAG
TCGTGGACAGATCCGAGACAGATTTGACTGTGTATTTCGATGAGTGTTATGGATTCATCG
ACCAAGCTATTCAATCCGGAGGTGGTGTTTTGGTTCATTGCTTCATGGGGATATCAAGGA
GTGTGACTATAGTTGTGGCTTATTTGATGGGAAAGCATGGTATGGGTTTCTCTAAAGCTA
TGGAGCTCGTAAAGAGTAGACGTTCTCAAGCATTGCCTAACTTTGGTTTCGTTTCTCAGT
TTCAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGTACATGATGCGAGTTCTTCTTCAGCTGATAAGA
AGATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATTATGAAGAAGTCTCATGAGCCCCATGATGA
CCAAAAAAATTAAACTCATTGTTTCGTTTTCTTGTGAACTATTATTGATGGTGAGCTATT
TGCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAATAAAAACGCAGATACT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D255JQ C 1
AF RR2D255TF U 1
BS 1 2 RR2D255JQ
BS 3 608 RR2D255TF
BS 609 609 RR2D255JQ
BS 610 637 RR2D255TF
BS 638 638 RR2D255JQ
BS 639 681 RR2D255TF
BS 682 705 RR2D255JQ

RD RR2D255JQ 705 0 0
GGGAGGCGAGAAAGATGGAGAAAGTGGTAGATCTCTTCGGAGTGGGAGAAGCCAATACAC
AGAAGCTACTCGAAGGAGGCAACGATCTCAGCCAAATCCAACAGGGACTGTTCATAGGCT
CAGTAGCTGAAGCGAACAACAAGGATTTGCTCAAAACCTCCAACGTCACTCATGTCCTAA
CCATAGCTGTCGCTCTCTCTCCTCCTTACCCTGACGACTTTGTCTATAAAGTCATCGAAG
TCGTGGACAGATCCGAGACAGATTTGACTGTGTATTTCGATGAGTGTTATGGATTCATCG
ACCAAGCTATTCAATCCGGAGGTGGTGTTTTGGTTCATTGCTTCATGGGGATATCAAGGA
GTGTGACTATAGTTGTGGCTTATTTGATGGGAAAGCATGGTATGGGTTTCTCTAAAGCTA
TGGAGCTCGTAAAGAGTAGACGTTCTCAAGCATTGCCTAACTTTGGTTTCGTTTCTCAGT
TTCAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGTACATGATGCGAGTTCTTCTTCAGCTGATAAGA
AGATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATTATGAAGAAGTCTCATGAGCCCCATGATGA
CCAAAAAAATTAAACTCATTGTTTCGTTTTCTTGTGAACTATTATTGATGGTGAGCTATT
TGCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAATAAAAACGCAGATACT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2D255TF 681 0 0
GG
GAGGCGAGAAAGATGGAGAAAGTGGTAGATCTCTTCGGAGTGGGAGAAGCCAATACACAG
AAGCTACTCGAAGGAGGCAACGATCTCAGCCAAATCCAACAGGGACTGTTCATAGGCTCA
GTAGCTGAAGCGAACAACAAGGATTTGCTCAAAACCTCCAACGTCACTCATGTCCTAACC
ATAGCTGTCGCTCTCTCTCCTCCTTACCCTGACGACTTTGTCTATAAAGTCATCGAAGTC
GTGGACAGATCCGAGACAGATTTGACTGTGTATTTCGATGAGTGTTATGGATTCATCGAC
CAAGCTATTCAATCCGGAGGTGGTGTTTTGGTTCATTGCTTCATGGGGATATCAAGGAGT
GTGACTATAGTTGTGGCTTATTTGATGGGAAAGCATGGTATGGGTTTCTCTAAAGCTATG
GAGCTCGTAAAGAGTAGACGTTCTCAAGCATTGCCTAACTTTGGTTTCGTTTCTCAGTTT
CAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGTACATGATGCGAGTTCTTCTTCAGCTGATAAGAAG
ATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATTATGAAGAAGTCTCATGAGCCCCATGATGACC
AAAAAA*TTAAACTCATTGTTTCGTTTTCTTGTGA*CTATTATTGATGGTGAGCTATTTG
CCATGTCCATTTGCCGAGT

QA 3 681 3 681
DS 



AS 1 4

CO CL2877Contig1 1034 4 3 U
GGCACTCGTAATAAGAATATCACACTCTCATAAAACCTCTAATTTTCTAACCAAATCAGC
AAGCGATAGAATGGCGGAGGCTGCTCCTGAAATTGCCAAGAAAATGGAGGAAAAGCAGGA
GACGCCAGTGACCGTGGCACCAACTAAGACGGTGGAGGCTACAAGTGCCGAAGCAGCGGA
GATCAAGGTGACGGTGGCACCTCCTGAAAAGGTTGATGCTACAAGTACACCGGCTGAAGA
GCAGGTGAAGACAACAGAGACGTCTAGCTTGTTGGGGAAGCTTGAGGCATACGTGGAGAT
CAAAGCTTCCGCGGAGATGTTCCATCACATGTTCACTGCGAAACCACACCATGTTTCCAA
AGCATCTCCAGGCAACATTCAGGGCTGTGAATTGCACGAAGGAGATTGGGGCAAACCCGG
CTCTATCATCTTCTGGAACTACTTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTGGCAAAGGAGAGGAT
CGAAGCGGTGGATCCCGAGAAGAACCTGCTAACGTTAAGGGTTATAGAAGGTGATTTGAT
GAAAGAGTACAAAAGCTTCTTGGCCACGATCCAGGTGACCCCTAAGCATGGTGGGACAGG
GAGTATCGTACACTGGCACCTTGAGTACGAGAAAATCAGCGAAGAGGTTGCTCATCCCGA
GACTCTCCTCCAGTTATGTGTCGAAATGTCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGTCCGA
GGAATAAAATGTGTGTGTGCCTTAAGTTCTGTCTCCTATTTAAAATTCAATAAGGGACTA
AGGAGCCGTGTCCCAGTTTGTGAGAGATTATAAATGATGAGAGTGTGGCGTGATATTATG
TGCGTGAATAAGTGTATACTGAGATCGTTCTACGTTGGACGTGGTAACTTTGAGAAGCGT
CGTGTACTAGCTACGATGAGGCAGCTAGAAATATATAATAAGACTAAGTGTGGTACAAAA
AAAAAGAATACAAGTGTGTTATGTTTGCTAATAATGTATACGTTTGTGTTAACTAATTAT
TTCCTACCTTGCTC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ58TF U 1
AF RR2FW74TF U 2
AF RR2FW74JQ C 208
AF RR2GJ58JQB C 423
BS 1 718 RR2GJ58TF
BS 719 956 RR2FW74JQ
BS 957 1034 RR2GJ58JQB

RD RR2GJ58TF 718 0 0
GGCACTCGTAATAAGAATATCACACTCTCATAAAACCTCTAATTTTCTAACCAAATCAGC
AAGCGATAGAATGGCGGAGGCTGCTCCTGAAATTGCCAAGAAAATGGAGGAAAAGCAGGA
GACGCCAGTGACCGTGGCACCAACTAAGACGGTGGAGGCTACAAGTGCCGAAGCAGCGGA
GATCAAGGTGACGGTGGCACCTCCTGAAAAGGTTGATGCTACAAGTACACCGGCTGAAGA
GCAGGTGAAGACAACAGAGACGTCTAGCTTGTTGGGGAAGCTTGAGGCATACGTGGAGAT
CAAAGCTTCCGCGGAGATGTTCCATCACATGTTCACTGCGAAACCACACCATGTTTCCAA
AGCATCTCCAGGCAACATTCAGGGCTGTGAATTGCACGAAGGAGATTGGGGCAAACCCGG
CTCTATCATCTTCTGGAACTACTTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTGGCAAAGGAGAGGAT
CGAAGCGGTGGATCCCGAGAAGAACCTGCTAACGTTAAGGGTTATAGAAGGTGATTTGAT
GAAAGAGTACAAAAGCTTCTTGGCCACGATCCAGGTGACCCCTAAGCATGGTGGGACAGG
GAGTATCGTACACTGGCACCTTGAGTACGAGAAAATCAGCGAAGAGGTTGCTCATCCCGA
GACTCTCCTCCAGTTATGTGTCGAAATGTCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGTCC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2FW74TF 689 0 0
GG
ACTCGTAATAAGAATATCACACTCTCATAAAACCTCTAATTTTCTAACCAAATCAGCAAG
CGATAGAATGGCGGAGGCTGCTCCTGAAATTGCCAAGAAAATGGAGGAAAAGCAGGAGAC
GCCAGTGACCGTGGCACCAACTAAGACGGTGGAGGCTACAAGTGCCGAAGCAGCGGAGAT
CAAGGTGACGGTGGCACCTCCTGAAAAGGTTGATGCTACAAGTACACCGGCTGAAGAGCA
GGTGAAGACAACAGAGACGTCTAGCTTGTTGGGGAAGCTTGAGGCATACGTGGAGATCAA
AGCTTCCGCGGAGATGTTCCATCACATGTTCACTGCGAAACCACACCATGTTTCCAAAGC
ATCTCCAGGCAACATTCAGGGCTGTGAATTGCACGAAGGAGATTGGGGCAAACCCGGCTC
TATCATCTTCTGGAACTACTTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTGGCAAAGGAGAGGATCGA
AGCGGTGGATCCCGAGAAGAACCTGCTAACGTTAAGGGTTATAGAAGGTGATTTGATGAA
ATAGTACAAAAGCTTCTTGGCCACGATCCAGGTGACCCCTAAGCATGGTGGGACAGGGAG
TATCGTACACTGGCACCTTGAGTACGAGAAAATCAGCGAAGAGGTTGCTCATCCCGAGAC
TCTCCTCCAGTTATGTGTCGAAATGTC

QA 3 689 3 689
DS 

RD RR2FW74JQ 749 0 0
AAAGGTTGATGCTACAAGTACACCGGCTGAAGAGCAGGTGAAGACAACAGAGACGTCTAG
CTTGTTGGGGAAGCTTGAGGCATACGTGGAGATCAAAGCTTCCGCGGAGATGTTCCATCA
CATGTTCACTGCGAAACCACACCATGTTTCCAAAGCATCTCCAGGCAACATTCAGGGCTG
TGAATTGCACGAAGGAGATTGGGGCAAACCCGGCTCTATCATCTTCTGGAACTACTTTCA
TGATGGAGAGGCAAAGGTGGCAAAGGAGAGGATCGAAGCGGTGGATCCCGAGAAGAACCT
GCTAACGTTAAGGGTTATAGAAGGTGATTTGATGAAATAGTACAAAAGCTTCTTGGCCAC
GATCCAGGTGACCCCTAAGCATGGTGGGACAGGGAGTATCGTACACTGGCACCTTGAGTA
CGAGAAAATCAGCGAAGAGGTTGCTCATCCCGAGACTCTCCTCCAGTTATGTGTCGAAAT
GTCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGTCCGAGGAATAAAATGTGTGTGTGCCTTAAGT
TCTGTCTCCTATTTAAAATTCAATAAGGGACTAAGGAGCCGTGTCCCAGTTTGTGAGAGA
TTATAAATGATGAGAGTGTGGCGTGATATTATGTGCGTGAATAAGTGTATACTGAGATCG
TTCTACGTTGGACGTGGTAACTTTGAGAAGCGTCGTGTACTAGCTACGATGAGGCAGCTA
GAAATATATAATAAGACTAAGTGTGGTAC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2GJ58JQB 612 0 0
CTATCATCTTCTGGAACTACTTTCATGATGGAGAGGCAAAGGTGGCAAAGGAGAGGATCG
AAGCGGTGGATCCCGAGAAGAACCTGCTAACGTTAAGGGTTATAGAAGGTGATTTGATGA
AAGAGTACAAAAGCTTCTTGGCCACGATCCAGGTGACCCCTAAGCATGGTGGGACAGGGA
GTATCGTACACTGGCACCTTGAGTACGAGAAAATCAGCGAAGAGGTTGCTCATCCCGAGA
CTCTCCTCCAGTTATGTGTCGAAATGTCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGTCCGAGG
AATAAAATGTGTGTGTGCCTTAAGTTCTGTCTCCTATTTAAAATTCAATAAGGGACTAAG
GAGCCGTGTCCCAGTTTGTGAGAGATTATAAATGATGAGAGTGTGGCGTGATATTATGTG
CGTGAATAAGTGTATACTGAGATCGTTCTACGTTGGACGTGGTAACTTTGAGAAGCGTCG
TGTACTAGCTACGATGAGGCAGCTAGAAATATATAATAAGACTAAGTGTGGTACAAAAAA
AAAGAATACAAGTGTGTTATGTTTGCTAATAATGTATACGTTTGTGTTAACTAATTATTT
CCTACCTTGCTC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 4

CO CL2878Contig1 1142 4 18 U
GGAAGAAACGGTCCACAGTATGTATGTCACTTCAGCAGCAAGCTAGTAGATCCAAAGTCT
CGGTTACTCCTCTAGAGCTTGAAGATCCCAAGGAGACTCCGTTGAACTTGTACAGGCCTA
AGGAGCCTTACACTGCAAAGATTGTTTCGGTTGAGAGAATCGTCGGTCCTAAAGCACCTG
GAGAGACTTGCCACATTGTGATTGATCATGATGGGAAGGTTCCTTACTGGGAAGGACAGA
GCTATGGAGTAATTCCTCCTGGTGAGAATCCTAAGAAACCAGGTGCTCCTCACAATGTTC
GCCTTTACTCTATTGCATCAACGAGATATGGTGATTCTTTTGATGGCAAGACGGCTAGCT
TATGTGTTCGCCGAGCTCAGTACTATGATCCAGAGACAGGAAAGGAAGATCCTTCCAAAG
CTGGTGTGTGTAGTAACTTCTTGTGCAATGCTAAACCTGGAGATAAGGTCCAAATCACCG
GTCCGTCTGGAAAGGTAATGCTTTTCCCTGAAGATGATCCAAAAGCTACACACATAATGA
TTGCTACCGGAACCGGAGTAGCTCCATTCAGAGGGTACTTGCGCCGTATGTTTATGGAGA
ATGTTCCCACGTTCAAGTTTGATGGACTCGCGTGGCTCTTCCTCGGTGTGGCTAACACAG
ACAGTCTTCTCTACGACGAAGAGTTCTCAAGCTACCTCAAGGACTATCCAGAGAACTTCA
GGTATGATAAAGCGTTGAGCAGGGAAGAGAAGAACAAGAAAGGAGGGAAGATGTATGTGC
AGGACAAGATTGAAGAGTACAGCGATGAGATCTTTAAGCTTTCGGATGATGGAGCTCATA
TTTACTTTTGTGGGCTTAAAGGAATGATGCCAGGGATTCAAGATACGCTTAAGAGAGTTG
CGGAGGAGAGAGGTGAAAGCTGGGAGCAGAAGCTTACTCAGCTTAGAAAGAACAAGCAAT
GGCATGTTGAAGTGTATTGAGCT*GTGTAATAGTCTCTCTCTCTGTGTT***TTTCTTTA
CATTTCTGCAATTGAATAAATGTTTGTGATGATCCATTTTGTATGGATGATAAGACTCTT
AAGATATAGCTCAAGCTTCATCTTGTTTCTGTGACTCTTGAATTGTATCATTTTTTGTCA
CG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB47TF U 1
AF RR2FR83TF U 299
AF RR2FR83JQ C 307
AF RR2GB47JQ C 512
BS 1 484 RR2GB47TF
BS 485 485 RR2FR83TF
BS 486 505 RR2GB47TF
BS 506 506 RR2FR83TF
BS 507 547 RR2GB47TF
BS 548 548 RR2FR83TF
BS 549 592 RR2GB47TF
BS 593 946 RR2FR83TF
BS 947 947 RR2GB47JQ
BS 948 1014 RR2FR83TF
BS 1015 1015 RR2FR83JQ
BS 1016 1074 RR2FR83TF
BS 1075 1093 RR2FR83JQ
BS 1094 1094 RR2GB47JQ
BS 1095 1099 RR2FR83JQ
BS 1100 1100 RR2GB47JQ
BS 1101 1115 RR2FR83JQ
BS 1116 1142 RR2GB47JQ

RD RR2GB47TF 596 0 0
GGAAGAAACGGTCCACAGTATGTATGTCACTTCAGCAGCAAGCTAGTAGATCCAAAGTCT
CGGTTACTCCTCTAGAGCTTGAAGATCCCAAGGAGACTCCGTTGAACTTGTACAGGCCTA
AGGAGCCTTACACTGCAAAGATTGTTTCGGTTGAGAGAATCGTCGGTCCTAAAGCACCTG
GAGAGACTTGCCACATTGTGATTGATCATGATGGGAAGGTTCCTTACTGGGAAGGACAGA
GCTATGGAGTAATTCCTCCTGGTGAGAATCCTAAGAAACCAGGTGCTCCTCACAATGTTC
GCCTTTACTCTATTGCATCAACGAGATATGGTGATTCTTTTGATGGCAAGACGGCTAGCT
TATGTGTTCGCCGAGCTCAGTACTATGATCCAGAGACAGGAAAGGAAGATCCTTCCAAAG
CTGGTGTGTGTAGTAACTTCTTGTGCAATGCTAAACCTGGAGATAAGGTCCAAATCACCG
GTCCATCTGGAAAGGTAATGCTTTTACCTGAAGATGATCCAAAAGCTACACACATAATGA
TTGCTACTGGAACCGGAGTAGCTCCATTCAGAGGGTACTTGCGCCGTATGTT
CATG

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2FR83TF 776 0 0
G
CGCCTTTACTCTATTGCATCAACGAGATATGGTGATTCTTTTGATGGCAAGACGGCTAGC
TTATGTGTTCGCCGAGCTCAGTACTATGATCCAGAGACAGGAAAGGAAGATCCTTCCAAA
GCTGGTGTGTGTAGTAACTTCTTGTGCAATGCTAAACCTGGAGATAAGGTCCAAATCACC
GGTCCGTCTGGAAAGGTAATGCTTTTCCCTGAAGATGATCCGAAAGCTACACACATAATG
ATTGCTACCGGAACCGGAGTAGCTCCATTCAGAGGGTACTTGCGTCGTATGTTTATGGAG
AATGTTCCCACGTTCAAGTTTGATGGACTCGCGTGGCTCTTCCTCGGTGTGGCTAACACA
GACAGTCTTCTCTACGACGAAGAGTTCTCAAGCTACCTCAAGGACTATCCAGAGAACTTC
AGGTATGATAAAGCGTTGAGCAGGGAAGAGAAGAACAAGAAAGGAGGGAAGATGTATGTG
CAGGACAAGATTGAAGAGTACAGCGATGAGATCTTTAAGCTTTCGGATGATGGAGCTCAT
ATTTACTTTTGTGGGCTTAAAGGAATGATGCCAGGGATTCAAGATACGCTTAAGAGAGTT
GCGGAGGAGAGAGGTGAAAGCTGGGAGCAGAAGCTTACTCAGCTTAG*AAGAACAAGCAA
TGGCATGTTGAAGTGTATTGAGCT*GTGTAATAGTCTCTCTCTCTGTGTT***TT*CTTT
ACATTTCTGCAATTGAATAAATGTTTGTGATGATCCATTTTGTATGGATGATAAG

QA 2 776 2 776
DS 

RD RR2FR83JQ 810 0 0
ACTCTATTGCATCAACGAGATATGGTGATTCTTTTGATGGCAAGACGGCTAGCTTATGTG
TTCGCCGAGCTCAGTACTATGATCCAGAGACAGGAAAGGAAGATCCTTCCAAAGCTGGTG
TGTGTAGTAACTTCTTGTGCAATGCTAAACCTGGAGATAAGGTCCAAATCACCGGTCCGT
CTGGAAAGGTAATGCTTTTCCCTGAAGATGATCCGAAAGCTACACACATAATGATTGCTA
CCGGAACCGGAGTAGCTCCATTCAGAGGGTACTTGCGTCGTATGTTTATGGAGAATGTTC
CCACGTTCAAGTTTGATGGACTCGCGTGGCTCTTCCTCGGTGTGGCTAACACAGACAGTC
TTCTTTACGACGAAGAGTTCTCAAGCTACCTCAAGGACTATCCAGAGAACTTCAGGTATG
ATAAAGCGTTGAGCAGGGAAGAGAAGAACAAGAAAGGAGGGAAGATGTATGTGCAGGACA
AGATTGAAGAGTACAGCGATGAGATCTTTAAGCTTTCGGATGATGGAGCTCATATTTACT
TTTGTGGGCTTAAAGGAATGATGCCAGGGATTCAAGATACGCTTAAGAGAGTTGCGGAGG
AGAGAGGTGAAAGCTGGGAGCAGAAGCTTACTCAGCTTAGGAAGAACAAGCAATGGCATG
TTGAAGTGTATTGAGCT*GTGTAATAGTCTCTCTCTCTGTGTT***TTTCTTTACATTTC
TGCAATTGAATAAATGTTTGTGATGATCCATTTTGTATGGATGATAAGACTCTTAAGATA
TAGCTCA*GCTTCGTCTTGTTTCTGTGAC
G

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2GB47JQ 631 0 0
AGATGATCCAAAAGCTACACACATAATGATTGCTACTGGAACCGGAGTAGCTCCATTCAG
AGGGTACTTGCGCCGTATGTTCATGGAGAACGTTCCCACGTTCAAGTTTGATGGACTCGC
GTGGCTATTCCTCGGTGTGGCTAACTCAGACAGTCTTCTCTACGACGAAGAGTTCTCAAG
CTACCTCAAGGACTATCCAGAGAATTTCAGGTATGATAAAGCGCTGAGCAGAGAAGAGAA
GAACAAGAAAGGTGGGAAGATGTATGTGCAGGACAAGATTGAGGAGTACAGCGATGAGAT
CTTTAAGCTTCTGGATAATGGAGCTCATATTTACTTTTGTGGGCTTAAAGGAATGATGTC
AGGGATTCAAGATACGCTTAAGAGAGTTGCGGAGGAGAGAGGTGAGAGCTGGGAGCAGAG
GCTTACTCAGCTTAGAAAGAACAAGCAATGGCATGTTGAAGTGTATTGAGCTTGTGTAAT
AGTCTCTCTCTGTGTGTTGTTTTTCTTTACATTTCTGCAATTGAATAAATGTTTGTGATG
ATCCATTTTGTATGGATGATAAGACTCTTAAGATATAGCTCAAGCTTCATCTTGTTTCTG
TGACTCTTGAATTGTATCATTTTTTGTCACG

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 4

CO CL2879Contig1 1037 4 20 U
GGGGAGAAAAACAGATCGGACGAATGAGCTTGAAGATGAGCTAAAACATAGAGAGAGAGA
GGACAAGTTGGAAAGCGATCAAGAAAGAAGGAAGGAGAGGTTGAGGATGAGCGAAGGGGG
AGAAGTGAAGAATAGGAGGGTAATGGAAGAGAAAACGGAAGAGAGAGGGGTGGCGAAAGG
AAGATCGTGCAAAGGATACCTTTACTACTCTTCCACTCTCAAATCCAAGGATAAGAATCC
TCGCTGCGTCGGCACCCCTCGTACTCTCCGTCAAGTTCCTGATTACGTTGTAGGACAATC
TGAAGCTGAAGCTTCTAAAGAAGGGCGTACCTTAGCTGATTTTTACTATGGATGTTTGGG
TTATTCCGTTTACATGACTGACAAAGACTCCTCTACTGCCATGAAGCAACAAACCAAGAC
CCAACTTCCCGTTTGTCTCGGCCTTGAGATACTAGCAGATAGAAGAGCAGCTTCATCAAG
CAACACTTCATCTATTCCCGCCCGCGCTCAAAATAGAAATGATTCTCGGGAGATACCTCA
GCACCAGAACCATAGACCAACTTCAATCCCAAAACCAACCCCAACCCCAGCCACTGCTAC
AAACAATGAAAACGGCTTCATAACGTGGTTCACAAGAAATGCAAACTTGGTAGCAGCAGG
GGTGATGAAGAACCTGAAGAGAGTGGGTAATTATGTCAAAGAGCATTTGGACTACTCCTT
GGATGATCATCGAAAGCGACCTAAATAAATAAAATCTCTGCGGTGAGAAACCAAAAAAAA
ACAGAAAAACACAATGTGACAGTCAACAGGATATAGAATGATTTGACACTTTTTGAAAAC
TCCTTTTGGATTCTCATAATAATAAAAAAATGGATGTATTGATATATATCTTTATTATCT
TTTGTACAAGCACGAGAATTGTAATGTGTTCACCTTCCTCAGTTTTGCTTGTGCTTTGTA
TACCAAAAGGGTCTAGATGACAAAAGATTCTCATAAACTCGTATTATTGTTTTGCTTATG
CATTATTTCTCTGTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG40TF U 1
AF RR2G580TF U 16
AF RR2G580JQ C 203
AF RR2EG40JQ C 257
BS 1 254 RR2EG40TF
BS 255 255 RR2G580TF
BS 256 468 RR2EG40TF
BS 469 469 RR2G580TF
BS 470 498 RR2EG40TF
BS 499 499 RR2G580TF
BS 500 532 RR2EG40TF
BS 533 533 RR2G580TF
BS 534 534 RR2EG40TF
BS 535 535 RR2G580TF
BS 536 621 RR2EG40TF
BS 622 658 RR2G580TF
BS 659 659 RR2G580JQ
BS 660 689 RR2G580TF
BS 690 690 RR2G580JQ
BS 691 742 RR2G580TF
BS 743 814 RR2G580JQ
BS 815 815 RR2EG40JQ
BS 816 994 RR2G580JQ
BS 995 1037 RR2EG40JQ

RD RR2EG40TF 623 0 0
GGGGAGAAAAACAGATCGGACGAATGAGCTTGAAGATGAGCTAAAACATAGAGAGAGAGA
GGACAAGTTGGAAAGCGATCAAGAAAGAAGGAAGGAGAGGTTGAGGATGAGCGAAGGGGG
AGAAGTGAAGAATAGGAGGGTAATGGAAGAGAAAACGGAAGAGAGAGGGGTGGCGAAAGG
AAGATCGTGCAAAGGATACCTTTACTACTCTTCCACTCTCAAATCCAAGGATAAGAATCC
TCGCTGCGTCGGCATCCCTCGTACTCTCCGTCAAGTTCCTGATTACGTTGTAGGACAATC
TGAAGCTGAAGCTTCTAAAGAAGGGCGTACCTTAGCTGATTTTTACTATGGATGTTTGGG
TTATTCCGTTTACATGACTGACAAAGACTCCTCTACTGCCATGAAGCAACAAACCAAGAC
CCAACTTCCCGTTTGTCTCGGCCTTGAGATACTAGCAGATAGAAGAGCTGCTTCATCAAG
CAACACTTCATCTATTCCTGCCCGCGCTCAAAATAGAAATGATTCTCGGGAGTTGCCTCA
GCACCAGAACCATAGACCAACTTCAATCCCAAAACCAACCCCAACCCCAGCCACTGCTAC
AAACAATGAAAACGGCTTCAT
TA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2G580TF 727 0 0
GG
GGACGAATGAGCTTGAAGATGAGCTAAAACATAGAGAGAGAGAGGACAAGTTGGAAAGCG
ATCAAGAAAGAAGGAAGGAGAGGTTGAGGATGAGCGAAGGGGGAGAAGTGAAGAATAGGA
GGGTAATGGAAGAGAAATCGGAAGAGAGAGGGGTGGCGAAAGGAAGATCGTGCAAAGGAT
ACCTTTACTACTCTTCCACTCTCAAATCCAAGGATAAGAATCCTCGCTGCGTCGGCACCC
CTCGTACTCTCCGTCAAGTTCCTGATTACGTTGTAGGACAATCTGAAGCTGAAGCTTCTA
AAGAAGGGCGTACCTTAGCTGATTTTTACTATGGATGTTTGGGTTATTCTGTTTACATGA
CTGACAAAGACTCGTCTACTGCCATGAAGCAACAAACCAAGACCCAACTTCCCGTTTGTC
TCGGCCTTGAGATACTAGCAGATAGAAGAGCAGCTTCGTCAAGCAACACTTCATCTATTC
CCGCCCGCGCTCAAAATAGAAATGATTCTCGGGAGATACCTCAGCACCAGAACCATAGAC
CAACTTCAATCCCAAAACCAACCCCAACCCCAGCCACTGCTACAAACACTGAAAACGGCT
TCATAACGTGGTTCACAAGAAATGCAAACTTGGTAGCAGCACGGGTGATGAAGAACCTGA
AGAGAGTGGGTA*TTATGTCAAAGAGCATTTGGACTACTCCTTGGATGATCATCGAAAGC
GACCT

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR2G580JQ 792 0 0
TACTACTCTTCCACTCTCAAATCCAAGGATAAGAATCCTCGCTGCGTCGGCACCCCTCGT
ACTCTC*GTCAAGTTCCTGATTACGTTGTAGGACAATCTGAAGCTGAAGCTTCTAAAGAA
GGGCGTACCTTAGCTGATTTTTACTATGGATGTTTGGGTTATTCTGTTTACATGACTGAC
AAAGACTCGTCTACTGCCATGAAGCAACAAACCAAGACCCAACTTCCCGTTTGTCTCGGC
CTTGAGATACTAGCAGATAGAAGAGCAGCTTCGTCAAGCAACACTTCATCTATTCCCGCC
CGCGCTCAAAATAGAAATGATTCTCGGGAGATACCTCAGCACCAGAACCATAGACCAACT
TCAATCCCAAAACCAACCCCAACCCCAGCCACTGCTACAAACACTGAAAACGGCTTCATA
ACGTGGTTCACAAGAAATGCAAACTTGGTAGCAGCAGGGGTGATGAAGAACCTGAAGAGA
GTGGGTAATTATGTCAAAGAGCATTTGGACTACTCCTTGGATGATCATCGAAAGCGACCT
AAATAAATAAAATCTCTGCGGTGAGAAACCAAAAAAAAACAGAAAAACACAATGTGACAG
TCAACAGGATATGGAATGATTTGACACTTTTTGAAAACTCCTTTTGGATTCTCATAATAA
TAAAAAAATGGATGTATTGATATATATCTTTATTATCTTTTGTACAAGCACGAGAATTGT
AATGTGTTCACCTTCCTCAGTTTTGCTTGTGCTTTGTATACCAAAAGGGTCTAGATGACA
AAAGATTCTCAT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2EG40JQ 781 0 0
CCTCGTACTCTCCGTCAAGTTC*TGATTACGTTGTAGGACAATCTGAAGCTGAAGCTTCT
AAAGAAGGGCGTACCTTAGCTGATTTTTACTATGGATGTTTGGGTTATTCCGTTTACATG
ACTGACAAAGACTCCTCTACTGCCATGAAGCAACAAACCAAGACCCAACTTCCCGTTTGT
CTCGGCCTTGAGATACTAGCAGATAGAAGAGCTGCTTCATCAAGCAACACTTCATCTATT
CCTGCCCGCGCTCAAAATAGAAATGATTCTCGGGAGTTGCCTCAGCACCAGAACCATAGA
CCAACTTCAATCCCAAAACCAACCCCAACCCCAGCCACTGCTACAAACAATGAAAACGGC
TTCATTACGAGGTTCACAAGAAATGCAAACCTGGTAGCAGCAGGGGTGATGAAGAACCTG
AAGAGAGTGGGTAATTATGTCAAAGAGCATTTGGACGACTCCTTGGATGATCATCGAAAG
CGACCTAAATAAATAAAATCTCTGCGGTGAGAAAC*AAAAAAAAACAGAAAAACACAATG
TGACAGTCAACAGGATATAGAATGATTTGACACTTTTTGAAAACTCCTTTTGGATTCTCA
TAATAATAAAAAAATGGATGTATTGATATATATCTTTATTATCTTTTGTACAAGCACGAG
AATTGTAATGTGTTCACCTTCCTCAGTTTTGCTTGTGCTTTGTATACCAAAAGGGTCTAG
ATGACAAAAGATTCTCATAAACTCGTATTATTGTTTTGCTTATGCATTATTTCTCTGTAT
T

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL2880Contig1 1246 2 2 U
GTATAATATGAATACATTTCGTCATCATAAGACATAAAGACCGGATCATTACTAGTCATT
ACCCAAAGAAATAGGTTTTGTCTAATAACAATACACAAGTAACATCAATCTTATTATTAC
CAAACAAATGGGTTTCTTATGTCTCCAGTATTTTTTTTTCTTTCTTTATTCCCCACATCT
TAAACTAACAGTGAGCCAAATCAGAGCTTCGACGTCACGGAGGGATTAGGAGGTCTTGCA
TCTCTTAACAAGGCCTCTTGCGTTAACGATACAACCAGCTCTCCTTTTCTGTCGAACATT
TCACCAGTGACAAAACCCCTGGTCACGTGCGCAGTTGGACTAACAATCACAAAAAGCAAC
CAGTCATCAGCTCTAAAAGGTCGGTGAAACCACATCGCATGGTCCAGGCTAAGTGCAGCA
GATCTCAGGCCCTTTCTTCGGTGAGGGTTCAAACTGATACTTGCAAATATCAAATCCGAA
AAAAATGCCACAACACATCGATGCAAAGCTTGGTCATCAGAAAGCTTTCCCTTTGCTCTA
AACCAATACCTCAATCTTGGTGGAGACTTTGTCTGGTTTGTAGAATTACTGGGTTCACAA
AACCGAATCTCTATAGGCCATGGAATAAAATTTGCAGTTGCAACTTTGTTCCGGTAACTC
CTAGGAAGATGAGGGTCAGTTATACGACGTTCACGTAGCTCCTCTAGTGATAGAAGCGTA
TCAGGATCCGGTGCAGTGGGCATGGTTGACTCCTGGTGATCAAATCCCTGTTGCTCTTTC
TGAAAGGAAGCCATCAATATGAAAATGATATTCCCTTTCTGTATAGCATCTACTCTTCGG
GTGGCAAAGTTGTTCCCATCACGTATACGGTGAACTTGATATATAATGGCCGAAGTAATC
ATATTGTTTCAAGAGAAACTCGGAACGATTTTCTTCATCGTCGGGTCCGGAAACTTGAGC
CTCTCCAGAGAAAATGAAATAGCAACCATCCCAAGCTTGCTCTTCACGGATCACATACTC
CCCTTTCCCGTATCGTTTCAAGACAACAACTTGGGCGATTTTCTTAAGAGAAGAACTAGG
CAGCTTCTGAAGTAAGGGAACGTTTCCAAGGAACTCCACTACTGATTCCGTGTTCATGGC
GGAGTCGTCAAGTCTCGAACTGATCGCCACAAAATCAAACAAATTTGTAGATTTCTCCTC
CGACAATTATGGGTTTTTTTTTTTTTAATTACTCCGGAAGGTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV81JQ U 1
AF RR2AP31TF C 607
BS 1 711 RR2CV81JQ
BS 712 1246 RR2AP31TF

RD RR2CV81JQ 711 0 0
GTATAATATGAATACATTTCGTCATCATAAGACATAAAGACCGGATCATTACTAGTCATT
ACCCAAAGAAATAGGTTTTGTCTAATAACAATACACAAGTAACATCAATCTTATTATTAC
CAAACAAATGGGTTTCTTATGTCTCCAGTATTTTTTTTTCTTTCTTTATTCCCCACATCT
TAAACTAACAGTGAGCCAAATCAGAGCTTCGACGTCACGGAGGGATTAGGAGGTCTTGCA
TCTCTTAACAAGGCCTCTTGCGTTAACGATACAACCAGCTCTCCTTTTCTGTCGAACATT
TCACCAGTGACAAAACCCCTGGTCACGTGCGCAGTTGGACTAACAATCACAAAAAGCAAC
CAGTCATCAGCTCTAAAAGGTCGGTGAAACCACATCGCATGGTCCAGGCTAAGTGCAGCA
GATCTCAGGCCCTTTCTTCGGTGAGGGTTCAAACTGATACTTGCAAATATCAAATCCGAA
AAAAATGCCACAACACATCGATGCAAAGCTTGGTCATCAGAAAGCTTTCCCTTTGCTCTA
AACCAATACCTCAATCTTGGTGGAGACTTTGTCTGGTTTGTAGAATTACTGGGTTCACAA
AACCGAATCTCTATAGGCCATGGAATAAAATTTGCAGTTGCAACTTTGTTCCGGTAACTC
CTAGGAAGATGAGGGTCAGTTATACGACGTTCACGTAGCTCCTCTAGTGAT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2AP31TF 640 0 0
ATCTCTATAGGCCATGGAATAAAATTTGCAGTTGCAACTTTGTTCCGGTAACTCCTAGGA
AGATGAGGGTCAGTTATACGACGTTCACGTAGCTCCTCTAGTGATAGAAGCGTATCAGGA
TCCGGTGCAGTGGGCATGGTTGACTCCTGGTGATCAAATCCCTGTTGCTCTTTCTGAAAG
GAAGCCATCAATATGAAAATGATATTCCCTTTCTGTATAGCATCTACTCTTCGGGTGGCA
AAGTTGTTCCCATCACGTATACGGTGAACTTGATATATAATGGCCGAAGTAATCATATTG
TTTCAAGAGAAACTCGGAACGATTTTCTTCATCGTCGGGTCCGGAAACTTGAGCCTCTCC
AGAGAAAATGAAATAGCAACCATCCCAAGCTTGCTCTTCACGGATCACATACTCCCCTTT
CCCGTATCGTTTCAAGACAACAACTTGGGCGATTTTCTTAAGAGAAGAACTAGGCAGCTT
CTGAAGTAAGGGAACGTTTCCAAGGAACTCCACTACTGATTCCGTGTTCATGGCGGAGTC
GTCAAGTCTCGAACTGATCGCCACAAAATCAAACAAATTTGTAGATTTCTCCTCCGACAA
TTATGGGTTTTTTTTTTTTTAATTACTCCGGAAGGTTATC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 4

CO CL2881Contig1 1230 4 17 U
GGACCTTTCTTGGTTCTAAAAAAATCTGTTGGTCGTAAACACCACCAAACAAACAAAGAT
ACAAGACAGAGAGCACCGCACGAGAGAGAAGAACGAACAGTGAAACCCTAACTCCGGTCC
GTCGCAGTGGCGGTGCCGGAGGTGTTTCTTCCTTCCCTTTTCTTGTTTTTACTTTTGCTT
TCCTCCCCTAAGCTCAATCTATGTCGATATGCAAGCTCCTCTGAAGTCATCCCTTCCTTC
TATCGGTGCTTCGGTACTGAACGGAGACGGTGGTCACGACCTTGGAGAGACGGCGAGACT
GTGACGAGGCTAAGGTGTGGAGAGTCGGCGTTTTAGGACTGGAAATCTGGTTAGATCGAG
TTTTCCCCTTTTTCAGATCTAGGTTAGATTTCACCGGCGGTGGTACGTGTTTGGTGTTAG
ACGACTCTTCTACCCCATTAAAACTCCATGTTCGAGCGGTGAGATGGGTGAAGTAGAGGT
GCGATGAGTGGCTGAAGATGGTGATACCCTTGAAGCCTTAAGTTGTGACCGTTCATGTTT
CTACCGCCACGGTCCGCCTTTCAGTCCGGATTCGTGTCCGGTTTTGGCCACAGAGTGAGG
AAAGGATCGACGGCGATATGAATCAAACCGGAATGCGCCTTCAGGCGTTGATGCTATTGG
GACACGAACTCGACTCATACAGCATGGAGACCAATGGCTTGTACACTTTACGGTCCCGAC
TTTGGTTTATAGTTCGCTCGTGTAGATACTTATTCTCGTCTCAAGTGGTCTTTATAGGTT
CTTTTGCAGTCGGACCTTCTGTCCGTTAGGTGGCTACGGACTGAAGCTACGAACTCCAGG
AGACACAAGCTGCTTTCGGTAATGCGCTTCGGTGATGCTGCTATTGGGACACGCCCTGAA
TGCTGATCTCCTGGGACCATAGCGTGGGCTAAACTAGTTACACTGGTCAAGTTTGTTTGT
GTTTTGCTGTGTTAGTAGTAGTTTTCGAGTCATTGTGGTTAATTGTAGTGGTCTAAGAGA
TGGTTTGTTTCGATCTGTGGAGCATTCTCATCTCAGTTGGGGTTAAAAATACATCAATGT
ACTCTAGGTTGCGCTGGATCCGAGTGAGTTTTCACCTAGTGAGTGTTCCAGGGTGTTGCT
AAGATGCATTGTTTGTATATGTGGTAGAACTCTTGTGAGGTCAAATGTTTGTACCAAGAT
TATTGGTTAATGAAATAGTTGAAGTTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FC26TF U 1
AF RR2CJ50TF U 91
AF RR2CJ50JQ C 444
AF RR2FC26JQ C 612
BS 1 212 RR2FC26TF
BS 213 213 RR2CJ50TF
BS 214 214 RR2FC26TF
BS 215 215 RR2CJ50TF
BS 216 218 RR2FC26TF
BS 219 219 RR2CJ50TF
BS 220 517 RR2FC26TF
BS 518 518 RR2CJ50TF
BS 519 665 RR2FC26TF
BS 666 666 RR2CJ50TF
BS 667 691 RR2FC26TF
BS 692 692 RR2CJ50TF
BS 693 709 RR2FC26TF
BS 710 777 RR2CJ50TF
BS 778 778 RR2CJ50JQ
BS 779 788 RR2CJ50TF
BS 789 1230 RR2CJ50JQ

RD RR2FC26TF 709 0 0
GGACCTTTCTTGGTTCTAAAAAAATCTGTTGGTCGTAAACACCACCAAACAAACAAAGAT
ACAAGACAGAGAGCACCGCACGAGAGAGAAGAACGAACAGTGAAACCCTAACTCCGGTCC
GTCGCAGTGGCGGTGCCGGAGGTGTTTCTTCCTTCCCTTTTCTTGTTTTTACTTTTGCTT
TCCTCCCCTAAGCTCAATCTATGTCGATATGCGATCTC*TCTGAAGTCATCCCTTCCTTC
TATCGGTGCTTCGGTACTGAACGGAGACGGTGGTCACGACCTTGGAGAGACGGCGAGACT
GTGACGAGGCTAAGGTGTGGAGAGTCGGCGTTTTAGGACTGGAAATCTGGTTAGATCGAG
TTTTCCCCTTTTTCAGATCTAGGTTAGATTTCACCGGCGGTGGTACGTGTTTGGTGTTAG
ACGACTCTTCTACCCCATTAAAACTCCATGTTCGAGCGGTGAGATGGGTGAAGTAGAGGT
GCGATGAGTGGCTGAAGATGGTGATACCCTTGAAGCCCTAAGTTGTGACCGTTCATGTTT
CTACCGCCACGGTCCGCCTTTCAGTCCGGATTCGTGTCCGGTTTTGGCCACAGAGTGAGG
AAAGGATCGACGGCGATATGAATCAAACCGGAATGCGCCTTCAGGCGTTGATGCTATTGG
GACACTAACTCGACTCATACAGCATGGAGAC*AATGGCTTGTACACTTT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2CJ50TF 698 0 0
GG
ACGAACAGTGAAACCCTAACTCCGGTCCGTCGCAGTGGCGGTGCCGGAGGTGTTTCTTCC
TTCCCTTTTCTTGTTTTTACTTTTGCTTTCCTCCCCTAAGCTCAATCTATGTCGATATGC
ATGCTCCTCTGAAGTCATCCCTTCCTTCTATCGGTGCTTCGGTACTGAACGGAGACGGTG
GTCACGACCTTGGAGAGACGGCGAGACTGTGACGAGGCTAAGGTGTGGAGAGTCGGCGTT
TTAGGACTGGAAATCTGGTTAGATCGAGTTTTCCCCTTTTTCAGATCTAGGTTAGATTTC
ACCGGCGGTGGTACGTGTTTGGTGTTAGACGACTCTTCTACCCCATTAAAACTCCATGTT
CGAGCGGTGAGATGGGTGAAGTAGAGGTGCGATGAGTGGCTGAAGATGGTGATACCCTTG
AAGCCTTAAGTTGTGACCGTTCATGTTTCTACCGCCACGGTCCGCCTTTCAGTCCGGATT
CGTGTCCGGTTTTGGCCACAGAGTGAGGAAAGGATCGACGGCGATATGAATCAAACCGGA
ATGCGCCTTCAGGCGTTGATGCTATTGGGACACGAACTCGACTCATACAGCATGGAGACC
AATGGCTTGTACACTTTACGGTCCCGACTTTGGTTTATAGTTCGCTCGTGTAGATACTTA
TTCTCGTCTCAAGTGGTCTTTATAG*TTCTTTTGCA

QA 3 698 3 698
DS 

RD RR2CJ50JQ 787 0 0
CTCCATGTTCGAGCGGTGAGATGGGTGAAGTAGAGGTGCGATGAGTGGCTGAAGATGGTG
ATACCCTTGAAGCCTTAAGTTGTGACCGTTCATGTTTCTACCGCCACGGTCCGCCTTTCA
GTCCGGATTCGTGTCCGGTTTTGGCCACAGAGTGAGGAAAGGATCGACGGCGATATGAAT
CAAACCGGAATGCGCCTTCAGGCGTTGATGCTATTGGGACACGAACTCGACTCATACAGC
ATGGAGACCAATGGCTTGTACACTTTACGGTCCCGACTTTGGTTTATAGTTCGCTCGTGT
AGATACTTATTCTCGTCTCAAGTGGTCTTTATAGGTTCTTTTGCAGTCGGACCTTCTGTC
CGTTAGGTGGCTACGGACTGAAGCTACGAACTCCAGGAGACACAAGCTGCTTTCGGTAAT
GCGCTTCGGTGATGCTGCTATTGGGACACGCCCTGAATGCTGATCTCCTGGGACCATAGC
GTGGGCTAAACTAGTTACACTGGTCAAGTTTGTTTGTGTTTTGCTGTGTTAGTAGTAGTT
TTCGAGTCATTGTGGTTAATTGTAGTGGTCTAAGAGATGGTTTGTTTCGATCTGTGGAGC
ATTCTCATCTCAGTTGGGGTTAAAAATACATCAATGTACTCTAGGTTGCGCTGGATCCGA
GTGAGTTTTCACCTAGTGAGTGTTCCAGGGTGTTGCTAAGATGCATTGTTTGTATATGTG
GTAGAACTCTTGTGAGGTCAAATGTTTGTACCAAGATTATTGGTTAATGAAATAGTTGAA
GTTGAGC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2FC26JQ 619 0 0
GGCGATATGAATCAAACCGGAATGCGCCTTCAGGCGTTGATGCTATTGGGACACTAACTC
GACTCATACAGCATGGAGACCAATGGCTTGTACACTTTACGGTCCCGACTTTGGTTTATA
GTTTGCTCGTGTAGATACCTATTCTCGTCTCAAGTGGTCTTTATAGGTTCTTTTGCAGTC
GGACCTTCTGTCCGTTAGGTGGTTACGGACTGAAGTTACGAACTCCAGGAGACACAAGCT
GCTTTCGGTAATGCGCTTCGGTGATGCTGCTATTGGGACACGCCCTGAATGCTGATTTCC
TGGGACCATAGCGTGGGCTAAACTAGTTACACTGGTCAAGTTTGTTTGTGTTTTGCTGTG
TTAGTAGTAGTTTTCGAGTCATTGTGGTTAATTGTAGTGGTTTAAGAGATGGTTTGTTTC
GATCTGTGGAGCATTTTCATTTCAGTTGGGGTTAAAAATACATCAATGTACTTTAGGTTG
CGCTGGATCCGAGTGAGTTTTCACCTAGTGAGTGTTCCAGGGTGTTGTTAAGATGCATTG
TTTGTATATGTGGTAGAACTCTTGTGAGGTCAAATGTTTGTACCAAGATTATTGGTTAAT
GAAATAGTTGAAGTTGAGC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 4

CO CL2882Contig1 887 4 7 U
GATAGGGAGAGATTCCACTCTTCTTTCTCTTTCTATTTTCTTTTTTCTCTGTTTGCTTGT
CGTTTCCGTTCAACTTTGATATCTCCGACCGACGTTCAGTGGGCTTTCTCAGCCACGACG
TCGGTCGGAATCTCTCCTTTCTTGTTTTGTAATCGGTTTCACTTTGATCTGTCCAGTCGG
ATTTTGATTATGCTCAGGTTTTAGAAAGTTCAGTTCTAGATCTCGAGCTTGAGTTCTTTC
GACGGGTCTGTGACTTGGTGTTACGGTGATAGTCTCCACCATGGCAATTCTCTGAGTTGC
CTTTACCTTTGGTTCAGATCTGATCGTTCGCAACTTGGTGTTTTCCTTTTATTCACACTG
TTGAAGTTGTTGTCGAGAGTGGAAGGTTCGATCTTCTTGCATGCATGGTTCTACGGCTCG
GTTCAAAGGATATGGAGCTTCAGTTCATTCTCATCAGGTCGTCGGAGGCGTCAGTTTAAC
CGATCTCTTATCTGCGTCTTCCGGGAGCGTGTCCAGTGTTCTTACTCTGTCTCCATAAGT
GGGTTGAAGGTGTGTCGTTTGGAGCTTTTAATAAAAAGGGTCGCTGGGACTCCCAAATAA
AATCGATCGTTGGTGGCTAGTTCTTTCCTTTCCTTACTTTTCGATCTTCCTTCATGACTT
CATATTTTTAGTGTGTTTTTGCTAGATGTTAACTTTTTCTTTGTAAAGTTGTCGCTGCTG
GTATTTAGTTATTTTTTCCGGGGATAGGTTTGTTTGTCCGCCGGCTCAGGTTTCCAGGGA
TTGTTCTATCATCCGCTGGCTTTAGTTTCCGGGAGATTGATTCTCGCCAGCTATAGTTTC
ATCCTTGCTGTAATCGTTTGGTTTAATGAAGTAATCGTCCAGAAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2AK31TF U 1
AF RR2AU08TF U 47
AF RR2AU08JQ C 43
AF RR2AK31JQ C 115
BS 1 275 RR2AK31TF
BS 276 276 RR2AU08TF
BS 277 736 RR2AK31TF
BS 737 745 RR2AU08JQ
BS 746 746 RR2AK31JQ
BS 747 885 RR2AU08JQ
BS 886 887 RR2AK31JQ

RD RR2AK31TF 739 0 0
GATAGGGAGAGATTCCACTCTTCTTTCTCTTTCTATTTTCTTTTTTCTCTGTTTGCTTGT
CGTTTCCGTTCAACTTTGATATCTCCGACCGACGTTCAGTGGGCTTTCTCAGCCACGACG
TCGGTCGGAATCTCTCCTTTCTTGTTTTGTAATCGGTTTCACTTTGATCTGTCCAGTCGG
ATTTTGATTATGCTCAGGTTTTAGAAAGTTCAGTTCTAGATCTCGAGCTTGAGTTCTTTC
GACGGGTCTGTGACTTGGTGTTACGGTGATAGTCTTCACCATGGCAATTCTCTGAGTTGC
CTTTACCTTTGGTTCAGATCTGATCGTTCGCAACTTGGTGTTTTCCTTTTATTCACACTG
TTGAAGTTGTTGTCGAGAGTGGAAGGTTCGATCTTCTTGCATGCATGGTTCTACGGCTCG
GTTCAAAGGATATGGAGCTTCAGTTCATTCTCATCAGGTCGTCGGAGGCGTCAGTTTAAC
CGATCTCTTATCTGCGTCTTCCGGGAGCGTGTCCAGTGTTCTTACTCTGTCTCCATAAGT
GGGTTGAAGGTGTGTCGTTTGGAGCTTTTAATAAAAAGGGTCGCTGGGACTCCCAAATAA
AATCGATCGTTGGTGGCTAGTTCTTTCCTTTCCTTACTTTTCGATCTTCCTTCATGACTT
CATATTTTTAGTGTGTTTTTGCTAGATGTTAACTTTTTCTTTGTAAAGTTGTCGCTGCTG
GTATTTAGTTATTTTT
CCG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2AU08TF 675 0 0
CTCTGTTTGCTTGTCGTTTCCGTTCAACTTTGATATCTCCGACCGACGTTCAGTGGGCTT
TCTCAGCCACGACGTCGGTCGGAATCTCTCCTTTCTTGTTTTGTAATCGGTTTCACTTTG
ATCTGTCCAGTCGGATTTTGATTATGCTCAGGTTTTAGAAAGTTCAGTTCTAGATCTCGA
GCTTGAGTTCTTTCGACGGGTCTGTGACTTGGTGTTACGGTGATAGTCTCCACCATGGCA
ATTCTCTGAGTTGCCTTTACCTTTGGTTCAGATCTGATCGTTTGCAACTTGGTGTTTTCC
TTTTATTCACACTGTTGAAGTTGTTGTCGAGAGTGGAAGGTTCGATCTTCTTGCATGCAT
GGTTCTACGGCTCGGTTCAAAGGATATGGAGCTTCAGTTCATTCTCATCAGGTCGTCGGA
GGCGTCAGTTTAACCGATCTCTTATCTGCGTCTTCCGGGAGCGTGTCCAGTGTTCTTACT
CTGTCTCCATAAGTGGGTTGAAGGTGTGTCGTTTGGAGCTTTTAATAAAAAGGGTCGCTG
GGACTCCCAAATAAAATCGATCGTTGGTGGCTAGTTCTTTCCTTTCCTTACTTTTCGATC
TTCCTTCATGACTTCATATTTTTAGTGTGTTTTTGCTAGATGTTAACTTTTTCTTTGTAA
AGTTGTCGCTGCTGG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2AU08JQ 845 0 0
TTTT
CTCTGTTTGCTTGTCGTTTCCGTTCAACTTTGATATCTCCGACCGACGTTCAGTGGGCTT
TCTCAGCCACGACGTCGGTCGGAATCTCTCCTTTCTTGTTTTGTAATCGGTTTCACTTTG
ATCTGTCCAGTCGGATTTTGATTATGCTCAGGTTTTAGAAAGTTCAGTTCTAGATCTCGA
GCTTGAGTTCTTTCGACGGGTCTGTGACTTGGTGTTACGGTGATAGTCTCCACCATGGCA
ATTCTCTGAGTTGCCTTTACCTTTGGTTCAGATCTGATCGTTTGCAACTTGGTGTTTTCC
TTTTATTCACACTGTTGAAGTTGTTGTCGAGAGTGGAAGGTTCGATCTTCTTGCATGCAT
GGTTCTACGGCTCGGTTCAAAGGATATGGAGCTTCAGTTCATTCTCATCAGGTCGTCGGA
GGCGTCAGTTTAACCGATCTCTTATCTGCGTCTTCCGGGAGCGTGTCCAGTGTTCTTACT
CTGTCTCCATAAGTGGGTTGAAGGTGTGTCGTTTGGAGCTTTTAATAAAAAGGGTCGCTG
GGACTCCCAAATAAAATCGATCGTTGGTGGCTAGTTCTTTCCTTTCCTTACTTTTCGATC
TTCCTTCATGACTTCATATTTTTAGTGTGTTTTTGCTAGATGTTAACTTTTTCTTTGTAA
AGTTGTCGCTGCTGGTATTTAGTTATTTTTTCCGGGGATTGGTTTGTTTGTCCGCCGGCT
CAGGTTTCCAGGGATTGTTCTATCATCCGCTGGCTTTAGTTTCCGGGAGATTGATTCTCG
CCAGCTATAGTTTCATCCTTGCTGTAATCGTTTGGTTTAATGAAGTAATCGTCCAGAAG
AG

QA 5 843 5 843
DS 

RD RR2AK31JQ 773 0 0
ACGACGTCGGTCGGAATCTCTCCTTTCTTGTTTTGTAATCGGTTTCACTTTGATCTGTCC
AGTCGGATTTTGATTATGCTCAGGTTTTAGAAAGTTCAGTTCTAGATCTCGAGCTTGAGT
TCTTTCGACGGGTCTGTGACTTGGTGTTACGGTGATAGTCTTCACCATGGCAATTCTCTG
AGTTGCCTTTACCTTTGGTTCAGATCTGATCGTTCGCAACTTGGTGTTTTCCTTTTATTC
ACACTGTTGAAGTTGTTGTCGAGAGTGGAAGGTTCGATCTTCTTGCATGCATGGTTTTAC
GGCTCGGTTCAAAGGATATGGAGCTTCAGTTCATTCTCATCAGGTCGTCGGAGGGGTCAG
TTTAACCGATCTTTTATTTGCGTCTTCCGGGAGCGTGTCCAGTGTTCTTACTCTGTCTCC
ATAAGTGGGTTGAAGGTGTGTCGTTTGGAGCTTTTAATAAAAAGGGTCGCTGGGACTCCC
AAATAAAATCGATCGTTGGTGGCTAGTTCTTTCCTTTCCTTACTTTTCGATCTTCCTTCA
TGACTTCATATTTTTAGTGTGTTTTTGCTAGATGTTAACTTTTTCTTTGTAAAGTTGTCG
CTGCTGGTATTTAGTTATTTTT*CCGGGGATAGGTTTGTTTGTCCGCCGTCTCAGGTTTC
CAGGGATTGTTCTATCATCCGCTGGCTTTAGTTTCCGGGAGATTGATTCTCGCCAGCTAT
AGTTTCATCCTTGCTGTAATCGTTTGGTTTAATGAAGTAATCGTCCAGAAGGG

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 4

CO CL2883Contig1 714 4 12 U
TTCGGTTCTGTTCATTGGTGGTTGGGTTGATATTCGAGTAAGAATGAAGCCGGTGATAGG
CACAGTGGTCTCGAACAAGATGCAGAAATCAGTAGTCGTAGCCGTGGACAGACTCTTCCA
CAACAAGCTCTACAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGACGAGAA
AGACTCTTGCAACATCGGCGATCGAGTAAAGTTAGATCCTTCGAGACCGTTGAGCAAGAA
TAAGCATTGGGTTGTTGCTGAGATCATCAAGAAAGCTCGCACCTATTCTCCTCAAGCTGC
TGCCGCTGCTATTGCTGCTTCTGCATCAACTTCCTCAGCCTCCATTCCTGATTCTACTGC
TCAGTCTCAGGTTCCTCCGTCTTCTTCTTCTTAAGTTTTCTTAGGAGTCCGCATGCATAG
AGAAGGGAGATGTGTGTCTTGGATACTGGATTTCATGAGCTACTAAGAAAGACAGCTTTG
GACCGATCAACATATTCTCGATCTAAGTTGATTCTTCTGGATGATGTCTACGATATTTGG
TTCTCCTACGATAATTTAGTGAAAATTTTATGAGTAGGACTGTTAGTGAACTCTCAGTTG
GTGAGCTTTTAATATCTTGTTATGCCATTTTGGTACCATATGTGCATGAATGAAACAGTG
AGTGAACCTTGATGATGTAATGCTTCTTTATTCTACAAATGCACATAACTCTTC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FI92JQ C 1
AF RR2EX05TF U 3
AF RR2FI92TF U 3
AF RR2EX05JQ C 116
BS 1 2 RR2FI92JQ
BS 3 51 RR2EX05TF
BS 52 52 RR2FI92TF
BS 53 611 RR2EX05TF
BS 612 612 RR2FI92TF
BS 613 636 RR2EX05TF
BS 637 637 RR2FI92TF
BS 638 665 RR2EX05TF
BS 666 666 RR2FI92TF
BS 667 679 RR2EX05TF
BS 680 703 RR2FI92TF
BS 704 714 RR2FI92JQ

RD RR2FI92JQ 714 0 0
TTCGGTTCTGTTCATTGGTGGTTGGGTTGATATTCGAGTAAGAATGAAGCCGGTGATAGG
CACAGTGGTCTCGAACAAGATGCAGAAATCAGTAGTCGTAGCCGTGGACAGACTCTTCCA
CAACAAGCTCTACAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGACGAGAA
AGACTCTTGCAACATCGGCGATCGAGTAAAGTTAGATCCTTCGAGACCGTTGAGCAAGAA
TAAGCATTGGGTTGTTGCTGAGATCATCAGGAAAGCTCGCATCTATTCTCCTCAAGCTGC
TGCCGCTGCTATTGCTGCTTCTGCATCAACTTCCTCAGCCTCCATTCCTGATTCTACTGC
TCAGTCTCAGGTTCCTCCGTCTTCTTCTTCTTAAGTTTTCTTAGGAGTCCGCATGCATAG
AGAAGGGAGATGTGTGTCTTGGATACTGGATTTCATGAGTTACTAAGAAAGACAGCTTTG
GACCGATCAACATATTCTCGATCTAAGTTGATTTTTCTGGATGATGTCTACGATATTTGG
TTCTCCTACGATAATTTAGTGAAAATTTTATGAGTAGGACTGTTAGTGAACTCTCAGTTG
GTGAGCTTTTAATATCTTGTTATGCCATTTTGGTACCATATGTGCATGAATGAAACAGTG
AGTGAACCTTGATGATGTAATGCTTCTTTATTCTACAAATGCACATAACTCTTC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2EX05TF 678 0 0
CGGTTCTGTTCATTGGTGGTTGGGTTGATATTCGAGTAAGAATGAAGCCAGTGATAGGCA
CAGTGGTCTCGAACAAGATGCAGAAATCAGTAGTCGTAGCCGTGGACAGACTCTTCCACA
ACAAGCTCTACAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGACGAGAAAG
ACTCTTGCAACATCGGCGATCGAGTAAAGTTAGATCCTTCGAGACCGTTGAGCAAGAATA
AGCATTGGGTTGTTGCTGAGATCATCAAGAAAGCTCGCACCTATTCTCCTCAAGCTGCTG
CCGCTGCTATTGCTGCTTCTGCATCAACTTCCTCAGCCTCCATTCCTGATTCTACTGCTC
AGTCTCAGGTTCCTCCGTCTTCTTCTTCTTAAGTTTTCTTAGGAGTCCGCATGCATAGAG
AAGGGAGATGTGTGTCTTGGATACTGGATTTCATGAGCTACTAAGAAAGACAGCTTTGGA
CCGATCAACATATTCTCGATCTAAGTTGATTCTTCTGGATGATGTCTACGATATTTGGTT
CTCCTACGATAATTTAGTGAAAATTTTATGAGTAGGACTGTTAGTGAACTCTCAGTTGGT
GAGCTTTTA*TATCTTGTTATGCCATTTTGGTAC*ATATGTGCATGAATGAAACAGTGAG
TGA*CCTTGATGATGTA
T

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2FI92TF 701 0 0
CGGTTCTGTTCATTGGTGGTTGGGTTGATATTCGAGTAAGAATGAAGCCGGTGATAGGCA
CAGTGGTCTCGAACAAGATGCAGAAATCAGTAGTCGTAGCCGTGGACAGACTCTTCCACA
ACAAGCTCTACAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGACGAGAAAG
ACTCTTGCAACATCGGCGATCGAGTAAAGTTAGATCCTTCGAGACCGTTGAGCAAGAATA
AGCATTGGGTTGTTGCTGAGATCATCAGGAAAGCTCGCATCTATTCTCCTCAAGCTGCTG
CCGCTGCTATTGCTGCTTCTGCATCAACTTCCTCAGCCTCCATTCCTGATTCTACTGCTC
AGTCTCAGGTTCCTCCGTCTTCTTCTTCTTAAGTTTTCTTAGGAGTCCGCATGCATAGAG
AAGGGAGATGTGTGTCTTGGATACTGGATTTCATGAGTTACTAAGAAAGACAGCTTTGGA
CCGATCAACATATTCTCGATCTAAGTTGATTTTTCTGGATGATGTCTACGATATTTGGTT
CTCCTACGATAATTTAGTGAAAATTTTATGAGTAGGACTGTTAGTGAACTCTCAGTTGGT
GAGCTTTTAATATCTTGTTATGCCATTTTGGTACCATATGTGCATGAATGAAACAGTGAG
TGAACCTTGATGATGTAATGCTTCTTTATTCTACAAATGCA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2EX05JQ 553 0 0
TTCCACAACAAGCTCTACAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGAC
GAGAAAGACTCTTGCAACATCGGCGATCGAGTAAAGTTAGATCCTTCGAGACCGTTGAGC
AAGAATAAGCATTGGGTTGTTGCTGAGATCATCAAGAAAGCTCGCACCTATTCTCCTCAA
GCTGCTGCCGCTGCTATTGCTGCTTCTGCATCAACTTCCTCAGCCTCCATTCCTGATTCT
ACTGCTCAGTCTCAGGTTCCTCCGTCTTCTTCTTCTTAAGTTTTCTTAGGAGTCCGCATG
CATAGAGAAGGGAGATGTGTGTCTTGGATACTGGATTTCATGAGCTACTAAGAAAGACAG
CTTTGGACCGATCAACATATTCTCGATCTAAGTTGATTCTTCTGGATGATGTCTACGATA
TTTGGTTCTCCTACGATAATTTAGTGAAAATTTTATGAGTAGGACTGTTAGTGAACTCTC
AGTTGGTGAGCTTTTAATATCTTGTTATGCCATTTTGGTACCATATGTGCATGAATGAAA
CAGTGAGTGA
ACC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 4

CO CL2884Contig1 791 4 6 U
GGACATCCAAATCCAATAGCAACAAAAAAGGGTCTGCTCCTTAGTTTCATATACAATCTT
TAGCAATCTTAACAACATGGCAATGTTCATCAAGAACAAGAACATGGCCTTCTCACTGAT
CTTGATGTGTTTCATTGTGGTGTCTCCAATGGCTAATGCTCAATTTGGTGGGCTTCCTGG
GACTAATATCCTCAATATACAAGGGCTTGTCACGTGCTCTATCAATGGCAGCGTCTCTAC
TAATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCGCCGGTGTACCCGTTGTGCTTCAGTGTGCTGGGCA
AAATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGTATTCTCGTTTCCTTCCACTACAGT
ATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAGGGTCATCGTCACGGC
CCCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCTCACGGCACCGGTAAA
TCTCGTAGGAAGCTCCGTAACCGGCGGCATCAGCATCTTGCAATTCGTCAATGGCCTCTT
TAGGCTCCTCTAACTGATTTAAAACCAAGTATCCCTTCTTGGTATGGTTACGGTGTTTTT
CCTTTCTGTTGTTTTATGTTTTTGTGTCATGGCCATTAACATGTATGCTTACGTATGCAT
GCATGAAATAAGGTCTATTATGCGTATGTCTCTACTTTCAAAATATTGTGGTTGTAACTT
CTTGTCCAGGTCTTCATTTGCATGCATAGTGCTGCAATGAAATGAAACGAATGAAAATAA
AATAGTTTCCT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H427TF U 2
AF RR2FW01TF U 1
AF RR2BJ37TF U 1
AF RR2H427JQB C 344
BS 1 213 RR2BJ37TF
BS 214 214 RR2H427TF
BS 215 411 RR2BJ37TF
BS 412 412 RR2H427TF
BS 413 764 RR2BJ37TF
BS 765 791 RR2H427JQB

RD RR2H427TF 691 0 0
GACATCCAAATCCAATAGCAACAAAAAAGGGTCTGCTCCTTAGTTTCTTATACAATCTTT
AGCAATCTTAGCAACATGGCAATGTTCATCAAGAACAAGAACATGGCCTTCTCACTGATC
TTGATGTGTTTCATTGTGGTGTCCCCAATGGCTAATGCTCAATTTGGTGGGCTTCCTGGG
ACTAATATCCTCAATATACAAGGGCTTGTCACGTGCTCTATCAATGGCAGCGTCTCTACT
AATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCGCCGGTGTACCCGTTGTGCTTCAGTGTGTTGGGCAA
AATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGTATTCTCGTTTCCTTCCACTACAGTA
TTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAGGGTCATCGTCACGGCC
CCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCTCACGGCACCGGTAAAT
CTCGTAGGAAGCTCCGTAACCGGCGGCATCAGCATCTTGCAATTCGTCAATGGCCTCTTT
AGGCTCCTCTAACTGATTTAAAACCAAGTATCCCTTCTTGGTATGGTTACAGTGTTTTTC
CTTTCTGTTGTTTTATGTTTTTGTGTCATGGCCATTAACATGTATGCTTACGTATGCATG
CATGAAATAAG*TCTATTATGCGTATGTCTC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2FW01TF 720 0 0
G
GACATCCAAATCCAATAGCAACAAAAAAGGGTCTGCTCCTTAGTTTCATATACAATCTTT
AGCAATCTTAACAACATGGCAATGTTCATCAAGAACAAGAACATGGCCTTCTCACTGATC
TTGATGTGTTTCATTGTGGTGTCTCCAATGGCTAATGCTCAATTTGGTGGGCTTCCTGGG
ACTAATATCCTCAATATACAAGGGCTTGTCACGTGCTCTATCAATGGCAGCGTCTCTACT
AATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCACCGGTGTACCCGTTGTGCTTCAGTGTGCTGGGCAA
AATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGTATTCTCGTTTCCTTCCACTACAGTA
TTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAGGGTCATTGTCACGGCC
CCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCTCACGGCACCTGTAAAT
CTCGTAGGAAGCGCCGTAACCGGCGGCATCAGCATCTTGCAATTCGTCACTGGCCTCTTT
AGGCTCCTCTAACTGATCTAAAACCAAGTATCCCTTCTTGGTATGGTTACGGTGTTTTTC
CTTTCTGTTGTTTTATGTTTTTGTGTCATGGCCATTAACATGTATGCTTACGTATGCATG
CATGAAATAAG*TCTATTATGCGTATGTCTCTACTTTCAAAGTATTGTGGTTGTA
CTTC

QA 2 716 2 716
DS 

RD RR2BJ37TF 764 0 0
GGACATCCAAATCCAATAGCAACAAAAAAGGGTCTGCTCCTTAGTTTCATATACAATCTT
TAGCAATCTTAACAACATGGCAATGTTCATCAAGAACAAGAACATGGCCTTCTCACTGAT
CTTGATGTGTTTCATTGTGGTGTCTCCAATGGCTAATGCTCAATTTGGTGGGCTTCCTGG
GACTAATATCCTCAATATACAAGGGCTTGTCACATGCTCTATCAATGGCAGCGTCTCTAC
TAATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCGCCGGTGTACCCGTTGTGCTTCAGTGTGCTGGGCA
AAATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGTATTCTCGTTTCCTTCCACTACAGT
ATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAGGGTCATTGTCACGGC
CCCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCTCACGGCACCGGTAAA
TCTCGTAGGAAGCTCCGTAACCGGCGGCATCAGCATCTTGCAATTCGTCAATGGCCTCTT
TAGGCTCCTCTAACTGATTTAAAACCAAGTATCCCTTCTTGGTATGGTTACGGTGTTTTT
CCTTTCTGTTGTTTTATGTTTTTGTGTCATGGCCATTAACATGTATGCTTACGTATGCAT
GCATGAAATAAGGTCTATTATGCGTATGTCTCTACTTTCAAAATATTGTGGTTGTAACTT
CTTGTCCAGGTCTTCATTTGCATGCATAGTGCTGCAATGAAATG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2H427JQB 448 0 0
TTTCCTTCCACTACAGTATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGT
AGGGTCATCGTCACGGCCCCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTC
CTCACGGCACCGGTAAATTTCGTAGGAAGCTCCGTAACCGGCGGCATCAGCATCTTGCAA
TTCGTCAATGGCCTCTTTAGGCTCCTCTAACTGATTTAAAACCAAGTATCCCTTCTTGGT
ATGGTTACGGTGTTTTTCCTTTCTGTTGTTTTATGTTTTTGTGTCATGGCCATTAACATG
TATGCTTACGTATGCATGCATGAAATAAGGTCTATTATGCGTATGTCTCTACTTTCAAAA
TATTGTGGTTGTAACTTCTTGTCCAGGTCTTCATTTGCATGCATAGTGCTGCAATGAAAT
GAAACGAATGAAAATAAAATAGTTTCCT

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 4

CO CL2885Contig1 712 4 7 U
GGAGAACTCAAAAACTCTTCTTTGGTCTGCAATGGCCGAAGCTTCTAATCCCGACAACGG
TAAAGAGAACCCGACATTCAAGATCCGAAGACTAGAGACCTCCGACAAGAGAAAGGGATA
CCTGGAGCTTCTCGGTCAACTCACCGTCGCCGGGCCATTAACCGACGACGAATTCGATCG
GCGATTCGAAGAGATCAGGTCCTACGGAGACGACCACTTCATCTGCGTGATCGAAGAGGA
GTCTTCGGGG*AAGATCGTGGCGACGGGGAGCGTAATGATAGAGAAGAAGTTCCTGAGGA
GCTGCGGGAAAGTCGGGCACGTAGAGGACGTGGTCGTGGACTCGGAGTTTCGCGGGAAGC
ATCTTGGGAAGAGAGTTGTTGAGTTTCTGACGGAACATAGCAGGTCTATGGGTTGCTACA
AGGTGATGCTTGATTGTAGCATGGAGAAGAAAGGGTTCTACGAGAAGTGTGGGATGTTCA
ATAGAGCGATTCAGATGACCAAGTACTTCGATTGAACACTCTCTCCGATCATTATCATAT
TGTTTGATTACTTCGATTGAACACTTTCCCTCCTGCTTCATCTTCCTTCTCTGGTCACCA
TCAGTCCCCTTTTCCACACTTTCCCAATTATGTATCATCTTCGTTTTCTTTCCTCGGCAT
TCTCACTTGTTGCCTGTTGTAATTTCAATTTCTATAATATTATTCCTTGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GL88JQ C 103
AF RR2GD69TF U 1
AF RR2GL88TF U 1
AF RR2GD69JQ C 150
BS 1 67 RR2GD69TF
BS 68 68 RR2GL88TF
BS 69 98 RR2GD69TF
BS 99 99 RR2GL88TF
BS 100 123 RR2GD69TF
BS 124 124 RR2GL88TF
BS 125 712 RR2GD69TF

RD RR2GL88JQ 453 0 0
GACAAGAGA
AAAGGGATACCTGGAGCTTCTCGGTCAACTCACCGTCGCCGGGCCATTAACCGACGACGA
ATTCGATCGGCGATTCGAAGAGATCAGGTCCTACGGAGACGACCACTTCATCTGCGTGAT
CGAAGAGGAGTCTTCGGGGGAAGATCGTGGCGACGGGGAGCGTAATGATAGAGAAGAAGT
TCCTGAGGAGTTGCGGGAAAGTCGGGCACGTAGAGGACGTGGTCGTGGACTCGGAGTTTC
GCGGGAAGCATCTTGGGAAGAGAGTTGTTGAGTTTCTGACGGAACATAGCAGGTCTATGG
GTTGCTACAAGGTGATGCTTGATTGTAGCATGGAGAAGAAAGGGTTCTACGAGAAGTGTG
GGATGTTCAATAGAGCGATTCAGATGACCAAGTACTTCGATTGAACACTCTCTCCGATCA
TTATCATATTGTTTGATTACTTCG

QA 10 453 10 453
DS 

RD RR2GD69TF 712 0 0
GGAGAACTCAAAAACTCTTCTTTGGTCTGCAATGGCCGAAGCTTCTAATCCCGACAACGG
TAAAGAGGACCCGACATTCAAGATCCGAAGACTAGAGATCTCCGACAAGAGAAAGGGATA
CCTTGAGCTTCTCGGTCAACTCACCGTCGCCGGGCCATTAACCGACGACGAATTCGATCG
GCGATTCGAAGAGATCAGGTCCTACGGAGACGACCACTTCATCTGCGTGATCGAAGAGGA
GTCTTCGGGG*AAGATCGTGGCGACGGGGAGCGTAATGATAGAGAAGAAGTTCCTGAGGA
GCTGCGGGAAAGTCGGGCACGTAGAGGACGTGGTCGTGGACTCGGAGTTTCGCGGGAAGC
ATCTTGGGAAGAGAGTTGTTGAGTTTCTGACGGAACATAGCAGGTCTATGGGTTGCTACA
AGGTGATGCTTGATTGTAGCATGGAGAAGAAAGGGTTCTACGAGAAGTGTGGGATGTTCA
ATAGAGCGATTCAGATGACCAAGTACTTCGATTGAACACTCTCTCCGATCATTATCATAT
TGTTTGATTACTTCGATTGAACACTTTCCCTCCTGCTTCATCTTCCTTCTCTGGTCACCA
TCAGTCCCCTTTTCCACACTTTCCCAATTATGTATCATCTTCGTTTTCTTTCCTCGGCAT
TCTCACTTGTTGCCTGTTGTAATTTCAATTTCTATAATATTATTCCTTGTCC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2GL88TF 704 0 0
GGAGAACTCAAAAACTCTTCTTTGGTCTGCAATGGCCGAAGCTTCTAATCCCGACAACGG
TAAAGAGAACCCGACATTCAAGATCCGAAGACTAGAGACCTCCGACAAGAGAAAGGGATA
CCTGGAGCTTCTCGGTCAACTCACCGTCGCCGGGCCATTAACCGACGACGAATTCGATCG
GCGATTCGAAGAGATCAGGTCCTACGGAGACGACCACTTCATCTGCGTGATCGAAGAGGA
GTCTTCGGGG*AAGATCGTGGCGACGGGGAGCGTAATGATAGAGAAGAAGTTCCTGAGGA
GTTGCGGGAAAGTCGGGCACGTAGAGGACGTGGTCGTGGACTCGGAGTTTCGCGGGAAGC
ATCTTGGGAAGAGAGTTGTTGAGTTTCTGACGGAACATAGCAGGTCTATGGGTTGCTACA
AGGTGATGCTTGATTGTAGCATGGAGAAGAAAGGGTTCTACGAGAAGTGTGGGATGTTCA
ATAGAGCGATTCAGATGACCAAGTACTTCGATTGAACACTCTCTCCGATCATTATCATAT
TGTTTGATTACTTCGATTGAACACTTTCCCTCCTGCTTCATCTTCCTTCTCTGGTCACCA
TCAGTCCCCTTTTCCACACTTTCCCAATTATGTATCATCTTCGTTTTCTTTCCTCGGCAT
TCTCACTTGTTGCCTGTTGTAATTTCAATTTCTATAATATTATT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2GD69JQ 563 0 0
CCGGGCCATTAACCGACGACGAATTCGATCGGCGATTCGAAGAGATCAGGTCCTACGGAG
ACGACCACTTCATCTGCGTGATCGAAGAGGAGTCTTCGGGG*AAGATCGTGGCGACGGGG
AGCGTAATGATAGAGAAGAAGTTCCTGAGGAGCTGCGGGAAAGTCGGGCACGTAGAGGAC
GTGGTCGTGGACTCGGAGTTTCGCGGGAAGCATCTTGGGAAGAGAGTTGTTGAGTTTCTG
ACGGAACATAGCAGGTCTATGGGTTGCTACAAGGTGATGCTTGATTGTAGCATGGAGAAG
AAAGGGTTTTACGAGAAGTGTGGGATGTTCAATAGAGCGATTCAGATGACCAAGTACTTC
GATTGAACACTCTCTCCGATCATTATCATATTGTTTGATTACTTCGATTGAACACTTTCC
CTCCTGCTTCATCTTCCTTCTCTGGTCACCATCAGTCCCCTTTTCCACACTTTCCCAATT
ATGTATCATCTTCGTTTTCTTTCCTCGGCATTCTCACTTGTTGCCTGTTGTAATTTCAAT
TTCTATAATATTATTCCTTGTCC

QA 1 563 1 563
DS 



AS 2 4

CO CL2886Contig1 800 2 2 U
GGCCAACTTCTAAATCAGAAGTCTTTTCAACTGCTGCTGATGGTCAGACAAGCGTTGAGA
TTAATGTGCTACAGGGCGAGAGGGAGTTTGTTAAGGATAACAAGTCTCTCGGCAGTTTCC
GTCTAGATGGTATTCCACCAGCACCACGTGGAGTTCCACAGATCGAAGTCAAATTTGACA
TTGATGCCAATGGAATCCTCTCCGTCAGTGCTAGTGACAAAGGCACCGGAAAGAAACAAG
ACATTACCATTACTGGTGCCAGTACATTGCCCAAGGATGAGGTAGACCAGATGGTCCAGG
AAGCAGAAAGGTTTGCAAAGGATGACAAGGAGAAGAGAGACGCAATTGACACAAAGAACC
AGGCGGATTCAGTTGTGTACCAGACAGAGAAGCAACTTAAAGAACTTGGAGAGAAAATCC
CAGGTGAAGTGAAAGGGAAGGTGGAGGCCAAGCTACAAGAGCTTAAAGACAAGATTGCAA
GTGGAACGACCCAAGAGATCAAGGACACCATGGCTGCTCTCAACCAAGAAGTGATGCAGA
TCGGTCAGTCTATGTACAACCAGCCTGGAGCTGGAGCAGGTGCAGGTCCTTCCCCTGGTG
GTGAAGATGCTTCATCAGCAGATTCATCAAAAAGTAAAGATGGAGATGATGTGATCGATG
CTGACTTCACTGACAGCCAATGAGGAAAACAGAGTTAGGATGGTTTTGAGTTCATATGTA
TCCGTTGGTGTAAAAACGCATGATTTTGTTGGTTGGTTGGGTTGGGTTGAGACACGCATG
GATTAAGCAGTTCTTGTGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT16TF U 1
AF RR2AT16JQ C 1
BS 1 682 RR2AT16TF
BS 683 800 RR2AT16JQ

RD RR2AT16TF 682 0 0
GGCCAACTTCTAAATCAGAAGTCTTTTCAACTGCTGCTGATGGTCAGACAAGCGTTGAGA
TTAATGTGCTACAGGGCGAGAGGGAGTTTGTTAAGGATAACAAGTCTCTCGGCAGTTTCC
GTCTAGATGGTATTCCACCAGCACCACGTGGAGTTCCACAGATCGAAGTCAAATTTGACA
TTGATGCCAATGGAATCCTCTCCGTCAGTGCTAGTGACAAAGGCACCGGAAAGAAACAAG
ACATTACCATTACTGGTGCCAGTACATTGCCCAAGGATGAGGTAGACCAGATGGTCCAGG
AAGCAGAAAGGTTTGCAAAGGATGACAAGGAGAAGAGAGACGCAATTGACACAAAGAACC
AGGCGGATTCAGTTGTGTACCAGACAGAGAAGCAACTTAAAGAACTTGGAGAGAAAATCC
CAGGTGAAGTGAAAGGGAAGGTGGAGGCCAAGCTACAAGAGCTTAAAGACAAGATTGCAA
GTGGAACGACCCAAGAGATCAAGGACACCATGGCTGCTCTCAACCAAGAAGTGATGCAGA
TCGGTCAGTCTATGTACAACCAGCCTGGAGCTGGAGCAGGTGCAGGTCCTTCCCCTGGTG
GTGAAGATGCTTCATCAGCAGATTCATCAAAAAGTAAAGATGGAGATGATGTGATCGATG
CTGACTTCACTGACAGCCAATG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2AT16JQ 800 0 0
GGCCAACTTCTAAATCAGAAGTCTTTTCAACTGCTGCTGATGGTCAGACAAGCGTTGAGA
TTAATGTGCTACAGGGCGAGAGGGAGTTTGTTAAGGATAACAAGTCTCTCGGCAGTTTCC
GTCTAGATGGTATTCCACCAGCACCACGTGGAGTTCCACAGATCGAAGTCAAATTTGACA
TTGATGCCAATGGAATCCTCTCCGTCAGTGCTAGTGACAAAGGCACCGGAAAGAAACAAG
ACATTACCATTACTGGTGCCAGTACATTGCCCAAGGATGAGGTAGACCAGATGGTCCAGG
AAGCAGAAAGGTTTGCAAAGGATGACAAGGAGAAGAGAGACGCAATTGACACAAAGAACC
AGGCGGATTCAGTTGTGTACCAGACAGAGAAGCAACTTAAAGAACTTGGAGAGAAAATCC
CAGGTGAAGTGAAAGGGAAGGTGGAGGCCAAGCTACAAGAGCTTAAAGACAAGATTGCAA
GTGGAACGACCCAAGAGATCAAGGACACCATGGCTGCTCTCAACCAAGAAGTGATGCAGA
TCGGTCAGTCTATGTACAACCAGCCTGGAGCTGGAGCAGGTGCAGGTCCTTCCCCTGGTG
GTGAAGATGCTTCATCAGCAGATTCATCAAAAAGTAAAGATGGAGATGATGTGATCGATG
CTGACTTCACTGACAGCCAATGAGGAAAACAGAGTTAGGATGGTTTTGAGTTCATATGTA
TCCGTTGGTGTAAAAACGCATGATTTTGTTGGTTGGTTGGGTTGGGTTGAGACACGCATG
GATTAAGCAGTTCTTGTGAC

QA 1 800 1 800
DS 



CO CL2886Contig2 806 2 2 U
GCAAGTCTCTCGGCAGTTTCCGTCTAGATGGTATTCCACCAGCACCACGTGTAGTTCCAC
AGATCGAAGTTAAATTTGACATTGACGCCAATGGAATCCTCTCCGTCAGTGCTAGTGACA
AAGGCGGAAAGAAACAAGACATTACCATTACTGGTGCCAGTACATTGCCCAAGGACGAGG
TAGACCAGATGGTTCAGGAAGCAGAAAGGTTTGCAAAGGATGACAAGGAGAAGAGAGACG
CAATTGACACAAAGAACCAGGCGGATTCAGTTGTGTACCAGACAGAGAAGCAACTTAAAG
AACTCGGAGAAAAAATTCCAGGTGAAGTGAAAGGAAAGGTGGAGGCTAAGCTACAAGAGC
TTAAAGACAAGATTGCAAGTGGAACGACCCAAGAGATCAAAGACACCATGGCTGCTCTCA
ACCAAGAAGTGATGCAGATCGGTCAGTCTATGTACAACCAGCCTGGAGCAGGAGCAGGTG
CAGGTGCAGGTCCTTCCCCTGGTAGTGAAGATGCTTCATCAGCAGATTCATCAAAAAGTA
AAGATGGAGATGATGTGATCGACGCTGACTTCAGTGACAGCCAATGAGGAAAACAGAGTT
AGGATGGTTTTGAGTTCATATGTATCCGTTGGTGTAAAAACGCATGATTTTGTTGGTTGG
TTGGGTTGAGAAACGCATGGATTAAGCAGTTCTTGTGATAAAACGATTATTTGTCGTTAG
AAAGCAATGTGTTGCAGTCCAATGCCTACTAGTATGTTGCAGTCCGGTCTCTTCAAGATG
CTTCAGTGGACTTAAACTTAATAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV48TF U 1
AF RR2AV48JQ C 74
BS 1 754 RR2AV48TF
BS 755 806 RR2AV48JQ

RD RR2AV48TF 754 0 0
GCAAGTCTCTCGGCAGTTTCCGTCTAGATGGTATTCCACCAGCACCACGTGTAGTTCCAC
AGATCGAAGTTAAATTTGACATTGACGCCAATGGAATCCTCTCCGTCAGTGCTAGTGACA
AAGGCGGAAAGAAACAAGACATTACCATTACTGGTGCCAGTACATTGCCCAAGGACGAGG
TAGACCAGATGGTTCAGGAAGCAGAAAGGTTTGCAAAGGATGACAAGGAGAAGAGAGACG
CAATTGACACAAAGAACCAGGCGGATTCAGTTGTGTACCAGACAGAGAAGCAACTTAAAG
AACTCGGAGAAAAAATTCCAGGTGAAGTGAAAGGAAAGGTGGAGGCTAAGCTACAAGAGC
TTAAAGACAAGATTGCAAGTGGAACGACCCAAGAGATCAAAGACACCATGGCTGCTCTCA
ACCAAGAAGTGATGCAGATCGGTCAGTCTATGTACAACCAGCCTGGAGCAGGAGCAGGTG
CAGGTGCAGGTCCTTCCCCTGGTAGTGAAGATGCTTCATCAGCAGATTCATCAAAAAGTA
AAGATGGAGATGATGTGATCGACGCTGACTTCAGTGACAGCCAATGAGGAAAACAGAGTT
AGGATGGTTTTGAGTTCATATGTATCCGTTGGTGTAAAAACGCATGATTTTGTTGGTTGG
TTGGGTTGAGAAACGCATGGATTAAGCAGTTCTTGTGATAAAACGATTATTTGTCGTTAG
AAAGCAATGTGTTGCAGTCCAATGCCTACTAGTA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2AV48JQ 733 0 0
ATTTGACATTGACGCCAATGGAATCCTCTCCGTCAGTGCTAGTGACAAAGGCGGAAAGAA
ACAAGACATTACCATTACTGGTGCCAGTACATTGCCCAAGGACGAGGTAGACCAGATGGT
TCAGGAAGCAGAAAGGTTTGCAAAGGATGACAAGGAGAAGAGAGACGCAATTGACACAAA
GAACCAGGCGGATTCAGTTGTGTACCAGACAGAGAAGCAACTTAAAGAACTCGGAGAAAA
AATTCCAGGTGAAGTGAAAGGAAAGGTGGAGGCTAAGCTACAAGAGCTTAAAGACAAGAT
TGCAAGTGGAACGACCCAAGAGATCAAAGACACCATGGCTGCTTTCAACCAAGAAGTGAT
GCAGATCGGTCAGTCTATGTACAACCAGCCTGGAGCAGGAGCAGGTGCAGGTGCAGGTCC
TTCCCCTGGTAGTGAAGATGCTTCATCAGCAGATTCATCAAAAAGTAAAGATGGAGATGA
TGTGATCGACGCTGACTTCAGTGACAGCCAATGAGGAAAACAGAGTTAGGATGGTTTTGA
GTTCATATGTATCCGTTGGTGTAAAAACGCATGATTTTGTTGGTTGGTTGGGTTGAGAAA
CGCATGGATTAAGCAGTTCTTGTGATAAAACGATTATTTGTCGTTAGAAAGCAATGTGTT
GCAGTCCAATGCCTACTAGTATGTTGCAGTCCGGTCTCTTCAAGATGCTTCAGTGGACTT
AAACTTAATAGAG

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 4

CO CL2887Contig1 944 4 8 U
TTTTTTCACGATTTCTTTAACTTTTCATGCTTTGTACAGCAGAACAAAAGTAAACAACTA
TCAATTTCAACGATTCAGATGAATATAAAGCAGAGTTTTAGAAGGAAATTAAGCAGGTTT
GCGTTTTCGAACACGGCGAGTTCTCCCTTAGGAACTCGTGTGAAAACTGAAACGGGCACA
ACTACAAAACCCTAATCTCAGTTTCTGTGCTCTGTTTGGTAGTCAAAGTTTGGATCCTTT
TTTTAGAATCTGTGTTGAAGAGGTAGAAAGAGATGAACAGAGGAAGGAGGAATCTGAAAC
AAGCGGCCTCAGAGCAGGAATTCACGCTTGAGGAATGTCAGAGCATCGCTCAGGTCGTCT
CTCTCAGAGGTTCCAATCAAATTGAGATAATGGATGCAAAAGGAGAGAACTCATTAGCAC
TGTTTCCAGCCAAGTTTCGTGAGAGCATGTGGATCAGACGAGGAAGCTTTGTGGTGATTG
ACCATACAGGAAAGGAACAGGCGCAAGAAGCTGGTAGCAAAGTTACATCTATTGTCTGTA
AAGTTCTCTTCTTTGACCAAATCCGTCTCCTTCAAAAGTCTCCGGAATGGCCAGAAATCT
TCAGGGATGCTAAGGCAATTCCAGCAGATGAAAGCTCTCAAATTCCCGTGGTAAATCAAG
ATGCTGACGGTGAAATAGGTTCGAGTGATGATGGGATGCCTCCACTGGAAGCAAACACAA
ACAGGTTGAGACCGTTTGGGGTGCAGTGTGATGCAGAAACAGATTCTGGATCAGATTCTG
ACTCATAGAAACATCCGCCGGTACATGCTTTTCTCTTGTTTCTCAAGAGAGGGAACACTA
ATAGTTGTGAGATGTCTCCTCTCTTATTATTAAACAGTATGTAACCGACACAGAGCTGCT
TCAAAATGCAGAGCTTTGATTTTGCAATGAATTGTTTATTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED06TF U 1
AF RR2CP53TF U 113
AF RR2CP53JQ C 241
AF RR2ED06JQ C 242
BS 1 625 RR2ED06TF
BS 626 626 RR2CP53TF
BS 627 670 RR2ED06TF
BS 671 724 RR2CP53TF
BS 725 725 RR2CP53JQ
BS 726 795 RR2CP53TF
BS 796 927 RR2CP53JQ
BS 928 944 RR2ED06JQ

RD RR2ED06TF 670 0 0
TTTTTTCACGATTTCTTTAACTTTTCATGCTTTGTACAGCAGAACAAAAGTAAACAACTA
TCAATTTCAACGATTCAGATGAATATAAAGCAGAGTTTTAGAAGGAAATTAAGCAGGTTT
GCGTTTTCGAACACGGCGAGTTCTCCCTTAGGAACTCGTGTGAAAACTGAAACGGGCACA
ACTACAAAACCCTAATCTCAGTTTCTGTGCTCTGTTTGGTAGTCAAAGTTTGGATCCTTT
TTTTAGAATCTGTGTTGAAGAGGTAGAAAGAGATGAACAGAGGAAGGAGGAATCTGAAAC
AAGCGGCCTCAGAGCAGGAATTCACGCTTGAGGAATGTCAGAGCATCGCTCAGGTCGTCT
CTCTCAGAGGTTCCAATCAAATTGAGATAATGGATGCAAAAGGAGAGAACTCATTAGCAC
TGTTTCCAGCCAAGTTTCGTGAGAGCATGTGGATCAGACGAGGAAGCTTTGTGGTGATTG
ACCATACAGGAAAGGAACAGGCGCAAGAAGCTGGTAGCAAAGTTACATCTATTGTCTGTA
AAGTTCTCTTCTTTGACCAAATCCGTCTCCTTCAAAAGTCTCCGGAATGGCCAGAAATCT
TCAGGGATGCTAAGGCAATTCCAGCTGATGAAAGCTCTCAAATTCCCGTGGTAAATCAAG
ATGCTGACGG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2CP53TF 683 0 0
GG
AGGTTTGCGTTTTCGAACACGGCGAGTTCTCCCTTAGGAACTCGTGTGAAAACTGAAACG
GGCACAACTACAAAACCCTAATCTCAGTTTCTGTGCTCTGTTTGGTAGTCAAAGTTTGGA
TCCTTTTTTTAGAATCTGTGTTGAAGAGGTAGAAAGAGATGAACAGAGGAAGGAGGAATC
TGAAACAAGCGGCCTCAGAGCAGGAATTCACGCTTGAGGAATGTCAGAGCATCGCTCAGG
TCGTCTCTCTCAGAGGTTCCAATCAAATTGAGATAATGGATGCAAAAGGAGAGAACTCAT
TAGCACTGTTTCCAGCCAAGTTTCGTGAGAGCATGTGGATCAGACGAGGAAGCTTTGTGG
TGATTGACCATACAGGAAAGGAACAGGCGCAAGAAGCTGGTAGCAAAGTTACATCTATTG
TCTGTAAAGTTCTCTTCTTTGACCAAATCCGTCTCCTTCAAAAGTCTCCGGAATGGCCAG
AAATCTTCAGGGATGCTAAGGCAATTCCAGCAGATGAAAGCTCTCAAATTCCCGTGGTAA
ATCAAGATGCTGACGGTGAAATAGGTTCGAGTGATGATGGGATGCCTCCACTGGAAGCAA
ACACAAACAG*TTGAGACCGTTTGGGGTGCAGTGTGATGCAGAAACAGATTCTGGATCAG
ATTCTGACTCATAGAAACATC

QA 3 683 3 683
DS 

RD RR2CP53JQ 690 0 0
T
TTTAGAATCTGTGTTGAAGAGGTAGAAAGAGATGAACAGAGGAAGGAGGAATCTGAAACA
AGCGGCCTCAGAGCAGGAATTCACGCTTGAGGAATGTCAGAGCATCGCTCAGGTCGTCTC
TCTCAGAGGTTCCAATCAAATTGAGATAATGGATGCAAAAGGAGAGAACTCATTAGCACT
GTTTCCAGCCAAGTTTCGTGAGAGCATGTGGATCAGACGAGGAAGCTTTGTGGTGATTGA
CCATACAGGAAAGGAACAGGCGCAAGAAGCTGGTAGCAAAGTTACATCTATTGTCTGTAA
AGTTTTCTTCTTTGACCAAATCCGTCTCCTTCAAAAGTTTCCGGAATGGCCAGAAATCTT
CAGGGATGCTAAGGCAATTCCAGCAGATGAAAGCTCTCAAATTCCCGTGGTAAATCAAGA
TGCTGACGGTGAAATAGGTTCGAGTGATGATGGGATGCCTCCACTGGAAGCAAACACAAA
CAGGTTGAGACCGTTTGGGGTGCAGTGTGATGCAGAAACAGATTCTGGATCAGATTCTGA
CTCATAGAAACATCCGCCGGTACATGCTTTTCTCTTGTTTCTCAAGAGAGGGAACACTAA
TAGTTGTGAGATGTCTCCTCTCTTATTATTAAACAGTATGTAACCGACACAGAGCTGCTT
CAAAATGCAGAGCTTTGATTTTGCAA
ATG

QA 2 687 2 687
DS 

RD RR2ED06JQ 703 0 0
TTTAGAATCTGTGTTGAAGAGGTAGAAAGAGATGAACAGAGGAAGGAGGAATCTGAAACA
AGCGGCCTCAGAGCAGGAATTCACGCTTGAGGAATGTCAGAGCATCGCTCAGGTCGTCTC
TCTCAGAGGTTCCAATCAAATTGAGATAATGGATGCAAAAGGAGAGAACTCATTAGCACT
GTTTCCAGCCAAGTTTCGTGAGAGCATGTGGATCAGACGAGGAAGCTTTGTGGTGATTGA
CCATACAGGAAAGGAACAGGCGCAAGAAGCTGGTAGCAAAGTTACATCTATTGTCTGTAA
AGTTCTCTTCTTTGACCAAATCCGTCTCCTTCAAAAGTCTCCGGAATGGCCAGAAATCTT
CAGGGATGCTAAGGCAATTCCAGCTGATGAAAGCTCTCAAATTCCCGTGGTAAATCAAGA
TGCTGACGGTGAAATAGGTTCGAGTGATGATGGGATGCCTCCACTGGAAGCAAACACAAA
CAGGTTGAGACCGTTTGGGGTGCAGTGTGATGCAGAAACAGATTCTGGATCAGATTCTGA
CTCATAGAAACATCCGCCGGTACATGCTTTTCTCTTGTTTCTCAAGAGAGGGAACACTAA
TAGTTGTGAGATGTCTCCTCTCTTATTATTAAACAGTATGTAACCGACACAGAGCTGTTT
CAAAATGCAGAGTTTTGATTTTGCAATGAATTGTTTATTGACC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 4

CO CL2888Contig1 634 4 7 U
GGTAAATACGTAAGCTACTATTATCATATCATAACCACAATCAGGATACAATACAGAGCA
AAAGACTACAAAATAACATGACGAACTTTCCAACAACGAAATAAAAACAAGACAAAGCAG
GGTATGCTGAGGTCAGCGTACATAGGCCCCTCTTTATTTTACTTATGCTAGACCAAGCAC
TCTTAATCCTCAGGATGATGTATGAGTTCTCACTTCACTTGACGGTGTCGCAGTTAGTGC
TCATGGAGATGGGATAGGGAATGCTAACACCGCACTTTCCAGGAAGGCTAGAGACTAGAC
TGGGGTTGATGCTCTTTGCAGCGGCCTTTAGGCATTTGCATGCTTGTTGGCGGTCCGATG
TGGTTTGAGCCATACCATTCAGTTTTTTGACTCCCGCACAGCATGGAGGCGGCACCACCC
CACCTTTGGATAGGTAGCCGGCACATGGAACCAAGCTACTTGCCACTGTGCCACATGAGA
TTGCTGCATCTACTGATGCAACTATGCACACCGTCAACATAAGGCATGTGAAGAACCTCA
AAGCGAAGGCCATTGTCTCTTTTGTAATAAGAAAATAGGAAAATTTAGTTTACTTTTCTG
TGTGTTTAAGCTTGTGTTTTGCTGTTGGATATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RR2BJ83JQ U 1
AF RR2BJ83TF C 1
AF RR2AV80JQ U 9
AF RR2AV80TF C 9
BS 1 293 RR2BJ83JQ
BS 294 294 RR2AV80JQ
BS 295 319 RR2BJ83JQ
BS 320 320 RR2AV80JQ
BS 321 357 RR2BJ83JQ
BS 358 358 RR2AV80JQ
BS 359 634 RR2BJ83JQ

RD RR2BJ83JQ 634 0 0
GGTAAATACGTAAGCTACTATTATCATATCATAACCACAATCAGGATACAATACAGAGCA
AAAGACTACAAAATAACATGACGAACTTTCCAACAACGAAATAAAAACAAGACAAAGCAG
GGTATGCTGAGGTCAGCGTACATAGGCCCCTCTTTATTTTACTTATGCTAGACCAAGCAC
TCTTAATCCTCAGGATGATGTATGAGTTCTCACTTCACTTGACGGTGTCGCAGTTAGTGC
TCATGGAGATGGGATAGGGAATGCTAACACCGCACTTTCCAGGAAGGCTAGAGGCTAGAC
TGGGGTTGATGCTCTTTGCGGCGGCCTTTAGGCATTTGCATGCTTGTTGGCGGTCCGGTG
TGGTTTGAGCCATACCATTCAGTTTTTTGACTCCCGCACAGCATGGAGGCGGCACCACCC
CACCTTTGGATAGGTAGCCGGCACATGGAACCAAGCTACTTGCCACTGTGCCACATGAGA
TTGCTGCATCTACTGATGCAACTATGCACACCGTCAACATAAGGCATGTGAAGAACCTCA
AAGCGAAGGCCATTGTCTCTTTTGTAATAAGAAAATAGGAAAATTTAGTTTACTTTTCTG
TGTGTTTAAGCTTGTGTTTTGCTGTTGGATATCC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2BJ83TF 634 0 0
GGTAAATACGTAAGCTACTATTATCATATCATAACCACAATCAGGATACAATACAGAGCA
AAAGACTACAAAATAACATGACGAACTTTCCAACAACGAAATAAAAACAAGACAAAGCAG
GGTATGCTGAGGTCAGCGTACATAGGCCCCTCTTTATTTTACTTATGCTAGACCAAGCAC
TCTTAATCCTCAGGATGATGTATGAGTTCTCACTTCACTTGACGGTGTCGCAGTTAGTGC
TCATGGAGATGGGATAGGGAATGCTAACACCGCACTTTCCAGGAAGGCTAGAGGCTAGAC
TGGGGTTGATGCTCTTTGCGGCGGCCTTTAGGCATTTGCATGCTTGTTGGCGGTCCGGTG
TGGTTTGAGCCATACCATTCAGTTTTTTGACTCCCGCACAGCATGGAGGCGGCACCACCC
CACCTTTGGATAGGTAGCCGGCACATGGAACCAAGCTACTTGCCACTGTGCCACATGAGA
TTGCTGCATCTACTGATGCAACTATGCACACCGTCAACATAAGGCATGTGAAGAACCTCA
AAGCGAAGGCCATTGTCTCTTTTGTAATAAGAAAATAGGAAAATTTAGTTTACTTTTCTG
TGTGTTTAAGCTTGTGTTTTGCTGTTGGATATCC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2AV80JQ 626 0 0
CGTAAGCTACTATTATCATATCATAACCACAATCAGGATACAATACAGAGCAAAAGACTA
CAAAATAACATGACGAACTTTCCAACAACGAAATAAAAACAAGACAAAGCAGGGTATGCT
GAGGTCAGCGTACATAGGCCCCTCTTTATTTTACTTATGCTAGACCAAGCACTCTTAATC
CTCAGGATGATGTATGAGTTCTCACTTCACTTGACGGTGTCG*AGTTAGTGCTCATGGAG
ATGGGATAGGGAATGCTAACACCGCACTTTCCAGGAAGGCTAGAGACTAGACTGGGGTTG
ATGCTCTTTGCAGCGGCCTTTAGGCATTTGCATGCTTGTTGGCGGTCCGATGTGGTTTGA
GCCATACCATTCAGTTTTTTGACTCCCGCACAGCATGGAGGCGGCACCACCCCACCTTTG
GATAGGTAGCCGGCACATGGAACCAAGCTACTTGCCACTGTGCCACATGAGATTGCTGCA
TCTACTGATGCAACTATGCACACCGTCAACATAAGGCATGTGAAGAACCTCAAAGCGAAG
GCCATTGTCTCTTTTGTAATAAGAAAATAGGAAAATTTAGTTTACTTTTCTGTGTGTTTA
AGCTTGTGTTTTGCTGTTGGATATCC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2AV80TF 626 0 0
CGTAAGCTACTATTATCATATCATAACCACAATCAGGATACAATACAGAGCAAAAGACTA
CAAAATAACATGACGAACTTTCCAACAACGAAATAAAAACAAGACAAAGCAGGGTATGCT
GAGGTCAGCGTACATAGGCCCCTCTTTATTTTACTTATGCTAGACCAAGCACTCTTAATC
CTCAGGATGATGTATGAGTTCTCACTTCACTTGACGGTGTCG*AGTTAGTGCTCATGGAG
ATGGGATAGGGAATGCTAACACCGCACTTTCCAGGAAGGCTAGAGACTAGACTGGGGTTG
ATGCTCTTTGCAGCGGCCTTTAGGCATTTGCATGCTTGTTGGCGGTCCGATGTGGTTTGA
GCCATACCATTCAGTTTTTTGACTCCCGCACAGCATGGAGGCGGCACCACCCCACCTTTG
GATAGGTAGCCGGCACATGGAACCAAGCTACTTGCCACTGTGCCACATGAGATTGCTGCA
TCTACTGATGCAACTATGCACACCGTCAACATAAGGCATGTGAAGAACCTCAAAGCGAAG
GCCATTGTCTCTTTTGTAATAAGAAAATAGGAAAATTTAGTTTACTTTTCTGTGTGTTTA
AGCTTGTGTTTTGCTGTTGGATATCC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 4

CO CL2889Contig1 1173 4 5 U
GACAGCTGTTTCAGATGCAAGCCAAGGAAAATCTGAAAGTGTACAAACGGCTCAGGAGTC
AAATGGAGTGACGCAACATAAAGATGTCTCTGGTGCTGAACTGAAAGCAGTAGATGCTGA
AAGAGATGATTTGCCTAATGGAGACTCTAGCCCAAAGACATCAGTAGTTGCAGATGGAGA
AAAGCAAGAAGCATGCGAGGCGCAGCAAAAGGAGATGAGCAAGAAGCTCTCTGCTTCTGC
ACCACCCTATACCCCAACGACCATTCCAATTTTTGGATCGATAGCAGTTCCAGGATTTAA
CGACCATGTGGGAATCCTTCCCTCACCAATGAACATACCGCCAATGCTTCCTGTAAACCA
TGTCCGGAGGTCAACTCCTCATCAGTCTGTAACAGCTCGAGTTCCTTATGGGCCAAGGCT
CTCAGGTGGTGGTTACAACCGATCTGGAAACCGGGTTCCTCGCAACAAACCAAGCTTCCC
CAGTATCGCTGAGTCCAATGGAGAGGCTAATCAGTTCATTGGCCCAAGAATAATGAACCC
TCATGCGGCTGAGTTCATACCGAGTCAACCATGGGCTTCTAATGGTTATCCAGTGTCACC
AAACGGATATTTGGCATCACCAAATGGGACGGAAATAACACCAAATGGTTACCCGTTGTC
ACCAGTAGCAGAAGGTGCATATCCGTGTAACATACCCGTACAGCCTCAGAATGGGCATAG
TACAGCTGCACCAGTGGCTACTGAAACCGCTGAGGAGAAGAGTGGAGGTGAAGAAGAGAG
CAACAAGGAGAAGATAGCTGCAGAGGATGAGGAAGTCATTGCACAAGAAACTATAGAAAC
ACTTGAAAATGGACACTCCACAGTAGGTGAAGAGAAAACCACAGCACAAGAGATATCTGA
CGAGAAAGGACAAGGAGGCAAGTGCTGGGGAGATTACAGCGACAGTGAAATTGAAGTCAC
AAATTGAAGAAGCAATTTTTCTGTCATTTGAAGTTTTAACATTGAGGCTGAAGTAACGGA
GTGAAACTTGGCTCCATGGATGAGGTTGAGTTACATCAAGCTTTAACGAGGAAAAACATT
TCTACATTTGAATATTTTGAGGTTGATTGTTTACAGCTTTCGAGGACAATCAAGTTCTTA
GAGAAATAGATTCTGTATAATCTATGGAAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2BK72TF U 1
AF RR2EK94TF U 416
AF RR2EK94JQ C 459
AF RR2BK72JQ C 481
BS 1 468 RR2BK72TF
BS 469 469 RR2EK94TF
BS 470 670 RR2BK72TF
BS 671 1038 RR2EK94TF
BS 1039 1173 RR2EK94JQ

RD RR2BK72TF 670 0 0
GACAGCTGTTTCAGATGCAAGCCAAGGAAAATCTGAAAGTGTACAAACGGCTCAGGAGTC
AAATGGAGTGACGCAACATAAAGATGTCTCTGGTGCTGAACTGAAAGCAGTAGATGCTGA
AAGAGATGATTTGCCTAATGGAGACTCTAGCCCAAAGACATCAGTAGTTGCAGATGGAGA
AAAGCAAGAAGCATGCGAGGCGCAGCAAAAGGAGATGAGCAAGAAGCTCTCTGCTTCTGC
ACCACCCTATACCCCAACGACCATTCCAATTTTTGGATCGATAGCAGTTCCAGGATTTAA
CGACCATGTGGGAATCCTTCCCTCACCAATGAACATACCGCCAATGCTTCCTGTAAACCA
TGTCCGGAGGTCAACTCCTCATCAGTCTGTAACAGCTCGAGTTCCTTATGGGCCAAGGCT
CTCAGGTGGTGGTTACAACCGATCTGGAAACCGGGTTCCTCGCAACAAGCCAAGCTTCCC
CAGTATCGCTGAGTCCAATGGAGAGGCTAATCAGTTCATTGGCCCAAGAATAATGAACCC
TCATGCGGCTGAGTTCATACCGAGTCAACCATGGGCTTCTAATGGTTATCCAGTGTCACC
AAACGGATATTTGGCATCACCAAATGGGACGGAAATAACACCAAATGGTTACCCGTTGTC
ACCAGTAGCA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2EK94TF 627 0 0
G
GGCTCTCAGGTGGTGGTTACAACCGATCTGGAAACCGGGTTCCTCGCAACAAACCAAGCT
TCCCCAGTATCGCTGAGTCCAATGGAGAGGCTAATCAGTTCATTGGCCCAAGAATAATGA
ACCCTCATGCGGCTGAGTTCATACCGAGTCAACCATGGGCTTCTAATGGTTATCCAGTGT
CACCAAACGGATATTTGGCATCACCAAATGGGACGGAAATAACACCAAATGGTTACCCGT
TGTCACCAGTAGCAGAAGGTGCATATCCGTGTAACATACCCGTACAGCCTCAGAATGGGC
ATAGTACAGCTGCACCAGTGGCTACTGAAACCGCTGAGGAGAAGAGTGGAGGTGAAGAAG
AGAGCAACAAGGAGAAGATAGCTGCAGAGGATGAGGAAGTCATTGCACAAGAAACTATAG
AAACACTTGAAAATGGACACTCCACAGTAGGTGAAGAGAAAACCACAGCACAAGAGATAT
CTGACGAGAAAGGACAAGGAGGCAAGTGCTGGGGAGATTACAGCGACAGTGAAATTGAAG
TCACAAATTGAAGAAGCAATTTTTCTGTCATTTGAAGTTTTAACATTGAGGCTGAAGTAA
CGGAGTGAAACTTGGCTCCATG
GATG

QA 2 623 2 623
DS 

RD RR2EK94JQ 715 0 0
CTCGCAACAAACCAAGCTTCCCCAGTATCGCTGAGTCCAATGGAGAGGCTAATCAGTTCA
TTGGCCCAAGAATAATGAACCCTCATGCGGCTGAGTTCATACCGAGTCAACCATGGGCTT
CTAATGGTTATCCAGTGTCACCAAACGGATATTTGGCATCACCAAATGGGACGGAAATAA
CACCAAATGGTTACCCGTTGTCACCAGTAGCAGAAGGTGCATATCCGTGTAACATACCCG
TACAGCCTCAGAATGGGCATAGTACAGCTGCACCAGTGGCTACTGAAACCGCTGAGGAGA
AGAGTGGAGGTGAAGAAGAGAGCAACAAGGAGAAGATAGCTGCAGAGGATGAGGAAGTCA
TTGCACAAGAAACTATAGAAACACTTGAAAATGGACACTCCACAGTAGGTGAAGAGAAAA
CCACAGCACAAGAGATATCTGACGAGAAAGGACAAGGAGGCAAGTGCTGGGGAGATTACA
GCGACAGTGAAATTGAAGTCACAAATTGAAGAAGCAATTTTTCTGTCATTTGAAGTTTTA
ACATTGAGGCTGAAGTAACGGAGTGAAACTTGGCTCCATGGATGAGGTTGAGTTACATCA
AGCTTTAACGAGGAAAAACATTTCTACATTTGAATATTTTGAGGTTGATTGTTTACAGCT
TTCGAGGACAATCAAGTTCTTAGAGAAATAGATTCTGTATAATCTATGGAAACTG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2BK72JQ 693 0 0
CAGTATCGCTGAGTCCAATGGAGAGGCTAATCAGTTCATTGGCCCAAGAATAATGAACCC
TCATGCGGCTGAGTTCATACCGAGTCAACCATGGGCTTCTAATGGTTATCCAGTGTCACC
AAACGGATATTTGGCATCACCAAATGGGACGGAAATAACACCAAATGGTTACCCGTTGTC
ACCAGTAGCAGAAGGTGCATATCCGTGTAACATACCCGTACAGCCTCAGAATGGGCATAG
TACAGCTGCACCAGTGGCTACTGAAACCGCTGAGGAGAAGAGTGGAGGTGAAGAAGAGAG
CAACAAGGAGAAGATAGCTGCAGAGGATGAGGAAGTCATTGCACAAGAAACTATAGAAAC
GCTTGAAAATGGACACTCCACAGTAGGTGAAGAGAAAACCACAGCACAAGAGATATCTGA
CGAGAAAGGACAAGGAGGCAAGTGCTGGGGAGATTACAGCGACAGTGAAATTGAAGTCAC
AAATTGAAGAAGCAATTTTTCTGTCATTTGAAGTTTTAACATTGAGGCTGAAGTAACGGA
GTGAAACTTGGCTCCATG*ATGAGGTTGAGTTACATCAAGCTTTAACGAGGAAAAACATT
TCTACATTTGAATATTTTGAGGTTGATTGTTTACAGCTTTCGAGGACAATCAAGTTCTTA
GAGAAATAGATTCTGTATAATCTATGGAAACTG

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 4

CO CL2890Contig1 1117 4 8 U
CAATTCTGGCTATATTAGTGATCAAAAGTCTAATGATTAAAAAAGTTACAATGTTTGTAT
GTTTGGTCTCCTTCAAACTGAGAGACCTTGGTTTTTGTAAGTTTTTCAGTAACGTGAAGG
TCATTCTCAGTAAAAAGCTTTGAGTTTAATGACAAATAAAAAAGAAAATCAAATATTGTT
ACAGAAAGTCTAAACACAGTTCCCTCCTTTGCCTCACTCTTCCATAAAATTCTTAAACCC
ATCTCTGTTTAAGCGAAGCAACTTTGCGCCCTGATGAACAAGGTTGATGATAATAGCCTT
CCTCAAACAAAAGGCAGCTGCTACCTCTTTTAACACCAATTTGCTTCAATCAGTATGGTC
TGTAGCGCATTGGCCGTCTGAACCTGGGAACTCTCCCATAAGCATATGGAGGATAGAATG
GAGGTCCGGGCATGAAGCCCCTCATGGGTCTGAAGGGGCGCCTTCCTCGGAATTGCCTCA
TCCCGGGGACGTTAGTCCTCTTTGCAGATACCTTTATCTGACGACCACGCAGTTCTGTCT
CGTTCAAAACAAGAGAATTCTGAACGGCTTCTTCTTCCACGAATTCCACGTAGGCAAAAC
CTTTGGGTTGGCCAAACTTATCTGTCAGAATCGTAACCCTATTGACCGTCCAACAGGATT
GAAAATGCTGCTGGACTTCCTCTGGAGTACATGCGTAGTCCACATTGCCAACATATATAG
AACGCAAATCCACTTCCTCCTTCTCTACCGCACTAATAGCACTTGATGGATCTTGAGCAG
CAGCCATATCGTTCTCAGCTTTGGCTTGCATTTCACGCAAAGCACTAGCCTCTTCCTCGA
TCTCCTTAATCCGTTTCTTCATCTCCTCTAAATCCCTAGAAGCAGAGCCTGGCTCTAGCT
CCTCCTCGTCTTCCGCGGCGGCGGCGGCGCCTTCTTCTTCTTCTCCGGCGTGTTCTAGAT
ACTCGTCCGTCTCCATCTCGCCTTCGTCCTCCTCTGGGATGTCTCCACCGTACACCTCGT
GCTCTTGCTCATCTTGCAGCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCGGCTACTGTG
GTGAAGCGAGGTCGAAATTTTTAGGGCTTGGAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX66JQ U 17
AF RR2GH14JQB U 1
AF RR2GH14TF C 379
AF RR2DX66TF C 605
BS 1 85 RR2GH14JQB
BS 86 86 RR2DX66JQ
BS 87 822 RR2GH14JQB
BS 823 823 RR2DX66TF
BS 824 991 RR2GH14TF
BS 992 992 RR2DX66TF
BS 993 1062 RR2GH14TF
BS 1063 1117 RR2DX66TF

RD RR2DX66JQ 713 0 0
C
GTGATCAAAAGTCTAATGATTAAAAAAGTTACAATGTTTGTATGTTTGGTCTCCTTCAAA
CTGAGAGACCTTGGTTTTTGTAAGTTTTTCAGTAACGTGAAGGTCATTCTCAGTAGAAAG
CTTTGAGTTTAATGACAAATAAAAAAGAAAATCAAATATTGTTACAGAAAGTCTAAACAC
AGTTCCCTCCTTTGCCTCACTCTTCCATAAAATTCTTAAACCCATCTCTGTTTAAGCGAA
GCAACTTTGCGCCCTGATGAACAAGGTTGATGATAATAGCCTTCCTCAAACAAAAGGCAG
CTGCTACCTCTTTTAACACCAATTTGCTTCAATCAGTATGGTCTGTAGCGCATTGGCCGT
CTGAACCTGGGAACTCTCCCATAAGCATATGGAGGATAGAATGGAGGTCCGGGCATGAAG
CCCCTCATGGGTCTGAAGGGGCGCCTTCCTCGGAATTGCCTCATCCCGGGGACGTTAGTC
CTCTTTGCAGATACCTTTATCTGACGACCATGCAGTTCTGTCTCGTTCAAAACAAGAGAA
TTCTGAACGGCTTCTTCTTCCACGAATTCCACGTAGGCAAAACCTTTGGGTTGGCCAAAC
TTATCTGTCAGAATCGTAACCCTATTGACCGTCCCACAGGATTGAAAATGCTGCTGGACT
TCCTCTGGAGTACATGCGTAGTCCACATTGCCAACATATATAGAACGCAAAT

QA 2 713 2 713
DS 

RD RR2GH14JQB 825 0 0
CAATTCTGGCTATATTAGTGATCAAAAGTCTAATGATTAAAAAAGTTACAATGTTTGTAT
GTTTGGTCTCCTTCAAACTGAGAGATCTTGGTTTTTGTAAGTTTTTCAGTAACGTGAAGG
TCATTCTCAGTAAAAAGCTTTGAGTTTAATGACAAATAAAAAAGAAAATCAAATATTGTT
ACAGAAAGTCTAAACACAGTTCCCTCCTTTGCCTCACTCTTCCATAAAATTCTTAAACCC
ATCTCTGTTTAAGCGAAGCAACTTTGCGCCCTGATGAACAAGGTTGATGATAATAGCCTT
CCTCAAACAAAAGGCAGCTGCTACCTCTTTTAACACCAATTTGCTTCAATCAGTATGGTC
TGTAGCGCATTGGCCGTCTGAACCTGGGAACTCTCCCATAAGCATATGGAGGATAGAATG
GAGGTCCGGGCATGAAGCCCCTCATGGGTCTGAAGGGGCGCCTTCCTCGGAATTGCCTCA
TCCCGGGGACGTTAGTCCTCTTTGCAGATACCTTTATCTGACGACCACGCAGTTCTGTCT
CGTTCAAAACAAGAGAATTCTGAACGGCTTCTTCTTCCACGAATTCCACGTAGGCAAAAC
CTTTGGGTTGGCCAAACTTATCTGTCAGAATCGTAACCCTATTGACCGTCCAACAGGATT
GAAAATGCTGCTGGACTTCCTCTGGAGTACATGCGTAGTCCACATTGCCAACATATATAG
AACGCAAATCCACTTCCTCCTTCTCTACCGCACTAATAGCACTTGATGGATCTTGAGCAG
CAGCCATATCGTTCTCAGCTTTGGCTTGCATTTCACGCAAAG
TAC

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR2GH14TF 686 0 0
TGAACCTGGGAACTCTCCCATAAGCATATGGAGGATAGAATGGAGGTCCGGGCATGAAGC
CC*TCATGGGTCTGAAGGGGCGCTTTCCTCGGAATTGCCTCATCCCGGGGACGTTAGTCC
TCTTTGCAGATACCTTTATCTGACGACCACGCAGTTCTGTCTCGTTCAAAACAAGAGAAT
TCTGAACGGCTTCTTCTTCCACGAATTCCACGTAGGCAAAACCTTTGGGTTGGCCAAACT
TATCTGTCAGAATCGTAACCCTATTGACCGTCCAACAGGATTGAAAATGCTGCTGGACTT
CCTCTGGAGTACATGCGTAGTCCACATTGCCAACATATATAGAACGCAAATCCACTTCCT
CCTTCTCTACCGCACTAATAGCACTTGATGGATCTTGAGCAGCAGCCATATCGTTCTCAG
CTTTGGCTTGCATTTCACGCAAAGTACTAGCCTCTTCCTCGATCTCCTTAATCCGTTTCT
TCATCTCCTCTAAATCCCTAGAAGCAGAGCCTGGCTCTAGCTCCTCCTCGTCTTCCGCGG
CGGCGGCGGCGCCTTCTTCTTCTTCTCCGGCGTGTTCTAGATACTCGTCCGTCTCCATCT
CGCCTTCGTCCTCTTCTGGGATGTCTCCACCGTACACCTCGTGCTCTTGCTCATCTTGCA
GCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTC
CC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2DX66TF 513 0 0
GGGTTGGCCAAACTTATCTGTCAGAATCGTAACCCTATTGACCGTCCCACAGGATTGAAA
ATGCTGCTGGACTTCCTCTGGAGTACATGCGTAGTCCACATTGCCAACATATATAGAACG
CAAATCCACTTCCTCCTTCTCTGCCGCACTAATAGCACTTGATGGATCTTGAGCAGCAGC
CATATCGTTCTCAGCTTTGGCTTGCATTTCACGCAAAGCACTAGCCTCTTCCTCGATCTC
CTTAATCCGTTTCTTCATCTCCTCTAAATCCCTAGAAGCAGAGCCTGGCTCTAGCTCCTC
CTCGTCTTCCGCGGCGGCGGCGGCGCCTTCTTCTTCTTCTCCGGCGTGTTCTAGATACTC
GTCCGTCTCCATCTCGCCTTCGTCCTCCTCTGGGATGTCTCCACCGTACACCTCGTGCTC
TTGCTCATCTTGCAGCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCGGCTACTGTGGTGA
AGCGAGGTCGAAATTTTTAGGGCTTGGAATTCC

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 4

CO CL2891Contig1 336 4 3 U
AGGGACCGTCATTTCTATTTGCAGCCAATCTGAGTTGAGAAGTTACCAGAGATTTGATCG
AAAAGATGATTTACGATGTCAACTCCGTTCTCTTCAAATCCTTCCTGAGCTCCAAGTTCT
CTACCGACAAAAGGAGAGGCGAGGACAAGCCAAGAGAGCAGAAGCCCAAGGCCAGCGACA
ACAAGCCTGTGATGAATGAATAAGATTTGTTCTTTGTTATGTAACTTTTCTATGTTCTAA
AAACATTTTCAGTTTCAATGGTTCATCTTTACTTATTTAGCTTTTGAACGTATCCAGGTT
CTTATATGTCTAATTGAAGAAATCCATTCGCTGCTC


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AV23JQ C 1
AF RR2AV23TF U 1
AF RR2C114TF U 4
AF RR2H108TF U 4
BS 1 3 RR2AV23JQ
BS 4 274 RR2AV23TF
BS 275 336 RR2C114TF

RD RR2AV23JQ 274 0 0
AGGGACCGTCATTTCTATTTGCAGCCAATCTGAGTTGAGAAGTTACCAGAGATTTGATCG
AAAAGATGATTTACGATGTCAACTCCGTTCTCTTCAAATCCTTCCTGAGCTCCAAGTTCT
CTACCGACAAAAGGAGAGGCGAGGACAAGCCAAGAGAGCAGAAGCCCAAGGCCAGCGACA
ACAAGCCTGTGATGAATGAATAAGATTTGTTCTTTGTTATGTAACTTTTCTATGTTCTAA
AAACATTTTCAGTTTCAATGGTTCATCTTTACTT

QA 1 274 1 274
DS 

RD RR2AV23TF 274 0 0
AGG
GACCGTCATTTCTATTTGCAGCCAATCTGAGTTGAGAAGTTACCAGAGATTTGATCGAAA
AGATGATTTACGATGTCAACTCCGTTCTCTTCAAATCCTTCCTGAGCTCCAAGTTCTCTA
CCGACAAAAGGAGAGGCGAGGACAAGCCAAGAGAGCAGAAGCCCAAGGCCAGCGACAACA
AGCCTGTGATGAATGAATAAGATTTGTTCTTTGTTATGTAACTTTTCTATGTTCTAAAAA
CATTTTCAGTTTCAATGGTTCATCTTTACTT

QA 4 274 4 274
DS 

RD RR2C114TF 333 0 0
GACCGTCATTTCTATTTGCAGCCAATCTGAGTTGAGAAGTTACCAGAGATTTGATCGAAA
AGATGATTTACGATGTCAACTCCGTTCTCTTCAAATCCTTCCTGAGCTCCAAGTTCTCTA
CCGACAAAAGGAGAGGCGAGGACAAGCCAAGAGAACAGAAGCCCAAGGCCAGCGACAACA
AGCCTGTGATGAATGAATAAGATTTGTCCTTTGTTATGTAACTTTTCTATGTTCTAAAAA
CATTTTCAGTTTCAATGGTTCATCTTTACTTATTTAGCTTTTGAACGTATCCAGGTTCTT
ATATGTCTAATTGAAGAAATCCATTCGCTGCTC

QA 1 333 1 333
DS 

RD RR2H108TF 333 0 0
GACCGTCATTTCTATTTGCAGCCAATCTGAGTTGAGAAGTTACCAGAGATTTGATCGAAA
AGATGATTTACGATGTCAACTCCGTTCTCTTCAAATCCTTCCTGAGCTCCAAGTTCTCTA
CCGACAAAAGGAGAGGCGAGGACAAGCCAAGAGAACAGAAGCCCAAGGCCAGCGACAACA
AGCCTGTGATGAATGAATAAGATTTGTCCTTTGTTATGTAACTTTTCTATGTTCTAAAAA
CATTTTCAGTTTCAATGGTTCATCTTTACTTATTTAGCTTTTGAACGTATCCAGGTTCTT
ATATGTCTAATTGAAGAAATCCATTCGCTGCTC

QA 1 333 1 333
DS 



AS 1 3

CO CL2892Contig1 969 3 12 U
AAATAAATATGTCACGCTTGAGATTAATTAATAGGTTATACATTGATTAGGAATAATAAT
GCAAAGATCATAAATCCATAAATGTTTCCAATATAACAAGAGACAAATAGATAACTTGGG
AGTGAAACAACTAGTTAGCTGGAACTCTGCCTTTGAGGAAGTTCTTGCAAATCGTCTCCA
AAAGTTTCCTGTCAGCTCCCTTATTATCCACCGATGCCTTTGCCGCATCAGCCATTTCTT
GCTTGATGAAGCCAAGACGAAGAACACGATCTACGATCTCGAAGAGAATCTCCTTGTTAT
ACTCGGGATGTCCTTGAATACAGAACAAATGATCTTCTATGGAGAACATCTCCACCTCGT
ACTTGTCTGAATAAGCTAGTACTTTGGCACCTTCCGGCAACACCAACACCTCATCCTGGT
GTAGTTTTATGATGGATATGCTGTCTGGAATCTCGTCTCCGAAGTAGCTTCCTGGTGTGA
TTGCATCCTTGACGATGGTTATCTTTCCAAGTGTAAGCTCTGGTCCCTTCCTTGCTCTTC
CAACTGTTCCTCCTCTAACTCTGGCTATGATCTGGTGACCGAAGCAGATGCCAAGAACTT
TCTTCTTCATCTCATCAAGTTTCTTGACGATCTCGCATAGCTTAAGGATCCACTCATCAT
TCTCAAAAGAATCATGAGAGCTTCCACTGATAACGAAACCATCGTACTTCTCAAGATCTT
TCTCGTCGGGGAACTCGCCTTCCACGACCCTAAACGAGTCCCAGTGCTCTCCCTCGTCTC
CGAACGTCTCCACGAACACGTTGTGGTACCCTCCGTACGCTTTCTTAACGAACTCTGAAT
CAGGAGTCGCTAGAAACAGAGCGAACTTCTTCTGGTCAACCATTTCTTTTACCGGCTGAA
AATAAACACAAAGAGAAGTTGATTACGTGAGAGAGATAAGGAGAGAGAGAGGGAGACAAG
GAGCAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU79JQ U 1
AF RR2E929JQ U 7
AF RR2BU79TF C 210
BS 1 32 RR2BU79JQ
BS 33 33 RR2E929JQ
BS 34 100 RR2BU79JQ
BS 101 101 RR2E929JQ
BS 102 173 RR2BU79JQ
BS 174 174 RR2E929JQ
BS 175 181 RR2BU79JQ
BS 182 182 RR2E929JQ
BS 183 193 RR2BU79JQ
BS 194 194 RR2E929JQ
BS 195 724 RR2BU79JQ
BS 725 969 RR2BU79TF

RD RR2BU79JQ 724 0 0
AAATAAATATGTCACGCTTGAGATTAATTAATGGGTTATACATTGATTAGGAATAATAAT
GCAAAGATCATAAATCCATAAATGTTTCCAATATAACAAGGGACAAATAGATAACTTGGG
AGTGAAACAACTAGTTAGCTGGAACTCTGCCTTTGAGGAAGTTCTTGCAAATCTTCTCCA
AGAGTTTCCTGTCTGCTCCCTTATTATCCACCGATGCCTTTGCCGCATCAGCCATTTCTT
GCTTGATGAAGCCAAGACGAAGAACACGATCTACGATCTCGAAGAGAATCTCCTTGTTAT
ACTCGGGATGTCCTTGAATACAGAACAAATGATCTTCTATGGAGAACATCTCCACCTCGT
ACTTGTCTGAATAAGCTAGTACTTTGGCACCTTCCGGCAACACCAACACCTCATCCTGGT
GTAGTTTTATGATGGATATGCTGTCTGGAATCTCGTCTCCGAAGTAGCTTCCTGGTGTGA
TTGCATCCTTGACGATGGTTATCTTTCCAAGTGTAAGCTCTGGTCCCTTCCTTGCTCTTC
CAACTGTTCCTCCTCTAACTCTGGCTATGATCTGGTGACCGAAGCAGATGCCAAGAACTT
TCTTCTTCATCTCATCAAGTTTCTTGACGATCTCGCATAGCTTAAGGATCCACTCATCAT
TCTCAAAAGAATCATGAGAGCTTCCACTGATAACGAAACCATCGTACTTCTCAAGATCTT
TCTC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2E929JQ 718 0 0
AA
ATGTCACGCTTGAGATTAATTAATAGGTTATACATTGATTAGGAATAATAATGCAAAGAT
CATAAATCCATAAATGTTTCCAATATAACAGGAGACAAATAGATAACTTGGGAGTGAAAC
AACTAGTTAGCTGGAACTCTGCCTTTGAGGAAGTTCTTGCAAATCGTCTCCAAAAGTTTC
CTGTCAGCTCCCTTATTATCCATCGATGCCTTTGCCGCATCAGCCATTTCTTGCTTGATG
AAGCCAAGACGAAGAACACGATCTACGATCTCGAAGAGGATCTCTTTGTTATACTCGGGA
TGTCCTTGAATACAGAACAAATGATCTTCTATGGAGAACATCTCCACCTCGTACTTGTCT
GAATAAGCTAGTACTTTGGCACCTTCCGGCAACACCAACACCTCATCCTGGTGTAGTTTT
ATGATGGATATGCTGTCTGGAATCTCGTCTCCGAAGTAACTTCCTGGTGTGATTGCATCC
TTGACGATGGTTATTTTTCCAAGTGTAAGCTCTGGTCCCTTCCTTGCTCTTCCAACTGTT
CCTCCTCTTACTCTGGCTATGATCTGGTGACCGAAGCAGACACCAAGAACTTTCTTCTTC
ATCTCATCAAGTTTCTTGACGATCTCACATAGCTTAAGGATCCACTCGTCATTCTCAAAA
GAATCATGAGAGCTTCCACTGATAACGAAACCATCGTACTTCTCAAGATCTTTCTC

QA 3 718 3 718
DS 

RD RR2BU79TF 760 0 0
TCCACGATGCTTTG
CGCATCAGCCATT*CTTGCTTGATGAAGCCAAGACGAAGAACACGATCTACGATCTCGAA
GAG*ATCTCCTTGTTATACTCGGGATGTC*TTGAATACAGAACAAATGATCTTCTATGGA
GAACATCTCCACCTCGTACTTGTCTGAATAAGCTAGTACTTTGGCACCTTCCGGCAACAC
CAACACCTCATCCTGGTGTAGTTTTATGATGGATATGCTGTCTGGAATCTCGTCTCCGAA
GTAGCTTCCTGGTGTGATTGCATCCTTGACGATGGTTATCTTTCCAAGTGTAAGCTCTGG
TCCCTTCCTTGCTCTTCCAACTGTTCCTCCTCTAACTCTGGCTATGATCTGGTGACCGAA
GCAGATGCCAAGAACTTTCTTCTTCATCTCATCAAGTTTCTTGACGATCTCGCATAGCTT
AAGGATCCACTCATCATTCTCAAAAGAATCATGAGAGCTTCCACTGATAACGAAACCATC
GTACTTCTCAAGATCTTTCTCGTCGGGGAACTCGCCTTCCACGACCCTAAACGAGTCCCA
GTGCTCTCCCTCGTCTCCGAACGTCTCCACGAACACGTTGTGGTACCCTCCGTACGCTTT
CTTAACGAACTCTGAATCAGGAGTCGCTAGAAACAGAGCGAACTTCTTCTGGTCAACCAT
TTCTTTTACCGGCTGAAAATAAACACAAAGAGAAGTTGATTACGTGAGAGAGATAAGGAG
AGAGAGAGGGAGACAAGGAGCAATCC

QA 15 760 15 760
DS 



AS 1 3

CO CL2893Contig1 1017 3 14 U
CAACAGTGAACAATTGATTTATTAGTTAATAGAGTTGCAGACATTTAATTTGAAACAGAG
GAAAGACAAAAGAAGAACTATACGGAACTCCACAGAGATATGGTTGAATGGCGTATTCAA
TCGTCGTCAACGTAGATGGTCTCCTGTTTAAACAGTCCTCCGAACACTTTCCTCACCTCT
TTCTCTGGTTTCTTAGGACGCTCTTCTTTTTGTTTGGACGCAAACGCAGCTGTGGCTGGT
TTCACCACTGCTTTCTTGGGTGGCAAGTTTCTAGCCTTTGCCTGTCCTCTGACAGTAGCG
ACCTGCACTTTCGGCGTTTCTGAAGCGTTCTGAACCGCGGTAGCAAGCTGAGAACTGAGT
GTATTCCAGGAGAGTCCGGATCCAATATCTTTCGCCTTGTTAAATAGACCGTCCACTGAG
ATTCCCACAGCTTCTGCCTTTTGCTGCGCGTCCTCAGCTAGGCTTGCAGCTTCTGCTTCT
TTCTCAGAGAGCTTCAGCATTTGCATCTCGAGCTCTTTGGCTGCTTCCGCTGCCTCTCGA
GCTCTCTCAGCAGCGACTTTAGCTTCTTCCTCGGCTCTTGCCTTTGCCATCGCATCTGCG
TACACTTTCCTCCTCCCGTCTTCCGGGATTACACTGAAAAGCTCATCGAATGGCCGTGAC
GGTGCGGATGGATCTGTAGAAACTTCTACTACCTTATTTTCTGCCACTGCCGTGTTACCA
AAAATGTCTGCAACCAGCGAGGCAATCTTCAGTTTTGGAACTTTGTACGCCTCAGATGAA
CTACTGCCACTTCCGCTGTTACTCCCTTCAGCTGAAACGACGACGTTATAAGATTTCTCC
GGGGAGAAATCCTCCGTCAAGCTCGTCTTTATGAGTGTGTACGCCACGTCAGTTTGAGCA
ACTTTCTCGATGAGATCAGAGATACTCAGAGGCTGAGATTGAGCGAACAAGTTGCTGAAG
AAGGAAGTTATCCCGTCGAGCACGTTGTATGTTGACCCGCTAATGCTCCCGTCGTAC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW81JQ U 1
AF RR2BI47JQ U 3
AF RR2BI47TF C 210
BS 1 76 RR2AW81JQ
BS 77 77 RR2BI47JQ
BS 78 246 RR2AW81JQ
BS 247 247 RR2BI47JQ
BS 248 290 RR2AW81JQ
BS 291 291 RR2BI47JQ
BS 292 327 RR2AW81JQ
BS 328 328 RR2BI47JQ
BS 329 473 RR2AW81JQ
BS 474 474 RR2BI47JQ
BS 475 539 RR2AW81JQ
BS 540 540 RR2BI47JQ
BS 541 837 RR2AW81JQ
BS 838 1017 RR2BI47TF

RD RR2AW81JQ 837 0 0
CAACAGTGAACAATTGATTTATTAGTTAATAGAGTTGCAGACATTTAATTTGAAACAGAG
GAAAGACAAAAGAAGAGCTATACGGAACTCCACAGAGATATGGTTGAATGGCGTATTCAA
TCGTCGTCAACGTAGATGGTCTCCTGTTTAAACAGTCCTCCGAACACTTTCCTCACCTCT
TTCTCTGGTTTCTTAGGACGCTCTTCTTTTTGTTTGGACGCAAACGCAGCTGTGGCTGGT
TTCACCTCTGCTTTCTTGGGTGGCAAGTTTCTAGCCTTTGCCTGTCCTCTAACAGTAGCG
ACCTGCACTTTCGGCGTTTCTGAAGCGCTCTGAACCGCGGTAGCAAGCTGAGAACTGAGT
GTATTCCAGGAGAGTCCGGATCCAATATCTTTCGCCTTGTTAAATAGACCGTCCACTGAG
ATTCCCACAGCTTCTGCCTTTTGCTGCGCGTCCTCAGCTAGGCTTGCAGCTTCCGCTTCT
TTCTCAGAGAGCTTCAGCATTTGCATCTCGAGCTCTTTGGCTGCTTCCGCTGCCTCTCGG
GCTCTCTCAGCAGCGACTTTAGCTTCTTCCTCGGCTCTTGCCTTTGCCATCGCATCTGCG
TACACTTTCCTCCTCCCGTCTTCCGGGATTACACTGAAAAGCTCATCGAATGGCCGTGAC
GGTGCGGATGGATCTGTAGAAACTTCTACTACCTTATTTTCTGCCACTGCCGTGTTACCA
AAAATGTCTGCAACCAGCGAGGCAATCTTCAGTTTTGGAACTTTGTACGCCTCAGATGAA
CTACTGCCACTTCCGCTGTTACTCCCTTCAGCTGAAACGACGACGTTATAAGATTTC

QA 1 837 1 837
DS 

RD RR2BI47JQ 837 0 0
GT
AGTGAACAATTGATTTATTAGTTAATAGAGTTGCAGACATTTAATTTGAGACAGAGGAAA
GACAAAAGAAGAACTATACGGAACTCCACGGAGATATGGTTGAATGGCGTATTCAATCGT
CGTCAACGTAGATGGTCTCCTGTTTAAACAGTCCTCCGAACACTTTCCTCACCTCTTTCT
CTGGTTTCTTAGGACGCTCTTCTTTTTGTTTGGACGCAAACGCAGCTGTGGCTGGTTTCA
CCACTGCTTTCTTGGGTGGCAAGTTTCTAGCCTTTGCCTGTCCTCTGACAGTAGCGACCT
GCACTTTCGGCGTTTCTGAAGCGTTCTGAACCGCGGTAGCAAGCTGAGAACTGAGTGTAT
TCCAGGAGAGTCCGGATCCAATATCTTTCGCCTTGTTAAATAGACCGTCCACTGAGATTC
CCACAGCTTCTGCCTTTTGCTGCGCGTCCTCAGCTAGGCTTGCAGCTTCTGCTTCTTTCT
CAGAGAGCTTCAGCATTTGCATCTCGAGCTCTTTGGCTGCTTCCGCTGCCTCTCGAGCTC
TCTCAGCAGCGACTTTAGCTTCTTCCTCGGCTCTTGCCTTTGCCATCGCATCTGCGTACA
CTTTCCTCCTCCCGTCTTCCGGGATTACACTGAAAAGCTCATCGAATGGCCGTGACGGTG
CGGATGGATCTGTAGAAACTTCTACTACCTTATTTTCTGCCACTGCCGTGTTACCAAAAA
TGTCTGCAACCAGCGAGGCAATCTTCAGTTTTGGAACTTTGTACGCCTCAGATGAACTAC
TGCCACTTCCGCTGTTACTCCCTTCAGCTGAAACGACGACGTTATAAGATTTC
TC

QA 3 835 3 835
DS 

RD RR2BI47TF 808 0 0
TTGTTTGGACGCAAACGCAGCTGTGGCTGGTTTCACCACTGCTTTCTTGGGTGGCAAGTT
TCTAGCCTTTGCCTGTCCTCTGACAGTAGCGAC*TGCACTTTCGGCGTTTCTGAAGCGTT
CTGAACCGCGGTAGCAAGCTGAGAACTGAGTGTATTCCAGGAGAGTCCGGATCCAATATC
TTTCGCCTTGTTAAATAGACCGTCCACTGAGATTCCCACAGCTTCTGCCTTTTGCTGCGC
GTCCTCAGCTAGGCTTGCAGCTTCTGCTTCTTTCTCAGAGAGCTTCAGCATTTGCATCTC
GAGCTCTTTGGCTGCTTCCGCTGCCTCTCGAGCTCTCTCAGCAGCGACTTTAGCTTCTTC
CTCGGCTCTTGCCTTTGCCATCGCATCTGCGTACACTTTCCTCCTCCCGTCTTCCGGGAT
TACACTGAAAAGCTCATCGAATGGCCGTGACGGTGCGGATGGATCTGTAGAAACTTCTAC
TACCTTATTTTCTGCCACTGCCGTGTTACCAAAAATGTCTGCAACCAGCGAGGCAATCTT
CAGTTTTGGAACTTTGTACGCCTCAGATGAACTACTGCCACTTCCGCTGTTACTCCCTTC
AGCTGAAACGACGACGTTATAAGATTTCTCCGGGGAGAAATCCTCCGTCAAGCTCGTCTT
TATGAGTGTGTACGCCACGTCAGTTTGAGCAACTTTCTCGATGAGATCAGAGATACTCAG
AGGCTGAGATTGAGCGAACAAGTTGCTGAAGAAGGAAGTTATCCCGTCGAGCACGTTGTA
TGTTGACCCGCTAATGCTCCCGTCGTAC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 3

CO CL2894Contig1 1035 3 21 U
GGAGCAGCCACACACTCTGTTTCGATCTTTCTCGGTATCGCAGCGAGTTCGAAAACAGAG
TATTGAAAGAATGGAGACGGCTCTGCTCCGGTTCTGCGTTAGTTTCTCCGGCCATCCCCA
CCACAAGAAAATCGCCGCTGCTCATCACAGAGTCAGTTGTGAGATTCCGGGAGGATCATC
CGAAGACGAGTGGTCTGCTAAGATTTTGAGTAGAAGATCGGTACTTGCGACGGTTTCTGG
ACTCTCACTGGTCTCTTCGACGTCTTTAGCGTTTCCAGAGGAAGGATTAGCTGTCGTGAA
ACAAGGTCTTCTCGCCGGGAGAGTTCCCGGCCTATCCGAACCCGATGACGAAGGTTGGAG
AACATACCGAAGACCAGACGAGAAGTCAGGAGGGCATGGGGTTGGTTGGAGTCCTATTAT
CCCTTACGCCTTCTCTGTTCCTCAAGATTGGAACGAGGTACCTGTGTCGATAGCTGATCT
TGGTGGCACTGAGATTGACTTGAGATTCGCCAGTCCTAAAGAAGGCCGCTTGTCTGTAAT
TGTCGCTCCCGTTCTTAGATTTGCAGATAACCTTAGGGACAACGTGAAGATTGAAAACAT
TGGAACACCAGCGAAGGTGATCAACGCCTTTGGACCAGAAGTTATCGGAGAAAACGTCGA
AGGGAAGGTGTTAAGTTCAAACGTAGCGGAACACGAGGGTAGGCTCTATTACCAGTTCGA
GCTAGAGCCACCTCATGTACTCATCACTGCGACAGCTGCTGGAAACCGCCTTTACTTGTT
CAGTGTCACCGGAAACGGGCTTCAGTGGAAGAGATACTACAAGGATCTGAAGAAGATAGC
TACTTCTTTCCGCGTTGTTTAGAGACATTTGCAAAAAAAAGGTTTCCTTTTTGATTCATG
CATGGGTTCTTCTACAAGTGACTTAAATAGTTTATGGATGACCCACCAGTCTCGTACGTC
ATATATTTGTATAAAGTTGAGAATCCTGTAACAACTTTACAGTAGACCAAATCCAAGCAG
TACATTAAGTCTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G402TF U 1
AF RR2GH28TF U 176
AF RR2GH28JQB C 268
BS 1 247 RR2G402TF
BS 248 248 RR2GH28TF
BS 249 278 RR2G402TF
BS 279 279 RR2GH28TF
BS 280 288 RR2G402TF
BS 289 289 RR2GH28TF
BS 290 291 RR2G402TF
BS 292 292 RR2GH28TF
BS 293 330 RR2G402TF
BS 331 331 RR2GH28TF
BS 332 453 RR2G402TF
BS 454 454 RR2GH28TF
BS 455 574 RR2G402TF
BS 575 575 RR2GH28TF
BS 576 603 RR2G402TF
BS 604 604 RR2GH28TF
BS 605 616 RR2G402TF
BS 617 617 RR2GH28TF
BS 618 635 RR2G402TF
BS 636 823 RR2GH28TF
BS 824 1035 RR2GH28JQB

RD RR2G402TF 635 0 0
GGAGCAGCCACACACTCTGTTTCGATCTTTCTCGGTATCGCAGCGAGTTCGAAAACAGAG
TATTGAAAGAATGGAGACGGCTCTGCTCCGGTTCTGCGTTAGTTTCTCCGGCCATCCCCA
CCACAAGAAAATCGCCGCTGCTCATCACAGAGTCAGTTGTGAGATTCCGGGAGGATCATC
CGAAGACGAGTGGTCTGCTAAGATTTTGAGTAGAAGATCGGTACTTGCGACGGTTTCTGG
ACTCTCATTGGTCTCTTCGACGTCTTTAGCGTTTCCAGGGGAAGGATTGGCCGTCGTGAA
ACAAGGTCTTCTCGCCGGGAGAGTTCCCGGTCTATCCGAACCCGATGACGAAGGTTGGAG
AACATACCGAAGACCAGACGAGAAGTCAGGAGGGCATGGGGTTGGTTGGAGTCCTATTAT
CCCTTACGCCTTCTCTGTTCCTCAAGATTGGAATGAGGTACCTGTGTCGATAGCTGATCT
TGGTGGCACTGAGATTGACTTGAGATTCGCCAGTCCTAAAGAAGGCCGCTTGTCTGTAAT
TGTCGCTCCCGTTCTTAGATTTGCAGATAACCTTGGGGACAACGTGAAGATTGAAAACAT
TGGCACACCAGCGAAG*TGATCAACGCCTTTGGAC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2GH28TF 664 0 0
G
CATCCGAAGACGAGTGGTCTGCTAAGGTTTTGAGTAGAAGATCGGTACTTGCGACGGTTT
CTGGACTCTCACTGGTCTCTTCGACGTCTTTAGCGTTTCCAGAGGAAGGATTAGCTGTCG
TGAAACAAGGTCTTCTCGCCGGGAGAGTTCCCGGCCTATCCGAACCCGATGACGAAGGTT
GGAGAACATACCGAAGACCAGACGAGAAGTCAGGAGGGCATGGGGTTGGTTGGAGTCCTA
TTATCCCTTACGCCTTCTCTGTTCCTCAAGATTGGAACGAGGTACCTGTGTCGATAGCTG
ATCTTGGTGGCACTGAGATTGACTTGAGATTCGCCAGTCCTAAAGAAGGCCGCTTGTCTG
TAATTGTCGCTCCCGTTCTTAGATTTGCAGATAACCTTAGGGACAACGTGAAGATTGAAA
ACATTGGAACACCAGCGAAGGTGATCAACGCCTTTGGACCAGAAGTTATCGGAGAAAACG
TCGAAGGGAAGGTGTTAAGTTCAAACGTAGCGGAACACGAGGGTAGGCTCTATTACCAGT
TCGAGCTAGAGCCACCTCATGTACTCATCACTGCGACAGCTGCTGGAAACCGCCTTTACT
TGTTCAGTGTCACCGGAAACGGGCTTCAGTGGAAGAGATACTACAAG
ATCTGAGAAGATAGCT

QA 2 648 2 648
DS 

RD RR2GH28JQB 768 0 0
AGCGTTTCCAGAGGAAGGATTAGCTGTCGTGAAACAAGGTCTTCTCGCCGGGAGAGTTCC
CGGCCTATCCGAACCCGATGACGAAGGTTGGAGAACATACCGAAGACCAGACGAGAAGTC
AGGAGGGCATGGGGTTGGTTGGAGTCCTATTATCCCTTACGCCTTCTCTGTTCCTCAAGA
TTGGAACGAGGTACCTGTGTCGATAGCTGATCTTGGTGGCACTGAGATTGACTTGAGATT
CGCCAGTCCTAAAGAAGGCCGCTTGTCTGTAATTGTCGCTCCCGTTCTTAGATTTGCAGA
TAACCTTAGGGACAACGTGAAGATTGAAAACATTGGAACACCAGCGAAGGTGATCAACGC
CTTTGGACCAGAAGTTATCGGAGAAAACGTCGAAGGGAAGGTGTTAAGTTCAAACGTAGC
GGAACACGAGGGTAGGCTCTATTACCAGTTCGAGCTAGAGCCACCTCATGTACTCATCAC
TGCGACAGCTGCTGGAAACCGCCTTTACTTGTTCAGTGTCACCGGAAACGGGCTTCAGTG
GAAGAGATACTACAAGGATCTGAAGAAGATAGCTACTTCTTTCCGCGTTGTTTAGAGACA
TTTGCAAAAAAAAGGTTTCCTTTTTGATTCATGCATGGGTTCTTCTACAAGTGACTTAAA
TAGTTTATGGATGACCCACCAGTCTCGTACGTCATATATTTGTATAAAGTTGAGAATCCT
GTAACAACTTTACAGTAGACCAAATCCAAGCAGTACATTAAGTCTGGC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 3

CO CL2895Contig1 819 3 4 U
GAAAAAAAAACGTTTAAGATACCATGAATCTTTTTGAGTCTTTGAAGGATGATTCGCAAC
TTTATGTCTGTAGTCAAAGGTAAAAGTAAAGTTTCTAACAGGCATGATCAGAGTTCTAGT
GTTAAGAGACGAACGAGTATAAATAGAGAGATTCATGTGTTGTTGAGCTGTGTTTGGTTT
CTCGCCTCTTAAGTCGTGAGAAGAAGATAGACGAGTCCTTTTAGATATTCCACTATTTCA
GATCCTCCCAGCTTCGAAGTTCCAAAGACTCTATCCACAAATGTGATCGGTACCTCTTCA
ATATGGTATCCTTTTCTGGTAGCACGGACGATCATTTCCATCTGAAAGACATAACCTTTA
CTCACACATGAGCTTATCACGTCTTCAAGCACAGATTTCTTGTATAGCCTAAATGATCCG
GTTAAATCAGATACACCAGGCCATAAAAGTGTGTGAGCTAGAACATTTGCTCCTCTGCTT
GTGAGTTTCCGCATAAGATTCCACCCGTGTACACCACCTCCTTTTACATATCGTGTACCT
GTCACTATGCTTGCATTCGTCTCTAGTTGTTTCTTGATGAAACTTGGCAAATACTTTGGA
TGATGTGAAAGATCAGCATCCATGATTACAACGAAATCACCTGTAGCATGCTTCAAACCA
TGGATATATGCGGTTCCCAAACCAAGCTTCTTGGCTCTAGCTCTTAAAAGAATGCGGTCT
TCACCATACAAGTCCTGCAGCTGCTTGACAATTTCTTGAGTCCCATCAGGACTCCCGTCA
TCCACAACAATTATCTCAAAATCAACATCCCGGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E321JQ U 1
AF RR2AQ44JQ U 21
AF RR2AQ44TF C 21
BS 1 128 RR2E321JQ
BS 129 129 RR2AQ44JQ
BS 130 702 RR2E321JQ
BS 703 819 RR2AQ44JQ

RD RR2E321JQ 702 0 0
GAAAAAAAAACGTTTAAGATACCATGAATCTTTTTGAGTCTTTGAAGGATGATTCGCAAC
TTTATGTCTGTAGTCAAAGGTAAAAGTAAAGTTTCTAACAGGCATGATCAGAGTTCTAGT
GTTAAGAGGCGAACGAGTATAAATAGAGAGATTCATGTGTTGTTGAGCTGTGTTTGGTTT
CTCGCCTCTTAAGTCGTGAGAAGAAGATAGACGAGTCCTTTTAGATATTCCACTATTTCA
GATCCTCCCAGCTTCGAAGTTCCAAAGACTCTATCCACAAATGTGATCGGTACCTCTTCA
ATATGGTATCCTTTTCTGGTAGCACGGACGATCATTTCCATCTGAAAGACATAACCTTTA
CTCACACATGAGCTTATCACGTCTTCAAGCACAGATTTCTTGTATAGCCTAAATGATCCG
GTTAAATCAGATACACCAGGCCATAAAAGTGTGTGAGCTAGAACATTTGCTCCTCTGCTT
GTGAGTTTCCGCATAAGATTCCACCCGTGTACACCACCTCCTTTTACATATCGTGTACCT
GTCACTATGCTTGCATTCGTCTCTAGTTGTTTCTTGATGAAACTTGGCAAATACTTTGGA
TGATGTGAAAGATCAGCATCCATGATTACAACGAAATCACCTGTAGCATGCTTCAAACCA
TGGATATATGCGGTTCCCAAACCAAGCTTCTTGGCTCTAGCT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2AQ44JQ 799 0 0
ACCATGAATCTTTTTGAGTCTTTGAAGGATGATTCGCAACTTTATGTCTGTAGTCAAAGG
TAAAAGTAAAGTTTCTAACAGGCATGATCAGAGTTCTAGTGTTAAGAGACGAACGAGTAT
AAATAGAGAGATTCATGTGTTGTTGAGCTGTGTTTGGTTTCTCGCCTCTTAAGTCGTGAG
AAGAAGATAGACGAGTCCTTTTAGATATTCCACTATTTCAGATCCTCCCAGCTTCGAAGT
TCCAAAGACTCTATCCACAAATGTGATCGGTACCTCTTCAATATGGTATCCTTTTCTGGT
AGCACGGACGATCATTTCCATCTGAAAGACATAACCTTTACTCACACATGAGCTTATCAC
GTCTTCAAGCACAGATTTCTTGTATAGCCTAAATGATCCGGTTAAATCAGATACACCAGG
CCATAAAAGTGTGTGAGCTAGAACATTTGCTCCTCTGCTTGTGAGTTTCCGCATAAGATT
CCACCCGTGTACACCACCTCCTTTTACATATCGTGTACCTGTCACTATGCTTGCATTCGT
CTCTAGTTGTTTCTTGATGAAACTTGGCAAATACTTTGGATGATGTGAAAGATCAGCATC
CATGATTACAACGAAATCACCTGTAGCATGCTTCAAACCATGGATATATGCGGTTCCCAA
ACCAAGCTTCTTGGCTCTAGCTCTTAAAAGAATGCGGTCTTCACCATACAAGTCCTGCAG
CTGCTTGACAATTTCTTGAGTCCCATCAGGACTCCCGTCATCCACAACAATTATCTCAAA
ATCAACATCCCGGAGATCC

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2AQ44TF 799 0 0
ACCATGAATCTTTTTGAGTCTTTGAAGGATGATTCGCAACTTTATGTCTGTAGTCAAAGG
TAAAAGTAAAGTTTCTAACAGGCATGATCAGAGTTCTAGTGTTAAGAGACGAACGAGTAT
AAATAGAGAGATTCATGTGTTGTTGAGCTGTGTTTGGTTTCTCGCCTCTTAAGTCGTGAG
AAGAAGATAGACGAGTCCTTTTAGATATTCCACTATTTCAGATCCTCCCAGCTTCGAAGT
TCCAAAGACTCTATCCACAAATGTGATCGGTACCTCTTCAATATGGTATCCTTTTCTGGT
AGCACGGACGATCATTTCCATCTGAAAGACATAACCTTTACTCACACATGAGCTTATCAC
GTCTTCAAGCACAGATTTCTTGTATAGCCTAAATGATCCGGTTAAATCAGATACACCAGG
CCATAAAAGTGTGTGAGCTAGAACATTTGCTCCTCTGCTTGTGAGTTTCCGCATAAGATT
CCACCCGTGTACACCACCTCCTTTTACATATCGTGTACCTGTCACTATGCTTGCATTCGT
CTCTAGTTGTTTCTTGATGAAACTTGGCAAATACTTTGGATGATGTGAAAGATCAGCATC
CATGATTACAACGAAATCACCTGTAGCATGCTTCAAACCATGGATATATGCGGTTCCCAA
ACCAAGCTTCTTGGCTCTAGCTCTTAAAAGAATGCGGTCTTCACCATACAAGTCCTGCAG
CTGCTTGACAATTTCTTGAGTCCCATCAGGACTCCCGTCATCCACAACAATTATCTCAAA
ATCAACATCCCGGAGATCC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 3

CO CL2896Contig1 707 3 9 U
GGAAAATCATTTGCTTATAAAACATAAATGGCGTTTGCTTCGAAGATCATCACATGCCTC
CTCCTCCTTAGGGTCTACATGGCAGCTCCAACAGAGTCGCACATTACGTGCGGGATAGTG
ACATCCACATTGGCTCAGTGCATGGGCTACTTGACCAACTTTGGTCCAGTGCCATCAGAC
TACTGCTGCGCGGAAGTCAAAGAATTGAATCAAATGGCTCAGACCACACCGGACCGTCGA
CAAGTATGTAAGTGCCTTAAAGCAGTGGCTAAGGAAAACAAAGGATTCATCCACATCGAG
CTTGTGGGCACACTGCCCACTATTTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCATTTAGTTTCAGG
ACCAATTGTGACAAAATATCGACTGCCGTGTGAAGGAGGGTAGCTAGAGATGTACGACTA
ATCAAACTTGCCGGCTTTCTAACCTAACTTCATAACTATTCTGCTTCCATTTTGTTACCG
TATTGTTTTATTATTATGTAAATTGTAATTCTCCTCTTCATATGGTAATAACGACAAAGG
AACTCCCTCTCTTTACTGTCACTTTGATGTATATGTACACGCAGGAGTGAGGCTGCTTAC
ATTTTGGGTGGGGCAGTTACCTCCTATGATATTTGTAAATTTGGTGTAATTGTTTACCAA
TTTTTAAAATTGTACGTCTTGATTTATTAAATTATATTTTAATATGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF05TF U 1
AF RR2GW96TF U 1
AF RR2GW96JQ C 71
BS 1 236 RR2FF05TF
BS 237 237 RR2GW96TF
BS 238 291 RR2FF05TF
BS 292 292 RR2GW96TF
BS 293 446 RR2FF05TF
BS 447 447 RR2GW96TF
BS 448 555 RR2FF05TF
BS 556 647 RR2GW96TF
BS 648 707 RR2GW96JQ

RD RR2FF05TF 557 0 0
GGAAAATCATTTGCTTATAAAACATAAATGGCGTTTGCTTCGAAGATCATCACATGCCTC
CTCCTCCTTAGGGTCTACATGGCAGCTCCAACAGAGTCGCACATTACGTGCGGGATAGTG
ACATCCACATTGGCTCAGTGCATGGGCTACTTGACCAACTTTGGTCCAGTGCCATCAGAC
TACTGCTGCGCGGAAGTCAAAGAATTGAATCAAATGGCTCAGACCACACCGGACCGCCGA
CAAGTATGTAAGTGCCTTAAAGCAGTGGCTAAGGAAAACAAAGGATTCATCAACATCGAG
CTTGTGGGCACACTGCCCACTATTTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCATTTAGTTTCAGG
ACCAATTGTGACAAAATATCGACTGCCGTGTGAAGGAGGGTAGCTAGAGATGTACGACTA
ATCAAACTTGCCGGCTTTCTAACCTAGCTTCATAACTATTCTGCTTCCATTTTGTTACCG
TATTGTTTTATTATTATGTAAATTGTAATTCTCCTCTTCATATGGTAATAACGACAAAGG
AACTCCCTCTCTTTA
AA

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2GW96TF 647 0 0
GGAAAATCATTTGCTTATAAAACATAAATGGCGTTTGCTTCGAAGATCATCACATGCCTC
CTCCTCCTTAGGGTCTACATGGCAGCTCCAACAGAGTCGCACATTACGTGCGGGATAGTG
ACATCCACATTGGCTCAGTGCATGGGCTACTTGACCAACTTTGGTCCAGTGCCATCAGAC
TACTGCTGCGCGGAAGTCAAAGAATTGAATCAAATGGCTCAGACCACACCGGACCGTCGA
CAAGTATGTAAGTGCCTTAAAGCAGTGGCTAAGGAAAACAAAGGATTCATCCACATCGAG
CTTGTGGGCACACTGCCCACTATTTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCATTTAGTTTCAGG
ACCAATTGTGACAAAATATCGACTGCCGTGTGAAGGAGGGTAGCTAGAGATGTACGACTA
ATCAAACTTGCCGGCTTTCTAACCTAACTTCATAACTATTCTGCTTCCATTTTGTTACCG
TATTGTTTTATTATTATGTAAATTGTAATTCTCCTCTTCATATGGTAATAACGACAAAGG
AACTCCCTCTCTTTACTGTCACTTTGATGTATATGTACACGCAGGAGTGAGGCTGCTTAC
ATTTTGGGTGGGGCAGTTACCTCCTATGATATTTGTAAATTTGGTGT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2GW96JQ 637 0 0
GGGTCTACATGGCAGCTCCAACAGAGTCGCACATTACGTGCGGGATAGTGACATCCACAT
TGGCTCAGTGCATGGGCTACTTGACCAACTTTGGTCCAGTGCCATCAGACTACTGCTGCG
CGGAAGTCAAAGAATTGAATCAAATGGCTCAGACCACACCGGACCGTCGACAAGTATGTA
AGTGCCTTAAAGCAGTGGCTAAGGAAAACAAAGGATTCATCCACATCGAGCTTGTGGGCA
CACTGCCCACTATTTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCATTTAGTTTCAGGACCAATTGTG
ACAAAATATCGACTGCCGTGTGAAGGAGGGTAGCTAGAGATGTACGACTAATCAAACTTG
CCGGCTTTTTAACCTAACTTCATAACTATTTTGCTTCCATTTTGTTACCGTATTGTTTTA
TTATTATGTAAATTGTAATTTTCCTCTTCATATGGTAATAACGACAAAGGAACTCCCTCT
CTTTACTGTCACTTTGATGTATATGTACACGCAGGAGTGAGGCTGCTTACATTTTGGGTG
GGGCAGTTACCTCCTATGATATTTGTAAATTTGGTGTAATTGTTTACCAATTTTTAAAAT
TGTACGTCTTGATTTATTAAATTATATTTTAATATGT

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 3

CO CL2897Contig1 771 3 13 U
GGGAAGTGCACTACTCTCTGTCTCTGGCTTTCTCGATCTCGACGAAAACAATGGCAGCAG
CTAGGTTCTTGTGGGCTTCTAGGGTTGCTTCTCATCTAAGGATCTCCGTTGCCCAACGAG
GGTTTGCTTCCGTGGTATTGAAGGATTTGAAATATGCTGATTCACATGAATGGGTGAAGA
TTGATGGGAATAAAGCAACGTTTGGTATAACGGATCACGCGCAGGACCACTTGGGCGATG
TGGTCTATGTTGAGTTGCCTGATCTAGGACGTTCGGTGTCTCAAGGTGAGAGTTTTGGAG
CAGTTGAAAGTGTGAAAGCTACTAGTGATATCAATTCTCCAGTCTCTGGTAAGGTGGTTG
AAGTCAATGAGGTGCTCACCGAGTCCCCTGGATTGGTGAACACGAGCCCTTATGAAGAAG
GATGGATCATAAAGGTGGAGCTGAGTGATGCAGGCGAGGTAGAGAAGCTGATGGATTCAG
ACAAGTACTCTAAGTTTTGTGAAGAAGAGGACGCCAAGTACTGAGCTTTTCTTTGTCTTC
TAGAAACTTTCACTGCAACAGAGTTTGTTGTTTTCTCAAACGAAGATCAAAACAAAAAAA
CGAAATCTTGGTCTATGGAGGTAGATGAATCAAGGAAATTCTCAAGATTTCGATCTCTGC
TTCTCTTTTAAGTACTGTTTTTAATAGAAAAAAGTAATAATGGTAGAGAATAATAAGCTT
TGACATATACAATTGATTTGATCTTTCATGAAGTCACACCTATTTGTTTCT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM28TF U 1
AF RR2GZ93TF U 2
AF RR2GZ93JQ C 105
BS 1 157 RR2GM28TF
BS 158 158 RR2GZ93TF
BS 159 368 RR2GM28TF
BS 369 369 RR2GZ93TF
BS 370 518 RR2GM28TF
BS 519 519 RR2GZ93TF
BS 520 528 RR2GM28TF
BS 529 529 RR2GZ93TF
BS 530 579 RR2GM28TF
BS 580 580 RR2GZ93TF
BS 581 598 RR2GM28TF
BS 599 679 RR2GZ93TF
BS 680 771 RR2GZ93JQ

RD RR2GM28TF 598 0 0
GGGAAGTGCACTACTCTCTGTCTCTGGCTTTCTCGATCTCGACGAAAACAATGGCAGCAG
CTAGGTTCTTGTGGGCTTCTAGGGTTGCTTCTCATCTAAGGATCTCCGTTGCCCAACGAG
GGTTTGCTTCCGTGGTATTGAAGGATTTGAAATATGCCGATTCACATGAATGGGTGAAGA
TTGATGGGAATAAAGCAACGTTTGGTATAACGGATCACGCGCAGGACCACTTGGGCGATG
TGGTCTATGTTGAGTTGCCTGATCTAGGACGTTCGGTGTCTCAAGGTGAGAGTTTTGGAG
CAGTTGAAAGTGTGAAAGCTACTAGTGATATCAATTCTCCAGTCTCTGGTAAGGTGGTTG
AAGTCAATTAGGTGCTCACCGAGTCCCCTGGATTGGTGAACACGAGCCCTTATGAAGAAG
GATGGATCATAAAGGTGGAGCTGAGTGATGCAGGCGAGGTAGAGAAGCTGATGGATTCAG
ACAAGTACTCTAAGTTTTGTGAAGAAGAGGACGCCAAGCACTGAGCTTCTCTTTGTCTTC
TAGAAACTTTCACTGCAACAGAGTTTGTTGTTTTCTCAA*CGAAGATCAAAACAAAAA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2GZ93TF 678 0 0
GGAAGTGCACTACTCTCTGTCTCTGGCTTTCTCGATCTCGACGAAAACAATGGCAGCAGC
TAGGTTCTTGTGGGCTTCTAGGGTTGCTTCTCATCTAAGGATCTCCGTTGCCCAACGAGG
GTTTGCTTCCGTGGTATTGAAGGATTTGAAATATGCTGATTCACATGAATGGGTGAAGAT
TGATGGGAATAAAGCAACGTTTGGTATAACGGATCACGCGCAGGACCACTTGGGCGATGT
GGTCTATGTTGAGTTGCCTGATCTAGGACGTTCGGTGTCTCAAGGTGAGAGTTTTGGAGC
AGTTGAAAGTGTGAAAGCTACTAGTGATATCAATTCTCCAGTCTCTGGTAAGGTGGTTGA
AGTCAATGAGGTGCTCACCGAGTCCCCTGGATTGGTGAACACGAGCCCTTATGAAGAAGG
ATGGATCATAAAGGTGGAGCTGAGTGATGCAGGCGAGGTAGAGAAGCTGATGGATTCAGA
CAAGTACTCTAAGTTTTGTGAAGAAGAGGACGCCAAGTACTGAGCTTTTCTTTGTCTTCT
AGAAACTTTCACTGCAACAGAGTTTGTTGTTTTCTCAAACGAAGATCAAAACAAAAAAAC
GAAATCTTGGTCTATGGAGGTAGATGAATCAAGGAAATTCTCAAGATTTCGATCTCTGCT
TCTCTTTTAAGTACTGTT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2GZ93JQ 667 0 0
TCCGTTGCCCAACGAGGGTTTGCTTCCGTGGTATTGAAGGATTTGAAATATGCTGATTCA
CATGAATGGGTGAAGATTGATGGGAATAAAGCAACGTTTGGTATAACGGATCACGCGCAG
GACCACTTGGGCGATGTGGTCTATGTTGAGTTGCCTGATCTAGGACGTTCGGTGTCTCAA
GGTGAGAGTTTTGGAGCAGTTGAAAGTGTGAAAGCTACTAGTGATATCAATTCTCCAGTC
TCTGGTAAGGTGGTTGAAGTCAATGAGGTGCTCACCGAGTCCCCTGGATTGGTGAACACG
AGCCCTTATGAAGAAGGATGGATCATAAAGGTGGAGCTGAGTGATGCAGGCGAGGTAGAG
AAGCTGATGGATTCAGACAAGTACTCTAAGTTTTGTGAAGAAGAGGACGCCAAGTACTGA
GCTTTTCTTTGTCTTCTAGAAACTTTCACTGCAACAGAGTTTGTTGTTTTCTCAAACGAA
GATCAAAACAAAAAAACGAAATCTTGGTCTATGGAGGTAGATGAATCAAGGAAATTCTCA
AGATTTCGATCTCTGCTTCTCTTTTAAGTACTGTTTTTAATAGAAAAAAGTAATAATGGT
AGAGAATAATAAGCTTTGACATATACAATTGATTTGATCTTTCATGAAGTCACACCTATT
TGTTTCT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 3

CO CL2898Contig1 743 3 8 U
CAGCTATAACCTCCTCTCTCTAGAAGTCTCTCCAGCTTCTCTCTAAAACAAAAGGTTTCC
CGGCCTCCGGTTTCTTCTCCGACCGATGACGGTGGGCTTCCAAAGACACGTCGTCGGTCG
GGATCTGTTTAGTGTTTAGTGTATAGTCTTAGTCTTCTGTTTTCTTCTTCTTCCGGCGTC
GCACCTTCTCTTCGGTGGTCGGTCGGTCTCGTTTCCGGCGTTGTATCTACCCTTTGAAGA
TAAACGTTCGGCTAAAGCTCCGCGTTGTACGATACTTGCGGTTAAGATGGCGGCTCTGTT
CGATTCCTATGGTGTTCTTGAGTGATGACTTGATGGTTTGATGTGTTTGGATGAGATCTC
GATCTTGGTTGATTGATGCTCTCCAATGGTCAGAAGTAAAGTGGTGAAGGTCTATGAAGT
GTAGGTGATGGATTTCTACTCGTGTGGTGGGTGGCTTCGTTTCTGGATGAGATCTCGACC
TTTCGATTGACGCTCTTCAGTAGAAGAAGCACAGGTGATGAAGTGGTTTGAGTGGTAGCG
TCTGTTTCCGGTGAGGTCCGGTGAAACGACGTGCAGTCTCCGGTGGGTTTCTTTTGGCGG
CGATGATGTGCTGCTTTCGATTTAGGGTTTCCTTTTGAGATCTTTTGTATTGGGCTGGTT
TGTATTTTCTAGTTTGGGCTGTTGCCTTGGGTTGTATGGGCCTGAATGAACTTTGGTTAT
TAATAAAACTAAATGTTTGTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO24TF U 109
AF RR2C752TF U 1
AF RR2DO24JQ C 109
BS 1 447 RR2C752TF
BS 448 448 RR2DO24TF
BS 449 626 RR2C752TF
BS 627 627 RR2DO24JQ
BS 628 645 RR2C752TF
BS 646 646 RR2DO24JQ
BS 647 686 RR2C752TF
BS 687 743 RR2DO24JQ

RD RR2DO24TF 484 0 0
G
GTCGTCGGTCGGGATCTGTTTAGTGTTTAGTGTATAGTCTTAGTCTTCTGTTTTCTTCTT
CTTCCGGCGTCGCACCTTCTCTTCGGTGGTCGGTCGGTCTCGTTTCCGGCGTTGTATCTA
CCCTTTGAAGATAAACGTTCGGCTAAAGCTCCGCGTTGTACGATACTTGCGGTTAAGATG
GCGGCTCTGTTCGATTCCTATGGTGTTCTTGAGTGATGACTTGATGGTTTGATGTGTTTG
GATGAGATCTCGATCTTGGTTGATTGATGCTCTCCAATGGTCAGAAGTAAAGTGGTGAAG
GTCTATGAAGTGTAGGTGATGGATTTCTACTCGTGTGGTGGGTGGCTTCGTTTCTGGATG
AGATCTCGACCTTTCGATTGACGCTCTTCAGTAGAAGAAGCACAGGTGATGAAGTGGTTT
GAGTGGTAGCGTCTGTTTCCGGTGAGGTCCGGTGAAACGACGTGCAGTCTCCGGTGGGTT
TCT

QA 2 484 2 484
DS 

RD RR2C752TF 686 0 0
CAGCTATAACCTCCTCTCTCTAGAAGTCTCTCCAGCTTCTCTCTAAAACAAAAGGTTTCC
CGGCCTCCGGTTTCTTCTCCGACCGATGACGGTGGGCTTCCAAAGACACGTCGTCGGTCG
GGATCTGTTTAGTGTTTAGTGTATAGTCTTAGTCTTCTGTTTTCTTCTTCTTCCGGCGTC
GCACCTTCTCTTCGGTGGTCGGTCGGTCTCGTTTCCGGCGTTGTATCTACCCTTTGAAGA
TAAACGTTCGGCTAAAGCTCCGCGTTGTACGATACTTGCGGTTAAGATGGCGGCTCTGTT
CGATTCCTATGGTGTTCTTGAGTGATGACTTGATGGTTTGATGTGTTTGGATGAGATCTC
GATCTTGGTTGATTGATGCTCTCCAATGGTCAGAAGTAAAGTGGTGAAGGTCTATGAAGT
GTAGGTGATGGATTTCTACTCGTGTGGCGGGTGGCTTCGTTTCTGGATGAGATCTCGACC
TTTCGATTGACGCTCTTCAGTAGAAGAAGCACAGGTGATGAAGTGGTTTGAGTGGTAGCG
TCTGTTTCCGGTGAGGTCCGGTGAAACGACGTGCAGTCTCCGGTGGGTTTCTTTTGGCGG
CGATGATGTGCTGCTTTCGATTTAGG*TTTCCTTTTGAGATCTTT*GTATTGGGCTGGTT
TGTATTTTCTAGTTTGGGCTGTTGCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2DO24JQ 635 0 0
G
GTCGTCGGTCGGGATCTGTTTAGTGTTTAGTGTATAGTCTTAGTCTTCTGTTTTCTTCTT
CTTCCGGCGTCGCACCTTCTCTTCGGTGGTCGGTCGGTCTCGTTTCCGGCGTTGTATCTA
CCCTTTGAAGATAAACGTTCGGCTAAAGCTCCGCGTTGTACGATACTTGCGGTTAAGATG
GCGGCTCTGTTCGATTCCTATGGTGTTCTTGAGTGATGACTTGATGGTTTGATGTGTTTG
GATGAGATCTCGATCTTGGTTGATTGATGCTCTCCAATGGTCAGAAGTAAAGTGGTGAAG
GTCTATGAAGTGTAGGTGATGGATTTCTACTCGTGTGGTGGGTGGCTTCGTTTCTGGATG
AGATCTCGACCTTTCGATTGACGCTCTTCAGTAGAAGAAGCACAGGTGATGAAGTGGTTT
GAGTGGTAGCGTCTGTTTCCGGTGAGGTCCGGTGAAACGACGTGCAGTCTCCGGTGGGTT
TCTTTTGGCGGCGATGATGTGCTGCTTTCGATTTAGGGTTTCCTTTTGAGATCTTTTGTA
TTGGGCTGGTTTGTATTTTCTAGTTTGGGCTGTTGCCTTGGGTTGTATGGGCCTGAATGA
ACTTTGGTTATTAATAAAACTAAATGTTTGTGGG

QA 2 635 2 635
DS 



AS 1 3

CO CL2899Contig1 735 3 5 U
GGCAAGCATATGTTCTTAATATTTAATAAATAGGGACGAAAAATAGTCATGGATTGCAAA
GCGAAAAATAGAAAGAAAACCAAGTCTATCATCATCCACAGAGTAAAAGAAAAGGACAAT
AACATAAAAGGGGTTTTGCTTCAATGACAGGCCATTGATCATTCAAAAGCCCACTGGTTC
TCTCTGCGCACCTCCTCCTCTTCCCCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAAGGTCTGG
CGAATCTCTTCTGGAGTCTTGCCCTTGATCATATCAGCAACCGTCTGGCATGTCAGGTCA
AGAAGGTTCTTGATGTTCAAATAGTTAGCAGCCAGGATGATCTCGAAGAGGGTGGCCTGA
TCGATCTTCATGAACTCGCCGTCCCACGCCTTGAGGTCATCGTCGGAGGAAGCGCCACCA
TCGACGGCCTCAGTCTTGGAAGCGGCAGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTCAATCACC
TTGGCGAGGATCTTGCTCGTGACGTTGGGGAGAGGGATCCCGTTGTCGACGCAGTCGTCT
TCGACCATGTGGGCTATGGTCTGAAACTCGAGAGCCACGGCCTCGTCGACCTCGAAGGAC
TCGCCGTCGGAGCTTTTCAACACAATCTTCTTCGTCGACATCTTTTGTGAGATGGTTTTG
ATTTCTAGAAGAGATCTGAGAGAAGCGTTCAAGGTAGGGTAAGGAAGGGAAGGGGCTGCG
TCTCTATCTCTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E223JQ U 1
AF RR2C877JQ U 130
AF RR2E223TF C 175
BS 1 341 RR2E223JQ
BS 342 446 RR2C877JQ
BS 447 447 RR2E223TF
BS 448 700 RR2C877JQ
BS 701 735 RR2E223TF

RD RR2E223JQ 341 0 0
GGCAAGCATATGTTCTTAATATTTAATAAATAGGGACGAAAAATAGTCATGGATTGCAAA
GCGAAAAATAGAAAGAAAACCAAGTCTATCATCATCCACAGAGTAAAAGAAAAGGACAAT
AACATAAAAGGGGTTTTGCTTCAATGACAGGCCATTGATCATTCAAAAGCCCACTGGTTC
TCTCTGCGCACCTCCTCCTCTTCCCCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAAGGTCTGG
CGAATCTCTTCTGGAGTCTTGCCCTTGATCATATCAGCAACCGTCTGGCATGTCAGGTCA
AGAAGGTTCTTGATGTTCAAATAGTTAGCAGCCAGGATGAT

QA 1 341 1 341
DS 

RD RR2C877JQ 573 0 0
GGGGTTTTGCTTCAATGACAGGCCATTGATCATTCAAAAGCCCACTGGTTCTCTCTGCGC
ACCTCCTCCTCTTCCTCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAAGGTCTGGCGAATCTCT
TCTGGAGTCTTGCCCTTGATCATATCAGCAGCCGTCTGGCATGTCAGGTCAAGAAGGTTC
TTGATGTTCAAATAGTTAGCAGCCAGGATGATCTCGAAGAGGGTGGCCTGATCGATCTTC
ATGAACTCGCCGTCCCACGCCTTGAGGTCATCGTCGGAGGAAGCGCCACCATCGACGGCC
TCAGTCTTGGAAGCGGCGGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTCAATCACCTTGGCGAGG
ATCTTGCTCGTGACGTTGGGGAGAGGGATCCCGTTGTCGACGCAGTCGTCTTCGACCATG
TGGGCTATGGTCTGAAACTCGAGAGCCACGGCCTCGTCGACCTCGAAGGACTCGCCGTCG
GAGCTTTTCAACACAATCTTCTTCGTCGACATCTTTTGTGAGATGGTTTTGATTTCTAGA
AGAGATCTGAGAGAAGCGTTCAAGGTAGGGT
CC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2E223TF 561 0 0
TGGTTCTCTCTGCGCACCTCCTCCTCTTCCCCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAAG
GTCTGGCGAATCTCTTCTGGAGTCTTGCCCTTGATCATATCAGCAACCGTCTGGCATGTC
AGGTCAAGAAGGTTCTTGATGTTCAAATAGTTAGCAGCCAGGATGATCTCGAAGAGGGTG
GCCTGATCGATCTTCATGAACTCGCCGTCCCACGCCTTGAGGTCATCGTCGGAGGAAGCG
CCACCATCGACGGCCTCAGTCTTGGAAGCGGCAGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTCA
ATCACCTTGGCGAGGATCTTGCTCGTGACGTTGGGGAGAGGGATCCCGTTGTCGACGCAG
TCGTCTTCGACCATGTGGGCTATGGTCTGAGACTCGAGAGCCACGGCCTCGTCGACCTCG
AAGGACTCGCCGTCGGAGCTTTTCAACACAATCTTCTTCGTCGACATCTTTTGTGAGATG
GTTTTGATTTCTAGAAGAGATCTGAGAGAAGCGTTCAAGGTAGGGTAAGGAAGGGAAGGG
GCTGCGTCTCTATCTCTATCC

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 3

CO CL2900Contig1 807 3 2 U
CAAAAAAACAACAGCAACATTGCCCAAGTTTGCACAATAAGAGTTTTGGTTTTTCATCAT
AATATCAAATGCAAACATAGACAGAAACGTACATAACAATGATAAGAACCGGGTTGTGTT
TTAAGCAACGAAGATCAGAGGAGATCGAACAAAAGTAGTGACTAATGAGAGCATATAATA
ACTCTTCTTACTTTCGGAGTAAATGGCGGCCGCGTTGGTTAGATTGTTGGACTCTGAAGT
TGAGTTCGTCAACATCATCTTGAAAATGATCAAGCCCTTTATTCTGCTTTTCGATTTCAC
TTCCCATGTCGACTGCCATGTTCTTTAGCTCTCCCAGTATATCACTCAAATCTGAAAGCC
CATCGTCTTGCTTGGCTTTTTCCATCTCCACTCTTTGATATGCATCAGCTGATTCAGGAA
GCGGTTCTCTGCTTCTTGATTGTGCTTTTGGTGGTGGGTTCAGTCCCAGTTTCTCCCTTT
TCTCCAAGTGGTTAATTCTTCTCGTTGGTGAGTGATCTCTAGTTATGACAGGACCATTTA
TAGGGCGAGTCTTCTTGGGCTTCCAAGTCTTTGAAAACATACCTCCAAGGCTTTCAAGAA
GCTTCTCACCTCTACTGAGATCATGATCAATTTCAACAGCTTGATGGTGCGTCCTGGTGA
TCTGCTCGCCCTGCTCGTGCAACATAACCAGAGTTCTAGTCGCATCAGACCTAATATCCT
CAGCCACCTTGAGACAGCCCTGTACAGATTTGGTAGTCTCCTCAGCCTTGTAAACAGCAT
AGCCCTCAAGCTCCTGACAGACTGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ71JQ U 1
AF RR2B694TF C 55
AF RR2G250JQ U 50
BS 1 758 RR2GZ71JQ
BS 759 807 RR2G250JQ

RD RR2GZ71JQ 758 0 0
CAAAAAAACAACAGCAACATTGCCCAAGTTTGCACAATAAGAGTTTTGGTTTTTCATCAT
AATATCAAATGCAAACATAGACAGAAACGTACATAACAATGATAAGAACCGGGTTGTGTT
TTAAGCAACGAAGATCAGAGGAGATCGAACAAAAGTAGTGACTAATGAGAGCATATAATA
ACTCTTCTTACTTTCGGAGTAAATGGCGGCCGCGTTGGTTAGATTGTTGGACTCTGAAGT
TGAGTTCGTCAACATCATCTTGAAAATGATCAAGCCCTTTATTCTGCTTTTCGATTTCAC
TTCCCATGTCGACTGCCATGTTCTTTAGCTCTCCCAGTATATCACTCAAATCTGAAAGCC
CATCGTCTTGCTTGGCTTTTTCCATCTCCACTCTTTGATATGCATCAGCTGATTCAGGAA
GCGGTTCTCTGCTTCTTGATTGTGCTTTTGGTGGTGGGTTCAGTCCCAGTTTCTCCCTTT
TCTCCAAGTGGTTAATTCTTCTCGTTGGTGAGTGATCTCTAGTTATGACAGGACCATTTA
TAGGGCGAGTCTTCTTGGGCTTCCAAGTCTTTGAAAACATACCTCCAAGGCTTTCAAGAA
GCTTCTCACCTCTACTGAGATCATGATCAATTTCAACAGCTTGATGGTGCGTCCTGGTGA
TCTGCTCGCCCTGCTCGTGCAACATAACCAGAGTTCTAGTCGCATCAGACCTAATATCCT
CAGCCACCTTGAGACAGCCCTGTACAGATTTGGTAGTC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2B694TF 722 0 0
CATCATAATATCAAATGCAAA***AGACAGAAACGTACATAACAATGATAAGAACCGGGT
TGTGTTTTAAGCAACGAAGATCAGAGAAGATCGAACAAAAGTAGTGACTAATGAGAGCAT
ATAATAACTCTTCTTACTTTCGGAGTAAATGGCGGCCGCGTTGGTTAGATTGTTGGACTC
TGAAGTTGAGTTCGTCAACATCATCTTGAAGATGATCAAGCCCTTTATTCTGCTTTTCGA
TTTCACTTCCCATGTCGACTGCCATGTTCTTTAGCTCTCCCAGTATATCACTCAAATCTG
AAAGCCCATCGTCTTGCTTGGCTTTTTCCATCTCCACTCTTTGATATGCATCAGCTGATT
CAGGAAGCGGTTCTCTGCTTCTTGATTGTGCTTTTGGTGGTGGGTTCAGTCCCAGTTTCT
CCCTTTTCTCCAAGTGGTTAATTCTTCTCGTTGGTGAGTGATCTCTAGTTATGACAGGAC
CATTTATAGGGCGAGTCTTCTTGGGCTTCCAAGTCTTTGAAAACATACCTCCAAGGCTTC
CAAGAAGCTTCTCACCTCTACTGAGATCATGATCAATTTCAACAGCTTGATGGTGCGTCC
TGGTGATCTGCTCGCCCTGCTCGTGCAACATAACCAGAGTTCTAGTCGCATCAGACCTAA
TATCCTCAGCCACCTTGAGACAGCCCTGTACAGATTTGGTAGTCTCCTCAGCCTTGTAAA
C
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2G250JQ 758 0 0
TTTTT
CATCATAATATCAAATGCAAACATAGACAGAAACGTACATAACAATGATAAGAACCGGGT
TGTGTTTTAAGCAACGAAGATCAGAGGAGATCGAACAAAAGTAGTGACTAATGAGAGCAT
ATAATAACTCTTCTTACTTTCGGAGTAAATGGCGGCCGCGTTGGTTAGATTGTTGGACTC
TGAAGTTGAGTTCGTCAACATCATCTTGAAAATGATCAAGCCCTTTATTCTGCTTTTCGA
TTTCACTTCCCATGTCGACTGCCATGTTCTTTAGCTCTCCCAGTATATCACTCAAATCTG
AAAGCCCATCGTCTTGCTTGGCTTTTTCCATCTCCACTCTTTGATATGCATCAGCTGATT
CAGGAAGCGGTTCTCTGCTTCTTGATTGTGCTTTTGGTGGTGGGTTCAGTCCCAGTTTCT
CCCTTTTCTCCAAGTGGTTAATTCTTCTCGTTGGTGAGTGATCTCTAGTTATGACAGGAC
CATTTATAGGGCGAGTCTTCTTGGGCTTCCAAGTCTTTGAAAACATACCTCCAAGGCTTT
CAAGAAGCTTCTCACCTCTACTGAGATCATGATCAATTTCAACAGCTTGATGGTGCGTCC
TGGTGATCTGCTCGCCCTGCTCGTGCAACATAACCAGAGTTCTAGTCGCATCAGACCTAA
TATCCTCAGCCACCTTGAGACAGCCCTGTACAGATTTGGTAGTCTCCTCAGCCTTGTAAA
CAGCATAGCCCTCAAGCTCCTGACAGACTGGCT

QA 6 758 6 758
DS 



AS 1 3

CO CL2901Contig1 736 3 2 U
GGAAACCAAAAAAAAGGACAATCCCACAACACCATAAAACTCCAAACCCACCACTTCTGC
AATCAAAGAAAGAAAACACATAGAAACATTCCTCTTTGAAGCCGTATCTAAACGAGTTCT
CATTTCTGATTCTTGATTGGTCTAAACCTTAATCAAGAAGATATGGTATGTTTCTGTTTC
TTGGTGGATCAGAAGAGGAAAGTGAAGCGGAGTAAACCGGCGGCAGGAACTCGCTCACGG
TGCGGCCATGGTGCGAGCATCGCTGACATGAAGACGTCGACGAGATTTTGTTTCGTTCCA
ATTTACTGGAAATCTTGGAGAGCCGTCGTTTGCAGTTTTTGTGGGTCTGTTCTTAAGTCC
TACCGTTAAAAGATTTTCTAGATTTTCATTATAATGTTTAACAAAATTGTAAAGTAACAT
ATAAATATATATCTATGTGTGTGGGTATAGAGATCATAGGTTTTCTTTTGAATAAAATTC
GACGAGTCTACATGCAAGAGGATTTTTTGACCTGTTAAAACCTCTTGTAATTATAAACGG
AACAATATGGGTAGGGTTATCGTATATGTATCATTAGTGAGGGTTAAAGTGATTAGTGTG
CTGAACATGATTTTAGTAGTATAAGATTTGATCTAATTTTGTGTAATTATTTTCTTGATT
ATTACAATAAAGAGCCCTTTTTGTTGTTAGTTGTTAGTAGCTCAAGTTATTTGCATCCAT
ATATGAAAGTTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F155TF U 1
AF RR2F155JQ C 121
AF RR2BR87TF U 270
BS 1 688 RR2F155TF
BS 689 736 RR2BR87TF

RD RR2F155TF 689 0 0
GGAAACCAAAAAAAAGGACAATCCCACAACACCATAAAACTCCAAACCCACCACTTCTGC
AATCAAAGAAAGAAAACACATAGAAACATTCCTCTTTGAAGCCGTATCTAAACGAGTTCT
CATTTCTGATTCTTGATTGGTCTAAACCTTAATCAAGAAGATATGGTATGTTTCTGTTTC
TTGGTGGATCAGAAGAGGAAAGTGAAGCGGAGTAAACCGGCGGCAGGAACTCGCTCACGG
TGCGGCCATGGTGCGAGCATCGCTGACATGAAGACGTCGACGAGATTTTGTTTCGTTCCA
ATTTACTGGAAATCTTGGAGAGCCGTCGTTTGCAGTTTTTGTGGGTCTGTTCTTAAGTCC
TACCGTTAAAAGATTTTCTAGATTTTCATTATAATGTTTAACAAAATTGTAAAGTAACAT
ATAAATATATATCTATGTGTGTGGGTATAGAGATCATAGGTTTTCTTTTGAATAAAATTC
GACGAGTCTACATGCAAGAGGATTTTTTGACCTGTTAAAACCTCTTGTAATTATAAACGG
AACAATATGGGTAGGGTTATCGTATATGTATCATTAGTGAGGGTTAAAGTGATTAGTGTG
CTGAACATGATTTTAGTAGTATAAGATTTGATCTAATTTTGTGTAATTATTTTCTTGATT
ATTACAATAAAGAGCCCTTTTTGTTGTT
A

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2F155JQ 568 0 0
CATTTCTGATTCTTGATTGGTCTAAACCTTAATCAAGAAGATATGGTATGTTTCTGTTTC
TTGGTGGATCAGAAGAGGAAAGTGAAGCGGAGTAAACCGGCGGCAGGAACTCGCTCACGG
TGCGGCCATGGTGCGAGCATCGCTGACATGAAGACGTCGACGAGATTTTGTTTCGTTCCA
ATTTACTGGAAATCTTGGAGAGCCGTCGTTTGCAGTTTTTGTGGGTCTGTTCTTAAGTCC
TACCGTTAAAAGATTTTCTAGATTTTCATTATAATGTTTAACAAAATTGTAAAGTAACAT
ATAAATATATATCTATGTGTGTGGGTATAGAGATCATAGGTTTTCTTTTGAATAAAATTC
GACGAGTTTACATGCAAGAGGATTTTTTGACCTGTTAAAACCTCTTGTAATTATAAACGG
AACAATATGGGTAGGGTTATCGTATATGTATCATTAGTGAGGGTTAAAGTGATTAGTGTG
CTGAACATGATTTTAGTAGTATAAGATTTGATCTAATTTTGTGTAATTATTTTCTTGATT
ATTACAATAAAGAGCCCTTTTTGTTGTT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2BR87TF 467 0 0
GAAGACGTCGACGAGATTTTGTTTCGTTCCAATTTACTGGAAATCTTGGAGAGCCGTCGT
TTGCAGTTTTTGTGGGTCTGTTCTTAAGTCCTACCGTTAAAAGATTTTCTAGATTTTCAT
TATAATGTTTAACAAAATTGTAAAGTAACATATAAATATATATCTATGTGTGTGGGTATA
GAGATCATAGGTTTTCTTTTGAATAAAATTCGACGAGTCTACATGCAAGAGGATTTTTTG
ACCTGTTAAAACCTCTTGTAATTATAAACGAAACAATATGGGTAGGGTTATCGTATATGT
ATCATTAGTGAGGGTTAAAGTGATTAGTGTGCTGAACATGATTTTAGTAGTATAAGATTT
GATCTAATTTTGTATAATTATTTTCTTGATTATTACA*TAAAGAGCCCTTTTTGTTGTTA
GTTGTTAGTAGCTCAAGTTATTTGCATCCATATATGAAAGTTTGATT

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 3

CO CL2902Contig1 1114 3 4 U
GGGACCTAAAGTCAAAACTTCTTAAACTTGGCTTCAGATCTGAAAAGGGCTTCATCGAAC
TCTCCGGCGTCGTTTCATGATCTGACTCGCTTCTTCTTCTTCATTATCTCTTTACTTAGG
ACTAAGCAAAGCTGACAACACAATCTGGTTTGAAGACGGTTCCTTTTAGTTTTCTCTCAC
AAAGACCATTTCAAGTGCTCTTATGAACATGGATTCAGCAAACAGTGAGTTCAACAAACG
CGCTAGATTGTTTGAGGATCGTGAAAACAAAGACTCCAAGGTGATTCATTCAATGATCCC
TGAATCTACCACACCCCTTAATAAAGGGTATGACGCTTCTACAACCACTCAAAACTTGTT
CGTTGAATCAAGACCTGAAGCTACGACGCCTAAAGTACTTAAGAAGAGAGGAAGGAAGAA
GAAGAATCCTAACCCCGAGGAAACAAACTCGTCAACTCCAGGTGGAGAGGACTCAGAGAA
CCGCTCAAAGTTCTACGAGAGTGCTTCTGCTAGGATGAGAACTGCAACTGCAGAGGAAAG
AGAGAGAGCCATCAGTGCAACCAAAACCTACGAACCAACCAATCCTTTCTTTAGAGTTGT
TCTGCGACCATCTTATCTCTACAGAGGCTGCATCATGTACTTGCCTTCTGGTTTTGCTGA
GAAGTACTTGAGCGGAATCTCTGGCTTCATTAAGATCCAGCTAGGGGAGAAACAGTGGCC
AGTGAGGTGTCTTTACAAGGCAGGGAGAGCTAAGTTCAGCCAAGGATGGTATGAGTTCAC
GCTTGAGAACAACATAGGTGAAGGGGATGTTTGTGTGTTTGAGCTTCTCAGTTCTCGGGA
CTTTGTTCTGAAAGTCACTGCCTTTCGCGTCAATCAGTACGTGTGACTCTTCATGAGCGG
TCTTCGTTCCCAAAGTTCAAAAATTTCATGTAGGGTCTTTTATCTGTTTGTTCTGAGTGA
AATTTCTGGTTACTGTGGTTTCAATGTGATTAAGTATTTGAAGATTGAGTGAAAAACTCT
GTATGAGTGGGTAGTTAGGGTCGAAAGTAGAAGATGTTATTACTTTTATGTGATGTGACT
ATGATGTGGTTTAAGGTTTGGCTCCGAACAAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D674TF U 1
AF RR2D674JQ C 403
AF RR2G007TF U 474
BS 1 654 RR2D674TF
BS 655 655 RR2G007TF
BS 656 695 RR2D674TF
BS 696 1114 RR2G007TF

RD RR2D674TF 695 0 0
GGGACCTAAAGTCAAAACTTCTTAAACTTGGCTTCAGATCTGAAAAGGGCTTCATCGAAC
TCTCCGGCGTCGTTTCATGATCTGACTCGCTTCTTCTTCTTCATTATCTCTTTACTTAGG
ACTAAGCAAAGCTGACAACACAATCTGGTTTGAAGACGGTTCCTTTTAGTTTTCTCTCAC
AAAGACCATTTCAAGTGCTCTTATGAACATGGATTCAGCAAACAGTGAGTTCAACAAACG
CGCTAGATTGTTTGAGGATCGTGAAAACAAAGACTCCAAGGTGATTCATTCAATGATCCC
TGAATCTACCACACCCCTTAATAAAGGGTATGACGCTTCTACAACCACTCAAAACTTGTT
CGTTGAATCAAGACCTGAAGCTACGACGCCTAAAGTACTTAAGAAGAGAGGAAGGAAGAA
GAAGAATCCTAACCCCGAGGAAACAAACTCGTCAACTCCAGGTGGAGAGGACTCAGAGAA
CCGCTCAAAGTTCTACGAGAGTGCTTCTGCTAGGATGAGAACTGCAACTGCAGAGGAAAG
AGAGAGAGCCATCAGTGCAACCAAAACCTACGAACCAACCAATCCTTTCTTTAGAGTTGT
TCTGCGACCATCTTATCTCTACAGAGGCTGCATCATGTACTTGCCTTCTGGTTT*GCTGA
GAAGTACTTGAGCGGAATCTCTGGCTTCATTAAGA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2D674JQ 653 0 0
GAAGAGAGGAAGGAAGAAGAAGAATCCTAACCCCGAGGAAACAAACTCGTCAACTCCAGG
TGGAGAGGACTCAGAGAACCGCTCAAAGTTCTACGAGAGTGCTTCTGCTAGGATGAGAAC
TGCAACTGCAGAGGAAAGAGAGAGAGCCATCAGTGCAACCAAAACCTACGAACCAACCAA
TCCTTTCTTTAGAGTTGTTCTGCGACCATCTTATCTCTACAGAGGCTGCATCATGTACTT
GCCTTCTGGTTTTGCTGAGAAGTACTTGAGCGGAATCTCTGGCTTCATTAAGATCCAGCT
AGGGGAGAAACAGTGGCCAGTGAGGTGTCTTTACAAGGCAGGGAGAGCTAAGTTCAGCCA
AGGATGGTATGAGTTCACGCTTGAGAACAACATAGGTGAAGGGGATGTTTGTGTGTTTGA
GCTTCTCAGTTCTCGGGACTTTGTTCTGAAAGTCACTGCCTTTCGCGTTAATCAGTACGT
GTGACTCTTCATGAGCGGTCTTCGTTCCCAAAGTTCAAAAATTTCATGTAGGGTCTTTTA
TCTGTTTGTTCTGAGTGAAATTTCTGGTTACTGTGGTTTCAATGTGATTAAGTATTTGAA
GATTGAGTGAAAAACTCTGTATGAGTGGGTAGTTAGGGTCGAAA
AGTAGAAGA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2G007TF 641 0 0
CAGAGAACCGCTCAAAGTTCTACGAGAGTGCTTCTGCTAGGATGAGAACTGCAACTGCAG
AGGAAAGAGAGAGAGCCATCAGTGCAGCCAAAACCTACGAACCAACCAATCCTTTCTTTA
GAGTTGTTCTGCGACCATCTTATCTCTACAGAGGCTGTATCATGTACTTGCCTTCTGGTT
TTGCTGAGAAGTACTTGAGCGGAATCTCTGGCTTCATTAAGATCCAGCTAGGGGAGAAAC
AGTGGCCAGTGAGGTGTCTTTACAAGGCAGGGAGAGCTAAGTTCAGCCAAGGATGGTATG
AGTTCACGCTTGAGAACAACATAGGTGAAGGGGATGTTTGTGTGTTTGAGCTTCTCAGTT
CTCGGGACTTTGTTCTGAAAGTCACTGCCTTTCGCGTCAATCAGTACGTGTGACTCTTCA
TGAGCGGTCTTCGTTCCCAAAGTTCAAAAATTTCATGTAGGGTCTTTTATCTGTTTGTTC
TGAGTGAAATTTCTGGTTACTGTGGTTTCAATGTGATTAAGTATTTGAAGATTGAGTGAA
AAACTCTGTATGAGTGGGTAGTTAGGGTCGAAAGTAGAAGATGTTATTACTTTTATGTGA
TGTGACTATGATGTGGTTTAAGGTTTGGCTCCGAACAAAAT

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 3

CO CL2903Contig1 1404 3 19 U
GGGATATGTTTCAATCCCAAAACCTTAAAACTTTATCAACAGCAAGAAGCCAAGAACACA
ATGCTAAATTCATCACATGCATTCTCTACACTTGTGTTTCTTTACCTTTTCTTCACCTCA
GCGGCTTTGTCTTTGCCAGTTTCCGACCCCGAGCTCGTCGTTGAGGAAGTACACAGGAAA
ATAAACGAGTCTATATCAAGAAGGAACTTAGGGTACTTCTCGTGTGAGACCGGTAATCCA
ATTGATGATTGTTGGCGATGCGACAAAGATTGGGAGAAAAACCGAAAACGGTTAGCTGAT
TGTGGAATCGGTTTTGGCAAAAACGCAATTGGTGGTCGTGATGGCGAAATCTACGTAGTC
ACTGATCCAGGAAACGATAATCCGGTAAACCCTAAACCCGGAACACTAAGATATGCAGTA
ATCCAGGACCAACCGCTTTGGATCATATTTAGCCGTGACATGACGATCCAACTGAAAGAA
GAACTCATAATGAACTCTTTCAAAACCCTAGACGGACGAGGTGCTTCCGTACACATCTCT
GGTGGACCGTGCATAACCATACAATATGTGACCAACATTATAATCCATGGTTTAAACATA
CATGACTGTAAGCAAGGTGGGAACACTTACGTGCGAGACTCTCCAGAGCACTACGGTTGG
AGGACTATATCGGATGGTGATGGTGTGTCCATCTTCGGTGGGAGCCACGTGTGGGTTGAT
CATTGCTCGCTCTCGAATTGTAACGATGGGTTGATTGATGCGATACGTGGATCAACGGCT
ATAACTATCTCTAATAATTACCTGACGCATCATAATAAGGTTATGTTATTGGGACATAGC
GACACGTATGTGCAAGACAAGAACATGCAAGTCACTATCGCTTTTAACCATTTTGGAGAA
GGCCTCGTCCAAAGAATGCCAAGATGCCGACATGGATATTTCCATGTGGTGAACAACGAC
TATACACATTGGGAGATGTATGCAATTGGAGGAAGTGCAAGTCCTACCATAAACTCTCAA
GGCAACCGTTTTCTTGCTCCTGATGGTCCTGATGACAAAGAGGTAACAAAGCATGAGGAT
GCACCCGAGAACGAATGGAGTCATTGGAATTGGAGATCAGAAGGAGATTTAATGCTTAAC
GGTGCATTCTTTACACTTTCTGGAGCTGGACCAACTAAATCGTCAAGCTATTCAAGAGCC
TCGAGCCTAGCTGCTAGACCGTCCTCTCATGTTGGTGATTTAACTATAGCATCGGGTGCA
CTCAGCTGCAAAAAGGGTTCTCACTGCTGACCCCACCAGCGTGTATTTATATATGTGTGT
ATATATATAATATAATGAAACTAGCACTTGAAAGCTAGTTATGTAATAATCTTGATGAAA
AAAGTGAAGAAGAGAGTTAATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ69TF U 1
AF RR2F358TF U 459
AF RR2AQ69JQ C 564
BS 1 697 RR2AQ69TF
BS 698 698 RR2F358TF
BS 699 814 RR2AQ69TF
BS 815 896 RR2F358TF
BS 897 897 RR2AQ69JQ
BS 898 1090 RR2F358TF
BS 1091 1091 RR2AQ69JQ
BS 1092 1121 RR2F358TF
BS 1122 1122 RR2AQ69JQ
BS 1123 1129 RR2F358TF
BS 1130 1130 RR2AQ69JQ
BS 1131 1171 RR2F358TF
BS 1172 1172 RR2AQ69JQ
BS 1173 1178 RR2F358TF
BS 1179 1179 RR2AQ69JQ
BS 1180 1194 RR2F358TF
BS 1195 1195 RR2AQ69JQ
BS 1196 1234 RR2F358TF
BS 1235 1404 RR2AQ69JQ

RD RR2AQ69TF 819 0 0
GGGATATGTTTCAATCCCAAAACCTTAAAACTTTATCAACAGCAAGAAGCCAAGAACACA
ATGCTAAATTCATCACATGCATTCTCTACACTTGTGTTTCTTTACCTTTTCTTCACCTCA
GCGGCTTTGTCTTTGCCAGTTTCCGACCCCGAGCTCGTCGTTGAGGAAGTACACAGGAAA
ATAAACGAGTCTATATCAAGAAGGAACTTAGGGTACTTCTCGTGTGAGACCGGTAATCCA
ATTGATGATTGTTGGCGATGCGACAAAGATTGGGAGAAAAACCGAAAACGGTTAGCTGAT
TGTGGAATCGGTTTTGGCAAAAACGCAATTGGTGGTCGTGATGGCGAAATCTACGTAGTC
ACTGATCCAGGAAACGATAATCCGGTAAACCCTAAACCCGGAACACTAAGATATGCAGTA
ATCCAGGACCAACCGCTTTGGATCATATTTAGCCGTGACATGACGATCCAACTGAAAGAA
GAACTCATAATGAACTCTTTCAAAACCCTAGACGGACGAGGTGCTTCCGTACACATCTCT
GGTGGACCGTGCATAACCATACAATATGTGACCAACATTATAATCCATGGTTTAAACATA
CATGACTGTAAGCAAGGTGGGAACACTTACGTGCGAGACTCTCCAGAGCACTACGGTTGG
AGGACTATATCGGATGGTGATGGTGTGTCCATCTTCG*TGGGAGCCACGTGTGGGTTGAT
CATTGCTCGCTCTCGAATTGTAACGATGGGTTGATTGATGCGATACGTGGATCAACGGCT
ATAACTATCTCTAATAATTACCTGACGCATCATA
TAAGT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR2F358TF 776 0 0
G
ATGACGATCCAACTGAAAGAAGAACTCATAATGAACTCTTTCAAAACCCTAGACGGACGA
GGTGCTTCCGTACACATCTCTGGTGGACCGTGCATAACCATACAATATGTGACCAACATT
ATAATCCATGGTTTAAACATACATGACTGTAAGCAAGGTGGGAACACTTACGTGCGAGAC
TCTCCAGAGCACTACGGTTGGAGGACTATATCGGATGGTGATGGTGTGTCCATCTTCGGT
GGGAGCCACGTGTGGGTTGATCATTGCTCGCTCCCGAATTGTAACGATGGGTTGATTGAT
GCGATACGTGGATCAACGGCTATAACTATCTCTAATAATTACCTGACGCATCATAATAAG
GTTATGTTATTGGGACATAGCGACACGTATGTGCAAGACAAGAACATGCAAGTCACTATC
GCTTTTAACCATTTTGGGGAAGGCCTCGTCCAAAGAATGCCAAGATGCCGACATGGATAT
TTCCATGTGGTGAACAACGACTATACACATTGGGAGATGTATGCAATTGGAGGAAGTGCA
AGTCCTACCATAAACTCTCAAGGCAACCGTTTTCTTGCTCCTGATGGTCCTGATGACAAA
GAGGTAACAAAGCATGAGGATGCACCCGAGAGCGAATGGAGTCATTGGAATTGGAGATCA
GAGGGAGATT*AATGCTTAACGGTGCATTCTTTACACTTTCTGGAGCTGGAC*AACTAA*
TCGTCAAGCTATTCA*GAGCCTCGAGCCTAGCTGCTAGACCGTCCTCTCATGTTG

QA 2 776 2 776
DS 

RD RR2AQ69JQ 841 0 0
ATATGTGACCAACATTATAATCCATGGTTTAAACATACATGACTGTAAGCAAGGTGGGAA
CACTTACGTGCGAGACTCTCCAGAGCACTACGGTTGGAGGACTATATCGGATGGTGATGG
TGTGTCCATCTTCGGTGGGAGCCACGTGTGGGTTGATCATTGCTCGCTCTCGAATTGTAA
CGATGGGTTGATTGATGCGATACGTGGATCAACGGCTATAACTATCTCTAATAATTACCT
GACGCATCATAATAAGGTTATGTTATTGGGACATAGCGACACGTATGTGCAAGACAAGAA
CATGCAAGTCACTATCGCTTTTAACCATTTTGGAGAAGGCCTCGTCCAAAGAATGCCAAG
ATGCCGACATGGATATTTCCATGTGGTGAACAACGACTATACACATTGGGAGATGTATGC
AATTGGAGGAAGTGCAAGTCCTACCATAAACTCTCAAGGCAACCGTTTTCTTGCTCCTGA
TGGTCCTGATGACAAAGAGGTAACAAAGCATGAGGATGCACCCGAGAACGAATGGAGTCA
TTGGAATTGGAGATCAGAAGGAGATTTAATGCTTAACGGTGCATTCTTTACACTTTCTGG
AGCTGGACCAACTAAATCGTCAAGCTATTCAAGAGCCTCGAGCCTAGCTGCTAGACCGTC
CTCTCATGTTGGTGATTTAACTATAGCATCGGGTGCACTCAGCTGCAAAAAGGGTTCTCA
CTGCTGACCCCACCAGCGTGTATTTATATATGTGTGTATATATATAATATAATGAAACTA
GCACTTGAAAGCTAGTTATGTAATAATCTTGATGAAAAAAGTGAAGAAGAGAGTTAATTA
C

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 3

CO CL2904Contig1 736 3 5 U
CGGGGACAAAACACACAAACCAAACTAAAGAAACCGTTAAAGAAAGAAAAAAAAACTGCG
TTGTTTCTTGAAAATGGAGATTGTTAGGTTCGCAGTCGCCGTCATTTTTGCACTTTCCTC
CATCTCGTCGTCTAACGCGGCAACTACACCACCGAGCGGCGGAGCAGGAGATGCTCACTC
AATGCCATGTATACAGAAACTGATGCCGTGTCAGCCGTATCTTCACTCGTCGACACCTCT
TCCTCCAGCGTCGTGTTGCATGCCGTTGAAGGAGATCGTCGAGACCGACGTAACCTGTCT
TTGCTCCGTATTCAACAACGTAGATATGCTTAGATCGCTTAACTTAACCAAAGAAAACGC
TCTTGTTCTCCCTAAAGCTTGTGGCGCTAACGCTGATGTGTCACAATGTAAAGCCAGTAC
CGGTATTACTACGCCTTCGACGTCTCCGGGAACTACTAAAACTCCTCCGGCATCTCCCGC
TGAAAGCGGCTCAGCCGGAGGTTCAGCTTCTTCAACGGCCAAACCATCAGACTCGGCTCC
GGCCATCAACTTTTCCGGAATAAGCTTCGCCTCAGCTTTCGTGGCATTGGCAACAATCTT
TTTCTGATATCCTACTAAGTCACGTCTTTATTCAGTTTAGTAAGTTTAAAATGTTGGAAA
CTATTATTATCAGACAATATTTGGTAACCGATGAGTATTAACATGTACTATGAAATTTCT
GATATAGTAATACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C669TF U 1
AF RR2GS89TF U 4
AF RR2GF91TF U 5
BS 1 331 RR2C669TF
BS 332 700 RR2GS89TF
BS 701 701 RR2GF91TF
BS 702 729 RR2GS89TF
BS 730 736 RR2GF91TF

RD RR2C669TF 331 0 0
CGGGGACAAAACACACAAACCAAACTAAAGAAACCGTTAAAGAAAGAAAAAAAAACTGCG
TTGTTTCTTGAAAATGGAGATTGTTAGGTTCGCAGTCGCCGTCATTTTTGCACTTTCCTC
CATCTCGTCGTCTAACGCGGCAACTACACCACCGAGCGGCGGAGCAGGAGATGCTCACTC
AATGCCATGTATACAGAAACTGATGCCGTGTCAGCCGTATCTTCACTCGTCGACACCTCT
TCCTCCAGCGTCGTGTTGCATGCCGTTGAAGGAGATCGTCGAGACCGACGTAACCTGTCT
TTGCTCCGTATTCAACAACGTAGATATGCTT

QA 1 331 1 331
DS 

RD RR2GS89TF 726 0 0
GGAC
AAAACACACAAACCAAACTAAAGAAACCGTTAAAGAAAGAAAAAAAAACTGCGTTGTTTC
TTGAAAATGGAGATTGTTAGGTTCGCAGTCGCCGTCATTTTTGCACTTTCCTCCATCTCG
TCGTCTAACGCGGCAACTACACCACCGAGCGGCGGAGCAGGAGATGCTCACTCAATGCCA
TGTATACAGAAACTGATGCCGTGTCAGCCGTATCTTCACTCGTCGACACCTCTTCCTCCA
GCGTCGTGTTGCATGCCGTTGAAGGAGATCGTCGAGACCGACGTAACCTGTCTTTGCTCC
GTATTCAACAACGTAGATATGCTTAGATCGCTTAACTTAACCAAAGAAAACGCTCTTGTT
CTCCCTAAAGCTTGTGGCGCTAACGCTGATGTGTCACAATGTAAAGCCAGTACCGGTATT
ACTACGCCTTCGACGTCTCCGGGAACTACTAAAACTCCTCCGGCATCTCCCGCTGAAAGC
GGCTCAGCCGGAGGTTCAGCTTCTTCAACGGCCAAACCATCAGACTCGGCTCCGGCCATC
AACTTTTCCGGAATAAGCTTCGCCTCAGCTTTCGTGGCATTGGCAACAATCTTTTTCTGA
TATCCTACTAAGTCACGTCTTTATTCAGTTTAGTAAGTTTAAAATGTTGGAAACTATTAT
TATCAGACAATATTTGGTAACCGATGAGTATTA*CATGTACTATGAAATTTCTGATATAG
TA

QA 5 726 5 726
DS 

RD RR2GF91TF 732 0 0
GGA
AAAACACACAAACCAAACTAAAGAAACCGTTAAAGAAAGAAAAAAAAACTGCGTTGTTTC
TTGAAAATGGAGATTGTTAGGTTCGCAGTCGCCGTCATTTTTGCACTTTCCTCCATCTCG
TCGTCTAACGCGGCAACTACACCACCGAGCGGCGGAGCAGGAGATGCCCACTCAATGCCA
TGTATACAGAAACTGATGCCGTGTCAGCCGTATCTTCACTCGTCGACACCTCTTCCTCCA
GCGTCGTGTTGCATGCCGTTGAAGGAGATCGTCGAGACCGGCGTAACCTGTCTTTGCTCC
GTATTCAACAACGTAGATATGCTTAGATCGCTTAACTTAACCAAAGAAAACGCTCTTGTT
CTCCCTAAAGCTTGTGGCGCTAACGCTGATGTGTCACAATGTAAAGCCAGTACCGGTATT
ACTACGCCTTCGACGTCTCCGGGAACTACTAAAACTCCTCCGGCATCTCCCGCTGAAAGC
GGCTCAGCCGGAGGTTCAGCTTCTTCAACGGCCAAACCATCAGACTCGGCTCCGGCCATC
AACTTTTCCGGAATAAGCTTCGCCTCAGCTTTCGTGGCATTGGCAACAATCTTTTTCTGA
TATCCTACTAAGTCACGTCTTTATTCAGTTTAGTAAGTTTAAAATGTTGGAAACTATTAT
TATCAGACAATATTTGGTAACCGATGAGTATTAACATGTACTATGAA*TTTCTGATATAG
TAATACTTT

QA 4 732 4 732
DS 



AS 1 3

CO CL2905Contig1 573 3 9 U
GGATCCAAGAGAAAACGATCCATCTTTCTCATCTGCTACCTCTCGATCTCAGGAAAAGAA
AAGGATCTGATGGGAGGAGGAGGAGAGCATGGACACGGAGGCGATTTCAGAGCGAAGGTT
TGGAGCATGTCTGGTGGGCCTTACTGTAGGCCCAAACACTGGCGTCGCAACACTGCCCTT
GCTATGTTCGGCGTCTTCCTTGTCTGCATCCCCATCGCCCTGAAATCTGCTGAACTAGAG
CAAAGGCCACACATGCCGGTACGTCCGATTCCTTCACAGATGTGGTGCAAGAACTTTGGC
ACCAAGGATGATTACGAAAAAGAGCATTGATTCTAAAATCCTTTTTCATTTTCGTTACTA
GTGTGACATTAAATCCATAATAATCTGTCTTTGCTGGAATCCTCTCAAACCGATGGAATG
TTTTGCACGCTTATGTTTTTATGTTTGCCATTCAAATAGTGGTTTTTCATCAAACATTTG
AGTTTTGCCTTGATGTATCGCAACAACTATAAAGACAATTCTTCAATATTCTATCAAACT
CTATCTGCATCATATATTTCTGTGTATTCCATC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FJ02TF U 2
AF RR2ET73JQ C 1
AF RR2ET73TF U 1
BS 1 1 RR2ET73JQ
BS 2 173 RR2FJ02TF
BS 174 174 RR2ET73TF
BS 175 310 RR2FJ02TF
BS 311 311 RR2ET73TF
BS 312 338 RR2FJ02TF
BS 339 339 RR2ET73TF
BS 340 524 RR2FJ02TF
BS 525 573 RR2ET73TF

RD RR2FJ02TF 523 0 0
GATCCAAGAGAAAACGATCCATCTTTCTCATCTGCTACCTCTCGATCTCAGGAAAAGAAA
AGGATCTGATGGGAGGAGGAGGAGAGCATGGACACGGAGGCGATTTCAGAGCGAAGGTTT
GGAGCATGTCTGGTGGGCCTTACTGTAGGCCCAAACACTGGCGTCGCAACACAGCCCTTG
CTATGTTCGGCGTCTTCCTTGTCTGCATCCCCATCGCCCTGAAATCTGCTGAACTAGAGC
AAAGGCCACACATGCCGGTACGTCCGATTCCTTCACAGATGTGGTGCAAGAACTTTGGCA
CCAAGGATGGTTACGAAAAAGAGCATTGATTCTAAAAGCCTTTTTCATTTTCGTTACTAG
TGTGACATTAAATCCATAATAATCTGTCTTTGCTGGAATCCTCTCAAACCGATGGAATGT
TTTGCACGCTTATGTTTTTATGTTTGCCATTCAAATAGTGGTTTTTCATCAAACATTTGA
GTTTTGCCTTGATGTATCGCAACAACTATAAAGACAATTCTTC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2ET73JQ 573 0 0
GGATCCAAGAGAAAACGATCCATCTTTCTCATCTGCTACCTCTCGATCTCAGGAAAAGAA
AAGGATCTGATGGGAGGAGGAGGAGAGCATGGACACGGAGGCGATTTCAGAGCGAAGGTT
TGGAGCATGTCTGGTGGGCCTTACTGTAGGCCCAAACACTGGCGTCGCAACACTGCCCTT
GCTATGTTCGGCGTCTTCCTTGTCTGCATCCCCATCGCCCTGAAATCTGCTGAACTAGAG
CAAAGGCCACACATGCCGGTACGTCCGATTCCTTCACAGATGTGGTGCAAGAACTTTGGC
ACCAAGGATGATTACGAAAAAGAGCATTGATTCTAAAATCCTTTTTCATTTTCGTTACTA
GTGTGACATTAAATCCATAATAATCTGTCTTTGCTGGAATCCTCTCAAACCGATGGAATG
TTTTGCACGCTTATGTTTTTATGTTTGCCATTCAAATAGTGGTTTTTCATCAAACATTTG
AGTTTTGCCTTGATGTATCGCAACAACTATAAAGACAATTCTTCAATATTCTATCAAACT
CTATCTGCATCATATATTTCTGTGTATTCCATC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2ET73TF 573 0 0
G
GATCCAAGAGAAAACGATCCATCTTTCTCATCTGCTACCTCTCGATCTCAGGAAAAGAAA
AGGATCTGATGGGAGGAGGAGGAGAGCATGGACACGGAGGCGATTTCAGAGCGAAGGTTT
GGAGCATGTCTGGTGGGCCTTACTGTAGGCCCAAACACTGGCGTCGCAACACTGCCCTTG
CTATGTTCGGCGTCTTCCTTGTCTGCATCCCCATCGCCCTGAAATCTGCTGAACTAGAGC
AAAGGCCACACATGCCGGTACGTCCGATTCCTTCACAGATGTGGTGCAAGAACTTTGGCA
CCAAGGATGATTACGAAAAAGAGCATTGATTCTAAAATCCTTTTTCATTTTCGTTACTAG
TGTGACATTAAATCCATAATAATCTGTCTTTGCTGGAATCCTCTCAAACCGATGGAATGT
TTTGCACGCTTATGTTTTTATGTTTGCCATTCAAATAGTGGTTTTTCATCAAACATTTGA
GTTTTGCCTTGATGTATCGCAACAACTATAAAGACAATTCTTCAATATTCTATCAAACTC
TATCTGCATCATATATTTCTGTGTATTCCATC

QA 2 573 2 573
DS 



AS 1 3

CO CL2906Contig1 590 3 3 U
CGCAAGAAGTTGGTCATTTCATAGGGTGTATGTGTGACAACAATAGCATTACAACAACAG
CGGTAAGAAACATACAAATATAAGAGTTTGATTACAACGAAATGATATTTGAGAATTAAA
GGGTTACAAGAGGCTCTTCGTTGGTTTTGGTGTCACTGGCTGGTGCAACCTCCTCTTGTT
TTGGTGGCTCAGTCTCATCAACAGCTTCGACGGTTGCTTCAGTCTTCACAGCCTCTGGAG
CTGCCTCAGCCTCAGCTGGTTTGGCTGGTTCAGCTTCCTTCTGTGACTCTGCTCCATCTA
CAGCAGGCTCTTCCTTCTCTGCAACAACTTCGTCTGCCTTCTCCTGAGTAACGGCTTCGG
ATTCCACATTCTTGGACTCCACGGCGACGTTTTCTGTCACGGCAGGGGTTTCAAGGATAT
CAGACTCCTTAGGTTTGCTCGCACAGCCTCCCATGGTGTTGAATGAAAGAATCTGCTTAA
AACAAAGACAAGTTACAATGGGAAGAACTGTGGAGCCAACAATGAAACTCCTTTTCTGAT
CCTTTTTTAAAA*AGCCAAAACTGTTTTTTCGTTATTAGAGGCTGAGCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AE83JQ U 1
AF RR2AE83TF C 1
AF RR2AI53JQ U 31
BS 1 422 RR2AE83JQ
BS 423 423 RR2AI53JQ
BS 424 590 RR2AE83JQ

RD RR2AE83JQ 590 0 0
CGCAAGAAGTTGGTCATTTCATAGGGTGTATGTGTGACAACAATAGCATTACAACAACAG
CGGTAAGAAACATACAAATATAAGAGTTTGATTACAACGAAATGATATTTGAGAATTAAA
GGGTTACAAGAGGCTCTTCGTTGGTTTTGGTGTCACTGGCTGGTGCAACCTCCTCTTGTT
TTGGTGGCTCAGTCTCATCAACAGCTTCGACGGTTGCTTCAGTCTTCACAGCCTCTGGAG
CTGCCTCAGCCTCAGCTGGTTTGGCTGGTTCAGCTTCCTTCTGTGACTCTGCTCCATCTA
CAGCAGGCTCTTCCTTCTCTGCAACAACTTCGTCTGCCTTCTCCTGAGTAACGGCTTCGG
ATTCCACATTCTTGGACTCCACGGCGACGTTTTCTGTCACGGCAGGGGTTTCAAGGATAT
CAAACTCCTTAGGTTTGCTCGCACAGCCTCCCATGGTGTTGAATGAAAGAATCTGCTTAA
AACAAAGACAAGTTACAATGGGAAGAACTGTGGAGCCAACAATGAAACTCCTTTTCTGAT
CCTTTTTTAAAA*AGCCAAAACTGTTTTTTCGTTATTAGAGGCTGAGCCC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2AE83TF 590 0 0
CGCAAGAAGTTGGTCATTTCATAGGGTGTATGTGTGACAACAATAGCATTACAACAACAG
CGGTAAGAAACATACAAATATAAGAGTTTGATTACAACGAAATGATATTTGAGAATTAAA
GGGTTACAAGAGGCTCTTCGTTGGTTTTGGTGTCACTGGCTGGTGCAACCTCCTCTTGTT
TTGGTGGCTCAGTCTCATCAACAGCTTCGACGGTTGCTTCAGTCTTCACAGCCTCTGGAG
CTGCCTCAGCCTCAGCTGGTTTGGCTGGTTCAGCTTCCTTCTGTGACTCTGCTCCATCTA
CAGCAGGCTCTTCCTTCTCTGCAACAACTTCGTCTGCCTTCTCCTGAGTAACGGCTTCGG
ATTCCACATTCTTGGACTCCACGGCGACGTTTTCTGTCACGGCAGGGGTTTCAAGGATAT
CAGACTCCTTAGGTTTGCTCGCACAGCCTCCCATGGTGTTGAATGAAAGAATCTGCTTAA
AACAAAGACAAGTTACAATGGGAAGAACTGTGGAGCCAACAATGAAACTCCTTTTCTGAT
CCTTTTTTAAAA*AGCCAAAACTGTTTTTTCGTTATTAGAGGCTGAGCCC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2AI53JQ 545 0 0
TGTGTGACAACAATAGCATTACAACAACAGCGGTAAGAAACATACAAATATAAGAGTTTG
ATTACAACGAAATGATATTTGAGAATTAAAGGGTTACAAGAGGCTCTTCGTTGGTTTTGG
TGTCACTGGCTGGTGCAACCTCCTCTTGTTTTGGTGGCTCAGTCTCATCAACAGCTTCGA
CGGTTGCTTCAGTCTTCACAGCCTCTGGAGCTGCCTCAGCCTCAGCTGGTTTGGCTGGTT
CAGCTTCCTTCTGTGACTCTGCTCCATCTACAGCAGGCTCTTCCTTCTCTGCAACAACTT
CGTCTGCCTTCTCCTGAGTAACGGCTTCGGATTCCACATTCTTGGACTCCACGGCGACGT
TTTCTGTCACGGCAGGGGTTTCAAGGATATCAGACTCCTTAGGTTTGCTCGCACAGCCTC
CCATGGTGTTGAATGGAAGAATCTGCTTAAAACAAAGACAAGTTACAATGGGAAGAACTG
TGGAGCCAACAATGAAACTCCTTTTCTGATCCTTTTTTTAAAGAGCCAAAACTGTTTTTT
CGTTA

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 3

CO CL2907Contig1 1376 3 12 U
GGACAGATATCTTCGGTTTCAAAATGATAAGCTACATATATGGCGATTGAGATTCGTAAC
GGCGGCGTCGTGTAACTCCCACTTTAACCCTTTGTCTTTAATGGTGTTTACGACCTCTTC
AGATGGACCTTCCAGTCGTCGAATCGGTCCGGTCGATGCTCAAAGGTTGTCGAAGCTAGG
CTTCTGAGGTTCTGGGAAGCTCGGAACATCAAGTGTGGTGGGGAGCTCATGTGGATGGAT
TTGGTGATGGTGGACGTCAATGGTGCCATGATGCAAGCTGTTATTGGTTCTAGCCTTCTT
CCCAAGTACCGTGAAAGACTCACGGCTGGAACCGTGTTCTCTGTCTCTGGATTTGATGTC
TCCAGATGTGCCCAAAACTTCCGACTCACTGACTCCCCGTTGATGATCCGGTTCAATGAG
AACACCTCTTTCGAGGAGTTGGCGGAACCTGTCTCTCCTTTGCCAGAAGAAGCATTCCGG
TTCCGTAACCAGTCTGAGTTGATTGGCTTAGCCAACAGTAACACTCAGTTGCCAGACGTC
ATTGGTGAACTGGTTAGTGTGAGAAGCACCGTTTCAGACCCTCCGGAGGAGAAGAACCGG
GTTATGGTGACTGTGAAGCTGGAGAGTGAGGAGACTGTCACTCTAAGTTTGTTTGACTCT
CACGCTGTTGCCTTTCATAGGCAACTAGAGGATATCCGTGATGACCCGAGGGTTATTGTT
GCTACCAGCATCAATCCAAAGATGGTTGGAGGTCGTTTGTTTCTGAATGCAACATCAGGA
ACACACGTGTACTTTGATAAGAATACCATTGCAGGGAGTAACCGTTTATTGCAGAAATGG
AGGGAAGGACCTACACTTTCCAGGTGAGAGTCAACGCGTACAACTTCACCCAGCATCATA
AGACATTCACGATAACGCGTGTTGCTAAGGATCATGGTCGGTTGCCAGTCGATGAATTGG
AAAACAATGGAGATAATGATGGTGGTGATGACGGTGCTCCTGCTGATGGTGATGACGGTG
CTCCTGCTGATGGTGGTGACGGTGCTCCTGCTGATGGTGATGACGACGCTCCTGCTGATG
GTGGTGACGATGCTCCTGCTGATGGTGGTGACGTTCCTACTGGTGATGGTGGTGACAATG
CTCCTGATGATGGTGATGTCAAGAAATCCGGCGGCAAGACACGTAAGAAATCGGGCGGAG
GACTGTCCAAGCCTTTGAAGAAGGCGCGTGCTGGTTGAGATACTATATATGTCTGACCAA
TTATATGCATCTATGTTTATTGAAGTTTATTTGGATTTGAATACTTATGTTTTGGTATTT
CCCCGTTTTGGGCGGATTTATTTTGAATACATTGCTTTGGTTTAGTGTTACAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY10TFB U 276
AF RR2GF17TF U 1
AF RR2GF17JQ C 598
BS 1 433 RR2GF17TF
BS 434 434 RR2AY10TFB
BS 435 680 RR2GF17TF
BS 681 681 RR2GF17JQ
BS 682 691 RR2GF17TF
BS 692 692 RR2GF17JQ
BS 693 725 RR2GF17TF
BS 726 726 RR2GF17JQ
BS 727 733 RR2GF17TF
BS 734 734 RR2GF17JQ
BS 735 766 RR2GF17TF
BS 767 1376 RR2GF17JQ

RD RR2AY10TFB 380 0 0
AGCTGTTATTGGTTCTAGCCTTCTTCCCAAGTACCGTGAAAGACTCACGGCTGGAACCGT
GTTCTCTGTCTCTGGATTTGATGTCTCCAGATGTGCCCAAAACTTCCGACTCACTGACTC
CCCGTTGATGATCCGGTTCAATGAGAACACCTCTTTCGAGGAGTTGGCGGAACCTGTCTC
TCCTTTGCCAGAAGAAGCATTCCGGTTCCGTAACCAGTCTGAGTTGATTGGCTTAGCCAA
CTGTAACACTCAGTTGCCAGACGTCATTGGTGAACTGGTTAGTGTGAGAAGCACCGTTTC
AGACCCTCCGGAGGAGAAGAACCGGGTTATGGTGACTGTGAAGCTGGAGAGTGAGGAGAC
TGTCACTCTAAGTTTGTTTG

QA 1 380 1 380
DS 

RD RR2GF17TF 785 0 0
GGACAGATATCTTCGGTTTCAAAATGATAAGCTACATATATGGCGATTGAGATTCGTAAC
GGCGGCGTCGTGTAACTCCCACTTTAACCCTTTGTCTTTAATGGTGTTTACGACCTCTTC
AGATGGACCTTCCAGTCGTCGAATCGGTCCGGTCGATGCTCAAAGGTTGTCGAAGCTAGG
CTTCTGAGGTTCTGGGAAGCTCGGAACATCAAGTGTGGTGGGGAGCTCATGTGGATGGAT
TTGGTGATGGTGGACGTCAATGGTGCCATGATGCAAGCTGTTATTGGTTCTAGCCTTCTT
CCCAAGTACCGTGAAAGACTCACGGCTGGAACCGTGTTCTCTGTCTCTGGATTTGATGTC
TCCAGATGTGCCCAAAACTTCCGACTCACTGACTCCCCGTTGATGATCCGGTTCAATGAG
AACACCTCTTTCGGGGAGTTGGCGGAACCTGTCTCTCCTTTGCCAGAAGAAGCATTCCGG
TTCCGTAACCAGTCTGAGTTGATTGGCTTAGCCAACAGTAACACTCAGTTGCCAGACGTC
ATTGGTGAACTGGTTAGTGTGAGAAGCACCGTTTCAGACCCTCCGGAGGAGAAGAACCGG
GTTATGGTGACTGTGAAGCTGGAGAGTGAGGAGACTGTCACTCTAAGTTTGTTTGACTCT
CACGCTGTTGCCTTTCATAG*CAACTAGAGG*TATCCGTGATGACCCGAGGGTTATTGTT
GCTAC*AGCATCA*TCCAAAGATGGTTGGAGGTCGTTTGTTTCTGA
TGCACATCAGACACACGTG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2GF17JQ 779 0 0
CGGGTTATGGTGACTGTGAAGCTGGAGAGTGAGGAGACTGTCACTCTAAGTTTGTTTGAC
TCTCAGGCTGTTGCCTTTCATAGGCAACTAGAGGATATCCGTGATGACCCGAGGGTTATT
GTTGCTACCAGCATCAATCCAAAGATGGTTGGAGGTCGTTTGTTTCTGAATGCAACATCA
GGAACACACGTGTACTTTGATAAGAATACCATTGCAGGGAGTAACCGTTTATTGCAGAAA
TGGAGGGAAGGACCTACACTTTCCAGGTGAGAGTCAACGCGTACAACTTCACCCAGCATC
ATAAGACATTCACGATAACGCGTGTTGCTAAGGATCATGGTCGGTTGCCAGTCGATGAAT
TGGAAAACAATGGAGATAATGATGGTGGTGATGACGGTGCTCCTGCTGATGGTGATGACG
GTGCTCCTGCTGATGGTGGTGACGGTGCTCCTGCTGATGGTGATGACGACGCTCCTGCTG
ATGGTGGTGACGATGCTCCTGCTGATGGTGGTGACGTTCCTACTGGTGATGGTGGTGACA
ATGCTCCTGATGATGGTGATGTCAAGAAATCCGGCGGCAAGACACGTAAGAAATCGGGCG
GAGGACTGTCCAAGCCTTTGAAGAAGGCGCGTGCTGGTTGAGATACTATATATGTCTGAC
CAATTATATGCATCTATGTTTATTGAAGTTTATTTGGATTTGAATACTTATGTTTTGGTA
TTTCCCCGTTTTGGGCGGATTTATTTTGAATACATTGCTTTGGTTTAGTGTTACAATTC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL2908Contig1 807 2 6 U
AACAAGCCATAACTGTCTTGACTATCCATGTCTGCCAATAAGTCAAGATGATACCATCTA
TCAAAAACAACACTAACAACAAACACACACAGATACACATTCTAGTACATCATTCTACTC
CTCAAATGTCTTTTTCGTTTGTTGGTCTTCTCTCATGTGTTTTCTTTCATACAAACCTCT
CTCTTCCTAAACAGACAAGAGTGAAAACTACACATGTTTGCCTTTAAAATCTTCAGGGTG
AAGCTGAAACATGATCTGCAGCACCAGAAACCGGAAAAGAAGCAGCAGCTTCCTCTTTCG
AAATGGCAACGTAGTTTGTAGGAGCAGCCGGCCTGTCTATAGTCTCCCTTCTCCCTCCTC
CTTTGGCAATTGACCTGCTTCCGTTCTGGCTTGCATTCAAAGATAAGCGCCTGCTTGGTG
CTCCGTTAGCTCCTCCGTTGTTAGCTCGTGCCCCCACCGGTTTCTTAGCACTGACTGGTC
TTACAGGACTTGGCCTGGTGCTGAAGGCAGTGTCTTGCTCTATATGTGGCTGTTCCTGAA
CCTTCTTTTGTTCCCTGAGCCTCCGTTTCTCATCTTCTCGTTCTTGCCTAAGCATACCGT
ACTCATCTAACATAGCTAGCAGGGGAACCCCATCGTATGCAAAGGACATGCTGTGCTCTT
CTTCCCAAGCTCGCGTCTTAGCGACCAATGTATCAACCATGGCAGGAATCTTGCTGACAA
GAATCCTAGCTTTCTCAGCTCTCTTGAGATTCAAATGTGCACCTCTGCTTGCACTGTACC
TGTTCTGATACCGGTTGTAGTCCTCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D785JQ U 1
AF RR2FL08JQ U 34
BS 1 97 RR2D785JQ
BS 98 98 RR2FL08JQ
BS 99 261 RR2D785JQ
BS 262 262 RR2FL08JQ
BS 263 272 RR2D785JQ
BS 273 807 RR2FL08JQ

RD RR2D785JQ 272 0 0
AACAAGCCATAACTGTCTTGACTATCCATGTCTGCCAATAAGTCAAGATGATACCATCTA
TCAAAAACAACACTAACAACAAACACACACAGATACATATTCTAGTACATCATTCTACTC
CTCAAATGTCTTTTTCGTTTGTTGGTCTTCTCTCATGTGTTTTCTTTCATACAAACCTCT
CTCTTCCTAAACAGACAAGAGTGAAAACTACACATGTTTGCCTTTAAAATCTTCAGGGTG
AAGCTGAAACATGATCTGCAGTACCAGAAACC

QA 1 272 1 272
DS 

RD RR2FL08JQ 774 0 0
GT
CAATAAGTCAAGATGATACCATCTATCAAAAACAACACTAACAACAAACACACACAGATA
CACATTCTAGTACATCATTCTACTCCTCAAATGTCTTTTTCGTTTGTTGGTCTTCTCTCA
TGTGTTTTCTTTCATACAAACCTCTCTCTTCCTAAACAGACAAGAGTGAAAACTACACAT
GTTTGCCTTTAATATCTTCAGGGTGAAGCTGAAACATGATCTGCAGCACCAGAAACCGGA
AAAGAAGCAGCAGCTTCCTCTTTCGAAATGGCAACGTAGTTTGTAGGAGCAGCCGGCCTG
TCTATAGTCTCCCTTCTCCCTCCTCCTTTGGCAATTGACCTGCTTCCGTTCTGGCTTGCA
TTCAAAGATAAGCGCCTGCTTGGTGCTCCGTTAGCTCCTCCGTTGTTAGCTCGTGCCCCC
ACCGGTTTCTTAGCACTGACTGGTCTTACAGGACTTGGCCTGGTGCTGAAGGCAGTGTCT
TGCTCTATATGTGGCTGTTCCTGAACCTTCTTTTGTTCCCTGAGCCTCCGTTTCTCATCT
TCTCGTTCTTGCCTAAGCATACCGTACTCATCTAACATAGCTAGCAGGGGAACCCCATCG
TATGCAAAGGACATGCTGTGCTCTTCTTCCCAAGCTCGCGTCTTAGCGACCAATGTATCA
ACCATGGCAGGAATCTTGCTGACAAGAATCCTAGCTTTCTCAGCTCTCTTGAGATTCAAA
TGTGCACCTCTGCTTGCACTGTACCTGTTCTGATACCGGTTGTAGTCCTCTA

QA 3 774 3 774
DS 



AS 1 3

CO CL2909Contig1 774 3 7 U
GGATCTCACAATCAAAAACACAACACACACAAACAAAGCTGTGAAGATATATCAATAGAC
AAAACAAATCACATCAAATATCAACCTGAAGCCAAAGGATCAAGGAAAAGATAACAAAAG
TGAGAAGCAATGTCAAAAGTTTCCCTTATTAGATTGTCACTGTTTGGGTTCCTGGTGATC
GCTGTCGTCACTCCATTGGCGGAAGCTACAAGAAAGTCTGTCGTTCTGGGAGGGAAGTCA
GATGTTCCGAATGTTCAGACCAACATGGAAATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGGAG
CAATTCAACCTAATGGAAGAGAGTGAGCAAGGAAACGCAGCATCCATTGCGGACACCGCC
GTGTTGAATCCGTTGAATTTTAGCAGAGTTTTGTCGGCTCAGAAACAGGTCGTGGCTGGT
CTAAAATACAATCTAAGGATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGAC
TCAGTTGTGGTTATTCAACCATGGCTCCATTCGAAGAAGTTACTCGGTTTCACTCCCGTT
GCTACTCCTGTCTACTAACTTTATTTCTTTATTGGCCAAACAAGTTTCTATAATATAATC
CAAAAAGATCAAAAGTGTTCAATGATATGAAGCTATTAACAATGGTTTAATAGTTGGTTT
TTAATGTTTCACGTTGTTCATAATGAAGACAAAAGATGTTATGAAGATGTGATGAGAGAC
TTGTTAGAATATATAATGCTAAATTTGTTCAATCCAAAAAACTATTTTTACATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG81JQ C 1
AF RR2CA26TF U 371
AF RR2CG81TF U 1
BS 1 371 RR2CG81TF
BS 372 609 RR2CA26TF
BS 610 610 RR2CG81TF
BS 611 635 RR2CA26TF
BS 636 636 RR2CG81TF
BS 637 734 RR2CA26TF
BS 735 774 RR2CG81JQ

RD RR2CG81JQ 774 0 0
GGATCTCACAATCAAAAACACAACACACACAAACAAAGCTGTGAAGATATATCAATAGAC
AAAACAAATCACATCAAATATCAACCTGAAGCCAAAGGATCAAGGAAAAGATAACAAAAG
TGAGAAGCAATGTCAAAAGTTTCCCTTATTAGATTGTCACTGTTTGGGTTCCTGGTGATC
GCTGTCGTCACTCCATTGGCGGAAGCTACAAGAAAGTCTGTCGTTCTGGGAGGGAAGTCA
GATGTTCCGAATGTTCAGACCAACATGGAAATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGGAG
CAATTCAACCTAATGGAAGAGAGTGAGCAAGGAAACGCAGCATCCATTGCGGACACCGCC
GTGTTGAATCCGTTGAATTTTAGCAGAGTTTTGTCGGCTCAGAAACAGGTCGTGGCTGGT
CTAAAATACAATCTAAGGATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGAC
TCAGTTGTGGTTATTCAACCATGGCTCCATTCGAAGAAGTTACTCGGTTTCACTCCCGTT
GCTACTCCTGTCTACTAACTTTATTTCTTTATTGGCCAAACAAGTTTCTATAATATAATC
CAAAAAGATCAAAAGTGTTCAATGATATGAAGCTATTAACAATGGTTTAATAGTTGGTTT
TTAATGTTTCACGTTGTTCATAATGAAGACAAAAGATGTTATGAAGATGTGATGAGAGAC
TTGTTAGAATATATAATGCTAAATTTGTTCAATCCAAAAAACTATTTTTACATC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2CA26TF 364 0 0
G
GTTGAATTTTAGCAGAGTTTTGTCGGCTCAGAAACAGGTCGTGGCTGGTCTAAAATACAA
TCTAAGGATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTGTGGT
TATTCAACCATGGCTCCATTCGAAGAAGTTACTCGGTTTCACTCCCGTTGCTACTCCTGT
CTACTAACTTTATTTCTTTATTGGCCAAACAAGTTTCTATAATATAATCCAAAAAGATAA
AAAGTGTTCAATGATATGAAGCTACTAACAATGGTTTAATAGTTGGTTTTTAATGTTTCA
CGTTGTTCATAATGAAGACAAAAGATGTTATGAAGATGTGATGAGAGACTTGTTAGAATA
TAT

QA 2 364 2 364
DS 

RD RR2CG81TF 721 0 0
GGATCTCACAATCAAAAACACAACACACACAAACAAAGCTGTGAAGATATATCAATAGAC
AAAACAAATCACATCAAATATCAACCTGAAGCCAAAGGATCAAGGAAAAGATAACAAAAG
TGAGAAGCAATGTCAAAAGTTTCCCTTATTAGATTGTCACTGTTTGGGTTCCTGGTGATC
GCTGTCGTCACTCCATTGGCGGAAGCTACAAGAAAGTCTGTCGTTCTGGGAGGGAAGTCA
GATGTTCCGAATGTTCAGACCAACATGGAAATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGGAG
CAATTCAACCTAATGGAAGAGAGTGAGCAAGGAAACGCAGCATCCATTGCGGACACCGCC
GTGTTGAATCCGTTGAATTTTAGCAGAGTTTTGTCGGCTCAGAAACAGGTCGTGGCTGGT
CTAAAATACAATCTAAGGATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGAC
TCAGTTGTGGTTATTCAACCATGGCTCCATTCGAAGAAGTTACTCGGTTTCACTCCCGTT
GCTACTCCTGTCTACTAACTTTATTTCTTTATTGGCCAAACAAGTTTCTATAATATAATC
CAAAA*GATCAAAAGTGTTCAATGATATGAAGCTATTAACAATGGTTTAATAGTTGGTTT
TTAATGTTTCACGTTGTTCATAATGA*GACAAAAGATGTTATGAAGATGTGATGAGAGAC
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 3

CO CL2910Contig1 1318 3 29 U
GATACAATACATATTTGGCGTTCTCCTTCAGTCACAGGTCCAGTGTACTGTTTGCAGTAA
TGTTTCTGACCAATACGAAAATATGATGGATTTAACCGTTGAGATCCACGGAGATGCGGT
ATCATTGGAGGAATGTCTCGATCAGTTCACAGCTAAAGAATGGCTTCAGGGAGAAAACCT
TTACAAATGTGATAGATGTAATGACTACGTGAAGGCATGTAAGCGCCTTTCAATCCGTTC
TGCTCCTAATATACTTACCATTGCCTTAAAAAGATTCCAGGGTGGGAGGTTTGGTAAACT
GAACAAAAGAATAAGTTTTCCCGAGACATTTGATCTCGGCCCTTACATGAGCAGCTGTGG
TGGAGGAGAAGGATCAGATGTATACAAACTCTATGCTGTGATCGTCCATTTAGATATGTT
GAATGCCTCATTTTTCGGCCACTACATTTGCTACGTTAAGGACTTCCGAGGAGACTGGTA
TAGAATAGACGATTCTGAGGTGGAAAAGGTTGAACTAGATGATGTCCTTTCTCAACGAGC
ATACATGCTCCTCTACACCAGGGTTCAGACCAGACCATCAAGTCTTAGACCCGAAGAAGT
TGAAGAGGAGAAGAAAACAGATACATTGAACACAGAATCTAATAGCCAAGATGGATCTGT
TGAGAGTTCCGGGGTGGGAACAAGTGGCACCGGTGTGTCCTCCCTCTCTGTGCAACGGCA
TCATCTCACATTCAGAAAACCATGAATGCAAAAAAGAATCGTCATCATCCGTAACTGTCA
CCGAAAAGGAAAGGGAAGTTGTTGCGGAAAGGGTTGATACAGTAGATTCTGAATCAAACC
CTTGTATTGACATGGAACATGATCAATACTCAGAAGAAGCAGCAAATGGGAAAGAAGATC
CAACGGCTGTTGATTCTCCTTGTTCGGACATTACTACTTCATCTCTGTGTGCTACAACAG
AGTCCAATCACCGGGAGAAAGAAGATTCAGACACTGAAATGATTGATAGTGCTTAATGAA
TCCAAAAAGGATAGTGAAGATCAACAAGGGAGCTTCTAACTTGGCAATAATGCTGGCAAA
ATTTGTTTTAGACGCTGCGACTTCTGGTGCCTGAAGGCGATACTTAGTCATGTGTGAGAT
GGAAACTTCAGGATGATGAAGTACGTAGTAAGTTATTGTTTTTGACTTTTATTTTTCTGT
TAAAGTAGATTTTACCATTGAGAACCCAAAACTCTTATAGCAAAGAACGATTAACACAGT
GATAACTTTTTCTGCTTATTTTGGTTTGGATAATACAGAAATCAAACTCGATTTGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY11TF U 1
AF RR2AV39TF U 101
AF RR2AV39JQ C 384
BS 1 108 RR2DY11TF
BS 109 109 RR2AV39TF
BS 110 111 RR2DY11TF
BS 112 112 RR2AV39TF
BS 113 174 RR2DY11TF
BS 175 175 RR2AV39TF
BS 176 336 RR2DY11TF
BS 337 337 RR2AV39TF
BS 338 339 RR2DY11TF
BS 340 340 RR2AV39TF
BS 341 393 RR2DY11TF
BS 394 394 RR2AV39TF
BS 395 402 RR2DY11TF
BS 403 403 RR2AV39TF
BS 404 429 RR2DY11TF
BS 430 430 RR2AV39TF
BS 431 432 RR2DY11TF
BS 433 433 RR2AV39TF
BS 434 498 RR2DY11TF
BS 499 499 RR2AV39TF
BS 500 588 RR2DY11TF
BS 589 788 RR2AV39TF
BS 789 789 RR2AV39JQ
BS 790 885 RR2AV39TF
BS 886 886 RR2AV39JQ
BS 887 895 RR2AV39TF
BS 896 896 RR2AV39JQ
BS 897 961 RR2AV39TF
BS 962 1318 RR2AV39JQ

RD RR2DY11TF 588 0 0
GATACAATACATATTTGGCGTTCTCCTTCAGTCACAGGTCCAGTGTACTGTTTGCAGTAA
TGTTTCTGACCAATACGAAAATATGATGGATTTAACCGTTGAGATCCATGGGGATGCGGT
ATCATTGGAGGAATGTCTCGATCAGTTCACAGCTAAAGAATGGCTTCAGGGAGATAACCT
TTACAAATGTGATAGATGTAATGACTACGTGAAGGCATGTAAGCGCCTTTCAATCCGTTC
TGCTCCTAATATACTTACCATTGCCTTAAAAAGATTCCAGGGTGGGAGGTTTGGTAAACT
GAACAAAAGAATAAGTTTTCCCGAGACATTTGATCTTGGGCCTTACATGAGCAGCTGTGG
TGGAGGAGAAGGATCAGATGTATACAAACTCTACGCTGTGATTGTCCATTTAGATATGTT
GAATGCCTCGTTCTTCGGCCACTACATTTGCTACGTTAAGGACTTCCGAGGAGACTGGTA
TAGAATAGACGATTCTGATGTGGAAAAGGTTGAACTAGATGATGTCCTTTCTCAACGAGC
ATACATGCTCCTCTACACCAGGGTTCAGACCAGACCATCAAGTCTTAG

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2AV39TF 861 0 0
GG
GATCCACGGAGATGCGGTATCATTGGAGGAATGTCTCGATCAGTTCACAGCTAAAGAATG
GCTTCAGGGAGAAAACCTTTACAAATGTGATAGATGTAATGACTACGTGAAGGCATGTAA
GCGCCTTTCAATCCGTTCTGCTCCTAATATACTTACCATTGCCTTAAAAAGATTCCAGGG
TGGGAGGTTTGGTAAACTGAACAAAAGAATAAGTTTTCCCGAGACATTTGATCTCGGCCC
TTACATGAGC***TGTTGTGGAGGAGGAGGATCAGATGTATACAAACTCTATGCTGTGAT
CGTCCATTTAGATATGTTGAATGCCTCATTTTTCGGCCACTACATTTGCTACGTTAAGGA
CTTCCGAGGAGACTGGTATAGAATAGACGATTCTGAGGTGGAAAAGGTTGAACTAGATGA
TGTCCTTTCTCAACGAGCATACATGCTCCTCTACACCAGGGTTCAGACCAGACCATCAAG
TCTTAGACCCGAAGAAGTTGAAGAGGAGAAGAAAACAGATACATTGAACACAGAATCTAA
TAGCCAAGATGGATCTGTTGAGAGTTCCGGGGTGGGAACAAGTGGCACCGGTGTGTCCTC
CCTCTCTGTGCAACGGCATCATCTCACATTCAGAAAACCATGAATGCAAAAAAGAATCGT
CATCATCCGTAACTGTCACCGAAAAG*AAAGGGAAGTTGTTGCGGAAAGGGTTGATACAG
TAGATTCTGAATCAAACCCTTGTATTGACATGGAACATGATCAATACTCAGAAGAAGCAG
CAA*TGGGAAAGA*GATCCAACGGCTGTTGATTCTCCTTGTTCGGACATTACTACTTCAT
CTCTGTGTGCTACAACAGA

QA 3 861 3 861
DS 

RD RR2AV39JQ 935 0 0
ACAAACTCTATGCTGTGATCGTCCATTTAGATATGT*GAATGCCTCATTTTTCGGCCACT
ACATTTGCTACGTTAAGGACTTCCGAGGAGACTGGTATAGAATAGACGATTCTGAGGTGG
AAAAGGTTGAACTAGATGATGTCCTTTCTCAACGAGCATACATGCTCCTCTACACCAGGG
TTCAGACCAGACCATCAAGTCTTAGACCCGAAGAAGTTGAAGAGGAGAAGAAAACAGATA
CATTGAACACAGAATCTAATAGCCAAGATGGATCTGTTGAGAGTTCCGGGGTGGGAACAA
GTGGCACCGGTGTGTCCTCC*TCTCTGTGCAACGGCATCATCTCACATTCAGAAAACCAT
GAATGCAAAAAAGAATCGTCATCATCCGTAACTGTCACCGAAAAGGAAAGGGAAGTTGTT
GCGGAAAGGGTTGATACAGTAGATTCTGAATCAAACCCTTGTATTGACATGGAACATGAT
CAATACTCAGAAGAAGCAGCAAATGGGAAAGAAGATCCAACGGCTGTTGATTCTCCTTGT
TCGGACATTACTACTTCATCTCTGTGTGCTACAACAGAGTCCAATCACCGGGAGAAAGAA
GATTCAGACACTGAAATGATTGATAGTGCTTAATGAATCCAAAAAGGATAGTGAAGATCA
ACAAGGGAGCTTCTAACTTGGCAATAATGCTGGCAAAATTTGTTTTAGACGCTGCGACTT
CTGGTGCCTGAAGGCGATACTTAGTCATGTGTGAGATGGAAACTTCAGGATGATGAAGTA
CGTAGTAAGTTATTGTTTTTGACTTTTATTTTTCTGTTAAAGTAGATTTTACCATTGAGA
ACCCAAAACTCTTATAGCAAAGAACGATTAACACAGTGATAACTTTTTCTGCTTATTTTG
GTTTGGATAATACAGAAATCAAACTCGATTTGACT

QA 1 935 1 935
DS 



AS 1 3

CO CL2911Contig1 552 3 8 U
GGACAACCATCAAACTAGTAAACCAAAAAAAGAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCTTTA
TCATAATAATATCACAAAGATCAGAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCGTCAT
CCTGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAAACC
ATTCTGCGCACCAGTCAATTGCGACGCTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGTCA
CTATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGGTG
CAAGTAGGGTGCAAGGCATAAGTTATCTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATCTG
CTTCCTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAACTTATGCA
TAATGTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTCTACACGATAGTTTAACCTATTTTCTCTC
CTTCTGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTTCTTCTGATTAATGACTAATAAGAG
TAAGTTTTTATG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2CW83TF U 1
AF RR2FB58TF U 1
AF RR2BO88TF U 29
BS 1 85 RR2CW83TF
BS 86 86 RR2FB58TF
BS 87 229 RR2CW83TF
BS 230 230 RR2FB58TF
BS 231 357 RR2CW83TF
BS 358 358 RR2FB58TF
BS 359 551 RR2CW83TF
BS 552 552 RR2BO88TF

RD RR2CW83TF 552 0 0
GGACAACCATCAAACTAGTAAACCAAAAAAAGAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCTTTA
TCATAATAATATCACAAAGATCAGAGTGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCGTCAT
CCTGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAAACC
ATTCTGCGCACCAGTCAATTGCGACGCTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTACTCACTGTCA
CTATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGGTG
CAAGTAGGGTGCAAGGCATAAGTTATCTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTAT*TG
CTTCCTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAACTTATGCA
TAATGTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTCTACACGATAGTTTAACCTATTTTCTCTC
CTTCTGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTTCTTCTGATTAATGACTAATAAGAG
TAAGTTTTTAT
G

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2FB58TF 551 0 0
GGACAACCATCAAACTAGTAAACCAAAAAAAGAAAACTCTAATTAATAAGCCTGTCTTTA
TCATAATAATATCACAAAGATCAGAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCGTCAT
CCTGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAAACC
ATTCTGCGCACCAGTCAATTGCGACGCTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGTCA
CTATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGGTG
CAAGTAGGGTGCAAGGCATAAGTTATCTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATCTG
CTTCCTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAACTTATGCA
TAATGTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTCTACACGATAGTTTAACCTATTTTCTCTC
CTTCTGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTTCTTCTGATTAATGACTAATAAGAG
TAAGTTTTTAT

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2BO88TF 524 0 0
G
AAGAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCTTTATCATAATAATATCACAAAGATCAGAATGT
CTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCGTCATCCTGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAAT
TTGCCGATGGCCAAAACGCTCAAGGGAAACCATTCTGCGCACCAGTCAATTGCGACGCTA
AAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGTCACTATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTT
TCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGGTGCAAGTAGGGTGCAAGGCATAAGTTATCTC
AGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATCTGCTTCCTACTTTGATTATAACACATAAGCT
TATTTTAAGTCCAACAAATAAAACTTATGCATAATGTATGTATGTTTAAAGATTTCCATA
GTCTACACGATAGTTTAACCTATTTTCTCTCCTTCTGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAG
AATATTTCTTCTGATTAATGACTAATAAGAGTAAGTTTTTATG

QA 2 524 2 524
DS 



AS 1 2

CO CL2912Contig1 774 2 4 U
GGATTAAATCGTGCATGAACAATAAAAATGGAGTTTTGGAGGATTAGTCTAGTGACGATA
GCAATAGCACTAATAATGGCGACGATGGTGGCTGCTGGTGAGGACAAGGCGAAGGATAAG
GAAGAGTGTACCGAGCAGCTTGTGGGTATGGCCACATGTCTTCCTTACGTGCAAGGCCAG
GCAAAGACTCCGACGCCGGACTGTTGCTCCGGCTTAAAACAGGTTCTCAAATCCGACAAG
AAGTGTCTGTGTGTGATCATCCAAGACAGGAATGATCCTGACTTGGGTCTCCAGATCAAC
GTCTCTCTCGCTCTTGCTCTTCCTACTGTTTGCCACGCCGTTGCTGACGTCACCAAGTGC
CCTGCTTTGCTTCATATGGACCCAAAATCTCAAGAAGCTCAAGTGTTCTATCAGTTGGCA
AACGGTTTAAACAAAACTAGCCCAGCCTCTGCTCCCGCCGGTTCGGCCCCTGAGCCCACA
AGTATATCTCCAACCGCAGGATCCGATGGTAACAACAGTGGTCGGACGACCTCTTTGCCA
AGCAAGAACCACGCTCGTAGCTTTCGGAAACGGTGGCTAAGGCTTGAAGTTGTTGCCCAA
CTCTTCATAATATCATTTATTATCACCGTTTAAAAATAGTACTGTATTGAAAAGTGAATT
TGTGCGGTTGCAGTGAGTCAGTGCCATTGATTTTATGCAGTTACTGTTTCGTGAGAACTC
TTACCAACTTTTTTTTTGTATGACGCAAAATAAGACACGAGTTACAGTTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2F584TF U 1
AF RR2F584JQ C 56
BS 1 736 RR2F584TF
BS 737 737 RR2F584JQ
BS 738 772 RR2F584TF
BS 773 774 RR2F584JQ

RD RR2F584TF 772 0 0
GGATTAAATCGTGCATGAACAATAAAAATGGAGTTTTGGAGGATTAGTCTAGTGACGATA
GCAATAGCACTAATAATGGCGACGATGGTGGCTGCTGGTGAGGACAAGGCGAAGGATAAG
GAAGAGTGTACCGAGCAGCTTGTGGGTATGGCCACATGTCTTCCTTACGTGCAAGGCCAG
GCAAAGACTCCGACGCCGGACTGTTGCTCCGGCTTAAAACAGGTTCTCAAATCCGACAAG
AAGTGTCTGTGTGTGATCATCCAAGACAGGAATGATCCTGACTTGGGTCTCCAGATCAAC
GTCTCTCTCGCTCTTGCTCTTCCTACTGTTTGCCACGCCGTTGCTGACGTCACCAAGTGC
CCTGCTTTGCTTCATATGGACCCAAAATCTCAAGAAGCTCAAGTGTTCTATCAGTTGGCA
AACGGTTTAAACAAAACTAGCCCAGCCTCTGCTCCCGCCGGTTCGGCCCCTGAGCCCACA
AGTATATCTCCAACCGCAGGATCCGATGGTAACAACAGTGGTCGGACGACCTCTTTGCCA
AGCAAGAACCACGCTCGTAGCTTTCGGAAACGGTGGCTAAGGCTTGAAGTTGTTGCCCAA
CTCTTCATAATATCATTTATTATCACCGTTTAAAAATAGTACTGTATTGAAAAGTGAATT
TGTGCGGTTGCAGTGAGTCAGTGCCATTGATTTTATGCAGTTACTGTTTCGTGAGAACTC
TTACCAACTTTTTTTT*GTATGACGCAAAATAAGACACGAGTTACAGTTTTT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2F584JQ 719 0 0
CGATAGCAATAGCACTAATAATGGCGACGATGGTGGCTGCTGGTGAGGACAAGGCGAAGG
ATAAGGAAGAGTGTACCGAGCAGCTTGTGGGTATGGCCACATGTCTTCCTTACGTGCAAG
GCCAGGCAAAGACTCCGACGCCGGACTGTTGCTCCGGCTTAAAACAGGTTCTCAAATCCG
ACAAGAAGTGTCTGTGTGTGATCATCCAAGACAGGAATGATCCTGACTTGGGTCTCCAGA
TCAACGTCTCTCTCGCTCTTGCTCTTCCTACTGTTTGCCACGCCGTTGCTGACGTCACCA
AGTGCCCTGCTTTGCTTCATATGGACCCAAAATCTCAAGAAGCTCAAGTGTTCTATCAGT
TGGCAAACGGTTTAAACAAAACTAGCCCAGCCTCTGCTCCCGCCGGTTCGGCCCCTGAGC
CCACAAGTATATCTCCAACCGCAGGATCCGATGGTAACAACAGTGGTCGGACGACCTCTT
TGCCAAGCAAGAACCACGCTCGTAGCTTTCGGAAACGGTGGCTAAGGCTTGAAGTTGTTG
CCCAACTCTTCATAATATCATTTATTATCACCGTTTAAAAATAGTACTGTATTGAAAAGT
GAATTTGTGCGGTTGCAGTGAGTCAGTGCCATTGATTTTATGCAGTTACTGTTTCGTGAG
AACTCTTACCAACTTTTTTTTTGTATGACGCAAAATAAGACACGAGTTACAGTTTTTGC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 3

CO CL2913Contig1 665 3 27 U
GGAGACGATTTGTTTGGAGAGAAAAAAAAAGTGAGCGAAAGAGAGAAGCGGAAGAAACAA
TGTACAAGAGATCACCACTAACGTCGCTCACCCTCCTGTCTCTGTTATTGGGATTCCTCA
ATCTCACCAACGCTCTTTACGGATCCTCGTCGCCTGTGGTTCAGCTCACTGCCTCTAACT
TCAAATCCAAGGTACTTAATTCAAATGGAGTAGTGTTGGTAGAGTTCTTTGCACCATGGT
GTGGTCATTGCAAAGCTCTCACACCAACATGGGAGAAAGTGGCTACTGTTTTGAAAGGTG
TTGCTACTGTCGCAGCTCTTGATGCAGACGCTCACCAGTCTGCTGCTCAGGATTATGGTA
TTCAAGGCTTCCCAACGATCAAGGTCTTTGTTCCTGGAAGGCCTCCTGTTGATTACCAAG
GAGCTAGAGATGCCAAATCCATTGCTAATTTTGCTTACAAGCAGATCAAAGCTCTTCTGA
GTGACCGTTTGGAAGGAAAAAGCAAGCCAACTGGAGGATTTAATGAAAAGAAATCTGAGC
CTAGTGCATCTGTGGAACTGAACTCTGCCAATTTTGATGAGTTGGTCATCAAAAGCAATG
ACCTCTGGATCGTTGAGTTCTTCGCACCTTGGTGTGGACACTGCAAAAGCTTGCCCCAGA
GTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2GP09TF U 10
AF RR2GU78TF U 10
AF RR2CV18TF U 1
BS 1 34 RR2CV18TF
BS 35 36 RR2GP09TF
BS 37 84 RR2CV18TF
BS 85 85 RR2GP09TF
BS 86 95 RR2CV18TF
BS 96 96 RR2GP09TF
BS 97 172 RR2CV18TF
BS 173 173 RR2GP09TF
BS 174 235 RR2CV18TF
BS 236 236 RR2GP09TF
BS 237 280 RR2CV18TF
BS 281 281 RR2GP09TF
BS 282 290 RR2CV18TF
BS 291 291 RR2GP09TF
BS 292 310 RR2CV18TF
BS 311 311 RR2GP09TF
BS 312 317 RR2CV18TF
BS 318 318 RR2GP09TF
BS 319 399 RR2CV18TF
BS 400 400 RR2GP09TF
BS 401 466 RR2CV18TF
BS 467 467 RR2GP09TF
BS 468 519 RR2CV18TF
BS 520 520 RR2GP09TF
BS 521 559 RR2CV18TF
BS 560 560 RR2GP09TF
BS 561 665 RR2CV18TF

RD RR2GP09TF 640 0 0
TTTTTTTTCTGGAGAC
AAAAAGTGAGCGAAAGAGAGAAGCGGAAGAAACAATGTACAAGAGATCACCACTAACGTC
GCTCACCCTCCTGTCTCTGTTATTGGGATTCCTCAATCTCACCAACGCTCTTTACGGATC
CTCGTCGCCTGTGGTTCAGCTCACTGCCTCTAACTTCAAATCCAAGGTACTTAATTCAAA
TGGAGTAGTGTTGGTAGAGTTCTTTGCACCATGGTGTGGTCATTGCAAAGCTCTCACACC
AACATGGGAGAAAGTGGCTACTGTTTTGAAAGGTGTTGCTACTGTCGCAGCTCTTGATGC
AGACGCTCACCAGTCTGCTGCTCAGGATTATGGTATTCAAGGCTTCCCAACGATCAAGGT
CTTTGTTCCTGGAAGGCCTCCTGTTGATTACCAAGGAGCTAGAGATGCCAAATCCATTGC
TAATTTTGCTTACAAGCAGATCAAAGCTCTTCTGAGTGACCGTTTGGAAGGAAAAAGCAA
GCCAACTGGAGGATTTAATGAAAAGAAATCTGAGCCTAGTGCATCTGTGGAACTGAACTC
TGCCAATTTTGATGAGTTGGTCATCAAAAGCAATGACCTCTGGATCGTTGAGTTCTTCGC
ACCTTGGTGTGGACACT
GCAAAAA

QA 17 633 17 633
DS 

RD RR2GU78TF 633 0 0
TTTTTTTTCTGGAGAC
AAAAAGTGAGCGAAAGAGAGAAGCGGAAGAAACAATGTACAAGAGATCACCACTAACGTC
GCTCACCCTCCTGTCTCTGTTATTGGGATTCCTCAATCTCACCAACGCTCTTTACGGATC
CTCGTCGCCTGTGGTTCAGCTCACTGCCTCTAACTTCAAATCCAAGGTACTTAATTCAAA
TGGAGTAGTGTTGGTAGAGTTCTTTGCACCATGGTGTGGTCATTGCAAAGCTCTCACACC
AACATGGGAGAAAGTGGCTACTGTTTTGAAAGGTGTTGCTACTGTCGCAGCTCTTGATGC
AGACGCTCACCAGTCTGCTGCTCAGGATTATGGTATTCAAGGCTTCCCAACGATCAAGGT
CTTTGTTCCTGGAAGGCCTCCTGTTGATTACCAAGGAGCTAGAGATGCCAAATCCATTGC
TAATTTTGCTTACAAGCAGATCAAAGCTCTTCTGAGTGACCGTTTGGAAGGAAAAAGCAA
GCCAACTGGAGGATTTAATGAAAAGAAATCTGAGCCTAGTGCATCTGTGGAACTGAACTC
TGCCAATTTTGATGAGTTGGTCATCAAAAGCAATGACCTCTGGATCGTTGAGTTCTTCGC
ACCTTGGTGTGGACACT

QA 17 633 17 633
DS 

RD RR2CV18TF 665 0 0
GGAGACGATTTGTTTGGAGAGAAAAAAAAAGTGAAAGAAAGAGAGAAGCGGAAGAAACAA
TGTACAAGAGATCACCACTAACGTTGCTCACCCTCTTGTCTCTGTTATTGGGATTCCTCA
ATCTCACCAACGCTCTTTACGGATCCTCGTCGCCTGTGGTTCAGCTCACTGCTTCTAACT
TCAAATCCAAGGTACTTAATTCAAATGGAGTAGTGTTGGTAGAGTTCTTTGCACCGTGGT
GTGGTCATTGCAAAGCTCTCACACCAACATGGGAGAAAGTTGCTACTGTTCTGAAAGGTG
TTGCTACTGTGGCAGCTATTGATGCAGACGCTCACCAGTCTGCTGCTCAGGATTATGGTA
TTCAAGGCTTCCCAACGATCAAGGTCTTTGTTCCTGGAAAGCCTCCTGTTGATTACCAAG
GAGCTAGAGATGCCAAATCCATTGCTAATTTTGCTTACAAGCAGATTAAAGCTCTTCTGA
GTGACCGTTTGGAAGGAAAAAGCAAGCCAACTGGAGGATCTAATGAAAAGAAATCTGAGC
CTAGTGCATCTGTGGAACTAAACTCTGCCAATTTTGATGAGTTGGTCATCAAAAGCAATG
ACCTCTGGATCGTTGAGTTCTTCGCACCTTGGTGTGGACACTGCAAAAGCTTGCCCCAGA
GTGGA

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 3

CO CL2914Contig1 830 3 10 U
GGAAAGGCATTGACGACGAAAAAAAAGCCTTCTTCGATCTACACTTCTCTTCTCTTCTCT
TGTCTCTCTCTCTCTCTCCCATCTAACCTCTCGCAGACAAGGTTGGTAATGGCAGAATCA
TCCAAAGTCATTCATGTTCGTAATGTTGGACATGAGATTTCTGAAAATGATTTGCTTCAG
CTTTTCCAACCGTTTGGTGTCATAACTAAGCTCGTGATGCTCAGGGCAAAGAATCAGGCT
CTTCTCCAGATGCAAGATGTTTCTTCAGCAATCACTGCTCTTCAGTTCTTCACTACTGTC
CAGCCAACCATAAGAGGAAGGAATGTGTATATCCAATTCTCGTCTCACCAAGAATTGACA
ACAGCCGAGCAGAATATTCATGGACGTGAAGATGAGCCGAATCGTATTCTCTTGGTCACA
GTCCATCACATGCTGTATCCAATCACCGTTGACGTCCTGCATCAAGTTTTTTCTCCCTAT
GGATTTGTGGAGAAGATCGTCACTTTCCAGAAGTCTGCTGGTTTTCAAGCTCTTATACAG
TATCAGGCACAACAGTGTGCTGCCTCTGCTAGAACTTCTCTACAGGGTCGTAACATATAT
GACGGGTGTTGTCAGTTGGATATCCAGTTCTCCAACCTTGAGGAGCTGCAAGTAAATTAC
AACAACGATCGATCTAGGGATTATACAAATCCAAACCTGCCATCAGAGCAAAAAGGCCGG
TTACCTCACCCTGGCTATGGTGATGCAGGAGTGGCTTATCCTCAGATGGCAAACACATCT
GCGATTGCAGCTGCCTTTGGCGGTGGCTTGCCTCCGGGTATACTGGCACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF83TF U 7
AF RR2FK85TF U 1
AF RR2B202TF U 7
BS 1 179 RR2FK85TF
BS 180 180 RR2EF83TF
BS 181 376 RR2FK85TF
BS 377 377 RR2EF83TF
BS 378 715 RR2FK85TF
BS 716 716 RR2B202TF
BS 717 719 RR2FK85TF
BS 720 720 RR2B202TF
BS 721 748 RR2FK85TF
BS 749 830 RR2B202TF

RD RR2EF83TF 536 0 0
GG
ATTGACGACGAAAAAAAAGCCTTCTTCGATCTACACTTCTCTTCTCTTCTCTTGTCTCTC
TCTCTCTCTCCCATCTAACCTCTCGCAGACAAGGTTGGTAATGGCAGAATCGTCCAAAGT
CATTCATGTTCGTAATGTTGGACATGAGATTTCTGAAAATGAATTGCTTCAGCTTTTCCA
ACCGTTTGGTGTCATAACTAAGCTCGTGATGCTCAGGGCAAAGAATCAGGCTCTTCTCCA
GATGCAAGATGTTTCTTCAGCAATCACTGCTCTTCAGTTCTTCACTACTGTCCAGCCAAC
CATAAGAGGAAGGAATGTGTATATCCAATTCTCGTCTCACCAAGAATTGACAACAGCCGA
GCAGAATATTCATGGACGTGAAGATGAGCCGAATCGTATTCTCTTGGTCACAGTCCATCA
CATGCTGTATCCAATCACCGTTGACGTCCTGCATCAAGTTTTTTCTCCCTATGGATTTGT
GGAGAAGATCGTCACTTTCCAGAAGTCTGCTGGTTTTCAAGCTCTTATACAGTA

QA 3 536 3 536
DS 

RD RR2FK85TF 752 0 0
GGAAAGGCATTGACGACGAAAAAAAAGCCTTCTTCGATCTACACTTCTCTTCTCTTCTCT
TGTCTCTCTCTCTCTCTCCCATCTAACCTCTCGCAGACAAGGTTGGTAATGGCAGAATCA
TCCAAAGTCATTCATGTTCGTAATGTTGGACATGAGATTTCTGAAAATGATTTGCTTCAA
CTTTTCCAACCGTTTGGTGTCATAACTAAGCTCGTGATGCTCAGGGCAAAGAATCAGGCT
CTTCTCCAGATGCAAGATGTTTCTTCAGCAATCACTGCTCTTCAGTTCTTCACTACTGTC
CAGCCAACCATAAGAGGAAGGAATGTGTATATCCAATTCTCGTCTCACCAAGAATTGACA
ACAGCCGAGCAGAATACTCATGGACGTGAAGATGAGCCGAATCGTATTCTCTTGGTCACA
GTCCATCACATGCTGTATCCAATCACCGTTGACGTCCTGCATCAAGTTTTTTCTCCCTAT
GGATTTGTGGAGAAGATCGTCACTTTCCAGAAGTCTGCTGGTTTTCAAGCTCTTATACAG
TATCAGGCACAACAGTGTGCTGCCTCTGCTAGAACTTCTCTACAGGGTCGTAACATATAT
GACGGGTGTTGTCAGTTGGATATCCAGTTCTCCAACCTTGAGGAGCTGCAAGTAAATTAC
AACAACGATCGATCTAGGGATTATACAAATCCAAACCTGCCATCAGAGCAAAAAG*CCGT
TTACCTCACCCTGGCTATGGTGATGCAG
AGTG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2B202TF 824 0 0
GG
ATTGACGACGAGAAATAAGCCTTCTTCGATCTACACTTCTCTTCTCTTCTCTTGTCTCTC
TCTCTCTCTCCCATCTAACCTCTCGCAGACAAGGTTGGTAATGGCAGAATCATCCAAAGT
CATTCATGTTCGTAATGTTGGACATGAGATTTCTGAAAATGATTTGCTTCAGCTTTTCCA
ACCGTTTGGTGTCATAACTAAGCTCGTGATGCTCAGGGCAAAGAATCAGGCTCTTCTCCA
GATGCAAGATGTTTCTTCAGCAATCACTGCTCTTCAGTTCTTCACTACTGTCCAGCCAAC
CATAAGAGGAAGGAATGTGTATATCCAATTCTCGTCTCACCAAGAATTGACAACAGCCGA
GCAGAATATTCATGGACGTGAAGATGAGCCGAATCGTATTCTCTTGGTGACAGTCCATCA
CATGCTGTATCCAATCACCGTTGACGTCCTGCATCAAGTTTTTTCTCCCTATGGATTTGT
GGAGAAGATCGTCACTTTCCAGAAGTCTGCTGGTTTTCAAGCTCTTATACAGTATCAGGC
ACAACAGTGTGCTGCCTCTGCTAGAACTTCTCTACAGGGTCGTAACATATATGACGGGTG
TTGTCAGTTGGATATCCAGTTCTCCAACCTTGAGGAGCTGCAAGTAAATTACAACAACGA
TCGATCTAGGGATTATACAAATCCAAACCTGCCATCAGAGCAAAAAGGCCGGTTACCTCA
CCCTGGCTATGGTGATGCAGGAGTGGCTTATCCTCAGATGGCAAACACATCTGCGATTGC
AGCTGCCTTTGGCGGTGGCTTGCCTCCGGGTATACTGGCACA

QA 3 824 3 824
DS 



AS 1 2

CO CL2915Contig1 683 2 3 U
TCATAACAAACATGATTACTTTTGAATCGAGATGGAACAAAGATACATACAATAAGACAT
AAACGCAATCTTATGTTTCACCACTCAAAACTACGTAATCAAAAGTATAAAACAACTTTG
AACTCATCTTCACGAGTCCATGGAACCACACCATCCATCGAGTATTATGTCGATGTCATA
TATTTAAATTATGAACCGCTGCTGCCTCATTCGCTTGATACATTTCCAAATTGCCAAGGA
TTAAACTCGATAGATTTGAGGTCCACTTCACTGCTCGAGCTCGGTGCTGTATCTCGGTGT
TCATTGTACTTCCCATTGTATTGGTATATATCAATATCTCCCCATGGCGTAAATGTGATC
TCATCCGTTAAATCGAACCATCTTGGTGTGAACTTCTGTCCCTTTGTCTCTCGTGTCCTC
TTTTCCGCCCTTTGTCTCTCCCCAAGGCTGTGCTTCTCGGAACCAGCTTTAAAAAGGTCA
CCCTGCTCAAGTGCATATCTATCGGGACGGAAACGTGAGTCCGAAGCCAAGAGCTTAGAA
GGAGCTGTGTCGAAGCTGTTTTCTTGTGAGCAAAGTGCGTGTACTGAAACTTGTCATTCT
TGGGAACATCAGCCACATGCCACACCTCTTTAAGCTCAGTGCCAGGAAGGGGTTCTCCCT
CAGTATCACAAGGCTGGTAGCTC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI79JQB U 2
AF RR2GI79TF C 1
BS 1 1 RR2GI79TF
BS 2 521 RR2GI79JQB
BS 522 683 RR2GI79TF

RD RR2GI79JQB 524 0 0
CATAACAAACATGATTACTTTTGAATCGAGATGGAACAAAGATACATACAATAAGACATA
AACGCAATCTTATGTTTCACCACTCAAAACTACGTAATCAAAAGTATAAAACAACTTTGA
ACTCATCTTCACGAGTCCATGGAACCACACCATCCATCGAGTATTATGTCGATGTCATAT
ATTTAAATTATGAACCGCTGCTGCCTCATTCGCTTGATACATTTCCAAATTGCCAAGGAT
TAAACTCGATAGATTTGAGGTCCACTTCACTGCTCGAGCTCGGTGCTGTATCTCGGTGTT
CATTGTACTTCCCATTGTATTGGTATATATCAATATCTCCCCATGGCGTAAATGTGATCT
CATCCGTTAAATCGAACCATCTTGGTGTGAACTTCTGTCCCTTTGTCTCTCGTGTCCTCT
TTTCCGCCCTTTGTCTCTCCCCAAGGCTGTGCTTCTCGGAACCAGCTTTAAAAAGGTCAC
CCTGCTCAAGTGCATATCTATCGGGACGGAAACGTGAGTC
CGAA

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2GI79TF 683 0 0
TCATAACAAACATGATTACTTTTGAATCGAGATGGAACAAAGATACATACAATAAGACAT
AAACGCAATCTTATGTTTCACCACTCAAAACTACGTAATCAAAAGTATAAAACAACTTTG
AACTCATCTTCACGAGTCCATGGAACCACACCATCCATCGAGTATTATGTCGATGTCATA
TATTTAAATTATGAACCGCTGCTGCCTCATTCGCTTGATACATTTCCAAATTGCCAAGGA
TTAAACTCGATAGATTTGAGGTCCACTTCACTGCTCGAGCTCGGTGCTGTATCTCGGTGT
TCATTGTACTTCCCATTGTATTGGTATATATCAATATCTCCCCATGGCGTAGATGTGATC
TCATCCGTTAGATCGAACCATCTTGGTGTGAACTTCTGTCCCTTTGTCTCTCGTGTCCTC
TTTTCCGCCCTTTGTCTCTCCCCAAGGCTGTGCTTCTCGGAACCAGCTTTAGAAAGGTCA
CCCTGCTCAAGTGCATATCTATCGGGACGGAGACGTGAGTCCGAAGCCAAGAGCTTAGAA
GGAGCTGTGTCGAAGCTGTTTTCTTGTGAGCAAAGTGCGTGTACTGAAACTTGTCATTCT
TGGGAACATCAGCCACATGCCACACCTCTTTAAGCTCAGTGCCAGGAAGGGGTTCTCCCT
CAGTATCACAAGGCTGGTAGCTC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 3

CO CL2916Contig1 933 3 13 U
GACATTGAAATTTCAAATTCTTGTCTCTGGTTAAACCTCGGAACTAGAGACACGGTATGG
TCTATAATATCAAGTCACTTTTATTTATAAGCTCTTCTTTCTCTCATCTCATCATAATAG
TCTTAAATCTCTCCTTCTCTCCAACATTGGGCTGTATCTTTATCTTTAGTAATTCATCAT
GAGAATGCTTCTTGGTCTCGTGTTTCTATTGGCCTTAACCAGCTACTCAAGTACAACTTA
CTGTCTATGTAGAGATGGAGTTGCAGAGAAAGATCTTCAAACGTCGATAGACTATGCATG
CGGAGTTTTAGGAGATTGTAATCAAATCCATGAGAAAGGTCCTTGTTACCAACCCAACAA
TGTCAAGGGCCATTGTGATTGGGCAGTGAATAGCTATTTCCAAAGAGCCCGTCAAGTTCC
TGGAAGCTGTAATTTCTCAGGAACTGCTACTACCAGTCCAAATCCTCCTTCAACTGTGGT
TACTGGTTGCATCTATCCTTCAAGTCCTGGAAATGCTGGGACAGGAGCTCCAGGGACACC
GATCTTTCCAGGACCTCCTGCGTTTGGTCCGACCGGAATTTTTGATCCTTCAGGGAATGA
TGCTTTGAGTTTGATCACTGCAATAGCACTCACACTTGGTTTCTCCGTCATTGTGTTTCT
ATATTAGTATGACTAGTCTTTTACAAAAAAAAATATATATATTAGTATGACTAGCAAGTG
GGGTTAAGGATTTAGATCGAAGGATGAAGTTTTGCCACATATCAATGCAAGTTCTTTGAG
GCAGACATCCACTTAGGGTTGCTTTTCTTGAAGTTAGGCTTTTCTTATTTCTGTTTGTTT
CTTTCTTTCTTTCATGTATGCAATGCAATGTAAGTAAGAGTTGATGGAATCTTTCTTTTT
AAGTGTTATATATGCTTACTGAAAATAATACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR35TF U 1
AF RR2CH70TF U 85
AF RR2CH70JQ C 216
BS 1 116 RR2CR35TF
BS 117 117 RR2CH70TF
BS 118 130 RR2CR35TF
BS 131 131 RR2CH70TF
BS 132 232 RR2CR35TF
BS 233 233 RR2CH70TF
BS 234 300 RR2CR35TF
BS 301 301 RR2CH70TF
BS 302 594 RR2CR35TF
BS 595 595 RR2CH70TF
BS 596 675 RR2CR35TF
BS 676 686 RR2CH70TF
BS 687 933 RR2CH70JQ

RD RR2CR35TF 675 0 0
GACATTGAAATTTCAAATTCTTGTCTCTGGTTAAACCTCGGAACTAGAGACACGGTATGG
TCTATAATATCAAGTCACTTTTATTTATAAGCTCTTCTTTCTCTCATCTCATCATAGTAG
TCTTAAATCTTTCCTTCTCTCCAACATTGGGCTGTATCTTTATCTTTAGTAATTCATCAT
GAGAATGCTTCTTGGTCTCGTGTTTCTATTGGCCTTAACCAGCTACTCAAGTGCAACTTA
CTGTCTATGTAGAGATGGAGTTGCAGAGAAAGATCTTCAAACGTCGATAGACTATGCATG
TGGAGTTTTAGGAGATTGTAATCAAATCCATGAGAAAGGTCCTTGTTACCAACCCAACAA
TGTCAAGGGCCATTGTGATTGGGCAGTGAATAGCTATTTCCAAAGAGCCCGTCAAGTTCC
TGGAAGCTGTAATTTCTCAGGAACTGCTACTACCAGTCCAAATCCTCCTTCAACTGTGGT
TACTGGTTGCATCTATCCTTCAAGTCCTGGAAATGCTGGGACAGGAGCTCCAGGGACACC
GATCTTTCCAGGACCTCCTGCGTTTGGTCCGACCGGAATTTTTGATCCTTCAGG*AATGA
TGCTTTGAGTTTGATCACTGCAATAGCACTCACACTTGGTTTCTCCGTCATTGTGTTTCT
ATATTAGTATGACTA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2CH70TF 602 0 0
TTAC
AAGCTCTTCTTTCTCTCATCTCATCATAATAGTCTTAAATCTCTCCTTCTCTCCAACATT
GGGTTGTATCTTTATCTTTAGTAATTCATCATGAGAATGCTTCTTGGTCTCGTGTTTCTA
TTGGCCTTAACCAGCTACTCAAGTACAACTTACTGTCTATGTAGAGATGGAGTTGCAGAG
AAAGATCTTCAAACGTCGATAGACTATGCATGCGGAGTTTTAGGAGATTGTAATCAAATC
CATGAGAAAGGTCCTTGTTACCAACCCAACAATGTCAAGGGCCATTGTGATTGGGCAGTG
AATAGCTATTTCCAAAGAGCCCGTCAAGTTCCTGGAAGCTGTAATTTCTCAGGAACTGCT
ACTACCAGTCCAAATCCTCCTTCAACTGTGGTTACTGGTTGCATCTATCCTTCAAGTCCT
GGAAATGCTGGGACAGGAGCTCCAGGGACACCGATCTTTCCAGGACCTCCTGCGTTTGGT
CCGACCGGAATTTTTGATCCTTCAGGGAATGATGCTTTGAGTTTGATCACTGCAATAGCA
CTCACACTTGGTTTCTCCGTCATTGTGTTTCTATATTAGTATGACTAGTCTTTTACAA

QA 5 602 5 602
DS 

RD RR2CH70JQ 718 0 0
TAACCAGCTACTCAAGTACAACTTACTGTCTATGTAGAGATGGAGTTGCAGAGAAAGATC
TTCAAACGTCGATAGACTATGCATGCGGAGTTTTAGGAGATTGTAATCAAATCCATGAGA
AAGGTCCTTGTTACCAACCCAACAATGTCAAGGGCCATTGTGATTGGGCAGTGAATAGCT
ATTTCCAAAGAGCCCGTCAAGTTCCTGGAAGCTGTAATTTCTCAGGAACTGCTACTACCA
GTCCAAATCCTCCTTCAACTGTGGTTACTGGTTGCATCTATCCTTCAAGTCCTGGAAATG
CTGGGACAGGAGCTCCAGGGACACCGATCTTTCCAGGACCTCCTGCGTTTGGTCCGACCG
GAATTTTTGATCCTTCAGGGAATGATGCTTTGAGTTTGATCACTGCAATAGCACTCACAC
TTGGTTTCTCCGTCATTGTGTTTCTATATTAGTATGACTAGTCTTTTACAAAAAAAAATA
TATATATTAGTATGACTAGCAAGTGGGGTTAAGGATTTAGATCGAAGGATGAAGTTTTGC
CACATATCAATGCAAGTTCTTTGAGGCAGACATCCACTTAGGGTTGCTTTTCTTGAAGTT
AGGCTTTTCTTATTTCTGTTTGTTTCTTTCTTTCTTTCATGTATGCAATGCAATGTAAGT
AAGAGTTGATGGAATCTTTCTTTTTAAGTGTTATATATGCTTACTGAAAATAATACTC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 3

CO CL2917Contig1 1004 3 13 U
GGGAACAGAGGAGAAACCGAGGATCAGACGCCGGAAAAAAGGAACGATGCTGGGACTCTC
TTACGGTGAGATTTTAGTAATCATCGGCGCAACAGCTGCTGTTGTAGGGCCAAAGGATCT
TCCGATAATCGCAAGAGCAGGAGGAAGATTGTTCGGAAGAGCGATTGGTTACATCCAAAT
GGCTCGTGGCCACATAGACGGTGTCATGAAACAACCTCAAATGCAGCAGATTTCGAAAGA
AGTTCAAGATTTGCGAGCACAAGTTGATGCTATTAGCCACGGAGCAAGTTTCTCTCTCTT
TAACTCCAATCCTTTGACCCGAAGAGTGGACAACCATTCTCCAGAATCTTCTAATACAAC
CACCAATGGGACTGTTACATCTCCCAATGTTGAGGAAAGACACAAGGTTGCAGATCATTG
GACAAAGGCTCAAGAGTTTAGTGGTTCGTCATCGGCTTCAGTTAATTTGCACGCCCAAGC
AACAGCGTTTGAACGTTTATCTGAGTCTGTCAGTGGCAAAACTCACACTATAACTAGTGA
TTCACCTGTTCTTCCAGTTTCTGCTGAGATGGCAAAGTTGCTCCCTCACCGCAAAGAGAG
TGCAAAAGGATCTGATTTAATGCTGGAGGCTCTTCTTGAAGCTGAAGTAGCACACAAAGC
CAAACACTTTTTTGCACAAGCCGAAAAGGAAACTCCAGCTTTAAAAGGGAAGTTTGTTGT
TGAAGAGAAAGGAGAAACTTGAAAGTCAAGTTTTATGGATCATCGATCAACAAGTCACAA
GAAGACACCGGCTTAGTCTTTGTTTGTTACTTGTAGCCTGAGAATACTAACTGGGCCAGA
GTCCTAAAATCTGTTTCTGCTCCGGCAACAAGTGAGTTAAACCTGGCAGAGATAAGTTCA
GTAATTGATCTTGTAATTTTGGTAAACGATCTTGATTCCTATAATTTATTCTGCGGCTTT
GTAATTTCTTAGGAATATGAATAAATGTGTGTGATTTAGTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK80TF U 1
AF RR2B220TF U 28
AF RR2B220JQ C 316
BS 1 157 RR2EK80TF
BS 158 158 RR2B220TF
BS 159 278 RR2EK80TF
BS 279 280 RR2B220TF
BS 281 327 RR2EK80TF
BS 328 328 RR2B220TF
BS 329 386 RR2EK80TF
BS 387 387 RR2B220TF
BS 388 588 RR2EK80TF
BS 589 589 RR2B220TF
BS 590 628 RR2EK80TF
BS 629 877 RR2B220TF
BS 878 1004 RR2B220JQ

RD RR2EK80TF 630 0 0
GGGAACAGAGGAGAAACCGAGGATCAGACGCCGGAAAAAAGGAACGATGCTGGGACTCTC
TTACGGTGAGATTTTAGTAATCATCGGCGCAACAGCTGCTGTTGTAGGGCCAAAGGATCT
TCCGATAATCGCAAGAGCAGGAGGAAGATTGTTCGGACGAGCGATTGGTTACATCCAAAT
GGCTCGTGGCCACATAGACGGTGTCATGAAACAACCTCAAATGCAGCAGATTTCGAAAGA
AGTTCAAGATTTGCGAGCACAAGTTGATGCTATTAGCCGTGGAGCAAGTTTCTCTCTCTT
TAACTCCAATCCTTTGACCCGAAGAGTAGACAACCATTCTCCAGAATCTTCTAATACAAC
CACCAATGGGACTGTTACATCTCCCACTGTTGAGGAAAGACACAAGGTTGCAGATCATTG
GACAAAGGCTCAAGAGTTTAGTGGTTCGTCATCGGCTTCAGTTAATTTGCACGCCCAAGC
AACAGCGTTTGAACGTTTATCTGAGTCTGTCAGTGGCAAAACTCACACTATAACTAGTGA
TTCACCTGTTCTTCCAGTTTCTGCTGAGATGGCAAAGTTGCTCCCTCATCGCAAAGAGAG
TGCAAAAGGATCTGATTTAATGCTGGAG
CT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2B220TF 854 0 0
GG
GCCGGAAAAAAGGAACGATGCTGGGACTCTCTTACGGTGAGATTTTAGTAATCATCGGCG
CAACAGCTGCTGTTGTAGGGCCAAAGGATCTTCCGATAATCGCAAGAGCAGGAGGAAGAT
TGTTCGGAAGAGCGATTGGTTACATCCAAATGGCTCGTGGCCACATAGACGGTGTCA**A
AACAACCTCAAATGCAGCAGATTTCGAAAGAAGTTCAAGATTTGCGAGCACAAGTTGATG
CTATTAGCCACGGAGCAAGTTTCTCTCTCTTTAACTCCAATCCTTTGACTCGAAGAGTGG
ACAACCATTCTCCAGAATCTTCTAATACAACCACCAATGGGACTGTTACATCTCCCAATG
TTGAGGAAAGACACAAGGTTGCAGATCATTGGACAAAGGCTCAAGAGTTTAGTGGTTCGT
CATCGGCTTCAGTTAATTTGCACGCCCAAGCAACAGCGTTTGAACGTTTATCTGAGTCTG
TCAGTGGCAAAACTCACACTATAACTAGTGATTCACCTGTTCTTCCAGTTTCTGCTGAGA
TGGCAAAGTTGCTCCCTCACCGCAAAGAGAGTGCAAAAGGATCTGATTTAATGCTGGAGG
CTCTTCTTGAAGCTGAAGTAGCACACAAAGCCAAACACTTTTTTGCACAAGCCGAAAAGG
AAACTCCAGCTTTAAAAGGGAAGTTTGTTGTTGAAGAGAAAGGAGAAACTTGAAAGTCAA
GTTTTATGGATCATCGATCAACAAGTCACAAGAAGACACCGGCTTAGTCTTTGTTTGTTA
CTTGTAGCCTGAGAATACTAACTGGGCCAGAGTCCTAAAATCTGTTTCTGCTCCGGCAAC
AAGTGAGT
AAAC

QA 3 850 3 850
DS 

RD RR2B220JQ 689 0 0
GACT
CGAAGAGTGGACAACCATTCTCCAGAATCTTCTAATACAACCACCAATGGGACTGTTACA
TCTCCCAATGTTGAGGAAAGACACAAGGTTGCAGATCATTGGACAAAGGCTCAAGAGTTT
AGTGGTTCGTCATCGGCTTCAGTTAATTTGCACGCCCAAGCAACAGCGTTTGAACGTTTA
TCTGAGTCTGTCAGTGGCAAAACTCACACTATAACTAGTGATTCACCTGTTCTTCCAGTT
TCTGCTGAGATGGCAAAGTTGCTCCCTCACCGCAAAGAGAGTGCAAAAGGATCTGATTTA
ATGCTGGAGGCTCTTCTTGAAGCTGAAGTAGCACACAAAGCCAAACACTTTTTTGCACAA
GCCGAAAAGGAAACTCCAGCTTTAAAAGGGAAGTTTGTTGTTGAAGAGAAAGGAGAAACT
TGAAAGTCAAGTTTTATGGATCATCGATCAACAAGTCACAAGAAGACACCGGCTTAGTCT
TTGTTTGTTACTTGTAGCCTGAGAATACTAACTGGGCCAGAGTCCTAAAATCTGTTTCTG
CTCCGGCAACAAGTGAGTTAAACCTGGCAGAGATAAGTTCAGTAATTGATCTTGTAATTT
TGGTAAACGATCTTGATTCCTATAATTTATTCTGCGGCTTTGTAATTTCTTAGGAATATG
AATAAATGTGTGTGATTTAGTTCTC

QA 5 689 5 689
DS 



AS 1 2

CO CL2918Contig1 642 2 13 U
AAGAAGGTTCCAGGCAACCTAATGGCTTCAGCTCGCTCGGAATCTCATTCATTTGATTCT
TCTCAGATGAATATGTCCCATGTCGTTAACCATCTTTCATTTGGACGGAGGATTACGCCT
GAAACATTTGCTGATTTAAAACGCTTGGCACCGTATCTCGGCGGAAGCTACAACCGTTTG
GACGACCGCTCCTTCATAAACCAACATGATATTGGCCCTAATGTTACCATCGAGCATTAT
CTTCAAATAGTAAAGACAGAGGTATTGAATAGCAATGGACATGCACTGATCGAGGAGTAT
GAGTACACAGCACATAGCAGCGTTGCTCATAGTTACTATTTACCAGTCGCCAAGTTTCAC
TTTGAGCTCTCACCGATGCAGGTTCTCATAACCGAAAACTCCAAATCTTTCTCACACTTT
ATTACCAATGTATGCGCCATCATCGGTGGTGTCTTCACGGTTGCGGGAATCTTGGATTCT
ATTCTCCACCAGACGATGACACTGATGAAAAAGATTGAACTTGGTAAAAACTTTTGAAGA
AAGGTTTCATATCGTTTGCTCTATGTAACGAATCCGAATCTTTTTGTTACATTTACCACG
AACAAATGAGATGAAACTATAAAGTTAATATATTGAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK73JQ C 1
AF RR2CV29TF U 18
BS 1 18 RR2EK73JQ
BS 19 25 RR2CV29TF
BS 26 26 RR2EK73JQ
BS 27 290 RR2CV29TF
BS 291 291 RR2EK73JQ
BS 292 401 RR2CV29TF
BS 402 402 RR2EK73JQ
BS 403 483 RR2CV29TF
BS 484 484 RR2EK73JQ
BS 485 557 RR2CV29TF
BS 558 558 RR2EK73JQ
BS 559 635 RR2CV29TF
BS 636 642 RR2EK73JQ

RD RR2EK73JQ 642 0 0
AAGAAGGTTCCAGGCAACCTAATGGCTTCAGCTCGCTCGGAATCTCATTCATTTGATTCT
TCTCAGATGAATATGTCCCATGTCGTTAACCATCTTTCATTTGGACGGAGGATTACGCCT
GAAACATTTGCTGATTTAAAACGCTTGGCACCGTATCTCGGCGGAAGCTACAACCGTTTG
GACGACCGCTCCTTCATAAACCAACATGATATTGGCCCTAATGTTACCATCGAGCATTAT
CTTCAAATAGTAAAGACAGAGGTTTTGAATAGCAATGGACATGCACTGATCGAGGAGTAT
GAGTACACAGCACATAGCAGCGTTGCTCATAGTTACTATTTACCAGTCGCCAAGTTTCAC
TTTGAGCTCTCACCGATGCAGGTTCTCATTACCGAAAACTCCAGATCTTTCTCACACTTT
ATTACCAATGTATGCGCCATCATCGGTGGTGTCTTCACGGTTGCGGGAATCTTGGATTCT
ATTCTCCACCAGACGATGACACTTATGAAAAAGATTGAACTTGGTAAAAACTTTTGAAGA
TAGGTTTCATATCGTTTGC**TATGTAACGAATCCGAATTTTTTTGTTACCTTTACCACG
AACAAATGAGATGAAACTATAAAGTTAATATATTGAGAAAAA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2CV29TF 620 0 0
G
CTAATGGTTTCAGCTCGCTCGGAATCTCATTCATTTGATTCTTCTCAGATGAATATGTCC
CATGTCGTTAACCATCTTTCATTTGGACGGAGGATTACGCCTGAAACATTTGCTGATTTA
AAACGCTTGGCACCGTATCTCGGCGGAAGCTACAACCGTTTGGACGACCGCTCCTTCATA
AACCAACATGATATTGGCCCTAATGTTACCATCGAGCATTATCTTCAAATAGTAAAGACA
GAGGTATTGAATAGCAATGGACATGCACTGATTGAGGAGTATGAGTACACAGCACATAGC
AGCGTTGCTCATAGTTACTATTTACCAGTCGCCAAGTTTCACTTTGAGCTCTCACCGATG
CAGGTTCTCATAACCGAAAACTCGAAATCTTTCTCACACTTTATTACCAATGTATGCGCC
ATCATCGGTGGTGTCTTCACGGTTGCGGGAATCTTGGATTCTATTTTCCACCAGACGATG
ACACTGATGAAAAAGATTGAACTTGGTAAAAACTTTTGAAGAAAGGTTTCATATCGTTTT
CTCTATGTAACGAATCCGAATCTTTTTGTTACATTTACCACGAACAAATGAGATGAAACT
ATAAAGTTAATATATTG
AG

QA 2 618 2 618
DS 



AS 1 3

CO CL2919Contig1 1171 3 8 U
GGGTGGAGGTTTCACAAACACCACCAATCTTCTTCTTCTCTCATCATCTTTTTGTTACTT
CTTAGTTTGTTCGCTTGATTTGATCAAAGCCCTTCCCTCGATCAAGATCATGCTTAGCAA
AAGAACTCATCCCATGATAGGAAAAATATCTGAGCTCCTCGTTGGCGTGAACCGATCTGC
AGCCGCAGCGGCTCCGTTCTTGGACGTCTTGATGACGAGCCCTAGAAGCCCACTAGATTT
CAAGATTCTCCCTCAGATATCTCAAAGAAACAGTTCAAAGAGATTCTACGATGACAATCT
TGGTGGGTCCGTTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGCCGGAT
CACGAGCGTTTCAAGAAATGAACCGAACCAATCCGGCCGGTCTGAACCGGTTCAGTTCAT
GAGCCATGTCGGAAGCTCGGACGAGGAAGATGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGAGGA
CTATACGCTGGTGACGTCCCACCATGGTCCTAGTGGAACTTGTAGCACTAGGGTTTATGA
CAAAGATGGGCTCGAGTGTTTCGCAACTAAGGTGAACGAAGAACGTCGTGAGAGACTTTT
CGTGGTCGATGTCGGTACGGAATCTCCAAAGAATACTCCGGAGTTTCAGGGTTTGGGTTT
CCTCAACTCGTGTTACTTATGCAGGAAGAAACTTCACGGCCAGGACATATTTATTTACAG
AGGAGAAAAAGCTTTTTGCAGCACAGAGTGTCGATCGAGTCATATAGCAAGTACTGAAAG
GAAAGAGAGATGTAGATCGAAGTTTTCAACCTCCTTACACCGCCGGTCAAATTTTCTCCG
CCGGAGTTCTAGTGACTTAGCTGGAGTTCTTCTACTGAGTATATATATATATGGGGGAAA
GGGGTAAATAAAATAATAACTAGGCATTAATAAAATGCGAGAGAAATAAAGTAGCATATA
TAAAAATATGACATGTATGTCCATATAATTGTTATATGTCATATGGTGGAAGAGAAACAA
CATGAAATTTTGGGTGAAGGGGGTTTATGAGAGAGAGCTAGTTCTTGATCGTCAAGATGG
CGAAAATGGAATAATGCTCTTGTTTTTTCTTCTATTGTTATTGCATTTTGTATTTGGTGC
TTATTAACATGTTAAAATAATTTTAATGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT72TF U 13
AF RR2B827TF U 1
AF RR2B827JQ C 374
BS 1 164 RR2B827TF
BS 165 165 RR2GT72TF
BS 166 282 RR2B827TF
BS 283 283 RR2GT72TF
BS 284 372 RR2B827TF
BS 373 373 RR2GT72TF
BS 374 680 RR2B827TF
BS 681 1171 RR2B827JQ

RD RR2GT72TF 624 0 0
AAACACCACCAATCT
TCTTCTTCTTCTCTCATCATCTTTTTGTTACTTCTTAGTTTGTTGGCTTGATTTGATCAA
AGCCCTTCCCTCGATCAAGATCATGCTTAGCAAAAGAACTCATCCCATGATAGGAAAAAT
ATCTGAGCTCCTCGTTGGCGTGAACCGATCTGCAGCCGCAGCGGCTCCGTTCTTGGACGT
CTTGATGACGAGCCCTAGAAGCCCACTAGATTTCAAGATTCTCCCTCAGATATCTCAAAG
AAACAGTTCAAAGAGATTCTACGATGACAATCTTGGTGGGTCCGTTGGTCTAGGGATT*T
AGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGCCGGATCACGAGCGTTTCAAGAAATGAACCGAA
CCAATCCGGCCGGTCTGAACCGGTTCAGTTCATGAGCCATGTCGGAAGCTCGGACGAGGA
AGATGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGAGGACTATACGCTGGTGACGTCTCACCATGG
TCCTAGTGGAACTTGTAGCACAAGGGTTTATGACAAAGATGGTCTCGAGTGTTTCGCAAC
TAAGGCTAACGAAGAACGTCGTGAGAGACTTTTCGTGGTCGATGTCGGTACGGAATCTCC
AAAGAATAC

QA 16 624 16 624
DS 

RD RR2B827TF 680 0 0
GGGTGGAGGTTTCACAAACACCACCAATCTTCTTCTTCTCTCATCATCTTTTTGTTACTT
CTTAGTTTGTTCGCTTGATTTGATCAAAGCCCTTCCCTCGATCAAGATCATGCTTAGCAA
AAGAACTCATCCCATGATAGGAAAAATATCTGAGCTCCTCGTTGTCGTGAACCGATCTGC
AGCCGCAGCGGCTCCGTTCTTGGACGTCTTGATGACGAGCCCTAGAAGCCCACTAGATTT
CAAGATTCTCCCTCAGATATCTCAAAGAAACAGTTCAAAGAGGTTCTACGATGACAATCT
TGGTGGGTCCGTTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGCCGGAT
CACGAGCGTTTCTAGAAATGAACCGAACCAATCCGGCCGGTCTGAACCGGTTCAGTTCAT
GAGCCATGTCGGAAGCTCGGACGAGGAAGATGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGAGGA
CTATACGCTGGTGACGTCCCACCATGGTCCTAGTGGAACTTGTAGCACTAGGGTTTATGA
CAAAGATGGGCTCGAGTGTTTCGCAACTAAGGTGAACGAAGAACGTCGTGAGAGACTTTT
CGTGGTCGATGTCGGTACGGAATCTCCAAAGAATACTCCGGAGTTTCAGGGTTTGGGTTT
CCTCAACTCGTGTTACTTAT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2B827JQ 798 0 0
AGAAATGAACCGAACCAATCCGGCCGGTCTGAACCGGTTCAGTTCATGAGCCATGTCGGA
AGCTCGGACGAGGAAGATGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGAGGACTATACGCTGGTG
ACGTCCCACCATGGTCCTAGTGGAACTTGTAGCACTAGGGTTTATGACAAAGATGGGCTC
GAGTGTTTCGCAACTAAGGTGAACGAAGAACGTCGTGAGAGACTTTTCGTGGTCGATGTC
GGTACGGAATCTCCAAAGAATACTCCGGAGTTTCAGGGTTTGGGTTTCCTCAACTCGTGT
TACTTATGCAGGAAGAAACTTCACGGCCAGGACATATTTATTTACAGAGGAGAAAAAGCT
TTTTGCAGCACAGAGTGTCGATCGAGTCATATAGCAAGTACTGAAAGGAAAGAGAGATGT
AGATCGAAGTTTTCAACCTCCTTACACCGCCGGTCAAATTTTCTCCGCCGGAGTTCTAGT
GACTTAGCTGGAGTTCTTCTACTGAGTATATATATATATGGGGGAAAGGGGTAAATAAAA
TAATAACTAGGCATTAATAAAATGCGAGAGAAATAAAGTAGCATATATAAAAATATGACA
TGTATGTCCATATAATTGTTATATGTCATATGGTGGAAGAGAAACAACATGAAATTTTGG
GTGAAGGGGGTTTATGAGAGAGAGCTAGTTCTTGATCGTCAAGATGGCGAAAATGGAATA
ATGCTCTTGTTTTTTCTTCTATTGTTATTGCATTTTGTATTTGGTGCTTATTAACATGTT
AAAATAATTTTAATGTTC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 3

CO CL2920Contig1 850 3 11 U
ATCTGAAATTAGCAGCCTCTTGAAATATAAAATCTAGAATTAAACATTAATAGAAGACAA
ACTAACAAATCAAACAAAAAACAATTACACCACAACAATCTAAAAAATGACACAAAGAAG
TTGGCAATAGGACCCACAAAACACACTGTCAGAAAATCTTCAGAGTTTCAGAGAAAGAAA
CAGAGAAGAAGGAAGAAGAAGCAGGATCAAACAGTAAACCCAGGAATAATATCTCTCTTA
CCAAATCAGAACCAAACCTATCTCTTCTTATTCTTGTCTCTTCCATTTCCAGAGAATAGA
GAACCCAAACCAAACAAGTTCCCAGATGGAACCATGTTTATAACCGGACTCACTCTAGTT
ACACTCCCATGGCTCCCGTAACTGTAGCCTCCGTAATTCTTCTTCAACGGCGGTTTCTGA
AAGCTACTGTTACTCGATGAACAAGAAGACGAAGATGATAACGATGACGACTGTCGTAGC
TTTATATGCTCTGTTGCGTGTTTCCTAGAGCTCTGTTTCGGTTTACTAGAAGTCGAACCG
GTCGAATTGCTCCGGTTTAGTAACGGTAACGGACATAAACTCCGTCCGTAACTGCTCCCG
CAGTTTAAACTGCTACTCCTCTTAAACCCCCAAAACGACTTCGTACTCGGTTTCTACTCC
GTTATGACGGCGTCATCTTCGTCTACTTCAACCGGTTTTCTCGGTTTTCTACTATCCGGT
TTAGACGGTTCGAGTGGACCGGTATCGGATGCTTTTTTCTCCGGTTTGCGTTTCTCGTGT
GGTGGCGGTGGTGATTCGGGTTTCTTTTTCTTGATCTCGGTTGGCAAGATTTACCGTTGC
GGAAGAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX92JQ U 23
AF RR2BX92TF C 82
AF RR2DD30JQ U 1
BS 1 165 RR2DD30JQ
BS 166 166 RR2BX92JQ
BS 167 360 RR2DD30JQ
BS 361 361 RR2BX92JQ
BS 362 474 RR2DD30JQ
BS 475 475 RR2BX92TF
BS 476 655 RR2DD30JQ
BS 656 656 RR2BX92TF
BS 657 739 RR2DD30JQ
BS 740 740 RR2BX92TF
BS 741 850 RR2DD30JQ

RD RR2BX92JQ 430 0 0
AAATATAAAATCTAGAATTAAACATTAATAGAAGACAAACTAACAAATCAAACAAAAAAC
AATTACCCCACAACAATCTAAAAAATGACACAAAGAAGTTGGCAATAGGACCCACAAAAC
ACACTGTCAGAAAATCTTCAGAGTTTCAGAAAAAGAAACAGAGAAAAAGGAAGAAGAAGC
AGGATCAAACAGTAAACCCAGGAATAATATCTCTCTTACCAAATCAAAACCAAACCTATC
TCTTCTTATTCTTGTCTCTTCCATTTCCAGAGAATAGAGAACCCAAACCAAACAAGTTCC
CAGATGGAACCATGTTTATAACCGGACTCACTCTAGTTACACTCCCATGGCTCCCGTAAC
TGTAGCCTCCGTAATTCTTCTTCAACGGCGGTTTCTGAAAGCTACTGTTACTCGATGAAC
AAGAAGACGA

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2BX92TF 718 0 0
CAATTACACCACAACAATCTAAAAA*TGACACAAAGAAGTTGGCAATAGGACCCACAAAA
CACACTGTCAGAAAATCTTCAGAGTTTCAGAGAAAGAAACAGAGAAGAAGGAAGAAGAAG
CAGGATCAAACAGTAAACCCAGGAATAATATCTCTCTTACCAAATCAGAACCAAACCTAT
CTCTTCTTATTCTTGTCTCTTCCATTTCCAGAGAATAGAGAACCCAAACCAAACAAGTTC
CCAGATGGAACCATGTTTATAACCGGACTCACTCTAGTTACACTCCCATGGCTCCCGTAA
CTGTAGCCTCCGTAATTCTTCTTCAACGGCGGTTTCTGAAAGCTACTGTTACTCGATGAA
CAAGAAGACGAAGATGATAACGATGACGACTGTCGTAGCTTTATATGCTCTGTTGCGTGT
TTCCTAGAGCTCTGTTTCGGTTTACTAGAAGTCGAACCGGTCGAATTGCTCCGGTTTAGT
AACGGTAACGGACATAAACTCCGTCCGTAACTGCTCCCGCAGTTTAAACTGCTACTCCTC
TTAAACCCCCAAAACGACTTCGTACTCGGTTTCTACTCCGTTATGACGGCGTCATCTTCG
TCTACTTCAACCGGTTTTCTCGGTTTTCTACTATCCGGTTTAGACGGTTCGAGTGGACCG
GTATCGGATGCTTTTTTCTCCGGTTTGCGTTTCTCGTGTGGTGGCGGTGGTGATTCGG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2DD30JQ 850 0 0
ATCTGAAATTAGCAGCCTCTTGAAATATAAAATCTAGAATTAAACATTAATAGAAGACAA
ACTAACAAATCAAACAAAAAACAATTACACCACAACAATCTAAAAAATGACACAAAGAAG
TTGGCAATAGGACCCACAAAACACACTGTCAGAAAATCTTCAGAGCTTCAGAGAAAGAAA
CAGAGAAGAAGGAAGAAGAAGCAGGATCAAACAGTAAACCCAGGAATAATATCTCTCTTA
CCAAATCAGAACCAAACCTATCTCTTCTTATTCTTGTCTCTTCCATTTCCAGAGAATAGA
GAACCCAAACCAAACAAGTTCCCAGATGGAACCATGTTTATAACCGGACTCACTCTAGTT
CCACTCCCATGGCTCCCGTAACTGTAGCCTCCGTAATTCTTCTTCAACGGCGGTTTCTGA
AAGCTACTGTTACTCGATGAACAAGAAGACGAAGATGATAACGATGACGACTGTTGTAGC
TTTATATGCTCTGTTGCGTGTTTCCTAGAGCTCTGTTTCGGTTTACTAGAAGTCGAACCG
GTCGAATTGCTCCGGTTTAGTAACGGTAACGGACATAAACTCCGTCCGTAACTGCTCCCG
CAGTTTAAACTGCTACTCCTCTTAAACCCCCAAAACGACTTCGTACTCGGTTTCTCCTCC
GTTATGACGGCGTCATCTTCGTCTACTTCAACCGGTTTTCTCGGTTTTCTACTATCCGGT
TTAGACGGTTCGAGTGGACTGGTATCGGATGCTTTTTTCTCCGGTTTGCGTTTCTCGTGT
GGTGGCGGTGGTGATTCGGGTTTCTTTTTCTTGATCTCGGTTGGCAAGATTTACCGTTGC
GGAAGAGCTC

QA 1 850 1 850
DS 



AS 1 3

CO CL2921Contig1 469 3 3 U
GGTCTGATTCTCTGAACCAACAAGTAGCAGCGGCGCATCAGTTGAACACGATTCAAGCTC
ACGATGGCAAGAATTAAGGTTCACGAGCTGAGAGACAAGTCGAAGAGCGATCTTCAGAAC
CAGCTTCAGGATCTCAAGGCCGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGAGGT
GCCCCCAACAAGCTTTCCAAAATCAAGGTTGTCCGAAAATCGATAGCTCAGGTGTTGACC
GTGACATCTCAGAAGCAGAAGTCTGCTCTCAGAGAAGCGTACAAGAACAAGGAGTTCATC
CCTCTTGATCTACGCCCCAAGAAAACACGTGCTATCCGCAGGCGCCTTACCAAACATCAG
CTGTCGTTGAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGTAC
GCTATCAAAGTTTAATTCTAGCTTACTAGATACTCTGTTTCAGTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2H147TF U 1
AF RR2CS15JQ C 12
AF RR2CS15TF U 12
BS 1 291 RR2H147TF
BS 292 292 RR2CS15TF
BS 293 469 RR2H147TF

RD RR2H147TF 469 0 0
GGTCTGATTCTCTGAACCAACAAGTAGCAGCGGCGCATCAGTTGAACACGATTCAAGCTC
ACGATGGCAAGAATTAAGGTTCACGAGCTGAGAGACAAGTCGAAGAGCGATCTTCAGAAC
CAGCTTCAGGATCTCAAGGCCGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGAGGT
GCCCCCAACAAGCTTTCCAAAATCAAGGTTGTCCGAAAATCGATAGCTCAGGTGTTGACC
GTGACATCTCAGAAGCAGAAGTCTGCTCTCAGAGAAGCGTACAAGAACAAGAAGTTCATC
CCTCTTGATCTACGCCCCAAGAAAACACGTGCTATCCGCAGGCGCCTTACCAAACATCAG
CTGTCGTTGAAGACAGAGCGTGAGAAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGTAC
GCTATCAAAGTTTAATTCTAGCTTACTAGATACTCTGTTTCAGTTGACC

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR2CS15JQ 458 0 0
GG
GAACCAACAAGTAGCAGCGGCGCATCAGTTGAACACGATTCAAGCTCACGATGGCAAGAA
TTAAGGTTCACGAGCTGAGAGACAAGTCGAAGAGCGATCTTCAGAACCAGCTTCAGGATC
TCAAGGCCGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGAGGTGCCCCCAACAAGC
TTTCCAAAATCAAGGTTGTCCGAAAATCGATAGCTCAGGTGTTGACCGTGACATCTCAGA
AGCAGAAGTCTGCTCTCAGAGAAGCGTACAAGAACAAGGAGTTCATCCCTCTTGATCTAC
GCCCCAAGAAAACACGTGCTATCCGCAGGCGCCTTACCAAACATCAGCTGTCGTTGAAGA
CAGAGCGTGAGAAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGTACGCTATCAAAGTTT
AATTCTAGCTTACTAGATACTCTGTTTCAGTTGACC

QA 3 458 3 458
DS 

RD RR2CS15TF 458 0 0
GG
GAACCAACAAGTAGCAGCGGCGCATCAGTTGAACACGATTCAAGCTCACGATGGCAAGAA
TTAAGGTTCACGAGCTGAGAGACAAGTCGAAGAGCGATCTTCAGAACCAGCTTCAGGATC
TCAAGGCCGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGAGGTGCCCCCAACAAGC
TTTCCAAAATCAAGGTTGTCCGAAAATCGATAGCTCAGGTGTTGACCGTGACATCTCAGA
AGCAGAAGTCTGCTCTCAGAGAAGCGTACAAGAACAAGGAGTTCATCCCTCTTGATCTAC
GCCCCAAGAAAACACGTGCTATCCGCAGGCGCCTTACCAAACATCAGCTGTCGTTGAAGA
CAGAGCGTGAGAAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGTACGCTATCAAAGTTT
AATTCTAGCTTACTAGATACTCTGTTTCAGTTGACC

QA 3 458 3 458
DS 



AS 1 3

CO CL2922Contig1 810 3 4 U
AATTCGTACATTTAACAAACATTGTCAACAATCTGGCACACAACAACTCTAAGCGTTTCC
ACTCGCATAACAAAAGCTTTTTGCTTATACAACATAACGGTAGGTAACATAACGACCAGC
AGTTTCACTCGGACGTATGATCTTCACGACTTGTCCACGTTTTAGCCCAAAGTATCTTGC
GATTGGATCAGTCACTTGGATCCTTGGAAGCTGTGTCTCCTTGACAGTGTATCTCTCCAG
AAGAGTTTTCTTCTCCTCGGTGGTGAGAACTTGGTGCTCCGGAACAAGAACATGTTCTTT
AATGTTCACTAGCATTTCCGCCTCCTGGAAGACTTCCAAATGAAACTTAGAAGAGATCTC
ACTAATGCAAGTTCGAGCAAAAGGAGTCAAGTTCTGCTGCACCACCAAGATTGCTCTGTA
AACATTCTCTGATTTCATCCTGTTTGTGTACACCTTCATCGTCTTAACCCCAACTTTGGC
CTCATCAGGGAAGAAGATATAGAGCTGGTCACTGCTGTCGTTTCTCTTAGCTTTGAGAGT
AACAAGATCCTCTCTTTTCATGTTGTCTCCATACTTTCTAACGAACTGCGATAAGCTCAT
GGTGATCTCAGAGTCTGCGATGAAGTAGCCACGGTCCTTGAGCATCTGCATCAACGTCTT
CTGGATCCTGTAAAGTCTTTTGATTTCTTCTTCCGTTAGACCCATATCTCGAATAAATAT
TTAGAGGGTAAAGAGAGAAGAGAGATGGGAAGCACAGAACGACGAAGAAGACGGAGCGGC
GTTTCAAAGAGCTTTCCTTTCAAGTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM26JQ U 134
AF RR2F357JQ U 1
AF RR2F357TF C 81
BS 1 349 RR2F357JQ
BS 350 350 RR2EM26JQ
BS 351 686 RR2F357JQ
BS 687 810 RR2F357TF

RD RR2EM26JQ 362 0 0
CGTATGATCTTCACGACTTGTCCACGTTTTAGCCCAAAGTATCTTGCGATTGGATCAGTC
ACTTGGATCCTTGGAAGCTGTGTCTCCTTGACAGTGTATCTCTCCAGAAGAGTTTTCTTC
TCCTCGGTGGTGAAAACTTGGTGCTCCGGAACAAGAACATGTTCTTTAATGTTCACTAGC
ATTTCCGCCTCCTGGAAGACTTCCAAATGAAACTTAGAAGAGATCTCACTAACGCAAGTT
CGAGCAAAAGGAGTCAAGTTCTGCTGCACCACCAAGATTGCTCTGTAAACATTCTCTGAT
TTCATCCTGTTTGTGTACACCTTCATCGTCTTAACCCCAACTTTGGCCTCATCAGGGGAG
AA

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR2F357JQ 686 0 0
AATTCGTACATTTAACAAACATTGTCAACAATCTGGCACACAACAACTCTAAGCGTTTCC
ACTCGCATAACAAAAGCTTTTTGCTTATACAACATAACGGTAGGTAACATAACGACCAGC
AGTTTCACTCGGACGTATGATCTTCACGACTTGTCCACGTTTTAGCCCAAAGTATCTTGC
GATTGGATCAGTCACTTGGATCCTTGGAAGCTGTGTCTCCTTGACAGTGTATCTCTCCAG
AAGAGTTTTCTTCTCCTCGGTGGTGAGAACTTGGTGCTCCGGAACAAGAACATGTTCTTT
AATGTTCACTAGCATTTCCGCCTCCTGGAAGACTTCCAAATGAAACTTAAAAGAGATCTC
ACTAATGCAAGTTCGAGCAAAAGGAGTCAAGTTCTGCTGCACCACCAAGATTGCTCTGTA
AACATTCTCTGATTTCATCCTGTTTGTGTACACCTTCATCGTCTTAACCCCAACTTTGGC
CTCATCAGGGAAGAAGATATAGAGCTGGTCACTGCTGTCGTTTCTCTTAGCTTTGAGAGT
AACAAGATCCTCTCTTTTCATGTTGTCTCCATACTTTCTAACGAACTGCGATAAGCTCAT
GGTGATCTCAGAGTCTGCGATGAAGTAGCCACGGTCCTTGAGCATCTGCATCAACGTCTT
CTGGATCCTGTAAAGTCTTTTGATTT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2F357TF 730 0 0
TTGCTTATACAACATAACGGTAGGTAACATAACGACCAGCAGTT*CACTCGGACGTATGA
TCTTCACGACTTGTCCACGTTTTAGCCCAAAGTATCTTGCGATTGGATCAGTCACTTGGA
TCCTTGGAAGCTGTGTCTCCTTGACAGTGTATCTCTCCAGAAGAGTTTTCTTCTCCTCGG
TGGTGAGAACTTGGTGCTCCGGAACAAGAACATGTTCTTTAATGTTCACTAGCATTTCCG
CCTCCTGGAAGACTTCCAAATGAAACTTAGAAGAGATCTCACTAATGCAAGTTCGAGCAA
AAGGAGTCAAGTTCTGCTGCACCACCAAGATTGCTCTGTAAACATTCTCTGATTTCATCC
TGTTTGTGTACACCTTCATCGTCTTAACCCCAACTTTGGCCTCATCAGGGAAGAAGATAT
AGAGCTGGTCACTGCTGTCGTTTCTCTTAGCTTTGAGAGTAACAAGATCCTCTCTTTTCA
TGTTGTCTCCATACTTTCTAACGAACTGCGATAAGCTCATGGTGATCTCAGAGTCTGCGA
TGAAGTAGCCACGGTCCTTGAGCATCTGCATCAACGTCTTCTGGATCCTGTAAAGTCTTT
TGATTTCTTCTTCCGTTAGACCCATATCTCGAATAAATATTTAGAGGGTAAAGAGAGAAG
AGAGATGGGAAGCACAGAACGACGAAGAAGACGGAGCGGCGTTTCAAAGAGCTTTCCTTT
CAAGTAAAAA

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 3

CO CL2923Contig1 725 3 27 U
AAGAGTAAAAGCCGAAATAAGATTATAAAAGAACAGCTACTGTCCTCTTTTAAAGGCAGA
GCTATCTCAGTTTTTTTTCTTACAAAA*AAAGAAACTAAACTCCCAACAAGGGGAGTTCG
CAAAATAAACCAACAAAAAAAGAGAGCAAACGTAGTGTTTTTATTAAAGTAAAA*TGATC
AAACACAACTCTGATCTTCTCGTCACAAAGAAGAGCACTTCGATTCTGAAAAGCTGGCAC
TTGTCTAGTACGGCTCAACAGGTTTGCGGAAGTTAGCTCCGGCGTAAACTGCCTCTGAAC
CCAACTCCTCCTCAATACGCAAAAGCTGGTTGTACTTGGCAAGACGCTCGGACCTGCAAG
GAGCACCAGTCTTGATTTGTCCGGTAGACAAGCCAACAGCTAGGTCAGCAATGAAGGTGT
CCTCGGTTTCACCACTTCTGTGGCTGGTCATCACTCCCCATCCTGCTTTCTTCGACATCC
TCACTGCCTCAATACTCTCTGTCGCTGACCCGATTTGGTTAACCTTCAAGAGAAGAGCAT
TGCAAGACTTTTCTGCGATTGCCTTAGCAACCCTCTTGGGGTTGGTGACCAACAAATCAT
CACCAACAATCTGAACATTGTCTCCACACTCTGCGGTCATCTTGGCATAGTGCTCCCAGT
CATCTTGGTCAAATGGGTCCTCAATGGACACAATTGGGTACTCAGCAACAAAGGACTTGT
ATAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2CS90JQ U 2
AF RR2CS90TF C 2
AF RR2GP90JQ U 1
BS 1 18 RR2GP90JQ
BS 19 19 RR2CS90JQ
BS 20 20 RR2GP90JQ
BS 21 21 RR2CS90JQ
BS 22 87 RR2GP90JQ
BS 88 88 RR2CS90JQ
BS 89 92 RR2GP90JQ
BS 93 93 RR2CS90JQ
BS 94 169 RR2GP90JQ
BS 170 170 RR2CS90JQ
BS 171 174 RR2GP90JQ
BS 175 175 RR2CS90JQ
BS 176 212 RR2GP90JQ
BS 213 213 RR2CS90JQ
BS 214 222 RR2GP90JQ
BS 223 223 RR2CS90JQ
BS 224 280 RR2GP90JQ
BS 281 281 RR2CS90JQ
BS 282 298 RR2GP90JQ
BS 299 299 RR2CS90JQ
BS 300 366 RR2GP90JQ
BS 367 367 RR2CS90JQ
BS 368 503 RR2GP90JQ
BS 504 504 RR2CS90JQ
BS 505 531 RR2GP90JQ
BS 532 532 RR2CS90JQ
BS 533 725 RR2GP90JQ

RD RR2CS90JQ 587 0 0
AAAAGT
AAAGCCGAAATAAGATTATAAAAGAACAGCTACTGTCCTCTTTTAAAGGCAGAGCTATCT
CAGTTTTTTTTCTTACAAAA*AAAGAAACTAAACTCCCAACAAGGGGAGTTCGCAAAATA
AACCAACAAAAAAAGAGAGCAAACGTAGTGTTTTTATTAAAGTAAAA*TGATCAAACACA
ACTCTGATCTTCTCGTCACAAAGAAGAGCACTTCGATTCTGAAAAGCTGGCACTTGTCTA
GTACGGCTCAACAGGTTTGCGGAAGTTAGCTCCGGCGTAAACTGCCTCTGAACCCAACTC
CTCCTCAATACGCAAAAGCTGGTTGTACTTGGCAAGACGCTCGGACCTGCAAGGAGCACC
AGTCTTGATTTGTCCGGTAGACAAGCCAACAGCTAGGTCAGCAATGAAGGTGTCCTCGGT
TTCACCACTTCTGTGGCTGGTCATCACTCCCCATCCTGCTTTCTTCGACATCCTCACTGC
CTCAATACTCTCTGTCGCTGACCCGATTTGGTTAACCTTCAAGAGAAGAGCATTGCAAGA
CTTTTCTGCGATTGCCTTAGCAACCCTCTTGGGGTTGGTG
C

QA 7 586 7 586
DS 

RD RR2CS90TF 587 0 0
AAAAGT
AAAGCCGAAATAAGATTATAAAAGAACAGCTACTGTCCTCTTTTAAAGGCAGAGCTATCT
CAGTTTTTTTTCTTACAAAA*AAAGAAACTAAACTCCCAACAAGGGGAGTTCGCAAAATA
AACCAACAAAAAAAGAGAGCAAACGTAGTGTTTTTATTAAAGTAAAA*TGATCAAACACA
ACTCTGATCTTCTCGTCACAAAGAAGAGCACTTCGATTCTGAAAAGCTGGCACTTGTCTA
GTACGGCTCAACAGGTTTGCGGAAGTTAGCTCCGGCGTAAACTGCCTCTGAACCCAACTC
CTCCTCAATACGCAAAAGCTGGTTGTACTTGGCAAGACGCTCGGACCTGCAAGGAGCACC
AGTCTTGATTTGTCCGGTAGACAAGCCAACAGCTAGGTCAGCAATGAAGGTGTCCTCGGT
TTCACCACTTCTGTGGCTGGTCATCACTCCCCATCCTGCTTTCTTCGACATCCTCACTGC
CTCAATACTCTCTGTCGCTGACCCGATTTGGTTAACCTTCAAGAGAAGAGCATTGCAAGA
CTTTTCTGCGATTGCCTTAGCAACCCTCTTGGGGTTGGTG
C

QA 7 586 7 586
DS 

RD RR2GP90JQ 725 0 0
AAGAGTAAAAGCCGAAATTAAATTATAAAAGAACAGCTACTGTCCTCTTTTAAAGGCAGA
GCTATCTCAGTTTTTTTTCTTACAAAAGAAAGCAACTAAACTCCCAACAAGGGGAGTTCG
CAAAATAAACCAACAAAAAAAGAGAGCAAACGTAGTGTTTTTATTAAAGCAAAAATGATC
AAACACAACTCTGATCTTCTCGTCACAAAGAAAAGCACTTCGCTTCTGAAAAGCTGGCAC
TTGTCTAGTACGGCTCAACAGGTTTGCGGAAGTTAGCTCCAGCGTAAACTGCCTCTGATC
CCAACTCCTCCTCAATACGCAAAAGCTGGTTGTACTTGGCAAGACGCTCGGACCTGCAAG
GAGCACAAGTCTTGATTTGTCCGGTAGACAAGCCAACAGCTAGGTCAGCAATGAAGGTGT
CCTCGGTTTCACCACTTCTGTGGCTGGTCATCACTCCCCATCCTGCTTTCTTCGACATCC
TCACTGCCTCAATACTCTCTGTCACTGACCCGATTTGGTTAACCTTCAAGAAAAGAGCAT
TGCAAGACTTTTCTGCGATTGCCTTAGCAACCCTCTTGGGGTTGGTGACCAACAAATCAT
CACCAACAATCTGAACATTGTCTCCACACTCTGCGGTCATCTTGGCATAGTGCTCCCAGT
CATCTTGGTCAAATGGGTCCTCAATGGACACAATTGGGTACTCAGCAACAAAGGACTTGT
ATAGG

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 3

CO CL2924Contig1 1075 3 11 U
GAACGAGCAAGATGCATGCTTGCCGATGGGGACACTTCCTCTTTCCTTCCCTCCAAACCT
CAAGGACGCTTTGTGAGAATGTTTTTGGGACCTGTCAATGTTCGAGCCTCCAGGAAAGAT
ATTCAGCTTAAAGTCAAAGAAGAATACAATAGCTACAGAGATAGGACAGCTCTTCTTTTT
CTTGTTTTCCCAGCTATTCTTTTGACACTAAGATCTTATGTCTGGGGTGGATGTTTGCCT
GCTTTCCCTGTTCAGCTCTATGAGGCTTGGCTTTTGTTCCTTTATGCTGGCTTGGCTATG
CGAGAGAACATTTTGAGAGCCAACGGGAGTGACATCCGTTCTTGGTGGCTTTATCATCAT
TATTGTGCCATGGCTATGGCCCTTGTCAGTCTCACTTGGGAAATCAAAGGTCAACCAAAC
TGTGTTCAGAAGCAGAAAGGAGTCCCTCTTTTCCTCCAATGGGCTATGATGCAAGGTGTT
GCCATGCTTCTGCAGAATAGATATCAGCGCCAAAGATTATACACTCGCATTGCACTAGGA
AAGGCGAAGAGAATGGATGTTGTATGGGGAGAAACGGCTGGAGTAGATGGGCAATTATGG
CTGTTATGTCCTCTTTTGTTCACTTTACAGGGCTTTGAAGCATACGTTGGTCTGCAGTTA
CTAAGGACAGCGTTAACTGGAGTAGTCGCCGAATGGCAGGTATTGATCTGTGGCATTCTT
CTGGTTGTGATGGCCGTTGGTAACTTCATAAACACAGTAGAGACATTGATGGTTAAGTCG
AGGTTCAAGGCTAAGATGAAGAGAAGTAAAAGCAGAGCGGAGCTTGATTAAACTGCTTAA
CTTATATTTGACTACAGCTTCATAGTTCCCAACTTCGGATCTTTCTCCCCATTAATTATT
TTTACTTTATAAATTTTGTTTGCTTGGGGCACAAGTTACCTAAAGTTCTTGAAAAAAAAA
AGAAATTGACCCTTTCTTTGTGTAAACTAGATTATCTTTTTTGTGTAAACTAGATATAAA
TCCGTGCAACATTTTAATTTCACAAACACATATAGAAAATGAAAATCTTTTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV29TF U 1
AF RR2GK31TF U 318
AF RR2BV29JQ C 386
BS 1 664 RR2BV29TF
BS 665 665 RR2GK31TF
BS 666 699 RR2BV29TF
BS 700 707 RR2GK31TF
BS 708 708 RR2BV29JQ
BS 709 960 RR2GK31TF
BS 961 961 RR2BV29JQ
BS 962 985 RR2GK31TF
BS 986 986 RR2BV29JQ
BS 987 1001 RR2GK31TF
BS 1002 1075 RR2BV29JQ

RD RR2BV29TF 711 0 0
GAACGAGCAAGATGCATGCTTGCCGATGGGGACACTTCCTCTTTCCTTCCCTCCAAACCT
CAAGGACGCTTTGTGAGAATGTTTTTGGGACCTGTCAATGTTCGAGCCTCCAGGAAAGAT
ATTCAGCTTAAAGTCAAAGAAGAATACAATAGCTACAGAGATAGGACAGCTCTTCTTTTT
CTTGTTTTCCCAGCTATTCTTTTGACACTAAGATCTTATGTCTGGGGTGGATGTTTGCCT
GCTTTCCCTGTTCAGCTCTATGAGGCTTGGCTTTTGTTCCTTTATGCTGGCTTGGCTATG
CGAGAGAACATTTTGAGAGCCAACGGGAGTGACATCCGTTCTTGGTGGCTTTATCATCAT
TATTGTGCCATGGCTATGGCCCTTGTCAGTCTCACTTGGGAAATCAAAGGTCAACCAAAC
TGTGTTCAGAAGCAGAAAGGAGTCCCTCTTTTCCTCCAATGGGCTATGATGCAAGGTGTT
GCCATGCTTCTGCAGAATAGATATCAGCGCCAAAGATTATACACTCGCATTGCACTAGGA
AAGGCGAAGAGAATGGATGTTGTATGGGGAGAAACGGCTGGAGTAGATGGGCAATTATGG
CTGTTATGTCCTCTTTTGTTCACTTTACAGGGCTTTGAAGCATACGTTGGTCTGCAGTTA
CTAAAGACAGCGTTAACTGGAGTAGTCGCCGAATGGCAG
TATTGATCTGTG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2GK31TF 687 0 0
AGCCAACGGGAGTGACATCCGTTCTTGGTGGCTTTATCATCATTATTGTGCCATGGCTAT
GGCCCTTGTCAGTCTCACTTGGGAAATCAAAGGTCAACCAAACTGTGTTCAGAAGCAGAA
AGGAGTCCGTCTTTTCCTCCAATGGGCTATGATGCAAGGTGTTGCCATGCTTCTGTAGAA
TAGATATCAGCGCCAAAGATTATACACTCGCATTGCACTAGGAAAGGCGAAGAGAATGGA
TGTTGTATGGGGAGAAACGGCTGGAGTAGATGGGCAATTATGGCTGTTATGTCCTCTTTT
GTTCACTTTACAGGGCTTTGAAGCATACGTTGGTCTGCAGTTACTAAGGACAGCGTTAAC
TGGAGTAGTCGCCGAATGGCAGGTATTGAT*TGTGGCATTCTTCTGGTTGTGATGGCCGT
TGGTAACTTCATAAACACAGTAGAGACATTGATGGTTAAGTCGAGGTTCAAGGCTAAGAT
GAAGAGAAGTAAAAGCAGAGCGGAGCTTGATTAAACTGCTTAACTTATATTTGACTACAG
CTTCATAGTTCCCAACTTCGGATCTTTCTCCCCATTAATTATTTTTACTTTATAAATTTT
GTTTGCTTGGGGCACAAGTTACCTAAAGTTCTTGAAAAAAAAA*GAAATTGACCCTTTCT
TTGTGTAA*CTAGATTATCTTTTT
GTG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2BV29JQ 690 0 0
TCAGTCTCACTTGGGAAATCAAAGGTCAACCAAACTGTGTTCAGAAGCAGAAAGGAGTCC
CTCTTTTCCTCCAATGGGCTATGATGCAAGGTGTTGCCATGCTTCTGCAGAATAGATATC
AGCGCCAAAGATTATACACTCGCATTGCACTAGGAAAGGCGAAGAGAATGGATGTTGTAT
GGGGAGAAACGGCTGGAGTAGATGGGCAATTATGGCTGTTATGTCCTCTTTTGTTCACTT
TACAGGGCTTTGAAGCATACGTTGGTCTGCAGTTACTAAGGACAGCGTTAACTGGAGTAG
TCGCCGAATGGCAGGTATTGATCTGTGGCATTTTTCTGGTTGTGATGGCCGTTGGTAACT
TCATAAACACAGTAGAGACATTGATGGTTAAGTCGAGGTTCAAGGCTAAGATGAAGAGAA
GTAAAAGCAGAGCGGAGCTTGATTAAACTGCTTAACTTATATTTGACTACAGCTTCATAG
TTCCCAACTTCGGATCTTTCTCCCCATTAATTATTTTTACTTTATAAATTTTGTTTGCTT
GGGGCACAAGTTACCTAAGGTTCTTGAAAAAAAAAAGAAATTGACCCTTTCTTTGTGTAA
ACTAGATTATCTTTTTTGTGTAAACTAGATATAAATCCGTGCAACATTTTAATTTCACAA
ACACATATAGAAAATGAAAATCTTTTTCAC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL2926Contig1 751 3 4 U
GGACTACCGAACCATCAGTTAATTGTACCAACACTACAAAGGTAGTAG***GATTCAGGA
ATCTCTCCAGAGGCAAACAACACAAAGTTTCAATCTTTGTTAAGGAGGAGGAGGAGAAGA
TGAGAGGTGGGAGTCTATGGCAGCTAGGCCAATCCATAACCCGTCGTCTTTCTCAAACCG
ACAAGAAAGCCGTCTCACGCCGCTGCTTCGCCTCTGGCGCTGCTGACCTAAAAAAAACCG
CCCTTTACGACTTCCACGTCGCGCACGGAGGAAAGATGGTTCCTTTCGCTGGTTGGAGCA
TGCCGATTCAGTACAAAGACTCCATCATCGACTCCACCGTTAACTGCAGGGTCAACGGGA
GTCTGTTCGACGTTGCGCACATGTGTGGCTTAAGCCTCAAGGGCAAAGACTGTGTGCCTT
TCCTCGAGACGCTCGTGGTTGCTGACGTGGCTGGTTTGGCTCCCGGAACGGGGAGCTTGA
CAGTGTTCACGAATGAGAAAGGAGGTGCCATTGATGACTCGGTGATTACTAAAGTGACTG
ATGAGCATATCTATCTGGTGGTGAATGCTGGTTGTAGGGATAAGGATTTGGCTCATATTG
AGGAGCATATGAAGGCTTTTAAATCCAAAGGAGGTGATGTCTCTTGGCATATCCATGATG
AGAGATCTCTTCTCGCCCTTCAGGTCCTTTGGCTGCTCCGTGCTTCAACACCTGACTAAA
GAAGACTTGAGCAAGCTTTACTTTGGACAGT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB58TF U 4
AF RR2F343TF U 1
AF RR2FM78TF U 1
BS 1 18 RR2F343TF
BS 19 19 RR2GB58TF
BS 20 674 RR2F343TF
BS 675 751 RR2FM78TF

RD RR2GB58TF 578 0 0
GG
ACCGAACCATCGGTTAATTGTACCAACACTACAAAGGTAGTAG***GATTCAGGAATCTC
TCCAGAGGCAAACAACACAAAGTTTCAATCTTTGTTAAGGAGGAGGAGGAGAAGATGAGA
GGTGGGAGTCTATGGCAGCTAGGCCAATCCATAACCCGTCGTCTTTCTCAAACCGACAAG
AAAGCCGTCTCACGCCGCTGCTTCGCCTCTGGCGCTGCTGACCTAAAAAAAACCGCCCTT
TACGACTTCCACGTCGTGCACGGAGGAAAGATGGTTCCTTTCGCTGGTTGGAGCATGCCG
ATTCAGTACAAAGACTCCATCATCGACTCCACCGTTAACTGCAGGGTCAACGGGAGTCTG
TTCGACGTTGCGCACATGTGTGGCTTAAGCCTCAAGGGCAAAGACTGTGTGCCTTTCCTC
GAGACGCTCGTGGTTGCTGACGTGGCTGGTTTGGCTCCCGGAACGGGGAGCTTGACAGTG
TTCACGAATGAGAAAGGAGGTGCCATTGATGACTCGGTGATTACTAAAGTGACTGATGAG
CATATCTATCTGGTGGTGAATGCTGGTTGTAGGGAT

QA 3 578 3 578
DS 

RD RR2F343TF 674 0 0
GGACTACCGAACCATCAGCTAATTGTACCAACACTACAAAGGTAGTAG***GATTCAGGA
ATCTCTCCAGAGGCAAACAACACAAAGTTTCAATCTTTGTTAAGGAGGAGGAGGAGAAGA
TGAGAGGTGGGAGTCTATGGCAGCTAGGCCAATCCATAACCCGTCGTCTTTCTCAAACCG
ACAAGAAAGCCGTCTCACGCCGCTGCTTCGCCTCTGGCGCTGCTGACCTAAAAAAAACCG
CCCTTTACGACTTCCACGTCGCGCACGGAGGAAAGATGGTTCCTTTCGCTGGTTGGAGCA
TGCCGATTCAGTACAAAGACTCCATCATCGACTCCACCGTTAACTGCAGGGTCAACGGGA
GTCTGTTCGACGTTGCGCACATGTGTGGCTTAAGCCTCAAGGGCAAAGACTGTGTGCCTT
TCCTCGAGACGCTCGTGGTTGCTGACGTGGCTGGTTTGGCTCCCGGAACGGGGAGCTTGA
CAGTGTTCACGAATGAGAAAGGAGGTGCCATTGATGACTCGGTGATTACTAAAGTGACTG
ATGAGCATATCTATCTGGTGGTGAATGCTGGTTGTAGGGATAAGGATTTGGCTCATATTG
AGGAGCATATGAAGGCTTTTAAATCCAAAGGAGGTGATGTCTCTTGGCATATCCATGATG
AGAGATCTCTTCTC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2FM78TF 751 0 0
GGACT
ACCGAACCATCAGTTAATTGTACCAACACTACAAAGGTAGTAGTAGGATTCAGGAATCTC
TCCAGAGGCAAACAACACAAAGTCTCAATCTTTGTT***GAGGAGGAGGAGAAGATGAGA
GGAGGGAGTCTATGGCAGCTAGGCCAATCCATAACCCGTCGTCTTTCTCAAACCGACAAG
AAAGCCGTCTCACGCCGCTGCTTCGCCTCTGGCGGTGCTGACCTCAAAAAA*CCGCCCTT
TACGACTTCCACGTCGCACACGGAGGAAAGATGGTTCCTTTCGCTGGTTGGAGCATGCCC
ATTCAGTACAAAGACTCCATCATCGACTCAACTGTTAACTGCAGGGTCAACGGTAGTTTG
TTCGACGTTGCCCACATGTGTGGCTTGAGCCTCAAGGGCAAAGACTGTGTGCCTTTCCTC
GAGACGCTCGTGGTTGCTGACGTGGCTGGTCTGGCTCCCGGAACGGGGAGTTTGACTGTG
TTCACGAATGAGAAAGGAGGTGCTATTGATGACTCGGTGATTACTAAAGTGACTGATGAG
CATATCTATCTGGTGGTGAATGCTGGTTGTAGGGATAAGGATTTGGCTCATATTGAGGAG
CATATGAAGGCTTTTAAATCCAAAGGAGGTGATGTCTCTTGGCATATCCATGATGAGAGA
TCTCTTCTCGCCCTTCAGGTCCTTTGGCTGCTCCGTGCTTCAACACCTGACTAAAGAAGA
CTTGAGCAAGCTTTACTTTGGACAGT

QA 6 751 6 751
DS 



AS 1 3

CO CL2927Contig1 799 3 2 U
GGAGTCTCACAGTGCTATAGCTTTGTGCCTCTTTTGACCATAGAAAGAAGAAGCTCTGTG
CGCCTCTTTGCAGTGAAAGCTCAACCAACAAGAAGATGATTATCACAGAGACCAACCGCA
GAGAGATCTGCAAGTACCTTTTCAAAGAAGGAGTATTGTTCGCGAAGAAGGATTTCAATC
TCCCAAAGCATCCGTTGATCGAGTCAGTGCCCAACCTGCAAGTGATCAAGCTCATGCAGA
GTTTCAAGTCCAAGGAGTACGTTAGGGAGACGTTCGCTTGGATGCACTACTATTGGTTTC
TCACCAACGAAGGGATTGAGTTCTTGAGAACTTATCTTAACCTCCCATCGGACGTTGTTC
CCGCGACTTTGAAGAAGTCTGCTAAGCCCATTGGTCGTCCCTTTGGTGGCCCACCCGGTG
ACCGCCCAAGAGGACCTCGCTTTGAGGGAGACCGTCCCAGATTTGGTGACCGTGATGGCT
ACCATGCAGGGCCACGTGGCGGTGATGCAGGAGGTGAAAAGGGTGGAGCTCCAGCTGATT
ACCAGCCGTCTTTCCAAGGAGGTGGTGGTGGTAGGCCTGGATTTGGCCGTGGTGCAGGCG
GTTACAACGCAGCAGCACCATCTGGTTCGGGTTTGCCTTGAAAGAGCACTTGTTATCGTT
TTGATTATTGAAAGACCCGAGTTTTGTTTTTGTTTTGGCTTTAGTTTTTGTTTGTGTAAC
GCAAATCCAGAATCTATAATTTATCTATTTCTCTGACATTTGGTCTGAGTTAACAATCCT
TGATAGTTTCCAAGATAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV11TF U 1
AF RR2EV11JQ C 132
AF RR2H286TF U 7
BS 1 560 RR2EV11TF
BS 561 799 RR2H286TF

RD RR2EV11TF 560 0 0
GGAGTCTCACAGTGCTATAGCTTTGTGCCTCTTTTGACCATAGAAAGAAGAAGCTCTGTG
CGCCTCTTTGCAGTGAAAGCTCAACCAACAAGAAGATGATTATCACAGAGACCAACCGCA
GAGAGATCTGCAAGTACCTTTTCAAAGAAGGAGTATTGTTCGCGAAGAAGGATTTCAATC
TCCCAAAGCATCCGTTGATCGAGTCAGTGCCCAACCTGCAAGTGATCAAGCTCATGCAGA
GTTTCAAGTCCAAGGAGTACGTTAGGGAGACGTTCGCTTGGATGCACTACTATTGGTTTC
TCACCAACGAAGGGATTGAGTTCTTGAGAACTTATCTTAACCTCCCATCGGACGTTGTTC
CCGCGACTTTGAAGAAGTCTGCTAAGCCCATTGGTCGTCCCTTTGGTGGCCCACCCGGTG
ACCGCCCAAGAGGACCTCGCTTTGAGGGAGACCGTCCCAGATTTGGTGACCGTGATGGCT
ACCATGCAGGGCCACGTGGCGGTGATGCAGGAGGTGAAAAGGGTGGAGCTCCAGCTGATT
ACCAGCCGTCTTTCCAAGGA

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2EV11JQ 602 0 0
CAAGTA
CTTTTCAAAGAAGGAGTATTGTTCGCGAAGAAGGATTTCAATCTCCCAAAGCATCCGTTG
ATCGAGTCAGTGCCCAACCTGCAAGTGATCAAGCTCATGCAGAGTTTCAAGTCCAAGGAG
TACGTTAGGGAGACGTTCGCTTGGATGCACTACTATTGGTTTCTCACCAACGAAGGGATT
GAGTTCTTGAGAACTTATCTTAACCTCCCATCGGACGTTGTTCCCGCGACTTTGAAGAAG
TCTGCTAAGCCCATTGGTCGTCCCTTTGGTGGCCCACCCGGTGACCGCCCAAGAGGACCT
CGCTTTGAGGGAGACCGTCCCAGATTTGGTGACCGTGATGGCTACCATGCAGGGCCACGT
GGCGGTGATGCAGGAGGTGAAAAGGGTGGAGCTCCAGCTGATTACCAGCCGTCTTTCCAA
GGAGGTGGTGGTGGTAGGCCTGGATTTGGCCGTGGTGCAGGCGGTTACAACGCAGCAGCA
CCATCTGGTTCGGGTTTGCCTTGAAAGAGCACTTGTTATCGTTTTGATTATTGAAAGACC
CGAGTTTTGTTTTTGTTTTGGCTTTAGTTTTTGTTTGTGTAACGCAAATCCAGAAT

QA 7 602 7 602
DS 

RD RR2H286TF 793 0 0
GG
ACAGTGCTATAGCTTTGTGCCTCTTTTGACCATAGAAAGAAGAAGCTCTGTGCGCCTCTT
TGCAGTGAAAGCTCAACCAACAAGAAGATGATTATCACAGAGACCAACCGCAGAGAGATC
TGCAAGTACCTTTTCAAAGAAGGAGTATTGTTCGCGAAGAAGGATTTCAATCTCCCAAAG
CATCCGTTGATCGAGTCAGTGCCCAACCTGCAAGTGATCAAGCTCATGCAGAGTTTCAAG
TCCAAGGAGTACGTTAGGGAGACGTTCGCTTGGATGCACTACTATTGGTTTCTCACCAAC
GAAGGGATTGAGTTCTTGAGAACTTATCTTAACCTCCCGTCGGACGTTGTTCCCGCGACT
TTGAAGAAGTCTGCTAAGCCCATTGGTCGTCCCTTTGGTGGCCCACCCGGTGACCGCCCA
AGAGGACCTCGCTTTGAGGGAGATCGTCCCAGATTTGGTGACCGTGATGGCTACCGTGCA
GGGCCACGTGGCGGTGATGCAGGAGGTGAAAAGGGTGGAGCTCCAGCTGATTACCAGCCG
TCTTTCCAAGGAGGTGGTGGTGGTAGGCCTGGATTTGGCCGTGGTGCAGGCGGTTACAAC
GCAGCAGCACCATCTGGTTCGGGTTTGCCTTGAAAGAGCACTTGTTATCGTTTTGATTAT
TGAAAGACCCGAGTTTTGTTTTTGTTTTGGCTTTAGTTTTTGTTTGTGTAACGCAAATCC
AGAATCTATAATTTATCTATTTCTCTGACATTTGGTCTGAGTTAACAATCCTTGATAGTT
TCCAAGATAGT

QA 3 793 3 793
DS 



AS 1 3

CO CL2928Contig1 1445 3 3 U
GCACATCAATGTGTCTTTCAACCAGTTCATATCCATAGAGGTTGTTCAGGTTATAGGCAT
TGAATCCCGCCTGCGGATACTTGACGCTGAAGGAAACCAGTTACAAGGTCACCTTCCACT
GAACCTGCCGTCTTATGGAAACTTGAAGTATATCAATCTACGGAGCAACAAGTTCTCCGG
AGATATTCCGAGGATTTATGGGAAAAGACTTGAGAGTTCATGGAGAAGCTTGTACTTGGA
GAACAACTACCTCACAGGTTTGCTTCCTGAGGAGTTTCTAAGGCTCTCCAAGCAAGTCAG
AGGAAGCCTTTCCAATAACTGTCTGCAATGTCCTAAGAATGTTCCAATCTGCCAAGGAGT
ACAAAAGCCAAAATCACAATGCACCAATGCAATGCAGAAGGAGGGCTTAGAGTAGAGATC
ATACACATGGGAAACAGTTTCTATTACTTGACCAAAGTTCATGTCCTTGTCTGTTTTTTA
GTCATGGTAGAAATGTACTCTATGAGAAAAATAACATCAGAGGTGTTCTCTTCACAACAA
GTTAAACGTAATGTCATTTCAAAAGGGCCAATTGACACTAATGTTACCAAGCCAGATCAA
AAGAGGGAACTGAGCTAAAGCTACAAAGATCAACAGGTAGTGATGCCTGCTCGAGTCATA
ACTCCTAGCTTCAGCAAAGAGAACTCGCTTCATTGTCTTCACTAAAAAAACCCCGGTGCA
CAAGCAGGTCCACGGAACCAGAACATAGCAAGAGTATCCCCACATGATCTTGCCAAGAAC
TGCTAAGCATAGACCCGTGAAAGCATACCCTGCATACGCCACGATATCCAATAGTGGTGC
TTCTCCACTACCCAATGAAAGCAATGTCATCTTCAGCAGCATGACTTGCATAAACCATCC
AACCATTCCTTTCACAAAAAGCCAGTTCAAAGCTTCCGGAAAAAACTTCCCAAAGAGTCC
TAGTGATAAACCAGCAAGAACAAGATAGGTGCCAAAGGCCATGAGTGGAATGTATAAATC
TGGCGCATTAATATCATATATAGGAGGCTTGTATGAAAGTCTACCACCAACAGGTTCAGA
GATTCTAGCCCAGTGTCCCCTGTGAAGGAAAGGAAGCAGAACAATCTTCAACTTGTTCCT
CACATACTGGTCGTTCACTTGGAAATAGTATTGCGGATCAGAGAAGTAACGAGTTATGTT
GCTCTGCACATACTCAGAGCTGGATCCGAATATTTTCTCCCCATAAGCACCCAGGCCACT
TCTGATAAGACCAGAGCTAGGTCCAGAGAAGGCATTGCCAAAAGGGTTAGGCTGCTGAGG
AACTGACTGAGGTCCCATGTTGTTGTTGTTATACATCTCTTAAGGGAAGGTGTGGAGGAG
ATGATAGATGGAGAACCTTGCTTTATCGGTTGATTTGATTCGTTCGCCGGCTAAGTTTCC
GGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2DV43TF U 1
AF RR2FK57JQ U 505
AF RR2FK57TF C 704
BS 1 560 RR2DV43TF
BS 561 1291 RR2FK57JQ
BS 1292 1445 RR2FK57TF

RD RR2DV43TF 560 0 0
GCACATCAATGTGTCTTTCAACCAGTTCATATCCATAGAGGTTGTTCAGGTTATAGGCAT
TGAATCCCGCCTGCGGATACTTGACGCTGAAGGAAACCAGTTACAAGGTCACCTTCCACT
GAACCTGCCGTCTTATGGAAACTTGAAGTATATCAATCTACGGAGCAACAAGTTCTCCGG
AGATATTCCGAGGATTTATGGGAAAAGACTTGAGAGTTCATGGAGAAGCTTGTACTTGGA
GAACAACTACCTCACAGGTTTGCTTCCTGAGGAGTTTCTAAGGCTCTCCAAGCAAGTCAG
AGGAAGCCTTTCCAATAACTGTCTGCAATGTCCTAAGAATGTTCCAATCTGCCAAGGAGT
ACAAAAGCCAAAATCACAATGCACCAATGCAATGCAGAAGGAGGGCTTAGAGTAGAGATC
ATACACATGGGAAACAGTTTCTATTACTTGACCAAAGTTCATGTCCTTGTCTGTTTTTTA
GTCATGGTAGAAATGTACTCTATGAGAAAAATAACATCAGAGGTGTTCTCTTCACAACAA
GTTAAACGTAATGTCATTTC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2FK57JQ 795 0 0
C
GAAAAATAACATCAGAGGTGTTCTCTTCACAACAAGTTAAACGTAATGTCATTTCAAAAG
GGCCAATTGACACTAATGTTACCAAGCCAGATCAAAAGAGGGAACTGAGCTAAAGCTACA
AAGATCAACAGGTAGTGATGCCTGCTCGAGTCATAACTCCTAGCTTCAGCAAAGAGAACT
CGCTTCATTGTCTTCACTAAAAAAACCCCGGTGCACAAGCAGGTCCACGGAACCAGAACA
TAGCAAGAGTATCCCCACATGATCTTGCCAAGAACTGCTAAGCATAGACCCGTGAAAGCA
TACCCTGCATACGCCACGATATCCAATAGTGGTGCTTCTCCACTACCCAATGAAAGCAAT
GTCATCTTCAGCAGCATGACTTGCATAAACCATCCAACCATTCCTTTCACAAAAAGCCAG
TTCAAAGCTTCCGGAAAAAACTTCCCAAAGAGTCCTAGTGATAAACCAGCAAGAACAAGA
TAGGTGCCAAAGGCCATGAGTGGAATGTATAAATCTGGCGCATTAATATCATATATAGGA
GGCTTGTATGAAAGTCTACCACCAACAGGTTCAGAGATTCTAGCCCAGTGTCCCCTGTGA
AGGAAAGGAAGCAGAACAATCTTCAACTTGTTCCTCACATACTGGTCGTTCACTTGGAAA
TAGTATTGCGGATCAGAGAAGTAACGAGTTATGTTGCTCTGCACATACTCAGAGCTGGAT
CCGAATATTTTCTCCCCATAAGCACCCAGGCCACTTCTGATAAGACCAGAGCTAGGTCCA
GAGAAG
CATTGCCA

QA 2 787 2 787
DS 

RD RR2FK57TF 742 0 0
TAAGAAAA
CCCGGTGCACAAGCAG*TCCACG*AACCAGAACATAGCAAGAGTATCCCCACATGATCTT
GCCAAGA*CTGCTAAGCATAGACCCGTGAAAGCATACCCTGCATACGCCACGATATCCAA
TAGTGGTGCTTCTCCACTACCCAATGAAAGCAATGTCATCTTCAGCAGCATGACTTGCAT
AAACCATCCAACCATTCCTTTCACAAAAAGCCAGTTCAGAGCTTCCGGAGAAAACTTCCC
AAAGAGTCCTAGTGATAAACCAGCAAGAACAAGATAGGTGCCAAAGGCCATGAGTGGAAT
GTATAAATCTGGCGCATTAATATCATATATAGGAGGCTTGTATGAAAGTCTACCACCAAC
AGGTTCAGAGATTCTAGCCCAGTGTCCCCTGTGAAGGAAAGGAAGCAGAACAATCTTCAA
CTTGTTCCTCACATACTGGTCGTTCACTTGGAAATAGTATTGCGGATCAGAGAAGTAACG
AGTTATGTTGCTCTGCACATACTCAGAGCTGGATCCGAATATTTTCTCCCCATAAGCACC
CAGGCCACTTCTGATAAGACCAGAGCTAGGTCCAGAGAAGGCATTGCCAAAAGGGTTAGG
CTGCTGAGGAACTGACTGAGGTCCCATGTTGTTGTTGTTATACATCTCTTAAGGGAAGGT
GTGGAGGAGATGATAGATGGAGAACCTTGCTTTATCGGTTGATTTGATTCGTTCGCCGGC
TAAGTTTCCGGTCC

QA 9 742 9 742
DS 



AS 1 3

CO CL2929Contig1 629 3 23 U
GGAATCCTAGGGTTATCAATAAAAAACTTGTGTAATTTTTTCAATCTCCACAGCCTTAAC
CCAACCAAAACAACAAAAACAAAACTAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAAACCCAAGGA
ATCAGACATGAACAACGAAGAAGGCTCTGTTCCTAACAAGCCTGTGTCTGAAACCATAGT
ACAAGAGAACAACACAGAAGAAAGCGGTGAGAAACAGAACCAGACAGAGACTGAAACAAC
TTCTGTCGAACCTAAGGAAGCATCTGAGGTCGAGCCGACCAAGGAAACATCTCCTGCTGT
TGAGCCAGAGGTTGCAGCAGCTGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGCTGCAGCACC
CGAGAAGGTGGAGAACGCAGCGGCTGCAACAGAAAATGCTGAAGCAGCTGTGGAAGCGGT
CGTCGCTGCTGAACCAGTAAAGGATGAGGTTAAAAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCGC
TATTTGATTGATTAAATCTTGTGAAAATGTTTTGAATGTTGTTGTATACCACCTGGATTT
GATTTGCTACTGACTGGTTTTATCGAGCTGTTCTTTGTATTTCACAATGGTTATTCTTTG
ATTCAATTAAATATAAATCAGTTTTGCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2FR02TF U 1
AF RR2B383TF U 1
AF RR2CJ61TF U 1
BS 1 13 RR2B383TF
BS 14 14 RR2CJ61TF
BS 15 25 RR2B383TF
BS 26 26 RR2CJ61TF
BS 27 62 RR2B383TF
BS 63 63 RR2CJ61TF
BS 64 73 RR2B383TF
BS 74 77 RR2CJ61TF
BS 78 84 RR2B383TF
BS 85 85 RR2CJ61TF
BS 86 183 RR2B383TF
BS 184 184 RR2CJ61TF
BS 185 195 RR2B383TF
BS 196 196 RR2CJ61TF
BS 197 225 RR2B383TF
BS 226 226 RR2CJ61TF
BS 227 286 RR2B383TF
BS 287 287 RR2CJ61TF
BS 288 360 RR2B383TF
BS 361 361 RR2CJ61TF
BS 362 585 RR2B383TF
BS 586 586 RR2CJ61TF
BS 587 629 RR2B383TF

RD RR2FR02TF 572 0 0
GGAATCCTAGGGTTATCAATAAAAAACTTGTGTAATTTTTTCAATCTCCACAGCCTTAAC
CCAACCAAAACAACAAAAACAAAACTAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAAACCCAAGGA
ATCAGACATGAACAACGAAGAAGGCTCTGTTCCTAACAAGCCTGTGTCTGAAACCATAGT
ACAAGAGAACAACACAGAAGAAAGCGGTGAGAAACAGAACCAGACAGAGACTGAAACAAC
TTCTGTCGAACCTAAGGAAGCATCTGAGGTCGAGCCGACCAAGGAAACATCTCCTGCTGT
TGAGCCAGAGGTTGCAGCAGCTGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGCTGCAGCACC
CGAGAAGGTGGAGAACGCAGCGGCTGCAACAGAAAATGCTGAAGCAGCTGTGGAAGCGGT
CGTCGCTGCTGAACCAGTAAAGGATGAGGTTAAAAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCGC
TATTTGATTGATTAAATCTTGTGAAAATGTTTTGAATGTTGTTGTATACCACCTGGATTT
GATTTGCTACTGACTGGTTTTATCGAGCTGTT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2B383TF 629 0 0
GGAATCCTAGGGTCATCAATAAAAATCTTGTGTAATTTTTTCAATCTCCACAGCCTTAAC
CCTACCAAAACAA****AACAAAATTAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAAACCCAAGGA
ATCAGACATGAACAACGAAGAAGGCTCTGTTCCTAACAAGCCTGTGTCTGAAACCATAGT
ACAGGAGAACAACACGGAAGAAAGCGGTGAGAAACAGAACCAGACGGAGACTGAAACAAC
TTCTGTCGAACCTAAGGAAGCATCTGAGGTCGAGCCGACCAAGGAAGCATCTCCTGCTGT
TGAGCCAGAGGTTGCAGCAGCTGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGCTGCAGCACC
TGAGAAGGTGGAGAACGCAGCGGCTGCAACAGAAAATGCTGAAGCAGCTGTGGAAGCGGT
CGTCGCTGCTGAACCAGTAAAGGATGAGGTTAAAAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCGC
TATTTGATTGATTAAATCTTGTGAAAATGTTTTGAATGTTGTTGTATACCACCTGGATTT
GATTTGCTACTGACTGGTTTTATCGAGCTGTTCTTTGTATTTCACTATGGTTATTCTTTG
ATTCAATTAAATATAAATCAGTTTTGCCC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2CJ61TF 625 0 0
GGAATCCTAGGGTTATCAATAAAAAACTTGTGTAATTTTTTCAATCTCCACAGCCTTAAC
CCAACCAAAACAACAAAAACAAAACTAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAAACCCAAGGA
ATCAGGCATGAACAACGAAGAAGGCTCTGTTCCTAACAAGCCTGTGTCTGAAACCATAGT
ACAAGAGAACAACACAGAAGAAAGCGGTGAGAAACAGAACCAGACAGAGACTGAAGCAAC
TTCTGTCGAACCTAAGGAAGCATCTGAGGTCGAGCCGACCAAGGAAACATCTCCTGCTGT
TGAGCCAGAGGTTGCAGCAGCTGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGCTGCAGCACC
CGAGAAGGTGGAGAACGCAGCGGCTGCAACAGAAAATGCTGAAGCAGCTGTGGAAGCGGT
CGTCGCTGCTGAACCAGTAAAGGATGAGGTTAAAAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCGC
TATTTGATTGATTAAATCTTGTGAAAATGTTTTGAATGTTGTTGTATACCACCTGGATTT
GATTTGCTACTGACTGGTTTTATCGAGCTGTTCTTTGTATTTCACAATGGTTATTCTTTG
ATTCAATTAAATATAAATCAGTTTT

QA 1 625 1 625
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL2931Contig1 965 2 2 U
GGGGGATGTGTATGCTGGTGAGTGGTCTAATGGACAGAGCCATGGGTGTGGTGTGTATAC
CTCTCAGGATGGTAGTCGCTTTGTTGGGGAGTTTAAATGGGGTGTCAAACATGGCCTTGG
TCATTACCATTTCAGAAATGGTGATACATATGCTGGGGAGTATTTTGCAGACAGGATGCA
TGGTTTTGGAGTGTATCAATTTGGAAACGGACATCGGTATGAAGGAGCCTGGCATGAGGG
GAGAAGACAAGGTCTTGGTATGTACACATTCAGGAATGGTGAGACGCAGGCAGGCCATTG
GGAAGACGGTGTCCTCAGCTGTCCTACCGAGCAGACCACCCGTCATGGTCCATCGTTTTC
CATTAGTCATTCCAAGGTTCTCGACACTGTTCAGCAAGCTAGGAAAGCAGCCGAGAAAGC
ACATGAAGTTGTGAAAGTGGAAGAAAGAGTGAACAGAGCAGTGATGGTTGCGAACCGAGC
AGCAAATTCTGCTAGAGTTGCTGCAACAAAGGCTGTTCAAACCCAAACATATTACACTAG
TGGCGGCGATGATCCCTTGTGAGATCGTGTGTCAAAGCTTTTGACATAGTCACAGTCATG
AATCTCACCTGGAACTTTTTCGGTGACATGAGAGAGATAAAACAGAGACATCTAAGAAGG
CAATCAAAATTGGCATCTCCGTTTGAGATTTATCTTGAAGGTGGAACCAATGTCGAGATC
TCGTAAGTATTAAATAAGAGATCTGGCTATGGAGCAAGCAATGCAGGTTTACGTTTTTTT
CTTTTCTCCCAGCTCTTTTCTTTATTATGAGCAGGCTGGTGGTTTATAAGCTGTACATAG
GTTGTTGAAGACTAAAGCAATGTGTTTTAACAAAAGATCTTTTTAACAAGCATAACCCAT
GTAAAGAGAAGCAACAAAACATTGTCTTAGTTTTACAATGTGTGAAAATGACACCCCTTC
CTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2B003TF U 1
AF RR2B003JQ C 159
BS 1 709 RR2B003TF
BS 710 965 RR2B003JQ

RD RR2B003TF 722 0 0
GGGGGATGTGTATGCTGGTGAGTGGTCTAATGGACAGAGCCATGGGTGTGGTGTGTATAC
CTCTCAGGATGGTAGTCGCTTTGTTGGGGAGTTTAAATGGGGTGTCAAACATGGCCTTGG
TCATTACCATTTCAGAAATGGTGATACATATGCTGGGGAGTATTTTGCAGACAGGATGCA
TGGTTTTGGAGTGTATCAATTTGGAAACGGACATCGGTATGAAGGAGCCTGGCATGAGGG
GAGAAGACAAGGTCTTGGTATGTACACATTCAGGAATGGTGAGACGCAGGCAGGCCATTG
GGAAGACGGTGTCCTCAGCTGTCCTACCGAGCAGACCACCCGTCATGGTCCATCGTTTTC
CATTAGTCATTCCAAGGTTCTCGACACTGTTCAGCAAGCTAGGAAAGCAGCCGAGAAAGC
ACATGAAGTTGTGAAAGTGGAAGAAAGAGTGAACAGAGCAGTGATGGTTGCGAACCGAGC
AGCAAATTCTGCTAGAGTTGCTGCAACAAAGGCTGTTCAAACCCAAACATATTACACTAG
TGGCGGCGATGATCCCTTGTGAGATCGTGTGTCAAAGCTTTTGACATAGTCACAGTCATG
AATCTCACCTGGAACTTTTTCGGTGACATGAGAGAGATAAAACAGAGACATCTAAGAAGG
CAATCAAAATTGGCATCTCCGTTTGAGATTTATCTTGAAGGTGGAACCA
ATGTCGAGATCTC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2B003JQ 807 0 0
AGTATTTTGCAGACAGGATGCATGGTTTTGGAGTGTATCAATTTGGAAACGGACATCGGT
ATGAAGGAGCCTGGCATGAGGGGAGAAGACAAGGTCTTGGTATGTACACATTCAGGAATG
GTGAGACGCAGGCAGGCCATTGGGAAGACGGTGTCCTCAGCTGTCCTACCGAGCAGACCA
CCCGTCATGGTCCATCGTTTTCCATTAGTCATTCCAAGGTTCTCGACACTGTTCAGCAAG
CTAGGAAAGCAGCCGAGAAAGCACATGAAGTTGTGAAAGTGGAAGAAAGAGTGAACAGAG
CAGTGATGGTTGCGAACCGAGCAGCAAATTCTGCTAGAGTTGCTGCAACAAAGGCTGTTC
AAACCCAAACATATTACACTAGTGGCGGCGATGATCCCTTGTGAGATCGTGTGTCAAAGC
TTTTGACATAGTCACAGTCATGAATCTCACCTGGAACTTTTTCGGTGACATGAGAGAGAT
AAAACAGAGACATCTAAGAAGGCAATCAAAATTGGCATCTCCGTTTGAGATTTATCTTGA
AGGTGGAACCAATGTCGAGATCTCGTAAGTATTAAATAAGAGATCTGGCTATGGAGCAAG
CAATGCAGGTTTACGTTTTTTTCTTTTCTCCCAGCTCTTTTCTTTATTATGAGCAGGCTG
GTGGTTTATAAGCTGTACATAGGTTGTTGAAGACTAAAGCAATGTGTTTTAACAAAAGAT
CTTTTTAACAAGCATAACCCATGTAAAGAGAAGCAACAAAACATTGTCTTAGTTTTACAA
TGTGTGAAAATGACACCCCTTCCTACG

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 3

CO CL2932Contig1 847 3 11 U
GCAGCTGGGTTTGAACAGCGTTGCCTACTTGATGGGAAATGATGGGACTAAGAAATGGCA
TGTCTATGCTGCCTCTGCCCAGTCCTCCAGCAACTGCACCAACAATGTCTACACGCTCGA
GATGTGCATGACTGGTCTTGACAGGGAGAAAGCATCTGTGTTCTACAAGAATGGCGAGAC
TGGATCAATGACTGACAACTCTGCAATCAGAAAGATCCTTCCTCAGTCCCAGATCTGCGA
CTTTGAGTTCGAGCCCTGTGGCTACTCTATGAACTCCATTGAAGGAGATGCGATCTCCAC
TATCCATGTGACCCCTGAGGATGGGTTTAGCTACGCTAGCTTTGAAGCTGTAGGTTATGA
CTTCAACACTTTGGACCTGAGCCAGCTGGTGACAGGGGTTCTGTCCTGCTTTGAGCCAAA
GCAATTCTCTGTGGCTGTGCACTCTAGCGTTGGAGTGAACGCGTACAAGCCTGAGATCAG
TGTGGACTTGGAAGATTACGGGTGCAGGGAGAGGACATTTGAGTGTCTAGGAGAGGAGAG
TGGAACGGTGATGTATCAGACGTTTGAGAAGCTAGGCAAGTACTGTGGGTCGCCTAGATC
TACGTTGAAGTGTGAGTGGAGCAGCAACAATAGTAGCTGCAGCAGCGAGGACGAGAAAGA
CGAGGGAATCTAGCAGA*CTTTATTATCTAAAACTACTTTTGAGCTTCTTTTTTTTCTTC
GCTTTGTTTTATTTAATAATGAATAAATACTTGTGAAGCTGAGGTACTCCTTCATAAGCA
TGTGTGTTGTGTTTTCTTAATTTATATGAATTCTGGTTTTAATATATAAGACTGTTATGT
TTGCTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG52TF U 1
AF RR2GV07TF U 1
AF RR2ES78TF U 275
BS 1 657 RR2GG52TF
BS 658 658 RR2GV07TF
BS 659 709 RR2GG52TF
BS 710 715 RR2GV07TF
BS 716 716 RR2ES78TF
BS 717 719 RR2GV07TF
BS 720 720 RR2ES78TF
BS 721 729 RR2GV07TF
BS 730 730 RR2ES78TF
BS 731 763 RR2GV07TF
BS 764 847 RR2ES78TF

RD RR2GG52TF 709 0 0
GCAGCTGGGTTTGAACAGCGTTGCCTACTTGATGGGAAATGATGGGACTAAGAAATGGCA
TGTCTATGCTGCCTCTGCCCAGTCCTCCAGCAACTGCACCAACAATGTCTACACGCTCGA
GATGTGCATGACTGGTCTTGACAGGGAGAAAGCATCTGTGTTCTACAAGAATGGCGAGAC
TGGATCAATGACTGACAACTCTGCAATCAGAAAGATCCTTCCTCAGTCCCAGATCTGCGA
CTTTGAGTTCGAGCCCTGTGGCTACTCTATGAACTCCATTGAAGGAGATGCGATCTCCAC
TATCCATGTGACCCCTGAGGATGGGTTTAGCTACGCTAGCTTTGAAGCTGTAGGTTATGA
CTTCAACACTTTGGACCTGAGCCAGCTGGTGACAGGGGTTCTGTCCTGCTTTGAGCCAAA
GCAATTCTCTGTGGCTGTGCACTCTAGCGTTGGAGTGAACGCGTACAAGCCTGAGATCAG
TGTGGACTTGGAAGATTACGGGTGCAGGGAGAGGACATTTGAGTGTCTAGGAGAGGAGAG
TGGAACGGTGATGTATCAGACGTTTGAGAAGCTAGGCAAGTACTGTGGGTCGCCTAGATC
TACGTTGAAGTGTGAGTGGAGCAGCAACAATAGTAGCTGCAGCAGCGAGGACGAGAA*GA
CGAGGGAATCTAGCAGA*CTTTATTATCTAAAACTACTTTTGAGCTTCT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2GV07TF 767 0 0
GCAGCTGGGTTTGAACAGCGTTGCCTACTTGATGGGAAATGATGGGACTAAGAAATGGCA
TGTCTATGCTGCCTCTGCCCAGTCCTCCAGCAACTGCACCAACAATGTCTACACGCTCGA
GATGTGCATGACTGGTCTTGACAGGGAGAAAGCATCTGTGTTCTACAAGAATGGCGAGAC
TGGATCAATGACTGACAACTCTGCAATCAGAAAGATCCTTCCTCAGTCCCAGATCTGCGA
CTTTGAGTTCGAGCCCTGTGGCTACTCTATGAACTCCATTGAAGGAGATGCGATCTCCAC
TATCCATGTGACCCCTGAGGATGGGTTTAGCTACGCTAGCTTTGAAGCTGTAGGTTATGA
CTTCAACACTTTGGACCTGAGCCAGCTGGTGACAGGGGTTCTGTCCTGCTTTGAGCCAAA
GCAATTCTCTGTGGCTGTGCACTCTAGCGTTGGAGTGAACGCGTACAAGCCTGAGATCAG
TGTGGACTTGGAAGATTACGGGTGCAGGGAGAGGACATTTGAGTGTCTAGGAGAGGAGAG
TGGAACGGTGATGTATCAGACGTTTGAGAAGCTAGGCAAGTACTGTGGGTCGCCTAGATC
TACGTTGAAGTGTGAGTGGAGCAGCAACAATAGTAGCTGCAGCAGCGAGGACGAGAAAGA
CGAGGGAATCTAGCAGA*CTTTATTATCTAAAACTACTTTTGAGCTTCTTTTTTT*CTTT
GCTTTGTTT*ATTTAATAATGAATAAATACTTGTGAAGCTGAG
TACT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2ES78TF 573 0 0
G
CCATTGAAGGAGATGCGATCTCCACTATCCATGTGACCCCTGAGGATGGGTTTAGCTACG
CTAGCTTTGAAGCTGTAGGTTATGACTTCAACACTTTGGACCTGAGCCAGCTGGTGACAA
GGGTTCTGTCCTGCTTTGAGCCAAAGCAATTCTCTGTGGCTGTGCACTCTAGCGTTGGAG
TGAACGCGTACAAGCCTGAGATCAGTGTGGACTTGGAAGATTACGGGTGCAGGGAGAGGA
CATTTGAGTGTCTAGGAGAGGAGAGTGGAATGGTGATGTATCAGACGTTTGAGAAGCTAG
GCAAGTACTGTGGGTCGCCTAGATCTACGTTGAAGTGTGAGTGGAGCAGCAACAATAGTA
GCTGCAGCAGCGAGGACGAGAAGGACGAGGGAATCTAGCAGAACTTTATTATCTAAAACT
ACTTTTGAGCTTCTTTTTTTTCTTCGCTTTGTTTTATTTAATAATGAATAAATACTTGTG
AAGCTGAGGTACTCCTTCATAAGCATGTGTGTTGTGTTTTCTTAATTTATATGAATTCTG
GTTTTAATATATAAGACTGTTATGTTTGCTCT

QA 2 573 2 573
DS 



AS 1 3

CO CL2933Contig1 979 3 2 U
CAATGGGATTATTTGTAATTAAAACAATAATTTAATCATACAGAGTAAATGAACATGAGG
TTTATCACTCGCCAGGAGAGTAAAATGTACAACACAAACTGAAATGGTATGAAGTACACA
CACACTGTTCCATACATATAATGCACAACACTAGAGACACCGGTGGCGGTGGAGCCTCAT
GGAGCATGCGACTGCACAGCTTCTTGAAGGCTCTTCACAGCGCTATCATAAGTCACAAAC
CCCATAAACCAAAACTCGTGGTTGTCGACAGAAATCACTTGTATGTACTTCTCAAATGTG
TTCACTCTGCTTGTTGACGGGTTCACTGCCTTCAGCTGGTTCACCGGAAGTACCACCTTG
TAATAGCTCCACTTGGTCTGATCACCTTCCTTGTAGGAAAGAGGAGAGTCACTACAAAAC
GCAAGCTTGTGCGTAGAAAGATACATAACACCCATGACAGGACCAGCAGATGTGGACAAG
TAGCAAGCATAGGTCTTGCGAAGCTGCTCATCAGGAAAGCACTCAAACGTCTGCTTGAAA
ACCTTCTCATATCCACCTTCCGCAAGTATCTTCGTCCCCTGAGCGATTCGAGAAACAGCA
GCATCAGCTACACTTGGGCCTGTTTTCAAGTGCTGCCAAACGTTCCCGGAGAGATCCTGA
GCCTTCTTGGTGGCGTCTGCTGCCATCTTCCCCCATTTCCCAAGCGTATCCTTCACAGAG
TCCATTGTATTCTTGGGGACAGGGGAAGGAGAGACGTAAGGATTGAACTCCGGCGGCATG
GTGGTGGCGGCGGCGTTGTCGGAGATGGGAGCAGGAGGAGGAGGAGTGACGTCGTTGGGA
TCGAGCTTAGGGTAAGGAGCGTAGTCAGAGGAGTGAGGAGCTTTGGGCTCCGATGATGCG
GAGGAGGGAGTAGAGATCCGGCTGACGTCATCGTGATTCTCGTGCCCACTCATGCTTTTG
ATTCTTCTTCTTCTTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G849JQ U 21
AF RR2GY78JQ U 1
AF RR2GY78TF C 334
BS 1 789 RR2GY78JQ
BS 790 979 RR2GY78TF

RD RR2G849JQ 444 0 0
AAAACAATAATTTAATCATACAGAGTAAATGAACATGAGGTTTATCACTCGCCAGGTGAG
TAAAATGTACAACACAAACTGAAATGGTATGAAGTACACACACACTGTTCCATACATATA
ATGCACAACACTAGAGTCACCGGTGGCGGTGGAGCCTCATGGAGCATGCGACTGCACAGC
TTCTTGAAGGCTCTTCACAGCGCTATCATAAGTCACAAACCCCATAAACCAGAACTCGTG
GTTGTCGACAGAAATCACTTGTATGTACTTCTCAAATGTGTTCACTCTGCTTGTTGACGG
GTTCACTGCCTTCAGCTGGTTCACCGGAAGTACCACCTTGTAATAACTCCACTTGGTCTG
ATCACCTTCCTTGTAGGAAAGAGGAGAGTCACTACAAAACGCAAGCTTGTGCGTAGAAAG
ATACATAACACCCATGACAGGACC

QA 1 444 1 444
DS 

RD RR2GY78JQ 789 0 0
CAATGGGATTATTTGTAATTAAAACAATAATTTAATCATACAGAGTAAATGAACATGAGG
TTTATCACTCGCCAGGAGAGTAAAATGTACAACACAAACTGAAATGGTATGAAGTACACA
CACACTGTTCCATACATATAATGCACAACACTAGAGACACCGGTGGCGGTGGAGCCTCAT
GGAGCATGCGACTGCACAGCTTCTTGAAGGCTCTTCACAGCGCTATCATAAGTCACAAAC
CCCATAAACCAAAACTCGTGGTTGTCGACAGAAATCACTTGTATGTACTTCTCAAATGTG
TTCACTCTGCTTGTTGACGGGTTCACTGCCTTCAGCTGGTTCACCGGAAGTACCACCTTG
TAATAGCTCCACTTGGTCTGATCACCTTCCTTGTAGGAAAGAGGAGAGTCACTACAAAAC
GCAAGCTTGTGCGTAGAAAGATACATAACACCCATGACAGGACCAGCAGATGTGGACAAG
TAGCAAGCATAGGTCTTGCGAAGCTGCTCATCAGGAAAGCACTCAAACGTCTGCTTGAAA
ACCTTCTCATATCCACCTTCCGCAAGTATCTTCGTCCCCTGAGCGATTCGAGAAACAGCA
GCATCAGCTACACTTGGGCCTGTTTTCAAGTGCTGCCAAACGTTCCCGGAGAGATCCTGA
GCCTTCTTGGTGGCGTCTGCTGCCATCTTCCCCCATTTCCCAAGCGTATCCTTCACAGAG
TCCATTGTATTCTTGGGGACAGGGGAAGGAGAGACGTAAGGATTGAACTCCGGCGGCATG
GTGGTGGCG

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2GY78TF 646 0 0
AGCTGGTTCACCGGAAGTACCACCTTGTAATAGCTCCACTTGGTCTGATCACCTTCCTTG
TAGGAAAGAGGAGAGTCACTACAAAACGCAAGCTTGTGCGTAGAAAGATACATAACACCC
ATGACAGGACCAGCAGATGTGGACAAGTAGCAAGCATAGGTCTTGCGAAGCTGCTCATCA
GGAAAGCACTCAAACGTCTGCTTGAAAACCTTCTCATATCCACCTTCCGCAAGTATCTTC
GTCCCCTGAGCGATTCGAGAAACAGCAGCATCAGCTACACTTGGGCCTGTTTTCAAGTGC
TGCCAAACGTTCCCGGAGAGATCCTGAGCCTTCTTGGTGGCGTCTGCTGCCATCTTCCCC
CATTTCCCAAGCGTATCCTTCACAGAGTCCATTGTATTCTTGGGGACAGGGGAAGGAGAG
ACGTAAGGATTGAACTCCGGCGGCATGGTGGTGGCGGCGGCGTTGTCGGAGATGGGAGCA
GGAGGAGGAGGAGTGACGTCGTTGGGATCGAGCTTAGGGTAAGGAGCGTAGTCAGAGGAG
TGAGGAGCTTTGGGCTCCGATGATGCGGAGGAGGGAGTAGAGATCCGGCTGACGTCATCG
TGATTCTCGTGCCCACTCATGCTTTTGATTCTTCTTCTTCTTCCCT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 3

CO CL2934Contig1 1084 3 2 U
GAAGCTTGTATGGGAGTTCTCCGTCTCGCACGAGCCTTCACCAACAAAGAGAAGTTCATC
AAGTTCGAAGGATGTTACCACGGTCACGCCAACGCCTTCCTTGTTAAAGCTGGTAGTGGT
GTAGCCACTCTGGGGCTACCTGACTCGCCTGGTGTACCTAAAGCAGCTACTTCGGATACT
TTGACAGCTCCTTACAATGATATTGAAGCCGTTGCGAAGCTCTTTGAGGCGCATAAAGGG
GAGATCTCTGCGGTTATTCTCGAGCCTGTTGTTGGTAACTCGGGGTTCATCACTCCTACG
CCTGAGTTCATCAACGGTTTGCGTCAGCTGAGTAGAGACAATGGTGCGCTTCTCATCTTT
GATGAAGTCATGACTGGCTTTCGTTTAGCTTATGGTGGTGCTCAAGAGTACTTTGGAATC
ACTCCTGACTTGACTACTCTTGGAAAAATCATCGGTGGCGGTCTTCCTGTGGGAGCTTAT
GGTGGAAGACGTGATATTATGGAGATGGTTGCTCCTGCAGGACCAATGTACCAAGCCGGG
ACACTTAGTGGTAACCCTCTGGCAATGACGGCAGGTATTCATACACTGAAGCGGCTAAAG
CAGCCAGGAACATACGAGTATTTAGACAATATCACAAAGGAGCTAACCAACAGCATCTTA
GAAGCCGGGAAGAAAACCGGACATGCAATGTGCGGCGGTTACATAAGTGGTATGTTCGGT
TTCTTTTTCACGGAAGGACCGGTCTACAACTTTGCGGATGCCAAGAAGAGTGATACGGAG
AAGTTTGGTAGGTTCTTCAGGGGAATGTTGGAAGAAGGTGTTTACTTTGCGCCGTCTCAG
TTCGAAGCTGGGTTTACTAGCTTGGCTCACACTCAAGAGGATATACAGTTCACGATTGCT
GCGGCGGAGAGGGTTCTTGGTAGGATCTAGGATGGTCCAGGACCTAACCTGGAGTCTCGT
TCGATGAAGGGGTGTTGTAGTAGTGAGATTTTTATTTCATTTTTATCATCGGTAGCTTGA
GATTTTTTTGTATGATGAAAATTGAAACCATCCGTTTTGTTAATTTAATGAGAAGTTTAG
CTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 

AF RR2AV77TF U 1
AF RR2AV77JQ C 324
AF RR2EN60TF U 497
BS 1 732 RR2AV77TF
BS 733 1084 RR2EN60TF

RD RR2AV77TF 732 0 0
GAAGCTTGTATGGGAGTTCTCCGTCTCGCACGAGCCTTCACCAACAAAGAGAAGTTCATC
AAGTTCGAAGGATGTTACCACGGTCACGCCAACGCCTTCCTTGTTAAAGCTGGTAGTGGT
GTAGCCACTCTGGGGCTACCTGACTCGCCTGGTGTACCTAAAGCAGCTACTTCGGATACT
TTGACAGCTCCTTACAATGATATTGAAGCCGTTGCGAAGCTCTTTGAGGCGCATAAAGGG
GAGATCTCTGCGGTTATTCTCGAGCCTGTTGTTGGTAACTCGGGGTTCATCACTCCTACG
CCTGAGTTCATCAACGGTTTGCGTCAGCTGAGTAGAGACAATGGTGCGCTTCTCATCTTT
GATGAAGTCATGACTGGCTTTCGTTTAGCTTATGGTGGTGCTCAAGAGTACTTTGGAATC
ACTCCTGACTTGACTACTCTTGGAAAAATCATCGGTGGCGGTCTTCCTGTGGGAGCTTAT
GGTGGAAGACGTGATATTATGGAGATGGTTGCTCCTGCAGGACCAATGTACCAAGCCGGG
ACACTTAGTGGTAACCCTCTGGCAATGACGGCAGGTATTCATACACTGAAGCGGCTAAAG
CAGCCAGGAACATACGAGTATTTAGACAATATCACAAAGGAGCTAACCAACAGCATCTTA
GAAGCCGGGAAGAAAACCGGACATGCAATGTGCGGCGGTTACATAAGTGGTATGTTCGGT
TTCTTTTTCACG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2AV77JQ 758 0 0
TCAGCTGAGTAGAGACAATGGTGCGCTTCTCATCTTTGATGAAGTCATGACTGGCTTTCG
TTTAGCTTATGGTGGTGCTCAAGAGTACTTTGGAATCACTCCTGACTTGACTACTCTTGG
AAAAATCATCGGTGGCGGTCTTCCTGTGGGAGCTTATGGTGGAAGACGTGATATTATGGA
GATGGTTGCTCCTGCAGGACCAATGTACCAAGCCGGGACACTTAGTGGTAACCCTCTGGC
AATGACGGCAGGTATTCATACACTGAAGCGGCTAAAGCAGCCAGGAACATACGAGTATTT
AGACAATATCACAAAGGAGCTAACCAACAGCATCTTAGAAGCCGGGAAGAAAACCGGACA
TGCAATGTGCGGCGGTTACATAAGTGGTATGTTCGGTTTCTTTTTCACGGAAGGACCGGT
CTACAACTTTGCGGATGCCAAGAAGAGTGATACGGAGAAGTTTGGTAGGTTCTTCAGGGG
AATGTTGGAAGAAGGTGTTTACTTTGCGCCGTCTCAGTTCGAAGCTGGGTTTACTAGCTT
GGCTCACACTCAAGAGGATATACAGTTCACGATTGCTGCGGCGGAGAGGGTTCTTGGTAG
GATCTAGGATGGTCCAGGACCTAACCTGGAGTCTCGTTCGATGAAGGGGTGTTGTAGTAG
TGAGATTTTTATTTTATTTTTATCATCGGTAGCTTGAGATTTTTTTGTATGATGAAAATT
GAAACCATCCGTTTTGTTAATTTAATGAGAAGTTTAGC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2EN60TF 588 0 0
G
TATGGAGATGGTTGCTCCTGCAGGACCAATGTACCAAGCCGGGACACTTAGTGGTAACCC
TCTGGCAATGACGGCAGGTATTCATACACTGAAGCGGCTAAAGCAGCCAGGAACATACGA
GTATTTAGACAAGATCACAAAGGAGCTAACCAACGGCATCTTAGAAGCCGGGAAGAAAAC
CGGACATGCAATGTGCGGCGGTTACATAAGTGGTATGTTCGGTTTCTTTTTCACGGAAGG
ACCGGTCTACAACTTTGCGGATGCCAAGAAGAGTGATACGGAGAAGTTTGGTAGGTTCTT
CAGGGGAATGTTGGAAGAAGGTGTTTACTTTGCGCCGTCTCAGTTCGAAGCTGGGTTTAC
TAGCTTGGCTCACACTCAAGAGGATATACAGTTCACGATTGCTGCGGCGGAGAGGGTTCT
TGGTAGGATCTAGGATGGTCCAGGACCTAACCTGGAGTCTCGTTCGATGAAGGGGTGTTG
TAGTAGTGAGATTTTTATTTCATTTTTATCATCGGTAGCTTGAGATTTTTTTGTATGATG
AAAATTGAAACCATCCGTTTTGTTAATTTAATGAGAAGTTTAGCTCA

QA 2 588 2 588
DS 



AS 1 2

CO CL2935Contig1 761 2 14 U
AGGTTCACAACAAGAACAAACTTGAGAGAGTTTTAAACATGGTTCGTTATGAAAAAGACA
AGAACATGCACAAGTGAGAGAGTAACACAATCACAGAAACAAAGAAAAAAAACAATCTGA
AACCAGTTTTGGTAGTAACACCTTTTGTTTCAAAGTTAAGATTCAGGGACGGCTTCTACA
TCAGCAGCGGCAGCAGCAGCTGTGGCCGCAGCAGCGGCGGCGCGTTTGATGGAAGCAGAT
TTGATGAGGTGATTGTAACTTCCTTTCTCCTTGAAAAGCTGAGCGAAATGGTGTTTGCAG
TACAAGATTCCTTCCAGAGCCGCGTAGTTGGAAGGAGAGATAGGACAGCCTCCGTGGGAA
CACTTGAAGCAGGACTTGTGGTAACACTGGCTCTCCACGGTTACCTTCTCGATAGGGTAC
ACGGTTTTACTGCAAGTAGCGCATTTATCTTGCGTACCAAAAAACATTCCAGCAACTCGG
CTAGGTGTCCTTGTCAGCTCAGGGGTTGGCTTGTCAGTTAATGGCTTTGCAGGTGATTGA
AAGTTCTTCTTGTTGAAACTACCAGTCTCCTTGAAGAGCTGCTCAAAGTGAGGCTTACAG
TACAACACACCTTCCATCGATGAATAATTGCTCAGTTGAAGGGTGGATTTGCAGTGAGAG
CACTTGGAGCAAGACTTGTGAAAAGGGACGCCATCAGCTGAGAGAAGCTCCATAGGGTAC
ACTGTCTTCTCACACGCCCTGCATTTCTGCTGCGTTCCTGT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE30JQ U 1
AF RR2HA51JQ U 1
BS 1 55 RR2EE30JQ
BS 56 56 RR2HA51JQ
BS 57 109 RR2EE30JQ
BS 110 112 RR2HA51JQ
BS 113 116 RR2EE30JQ
BS 117 117 RR2HA51JQ
BS 118 455 RR2EE30JQ
BS 456 456 RR2HA51JQ
BS 457 459 RR2EE30JQ
BS 460 460 RR2HA51JQ
BS 461 590 RR2EE30JQ
BS 591 591 RR2HA51JQ
BS 592 636 RR2EE30JQ
BS 637 761 RR2HA51JQ

RD RR2EE30JQ 636 0 0
AGGTTCACAACAAGAACAAACTTGAGAGAGTTTTAAACATGGTTCGTTATGAAAA*GACA
AGAACATGCACAAGTGAGAGAGTAACACAATCACAGAAACAAAGAAAAA***CAATTTGA
AACCAGTTTTGGTAGTAACACCTTTTGTTTCAAAGTTAAGATTCAGGGACGGCTTCTACA
TCAGCAGCGGCAGCAGCAGCTGTGGCCGCAGCAGCGGCGGCGCGTTTGATGGAAGCAGAT
TTGATGAGGTGATTGTAACTTCCTTTCTCCTTGAAAAGCTGAGCGAAATGGTGTTTGCAG
TACAAGATTCCTTCCAGAGCCGCGTAGTTGGAAGGAGAGATAGGACAGCCTCCGTGGGAA
CACTTGAAGCAGGACTTGTGGTAACACTGGCTCTCCACGGTTACCTTCTCGATAGGGTAC
ACGGTTTTACTGCAAGTAGCGCATTTATCTTGCGTTCCAGAAAACATTCCAGCAACTCGG
CTAGGTGTCCTTGTCAGCTCAGGGGTTGGCTTGTCAGTTAATGGCTTTGCAGGTGATTGA
AAGTTCTTCTTGTTGAAACTACCAGTCTCCTTGAAGAGCTGCTCAAAGTGGGGCTTACAG
TACAACACACCTTCCATCGATGAATAATTGCTCAGT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2HA51JQ 761 0 0
C
GGTTCACAACAAGAACAAACTTGAGAGAGTTTTAAACATGGTTCGTTATGAAAAAGACAA
GAACATGCACAAGTGAGAGAGTAACACAATCACAGAAACAAAGAAAAAAAACAATCTGAA
ACCAGTTTTGGTAGTAACACCTTTTGTTTCAAAGTTAAGATTCAGGGACGGCTTCTACAT
CAGCAGCGGCAGCAGCAGCTGTGGCCGCAGCAGCGGCGGTGCGTTTGATGGAAGCAGATT
TGATGAGGTGATTGTAACTTCCTTTCTCCTTGAAAAGCTGAGCGAAATGGTGTTTGCAGT
ACAAGATTCCTTCGAGAGCTGCGTAGTTGGATGGAGAGATGGGACAGCCTCCGTGGGAAC
ACTTGAAGCAGGACTTGTGGTAACACTGGCTCTCCACGGTTACCTTCTCGATAGGGTACA
CGGTTTTGCTGCAGGTAGCGCATTTATCTTGCGTACCAAAGAACATTCCAGCGACTCGGC
TAGGTGTCCTTGTCAGCTCAGGGGTTGGCTTGTCAGTTAATGGCTTTGCAGGTGATTGAA
AGTTCTT***GTTGAAACTACCAGTCTCCTTGAAGAGCTGCTCAAAGTGAGGCTTACAGT
ACAACACACCTTCCATCGATGAATAATTGCTCAGTTGAAGGGTGGATTTGCAGTGAGAGC
ACTTGGAGCAAGACTTGTGAAAAGGGACGCCATCAGCTGAGAGAAGCTCCATAGGGTACA
CTGTCTTCTCACACGCCCTGCATTTCTGCTGCGTTCCTGT

QA 2 761 2 761
DS 



AS 1 2

CO CL2936Contig1 760 2 2 U
GGGAGTTTAGACAAAGCCTTAGAGAGAGAGTGTGTCTGTCGGTGAATATCTGGGGAAGAT
GGTGAAGTCTTCAGAGATCGTGAAGAAGCTGCATCTCAGGTCACACCAAGAAGGTGGTTT
CTTCTATGAAACGTTCAGAGATTCTTCTGTCATCCTCTCCACCTCTCATCTCCCACCTAC
CTTCAAGGTGGACAGAGCTGTGAGCACAAGCATCTACTTCTTGCTTCCATCTGGTAACGT
CTCACGTCTTCATCGCATTCCAATGGCTGAAACCTGGCACTTCTATTTGGGTGAACCCCT
CACTGTAGTGGAGATCCACGACAATGGGAAGTTGAATATCACGTGTCTTGGTCCTGACCT
GATTGAAGGCGACCAGAAGCCTCAGTACACTGTCCCTCCAAACATCTGGTTTGGTTCTTT
TCCGACAAAGGATTTTCATTTCCCTCATGAGGGGACTCTGCTTAGAACTGAGCCTAGAGA
CTCCGAGAACCATTTCTCTCTTGTCGGATGCACCTGCGCTCCCGGTTTCCAGTTTGAGGA
CTTTGAGCTTGCGAAACGCTCTCACCTCTTATCTCTGTTTCCTCAGCACGAGTCGCTTAT
CACAATGCTCTCTTATCCTGAGTGAAGGAGGTTAATGATAATAAAAAGAAGACAAAATGA
GTTCACTATGTTGTTCTGTTTCTTCAGCACCTTACTTATGAACCATGCGAGGTTGTAATT
GTACTCTTTGATTTTAGTTTTGAACTATCTTTATTTGTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL73TF U 1
AF RR2AL73JQ C 1
BS 1 584 RR2AL73TF
BS 585 760 RR2AL73JQ

RD RR2AL73TF 584 0 0
GGGAGTTTAGACAAAGCCTTAGAGAGAGAGTGTGTCTGTCGGTGAATATCTGGGGAAGAT
GGTGAAGTCTTCAGAGATCGTGAAGAAGCTGCATCTCAGGTCACACCAAGAAGGTGGTTT
CTTCTATGAAACGTTCAGAGATTCTTCTGTCATCCTCTCCACCTCTCATCTCCCACCTAC
CTTCAAGGTGGACAGAGCTGTGAGCACAAGCATCTACTTCTTGCTTCCATCTGGTAACGT
CTCACGTCTTCATCGCATTCCAATGGCTGAAACCTGGCACTTCTATTTGGGTGAACCCCT
CACTGTAGTGGAGATCCACGACAATGGGAAGTTGAATATCACGTGTCTTGGTCCTGACCT
GATTGAAGGCGACCAGAAGCCTCAGTACACTGTCCCTCCAAACATCTGGTTTGGTTCTTT
TCCGACAAAGGATTTTCATTTCCCTCATGAGGGGACTCTGCTTAGAACTGAGCCTAGAGA
CTCCGAGAACCATTTCTCTCTTGTCGGATGCACCTGCGCTCCCGGTTTCCAGTTTGAGGA
CTTTGAGCTTGCGAAACGCTCTCACCTCTTATCTCTGTTTCCTC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2AL73JQ 760 0 0
GGGAGTTTAGACAAAGCCTTAGAGAGAGAGTGTGTCTGTCGGTGAATATCTGGGGAAGAT
GGTGAAGTCTTCAGAGATCGTGAAGAAGCTGCATCTCAGGTCACACCAAGAAGGTGGTTT
CTTCTATGAAACGTTCAGAGATTCTTCTGTCATCCTCTCCACCTCTCATCTCCCACCTAC
CTTCAAGGTGGACAGAGCTGTGAGCACAAGCATCTACTTCTTGCTTCCATCTGGTAACGT
CTCACGTCTTCATCGCATTCCAATGGCTGAAACCTGGCACTTCTATTTGGGTGAACCCCT
CACTGTAGTGGAGATCCACGACGATGGGAAGTTGAATATCACGTGTCTTGGTCCTGACCT
GATTGAAGGCGACCAGAAGCCTCAGTACACTGTCCCTCCAAACATCTGGTTTGGTTCTTT
TCCGACAAAGGATTTTCATTTCCCTCATGAGGGGACTCTGCTTAGAACTGAGCCTAGAGA
CTCCGAGAACCATTTCTCTCTTGTCGGATGCACCTGCGCTCCCGGTTTCCAGTTTGAGGA
CTTTGAGCTTGCGAAACGCTCTCACCTCTTATCTCTGTTTCCTCAGCACGAGTCGCTTAT
CACAATGCTCTCTTATCCTGAGTGAAGGAGGTTAATGATAATAAAAAGAAGACAAAATGA
GTTCACTATGTTGTTCTGTTTCTTCAGCACCTTACTTATGAACCATGCGAGGTTGTAATT
GTACTCTTTGATTTTAGTTTTGAACTATCTTTATTTGTTC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 3

CO CL2937Contig1 1001 3 9 U
GGTTCCCATCGCGACGCGTCTGCCATGTCGATCACGGCCGTAGCCGCGCTCTTTCACGCG
AGCAGATTCCCTCTTATCGCCCCTCGAACTTTCCCGTCTTCTGTTAGTTACTGTCCCCGG
ACTCTTCTTTCCAATGGATTCACCTACCGACTACAATCTATCATCTGTTTTTCATCGTCC
GACGGTGGCGGCGTTAGCGAATCCGATACGGTTGTTTCAGAAGTTCAGGGTCCCAATTTT
CTAAAGTACAGCGACGAAGAGTTGATGAAGCAATGCAAATTCGAGACCTTTAGAGTTTCA
GGACCCGGAGGACAGCACCGCAACAAACGTGACTCCGCCGTTAGGCTCAAACACCTCCCC
ACCGGAATCGTATCTCAGGCCGTCGAGGACCGTTCCCAGCACAAGAACCGAGCTTCTGCT
CTTAACCGCCTTCGCACTCTCCTCGCTATCAAAGTGAGGAACAAGGTGGACATTGAAGGC
TATTCTCCTCCTCCCGAGCTTCTTCAGATTCTACCTCCCAAGTCCACCGTTAGATCTTCT
TCTTCTGGTTCTCAGATTGGTCCCAACAATCCTAAATTTGTACCTGGGATGCAAGCTTTG
CTTGATGTTATTTCTGCTTCTGACGGTTCTGTTGCTGATTCCGCCAAGTTGCTGGGTTTG
AGCACTGGTGGCTTGTCTCGTTTGATACTCTCTCATGATGGTCTTCGTATGGCAGTCAAT
AGCATGAGGGCAGCCAAGGGAATGAAGCCTCTCAAGTAGTTGGGATGTATAGACATTTGA
AGAATGATGGTGGGACCTTTGACCGTCTCTACCATTTTACGCACCTTATTTTGTATACAA
AACAAAAGTATAAATGTTGAGAGTCTAGCATTCATTCAGATCGTCATGTATTTTGAGATG
ATATACTACTATATAGGCTGCTAAAATATTTATGGTTATTTCGAGTCGCCTTTTGTTGTG
TTGGAACTTTGAAGCTAATACAGTTGGAACCATTTTGGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT04TF U 1
AF RR2D832TF U 35
AF RR2D832JQ C 245
BS 1 93 RR2AT04TF
BS 94 94 RR2D832TF
BS 95 628 RR2AT04TF
BS 629 629 RR2D832TF
BS 630 735 RR2AT04TF
BS 736 741 RR2D832TF
BS 742 742 RR2D832JQ
BS 743 774 RR2D832TF
BS 775 1001 RR2D832JQ

RD RR2AT04TF 735 0 0
GGTTCCCATCGCGACGCGTCTGCCATGTCGATCACGGCCGTAGCCGCGCTCTTTCACGCG
AGCAGATTCCCTCTTATCGCCCCTCGAACTTTCTCGTCTTCTGTTAGTTACTGTCCCCGG
ACTCTTCTTTCCAATGGATTCACCTACCGACTACAATCTATCATCTGTTTTTCATCGTCC
GACGGTGGCGGCGTTAGCGAATCCGATACGGTTGTTTCAGAAGTTCAGGGTCCCAATTTT
CTAAAGTACAGCGACGAAGAGTTGATGAAGCAATGCAAATTCGAGACCTTTAGAGTTTCA
GGACCCGGAGGACAGCACCGCAACAAACGTGACTCCGCCGTTAGGCTCAAACACCTCCCC
ACCGGAATCGTATCTCAGGCCGTCGAGGACCGTTCCCAGCACAAGAACCGAGCTTCTGCT
CTTAACCGCCTTCGCACTCTCCTCGCTATCAAAGTGAGGAACAAGGTGGACATTGAAGGC
TATTCTCCTCCTCCCGAGCTTCTTCAGATTCTACCTCCCAAGTCCACCGTTAGATCTTCT
TCTTCTGGTTCTCAGATTGGTCCCAACAATCCTAAATTTGTACCTGGGATGCAAGCTTTG
CTTGATGTTATTTCTGCTTCTGACGGTTTTGTTGCTGATTCCGCCAAGTTGCTGGGTTTG
AGCACTGGTGGCTTGTCTCGTTTGATACTCTCTCATGATGGTCTTCGTATGGCAGTCAAT
AGCATGAGGGCAGCC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2D832TF 740 0 0
CGGCCGTAGCCGCGCTCTTTCACGCGAGCAGATTCCCTCTTATCGCCCCTCGAACTTTCC
CGTCTTCTGTTAGTTACTGTCCCCGGACTCTTCTTTCCAATGGATTCACCTACCGACTAC
AATCTATCATCTGTTTTTCATCGTCCGACGGTGGCGGCGTTAGCGAATCCGATACGGTTG
TTTCAGAAGTTCAGGGTCCCAATTTTCTAAAGTACAGCGACGAAGAGTTGATGAAGCAAT
GCAAATTCGAGACCTTTAGAGTTTCAGGACCCGGAGGACAGCACCGCAACAAACGTGACT
CCGCCGTTAGGCTCAAACACCTCCCCACCGGAATCGTATCTCAGGCCGTCGAGGACCGTT
CCCAGCACAAGAACCGAGCTTCTGCTCTTAACCGCCTTCGCACTCTCCTCGCTATCAAAG
TGAGGAACAAGGTGGACATTGAAGGCTATTCTCCTCCTCCCGAGCTTCTTCAGATTCTAC
CTCCCAAGTCCACCGTTAGATCTTCTTCTTCTGGTTCTCAGATTGGTCCCAACAATCCTA
AATTTGTACCTGGGATGCAAGCTTTGCTTGATGTTATTTCTGCTTCTGACGGTTCTGTTG
CTGATTCCGCCAAGTTGCTGGGTTTGAGCACTGGTGGCTTGTCTCGTTTGATACTCTCTC
ATGATGGTCTTCGTATGGCAGTCAATAGCATGAGGGCAGCCAAGGGA*TGAAGCCTCTCA
AGTAGTTGGGATGTATAGAC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2D832JQ 757 0 0
AGTACAGCGACGAAGAGTTGATGAAGCAATGCAAATTCGAGACCTTTAGAGTTTCAGGAC
CCGGAGGACAGCACCGCAACAAACGTGACTCCGCCGTTAGGCTCAAACACCTCCCCACCG
GAATCGTATCTCAGGCCGTCGAGGACCGTTCCCAGCACAAGAACCGAGCTTCTGCTCTTA
ACCGCCTTCGCACTCTCCTCGCTATCAAAGTGAGGAACAAGGTGGACATTGAAGGCTATT
CTCCTCCTCCCGAGCTTCTTCAGATTCTACCTCCCAAGTCCACCGTTAGATCTTCTTCTT
CTGGTTCTCAGATTGGTCCCAACAATCCTAAATTTGTACCTGGGATGCAAGCTTTGCTTG
ATGTTATTTCTGCTTCTGACGGTTCTGTTGCTGATTCCGCCAAGTTGCTGGGTTTGAGCA
CTGGTGGCTTGTCTCGTTTGATACTCTCTCATGATGGTCTTCGTATGGCAGTCAATAGCA
TGAGGGCAGCCAAGGGAATGAAGCCTCTCAAGTAGTTGGGATGTATAGACATTTGAAGAA
TGATGGTGGGACCTTTGACCGTCTCTACCATTTTACGCACCTTATTTTGTATACAAAACA
AAAGTATAAATGTTGAGAGTCTAGCATTCATTCAGATCGTCATGTATTTTGAGATGATAT
ACTACTATATAGGCTGCTAAAATATTTATGGTTATTTCGAGTCGCCTTTTGTTGTGTTGG
AACTTTGAAGCTAATACAGTTGGAACCATTTTGGATT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL2938Contig1 672 2 11 U
AACCGTTGTAAATACTCATACATCTTCATTCATAGATAGTCTCAAACCTCCACATTAAAA
ACGTAATTACTAGCACTAACAATACAAACACAGGACTTTGTCCTAAGCTCGTCATCTTCT
TACACTTACCCCTAACACCTTGCACACACACGAGTTTTCTTACCACTTCACTCCCTTCCG
ACGACCTGAAGGAAACAGTTACAGAACCAACCCTTGCCTCCTCCTCTTAAGCCTTTCGCT
GTCTTAACGGTCTTCCCAAGATCCAAGATTCTTCGTTGAGACCTGACCCATTCCCTTGTC
TGATACTGTAGTCTGTGTTGTTGCTAAAACCAACACCTTGCTGTCTTAAATTTGCATAGG
AAGATAAACCATGAATGGCCGGCATTGAAGCAGCAACAGATGAAGGACTATCTAAAGCCC
CAAAACACCGGTTAGAAGCTGATGATACATTACCACCAACAAGATGATTGTCACTAGGTA
TCCAAACTCCAAAACCACCAGACATATGATTATCTATCGGTCGACCATACAAGGCAGCTA
ATGCCTGTGGATGTATCTGTCCTGAAGAAACCATAGCTTGAATGTTTTCATATCTTTCCA
TAGACTCAGCGTCCTTACTCTGGGAAGCTACACCGCTTAATCTCTTCAAATACAATCGGT
ACTTCTGTAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E304JQ U 14
AF RR2G653JQ U 1
BS 1 60 RR2G653JQ
BS 61 61 RR2E304JQ
BS 62 178 RR2G653JQ
BS 179 179 RR2E304JQ
BS 180 211 RR2G653JQ
BS 212 212 RR2E304JQ
BS 213 304 RR2G653JQ
BS 305 305 RR2E304JQ
BS 306 332 RR2G653JQ
BS 333 333 RR2E304JQ
BS 334 672 RR2G653JQ

RD RR2E304JQ 516 0 0
G
CTCATACATCTTCATTCATAGATAGTCTCAAACCTCCACATTAAAAACGTAATTACTAGC
ACTAACAATACAAACACAGGACTTTGTCCTAAGCTCGTCATCTTCTTACACTTACCCCTA
ACACCTTGCACACACACGAGTTTTCTTACCACTTCACTCCCTTCCGACGACCTGAAGGAA
GCAGTTACAGAACCAACCCTTGCCTCCTCCTCTTAAGCCTTTCGCTGTCTTAACGGTCTT
CCCAAGATCCAAGATTCTTCGTTGAGACCTGACCCATTCCCTTGTCTGATACTGTAGTCT
GTGTTGTTGCTAAAACCAACACCTTGCTGTCTTAAATTTGCATAGGAAGATAAACCATGA
ATGGCCG***TTGAAGCAGCAACAGATGAAGGACTATCTAAAGCCCCAAAACACCGGTTA
GAAGCTGATGATACATTACCACCAACAAGATGATTGTCACTAGGTATCCATACTCCAAAA
CCACCAGACATATGATTATCTATTGGTCGACCATA

QA 2 516 2 516
DS 

RD RR2G653JQ 672 0 0
AACCGTTGTAAATACTCATACATCTTCATTCATAGATAGTCTCAAACCTCCACATTAAAA
*CGTAATTACTAGCACTAACAATACAAACACAGGACTTTGTCCTAAGCTCGTCATCTTCT
TACACTTACCCCTAACACCTTGCACACACACGAGTTTTCTTACCACTTCACTCCCTTCTG
ACGACCTGAAGGAAACAGTTACAGAACCAACGCTTGCCTCCTCCTCTTAAGCCTTTCGCT
GTCTTAACGGTCTTCCCAAGATCCAAGATTCTTCGTTGAGACCTGACCCATTCCCTTGTC
TGATTCTGTAGTCTGTGTTGTTGCTAAAACCACCACCTTGCTGTCTTAAATTTGCATAGG
AAGATAAACCATGAATGGCCGGCATTGAAGCAGCAACAGATGAAGGACTATCTAAAGCCC
CAAAACACCGGTTAGAAGCTGATGATACATTACCACCAACAAGATGATTGTCACTAGGTA
TCCAAACTCCAAAACCACCAGACATATGATTATCTATCGGTCGACCATACAAGGCAGCTA
ATGCCTGTGGATGTATCTGTCCTGAAGAAACCATAGCTTGAATGTTTTCATATCTTTCCA
TAGACTCAGCGTCCTTACTCTGGGAAGCTACACCGCTTAATCTCTTCAAATACAATCGGT
ACTTCTGTAGAT

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL2939Contig1 679 2 6 U
GGAAGTTGGGAAACGTGCCCAATTCGGAAAAGAAGGACAAATGCTTCACGCTTTCTCTCT
CTATCATCGTCGTCCGGCTGTTGTTTGTGTTGATGGTACAGAGTCGTCGTAGCGATTTCA
ATTCGAAAAAGAAACCAGCGAATATCCCATACGAACAATCATCTCACCAAACCCCATCTT
CAAAGTTTTCTCCTTTTCTCTTGATTGTCGCGAGATTCATCATCATCCTTACCCAATTGG
GAAACTTCTTCTCTTTTTTTACTCATCACCCATCATCATCCTTACAGCCCGGTTTACCGA
TCTAAACCTGTGATCGCTTGAAACTCTTAAGTTTTTCCATCAAATTGAATGGCCGGTTAC
GCGAATTATCTACGATTGGCAAGACTTGGAACCGGTTCAGGCGTAAATTTCTCGACTCTG
AGATCAATCGGTTCACCGAACCCGACATTTGACCGGACTCTCTTCGATCACCACGACATT
CTTCGTTCATCATCATCATCTCCTCTGTACATGTACAGACAATCAAACTCCAGATTCATA
TCTCAACTTGTCAAAACCAATGGCAAACGTTTGTATCTTGTCGACACACTCGCTTTGGTA
AGGAGCTTAGAAGCACAAAGGTTGCCTTCAAAGCAAGCAGAGGCTATCACAGTGCTATAA
CTGAGTTCTCAATGATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C681TF U 1
AF RR2GJ54TF U 92
BS 1 618 RR2C681TF
BS 619 619 RR2GJ54TF
BS 620 642 RR2C681TF
BS 643 643 RR2GJ54TF
BS 644 665 RR2C681TF
BS 666 679 RR2GJ54TF

RD RR2C681TF 677 0 0
GGAAGTTGGGAAACGTGCCCAATTCGGAAAAGAAGGACAAATGCTTCACGCTTTCTCTCT
CTATCATCGTCGTCCGGCTGTTGTTTGTGTTGATGGTACAGAGTCGTCGTAGCGATTTCA
ATTCGAAAAAGAAACCAGCGAATATCCCATACGAACAATCATCTCACCAAACCCCATCTT
CAAAGTTTTCTCCTTTTCTCTTGATTGTCGCGAGATTCATCATCATCCTTACCCAATTGG
GAAACTTCTTCTCTTTTTTTACTCATCACCCATCATCATCCTTACAGCCCGGTTTACCGA
TCTAAACCTGTGATCGCTTGAAACTCTTAAGTTTTTCCATCAAATTGAATGGCCGGTTAC
GCGAATTATCTACGATTGGCAAGACTTGGAACCGGTTCAGGCGTAAATTTCTCGACTCTG
AGATCAATCGGTTCACCGAACCCGACATTTGACCGGACTCTCTTCGATCACCACGACATT
CTTCGTTCATCATCATCATCTCCTCTGTACATGTACAGACAATCAAACTCCAGATTCATA
TCTCAACTTGTCAAAACCAATGGCAAACGTTTGTATCTTGTCGACACACTCGCTTTGGTA
AGGAGCTTAGAAGCACAAGGGTTGCCTTCAAAGCAAGCAGAG*CTATCACAGTGCTATAA
CTGAG
TTCTCATGATAG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2GJ54TF 588 0 0
GGG
GGTACAGAGTCGTCGTAGCGATTTCAATTCGAAAAAGAAACCAGCGAATATCCCATACGA
ACAATCATCTCACCAAACCCCATCTTCAAAGTTTTCTCCTTTTCTCTTGATTGTCGCGAG
ATTCATCATCATCCTTACCCAATTGGGAAACTTCTTCTCTTTTTTTACTCATCACCCATC
ATCATCCTTACAGCCCGGTTTACCGATCTAAACCTGTGATCGCTTGAAACTCTTAAGTTT
TTCCATCAAATTGAATGGCCGGTTACGCGAATTATCTACGATTGGCAAGACTTGGAACCG
GTTCAGGCGTAAATTTCTCGACTCTGAGATCAATCGGTTCACCGAACCCGACATTTGACC
GGACTCTCTTCGATCACCACGACATTCTTCGTTCATCATCATCATCTCCTCTGTACATGT
ACAGACAATCAAACTCCAGATTCATATCTCAACTTGTCAAAACCAATGGCAAACGTTTGT
ATCTTGTCGACACACTCGCTTTGGTAAGGAGCTTAGAAGCACAAAGGTTGCCTTCAAAGC
AAGCAGAGGCTATCACAGTGCTATAACTGAGTTCTCAATGATAGC

QA 4 588 4 588
DS 



AS 1 3

CO CL2940Contig1 725 3 14 U
GGAATTACGACAAGAGAGCAAAAGAAGAAACATAACCTAACAAA**AAAAATATGAAAAT
GGTCGGAAGGATCTTTCTCCTTTTCCTCTCCATCGTCGTCACGGTGGTCATTGCCGGAAA
AGCTCCACCACCAACATTCACCGAGACAGGCAAAGCTTTAGCCGAGAAACTATGCGAGAA
ATCCGAGGACAAAGCGTTTTGCGTTGCGAGCCTAACCTCACGTCACGAGTCAGAAACCGC
AACTGCGCCTAAACTTGGTGTGATCGCGTTAAGCGTCGCGTCTACAAACGCTTCGGACAC
GTCTTTCTACATCAAGTCGAAACTGAAACAGAGGAACCTTGAGCCGGCGTTGGAAGACAC
GCTTGATGACTGCTCCAAGAACTACTTAGACGCAGTCGCACAACTCGATGATTCTCTCGC
CGCTTTGCTTGCGAATGCGTATATTGATGTTGATATTTGGCTTAATACGGCAATTACCGA
TGGAGAAGCTTGTGAAGATGCTTTGAACGAACGTGCTGGTAATGATGCTGAGCTTGCTCG
TAGGAACACCAACTTCTTGAAACTTTGCAAGGACGCTCTTCTCATCAACACTATTTTAAC
TCCATAAGCTTAATGTTGTGGTTACTTCATTTATATTTATGTATTTGTTATAATATCTAA
AAAGGGTTTGGTTGATTTATGGGTGTAAATGAAACGATATGTGATATATTTGTTTTGGGA
AAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2GB89TF U 1
AF RR2GX21JQ C 5
AF RR2GX21TF U 5
BS 1 44 RR2GB89TF
BS 45 46 RR2GX21TF
BS 47 51 RR2GB89TF
BS 52 52 RR2GX21TF
BS 53 238 RR2GB89TF
BS 239 239 RR2GX21TF
BS 240 255 RR2GB89TF
BS 256 256 RR2GX21TF
BS 257 431 RR2GB89TF
BS 432 432 RR2GX21TF
BS 433 543 RR2GB89TF
BS 544 544 RR2GX21TF
BS 545 567 RR2GB89TF
BS 568 725 RR2GX21TF

RD RR2GB89TF 567 0 0
GGAATTACGACAAGAGAGCAAAAGAAGAAACATAACCTAACAAACAAAAAAGATGAAAAT
GGTCGGAAGGATCTTTCTCCTTTTCCTCTCCATCGTCGTCACGGTGGTCATTGCCGGAAA
AGCTCCACCACCAACATTCACCGAGACAGGCAAAGCTTTAGCCGAGAAACTATGCGAGAA
ATCCGAGGACAAAGCGTTTTGCGTTGCGAGCCTAACCTCACGTCACGAGTCAGAAACCTC
AACTGCGCCTAAACTCGGTGTGATCGCGTTAAGCGTCGCGTCTACAAACGCTTCGGACAC
GTCTTTCTACATCAAGTCGAAACTGAAACAGAGGAACCTTGAGCCGGCGTTGGAAGACAC
GCTTGATGACTGCTCCAAGAACTACTTAGACGCAGTCGCACAACTCGATGATTCTCTCGC
CGCTTTGCTTGTGAATGCGTATATTGATGTTGATATTTGGCTTAATACGGCAATTACCGA
TGGAGAAGCTTGTGAAGATGCTTTGAACGAACGTGCTGGTAATGATGCTGAGCTTGCTCG
TAG*AACACCAACTTCTTGAAACTTTG

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2GX21JQ 715 0 0
GG
ACGACAAGAGAGCAAAAGAAGAAACATAACCTAACAAA**AAAAATATGAAAATGGTCGG
AAGGATCTTTCTCCTTTTCCTCTCCATCGTCGTCACGGTGGTCATTGCCGGAAAAGCTCC
ACCACCAACATTCACCGAGACAGGCAAAGCTTTAGCCGAGAAACTATGCGAGAAATCCGA
GGACAAAGCGTTTTGCGTTGCGAGCCTAACCTCACGTCACGAGTCAGAAACCGCAACTGC
GCCTAAACTTGGTGTGATCGCGTTAAGCGTCGCGTCTACAAACGCTTCGGACACGTCTTT
CTACATCAAGTCGAAACTGAAACAGAGGAACCTTGAGCCGGCGTTGGAAGACACGCTTGA
TGACTGCTCCAAGAACTACTTAGACGCAGTCGCACAACTCGATGATTCTCTCGCCGCTTT
GCTTGCGAATGCGTATATTGATGTTGATATTTGGCTTAATACGGCAATTACCGATGGAGA
AGCTTGTGAAGATGCTTTGAACGAACGTGCTGGTAATGATGCTGAGCTTGCTCGTAGGAA
CACCAACTTCTTGAAACTTTGCAAGGACGCTCTTCTCATCAACACTATTTTAACTCCATA
AGCTTAATGTTGTGGTTACTTCATTTATATTTATGTATTTGTTATAATATCTAAAAAGGG
TTTGGTTGATTTATGGGTGTAAATGAAACGATATGTGATATATTTGTTTTGGG

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR2GX21TF 721 0 0
GG
ACGACAAGAGAGCAAAAGAAGAAACATAACCTAACAAA**AAAAATATGAAAATGGTCGG
AAGGATCTTTCTCCTTTTCCTCTCCATCGTCGTCACGGTGGTCATTGCCGGAAAAGCTCC
ACCACCAACATTCACCGAGACAGGCAAAGCTTTAGCCGAGAAACTATGCGAGAAATCCGA
GGACAAAGCGTTTTGCGTTGCGAGCCTAACCTCACGTCACGAGTCAGAAACCGCAACTGC
GCCTAAACTTGGTGTGATCGCGTTAAGCGTCGCGTCTACAAACGCTTCGGACACGTCTTT
CTACATCAAGTCGAAACTGAAACAGAGGAACCTTGAGCCGGCGTTGGAAGACACGCTTGA
TGACTGCTCCAAGAACTACTTAGACGCAGTCGCACAACTCGATGATTCTCTCGCCGCTTT
GCTTGCGAATGCGTATATTGATGTTGATATTTGGCTTAATACGGCAATTACCGATGGAGA
AGCTTGTGAAGATGCTTTGAACGAACGTGCTGGTAATGATGCTGAGCTTGCTCGTAGGAA
CACCAACTTCTTGAAACTTTGCAAGGACGCTCTTCTCATCAACACTATTTTAACTCCATA
AGCTTAATGTTGTGGTTACTTCATTTATATTTATGTATTTGTTATAATATCTAAAAAGGG
TTTGGTTGATTTATGGGTGTAAATGAAACGATATGTGATATATTTGTTTTGGGAAAAAA

QA 3 721 3 721
DS 



AS 1 3

CO CL2941Contig1 846 3 3 U
GGACTACAAGTTTTATATATCCTGCCAAATCCTCAGTTCCAAATCATTTTATATTATATA
TAATTATACATTTACAATATTTTTGTTAGAGTCTGTCTTTATTCTCACAATTAGATTACA
AAACGGGGAATAACCAAAACAGAGGGCAGCTTATAAGAGAACTGGATATCCCTCTTGGAA
GGAGAGAAAAGAGATGGTGAGGTTGAGAGAAACAGAAGTGATCCTGAGACTCTGTATCGT
CTTTCTTCTTATACTCACTTCTATTCTGATTGGTTTGGATTCTCAGACCAAAGATATTGC
TTATATCCACAAGAAAGTCACTTTCAGATACTTGTTTGCTCTGGAGGTTGAGTTGTACAT
AAATGTTGTGGTTGCTGCATATAATATCGTTCAGTTAGGATTTGGTTGGTACGGTGTTGC
ACAAAAAAA*CACCAATTCTAAATGGCTCTCTTACCTCTTAGATCAGACGGCGGTGTATG
TGGTGTTCGCCGGGGCATCTGCGGCGGCACAACACTCATTGCTTGTGGTGACTGGTTCAA
AGGAGCTTCAGTGGATGAAGTGGTGCTACAAGTTCACAAGGTTCTGCTTTCAGATCGGAG
GTGCCATCATCTTAAACTACATCGCAGCGGTGCTCATGATCATCCTCTCCTTCATCTCAG
CCTTCAGTCTCTTCCGCCTCTACTCCCCTAAACGTTATTTTCAGTTTAAGTCCTCCTCTT
AATTATTTACTATGTTAAATCCTTTTCTTGATCTAAAATAATGTTGATTAATGCGAAGAA
TATGATTATTGTTCGTCTCTAAATTATAATTTTGTATCTTTAAGTAAATGCAAATTTGTC
TTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2GV17TF U 1
AF RR2H624TF U 151
AF RR2GV17JQB C 176
BS 1 575 RR2GV17TF
BS 576 777 RR2H624TF
BS 778 846 RR2GV17JQB

RD RR2GV17TF 575 0 0
GGACTACAAGTTTTATATATCCTGCCAAATCCTCAGTTCCAAATCATTTTATATTATATA
TAATTATACATTTACAATATTTTTGTTAGAGTCTGTCTTTATTCTCACAATTAGATTACA
AAACGGGGAATAACCAAAACAGAGGGCAGCTTATAAGAGAACTGGATATCCCTCTTGGAA
GGAGAGAAAAGAGATGGTGAGGTTGAGAGAAACAGAAGTGATCCTGAGACTCTGTATCGT
CTTTCTTCTTATACTCACTTCTATTCTGATTGGTTTGGATTCTCAGACCAAAGATATTGC
TTATATCCACAAGAAAGTCACTTTCAGATACTTGTTTGCTCTGGAGGTTGAGTTGTACAT
AAATGTTGTGGTTGCTGCATATAATATCGTTCAGTTAGGATTTGGTTGGTACGGTGTTGC
ACAAAAAAA*CACCAATTCTAAATGGCTCTCTTACCTCTTAGATCAGACGGCGGTGTATG
TGGTGTTCGCCGGGGCATCTGCGGCGGCACAACACTCATTGCTTGTGGTGACTGGTTCAA
AGGAGCTTCAGTGGATGAAGTGGTGCTACAAGTTC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2H624TF 627 0 0
GG
ATAAGAGAACTGGATATCCCTCTTGGAAGGAGAGAAAAGAGATGGTGAGGTTGAGAGAAA
CAGAAGTGATCCTGAGACTCTGTATCGTCTTTCTTCTTATACTCACTTCTATTCTGATTG
GTTTGGATTCTCAGACCAAAGATATTGCTTATATCCACAAGAAAGTCACTTTCAGATACT
TGTTTGCTCTGGAGGTTGAGTTGTATATAAATGTTGTGGTTGCTGCATATAATATCGTTC
AGTTAGGATTTGGTTGGTACGGTGTTGCACAAAAAAAACTCCAATTCTAAATGGCTCTCC
TACCTCTTGGATCAGACGGCGGTGTACGTGGTGTTCGCCGGGGCATCTGCGGCGGCACAA
CACTCATTGCTTGTGGTGACTGGTTCAAAGGAGCTTCAGTGGATGAAGTGGTGCTACAAG
TTCACAAGGTTCTGCTTTCAGATCGGAGGTGCCATCATCTTAAACTACATCGCAGCGGTG
CTCATGATCATCCTCTCCTTCATCTCAGCCTTCAGTCTCTTCCGCCTCTACTCCCCTAAA
CGTTATTTTCAGTTTAAGTCCTCCTCTTAATTATTTACTATGTTAAATCCTTTTCTTGAT
CTAAAATAATGTTGATTAATGCGAA

QA 3 627 3 627
DS 

RD RR2GV17JQB 671 0 0
TGGAAGGAGAGAAAAGAGATGGTGAGGTTGAGAGAAACAGAAGTGATCCTGAGACTCTGT
ATCGTCTTTCTTCTTATACTCACTTCTATTCTGATTGGTTTGGATTCTCAGACCAAAGAT
ATTGCTTATATCCACAAGAAAGTCACTTTCAGATACTTGTTTGCTCTGGAGGTTGAGTTG
TACATAAATGTTGTGGTTGCTGCATATAATATCGTTCAGTTAGGATTTGGTTGGTACGGT
GTTGCACAAAAAAA*CACCAATTCTAAATGGCTCTCTTACCTCTTAGATCAGACGGCGGT
GTATGTGGTGTTCGCCGGGGCATCTGCGGCGGCACAACACTCATTGCTTGTGGTGACTGG
TTCAAAGGAGCTTCAGTGGATGAAGTGGTGCTACAAGTTCACAAGGTTCTGCTTTCAGAT
CGGAGGTGCCATCATCTTAAACTACATCGCAGCGGTGCTCATGATCATCCTCTCCTTCAT
CTCAGCCTTCAGTCTCTTCCGCCTCTACTCCCCTAAACGTTATTTTCAGTTTAAGTCCTC
CTCTTAATTATTTACTATGTTAAATCCTTTTCTTGATCTAAAATAATGTTGATTAATGCG
AAGAATATGATTATTGTTCGTCTCTAAATTATAATTTTGTATCTTTAAGTAAATGCAAAT
TTGTCTTACAT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL2942Contig1 1077 2 2 U
CTCTCTTCTCTCCTTCACTCTTACACTCACATCTGTGTACATGTAAGAGCTAGATATCAC
GCCCAAAGTATACCTTTCTTCATTCACCGAAAAAAAAAAAATGGCGGCCAATGCCTCATT
CGCCGCCGCATTATTAATCGGCTTTTCGCTTCTCTTCGCCGTCATGGCGGAAAGTCCGTA
CAGGTTCTTCGATTGGAACGTCACTTACGGTGATATCTACCCACTCGGTGTTCGCCAGCA
GGGTATTCTGATCAACGGGCAGTTTCCGGGACCGGATATTCACTCCGTTACTAATGACAA
TGTCATCATTAACGTCTACAATAGCCTCGACGAACCTTTCCTCCTTTCATGGAATGGAAT
TCAACAGAGGAGGAACTCGTACGTGGATGGAGTGTACGGAACGACTTGTCCTATCCCGCC
GGGGAAGAACTACACTTACATTCTTCAAGTGAAGGATCAGATCGGAAGTTTCTACTACTT
CCCTTCTCTCGCTTTCCACAGGGCCGCCGGTGCTTTTGGTGGCTTCCGTATCCTCAGCCG
TCCTGGTATCCCCGTCCCTTTCGCTGACCCTGCCGGAGATTACACTGTTCTCATCGGAGA
CTGGTACAAATCTAACCACACGGATTTGAAAGCACAGCTTGATAGTGGTAGGAAGCTTCC
TTTACCAGATGGTATCCTCATCAATGGCCGTGGAAGTGGTGCCACTCTCAATGTTGAACA
AGGTAAGACATACAGGTTGAGAATATCCAATGTAGGGTTACAAAACTCGCTCAACTTCCG
CATCCAAAACCACAAGATGAAAGTGGTCGAAGTCGAAGGAACTCACACTCTTCAGACTAC
ATTCTCTTCTCTCGATGTTCACGTTGGTCAGTCTTACTCGGTCCTTGTGACTGCGGACCA
GCCTGCTCAGGACTATTACGTGGTGGTCTCTTCTAGGTTTACCTCGGATGTCCTCACCAC
CACTGGTGTTCTCCGTTACAGTGGCTCTGCTGGTGGTGTTTCTGGACCTATTCCTGGTGG
ACCAACCATACAGATCGACTGGTCCTTGAACCAGGCTCGAGCCATCAGGACTAACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C940TF U 1
AF RR2AP09TF U 529
BS 1 659 RR2C940TF
BS 660 1077 RR2AP09TF

RD RR2C940TF 659 0 0
CTCTCTTCTCTCCTTCACTCTTACACTCACATCTGTGTACATGTAAGAGCTAGATATCAC
GCCCAAAGTATACCTTTCTTCATTCACCGAAAAAAAAAAAATGGCGGCCAATGCCTCATT
CGCCGCCGCATTATTAATCGGCTTTTCGCTTCTCTTCGCCGTCATGGCGGAAAGTCCGTA
CAGGTTCTTCGATTGGAACGTCACTTACGGTGATATCTACCCACTCGGTGTTCGCCAGCA
GGGTATTCTGATCAACGGGCAGTTTCCGGGACCGGATATTCACTCCGTTACTAATGACAA
TGTCATCATTAACGTCTACAATAGCCTCGACGAACCTTTCCTCCTTTCATGGAATGGAAT
TCAACAGAGGAGGAACTCGTACGTGGATGGAGTGTACGGAACGACTTGTCCTATCCCGCC
GGGGAAGAACTACACTTACATTCTTCAAGTGAAGGATCAGATCGGAAGTTTCTACTACTT
CCCTTCTCTCGCTTTCCACAGGGCCGCCGGTGCTTTTGGTGGCTTCCGTATCCTCAGCCG
TCCTGGTATCCCCGTCCCTTTCGCTGACCCTGCCGGAGATTACACTGTTCTCATCGGAGA
CTGGTACAAATCTAACCACACGGATTTGAAAGCACAGCTTGATAGTGGTAGGAAGCTTC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2AP09TF 549 0 0
G
ATCCTCAGCCGTCCTGGTATCCCCGTCCCTTTCGCTGACCCTGCCGGAGATTACACTGTT
CTCATCGGAGACTGGTACAAATCTAACCACACGGATTTGAAAGCACAGCTTGATAGTGGT
AGGAAGCTTCCTTTACCAGATGGTATCCTCATCAATGGCCGTGGAAGTGGTGCCACTCTC
AATGTTGAACAAGGTAAGACATACAGGTTGAGAATATCCAATGTAGGGTTACAAAACTCG
CTCAACTTCCGCATCCAAAACCACAAGATGAAAGTGGTCGAAGTCGAAGGAACTCACACT
CTTCAGACTACATTCTCTTCTCTCGATGTTCACGTTGGTCAGTCTTACTCGGTCCTTGTG
ACTGCGGACCAGCCTGCTCAGGACTATTACGTGGTGGTCTCTTCTAGGTTTACCTCGGAT
GTCCTCACCACCACTGGTGTTCTCCGTTACAGTGGCTCTGCTGGTGGTGTTTCTGGACCT
ATTCCTGGTGGACCAACCATACAGATCGACTGGTCCTTGAACCAGGCTCGAGCCATCAGG
ACTAACCT

QA 2 549 2 549
DS 



AS 1 3

CO CL2943Contig1 996 3 7 U
CCCCACTCACTCAGACTTCGATCCTCCTCTCGTCGACGCCGTCCACAAACATCCGACGTA
TCCTCGCCGCAAATTTCAGCTAAGAGTTCACAAAGAATGGAGTACGTAAACCCTGAAGGT
CTTAGGTTAGATGGTCGCCGATTCAATGAGATGAGGCAAATCGTAGCTGAAGTTGGAGTG
GTTTCCAAGGCTGATGGCTCGGCTGTTTTCGAGATGGGTAACACAAAAGTAATAGCAGCT
GTTTATGGCCCTAGAGAGATTCAAAACAAGAGCCAACAAAAGAATGGTCATGCATTGGTG
CTTTGTGAGTATAGTATGGCTCATTTTAGTACTGGTGATCGTAGAAGACAGAAAAACGAC
AGGCGATCAACAGAGCTATCTCTTGTCATCCGGCAGACAATGGAAGCTTGCATATTAACC
GAACTGGAGCCTCATTCTCAGATTGACATTTTCCTTCAGGTCCTACAAGCTGATGGAGGA
ACAAGATCAGCTTGTATCAATGCTGCAACGCTAGCTCTTGCAGACGCTGGGATTCCAATG
CGTGATCTCGCTGTTTCCTGCAGTGCTGGGTACTTGAACAGTACTCCGCTTCTTGATCTC
AACTACGTCGAAGATAGCGCTGGAGGAGCTGATGTAACCGTCGGCATTCTACCTAAACTA
GACAAAGTCACACTCCTTCAGATGGATGCAAAGTTACCGATGGAAACATTTGAAACGGTG
TTTGCGTTGGCTTCTGAAAGCTGCAAGGCGATTGCAGAGAGAGTACGCGAGGTTTTTCAA
GAAAACACCAAACAGCTAGAGTATCGTCGTGCTTCATAAACTTCAGAGCTAGCTAACTAG
AGCAAAAAAAAAAAAAGATTAATGTGCCAAAAGATTTTTTGTTAAATGTTGCTTCTAACT
TTCCCAAACTCAAAAGTTAGAAATGCAAAAGACATGCTGTTTTTTTGGTTAATATGCGAA
TCTTAAAGCTTAGATTATGGTTTCATATATTCATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD81TF U 1
AF RR2AS34TF U 18
AF RR2CD81JQ C 439
BS 1 343 RR2CD81TF
BS 344 345 RR2AS34TF
BS 346 426 RR2CD81TF
BS 427 428 RR2AS34TF
BS 429 623 RR2CD81TF
BS 624 774 RR2AS34TF
BS 775 996 RR2CD81JQ

RD RR2CD81TF 623 0 0
CCCCACTCACTCAGACTTCGATCCTCCTCTCGTCGACGCCGTCCACAAACATCCGACGTA
TCCTCGCCGCAAATTTCAGCTAAGAGTTCACAAAGAATGGAGTACGTAAACCCTGAAGGT
CTTAGGTTAGATGGTCGCCGATTCAATGAGATGAGGCAAATCGTAGCTGAAGTTGGAGTG
GTTTCCAAGGCTGATGGCTCGGCTGTTTTCGAGATGGGTAACACAAAAGTAATAGCAGCT
GTTTATGGCCCTAGAGAGATTCAAAACAAGAGCCAACAAAAGAATGGTCATGCATTGGTG
CTTTGTGAGTATAGTATGGCTCATTTTAGTACTGGTGATCGTA**AGACAGAAAAACGAC
AGGCGATCAACAGAGCTATCTCTTGTCATCCGGCAGACAATGGAAGCTTGCATATTAACC
GAACTGTTGCCTCATTCTCAGATTGACATTTTCCTTCAGGTCCTACAAGCTGATGGAGGA
ACAAGATCAGCTTGTATCAATGCTGCAACGCTAGCTCTTGCAGACGCTGGGATTCCAATG
CGTGATCTCGCTGTTTCCTGCAGTGCTGGGTACTTGAACAGTACTCCGCTTCTTGATCTC
AACTACGTCGAAGATAGCGCTGG

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2AS34TF 758 0 0
GG
GATCCTCCTCTCGTCGACGCCGTCCACAAACATCCGACGTATCCTCGCCGCAAATTTCAG
CTAAGAGTTCACAAAGAATGGAGTACGTAAACCCTGAAGGTCTTAGGTTAGATGGTCGCC
GATTCAATGAGATGAGGCAAATCGTAGCTGAAGTTGGAGTGGTTTCCAAGGCTGATGGCT
CTGCTGTTTTCGAGATGGGTAACACAAAAGTAATAGCAGCTGTTTATGGCCCTAGAGAGA
TTCAAAACAAGAGCCAACAAAAGAATGGTCATGCATTGGTGCTTTGTGAGTATAGTATGG
CTCATTTTAGTACTGGTGATCGTAGAAGACAGAAAAACGACAGGCGATCAACAGAGCTAT
CTCTTGTCATCCGGCAGACAATGGAAGCTTGCATATTAACCGAACTGGATCCTCATTCTC
AGATTGACATTTTCCTTCAGGTCCTACAGGCTGATGGAGTAACAAGATCAGCTTGTATCA
ATGCTGCAACGCTAGCTCTTGCAGACGCTGGGATTCCAATGCGTGATCTCGCTGTTTCCT
GCAGTGCTGGGTACTTGAACAGTACTCCGCTTCTTGATCTCAACTACGTCGAAGATAGCG
CTGGAGGAGCTGATGTAACCGTCGGCATTCTACCTAAACTAGACAAAGTCACACTCCTTC
AGATGGATGCAAAGTTACCGATGGAAACATTTGAAACGGTGTTTGCGTTGGCTTCTGAAA
GCTGCAAGGCGATTGCAGAGAGAGTACGCGAGGTT
C

QA 3 757 3 757
DS 

RD RR2CD81JQ 558 0 0
CAGATTGACATTTTCCTTCAGGTCCTACAAGCTGATGGAGGAACAAGATCAGCTTGTATC
AATGCTGCAACGCTAGCTCTTGCAGACGCTGGGATTCCAATGCGTGATCTCGCTGTTTCC
TGCAGTGCTGGGTACTTGAACAGTACTCCGCTTCTTGATCTCAACTACGTCGAAGATAGC
GCTGGAGGAGCTGATGTAACCGTCGGCATTCTACCTAAACTAGACAAAGTCACACTCCTT
CAGATGGATGCAAAGTTACCGATGGAAACATTTGAAACGGTGTTTGCGTTGGCTTCTGAA
GGCTGCAAGGCGATTGCAGAGAGAGTACGCGAGGTTTTTCAAGAAAACACCAAACAGCTA
GAGTATCGTCGTGCTTCATAAACTTCAGAGCTAGCTAACTAGAGCAAAAAAAAAAAAAGA
TTAATGTGCCAAAAGATTTTTTGTTAAATGTTGCTTCTAACTTTCCCAAACTCAAAAGTT
AGAAATGCAAAAGACATGCTGTTTTTTTGGTTAATATGCGAATCTTAAAGCTTAGATTAT
GGTTTCATATATTCATAC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 3

CO CL2944Contig1 1304 3 8 U
TTTTTATTTTCTGTTTGTTGGGATTTTCAGCCAATGCTGTATACATCACCATTGGTTCCT
CTTCAGGTTCTGATATTACTCAGGCACTTCTGAAAGCATTCACAACAGCATGCCAATCTC
CCACACCGAGCAAAGTGGTGATCCCAAAAGGAATGTTCAAGCTTGGTGAGATCCAGATGA
GGGGTCCATGCAAAGCCCCAATCGAGATCACCATTCAAGGCACTGTCAAAGCTGATGGTA
ACGCGATCCAGGGGAAGGACACATGGGTTGTCTTCGGCAACATTAATGGATTTAAGTTGA
ACGGAGGTGGAGCTTTCGATGGTGAAGGAAACGCAGCTTGGAGGGTTAACAACTGTCACC
AGACTTTCAACTGCAAGAAACTTCCTATCAGTATAAGATTTGATTTCGTGGAGAACGCTG
AGATCAGAGACATATCTTCAATAGATGCCAAGAACTTCCACATCAACGTGCTTGGTGCCA
AGAACGTGACCTTTGATCACATCAACATCATTGCTCCAAAAGACAGTCCCAACACTGACG
GTATCCATTTGGGAAGAAGTGACGGAGTCAAGATCCTTAACACATTCATCACCACCGGAG
ATGACTGCATCTCTGTTGGAGATGGGATGAGGAACCTCCACGTGGAGAAAGTCACGTGCG
GTCCAGGACATGGAATCAGTGTCGGAAGCCTTGGAAGGTACGGAATGGAACAAGATGTCA
CCGGCATTAGAGTCATAAACTGCACTCTCCAAGAGACTACCAACGGACTGAGGATCAAGA
CATGGCCGTCTGCAGCTTGCTCCACCACTGCCTCCGATATTCATTTCGAGAATATCATTG
TCAAGAACGTATTAAACCCAATCCTCATCGACCAAGAGTACTGCCCTTGGAACCAATGCA
ACAAGCAGAAACCATCAACGATTAAGCTTGTGAACATCAGCTTCAAGCAAATCAGAGGAA
CATCAGGGAACAAGGATGCAGTGAAGCTTTTGTGCAGCAGGGGATACCCATGCCAAAACG
TCGAGATTGGAGACATCGATATCAAGTACAACGGAGCAGATGGTCCAGCGACTTTCCAGT
GCTCAAACGTGAGCCCCAGACTCATGGGAACTCAGAACCCTAAAGCTTGCACTGGTCCAG
TTACCAATTTACCCCAATAAGTAGAAGGCTCCAAAAAATATTAACCTAAAAACACCCATT
CATTATTTGTTTTGTTTCCTCTACACACAATTTAATTATATGGTCTATGATGTATGCTCT
CATTCTTTTTTATTCCATAATAAATGCATTCATTATGCCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ09TF U 1
AF RR2EQ09JQ C 514
AF RR2FD95TF U 712
BS 1 686 RR2EQ09TF
BS 687 687 RR2EQ09JQ
BS 688 698 RR2EQ09TF
BS 699 712 RR2EQ09JQ
BS 713 983 RR2FD95TF
BS 984 984 RR2EQ09JQ
BS 985 1297 RR2FD95TF
BS 1298 1304 RR2EQ09JQ

RD RR2EQ09TF 698 0 0
TTTTTATTTTCTGTTTGTTGGGATTTTCAGCCAATGCTGTATACATCACCATTGGTTCCT
CTTCAGGTTCTGATATTACTCAGGCACTTCTGAAAGCATTCACAACAGCATGCCAATCTC
CCACACCGAGCAAAGTGGTGATCCCAAAAGGAATGTTCAAGCTTGGTGAGATCCAGATGA
GGGGTCCATGCAAAGCCCCAATCGAGATCACCATTCAAGGCACTGTCAAAGCTGATGGTA
ACGCGATCCAGGGGAAGGACACATGGGTTGTCTTCGGCAACATTAATGGATTTAAGTTGA
ACGGAGGTGGAGCTTTCGATGGTGAAGGAAACGCAGCTTGGAGGGTTAACAACTGTCACC
AGACTTTCAACTGCAAGAAACTTCCTATCAGTATAAGATTTGATTTCGTGGAGAACGCTG
AGATCAGAGACATATCTTCAATAGATGCCAAGAACTTCCACATCAACGTGCTTGGTGCCA
AGAACGTGACCTTTGATCACATCAACATCATTGCTCCAAAAGACAGTCCCAACACTGACG
GTATCCATTTGGGAAGAAGTGACGGAGTCAAGATCCTTAACACATTCATCACCACCGGAG
ATGACTGCATCTCTGTTGGAGATGGGATGAGGAACCTCCACGTGGAGAAAGTCACGTGCG
GTCCAGGACATGGAATCAGTGTCGGA*GCCTTGGAAGG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2EQ09JQ 791 0 0
CTCCAAAAGACAGTCCCAACACTGACGGTATCCATTTGGGAAGAAGTGACGGAGTCAAGA
TCCTTAACACATTCATCACCACCGGAGATGACTGCATCTCTGTTGGAGATGGGATGAGGA
ACCTCCACGTGGAGAAAGTCACGTGCGGTCCAGGACATGGAATCAGTGTCGGAAGCCTTG
GAAGGTACGGAATGGAACAAGATGTCACCGGCATTAGAGTCATAAACTGCACTCTCCAAG
AGACTACCAACGGACTGAGGATCAAGACATGGCCGTCTGCAGCTTGCTCCACCACTGCCT
CCGATATTCATTTCGAGAATATCATTGTCAAGAACGTATTAAACCCAATCCTCATCGACC
AAGAGTACTGCCCTTGGAACCAATGCAACAAGCAGAAACCATCAACGATTAAGCTTGTGA
ACATCAGCTTCAAGCAAATCAGAGGAACATCAGGGAACAAGGATGCAGTGAAGCTTTTGT
GCAGCAGGGGATACCCATGCCAAAACGTCGAGATTGGAGACATCGATATCAAGTACAACG
GAGCAGATGGTCCAGCGACTTTCCAGTGCTCAAACGTGAGCCCCAGACTCATGGGAACTC
AGAACCCTAAAGCTTGCACTGGTCCAGTTACCAATTTACCCCAATAAGTAGAAGGCTCCA
AAAAATATTAACCTAAAAACACCCATTCATTATTTGTTTTGTTTCCTCTACACACAATTT
AATTATATGGTCTATGATGTATGCTCTCATTCTTTTTTATTCCATAATAAATGCATTCAT
TATGCCTTTTT

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2FD95TF 586 0 0
G
AGATGTCACCGGCATTAGAGTCATAAACTGCACTCTCCAAGAGACTACCAACGGACTGAG
GATCAAGACATGGCCGTCTGCAGCTTGCTCCACCACTGCCTCCGATATTCATTTCGAGAA
TATCATTGTCAAGAACGTATTAAACCCAATCCTCATCGACCAAGAGTACTGCCCTTGGAA
CCAATGCAACAAGCAGAAACCATCAACGATTAAGCTTGTGAACATCAGCTTCAAGCAAAT
CAGAGGAACATCAGGGAACAAGGATGCAGTGGAGCTTTTGTGCAGCAGGGGATACCCATG
CCAAAACGTCGAGATTGGAGACATCGATATCAAGTACAACGGAGCAGATGGTCCAGCGAC
TTTCCAGTGCTCAAACGTGAGCCCCAGACTCATGGGAACTCAGAACCCTAAAGCTTGCAC
TGGTCCAGTTACCAATTTACCCCAATAAGTAGAAGGCTCCAAAAAATATTAACCTAAAAA
CACCCATTCATTATTTGTTTTGTTTCCTCTACACACAATTTAATTATATGGTCTATGATG
TATGCTCTCATTCTTTTTTATTCCATAATAAATGCATTCATTATG

QA 2 586 2 586
DS 



AS 1 2

CO CL2945Contig1 1263 2 2 U
TACGCCGTTACATCCTCCACTACGGAGACATGGCTGAAGTCGGATACGTTACCTTTAATA
GCTACCGCCGGTCCAAATATGTAGGAGATAGCTGCTACACTAAGGAAGAGCTCTTTGCTC
GTACCGGCTACCTCAAGGCCAACCCTTTCAGGTACGAGGTGACTAAGTACATATATGGAA
CATCGTCGATAAGGTTACCAGAATGTTTCTTAATCAACTCATTGTCAAGGGAAGCATGGA
ACAGAGAGTCTAACTGGTTAGGCTACATTGCGGTGGCCACAGACGAAGGCAGAGAGTTGT
TAGGGAGAAGAGACATTGTTGTAGCATGGCGAGGAACCATTCAGCTGTATGAGTGGGCTA
ATGATTTCGATTTCCCACTTGAATTAGCTACCTCGGTTTTCCCTCCTACTGACCCGAATG
ACCCAGGTGACCCCCCTCGTATTGCCAATGGTTGGCTGTCTCTATACACAACCTCTGATA
CACGCTCACGTTTTGACAAGACCAGTGCACAAGAACAGGTTCAAGGAGAGCTAAAAAGAT
TACTAGAATTGTATAAACATGAAGAAGTTAGCATCACCTTTACAGGCCATAGCTTGGGTG
CAGTTCTATCGATTCTATCCGCCACAGACTTTCTCCACAACGAATGGCCTAAGAACACAA
CAAGTCTTGGAGACACGCTTTCTTGTGTAACGGTGTTTGCTTTCGGCAGTCCCCGCATCG
GTGACCTCAACTTCAGAAGACTGGTTGAGTCCTTAAAAAAACTCAACATCTTGAGAATAA
CAAATGTCCCCGATCTCATTCCGCATTACCCGGTGTTCAGGTTCAGAGATGTAGGAGAGG
AGCTTGAGATCAACACATTGAAATCAGAGTACCTGAAACGGTCTTTAAACTTGGCACATT
TCCATAACCTGGAGGCTTACTTGCACGGCGTGGCGGGGACACAACACAACCAAGATGAGT
TCAAGCTGGAGATTGACCGGGATCGCGCTGCTCAATAAGGATTTAGATGCTCTCCAAGAT
AAGTACTTAGTGCCTGGGCATTGGTTGGTTCTTGAAAACAGAGGGATGGTTCAAGCAGAT
GACGGGACATGGATTCTTAATGGAGATATGGGAAATAATGATCAAGAAGAAGAAAAAGAC
AAATGCGAATTACCATGAATATATCTATAATACATGTTTAATTAACAGGCACAAAATCCT
TTTGAAGAAGTAAAACAACAAGAAAATGTTACTTATTCTCAAACAATAACATTTGAAGCA
CCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2AL60TF U 1
AF RR2AL60JQ C 553
BS 1 632 RR2AL60TF
BS 633 1263 RR2AL60JQ

RD RR2AL60TF 632 0 0
TACGCCGTTACATCCTCCACTACGGAGACATGGCTGAAGTCGGATACGTTACCTTTAATA
GCTACCGCCGGTCCAAATATGTAGGAGATAGCTGCTACACTAAGGAAGAGCTCTTTGCTC
GTACCGGCTACCTCAAGGCCAACCCTTTCAGGTACGAGGTGACTAAGTACATATATGGAA
CATCGTCGATAAGGTTACCAGAATGTTTCTTAATCAACTCATTGTCAAGGGAAGCATGGA
ACAGAGAGTCTAACTGGTTAGGCTACATTGCGGTGGCCACAGACGAAGGCAGAGAGTTGT
TAGGGAGAAGAGACATTGTTGTAGCATGGCGAGGAACCATTCAGCTGTATGAGTGGGCTA
ATGATTTCGATTTCCCACTTGAATTAGCTACCTCGGTTTTCCCTCCTACTGACCCGAATG
ACCCAGGTGACCCCCCTCGTATTGCCAATGGTTGGCTGTCTCTATACACAACCTCTGATA
CACGCTCACGTTTTGACAAGACCAGTGCACAAGAACAGGTTCAAGGAGAGCTAAAAAGAT
TACTAGAATTGTATAAACATGAAGAAGTTAGCATCACCTTTACAGGCCATAGCTTGGGTG
CAGTTCTATCGATTCTATCCGCCACAGACTTT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2AL60JQ 711 0 0
ATAAACATGAAGAAGTTAGCATCACCTTTACAGGCCATAGCTTGGGTGCAGTTCTATCGA
TTCTATCCGCCACAGACTTTCTCCACAACGAATGGCCTAAGAACACAACAAGTCTTGGAG
ACACGCTTTCTTGTGTAACGGTGTTTGCTTTCGGCAGTCCCCGCATCGGTGACCTCAACT
TCAGAAGACTGGTTGAGTCCTTAAAAAAACTCAACATCTTGAGAATAACAAATGTCCCCG
ATCTCATTCCGCATTACCCGGTGTTCAGGTTCAGAGATGTAGGAGAGGAGCTTGAGATCA
ACACATTGAAATCAGAGTACCTGAAACGGTCTTTAAACTTGGCACATTTCCATAACCTGG
AGGCTTACTTGCACGGCGTGGCGGGGACACAACACAACCAAGATGAGTTCAAGCTGGAGA
TTGACCGGGATCGCGCTGCTCAATAAGGATTTAGATGCTCTCCAAGATAAGTACTTAGTG
CCTGGGCATTGGTTGGTTCTTGAAAACAGAGGGATGGTTCAAGCAGATGACGGGACATGG
ATTCTTAATGGAGATATGGGAAATAATGATCAAGAAGAAGAAAAAGACAAATGCGAATTA
CCATGAATATATCTATAATACATGTTTAATTAACAGGCACAAAATCCTTTTGAAGAAGTA
AAACAACAAGAAAATGTTACTTATTCTCAAACAATAACATTTGAAGCACCG

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 3

CO CL2946Contig1 848 3 2 U
GTGTTCTTATATAATTCTTATGTATATGAATACGAATCCATCTTTTTTTTTCTACGCAAG
CAGTCTTCTCATTTACGATCGACATCTTATGACGTCTTTTTTGAGCGAATTTTATTCTAT
GGAAAAATACAACATTTTTTAAAAGTCTTTGTTAATAAATTTCCGGCGCTTTTAGGGTTG
TTCAAGGATCCTTTCCTACATTATGTTAGATATCATGGAAAATACATTTTGGCAACAAAG
GATACGCCACTTCTGATGAATAAATGGAAATTTTATTTTGTTAATTTATGGCAATGTTAT
TTTTCCGTATGGTTTCAATCGCAAAAGGTTAATATAAATCAATTATCTAAAGATAATTTA
GAATTTCTGGGTTATCTCTCAAGTTTGCGACTAAATCCTTTAGTGGTACGTAGTCAAATG
CTAGAAAACTCATTTTTAATAGATAATGTTAGAATAAAATTGGATAGCAACATTCCAATT
TTTTCTATTATTGGGTCGTTGGCTAAAGATAAATTTTGTAATGTATTAGGGCATCCCATT
AGTAAAGCGACCTGGACGGATTCATCAGATTCTGATATTCTCAACCGATTTGTGCGTATA
TCCAGAAATATTTCACATTATTACAGCGGATCTTCAAACAAAAAGAATTTGTATCGAATA
AAATATATACTTCGTCTTTGTTGTGTTAAAACTTTGGCTCGTAAACACAAAAGTACTTAC
GCGCTTTTTTAAAAAGGTTGGGCTCGGGTTTATTAGAAGAACTCCTTACGGGGAAGACCA
AGTTCTTTCTTTAATCTTCCCAAGAAGTGATTATGCTTCTAAAGATTATATCGAGTGCGG
GTTTGGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG89TF U 1
AF RR2AG89JQ C 52
AF RR2FJ84TF U 148
BS 1 639 RR2AG89TF
BS 640 848 RR2FJ84TF

RD RR2AG89TF 639 0 0
GTGTTCTTATATAATTCTTATGTATATGAATACGAATCCATCTTTTTTTTTCTACGCAAG
CAGTCTTCTCATTTACGATCGACATCTTATGACGTCTTTTTTGAGCGAATTTTATTCTAT
GGAAAAATACAACATTTTTTAAAAGTCTTTGTTAATAAATTTCCGGCGCTTTTAGGGTTG
TTCAAGGATCCTTTCCTACATTATGTTAGATATCATGGAAAATACATTTTGGCAACAAAG
GATACGCCACTTCTGATGAATAAATGGAAATTTTATTTTGTTAATTTATGGCAATGTTAT
TTTTCCGTATGGTTTCAATCGCAAAAGGTTAATATAAATCAATTATCTAAAGATAATTTA
GAATTTCTGGGTTATCTCTCAAGTTTGCGACTAAATCCTTTAGTGGTACGTAGTCAAATG
CTAGAAAACTCATTTTTAATAGATAATGTTAGAATAAAATTGGATAGCAACATTCCAATT
TTTTCTATTATTGGGTCGTTGGCTAAAGATAAATTTTGTAATGTATTAGGGCATCCCATT
AGTAAAGCGACCTGGACGGATTCATCAGATTCTGATATTCTCAACCGATTTGTGCGTATA
TCCAGAAATATTTCACATTATTACAGCGGATCTTCAAAC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2AG89JQ 588 0 0
CTACGCAAGCAGTCTTCTCATTTACGATCGACATCTTATGACGTCTTTTTTGAGCGAATT
TTATTCTATGGAAAAATACAACATTTTTTAAAAGTCTTTGTTAATAAATTTCCGGCGCTT
TTAGGGTTGTTCAAGGATCCTTTCCTACATTATGTTAGATATCATGGAAAATACATTTTG
GCAACAAAGGATACGCCACTTTTGATGAATAAATGGAAATTTTATTTTGTTAATTTATGG
CAATGTTATTTTTCCGTATGGTTTCAATCGCAAAAGGTTAATATAAATCAATTATCTAAA
GATAATTTAGAATTTCTGGGTTATCTCTCAAGTTTGCGACTAAATCCTTTAGTGGTACGT
AGTCAAATGCTAGAAAACTCATTTTTAATAGATAATGTTAGAATAAAATTGGATAGCAAC
ATTCCAATTTTTTTTATTATTGGGTCGTTGGCTAAAGATAAATTTTGTAATGTATTAGGG
CATCCCATTAGTAAAGCGACCTGGACGGATTCATCAGATTCTGATATTCTCAACCGATTT
GTGCGTATATCCAGAAATATTTCACATTATTACAGCGGATCTTCAAAC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2FJ84TF 701 0 0
TTTGTTAATAAATTTCCGGCGCTTTTAGGGTTGTTCAAGGATCCTTTCCTACATTATGTT
AGATATCATGGAAAATACATTCTGGCAACAAAGGATACGCCACTTCTGATGAATAAATGG
AAATTTTATTTTGTTAATTTATGGCAATGTTATTTTTCCGTATGGTTTCAATCGCAAAAG
GTTAATATAAATCAATTATCTAAAGATAATTTAGAATTTCTGGGTTATCTCTCAAGTTTG
CGACTAAATCCTTTAGTGGTACGTAGTCAAATGCTAGAAAACTCATTTCTAATAGATAAT
GTTAGAATAAAATTGGATAGCAACATTCCAATTTTTTCTATTATTGGGTCGTTGGCTAAA
GATAAATTTTGTAATGTATTAGGGCATCCCATTAGTAAAGCGACCTGGACGGATTCATCA
GATTCTGATATTCTCAACCGATTTGTGCGTATATCCAGAAATATTTCACATTATTACAGC
GGATCTTCAAACAAAAAGAATTTGTATCGAATAAAATATATACTTCGTCTTTGTTGTGTT
AAAACTTTGGCTCGTAAACACAAAAGTACTTACGCGCTTTTTTAAAAAGGTTGGGCTCGG
GTTTATTAGAAGAACTCCTTACGGGGAAGACCAAGTTCTTTCTTTAATCTTCCCAAGAAG
TGATTATGCTTCTAAAGATTATATCGAGTGCGGGTTTGGTA

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 3

CO CL2947Contig1 979 3 7 U
GGCCGAACCAACTACCCGCCGGGAACCCCTAAAGATAACAAAAGCCTTCCTTCTTCTTCT
AGAAATCTCTTTTAATTTTCAAATTCAATTTCTCGAAAAAAAAACAAAATGGTGATTAAT
TCTTCAAGAACCAAATCAAGCGGACCGGTGCTACGCTCGGTATCACCGTCCGGTCGTTTC
TACGGCGGCGTATCGTCTCCTTCCTCGTCAGGCTTCGCTTCCTCCACAAGCTCCAGCTTC
TCTTCCACATCCTTTTTCAGCAACAGCCGTCAGCATCAGCCCCACCACAGATCCGCGTCT
CCTACGCGCGTGAACCTCTTCTCATCAGCTCCGTCGTCGTTCCGTTACTCGATCGATAAC
AGATCCGTATCCCCGAATCAATCCGTCGCCGTTTCGAAGAAGCCGAGCAGCAACAAGATC
ACGGACTCGAGGAGGAGGACGTGTATGTGTTCGCCGTCGACTCACCCCGGATCGTTCCGG
TGCGGTCTGCACAAGAACGTAGCGAATCCGCACGGCCAGGGCGTGGCGTCGAATAACGGA
TTGAATATGAGGAGGTCGGCGATGACGAACTCGCTGGTGAGGATCGGTGGCGTCGAAGGG
GAGTGGGTGAGGAGAGCGTTGACGACTCTGATAAGGCCTTCGTCGCATCAGCTCAAGAGG
CGATCTGCTTATCAGCCCAGGCCTAGCAGGCTATCGTCTATGTCGATGGCGGAAGAAGGT
GTTTGATTTGGTTTTTTCAGGTTTTGTTCTTGTTGAATCTGGATAGATCCGGCGAAGAAG
TCCGGATCCGAAGCGAGCTGGATCTGCGCGGACGGGTCGAGTCGAATTGGGCTGAGTCAA
ACCGAGTTATGTAAACCGGAGATCGAAAACGACACCGTCTTTAAGACTTTGTTATGTTGG
GTGAAAATGAGATTGTACCCTAGGACTCATATGATGATATCGAAGCAGATAATGTTTCCC
TAAGCAGAAAATATCTTAG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP28TF U 1
AF RR2EL61TF U 3
AF RR2EL61JQ C 256
BS 1 358 RR2DP28TF
BS 359 359 RR2EL61TF
BS 360 593 RR2DP28TF
BS 594 689 RR2EL61TF
BS 690 690 RR2EL61JQ
BS 691 717 RR2EL61TF
BS 718 979 RR2EL61JQ

RD RR2DP28TF 593 0 0
GGCCGAACCAACTACCCGCCGGGAACCCCTAAAGATAACAAAAGCCTTCCTTCTTCTTCT
AGAAATCTCTTTTAATTTTCAAATTCAATTTCTCGAAAAAAAAACAAAATGGTGATTAAT
TCTTCAAGAACCAAATCAAGCGGACCGGTGCTACGCTCGGTATCACCGTCCGGTCGTTTC
TACGGCGGCGTATCGTCTCCTTCCTCGTCAGGCTTCGCTTCCTCCACAAGCTCCAGCTTC
TCTTCCACATCCTTTTTCAGCAACAGCCGTCAGCATCAGCCCCACCACAGATCCGCGTCT
CCTACGCGCGTGAACCTCTTCTCATCAGCTCCGTCGTCGTTCCGTTACTCGATCGATATC
AGATCCGTATCCCCGAATCAATCCGTCGCCGTTTCGAAGAAGCCGAGCAGCAACAAGATC
ACGGACTCGAGGAGGAGGACGTGTATGTGTTCGCCGTCGACTCACCCCGGATCGTTCCGG
TGCGGTCTGCACAAGAACGTAGCGAATCCGCACGGCCAGGGCGTGGCGTCGAATAACGGA
TTGAATATGAGGAGGTCGGCGATGACGAACTCGCTGGTGAGGATCGGTGGCGT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2EL61TF 715 0 0
GG
GAACCAACTACCCGCCGGGAACCCCTAAAGATAACAAAAGCCTTCCTTCTTCTTCTAGAA
ATCTCTTTTAATTTTCAAATTCAATTTCTCGAAAAAAAA*CAAAATGGTGATTAATTCTT
CAAGAACCAAATCAAGCGGACCGGTGCTACGCTCGGTATCACCGTCCGGTCGTTTCTACG
GCGGCGTATCGTCTCCTTCCTCGTCAGGCTTCGCTTCCTCCACAAGCTCCAGCTTCTCTT
CCACATCCTTTTTCAGCAACAGCCGTCAGCATCAGCCCCACCACAGATCCGCGTCTCCTA
CGCGCGTGAACCTCTTCTCATCAGCTCCGTCGTCGTTCCGTTACTCGATCGATAACAGAT
CCGTATCCCCGAATCAATCCGTCGCCGTTTCGAAGAAGCCGAGCAGCAACAAGATCACGG
ACTCGAGGAGGAGGACGTGTATGTGTTCGCCGTCGACTCACCCCGGATCGTTCCGGTGCG
GTCTGCACAAGAACGTAGCGAATCCGCACGGCCAGGGCGTGGCGTCGAATAACGGATTGA
ATATGAGGAGGTCGGCGATGACGAACTCGCTGGTGAGGATCGGTGGCGTCGAAGGGGAGT
GGGTGAGGAGAGCGTTGACGACTCTGATAAGGCCTTCGTCGCATCAGCTCAAGAGGCGAT
CTGCTTATCAGCCCAGGCCTAGCAG*CTATCGTCTATGTCGATGGCGGAAGAA

QA 3 715 3 715
DS 

RD RR2EL61JQ 724 0 0
TTCAGCAACAGCCGTCAGCATCAGCCCCACCACAGATCCGCGTCTCCTACGCGCGTGAAC
CTCTTCTCATCAGCTCCGTCGTCGTTCCGTTACTCGATCGATAACAGATCCGTATCCCCG
AATCAATCCGTCGCCGTTTCGAAGAAGCCGAGCAGCAACAAGATCACGGACTCGAGGAGG
AGGACGTGTATGTGTTCGCCGTCGACTCACCCCGGATCGTTCCGGTGCGGTCTGCACAAG
AACGTAGCGAATCCGCACGGCCAGGGCGTGGCGTCGAATAACGGATTGAATATGAGGAGG
TCGGCGATGACGAACTCGCTGGTGAGGATCGGTGGCGTCGAAGGGGAGTGGGTGAGGAGA
GCGTTGACGACTCTGATAAGGCCTTCGTCGCATCAGCTCAAGAGGCGATCTGCTTATCAG
CCCAGGCCTAGCAGGCTATCGTCTATGTCGATGGCGGAAGAAGGTGTTTGATTTGGTTTT
TTCAGGTTTTGTTCTTGTTGAATCTGGATAGATCCGGCGAAGAAGTCCGGATCCGAAGCG
AGCTGGATCTGCGCGGACGGGTCGAGTCGAATTGGGCTGAGTCAAACCGAGTTATGTAAA
CCGGAGATCGAAAACGACACCGTCTTTAAGACTTTGTTATGTTGGGTGAAAATGAGATTG
TACCCTAGGACTCATATGATGATATCGAAGCAGATAATGTTTCCCTAAGCAGAAAATATC
TTAG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL2948Contig1 548 2 2 U
GGATTTCTCTCTGCTTCCGTAGTCTCCTCGTTCGTGTTGCTTCTCTCTCTCGCTCGTCTA
CGCGATTTGACTCGAGGATTTGTGCTAGGTTGAAATGGCAGGACACAGGGTTGCGCATGC
TACATTGAAAGGCCCGAGTGTGGTGAAGGAGTTAGTTATCGGTTTGGCACTCGGTTTAGC
TGCGGGTGGTCTCTGGAAGATGCACCACTGGAACGAGCAGAGGAAAACCAGAGCTTTCTA
TGACTTGCTTGAGAGGGGCGAGATCAGCGTTGTCCTCCCTGAAGAATGAGTAGTGAATTC
AACACCTACCAATCTCTCAATCTCTACTTTTTTTTATGTTATTGTATGATTTCTTTCTTG
ACAACTTGGATGAAGTGCCTGAGAAAATGGGGGTTGCTTACGTAATAAACAACAAATCTG
AGACCGGATTTTTGGGGATTTGTTAAACATAATATTGTTTTCCGGAAGATGCATGTATGC
TACTACTGTACTCCATTGTTCAATTTCAGACAGCTTTCTTGACTTTACCTAAATAAACAG
GTGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CT81JQ C 1
AF RR2CT81TF U 8
BS 1 7 RR2CT81JQ
BS 8 548 RR2CT81TF

RD RR2CT81JQ 548 0 0
GGATTTCTCTCTGCTTCCGTAGTCTCCTCGTTCGTGTTGCTTCTCTCTCTCGCTCGTCTA
CGCGATTTGACTCGAGGATTTGTGCTAGGTTGAAATGGCAGGACACAGGGTTGCGCATGC
TACATTGAAAGGCCCGAGTGTGGTGAAGGAGTTAGTTATCGGTTTGGCACTCGGTTTAGC
TGCGGGTGGTCTCTGGAAGATGCACCACTGGAACGAGCAGAGGAAAACCAGAGCTTTCTA
TGACTTGCTTGAGAGGGGCGAGATCAGCGTTGTCCTCCCTGAAGAATGAGTAGTGAATTC
AACACCTACCAATCTCTCAATCTCTACTTTTTTTTATGTTATTGTATGATTTCTTTCTTG
ACAACTTGGATGAAGTGCCTGAGAAAATGGGGGTTGCTTACGTAATAAACAACAAATCTG
AGACCGGATTTTTGGGGATTTGTTAAACATAATATTGTTTTCCGGAAGATGCATGTATGC
TACTACTGTACTCCATTGTTCAATTTCAGACAGCTTTCTTGACTTTACCTAAATAAACAG
GTGCTTCC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2CT81TF 541 0 0
TCTCTGCTTCCGTAGTCTCCTCGTTCGTGTTGCTTCTCTCTCTCGCTCGTCTACGCGATT
TGACTCGAGGATTTGTGCTAGGTTGAAATGGCAGGACACAGGGTTGCGCATGCTACATTG
AAAGGCCCGAGTGTGGTGAAGGAGTTAGTTATCGGTTTGGCACTCGGTTTAGCTGCGGGT
GGTCTCTGGAAGATGCACCACTGGAACGAGCAGAGGAAAACCAGAGCTTTCTATGACTTG
CTTGAGAGGGGCGAGATCAGCGTTGTCCTCCCTGAAGAATGAGTAGTGAATTCAACACCT
ACCAATCTCTCAATCTCTACTTTTTTTTATGTTATTGTATGATTTCTTTCTTGACAACTT
GGATGAAGTGCCTGAGAAAATGGGGGTTGCTTACGTAATAAACAACAAATCTGAGACCGG
ATTTTTGGGGATTTGTTAAACATAATATTGTTTTCCGGAAGATGCATGTATGCTACTACT
GTACTCCATTGTTCAATTTCAGACAGCTTTCTTGACTTTACCTAAATAAACAGGTGCTTC
C

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 3

CO CL2949Contig1 871 3 17 U
GAAGCGAGATCTGAGTAGCTACATCGAAGAAGAAGAAGATGAAGCGTGAGTTAGCGACAA
CGCTCTTACTCTCGACTCTCTTTACCTTTCTGGTGCCGGAGCTAATTCCGGTATGCGAAG
CCGTGTGGCTCACCATTCCCAAGACCGGAACAAAGTGCGTGTCGGAGGAAATCCAGAGCA
AGGTCGTCGTTTTGGCCGATTACCTCGTCATCTCCGACGAACATTCCATCTTCCCTACCG
TTTCTCTCAAGGTTACATCACCATATGGCAGCGTTTTGCACCACAGCGAAAATGCTACGC
ATGGTCAGTTTGCGTTTACAACCCAGGAATCAGGAACCTACTTGGCATGTTTTGAGGCCG
TAGGGAATAGTCACGGTAACAAGGATATCAGCATCAACCTTGACTGGAAAACTGGAATCG
CGGCCAAGGATTGGGACCCCATTGCTAAAAAAGAGAAGATCGAGGGTGTGGAGCTTGAGC
TTAGGAAACTCGAAGGTTCAGTTGAAGCCATACATGAAAACCTACTTTACCTCCGTAACA
GAGAAGCAGACATGAGGATTGTGAGTGAAAAAACAAACTCGCGAGTCGCGTGGTACAGTA
TAATGTCACTAGGCATCTGCATTGTGGTCTCTGGTTTACAGATTTTGTACTTGAAGCAAT
ACTTTGAAAAGAAGAAGCTTATTTAGATGAGAGTGATCCATGGGTACTTGAGACACCAAC
AGACTGTTCAGTTTCCTTTGCTTTCGTTTCTTGTAACACTGTTTCGTTTTCTTGTAACAC
TCTGCTTCGAACCTGATAGTATACAAATTTTGTTCACTTATTTAACTTGTAATCCGTCTC
CGGTTAGATTATATTTATATACCTAGACTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2CJ20TF U 1
AF RR2AR46TF U 24
AF RR2CJ20JQ C 101
BS 1 103 RR2CJ20TF
BS 104 104 RR2AR46TF
BS 105 612 RR2CJ20TF
BS 613 613 RR2AR46TF
BS 614 678 RR2CJ20TF
BS 679 745 RR2AR46TF
BS 746 746 RR2CJ20JQ
BS 747 783 RR2AR46TF
BS 784 785 RR2CJ20JQ
BS 786 795 RR2AR46TF
BS 796 796 RR2CJ20JQ
BS 797 840 RR2AR46TF
BS 841 841 RR2CJ20JQ
BS 842 844 RR2AR46TF
BS 845 845 RR2CJ20JQ
BS 846 870 RR2AR46TF
BS 871 871 RR2CJ20JQ

RD RR2CJ20TF 678 0 0
GAAGCGAGATCTGAGTAGCTACATCGAAGAAGAAGAAGATGAAGCGTGAGTTAGCGACAA
CGCTCTTACTCTCGACTCTCTTTACCTTTCTGGTGCCGGAGCTGATTCCGGTATGCGAAG
CCGTGTGGCTCACCATTCCCAAGACCGGAACAAAGTGCGTGTCGGAGGAAATCCAGAGCA
AGGTCGTCGTTTTGGCCGATTACCTCGTCATCTCCGACGAACATTCCATCTTCCCTACCG
TTTCTCTCAAGGTTACATCACCATATGGCAGCGTTTTGCACCACAGCGAAAATGCTACGC
ATGGTCAGTTTGCGTTTACAACCCAGGAATCAGGAACCTACTTGGCATGTTTTGAGGCCG
TAGGGAATAGTCACGGTAACAAGGATATCAGCATCAACCTTGACTGGAAAACTGGAATCG
CGGCCAAGGATTGGGACCCCATTGCTAAAAAAGAGAAGATCGAGGGTGTGGAGCTTGAGC
TTAGGAAACTCGAAGGTTCAGTTGAAGCCATACATGAAAACCTACTTTACCTCCGTAACA
GAGAAGCAGACATGAGGATTGTGAGTGAAAAAACAAACTCGCGAGTCGCGTGGTACAGTA
TAATGTCACTAG*CATCTGCATTGTGGTCTCTGGTTTACAGATTTTGTACTTGAAGCAAT
ACTTTGAAAAGAAGAAGC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2AR46TF 847 0 0
GG
GAAGAAGAAGAAGATGAAGCGTGAGTTTGCGACAACGCTCTTACTCTCGACTCTCTTTAC
CTTTCTGGTGCCGGAGCTAATTCCGGTATGTGAAGCCGTGTGGCTCACCATTCCCAAGAC
CGGAACAAAGTGCGTGTCGGAGGAAATCCAGAGCAAGGTCGTCGTTTTGGCCGATTACCT
CGTCATCTCCGACGAACATTCCATCTTCCCTACTGTCTCTCTCAAGGTTACATCACCATA
TGGCAGCGTTTTGCACCACAGCGAAAATGCTACGCATGGTCAGTTTGCGTTTACAACCCA
GGAATCAGGAACCTACTTGGCATGTTTTGAGGCCGTAGGGAATAGTCACGGTAACAAGGA
TATCAGCATCAACCTTGACTGGAAAACTGGAATCGCGGCCAAGGATTGGGACTCCATTGC
TAGAAAAGAGAAGATCGAGGGTGTGGAGCTTGAGCTTAGGAAACTCGAAGGTTCAGTTGA
AGCCATACATGAAAACCTACTTTACCTCCGTAACAGAGAAGCAGACATGAGGATTGTGAG
TGAAAAAACAAACTCGCGAGTCGCGTGGTACAGTATAATGTCACTAGGCATCTGCATTGT
GGTCTCTGGTTTACAGATTTTGTACTTGAAGCAATACTTTGAAAGGAAGAAGCTTATTTA
GATGAGAGTGATCCATGGGTACTTGAGACACCAACAGACTGTTCAGTTTCCTTTGCTTTC
TTTTCTTGTAACACTGTTTCGTTTTCTTGTAACACTCTTTTTCGAACCTGTTAGTATACA
AATTTTGTTCACTTATTTAACTTGTAATCCGTCTCTGGT*AGATTATATTTATATACCTA
GACTC

QA 3 847 3 847
DS 

RD RR2CJ20JQ 771 0 0
GCTG
ATTCCGGTATGCGAAGCCGTGTGGCTCACCATTCCCAAGACCGGAACAAAGTGCGTGTCG
GAGGAAATCCAGAGCAAGGTCGTCGTTTTGGCCGATTACCTCGTCATCTCCGACGAACAT
TCCATCTTCCCTACCGTTTCTCTCAAGGTTACATCACCATATGGCAGCGTTTTGCACCAC
AGCGAAAATGCTACGCATGGTCAGTTTGCGTTTACAACCCAGGAATCAGGAACCTACTTG
GCATGTTTTGAGGCCGTAGGGAATAGTCACGGTAACAAGGATATCAGCATCAACCTTGAC
TGGAAAACTGGAATCGCGGCCAAGGATTGGGACCCCATTGCTAAAAAAGAGAAGATCGAG
GGTGTGGAGCTTGAGCTTAGGAAACTCGAAGGTTCAGTTGAAGCCATACATGAAAACCTA
CTTTACCTCCGTAACAGAGAAGCAGACATGAGGATTGTGAGTGAAAAAACAAACTCGCGA
GTCGCGTGGTACAGTATAATGTCACTAGGCATCTGCATTGTGGTCTCTGGTTTACAGATT
TTGTACTTGAAGCAATACTTTGAAAAGAAGAAGCTTATTTAGATGAGAGTGATCCATGGG
TACTTGAGACACCAACAGACTGTTCAGTTTCCTTTGCTTTCGTTTCTTGTAACACTGTTT
CGTTTTCTTGTAACACTCTGCTTCGAACCTGATAGTATACAAATTTTGTTCACTTATTTA
ACTTGTAATCTGTCTCCGGTTAGATTATATTTATATACCTAGACTCT

QA 5 771 5 771
DS 



AS 1 2

CO CL2950Contig1 735 2 2 U
GCTACTTCCTCCTCCAGGTAACCAATGGTTAGTTCCAGTAATGTCTCCTTCAGAAGGTCT
GGTCTATAAACCATACGCAGGACCATGTCCTCCTCCTCCTTCAGCTTTCATGGTTCCTAT
CTATGGACAAGATCCGCTCGCCACAGCATCCAGGTTCCCTGCTTCTACTCAGTTTAGCCA
CAACCACTTCCCACCGAGGACAAAAGTACTTGACCAGACAAACCCGTTTGGTCAGCTTCA
AAGATGGTCAAGCACATCTAGCCACATGACTCAAGCGATTCCATTTTCCTTAAAGAAGTC
TGATCAGGAATCTAATGACAGTGAGGTACATGGAAGTACAGCTTCAAGTCCACCAGAGAA
GCATAAATATGATGTCCTTCCACTTTTTCCTACAGAGCCTACTACTCATCACACTGATGA
GTATGAGCGGAAACAGCAGCAGCCCCTGGCTCGTGCCATTAAAGCCATTCCTCATAATTC
AACATCTGCCTCTGAATCTGCTGCAAGAATTTTCCGGTCAATTCAGGAAGAAAGGAGGGA
CACAGATCATATGATTAGTTAGTTTTTTCTCTTAATTTCTCCACATTCTTTTTTCTCTAT
AATTGCTTCTTCATCTACTTTAGATTTTATACTATTTACTCTTCATGTGAAGATGTAAAT
CAATACTGTCACTATACAAAAAACATACATACATCTTATACTGATATTGTATTGACAAAC
AGAAAATAAATGATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG55TF U 1
AF RR2EG55JQ C 163
BS 1 522 RR2EG55TF
BS 523 735 RR2EG55JQ

RD RR2EG55TF 523 0 0
GCTACTTCCTCCTCCAGGTAACCAATGGTTAGTTCCAGTAATGTCTCCTTCAGAAGGTCT
GGTCTATAAACCATACGCAGGACCATGTCCTCCTCCTCCTTCAGCTTTCATGGTTCCTAT
CTATGGACAAGATCCGCTCGCCACAGCATCCAGGTTCCCTGCTTCTACTCAGTTTAGCCA
CAACCACTTCCCACCGAGGACAAAAGTACTTGACCAGACAAACCCGTTTGGTCAGCTTCA
AAGATGGTCAAGCACATCTAGCCACATGACTCAAGCGATTCCATTTTCCTTAAAGAAGTC
TGATCAGGAATCTAATGACAGTGAGGTACATGGAAGTACAGCTTCAAGTCCACCAGAGAA
GCATAAATATGATGTCCTTCCACTTTTTCCTACAGAGCCTACTACTCATCACACTGATGA
GTATGAGCGGAAACAGCAGCAGCCCCTGGCTCGTGCCATTAAAGCCATTCCTCATAATTC
AACATCTGCCTCTGAATCTGCTGCAAGAATTTTCCGGTCAAT
T

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2EG55JQ 573 0 0
TTCTACTCAGTTTAGCCACAACCACTTCCCACCGAGGACAAAAGTACTTGACCAGACAAA
CCCGTTTGGTCAGCTTCAAAGATGGTCAAGCACATCTAGCCACATGACTCAAGCGATTCC
ATTTTCCTTAAAGAAGTCTGATCAGGAATTTAATGACAGTGAGGTACATGGAAGTACAGC
TTCAAGTCCACCAGAGAAGCATAAATATGATGTCCTTCCACTTTTTCCTACAGAGCCTAC
TACTCATCACACTGATGAGTATGAGCGGAAACAGCAGCAGCCCCTGGCTCGTGCCATTAA
AGCCATTCCTCATAATTCAACATCTGCCTCTGAATCTGCTGCAAGAATTTTCCGGTCAAT
TCAGGAAGAAAGGAGGGACACAGATCATATGATTAGTTAGTTTTTTCTCTTAATTTCTCC
ACATTCTTTTTTCTCTATAATTGCTTCTTCATCTACTTTAGATTTTATACTATTTACTCT
TCATGTGAAGATGTAAATCAATACTGTCACTATACAAAAAACATACATACATCTTATACT
GATATTGTATTGACAAACAGAAAATAAATGATA

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 3

CO CL2951Contig1 1526 3 23 U
GGACACCAGGAGAGAGATAAGGAAGGAGAAAACAAAAAGGAAGAAGAGGAGAGGAAGTAG
AAAATGGCGAATCTCAACTCAGCAATTGACTCAGTGTTCTGGGACCAGAACCTTTCTTCA
CCTCAAACCCTCCAAGGCACAGCTCGCTCTGTTCCCGGCGAGCCATTTCCCGTCGACGGC
GCAAGAGCCAGCCGCTCTCACCGCATTCAGCAGCTCTCTCTTCTCCGCGAAGGCTTCCCC
CTCGGAGTCATCCCTGCTTTTGGTCCTTCTTCCGACAAGAGACTCGGCTCTTTCTCTCTC
AACTCTCTCTTGCTCTCTCCTTCCTCTTCCAACTGGTGGGCAGGATTGGTTGGGCAGTTC
AAGCCAAAGAAGCTCTTTGCTGATATCAAAACTAGTATCAGCAAGGCAGAGGAGTGGGAT
CTACAGCTTTTCAAAAACACAACAAAACACATTGTAGACAAATCTCTTTACTCAGTTGGT
CTACGGACTCAGATTGCACTAGGCTCTTCTTCCTCTCTCTTGCTCAGCGCCGAGCGTCTC
GGCGATAAAGACGGGATCAGAAAGAAGCTAATGTTTGTTCATCCGCTTGAGAAACATGAT
CTCACTGTGGAAGCAGCTTGGCCAGACTTGTTTTTGGACCATAAAGGACGCTTCTGGGAT
GTACCCGAGTCGCTAAACTTTGATGTCTCGTCTCTTGCTCCAGAGACGACCGGGCTTCAC
TACCGTTTCGGTGTACACAAAAGCAAAGGTGATCCTCTGGAAGTGAACGCTGCTGAGAGT
AGTGGTGGCGGCGGTGCTCCTCCTGCTTCTTTGATGCCTGGTTTATGCGCCAAGGCTGCG
GTTTCATACAAGTCTAAGAGAGTCCTGTGGAGGCCGGAAGAGAAAGAAGAAGAAGATGAT
GATGATGATTCACCTGTTTTTCTTCCTTACGATTTACGCCTCAAGGAGCCTCACGCAGCA
GTTTCAGGAATAGTAGGTAGCAGCTTGGCAGCTTGGATTACAGGGCGAGACATCATCATG
AAGAGGAGTTTGATAAGCGCAGATGTGTTTGGTTCTGCTTGTTGTACGTTTCAGAAAGGA
CGGTTTAGTAAGCTGTATGGTGATCTAACGAGAGTAGATGCTCGTGTGGACGTTTCCTCA
GCTTCAGCTCTTGCTAAAAGAATCTTTCACGCAATCAGAAGATCTTCAGGGAGTGAGAAA
ACAGATGATGACGCTACATCAGCAAGTTCTCCCAGGCTCAGCCTTATATTCCAGCAACAG
GTTGCAGGGCCAATTGTTTTCAAAGTGGACTCGCAGTTTGAGGTTGGTGCAGGGAAGTAC
GGTGCACAAATGGAAGATCTGGTTTACAGTTTGAACTACTCGTTGAGGCTTCTCGATTCT
GGGAAGGTCGTGGCTTGGTATTTACCAAAGAGAAAAGAAGGCATGGTCGAGCTTCGAGTT
TTTGAGTTTTAAATCTTTTTAGTTTCTTTGTATCAGAAGATAAAAAAATTGGTTTGTTGG
TTTAACAAGTTGAAGATGTTTTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H645TF U 1
AF RR2BA54TF U 25
AF RR2BA54JQ C 684
BS 1 46 RR2H645TF
BS 47 47 RR2BA54TF
BS 48 89 RR2H645TF
BS 90 90 RR2BA54TF
BS 91 119 RR2H645TF
BS 120 120 RR2BA54TF
BS 121 179 RR2H645TF
BS 180 180 RR2BA54TF
BS 181 203 RR2H645TF
BS 204 204 RR2BA54TF
BS 205 422 RR2H645TF
BS 423 423 RR2BA54TF
BS 424 529 RR2H645TF
BS 530 530 RR2BA54TF
BS 531 539 RR2H645TF
BS 540 540 RR2BA54TF
BS 541 569 RR2H645TF
BS 570 570 RR2BA54TF
BS 571 646 RR2H645TF
BS 647 647 RR2BA54TF
BS 648 699 RR2H645TF
BS 700 746 RR2BA54TF
BS 747 1526 RR2BA54JQ

RD RR2H645TF 699 0 0
GGACACCAGGAGAGAGATAAGGAAGGAGAAAACAAAAAGGAAGAAGCGGAGAGGAAGTAG
AAAATGGCGAATCTCAACTCAGCAATTGATTCAGTGTTCTGGGACCAGAACCTTTCTTCG
CCTCAAACCCTCCAAGGCACAGCTCGCTCTGTTCCCGGCGAGCCATTTCCCGTCGACGGT
GCAAGAGCCAGCCGCTCTCACCGTATTCAGCAGCTCTCTCTTCTCCGCGAAGGCTTCCCC
CTCGGAGTCATCCCTGCTTTTGGTCCTTCTTCCGACAAGAGACTCGGCTCTTTCTCTCTC
AACTCTCTCTTGCTCTCTCCTTCCTCTTCCAACTGGTGGGCAGGATTGGTTGGGCAGTTC
AAGCCAAAGAAGCTCTTTGCTGATATCAAAACTAGTATCAGCAAGGCAGAGGAGTGGGAT
CTCCAGCTTTTCAAAAACACAACAAAACACATTGTAGACAAATCTCTTTACTCAGTTGGT
CTACGGACTCAGATTGCACTAGGCTCTTCTTCCTCTCTCTTGCTCAGCGTCGAGCGTCTT
GGCGATAAAGACGGGATCAGAAAGAAGCTTATGTTTGTTCATCCGCTTGAGAAACATGAT
CTCACTGTGGAAGCAGCTTGGCCAGACTTGTTTTTGGACCATAAAG*ACGCTTCTGGGAT
GTACCCGAGTCGCTAAACTTTGATGTCTCGTCTCTTGCT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2BA54TF 722 0 0
GGACAGAGATAAGGAA
AAGAAGAGGAGAGGAAGTAGAAAATGGCGAATCTCAACTCAGCAATTGACTCAGTGTTCT
GGGACCAGAACCTTTCTTCACCTCAAACCCTCCAAGGCACAGCTCGCTCTGTTCCCGGCG
AGCCATTTCCCGTCGACGGCGCAAGAGCCAGCCGCTCTCACCGCATTCAGCAGCTCTCTC
TTCTCCGCGAAGGTTTCCCCCTCGGAGTCATCCCTGCTTTTGGTCCTTCTTCCGACAAGA
GACTCGGCTCTTTCTCTCTCAACTCTCTCTTGCTCTCTCCTTCCTCTTCCAACTGGTGGG
CAGGATTGGTTGGGCAGTTCAAGCCAAAGAAGCTCTTTGCTGATATCAAAACTAGTATCA
GCAAGGCAGAGGAGTTGGATCTACAGCTTTTCAAAAACACAACAAAACACATTGTAGACA
AGTCTCTTTACTCAGTTGGTCTATGGACTCAGATTGCATTAGGCTCTTCTTCCTCTCTCT
TGCTGAGCGCTGAGCGTCTCGGCGATAAAGACGGGATCAGAAAGAAGTTAATGTTTGTTC
ATCCGCTTGAGAAACATGATCTCACTGTGGAAGCAGCTTGGCCAGACTTGTTTTTGGACC
ATAAAGGACGCTTCTGGGATGTTCCCGAGTCGTTAAACTTTGATGTCTCGTCTCTTGCTC
CAGAGACGACCGGGCTTCACTACCGTTTCGGTGTACACAAAAGCAA

QA 17 722 17 722
DS 

RD RR2BA54JQ 843 0 0
TGTCTCGTCTCTTGCTCCAGAGACGACCGGGCTTCACTACCGTTTCGGTGTACACAAAAG
CAAAGGTGATCCTCTGGAAGTGAACGCTGCTGAGAGTAGTGGTGGCGGCGGTGCTCCTCC
TGCTTCTTTGATGCCTGGTTTATGCGCCAAGGCTGCGGTTTCATACAAGTCTAAGAGAGT
CCTGTGGAGGCCGGAAGAGAAAGAAGAAGAAGATGATGATGATGATTCACCTGTTTTTCT
TCCTTACGATTTACGCCTCAAGGAGCCTCACGCAGCAGTTTCAGGAATAGTAGGTAGCAG
CTTGGCAGCTTGGATTACAGGGCGAGACATCATCATGAAGAGGAGTTTGATAAGCGCAGA
TGTGTTTGGTTCTGCTTGTTGTACGTTTCAGAAAGGACGGTTTAGTAAGCTGTATGGTGA
TCTAACGAGAGTAGATGCTCGTGTGGACGTTTCCTCAGCTTCAGCTCTTGCTAAAAGAAT
CTTTCACGCAATCAGAAGATCTTCAGGGAGTGAGAAAACAGATGATGACGCTACATCAGC
AAGTTCTCCCAGGCTCAGCCTTATATTCCAGCAACAGGTTGCAGGGCCAATTGTTTTCAA
AGTGGACTCGCAGTTTGAGGTTGGTGCAGGGAAGTACGGTGCACAAATGGAAGATCTGGT
TTACAGTTTGAACTACTCGTTGAGGCTTCTCGATTCTGGGAAGGTCGTGGCTTGGTATTT
ACCAAAGAGAAAAGAAGGCATGGTCGAGCTTCGAGTTTTTGAGTTTTAAATCTTTTTAGT
TTCTTTGTATCAGAAGATAAAAAAATTGGTTTGTTGGTTTAACAAGTTGAAGATGTTTTG
TTG

QA 1 843 1 843
DS 



AS 1 3

CO CL2952Contig1 570 3 2 U
GGGCCGTCTTCAAAAACACTCGTGAGCTTTCCTCCTCCTTCGAGATCTCCATCAAACTTC
TGCTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCCTACTTGCTCGCCGCATTGAGCGGGAAAGCTTCCCC
AACCAGTGCCGATGTCAAGACCATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTCTCA
GATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTGAACGGGAAAGACTTGTGCGAACTGATCGTTGCTGG
TAGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGCGGTGGTGGTGTTGCCATGGCCTCTGCTCCATC
TGCAGGTGGTGGAGGAGGTGCAGCTCCTGCGGCTGAGGCCAAGAAGGAAGAGAAGAAAGA
AGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTTTTCGAGTAATGCTTTTCCGC
ATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTCATTTTGTGTTAAACCCTTTGGAACCTCTGTTGTTTTT
TCTTAGTTCGTACCCGATGATGGCTATCTTTTTGACATTCCTGCAATTCTCGAGAGATTT
TTTTAGTTATATCTATAATCCTTATCTTTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AU96JQ C 1
AF RR2AU96TF U 1
AF RR2F872TF U 1
BS 1 516 RR2AU96TF
BS 517 570 RR2F872TF

RD RR2AU96JQ 516 0 0
GGGCCGTCTTCAAAAACACTCGTGAGCTTTCCTCCTCCTTCGAGATCTCCATCAAACTTC
TGCTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCCTACTTGCTCGCCGCATTGAGCGGGAAAGCTTCCCC
AACCAGTGCCGATGTCAAGACCATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTCTCA
GATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTGAACGGGAAAGACTTGTGCGAACTGATCGTTGCTGG
TAGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGCGGTGGTGGTGTTGCCATGGCCTCTGCTCCATC
TGCAGGTGGTGGAGGAGGTGCAGCTCCTGCGGCTGAGGCCAAGAAGGAAGAGAAGAAAGA
AGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTTTTCGAGTAATGCTTTTCCGC
ATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTCATTTTGTGTTAAACCCTTTGGAACCTCTGTTGTTTTT
TCTTAGTTCGTACCCGATGATGGCTATCTTTTTGAC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2AU96TF 516 0 0
GGGCCGTCTTCAAAAACACTCGTGAGCTTTCCTCCTCCTTCGAGATCTCCATCAAACTTC
TGCTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCCTACTTGCTCGCCGCATTGAGCGGGAAAGCTTCCCC
AACCAGTGCCGATGTCAAGACCATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTCTCA
GATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTGAACGGGAAAGACTTGTGCGAACTGATCGTTGCTGG
TAGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGCGGTGGTGGTGTTGCCATGGCCTCTGCTCCATC
TGCAGGTGGTGGAGGAGGTGCAGCTCCTGCGGCTGAGGCCAAGAAGGAAGAGAAGAAAGA
AGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTTTTCGAGTAATGCTTTTCCGC
ATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTCATTTTGTGTTAAACCCTTTGGAACCTCTGTTGTTTTT
TCTTAGTTCGTACCCGATGATGGCTATCTTTTTGAC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2F872TF 570 0 0
GGGCCGTCTTCAAAAACACTCGTGAGCTTTCCTCCTCCTTCGAGATCTCCATCAAACTTC
TGCTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCCTACTTGCTCGCCGCATTGAGCGGGAAAGCTTCCCC
AACCAGTGCCGATGTCAAGACCATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTCTCA
GATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTGAACGGGAAAGACTTGTGCGAACTGATCGCTGCTGG
TAGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGCGGTGGTGGTGTTGCCATGGCCTCTGCTCCATC
TGCAGGTGGTGGAGGAGGTGCAGCTCCTGCGGCTGAGGCCAAGAAGGAAGAGAAGAAAGA
AGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTTTTCGAGTAATGCTTTTCCGC
ATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTCATTTTGTGTTAAACCCTTTGGAACCTCTGTTGTTTTT
TCTTAGTTCGTACCCGATGATGGCTATCTTTTTGACATTCCTGCAATTCTCGAGAGATTT
TTTTAGTTATATCTATAATCCTTATCTTTT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 3

CO CL2953Contig1 868 3 16 U
GGTATCGCCACTGGACCAGCACTTCCTCAACAGCTTCCAATGCATCCTTACTCTCAACCC
ACAATGCCGCTAGCACACTATGCAAACATGATTAGTTATCCTCTAATGCCTCAGAACTAT
CCATACATGCCATCCGCTTTCCAGCAAACATACGCTGGCAACAGCTCCTATCACCAGCAA
CTAGCAGCGTTGCTTCCGCAGTACAAAACCAATCTCTCTCCCAGTAATTTGCCTCAGTCC
GCAACAGCGCCAGCTGCGTCCGCTTATGGATATGGAAACTCCGCCAATGTTGGATCTGCT
GGAAACTTCCCTCTTAGCCAACAGGCTGCTCCTACCGGTTATGAAGATGTTCTGAGTTCT
CAATACAAAGAGAGTAATCATCTGTTGGCACTTCAACATCAGCAGCAGCAGAACGAAAAC
TCGGCAATGTGGCATCAGGGTCATGGCTCTCGGACCATGTCAGGTGTCCCGGCTAACACA
TACTACAACCTCCAAGCACAACAACAACAGCAACTACCACAGACTCCACAAGCAGCGGCA
GGAGGGTATCGTCAAGCTCAGCAACAACAGCAACAGCGTTATGGATCACATGGCTACCCT
AACTTCTATCAGTCCCAAACAGAAATGTCGCTAGAGCGCCAGCAGCAAAACCCTAGAGAT
GGTGCGGGGGCTCAGGTTGGCCAGCCCTCAGATCAAACCCAGCAGCTCTGGCAAAACTCT
TACTAAATGAAGAAAGGAGTGTGTTCTTCTTTCGGTTATAGAGTGGGTTTTGTGTGGTGA
GGCATGGATATGTTCTGAATGTATGTTATATAAATCATCTTTTTGTCTACTCTGTTAACT
TAGGTAACAGGCAATTCTGATTTCATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF87TF U 65
AF RR2DT39TF U 1
AF RR2DT39JQ C 304
BS 1 79 RR2DT39TF
BS 80 80 RR2GF87TF
BS 81 131 RR2DT39TF
BS 132 132 RR2GF87TF
BS 133 182 RR2DT39TF
BS 183 183 RR2GF87TF
BS 184 207 RR2DT39TF
BS 208 208 RR2GF87TF
BS 209 253 RR2DT39TF
BS 254 256 RR2GF87TF
BS 257 275 RR2DT39TF
BS 276 276 RR2GF87TF
BS 277 649 RR2DT39TF
BS 650 650 RR2DT39JQ
BS 651 671 RR2DT39TF
BS 672 868 RR2DT39JQ

RD RR2GF87TF 395 0 0
G
GCCGCTAGCACACTATGCAAACATGATTAGTTATCCTCTAATGCCTCAGAACTATCCATA
CATGCCATCCGCTTTCCAGCAAACATACGCTGGCAACAGCTCCTATCACCAGCAACTAGC
TGCGTTGCTTCCGCAGTACAAAACCAATCTCTCTCCCAGTAATTTGCCTCAGTCCGCAAC
AGCGCCTGCTGCGTCCGCTTATGGATATGGAAACTCCGCCAATGTTGGATCTGCTGGAAA
CTTCCCTCTTAGCCAACAGTCTGCTCCTACCGGTTATGAAGATGTTCTGAGTTCTCAATA
CAAAGAGAGTAATCATCTGTTGGCACTTCAACATCAGCAGCAACAGAACGAAAACTCGGC
AATGTGGCATCACGGTCATGGTTCTCGGAC
AATG

QA 2 391 2 391
DS 

RD RR2DT39TF 671 0 0
GGTATCGCCACTGGACCAGCACTTCCTCAACAGCTTCCAATGCATCCTTACTCTCAACCC
ACAATGCCGCTAGCACACTTTGCAAACATGATTAGTTATCCTCTAATGCCTCAGAACTAT
CCATACATGCCGTCCGCTTTCCAGCAAACATACGCTGGCAACAGCTCCTATCACCAGCAA
CTGGCAGCGTTGCTTCCGCAGTACAAAGCCAATCTCTCTCCCAGTAATTTGCCTCAGTCC
GCAACAGCGCCAG***CGTCCGCTTATGGATATGGGAACTCCGCCAATGTTGGATCTGCT
GGAAACTTCCCTCTTAGCCAACAGGCTGCTCCTACCGGTTATGAAGATGTTCTGAGTTCT
CAATACAAAGAGAGTAATCATCTGTTGGCACTTCAACATCAGCAGCAGCAGAACGAAAAC
TCGGCAATGTGGCATCAGGGTCATGGCTCTCGGACCATGTCAGGTGTCCCGGCTAACACA
TACTACAACCTCCAAGCACAACAACAACAGCAACTACCACAGACTCCACAAGCAGCGGCA
GGAGGGTATCGTCAAGCTCAGCAACAACAGCAACAGCGTTATGGATCACATGGCTACCCT
AACTTCTATCAGTCCCAAACAGAAATGTCGCTAGAGCGCCAGCAGCAAA*CCCTAGAGAT
GGTGCGGGGGC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2DT39JQ 565 0 0
AACTTCCCTCTTAGCCAACAGGCTGCTCCTACCGGTTATGAAGATGTTCTGAGTTCTCAA
TACAAAGAGAGTAATCATCTGTTGGCACTTCAACATCAGCAGCAGCAGAACGAAAACTCG
GCAATGTGGCATCAGGGTCATGGCTCTCGGACCATGTCAGGTGTCCCGGCTAACACATAC
TACAACCTCCAAGCACAACAACAACAGCAACTACCACAGACTCCACAAGCAGCGGCAGGA
GGGTATCGTCAAGCTCAGCAACAACAGCAACAGCGTTATGGATCACATGGCTACCCTAAC
TTCTATCAGTCCCAAACAGAAATGTCGCTAGAGCGCCAGCAGCAAAACCCTAGAGATGGT
GCGGGGGCTCAGGTTGGCCAGCCCTCAGATCAAACCCAGCAGCTCTGGCAAAACTCTTAC
TAAATGAAGAAAGGAGTGTGTTCTTCTTTCGGTTATAGAGTGGGTTTTGTGTGGTGAGGC
ATGGATATGTTCTGAATGTATGTTATATAAATCATCTTTTTGTCTACTCTGTTAACTTAG
GTAACAGGCAATTCTGATTTCATCG

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL2954Contig1 1022 2 4 U
AACAAATCAGAACATCTCTCCTTTCTAAGAACGGTTGCATAGTTAATATGACAGCTGATG
GGAAGTCCCTCACAAACACAGAGAAACTTGTTGGGAAATTCCTTGATTCACTCCCTGAAA
AGCCTTCTGGTGGACAAGTGACTTGGGATGCACGGCTTCCTTTGAGAAATGAAGCTATAG
TAATACCAACTCAGGTGAACTATGTGGGGAAAGCAGGTAACATATACAGCAGTGGCTACA
AGCTTGATGGGAGTTCATATGTTATATCAAAGCATATTGGTAACACATGGTTATGGGACC
GTGTTCGTGTAAGTGGTGGTGCATATGGCGGTTTCTGTGATTTTGATTCACATTCAGGAG
TGTTTTCGTTCTTGTCTTACCGTGATCCCAACTTACTGAAGACACTAGACATATATGATG
GAACTGGAGACTTCTTACGTGGCCTTGACGTCGATGAAGACACCCTTACTAAAGCAGTTA
TTGGGACAATTGGGGACGTTGATTCGTATCAGCTCCCTGATGCCAAAGGTTATAGCAGTT
TGTTGAGGCATTTGCTTAATGTAACTGACGAAGAGAGGCAAATAAGGCGTGAAAAGGTAT
TATCAACAAGTTTGAAGGACTTTAAGGAATTCGCAGAGGCGGTAGATTCTGTTAGAGATA
AAGGTGTTGCAGTGGCCGTGGCATCACAAGAAGACATTGATGCAGCTAACAGAGAACGCT
CAAACTTTTTCGAGGTGAAGAAAGCTCTATGAACTCTTTAAAAAGTAGGAAGGAGTTTTC
TTAGGTTCATGGAACGAGGCATCATATCTCTAAGCTCACCTTTTTAGGTTTTGCTTCACT
ATGCTTACAAAAGCTAAATGCCAACATCATGATCTATTATAGTGGAATAAAATTTACCAT
TTACTAAAACACAGGCTTAGCAACTGTTGCACTCCCGGAATTTTTAGTGCCTTTTAGGTT
TGAGCCAAACCTTGTTTAGTTCGCATGTGGTTTAAAATGAAGAGTCCAACTGTTTGCTTG
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2BD54TF U 1
AF RR2BD54JQ C 196
BS 1 625 RR2BD54TF
BS 626 626 RR2BD54JQ
BS 627 760 RR2BD54TF
BS 761 1022 RR2BD54JQ

RD RR2BD54TF 760 0 0
AACAAATCAGAACATCTCTCCTTTCTAAGAACGGTTGCATAGTTAATATGACAGCTGATG
GGAAGTCCCTCACAAACACAGAGAAACTTGTTGGGAAATTCCTTGATTCACTCCCTGAAA
AGCCTTCTGGTGGACAAGTGACTTGGGATGCACGGCTTCCTTTGAGAAATGAAGCTATAG
TAATACCAACTCAGGTGAACTATGTGGGGAAAGCAGGTAACATATACAGCAGTGGCTACA
AGCTTGATGGGAGTTCATATGTTATATCAAAGCATATTGGTAACACATGGTTATGGGACC
GTGTTCGTGTAAGTGGTGGTGCATATGGCGGTTTCTGTGATTTTGATTCACATTCAGGAG
TGTTTTCGTTCTTGTCTTACCGTGATCCCAACTTACTGAAGACACTAGACATATATGATG
GAACTGGAGACTTCTTACGTGGCCTTGACGTCGATGAAGACACCCTTACTAAAGCAGTTA
TTGGGACAATTGGGGACGTTGATTCGTATCAGCTCCCTGATGCCAAAGGTTATAGCAGTT
TGTTGAGGCATTTGCTTAATGTAACTGACGAAGAGAGGCAAATAAGGCGTGAAAAGGTAT
TATCAACAAGTTTGAAGGACTTTAATGAATTCGCAGAGGCGGTAGATTCTGTTAGAGATA
AAGGTGTTGCAGTGGCCGTGGCATCACAAGAAGACATTGATGCAGCTAACAGAGAACGCT
CAAACTTTTTCGAGGTGAAGAAAGCTCTATGAACTCTTTA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2BD54JQ 827 0 0
TG
AACTATGTGGGGAAAGCAGGTAACATATACAGCAGTGGCTACAAGCTTGATGGGAGTTCA
TATGTTATATCAAAGCATATTGGTAACACATGGTTATGGGACCGTGTTCGTGTAAGTGGT
GGTGCATATGGCGGTTTCTGTGATTTTGATTCACATTCAGGAGTGTTTTCGTTCTTGTCT
TACCGTGATCCCAACTTACTGAAGACACTAGACATATATGATGGAACTGGAGACTTCTTA
CGTGGCCTTGACGTCGATGAAGACACCCTTACTAAAGCAGTTATTGGGACAATTGGGGAC
GTTGATTCGTATCAGCTCCCTGATGCCAAAGGTTATAGCAGTTTGTTGAGGCATTTGCTT
AATGTAACTGACGAAGAGAGGCAAATAAGGCGTGAAAAGGTATTATCAACAAGTTTGAAG
GACTTTAAGGAATTCGCAGAGGCGGTAGATTCTGTTAGAGATAAAGGTGTTGCAGTGGCC
GTGGCATCACAAGAAGACATTGATGCAGCTAACAGAGAACGCTCAAACTTTTTCGAGGTG
AAGAAAGCTCTATGAACTCTTTAAAAAGTAGGAAGGAGTTTTCTTAGGTTCATGGAACGA
GGCATCATATCTCTAAGCTCACCTTTTTAGGTTTTGCTTCACTATGCTTACAAAAGCTAA
ATGCCAACATCATGATCTATTATAGTGGAATAAAATTTACCATTTACTAAAACACAGGCT
TAGCAACTGTTGCACTCCCGGAATTTTTAGTGCCTTTTAGGTTTGAGCCAAACCTTGTTT
AGTTCGCATGTGGTTTAAAATGAAGAGTCCAACTGTTTGCTTGTT

QA 3 827 3 827
DS 



AS 1 3

CO CL2955Contig1 1083 3 16 U
GGGCTGACGCCGGCGAGCAAAATCTTCAGACCTCAACAGAAGAAGACAACTTAATCGAGC
ATGGCTATGCAAACCGGTATAGGGTTATCAAGGCTTCTGATTCTAGCTGGAGCAGGGTAT
ACAGGAACGATCCTGGTGAAGAATGGGAAGATGTCAGATCTTTTGGGTGAGCTGCAGGCT
TTGGTGAAGAGATTTGAGAGATCAGGAGATCATTCAGATGACGATTCTGATCCCATGTCT
ACTGAGATGCAACGGTTAGCTATGGAGATCCGGCAAATGTCCTCATCTCGTCAGATAACT
GTTGTCAATGGAGGAACTCAAGGAGCTGACTTCACCCCGCTTATAGTTCCCGCAGCGACA
TTAGGAGCTATAGGCTATGGCTACATGTGGTACAAGGGTATTTCATTCTCTGACATCATG
TGCGTAACAAAGAAGAACATGGAAGATGCTGTCTCCAACTTGACTAAGCATTTGAGCACC
GTTTCTGAAGCTATTTCTAATGCTAAGAAGCACTTGTCCGAGAGGCTTAATAAGACGGAC
GATAAGCTGGAATCGCAGAAGGATCTCTTAAAGGGACTCCAGGACGATGTGGGTTTGACT
CTAGAGGATATGGCTAAGATTGGAGATGATTTTTATGCAACGCATAACATGTTTGGTGG*
TATGGGTGGAACGTTAGATAGTATTGAGTACAAGCAGAATATTGCGAATATGGGTTTAAT
GCATCTGTGCGACTCTATGGGAGGAGATAATCACAAGATGCCTGATATTATGATGCAGGA
GAAGCTTCGACTTTCTGGGAAGTCAAGCACATGTATAATACTTACAGACGAAGAAACTTC
AAGCTCAGAGGGTTTGAAAGAAAGTGATAAGATAGAGCTTATTGAAGGCCGATTCAATTC
AGATGGTACACCATATGTCATCAAGGTTTGATGATATGATGTGTAGTATAGGATACTGAG
ATATAGAATGTATTTTGGTGGTTTAAATTAATGGCCTTTGAAGGGCAAATAAACAAAAAG
AATGAAGCCTAATCATTTACATGTAACTGCATTATGCACAATTTGTTACAAAACACCATT
CAC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2EA47TF U 2
AF RR2AR42TF U 1
AF RR2EA47JQ C 342
BS 1 315 RR2AR42TF
BS 316 316 RR2EA47TF
BS 317 530 RR2AR42TF
BS 531 531 RR2EA47TF
BS 532 640 RR2AR42TF
BS 641 641 RR2EA47TF
BS 642 659 RR2AR42TF
BS 660 660 RR2EA47TF
BS 661 778 RR2AR42TF
BS 779 779 RR2EA47JQ
BS 780 782 RR2AR42TF
BS 783 783 RR2EA47JQ
BS 784 800 RR2AR42TF
BS 801 801 RR2EA47JQ
BS 802 817 RR2AR42TF
BS 818 1083 RR2EA47JQ

RD RR2EA47TF 728 0 0
GGCTGACGCCGGCGAGCAAAATCTTCAGACCTCAACAGAAGAAGACAACTTAATCGAGCA
TGGCTATGCAAACCGGTATAGGGTTATCAAGGCTTCTGATTCTAGCTGGAGCAGGGTATA
CAGGAACGATCCTGGTGAAGAATGGGAAGATGTCAGATCTTTTGGGTGAGCTGCAGGCTT
TGGTGAAGAGATTTGAGAGATCAGGAGATCATTCAGATGACGATTCTGATCCCATGTCTA
CTGAGATGCAACGGTTAGCTATGGAGATCCGGCAAATGTCCTCATCTCGTCAGATAACTG
TTGTCAATGGAGGAACTCAAGGAGCTGACTTCACCCCGCTTATAGTTCCCGCAGCGACAT
TAGGAGCTATAGGCTATGGCTACATGTGGTACAAGGGTATTTCATTCTCTGACATCATGT
GCGTAACAAAGAAGAACATGGAAGATGCTGTCTCCAACTTGACTAAGCATTTGAGCACCG
TTTCTGAAGCTATTTCTAATGCTAAGAAGCACTTGTCCGAGAGGCTTAATAAGACGGACG
ATAAGCTGGAATCGCAGAAGGATCTCTTAAAGGGACTCCAGGACGATGTGGGTTTGACTC
TAGAGGATATGGCTAAGATTGGAGATGATTTTTATGCAACGCATAACATGTTTGGTGG*T
ATGGGTGGAACGTTAGATAGTATTGAGTACAAGCAGAATATTGCGAATATGGGTTTAATG
CATCTGTG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2AR42TF 822 0 0
GGGCTGACGCCGGCGAGCAAAATCTTCAGACCTCAACAGAAGAAGACAACTTAATCGAGC
ATGGCTATGCAAACCGGTATAGGGTTATCAAGGCTTCTGATTCTAGCTGGAGCAGGGTAT
ACAGGAACGATCCTGGTGAAGAATGGGAAGATGTCAGATCTTTTGGGTGAGCTGCAGGCT
TTGGTGAAGAGATTTGAGAGATCAGGAGATCATTCAGATGACGATTCTGATCCCATGTCT
ACTGAGATGCAACGGTTAGCTATGGAGATCCGGCAAATGTCCTCATCTCGTCAGATAACT
GTTGTCAATGGAGGAGCTCAAGGAGCTGACTTCACCCCGCTTATAGTTCCCGCAGCGACA
TTAGGAGCTATAGGCTATGGCTACATGTGGTACAAGGGTATTTCATTCTCTGACATCATG
TGCGTAACAAAGAAGAACATGGAAGATGCTGTCTCCAACTTGACTAAGCATTTGAGCACC
GTTTCTGAAGCTATTTCTAATGCTAAGAAGCACTTGTCCGAGAGGCTTAAGAAGACGGAC
GATAAGCTGGAATCGCAGAAGGATCTCTTAAAGGGACTCCAGGACGATGTGGGTTTGACT
CTAGAGGATATGGCTAAGATTGGAGATGATTTTTATGCAATGCATAACATGTTTGGTGGG
TATGGGTGGAACGTTAGATAGTATTGAGTACAAGCAGAATATTGCGAATATGGGTTTAAT
GCATCTGTGCGACTCTATGGGAGGAGATAATCACAAGATGCCTGATATTATGATGCAG*A
GA*GCTTCGACTTTCTGGGA*GTCAAGCACATGTATA
TACTT

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2EA47JQ 742 0 0
TATAGTTCCCGCAGCGACATTAGGAGCTATAGGCTATGGCTACATGTGGTACAAGGGTAT
TTCATTCTCTGACATCATGTGCGTAACAAAGAAGAACATGGAAGATGCTGTCTCCAACTT
GACTAAGCATTTGAGCACCGTTTCTGAAGCTATTTCTAATGCTAAGAAGCACTTGTCCGA
GAGGCTTAATAAGACGGACGATAAGCTGGAATCGCAGAAGGATCTCTTAAAGGGACTCCA
GGACGATGTGGGTTTGACTCTAGAGGATATGGCTAAGATTGGAGATGATTTTTATGCAAC
GCATAACATGTTTGGTGG*TATGGGTGGAACGTTAGATAGTATTGAGTACAAGCAGAATA
TTGCGAATATGGGTTTAATGCATCTGTGCGACTCTATGGGAGGAGATAATCACAAGATGC
CTGATATTATGATGCAGGAGAAGCTTCGACTTTCTGGGAAGTCAAGCACATGTATAATAC
TTACAGACGAAGAAACTTCAAGCTCAGAGGGTTTGAAAGAAAGTGATAAGATAGAGCTTA
TTGAAGGCCGATTCAATTCAGATGGTACACCATATGTCATCAAGGTTTGATGATATGATG
TGTAGTATAGGATACTGAGATATAGAATGTATTTTGGTGGTTTAAATTAATGGCCTTTGA
AGGGCAAATAAACAAAAAGAATGAAGCCTAATCATTTACATGTAACTGCATTATGCACAA
TTTGTTACAAAACACCATTCAC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 3

CO CL2956Contig1 778 3 12 U
GGATCTTTGGGCTAATAGGGTTTCTATTTTCCGGGACAAAGTTTGCTTCTTTCGTATCCC
CGCAAGAATGCTCAGATGGTCGATTGAGGTTGATCATCTAGAAGAAGAAAAATCAACAGA
GGATCTCCAATTCTAGGATTTTTATTTTTTGAAGATCTAAAAGGCTCAAAATCTTAAGCT
TTTTTTTTTT*GATTTTTTCCCTGAACGTATTATTACAAATGAGCGCTTCAAGATTTGTA
AAGTGTGTGACGGTTGGTGATGGAGCTGTCGGAAAAACATGTCTGTTGATTTCTTACACT
AGCAACACTTTCCCTACGGATTATGTGCCCACCGTTTTCGATAATTTCAGTGCAAATGTG
GTGGTTAATGGAGCCACCGTCAATCTTGGATTGTGGGATACTGCAGGGCAAGAGGATTAC
AACAGATTAAGACCATTAAGCTACCGTGGAGCAGATGTTTTCATATTGGCCTTCTCCCTT
ATCAGTAAAGCCAGTTATGAAAACGTCTCCAAAAAGTGGATCCCGGAGTTGAAACATTAC
GCACCTGGTGTCCCCATTATCCTTGTTGGATCAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGCAG
TTCTTCGTCGACCATCCTGGTGCTGTCCCAATCACTACTGTTCAGGGAGAGGAGCTTAAG
AAGCTAATAGAAGCACCTTCTTACATCGAATGCAGTTCCAAATCTCAAGAGAATGTGAAG
GCAGTGTTTGACGCGGCCATTCGAGTGGTGTTGCACCTCCGAAGCAGAAGAAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DE24TF U 32
AF RR2ET19TF U 1
AF RR2F202TF U 8
BS 1 190 RR2ET19TF
BS 191 191 RR2F202TF
BS 192 329 RR2ET19TF
BS 330 330 RR2F202TF
BS 331 351 RR2ET19TF
BS 352 352 RR2F202TF
BS 353 712 RR2ET19TF
BS 713 713 RR2F202TF
BS 714 720 RR2ET19TF
BS 721 721 RR2F202TF
BS 722 747 RR2ET19TF
BS 748 778 RR2F202TF

RD RR2DE24TF 566 0 0
G
GGGACAAAGTTTGCTTCTTTCGTATCCCCGCAAGAATGCTCAGATGGTCGATTGAGGTTG
ATCATCTAGAAGAAGAAAAATCAACAGAGGATCTCCAATTCTAGGATTTTTATTTTTTGA
AGATCTAAAAGGCTCAAAATCTTAAGCTTTTTTTTTT**GATTTTTTCCCTGAACGTATT
ATTACAAATGAGCGCTTCAAGATTTGTAAAGTGTGTGACGGTTGGTGATGGAGCTGTCGG
AAAAACATGTCTGTTGATTTCTTACACTATCAACACTTTCCCTACGGATTATGTGCCCAC
CGTTTTCGATAATTTCAGTGCAAATGTGGTGGTTAATGGAGCCACCGTCAATCTTGGATT
GTGGGATACTGCAGGGCAAGAGGATTACAACAGATTAAGACCATTAAGCTACCGTGGAGC
AGATGTTTTCATATTGGCCTTCTCCCTTATCAGTAAAGCCAGTTATGAAACCGTCTCCAA
AAAGTGGATCCCGGAGTTGAAACATTACGCACCTGGTGTCCCCATTATCCTTGTTGGATC
AAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAG

QA 2 566 2 566
DS 

RD RR2ET19TF 747 0 0
GGATCTTTGGGCTAATAGGGTTTCTATTTTCCGGGACAAAGTTTGCTTCTTTCGTATCCC
CGCAAGAATGCTCAGATGGTCGATTGAGGTTGATCATCTAGAAGAAGAAAAATCAACAGA
GGATCTCCAATTCTAGGATTTTTATTTTTTGAAGATCTAAAAGGCTCAAAATCTTAAGCT
TTTTTTTTTTTGATTTTTTCCCTGAACGTATTATTACAAATGAGCGCTTCAAGATTTGTA
AAGTGTGTGACGGTTGGTGATGGAGCTGTCGGAAAAACATGTCTGTTGATTTCTTACACT
AGCAACACTTTCCCTACGGATTATGTGCCAACCGTTTTCGATAATTTCAGTTCAAATGTG
GTGGTTAATGGAGCCACCGTCAATCTTGGATTGTGGGATACTGCAGGGCAAGAGGATTAC
AACAGATTAAGACCATTAAGCTACCGTGGAGCAGATGTTTTCATATTGGCCTTCTCCCTT
ATCAGTAAAGCCAGTTATGAAAACGTCTCCAAAAAGTGGATCCCGGAGTTGAAACATTAC
GCACCTGGTGTCCCCATTATCCTTGTTGGATCAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGCAG
TTCTTCGTCGACCATCCTGGTGCTGTCCCAATCACTACTGTTCAGGGAGAGGAGCTTAAG
AAGCTAATAGAAGCACCTTCTTACATCGAATGCAGTTCCAAATCTCAAGAGA*TGTGAAG
*CAGTGTTTGACGCGGCCATTCGAGTG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2F202TF 771 0 0
G
GGGCTAATAGGGTTTCTATTTTCCGGGACAAAGTTTGCTTCTTTCGTATCCCCGCAAGAA
TGCTCAGATGGTCGATTGAGGTTGATCATCTAGAAGAAGAAAAATCAACAGAGGATCTCC
AATTCTAGGATTTTTATTTTTTGAAGATCTAAAAGGCTCAAAATCTTAAGCTTTTTTTTT
TT*GATTTTTTCCCTGAACGTATTATTACAAATGAGCGCTTCAAGATTTGTAAAGTGTGT
GACGGTTGGTGATGGAGCTGTCGGAAAAACATGTCTGTTGATTTCTTACACTAGCAACAC
TTTCCCTACGGATTATGTGCCCGCCGTTTTCGATAATTTCAGTGCAAATGTGGTGGTTAA
TGGAGCCACCGTCAATCTTGGATTGTGGGATACTGCAGGGCAAGAGGATTACAACAGATT
AAGACCATTAAGCTACCGTGGAGCAGATGTTTTCATATTGGCCTTCTCCCTTATCAGTAA
AGCCAGTTATGAAAACGTCTCCAAAAAGTGGATCCCGGAGTTGAAACATTACGCACCTGG
TGTCCCCATTATCCTTGTTGGATCAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGCAGTTCTTCGT
CGACCATCCTGGTGCTGTCCCAATCACTACTGTTCAGGGAGAGGAGCTTAAGAAGCTAAT
AGAAGCACCTTCTTACATCGAATGCAGTTCCAAATCTCAAGAGAATGTGAAGGCAGTGTT
TGACGCGGCCATTCGAGTGGTGTTGCACCTCCGAAGCAGAAGAAGAAAAA

QA 2 771 2 771
DS 



AS 1 3

CO CL2957Contig1 601 3 4 U
GGGCGAGTCAAAGTTGAATTCTCCGGGACCGGGAGGAGTCAGATCTTCTGAGCAGATGGG
AGGGAGCAGCGAGGATAGATGGAAGGGATCGTTAGAGAACATAACGGAGATGGCATCCAA
TCTCGATTCTCTCCAGAAGCTTCTCCTCAAGAAAGCCGTCTTCGTTGAAGAAGACACTTT
CTCTAGAGCCTCTCTCGTCTCCGAACAAGCCCGAACCATCAAGGTGCTTGAGCAAAGGGT
ACAAACACTAGAGAGAGAACTAGATGCTGCTATTACAGCTGCTGCTCATGCTCGGTCTGA
GAAACGCAAAGCTGAGTCCTCTCAAAAAAACTGCTGAATCACGTGCACTAGAGGTCACAA
AGGAACTCGAAAACACCACGAAGGTTTTCAAGCTGCATATGGAAGAGCTCCGAGGGATGC
AAGAACAGATATCCAAACGCGATAACGAGATCAAGCTCTTGGAAGCTATCATCCAAACGC
TCGGTGGGAAAGAGCGTCTGAGAAAAAGCAGCGGTGTTTAATGATTTGAGTGATTGATTG
ATCATGCGTTTCTTGTAATATTCTGTATATCACAAGATAAAATATTAATCAGGCCTTATG
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2H505TF U 1
AF RR2B524JQ C 23
AF RR2B524TF U 23
BS 1 329 RR2H505TF
BS 330 330 RR2B524TF
BS 331 588 RR2H505TF
BS 589 601 RR2B524TF

RD RR2H505TF 588 0 0
GGGCGAGTCAAAGTTGAATTCTCCGGGACCGGGAGGAGTCAGATCTTCTGAGCAGATGGG
AGGGAGCAGCGAGGATAGATGGAAGGGATCGTTAGAGAACATAACGGAGATGGCATCCAA
TCTCGATTCTCTCCAGAAGCTTCTCCTCAAGAAAGCCGTCTTCGTTGAAGAAGACACTTT
CTCTAGAGCCTCTCTCGTCTCCGAACAAGCCCGAACCATCAAGGTGCTTGAGCAAAGGGT
ACAAACACTAGAGAGAGAACTAGATGCTGCTATTACAGCTGCTGCTCATGCTCGGTCTGA
GAAACGCAAAGCTGAGTCCTCTCAAAAAA*CTGCTGAATCACGTGCACTAGAGGTCACAA
AGGAACTCGAAAACACCACGAAGGTTTTCAAGCTGCATATGGAAGAGCTCCGAGGGATGC
AAGAACAGATATCCAAACGCGATAACGAGATCAAGCTCTTGGAAGCTATCATCCAAACGC
TCGGTGGGAAAGAGCGTCTGAGAAAAAGCAGCGGTGTTTAATGATTTGAGTGATTGATTG
ATCATGCGTTTCTTGTAATATTCTGTATATCACAAGATAAAATATTAA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2B524JQ 579 0 0
GG
GGGACCGGGAGGAGTCAGATCTTCTGAGCAGATGGGAGGGAGCAGCGAGGATAGATGGAA
GGGATCGTTAGAGAACATAACGGAGATGGCATCCAATCTCGATTCTCTCCAGAAGCTTCT
CCTCAAGAAAGCCGTCTTCGTTGAAGAAGACACTTTCTCTAGAGCCTCTCTCGTCTCCGA
ACAAGCCCGAACCATCAAGGTGCTTGAGCAAAGGGTACAAACACTAGAGAGAGAACTAGA
TGCTGCTATTACAGCTGCTGCTCATGCTCGGTCTGAGAAACGCAAAGCTGAGTCCTCTCA
AAAAAACTGCTGAATCACGTGCACTAGAGGTCACAAAGGAACTCGAAAACACCACGAAGG
TTTTCAAGCTGCATATGGAAGAGCTCCGAGGGATGCAAGAACAGATATCCAAACGCGATA
ACGAGATCAAGCTCTTGGAAGCTATCATCCAAACGCTCGGTGGGAAAGAGCGTCTGAGAA
AAAGCAGCGGTGTTTAATGATTTGAGTGATTGATTGATCATGCGTTTCTTGTAATATTCT
GTATATCACAAGATAAAATATTAATCAGGCCTTATGT

QA 3 579 3 579
DS 

RD RR2B524TF 579 0 0
GG
GGGACCGGGAGGAGTCAGATCTTCTGAGCAGATGGGAGGGAGCAGCGAGGATAGATGGAA
GGGATCGTTAGAGAACATAACGGAGATGGCATCCAATCTCGATTCTCTCCAGAAGCTTCT
CCTCAAGAAAGCCGTCTTCGTTGAAGAAGACACTTTCTCTAGAGCCTCTCTCGTCTCCGA
ACAAGCCCGAACCATCAAGGTGCTTGAGCAAAGGGTACAAACACTAGAGAGAGAACTAGA
TGCTGCTATTACAGCTGCTGCTCATGCTCGGTCTGAGAAACGCAAAGCTGAGTCCTCTCA
AAAAAACTGCTGAATCACGTGCACTAGAGGTCACAAAGGAACTCGAAAACACCACGAAGG
TTTTCAAGCTGCATATGGAAGAGCTCCGAGGGATGCAAGAACAGATATCCAAACGCGATA
ACGAGATCAAGCTCTTGGAAGCTATCATCCAAACGCTCGGTGGGAAAGAGCGTCTGAGAA
AAAGCAGCGGTGTTTAATGATTTGAGTGATTGATTGATCATGCGTTTCTTGTAATATTCT
GTATATCACAAGATAAAATATTAATCAGGCCTTATGT

QA 3 579 3 579
DS 



AS 1 3

CO CL2958Contig1 1144 3 6 U
GCTTCTAACGACACTTTCCCTACTGTCATGCACATTGCAGCTGCAACCGAGATTAATTCA
AGGCTCATCCCTAGTTTGAAAACTTTGCATTCCACTCTCGACTCTAAGTCCTTCGAGTTC
AAAGATATTGTCAAAATTGGAAGAACTCACACTCAAGATGCTACTCCTTTGACCCTTGGA
CAAGAATTTGGTGGCTATGCTACTCAAGTTAAGTATGGGCTTAATCGAGTCACATGTACT
CTACCCCGCCTCTATCAGCTTGCACAAGGTGGAACTGCTGTTGGGACAGGACTAAACACC
AAGAAAGGGTTTGATGTAAAGATAGCTGCTGCAGTGGCAGAAGAAACAAACCTGCCGTTC
GTCACTGCAGAAAACAAGTTCGAAGCTCTGGCTGCACACGATGCTTGTGTTGAAACCAGT
GGGTCACTTAACACAATCGCCACGTCGTTGATGAAAATTGCCAATGATATCCGTTTTCTT
GGAAGTGGTCCAAGATGTGGTCTTGGTGAACTTGTTCTGCCTGAAAATGAGCCAGGAAGC
AGCATCATGCCTGGGAAGGTAAATCCTACACAGTGTGAGGCCTTGACCATGGTTTGTGCT
CAGGTAATGGGCAACCATGTCGCTGTGACAGTTGGTGGGTCAAATGGTCATTTCGAATTG
AATGTATTTAAGCCGGCGATCGCAAGCTCTCTCTTGCATTCCGTAAGATTGATAGCAGAT
GCTTCAGCTTCTTTTGAGAAAAACTGTGTGAGGGGCATTGAGGCCAACAGAGAAAGGATC
TCAAAGCTATTACACGAGTTTCTTATGCTTGTGACATCATTGAATCCGAAAATCGGATAT
GACAATGCTGCAGCAGTTGCCAAGAAAGCTCACAAAGAAGGATCGACATTGAAGGAAGCG
GCTCTGAAGTTAGGTGTTCTTACCTCTGAAGAGTTTGATACGCTTGTCGTCCCAGAGAAG
ATGATCGGGCCCTCCGATTGATGTTGAGCTAAAAGCTTCATTTCACATGTCTTATTCTTG
TTAAGGTTGTGATGACAAATAAGCAAATCCCGAAACTCAAATTCAGATTTTGCATTGGAA
GGATTCAATTCTTGATGTATCAGTTATTTTTGTTGAATAAAAGAGTAACTATCATGTTTA
GACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2EI28TF U 348
AF RR2GF42TF U 1
AF RR2GF42JQ C 386
BS 1 603 RR2GF42TF
BS 604 604 RR2GF42JQ
BS 605 661 RR2GF42TF
BS 662 662 RR2GF42JQ
BS 663 680 RR2GF42TF
BS 681 1144 RR2GF42JQ

RD RR2EI28TF 244 0 0
G
AACCTGCCGTTCGTCACTGCAGAAAACAAGTTCGAAGCTCTGGCTGCACATGATGCTTGT
GTTGAAACCAGTGGGTCACTTAACACAATCGCCACGTCGTTGATGAAAATTGCCAATGAT
ATACGTTTTCTTGGAAGTGGTCCAAGATGTGGTCTTGGTGAACTTGTTCTGCCTGAAAAT
GAGCCAGGAAGCAGCATCATGCCTGGGAAGG*AAATCCTACACAGTGTGAGG
TTTGACCATGG

QA 2 233 2 233
DS 

RD RR2GF42TF 680 0 0
GCTTCTAACGACACTTTCCCTACTGTCATGCACATTGCAGCTGCAACCGAGATTAATTCA
AGGCTCATCCCTAGTTTGAAAACTTTGCATTCCACTCTCGACTCTAAGTCCTTCGAGTTC
AAAGATATTGTCAAAATTGGAAGAACTCACACTCAAGATGCTACTCCTTTGACCCTTGGA
CAAGAATTTGGTGGCTATGCTACTCAAGTTAAGTATGGGCTTAATCGAGTCACATGTACT
CTACCCCGCCTCTATCAGCTTGCACAAGGTGGAACTGCTGTTGGGACAGGACTAAACACC
AAGAAAGGGTTTGATGTAAAGATAGCTGCTGCAGTGGCAGAAGAAACAAACCTGCCGTTC
GTCACTGCAGAAAACAAGTTCGAAGCTCTGGCTGCACACGATGCTTGTGTTGAAACCAGT
GGGTCACTTAACACAATCGCCACGTCGTTGATGAAAATTGCCAATGATATCCGTTTTCTT
GGAAGTGGTCCAAGATGTGGTCTTGGTGAACTTGTTCTGCCTGAAAATGAGCCAGGAAGC
AGCATCATGCCTGGGAAGGTAAATCCTACACAGTGTGAGGCCTTGACCATGGTTTGTGCT
CAG*TAATGGGCAACCATGTCGCTGTGACAGTTGGTGGGTCAAATGGTCATTTCGAATTG
A*TGTATTTAAGCCGGCGAT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2GF42JQ 759 0 0
CTCTGGCTGCACACGATGCTTGTGT*GAAACCAGTGGGTCACTTAACACAATCGCCACGT
CGTTGATGAAAATTGCCAATGATATCCGTTTTCTTGGAAGTGGTCCAAGATGTGGTCTTG
GTGAACTTGTTCTGCCTGAAAATGAGCCAGGAAGCAGCATCATGCCTGGGAAGGTAAATC
CTACACAGTGTGAGGCCTTGACCATGGTTTGTGCTCAGGTAATGGGCAACCATGTCGCTG
TGACAGTTGGTGGGTCAAATGGTCATTTCGAATTGAATGTATTTAAGCCGGCGATCGCAA
GCTCTCTCTTGCATTCCGTAAGATTGATAGCAGATGCTTCAGCTTCTTTTGAGAAAAACT
GTGTGAGGGGCATTGAGGCCAACAGAGAAAGGATCTCAAAGCTATTACACGAGTTTCTTA
TGCTTGTGACATCATTGAATCCGAAAATCGGATATGACAATGCTGCAGCAGTTGCCAAGA
AAGCTCACAAAGAAGGATCGACATTGAAGGAAGCGGCTCTGAAGTTAGGTGTTCTTACCT
CTGAAGAGTTTGATACGCTTGTCGTCCCAGAGAAGATGATCGGGCCCTCCGATTGATGTT
GAGCTAAAAGCTTCATTTCACATGTCTTATTCTTGTTAAGGTTGTGATGACAAATAAGCA
AATCCCGAAACTCAAATTCAGATTTTGCATTGGAAGGATTCAATTCTTGATGTATCAGTT
ATTTTTGTTGAATAAAAGAGTAACTATCATGTTTAGACC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 3

CO CL2959Contig1 882 3 3 U
GACCGGATACGATAATATAATATTGCTAAACCAAGTTATACGTCCGACAACATCTTACAT
TAATATAACAAAATAAGACAAGACTGGTCAGGACTCAGGACTCAGAATCGGTGAAGCTGG
GACTCTCGAGGTCAGCCATGCTCGCCGAGGCAAACGATTCGAACGAGTCCATTGTTGAAA
GCGAAGACGTTTCTAGGGACTCTGAGTGTTCTTCATCATCATCGTCAATCTCAGGGAGGA
CAATGTGACCCTCTCCCTCTTCTTCTTGTTCTTCACACTCATATTCTTCTTCTTCCGCTT
CTGAAGCTTCATCAGAGCCCATGAGCAGCCTGTTGATTGCTGACTTGGCTGCTTCCGTGA
ACCACTCCGCCTTCGGAAGTGAGCTTTGTGGGTTGATGCCTCTTGAGGAGAATATGTTGA
TAGCTCTATTGATCACCACTGACGCATGGTTCTGCACCACTTTAAATGGATAACCCGCGA
ACCGGGCTATCTCCACTGTGAAGTTCATGTCCAGTATCAACTGTTGCAAACCAGACGGCT
GAAGTGGAGTTGACTCATCCTCGAACGCACTCCAAAACTCCTGCTCGTTTGACAGTCAGA
TTATAACCGTCTCGGTTAGTCTCGCTAGTAGAATCTTTTGCAGTTTCTCTTTCCCAAGCA
GAACATCCCCAGCAATGATGGCCAGCTGTTGCAGCTTAGAGAACAATGCCTGAAACGGTA
GAGAAAGAAGATGCAAGTCGTCTGGCGACTCTGTTAAATAGATGAGCGCATCTAACCGAG
TTAGTCCTTCCCTAGAGTAGATGAAGCTCAATACAAACTGCAAACAGAAGTAGTTTCTGA
GTTTGTCGAACGACTGAGCCATGTGTCGTTTCCATTCTTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G664JQ U 1
AF RR2GX13JQ U 1
AF RR2GX13TF C 157
BS 1 713 RR2G664JQ
BS 714 830 RR2GX13JQ
BS 831 882 RR2GX13TF

RD RR2G664JQ 713 0 0
GACCGGATACGATAATATAATATTGCTAAACCAAGTTATACGTCCGACAACATCTTACAT
TAATATAACAAAATAAGACAAGACTGGTCAGGACTCAGGACTCAGAATCGGTGAAGCTGG
GACTCTCGAGGTCAGCCATGCTCGCCGAGGCAAACGATTCGAACGAGTCCATTGTTGAAA
GCGAAGACGTTTCTAGGGACTCTGAGTGTTCTTCATCATCATCGTCAATCTCAGGGAGGA
CAATGTGACCCTCTCCCTCTTCTTCTTGTTCTTCACACTCATATTCTTCTTCTTCCGCTT
CTGAAGCTTCATCAGAGCCCATGAGCAGCCTGTTGATTGCTGACTTGGCTGCTTCCGTGA
ACCACTCCGCCTTCGGAAGTGAGCTTTGTGGGTTGATGCCTCTTGAGGAGAATATGTTGA
TAGCTCTATTGATCACCACTGACGCATGGTTCTGCACCACTTTAAATGGATAACCCGCGA
ACCGGGCTATCTCCACTGTGAAGTTCATGTCCAGTATCAACTGTTGCAAACCAGACGGCT
GAAGTGGAGTTGACTCATCCTCGAACGCACTCCAAAACTCCTGCTCGTTTGACAGTCAGA
TTATAACCGTCTCGGTTAGTCTCGCTAGTAGAATCTTTTGCAGTTTCTCTTTCCCAAGCA
GAACATCCCCAGCAATGATGGCCAGCTGTTGCAGCTTAGAGAACAATGCCTGA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2GX13JQ 830 0 0
GACCGGATACGATAATATAATATTGCTAAACCAAGTTATACGTCCGACAACATCTTACAT
TAATATAACAAAATAAGACAAGACTGGTCAGGACTCAGGACTCAGAATCGGTGAAGCTGG
GACTCTCGAGGTCAGCCATGCTCGCCGAGGCAAACGATTCGAACGAGTCCATTGTTGAAA
GCGAAGACGTTTCTAGGGACTCTGAGTGTTCTTCATCATCATCGTCAATCTCAGGGAGGA
CAATGTGACCCTCTCCCTCTTCTTCTTGTTCTTCACACTCATATTCTTCTTCTTCCGCTT
CTGAAGCTTCATCAGAGCCCATGAGCAGCCTGTTGATTGCTGACTTGGCTGCTTCCGTGA
ACCACTCCGCCTTCGGAAGTGAGCTTTGTGGGTTGATGCCTCTTGAGGAGAATATGTTGA
TAGCTCTATTGATCACCACTGACGCATGGTTCTGCACCACTTTAAATGGATAACCCGCGA
ACCGGGCTATCTCCACTGTGAAGTTCATGTCCAGTATCAACTGTTGCAAACCAGACGGCT
GAAGTGGAGTTGACTCATCCTCGAACGCACTCCAAAACTCCTGCTCGTTTGACAGTCAGA
TTATAACCGTCTCGGTTAGTCTCGCTAGTAGAATCTTTTGCAGTTTCTCTTTCCCAAGCA
GAACATCCCCAGCAATGATGGCCAGCTGTTGCAGCTTAGAGAACAATGCCTGAAACGGTA
GAGAAAGAAGATGCAAGTCGTCTGGCGACTCTGTTAAATAGATGAGCGCATCTAACCGAG
TTAGTCCTTCCCTAGAGTAGATGAAGCTCAATACAAACTGCAAACAGAAG

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR2GX13TF 726 0 0
ATTCGAACGAGTCCATTGT*GAAAGCGAAGACGTTTCTAGGGACTCTGAGTGTTCTTCAT
CATCATCGTCAATCTCAGGGAGGACAATGTGACCCTCTCCCTCTTCTTCTTGTTCTTCAC
ACTCATATTCTTCTTCTTCCGCTTCTGAAGCTTCATCAGAGCCCATGAGCAGCCTGTTGA
TTGCTGACTTGGCTGCTTCCGTGAACCACTCCGCCTTCGGAAGTGAGCTTTGTGGGTTGA
TGCCTCTTGAGGAGAATATGTTGATAGCTCTATTGATCACCACTGACGCATGGTTCTGCA
CCACTTTAAATGGATAACCCGCGAACCGGGCTATCTCCACTGTGAAGTTCATGTCCAGTA
TCAACTGTTGCAAACCAGACGGCTGAAGTGGAGTTGACTCATCCTCGAACGCACTCCAAA
ACTCCTGCTCGTTTGACAGTCAGATTATAACCGTCTCGGTTAGTCTCGCTAGTAGAATCT
TTTGCAGTTTCTCTTTCCCAAGCAGAACATCCCCAGCAATGATGGCCAGCTGTTGCAGCT
TAGAGAACAATGCCTGAAACGGTAGAGAAGGAAGATGCAAGTCGTCTGGCGACTCTGTTA
AATAGATGAGCGCATCTAACCGAGTTAGTCCTTCCCTAGAGTAGATGAAGCTCAATACAA
ACTGCAAACAGAAGTAGTTTCTGAGTTTGTCGAACGACTGAGCCATGTGTCGTTTCCATT
CTTTCC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 3

CO CL2960Contig1 959 3 5 U
GGGTGGCAGATGTTTGAAACCAGTGGAGGAGAAGGAGAATGGGAGATCTCTACGCTCTGG
ACTTCGACGGAGTTCTCTGCGATAGTTGTGGCGAAAGCTCTCTCTCTGCTGTTAAGGCTG
CGAGAGCGAGGTGGCCTGGTTTGTTCCAAGGAGTTGACTCAGCTTTAGAGGAATGGATCG
TTGACCAGATGCATATTGTGAGACCTGTGGTGGAAACTGGCTATGAAAATCTTCTGCTTG
TTCGTCTACTGTTGGAGACTAAGATGCCCTCTATTCGAAAATCTTCAGTTGCAGAGGGAT
TGACTGTTGATGGGATATTGGAGAGCTGGGGAAAGATTAAGCCGGTTATCATGGAAGCTT
GGGGTGAAGAAGATAAAGAAGCTTTGATCGATTTGTTTGGTAAAGTTAGAGATGATTGGA
TTAACAATGACTTGACTACTTGGATTGGTGCCAATAGATTCTATCCAGGAGTATCAGATG
CATTGAAGTTTGCCAGCTCAAAGATTTACATTGTTACCA**AAACAGGGCCGGTTTGCAG
AAGCGTTGCTACGTGAAATAGCAGGTGTGATCATACCACCAGAAAGGATCTATGGTCTGG
GGTACAGGGCCAAAGGTGGAAGTGCTAAAGTTACTTCAGAACAAACCAGAGCATCAGGGC
TTGAAGCTGCATTTCGTGGAAAGACAGACTCGCAACGCTGAAGAATGTCATCAAAGAGCC
TGAACTAGACAAATGGAATCTATACCTAAGTAACTGGGGCTACAACACGGAGAAAGAAAG
AGCAGAGGCAGAAAGCATTCCAAGAATTCAGGTTATTGAGCTTTCCACGTTTAGCAATAA
GCTTAAATGAGTGGCATACTCATCAGAAAAAAAAAAAAAAAACTTCTCTTTTCATTGTAT
TCTACAAGCCAAACATTGTAGCTAAGAATCAGCTAAAAGAGATAAAACTTTTCAATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED35TF U 1
AF RR2AC92TF U 20
AF RR2ED35JQ C 278
BS 1 560 RR2ED35TF
BS 561 787 RR2AC92TF
BS 788 788 RR2ED35JQ
BS 789 807 RR2AC92TF
BS 808 959 RR2ED35JQ

RD RR2ED35TF 560 0 0
GGGTGGCAGATGTTTGAAACCAGTGGAGGAGAAGGAGAATGGGAGATCTCTACGCTCTGG
ACTTCGACGGAGTTCTCTGCGATAGTTGTGGCGAAAGCTCTCTCTCTGCTGTTAAGGCTG
CGAGAGCGAGGTGGCCTGGTTTGTTCCAAGGAGTTGACTCAGCTTTAGAGGAATGGATCG
TTGACCAGATGCATATTGTGAGACCTGTGGTGGAAACTGGCTATGAAAATCTTCTGCTTG
TTCGTCTACTGTTGGAGACTAAGATGCCCTCTATTCGAAAATCTTCAGTTGCAGAGGGAT
TGACTGTTGATGGGATATTGGAGAGCTGGGGAAAGATTAAGCCGGTTATCATGGAAGCTT
GGGGTGAAGAAGATAAAGAAGCTTTGATCGATTTGTTTGGTAAAGTTAGAGATGATTGGA
TTAACAATGACTTGACTACTTGGATTGGTGCCAATAGATTCTATCCAGGAGTATCAGATG
CATTGAAGTTTGCCAGCTCAAAGATTTACATTGTTACCA**AAACAGGGCCGGTTTGCAG
AAGCGTTGCTACGTGAAATA

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2AC92TF 788 0 0
G
CAGTGGAGGAGAAGGAGAATGGGAGATCTCTACGCTCTGGACTTCGACGTAGTTCTCTGC
GATAGTTGTGGCGAAAGCTCTCTCTCTGCTGTTAAGGCTGCGAGAGCGAGGTGGCCTGGT
TTGTTCCAAGGAGTTGACTCAGCTTTAGAGGAATGGATCGTTGACCAGATGCATATTGTG
AGACCTGTGGTGGAAACTGGCTATGAAAATCTTCTGCTTGTTCGTCTACTGTTGGAGACT
AAGATGCCCTCTATTCGAAAATCTTCAGTTGCAGAGGGATTGACTGTTGATGGGATATTG
GAGAGCTGGGGAAAGATTAAGCCGGTTATCATGGAAGCTTGGGGTGAAGAAGATAAAGAA
GCTTTGATCGATTTGTTTGGTAAAGTTAGAGATGATTGGATTAACAATGACTTGACTACT
TGGATTGGTGCCAATAGATTCTATCCAAGAGTATCAGATGCATTGAAGTTTGCCAGCTCA
AAGATTTACATTGTTACCACGAAACAGGGCCGGTTTGCAGAAGCGTTGCTACGTGAAATA
GCAGGTGTGATCATACCACCAGAAAGGATCTATGGTCTGGGGTACAGGGCCAAAGGTGGA
AGTGCTAAAGTTACTTCAGAACAAACCAGAGCATCAGGGCTTGAAGCTGCATTTCGTGGA
AAGACAGACTCGCAACGCTGAAGAATGTCATCAAAGAGCCTGAACTAGACAAATGGAATC
TATACCTAAGTAACTGGGGCTACAACACGGAGAAAGAAAGAGCAGAG*CAGAAAGCATTC
CAAGAAT

QA 2 788 2 788
DS 

RD RR2ED35JQ 682 0 0
AAAATCTTCAGTTGCAGAGGGATTGACTGTTGATGGGATATTGGAGAGCTGGGGAAAGAT
TAAGCCGGTTATCATGGAAGCTTGGGGTGAAGAAGATAAAGAAGCTTTGATCGATTTGTT
TGGTAAAGTTAGAGATGATTGGATTAACAATGACTTGACTACTTGGATTGGTGCCAATAG
ATTCTATCCAGGAGTATCAGATGCATTGAAGTTTGCCAGCTCAAAGATTTACATTGTTAC
CA**AAACAGGGCCGGTTTGCAGAAGCGTTGCTACGTGAAATAGCAGGTGTGATCATACC
ACCAGAAAGGATCTATGGTCTGGG*TACAGGGCCAAAGGTGGAAGTGCTAAAGTTACTTC
AGAACAAACCAGAGCATCAGGGCTTGAAGCTGCATTTCGTGGAA*GACAGACTCGCAACG
CTGAAGAATGTCATCAAAGAGCCTGAACTAGACAAATGGAATCTATACCTAAGTAACTGG
GGCTACAACACGGAGAAAGAAAGAGCAGAGGCAGAAAGCATTCCAAGAATTCAGGTTATT
GAGCTTTCCACGTTTAGCAATAAGCTTAAATGAGTGGCATACTCATCAGAAAAAAAAAAA
AAAAACTTCTCTTTTCATTGTATTCTACAAGCCAAACATTGTAGCTAAGAATCAGCTAAA
AGAGATAAAACTTTTCAATCTC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 3

CO CL2961Contig1 597 3 2 U
GGACACAACATTCACACAACCTTAACAAAGATATCATATTGATTAGGAAACCTATTCCAA
ACGTTAAATAAAGAAACAAAAACTAAGCAACTGCATTTTAGTTGTGACACCATATAAAAC
TAGTAATGGAGATGATAACGAAGATGGTGATGGAGAGACCAGTGGTGATATACAGCAAAA
GCTCATGTTGCATGTCCCACACGGTCAAGACTTTGCTCTGCGACTTCGGTGCCAATCCAG
CGGTTCACGAGCTTGATGAAGTACCTAGAGGCAGGGAGATTGAGCAGGCGTTGTTGCGTC
TTGGTTGTAGCCCTGCGGTTCCAGCCATTTTTATTGGAGGGGAGTTGGTTGGTGGAGCTA
ACGAGGTCATGAGTCTTCACCTTAACGGTTCATTGATCCCTATGCTTAAGCAGGCTGGTG
CATTGTGGGTTTGACTTATCTACTTTATCTAACTATTTACTTAACACTAAGTTAAGTACG
CAGAATAATGTTTTGTAACACATCTATGATCTTTGACATGGTGTTTTGTAACACGTCAGG
TCAATAATCCGGGTGTTATCTGTTTAGTGTTTTTGATGTTATCCTAATTTAAACGCG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2GA90JQ C 1
AF RR2GA90TF U 1
AF RR2H919TF U 1
BS 1 594 RR2GA90TF
BS 595 597 RR2GA90JQ

RD RR2GA90JQ 597 0 0
GGACACAACATTCACACAACCTTAACAAAGATATCATATTGATTAGGAAACCTATTCCAA
ACGTTAAATAAAGAAACAAAAACTAAGCAACTGCATTTTAGTTGTGACACCATATAAAAC
TAGTAATGGAGATGATAACGAAGATGGTGATGGAGAGACCAGTGGTGATATACAGCAAAA
GCTCATGTTGCATGTCCCACACGGTCAAGACTTTGCTTTGGGACTTCGGTGCCAATCCAG
CGGTTCACGAGCTTGATGAAGTACCTAGAGGCAGGGAGATTGAGCAGGCGTTGTTGCGTC
TTGGTTGTAGCCCTGCGGTTCCAGCCATTTTTATTGGAGGGGAGTTGGTTGGTGGAGCTA
ACGAGGTCATGAGTTTTCACCTTAACGGTTCATTGATCCCTATGCTTAAGCAGGCTGGTG
CATTGTGGGTTTGACTTATTTACTTTATCTAACTATTTACTTAACACTAAGTTAAGTACG
CAGAATAATGTTTTGTAACACATTTATGATTTTTGACATGGTGTTTTGTAACACGTCAGG
TCAATAATCCGGGTGTTATCTGTTTAGTGTTTTTGATGTTATCCTAATTTAAACGCG

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2GA90TF 594 0 0
GGACACAACATTCACACAACCTTAACAAAGATATCATATTGATTAGGAAACCTATTCCAA
ACGTTAAATAAAGAAACAAAAACTAAGCAACTGCATTTTAGTTGTGACACCATATAAAAC
TAGTAATGGAGATGATAACGAAGATGGTGATGGAGAGACCAGTGGTGATATACAGCAAAA
GCTCATGTTGCATGTCCCACACGGTCAAGACTTTGCTCTGCGACTTCGGTGCCAATCCAG
CGGTTCACGAGCTTGATGAAGTACCTAGAGGCAGGGAGATTGAGCAGGCGTTGTTGCGTC
TTGGTTGTAGCCCTGCGGTTCCAGCCATTTTTATTGGAGGGGAGTTGGTTGGTGGAGCTA
ACGAGGTCATGAGTCTTCACCTTAACGGTTCATTGATCCCTATGCTTAAGCAGGCTGGTG
CATTGTGGGTTTGACTTATCTACTTTATCTAACTATTTACTTAACACTAAGTTAAGTACG
CAGAATAATGTTTTGTAACACATCTATGATCTTTGACATGGTGTTTTGTAACACGTCAGG
TCAATAATCCGGGTGTTATCTGTTTAGTGTTTTTGATGTTATCCTAATTTAAAC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2H919TF 582 0 0
GGACACAACATTCACACAACCTTAACAAAGATATCATATTGATTAGGAAACCTATTCCAA
ACGTTAAATAAAGAAACAAAAACTAAGCAACTGCATTTTAGTTGTGACACCATATAAAAC
TAGTAATGGAGATGATAACGAAGATGGTGATGGAGAGACCAGTGGTGATATACAGCAAAA
GCTCATGTTGCATGTCCCACACGGTCAAGACTTTGCTCTGCGACTTCGGTGCCAATCCAG
CGGTTCACGAGCTTGATGAAGTACCTAGAGGCAGGGAGATTGAGCAGGCGTTGTTGCGTC
TTGGTTGTAGCCCTGCGGTTCCAGCCATTTTTATTGGAGGGGAGTTGGTTGGTGGAGCTA
ACGAGGTCATGAGTCTTCACCTTAACGGTTCATTGATCCCTATGCTTAAGCAGGCTGGTG
CATTGTGGGTTTGACTTATCTACTTTATCTAACTAGTTACTTAACACTAAGTTAAGTACG
CAGAATAATGTTTTGTAACACATCTATGATCTTTGACATGGTGTTTTGTAACACGTCAGG
TCAATAATCCGGGTGTTATCTGTTTAGTGTTTTTGATGTTAT

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 3

CO CL2962Contig1 1283 3 9 U
AAAAAAAAAATTTGTGTTATTGCATAATAGCTAAAACTTTGCTGTACACAATGTAAGAAG
AAACATAGCATCTCAAAAGACACAAGGAAAAAAAATGTTATACTCTTTTTTTACATACAA
CACGTTGTGTAATTAGGTAGCGAGTATAGGGTTCCTTTCTTCATCGATATCTATGGCAAG
GACGCGCTCAGGTTCCGACCCGCTTGGTCCTTCAGCATAAAGCGTCGGAAGATACGCCTT
GTATGCCGGCAAATACCTCGACACAAAGTCATTCACCTCATCATCTGACATCCCTGGTTT
CCCAGCCTGTCTCATTGCTATTTCCGCCTGAAAACGCCACCGGTAAACATAACTTGGGTC
CTTGATTTTGATGACCACCCAAGCATTGATGTACTTGTCCCATGCCTCGTAATACGCTTC
CAGGTCCTTATTCACTGTCTCCAGCTGGGGATCCACTGCTTTAACGGCTTCAGCAGGAAG
GGGTTTAAAACCAAGCATCCATCCCTCAAACAGAATCACCTTTAGAGGTCCTTCAACTTC
AGGCCATGTTGTTGCATCACCTCTGTCACCCCTTCCACTATAAGCAGATTTATCGTACCG
AGGAACTTTCATCTTCATGCCGTCCTTGGTCAGTTGAGTGAGGGCTTCTATTGTTTCCAC
AGAGAATGGAAGATCGTGGCTTCCTGCATTCCCTCGATACTCTAGGAGTGCATTTTCTGG
ATTCTCTTCTCTCAATTTAGCCTGGCCTTGTGCAGTCAGGTAAAAATCGTCTATGGATAT
TGTCGCCGACTTCATTTTGGTAGTTTTGAAAAGATAATCAAGTGCAAAGACAAGTGTAGT
CTTGCCACATCCTTGAGGCGCGCTAAATCCAATCACGAGTGGAGGCACATCATCTCCATC
TTTAAACTCGGAGTTATGAAGAGCAATCTGATCTTGGCACCAAACAAAGACGGGAATATA
ATAATGGTAAAGCCTGGCTTTCTGGGGGATGGTGAGCATAAGCTCATTAAGCTGAAAGAG
CCGACAGAGCTGGGAGCCGTATAGTAACCATTTGTCAATGGACTGACCGACATTTTCAGG
AGTAATACCGATCTTGTCAACGAGTGGACCAGAACAAATGAACTCGAAAAGGTCAGACAC
TGAAGAGACATCCACTGTTGTTTTGTTAGGTAACGCCGAGCATTTCTTCAAGGGCGAATC
AAGAACCATCGAATTGTCTTGAATCCACGAGCAACCAGACATTGAGTCACGGCCTTGAAC
CGGAGAGGAGTAAGAAGCGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW06JQ U 1
AF RR2AK89JQ U 11
AF RR2AK89TF C 576
BS 1 122 RR2AW06JQ
BS 123 123 RR2AK89JQ
BS 124 425 RR2AW06JQ
BS 426 426 RR2AK89JQ
BS 427 675 RR2AW06JQ
BS 676 676 RR2AK89JQ
BS 677 732 RR2AW06JQ
BS 733 853 RR2AK89JQ
BS 854 1283 RR2AK89TF

RD RR2AW06JQ 732 0 0
AAAAAAAAAATTTGTGTTATTGCATAATAGCTAAAACTTTGCTGTACACAATGTAAGAAG
AAACATAGCATCTCAAAAGACACAAGGAAAAAAAATGTTATACTCTTTTTTTACATACAA
CATGTTGTGTAATTAGGTAGCGAGTATAGGGTTCCTTTCTTCATCGATATCTATGGCAAG
GACGCGCTCAGGTTCCGACCCGCTTGGTCCTTCAGCATAAAGCGTCGGAAGATACGCCTT
GTATGCCGGCAAATACCTCGACACAAAGTCATTCACCTCATCATCTGACATCCCTGGTTT
CCCAGCCTGTCTCATTGCTATTTCCGCCTGAAAACGCCACCGGTAAACATAACTTGGGTC
CTTGATTTTGATGACCACCCAAGCATTGATGTACTTGTCCCATGCCTCGTAATACGCTTC
CAGGTTCTTATTCACTGTCTCCAGCTGGGGATCCACTGCTTTAACGGCTTCAGCAGGAAG
GGGTTTAAAACCAAGCATCCATCCCTCAAACAGAATCACCTTTAGAGGTCCTTCAACTTC
AGGCCATGTTGTTGCATCACCTCTGTCACCCCTTCCACTATAAGCAGATTTATCGTACCG
AGGAACTTTCATCTTCATGCCGTCCTTGGTCAGTTGAGTGAGGGCTTCTATTGTTTCCAC
AGAGAATGGAAGATCATGGCTTCCTGCATTCCCTCGATACTCTAGGAGTGCATTTTCTGG
ATTCTCTTCTCT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2AK89JQ 843 0 0
TTTGTGTTATTGCATAATAGCTAAAACTTTGCTGTACACAATGTAAGAAGAAACATAGCA
TCTCAAAAGACACAAGGAAGAGAAATGTTATACTCTTTTTT*ACATACAACACGTTGTGT
AATTAGGTAGCGAGTATAGGGTTCCTTTCTTCATCGATATCTATGGCAAGGACGCGCTCA
GGTTCCGACCCGCTTGGTCCTTCAGCATAAAGCGTCGGAAGATACGCCTTGTATGCCGGC
AAATACCTCGACACAAAGTCATTCACCTCATCATCTGACATCCCTGGTTTCCCAGCCTGT
CTCATTGCTATTTCCGCCTGAAGACGCCACCGGTAAACATAACTTGGGTCCTTGATTTTG
ATGACCACCCAAGCATTGATGTACTTGTCCCATGCCTCGTAATACGCTTCCAGGTCCTTA
TTCACTGTCTCCAGCTGGGGATCCACTGCTTTAACGGCTTCAGCAGGAAGGGGTTTAAAA
CCAAGCATCCATCCCTCAAACAGAATCACCTTTAGAGGTCCTTCAACTTCAGGCCATGTT
GTTGCATCACCTCTGTCACCCCTTCCACTATAAGCAGATTTATCGTACCGAGGAACTTTC
ATCTTCATGCCGTCCTTGGTCAGTTGAGTGAGGGCTTCTATTGTTTCCACAGAGAATGGA
AGATCGTGGCTTCCTGCATTCCCTCGATACTCTAGGAGTGCATTTTCTGGATTCTCTTCT
CTCAATTTAGCCTGGCCTTGTGCAGTCAGGTAAAAATCGTCTATGGATATTGTCGCCGAC
TTCATTTTGGTAGTTTTGAAAAGATAATCAAGTGCAAAGACAAGTGTAGTCTTGCCACAT
CCT

QA 1 843 1 843
DS 

RD RR2AK89TF 708 0 0
CACTATAAGCAGATTTATCGTACCGAGGAACTTTCATCTTCATGCCGTCCTTGGTCAGTT
GAGTGAGGGCTTCTATTGTTTCCACAGAGAATGGAAGATCGTGGCTTCCTGCATTCCCTC
GATACTCTAGGAGTGCATTTTCTGGATTCTCTTCTCTCAATTTAGCCTGGCCTTGTGCAG
TCAGGTAAAAATCGTCTATGGATATTGTCGCCGACTTCATTTTGGTAGTTTTGAAAAGAT
AATCAAGTGCAAAGACAAGTGTAGTCTTGCCACATCCTTGAGGCGCGCTAAATCCAATCA
CGAGTGGAGGCACATCATCTCCATCTTTAAACTCGGAGTTATGAAGAGCAATCTGATCTT
GGCACCAAACAAAGACGGGAATATAATAATGGTAAAGCCTGGCTTTCTGGGGGATGGTGA
GCATAAGCTCATTAAGCTGAAAGAGCCGACAGAGCTGGGAGCCGTATAGTAACCATTTGT
CAATGGACTGACCGACATTTTCAGGAGTAATACCGATCTTGTCAACGAGTGGACCAGAAC
AAATGAACTCGAAAAGGTCAGACACTGAAGAGACATCCACTGTTGTTTTGTTAGGTAACG
CCGAGCATTTCTTCAAGGGCGAATCAAGAACCATCGAATTGTCTTGAATCCACGAGCAAC
CAGACATTGAGTCACGGCCTTGAACCGGAGAGGAGTAAGAAGCGGTCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 3

CO CL2963Contig1 721 3 21 U
CTAAACCAAAGCCAAACTTGTCTAGATAATACAAATACCATTACAACACTGGTTTGTGGA
ACTATTCCACAGTCTATCTTGTGTTGTAACTCAAGAAAACTAATGTAAAAGACATGTTTG
AGTTCTCATAAGAAAAGCACAAGTCCTCCTAGATATAAACAATACAACAAAAGCATTCTT
TGGAACATTTCATTTGTCATCATCTTTGCCTTGTCCATCTGCTCCATCTTGCTTTCCCCC
TCTAAGCCCCACGTTTGCAGGGGTTCCTCCGAAAGAGGTTTCTGGTGGTTGTTGCATCTG
ATGCTGCATCCCGTTGTTGATACCCATTGGTCTCATCCCCATGTGTCCTTGCATAGCTTG
TTGATGCATATGCTGCTGTTGAGGATCCTGAAGATGGTGTGGGCTACCAAACTGCAAAGG
ACCTCTTGGAGGGAAAATACCACCGGGTGGTGCTTGTTGACCCATCCCCGAAGCTTGTTG
GTGCTGTTGCATAAAGTAGCTCGGCGGTTGAATCGCAGGATGATGCGGTGGTGCCGCCAT
CTGGGAAGCCATAGCTGGTGGTGGTGTAGCTCCAGCTGTAGATGGAGGAGGCTGAGCATC
GGCAATAGCAGCGAGGTACATTAAGTTCTTCTGGAGAAGAGCTTGGTACTGTGCACACTC
TGCAAGTTTTCCAAGATTCTGATTTTCCATGATTGCCATTATCAGCTTCTTATTCTCCTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2DP49JQ U 1
AF RR2H809JQ U 20
AF RR2H809TF C 20
BS 1 24 RR2DP49JQ
BS 25 25 RR2H809JQ
BS 26 105 RR2DP49JQ
BS 106 106 RR2H809JQ
BS 107 110 RR2DP49JQ
BS 111 111 RR2H809JQ
BS 112 131 RR2DP49JQ
BS 132 132 RR2H809JQ
BS 133 151 RR2DP49JQ
BS 152 152 RR2H809JQ
BS 153 196 RR2DP49JQ
BS 197 197 RR2H809JQ
BS 198 274 RR2DP49JQ
BS 275 275 RR2H809JQ
BS 276 329 RR2DP49JQ
BS 330 330 RR2H809JQ
BS 331 392 RR2DP49JQ
BS 393 394 RR2H809JQ
BS 395 510 RR2DP49JQ
BS 511 594 RR2H809JQ
BS 595 721 RR2H809TF

RD RR2DP49JQ 513 0 0
CTAAACCAAAGCCAAACTTGTCTAAATAATACAAATACCATTACAACACTGGTTTGTGGA
ACTATTCCACAGTCTATCTTGTGTTGTAACTCAAGAAAACTAATGCAAAAAACATGTTTG
AGTTCTCATAAAAAAAGCACAAGTCCTCCTAAATATAAACAATACAACAAAAGCATTCTT
TGGAACATTTCATTTGCCATCATCTTTGCCTTGTCCATCTGCTCCATCTTGCTTTCCCCC
TCTAAGCCCCACGTTTGCAGGGGTTCCTCCGAAAAAGGTTTCTGGTGGTTGTTGCATCTG
ATGCTGCATCCCGTTGTTGATACCCATTGTTCTCATCCCCATGTGTCCTTGCATAGCTTG
TTGATGCATATGCTGCTGTTGAGGATCCTGAACCTGGTGTGGGCTACCAAACTGCAAAGG
ACCTCTTGGAGGGAAAATACCACCGGGTGGTGCTTGTTGACCCATCCCCGAAGCTTGTTG
GTGCTGTTGCATAAAGTAGCTCGGCGGTTG
CAT

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2H809JQ 575 0 0
GTCTAGATAATACAAATACCATTACAACACTGGTTTGTGGAACTATTCCACAGTCTATCT
TGTGTTGTAACTCAAGAAAACTAATGTAAAAGACATGTTTGAGTTCTCATAAGAAAAGCA
CAAGTCCTCCTAGATATAAACAATACAACAAAAGCATTCTTTGGAACATTTCATTTGTCA
TCATCTTTGCCTTGTCCATCTGCTCCATCTTGCTTTCCCCCTCTAAGCCCCACGTTTGCA
GGGGTTCCTCCGAAAGAGGTTTCTGGTGGTTGTTGCATCTGATGCTGCATCCCGTTGTTG
ATACCCATTGGTCTCATCCCCATGTGTCCTTGCATAGCTTGTTGATGCATATGCTGCTGT
TGAGGATCCTGAAGATGGTGTGGGCTACCAAACTGCAAAGGACCTCTTGGAGGGAAAATA
CCACCGGGTGGTGCTTGTTGACCCATCCCCGAAGCTTGTTGGTGCTGTTGCATAAAGTAG
CTCGGCGGTTGAATCGCAGGATGATGCGGTGGTGCCGCCATCTGGGAAGCCATAGCTGGT
GGTGGTGTAGCTCCAGCTGTAGATGGAGGAGGCTG

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2H809TF 702 0 0
GTCTAGATAATACAAATACCATTACAACACTGGTTTGTGGAACTATTCCACAGTCTATCT
TGTGTTGTAACTCAAGAAAACTAATGTAAAAGACATGTTTGAGTTCTCATAAGAAAAGCA
CAAGTCCTCCTAGATATAAACAATACAACAAAAGCATTCTTTGGAACATTTCATTTGTCA
TCATCTTTGCCTTGTCCATCTGCTCCATCTTGCTTTCCCCCTCTAAGCCCCACGTTTGCA
GGGGTTCCTCCGAGAGAGGTTTCTGGTGGTTGTTGCATCTGATGCTGCATCCCGTTGTTG
ATACCCATTGGTCTCATCCCCATGTGTCCTTGCATAGCTTGTTGATGCATATGCTGCTGT
TGAGGATCCTGAAGATGGTGTGGGCTACCAAACTGCAAAGGACCTCTTGGAGGGAAGATA
CCACCGGGTGGTGCTTGTTGACCCATCCCCGAAGCTTGTTGGTGCTGTTGCATAAAGTAG
CTCGGCGGTTGAATCGCAGGATGATGCGGTGGTGCCGCCATCTGGGAAGCCATAGCTGGT
GGTGGTGTAGCTCCAGCTGTAGATGGAGGAGGCTGAGCATCGGCAATAGCAGCGAGGTAC
ATTAAGTTCTTCTGGAGAAGAGCTTGGTACTGTGCACACTCTGCAAGTTTTCCAAGATTC
TGATTTTCCATGATTGCCATTATCAGCTTCTTATTCTCCTCC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 3

CO CL2964Contig1 523 3 6 U
GGAGCCGCATTTGGAGAGTGAATTAGTCAGTTGCGTCCTCCTCCGTCCGTCTAGGGTTTC
ACCAAATCGTCTTCGTTGCATTCGCGCAAACAATCATGGTTCTCCAAAACGACATCGATC
TGCTGAATCCACCTGCTGAGCTGGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTTCAAT
CTCCTAACTCCTTCTTCATGGACGTCAAGTGCCAGGGGTGCTTCAACATAACCACTGTGT
TCAGTCACTCTCAGACAGTTGTAGTGTGTGGAAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCCA
CCGGTGGTAAAGCTAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAAAAGTGAAGAGTATGAG
AAGCTTCCACCCAAAAGTTATCGTTTTTTCACTAATGTTAATGTGAGAGAACAGAGATGA
GATCTTTTGTTCAGTTTGTTTTTTCTTGCTTAGTTGTTGGTATGAACTTATGTTGCTTAT
GAAAGAAGATTTGTTAAGGTATCATCAAACTACTAGTTGAGTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EB88JQ C 1
AF RR2F649TF U 1
AF RR2EB88TF U 1
BS 1 34 RR2F649TF
BS 35 35 RR2EB88TF
BS 36 83 RR2F649TF
BS 84 84 RR2EB88TF
BS 85 501 RR2F649TF
BS 502 523 RR2EB88TF

RD RR2EB88JQ 523 0 0
GGAGCCGCATTTGGAGAGTGAATTAGTCAGTTGCGTCCTCCTCCGTCCGTCTAGGGTTTC
ACCAAATCGTCTTCGTTGCATTCGCGCAAACAATCATGGTTCTCCAAAACGACATCGATC
TGCTGAATCCACCTGCTGAGCTGGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTTCAAT
CTCCTAACTCCTTCTTCATGGACGTCAAGTGCCAGGGGTGCTTCAACATAACCACTGTGT
TCAGTCACTCTCAGACAGTTGTAGTGTGTGGAAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCCA
CCGGTGGTAAAGCTAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAAAAGTGAAGAGTATGAG
AAGCTTCCACCCAAAAGTTATCGTTTTTTCACTAATGTTAATGTGAGAGAACAGAGATGA
GATCTTTTGTTCAGTTTGTTTTTTCTTGCTTAGTTGTTGGTATGAACTTATGTTGCTTAT
GAAAGAAGATTTGTTAAGGTATCATCAAACTACTAGTTGAGTT

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2F649TF 501 0 0
GGAGCCGCATTTGGAGAGTGAATTAGTCAGTTGCATCCTCCTCCGTCCGTCTAGGGTTTC
ACCAAATCGTCTTCGTTGCATTCTCGCAAACAATCATGGTTCTCCAAAACGACATCGATC
TGCTGAATCCACCTGCTGAGCTGGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTTCAAT
CTCCTAACTCCTTCTTCATGGACGTCAAGTGCCAGGGGTGCTTCAACATAACCACTGTGT
TCAGTCACTCTCAGACAGTTGTAGTGTGTGGAAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCCA
CCGGTGGTAAAGCTAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAAAAGTGAAGAGTATGAG
AAGCTTCCACCCAAAAGTTATCGTTTTTTCACTAATGTTAATGTGAGAGAACAGAGATGA
GATCTTTTGTTCAGTTTGTTTTTTCTTGCTTAGTTGTTGGTATGAACTTATGTTGCTTAT
GAAAGAAGATTTGTTAAGGTA

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR2EB88TF 523 0 0
GGAGCCGCATTTGGAGAGTGAATTAGTCAGTTGCGTCCTCCTCCGTCCGTCTAGGGTTTC
ACCAAATCGTCTTCGTTGCATTCGCGCAAACAATCATGGTTCTCCAAAACGACATCGATC
TGCTGAATCCACCTGCTGAGCTGGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTTCAAT
CTCCTAACTCCTTCTTCATGGACGTCAAGTGCCAGGGGTGCTTCAACATAACCACTGTGT
TCAGTCACTCTCAGACAGTTGTAGTGTGTGGAAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCCA
CCGGTGGTAAAGCTAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAAAAGTGAAGAGTATGAG
AAGCTTCCACCCAAAAGTTATCGTTTTTTCACTAATGTTAATGTGAGAGAACAGAGATGA
GATCTTTTGTTCAGTTTGTTTTTTCTTGCTTAGTTGTTGGTATGAACTTATGTTGCTTAT
GAAAGAAGATTTGTTAAGGTATCATCAAACTACTAGTTGAGTT

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 3

CO CL2965Contig1 580 3 2 U
GGACGTCAAAACAAAATCTCTCTTACTATCCTTAAGATCCTCCAACGATGACAACCATAG
CTGCAACCGGTCTCAACGTCGCAACTCCAAGAGCGTTCGTTCAACCGGTAGTGGCTCGTC
TATCGGCCCCGGTCCGTCTGAACTACCCTTGGAAATTCAGTTCGATGAAGAGGATGGTTA
TGTCTGTTAAGGCGACATCGGAGGGAGGCATATCGGATAAGGTGGAGAAGAGTATTCAGG
AAGCGAAGGAGACTTGCGCCGATGATCCAGTGAGCGGCGAGTGTGTGGCGGCGTGGGACG
AGGTGGAGGAGCTGAGTGCGGCGGCTAGTCACGCTAGGGACAAGAAGAAGGCTGGTGGAT
CCGATCCTTTGGAGGAATATTGCAGTGATAATCCTGAGACCGATGAGTGTCGTACTTATG
ATAATTAAAACATGTTTTGAAAATTTAGGTACTTGTGTCGGATCATCTTTCTTCTTGTTG
CTGGTGTTGTCGTCGTGTATGGTTTGGTTTTGGTTTGTTTTGGTGCTTGTAATGTGATGA
ATAGTACAAGTGCAATACATATAAGATGTTTCATAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RR2F339TF U 1
AF RR2CC17JQ C 8
AF RR2CC17TF U 8
BS 1 579 RR2F339TF
BS 580 580 RR2CC17JQ

RD RR2F339TF 579 0 0
GGACGTCAAAACAAAATCTCTCTTACTATCCTTAAGATCCTCCAACGATGACAACCATAG
CTGCAACCGGTCTCAACGTCGCAACTCCAAGAGCGTTCGTTCAACCGGTAGTGGCTCGTC
TATCGGCCCCGGTCCGTCTGAACTACCCTTGGAAATTCAGTTCGATGAAGAGGATGGTTA
TGTCTGTTAAGGCGACATCGGAGGGAGGCATATCGGATAAGGTGGAGAAGAGTATTCAGG
AAGCGAAGGAGACTTGCGCCGATGATCCAGTGAGCGGCGAGTGTGTGGCGGCGTGGGACG
AGGTGGAGGAGCTGAGTGCGGCGGCTAGTCACGCTAGGGACAAGAAGAAGGCTGGTGGAT
CCGATCCTTTGGAGGAATATTGCAGTGATAATCCTGAGACCGATGAGTGTCGTACTTATG
ATAATTAAAACATGTTTTGAAAATTTAGGTACTTGTGTCGGATCATCTTTCTTCTTGTTG
CTGGTGTTGTCGTCGTGTATGGTTTGGTTTTGGTTTGTTTTGGTGCTTGTAATGTGATGA
ATAGTACAAGTGCAATACATATAAGATGTTTCATAGATC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2CC17JQ 573 0 0
GG
AACAAAATCTCTCTTACTATCCTTAAGATCCTCCAACGATGACAACCATAGCTGCAACCG
GTCTCAACGTCGCAACTCCAAGAGCGTTCGTTCAACCGGTAGTGGCTCGTCTATCGGCCC
CGGTCCGTCTGAACTACCCTTGGAAATTCAGTTCGATGAAGAGGATGGTTATGTCTGTTA
AGGCGACATCGGAGGGAGGCATATCGGATAAGGTGGAGAAGAGTATTCAGGAAGCGAAGG
AGACTTGCGCCGATGATCCAGTGAGCGGCGAGTGTGTGGCGGCGTGGGACGAGGTGGAGG
AGCTGAGTGCGGCGGCTAGTCACGCTAGGGACAAGAAGAAGGCTGGTGGATCCGATCCTT
TGGAGGAATATTGCAGTGATAATCCTGAGACCGATGAGTGTCGTACTTATGATAATTAAA
ACATGTTTTGAAAATTTAGGTACTTGTGTCGGATCATCTTTCTTCTTGTTGCTGGTGTTG
TCGTCGTGTATGGTTTGGTTTTGGTTTGTTTTGGTGCTTGTAATGTGATGAATAGTACAA
GTGCAATACATATAAGATGTTTCATAGATCC

QA 3 573 3 573
DS 

RD RR2CC17TF 573 0 0
GG
AACAAAATCTCTCTTACTATCCTTAAGATCCTCCAACGATGACAACCATAGCTGCAACCG
GTCTCAACGTCGCAACTCCAAGAGCGTTCGTTCAACCGGTAGTGGCTCGTCTATCGGCCC
CGGTCCGTCTGAACTACCCTTGGAAATTCAGTTCGATGAAGAGGATGGTTATGTCTGTTA
AGGCGACATCGGAGGGAGGCATATCGGATAAGGTGGAGAAGAGTATTCAGGAAGCGAAGG
AGACTTGCGCCGATGATCCAGTGAGCGGCGAGTGTGTGGCGGCGTGGGACGAGGTGGAGG
AGCTGAGTGCGGCGGCTAGTCACGCTAGGGACAAGAAGAAGGCTGGTGGATCCGATCCTT
TGGAGGAATATTGCAGTGATAATCCTGAGACCGATGAGTGTCGTACTTATGATAATTAAA
ACATGTTTTGAAAATTTAGGTACTTGTGTCGGATCATCTTTCTTCTTGTTGCTGGTGTTG
TCGTCGTGTATGGTTTGGTTTTGGTTTGTTTTGGTGCTTGTAATGTGATGAATAGTACAA
GTGCAATACATATAAGATGTTTCATAGATC
C

QA 3 572 3 572
DS 



AS 1 3

CO CL2966Contig1 974 3 6 U
AATGAAAATCTCATATTATTCATTCAACAAATTTTACACAACAATATAATCAAGAACACA
ATTATTCCACATAGACTTTTTTGTTTCTGTCCTTTTCATAATTAAGATTGAGGGCATAAT
AATACAAACAGATAAATTAAAAGATAATTAGCAAATTAAATGCTTAGTCTTGCTTGCGAG
AATCGGCCTTCTCTTTATTCTTTTTAGCACAGTATTCAAATAAACTTGCATCAAAAACAC
CTCTCACAGCTTCTTTAAACACGAACCCTTCTTCATCCCTAGCAAGTAGATAGACTAGTA
GCCATTCAACTTTATTCGCAAGCCATCCAAAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGG
TTAGGTTCCAAAGCTCTTTTAATGTTATCTTATTTGGAGCTGTTAGCGCATATTTGCTAA
AGATGTTCTCGAGATTAACCGGGACATACCTTCCTTCAGTATCATAGGTGCTTGAATCAC
TCCCATGTTTGGCTTTGTGTATGTTATCGATGTAAACAGGTAATAGTGGGGATGGCAACC
AACTCGGAAGTGTAACGTAGCTAAACGCTAAGTTTATGATTATGCTCCAAAAAACAGAAG
AGATTGGGTTGAAACCAAGGCCACGGAATCCTGCATAAGTCTCCTAAGGATAGACGATTC
CATCGCCGTTTTGGTCGAAGAAAGCACAATGTTGTTGCATAACACTCATTCCTCTGCTGT
CATGACCTTCTGATCCATTCGGATGCTCTGTATCTGGAGCTACTAGTGCTCTTGCCAAAT
ATGGTTTAGGTAATGTTTCCTCCAAGTCTTTCCTTACTTTCCGCTGACCGGTCACTGGAG
CAAGTGGCGCCGTAGTGGCAAAAGCCTCTGACTCTTCTCCCATACTCTCTCTTTATCCTT
TGGATCTCCTTCTCTTTCTCTTCTGTAAGTGTTAATAATTGAAGATGCTCTCAGTTTCAA
CTTTTGCAGAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA37JQ U 1
AF RR2DO47JQ U 1
AF RR2DO47TF C 310
BS 1 37 RR2DO47JQ
BS 38 38 RR2GA37JQ
BS 39 257 RR2DO47JQ
BS 258 258 RR2GA37JQ
BS 259 737 RR2DO47JQ
BS 738 974 RR2DO47TF

RD RR2GA37JQ 420 0 0
AATGAAAATCTCATATTATTCATTCAACAAATTTTACACAACAATATAATCAAGAACACA
ATTATTCCACATAGACTTTTTTGTTTCTGTCCTTTTCATAATTAAGATTGAGGGCATAAT
AATACAAACAGATAAATTAAAAGATAATTAGCAAATTAAATGCTTAGTCTTGCTTGCGAG
AATCGGCCTTCTCTTTATTCTTTTTAGCACAGTATTCAAATAAACTTGCATCAAAAACAC
CTCTCACAGCTTCTTTAAACACGAACCCTTCTTCATCCTTAGCAAGTAGATAGACTAGTA
GCCATTCAACTTTATTCCCAAGCCATCCAAAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGG
TTAGGTTCCAAAGCTCTTTTAATGTTATCTTATTTGGAGCTGTTAGCGCATATTTGCTAA

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR2DO47JQ 737 0 0
AATGAAAATCTCATATTATTCATTCAACAAATTTTACGCAACAATATAATCAAGAACACA
ATTATTCCACATAGACTTTTTTGTTTCTGTCCTTTTCATAATTAAGATTGAGGGCATAAT
AATACAAACAGATAAATTAAAAGATAATTAGCAAATTAAATGCTTAGTCTTGCTTGCGAG
AATCGGCCTTCTCTTTATTCTTTTTAGCACAGTATTCAAATAAACTTGCATCAAAAACAC
CTCTCACAGCTTCTTTAGACACGAACCCTTCTTCATCCCTAGCAAGTAGATAGACTAGTA
GCCATTCAACTTTATTCGCAAGCCATCCAAAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGG
TTAGGTTCCAAAGCTCTTTTAATGTTATCTTATTTGGAGCTGTTAGCGCATATTTGCTAA
AGATGTTCTCGAGATTAACCGGGACATACCTTCCTTCAGTATCATAGGTGCTTGAATCAC
TCCCATGTTTGGCTTTGTGTATGTTATCGATGTAAACAGGTAATAGTGGGGATGGCAACC
AACTCGGAAGTGTAACGTAGCTAAACGCTAAGTTTATGATTATGCTCCAAAAAACAGAAG
AGATTGGGTTGAAACCAAGGCCACGGAATCCTGCATAAGTCTCCTAAGGATAGACGATTC
CATCGCCGTTTTGGTCGAAGAAAGCACAATGTTGTTGCATAACACTCATTCCTCTGCTGT
CATGACCTTCTGATCCA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2DO47TF 665 0 0
CTTTATTCGCAAGCCATCCAAAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGTTAGGTTCC
AAAGCTCTTTTAATGTTATCTTATTTGGAGCTGTTAGCGCATATTTGCTAAAGATGTTCT
CGAGATTAACCGGGACATACCTTCCTTCAGTATCATAGGTGCTTGAATCACTCCCATGTT
TGGCTTTGTGTATGTTATCGATGTAAACAGGTAATAGTGGGGATGGCAACCAACTCGGAA
GTGTAACGTAGCTAAACGCTAAGTTTATGATTATGCTCCAAAAAACAGAAGAGATTGGGT
TGAAACCAAGGCCACGGAATCCTGCATAAGTCTCCTAAGGATAGACGATTCCATCGCCGT
TTTGGTCGAAGAAAGCACAATGTTGTTGCATAACACTCATTCCTCTGCTGTCATGACCTT
CTGATCCATTCGGATGCTCTGTATCTGGAGCTACTAGTGCTCTTGCCAAATATGGTTTAG
GTAATGTTTCCTCCAAGTCTTTCCTTACTTTCCGCTGACCGGTCACTGGAGCAAGTGGCG
CCGTAGTGGCAAAAGCCTCTGACTCTTCTCCCATACTCTCTCTTTATCCTTTGGATCTCC
TTCTCTTTCTCTTCTGTAAGTGTTAATAATTGAAGATGCTCTCAGTTTCAACTTTTGCAG
AAAAA

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 3

CO CL2967Contig1 573 3 3 U
GGAAAAGAACAAAAAAAAAATTAATGGCGAGACTCTTCGTCTCTATCCCTATGCAAACGG
CAGCCTTGTCGGCGCTTTCTCAGCCTCTATTTTCGCCGCCGGTGAGCTATTTCGCCGATG
TAGGGGTGGGAGGATTATGTTTTTCCAGAAGAATCAGAGACCGTTCCGTGGTGGTGCGAG
CAGGGCCCAGTACGAGTAGCTACTTGCTCGCGTTCGCCATTCCTGCGACTCTTATCGCCG
CTACTGTTTTCACTTCGGCCAAGATTGCTGATAAGCTTGATGATGACTTCCTCGAAGATA
TTGCGTTGAACCAGGCGATAAAAGCAGCAGAAGATGGAGAGAATGGCCAAGGTGAAATCT
CGATGGACGATTTGATTAAAGAGCCTGTGCTTCAACGAACCCGTAAACGTCCTAAGCGTG
AAGTTTAAGCAGAACACACACACGCACACACACACACTTAAACTTCTTCTTAAGGAGTTT
CATTCAATGATCCAATGACTGTAGTAATGTCTTGTGTTTGTACAAGCATGTAATAACATT
TATAGTTGTAGTTACTGATAAGTTTATTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR2AB27JQ C 1
AF RR2AB27TF U 1
AF RR2FM66TF U 7
BS 1 8 RR2AB27JQ
BS 9 568 RR2AB27TF
BS 569 573 RR2FM66TF

RD RR2AB27JQ 568 0 0
GGAAAAGAACAAAAAAAAAATTAATGGCGAGACTCTTCGTCTCTATCCCTATGCAAACGG
CAGCCTTGTCGGCGCTTTCTCAGCCTCTATTTTCGCCGCCGGTGAGCTATTTCGCCGATG
TAGGGGTGGGAGGATTATGTTTTTCCAGAAGAATCAGAGACCGTTCCGTGGTGGTGCGAG
CAGGGCCCAGTACGAGTAGCTACTTGCTCGCGTTCGCCATTCCTGCGACTCTTATCGCCG
CTACTGTTTTCACTTCGGCCAAGATTGCTGATAAGCTTGATGATGACTTCCTCGAAGATA
TTGCGTTGAACCAGGCGATAAAAGCAGCAGAAGATGGAGAGAATGGCCAAGGTGAAATCT
CGATGGACGATTTGATTAAAGAGCCTGTGCTTCAACGAACCCGTAAACGTCCTAAGCGTG
AAGTTTAAGCAGAACACACACACGCACACACACACACTTAAACTTCTTCTTAAGGAGTTT
CATTCAATGATCCAATGACTGTAGTAATGTCTTGTGTTTGTACAAGCATGTAATAACATT
TATAGTTGTAGTTACTGATAAGTTTATT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2AB27TF 568 0 0
GGAAAAGA
ACAAAAAAAAAATTAATGGCGAGACTCTTCGTCTCTATCCCTATGCAAACGGCAGCCTTG
TCGGCGCTTTCTCAGCCTCTATTTTCGCCGCCGGTGAGCTATTTCGCCGATGTAGGGGTG
GGAGGATTATGTTTTTCCAGAAGAATCAGAGACCGTTCCGTGGTGGTGCGAGCAGGGCCC
AGTACGAGTAGCTACTTGCTCGCGTTCGCCATTCCTGCGACTCTTATCGCCGCTACTGTT
TTCACTTCGGCCAAGATTGCTGATAAGCTTGATGATGACTTCCTCGAAGATATTGCGTTG
AACCAGGCGATAAAAGCAGCAGAAGATGGAGAGAATGGCCAAGGTGAAATCTCGATGGAC
GATTTGATTAAAGAGCCTGTGCTTCAACGAACCCGTAAACGTCCTAAGCGTGAAGTTTAA
GCAGAACACACACACGCACACACACACACTTAAACTTCTTCTTAAGGAGTTTCATTCAAT
GATCCAATGACTGTAGTAATGTCTTGTGTTTGTACAAGCATGTAATAACATTTATAGTTG
TAGTTACTGATAAGTTTATT

QA 9 568 9 568
DS 

RD RR2FM66TF 567 0 0
GG
ACAAAAAAAAAATTAATGGCGAGACTCTTCGTCTCTATCCCTATGCAAACGGCAGCCTTG
TCGGCGCTTTCTCAGCCTCTATTTTCGCCGCCGGTGAGTTATTTCGCCGATGTAGGGGTG
GGAGGATTATGTTTTTCCAGAAGAATCAGAGACCGTTCCGTGGTGGTGCGAGCAGGGCCC
AGTACGAGTAGCTACTTGCTCGCGTTCGCCATTCCTGCGACTCTTATCGCCGCTACTGTT
TTCACTTCGGCTAAGATTTCTGATAAGCTTGATGATGACTTCCTCGAAGATATTGCGTTG
AACCAGGCGATAAAAGCAGCAGAAGATGGAGAGAATGGCCAAGGTGAAATCTCGATGGAC
GATTTGATTAAAGAGCCTGTGCTTCAACGAACCCGTAAACGTCCTAAGCGTGAAGTTTAA
GCAGAACACACACAC**ACACACACACACTTAAACTTCTTCTTAAGGAGTTTCATTCAAT
GATCCAATGACTGTAGTAATGTCTTGTATTTGTACAAGCATGTAATAACATTTATAGTTG
TAGTTACTGATAAGTTTATTAAAAA

QA 3 567 3 567
DS 



AS 1 3

CO CL2968Contig1 808 3 6 U
GAAGAAAATGTATGACCTCATTGATGAATACAAGCTCAACGGCCAGTTCAGGTGGATCTC
ATCCCAGATGAACAGAGTTAGGAACGGTGAGCTCTACAGGTACATCTGTGACACCAAGGG
TGCTTTTGTGCAGCCAGCACTGTATGAAGCCTTTGGGTTGACTGTTGTGGAGGCCATGAC
CTGTGGTTTACCAACGTTCGCCACATGCAAAGGTGGTCCAGCTGAGATCATTGTGCACGG
CAAATCGGGTTTCCACATTGACCCTTACCACGGTGATCAGGCGGCTGATACTCTTGCTGA
TTTCTTCACCAAGTGTAAGGAAGATCCATCTCACTGGGACCAGATCTCAAAGGGAGGGCT
TCAGAGGATTGAGGAGAAATACACATGGCAGATTTACTCACAGAGGCTCCTGACATTGAC
CGGTGTATATGGATTCTGGAAGCATGTCTCGAACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTA
CCTTGAGATGTTCTATGCCTTGAAGTATCGCCCACTGGCTAAGGCTGTTCCTCTTGCTGA
AGAGTAATGAAGAAGAGAAAAAGATGTGGGAACCATTAAAAGAGCTTGAAGATAAAGGTT
CCAGTGTTTGATGAATAATAACAAAAATCTCTTTTGATTCTTAGTATCATTTGGATTTAG
GAGCGGTTTTATGTTCCTCTTGCTTTGTTGTTTCAATCCTTTTGTCTTTGTTTTTT*CCC
TTTGTCTTTCCG*CAATGATTTGTATTCTGATTGTTGAGGGATCTCCCCTGATCATTGGC
AATGAAATTTCTACTTTTCTATTCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM18TF U 1
AF RR2AJ94TF U 9
AF RR2DM18JQ C 185
BS 1 660 RR2DM18TF
BS 661 661 RR2AJ94TF
BS 662 735 RR2DM18TF
BS 736 736 RR2AJ94TF
BS 737 755 RR2DM18TF
BS 756 808 RR2DM18JQ

RD RR2DM18TF 755 0 0
GAAGAAAATGTATGACCTCATTGATGAATACAAGCTCAACGGCCAGTTCAGGTGGATCTC
ATCCCAGATGAACAGAGTTAGGAACGGTGAGCTCTACAGGTACATCTGTGACACCAAGGG
TGCTTTTGTGCAGCCAGCACTGTATGAAGCCTTTGGGTTGACTGTTGTGGAGGCCATGAC
CTGTGGTTTACCAACGTTCGCCACATGCAAAGGTGGTCCAGCTGAGATCATTGTGCACGG
CAAATCGGGTTTCCACATTGACCCTTACCACGGTGATCAGGCGGCTGATACTCTTGCTGA
TTTCTTCACCAAGTGTAAGGAAGATCCATCTCACTGGGACCAGATCTCAAAGGGAGGGCT
TCAGAGGATTGAGGAGAAATACACATGGCAGATTTACTCACAGAGGCTCCTGACATTGAC
CGGTGTATATGGATTCTGGAAGCATGTCTCGAACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTA
CCTTGAGATGTTCTATGCCTTGAAGTATCGCCCACTGGCTAAGGCTGTTCCTCTTGCTGA
AGAGTAATGAAGAAGAGAAAAAGATGTGGGAACCATTAAAAGAGCTTGAAGATAAAGGTT
CCAGTGTTTGATGAATAATAACAAAAATCTCTTTTGATTCTTAGTATCATTTGGATTTAG
*AGCGGTTTTATGTTCCTCTTGCTTTGTTGTTTCAATCCTTTTGTCTTTGTTTTTT*CCC
TTTGTCTTTCCG*CA*TGATTTGTATTCTGATTGT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2AJ94TF 750 0 0
TGTATGACCTCATTGATGAATACAAGCTCAACGGCCAGTTCAGGTGGATCTCATCCCAGA
TGAACAGAGTTAGGAACGGTGAGCTCTACAGGTACATCTGTGACACCAAGGGTGCTTTTG
TGCAGCCAGCACTGTATGAAGCCTTTGGGTTGACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGTT
TACCAACGTTCGCCACATGCAAAGGTGGTGCAGCTGAGATCATTGTGCACGGCAAATCGG
GTTTTCACATTGACCCTTACCACGGTGATCAGGCGGCTGATACTCTTGCCGATTTCTTCA
CCAAGTGTAAGGAAGATCCATCTCACTGGGACCAGATCTCAAAGGGAGGGCTTCAGAGGA
TTGAGGAGAAATACACATGGCAGATTTACTCACAGAGGCTCCTGACATTGACCGGTGTAT
ATGGATTCTGGAAGCATGTCTCGAACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTTGAGA
TGTTCTATGCCTTGAAGTACCGCCCACTGGCTAAGGCTGTTCCTCTTGCTGAAGAGTAAT
GAAGAAGAGAAAAAGATGTGGGAACCATTAAAATAGCTTGAAGATAAAGGTTCCAGTGTT
TGATGAATAATAACAAAAATCTCTTTTGATTCTTAGTATCATTTGGATTTAGGAGCGGTT
TTATGTTCCTCTTGCTTTGTTGTTTCAATCCTTTTGTCTTTGTTTTTT*CC*TTTGTCTT
TCCG*CAATGATTTGTATTCTGATTGT
TGA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2DM18JQ 624 0 0
GGTTTACCAACGTTCGCCACATGCAAAGGTGGTCCAGCTGAGATCATTGTGCACGGCAAA
TCGGGTTTCCACATTGACCCTTACCACGGTGATCAGGCGGCTGATACTCTTGCTGATTTC
TTCACCAAGTGTAAGGAAGATCCATCTCACTGGGACCAGATCTCAAAGGGAGGGCTTCAG
AGGATTGAGGAGAAATACACATGGCAGATTTACTCACAGAGGCTCCTGACATTGACCGGT
GTATATGGATTCTGGAAGCATGTCTCGAACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTT
GAGATGTTCTATGCCTTGAAGTATCGCCCACTGGCTAAGGCTGTTCCTCTTGCTGAAGAG
TAATGAAGAAGAGAAAAAGATGTGGGAACCATTAAAAGAGCTTGAAGATAAAGGTTCCAG
TGTTTGATGAATAATAACAAAAATCTCTTTTGATTCTTAGTATCATTTGGATTTAGGAGC
GGTTTTATGTTCCTCTTGCTTTGTTGTTTCAATCCTTTTGTCTTTGTTTTTTTCCCTTTG
TCTTTCCGGCAATGATTTGTATTCTGATTGTTGAGGGATCTCCCCTGATCATTGGCAATG
AAATTTCTACTTTTCTATTCTTAC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL2969Contig1 642 2 2 U
GGGAAGCCGCAGCGAGAGAGAGAGAGTAGCATCACAAACCGCAGAGCTCAGTGTGATCTC
GGAGAAATCGCAGCAGCCATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAGGACCAGGAAGTTCATG
ACCAACAGACTTCTCTCCAGGAAGCAGTTTGTTATTGATGTTCTTCACCCAGGAAGAGCC
AATGTTTCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCAAGGATGTACGAGGTTAAGGACCCA
AACGCAATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACCCACTTTGGAGGTGGCAAATCTTCTGGATTT
GGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCCCAAGTACAGGCTCATC
AGGAATGGACTTGACACCAAGATTGAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAAC
AGGGCCAAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTGA
GGTGTTAAAGACTAGCCGGCAGCATTTTGGGTTTTGTTCTGCATCATCCCTTCTTTATTT
GGATTTTGTACTTGTCATTGTCACATTGTTCTGTCTCGTTTTGCATTATGCGTTAAGCTT
TAGAGAATCATGTGCTAAAGATTTTGCTGAATACATTTATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AV40TF U 1
AF RR2AV40JQ C 61
BS 1 640 RR2AV40TF
BS 641 642 RR2AV40JQ

RD RR2AV40TF 642 0 0
GGGAAGCCGCAGCGAGAGAGAGAGAGTAGCATCACAAACCGCAGAGCTCAGTGTGATCTC
GGAGAAATCGCAGCAGCCATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAGGACCAGGAAGTTCATG
ACCAACAGACTTCTCTCCAGGAAGCAGTTTGTTATTGATGTTCTTCACCCAGGAAGAGCC
AATGTTTCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCAAGGATGTACGAGGTTAAGGACCCA
AACGCAATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACCCACTTTGGAGGTGGCAAATCTTCTGGATTT
GGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCCCAAGTACAGGCTCATC
AGGAATGGACTTGACACCAAGATTGAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAAC
AGGGCCAAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTGA
GGTGTTAAAGACTAGCCGGCAGCATTTTGGGTTTTGTTCTGCATCATCCCTTCTTTATTT
GGATTTTGTACTTGTCATTGTCACATTGTTCTGTCTCGTTTTGCATTATGCGTTAAGCTT
TAGAGAATCATGTGCTAAAGATTTTGCTGAATACATTTAT
CT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2AV40JQ 582 0 0
GGAGAAATC
GCAGCAGCCATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAGGACCAGGAAGTTCATGACCAACAGA
CTTCTCTCCAGGAAGCAGTTTGTTATTGATGTTCTTCACCCAGGAAGAGCCAATGTTTCA
AAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCAAGGATGTACGAGGTTAAGGACCCAAACGCAATC
TTTGTTTTCAAATTCAGAACCCACTTTGGAGGTGGCAAATCTTCTGGATTTGGTTTGATC
TATGACAATGTCGAGAGTGCCAAGAAGTTCGAGCCCAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGA
CTTGACACCAAGATTGAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGGGCCAAG
AAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTGAGGTGTTAAA
GACTAGCCGGCAGCATTTTGGGTTTTGTTCTGCATCATCCCTTCTTTATTTGGATTTTGT
ACTTGTCATTGTCACATTGTTCTGTCTCGTTTTGCATTATGCGTTAAGCTTTAGAGAATC
ATGTGCTAAAGATTTTGCTGAATACATTTATCT

QA 10 582 10 582
DS 



AS 1 3

CO CL2970Contig1 599 3 2 U
GGGAGCGAATAGGTTGATTGATTGATTGAGAAAGTGTAATGGGAAGCGCACCAGCACAGA
TTCCGACTAGCTTCGGCCATGAGCTAAGGGCTTGTCTTCGCTGCCGACTCGTCAAGACCT
ATGACCAGTTCAGGGACGCAGGGTGCGAGAATTGTCCGTTCTTCAAGATGGAAGAGGATC
ACGAGCGTATCGTCGAAGTCACAACTCCTAATTTCAATGGCATAATATCTGTGATGGATC
CAAGTAGAAGCTGGGCGGCTAGGTGGTTAAGAATCGGTAAGTTTGCTCCTGGTTGCTACA
CTCTCGCTGTCTCCGAGCCACTCACAGAGGAAATGCAGCACATATGCCAAGAAGAGCGTG
TACAATACGTTCCTCCGAAACGCATGTAAAAGCAAATACATCAAAGACAAAGAACGCAAG
TAGTACTCTTTCTTATGTTTAGCTTCATGTTAACAATACCAGGTGCTTATATGTGTGTCT
TCATGTTGACAGTT*CCAAGATGTTGTTGCTTCTTTTAAGTACCTTAGGTTTCATCTATG
TAAGGTCGTTATTTATAACTTTTGAACTTCCCAGACCAAATGCTTCTCTGAGAGAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B704JQ C 1
AF RR2B704TF U 1
AF RR2E261TF U 33
BS 1 575 RR2B704TF
BS 576 599 RR2E261TF

RD RR2B704JQ 577 0 0
GGGAGCGAATAGGTTGATTGATTGATTGAGAAAGTGTAATGGGAAGCGCACCAGCACAGA
TTCCGACTAGCTTCGGCCATGAGCTAAGGGCTTGTCTTCGCTGCCGACTCGTCAAGACCT
ATGACCAGTTCAGGGACGCAGGGTGCGAGAATTGTCCGTTCTTCAAGATGGAAGAGGATC
ACGAGCGTATCGTCGAAGTCACAACTCCTAATTTCAATGGCATAATATCTGTGATGGATC
CAAGTAGAAGCTGGGCGGCTAGGTGGTTAAGAATCGGTAAGTTTGCTCCTGGTTGCTACA
CTCTCGCTGTCTCCGAGCCACTCACAGAGGAAATGCAGCACATATGCCAAGAAGAGCGTG
TACAATACGTTCCTCCGAAACGCATGTAAAAGCAAATACATCAAAGACAAAGAACGCAAG
TAGTACTCTTTCTTATGTTTAGCTTCATGTTAACAATACCAGGTGCTTATATGTGTGTCT
TCATGTTGACAGTT*CCAAGATGTTGTTGCTTCTTTTAAGTACCTTAGGTTTCATCTATG
TAAGGTCGTTATTTATAACTTTTGAACTTCCCAGA
AC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2B704TF 577 0 0
GGGAGCGAATAGGTTGATTGATTGATTGAGAAAGTGTAATGGGAAGCGCACCAGCACAGA
TTCCGACTAGCTTCGGCCATGAGCTAAGGGCTTGTCTTCGCTGCCGACTCGTCAAGACCT
ATGACCAGTTCAGGGACGCAGGGTGCGAGAATTGTCCGTTCTTCAAGATGGAAGAGGATC
ACGAGCGTATCGTCGAAGTCACAACTCCTAATTTCAATGGCATAATATCTGTGATGGATC
CAAGTAGAAGCTGGGCGGCTAGGTGGTTAAGAATCGGTAAGTTTGCTCCTGGTTGCTACA
CTCTCGCTGTCTCCGAGCCACTCACAGAGGAAATGCAGCACATATGCCAAGAAGAGCGTG
TACAATACGTTCCTCCGAAACGCATGTAAAAGCAAATACATCAAAGACAAAGAACGCAAG
TAGTACTCTTTCTTATGTTTAGCTTCATGTTAACAATACCAGGTGCTTATATGTGTGTCT
TCATGTTGACAGTT*CCAAGATGTTGTTGCTTCTTTTAAGTACCTTAGGTTTCATCTATG
TAAGGTCGTTATTTATAACTTTTGAACTTCCCAGA
AC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2E261TF 567 0 0
G
GTGTAATGGGAAGCGCACCAGCACAGATTCCGACTAGCTTCGGCCATGAGCTAAGGGCTT
GTCTTCGCTGCCGACTCGTCAAGACCTATGACCAGTTCAGGGACGCAGGGTGCGAGAATT
GTCCGTTCTTCAAGATGGAAGAGGATCACGAGCGTATCGTCGAAGTCACAACTCCTAATT
TCAATGGCATAATATCTGTGATGGATCCAAGTAGAAGCTGGGCGGCTAGGTGGTTAAGAA
TCGGTAAGTTTGCTCCTGGTTGCTACACTCTCGCTGTCTCCGAGCCACTCACAGAGGAAA
TGTAGCACATATGCCAAGAAGAGCGTGTACAATACGTTCCTCCGAAACGCATGTAAAAGC
AAATACATCAAAGACAAGGAACGCAAGTAGTACTCTTTCTTATGTTTAGCTTCATGTTAA
CAATACCAGGTGCTTATATGTGTGTCTTCATGTTGACAGTTTCCAAGATGTCGTTGCTTC
TTTTAAGTACCTTAGGTTTCATCTATGTAAGGTCGTTATTTATAACTTTTGAACTTCCCA
GACCAAATGCTTCTCTGAGAGAAAAA

QA 2 567 2 567
DS 



AS 1 3

CO CL2971Contig1 1058 3 6 U
ACTAGACTAGACTTTTATTTTGTCGTTATAATAACAAAAGTATAATTCAATTCAAGAACA
CATGAGATTGTTTAAAAGATATATCCTAAAAACAAAAGACTCAGTACAGTAGTAAGTACC
CAAAATAACAAAAGAGAAGCGATTTATAAAAAGCAAGAGAATATTGAAGTCTCTCTCTTC
TTTCAAGTTTTCTACCTGGGCTCAGGAGGCACTACTTTTAAACTCCTCATCCACTCGCAG
AAACTCTCTTCATCAAACTCTATAAAACTACTCTTTAGTTTCCTTCTTTGCTCCCCCGTC
AACCTTCTTACCTGTGGAAATCTTGCTTCCTGCTCATAAGGAGGATCTTTATGCGCTGGT
ATAAGCCGGCAAACAAAGTACCTAGCCTGTGAACTTCCCTCCTTGAATGCAAGAATGCGC
GGTGCTGGAAACCTGAACTCGGTTAGTTCTTCAGCCAACGTTCTGCATGCTGCTAAAACC
GCAGCGCTCTTCACCTCATCAGCAGACAGTTCGGCTCCCGACCAAATAAATATATCTGTG
CCATGGTCAAGAATAACAGCCTTATCTGATTGCATTGACAGATCATAAGCTGGCAGTTCC
TCAAACGTGCCTCCTTCTTGGTGCATCAAGCAACGTGGCGCCACCATTCGTAGAGACAGA
TCGAAAGATGCGTTGAGAAACAAGTTCCTTAGCACCGATCTTTCATCTTCATGACCAATG
ATGTTTCCCAACAGAGGACCCCTCCTAAGGTGGAAGAGGAGCTCCGGAAGAGAAGATAGT
TCCTTGGGGAAGCTATAAAGCTTTGATTTTGGCACTTGTGATCCGAACTTCAAAGCAATG
TCTTTGATTCTCTCGTCTACTGTACCACGCATATCCACTGCATCCTTCTGAGTTTTCGCT
ATTAGAAGCGTTCTCTTGGAGATGAGAACCGCAGCAGCTTCGTCTACAACACTCTGAAGA
TATGCTGAGACACTATCAACGGTTGGTAATTTGAACGTAATCACTCGAGACACATCTGCT
TGATAAACATCTGAATAGTGGAAAGCAAACTGGAAAAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ86JQ U 1
AF RR2BB24JQ U 1
AF RR2DJ86TF C 391
BS 1 519 RR2BB24JQ
BS 520 520 RR2DJ86JQ
BS 521 665 RR2BB24JQ
BS 666 666 RR2DJ86TF
BS 667 745 RR2BB24JQ
BS 746 1058 RR2DJ86TF

RD RR2DJ86JQ 576 0 0
G
CTAGACTAGACTTTTATTTTGTTGTTATAATAACAAAAGTATAATTCAATTCAAGAACAC
ATGAGATTGTTTAAAAGATATATCCTAAAAACAAAAGACTCAGTACAGTAGTAAGTACCC
AAAATAACAAAAGAGAAGCGATTTATAAAAAGCAAGAGAATATTGAAGTCTCTCTCTTCT
TTCAAGTTTTCTACCTGGGCTCAGGAGGCACTACTTTTAAACTCCTCATCCACTCGCAGA
AACTCTCTTCATCAAACTCTATAAAACTACTCTTTAGTTTCCTTCTTTGCTCCCCCGTCA
ACCTTCTTACCTGTGGAAATCTTGCTTCCTGCTCATAAGGAGGATCTTTATGCGCTGGTA
TAAGCCGGCAAACAAAGTACCTAGCCTGTGAACTTCCCTCCTTGAATGCAAGAATGCGCG
GTGCTGGAAACCTGAACTCGGTTAGTTCTTCAGCCAACGTTCTGCATGCTGCTAAAACCG
CAGCGCTCTTCACCTCATCAGCAGACAGTTCGGCTCCCGACCAAATAAATATATCTGTGC
CATGGTCAAGAATAACAGCCTTATCTGATTGCATT

QA 2 576 2 576
DS 

RD RR2BB24JQ 745 0 0
ACTAGACTAGACTTTTATTTTGTCGTTATAATAACAAAAGTATAATTCAATTCAAGAACA
CATGAGATTGTTTAAAAGATATATCCTAAAAACAAAAGACTCAGTACAGTAGTAAGTACC
CAAAATAACAAAAGAGAAGCGATTTATAAAAAGCAAGAGAATATTGAAGTCTCTCTCTTC
TTTCAAGTTTTCTACCTGGGCTCAGGAGGCACTACTTTTAAACTCCTCATCCACTCGCAG
AAACTCTCTTCATCAAACTCTATAAAACTACTCTTTAGTTTCCTTCTTTGCTCCCCCGTC
AACCTTCTTACCTGTGGAAATCTTGCTTCCTGCTCATAAGGAGGATCTTTATGCGCTGGT
ATAAGCCGGCAAACAAAGTACCTAGCCTGTGAACTTCCCTCCTTGAATGCAAGAATGCGC
GGTGCTGGAAACCTGAACTCGGTTAGTTCTTCAGCCAACGTTCTGCATGCTGCTAAAACC
GCAGCGCTCTTCACCTCATCAGCAGACAGTTCGGCTCCCAACCAAATAAATATATCTGTG
CCATGGTCAAGAATAACAGCCTTATCTGATTGCATTGACAGATCATAAGCTGGCAGTTCC
TCAAACGTGCCTCCTTCTTGGTGCATCAAGCAACGTGGCGCCACCATTCGTAGAGACAGA
TCGAAGGATGCGTTGAGAAACAAGTTCCTTAGCACCGATCTTTCATCTTCATGACCAATG
ATGTTTCCCAACAGAGGACCCCTCC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2DJ86TF 668 0 0
GAACTTCCCTCCTTGAATGCAAGAATGCGCGGTGCTGGAAAC*TGAACTCGGTTAGTTCT
TCAGCCAACGTTCTGCATGCTGCTAAAACCGCAGCGCTCTTCACCTCATCAGCAGACAGT
TCGGCTCCCGACCAAATAAATATATCTGTGCCATGGTCAAGAATAACAGCCTTATCTGAT
TGCATTGACAGATCATAAGCTGGCAGTTCCTCAAACGTGCCTCCTTCTTGGTGCATCAAG
CAACGTGGCGCCACCATTCGTAGAGACAGATCGAAAGATGCGTTGAGAAACAAGTTCCTT
AGCACCGATCTTTCATCTTCATGACCAATGATGTTTCCCAACAGAGGACCCCTCCTAAGG
TGGAAGAGGAGCTCCGGAAGAGAAGATAGTTCCTTGGGGAAGCTATAAAGCTTTGATTTT
GGCACTTGTGATCCGAACTTCAAAGCAATGTCTTTGATTCTCTCGTCTACTGTACCACGC
ATATCCACTGCATCCTTCTGAGTTTTCGCTATTAGAAGCGTTCTCTTGGAGATGAGAACC
GCAGCAGCTTCGTCTACAACACTCTGAAGATATGCTGAGACACTATCAACGGTTGGTAAT
TTGAACGTAATCACTCGAGACACATCTGCTTGATAAACATCTGAATAGTGGAAAGCAAAC
TGGAAAAA

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 3

CO CL2972Contig1 787 3 2 U
GGGATCTATTCCCATCTTTAATCGTCAGTCAATAAATTGTGAAGCTCTTATCAGAAAAAA
ATGGAGACAGTAACAGTGATGAAGCCATTGATCAGAGTCGCTGCTCTCTCCGGTTCCCTG
CGGAAAGGCTCTTACCACAATGGTCTTCTCCGTGCCGCGATCGACTTGACGAAAGAATTG
GTCCCGGGAATGCAGATTGAGTATATCGACATATCTCCACTGCCGTTCATCAATACCGAC
CTGGAAATAAATGGTACCTATCCTGCTGTCGTCGAAGCTTTCCGGCAGAAAATCCTTGAA
GCCGATAGTATTCTGTTCGCCTCCCCTGAGTATAATTACTCTGTCTCAGCTCCTCTTAAG
AACGCGATTGACTGGGCTTCCCGACCACCTAATGTCTGGGCTGACAAACCTGCCGCCATC
ATTAGCACCGGTGGAATATTTGGTGGAGGAGTATCTCAATATCATCTTCGCCAAATTGGT
GTATTCCTTGATCTTCATTTTATCAACAAGCCAGAATTTACTCTCAATGCATTCCAACCG
CCTGAGAAATTTGATGTGGAAGGAAACTTGGTCGATGAACCAGCTAAGGAGAGGTTGAAA
AAAGTCCTTATCTCATTGCAAGAATTTACTATTCGACTTCAGGGTCGTGAGTGAGGGAAT
TCTTAATCATTTGTAAGGCTTGTTCGTGTGATGGAAATAATGCAAATTGTTGTAATAAAA
ACAGTGTGTCACTTATCTTATAATCGTTTACTGTTTTTTTTATCTTATAATCGTTTATGT
TTATTAT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG02TF U 1
AF RR2GG30TF U 60
AF RR2GG02JQB C 2
BS 1 582 RR2GG02TF
BS 583 787 RR2GG02JQB

RD RR2GG02TF 582 0 0
GGGATCTATTCCCATCTTTAATCGTCAGTCAATAAATTGTGAAGCTCTTATCAGAAAAAA
ATGGAGACAGTAACAGTGATGAAGCCATTGATCAGAGTCGCTGCTCTCTCCGGTTCCCTG
CGGAAAGGCTCTTACCACAATGGTCTTCTCCGTGCCGCGATCGACTTGACGAAAGAATTG
GTCCCGGGAATGCAGATTGAGTATATCGACATATCTCCACTGCCGTTCATCAATACCGAC
CTGGAAATAAATGGTACCTATCCTGCTGTCGTCGAAGCTTTCCGGCAGAAAATCCTTGAA
GCCGATAGTATTCTGTTCGCCTCCCCTGAGTATAATTACTCTGTCTCAGCTCCTCTTAAG
AACGCGATTGACTGGGCTTCCCGACCACCTAATGTCTGGGCTGACAAACCTGCCGCCATC
ATTAGCACCGGTGGAATATTTGGTGGAGGAGTATCTCAATATCATCTTCGCCAAATTGGT
GTATTCCTTGATCTTCATTTTATCAACAAGCCAGAATTTACTCTCAATGCATTCCAACCG
CCTGAGAAATTTGATGTGGAAGGAAACTTGGTCGATGAACCA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2GG30TF 523 0 0
GCG
GGAGACAGTAACAGTGATGAAGCCATTGATCAGAGTCGCTGCTCTCTCCGGTTCCCTGCG
GAAAGGCTCTTACCACAATGGTCTTCTCCGTGCCGCGATCGACTTGACGAAAGAATTGGT
CCCGGGAATGCAGATTGAGTATATCGACATATCTCCACTGCCGTTCATCAATACCGACCT
GGAAATAAATGGTACCTATCCTGCTGTCGTCGAAGCTTTCCGGCAGAAAATCCTTGAAGC
CGATAGTATTCTGTTCGCCTCCCCTGAGTATAATTACTCTGTCTCAGCTCCTCTTAAGAA
CGCGATTGACTGGGCTTCCCGACCACCTAATGTCTGGGCTGACAAACCTGCCGCCATCAT
TAGCACCGGTGGAATATTTGGTGGAGGAGTATCTCAATATCATCTTCGCCAAATTGGTGT
ATTCCTTGATCTTCATTTTATCAACAAGCCAGAATTTACTCTCAATGCATTCCAACCGCC
TGAGAAATTTGATGTGGAAGGAAACTTGGTCGATGAACCA

QA 4 523 4 523
DS 

RD RR2GG02JQB 786 0 0
GGATCTATTCCCATCTTTAATCGTCAGTCAATAAATTGTGAAGCTCTTATCAGAAAAAAA
TGGAGACAGTAACAGTGATGAAGCCATTGATCAGAGTCGCTGCTCTCTCCGGTTCCCTGC
GGAAAGGCTCTTACCACAATGGTCTTCTCCGTGCCGCGATCGACTTGACGAAAGAATTGG
TCCCGGGAATGCAGATTGAGTATATCGACATATCTCCACTGCCGTTCATCAATACCGACC
TGGAAATAAATGGTACCTATCCTGCTGTCGTCGAAGCTTTCCGGCAGAAAATCCTTGAAG
CCGATAGTATTCTGTTCGCCTCCCCTGAGTATAATTACTCTGTCTCAGCTCCTCTTAAGA
ACGCGATTGACTGGGCTTCCCGACCACCTAATGTCTGGGCTGACAAACCTGCCGCCATCA
TTAGCACCGGTGGAATATTTGGTGGAGGAGTATCTCAATATCATCTTCGCCAAATTGGTG
TATTCCTTGATCTTCATTTTATCAACAAGCCAGAATTTACTCTCAATGCATTCCAACCGC
CTGAGAAATTTGATGTGGAAGGAAACTTGGTCGATGAACCAGCTAAGGAGAGGTTGAAAA
AAGTCCTTATCTCATTGCAAGAATTTACTATTCGACTTCAGGGTCGTGAGTGAGGGAATT
CTTAATCATTTGTAAGGCTTGTTCGTGTGATGGAAATAATGCAAATTGTTGTAATAAAAA
CAGTGTGTCACTTATCTTATAATCGTTTACTGTTTTTTTTATCTTATAATCGTTTATGTT
TATTAT

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 3

CO CL2973Contig1 1066 3 17 U
GCATTTCACATTGCTTGATGGAGAGATGATTATTGATACCTTGCCGGATAAACAAAGGCA
GGAGAGAAGATACCTAATATATGATATGGTAGCAATCAACGGTCAATCAGTTGTAGAGCG
GCCTTTCTATGAAAGATGGAAGATGCTCGAGAAGGAGGTGATAGACCCCCGTAATCACGA
GAAGGCCAGAAGTCAAATCTACCGATATGACCTCGAGCCTTTTAGGGTGCGGAGAAAGGA
TTTCTGATTGCTTTCGGCGGTTGAAAAGATTTTGAAGAGTTTCATACCATCACTTTCACA
CGAAGCCGACGGCCTAATCTTTCAGGGCTGGGATGATCCTTATGTTGCCCGTACCCATGA
AGGTCTGTTGAAATGGAAGTATCCAGAAATGAATTCGGTTGACTTTCTGTACGAGCAGGA
TGAGAGTGGCCGTGGAATGCTGTTTTTGTTTGAAAGAGGGAAGAAAAAGCATATGGATGG
GAATACTGTTGTTTTTAGAGATGATTCAGACCCTGCCGAGTACTCCGGGAAGATTGTAGA
GTGTTCGTGGGATCAGGATGAGCAAGTCTGGGTTAGCATGCGAGTCAGGGTCGATAAATC
AACGCCAAATGATATCAACACTTATAGAAAGGTGATGAGAAGCATAAAGGACAACATCAC
AGAGGAAGTGTTGCTCCAGGAGATAAGGGAGACCATCCGGTTGCCTATGTATGCAGACCG
TATTCAAATGGATAGCAAAGCTGCGCGCCGCAGATGAAACAACACCTCTTGTCGACGCAT
ACATGAAGCTGAATCAAGAAAGAGACATCATCTGCGGATGGCCGGTAATGTTCTTTACTC
GTCTTCTTTGTGAATCCATGGTACTTGTATACTGCTAACAGTTTTAGGGTTTATTGTGGA
ATCATATATTCCGTTTGGCATTTGTGATGATGGTTTTAGCTTTGCAAAAAAGGTGTGTGG
TACTCTTGTAAGTGATATTCATATATGTTTAGATGTAGAAGTTGTAATGGGACAAATAAT
AGTACTTAGGAAGGGATAATGTTGTAATCTTTAGTATTAGTATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO64TF U 1
AF RR2AM83TF U 93
AF RR2AM83JQ C 347
BS 1 277 RR2DO64TF
BS 278 278 RR2AM83TF
BS 279 299 RR2DO64TF
BS 300 300 RR2AM83TF
BS 301 351 RR2DO64TF
BS 352 352 RR2AM83TF
BS 353 556 RR2DO64TF
BS 557 557 RR2AM83TF
BS 558 589 RR2DO64TF
BS 590 590 RR2AM83TF
BS 591 608 RR2DO64TF
BS 609 609 RR2AM83TF
BS 610 631 RR2DO64TF
BS 632 632 RR2AM83TF
BS 633 649 RR2DO64TF
BS 650 792 RR2AM83TF
BS 793 1066 RR2AM83JQ

RD RR2DO64TF 651 0 0
GCATTTCACATTGCTTGATGGAGAGATGATTATTGATACCTTGCCGGATAAACAAAGGCA
GGAGAGAAGATACCTAATATATGATATGGTAGCAATCAACGGTCAATCAGTTGTAGAGCG
GCCTTTCTATGAAAGATGGAAGATGCTCGAGAAGGAGGTGATAGACCCCCGTAATCACGA
GAAGGCCAGAAGTCAAATCTACCGATATGACCTCGAGCCTTTTAGGGTGCGGAGAAAGGA
TTTCTGATTGCTTTCGGCGGTTGAAAAGATTTTGAAGGGTTTCATACCATCACTTTCACG
CGAAGCCGACGGCCTAATCTTTCAGGGCTGGGATGATCCTTATGTTGCCCGAACCCATGA
AGGTCTGTTGAAATGGAAGTATCCAGAAATGAATTCGGTTGACTTTCTGTACGAGCAGGA
TGAGAGTGGCCGTGGAATGCTGTTTTTGTTTGAAAGAGGGAAGAAAAAGCATATGGATGG
GAATACTGTTGTTTTTAGAGATGATTCAGACCCTGCCGAGTACTCCGGGAAGATTGTAGA
GTGTTCGTGGGATCAG*ATGAGCAAGTCTGGGTTAGCATGCGAGTCAGG*TCGATAAATC
AACGCCAA*TGATATCAACACTTATAGAAAG*TGATGAGAAGCATAAAG
AC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2AM83TF 700 0 0
G
AATCAACGGTCAATCAGTTGTAGAGCGGCCTTTCTATGAAAGATGGAAGATGCTCGAGAA
GGAGGTTATAGACCCCCGTAATCACGAGAAGGCCAGAAGTCAAATCTACCGATATGACCT
TGAGCCTTTTAGGGTGCGGAGAAAGGATTTCTGGTTGCTTTCGGCGGTTGAAAAGATTTT
GAAGAGTTTCATACCATCACTTTCACACGAAGCCGACGGCCTAATCTTTCAGGGCTGGGA
TGATCCTTATGTTGCCCGTACCCATGAAGGTCTGTTGAAATGGAAGTATCCAGAAATGAA
TTCGGTTGACTTTCTGTACGAGCAGGATGAGAGTGGCCGTGGAATGCTGTTTTTGTTTGA
AAGAGGGAAGAAAAAGCATATGGATGGGAATACTGTTGTTTTTAGAGATGATTCAGACCC
TGCCGAGTACTCCGGGAAGATTGTAGAGTGTTCGTGGGATCAGGATGAGCAAGTCTGGGT
TAGCATGCGAGTCAGGGTCGATAAATCAACGCCAAATGATATCAACACTTATAGAAAGGT
GATGAGAAGCATAAAGGACAACATCACAGAGGAAGTGTTGCTCCAGGAGATAAGGGAGAC
CATCCGGTTGCCTATGTATGCAGACCGTATTCAAATGGATAGCAAAGCTGCGCGCCGCAG
ATGAAACAACACCTCTTGTCGACGCATACATGAAGCTGA

QA 2 700 2 700
DS 

RD RR2AM83JQ 720 0 0
GCCCGTACCCATGAAGGTCTGTTGAAATGGAAGTATCCAGAAATGAATTCGGTTGACTTT
CTGTACGAGCAGGATGAGAGTGGCCGTGGAATGCTGTTTTTGTTTGAAAGAGGGAAGAAA
AAGCATATGGATGGGAATACTGTTGTTTTTAGAGATGATTCAGACCCTGCCGAGTACTCC
GGGAAGATTGTAGAGTGTTCGTGGGATCAGGATGAGCAAGTCTGGGTTAGCATGCGAGTC
AGGGTCGATAAATCAACGCCAAATGATATCAACACTTATAGAAAGGTGATGAGAAGCATA
AAGGACAACATCACAGAGGAAGTGTTGCTCCAGGAGATAAGGGAGACCATCCGGTTGCCT
ATGTATGCAGACCGTATTCAAATGGATAGCAAAGCTGCGCGCCGCAGATGAAACAACACC
TCTTGTCGACGCATACATGAAGCTGAATCAAGAAAGAGACATCATCTGCGGATGGCCGGT
AATGTTCTTTACTCGTCTTCTTTGTGAATCCATGGTACTTGTATACTGCTAACAGTTTTA
GGGTTTATTGTGGAATCATATATTCCGTTTGGCATTTGTGATGATGGTTTTAGCTTTGCA
AAAAAGGTGTGTGGTACTCTTGTAAGTGATATTCATATATGTTTAGATGTAGAAGTTGTA
ATGGGACAAATAATAGTACTTAGGAAGGGATAATGTTGTAATCTTTAGTATTAGTATCAT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL2974Contig1 884 2 2 U
GGTTCGGTCTCTATCTATAAGTTTATTATTCATGAACATATTGTAGTAAACTTAAGCCAT
CATGAGCACAGAGTCTTGGAATCTTGATATTCAGTTCATGATAATATCTCCTTGTGCCTC
TGTGATAACTAGCGGAGCACGAGGAACCGTTGGCTGTAGCGGTTTGCAGTCCCAGTCTTT
ACCGTTTCTAACCACTGAGAAATGCTTGGGAACCCACGACTCACCAGAAGCCTCTCTCTG
TTTCAGAGACTCTCTCTGTTTATCCTCCACAGCTTTCTTAGCTTCTCTTGCCTTTTCCCA
GTCTTTCTTTAGTATCTTTTCACTTACTTCACTCCACACCATCGCAGACTCGGTCTCCAT
TACCTCTTTCAGATTCTTCACAGTAGGAGGTTTGAGTCCCGAGATACTCTCCTTGGCATT
GTATATGACTTCGTCCTCACCGGTCTTCAGATTTTTGGCCATTACCGTTCTATCCCAATG
GCCAGAGATGTCGTAAAGCTTATCTCCAGAGGAAGTCTGAGAGATCTTTCCTTTGATTGA
TCTGTTGTTGTTGCCTTTGAATCTTTCGATGAGTGAATCAGAGATCAAGTGTAGCTCAGC
TTCGAGATCGGTCTCTGGACACTTTATCTTGATTTTTCCGGTCCAGTGAGCTCCAGGAGC
AGGTAAGAATCTCACAACAAGTCTTGGTTGGTCCATCTCGTAAGTCTCTTTCCGATTCAG
AAGGTTCATTATCCTTCTGCCCTTTACCTCGACGTCTACGTAAGCACCACGGAACTTGGG
AGTGAAATATTGACACCATGTCACGTCAATATTTTCGTTCTCGTGAGTCGCATGAAGTGC
CGACACTGGAGGATGATGCGATACTTGTTCGGCGAGGACGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV58JQ U 1
AF RR2A453TF C 30
BS 1 739 RR2BV58JQ
BS 740 884 RR2A453TF

RD RR2BV58JQ 739 0 0
GGTTCGGTCTCTATCTATAAGTTTATTATTCATGAACATATTGTAGTAAACTTAAGCCAT
CATGAGCACAGAGTCTTGGAATCTTGATATTCAGTTCATGATAATATCTCCTTGTGCCTC
TGTGATAACTAGCGGAGCACGAGGAACCGTTGGCTGTAGCGGTTTGCAGTCCCAGTCTTT
ACCGTTTCTAACCACTGAGAAATGCTTGGGAACCCACGACTCACCAGAAGCCTCTCTCTG
TTTCAGAGACTCTCTCTGTTTATCCTCCACAGCTTTCTTAGCTTCTCTTGCCTTTTCCCA
GTCTTTCTTTAGTATCTTTTCACTTACTTCACTCCACACCATCGCAGACTCGGTCTCCAT
TACCTCTTTCAGATTCTTCACAGTAGGAGGTTTGAGTCCCGAGATACTCTCCTTGGCATT
GTATATGACTTCGTCCTCACCGGTCTTCAGATTTTTGGCCATTACCGTTCTATCCCAATG
GCCAGAGATGTCGTAAAGCTTATCTCCAGAGGAAGTCTGAGAGATCTTTCCTTTGATTGA
TCTGTTGTTGTTGCCTTTGAATCTTTCGATGAGTGAATCAGAGATCAAGTGTAGCTCAGC
TTCGAGATCGGTCTCTGGACACTTTATCTTGATTTTTCCGGTCCAGTGAGCTCCAGGAGC
AGGTAAGAATCTCACAACAAGTCTTGGTTGGTCCATCTCGTAAGTCTCTTTCCGATTCAG
AAGGTTCATTATCCTTCTG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2A453TF 855 0 0
TCATGAACATAT*GTAGTAAACTTAAGCCATCATGAGCACAGAGTCTTGGAATCTTGATA
TTCAGTTCATGATAATATCTCCTTGTGCCTCTGTGATAACTAGCGGAGCACGAGGAACCG
TTGGCTGTAGCGGTTTGCAGTCCCAGTCTTTACCGTTTCTAACCACTGAGAAATGCTTGG
GAACCCACGACTCACCAGAAGCCTCTCTCTGTTTCAGAGACTCTCTCTGTTTATCCTCCA
CAGCTTTCTTAGCTTCTCTTGCCTTTTCCCAGTCTTTCTTTAGTATCTTTTCGCTTACTT
CACTCCACACCATCGCAGACTCGGTCTCCATTACCTCTTTCAGATTCTTCACAGTAGGAG
GTTTGAGTCCCGAGATACTCTCCTTGGCATTGTATGTGACTTCGTCCTCACCGGTCTTCA
GATTTTTGGCCATTACCGTTCTATCCCAATGGCCAGAGATGTCGTAGAGCTTATCTCCAG
AGGAAGTCTGAGAGATCTTTCCTTTGATTGATCTGTTGTTGTTGCCTTTGAATCTTTCGA
TGAGTGAATCAGAGATCAAGTGTAGCTCAGCTTCGAGATCGGTCTCTGGACACTTTATCT
TGATTTTTCCGGTCCAGTGAGCTCCAGGAGCAGGTAAGAATCTCACAACAAGTCTTGGTT
GGTCCATCTCGTAAGTCTCTTTCCGATTCAGAAGGTTCATTATCCTTCTGCCCTTTACCT
CGACGTCTACGTAAGCACCACGGAACTTGGGAGTGAAATATTGACACCATGTCACGTCAA
TATTTTCGTTCTCGTGAGTCGCATGAAGTGCCGACACTGGAGGATGATGCGATACTTGTT
CGGCGAGGACGTTGC

QA 1 855 1 855
DS 



AS 1 3

CO CL2975Contig1 1286 3 10 U
GGACTCAGGCGGCTTCTAATCGCCGTAAGAAAAGACGACGAGTAGAGAAAGAGGGTGTGT
GGCTGCAAAATGTCGGAGTCAGAAAAGAAACCACTTTTCATACCAAAGGAATGGTCTGAT
GCAGCGAGTTCCGTTTCCTGCAGCAGTTCGTTGCAACCCGCTGTAGCTTTGGTTTGTGGT
CCTAAAGACAGTGGAAAGACTACATTCTCCCGCAATCTTGTTAAAGTTCTTCTCCAAAGA
TACAAGAGGGTTGCTTATTTGGACATTGATGTTAGTCAGCCTGAATTCACTGTACCTGGT
TTTCTTTCTCTCACAGTTGCCGATAAATCCATTCTAGACCAGGATTGGACAGCTCCTTGT
TTAAAGACACCGGAGAGATATTACTTCTATGGTGATGATTCTGCAAAGAGAGATCCAAAG
GCTTATCTACAGTTTGTATACACCTTGTTCGATTACTACCAGCTACACTTCTGCAAGTCG
AGTGAGAATAATAAGACTGCGTTACCTCTTGTCATTAATACCCCTGGCTGGGTTAAAGGC
CTTGGCTACCATGTATTGGTTGACGTATTGAGATATGTTTCCCCCTCCCATGTTGTGAAA
ATCAACATCGAAATTCACAAGAAGAACCTACCAGCTGGGTTGTTCTGGTTAGACGGTTAT
CATGATGAGAGACCTCATTTGATTGAGATTCAATCTGCTTACCCAGTCAGTTACTATCGA
TCCGCAGCGGAAAAGCATGCTCGACGTTTGATGAGGGATAGGCGTATAATCGCCTACTTC
AAGCAATGCATTAAAGGAAAAGAAGTAGACACGACCAAAGAGCTTTCCCAAGAACTCGCT
TTTCTTGTTCCTTACGAGGTTCCAATATCTAGTTTAACAATCACTCATCTACATTGTCAG
ATTCCAAGTTCAGAAGTGTTTTATAGTTTGAATGCTTCCATTGTTGGTTTGGGGATTAGC
TTTGAAGTGTTTGAAGATTTGCCTTTATGCGTTGGTCTTGGAATCGTGAGGGGAATAGAC
ATAGAGAGAGGAATCTTGTATGTGATCACTCCAGTTGCAGAAAATGTGGTTGAGAAAGTT
GATCTTCTTTGGCAAGGCTTCATTCAGATACCTACTAGTCTTTTGGGGGTGAAAGATTAC
AGGTCTCCTTATCTGTCTCCCTATGTCTTAGCTTCCACCTAAACTTCATCTTCTTTTAAG
ACTTTCTTTGCTCAGTATTTTTTTTTTCTGTTTGCTACTAGTATGTATCATTAATTTATC
TAATACCAAGTTTCAGTTTCTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR09TF U 14
AF RR2CB69TF U 1
AF RR2DR09JQ C 563
BS 1 273 RR2CB69TF
BS 274 274 RR2DR09TF
BS 275 330 RR2CB69TF
BS 331 331 RR2DR09TF
BS 332 337 RR2CB69TF
BS 338 342 RR2DR09TF
BS 343 733 RR2CB69TF
BS 734 734 RR2DR09JQ
BS 735 751 RR2CB69TF
BS 752 1286 RR2DR09JQ

RD RR2DR09TF 606 0 0
TTCTAATCGCCGTAAGAAAAGACGACGAGTAGAGAAAGAGGGTGTGTGGCTGCAAAATGT
CGGAGTCAGAAAAGAAACCACTTTTCATACCAAAGGAATGGTCTGATGCAGCGAGTTCCG
TTTCCTGCAGCAGTTCGTTGCAACCCGCTGTAGCTTTGGTTTGTGGTCCTAAAGACGGTG
GAAAGACTACATTCTCCCGCAATCTTGTTAAAGTTCTTCTCCAAAGATACAAGAGGGTTG
CTTATTTGGACATTGATGTTAGTCAGCCTGAATTCACTGTACCTGGTTTTCTTTCTCTCA
CAGTTGTCGATAAATCCATTCTAGACCAGGATTGGACAGCTCCTTGTTTAAAGACACCGG
AGAGATATTACTTCTATGGTGATGATTCTGCAAAGAGAGATCCAAAGGCTTATCTACAGT
TTGTATACACCTTGTTCGATTACTACCAGCTACACTTCTGCAAGTCGAGTGAGAATAATA
AGACTGCGTTACCTCTTGTCATTAATACCCCTGGCTGGGTTAAAGGCCTTGGCTACCATG
TATTGGTTGACGTATTGAGATATGTTTCCCCCTCCCATGTTGTGAAAATCAACATCGAAA
TTCACA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2CB69TF 751 0 0
GGACTCAGGCGGCTTCTAATCGCCGTAAGAAAAGACGACGAGTAGAGAAAGAGGGTGTGT
GGCTGCAAAATGTCGGAGTCAGAAAAGAAACCACTTTTCATACCAAAGGAATGGTCTGAT
GCAGCGAGTTCCGTTTCCTGCAGCAGTTCGTTGCAACCCGCTGTAGCTTTGGTTTGTGGT
CCTAAAGACAGTGGAAAGACTACATTCTCCCGCAATCTTGTTAAAGTTCTTCTCCAAAGA
TACAAGAGGGTTGCTTATTTGGACATTGATGTTGGTCAGCCTGAATTCACTGTACCTGGT
TTTCTTTCTCTCACAGTTGCCGATAAATCCGTTCTAG*****GATTGGACAGCTCCTTGT
TTAAAGACACCGGAGAGATATTACTTCTATGGTGATGATTCTGCAAAGAGAGATCCAAAG
GCTTATCTACAGTTTGTATACACCTTGTTCGATTACTACCAGCTACACTTCTGCAAGTCG
AGTGAGAATAATAAGACTGCGTTACCTCTTGTCATTAATACCCCTGGCTGGGTTAAAGGC
CTTGGCTACCATGTATTGGTTGACGTATTGAGATATGTTTCCCCCTCCCATGTTGTGAAA
ATCAACATCGAAATTCACAAGAAGAACCTACCAGCTGGGTTGTTCTGGTTAGACGGTTAT
CATGATGAGAGACCTCATTTGATTGAGATTCAATCTGCTTACCCAGTCAGTTACTATCGA
TCCGCAGCGGAAA*GCATGCTCGACGTTTGA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2DR09JQ 724 0 0
ACGTATTGAGATATGTTTCCCCCTCCCATGTTGTGAAAATCAACATCGAAATTCACAAGA
AGAACCTACCAGCTGGGTTGTTCTGGTTAGACGGTTATCATGATGAGAGACCTCATTTGA
TTGAGATTCAATCTGCTTACCCAGTCAGTTACTATCGATCCGCAGCGGAAAAGCATGCTC
GACGTTTGATGAGGGATAGGCGTATAATCGCCTACTTCAAGCAATGCATTAAAGGAAAAG
AAGTAGACACGACCAAAGAGCTTTCCCAAGAACTCGCTTTTCTTGTTCCTTACGAGGTTC
CAATATCTAGTTTAACAATCACTCATCTACATTGTCAGATTCCAAGTTCAGAAGTGTTTT
ATAGTTTGAATGCTTCCATTGTTGGTTTGGGGATTAGCTTTGAAGTGTTTGAAGATTTGC
CTTTATGCGTTGGTCTTGGAATCGTGAGGGGAATAGACATAGAGAGAGGAATCTTGTATG
TGATCACTCCAGTTGCAGAAAATGTGGTTGAGAAAGTTGATCTTCTTTGGCAAGGCTTCA
TTCAGATACCTACTAGTCTTTTGGGGGTGAAAGATTACAGGTCTCCTTATCTGTCTCCCT
ATGTCTTAGCTTCCACCTAAACTTCATCTTCTTTTAAGACTTTCTTTGCTCAGTATTTTT
TTTTTCTGTTTGCTACTAGTATGTATCATTAATTTATCTAATACCAAGTTTCAGTTTCTT
TCTC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 3

CO CL2976Contig1 977 3 2 U
GGATCATCTTCTTCATTAAGCAAAATAAAACTTTCAAACACTTTTTCATTCTTCATCTAA
AACGATGGCAGGAGTTGCTTTTGGTTCTTTTGATGATTCTTTCAGCTTGGCTTCTCTAAA
AGCATACCTCGCCGAGTTCATCTCCACTTTGCTCTTTGTTTTCGCTGGTGTTGGTTCCGC
CATTGCCTACGGTAAGTTGACATCGGATGCTGCTCTTGATACTCCGGGGCTTGTCGCCAT
CGCTGTGTGCCATGGTTTCGCCCTCTTCGTGGCGGTTGCCATCGGAGCCAACATCTCCGG
TGGCCATGTGAACCCGGCCGTCACTTTTGGCCTTGCTCTTGGTGGTCAAATCACGCTCAT
CACCGGAGTTTTCTACTGGGTTGCTCAGCTTCTCGGCTCCACCGCCGCTTGCTTCCTTCT
TAAGTTCGTCACTGGTGGTTTGGCGGTTCCAACTCACAGCGTTGCAGCTGGACTAGGGGC
GATAGAAGGAGTAGTGATGGGGATCATCATCACTTTCGCTTTGGTCTACACCGTCTACGC
CACCGCCGCTGACCCCAAGAAAGGTTCTCTTGGAACCATCGCTCCTCTCGCCATTGGTCT
CATCGTCGGTGCTAACATCCTCGCCGCCGGGCCATTCTCCGGTGGATCCATGAACCCAGC
ACGTTCCTTTGGACCAGCTTTCGCAGCTGGAGACTTCTCTGGTCACTGGGTCTACTGGGT
GGGACCACTCATCGGTGGTGGACTCGCTGGACTTATCTACGGAAATGTTTTCATGACTTC
CGAACATGTTCCTCTTGCATCTGACTTCTAAGCATATAAAATGCTAAGATTCTTGATTCA
TATTTCTGTGTTTGGCTTCTTTGTCTCTCGATTGATATGTTTTCTTTACAATTTCGTACC
ATTTCGTTGTAATTTTATCCAATCTGTATGAAAATTATTTTTAAATCTATTTAAAAAAAA
ATTAAAAGAATTCGGCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D603TF U 4
AF RR2B577TF U 1
AF RR2B577JQ C 135
BS 1 890 RR2B577TF
BS 891 977 RR2B577JQ

RD RR2D603TF 179 0 0
GG
ATCTTCTTCATTAAGCAAAATAAAACTTTCAAACACTTTTTCATTCTTCATCTAAAACGA
TGGCAGGAGTTGCTTTTGGTTCTTTTGATGATTCTTTCAGCTTGGCTTCTCTAAAAGCAT
ACCTCGCTGAGTTCATCTCCACTTTGCTTTTTGTTTTCGCTGGTGTTGGTTCCGCCA

QA 3 179 3 179
DS 

RD RR2B577TF 890 0 0
GGATCATCTTCTTCATTAAGCAAAATAAAACTTTCAAACACTTTTTCATTCTTCATCTAA
AACGATGGCAGGAGTTGCTTTTGGTTCTTTTGATGATTCTTTCAGCTTGGCTTCTCTAAA
AGCATACCTCGCCGAGTTCATCTCCACTTTGCTCTTTGTTTTCGCTGGTGTTGGTTCCGC
CATTGCCTACGGTAAGTTGACATCGGATGCTGCTCTTGATACTCCGGGGCTTGTCGCCAT
CGCTGTGTGCCATGGTTTCGCCCTCTTCGTGGCGGTTGCCATCGGAGCCAACATCTCCGG
TGGCCATGTGAACCCGGCCGTCACTTTTGGCCTTGCTCTTGGTGGTCAAATCACGCTCAT
CACCGGAGTTTTCTACTGGGTTGCTCAGCTTCTCGGCTCCACCGCCGCTTGCTTCCTTCT
TAAGTTCGTCACTGGTGGTTTGGCGGTTCCAACTCACAGCGTTGCAGCTGGACTAGGGGC
GATAGAAGGAGTAGTGATGGGGATCATCATCACTTTCGCTTTGGTCTACACCGTCTACGC
CACCGCCGCTGACCCCAAGAAAGGTTCTCTTGGAACCATCGCTCCTCTCGCCATTGGTCT
CATCGTCGGTGCTAACATCCTCGCCGCCGGGCCATTCTCCGGTGGATCCATGAACCCAGC
ACGTTCCTTTGGACCAGCTTTCGCAGCTGGAGACTTCTCTGGTCACTGGGTCTACTGGGT
GGGACCACTCATCGGTGGTGGACTCGCTGGACTTATCTACGGAAATGTTTTCATGACTTC
CGAACATGTTCCTCTTGCATCTGACTTCTAAGCATATAAAATGCTAAGATTCTTGATTCA
TATTTCTGTGTTTGGCTTCTTTGTCTCTCGATTGATATGTTTTCTTTACA

QA 1 890 1 890
DS 

RD RR2B577JQ 843 0 0
AGTTCATCTCCACTTTGCTCTTTGTTTTCGCTGGTGTTGGTTCCGCCATTGCCTACGGTA
AGTTGACATCGGATGCTGCTCTTGATACTCCGGGGCTTGTCGCCATCGCTGTGTGCCATG
GTTTCGCCCTCTTCGTGGCGGTTGCCATCGGAGCCAACATCTCCGGTGGCCATGTGAACC
CGGCCGTCACTTTTGGCCTTGCTCTTGGTGGTCAAATCACGCTCATCACCGGAGTTTTCT
ACTGGGTTGCTCAGCTTTTCGGCTCCACCGCCGCTTGCTTCCTTCTTAAGTTCGTCACTG
GTGGTTTGGCGGTTCCAACTCACAGCGTTGCAGCTGGACTAGGGGCGATAGAAGGAGTAG
TGATGGGGATCATCATCACTTTCGCTTTGGTCTACACCGTCTACGCCACCGCCGCTGACC
CCAAGAAAGGTTCTCTTGGAACCATCGCTCCTCTCGCCATTGGTCTCATCGTCGGTGCTA
ACATCCTCGCCGCCGGGCCATTCTCCGGTGGATCCATGAACCCAGCACGTTCCTTTGGAC
CAGCTTTCGCAGCTGGAGACTTCTCTGGTCACTGGGTCTACTGGGTGGGACCACTCATCG
GTGGTGGACTCGCTGGACTTATCTACGGAAATGTTTTCATGACTTCCGAACATGTTCCTC
TTGCATCTGACTTCTAAGCATATAAAATGCTAAGATTCTTGATTCATATTTCTGTGTTTG
GCTTCTTTGTCTCTCGATTGATATGTTTTCTTTACAATTTCGTACCATTTCGTTGTAATT
TTATCCAATCTGTATGAAAATTATTTTTAAATCTATTTAAAAAAAAATTAAAAGAATTCG
GCC

QA 1 843 1 843
DS 



AS 1 3

CO CL2977Contig1 583 3 3 U
GGGCAAAAGAGAGAGACAGGAAGAAAGAAAAGACCTTATCTAAGCAATGGCTTCTTCTTC
CACTTTTGTCTCTCTACCAAAACCCTTCTTTGCTATTCCGGTTAAAACCACAACTCCCGC
TCTAGCTAACCACCATAAGCTTCTCGGAAACCGAAGAGGTTGTCTTAGAGTCAAAGCGGT
TTCTACGAAATGGGAACCGGCAAAGGTTGTTCCTCAAGCAGACAGGGTTCTTGTTCGTCT
TGAAGAGCTTGCTCAGACAACATCAGGTGGAGTGTTGTTGCCTAAAGCAGCTGTTAAGTT
TGAGAGGTACCTAACCGGAGAGGTTGTCTCTGTTGGTTCTGAGGTTGGACAACAAGTTGG
ACCTGGAAAGAAGGTTCTGTTCTCTGACGTGAGCGCATATGAGGTCGATTTTTGAACCGG
TGCTAGGCATTGCTTTTGTAAAGAGAGCGACTTGTTGGCCCTCGTGGAGTAGTTGAGTGA
GATGATTACTTGCAGTGTTCCTTAAAGATTTTAAGTTGCTTACTGTAATTTTCAGACTTT
GTTTTGTGACAATCTTTCAGACATTTATATATCATTTGAGAAT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2AG74TF U 1
AF RR2BE84JQ C 1
AF RR2BE84TF U 1
BS 1 411 RR2AG74TF
BS 412 413 RR2BE84TF
BS 414 583 RR2AG74TF

RD RR2AG74TF 583 0 0
GGGCAAAAGAGAGAGACAGGAAGAAAGAAAAGACCTTATCTAAGCAATGGCTTCTTCTTC
CACTTTTGTCTCTCTACCAAAACCCTTCTTTGCTATTCCGGTTAAAACCACAACTCCCGC
TCTAGCTAACCACCATAAGCTTCTCGGAAACCGAAGAGGTTGTCTTAGAGTCAAAGCGGT
TTCTACGAAATGGGAACCGGCAAAGGTTGTTCCTCAAGCAGACAGGGTTCTTGTTCGTCT
TGAAGAGCTTGCTCAGACAACATCAGGTGGAGTGTTGTTGCCTAAAGCAGCTGTTAAGTT
TGAGAGGTACCTAACCGGAGAGGTTGTCTCTGTTGGTTCTGAGGTTGGACAACAAGTTGG
ACCTGGAAAGAAGGTTCTGTTCTCTGACGTGAGCGCATATGAGGTCGATTTGGGAACCGG
TGCTAGGCATTGCTTTTGTAAAGAGAGCGACTTGTTGGCCCTCGTGGAGTAGTTGAGTGA
GATGATTACTTGCAGTGTTCCTTAAAGATTTTAAGTTGCTTACTGTAATTTTCAGACTTT
GTTTTGTGACAATCTTTCAGACATTTATATATCATTTGAGAAT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2BE84JQ 583 0 0
GGGCAAAAGAGAGAGACAGGAAGAAAGAAAAGACCTTATCTAAGCAATGGCTTCTTCTTC
CACTTTTGTCTCTCTACCAAAACCCTTCTTTGCTATTCCGGTTAAAACCACAACTCCCGC
TCTAGCTAACCACCATAAGCTTCTCGGAAACCGAAGAGGTTGTCTTAGAGTCAAAGCGGT
TTCTACGAAATGGGAACCGGCAAAGGTTGTTCCTCAAGCAGACAGGGTTCTTGTTCGTCT
TGAAGAGCTTGCTCAGACAACATCAGGTGGAGTGTTGTTGCCTAAAGCAGCTGTTAAGTT
TGAGAGGTACCTAACCGGAGAGGTTGTCTCTGTTGGTTCTGAGGTTGGACAACAAGTTGG
ACCTGGAAAGAAGGTTCTGTTCTCTGACGTGAGCGCATATGAGGTCGATTTTTGAACCGG
TGCTAGGCATTGCTTTTGTAAAGAGAGCGACTTGTTGGCCCTCGTGGAGTAGTTGAGTGA
GATGATTACTTGCAGTGTTCCTTAAAGATTTTAAGTTGCTTACTGTAATTTTCAGACTTT
GTTTTGTGACAATCTTTCAGACATTTATATATCATTTGAGAAT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2BE84TF 583 0 0
GGGCAAAAGAGAGAGACAGGAAGAAAGAAAAGACCTTATCTAAGCAATGGCTTCTTCTTC
CACTTTTGTCTCTCTACCAAAACCCTTCTTTGCTATTCCGGTTAAAACCACAACTCCCGC
TCTAGCTAACCACCATAAGCTTCTCGGAAACCGAAGAGGTTGTCTTAGAGTCAAAGCGGT
TTCTACGAAATGGGAACCGGCAAAGGTTGTTCCTCAAGCAGACAGGGTTCTTGTTCGTCT
TGAAGAGCTTGCTCAGACAACATCAGGTGGAGTGTTGTTGCCTAAAGCAGCTGTTAAGTT
TGAGAGGTACCTAACCGGAGAGGTTGTCTCTGTTGGTTCTGAGGTTGGACAACAAGTTGG
ACCTGGAAAGAAGGTTCTGTTCTCTGACGTGAGCGCATATGAGGTCGATTTTTGAACCGG
TGCTAGGCATTGCTTTTGTAAAGAGAGCGACTTGTTGGCCCTCGTGGAGTAGTTGAGTGA
GATGATTACTTGCAGTGTTCCTTAAAGATTTTAAGTTGCTTACTGTAATTTTCAGACTTT
GTTTTGTGACAATCTTTCAGACATTTATATATCATTTGAGAAT

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL2978Contig1 740 2 5 U
GGAGACACAGAAAAATACAAGAGTGGAGAGAAAAAAACTGAGAAAAAGATAAGACATATA
TGGATACACAAAGATTACTCAAGAAAGAAGAAGATGATTATCAACCTTCCTCAACAATCG
AGTCCATGAATACTTTCTCTCAAGACCAACACAACTACTCTATGGATGATTTTGACAGCA
TTTTAGACCTCAACATTGACGGTTCAAAATGCTCTCAACAACTCATCTGGGATTTCTTTA
AAGAAGATGGCGAAGATGATGAAGAAAAAAGATTGAGTACTGATCAAGAAGGCTCAAGTT
CGGGGGTTTGGGATAATATGTCAGCGGATTGTGAAGACAGAGAGTTGGGTCTGAAGCTGA
ACTTGAACCATCAAGAAGTTATTAATGCTTGGTCTGATCGCCGCCAGCAACCTCTGTGGA
CGGATAACGCAAATTTAGTGGCTCCGACCAGTGCCGTTTATAGTGGAGAAGTGCCGGTGA
TGGATGAAGAGAGAAACACGAGAAGAGAAGCGAGTGTGTTGAGATACAAAGAGAAGAGAC
AAAGTAGGCTCTTCTCTAAGAAGATAAGGTATCAAGTCAGAAAGCTCAACGCCGATAAAC
GACCACGTTTCAAGGGTCGGTTCGTGAAAAGGGAGACTTAAATGGGAAAATAAAATATCT
CAAATCTTCGATCTGTCTTTTTTATTAGTATTATATGTATATTCGGCTAATTGAGCCTAT
ATTTATTTCATATCATTGTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW55TF U 1
AF RR2AP38TF U 1
BS 1 142 RR2AP38TF
BS 143 143 RR2DW55TF
BS 144 376 RR2AP38TF
BS 377 377 RR2DW55TF
BS 378 740 RR2AP38TF

RD RR2DW55TF 610 0 0
GGAGACACAGAAAAATACAAGAGTGGAGAGAAAAAAACTGAGAAAAAGATAAGACATATA
TGGATACACAAAGATTACTCAAGAAAGAAGAAGATGATTATCAACCTTCCTCAACAATCG
AGTCCATGAATGCTTTCTCTCAAGACCAACACAACTACTCTATGGATGATTTTGACAGCA
TTTTAGACCTCAACATTGACGGTTCAAAATGCTCTCAACAACTCATCTGGGATTTCTTTA
AAGAAGATGGCGAAGATGATGAAGAAAAAAGATTGAGTACTGATCAAGAAGGCTCAAGTT
CGGGGGTTTGGGATAATATGTCAGCGGATTGTGAAGACAGAGAGTTGGGTCTGAAGTTGA
ACTTGAACCATCAAGAAGTTATTAATGCTTGGTCTGATCGCCGCCAGCAACCTCTGTGGA
CGGATAACGCAAATTTAGTGGCTCCGACCAGTGCCGTTTATAGTGGAGAAGTGCCGGTGA
TGGATGAAGAGAGAAACACGAGAAGAGAAGCGAGTGTGTTTAGATACAAAGAGAAGAGAC
AAAGTAG*CTCTTCTCTAAGAAGATA*GGTATCAAGTCAGAAAGCTCAACGCCGATAAAC
GACCACGTTT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2AP38TF 740 0 0
GGAGACACAGAAAAATACAAGAGTGGAGAGAAAAAAACTGAGAAAAAGATAAGACATATA
TGGATACACAAAGATTACTCAAGAAAGAAGAAGATGATTATCAACCTTCCTCAACAATCG
AGTCCATGAATACTTTCTCTCAGGACCAACACAACTACTCTATGGATGATTTTGACAGCA
TTTTAGACCTCAACATTGACGGTTCAAAATGCTCTCAACAACTCATCTGGGATTTCTTTA
AAGAAGATGGCGAAGATGATGAAGAAAAAAGATTGAGTACTGATCAAGAAGGCTCAAGTT
CGGGGGTTTGGGATAATATGTCAGCGGATTGTGAAGACAGAGAGTTGGGTCTGAAGCTGA
ACTTGAACCATCAAGAGGTTATTAATGCTTGGTCTGATCGCCGCCAGCAACCTCTGTGGA
CGGATAACGCAAATTTAGTGGCTCCGACCAGTGCCGTTTATAGTGGAGAAGTGCCGGTGA
TGGATGAAGAGAGAAACACGAGAAGAGAAGCGAGTGTGTTGAGATACAAAGAGAAGAGAC
AAAGTAGGCTCTTCTCTAAGAAGATAAGGTATCAAGTCAGAAAGCTCAACGCCGATAAAC
GACCACGTTTCAAGGGTCGGTTCGTGAAAAGGGAGACTTAAATGGGAAAATAAAATATCT
CAAATCTTCGATCTGTCTTTTTTATTAGTATTATATGTATATTCGGCTAATTGAGCCTAT
ATTTATTTCATATCATTGTC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 3

CO CL2979Contig1 837 3 3 U
GGACGCTGTGTACGAAGAGTCGGACTGTTTTCCTCTCGTGATGAAGCTGTGTTCCGGGGG
ACGTTTGATTGATCAGATGGTTAGGGAAGGTAGGTACTCTGAGCAGCGAGCGGCTAATAT
ATTCAAGGACCTCATGCTTATCAGTTATTGCCACGAGATGGGAGTTGTACTTAGAGATCT
GTTGGGGAGAATGCTAACAAGAGACGAATCTGCCAGGATCACAGCGGATGAAGTGCTAAG
GCATCCATGGATACTCTTTTACACAGACCGGACACTCAAGACAATGTGTATTAAATCGAA
ACACAAGGGTCTAATAGCAGGAACTTCTCCTCCCTGCCTTCAGCTTCGCAATCCGATAAA
GAATACTGACGTAAACAGAAGCTAACAGGGAGAAGAAGACAACACATGATGATTCACCAC
CGACTGATTCATTCTCCAACACAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGATG
AAAGCGGTGTGGTCGATGTGCTTGTGGTTGCAATCTCCAACGTGAGGATCTCAGAACCGA
AGAGAAGCAGACTCTGTAGTCCCACCAACACCCCCATTGAGCAGCAACACTCTTCTAACT
TGACCACGACTAATACACTCTGTCGAGCCTTCTGACGCTAAACCAGCTTCACTCACTCGT
CCAAGTCTCTAAGTCACACGGGTTTGTCCCTGATATGATGATCTTGGTTACTGTCATAGA
TCATCATAATAGCTCTCTCTAATTAGTTGGATTTGATCTGATTCTGGTTTTCTCCTTCTA
CATTTCTGACTTTGCTGTACATATTATATCTTCATGCAAATAGAATACGCTACAAGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F685TF U 1
AF RR2F686TF U 1
AF RR2F686JQ C 198
BS 1 119 RR2F685TF
BS 120 766 RR2F686TF
BS 767 837 RR2F686JQ

RD RR2F685TF 119 0 0
GGACGCTGTGTACGAAGAGTCGGACTGTTTTCCTCTCGTGATGAAGCTGTGTTCCGGGGG
ACGTTTGATTGATCAGATGGTTAGGGAAGGTAGGTACTCTGAGCAGCGAGCGGCTAATA

QA 1 119 1 119
DS 

RD RR2F686TF 766 0 0
GGACGCTGTGTACGAAGAGTCGGACTGTTTTCCTCTCGTGATGAAGCTGTGTTCCGGGGG
ACGTTTGATTGATCAGATGGTTAGGGAAGGTAGGTACTCTGAGCAGCGAGCGGCTAATAT
ATTCAAGGACCTCATGCTTATCAGTTATTGCCACGAGATGGGAGTTGTACTTAGAGATCT
GTTGGGGAGAATGCTAACAAGAGACGAATCTGCCAGGATCACAGCGGATGAAGTGCTAAG
GCATCCATGGATACTCTTTTACACAGACCGGACACTCAAGACAATGTGTATTAAATCGAA
ACACAAGGGTCTAATAGCAGGAACTTCTCCTCCCTGCCTTCAGCTTCGCAATCCGATAAA
GAATACTGACGTAAACAGAAGCTAACAGGGAGAAGAAGACAACACATGATGATTCACCAC
CGACTGATTCATTCTCCAACACAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGATG
AAAGCGGTGTGGTCGATGTGCTTGTGGTTGCAATCTCCAACGTGAGGATCTCAGAACCGA
AGAGAAGCAGACTCTGTAGTCCCACCAACACCCCCATTGAGCAGCAACACTCTTCTAACT
TGACCACGACTAATACACTCTGTCGAGCCTTCTGACGCTAAACCAGCTTCACTCACTCGT
CCAAGTCTCTAAGTCACACGGGTTTGTCCCTGATATGATGATCTTGGTTACTGTCATAGA
TCATCATAATAGCTCTCTCTAATTAGTTGGATTTGATCTGATTCTG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2F686JQ 640 0 0
CAAGAGACGAATCTGCCAGGATCACAGCGGATGAAGTGCTAAGGCATCCATGGATACTCT
TTTACACAGACCGGACACTCAAGACAATGTGTATTAAATCGAAACACAAGGGTCTAATAG
CAGGAACTTCTCCTCCCTGCCTTCAGCTTCGCAATCCGATAAAGAATACTGACGTAAACA
GAAGCTAACAGGGAGAAGAAGACAACACATGATGATTCACCACCGACTGATTCATTCTCC
AACACAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGATGAAAGCGGTGTGGTCGAT
GTGCTTGTGGTTGCAATCTCCAACGTGAGGATCTCAGAACCGAAGAGAAGCAGACTCTGT
AGTCCCACCAACACCCCCATTGAGCAGCAACACTCTTCTAACTTGACCACGACTAATACA
CTCTGTCGAGCCTTCTGACGCTAAACCAGCTTCACTCACTCGTCCAAGTCTCTAAGTCAC
ACGGGTTTGTCCCTGATATGATGATCTTGGTTACTGTCATAGATCATCATAATAGCTCTC
TCTAATTAGTTGGATTTGATCTGATTCTGGTTTTCTCCTTCTACATTTCTGACTTTGCTG
TACATATTATATCTTCATGCAAATAGAATACGCTACAAGT

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 3

CO CL2980Contig1 1336 3 12 U
GGACAGCCAATTCACCCGGCGATCGGAAAGCTACCGGAACAATGAGCAGTACGGCAGGGA
AGCTCGTGACGTCGAGATCGGAGCTCAACATTGAAGATTATCTTCCTTCCGGCTCCACCA
TCCATGAACCTCGCGGCAAGCTCCGCCTGATTGATTGGATCGACATCTCACCAACTCTCA
CTGAAGCTGCTGGTGCCATCGTTGATGACTCATTCACAAGATGTTTCAAGTCGAATCCAC
CAGAGCCTTGGAACTGGAATATTTACTTGTTTCCACTATGGTGCTTTGGGGTTGTGGTTA
GATACTGCATTCTCTTTCCCTTGAGGTGCCTAACTTTAGCATTTGGGTGGTTTATTTTTC
TTTCAACATTCATCCCCGTACATTCGCTGCTCAAAGGTCAAGACAGGTTGAGGAAAAATA
TAGAGAGGGTCTTGGTGGAAATGATTTGCAGCTTTTTTGTCGGTTCATGGACAGGAGTTG
TCAAATATCATGGCCCACGCCCTAGCATTCGTCCTAAACAGGTCTATGTTGCCAACCATA
CCTCAATGATTGATTTCATCGTCTTGGAGCAGATGACCGCATTTGCTGTTATAATGCAGA
AGCATCCTGGGTTGGGTTGGGCTTCTGCAGAGCACAATATTAGAGAGTGTAGGATGTATC
TGGTTCAATCGTTCCGAGGCAAAGGATCGTGAAATTGTAGCGAGAAAGTTAAGAGACCAT
GTCCAAGGAGCTGACAATAATCCTCTTCTCATATTTCCCGAAGGGACGTGTGTAAATAAT
AATTATACGGTGATGTTTAAGAAGGGTGCTTTTGAATTGGGCTGCACTGTATGTCCAATC
GCCATCAAATACAACAAGATTTTTGTTGACGCCTTCTGGAACAGCAGAAAACAATCATTC
ACGATGCACTTGCTGCAACTCATGACTTTATGGGCAGTTGTGTTGAAGTGTGGTACTTGG
AACCCCAAACTATAAGGCCTGGTGAAACAGCAATTGAGTTTGCAGAGAGGGTGAGAGACA
TGATATCTCTTCGGGCAGGCCTCAAAAAGGTCCCTTGGGATGGATACTTGAAGTATTCAA
GACCAAGCTCCAAGCATAGTGAACGCAAGCAACAGAGTTTTGCGGAGTCCCTCCTTGCTA
GATTGGAAGAGAAGTGAATGTAACGATAAAGCACCTTTCCGTTTAGATAAAACAAATTCG
TGGCTTATTTTGCTTTAGTTTCTCTACGTTTTTTGTGAATCTTTGAATATGAATTCTTTT
GTAAGACCACAACCGGTCTTATTCACGAGCTCTTCCGAGTTTGGAAAGGCTAAGAATTAA
AACGTGCTCTGCAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D084TF U 7
AF RR2CI47TF U 1
AF RR2D084JQ C 553
BS 1 116 RR2CI47TF
BS 117 117 RR2D084TF
BS 118 156 RR2CI47TF
BS 157 157 RR2D084TF
BS 158 295 RR2CI47TF
BS 296 296 RR2D084TF
BS 297 537 RR2CI47TF
BS 538 538 RR2D084TF
BS 539 601 RR2CI47TF
BS 602 602 RR2D084TF
BS 603 674 RR2CI47TF
BS 675 1336 RR2D084JQ

RD RR2D084TF 603 0 0
GG
AATTCACCCGGCGATCGGAAAGCTACCGGAACAATGAGCAGTACGGCAGGGAAGCTCGTG
ACGTCGAGATCGGAGCTTAACATTGAAGATTATCTTCCTTCCGGCTCGACCATCCATGAA
CCTCGCGGCAAGCTCCGCCTGATTGATTGGATCGACATCTCACCAACTCTCACTTAAGCT
GCTGGTGCCATCGTTGATGACTCATTCACAAGATGTTTCAAGTCGAATCCACCAGAGCCT
TGGAACTGGAATATTTACTTGTTTCCACTATGGTGCTTTGGGGTTGTGGTTAGATACTGC
ATTCTCTTTCCCTTGAGGTGCCTAACTTTAGCATTTGGGTGGTTTATTTTTCTTTCAACA
TTCATCCCCGTACATTCGCTGCTCAAAGGTCAAGACAGGTTGAGGAAAAATATAGAGAGG
GTCTTGGTGGAAATGATTTGCAGCTTTTTTGTCGGTTCATGGACAGGAGTTGTCAAATAT
CATGGCCCACGCCCTAGCATTCGTCCTAAACAGGTCTATGTTGCCAACCATACCTCAATG
ATTGATTTCATCGTCTTGGAGCAGATGACCGCATTTGCTGTTATAATGCAGAAGCATCCT
G

QA 3 603 3 603
DS 

RD RR2CI47TF 674 0 0
GGACAGCCAATTCACCCGGCGATCGGAAAGCTACCGGAACAATGAGCAGTACGGCAGGGA
AGCTCGTGACGTCGAGATCGGAGCTCAACATTGAAGATTATCTTCCTTCCGGCTCCTCCA
TCCATGAACCTCGCGGCAAGCTCCGCCTGATTGATTTGATCGACATCTCACCAACTCTCA
CTGAAGCTGCTGGTGCCATCGTTGATGACTCATTCACAAGATGTTTCAAGTCGAATCCAC
CAGAGCCTTGGAACTGGAATATTTACTTGTTTCCACTATGGTGCTTTGGGGTTGTTGTTA
GATACTGCATTCTCTTTCCCTTGAGGTGCCTAACTTTAGCATTTGGGTGGTTTATTTTTC
TTTCAACATTCATCCCCGTACATTCGCTGCTCAAAGGTCAAGACAGGTTGAGGAAAAATA
TAGAGAGGGTCTTGGTGGAAATGATTTGCAGCTTTTTTGTCGGTTCATGGACAGGAGTTG
TCAAATATCATGGCCCACGCCCTAGCATTCGTCCTAAACAGGTCTATGTTGCCAACCGTA
CCTCAATGATTGATTTCATCGTCTTGGAGCAGATGACCGCATTTGCTGTTATAATGCAGA
AACATCCTGGGTTGGGTTGGGCTTCTGCAGAGCACAATATTAGAGAGTGTAGGATGTATC
TGGTTCAATCGTTC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2D084JQ 784 0 0
ATTTCATCGTCTTGGAGCAGATGACCGCATTTGCTGTTATAATGCAGAAGCATCCTGG*T
TGGGTTGGGCTTCTGCAGAGCACAATATTAGAGAGTGTAGGATGTATCTGGTTCAATCGT
TCCGAGGCAAAGGATCGTGAAATTGTAGCGAGAAAGTTAAGAGACCATGTCCAAGGAGCT
GACAATAATCCTCTTCTCATATTTCCCGAAGGGACGTGTGTAAATAATAATTATACGGTG
ATGTTTAAGAAGGGTGCTTTTGAATTGGGCTGCACTGTATGTCCAATCGCCATCAAATAC
AACAAGATTTTTGTTGACGCCTTCTGGAACAGCAGAAAACAATCATTCACGATGCACTTG
CTGCAACTCATGACTTTATGGGCAGTTGTGTTGAAGTGTGGTACTTGGAACCCCAAACTA
TAAGGCCTGGTGAAACAGCAATTGAGTTTGCAGAGAGGGTGAGAGACATGATATCTCTTC
GGGCAGGCCTCAAAAAGGTCCCTTGGGATGGATACTTGAAGTATTCAAGACCAAGCTCCA
AGCATAGTGAACGCAAGCAACAGAGTTTTGCGGAGTCCCTCCTTGCTAGATTGGAAGAGA
AGTGAATGTAACGATAAAGCACCTTTCCGTTTAGATAAAACAAATTCGTGGCTTATTTTG
CTTTAGTTTCTCTACGTTTTTTGTGAATCTTTGAATATGAATTCTTTTGTAAGACCACAA
CCGGTCTTATTCACGAGCTCTTCCGAGTTTGGAAAGGCTAAGAATTAAAACGTGCTCTGC
AACG

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 3

CO CL2981Contig1 571 3 3 U
GGGATCTGAGGAAGAAGGGCGAAAATGGCGAAACCGTTGGGAACTACGGGAGAGTTTTTC
AGGAGAAGGGATGAGTGGAGGAAGCACCCGATGCTTTCTAATCAAATAAGACACGCGCTT
CCTGGTCTCGGCATCGGCGTCGGCGCCTTCTGCGTTTACCTTGTCGGCGAGCAGATCTAT
ACCAAACTCATGGCTCCTTCTCAATCTTCTCACCAGAAACAACCAGCTCCCTCTTCTCAC
TGAGACTGATTGTTTCGATCGTGATGAAACTTGCAGCAGATTAAGAGTTGTGGGATTCAG
AATTTGCCATTTTTCTCGGTTTATCTCAATAAGATGTTGATGAAAGACAGAAGACTTGTA
TGACATTCTGCTGTGTGGTCTTGCTATGTATTGTCGTTTTGGTTAATAACAGTTCTAAAA
TGACATTGAAGAATAAAGAATGACTCTTAGACATCCAAGGACAGGTCTGTATTCATCTAA
AGTCTAAACAAACTACGTCGATTAGATCGATAATGGAGTTTTCTCTGAAAATGGGCCTAT
TGACAATCTCTATAATAAATAGAGAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR04JQ C 1
AF RR2AR04TF U 1
AF RR2GX64TF U 6
BS 1 7 RR2AR04JQ
BS 8 434 RR2AR04TF
BS 435 571 RR2GX64TF

RD RR2AR04JQ 434 0 0
GGGATCTGAGGAAGAAGGGCGAAAATGGCGAAACCGTTGGGAACTACGGGAGAGTTTTTC
AGGAGAAGGGATGAGTGGAGGAAGCACCCGATGCTTTCTAATCAAATAAGACACGCGCTT
CCTGGTCTCGGCATCGGCGTCGGCGCCTTCTGCGTTTACCTTGTCGGCGAGCAGATCTAT
ACCAAACTCATGGCTCCTTCTCAATCTTCTCACCAGAAACAACCAGCTCCCTCTTCTCAC
TGAGACTGATTGTTTCGATCGTGATGAAACTTGCAGCAGATTAAGAGTTGTGGGATTCAG
AATTTGCCATTTTTCTCGGTTTATCTCAATAAGATGTTGATGAAAGACAGAAGACTTGTA
TGACATTCTGCTGTGTGGTCTTGCTATGTATTGTCGTTTTGGTTAATAACAGTTCTAAAA
TGACATTGAAGAAT

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR2AR04TF 434 0 0
GGGATCT
GAGGAAGAAGGGCGAAAATGGCGAAACCGTTGGGAACTACGGGAGAGTTTTTCAGGAGAA
GGGATGAGTGGAGGAAGCACCCGATGCTTTCTAATCAAATAAGACACGCGCTTCCTGGTC
TCGGCATCGGCGTCGGCGCCTTCTGCGTTTACCTTGTCGGCGAGCAGATCTATACCAAAC
TCATGGCTCCTTCTCAATCTTCTCACCAGAAACAACCAGCTCCCTCTTCTCACTGAGACT
GATTGTTTCGATCGTGATGAAACTTGCAGCAGATTAAGAGTTGTGGGATTCAGAATTTGC
CATTTTTCTCGGTTTATCTCAATAAGATGTTGATGAAAGACAGAAGACTTGTATGACATT
CTGCTGTGTGGTCTTGCTATGTATTGTCGTTTTGGTTAATAACAGTTCTAAAATGACATT
GAAGAAT

QA 8 434 8 434
DS 

RD RR2GX64TF 566 0 0
GG
GAGGAAGAAGGGCGAAAATGGCGAAACCGTTGGGAACTACGGGAGAGTTTTTCAGGAGAA
GGGATGAGTGGAGGAAGCACCCGATGCTTTCTAATCAAATAAGACACGCGCTTCCTGGTC
TCGGCATCGGCGTCGGCGCCTTCTGCGTTTACCTTGTCGGCGAGCAGATCTATACCAAAC
TCATGGCTCCTTCTCAATCTTCTCACCAGAAACAACCAGCTCCCTCTTCTCACTGAGACT
GATTGTTTCGATCATGATGAAACTTGCAGCAGATTAAGAGTTGTGGGATTCAGAATTTGC
CATTTTTCTCGGTTTATCTCAATAAGATGTTGATGAAAGACAGAAGACTTGTATGACATT
CTGCTGTGTGGTCTTGCTATGTATTGTCGTTTTGGTTAATAACAGTTCTAAAATGACATT
GAAGAATAAAGAATGACTCTTAGACATCCAAGGACAGGTCTGTATTCATCTAAAGTCTAA
ACAAACTACGTCGATTAGATCGATAATGGAGTTTTCTCTGAAAATGGGCCTATTGACAAT
CTCTATAATAAATAGAGAAAAAAA

QA 3 566 3 566
DS 



AS 1 3

CO CL2982Contig1 607 3 1 U
GGATAGGATTCAAATCAGAAGTTATAATTTGTGAGGGGTTCCATTATTCTCTCTAACGTT
GCTATACTCTCAAGAGTGCTATTATCTTCTACAAAATTGCGATGCATTCGTTGATGCTGT
CATCAAAACTGGCAGAAGTTCTGATCTATAGTGGAAAAACGGCAAGGCGTTTTCCACCCT
GCAGGGCATTCGTCTCAGCGTCAAGGCCCTTACAAGGAAAAGAAGAGGCAGAGCAATGCC
AAAAGGTGAAAGAAGCAGCAGAGGCGGTGAAAGAAGGAGCACAGGCGGTGAAAGAAACCA
CCGAGTATATCCACGATGTCGCTTCTACTACGGCTAACCGTGTGAGTAAGATGACAAAGG
ATGTGACCGAGAAAGTTACTGAGACAACGGATTCTATCACTGAGAAAGCTAAAGGATCTG
TATCTGGAGTTTTGGGCACAGCCAAAAACGCCACTGATATCATCAAAAAAAAAAATTCTT
GGTGGTGATTAGTTACTACTTATAAATATTTAATATGTTTATGTAAGTTTCAATAAAATT
AGTAGTATTCAAAATATTTGTAAGTTTTATTTGGCAACGAATGCTTCAATGATATTTTAT
ACTAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY58JQ C 148
AF RR2EJ79TF U 17
AF RR2CY58TF U 1
BS 1 607 RR2CY58TF

RD RR2CY58JQ 301 0 0
ATAGTGGAAAAACGGCAAGGCGTTTTCCACCCTGCAGGGCATTCGTTTCAGCGTCAAGGC
CCTTACAAGGAAAAGAAGAGGCAGAGCAATGCCAAAAGGTGAAAGAAGCAGCAGAGGCGG
TGAAAGAAGGAGCACAGGCGGTGAAAGAAACCACCGAGTATATCCACGATGTCGCTTTTA
TTACGGCTAACCGTGTGAGTAAGATGACAAAGGATGTGACCGAGAAAGTTACTGAGACAA
CGGATTCTATCACTGAGAAAGCTAAAGGATCTGTATCTGGAGTTTTGGGCACAGCCAAAA
A

QA 1 301 1 301
DS 

RD RR2EJ79TF 518 0 0
AGAAGTTATAATTTGTGAGGGGTTCCATTATTCTCTCTAACGTTGCTATACTCTCAAGAG
TGCTATTATCTTCTACAAAATTGCGATGCATTCGTTGATGCTGTCATCAAAACTGGCAGA
AGTTCTGATCTATAGTGGAAAAACGGCAAGGCGTTTTCCACTCTGCAGGGCATTCGTCTC
AACGTCAAGGCCCTTACAAGGAAAAGAAGAGGCAGAGCAATGCCAAAAGGTGAAAGAAGC
AGCAGAGGCGGTGAAAGAAGGAGCACAGGCGGTGAAAGAAACCACCGAGTATATCCACGA
TGTCGCTTCTACTACGGCTAACCGTGTGAGTAAGATGACAAAGGATGTGACCGAGAAAGT
TACTGAGACAACGGATTCTATCACTGAGAAAGCTAAAGGATCTGTATCTGGAGTTTTGGG
CACAGCCAAAAACGCCACTGATATCATCAAAAAAAAA**TTCTTGGTGGTGATTAGTTAC
TACTTATAAATATTTAATATGTTTATGTAAGTTTCAAT

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2CY58TF 607 0 0
GGATAGGATTCAAATCAGAAGTTATAATTTGTGAGGGGTTCCATTATTCTCTCTAACGTT
GCTATACTCTCAAGAGTGCTATTATCTTCTACAAAATTGCGATGCATTCGTTGATGCTGT
CATCAAAACTGGCAGAAGTTCTGATCTATAGTGGAAAAACGGCAAGGCGTTTTCCACCCT
GCAGGGCATTCGTCTCAGCGTCAAGGCCCTTACAAGGAAAAGAAGAGGCAGAGCAATGCC
AAAAGGTGAAAGAAGCAGCAGAGGCGGTGAAAGAAGGAGCACAGGCGGTGAAAGAAACCA
CCGAGTATATCCACGATGTCGCTTCTACTACGGCTAACCGTGTGAGTAAGATGACAAAGG
ATGTGACCGAGAAAGTTACTGAGACAACGGATTCTATCACTGAGAAAGCTAAAGGATCTG
TATCTGGAGTTTTGGGCACAGCCAAAAACGCCACTGATATCATCAAAAAAAAAAATTCTT
GGTGGTGATTAGTTACTACTTATAAATATTTAATATGTTTATGTAAGTTTCAATAAAATT
AGTAGTATTCAAAATATTTGTAAGTTTTATTTGGCAACGAATGCTTCAATGATATTTTAT
ACTAGTC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 3

CO CL2983Contig1 591 3 6 U
GGTCGTCTTTGTGAGCTTCTTCATATTTCGGCCTCTAATCTACTCAACATTCAACATCAT
GGCGCCAAAGAAGGATAAGGTTCCGCCGCCCTCATCGAAGCCGGCCAAATCCGGAGGTGG
AAAACAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGT
GTTGTTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAAGCTCCCAAGTTCAAGCTCAT
CACCCCGTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTAGCAAGGAAGGCCAT
TAGGGAGTTAATGGCAAAAGGTGTGATTAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGAT
CTACACTCGTGCCACCAACACCTAAACAGATTTGCTTTTGTCAATGGTTTGATGCTTCTT
TTCACTCCTTTGTACTCGAGAAACTCTTTTAGAATGCCTTTTTTGGATATTATGTCTACT
TAATTTTGAACCATTTTCTATTTTTGCTCTCAGTAGTCTTATCATAATTTCATTCAGATA
TCCAAGTCAGTTTTTTTGTGTTCTTTTATTTGATTTCTCAGTATTGCTCTC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2EI68TF U 1
AF RR2EI68JQ C 1
AF RR2AD21TF U 4
BS 1 4 RR2EI68JQ
BS 5 237 RR2EI68TF
BS 238 556 RR2AD21TF
BS 557 557 RR2EI68JQ
BS 558 588 RR2AD21TF
BS 589 591 RR2EI68JQ

RD RR2EI68TF 237 0 0
GGTC
GTCTTTGTGAGCTTCTTCATATTTCGGCCTCTAATCTACTCAACATTCAACATCATGGCG
CCAAAGAAGGATAAGGTTCCGCCGCCCTCATCGAAGCCGGCCAAATCCGGAGGTGGAAAA
CAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTG
TTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAAGCTCCCAAGTTCAAGCT

QA 5 237 5 237
DS 

RD RR2EI68JQ 591 0 0
GGTCGTCTTTGTGAGCTTCTTCATATTTCGGCCTCTAATCTACTCAACATTCAACATCAT
GGCGCCAAAGAAGGATAAGGTTCCGCCGCCCTCATCGAAGCCGGCCAAATCCGGAGGTGG
AAAACAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGT
GTTGTTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAAGCTCCCAAGTTCAAGCTCAT
CACCCCGTCCATTCTCTCCGGCCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTAGCAAGGAAGGCCAT
TAGGGAGTTA*TGGCAAAAGGTGTGATTAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGAT
CTACACTCGTGCCACCAACACCTAAACAGATTTGCTTTTGTCAATGGTTTGATGCTTCTT
TTCACTCCTTTGTACTCGAGAAACTCTTTTAGAATGCCTTTTTTGGATATTATGTCTACT
TAATTTTGAACCATTTTCTATTTTTGCTCTCAGTAGTCTTATCATAATTTCATTCAGATA
TCCAAGTCAGTTTTTTTGTGTTCTTTTATTTGATTTCTCAGTATTGCTCTC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2AD21TF 585 0 0
G
GTCTTTGTGAGCTTCTTCATATTTCGGCCTCTAATCTACTCAACATTCAACATCATGGCG
CCAAAGAAGGATAAGGTTCCGCCGCCCTCATCGAAGCCGGCCAAATCCGGAGGTGGAAAA
CAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTG
TTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAAGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACC
CCGTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTAGCAAGGAAGGCCATTAGG
GAGTTAATGGCAAAAGGTGTGATTAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTAC
ACTCGTGCCACCAACACCTAAACAGATTTGCTTTTGTCAATGGTTTGATGCTTCTTTTCA
CTCCTTTGTACTCGAGAAACTCTTTTAGAATGCCTTTTTTGGATATTATGTCTACTTAAT
TTTGAACCATTTTCTATTTTTGCTCTCAGTAGTCTTATCATAATTTCATTCAGATATCCA
AGTCAGTTTTTT*GTGTTCTTTTATTTGATTTCTCAGTATTGCT

QA 2 585 2 585
DS 



AS 1 2

CO CL2984Contig1 1030 2 8 U
TTGGAAAAAGAAAAAAAATCATCAAACCCTAAAATTTTTACATCTCGTTCGGAGCAGATT
GTTATCGTATCATCTCTTGTGGGGGCAAAAGAGTGGGAGAGAGAGAGATGGATTGGGATA
GCGTAGCAGCGGGGGATGTGATAGAGGCGTTAAGAGAGGTAGAGTAGTCGACGAGTCCTC
GTTCCTTGGCAGAGTTCTTCTCCAGATTCGCCTTCCCTCGCTCTTTCTCTAAATGGATGA
GCCGCCTCAAATGCAATCTCTACTACTATAGGACCAATTACTTCATCCTCTTGATTTTCG
TTCTCGGTCTTACACTTATCACCCGACCTATTGCTATTATTGGTGCTGCTCTTACTGCCC
TGAGCCTAGCTTTCCTTAACGACAGCTTTGCAGCTACTTTCAATGAAAAGGCTATCCGGA
CCATAAGGCAATTCTCCCCACATTTAGCTGCAAAGATGAGGCCTCCCCACATGCCCGTCA
TTCGTGGGCGATCTGCGTCTAGAAAGACGGTCTACGTTTGTGGCCAACCACGTTTGGTGT
TCGTGTTGCTTGGATTAACCGCCAGCTTTGTCTTGTGGTTTACTTCCTGCGGTTTGTTAT
GGGTCCTCTATGCACTTGCCACTGCCCTTCTCATGATCATGCTTCATGCAAGCCTGAGAA
CCCCAAACCTCAAGGCACGCTTGAACACATTCCGCGAAGAGTTCAGAGCTGTCTGGCGTA
ACTACAGTGAACTTTAAAGTCAACAAAAGAAGCTTTCAAGGTTGAAGGCTATAAACCAAA
AGCGGGGGATATTAAAGTTTCAAGTAAGGGCATAAGTTGCAACTCACTCCATCATGTGCG
TGAACAACAACAACAATCGCAGTTATTCTTGTCTTTTAGCTAGCTAGTAATTGTAAAAGC
CACTTTGTCTGGCTTAGTTGAGTTGAAATCACAGGGTTGGTTGATAAATCTCAGACAAGA
GAATATAGTGTTGTGTGCCGTTAAAGTTCATTGTAATGCTGCTGCTCTCAACACCAAGCC
TGTGTATTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY52TFB U 1
AF RR2AC69TF U 331
BS 1 359 RR2AY52TFB
BS 360 360 RR2AC69TF
BS 361 400 RR2AY52TFB
BS 401 401 RR2AC69TF
BS 402 559 RR2AY52TFB
BS 560 560 RR2AC69TF
BS 561 670 RR2AY52TFB
BS 671 1030 RR2AC69TF

RD RR2AY52TFB 670 0 0
TTGGAAAAAGAAAAAAAATCATCAAACCCTAAAATTTTTACATCTCGTTCGGAGCAGATT
GTTATCGTATCATCTCTTGTGGGGGCAAAAGAGTGGGAGAGAGAGAGATGGATTGGGATA
GCGTAGCAGCGGGGGATGTGATAGAGGCGTTAAGAGAGGTAGAGTAGTCGACGAGTCCTC
GTTCCTTGGCAGAGTTCTTCTCCAGATTCGCCTTCCCTCGCTCTTTCTCTAAATGGATGA
GCCGCCTCAAATGCAATCTCTACTACTATAGGACCAATTACTTCATCCTCTTGATTTTCG
TTCTCGGTCTTACACTTATCACCCGACCTATTGCTATTATTGGTGCTGCTCTTACTGCCT
TGAGCCTAGCTTTCCTTAACGACAGCTTTGCAGCTACTTTTAATGAAAAGGCTATCCGGA
CCATAAGGCAATTCTCCCCACATTTAGCTGCAAAGATGAGGCCTCCCCACATGCCCGTCA
TTCGTGGGCGATCTGCGTCTAGAAAGACGGTCTACGTTTGTGGCCAACCACGTTTGGTGT
TCGTGTTGCTTGGATTAACTGCCAGCTTTGTCTTGTGGTTTACTTCCTGCGGTTTGTTAT
GGGTCCTCTATGCACTTGCCACTGCCCTTCTCATGATCATGCTTCATGCAAGCCTGAGAA
CCCCAAACCT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2AC69TF 700 0 0
G
TGCTATTATTGGTGCTGCTCTTACTGCCCTGAGCCTAGCTTTCCTTAATGACAGCTTTGC
AGCTACTTTCAATGAAAAGGCTATCCGGACCATAAGGCAATTCTCCCCACATTTAGCTGC
AAAGATGAGGCCTCCCCACATGCCCGTCATTCGTGGGCGATCTGCGTCTAGAAAGACGGT
CTACGTTTGTGGCCAACCACGTTTGGTGTTCGTGTTGCTTGGATTAACCGCCAGCTTTGT
CTTGTGGTTTACTTCCTGCGGTTTGTTATGGGTCCTCTATGCACTTGCCACTGCCCTTCT
CATGATCATGCTTCATGCAAGCCTGAGAACTCCAAACCTCAAGGCACGCTTGAACACATT
CCGCGAAGAGTTCAGAGCTGTCTGGCGTAACTACAGTGAACTTTAAAGTCAACAAAAGAA
GCTTTCAAGGTTGAAGGCTATAAACCAAAAGCGGGGGATATTAAAGTTTCAAGTAAGGGC
ATAAGTTGCAACTCACTCCATCATGTGCGTGAACAACAACAACAATCGCAGTTATTCTTG
TCTTTTAGCTAGCTAGTAATTGTAAAAGCCACTTTGTCTGGCTTAGTTGAGTTGAAATCA
CAGGGTTGGTTGATAAATCTCAGACAAGAGAATATAGTGTTGTGTGCCGTTAAAGTTCAT
TGTAATGCTGCTGCTCTCAACACCAAGCCTGTGTATTTA

QA 2 700 2 700
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL2986Contig1 1362 3 11 U
GGGTTGGTGAAGAAGATGAAATTTCCCAAGAGCTTGATCGAGGATCTTCACAAATGGGGA
CGCATGAAGCAGACGGGCGTGAGCCTCAGGTACATGATGGAGTTCGGTTCCACCCCTACC
GAGAGGAACCTTTTGATCTCTGCGCAGTTTCTCCACAAGGAGCTTCCGATTCGCGTCGCG
AGGCGGGCACTCGAACTCGAGACGCTGCCTTACGGTCTCTCCGACAAACCTGCCGTCTTG
AAGGTAAGGGATTGGTATCTGGAATCATTCAGGGACATGAGAGCGTTTCCCGAGATCAAG
GACACTGCTGACGAGAAAGACTTCACTCAGATGATAAAGGCCGTCAAAGTAAGGCACAAC
AACGTGGTTCCCATGATGGCTCTCGGTGTTAACCAGCTCAAGAAAAGGAGTCCATTTCTA
CGAGAATCTTGATGAGATTCATCAGTTTCTTGATCGCTTCTACTTGTCCCGTATAGGCGT
CCGTAACCTCATTGGGCAGCATGTTGAGTTGCATAATCCAAACCCGCCACGTCACTGTGT
GGGTTACATACACACCAAGATGTCTCCTGTGGAGGTAGCAAGGAACGCGACTGAAGACGC
ACGGTCTATATGTTACCGAGAGTATGGTTCTGCTCCGGAGATCAACATATACGGTGATCC
AAGTTTCACCTTTCCGTATGTTCCAACACATTTGCATCTTATGGTGTATGAGCTAGTCAA
GAACTCTCTACGTGCGGTCCAAGAGCGATATGTTGATTCCGATAGAGTTGCACCACCAGT
CCGCATTATAGTTGCTGATGGTATCGAAGATGTTACAATAAAGGTGTCAGATGAAGGTGG
AGGTATACCGAGAAGTGGTCTCCCCAAAATATTCACGTATCTTTACAGCACGGCAACAAA
CCCGCTTGAAGAGGAATTGCAGTTTGGAACAGCTGATGTTCCCGTGATTATGGCTGGCTA
TGGTTATGGTCTGCCAATTAGTCGTTTGTATGCTCGTTATTTCGGTGGAGATTTGCAGAT
CATATCCATGGAAGGATACGGGACTGATGCTTACTTGCACTTGTCGCGCCTTGGTGATTC
ACAAGAGCCTTTGCCCTGAGAAAATCTCACAGCTCAGGCTTGTGAATAAAGCTTTGACAT
ACTAATGGTAGTGACACGGGATCTACTTTGTTCACTAAGTTCTTTTTTTCAGTTTATTTG
ATGTACATACATTATTACTCTCATTTATGATTTGAAACTCAGATATGGAGGTTATTCTAA
GTGAGTTAAATCTCCTCTGACTTGTGATTTTATTTGATTCAAAACATTTTGTAAGCAAAA
CGTTACTGTCCTGGTTTATATATTTGAAAAAAATATTTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL28TF U 1
AF RR2G010TF U 192
AF RR2G010JQ C 628
BS 1 653 RR2FL28TF
BS 654 654 RR2G010TF
BS 655 739 RR2FL28TF
BS 740 740 RR2G010TF
BS 741 768 RR2FL28TF
BS 769 769 RR2G010TF
BS 770 786 RR2FL28TF
BS 787 915 RR2G010TF
BS 916 916 RR2G010JQ
BS 917 960 RR2G010TF
BS 961 1362 RR2G010JQ

RD RR2FL28TF 789 0 0
GGGTTGGTGAAGAAGATGAAATTTCCCAAGAGCTTGATCGAGGATCTTCACAAATGGGGA
CGCATGAAGCAGACGGGCGTGAGCCTCAGGTACATGATGGAGTTCGGTTCCACCCCTACC
GAGAGGAACCTTTTGATCTCTGCGCAGTTTCTCCACAAGGAGCTTCCGATTCGCGTCGCG
AGGCGGGCACTCGAACTCGAGACGCTGCCTTACGGTCTCTCCGACAAACCTGCCGTCTTG
AAGGTAAGGGATTGGTATCTGGAATCATTCAGGGACATGAGAGCGTTTCCCGAGATCAAG
GACACTGCTGACGAGAAAGACTTCACTCAGATGATAAAGGCCGTCAAAGTAAGGCACAAC
AACGTGGTTCCCATGATGGCTCTCGGTGTTAACCAGCTCAAGAAAAGGAGTCCATTTCTA
CGAGAATCTTGATGAGATTCATCAGTTTCTTGATCGCTTCTACTTGTCCCGTATAGGCGT
CCGTAACCTCATTGGGCAGCATGTTGAGTTGCATAATCCAAACCCGCCACGTCACTGTGT
GGGTTACATACACACCAAGATGTCTCCTGTGGAGGTAGCAAGGAACGCGACTGAAGACGC
ACGGTCTATATGTTACCGAGAGTATGGTTCTGCTCCGGAGATCAACATATACG*TGATCC
AAGTTTCACCTTTCCGTATGTTCCAACACATTTGCATCTTATGGTGTATGAGCTAGTCAA
GAACTCTCTACGTGCGGTC*AAGAGCGATATGTTGATTCCGATAGAGT*GCACCACCAGT
CCGCAT
ATA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2G010TF 769 0 0
G
GAACTCGAGACGCTGCCTTACGGTCTCTCCGACAAACCTGCCGTCTTGAAGGTAAGGGAT
TGGTATCTGGAATCATTCAGGGACATGAGAGCGTTTCCCGAGATCAAGGACACTGCTGAC
GAGAAAGACTTCACTCAGATGATAAAGGCCGTCAAAGTAAGGCACAACAACGTGGTTCCC
ATGATGGCTCTCGGTGTTAACCAGCTCAAGAAA*GGAGTCCATTTCTACGAGAATCTTGA
TGAGATTCATCAGTTTCTTGATCGCTTCTACTTGTCCCGTATAGGCGTCCGTAACCTTAT
TGGGCAGCATGTTGAGTTGCATAATCCAAACCCGCCACGTCACTGTGTGGGTTACATACA
CACCAAGATGTCTCCTGTGGAGGTAGCAAGGAACGCGACTGAAGACGCACGGTCTATATG
TTACCGAGAGTATGGTTCTGCTCCGGAGATCAACATATACGGTGATCCAAGTTTCACCTT
TCCGTATGTTCCAACACATTTGCATCTTATGGTGTATGAGCTAGTCAAGAACTCTCTACG
TGCGGTCCAAGAGCGATATGTTGATTCCGATAGAGTTGCACCACCAGTCCGCATTATAGT
TGCTGATGGTATCGAAGATGTTACAATAAAGGTGTCAGATGAAGGTGGAGGTATACCGAG
AAGTGGTCTCCCCAAAATATTCACGTATCTTTACAGCACGGCAACAAACCCGCTTGAAGA
GGA*TTGCAGTTTGGAACAGCTGATGTTCCCGTGATTATGGCTGGCTA

QA 2 769 2 769
DS 

RD RR2G010JQ 735 0 0
TTCTGCTCCGGAGATCAACATATACGGTGATCCAAGTTTCACCTTTCCGTATGTTCCAAC
ACATTTGCATCTTATGGTGTATGAGCTAGTCAAGAACTCTCTACGTGCGGTCCAAGAGCG
ATATGTTGATTCCGATAGAGTTGCACCACCAGTCCGCATTATAGTTGCTGATGGTATCGA
AGATGTTACAATAAAGGTGTCAGATGAAGGTGGAGGTATACCGAGAAGTGGTCTCCCCAA
AATATTCACGTATCTTTACAGCACGGCAACAAACCCGCTTGAAGAGGAATTGCAGTTTGG
AACAGCTGATGTTCCCGTGATTATGGCTGGCTATGGTTATGGTCTGCCAATTAGTCGTTT
GTATGCTCGTTATTTCGGTGGAGATTTGCAGATCATATCCATGGAAGGATACGGGACTGA
TGCTTACTTGCACTTGTCGCGCCTTGGTGATTCACAAGAGCCTTTGCCCTGAGAAAATCT
CACAGCTCAGGCTTGTGAATAAAGCTTTGACATACTAATGGTAGTGACACGGGATCTACT
TTGTTCACTAAGTTCTTTTTTTCAGTTTATTTGATGTACATACATTATTACTCTCATTTA
TGATTTGAAACTCAGATATGGAGGTTATTCTAAGTGAGTTAAATCTCCTCTGACTTGTGA
TTTTATTTGATTCAAAACATTTTGTAAGCAAAACGTTACTGTCCTGGTTTATATATTTGA
AAAAAATATTTATTG

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 3

CO CL2987Contig1 591 3 4 U
GGCTGTAAAACTTTTTCAGTAAAGAATGGATATATCGTATCTTAGGACAACAGACATATA
TGTTGTGTCACATAAAATCATGGACTGGTTACAGTTTCCTGGAA*GAATTGAATCAGCAG
ATATTGTTTCGCCGTCTCCTTGATGTTCTTCTGTGTGCAGCCCATCTTTCCTTTATATCT
CGAGGATTCACAATCAGTTGCTCATCCGGCGACTGACTATCATCCGTCTCTCCGGTTGCC
AAACGTTTGCGGATCTTAGCGGTCTCAGCCAACAAGTCATGGATGAGCATCTCTGTTGTC
TTGGCCGTGATGCCTCTCAGATACCAAGAAATGGGAGGTGGTGGAACGATCGCCGGCTGT
ATAAGCTGGTCAAGCGTCACCTTTGATCCGACCCTCCCTTTACCTCCAGTGCACTGGTCA
TACTCCTCGAGTGTTTTCGGTTTCAGACGATCGCACATATGCTCGTCCACAAACAAAGGC
TGTACTTTCCAGTTTCCTTCGAATCTCTTCATGAACCCGCTCTTCACTTGCTTGAATCTC
ATAGAGTGATCTGCTCGGTTCTGATCCACCAGGACATGAACTGAGATTGTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT74JQ U 1
AF RR2BT74TF C 1
AF RR2GI59JQB U 1
BS 1 319 RR2BT74JQ
BS 320 320 RR2GI59JQB
BS 321 468 RR2BT74JQ
BS 469 591 RR2GI59JQB

RD RR2BT74JQ 471 0 0
GGCTGTAAAACTTTTTCAGTAAAGAATGGATATATCGTATCTTAGGACAACAGACATATA
TGTTGTGTCACATAAAATCATGGACTGGTTACAGTTTCCTGGAA*GAATTGAATCAGCAG
ATATTGTTTCGCCGTCTCCTTGATGTTCTTCTGTGTGCAGCCCATCTTTCCTTTATATCT
CGAGGATTCACAATCAGTTGCTCATCCGGCGACTGACTATCATCCGTCTCTCCGGTTGCC
AAACGTTTGCGGATCTTAGCGGTCTCAGCCAACAAGTCATGGATGAGCATCTCTGTTGTC
TTGGCCGTGATGCCTCTCAAATACCAAGAAATGGGAGGTGGTGGAACGATCGCCGGCTGT
ATAAGCTGGTCAAGCGTCACCTTTGATCCGACCCTCCCTTTACCTCCAGTGCACTGGTCA
TACTCCTCGAGTGTTTTCGGTTTCAGACGATCGCACATATGCTCGTCC
CCC

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR2BT74TF 461 0 0
GGCTGTAAAACTTTTTCAGTAAAGAATGGATATATCGTATCTTAGGACAACAGACATATA
TGTTGTGTCACATAAAATCATGGACTGGTTACAGTTTCCTGGAA*GAATTGAATCAGCAG
ATATTGTTTCGCCGTCTCCTTGATGTTCTTCTGTGTGCAGCCCATCTTTCCTTTATATCT
CGAGGATTCACAATCAGTTGCTCATCCGGCGACTGACTATCATCCGTCTCTCCGGTTGCC
AAACGTTTGCGGATCTTAGCGGTCTCAGCCAACAAGTCATGGATGAGCATCTCTGTTGTC
TTGGCCGTGATGCCTCTCAGATACCAAGAAATGGGAGGTGGTGGAACGATCGCCGGCTGT
ATAAGCTGGTCAAGCGTCACCTTTGATCCGACCCTCCCTTTACCTCCAGTGCACTGGTCA
TACTCCTCGAGTGTTTTCGGTTTCAGACGATCGCACATATG

QA 1 461 1 461
DS 

RD RR2GI59JQB 591 0 0
GGCTGTAAAACTTTTTCAGTAAAGAATGGATATATTGTATCTTAGGACAAAAGACATATA
TGTTGTGTCACATAAAATCATGGACTGGTTACAGTTTCCTGGAAAGAATTGAATCAGCAA
ATATTGTTTCGCCGTCTCCTTGATGTTCTTCTGTGTGCAGCCCATCTTTCCTTTATATCT
CGGGGATTCACAATCAGTTGCTCATCCGGCGACTGACTATCATCCGTTTCACCGGTTGCC
AAACGTTTGCGGATCTTAGCGGTCTCAGCCAACAAGTCATGGATGAACATCTCTGTTGTC
TTGGCCGTGATGCCTCTCAGGTACCAAGAAATGGGAGGTGGTGGAACAATCGCCGGCTGT
ATAAGCTGGTCAAGCGTCACCTTTGATCCGACCCTCCCTTTACCTCCAGTGCACTGGTTA
TACTCCTCGAGTGTTTTCGGTTTCAGACGATCGCACATATGCTCGTCCACAAACAAAGGC
TGTACTTTCCAGTTTCCTTCGAATCTCTTCATGAACCCGCTCTTCACTTGCTTGAATCTC
ATAGAGTGATCTGCTCGGTTCTGATCCACCAGGACATGAACTGAGATTGTT

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 3

CO CL2988Contig1 603 3 25 U
GGGCCTCTGAGATCTCTCCCATCCCTGACGCAAAGGAAGCAAAAATGGCGGTACCTTTGC
TAACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGCA
GAATCACCGTCAAGGAAAGCTGGAGAAGGCCAAAGGGTATTGATTCTCGGGTGAGGAGGA
AGTTCAAAGGTGTCACTTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCCGACAAGAAGACCCGTC
ACTATCTCCCCAACGGTTTCAAGAAATTCGTCGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTGC
TCATGATGCACAACAGGACCTACTGTGCGGAGATTGCTCACAATGTTTCGACGAAGAAGA
GGAAAGCAATCGTGGAGAGAGCTTCTCAGCTAGACATTGTCGTTACCAACAGGCTTGCTA
GGTTGCGTAGCCAGGAAGACGAGTAAAAAATTAAGCCCTAGGGTTTACTTTTCATCTGTC
TTTAACAATTTCAGACCGTTTTTTTTTGTTTTTTTTGCGTATTAAGTTTGTTTTATTCAT
AATCTGTTTTACATTCGATAATACAGTTTCATCAATACTACTATACTAAAAGCTAAATAA
GCT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2F793JQ C 1
AF RR2F793TF U 1
AF RR2D516TF U 1
BS 1 34 RR2D516TF
BS 35 35 RR2F793TF
BS 36 55 RR2D516TF
BS 56 56 RR2F793TF
BS 57 118 RR2D516TF
BS 119 119 RR2F793TF
BS 120 145 RR2D516TF
BS 146 146 RR2F793TF
BS 147 216 RR2D516TF
BS 217 217 RR2F793TF
BS 218 286 RR2D516TF
BS 287 287 RR2F793TF
BS 288 319 RR2D516TF
BS 320 320 RR2F793TF
BS 321 477 RR2D516TF
BS 478 478 RR2F793TF
BS 479 480 RR2D516TF
BS 481 481 RR2F793TF
BS 482 483 RR2D516TF
BS 484 484 RR2F793TF
BS 485 502 RR2D516TF
BS 503 510 RR2F793TF
BS 511 536 RR2D516TF
BS 537 537 RR2F793TF
BS 538 603 RR2D516TF

RD RR2F793JQ 578 0 0
GGGCCTCTGAGATCTCTCCCATCCCTGACGCAAAGGAAGCAAAAATGGCGGTACCTTTGC
TAACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGCA
GAATCACCGTCAAGGAAAGCTGGAGAAGGCCAAAGGGTATTGATTCTCGGGTGAGGAGGA
AGTTCAAAGGTGTCACTTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCCGACAAGAAGACCCGTC
ACTATCTCCCCAACGGTTTCAAGAAATTCGTCGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTGC
TCATGATGCACAACAGGACCTACTGTGCGGAGATTGCTCACAATGTTTCGACGAAGAAGA
GGAAAGCAATCGTGGAGAGAGCTTTTCAGCTAGACATTGTCGTTACCAACAGGCTTGCTA
GGTTGCGTAGCCAGGAAGACGAGTAAAAAATTAAGCCCTAGGGTTTACTTTTCATCTGTC
TTTAACAATTTCAGACCGTTTTTTTTTGTTTTTTTTGCGTATTAAGTTTGTTTTATTCAT
AATCTGTTTTACATTCGATAATACAGTTTCAT
ATATTT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2F793TF 572 0 0
GGGCCTCTGAGATCTCTCCCATCCCTGACGCAAAGGAAGCAAAAATGGCGGTACCTTTGC
TAACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGCA
GAATCACCGTCAAGGAAAGCTGGAGAAGGCCAAAGGGTATTGATTCTCGGGTGAGGAGGA
AGTTCAAAGGTGTCACTTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCCGACAAGAAGACCCGTC
ACTATCTCCCCAACGGTTTCAAGAAATTCGTCGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTGC
TCATGATGCACAACAGGACCTACTGTGCGGAGATTGCTCACAATGTTTCGACGAAGAAGA
GGAAAGCAATCGTGGAGAGAGCTTCTCAGCTAGACATTGTCGTTACCAACAGGCTTGCTA
GGTTGCGTAGCCAGGAAGACGAGTAAAAAATTAAGCCCTAGGGTTTACTTTTCATCTGTC
TTTAACAATTTCAGACCGTTTTTTTTTGTTTTTTTTGCGTATTAAGTTTGTTTTATTCAT
AATCTGTTTTACATTCGATAATACAGTTTCAT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2D516TF 603 0 0
GGGCCTCTGAGATCTCTCCCATCCCTGACGCAAAAGAAGCAAAAATGGCGGTACCGTTGC
TAACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGTA
GAATCACCGTCAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGATTCTCGGGTGAGGAGGA
AGTTCAAAGGTGTCACTTTGATGCCCAATGTTGGTTGCGGATCCGACAAGAAGACCCGTC
ACTATCTCCCCAACGGTTTCAAGAAATTCGTCGTTCACAACTCTGCCGATCTTGAGTTGC
TCATGATGCACAACAGGACTTACTGTGCGGAGATTGCTCACAATGTTTCGACGAAGAAGA
GGAAAGCAATCGTGGAGAGAGCTTCTCAGCTAGACATTGTCGTTACCAACAGGCTTGCTA
GGTTGCGTAGCCAGGAAGACGAGTAAAAAATTAAGCCCTAGGGTTTACTTTTCATCTCTC
ATTGACAATTTCAGACCGTTTT*******ATTTTTTGCGTATTAAGTTTGTTTTATCCAT
AATCTGTTTTACATTCGATAATACAGTTTCATCAATACTACTATACTAAAAGCTAAATAA
GCT

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 3

CO CL2989Contig1 910 3 12 U
GCGGTTCATGACCCACCACCAAAGGTAGAGCCCCCACCTCCAGTTCCGGTTTACAAGCCA
CCACCAAAGGTAGAGCACCCACCTCCAGTTCCGGTTTACAAGCCACCTCCAAAGTTAGAA
CACCCACCTCCAGTTCCGGTTTACAAGCCACCTCCAAAGGTAGAGCACCCACCTCCGGTT
CCGGTTTACAAGCCACCGACAATCCCCAAAAAGCCATGCCCGCCTAAGTCGCCAAAGATC
GAGCTTCCACCTCCAGTGTCAGTTCACAAACCACCGACTAAGAAGCCTTGCCCGCCCAAG
CCGCCGAAGAAAGTTGATCCACCACCGGTTCCAGTCCACAAGCCGCCAAAGAAGCCGTGC
CCGCCCAAAACACCAAAGGTCGAGCTTCCACCACCAGTACCGGTCTACAAGCCACCACCG
AAGATAGAGCATCCACCAATCTACGTTCCACCGGTGATCCCAAAGAAGCCTTGCCCGCCC
AAAGCGCCGAAGATCGATCCTCCACCGCCGGTTCCGGTCTACAAGCCGCCACCGAAGATA
GGGCATCCACCAATCTACGTTCCACCGGTGATCCCAAAGAAGCCGTGTCCTCCGCCGGTA
CCAATCTACGTGCCACCGGTGGTGATTCCGAAGAAGCCATGTCCGCCACTTCCACCACTT
CCAAAGTTTCCGCCTCTTCCTCCTAAATACATTCACCACCCCAAGTTCGGCAAATGGCCT
CCGTTGCCGACTCACCCTTGAGAATTTAATACGTATACTTGTATGTAATCAACGTGTTGC
TTTTAAAAAAAAAAATATCATCCTGCATGTTTGAAATTTGGTTTGTTTTGCGACTTTCAT
CTTTTGTCTACTTAATTTCTCTCTGAGTTTTATGTGTAGACTGTTTGTTCATCTCTTCCA
GGAATAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DJ19TF U 1
AF RR2ER46JQ C 331
AF RR2ER46TF U 331
BS 1 389 RR2DJ19TF
BS 390 391 RR2ER46TF
BS 392 445 RR2DJ19TF
BS 446 446 RR2ER46TF
BS 447 483 RR2DJ19TF
BS 484 484 RR2ER46TF
BS 485 511 RR2DJ19TF
BS 512 512 RR2ER46TF
BS 513 541 RR2DJ19TF
BS 542 542 RR2ER46TF
BS 543 634 RR2DJ19TF
BS 635 910 RR2ER46TF

RD RR2DJ19TF 634 0 0
GCGGTTCATGACCCACCACCAAAGGTAGAGCCCCCACCTCCAGTTCCGGTTTACAAGCCA
CCACCAAAGGTAGAGCACCCACCTCCAGTTCCGGTTTACAAGCCACCTCCAAAGTTAGAA
CACCCACCTCCAGTTCCGGTTTACAAGCCACCTCCAAAGGTAGAGCACCCACCTCCGGTT
CCGGTTTACAAGCCACCGACAATCCCCAAAAAGCCATGCCCGCCTAAGTCGCCAAAGATC
GAGCTTCCACCTCCAGTGTCAGTTCACAAACCACCGACTAAGAAGCCTTGCCCGCCCAAG
CCGCCGAAGAAAGTTGATCCACCACCGGTTCCAGTCCACAAGCCGCCAAAGAAGCCGTGC
CCGCCCAAAACACCAAAGGTCGAGCTTCC**CACCAGTACCGGTCTACAAGCCACCACCG
AAGATAGAGCATCCACCAATCTACGCTCCACCGGTGATCCCAAAGAAGCCTTGCCCGCCC
AAATCGCCGAAGATCGATCCTCCACCGCCGGCTCCGGTCTACAAGCCGCCACCGAAGATA
GAGCATCCACCAATCTACGTTCCACCGGTGATCCCAAAGAAGCCGTGTCCTCCGCCGGTA
CCAATCTACGTGCCACCGGTGGTGATTCCGAAGA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2ER46JQ 580 0 0
G
CAGTCCACAAGCCGCCAAAGAAGCCGTGCCCGCCCAAAACACCAAAGGTCGAGCTTCCAC
CACCAGTACCGGTCTACAAGCCACCACCGAAGATAGAGCATCCACCAATTTACGTTCCAC
CGGTGATCCCAAAGAAGCCTTGCCCGCCCAAAGCGCCGAAGATCGATCCTCCACCGCCGG
TTCCGGTCTACAAGCCGCCACCGAAGATAGGGCATCCACCAATTTACGTTCCACCGGTGA
TCCCAAAGAAGCCGTGTCCTCCGCCGGTACCAATCTACGTGCCACCGGTGGTGATTCCGA
AGAAGCCATGTCCGCCACTTCCACCACTTCCAAAGTTTCCGCCTCTTCCTCCTAAATACA
TTCACCACCCCAAGTTCGGCAAATGGCCTCCGTTGCCGACTCACCCTTGAGAATTTAATA
CGTATACTTGTATGTAATCAACGTGTTGCTTTTAAAAAAAAAAATATCATCCTGCATGTT
TGAAATTTGGTTTGTTTTGCGACTTTCATCTTTTGTCTACTTAATTTCTCTCTGAGTTTT
ATGTGTAGACTGTTTGTTCATCTCTTCCAGGAATAATAT

QA 2 580 2 580
DS 

RD RR2ER46TF 580 0 0
G
CAGTCCACAAGCCGCCAAAGAAGCCGTGCCCGCCCAAAACACCAAAGGTCGAGCTTCCAC
CACCAGTACCGGTCTACAAGCCACCACCGAAGATAGAGCATCCACCAATCTACGTTCCAC
CGGTGATCCCAAAGAAGCCTTGCCCGCCCAAAGCGCCGAAGATCGATCCTCCACCGCCGG
TTCCGGTCTACAAGCCGCCACCGAAGATAGGGCATCCACCAATCTACGTTCCACCGGTGA
TCCCAAAGAAGCCGTGTCCTCCGCCGGTACCAATCTACGTGCCACCGGTGGTGATTCCGA
AGAAGCCATGTCCGCCACTTCCACCACTTCCAAAGTTTCCGCCTCTTCCTCCTAAATACA
TTCACCACCCCAAGTTCGGCAAATGGCCTCCGTTGCCGACTCACCCTTGAGAATTTAATA
CGTATACTTGTATGTAATCAACGTGTTGCTTTTAAAAAAAAAAATATCATCCTGCATGTT
TGAAATTTGGTTTGTTTTGCGACTTTCATCTTTTGTCTACTTAATTTCTCTCTGAGTTTT
ATGTGTAGACTGTTTGTTCATCTCTTCCAGGAATAATAT

QA 2 580 2 580
DS 



AS 1 3

CO CL2990Contig1 1363 3 9 U
GAGAAGAAAGAAATATTCTTATTAGATAGAACTTTTATAATTACAGCACGAGAATCTTAA
AAATACCCCAAATGAAATAGAGATTTAAGTATATCTAGAGCAAATAAATACAAACATTTA
TGATTTGCTTTTTCTTATTTCTAACTTCCATTTCCCAATCCCCTTAAAAACCGAATCCCA
ACCCCTAAACCGTACACAAAATCCAAACAATTACCAAACCGTACTTGAAGACGTTTTGGT
TCAAATTTTGACAACTTCGGGGATAAAGACAGGGTAACGGTCAATACAATCGGACCATGG
TCCATCCTTCGGTGTCTTAATCGTACGGTTACATTTCCAGACAGCAGAGTTACACTTGAA
ACCACTCCCAAACGCAATCTGCCAAACTCGATCTCCTCTCCTCATTCTCCCTTTAGACTC
GATGTAGCAAAGCTCGTACCATAGCGACGACGACGATGTGTTACCAAAACGATGTAGTGT
CATTCTCGAGGCTTCCACGTGTTCTCCTGATAGCTGTAGATTCTTTTGGAGCTCATCGAT
TACGGCTCTACCCCCTGCATGGATGCAGAAGTGTTCGAAGGCTAGCTTAAAATCTGGTAT
GTATGGTTTCCATTTGAGGTTGAAGATTTTACGTCCGATTAAAGACAAGAGGAAGAGGAG
TTGCTCCGATGCCGGTAGGACCAGAGGACCCATTGTGGTGATGTTAGCCTTGAGGGCCTC
GCCGGCGATGGCCATAAGATCTTTGGACAAGTTGATGCCAACCTTTCCTTCTTTATCTTC
CCGTTCATACACACAGTAGTAAGACCTGTCGTCAGCGCCACGGTGAGTCCGGACAAGGTG
GCAAAGCTTGTACTTGGCTCGCCACCGGTCAGACCGACGGTTTGACATAAGAATTGCTGC
GGATCCCATGCGGAAGAGACAGTTGGGTAACAACATGGCTCTCTCGTTCCCTTTGTAGTA
ATTAGGAGTTATGATCTCGGTGCTGACAATGACTGCATTAGAATTGGGATGGACCTGAAG
GAGATCACGGGCCAGATCGACTGAGATCAGGCCCGCGCTACAGCCCATCCCGGAGAGATT
AAAGCTTTTAATGTTGCTCCTAAGCTTATATTTGTTGATGACCATAGCTGAGAGCGATGG
TGTGGGCGAGAAGAGAGAGCAGTTGACAATTAGTATGTCGATGTCTTTAGGCATGAGACC
AGTTTTCTTGAAGAGATCATCCATAGCCGTGAAGATAACCATCTGAGCCTCGCTTCTTGC
CTCGTCCATGGTTGGTGTAGGAGGAATGTAATGAATAGCTGGAGGGAGACAAGTCTCTTC
ACCAAGACCGGACCGTTCAAGAATTCTCATTTGAAGCTCAACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ87JQ U 1
AF RR2DE54JQ U 1
AF RR2CZ87TF C 628
BS 1 44 RR2CZ87JQ
BS 45 45 RR2DE54JQ
BS 46 133 RR2CZ87JQ
BS 134 134 RR2DE54JQ
BS 135 416 RR2CZ87JQ
BS 417 417 RR2DE54JQ
BS 418 708 RR2CZ87JQ
BS 709 765 RR2DE54JQ
BS 766 1363 RR2CZ87TF

RD RR2CZ87JQ 710 0 0
GAGAAGAAAGAAATATTCTTATTAGATAGAACTTTTATAATTACGGCACGAGAATCTTAA
AAATACCCCAAATGAAATAGAGATTTAAGTATATCTAGAGCAAATAAATACAAACATTTA
TGATTTGCTTTTT*TTATTTCTAACTTCCATTTCCCAATCCCCTTAAAAACCGAATCCCA
ACCCCTAAACCGTACACAAAATCCAAACAATTACCAAACCGTACTTGAAGACGTTTTGGT
TCAAATTTTGACAACTTCGGGGATAAAGACAGGGTAACGGTCAATACAATCGGACCATGG
TCCATCCTTCGGTGTCTTAATCGTACGGTTACATTTCCAGACAGCAGAGTTACACTTGAA
ACCACTCCCAAACGCAATCTGCCAAACTCGATCTCCTCTCCTCATTCTCCCTTTAGGCTC
GATGTAGCAAAGCTCGTACCATAGCGACGACGACGATGTGTTACCAAAACGATGTAGTGT
CATTCTCGAGGCTTCCACGTGTTCTCCTGATAGCTGTAGATTCTTTTGGAGCTCATCGAT
TACGGCTCTACCCCCTGCATGGATGCAGAAGTGTTCGAAGGCTAGCTTAAAATCTGGTAT
GTATGGTTTCCATTTGAGGTTGAAGATTTTACGTCCGATTAAAGACAAGAGGAAGAGGAG
TTGCTCCGATGCCGGTAGGACCAGAGGACCCATTGTGGTGATGTTAGC
CT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2DE54JQ 765 0 0
GAGAAGAAAGAAATATTCTTATTAGATAGAACTTTTATAATTACAGCACGAGAATCTTAA
AAATACCCCAAATGAAATAGAGATTTAAGTATATCTAGAGCAAATAAATACAAACATTTA
TGATTTGCTTTTTCTTATTTCTAACTTCCATTTCCCAATCCCCTTAAAAACCGAATCCCA
ACCCCTAAACCGTACACAAAATCCAAACAATTACCAAACCGTACTTGAAGACGTTTTGGT
TCAAATTTTGACAACTTCGGGGATAAAGACAGGGTAACGGTCAATACAATCGGACCATGG
TCCATCCTTCGGTGTCTTAATCGTACGGTTACATTTCCAGACAGCAGGGTTACACTTGAA
ACCACTCCCAAACGCAATCTGCCAAACTCGATCTCCTCTCCTCATTCTCCCTTTAGACTC
GATGTAGCAAAGCTCGTACCATAGCGACGACGACGATGTGTTACCAAAACGATGTAGTGT
CATTCTCGAGGCTTCCACGTGTTCTCCTGATAGCTGTAGATTCTTTTGGAGCTCATCGAT
TACGGCTCTACCCCCTGCATGGATGCAGAAGTGTTCGAAGGCTAGCTTAAAATCTGGTAT
GTATGGTTTCCATTTGAGGTTGAAGATTTTACGTCCGATTAAAGACAAGAGGAAGAGGAG
TTGCTCCGATGCCGGTAGGACCAGAGGACCCATTGTGGTGATGTTAGCCTTGAGGGCCTC
GCCGGCGATGGCCATAAGATCTTTGGACAAGTTGATGCCAACCTT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2CZ87TF 736 0 0
TTTACGTCCGATTAAAGACAAGAGGAAGAGGAGTTGCTCCGATGCCGGTAGGACCAGAGG
ACCCATTGTGGTGATGTTAGC*TTGAGGGCCTCGCCGGCGATGGCCATAAGATCTTTGGA
CAAGTTGATGCCAACCTTTCCTTCTTTATCTTCCCGTTCATACACACAGTAGTAAGACCT
GTCGTCAGCGCCACGGTGAGTCCGGACAAGGTGGCAAAGCTTGTACTTGGCTCGCCACCG
GTCAGACCGACGGTTTGACATAAGAATTGCTGCGGATCCCATGCGGAAGAGACAGTTGGG
TAACAACATGGCTCTCTCGTTCCCTTTGTAGTAATTAGGAGTTATGATCTCGGTGCTGAC
AATGACTGCATTAGAATTGGGATGGACCTGAAGGAGATCACGGGCCAGATCGACTGAGAT
CAGGCCCGCGCTACAGCCCATCCCGGAGAGATTAAAGCTTTTAATGTTGCTCCTAAGCTT
ATATTTGTTGATGACCATAGCTGAGAGCGATGGTGTGGGCGAGAAGAGAGAGCAGTTGAC
AATTAGTATGTCGATGTCTTTAGGCATGAGACCAGTTTTCTTGAAGAGATCATCCATAGC
CGTGAAGATAACCATCTGAGCCTCGCTTCTTGCCTCGTCCATGGTTGGTGTAGGAGGAAT
GTAATGAATAGCTGGAGGGAGACAAGTCTCTTCACCAAGACCGGACCGTTCAAGAATTCT
CATTTGAAGCTCAACC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL2991Contig1 739 2 14 U
GGAAGAAGGATCTTGGCTCTCCTGAGTATAAGAAAACGAAAGTGATGGCTGCCGTAAATG
GGTACCAAGGAAACACTCCGGCGGATCCTCCGGCGCCAAACGGGTCAAAGCAATCTGCGC
CTCCGACTAAGACTGTTGACAGCCAATCTGTTCTCAAAAGGCTGCAATCTGAACTAATGG
GCTTGATGATGGGCGGTGACCCGGGAATATCGGCTTTCCCAGAGGAAGACAACATCTTCT
GTTGGAAAGGGACAATAACAGGAAGCAAAGATACTGTCTTTGAAGGAACTGAGTACAGAC
TCTCACTCTCTTTCTCCAACGACTATCCTTTCAAACCTCCAAAGATCAAGTTCCACACTT
GTTGCTTCCACCCCAATGTTGATCTCTATGGCAACATCTGCTTGGACATTCTCCAGGATA
AATGGTCTTCTGCATATGATGTGAGGACAATCCTACTATCCATTCAGAGCCTTTTGGGAG
AACCGAACATCAGCTCACCACTGAACACTCAAGCAGCGCAGCTCTGGAGCAACCAAGAAG
AGTATAGGAAGATGGTTGAGAAGCTATACAAACCTCCCAGTGCATGATATCTTTAAGTTG
TTCTGATTCACAAACCTCTCCACATGCCTTTGATGAGTGACTTTTAGACAATAAGCATTT
TGTGTCATTCATTTGCTCTATAATTTGTCTGTAACGTTTTACCTTGTGTTTTGACCTGAG
CCAATATATGTGAGCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER48TF U 1
AF RR2B246TF U 6
BS 1 172 RR2ER48TF
BS 173 173 RR2B246TF
BS 174 238 RR2ER48TF
BS 239 239 RR2B246TF
BS 240 277 RR2ER48TF
BS 278 278 RR2B246TF
BS 279 319 RR2ER48TF
BS 320 320 RR2B246TF
BS 321 538 RR2ER48TF
BS 539 539 RR2B246TF
BS 540 565 RR2ER48TF
BS 566 566 RR2B246TF
BS 567 639 RR2ER48TF
BS 640 739 RR2B246TF

RD RR2ER48TF 647 0 0
GGAAGAAGGATCTTGGCTCTCCTGAGTATAAGAAAACGAAAGTGATGGCTGCCGTAAATG
GGTACCAAGGAAACACTCCGGCGGATCCTCCGGCGCCAAACGGGTCAAAGCAATCTGCGC
CTCCGACTAAGACTGTTGACAGCCAATCTGTTCTCAAAAGGCTGCAATCTGAGCTAATGG
GCTTGATGATGGGCGGTGACCCGGGAATATCGGCTTTCCCAGAGGAAGACAACATCTTTT
GTTGGAAAGGGACAATAACAGGAAGCAAAGATACTGTGTTTGAAGGAACTGAGTACAGAC
TCTCACTCTCTTTCTCCAATGACTATCCTTTCAAACCTCCAAAGATCAAGTTCCACACTT
GTTGCTTCCACCCCAATGTTGATCTCTATGGCAACATCTGCTTGGACATTCTCCAGGATA
AATGGTCTTCTGCATATGATGTGAGGACAATCCTACTATCCATTCAGAGCCTTTTGGGAG
AACCGAACATCAGCTCACCACTGAACACTCAAGCAGCGCAGCTCTGGAGCAACCAAGAGG
AGTATAGGAAGATGGTTGAGAAGCTCTACAAACCTCCCAGTGCATGATATCTTTAAGTTG
TTCTGATTCACAAACCTCTCCACATGCCTTTGATGAGTG
CTTTTAGA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2B246TF 734 0 0
ATCTTGGCTCTCC
CTCCTGAGTATAAGAAAACGAAAGTGATGGCTGCCGTAAATGGGTACCAAGGAAACACTC
CGGCGGATCCTCCGGCGCCAAACGGGTCAAAGCAATCTGCGCCTCCGACTAAGACTGTTG
ACAGCCAATCTGTTCTCAAAAGGCTGCAATCTGAACTAATGGGCTTGATGATGGGCGGTG
ACCCGGGAATATCGGCTTTCCCAGAGGAAGACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGACAATAA
CAGGAAGCAAAGATACTGTCTTTGAAGGAACTGAGTACAGACTCTCACTCTCTTTCTCCA
ACGACTGTCCTTTCAAACCTCCAAAGATTAAGTTTCACACTTGTTGCTTCCACCCCAATG
TTGATCTCTATGGCAATATCTGCTTGGACATTCTCCAGGATAAATGGTCTTCTGCATATG
ATGTGAGGACAATCCTACTATCCATTCAGAGCCTTTTGGGAGAACCGAACATCAGCTCAC
CACTGAACACTCAAGCAGCGCAGCTCTGGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGGTTG
AGAAGCTATACAAACCTCCCAGTGCATGATATCTTTAAGTTGTTCTGATTCATAAACCTC
TCCACATGCCTTTGATGAGTGACTTTTAGACAATAAGCATTTTGTGTCATTCATTTGCTC
TATAATTTGTCTGTAACGTTTTACCTTGTGTTTTGACCTGAGCCAATATATGTGAGCTTT
T

QA 14 734 14 734
DS 



AS 1 3

CO CL2992Contig1 1063 3 6 U
AAACACAATTGTCACGAGCTGTCTTTCTTTTCTTATTGAAAATGATGAAACATGAAACAA
TTGAACTTTTTAGAACTTTGAAACTCCTATGTTTCGCAGTCACAAGCTTCTAAATGCGTA
TAGACTAAGAAAAAAAAGACGTAAAAACAAAATCGAAAGGAATGAAACCAACTTCAGAGT
TTTTATAAACACTTAAACTTTCAATCTCCATCTGCTATCTCCTCTCCTTTCCCCATATTC
TCCTTATGCCATTTACAGAACCCTTCAACCAACGCATCCTTCATCCAAGCGTGCCTGCAA
CTCTCTACAGCTTCTTCGATCGTCAGCCATGTCCTTGTTCTAGTCTTCTGTTCCGGCCAC
GTCTCCAGCTCTTCCTTCACATACAAGGCGTACATTGCAGCTTTACATAAACCTTCTGGG
CTAAACTCATCTTGGTGTGTTTTGCTTTTGAACTCATAATCACCCAAGAAGTCCATTAAA
ATCCCACGGACTCCCGCTTCTTCCACTGCTTCCCTTACTGCAGCTTCCCTGACTGTCTCA
TCATTCTCCCACCCTCCCTTGGGAAACAAAAGTCCAGGTCCACTAGATGAGCTGATCATC
AACACTTGAACCACTTTCCCAGATTCAGAATTTAGATACCTAAACGGAATACACCCGGCT
ACGAGACGCGAGCCATCAGCGTACCGTTGCTGGAGCCGACCCGTACGCGCGACCAAATCA
CACATCACCACCACCGAGATCACAAGAAAATAGCTAGAGGAAATTCGAATTGTTGGCCAT
CAAGATGAATGAGAGAATAATCTTTCACAAATGCGACTCTTCTACCTCCACCATTGCTGA
CTCCTAAGATTCCAACGGTTCAGAAGAGATCTCCTCATTTGATCTAATCTGACGGCTAGG
GTTAGATCTAGGGTTTGGAATAGTCACGCCCGCTAGTAGATTTGTATAAAAAAAACAGAG
AACACAGATTTGTTTTGGTCAACAATGGTAGATTTGATTAGGAAAGTCGAAAGAGCACAG
AAAAAAATGAAGAGTGATTTTTCTTTAGTCGGGGCCACTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H363JQ U 1
AF RR2A414JQ U 35
AF RR2H363TF C 562
BS 1 186 RR2H363JQ
BS 187 187 RR2A414JQ
BS 188 494 RR2H363JQ
BS 495 495 RR2A414JQ
BS 496 644 RR2H363JQ
BS 645 1063 RR2H363TF

RD RR2H363JQ 644 0 0
AAACACAATTGTCACGAGCTGTCTTTCTTTTCTTATTGAAAATGATGAAACATGAAACAA
TTGAACTTTTTAGAACTTTGAAACTCCTATGTTTCGCAGTCACAAGCTTCTAAATGCGTA
TAGACTAAGAAAAAAAAGACGTAAAAACAAAATCGAAAGGAATGAAACCAACTTCAGAGT
TTTTATGAACACTTAAACTTTCAATCTCCATCTGCTATCTCCTCTCCTTTCCCCATATTC
TCCTTATGCCATTTACAGAACCCTTCAACCAACGCATCCTTCATCCAAGCGTGCCTGCAA
CTCTCTACAGCTTCTTCGATCGTCAGCCATGTCCTTGTTCTAGTCTTCTGTTCCGGCCAC
GTCTCCAGCTCTTCCTTCACATACAAGGCGTACATTGCAGCTTTACATAAACCTTCTGGG
CTAAACTCATCTTGGTGTGTTTTGCTTTTGAACTCATAATCACCCAAGAAGTCCATTAAA
ATCCCACGGACTCCTGCTTCTTCCACTGCTTCCCTTACTGCAGCTTCCCTGACTGTCTCA
TCATTCTCCCACCCTCCCTTGGGAAACAAAAGTCCAGGTCCACTAGATGAGCTGATCATC
AACACTTGAACCACTTTCCCAGATTCAGAATTTAGATACCTAAA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2A414JQ 599 0 0
ATTGAAAATGATGAAACATGAAACAATTGAACTTTTTAGAACTTTGAAACTCCTATGTTT
CGCAGTCACAAGCTTCTAAATGCGTATAGACTAAGAAAAAAAAGACGTAAAAACAAAATC
GAAAGGAATGAAACCAACTTCAGAGTTTTTATAAACACTTAAACTTTCAATCTCCATCTG
CTATCTCCTCTCCTTTCCCCATATTCTCCTTATGCCATTTACAGAACCCTTCAACCAACG
CATCCTTCATCCAAGCGTGCCTGCAACTCTCTACAGCTTCTTCGATCGTCAGCCATGTCC
TTGTTCTAGTCTTCTGTTCCGGCCACGTCTCCAGCTCTTCCTTCACATACAAGGCGTACA
TTGCAGCTTTACATAAACCTTCTGGGCTAAACTCATCTTGGTGTGTTTTGCTTTTGAACT
CATAATCACCCAAGAAGTCCATTAAAATCCCACGGACTCCCGCTTCTTCCACTGCTTCCC
TTACTGCA*CTTCCCTGACTGTCTCATCATTCTCCCACCCTCCCTTGGGAA*CAAAAGTC
CAGGTCCACTAGATGAGCTGATCATCAACACTTGAACCACTTTCCCAGATTCAGAATTT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2H363TF 502 0 0
GGA
AACAAAAGTCCAGGTCCACTAGATGAGCTGATCATCAACACTTGAACCACTTTCCCAGAT
TCAGAATTTAGATACCTAAACGGAATACACCCGGCTACGAGACGCGAGCCATCAGCGTAC
CGTTGCTGGAGCCGACCCGTACGCGCGACCAAATCACACATCACCACCACCGAGATCACA
AGAAAATAGCTAGAGGAAATTCGAATTGTTGGCCATCAAGATGAATGAGAGAATAATCTT
TCACAAATGCGACTCTTCTACCTCCACCATTGCTGACTCCTAAGATTCCAACGGTTCAGA
AGAGATCTCCTCATTTGATCTAATCTGACGGCTAGGGTTAGATCTAGGGTTTGGAATAGT
CACGCCCGCTAGTAGATTTGTATAAAAAAAACAGAGAACACAGATTTGTTTTGGTCAACA
ATGGTAGATTTGATTAGGAAAGTCGAAAGAGCACAGAAAAAAATGAAGAGTGATTTTTCT
TTAGTCGGGGCCACTGTCC

QA 4 502 4 502
DS 



AS 1 2

CO CL2993Contig1 977 2 2 U
GGATCATATATTAAATTCCTCCGTCTGAGATTACTCCTCTCCTTCCGTCGCCGCCGAGAT
CAGTAGATCGATACACAGAGACAGAAGAGAGATGGCTATGTCTCAGGTGGTGAACACGTA
CCCGCTTTCGAACTACAGCTTCGGAACTAAAGAACCGAAGCTCGAAAAGGACACCTCCGT
CGCCGACCGTCTCGCTCGTATGAAAATCAACTATATGAAAGAGGGCATGAGGACTAGCGT
TGATGCGATTCTGCTGGTACAAGAACACAACCATCCTCACATACTTCTCCTGCAAATTGG
GAACACATTCTGCAAACTTCCTGGTGGACGCCTGAAGCCTGGAGAAAATGAAGTTGAAGG
CCTGAAAAGAAAGTTGACTAGTAAGCTTGGAGGCAATTCGGCTGGTCTTGTACCTGACTG
GAAGGTAGGAGAATGTGTTGCGACATGGTGGCGTCCAAACTTTAAAACCATGATGTACCC
GTATTGCCCTCCTCACATAACCAAGCCAAAGGAGTGCAAGAGACTCTACATTGTTCACTT
GTCCGAGAAAGAGTACTTTGCAGTGCCCAAGAACTTGAAGCTCTTGGCCGTCCCTTTGTT
CGAACTCTATGGCAATGTTCAGAGATATGGACCCGTTATATCAACCATTCCTCAGCAGCT
ATCCAGATTCCATTTCAACATGATTAGTTCATAATCCGACTTGGTATTCAAGAACGAAGA
AAACCTATATGATGGTAAAGTTACTTAGGGACAGTAGAGAGCTGTCGCTACTTGACATTA
TAGACTTGTTCGGTTCATTCAAGTTTCAGCACAAGAAAGATTATTGATTTTATGCTTTTG
AAAAGCATTCGTCATTATTTGACTAACGCCTTTCTTGTTGAATGATACTTTCTATGTTTG
TGGTATGTATGAAACAGAACAACCGAACAAGCTAGGCCATGCTAAAACTTATTCGTTGGA
TCAATCATTCTTCCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH11TF U 1
AF RR2CH11JQ C 313
BS 1 777 RR2CH11TF
BS 778 977 RR2CH11JQ

RD RR2CH11TF 777 0 0
GGATCATATATTAAATTCCTCCGTCTGAGATTACTCCTCTCCTTCCGTCGCCGCCGAGAT
CAGTAGATCGATACACAGAGACAGAAGAGAGATGGCTATGTCTCAGGTGGTGAACACGTA
CCCGCTTTCGAACTACAGCTTCGGAACTAAAGAACCGAAGCTCGAAAAGGACACCTCCGT
CGCCGACCGTCTCGCTCGTATGAAAATCAACTATATGAAAGAGGGCATGAGGACTAGCGT
TGATGCGATTCTGCTGGTACAAGAACACAACCATCCTCACATACTTCTCCTGCAAATTGG
GAACACATTCTGCAAACTTCCTGGTGGACGCCTGAAGCCTGGAGAAAATGAAGTTGAAGG
CCTGAAAAGAAAGTTGACTAGTAAGCTTGGAGGCAATTCGGCTGGTCTTGTACCTGACTG
GAAGGTAGGAGAATGTGTTGCGACATGGTGGCGTCCAAACTTTAAAACCATGATGTACCC
GTATTGCCCTCCTCACATAACCAAGCCAAAGGAGTGCAAGAGACTCTACATTGTTCACTT
GTCCGAGAAAGAGTACTTTGCAGTGCCCAAGAACTTGAAGCTCTTGGCCGTCCCTTTGTT
CGAACTCTATGGCAATGTTCAGAGATATGGACCCGTTATATCAACCATTCCTCAGCAGCT
ATCCAGATTCCATTTCAACATGATTAGTTCATAATCCGACTTGGTATTCAAGAACGAAGA
AAACCTATATGATGGTAAAGTTACTTAGGGACAGTAGAGAGCTGTCGCTACTTGACA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2CH11JQ 665 0 0
CAAACTTCCTGGTGGACGCCTGAAGCCTGGAGAAAATGAAGTTGAAGGCCTGAAAAGAAA
GTTGACTAGTAAGCTTGGAGGCAATTCGGCTGGTCTTGTACCTGACTGGAAGGTAGGAGA
ATGTGTTGCGACATGGTGGCGTCCAAACTTTAAAACCATGATGTACCCGTATTGCCCTCC
TCACATAACCAAGCCAAAGGAGTGCAAGAGACTTTACATTGTTCACTTGTCCGAGAAAGA
GTACTTTGCAGTGCCCAAGAACTTGAAGCTCTTGGCCGTCCCTTTGTTCGAACTTTATGG
CAATGTTCAGAGATATGGACCCGTTATATCAACCATTCCTCAGCAGCTATCCAGATTCCA
TTTCAACATGATTAGTTCATAATCCGACTTGGTATTCAAGAACGAAGAAAACCTATATGA
TGGTAAAGTTACTTAGGGACAGTAGAGAGCTGTCGCTACTTGACATTATAGACTTGTTCG
GTTCATTCAAGTTTCAGCACAAGAAAGATTATTGATTTTATGCTTTTGAAAAGCATTCGT
CATTATTTGACTAACGCCTTTCTTGTTGAATGATACTTTCTATGTTTGTGGTATGTATGA
AACAGAACAACCGAACAAGCTAGGCCATGCTAAAACTTATTCGTTGGATCAATCATTCTT
CCTTT

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 3

CO CL2994Contig1 931 3 2 U
GACAGATCACACACAACACAACTGAGCTCGAACTCATAGCTTCTTTGACTAAGAAACAAC
AATGATCTTACCAATGAAAATTCTTCATCCACTCCATCACACTCTCTCTTCCTCCATTCC
TTTTCAATCAAGAAGAAGGCAATCCAAATCTTACCGGTGCTCGTTACCGTCTCCCGGCGG
CGAAAACATCATCAGATCAGAGACCGTTGTTTCTCCGGTGAGCTACGAAGGAAGAAGAGT
TTTACTTGGATGTCTCCTCTCCGCTGCGTCTGGGATTCTGTTAACTGATTCATCCGCGGC
CGTAAGCACCAGCAGAAGAGCTCTACGTGCATCTAAGATACCTGACAGCGAATTTACTAC
TCTCCCCAATGGTCTCAAGTACTATGATATAAAAGTTGGCAATGGAGCAGAGGCTGTGAA
AGGATCTCGGGTCGCAGTCCATTATGTTGCAAAATGGAAAGGGATAACGTTCATGACAAG
TCGACAAGGACTTGGCGTTGGAGGTGGAACGCCTTACGGGTTTGACGTTGGACAATCAGA
GAACGGGAATGTTCTCAAAGGACTTGACCTTGGCGTTGAAGGGATGCATGTAGGCGGTCA
GAGACTGGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTGCTTACGGAAAGAAAGGAGTGCAAGAGATTCC
TCCTAACGCAACAATCGAGCTTGACATTGAGCTTTTATCAATCAAGCAGAGTCCTTTCGG
GACGCCAGTGAAGATCGTTGAAGGCTAAGATACTAATCAGAAGCAGAGCTATGGAAGCTT
CAACTGTATCAACTGTATCAGAAGAATCTGTTTAATGATACCGGCTTAGTCCGGATTCAT
AGCAACTTCTCATCTCTTCTCTATTAGTACATGTTTGTGCTTTGCAAAACATCAGACTCG
GTTCAATCCCATAAAGTCGATAAGATACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM21TF U 49
AF RR2FJ05TF U 1
AF RR2FJ05JQ C 217
BS 1 731 RR2FJ05TF
BS 732 931 RR2FJ05JQ

RD RR2GM21TF 666 0 0
GG
AAGAAACAACAATGATCTTACCAATGAAAATTCTTCATCCACTCCATCACACTCTCTCTT
CCTCCATTCCTTTTCAATCAAGAAGAAGGCAATCCAAATCTTACCGGTGCTCGTTACCGT
CTCCCGGCGGCGAAAACATCATCAGATCAGAGACCGTTGTTTCTCCGGTGAGCTACGAAG
GAAGAAGAGTTTTACTTGGATGTCTCCTCTCCGCTGCGTCTGGGATTCTGTTAACTGATT
CATCCGCGGCCGTAAGCACCAGCAGAAGAGCTCTACGTGCATCTAAGATACCTGACAGCG
AATTTACTACTCTCCCCAATGGTCTCAAGTACTATGATATAAAAGTTGGCAATGGAGCAG
AGGCTGTGAAAGGATCTCGGGTCGCAGTCCATTATGTTGCAAAATGGAAAGGGATAACGT
TCATGACAAGTCGACAAGGACTTGGCGTTGGAGGTGGAACGCCTTACGGGTTTGACGTTG
GACAATCAGAGAACGGGAATGTTCTCAAAGGACTTGACCTTGGCGTTGAAGGGATGCATG
TAGGCGGTCAGAGACTGGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTGCTTACAGAAAGAAAGGAGTGC
AAGAGATTCCTCCTAACGCAACCATCGAGCTTTACATTGAGCTTTTATCAATCAAGCAGA
GTCC

QA 3 666 3 666
DS 

RD RR2FJ05TF 738 0 0
GACAGATCACACACAACACAACTGAGCTCGAACTCATAGCTTCTTTGACTAAGAAACAAC
AATGATCTTACCAATGAAAATTCTTCATCCACTCCATCACACTCTCTCTTCCTCCATTCC
TTTTCAATCAAGAAGAAGGCAATCCAAATCTTACCGGTGCTCGTTACCGTCTCCCGGCGG
CGAAAACATCATCAGATCAGAGACCGTTGTTTCTCCGGTGAGCTACGAAGGAAGAAGAGT
TTTACTTGGATGTCTCCTCTCCGCTGCGTCTGGGATTCTGTTAACTGATTCATCCGCGGC
CGTAAGCACCAGCAGAAGAGCTCTACGTGCATCTAAGATACCTGACAGCGAATTTACTAC
TCTCCCCAATGGTCTCAAGTACTATGATATAAAAGTTGGCAATGGAGCAGAGGCTGTGAA
AGGATCTCGGGTCGCAGTCCATTATGTTGCAAAATGGAAAGGGATAACGTTCATGACAAG
TCGACAAGGACTTGGCGTTGGAGGTGGAACGCCTTACGGGTTTGACGTTGGACAATCAGA
GAACGGGAATGTTCTCAAAGGACTTGACCTTGGCGTTGAAGGGATGCATGTAGGCGGTCA
GAGACTGGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTGCTTACGGAAAGAAAGGAGTGCAAGAGATTCC
TCCTAACGCAACAATCGAGCTTGACATTGAGCTTTTATCAATCAAGCAGAGTCCTTTCGG
GACGCCAGTGA
GATCGTT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2FJ05JQ 715 0 0
GGTGAGCTACGAAGGAAGAAGAGTTTTACTTGGATGTCTCCTCTCCGCTGCGTCTGGGAT
TCTGTTAACTGATTCATCCGCGGCCGTAAGCACCAGCAGAAGAGCTCTACGTGCATCTAA
GATACCTGACAGCGAATTTACTACTCTCCCCAATGGTCTCAAGTACTATGATATAAAAGT
TGGCAATGGAGCAGAGGCTGTGAAAGGATCTCGGGTCGCAGTCCATTATGTTGCAAAATG
GAAAGGGATAACGTTCATGACAAGTCGACAAGGACTTGGCGTTGGAGGTGGAACGCCTTA
CGGGTTTGACGTTGGACAATCAGAGAACGGGAATGTTCTCAAAGGACTTGACCTTGGCGT
TGAAGGGATGCATGTAGGCGGTCAGAGACTGGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTGCTTACGG
AAAGAAAGGAGTGCAAGAGATTCCTCCTAACGCAACAATCGAGCTTGACATTGAGCTTTT
ATCAATCAAGCAGAGTCCTTTCGGGACGCCAGTGAAGATCGTTGAAGGCTAAGATACTAA
TCAGAAGCAGAGCTATGGAAGCTTCAACTGTATCAACTGTATCAGAAGAATCTGTTTAAT
GATACCGGCTTAGTCCGGATTCATAGCAACTTCTCATCTCTTCTCTATTAGTACATGTTT
GTGCTTTGCAAAACATCAGACTCGGTTCAATCCCATAAAGTCGATAAGATACTTT

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 3

CO CL2995Contig1 1014 3 14 U
GAGTGTGAAACCTATAGTTTCCCTTGTAAATGTACCATGGTCAAGTTACTTCTAGATCAT
TCCACAGCGAGCAAGCAGAAAACAGAATAAATCAAAGAGCTAAATCAATACTAATCATAA
CTGCTTCATCTAATACAAGATATCTCTTCAATCATCCATCGGGAGAGTAATGTGTGTTGT
TTGGCAGTCTCCGGCCATGCACAAAGCTACTGAACATATGCAGGGCTCGTGAAGGCTGCG
CATACGGCACCATATGAGCCGCCCCTCTCACCGTTGCAAACGTCAACAGCTTTCCATACT
CGGTGACCCAGCCACCAACCTGATCTTTGTGGAACCCGGGTCTATAGGGAAGTGTGGTAC
TGAAGTTGAGATGGTGAGCGAGTTCTAGTACGAGACTTCTTGAACCAAGAAGTGGAGCAA
CAGCATCTTGATCTCCACTGAAGATCCAAACAGGAGTTTTGTTCTGTATAATTCTCTTAA
GAATCGGAAGCATGTTGATGCTCGAGTCGGCGTCACTGTAATCCAACAGACCGCTGCACA
TAGACCACTGGTAGGGTAAACGAGTGCGGTTGGCGTGTAGAGCTTGTTGGACCTCTGGGA
GATTGAAATAGAACTTTCTCTCGTAAGTCATACAAACATCCACCCCCATGCTAATCTTAG
TTGCCATCTGCTTGAGTCTCAGCTCTTGCTGGACGATAGAAGGGTAGCATACGTCAAGGA
GAACGTCGTAGCTGTTGACGTATCCGTTGATAGTGTCGGCTTCCTTGATGGCATCGCTAC
AGACTTTGCTGAGGTTATTGAGATTGGAAAAATCACAGTGGGTTATGATTGTGCCTCTTG
TTTCATCAGATATCATCCCATGCGACCAGTAGTACTCGTACGTAGCTGAAGTGTCCCTCC
CAAGCTCCAGAAGTGGATTCCCAATCGCAACGCCTTTGACATTGAACTTAAACCCACTTG
AGTGTAGATTGTAGCTGAGTATAGCATCTGCCAGTTGCGGTATGTAATGTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT04JQ U 1
AF RR2F246JQ U 39
AF RR2BT04TF C 297
BS 1 69 RR2BT04JQ
BS 70 70 RR2F246JQ
BS 71 84 RR2BT04JQ
BS 85 85 RR2F246JQ
BS 86 89 RR2BT04JQ
BS 90 90 RR2F246JQ
BS 91 106 RR2BT04JQ
BS 107 107 RR2F246JQ
BS 108 135 RR2BT04JQ
BS 136 136 RR2F246JQ
BS 137 271 RR2BT04JQ
BS 272 272 RR2F246JQ
BS 273 754 RR2BT04JQ
BS 755 1014 RR2BT04TF

RD RR2BT04JQ 754 0 0
GAGTGTGAAACCTATAGTTTCCCTTGTAAATGTACCATGGTCAAGTTACTTCTAGATCAT
TCCACAGCGTGCAAGCAGAAAACA*AATACATCAAAGAGCTAAATCGATACTAATCATAA
CTGCTTCATCTAATATAAGATATCTCTTCAATCATCCATCGGGAGAGTAATGTGTGTTGT
TTGGCAGTCTCCGGCCATGCACAAAGCTACTGAACATATGCAGGGCTCGTGAAGGCTGCG
CATACGGCACCATATGAGCCGCCCCTCTCACGGTTGCAAACGTCAACAGCTTTCCATACT
CGGTGACCCAGCCACCAACCTGATCTTTGTGGAACCCGGGTCTATAGGGAAGTGTGGTAC
TGAAGTTGAGATGGTGAGCGAGTTCTAGTACGAGACTTCTTGAACCAAGAAGTGGAGCAA
CAGCATCTTGATCTCCACTGAAGATCCAAACAGGAGTTTTGTTCTGTATAATTCTCTTAA
GAATCGGAAGCATGTTGATGCTCGAGTCGGCGTCACTGTAATCCAACAGACCGCTGCACA
TAGACCACTGGTAGGGTAAACGAGTGCGGTTGGCGTGTAGAGCTTGTTGGACCTCTGGGA
GATTGAAATAGAACTTTCTCTCGTAAGTCATACAAACATCCACCCCCATGCTAATCTTAG
TTGCCATCTGCTTGAGTCTCAGCTCTTGCTGGACGATAGAAGGGTAGCATACGTCAAGGA
GAACGTCGTAGCTGTTGACGTATCCGTTGATAGT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2F246JQ 691 0 0
GGTCAAGTTACTTCTAGATCATTCCACAGCGAGCAAGTAGAAAACAGAATAAATCAA***
GCTAAATCAATACTAATCATAACTGCTTCATCTAATACAAGATATCTCTTCAATCATTCA
TCGGGAGAGTGATGTGTGTTGTTTGGCAGTCTCCGGCCATGCACAAAGCTACTGAACATA
TGCAGGGCTCGTGAAGGCTGCGCATACGGCACCATATGAGCCGCCCCTCTCACCGTTGCA
AACGTCAACAGCTTTCCATACTCGGTGACCCAGCCACCAACCTGATCTTTGTGGAACCAG
GGTCTATAGGGAAGTGTGGTACTGAAGTTGAGACGATGAGCGAGTTCTAATACGAGACTT
CTTGAACCAAGAAGTGGAACAACAGCATCTTGATCTCCACTGAAGATCCAAACAGGAGTT
TTGTTCTGTATAATTCTCTTAAGAATCGGAAGCATGTTGATGCTCGAGTCGGCGTCACTG
TAATCCAACAGACCGCTGCACATGGACCACTGGTAGGGTAAACGAGTGCGGTTGGCGTGT
AGAGCTTGTTGGACCTCTGGGAGATTGAAATAGAACTTTCTCTCGTAAGTCATACAAACA
TCCACCCCCATGCTAATCTTAGTTGCCATCTGCTTGAGTCTCAGCTCTTGCTGGACGATA
GAAGGGTAGCATACGTCAAGGAGAACGTCGT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2BT04TF 718 0 0
TACTCGGTGACCCAGCCACCAAC*TGATCTTTGTGGAACCCGGGTCTATAGGGAAGTGTG
GTACTGAAGTTGAGATGGTGAGCGAGTTCTAGTACGAGACTTCTTGAACCAAGAAGTGGA
GCAACAGCATCTTGATCTCCACTGAAGATCCAAACAGGAGTTTTGTTCTGTATAATTCTC
TTAAGAATCGGAAGCATGTTGATGCTCGAGTCGGCGTCACTGTAATCCAACAGACCGCTG
CACATAGACCACTGGTAGGGTAAACGAGTGCGGTTGGCGTGTAGAGCTTGTTGGACCTCT
GGGAGATTGAAATAGAACTTTCTCTCGTAAGTCATACAAACATCCACCCCCATGCTAATC
TTAGTTGCCATCTGCTTGAGTCTCAGCTCTTGCTGGACGATAGAAGGGTAGCATACGTCA
AGGAGAACGTCGTAGCTGTTGACGTATCCGTTGATAGTGTCGGCTTCCTTGATGGCATCG
CTACAGACTTTGCTGAGGTTATTGAGATTGGAAAAATCACAGTGGGTTATGATTGTGCCT
CTTGTTTCATCAGATATCATCCCATGCGACCAGTAGTACTCGTACGTAGCTGAAGTGTCC
CTCCCAAGCTCCAGAAGTGGATTCCCAATCGCAACGCCTTTGACATTGAACTTAAACCCA
CTTGAGTGTAGATTGTAGCTGAGTATAGCATCTGCCAGTTGCGGTATGTAATGTCCTC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 3

CO CL2996Contig1 687 3 7 U
TCTTTGCAGGTAAGTAGCATATAACCGAAAAGATGGGACGTGTCCGAACCAAGACCGTGA
AGAAATCATCTCGTCAAGTCATCGAGAAGTACTACTCTCGCATGACACTCGACTTCCACA
CCAACAAGAAGATCCTCGAAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGA
TCGCTGGATTCTCCACCCATTTGATGAAACGTATCCAGAAGGGACCGGTCCGTGGCATCT
CGCTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGCGAGCGCCGCATGGACTTTGTGCCCGATGAGTCTG
CCATCAAGACTGATGTGATCAAGGTCGATAAAGAGACTCTGGAGATGCTTGCTTCCCTTG
GAATGTCTGACGCTCATGGCTTCTCTGAAGTCGAGGCACAGGCCGCACCTTCTTTCAGCA
GGCCACCAAGAAGGTTCTGAGGAGGAGGTTGTTGTTGTTGTTGTTATCAGTCTAACCCAA
AGAGAAATCTTTAGATTGGCTGTTTTTGTTTTGAAGTTAGGGACGAAAGACTTGGATTCG
AGATTGCTGTTCTTGAAATGTTTATTGCTTGTTTTGATTCTAGATTTATGTCCTAAACTA
AAAGTCATACACTTTTTCTATTCCATGGTTTTAAGTTTTTGATGATCATTCGTGAATCGT
GATGAAACAACAATACGAGGGAGAAAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV87JQB C 158
AF RR2GV87TF U 1
AF RR2EY10TF U 1
BS 1 360 RR2EY10TF
BS 361 361 RR2GV87TF
BS 362 362 RR2EY10TF
BS 363 363 RR2GV87TF
BS 364 393 RR2EY10TF
BS 394 394 RR2GV87TF
BS 395 687 RR2EY10TF

RD RR2GV87JQB 477 0 0
TTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCTGGATTCTCCACCCATTTGATGAAACGTATCCA
GAAGGGACCGGTCCGTGGCATCTCGCTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGCGAGCGCCGCAT
GGACTTTGTGCCCGATGAGTCTGCCATCAAGACTGATGTGATCAAGGTCGATAAAGAGAC
TCTGGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGTCTGACGCTCATGGCTTCTCTGAAGTCGAGGC
ACAGGCCGCACCTTCTTTCAGCAGGCCACCAAGAAGGTTCTGAGGAGGAGGTTGTTGTTG
TTGTTGTTATCAGTCTAACCCAAAGAGAAATCTTTAGATTGGCTGTTTTTGTTTTGAAGT
TAGGGACGAAAGACTTGGATTCGAGATTGCTGTTCTTGAAATGTTTATTGCTTGTTTTGA
TTCTAGATTTATGTCCTAAACTAAAAGTCATACACTTTTTCTATTCCATGGTTT
TAA

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2GV87TF 631 0 0
TCTTTGCAGGTAAGTAGCATATAACCGAAAAGATGGGACGTGTCCGAACCAAGACCGTGA
AGAAATCATCTCGTCAAGTCATCGAGAAGTACTACTCTCGCATGACACTCGACTTCCACA
CCAACAAGAAGATCCTCGAAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGA
TCGCTGGATTCTCCACCCATTTGATGAAACGTATCCAGAAGGGACCGGTCCGTGGCATCT
CGCTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGCGAGCGCCGCATGGACTTTGTGCCCGATGAGTCTG
CCATCAAGACTGATGTGATCAAGGTCGATAAAGAGACTCTGGAGATGCTTGCTTCCCTTG
GAATGTCTGACGCTCATGGCTTCTCTGAAGTCGAGGCACAGGCCGCACCTTCTTTCAGCA
GGCCACCAAGAAGGTTCTGAGGAGGAGGTTGTTGTTGTTGTTGTTATCAGTCTAACCCAA
AGAGAAATCTTTAGATTGGCTGTTTTTGTTTTGAAGTTAGGGACGAAAGACTTGGATTCG
AGATTGCTGTTCTTGAAATGTTTATTGCTTGTTTTGATTCTAGATTTATGTCCTAAACTA
AAAGTCATACACTTTTTCTATTCCATGGTTT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2EY10TF 687 0 0
TCTTTGCAGGTAAGTAGCATATAACCGAAAAGATGGGACGTGTCCGAACCAAGACCGTGA
AGAAATCATCTCGTCAAGTCATCGAGAAGTACTACTCTCGCATGACACTCGACTTCCACA
CCAACAAGAAGATCCTCGAAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGA
TCGCTGGATTCTCCACCCATTTGATGAAACGTATCCAGAAGGGACCGGTCCGTGGCATCT
CGCTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGCGAGCGCCGCATGGACTTTGTGCCCGATGAGTCTG
CCATCAAGACTGATGTGATCAAGGTCGATAAAGAGACTCTGGAGATGCTTGCTTCCCTTG
TA*TGTCTGACGCTCATGGCTTCTCTGAAGTCGGGGCACAGGCCGCACCTTCTTTCAGCA
GGCCACCAAGAAGGTTCTGAGGAGGAGGTTGTTGTTGTTGTTGTTATCAGTCTAACCCAA
AGAGAAATCTTTAGATTGGCTGTTTTTGTTTTGAAGTTAGGGACGAAAGACTTGGATTCG
AGATTGCTGTTCTTGAAATGTTTATTGCTTGTTTTGATTCTAGATTTATGTCCTAAACTA
AAAGTCATACACTTTTTCTATTCCATGGTTTTAAGTTTTTGATGATCATTCGTGAATCGT
GATGAAACAACAATACGAGGGAGAAAT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 3

CO CL2997Contig1 621 3 1 U
GGGTTGTAGAGAACAGAGGAAGAAGCCTAAGCCGACGCGAGAGACGACGACGAAGAATAT
GAGGGAGACGGTGAAGTTGATAAGCATGGAGGGTTTCGAGTTCATCATCGACAGGGAAGC
CGCCATGGTTTCTCATACTATCCGGAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGCTTTTCGGAATC
GAAAGATGGTGTCGTGACTTTCCCTGATATCAGCACCACGATTCTAGAGAAGATCTGCCA
GTACTTCTATTGGTCTCTACAGTACTCCAGAGGCAAAGAGACGGAGTTCCACATCGAGCC
TGAACTGACTCTGGAGCTAATGATGGCTGCTAATTATCTTCACACTTGAAGACTTAAAAT
GATAACGCTGCTGGACATAACATGTAAATCCCTGGAGCACTTTTGTGGGGTTATACTTCA
AACATTTGACAAAAATTGAGTTCTTGCAGAACTATTGAATAGCTCCAAGGGGAAACTCGT
CTACTTTATTTACTAGTTATGACTATTTAATGCAAACATTAAAGTTCCTGTGGCGTTATT
CGTTGCTTATGTTCAAACAGCTTACAATGCTTTGTAATAAGCAACAAACGTATGTCTTAA
TAACGATTGGTTTTGGTGCCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BR31TF U 47
AF RR2BE61JQ C 1
AF RR2BE61TF U 1
BS 1 621 RR2BE61TF

RD RR2BR31TF 491 0 0
GG
GACGAAGAATATGAGGGAGACGGTGAAGTTGATAAGCATGGAGGGTTTCGAGTTCATCAT
CGACAGGGAAGCCGCCATGGTTTCTCATACTATCCGGAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGG
CTTTTCGGAATCGAAAGATGGTGTCGTGACTTTCCCTGATATCAGCACCACGATTCTAGA
GAAGATCTGCCAGTACTTCTATTGGTCTCTACAGTACTCCAGAGGCAAAGAGACGGAGTT
CCACATCGAGCCTGAACTGACTCTGGAGCTAATGATGGCTGCTAATTATCTTCACACTTG
AAGACTTAAAATGATAACGCTGCTGGACATAACATGTAAATCCCTGGAGCACTTTTGTGG
GGTTATACTTCAAACATTTGACAAAAATTGAGTTCTTGCAGAACTATTGAATAGCTCCAA
GGGGAAACTCGTCTACTTTATTTACTAGTTATGACTATTTAATGCAAACATTAAAGTTCC
TGTGGCGTT

QA 3 491 3 491
DS 

RD RR2BE61JQ 621 0 0
GGGTTGTAGAGAACAGAGGAAGAAGCCTAAGCCGACGCGAGAGACGACGACGAAGAATAT
GAGGGAGACGGTGAAGTTGATAAGCATGGAGGGTTTCGAGTTCATCATCGACAGGGAAGC
CGCCATGGTTTTTCATACTATCCGGAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGCTTTTCGGAATC
GAAAGATGGTGTCGTGACTTTCCCTGATATCAGCACCACGATTCTAGAGAAGATCTGCCA
GTACTTCTATTGGTCTCTACAGTACTCCAGAGGCAAAGAGACGGAGTTCCACATCGAGCC
TGAACTGACTCTGGAGCTAATGATGGCTGCTAATTATCTTCACACTTGAAGACTTAAAAT
GATAACGCTGCTGGACATAACATGTAAATCCCTGGAGCACTTTTGTGGGGTTATACTTCA
AACATTTGACAAAAATTGAGTTCTTGCAGAACTATTGAATAGCTCCAAGGGGAAACTCGT
CTACTTTATTTACTAGTTATGACTATTTAATGCAAACATTAAAGTTCCTGTGGCGTTATT
CGTTGCTTATGTTCAAACAGCTTACAATGCTTTGTAATAAGCAACAAACGTATGTCTTAA
TAACGATTGGTTTTGGTGCCG

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2BE61TF 621 0 0
GGGTTGTAGAGAACAGAGGAAGAAGCCTAAGCCGACGCGAGAGACGACGACGAAGAATAT
GAGGGAGACGGTGAAGTTGATAAGCATGGAGGGTTTCGAGTTCATCATCGACAGGGAAGC
CGCCATGGTTTCTCATACTATCCGGAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGCTTTTCGGAATC
GAAAGATGGTGTCGTGACTTTCCCTGATATCAGCACCACGATTCTAGAGAAGATCTGCCA
GTACTTCTATTGGTCTCTACAGTACTCCAGAGGCAAAGAGACGGAGTTCCACATCGAGCC
TGAACTGACTCTGGAGCTAATGATGGCTGCTAATTATCTTCACACTTGAAGACTTAAAAT
GATAACGCTGCTGGACATAACATGTAAATCCCTGGAGCACTTTTGTGGGGTTATACTTCA
AACATTTGACAAAAATTGAGTTCTTGCAGAACTATTGAATAGCTCCAAGGGGAAACTCGT
CTACTTTATTTACTAGTTATGACTATTTAATGCAAACATTAAAGTTCCTGTGGCGTTATT
CGTTGCTTATGTTCAAACAGCTTACAATGCTTTGTAATAAGCAACAAACGTATGTCTTAA
TAACGATTGGTTTTGGTGCCG

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 3

CO CL2998Contig1 916 3 2 U
TGAAAAATATGTAAACGTATCAATCGTAAACATAATTATAAACAGTTAACAACTCTTTTT
TATTTGGGGAAAGAAATTAAATCATCATTGTGAAAGTTAAATTTCC*AAATCTACCCCTG
GAAACTCACTGGACACACTTCTTCTTCGCGAACCCAAACCTGTCATTCTCCAAATCGTAT
TCCACGTGATAGTTCTGTTGCTGAAAAACTCCCGAGAATAATCGCCGGACCACTCCTTCC
ACCGGTGTTATCGGAAACAACCGTTAAACAGACGTTATCAACGCTTCCGACAAGCGTGAA
GTAATTAGACAAAGGCAGCTCCATTTTAGCTCCACCTTTGAACTCGAAGATTAACTCCGG
AACCGTAACTGATCCCTTGCCGGAGATATTGAAACACGGACCAAGTCCCGTGATCTTCCC
CAAGTCTTTTTCTCTGCTGTAGCTCGACATCTGCGCCGCGAACTCTTCAGCAAAGAGCTC
GAAAACGGGTCGATCCATTGAAGTGAATGTGGATCCGGAATCCACGATGGTTCCTCCGTT
CCCGTCGGGTCCCGGCGCGAGGAACTCGTAAGGGATCCTCACGCGCTTGTTTCCTACGTA
GATTCGCCTGAGGTTGAGGTAGTAGTACTCGAGAAACGCTGCGTTGGAGACGTTGGGGTT
GTTACGAAACGGCGGATGCAGAGGGGGCGGAGAGAGCGTTTTCGTCGGGTTTAATGGAGC
TGGGTTGTTTGAGCTGTTGGGCTCTTGCGATGGAGGAGTCGGCGAGACGGCGGAGAGAGA
GGTAAGGATCGTTGCTGGGTGATTGGTCTGTGTGGTGGGAGAGAGGAGAGAGAGGTAGTT
TGATGGCGGAGGCGACGGAGAGGAAGATAAGGAAGAAGAGGAGAGGAGGAGAAGACATTG
TGTTTGTGTTGCGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D052JQ U 70
AF RR2BI44JQ U 1
AF RR2BI44TF C 82
BS 1 771 RR2BI44JQ
BS 772 916 RR2BI44TF

RD RR2D052JQ 520 0 0
AAAGAAATTAAATCATCATTGTGAAAGTTAAATTTCC*AAATCTACCCCTGGAAACTCAC
TGGACACACTTCTTCTTCGCGAACCCAAACCTGTCATTCTCCAAATCGTATTCCACGTGA
TAGTTCTGTTGCTGAAAA*CTCCCGAGAATGATCGCCGGACCACTCCTTCCACCGGTGTT
ATCGGAAACAACCGTTAAACAGACGTTATCAACGCTTCCGACAAGCGTGAAGTAATTAGA
CAAAGGCAGCTCCATTTTAGCTCCACCTTTGAACTCGAAGATTAACTCCGGAACCGTAAC
TGATCCCTTGCCGGAGATATTGAAACACGGACCAAGTCCCGTGATCTTCTCCAAGTCTTT
TTCTCTGCTGTAGCTCGACATCTGCGCCGCGAACTCTTCAGCAACGAGCTCGAAAACGGG
TCGATCCATTGAAGTGAATGTGGATCCGGAATCCACGATGGTTCCTCCGTTCCCGTCGGG
TCCCGGCGCGAGGAACTCGTAAGGGATCCTCACGCGCTTG

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2BI44JQ 771 0 0
TGAAAAATATGTAAACGTATCAATCGTAAACATAATTATAAACAGTTAACAACTCTTTTT
TATTTGGGGAAAGAAATTAAATCATCATTGTGAAAGTTAAATTTCC*AAATCTACCCCTG
GAAACTCACTGGACACACTTCTTCTTCGCGAACCCAAACCTGTCATTCTCCAAATCGTAT
TCCACGTGATAGTTCTGTTGCTGAAAAACTCCCGAGAATAATCGCCGGACCACTCCTTCC
ACCGGTGTTATCGGAAACAACCGTTAAACAGACGTTATCAACGCTTCCGACAAGCGTGAA
GTAATTAGACAAAGGCAGCTCCATTTTAGCTCCACCTTTGAACTCGAAGATTAACTCCGG
AACCGTAACTGATCCCTTGCCGGAGATATTGAAACACGGACCAAGTCCCGTGATCTTCCC
CAAGTCTTTTTCTCTGCTGTAGCTCGACATCTGCGCCGCGAACTCTTCAGCAAAGAGCTC
GAAAACGGGTCGATCCATTGAAGTGAATGTGGATCCGGAATCCACGATGGTTCCTCCGTT
CCCGTCGGGTCCCGGCGCGAGGAACTCGTAAGGGATCCTCACGCGCTTGTTTCCTACGTA
GATTCGCCTGAGGTTGAGGTAGTAGTACTCGAGAAACGCTGCGTTGGAGACGTTGGGGTT
GTTACGAAACGGCGGATGCAGAGGGGGCGGAGAGAGCGTTTTCGTCGGGTTTAATGGAGC
TGGGTTGTTTGAGCTGTTGGGCTCTTGCGATGGAGGAGTCGGCGAGACGGC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2BI44TF 835 0 0
ATCATCA
TGTGAAAGTTAAATTTCCCAAATCTACCCCTGGAAACTCACTGGACACACTTCTTCTTCG
CGAACCCAAACCTGTCATTCTCCAAATCGTATTCCACGTGATAGTTCTGTTGCTGAAAAA
CTCCCGAGAATAATCGCCGGACCACTCCTTCCACCGGTGTTATCGGAAACAACCGTTAAA
CAGACGTTATCAACGCTTCCGACAAGCGTGAAGTAATTAGACAAAGGCAGCTCCATTTTA
GCTCCACCTTTGAACTCGAAGATTAACTCCGGAACCGTAACTGATCCCTTGCCGGAGATA
TTGAAACACGGACCAAGTCCCGTGATCTTCCCCAAGTCTTTTTCTCTGCTGTAGCTCGAC
ATCTGCGCCGCGAACTCTTCAGCAAAGAGCTCGAAAACGGGTCGATCCATTGAAGTGAAT
GTGGATCCGGAATCCACGATGGTTCCTCCGTTCCCGTCGGGTCCCGGCGCGAGGAACTCG
TAAGGGATCCTCACGCGCTTGTTTCCTACGTAGATTCGCCTGAGGTTGAGGTAGTAGTAC
TCGAGAAACGCTGCGTTGGAGACGTTGGGGTTGTTACGAAACGGCGGATGCAGAGGGGGC
GGAGAGAGCGTTTTCGTCGGGTTTAATGGAGCTGGGTTGTTTGAGCTGTTGGGCTCTTGC
GATGGAGGAGTCGGCGAGACGGCGGAGAGAGAGGTAAGGATCGTTGCTGGGTGATTGGTC
TGTGTGGTGGGAGAGAGGAGAGAGAGGTAGTTTGATGGCGGAGGCGACGGAGAGGAAGAT
AAGGAAGAAGAGGAGAGGAGGAGAAGACATTGTGTTTGTGTTGCGCCC

QA 8 835 8 835
DS 



AS 1 3

CO CL2999Contig1 701 3 2 U
GGGATTTTGGTTGTGTATCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTGTCGGAACAAGCCGAA
AGCAAAGGATAAAAGAGAGAGAGATGGAGTCTAGCAGAGGTCAAGGTGGGATCCAGCAGT
TGCTTGCTGCTGAACAAGAAGCTCAACATCGTCAATGCTGCAAGGACCGCAAAGATGGGA
AGGCTGAAGCAAGCAAAGGAAGAGGCTGAGAAGGAGATAGCTGAATACAAAGCTAAAACA
GAGCAAGACTTCCAGAGGAAACTTGAGGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAG
AGGCTGGAGCAAGAGACAGATGAGAAAATCGAACAGCTGAAGAAGGAAGCAGCCAGGATT
TCCAACGATGTTGTGGAGATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGAGA
TTCCTGTAATAATAATAAAAAAATGTCATTTATGAGTGTTTATGCTCCTCCTCTGTTTCT
GTTTCTCTCATTCACGCGTGTGGTGTTACTGGGATGGGGATCTCAGTGACTCAAATCTCT
CATATGAAATGTGTTGCTTGTTTTTT**TGTTATTGTAATTTATTCTCTACCATCTTCTG
TTGTTGTTGTTTGTTGTTTGTTGTGGTTGTATTCATCATTTCCCTTTAGAGGATTGTAAT
AAAAAAAACATTGAAATCTAATAAGATTTACATAAAAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP96JQ C 1
AF RR2BP96TF U 1
AF RR2F849TF U 129
BS 1 661 RR2BP96TF
BS 662 701 RR2F849TF

RD RR2BP96JQ 679 0 0
GGGATTTTGGTTGTGTATCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTGTCGGAACAAGCCGAA
AGCAAAGGATAAAAGAGAGAGAGATGGAGTCTAGCAGAGGTCAAGGTGGGATCCAGCAGT
TGCTTGCTGCTGAACAAGAAGCTCAACATCGTCAATGCTGCAAGGACCGCAAAGATGGGA
AGGCTGAAGCAAGCAAAGGAAGAGGCTGAGAAGGAGATAGCTGAATACAAAGCTAAAACA
GAGCAAGACTTCCAGAGGAAACTTGAGGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAG
AGGCTGGAGCAAGAGACAGATGAGAAAATCGAACAGCTGAAGAAGGAAGCAGCCAGGATT
TCCAACGATGTTGTGGAGATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGAGA
TTCCTGTAATAATAATAAAAAAATGTCATTTATGAGTGTTTATGCTCCTCCTCTGTTTCT
GTTTCTCTCATTCACGCGTGTGGTGTTACTGGGATGGGGATCTCAGTGACTCAAATCTCT
CATATGAAATGTGTTGCTTGTTTTTT**TGTTATTGTAATTTATTCTCTACCATCTTCTG
TTGTTGTTGTTTGTTGTTTGTTGTGGTTGTATTCATCATTTCCCTTTAGAGGATTGTAAT
AAAAAAAACATTGAAATC
C

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2BP96TF 661 0 0
GGGATTTTGGTTGTGTATCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTGTCGGAACAAGCCGAA
AGCAAAGGATAAAAGAGAGAGAGATGGAGTCTAGCAGAGGTCAAGGTGGGATCCAGCAGT
TGCTTGCTGCTGAACAAGAAGCTCAACATCGTCAATGCTGCAAGGACCGCAAAGATGGGA
AGGCTGAAGCAAGCAAAGGAAGAGGCTGAGAAGGAGATAGCTGAATACAAAGCTAAAACA
GAGCAAGACTTCCAGAGGAAACTTGAGGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAG
AGGCTGGAGCAAGAGACAGATGAGAAAATCGAACAGCTGAAGAAGGAAGCAGCCAGGATT
TCCAACGATGTTGTGGAGATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGAGA
TTCCTGTAATAATAATAAAAAAATGTCATTTATGAGTGTTTATGCTCCTCCTCTGTTTCT
GTTTCTCTCATTCACGCGTGTGGTGTTACTGGGATGGGGATCTCAGTGACTCAAATCTCT
CATATGAAATGTGTTGCTTGTTTTTT**TGTTATTGTAATTTATTCTCTACCATCTTCTG
TTGTTGTTGTTTGTTGTTTGTTGTGGTTGTATTCATCATTTCCCTTTAGAGGATTGTAAT
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2F849TF 573 0 0
GGAACAGGAAGCTCAAC
ACATCGTCAATGCTGCAAGGACCGCAAAGATGGGAAGGCTGAAGCAAGCAAAGGAAGAGG
CTGAGAAGGAGATAGCTGAATACAAAGCTAAAACAGAGCAAGACTTCCAGAGGAAACTTG
AGGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGAGGCTGGAGCAAGAGACAGATGAGA
AAATCGAACAGCTGAAGAAGGAAGCAGCCAGGATTTCCAACGATGTTGTGGAGATGCTCC
TCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGAGATTCCTGTAATAATAATAAAAAAATG
TCATTTATGAGTGTTTATGCTCCTCCTCTGTTTCTGTTTCTCTCATTCACGCGTGTGGTG
TTACTGGGATGGGGATCTCAGTGACTCAAATCTCTCATATGAAATGTGTTGCTTGTTTTT
TTTTGTTATTGTAATTTATTCTCTACCATCTTCTGTTGTTGTTGTTTGTTGTTTGTTGTG
GTTGTATTCATCATTTCCCTTTAGAGGATTGTAATAAAAAAAACATTGAAATCTAATAAG
ATTTACATAAAAAAAA

QA 18 573 18 573
DS 



AS 1 3

CO CL3000Contig1 1519 3 5 U
GGCCAAATTGATTTTTTTTTCCATTTTCAATGGTATTCCACAAACACAAAAGGTGCAAAG
CATTATAGTTATTATAAACCATAGAATCTAAAAATAAACACAAACAAACTTGGACACGTA
AATAGCATAAAAACAAAACAAGAAAGAAAGATAAAGAAATTTCCCTTCTTGGAAATTTGG
TGTTCAAAAATTGAGAGCAATTGACTTTTTCGTTTTTGTTTCTTTGATTGCTTCATCCGG
GCTGCAATCAAGTACTAGTAGTCACACCTTTGGTAGGTGCACAAGGAATACCACCACCAT
CCGTTGATGTTATGTTGGTGATCGGCAGCTCCTGCATTCCTATTTTCTCCTCCGTCGTCG
AAATCACTTCGTCCTTAGCTTTTCCCCAAACAACACTGTATAGCCCAAAGACGATGAGAC
CCGCCCCGATTATACTTCCGAGATGAATCTTTTCGGCCAAAACTAACGCGCCAAGGAAGG
CAGTAATGATCATGCACATCGGACTAAATGACGTCGTAAATACTGGGCCTCGTTCTCTAA
TCACAATGCTTTGTATGTAATACGCCATTCCAGAACAAACCACTCCGGAGTAAACCGCTG
CGAGCGTGCCCGAGTCCATGCCGATTTTCCATGCGCTCAAGTCACGAACCATCACCAGGG
AAGCAGCGGTGTTTAAGATTGTCCCCATGCCGCATATCCACATCACTAGTGATAGCTCCC
CCGGATATTTTTTCAATGTGAATGATTGTAAAATGAAGAAACCTGCCCAACTGATGATGC
TAGCCATCAGCGCTAACGTTCCCATAACCCAATGTTGGTCGGTGGCCTCGGAAGAGGAGC
CGCCGTGAATAGAGGTATGAGCGGCCTTGATGAGCTCGATGGCTGGACCTTTGTATAACG
TCATTACCATTGCCCCACCCACGGTTATTGCTGTTCCAATCACCTTTGCAAGACTACGTA
TCTTCTTCAAATTCACAGTTTCTAACCTGAAAATGACGGCCATTATGAAGGTGACGGCGG
GAAGTGCATTAACAAAGGCAGAACTGTACGTTGCTGATGTGGCTTTCATTCCTATGTAGT
AGAAGTTCTGGTCCATAAGCGGTTCTAGGATTCCGAGGGCAAGGATCCTAAGGAATAATG
GCCATGTCATCTTTGGCCGTATTTTCCTTTCGAGAATTAGAGCAAAAGGAGCCATGACGA
TGGTAGCGACGACATGTCGGTAGGTGGCAAGGACCCAATGGTTCATTCCATGCTTGAAAG
AAACCATTGTAATGATGTACATGCCTGCATATCCGAATTGGAGTGATATGATCGCTATTA
TTGGCTTCAGTTTATCCACTTTCCCACATTGCTTCTCCCCTCCCTTCATTTTCTCTTTAT
TTGAGAGATATACGTACACTTATGTATTTATTTAAGTATTTATTTACGTATGTAAATATG
ATCCTAGAAAGAGTATTTTCTTTCTCTCTCTAGATACAATATATTAGGTGAACAATGAAG
AGTTGCTTGCTTGATGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E286JQ U 1
AF RR2AI52JQ U 21
AF RR2AI52TF C 767
BS 1 272 RR2E286JQ
BS 273 273 RR2AI52JQ
BS 274 587 RR2E286JQ
BS 588 848 RR2AI52JQ
BS 849 1519 RR2AI52TF

RD RR2E286JQ 587 0 0
GGCCAAATTGATTTTTTTTTCCATTTTCAATGGTATTCCACAAACACAAAAGGTGCAAAG
CATTATAGTTATTATAAACCATAGAATCTAAAAATAAACACAAACAAACTTGGACACGTA
AATAGCATAAAAACAAAACAAGAAAGAAAGATAAAGAAATTTCCCTTCTTGGAAATTTGG
TGTTCAAAAATTGAGAGCAATTGACTTTTTCGTTTTTGTTTCTTTGATTGCTTCATCCGG
GCTGCAATCAAGTACTAGTAGTCACACCTTTGTTAGGTGCACAAGGAATACCACCACCAT
CCGTTGATGTTATGTTGGTGATCGGCAGCTCCTGCATTCCTATTTTCTCCTCCGTCGTCG
AAATCACTTCGTCCTTAGCTTTTCCCCAAACAACACTGTATAGCCCAAAGACGATGAGAC
CCGCCCCGATTATACTTCCGAGATGAATCTTTTCGGCCAAAACTAACGCGCCAAGGAAGG
CAGTAATGATCATGCACATCGGACTAAATGACGTCGTAAATACTGGGCCTCGTTCTCTAA
TCACAATGCTTTGTATGTAATACGCCATTCCAGAACAAACCACTCCG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2AI52JQ 828 0 0
CCATTTTCAATGGTATTCCACAAACACAAAAGGTGCAAAGCATTATAGTTATTATAAACC
ATAGAATCTAAAAATAAACACAAACAAACTTGGACACGTAAATAGCATAAAAACAAAACA
AGAAAGAAAGATAAAGAAATTTCCCTTCTTGGAAATTTGGTGTTCAAAAATTGAGAGCAA
TTGACTTTTTCGTTTTTGTTTCTTTGATTGCTTCATCCGGGCTGCAATCAAGTACTAGTA
GTCACACCTTTGGTAGGTGCACAAGGAATACCACCACCATCCGTTGATGTTATGTTGGTG
ATCGGCAGCTCCTGCATTCCTATTTTCTCCTCCGTCGTCGAAATCACTTCGTCCTTAGCT
TTTCCCCAAACAACACTGTATAGCCCAAAGACGATGAGACCCGCCCCGATTATACTTCCG
AGATGAATCTTTTCGGCCAAAACTAACGCGCCAAGGAAGGCAGTAATGATCATGCACATC
GGACTAAATGACGTCGTAAATACTGGGCCTCGTTCTCTAATCACAATGCTTTGTATGTAA
TACGCCATTCCAGAACAAACCACTCCGGAGTAAACCGCTGCGAGCGTGCCCGAGTCCATG
CCGATTTTCCATGCGCTCAAGTCACGAACCATCACCAGGGAAGCAGCGGTGTTTAAGATT
GTCCCCATGCCGCATATCCACATCACTAGTGATAGCTCCCCCGGATATTTTTTCAATGTG
AATGATTGTAAAATGAAGAAACCTGCCCAACTGATGATGCTAGCCATCAGCGCTAACGTT
CCCATAACCCAATGTTGGTCGGTGGCCTCGGAAGAGGAGCCGCCGTGA

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2AI52TF 753 0 0
CCAACTGATGATGCTAGCCATCAGCGCTAACGTTCCCATAACCCAATGTTGGTCGGTGGC
CTCGGAAGAGGAGCCGCCGTGAATAGAGGTATGAGCGGCCTTGATGAGCTCGATGGCTGG
ACCTTTGTATAACGTCATTACCATTGCCCCACCCACGGTTATTGCTGTTCCAATCACCTT
TGCAAGACTACGTATCTTCTTCAAATTCACAGTTTCTAACCTGAAAATGACGGCCATTAT
GAAGGTGACGGCGGGAAGTGCATTAACAAAGGCAGAACTGTACGTTGCTGATGTGGCTTT
CATTCCTATGTAGTAGAAGTTCTGGTCCATAAGCGGTTCTAGGATTCCGAGGGCAAGGAT
CCTAAGGAATAATGGCCATGTCATCTTTGGCCGTATTTTCCTTTCGAGAATTAGAGCAAA
AGGAGCCATGACGATGGTAGCGACGACATGTCGGTAGGTGGCAAGGACCCAATGGTTCAT
TCCATGCTTGAAAGAAACCATTGTAATGATGTACATGCCTGCATATCCGAATTGGAGTGA
TATGATCGCTATTATTGGCTTCAGTTTATCCACTTTCCCACATTGCTTCTCCCCTCCCTT
CATTTTCTCTTTATTTGAGAGATATACGTACACTTATGTATTTATTTAAGTATTTATTTA
CGTATGTAAATATGATCCTAGAAAGAGTATTTTCTTTCTCTCTCTAGATACAATATATTA
GGTGAACAATGAAGAGTTGCTTGCTTGATGCCC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL3001Contig1 901 2 32 U
GGCTAATATAAGGGAATGTCAAGAACCGCTGTTTGATTATATGTCTGCTTTAGCTATTAA
TGGCCGCAAGACAGCACAAGTGAACTACGGAGCAAGTGGTTGGGTGACACATCAAGTATC
AGACATATGGGCGAAAACTTCACCGGATAGAGGTGAGGCAGTGTGGGCTCTATGGCCAAT
GGGTGGAGCTTGGCTCTGCACTCATGCATGGGAGCATTATACTTACACAATGGATAAGGA
ATTTCTTAAAAAGAAAGGGTATCCATTGTTGGAAGGATGCACATCGTTTCTATTGGACTG
GCTAATCAAAGGCAAAGACGGATATCTTCAGACCAATCCATCAACATCCCCTGAGCATAT
GTTCACTGCTCCAGATGGCAAACCTGCCAGTGTTAGCTACTCATCAACCATGGACATTGC
CATTGTAAAAGAAGTCTTCTCTGCTATTGTTTCCGCATCAGAGGTTTTGGGAAAAACGAA
TGAGACTCTGATAGGAAAAGTCATTGCCGCACAAGCAAACCTTCCACCCACTAGACTATC
AAAGGACGGTTCCATAATGGAATGGGCAGAGGACTTTGAGGACCCAGAGGTGCATCATAG
ACATGTTTCACATCTCTTTGGCCTGTTCCCTGGTCACACAATCACACTTGAAAAGTCTCC
GGAGCTTGCTAAAGCTGTGGAAGTATCACTTAAGAAAAGAGGAGAGGAAGGACCAGGGTG
GTCCACCACTTGGAAAGCTGCCTTGTGGGCAAGCTTCACAACAGTGAGCACGCGTATAGA
CTAGTTACTCATATTTTTGATCTGGTGGATCCGCTAACGAACGTAACTATGAAGAGGACT
GTATACTAACTTGTTCACAGCTCACCCGCCGTTCAGATCGACGCCACTTTGGATTCTCAG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2EY02TF U 1
AF RR2G262TF U 113
BS 1 178 RR2EY02TF
BS 179 179 RR2G262TF
BS 180 279 RR2EY02TF
BS 280 280 RR2G262TF
BS 281 513 RR2EY02TF
BS 514 514 RR2G262TF
BS 515 552 RR2EY02TF
BS 553 553 RR2G262TF
BS 554 613 RR2EY02TF
BS 614 614 RR2G262TF
BS 615 621 RR2EY02TF
BS 622 622 RR2G262TF
BS 623 697 RR2EY02TF
BS 698 698 RR2G262TF
BS 699 751 RR2EY02TF
BS 752 752 RR2G262TF
BS 753 760 RR2EY02TF
BS 761 761 RR2G262TF
BS 762 785 RR2EY02TF
BS 786 786 RR2G262TF
BS 787 797 RR2EY02TF
BS 798 798 RR2G262TF
BS 799 813 RR2EY02TF
BS 814 814 RR2G262TF
BS 815 817 RR2EY02TF
BS 818 818 RR2G262TF
BS 819 820 RR2EY02TF
BS 821 821 RR2G262TF
BS 822 825 RR2EY02TF
BS 826 826 RR2G262TF
BS 827 846 RR2EY02TF
BS 847 901 RR2G262TF

RD RR2EY02TF 846 0 0
GGCTAATATAAGGGAATGTCAAGAACCGCTGTTTGATTATATGTCTGCTTTAGCTATTAA
TGGCCGCAAGACAGCACAAGTGAACTACGGAGCAAGTGGTTGGGTGACACATCAAGTATC
AGACATATGGGCGAAAACTTCACCGGATAGAGGTGAGGCAGTGTGGGCTCTATGGCCAGT
GGGTGGAGCTTGGCTCTGCACTCATGCATGGGAGCATTATACTTACACAATGGATAAGGA
ATTTCTTAAAAAGAAAGGGTATCCATTGTTGGAAGGATGTACATCGTTTCTATTGGACTG
GCTAATCAAAGGCAAAGACGGATATCTTCAGACCAATCCATCAACATCCCCTGAGCATAT
GTTCACTGCTCCAGATGGCAAACCTGCCAGTGTTAGCTACTCATCAACCATGGACATTGC
CATTGTAAAAGAAGTCTTCTCTGCTATTGTTTCCGCATCAGAGGTTTTGGGAAAAACGAA
TGAGACTCTGATAGGAAAAGTCATTGCCGCACAGGCAAACCTTCCACCCACTAGACTATC
AAAGGACGGTTCTATAATGGAATGGGCAGAGGACTTTGAGGACCCAGAGGTGCATCATAG
ACATGTTTCACATTTCTTTGGTCTGTTCCCTGGTCACACAATCACACTTGAAAAGTCTCC
GGAGCTTGCTAAAGCTGTGGAAGTATCACTTAAGAAA*GAGGAGAGGAAGGACCAGGGTG
GTCCACCACTTGGAAAGCTGCCTTGTGGGCA*GCTTCACA*CAGTGAGCACGCGTATAGA
CTAGT*ACTCATATTTT*GATCTGGTGGATCCGTTAATGA*CGTA*CTATGAAGAGGACT
GTATAC

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR2G262TF 789 0 0
G
AAGTATCAGACATATGGGCGAAAACTTCACCGGATAGAGGTGAGGCAGTGTGGGCTCTAT
GGCCAATGGGTGGAGCTTGGCTCTGCACTCATGCATGGGAGCATTATACTTACACAATGG
ATAAGGAATTTCTTAAAAAGAAAGGGTATCCATTGTTGGAAGGATGCACATCGTTTCTAT
TGGACTGGCTAATCAAAGGCAAAGACGGATATCTTCAGACCAATCCATTCACATCCCCTG
AGCATATGTTCACTGCTCCAGATGGCAAACCTGCCAGTTT**GTTACTCATCAACCATGG
ATATTGCCATTGTAAAAGAAGTCTTCTCTGCTATTGTTTCCGCATCAGAGGTTTTGGGGA
AAGCGAATGAGACTCTGATAGGAAAAGTCATTGCTGCACAAGCAAACCTTCCACCCACTA
GACTATCAAAGGACGGTTCCATAATGGAATGGGCAGAGGACTTTGAGGACCCAGAGGTGC
ATCATAGACATGTTTCACATCTCTTTGGCCTGTTCCCTGGTCACACTATCACACTTGAAA
AGTCTCCGGAGCTTGCTAAAGCTGTTGAAGTATCACTTAAGAAAAGAGGAGAGGAAGGAC
CAGGGTGGTCCACCACTTGGAAAGCTGCCTTGTGGGCAAGCTTCACAACAGTGAGCACGC
GTATAGACTGGTTACTCATATTTTTGATCTGGTGGATCCGCTAACGAACGTAACTATGAA
GGGGACTGTATACTAACTTGTTCACAGCTCACCCGCCGTTCAGATCGACGCCACTTTGGA
TTCTCAGC

QA 2 789 2 789
DS 



AS 1 2

CO CL3002Contig1 1412 2 2 U
GGAGACGTTGTTGTGTGTCTGTCTTTGGCTCCAAACGTATGAACCAGAAGAAAGGGCTTT
TCGATACACTTCCGTGTTGCAACCCCTAAGATTATATTTCCAATCAATTCAACCTCTTGC
CTTGATTTAGAAGAAACCCTAAACCCGATCAATCATGATGATGGACTGCTCATGCAGCAC
TCGCCCTTCTTCCTCTCTACTCATCTCCTCCGAACCGTCTCTTCGCTTCCCTCGCTGCTC
TAACCTCTCCTCCGATCTCAGCTTACTGGTGCCGAAAGATGCGAAGGTGGTGAAGAAGCA
GCAGCAGCGTTTGGTAGTGAGGAGTTGTTCTTCTTCTGGGTCTGCTCAAAACGGCGACGT
TGATGGGTTTCCTCCTCTTAAGCCAAACAAACTCTTTATGCAAGAGGCGATTGGAGCTGA
GTATGGAGAAGGGTTTGAGACTTTTAGACAGGATGGTCCTCTTAAAGTCGATGTGGATTT
CTGGAATGAGAAATTGCAAGATGGTTTTCTTCAAAGGATACGTTATGCAATGAAACCAGA
TGAAGCCTATGGACTTATCTTCTCTTGGGACAATGTCGTGGCTGATACTCGAGGTTTGAA
GTTGGATGCTTGGAAGCAGCTAGCTGCCGAAGAAGGAAAAGAAATTGCGGAGGAGAATGA
CATTCAAAGACTGATGCTTTATGCTGGCGCTGACCATGTGCTTAGTAAGGTCTTGTTTTG
GGAAAATACTCAAAGCAAAATCGACAGCTTGAAACTCAGGCTATCTGAAATATACTATGA
TAATCTTCTAAGACTCACAGAACCAAAGGAAGGACTTAGAGATTGGCTCGAGGCTGTCAC
GAATGCTCGCATTCCCTGTGCTGTTGTCTCAAACCTTGATCGAAAGAACATGATCAATGC
TCTTGAAAAGATGGGACTTCAAAACTATTTCCAGGCAGTAGTTTCCGAGGAAGATGGTAT
GGAATCTATTGCTCGTAGGTTTCTTTCCGCTGCTGTGAAGTTGGATAGAAAACCATCAAA
ATGTGTTGTGTTTGAGGATGATCCTAGGGGTATTACCGCTGCTCACAACTGTACTATGAT
GGCTATAGGATTAATCGGTGCTCATAGAGCGTATGATCTGGTTCAGGCTGATCTTGCTGT
TGGAAACTTCTACGAGCTATCGGTGATAAACCTCAGAAGATTGTTTGCAAACAAAGGCTA
CATTCATGGAACACGAGAAGCAAATCATTGAAAAATCGCCTCCCAAGAGAAAGCTAACCA
TTGATACCATATTCTAAAGGCATTGGATCGTGGTATATAGTAGTTAGGTTAGGTTCGGTT
CGAAATACCTTAAGTTCTTTGTCGTTATGGTTTATATGTTTAATACTACAAGTAAAACCG
TATTTGATTTGAGTGAAATATAGATTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B781TF U 1
AF RR2AB48JQ C 611
BS 1 754 RR2B781TF
BS 755 1412 RR2AB48JQ

RD RR2B781TF 754 0 0
GGAGACGTTGTTGTGTGTCTGTCTTTGGCTCCAAACGTATGAACCAGAAGAAAGGGCTTT
TCGATACACTTCCGTGTTGCAACCCCTAAGATTATATTTCCAATCAATTCAACCTCTTGC
CTTGATTTAGAAGAAACCCTAAACCCGATCAATCATGATGATGGACTGCTCATGCAGCAC
TCGCCCTTCTTCCTCTCTACTCATCTCCTCCGAACCGTCTCTTCGCTTCCCTCGCTGCTC
TAACCTCTCCTCCGATCTCAGCTTACTGGTGCCGAAAGATGCGAAGGTGGTGAAGAAGCA
GCAGCAGCGTTTGGTAGTGAGGAGTTGTTCTTCTTCTGGGTCTGCTCAAAACGGCGACGT
TGATGGGTTTCCTCCTCTTAAGCCAAACAAACTCTTTATGCAAGAGGCGATTGGAGCTGA
GTATGGAGAAGGGTTTGAGACTTTTAGACAGGATGGTCCTCTTAAAGTCGATGTGGATTT
CTGGAATGAGAAATTGCAAGATGGTTTTCTTCAAAGGATACGTTATGCAATGAAACCAGA
TGAAGCCTATGGACTTATCTTCTCTTGGGACAATGTCGTGGCTGATACTCGAGGTTTGAA
GTTGGATGCTTGGAAGCAGCTAGCTGCCGAAGAAGGAAAAGAAATTGCGGAGGAGAATGA
CATTCAAAGACTGATGCTTTATGCTGGCGCTGACCATGTGCTTAGTAAGGTCTTGTTTTG
GGAAAATACTCAAAGCAAAATCGACAGCTTGAAA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2AB48JQ 802 0 0
TGGAAGCAGCTAGCTGCCGAAGAAGGAAAAGAAATTGCGGAGGAGAATGACATTCAAAGG
CTGATGCTTTATGCTGGCGCTGACCATGTGCTTAGTAAGGTCTTGTTTTGGGAAAATACT
CAAAGCAAAATCGACAGCTTGAAACTCAGGCTATCTGAAATATACTATGATAATCTTCTA
AGACTCACAGAACCAAAGGAAGGACTTAGAGATTGGCTCGAGGCTGTCACGAATGCTCGC
ATTCCCTGTGCTGTTGTCTCAAACCTTGATCGAAAGAACATGATCAATGCTCTTGAAAAG
ATGGGACTTCAAAACTATTTCCAGGCAGTAGTTTCCGAGGAAGATGGTATGGAATCTATT
GCTCGTAGGTTTCTTTCCGCTGCTGTGAAGTTGGATAGAAAACCATCAAAATGTGTTGTG
TTTGAGGATGATCCTAGGGGTATTACCGCTGCTCACAACTGTACTATGATGGCTATAGGA
TTAATCGGTGCTCATAGAGCGTATGATCTGGTTCAGGCTGATCTTGCTGTTGGAAACTTC
TACGAGCTATCGGTGATAAACCTCAGAAGATTGTTTGCAAACAAAGGCTACATTCATGGA
ACACGAGAAGCAAATCATTGAAAAATCGCCTCCCAAGAGAAAGCTAACCATTGATACCAT
ATTCTAAAGGCATTGGATCGTGGTATATAGTAGTTAGGTTAGGTTCGGTTCGAAATACCT
TAAGTTCTTTGTCGTTATGGTTTATATGTTTAATACTACAAGTAAAACCGTATTTGATTT
GAGTGAAATATAGATTTTTTTC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL3003Contig1 759 2 5 U
GGATCCAAAACAAAAACAAAAACAAAAAAAAGATAATAATCTCATCTTCATTTCTCTTCT
TCAAAAATAAAAAATGGCAAAAAATTCATTAGCCATATATCTAATGTTACTAATTGCATT
GAGCACTGTTTATGAAACACAGGGGACATTCTCATTACCTCTTTACTTGAAGAACTTTCC
CAAAGTAGGCCAAGATTTTGAGTCTTTCGCTTACAAAGGTATGATGGATTTCATGGGTGA
CTTGGAAGGCAAATGTCCTCAGACCACAGAGTTTAAGGATTTTTTTGTAAAGCTGAAGGA
TTACATGGCATGTTATAGTTCAACATCGCCCGGGTCAAAAGATCTCCAAGTTGAGCTGTC
AATAAAATCTGAGACACTCTTCAGGGCTACGTCTGATTTTAGTGGAACTAAAGGCGGAAC
ATCAGAGGATACATGGACGCTAGTGGATGGCTTATTGTCAATGGGAAAGAGTTTGGTTGA
TACGAAGAAGAGTGGTTCTAAGGAAATAACTTTTGAACAAAGAAAAGAAATTATTCAATC
CATGGTGAAATGGACTCGAGGAATCGGTCTATTCGTAAAGAAGGTCTCCGAGAATAAAGG
AAAATCTATCGATTTATCATCATTTGGAATTGACTATGACACCAATGTGTCTTCTCCTTC
TGAGAGAGCTCTTTACGAAACACAAGGAACGTTCTCATTGCCCCACTACTTGAAGGATTT
TCCAAAATGAGCAAAGACTTTGAGCTTTTGCTTACAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D914TF U 13
AF RR2F392TF U 1
BS 1 381 RR2F392TF
BS 382 382 RR2D914TF
BS 383 482 RR2F392TF
BS 483 483 RR2D914TF
BS 484 759 RR2F392TF

RD RR2D914TF 644 0 0
GGAT
CAAAAACAAAAAAAAGATAATAATCTCATCTTCATTTCTCTTCTTCAAAAATAAAAAATG
GCAAAAAATTCATTAGCCATATATCTAATGTTACTAATTGCATTGAGCACTGTTTATGAA
ACACAGGGGACATTCTCATTACCTCTTTACTTGAAGAACTTTCCCAAAGTAGGCCAAGAT
TTTGAGTCTTTCGCTTACAAAGGTATGATGGATTTCATGGGTGACTTGGAAGGCAAATGT
CCTCAGACCACAGGGTTTAAGGATTTTTTTGTAAAGCTGAAGGATTACATGGCATGTTAT
AGTTCAACATCGCCCGGGTCAAAAGATCTCCAAGTTGAGCTGTCAATAAAATCTGAGACA
CTCTTCAGGGCTATGTCTGATTTTAGTGGAACTAAAGGCGGAACATCAGAGGATGCATGG
ACGCTGGTGGATGGCTTATTGTCAATGGGAAAGAGTTTGGTTGATACGAAGAAGAGTGGT
TCTAAGGAAATAACTTTTGAACAAAGAAAAGAAATTATTCAATCCATGGTGAAATGGACT
CGAGGAATCGGTCTATTCGTAAAGAAGGTCTCCGAGAATAAAGGAAAATCTATCGATTTA
TCATCATTTGGAATTGACTATGACACCAATGTGTCTTCTC

QA 5 644 5 644
DS 

RD RR2F392TF 759 0 0
GGATCCAAAACAAAAACAAAAACAAAAAAAAGATAATAATCTCATCTTCATTTCTCTTCT
TCAAAAATAAAAAATGGCAAAAAATTCATTAGCCATATATCTAATGTTACTAATTGCATT
GAGCACTGTTTATGAAACACAGGGGACATTCTCATTACCTCTTTACTTGAAGAACTTTCC
CAAAGTAGGCCAAGATTTTGAGTCTTTCGCTTACAAAGGTATGATGGATTTCATGGGTGA
CTTGGAAGGCAAATGTCCTCAGACCACAGAGTTTAAGGATTTTTTTGTAAAGCTGAAGGA
TTACATGGCATGTTATAGTTCAACATCGCCCGGGTCAAAAGATCTCCAAGTTGAGCTGTC
AATAAAATCTGAGACACTCTTTAGGGCTACGTCTGATTTTAGTGGAACTAAAGGCGGAAC
ATCAGAGGATACATGGACGCTAGTGGATGGCTTATTGTCAATGGGAAAGAGTTTGGTTGA
TATGAAGAAGAGTGGTTCTAAGGAAATAACTTTTGAACAAAGAAAAGAAATTATTCAATC
CATGGTGAAATGGACTCGAGGAATCGGTCTATTCGTAAAGAAGGTCTCCGAGAATAAAGG
AAAATCTATCGATTTATCATCATTTGGAATTGACTATGACACCAATGTGTCTTCTCCTTC
TGAGAGAGCTCTTTACGAAACACAAGGAACGTTCTCATTGCCCCACTACTTGAAGGATTT
TCCAAAATGAGCAAAGACTTTGAGCTTTTGCTTACAAAG

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 3

CO CL3004Contig1 775 3 2 U
TTTTTCTTTGACCAAACTCTCTCTCTCTCTTCTCTTCTTCTCTTTCACAGAACTCTCTTC
TATCTATCCATCCCTGTTTCCATGGAAGCAAGGAGATGTGTTCATTTCTCCCTATCTTTC
TCTTCAGCGTTACATGAACACTGACTACTCTCTCTCCTGCTTAATTTTTTTCCTGGAGAA
AAAGGGTTTCTCGTGATCTCTAATCGCTCAAAAATCCTAATTTTCAGGTCACGCTTTGAT
GTAAGTCTGTGGCAATATTTGATTACTAGAGTCAAGAAACGTTACTCAAATCAAGCTTAG
TATTTTTAAGTTAATCCATGGCCTCAAAAACTCCAGAAGGATCACTTACCAGTTCAAGTA
AAAGTATGTCAGTTAGTACTTTAGCAGATCAAGTCTCTTCAAGCTTGTCTTTAGCCGATC
CAAGCACTGACAACAGCAAAACCGGTAACAACAACAACAACAAGACCAGCGAGGAGCAAG
GAGAGAGCGGGAAGAGCAGCACGTGTAGACCGAGCACGAGCAGTGATATAAGCGATGAG*
*CACTTGTAGCAGCTTCAGCAGCAGCATCAACAAACCTCACAAG*CCAACGATGTGAGAT
GGGAAGCTATTCAAGCCGTCAGAACCAAACACGGCGGTTTGGGTTTGAACCATTTTAGCT
CTTGAAGAGGTTAGGATGTGGTGATATCGGAACTGTTCATCTCGCTGAGTGACGGGACGA
GTGTTACTTCGCCATGAAGTCATGGACAAAACGCTCTGCTAGCAGAAAAGCTCTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G517TF U 1
AF RR2GR56TF U 1
AF RR2FN18TF U 15
BS 1 619 RR2G517TF
BS 620 775 RR2FN18TF

RD RR2G517TF 620 0 0
TTTTTCTTTGACCAAACTCTCTCTCTCTCTTCTCTTCTTCTCTTTCACAGAACTCTCTTC
TATCTATCCATCCCTGTTTCCATGGAAGCAAGGAGATGTGTTCATTTCTCCCTATCTTTC
TCTTCAGCGTTACATGAACACTGACTACTCTCTCTCCTGCTTAATTTTTTTCCTGGAGAA
AAAGGGTTTCTCGTGATCTCTAATCGCTCAAAAATCCTAATTTTCAGGTCACGCTTTGAT
GTAAGTCTGTGGCAATATTTGATTACTAGAGTCAAGAAACGTTACTCAAATCAAGCTTAG
TATTTTTAAGTTAATCCATGGCCTCAAAAACTCCAGAAGGATCACTTACCAGTTCAAGTA
AAAGTATGTCAGTTAGTACTTTAGCAGATCAAGTCTCTTCAAGCTTGTCTTTAGCCGATC
CAAGCACTGACAACAGCAAAACCGGTAACAACAACAACAACAAGACCAGCGAGGAGCAAG
GAGAGAGCGGGAAGAGCAGCACGTGTAGACCGAGCACGAGCAGTGATATAAGCGATGAG*
*CACTTGTAGCAGCTTCAGCAGCAGCATCAACAAACCTCACAAG*CCAACGATGTGAGAT
GGGAAGCTATTCAAGCCGT
C

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2GR56TF 619 0 0
TTTTTCTTTGACCAAACTCTCTCTCTCTCTTCTCTTCTTCTCTTTCACAGAACTCTCTTC
TATCTATCCATCCCTGTTTCCATGGAAGCAAGGAGATGTGTTCATTTCTCCCTATCTTTC
TCTTCAGCGTTACATGAACACTGACTACTCTCTCTCCTGCTTAATTTTTTTCCTGGAGAA
AAAGGGTTTCTCGTGATCTCTAATCGCTCAAAAATCCTAATTTTCAGGTCACGCTTTGAT
GTAAGTCTGTGGCAATATTTGATTACTAGAGTCAAGAAACGTTACTCAAATCAAGCTTAG
TATTTTTAAGTTAATCCATGGCCTCAAAAACTCCAGAAGGATCACTTACCAGTTCAAGTA
AAAGTATGTCAGTTAGTACTTTAGCAGATCAAGTCTCTTCAAGCTTGTCTTTAGCCGATC
CAAGCACTGACAACAGCAAAACCGGTAACAACAACAACAACAAGACCAGCGAGGAGCAAG
GAGAGAGCGGGAAGAGCAGCACGTGTAGACCGAGCACGAGCAGTGATATAAGCGATGAG*
*CACTTGTAGCAGCTTCAGCAGCAGCATCAACAAACCTCACAAG*CCAACGATGTGAGAT
GGGAAGCTATTCAAGCCGT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2FN18TF 761 0 0
CAAA
CTCTCTCTCTCTTCTCTTCTTCTCTTTCACAGAACTCTCTTCTATCTATCCATCCCTGTT
TCCATGGAAGCAAGGAGATGTGTTCATTTCTCCCTATCTTTCCCTTCAGCGTTACATGAA
CACTGACTACTCTCTCTCCTGCTTAATTTTTTTCCTGGAGAAAAAGGGTTTCTCGTGATC
TCTAATCGCTCAAAAATCCTAATTTTCAGGCCACGCTTTGATGTAAGTCTGTGGCAATAT
TTGATTACTAGAGTCAAGAAACGTTACTCAAATCAAGCTTAGTATTTTTAAGTTAATCCA
TGGCCTCAAAA*CTCCAGAAGGATCACTTACCAGTTCAAGTAAAAGTATGTCAGTTAGTA
CTTTAGCAGATCAAGTCTCTTCAAGCTTGTCTTTAGCCGATCCAAGCACTGACAACAGCA
AAACCGGTAACAACAACAACAACAAGACCAGCGAGGAGCAAGGAGAGAGCGGGAAGAGCA
GCACGTGTAGACCGAGCACGAGCAGTGATATAAGCGATGAGAGCACTTGTAGCAGCTTCA
GCAGCAGCATCAACAAACCTCACAAGGCCAACGATGTGAGATGGGAAGCTATTCAAGCCG
TCAGAACCAAACACGGCGGTTTGGGTTTGAACCATTTTAGCTCTTGAAGAGGTTAGGATG
TGGTGATATCGGAACTGTTCATCTCGCTGAGTGACGGGACGAGTGTTACTTCGCCATGAA
GTCATGGACAAAACGCTCTGCTAGCAGAAAAGCTCTA

QA 5 761 5 761
DS 



AS 1 2

CO CL3005Contig1 856 2 6 U
GACAAGCTGACAAATTAGCTGCGGCTAGAGCCACGGCTTTCACCTTCGACTACTTCTTGG
AGCCAATCGTCTATGGTAGATACCCGGCCGACATGGTCAATTATGTGAAAGGCGGTCGTC
TTCCTACATTCACACCAGAAGAGTCCTCCATGCTCAAAGGATCGTATGATTACGTAGGCG
TTAACTATTACTCATCTTTCTACGTCAGAGATGTGCCGTGCGCAACTGAAAACATCACCA
TGAACACTGATTCTTGCGTCAGCATCGTAGGTGAGCGAAATGGAGTGCCCATCGGTCCAA
CGGCTGGGTCGGATTGGCTTTTGATATACCCTGAGGGTATTCGTGATCTTCTACTACATG
CCAAACTCAAATTCAATGATCCCGCCTTGTACATAACAGAAAACGGAGTGGATGAAGCTA
GCATTGGAGAAATCTTTCTTAATGATGACCTGAGAATTGACTACTACGCTAATCACCTAA
AGATGGTCAGCGATGCAATCTTGATGGGGGTGAATGTGAAAGGATATTTTGCATGGTCGT
TGATGGACAATTTCGAATGGTCGGAAGGATACACCGTTCGGTTTGGACTAGTGTTTGTGG
ACTTTGAAGATGGACGTAAGAGGTATCTGAAGAAATCAGCTAAGTGGTTTAGGAGATTGT
TGAAAGGGAGAGTATAATGGGACGAGCCAGAAGGTGGCTGTTATTTAATAATTCATGAGC
TATTTATCAAATATTGATGTATTCTACTATTTTTACAAGTACCGTTCCTTGTCGATACGC
AGAAAATAAAGTTGGAGGGGGATTTGTTCGATGTTACTAAATTTTAATAATGGAAAAAAC
TTAGAGGGATGTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF55TF U 1
AF RR2AF55JQ C 90
BS 1 652 RR2AF55TF
BS 653 653 RR2AF55JQ
BS 654 693 RR2AF55TF
BS 694 694 RR2AF55JQ
BS 695 788 RR2AF55TF
BS 789 856 RR2AF55JQ

RD RR2AF55TF 788 0 0
GACAAGCTGACAAATTAGCTGCGGCTAGAGCCACGGCTTTCACCTTCGACTACTTCTTGG
AGCCAATCGTCTATGGTAGATACCCGGCCGACATGGTCAATTATGTGAAAGGCGGTCGTC
TTCCTACATTCACACCAGAAGAGTCCTCCATGCTCAAAGGATCGTATGATTACGTAGGCG
TTAACTATTACTCATCTTTCTACGTCAGAGATGTGCCGTGCGCAACTGAAAACATCACCA
TGAACACTGATTCTTGCGTCAGCATCGTAGGTGAGCGAAATGGAGTGCCCATCGGTCCAA
CGGCTGGGTCGGATTGGCTTTTGATATACCCTGAGGGTATTCGTGATCTTCTACTACATG
CCAAACTCAAATTCAATGATCCCGCCTTGTACATAACAGAAAACGGAGTGGATGAAGCTA
GCATTGGAGAAATCTTTCTTAATGATGACCTGAGAATTGACTACTACGCTAATCACCTAA
AGATGGTCAGCGATGCAATCTTGATGGGGGTGAATGTGAAAGGATATTTTGCATGGTCGT
TGATGGACAATTTCGAATGGTCGGAAGGATACACCGTTCGGTTTGGACTAGTGTTTGTGG
ACTTTGAAGATGGACGTAAGAGGTATCTGAAGAAATCAGCTAAGTGGTTTAG*AGATTGT
TGAAAGGGAGAGTATAATGGGACGAGCCAGAAG*TGGCTGTTATTTAATAATTCATGAGC
TATTTATCAAATATTGATGTATTCTACTATTTTTACAAGTACCGTTCCTTGTCGATACGC
AGAAAATA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2AF55JQ 767 0 0
GACATGGTCAATTATGTGAAAGGCGGTCGTCTTCCTACATTCACACCAGAAGAGTCCTCC
ATGCTCAAAGGATCGTATGATTACGTAGGCGTTAACTATTACTCATCTTTCTACGTCAGA
GATGTGCCGTGCGCAACTGAAAACATCACCATGAACACTGATTCTTGCGTCAGCATCGTA
GGTGAGCGAAATGGAGTGCCCATCGGTCCAACGGCTGGGTCGGATTGGCTTTTGATATAC
CCTGAGGGTATTCGTGATCTTTTACTACATGCCAAACTCAAATTCAATGATCCCGCCTTG
TACATAACAGAAAACGGAGTGGATGAAGCTAGCATTGGAGAAATCTTTCTTAATGATGAC
CTGAGAATTGACTACTACGCTAATCACCTAAAGATGGTCAGCGATGCAATCTTGATGGGG
GTGAATGTGAAAGGATATTTTGCATGGTCGTTGATGGACAATTTCGAATGGTCGGAAGGA
TACACCGTTCGGTTTGGACTAGTGTTTGTGGACTTTGAAGATGGACGTAAGAGGTATCTG
AAGAAATCAGCTAAGTGGTTTAGGAGATTGTTGAA*GGGAGAGTATAATGGGACGAGCCA
GAAGGTGGCTGTTATTTAATAATTCATGAGCTATTTATCAAATATTGATGTATTCTACTA
TTTTTACAAGTACCGTTCCTTGTCGATACGCAGAAAATAAAGTTGGAGGGGGATTTGTTC
GATGTTACTAAATTTTAATAATGGAAAAAACTTAGAGGGATGTATTG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL3006Contig1 789 2 2 U
GGGAACAAAGTAAAGAGTTTGGGGGATACCGGAGATGACGGTGAGACAGAAAGCTATGTC
GACGTTACCGAAGCTGATTCGAGCCATGAGAAAGGAAGCTCCCAAGCAGCAACAAAACCT
CCTCTTGCCATCTCTGAGAAGAGCTTTCTCTCTCTACGATCAGATCAATCTCATCGATAA
CGTTCCCGAGGATCAGCTTCGGTTTCAGGAATTTGATGAGACGAGTTTCACGGTGAATGG
GGTTAAGTACGATGGGAGCTTGCTCTGTGCTGGGAACTTGCTTATGTCATGGAGCCCTCG
TAGCTTCTCTGAGATCTCAACCGATAGCTTGTCAATTTTCCAGACTGTTAGACCAATTCC
AGAGCTGTTAATTGTGGGTTGTGGAAGATACAATCATCCAGTGAATCCCCAAGTGCGTCA
ATTTGTGAAGTCAATTGGCATGAAGCTAGAAACCTTGGACTCTAGAAATGCTGCATCGAC
TTACAACATACTGAATGAGGAAGGCAGGATCGTGGCAGCTGCGTTGCTTCCTTATGGAGT
TATACATCCTAACCCTTAACTTCGGCAGAACAAACTTTGAACAACTTGAGATTATCTTTT
GGTTGAAAACACCAGCAACGGTCTGTAAATGAAATCTTTCACACTTATTGTTTTTGCGAA
ACGTTTGTAAAAGAATCAGTTTTTTTTTTTCATATTTAACTTTTCTCGTCTTTGTAGCTT
AAATAAAATTGAGCTTTCTCTGGAAACAAACAGCAGTTTCCTGCTTTATATACATTGGTA
CTCTCTACG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL24TF U 1
AF RR2BL24JQ C 2
BS 1 682 RR2BL24TF
BS 683 789 RR2BL24JQ

RD RR2BL24TF 682 0 0
GGGAACAAAGTAAAGAGTTTGGGGGATACCGGAGATGACGGTGAGACAGAAAGCTATGTC
GACGTTACCGAAGCTGATTCGAGCCATGAGAAAGGAAGCTCCCAAGCAGCAACAAAACCT
CCTCTTGCCATCTCTGAGAAGAGCTTTCTCTCTCTACGATCAGATCAATCTCATCGATAA
CGTTCCCGAGGATCAGCTTCGGTTTCAGGAATTTGATGAGACGAGTTTCACGGTGAATGG
GGTTAAGTACGATGGGAGCTTGCTCTGTGCTGGGAACTTGCTTATGTCATGGAGCCCTCG
TAGCTTCTCTGAGATCTCAACCGATAGCTTGTCAATTTTCCAGACTGTTAGACCAATTCC
AGAGCTGTTAATTGTGGGTTGTGGAAGATACAATCATCCAGTGAATCCCCAAGTGCGTCA
ATTTGTGAAGTCAATTGGCATGAAGCTAGAAACCTTGGACTCTAGAAATGCTGCATCGAC
TTACAACATACTGAATGAGGAAGGCAGGATCGTGGCAGCTGCGTTGCTTCCTTATGGAGT
TATACATCCTAACCCTTAACTTCGGCAGAACAAACTTTGAACAACTTGAGATTATCTTTT
GGTTGAAAACACCAGCAACGGTCTGTAAATGAAATCTTTCACACTTATTGTTTTTGCGAA
ACGTTTGTAAAAGAATCAGTTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2BL24JQ 788 0 0
G
GAACAAAGTAAAGAGTTTGGGGGATACCGGAGATGACGGTGAGACAGAAAGCTATGTCGA
CGTTACCGAAGCTGATTCGAGCCATGAGAAAGGAAGCTCCCAAGCAGCAACAAAACCTCC
TCTTGCCATCTCTGAGAAGAGCTTTCTCTCTCTACGATCAGATCAATCTCATCGATAACG
TTCCCGAGGATCAGCTTCGGTTTCAGGAATTTGATGAGACGAGTTTCACGGTGAATGGGG
TTAAGTACGATGGGAGCTTGCTCTGTGCTGGGAACTTGCTTATGTCATGGAGCCCTCGTA
GCTTCTCTGAGATCTCAACCGATAGCTTGTCAATTTTCCAGACTGTTAGACCAATTCCAG
AGCTGTTAATTGTGGGTTGTGGAAGATACAATCATCCAGTGAATCCCCAAGTGCGTCAAT
TTGTGAAGTCAATTGGCATGAAGCTAGAAACCTTGGACTCTAGAAATGCTGCATCGACTT
ACAACATACTGAATGAGGAAGGCAGGATCGTGGCAGCTGCGTTGCTTCCTTATGGAGTTA
TACATCCTAACCCTTAACTTCGGCAGAACAAACTTTGAACAACTTGAGATTATCTTTTGG
TTGAAAACACCAGCAACGGTCTGTAAATGAAATCTTTCACACTTATTGTTTTTGCGAAAC
GTTTGTAAAAGAATCAGTTTTTTTTTTTCATATTTAACTTTTCTCGTCTTTGTAGCTTAA
ATAAAATTGAGCTTTCTCTGGAAACAAACAGCAGTTTCCTGCTTTATATACATTGGTACT
CTCTACG

QA 2 788 2 788
DS 



AS 1 2

CO CL3007Contig1 604 2 1 U
GTTTCAGAGATGAATCAGTTCAAATACTTCCAAACTTGGATTTTTATTATAGTAGTCACG
GTTTGTTGCATTTTGCAAATCAATTACTTGAACAAGGCATTGGATACGTTCAACACAGCT
GTTATATCTCCGGTTTACTTCGTTATGTTCACAACTTTCACCATCATAGCTAGTATGATC
ATGTTCAAGGATTGGGCTTCACAGAGCGGGTTAAAGATTGCAACAGAACTGTGTGGTTTT
GTCACCATTTTGTCAGGAACGTTTCTGCTTCATAAGACGAAAGATATGGGAAACAGTGCA
AGTGGTCGTGGAGCTCCCTCTACGCCTAGAGACAATCCTGTCTTCACCAGTTCAGGATCT
GGTCTGAGCCCCACCTCCGAAAAAGTATCCTCCTGAGAATTTTTTTATCATCCCACTGTT
TGATGCGAGCACCTAAGAAGAACAAGAAGAATACTCAAAGCAGAGATGATGTGTTATTGG
TATAGTGATTATTTTGTTAGGAACATTTGACTGATTGCTTTTTTTTATGTTGTTTCCCAC
ATGAAAATGTAACGTTACAACTAAAGAGAGAACCAACAAAAAAAACTCTTTTAAGTAGAT
GTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2CM13JQ C 1
AF RR2CM13TF U 1
BS 1 604 RR2CM13TF

RD RR2CM13JQ 604 0 0
GTTTCAGAGATGAATCAGTTCAAATACTTCCAAACTTGGATTTTTATTATAGTAGTCACG
GTTTGTTGCATTTTGCAAATCAATTACTTGAACAAGGCATTGGATACGTTCAACACAGCT
GTTATATCTCCGGTTTACTTCGTTATGTTCACAACTTTCACCATCATAGCTAGTATGATC
ATGTTCAAGGATTGGGCTTCACAGAGCGGGTTAAAGATTGCAACAGAACTGTGTGGTTTT
GTCACCATTTTGTCAGGAACGTTTCTGCTTCATAAGACGAAAGATATGGGAAACAGTGCA
AGTGGTCGTGGAGCTCCCTCTACGCCTAGAGACAATCCTGTCTTCACCAGTTCAGGATCT
GGTCTGAGCCCCACCTCCGAAAAAGTATCCTCCTGAGAATTTTTTTATCATCCCACTGTT
TGATGCGAGCACCTAAGAAGAACAAGAAGAATACTCAAAGCAGAGATGATGTGTTATTGG
TATAGTGATTATTTTGTTAGGAACATTTGACTGATTGCTTTTTTTTATGTTGTTTCCCAC
ATGAAAATGTAACGTTACAACTAAAGAGAGAACCAACAAAAAAAACTCTTTTAAGTAGAT
GTAT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2CM13TF 604 0 0
GTTTCAGAGATGAATCAGTTCAAATACTTCCAAACTTGGATTTTTATTATAGTAGTCACG
GTTTGTTGCATTTTGCAAATCAATTACTTGAACAAGGCATTGGATACGTTCAACACAGCT
GTTATATCTCCGGTTTACTTCGTTATGTTCACAACTTTCACCATCATAGCTAGTATGATC
ATGTTCAAGGATTGGGCTTCACAGAGCGGGTTAAAGATTGCAACAGAACTGTGTGGTTTT
GTCACCATTTTGTCAGGAACGTTTCTGCTTCATAAGACGAAAGATATGGGAAACAGTGCA
AGTGGTCGTGGAGCTCCCTCTACGCCTAGAGACAATCCTGTCTTCACCAGTTCAGGATCT
GGTCTGAGCCCCACCTCCGAAAAAGTATCCTCCTGAGAATTTTTTTATCATCCCACTGTT
TGATGCGAGCACCTAAGAAGAACAAGAAGAATACTCAAAGCAGAGATGATGTGTTATTGG
TATAGTGATTATTTTGTTAGGAACATTTGACTGATTGCTTTTTTTTATGTTGTTTCCCAC
ATGAAAATGTAACGTTACAACTAAAGAGAGAACCAACAAAAAAAACTCTTTTAAGTAGAT
GTAT

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL3008Contig1 943 2 12 U
GGAAAAATTAACTTCCCGTCAGAGATGGAGGAGATTTGCAACGGTGGGATCTCAAACGGC
GACGTTTTGGGTATCTCTGCTTCTTCTAAGCGGGAGAAGCTCATTATCGATACAGACCCA
GGGATCGATGATAGCATGGCGATAATGATGGCGTTTCAAACACCGGAGCTGGAGATATTA
GGACTCACCACCGTCTTTGGTAATGTTTCTACACAAGATGCTACTCGCAACGCCTTACTC
CTGTGTGAGATTGCTGGCTTCCCTGATCTTCCTGTGGCTGAAGGAAGCTCCGAACCCTTA
AAGGGTGGGATTCCACGTGCTGCTGATTTTGTGCACGGTAAAAACGGACTAGGAGATGTC
GCTGTTCCTCTTCCTAGTAGAAACAAATGTGACAAAAGTGCAGCTGAGTTTCTAGTTGAG
AAGGTCTCTGAGCATCCTGGTGAAGTCACCATTCTCGCCCTTGGACCACTAACCAACCTT
GCAATAGCCATCAAACGAGATAGTTCATTTGCTAGTAAGGTGAAGAAGATTGTTATACTT
GGTGGAGCTTTCTTTGCTTTGGGGAATGTCAATCCTGCAGCTGAAGCCAATATATATGGT
GACCCGGAAGCAGCTGATGTTGTGTTCACTTGTGGTGCTGATATCACTGTTGTTGGGATT
AACATCACAACTCAACTTCAACTAACAGATGAAGACCTCTTAGCCCTGCGTGACTCCAAG
GGGAAACACGCCAAGTTATTAAGTGACATGTGCAAGTTCTACAGAGATTGGCACGTCAAA
TCTGATGGTGTTTACAGAGTTTACCTCCATGACCCGGTCAGCTTTGTGGCTGTAGTACGC
CTGATCTGTTCACATATAAGAAGTGTTGTTCGGGTGGAGACTCAAGGATATGCGTTGGTC
ACACTCTCATGGATCAAGCCTCAAGAGATGGATGGGAGCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH24TF U 1
AF RR2H414TF U 135
BS 1 191 RR2AH24TF
BS 192 192 RR2H414TF
BS 193 344 RR2AH24TF
BS 345 345 RR2H414TF
BS 346 360 RR2AH24TF
BS 361 361 RR2H414TF
BS 362 467 RR2AH24TF
BS 468 468 RR2H414TF
BS 469 692 RR2AH24TF
BS 693 693 RR2H414TF
BS 694 792 RR2AH24TF
BS 793 943 RR2H414TF

RD RR2AH24TF 792 0 0
GGAAAAATTAACTTCCCGTCAGAGATGGAGGAGATTTGCAACGGTGGGATCTCAAACGGC
GACGTTTTGGGTATCTCTGCTTCTTCTAAGCGGGAGAAGCTCATTATCGATACAGACCCA
GGGATCGATGATAGCATGGCGATAATGATGGCGTTTCAAACACCGGAGCTGGAGATATTA
GGACTCACCACTGTCTTTGGTAATGTTTCTACACAAGATGCTACTCGCAACGCCTTACTC
CTGTGTGAGATTGCTGGCTTCCCTGATCTTCCTGTGGCTGAAGGAAGCTCCGAACCCTTA
AAGGGTGGGATTCCACGTGCTGCTGATTTTGTGCACGGTAAAAATGGACTAGGAGATGTC
TCTGTTCCTCTTCCTAGTAGAAACAAATGTGACAAAAGTGCAGCTGAGTTTCTAGTTGAG
AAGGTCTCTGAGCATCCTGGTGAAGTCACCATTCTCGCCCTTGGACCTCTAACCAACCTT
GCAATAGCCATCAAACGAGATAGTTCATTTGCTAGTAAGGTGAAGAAGATTGTTATACTT
GGTGGAGCTTTCTTTGCTTTGGGGAATGTCAATCCTGCAGCTGAAGCCAATATATATGGT
GACCCGGAAGCAGCTGATGTTGTGTTCACTTGTGGTGCTGATATCACTGTTGTTGGGATT
AACATCACAACTCAACTTCAACTAACAGATGATGACCTCTTAGCCCTGCGTGACTCCAAG
GGGAAACACGCCAAGTTATTAAGTGACATGTGCAAGTTCTACAGAGATTGGCACGTCAAA
TCTGATGGTGTT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2H414TF 809 0 0
G
ATGGCGATAATGATGGCGTTTCAAACACCGGAGCTGGAGATATTAGGACTCACTACCGTC
TTTGGTAATGTTTCTACACAAGATGCTACTCGCAACGCCTTACTCCTGTGTGAGATTGCT
GGCTTCCCTGATCTTCCTGTGGCTGAAGGAAGCTCCGAACCTTTAAAGGGTGGGATTCCA
CGTGTTGCTGATTTTGTGCACGGTAAAAACGGACTAGGAGATGTCGCTGTTCCTCTTCCT
AGTAGAAACAAATGTGACAAAAGTGCAGCTGAGTTTCTAGTTGAGAAGGTCTCTGAGCAT
CCTGGTGAAGTCACCATTCTCGCCCTTGGACCACTAACCAACCTTGCAATAGCCATCAAA
CGAGATAGTTCATTTGCTAGTAAGGTGAAGAAGATTGTTATACTTGGTGGAGCTTTCTTT
GCTTTGGGGAATGTCAATCCTGCAGCTGAAGCCAATATATATGGTGACCCGGAAGCAGCT
GATGTTGTGTTCACTTGTGGTGCTGATATCACTGTTGTTGGGAT*AACATCACAACTCAA
CTTCAACTAACAGATGAAGACCTCTTAGCCCTGCGTGACTCCAAGGGGAAACACGCCAAG
TTATTAAGTGACATGTGCAAGTTCTACAGAGATTGGCACGTCAAATCTGATGGTGTTTAC
AGAGTTTACCTCCATGACCCGGTCAGCTTTGTGGCTGTAGTACGCCTGATCTGTTCACAT
ATAAGAAGTGTTGTTCGGGTGGAGACTCAAGGATATGCGTTGGTCACACTCTCATGGATC
AAGCCTCAAGAGATGGATGGGAGCATCC

QA 2 809 2 809
DS 



AS 1 3

CO CL3009Contig1 1016 3 7 U
GCTAGTCCAGCTCCGAAACCTGTGCCACCACCTACTCCATCGCCAAAACCTAGCCCACCT
ACTCCATCGCCAAAACCCAGACCACCTGCCCCATTACCACCTAAGCGAGAAAACAAAACC
ATACCGGCCGTGTTTTTCTTTGGGGATTCGATATTCGACACAGGGAATAATAATAATTTA
AAGACAAAGATAAAAAGTAACTATCGCCCCTATGGAATGGATTTTCCTTCTAGAGTAGCT
ACCGGTAGATTCAGCAACGGAAAGGTCGCTTCTGATTTTATATCCAAATATATGGGAGTA
AAAGAAATAGTACCCGCATATTTAGACCAGAAACTACAACAAAACAAACTACAACGTAGC
GATCTACTTACGGGCGTCTCTTTTGCTTCGGGTGGTGCTGGCTTCGATCCTGAAACATCT
GAATCATTGGATGTCATACCAATGTTGGACCAATTGTCATATTTTCAAGACTACATAAAG
AGACTGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAAGAGGCTAAACGAATAGTGTCCAACGGAGTAGCC
ATTGTGGTCGCAGGAGGCACCGATCTGATTTACACATATTTTGGAATTGGTGCTCAACAC
CTTAAAACTGACGTCGACTCTTTCACCACCACTACAAAAAAAATGTGAATATTGTGACTA
AATATTATGACAAAAAAATTGGTCGCAATATTGCTACTATTTACATACGGGGTAGTGACT
AATTATTTTTGTCACAAAATCGTGAATATTTTGTCACAATGTTGTGACGAATGTAAAAGT
AGCGAAAAAACGTTGCCAAAAGTTACAATAATGCGACGAAGTTTTTAGTCACAAGTATTG
TTACGGAAACGAGACTAAAAGCCGTCCCTACTAAACACGATTTCATGGCTTACATAAGGT
CACCTATTGTGACCAAAGTTTGTAATTATATCATCTCAATTTGTTACGGTGTTTATGACT
TTTAATTTAGTCATAATTGTGACATAATTACTTTATGAATATATTCCATCTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ54TF U 1
AF RR2CQ58TF U 231
AF RR2CQ58JQ C 313
BS 1 640 RR2GZ54TF
BS 641 642 RR2CQ58TF
BS 643 677 RR2GZ54TF
BS 678 898 RR2CQ58TF
BS 899 899 RR2CQ58JQ
BS 900 935 RR2CQ58TF
BS 936 1016 RR2CQ58JQ

RD RR2GZ54TF 677 0 0
GCTAGTCCAGCTCCGAAACCTGTGCCACCACCTACTCCATCGCCAAAACCTAGCCCACCT
ACTCCATCGCCAAAACCCAGACCACCTGCCCCATTACCACCTAAGCGAGAAAACAAAACC
ATACCGGCCGTGTTTTTCTTTGGGGATTCGATATTCGACACAGGGAATAATAATAATTTA
AAGACAAAGATAAAAAGTAACTATCGCCCCTATGGAATGGATTTTCCTTCTAGAGTAGCT
ACCGGTAGATTCAGCAACGGAAAGGTCGCTTCTGATTTTATATCCAAATATATGGGAGTA
AAAGAAATAGTACCCGCATATTTAGACCAGAAACTACAACAAAACAAACTACAACGTAGC
GATCTACTTACGGGCGTCTCTTTTGCTTCGGGTGGTGCTGGCTTCGATCCTGAAACATCT
GAATCATTGGATGTCATACCAATGTTGGACCAATTGTCATATTTTCAAGACTACATAAAG
AGACTGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAAGAGGCTAAACGAATAGTGTCCAACGGAGTAGCC
ATTGTGGTCGCAGGAGGCACCGATCTGATTTACACATATTTTGGAATTGGTGCTCAACAC
CTTAAAACTGACGTCGACTCTTTCACCACCACTACAAAAA**ATGTGAATATTGTGACTA
AATATTATGACAAAAAA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2CQ58TF 705 0 0
G
AGAGTAGCTACCGGTAGATTCAGCAACGGAAAGGTCGCTTCTGATTTTATATCCAAATAT
ATGGGAGTAAAAGAAATAGTACCCGCATATTTAGACCAGAAACTACAACAAAACAAACTA
CAACGTAGCGATCTACTTACGGGCGTCTCTTTTGCTTCGGGTGGTGCTGGCTTCGATCCT
GAAACATCTGAATCATTGGATGTCATACCAATGTTGGACCAATTGTCATATTTTCAAGAC
TACATAAAGAGACTGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAAGAGGCTAAACGAATAGTGTCCAAC
GGAGTAGCCATTGTGGTCGCAGGAGGCACCGATCTGATTTACACATATTTTGGAATTGGT
GCTCAACACCTTAAAACTGACGTCGACTCTTTCACCACCACTACAAAAAAAATGTGAATA
TTGTGACTAAATATTATGACAAAAAAATTGGTCGCAATATTGCTACTATTTACATACGGG
GTAGTGACTAATTATTTTTGTCACAAAATCGTGAATATTTTGTCACAATGTTGTGACGAA
TGTAAAAGTAGCGAAAAAACGTTGCCAAAAGTTACAATAATGCGACGAAGTTTTTAGTCA
CAAGTATTGTTACGGAAACGAGACTAAAAGCCGTCCCTACTAAACACGATTTCATGGCTT
ACATAAG*TCACCTATTGTGACCAAAGTTTGTAATTATATCATC

QA 2 705 2 705
DS 

RD RR2CQ58JQ 704 0 0
CCCGCATATTTAGACCAGAAACTACAACAAAACAAACTACAACGTAGCGATCTACTTACG
GGCGTCTCTTTTGCTTCGGGTGGTGCTGGCTTCGATCCTGAAACATCTGAATCATTGGAT
GTCATACCAATGTTGGACCAATTGTCATATTTTCAAGACTACATAAAGAGACTGAAGAAG
CTAGTAGGAAAAAAAGAGGCTAAACGAATAGTGTCCAACGGAGTAGCCATTGTGGTCGCA
GGAGGCACCGATCTGATTTACACATATTTTGGAATTGGTGCTCAACACCTTAAAACTGAC
GTCGACTCTTTCACCACCACTACAAAAAAAATGTGAATATTGTGACTAAATATTATGACA
AAAAAATTGGTCGCAATATTGCTACTATTTACATACGGGGTAGTGACTAATTATTTTTGT
CACAAAATCGTGAATATTTTGTCACAATGTTGTGACGAATGTAAAAGTAGCGAAAAAACG
TTGCCAAAAGTTACAATAATGCGACGAAGTTTTTAGTCACAAGTATTGTTACGGAAACGA
GACTAAAAGCCGTCCCTACTAAACACGATTTCATGGCTTACATAAGGTCACCTATTGTGA
CCAAAGTTTGTAATTATATCATCTCAATTTGTTACGGTGTTTATGACTTTTAATTTAGTC
ATAATTGTGACATAATTACTTTATGAATATATTCCATCTTCTCC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 3

CO CL3010Contig1 783 3 10 U
GGCTCTCACGGTCTACTGGTGTTTGTATTTCAAAAAAAAAAAAAAACAGAGAGCAAACCC
TAAATCGTGTGTAAAAATGGAGAGGAATCTCGTGGGATATAGGTTTAGTCCTACGGGAGA
GGAAGTGATCAACTATTACCTCAAGAACAAGATTCTTGATAAACCATGGCTAGTCAACGA
AGCCATTAACGAGATCAACATCTGTGCTTACGATCCAGAGTCCTTGCCTTCGTTATCGAA
GCTGGAATCAAAGGATCTTGTATGGTACTTCTTCACTCCCAGGGAGTACCACGCATCTGA
GAAGAAGAAGGGAACGAAGAGGACAACGCCTTCTGGGTATTGGAAAGCTACTGGTGTTGA
TCGGAAGGTCAAGGATAAAAGAGGGAATGGTGTGGAGATTGGGATCAAGAAGACGCTCGT
GTACCATCATGGTAAATCAGCTAATGGTGTTTGGACTCCTTGGGTCATGCACGAGTATCA
CATCACGTCCTTGCCTCCTACTCAGAGGAACTATGTTATCTGCCAAGTAATGTACAAGGG
TGCCGACGGAGACAGTTTGTACGGTAATAACTCCAATGAGTTGGTCTCTGCTTCCAATAC
TGGCAGAGTGATCAACACAACCCCTGAGGCTGAGCAACGAAGGGACAAAGATCTCTATAT
ATCTGTTGATGATTTGGCCAACCCACTGAATGAGCAGGATGATGTCTCTCTATTCAATCC
AGACACGTTTTTCAACGACAACTACTGCCCTTACAGCAGCCGCAAGCTTCGTGGGATGAT
GAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2D479TF U 1
AF RR2F831TF U 6
AF RR2DJ28TF U 422
BS 1 123 RR2D479TF
BS 124 124 RR2F831TF
BS 125 536 RR2D479TF
BS 537 537 RR2F831TF
BS 538 628 RR2D479TF
BS 629 629 RR2F831TF
BS 630 697 RR2D479TF
BS 698 698 RR2F831TF
BS 699 749 RR2D479TF
BS 750 783 RR2DJ28TF

RD RR2D479TF 749 0 0
GGCTCTCACGGTCTACTGGTGTTTGTATTTCAAAAAAAAAAAAAAACAGAGAGCAAACCC
TAAATCGTGTGTAAAAATGGAGAGGAATCTCGTGGGATATAGGTTTAGTCCTACGGGAGA
GGAGGTGATCAACTATTACCTCAAGAACAAGATTCTTGATAAACCATGGCTAGTCAACGA
AGCCATTAACGAGATCAACATCTGTGCTTACGATCCAGAGTCCTTGCCTTCGTTATCGAA
GCTGGAATCAAAGGATCTTGTATGGTACTTCTTCACTCCCAGGGAGTACCACGCATCTGA
GAAGAAGAAGGGAACGAAGAGGACAACGCCTTCTGGGTATTGGAAAGCTACTGGTGTTGA
TCGGAAGGTCAAGGATAAAAGAGGGAATGGTGTGGAGATTGGGATCAAGAAGACGCTCGT
GTACCATCATGGTAAATCAGCTAATGGTGTTTGGACTCCTTGGGTCATGCACGAGTATCA
CATCACGTCCTTGCCTCCTACTCAGAGGAACTATGTTATCTGCCAAGTAATGTACAGGGG
TGCCGACGGAGACAGTTTGTACGGTAATAACTCCAATGAGTTGGTCTCTGCTTCCAATAC
TGGCAGAGTGATCAACACAACCCCTGAG*CTGAGCAACGAAGGGACAAAGATCTCTATAT
ATCTGTTGATGATTTGGCCAACCCACTGAATGAGCAG*ATGATGTCTCTCTATTCAATCC
AGACACGTTTTTCAACGACAACTACTGCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2F831TF 721 0 0
GG
ACGGTCTACTGGTGTTTGTATTTCAAAAAAAAAAAAAAACAGAGAGCAAACCCTAGATCG
TGTGTAAAAATGGAGAGGAATCTCGTGGGATATAGGTTTAGTCCTACGGGAGAGGAAGTG
ATCAACTATTACCTCAAGAACAAGATTCTTGATAAACCATGGCTAGTCAACGAAGCCATT
AACGAGATCAACATCTGTGCTTACGATCCAGAGTCCTTGCCTTCGTTATCGAAGCTGGAA
TCAAAGGATCTTGTATGGTACTTCTTCACTCCCAGGGAGTACCACGCATCTGAGAAGAAG
AAGGGAACGAAGAGGACAACGCCTTCTGGGTATTGGAAAGCTACTGGTGTTGATCGGAAG
GTCAGGGATAAAAGAGGGAATGGTGTGGAGATTGGGATCAAGAAGACGCTTGTGTACCAT
CATGGTAAATCAGCTAATGGTGTTTGGACTCCTTGGGTCATGCACGAGTATCACATCACG
TCCTTGCCTCCTACTCAGAGGAACTATGTTATCTGCCAAGTAATGTACAAGGGTGCCGAC
GGAGACAGTTTGTACGGTAATAACTCCAATGAGTTGGTCTCTGCTTCCAATACTGGCAGA
GTGATCAACACAACCCCTGAGGCTGAGCAACGAAGGGACAAAGATCTCTATATATCTGTT
GATGATT*GGCCAACCCACTGAATGAGCAGGATGATGTCTCTCTATTCA*TCCAGACAC

QA 3 721 3 721
DS 

RD RR2DJ28TF 362 0 0
TACCATCATGGTAAATCAGCTAATGGTGTTTGGACTCCTTGGTTCATGCACGAGTATCAC
ATCACGTCCTTGCCTCCTACTCAGAGGAACTATGTTATCTGCCAAGTAATGTACAAGGGT
GCCGACGGAGGCAGTTTGTACGGTAATAACTCCAATGAGTTGGTCTCTGCTTCCAATACT
GGCAGAGTGATCAACACAACCCCTGAGGCTGAGCAACGAAGGGACAAAGATCTCTATATA
TCTGTTGATGATTTGGCCAACCCACTGAATGAGCAGGATGATGTCTCTCTATTCAATCCA
GACACGTTTT*CAACGACAACTACTGCCCTTACAGCAGCCGCAAGCTTCGTGGGATGATG
AT

QA 1 362 1 362
DS 



AS 1 3

CO CL3011Contig1 914 3 24 U
ATCGAGAGACTTGACTTCTGCAATAATGGCGGGGATCGCAAGCCCTAGCCCTACGGCACT
TTGTTTCACCAGTGATCTCGGGACAAGGCGGTTGAAAGCGGTGAGCTGGTCCGGAAAGAG
CGTCTCTGGTAACAATATCCGCCGGAGAAGTCTGAGAGTTGCGGCTGAGGTGAAGTTCGT
GAATGCAGAGGAAGCAAAGAAGTTGATAGCAGCGGAAGGTTACAAGGTTGTGGATGTAAG
AGACAAGACTCAGTTCGAGAGAGCTCATATAAAGTCTTGCCACCATATCCCTCTCTTCAT
CTTCAACGAAGACAACGATCTTGGTACGATAGTGAAGAGGACAGTGCACAACAACTTCTC
AGGGCTCTTCTTTGGTTTGCCCTTCACGAAACTGAATCCGGAGTTCGTTAAATCCGTTAG
AAACGAGTTTTCACAGGACAGCAAACTGTTACTGGTTTGCCAAGAAGGTCTCAGATCTGC
AGCTGCTGCTAGTAGATTGGAGGAAGCAGGTTACGATAACATTGCTTGTGTAACATCAGG
GTTACAATCTGTTAAACCAGAGACATTTGAGTCGGTTGGTTCAACGGAGTTGCAGAATGC
AGGCAAGGCAGGGCTTATCACAATTCAAGGCAAGATCTCAGCTGTCTTAGGAACAGTGCT
CGTCTGTACTTTGTTGTTCATAACGTTCTTCCCTGACCAGGCAGAGAAGCTGTTTCCTTC
AAGCTAAGACAAGAGAATCGCAATGATTGGTTCAGAAAAGTTTTTACAGTTTCAGCGCGT
ATGTATGTAGATGCTTAAGGAACAATGAAAGAATCTTAAAATATTTGAATTTTTGAAGTA
GTTACAAAAACATATGGTATCGGACAAAGTTGTTATCTGCTTGTATAACAATTAAGAAAA
AAAAGTCACCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C279TF U 5
AF RR2DE03TF U 1
AF RR2C279JQ C 152
BS 1 57 RR2DE03TF
BS 58 58 RR2C279TF
BS 59 195 RR2DE03TF
BS 196 196 RR2C279TF
BS 197 237 RR2DE03TF
BS 238 238 RR2C279TF
BS 239 376 RR2DE03TF
BS 377 377 RR2C279TF
BS 378 381 RR2DE03TF
BS 382 382 RR2C279TF
BS 383 414 RR2DE03TF
BS 415 415 RR2C279TF
BS 416 420 RR2DE03TF
BS 421 421 RR2C279TF
BS 422 476 RR2DE03TF
BS 477 477 RR2C279TF
BS 478 546 RR2DE03TF
BS 547 547 RR2C279TF
BS 548 560 RR2DE03TF
BS 561 561 RR2C279TF
BS 562 650 RR2DE03TF
BS 651 651 RR2C279JQ
BS 652 686 RR2DE03TF
BS 687 914 RR2C279JQ

RD RR2C279TF 621 0 0
AATCGAGA
GACTTCTGCAATAATGGCGGGGATTGCAAGCCCTAGCCCTACGGCACTTTGTTTCACCAG
TGATCTCGGGACAAGGCGGTTGAAAGCGGTGAGCTGGTCCGGAAAGAGCGTCTCTGGTAA
CAATATCCGCCGGAGAAGTCTGAGAGTTGCGGCTGAGGTGAAGTTCGTGAATGCAGAGGA
AGCAAAGAAGTTGATAGCAGCGGAAGGTTACAAGGTTGTGGATGTAAGAGACAAGACTCA
GTTCGAGAGAGCTCATATAAAGTCTTGCCACCATATCCCTCTCTTCATCTTCAACGAAGA
CAACGATCTTGGTACGATAGTGAAGAGGACAGTGCACAACAACTTCTCAGGGCTCTTCTT
TGGTTTGCCCTTCACGAAACTGAATCCGGAGTTCGTTAAATCCGTTAGAAACGAGTTTTC
ACAGGACAGCAAACTGTTACTGGTTTGCCAAGAAGGTCTCAGATCTGCAGCTGCTGCTAG
TAGATTGGAGGAAGCAGGTTACGATAACATTGCTTGTGTAACATCAGGGTTACAATCTGT
TAAACCAGAGACATTTGAGTCGGTTGGTTCAACGGAGTTGCAGAATGCAGGCAAGGCAGG
GCTTATCACAATT

QA 9 621 9 621
DS 

RD RR2DE03TF 686 0 0
ATCGAGAGACTTGACTTCTGCAATAATGGCGGGGATCGCAAGCCCTAGCCCTACGGCTCT
TTGTTTCACCAGTGATCTCGGGACAAGGCGGTTGAAAGCGGTGAGCTGGTCCGGAAAGAG
CGTCTCTGGTAACAATATCCGCCGGAGAAGTCTGAGAGTTGCGGCTGAGGTGAAGTTCGT
GAATGCAGAGGAAGCGAAGAAGTTGATAGCAGCGGAAGGTTACAAGGTTGTGGATGTGAG
AGACAAGACTCAGTTCGAGAGAGCTCATATAAAGTCTTGCCACCATATCCCTCTCTTCAT
CTTCAACGAAGACAACGATCTTGGTACGATAGTGAAGAGGACAGTGCACAACAACTTCTC
AGGGCTCTTCTTTGGTCTGCCTTTCACGAAACTGAATCCGGAGTTCGTTAAATCTGTTAG
TAACGAGTTTTCACAGGACAGCAAACTGTTACTGGTTTGCCAAGAAGGTCTCAGATTTGC
AGCTGCTGCTAGTAGATTGGAGGAAGCAGGTTACGATAACATTGCTTGTGTAACATCAGG
GTTACAGTCTGTTAAACCAGGGACATTTGAGTCGGTTGGTTCAACGGAGTTGCAGAATGC
AGGCAAGGCAGGGCTTATCACAATTCAAGGCAAGATCTCAGCTGTCTTAG*AACAGTGCT
CGTCTGTACTTTGTTGTTCATAACGT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2C279JQ 763 0 0
TCTGAGAG
TGCGGCTGAGGTGAAGTTCGTGAATGCAGAGGAAGCAAAGAAGTTGATAGCAGCGGAAGG
TTACAAGGTTGTGGATGTAAGAGACAAGACTCAGTTCGAGAGAGCTCATATAAAGTCTTG
CCACCATATCCCTCTCTTCATCTTCAACGAAGACAACGATCTTGGTACGATAGTGAAGAG
GACAGTGCACAACAACTTCTCAGGGCTCTTCTTTGGTTTGCCCTTCACGAAACTGAATCC
GGAGTTCGTTAAATCCGTTAGAAACGAGTTTTCACAGGACAGCAAACTGTTACTGGTTTG
CCAAGAAGGTCTCAGATCTGCAGCTGCTGCTAGTAGATTGGAGGAAGCAGGTTACGATAA
CATTGCTTGTGTAACATCAGGGTTACAATCTGTTAAACCAGAGACATTTGAGTCGGTTGG
TTCAACGGAGTTGCAGAATGCAGGCAAGGCAGGGCTTATCACAATTCAAGGCAAGATTTC
AGCTGTCTTAGGAACAGTGCTTGTCTGTGCTTTGTTGTTCATAACGTTCTTCCCTGACCA
GGCAGAGAAGCTGTTTCCTTCAAGCTAAGACAAGAGAATCGCAATGATTGGTTCAGAAAA
GTTTTTACAGTTTCAGCGCGTATGTATGTAGATGCTTAAGGAACAATGAAAGAATCTTAA
AATATTTGAATTTTTGAAGTAGTTACAAAAACATATGGTATCGGACAAAGTTGTTATCTG
CTTGTATAACAATTAAGAAAAAAAAGTCACCAATT

QA 9 763 9 763
DS 



AS 1 3

CO CL3012Contig1 741 3 3 U
ACTGAATTTTGCATTAGGACATATAAGAAACGCACTTCCGCAGAAACACTTACATAGCGC
TCTCAGTTCACCTGTCTCGACTAGCTTGATACAACAAGAAACAAGAGTTGTTTCTAGTGA
TGGGTACATACATTATATTTTACAGCGTCTTAAGACTAGTCGATGCCTCCGCAATATAGC
ACATTTGCTTTGCGGCCAAAACTCCACTAGGATACGCTCGTTCAGTGACTTGATGCTAAT
GCCGTCACGGATATGCCAAGCACCAAGAACGGCTGTGCACTAGCCTGGTACTTGACGTCG
TATTTGACAGGGTCCTTGAGAAAGTACTTAAACTGGAACACAATCTGTGGAATAATCAAA
GCAAGTAGGGCCAACGCATAATAAGGTTTGCCAGACGCTAATAGATAGCCGGAAACAGAG
AGTTGAGTAACGTCTATAGCACCAACGCATATCCATTTTGCAGCTTCAGTGCCAAAAGCT
ACAGGGAGAGACTGAAGCCCCATTGCTCTGTCTCCTTCAACACTTTTGAAGTCATTAACA
ATGGCTATACCCAACCCAGCTATGCTGTACAAGAGTGTTAAAACGACAACGTCTGGTGTA
AGAGTGCCAAACAATGCTTGTCCAGCCCACCACGGTAAACTGATATAGCTCGCCCCCAGT
GCAAAGTTTCCAACCCATCCATTTTGTTTTAGCTTCAAAGGCGGAGCAGAGTATATATAT
GACAGCAAGGATCCTCCCAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ40TF C 1
AF RR2FZ40JQ U 14
AF RR2FD29JQ U 39
BS 1 13 RR2FZ40TF
BS 14 693 RR2FZ40JQ
BS 694 741 RR2FD29JQ

RD RR2FZ40TF 694 0 0
ACTGAATTTTGCATTAGGACATATAAGAAACGCACTTCCGCAGAAACACTTACATAGCGC
TCTCAGTTCACCTGTCTCGACTAGCTTGATACAACAAGAAACAAGAGTTGTTTCTAGTGA
TGGGTACATACATTATATTTTACAGCGTCTTAAGACTAGTCGATGCCTCCGCAATATAGC
ACATTTGCTTTGCGGCCAAAACTCCACTAGGATACGCTCGTTCAGTGACTTGATGCTAAT
GCCGTCACGGATATGCCAAGCACCAAGAACGGCTGTGCACTAGCCTGGTACTTGACGTCG
TATTTGACAGGGTCCTTGAGAAAGTACTTAAACTGGAACACAATCTGTGGAATAATCAAA
GCAAGTAGGGCCAACGCATAATAAGGTTTGCCAGACGCTAATAGATAGCCGGAAACAGAG
AGTTGAGTAACGTCTATAGCACCAACGCATATCCATTTTGCAGCTTCAGTGCCAAAAGCT
ACAGGGAGAGACTGAAGCCCCATTGCTCTGTCTCCTTCAACACTTTTGAAGTCATTAACA
ATGGCTATACCCAACCCAGCTATGCTGTACAAGAGTGTTAAAACGACAACGTCTGGTGTA
AGAGTGCCAAACAATGCTTGTCCAGCCCACCACGGTAAACTGATATAGCTCGCCCCCAGT
GCAAAGTTTCCAACCCATCCATTTTGTTTTAGC
C

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2FZ40JQ 681 0 0
TTAGGACATATAAGAAACGCACTTCCGCAGAAACACTTACATAGCGCTCTCAGTTCACCT
GTCTCGACTAGCTTGATACAACAAGAAACAAGAGTTGTTTCTAGTGATGGGTACATACAT
TATATTTTACAGCGTCTTAAGACTAGTCGATGCCTCCGCAATATAGCACATTTGCTTTGC
GGCCAAAACTCCACTAGGATACGCTCGTTCAGTGACTTGATGCTAATGCCGTCACGGATA
TGCCAAGCACCAAGAACGGCTGTGCACTAGCCTGGTACTTGACGTCGTATTTGACAGGGT
CCTTGAGAAAGTACTTAAACTGGAACACAATCTGTGGAATAATCAAAGCAAGTAGGGCCA
ACGCATAATAAGGTTTGCCAGACGCTAATAGATAGCCGGAAACAGAGAGTTGAGTAACGT
CTATAGCACCAACGCATATCCATTTTGCAGCTTCAGTGCCAAAAGCTACAGGGAGAGACT
GAAGCCCCATTGCTCTGTCTCCTTCAACACTTTTGAAGTCATTAACAATGGCTATACCCA
ACCCAGCTATGCTGTACAAGAGTGTTAAAACGACAACGTCTGGTGTAAGAGTGCCAAACA
ATGCTTGTCCAGCCCACCACGGTAAACTGATATAGCTCGCCCCCAGTGCAAAGTTTCCAA
CCCATCCATTTTGTTTTAGC
C

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2FD29JQ 703 0 0
CGCAAAAACACTTACATAGCGCTCTCAGTTCACCTGTCTCGACTAGCTTGATACAACAAG
AAACAAGAGTTGTTTCTAGTGATGGGTACATACATTATATTTTACAGCGTCTTAAGACTA
GTCGATGCCTCCGCAATATAGCACATTTGCTTTGTGGCCAAAACTCCACTAGGATACGCT
CGTTCAGTGACTTGATGCTAATGCCGTCACGAATATGCCAAGCACCAAGAACGGCTGTGC
ACTAGCCTGGTACTTGACGTCGTATTTGACAGGGTCCTTGAGAAAGTACTTAAACTGGAA
CACAATCTGTGGAATAATCAAAGCAAGTAGGGCCAACGCGTAATAAGGTTTGCCAGACGC
TAATAGATAGCCGGAAACAGAGAGTTGAGTAACGTATATAGCACCAACGCATATCCATTT
TGCAGCTTCAGTGCCAAAAGCTACAGGGAGAGACTGAAGCCCCATTGCTCTGTCTCCTTC
AACACTTTTGAAGTCATTAACAATGGCTATACCCAACCCAGCTATGCTGTACAAGAGTGT
TAAAACGACAACGTCTGGTGTAAGAGTGCCAAACAATGCTTGTCCAGCCCACCACGGTAA
ACTGATATAGCTCGCCCCCAGTGCAAAGTTTCCAACCCATCCACTTTGTTTTAGCTTCAA
AGGCGGAGCAGAGTATATATATGACAGCAAGGATCCTCCCAAA

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 3

CO CL3013Contig1 679 3 8 U
GGGCCCAAATTCCAATCCGGAAAATGGCTCTCCGATCTGTCAAAACGCCGTTTGTAACTC
CCGCCACCGTCGTCTCCTCCTCGATTATCAACAGACCACAGTCTTTCAGATTCGCCTCAA
AACCGAGGGCACCACTGGCCGTCTGCAACAACCACCACCAACCGATCTCCATCACTCGAT
CGAATCTTATACCCAAACTCAAACCATCATCTCCCGCCGCCAAATTCAGGTGCTCGGCGT
CGTCGTCGGCGCTCACGCCCCAACTCAGAGATACGCTGGAGAAGCTGGTGAATTCGGAGA
AAGTCGTGTTATTCATGAAAGGCACGAGGGATTTCCCCATGTGCGGATTCTCGAACACGG
TGGTGCAGATCCTCAAGAATCTCAACGTCCCCTTCGAAGACGTCAGCATTCTCGAGAACG
AGATACTGAGGCAAGGGCTGAAAGAGTACTCTAATTGGCCCACGTTTCCTCAGCTTTACA
TCGACGGCGAGTTCTTCGGTGGCTGTGACATCACTCTCGAGGCGTTTCAGAGTGGGGAGT
TGCAGGAAGTTGTTGAAAGAGCTATTTGTTCTTGATGCTTGTCTTTGGGTTTTGTAACGA
TGCTATTTGAGCGTATTGTGTGATGGATTTAATTATAGAACATTGGATCTATACATTATA
AAAGTCTTCTTGATGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CO90TF U 1
AF RR2DU07TF U 5
AF RR2DU07JQ C 246
BS 1 39 RR2CO90TF
BS 40 40 RR2DU07TF
BS 41 208 RR2CO90TF
BS 209 209 RR2DU07TF
BS 210 259 RR2CO90TF
BS 260 260 RR2DU07TF
BS 261 299 RR2CO90TF
BS 300 679 RR2DU07TF

RD RR2CO90TF 299 0 0
GGGCCCAAATTCCAATCCGGAAAATGGCTCTCCGATCTG*CAAAACGCCGTTTGTAACTC
CCGCCACCGTCGTCTCCTCCTCGATTATCAACAGACCACAGTCTTTCAGATTCGCCTCAA
AACCGAGGGCACCACTGGCCGTCTGCAACAACCACCACCAACCGATCTCCATCACTCGAT
CGAATCTTATACCCAAACTCAAACCATCCTCTCCCGCCGCCAAATTCAGGTGCTCGGCGT
CGTCGTCGGCGCTCACGCCTCAACTCAGAGATACGCTGGAGAAGCTGGTGAATTCGGAG

QA 1 299 1 299
DS 

RD RR2DU07TF 675 0 0
GAAATTCCA
AATCCGGAAAATGGCTCTCCGATCTGTCAAAACGCCGTTTGTAACTCCCGCCGCCGTCGT
CTCCTCCTCGATTATCAACAGACCACAGTCTTTCAGATTCGCCTCAAAACCGAGGGCACC
ACTGGCCGTCTGCAACAACCACCACCAACCGATCTCCATCACTCGATCGAATCTTATACC
CAAACTCAAACCATCATCTCCCGCCTCGAAATTCAGGTGCTCGGCGTCGTCGTCGGCGCT
CACGCCCCAACTCAGAGATACGCTGGAGAAGCTGGTGAATTCGGAGAAAGTCGTGTTATT
CATGAAAGGCACGAGGGATTTCCCCATGTGCGGATTCTCGAACACGGTGGTGCAGATCCT
CAAGAATCTCAACGTCCCCTTCGAAGACGTCAGCATTCTCGAGAACGAGATACTGAGGCA
AGGGCTGAAAGAGTACTCTAATTGGCCCACGTTTCCTCAGCTTTACATCGACGGCGAGTT
CTTCGGTGGCTGTGACATCACTCTCGAGGCGTTTCAGAGTGGGGAGTTGCAGGAAGTTGT
TGAAAGAGCTATTTGTTCTTGATGCTTGTCTTTGGGTTTTGTAACGATGCTATTTGAGCG
TATTGTGTGATGGATTTAATTATAGAACATTGGATCTATACATTATAAAAGTCTTCTTGA
TGTCCC

QA 10 675 10 675
DS 

RD RR2DU07JQ 434 0 0
TCGGCGCTCACGCCCCAACTCAGAGATACGCTGGAGAAGCTGGTGAATTCGGAGAAAGTC
GTGTTATTCATGAAAGGCACGAGGGATTTCCCCATGTGCGGATTCTCGAACACGGTGGTG
CAGATCCTCAAGAATCTCAACGTCCCCTTCGAAGACGTCAGCATTCTCGAGAACGAGATA
CTGAGGCAAGGGCTGAAAGAGTACTCTAATTGGCCCACGTTTCCTCAGCTTTACATCGAC
GGCGAGTTCTTCGGTGGCTGTGACATCACTCTCGAGGCGTTTCAGAGTGGGGAGTTGCAG
GAAGTTGTTGAAAGAGCTATTTGTTCTTGATGCTTGTCTTTGGGTTTTGTAACGATGCTA
TTTGAGCGTATTGTGTGATGGATTTAATTATAGAACATTGGATCTATACATTATAAAAGT
CTTCTTGATGTCCC

QA 1 434 1 434
DS 



AS 1 3

CO CL3014Contig1 630 3 16 U
GGATTGTCAACATCTTATCTTCTCTCATATCTCCACACAGCATGTCTGTACAAGCAGGCG
CTCATGATCAACAACTAAAGAGGAAGGAATCGGCTATTGGTTCAGAGCCTCCCGCGTGTG
GAAACAAGTGCCTGAATTGCAAGCCTTGCCTTCCTTATCTATTTGACATTCATGGTGCTG
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAT***CGTGAACCATACTATCCGGTAAGGT
GGATGTGTAGATGTCGGGAAAAGATATTCGGACCTTAAGAATAGTACCATTACCTATATT
ATTTATTTAGTGCTTGCTTTGCTTATTATCATGGACGTTCATGAATCATGATGATCCATG
AATATGGTTCATCGTTAACGGTCGAGATTAAGCATATCTTCTAATATGCAAACGGGTGGG
TGGGGGATACTATTTCAATCTGAATTTTGTCCATTGTGCCTATTGCTTTTTTTTGAACTT
TGTGTATTTCATATCAGACTAAATAAAAACTTTTATTTCTGAACTTTATAATAGTACATA
TTTCTAATATGGGGGGGGGGGGATACTATTTCAATTTGAATTTTGTCCATTGTGCCTATT
GCTTTTTTTGAACTTTGTGTATTTCATATC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FO27TF U 1
AF RR2CE55JQ C 1
AF RR2CE55TF U 1
BS 1 93 RR2FO27TF
BS 94 94 RR2CE55TF
BS 95 212 RR2FO27TF
BS 213 215 RR2CE55TF
BS 216 287 RR2FO27TF
BS 288 288 RR2CE55TF
BS 289 289 RR2FO27TF
BS 290 290 RR2CE55TF
BS 291 335 RR2FO27TF
BS 336 336 RR2CE55TF
BS 337 345 RR2FO27TF
BS 346 346 RR2CE55TF
BS 347 473 RR2FO27TF
BS 474 474 RR2CE55TF
BS 475 495 RR2FO27TF
BS 496 630 RR2CE55TF

RD RR2FO27TF 495 0 0
GGATTGTCAACATCTTATCTTCTCTCATATCTCCACACAGCATGTCTGTACAAGCAGGCG
CTCATGATCAACAACTAAAGAGGAAGGAATCGGTTATTGGTTCAGAGCCTCCCGCGTGTG
GAAACAAGTGCCTGAATTGCAAGCCTTGCCTTCCTTATCTATTTGACATTCATGGTGCTG
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATCGTGAACCATACTATCCGGTAAGGT
GGATGTGTAGATGTCGGGAAAAGATATTCGGACCTTAAGAATAGTACTACTACCTATATT
ATTTATTTAGTGCTTGCTTTGCTTATTATCATGGATGTTCATGAACCATGATGATCCATG
AATATGGTTCATCGTTAACGGTCGAGATTAAGCATATCTTCTAATATGCAAACGGGTGGG
TGGGGGATACTATTTCAATCTGAATTTTGTCCATTGTGCCTATTGCTTTTTTT*GAACTT
TGTGTATTTCATATC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR2CE55JQ 630 0 0
GGATTGTCAACATCTTATCTTCTCTCATATCTCCACACAGCATGTCTGTACAAGCAGGCG
CTCATGATCAACAACTAAAGAGGAAGGAATCGGCTATTGGTTCAGAGCCTCCCGCGTGTG
GAAACAAGTGCCTGAATTGCAAGCCTTGCCTTCCTTATCTATTTGACATTCATGGTGCTG
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAT***CGTGAACCATACTATCCGGTAAGGT
GGATGTGTAGATGTCGGGAAAAGATATTCGGACCTTAAGAATAGTACCATTACCTATATT
ATTTATTTAGTGCTTGCTTTGCTTATTATCATGGACGTTCATGAATCATGATGATCCATG
AATATGGTTCATCGTTAACGGTCGAGATTAAGCATATCTTCTAATATGCAAACGGGTGGG
TGGGGGATACTATTTCAATCTGAATTTTGTCCATTGTGCCTATTGCTTTTTTTTGAACTT
TGTGTATTTCATATCAGACTAAATAAAAACTTTTATTTCTGAACTTTATAATAGTACATA
TTTCTAATATGGGGGGGGGG**ATACTATTTCAATTTGAATTTTGTCCATTGTGCCTATT
GCTTTTTTTGAACTTTGTGTATTTCATATC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2CE55TF 630 0 0
GGATTGTCAACATCTTATCTTCTCTCATATCTCCACACAGCATGTCTGTACAAGCAGGCG
CTCATGATCAACAACTAAAGAGGAAGGAATCGGCTATTGGTTCAGAGCCTCCCGCGTGTG
GAAACAAGTGCCTGAATTGCAAGCCTTGCCTTCCTTATCTATTTGACATTCATGGTGCTG
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAT***CGTGAACCATACTATCCGGTAAGGT
GGATGTGTAGATGTCGGGAAAAGATATTCGGACCTTAAGAATAGTACCATTACCTATATT
ATTTATTTAGTGCTTGCTTTGCTTATTATCATGGACGTTCATGAATCATGATGATCCATG
AATATGGTTCATCGTTAACGGTCGAGATTAAGCATATCTTCTAATATGCAAACGGGTGGG
TGGGGGATACTATTTCAATCTGAATTTTGTCCATTGTGCCTATTGCTTTTTTTTGAACTT
TGTGTATTTCATATCAGACTAAATAAAAACTTTTATTTCTGAACTTTATAATAGTACATA
TTTCTAATATGGGGGGGGGGGGATACTATTTCAATTTGAATTTTGTCCATTGTGCCTATT
GCTTTTTTTGAACTTTGTGTATTTCATATC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL3015Contig1 1149 2 2 U
GGGCCTCTCGTCTGATTTATACACTGCAAAAGCTAATCTCGGCGATTAGGTCTCTGAGAA
GAAGAGCGAAGAGAAAATGGCGAGTAATGGATCTGGACAGCTGTCGCAGAAGGAAGCTGA
CATCAAGATGATGTGTGCCGCTGAGGTTCACCTCGGAACCAAGAACTGTAACTACCAAAT
GGAGCGTTACGTCTTCAAGAGACGCAACGACGGTATTTACATCTTTAACCTGGGCAAAAC
ATGGGACAAGCTGCAGATGGCCGCTAGGGTTATTGTTGGTATTGAGAACCCACAGGACAT
CATTGTTCAGTCAGCTAGGCCCTATGGTCAGAGAGCTGTCCTCAAGTTCGCTCAGTACAC
TGGAGCCAACGCCATTGCTGGAAGGCACACCCCTGGTACCTTTATCAATCAGATGCAGAC
CTCCTTCAGCGAGCCTAGGCTGTTGATTCTCACCGATCCACGTACCGACCATCAGCCAAT
CAAGGAAGGTGCTTTGGGAAACATTCCAATCATTGCTTTCTGTGACACTGACTCTCCAAT
GAGGTTTGTTGACATTGGTATCCCCGCCAATAACAAGGGAAAGCACAGCATTGGTTGTCT
CTTTTGGCTTCTTGCCCGCATGGTCCTCCAGATGCGTGGAACTATTCGCCCTGCCCAGAA
GTGGGATGTCATGGTTGACCTGTTCTTCTACAGGGAGCCAGAGGAGGCTAAGCCAGAGGA
TGAAGACGAAGTTGCTCCTCAGGCAGAGTATGGACTACCTGCTCCTGAGTATGGAGGTGG
TGGTGACCAGTGGACCACTGCTGCCATCCCTGATGCCGCATGGCCTGGAGAAGGTCAGGC
GCCAATCGCCGCTGCTCCTGCCGGTGCTTCATGGAACGAATCCAGCACTGCTCCAGCAGC
AGAAGGTGGATGGGACACTGCTGTGCCACCCACAGCTGCAGTTGGCGGTTGGGAGTGAAG
TTGATGAGCCTTTACAATGGTTATAGACATGGTTTTTAGTTACTGTTGGGATTGAAGAGT
TCTCAAACCGGAATTGTGTTTCTCTTTTTTCTTTTGCACTCTTTTCTTTCAAGACAAAAC
ATTAGATTTTTGCACTTTTTGTTTTGAATGAAATTTCTACTATTATCTATATCTCGTATG
TCTTAATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D472TF U 1
AF RR2D472JQ C 428
BS 1 694 RR2D472TF
BS 695 1149 RR2D472JQ

RD RR2D472TF 698 0 0
GGGCCTCTCGTCTGATTTATACACTGCAAAAGCTAATCTCGGCGATTAGGTCTCTGAGAA
GAAGAGCGAAGAGAAAATGGCGAGTAATGGATCTGGACAGCTGTCGCAGAAGGAAGCTGA
CATCAAGATGATGTGTGCCGCTGAGGTTCACCTCGGAACCAAGAACTGTAACTACCAAAT
GGAGCGTTACGTCTTCAAGAGACGCAACGACGGTATTTACATCTTTAACCTGGGCAAAAC
ATGGGACAAGCTGCAGATGGCCGCTAGGGTTATTGTTGGTATTGAGAACCCACAGGACAT
CATTGTTCAGTCAGCTAGGCCCTATGGTCAGAGAGCTGTCCTCAAGTTCGCTCAGTACAC
TGGAGCCAACGCCATTGCTGGAAGGCACACCCCTGGTACCTTTATCAATCAGATGCAGAC
CTCCTTCAGCGAGCCTAGGCTGTTGATTCTCACCGATCCACGTACCGACCATCAGCCAAT
CAAGGAAGGTGCTTTGGGAAACATTCCAATCATTGCTTTCTGTGACACTGACTCTCCAAT
GAGGTTTGTTGACATTGGTATCCCCGCCAATAACAAGGGAAAGCACAGCATTGGTTGTCT
CTTTTGGCTTCTTGCCCGCATGGTCCTCCAGATGCGTGGAACTATTCGCCCTGCCCAGAA
GTGGGATGTCATGGTTGACCTGTTCTTCTACAGG
AGCC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2D472JQ 722 0 0
AGCGAGCCTAGGCTGTTGATTCTCACCGATCCACGTACCGACCATCAGCCAATCAAGGAA
GGTGCTTTGGGAAACATTCCAATCATTGCTTTCTGTGACACTGACTCTCCAATGAGGTTT
GTTGACATTGGTATCCCCGCCAATAACAAGGGAAAGCACAGCATTGGTTGTCTCTTTTGG
CTTCTTGCCCGCATGGTCCTCCAGATGCGTGGAACTATTCGCCCTGCCCAGAAGTGGGAT
GTCATGGTTGACCTGTTCTTCTACAGGGAGCCAGAGGAGGCTAAGCCAGAGGATGAAGAC
GAAGTTGCTCCTCAGGCAGAGTATGGACTACCTGCTCCTGAGTATGGAGGTGGTGGTGAC
CAGTGGACCACTGCTGCCATCCCTGATGCCGCATGGCCTGGAGAAGGTCAGGCGCCAATC
GCCGCTGCTCCTGCCGGTGCTTCATGGAACGAATCCAGCACTGCTCCAGCAGCAGAAGGT
GGATGGGACACTGCTGTGCCACCCACAGCTGCAGTTGGCGGTTGGGAGTGAAGTTGATGA
GCCTTTACAATGGTTATAGACATGGTTTTTAGTTACTGTTGGGATTGAAGAGTTCTCAAA
CCGGAATTGTGTTTCTCTTTTTTCTTTTGCACTCTTTTCTTTCAAGACAAAACATTAGAT
TTTTGCACTTTTTGTTTTGAATGAAATTTCTACTATTATCTATATCTCGTATGTCTTAAT
CG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL3016Contig1 590 2 3 U
GGAGGTCCCTGAAACCATATAGTATATACAATACATGATTTTGTCCTGTTGAACTTTTCT
CCCGGTCCCGGTAAGTCAATTATCTCTTTGGGGGGCTATATTTTCAGGGAGTAAAATGGG
TATATTCCCCGAGTTTGGTGCCTGGATCAGTCAGAACACACAACATCCTACAAAATCTGA
AGAAAATGTTAAATCCAAGCCAATGACACAGCCAAAAACTCACGAGGAGAGAAATGAGTT
GAAGGAGCAATTAAAACTATGGAGAGATGCAAATAAGAAGGAACAATATCACGAAACTCC
TCCTACCGTGAAGAAGGTGCGTACAGACCATAATTCTGGCATTTCCTATATGAAAATGGA
ATTTACATTAGGATTGCCACCTCAAGCAGCTTACGGCTTTTTAACTAATGAGGACAACAT
AGCATACTCCAGAGAAATCAAAGGCCGCCCACTTCTGAAAGCCGTATCAAGAAAAGTTCA
ACAAGAGAAGGATGTACGTGATCAAGGGAGTATGCTGGACGTGGAGGTTGAGAAAGAGTT
GGCATGGAACTTCCTTTTCTTGTCAGGAACTATCCCAATACGTCTAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY32TF U 1
AF RR2C992TF U 1
BS 1 171 RR2C992TF
BS 172 172 RR2DY32TF
BS 173 590 RR2C992TF

RD RR2DY32TF 367 0 0
GGGAGG
CCCTGAAACCATATAGTATATACAATACATGATTTTGTCCTGTTGAACTTTTCTCCCGGT
CCCGGTAAGTCAATTATCTCTTTGGGGGGCTATATTTTCAGGGAGTAAAATGGGTATATT
CCCCGAGTTTGGTGCCTGGATCAGTCAGAACACACAACATCCTACAAAATCTGAAGAAAA
TGTTAAATCCAAGCCAATGACACAGCCAAAAACTCACGAGGAGAGAAATGAGTTGAAGGA
GCAATTAAAACTATGGAGAG*TGCAAATAAGAAGGAACAATATCACGAAACTCCTCCTAC
CGTGAAGAAGG*GCGTACAGACCATAATTCTGGC*TTTCCTATATGAAAATGGAATTTAC
A

QA 7 367 7 367
DS 

RD RR2C992TF 590 0 0
GGAGGTCCCTGAAACCATATAGTATATACAATACATGATTTTGTCCTGTTGAACTTTTCT
CCCGGTCCCGGTAAGTCAATTATCTCTTTGGGGGGCTATATTTTCAGGGAGTAAAATGGG
TATATTCCCCGAGTTTGGTGCCTGGATCAGTCAGAACACACAACATCCTACGAAATCTGA
AGAAAATGTTAAATCCAAGCCAATGACACAGCCAAAAACTCACGAGGAGAGAAATGAGTT
GAAGGAGCAATTAAAACTATGGAGAGATGCAAATAAGAAGGAACAATATCACGAAACTCC
TCCTACCGTGAAGAAGGTGCGTACAGACCATAATTCTGGCATTTCCTATATGAAAATGGA
ATTTACATTAGGATTGCCACCTCAAGCAGCTTACGGCTTTTTAACTAATGAGGACAACAT
AGCATACTCCAGAGAAATCAAAGGCCGCCCACTTCTGAAAGCCGTATCAAGAAAAGTTCA
ACAAGAGAAGGATGTACGTGATCAAGGGAGTATGCTGGACGTGGAGGTTGAGAAAGAGTT
GGCATGGAACTTCCTTTTCTTGTCAGGAACTATCCCAATACGTCTAAATG

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 3

CO CL3017Contig1 1313 3 7 U
GGACATCACATCTCTCTCTCTCTTCTCCGCCGTTAACCACCAGTATACAGAGAGGCTGGA
GCTGGGGAAGAAGAAAAGGATTGTTTATGGAGGGAGAAGGCGTAAAAGGTTTGGCATGCC
AGAAGATTATGGATGGGAATGCGAGTAATGGGAATGATGGTCTGGAGAAGACTGTTGTAC
CTTCTTGTTGCCTCAAGGCCATCTCTTGCTTACCTGAGCAAGATGCTAAGTGCCACTCCA
CTGTTGTCTCTGGATGGTTCTCCGAACCTCCTCACCCTCGCTCTGGGAAAAGAGGCAAAT
CAGTGTATTTCAACAACCCTATGTGGCCTGGAGAAGCACACTCACTGAAAGTTGAGAAAG
TTCTATTCAAAGACAAGTCAGATTATCAGGAAGTCCTAGTGTTTGAGTCAGCTACGTATG
GGAAAGTGCTTGTTCTAGATGGTATTCTACAGCTGACTGAAAAAGATGAATTTGCATATC
AGGAGATGATAGCCCATCTACCTTTATGCTCTACACCTTCACCTAAAAATGTTCTGGTTG
TTGGTGGAGGTGATGGTGGTGTTCTCAGGGAGATTTCTCGCCATAGCTCTGTTGAGGTTA
TTGACATTTGTGAGATAGACAAGATGGTCATAGATGTATCTAAGAAGTTCTTCCCCGAGT
TAGCAGTTGGATTTGAGGATCCTCGTGTTCATCTTCACATTGGTGATGCTGTTGAGTTCC
TTCGTAAATCCCCTGAAGGGAAGTATGATGCCATTATTGTGGATTCTTCAGACCCTGTTG
GTCCTGCTCAGGCGCTTGTTGAGAAGCCTTTCTTTGAGACGTTAGCTAGAGCGTTGAAGC
CTGGAGGAGTTCTTTGCAACATGGCGGAAAGTATGTGGCTCCACACTCATCTCATTGAAG
ACATGATCTCCATTTGCCGCCAAACATTCAAAAACGTTCAGTATGCGTGGAGCACCGTCC
CAACATACCCAAGCGGCGTGATTGGTTTTATCTTGTGCTCTACGGGCGGTCCCGCTGTTG
ATTTCAAGAACCCTATCAACCCTATTGAGAAACTAGACGGTGCCATGACCTATAAGCGAG
AAATGAAGTTTTATAACTCGGATATGCACAGAGCAGCTTTCGCTTTGCCTACATTCCTTA
GAAGAGAAGTGGCTCCACTTCTGTCTTCTTCTTGACTTCTGTTTGTCTTAAACATTTTAC
TATAAAACCTCTGTAAAAAGAGGAAATAATTGCATCATAGGAGGCTTTGTATCACAATGC
TCACTCCTTTTAATATTTAAAGACTTCTATTTTTATATATTGGCACTATATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT93TF U 1
AF RR2FU55TF U 378
AF RR2AT93JQ C 506
BS 1 763 RR2AT93TF
BS 764 935 RR2FU55TF
BS 936 936 RR2AT93JQ
BS 937 1059 RR2FU55TF
BS 1060 1060 RR2AT93JQ
BS 1061 1134 RR2FU55TF
BS 1135 1313 RR2AT93JQ

RD RR2AT93TF 763 0 0
GGACATCACATCTCTCTCTCTCTTCTCCGCCGTTAACCACCAGTATACAGAGAGGCTGGA
GCTGGGGAAGAAGAAAAGGATTGTTTATGGAGGGAGAAGGCGTAAAAGGTTTGGCATGCC
AGAAGATTATGGATGGGAATGCGAGTAATGGGAATGATGGTCTGGAGAAGACTGTTGTAC
CTTCTTGTTGCCTCAAGGCCATCTCTTGCTTACCTGAGCAAGATGCTAAGTGCCACTCCA
CTGTTGTCTCTGGATGGTTCTCCGAACCTCCTCACCCTCGCTCTGGGAAAAGAGGCAAAT
CAGTGTATTTCAACAACCCTATGTGGCCTGGAGAAGCACACTCACTGAAAGTTGAGAAAG
TTCTATTCAAAGACAAGTCAGATTATCAGGAAGTCCTAGTGTTTGAGTCAGCTACGTATG
GGAAAGTGCTTGTTCTAGATGGTATTCTACAGCTGACTGAAAAAGATGAATTTGCATATC
AGGAGATGATAGCCCATCTACCTTTATGCTCTACACCTTCACCTAAAAATGTTCTGGTTG
TTGGTGGAGGTGATGGTGGTGTTCTCAGGGAGATTTCTCGCCATAGCTCTGTTGAGGTTA
TTGACATTTGTGAGATAGACAAGATGGTCATAGATGTATCTAAGAAGTTCTTCCCCGAGT
TAGCAGTTGGATTTGAGGATCCTCGTGTTCATCTTCACATTGGTGATGCTGTTGAGTTCC
TTCGTAAATCCCCTGAAGGGAAGTATGATGCCATTATTGTGGA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2FU55TF 757 0 0
G
CAGATTATCAGGAAGTCCTAGTGTTTGAGTCAGCTACGTATGGGAAAGTGCTTGTTCTAG
ATGGTATTCTACAGCTGACTGAAAAAGATGAATTTGCATATCAGGAGATGATAGCCCATC
TACCTTTATGCTCTACACCTTCACCTAAAAATGTTCTGGTTGTTGGTGGAGGTGATGGTG
GTGTTCTCAGGGAGATTTCTCGCCATAGCTCTGTTGAGGTTATTGACATTTGTGAGATAG
ACAAGATGGTCATAGATGTATCTAAGAAGTTCTTCCCCGAGTTAGCAGTTGGATTTGAGG
ATCCCCGTGTTCATCTTCACATTGGTGATGCTGTTGAGTTCCTTCGTAAATCCCCTGAAG
GGAAGTATGATGCCATTATTGTGGATTCTTCAGACCCTGTTGGTCCTGCTCAGGCGCTTG
TTGAGAAGCCTTTCTTTGAGACGTTAGCTAGAGCGTTGAAGCCTGGAGGAGTTCTTTGCA
ACATGGCGGAAAGTATGTGGCTCCACACTCATCTCATTGAAGACATGATCTCCATTTGCC
GCCAAACATTCAAAAACTTTCAGTATGCGTGGAGCACCGTCCCAACATACCCAAGCGGCG
TGATTGGTTTTATCTTGTGCTCTACGGGCGGTCCCGCTGTTGATTTCAAGAACCCTATCA
ACCCTATTGAGAAACTAGACG*TGCCATGACCTATAAGCGAGAAATGAAGTTTTATAACT
CGGATATGCACAGAGCAGCTTTCGCTTTGCCTACAT

QA 2 757 2 757
DS 

RD RR2AT93JQ 808 0 0
ATGCTCTACACTTTCACCTAAAAATGTTCTGGTTGTTGGTGGAGGTGATGGTGGTGTTCT
CAGGGAGATTTCTCGCCATAGCTCTGTTGAGGTTATTGACATTTGTGAGATAGACAAGAT
GGTCATAGATGTATCTAAGAAGTTCTTCCCCGAGTTAGCAGTTGGATTTGAGGATCCTCG
TGTTCATCTTCACATTGGTGATGCTGTTGAGTTCCTTCGTAAATCCCCTGAAGGGAAGTA
TGATGCCATTATTGTGGATTCTTCAGACCCTGTTGGTCCTGCTCAGGCGCTTGTTGAGAA
GCCTTTCTTTGAGACGTTAGCTAGAGCGTTGAAGCCTGGAGGAGTTCTTTGCAACATGGC
GGAAAGTATGTGGCTCCACACTCATCTCATTGAAGACATGATCTCCATTTGCCGCCAAAC
ATTCAAAAACGTTCAGTATGCGTGGAGCACCGTCCCAACATACCCAAGCGGCGTGATTGG
TTTTATCTTGTGCTCTACGGGCGGTCCCGCTGTTGATTTCAAGAACCCTATCAACCCTAT
TGAGAAACTAGACGGTGCCATGACCTATAAGCGAGAAATGAAGTTTTATAACTCGGATAT
GCACAGAGCAGCTTTCGCTTTGCCTACATTCCTTAGAAGAGAAGTGGCTCCACTTCTGTC
TTCTTCTTGACTTCTGTTTGTCTTAAACATTTTACTATAAAACCTCTGTAAAAAGAGGAA
ATAATTGCATCATAGGAGGCTTTGTATCACAATGCTCACTCCTTTTAATATTTAAAGACT
TCTATTTTTATATATTGGCACTATATAC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL3020Contig1 1050 2 2 U
AGGAGGATTTTATGTTTATGTTAAAAGGTATAGACATACATGAAACCTACCTGGCTATGC
AGCTTCTTCTTCTTGTTTCTACCAAAAACAAAGATTCTTTGCACAGTTCAAACTCAAATA
AAACAAAACTACAAAAGTTCATATCAGGTTCTTATTTCTTATCCTCCTCTTCCTCTCTTC
ATCTACCGCTTCTGCATTTTTATGACTCTCCAGCATCTCCGCAGCTTCTCCTGTGGTGTC
CCCTCTCTTCTCATCCATCTCATTCCCTCTCCACTCTTCCTCAATTATGCCTACCGTGGA
AGGTTTAGTCACCACCAGGTTACAACTTTGTAATTGTGGTTGCTGTTTCCTACATTCCCT
TAAACCATAACTGCCTCTGTTAGCTTCTTGACCACCGATGAAGTAAAACTCAAAGAGCCA
AGCACATAATTTTTTTTAATTATGTTGTCCCAACATAAGTTGTGATGGGTTGTGATGGGA
AGATGAGTCCAGTAAGTATTCACTAACGGCTACGTCAGCAGAAGATAAGACCAGCGCATG
TCCCCCAAACAGATTTCCCCGTCTTAACAAACTCACGTAGAGCCGGAAACTTATGTACTT
GTATATTAGAAGTCCTCTCCTTTTTCAATCTCAAAGCCAATGTTTTTGGACAGAGATACT
CTCTAGCAGTTAGAGACGATCATCAAACCACAAAATTTCCCTAACTAATACAGAAATCAT
TTCTCCAAAAAGATCAGAACTTTGGAACAAACGAACTTTCCTTAAGACAAAACCTCAAAC
TATAAATTTGATAAACATTCGTTCCAACAGACACATAAAAGAGAAATATTTCCTAGTTTC
ACCAAATTGGCTCCTCGTAAAAACATTAAATTTCATTCCCAAACAATTGGATTACTGAAT
AAAGAAAACCAAGATTCGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGGACCGGGTTCTGGTACTCGGCG
AGTTTGGCCATGGTGGTGCTATCCATCTTATTCCCTCTCCACACTCATCGTCTGTGTGTA
TTACTTTGCGGCGTCACCGACTCTTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV40JQ U 1
AF RR2A969TF C 293
BS 1 525 RR2BV40JQ
BS 526 1050 RR2A969TF

RD RR2BV40JQ 525 0 0
AGGAGGATTTTATGTTTATGTTAAAAGGTATAGACATACATGAAACCTACCTGGCTATGC
AGCTTCTTCTTCTTGTTTCTACCAAAAACAAAGATTCTTTGCACAGTTCAAACTCAAATA
AAACAAAACTACAAAAGTTCATATCAGGTTCTTATTTCTTATCCTCCTCTTCCTCTCTTC
ATCTACCGCTTCTGCATTTTTATGACTCTCCAGCATCTCCGCAGCTTCTCCTGTGGTGTC
CCCTCTCTTCTCATCCATCTCATTCCCTCTCCACTCTTCCTCAATTATGCCTACCGTGGA
AGGTTTAGTCACCACCAGGTTACAACTTTGTAATTGTGGTTGCTGTTTCCTACATTCCCT
TAAACCATAACTGCCTCTGTTAGCTTCTTGACCACCGATGAAGTAAAACTCAAAGAGCCA
AGCACATAATTTTTTTTAATTATGTTGTCCCAACATAAGTTGTGATGGGTTGTGATGGGA
AGATGAGTCCAGTAAGTATTCACTAACGGCTACGTCAGCAGAAGA

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2A969TF 758 0 0
ACCGTGGAAGGTTTAGTCACCACCAGGTTACAACTTTGTAATTGTGGTTGCTGTTTCCTA
CATTCCCTTAGACCATAACTGCCTCTGTTAGCTTCTTGACCACCGATGAAGTAAAACTCA
AAGAGCCAAGCACATAATTTTTTTTAATTATGTTGTCGCAACATAAGTTGTGATGGGTTG
TGATGGGAAGATGAGTCCAGTAAGTATTCACTAACGGCTACGTCAGCAGAAGATAAGACC
AGCGCATGTCCCCCAAACAGATTTCCCCGTCTTAACAAACTCACGTAGAGCCGGAAACTT
ATGTACTTGTATATTAGAAGTCCTCTCCTTTTTCAATCTCAAAGCCAATGTTTTTGGACA
GAGATACTCTCTAGCAGTTAGAGACGATCATCAAACCACAAAATTTCCCTAACTAATACA
GAAATCATTTCTCCAAAAAGATCAGAACTTTGGAACAAACGAACTTTCCTTAAGACAAAA
CCTCAAACTATAAATTTGATAAACATTCGTTCCAACAGACACATAAAAGAGAAATATTTC
CTAGTTTCACCAAATTGGCTCCTCGTAAAAACATTAAATTTCATTCCCAAACAATTGGAT
TACTGAATAAAGAAAACCAAGATTCGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGGACCGGGTTCTGGT
ACTCGGCGAGTTTGGCCATGGTGGTGCTATCCATCTTATTCCCTCTCCACACTCATCGTC
TGTGTGTATTACTTTGCGGCGTCACCGACTCTTCCTCC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL3021Contig1 724 2 6 U
AGACTAAGAAACTAATCAAAAATCACAAAGTTGTGTACCATTGGATTTACAGAGTCAAAA
GCATTAGAAAGAGTAAACAACAATGCTCTTTAAGGTTCATGATCATTAATTTTGTAAATA
AGACTATAGAATGCAAGATACTTTTGAGAAGTTTCCAAAGTTGTGAAAGGAACAGAACAA
AAGAACTCAGAGGCAACAATGGTGAAACTCTGAGTAAACTCTTTGCTCATTTCTCTCTCT
CTCTCCTCCGTTTCTAGACAGAAGGGAAGTACTTGTTGAGATTGAAAGGAAGAGAGTAGA
ACTCTTCGCTTCTTGTGTCACCTTTGAAAGATCTAAACTTATCCCACCAATGCTTCCCTC
TGTCTTTCCTTATCGACGAATCTTTCTTGTGCAACGTGTTGTCCAAGAAGAAAGCCACCA
CGCCAGCAACAAAAGGTTCCGAGGAGAACGGGACATTCACCATATCATTGAACCAACGAG
CGCCTGTGTGGACAGGACCATAGCCTTTGATTGCAGTGTACTCGTTGAAGTACTGAGGGA
TGGACAAGCCGAGGAAGACAGAGAAGCCTAAGATGAACTTGGTCCGGAAGCTGTTTAAGT
TGCAGAACTGAAGAAAACTCAGACCTCCAGCTCCTACGTAGGCAAAGAAGAGACAGTACA
AAGCAGCGATTATCGGTGCAGGGATTGACGCAAACACAGCTCCGAATTTTCCGAGAATAG
AGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2FV73JQ U 1
AF RR2FF15JQ U 49
BS 1 243 RR2FV73JQ
BS 244 245 RR2FF15JQ
BS 246 585 RR2FV73JQ
BS 586 586 RR2FF15JQ
BS 587 677 RR2FV73JQ
BS 678 724 RR2FF15JQ

RD RR2FV73JQ 677 0 0
AGACTAAGAAACTAATCAAAAATCACAAAGTTGTGTACCATTGGATTTACAGAGTCAAAA
GCATTAGAAAGAGTAAACAACAATGCTCTTTAAGGTTCATGATCATTAATTTTGTAAATA
AGACTATAGAATGCAAGATACTTTTGAGAAGTTTCCAAAGTTGTGAAAGGAACAGAACAA
AAGAACTCAGAGGCAACAATGGTGAAACTCTGAGTAAACTCTTTGCTCATTTCTCTCTCT
CTC**CTCCGTTTCTAGACAGAAGGGAAGTACTTGTTGAGATTGAAAGGAAGAGAGTAGA
ACTCTTCGCTTCTTGTGTCACCTTTGAAAGATCTAAACTTATCCCACCAATGCTTCCCTC
TGTCTTTCCTTATCGACGAATCTTTCTTGTGCAACGTGTTGTCCAAGAAGAAAGCCACCA
CGCCAGCAACAAAAGGTTCCGAGGAGAACGGGACATTCACCATATCATTGAACCAACGAG
CGCCTGTGTGGACAGGACCATAGCCTTTGATTGCAGTGTACTCGTTGAAGTACTGAGGGA
TGGACAAGCCGAGGAAGACAGAGAAGCCTAAGATGAACTTGGTCCTGAAGCTGTTTAAGT
TGCAGAACTGAAGAAAACTCAGACCTCCAGCTCCTACGTAGGCAAAGAAGAGACAGTACA
AAGCAGCGATTATCGGT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2FF15JQ 676 0 0
ACAGAGTCAAAAGCATTAGAAAGAGTAAACAACAATGCTCTTTAAGGTTCATGATCATTA
ATTTTGTAAATAAGACTGTAGAATGCAAGATACTTTTGAGAAGTTTCCAAAGTTGTGAAA
GGAACAGAACAAAAGAACTCAGAGGCAACAATGGTGAAACTCTGAGTAAACTCTTTGCTC
ATTTCTCTCTCTCTCTCCTCCGTTTCTAGACAGAAGGGAAGTACTTGTTGAGATTGAAAG
GAAGAGAGTAGAACTCTTCGCTTCTTGTGTCACCTTTGAAAGATCTAAACTTATCCCACC
AATGCTTCCCTCTGTCTTTCCTTATCGACGAATCTTTCTTGTGCAACGTGTTGTCCAAGA
AGAAAGCCACCACGCCAGCAACAAAAGGTTCCGAGGAGAACGGGACATTCACCATATCAT
TGAACCAACGAGCGCCTGTGTGGACAGGACCATAGCCTTTGATTGCAGTGTACTCGTTGA
AGTACTGAGGGATGGACAAGCCGAGGAAGACAGAGAAGCCTAAGATGAACTTGGTCCGGA
AGCTGTTTAAGTTGCAGAACTGAAGAAAACTCAGACCTCCAGCTCCTACGTAGGCAAAGA
AGAGACAGTACAAAGCAGCGATTATCGGTGCAGGGATTGACGCAAACACAGCTCCGAATT
TTCCGAGAATAGAGAA

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 3

CO CL3022Contig1 595 3 4 U
GGACGCCAAAAATGCAGATCTTTGTGAAAACCCTGACGGGGAAGACGATAACCCTAGAGG
TCGAATCATCCGACACGATCGACAATGTCAAGGCCAAGATTCAGGACAAGGAAGGGATCC
CACCGGACCAGCAGCGTCTGATCTTCGCCGGGAAGCAGCTTGAAGACGGGAGGACGCTCG
CGGACTACAACATCCATAAGGAGTCGACGCTTCACTTGGTGCTCCGTCTGAGAGGAGGAG
CGAAGAAGAGGAAGAAGAAGACGTACACGAAGCCGAAGAAGATCAAGCATAAGCACAAGA
AGGTGAAGCTCGCGGTTCTGCAGTTTTACAAGGTTGATGGGACAGGGAAGGTTCAGAGGC
TGAGGAAAGAGTGTCCTTCGGCTAGTTGTGGTCCGGGGACTTTCATGGCGAGTCATTTCG
ATAGGCATTACTGTGGCAAGTGTGGAACCACTTATGTCTTCAAGAAGCCTGATGAAGAGT
GATTAGTTGTTATGTGTTTTTTTTT**GCCTGCCCTTTTATTATTGAATTATCGTATTGG
AACTTATAATTGGCTTAATTTGGATTGGTTTCCTTTTGTTGAGGTTTGCAACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E634TF U 1
AF RR2AR08JQ C 268
AF RR2AR08TF U 268
BS 1 505 RR2E634TF
BS 506 507 RR2AR08TF
BS 508 573 RR2E634TF
BS 574 595 RR2AR08TF

RD RR2E634TF 573 0 0
GGACGCCAAAAATGCAGATCTTTGTGAAAACCCTGACGGGGAAGACGATAACCCTAGAGG
TCGAATCATCCGACACGATCGACAATGTCAAGGCCAAGATTCAGGACAAGGAAGGGATCC
CACCGGACCAGCAGCGTCTGATCTTCGCCGGGAAGCAGCTTGAAGACGGGAGGACGCTCG
CGGACTACAACATCCATAAGGAGTCGACGCTTCACTTGGTGCTCCGTCTGAGAGGAGGAG
CGAAGAAGAGGAAGAAGAAGACGTACACGAAGCCGAAGAAGATCAAGCATAAGCACAAGA
AGGTGAAGCTCGCGGTTCTGCAGTTTTACAAGGTTGATGGGACAGGGAAGGTTCAGAGGC
TGAGGAAAGAGTGTCCTTCGGCTAGTTGTGGTCCGGGGACTTTCATGGCGAGTCATTTCG
ATAGGCATTACTGTGGCAAGTGTGGAACCACTTATGTCTTCAAGAAGCCTGATGAAGAGT
GATTAGTTGTTATGTGTTTTTTTTTTTGCCTGCCCTTTTATTATTGAATTATCGTATTGG
AACTTATAATTGGCTTAATTTGGATTGGTTTCC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2AR08JQ 328 0 0
G
GAAGCCGAAGAAGATCAAGCATAAGCACAAGAAGGTGAAGCTCGCGGTTCTGCAGTTTTA
CAAGGTTGATGGGACAGGGAAGGTTCAGAGGCTGAGGAAAGAGTGTCCTTCGGCTAGTTG
TGGTCCGGGGACTTTCATGGCGAGTCATTTCGATAGGCATTACTGTGGCAAGTGTGGAAC
CACTTATGTCTTCAAGAAGCCTGATGAAGAGTGATTAGTTGTTATGTGTTTTTTTTT**G
CCTGCCCTTTTATTATTGAATTATCGTATTGGAACTTATAATTGGCTTAATTTGGATTGG
TTTCCTTTTGTTGAGGTTTGCAACTCC

QA 2 328 2 328
DS 

RD RR2AR08TF 328 0 0
G
GAAGCCGAAGAAGATCAAGCATAAGCACAAGAAGGTGAAGCTCGCGGTTCTGCAGTTTTA
CAAGGTTGATGGGACAGGGAAGGTTCAGAGGCTGAGGAAAGAGTGTCCTTCGGCTAGTTG
TGGTCCGGGGACTTTCATGGCGAGTCATTTCGATAGGCATTACTGTGGCAAGTGTGGAAC
CACTTATGTCTTCAAGAAGCCTGATGAAGAGTGATTAGTTGTTATGTGTTTTTTTTT**G
CCTGCCCTTTTATTATTGAATTATCGTATTGGAACTTATAATTGGCTTAATTTGGATTGG
TTTCCTTTTGTTGAGGTTTGCAACTCC

QA 2 328 2 328
DS 



AS 1 3

CO CL3023Contig1 862 3 11 U
GGCTCTCTCTCCTGACTCTCTGTAGAAATCGAAAAGATCTCAGAGATACAACGAAGCCGT
AAATCTCGTTAAGGGTTTTAAAACTTTTTTTTTTTTTTAAAAACAAGCATTCTGATCTGT
CTTTTCTTTTTTTGCTTAATCGAAATCCAATGGCTGGTTACAGAGCAGATGATGAATACG
ATTACCTTTTCAAGGTTGTTCTCATCGGTGATTCCAGTGTGGGAAAGTCCAATCTCCTTT
CAAGATTCACTAAGAACGAGTTTAGCCTCTAGTCTAAATCCACGATCGGAGTAGAGTTCG
CGACTAGGAGTTTGAATGTTGATGATAAAGTCATCAAAGCCCAGATTTGGGATACTGCTG
GTCAAGAAAGGTACCGAGCCATCACTAGCGCGTATTACCGAGGCGCCGTTGGAGCGCTTC
TTGTCTACGATGTAACCCGACACTCCACCTTCGAAAACGTGGAGACGTGGCTGAAAGAAC
TCAGAAACCACACTGATCCAAACATCGTAGTCATGCTCGTGGGCAACAAATCTGATCTCC
GCCACCTCGTGGCTGTTCAGACAGAGGACGCCAAGTCATTCGCTGAGAAAGAATCTCTTT
GCTTCATGGAAACCTCTGCTCTTGAGTCCACGAATGTCGAGGACGCTTTCGCGCAAGTCC
TCACTCAGATCCACAGCATTGTGAGCAAAAAGGCAATGGAAGCAGCCAGCGAGTCAGCTA
ACGCTCCGTCAAAAGGAGACAAGATCGAGATAGGTAAAGATGTTTCTGCTGTCAAGAAAG
CTGGATGTTGTTCAAACTAGTAAGAGAGTGGTTATTATTGGTTTTTGTTAACGGTTTATT
TATTCAAAGTCATTCGAATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT14TF U 1
AF RR2A385TF U 51
AF RR2A385JQ C 213
BS 1 177 RR2BT14TF
BS 178 178 RR2A385TF
BS 179 215 RR2BT14TF
BS 216 216 RR2A385TF
BS 217 269 RR2BT14TF
BS 270 270 RR2A385TF
BS 271 378 RR2BT14TF
BS 379 379 RR2A385TF
BS 380 670 RR2BT14TF
BS 671 830 RR2A385TF
BS 831 862 RR2A385JQ

RD RR2BT14TF 670 0 0
GGCTCTCTCTCCTGACTCTCTGTAGAAATCGAAAAGATCTCAGAGATACAACGAAGCCGT
AAATCTCGTTAAGGGTTTTAAAACTTTTTTTTTTTTTTAAAAACAAGCATTCTGATCTGT
CTTTTCTTTTTTTGCTTAATCGAAATCCAATGGCTGGTTACAGAGCAGATGATGAATCCG
ATTACCTTTTCAAGGTTGTTCTCATCGGTGATTCCGGTGTGGGAAAGTCCAATCTCCTTT
CAAGATTCACTAAGAACGAGTTTAGCCTCGAGTCTAAATCCACGATCGGAGTAGAGTTCG
CGACTAGGAGTTTGAATGTTGATGATAAAGTCATCAAAGCCCAGATTTGGGATACTGCTG
GTCAAGAAAGGTACCGAGTCATCACTAGCGCGTATTACCGAGGCGCCGTTGGAGCGCTTC
TTGTCTACGATGTAACCCGACACTCCACCTTCGAAAACGTGGAGACGTGGCTGAAAGAAC
TCAGAAACCACACTGATCCAAACATCGTAGTCATGCTCGTGGGCAACAAATCTGATCTCC
GCCACCTCGTGGCTGTTCAGACAGAGGACGCCAAGTCATTCGCTGAGAAAGAATCTCTTT
GCTTCATGGAAACCTCTGCTCTTGAGTCCACGAATGTCGAGGACGCTTTCGCGCAAGTCC
TCACTCAGAT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2A385TF 780 0 0
TGGGG
GCCGTAAATCTCGTTAAGGGTTTTAAAACTTTTTTTTTTTT**AAAAACAAGCATTCTGA
TCTGTCTTTTCTTTTTTTGCTTAATCGAAATCCAATGGCTGGTTACAGAGCAGATGATGA
ATACGATTACCTTTTCAAGGTTGTTCTCATCGGTGATTCCAGTGTGGGAAAGTCCAATCT
CCTTTCAAGATTCACTAAGAACGAGTTTAGCCTCTAGTCTAAATCCACGATCGGAGTAGA
GTTCGCGACTAGGAGTTTGAATGTTGATGATAAAGTCATCAAAGCCCAGATTTGGGATAC
TGCTGGTCAAGAAAGGTACCGAGCCATCACTAGCGCGTATTACCGAGGCGCCGTTGGAGC
GCTTCTTGTCTACGATGTAACCCGACACTCCACCTTCGAAAACGTGGAGACGTGGCTGAA
AGAACTCAGAAACCACACTGATCCAAACATCGTAGTCATGCTCGTGGGCAACAAATCTGA
TCTCCGCCACCTCGTGGCTGTTCAGACAGAGGACGCCAAGTCATTCGCTGAGAAAGAATC
TCTTTGCTTCATGGAAACCTCTGCTCTTGAGTCCACGAATGTCGAGGACGCTTTCGCGCA
AGTCCTCACTCAGATCCACAGCATTGTGAGCAAAAAGGCAATGGAAGCAGCCAGCGAGTC
AGCTAACGCTCCGTCAAAAGGAGACAAGATCGAGATAGGTAAAGATGTTTCTGCTGTCAA
GAAAGCTGGATGTTGTTCAAACTAGTAAGAGAGTGGTTATTATTGGTTTTTGTTA

QA 6 780 6 780
DS 

RD RR2A385JQ 650 0 0
TCCA
GTGTGGGAAAGTCCAATCTCCTTTCAAGATTCACTAAGAACGAGTTTAGCCTCTAGTCTA
AATCCACGATCGGAGTAGAGTTCGCGACTAGGAGTTTGAATGTTGATGATAAAGTCATCA
AAGCCCAGATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAAAGGTACCGAGCCATCACTAGCGCGTATT
ACCGAGGCGCCGTTGGAGCGCTTCTTGTTTACGATGTAACCCGACACTCCACCTTCGAAA
ACGTGGAGACGTGGCTGAAAGAACTCAGAAACCACACTGATCCAAACATCGTAGTCATGC
TCGTGGGCAACAAATCTGATTTCCGCCACCTCGTGGCTGTTCAGACAGAGGACGCCAAGT
CATTCGCTGAGAAAGAATCTCTTTGCTTCATGGAAACCTCTGCTCTTGAGTCCACGAATG
TCGAGGACGCTTTCGCGCAAGTCCTCACTCAGATCCACAGCATTGTGAGCAAAAAGGCAA
TGGAAGCAGCCAGCGAGTCAGCTAACGCTCCGTCAAAAGGAGACAAGATCGAGATAGGTA
AAGATGTTTCTGCTGTCAAGAAAGCTGGATGTTGTTCAAACTAGTAAGAGAGTGGTTATT
ATTGGTTTTTGTTAACGGTTTATTTATTCAAAGTCATTCGAATGCT

QA 5 650 5 650
DS 



AS 1 2

CO CL3024Contig1 1233 2 6 U
GGAAAAGAGAAAACAAAGACGAAGACTCTCATCGTCTCTTCTCTTCTCGCCTCTCTCTAG
CTTATTGATGATCTTGAAGCAAGAATCATGAGCATCCTTCACAGGTTTCTGTCGAAGGAT
ATGGCCAACATCACGGACACGGACTGTTTGGTTTGCAAAGAAGAACTCACAACTTTAGGA
GTTTGTGGACCCATTTGTTCTAAAGACTGTCTTTCCATCTGCGAGAACTACCTAGATACA
GATCTTTCTCCACCACCTCCAGTGATTCACCACTACATAGACGAAAACGTGAAAAGGATC
TTGATCATCTCAACTTCCTCCATCATCACAACTCTCTTTCTCCTTACTCTACTCGTTCTC
TGTTTCAAATGGTACAACAGGAGGAGAAGATCAATAGCTATATCAAGAAGATGGAGCATG
GAGGAAGCTAGGAACTGGGAGTTTGATGGACCGTCACCGGTTATTGTTGATCATCCGGTT
TGGCATATAAGAACCATCGGTTTGAATCCAACGGTTATAAGCTCGATCAAAGTTTGTAAG
TATAGCAAACAAGATGGTGTGGTGGAAGGTACGGATTGTTCGGTTTGTTTAAGCGAGTTC
GAAGAAGAAGAGACGCTTAGATTGTTACCAAAGTGTAGACATGCTTTTCATGTCCCTTGT
ATTGATACTTGGCTTAGATCACACACCAATTGCCCGGTTTGTCGTGCTCCTGTTGTCGCG
GTAACTGATGATGATAGTGACGGTGTTGAGGAGATCCTTGTGAGGATACCGGAGGAGGAA
AGTGGAGAACTCAATGAAGAAACCGAGAGAGGTGATGTGGAAGAAGCTGAAGAGTTTTTC
AGTATTGTTGTTAGTGATGAAGAAGAAGAAGAAGATAAGTCGCTGCAGCTAGTGAGGAGG
TCAGTGTCTTTTAGCTCGATATCGGGTTTAAGGGTAAGTGAAGTTGTTGCTGCTGGTAGA
GGAAAAGAGAAGTTGAAGAGAGGCAACTCTGGATCTTCGGTTGTTGGGAGGTCAAGTTTC
TTGAAGAGGTCTATCTCTTACAATGGTAAGTAGTAAGAGCTCTATATAGGCTTCTTGAAG
ACATCTACAAATGTAGTATATTATTTTTTGAAAGAAAATCAAAATAAGAAAAATAAGATA
GATTATATGTGTTTAAGGTGATATAAAGAGGATGATCCTACTGCATATTGTTTATCAAAG
CTGCTACGCTTGTCAAGTTAAAAGAGTTCTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW28TF U 1
AF RR2FW28JQ C 476
BS 1 653 RR2FW28TF
BS 654 654 RR2FW28JQ
BS 655 723 RR2FW28TF
BS 724 724 RR2FW28JQ
BS 725 742 RR2FW28TF
BS 743 1233 RR2FW28JQ

RD RR2FW28TF 747 0 0
GGAAAAGAGAAAACAAAGACGAAGACTCTCATCGTCTCTTCTCTTCTCGCCTCTCTCTAG
CTTATTGATGATCTTGAAGCAAGAATCATGAGCATCCTTCACAGGTTTCTGTCGAAGGAT
ATGGCCAACATCACGGACACGGACTGTTTGGTTTGCAAAGAAGAACTCACAACTTTAGGA
GTTTGTGGACCCATTTGTTCTAAAGACTGTCTTTCCATCTGCGAGAACTACCTAGATACA
GATCTTTCTCCACCACCTCCAGTGATTCACCACTACATAGACGAAAACGTGAAAAGGATC
TTGATCATCTCAACTTCCTCCATCATCACAACTCTCTTTCTCCTTACTCTACTCGTTCTC
TGTTTCAAATGGTACAACAGGAGGAGAAGATCAATAGCTATATCAAGAAGATGGAGCATG
GAGGAAGCTAGGAACTGGGAGTTTGATGGACCGTCACCGGTTATTGTTGATCATCCGGTT
TGGCATATAAGAACCATCGGTTTGAATCCAACGGTTATAAGCTCGATCAAAGTTTGTAAG
TATAGCAAACAAGATGGTGTGGTGGAAGGTACGGATTGTTCGGTTTGTTTAAGCGAGTTC
GAAGAAGAAGAGACGCTTAGATTGTTACCAAAGTGTAGACATGCTTTTCATGTTCCTTGT
ATTGATACTTGGCTTAGATCACACACCAATTGCCCGGTTTGTCGTGCTCCTGTTGTCGCG
GTA*CTGATGATGATAGTGACG
TGTTG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2FW28JQ 758 0 0
CGGTTTGGCATATAAGAACCATCGGTTTGAATCCAACGGTTATAAGCTCGATCAAAGTTT
GTAAGTATAGCAAACAAGATGGTGTGGTGGAAGGTACGGATTGTTCGGTTTGTTTAAGCG
AGTTCGAAGAAGAAGAGACGCTTAGATTGTTACCAAAGTGTAGACATGCTTTTCATGTCC
CTTGTATTGATACTTGGCTTAGATCACACACCAATTGCCCGGTTTGTCGTGCTCCTGTTG
TCGCGGTAACTGATGATGATAGTGACGGTGTTGAGGAGATCCTTGTGAGGATACCGGAGG
AGGAAAGTGGAGAACTCAATGAAGAAACCGAGAGAGGTGATGTGGAAGAAGCTGAAGAGT
TTTTCAGTATTGTTGTTAGTGATGAAGAAGAAGAAGAAGATAAGTCGCTGCAGCTAGTGA
GGAGGTCAGTGTCTTTTAGCTCGATATCGGGTTTAAGGGTAAGTGAAGTTGTTGCTGCTG
GTAGAGGAAAAGAGAAGTTGAAGAGAGGCAACTCTGGATCTTCGGTTGTTGGGAGGTCAA
GTTTCTTGAAGAGGTCTATCTCTTACAATGGTAAGTAGTAAGAGCTCTATATAGGCTTCT
TGAAGACATCTACAAATGTAGTATATTATTTTTTGAAAGAAAATCAAAATAAGAAAAATA
AGATAGATTATATGTGTTTAAGGTGATATAAAGAGGATGATCCTACTGCATATTGTTTAT
CAAAGCTGCTACGCTTGTCAAGTTAAAAGAGTTCTCAC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 3

CO CL3025Contig1 710 3 1 U
GGATAGCATCTCCTCTCAAACAAAACTAACAACTTTTGTTTTCACCCCAACAACTAATAT
CACAAATATATAAAGAGGAGAATATTACTCTAAGACTAATAATGGCCAAATTCTTCATCG
TCTTCCTTGCCTCTACCATATGTTTCACCACCCTTCTTCACTTTGCCGCCGCTGATGCCG
ACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAGGATCCGTCTACTGCGATACCTGCCGTGTCCAAT
TCATGACCCGCCTCAGTAAAGTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTTGAGTGCAAGGGTC
GTGAGAACCAGACAGTAACACTGACGAAAGAAGCTGTGACCGACAAAGACGGAAAGTACG
AGATGGTAGTAATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGCGAGATCATCCTCGAGGAATCAC
CGGACGCAGAGTGCAGCGAGGTGAACAACCAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCCAGGATCA
GTCTTACGGCGAATGATGGCATTGTCTCTAACGAGGTTCGAACCATTAACCCACTCGGGT
TCATGAGGAAGACTTCTCTCGCTGATTGTCCCCTAGTTTTCAAGGAGCTCGGAATCGTCC
CTGATGTCATCTTCTAAGCTTTATTATATATTTTACCTACATATGCAGCACCGATCTGTC
AACAATTTTTAATTTCTTGTTAACTCTTTTTCACCTATTATATAAAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY01TFB U 313
AF RR2H222TF U 1
AF RR2H222JQ C 154
BS 1 710 RR2H222TF

RD RR2AY01TFB 112 0 0
CAGTAACACTGACGAAAGAAGCTGTTACCGACAAAGACGGAAAGTACGAGATGGTAGTAA
TGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGCGAGATCATCCTCGAGGAATCACCGGA

QA 1 112 1 112
DS 

RD RR2H222TF 710 0 0
GGATAGCATCTCCTCTCAAACAAAACTAACAACTTTTGTTTTCACCCCAACAACTAATAT
CACAAATATATAAAGAGGAGAATATTACTCTAAGACTAATAATGGCCAAATTCTTCATCG
TCTTCCTTGCCTCTACCATATGTTTCACCACCCTTCTTCACTTTGCCGCCGCTGATGCCG
ACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAGGATCCGTCTACTGCGATACCTGCCGTGTCCAAT
TCATGACCCGCCTCAGTAAAGTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTTGAGTGCAAGGGTC
GTGAGAACCAGACAGTAACACTGACGAAAGAAGCTGTGACCGACAAAGACGGAAAGTACG
AGATGGTAGTAATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGCGAGATCATCCTCGAGGAATCAC
CGGACGCAGAGTGCAGCGAGGTGAACAACCAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCCAGGATCA
GTCTTACGGCGAATGATGGCATTGTCTCTAACGAGGTTCGAACCATTAACCCACTCGGGT
TCATGAGGAAGACTTCTCTCGCTGATTGTCCCCTAGTTTTCAAGGAGCTCGGAATCGTCC
CTGATGTCATCTTCTAAGCTTTATTATATATTTTACCTACATATGCAGCACCGATCTGTC
AACAATTTTTAATTTCTTGTTAACTCTTTTTCACCTATTATATAAAACTT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2H222JQ 510 0 0
TTCTTCACTTTGCCGCCGCTGATGCCGACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAGGATCCG
TCTACTGCGATACCTGCCGTGTCCAATTCATGACCCGCCTCAGTAAAGTCCTCGAAGGGG
CAAAGGTAAAGCTTGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTAACACTGACGAAAGAAG
CTGTGACCGACAAAGACGGAAAGTACGAGATGGTAGTAATGGGAGACCACGAAGAGGAAG
TGTGCGAGATCATCCTCGAGGAATCACCGGACGCAGAGTGCAGCGAGGTGAACAACCAAG
AGTTCCTAAGAAACGCAGCCAGGATCAGTCTTACGGCGAATGATGGCATTGTCTCTAACG
AGGTTCGAACCATTAACCCACTCGGGTTCATGAGGAAGACTTCTCTCGCTGATTGTCCCC
TAGTTTTCAAGGAGCTCGGAATCGTCCCTGATGTCATCTTTTAAGCTTTATTATATATTT
TACCTACATATGCAGCACCGATCTGTCAAC

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL3026Contig1 757 2 2 U
GTATGTTGCAGCATGTGATGTGCCAGGAATCAAAAGGTTACTTCCCAAAGAATGGCGAGA
ATCTCGTTTCTTCAACGATATATACGAACTAGAGGGAGTACCGGTCTGCACGGTGCAGCT
CAGATACAATGGCTGGGTCACTGAGTTACAAGACATTGAACTTTCCAGGCAGTTGAAACG
AGCGGTTGGTTTAGATAACCTTCTCTACACTCCTGATGCTGATTTCTCATGCTTTGCGGA
TCTTGCGCTCGCTTCGCCTGCTGATTATTACATTGAAGGACAAGGCTCTCTGCTTCAATG
CGTTTTAACTCCAGGTGATCCCTACATGCGATTACCGAATGAGAAGATCATAGAGAAAGT
AGCAATGCAGGTCACAGAGCTGTTTCCATCGTCGCGTGGTCTAGAAGTCACCTGGTCATC
AGTAGTCAAAATAGCTCAGTCTCTGTACCGTGAAGCACCAGGTAAAGATCCATTCAGACC
TGACCAGAAGACTCCCGTAAAAAACTTCTTCCTCGCTGGTTCATACACAAAGCAGGATTA
CATAGATAGTATGGAAGGAGCGACGTTGTCAGTGAGACAAGCTTCGTCATACATCTGTGA
CGCCGGTGAAGAACTAGCTGAGCTAAACAAGAAGCTTTCTCCTTCAGATGAGCTAAGTCT
TGTCTAATGATTGAATATGTAACCGTACAACAAGAAGAAGCAATGTGTAGAAAACTTCTT
ATAGTGTTCACAAGAGAAGACATTTTGTATTATTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F360TF U 1
AF RR2F360JQ C 86
BS 1 695 RR2F360TF
BS 696 757 RR2F360JQ

RD RR2F360TF 695 0 0
GTATGTTGCAGCATGTGATGTGCCAGGAATCAAAAGGTTACTTCCCAAAGAATGGCGAGA
ATCTCGTTTCTTCAACGATATATACGAACTAGAGGGAGTACCGGTCTGCACGGTGCAGCT
CAGATACAATGGCTGGGTCACTGAGTTACAAGACATTGAACTTTCCAGGCAGTTGAAACG
AGCGGTTGGTTTAGATAACCTTCTCTACACTCCTGATGCTGATTTCTCATGCTTTGCGGA
TCTTGCGCTCGCTTCGCCTGCTGATTATTACATTGAAGGACAAGGCTCTCTGCTTCAATG
CGTTTTAACTCCAGGTGATCCCTACATGCGATTACCGAATGAGAAGATCATAGAGAAAGT
AGCAATGCAGGTCACAGAGCTGTTTCCATCGTCGCGTGGTCTAGAAGTCACCTGGTCATC
AGTAGTCAAAATAGCTCAGTCTCTGTACCGTGAAGCACCAGGTAAAGATCCATTCAGACC
TGACCAGAAGACTCCCGTAAAAAACTTCTTCCTCGCTGGTTCATACACAAAGCAGGATTA
CATAGATAGTATGGAAGGAGCGACGTTGTCAGTGAGACAAGCTTCGTCATACATCTGTGA
CGCCGGTGAAGAACTAGCTGAGCTAAACAAGAAGCTTTCTCCTTCAGATGAGCTAAGTCT
TGTCTAATGATTGAATATGTAACCGTACAACAAGA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2F360JQ 672 0 0
GAACTAGAGGGAGTACCGGTCTGCACGGTGCAGCTCAGATACAATGGCTGGGTCACTGAG
TTACAAGACATTGAACTTTCCAGGCAGTTGAAACGAGCGGTTGGTTTAGATAACCTTCTC
TACACTCCTGATGCTGATTTCTCATGCTTTGCGGATCTTGCGCTCGCTTCGCCTGCTGAT
TATTACATTGAAGGACAAGGCTCTCTGCTTCAATGCGTTTTAACTCCAGGTGATCCCTAC
ATGCGATTACCGAATGAGAAGATCATAGAGAAAGTAGCAATGCAGGTCACAGAGCTGTTT
CCATCGTCGCGTGGTCTAGAAGTCACCTGGTCATCAGTAGTCAAAATAGCTCAGTCTCTG
TACCGTGAAGCACCAGGTAAAGATCCATTCAGACCTGACCAGAAGACTCCCGTAAAAAAC
TTCTTCCTCGCTGGTTCATACACAAAGCAGGATTACATAGATAGTATGGAAGGAGCGACG
TTGTCAGTGAGACAAGCTTCGTCATACATCTGTGACGCCGGTGAAGAACTAGCTGAGCTA
AACAAGAAGCTTTCTCCTTCAGATGAGCTAAGTCTTGTCTAATGATTGAATATGTAACCG
TACAACAAGAAGAAGCAATGTGTAGAAAACTTCTTATAGTGTTCACAAGAGAAGACATTT
TGTATTATTACT

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 3

CO CL3027Contig1 961 3 2 U
GGCATGATGGTGTTGTCCCACTCTCTGACAGGGCCAGACCTGAAGCTGAGAAGCCCGTCC
CTGTGTTCAATCCACTTGCTGCTAAGGCCGCCACCATTAGTCTCTCATCTTTTGGACCTG
GAGGCCCTTTTGGATTCGATGCGTTTTCTCACATGTTTAAAAACCAAAAGAGAAACTCTG
ACTCTTCCAAAAACAACAAGGATTCTTCCAAGGGAGGAAACCACGAATCTATGAGTGACG
ACTGGCTACAAACAGGAAACTACCCCATTGCAAAATCGTACCGAGCTGTAAGCGGCGTGG
CACCGCTCGTGGCGAAGATCCTGCAACCACCTCCAGGAATGACATACAAGTGCCCTAAAG
CAATAGTAGCAGCTCGAGCAGCCATATCAAAAACAGCTTTCGCCAAGAACCTCCGCCCGC
AGCCTTTATCATCCAAAGTTCTTGTGATTGGGATGCTCGGCATGGCGCTAAACGTTCCTC
TTGGGGTCTGGAGAGAGCACACTGAGAAGTTCTCTGCATCTTGGTTTATAGCCCTTCACG
CAGCGGTTCCGTTCATAGGAATACTGAGGAAGTCGGTGTTGATGCCTAAGATGGCGATGG
TGTTTACCATAGCAGCATCGGTTATGGGACAGGTGATTGGGTCAAGAGCAGAGAGGTATA
GGCTCAAGTCGGCAGCTCAGAAGAAGATGTCATCATTGGCTGTACCAAACCCTTCGTCTG
TTGAAGCAACTCCGATGCAGTTCCCCGGAGTTTCATCATCGGATGGAAGGTGCGGTGACA
AAGTGATGATGAAATGGAACCCCATGTTGCTTGAAGCAGCAAGTCCTGTCTCTACCGGAG
CAACTAATGTTGTCTGCTAAATATTTTGATTTTCTTCAAGAAGATCTCGAATATATATAT
AATTGTTTTTCTTCTTGTTTTGGAGATTGTATTTGTAAAAGTTTCTATATGTTTGAAAAA
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2BK15TF U 1
AF RR2CV06TF U 299
AF RR2BK15JQ C 343
BS 1 611 RR2BK15TF
BS 612 961 RR2CV06TF

RD RR2BK15TF 611 0 0
GGCATGATGGTGTTGTCCCACTCTCTGACAGGGCCAGACCTGAAGCTGAGAAGCCCGTCC
CTGTGTTCAATCCACTTGCTGCTAAGGCCGCCACCATTAGTCTCTCATCTTTTGGACCTG
GAGGCCCTTTTGGATTCGATGCGTTTTCTCACATGTTTAAAAACCAAAAGAGAAACTCTG
ACTCTTCCAAAAACAACAAGGATTCTTCCAAGGGAGGAAACCACGAATCTATGAGTGACG
ACTGGCTACAAACAGGAAACTACCCCATTGCAAAATCGTACCGAGCTGTAAGCGGCGTGG
CACCGCTCGTGGCGAAGATCCTGCAACCACCTCCAGGAATGACATACAAGTGCCCTAAAG
CAATAGTAGCAGCTCGAGCAGCCATATCAAAAACAGCTTTCGCCAAGAACCTCCGCCCGC
AGCCTTTATCATCCAAAGTTCTTGTGATTGGGATGCTCGGCATGGCGCTAAACGTTCCTC
TTGGGGTCTGGAGAGAGCACACTGAGAAGTTCTCTGCATCTTGGTTTATAGCCCTTCACG
CAGCGGTTCCGTTCATAGGAATACTGAGGAAGTCGGTGTTGATGCCTAAGATGGCGATGG
TGTTTACCATA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2CV06TF 663 0 0
GGCACCGCTCGTGGCGAAGATCCTGCAACCACCTCCAGGAATGACATACAAGTGCCCTAA
AGCAATAGTAGCAGCTCGAGCAGCCATATCAAAAACAGCTTTCGCCAAGAACCTCCGCCC
GCAGCCTTTATCATCCAAAGTTCTTGTGATTGGGATGCTCGGCATGGCGCTAAACGTTCC
TCTTGGGGTCTGGAGAGAGCACACTGAGAAGTTCTCTGCATCTTGGTTTATAGCCCTTCA
CGCAGCGGTTCCGTTCATAGGAATACTGAGGAAGTCGGTGTTGATGCCTAAGATGGCGAT
GGTGTTTACCATAGCAGCATCGGTTATGGGACAGGTGATTGGGTCAAGAGCAGAGAGGTA
TAGGCTCAAGTCGGCAGCTCAGAAGAAGATGTCATCATTGGCTGTACCAAACCCTTCGTC
TGTTGAAGCAACTCCGATGCAGTTCCCCGGAGTTTCATCATCGGATGGAAGGTGCGGTGA
CAAAGTGATGATGAAATGGAACCCCATGTTGCTTGAAGCAGCAAGTCCTGTCTCTACCGG
AGCAACTAATGTTGTCTGCTAAATATTTTGATTTTCTTCAAGAAGATCTCGAATATATAT
ATAATTGTTTTTCTTCTTGTTTTGGAGATTGTATTTGTAAAAGTTTCTATATGTTTGAAA
AAA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2BK15JQ 619 0 0
CATACAAGTGCCCTAAAGCAATAGTAGCAGCTCGAGCAGCCATATCAAAAACAGCTTTCG
CCAAGAACCTCCGCCCGCAGCCTTTATCATCCAAAGTTCTTGTGATTGGGATGCTCGGCA
TGGCGCTAAACGTTCCTCTTGGGGTCTGGAGAGAGCACACTGAGAAGTTCTTTGCATCTT
GGTTTATAGCCCTTCACGCAGCGGTTCCGTTCATAGGAATACTGAGGAAGTCGGTGTTGA
TGCCTAAGATGGCGATGGTGTTTACCATAGCAGCATCGGTTATGG*ACAGGTGATTGGGT
CAAGAGCAGAGAGGTATAGGCTCAAGTCGGCAGCTCAGAAGAAGATGTCATCATTGGCTG
TACCAAACCCTTCGTCTGTTGAAGCAACTCCGATGCAGTTCCCCGGAGTTTCATCATCGG
ATGGAAGGTGCGGTGACAAAGTGATGATGAAATGGAACCCCATGTTGCTTGAAGCAGCAA
GTCCTGTCTCTACCGGAGCAACTAATGTTGTCTGCTAAATATTTTGATTTTCTTCAAGAA
GATCTCGAATATATATATAATTGTTTTTCTTCTTGTTTTGGAGATTGTATTTGTAAAAGT
TTCTATATGTTTGAAAAAA

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 3

CO CL3028Contig1 794 3 4 U
TATTACTTTTACCTTCTTCATATGAAAAATGTATTATCAATTGAAACAAAACGTAGACAT
AAGTGTCGAACACTCTCACCAAACAAAAGATGCAACCAACTTTTGAAAGCTCGGCAAATA
CCAAACGCCTGTAGAAAAAGATTTTATAACGCCACATGCTTTTGAACACAACTCTAAAGC
TGAGAGCACCAGTCCCTAGCATTCTGGAACATCTTCAACCACGGACTAGGCCCAGCTTTC
TCAACCTCCCAGCTCTTCGGGTACCACGGGTACTGCCACATCAAGAAACAACGTTCAGGA
TGAGGCATCATCGCCAAATGCCTCCCATCAGGCGAGCATATAGCAGCTATCCCCAACGGT
GAACCATTGAGGTTAAAAGGATAAGCTTCAGTGACACTCCCATCATCATCACAGTATCTC
AACGGAGCCAAATCCGAGTGAAGCATACGGTCCAAGACTCCTTCGTCCGGGAAATAAGCC
CTTCCCTCTCCATGAGCCGCCCAAACTCCCAAGGTGCTTCCCTCCATCCCTTTCAGCATT
ATCGACGGCGAGTCCTTGATGGTCACGCTTGTGAACCTGCACTCAAACCTTCCTGACTCG
TTGTGAACGAACCTAGGCTACGCCGTGTCAAGCGACCCGCCGACTTGAGGGCCTGGAACC
CATCCTAACAAGGCCATTAGCTGACAGCCATTGCAGATTCCGAGGCTGAACGTGTCTGGT
CTCTTGTAGAACTCTTGGAACTGGCTTAGAAGAGGCTCGTTGAACCTTATTGAAGCTGCC
CATCCTTTGGCTGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CP50JQ U 72
AF RR2B538TF C 1
AF RR2B538JQ U 2
BS 1 1 RR2B538TF
BS 2 58 RR2B538JQ
BS 59 59 RR2B538TF
BS 60 794 RR2B538JQ

RD RR2CP50JQ 621 0 0
ACTCTCACCAAACAAAAGATGCAACCAACTTTTGAAAGCTCGGCAAATACCAAACGCCTG
TAAGAAAAGATTTTATAACGCCACATGCTT**GAACACAACTCTAAAGCTGAGAGCACCA
GTCCCTAGCATTCTGGAACATCTTCAACCACGGACTAGGCCCAGCTTTCTCAACCTCCCA
GCTCTTCGGGTACCACGGGTACTGCCACATCAAGAAACAACGTTCAGGATGAGGCATCAT
CGCCAAGTGTCTTCCATCAGGCGAACATATAGCAGCTATCCCCAACGGTGAACCATTGAG
GTTAAAAGGGTAAGCTTCAGTGACGCTCCCACCATCATCACAGTATCTCAACGGAGCCAA
ATCCGAGTGAAGCATACGGTCCAAGACTCCTTCGTCCGGGAAATAAGCCCTTCCTTCTCC
ATGAGCCGCCCAAACTCCCAAGGTGCTTCCCTCCATCCCTTTAAGCATTATCGACGGCGA
GTCCTTGATTGTCACGCTTGTGAACCTGCACTCAAACCTTCCTGACTCGTTGTGAACGAA
CCTAGGCTGCGCCGTGTCGAGCGACCCGCCGACTTGAGGGCCTGGAACCCATCCTAACAA
GGCCATTAGCTGACAGCCATT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2B538TF 794 0 0
TATTACTTTTACCTTCTTCATATGAAAAATGTATTATCAATTGAAACAAAACGTAGACAT
AAGTGTCGAACACTCTCACCAAACAAAAGATGCAACCAACTTTTGAAAGCTCGGCAAATA
CCAAACGCCTGTAGAAAAAGATTTTATAACGCCACATGCTTTTGAACACAACTCTAAAGC
TGAGAGCACCAGTCCCTAGCATTCTGGAACATCTTCAACCACGGACTAGGCCCAGCTTTC
TCAACCTCCCAGCTCTTCGGGTACCACGGGTACTGCCACATCAAGAAACAACGTTCAGGA
TGAGGCATCATCGCCAAATGCCTCCCATCAGGCGAGCATATAGCAGCTATCCCCAACGGT
GAACCATTGAGGTTAAAAGGATAAGCTTCAGTGACACTCCCATCATCATCACAGTATCTC
AACGGAGCCAAATCCGAGTGAAGCATACGGTCCAAGACTCCTTCGTCCGGGAAATAAGCC
CTTCCCTCTCCATGAGCCGCCCAAACTCCCAAGGTGCTTCCCTCCATCCCTTTCAGCATT
ATCGACGGCGAGTCCTTGATGGTCACGCTTGTGAACCTGCACTCAAACCTTCCTGACTCG
TTGTGAACGAACCTAGGCTACGCCGTGTCAAGCGACCCGCCGACTTGAGGGCCTGGAACC
CATCCTAACAAGGCCATTAGCTGACAGCCATTGCAGATTCCGAGGCTGAACGTGTCTGGT
CTCTTGTAGAACTCTTGGAACTGGCTTAGAAGAGGCTCGTTGAACCTTATTGAAGCTGCC
CATCCTTTGGCTGC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2B538JQ 793 0 0
ATTACTTTTACCTTCTTCATATGAAAAATGTATTATCAATTGAAACAAAACGTAGACCTA
AGTGTCGAACACTCTCACCAAACAAAAGATGCAACCAACTTTTGAAAGCTCGGCAAATAC
CAAACGCCTGTAGAAAAAGATTTTATAACGCCACATGCTTTTGAACACAACTCTAAAGCT
GAGAGCACCAGTCCCTAGCATTCTGGAACATCTTCAACCACGGACTAGGCCCAGCTTTCT
CAACCTCCCAGCTCTTCGGGTACCACGGGTACTGCCACATCAAGAAACAACGTTCAGGAT
GAGGCATCATCGCCAAATGCCTCCCATCAGGCGAGCATATAGCAGCTATCCCCAACGGTG
AACCATTGAGGTTAAAAGGATAAGCTTCAGTGACACTCCCATCATCATCACAGTATCTCA
ACGGAGCCAAATCCGAGTGAAGCATACGGTCCAAGACTCCTTCGTCCGGGAAATAAGCCC
TTCCCTCTCCATGAGCCGCCCAAACTCCCAAGGTGCTTCCCTCCATCCCTTTCAGCATTA
TCGACGGCGAGTCCTTGATGGTCACGCTTGTGAACCTGCACTCAAACCTTCCTGACTCGT
TGTGAACGAACCTAGGCTACGCCGTGTCAAGCGACCCGCCGACTTGAGGGCCTGGAACCC
ATCCTAACAAGGCCATTAGCTGACAGCCATTGCAGATTCCGAGGCTGAACGTGTCTGGTC
TCTTGTAGAACTCTTGGAACTGGCTTAGAAGAGGCTCGTTGAACCTTATTGAAGCTGCCC
ATCCTTTGGCTGC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 3

CO CL3029Contig1 991 3 28 U
GGAGTTTAACAGCTATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAACTTTGAAA
ACAATTCGCCGCCTCTAGGACGAAGAAGAAAATGGCCGGAGGAGGCGGATACGGCGGCGC
ATCGGGAAAAGTGGATTACGTGTTCAAGGTAGTTCTGATCGGAGATTCAGCAGTTGGGAA
ATCACAGCTACTAGCTCGATTCGCAAGAGACGAGTTCAGCTTGGACTCCAAAGCCACCAT
CGGTGTCGAGTTTCAGACTCGTACCCTCCTCATTGAAGAGAAAAGCGTCAAGGCTCAGAT
CTGGGATACCGCCGGCCAAGAAAGATACGGAGCGGTTACGAGCGCATACTACAGAGGAGC
AGTTGGTGCGATGCTTGTTTATGATATTACTAAGCGTGAGACCTTTGACCACATCCCTCG
TTGGCTTGAAGAATTGCGAGCTCATGCTGATAAGAACATTGTCATCATCCTCATTGGTAA
CAAGTCTGATCTCGAAGATCAGAGAGCGATTCCCACCGAAGACGCTAAAGAGTTTGCTGA
GAAGGAAGGTCTTTTCTTCCTCGAGACCTCTGCTTTGAACGCAACCAACGTCGAAAACTC
CTTCAACACTCTCATGACAGAAATCTTCAACACTGTTAACAAGAAGAGTCTCTCATCTGC
TGGTGAGTCAAATAACCCTGGTTCGTTGGCTGGTAAGAAGATAGTCATCCCAGGTCCTGG
ACAGGAGGTTCCCGCTAAGACCAGCACGTGTTGTAGTTCTGCTTGATCTGTGTCGTTTAC
AAAAGCAAAAATTCATTTGTCCCGTCTCCCCCTTTGAACTATGGTGATGATAGAGAATGC
TTACTTTCATATTGTATATTCTTTTTGGAATCTGGCTTGTGTTGCTTGCTTCCTTGGTTC
ATTAAACAATGGTGCAATTAGACACCGATAGAGAGTGTATTGGAGAACAAATAGCTTTTG
ATTTTGAAATGTTAAACAGCATCCTTCAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D312TF U 24
AF RR2AS21TF U 1
AF RR2D312JQ C 273
BS 1 82 RR2AS21TF
BS 83 83 RR2D312TF
BS 84 162 RR2AS21TF
BS 163 163 RR2D312TF
BS 164 201 RR2AS21TF
BS 202 202 RR2D312TF
BS 203 264 RR2AS21TF
BS 265 265 RR2D312TF
BS 266 282 RR2AS21TF
BS 283 283 RR2D312TF
BS 284 328 RR2AS21TF
BS 329 329 RR2D312TF
BS 330 369 RR2AS21TF
BS 370 370 RR2D312TF
BS 371 381 RR2AS21TF
BS 382 382 RR2D312TF
BS 383 390 RR2AS21TF
BS 391 391 RR2D312TF
BS 392 501 RR2AS21TF
BS 502 502 RR2D312TF
BS 503 507 RR2AS21TF
BS 508 508 RR2D312TF
BS 509 669 RR2AS21TF
BS 670 670 RR2D312JQ
BS 671 702 RR2AS21TF
BS 703 703 RR2D312JQ
BS 704 779 RR2AS21TF
BS 780 991 RR2D312JQ

RD RR2D312TF 568 0 0
GGGTAACAGCT
AGAGAGAGAGAGAGAAAACTTTGAAAACAATTCGCCGCTTCTAGGACGAAGAAGAAAATG
GCCGGAGGAGGCGGATACGGCGGCGCATCGGGAAAAGTGGATTACGTGTTCAAGGTAGTT
CTGATCGGAGATTCAGCAGTTGGGAAATCACAGCTGCTAGCTCGATTCGCAAGAGACGAG
TTCAGCTTGGACTCCAAAGCCACCATCGGTGTCGAGTTTCAGACTCGTACCCTCCTCATT
GAAGAGAAAAGCGTCAAGGCTCAGATCTGGGATACCGCCGGCCAAGAAAGATACGGAGCG
GTTACGAGCGCATACTACAGAGGAGCAGTTGGTGCGATGCTTGTTTATGATATTACTAAG
CGTGAGACCTTTGACCACATCCCTCGTTGGCTTGAAGAATTGCGAGCTCATGCTGATAAG
AACATTGTCATCATCCTCATTGGTAACAAGTCTGATCTCGAAGATCAGAGAGCGATTCCC
ACCGAAGACGCTAAAGAGTTTGCTGAGAAGGAAGGTCTTTTCTTCCTCGAGACCTCTGCT
TTGAACGCAACCAA
TGT

QA 12 565 12 565
DS 

RD RR2AS21TF 779 0 0
GGAGTTTAACAGCTATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAACTTTGAAA
ACAATTCGCCGCCTCTAGGACGTAGAAGAAAATGGCCGGAGGAGGCGGATACGGCGGCGC
ATCGGGAAAAGTGGATTACGTGTTCAAGGTAGTTCTGATCGGCGATTCAGCAGTTGGGAA
ATCACAGCTACTAGCTCGATTTGCAAGAGACGAGTTCAGCTTGGACTCCAAAGCCACCAT
CGGTGTCGAGTTTCAGACTCGTACGCTCCTCATTGAAGAGAAGAGCGTCAAGGCTCAGAT
CTGGGATACCGCCGGCCAAGAAAGATACAGAGCGGTTACGAGCGCATACTACAGAGGAGC
AGTTGGTGCCATGCTTGTTTACGATATTACCAAGCGTGAGACCTTTGACCACATCCCTCG
TTGGCTTGAAGAATTGCGAGCTCATGCTGATAAGAACATTGTCATCATCCTCATTGGTAA
CAAGTCTGATCTCGAAGATCAAAGAGCTATTCCCACCGAAGACGCTAAAGAGTTTGCTGA
GAAGGAAGGTCTTTTCTTCCTCGAGACCTCTGCTTTGAACGCAACCAACGTCGAAAACTC
CTTCAACACTCTCATGACAGAAATCTTCAACACTGTTAACAAGAAGAGTCTCTCATCTGC
TGGTGAGTCTAATAACCCTGGTTCGTTGGCTGGTAAGAAGATTGTCATCCCAGGTCCTGG
ACAGGAGGTTCCCGCTAAGACCAGCACGTGTTGTAGTTCTGCTTGATCTGTGTCGTTTA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2D312JQ 719 0 0
TTGAAGAGAAAAGCGTCAAGGCTCAGATCTGGGATACCGCCGGCCAAGAAAGATACGGAG
CGGTTACGAGCGCATACTACAGAGGAGCAGTTGGTGCGATGCTTGTTTATGATATTACTA
AGCGTGAGACCTTTGACCACATCCCTCGTTGGCTTGAAGAATTGCGAGCTCATGCTGATA
AGAACATTGTCATCATCCTCATTGGTAACAAGTCTGATCTCGAAGATCAGAGAGCGATTC
CCACCGAAGACGCTAAAGAGTTTGCTGAGAAGGAAGGTCTTTTCTTCCTCGAGACCTCTG
CTTTGAACGCAACCAATGTCGAAAACTCCTTCAACACTCTCATGACAGAGATCTTCAACA
CTGTTAACAAGAAGAGTCTCTCATCTGCTGGTGAGTCAAATAACCCTGGTTCGTTGGCTG
GTAAGAAGATAGTCATCCCAGGTCCTGGACAGGAGGTTCCCGCTAAGACCAGCTCGTGTT
GTAGTTCTGCTTGATCTGTGTCGTTTACAAAAGCAAAAATTCATTTGTCCCGTCTCCCCC
TTTGAACTATGGTGATGATAGAGAATGCTTACTTTCATATTGTATATTCTTTTTGGAATC
TGGCTTGTGTTGCTTGCTTCCTTGGTTCATTAAACAATGGTGCAATTAGACACCGATAGA
GAGTGTATTGGAGAACAAATAGCTTTTGATTTTGAAATGTTAAACAGCATCCTTCAGTT

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL3030Contig1 973 2 2 U
TTTTTGATAACAATGGCTGGTGGTACAGCTTTGACTCCAACCTCTGTAGGATCTAAGTCA
CTACTTCCATTGAGGAACCAAGAAGCAGCAGAGAGAGTCAACGACAACAACAACAACAAC
CTGAAAGCATTACCCAAAGAGGTCCAGCCGGTTTCATCAATTGAAGGAGGGATGGTTAAG
AGGCCAAGAGGTAGACCAGCTGGCTCCAAGAACAAACCAAAACCACCAATCATTGTGACT
CAGGACAGTCCAAACTCCCTCAGAGCTCATGCCGTTGAGATCAGCCCAGGCAATGACATC
TGTGAGGCTTTAGCAGATTTTGCAAGAAGGAAACAGAAAGGACTCTGCATACTCAGTGCC
AATGGTTGCGTCACCAATGTGACATTAAGCAGCCAGCTTCATCAGGAGCTATTGTGACTT
TACACGGACGTTTCGAGATCCTCTCATTGCTAGGATCAGTCTTGCCTCCACCAGCACCGC
TTGGGATCACTGGTTTCACCATTTACTTAGCCGGGCATCAAGGACAGGTTGTTGGTGGAG
GAGTGGGGTTGGTGGGCTAATAGCATCTGGTCCTGTTGTTATCATGGCTGCATCATTCAT
GAACGCTGTGTTTGATCGCCTTCCGCTGGATGATGATGAAGCTGCTTCTATGCAGAATCA
GCAGTACTACCAGAACGGAAGAGCCCGTCCTTTAGATGGCGGCATTCATGGATTACCTCA
AAACCTGCTCACTAATGGGAACTCAGGTTTTGATATATACCATTGGGGGCCTACGCAGCG
TGTCATGTCCAAGCCTTAATATTGCTAATGAAATTAGAGGGAGAACCATAAGTTAGCTGA
AGCTAATCTTCCTCTCCTCTGTAGTTTGTGTACTTGCATCATTACAAAGAAGAAACTAAA
ACAAAGATAAGTAATTGTTAATGAACTTAAGCAGCATCCTCTAGTTAATACAAAAGAAAT
ATTACTGTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH06TF U 1
AF RR2CH06JQ C 246
BS 1 682 RR2CH06TF
BS 683 973 RR2CH06JQ

RD RR2CH06TF 685 0 0
TTTTTGATAACAATGGCTGGTGGTACAGCTTTGACTCCAACCTCTGTAGGATCTAAGTCA
CTACTTCCATTGAGGAACCAAGAAGCAGCAGAGAGAGTCAACGACAACAACAACAACAAC
CTGAAAGCATTACCCAAAGAGGTCCAGCCGGTTTCATCAATTGAAGGAGGGATGGTTAAG
AGGCCAAGAGGTAGACCAGCTGGCTCCAAGAACAAACCAAAACCACCAATCATTGTGACT
CAGGACAGTCCAAACTCCCTCAGAGCTCATGCCGTTGAGATCAGCCCAGGCAATGACATC
TGTGAGGCTTTAGCAGATTTTGCAAGAAGGAAACAGAAAGGACTCTGCATACTCAGTGCC
AATGGTTGCGTCACCAATGTGACATTAAGCAGCCAGCTTCATCAGGAGCTATTGTGACTT
TACACGGACGTTTCGAGATCCTCTCATTGCTAGGATCAGTCTTGCCTCCACCAGCACCGC
TTGGGATCACTGGTTTCACCATTTACTTAGCCGGGCATCAAGGACAGGTTGTTGGTGGAG
GAGTGGGGTTGGTGGGCTAATAGCATCTGGTCCTGTTGTTATCATGGCTGCATCATTCAT
GAACGCTGTGTTTGATCGCCTTCCGCTGGATGATGATGAAGCTGCTTCTATGCAGAATCA
GCAGTACTACCAGAACGGAAGA
GCC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2CH06JQ 728 0 0
CAGTCCAAACTCCCTCAGAGCTCATGCCGTTGAGATCAGCCCAGGCAATGACATCTGTGA
GGCTTTAGCAGATTTTGCAAGAAGGAAACAGAAAGGACTCTGCATACTCAGTGCCAATGG
TTGCGTCACCAATGTGACATTAAGCAGCCAGCTTCATCAGGAGCTATTGTGACTTTACAC
GGACGTTTCGAGATCCTCTCATTGCTAGGATCAGTCTTGCCTCCACCAGCACCGCTTGGG
ATCACTGGTTTCACCATTTACTTAGCCGGGCATCAAGGACAGGTTGTTGGTGGAGGAGTG
G**TTGGTGGGCTAATAGCATCTGGTCCTGTTGTTATCATGGCTGCATCATTCATGAACG
CTGTGTTTGATCGCCTTCCGCTGGATGATGATGAAGCTGCTTTTATGCAGAATCAGCAGT
ACTACCAGAACGGAAGAGCCCGTCCTTTAGATGGCGGCATTCATGGATTACCTCAAAACC
TGCTCACTAATGGGAACTCAGGTTTTGATATATACCATTGGGGGCCTACGCAGCGTGTCA
TGTCCAAGCCTTAATATTGCTAATGAAATTAGAGGGAGAACCATAAGTTAGCTGAAGCTA
ATCTTCCTCTCCTCTGTAGTTTGTGTACTTGCATCATTACAAAGAAGAAACTAAAACAAA
GATAAGTAATTGTTAATGAACTTAAGCAGCATCCTCTAGTTAATACAAAAGAAATATTAC
TGTGTTTT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

CO CL3031Contig1 756 3 6 U
CATAACAAATTCTCTTTTTATCAAAAAAAAAAAGAACACAACTAAATGTATTTTGAAAAT
ATCCAAATCCGAATGTAAAACTAGTTGAAGGATACAAGGTAAAGAGAGATCGAACTGATG
GGGAGAGAGATTAGGCGTAGTAGTTCAAGCTTGCTTTCTTCTTGGCCTGGACTTGGATGA
TACCTTCATTGAAGTCCTCATGGTTCACCTCTGTGGCATCACGACGGAGAGCTAACATGC
CAGCCTCTACACATACTGCTTTCAGTTGAGCGCCATTGAAATCGTCTGTCGATCTTGCAA
GCTCCTCAAAGTTGACGTCTGGGTGGACATTCATCTTCCTCGAGTGAATCTGTAAAATTC
TGGCTCTTGCTTCTTCTGTTGGATGTGGGAACTCAATCTTCCTGTCTAGCCGACCAGAAC
GCATAAGTGCCGGGTCCAGAATATCTGCACGGTTAGTGGCTGCAATCACCTTAATACGCT
CATCGCTACTGAATCCATCAAGCTGATTGAGTAGCTCCAACATAGTCCTCTGCACTTCCC
TGTCTCCGCTAACTTCACTGTCAAAACGCTTTGTTCCAATTGCATCAATCTCATCAATGA
AGATGATACAAGGAGCTTTCTCTTTTGCTAGTTGAAAGGCATCACGGACAAGTTTTGCTC
CGTCTCCAATAAACATCTGGACCAATTGAGGGCCTGCCAATTTGAGGAAGGTTGCATTGG
TCTGTGCTGCACAGGCACGAGCCATCAAAGTTTTAC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR92JQ U 1
AF RR2AR92TF C 20
AF RR2HB59JQ U 1
BS 1 23 RR2AR92JQ
BS 24 24 RR2HB59JQ
BS 25 26 RR2AR92JQ
BS 27 27 RR2HB59JQ
BS 28 745 RR2AR92JQ
BS 746 756 RR2HB59JQ

RD RR2AR92JQ 749 0 0
CATAACAAATTCTCTTTTTATCAGAAGAAAAAAGAACACAACTAAATGTATTTTGAAAAT
ATCCAAATCCGAATGTAAAACTAGTTGAAGGATACAAGGTAAAGAGAGATCGAACTGATG
GGGAGAGAGATTAGGCGTAGTAGTTCAAGCTTGCTTTCTTCTTGGCCTGGACTTGGATGA
TACCTTCATTGAAGTCCTCATGGTTCACCTCTGTGGCATCACGACGGAGAGCTAACATGC
CAGCCTCTACACATACTGCTTTCAGTTGAGCGCCATTGAAATCGTCTGTCGATCTTGCAA
GCTCCTCAAAGTTGACGTCTGGGTGGACATTCATCTTCCTCGAGTGAATCTGTAAAATTC
TGGCTCTTGCTTCTTCTGTTGGATGTGGGAACTCAATCTTCCTGTCTAGCCGACCAGAAC
GCATAAGTGCCGGGTCCAGAATATCTGCACGGTTAGTGGCTGCAATCACCTTAATACGCT
CATCGCTACTGAATCCATCAAGCTGATTGAGTAGCTCCAACATAGTCCTCTGCACTTCCC
TGTCTCCGCTAACTTCACTGTCAAAACGCTTTGTTCCAATTGCATCAATCTCATCAATGA
AGATGATACAAGGAGCTTTCTCTTTTGCTAGTTGAAAGGCATCACGGACAAGTTTTGCTC
CGTCTCCAATAAACATCTGGACCAATTGAGGGCCTGCCAATTTGAGGAAGGTTGCATTGG
TCTGTGCTGCACAGGCACGAGCCAT
TAGA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2AR92TF 730 0 0
ATCAGAAG
AAAAAAGAACACAACTAAATGTATTTTGAAAATATCCAAATCCGAATGTAAAACTAGTTG
AAGGATACAAGGTAAAGAGAGATCGAACTGATGGGGAGAGAGATTAGGCGTAGTAGTTCA
AGCTTGCTTTCTTCTTGGCCTGGACTTGGATGATACCTTCATTGAAGTCCTCATGGTTCA
CCTCTGTGGCATCACGACGGAGAGCTAACATGCCAGCCTCTACACATACTGCTTTCAGTT
GAGCGCCATTGAAATCGTCTGTCGATCTTGCAAGCTCCTCAAAGTTGACGTCTGGGTGGA
CATTCATCTTCCTCGAGTGAATCTGTAAGATTCTGGCTCTTGCTTCTTCTGTTGGATGTG
GGAACTCAATCTTCCTGTCTAGCCGACCAGAACGCATAAGTGCCGGGTCCAGAATATCTG
CACGGTTAGTGGCTGCAATCACCTTAATACGCTCATCGCTACTGAATCCATCAAGCTGAT
TGAGTAGCTCCAACATAGTCCTCTGCACTTCCCTGTCTCCGCTAACTTCACTGTCAAAAC
GCTTTGTTCCAATTGCATCAATCTCATCAATGAAGATGATACAAGGAGCTTTCTCTTTTG
CTAGTTGAAAGGCATCACGGACAAGTTTTGCTCCGTCTCCAATAAACATCTGGACCAATT
GAGGGCCTGCCAATTTGAGGAAGGTTGCATTGGTCTGTGCTGCACAGGCACGAGCCAT
TAGA

QA 9 726 9 726
DS 

RD RR2HB59JQ 756 0 0
CG
TAACAAATTCTCTTTTTATCAAAAAAAAAAA*AACACAACTAAATGTATTTTGAAAATAT
CCAAATCCGAATGTAAAACTAGTTGAAGGATACAAGGTAAAGAGAGATCGAACTGATGGG
GAGAGAGATTAGGCGTAGTAGTTCAAGCTTGCTTTCTTCTTGGCCTGGACTTGGATGATA
CCTTCATTGAAGTCCTCATGGTTCACCTCTGTGGCATCACGACGGAAAGCTAACATGCCA
GCCTCTACACATACTGCTTTCAGTTGAGCGCCATTGAAATCGTCTGTCGATCTTGCAAGC
TCCTCAAAGTTGACGTCTGGGTGGACATTCATCTTCCTCGAGTGAATCTGTAAAATTCTG
GCTCTTGCTTCTTCTGTTGGATGTGGGAACTCAATCTTCCTGTCTAGCCGACCAAAACGC
ATGAGTGCCGGGTCCAGAATATCTGCACGGTTTGTGGCTGCAATCACCTTAATACGCTCA
TCGCTACTGAATCCATCAAGCTGATTGAGTAGCTCCAACATAGTCCTCTGCACTTCCCTG
TCTCCGCTAACTTCACTGTCAAAACGCTTTGTTCCAATTGCATCAATCTCATCAATGAAG
ATGATGCAAGGAGCTTTCTCTTTTGCTAGTTGAAAGGCATCACGGACAAGTTTTGCTCCG
TCTCCAATAAACATCTGGACCAACTGAGGACCTGCCAATTTGAGGAAGGTGGCATTGGTC
TGTGCTGCACAGGCACGGGCCATCAAAGTTTTAC

QA 3 756 3 756
DS 



AS 1 3

CO CL3032Contig1 744 3 10 U
GAAAGTAAAATAACCTTATGATATAAATATATGGAAATGTTACAACCAAAAACGGAAGGA
AAGGTCTCCAATAATCTTTTGATTTAAATAATAACACATCTTTCAGTCAGGAGACTGATT
ATGAATCGCAGTCCAGTTTAGGTTTTATACCGAGTCGGAACAAACAAATCTATATTGCCT
GCATTTCACGCCTTGGATTTGGCTTCATATTCATTTGGAGGCATGAAAGTTGCAGATATC
ATCTTTTGTGCAAACCATCTCATGTGCATTGCTCTTTGAGCTGCCGCTGCAGCCTGCACC
GATTCAAACCGCAGATACACAAAACCTGCGCTCTTCTTGTCTACATAAATATGGTTGACC
TGCCCATACTTGGAGCATTCTTGACCAACGTCTTCTCTTATATCATCATCAAAATCCAAT
TCCGTCTCGGTTGCAGGATCAAACATGTTCTTCAATAGAAGACATTGACTTGGCTGACCA
ACAGGCTCTGTGACAAAAGCAGGGCTGGCTGTTGTCGGAAGCACTGATGTCGGGAAACCA
GGATTCATGCCTGGTTGATTAAGAGCTGCTCCATTCAAAGCTGGTACTCCAAAAGGTCCC
ACAATGTTTGCTGCAACACCTGTACGATCCAGCTTCTGCATAAGCTGAACCCTCGTTTGT
GCATTTAGAGCCGGCCCACCTCCATCATCATCATCAAAATCAGTGGATTTTGGATTAGCG
TCTTGTGTGCCTATATGCTCAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY40JQ U 234
AF RR2DQ37JQ U 1
AF RR2EQ24JQ U 7
BS 1 30 RR2DQ37JQ
BS 31 31 RR2EQ24JQ
BS 32 99 RR2DQ37JQ
BS 100 100 RR2EQ24JQ
BS 101 196 RR2DQ37JQ
BS 197 197 RR2EQ24JQ
BS 198 577 RR2DQ37JQ
BS 578 578 RR2EQ24JQ
BS 579 665 RR2DQ37JQ
BS 666 744 RR2EQ24JQ

RD RR2CY40JQ 327 0 0
AGATATCATCTTTTGTGCAAACCATCTCATGTGCATTGCTCTTTGAGCCGCCGCTGCAGC
CTGCACCGATTCAAACCGCAAATACACAAAACCTGCGCTCTTCTTGTCTACATAAATATG
GTTGACCTGCCCATACTTGGAGCATTCTTGACCAACGTCTTCTCTTATATCATCATCAAA
ATCCAATTCCGTCTCGGTTGCAGGATCAAACATGTTCTTCAATAAAAAACATTGACTTGG
CTGACCAACAGGCTCTGTGACAAAAGCAGGGCTGGCTGTTGTCGGAAGCACTGATGTCGG
GAAACCAGGATTCATGCCTGGTTGATT

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR2DQ37JQ 665 0 0
GAAAGTAAAATAACCTTATGATATAAATATTTGGAAATGTTACAACCAAAAACGGAAGGA
AAGGTCTCCAATAATCTTTTGATTTAAATAATAACACATGTTTCAGTCAGGAGACTGATT
ATGAATCGCAGTCCAGTTTAGGTTTTATACCGAGTCGGAACAAACAAATCTATATTGCCT
GCATTTCACGCCTTGGCTTTGGCTTCATATTCATTTGGAGGCATGAAAGTTGCAGATATC
ATCTTTTGTGCAAACCATCTCATGTGCATTGCTCTTTGAGCTGCCGCTGCAGCCTGCACC
GATTCAAACCGCAGATACACAAAACCTGCGCTCTTCTTGTCTACATAAATATGGTTGACC
TGCCCATACTTGGAGCATTCTTGACCAACGTCTTCTCTTATATCATCATCAAAATCCAAT
TCCGTCTCGGTTGCAGGATCAAACATGTTCTTCAATAGAAGACATTGACTTGGCTGACCA
ACAGGCTCTGTGACAAAAGCAGGGCTGGCTGTTGTCGGAAGCACTGATGTCGGGAAACCA
GGATTCATGCCTGGTTGATTAAGAGCTGCTCCATTCACAGCTGGTACTCCAAAAGGTCCC
ACAATGTTTGCTGCAACACCTGTACGATCCAGCTTCTGCATAAGCTGAACCCTCGTTTGT
GCATT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2EQ24JQ 738 0 0
AAAATAACCTTATGATATAAATATATGGAAATGTTACAACCAAAAACGGAAGGAAAGGTC
TCCAATAATCTTTTGATTTAGATAATAACACATCTTTCAGTCAGGAGACTGATTATGAAT
CGCAGTCCAGTTTAGGTTTTATACCGAGTCGGAACAAACAAATCTATCTTGCCTGCATTT
CACGCCTTGGATTTGGCTTCATATTCATTTGGAGGCATGAAAGTTGCAGATATCATCTTT
TGTGCAAACCATCTCATGTGCATCGCTCTTTGAGCTGCCGCTGCAGCCTGAACCGTTTCA
AACCGCAGATACACAAAACCTGCGCTCTTCTTGTCTACATAAATATGGTTGACCTGCCCA
TACTTGGAGCATTCTTGACCAACGTCTTCTCTTATTTCATCATCAAAATCCAATTCCGTC
TCGGTTGCAGGATCAAACATGTTCTTCAATAGAAGACATTGACTTGGCTGACCAACAGGC
TCTGTGACAAAAGCGGGGCTGGCTGTTGTCGGAAGCACTGATGTCGGGAAACCAGGATTC
ATGCCTGGTTGATTAAGAGCTGCTCCATTCAAAGCTGGTACTCCAAAAGGTCCCACAATG
TTTGCTGCAACACCTGTACGATCCAGCTTCTGCATAAGCTGAACCCTCGTTTGTGCATTT
AGAGCCGGCCCACCTCCATCATCATCATCAAAATCAGTGGATTTTGGATTAGCGTCTTGT
GTGCCTATATGCTCAGAG

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 3

CO CL3033Contig1 768 3 34 U
CAAAGGAAGATCTCTCTGAAAACATCCATGGGCAAACACAGTAATCCGAATGCAGTTGAA
ACTGGAGCGGCGGCGACGGATCCGGTGTGGGAATGCAATGGAAAAGGAGCGTGTGAATTG
AGACAGAGGCGATTTGCTGATACCATCATGCCTCATATCCTCAACTTGTATGGGTCTTGC
GCAAAAGCCAAGGATTTTGACATGTATGCACCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACT
CATGCTCAAGGGGTGAAGCAAATCAAATCAGCATTTTATTCGCTCTCCAAGGTATTTGGT
GAGTCCAGAATAGTTGAATATCATATTCAGGAAAGTGATATCGCACCGGGAAAGAAAGAG
ATACTAATTGACAACAAACAACATTACAAGCTCCTGGGAAAGAACATTCAAATGATCTCT
CTCATTAAACTCTATGTCGAGAACAACAAGATTGTCCGACACGAAGACTGGTGGGACAAG
AAACCTCTAAGGAATAGAGACACTGTTGGCTTTCCGTTAGTCGGGCGGGTAATGGAGATG
GGTCGAAGAGGCTTGATGCTAGCGACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGATCCTAGC
TCGCATTGAGTTAACTTTAAAAGGAGATTCTTCAGGAAAAACAAAAAAAAAGACAGTATA
CTGTAGTATCTAAAACTCTTCAAAACACTCACACTGAGGTTGATGA*ACTCCTTAAATGT
TTGTAAGATGTTAAACGTATTGTTGGTTTTTAGTCTCTTTTTCTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 10 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI10TF U 1
AF RR2CX33TF U 31
AF RR2CX33JQ C 170
BS 1 250 RR2DI10TF
BS 251 251 RR2CX33TF
BS 252 293 RR2DI10TF
BS 294 294 RR2CX33TF
BS 295 307 RR2DI10TF
BS 308 308 RR2CX33TF
BS 309 317 RR2DI10TF
BS 318 318 RR2CX33TF
BS 319 456 RR2DI10TF
BS 457 457 RR2CX33TF
BS 458 494 RR2DI10TF
BS 495 495 RR2CX33TF
BS 496 512 RR2DI10TF
BS 513 513 RR2CX33TF
BS 514 607 RR2DI10TF
BS 608 608 RR2CX33TF
BS 609 644 RR2DI10TF
BS 645 648 RR2CX33TF
BS 649 658 RR2DI10TF
BS 659 659 RR2CX33TF
BS 660 664 RR2DI10TF
BS 665 665 RR2CX33TF
BS 666 684 RR2DI10TF
BS 685 685 RR2CX33TF
BS 686 690 RR2DI10TF
BS 691 691 RR2CX33TF
BS 692 692 RR2DI10TF
BS 693 694 RR2CX33TF
BS 695 697 RR2DI10TF
BS 698 698 RR2CX33TF
BS 699 706 RR2DI10TF
BS 707 707 RR2CX33TF
BS 708 732 RR2DI10TF
BS 733 768 RR2CX33JQ

RD RR2DI10TF 733 0 0
CAAAGGAAGATCTCTCTGAAAACATCCATGGGCAAACACAGTAATCCGAATGCAGTTGAA
ACTGGAGCGGCGGCGACGGATCCGGTGTGGGAATGCAATGGAAAAGGAGCGTGTGAATTG
AGACAGAGGCGATTTGCTGATACCATCATGCCTCATATCCTCAACTTGTATGGGTCTTGC
GCAAAAGCCAAGGATTTTGACATGTATGCACCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACT
CATGCTCAAGTGGTGAAGCAAATCAAATCAGCATTTTATTCGCTCTCCAAGGTGTTTGGT
GAGTCCAAAATAGTTGAGTATCATATTCAGGAAAGTGATATCGCACCGGGAAAGAAAGAG
ATACTAATTGACAACAAACAACATTACAAGCTCCTGGGAAAGAACATTCAAATGATCTCT
CTCATTAAACTCTATGTCGAGAACAACAAGATTGTCAGACACGAAGACTGGTGGGACAAG
AAACCTCTAAGGAACAGAGACACTGTTGGCTTCCCGTTAGTCGGGCGGGTAATGGAGATG
GGTCGAAGAGGCTTGATGCTAGCGACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGATCCTAGC
TCGCATTAAGTTAACTTTAAAAGGAGATTCTTCAGGAAAAACAA****AAAGACAGTACA
CTGTTGTATCTAAAACTCTTCAAA*CACTCTC**TGAAGTTGATGAGACTCCTTAAATGT
TTGTAAGATGTT
A

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2CX33TF 702 0 0
GGA
AAACACAGTAATCCGAATGCAGTTGAAACTGGAGCGGCGGCGACGGATCCGGTGTGGGAA
TGCAATGGAAAAGGAGCGTGTGAATTGAGACAGAGGCGATTTGCTGATACCATCATGCCT
CATATCCTCAACTTGTATGGGTCTTGCGCAAAAGCCAAGGATTTTGACATGTATGCACCA
AATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACTCATGCTCAAGGGGTGAAGCAAATCAAATCAGCA
TTTTATTCGCTCTCCAAGGTATTTGGTGAGTCCAGAATAGTTGAATATCATATTCAGGAA
AGTGATATCGCACCGGGAAAGAAAGAGATACTAATTGACAACAAACAACATTACAAGCTC
CTGGGAAAGAACATTCAAATGATCTCTCTCATTAAACTCTATGTCGAGAACAACAAGATT
GTCCGACACGAAGACTGGTGGGACAAGAAACCTCTAAGGAATAGAGACACTGTTGGCTTT
CCGTTAGTCGGGCGGGTAATGGAGATGGGTCGAAGAGGCTTGATGCTAGCGACTCATGCC
ATGATGGGTTTTGGTAAAGATCCTAGCTCGCATTGAGTTAACTTTAAAAGGAGATTCTTC
AGGAAAAACAAAAAAAAAGACAGTATACTGTAGTATCTAAAACTCTTCAAAACACTCACA
CTGAGGTTGATGA*ACTCCTTAAATGTTTGTAAGATGTT

QA 4 702 4 702
DS 

RD RR2CX33JQ 599 0 0
ATGGGTCTTGCGCAAAAGCCAAGGATTTTGACATGTATGCACCAAATGCTTCGTTTGAGG
ACCCTTTAACTCATGCTCAAGGGGTGAAGCAAATCAAATCAGCATTTTATTCGCTCTCCA
AGGTATTTGGTGAGTCCAGAATAGTTGAATATCATATTCAGGAAAGTGATATCGCACCGG
GAAAGAAAGAGATACTAATTGACAACAAACAACATTACAAGCTCCTGGGAAAGAACATTC
AAATGATCTCTCTCATTAAACTCTATGTCGAGAACAACAAGATTGTCCGACACGAAGACT
GGTGGGACAAGAAACCTCTAAGGAATAGAGACACTGTTGGCTTTCCGTTAGTCGGGCGGG
TAATGGAGATGGGTCGAAGAGGCTTGATGCTAGCGACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTA
AAGATCCTAGCTCGCATTGAGTTAACTTTAAAAGGAGATTCTTCAGGAAAAACAAAAAAA
AAGACAGTATACTGTAGTATCTAAAACTCTTCAAAACACTCACACTGAGGTTGATGA*AC
TCCTTAAATGTTTGTAAGATGTTAAACGTATTGTTGGTTTTTAGTCTCTTTTTCTACTC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 3

CO CL3034Contig1 757 3 2 U
GGAAAATAATCTAAATTCCAAACAGCACATAGCAAAAGCAGAACATTATCCCAAAAACAT
ATGAACAACAACGCAGAAGCAGAGCAAGAAGAAGAGTTCAGTGAATGGGTAGTGATACAA
ACCTCACCCACAAGCTCATCAATCGACGCATTTAGCCCTCTAAACTCACCGATATCACAA
GCAAGCCAAGGCCATGATGATGAAGATTCTGTTGTTCCCGTCGTAGAAGAGGAAGACGAT
GAACCCTCCTCCACGCTGAATCAGTCATTTCCGTGTTGGGTGATTGAGACTGCCAAGAAG
CGTTTGAAGGACTCAAGATTTTTCGAGAGGGCGTCTTGTAATTACTTGAGTAGTACAAGG
GTTTTCTGGTCATTGACCCTCGTTTGTGGTTTCTCCCTTGTCTCGAGCCTTGTTTATGTT
AAGGTCGTGAGATGGTGGAGACGATTACAAGAAGAGAAGCTGAGGTTTCTGCTTCTTCAG
CTTAGAGAGAAAGATCAGAAAATAAAGGAGCTTATACTTGAAATCGGGAGACTGAATGAA
TCGCTATCATCAAGACGCAGAGTTCGAGTGATTCGAATCGTGTGACGAGACCAATATATT
TGTGTAGTAGAGCATTGGCTATTTGTTTGTGTGACTAGTATACAGATTATGGACATATAT
TGTCCGTGTGTATGCAATAATATACATATAAAAACCAGAGGAAGATAGAGTGGAATACAG
TTTACGTATGGTGTTTCTATGGTATCAAATATTAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR35TF U 328
AF RR2GV24TF U 1
AF RR2GV24JQB C 213
BS 1 558 RR2GV24TF
BS 559 757 RR2GV24JQB

RD RR2BR35TF 111 0 0
AGGGCGTCTTGTAATTACTTGAGTAGTACAAGGGTTTTCTGGTCATTGACCCTCGTTTGT
GGTTTCTCCCTTGTCTCGAGCCTTGTTTATGTTAATGTCGTGAGATGGTGG

QA 1 111 1 111
DS 

RD RR2GV24TF 558 0 0
GGAAAATAATCTAAATTCCAAACAGCACATAGCAAAAGCAGAACATTATCCCAAAAACAT
ATGAACAACAACGCAGAAGCAGAGCAAGAAGAAGAGTTCAGTGAATGGGTAGTGATACAA
ACCTCACCCACAAGCTCATCAATCGACGCATTTAGCCCTCTAAACTCACCGATATCACAA
GCAAGCCAAGGCCATGATGATGAAGATTCTGTTGTTCCCGTCGTAGAAGAGGAAGACGAT
GAACCCTCCTCCACGCTGAATCAGTCATTTCCGTGTTGGGTGATTGAGACTGCCAAGAAG
CGTTTGAAGGACTCAAGATTTTTCGAGAGGGCGTCTTGTAATTACTTGAGTAGTACAAGG
GTTTTCTGGTCATTGACCCTCGTTTGTGGTTTCTCCCTTGTCTCGAGCCTTGTTTATGTT
AAGGTCGTGAGATGGTGGAGACGATTACAAGAAGAGAAGCTGAGGTTTCTGCTTCTTCAG
CTTAGAGAGAAAGATCAGAAAATAAAGGAGCTTATACTTGAAATCGGGAGACTGAATGAA
TCGCTATCATCAAGACGC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2GV24JQB 545 0 0
TGTTCCCGTCGTAGAAGAGGAAGACGATGAACCCTCCTCCACGCTGAATCAGTCATTTCC
GTGTTGGGTGATTGAGACTGCCAAGAAGCGTTTGAAGGACTCAAGATTTTTCGAGAGGGC
GTCTTGTAATTACTTGAGTAGTACAAGGGTTTTCTGGTCATTGACCCTCGTTTGTGGTTT
CTCCCTTGTCTAGAGCCTTGTTTATGTTAAGGTCGTGAGATGGTGGAGACGATTACAAGA
AGAGAAGCTGAGGTTTCTGCTTCTTCAGCTTAGAGAGAAAGATCAGAAAATAAAGGAGCT
TATACTTGAAATCGGGAGACTGAATGAATCGCTATCATCAAGACGCAGAGTTCGAGTGAT
TCGAATCGTGTGACGAGACCAATATATTTGTGTAGTAGAGCATTGGCTATTTGTTTGTGT
GACTAGTATACAGATTATGGACATATATTGTCCGTGTGTATGCAATAATATACATATAAA
AACCAGAGGAAGATAGAGTGGAATACAGTTTACGTATGGTGTTTCTATGGTATCAAATAT
TAGAT

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 3

CO CL3035Contig1 878 3 8 U
GGACCAGAGTCACGAGACTCACCAGCCATCGGTCAGAAACAACACACTTATAAATATCTT
TCTTTTTTTCTGAAAAAGAAACTTATAAATATCTTTCTTTGATTACTTTCCAGCAAGGTC
GCTATCATCTAAAAGTCATCTAAAACTCTTCATAGCCCTCATTAGCTGAGTTAGGTTCCT
TTTCAGACACAAACTGGACCCTTCAGAGCTCATAAACATCTTCTTCTTTTTCTTCTTTCT
CTCTATCTCTGAGATGGGTTTGTTTGGGACGAAGAAGATCGGCAAGTATGAGATAGGAAG
GACCATAGGAGAAGGGAACTTCGCAAAAGTGAAACTTGGTTACGACACGACCAATGGTAC
CTACGTTGCTGTCAAAATCATAGACAAGGCTCTGGTTATCCAAAAGGGTCTACAGTCTCA
AGTCCAAAGAGAGATACGTACCATGAAGCTTCTAAACCATCCCAACATCGTGCAGATACA
CGAGGTGATTGGGACCAAGACAAAGATCTGTATTGTGATGGAATATGTTGCAGGTGGTCA
GCTTTCAGACAAACTTTGTAGACATAAGATGAAAGAATCAGATGCCAGAAAGCTTTTCCA
ACAATTGATTGATGCTGTTGATTATTGTCATAACAGAGGAGTTTACCACAGAGACCTTAA
GCCACAAAACTTGCTTTTAGATTCAAAGGGTAATCTCAAAGTCTCTGATTTTGGACTAAG
TGCAGTTCCTAAATCAGGGGATATGCTTTCTACAGCTTGTGGATCTCCATGCTATATAGC
ACCTGAGCTGATTATGAACAAAGGCTACTCAGAGCAGCAGTGGATGTGTGGTCTTGTGGA
GTAATTCTATTTGAGTTGCTTGCTGGTTATCCACCGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ13TF U 1
AF RR2DK16TF U 173
AF RR2EL52TF U 183
BS 1 284 RR2FQ13TF
BS 285 285 RR2DK16TF
BS 286 728 RR2FQ13TF
BS 729 729 RR2DK16TF
BS 730 739 RR2FQ13TF
BS 740 740 RR2DK16TF
BS 741 792 RR2FQ13TF
BS 793 878 RR2EL52TF

RD RR2FQ13TF 805 0 0
GGACCAGAGTCACGAGACTCACCAGCCATCGGTCAGAAACAACACACTTATAAATATCTT
TCTTTTTTTCTGAAAAAGAAACTTATAAATATCTTTCTTTGATTACTTTCCAGCAAGGTC
GCTATCATCTAAAAGTCATCTAAAACTCTTCATAGCCCTCATTAGCTGAGTTAGGTTCCT
TTTCAGACACAAACTGGACCCTTCAGAGCTCATAAACATCTTCTTCTTTTTCTTCTTTCT
CTCTATCTCTGAGATGGGTTTGTTTGGGACGAAGAAGATCGGCA*GTATGAGATAGGAAG
GACCATAGGAGAAGGGAACTTCGCAAAAGTGAAACTTGGTTACGACACGACCAATGGTAC
CTACGTTGCTGTCAAAATCATAGACAAGGCTCTGGTTATCCAAAAGGGTCTACAGTCTCA
AGTCCAAAGAGAGATACGTACCATGAAGCTTCTAAACCATCCCAACATCGTGCAGATACA
CGAGGTGATTGGGACCAAGACAAAGATCTGTATTGTGATGGAATATGTTGCAGGTGGTCA
GCTTTCAGACAAACTTTGTAGACATAAGATGAAAGAATCAGATGCCAGAAAGCTTTTCCA
ACAATTGATTGATGCTGTTGATTATTGTCATAACAGAGGAGTTTACCACAGAGACCTTAA
GCCACAAAACTTGCTTTTAGATTCAAAGGGTAATCTCAAAGTCTCTGATTTTGGACTAAG
TGCAGTTC*TAAATCAGGG*ATATGCTTTCTACAGCTTGTGGATCTCCATGCTATATAGC
ACCTGAGCTGAT
ATGAACAAGGTAC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2DK16TF 629 0 0
G
GGTTCCTTTTCAGACACAAACTGGACCCTTCAGAGCTCATAAACATCTTCTTCTTTTTCT
TCTTTCTCTCTATCTCTGAGATGGGTTTGTTTGGGACGAAGAAGATCGGCAAGTATGAGA
TAGGAAGGACCATAGGAGAAGGGAACTTCGCAAAAGTGAAACTTGGTTACGACACGACCA
ATGGTACCTACGTTGCTGTCAAAATCATAGACAAGGCTCTGGTTATCCAAAAGGGTCTAC
AGTCTCAAGTCCAAAGAGAGATACGTACCATGAAGCTTCTAAACCATCCCAACATCGTGC
AGATACACGAGGTGATTGGGACCAAGACAAAGATCTGTATTGTGATGGAATATGTTGCAG
GTGGTCAGCTTTCAGACAAACTTTGTAGACATAAGATGAAAGAATCAGATGCCAGAAGGC
TTTTCCAACAATTGATTGATGCTGTTGATTATTGTCATAACAGAGGAGTTTACCACAGAG
ACCTTAAGCCACAAAACTTGCTTTTAGATTCAAAGGGTAATCTCAAAGTCTCTGATTTTG
GACTAAGTGCAGTTCCTAAATCAGGGGATATGCTTTCTACAGCTTGTGGATCTCCATGCT
ATATAGCACCTGAGCTGAT
TATGAACAA

QA 2 620 2 620
DS 

RD RR2EL52TF 696 0 0
GG
AGACACAAACTGGACCCTTCAGAGCTCATAAACATCTTCTTCTTTTTCTTCTTTCTCTCT
ATCTCTGAGATGGGTTTGTTTGGGACGAAGAAGATCGGCAAGTATGAGATAGGAAGGACC
ATAGGAGAAGGGAACTTCGCAAAAGTGAAACTTGGTTACGACACGACCAATGGTACCTAC
GTTGCTGTCAAAATCATAGACAAGGCTCTGGTTATCCAAAAGGGTCTACAGTCTCAAGTC
CAAAGAGAGATACGTACCATGAAGCTTCTAAACCATCCCAACATCGTGCAGATACACGAG
GTGATTGGGACCAAGACAAAGATCTGTATTGTGATGGAATATGTTGCAGGTGGTCAGCTT
TCAGACAAACTTTGTAGACATAAGATGAAAGAATCAGATGCCAGAAAGCTTTTCCAACAA
TTGATTGATGCTGTTGATTATTGTCATAACAGAGGAGTTTACCACAGAGACCTTAAGCCA
CAAAACTTGCTTTTAGATTCAAAGGGTAATCTCAAAGTCTCTGATTTTGGACTAAGTGCA
GTTCCTAAATCAGGGGATATGCTTTCTACAGCTTGTGGATCTCCATGCTATATAGCACCT
GAGCTGATTATGAACAAAGGCTACTCAGAGCAGCAGTGGATGTGTGGTCTTGTGGAGTAA
TTCTATTTGAGTTGCTTGCTGGTTATCCACCGTT

QA 3 696 3 696
DS 



AS 1 3

CO CL3036Contig1 764 3 2 U
AATTAAACATCGGAAGCTAGCTAAACCAGGTCCTTTCAAGAAGGAATGGAAATAATTGTT
ACCACATTACATTATTTTTATATTTTCACTATACATTGTATCATAATAGTCTTTCTGCCT
TATCATATTAATCAGTTTTAACCATTACATATATTAACATAAAAATTGTAAAAAGTTTTT
TTTCCCTTACAATGCCGTACAATTCATGACACGTCATATGCTAAACATTGGAATAGGTCC
ACCAATGTCTTTTATTCTTCCATGAATTCACGTTTACTCACATGTGTTTACCACCACTCC
CATGTGAACTTTCACCATCTGAACTTCCATCTGAACTTCCATCTGAACTTTCACTTGAAC
TACTTGCATCCATAGATGAACCTGCATAATGGAATTCTTTTTTCTCCTTTTTAGAAGAGC
CTCCACCCCCGTGTTTACCTTCACCCATTGACGAACCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCAC
TTCCATGTTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCACTTCCGT
GTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGCCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGC
CTCCACTTCCGTGTTTACCTTCACCCATTGATGAACCTCCACTTCCGTGTTTACCTCCAC
CTCCATGCTTAGCTTCATCCGTCGACGAACCTCCACTTCCATGTTTACCTCCGCTTCCGT
GCTTACCTTTATCCATTGACGAACCTCCACCTCCATGTTTACCT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E847JQ U 1
AF RR2E847TF C 4
AF RR2GH36JQB U 102
BS 1 680 RR2E847JQ
BS 681 764 RR2GH36JQB

RD RR2E847JQ 681 0 0
AATTAAACATCGGAAGCTAGCTAAACCAGGTCCTTTCAAGAAGGAATGGAAATAATTGTT
ACCACATTACATTATTTTTATATTTTCACTATACATTGTATCATAATAGTCTTTCTGCCT
TATCATATTAATCAGTTTTAACCATTACATATATTAACATAAAAATTGTAAAAAGTTTTT
TTTCCCTTACAATGCCGTACAATTCATGACACGTCATATGCTAAACATTGGAATAGGTCC
ACCAATGTCTTTTATTCTTCCATGAATTCACGTTTACTCACATGTGTTTACCACCACTCC
CATGTGAACTTTCACCATCTGAACTTCCATCTGAACTTCCATCTGAACTTTCACTTGAAC
TACTTGCATCCATAGATGAACCTGCATAATGGAATTCTTTTTTCTCCTTTTTAGAAGAGC
CTCCACCCCCGTGTTTACCTTCACCCATTGACGAACCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCAC
TTCCATGTTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCACTTCCGT
GTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGCCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGC
CTCCACTTCCGTGTTTACCTTCACCCATTGATGAACCTCCACTTCCGTGTTTACCTCCAC
CTCCATGCTTAGCTTCATCC
C

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2E847TF 678 0 0
TAAACATCGGAAGCTAGCTAAACCAGGTCCTTTCAAGAAGGAATGGAAATAATTGTTACC
ACATTACATTATTTTTATATTTTCACTATACATTGTATCATAATAGTCTTTCTGCCTTAT
CATATTAATCAGTTTTAACCATTACATATATTAACATAAAAATTGTAAAAAGTTTTTTTT
CCCTTACAATGCCGTACAATTCATGACACGTCATATGCTAAACATTGGAATAGGTCCACC
AATGTCTTTTATTCTTCCATGAATTCACGTTTACTCACATGTGTTTACCACCACTCCCAT
GTGAACTTTCACCATCTGAACTTCCATCTGAACTTCCATCTGAACTTTCACTTGAACTAC
TTGCATCCATAGATGAACCTGCATAATGGAATTCTTTTTTCTCCTTTTTAGAAGAGCCTC
CACCCCCGTGTTTACCTTCACCCATTGACGAACCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTC
CATGTTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCACTTCCGTGTT
TGTCTCCACTTCCGTGTTTGCCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGCCTC
CACTTCCGTGTTTACCTTCACCCATTGATGAACCTCCACTTCCGTGTTTACCTCCACCTC
CATGCTTAGCTTCATCC
C

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2GH36JQB 663 0 0
CATAATAGTCTTTCTGTCTTATCATATTAATCAGTTTTAACCATTACATATATTAACATA
AAAATTGTAAAAAGTTTTTTTTCCCTTACAATGCCGTACAATTCATGACACGTCATATGC
TAAACATTGGAATAGGTCCACCAATGTCTTTTATTCTTCCATGAATTCACGTTTACTCAC
ATGTGTTTACCACCACTCCCATGTGAACTTTCACCATCTGAACTTCCATCTGAACTTCCA
TCTGAACTTTCACTTGAACTACTTGCATCCATAGATGAACCTGCATAATGGAATTCTTTT
TTCTCCTTTTTAGAAGAGCCTCCACCCCCGTGTTTACCTTCACCCATTGACGAACCTCCA
CTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCATGTTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCACTCTCG
TGTTTGCCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGCCTCCACTTCCGTGTTTG
TCTCCACTTCTGTGTTTGCCTCCACTTCCGTGTTTACCTTCACCCATTGATGAACCTCCA
CTTCCGTGTTTACCTCCACCTCCATGCTTAGCTTCATCCGTCGACGAACCTCCACTTCCA
TGTTTACCTCCGCTTCCGTGCTTACCTTTATCCATTGACGAACCTCCACCTCCATGTTTA
CCT

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 3

CO CL3037Contig1 1432 3 8 U
GGATCTAATGATCGATCGTAAAAGGCAAACATCGACCCAGCACAAGATCATTATTGCCGT
TATGTGGAAGTTGAAAATAGGAGAGGGAAATGGGGAAGAGTACCCTTACTTATTCAGCAG
CAACAACTTTGTCGGACGTCAAACATGGGAATTTGATCCCAAAGGCGGCACAGCAGAGGA
ACGAGCCGCCGTCGAAAAAGCTCGACGGCATTTCTTGATCAACCGGTCTCGTGTTAAAGG
CTGCAGTGATCTCTTGTGGAGAATGCAATTTCTGAAAGATGCGAAATTCGAGCAAGCGAT
CCCGCCGGTGAACATCGACGGCGACGAAGGCCTAACTTACGAGAAAGCGACGGATGCGTT
ACGGAGAGGAGTTTCTTTCTTCTCGGCTTTGCAAGCCTCCGACGGTCACTGGCCTGGAGA
AATCACCGGACCTCTCTTCTTCCTTCCTCCGCTGGTATTTTGTTTGTACATAACAGGACA
CCTCGAGAAAGTATTCGATGAAGAACACCGCAAAGAGATGCTTCGACATGTCTATTGTCA
TCAGAACGAAGATGGTGGATGGGGACTACACATCGAAAGTAGGAGCATTATGTTCTGCAC
CGCGCTGAATTACATTTGCTTGCGTATGCTCGGAGAAGGTCCCAATGGAGGACGAGAGAA
CGCGTGTAAACGGGCAAGACAGTGGATTCTTGACCGTGGTGGTGTCACTTATGTTCCTTC
ATGGGGGAAAATATGGCTATCGATACTTGGAATCTATGATTGGTCAGGAACCAATCCGAT
GCCTCCTGAGATCTGGTTGCTACCTTCCTGTCTTCCAATACACTTAGCGAAAACTTTGTG
CTATTGCCGGATGGTTTACATGCCGATGTCGTATCTATATGGGAAGAGGTTTGTTGGTCC
TATAACACCTCTTATTCTGCAACTGCGTGACGAACTCCATTTGCAACCTTACGAAGAAAT
CAACTGGAATAAAACACGGCGGCTATACGCAAAGGAGGACATGTATTTTCCACATCCTTT
GGTTCAAGATTTGGTGTGGGATGCTCTTTACGTTCTCGTGGAGCCGGTCCTTACCCGTTG
GCCGTTAAACAAGCTTGTGAGGGAAAAAGCTCTTCGGCTGGCGATGAAACACATACATTA
CGAAGACGAGAATAGCCATTATATCACCATCGGTTGTGTTGAGAAGGTATTGTGCATGCT
TGCATGTTGGATTGAAAACCCGAATGGGGACTACTTCAAGAAGCATCTTGCTAGAATTCC
AGATTACATGTGGGTCGCCGAAGATGGAATGAAAATGCGGAGCTTTGGAAGTCAACTATG
GGATACTGGGTTTGCGGTTCAAGCTATACTTGCTAGTGATCTCTTTGATGAAACTGGCAG
TGTATTAAAGAAAGGACATGATTATATTAAGAATCTCAGTTAGAGAAACCCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH49TF U 1
AF RR2B644TF U 1
AF RR2D590TF U 683
BS 1 147 RR2B644TF
BS 148 148 RR2EH49TF
BS 149 486 RR2B644TF
BS 487 487 RR2EH49TF
BS 488 577 RR2B644TF
BS 578 578 RR2EH49TF
BS 579 764 RR2B644TF
BS 765 1432 RR2D590TF

RD RR2EH49TF 642 0 0
GGATCTAATGATCGATCGTAAAAGGCAAACATCGACCCAGCACAAGATCATTATTGCCGT
TATGTGGAAGTTGGAAATAGGAGAGGGAAATGGGGAAGAGTACCCTTACTTATTCAGCAG
CAACAACTTTGTCGGACGTCAAACATGGGAATTTGATCCCAAAGGCGGCACAGCAGAGGA
ACGAGCCGCCGTCGAAAAAGCTCGACGGCATTTCT*GATCAACCGGTCTCGTGTTAAAGG
CTGCAGTGATCTCTTGTGGAGAATGCAATTTCTGAAAGATGCGAAATTCGAGCAAGCGAT
CCCGCCGGTGAACATCGACGGCGACGAAGGCCTAACTTACGAGAAAGCGACGGATGCGTT
ACGGAGAGGAGTTTCTTTCTTCTCGGCTTTGCAAGCCTCCGGCGGTCACTGGCCTGGAGA
AATCACCGGACCTCTCTTCTTCCTTCCTCCGCTGGTATTTTGTTTGTACATAACAGGACA
CCTCGAGAAAGTATTCGATGAAGAACACCGCAAAGAGATGCTTCGACATGTCTATTGTCA
TCAGAACGAAGATGGTGGATGGGGACTACACATCGAAAGTAGGAGCATTATGTTCTGCAC
CGCGCTGAATTACATTTGCTTGCGTATGCTCGGAGAAG
TCCC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2B644TF 764 0 0
GGATCTAATGATCGATCGTAAAAGGCAAACATCGACCCAGCACAAGATCATTATTGCCGT
TATGTGGAAGTTGAAAATAGGAGAGGGAAATGGGGAAGAGTACCCTTACTTATTCAGCAG
CAACAACTTTGTCGGACGTCAAACATGTGAATTTGATCCCAAAGGCGGCACAGCAGAGGA
ACGAGCCGCCGTCGAAAAAGCTCGACGGCATTTCTTGATCAACCGGTCTCGTGTTAAAGG
CTGCAGTGATCTCTTGTGGAGAATGCAATTTCTGAAAGATGCGAAATTCGAGCAAGCGAT
CCCGCCGGTGAACATCGACGGCGACGAAGGCCTAACTTACGAGAAAGCGACGGATGCGTT
ACGGAGAGGAGTTTCTTTCTTCTCGGCTTTGCAAGCCTCCGACGGTCACTGGCCTGGAGA
AATCACCGGACCTCTCTTCTTCCTTCCTCCGCTGGTATTTTGTTTGTACATAACAGGACA
CCTCGA*AAAGTATTCGATGAAGAACACCGCAAAGAGATGCTTCGACATGTCTATTGTCA
TCAGAACGAAGATGGTGGATGGGGACTACACATCGAAGGTAGGAGCATTATGTTCTGCAC
CGCGCTGAATTACATTTGCTTGCGTATGCTCGGAGAAGGTCCCAATGGAGGACGAGAGAA
CGCGTGTAAACGGGCAAGACAGTGGATTCTTGACCGTGGTGGTGTCACTTATGTTCCTTC
ATGGGGGAAAATATGGCTATCGATACTTGGAATCTATGATTGGT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2D590TF 750 0 0
G
GGATTCTTGACCGTGGTGGTGTCACTTATGTTCCTTCATGGGGGAAAATATGGCTATCGA
TACTTGGAATCTATGATTGGTCAGGAACCAATCCGATGCCTCCTGAGATCTGGTTGCTAC
CTTCCTGTCTTCCAATACACTTAGCGAAAACTTTGTGCTATTGCCGGATGGTTTACATGC
CGATGTCGTATCTATATGGGAAGAGGTTTGTTGGTCCTATAACACCTCTTATTCTGCAAC
TGCGTGACGAACTCCATTTGCAACCTTACGAAGAAATCAACTGGAATAAAACACGGCGGC
TATACGCAAAGGAGGACATGTATTTTCCACATCCTTTGGTTCAAGATTTGGTGTGGGATG
CTCTTTACGTTCTCGTGGAGCCGGTCCTTACCCGTTGGCCGTTAAACAAGCTTGTGAGGG
AAAAAGCTCTTCGGCTGGCGATGAAACACATACATTACGAAGACGAGAATAGCCATTATA
TCACCATCGGTTGTGTTGAGAAGGTATTGTGCATGCTTGCATGTTGGATTGAAAACCCGA
ATGGGGACTACTTCAAGAAGCATCTTGCTAGAATTCCAGATTACATGTGGGTCGCCGAAG
ATGGAATGAAAATGCGGAGCTTTGGAAGTCAACTATGGGATACTGGGTTTGCGGTTCAAG
CTATACTTGCTAGTGATCTCTTTGATGAAACTGGCAGTGTATTAAAGAAAGGACATGATT
ATATTAAGAATCTCAGTTAGAGAAACCCT

QA 2 750 2 750
DS 



AS 1 3

CO CL3038Contig1 996 3 6 U
GGGATCCTTTCGAGTTTCGACAAAAAGGAAGACTTTAATAAGAGCTAAGAAACACACAGA
CAGCGAAACCAGATCGGAAGCCATGGCGGATTTGGAAGATGTTCAGACCGTGGATCTCAT
GTCCGAACTCCTCCGCCGTCCCAAATGTTCACAGAAACCTGACAAACGCCTCATCTTCAT
AGGACCTCCAGGGTCAGGGAAAGGTACACAATCTCCAATAGTGAAGGATGAGTTTTGCTT
GTGTCATTTATCCACTGGAGATATGTTAAGAGCTGCTGTTGCTTCTAAGACCCCTCTTGG
TCTCAAGGCCAAAGAAGCTATGGACACGGGAGCGCTTGTCACTGATGAATTGGTTGTTGG
TATAATTGATGAAGCCATGAACAAGCCAAAATGTCAGAAAGGTTTTATCCTTGATGGGTT
TCCCAGGACTGTTGCTCAGGCTGAGAAGCTAGATGAGATGCTTAAGAAGCGTGGAACTGG
AATCGACAAAGTTCTAAACTTTGCTATCGATGACTCAGTCCTGGAGGAAAGAATAACCGG
GAGATGGATCCACCCATCTAGTGGCAGGAGTTACCACACCAAATTTGCGCCTCCCAAAAC
CCCTGGAGTTGATGATATTACCGGAGAGCCTCTGATCCAACGTAAAGATGATAATGCTGA
GGTTCTAAG*TCAAGACTTGCAGCTTTCCACACTCAAACTGAACCGGTGATCGACTACTA
CGCAAAGAAG*CCGTTCTTACAAACATCCACGCCGAGAAGGCTCCACAAGAAGTGACGTC
AGAGGTACAGAAAGCATTGTCCTGATGACGAAAGAAAGACTGCTCAAGGCAGTCCATCTC
CTCTTGAGTTAAAATCCATTCTTTTTCCTTTCTACAAGAGAGACACACTTCTATATATCT
TCTCTTCTGCGGAATGACGGTTTTTTTTCTAGTCTTTTGCGCCTTTTACGTTTTCGACTA
ACTTTAAACTTTGGGAGAATAATGTATGCTTCCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU38TF U 1
AF RR2H032TF U 213
AF RR2EU38JQ C 276
BS 1 743 RR2EU38TF
BS 744 744 RR2EU38JQ
BS 745 760 RR2EU38TF
BS 761 761 RR2EU38JQ
BS 762 780 RR2EU38TF
BS 781 996 RR2EU38JQ

RD RR2EU38TF 780 0 0
GGGATCCTTTCGAGTTTCGACAAAAAGGAAGACTTTAATAAGAGCTAAGAAACACACAGA
CAGCGAAACCAGATCGGAAGCCATGGCGGATTTGGAAGATGTTCAGACCGTGGATCTCAT
GTCCGAACTCCTCCGCCGTCCCAAATGTTCACAGAAACCTGACAAACGCCTCATCTTCAT
AGGACCTCCAGGGTCAGGGAAAGGTACACAATCTCCAATAGTGAAGGATGAGTTTTGCTT
GTGTCATTTATCCACTGGAGATATGTTAAGAGCTGCTGTTGCTTCTAAGACCCCTCTTGG
TCTCAAGGCCAAAGAAGCTATGGACACGGGAGCGCTTGTCACTGATGAATTGGTTGTTGG
TATAATTGATGAAGCCATGAACAAGCCAAAATGTCAGAAAGGTTTTATCCTTGATGGGTT
TCCCAGGACTGTTGCTCAGGCTGAGAAGCTAGATGAGATGCTTAAGAAGCGTGGAACTGG
AATCGACAAAGTTCTAAACTTTGCTATCGATGACTCAGTCCTGGAGGAAAGAATAACCGG
GAGATGGATCCACCCATCTAGTGGCAGGAGTTACCACACCAAATTTGCGCCTCCCAAAAC
CCCTGGAGTTGATGATATTACCGGAGAGCCTCTGATCCAACGTAAAGATGATAATGCTGA
GGTTCTAAG*TCAAGACTTGCAGCTTTCCACACTCAAACTGAACCGGTGATCGACTACTA
CGCAAAGAAG*CCGTTCTTACAA*CATCCACGCCGAGAAG*CTCCACAAGAAGTGACGTC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2H032TF 539 0 0
CTCCAATGGTGAAGGATGAGTTTTGCTTGTGTCATTTATCCACTGGAGATATGTTAAGAG
CTGCTGTTGCTTCTAAGACCCCTCTTGGTCTCAAGGCCAAAGAAGCTATGGACACGGGAG
CGCTTGTCACTGATGAATTGGTTGTTGGTATAATTGATGAAGCCATGAACAAGCCAAAAT
GTCAGAAAGGTTTTATCCTTGATGGGTTTCCCAGGACTGTTGCTCAGGCTGAGAAGCTAG
ATGAGATGCTTAAGAAGCGTGGAACTGGAATCGACAAAGTTCTAAACTCTGCTATCGATG
ACTCAGTCCTGGAGGAAAGAATAACCGGGAGATGGATCCACCCATCTAGTGGCAGGAGTT
ACCACACCAAATTTGCGCCTCCCAAACCCCCTGGAGTTGATGATATTACCGGAGAGCCTC
TGATCCAACGTAAAGATGATAATGCTGAG*TTCTAAG*TCAAGACTTGCAGCTTTCCACA
CTCAAACTGAACCGGTGATCGACTACTACGCAAAGAAG*CCGTTCTTACAA
CATCACGC

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2EU38JQ 721 0 0
CTGTTGCTTCTAAGACCCCTCTTGGTCTCAAGGCCAAAGAAGCTATGGACACGGGAGCGC
TTGTCACTGATGAATTGGTTGTTGGTATAATTGATGAAGCCATGAACAAGCCAAAATGTC
AGAAAGGTTTTATCCTTGATGGGTTTCCCAGGACTGTTGCTCAGGCTGAGAAGCTAGATG
AGATGCTTAAGAAGCGTGGAACTGGAATCGACAAAGTTCTAAACTTTGCTATCGATGACT
CAGTCCTGGAGGAAAGAATAACCGGGAGATGGATCCACCCATCTAGTGGCAGGAGTTACC
ACACCAAATTTGCGCCTCCCAAAACCCCTGGAGTTGATGATATTACCGGAGAGCCTCTGA
TCCAACGTAAAGATGATAATGCTGAGGTTCTAAGGTCAAGACTTGCAGCTTTCCACACTC
AAACTGAACCGGTGATCGACTACTACGCAAAGAAGGCCGTTCTTACAAACATCCACGCCG
AGAAGGCTCCACAAGAAGTGACGTCAGAGGTACAGAAAGCATTGTCCTGATGACGAAAGA
AAGACTGCTCAAGGCAGTCCATCTCCTCTTGAGTTAAAATCCATTCTTTTTCCTTTCTAC
AAGAGAGACACACTTCTATATATCTTCTCTTCTGCGGAATGACGGTTTTTTTTCTAGTCT
TTTGCGCCTTTTACGTTTTCGACTAACTTTAAACTTTGGGAGAATAATGTATGCTTCCGA
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL3039Contig1 822 2 2 U
GACCACAAAACTCCCACTAATCACATAGCCGCCGGCACTCCCAAAATGGCTTATCTCCGG
GGAGCAGCCGCCGCATTGATTATTATGTTCCAACTCTTGTCACTCTCAAACGCCCACAAC
ATAACCAAAATCTTGGCCAAAGACCCTGAGTTCTCCACATTCAACCACTACCTCTCAGCC
ACTCATCTCGCCGACGAGATCAACCGCCGCCAAACCATCACCGTCCTGGCCGTTGACAAC
GGAGCAATGAACTCAATCCTCTCCAAAGGCTACTCACTCTACACAATCCGCAACATCCTC
TCCCTCCACGTCCTCGTCGATTACTTCGGCGCCAAGAAGCTCCACCAGATCACAGACGGC
TCCACCTCCACCGCGTCCATGTTCCAGTCCACCGGATCCACCACCGGAACTTCCGGCTAC
GTCAACATCACCGACATCAAAGGCGGGAAAGTCGCTTTCGGCGTCCAGGACGACGACAGC
CAGCTCACGGCTCGCTACATCAAATCCGTCTTCGAGAAGGCTTACAACATCTCCGTCCTC
CACATCAGCCAAGTCTTGACCTCGCCGGAAGCCGAGGCTCCCACCGCGAGCCCCAGCGAC
CTCATCCTCACGGCCATTCTCGAGAAGCAAGGATGCAAGACCTTCTCCGACATGTTGAAA
TCCACCGGAGCCGACAAGACGTTTCAAGACACCGTCGACGGAGGGTTGACTGTATAAGAG
ATATATCATTAAGGGTTATTATTGTAATTAGTGTATCCCTAATCCCTTATGTATTCTGTA
TAAATACTGTAACAATACGTATCAATAAAGTATTCAGCCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ32TF U 1
AF RR2AQ32JQ C 191
BS 1 696 RR2AQ32TF
BS 697 822 RR2AQ32JQ

RD RR2AQ32TF 697 0 0
GACCACAAAACTCCCACTAATCACATAGCCGCCGGCACTCCCAAAATGGCTTATCTCCGG
GGAGCAGCCGCCGCATTGATTATTATGTTCCAACTCTTGTCACTCTCAAACGCCCACAAC
ATAACCAAAATCTTGGCCAAAGACCCTGAGTTCTCCACATTCAACCACTACCTCTCAGCC
ACTCATCTCGCCGACGAGATCAACCGCCGCCAAACCATCACCGTCCTGGCCGTTGACAAC
GGAGCAATGAACTCAATCCTCTCCAAAGGCTACTCACTCTACACAATCCGCAACATCCTC
TCCCTCCACGTCCTCGTCGATTACTTCGGCGCCAAGAAGCTCCACCAGATCACAGACGGC
TCCACCTCCACCGCGTCCATGTTCCAGTCCACCGGATCCACCACCGGAACTTCCGGCTAC
GTCAACATCACCGACATCAAAGGCGGGAAAGTCGCTTTCGGCGTCCAGGACGACGACAGC
CAGCTCACGGCTCGCTACATCAAATCCGTCTTCGAGAAGGCTTACAACATCTCCGTCCTC
CACATCAGCCAAGTCTTGACCTCGCCGGAAGCCGAGGCTCCCACCGCGAGCCCCAGCGAC
CTCATCCTCACGGCCATTCTCGAGAAGCAAGGATGCAAGACCTTCTCCGACATGTTGAAA
TCCACCGGAGCCGACAAGACGTTTCAAGACACCGTC
G

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2AQ32JQ 632 0 0
CCGACGAGATCAACCGCCGCCAAACCATCACCGTCCTGGCCGTTGACAACGGAGCAATGA
ACTCAATCCTCTCCAAAGGCTACTCACTTTACACAATCCGCAACATCCTCTCCCTCCACG
TCCTCGTCGATTACTTCGGCGCCAAGAAGCTCCACCAGATCACAGACGGCTCCACCTCCA
CCGCGTCCATGTTCCAGTCCACCGGATCCACCACCGGAACTTCCGGCTACGTCAACATCA
CCGACATCAAAGGCGGGAAAGTCGCTTTCGGCGTCCAGGACGACGACAGCCAGCTCACGG
CTCGCTACATCAAATCCGTTTTCGAGAAGGCTTACAACATTTCCGTCCTCCACATCAGCC
AAGTTTTGACCTCGCCGGAAGCCGAGGCTCCCACCGCGAGCCCCAGCGACCTCATCCTCA
CGGCCATTCTCGAGAAGCAAGGATGCAAGACCTTTTCCGACATGTTGAAATCCACCGGAG
CCGACAAGACGTTTCAAGACACCGTCGACGGAGGGTTGACTGTATAAGAGATATATCATT
AAGGGTTATTATTGTAATTAGTGTATCCCTAATCCCTTATGTATTCTGTATAAATACTGT
AACAATACGTATCAATAAAGTATTCAGCCTCT

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 3

CO CL3040Contig1 741 3 4 U
GGACTGTTCTCTAATCTAATCCAATTTCACCTTTCCTACAAAACCCAAAAACCTTTTTTC
TTATTACACAACCTAAAAGTCCCTAAGTTTCTGAAAATGTCGGAAGAGTTCGACGAATCT
GAGATCATTTTCTCCGACAACTTCTTCCCGATTCGCCGGCGCGAGGACGTGATCGAGAAA
GAGAATCGTCCGGCTAATTTCCGAGAAAACTCCGAAGGCAGAATGAGAAACACATCGAGG
CTGAGTAAAACGACGCCGTTGCCTTCTTCACCGGCGGCTTTCTCATCGTCGCTTCCGGTG
AATATTCCGGGAAGGAAGTTTTCTGAGGATGAGGAGTATTCGGAGGAAGACGGAGGAAGG
AGAATGGTTCCGCCGCATCTGATCGTTGGACGGAGAATCGAA*GAGGTCAAATGGCGTTC
TCCGTTTGTACCGGTCACGGAAGGACTCTTAAAGGCCGAGATCTGTGCCGGGTTCGTAAT
TCGGTTCTCAGGTTAACCGGTTTTTTGGAGGCTTGAATACGGACCGGTTTTTGATTTACA
AAAAAATTCTGTCTTCCAATTTTTTTTATTTACCGGAAGAAATTCAGTTGTCTGATATTG
GTGTTAGTTTAATCACTTGAATGAATGTCAAAAGGAAAATGTCAAAAAGAACATTTATTT
CTTTGTTTATTTATATGAATTCTTAGTTTTGATTTCTCTCAAATGTAACAGAAAAATAAT
TGAAGTTACTTTTTTTTGATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH15TF U 1
AF RR2DG40TF U 1
AF RR2AH15JQ C 135
BS 1 96 RR2AH15TF
BS 97 97 RR2DG40TF
BS 98 696 RR2AH15TF
BS 697 741 RR2AH15JQ

RD RR2AH15TF 705 0 0
GGACTGTTCTCTAATCTAATCCAATTTCACCTTTCCTACAAAACCCAAAAACCTTTTTTC
TTATTACACAACCTAAAAGTCCCTAAGTTTCTGAAA*TGTCGGAAGAGTTCGACGAATCT
GAGATCATTTTCTCCGACAACTTCTTCCCGATTCGCCGGCGCGAGGACGTGATCGAGAAA
GAGAATCGTCCGGCTAATTTCCGAGAAAACTCCGAAGGCAGAATGAGAAACACATCGAGG
CTGAGTAAAACGACGCCGTTGCCTTCTTCACCGGCGGCTTTCTCATCGTCGCTTCCGGTG
AATATTCCGGGAAGGAAGTTTTCTGAGGATGAGGAGTATTCGGAGGAAGACGGAGGAAGG
AGAATGGTTCCGCCGCATCTGATCGTTGGACGGAGAATCGAA*GAGGTCAAATGGCGTTC
TCCGTTTGTACCGGTCACGGAAGGACTCTTAAAGGCCGAGATCTGTGCCGGGTTCGTAAT
TCGGTTCTCAGGTTAACCGGTTTTTTGGAGGCTTGAATACGGACCGGTTTTTGATTTACA
AAAAAATTCTGTCTTCCAATTTTTTTTATTTACCGGAAGAAATTCAGTTGTCTGATATTG
GTGTTAGTTTAATCACTTGAATGAATGTCAAAAGGAAAATGTCAAAAAGAACATTTATTT
CTTTGTTTATTTATATGAATTCTTAGTTTTGATTTC
TCTCAAATG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2DG40TF 701 0 0
GGACTGTTCTCTAATCTAATCCAATTTCACCTTTCCTACAAAACCCAAAAACCTTTTTTC
TTATTACACAACCTAAAAGTCCCTAAGTTTCTGAAAATGTCGGAAGAGTTCGACGAATCT
GAGATCATTTTCTCCGACAACTTCTTCCCGATTCGCCGGCGCGAGGACGTGATCGAGAAA
GAGAATCGTCCGGTTAATTTCCGAGAAAACTCCGAAGGCAGAATGAGAAACACATCGAGG
CTGAGTAAAACGACGCCGTTGCCTTCTTCACCGGCGGCTTTCTCATCGTCGCTTCCGGTG
AATATTCCGGGAAGGAAGTTTTCTGAGGATGAGGAGTATTCGGAGGAAGACGGAGGAAGG
AGAATGGTTCCGCCGCATCTGATCGTTGGACGGAGAATCGAAAGAGGTCAAATGGCGTTC
TCCGTTTGTACCGGTCACGGAAGGACTCTTAAAGGCCGAGATCTGTGCCGGGTTCGTAAT
TCGGTTCTCAGGTTAACCGGTTTTTTGGAGGCTTGAATACGGACCGGTTTTTGATTTACA
AAAAAATTCTGTCTTCCAATTTTTTTTATTTACCGGAAGAAATTCAGTTGTCTGATATTG
GTGTTAGTTTAATCACTTGAATGAATGTCAAAAGGAAAATGTCAAAAAGAACATTTATTT
CTTTGTTTATTTATATGAATTCTTAGTTTTGATTTC
AAAAA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2AH15JQ 607 0 0
CGACAACTTCTTCCCGATTCGCCGGCGCGAGGACGTGATCGAGAAAGAGAATCGTCCGGC
TAATTTCCGAGAAAACTCCGAAGGCAGAATGAGAAACACATCGAGGCTGAGTAAAACGAC
GCCGTTGCCTTCTTCACCGGCGGCTTTCTCATCGTCGCTTCCGGTGAATATTCCGGGAAG
GAAGTTTTCTGAGGATGAGGAGTATTCGGAGGAAGACGGAGGAAGGAGAATGGTTCCGCC
GCATCTGATCGTTGGACGGAGAATCGAA*GAGGTCAAATGGCGTTCTCCGTTTGTACCGG
TCACGGAAGGACTCTTAAAGGCCGAGATCTGTGCCGGGTTCGTAATTCGGTTTTCAGGTT
AACCGGTTTTTTGGAGGCTTGAATACGGACCGGTTTTTGATTTACAAAAAAATTCTGTCT
TCCAATTTTTTTTATTTACCGGAAGAAATTCAGTTGTCTGATATTGGTGTTAGTTTAATC
ACTTGAATGAATGTCAAAAGGAAAAAGTCAAAAAGAACATTTATTTCTTTGTTTATTTAT
ATGAATTCTTAGTTTTGATTTCTCTCAAATGTAACAGAAAAATAATTGAAGTTACTTTTT
TTTGATC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL3041Contig1 883 2 4 U
GAAGGATGGCTTCCTCATCTGTTTGTGGGGAACTTGCTTAAAGGACAGACTGTGGGAGTG
ATTGGAGCTGGACGTATTGGTTCTGCTTATGCTAGAATGATGGTTGAAGGGTTTAAGATG
AATTTGATCTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAGAAGTTTGTGACAGCTTAT
GGACAATTCTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGACATGGAAACGAGCTTCTTCCATG
GAGGAGGTGTTAAGAGAGGCTGATCTGATAAGTCTTCACCCTGTGTTGGACAAAACCACT
TACCATCTTGTCAACAAGGAGAGGCTTGCAATGATGAAAAAGGAAGCAATCCTTGTGAAC
TGCAGTAGAGGTCCTGTGATCGATGAGGTAGCTCTGGTCAATCATCTGAGAGAGAACCCG
ATGTTTCGAGTTGGTCTTGATGTGTTCGAGGAAGAGCCTTTCATGAAACCAGGGCTTGCT
GATATGAAGAATCCCATTGTTGTTCCTCACATTGCTTCTGCTTCCAAGTGGACTCGTGAA
GGAATGGCTACGCTTGCAGCACTCAACTTCCTCGGAAGGGTCAAAGGATATCCAATTTGG
AGTGACCCTAACCGGGTCGACCCGTTCTTGAATGAAAACGCTTCACCACCCAATGCTAGC
CCAAGCATTGTGAACTCAAAAGCCTTAGGATTGCCTGTTTCGAAACTATGAGTTCAAAGA
ACGGGAGATAAGGAAGAATCATGTTAATATATGTATCTGATGGTCTCAAGTTGTGTTCAT
GTAATGTATTACAACAACCATGTTGGATCATTAAAAAAACACACGTTATAAGTGGTGTTA
AGTTTGCTGAGTCTTGTACCCATCATGCTCTTCACATCATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C932TF U 1
AF RR2C932JQ C 46
BS 1 680 RR2C932TF
BS 681 681 RR2C932JQ
BS 682 715 RR2C932TF
BS 716 883 RR2C932JQ

RD RR2C932TF 715 0 0
GAAGGATGGCTTCCTCATCTGTTTGTGGGGAACTTGCTTAAAGGACAGACTGTGGGAGTG
ATTGGAGCTGGACGTATTGGTTCTGCTTATGCTAGAATGATGGTTGAAGGGTTTAAGATG
AATTTGATCTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAGAAGTTTGTGACAGCTTAT
GGACAATTCTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGACATGGAAACGAGCTTCTTCCATG
GAGGAGGTGTTAAGAGAGGCTGATCTGATAAGTCTTCACCCTGTGTTGGACAAAACCACT
TACCATCTTGTCAACAAGGAGAGGCTTGCAATGATGAAAAAGGAAGCAATCCTTGTGAAC
TGCAGTAGAGGTCCTGTGATCGATGAGGTAGCTCTGGTCAATCATCTGAGAGAGAACCCG
ATGTTTCGAGTTGGTCTTGATGTGTTCGAGGAAGAGCCTTTCATGAAACCAGGGCTTGCT
GATATGAAGAATCCCATTGTTGTTCCTCACATTGCTTCTGCTTCCAAGTGGACTCGTGAA
GGAATGGCTACGCTTGCAGCACTCAACTTCCTCGGAAGGGTCAAAGGATATCCAATTTGG
AGTGACCCTAACCGGGTCGACCCGTTCTTGAATGAAAACGCTTCACCACCCAATGCTAGC
CCAAGCATTGTGAACTCAAA*GCCTTAGGATTGCCTGTTTCGAAACTATGAGTTC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2C932JQ 838 0 0
CAGACTGTGGGAGTGAT*GGAGCTGGACGTATTGGTTCTGCTTATGCTAGAATGATGGTT
GAAGGGTTTAAGATGAATTTGATCTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAGAAG
TTTGTGACAGCTTATGGACAATTCTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGACATGGAAA
CGAGCTTCTTCCATGGAGGAGGTGTTAAGAGAGGCTGATCTGATAAGTCTTCACCCTGTG
TTGGACAAAACCACTTACCATCTTGTCAACAAGGAGAGGCTTGCAATGATGAAAAAGGAA
GCAATCCTTGTGAACTGCAGTAGAGGTCCTGTGATCGATGAGGTAGCTCTGGTCAATCAT
CTGAGAGAGAACCCGATGTTTCGAGTTGGTCTTGATGTGTTCGAGGAAGAGCCTTTCATG
AAACCAGGGCTTGCTGATATGAAGAATCCCATTGTTGTTCCTCACATTGCTTCTGCTTCC
AAGTGGACTCGTGAAGGAATGGCTACGCTTGCAGCACTCAACTTCCTCGGAAGGGTCAAA
GGATATCCAATTTGGAGTGACCCTAACCGGGTCGACCCGTTCTTGAATGAAAACGCTTCA
CCACCCAATGCTAGCCCAAGCATTGTGAACTCAAAAGCCTTAGGATTGCCTGTTTCGAAA
CTATGAGTTCAAAGAACGGGAGATAAGGAAGAATCATGTTAATATATGTATCTGATGGTC
TCAAGTTGTGTTCATGTAATGTATTACAACAACCATGTTGGATCATTAAAAAAACACACG
TTATAAGTGGTGTTAAGTTTGCTGAGTCTTGTACCCATCATGCTCTTCACATCATGTG

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 2

CO CL3042Contig1 825 2 18 U
GGGAAGAATAACACGGATCTTAATATACTAATGAAGGTAATTCTGTTGGTTAATCAAAAA
GTATCTACCAGTTTGATCGTCTATTGCACCTTTAGAATTGGACACATACGAGTGTTCCTC
ACTAGTCTCATCAAAATTTACCCTTTTATATAAGACACTGATACATCTAGAAGCCAAAGA
AGCCGAGCTCGCTCGCTTTTTCCTTCTCAAAGGTTTCGAAATACTGATATATGATTGTCA
CAGCTAGCAAGATTCCAGTCCCCGACCCAATGGCTCCCATGAAATCAGCCAAAACAGTGA
GTGCACCGATGCAAACTCCTCCAAAAGCAGCTGCGGTCGGAATATAACGGTTCAGCTCCT
TCTGCAAGTTCGACTCTCTGTGTCCCGGCATCACCATTTGTTGTTCCTTGAGCTGCTTAG
CTACATCTCTAGCAGAAGACCCGGAGACTTCAATCCAAGTCTTTGAGAAGAGGGCACAAG
CGGTGAGCATGAAGACGATATAGAACAGAGCATGGAACGGATGAGCTGCCATCTCGGCAA
AGCTTGCTGGAGCTGTGATTAAGTAAGCAAGACCACTAACTGGTATAGACTGTCCACTGT
ACTCTGATTCTTTCCACTGTCCCAATAGGTTCACAAAGAAATTTCCACTAAACTTCCTGT
ACAGTAGCTGAGAGATGAAGTAGAGATTTGAGACGAGAGCAGACTGGAGAATGATCGGCA
TGTTGGAGGTGTAGAACAGTTTGATAGGGTAAGAACCCTGTTGGCCACGGACACTCTTTG
ACCTCACGGGTAACACAACACGGAACCCTTGGAAGTAGATAACGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB37JQ U 1
AF RR2CH15JQ U 52
BS 1 129 RR2AB37JQ
BS 130 130 RR2CH15JQ
BS 131 166 RR2AB37JQ
BS 167 167 RR2CH15JQ
BS 168 517 RR2AB37JQ
BS 518 518 RR2CH15JQ
BS 519 538 RR2AB37JQ
BS 539 539 RR2CH15JQ
BS 540 589 RR2AB37JQ
BS 590 590 RR2CH15JQ
BS 591 649 RR2AB37JQ
BS 650 650 RR2CH15JQ
BS 651 661 RR2AB37JQ
BS 662 662 RR2CH15JQ
BS 663 685 RR2AB37JQ
BS 686 686 RR2CH15JQ
BS 687 720 RR2AB37JQ
BS 721 825 RR2CH15JQ

RD RR2AB37JQ 724 0 0
GGGAAGAATAACACGGATCTTAATATACTAATGAAGGTAATTCTGTTGGTTAATCAAAAA
GTATCTACCAGTTTGATCGTCTATTGCACCTTTAGAATTGGACACATACGAGTGTTCCTC
ACTAGTCTCCTCAAAATTTACCCTTTTATATAAGACACTGATACATTTAGAAGCCAAAGA
AGCCGAGCTCGCTCGCTTTTTCCTTCTCAAAGGTTTCGAAATACTGATATATGATTGTCA
CAGCTAGCAAGATTCCAGTCCCCGACCCAATGGCTCCCATGAAATCAGCCAAAACAGTGA
GTGCACCGATGCAAACTCCTCCAAAAGCAGCTGCGGTCGGAATATAACGGTTCAGCTCCT
TCTGCAAGTTCGACTCTCTGTGTCCCGGCATCACCATTTGTTGTTCCTTGAGCTGCTTAG
CTACATCTCTAGCAGAAGACCCGGAGACTTCAATCCAAGTCTTTGAGAAGAGGGCACAAG
CGGTGAGCATGAAGACGATATAGAACAGAGCATGGAATGGATGAGCTGCCATCTCGGCGA
AGCTTGCTGGAGCTGTGATTAAGTAAGCAAGACCACTAACTGGTATAGATTGTCCACTGT
ACTCTGATTCTTTCCACTGTCCCAATAGGTTCACAAAGAAATTTCCACTGAACTTCCTGT
AGAGTAGCTGAGAGATGAAGTAGAGGTTTGAGACGAGAGCAGACTGGAGAATGATCGGCA
TGTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2CH15JQ 774 0 0
AATCAAAAAGTATCTACCAGTTTGATCGTCTATTGCACCTTTAGACTTGGACACATACGA
GTGTTCCTCACTAGTCTCATCAAAATTTACCCTTTTATATAAGACACTGATACATCTAGA
AGCCAAAGAAGCCGAGCTCGCTCGCTTTTTCCTTCTCAAAGGTTTCGAAATACTGATATA
TGATTGTCACAGCTAGCAAGATTCCAGTCCCCGACCCAATGGCTCCCATGAAATCAGCCA
AAACAGTGAGTGCACCTATGCAAACTCCTCCAAAAGCAGCTGCGGTCGGGATATAACGGT
TCAGCTCCTTCTGCAAGTTCGACTCTCTGTGTCCCGGCATCACCATTTGTTGTTCCTTGA
GCTGCTTAGCTACATCTCTAGCAGAAGACCCGGAGACTTCAATCCAAGTCTTTGAGAAGA
GGGCACAAGCGGTGAGCATGAAGACGATATAGAACAGAGCATGGAACGGATGGGCTGCCA
TCTCGGCAAAGCTTGCTGGAGCTGTGATTAAGTAAGCAAGACCACTAACTGGTATAGACT
GTCCACTGTACTCTGATTCTTTCCACTGTCCCAATAGGTTCACAAAGAAATTTCCACTAA
ACTTCCTGTACAGTAGCTGAGAGATGAAGTAGAGATTTGAGACGAGAGCAGACTGGAGAA
TGATCGGCATGTTGGAGGTGTAGAACAGTTTGATAGGGTAAGAACCCTGTTGGCCACGGA
CACTCTTTGACCTCACGGGTAACACAACACGGAACCCTTGGAAGTAGATAACGA

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 3

CO CL3043Contig1 719 3 3 U
GGATATCACGAAAAAAAAAAAAATGACTGAGGAGAACCCAGAAGAAGACCATGAATCTCC
TGAAGGAGCCGAAACAAATCCAGAAAACCCTTCTTTGAAGAACAACTGCATCAACAATAA
AGAACAAGACCGGTTTCTTCCAATTGCTAATGTCGGAAGGATCATGAAAAAGGTTCTTCC
CGGTAACGGTAAGATCTCGAAAGATGCCAAAGAAACCGTTCAAGAATGTGTATCAGAATT
TATCAGCTTTGTTACTGGTGAAGCTTCTGATAAGTGTCAAAGAGAGAAAAGGAAAACCAT
CAATGGAGATGATATCATTTGGGCCATTACAACTCTTGGTTTCGAAGACTATGTGGCTCC
ATTAAAGATCTATCTCGGGAAATACCGAGAAACTGAAGGAGAGAAAGTCAATAGCCCAAA
ACAAAGACATCAACAACAACAACCGCAGGATAATCATCATTTCCAGTTTCAAGAACAAGA
CCATAACAACTTTTCATGTACTAGTTACATCTCTCATCATCAACCTTCTCCATTTTTGCC
CGTAGATCATCAACCTTTTCCAAATCTCCCTTTCTCTCCTAAATCATTGCAAACACAGTT
CCCGCAACAGCATGATAACACTGATTCCATTGGACAGTGGTCAGTGTAAAACTTTTTTTT
T*TAAATTCCTTTTTTTTGTTTTATATTATTATATTTTATTGTTTCCGGTACAAAACAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA33TF U 1
AF RR2BA33JQ C 92
AF RR2HB83TF U 6
BS 1 21 RR2BA33TF
BS 22 22 RR2HB83TF
BS 23 719 RR2BA33TF

RD RR2BA33TF 719 0 0
GGATATCACGAAAAAAAAAAAGATGACTGAGGAGAACCCAGAAGAAGACCATGAATCTCC
TGAAGGAGCCGAAACAAATCCAGAAAACCCTTCTTTGAAGAACAACTGCATCAACAATAA
AGAACAAGACCGGTTTCTTCCAATTGCTAATGTCGGAAGGATCATGAAAAAGGTTCTTCC
CGGTAACGGTAAGATCTCGAAAGATGCCAAAGAAACCGTTCAAGAATGTGTATCAGAATT
TATCAGCTTTGTTACTGGTGAAGCTTCTGATAAGTGTCAAAGAGAGAAAAGGAAAACCAT
CAATGGAGATGATATCATTTGGGCCATTACAACTCTTGGTTTCGAAGACTATGTGGCTCC
ATTAAAGATCTATCTCGGGAAATACCGAGAAACTGAAGGAGAGAAAGTCAATAGCCCAAA
ACAAAGACATCAACAACAACAACCGCAGGATAATCATCATTTCCAGTTTCAAGAACAAGA
CCATAACAACTTTTCATGTACTAGTTACATCTCTCATCATCAACCTTCTCCATTTTTGCC
CGTAGATCATCAACCTTTTCCAAATCTCCCTTTCTCTCCTAAATCATTGCAAACACAGTT
CCCGCAACAGCATGATAACACTGATTCCATTGGACAGTGGTCAGTGTAAAACTTTTTTTT
T*TAAATTCCTTTTTTTTGTTTTATATTATTATATTTTATTGTTTCCGGTACAAAACAA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2BA33JQ 621 0 0
TCTTTGAAGAACAACTGCATCAACAATAAAGAACAAGACCGGTTTCTTCCAATTGCTAAT
GTCGGAAGGATCATGAAAAAGGTTCTTCCCGGTAACGGTAAGATCTCGAAAGATGCCAAA
GAAACCGTTCAAGAATGTGTATCAGAATTTATCAGCTTTGTTACTGGTGAAGCTTCTGAT
AAGTGTCAAAGAGAGAAAAGGAAAACCATCAATGGAGATGATATCATTTGGGCCATTACA
ACTCTTGGTTTCGAAGACTATGTGGCTCCATTAAAGATCTATCTCGGGAAATACCGAGAA
ACTGAAGGAGAGAAAGTCAATAGCCCAAAACAAAGACATCAACAACAACAACCGCAGGAT
AATCATCATTTCCAGTTTCAAGAACAAGACCATAACAACTTTTCATGTACTAGTTACATC
TCTCATCATCAACCTTCTCCATTTTTGCCCGTAGATCATCAACCTTTTCCAAATCTCCCT
TTCTCTCCTAAATCATTGCAAACACAGTTCCCGCAACAGCATGATAACACTGATTCCATT
GGACAGTGGTCAGTGTAAAACTTTTTTTTT*TAAATTCCTTTTTTT*GTTTTATATTATT
ATATTTTATTGTTTCCGGTAC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2HB83TF 674 0 0
GGATCACG
AAAAAAAAAATGACTGAGGAGGACCCAGAAGAAGACCATGAATCTCCTGAAGGAGCCGAA
ACAAATCCAGAAAACCCTTCTTTGAAGAACAACAGCATCAACAATAAAGAACAAGACCGG
TTTCTTCCAATTGCTAATGTCGGAAGGATCATGAAAAAGGTTCTTCCCGGTAACGGTAAG
ATCTCGAAAGATGCCAAAGAAACCGTTCAAGAATGTGTATCAGAATTTATCAGCTTTGTT
ACTGGTGAAGCTTCTGATAAGTGTCAAAGAGAGAAAAGGAAAACCATCAATGGAGATGAT
ATCATTTGGGCCATTACCACTCTTGGTTTCGAAGACTATGTGGCTCCATTAAAGATCTAT
CTCGGGAAATACCGAGAAACTGAAGGAGAGAAAGTCAATAGCCCAAAACAAAGACATCAA
CAACAACAACCGCAGGATAATCATCATTTCCAGTTTCAAGAACAAGACCATAACAACTTT
TCATGTACTAGTTACATCTCTCATCATCAACCTTCTCCATTTTTACCCGCAGATCACCAA
CCTTTTCCAAATCTCCCTTTCTCTCCTAAATCATTGCAAACACAGTTCCCGCAACAGCAT
GATAACACTGATTCCATTGGACAGTGGTCAGTGTAAAACTTTTTCTTTATAAATTCCTTT
TTTT
GT

QA 9 672 9 672
DS 



AS 1 3

CO CL3044Contig1 643 3 4 U
GAGGAAAGAGTGCTCTTTGATATGGTTCAAGGCTCTTTCACATTAAAAGAGTGACATCGA
AAACTCTCAAAGGCAAGACAAAAGGTAAAGGTAAGAAGCATCATCAGATCCCAGAGTTAC
ACTATCAAAACAAGAGATGCAAACAAACATCTTTACATGTCTGTGTATGCTGTTTCGCAA
GAGAGAGCGAGACACACGCACACATATATATATATATAGAGAGACATATGTGGAAACGTG
TAAAGCTAAAATCAATGCATTGGATGCCTCGGTGATCTGGGACGAACAGGTGTCTTCCAA
GGACTCACCCTTATCGGTAAAGAACCTAAAACAACTCCACTGCAGTTGAAAGCTGCTATC
GCGCTTTCTGCCATCACGAACTCTACAAAAGCAATACGAGTTGAGTGTTGATAATCTCCA
AGTAGCCTCAGACGGAAAACCTCTCCACAGAATGATTCAAAAAAGATCTTCACGTCTGAT
TGAGTCACCTTCTTGTCAATGTTAGTGCAATAGATAGTTCTTGCACACATCTCTCGCTCA
TCTTCAGTCCTGGGCAAGAAAGTAGGGTTAACAGGTGCAATAGCTGTTTTAGATGGCAGG
ACTTTCACAGGATAGAATCCCAACATAGTCCCGGATAGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G304JQ U 1
AF RR2E653JQ U 38
AF RR2E653TF C 436
BS 1 216 RR2G304JQ
BS 217 218 RR2E653JQ
BS 219 404 RR2G304JQ
BS 405 643 RR2E653JQ

RD RR2G304JQ 404 0 0
GAGGAAAGAGTGCTCTTTGATATGGTTCAAGGCTCTTTCACATTAAAAGAGTGACATCGA
AAACTCTCAAAGGCAAGACAAAAGGTAAAGGTAAGAAGCATCATCAGATCCCAGAGTTAC
ACTATCAAAACAAGAGATGCAAACAAACATCTTTACATGTCTGTGTATGCTGTTTCGCAA
GAGAGAGCGAGACACACGCACACATATATATATATA**GAGAGACATATGTGGAAACGTG
TAAAGCTAAAATCAATGCATTGGATGCCTCGGTGATCTGGGACGAACAGGTGTCTTCCAA
GGACTCACCCTTATCGGTAAAGAACCTAAAACAACTCCACTGCAGTTGAAAGCTGCTATC
GCGCTTTCTGCCATCACGAACTCTACAAAAGCAATACGAGTTGA

QA 1 404 1 404
DS 

RD RR2E653JQ 606 0 0
TCACATTAAAAGAGTGACATCGAAAACTCTCAAAGGCAAGACAAAAGGTAAAGGTAAGAA
GCATCATCAGATCCCAGAGTTACACTCTCAAAACAAGAGATGCAAACAAACATCTTTACA
TGTCTGTGTATGCTGTTTCGCAAGAGAGAGCGAGACACACGCACACATATATATATATAT
AGAGAGACATATGTGGAAACGTGTAAAGCTAAGATCAATGCATTGGATGCCTCGGTGATC
TGGGACGAACAGGTGTCTTCGAAGGACTCACCCTTATCGGTAAAGAACCTAGAACAACTC
CACTGCAGTTGAGAGCTGCTATCGCGCTTTCTGCCATCACGAACTCTACAAAAGCAATAC
GAGTTGAGTGTTGATAATCTCCAAGTAGCCTCAGACGGAAAACCTCTCCACAGAATGATT
CAAAAAAGATCTTCACGTCTGATTGAGTCACCTTCTTGTCAATGTTAGTGCAATAGATAG
TTCTTGCACACATCTCTCGCTCATCTTCAGTCCTGGGCAAGAAAGTAGGGTTAACAGGTG
CAATAGCTGTTTTAGATGGCAGGACTTTCACAGGATAGAATCCCAACATAGTCCCGGATA
GATTCC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2E653TF 208 0 0
G
AAACCTCTCCACAGAATGATTCAAAAAAGATCTTCACGTCTGATTGAGTCACCTTCTTGT
CAATGTTAGTGCAATAGATAGTTCTTGCACACATCTCTCGCTCATCTTCAGTCCTGGGCA
AGAAAGTAGGGTTAACAGGTGCAATAGCTGTTTTAGATGGCAGGACTTTCACAGGATAGA
ATCCCAACATAGTCCCGGATAGATTCC

QA 2 208 2 208
DS 



AS 1 3

CO CL3045Contig1 739 3 7 U
CCACTCGGATCAACCCGCCGACTTGGCTTCTTATATTTAAAGTGATTCGTGTATCGACTC
CAATGATACTATAGTTCTGGACCATTATGGCGGAGGATTCGGGTAAAATATGCACTTCCT
CAGGAATGAAAAAAAAAGCGATCTACTTTCATTTCGTATTTTGTCTTAAATTTTTGGACT
CCTCGATACTCCATCATATCCTCTTTTTGGACGATTGAGTCCGCCTTTAGAGTTCCATAT
TTAAGAATTCCGGAACTCTTTCTTCTGTATCTAGGATCATCAAAAAAAGCAAAAATACTG
TTTCTACGGAAAATACCATTTATGGGTATTTCAATCGAGATACCTGAATGTGGTATGAAC
TCTTTCGCTTGCTCTTGAATCGATTGGAATGGAATGAGAAATCTATTTCTTCGCCTTTTT
GCTAATAAATCCAAATTCTCATGAAAAATAGCAGAATATATGAAATTATAATGACTAGTA
CCTACGATTCCATTCAATTCTGAATAATTGGGAATCCCAGATTTTTTTTATCAGAAAAAT
CTGAACTGAAAAATTTTTGGCTCACTTGATCATTATTCACCGAGAGGCTAGAAATAGATT
TTCTTTCGACGGAAAGAAAGGGTATGTTCATTTGATCTTGATCTTTGTGGATCGAAAAAA
GAATTAGACTAGATCCACGAGAACCTCCTGATAATATCCATAAATGACTTGTTTTTGGTA
AAAGATGGACATTACTATA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ58JQ U 1
AF RR2EZ58TF C 1
AF RR2CO25JQ U 1
BS 1 136 RR2CO25JQ
BS 137 137 RR2EZ58JQ
BS 138 191 RR2CO25JQ
BS 192 192 RR2EZ58JQ
BS 193 230 RR2CO25JQ
BS 231 231 RR2EZ58JQ
BS 232 739 RR2CO25JQ

RD RR2EZ58JQ 250 0 0
CCACTCGGATCAACCCGCCGACTTGGCTTCTTATATTTAAAGTGATTCGTGTATCGACTC
CAATGATACTATAGTTCTGGACCATTATGGCGGAGGATTCGGGTAAAATATGCACTTCCT
CAGGAATGAAAAAAAAAGCGATCTACTTTCATTTCGTATTTTGTCTTAAATTTTTGGACT
CCTCGATACTCCATCATATCCTCTTTTTGGACGATTGAGTCCGCCTTTAGAGTTCCATAT
TTAAGAATTC

QA 1 250 1 250
DS 

RD RR2EZ58TF 250 0 0
CCACTCGGATCAACCCGCCGACTTGGCTTCTTATATTTAAAGTGATTCGTGTATCGACTC
CAATGATACTATAGTTCTGGACCATTATGGCGGAGGATTCGGGTAAAATATGCACTTCCT
CAGGAATGAAAAAAAAAGCGATCTACTTTCATTTCGTATTTTGTCTTAAATTTTTGGACT
CCTCGATACTCCATCATATCCTCTTTTTGGACGATTGAGTCCGCCTTTAGAGTTCCATAT
TTAAGAATTC

QA 1 250 1 250
DS 

RD RR2CO25JQ 739 0 0
CCACTCGGATCAACCCGCCGACTTGGCTTCTTATATTTAAAGTGATTCGTGTATCGACTC
CAATGATACTATAGTTCTGGACCATTATGGCGGAGGATTCGGGTAAAATATGCACTTCCT
CAGGAATGAAAAAAAA*GCGATCTACTTTCATTTCGTATTTTGTCTTAAATTTTTGGACT
CCTCGATACTCAATCATATCCTCTTTTTGGACGATTGAGTCCGCCTTTAGTGTTCCATAT
TTAAGAATTCCGGAACTCTTTCTTCTGTATCTAGGATCATCAAAAAAAGCAAAAATACTG
TTTCTACGGAAAATACCATTTATGGGTATTTCAATCGAGATACCTGAATGTGGTATGAAC
TCTTTCGCTTGCTCTTGAATCGATTGGAATGGAATGAGAAATCTATTTCTTCGCCTTTTT
GCTAATAAATCCAAATTCTCATGAAAAATAGCAGAATATATGAAATTATAATGACTAGTA
CCTACGATTCCATTCAATTCTGAATAATTGGGAATCCCAGATTTTTTTTATCAGAAAAAT
CTGAACTGAAAAATTTTTGGCTCACTTGATCATTATTCACCGAGAGGCTAGAAATAGATT
TTCTTTCGACGGAAAGAAAGGGTATGTTCATTTGATCTTGATCTTTGTGGATCGAAAAAA
GAATTAGACTAGATCCACGAGAACCTCCTGATAATATCCATAAATGACTTGTTTTTGGTA
AAAGATGGACATTACTATA

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 3

CO CL3046Contig1 754 3 23 U
CGGCAGAGCATTAAAGACTAAGTTTATTTAATTTGAAAATATAAAATATTTTTT*ACATT
CTTATATACAGACATCTCATAACACTTTCACCATCAAAACCAAAATTTTAAGGACATACG
TATATAAGAATGTAAGAAACGTCTGAACCGAACCACACCAAACCAAATCAAAGCGAGTCC
CTGGGAGGCTGAGGATCAGGCAAGCCCTTAATAATGCCACAGCGGAAACCGTTTGCCGGA
AAGCTGTACTCATCCCTCTGGGATAATTCCGGTGGGCCAACATTAACATAAAGCTGTTGA
CCTAAGTAACGTTTCTCGAGAATCTCAGACCGAATATTCCACATGCCACAGTTGTCGAAA
GTCAACAAGATGGCTCCCCAACATTTTGGATAAACTTGGATTGTGTGTCGGTATACTGCG
TCTAACAGATTATAGTTCTTCCTCTTCGCAGGCGTCCACTTCCCTGGCTCAACCGCGACA
GCAAAGAAAGAGTATCCATCAAGATGCCAAGACTGTGCAGTCTTTTCGTGATTTTCGAAC
ACAATCTCCACGAATGAACGGTGCTCGATGTTCAAAACGTTCGGCTGCACCAAAATATTA
CTAGTGTCGATCGTGGTTGGCTCGTCCTTAATAGTGTCGTACTTGAACACCTTGTCGGCT
ACACCAAAATACTGAGCCAGCTTAATCGGCGTTTCCGGTTCCACGTGTGACACTCCGCTA
AGCGCGTACCTGAGCTTCTTTCCTCTGTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E981JQ U 1
AF RR2GO91JQ U 9
AF RR2BM52JQ U 23
BS 1 48 RR2E981JQ
BS 49 49 RR2GO91JQ
BS 50 57 RR2E981JQ
BS 58 58 RR2GO91JQ
BS 59 95 RR2E981JQ
BS 96 97 RR2GO91JQ
BS 98 149 RR2E981JQ
BS 150 150 RR2GO91JQ
BS 151 159 RR2E981JQ
BS 160 160 RR2GO91JQ
BS 161 209 RR2E981JQ
BS 210 210 RR2GO91JQ
BS 211 226 RR2E981JQ
BS 227 227 RR2GO91JQ
BS 228 272 RR2E981JQ
BS 273 273 RR2GO91JQ
BS 274 519 RR2E981JQ
BS 520 520 RR2GO91JQ
BS 521 617 RR2E981JQ
BS 618 618 RR2GO91JQ
BS 619 676 RR2E981JQ
BS 677 718 RR2GO91JQ
BS 719 754 RR2BM52JQ

RD RR2E981JQ 676 0 0
CGGCAGAGCATTAAAGACTAAGTTTATTTAATTTGAAAATATAAAATAATTTTT*ACTTT
CTTATATACAGACATCTCATAACACTTTCACCATCGTAACCAAAATTTTAAGGACATACG
TATATAAGAATGTAAGAAACGTCTGAACCCAACCACACCGAACCAAATCAAAGCGAGTCC
CTGGGAGGCTGAGGATCAGGCAAGCCCTTGATAATGCCACAGCGGAGACCGTTTGCCGGA
AAGCTGTACTCATCCCTCTGGGATAATTCCGGCGGGCCAACATTAACATAAAGCTGTTGA
CCTAAGTAACGTTTCTCGAGAATCTCAGACCGAATATTCCACATGCCACAGTTGTCGAAA
GTCAACAAGATGGCTCCCCAACATTTTGGATAAACTTGGATTGTGTGTCGGTATACTGCG
TCTAACAGATTATAGTTCTTCCTCTTCGCAGGCGTCCACTTCCCTGGCTCAACCGCGACA
GCAAAGAAAGAGTATCCATCAAGATGCCAAGACTGTGCAATCTTTTCGTGATTTTCGAAC
ACAATCTCCACGAATGAACGGTGCTCGATGTTCAAAACGTTCGGCTGCACCAAAATATTA
CTAGTGTCGATCGTGGTCGGCTCGTCCTTAATAGTGTCGTACTTGAACACCTTGTCGGCT
ACACCAAAATACTGAG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2GO91JQ 710 0 0
CATTGAAGACTAATTTTATTTAATTTGAAAATATAAAATATTTTTT*ACATTCTTATATA
CAGACATCTCATAACACTTTCACCATCAAAACCAAAATTTTAAGGACATACGTATATAAA
AATGTAAGAAACGTCTGAACCGAACCACACCAAACCAAATCAAAGCGAGTCCCTGGGAGG
CTGAGGATCAGGCAAGCCCTTAATAATGCCACAGCGGAAACCGTTTGCCGGAAAGCTGTA
CTCATCCCTCTGGGATAATTCCGATGGGCCAACATTAACATAAAGCTGTTGACCTAAGTA
ACGTTTCTCGAGAATCTCAAACCGAATATTCCACATGCCACAGTTGTCGAAAGTCAACAA
GATGGCTCCCCAACATTTTGGATAAACTTGGATTGTGTGTCGGTATACTGCGTCTAACAG
ATTATAGTTCTTCTTCTTCGCAGGCGTCCACTTCCCTGGCTCAACCGCGACAGCAAAGAA
AGAGTATCCATCAAGATGCCAAGACTGTGCAGTCTTTTCGCGATTTTCGAACACAATCTC
CACGAATGAACGGTGCTCGATGTTCAAAACGTTCGGCTGCACCAAAATATTACTAGTGCC
GATCGTGGTTGGCTCGTCCTTAATAGTGTCGTACTTGAACACCTTGTCGGCTACACCAAA
ATACTGAGCCAGCTTAATCGGCGTTTCCGGTTCCACGTGTGACACTCCGC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2BM52JQ 732 0 0
TTTATTTAATTTGAAAATATAAAATATTTTTTTACATTCTTATATACAGACATCTCATAA
CACTTTCACCATCAAAACCAAAATTTTAAGGACATACGTATATAAGAATGTAAGAAACGT
CTGAACCGAACCACACCAAACCAAATCAAAGCGAGTCCCTGGGAGGCTGAGGATCAGGCA
AGCCCTTAATAATGCCACAGCGGAAACCGTTTGCCGGAAAGCTGTACTCATCCCTCTGGG
ATAATTCCGGTGGGCCAACATTAACATAAAGCTGTTGACCTAAGTAACGTTTCTCGAGAA
TCTCAGACCGAATATTCCACATGCCACAGTTGTCGAAAGTCAACAAGATGGCTCCCCAAC
ATTTTGGATAAACTTGGATTGTGTGTCGGTATACTGCGTCTAACAGATTATAGTTCTTCC
TCTTCGCAGGCGTCCACTTCCCTGGCTCAACCGCGACAGCAAAGAAAGAGTATCCATCAA
GATGCCAAGACTGTGCAGTCTTTTCGTGATTTTCGAACACAATCTCCACGAATGAACGGT
GCTCGATGTTCAAAACGTTCGGCTGCACCAAAATATTACTAGTGTCGATCGTGGTTGGCT
CGTCCTTAATAGTGTCGTACTTGAACACCTTGTCGGCTACACCAAAATACTGAGCCAGCT
TAATCGGCGTTTCCGGTTCCACGTGTGACACTCCGCTAAGCGCGTACCTGAGCTTCTTTC
CTCTGTTTTCCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL3047Contig1 826 2 2 U
GGGGGGTCCAGAGAGAGAAAAAAGAGAGAGAAAAAGGATAAGTTGATTTGTGTTTCCGGC
CGACGGTGAGGCTCCTCCACCGTCGGTCCGGCTAGGGGTTTTCTTTTTGTGTCTTGCTCG
TTTGTTCTAGTGTTTGGCTTTAAATAACTCTGATCGAAATTCTAGTCTCTGTTGGATTTT
GTGCTCGGAGACGCACCATATCTACGGTGGTCGTCCCTATTGTCTCTGGGAAGTGGCGGC
TTGTTCAGCAGTCTACTTCGCCGGCTTAAGATTCCGGGAGACGGTGGCTTCTTTAGCATC
GTCATCGCCGGCCTTTCCTCGGGTTTATCCCGATCTATGTTGATTGTGGGATGGTTTGTC
TTGTGATGGAAGTGGTGGTTCGTGGTGGAACTGGTGGTTCGAGGTAGCGAATGAGATCTC
GTCGCTGACGATGGAAGCTCTCCGATGGATGGTGGTTCGTCCGTGTGTGAGGCCTTTTCT
TCTCTCTGTGTTAGTATTATTTAGAGTTTTGGATGAGATCTCGATTGGTGATTGATGCTC
TCCTAAACTCGGAACGAAGAAGATAAAAGCGTATGCCTTCAACAGGGGGTTCGATGGCTG
ATGTTTGGGATCTTTTCCCGGTAGGTTACTTCGTCCGATGAAGTCTAGATCGGAGAAGAA
GGTGAAGGATGGTTGTCGGCAAAGCAGTGGACGTTAGGTCAAATGTTGCTGTTTTGTTAT
TTGGGCTATGACCCATGTTTCTATTTTGGCCTGTGTCTTTGGGCTTTTGTCTGTAGTGTG
GGCTTAGCTCTTTTGGGCCTTGACCCACTTAATAAAATTCAGTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FI81TF U 1
AF RR2FI81JQ C 105
BS 1 559 RR2FI81TF
BS 560 826 RR2FI81JQ

RD RR2FI81TF 559 0 0
GGGGGGTCCAGAGAGAGAAAAAAGAGAGAGAAAAAGGATAAGTTGATTTGTGTTTCCGGC
CGACGGTGAGGCTCCTCCACCGTCGGTCCGGCTAGGGGTTTTCTTTTTGTGTCTTGCTCG
TTTGTTCTAGTGTTTGGCTTTAAATAACTCTGATCGAAATTCTAGTCTCTGTTGGATTTT
GTGCTCGGAGACGCACCATATCTACGGTGGTCGTCCCTATTGTCTCTGGGAAGTGGCGGC
TTGTTCAGCAGTCTACTTCGCCGGCTTAAGATTCCGGGAGACGGTGGCTTCTTTAGCATC
GTCATCGCCGGCCTTTCCTCGGGTTTATCCCGATCTATGTTGATTGTGGGATGGTTTGTC
TTGTGATGGAAGTGGTGGTTCGTGGTGGAACTGGTGGTTCGAGGTAGCGAATGAGATCTC
GTCGCTGACGATGGAAGCTCTCCGATGGATGGTGGTTCGTCCGTGTGTGAGGCCTTTTCT
TCTCTCTGTGTTAGTATTATTTAGAGTTTTGGATGAGATCTCGATTGGTGATTGATGCTC
TCCTAAACTCGGAACGAAG

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2FI81JQ 722 0 0
T
TTTGTGTCTTGCTCGTTTGTTCTAGTGTTTGGCTTTAAATAACTCTGATCGAAATTCTAG
TCTCTGTTGGATTTTGTGCTCGGAGACGCACCATATCTACGGTGGTCGTCCCTATTGTCT
CTGGGAAGTGGCGGCTTGTTCAGCAGTCTACTTCGCCGGCTTAAGATTCCGGGAGACGGT
GGCTTCTTTAGCATCGTCATCGCCGGCCTTTCCTCGGGTTTATCCCGATCTATGTTGATT
GTGGGATGGTTTGTCTTGTGATGGAAGTGGTGGTTCGTGGTGGAACTGGTGGTTCGAGGT
AGCGAATGAGATCTCGTCGCTGACGATGGAAGCTCTCCGATGGATGGTGGTTCGTCCGTG
TGTGAGGCCTTTTCTTCTCTCTGTGTTAGTATTATTTAGAGTTTTGGATGAGATCTCGAT
TGGTGATTGATGCTCTCCTAAACTCGGAACGAAGAAGATAAAAGCGTATGCCTTCAACAG
GGGGTTCGATGGCTGATGTTTGGGATCTTTTCCCGGTAGGTTACTTCGTCCGATGAAGTC
TAGATCGGAGAAGAAGGTGAAGGATGGTTGTCGGCAAAGCAGTGGACGTTAGGTCAAATG
TTGCTGTTTTGTTATTTGGGCTATGACCCATGTTTCTATTTTGGCCTGTGTCTTTGGGCT
TTTGTCTGTAGTGTGGGCTTAGCTCTTTTGGGCCTTGACCCACTTAATAAAATTCAGTTG
G

QA 2 722 2 722
DS 



AS 1 2

CO CL3048Contig1 757 2 27 U
GAACGAAGAAGATAAAGCGAGGAACAGAGTTTTCTTCCAAAGGAATTGAATTTTGGTTTC
TCTCCAATTATTATCAGAAAAAAAATGATGAAGTTTTGCTTCATGACCTCTCATGGCTAT
TCAATCCCCGGTGGGCTTGGTCTTCCTCATGAGCTCAGCAAAGCTGAAATCATCAAGAGT
AACCGGGCTTATCTGGTGAACCCTGGAGCAAAACAAGAGATCATACCTGCGAGCTCCTTC
AACCTGAATCCAGACCACTTGGAACCGTGGAAACCGGTTTCTCCACTGAACAAATCTAGC
CAATTCGTGGAGCTTGACTCATCCATGATGAAACCTCTGCTCATGGATGTTCATGGAAAG
GACAAGCCACCAGAGTCTCTGGTTCTGAGCTTTGGAATCGCCGAGAAGTACGCGAGACAA
GAGAAAGTGATGGAGTTTCTACTCTCTCGGTCAGAGGAATTCAAAGAAAGAGGGCTTGAT
ATGTCTAAGCTATCAGAACTGATGGAACTAGAGGCTATGAAATCAAGTTCTCAGCTACTT
CCATACGGTGCTTCCTCTGTTCTTTACTTGAATCAAGAATTAGAGAAACCGGTTTTGGAT
CTCGTTAGGGATATGATGGAGAATCCAGAGTTCTCTCTGAAACCAAATGATCACCTTCTC
TTCTCCTCAAGTAGCAATGCTGAGCTGAACGATATACTTTCAATCGCTTCTGAGTACAAT
TTGTCAAGAGATTCAACAAAATGGAGACAGCTCTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY52TF U 1
AF RR2G301TF U 18
BS 1 73 RR2GY52TF
BS 74 76 RR2G301TF
BS 77 186 RR2GY52TF
BS 187 187 RR2G301TF
BS 188 209 RR2GY52TF
BS 210 210 RR2G301TF
BS 211 214 RR2GY52TF
BS 215 215 RR2G301TF
BS 216 331 RR2GY52TF
BS 332 332 RR2G301TF
BS 333 366 RR2GY52TF
BS 367 367 RR2G301TF
BS 368 474 RR2GY52TF
BS 475 475 RR2G301TF
BS 476 506 RR2GY52TF
BS 507 507 RR2G301TF
BS 508 536 RR2GY52TF
BS 537 537 RR2G301TF
BS 538 569 RR2GY52TF
BS 570 570 RR2G301TF
BS 571 702 RR2GY52TF
BS 703 703 RR2G301TF
BS 704 718 RR2GY52TF
BS 719 719 RR2G301TF
BS 720 725 RR2GY52TF
BS 726 726 RR2G301TF
BS 727 757 RR2GY52TF

RD RR2GY52TF 757 0 0
GAACGAAGAAGATAAAGCGAGGAACAGAGTTTTCTTCCAAAGGAATTGAATTTTGGTTTC
TCTCCAATTATTA**GGAAAAAAAATGATGAAGTTTTGCTTCATGACCTCTCATGGCTAT
TCAATCCCCGGTGGGCTTGGTCTTCCTCATGAGCTCAGCAAAGCTGAAATCATCAAGAGT
AACCGGTCTTATCTGGTGAACCCTGGAGCCAAACTAGAGATCATACCTGCGAGCTCCTTC
AACCTGAATCCAGACCACTTGGAACCGTGGAAACCGGTTTCTCCACTGAACAAATCTAGC
CAATTCGTGGAGCTTGACTCATCCATGATGAGACCTCTGCTCATGGATGTTCATGGAAAG
GACAAGGCACCAGAGTCTCTGGTTCTGAGCTTTGGAATCGCCGAGAAGTACGCGAGACAA
GAGAAAGTGATGGAGTTTCTACTCTCTCGGTCAGAGGAATTCAAAGAAAGAGGGTTTGAT
ATGTCTAAGCTATCAGAACTGATGGAGCTAGAGGCTATGAAATCAAGTTCTCAGCTGCTT
CCATACGGTGCTTCCTCTGTTCTTTACTTTAATCAAGAATTAGAGAAACCGGTTTTGGAT
CTCGTTAGGGATATGATGGAGAATCCAGAGTTCTCTCTGAAACCAAATGATCACCTTCTC
TTCTCCTCAAGTAGCAATGCTGAGCTGAACGATATACTTTCAGTCGCTTCTGAGTACAGT
TTGTCGAGAGATTCAACAAAATGGAGACAGCTCTCAC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2G301TF 719 0 0
G
GAGGAACAGAGTTTTCTTCCAAAGGAATTGAATTTTGGTTTCTCTTCAATTATTATCAGA
AAAAAAATGATGAAGTTTTGCTTCATGACCTCTCATGGCTATTCAATCCCTGGTGGGCTT
GGTCTTCCTCATGAGCTCAGTAAAGCTGAGATCATCAAGAGTAACCGGGCTTATCTGGTG
AACCCTGGAGCAAAACAAGAGATCATACCTGCGAGCTCCTTCAACCTGAATCCAGACCAC
TTGGAACCGTGGAAACCGGTTTCTCCACTGAACAAATCTAGCCAATTCGTGGAGCTTGAC
TCATCCATGATGAAACCTCTGCTCATGGATGTTCATGGTAAGGACAAGCCACCAGAGTCT
TTGGTTCTGAGCTTTGGAATCGCCGAGAAGTACGCGAGACAAGAGAAATTGATGGAGTTT
CTACTCTCTCGGTCAGAGGAATTCAAGGAAAGAGGGCTTGATATGTCTATGCTATCAGAA
CTGATGGAACTAGAGGCTATGAAATCAAGTTCTCAGCTACTTCCATACGGTGCTTCCTCT
GTTCTTTACTTGAATCAAGATTTGGAGAAACCGGTTTTGGATCTCGTTAGGGATATGATG
GAGAATCCAGAGTTCTCTCTGAAACCAAATGATCACCTTCTCTTCTCCTCAAGTAGCAAT
GCTGAGCTGAATGATATACTTTCAATCGCTTCTGAGTTCAATTTGTCAAGAGA
GTCAA

QA 2 714 2 714
DS 



AS 1 3

CO CL3049Contig1 793 3 16 U
TGTCGCCGCTTAAGGATATCCTAGCAAGGGAAGCCAAGAGGGAAGCCGAGAGGGAAGCCG
AGAGGGAAGCCGATCTTCTCAGTTCGCCTCCGGCGGACAGTCCCAAGAGGATGAGAATCA
GTGGGCTGGAATGGGACGACCCTCGTACTCTTGTATACAAATTCAAAACCCGTGACGTTG
GGAGGGTTTTCGTAACGGGGTATGACACCAAGCTTCCACATGATGATGTC*ATGGAGCGT
TGAGAAATCACTTCTCATCATGTGGAAGGATCACTGATATTCTTATCCGCCAAACAGATG
AAGGACTCGCAAGCCATGCAATCATTTTTTTCCTGGCAGAAGGCGCAGTAGACAAGGCGT
TGCAACTTAGTGGAAGTGACGTTGGAGG*ATGGACGGCCATTGTTGAGCCCTTTCCTTTT
CTGAAATATGAAGGCCGTTCCATTACCGTAAATGTTACTGGGTATGACATCTCGCGTAGT
GAGATTGATTTCAAGAGTGCAATTCGTCAACATTTCTCTTCATGTGGAGAGATAAGCCAC
TTCAAAATTTCCAAGAAGGTTGCTTCAGCTAAATTTGATGTTGATGGAGAAGATACACAA
GACGAGGTGATGGAACTTGATGAAAGCATCATGTGTGGAAGCAAAATACATGTTGATGTT
ATTTCTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAGGCGTCATCTTTCCCGCAAGATGATCTAA
GGTGCTATGGAGGAGCCTTTCTATCTATGCTGTTTTCTTAACAAGTTTAGGAGCCTTCGA
CACTTTTTAACTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A649TF U 1
AF RR2AA33TF U 1
AF RR2AA33JQ C 98
BS 1 230 RR2A649TF
BS 231 231 RR2AA33TF
BS 232 303 RR2A649TF
BS 304 304 RR2AA33TF
BS 305 404 RR2A649TF
BS 405 405 RR2AA33TF
BS 406 594 RR2A649TF
BS 595 595 RR2AA33TF
BS 596 596 RR2A649TF
BS 597 597 RR2AA33TF
BS 598 602 RR2A649TF
BS 603 604 RR2AA33TF
BS 605 664 RR2A649TF
BS 665 665 RR2AA33TF
BS 666 717 RR2A649TF
BS 718 793 RR2AA33JQ

RD RR2A649TF 717 0 0
TGTCGCCGCTTAAGGATATCCTAGCAAGGGAAGCCAAGAGGGAAGCCGAGAGGGAAGCCG
AGAGGGAAGCCGATCTTCTCAGTTCGCCTCCGGCGGACAGTCCCAAGAGGATGAGAATCA
GTGGGCTGGAATGGGACGACCCTCGTACTCTTGTATACAAATTCAAAACCCGTGACGTTG
GGAGGGTTTTCGTAACGGGGTATGACACCAAGCTTCCACATGATGATGTCGATGGAGCGT
TGAGAAATCACTTCTCATCATGTGGAAGGATCACTGATATTCTTATCCGCCAAACAGATG
AAGTACTCGCAAGCCATGCAATCATTTTTTTCCTGGCAGAAGGCGCAGTAGACAAGGCGT
TGCAACTTAGTGGAAGTGACGTTGGAGG*ATGGACGGCCATTGT*GAGCCCTTTCCTTTT
CTGAAATATGAAGGCCGTTCCATTACCGTAAATGTTACTGGGTATGACATCTCGCGTAGT
GAGATTGATTTCAAGAGTGCAATTCGTCAACATTTCTCTTCATGTGGAGAGATAAGCCAC
TTCAAAATTTCCAAGAAGGTTGCTTCAGCTAAATTTGATGTTGATGGAGAAGATGCGCAA
GATAAGGTGATGGAACTTGATGAAAGCATCATGTGTGGAAGCAAAATACATGTTGATGTT
ATTTGTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAGGCGTCATCTTTCCCGCAAGATGATC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2AA33TF 719 0 0
TGTCGCCGCTTAAGGATATCCTAGCAAGGGAAGCCAAGAGGGAAGCCGAGAGGGAAGCCG
AGAGGGAAGCCGATCTTCTCAGTTCGCCTCCGGCGGACAGTCCCAAGAGGATGAGAATCA
GTGGGCTGGAATGGGACGACCCTCGTACTCTTGTATACAAATTCAAAACCCGTGACGTTG
GGAGGGTTTTCGTAACGGGGTATGACACCAAGCTTCCACATGATGATGTC*ATGGAGCGT
TGAGAAATCACTTCTCATCATGTGGAAGGATCACTGATATTCTTATCCGCCAAACAGATG
AAGGACTCGCAAGCCATGCAATCATTTTTTTCCTGGCAGAAGGCGCAGTAGACAAGGCGT
TGCAACTTAGTGGAAGTGACGTTGGAGGGATGGACGGCCATTGTTGAGCCCTTTCCTTTT
CTGAAATATGAAGGCCGTTCCATTACCGTAAATGTTACTGGGTATGACATCTCGCGTAGT
GAGATTGATTTCAAGAGTGCAATTCGTCAACATTTCTCTTCATGTGGAGAGATAAGCCAC
TTCAAAATTTCCAAGAAGGTTGCTTCAGCTAAATTTGATGTTGATGGAGAAGATACACAA
GACGAGGTGATGGAACTTGATGAAAGCATCATGTGTGGAAGCAAAATACATGTTGATGTT
ATTTCTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAGGCGTCATCTTTCCCGCAAGATGATC
TA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2AA33JQ 696 0 0
CAGTCCCAAGAGGATGAGAATCAGTGGGCTGGAATGGGACGACCCTCGTACTCTTGTATA
CAAATTCAAAACCCGTGACGTTGGGAGGGTTTTCGTAACGGGGTATGACACCAAGCTTCC
ACATGATGATGTC*ATGGAGCGTTGAGAAATCACTTCTCATCATGTGGAAGGATCACTGA
TATTCTTATCCGCCAAACAGATGAAGGACTCGCAAGCCATGCAATCATTTTTTTCCTGGC
AGAAGGCGCAGTAGACAAGGCGTTGCAACTTAGTGGAAGTGACGTTGGAGG*ATGGACGG
CCATTGTTGAGCCCTTTCCTTTTCTGAAATATGAAGGCCGTTCCATTACCGTAAATGTTA
CTGGGTATGACATCTCGCGTAGTGAGATTGATTTCAAGAGTGCAATTCGTCAACATTTCT
CTTCATGTGGAGAGATAAGCCACTTCAAAATTTCCAAGAAGGTTGCTTCAGCTAAATTTG
ATGTTGATGGAGAAGATACACAAGACGAGGTGATGGAACTTGATGAAAGCATCATGTGTG
GAAGCAAAATACATGTTGATGTTATTTCTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAGGCGTC
ATCTTTCCCGCAAGATGATCTAAGGTGCTATGGAGGAGCCTTTCTATCTATGCTGTTTTC
TTAACAAGTTTAGGAGCCTTCGACACTTTTTAACTA

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 3

CO CL3050Contig1 1147 3 11 U
GTAATTAAACAACGGCTAAAATGGTAAAAGAAGTAAGAACGGATAAAACAAATATTTATT
ACAAGTAAATCTACAAAATCGAAATAAATTGCTGGAGGTAATAATGGGTGTATAATCAGG
TGCTGGAGATAGCGCGGACGACTTCCTCAGAGTAAGGGTGAATAAAAGCACTGTTCATTT
GCCAGACTTTGAACGACGCCGTAACAGTCGCATCAATAGCATTGTTGAATACAAAAAGCT
TAACTGCTCCGTAAATGGCTTTTGTTGGATATACCCTTGAGGTTATACATGTTCTTCCAC
CTTGTGCGAATCCTTCTACGATGGAATGATCCACCAATATTCTCATGGTCAATTTCTCTC
CTCTAAGAACCGGTACAGAACTACCATAAATCGGCTTAACGACATCGTTGGCAAAAGTTG
ACCTTGAAGTGTCTGTGCAGAAAAAAGTTTTGAGCTTAAAATCTTTTCCTTTAGCCACAT
AGAAGTAAACCGGAGTTTGCTCCGACAAGCTCTTATCGGCGAGAACCGAAAATCCAAACG
GTCCTAACGCACCACGGACGGTGGAGCCACCGCTCTTCTGGCAGCTAAACTCCTCAGCCT
CAGCCGCAACCGAAGCATCTCCAAGGATTTTGTCAAGAAACTCTTTCTTGATCTCGAACT
ATGCTTCGATATCTAGCTGAGTTGCGGTATCCACATCGACCGGTACCACTGAACCGGGAC
CGACTTCCATATCAAATTGCTTGCTGCTTAATCTAAGAGATTCTATTTCTTCCACTGGCC
ACTGGACCAAGTTCTTCCCAGTCTTTGGGTCGAGAACGACGGTTCTTGGGATACCCTGAA
GAGAAGACCAGCCTTTTTGTACGTCAGCAGCCTCACTGTCGGATTCACCAATCCAACTCC
ACAAGATTCTCCGACCCTTGTTCTGGTCATAAAACGTCTTTGAAGCATAGAACTTTCCGT
AATCATATCTCAAACTAGCACTCATCCCAACATCGATAGTAGGATCATCTGGGATCCATG
TTCCGTTCGAATCAAAATACGTTCCTACAGCATAATGATCAAACCTGGTGTCGTCCATGC
TAGCCTTCACGATGTGCTTTACATTTGGTCCGTTGGCCGATGTGTCGAGCCCATTGACCG
CGGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A721JQ U 1
AF RR2C050JQ U 37
AF RR2A721TF C 460
BS 1 40 RR2A721JQ
BS 41 41 RR2C050JQ
BS 42 79 RR2A721JQ
BS 80 80 RR2C050JQ
BS 81 102 RR2A721JQ
BS 103 105 RR2C050JQ
BS 106 458 RR2A721JQ
BS 459 459 RR2C050JQ
BS 460 714 RR2A721JQ
BS 715 784 RR2C050JQ
BS 785 1147 RR2A721TF

RD RR2A721JQ 714 0 0
GTAATTAAACAACGGCTAAAATGGTAAAAGAAGTAAGAACTGATAAAACAAATATTTATT
ACAAGTAAATCTACAAAATTGAAATAAATTGCTGGAGGTAAT***GGGTGTATAATCAGG
TGCTGGAGATAGCGCGGACGACTTCCTCAGAGTAAGGGTGAATAAAAGCACTGTTCATTT
GCCAGACTTTGAACGACGCCGTAACAGTCGCATCAATAGCATTGTTGAATACAAAAAGCT
TAACTGCTCCGTAAATGGCTTTTGTTGGATATACCCTTGAGGTTATACATGTTCTTCCAC
CTTGTGCGAATCCTTCTACGATGGAATGATCCACCAATATTCTCATGGTCAATTTCTCTC
CTCTAAGAACCGGTACAGAACTACCATAAATCGGCTTAACGACATCGTTGGCAAAAGTTG
ACCTTGAAGTGTCTGTGCAGAAAAAAGTTTTGAGCTTAGAATCTTTTCCTTTAGCCACAT
AGAAGTAAACCGGAGTTTGCTCCGACAAGCTCTTATCGGCGAGAACCGAAAATCCAAACG
GTCCTAACGCACCACGGACGGTGGAGCCACCGCTCTTCTGGCAGCTAAACTCCTCAGCCT
CAGCCGCAACCGAAGCATCTCCAAGGATTTTGTCAAGAAACTCTTTCTTGATCTCGAACT
ATGCTTCGATATCTAGCTGAGTTGCGGTATCCACATCGACCGGTACCACTGAAC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2C050JQ 748 0 0
GAACGGATAAAACAAATATTTATTACAAGTAAATCTACAAAATCGAAATAAATTGCTGGA
GGTAATAATGGGTGTATAATCAGGTGCTGGAGATAGCGCGGACGACTTCCTCAGAGTAAG
GGTGAATAAAAGCACTGTTCATTTGCCAGACTTTGAACGACGCCGTAACAGTCGCATCAA
TAGCATTGTTGAATACAAAAAGCTTAGCTGCTCCGTAAATGGCTTTTGTTGGATATGCCC
TTGAGGTTATACATGTTCTTCCACCTTGTGCGAATCCTTCTACGATGGAATGATCCACCA
ATATTCTCATGGTCAATTTCTCTCCTCTAAGAACCGGTACAGAACTACCATAAATCGGCT
TAACGACATCGTTGGCAAAAGTTGACCTTGAAGTGTCTGTGCAGAAAAAAGTTTTGAGCT
TAAAATCTTTTCCTTTAGCCACATAGAAGTAAACCGGAGTTTGCTCCGACAAGCTCTTAT
CGGCGAGAACCGAGAATCCAAACGGTCCTAACGCACCACGGACGGTGGAGCCTCCGCTCT
TCTGGCAGCTAAACTCCTCAGCCTCAGCCGCAACCGAAGCATCTCCAAGGATTTTGTCAA
GAAACTCTTTCTTGATCTCGAACTCTGCTTCGATGTCTAGCTGAGTTGCGGTATCCACAT
CGACCGGTACCACTGAACCGGGACCGACTTCCATATCAAATTGCTTGCTGCTTAATCTAA
GAGATTCTATTTCTTCCACTGGCCACTG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2A721TF 688 0 0
AATCTTTTCCTTTAGCCACATAGAAGTAAACCGGAGTTTGCTCCGACAAGCTCTTATCGG
CGAGAACCGAAAATCCAAACGGTCCTAACGCACCACGGACGGTGGAGCCACCGCTCTTCT
GGCAGCTAAACTCCTCAGCCTCAGCCGCAACCGAAGCATCTCCAAGGATTTTGTCAAGAA
ACTCTTTCTTGATCTCGAACTATGCTTCGATATCTAGCTGAGTTGCGGTATCCACATCGA
CCGGTACCACTGAACCGGGACCGACTTCCATATCAAATTTCTTGCTGCTTAATCTAAGAG
ATTCTATTTCTTCCACTGGCCACTGGACCAAGTTCTTCCCAGTCTTTGGGTCGAGAACGA
CGGTTCTTGGGATACCCTGAAGAGAAGACCAGCCTTTTTGTACGTCAGCAGCCTCACTGT
CGGATTCACCAATCCAACTCCACAAGATTCTCCGACCCTTGTTCTGGTCATAAAACGTCT
TTGAAGCATAGAACTTTCCGTAATCATATCTCAAACTAGCACTCATCCCAACATCGATAG
TAGGATCATCTGGGATCCATGTTCCGTTCGAATCAAAATACGTTCCTACAGCATAATGAT
CAAACCTGGTGTCGTCCATGCTAGCCTTCACGATGTGCTTTACATTTGGTCCGTTGGCCG
ATGTGTCGAGCCCATTGACCGCGGTCTC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL3051Contig1 704 2 1 U
GGCTCTTCTTCCTTCCTCTCTTTGCTTTCTTCCTCCGTCACTTAGCAACCTGCCAGTCTA
AGGGCGTGCGCTAAGGAGAAGAAGAAAAAAGAATGGTGAGAATAAGTGTACTCAACGATG
CGCTGAAGAGCATGTACAATGCGGAGAAACGAGGCAAGAGGCAGGTCATGATCAGGCCTT
CTTCCAAAGTCATCATCAAGTTTCTTATCGTCATGCAGAAGCACGGTTACAGTGGTGAGT
TTGAGTATGTTGATGACCATAGATCTGGCAAAATCGTTGTTGAGCTAAACGGGAGGTCGA
ACAAGTGTGGCGTTATCAGCCCTCGTTTTGATGTTGGTGTTAAGGAGATTGAAAGTTGGA
CTGCTCGTTTGCTTCCTTCCCGACAGTTTGGTTACATCGTTCTGACTACCTCCGCCGGTA
TTATGGACCATGAAGAAGCCAGAAGAAAGAATGTCGGAGGCAAGGTCCTCGGATTCTTCT
ATTAATATGTTATATGGTGAAGAAGATGTTCAGTCTGTTACTATAACTTTTGCCCTCCCT
TTGTCTTTTTTCTTTTCTTTTTAATTTTGTGGTTACTTTTGTTGGATAGTGGTTAAATTA
CTCTTGTTGGTCTCGAGTTCTTTAAAGATTCATTCGGACTACATCTATCTCAAGTCTTCA
GTTTAGTCTAGCACATTCCTTATTCATATCAATGAGAATGACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BU50TF U 1
AF RR2BU50JQ C 26
BS 1 704 RR2BU50TF

RD RR2BU50TF 704 0 0
GGCTCTTCTTCCTTCCTCTCTTTGCTTTCTTCCTCCGTCACTTAGCAACCTGCCAGTCTA
AGGGCGTGCGCTAAGGAGAAGAAGAAAAAAGAATGGTGAGAATAAGTGTACTCAACGATG
CGCTGAAGAGCATGTACAATGCGGAGAAACGAGGCAAGAGGCAGGTCATGATCAGGCCTT
CTTCCAAAGTCATCATCAAGTTTCTTATCGTCATGCAGAAGCACGGTTACAGTGGTGAGT
TTGAGTATGTTGATGACCATAGATCTGGCAAAATCGTTGTTGAGCTAAACGGGAGGTCGA
ACAAGTGTGGCGTTATCAGCCCTCGTTTTGATGTTGGTGTTAAGGAGATTGAAAGTTGGA
CTGCTCGTTTGCTTCCTTCCCGACAGTTTGGTTACATCGTTCTGACTACCTCCGCCGGTA
TTATGGACCATGAAGAAGCCAGAAGAAAGAATGTCGGAGGCAAGGTCCTCGGATTCTTCT
ATTAATATGTTATATGGTGAAGAAGATGTTCAGTCTGTTACTATAACTTTTGCCCTCCCT
TTGTCTTTTTTCTTTTCTTTTTAATTTTGTGGTTACTTTTGTTGGATAGTGGTTAAATTA
CTCTTGTTGGTCTCGAGTTCTTTAAAGATTCATTCGGACTACATCTATCTCAAGTCTTCA
GTTTAGTCTAGCACATTCCTTATTCATATCAATGAGAATGACTT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2BU50JQ 679 0 0
TTTCT
TCCTCCGTCACTTAGCAACCTGCCAGTCTAAGGGCGTGCGCTAAGGAGAAGAAGAAAAAA
GAATGGTGAGAATAAGTGTACTCAACGATGCGCTGAAGAGCATGTACAATGCGGAGAAAC
GAGGCAAGAGGCAGGTCATGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTTTCTTATCG
TCATGCAGAAGCACGGTTACAGTGGTGAGTTTGAGTATGTTGATGACCATAGATCTGGCA
AAATCGTTGTTGAGCTAAACGGGAGGTCGAACAAGTGTGGCGTTATCAGCCCTCGTTTTG
ATGTTGGTGTTAAGGAGATTGAAAGTTGGACTGCTCGTTTGCTTCCTTCCCGACAGTTTG
GTTACATCGTTCTGACTACCTCCGCCGGTATTATGGACCATGAAGAAGCCAGAAGAAAGA
ATGTCGGAGGCAAGGTCCTCGGATTCTTCTATTAATATGTTATATGGTGAAGAAGATGTT
CAGTCTGTTACTATAACTTTTGCCCTCCCTTTGTCTTTTTTCTTTTCTTTTTAATTTTGT
GGTTACTTTTGTTGGATAGTGGTTAAATTACTCTTGTTGGTCTCGAGTTCTTTAAAGATT
CATTCGGACTACATCTATCTCAAGTCTTCAGTTTAGTCTAGCACATTCCTTATTCATATC
AATGAGAATGACTT

QA 6 679 6 679
DS 



AS 1 2

CO CL3052Contig1 782 2 1 U
GGCATGGAGTGACGAGGACTTGCTGGATGCACTGAACCAACTAGAGGAAGGGTTAAAAGA
CAAGATCAGGAAGCTGAGTTCCTTTGACAAATATAAGCAAGAGGTTCTTCTTGGTCATCT
TGATTGGAATCCAATGCACAAAGAGGCCAATTTCTGGCGTGAGAATGTCACTTGCTTTGA
GGAGAATGACTTCCAGATACTCAGGGTTCTCCTCACAATCCTGGACACGTCAAGTGATCC
AAGATCGTTGGCGGTGGCATGCTATGATCTCTCACAGTTCATACAGTACCATGCAGCGGG
GAGAGTGATTGTCACAGACCTCAAGGCGAAAGAACGAGTGATGAAACTGATGAGCCATGA
GAACGCTGAGGTTACCAAGAACGCTCTCTTATGCATTCAGAGGCTTCTCCTTGGTGCTAA
GTACGCCAGCTTCTTGCAAGCTTGATGGGACTTCAATGTTTCTTTCTATATATGGAAAGC
AACCAAAACACACAGACTGCATTTCTTCTTTTTCCCTGTGGTATTTGTTGTTGTTCATTC
CAAAACCTACCCCAACTCCTGCCTCTGCTTCTTGTCTTTGAGTTCTACATTCCAAGACCA
TCTCTTTATTATTTGTCCAGGAAAAATCTGCCGTGTGTATGCTCTCTGCGGTATTTTTTC
CTTCTGTATTTATTTATTTAATAAGGCCTTGAGGAACGCTATTGTTACAGACAGCAGTTT
TGGGCCAGCTTGTCGTCATGACTGTAAGAGTTTCAGTGTAATACAGATGATTAATATGGC
TG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2AO49JQ C 1
AF RR2AO49TF U 1
BS 1 782 RR2AO49TF

RD RR2AO49JQ 782 0 0
GGCATGGAGTGACGAGGACTTGCTGGATGCACTGAACCAACTAGAGGAAGGGTTAAAAGA
CAAGATCAGGAAGCTGAGTTCCTTTGACAAATATAAGCAAGAGGTTCTTCTTGGTCATCT
TGATTGGAATCCAATGCACAAAGAGGCCAATTTCTGGCGTGAGAATGTCACTTGCTTTGA
GGAGAATGACTTCCAGATACTCAGGGTTCTCCTCACAATCCTGGACACGTCAAGTGATCC
AAGATCGTTGGCGGTGGCATGCTATGATCTCTCACAGTTCATACAGTACCATGCAGCGGG
GAGAGTGATTGTCACAGACCTCAAGGCGAAAGAACGAGTGATGAAACTGATGAGCCATGA
GAACGCTGAGGTTACCAAGAACGCTCTCTTATGCATTCAGAGGCTTCTCCTTGGTGCTAA
GTACGCCAGCTTCTTGCAAGCTTGATGGGACTTCAATGTTTCTTTCTATATATGGAAAGC
AACCAAAACACACAGACTGCATTTCTTCTTTTTCCCTGTGGTATTTGTTGTTGTTCATTC
CAAAACCTACCCCAACTCCTGCCTCTGCTTCTTGTCTTTGAGTTCTACATTCCAAGACCA
TCTCTTTATTATTTGTCCAGGAAAAATCTGCCGTGTGTATGCTCTTTGCGGTATTTTTTC
CTTCTGTATTTATTTATTTAATAAGGCCTTGAGGAACGCTATTGTTACAGACAGCAGTTT
TGGGCCAGCTTGTCGTCATGACTGTAAGAGTTTCAGTGTAATACAGATGATTAATATGGC
TG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2AO49TF 782 0 0
GGCATGGAGTGACGAGGACTTGCTGGATGCACTGAACCAACTAGAGGAAGGGTTAAAAGA
CAAGATCAGGAAGCTGAGTTCCTTTGACAAATATAAGCAAGAGGTTCTTCTTGGTCATCT
TGATTGGAATCCAATGCACAAAGAGGCCAATTTCTGGCGTGAGAATGTCACTTGCTTTGA
GGAGAATGACTTCCAGATACTCAGGGTTCTCCTCACAATCCTGGACACGTCAAGTGATCC
AAGATCGTTGGCGGTGGCATGCTATGATCTCTCACAGTTCATACAGTACCATGCAGCGGG
GAGAGTGATTGTCACAGACCTCAAGGCGAAAGAACGAGTGATGAAACTGATGAGCCATGA
GAACGCTGAGGTTACCAAGAACGCTCTCTTATGCATTCAGAGGCTTCTCCTTGGTGCTAA
GTACGCCAGCTTCTTGCAAGCTTGATGGGACTTCAATGTTTCTTTCTATATATGGAAAGC
AACCAAAACACACAGACTGCATTTCTTCTTTTTCCCTGTGGTATTTGTTGTTGTTCATTC
CAAAACCTACCCCAACTCCTGCCTCTGCTTCTTGTCTTTGAGTTCTACATTCCAAGACCA
TCTCTTTATTATTTGTCCAGGAAAAATCTGCCGTGTGTATGCTCTCTGCGGTATTTTTTC
CTTCTGTATTTATTTATTTAATAAGGCCTTGAGGAACGCTATTGTTACAGACAGCAGTTT
TGGGCCAGCTTGTCGTCATGACTGTAAGAGTTTCAGTGTAATACAGATGATTAATATGGC
TG

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 3

CO CL3053Contig1 1122 3 11 U
GCAAGCCGAGATAGCTGTGCTCACTAAGGTCAGGCATAGACATTTGGTTGCTCTGTTGGG
TTACTGTGTGAACGGGAACGAGAGATTGCTTGTATATGAGTACATGCCGCAGGGTAACCT
CGGACAGCATTTATTTGAGTACGGTGAACTCGGTTACCCTCCTCTGACATGGAAACAGAG
AGTGAGTATAGCTCTAGACGTGGCACGAGGCGTGGAATATCTCCATAGCTTGGCTCAGCA
GAGCTTCATCCACAGAGATTTAAAGCCCTCTAACATCCTTCTTGGTGATGACATGAGGGC
AAAGGTTGCTGATTTTGGATTGGTTAAGAACGCACCTGATGGGAAATACTCTGTTGAGAC
GAGATTAGCAGGCACTTTTGGTTATCTAGCACCTGAATACGCCGCTACTGGAAGAGTAAC
GACGAAAGTGGATGTGTATGCATTTGGAGTGGTTCTTATGGAAATGATAACCGGAAGAAA
AGCATTAGATGATTCACTACCGGACGAGAGATCTCACCTAGTCACATGGTTCAGAAGAAT
CCTAATCAATAAAGAAAACATCCCAAAGGCGATCGACCAGACCTTAGAGGCAGACGAGGA
AACATTGGAGAGCATTCACAGGGTTGCAGAGCTAGCAGGACACTGCACAGCACGTGAGCC
TCAACAGAGACCAGACATGGGCCACGCGGTTAACGTGCTAGGTCCCCTAGTAGAGAAGTG
GAAACCCTCGTGCCAAGAAGAAGAAGAGAGTTTTGGGATCGATGTGAACAACATGAGTTT
ACCTCAAGCTCTACAGAGATGGCAGCAAAACGAAGGAACATCGACGTCAATGTTCCATGG
AGACTTCTCTTACTCTCAGACACAGTCTAGTATTCCTCCAAAGCCTTCTGGTTTCCCTAA
CACGTTCGATTCGGCTGATGGTCGGTGACACCAAACTCTGTGTGTGTAATCAAATCGGTG
ATACTTAAGATCTTCCATTTGGGATTTTTTGTCTTTTTATGAAATGATGATTATATTTAT
ATATTGTAAGCATATATGTTGTATTTGCGACTGACCACTTGAGCATTTGCGCTTGTTTAT
TCTTTGTAAGGGAAATTGTATCACGTAACTTGGTTTTCTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B434TF U 1
AF RR2DM10TF U 371
AF RR2B434JQ C 285
BS 1 697 RR2B434TF
BS 698 906 RR2DM10TF
BS 907 907 RR2B434JQ
BS 908 948 RR2DM10TF
BS 949 949 RR2B434JQ
BS 950 989 RR2DM10TF
BS 990 990 RR2B434JQ
BS 991 1003 RR2DM10TF
BS 1004 1004 RR2B434JQ
BS 1005 1077 RR2DM10TF
BS 1078 1122 RR2B434JQ

RD RR2B434TF 697 0 0
GCAAGCCGAGATAGCTGTGCTCACTAAGGTCAGGCATAGACATTTGGTTGCTCTGTTGGG
TTACTGTGTGAACGGGAACGAGAGATTGCTTGTATATGAGTACATGCCGCAGGGTAACCT
CGGACAGCATTTATTTGAGTACGGTGAACTCGGTTACCCTCCTCTGACATGGAAACAGAG
AGTGAGTATAGCTCTAGACGTGGCACGAGGCGTGGAATATCTCCATAGCTTGGCTCAGCA
GAGCTTCATCCACAGAGATTTAAAGCCCTCTAACATCCTTCTTGGTGATGACATGAGGGC
AAAGGTTGCTGATTTTGGATTGGTTAAGAACGCACCTGATGGGAAATACTCTGTTGAGAC
GAGATTAGCAGGCACTTTTGGTTATCTAGCACCTGAATACGCCGCTACTGGAAGAGTAAC
GACGAAAGTGGATGTGTATGCATTTGGAGTGGTTCTTATGGAAATGATAACCGGAAGAAA
AGCATTAGATGATTCACTACCGGACGAGAGATCTCACCTAGTCACATGGTTCAGAAGAAT
CCTAATCAATAAAGAAAACATCCCAAAGGCGATCGACCAGACCTTAGAGGCAGACGAGGA
AACATTGGAGAGCATTCACAGGGTTGCAGAGCTAGCAGGACACTGCACAGCACGTGAGCC
TCAACAGAGACCAGACATGGGCCACGCGGTTAACGTG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2DM10TF 709 0 0
GGCACATTTGGTTATCTAGCACCTGAATACGCCGCTACTGGAAGAGTAACGACGAAAGTG
GACGTGTATGCATTTGGAGTGGTTCTTATGGAAATGATAACCGGAAGAAAAGCGTTAGAT
GATTCATTACCGGACGAGAGATCTCACCTAGTCACATGGTTCAGAAGAATCCTAATCAAT
AAAGAAAACATCCCAAAGGCGATCGACCAGACCTTAGAGGCAGACGAGGAAACAATGGAG
AGCATTCACAGGGTTGCTGAGCTAGCAGGACACTGCACAGCACGTGAGCCTCAACAGAGA
CCAGACATGGGCCACGCGGTTAACGTGCTAGGTCCCCTAGTAGAGAAGTGGAAACCCTCG
TGCCAAGAAGAAGAAGAGAGTTTTGGGATCGATGTGAACAACATGAGTTTACCTCAAGCT
CTACAGAGATGGCAGCAAAACGAAGGAACATCGACGTCAATGTTCCATGGAGACTTCTCT
TACTCTCAGACACAGTCTAGTATTCCTCCAAAGCCTTCTGGTTTCCCTAACACGTTTGAT
TCGGCTGATGGTCGGTGACACCAAACTCTGTGTGTGTATTCAAATCGGTGATACTTAAGA
TCTTCCATTTGGGATTTTT*GTCTTTTTATGAAGTGATGATTATATTTATATATTGTAAG
CATATATGTTGTATTTGCGACTGACCACTTGAGCATTTGCGCTTGTT
CA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2B434JQ 838 0 0
GTGATGACATGAGGGCAAAGGTTGCTGATTTTGGATTGGTTAAGAACGCACCTGATGGGA
AATACTCTGTTGAGACGAGATTAGCAGGCACTTTTGGTTATCTAGCACCTGAATACGCCG
CTACTGGAAGAGTAACGACGAAAGTGGATGTGTATGCATTTGGAGTGGTTCTTATGGAAA
TGATAACCGGAAGAAAAGCATTAGATGATTCACTACCGGACGAGAGATCTCACCTAGTCA
CATGGTTCAGAAGAATCCTAATCAATAAAGAAAACATCCCAAAGGCGATCGACCAGACCT
TAGAGGCAGACGAGGAAACATTGGAGAGCATTCACAGGGTTGCAGAGCTAGCAGGACACT
GCACAGCACGTGAGCCTCAACAGAGACCAGACATGGGCCACGCGGTTAACGTGCTAGGTC
CCCTCGTGGAGAAGTGGAAACCGTCGTGCCAAGAAGAAGAAGAGAGTTTTGGGATCGATG
TGAACAACATGAGTTTACCTCAAGCTCTACAGAGATGGCAGCAAAACGAAGGAACATCGA
CGTCAATGTTCCATGGAGACTTCTCTTACTTTCAGACACAGTCTAGTATTCCTCCAAAGC
CTTCTGGTTTCCCTAACACGTTCGATTCGGCTGATGGTCGGTGACACCAAACTCTGTGTG
TGTAATCAAATCGGTGATACTTAAGCTCTTCCATTTGGGATTTTTTGTCTTTTTATGAAA
TGATGATTATATTTATATATTGTAAGCATGTATGTTGTATTTGCTACTGACCACTTGAGC
TTTTGCGTTTGTTTATTCTTTGTAAGGGAAATTGTATCACGTAACTTGGTTTTCTGGT

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 3

CO CL3054Contig1 823 3 8 U
CGGAATCAAAGTCTTTTATTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTAAAATATGTTTTTGGTTCATA
AGCGTTTTGACTTACACGTAACCTTTACAACCCCTACATATAGTTTTCTTTTCTTTAAAG
ATCAAATTACAGAAGGAAACGTAAAGTGTTTACACAACACACAGTCTACACATTTTCTTT
GTTTGCTGCTATTACATCTGAACAACCAGATCATCGCCTTCTGTAGTACCTACAGGATGT
TCTCCACCAAGCGACTTCTTCATCCATCCCTCCAACATTTTCAACGCAGCTTTTGGCTGG
TCCATTGGAACCATGTGTCCCGCATCGTGCACCTTGAGGAAACTGAGTTGTTCATAACTC
TTTAACTTGCCTGCTTCTTTGCCATCAACCAAAAAGGGAACTTCCTTAGCCGCCTTAAAG
TTCTCTTTACCTGACCACTCCATTGCATTCACCCACCTCGAGTTACCGAGCCAGTTGCAG
ATGAGATCATATTCTCCCGCGTACACAAGAAGGTTGATTCCATCTTCAAGGAGCGCGGGA
ATTCCAACCTCGAGATTCCTCATCAAGTCTTGTAGCATTGCCTGATAGACACTAGTACTA
CAGGACACGAACTCTATCTCCCCAACACCAAGCGACTTTCTCACCGGGTTCAGGTTCAAG
AATTTCTCCATGTCTGAGAAGTCGTAGCACAAATTTCCCTCACACTTCTTCCTGATGTCG
TAATAGTTTACTCCATGAGCATGATTTATTACACCGCTGAACAAGGTGTTGCAAACAAGA
TATGACGCCAAACAGGAAGTTGTTCCATCAGTTCCACAGATCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D910JQ U 2
AF RR2DF71JQ U 1
AF RR2D910TF C 232
BS 1 40 RR2DF71JQ
BS 41 41 RR2D910JQ
BS 42 117 RR2DF71JQ
BS 118 118 RR2D910JQ
BS 119 201 RR2DF71JQ
BS 202 202 RR2D910JQ
BS 203 757 RR2DF71JQ
BS 758 823 RR2D910TF

RD RR2D910JQ 477 0 0
GGAATCAAAGTCTTTTATTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTAAAATATGTTTTTGGTTCATAA
GCGTTTTGACTTACACGTAACCTTTACAACCCCTACATATAGTTTTCTTTTCTTTAAAGA
TCAAATTACAGAAGGAAACGTAAAGTGTTTACACAACACACAGTCTACACATTTTCTTTG
TTTGCTGCTATTACATCTGAACAACCAGATCATCGCCTTCTGTAGTACCTACAGGATGTT
CTCCACCAAGCGACTTCTTCATCCATCCCTCCAACATTTTCAACGCAGCTTTTGGCTGGT
CCATTGGAACCATGTGTCCCGCATCGTGCACCTTGAGGAAACTGAGTTGTTCATAACTCT
TTAACTTGCCTGCTTCTTTGCCATCAACCAAAAAGGGAACTTCCTTAGCCGCCTTAAAGT
TCTCTTTACCTGACCACTCCATTGCATTCACCCACCTCGAGTTACCGAGCCAGTTGC

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2DF71JQ 757 0 0
CGGAATCAAAGTCTTTTATTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTAGAATATGTTTTTGGTTCATA
AGCGTTTTGACTTACACGTAACCTTTACAACCCCTACATATAGTTTTCTTTTCTTTAGAG
ATCAAATTACAGAAGGAAACGTAAAGTGTTTACACAACACACAGTCTACACATTTTCTTT
GTTTGCTGCTATTACATCTGAGCAACCAGATCATCGCCTTCTGTAGTACCTACAGGATGT
TCTCCACCAAGCGACTTCTTCATCCATCCCTCCAACATTTTCAACGCAGCTTTTGGCTGG
TCCATTGGAACCATGTGTCCCGCATCGTGCACCTTGAGGAAACTGAGTTGTTCATAACTC
TTTAACTTGCCTGCTTCTTTGCCATCAACCAAAAAGGGAACTTCCTTAGCCGCCTTAAAG
TTCTCTTTACCTGACCACTCCATTGCATTCACCCACCTCGAGTTACCGAGCCAGTTGCAG
ATGAGATCATATTCTCCCGCGTACACAAGAAGGTTGATTCCATCTTCAAGGAGCGCGGGA
ATTCCAACCTCGAGATTCCTCATCAAGTCTTGTAGCATTGCCTGATAGACACTAGTACTA
CAGGACACGAACTCTATCTCCCCAACACCAAGCGACTTTCTCACCGGGTTCAGGTTCAAG
AATTTCTCCATGTCTGAGAAGTCGTAGCACAAATTTCCCTCACACTTCTTCCTGATGTCG
TAATAGTTTACTCCATGAGCATGATTTATTACACCGC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2D910TF 592 0 0
ACAGGATGTTCTCCACCAAGCGACTTCTTCATCCATCCCTCCAACATTTTCAACGCAGCT
TTTGGCTGGTCCATTGGAACCATGTGTCCCGCATCGTGCACCTTGAGGAAACTGAGTTGT
TCATAACTCTTTAACTTGCCTGCTTCTTTGCCATCAACCAAAAAGGGAACTTCCTTAGCC
GCCTTAAAGTTCTCTTTACCTGACCACTCCATTGCATTCACCCACCTCGAGTTACCGAGC
CAGTTGCAGATGAGATCATATTCTCCCGCGTACACAAGAAGGTTGATTCCATCTTCAAGG
AGCGCGGGAATTCCAACCTCGAGATTCCTCATCAAGTCTTGTAGCATTGCCTGATAGACA
CTAGTACTACAGGACACGAACTCTATCTCCCCAACACCAAGCGACTTTCTCACCGGGTTC
AGGTTCAAGAATTTCTCCATGTCTGAGAAGTCGTAGCACAAATTTCCCTCGCACTTCTTC
CTGATGTCGTAATAGTTTACTCCATGAGCATGATTTATTACACCGCTGAACAAGGTGTTG
CAAACAAGATATGACGCCAAACAGGAAGTTGTTCCATCAGTTCCACAGATCC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL3055Contig1 633 2 2 U
GGAACACAATAGAAACCTAAAGAAAGAAGAAAGACAGGAAAAAATGGTTAGGTCTTTTTC
TCTGTTTCCAGCCCTAATGATACTCAGCTTCTTCTTAATCATCTTTTCACCTCTGATCCA
AGCCAGCTTCACCGATGATCTCAAGGGTCTAGAATGGTCCTCTACGGGAGTCCATGACTC
CTCAGGCTGCAACGGTTCCATAGCAGACTGTATCGGAGCAGAGGAAGAGGAAATGGACTC
AGAGATCAACAGAAGAATATTGGCGACAACAAAGTACATAAGCTATCAATCTTTGCAGCG
GAACAGTGTGCCTTGTTCGAGAAGAGGGGCGTCATATTACAATTGCCAGAACGGAGCTCA
GGCTAATCCTTATAGTCGTGGTTGCAGCGCTATTGCTCGTTGCAGGAGTTAGGTGTCAAG
ACAAGCACTCTTTTTTTCTTTTAACAAGCTCTTTTCTCTTCTCTATGGTTTCTTATAATT
TGTACGCTACACATATAAGTTGGATTTGGATGTGAATAATCTTGGGTTGTTGTATGATCC
ATTAAGTGTTTAGTTGTGCTATAAGCCTATAAGCTTTGAATATTTCATGTGTACTCTCTT
GCACAAATAATAGTACAAAGCCTATGTTTATTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EP85JQ C 1
AF RR2EP85TF U 1
BS 1 5 RR2EP85JQ
BS 6 633 RR2EP85TF

RD RR2EP85JQ 633 0 0
GGAACACAATAGAAACCTAAAGAAAGAAGAAAGACAGGAAAAAATGGTTAGGTCTTTTTC
TCTGTTTCCAGCCCTAATGATACTCAGCTTCTTCTTAATCATCTTTTCACCTCTGATCCA
AGCCAGCTTCACCGATGATCTCAAGGGTCTAGAATGGTCCTCTACGGGAGTCCATGACTC
CTCAGGCTGCAACGGTTCCATAGCAGACTGTATCGGAGCAGAGGAAGAGGAAATGGACTC
AGAGATCAACAGAAGAATATTGGCGACAACAAAGTACATAAGCTATCAATCTTTGCAGCG
GAACAGTGTGCCTTGTTCGAGAAGAGGGGCGTCATATTACAATTGCCAGAACGGAGCTCA
GGCTAATCCTTATAGTCGTGGTTGCAGCGCTATTGCTCGTTGCAGGAGTTAGGTGTCAAG
ACAAGCACTCTTTTTTTCTTTTAACAAGCTCTTTTCTCTTCTCTATGGTTTCTTATAATT
TGTACGCTACACATATAAGTTGGATTTGGATGTGAATAATCTTGGGTTGTTGTATGATCC
ATTAAGTGTTTAGTTGTGCTATAAGCCTATAAGCTTTGAATATTTCATGTGTACTCTCTT
GCACAAATAATAGTACAAGGCCTATGTTTATTC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2EP85TF 633 0 0
GGAAC
ACAATAGAAACCTAAAGAAAGAAGAAAGACAGGAAAAAATGGTTAGGTCTTTTTCTCTGT
TTCCAGCCCTAATGATACTCAGCTTCTTCTTAATCATCTTTTCACCTCTGATCCAAGCCA
GCTTCACCGATGATCTCAAGGGTCTAGAATGGTCCTCTACGGGAGTCCATGACTCCTCAG
GCTGCAACGGTTCCATAGCAGACTGTATCGGAGCAGAGGAAGAGGAAATGGACTCAGAGA
TCAACAGAAGAATATTGGCGACAACAAAGTACATAAGCTATCAATCTTTGCAGCGGAACA
GTGTGCCTTGTTCGAGAAGAGGGGCGTCATATTACAATTGCCAGAACGGAGCTCAGGCTA
ATCCTTATAGTCGTGGTTGCAGCGCTATTGCTCGTTGCAGGAGTTAGGTGTCAAGACAAG
CACTCTTTTTTTCTTTTAACAAGCTCTTTTCTCTTCTCTATGGTTTCTTATAATTTGTAC
GCTACACATATAAGTTGGATTTGGATGTGAATAATCTTGGGTTGTTGTATGATCCATTAA
GTGTTTAGTTGTGCTATAAGCCTATAAGCTTTGAATATTTCATGTGTACTCTCTTGCACA
AATAATAGTACAAAGCCTATGTTTATTC

QA 6 633 6 633
DS 



AS 1 3

CO CL3056Contig1 722 3 2 U
GGAACAATCTATTCTTCTCACCATATCCTCTGCTCTGCTTCTCCCAAAGAAAACAAACAA
TATAAAAGGAGAATATAAAAAAATGAAATTTCTGCTTTACCTAGTTACGTGCTTTCTCCT
CTTACACGTTTTCGCAACAGCAAAATCTCTCATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAGC
GAAAAACCGAAAAGTACTCAAACTCGATTTCTGCCTCAAGTCTCTCGAAGGGTGTCGGCA
GTGCCAGACCGCAAAAAATCTCAGCGAACTAGTCTTCGCGTCGATGAAGAACGCTAGGAC
GAAAACGAAGAGAGTGCACGCACAGATTAAGAAGGATTTTGACGCGAAGAAGTATCCCAA
GGACAATGACATGCTGGTAATGGAGTGTCTCAGCGATTATTCAAGCACTGTTCAGATATT
GGGCTTGGCTATGGAGACCTTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGAC
TCTTGGAATGGAGAGCATGGATGCTTGCGATAAAGGATACAAAGAAAGATCAACGCCTCA
GATATCTCCGTTTATAAAAAGCAACGAGTTTATAACTAATTTGATTCAGATTCCTGTAGC
TTTTACAAAGATGTTGAAAAGAGAATGGTAAGTTAAGAGTAACTGGGTTGCTCAATAATG
TACGTAGCCTCTAGCCTTCTTTAACTGAATCTTTATGGAAATTGATACCATGCTGATTAG
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2DY39TF U 1
AF RR2DY39JQ C 60
AF RR2GC87TF U 18
BS 1 641 RR2DY39TF
BS 642 722 RR2GC87TF

RD RR2DY39TF 651 0 0
GGAACAATCTATTCTTCTCACCATATCCTCTGCTCTGCTTCTCCCAAAGAAAACAAACAA
TATAAAAGGAGAATATAAAAAAATGAAATTTCTGCTTTACCTAGTTACGTGCTTTCTCCT
CTTACACGTTTTCGCAACAGCAAAATCTCTCATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAGC
GAAAAACCGAAAAGTACTCAAACTCGATTTCTGCCTCAAGTCTCTCGAAGGGTGTCGGCA
GTGCCAGACCGCAAAAAATCTCAGCGAACTAGTCTTCGCGTCGATGAAGAACGCTAGGAC
GAAAACGAAGAGAGTGCACGCACAGATTAAGAAGGATTTTGACGCGAAGAAGTATCCCAA
GGACAATGACATGCTGGTAATGGAGTGTCTCAGCGATTATTCAAGCACTGTTCAGATATT
GGGCTTGGCTATGGAGACCTTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGAC
TCTTGGAATGGAGAGCATGGATGCTTGCGATAAAGGATACAAAGAAAGATCAACGCCTCA
GATATCTCCGTTTATAAAAAGCAACGAGTTTATAACTAATTTGATTCAGATTCCTGTAGC
TTTTACAAAGATGTTGAAAAGAGAATGGTAAGTTAAGAGTA
TAAAAAAAAA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2DY39JQ 583 0 0
ATATAAAAGGAGAATATAAAAAAATGAAATTTCTGCTTTACCTAGTTACGTGCTTTCTCC
TCTTACACGTTTTCGCAACAGCAAAATCTCTCATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAG
CGAAAAACCGAAAAGTACTCAAACTCGATTTCTGCCTCAAGTCTCTCGAAGGGTGTCGGC
AGTGCCAGACCGCAAAAAATCTCAGCGAACTAGTCTTCGCGTCGATGAAGAACGCTAGGA
CGAAAACGAAGAGAGTGCACGCACAGATTAAGAAGGATTTTGACGCGAAGAAGTATCCCA
AGGACAATGACATGCTGGTAATGGAGTGTCTCAGCGATTATTCAAGCACTGTTCAGATAT
TGGGCTTGGCTATGGAGACCTTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGA
CTCTTGGAATGGAGAGCATGGATGCTTGCGATAAAGGATACAAAGAAAGATCAACGCCTC
AGATATCTCCGTTTATAAAAAGCAACGAGTTTATAACTAATTTGATTCAGATTCCTGTAG
CTTTTACAAAGATGTTGAAAAGAGAATGGTAAGTTAAGAGTA
T

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2GC87TF 705 0 0
GG
ACCATATCCTCTGCTCTGCTTCTCCCAAAGAAAACAAACAATATAAAAGGAGAATATAAA
AAAATGAAATTTCTGCTTTACCTAGTTACGTGCTTTCTCCTCTTACACGTTTTCGCAACA
GCAAAATCTCTCATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAGCGAAAAACCGAAAAGTACTC
AAACTCGATTTCTGCCTCAAGTCTCTCGAAGGGTGTCGGCAGTGCCAAACCGCAAAAAAT
CTCAGCGAACTAGTCTTCGCGTCGATGAAGAACGCTAGGACGAAAACGAAGAGAGTGCAC
GCACAGATGAAGAAGGATTTTGACGCGAAGAAGTATCCCAAGGACAATGACATGCTGGTA
ATGGAGTGTCTCAGCGATTATTCAAGCACTGTTCAGATATTGGGCTTGGCTATGGAGACC
TTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGACTCTTGGAATGGAGAGCATG
GATGCTTGCGATAAAGGATACAAAGAAAGATCAACGCCTCAGATATCTCCGTTTATAAAA
AGCAACGAGTTTATAACTAATTTGATTCAGATTCCTGTAGCTTTTACAAAGATGTTGAAA
AGAGAATGGTAAGTTAAGAGTAACTGGGTTGCTCAATAATGTACGTAGCCTCTAGCCTTC
TTTAACTGAATCTTTATGGAAATTGATACCATGCTGATTAGTT

QA 3 705 3 705
DS 



AS 1 3

CO CL3057Contig1 876 3 4 U
GGGGTTTACGAGCAGAGGAAAATAAAATCAATCGCAGATCTGTTTCGCAATCTACATTTC
CAAATTCCAAACAACAACACATCATGACGATCCCCTTAACTAAGCTTCTGATC*CCGCCA
TGTCGATCTTCATGCTCGTGTCCGTTTCGTTCGCGACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGG
TCCACAAGAAAGCTACTCTCAACAGGCTCAAATCTGGCGCCGAGCGTGTCCTCGTCTCCT
TCGACATCTACAATCAAGGATCTGCGACGGCCTATGATGTGACTCTAACTGATAAAACCT
GGATTAAGAAAACTTTTGAACTTGTTAATGGAAACAAGTCACGAACATGGGAGAGACTTG
ATGCAGGAGGCATCCTGTCTCATTCTTTCGAATTAGAGGCTAAGGTTAAAGGACCCTTCT
ATGGCGCTCCTGCTCTTGTTACTTTCCGTATCCCCACTAAGGCTGTTCTACAGGAAGCCT
ACTCAAATCCAATACTACCTCTAAACATCCTCGCTGACATACCTCCAACAGACCTATTGG
CGCTGGCCAAGAGGGTGCTTGCGAAATATGGATCGCTTGTTTCAGTGATCTCCATGGTGG
TTTTGTTCGTATACTTGATAGCAACACCTTCAAAGCCCAATGCGGCAAAAGCGGGCAGCA
AGAAGAAACGCTAAGTTCGTGGAATGAAGTTGAGAAAAAGGTTGTTGTTTCTGTGCTTTA
GTTGTGTGTTAGCAGATTAAAACACAGTTTCAAAACTTGTAAGAATCGTAGAACACACTT
TACTGTTCGCGTTGCAGAGTACTTTTTTATATGTTATTTTGTTCTGCGTAATAACATCGT
TTTGAGAGCATATTCATGAAGGTCTATTTTACTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB72TF U 6
AF RR2BR10TF U 1
AF RR2EB72JQ C 62
BS 1 113 RR2BR10TF
BS 114 114 RR2EB72TF
BS 115 696 RR2BR10TF
BS 697 876 RR2EB72JQ

RD RR2EB72TF 629 0 0
GG
ACGAGCAGAGGAAAATAAAATCAATCGCAGATCTGTTTCGCAATCTACATTTCCAAATTC
CAAACAACAACACATCATGACGATCCCCTTAACTAAGCTTCTGATC*CCGCCATGTCGAT
CTTCATGCTCGTGTCCGTTTCGTTCGCGACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTCCACAA
GAAAGCTACTCTCAACAGGCTCAAATCTGGCGCCGAGCGTGTCCTCGTCTCCTTCGACAT
CTACAATCAAGGATCTGCGACGGCCTATGATGTGACTCTAACTGATAAAACCTGGATTAA
GAAAACTTTTGAACTTGTTAATGGAAACAAGTCACGAACATGGGAGAGACTTGATGCAGG
AGGCATCCTGTCTCATTCTTTCGAATTAGAGGCTAAGGTTAAAGGACCCTTCTATGGCGC
TCCTGCTCTTGTTACTTTCCGTATCCCCACTAAGGCTGTTCTACAGGAAGCCTACTCAAA
TCCAATACTACCTCTAAACATCCTCGCTGACATACCTCCAACAGACCTATTGGCGCTGGC
CAAGAGGGTGCTTGCGAAATATGGATCGCTTGTTTCAGTGATCTCCATGGTGGTTTTGTT
CGTATACTTGATAGCAACACCTTCAAA

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR2BR10TF 696 0 0
GGGGTTTACGAGCAGAGGAAAATAAAATCAATCGCAGATCTGTTTCGCAATCTACATTTC
CAAATTCCAAACAACAACACATCATGACGATCCCCTTAACTAAGCTTCTGATCTCCGCCA
TGTCGATCTTCATGCTCGTGTCCGTTTCGTTCGCGACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGG
TCCACAAGAAAGCTACTCTCAACAGGCTCAAATCTGGCGCCGAGCGTGTCCTCGTCTCCT
TCGACATCTACAATCAAGGATCTGCGACGGCCTATGATGTGACTCTAACTGATAAAACCT
GGATTAAGAAAACTTTTGAACTTGTTAATGGAAACAAGTCACGAACATGGGAGAGACTTG
ATGCAGGAGGCATCCTGTCTCATTCTTTCGAATTAGAGGCTAAGGTTAAAGGACCCTTCT
ATGGCGCTCCTGCTCTTGTTACTTTCCGTATCCCCACTAAGGCTGTTCTACAGGAAGCCT
ACTCAAATCCAATACTACCTCTAAACATCCTCGCTGACATACCTCCAACAGACCTATTGG
CGCTGGCCAAGAGGGTGCTTGCGAAATATGGATCGCTTGTTTCAGTGATCTCCATGGTGG
TTTTGTTCGTATACTTGATAGCAACACCTTCAAAGCCCAATGCGGCAAAAGCGGGCAGCA
AGAAGAAACGCTAAGTTCGTGGAATGAAGTTGAGAA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2EB72JQ 815 0 0
AAATTCCAAACAACAACACATCATGACGATCCCCTTAACTAAGCTTCTGATC*CCGCCAT
GTCGATCTTCATGCTCGTGTCCGTTTCGTTCGCGACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGT
CCACAAGAAAGCTACTCTCAACAGGCTCAAATCTGGCGCCGAGCGTGTCCTCGTCTCCTT
CGACATCTACAATCAAGGATCTGCGACGGCCTATGATGTGACTCTAACTGATAAAACCTG
GATTAAGAAAACTTTTGAACTTGTTAATGGAAACAAGTCACGAACATGGGAGAGACTTGA
TGCAGGAGGCATCCTGTCTCATTCTTTCGAATTAGAGGCTAAGGTTAAAGGACCCTTCTA
TGGCGCTCCTGCTCTTGTTACTTTCCGTATCCCCACTAAGGCTGTTCTACAGGAAGCCTA
CTCAAATCCAATACTACCTCTAAACATCCTCGCTGACATACCTCCAACAGACCTATTGGC
GCTGGCCAAGAGGGTGCTTGCGAAATATGGATCGCTTGTTTCAGTGATCTCCATGGTGGT
TTTGTTCGTATACTTGATAGCAACACCTTCAAAGCCCAATGCGGCAAAAGCGGGCAGCAA
GAAGAAACGCTAAGTTCGTGGAATGAAGTTGAGAAAAAGGTTGTTGTTTCTGTGCTTTAG
TTGTGTGTTAGCAGATTAAAACACAGTTTCAAAACTTGTAAGAATCGTAGAACACACTTT
ACTGTTCGCGTTGCAGAGTACTTTTTTATATGTTATTTTGTTCTGCGTAATAACATCGTT
TTGAGAGCATATTCATGAAGGTCTATTTTACTTTG

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 3

CO CL3058Contig1 1117 3 6 U
GGCCAATTAACATCTAAAAAAACAATAGTCGTGAGAAAGGAAAAGAAAAAACATGGCCGA
GTCAGTCCCTTCAAAGTTCCAAGAAACATCTCCGGTAGATATTCCTATCGTGGATCTAAG
TAACCCAAACGAAGACCTAGTGGCGCGTGCTGTGGTGAAAGCTAGCAAGACATGGGGGAT
GTTCCAGGTGGTTAACCACGGGATACCCACCGAGCTGATGCTGCGGTCGAAAGAACTGGG
GACTGAGTTCTTCGAGCTGCCTGAGAAGGAGAAGGAAGCCGTAGCGTGGCCAGCTGACTC
CACAGACTTAGAAGGATACACAACGGATTACAAGAAAGACGGAGAAGGTAGAAAAACATG
GGCTGATCATCTCTTTCACAGAGTCTGGCCACCGTCAAGAATTAACTACAGGTTCTGGCC
TAAGAACTCTCCAGATTACAGGGAAGTGAATGAGGAGTATGCAAGGGAGATAAAAAAGCT
GTCAGAGAAAATCATGGGATGGTTATCAGAAGGATTGGGGTTACATCGTGATGTGTTGAA
GGAAGGTCTCGGCGGAGAAACGGTGGAGTATCTGATGAAAATCATCTTCTATCCACCGTG
TCCAAAACTCGAACTGCTCTACGGAGCTCCTCATCACACAGATCTCAATGGTATCACGTT
CTTGATCGCTGACGAGGTAGACGGACTTCAGGCATACCAGGATAACAAGTGGGTCGACGT
CAAGTATGATGACTCCGGGATCGTCGTCATCATCGCTGATCAAATTAAGAGGATGAGCAA
TGGGAGGTATAAGAGTGGGGAGCATAGAGCGACGATGGATACGGTGAGGACGAGACTCTC
GTGGCCGGTGTTTGCGGAACCGAACCTTGATCACGTTGTCGGGCCTTTGGCAGAGCTAGT
TATTGATGATGCTCCTAAGTACAAGCCTTATGTCTACAGAGAGTACAAGTTTCTTAAGAT
GAACGAGCTTCCTCTCGACTGAAGCTATAATCTCATTATCCAGAAACAGAGGAGCGAAGA
TCATGAACGACTGTTTCAGTTAATTGATGTTGAAGTTTCGGTTAATTAATTATCAATGTA
CTATATGCTTTTATAAATAAATGCTGAAGTTCCGGTC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO16TF U 1
AF RR2C135TF U 2
AF RR2AO16JQ C 288
BS 1 143 RR2AO16TF
BS 144 144 RR2C135TF
BS 145 227 RR2AO16TF
BS 228 228 RR2C135TF
BS 229 679 RR2AO16TF
BS 680 1117 RR2AO16JQ

RD RR2AO16TF 680 0 0
GGCCAATTAACATCTAAAAAAACAATAGTCGTGAGAAAGGAAAAGAAAAAACATGGCCGA
GTCAGTCCCTTCAAAGTTCCAAGAAACATCTCCGGTAGATATTCCTATCGTGGATCTAAG
TAACCCAAACGAAGACCTAGTGGTGCGTGCTGTGGTGAAAGCTAGCAAGACATGGGGGAT
GTTCCAGGTGGTTAACCACGGGATACCCACCGAGCTGATGCTGCGGTTGAAAGAACTGGG
GACTGAGTTCTTCGAGCTGCCTGAGAAGGAGAAGGAAGCCGTAGCGTGGCCAGCTGACTC
CACAGACTTAGAAGGATACACAACGGATTACAAGAAAGACGGAGAAGGTAGAAAAACATG
GGCTGATCATCTCTTTCACAGAGTCTGGCCACCGTCAAGAATTAACTACAGGTTCTGGCC
TAAGAACTCTCCAGATTACAGGGAAGTGAATGAGGAGTATGCAAGGGAGATAAAAAAGCT
GTCAGAGAAAATCATGGGATGGTTATCAGAAGGATTGGGGTTACATCGTGATGTGTTGAA
GGAAGGTCTCGGCGGAGAAACGGTGGAGTATCTGATGAAAATCATCTTCTATCCACCGTG
TCCAAAACTCGAACTGCTCTACGGAGCTCCTCATCACACAGATCTCAATGGTATCACGTT
CTTGATCGCTGACGAGGTA
G

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2C135TF 678 0 0
GG
CAATTAACATCTAAAAAAACAATAGTCGTGAGAAAGGAAAAGAAAAAACATGGCCGAGTC
AGTCCCTTCAAAGTTCCAAGAAACATCTCCGGTAGATATTCCTATCGTGGATCTAAGTAA
CCCAAACGAAGACCTAGTGGCGCGTGCTGTGGTGAAAGCTAGCAAGACATGGGGGATGTT
CCAGGTGGTTAACCACGGGATACCCACCGAGCTGATGCTGCGGTCGAAAGAACTGGGGAC
TGAGTTCTTCGAGCTGCCTGAGAAGGAGAAGGAAGCCGTAGCGTGGCCAGCTGACTCCAC
AGACTTAGAAGGATACACAACGGATTACAAGAAAGACGGAGAAGGTAGAAAAACATGGGC
TGATCATCTCTTTCACAGAGTCTGGCCACCGTCAAGAATTAACTACAGGTTCTGGCCTAA
GAACTCTCCAGATTACAGGGAATTGAATGAGGAGTATGCAAGGGAGATAAAAAAGCTGTC
AGAGAAAATCATGGGATGGTTATCAGAAGGATTGGGGTTACATCGTGATGCGTTGAAGGA
AGGTCTCGGCGGAGAAACGGTGGAGTATCTGATGAAAATCATCTTCTATCCACCGTGTCC
AAAACTCGAACTGCTCTACGGAGCTCCTCATCACACAGATCTCAATGGTATCACGTTCTT
GATCGCTGACGAGGTA

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR2AO16JQ 830 0 0
GGCCAGCTGACTCCACAGACTTAGAAGGATACACAACGGATTACAAGAAAGACGGAGAAG
GTAGAAAAACATGGGCTGATCATCTCTTTCACAGAGTCTGGCCACCGTCAAGAATTAACT
ACAGGTTCTGGCCTAAGAACTCTCCAGATTACAGGGAAGTGAATGAGGAGTATGCAAGGG
AGATAAAAAAGCTGTCAGAGAAAATCATGGGATGGTTATCAGAAGGATTGGGGTTACATC
GTGATGTGTTGAAGGAAGGTCTCGGCGGAGAAACGGTGGAGTATCTGATGAAAATCATCT
TCTATCCACCGTGTCCAAAACTCGAACTGCTCTACGGAGCTCCTCATCACACAGATCTCA
ATGGTATCACGTTCTTGATCGCTGACGAGGTAGACGGACTTCAGGCATACCAGGATAACA
AGTGGGTCGACGTCAAGTATGATGACTCCGGGATCGTCGTCATCATCGCTGATCAAATTA
AGAGGATGAGCAATGGGAGGTATAAGAGTGGGGAGCATAGAGCGACGATGGATACGGTGA
GGACGAGACTCTCGTGGCCGGTGTTTGCGGAACCGAACCTTGATCACGTTGTCGGGCCTT
TGGCAGAGCTAGTTATTGATGATGCTCCTAAGTACAAGCCTTATGTCTACAGAGAGTACA
AGTTTCTTAAGATGAACGAGCTTCCTCTCGACTGAAGCTATAATCTCATTATCCAGAAAC
AGAGGAGCGAAGATCATGAACGACTGTTTCAGTTAATTGATGTTGAAGTTTCGGTTAATT
AATTATCAATGTACTATATGCTTTTATAAATAAATGCTGAAGTTCCGGTC

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 3

CO CL3059Contig1 1106 3 4 U
TTTTTATGCTTTCTACTGAAAGTCCTCTCAGATCCTTACTACCTCTTCAGAGAAGCCTTC
TTCAATTTCTTCTTAGCCCTAACCATTTTTTTGAATTCTATCATGAACGAGTGAGTGATC
TGTCTTTAAAGCTAATGGCTTTCTTCATCCTCCGATCTGGGTTTTGGTTTTAACTTCATA
CCCAAGTAGAAAAAATCAGAAGACGAGAGCTTGTAATTAGGGTTTATAGGTTTACCCTAA
AGGAACAATCTTTTTTTTGTAAAAAAAAAAAATCGGACATGATTCAGCTACTGTTTCTGG
TTCTGTTTGTGGAAGGTGCGATTACATTCTTGCTGCTGATAAAGATCGGTCCTTTGAGGG
AGCTTGTGATTAAAAGCCTCGACCAGATGAAGATGGGGAAAGGTCCCGCCACCGTGAAAA
CCATCGCCGGAACCATGGCTGTTATCCTCTTCTCCAATCTCATGAGCATTGTCAAGATCC
AGAACAAAGGTGCCAAGCTCGGGACTATGTCTCCCATGGATCAGGTTCTTTGGAGAACCC
ATTTGCTTGAAGCCTCTCTAATGGGAGTGGTACTTTTTCTTGGCTTCGTGATTGACAGAA
TGCACCACTACATGAGAAAGCTAATCAATATAAGAGGCAACGTCGGGTCATCGAAAGAAG
AACTCGAACAGCTACAGAAAGAGAGAACCGAACTGAAGGAGAAAGAGGAGAAGGCGTCCA
AGGAAATCAAGCAGCTTCAAGAGAAACTGTCAACTATGTCAGAGAGGCTCAAGAAAGCAG
AGACGGAGTGTAAAGAGAAAGAAAAGAAGGTGGAGGCAGCTGAAACACATGTCACGGATC
TCCAAAAACAGTCCGCAGAGCTGCTACTTGAGTACGATAGGTTGCTAGAAGATAACGAGA
AGCTCCAGAGTCAGATTTTGGGGAACACGAAGAGCTAATGTTAAGATCGCTGGGTTTGTC
ATTTTTACCGAGGTTGTTGTTTTGTTTAGAGTATTTGTTAACAATGGTGATTGAGAAGAG
AGTTTTGCAGTTGGGTGTTGAATGTCTGATTGCTGCAGAGATGAATTTTAGATTTTAAAT
TACAGATGAGAGATGATGTTAATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DM66TF U 1
AF RR2AD51JQ C 478
AF RR2AD51TF U 478
BS 1 510 RR2DM66TF
BS 511 511 RR2AD51TF
BS 512 632 RR2DM66TF
BS 633 1106 RR2AD51TF

RD RR2DM66TF 632 0 0
TTTTTATGCTTTCTACTGAAAGTCCTCTCAGATCCTTACTACCTCTTCAGAGAAGCCTTC
TTCAATTTCTTCTTAGCCCTAACCATTTTTTTGAATTCTATCATGAACGAGTGAGTGATC
TGTCTTTAAAGCTAATGGCTTTCTTCATCCTCCGATCTGGGTTTTGGTTTTAACTTCATA
CCCAAGTAGAAAAAATCAGAAGACGAGAGCTTGTAATTAGGGTTTATAGGTTTACCCTAA
AGGAACAATCTTTTTTTTGTAAAAAAAAAAAATCGGACATGATTCAGCTACTGTTTCTGG
TTCTGTTTGTGGAAGGTGCGATTACATTCTTGCTGCTGATAAAGATCGGTCCTTTGAGGG
AGCTTGTGATTAAAAGCCTCGACCAGATGAAGATGGGGAAAGGTCCCGCCACCGTGAAAA
CCATCGCCGGAACCATGGCTGTTATCCTCTTCTCCAATCTCATGAGCATTGTCAAGATCC
AGAACAAAGGTGCCAAGCTCGGGACTATGTTTCCCATGGATCAGGTTCTTTGGAGAACCC
ATTTGCTTGAAGCCTCTCTAATGGGAGTGGTACTTTTTCTTGGCTTCGTGATTGACAGAA
TGCACCACTACATGAGAAAGCTAATCAATATA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2AD51JQ 629 0 0
G
CCAGAACAAAGGTGCCAAGCTCGGGACTATGTCTCCCATGGATCAGGTTCTTTGGAGAAC
CCATTTGCTTGAAGCCTCTCTAATGGGAGTGGTACTTTTTCTTGGCTTCGTGATTGACAG
AATGCACCACTACATGAGAAAGCTAATCAATATAAGAGGCAACGTCGGGTCATCGAAAGA
AGAACTCGAACAGCTACAGAAAGAGAGAACCGAACTGAAGGAGAAAGAGGAGAAGGCGTC
CAAGGAAATCAAGCAGCTTCAAGAGAAACTGTCAACTATGTCAGAGAGGCTCAAGAAAGC
AGAGACGGAGTGTAAAGAGAAAGAAAAGAAGGTGGAGGCAGCTGAAACACATGTCACGGA
TCTCCAAAAACAGTCCGCAGAGCTGCTACTTGAGTACGATAGGTTGCTAGAAGATAACGA
GAAGCTCCAGAGTCAGATTTTGGGGAACACGAAGAGCTAATGTTAAGATCGCTGGGTTTG
TCATTTTTACCGAGGTTGTTGTTTTGTTTAGAGTATTTGTTAACAATGGTGATTGAGAAG
AGAGTTTTGCAGTTGGGTGTTGAATGTCTGATTGCTGCAGAGATGAATTTTAGATTTTAA
ATTACAGATGAGAGATGATGTTAATGTT

QA 2 629 2 629
DS 

RD RR2AD51TF 629 0 0
G
CCAGAACAAAGGTGCCAAGCTCGGGACTATGTCTCCCATGGATCAGGTTCTTTGGAGAAC
CCATTTGCTTGAAGCCTCTCTAATGGGAGTGGTACTTTTTCTTGGCTTCGTGATTGACAG
AATGCACCACTACATGAGAAAGCTAATCAATATAAGAGGCAACGTCGGGTCATCGAAAGA
AGAACTCGAACAGCTACAGAAAGAGAGAACCGAACTGAAGGAGAAAGAGGAGAAGGCGTC
CAAGGAAATCAAGCAGCTTCAAGAGAAACTGTCAACTATGTCAGAGAGGCTCAAGAAAGC
AGAGACGGAGTGTAAAGAGAAAGAAAAGAAGGTGGAGGCAGCTGAAACACATGTCACGGA
TCTCCAAAAACAGTCCGCAGAGCTGCTACTTGAGTACGATAGGTTGCTAGAAGATAACGA
GAAGCTCCAGAGTCAGATTTTGGGGAACACGAAGAGCTAATGTTAAGATCGCTGGGTTTG
TCATTTTTACCGAGGTTGTTGTTTTGTTTAGAGTATTTGTTAACAATGGTGATTGAGAAG
AGAGTTTTGCAGTTGGGTGTTGAATGTCTGATTGCTGCAGAGATGAATTTTAGATTTTAA
ATTACAGATGAGAGATGATGTTAATGTT

QA 2 629 2 629
DS 



AS 1 3

CO CL3060Contig1 723 3 30 U
GGACCAAAGGATAACCCACGAAAAAAAAGAATCAAGACTTTCACTAAGATAAAACCAAGA
ACCATCACCATGGCCTCAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCGTTCACCGGCCTC
AAATCCACAGTCTCCAAACCCTCCGCCGTCGTCAGGCTCCCCACCACAACATCACGGAAC
CTCACCGTGAAGTCATCTCTAAAGGACTTCGGAGTCGCCGTCGTAGCGGCTGCAGCTTCC
ATCGCTTTGGCAGGAAACGCCATGGCGATAGACGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCT
TTGGCTTTCGTTCCCAACGAGTTCACGATAGCGAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAAC
AACGCTGGATTCCCGCACAACGTTGTGTTCGACGAGGACGAGATCCCGAGCGGCGTTGAC
GCGAGCAAGATCTCCATGGACGAGCAGGATCTACTCAACGCCGCTGGAGAGACGTACGAG
GTTGCTTTGACTGAGCCTGGGACCTACAGCTTCTACTGTGCGCCGCATCAGGGTGCTGGT
ATGGTTGGCAAAGTCACCGTTAACTAAATAAATTGTGTGTGTAAATGCGAAAGAGTGTCT
CTGATCCATGTAGAGGCTTTTCTTTCAGTTTTACTTACATAAAGGTGTTTTGTACTACTT
ATAAAGAGTGTTGGAATCAAATGGACATTGATTTGTTATAATATGAGAGTGCTGGTTCCA
TCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2DG72TF U 1
AF RR2F494JQ C 1
AF RR2F494TF U 1
BS 1 19 RR2DG72TF
BS 20 20 RR2F494TF
BS 21 28 RR2DG72TF
BS 29 31 RR2F494TF
BS 32 44 RR2DG72TF
BS 45 45 RR2F494TF
BS 46 49 RR2DG72TF
BS 50 50 RR2F494TF
BS 51 63 RR2DG72TF
BS 64 64 RR2F494TF
BS 65 129 RR2DG72TF
BS 130 130 RR2F494TF
BS 131 155 RR2DG72TF
BS 156 156 RR2F494TF
BS 157 162 RR2DG72TF
BS 163 163 RR2F494TF
BS 164 218 RR2DG72TF
BS 219 219 RR2F494TF
BS 220 220 RR2DG72TF
BS 221 221 RR2F494TF
BS 222 251 RR2DG72TF
BS 252 252 RR2F494TF
BS 253 304 RR2DG72TF
BS 305 305 RR2F494TF
BS 306 449 RR2DG72TF
BS 450 450 RR2F494TF
BS 451 484 RR2DG72TF
BS 485 485 RR2F494TF
BS 486 689 RR2DG72TF
BS 690 723 RR2F494TF

RD RR2DG72TF 689 0 0
GGACCAAAGGATAACCCACCAAAAAAAAACTTCAAGACTTTCACCAAGACAAAACCAAGA
ACCTTCACCATGGCCTCAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCGTTCACCGGCCTC
AAATCCACAATCTCCAAACCCTCCGCCGTCGTCAGACTCCCCGCCACAACATCACGGAAC
CTCACCGTGAAGTCATCTCTAAAGGACTTCGGAGTCGCGGCCGTAGCGGCTGCAGCTTCC
ATCGCTTTGGCCGGAAACGCCATGGCGATAGACGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCT
TTGGTTTTCGTTCCCAACGAGTTCACGATAGCGAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAAC
AACGCTGGATTCCCGCACAACGTTGTGTTCGACGAGGACGAGATCCCGAGCGGCGTTGAC
GCGAGCAAGATCTCCATGGACGAGCAGGACCTACTCAACGCCGCTGGAGAGACGTACGAG
GTTGTTTTGACTGAGCCTGGGACCTACAGCTTCTACTGTGCGCCGCATCAGGGTGCTGGT
ATGGTTGGCAAAGTCACCGTTAACTAAATAAATTGTGTGTGTAAATGCGAAAGAGTGTCT
CTGATCCATGTAGAGGCTTTTCTTTCAGTTTTACTTACATAAAGGTGTTTTGTACTACTT
ATAAAGAGTGTTGGAATCAAATGGACATT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2F494JQ 723 0 0
GGACCAAAGGATAACCCACGAAAAAAAAGAATCAAGACTTTCACTAAGATAAAACCAAGA
ACCATCACCATGGCCTCAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCGTTCACCGGCCTC
AAATCCACAGTCTCCAAACCCTCCGCCGTCGTCAGGCTCCCCACCACAACATCACGGAAC
CTCACCGTGAAGTCATCTCTAAAGGACTTCGGAGTCGCCGTCGTAGCGGCTGCAGCTTCC
ATCGCTTTGGCAGGAAACGCCATGGCGATAGACGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCT
TTGGCTTTCGTTCCCAACGAGTTCACGATAGCGAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAAC
AACGCTGGATTCCCGCACAACGTTGTGTTCGACGAGGACGAGATCCCGAGCGGCGTTGAC
GCGAGCAAGATCTCCATGGACGAGCAGGATCTACTCAACGCCGCTGGAGAGACGTACGAG
GTTGCTTTGACTGAGCCTGGGACCTACAGCTTCTACTGTGCGCCGCATCAGGGTGCTGGT
ATGGTTGGCAAAGTCACCGTTAACTAAATAAATTGTGTGTGTAAATGCGAAAGAGTGTCT
CTGATCCATGTAGAGGCTTTTCTTTCAGTTTTACTTACATAAAGGTGTTTTGTACTACTT
ATAAAGAGTGTTGGAATCAAATGGACATTGATTTGTTATAATATGAGAGTGCTGGTTCCA
TCC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2F494TF 723 0 0
GGACCAAAGGATAACCCACGAAAAAAAAGAATCAAGACTTTCACTAAGATAAAACCAAGA
ACCATCACCATGGCCTCAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCGTTCACCGGCCTC
AAATCCACAGTCTCCAAACCCTCCGCCGTCGTCAGGCTCCCCACCACAACATCACGGAAC
CTCACCGTGAAGTCATCTCTAAAGGACTTCGGAGTCGCCGTCGTAGCGGCTGCAGCTTCC
ATCGCTTTGGCAGGAAACGCCATGGCGATAGACGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCT
TTGGCTTTCGTTCCCAACGAGTTCACGATAGCGAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAAC
AACGCTGGATTCCCGCACAACGTTGTGTTCGACGAGGACGAGATCCCGAGCGGCGTTGAC
GCGAGCAAGATCTCCATGGACGAGCAGGATCTACTCAACGCCGCTGGAGAGACGTACGAG
GTTGCTTTGACTGAGCCTGGGACCTACAGCTTCTACTGTGCGCCGCATCAGGGTGCTGGT
ATGGTTGGCAAAGTCACCGTTAACTAAATAAATTGTGTGTGTAAATGCGAAAGAGTGTCT
CTGATCCATGTAGAGGCTTTTCTTTCAGTTTTACTTACATAAAGGTGTTTTGTACTACTT
ATAAAGAGTGTTGGAATCAAATGGACATTGATTTGTTATAATATGAGAGTGCTGGTTCCA
TCC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 3

CO CL3061Contig1 1102 3 11 U
CGCTCTAAAAGTCCTCACTCCTCGGTGGGTCTTCAAATTTATAGAAATAAAAAGTTTTGA
TTTTTTGATACACACATAGAAAGGTAAAAGAGAGTTAAAAATGTTGCAATAAAACTGCCA
CTAGAGAAGACAACATTACTACAGCCAACCTGGGCAGCTTTTATATAACACATAAGACTT
AATAATCCTCTAAATCTCTCTTTAACCTCCTTTTTTGCTTCTTCTAATACACAGAATCAT
CAGGAAAAGGCCAACCATTGTTAGTCTTCTTTTGCTTCATTACTAGTCTTGGTTATCTCA
AATTACCATTGGATCATCCATCGATGAAACCATCTGAGCCTCTGCTGCTTCCCCGCTTAT
CCGCTCCACAGGCATCACCTCAGCTGGTGATCGATCC*AGAGACATAGTTCTTGCCATCT
CAAGTGAATGACGCAATCCTTTCACAGCGTCAAA*GTTCTTGTATGTATAGCCAACAAAG
CTTAAATCCTTGGGTGCAAGATTCTTCCTGGAGGTACCCGATTTAGTTCTTTCAGTTGCA
GGAGAATTCACTTCATCAAACTTCATAAAGTTTTGTGTATCTAGCTCGTCGTTCACTTCT
GGTTTGTAAGCAGCCTCCATTTCATAGAGCTTTTCCCAAACAACATCTTTGAACCAAGGA
TGAACCTTGATTTGCTGGGCTCCTCCCCCAGTGCCAAGTCTATGGTCAACGTTGCACAGC
AACCTGCAGATAAGATCTTTTGCCTCGCGTGACAGCTTAGCATCCTCGGGAAATTGCAAA
TGATTTCTCCAATTGACAATCTTTCTGCATGTGGATAATGGGTCATCTGCATAAAAAGGA
GGATACCCAACGAGCATTTCGTACATAATTGCACCTAGTGACCACCAATCACACTCCATG
CCATATCCCTTCTTCAGTAAAACTTCAGGAGCTATATAGTCGGGTGTTCCCACAGTCGAA
AATGCCAGTGTTCTGCGATTCATCTGCCAATGCTGAAGTTGTTCCTGGGGACTGCGCCAG
CTTCTTTTGTTATCAGTGTCGGGAAAAGCTCTATCAACATCCACAGGTTCTGAAACAGCT
TCATCATCGGTGGCCCTATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG22JQB U 1
AF RR2B872JQ U 43
AF RR2B872TF C 294
BS 1 251 RR2GG22JQB
BS 252 252 RR2B872JQ
BS 253 387 RR2GG22JQB
BS 388 388 RR2B872JQ
BS 389 399 RR2GG22JQB
BS 400 400 RR2B872JQ
BS 401 758 RR2GG22JQB
BS 759 759 RR2B872JQ
BS 760 832 RR2GG22JQB
BS 833 882 RR2B872JQ
BS 883 1102 RR2B872TF

RD RR2GG22JQB 832 0 0
CGCTCTAAAAGTCCTCACTCCTCGGTGGGTCTTCAAATTTATAGAAATAAAAAGTTTTGA
TTTTTTGATACACACATAGAAAGGTAAAAGAGAGTTAAAAATGTTGCAATAAAACTGCCA
CTAGAGAAGACAACATTACTACAGCCAACCTGGGCAGCTTTTATATAACACATAAGACTT
AATAATCCTCTAAATCTCTCTTTAACCTCCTTTTTTGCTTCTTCTAATACACAGAATCAT
CAGGAAAAGGCTAACCATTGTTAGTCTTCTTTTGCTTCATTACTAGTCTTGGTTATCTCA
AATTACCATTGGATCATCCATCGATGAAACCATCTGAGCCTCTGCTGCTTCCCCGCTTAT
CCGCTCCACAGGCATCACCTCAGCTGGCGATCGATCC*AAAGACATAGTTCTTGCCATCT
CAAGTGAATGACGCAATCCTTTCACAGCGTCAAA*GTTCTTGTATGTATAGCCAACAAAG
CTTAAATCCTTGGGTGCAAGATTCTTCCTGGAGGTACCCGATTTAGTTCTTTCAGTTGCA
GGAGAATTCACTTCATCAAACTTCATAAAGTTTTGTGTATCTAGCTCGTCGTTCACTTCT
GGTTTGTAAGCAGCCTCCATTTCATAGAGCTTTTCCCAAACAACATCTTTGAACCAAGGA
TGAACCTTGATTTGCTGGGCTCCTCCCCCAGTGCCAAGTCTATGGTCAACGTTGCACAGC
AACCTGCAGATAAGATCTTTTGCCTCGCGTGACAGCTTGGCATCCTCGGGAAATTGCAAA
TGATTTCTCCAATTGACAATCTTTCTGCATGTGGATAATGGGTCATCTGCAT

QA 1 832 1 832
DS 

RD RR2B872JQ 840 0 0
AGAAATAAAAAGTTT*GATTTTTTGATACACACATAGAAAGGTAAAAGAGAGTTAAAAAT
GTTGCAATAAAACTGCCACTAGAGAAGACAACATTACTACAGCCAACCTGGGCAGCTTTT
ATATAACACATAAGACTTAATAATCCTCTAAATCTCTCTTTAACCTCCTTTTTTGCTTCT
TCTAATACACAGAATCATCAGGAAAAGGCCAACCATTGTTAGTCTTCTTTTGCTTCATTA
CTAGTCTTGGTTATCTCAAATTACCATTGGATCATCCATCGATGAAACCATCTGAGCCTC
TGCTGCTTCCCCGCTTATCCGCTCCACAGGCATCACCTCAGCTGGTGATCGATCC*AGAG
ACATAGTTCTTGCCATCTCAAGTGAATGACGCAATCCTTTCACAGCGTCAAA*GTTCTTG
TATGTATAGCCAACAAAGCTTAAATCCTTGGGTGCAAGATTCTTCCTGGAGGTACCCGAT
TTAGTTCTTTCAGTTGCAGGAGAATTCACTTCATCAAACTTCATAAAGTTTTGTGTATCT
AGCTCGTCGTTCACTTCTGGTTTGTAAGCAGCCTCCATTTCATAGAGCTTTTCCCAAACA
ACATCTTTGAACCAAGGATGAACCTTGATTTGCTGGGCTCCTCCCCCAGTGCCAAGTCTA
TGGTCAACGTTGCACAGCAACCTGCAGATAAGATCTTTTGCCTCGCGTGACAGCTTAGCA
TCCTCGGGAAATTGCAAATGATTTCTCCAATTGACAATCTTTCTGCATGTGGATAATGGG
TCATCTGCATAAAAAGGAGGATACCCAACGAGCATTTCGTACATAATTGCACCTAGTGAC

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2B872TF 809 0 0
TATCTCAAATTACCATTGGATCATCCATCGATGAAACCATCTGAGCCTCTGCTGCTTCCC
CGCTTATCCGCTCCACAGGCATCACCTCAGCTGGTGATCGATCCCAGAGACATAGTTCTT
GCCATCTCAAGTGAATGACGCAATCCTTTCACAGCGTCAAAAGTTCTTGTATGTATAGCC
AACAAAGCTTAAATCCTTGGGTGCAAGATTCTTCCTGGAGGTACCCGATTTAGTTCTTTC
AGTTGCAGGAGAATTCACTTCATCAAACTTCATAAAGTTTTGTGTATCTAGCTCGTCGTT
CACTTCTGGTTTGTAAGCAGCCTCCATTTCATAGAGCTTTTCCCAAACAACATCTTTGAA
CCAAGGATGAACCTTGATTTGCTGGGCTCCTCCCCCAGTGCCAAGTCTATGGTCAACGTT
GCACAGCAACCTGCAGATAAGATCTTTTGCCTCGCGTGACAGCTTAGCATCCTCGGGAAA
TTGCAAATGATTTCTCCAATTGACAATCTTTCTGCATGTGGATAATGGGTCATCTGCATA
AAAAGGAGGATACCCAACGAGCATTTCGTACATAATTGCACCTAGTGACCACCAATCACA
CTCCATGCCATATCCCTTCTTCAGTAAAACTTCAGGAGCTATATAGTCGGGTGTTCCCAC
AGTCGAAAATGCCAGTGTTCTGCGATTCATCTGCCAATGCTGAAGTTGTTCCTGGGGACT
GCGCCAGCTTCTTTTGTTATCAGTGTCGGGAAAAGCTCTATCAACATCCACAGGTTCTGA
AACAGCTTCATCATCGGTGGCCCTATTCT

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

CO CL3062Contig1 1143 2 2 U
GGTGATACTGTTGATTTAAATTCAATATGAAAAAAAAATAGTGTTGATGGGATACAAAAG
GACAAAAAACTTTGTTACAAAATACAAAGGAAGAATATCGATTATGCTATATATGTTTTC
TTACGTGTGAATGTGGAACAGTAGTGAGTGGTTAATGTAATGGCTTGAGGTGGAAGACTT
GGCAGGCTGGTTTGTATGATCCTTTGGAAACAGCTTGTTCAAACTTCTTGCTTGGTCCTT
CGTTTTCTTCTAAGCTTGTCTGGACAGAGAACCGGTTCCACCATGATGCACTACGCATTT
TAGCGGGACGCCCAAATTTAGACAATTCAGCAACTTTAGCTCTCTGCTGACCAGGGAGAC
CAGAAAAAAGAACCAAACCATCAGAAGCAACTCTAGCAAGTTCAGGGACGGTCTTGTTAA
GGTACTTGGGGGAGAGATAATCGAGAGCATCTGAAACGATGACAAGAGAGAAAGATTTCG
CCCTGTAAGGGAGAGGGAACTTGATATCAGCGACACGTACAAGGCCTTTGCTGACAAGAC
TCTTGCAGTGAGAATCAGCATCCTCGATATCATAAGGTTCGACACCCCACGCTTCGGCCT
CGTCATCTTCATTCAAGAGAGCTGAAACCACAGAGCAAGTCTCAGGGCCTACGTGTAAGA
CCTTGCGCATCCCATCTCCGTAAGCTTTCTTAAGAAGAGAAACGGCTTTTTGAACTTCTG
AAGTGCAAGAATAGTCACCTGAAACTTTGCTGACTTCTTTGACACTTTTAAAGATTCCTG
GACCACTGTAAGCATACCAAATGAGAAGGGAAGCCCCCAGAAGAAGAAGGCAAATAGATA
AAAGAGGAGAAGAACGAGACTTGGAGTGAGAAGCTCCAGCAAAAGGGAAGCTACCGCCAT
CTCCTACACGCCGTGTTGTACCTGCTTGCCTTCTCGCCATTATTTAATAAGATCCCACAA
AGCTATTCGATCTCTTAGAGCAATGAATGATACAGAAGAAGAATAAAAGAATGGTGTTGG
GATGGGATGAAAGATCTGAGATCCGAGAAAATGAGCCTTTAACACCTTTTCTCTGTACAC
TTGAATCAATCAATTTTAATTTTAACTAAAGGAGGAGGAGGAGAATAAGCTTCGCAATCG
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2FL92JQ U 1
AF RR2BS72TF C 363
BS 1 593 RR2FL92JQ
BS 594 1143 RR2BS72TF

RD RR2FL92JQ 593 0 0
GGTGATACTGTTGATTTAAATTCAATATGAAAAAAAAATAGTGTTGATGGGATACAAAAG
GACAAAAAACTTTGTTACAAAATACAAAGGAAGAATATCGATTATGCTATATATGTTTTC
TTACGTGTGAATGTGGAACAGTAGTGAGTGGTTAATGTAATGGCTTGAGGTGGAAGACTT
GGCAGGCTGGTTTGTATGATCCTTTGGAAACAGCTTGTTCAAACTTCTTGCTTGGTCCTT
CGTTTTCTTCTAAGCTTGTCTGGACAGAGAACCGGTTCCACCATGATGCACTACGCATTT
TAGCGGGACGCCCAAATTTAGACAATTCAGCAACTTTAGCTCTCTGCTGACCAGGGAGAC
CAGAAAAAAGAACCAAACCATCAGAAGCAACTCTAGCAAGTTCAGGGACGGTCTTGTTAA
GGTACTTGGGGGAGAGATAATCGAGAGCATCTGAAACGATGACAAGAGAGAAAGATTTCG
CCCTGTAAGGGAGAGGGAACTTGATATCAGCGACACGTACAAGGCCTTTGCTGACAAGAC
TCTTGCAGTGAGAATCAGCATCCTCGATATCATAAGGTTCGACACCCCACGCT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2BS72TF 781 0 0
GC
AAAAAGAACCAAACCGTCTGAAGCAACTCTAGCAAGT*CAGGGACGGTCTTGTTAAGGTA
CTTGGGG*AGAGATAATCGAGAGCATCTGAGACGATGACAAGAGAGAAAGATTTCGCCCT
GTAGGGGAGAGGGAACTTGATATCAGCGACACGTACAAGGCCTTTGCTGACAAGACTCTT
GCAGTGAGAATCAGCATCCTCGATATCATAAGGTTCGACACCCCACGCTTCGGCCTCGTC
ATCTTCATTCAAGAGAGCTGAAACCACAGAGCAAGTCTCAGGGCCTACGTGTAAGACCTT
GCGCATCCCATCTCCGTAAGCTTTCTTAAGAAGAGAAACGGCTTTTTGAACTTCTGAAGT
GCAAGAATAGTCACCTGAAACTTTGCTGACTTCTTTGACACTTTTAAAGATTCCTGGACC
ACTGTAAGCATACCAAATGAGAAGGGAAGCCCCCAGAAGAAGAAGGCAAATAGATAAAAG
AGGAGAAGAACGAGACTTGGAGTGAGAAGCTCCAGCAAAAGGGAAGCTACCGCCATCTCC
TACACGCCGTGTTGTACCTGCTTGCCTTCTCGCCATTATTTAATAAGATCCCACAAAGCT
ATTCGATCTCTTAGAGCAATGAATGATACAGAAGAAGAATAAAAGAATGGTGTTGGGATG
GGATGAAAGATCTGAGATCCGAGAAAATGAGCCTTTAACACCTTTTCTCTGTACACTTGA
ATCAATCAATTTTAATTTTAACTAAAGGAGGAGGAGGAGAATAAGCTTCGCAATCGCCC

QA 3 781 3 781
DS 



AS 1 3

CO CL3063Contig1 688 3 5 U
GGAACCAACTCATTATTGTTATCGTCTCAAATACGCTTTGCTTTGTTCATATACAACTTT
TTAACCTTTCTAGAGAGTTTCCACAGAGATGGCGGGTCGGGGAAAACAACTTGGATCTGG
CGCAGCGAAGAAGGCTACTTCTCGTAGTAGCAAGGCCGGGCTCCAATTCCCTGTGGGTCG
TATCGCTCGATTCCTCAAGGCCGGGAAGTACGCTGAGCGTGTTGGAGCCGGAGCTCCGGT
TTATCTCGCCGCCGTTCTTGAATACCTCGCCGCTGAGGTGCTTGAGCTCGCTGGGAACGC
TGCAAGAGATAACAAGAAGACAAGGATTGTGCCTCGTCACATTCAGCTTGCTGTGAGGAA
CGATGAGGAGCTAAGCAAGCTACTTGGAGATGTGACGATTGCTAATGGAGGAGTGATGCC
TAACATCCACAATCTCCTTCTCCCGAACAAGAAGGCTGGCTCATCTAAGCCTACCGATGA
AGATTAGGATATCCTAAGTGACAAAGCTGATAATGGTGTGATGTCAGAGTGGACACGTAG
TAGAGGACGCTTACACAACAGCTGTGTGGTATTAGTAGTAGTTGCATATGATATTTTGTT
TCTGTTGTGTGAATATAAGAAGAACACTACACTCTTCTGCTTTAGGTGTTACTGTAATAT
TCCACTTTGTTGACTTATTGCAATGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RR2GX34TF U 1
AF RR2FZ72JQ C 145
AF RR2FZ72TF U 5
BS 1 568 RR2GX34TF
BS 569 569 RR2FZ72TF
BS 570 663 RR2GX34TF
BS 664 664 RR2FZ72TF
BS 665 688 RR2GX34TF

RD RR2GX34TF 688 0 0
GGAACCAACTCATTATTGTTATCGTCTCAAATACGCTTTGCTTTGTTCATATACAACTTT
TTAACCTTTCTAGAGAGTTTCCACAGAGATGGCGGGTCGGGGAAAACAACTTGGATCTGG
CGCAGCGAAGAAGGCTACTTCTCGTAGTAGCAAGGCCGGGCTCCAATTCCCTGTGGGTCG
TATCGCTCGATTCCTCAAGGCCGGGAAGTACGCTGAGCGTGTTGGAGCCGGAGCTCCGGT
TTATCTCGCCGCCGTTCTTGAATACCTCGCCGCTGAGGTGCTTGAGCTCGCTGGGAACGC
TGCAAGAGATAACAAGAAGACAAGGATTGTGCCTCGTCACATTCAGCTTGCTGTGAGGAA
CGATGAGGAGCTAAGCAAGCTACTTGGAGATGTGACGATTGCTAATGGAGGAGTGATGCC
TAACATCCACAATCTCCTTCTCCCGAACAAGAAGGCTGGCTCATCTAAGCCTACCGATGA
AGATTAGGATATCCTAAGTGACAAAGCTGATAATGGTGTGATGTCAGAGTGGACACGTAG
TAGAGGACGCTTACACAACAGCTGTGTG*TATTAGTAGTAGTTGCATATGATATTTTGTT
TCTGTTGTGTGAATATAAGAAGAACACTACACTCTTCTGCTTTAGGTGTTACTGTAATAT
TCCGCTTTGTTGACTTATTGCAATGGCT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2FZ72JQ 540 0 0
TAGTAGCAAGGCCGGGCTCCAATTCCCTGTGGGTCGTATCGCTCGATTCCTCAAGGCCGG
GAAGTACGCTGAGCGTGTTGGAGCCGGAGCTCCGGTTTATCTCGCCGCCGTTCTTGAATA
CCTCGCCGCTGAGGTGCTTGAGCTCGCTGGGAACGCTGCAAGAGATAACAAGAAGACAAG
GATTGTGCCTCGTCACATTCAGCTTGCTGTGAGGAACGATGAGGAGCTAAGCAAGCTACT
TGGAGATGTGACGATTGCTAATGGAGGAGTGATGCCTAACATCCACAATCTCCTTCTCCC
GAACAAGAAGGCTGGCTCATCTAAGCCTACCGATGAAGATTAGGATATCCTAAGTGACAA
AGCTGATAATGGTGTGATGTCAGAGTGGACACGTAGTAGAGGACGCTTACACAACAGCTG
TGTGGTATTAGTAGTAGTTGCATATGATATTTTGTTTCTGTTGTGTGAATATAAGAAGAA
CACTACACTCTTCTGCTTTAGGTGTTACTGTAATATTCCACTTTGTTGACTTATTGCAA
T

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2FZ72TF 679 0 0
GG
AACTCATTATTGTTATCGTCTCAAATACGCTTTGCTTTGTTCATATACAACTTTTTAACC
TTTCTAGAGAGTTTCCACAGAGATGGCGGGTCGGGGAAAACAACTTGGATCTGGCGCAGC
TAAGAAGGCTACTTCTCGTAGTAGCAAGGCCGGGCTCCAATTCCCTGTGGGTCGTATCGC
TCGATTCCTCAAGGCCGGGAAGTACGCTGAGCGTGTTGGAGCCGGAGCTCCGGTTTATCT
CGCCGCCGTTCTTGAATACCTCGCCGCTGAGGTGCTTGAGCTCGCTGGGAACGCTGCAAG
AGATAACAAGAAGACAAGGATTGTGCCTCGTCACATTCAGCTTGCTGTGAGGAACGATGA
GGAGCTAAGCAAGCTACTTGGAGATGTGACGATTGCTAATGGAGGAGTGATGCCTAACAT
CCACAATCTCCTTCTCCCGAACAAGAAGGCTGGCTCATCTAAGCCTACCGATGAAGATTA
GGATATCCTAAGTGACAAAGCTGATAATGGTGTGATGTCAGAGTGGACACGTAGTAGAGG
ACGCTTACACAACAGCTGTGTGGTATTAGTAGTAGTTGCATATGATATTTTGTTTCTGTT
GTGTGAATATAAGAAGAACACTACACTCTTCTGCTTTAG*TGTTACTGTAATATTCCACT
TTGTTGACTTATTGCAA

QA 3 679 3 679
DS 



AS 1 2

CO CL3064Contig1 833 2 8 U
GGACTTCACACTTGAGACCTCTCTCTCTATCTATCTATCGCTGCCGCTTCGGTGCTTAGA
TAGAGCCCATTTTCCACTAACTAAAGAGAAGAGAAAGTTCCTTGGTTTCCCAATATAGAC
TCACCTATTATAGAAGAAGAAGCAGCAACTTCTTAGATCCGATTCTCACTCCCCTCTCTC
TCCCTCTGCCTTGATCTTGATCTGTTTGTTCCCATTCCTCTTCTGAATCTAAGAGCCACT
GACACGAGAAGGAGAAGGCGATGAGAGGAGGAAGATCAGACGGAGGCAAAAAGAAGCCAG
TGATCGCTTTGGTCTGCATTGCAGCGGTACTTCTTGTTTTTGTATACCTCTTCTTCGGCT
CCTCTAACCATGGAGCCTCAGCTATTGAGTATGGGAGGAAGCTTGGTTTGGGTGGTGATG
ATGATCCCACCACCAAAAAGGACGAGCCTTCTTCTACCTCCTCCTTTTATGTAGATGATA
ATGATGATGATGTCAATGGTTTCACTCCAAGAAGCTTCCCTGTGTGTGATGACCGCCACT
CGGAGCTTATTCCTTGCTTAGACAGGAACCTCATTTACCAGATGAGATTGAAGCTTGACT
TGTCTTTGATGGAGCATTATGAGCGTCACTGTCCTCCTCCTGAAAGAAGGTTTAACTGCT
TGATTCCTCCTCCTCCTGGTTATAAGGTTCCGATTAAGTGGCCGAAAAGCAGAGACGAAG
TTTGGAAAGTGAACATTCCTCATACTCACCTTGCTCATGAGAAGTCTGACCAGAACTGGA
TGTTTGTCAAAGGGGATAAAATCAATTTCCCTGGTGGTGGCACTCATTTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F855TF U 1
AF RR2F137TF U 61
BS 1 266 RR2F855TF
BS 267 267 RR2F137TF
BS 268 528 RR2F855TF
BS 529 529 RR2F137TF
BS 530 649 RR2F855TF
BS 650 650 RR2F137TF
BS 651 664 RR2F855TF
BS 665 833 RR2F137TF

RD RR2F855TF 664 0 0
GGACTTCACACTTGAGACCTCTCTCTCTATCTATCTATCGCTGCCGCTTCGGTGCTTAGA
TAGAGCCCATTTTCCACTAACTAAAGAGAAGAGAAAGTTCCTTGGTTTCCCAATATAGAC
TCACCTATTATAGAAGAAGAAGCAGCAACTTCTTAGATCCGATTCTCACTCCCCTCTCTC
TCCCTCTGCCTTGATCTTGATCTGTTTGTTCCCATTCCTCTTCTGAATCTAAGAGCCACT
GACACGAGAAGGAGAAGGCGATGAGATGAGGAAGATCAGACGGAGGCAAAAAGAAGCCAG
TGATCGCTTTGGTCTGCATTGCAGCGGTACTTCTTGTTTTTGTATACCTCTTCTTCGGCT
CCTCTAACCATGGAGCCTCAGCTATTGAGTATGGGAGGAAGCTTGGTTTGGGTGGTGATG
ATGATCCCACCACCAAAAAGGACGAGCCTTCTTCTACCTCCTCCTTTTATGTAGATGATA
ATGATGATGATGTCAATGGTTTCACTCCAAGAAGCTTCCCTGTGTGTGGTGACCGCCACT
CGGAGCTTATTCCTTGCTTAGACAGGAACCTCATTTACCAGATGAGATTGAAGCTTGACT
TGTCTTTGATGGAGCATTATGAGCGTCACTGTCCTCCTCCTGAAAGAAG*TTTAACTGCT
TGAT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2F137TF 773 0 0
G
AGAGCCCATTTTCCACTAACTAAAGAGAAGAGAAAGTTCGTTGGTTTCCCAATATAGACT
CACCTATTATAGAAGAAGAAGCAGCAACTTCTTAGATCCGATTCTCACTCCCCTCTCTCT
CCCTCTGCCTTGATCTTGATCTGTTTGTTCCCATTCCTCTTCTGAATCTAAGAGCCACTG
ACACGAGAAGGAGAAGGCGATGAGAGGAGGAAGATCAGACGGAGGCAAAAAGAAGCCAGT
GATCGCTTTGGTCTGCATTGCAGCGGTACTTCTTGTTTTTGTATACCTCTTCTTCGGCTC
CTCTAACCATGGAGCCTCAGCTATTGAGTATGGGAGGAAGCTTGGTTTGGGTGGTGATGA
TGATCCCACCACCAAAAAGGACGAGCCTTCTTCTACCTCCTCCTTTTATGTAGATGATAA
TGATGATGATGTCAATGGTTTCACTCCAAGAAGCTTCCCTGTGTGTGATGACCGCCACTC
GGAGCTTATTCCTTGCTTAGACAGGAACCTCATTTACCAGATGAGATTGAAGCTTGACTT
GTCTTTGATGGAGCATTATGAGCGTCACTGTCCTCCTCCTGAAAGAAGGTTTAACTGCTT
GATTCCTCCTCCTCCTGGTTATAAGGTTCCGATTAAGTGGCCGAAAAGCAGAGACGAAGT
TTGGAAAGTGAACATTCCTCATACTCACCTTGCTCATGAGAAGTCTGACCAGAACTGGAT
GTTTGTCAAAGGGGATAAAATCAATTTCCCTGGTGGTGGCACTCATTTTCAC

QA 2 773 2 773
DS 



AS 1 3

CO CL3065Contig1 863 3 22 U
GGGTCTCCGTGGGCTTCAACGCGGCTGCAAGTGTACGGACAAGTAACGAGCTTGGAGCAG
AAAATCCGAAATCGGCATTGTTCTCTACATGGACGGCTACCTTAGTCTCCTTCATAATCT
CCGTCGCGGAAGCCCTGGCGGTCATGGCGGCACGTGATTACATCAGCTACATTTTCACGT
CGGACGCTGAGGTGGCCAAAGCCGTTTCTGACCTCTGCCCTTTCCTCGCAGTCACCATCA
TCCTCAACGGAGTCCAGCCAGTCTTGTCCGGAGTGGCTGTGGGATGTGGATGGCAGGCAT
TCGTGGCATATGTGAATGTTGGTTGTTACTATATAGTTGGTATTCCTGTTGGCTGTATTC
TCGGCTTCACTTTCAACTTTCAAGCTAAGGGAATATGGACGGGGATGATAGGAGGTACCC
TCATGCAAACTCTCATCTTGCTTTACGTGACGTATCGAACTGATTGGGATAAAGAGGTGG
AGAAAGCGAGAAAGCGATTGGAGATGTGGGACGATAAGAAGGAACCTCTTCAAAATTAAA
CGAGTAATGGATTAGATGAAAAGGTATAACAACTGTGGAGCGAAAAAAGAAAAAAAAAAA
TAAGTGTTGTCTTCGGAGGTGGTTTTTTTTGAAAAGAAGATGGCTTCTTTTTATCATTAG
AACTTAGGCTATTCCACCAGATTTCTTCTTTTTTTTTTGTTTCCTTGGAAAATTTTTGTG
GCGACATCTGATGGATGGATGGATTACTCATTCTAATTAAGCAGTATTTTAAACTGTATT
ACTTTTGATGACAATATTTGATTATTTATCCTGGATTATTGATGTAATTGGACAATTCAA
AGCAATGATAGATTATTGCTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ84TF U 1
AF RR2FC16TF U 20
AF RR2FC16JQ C 209
BS 1 60 RR2EQ84TF
BS 61 61 RR2FC16TF
BS 62 100 RR2EQ84TF
BS 101 101 RR2FC16TF
BS 102 229 RR2EQ84TF
BS 230 230 RR2FC16TF
BS 231 409 RR2EQ84TF
BS 410 410 RR2FC16TF
BS 411 447 RR2EQ84TF
BS 448 448 RR2FC16TF
BS 449 451 RR2EQ84TF
BS 452 452 RR2FC16TF
BS 453 498 RR2EQ84TF
BS 499 499 RR2FC16TF
BS 500 598 RR2EQ84TF
BS 599 600 RR2FC16TF
BS 601 629 RR2EQ84TF
BS 630 630 RR2FC16TF
BS 631 667 RR2EQ84TF
BS 668 668 RR2FC16TF
BS 669 696 RR2EQ84TF
BS 697 863 RR2FC16JQ

RD RR2EQ84TF 697 0 0
GGGTCTCCGTGGGCTTCAACGCGGCTGCAAGTGTACGGACAAGTAACGAGCTTGGAGCAG
CAAATCCGAAATCGGCATTGTTCTCTACATGGACGGCTACTTTAGTCTCCTTCATAATCT
CCGTCGCGGAAGCCCTGGCGGTCATGGCGGCACGTGATTACATCAGCTACATTTTCACGT
CGGACGCTGAGGTGGCCAAAGCCGTTTCTGACCTCTGCCCTTTCCTCGCCGTCACCATCA
TCCTCAACGGAGTCCAGCCAGTCTTGTCCGGAGTGGCTGTGGGATGTGGATGGCAGGCAT
TCGTGGCATATGTGAATGTTGGTTGTTACTATATAGTTGGTATTCCTGTTGGCTGTATTC
TCGGCTTCACTTTCAACTTTCAAGCTAAGGGAATATGGACGGGGATGATTGGAGGTACCC
TCATGCAAACTCTCATCTTGCTTTACGCGACCTATCGAACTGATTGGGATAAAGAGGTGG
AGAAAGCGAGAAAGCGATCGGAGATGTGGGACGATAAGAAGGAACCTCTTCAAAATTAAA
CGAGTAATGGATTAGATGAAAAGGTATAACAACTGTGGAGCGAAAAAAGAAAAAAAAA**
TAAGTGTTGTCTTCGGAGGTGGTTTTTTT*GAAAAGAAGATGGCTTCTTTTTATCATTAG
AACTTAG*CTATTCCACCAGATTTCTTCTTTTTTTT
T

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2FC16TF 677 0 0
G
GCGGCTGCAAGTGTACGGACAAGTAATGAGCTTGGAGCAGAAAATCCGAAATCGGCATTG
TTCTCTACATGGACGGCTACCTTAGTCTCCTTCATAATCTCCGTCGCGGAATCCCTGGCG
GTCATGGCGGCACGTGATTACATCAGCTACATTTTCACGTCGGACGCTGAGGTGGCCAAA
GCCGTTTCTGACCTCTGCCCTTTCCTCGCAGTCACCATCATCCTCAACGGAGTCCAGCCA
GTCTTGTCCGGAGTGGCTGTGGGATGTGGATGGCAGGCATTCGTGGCATATGTGAATGTT
GGTTGTTACTATATAGTTGGTATTCCTGTTGGCTGTATTCTCGGCTTCACTTTCAACTTT
CAAGCTAAGGGAATATGGACGGGGATGATAGGAGGTACCCTCATGCAAACTCTCATCTTG
CTTTACGTGACGTATCGAACTGATTGGGATAAAGAGGTGGAGAAAGCGAGAAAGCGATTG
GAGATGTGGGACGATAAGAAGGAACCTCTTCAAAATTAAACGAGTAATGGATTAGATGAA
AAGGTATAACAACTGTGGAGCGAAAAAAGAAAAAAAAAAATAAGTGTTGTCTTCGGAGGT
GGTTTTTTTTGAAAAGAAGATGGCTTCTTTTTATCATTAGAACTTAGGCTATTCCACCAG
ATTTCTTCTTTTTTTT

QA 2 677 2 677
DS 

RD RR2FC16JQ 655 0 0
TGACCTCTGCCCTTTCCTCGCAGTCACCATCATCCTCAACGGAGTCCAGCCAGTCTTGTC
CGGAGTGGCTGTGGGATGTGGATGGCAGGCATTCGTGGCATATGTGAATGTTGGTTGTTA
CTATATAGTTGGTATTCCTGTTGGCTGTATTCTCGGCTTCACTTTCAACTTTCAAGCTAA
GGGAATATGGACGGGGATGATAGGAGGTACCCTCATGCAAACTCTCATCTTGCTTTACGT
GACGTATCGAACTGATTGGGATAAAGAGGTGGAGAAAGCGAGAAAGCGATTGGAGATGTG
GGACGATAAGAAGGAACCTCTTCAAAATTAAACGAGTAATGGATTAGATGAAAAGGTATA
ACAACTGTGGAGCGAAAAAAGAAAAAAAAAAATAAGTGTTGTCTTCGGAGGTGGTTTTTT
TTGAAAAGAAGATGGCTTCTTTTTATCATTAGAACTTAGGCTATTCCACCAGATTTCTTC
TTTTTTTTTTGTTTCCTTGGAAAATTTTTGTGGCGACATCTGATGGATGGATGGATTACT
CATTCTAATTAAGCAGTATTTTAAACTGTATTACTTTTGATGACAATATTTGATTATTTA
TCCTGGATTATTGATGTAATTGGACAATTCAAAGCAATGATAGATTATTGCTCAG

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 3

CO CL3066Contig1 1045 3 11 U
TTTTTTTATTTTAAAATTTCGTTTTTATTAGGGTTCATTTCCGTCGTTCGTTCCCAGATT
TTGATTTTAACCGGAAATATAAAGTCACTTTACTCCGGCGATTGTGAGGCTAATTGATCC
TCCGGTGAGGTTCGATAAAAAAATGGAGGTAATCACTCATCCAACACCTCGAACTGTCGA
AGAGGTCTTTACTGACTTCAGAGGTCGTCGAGCTGGTCTTATCAAGGCTCTCACTACCGA
TATGGTGAAGTTTTACCAAACGTGCGATCCTGAGAAAGAGAACTTGTGCCTCTACGGACT
TCCTAACGAGACATGGGAGGTTAATCTTCCCGTCGAGGAAGTTCCTCCCGAGCTTCCTGA
GCCTGCTCTTGGCATCAACTTCGCTAGAGACGGGATGCAAGAAAAGGACTGGGTGTCTTT
GGTCGCTGTTCACAGTGATTCCTGGCTCCTCTCTGTCGCGTTTTACTTTGGTGCACGTTT
TGGGTTTGGTAAGAACGAGAGGAAGGAGCTCTTCCAGATGATAAACGAGCTCCCAACCAT
TTTCGAGATTGTGACAGGCAATGCAAAGCAATCCAAGGATCTATCTGCCAACAACAACAA
CAACAACAACAGTAGCAAAAGCAAATCCAACGGCTTGAAGGTTCCAAAGATGTCATCTCC
ACCGCCTAAAGAAGAAGACGAGAGTGAGAAATGGTTCCATGGGAAATGTGTGAAGATAAC
ACCTGCAAAAGCGGAACACATCAAGCATTACAAATGCCCAACCTGCAGTAACAAGAGAGC
CAGGCCTTGATGATGCCTAAGTGAACAAAGGTAAAAGAGTTAGGAGGAAGCTGTGAAAGG
AGGAGGAGAAGTTCCCAGTTTATTGAACGAAAAGGCCAAAGATAAATGGGGTTTTAGAAG
ATGTAAGAAGGTTTAAAAAACACGTTTGCTTGCTTAGTCTTTGTTTATGGATTCAGACTA
TTTACTATTGATGTGATGTTTTTCTTTGGATGCTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTAATGTC
AATGCTACTACTGATTTGGCCTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G457TF U 1
AF RR2B913TF U 27
AF RR2B913JQ C 119
BS 1 351 RR2G457TF
BS 352 352 RR2B913TF
BS 353 505 RR2G457TF
BS 506 506 RR2B913TF
BS 507 582 RR2G457TF
BS 583 583 RR2B913TF
BS 584 627 RR2G457TF
BS 628 628 RR2B913TF
BS 629 672 RR2G457TF
BS 673 807 RR2B913TF
BS 808 1045 RR2B913JQ

RD RR2G457TF 683 0 0
TTTTTTTATTTTAAAATTTCGTTTTTATTAGGGTTCATTTCCGTCGTTCGTTCCCAGATT
TTGATTTTAACCGGAAATATAAAGTCACTTTACTCCGGCGATTGTGAGGCTAATTGATCC
TCCGGTGAGGTTCGATAAAAAAATGGAGGTAATCACTCATCCAACACCTCGAACTGTCGA
AGAGGTCTTTACTGACTTCAGAGGTCGTCGAGCTGGTCTTATCAAGGCTCTCACTACCGA
TATGGTGAAGTTTTACCAAACGTGCGATCCTGAGAAAGAGAACTTGTGCCTCTACGGACT
TCCTAACGAGACATGGGAGGTTAATCTTCCCGTCGAGGAAGTTCCTCCCGATCTTCCTGA
GCCTGCTCTTGGCATCAACTTCGCTAGAGACGGGATGCAAGAAAAGGACTGGGTGTCTTT
GGTCGCTGTTCACAGTGATTCCTGGCTCCTCTCTGTCGCGTTTTACTTTGGTGCACGTTT
TGGGTTTGGTAAGAACGAGAGGAAGAAGCTCTTCCAGATGATAAACGAGCTCCCAACCAT
TTTCGAGATTGTGACAGGCAATGCAAAGCAATCCAAGGATCTTTCTGCCAACAACAACAA
CAACAACAACAGTAGCAAAAGCAAATCAAACGGCTTGAAGGTTCCAAAGATGTCATCTCC
ACCGCCTAAAGA
GAGACGAGAGT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2B913TF 781 0 0
ATTAGGGTTCATTTCCGTCGTTCGTTCCCAGATTTTGATTTTAACCGGAAATATAAAGTC
ACTTTACTCCGGCGATTGTGAGGCTAATTGATCCTCCGGTGAGGTTCGATAAAAAAATGG
AGGTAATCACTCATCCAACACCTCGAACTGTCGAAGAGGTCTTTACTGACTTCAGAGGTC
GTCGAGCTGGTCTTATCAAGGCTCTCACTACCGATATGGTGAAGTTTTACCAAACGTGCG
ATCCTGAGAAAGAGAACTTGTGCCTCTACGGACTTCCTAACGAGACATGGGAGGTTAATC
TTCCCGTCGAGGAAGTTCCTCCCGAGCTTCCTGAGCCTGCTCTTGGCATCAACTTCGCTA
GAGACGGGATGCAAGAAAAGGACTGGGTGTCTTTGGTCGCTGTTCACAGTGATTCCTGGC
TCCTCTCTGTCGCGTTTTACTTTGGTGCACGTTTTGGGTTTGGTAAGAACGAGAGGAAGG
AGCTCTTCCAGATGATAAACGAGCTCCCAACCATTTTCGAGATTGTGACAGGCAATGCAA
AGCAATCCAAGGATCTATCTGCCAACAACAACAACAACAACAACAGTAGCAAAAGCAAAT
CCAACGGCTTGAAGGTTCCAAAGATGTCATCTCCACCGCCTAAAGAAGAAGACGAGAGTG
AGAAATGGTTCCATGGGAAATGTGTGAAGATAACACCTGCAAAAGCGGAACACATCAAGC
ATTACAAATGCCCAACCTGCAGTAACAAGAGAGCCAGGCCTTGATGATGCCTAAGTGAAC
A

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2B913JQ 927 0 0
CCTCCGGTGAGGT*CGATAAAAAAATGGAGGTAATCACTCATCCAACACCTCGAACTGTC
GAAGAGGTCTTTACTGACTTCAGAGGTCGTCGAGCTGGTCTTATCAAGGCTCTCACTACC
GATATGGTGAAGTTTTACCAAACGTGCGATC*TGAGAAAGAGAACTTGTGCCTCTACGGA
CTTCCTAACGAGACATGGGAGGTTAATCTTCCCGTCGAGGAAGTTCCTCCCGAGCTTCCT
GAGCCTGCTCTTGGCATCAACTTCGCTAGAGACGGGATGCAAGAAAAGGACTGGGTGTCT
TTGGTCGCTGTTCACAGTGATTCCTGGCTCCTCTCTGTCGCGTTTTACTTTGGTGCACGT
TTTGGGTTTGGTAAGAACGAGAGGAAGGAGCTCTTCCAGATGATAAACGAGCTCCCAACC
ATTTTCGAGATTGTGACAGGCAATGCAAAGCAATCCAAGGATCTATCTGCCAACAACAAC
AACAACAACAACAGTAGCAAAAGCAAATCCAACGGCTTGAAGGTTCCAAAGATGTCATCT
CCACCGCCTAAAGAAGAAGACGAGAGTGAGAAATGGTTCCATGGGAAATGTGTGAAGATA
ACACCTGCAAAAGCGGAACACATCAAGCATTACAAATGCCCAACCTGCAGTAACAAGAGA
GCCAGGCCTTGATGATGCCTAAGTGAACAAAGGTAAAAGAGTTAGGAGGAAGCTGTGAAA
GGAGGAGGAGAAGTTCCCAGTTTATTGAACGAAAAGGCCAAAGATAAATGGGGTTTTAGA
AGATGTAAGAAGGTTTAAAAAACACGTTTGCTTGCTTAGTCTTTGTTTATGGATTCAGAC
TATTTACTATTGATGTGATGTTTTTCTTTGGATGCTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTAATG
TCAATGCTACTACTGATTTGGCCTTGT

QA 1 927 1 927
DS 



AS 1 3

CO CL3067Contig1 1136 3 25 U
GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAGCGAAGAAGAAGAAGAATCATCCCAGCTTTCTGC
CTAACTGTGAAGAATCCACATAGTGTGTGAATTGTAAGTTGTAAAGGATAAAGCTTTTCA
ACTTTAGACGTTGGTTTGAATTTGATTCCTCAGAAGGATGATTTTTTTGAGATATTCACT
ACCACCTTATCTTCCTCCTCAGACAAAGGAATCAACCAAACTCTTCTCCAAGAGGCCCAA
CAATGTTGTGGTATGTGCTGCTAGAGGTCCAAGGCCTCGTTCCCCTCGAGTATGGAAAAC
AAGAAAAAGAATCGGAACTATCTCCAAGTCCGCCAAGATGATTGCTTGTATTAAAGAACT
CTCCAACGTTAAAGAAGAAGTCTACGGAGCGCTAGACTCCTTCATCGCCTGGGAGCTAGA
CTTCCCTCTCGTCATCGTCAAGAAGGCTTTAACCATTCTCCAAGACGAAAGAGAGTGGAA
GAAGATCGTCCAGGTGACGAAATGGATGCTGAGCAAAGGCCAAGGGAGAACTATGGGGAC
TTACTTCTCCTTGCTCAACGCTCTTGCTGAAGACAACCGTCTCGACGAAGCCGAGGAGCT
TTGGAACAAACTCTTCATGGAGCATTTGCAAGGAACTCCCAGAAAGTTCTTCAACAAGAT
GATCTCTATCTATTACAAGAGAGATATGCACCACAAGCTCTTCGAGGTGTTTGCTGACAT
GGAGGAGCTTGGAGTGAAACCGAACGTTGCGATAGTGAATATGGTTGGGAAAGTGTTTTT
GAAACTTGGGATGGAGGATAAGTACGAGAAGCTCGTGAAGAAGTATCCTCCACCGCAGTG
GGAGTTTAGATATATTAAAGGAAGGCGCGTTAAGGTCAAGGCCAATCAGCTTAATGAGCT
AAGTGAAGGTGAAGGAGGCCTCAGCAGTGATGAAGATAGTATTGATGATGAGATTGAGAG
TAAATTTGAATTGTTGTTGTCAGATAAGGAACCAAACAAAGTTGGTGAGGATATCTCAGC
AGTGAAGAGGAAGAAGAAGATTGTTGTTGATCATTTGGACTCTTGCTGAGATTGTATCTA
CCGTTGGATCATTTGCAAGGAAACAAAGTTATTCAATGAAGCTTTTTTGGACTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H375TF U 1
AF RR2BT12TF U 27
AF RR2BT12JQ C 404
BS 1 49 RR2H375TF
BS 50 50 RR2BT12TF
BS 51 179 RR2H375TF
BS 180 181 RR2BT12TF
BS 182 198 RR2H375TF
BS 199 199 RR2BT12TF
BS 200 430 RR2H375TF
BS 431 431 RR2BT12TF
BS 432 433 RR2H375TF
BS 434 434 RR2BT12TF
BS 435 671 RR2H375TF
BS 672 672 RR2BT12TF
BS 673 695 RR2H375TF
BS 696 696 RR2BT12TF
BS 697 706 RR2H375TF
BS 707 707 RR2BT12TF
BS 708 729 RR2H375TF
BS 730 730 RR2BT12TF
BS 731 743 RR2H375TF
BS 744 744 RR2BT12TF
BS 745 754 RR2H375TF
BS 755 779 RR2BT12TF
BS 780 780 RR2BT12JQ
BS 781 789 RR2BT12TF
BS 790 1136 RR2BT12JQ

RD RR2H375TF 754 0 0
GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAGCGAAGAAGAAGAAGAATCATCCTAGCTTTCTGC
CTAACTGTGAAGAATCCACATAGTGTGTGAATTGTAAGTTGTAAAGGATAAAGCTTTTCA
ACTTTAGACGTTGGTTTGAATTTGATTCCTCAGAAGGATGATTTTTTTGAGATATTCAC*
*CCACCTTATCTTCCTCC*CAGACAAAGGAATCAACCAAACTCTTCTCCAAGAGGCCCAA
CAATGTTGTGGTATGTGCTGCTAGAGGTCCAAGGCCTCGTTCCCCTCGAGTATGGAAAAC
AAGAAAAAGAATCGGAACTATCTCCAAGTCCGCCAAGATGATTGCTTGTATTAAAGAACT
CTCCAACGTTAAAGAAGAAGTCTACGGAGCGCTAGACTCCTTCATCGCCTGGGAGCTAGA
CTTCCCTCTC*TC*TCGTCAAGAAGGCTTTAACCATTCTCCAAGACGAAAGAGAGTGGAA
GAAGATCGTCCAGGTGACGAAATGGATGCTGAGCAAAGGCCAAGGGAGAACTATGGGGAC
TTACTTCTCCTTGCTCAACGCTCTTGCTGAAGACAACCGTCTCGACGAAGCCGAGGAGCT
TTGGAACAAACTCTTCATGGAGCATTTGCAAGGAACTCCCAGAAAGTTCTTCAACAAGAT
GATCTCTATCTCTTACAAGAGAGATATGCACCACA*GCTCTTCGAG*TGTTTGCTGACAT
GGAGGAGCT*GGAGTGAAACCGA*CGTTGCGATA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2BT12TF 763 0 0
GG
GAAGAAGAAGAAGAATCATCCCAGCTTTCTGCCTAACTGTGAAGAATCCACATAGTGTGT
GAATTGTAAGTTGTAAAGGATAAAGCTTTTCAACTTTAGACGTTGGTTTGAATTTGATTC
CTCAGAAGGATGATTTTTTTGAGATATTCACTACCACCTTATCTTCCTCCTCAGACAAAG
GAATCAACCAAACTCTTCTCCAAGAGGCCTAACAATGTTGTGGTATGTGCTGCTAGAGGT
CCAAGGCCTCGTTCCCCTCGAGTATGGAAAACAAGAAAAAGAATCGGAACTATCTCCAAG
TCCGCCAAGATGATTGCTTGTATTAAAGAACTCTCCAACGTTAAAGAAGAAGTCTACGGA
GCGCTAGACTCCTTCATCGCCTGGGAGCTAGACTTCCCTCTCGTCATCGTCAAGAAGGCT
TTAACCATTCTCCAAGACGAAAGAGAGTGGAAGAAGATCGTCCAGGTGACGAAATGGATG
CTGAGCAAAGGCCAAGGGAGAACTATGGGGACTTACTTCTCCTTGCTCAACGCTCTTGCT
GAAGACAACCGTCTCGACGAAGCCGAGGAGCTTTGGAACAAACTCTTCATGGAGCATTTG
CAAGGAACTCCCAGAAAGTTCTTCAACAAGATGATCTCTATCTATTACAAGAGAGATATG
CACCACAAGCTCTTCGAGGTGTTTGCTGACATGGAGGAGCTTGGAGTGAAACCGAACGTT
GCGATAGTGAATATGGTTGGGAAAGTGTTTT*GAAACTTGG

QA 3 763 3 763
DS 

RD RR2BT12JQ 733 0 0
ATCGCCTGGGAGCTAGACTTCCCTCTCGTCATCGTCAAGAAGGCTTTAACCATTCTCCAA
GACGAAAGAGAGTGGAAGAAGATCGTCCAGGTGACGAAATGGATGCTGAGCAAAGGCCAA
GGGAGAACTATGGGGACTTACTTCTCCTTGCTCAACGCTCTTGCTGAAGACAACCGTCTC
GACGAAGCCGAGGAGCTTTGGAACAAACTCTTCATGGAGCATTTGCAAGGAACTCCCAGA
AAGTTTTTCAACAAGATGATCTCTATTTATTACAAGAGAGATATGCACCACAAGCTTTTC
GAGGTGTTTGCTGACATGGAGGAGCTTGGAGTGAAACCGAACGTTGCGATAGTGAATATG
GTTGGGAAAGTGTTTTTGAAACTTGGGATGGAGGATAAGTACGAGAAGCTCGTGAAGAAG
TATCCTCCACCGCAGTGGGAGTTTAGATATATTAAAGGAAGGCGCGTTAAGGTCAAGGCC
AATCAGCTTAATGAGCTAAGTGAAGGTGAAGGAGGCCTCAGCAGTGATGAAGATAGTATT
GATGATGAGATTGAGAGTAAATTTGAATTGTTGTTGTCAGATAAGGAACCAAACAAAGTT
GGTGAGGATATCTCAGCAGTGAAGAGGAAGAAGAAGATTGTTGTTGATCATTTGGACTCT
TGCTGAGATTGTATCTACCGTTGGATCATTTGCAAGGAAACAAAGTTATTCAATGAAGCT
TTTTTGGACTGTG

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL3068Contig1 797 2 19 U
GGACACAAACATTTTACAATCTGAAACACAACTCCAAAAGAAAAGAAAAATGGCTTCAAC
TTCAACACTTTCAATCAAAACAACCTTCATCGTACTCATCGTTGTCTCGTTTACAATTTC
TTCAGCAACTTCAACGGTGCCTGATGAATGCGCAAGCGAGTCAGCAAACCCGTGCGTCAA
CAAAGCTAAAGCTTTGCCTCTCAAAATCATAGCTATCGCCACAATCCTAGTCGCTAGCAT
GATTGGTGTGGGTGCTCCTCTCTTTAGCCGTTCGGTGCCGTTCCTCCGACCCGACGGTGA
CATTTTCACAGTTGTTAAGTGCTTTGCCTCCGGGATCATCCTCGGAACCGGTTTTATGCA
CGTGTTGCCTGATTCTTTCGACATGTTATCATCACAATGTCTTGAAGAGAACCCGTGGCA
CAAGTTTCCCTTCACGGGGCTTCTCGCTATGTTGTCCGGTCTAATCACTCTAGCCATCGA
TTCCATGGCTACGAGCCTCTATACTAGCAAGAACGCAGTTGGGATCATACCCCACGGTCA
TGGTCACGGCCCCGCAAATAATGTTACCTTACCAACGAAAGATGATGATTCCACGAGTGC
ACAACTCTTGCGATACCGAGTCATTGCTATGGTCTTGGAGCTTGGAATAATAGTTCACTC
TGTGGTCATTGGACTGTCTCTAGGAGCAACTAATGATACTTGCACCATTAAAGGACTCAT
CGCAGCTCTTTGCTTCCATCAAATGTTTGAAGGCATGGGACTTGGAGGTTGCATTCTCCA
GGCTGAGTACACGAACT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2ED70TF U 1
AF RR2FB34TF U 3
BS 1 165 RR2ED70TF
BS 166 166 RR2FB34TF
BS 167 336 RR2ED70TF
BS 337 337 RR2FB34TF
BS 338 371 RR2ED70TF
BS 372 372 RR2FB34TF
BS 373 509 RR2ED70TF
BS 510 510 RR2FB34TF
BS 511 560 RR2ED70TF
BS 561 561 RR2FB34TF
BS 562 742 RR2ED70TF
BS 743 743 RR2FB34TF
BS 744 762 RR2ED70TF
BS 763 763 RR2FB34TF
BS 764 767 RR2ED70TF
BS 768 768 RR2FB34TF
BS 769 774 RR2ED70TF
BS 775 775 RR2FB34TF
BS 776 797 RR2ED70TF

RD RR2ED70TF 797 0 0
GGACACAAACATTTTACAATCTGAAACACAACTCCAAAAGAAAAGAAAAATGGCTTCAAC
TTCAACACTTTCAATCAAAACAACCTTCATCGTACTCATCGTTGTCTCGTTTACAATTTC
TTCAGCAACTTCAACGGTGCCTGATGAATGCGCAAGCGAGTCAGCGAACCCGTGCGTCAA
CAAAGCTAAAGCTTTGCCTCTCAAAATCATAGCTATCGCCACAATCCTAGTCGCTAGCAT
GATTGGTGTGGGTGCTCCTCTCTTTAGCCGTTCGGTGCCGTTCCTCCGACCCGACGGTGA
CATTTTCACAGTTGTTAAGTGCTTTGCCTCCGGGATTATCCTCGGAACCGGTTTTATGCA
CGTGTTGCCTGGTTCTTTCGACATGTTATCATCACAATGTCTTGAAGAGAACCCGTGGCA
CAAGTTTCCCTTCACGGGGCTTCTCGCTATGTTGTCCGGTCTAATCACTCTAGCCATCGA
TTCCATGGCTACGAGCCTCTATACTAGCAGGAACGCAGTTGGGATCATACCCCACGGTCA
TGGTCACGGCCCCGCAAATATTGTTACCTTACCAACGAAAGATGATGATTCCACGAGTGC
ACAACTCTTGCGATACCGAGTCATTGCTATGGTCTTGGAGCTTGGAATAATAGTTCACTC
TGTGGTCATTGGACTGTCTCTAGGAGCAACTAATGATACTTGCACCATTAAAGGACTCAT
CGCAGCTCTTTGCTTCCATCAA*TGTTTGAAGGCATGGGACT*GGAG*TTGCAT*CTCCA
GGCTGAGTACACGAACT

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2FB34TF 795 0 0
GG
ACAAATATTTTACAATCTGAAACACAACTCCAAAAGAAAA*AAAAATGGCTTCAACTTCA
ACACTTTTAATCAAAACAACCTTCATCGTACTCATCTTTGTCTCGTTTACAATTTCTTCA
GCAACTTCAACGGTGCCTGATGAATGCGCAAGCGAGTCAGCAAACCCGTGCGTCAACAAA
GCTAAAGCTTTGCCTCTCAAAATCATAGCTATTGCCACAATCCTAGTCGCTAGCATGATT
GGTGTGGGTGCTCCTCTCTTTAGCCGT*CGGTGCCGTTCCTCCGACCCGACGGTGACATT
TTCACAGTTGTTAAGTGCTTTGCCTCCGGGATCATCCTCGGAACCGGTTTTATGCACGTG
TTGCCTGATTCTTTCGACATGTTATCATCACAATGTCTTGAA*ATAACCCGTGGCACAAG
TTTCCCTTCACGGGGTTTCTCGCTATGTTGTCCGGTCTAATCACTCTAGCCATCGATTCC
ATGGCTACGAGCCTCTATACTAGCAAGAACGCAGTTGGGATCATACCCCATGGTCATGGT
CACGGCCCCGCAAATAATGTTACCTTACCGATGAAAGATGATGATTCCACGAGTGCACAA
CTCTTGTGATACCGAGTCATTGCTATGGTCTTGGAGCTTGGAATAATAGTTCACTCTGTG
GTCATTGGACTGTCTCTAGGAGCA*CTAATGATACTTGCACCATTAAAGGACTCATCGCA
GCTCTTTGCTTCCATCAAATGTTTGAAGG*ATGGGACTTGGAGGTTGCATTCTCCAG*CT
GAGTACACGA
CTT

QA 3 792 3 792
DS 



AS 1 2

CO CL3069Contig1 741 2 3 U
CTTTTGTACATTACACAAAAATACATATACAAGTTATAACGTTTTTCATTTTCACCCCTT
AATTCATTATTTCCTGAACTAGATAGAAGCAAAAAATAAAAAAAACGTTCGTCTTTAATT
AAGACAGTAGTTAAAAAAAATATTGTTCTAACAGCGTCTTCCGACTCTGCAATCAAGGGC
TCCTGCGTATTTGGACAGCTTTGAAACAGCGTATCCATTTTTCGGTTTAATCATGTTACG
TCTTGTGTGATCAGTTTCGTAATTAGGATCTCCAGATTGTCTGAAATAAGCTCCATTCAT
GAATATATCTTTTTCGGATCTCCAGTTCCAGTGTTTACACTCTTCTTCGGGAGCATAGTC
TCTCTTTGTCACCCCTCTGTAATGAGGCAAGTGTGAAGGAGCTATGAATCGGTTTCCTTG
GCTGAAAATTGTTGGACTTTGACTGCCTCCGATAGCGTAAAGCTCCCAATGAGTGTAGTC
ATTGTTCACAACATGAACAAATCCCCACCTGATCCTTGGCATCCTCTGCACAAGTCCTTT
ACCGAAATGGTTATATGCTACTGTCACTTGCATCTTCTTGTCCAAATCATAAGTGTTTTG
AGCACCAAGCAACATCACATCGTTGTGGTGAGTGAAGTGAGAGTTGGAGATTGTAATGGC
AGTGGATCCAACAATGGCATCAATGAGTCCATCTTGACATTGCGACATGGAGACATGGTC
AATCCAATGTTAGACGAGCCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW17JQ U 1
AF RR2CG38JQ U 1
BS 1 395 RR2CG38JQ
BS 396 396 RR2EW17JQ
BS 397 741 RR2CG38JQ

RD RR2EW17JQ 570 0 0
CTTTTGTACATTACACAAAAATACATATACAAGTTATAACGTTTTTCATTTTCACCCCTT
AATTCATTATTTCCTGAACTAGATAGAAGCAAAAAATAAAAAAAACGTTCGTCTTTAATT
AAGACAGTAGTTAAAAAAAATATTGTTCTAACAGCGTCTTCCGACTCTGCAATCAAGGGC
TCCTGCGTATTTGGTCAGCTTTGAAACAGCGTATCCATTTTTCGGTTTAATCATGTTACG
TCTTGTGTGATCAGTTTCGTAATTAGGATCTCCAGATTGTCTGAAATAAGCTCCATTCAT
GAATATATCTTTTTCGGATCTCCAGTTCCAGTGTTTCCACTCTTCTTCGGGAGCATAGTC
TCTCTTTGTCACCTCTCTGTAATGAGGCAAGTGTGAAGGAGCTATGAATCGGTTTCCTTG
GCTGAGAATTGTTGGACTTTGACTGCCTCCGATAGCGTAAAGCTCCCAATGAGTGTAGTC
ATTGTTCACAACATGAACAAATCCCCACCTGATCCTTGGCATCCTCTGCACAAGTCCTTT
ACCGAAATGGTTATATGCTACTGTCACTTG

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2CG38JQ 741 0 0
CTTTTGTACATTACACAAAAATACATATACAAGTTATAACGTTTTTCATTTTCACCCCTT
AATTCATTATTTCCTGAACTAGATAGAAGCAAAAAATAAAAAAAACGTTCGTCTTTAATT
AAGACAGTAGTTAAAAAAAATATTGTTCTAACAGCGTCTTCCGACTCTGCAATCAAGGGC
TCCTGCGTATTTGGACAGCTTTGAAACAGCGTATCCATTTTTCGGTTTAATCATGTTACG
TCTTGTGTGATCAGTTTCGTAATTAGGATCTCCAGATTGTCTGAAATAAGCTCCATTCAT
GAATATATCTTTTTCGGATCTCCAGTTCCAGTGTTTACACTCTTCTTCGGGAGCATAGTC
TCTCTTTGTCACCCCTCTGTAATGAGGCAAGTGTGGAGGAGCTATGAATCGGTTTCCTTG
GCTGAAAATTGTTGGACTTTGACTGCCTCCGATAGCGTAAAGCTCCCAATGAGTGTAGTC
ATTGTTCACAACATGAACAAATCCCCACCTGATCCTTGGCATCCTCTGCACAAGTCCTTT
ACCGAAATGGTTATATGCTACTGTCACTTGCATCTTCTTGTCCAAATCATAAGTGTTTTG
AGCACCAAGCAACATCACATCGTTGTGGTGAGTGAAGTGAGAGTTGGAGATTGTAATGGC
AGTGGATCCAACAATGGCATCAATGAGTCCATCTTGACATTGCGACATGGAGACATGGTC
AATCCAATGTTAGACGAGCCG

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 3

CO CL3070Contig1 706 3 9 U
GGGGGGGAGAGGAAGGCTTAGATTAGAATAGTTCCCGCCGCCATGGCCGTTACGGCGTCT
GGATTCATCGGCAAAGCTACAATCTCCTCCGTTCGAGTAGAGTTCTCTTCCAAATTATCA
TACCTGAAACGTCCCTTCTCTGCCTCAAAGCCTCCGGTGGTTCGGTCCGTAGCTTTATCG
CCGCCGGCGAGAACAGTTGAGTCGCCGCCGGTTGGTTACCGGAAAAATGTTGGGATTTGT
CTCGTTAGTCCATGTCGAAAGATTTTTACTGCATCAAAGATTCACGTTCCGGATACATGG
CAGATGCCTCAGGGTGGGGCTGATGAGGGAGAAGATCTTAGAAATGCTGCTTTTAGAGAG
CTCAGAGAAGAAACAGGGGTTACCTCTGCTGAATTCATTGCCGAGATACCAAACTGGCTG
ACCTATGATTTCCCCCGGGATGTGAAGGACAAACTGAATCGGAAATGGCGAACAAGTTAC
AAAGGCCAAGCTCAGAAATGGTTTCTCTTCAAGTTCACTGGCAAGGAGGAAGAAATAAAT
CTCCTAGGAGATGGTACTGCAAAACCAGAGTTTAAGGTGTGGTCCTGGATGCTACCCGAA
CAAGTGATTGAACATGCTGTATATTTCAAGAGACCTGTCTACGAGCATGTCATAAATCAA
TTCAATCCTTACTTTGAGGATGAAGACAAGAACTCCCGTAAGATTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW29TF U 1
AF RR2GP75TF U 1
AF RR2GQ25TF U 12
BS 1 521 RR2FW29TF
BS 522 641 RR2GP75TF
BS 642 642 RR2GQ25TF
BS 643 644 RR2GP75TF
BS 645 645 RR2GQ25TF
BS 646 676 RR2GP75TF
BS 677 677 RR2GQ25TF
BS 678 688 RR2GP75TF
BS 689 706 RR2GQ25TF

RD RR2FW29TF 521 0 0
GGGGGGGAGAGGAAGGCTTAGATTAGAATAGTTCCCGCCGCCATGGCCGTTACGGCGTCT
GGATTCATCGGCAAAGCTACAATCTCCTCCGTTCGAGTAGAGTTCTCTTCCAAATTATCA
TACCTGAAACGTCCCTTCTCTGCCTCAAAGCCTCCGGTGGTTCGGTCCGTAGCTTTATCG
CCGCCGGCGAGAACAGTTGAGTCGCCGCCGGTTGGTTACCGGAAAAATGTTGGGATTTGT
CTCGTTAGTCCATGTCGAAAGATTTTTACTGCATCAAAGATTCACGTTCCGGATACATGG
CAGATGCCTCAGGGTGGGGCTGATGAGGGAGAAGATCTTAGAAATGCTGCTTTTAGAGAG
CTCAGAGAAGAAACAGGGGTTACCTCTGCTGAATTCATTGCCGAGATACCAAACTGGCTG
ACCTATGATTTCCCCCGGGATGTGAAGGACAAACTGAATCGGAAATGGCGAACAAGTTAC
AAAGGCCAAGCTCAGAAATGGTTTCTCTTCAAGTTCACTGG

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2GP75TF 695 0 0
GGGGGGGAGAGGAAGGCTTAGATTAGAATAGTTCCCGCCGCCATGGCCGTTACGGCGTCT
GGATTCATCGGCAAAGCTACAATCTCCTCCGTTCGAGTAGAGTTCTCTTCCAAATTATCA
TACCTGAAACGTCCCTTCTCTGCCTCAAAGCCTCCGGTGGTTCGGTCCGTAGCTTTATCG
CCGCCGGCGAGAACAGTTGAGTCGCCGCCGGTTGGTTACCGGAAAAATGTTGGGATTTGT
CTCGTTAGTCCATGTCGAAAGATTTTTACTGCATCAAAGATTCACGTTCCGGATACATGG
CAGATGCCTCAGGGTGGGGCTGATGAGGGAGAAGATCTTAGAAATGCTGCTTTTAGAGAG
CTCAGAGAAGAAACAGGGGTTACCTCTGCTGAATTCATTGCCGAGATACCAAACTGGCTG
ACCTATGATTTCCCCCGGGATGTGAAGGACAAACTGAATCGGAAATGGCGAACAAGTTAC
AAAGGCCAAGCTCAGAAATGGTTTCTCTTCAAGTTCACTGGCAAGGAGGAAGAAATAAAT
CTCCTAGGAGATGGTACTGCAAAACCAGAGTTTAAGGTGTGGTCCTGGATGCTACCCGAA
CAAGTGATTGAACATGCTGTATATTTCAAGAGACCTGTCTATGATCATGTCATAAATCAA
TTCAATCCTTACTTTGTGGATGAAGACA
GGACTCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2GQ25TF 695 0 0
GGGCCT
TTAGATTAGTATAGTTCCCGCCGCCATGGCCGTTACGGCGTCTGGATTCATCGGCAAAGC
TACAATCTCCTCCGTTCGAGTAGAGTTCTCTTCCAAATTATCATACCTGAAACGTCCCTT
CTCTGCCTCAAAGCCTCCGGTGGTTCGTTCCGTAGCTTTATCGCCGCCGGCGAGAACAGT
TGAGTCACCGCCGGTTGGTTACCGGAAAAATGTTGGGATTTGTCTCGTTAGTCCATGTAG
AAAGATTTTTACTGCATCAAAGATTCACGTTCCGGATACATGGCAAATGCCTCAGGGTGG
TGCTGATGAGGGAGAAGATCTGAGAAATGCTGCTTTTAGAGAGCTCAGAGAAGAAACAGG
GGTTACCTCTGC*GAATTCATTGCCGAGATACCAAACTGGCTGACCTATGATTTCCCCCG
GGATGTGAAGGACAAACTGAATCGGAAATGGCGAACAAGTTACAAAGGCCAAGCTCAGAA
ATGGTTTCTCTTCAAGTTCACTGGCAAGGAGGAAGAAATAAATCTCCTAGGAGATGGTAC
TGCAAAACCAGAGTTTAAGGTGTGGTCCTGGATGCTGCCCGAACAAGTGATTGAACATGC
TGTATATTTCAAGAGACCTGTCTACGAGCATGTCATAAATCAATTCAATCCTTACTTTGA
GGATGAAGACAAGAACTCCCGTAAGATTG

QA 7 695 7 695
DS 



AS 1 3

CO CL3071Contig1 517 3 3 U
CTAATAACAACATCTTCCATAAATTTTACGAATCTCTTGGGAGTTTACATGATTTCTTAC
ACATTTATGCTGAATTTATTCAGTACCTTAAATATATTCAGAGTATCTATTGTATATATC
ACACCAAGAGACTATGAAGTGTGATAGCTTCAGCTCCAAGTTCCATACCGATAAAATCAA
GCAAGAAAAGAAAAAAAAAACACAAAAGCAAGGAAGCAGTTAAGACATAGATAAAGTGGT
TTGTTCTTGTACAAATCAATACCATTAGTGTCTTGGTCGGAGCTCAATGTTAGGACCTCC
ACGTCTTATTTCACCTCCAGCATGATGGTCTTCGTTTTCCTCAGGTAACTTAAATCTCAC
TCCATGTTTGATAACCGGCGGAGGAGGAAGTCCTCCTCCCCCTCTTTCTTCTCTCTTGTT
ATCAAATCCAAATTCTATATCCTCGCCGTGATCTATTCCAGAGGGTTTCTCAACATGCTC
AGGCCGTTTCATATCCAACCCAAACTCCAAATCACCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F506JQ U 1
AF RR2CR60JQ U 1
AF RR2CR60TF C 1
BS 1 223 RR2CR60JQ
BS 224 224 RR2F506JQ
BS 225 517 RR2CR60JQ

RD RR2F506JQ 455 0 0
CTAATAACAACATCTTCCATAAATTTTATGAATCTCTTGGGAGTTTACATGATTTCTTAC
ACATTTATGCTGAATTTATTCAGTACCTTAAATATATTCAGAGTATCTATTGTATATATC
ACACCAAGAGACTATGAAGTGTGATAGCTTCAGCTCCAAGTTCCATACCGATAAAATCAA
GCAAGAAAAGAAAAAAAAAACACAAAAGCAAGGAAGCAGTTAAGACATAGATAAAGTGGT
TTGTTCTTGTACAAATCAATACCATTAGTGTCTTGGTCGGAGCTCAATGTTAGGACCTCC
ACGTCTTATTTCACCTCCAGCATGATGGTCTTCGTTTTCCTCAGGTAACTTAAATCTCAC
TCCATGTTTGATAACCGGCGGAGGAGGAAGTCCTCCTCCCCCTCTTTCTTCTCTCTTGTT
ATCAAATCCAAATTCTATATCCTCGCCGTGATCTA

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR2CR60JQ 517 0 0
CTAATAACAACATCTTCCATAAATTTTACGAATCTCTTGGGAGTTTACATGATTTCTTAC
ACATTTATGCTGAATTTATTCAGTACCTTAAATATATTCAGAGTATCTATTGTATATATC
ACACCAAGAGACTATGAAGTGTGATAGCTTCAGCTCCAAGTTCCATACCGATAAAATCAA
GCAAGAAAAGAAAAAAAAAACACAAAAGCAAGGAAGCAGTTAAAACATAGATAAAGTGGT
TTGTTCTTGTACAAATCAATACCATTAGTGTCTTGGTCGGAGCTCAATGTTAGGACCTCC
ACGTCTTATTTCACCTCCAGCATGATGGTCTTCGTTTTCCTCAGGTAACTTAAATCTCAC
TCCATGTTTGATAACCGGCGGAGGAGGAAGTCCTCCTCCCCCTCTTTCTTCTCTCTTGTT
ATCAAATCCAAATTCTATATCCTCGCCGTGATCTATTCCAGAGGGTTTCTCAACATGCTC
AGGCCGTTTCATATCCAACCCAAACTCCAAATCACCC

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2CR60TF 517 0 0
CTAATAACAACATCTTCCATAAATTTTACGAATCTCTTGGGAGTTTACATGATTTCTTAC
ACATTTATGCTGAATTTATTCAGTACCTTAAATATATTCAGAGTATCTATTGTATATATC
ACACCAAGAGACTATGAAGTGTGATAGCTTCAGCTCCAAGTTCCATACCGATAAAATCAA
GCAAGAAAAGAAAAAAAAAACACAAAAGCAAGGAAGCAGTTAAGACATAGATAAAGTGGT
TTGTTCTTGTACAAATCAATACCATTAGTGTCTTGGTCGGAGCTCAATGTTAGGACCTCC
ACGTCTTATTTCACCTCCAGCATGATGGTCTTCGTTTTCCTCAGGTAACTTAAATCTCAC
TCCATGTTTGATAACCGGCGGAGGAGGAAGTCCTCCTCCCCCTCTTTCTTCTCTCTTGTT
ATCAAATCCAAATTCTATATCCTCGCCGTGATCTATTCCAGAGGGTTTCTCAACATGCTC
AGGCCGTTTCATATCCAACCCAAACTCCAAATCACCC

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 3

CO CL3072Contig1 644 3 10 U
GGGATTTTGATTGTCTCTCTCTCTCCTCTGTAGGAACAAGCCAAAAGCAAAGGATAAAAG
AGAGATGGAGTCTAGCAGAGGTCAAGGTGGGATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACAAGA
AGCTCAACACATCGTCAATGCTGCAAGGACCGCAAAGATGGGAAGGCTGAAGCAAGCAAA
GGAAGAGGCTGAGAAGGAGATAGCTGAATACAAAGCGAAAACAGAGCAAGACTTCCAGAG
GAAACTTGAGGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGCGGCTGGAGCAAGAGAC
AGATGAGAAAATCGAACAGCTCAAAAGCGAAGCAGCCAGGATTTCGAACGATGTTGTGGA
GATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGAGAGATTCCTGTAATAATTA
AAAAAAAA*GTCATTTATGAGTGTTTATACTCCTCCTCTGTTTTTCTTTCTCTCATTCAC
GCGTGTTGTGTTACTGGATGGGGATCTCAGTGACTCAAATCTCTCATATGAATGTGTTGC
TTGTTTTTTGTTTTGTTTGTAATTTGTTCTCTACCATCTTTTGTTGTTGTTTGTTGTGGT
TGTATTCATCATTTCCCTTTTGAGGATTGTAATAAAAAACACCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A722TF U 1
AF RR2AU25TF U 1
AF RR2AU25JQ C 23
BS 1 23 RR2A722TF
BS 24 25 RR2AU25TF
BS 26 146 RR2A722TF
BS 147 147 RR2AU25TF
BS 148 428 RR2A722TF
BS 429 429 RR2AU25TF
BS 430 464 RR2A722TF
BS 465 465 RR2AU25TF
BS 466 630 RR2A722TF
BS 631 644 RR2AU25TF

RD RR2A722TF 630 0 0
GGGATTTTGATTGTCTCTCTCTC**CTCTGTAGGAACAAGCCAAAAGCAAAGGATAAAAG
AGAGATGGAGTCTAGCAGAGGTCAAGGTGGGATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACAAGA
AGCTCAACACATCGTCAATGCTGCAATGACCGCAAAGATGGGAAGGCTGAAGCAAGCAAA
GGAAGAGGCTGAGAAGGAGATAGCTGAATACAAAGCGAAAACAGAGCAAGACTTCCAGAG
GAAACTTGAGGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGCGGCTGGAGCAAGAGAC
AGATGAGAAAATCGAACAGCTCAAAAGCGAAGCAGCCAGGATTTCGAACGATGTTGTGGA
GATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGAGAGATTCCTGTAATAATTA
AAAAAAAAAGTCATTTATGAGTGTTTATACTCCTCCTCTGTTTTCCTTTCTCTCATTCAC
GCGTGTTGTGTTACTGGATGGGGATCTCAGTGACTCAAATCTCTCATATGAATGTGTTGC
TTGTTTTTTGTTTTGTTTGTAATTTGTTCTCTACCATCTTTTGTTGTTGTTTGTTGTGGT
TGTATTCATCATTTCCCTTTTGAGGATTGT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2AU25TF 644 0 0
GGGATTTTGATTGTCTCTCTCTCTCCTCTGTAGGAACAAGCCAAAAGCAAAGGATAAAAG
AGAGATGGAGTCTAGCAGAGGTCAAGGTGGGATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACAAGA
AGCTCAACACATCGTCAATGCTGCAAGGACCGCAAAGATGGGAAGGCTGAAGCAAGCAAA
GGAAGAGGCTGAGAAGGAGATAGCTGAATACAAAGCGAAAACAGAGCAAGACTTCCAGAG
GAAACTTGAGGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGCGGCTGGAGCAAGAGAC
AGATGAGAAAATCGAACAGCTCAAAAGCGAAGCAGCCAGGATTTCGAACGATGTTGTGGA
GATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGAGAGATTCCTGTAATAATTA
AAAAAAAA*GTCATTTATGAGTGTTTATACTCCTCCTCTGTTTTTCTTTCTCTCATTCAC
GCGTGTTGTGTTACTGGATGGGGATCTCAGTGACTCAAATCTCTCATATGAATGTGTTGC
TTGTTTTTTGTTTTGTTTGTAATTTGTTCTCTACCATCTTTTGTTGTTGTTTGTTGTGGT
TGTATTCATCATTTCCCTTTTGAGGATTGTAATAAAAAACACCG

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2AU25JQ 622 0 0
CTCCTCTGTAGGAACAAGCCAAAAGCAAAGGATAAAAGAGAGATGGAGTCTAGCAGAGGT
CAAGGTGGGATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACAAGAAGCTCAACACATCGTCAATGCT
GCAAGGACCGCAAAGATGGGAAGGCTGAAGCAAGCAAAGGAAGAGGCTGAGAAGGAGATA
GCTGAATACAAAGCGAAAACAGAGCAAGACTTCCAGAGGAAACTTGAGGAGACAAGTGGA
GACTCGGGTGCGAATGTGAAGCGGCTGGAGCAAGAGACAGATGAGAAAATCGAACAGCTC
AAAAGCGAAGCAGCCAGGATTTCGAACGATGTTGTGGAGATGCTCCTCAAACATGTCACC
ACTGTCAAGAACTGAGAGAGAGATTCCTGTAATAATTAAAAAAAAA*GTCATTTATGAGT
GTTTATACTCCTCCTCTGTTTTTCTTTCTCTCATTCACGCGTGTTGTGTTACTGGATGGG
GATCTCAGTGACTCAAATCTCTCATATGAATGTGTTGCTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTAA
TTTGTTCTCTACCATCTTTTGTTGTTGTTTGTTGTGGTTGTATTCATCATTTCCCTTTTG
AGGATTGTAATAAAAAACACCG

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 3

CO CL3073Contig1 1163 3 8 U
GGGTGCACAAACGCTTTTCTTGAATTTTCTTCTATAAATTCTACCACCCAAAACCATTCA
GACCTCCCCTTCTCTCTTCTCCCTCGTTCAAAGATTTGGCCTTCCTTCTTCCTGTTTAGT
TCTTCTGAACTATATCCACCCAAACACATTAGAACAAAACCATTAATGCTTAATCAGCAG
TTCTTGGTCATTGAGACACATGTCTCCGATCATACTCAGTGAGATCTTCCTCTCTGGGTT
TATGCTAAACTCCACCATCAGGCGCAGGACCCATCTCGTTCAATCTTTCTCTGTTGTCTT
CCTTTACTGGCTTTACTACGTCTCTTAGTTTCTCATAATTAATCTCCAGTTTTTCTTCTT
CCGTTATATATATTATATTCTCGTAATCAAAACCCTAATTTTTAAAGTCTTTCTTTTGTT
TCTTGCTCGTTACGTCATCGATCTGGGTCCTGTCCTGCTTTATCCCTCTTCCGGTAAAAC
AGAAGAGTTTCTTTGTTTGTTTGTTTGTATAAATGGAACCGTCGTCGTCGGGAACAACTT
TGCCGTCGGGATCGGAAGAGAGTCTCATGGAGCAGAGGAAGCGGAAGAGGATGCTCTCAA
ACCGTGAATCAGCGAGGAGATCGAGGATGAAGAAACAGAAGCTCCTCGACGATCTAACGG
CTCAGGTTAACCAGCTCAAAGAACAGAACAACGAGATCGTGACAAGTGTCAGCATCACGA
CGCAGCACTACTTAACCATCGAAGCAGAGAACTCTGTTCTCAGAGCTCAGCTTGATGAAC
TCAGCCACAGGCTCGAATCTCTCAATGACATCATCGAGTTACTCGATAGTACCAACGGGA
TTTGTCCGAGCCTTCTGACTGGTCCAGAGCCTGATGATTTTCTCGTGAACCAGATGAATA
CGAACATGTTTTGTATGAACCAGCCTCTCATGGCATCTTCTGATGCGTTACTGTATTAGA
AACGTGGTCCAGAAAACCTCGAAATTACAAAATGGGGCCGTTTCTTTTGTCTGATTTTAA
GATATGTCCAAAGAGAGATATATGAAAAAAAATCTATCAGTGGGGTATGCTGTTTGATTG
TGCTTTGTTCCGTCTTTGGCTCTATGTATTAAAAGCATCGTTGTTACGAGTGTTTGCAAT
AAAGGCTCTGTTGGCATGAGTAC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G655TF U 3
AF RR2AO34TF U 1
AF RR2AO34JQ C 448
BS 1 31 RR2AO34TF
BS 32 32 RR2G655TF
BS 33 151 RR2AO34TF
BS 152 152 RR2G655TF
BS 153 164 RR2AO34TF
BS 165 165 RR2G655TF
BS 166 762 RR2AO34TF
BS 763 1163 RR2AO34JQ

RD RR2G655TF 255 0 0
GG
GCACAAACGCTTTTCTTGAATTTTCTTCTATAAATTCTATCACCCAAAACCATTCAGACC
TCCCCTTCTCTCTTCTCCCTCGTTCAAAGATTTGGCCTTCCTTCTTCCTGTTTAGTTCTT
CTGAATTATATCCACCCAAACACATTAGAACAAAACCATTAATGCTTAATCAGCAGTTCT
TGGTCATTGAGACACATGTCTCCGATCATTCTCAGTGAGATCTTCCTCTCTGGGTTTATG
CTAAACTCCACCA

QA 3 255 3 255
DS 

RD RR2AO34TF 762 0 0
GGGTGCACAAACGCTTTTCTTGAATTTTCTTTTATAAATTCTACCACCCAAAACCATTCA
GACCTCCCCTTCTCTCTTCTCCCTCGTTCAAAGATTTGGCCTTCCTTCTTCCTGTTTAGT
TCTTCTGAACTATATCCACCCAAACACATTATAACAAAACCATTGATGCTTAATCAGCAG
TTCTTGGTCATTGAGACACATGTCTCCGATCATACTCAGTGAGATCTTCCTCTCTGGGTT
TATGCTAAACTCCACCATCAGGCGCAGGACCCATCTCGTTCAATCTTTCTCTGTTGTCTT
CCTTTACTGGCTTTACTACGTCTCTTAGTTTCTCATAATTAATCTCCAGTTTTTCTTCTT
CCGTTATATATATTATATTCTCGTAATCAAAACCCTAATTTTTAAAGTCTTTCTTTTGTT
TCTTGCTCGTTACGTCATCGATCTGGGTCCTGTCCTGCTTTATCCCTCTTCCGGTAAAAC
AGAAGAGTTTCTTTGTTTGTTTGTTTGTATAAATGGAACCGTCGTCGTCGGGAACAACTT
TGCCGTCGGGATCGGAAGAGAGTCTCATGGAGCAGAGGAAGCGGAAGAGGATGCTCTCAA
ACCGTGAATCAGCGAGGAGATCGAGGATGAAGAAACAGAAGCTCCTCGACGATCTAACGG
CTCAGGTTAACCAGCTCAAAGAACAGAACAACGAGATCGTGACAAGTGTCAGCATCACGA
CGCAGCACTACTTAACCATCGAAGCAGAGAACTCTGTTCTCA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2AO34JQ 716 0 0
TCCTGTCCTGCTTTATCCCTCTTCCGGTAAAACAGAAGAGTTTCTTTGTTTGTTTGTTTG
TATAAATGGAACCGTCGTCGTCGGGAACAACTTTGCCGTCGGGATCGGAAGAGAGTCTCA
TGGAGCAGAGGAAGCGGAAGAGGATGCTCTCAAACCGTGAATCAGCGAGGAGATCGAGGA
TGAAGAAACAGAAGCTCCTCGACGATCTAACGGCTCAGGTTAACCAGCTCAAAGAACAGA
ACAACGAGATCGTGACAAGTGTCAGCATCACGACGCAGCACTACTTAACCATCGAAGCAG
AGAACTCTGTTCTCAGAGCTCAGCTTGATGAACTCAGCCACAGGCTCGAATCTCTCAATG
ACATCATCGAGTTACTCGATAGTACCAACGGGATTTGTCCGAGCCTTCTGACTGGTCCAG
AGCCTGATGATTTTCTCGTGAACCAGATGAATACGAACATGTTTTGTATGAACCAGCCTC
TCATGGCATCTTCTGATGCGTTACTGTATTAGAAACGTGGTCCAGAAAACCTCGAAATTA
CAAAATGGGGCCGTTTCTTTTGTCTGATTTTAAGATATGTCCAAAGAGAGATATATGAAA
AAAAATCTATCAGTGGGGTATGCTGTTTGATTGTGCTTTGTTCCGTCTTTGGCTCTATGT
ATTAAAAGCATCGTTGTTACGAGTGTTTGCAATAAAGGCTCTGTTGGCATGAGTAC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL3074Contig1 985 2 6 U
GGAAACCATTTATCGACTACAATAAACCTTCTCTCTCTCCTCTTTTTCTCTAACTTCTCT
CTAAAGGTTTCCTAAATCAGATTTGATCTCCGGTGGCCGGAGGCCTTATGCCGCCGGTTA
CCAACCTCTTTTGTTTTTTGTTTTCTCTTGTATAATAGTACTTCGCTAGGCGATTCCGTT
TTCCGTTTGCGGATCTCTCTTTTCGCGATGGCGAGTTTTTTGTTTTGTATCTATCTCAAC
TGAATCGGAGTAGTTTCTCATAAATATTCCTTTTATCTCCGATTATCGTTGATTAAAAAT
CTTATACTCTTTCTTCTGTTCTATTGTGAAATCCCGTTTGATATCAAGAAATGATTGGTA
TTCTCTGGTCATCCTCAAGACTACTTTTGGAAAGAATCAATCTTTGCCCCTTAAAAGTGA
TTGGCCGTTTGGCATATGGGCAGAGTATCTAACCGAATTAGCTTCTTGAGTTGATTGATT
AAGCTCAGGACTTAATTGGAGGATTCAGTAGAGTTGAAGCTTTTCATAAGGAGAAGCGTT
TCAACAAAGTGTCTTTCCAACTTTTCTGAAGCTTTCTCGTTGTTATTCACATCTGGAGAA
TGGCAAGAATTTTTTGGTAGCTACGGTTGTTATAGAAGAAGGAGTAACTGCAGATGGTAT
CAGAGATTGAAGATGCTATCTCCATAGGCGAGAAATCAAAGCTTCGTCATGGTGATAAGA
CGCAAAGATACGAACGAGATTGCAGAGGAGTTTACGGTGGAGAAGCTTTGCGGGGACCGG
GGAAGAGTACCTCGGCATGAAAGACACGTGTGTAACATGTGTTTTGTTATCATTCCCAAG
CTTGATACGTGGTCAATCTGATTTACATCCACCGTTTTAGTGACTTTTCTGTATAATATA
ATGTAATATCTTTGTTGGACTATATTGTATTTGATACCATTGTAATTGTCCATTGGGCTC
ATTTCAAGGAAATGAAAAAGTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB70TF U 1
AF RR2HB70JQ C 369
BS 1 614 RR2HB70TF
BS 615 615 RR2HB70JQ
BS 616 625 RR2HB70TF
BS 626 626 RR2HB70JQ
BS 627 636 RR2HB70TF
BS 637 985 RR2HB70JQ

RD RR2HB70TF 636 0 0
GGAAACCATTTATCGACTACAATAAACCTTCTCTCTCTCCTCTTTTTCTCTAACTTCTCT
CTAAAGGTTTCCTAAATCAGATTTGATCTCCGGTGGCCGGAGGCCTTATGCCGCCGGTTA
CCAACCTCTTTTGTTTTTTGTTTTCTCTTGTATAATAGTACTTCGCTAGGCGATTCCGTT
TTCCGTTTGCGGATCTCTCTTTTCGCGATGGCGAGTTTTTTGTTTTGTATCTATCTCAAC
TGAATCGGAGTAGTTTCTCATAAATATTCCTTTTATCTCCGATTATCGTTGATTAAAAAT
CTTATACTCTTTCTTCTGTTCTATTGTGAAATCCCGTTTGATATCAAGAAATGATTGGTA
TTCTCTGGTCATCCTCAAGACTACTTTTGGAAAGAATCAATCTTTGCCCCTTAAAAGTGA
TTGGCCGTTTGGCATATGGGCAGAGTATCTAACCGAATTAGCTTCTTGAGTTGATTGATT
AAGCTCAGGACTTAATTGGAGGATTCAGTAGAGTTGAAGCTTTTCATAAGGAGAAGCGTT
TCAACAAAGTGTCTTTCCAACTTTTCTGAAGCTTTCTCGTTGTTATTCACATCTGGAGAA
TGGCAAGAATTTTT*GGTAGCTACG*TTGTTATAGA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2HB70JQ 617 0 0
TCATCCTCAAGACTACTTTTGGAAAGAATCAATCTTTGCCCCTTAAAAGTGATTGGCCGT
TTGGCATATGGGCAGAGTATCTAACCGAATTAGCTTCTTGAGTTGATTGATTAAGCTCAG
GACTTAATTGGAGGATTCAGTAGAGTTGAAGCTTTTCATAAGGAGAAGCGTTTCAACAAA
GTGTCTTTCCAACTTTTTTGAAGCTTTCTCGTTGTTATTCACATCTGGAGAATGGCAAGA
ATTTTTTGGTAGCTACGGTTGTTATAGAAGAAGGAGTAACTGCAGATGGTATCAGAGATT
GAAGATGCTATCTCCATAGGCGAGAAATCAAAGCTTCGTCATGGTGATAAGACGCAAAGA
TACGAACGAGATTGCAGAGGAGTTTACGGTGGAGAAGCTTTGCGGGGACCGGGGAAGAGT
ACCTCGGCATGAAAGACACGTGTGTAACATGTGTTTTGTTATCATTCCCAAGCTTGATAC
GTGGTCAATCTGATTTACATCCACCGTTTTAGTGACTTTTCTGTATAATATAATGTAATA
TCTTTGTTGGACTATATTGTATTTGATACCATTGTAATTGTCCATTGGGCTCATTTCAAG
GAAATGAAAAAGTTGAC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL3075Contig1 1029 2 8 U
GCCAGAAATGTAATTATCTTATTTTGACTTAATCAAACTTTGAAAATATATTTCATAATT
CATGCAAAATCAACTCAAATACAACCAGATAGTACATAAACAGAGGAACTAAAAGGCAGT
TGACTAAACCGGTGTTCGGCTTATGACAGGATCATGGCTAAACCTGATCCCAGCTTGACC
ATGACTCAAAACCACTTCACACTTGGTACTGGTGTGGTTTTCAAGGAATGGTACTTGATT
CCAGCTTGACCAAGACTTGTAACCACTTCAAAGTCTCCAGCTTTAGCAGACCCTCCTTGA
CTCGAGACCTGTCTTCTCAGTTCAGCACAAGCACAATACTCTACTTCGTACACATCTACG
TCTTTATAGGTTGCAAATGTAGTCCTTACTCCTTCCCCGTGAGTGACTAAAAGCAAGTTC
TCTGAAGGGTACTTATCAGCAAGAGTCTTCACCAAACCAAGAAACCGTTCTGTGCATTCT
TCCACAGTCTCTTCCCATCGTGGCATCTCTTTATAAACAGGATCAATATTATGATCCACC
ATTCCCTCAGGAAACATAGCTTCAAGATCTAAAATCTTGAAATCGAATTTTCCATCTTTT
GGAGCAATCTCAGACCTAATAGCCATACTGTTCATCATCTCACTCAAACCAAACTCGATA
GACACCTTGAGCTTAGATTTATCGATGGCAAGCACGTCTTTTAGAGGAAGTAGCGTTTGG
GTTTAAGTCAACGGCGGAGAGAGCGGCGATAGCTTCTGAAGCGGTCTGAACGCAACGGAT
GAAGGGAGAGACGAAGACCCTGTGGATAGGAAACTGGATCTGAGATCGGATCCGTTGACC
AGTTTGAAACGCACGAACCAAACCGTTCTGTACGAGAGGAGGGTCCCAAGGTCTCGAAGC
TGTATCGAGCCAGAGTGGGTTGATCCTATCAACGCGATCACCGTGACGCAGCATCAAGAT
GTTTTGGTATCCATCGTTGGTATTCGAATTAGCAGACGACTCCATTGTTGCTCTGATGGT
GGTTGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H004JQ U 1
AF RR2ER51TF C 364
BS 1 570 RR2H004JQ
BS 571 571 RR2ER51TF
BS 572 610 RR2H004JQ
BS 611 611 RR2ER51TF
BS 612 615 RR2H004JQ
BS 616 616 RR2ER51TF
BS 617 725 RR2H004JQ
BS 726 1029 RR2ER51TF

RD RR2H004JQ 725 0 0
GCCAGAAATGTAATTATCTTATTTTGACTTAATCAAACTTTGAAAATATATTTCATAATT
CATGCAAAATCAACTCAAATACAACCAGATAGTACATAAACAGAGGAACTAAAAGGCAGT
TGACTAAACCGGTGTTCGGCTTATGACAGGATCATGGCTAAACCTGATCCCAGCTTGACC
ATGACTCAAAACCACTTCACACTTGGTACTGGTGTGGTTTTCAAGGAATGGTACTTGATT
CCAGCTTGACCAAGACTTGTAACCACTTCAAAGTCTCCAGCTTTAGCAGACCCTCCTTGA
CTCGAGACCTGTCTTCTCAGTTCAGCACAAGCACAATACTCTACTTCGTACACATCTACG
TCTTTATAGGTTGCAAATGTAGTCCTTACTCCTTCCCCGTGAGTGACTAAAAGCAAGTTC
TCTGAAGGGTACTTATCAGCAAGAGTCTTCACCAAACCAAGAAACCGTTCTGTGCATTCT
TCCACAGTCTCTTCCCATCGTGGCATCTCTTTATAAACAGGATCAATATTATGATCCACC
ATTCCCTCAGGAAACATAGCTTCAAGATCTGAAATCTTGAAATCGAATTTTCCATCTTTT
GGAGCAATCTTAGACTTAATAGCCATACTGTTCATCATCTCACTCAAACCAAACTCGATA
GACACCTTGAGCTTAGATTTATCGATGGCAAGCACGTCTTTTAGAGGAAGTAGCGTTTGG
GTTTA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2ER51TF 666 0 0
CTTATA
GTTGCAAATGTAGTCCTTACTCCTTCCCCGTGAGTGACTAAGAGCAAGTTCTCTGAAGGG
TACTTATCAGCAAGAGTCTTCACCAAACTAAGAAACCGTTCTGTGCATTCTTCCACAGTC
TCTTCCCATCGTGGCATCTCTTTATAAACAGGATCAATATTATGATCCACCATTCCCTCA
GGAAACATAGCTTCAAGATCTAAAATCTTGAAATCGAATTTTCCATCTTTTGGAGCAATC
TCAGACCTAATAGCCATACTGTTCATCATTTCACTCAAACCAAACTCGATAGACACCTTG
AGCTTAGATTTATCGATGGCAAGCACGTCTTT*AGAGGAAGTAGCGTTTGGGTTTAAGTC
AACGGCGGAGAGAGCGGCGATAGCTTCTGAAGCGGTCTGAACGCAACGGATGAAGGGAGA
GACGAAGACCCTGTGGATAGGAAACTGGATCTGAGATCGGATCCGTTGACCAGTTTGAAA
CGCACGAACCAAACCGTTCTGTACGAGAGGAGGGTCCCAAGGTCTCGAAGCTGTATCGAG
CCAGAGTGGGTTGATCCTATCAACGCGATCACCGTGACGCAGCATCAAGATGTTTTGGTA
TCCATCGTTGGTATTCGAATTAGCAGACGACTCCATTGTTGCTCTGATGGTGGTTGGTCC

QA 7 666 7 666
DS 



AS 1 3

CO CL3076Contig1 738 3 16 U
GAAGATTCTCGAGAACCGAGCAGAGGAGCTCAAGCTTGACTTCGGAGTTTGGAGGAGTGA
ATTGAGCGAGCAGAAGCAAAAGTTCCCGTTGAGTTTCAAGACGTTTGGAGAAGCCATTCC
TCCACAGTACGCGATTCAGGTCCTCGACGAGCTAACAGATGGGAAGGCTATCATCAGTAC
TGGTGTTGGACAACATCAGATGTGGGCAGCACAGTTTTACAAGTACAGGAAGCCGAGGCA
GTGGTTGTCATCATCAGGACTTGGAGCTATGGGTTTTGGACTCCCTGCTGCTATTGGAGC
GTCTGTGGCCAACCCTGATGAGATTTGTCGTGGACATTGACGGAGATGGAAGCTTCATAA
TGAACGTACAAGAGCTGGCCACAATCCGTGTGGAGAATCTTCCTGTGAAGATACTCTTGT
TAAACAACCAGCATCTTGGGATGGTCATGCAATGGGAAGATCGGTTCTACAAAGCTAACA
GAGCGCACACTTATCTTGGGGACCCAGCAAGGGAGAGCGAGATCTTCCCTAACATGCTGC
AGTTTGCAGGAGCTTGCGGGATTCCAGCTGCGAGAGTGACGAAGAAAGAAGAGCTCCGAG
AAGCTATTCAGACAATGCTGGATACACCGGGACCATACCTGTTGGATGTGATATGTCCGC
ACCAAGAGCATGTGTTACCAATGATCCCAAGTGGTGGCACGTTCAAAGATGTAATAACAG
AAGGGGATGGACGCACTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX20TF U 1
AF RR2CK29TF U 39
AF RR2CK29JQ C 496
BS 1 153 RR2GX20TF
BS 154 154 RR2CK29TF
BS 155 258 RR2GX20TF
BS 259 259 RR2CK29TF
BS 260 300 RR2GX20TF
BS 301 301 RR2CK29TF
BS 302 322 RR2GX20TF
BS 323 323 RR2CK29TF
BS 324 367 RR2GX20TF
BS 368 368 RR2CK29TF
BS 369 628 RR2GX20TF
BS 629 629 RR2CK29TF
BS 630 679 RR2GX20TF
BS 680 680 RR2CK29JQ
BS 681 706 RR2GX20TF
BS 707 738 RR2CK29JQ

RD RR2GX20TF 711 0 0
GAAGATTCTCGAGAACCGAGCAGAGGAGCTCAAGCTTGACTTCGGAGTTTGGAGGAGTGA
ATTGAGCGAGCAGAAGCAAAAGTTCCCGTTGAGTTTCAAGACGTTTGGAGAAGCCATTCC
TCCACAGTACGCGATTCAGGTCCTCGACGAGCTGACAGATGGGAAGGCTATCATCAGTAC
TGGTGTTGGACAACATCAGATGTGGGCAGCACAGTTTTACAAGTACAGGAAGCCGAGGCA
GTGGTTGTCATCATCAGGCCTTGGAGCTATGGGTTTTGGACTCCCTGCTGCTATTGGAGC
TTCTGTGGCCAACCCTGATGAGGTTTGTCGTGGACATTGACGGAGATGGAAGCTTCATAA
TGAACGTCCAAGAGCTGGCCACAATCCGTGTGGAGAATCTTCCTGTGAAGATACTCTTGT
TAAACAACCAGCATCTTGGGATGGTCATGCAATGGGAAGATCGGTTCTACAAAGCTAACA
GAGCGCACACTTATCTTGGGGACCCAGCAAGGGAGAGCGAGATCTTCCCTAACATGCTGC
AGTTTGCAGGAGCTTGCGGGATTCCAGCTGCGAGAGTGACGAAGAAAGAAGAGCTCCGAG
AAGCTATTCAGACAATGCTGGATACACCAGGACCATACCTGTTGGATGTGATATGTCCGC
ACCAAGAGCATGTGTTACCTATGATCCCAAGTGGTGGCACGTTCAA
TGATG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2CK29TF 669 0 0
ACTTCGGAGTTTGGAGGAGTGAATTGAGCGAGCAGAAGCAAAAGTTCCCGTTGAGTTTCA
AGACGTTTGGAGAAGCTATTCCTCCGCAGTACGCGATTCAGGTCCTCGACGAGTTAACCG
ATGGGAAGGCTATCATCAGTACTGGTGTTGGACAACATCAGATGTGGGCAGCACAGTTTT
ACAAGTACAGGAAGCCGAGGCAGTGGTTGTCATCATCAGGACTTGGAGCTATGGGTTTTG
GACTCCCTGCTGCTATTGGAGCGTCTGTGGCCAACCCTGATGCGATT*GTTGTGGACATT
GACGGAGATGGAAGCTTCATAATGAACGTACAAGAGCTGGCCACAATCCGTGTGGAGAAT
CTTCCTGTGAAGATACTCTTGTTAAACAACCAGCATCTTGGGATGGTCATGCAATGGGAA
GATCGGTTCTACAAAGCTAACAGAGCGCACACTTATCTTGGGGACCCAGCAAGGGAGAGC
GAGATCTTCCCTAACATGCTGCAGTTTGCACGAGCTTGCGGGATTCCAGCTGCGAGAGTG
ACGAAGAAAGAAGAGCTCCGAGAAGCTATTCAGACAATGCTGGATACACCGGGACCATAC
CTGTTGGATGTGATATGTCCGCACCAAGAGCATGTGTTACA*ATGATCCCA*GTGGTGGC
ACGTTCAA
G

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2CK29JQ 243 0 0
TTGGGGACCCAGCAAGGGAGAGCGAGATTTTCCCTAACATGCTGCAGTTTGCAGGAGCTT
GCGGGATTCCAGCTGCGAGAGTGACGAAGAAAGAAGAGTTCCGAGAAGTTATTCAGACAA
TGCTGGATACACCGGGACCATACCTGTTGGATGTGATATGTCCGCACCAAGAGCATGTGT
TACCAATGATCCCAAGTGGTGGCACGTTCAAAGATGTAATAACAGAAGGGGATGGACGCA
CTA

QA 1 243 1 243
DS 



AS 1 2

CO CL3077Contig1 858 2 6 U
GACAGAACATAACCACACTGTGTGTGTCATATAAAATATTAAATTGATGTCACAGCCAAA
ATAGAAACATTAACAACAACAAAAAGGTAAAAGAACAAGTATTACTTAGAAGAAGAAAAA
AAATCCAGTATAAGCAACCACATAAGATATCAAAACAAAAGTCATAGAGCAAGAACACTA
CGGAGTATCAAACAAGACCAGTTCTCTTTTTCACTTGAAGCACTTGGCGTCCAAGAGAGC
CTCACCTTCAAATGGCTCTGCGTCTTCAATCATCTGGCTAACACGCTCCTTCTGAGCTTC
GTCAGAAATATCAACCTTAGTCCACTCGTACAGCTCCATGTCATACACCTCGTCCATTAC
GAACTTGGGGATCTCTGGTCCACGGAACAACCACAAACCCTTCACCTTGAAGGGACCCTC
CGATCCGCAAATAAGCATCTTCCCAAAGGCATATTTACGTGCCAAGTCCATGCGCTGAAG
GAACCCTCCTACCTTGTTGAGGGTGACAAACGACACCATGTTCTCGTCGTTGTACTTGTA
GTCACAGAACCATAGTGAGTATCCCTCTGGGTCATACATGTCCCAAAATCCTTTAATAGC
GACCTCACGGAAGTTAGATTTGGTGTTAGAGTAAAGCCTCTTCCACTCATCGAGAACCAT
TGGGCTTGGTGGTAGCAAGTCAAGAGGGTTCTTTGCCTTGGGCTTTGGCGCCTCTTCCTC
TTCGACAGGCTTAGGTGCCTCTGCTGCAGGTGCTTCCTTTTTCTTAGGCTGCTCCTTGGG
CTTCGCAGGCTGCCCGGCTTTCTTGATAGGAGGAACAGATTCAGTCTGTTTAACATCACC
GACAACCTTCTTGAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F468JQ U 1
AF RR2C785JQ U 100
BS 1 237 RR2F468JQ
BS 238 238 RR2C785JQ
BS 239 585 RR2F468JQ
BS 586 586 RR2C785JQ
BS 587 728 RR2F468JQ
BS 729 858 RR2C785JQ

RD RR2F468JQ 731 0 0
GACAGAACATAACCACACTGTGTGTGTCATATAAAATATTAAATTGATGTCACAGCCAAA
ATAGAAACATTAACAACAACAAAAAGGTAAAAGAACAAGTATTACTTAGAAGAAGAAAAA
AAATCCAGTATAAGCAACCACATAAGATATCAAAACAAAAGTCATAGAGCAAGAACACTA
CGGAGTATCAAACAAGACCAGTTCTCTTTTTCACTTGAAGCACTTGGCGTCCAAGAGGGC
CTCACCTTCAAATGGCTCTGCGTCTTCAATCATCTGGCTAACACGCTCCTTCTGAGCTTC
GTCAGAAATATCAACCTTAGTCCACTCGTACAGCTCCATGTCATACACCTCGTCCATTAC
GAACTTGGGGATCTCTGGTCCACGGAACAACCACAAACCCTTCACCTTGAAGGGACCCTC
CGATCCGCAAATAAGCATCTTCCCAAAGGCATATTTACGTGCCAAGTCCATGCGCTGAAG
GAACCCTCCTACCTTGTTGAGGGTGACAAACGACACCATGTTCTCGTCGTTGTACTTGTA
GTCACAGAACCATAGTGAGTATCCCTCTGGGTCATACATGTCCCAGAATCCTTTAATAGC
GACCTCACGGAAGTTAGATTTGGTGTTAGAGTAAAGCCTCTTCCACTCATCGAGAACCAT
TGGGCTTGGTGGTAGCAAGTCAAGAGGGTTCTTTGCCTTGGGCTTTGGCGCCTCTTCCTC
TTCGACAG
GCT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2C785JQ 759 0 0
TATTACTTAGAAGAAGAAAAAAAATCCAGTATAAGCAACCACATAAGATATCAAAACAAA
AGTCATAGAGCAAGAACACTACGGAGTATCAAACAAGACCAGTTCTCTTTTTCACTTGAA
GCACTTGGCGTCCAAGAGAGCCTCACCTTCAAATGGCTCTGCGTCTTCAATCATCTGGCT
AACACGCTCCTTCTGAGCTTCGTCAGAGATATCAACCTTAGTCCACTCGTACAGCTCCAT
GTCATACACCTCGTCCATTACGAACTTGGGGATCTCTGGTCCACGGAACAACCACAAACC
CTTCACCTTGAAGGGACCCTCCGATCCGCAGATAAGCATCTTCCCAAAGGCATATTTACG
TGCCAAGTCCATGCGCTGAAGGAACCCTCCTACCTTGTTGAGGGTGACAAACGACACCAT
GTTCTCGTCGTTGTACTTGTAGTCACAGAACCATAGTGAGTATCCCTCTGGGTCATACAT
GTCCCAAAATCCTTTAATAGCGACCTCACGGAAGTTAGATTTGGTGTTAGAGTAAAGCCT
CTTCCACTCATCGAGAACCATTGGGCTTGGTGGTAGCAAGTCAAGAGGGTTCTTTGCCTT
GGGCTTTGGCGCCTCTTCCTCTTCGACAGGCTTAGGTGCCTCTGCTGCAGGTGCTTCCTT
TTTCTTAGGCTGCTCCTTGGGCTTCGCAGGCTGCCCGGCTTTCTTGATAGGAGGAACAGA
TTCAGTCTGTTTAACATCACCGACAACCTTCTTGAAGTT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL3078Contig1 625 2 2 U
GCTTGAGTGGAAAGGCTTGGACCAGCATGTTTGACAACAGGACTGCTTTCACGACCAAGA
AAGATTACGGTATTGGAGAAAGAGAAGCTCAATGGGCACAAGCTCAGAGGACACTGCACG
GTCTGCAGCCAAAAGAAGAGGTCAATATCTTCCCAGAGAAAGGAGGTTACAGAGAGCTGT
CTGAGATTGCCGAGCAAGCCAAGAGAAGGGCCGAGATAGCTAGGCTTAGGGAGCTTCACA
CACTGAAGGGACATGTTGAATCAGTTGCAAAGCTTAAGGGCTTGTACATTGATACAGCAG
GACATCACTATACCGTGTAGTTACAAGTTGAACAACACACAGACTCTACCAAAACCAACC
CCATCATGACTCCGTTTTTTTTTTAAATTTCTTCACAAGTCTTTTTTTTTTTTTTAAGAT
CGTAGTAGAGGGAAGAGAACTCTCTGTGTATTGCCATAACTCTTCCCAAATAACTCTTTT
CATCGTAGTCATTGTTCTTAAACTTCTACTTCGAGCTTTGCGAAATTCGCCTTTGAAGAA
ACAAGGCTCTTGCCTTGGTATTTTGGTACTTTGGCTACACCTTTTTTTTTAATGGCCTAA
TCTGAGCTTAATCTGAACTTGTTAG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E236JQ C 1
AF RR2E236TF U 1
BS 1 1 RR2E236JQ
BS 2 625 RR2E236TF

RD RR2E236JQ 625 0 0
GCTTGAGTGGAAAGGCTTGGACCAGCATGTTTGACAACAGGACTGCTTTCACGACCAAGA
AAGATTACGGTATTGGAGAAAGAGAAGCTCAATGGGCACAAGCTCAGAGGACACTGCACG
GTCTGCAGCCAAAAGAAGAGGTCAATATCTTCCCAGAGAAAGGAGGTTACAGAGAGCTGT
CTGAGATTGCCGAGCAAGCCAAGAGAAGGGCCGAGATAGCTAGGCTTAGGGAGCTTCACA
CACTGAAGGGACATGTTGAATCAGTTGCAAAGCTTAAGGGCTTGTACATTGATACAGCAG
GACATCACTATACCGTGTAGTTACAAGTTGAACAACACACAGACTCTACCAAAACCAACC
CCATCATGACTCCGTTTTTTTTTTAAATTTCTTCACAAGTCTTTTTTTTTTTTTTAAGAT
CGTAGTAGAGGGAAGAGAACTCTCTGTGTATTGCCATAACTCTTCCCAAATAACTCTTTT
CATCGTAGTCATTGTTCTTAAACTTCTACTTCGAGCTTTGCGAAATTCGCCTTTGAAGAA
ACAAGGCTCTTGCCTTGGTATTTTGGTACTTTGGCTACACCTTTTTTTTTAATGGCCTAA
TCTGAGCTTAATCTGAACTTGTTAG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2E236TF 625 0 0
G
CTTGAGTGGAAAGGCTTGGACCAGCATGTTTGACAACAGGACTGCTTTCACGACCAAGAA
AGATTACGGTATTGGAGAAAGAGAAGCTCAATGGGCACAAGCTCAGAGGACACTGCACGG
TCTGCAGCCAAAAGAAGAGGTCAATATCTTCCCAGAGAAAGGAGGTTACAGAGAGCTGTC
TGAGATTGCCGAGCAAGCCAAGAGAAGGGCCGAGATAGCTAGGCTTAGGGAGCTTCACAC
ACTGAAGGGACATGTTGAATCAGTTGCAAAGCTTAAGGGCTTGTACATTGATACAGCAGG
ACATCACTATACCGTGTAGTTACAAGTTGAACAACACACAGACTCTACCAAAACCAACCC
CATCATGACTCCGTTTTTTTTTTAAATTTCTTCACAAGTCTTTTTTTTTTTTTTAAGATC
GTAGTAGAGGGAAGAGAACTCTCTGTGTATTGCCATAACTCTTCCCAAATAACTCTTTTC
ATCGTAGTCATTGTTCTTAAACTTCTACTTCGAGCTTTGCGAAATTCGCCTTTGAAGAAA
CAAGGCTCTTGCCTTGGTATTTTGGTACTTTGGCTACACCTTTTTTTTTAATGGCCTAAT
CTGAGCTTAATCTGAACTTGTTAG

QA 2 625 2 625
DS 



AS 1 3

CO CL3079Contig1 1048 3 3 U
GGGACGCCGTTAACGCGGCGCCAAATAACAGCGGAGAGAGAAAGTTCGTTATCAAGATTA
GCGAGGGAGTGTACGAGGAGACCGTTAGGGTTCCGTTTGAGAAGAAGAACGTCGTCTTCG
TCGGAGACGGAATGGGCAAAACGGTCATTACGGGTTCCTTGAACGTCGGGATGCCTGGGA
TGACCACGTACAACACTGCAACTGTCGGAGTGGTAGGAGATGGATTCATGGCTCGTGATA
TAACCTTCCAAAACACGGCGGGACCCGACGCTCACCAAGCTGTGGCGTTTAGATCAGACA
GCGACTTTTCTCTGCTCGAGAACTGCGAGTTTCTTGGGAACCAAGACACACTCTACGCAC
ATGGACTTCGTCAGTTCTACAAAAGTTGCCGTATCCAAGGGAACGTTGACTTCATCTTCG
GAAACTCAGCTTGCGTCTTCCAGGACTGCGAGATCCTCATCGCTCCGCGTCAAGTCAACC
CCGAGAAGGGCGAGAAAAACGCTGTCACTGCACATGGAAGAATCGACCCGTCGCAGTCGA
CGGGGTTCGTGTTCTTGAACTGTTTGATAAACGGGACGGAGGAGTACATGAAGCTGTATA
AAGCTAACCCTAAGGTGCATAAGAACTTCTTGGGGAGGCCGTGGAAAGACTACTCGAGGA
CTGTGTTTATAGGTTGCAATATGGAGGTTTTGATAACTCCTGATGGGTGGCTACCGTGGA
GCGGGGATTTCGCTCTCCAGACGCTGTATTATGGAGAGTCTAAGAACACGGGTTTGGGAT
CAGATAGGTCGCAGAGGGTTTCGTGGAGCAGTGAGATACCAGACGAGCATGTTCATGTCT
ACTCGGTGGCTAACTTTATTCAAGGCGATGAGTGGGCTTTGATGTCTGGTTGAATCAATC
ATCATGACTAAAGGAAAAGTTATATAAGAAGTTTTAACCATTGTACTTTAGGTGAGAAAA
TTTATAAGACGAACCAAAAAAATAAGAACTTGGCATTCACGTTAGTTATATAAATTGAAA
GTTAAGAAATATCTAAACTAAATTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA88TF U 1
AF RR2AW43TFB U 445
AF RR2AA88JQ C 270
BS 1 760 RR2AA88TF
BS 761 928 RR2AW43TFB
BS 929 1048 RR2AA88JQ

RD RR2AA88TF 760 0 0
GGGACGCCGTTAACGCGGCGCCAAATAACAGCGGAGAGAGAAAGTTCGTTATCAAGATTA
GCGAGGGAGTGTACGAGGAGACCGTTAGGGTTCCGTTTGAGAAGAAGAACGTCGTCTTCG
TCGGAGACGGAATGGGCAAAACGGTCATTACGGGTTCCTTGAACGTCGGGATGCCTGGGA
TGACCACGTACAACACTGCAACTGTCGGAGTGGTAGGAGATGGATTCATGGCTCGTGATA
TAACCTTCCAAAACACGGCGGGACCCGACGCTCACCAAGCTGTGGCGTTTAGATCAGACA
GCGACTTTTCTCTGCTCGAGAACTGCGAGTTTCTTGGGAACCAAGACACACTCTACGCAC
ATGGACTTCGTCAGTTCTACAAAAGTTGCCGTATCCAAGGGAACGTTGACTTCATCTTCG
GAAACTCAGCTTGCGTCTTCCAGGACTGCGAGATCCTCATCGCTCCGCGTCAAGTCAACC
CCGAGAAGGGCGAGAAAAACGCTGTCACTGCACATGGAAGAATCGACCCGTCGCAGTCGA
CGGGGTTCGTGTTCTTGAACTGTTTGATAAACGGGACGGAGGAGTACATGAAGCTGTATA
AAGCTAACCCTAAGGTGCATAAGAACTTCTTGGGGAGGCCGTGGAAAGACTACTCGAGGA
CTGTGTTTATAGGTTGCAATATGGAGGTTTTGATAACTCCTGATGGGTGGCTACCGTGGA
GCGGGGATTTCGCTCTCCAGACGCTGTATTATGGAGAGTC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2AW43TFB 484 0 0
ACTGCGAGATCCTCATCGCTCCGCGTCAAGTCAACCCCGAGAAGGGCGAGAAAAACGCTG
TCACTGCACATGGAAGAATCGACCCGTCGCAGTCGACGGGGTTCGTGTTCTTGAACTGTT
TGATTAACGGGACGGAGGAGTACATGAGGCTTTATAAAGCTAACCCTAAGGTGCACAAGA
ACTTCTTGGGGAGGCCGTGGAAAGACTACTCGAGGACTGTGTTTATAGGTTGCGATATGG
AGGTTTTGATAACTCCTGATGGGTGGCTACCGTGGAGCGGGGATTTCGCTCTCCAGACGC
TGTATTATGGAGAGTCTAAGAACACGGGTTTGGGATCAGATAGGTCGCAGAGGGTTTCGT
GGAGCAGTGAGATACCAGACGAGCATGTTCATGTCTACTCGGTGGCTAACTTTATTCAAG
GCGATGAGTGGGCTTTGATGTCTGGTTGAATCAATCATCATGACTAAAGGAAAAGTTATA
TAAG

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2AA88JQ 779 0 0
GCTCACCAAGCTGTGGCGTTTAGATCAGACAGCGACTTTTCTCTGCTCGAGAACTGCGAG
TTTCTTGGGAACCAAGACACACTCTACGCACATGGACTTCGTCAGTTCTACAAAAGTTGC
CGTATCCAAGGGAACGTTGACTTCATCTTCGGAAACTCAGCTTGCGTCTTCCAGGACTGC
GAGATCCTCATCGCTCCGCGTCAAGTCAACCCCGAGAAGGGCGAGAAAAACGCTGTCACT
GCACATGGAAGAATCGACCCGTCGCAGTCGACGGGGTTCGTGTTCTTGAACTGTTTGATA
AACGGGACGGAGGAGTACATGAAGCTGTATAAAGCTAACCCTAAGGTGCATAAGAACTTC
TTGGGGAGGCCGTGGAAAGACTACTCGAGGACTGTGTTTATAGGTTGCAATATGGAGGTT
TTGATAACTCCTGATGGGTGGCTACCGTGGAGCGGGGATTTCGCTCTCCAGACGCTGTAT
TATGGAGAGTCTAAGAACACGGGTTTGGGATCAGATAGGTCGCAGAGGGTTTCGTGGAGC
AGTGAGATACCAGACGAGCATGTTCATGTCTACTCGGTGGCTAACTTTATTCAAGGCGAT
GAGTGGGCTTTGATGTCTGGTTGAATCAATCATCATGACTAAAGGAAAAGTTATATAAGA
AGTTTTAACCATTGTACTTTAGGTGAGAAAATTTATAAGACGAACCAAAAAAATAAGAAC
TTGGCATTCACGTTAGTTATATAAATTGAAAGTTAAGAAATATCTAAACTAAATTTCTT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL3080Contig1 898 2 2 U
GGGTATTCAGTGGACACTTGCACTGCAACCTCCAAAACCGTACCTCACCGCCGTCAACGA
CGACGTCCGCTTTGCCCCGTCATTGTGTCAGTATCAACGTAGAACAAGCTTTTAGCTCAG
TCCTAAGATCCGATGGAGGTTTGTGGTGTAGATTCTGAAGGGAAGGAGTTTACTCCAGAT
GATCAGAGGTACGATGTCATATGGGTTCAGTGGTGCATTGGGCATCTCACTGACGATGAT
TTTGTTTCTTTCTTTAACCGAGCAAAGGGATGCCTTAAACCCGGTGGGTTTTTTGTGGTG
AAAGAGAATCTCGCTAAGAAAGGTTTTGTTTTGGATAAAGAGGATCGTAGCATCACCCGA
TCGGATCCCTACTTTAAACAGCTCTTTCGTCGATGTGGGTTGCATCTCTTTCAAACTAAG
GATCAGAAGGGTCTTCCGCGAGAGTTATTTGCTGTTAAAATGTATGCTTTAACGGTTGAT
ACACCACCCAAAATCCATAAAACCAGATCGAAAACTCACGGCAACAGGCCGCACATTATC
AAATGACAGGCTTCTTGATTTAATGACAGAAGCTACCAACGTTATTGTAAGATCCGTAGA
TCAAGGCTTGGCTGCTTCAAGGATGGTTCATAATTGCGTAGTTTGGTTTCGTTCAGACCT
CCTGGCCTCGCCTAGTTTGTTAACCTTCTTATTCATTGTCTGATCATTTGTCCCGACTTG
AAGATAACTGTACTAGAATTTATATCTCAAGTTAGAGCATACGCTTCAGATAGTGATCTG
TAATCTGAAATTTAGCCGCTTCCTATGTAATAATTTTGTTTTTGCAGCCAAGGGGGAAAA
TATCTTTTTCTAAAATATGTAAATCTACATTGATCATGACATGAGTTAGTCAACTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR21TF U 1
AF RR2AR21JQ C 42
BS 1 819 RR2AR21TF
BS 820 898 RR2AR21JQ

RD RR2AR21TF 819 0 0
GGGTATTCAGTGGACACTTGCACTGCAACCTCCAAAACCGTACCTCACCGCCGTCAACGA
CGACGTCCGCTTTGCCCCGTCATTGTGTCAGTATCAACGTAGAACAAGCTTTTAGCTCAG
TCCTAAGATCCGATGGAGGTTTGTGGTGTAGATTCTGAAGGGAAGGAGTTTACTCCAGAT
GATCAGAGGTACGATGTCATATGGGTTCAGTGGTGCATTGGGCATCTCACTGACGATGAT
TTTGTTTCTTTCTTTAACCGAGCAAAGGGATGCCTTAAACCCGGTGGGTTTTTTGTGGTG
AAAGAGAATCTCGCTAAGAAAGGTTTTGTTTTGGATAAAGAGGATCGTAGCATCACCCGA
TCGGATCCCTACTTTAAACAGCTCTTTCGTCGATGTGGGTTGCATCTCTTTCAAACTAAG
GATCAGAAGGGTCTTCCGCGAGAGTTATTTGCTGTTAAAATGTATGCTTTAACGGTTGAT
ACACCACCCAAAATCCATAAAACCAGATCGAAAACTCACGGCAACAGGCCGCACATTATC
AAATGACAGGCTTCTTGATTTAATGACAGAAGCTACCAACGTTATTGTAAGATCCGTAGA
TCAAGGCTTGGCTGCTTCAAGGATGGTTCATAATTGCGTAGTTTGGTTTCGTTCAGACCT
CCTGGCCTCGCCTAGTTTGTTAACCTTCTTATTCATTGTCTGATCATTTGTCCCGACTTG
AAGATAACTGTACTAGAATTTATATCTCAAGTTAGAGCATACGCTTCAGATAGTGATCTG
TAATCTGAAATTTAGCCGCTTCCTATGTAATAATTTTGT

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2AR21JQ 857 0 0
ACCTCACCGCCGTCAACGACGACGTCCGCTTTGCCCCGTCATTGTGTCAGTATCAACGTA
GAACAAGCTTTTAGCTCAGTCCTAAGATCCGATGGAGGTTTGTGGTGTAGATTCTGAAGG
GAAGGAGTTTACTCCAGATGATCAGAGGTACGATGTCATATGGGTTCAGTGGTGCATTGG
GCATCTCACTGACGATGATTTTGTTTCTTTCTTTAACCGAGCAAAGGGATGCCTTAAACC
CGGTGGGTTTTTTGTGGTGAAAGAGAATCTCGCTAAGAAAGGTTTTGTTTTGGATAAAGA
GGATCGTAGCATCACCCGATCGGATCCCTACTTTAAACAGCTCTTTCGTCGATGTGGGTT
GCATCTCTTTCAAACTAAGGATCAGAAGGGTCTTCCGCGAGAGTTATTTGCTGTTAAAAT
GTATGCTTTAACGGTTGATACACCACCCAAAATCCATAAAACCAGATCGAAAACTCACGG
CAACAGGCCGCACATTATCAAATGACAGGCTTCTTGATTTAATGACAGAAGCTACCAACG
TTATTGTAAGATCCGTAGATCAAGGCTTGGCTGCTTCAAGGATGGTTCATAATTGCGTAG
TTTGGTTTCGTTCAGACCTCCTGGCCTCGCCTAGTTTGTTAACCTTCTTATTCATTGTCT
GATCATTTGTCCCGACTTGAAGATAACTGTACTAGAATTTATATCTCAAGTTAGAGCATA
CGCTTCAGATAGTGATCTGTAATCTGAAATTTAGCCGCTTCCTATGTAATAATTTTGTTT
TTGCAGCCAAGGGGGAAAATATCTTTTTCTAAAATATGTAAATCTACATTGATCATGACA
TGAGTTAGTCAACTGCC

QA 1 857 1 857
DS 



AS 1 2

CO CL3081Contig1 749 2 5 U
GATCTCTTTCTTCGGCTCGATGCAATAATTCTCTGTTGCCAGCTCCCCATTCACGAGACC
TCGCTGTTTTGCGGCGATCCTACTCAGCAACGATCGCGTCGGCGAACTCTCCCTTCCGGT
CCAACCTCCTCCGGATCATAAGAAACGAGATCGATTATCAATCGGAATATGCTCCTCCCC
ATCAGCCAGCGACTGAGTTCAAGTCATTCTCTGTTGAGGATCGTCCCGGTGAGCAATGCA
TTGTGATGAAAGGGAAGTTTGGCGAAGAGGAAAGCATCAAAATGGAAGCGACTATGTTCG
ATGGGTTTATGACTGTTCCACGTACCGGTTTAGATGCTTCCGGGCGCGACGTCCGTCTTC
ACGTTAGCTTGCTTGTCGACATTTCCAAGGCTGATGGGAGTGAGGACATGGAGTTTCTTT
GCTCCGTCTGGCCTAACCGTATCGAAATTCAAAACCTTTACATGCTTAAGCGTGATAAAA
TCACTGGTCAGCCTTACATGGGACCCAAGTTCGGGAGTTTGAAGTATGATTTTCAGACAG
CGATTAAAGAGTTTTTGGGAGTAAGAGGGATAGACTCGGAGCTTTGCTTTTTCTTGCATG
AGTATATGATGAATAAAGATAGGATTGAGCTCATTCAATGGTTTAGAAAGCTAAATTCAT
TCATCGCAAAGTAAATTTCCCATTGTTTTGACATCTTGTTAATTTATCAGTTCATACAAT
GTTTCAAATGGAATAAATCATATACTACT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ53JQ C 1
AF RR2BZ53TF U 1
BS 1 1 RR2BZ53JQ
BS 2 718 RR2BZ53TF
BS 719 719 RR2BZ53JQ
BS 720 732 RR2BZ53TF
BS 733 749 RR2BZ53JQ

RD RR2BZ53JQ 749 0 0
GATCTCTTTCTTCGGCTCGATGCAATAATTCTCTGTTGCCAGCTCCCCATTCACGAGACC
TCGCTGTTTTGCGGCGATCCTACTCAGCAACGATCGCGTCGGCGAACTCTCCCTTCCGGT
CCAACCTCCTCCGGATCATAAGAAACGAGATCGATTATCAATCGGAATATGCTCCTCCCC
ATCAGCCAGCGACTGAGTTCAAGTCATTCTCTGTTGAGGATCGTCCCGGTGAGCAATGCA
TTGTGATGAAAGGGAAGTTTGGCGAAGAGGAAAGCATCAAAATGGAAGCGACTATGTTCG
ATGGGTTTATGACTGTTCCACGTACCGGTTTAGATGCTTCCGGGCGCGACGTCCGTCTTC
ACGTTAGCTTGCTTGTCGACATTTCCAAGGCTGATGGGAGTGAGGACATGGAGTTTCTTT
GCTCCGTCTGGCCTAACCGTATCGAAATTCAAAACCTTTACATGCTTAAGCGTGATAAAA
TCACTGGTCAGCCTTACATGGGACCCAAGTTCGGGAGTTTGAAGTATGATTTTCAGACAG
CGATTAAAGAGTTTTTGGGAGTAAGAGGGATAGACTCGGAGCTTTGCTTTTTCTTGCATG
AGTATATGATGAATAAAGATAGGATTGAGCTCATTCAATGGTTTAGAAAGCTAAATTCAT
TCATCGCAAAGTAAATTTCCCATTGTTTTGACATCTTGTTAATTTATCAGTTCATACAAT
GTTTCAAATGGAATAAATCATATACTACT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2BZ53TF 749 0 0
G
ATCTCTTTCTTCGGCTCGATGCAATAATTCTCTGTTGCCAGCTCCCCATTCACGAGACCT
CGCTGTTTTGCGGCGATCCTACTCAGCAACGATCGCGTCGGCGAACTCTCCCTTCCGGTC
CAACCTCCTCCGGATCATAAGAAACGAGATCGATTATCAATCGGAATATGCTCCTCCCCA
TCAGCCAGCGACTGAGTTCAAGTCATTCTCTGTTGAGGATCGTCCCGGTGAGCAATGCAT
TGTGATGAAAGGGAAGTTTGGCGAAGAGGAAAGCATCAAAATGGAAGCGACTATGTTCGA
TGGGTTTATGACTGTTCCACGTACCGGTTTAGATGCTTCCGGGCGCGACGTCCGTCTTCA
CGTTAGCTTGCTTGTCGACATTTCCAAGGCTGATGGGAGTGAGGACATGGAGTTTCTTTG
CTCCGTCTGGCCTAACCGTATCGAAATTCAAAACCTTTACATGCTTAAGCGTGATAAAAT
CACTGGTCAGCCTTACATGGGACCCAAGTTCGGGAGTTTGAAGTATGATTTTCAGACAGC
GATTAAAGAGTTTTTGGGAGTAAGAGGGATAGACTCGGAGCTTTGCTTTTTCTTGCATGA
GTATATGATGAATAAAGATAGGATTGAGCTCATTCAATGGTTTAGAAAGCTAAATTCATT
CATCGCAAAGTAAATTTCCCATTGTTTTGACATCTTGTTAATTTATCAGTTCATACA*TG
TTTCAAATGGA
TAATCATATACTACTAA

QA 2 732 2 732
DS 



AS 1 3

CO CL3082Contig1 765 3 5 U
GGATTTCTTACATTCATATCAACAACTATGGCTCGCACTGACTCTCTCCTCCTCTCCCTC
CTCCTCATTGCCACCGTCTCTGTCGCCGCATTGGCCGTAACTGAACAAGAATGCGTCTAC
ACATTTAAAATCAAAACCGGAACAAGAGATAGCTCCGGCACCGATTCGATCATAGGGGCT
TCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTAGAGACCTAGAGAAATGGGGTGGT
GTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACA
GCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTATGCTTTTTGAATCTGAACTCTGACGGCTCCGGTGAT
AAGCCCGGCTGGTATGTTAAATACGTGGAAGTAAAGACGACCAGACCTGGAGTTGAGACC
AAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAGTGGCTTGCTGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTA
TCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTACCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAG
AACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATGAAGGTGTCGAGGAAAGTAACACG
GCAATATATAATGAACGTTCATATATAATGCAAAATTGAATAAAATTGTCTGTCAACGCG
TGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGTGTGTGGGATGGCATTGAT
CTAAAAGTTCCAATAGAATTAAACTGTGAGAATATTCAGTCAATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E686TF U 1
AF RR2F007TF U 1
AF RR2F007JQ C 243
BS 1 474 RR2E686TF
BS 475 475 RR2F007TF
BS 476 687 RR2E686TF
BS 688 724 RR2F007TF
BS 725 765 RR2F007JQ

RD RR2E686TF 687 0 0
GGATTTCTTACATTCATATCAACAACTATGGCTCGCACTGACTCTCTCCTCCTCTCCCTC
CTCCTCATTGCCACCGTCTCTGTCGCCGCATTGGCCGTAACTGAACAAGAATGCGTCTAC
ACATTTAAAATCAAAACCGGAACAAGAGATAGCTCCGGCACCGATTCGATCATAGGGGCT
TCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTAGAGACCTAGAGAAATGGGGTGGT
GTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACA
GCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTATGCTTTTTGAATCTGAACTCTGACGGCTCCGGTGAT
AAGCCCGGCTGGTATGTTAAATACGTGGAAGTAAAGACGACCAGACCTGGAGTTGAGACC
AAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAGTGGCTTGCTGTCGACGAGCCGCCGCATAAGCTA
TCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTACCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAG
AACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATGAAGGTGTCGAGGAAAGTAACACG
GCAATATATAATGAACGTTCATATATAATGCAAAATTGAATAAAATTGTCTGTCAACGCG
TGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2F007TF 724 0 0
GGATTTCTTACATTCATATCAACAACTATGGCTCGCACTGACTCTCTCCTCCTCTCCCTC
CTCCTCATTGCCACCGTCTCTGTCGCCGCATTGGCCGTAACTGAACAAGAATGCGTCTAC
ACATTTAAAATCAAAACCGGAACAAGAGATAGCTCCGGCACCGATTCGATCATAGGGGCT
TCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTAGAGACCTAGAGAAATGGGGTGGT
GTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACA
GCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTATGCTTTTTGAATCTGAACTCTGACGGCTCCGGTGAT
AAGCCCGGCTGGTATGTTAAATACGTGGAAGTAAAGACGACCAGACCTGGAGTTGAGACC
AAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAGTGGCTTGCTGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTA
TCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTACCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAG
AACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATGAAGGTGTCGAGGAAAGTAACACG
GCAATATATAATGAACGTTCATATATAATGCAAAATTGAATAGAATTGTCTGTCAACGCG
TGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGTGTGTGGGATGGCATTGAT
CTAA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2F007JQ 523 0 0
AATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGC
GCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTATGCTTTTTGAATCTGAACTCTGACGGCTCCGGTGATAA
GCCCGGCTGGTATGTTAAATACGTGGAAGTAAAGACGACCAGACCTGGAGTTGAGACCAA
GCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAGTGGCTTGCTGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATC
TGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTACCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAA
CAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATGAAGGTGTGGAGGAAAGTAACACGGC
AATATATAATGAACGTTCATATATAATGCAAAATTGAATAAAATTGTCTGTCAACGCGTG
ATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGTGTGTGGGATGGCATTGATCT
AAAAGTTCCAATAGAATTAAACTGTGAGAATATTCAGTCAATT

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 3

CO CL3083Contig1 1000 3 13 U
GGAGACAACAGACAATAGTGAGTGGTTGCTCAAAAAAAAAAGACAATAATGAGTTTTCTT
TTTCTTTTGACATCACCACCAAGAAACTAATGATTAAAGCTTGATCATCGACTAATACAT
TATTGTTACTTTTATCTAATCAAATCAAAACAGAGGAAGAAGATGAGTAGCTCAGATGCT
CTGTCTCATAACGTCTTCGTTTACGGCAGCATTCTTGAACCAGCCGTCGCCGCCGTGATC
CTTGACCGACCCGCTGATACAGTTCCCGCCCTTCTCCACGGCTATCACAAGTATAAACTC
AAAGGACGTCAGTATCCATGTATTGTCCCCTTTGAGTCTCGAAAAGTCAACGGCAAGGTA
ATAACGGGAGTATCCGATGCTGAGCTAAACAAATTCGATGTGATTGAAGGTAATGAGTAT
GAGAGAGTAACAGTTGAAGTTGTAAGGATGGACAATTCAGAGACAATGAAAGTGGAAACT
TATGTTTGGGTTAACAAAGATGATCCTAGTATGTATGGAGAATGGGATTACGAGGAATGG
AGAGTGAATCATGCGGATAAATTCGTGGAAATGTTTAGGAAAGTGTTGGAATGGAACAAG
AATCCAAATGGGAAGAAAAGAGAGGATATTGTGAAATCACTGTCCGATGATTGATGATTC
TTGAACAATGAACTTAGACATAAGTTGTTGTTTCTTGGCTGCTTATCTTTTTATTTTAAA
ATAAATTATTGGCTGCTAATTTTGGCAGACGAAGAGTGAGTAAAGAGTGTTTTTGTAATA
TATATTATTTTGTGTTTTTTGTGTTGCTAGAACTTGAAACCGATCTTCCTTTTTATTTTG
TTTGTGTTACTATGGAATCTTGTCTGCCCCAGATTCTGATTTCTAGGATCTTGAGTTGAG
GTTAAAGACTTTGACTTATAAGTCAAATGATATGTAGCACTGTAGTTAAGAGTTTATTGC
TAGATTGTGTATTAGAGTTGAGGTTAAACCTCTGTCCCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ13TF U 1
AF RR2BJ21TF U 145
AF RR2BJ21JQ C 224
BS 1 363 RR2BZ13TF
BS 364 364 RR2BJ21TF
BS 365 711 RR2BZ13TF
BS 712 712 RR2BJ21TF
BS 713 716 RR2BZ13TF
BS 717 718 RR2BJ21TF
BS 719 740 RR2BZ13TF
BS 741 741 RR2BJ21TF
BS 742 752 RR2BZ13TF
BS 753 753 RR2BJ21TF
BS 754 773 RR2BZ13TF
BS 774 903 RR2BJ21TF
BS 904 1000 RR2BJ21JQ

RD RR2BZ13TF 781 0 0
GGAGACAACAGACAATAGTGAGTGGTTGCTCAAAAAAAAAAGACAATAATGAGTTTTCTT
TTTCTTTTGACATCACCACCAAGAAACTAATGATTAAAGCTTGATCATCGACTAATACAT
TATTGTTACTTTTATCTAATCAAATCAAAACAGAGGAAGAAGATGAGTAGCTCAGATGCT
CTGTCTCATAACGTCTTCGTTTACGGCAGCATTCTTGAACCAGCCGTCGCCGCCGTGATC
CTTGACCGACCCGCTGATACAGTTCCCGCCCTTCTCCACGGCTATCACAAGTATAAACTC
AAAGGACGTCAGTATCCATGTATTGTCCCCTTTGAGTCTCGAAAAGTCAACGGCAAGGTA
ATAGCGGGAGTATCCGATGCTGAGCTAAACAAATTCGATGTGATTGAAGGTAATGAGTAT
GAGAGAGTAACAGTTGAAGTTGTAAGGATGGACAATTCAGAGACAATGAAAGTGGAAACT
TATGTTTGGGTTAACAAAGATGATCCTAGTATGTATGGAGAATGGGATTACGAGGAATGG
AGAGTGAATCATGCGGATAAATTCGTGGAAATGTTTAGGAAAGTGTTGGAATGGAACAAG
AATCCAAATGGGAAGAAAAGAGAGGATATTGTGAAATCACTGTCCGATGATTGATGATTC
TTGAACAATGAACTTAGACATAAGTTGTTGTTTCTTGGCTGCTTATCTTTT*ATTT**AA
ATAAATTATTGGCTGCTAATCTTGGCAGACGA*GAGTGAGTAAAGAGTGTTTT
GTATATAT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2BJ21TF 759 0 0
GG
AAAACAGAGGAAGAAGATGAGTAGCTCTGATGCTCTGTCTCATAACGTCTTCGTTTACGG
CAGCATTCTTGAACCAGCCGTCGCCGCCGTGATCCTTGACCGACCCGCTGATACAGTTCC
CGCCCTTCTCCACGGCTATCACAAGTATAAACTCAAAGGACGTCAGTATCCATGTATTGT
CCCCTTTGAGTCTCGAAAAGTCAACGGCAAGGTAATAACGGGAGTATCCGATGCTGAGCT
AAACAAATTCGATGTGATTGAAGGTAATGAGTATGAGAGAGTAACAGTTGAAGTTGTAAG
GATGGACAATTCAGAGACAATGAAAGTGGAAACTTATGTTTGGGTTAACAAAGATGATCC
TAGTATGTATGGAGAATGGGATTACGAGGAATGGAGAGTGAATCATGCGGATAAATTCGT
GGAAATGTTTAGGAAAGTGTTGGAATGGAACAAGAATCCAAATGGGAAGAAAAGAGAGGA
TATTGTGAAATCACTGTCCGATGATTGATGATTCTTGAACAATGAACTTAGACATAAGTT
GTTGTTTCTTGGCTGCTTATCTTTTTATTTTAAAATAAATTATTGGCTGCTAATTTTGGC
AGACGAAGAGTGAGTAAAGAGTGTTTTTGTAATATATATTATTTTGTGTTTTTTGTGTTG
CTAGAACTTGAAACCGATCTTCCTTTTTATTTTGTTTGTGTTACTATGGAATCTTGTCTG
CCCCAGATTCTGATTTCTAGGATCTTGAGTTGAGGTT

QA 3 759 3 759
DS 

RD RR2BJ21JQ 777 0 0
CCGTCGCCGCCGTGATCCTTGACCGACCCGCTGATACAGTTCCCGCCCTTCTCCACGGCT
ATCACAAGTATAAACTCAAAGGACGTCAGTATCCATGTATTGTCCCCTTTGAGTCTCGAA
AAGTCAACGGCAAGGTAATAACGGGAGTATCCGATGCTGAGCTAAACAAATTCGATGTGA
TTGAAGGTAATGAGTATGAGAGAGTAACAGTTGAAGTTGTAAGGATGGACAATTCAGAGA
CAATGAAAGTGGAAACTTATGTTTGGGTTAACAAAGATGATCCTAGTATGTATGGAGAAT
GGGATTACGAGGAATGGAGAGTGAATCATGCGGATAAATTCGTGGAAATGTTTAGGAAAG
TGTTGGAATGGAACAAGAATCCAAATGGGAAGAAAAGAGAGGATATTGTGAAATCACTGT
CCGATGATTGATGATTCTTGAACAATGAACTTAGACATAAGTTGTTGTTTCTTGGCTGCT
TATCTTTTTATTTTAAAATAAATTATTGGCTGCTAATTTTGGCAGACGAAGAGTGAGTAA
AGAGTGTTTTTGTAATATATATTATTTTGTGTTTTTTGTGTTGCTAGAACTTGAAACCGA
TCTTCCTTTTTATTTTGTTTGTGTTACTATGGAATCTTGTCTGCCCCAGATTCTGATTTC
TAGGATCTTGAGTTGAGGTTAAAGACTTTGACTTATAAGTCAAATGATATGTAGCACTGT
AGTTAAGAGTTTATTGCTAGATTGTGTATTAGAGTTGAGGTTAAACCTCTGTCCCTG

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL3084Contig1 825 2 6 U
AAACAGAAAAATGATACATCACATAAAGTTGAAAATAACATGTTTTGTCTGATTTTACAA
CAGCATGGTGGGTTCAGATCTTATTGATTGTTGTTACAGAAAGACTTGATGCGCAAACTA
TAAGTGGATCTTTATAACTCATCTCGTGAACCACTCTTGCTTTCATATGATGCATAAGCT
TTGATAATTGAAACATACACGTCAATCCCCTTCAAATACTCAGCTCTACCCAAATACTCA
TTGTGGTCATGAAGCAAACTAGGGGTGTTTGAAATGGGAGAGAAGCCAAAAGCGGGCACG
CCAGCCATCCGGAAGTAGCGAGCATCTGTTGATGCAGGGAAAATCTCAGGCTTACTAATT
TTACCTCCAGCTTCCTTAACAGCATTTTCCAAGAGCCTCCACCAAGGATTTGAATCATCT
GCTGCTGTAAGGAGCGGTTCCCCCGAATGCTTCTGCTTGAACTCAAAGGACATGTTGCGT
GCGGCGGGAGCCCATTCCTCCACCAAACGTATTTCAAGTGCTTCAGAATCAACGGTGGGA
GGGATACGAATGTCGAAACCAGCTTCAGCCTCAGAAGGTTGGAGATTCATCACGAAACCA
GTTGGGGAGGGTGTGCCAGCCTTGAGGAAGGCCATGTTGACGGAGACGACATCGCCTTCA
GCAGTGCCACCAGCTTTGAGAAGATCGAATTGGGAAGCTCTGAATCGACGAATACTCTCA
ATACTTTTGAGGAGATTCTCCATGGCAGAGTTGTCATAGAGCTTGGCACCGTGGCCAGGG
GGTCCTTTAGCCTTAATCACAAGCCACCAGGGACTCCTCTCTCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB17JQ U 1
AF RR2BJ05JQ U 6
BS 1 231 RR2FB17JQ
BS 232 232 RR2BJ05JQ
BS 233 510 RR2FB17JQ
BS 511 511 RR2BJ05JQ
BS 512 645 RR2FB17JQ
BS 646 825 RR2BJ05JQ

RD RR2FB17JQ 645 0 0
AAACAGAAAAATGATACATCACATAAAGTTGAAAATAACATGTTTTGTCTGATTTTACAA
CAGCATGGTGGGTTCAGATCTTATTGATTGTTGTTACAGAAAGACTTGATGCGCAAACTA
TAAGTGGATCTTTATAACTCATCTCGTGAACCACTCTTGCTTTCATATGATGCATAAGCT
TTGATAATTGAAACATACACGTCAATCCCCTTCAAATACTCAGCTCTACCCCAATACTCA
TTGTGGTCATGAAGCAAACTAGGGGTGTTTGAAATGGGAGAGAAGCCAAAAGCGGGCACG
CCAGCCATCCGGAAGTAGCGAGCATCTGTTGATGCAGGGAAAATCTCAGGCTTACTAATT
TTACCTCCAGCTTCCTTAACAGCATTTTCCAAGAGCCTCCACCAAGGATTTGAATCATCT
GCTGCTGTAAGGAGCGGTTCCCCCGAATGCTTCTGCTTGAACTCAAAGGACATGTTGCGT
GCGGCGGGAGCCCATTCCTCCACCAAACGTCTTTCAAGTGCTTCAGAATCAACGGTGGGA
GGGATACGAATGTCGAAACCAGCTTCAGCCTCAGAAGGTTGGAGATTCATCACGAAACCA
GTTGGGGAGGGTGTGCCAGCCTTGAGGAAGGCCATGTTGACGGAG

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2BJ05JQ 820 0 0
GAAAAAT
GATACATCACATAAAGTTGAAAATAACATGTTTTGTCTGATTTTACAACAGCATGGTGGG
TTCAGATCTTATTGATTGTTGTTACAGAAAGACTTGATGCGCAAACTATAAGTGGATCTT
TATAACTCATCTCGTGAACCACTCTTGCTTTCATATGATGCATAAGCTTTGATAATTGAA
ACATACACGTCAATCCCCTTCAAATACTCAGCTCTACCCAAATACTCATTGTGGTCATGA
AGCAAACTAGGGGTGTTTGAAATGGGAGAGAAGCCAAAAGCGGGCACGCCAGCCATCCGG
AAGTAGCGAGCATCTGTTGATGCAGGGAAAATCTCAGGCTTACTAGTTTTACCTCCAGCT
TCCTTGACAGCATTTTCCAAGAGCCTCCACCAAGGATTTGAATCATCTGCTGCTGTAAGG
AGCGGTTCCCCCGAATGCTTCTGCTTGAACTCAAAGGACATGTTGCGTGCGGCGGGAGCC
CATTCCTCCACCAAACGTATTTCAAGTGCTTCAGAATCAACGGTGGGAGGGATACGAATG
TCGAAACCAGCTTCAGCCTCAGAAGGTTGGAGATTCATCACGAAACCAGTTGGGGAGGGT
GTGCCAGCCTTGAGGAAGGCCATGTTGACGGAGACGACATCGCCTTCAGCAGTGCCACCA
GCTTTGAGAAGATCGAATTGGGAAGCTCTGAATCGACGAATACTCTCAATACTTTTGAGG
AGATTCTCCATGGCAGAGTTGTCATAGAGCTTGGCACCGTGGCCAGGGGGTCCTTTAGCC
TTAATCACAAGCCACCAGGGACTCCTCTCTCCA

QA 8 820 8 820
DS 



AS 1 3

CO CL3085Contig1 740 3 4 U
GGAGGAAACATCAAGGCAATGTGCGTGTATATAACAAAACCTCAAGCTCTCTCTCTCTTT
TCCTCACACCTTAAACTGAAAACCTAATTCGCTCATCGCTGCCGAAAGCTTATTCATCCA
TTCTTCGCTTAGTTTGTGATAATGTCTGCTGGTAAAAAAAGAACGTCCAGCTATCGGTAT
CGACCTGGGTACGACCTACTCGAGCGTCGGAGTATTTAACTCTGGTCCTGTCGGCAACAA
GACGACTCTGTCTGCTGGTAAAAGAGAACGTCCAGGGATCGGTATCGACCTGGGTACGAC
CTACTCGAGCATTGGAGTATTTAACTTTGGTCCTGTCGGCAACGGCAACAGGACGTCTCT
GTCTTACTTGCCCTTCACCGACTCCGAGAAGTTGATTGGTGATGCCGCCAAAAAGCAAGT
CACCATGAACCCCATTAACACCGTCTTCGATGCAAAGAGATTGATTGGTCGAAGATTCAG
AGACTCATCTGTCCAGAGCGACATGAAGCTCTGTGACAGGTTGGCTGTGCCTTCGCCAAT
GATGGAAAGACTCAAAGCGGCTGAAGTAACCGTTGAAGAGGAATAGAGGATACTCTCCAT
GAGAAAGAGAGTTTAGTCTATGCTTTATGTTTGCAATCTTATGTTTGCTACGTTGTATTT
TAATAATGTGTACAGCTACTTAAGCTGATTACTCTCAGGGTGTAAGGTTTTATCGAATGA
TTATTTACAAATTATCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EI09TF U 1
AF RR2BE25JQ C 61
AF RR2BE25TF U 61
BS 1 159 RR2EI09TF
BS 160 160 RR2BE25TF
BS 161 699 RR2EI09TF
BS 700 740 RR2BE25TF

RD RR2EI09TF 701 0 0
GGAGGAAACATCAAGGCAATGTGCGTGTATATAACAAAACCTCAAGCTCTCTCTCTCTTT
TCCTCACACCTTAAACTGAAAACCTAATTCGCTCATCGCTGCCGAAAGCTTATTCATCCA
TTCTTCGCTTAGTTTGTGATAATGTCTGCTGGTAAAAAA*GAACGTCCAGCTATCGGTAT
CGACCTGGGTACGACCTACTCGAGCGTCGGAGTATTTAACTCTGGTCCTGTCGGCAACAA
GACGACTCTGTCTGCTGGTAAAAGAGAACGTCCAGGGATCGGTATCGACCTGGGTACGAC
CTACTCGAGCATTGGAGTATTTAACTTTGGTCCTGTCGGCAACGGCAACAGGACGTCTCT
GTCTTACTTGCCCTTCACCGACTCCGAGAAGTTGATTGGTGATGCCGCCAAAAAGCAAGT
CACCATGAACCCCATTAACACCGTCTTCGATGCAAAGAGATTGATTGGTCGAAGATTCAG
AGACTCATCTGTCCAGAGCGACATGAAGCTCTGTGACAGGTTGGCTGTGCCTTCGCCAAT
GATGGAAAGACTCAAAGCGGCTGAAGTAACCGTTGAAGAGGAATAGAGGATACTCTCCAT
GAGAAAGAGAGTTTAGTCTATGCTTTATGTTTGCAATCTTATGTTTGCTACGTTGTATTT
TAATAATGTGTACAGCTACTTAAGCTGATTACTCTCAGG
TG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2BE25JQ 680 0 0
GG
CTCACACCTTAAACTGAAAACCTAATTCGCTCATCGCTGCCGAAAGCTTATTCATCCATT
CTTCGCTTAGTTTGTGATAATGTCTGCTGGTAAAAAAAGAACGTCCAGCTATCGGTATCG
ACCTGGGTACGACCTACTCGAGCGTCGGAGTATTTAACTCTGGTCCTGTCGGCAACAAGA
CGACTCTGTCTGCTGGTAAAAGAGAACGTCCAGGGATCGGTATCGACCTGGGTACGACCT
ACTCGAGCATTGGAGTATTTAACTTTGGTCCTGTCGGCAACGGCAACAGGACGTCTCTGT
CTTACTTGCCCTTCACCGACTCCGAGAAGTTGATTGGTGATGCCGCCAAAAAGCAAGTCA
CCATGAACCCCATTAACACCGTCTTCGATGCAAAGAGATTGATTGGTCGAAGATTCAGAG
ACTCATCTGTCCAGAGCGACATGAAGCTCTGTGACAGGTTGGCTGTGCCTTCGCCAATGA
TGGAAAGACTCAAAGCGGCTGAAGTAACCGTTGAAGAGGAATAGAGGATACTCTCCATGA
GAAAGAGAGTTTAGTCTATGCTTTATGTTTGCAATCTTATGTTTGCTACGTTGTATTTTA
ATAATGTGTACAGCTACTTAAGCTGATTACTCTCAGGGTGTAAGGTTTTATCGAATGATT
ATTTACAAATTATCTTAC

QA 3 680 3 680
DS 

RD RR2BE25TF 680 0 0
GG
CTCACACCTTAAACTGAAAACCTAATTCGCTCATCGCTGCCGAAAGCTTATTCATCCATT
CTTCGCTTAGTTTGTGATAATGTCTGCTGGTAAAAAAAGAACGTCCAGCTATCGGTATCG
ACCTGGGTACGACCTACTCGAGCGTCGGAGTATTTAACTCTGGTCCTGTCGGCAACAAGA
CGACTCTGTCTGCTGGTAAAAGAGAACGTCCAGGGATCGGTATCGACCTGGGTACGACCT
ACTCGAGCATTGGAGTATTTAACTTTGGTCCTGTCGGCAACGGCAACAGGACGTCTCTGT
CTTACTTGCCCTTCACCGACTCCGAGAAGTTGATTGGTGATGCCGCCAAAAAGCAAGTCA
CCATGAACCCCATTAACACCGTCTTCGATGCAAAGAGATTGATTGGTCGAAGATTCAGAG
ACTCATCTGTCCAGAGCGACATGAAGCTCTGTGACAGGTTGGCTGTGCCTTCGCCAATGA
TGGAAAGACTCAAAGCGGCTGAAGTAACCGTTGAAGAGGAATAGAGGATACTCTCCATGA
GAAAGAGAGTTTAGTCTATGCTTTATGTTTGCAATCTTATGTTTGCTACGTTGTATTTTA
ATAATGTGTACAGCTACTTAAGCTGATTACTCTCAGGGTGTAAGGTTTTATCGAATGATT
ATTTACAAATTATCTTAC

QA 3 680 3 680
DS 



AS 1 3

CO CL3086Contig1 765 3 13 U
GGACACTTCTCTTAAAAAAATTTCATAAAATCAAGTCGTCTCTTTCACAAATCAGATCAT
CAAATTCGGCACCACGATCCATAAACATTTCTTTCGTTCATTCCCCACCTTTCTCGGAAA
ATAAAAAAATAAAAAAAGCTCGAGAAAATGCATGATTTCTGCTTCACAATCCCGTACGGG
CTACTCCTGATCGGCGGTGGGTTCATCGGGTACATGAAGAAAGGAAGCATCACATCATTC
GCCGGAGGTGCAGGCACTGGTCTATTACTCATCCTCGCTGGATATCTCAGTCTCAATGCT
TTCCATAAGAAGAAGACTTCCTCTATCGCTGTTGTTCTTCAGACAGTCATTGCAGCTGCT
CTAACACTAGTCATGGGACAGCGTTACTTGCTCACTCAGAAGATTATGCCTGCTGGTTTA
GTTACTGTGATCAGTGCTCTCATGACCTGTTTTTACGTATACAAGATCGCTACTGGTGGC
AATAAAATCCCATTAAAAGCTGCAGAGTGATGATGATTATGCAACTCTGTTGGATGCAGA
CGATACTGTCCTTTGTTTGAATTTGTCGATTAGAAATCTCTTGTGGGTCTCTGAGATTAG
TTTGTATGGGTAAAGAACTTTCATATGGTCTTGTGTTGTGTGTTTCTGAGATTAGTTTCA
TTTGG*TCTTGTGTGTCTCTGACTCTGAGAATAGAAATCATGTTTCTGCTAACCACAAAC
GTTTTGGAGCCACATTAATATGAAGATATCCATGTTTCTGTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2GO72TF U 1
AF RR2FN74TF U 52
AF RR2GO72JQ C 163
BS 1 108 RR2GO72TF
BS 109 109 RR2FN74TF
BS 110 128 RR2GO72TF
BS 129 131 RR2FN74TF
BS 132 665 RR2GO72TF
BS 666 666 RR2FN74TF
BS 667 690 RR2GO72TF
BS 691 691 RR2FN74TF
BS 692 708 RR2GO72TF
BS 709 730 RR2FN74TF
BS 731 731 RR2GO72JQ
BS 732 761 RR2FN74TF
BS 762 765 RR2GO72JQ

RD RR2GO72TF 712 0 0
GGACACTTCTCTTAAAAAAATTTCATAAAATCAAGTCGTCTCTTTCACAAATCAGATCAT
CAAATTCGGCACCACGATCCATAAACATTTCTTTCGTTCATTCCCCACTTTTCTCGGAAA
ATAAAAAA**TAAAAAAGCTCGAGAAAATGCATGATTTCTGCTTCACAATCCCGTACGGG
CTACTCCTGATCGGCGGTGGGTTCATCGGGTACATGAAGAAAGGAAGCATCACATCATTC
GCCGGAGGTGCAGGCACTGGTCTATTACTCATCCTCGCTGGATATCTCAGTCTCAATGCT
TTCCATAAGAAGAAGACTTCCTCTATCGCTGTTGTTCTTCAGACAGTCATTGCAGCTGCT
CTAACACTAGTCATGGGACAGCGTTACTTGCTCACTCAGAAGATTATGCCTGCTGGTTTA
GTTACTGTGATCAGTGCTCTCATGACCTGTTTTTACGTATACAAGATCGCTACTGGTGGC
AATAAAATCCCATTAAAAGCTGCAGAGTGATGATGATTATGCAACTCTGTTGGATGCAGA
CGATACTGTCCTTTGTTTGAATTTGTCGATTAGAAATCTCTTGTGGGTCTCTGAGATTAG
TTTGTATGGGTAAAGAACTTTCATATGGTCTTGTGTTGTGTGTTTCTGAGATTAGTTTCA
TTTGGGTCTTGTGTGTCTCTGACTCTGAGA*TAGAAATCATGTTTCTG
TTAA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2FN74TF 711 0 0
GG
AGATCATCAAATTCGGCACCACGATCCATAAACATTTCTTTCGTTCATTCCCCACCTTTC
TCGGAAAATAAAAAAATAAAAAAAGCTCGAGAAAATGCATGATTTCTGCTTCACAATCCC
GTACGGGCTACTCCTGATCGGCGGTGGGTTCATCGGGTACATGAAGAAAGGAAGCATCAC
ATCATTCGCCGGAGGTGCAGGCACTGGTCTATTACTCATCCTCGCTGGATATCTCAGTCT
CAATGCTTTCCATAAGAAGAAGACTTCCTCTATCGCTGTTGTTCTTCAGACAGTCATTGC
AGCTGCTCTGACACTAGTCATGGGACAGCGTTACTTGCTCACTCAGAAGATTATGCCTGC
TGGTTTAGTTACTGTGATCAGTGCTCTCATGACCTGTTTTTACGTATACAAGATCGCTAT
TGGTGGCAATAAAATCCCATTAAAAGCTGCAGAGTGATGATGATTATGCAACTCTGTTGG
ATGCAGACGATACTGTCCTTTGTTTGAATTTGTCGATTAGAAATCTCTTGTGGGTCTCTG
AGATTAGTTTGTATGGGTAAAGAACTTTCATATGGTCTTGTGTTGTGTGTTTCTGAGATT
AGTTTCATTTGG*TCTTGTGTGTCTCTGACTCTGAGAATAGAAATCATGTTTCTGCTAAC
CACAAACGTTTTGGAGC*ACATTAATATGAAGATATCCATGTTTCTGT
A

QA 3 710 3 710
DS 

RD RR2GO72JQ 603 0 0
TTCACAATCCCGTACGGGCTACTCCTGATCGGCGGTGGGTTCATCGGGTACATGAAGAAA
GGAAGCATCACATCATTCGCCGGAGGTGCAGGCACTGGTCTATTACTCATCCTCGCTGGA
TATCTCAGTCTCAATGCTTTCCATAAGAAGAAGACTTCCTCTATCGCTGTTGTTCTTCAG
ACAGTCATTGCAGCTGCTCTAACACTAGTCATGGGACAGCGTTACTTGCTCACTCAGAAG
ATTATGCCTGCTGGTTTAGTTACTGTGATCAGTGCTCTCATGACCTGTTTTTACGTATAC
AAGATCGCTACTGGTGGCAATAAAATCCCATTAAAAGCTGCAGAGTGATGATGATTATGC
AACTCTGTTGGATGCAGACGATACTGTCCTTTGTTTGAATTTGTCGATTAGAAATCTCTT
GTGGGTCTTTGAGATTAGTTTGTATGGGTAAAGAACTTTCATATGGTCTTGTGTTGTGTG
TTTTTGAGATTAGTTTCATTTGG*TCTTGTGTGTCTCTGACTCTGAGAATAGAAATCATG
TTTCTGTTAACCACAAACGTTTTGGAGCCACATTAATATGAAGATATCCATGTTTCTGTT
ATG

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 3

CO CL3087Contig1 608 3 4 U
GGGCACTGTTAGTCATCTCCTTTCGTCGTCTCTCTAGCTACACGTTCCACAGGAGATCAG
AAACAACAATGAGTCAATACAATCAACATCCCGTTGGTGTTCCTCCTCCTCAAGGTTATC
CGCCTGAGGGGTATCCACCGCAAGGATATCCTCCTCAGGGATATCCGCCTCAAGGCTACC
CACAGCAGGGCTATCCACCACCGCAGGGTTATCCTCATCAATCTCCTCCTTATGCACCGC
AATATCCACAGCAGCATCAGCAGCAACAACAGAGCAAGCCTGGGTGTCTAGACGGATGTC
TTGCTGTTCTCTGCTGTTGTTGTCTCTGTGATCTTTGCATCTTCTGATTGGAGTACCTGT
TCGGAGCTGCTTTTTAATTGCAAGAGAGTGTTTGGCAACACAAGATCATTTGTTGCGTAA
TGGGCATTAAAATGAATTGCTGGATACAATCTCTTGTATATCCTCTGTCGTATTATCTTT
TATGTTTTTCGATTCATAAATAACATATTGTCTATCGACTTTCTGGCTTGGTTTGGTATT
GAGACTAGCGGGAATGTAAATTGGTGTGGTCGTGGAGACACTATTCCTTTTATTTACTTT
CGTATGCC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F252TF U 1
AF RR2AE28JQ C 3
AF RR2AE28TF U 3
BS 1 14 RR2F252TF
BS 15 15 RR2AE28TF
BS 16 526 RR2F252TF
BS 527 608 RR2AE28TF

RD RR2F252TF 526 0 0
GGGCACTGTTAGTCGTCTCCTTTCGTCGTCTCTCTAGCTACACGTTCCACAGGAGATCAG
AAACAACAATGAGTCAATACAATCAACATCCCGTTGGTGTTCCTCCTCCTCAAGGTTATC
CGCCTGAGGGGTATCCACCGCAAGGATATCCTCCTCAGGGATATCCGCCTCAAGGCTACC
CACAGCAGGGCTATCCACCACCGCAGGGTTATCCTCATCAATCTCCTCCTTATGCACCGC
AATATCCACAGCAGCATCAGCAGCAACAACAGAGCAAGCCTGGGTGTCTAGACGGATGTC
TTGCTGTTCTCTGCTGTTGTTGTCTCTGTGATCTTTGCATCTTCTGATTGGAGTACCTGT
TCGGAGCTGCTTTTTAATTGCAAGAGAGTGTTTGGCAACACAAGATCATTTGTTGCGTAA
TGGGCATTAAAATGAATTGCTGGATACAATCTCTTGTATATCCTCTGTCGTATTATCTTT
TATGTTTTTCGATTCATAAATAACATATTGTCTATCGACTTTCTGG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2AE28JQ 606 0 0
GG
ACTGTTAGTCATCTCCTTTCGTCGTCTCTCTAGCTACACGTTCCACAGGAGATCAGAAAC
AACAATGAGTCAATACAATCAACATCCCGTTGGTGTTCCTCCTCCTCAAGGTTATCCGCC
TGAGGGGTATCCACCGCAAGGATATCCTCCTCAGGGATATCCGCCTCAAGGCTACCCACA
GCAGGGCTATCCACCACCGCAGGGTTATCCTCATCAATCTCCTCCTTATGCACCGCAATA
TCCACAGCAGCATCAGCAGCAACAACAGAGCAAGCCTGGGTGTCTAGACGGATGTCTTGC
TGTTCTCTGCTGTTGTTGTCTCTGTGATCTTTGCATCTTCTGATTGGAGTACCTGTTCGG
AGCTGCTTTTTAATTGCAAGAGAGTGTTTGGCAACACAAGATCATTTGTTGCGTAATGGG
CATTAAAATGAATTGCTGGATACAATCTCTTGTATATCCTCTGTCGTATTATCTTTTATG
TTTTTCGATTCATAAATAACATATTGTCTATCGACTTTCTGGCTTGGTTTGGTATTGAGA
CTAGCGGGAATGTAAATTGGTGTGGTCGTGGAGACACTATTCCTTTTATTTACTTTCGTA
TGCC

QA 3 606 3 606
DS 

RD RR2AE28TF 606 0 0
GG
ACTGTTAGTCATCTCCTTTCGTCGTCTCTCTAGCTACACGTTCCACAGGAGATCAGAAAC
AACAATGAGTCAATACAATCAACATCCCGTTGGTGTTCCTCCTCCTCAAGGTTATCCGCC
TGAGGGGTATCCACCGCAAGGATATCCTCCTCAGGGATATCCGCCTCAAGGCTACCCACA
GCAGGGCTATCCACCACCGCAGGGTTATCCTCATCAATCTCCTCCTTATGCACCGCAATA
TCCACAGCAGCATCAGCAGCAACAACAGAGCAAGCCTGGGTGTCTAGACGGATGTCTTGC
TGTTCTCTGCTGTTGTTGTCTCTGTGATCTTTGCATCTTCTGATTGGAGTACCTGTTCGG
AGCTGCTTTTTAATTGCAAGAGAGTGTTTGGCAACACAAGATCATTTGTTGCGTAATGGG
CATTAAAATGAATTGCTGGATACAATCTCTTGTATATCCTCTGTCGTATTATCTTTTATG
TTTTTCGATTCATAAATAACATATTGTCTATCGACTTTCTGGCTTGGTTTGGTATTGAGA
CTAGCGGGAATGTAAATTGGTGTGGTCGTGGAGACACTATTCCTTTTATTTACTTTCGTA
TGCC

QA 3 606 3 606
DS 



AS 1 3

CO CL3088Contig1 512 3 5 U
GGACACAACAAATTTTCTGATAAAAAACATAATCAACTCATTCATTTTACCAAGAATGAA
AAAA*CCACTCATATTTTCTTTGGATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTCTTGTACTAGTGG
CCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAAGAGATGTGTCCTATATCTCTAGATA
ACCAAAAGGATGGAAGTTGTCACAACAAACCAGCTTGCCAATCTGCATGCAATAAGAGGA
TACAAGGATTAGGAATAAAGGGAATGATCGCTGGTTGTACCTCGGGAAACAAATGCATGT
GCTATGCCCCATGTGGAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACATAAATCAGATA
TATTTATAATAAATTATGATATGATTCATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAATTTGTT
ATTGTCAAATTATGATAACAATAAATATGATCATTTGCATATGTAGTGAATGGCAAAATA
AGTTGGAAAAGTTAATTAGAATTATTAACTTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B558JQ C 19
AF RR2B558TF U 3
AF RR2H282TF U 1
BS 1 64 RR2H282TF
BS 65 65 RR2B558TF
BS 66 344 RR2H282TF
BS 345 345 RR2B558TF
BS 346 512 RR2H282TF

RD RR2B558JQ 424 0 0
GATAAAAAACATAATCAACTCATTCATTTTACCAAGAATGAAAAAA*CCACTCATATTTT
CTTTGGATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTCTTGTACTAGTGGCCGGAGCGATGGGGCAAG
GGAATAAAAATAAAAAAGAGATGTGTCCTATATCTCTAGATAACCAAAAGGATGGAAGTT
GTCACAACAAACCAGCTTGCCAATCTGCATGCAATAAGAGGATACAAGGATTAGGAATAA
AGGGAATGATCGCTGGTTGTACCTCGGGAAACAAATGCATGTGCTATGCCCCATGTGGAA
AATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACATAAATCAGATATATTTATAATAAATTATG
ATATGATTCATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAATTTGTTATTGTCAAATTATGATAA
CAAT

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR2B558TF 440 0 0
GG
ACAACAAATTTTCTGATAAAAAACATAATCAACTCATTCATTTTACCAAGAATGAAAAAA
*CCACTCATATTTTCTTTGGATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTCTTGTACTAGTGGCCGG
AGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAAGAGATGTGTCCTATATCTCTAGATAACCA
AAAGGATGGAAGTTGTCACAACAAACCAGCTTGCCAATCTGCATGCAATAAGAGGATACA
AGGATTAGGAATAAAGGGAATGATCGCTGGTTGTACCTCGGGAAACAAATGCATGTGCTA
TGCCCCATGTGGAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACATAAATCAGATATATT
TATAATAAATTATGATATGATTCATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAATTTGTTATTG
TCAAATTATGATAACAAT

QA 3 440 3 440
DS 

RD RR2H282TF 512 0 0
GGACACAACAAATTTTCTGATAAAAAACATAATCAACTCATTCATTTTACCAAGAATGAA
AAAAACCACTCATATTTTCTTTGGATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTCTTGTACTAGTGG
CCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAAGAGATGTGTCCTATATCTCTAGATA
ACCAAAAGGATGGAAGTTGTCACAACAAACCAGCTTGCCAATCTGCATGCAATAAGAGGA
TACAAGGATTAGGAATAAAGGGAATGATCGCTGGTTGTACCTCGGGAAACAAATGCATGT
GCTATGCCCCATGTGGAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGATAACATAAATCAGATA
TATTTATAATAAATTATGATATGATTCATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAATTTGTT
ATTGTCAAATTATGATAACAATAAATATGATCATTTGCATATGTAGTGAATGGCAAAATA
AGTTGGAAAAGTTAATTAGAATTATTAACTTC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 3

CO CL3091Contig1 1120 3 5 U
GGGCAGGGAAGGGACGAGGATGATTCTGATAACCTCACCGTCAGTGACTTCCCTACGTCA
CTCCCTCCACGATCCTTACGCAAGATCTCTGCAAGCCCGCAGCCATTTTAGCTGGAGTAG
CCAAACCTCGACCGTCGTCAATCAATGCATTCAACCACGGCAGACAATGAACGGCTTCCA
AATACGAACAGGAGACAAAAGATCTATCTCATGCTTGGCTCGCCGGAAACCGGAGACGGT
AACGGTTGAGGTTGAAGATGATCCTCTCCGGAGCATCCTTCGGTCTCTACTGTGGACAGC
TGAAGCCGTGTACATACTATGGCTATTTCTTCTCCCTTATGCTCCCGGAGATCCAGTTTG
GGCAATTAGCTCAGAGACAGTGACCTCTCTTTTGGGACTTTCATTGAACTTCTTCTTTAT
CTTGCCTCTTACAAACTCTGTTGGTATTCATTTCCTAGAAGCTCCTGTTCTTCACCCTAT
GGCTGAAGGGTTATTCAACTTCGTAATAGCTTGGACACTCATGTTTGCTCCGTTGCTATA
CACAGACCGAAAGAGAGATCGTTACAAAAGCTCTCTTGACGTCTTATGGGGTCTCATGAT
GTTCCTCACAAACACGTTTCTGATCCCGTACATGGCTATACGGCTAAATGACGCTGACCA
AGATGATAAACCGAGCAAAAGGTCTCAACTCGGGGAAGTCATGACCAAAGGTGCATCGGT
AGTTGGTCTCACCGGTGTTACTGTGTGTCTGATATCGACCTTGTGGTCTCTCTACGGTCG
AGCAGATGGAGGTTTCGGTGGAATAATGGAGAGATGGCAGTATCTGACTGGTTATTTGGG
ATCGGAGAGACTAGCTTACGCGTTTATATGGGATATATGTTTGTACACAGTTTTCCAGCC
ATGGTTGATTGGAGAGAACCTGCAAAATGTGAAGAAGAGCAAGGTTGAGTTAGTGAGTTA
TCTTAGGTTCGTTCCTGTTCTTGGTTTACTTTCATATCTTCTGTTTCTCAATCTTGACGA
TGAAGATTTATAATTTGTGAAATAACTGTGACATGATACATGTTTATGTACGTATAAATA
TTTATTTTGGCAACGTAGTTTATCAAGTTTATTATTCCTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H683TF U 1
AF RR2AF46TF U 3
AF RR2AF46JQ C 340
BS 1 602 RR2H683TF
BS 603 681 RR2AF46TF
BS 682 682 RR2AF46JQ
BS 683 784 RR2AF46TF
BS 785 1120 RR2AF46JQ

RD RR2H683TF 602 0 0
GGGCAGGGAAGGGACGAGGATGATTCTGATAACCTCACCGTCAGTGACTTCCCTACGTCA
CTCCCTCCACGATCCTTACGCAAGATCTCTGCAAGCCCGCAGCCATTTTAGCTGGAGTAG
CCAAACCTCGACCGTCGTCAATCAATGCATTCAACCACGGCAGACAATGAACGGCTTCCA
AATACGAACAGGAGACAAAAGATCTATCTCATGCTTGGCTCGCCGGAAACCGGAGACGGT
AACGGTTGAGGTTGAAGATGATCCTCTCCGGAGCATCCTTCGGTCTCTACTGTGGACAGC
TGAAGCCGTGTACATACTATGGCTATTTCTTCTCCCTTATGCTCCCGGAGATCCAGTTTG
GGCAATTAGCTCAGAGACAGTGACCTCTCTTTTGGGACTTTCATTGAACTTCTTCTTTAT
CTTGCCTCTTACAAACTCTGTTGGTATTCATTTCCTAGAAGCTCCTGTTCTTCACCCTAT
GGCTGAAGGGTTATTCAACTTCGTAATAGCTTGGACACTCATGTTTGCTCCGTTGCTATA
CACAGACCGAAAGAGAGATCGTTACAAAAGCTCTCTTGACGTCTTATGGGGTCTCATGAT
GT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2AF46TF 782 0 0
GG
AGGGAAGGGACGAGGATGATTCTGATAACCTCACCGTCAGTGACTTCCCTACGTCACTCC
CTCCACGATCCTTACGCAAGATCTCTGCAAGCCCGCAGCCATTTTAGCTGGAGTAGCCAA
ACCTCGACCGTCGTCAATCAATGCATTCAACCACGGCAGACAATGAACGGCTTCCAAATA
CGAACAGGAGACAAAAGATCTATCTCATGCTTGGCTCGCCGGAAACCGGAGACGGTAACG
GTTGAGGTTGAAGATGATCCTCTCCGGAGCATCCTTCGGTCTCTACTGTGGACAGCTGAA
GCCGTGTACATACTATGGCTATTTCTTCTCCCTTATGCTCCCGGAGATCCAGTTTGGGCA
ATTAGCTCAGAGACAGTGACCTCTCTTTTGGGACTTTCATTGAACTTCTTCTTTATCTTG
CCTCTTACAAACTCTGTTGGTATTCATTTCCTAGAAGCTCCTGTTCTTCACCCTATGGCT
GAAGGGTTATTCAACTTCGTAATAGCTTGGACACTCATGTTTGCTCCGTTGCTATACACA
GACCGAAAGAGAGATCGTTACAAAAGCTCTCTTGACGTCTTATGGGGTCTCATGATGTTC
CTCACAAACACGTTTCTGATCCCGTACATGGCTATACGGCTAAATGACGCTGACCAAGAT
GATAAACCGAGCAAAAG*TCTCAACTCGGGGAAGTCATGACCAAAGGTGCATCGGTAGTT
GGTCTCACCGGTGTTACTGTGTGTCTGATATCGACCTTGTGGTCTCTCTACGGTCGAGCA

QA 3 782 3 782
DS 

RD RR2AF46JQ 781 0 0
TGCTCCCGGAGATCCAGTTTGGGCAATTAGCTCAGAGACAGTGACCTCTCTTTTGGGACT
TTCATTGAACTTCTTCTTTATCTTGCCTCTTACAAACTCTGTTGGTATTCATTTCCTAGA
AGCTCCTGTTCTTCACCCTATGGCTGAAGGGTTATTCAACTTCGTAATAGCTTGGACACT
CATGTTTGCTCCGTTGCTATACACAGACCGAAAGAGAGATCGTTACAAAAGCTCTCTTGA
CGTCTTATGGGGTCTCATGATGTTCCTCACAAACACGTTTCTGATCCCGTACATGGCTAT
ACGGCTAAATGACGCTGACCAAGATGATAAACCGAGCAAAAGGTCTCAACTCGGGGAAGT
CATGACCAAAGGTGCATCGGTAGTTGGTCTCACCGGTGTTACTGTGTGTCTGATATCGAC
CTTGTGGTCTCTCTACGGTCGAGCAGATGGAGGTTTCGGTGGAATAATGGAGAGATGGCA
GTATCTGACTGGTTATTTGGGATCGGAGAGACTAGCTTACGCGTTTATATGGGATATATG
TTTGTACACAGTTTTCCAGCCATGGTTGATTGGAGAGAACCTGCAAAATGTGAAGAAGAG
CAAGGTTGAGTTAGTGAGTTATCTTAGGTTCGTTCCTGTTCTTGGTTTACTTTCATATCT
TCTGTTTCTCAATCTTGACGATGAAGATTTATAATTTGTGAAATAACTGTGACATGATAC
ATGTTTATGTACGTATAAATATTTATTTTGGCAACGTAGTTTATCAAGTTTATTATTCCT
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL3092Contig1 1058 2 2 U
GGGCAAGTCTACTGACTATTTACTTGAGTAATTGCAACTACAGACTACAGTCTACTAACC
AGTAAATAACACTTGCAAAGTACTGCTAGCCTATTAATTTACTAGGAGATGAAACAGGAC
AAGTTGATGTACATAAGCATGAGAGAAAACTAGCTCCTGTGCAGTCTCCTGAGGTTAATA
ACCTGTGCAGGAAGCTGTGTTGATTCTTCACAATCAGCTTTAGGAAACGCTTTTATATAA
TTCAAATGGATGTGTATTACTTTTGTTTATTCAACTGACTGTCTTGTACTAATGATATAC
AAAATGAATTGATTATCTGTTAAATTATGTATTCTCATACTTGTATAAGATTAACAAAAT
TTGCAGATCCGACAAACAAATAAAGAAAACAACTTTTGATTGGGAGTATCACTCAACTTT
CGCAGGTTTCATACCGTCTAAAGAGAGGACAAAAGATGTTTGCATCAAACTCGCCATCCA
TTGCTGTAAGAAGACGTTAACGCCTTTGATCTCGACCATGTTATCCATCACCCACCATAA
GAACCTGTCTGAGCTCCAATCCACAGGATAATGCATAACAAGCCTTCCTTTTATCTGGCT
TCATAATGCATAACAAGCCTTCCTTTGATTGGACCCGGTTAATCACCAGTAATCACCACA
AGAGCAGACTCCATCCTTAAAATGATGAAACCGGTTCGAATCTCTCACAACAATCTCTCT
CTCAGTGATCCTCGATATGAACTTGGTAACGCTATGGCAATCACTACACACCCTCAGGTT
CTTAAAAATCTGAATCCTCGTCTTTGGAGGAGTGGTAATAAGCGCAAACGCAATAGCCAA
CCTTTCACTGTGACTCATCAGTATATGCTCTTTCTCATCGTCCTCAACATCCTGCAGCAC
AAACCTATGGTCCGGTACATACCCAATCATCTTCATTTTCTCGTGTAACAACGTCAACTC
CTTGTAGATTTCCTCACACATGGGATGCGTTTGGTTCCCCGTGTAAAACACCTCCACTCT
GTTGTTTACTTCCATCGAGCTCCAACCTGGTGTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G613JQ U 1
AF RR2B680TF C 305
BS 1 509 RR2G613JQ
BS 510 1058 RR2B680TF

RD RR2G613JQ 509 0 0
GGGCAAGTCTACTGACTATTTACTTGAGTAATTGCAACTACAGACTACAGTCTACTAACC
AGTAAATAACACTTGCAAAGTACTGCTAGCCTATTAATTTACTAGGAGATGAAACAGGAC
AAGTTGATGTACATAAGCATGAGAGAAAACTAGCTCCTGTGCAGTCTCCTGAGGTTAATA
ACCTGTGCAGGAAGCTGTGTTGATTCTTCACAATCAGCTTTAGGAAACGCTTTTATATAA
TTCAAATGGATGTGTATTACTTTTGTTTATTCAACTGACTGTCTTGTACTAATGATATAC
AAAATGAATTGATTATCTGTTAAATTATGTATTCTCATACTTGTATAAGATTAACAAAAT
TTGCAGATCCGACAAACAAATAAAGAAAACAACTTTTGATTGGGAGTATCACTCAACTTT
CGCAGGTTTCATACCGTCTAAAGAGAGGACAAAAGATGTTTGCATCAAACTCGCCATCCA
TTGCTGTAAGAAGACGTTAACGCCTTTGA

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2B680TF 754 0 0
TGAATTGATTATCTGTTAAATTATGTATTCTCATACTTGTATAAGATTAACAAAATTTGC
AGATCCGACAAACAAATAAAGAAAACAACTTTTGATTGGGAGTATCACTCAACTTTCGCA
GGTTTCATACCGTCTAAAGAGAGGACAAAAGATGTTTGCATCAAACTCGCCATCCATTGC
TGTAAGAAGACGTTAACGCCTTTGATCTCGACCATGTTATCCATCACCCACCATAAGAAC
CTGTCTGAGCTCCAATCCACAGGATAATGCATAACAAGCCTTCCTTTTATCTGGCTTCAT
AATGCATAACAAGCCTTCCTTTGATTGGACCCGGTTAATCACCAGTAATCACCACAAGAG
CAGACTCCATCCTTAAAATGATGAAACCGGTTCGAATCTCTCACAACAATCTCTCTCTCA
GTGATCCTCGATATGAACTTGGTAACGCTATGGCAATCACTACACACCCTCAGGTTCTTA
AAAATCTGAATCCTCGTCTTTGGAGGAGTGGTAATAAGCGCAAACGCAATAGCCAACCTT
TCACTGTGACTCATCAGTATATGCTCTTTCTCATCGTCCTCAACATCCTGCAGCACAAAC
CTATGGTCCGGTACATACCCAATCATCTTCATTTTCTCGTGTAACAACGTCAACTCCTTG
TAGATTTCCTCACACATGGGATGCGTTTGGTTCCCCGTGTAAAACACCTCCACTCTGTTG
TTTACTTCCATCGAGCTCCAACCTGGTGTCTTCC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL3093Contig1 993 2 2 U
TCATCATATCCATCGCTTGCGTTATCCTCGAGGGACGTTTCTCTCCCTTCCTCATCTCTC
TACTTTGGTCGGATAATTCACCGATCAAGCTTCGATGCTGACCTGAAGCTACGTTGTAAA
TCAAACGGAACACGCAGAACCAAGCCAGTGTCAGCTGTTATAAACTCAAGTCGTGTTCCG
GAGATTGATTCCTCTTCGGAACCAATTCAAGTGTTCGATGGCTCCACAAGGTTGTATATA
TCTTATTCTTGCCCATTTGCGCAACGTGCGTGGATTGCTCGGAACTACAAGCGTCTGCAA
GACAAGATAGAACTTGTACCAATTGATCTCAAGAACAGACCTGCTTGGTACAAGGAGAAA
GTTTACCCGGCTAACAAGGTGCCTGCATTAGAGCACAATAACCGAGTGATGGGAGAGAGC
CTCGACCTGATCAAGTACATCGACACCAATTTCGAAGGGCCTTCACTTGCACCCACTAGT
GGTAGAGAAGGAAGCATTCGCTGATGAGTTAATCTCTTACACCGACTCTTTCTCCAAGGC
CGTACGATCCACATTATCAGGTGCCGACAGTGATGCAGCAGATGCTGCATTTGATTACAT
TGAGCAGTCTCTTTCCAAATTCAAACAAGGGCCTTTCTTCCTTGGCCTATTTAGTTTGGT
TGATATTGCATATATTCCGTTCATAGAGAGATTCCATCTTATCTTTAAGGATGTAATGAA
TGTGGACATCACATCTGGTCGGCCAAACCTCGCCCTTTGGATTGAGGAGATGAACACTAT
TGAAGCTTACACAGAAACCCGTCAAGATCCACAAGAGATAGTTGAGAGACACAAAAAACG
AGCCCAAGCAGAAGCACGTCCCTAAGCATATGAGAGTTTGAGTCATCAAAGATTTGTTTA
ATATTATCATTTATTTTGTATCCGGAAAAAGAATGTAAAAGCATCTACATTGACACAGGC
AACAACTGCTTTTCATAATCTCAACTGCTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B070TF U 1
AF RR2B070JQ C 276
BS 1 641 RR2B070TF
BS 642 993 RR2B070JQ

RD RR2B070TF 641 0 0
TCATCATATCCATCGCTTGCGTTATCCTCGAGGGACGTTTCTCTCCCTTCCTCATCTCTC
TACTTTGGTCGGATAATTCACCGATCAAGCTTCGATGCTGACCTGAAGCTACGTTGTAAA
TCAAACGGAACACGCAGAACCAAGCCAGTGTCAGCTGTTATAAACTCAAGTCGTGTTCCG
GAGATTGATTCCTCTTCGGAACCAATTCAAGTGTTCGATGGCTCCACAAGGTTGTATATA
TCTTATTCTTGCCCATTTGCGCAACGTGCGTGGATTGCTCGGAACTACAAGCGTCTGCAA
GACAAGATAGAACTTGTACCAATTGATCTCAAGAACAGACCTGCTTGGTACAAGGAGAAA
GTTTACCCGGCTAACAAGGTGCCTGCATTAGAGCACAATAACCGAGTGATGGGAGAGAGC
CTCGACCTGATCAAGTACATCGACACCAATTTCGAAGGGCCTTCACTTGCACCCACTAGT
GGTAGAGAAGGAAGCATTCGCTGATGAGTTAATCTCTTACACCGACTCTTTCTCCAAGGC
CGTACGATCCACATTATCAGGTGCCGACAGTGATGCAGCAGATGCTGCATTTGATTACAT
TGAGCAGTCTCTTTCCAAATTCAAACAAGGGCCTTTCTTCC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2B070JQ 718 0 0
TGCTCGGAACTACAAGCGTCTGCAAGACAAGATAGAACTTGTACCAATTGATCTCAAGAA
CAGACCTGCTTGGTACAAGGAGAAAGTTTACCCGGCTAACAAGGTGCCTGCATTAGAGCA
CAATAACCGAGTGATGGGAGAGAGCCTCGACCTGATCAAGTACATCGACACCAATTTCGA
AGGGCCTTCACTTGCACCCACTAGTG*TAGAGAAGGAAGCATTCGCTGATGAGTTAATCT
CTTACACCGACTCTTTCTCCAAGGCCGTACGATCCACATTATCAGGTGCCGACAGTGATG
CAGCAGATGCTGCATTTGATTACATTGAGCAGTCTCTTTCCAAATTCAAACAAGGGCCTT
TCTTCCTTGGCCTATTTAGTTTGGTTGATATTGCATATATTCCGTTCATAGAGAGATTCC
ATCTTATCTTTAAGGATGTAATGAATGTGGACATCACATCTGGTCGGCCAAACCTCGCCC
TTTGGATTGAGGAGATGAACACTATTGAAGCTTACACAGAAACCCGTCAAGATCCACAAG
AGATAGTTGAGAGACACAAAAAACGAGCCCAAGCAGAAGCACGTCCCTAAGCATATGAGA
GTTTGAGTCATCAAAGATTTGTTTAATATTATCATTTATTTTGTATCCGGAAAAAGAATG
TAAAAGCATCTACATTGACACAGGCAACAACTGCTTTTCATAATCTCAACTGCTTGCT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL3094Contig1 753 2 30 U
GGACGTTTCTTCCTCTTCGTCGCAGCGCGTCCTCTCAAACTCGCAGAGTGCAGATAATAA
TTAGACCTAGCCAATGCCAATGGGAGGAGGATTCAGAGTCTTGCATCTGGTGAGGCCATT
CTTGCCTTTTCTCCCAGAAGTGCAGAGTGCAGACAGGAAGATTCCATTCAGAGAGAAAGT
CATCTACACAGTCATCCCCCTCTTCATCTTCCTCGTCTGCAGCCAGCTCCCTCTCTACGG
CATCCACGCCACCACCGGCGCTGATCCCTTGTACTGGATGCGTGTCATTCTCGCCTCCAA
CCGTGGTACCGTCATGGAGCTTGGTATCACCCCCATCGTCACCTCTGGTCTCGTTATGCA
GCTCTTGGCTGGGTCTAAGATCATTGAGGTTGACAACAATGTCCGCGAGGACCGTGCTCT
CCTGAATGGTGCTCAGAAGCTTCTTGGGATTCTGATTGCTATTGGTGAAGCTGTTGCGTA
TGTTCTTTCTGGAATGTACGGTCCTGTTGGTCAGCTTGGCGTTGGGAACTCTATCCTCAT
CATCCTACAGCTTTTCTTTGCTGGTATTATCGTTATCTGCCTCGACGAGCTTCTTCAAAA
GGGTTATGGGCTTGGCTCTGGGATCTCTCTTTTCATAGCAACCAATATCTGTGAAAGCAT
TATCTGGAAATCATTTAGTCCCACAACAATCAACACTGGTCGTGGAGCTGAGTTCGAAGC
GCTGTGATCGCATCGTTCATATGCTGATACTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH15TF U 1
AF RR2GF90TF U -2
BS 1 18 RR2CH15TF
BS 19 19 RR2GF90TF
BS 20 48 RR2CH15TF
BS 49 53 RR2GF90TF
BS 54 132 RR2CH15TF
BS 133 133 RR2GF90TF
BS 134 135 RR2CH15TF
BS 136 136 RR2GF90TF
BS 137 165 RR2CH15TF
BS 166 166 RR2GF90TF
BS 167 330 RR2CH15TF
BS 331 331 RR2GF90TF
BS 332 411 RR2CH15TF
BS 412 412 RR2GF90TF
BS 413 421 RR2CH15TF
BS 422 422 RR2GF90TF
BS 423 451 RR2CH15TF
BS 452 452 RR2GF90TF
BS 453 497 RR2CH15TF
BS 498 498 RR2GF90TF
BS 499 534 RR2CH15TF
BS 535 535 RR2GF90TF
BS 536 597 RR2CH15TF
BS 598 598 RR2GF90TF
BS 599 639 RR2CH15TF
BS 640 640 RR2GF90TF
BS 641 714 RR2CH15TF
BS 715 715 RR2GF90TF
BS 716 738 RR2CH15TF
BS 739 753 RR2GF90TF

RD RR2CH15TF 748 0 0
GGACGTTTCTTCCTCTTCTTCGCAGCGCGTCCTCTCAAACTCGCAGAG*****ATAATAA
TTAGACCTAGCCAATGCCAATGGGAGGAGGATTCAGAGTCTTGCATCTGGTGAGGCCATT
CTTGCCTTTTCTTCCCGAAGTGCAGAGTGCAGACAGGAAGATTCCGTTCAGAGAGAAAGT
CATCTACACAGTCATCCCCCTCTTCATCTTCCTCGTCTGCAGCCAGCTCCCTCTCTACGG
CATCCACGCCACCACCGGCGCTGATCCCTTGTACTGGATGCGTGTCATTCTCGCCTCCAA
CCGTGGTACCGTCATGGAGCTTGGTATCACTCCCATCGTCACCTCTGGTCTCGTTATGCA
GCTCTTGGCTGGGTCTAAGATCATTGAGGTTGACAACAATGTCCGCGAGGATCGTGCTCT
CTTGAATGGTGCTCAGAAGCTTCTTGGGATTTTGATTGCTATTGGTGAAGCTGTTGCGTA
TGTTCTTTCTGGAATGTGCGGTCCTGTTGGTCAGCTTGGCGTTGGGAACTCTATTCTCAT
CATCCTACAGCTTTTCTTTGCTGGTATTATCGTTATCTGCCTCGACGAGCTTCTTCAGAA
GGGTTATGGGCTTGGCTCTGGGATCTCTCTTTTCATAGCTACCAATATCTGTGAAAGCAT
TATCTGGAAATCATTTAGTCCCACAACAATCAACACTGGTCGTGGAGCTGAGTTTGAAGC
GCTGTGATCGCATCGTTC
CGTATGCTGA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2GF90TF 756 0 0
GGACGTCTCT
TCTTCTTCTTCGTCGCAGCGCTTCCTCTCAAACTCGCAGAGTGCAGATAATAATTAGACC
TAGCCAATGCCAATGGGAGGAGGATTCAGAGTCTTGCATCTGGTGAGGCCATTCTTGCCT
TTTCTCCCAGAGGTGCAGAGTGCAGACAGGAAGATTCCATTCAGAGAGAAAGTCATCTAC
ACAGTCATCTCCCTCTTCATCTTCCTCGTCTGCAGCCAGCTCCCTCTCTACGGTATCCAC
GCCACCACCGGCGCTGATCCCTTGTACTGGATGCGTGTCATTCTCGCCTCCAACCGTGGT
ACCGTCATGGAGCTTGGTATCACCCCCATCGTCACCTCTGGTCTCGTTATGCAGCTTTTG
GCTGGGTCTAAGATCATTGAGGTTGACAACAATGTCCGCGAGGACCGTGCTCTCCTGAGT
GGTGCTCAGAAGCTTCTTGGGATTCTGATTGCTATTGGTGAAGCTGTTGCGTATGTTCTT
TCTGGTATGTACGGTCCTGTTGGTCGGCTTGGCGTTGGGAACTCTATCCTCATCATCCTC
CAGCTTTTCTTTGCTGGTATTATCGTTATCTGCCTCGACGAGCTTCTTCAAAAGGGTTAT
GGGCTTGGCTCTGGGATCTCTCTTTTCATTGCAACCAATATCTGTGAAAGCATTATCTGG
AAATCATTTAGTCCTACAC**ATCAACACTGGTCGTGGAGCTGAGTTCGAAGCGCTGTGA
TCGCATTGTTCATATGCTGATACTAA

QA 11 756 11 756
DS 



AS 1 2

CO CL3095Contig1 1136 2 4 U
TTCGGCTTTCAACGAAATCGTTGAGCACACACTGCAGAAATGCGAGGATTTCAAGATGAA
AATTAACATGATCCAGGATTTGAGGGAGATGACAAAGAAGGTGCTTCACTACTACAAAGG
AGACTTCTTAGATGAGCTTCCTGGGCTTGATGATTTCACCGTGGTTCTCAATCTGTCTCC
AAGGCAGCTGACTGAAGTGAAGAAGTTGAGGCGTGAGAAGAGAAAATTCAAGGTTTCGGC
TGTGGGGAGTGCTATTTACCTTCATCCGAGGCTGAACGCTTTCTCTGAAAAGACTGATAG
TGTATCTGATTCAACTATGGACGAAATGCTAGAGAAGCTAGATGTGGATGAAGGCGTGAA
AGCAAAGTTCTTCCTAAACTTGATAGACTGTGTGACTCAGCAGGTGAGAAGCTCTTGGTT
TTCAGCCAGTATCTCGTGCCTCTGAGGTTTCTTGAAAGACTAGCTGCTCTAGCTAAGGGA
TGGAAGCTAGGGAAAGAAGTCTTTGTTCTTACGGGGGAATCCAGCTCTGAGCAGCGTGAG
TTGTCTATGGAAAGGTTCAACAATTCGCCAGACGCCAAAGTATTCTTCGGTTCGATAAGG
GCCTGTGGGAGAAAGTATCTCTCTAGTTGGAGCATCTCGGATACTGATTCTGGATGTTCC
TCTAAACCCTTCAGTGACACGCCAAGCGATAGGGAGAGCTTTTAGACCAGGACAGACGAA
GAAAGTGCATGCGTACAGATTGATCGCTGGGTCATCACCTGAGGAAGAGGATCACAACAC
TTGCTTCAAAAAGGAAGTCATCTCAAAGATGTGGTTCGAGTGGAATGAGTACTGTGGATA
CCGTAACTTTGAGGTAGAGACAATCGATGTGGATGATGCTGGTGATCTGTTCCTTGAAAG
TCCTGCCTTACGAGAAGACATAAGAGTTCTCTACAAAAGGTAAACCGAAGACAATTGCTG
ACGGAAACTTGGTCTTGTGGCTTTGGACATGCTTTAGGTTTTAGAAACCTGTTAATAAGA
TAACTTCGGGTAGGGGTCCTTTTGGTTTTTATGGAAGATTGTTGAATCTTTTGGACATGC
TTTTGGTTTTGTTTCATAAAGTAGAGAGCTTCTAGTGTTCTTTTGATGTTAAACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B844TF U 1
AF RR2B844JQ C 488
BS 1 723 RR2B844TF
BS 724 724 RR2B844JQ
BS 725 765 RR2B844TF
BS 766 1136 RR2B844JQ

RD RR2B844TF 765 0 0
TTCGGCTTTCAACGAAATCGTTGAGCACACACTGCAGAAATGCGAGGATTTCAAGATGAA
AATTAACATGATCCAGGATTTGAGGGAGATGACAAAGAAGGTGCTTCACTACTACAAAGG
AGACTTCTTAGATGAGCTTCCTGGGCTTGATGATTTCACCGTGGTTCTCAATCTGTCTCC
AAGGCAGCTGACTGAAGTGAAGAAGTTGAGGCGTGAGAAGAGAAAATTCAAGGTTTCGGC
TGTGGGGAGTGCTATTTACCTTCATCCGAGGCTGAACGCTTTCTCTGAAAAGACTGATAG
TGTATCTGATTCAACTATGGACGAAATGCTAGAGAAGCTAGATGTGGATGAAGGCGTGAA
AGCAAAGTTCTTCCTAAACTTGATAGACTGTGTGACTCAGCAGGTGAGAAGCTCTTGGTT
TTCAGCCAGTATCTCGTGCCTCTGAGGTTTCTTGAAAGACTAGCTGCTCTAGCTAAGGGA
TGGAAGCTAGGGAAAGAAGTCTTTGTTCTTACGGGGGAATCCAGCTCTGAGCAGCGTGAG
TTGTCTATGGAAAGGTTCAACAATTCGCCAGACGCCAAAGTATTCTTCGGTTCGATAAGG
GCCTGTGGGAGAAAGTATCTCTCTAGTTGGAGCATCTCGGATACTGATTCTGGATGTTCC
TCTAAACCCTTCAGTGACACGCCAAGCGATAGGGAGAGCTTTTAGACCAGGACAGACGAA
GAA*GTGCATGCGTACAGATTGATCGCTGGGTCATCACCTGAGGA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2B844JQ 649 0 0
TAGGGAAAGAAGTCTTTGTTCTTACGGGGGAATCCAGCTCTGAGCAGCGTGAGTTGTCTA
TGGAAAGGTTCAACAATTCGCCAGACGCCAAAGTATTCTTCGGTTCGATAAGGGCCTGTG
G*AGAAGGTATCTCTCTAGTTGGAGCATCTCGGATACTGATTCTGGATGTTCCTCTAAAC
CCTTCAGTGACACGCCAAGCGATAGGGAGAGCTTTTAGACCAGGACAGACGAAGAAAGTG
CATGCGTACAGATTGATCGCTGGGTCATCACCTGAGGAAGAGGATCACAACACTTGCTTC
AAAAAGGAAGTCATCTCAAAGATGTGGTTCGAGTGGAATGAGTACTGTGGATACCGTAAC
TTTGAGGTAGAGACAATCGATGTGGATGATGCTGGTGATCTGTTCCTTGAAAGTCCTGCC
TTACGAGAAGACATAAGAGTTCTCTACAAAAGGTAAACCGAAGACAATTGCTGACGGAAA
CTTGGTCTTGTGGCTTTGGACATGCTTTAGGTTTTAGAAACCTGTTAATAAGATAACTTC
GGGTAGGGGTCCTTTTGGTTTTTATGGAAGATTGTTGAATCTTTTGGACATGCTTTTGGT
TTTGTTTCATAAAGTAGAGAGCTTCTAGTGTTCTTTTGATGTTAAACAT

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL3096Contig1 868 2 14 U
GGAAAGCAATTAAGATGCGTTTGCTAGTAGCAGAAGTAGCTGCAGCAGCTTCACCATTGT
CCTCTACTTCTACAGAATGTAACTCTCCTACTTGCAGATGGAAGCCTTACTCCAACTCTA
CTGACTTCCAAGCAAACGCGTCCGTCCTCCTCATACTTCTCTTCTCTGCTCTCATATGTG
CTCTCTCTCTATGCGCTGCAATCCGTTGCTTTCTCCGGCCAACAACTCCCGAGACTGACG
GCAACGACTACAAGCCTGACCCTGAAGCGGATGGTTCATCCATTATAGCAACTCCTACGC
TTGTCTACTCCTCAGACCTCGAGCTAGCGGGAGCTGAAGCAGAGTGTGCCATTTGCTTGT
CTGAATTCGAAGAAGGTGAGAGCATCCAAGTGCTGGAGAAATGTCATCATGGGTTCCATG
TTAAGTGCATCCACAAGCGGCTCTCTTCCCACTCATCCTGTCCTACTTGCCGGACTTCTA
TCTTCTTACAAAGCACCTTAGACTCTGAACCATCAACCGAAGCTCCTTCAACAAACCAGA
TCAATGCTTAGCTTCTTTCCTCACTTCATCTCCCACTTTCTCATATTTCTTTCATCCAAA
TCTTAAGAGTTATATCATGTTTTGCTTAGAGTTGTAACATGTTTTGCTTGAGATTACTAC
CGTGATGATGTTCCGCATTAGGTAAAACTATAAAACACAGACAAATAACTACAACGTGTA
TGAATCGAATCATAATTAAGCTCTAAACAAATGCAAAATAATATCTCTATAAAAAAAAAC
AGGAGTTTATTTTCAGACGCCCTTGTGACTATTTAAAAATTCTTTAATCTCCTCCTATTA
AAATATTAATTATTGTTTAAGTATATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G430TF U 1
AF RR2G430JQ C 147
BS 1 681 RR2G430TF
BS 682 682 RR2G430JQ
BS 683 704 RR2G430TF
BS 705 705 RR2G430JQ
BS 706 713 RR2G430TF
BS 714 714 RR2G430JQ
BS 715 728 RR2G430TF
BS 729 729 RR2G430JQ
BS 730 746 RR2G430TF
BS 747 749 RR2G430JQ
BS 750 757 RR2G430TF
BS 758 758 RR2G430JQ
BS 759 777 RR2G430TF
BS 778 868 RR2G430JQ

RD RR2G430TF 777 0 0
GGAAAGCAATTAAGATGCGTTTGCTAGTAGCAGAAGTAGCTGCAGCAGCTTCACCATTGT
CCTCTACTTCTACAGAATGTAACTCTCCTACTTGCAGATGGAAGCCTTACTCCAACTCTA
CTGACTTCCAAGCAAACGCGTCCGTCCTCCTCATACTTCTCTTCTCTGCTCTCATATGTG
CTCTCTCTCTATGCGCTGCAATCCGTTGCTTTCTCCGGCCAACAACTCCCGAGACTGACG
GCAACGACTACAAGCCTGACCCTGAAGCGGATGGTTCATCCATTATAGCAACTCCTACGC
TTGTCTACTCCTCAGACCTCGAGCTAGCGGGAGCTGAAGCAGAGTGTGCCATTTGCTTGT
CTGAATTCGAAGAAGGTGAGAGCATCCAAGTGCTGGAGAAATGTCATCATGGGTTCCATG
TTAAGTGCATCCACAAGCGGCTCTCTTCCCACTCATCCTGTCCTACTTGCCGGACTTCTA
TCTTCTTACAAAGCACCTTAGACTCTGAACCATCAACCGAAGCTCCTTCAACAAACCAGA
TCAATGCTTAGCTTCTTTCCTCACTTCATCTCCCACTTTCTCATATTTCTTTCATCCAAA
TCTTAAGAGTTATATCATGTTTTGCTTAGAGTTGTAACATGTTTTGCTTGAGATTACTAC
CGTGATGATGTTCCGCATTAG*TAAAACTATAAAACACAGACAA*TAACTACA*CGTGTA
TGAATCGA*TCATAATTAAGCTCTAAC**AATGCAAA*TAATATCTCTATAAAAAAA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2G430JQ 722 0 0
CCT
CTCATACTTCTCTTCTCTGCTCTCATATGTGCTCTCTCTCTATGCGCTGCAATCCGTTGC
TTTCTCCGGCCAACAACTCCCGAGACTGACGGCAACGACTACAAGCCTGACCCTGAAGCG
GATGGTTCATCCATTATAGCAACTCCTACGCTTGTCTACTCCTCAGACCTCGAGCTAGCG
GGAGCTGAAGCAGAGTGTGCCATTTGCTTGTCTGAATTCGAAGAAGGTGAGAGCATCCAA
GTGCTGGAGAAATGTCATCATGGGTTCCATGTTAAGTGCATCCACAAGCGGCTCTCTTCC
CACTCATCCTGTCCTACTTGCCGGACTTCTATCTTCTTACAAAGCACCTTAGACTCTGAA
CCATCAACCGAAGCTCCTTCAACAAACCAGATCAATGCTTAGCTTCTTTCCTCACTTCAT
CTCCCACTTTCTCATATTTCTTTCATCCAAATCTTAAGAGTTATATCATGTTTTGCTTAG
AGTTGTAACATGTTTTGCTTGAGATTACTACCGTGATGATGTTCCGCATTAGGTAAAACT
ATAAAACACAGACAAATAACTACAACGTGTATGAATCGAATCATAATTAAGCTCTAAACA
AATGCAAAATAATATCTCTATAAAAAAAAACAGGAGTTTATTTTCAGACGCCCTTGTGAC
TATTTAAAAATTCTTTAATCTCCTCCTATTAAAATATTAATTATTGTTTAAGTATATTT

QA 4 722 4 722
DS 



AS 1 3

CO CL3097Contig1 716 3 16 U
AACCAAATTCATAAATAAATAATCACGAAAAAATCATTCTTTTCCGTAGAAAACGTTACA
AAAATAGTTCTACATGAATTACCTATTTTGACCAAACAAAATGAAAACATTAAAGGCTAT
TCATCCAAAAATATATCGATCAGTCGTTTAATTTCAGTAAAAAAATAATATCAAGATTCG
TGTTGGGATTT*GCATTATCCTCCCTTAAGCTTCCTTCAAGCTTCTTTACGCGTAATCCT
GAAGCAGTAGATTCCAAGTGCAGCAGTGATCTCATGAATGACTGAGGTTGCAAAATGCAT
ATATAGTGCCATTGTGAATATACAATAACCAAGAAGAACCCAGAACTCATCCACAAGAGC
AACCCCGTTGTTGAGTCTAGCGGTTAGAGCATTTGCTAGTGCAAAGGGAAGGTAAAGCAG
CGACATGCACATGTTTGTTTTTAATCCTTTTGGTTCATCACAAATGTGAGCTAGAATTAT
TCTCCCCACAATGAATCCAAATGAAAGACCAGTTCCCAATACAACTAAGTGAGGGTAGTT
TCTTATGAGATCAGTTGGAGACAAGTAGTCCCAAATCAAAACTCCAGCAAGTAGCCCAAC
GAAGGGAAACAGCATAGACAATGCTAGAAACATGCTTCCTTTTCTTGCCTGTATAACTTT
GTATACATTGGACACGCTCAATGCAAATGTTGGTATAACACCAAAAGCAATCATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY41JQ U 127
AF RR2DI62JQ U 1
AF RR2DC05JQ U 10
BS 1 32 RR2DI62JQ
BS 33 33 RR2DC05JQ
BS 34 162 RR2DI62JQ
BS 163 163 RR2DC05JQ
BS 164 191 RR2DI62JQ
BS 192 192 RR2DC05JQ
BS 193 420 RR2DI62JQ
BS 421 421 RR2DC05JQ
BS 422 462 RR2DI62JQ
BS 463 463 RR2DC05JQ
BS 464 483 RR2DI62JQ
BS 484 484 RR2DC05JQ
BS 485 562 RR2DI62JQ
BS 563 563 RR2DC05JQ
BS 564 597 RR2DI62JQ
BS 598 716 RR2DC05JQ

RD RR2EY41JQ 211 0 0
AAAAATATATCGATCAGTCGTTTAATTTCAGTAAAAAAATAATATCAAGATTCGTGTTGG
GATTT*GCATTATCCTCCCTTAAGCTTCCTTCAAGCTTCTTTACGCGTAATCCTGAAGCA
GTAGATTCCAAGTGCAGCAGTGATCTCATGAATGACCGAGGTTGCAAAATGCATATATAG
TGCCATTGTGAATATACAATAACCAAGAAGA

QA 1 211 1 211
DS 

RD RR2DI62JQ 597 0 0
AACCAAATTCATAAATAAATAATCACGAAAAA*TCATTCTTTTCCGTAGAAAACGTTACA
AAAATAGTTCTACATGAATTACCTATTTTGACCAAACAAAATGAAAACATTAAAGGCTAT
TCATCCAAAAATATATCGATCAGTCGTTTAATTTCAGTAAAATAATAATATCAAGATTCG
TGTTGGGATTTTGCATTATCCTCCCTTAAGCTTCCTTCAAGCTTCTTTACGCGTAATCCT
GAAGCAGTAGATTCCAAGTGCAGCAGTGATCTCATGAATGACTGAGGTTGCAAAATGCAT
ATATAGTGCCATTGTGAATATACAATAACCAAGAAGAACCCAGAACTCATCCACAAGAGC
AACCCCGTTGTTGAGTCTAGCGGTTAGAGCATTTGCTAGTGCAAAGGGAAGGTAAAGCAG
TGACATGCACATGTTTGTTTTTAATCCTTTTGGTTCATCACATATGTGAGCTAGAATTAT
TCTTCCCACAATGAATCCAAATGAAAGACCAGTTCCCAATACAACTAAGTGAGGGTAGTT
TCTTATGAGATCAGTTGGAGACGAGTAGTCCCAAATCAAAACTCCAGCAAGTAGCCC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2DC05JQ 707 0 0
CATAAATAAATAATCACGAAAAAATCATTCTTTTCCGTAGAAAACGTTACAAAAATAGTT
CTACATGAATTACCTATTTTGACCAAACAAAATGAAAACATTAAAGGCTATTCATCCAAA
AATATATCGATCAGTCGTTTAATTTCAGTAAAAAAATAATATCAAGATTCGTGTTGGGAT
TT*GCATTATCCTCCCTTAAGCTTCCTTCAAGCTTCTTTACGCGTAATCCTGAAGCAGTA
GATTCCAAGTGCAGCAGTGATCTCATGAATGACTGAGGTTGCAAAATGCATATATAGTGC
CATTGTGAATATACAATAACCAAGAAGAACCCAGAACTCATCCACAAGAGCAACCCCGTT
GTTGAGTCTAGCGGTTAGAGCATTTGCTAGTGCAAAGGGAAGGTAAAGCAGCGACATGCA
CATGTTTGTTTTTAATCCTTTTGGTTCATCACAAATGTGAGCTAGAATTATTCTCCCCAC
AATGAATCCAAATGAAAGACCAGTTCCCAATACAACTAAGTGAGGGTAGTTTCTTATGAG
ATCAGTTGGAGACAAGTAGTCCCAAATCAAAACTCCAGCAAGTAGCCCAACGAAGGGAAA
CAGCATAGACAATGCTAGAAACATGCTTCCTTTTCTTGCCTGTATAACTTTGTATACATT
GGACACGCTCAATGCAAATGTTGGTATAACACCAAAAGCAATCATCG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 3

CO CL3098Contig1 1324 3 16 U
GGATTATCTCTCTCCAATCTCTTTCTCTTGTTCTTGTCCCGGAGCAGTCTTGTCCGAATC
CCGGAATTGTCCGAATTCGAGACTCTTCTGTGTAAGTCTTTTTAAGAAAGGAAGCGAATT
TTGATGGCGGCGAGTGCGAATCCGCCGGGGAACAATCAGGAAGGTTCGTCGGCGGCTCAG
AAGGTGACGTCTTCATCACCGGCGAATGGTGCTGTGGATAATGGTGGTAATAAGGCGGCG
GTGGATAATTCAGAAACGATAAGCGCGTTGAGGCATAATCCAGGGATCTCTGTGGATTGG
ACTCATGAGGAGCAATCTCTATTGGAAGATTTGCTCGCAAAGTACGCGTCAGAGCCTACT
ATTGTTCGTTATGCCAAGATTGCGATGAAAATGAAGGATAAAACTGTCAGAGATGTTGCT
TTGCGTTGTAGATGGATGACGAAAAAGGAAAATGGAAAGCATAGGAAAGAAGATCATTCG
TCAAGGAAGAGCAAAGATAAGAAAGAAAAGACTACAGACTCTTCAGCCAAGTCCTCATCT
CATATGAACGTGCATCCGAATGGTCCTTCATATCCTCCTCCTATGATGCCTTTAGATACT
GATGATGGCATTTCATATAAAGCTATTGGTGGCGTGAGTGGAGATCTTCTCGAACAAAAT
GCTCAGATGTTCAACCAAGCTTCCACAAATTTCTCAGCTTTCCAGATACATGAGAACGTC
AATATCTTGTGCAAAGCTAGGGACA*TATCCTCTCA*TCTTGAACGACTTGAATGACTTG
CCTGAG*TTATGAAGCAGATGCCACCTCTTCCTGTGAAGGTGAACGAAGAGCTGGCTAAT
TCAATCCTCCCTCGCCCGCCCCATCAAAAGAAGTCGTGATGGGTTACTATAGAGTCATTT
ATGGTTTGGTTTGACCAAAAAAGGTACCCTCTTCACACACCAGGAGCAGTGAAGAAAAGG
AAATAAATCGTGGGATGTAGAGAGAGTTCCCACTCGTAATGGATGATGATTGGATGCAGG
TTTTTTACTTGCTCATAGAGTTACTACTAGTCTCTTTTGCAGTTTCAGTCGTCTCTGGAT
GTTTTTTTGTTTTTTTAGCAAATGGTGAATTGATACATGTGAGTAGAGTTGTATTGTGTT
GTTTAGGATGTGAATAGATTTCTACTGTTAATGGTAAAAGTCTGTGTGTAAAATTGGTTT
CAAGCTGAAAGGTTTTGAGATTCAATGAGCTATATATCCTACAGATGATGGTGAGATGTT
AGCTTAGAAGGAAACGAATGTACTCATAAGTTTTCTTGTATTAATAAAATATTTATGTTG
TTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2D556TF U 1
AF RR2GM62TF U 34
AF RR2GM62JQ C 696
BS 1 265 RR2D556TF
BS 266 266 RR2GM62TF
BS 267 503 RR2D556TF
BS 504 504 RR2GM62TF
BS 505 589 RR2D556TF
BS 590 590 RR2GM62TF
BS 591 595 RR2D556TF
BS 596 596 RR2GM62TF
BS 597 737 RR2D556TF
BS 738 738 RR2GM62TF
BS 739 772 RR2D556TF
BS 773 773 RR2GM62TF
BS 774 781 RR2D556TF
BS 782 783 RR2GM62TF
BS 784 802 RR2D556TF
BS 803 1324 RR2GM62JQ

RD RR2D556TF 802 0 0
GGATTATCTCTCTCCAATCTCTTTCTCTTGTTCTTGTCCCGGAGCAGTCTTGTCCGAATC
CCGGAATTGTCCGAATTCGAGACTCTTCTGTGTAAGTCTTTTTAAGAAAGGAAGCGAATT
TTGATGGCGGCGAGTGCGAATCCGCCGGGGAACAATCAGGAAGGTTCGTCGGCGGCTCAG
AAGGTGACGTCTTCATCACCGGCGAATGGTGCTGTGGATAATGGTGGTAATAAGGCGGCG
GTGGATAATTCAGAAACGATAAGCGTGTTGAGGCATAATCCAGGGATCTCTGTGGATTGG
ACTCATGAGGAGCAATCTCTATTGGAAGATTTGCTCGCAAAGTACGCGTCAGAGCCTACT
ATTGTTCGTTATGCCAAGATTGCGATGAAAATGAAGGATAAAACTGTCAGAGATGTTGCT
TTGCGTTGTAGATGGATGACGAAAAAGGAAAATGGAAAGCATAGGAAAGAAGATCATTCG
TCAAGGAAGAGCAAAGATAAGAAGGAAAAGACTACAGACTCTTCAGCCAAGTCCTCATCT
CATATGAACGTGCATCCGAATGGTCCTTCATATCCTCCTCCTATGATGC*TTTAGGTACT
GATGATGGCATTTCATATAAAGCTATTGGTGGCGTGAGTGGAGATCTTCTCGAACAAAAT
GCTCAGATGTTCAACCAAGCTTCCACAAATTTCTCAGCTTTCCAGATACATGAGAACGTC
AATATCTTGTGCAAAGCGAGGGACA*TATCCTCTCA*TCTTGAACGACTTGA*TGACTTG
CA*GAG*TTATGAAGCAGATGC

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2GM62TF 771 0 0
GG
GTCCCGGAGCAGTCTTGTCTGAATCCCGGAATTGTCCGAATTCGAGACTCTTCTGTGTAA
GTCTTTTTGAGAAAGGAAGCGAATTTTGATGGCGGCGAGTGCGAATCCGCCGGGGAACAA
TCAGGAAGGTTCGTCGGCGGCTCAGAAGGTGACGTCTTCATCACCGGCGAATGGTGCTGT
GGATAATGGTGGTAATAAGGCGGCGGTGGATAATTCAGAAACGATAAGCGCGTTGAGGCA
TAATCCAGGGATCTCTGTGGATTGGACTCATGAGGAGCAATCTCTATTGGAGGATTTGCT
CGCAAAGTACGCGTCAGAGCCTACTATTGTTCGTTATGCCAAGATTGCGATGAAAATGAA
GGATAAAACTGTCAGAGATGTTGCTTTGCGTTGTAGATGGATGACGAAAAAGGAAAATGG
AAAGCGTAGGAAAGAAGATCATTCGTCAAGGAAGAGCAAAGATAAGAAAGAAAAGACTAC
AGACTCTTCAGCCAAGTCCTCATCTCATATGAATGTGCATCCGAATGGTCCTTCATATCC
TCCTCCTATGATGCCTTTAGATACTGATGATGGCATTTCATATAAAGCTATTGGTGGCGT
GAGTGGAGATCTTCTCGAACAAAATGCTCAGATGTTCAACCAAGTTTCCACAAATTTCTC
AGCTTTCCAGATACATGAGAACGTCAATATCTTGTGCAAAGCTAGGGACA*TATCCTCTC
A*TCTTGAACGACTTGAATGACTTGCCTGAG*TTATGAAGCAGATGC
AC

QA 3 769 3 769
DS 

RD RR2GM62JQ 629 0 0
AGCTTTCCAGATACATGAGAACGTCAATATCTTGTGCAAAGCTAGGGACAATATCCTCTC
AATCTTGAACGACTTGAATGACTTGCCTGAGGTTATGAAGCAGATGCCACCTCTTCCTGT
GAAGGTGAACGAAGAGCTGGCTAATTCAATCCTCCCTCGCCCGCCCCATCAAAAGAAGTC
GTGATGGGTTACTATAGAGTCATTTATGGTTTGGTTTGACCAAAAAAGGTACCCTCTTCA
CACACCAGGAGCAGTGAAGAAAAGGAAATAAATCGTGGGATGTAGAGAGAGTTCCCACTC
GTAATGGATGATGATTGGATGCAGGTTTTTTACTTGCTCATAGAGTTACTACTAGTCTCT
TTTGCAGTTTCAGTCGTCTCTGGATGTTTTTTTGTTTTTTTAGCAAATGGTGAATTGATA
CATGTGAGTAGAGTTGTATTGTGTTGTTTAGGATGTGAATAGATTTCTACTGTTAATGGT
AAAAGTCTGTGTGTAAAATTGGTTTCAAGCTGAAAGGTTTTGAGATTCAATGAGCTATAT
ATCCTACAGATGATGGTGAGATGTTAGCTTAGAAGGAAACGAATGTACTCATAAGTTTTC
TTGTATTAATAAAATATTTATGTTGTTCG

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 3

CO CL3099Contig1 761 3 3 U
GGAGAAATCTGGAGAATCCTCCCTTCCTTCTTCCCCCAAAAAGAGAGAGTTTTGCGAATC
AGGCGAAAGTAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATAAAGAAAGGGAGAAGAGAATAAGATCGG
AACGGAAGGATGGCGAATCTGTATGTGAAAGCGGCACCACCGCCGGACATGAACAGGAAC
ACGGAGTGGTTCATGTATCCAGGGGTGTGGACGACTTATATACTAATCCTCTTCTTCGGG
TGGCTCGTTGTTCTCTCCCTCTCTGGCTGTTCTCCTGGAATGGCTTGGACTGTTGTTAAT
CTCGCTCACTTCGTTGTAACGTATCACTCCTTTCACTGGATGAAAGGAACTCCTTTTGCA
GACGACCAAGGAGTCTACAATGGTCTCACCTGGTGGGAACAGATGGACAATGGTCAGCAA
CTTACCCGCAACCGCAAGTTCCTTACCGTTGTTCCTGTCGTCCTGTACTTGATAGCATCA
CATACAACAGATTACAGACATCCATGGCTATTCCTCAACACACTCGCTGTGATGGTTCTA
GTTGTGGCCAAGTTCCCTAACATGCACAAGGTACGCATCTTCGGGATCAACGGTGATAAG
TAAGGCTTCTTTACCAAACTCTCAGATCCCATTTCTTTTTATGGCAACAGAAAAGTGGAT
ATGAAGCAAAACATATTTGTATAAAATGTTGATATGAGTTGGTTTTGAGTTGTCGGATAT
TTTGTAAGTAACTTTGAAGCTTTGAATTTCTTCTCTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2EK07TF U 1
AF RR2EK07JQ C 34
AF RR2E082TF U 177
BS 1 630 RR2EK07TF
BS 631 760 RR2E082TF
BS 761 761 RR2EK07JQ

RD RR2EK07TF 630 0 0
GGAGAAATCTGGAGAATCCTCCCTTCCTTCTTCCCCCAAAAAGAGAGAGTTTTGCGAATC
AGGCGAAAGTAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATAAAGAAAGGGAGAAGAGAATAAGATCGG
AACGGAAGGATGGCGAATCTGTATGTGAAAGCGGCACCACCGCCGGACATGAACAGGAAC
ACGGAGTGGTTCATGTATCCAGGGGTGTGGACGACTTATATACTAATCCTCTTCTTCGGG
TGGCTCGTTGTTCTCTCCCTCTCTGGCTGTTCTCCTGGAATGGCTTGGACTGTTGTTAAT
CTCGCTCACTTCGTTGTAACGTATCACTCCTTTCACTGGATGAAAGGAACTCCTTTTGCA
GACGACCAAGGAGTCTACAATGGTCTCACCTGGTGGGAACAGATGGACAATGGTCAGCAA
CTTACCCGCAACCGCAAGTTCCTTACCGTTGTTCCTGTCGTCCTGTACTTGATAGCATCA
CATACAACAGATTACAGACATCCATGGCTATTCCTCAACACACTCGCTGTGATGGTTCTA
GTTGTGGCCAAGTTCCCTAACATGCACAAGGTACGCATCTTCGGGATCAACGGTGATAAG
TAAGGCTTCTTTACCAAACTCTCAGATCCC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2EK07JQ 728 0 0
CCCCAAAAAGAGAGAGTTTTGCGAATCAGGCGAAAGTAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATA
AAGAAAGGGAGAAGAGAATAAGATCGGAACGGAAGGATGGCGAATCTGTATGTGAAAGCG
GCACCACCGCCGGACATGAACAGGAACACGGAGTGGTTCATGTATCCAGGGGTGTGGACG
ACTTATATACTAATCCTCTTCTTCGGGTGGCTCGTTGTTCTCTCCCTCTCTGGCTGTTCT
CCTGGAATGGCTTGGACTGTTGTTAATCTCGCTCACTTCGTTGTAACGTATCACTCCTTT
CACTGGATGAAAGGAACTCCTTTTGCAGACGACCAAGGAGTCTACAATGGTCTCACCTGG
TGGGAACAGATGGACAATGGTCAGCAACTTACCCGCAACCGCAAGTTCCTTACCGTTGTT
CCTGTCGTCCTGTACTTGATAGCATCACATACAACAGATTACAGACATCCATGGCTATTC
CTCAACACACTCGCTGTGATGGTTCTAGTTGTGGCCAAGTTCCCTAACATGCACAAGGTA
CGCATCTTCGGGATCAACGGTGATAAGTAAGGCTTCTTTACCAAACTCTCAGATCCCATT
TCTTTTTATGGCAACAGAAAAGTGGATATGAAGCAAAACATATTTGTATAAAATGTTGAT
ATGAGTTGGTTTTGAGTTGTCGGATATTTTGTAAGTAACTTTGAAGCTTTGAATTTCTTC
TCTCTTTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2E082TF 584 0 0
GAACACGGAGTGGTTCATGTATCCAGGGGTGTGGACGACTTATATACTAATCCTCTTCTT
CGGGTGGCTCGTTGTTCTCTCCCTCTCTGGCTGTTCTCCTGGAATGGCTTGGACTGTTGT
TAATCTCGCTCACTTCGTTGTAACGTATCACTCCTTTCACTGGATGAAAGGAACTCCTTT
TGCAGACGACCAAGGAGTCTACAATGGTCTCACCTGGTGGGAACAGATGGACAATGGTCA
GCAACTTACCCGCAACCGCAAGTTCCTTACCGTTGTTCCTGTCGTCCTGTACTTGATAGC
ATCACATACAACAGATTACAGACATCCATGGCTATTCCTCAACACACTCGCTGTGATGGT
TCTAGTTGTGGCCAAGTTCCCTAACATGCACAAGGTACGCATCTTCGGGATCAACGGTGA
TAAGTAAGGCTTCTTTACCAAACTCTCAGATCCCATTTCTTTTTATGGCAACAGAAAAGT
GGATATGAAGCAAAACATATTTGTATAAAATGTTGATATGAGTTGGTTTTGAGTTGTCGG
ATATTTTGTAAGTAACTTTGAAGCTTTGAATTTCTTCTCTCTTT

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL3100Contig1 792 2 9 U
TACGGGCTCTGCTATTGCAGGCTCTCTAGGTGGATTCAACGCTCACGCCAGCAACATAGT
CTCTGCTGTTTTCTTAGCAACTGGTCAAGATCCAGCTCAAAACGTTGAGAGCTCTCAGTG
TATCACAATGATGGAAGCCATTAATGACGGGAAAGATATCCATATCTCGGTCACTATGCC
ATCTATTGAGGTGGGGACTGTGGGAGGAGGAACACAGCCTGCCTCACAATCAGCGTGTTT
GAACTTACTCGGAGTTAAAGGAGCGAGCAAGGAGTCGCCGGGGATGAACTCAAGGAGGCT
AGCGACGATAGTGGCAGGAGCAGTTTTGGCAGGAGAGTTATCACTTATGTCAGCAATAGC
AGCTGGACAACTTGTGAGGAGTCACATGAAATACAATAGATCCAGCAGAGACATCTCTGG
AGCGACGACAACAACATGATCTGAATCATCATCATCTCTGTCTGGCCCAAAACTCGAAGG
AGGACAAAAATGTAAAAGAAGGCAGGCTTTTTACAACTCATATTCACTCATAACTCTGTG
GTGGACAACACACTTAGCCATGTGCGTGCCTTTGCCTTCTTTTGTTCAATAAAAACTTAA
AATTGTTTTTGTTTGTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTGACTTGTAAACCCTCTTTTTTTTT
AATGTGGGGATTAAGAGTGAGAGAGGGAGAGATTTGTGATTGTCATTGTCCCCTTCTTTC
CTCTTTCTCTCTCACTCATGGATAATTCATGTTCTCTTTGATTTGTCTAAGCTTTGTCTT
GTGTTTGTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES43TF U 139
AF RR2AM22JQ C 1
BS 1 139 RR2AM22JQ
BS 140 231 RR2ES43TF
BS 232 232 RR2AM22JQ
BS 233 295 RR2ES43TF
BS 296 296 RR2AM22JQ
BS 297 519 RR2ES43TF
BS 520 520 RR2AM22JQ
BS 521 764 RR2ES43TF
BS 765 792 RR2AM22JQ

RD RR2ES43TF 626 0 0
G
ATTAATGACGGGAAAGATATCCATATCTCGGTCACTATGCCATCTATTGAGGTGGGGACT
GTGGGAGGAGGAACACAGCCTGCCTCACAATCGGCGTGTTTGAACTTACTCGGAGTTAAA
GGAGCGAGCAAGGAGTCGCCGGGGATGAACTCAAGGGGGCTAGCGACGATAGTGGCAGGA
GCAGTTTTGGCAGGAGAGTTATCACTTATGTCAGCAATAGCAGCTGGACAACTTGTGAGG
AGTCACATGAAATACAATAGATCCAGCAGAGACATCTCTGGAGCGACGACAACAACATGA
TCTGAATCATCATCATCTCTGTCTGGCCCAAAACTCGAAGGAGGACAAAAATGTAAAAGA
AGGCAGGCTTTTTACAACTCGTATTCACTCATAACTCTGTGGTGGACAACACACTTAGCC
ATGTGCGTGCCTTTGCCTTCTTTTGTTCAATAAAAACTTAAAATTGTTTTTGTTTGTTTT
TGTTTTGTTTTTTGTTTGACTTGTAAACCCTCTTTTTTTTTAATGTGGGGATTAAGAGTG
AGAGAGGGAGAGATTTGTGATTGTCATTGTCCCCTTCTTTCCTCTTTCTCTCTCACTCAT
GGATAATTCATGTTCTCTTTGATTT

QA 2 626 2 626
DS 

RD RR2AM22JQ 792 0 0
TACGGGCTCTGCTATTGCAGGCTCTCTAGGTGGATTCAACGCTCACGCCAGCAACATAGT
CTCTGCTGTTTTCTTAGCAACTGGTCAAGATCCAGCTCAAAACGTTGAGAGCTCTCAGTG
TATCACAATGATGGAAGCCATTAATGACGGGAAAGATATCCATATCTCGGTCACTATGCC
ATCTATTGAGGTGGGGACTGTGGGAGGAGGAACACAGCTTGCCTCACAATCAGCGTGTTT
GAACTTACTCGGAGTTAAAGGAGCGAGCAAGGAGTCGCCGGGGATGAACTCAAGGAGGCT
AGCGACGATAGTGGCAGGAGCAGTTTTGGCAGGAGAGTTATCACTTATGTCAGCAATAGC
AGCTGGACAACTTGTGAGGAGTCACATGAAATACAATAGATCCAGCAGAGACATCTCTGG
AGCGACGACAACAACATGATCTGAATCATCATCATCTCTGTCTGGCCCAAAACTCGAAGG
AGGACAAAAATGTAAAAGAAGGCAGGCTTTTTACAACTCATATTCACTCATAACTCTGTG
GTGGACAACACACTTAGCCATGTGCGTGCCTTTGCCTTCTTTTGTTCAATAAAAACTTAA
AATTGTTTTTGTTTGTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTGACTTGTAAACTCTCTTTTTTTTT
AATGTGGGGATTAAGAGTGAGAGAGGGAGAGATTTGTGATTGTCATTGTCTCCTTCTTTC
CTCTTTCTCTCTCACTCATGGGTAATTCATGTTCTCTTTGATTTGTCTAAGCTTTGTCTT
GTGTTTGTTAGC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 3

CO CL3101Contig1 966 3 5 U
GGATACATCGACGCCAAAACTCTCTTCTCTCTACCGGAAAACGATTTTAACTCACCGGAG
ATCTTATCAGAATGAGTAACGCGCTTCTGGACATCGATCCTATCGATCTTCAATTCCCTT
TTGAATTGAAGAAACAGATCTCTTGCTCTCTCTATTTAGCTAACAAAACCGACGATTACG
TCGCCTTCAAGGTAAAAACGACGAATCCGAAGAAGTATTGTGTGAGGCCTAACACTGGCG
TTGTGCTTCCCAGATCCTCTTCTGAAGTTCTAGTGACGATGCAAGCGCAGAAGGAAGCTC
CTGGTGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTCTTGCTTCAGTGTGTTGTCTCTACTCCTGGAG
TCACTCCCAAGGATGTCACTCCTGAGATGTTTAGTAAAGAGGCAGGGCATCGAGTCGAGG
AGACTAAGTTGAGAGTTGTCTACGTTGATCCACCTCGGCCACCCTCGCCTGTGCGTGAAG
AAGGGTCTGAAGAGGGATCTTCTCCGAGAGCTTCAGTTTCTGACAATGGGGCTTCTGATT
TTACTGCTGCTCCGAGATTTAGCGTAGACAGGGTTGAACCTCAGGAAAACTCGTCTGAGG
CGAGAGCTCTCATCACAAAGCTCACGGAGGAAAAGAACTCTGCGATTCAACTGAACAACA
GACTTCAACAAGAATTGGAGAAGTTGAAGCGTGAAAGCAAGAGAAGTCAGAGTGGTGGTG
GAATCCCGTTCATGTACGTTCTTTTGGTGGGACTAATCGGCTTAATCTTGGGATACATTA
TGAAGAGGACATGATCTCGTTTGAAAACACACAATCCACAAGTCTCAAAAGTGGCTTCAC
GAAAAACCCAAATGACATGAAAAAGGAAAAAGAAAAGTAATATTTTGTCAGGACACTGAT
TGAATCTTCTCTTTTGTCTTATCGGTTTGTCCATTCACCCTTGGTTAAATCTTAAACTTA
GTGTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK37TF U 1
AF RR2E125TF U 1
AF RR2BK37JQ C 212
BS 1 583 RR2BK37TF
BS 584 584 RR2E125TF
BS 585 614 RR2BK37TF
BS 615 755 RR2E125TF
BS 756 966 RR2BK37JQ

RD RR2BK37TF 614 0 0
GGATACATCGACGCCAAAACTCTCTTCTCTCTACCGGAAAACGATTTTAACTCACCGGAG
ATCTTATCAGAATGAGTAACGCGCTTCTGGACATCGATCCTATCGATCTTCAATTCCCTT
TTGAATTGAAGAAACAGATCTCTTGCTCTCTCTATTTAGCTAACAAAACCGACGATTACG
TCGCCTTCAAGGTAAAAACGACGAATCCGAAGAAGTATTGTGTGAGGCCTAACACTGGCG
TTGTGCTTCCCAGATCCTCTTCTGAAGTTCTAGTGACGATGCAAGCGCAGAAGGAAGCTC
CTGGTGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTCTTGCTTCAGTGTGTTGTCTCTACTCCTGGAG
TCACTCCCAAGGATGTCACTCCTGAGATGTTTAGTAAAGAGGCAGGGCATCGAGTCGAGG
AGACTAAGTTGAGAGTTGTCTACGTTGATCCACCTCGGCCACCCTCGCCTGTGCGTGAAG
AAGGGTCTGAAGAGGGATCTTCTCCGAGAGCTTCAGTTTCTGACAATGGGGCTTCTGATT
TTACTGCTGCTCCGAGATTTAGCGTAGACAGGGTTGAACCTCACGAAAACTCGTCTGAGG
CGAGAGCTCTCATC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2E125TF 755 0 0
GGATACATCGACGCCAAAACTCTCTTCTCTCTACCGGAAAACGATTTTAACTCACCGGAG
ATCTTATCAGAATGAGTAACGCGCTTCTGGACATCGATCCTATCGATCTTCAATTCCCTT
TTGAATTGAAGAAACAGATCTCTTGCTCTCTCTATTTAGCTAACAAAACCGACGATTACG
TCGCCTTCAAGGTAAAA*CGACGAATCCGAAGAAGTATTGTGTGAGGCCTAACACTGGCG
TTGTGCTTCCCAGATCCTCTTCTGAAGTTCTAGTGACGATGCAAGCGCAGAAGGAAGCTC
CTGGTGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTCTTGCTTCAGTGCGTTGTCTCTACTCCTGGAG
TCACTCCCAAGGATGTCACTCCTGAGATGTTTAGTAAAGAGGCAGGGCATCGAGTCGAGG
AGACTAAGTTGAGAGTTGTCTACGTTGATCCACCTCGGCCACCCTCGCCTGTGCGTGAAG
AAGGGTCTGAAGAGGGATCTTCTCCGAGAGCTTCAGTTTCTGACAATGGGGCTTCTGATT
TTACTGCTGCTCCGAGATTTAGCGTGGACAGGGTTGAACCTCAGGAAAACTCGTCTGAGG
CGAGAGCTCTCATCACAAAGCTCACGGAGGAAAAGAACTCTGCGATTCAACTGAACAACA
GACTTCAACAAGAATTGGAGAAGTTGAAGCGTGAAAGCAAGAGAAGTCAGAGTGGTGGTG
GAATCCCGTTCATGTACGTTCTTTTGGTGGGACTA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2BK37JQ 755 0 0
GAAGTATTGTGTGAGGCCTAACACTGGCGTTGTGCTTCCCAGATCCTCTTCTGAAGTTCT
AGTGACGATGCAAGCGCAGAAGGAAGCTCCTGGTGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTCTT
GCTTCAGTGTGTTGTCTCTACTCCTGGAGTCACTCCCAAGGATGTCACTCCTGAGATGTT
TAGTAAAGAGGCAGGGCATCGAGTCGAGGAGACTAAGTTGAGAGTTGTCTACGTTGATCC
ACCTCGGCCACCCTCGCCTGTGCGTGAAGAAGGGTCTGAAGAGGGATCTTCTCCGAGAGC
TTCAGTTTCTGACAATGGGGCTTCTGATTTTACTGCTGCTCCGAGATTTAGCGTAGACAG
GGTTGAACCTCAGGAAAACTCGTCTGAGGCGAGAGCTCTCATCACAAGGCTCACGGAGGA
AAAGAACTCTGCGATTCAACTGAACAACAGACTTCAACAAGAATTGGAGAAGTTGAAGCG
TGAAAGCAAGAGAAGTCAGAGTGGTGGTGGAATCCCGTTCATGTACGTTCTTTTGGTGGG
ACTAATCGGCTTAATCTTGGGATACATTATGAAGAGGACATGATCTCGTTTGAAAACACA
CAATCCACAAGTCTCAAAAGTGGCTTCACGAAAAACCCAAATGACATGAAAAAGGAAAAA
GAAAAGTAATATTTTGTCAGGACACTGATTGAATCTTCTCTTTTGTCTTATCGGTTTGTC
CATTCACCCTTGGTTAAATCTTAAACTTAGTGTGT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 3

CO CL3102Contig1 601 3 5 U
GGAACGACAAAAGAAAAGAAATCTTAGCATCTTTTTATAAAAAGATGAAAGATCTCTCCA
TCTTTCTATTCCTTTTTAGCCTATGCATAATTGGTTATGTACATGGCCATGGAGTGAGGA
TTTCGAACGAACTCAAATTCCAGAAAGATCTTAATATGAGTTGTTTCTCCGCAGACGACA
GGATAAAAGAGAGAACAGTAAAACCAGGAACTCATTGGGAATTCAATTTTGGTTTGAATG
TTGTGGGGAACACCCGTTATATGTGCACTTTGAAACAAGGGCCTGGATTTAAACACCATC
AGAGCTTCAGAGCATTTAAAAGACGTGGTTTATGGGATTGGAGAGCCAGAGAAGATGGCA
TCTATTTGACGAGAAAAAATACAGAAGCCCCACATAAAGAGTATGATTGGATATACTAGT
TAGTCATCCGAGGATAGACGTTTTCTTCGATCTTCATGCAAGTGGTCTAAAAAATTTAAA
ATGTCATACGCTAATATTAACATATCTACGTTCATTTATTTTATCTATATATGATAAAAT
ATATAACTGTCTATCAAAAATTCGCAATATTTGTAATTATTTTTATTGCATTTTACATAA
A


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2G193TF U 32
AF RR2AZ54TFB U 1
AF RR2AZ54JQ C 1
BS 1 31 RR2AZ54TFB
BS 32 397 RR2G193TF
BS 398 398 RR2AZ54TFB
BS 399 595 RR2G193TF
BS 596 601 RR2AZ54JQ

RD RR2G193TF 564 0 0
TTTTTATAAAAAGATGAAAGATCTCTCCATCTTTCTATTCCTTTTTAGCCTATGCATAAT
TGGTTATGTACATGGCCATGGAGTGAGGATTTCGAACGAACTCAAATTCCAGAAAGATCT
TAATATGAGTTGTTTCTCCGCAGACGACAGGATAAAAGAGAGAACAGTAAAACCAGGAAC
TCATTGGGAATTCAATTTTGGTTTGAATGTTGTGGGGAACACCCGTTATATGTGCACTTT
GAAACAAGGGCCTGGATTTAAACACCATCAGAGCTTCAGAGCATTTAAAAGACGTGGTTT
ATGGGATTGGAGAGCCAGAGAAGATGGCATCTATTTGACGAGAAAAAATACAGAAGCCCC
ACATAAGGAGTATGATTGGATATACTAGTTAGTCATCCGAGGATAGACGTTTTCTTCGAT
CTTCATGCAAGTGGTCTAAAAAATTTAAAATGTCATACGCTAATATTAACATATCTACGT
TCATTTATTTTATCTATATATGATAAAATATATAACTGTCTATCAAAAATTCGCAATATT
TGTAATTATTTTTATTGCATTTTA

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2AZ54TFB 601 0 0
GGAACGACAAAAGAAAAGAAATCTTAGCATCTTTTTATAAAAAGATGAAAGATCTCTCCA
TCTTTCTATTCCTTTTTAGCCTATGCATAATTGGTTATGTACATGGCCATGGAGTGAGGA
TTTCGAACGAACTCAAATTCCAGAAAGATCTTAATATGAGTTGTTTCTCCGCAGACGACA
GGATAAAAGAGAGAACAGTAAAACCAGGAACTCATTGGGAATTCAATTTTGGTTTGAATG
TTGTGGGGAACACCCGTTATATGTGCACTTTGAAACAAGGGCCTGGATTTAAACACCATC
AGAGCTTCAGAGCATTTAAAAGACGTGGTTTATGGGATTGGAGAGCCAGAGAAGATGGCA
TCTATTTGACGAGAAAAAATACAGAAGCCCCACATAAAGAGTATGATTGGATATACTAGT
TAGTCATCCGAGGATAGACGTTTTCTTCGATCTTCATGCAAGTGGTCTAAAAAATTTAAA
ATGTCATACGCTAATATTAACATATCTACGTTCATTTATTTTATCTATATATGATAAAAT
ATATAACTGTCTATCAAAAATTCGCAATATTTGTAATTATTTTTATTGCATTTTA
CATAAA

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2AZ54JQ 601 0 0
GGAACGACAAAAGAAAAGAAATCTTAGCATCTTTTTATAAAAAGATGAAAGATCTCTCCA
TCTTTCTATTCCTTTTTAGCCTATGCATAATTGGTTATGTACATGGCCATGGAGTGAGGA
TTTCGAACGAACTCAAATTCCAGAAAGATCTTAATATGAGTTGTTTCTCCGCAGACGACA
GGATAAAAGAGAGAACAGTAAAACCAGGAACTCATTGGGAATTCAATTTTGGTTTGAATG
TTGTGGGGAACACCCGTTATATGTGCACTTTGAAACAAGGGCCTGGATTTAAACACCATC
AGAGCTTCAGAGCATTTAAAAGACGTGGTTTATGGGATTGGAGAGCCAGAGAAGATGGCA
TCTATTTGACGAGAAAAAATACAGAAGCCCCACATAAAGAGTATGATTGGATATACTAGT
TAGTCATCCGAGGATAGACGTTTTCTTCGATCTTCATGCAAGTGGTCTAAAAAATTTAAA
ATGTCATACGCTAATATTAACATATCTACGTTCATTTATTTTATCTATATATGATAAAAT
ATATAACTGTCTATCAAAAATTCGCAATATTTGTAATTATTTTTATTGCATTTTACATAA
A

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL3103Contig1 811 2 7 U
CCACCATCTCACCATCGTTCGTGTTTTCTCGATCCAAGCAAGGAGAGAAACAAGATTTGA
GCTTTATTTGAAGAAGAAGAGTCTGGTTCTTCTGAAGAAGTGTCTGAGTCACTCAAGCCA
AAATATCTATGGTAATATTGAGATTCCTTATTAGACATGGTTTGATATGGATATTGGCTG
GTTTAGATTCATAGGTCTGGAACATAAAGAGTTAGATGAGATAGATAAGAGTGCGTTTAG
ATAAGCAAGCTAGGGTCGGATATGCTGAATGCACACAACCTGTTCGATGGAATGCCAAAG
AGAATAGCTAATTGTTAAACTGCAATGTTTCGGTAGTATATTGATGGGAAGCAGAGAGTA
GGTAGAGGCTTACAGTTGTGGGAAGCAAATTCTCTGAGCAAAAAGATAGCGTAGTTGAGT
TAAAGAGGGCAAAAGACCCCAACTCATTGTGAGACAAATAGGTCAAAAGAACCTGAAAAT
GTTCTCACACTAATGACTAATCTCTAAGCCTTAGAGTAATCTCAGCCTACTGCACATGGA
TTCTTCTGCTACTCATGTTTCTGTCACAGTTATCTTCATTTGCGGTTCAAACTCAGCCTC
TTTGTTACACCCGACGCTAAGTTTGTGGGGGAGTATTGAAGCCCAAAGTAAAGCCCATGT
TTATTATCCATTTGAAGCTTTTGTAGCCCACGTAACTAGGGTTTTAGATTCTTATATATA
TGCTGTAATGTGTTTTGAGGAATCGAACCTTGGCTGCTACAAGCAGCTTCTCTATCTTAT
TTTGAATGAAATACAATCGTGTCTTGTAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2H118JQ C 1
AF RR2BF26TF U 224
BS 1 223 RR2H118JQ
BS 224 509 RR2BF26TF
BS 510 510 RR2H118JQ
BS 511 690 RR2BF26TF
BS 691 691 RR2H118JQ
BS 692 810 RR2BF26TF
BS 811 811 RR2H118JQ

RD RR2H118JQ 811 0 0
CCACCATCTCACCATCGTTCGTGTTTTCTCGATCCAAGCAAGGAGAGAAACAAGATTTGA
GCTTTATTTGAAGAAGAAGAGTCTGGTTCTTCTGAAGAAGTGTCTGAGTCACTCAAGCCA
AAATATCTATGGTAATATTGAGATTCCTTATTAGACATGGTTTGATATGGATATTGGCTG
GTTTAGATTCATAGGTCTGGAACATAAAGAGTTAGATGAGATAGATAAGAGTGCGTTTAG
ATAAGCAAGCTAGGGTCGGATATGCTGAATGCACACAACCTGTTCGATGGAATGCCAAAG
AGAATAGCTAATTGTTAGACTGCAATGTTTCGGTAGTATATTGATGGGAAGCAGAGAGTA
GGTAGAGGCTTACAGTTGTGGGAAGCAAATTCTCTGAGCAAAAAGATAGCGTAGTTGAGT
TAAAGAGGGCAAAAGACCCCAACTCATTGTGAGACAAATAGGTCAAAAGAACCTGAAAAT
GTTCTCACACTAATGACTAATCTCTAAGCCTTAGAGTAATCTCAGCCTACTGCACATGGA
TTCTTCTGCTACTCATGTTTCTGTCACAGTTATCTTCATTTGCGGTTCAAACTCAGCCTC
TTTGTTACACCCGACGCTAAGTTTGTGGGGGAGTATTGAAGCCCAAAGTAAAGCCCATGT
TTATTATCCATTTGAAGCTTTTGTAGCCCACGTAACTAGGGTTTTAGATTCTTATATATA
TGCTGTAATGTGTTTTGAGGAATCGAACCTTGGCTGCTACAAGCAGCTTCTCTATCTTAT
TTTGAATGAAATACAATCGTGTCTTGTAGCG

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2BF26TF 587 0 0
GATAAGAGTGCGTTTAGATAAGCAAGCTAGGGTCGGATATGCTGAATGCACACAACCTGT
TCGATGGAATGCCAAAGAGAATAGCTAATTGTTAAACTGCAATGTTTCGGTAGTATATTG
ATGGGAAGCAGAGAGTAGGTAGAGGCTTACAGTTGTGGGAAGCAAATTCTCTGAGCAAAA
AGATAGCGTAGTTGAGTTAAAGAGGGCAAAAGACCCCAACTCATTGTGAGACAAATAGGT
CAAAAGAACCTGAAAATGTTCTCACACTAATGACTAATCTCTAAGCTTTAGAGTAATCTC
AGCCTACTGCACATGGATTCTTCTGCTACTCATGTTTCTGTCACAGTTATCTTCATTTGC
GGTTCAAACTCAGCCTCTTTGTTACACCCGACGCTAAGTTTGTGGGGGAGTATTGAAGCC
CAAAGTAAAGCCCATGTTTATTATCCATTTGAAGCTTTTGTAGCCCATGTAACTAGGGTT
TTAGATTCTTATATATATGCTGTAATGTGTTTTGAGGAATCGAACCTTGGCTGCTACAAG
CAGCTTCTCTATCTTATTTTGAATGAAATACAATCGTGTCTTGTAGC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 3

CO CL3104Contig1 751 3 3 U
GGATCGACGGAGTTATTTCTGAGATCGCATCGGACGCTAATCTCGAACCGGAAAGATTCT
ACAATCTCGCGGTTTCGCTACCAGATGAAGCGAGGGTATACGATGACGGACTCTACAGAG
CCATCGATATATATCTCAAGTCGCATCCAAGGATATTGGAGACAGAAAGAGAAAAGATAT
GTAGTGTGATGGACTTTCAAAAGCTGACTATAGAAGGTTGCACACACGCAGCTCACAACG
AGCGTTTGCCACTGCGAGCCGTGGTAAAAGTCTTGTTCTTGGAGCAACTTCAGCTACGGA
TGTTAGTAAAGTCAGTGACGGAAGAAGACGGTGGTGGTGAGACGACGGCGGGAGGAGAAA
AGGTGGAGTTTGGGGTATGGGAGAAAGTGGTGAGGGAGAATCAGATACTTCGCTTGGATA
TGGATGCGATGAGGACGCGTTTGTACCATTTAGAAAGCGAGTATTTGAACTTGAAGGAAA
TGATCGCAAAGATTGATGAGGAACGTTTGTATGTGGCGAATGCTAGGCCGCCGCGAAAGT
GGTCCATCAGCAAGAAGTTCGGATGCAAATTCAAGACACAGGTCTGTGATTCGCACGAGG
CAAAGATGGTCGATCGAAGATGTCAACGACGTTCATAGTAGTAATATCTCGTACTTATTG
AATTGTATTTTTTT*GTTTCTGATTATGTAAAAGGTTGAAAACTTTATGTTATGATATTT
AACGAATATCAAATTTTCTTATTGTACTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E148TF U 1
AF RR2E148JQ C 89
AF RR2DN43TF U 264
BS 1 689 RR2E148TF
BS 690 728 RR2DN43TF
BS 729 751 RR2E148JQ

RD RR2E148TF 689 0 0
GGATCGACGGAGTTATTTCTGAGATCGCATCGGACGCTAATCTCGAACCGGAAAGATTCT
ACAATCTCGCGGTTTCGCTACCAGATGAAGCGAGGGTATACGATGACGGACTCTACAGAG
CCATCGATATATATCTCAAGTCGCATCCAAGGATATTGGAGACAGAAAGAGAAAAGATAT
GTAGTGTGATGGACTTTCAAAAGCTGACTATAGAAGGTTGCACACACGCAGCTCACAACG
AGCGTTTGCCACTGCGAGCCGTGGTAAAAGTCTTGTTCTTGGAGCAACTTCAGCTACGGA
TGTTAGTAAAGTCAGTGACGGAAGAAGACGGTGGTGGTGAGACGACGGCGGGAGGAGAAA
AGGTGGAGTTTGGGGTATGGGAGAAAGTGGTGAGGGAGAATCAGATACTTCGCTTGGATA
TGGATGCGATGAGGACGCGTTTGTACCATTTAGAAAGCGAGTATTTGAACTTGAAGGAAA
TGATCGCAAAGATTGATGAGGAACGTTTGTATGTGGCGAATGCTAGGCCGCCGCGAAAGT
GGTCCATCAGCAAGAAGTTCGGATGCAAATTCAAGACACAGGTCTGTGATTCGCACGAGG
CAAAGATGGTCGATCGAAGATGTCAACGACGTTCATAGTAGTAATATCTCGTACTTATTG
AATTGTATTTTTTT*GTTTCTGATTATGT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2E148JQ 663 0 0
AGCGAGGGTATACGATGACGGACTCTACAGAGCCATCGATATATATCTCAAGTCGCATCC
AAGGATATTGGAGACAGAAAGAGAAAAGATATGTAGTGTGATGGACTTTCAAAAGCTGAC
TATAGAAGGTTGCACACACGCAGCTCACAACGAGCGTTTGCCACTGCGAGCCGTGGTAAA
AGTCTTGTTCTTGGAGCAACTTCAGCTACGGATGTTAGTAAAGTCAGTGACGGAAGAAGA
CGGTGGTGGTGAGACGACGGCGGGAGGAGAAAAGGTGGAGTTTGGGGTATGGGAGAAAGT
GGTGAGGGAGAATCAGATACTTCGCTTGGATATGGATGCGATGAGGACGCGTTTGTACCA
TTTAGAAAGCGAGTATTTGAACTTGAAGGAAATGATCGCAAAGATTGATGAGGAACGTTT
GTATGTGGCGAATGCTAGGCCGCCGCGAAAGTGGTCCATCAGCAAGAAGTTCGGATGCAA
ATTCAAGACACAGGTCTGTGATTCGCACGAGGCAAAGATGGTCGATCGAAGATGTCAACG
ACGTTCATAGTAGTAATATCTCGTACTTATTGAATTGTATTTTTTT*GTTTCTGATTATG
TAAAAGGTTGAAAACTTTATGTTATGATATTTAACGAATATCAAATTTTCTTATTGTACT
ACC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2DN43TF 465 0 0
GTAAAAGTCTTGTTCTTGGAGCAACTTCAGCTACGGATGTTAGTAAAGTCAGTGACGGAA
GAAGACGGTGGTGGTGGGACGACGGCGGGAGGAGAAAAGGTGGAGTTTGGGGTATGGGAG
AAAGTGGTGAGGGAGAATCAGGTGCTTCGCTTGGATATGGAGGCGATGAGGACGCGTTTG
TACCATTTAGAAAGCGAATATTTGAACTTGAAGGAAGTGATCGCAAAGATTGATAAGGAA
CGTTTGTATGTGGCGAATGCTAGGCCGCCGCGAAAGTGGTCCATCAGCAAGAAGTTTGGA
TGCAAATTCAAGACACAGGTCTGTGATTCGCACGAGGCAAAGATGGTCGATCGAAGATGT
CAACGACGTTCATAGTAGTAATATCTTGTACTTATTGAATTGTATTTTTTTTGTTTCTGA
TTATGTAAAAGGTTGAAAACTTTATGTTATGATATTTAACGAATA

QA 1 465 1 465
DS 



AS 1 3

CO CL3105Contig1 601 3 13 U
GGGACAGCCGTGAGAAACCATGTGGTCGGCGACGCTCGCTTTCCCTTCCTTATTGGCTTC
ATCAACTTCTCTATCGAGTTACAAAAAGCCAAGACTTCCGAAGATTCAAGCTTCGCTATC
TAATTACCCTCTCGCCAGCAAAATCATGGTCAGAAACTTACCGTTTTCCACAAGTGAAGA
CTTTCTGCAAAAGGAGTTTTCAGCTTTCGGCGAGATAGCTGAAGTAAAGCTTGTCAAAGA
TGAGTCAATGAAGAGATCAAAAGGTCATGCCTTCATTCAATACATGTCTCAGGACGATGC
TTTTCTAGCCATTGAGACCATGGACCGTCGGATGTACAATGGGAGGATGATTTATATAGA
CATTGCGAAACCAGGGAAGCGTGATTTCCAACAGCAGCCGAGGACTTCTGGTCCCCCTGA
GAAGCTCCACGTGCCAGAAGAACCGGCCAGTAACGAGGTTGCTGATTGCTGGTATTAAAC
ATTTAGTACCAAGTTAACGAAACTGCGTCTGTATTTGCGTAGAAACATTAAGAGACAATG
ATCAATATAAACAAAATGTTGTTTTTACTACTGATAAACAATCACTGACACGGTTCCATT
T


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2G309TF U 10
AF RR2DW46JQ C 1
AF RR2DW46TF U 1
BS 1 11 RR2DW46TF
BS 12 34 RR2G309TF
BS 35 35 RR2DW46TF
BS 36 265 RR2G309TF
BS 266 266 RR2DW46TF
BS 267 440 RR2G309TF
BS 441 441 RR2DW46TF
BS 442 505 RR2G309TF
BS 506 506 RR2DW46TF
BS 507 550 RR2G309TF
BS 551 551 RR2DW46TF
BS 552 564 RR2G309TF
BS 565 601 RR2DW46TF

RD RR2G309TF 555 0 0
GG
GAGAAACCATGTGGTCGGCGACGTTCGCTTTCCCTTCCTTATTGGCTTCATCAACTTCTC
TATCGAGTTACAAAAAGCCAAGACTTCCGAAGATTCAAGCTTCGCTATCTAATTACCCTC
TCGCCAGCAAAATCATGGTCAGAAACTTACCGTTTTCCACAAGTGAAGACTTTCTGCAAA
AGGAGTTTTCAGCTTTCGGCGAGATAGCTGAAGTAAAGCTTGTCAAAGATGAGTCAATGA
AGAGATCAAAAGGTTATGCCTTCATTCAATACATGTCTCAGGACGATGCTTTTCTAGCCA
TTGAGACCATGGACCGTCGGATGTACAATGGGAGGATGATTTATATAGACATTGCGAAAC
CAGGGAAGCGTGATTTCCAACAGCAGCCGAGGACTTCTGGTCCCCCTGAGAAGCTCCACG
TGCCAGAAGGACCGGCCAGTAACGAGGTTGCTGATTGCTGGTATTAAACATTTAGTACCA
AGTTAACGAAACTGTGTCTGTATTTGCGTAGAAACATTAAGAGACAATGATCAATATAA*
CAAAATGTTGTTT

QA 3 555 3 555
DS 

RD RR2DW46JQ 601 0 0
GGGACAGCCGTGAGAAACCATGTGGTCGGCGACGCTCGCTTTCCCTTCCTTATTGGCTTC
ATCAACTTCTCTATCGAGTTACAAAAAGCCAAGACTTCCGAAGATTCAAGCTTCGCTATC
TAATTACCCTCTCGCCAGCAAAATCATGGTCAGAAACTTACCGTTTTCCACAAGTGAAGA
CTTTCTGCAAAAGGAGTTTTCAGCTTTCGGCGAGATAGCTGAAGTAAAGCTTGTCAAAGA
TGAGTCAATGAAGAGATCAAAAGGTCATGCCTTCATTCAATACATGTCTCAGGACGATGC
TTTTCTAGCCATTGAGACCATGGACCGTCGGATGTACAATGGGAGGATGATTTATATAGA
CATTGCGAAACCAGGGAAGCGTGATTTCCAACAGCAGCCGAGGACTTCTGGTCCCCCTGA
GAAGCTCCACGTGCCAGAAGAACCGGCCAGTAACGAGGTTGCTGATTGCTGGTATTAAAC
ATTTAGTACCAAGTTAACGAAACTGCGTCTGTATTTGCGTAGAAACATTAAGAGACAATG
ATCAATATAAACAAAATGTTGTTTTTACTACTGATAAACAATCACTGACACGGTTCCATT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2DW46TF 601 0 0
GGGACAGCCGTGAGAAACCATGTGGTCGGCGACGCTCGCTTTCCCTTCCTTATTGGCTTC
ATCAACTTCTCTATCGAGTTACAAAAAGCCAAGACTTCCGAAGATTCAAGCTTCGCTATC
TAATTACCCTCTCGCCAGCAAAATCATGGTCAGAAACTTACCGTTTTCCACAAGTGAAGA
CTTTCTGCAAAAGGAGTTTTCAGCTTTCGGCGAGATAGCTGAAGTAAAGCTTGTCAAAGA
TGAGTCAATGAAGAGATCAAAAGGTCATGCCTTCATTCAATACATGTCTCAGGACGATGC
TTTTCTAGCCATTGAGACCATGGACCGTCGGATGTACAATGGGAGGATGATTTATATAGA
CATTGCGAAACCAGGGAAGCGTGATTTCCAACAGCAGCCGAGGACTTCTGGTCCCCCTGA
GAAGCTCCACGTGCCAGAAGAACCGGCCAGTAACGAGGTTGCTGATTGCTGGTATTAAAC
ATTTAGTACCAAGTTAACGAAACTGCGTCTGTATTTGCGTAGAAACATTAAGAGACAATG
ATCAATATAAACAAAATGTTGTTTTTACTACTGATAAACAATCACTGACACGGTTCCATT
T

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL3106Contig1 968 2 2 U
GGACACTCGAATTAAAAAAAAAGACATGGCAACAACAGAGGTAAAACCCTCCGCCGCTAA
AAACCCTAAAAAGTCTCGGAACCCATCACTGGGTCCAAAGAAAGATCTGAAGAAGAAGAA
GAACAAGGCTAAGAAGTCAAAAGCTCCCGCCTTTGACAACACGGTCGAAAGAAACGACCA
GAGCGACGGCGAGGAACAACAACCTGTATCGGCTTCTGAACAGCTAAGCTTCTTCTTAAA
GCAGCTTGATTCAGCCATTGGTGTCCGTGTCTCTCCTTTAGAGCTCGATCCCATTAAAGA
CAAGTGTGTAGTTGAGTTATCTCAAAAGTTGGATCAGAATGTAAGCAACTTGGGAGAGCA
TATTAAGATGTCTTGTGGATCTTCCTGGAGAGAGACTCTTTGCGAAGAGGAGGCAATCGA
AGGGAAAGTCGATCCCGGAAACCCAGCTGTTCTCGTTGTTAGCTCCTCTGCTCTGAGATC
TTTGGAACTTATAAGGGGTTTGCATTCACTTACTAAGCAGTGTCCAGCTTTGAAGTTGTT
CTCAAAGCATGTGAAAGTTGAGGAACAGGTATCTCTGTTGAAAAAACGGGTTAATATTGG
GAGCGGCACACCGAGCAGAATAAAAAAGCTGATCGACATAGAGGCATTAGGGCTTTCACG
TTTAGATATGATTGTGCTTGACATGCACACAGATGTCAAGGGATTTTCCTTATTCACTTT
GCCCCAAGTCAGAGATGAGTTTTGGGATTTGTATAAGACCTGCTTCCACCAGAGAGTGCT
AGAAGGAAGTCTACGTATCTGTCTGTATGGTCCAAAGCCAGCAGCTCCAAAGCCTAAGAA
CAGTAAGAAACAGAGACAAAACCAGCATTGAGCAATGGCAGATTCTACTCAAGTTTTGAT
ATATTTAGCTCTAGTTTTGCTATGTTTGATTCGTCTGTCTTTTTACCATATAAAGTGAAT
CTTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B616TF U 1
AF RR2B616JQ C 226
BS 1 781 RR2B616TF
BS 782 968 RR2B616JQ

RD RR2B616TF 781 0 0
GGACACTCGAATTAAAAAAAAAGACATGGCAACAACAGAGGTAAAACCCTCCGCCGCTAA
AAACCCTAAAAAGTCTCGGAACCCATCACTGGGTCCAAAGAAAGATCTGAAGAAGAAGAA
GAACAAGGCTAAGAAGTCAAAAGCTCCCGCCTTTGACAACACGGTCGAAAGAAACGACCA
GAGCGACGGCGAGGAACAACAACCTGTATCGGCTTCTGAACAGCTAAGCTTCTTCTTAAA
GCAGCTTGATTCAGCCATTGGTGTCCGTGTCTCTCCTTTAGAGCTCGATCCCATTAAAGA
CAAGTGTGTAGTTGAGTTATCTCAAAAGTTGGATCAGAATGTAAGCAACTTGGGAGAGCA
TATTAAGATGTCTTGTGGATCTTCCTGGAGAGAGACTCTTTGCGAAGAGGAGGCAATCGA
AGGGAAAGTCGATCCCGGAAACCCAGCTGTTCTCGTTGTTAGCTCCTCTGCTCTGAGATC
TTTGGAACTTATAAGGGGTTTGCATTCACTTACTAAGCAGTGTCCAGCTTTGAAGTTGTT
CTCAAAGCATGTGAAAGTTGAGGAACAGGTATCTCTGTTGAAAAAACGGGTTAATATTGG
GAGCGGCACACCGAGCAGAATAAAAAAGCTGATCGACATAGAGGCATTAGGGCTTTCACG
TTTAGATATGATTGTGCTTGACATGCACACAGATGTCAAGGGATTTTCCTTATTCACTTT
GCCCCAAGTCAGAGATGAGTTTTGGGATTTGTATAAGACCTGCTTCCACCAGAGAGTGCT
A

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2B616JQ 743 0 0
AAGCTTCTTCTTAAAGCAGCTTGATTCAGCCATTGGTGTCCGTGTCTCTCCTTTAGAGCT
CGATCCCATTAAAGACAAGTGTGTAGTTGAGTTATCTCAAAAGTTGGATCAGAATGTAAG
CAACTTGGGAGAGCATATTAAGATGTCTTGTGGATCTTCCTGGAGAGAGACTCTTTGCGA
AGAGGAGGCAATCGAAGGGAAAGTCGATCCCGGAAACCCAGCTGTTCTCGTTGTTAGCTC
CTCTGCTCTGAGATCTTTGGAACTTATAAGGGGTTTGCATTCACTTACTAAGCAGTGTCC
AGCTTTGAAGTTGTTCTCAAAGCATGTGAAAGTTGAGGAACAGGTATTTCTGTTGAAAAA
ACGGGTTAATATTGGGAGCGGCACACCGAGCAGAATAAAAAAGCTGATCGACATAGAGGC
ATTAGGGCTTTCACGTTTAGATATGATTGTGCTTGACATGCACACAGATGTCAAGGGATT
TTCCTTATTCACTTTGCCCCAAGTCAGAGATGAGTTTTGGGATTTGTATAAGACCTGCTT
CCCCCAGAGAGTGCTAGAAGGAAGTCTACGTATCTGTCTGTATGGTCCAAAGCCAGCAGC
TCCAAAGCCTAAGAACAGTAAGAAACAGAGACAAAACCAGCATTGAGCAATGGCAGATTC
TACTCAAGTTTTGATATATTTAGCTCTAGTTTTGCTATGTTTGATTCGTCTGTCTTTTTA
CCATATAAAGTGAATCTTTTGTT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL3107Contig1 1300 2 6 U
GGGAGAGCAATCAGGTGAAAATGTCACTCGATCTTTCTCGTCTCTCACTCCTTTACTCGC
CTCGTCTCTCCTTCTCCACTCACACAGCTGCTTCTAGGAAAGGAGACGTTGTTAGGTGCG
CGATGAAGTCGTATAGATTATCTGAGCTTAGCTTCTCTCAAGTTGAAAACTTGAAGTCAC
GCCCTCGCATTGACTTCTCCTCCATTTTCACCACTGTTAACCCAATCATCGACGCGGTTC
GTAGCAAAGGAGATGTTGCTGTCAAAGAATATACTGAAAGATTTGACAAAGTCCAGCTCA
GTAAAGTGGTGGAGGACGTGTCTGAGCTTCCTATTCCTGAGCTTGACCCCACAGTCAAAG
AAGCGTTTGATGTTGCGTATGACAACATTTATGCATTTCATTTGGCTCAAAAGTCAACTG
AGAAGAGCGTTGAGAATATGAAAGGTGTCAGATGTAAAAGGGTGTCGAGATCTATTGGGT
CTGTAGGTCTTTATGTCCCTGGTGGAACAGCTGTTTTGCCATCTACTGCTTTGATGCTTG
CTATTCCTGCTCAGATTGCTGGATGTAAAACAGTTGTCCTCGCGACTCCACCAACCAAGG
AAGGAAGCATATGCAAGGAGGTGCTGTATTGTGCCAAGAGGGCTGGTGTAACTCACATAC
TTAAAGCTGGTGGAGCTCAGCTATAGCCGCGTGTGTTAGCCTTTTCATATGTTTTTTTTT
AATTGTAAGATTTTGAAGATTTTCCATTTTGCCTTTGCAGGCTATAGCTGCCATGGCCTG
GGGGACTGATTCATGTCCTAAGGTTGAGAAGATTTTCGGTCCTGGGAACCAGTATGTTAC
AGCTGCTAAGATGATTCTTCAAAACAGCGAGACAATGGTTTCGATTGATATGCCTGCTGG
CCCTTCAGAAGTTCTAGTCATCGCTGATGAACATGCTAATCCAGTTTACATTGCAGCAGA
CTTGCTTTCTCAGGCTGAGCATGGTCCAGATAGTCAAGTTGTTCTTGTTGTTGTAGGCGA
CGGTGTAAACCTCAAAGCCATCGAAGAAGAAATCGCCAAACAGTGCAAAAGCCTTCCTAG
AGGAGAGTTTGCTTCAAAGGCACTTAGTCACAGTTTCACTGTATTTGCTCGAGATATGAT
TGACGCAATAACTTTCTCAAATCTGTATGCACCCGAACACTTGATCATCAACGTCAAAGA
CGCTGAGAAATGGGAAGGACTGATCGAGACGCAGTTCCGTTTTCGTAGCCCGTGGACGTC
AGAGAGTGTTGGCGATACGTAGCGCACAACACGTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 0 0 0 0 15 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP64TF U 1
AF RR2EY45TF U 492
BS 1 613 RR2EP64TF
BS 614 614 RR2EY45TF
BS 615 687 RR2EP64TF
BS 688 688 RR2EY45TF
BS 689 690 RR2EP64TF
BS 691 1300 RR2EY45TF

RD RR2EP64TF 700 0 0
GGGAGAGCAATCAGGTGAAAATGTCACTCGATCTTTCTCGTCTCTCACTCCTTTACTCGC
CTCGTCTCTCCTTCTCCACTCACACAGCTGCTTCTAGGAAAGGAGACGTTGTTAGGTGCG
CGATGAAGTCGTATAGATTATCTGAGCTTAGCTTCTCTCAAGTTGAAAACTTGAAGTCAC
GCCCTCGCATTGACTTCTCCTCCATTTTCACCACTGTTAACCCAATCATCGACGCGGTTC
GTAGCAAAGGAGATGTTGCTGTCAAAGAATATACTGAAAGATTTGACAAAGTCCAGCTCA
GTAAAGTGGTGGAGGACGTGTCTGAGCTTCCTATTCCTGAGCTTGACCCCACAGTCAAAG
AAGCGTTTGATGTTGCGTATGACAACATTTATGCATTTCATTTGGCTCAAAAGTCAACTG
AGAAGAGCGTTGAGAATATGAAAGGTGTCAGATGTAAAAGGGTGTCGAGATCTATTGGGT
CTGTAGGTCTTTATGTCCCTGGTGGAACAGCTGTTTTGCCATCTACTGCTTTGATGCTTG
CTATTCCTGCTCAGATTGCTGGATGTAAAACAGTTGTCCTCGCGACTCCACCAACCAAGG
AAGGAAGCATATGTAAGGAGGTGCTGTATTGTGCCAAGAGGGCTGGTGTAACTCACATAC
TTAAAGCTGGTGGAGCTCAGCTATAGCTGC
ATGGCTGGGG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2EY45TF 809 0 0
AG
TGTCCCTGGTGGAACAGCTGTTTTGCCATCTACTGCTTTGATGCTTGCTATTCCTGCTCA
GATTGCTGGATGTAAAACAGTTGTCCTCGCGACTCCACCAACCAAGGAAGGAAGCATATG
CAAGGAGGTGCTGTATTGTGCCAAGAGGGCTGGTGTAACTCACATACTTAAAGCTGGTGG
AGCTCAGGTGTGTTCGTGTGTGTTAGCCTTTTCATATGTTTTTTTTTAATTGTAAGATTT
TGAAGATTTTCCATTTTGCCTTTGCAGGCTATAGCTGCCATGGCCTGGGGGACTGATTCA
TGTCCTAAGGTTGAGAAGATTTTCGGTCCTGGGAACCAGTATGTTACAGCTGCTAAGATG
ATTCTTCAAAACAGCGAGACAATGGTTTCGATTGATATGCCTGCTGGCCCTTCAGAAGTT
CTAGTCATCGCTGATGAACATGCTAATCCAGTTTACATTGCAGCAGACTTGCTTTCTCAG
GCTGAGCATGGTCCAGATAGTCAAGTTGTTCTTGTTGTTGTAGGCGACGGTGTAAACCTC
AAAGCCATCGAAGAAGAAATCGCCAAACAGTGCAAAAGCCTTCCTAGAGGAGAGTTTGCT
TCAAAGGCACTTAGTCACAGTTTCACTGTATTTGCTCGAGATATGATTGACGCAATAACT
TTCTCAAATCTGTATGCACCCGAACACTTGATCATCAACGTCAAAGACGCTGAGAAATGG
GAAGGACTGATCGAGACGCAGTTCCGTTTTCGTAGCCCGTGGACGTCAGAGAGTGTTGGC
GATACGTAGCGCACAACACGTTCTCCC

QA 3 809 3 809
DS 



AS 1 3

CO CL3108Contig1 769 3 2 U
CTAGTTTAAATCTTTTATCAAAAAAAAAAAATTCAGGCAAACATATAGTGAACAAACATA
CACTATAACTACCAAGTACTATTGATCAAGACTCAAACAAACTCTTGAGAAATCACTCTT
ATGGTTTATAATGCCATGAAATAAAAACAAAAAGTTAAGTTCAATGGTCTAAATTAAAAA
CCTTATTACCAGACTGGTCCAAAAAAGAAGCATGACTCACTGACTTATCCTTAGGCCCTA
ACAGACAATATTTCTTTTGTTCTCCACAAGGCGTTTCCAATACTTAGCGATATCCTCCAA
CGACATCTTAGCAGTCTTCTCTTCACCACCACTAACCTTTGCAGCTGCTGCTATATGTGC
AATCCGGCTAGGAAGCCCTTCAATCTCTTTCAGTACCTGTAAGATGTGTGTGATGAGTCT
GTCTGCAAGGCCTCGGCTAAAGTCTTCCCTGATAACAACTCTAAGCACAGCAATGTGTTG
TGCGTCAGCAGGCATAGTGTAAGCTGGTATGATCCACCCAAACTTCCTCAGAGACTCTGC
AATCTCAAACACTGTGTGTTTGCTACTGTCCTTGAGAGAGAATGCAACTAGTGGCACACC
AATATCTTTAGACACAATATTGAACTTCCCTGTCATCTCTATTCCTTCTCTTAGCCTCCT
TGCATTGTCCATGCAGTTTTCCATTATGTTCTTGTATCCCTCAAATCCTAGGCGGATAAA
CTGATAGTACTGACCAATGATCTGGCTCGACCCTTTAGAGAAATTAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX23JQ U 107
AF RR2EJ43JQ U 1
AF RR2GW74JQ U 60
BS 1 751 RR2EJ43JQ
BS 752 769 RR2GW74JQ

RD RR2FX23JQ 359 0 0
GG
GAAATCACTCTTATGGTTTATAATGCCATGAAATAAAAACAAAAAGTTAAGTTCAATGGT
CTAAATTAAAAACCTTATTACCAGACTGGTCCAAAAAAGAAGCATGACTCACTGACTTAT
CCTTAGGCCCTAACAGACAATATTTCTTTTGTTCTCCACAAGGGGTTTCCAATACTTAGC
GATATCCTCCAACGACATCTTAACAGTCTTCTCTTCACCACCACTAACCTTTGCAGCTGC
TGCTATATGTGCAAGCCGGCTAGGAAGCCCTTCAATCTCTTTCAGTACCTGTAAAATGTG
TGTGATGAGTCTGTCTGCAAGGCCTCGGCTAAAGTCTTCCCTGATAACAACTCTAAG

QA 3 359 3 359
DS 

RD RR2EJ43JQ 751 0 0
CTAGTTTAAATCTTTTATCAAAAAAAAAAAATTCAGGCAAACATATAGTGAACAAACATA
CACTATAACTACCAAGTACTATTGATCAAGACTCAAACAAACTCTTGAGAAATCACTCTT
ATGGTTTATAATGCCATGAAATAAAAACAAAAAGTTAAGTTCAATGGTCTAAATTAAAAA
CCTTATTACCAGACTGGTCCAAAAAAGAAGCATGACTCACTGACTTATCCTTAGGCCCTA
ACAGACAATATTTCTTTTGTTCTCCACAAGGCGTTTCCAATACTTAGCGATATCCTCCAA
CGACATCTTAGCAGTCTTCTCTTCACCACCACTAACCTTTGCAGCTGCTGCTATATGTGC
AATCCGGCTAGGAAGCCCTTCAATCTCTTTCAGTACCTGTAAGATGTGTGTGATGAGTCT
GTCTGCAAGGCCTCGGCTAAAGTCTTCCCTGATAACAACTCTAAGCACAGCAATGTGTTG
TGCGTCAGCAGGCATAGTGTAAGCTGGTATGATCCACCCAAACTTCCTCAGAGACTCTGC
AATCTCAAACACTGTGTGTTTGCTACTGTCCTTGAGAGAGAATGCAACTAGTGGCACACC
AATATCTTTAGACACAATATTGAACTTCCCTGTCATCTCTATTCCTTCTCTTAGCCTCCT
TGCATTGTCCATGCAGTTTTCCATTATGTTCTTGTATCCCTCAAATCCTAGGCGGATAAA
CTGATAGTACTGACCAATGATCTGGCTCGAC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2GW74JQ 710 0 0
G
CACTATAACTACCAAGTACTATTGATCAAGACTCAAACAAACTCTTGAGAAATCACTCTT
ATGGTTTATAATGCCATGAAATAAAAACAAAAAGTTAAGTTCAATGGTCTAAATTAAAAA
CCTTATTACCAGACTGGTCCAAAAAAGAAGCATGACTCACTGACTTATCCTTAGGCCCTA
ACAGACAATATTTCTTTTGTTTTCCACAAGGCGTTTCCAATACTTAGCGATATCCTCCAA
CGACATCTTAGCAGTCTTCTCTTCACCACCACTAACCTTTGCAGCTGCTGCTATATGTGC
AATCCGGCTAGGAAGCCCTTCAATCTCTTTCAGTACCTGTAAGATGTGTGTGATGAGTCT
GTCTGCAAGGCCTCGGCTAAAGTCTTCCCTGATAACAACTCTAAGCACAGCAATGTGTTG
TGCGTCAGCAGGCATAGTGTAAGCTGGTATGATCCACCCAAACTTCCTCAGAGACTCTGC
AATCTCAAACACTGTGTGTTTGCTACTGTCCTTGAGAGAGAATGCAACTAGTGGCACACC
AATATCTTTAGACACAATATTGAACTTCCCTGTCATCTCTATTCCTTCTCTTAGCCTCCT
TGCATTGTCCATGCAGTTTTCCATTATGTTCTTGTATCCCTCAAATCCTAGGCGGATAAA
CTGATAGTACTGACCAATGATCTGGCTCGACCCTTTAGAGAAATTAAGA

QA 2 710 2 710
DS 



AS 1 3

CO CL3109Contig1 494 3 7 U
GGCTCTCGCTTATTTGTTGTCGTTGCCTGCTATCTTCCGCCGTCTCTTGAGATTCTTGCG
AAGATGGTTCTTCAAAACGATATCGATCTGCTCAACCCACCAGCTGAGCTCGAGAAGAGG
AAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTTCAATCCCCCAGCTCATTTTTCATGGATGTGAAATGC
CAAGGCTGCTTCAACATCACTACTGTGTTCAGTCACTCGCAGACCGTTGTTGTATGCGGA
AACTGCCAGACAGTTCTGTGCCAGCCGACAGGAGGAAAAGCTAGGCTCACGGAAGGATGC
TCTTTCAGGAAGAAGTGAGATTGATTTGAAGCTTGAATCAATCAAGACCAGTTTCTTTTT
TTTGTTTTTGTCTTTTTTTTT**GAAGTTGTGGATCTTTGCATACCTGTTCTGAAAAGCA
ACTCGTTGGAGTTTAGAGGAATGAACCTTTGTTGATTTTCGATTTTAAGTTTGGTTATTA
CCATTTTAAAGTTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA83TF U 1
AF RR2GL50JQ C 1
AF RR2GL50TF U 1
BS 1 154 RR2AA83TF
BS 155 155 RR2GL50TF
BS 156 381 RR2AA83TF
BS 382 383 RR2GL50TF
BS 384 430 RR2AA83TF
BS 431 431 RR2GL50TF
BS 432 494 RR2AA83TF

RD RR2AA83TF 494 0 0
GGCTCTCGCTTATTTGTTGTCGTTGCCTGCTATCTTCCGCCGTCTCTTGAGATTCTTGCG
AAGATGGTTCTTCAAAACGATATCGATCTGCTCAACCCACCAGCTGAGCTCGAGAAGAGG
AAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTTCAATCCCCCAACTCATTTTTCATGGATGTGAAATGC
CAAGGCTGCTTCAACATCACTACTGTGTTCAGTCACTCGCAGACCGTTGTTGTATGCGGA
AACTGCCAGACAGTTCTGTGCCAGCCGACAGGAGGAAAAGCTAGGCTCACGGAAGGATGC
TCTTTCAGGAAGAAGTGAGATTGATTTGAAGCTTGAATCAATCAAGACCAGTTTCTTTTT
TTTGTTTTTGTCTTTTTTTTTTTGAAGTTGTGGATCTTTGCATACCTGTTCTGAAAAGCA
ACTCGTTGGATTTTAGAGGAATGAACCTTTGTTGATTTTCGATTTTAAGTTTGGTTATTA
CCATTTTAAAGTTT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2GL50JQ 482 0 0
GGCTCTCGCTTATTTGTTGTCGTTGCCTGCTATCTTCCGCCGTCTCTTGAGATTCTTGCG
AAGATGGTTCTTCAAAACGATATCGATCTGCTCAACCCACCAGCTGAGCTCGAGAAGAGG
AAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTTCAATCCCCCAGCTCATTTTTCATGGATGTGAAATGC
CAAGGCTGCTTCAACATCACTACTGTGTTCAGTCACTCGCAGACCGTTGTTGTATGCGGA
AACTGCCAGACAGTTCTGTGCCAGCCGACAGGAGGAAAAGCTAGGCTCACGGAAGGATGC
TCTTTCAGGAAGAAGTGAGATTGATTTGAAGCTTGAATCAATCAAGACCAGTTTCTTTTT
TTTGTTTTTGTCTTTTTTTTT**GAAGTTGTGGATCTTTGCATACCTGTTCTGAAAAGCA
ACTCGTTGGAGTTTAGAGGAATGAACCTTTGTTGATTTTCGATTTTAAGTTTGGTTATTA
CC

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR2GL50TF 482 0 0
GGCTCTCGCTTATTTGTTGTCGTTGCCTGCTATCTTCCGCCGTCTCTTGAGATTCTTGCG
AAGATGGTTCTTCAAAACGATATCGATCTGCTCAACCCACCAGCTGAGCTCGAGAAGAGG
AAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTTCAATCCCCCAGCTCATTTTTCATGGATGTGAAATGC
CAAGGCTGCTTCAACATCACTACTGTGTTCAGTCACTCGCAGACCGTTGTTGTATGCGGA
AACTGCCAGACAGTTCTGTGCCAGCCGACAGGAGGAAAAGCTAGGCTCACGGAAGGATGC
TCTTTCAGGAAGAAGTGAGATTGATTTGAAGCTTGAATCAATCAAGACCAGTTTCTTTTT
TTTGTTTTTGTCTTTTTTTTT**GAAGTTGTGGATCTTTGCATACCTGTTCTGAAAAGCA
ACTCGTTGGAGTTTAGAGGAATGAACCTTTGTTGATTTTCGATTTTAAGTTTGGTTATTA
CC

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL3110Contig1 975 2 2 U
GGAGTCTTGTCTGAATTCTACTGCTCTCAACCACAAAACCAAAAAAAATGATACTAATCC
CAACTTCTTCTTCTTCTTACGCTTGTTGTAGCCTTCCTCAAACTTCCTTCAATTCTAGTT
CATATCCATCGAATCAGTCTCTGTTCCTCTCCAAATCCGGTTATCCAATTCCACTTGGAA
GCATAAAGTTGAAGACTTTACGTCTCAGAGCTAATTTCTGGGAGTCAATCCGATCTGGGT
TTGTAAAGAATAATAACACGACCCAACTTGTGGAACCACCTTCTACAGTAGAAGAAGATG
AAGATACGGAACCAGTACTCCCTGTTGAATTCACTTTGGTTGAGAGAACTCTTCAAGATG
GTTTAGTTGAAGAGATCATATTTTCTTCTGGTGGTGAAATTGATGTCTATGATCTTCAAA
CCCTTTGTGACAAGGTGGGATGGCCTCGGAGACCGCTAACGAAACTAGCTGCAGCTTTGA
AAAATAGTTATATGGTTGCTACATTGCATTCTGTCTTGAAGTCATCATCATCAGAAGGCG
ATAATGAGGAGCAGCAGCAGCAGAATAAGAAGCTTATTGGAATGGCACGTGCGACGTCGG
ATCATGCCTTTAATGCTACAATTTGGGATGTTCTTGTTGATCCTGAGTATCAGGGTCAGG
GGCTTGGTAAAGCTCTCGTGGAAAAGCTTGTAAGGGCTCTTCTTCAGAGAGATATTGGTA
ATATATCTCTTTTTGCAGATAGTCAAGTTGTGGATTTCTATCAGAATTTGGGGTTTGAGG
CTGATCCAGAAGGCATCAAAGGCATGTTTTGGTACCCAAAGTAACAGTTTTTGGGTTTGC
AAAAGAATGGGGGACTTTACTATTTGGCTGTATGCTTTCTTATATGGATCAATAAGGAAG
TTCACTAACTGTGCATTTTGTAAGTTTAAAATCGATATTTTTCTTATTTAAGATTCAATC
AAGGAGTGTATAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ68TF U 1
AF RR2AJ68JQ C 150
BS 1 649 RR2AJ68TF
BS 650 975 RR2AJ68JQ

RD RR2AJ68TF 649 0 0
GGAGTCTTGTCTGAATTCTACTGCTCTCAACCACAAAACCAAAAAAAATGATACTAATCC
CAACTTCTTCTTCTTCTTACGCTTGTTGTAGCCTTCCTCAAACTTCCTTCAATTCTAGTT
CATATCCATCGAATCAGTCTCTGTTCCTCTCCAAATCCGGTTATCCAATTCCACTTGGAA
GCATAAAGTTGAAGACTTTACGTCTCAGAGCTAATTTCTGGGAGTCAATCCGATCTGGGT
TTGTAAAGAATAATAACACGACCCAACTTGTGGAACCACCTTCTACAGTAGAAGAAGATG
AAGATACGGAACCAGTACTCCCTGTTGAATTCACTTTGGTTGAGAGAACTCTTCAAGATG
GTTTAGTTGAAGAGATCATATTTTCTTCTGGTGGTGAAATTGATGTCTATGATCTTCAAA
CCCTTTGTGACAAGGTGGGATGGCCTCGGAGACCGCTAACGAAACTAGCTGCAGCTTTGA
AAAATAGTTATATGGTTGCTACATTGCATTCTGTCTTGAAGTCATCATCATCAGAAGGCG
ATAATGAGGAGCAGCAGCAGCAGAATAAGAAGCTTATTGGAATGGCACGTGCGACGTCGG
ATCATGCCTTTAATGCTACAATTTGGGATGTTCTTGTTGATCCTGAGTA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2AJ68JQ 826 0 0
TCCAAATCCGGTTATCCAATTCCACTTGGAAGCATAAAGTTGAAGACTTTACGTCTCAGA
GCTAATTTCTGGGAGTCAATCCGATCTGGGTTTGTAAAGAATAATAACACGACCCAACTT
GTGGAACCACCTTCTACAGTAGAAGAAGATGAAGATACGGAACCAGTACTCCCTGTTGAA
TTCACTTTGGTTGAGAGAACTCTTCAAGATGGTTTAGTTGAAGAGATCATATTTTCTTCT
GGTGGTGAAATTGATGTCTATGATCTTCAAACCCTTTGTGACAAGGTGGGATGGCCTCGG
AGACCGCTAACGAAACTAGCTGCAGCTTTGAAAAATAGTTATATGGTTGCTACATTGCAT
TCTGTCTTGAAGTCATCATCATCAGAAGGCGATAATGAGGAGCAGCAGCAGCAGAATAAG
AAGCTTATTGGAATGGCACGTGCGACGTCGGATCATGCCTTTAATGCTACAATTTGGGAT
GTTCTTGTTGATCCTGAGTATCAGGGTCAGGGGCTTGGTAAAGCTCTCGTGGAAAAGCTT
GTAAGGGCTCTTCTTCAGAGAGATATTGGTAATATATCTCTTTTTGCAGATAGTCAAGTT
GTGGATTTCTATCAGAATTTGGGGTTTGAGGCTGATCCAGAAGGCATCAAAGGCATGTTT
TGGTACCCAAAGTAACAGTTTTTGGGTTTGCAAAAGAATGGGGGACTTTACTATTTGGCT
GTATGCTTTCTTATATGGATCAATAAGGAAGTTCACTAACTGTGCATTTTGTAAGTTTAA
AATCGATATTTTTCTTATTTAAGATTCAATCAAGGAGTGTATAATC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL3111Contig1 1284 2 2 U
GCAGGGAAGACATTACTTGCGAAAACTTTGGCACGGTTTGTGAATGTTCCTTTTGTCATT
GCGGATGCAACTACACTGACTCAGGCTGGTTATGTGGGAGAGGACGTCGAGTCTATATTG
TACAAACTTCTCACAGTTCAGATTATAACGTTGCAGCGGCACAGCAGGGGATTGTTTACA
TTGACGAAGTTGACAAGATAACAAAAAAGGCAGAGAGCCTTAACATCAGCAGAGATGTAT
CAGGAGAGGGTGTTCAACAAGCATTGCTAAAAATGCTGGAAGGAACAATCGTTAATGTAC
CTGAGAAGGGCGCTAGGAAGCACCCTAGAGGTGACAATATCCAGATAGACACAAAAGATA
TACTTTTCATATGTGGTGGTGCTTTTGTAGACATCGAAAAGACCATCTCTGAGAGGCGCC
ATGATTCTTCAATAGGGTTTGGGGCTCCTGTACGTGCTAACATGAGGGTGGGTGGTGTTA
CAAGTGCCGCTGTTGCATCAAACCTGATGGAAACTGTGGAAAGCAGTGATCTGATTGCTT
ATGGTTTAATACCTGAATTTGTTGGAAGGTTTCCTGTTCTCGTTAGCTTATCTGCTTTGA
CTGAGAACCAACTCATGGAGGTGCTTACCGAGCCCAAGAACGCTCTTGGAAAGCAATACA
AAAAGATGTACCAGATGAATAGTGTAAAGCTGCATTTCACGGAAACAGCGCTGCGGCTAA
TAGCTAGAAAAGCAATAACAAAAAACACACGGGCTCGTGGCTTGAGAGCTCTTTTAGAAA
GCATCCTCATGGATTCTATGTACGAGATTCCGGACGAGGGTACAGGGAAGGATATGATAG
AGGCGGTTGTGGTGGATGAAGAAGCAGTTTAAGGAGAAGGGCGTAGAGGCTCTGGTGCTA
AGATTCTCCGTGGCAAAGGAGCTTTGGCTGTTTATCTCTCTGAAATCACCAAATCCAAAG
ATTCTCCTCAGACGACCAAGGAAGGATCAGAAGGAGAAATCGAGGTGGATGCAGAGATTC
CCTCCGTTGTAGCCAGTATGTAATGTATCATCCCTGACATACTGGTAAATGTATCTCTCT
GTATGCTTAATCTTATCGTTCTAATAATGTACATAAATGAAAGAAAGTTGTATCAGTAAG
TTTAAAAGAATACAAGGATGCATACACAGTTTGCACATTGATCAATGATGATGTAACGTT
TATGCAATACCTATCTTCCCATTACTTTTCTTTTTCTATCTTCCCATTTCTCTTTTATCT
TAAATGCAAAACTGAGAAATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF38TF U 1
AF RR2BF38JQ C 426
BS 1 808 RR2BF38TF
BS 809 1284 RR2BF38JQ

RD RR2BF38TF 808 0 0
GCAGGGAAGACATTACTTGCGAAAACTTTGGCACGGTTTGTGAATGTTCCTTTTGTCATT
GCGGATGCAACTACACTGACTCAGGCTGGTTATGTGGGAGAGGACGTCGAGTCTATATTG
TACAAACTTCTCACAGTTCAGATTATAACGTTGCAGCGGCACAGCAGGGGATTGTTTACA
TTGACGAAGTTGACAAGATAACAAAAAAGGCAGAGAGCCTTAACATCAGCAGAGATGTAT
CAGGAGAGGGTGTTCAACAAGCATTGCTAAAAATGCTGGAAGGAACAATCGTTAATGTAC
CTGAGAAGGGCGCTAGGAAGCACCCTAGAGGTGACAATATCCAGATAGACACAAAAGATA
TACTTTTCATATGTGGTGGTGCTTTTGTAGACATCGAAAAGACCATCTCTGAGAGGCGCC
ATGATTCTTCAATAGGGTTTGGGGCTCCTGTACGTGCTAACATGAGGGTGGGTGGTGTTA
CAAGTGCCGCTGTTGCATCAAACCTGATGGAAACTGTGGAAAGCAGTGATCTGATTGCTT
ATGGTTTAATACCTGAATTTGTTGGAAGGTTTCCTGTTCTCGTTAGCTTATCTGCTTTGA
CTGAGAACCAACTCATGGAGGTGCTTACCGAGCCCAAGAACGCTCTTGGAAAGCAATACA
AAAAGATGTACCAGATGAATAGTGTAAAGCTGCATTTCACGGAAACAGCGCTGCGGCTAA
TAGCTAGAAAAGCAATAACAAAAAACACACGGGCTCGTGGCTTGAGAGCTCTTTTAGAAA
GCATCCTCATGGATTCTATGTACGAGAT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2BF38JQ 859 0 0
TCTTCAATAGGGTTTGGGGCTCCTGTACGTGCTAACATGAGGGTGGGTGGTGTTACAAGT
GCCGCTGTTGCATCAAACCTGATGGAAACTGTGGAAAGCAGTGATCTGATTGCTTATGGT
TTAATACCTGAATTTGTTGGAAGGTTTCCTGTTCTCGTTAGCTTATCTGCTTTGACTGAG
AACCAACTCATGGAGGTGCTTACCGAGCCCAAGAACGCTCTTGGAAAGCAATACAAAAAG
ATGTACCAGATGAATAGTGTAAAGCTGCATTTCACGGAAACAGCGCTGCGGCTAATAGCT
AGAAAAGCAATAACAAAAAACACAGGGGCTCGTGGCTTGAGAGCTCTTTTAGAAAGCATC
CTCATGGATTCTATGTACGAGATTCCGGACGAGGGTACAGGGAAGGATATGATAGAGGCG
GTTGTGGTGGATGAAGAAGCAGTTTAAGGAGAAGGGCGTAGAGGCTCTGGTGCTAAGATT
CTCCGTGGCAAAGGAGCTTTGGCTGTTTATCTCTCTGAAATCACCAAATCCAAAGATTCT
CCTCAGACGACCAAGGAAGGATCAGAAGGAGAAATCGAGGTGGATGCAGAGATTCCCTCC
GTTGTAGCCAGTATGTAATGTATCATCCCTGACATACTGGTAAATGTATCTCTCTGTATG
CTTAATCTTATCGTTCTAATAATGTACATAAATGAAAGAAAGTTGTATCAGTAAGTTTAA
AAGAATACAAGGATGCATACACAGTTTGCACATTGATCAATGATGATGTAACGTTTATGC
AATACCTATCTTCCCATTACTTTTCTTTTTCTATCTTCCCATTTCTCTTTTATCTTAAAT
GCAAAACTGAGAAATCTCC

QA 1 859 1 859
DS 



AS 1 3

CO CL3112Contig1 1072 3 10 U
GAGAAAAGAGGCAAATGATTGAAGCTTTTAAAGTATTAAAAGGTAGTAAAAGCACACACT
CCACAATCTCAGCTTCTCAGAAAAAAAAATTAAAACAAAGTTTCACATTGCCAAAGTCAA
AGAACAAACAATAATACGAAACTGCCATTCCATTGCACTGTCCTTTCTTTATCCCTAGCT
CACACGACAAGAGTTTCTTAATCCCTCCTCTCACTCTTTTCCGAAATCTGCATTGTAGTG
TGAACTCGACTCAAGTTTCCTGGCCTCGCTCAGCTTTCTCACCGCCTTCATGAAATCTTC
CTGGATCACATAGTCCCGCTCTGCTCGGATTGCAAACATTCCAGCCTCCGTGCATATGTT
ACGCAGATCAGCACCATTAAAGCCCTCTGCAAGTTTGACAATAGCCTCGTACTCAATTTC
ACCATGTTTGGCTATACCAGCTGCATGGATCTTGAGGATATCCATTCTTGATTGCTCATT
TGGCAAAGGGATCTCAATCTTTCTATCTAATCTACCTGGA*GGAGAAGCGCAGGATCAAG
CACATCAGGCCTGTTCGTCGCCATTATCATTTTCACCTTTCCGAGGTTGTCAAACCCATC
AAGCTGGTTGAGTAACTCCATGAGTGTTCTTTGAATTTCACGATCAGCACTAGTTCCCTC
GCTAAAACGACGCCCACCAATAGCATCGATTTCGTCCATGAAAATGATACAAGGCTGGTG
TTCACGGGCATAGTTAAACATCTCACGAGTTCCTGAGGTTAGCTTCTCCTTGTCCACTTT
GCTACGGCAGCCTACCACATACCGAGGACCACTGCTAGCTTTGACAATCAATCTTTCGTT
ATCAAGAGGACGAAGGACTTCGCCAATGATCTGGCCAACACTTTGAAGAGACTTGAGATC
ATCTTCAGTTTTGTTGAATTCCTTTTTAGATCCTCTCAAGTTCTCCCTAGCTGTTCGAAC
TCGGGACTCGAGCTCCTTATGTTGGAGGAGCTTTTTACGGTAATCGGTAACTGCAGCGGT
ACGGCGTCTAGCGGCATCGTCTCCGTCGCTCATCCTCTCTGAGTGAGTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV41JQ U 17
AF RR2BD87JQ U 1
AF RR2BD87TF C 291
BS 1 70 RR2BD87JQ
BS 71 71 RR2EV41JQ
BS 72 88 RR2BD87JQ
BS 89 89 RR2EV41JQ
BS 90 181 RR2BD87JQ
BS 182 182 RR2EV41JQ
BS 183 259 RR2BD87JQ
BS 260 260 RR2EV41JQ
BS 261 845 RR2BD87JQ
BS 846 1072 RR2BD87TF

RD RR2EV41JQ 635 0 0
GG
TTGAAGCTTTTAAAGTATTAAAAGGTAGTAAAAGCACACACTCCGCAATCTCAGCTTCTC
AGAAAAAAAAATTAAAACAAAGTTTCACATTGCCAAAGTCAAAGAACAAACAATAATACG
AAACTGCCATTCCATTGCACTGTCCTTTCTTTATCCCTAGCTCACACGACAAGAGTTTCT
TAATCCCTCCTCTCACTCTTTTCCGAAATCTGCATTGTAGTGTGAACTCGACTCAAGTTT
CCTGGCCTCGCTCAGCTTTCTCACCGCCTTCATGAAATCTTCCTGGATCACATAGTCCCG
CTCTGCTCGGATTGCAAACATTCCAGCCTCCGTGCATATGTTACGCAGATCAGCACCATT
GAAGCCCTCTGCAAGTTTGACAATAGCCTCGTACTCAATTTCACCATGTTTGGCTATACC
AGCTGCATGGATCTTGAGGATATCCATTCTTGATTGCTCATTTGGCAAAGGGATCTCAAT
CTTTCTATCTAATCTACCTGGACGGAGAAGCGCAGGATCAAGCACATCAGGCCTGTTCGT
CGCCATTATCATTTTCACCTTTCTGAGGTTGTCAAACCCATCAAGCTGGTTGAGTAACTC
CATGAGTGTTCTTTGAATTTCACGATCAGCACT

QA 3 635 3 635
DS 

RD RR2BD87JQ 845 0 0
GAGAAAAGAGGCAAATGATTGAAGCTTTTAAAGTATTAAAAGGTAGTAAAAGCACACACT
CCACAATCTCTGCTTCTCAGAAAAAAAA*TTAAAACAAAGTTTCACATTGCCAAAGTCAA
AGAACAAACAATAATACGAAACTGCCATTCCATTGCACTGTCCTTTCTTTATCCCTAGCT
CGCACGACAAGAGTTTCTTAATCCCTCCTCTCACTCTTTTCCGAAATCTGCATTGTAGTG
TGAACTCGACTCAAGTTTCTTGGCCTCGCTCAGCTTTCTCACCGCCTTCATGAAATCTTC
CTGGATCACATAGTCCCGCTCTGCTCGGATTGCAAACATTCCAGCCTCCGTGCATATGTT
ACGCAGATCAGCACCATTAAAGCCCTCTGCAAGTTTGACAATAGCCTCGTACTCAATTTC
ACCATGTTTGGCTATACCAGCTGCATGGATCTTGAGGATATCCATTCTTGATTGCTCATT
TGGCAAAGGGATCTCAATCTTTCTATCTAATCTACCTGGA*GGAGAAGCGCAGGATCAAG
CACATCAGGCCTGTTCGTCGCCATTATCATTTTCACCTTTCCGAGGTTGTCAAACCCATC
AAGCTGGTTGAGTAACTCCATGAGTGTTCTTTGAATTTCACGATCAGCACTAGTTCCCTC
GCTAAAACGACGCCCACCAATAGCATCGATTTCGTCCATGAAAATGATACAAGGCTGGTG
TTCACGGGCATAGTTAAACATCTCACGAGTTCCTGAGGTTAGCTTCTCCTTGTCCACTTT
GCTACGGCAGCCTACCACATACCGAGGACCACTGCTAGCTTTGACAATCAATCTTTCGTT
ATCAA

QA 1 845 1 845
DS 

RD RR2BD87TF 782 0 0
TGAAATCTTCCTGGATCACATAGTCCCGCTCTGCTCGGATTGCAAACATTCCAGCCTCCG
TGCATATGTTACGCAGATCAGCACCATTAAAGCCCTCTGCAAGTTTGACAATAGCCTCGT
ACTCAATTTCACCATGTTTGGCTATACCAGCTGCATGGATCTTGAGGATATCCATTCTTG
ATTGCTCATTTGGCAAAGGGATCTCAATCTTTCTATCTAATCTACCTGGA*GGAGAAGCG
CAGGATCAAGCACATCAGGCCTGTTCGTCGCCATTATCATTTTCACCTTTCCGAGGTTGT
CAAACCCATCAAGCTGGTTGAGTAACTCCATGAGTGTTCTTTGAATTTCACGATCAGCAC
TAGTTCCCTCGCTAAAACGACGCCCACCAATAGCATCGATTTCGTCCATGAAAATGATAC
AAGGCTGGTGTTCACGGGCATAGTTAAACATCTCACGAGTTCCTGAGGTTAGCTTCTCCT
TGTCCACTTTGCTACGGCAGCCTACCACATACCGAGGACCACTGCTAGCTTTGACAATCA
ATCTTTCGTTATCAAGAGGACGAAGGACTTCGCCAATGATCTGGCCAACACTTTGAAGAG
ACTTGAGATCATCTTCAGTTTTGTTGAATTCCTTTTTAGATCCTCTCAAGTTCTCCCTAG
CTGTTCGAACTCGGGACTCGAGCTCCTTATGTTGGAGGAGCTTTTTACGGTAATCGGTAA
CTGCAGCGGTACGGCGTCTAGCGGCATCGTCTCCGTCGCTCATCCTCTCTGAGTGAGTGC
TC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL3113Contig1 824 2 2 U
GGATAGGCAAAAGAAAATGAAGATATCATCAACTGGTTGCATCTTTCTCCTTATCATCAT
CTCCATTGCCGTTGTTTTGAGTGCACCACCAGGGGGAGAAGTTGAGGATGAAACGAAGTT
TAGCTACGAGGCAAAAGGACCCAAGGGGCCAGCGAAATGGGGGACACTAAAGAAAGAGTG
GAAGTTGTGTGGAATTGGAAAACTGCAATCTCCGATTAATCTTACGGACGAAAATGTCAA
AGTTACTAGTAAACTTGTATCTCTCCGTAGCCGGTATTTACCTTCCAATGCCACTGTTAA
GAACAGAGGGCATGATATCATGTTGGAATTTAAAGGAGGGAATAAAGGTATTGGTATCAC
TATCCGTGGTATAAAATACAAACTTCAGCAGCTTCATTGGCATTCTCCTTCCGAACACTC
AGTCAATGGCAAAAGGTATGCTCTTGAGGAACACATGGTTCATCAGAGCAAAAGTGGACG
TTTCGCGGTTGTCGCGTTCTTATACAATATTGGGGAACCTGATCCTTTTCTTCTTTCGTT
GGAAGAACACTTGAACAAGATAACTGATACACACGAGTCCGAGGATTATGTCGGGATGAT
TGATCCCAAAAAACTAACTTTCGAATCAAAACAACACTATAGATATCTTGGATCACTTAC
AACTCCTCCATGTTCTGAACCCGTTATTTGGTCTGTTTCCAGAAAGATTAGGACCGTAAC
AAGTCAGCAGGTGGAGCTTCTCCGCGTGGCTGTACATGATGCTTCTGATACAAATGCTAG
GCCGCTTCAGCCAATCAATAAGCGCGTGGTGCATTTATACATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A335TF U 1
AF RR2A335JQ C 129
BS 1 727 RR2A335TF
BS 728 824 RR2A335JQ

RD RR2A335TF 727 0 0
GGATAGGCAAAAGAAAATGAAGATATCATCAACTGGTTGCATCTTTCTCCTTATCATCAT
CTCCATTGCCGTTGTTTTGAGTGCACCACCAGGGGGAGAAGTTGAGGATGAAACGAAGTT
TAGCTACGAGGCAAAAGGACCCAAGGGGCCAGCGAAATGGGGGACACTAAAGAAAGAGTG
GAAGTTGTGTGGAATTGGAAAACTGCAATCTCCGATTAATCTTACGGACGAAAATGTCAA
AGTTACTAGTAAACTTGTATCTCTCCGTAGCCGGTATTTACCTTCCAATGCCACTGTTAA
GAACAGAGGGCATGATATCATGTTGGAATTTAAAGGAGGGAATAAAGGTATTGGTATCAC
TATCCGTGGTATAAAATACAAACTTCAGCAGCTTCATTGGCATTCTCCTTCCGAACACTC
AGTCAATGGCAAAAGGTATGCTCTTGAGGAACACATGGTTCATCAGAGCAAAAGTGGACG
TTTCGCGGTTGTCGCGTTCTTATACAATATTGGGGAACCTGATCCTTTTCTTCTTTCGTT
GGAAGAACACTTGAACAAGATAACTGATACACACGAGTCCGAGGATTATGTCGGGATGAT
TGATCCCAAAAAACTAACTTTCGAATCAAAACAACACTATAGATATCTTGGATCACTTAC
AACTCCTCCATGTTCTGAACCCGTTATTTGGTCTGTTTCCAGAAAGATTAGGACCGTAAC
AAGTCAG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2A335JQ 696 0 0
AGGCAAAAGGACCCAAGGGGCCAGCGAAATGGGGGACACTAAAGAAAGAGTGGAAGTTGT
GTGGAATTGGAAAACTGCAATCTCCGATTAATCTTACGGACGAAAATGTCAAAGTTACTA
GTAAACTTGTATCTCTCCGTAGCCGGTATTTACCTTCCAATGCCACTGTTAAGAACAGAG
GGCATGATATCATGTTGGAATTTAAAGGAGGGAATAAAGGTATTGGTATCACTATCCGTG
GTATAAAATACAAACTTCAGCAGCTTCATTGGCATTCTCCTTCCGAACACTCAGTCAATG
GCAAAAGGTATGCTCTTGAGGAACACATGGTTCATCAGAGCAAAAGTGGACGTTTCGCGG
TTGTCGCGTTCTTATACAATATTGGGGAACCTGATCCTTTTCTTCTTTCGTTGGAAGAAC
ACTTGAACAAGATAACTGATACACACGAGTCCGAGGATTATGTCGGGATGATTGATCCCA
AAAAACTAACTTTCGAATCAAAACAACACTATAGATATCTTGGATCACTTACAACTCCTC
CATGTTCTGAACCCGTTATTTGGTCTGTTTCCAGAAAGATTAGGACCGTAACAAGTCAGC
AGGTGGAGCTTCTCCGCGTGGCTGTACATGATGCTTCTGATACAAATGCTAGGCCGCTTC
AGCCAATCAATAAGCGCGTGGTGCATTTATACATAC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL3114Contig1 930 2 2 U
GGAACCATGACTTGGTACTGACCTTTATGGATGTGCAGACACGCCTCATTAAGCCAATCT
GTCCTCATTATGCAGAATATGTTTGGAGGAAATTTCTCAAGAAGGAAGGCTGTGTGATAA
CAGCAGGCTGGCCAGCATCAAATGAGCCAGATTTGGTTCTCAAGGGTGCTAACAAATATC
TGCAGGATTCCATCGTCTTAATGAGAAAGCTTCTGCAAAAACAGCTTTTAGGATCCAAGA
AGGCTGCTAAGAAAGGCGCTCAAGTAACAGCAGTGGCAGAGGAGAAGTTGAAGGGCCTTG
TGTATGTGAATGAGGAATTTGATGGATGGAGAGCTCACTGCCTCCAGATTCCGCAAAGCA
AATTTGACCAGCAAACCCGTTGCTTTGCCCCTGATGCTGAGATATTTGCAGAACTGAGGG
AGACATTGCAGAAAGAGGGACAAGCGGAAAACTTCAAACAAATTCAGAAGATTTGCATGC
CTTTCCTTAAATTCAAAAAGGACGAGGCTATAGCTATCGGCGGCCAGGCTCTGAATTTGA
AGCTACCTTTTGGAGAGATGGAAGTTCTTCAGAGTAACATGGACTTGATCAAGCGGCAGC
TTGGTCTTTGAAGAGGTTGAGATCTATTCTGCAAGTGACCCTAATGATGTTGCTAAAGCT
GGTCCACATGCTTCTCTCCTGAAGCAGAATTCTCCATCTCCTGGCAGTCCAACCGCAATC
TTTGTCAACAGGGTTTGAAAAAGCGTGGGATATGCAACAACGACAAGTCAGGAGGTCGAA
AGGCTTGGCGTATGCAAGGTGTTTTGGTGTTTTTTACGAGTCGGATTTTATATGCAACTG
TTTTGACTTCTTTGCTGTGTGTTTTACCCTTTTTGGTATTGTTTAGTGACTTTCTATTCT
TGCTTATCAATGACACTTGTTTCATTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE19TF U 1
AF RR2CE19JQ C 96
BS 1 690 RR2CE19TF
BS 691 930 RR2CE19JQ

RD RR2CE19TF 692 0 0
GGAACCATGACTTGGTACTGACCTTTATGGATGTGCAGACACGCCTCATTAAGCCAATCT
GTCCTCATTATGCAGAATATGTTTGGAGGAAATTTCTCAAGAAGGAAGGCTGTGTGATAA
CAGCAGGCTGGCCAGCATCAAATGAGCCAGATTTGGTTCTCAAGGGTGCTAACAAATATC
TGCAGGATTCCATCGTCTTAATGAGAAAGCTTCTGCAAAAACAGCTTTTAGGATCCAAGA
AGGCTGCTAAGAAAGGCGCTCAAGTAACAGCAGTGGCAGAGGAGAAGTTGAAGGGCCTTG
TGTATGTGAATGAGGAATTTGATGGATGGAGAGCTCACTGCCTCCAGATTCCGCAAAGCA
AATTTGACCAGCAAACCCGTTGCTTTGCCCCTGATGCTGAGATATTTGCAGAACTGAGGG
AGACATTGCAGAAAGAGGGACAAGCGGAAAACTTCAAACAAATTCAGAAGATTTGCATGC
CTTTCCTTAAATTCAAAAAGGACGAGGCTATAGCTATCGGCGGCCAGGCTCTGAATTTGA
AGCTACCTTTTGGAGAGATGGAAGTTCTTCAGAGTAACATGGACTTGATCAAGCGGCAGC
TTGGTCTTTGAAGAGGTTGAGATCTATTCTGCAAGTGACCCTAATGATGTTGCTAAAGCT
GGTCCACATGCTTCTCTCCTGAAGCAGAAT
CT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2CE19JQ 835 0 0
CTCAAGAAGGAAGGCTGTGTGATAACAGCAGGCTGGCCAGCATCAAATGAGCCAGATTTG
GTTCTCAAGGGTGCTAACAAATATCTGCAGGATTCCATCGTCTTAATGAGAAAGCTTCTG
CAAAAACAGCTTTTAGGATCCAAGAAGGCTGCTAAGAAAGGCGCTCAAGTAACAGCAGTG
GCAGAGGAGAAGTTGAAGGGCCTTGTGTATGTGAATGAGGAATTTGATGGATGGAGAGCT
CACTGCCTCCAGATTCCGCAAAGCAAATTTGACCAGCAAACCCGTTGCTTTGCCCCTGAT
GCTGAGATATTTGCAGAACTGAGGGAGACATTGCAGAAAGAGGGACAAGCGGAAAACTTC
AAACAAATTCAGAAGATTTGCATGCCTTTCCTTAAATTCAAAAAGGACGAGGCTATAGCT
ATCGGCGGCCAGGCTCTGAATTTGAAGCTACCTTTTGGAGAGATGGAAGTTCTTCAGAGT
AACATGGACTTGATCAAGCGGCAGCTTGGTCTT*GAAGAGGTTGAGATCTATTCTGCAAG
TGACCCTAATGATGTTGCTAAAGCTGGTCCACATGCTTCTCTCCTGAAGCAGAATTCTCC
ATCTCCTGGCAGTCCAACCGCAATCTTTGTCAACAGGGTTTGAAAAAGCGTGGGATATGC
AACAACGACAAGTCAGGAGGTCGAAAGGCTTGGCGTATGCAAGGTGTTTTGGTGTTTTTT
ACGAGTCGGATTTTATATGCAACTGTTTTGACTTCTTTGCTGTGTGTTTTACCCTTTTTG
GTATTGTTTAGTGACTTTCTATTCTTGCTTATCAATGACACTTGTTTCATTTCGC

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 2

CO CL3115Contig1 783 2 4 U
GGGTAAGAATAAAATTTGAAATTCAAACGCTCCTTTTTCTCTCAAACCTACTTCAACTTC
CCCCTCTCTCTCTCTCTTCCACGATAAACCCTAAAAATTCAATTAAGTCTTCTTCACGAT
GACTCTTGCACCATCCATAGGTCGCGAGCTCTCGAATCCACCGTCCGATGGAATCTCTAA
TCTCCGGTTCTCCAATACCAGCGACCATCTACTAGTCTCTTCATGGGATAAGAGTGTGAG
ATTGTATGATGCGAACGCCGATTCGATGAAAGGAGAGTTCAAACATGGAGGAGCGGTGCT
CGATTGCTGCTTCCATGACGAGTCTTCTGGGTTCAGTGCCTGTGCCGATCATAAAGTTAG
ACGAATTGACTTCAATGCTGGCAAAGAGGACATTCTCGGAATGCATGATGAACCGGTTCG
TTGTGTTGAGTATTCTTATGCTGCAGGGCAAGTGATCACTGGAAGCTGGGATAGAACGAT
TAAATGTTGGGACCCGAGAGCTGCGAGTGGCCCGGAGCGTTCACAGATTGGAACATATAA
GCAACCTGAGCGTGTTAACTCTCTTTCTCTCGTTGGAAATCATTTGGTTGTGGCGACAGC
AGGGAGGCATGTCAACATTTATGACCTGAGGAATATGGCCCAGCCTGAGCAGAGAAGGGA
GTCCTCACTTAAGTACCAGACCAGATGTGTGCGTTGTTATCCCAATGGAACAGGGTATGC
ACTTAGCTCTGTTGAAGGAGGGTTTCATGGAGTTTTCGATCTATCAGAGGCTGCTCAACT
AAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2C495TF U 1
AF RR2DH73TF U 1
BS 1 117 RR2C495TF
BS 118 118 RR2DH73TF
BS 119 598 RR2C495TF
BS 599 783 RR2DH73TF

RD RR2C495TF 598 0 0
GGGTAAGAATAAAATTTGAAATTCAAACGCTCCTTTTTCTCTCAAACCTACTTCAACTTC
CCCCTCTCTCTCTCTCTTCCACGATAAACCCTAAAAATTCAATTAAGTCTTCTTCACTAT
GACTCTTGCACCATCCATAGGTCGCGAGCTCTCGAATCCACCGTCCGATGGAATCTCTAA
TCTCCGGTTCTCCAATACCAGCGACCATCTACTAGTCTCTTCATGGGATAAGAGTGTGAG
ATTGTATGATGCGAACGCCGATTCGATGAAAGGAGAGTTCAAACATGGAGGAGCGGTGCT
CGATTGCTGCTTCCATGACGAGTCTTCTGGGTTCAGTGCCTGTGCCGATCATAAAGTTAG
ACGAATTGACTTCAATGCTGGCAAAGAGGACATTCTCGGAATGCATGATGAACCGGTTCG
TTGTGTTGAGTATTCTTATGCTGCAGGGCAAGTGATCACTGGAAGCTGGGATAGAACGAT
TAAATGTTGGGACCCGAGAGCTGCGAGTGGCCCGGAGCGTTCACAGATTGGAACATATAA
GCAACCTGAGCGTGTTAACTCTCTTTCTCTCGTTGGAAATCATTTGGTTGTGGCGACA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2DH73TF 783 0 0
GGGTAAGAATAAAATTTGAAATTCAAACGCTCCTTTTTCTCTCAAACCTACTTCAACTTC
CCCCTCTCTCTCTCTCTTCCACGATAAACCCTAAAAATTCAATTAAGTCTTCTTCACGAT
GACTCTTGTACCATCCATAGGTCGCGAGCTCTCGAATCCACCGTCCGATGGAATCTCTAA
TCTCCGGTTCTCCAATACCAGCGACCATCTACTAGTCTCTTCATGGGATAAGAGTGTGAG
ATTGTATGATGCGAACGCCGATTCGATGAAAGGAGAGTTCAAACATGGAGGAGCGGTGCT
CGATTGCTGCTTCCATGACGAGTCTTCTGGGTTCAGTGCCTGTGCCGATCATAAAGTTAG
ACGAATTGACTTCAATGCTGGCAAAGAGGACATTCTCGGAATGCATGATGAACCGGTTCG
TTGTGTTGAGTATTCTTATGCTGCAGGGCAAGTGATCACTGGAAGCTGGGATAGAACGAT
TAAATGTTGGGACCCGAGAGCTGCGAGTGGCCCGGAGCGTTCACAGATTGGAACATATAA
GCAACCTGAGCGTGTTAACTCTCTTTCTCTCGTTGGAAATCATTTGGTTGTGGCGACAGC
AGGGAGGCATGTCAACATTTATGACCTGAGGAATATGGCCCAGCCTGAGCAGAGAAGGGA
GTCCTCACTTAAGTACCAGACCAGATGTGTGCGTTGTTATCCCAATGGAACAGGGTATGC
ACTTAGCTCTGTTGAAGGAGGGTTTCATGGAGTTTTCGATCTATCAGAGGCTGCTCAACT
AAA

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 3

CO CL3116Contig1 843 3 4 U
GGAGGTAAGCGCAACTTTGCAAATTAAATTGTGTATATATATTAACTTAGCATGGTACTA
CATCACACGGATCTACAGTTACAGAAGAAAACAGAGCTTTGCAACAGAAAATTAACAGAA
CAGAAATTGACCTCATGTCAAATTATTGAACAGGACTTCTTGACCTCATGTCAAACTGAT
AAATGGCCGGAAACAAACAAAAAGAAACAAATACATGAAGCTTGGAAGAAAGAAGAGACA
GGAAACAAAAATTAAAATAAGGACTTGAATCATGAAGCAAGATATATCAGCATTTGGGCA
AGTCTGCAGGAGGAGGAAGAAGCTTCTGATTAGGCTTATCTCCATCAAGAACAAGCCAAG
CCATCCTCAGACCCCAACTGGTATGTACTTCCAAGTGACAGTGCATGAACCACACTCCTG
GGTTATCTGCAAGGAACCGAATAGCAGCCCATCCACCTGATGGCACACCAACCGTGTTCC
TCTCTATCGGATCAACAAGATTGAAGTTCTTAGGATCCTTGTTGGGGTCAAAGTTCCCAA
ACCCTTGGCCAACGACAAAGAAGTTGAAACCGTGAAGGTGAAGAGGATGGCTTTCCGCCC
CAAGAATGCTAGTGTCTTGCATCACCAGCTCTACACTCGTGTTATAACGCAGAACCATCA
AGTTCGTCCCGGTGCTAACCATGGTGTTGTTAGGTGGAGTGCCTGTGTAGTTAAAAGGGA
CAATAGGATTCCATGGGAAGTTTGAAGAATACACTCCATTGGATTGCCCAGTGTAGTGAG
ACTGAAGGAGAGCTTTTGTAGGCAGCGTGAAGGAGATGTTGCTGATTGATGCAGCAAACA
TTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2GM85JQ U 1
AF RR2AW60JQ U 118
AF RR2EG46JQ U 101
BS 1 136 RR2GM85JQ
BS 137 137 RR2EG46JQ
BS 138 650 RR2GM85JQ
BS 651 843 RR2EG46JQ

RD RR2GM85JQ 650 0 0
GGAGGTAAGCGCAACTTTGCAAATTAAATTGTGTATATATATTAACTTAGCATGGTACTA
CATCACACGGATCTACAGTTACAGAAGAAAACAGAGCTTTGCAACAGAAAATTAACAGAA
CAGAAATTGACCTCATATCAAATTATTGAACAGGACTTCTTGACCTCATGTCAAACTGAT
AAATGGCCGGAAACAAACAAAAAGAAACAAATACATGAAGCTTGGAAGAAAGAAGAGACA
GGAAACAAAAATTAAAATAAGGACTTGAATCATGAAGCAAGATATATCAGCATTTGGGCA
AGTCTGCAGGAGGAGGAAGAAGCTTCTGATTAGGCTTATCTCCATCAAGAACAAGCCAAG
CCATCCTCAGACCCCAACTGGTATGTACTTCCAAGTGACAGTGCATGAACCACACTCCTG
GGTTATCTGCAAGGAACCGAATAGCAGCCCATCCACCTGATGGCACACCAACCGTGTTCC
TCTCTATCGGATCAACAAGATTGAAGTTCTTAGGATCCTTGTTGGGGTCAAAGTTCCCAA
ACCCTTGGCCAACGACAAAGAAGTTGAAACCGTGAAGGTGAAGAGGATGGCTTTCCGCCC
CAAGAATGCTAGTGTCTTGCATCACCAGCTCTACACTCGTGTTATAACGC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2AW60JQ 599 0 0
GG
ACAGAAATTGACCTCATGTCAAATTATTGAACAGGACTTCTTGACCTCATGTCAAACTGA
TAAATGGCCGGAAACAAACAAAAAGAAACAAATACATGAAGCTTGGAAGAAAGAAGAGAC
AGGAAACAAAAATTAAAATAAGGACTTGAATCATGAAGCAAGATATATCAGCATTTGGGC
AAGTCTGCAGGAGGGGGAAGAAGCTTCTGATTAGGCTTATCTCCATCAAGAACAAGCCAA
GCCATCCTCAGACCCCAACTGGTATGTACTTCCAAGTGACAGTGCATGAACCACACTCCT
GGGTTATCTGCAAGGAACCGAATAGCAGCCCATCCACCTGATGGCACACCAACCGTGTTC
CTCTCTATCGGATCAACAAGATTGAAGTTCTTAGGATCCTTGTTGGGGTCAAAGTTCCCA
AACCCTTGGCCAACGACAAAGAAGTTGAAACCGTGAAGGTGAAGAGGATGGCTTTCCGCC
CCAAGAATGCTAGTGTCTTGCATCACCAGCTCTACACTCGTGTTATAACGCAGAGCCATC
AAGTTCGTCCCGGTGCTAACCATGGTGTTGTTAGGTGGAGTGCCTGTGTAGTTAAAA

QA 3 599 3 599
DS 

RD RR2EG46JQ 743 0 0
C
CAACAGAAAATTAACAGAACAGAAATTGACCTCATGTCAAATTATTGAACAGGACTTCTT
GACCTCATGTCAAACTGATAAATGGCCGGAAACAAACAAAAAGAAACAAATACATGAAGC
TTGGAAGAAAGAAGAGACAGGAAACAAAAATTAAAATAAGGACTTGAATCATGAAGCAAG
ATATATCAGCATTTGGGCAAGTCTGCAGGAGGAGGAAGAAGCTTCTGATTAGGCTTATCT
CCATCAAGAACAAGCCAAGCCATCCTCAGACCCCAACTGGTATGTACTTCCAAGTGACAG
TGCATGAACCACACTCCTGGGTTATCTGCAAGGAACCGAATAGCAGCCCATCCACCTGAT
GGCACACCAACCGTGTTCCTCTCTATCGGATCAACAAGATTGAAGTTCTTAGGATCCTTG
TTGGGGTCAAAGTTCCCAAACCCTTGGCCAACGACAAAGAAGTTGAAACCGTGAAGGTGA
AGAGGATGGCTTTCCGCCCCAAGAATGCTAGTGTCTTGCATCACCAGCTCTACACTCGTG
TTATAACGCAGAACCATCAAGTTCGTCCCGGTGCTAACCATGGTGTTGTTAGGTGGAGTG
CCTGTGTAGTTAAAAGGGACAATAGGATTCCATGGGAAGTTTGAAGAATACACTCCATTG
GATTGCCCAGTGTAGTGAGACTGAAGGAGAGCTTTTGTAGGCAGCGTGAAGGAGATGTTG
CTGATTGATGCAGCAAACATTG

QA 2 743 2 743
DS 



AS 1 2

CO CL3117Contig1 952 2 4 U
GGGAGAGAGAGAGAAGCTAATAATAATAATATCCACATCATCATTGATCGTGCAGCTAAA
GGACACCTGCATCAAATCACAATCCACTCCAGGTTTATCCACTTCTTCCTGAACCACTGT
CTGAAATTTATAGCTCCCAAACAAGCCGACACGACAACTTCTACTTGCCCTTTCTCCAAA
GCTGCTCGTCCAGACGACGCAAAACAAGGCGAGACGACTGCTTCTGCTTGCCCTTTCTCT
AAAGCAGCTGTTGCCTCTGCTCCAAGCAAAGGATGTCCTGAAAACGAGGAGGACTCTGCT
GACTCTGCCAAGCAATGGGAGACTCAAGTTCTGCAGTCAAACATTTCGAAGAGAGTATTG
AGTTCCTTATGAAACTGCCCATGGATGATTTGGAGATTACACATACACTTTCTGTCTCAC
TCAATAAAATAGGAGATGTTAAATATTATGATGGCGAACTACAAGCTGCAACGTCGTATT
ACCTCCGGGCTTTAAATGTTAGACGTGATGCAATGAACCATCACCCAAATGCTCCTTCAC
AAATTCTGGATGTGGCAGTTTCATTAGCCAAAGTTGCAGATATAGACAGGAGTCTACAAA
ATGAAGATGCAGCCACAGATGGTTTCAAGGAAGGGATGAAACTGCTGGAATCTTTGAAAC
TGGACTCTGATGATTCTGCTGCTCTCGAGCAACGACGTCTGTCTGTGATGGAGTTTCTGA
AGAAGCAAGTAGAGAAGCCTGAACCGTCTGCGGAAACTGCACTCTAAACTGATTGCAGGC
TTACCTAAGTATATATATATACCTAATCGCTCTTCTCGCATTTTGTCTGAAATAAAGGAA
CGAGAAAGCAACAGTGTTCGTGTTTGCTTGCGCTTAAGGATTAAACAAAACAGAGCACTG
TGATGGTCTCAAAATTGTATACACTATTCTATTCTATGTGAACTTACGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ77TF U 1
AF RR2GQ77JQ C 351
BS 1 649 RR2GQ77TF
BS 650 650 RR2GQ77JQ
BS 651 700 RR2GQ77TF
BS 701 952 RR2GQ77JQ

RD RR2GQ77TF 700 0 0
GGGAGAGAGAGAGAAGCTAATAATAATAATATCCACATCATCATTGATCGTGCAGCTAAA
GGACACCTGCATCAAATCACAATCCACTCCAGGTTTATCCACTTCTTCCTGAACCACTGT
CTGAAATTTATAGCTCCCAAACAAGCCGACACGACAACTTCTACTTGCCCTTTCTCCAAA
GCTGCTCGTCCAGACGACGCAAAACAAGGCGAGACGACTGCTTCTGCTTGCCCTTTCTCT
AAAGCAGCTGTTGCCTCTGCTCCAAGCAAAGGATGTCCTGAAAACGAGGAGGACTCTGCT
GACTCTGCCAAGCAATGGGAGACTCAAGTTCTGCAGTCAAACATTTCGAAGAGAGTATTG
AGTTCCTTATGAAACTGCCCATGGATGATTTGGAGATTACACATACACTTTCTGTCTCAC
TCAATAAAATAGGAGATGTTAAATATTATGATGGCGAACTACAAGCTGCAACGTCGTATT
ACCTCCGGGCTTTAAATGTTAGACGTGATGCAATGAACCATCACCCAAATGCTCCTTCAC
AAATTCTGGATGTGGCAGTTTCATTAGCCAAAGTTGCAGATATAGACAGGAGTCTACAAA
ATGAAGATGCAGCCACAGATGGTTTCAAGGAAGGGATGAAACTGCTGGA*TCTTTGAAAC
TGGACTCTGATGATTCTGCTGCTCTCGAGCAACGACGTCT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2GQ77JQ 602 0 0
GAGAGTATTGAGTTCCTTATGAAACTGCCCATGGATGATTTGGAGATTACACATACACTT
TCTGTCTCACTCAATAAAATAGGAGATGTTAAATATTATGATGGCGATCTACAAGCTGCA
ACGTCGTATTACCTCCGGGCTTTAAATGTTAGACGTGATGCAATGAACCATCACCCAAAT
GCTCCTTCACAAATTCTGGATGTGGCAGTTTCATTAGCCAAAGTTGCAGATATAGACAGG
AGTCTACAAAATGAAGATGCAGCCACAGATGGTTTCAAGGAAGGGATGAAACTGCTGGAA
TCTTTGAAACTGGACTCTGATGATTCTGCTGCTCTCGAGCAACGACGTCTGTCTGTGATG
GAGTTTCTGAAGAAGCAAGTAGAGAAGCCTGAACCGTCTGCGGAAACTGCACTCTAAACT
GATTGCAGGCTTACCTAAGTATATATATATACCTAATCGCTCTTCTCGCATTTTGTCTGA
AATAAAGGAACGAGAAAGCAACAGTGTTCGTGTTTGCTTGCGCTTAAGGATTAAACAAAA
CAGAGCACTGTGATGGTCTCAAAATTGTATACACTATTCTATTCTATGTGAACTTACGAA
GC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL3118Contig1 737 2 6 U
TCTAGAGATATACAAAGGCTTTGAGGGATTATCTTCGTTGGTTGATGTTGGTGGTGGCAT
TGGAGTTACTCTCCGTATGATTGTCCCCAAGCACCCATACATCAAGGGGATCCTCTATGA
TCTCCCTCATGTCATCGAGGAAGCTATTTCCTATCCTGGTATTAAACACATTGGCGGAGA
TATGTTTGTGAATGTCCCTAAAGCAGATGCCATCTTCATGAAGTGGATATGTCATGATTG
GAGTGACCAACACTGTTTGAAATTTCTCAAGAATTGTTATGAAGCACTCCCAGACAACGG
GAAAGTGATAGTGGCGGAATCAATGCTTCCGGTGTTGCCAGACTCAAGCCTCATGACGAA
AGAAGTTGTCCACATGGACTGCCTCATGCTGGCTCACAACCCCGGAGGCAAAGAACGGAC
TGAGAAGGAGTTTGAAGCATTAGCCAGAGGTTCTGGCTTCCAAAGCTTTCAAGTTGTCTG
CAGAGCCTATGGTACTCACATCTTGGAGTTCAAGAAGATATGAGCCTAATAAGTACAAAT
ATCCATGGAACATCTTCTTCACGATTTTTTGCGTCCAAATATTTTTTCTACATTTTTCAG
TGTTACCCTGTTCTGCATATATGTTGTTTCTCTGGCTTGTGAGGCCACTATCGTCGTTGT
TTACTTGTTTAAGCTGTTTTTGATGTTGTTGGAAAATGCATTTCTTTGTAATTGTATTTC
CGATTTTAATGCATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E432TF U 1
AF RR2E432JQ C 283
BS 1 643 RR2E432TF
BS 644 644 RR2E432JQ
BS 645 661 RR2E432TF
BS 662 662 RR2E432JQ
BS 663 674 RR2E432TF
BS 675 737 RR2E432JQ

RD RR2E432TF 674 0 0
TCTAGAGATATACAAAGGCTTTGAGGGATTATCTTCGTTGGTTGATGTTGGTGGTGGCAT
TGGAGTTACTCTCCGTATGATTGTCCCCAAGCACCCATACATCAAGGGGATCCTCTATGA
TCTCCCTCATGTCATCGAGGAAGCTATTTCCTATCCTGGTATTAAACACATTGGCGGAGA
TATGTTTGTGAATGTCCCTAAAGCAGATGCCATCTTCATGAAGTGGATATGTCATGATTG
GAGTGACCAACACTGTTTGAAATTTCTCAAGAATTGTTATGAAGCACTCCCAGACAACGG
GAAAGTGATAGTGGCGGAATCAATGCTTCCGGTGTTGCCAGACTCAAGCCTCATGACGAA
AGAAGTTGTCCACATGGACTGCCTCATGCTGGCTCACAACCCCGGAGGCAAAGAACGGAC
TGAGAAGGAGTTTGAAGCATTAGCCAGAGGTTCTGGCTTCCAAAGCTTTCAAGTTGTCTG
CAGAGCCTATGGTACTCACATCTTGGAGTTCAAGAAGATATGAGCCTAATAAGTACAAAT
ATCCATGGAACATCTTCTTCACGATTTTTTGCGTCCAAATATTTTTTCTACATTTTTCAG
TGTTACCCTGTTCTGCATATATGTTGTTTCTCTGGCTTGTGAG*CCACTATCGTCGTTGT
T*ACTTGTTTAAGC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2E432JQ 455 0 0
AGCACTCCCAGACAACGGGAAAGTGATAGTGGCGGAATCAATGCTTCCGGTGTTGCCAGA
CTCAAGCCTCATGACGAAAGAAGTTGTCCACATGGACTGCCTCATGCTGGCTCACAACCC
CGGAGGCAAAGAACGGACTGAGAAGGAGTTTGAAGCATTAGCCAGAGGTTCTGGCTTCCA
AAGCTTTCAAGTTGTCTGCAGAGCCTATGGTACTCACATCTTGGAGTTCAAGAAGATATG
AGCCTAATAAGTACAAATATCCATGGAACATCTTCTTCACGATTTTTTGCGTCCAAATAT
TTTTTCTACATTTTTCAGTGTTACCCTGTTCTGCATATATGTTGTTTTTCTGGCTTGTGA
GGCCACTATCGTCGTTGTTTACTTGTTTAAGCTGTTTTTGATGTTGTTGGAAAATGCATT
TCTTTGTAATTGTATTTCCGATTTTAATGCATATG

QA 1 455 1 455
DS 



AS 1 3

CO CL3119Contig1 698 3 6 U
TTTTTTGCTCATTTCAGATTGCTATGTAAAGACCTCAAAACATACAACTTTTTCCCAACA
TTAAGTTGTTTCACATTTCTCAACAGAAAATATTTTATTCTGAGGCTAATTATCTCGAGC
GCTACTAATTAATCCCTAAAATGAAGTTAATTCTGTTGATGTGCATCGTCTTTGTCATGA
TGTTAACATCATTCCCTGCTACGATCAACGGTGATGATTGCCCTGACACTATTCGGACCT
GCCTGCGCCTAGCTAGAGCCAAAGATAACCAGTGGAAGACAATATGTTGTCCAATTTGGA
AAGGGCCTATACCACCAAAATTTTTAGCATGTATATGTCGTATAAGGAAAAACCCATTTG
ACAATAATGTTCTGGTCCGAGTTTTAAGAGCTTGTGAATTAGGAGATAAAGACATCAAGT
GTTAACGATGCGAGCATAAAATAGTCAAACCACCAATGATCGTCAAACCAAACTTGAGAT
AATAAGGTGTAGTAATTATCTGGCTATTTCTTAATTTCTTTTAATAATTTTAGTTAAGTT
CTTGTTCAATAACAAGATAAAATTTATATTGTTTATGTTCATGCTCTTATGAATTACGAT
TCCGTGTTCTTTTTTTGTTTCTGTGTATTTTATTATATGTAGAAATAATAAATCCAAAAA
GTTAGTCTACTCTAAAATAACCAAGATTTGTAATAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW78TF U 1
AF RR2H187TF U 55
AF RR2H187JQ C 102
BS 1 470 RR2GW78TF
BS 471 471 RR2H187TF
BS 472 556 RR2GW78TF
BS 557 557 RR2H187TF
BS 558 608 RR2GW78TF
BS 609 698 RR2H187TF

RD RR2GW78TF 610 0 0
TTTTTTGCTCATTTCAGATTGCTATGTAAAGACCTCAAAACATACAACTTTTTCCCAACA
TTAAGTTGTTTCACATTTCTCAACAGAAAATATTTTATTCTGAGGCTAATTATCTCGAGC
GCTACTAATTAATCCCTAAAATGAAGTTAATTCTGTTGATGTGCATCGTCTTTGTCATGA
TGTTAACATCATTCCCTGCTACGATCAACGGTGATGATTGCCCTGACACTATTCGGACCT
GCCTGCGCCTAGCTAGAGCCAAAGATAACCAGTGGAAGACAATATGTTGTCCAATTTGGA
AAGGGCCTATACCACCAAAATTTTTAGCATGTATATGTCGTATAAGGAAAAACCCATTTG
ACAATAATGTTCTGGTCCGAGTTTTAAGAGCTTGTGAATTAGGAGATAAAGACATCAAGT
GTTAACGATGCGAGCATAAAATAGTCAAACCACCAATGATCGTCAAACCAGACTTGAGAT
AATAAGGTGTAGTAATTATCTGGCTATTTCTTAATTTCTTTTAATAATTTTAGTTAAGTT
CTTGTTCAATAACAAGGTAAAATTTATATTGTTTATGTTCATGCTCTTATGAATTACGAT
TCCGTGTT
AA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2H187TF 644 0 0
GG
AACATTAAGTTGTTTCACATTTCTCAACAGAAAATATTTTATTCTGAGGCTAATTATCTC
GAGCGCTACTAATTAATCCCTAAAATGAAGTTAATTCTGTTGATGTGCATCGTCTTTGTC
ATGATGTTAACATCATTCCCTGCTACGATCAACGGTGATGATTGCCCTGACACTATTCGG
ACCTGCCTGCGCCTAGCTAGAGCCAAAGATAACCAGTGGAAGACAATATGTTGTCCAATT
TGGAAAGGGCCTATACCACCAAAATTTTTAGCATGTATATGTCGTATAAGGAAAAACCCA
TTTGACAATAATGTTCTGGTCCGAGTTTTAAGAGCTTGTGAATTAGGAGATAAAGACATC
AAGTGTTAACGATGCGAGCATAAAATAGTCAAACCACCAATGATCGTCAAACCAAACTTG
AGATAATAAGGTGTAGTAATTATCTGGCTATTTCTTAATTTCTTTTAATAATTTTAGTTA
AGTTCTTGTTCAATAACAAGATAAAATTTATATTGTTTATGTTCATGCTCTTATGAATTA
CGATTCCGTGTTCTTTTTTTGTTTCTGTGTATTTTATTATATGTAGAAATAATAAATCCA
AAAAGTTAGTCTACTCTAAAATAACCAAGATTTGTAATAAAA

QA 3 644 3 644
DS 

RD RR2H187JQ 590 0 0
GAGGCTAATTATCTCGAGCGCTACTAATTAATCCCTAAAATGAAGTTAATTCTGTTGATG
TGCATCGTCTTTGTCATGATGTTAACATCATTCCCTGCTACGATCAACGGTGATGATTGC
CCTGACACTATTCGGACCTGCCTGCGCCTAGCTAGAGCCAAAGATAACCAGTGGAAGACA
ATATGTTGTCCAATTTGGAAAGGGCCTATACCACCAAAATTTTTAGCATGTATATGTCGT
ATAAGGAAAAACCCATTTGACAATAATGTTCTGGTCCGAGTTTTAAGAGCTTGTGAATTA
GGAGATAAAGACATCAAGTGTTAACGATGCGAGCATAAAATAGTCAAACCACCAATGATC
GTCAAACCAAACTTGAGATAATAAGGTGTAGTAATTATCTGGCTATTTCTTAATTTCTTT
TAATAATTTTAGTTAAGTTCTTGTTCAATAACAAGATAAAATTTATATTGTTTATGTTCA
TGCTCTTATGAATTACGATTCCGTGTTCTTTTTTTGTTTCTGTGTATTTTATTATATGTA
GAAATAATAAATCCAAAAAGTTAGTCTACTCTAAAATAACCAAGATTTGT

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 3

CO CL3120Contig1 755 3 3 U
GCTCCTATAAATTTGTGAAAAAACTTTCCATAAAGGTTTACATAGTTACACACATAAGAA
AATGGCAACCATCTTTTGCCTTCTCGTGCAAGAAAGGCACATATAACCACCCTAAATAAA
CCTCTCCTTTTACAACAAGATATTCTGAATAAAAATCAAAAACACACCAAAAAAGACAAT
ATTATAAAAATAAAGCCCAAACACATTTCACCTCTTGTGGTATAAGGTTTCATTCATCTA
CTTACGAGCGCTTATAAGCTTGACGTCGTCAATCACAGGCCCACATAGAGACGAAAAATC
ATCGCCCCTCATTGCATAGAAAGTGCTGTAAAACATAACTCTAGTTCTTGTCGAAACCGC
GACAAACCTGATGGAAGCTCGTTTAAACCCTCCAGTGCCACGCGACTCGTAAGGTACCTT
AAGCGTATCTCTTCCAGCAAAAGCTTCAACAACCATTGAGCCTTTGCAAGCGTTGTTAGC
ATCTCCTACCGCAAAGGACAGGACATAAGTCTTCCCAATGATGGTCCTAGCCACTTGAGC
AATGGCGCTCTCTTTGCCTGCTACTAGCTCGATGGCTCTGCGTCCTTGTGGGATTGAGAA
GTGTTCTGTGTCTACATACTTGACGGCTTTGAGAGACTCCACCATCCATCCGGGTAGAGG
AGAGTGGTCGTCTTCTATGAACGGTGGGATCAAAACTCCTGTTGTTGAGCCTGGTAGTAC
TAGTGGACCTTCTTCAAATCCTCCGTTTTTCAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX33JQ U 15
AF RR2FX33TF C 185
AF RR2D845JQ U 1
BS 1 305 RR2D845JQ
BS 306 306 RR2FX33JQ
BS 307 755 RR2D845JQ

RD RR2FX33JQ 604 0 0
GTGAAAAAACTTTCCATAAAGGTTTACATAGTTACACACATAAGAAAATGGCAACCATCT
TTTGCCTTCTCGTGCAAGAAAGGCACATATAACCACCCTAAATAAACCTCTCCTTTTACA
ACAAGATATTTTGAATAAAAATCAAAAACACACCAAAAAAGACAATATTATAAAAATAAA
GCCCAAACACATTTCACCTCTTGTGGTATAAGGTTTCATTCATCTACTTACGAGCGCTTA
TAAGCTTGACGTCGTCAATCACAGGCCCACATAGAGACGAAAAATCATCGCCCCTCATTG
CATAAAAAGTGCTGTAAAACATAACTCTAGTTCTTGTCGAAACCGCGACAAACCTGATGG
AAGCTCGTTTAAACCCTCCAGTGCCACGCGACTCGTAAGGGACCTTAAGCGTATCTCTTC
CAGCAAAAGCTTCAACAACCATTGAGCCTTTGCAAGCGTTGTTAGCATCTCCTACCGCAA
AGGACAGGACATAAGTCTTCCCAATGATGGTCCTAGCCACTTGAGCAATGGCGCTCTCTT
TGCCTGCTACTAGCTCGATGGCTCTGCGTCCTTGTGGGATTGAGAAGTGTTCTGTGTCTA
CATA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2FX33TF 517 0 0
TAAAAATAAAGCCCAAACACATTTCACCTCTTGTGGTATAAGGTTTCATTCATCTACTTA
CGAGCGCTTATAAGCTTGACGTCGTCAATCACAGGCCCACATAGAGACGAGAAATCATCG
CCCCTCATTGCATAGAAAGTGCTGTAAAACATAACTCTAGTTCTTGTCGAAACCGCGACA
AACCTGATGGAAGCTCGTTTAAACCCTCCAGTGCCACGCGACTCGTAAGGTACCTTAAGC
GTATCTCTTCCAGCAAAAGCTTCAACAACCATTGAGCCTTTGCAAGCGTTGTTAGCATCT
CCTACCGCAAAGGACAGGACATAAGTCTTCCCAATGATGGTCCTAGCCACTTGAGCAATG
GCGCTCTCTTTGCCTGCTACTAGCTCGATGGCTCTGCGTCCTTGTGGGATTGAGAAGTGT
TCTGTGTCTACATACTTGACGGCTTTGAGAGACTCCACCATCCATCCGGGTAGAGGAGAG
TGGTCGTCTTCTATGAACGGTGGGATCAAAACTCCT
C

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2D845JQ 755 0 0
GCTCCTATAAATTTGTGAAAAAACTTTCCATAAAGGTTTACATAGTTACACACATAAGAA
AATGGCAACCATCTTTTGCCTTCTCGTGCAAGAAAGGCACATATAACCACCCTAAATAAA
CCTCTCCTTTTACAACAAGATATTCTGAATAAAAATCAAAAACACACCAAAAAAGACAAT
ATTATAAAAATAAAGCCCAAACACATTTCACCTCTTGTGGTATAAGGTTTCATTCATCTA
CTTACGAGCGCTTATAAGCTTGACGTCGTCAATCACAGGCCCACATAGAGACGAAAAATC
ATCGCTCCTCATTGCATAGAAAGTGCTGTAAAACATAACTCTAGTTCTTGTCGAAACCGC
GACAAACCTGATGGAAGCTCGTTTAAACCCTCCAGTGCCACGCGACTCGTAAGGTACCTT
AAGCGTATCTCTTCCAGCAAAAGCTTCAACAACCATTGAGCCTTTGCAAGCGTTGTTAGC
ATCTCCTACCGCAAAGGACAGGACATAAGTCTTCCCAATGATGGTCCTAGCCACTTGAGC
AATGGCGCTCTCTTTGCCTGCTACTAGCTCGATGGCTCTGCGTCCTTGTGGGATTGAGAA
GTGTTCTGTGTCTACATACTTGACGGCTTTGAGAGACTCCACCATCCATCCGGGTAGAGG
AGAGTGGTCGTCTTCTATGAACGGTGGGATCAAAACTCCTGTTGTTGAGCCTGGTAGTAC
TAGTGGACCTTCTTCAAATCCTCCGTTTTTCAAAT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 3

CO CL3121Contig1 686 3 39 U
GGGACGAACAAGGAAACGGAAGGAGAGTAATTCTGATTCTAACGAACGTTCTAGGTTTTG
GTGAAATCTTTCTACTTCGCAGGTGATGGATGCTCAGGCGAAGAAGAAGGCGCTGTTCCG
ATCTAAGCTCAACGCCAAGAAGAAAGACTCCCGCATCGATTCTCCTCTCGTTAGGTACAA
CGAATCAGATCAGCCTGTGTGTCGAGTGTGCAATATCGTGTTGAAGTCCGAATCTCTCTG
GGATGTCCACCAAGCTTCTCGTAAGCATCACGAGGCAATCGATAATTTAAAGGCTAGTGC
AGCAGCTGGAACTCAACGCGGGAGCAAACCTGCTGAAACCAAGCCGACCAAACCTGATAT
ATCATCCAAATCTCAGACATCATCATCTGCTTCTGGTCTCCCTCCAAATTTCTTCGAGTC
TTCTACTAAACATCCTGAAGTTGAATCATCAAAACCTAAGAACGTAGTAGTACAGCAACC
AAAGCAGACTATAGGTTCAGAAATGAATAAGGCAAAGGGACCTCTTCCAGAAGGGTTCTT
CGATAATCAGAAGATTGATGATTCTTCGGATAACAAAACCAACAGTGAGCCTAAACAGAG
TCAGACACAGACCACGGGTACTGTGGTGAAAGGAGCTCTTCCCACTGGTTTTTTCGATAA
TAAAGAAGCTGACCTGCTTGCCCGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ13TF U 9
AF RR2DW95TF U 39
AF RR2GX79TF U 1
BS 1 44 RR2GX79TF
BS 45 45 RR2DZ13TF
BS 46 58 RR2GX79TF
BS 59 59 RR2DZ13TF
BS 60 112 RR2GX79TF
BS 113 113 RR2DZ13TF
BS 114 126 RR2GX79TF
BS 127 127 RR2DZ13TF
BS 128 195 RR2GX79TF
BS 196 196 RR2DZ13TF
BS 197 234 RR2GX79TF
BS 235 235 RR2DZ13TF
BS 236 303 RR2GX79TF
BS 304 306 RR2DZ13TF
BS 307 345 RR2GX79TF
BS 346 346 RR2DZ13TF
BS 347 350 RR2GX79TF
BS 351 351 RR2DZ13TF
BS 352 356 RR2GX79TF
BS 357 357 RR2DZ13TF
BS 358 388 RR2GX79TF
BS 389 389 RR2DZ13TF
BS 390 425 RR2GX79TF
BS 426 426 RR2DZ13TF
BS 427 462 RR2GX79TF
BS 463 465 RR2DZ13TF
BS 466 483 RR2GX79TF
BS 484 484 RR2DZ13TF
BS 485 494 RR2GX79TF
BS 495 495 RR2DZ13TF
BS 496 504 RR2GX79TF
BS 505 505 RR2DZ13TF
BS 506 552 RR2GX79TF
BS 553 553 RR2DZ13TF
BS 554 579 RR2GX79TF
BS 580 580 RR2DZ13TF
BS 581 581 RR2GX79TF
BS 582 582 RR2DZ13TF
BS 583 686 RR2GX79TF

RD RR2DZ13TF 652 0 0
GGAACAACGGAAGTAG
GAGTAATTCTGATTCTAACGAACGTTCTAGGTTTTGGTGAAATCTTTCTACTTCGCAGGT
GATGGATGCTCAGGCGAAGAAGAAGGCGCTGTTCCGATCTAAGCTCAACGCCAAGAAGAA
AGACTCCCGCATCGATTCTCCTCTCGTTAGGTACAACGAATCAGATCAGCCTGTGTGTCG
AGTGTGCAATATCGTGTTGAAGTCCGAATCTCTCTGGGATGTCCACCAAGCTTCTCGTAA
GCATCACGAGGCAATCGATAATTTAAAGGCTAGTGCAGCAGCTGGAACTCAACGCGGGAG
CAAACCTGCTGAAACCAAGCCGACCAAACCTGATATATCATCCAAATCTCAGACATCATC
ATCTGCTTCTGGTCTCCCTCCAAATTTCTTCGAGTCTTCTACTAAACATCCTGAAGTTGA
ATCATCAAAACCTAAGAACGTAGTAGTACAGCAACCAAAGCAGACTATAGGTTCAGAAAT
GAATAAGGCAAAGGGACCTCTTCCAGAAGGGTTCTTCGATAATCAGAAGATTGATGATTC
TTCGGATAACAAAACCAACAGTGAGCCTAAACAGAGTCAGACACAGACCACGGGTACTGT
GGTGAAAGGAGCTCTTCCCACTGGTTTTTTCGATAA

QA 17 652 17 652
DS 

RD RR2DW95TF 589 0 0
GG
AACGAACGTTCTAGGTTTTGGTGAAATCTTTCTACTTCGCAGGTGATGGATGCTCAGGCG
AAGAAGAAGGCGCTGTTCCGATCTAAGCTCAACGCCAAGAAGAAAGACTCCCGCATCGAT
TCTCCTCTCGTTAGGTACAACGAATCAGATCAGCCTGTGTGTCGAGTGTGCAATATCGTG
TTGAAGTCCGAATCTCTCTGGGATGTCCACCAAGCTTCTCGTAAGCATCACGAGGCAATC
GATAATTTAAAGGCTAGTGCAGCAGCTGGAACTCAACGCGGGAGCAAACCTGCTGAAACC
AAGCCGACCAAACCTGATATATCATCCAAATCTCAGACATCATCATCTGCTTCTGGTCTC
CCTCCAAATTTCTTCGAGTCTTCTACTAAACATCCTGAAGTTGAATCATCAAAACCTAAG
AACGTAGTAGTACAGCAACCAAAGCAGACTATAGGTTCAGAAATGAATAAGGCAAAGGGA
CCTCTTCCAGAAGGGTTCTTCGATAATCAGAAGATTGATGATTCTTCGGATAACAAAACC
AACAGTGAGCCTAAACAGAGTCAGACACAGACCACGGGTACTGTGGT

QA 3 589 3 589
DS 

RD RR2GX79TF 686 0 0
GGGACGAACAAGGAAACGGAAGGAGAGTAATTCTGATTCTAACGGACGTTCTAGGTTTCG
GTGAAATCTTTCTACTTCGCAGGTGATGGATGCTCAGGCGAAGAAGAAGGCGTTGTTCCG
ATCTAAACTCAACGCCAAGAAGAAAGACTCCCGCATCGATTCTCCTCTCGTTAGGTACAA
CGAATCAGATCAGCCAGTGTGTCGAGTGTGCAATATCGTGTTGAAGTCCGAATCACTCTG
GGATGTCCACCAAGCTTCTCGTAAGCATCACGAGGCAATCGATAATTTAAAGGCTAGTGC
AGC***TGGAACTCAACGCGGGAGCAAACCTGCTGAAACCAAGCCAACCATACCTGCTAT
ATCATCCAAATCTCAGACATCATCATCTTCTTCTGGTCTCCCTCCAAATTTCTTCGAGTC
TTCTATTAAACATCCTGAAGTTGAATCATCAAAACCTAAGAA***AGTAGTACAGCAACC
AAAACAGACTATAGATTCAGAAATAAATAAGGCAAAGGGACCTCTTCCAGAAGGGTTCTT
CGATAATCAGAATATTGATGATTCTTCGGATAACAAAACTACCAGTGAGCCTAAACAGAG
TCAGACACAGACCACGGGTACTGTGGTGAAAGGAGCTCTTCCCACTGGTTTTTTCGATAA
TAAAGAAGCTGACCTGCTTGCCCGTG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 3

CO CL3122Contig1 765 3 10 U
GTCAACCATGTGGTTGGTTCGGATTGGTCGTTATGAAGTGGACGGATATGTCTATAACGC
CTCTGAAGAGCCCAAGATACTCATGACTGGTAAATGGAACGAGTCCATGAGTTATCAGCA
GTGTGATGGTGAAGGTGAACCTCTCCCAGGCACCGAACTAAAGGAGGTCTGGAAACTCGC
TGATGTCCCAAAGGATGACAAATACCAATACACACACTTTGCTCACAAGATCAATAGCTT
TGACACTGCCCCCAAAAAGCTGTTGCCCTCTGATTCACGGTTACGCCCTGATAGATACGC
ACTAGAGATTGGCGACATGTCCAAATCAGGCAATGAGAAGAGCAGCTTGGAAGAGAGACA
GAGAGCAGAGAAGAGAACACGTCAAGAGAAGGGGCAAAGCTTTACTCCCAAGTGGTTTGA
TATAACAGAGGAAGTCACTCCTACACCATGGGGGGATCTTGAAGTTTACCAGTTCAATGG
AAAGTACTTAGAACACCGGGAGGCAGCTGATAAGTCTGAAGATAACACCGACCCTAAGTC
AGTCCCATTCAACCCATGGCAGTTCCAAGACATGTCTACTTGAAATGAATT*GCTCCGGA
AGACAAAAAAGTGATCAAATCTTTTTGGTAACATTTGTTGTAATTCTTATTCTCTCGTAG
TTTCAACAAACTATGCTAGCTTTCTCAAGTTATAGTTTACAACATTTGTTTTTTTCTTTT
CTATTTATTCAAATCACTCTTTCATCCATAATTATATTCTTATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM45TF U 1
AF RR2F874TF U 34
AF RR2DM45JQ C 274
BS 1 186 RR2DM45TF
BS 187 187 RR2F874TF
BS 188 201 RR2DM45TF
BS 202 202 RR2F874TF
BS 203 609 RR2DM45TF
BS 610 610 RR2F874TF
BS 611 674 RR2DM45TF
BS 675 675 RR2DM45JQ
BS 676 729 RR2F874TF
BS 730 765 RR2DM45JQ

RD RR2DM45TF 675 0 0
GTCAACCATGTGGTTGGTTCGGATTGGTCGTTATGAAGTGGACGGATATGTCTATAACGC
CTCTGAAGAGCCCAAGATACTCATGACTGGTAAATGGAACGAGTCCATGAGTTATCAGCA
GTGTGATGGTGAAGGTGAACCTCTCCCAGGCACCGAACTAAAGGAGGTCTGGAAACTCGC
TGATGTTCCAAAGGATGACAAGTACCAATACACACACTTTGCTCACAAGATCAATAGCTT
TGACACTGCCCCCAAAAAGCTGTTGCCCTCTGATTCACGGTTACGCCCTGATAGATACGC
ACTAGAGATTGGCGACATGTCCAAATCAGGCAATGAGAAGAGCAGCTTGGAAGAGAGACA
GAGAGCAGAGAAGAGAACACGTCAAGAGAAGGGGCAAAGCTTTACTCCCAAGTGGTTTGA
TATAACAGAGGAAGTCACTCCTACACCATGGGGGGATCTTGAAGTTTACCAGTTCAATGG
AAAGTACTTAGAACACCGGGAGGCAGCTGATAAGTCTGAAGATAACACCGACCCTAAGTC
AGTCCCATTCAACCCATGGCAGTTCCAAGACATGTCTACTTGAAATGAATT*GCTCCGGA
AGACAAAAA*GTGATCAAATCTTTTTGGTAACATTTGTTGTAATTCTTATTCTCTCGTAG
TTTCAACAAACTAT
G

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2F874TF 696 0 0
G
GAAGTGGACGGATATGTCTATAACGCCTCTGAAGAGCCCAAGATACTCATGACTGGTAAA
TGGAACGAGTCCATGAGTTATCAGCAGTGTGATGGTGAAGGTGAACCTCTCCCAGGCACC
GAGCTAAAGGAGGTCTGGAAACTCGCTGATGTCCCAAAGGATGACAAATACCAATACACA
CACTTTGCTCACAAGATCAATAGCTTTGACACTGCCCCCAAAAAGCTGTTGCCCTCTGAT
TCACGGTTACGCCCTGATAGATACGCACTAGAGATGGGCGACATGTCCAAATCCGGCAAT
GAGAAGAGCAGCTTGGAAGAGAGACAGAGAGCAGAGAAGAGAACACGTCAAGAGAAGGAG
CAAAGCTTTACTCCCAAGTGGTTTGATATAACAGAGGAAGTCACTCCTACACCATGGGGG
GATCTTGAAGTTTACCAGTTCAATGGAAAGTACTTAGAACACCGGGAAGCAGCTGATAAG
TCTGAAGATAACACCGACCCTAAGTCAATCCCATTCAACCCATGGCAATTCCAAGACATG
TCTACTTGAAATGAATTTGCTTCAGAAGACAAAAAAGTGATCAAATCTTTTTGGTAACAT
TTGTTGTAATTCTTATTCTCTCGTAGTTTCAACAAACTATTCTAGCTTTCTCAAGTTATA
GTTTACAACATTTGTTTTTTTCTTTTCTATTTATT

QA 2 696 2 696
DS 

RD RR2DM45JQ 492 0 0
TTCACGGTTACGCCCTGATAGATACGCACTAGAGATTGGCGACATGTCCAAATCAGGCAA
TGAGAAGAGCAGCTTGGAAGAGAGACAGAGAGCAGAGAAGAGAACACGTCAAGAGAAGGG
GCAAAGCTTTACTCCCAAGTGGTTTGATATAACAGAGGAAGTCACTCCTACACCATGGGG
GGATCTTGAAGTTTACCAGTTCAATGGAAAGTACTTAGAACACCGGGAGGCAGCTGATAA
GTCTGAAGATAACACCGACCCTAAGTCAGTCCCATTCAACCCATGGCAGTTCCAAGACAT
GTCTACTTGAAATGAATT*GCTCCGGAAGACAAAAAAGTGATCAAATCTTTTTGGTAACA
TTTGTTGTAATTCTTATTCTCTCGTAGTTTCAACAAACTATGCTAGCTTTCTCAAGTTAT
AGTTTACAACATTTGTTTTTTTCTTTTCTATTTATTCAAATCACTCTTTCATCCATAATT
ATATTCTTATTC

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 2

CO CL3123Contig1 936 2 2 U
GAGAAGCAAATGGTGTTGGACAATTTAAAGGACTATACTGTTAAGGCTCTTGTAAATGCT
GTTGATCACCTGGGTACTGTTGCTTCCAAGCTTACTGATCTCTTTGATCAGCAGAGCTCT
GACATATCAACTATGGAGCTGAGGGCTTCTTGTGTTAGCCAGCAACTGCTTACTTGCCGG
ACTTATATAGACAAAGAAGGTCTTAGACAGCAACAGTTATTAGCAGTTATCCCACTCCAT
CACAAGCACTACATTCTACCTAATTCTGTCAACAAGCGGGTACACTTTAGTCCTCTCAGA
CGATCTGAATCAAGACAGAATCATCACCAAGCTATATCCCGTCTTCAACCTTCAGATGCC
CCTGCTTCGAAATCACTCTCCTGGCATTTAGGCTCAGAGACTAAGTCGACCCTGAAAGGA
ACAACAGCCACTGTTGCACCAAGCTCCAAAGATTCAAAAGCTTTTGCAAAGACAACTGGA
GTGTTCCATCTTTTAGGTGATGAAGAAAACGTAAAGCCTTTGGTCGGAGGTTCTCAAGTC
TCAGGTGTTCCTGCAACTTCTACTATCACAAGGCAGACACAGAAGGATATGGAAGTCCCC
AAACTTGCGACGGCTCACAACCCACGACGAGAGATCATTCAAGCACCTGTAAGGACCAAG
AGCGTTCTATCTGCATTCTTCGTCAAACAGAAAACTCCAAAGCTCAAAGCTGGTTACGTC
TAGTGAAAACAACTCCCCTAAACTGAGAATGAAATTTCAATATCATTCCATCACCTTTCT
TTTATTTTTACCAAAACGTCGTCTTTCCATGTATAAATTTTCTTAGTTCAAACATATCAA
TGTACTAAGTCGTACAAACATGTTCCGTGATTAACAAAACTGTGTAGATCAAGAATAATG
TTGTTTTAAGCAAAGCTTTGGAAGTGCAAAGACGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE72TF U 1
AF RR2EE72JQ C 308
BS 1 581 RR2EE72TF
BS 582 936 RR2EE72JQ

RD RR2EE72TF 581 0 0
GAGAAGCAAATGGTGTTGGACAATTTAAAGGACTATACTGTTAAGGCTCTTGTAAATGCT
GTTGATCACCTGGGTACTGTTGCTTCCAAGCTTACTGATCTCTTTGATCAGCAGAGCTCT
GACATATCAACTATGGAGCTGAGGGCTTCTTGTGTTAGCCAGCAACTGCTTACTTGCCGG
ACTTATATAGACAAAGAAGGTCTTAGACAGCAACAGTTATTAGCAGTTATCCCACTCCAT
CACAAGCACTACATTCTACCTAATTCTGTCAACAAGCGGGTACACTTTAGTCCTCTCAGA
CGATCTGAATCAAGACAGAATCATCACCAAGCTATATCCCGTCTTCAACCTTCAGATGCC
CCTGCTTCGAAATCACTCTCCTGGCATTTAGGCTCAGAGACTAAGTCGACCCTGAAAGGA
ACAACAGCCACTGTTGCACCAAGCTCCAAAGATTCAAAAGCTTTTGCAAAGACAACTGGA
GTGTTCCATCTTTTAGGTGATGAAGAAAACGTAAAGCCTTTGGTCGGAGGTTCTCAAGTC
TCAGGTGTTCCTGCAACTTCTACTATCACAAGGCAGACACA

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2EE72JQ 629 0 0
AATCAAGACAGAATCATCACCAAGCTATATCCCGTCTTCAACCTTCAGATGCCCCTGCTT
CGAAATCACTCTCCTGGCATTTAGGCTCAGAGACTAAGTCGACCCTGAAAGGAACAACAG
CCACTGTTGCACCAAGCTCCAAAGATTCAAAAGCTTTTGCAAAGACAACTGGAGTGTTCC
ATCTTTTAGGTGATGAAGAAAACGTAAAGCCTTTGGTCGGAGGTTCTCAAGTCTCAGGTG
TTCCTGCAACTTCTACTATCACAAGGCAGACACAGAAGGATATGGAAGTCCCCAAACTTG
CGACGGCTCACAACCCACGACGAGAGATCATTCAAGCACCTGTAAGGACCAAGAGCGTTC
TATCTGCATTCTTCGTCAAACAGAAAACTCCAAAGCTCAAAGCTGGTTACGTCTAGTGAA
AACAACTCCCCTAAACTGAGAATGAAATTTCAATATCATTCCATCACCTTTCTTTTATTT
TTACCAAAACGTCGTCTTTCCATGTATAAATTTTCTTAGTTCAAACATATCAATGTACTA
AGTCGTACAAACATGTTCCGTGATTAACAAAACTGTGTAGATCAAGAATAATGTTGTTTT
AAGCAAAGCTTTGGAAGTGCAAAGACGCT

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 3

CO CL3124Contig1 773 3 10 U
GGGCTTACGCGAGTAAGATTCACACTCCATAGAAAATT*GGCGATCAGAGATTCAGCAAA
AAGAAGCCGAAAATCGACGACCAAAATGGCGACTGAAACGCCGCCGGTACACCCCTTCGT
CGCACCGTTATCGTATCTATTGGGAACATGGAGAGGACAAGGCGAAGGTGAATATCCAAC
GATACCTTCCTTCCGCTACGGCGAAGAGATCTGTTTCTCACATTCCGGCAAGCCGGTGAT
AGCTTACACGTAGAAGACATGGAAGTTAGAAATAGGAGACCCGATGCACGCAGAGAGCGG
TTTCTTTCGTCCGAAGCCAGACGGTTCGATCGAAGTCGTTATAGCTCAGAGCTCTGGTCT
CGTCGAAGTCCAGAAAGGAGCTTACAATGTCGATAAGCAAACGATCACACTCAAGAGTGA
GCTTGTCGGAAACGCATCCAAGGTGAAGGAGACAAGCAGAGGATTTGAATTGGTTGATGG
AAAGCTATCGTACGTTGTTCATATGAGTACAAACACACAGCATCTTCAACCTCATCTCAA
AGCCACTCTCGAAAAGCTTTGAAACACTTGCTTGCTGCTGATTCTGTTGATTTTCACCAC
CGTTTAAGAACATTTTGATTTGATACTCCTTTAGTATTGAGTCGGACAATTTGAGAGCTT
AACGGGCCTTTCGAAAAACAGTGAAAAGGACCTTTAAGTTACTCTATAAGGTCAAAAGTG
ATTTGAGTCTGTTCTGTTAGGCCCGGCCCATATTCTTCAGTTCATTCAAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU91TF U 29
AF RR2BN31JQ C 1
AF RR2BN31TF U 1
BS 1 677 RR2BN31TF
BS 678 678 RR2BN31JQ
BS 679 699 RR2BN31TF
BS 700 700 RR2BN31JQ
BS 701 710 RR2BN31TF
BS 711 711 RR2BN31JQ
BS 712 716 RR2BN31TF
BS 717 717 RR2BN31JQ
BS 718 736 RR2BN31TF
BS 737 773 RR2BN31JQ

RD RR2DU91TF 627 0 0
ATAGAAAATTCGGCGATCAGAGATTCAGCAAAAAGAAGCCGAAAATCGACGACCAAAATG
GCGACGGAAACGCCGCCGGTACACCCCTTCGTCGCACCGTTATCGTATCTATTGGGAACA
TGGAGAGGACAAGGCGAAGGTGAATATCCAACGATACCTTCCTTCCGCTACGGCGAAGAG
ATCTGTTTCTCACATTCCGGCAAACCGGTGATAGCTTACACGCAGAAGACATGGAAGTTA
GAAACAGGAGACCCGATGCACGCAGAGAGCGGTTTCTTTCGTCCGAAGCCAGACGGTTCG
ATCGAAGTCGTTATAGCTCAGAGCTCTGGTCTCGTCGAAGTCCAGAAAGGAGCTTACAAT
GTCGATAAGCAAACGATCACACTCAAGAGTGAGCTTGTCGGAAACGCATCCAAGGTGAAG
GAGACAAGCAGAGGATTTGAATTGGTTGATGGAAAGCTATCGTACGTTGTTCATATGAGT
ACAAACACACAGCATCTTCAACCTCATCTCAAAGCCACTCTCGAAAAGCTTTGAAACACT
TGCTTGCTGCTGATTCTGTTGATTTTCACCACCGTTTAAGAACATTTTGATTTGATACTC
CTTTAGTATTGAGTCGGACAATTTGAG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2BN31JQ 773 0 0
GGGCTTACGCGAGTAAGAT*CACACTCCATAGAAAATT*GGCGATCAGAGATTCAGCAAA
A*GAAGCCGAAAATCGACGACCAAAATGGCGACTGAAACGCCGCCGGTACACCCCTTCGT
CGCACCGTTATCGTATCTATTGGGAACATGGAGAGGACAAGGCGAAGGTGAATATCCAAC
GATACCTTCCTTCCGCTACGGCGAAGAGATCTGTTTCTCACATTCCGGCAAGCCGGTGAT
AGCTTACACGTAGAAGACATGGAAGTTAGAAATAGGAGACCCGATGCACGCAGAGAGCGG
TTTCTTTCGTCCGAAGCCAGACGGTTCGATCGAAGTCGTTATAGCTCAGAGCTCTGGTCT
CGTCGAAGTCCAGAAAGGAGCTTACAATGTCGATAAGCAAACGATCACACTCAAGAGTGA
GCTTGTCGGAAACGCATCCAAGGTGAAGGAGACAAGCAGAGGATTTGAATTGGTTGATGG
AAAGCTATCGTACGTTGTTCATATGAGTACAAACACACAGCATCTTCAACCTCATCTCAA
AGCCACTCTCGAAAAGCTTTGAAACACTTGCTTGCTGCTGATTCTGTTGATTTTCACCAC
CGTTTAAGAACATTTTGATTTGATACTCCTTTAGTATTGAGTCGGACAATTTGAGAGCTT
AACGGGCCTTTCGAAAAACAGTGAAAAGGACCTTTAAGTTACTCTATAAGGTCAAAAGTG
ATTTGAGTCTGTTCTGTTAGGCCCGGCCCATATTCTTCAGTTCATTCAAAAAA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2BN31TF 736 0 0
GGGCTTACGCGAGTAAGATTCACACTCCATAGAAAATT*GGCGATCAGAGATTCAGCAAA
AAGAAGCCGAAAATCGACGACCAAAATGGCGACTGAAACGCCGCCGGTACACCCCTTCGT
CGCACCGTTATCGTATCTATTGGGAACATGGAGAGGACAAGGCGAAGGTGAATATCCAAC
GATACCTTCCTTCCGCTACGGCGAAGAGATCTGTTTCTCACATTCCGGCAAGCCGGTGAT
AGCTTACACGTAGAAGACATGGAAGTTAGAAATAGGAGACCCGATGCACGCAGAGAGCGG
TTTCTTTCGTCCGAAGCCAGACGGTTCGATCGAAGTCGTTATAGCTCAGAGCTCTGGTCT
CGTCGAAGTCCAGAAAGGAGCTTACAATGTCGATAAGCAAACGATCACACTCAAGAGTGA
GCTTGTCGGAAACGCATCCAAGGTGAAGGAGACAAGCAGAGGATTTGAATTGGTTGATGG
AAAGCTATCGTACGTTGTTCATATGAGTACAAACACACAGCATCTTCAACCTCATCTCAA
AGCCACTCTCGAAAAGCTTTGAAACACTTGCTTGCTGCTGATTCTGTTGATTTTCACCAC
CGTTTAAGAACATTTTGATTTGATACTCCTTTAGTATTGAGTCGGACAATTTGAGAGCTT
AACGGGCCTTTCGAAAA*CAGTGAAAAGGACCTTTAAGT*ACTCTATAAG*TCAAA*GTG
ATTTGAGTCTGTTCTG

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 3

CO CL3125Contig1 1071 3 10 U
GGACAAATAAGCCAATGTATGGACCTTTGGGAGGAAGAGTTTGTACAATCTCTTTGTTTA
AACGCCAAGGCAGTTGTTTGTTTGGTCTCTTGTCACGTCACAAACTTAGTTTCTGGTTTT
CTTTATGGCTTCAATAGCCAAAACATCATAATACCCTTGACGACATAAAACCTCATGGCC
TTGTCATGTAAGTGCCAAAAAAACAAATATAACAAAAAGACAAACAATCACGCTCTCTCA
ACGATTCATGATTCTGTCTTCTTATCATTACCTCGAAAAAGCTTTAGTTTGAATCCTCAA
ATGGAGGCAAACCCCACTCCTCTGGTTTGAAATCGAGTAAAGAAGTCATGATTTGATCTG
CAACGTCTTGGTGAGAGATATCCAGTCTAGGATCTGGCACCATCACCACGTTCATTCCGG
CGTTTTTAGCAGCAAGAACTCCGGATGGAGCATCTTCAAATACCAGAACCTTTTGTGGGT
CAACAGGACCGTCCTTAAATCTCCTGGATGCAGCGAGAAAGCCGTCAGGGGCAGGCTTTC
CTTGCTTCACCTCAGGATCATCACCGCGAACTACGTGATGCATCAGTGAGAACAACTCTT
TGTGTCTTTGTGTTTTTAAATCAAAGTGACGTGTGTGAGTTCCCGTAGCAATACAAATTG
GAATGTTGTTAGCATGGAGATGCTTGATGAGCCTGCTAGCCCCTGGCATAAGCTCACTAG
TAGGGAAGAGTTCTTGAAGCATGGCCTCTCTCTCGACAAGGAAGTCCTCAGCTGAAAGAG
AATCGCTAATCCCGCTTTCGTCAACAAAGATCCTGGCAGCTTCGATGGCTTTTCTTCCCA
TCATCTTAGCCTTGAGAGACCAGTCAAAAGTCTTGTTGAATCTAGCAAGTATGATCTCCT
GTACCTCCGTGTAAAACTTCTCCGTGTCGAGAAGAAGACCGTCCATGTCGAAGATCACGT
GGGTGATCGATCCTCTGCCGGCGGTCGCGGGAGTCGACATTGATACTACGACTCCGGTGG
ATCTACGCTTAGATATCTAATGGTTTCTACTTTCTTGGAGCCGACGCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
0 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FV25JQ U 43
AF RR2ER62JQ U 1
AF RR2ER62TF C 308
BS 1 51 RR2ER62JQ
BS 52 52 RR2FV25JQ
BS 53 64 RR2ER62JQ
BS 65 65 RR2FV25JQ
BS 66 122 RR2ER62JQ
BS 123 125 RR2FV25JQ
BS 126 277 RR2ER62JQ
BS 278 278 RR2FV25JQ
BS 279 718 RR2ER62JQ
BS 719 1071 RR2ER62TF

RD RR2FV25JQ 538 0 0
GTACAATCTCTTTGTTTAAACGCCAAGGCAGTTGTTTGTTTGGTCTCTTGTCACGTCGCA
AACTTAGTTTCTGTTTTTTTTTATGGCTTCAATAGCCAAAACATCATAATACCCTTGACG
ACATAAAACCTCATGGCCTTGTCATGTAAGTGCCAAAAAAACAAATATAACAAAAAGACA
AACAATCACGCTCTCTCAACGATTCATGATTCTGTCTTCTTATCATTACCTCGAAAAAGC
TTTAGTTTGAATCCTCAAATGGAGGCAAACCCCATTCCTCTGGTTTGAAATCCAGTAGAG
GAGTCATGATTTGATCTGCAACGTCTTGGTGAGATATATCTAGTCTAGGATCTGGCACCA
TCACCACGTTCATTCCGGCGTTTTTAGCAACAAGAACTCCGGATGGAGCATCTTCAAATA
CCAAAACCTTTTGTGGGTCAACAGGACCGTCCTTAAATCTCCTGGATGCAGCGAGAAAGC
CGTCAGGGGCAGGCTTTCCTTGCTTCACCTCAGGATCATCACCGCGAACTACGTGATG

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2ER62JQ 718 0 0
GGACAAATAAGCCAATGTATGGACCTTTGGGAGGAAGAGTTTGTACAATCTTTTTGTTTA
AACGTCAAGGCAGTTGTTTGTTTGGTCTCTTGTCACGTCACAAACTTAGTTTCTGGTTTT
CT***TGGCTTCAATAGCCAAAACATCATAATACCCTTGACGACATAAAACCTCATGGCC
TTGTCATGTAAGTGCCAAAAAAACAAATATAACAAAAAGACAAACAATCACGCTCTCTCA
ACGATTCATGATTCTGTCTTCTTATCATTACCTCGAAGAAGCTTTAGTTTGAATCCTCAA
ATGGAGGCAAACCCCACTCCTCTGGTTTGAAATCGAGTAAAGAAGTCATGATTTGATCTG
CAACGTCTTGGTGAGAGATATCCAGTCTAGGATCTGGCACCATCACCACGTTCATTCCGG
CGTTTTTAGCAGCAAGAACTCCGGATGGAGCATCTTCAAATACCAGAACCTTTTGTGGGT
CAACAGGACCGTCCTTAAATCTCCTGGATGCAGCGAGAAAGCCGTCAGGGGCAGGCTTTC
CTTGCTTCACCTCAGGATCATCACCGCGAACTACGTGATGCATCAGTGAGAACAACTCTT
TGTGTCTTTGTGTTTTTAAATCAAAGTGACGTGTGTGAGTTCCCGTAGCAATACAAATTG
GAATGTTGTTAGCATGGAGATGCTTGATGAGCCTGCTAGCCCCTGGCATAAGCTCACT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2ER62TF 764 0 0
CAAACCCCACTCCTCTG*TTTGAA*TCGAGTAAAGAAGTCATGATT*GATCTGCAACGTC
TTGGTGAGAGATATCCAGTCTAGGATCTGGCACCATCACCACGTTCAT*CCGGCGTTTTT
AGCAGCAAGAACTCCGGATGGAGCATCTTCAAATACCAGAACCTTTTGTGGGTCAACAGG
ACCGTCCTTAAATCTCCTGGATGCAGCGAGAAAGCCGTCAGGGGCAGGCTTTCCTTGCTT
CACCTCAGGATCATCACCGCGAACTACGTGATGCATCAGTGAGAACAACTCTTTGTGTCT
TTGTGTTTTTAAATCAAAGTGACGTGTGTGAGTTCCCGTAGCAATACAAATTGGAATGTT
GTTAGCATGGAGATGCTTGATGAGCCTGCTAGCCCCTGGCATAAGCTCACTAGTAGGGAA
GAGTTCTTGAAGCATGGCCTCTCTCTCGACAAGGAAGTCCTCAGCTGAAAGAGAATCGCT
AATCCCGCTTTCGTCAACAAAGATCCTGGCAGCTTCGATGGCTTTTCTTCCCATCATCTT
AGCCTTGAGAGACCAGTCAAAAGTCTTGTTGAATCTAGCAAGTATGATCTCCTGTACCTC
CGTGTAAAACTTCTCCGTGTCGAGAAGAAGACCGTCCATGTCGAAGATCACGTGGGTGAT
CGATCCTCTGCCGGCGGTCGCGGGAGTCGACATTGATACTACGACTCCGGTGGATCTACG
CTTAGATATCTAATGGTTTCTACTTTCTTGGAGCCGACGCTGTC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL3126Contig1 599 2 4 U
GGAGGAAAGCTCTGCAGGCAACCAAGATTGAGGAGAGGAAGGTTGACACCAAAGTCTTTG
AGACCATGCAACAGCTCTCAAGCAAAAAGAGCAACAATGATGAGGTCTTCATCAAACTGG
GAACAGACAAGGACAAGCGCCCAGCTGAGAAGGAAGAGAAGACCAAGAAGTCGTTGAGCA
TAAACGAGTTTCTGAAACCTGCCAATGGAGAGAGGTACGGAGGTGGTTACCGTGGTGGAA
GAGGAGGTCGTGGACCAAGAGGAGCTGATGAGGGAGGTCGTGGACCAAGAGGTGGAGCCG
AAGGTGGTCGTGGACCAAAAGGAGGAGCTGACAGAAAGCCTGCTGCACCTGCACCAAAGA
TTGAAGACGCTGCACACTTCCCTACTCTGGGAAAGTAAAGCTCTCTTGGTTTGGTCCTTC
AGCCCCCGTTTGGTCTGGTCTGCTTTTGTTTTTGTAATCTCTCACCCGGTTCCCTTTTTG
TTCTTCTGATTTCATTGTTATCGTCATACTTGCTGAAGGCTTTTTGTTCTACGAACCCAT
GTTTTGGGATTTTTTTTGCTAAGTTAAATGAGGCAGAAAAAAAAATCAGTTCTCCATCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FP65JQ C 1
AF RR2FP65TF U 1
BS 1 1 RR2FP65JQ
BS 2 584 RR2FP65TF
BS 585 585 RR2FP65JQ
BS 586 599 RR2FP65TF

RD RR2FP65JQ 599 0 0
GGAGGAAAGCTCTGCAGGCAACCAAGATTGAGGAGAGGAAGGTTGACACCAAAGTCTTTG
AGACCATGCAACAGCTCTCAAGCAAAAAGAGCAACAATGATGAGGTCTTCATCAAACTGG
GAACAGACAAGGACAAGCGCCCAGCTGAGAAGGAAGAGAAGACCAAGAAGTCGTTGAGCA
TAAACGAGTTTCTGAAACCTGCCAATGGAGAGAGGTACGGAGGTGGTTACCGTGGTGGAA
GAGGAGGTCGTGGACCAAGAGGAGCTGATGAGGGAGGTCGTGGACCAAGAGGTGGAGCCG
AAGGTGGTCGTGGACCAAAAGGAGGAGCTGACAGAAAGCCTGCTGCACCTGCACCAAAGA
TTGAAGACGCTGCACACTTCCCTACTCTGGGAAAGTAAAGCTCTCTTGGTTTGGTCCTTC
AGCCCCCGTTTGGTCTGGTCTGCTTTTGTTTTTGTAATCTCTCACCCGGTTCCCTTTTTG
TTCTTCTGATTTCATTGTTATCGTCATACTTGCTGAAGGCTTTTTGTTCTACGAACCCAT
GTTTTGGGATTTTTTTTGCTAAGTTAAATGAGGCAGAAAAAAAAATCAGTTCTCCATCC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2FP65TF 599 0 0
G
GAGGAAAGCTCTGCAGGCAACCAAGATTGAGGAGAGGAAGGTTGACACCAAAGTCTTTGA
GACCATGCAACAGCTCTCAAGCAAAAAGAGCAACAATGATGAGGTCTTCATCAAACTGGG
AACAGACAAGGACAAGCGCCCAGCTGAGAAGGAAGAGAAGACCAAGAAGTCGTTGAGCAT
AAACGAGTTTCTGAAACCTGCCAATGGAGAGAGGTACGGAGGTGGTTACCGTGGTGGAAG
AGGAGGTCGTGGACCAAGAGGAGCTGATGAGGGAGGTCGTGGACCAAGAGGTGGAGCCGA
AGGTGGTCGTGGACCAAAAGGAGGAGCTGACAGAAAGCCTGCTGCACCTGCACCAAAGAT
TGAAGACGCTGCACACTTCCCTACTCTGGGAAAGTAAAGCTCTCTTGGTTTGGTCCTTCA
GCCCCCGTTTGGTCTGGTCTGCTTTTGTTTTTGTAATCTCTCACCCGGTTCCCTTTTTGT
TCTTCTGATTTCATTGTTATCGTCATACTTGCTGAAGGCTTTTTGTTCTACGAACCCATG
TTTTGGGATTTTTTTTGCTAAGTTAAATGAGGCAGAAAAAAAA*TCAGTTCTCCATCC

QA 2 599 2 599
DS 



AS 1 2

CO CL3127Contig1 853 2 6 U
GGATATCTCTCCATCTCTCTCTCACGCCAGATTTCAATCATCGACTCGATTTCAGATCCG
AGATACAAACTCCGAACATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTCCCTTCTTCGGCT
TCCTCGGCGCCGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCATACGGAACAGCAA
AGAGTGGTGTAGGTGTGGCTTCGATGGGAGTGATGAGACCCGAGCTTGTGATGAAATCCA
TCGTCCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCA
TCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGACGTATACGCACATC
TCTCCTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTTTCCGCTGGAATGGCCATTGGTATTG
TGGGTGATGCTGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTC
TTATCCTTATTTTCGCTGAAGCGCTTGCTCTTTATGGGCTTATTGTAGGTATCATCCTTT
CCTCTAGAGCTGGTCAGTCTAGAGCTGAATGAGAAAGTTATCTCAAGATTTACCCGAATT
GTGATACATCGTTTACTTTCTGTGTGCGTTCTTTAGTATGTATCATCGAAACTGAAACAT
TTACTGGATTCTTGGAGCTTTGTTTCAGAAACAAAACCAGCTATGGGTTATTTATTGTTT
GGTTATGTAATAAAGAGCTCAGAGCAGCTTTGATTTTTTTTGTATTCTTGTATTGTCCTG
AGGAATTTAAAATACATTTATTTGTAAAGAAGTATGCTTTCTGAAACCATCTTGAATCGT
ATGAAATGTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G838TF U 1
AF RR2G838JQ C 502
BS 1 695 RR2G838TF
BS 696 696 RR2G838JQ
BS 697 729 RR2G838TF
BS 730 730 RR2G838JQ
BS 731 754 RR2G838TF
BS 755 853 RR2G838JQ

RD RR2G838TF 754 0 0
GGATATCTCTCCATCTCTCTCTCACGCCAGATTTCAATCATCGACTCGATTTCAGATCCG
AGATACAAACTCCGAACATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTCCCTTCTTCGGCT
TCCTCGGCGCCGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCATACGGAACAGCAA
AGAGTGGTGTAGGTGTGGCTTCGATGGGAGTGATGAGACCCGAGCTTGTGATGAAATCCA
TCGTCCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCA
TCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGACGTATACGCACATC
TCTCCTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTTTCCGCTGGAATGGCCATTGGTATTG
TGGGTGATGCTGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTC
TTATCCTTATTTTCGCTGAAGCGCTTGCTCTTTATGGGCTTATTGTAGGTATCATCCTTT
CCTCTAGAGCTGGTCAGTCTAGAGCTGAATGAGAAAGTTATCTCAAGATTTACCCGAATT
GTGATACATCGTTTACTTTCTGTGTGCGTTCTTTAGTATGTATCATCGAAACTGAAACAT
TTACTGGATTCTTGGAGCTTTGTTTCAGAAACAAA*CCAGCTATGGGTTATTTATTGTTT
GGTTATGTA*TAAAGAGCTCAGAGCAGCTTTGAT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2G838JQ 352 0 0
CGCTTGCTCTTTATGGGCTTATTGTAGGTATCATCCTTTCCTCTAGAGCTGGTCAGTCTA
GAGCTGAATGAGAAAGTTATCTCAAGATTTACCCGAATTGTGATACATCGTTTACTTTCT
GTGTGCGTTCTTTAGTATGTATCATCGAAACTGAAACATTTACTGGATTCTTGGAGCTTT
GTTTCAGAAACAAAACCAGCTATGGGTTATTTATTGTTTGGTTATGTAATAAAGAGCTCA
GAGCAGCTTTGATTTTTTTTGTATTCTTGTATTGTCCTGAGGAATTTAAAATACATTTAT
TTGTAAAGAAGTATGCTTTCTGAAACCATCTTGAATCGTATGAAATGTCTGC

QA 1 352 1 352
DS 



AS 1 2

CO CL3128Contig1 483 2 2 U
GGAGCGGAGGACGACGACGGCACGAGCTTTCACCGAAGAGCGAAAATGGTGAACATTCCC
AAGACTAAGAAGACTTACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTACACAAGGTC
ACCCAGTACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTTGTTATGACCGC
AAACAATCCGGTTACGGTGGTCAGACCAAGCCCGTTTTCCACAAGAAGGCTAAGACAACC
AAGAAGATTGTCTTGAGGCTCCAGTGCCAAACATGCAAGCATTTCTCCCAACACTCGATT
AAGAGGTGCAAGCACTTCGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACATCTCTCTTT
TAAGTTTTCTCCTCGTTATCTACTTTCTTTTTTTGTTTGTTACTACTCTTTTGCTTCGAT
ACTTGAATACATTTTGAATCTTCCAGAAATGGTTATCAGGTTTAATTTAGACAATATTTT
CGT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2FQ78JQ C 1
AF RR2FQ78TF U 1
BS 1 5 RR2FQ78JQ
BS 6 483 RR2FQ78TF

RD RR2FQ78JQ 483 0 0
GGAGCGGAGGACGACGACGGCACGAGCTTTCACCGAAGAGCGAAAATGGTGAACATTCCC
AAGACTAAGAAGACTTACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTACACAAGGTC
ACCCAGTACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTTGTTATGACCGC
AAACAATCCGGTTACGGTGGTCAGACCAAGCCCGTTTTCCACAAGAAGGCTAAGACAACC
AAGAAGATTGTCTTGAGGCTCCAGTGCCAAACATGCAAGCATTTCTCCCAACACTCGATT
AAGAGGTGCAAGCACTTCGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACATCTCTCTTT
TAAGTTTTCTCCTCGTTATCTACTTTCTTTTTTTGTTTGTTACTACTCTTTTGCTTCGAT
ACTTGAATACATTTTGAATCTTCCAGAAATGGTTATCAGGTTTAATTTAGACAATATTTT
CGT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR2FQ78TF 483 0 0
GGAGC
GGAGGACGACGACGGCACGAGCTTTCACCGAAGAGCGAAAATGGTGAACATTCCCAAGAC
TAAGAAGACTTACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTACACAAGGTCACCCA
GTACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTTGTTATGACCGCAAACA
ATCCGGTTACGGTGGTCAGACCAAGCCCGTTTTCCACAAGAAGGCTAAGACAACCAAGAA
GATTGTCTTGAGGCTCCAGTGCCAAACATGCAAGCATTTCTCCCAACACTCGATTAAGAG
GTGCAAGCACTTCGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACATCTCTCTTTTAAGT
TTTCTCCTCGTTATCTACTTTCTTTTTTTGTTTGTTACTACTCTTTTGCTTCGATACTTG
AATACATTTTGAATCTTCCAGAAATGGTTATCAGGTTTAATTTAGACAATATTTTCGT

QA 6 483 6 483
DS 



AS 1 2

CO CL3129Contig1 715 2 9 U
GGCTAATTCCACATGATTCCATTCATAAAAATGCAATCCAGTTACAGCCTTACTCTACTC
ATCCAGTTGATGAACTCAACTGCCAAAACGGGCAACTCTTTTTGTCTAATCCGTTCATAT
GTTTACTTCCAAGAATGGAGTTCTGTTGTTAGCTTCGTCTTGTCCCGGCTTAGTTGATCG
CTTCTCCATACTTGTGTCATCTTCACTGAGAATATTCTTCGAAAACGAAGTCCTCATCTC
CTCAATGGACGCCAAGCTCGGAACAATTATAGGTAGTTTCTTTGGCGTCTCGTTCTTGCG
CTGATCGACCTGATAGTCTTTAATGAGAGACTGTTCTGCTTTGTCTCTAATGTTTGATAC
AGCTTGTCCATGCTTCTCTTGCAACAACGTGACATGCTTCATGGAAGTATCCACTATAGC
ATCCGTTGCTTCTTTGTTCTCGCGGTCTTGCATCAACGAGTCATTAACAGCTGCGTGAAG
TTCATTAGTCCTAGTGACAAAGTTAGCATCCAATGTGGAGAATGTAGATGCAAACTCATC
GTGCATCTTGTCATTTTCTTTCGCCATGTCCCCCATTGTGACTTTGAGTTCTTGTTGGTA
CTTAGTGTTAAGGTTCTTTACGCCTGTTTCAGTGGTTTCCCACAGTTTTCTAGACTCATT
GGCCCTTCCCAAGCAATCTTCAAGGTAATGGTCCATGACTGTGATAGACTCTGCT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E043JQ U 1
AF RR2BK90JQ U 1
BS 1 179 RR2BK90JQ
BS 180 180 RR2E043JQ
BS 181 189 RR2BK90JQ
BS 190 190 RR2E043JQ
BS 191 261 RR2BK90JQ
BS 262 262 RR2E043JQ
BS 263 393 RR2BK90JQ
BS 394 394 RR2E043JQ
BS 395 715 RR2BK90JQ

RD RR2E043JQ 616 0 0
GA
CTAATTCCACATGATTCTATTCATAAAAATGCAATCCAGTTACAGCCTTACTCTACTCAT
CCAGTTGATGAACTCAACTGCCAAAACGGGCAACTCTTTTTGTCTAATCCGTTCATATGT
TTACTTCCAAGAATGGAGTTCTGTTGTTAGCTTCGTCTTGTCCCGGCTTAGTTGATCGCT
TCTCCATACTTGTGTCATCTTCACTGAGAATATTCTTCGAAAACGAAGTCCTCATCTCCT
CAATGGACGCCAAGCTCGGAACAATTATAGGTAGTTTCTTTGGCGTCTCGTTCTTGCGCT
GATCGACCTGATAGTCTTTTATGAGAGACTGTTCTGCTTTGTCTCTAATGTTTGATACAG
CTTGTCCATGCTTCTCTTGCAATAACGTGACATGCTTCATGGAAGTCTCCACTATAGCAT
CCGTTGCTTCTTTGTTCTCGCGGTTTTGCATCAACGAGTCATTAACAGCTGCGTGAAGTT
CATTAGTCCTAGTGGCAAAGTTAGCATCCAATGTGGGGAATGTAGATGCAAACTCATCGT
GCATCTTGTCATTTTCTTTCGCCATGTCCCCCATTGTGACTTTGAGTTCTTGTTGGTACT
TAGTGTTAAGGTTC

QA 3 616 3 616
DS 

RD RR2BK90JQ 715 0 0
GGCTAATTCCACATGATTCCATTCATAAAAATGCAATCCAGTTACAGCCTTACTCTACTC
ATCCAGTTGATGAACTCAACTGCCAAAACGGGCAACTCTTTTTGTCTAATCCGTTCATAT
GTTTACTTCCAAGAATGGAGTTCTGTTGTTAGCTTCGTCTTGTCCCGGCTTAGTTGATCT
CTTCTCCATGCTTGTGTCATCTTCACTGAGAATATTCTTCGAAAACGAAGTCCTCATCTC
CTCAATGGACGCCAAGCTCGGCACAATTATAGGTAGTTTCTTTGGCGTCTCGTTCTTGCG
CTGATCGACCTGATAGTCTTTAATGAGAGACTGTTCTGCTTTGTCTCTAATGTTTGATAC
AGCTTGTCCATGCTTCTCTTGCAACAACGTGACCTGCTTCATGGAAGTATCCACTATAGC
ATCCGTTGCTTCTTTGTTCTCGCGGTCTTGCATCAACGAGTCATTAACAGCTGCGTGAAG
TTCATTAGTCCTAGTGACAAAGTTAGCATCCAATGTGGAGAATGTAGATGCAAACTCATC
GTGCATCTTGTCATTTTCTTTCGCCATGTCCCCCATTGTGACTTTGAGTTCTTGTTGGTA
CTTAGTGTTAAGGTTCTTTACGCCTGTTTCAGTGGTTTCCCACAGTTTTCTAGACTCATT
GGCCCTTCCCAAGCAATCTTCAAGGTAATGGTCCATGACTGTGATAGACTCTGCT

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL3130Contig1 731 2 6 U
GGGAAAAGAAGAAAAAAAGAAAATAATTAATTAAAAAAGAAAACAAAAAAAAACACTTTT
ACTTTGTTTTGTTATTTCATCTTGTTTTCTTTTATTGAAAAACATGGCAAGGATTTCACT
AGGGTTGTGTCTGATGTTAGTAGTAACATCAAGTGTGATTTATGAAGCGCAAGGACATTT
CTTGTTGAAGAATTACTTGACGACTCAGTTTCCAAGCAAGAGCAACGAATTTGCGCCATA
CGCTAAGAAGGGTTTGACAGAGTTCTTGACCGACCTTGAACGTGTTTGTCCACCGACTCC
AGAGTTCAAAGGTTTCTTCACAGAATGCAGGTCTTACATGAGCTCCATCCAAACGTCATC
GTCATCGTCATCGTCATCGTCCTCGTCCTCCTCATCACAAAACATGGACGGGCTTACGAA
AGCTGTGTCTGCAATAAGTGGTGGTGCAGGCCAACAATCTGCGGAAGCAGGGAGTTTCAA
ATCTACCATGGCCTCTATGGCAAAGACTTTGGTTGAGCAGAAACAGAGCACAAAGACGAT
AACGTCTACTGAAAAGAAAACTCTAGTCACATCAATGGTGCAGTGGACTAGATCGATTGC
TACAGTCGTGAAGACAGCAGCTGAGAAGAAAGGAAAGAAAGTGGATATAAACTCTTTTGG
ACTTGATGTTGATGTCAATGACAAATCTATCATGACTGTTAGTGGAAGCAGCCATAGTAG
CTCTTCATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM12TF U 1
AF RR2D355JQ C 5
BS 1 42 RR2DM12TF
BS 43 44 RR2D355JQ
BS 45 80 RR2DM12TF
BS 81 81 RR2D355JQ
BS 82 518 RR2DM12TF
BS 519 731 RR2D355JQ

RD RR2DM12TF 518 0 0
GGGAAAAGAAGAAAAAAAGAAAATAATTAATTAAAAAAGAAACGAAAAAAAAACACTTTT
ACTTTGTTTTGTTATTTCATTTTGTTTTCTTTTATTGAAAAACATGGCAAGGATTTCACT
AGGGTTGTGTCTGATGTTAGTAGTAACATCAAGTGTGATTTATGAAGCGCAAGGACATTT
CTTGTTGAAGAATTACTTGACGACTCAGTTTCCAAGCAAGAGCAACGAATTTGCGCCATA
CGCTAAGAAGGGTTTGACAGAGTTCTTGACCGACCTTGAACGTGTTTGTCCACCGACTCC
AGAGTTCAAAGGTTTCTTCACAGAATGCAGGTCTTACATGAGCTCCATCCAAACGTCATC
GTCATCGTCATCGTCATCGTCCTCGTCCTCCTCATCACAAAACATGGACGGGCTTACGAA
AGCTGTGTCTGCAATAAGTGGTGGTGCAGGCCAACAATCTGCGGAAGCAGGGAGTTTCAA
ATCTACCATGGCCTCTATGGCAAAGACTTTGGTTGAGC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2D355JQ 727 0 0
AAAGAAG
AAAAAAAGAAAATAATTAATTAAAAAAGAAAACGAAAAAAAACACTTTTACTTTGTTTTG
TTATTTCATCTTGTTTTCTTTTATTGAAAAACATGGCAAGGATTTCACTAGGGTTGTGTC
TGATGTTAGTAGTAACATCAAGTGTGATTTATGAAGCGCAAGGACATTTCTTGTTGAAGA
ATTACTTGACGACTCAGTTTCCAAGCAAGAGCAACGAATTTGCGCCATACGCTAAGAAGG
GTTTGACAGAGTTCTTGACCGACCTTGAACGTGTTTGTCCACCGACTCCAGAGTTCAAAG
GTTTCTTCACAGAATGCAGGTCTTACATGAGCTCCATCCAAACGTCATCGTCATCGTCAT
CGTCATCGTCCTCGTCCTCCTCATCACAAAACATGGACGGGCTTACGAAAGCTGTGTCTG
CAATAAGTGGTGGTGCAGGCCAACAATCTGCGGAAGCAGGGAGTTTCAAATCTACCATGG
CCTCTATGGCAAAGACTTTGGTTGAGCAGAAACAGAGCACAAAGACGATAACGTCTACTG
AAAAGAAAACTCTAGTCACATCAATGGTGCAGTGGACTAGATCGATTGCTACAGTCGTGA
AGACAGCAGCTGAGAAGAAAGGAAAGAAAGTGGATATAAACTCTTTTGGACTTGATGTTG
ATGTCAATGACAAATCTATCATGACTGTTAGTGGAAGCAGCCATAGTAGCTCTTCATCCC

QA 8 727 8 727
DS 



AS 1 3

CO CL3131Contig1 834 3 7 U
TTCTCTCTCTCTCTATCAAACCAGAAGAAGAAAGATAGAAGATGGCTTCGCCGAGCAAAC
GCCGAGAGATGGACATGATGAAATTGATGATGAGTGATTACAAGGTCGATACAATCAACG
ACGATTTGCATATGTTCTATGTCACTTTCCATGGCCCCACTGACAGTCTTTATGAAGGAG
GTGTATGGAAGATCAAAGTCGAACTTCCTGATGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCTGTTG
GTTTCGTTAACAAGATTTATCACCCCAATGTTGATGAATCTTCTGGCGCAGTTTGCTTAG
ATGTAATAAACCAGACATGGAGTCCAATGTTTGATCTTATCAATGTCTTCGAGTCATTCC
TTCCGCAACTGCTTCTATATCCAAACCCATCTGATCCTTTCAATGGAGAAGCTGCCTCTC
TCTTGATGCGGGACCGTCCTGCCTATGAGCTGAAAGTCAAAGAATATTGCAAGAGATATG
CTAAACCAGAAGACATAGGAGCACCTGAGGAGATCTCAAGTGATGATGATGATGATGATA
GCATGAGCGAACGTGGTTCAGACTCTGATGACAACGATGAAATTGCTGGAAAAGCTGATC
CTTGATGACTTCGTCACAAATCAAATCTCTCTTTGTACTTTGATTTATTAGTCTGTTTCC
AAAAATATAAACCATTGATGTTCATTGCATGGGAGGAGATAAAAACTTTCCTCTGTAAAT
GTGTAAAAACTTGTTTTAATTCTTTAGGATCATTGAAACTTTCATTTGCTTCAAATGTAA
ATAACATATAACAATTTGCAACCTTACTACAATAAAACATGAATTCATCTCTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB57TF U 1
AF RR2BG40TF U 1
AF RR2AB57JQ C 56
BS 1 747 RR2AB57TF
BS 748 748 RR2BG40TF
BS 749 774 RR2AB57TF
BS 775 800 RR2BG40TF
BS 801 801 RR2AB57JQ
BS 802 811 RR2BG40TF
BS 812 834 RR2AB57JQ

RD RR2AB57TF 776 0 0
TTCTCTCTCTCTCTATCAAACCAGAAGAAGAAAGATAGAAGATGGCTTCGCCGAGCAAAC
GCCGAGAGATGGACATGATGAAATTGATGATGAGTGATTACAAGGTCGATACAATCAACG
ACGATTTGCATATGTTCTATGTCACTTTCCATGGCCCCACTGACAGTCTTTATGAAGGAG
GTGTATGGAAGATCAAAGTCGAACTTCCTGATGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCTGTTG
GTTTCGTTAACAAGATTTATCACCCCAATGTTGATGAATCTTCTGGCGCAGTTTGCTTAG
ATGTAATAAACCAGACATGGAGTCCAATGTTTGATCTTATCAATGTCTTCGAGTCATTCC
TTCCGCAACTGCTTCTATATCCAAACCCATCTGATCCTTTCAATGGAGAAGCTGCCTCTC
TCTTGATGCGGGACCGTCCTGCCTATGAGCTGAAAGTCAAAGAATATTGCAAGAGATATG
CTAAACCAGAAGACATAGGAGCACCTGAGGAGATCTCAAGTGATGATGATGATGATGATA
GCATGAGCGAACGTGGTTCAGACTCTGATGACAACGATGAAATTGCTGGAAAAGCTGATC
CTTGATGACTTCGTCACAAATCAAATCTCTCTTTGTACTTTGATTTATTAGTCTGTTTCC
AAAAATATAAACCATTGATGTTCATTGCATGGGAGGAGATAAAAACTTTCCTCTGTAAAT
GTGTAAAAACTTGTTTTAATTCTTTAG*ATCATTGAAACTTTCATTTGCTTCAA
TG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2BG40TF 814 0 0
TTCTCTCTCTCTCTATCAAACCAGAAGAAGAAAGATAGAAGATGGCTTCGCCGAGCAAAC
GCCGAGAGATGGACATGATGAAATTGATGATGAGTGATTACAAGGTCGATACAATCAACG
ACGATTTGCATATGTTCTATGTCACTTTCCATGGCCCCACTGACAGTCTTTATGAAGGAG
GTGTATGGAAGATCAAAGTCGAACTTCCTGATGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCTGTTG
GTTTCGTTAACAAGATTTATCACCCCAATGTTGATGGATCTTCTGGCGCAGTTTGCTTAG
ATGTAATAAACCAGACATGGAGTCCAATGTTTGATCTTATCAATGTCTTCGAGTCATTCC
TTCCGCAACTGCTTCTATATCCAAACCCATCTGATCCTTTCAATGGAGAAGCTGCCTCTC
TCTTGATGCGAGACCGTCCTGCCTATGAGCTGAAAGTCAAAGAATATTGCAAGAGATATG
CTAAACCAGAAGACATAGGAGCACCTGAGGAGATCTCAAGTGATGATGATGATGATGATA
GCATGAGCGAACGTGGTTCAGACTCTGATGACAACGATGAAATTGCTGGAAAAGCTGATC
CTTGATGACTTCGTCACAAATCAAATCTCTCTTTGTACTTTGATTTATTAGTCCATTTCC
AAAAATATAAACCATTGATGTTCATTGCATGGGAGGAGATAAAAACTTTCCTCTGTAAAT
GTGTAAAAACTTGTTTTAATTCTTTAGGATCATTGAAACTTTCATTTGCTTCAAATGTAA
ATAACATATAACAATTTGCA*CCTTACTACA
TAA

QA 1 811 1 811
DS 

RD RR2AB57JQ 779 0 0
CAAACGCCGAGAGATGGACATGATGAAATTGATGATGAGTGATTACAAGGTCGATACAAT
CAACGACGATTTGCATATGTTCTATGTCACTTTCCATGGCCCCACTGACAGTCTTTATGA
AGGAGGTGTATGGAAGATCAAAGTCGAACTTCCTGATGCTTATCCTTACAAATCTCCTTC
TGTTGGTTTCGTTAACAAGATTTATCACCCCAATGTTGATGAATCTTCTGGCGCAGTTTG
CTTAGATGTAATAAACCAGACATGGAGTCCAATGTTTGATCTTATCAATGTCTTCGAGTC
ATTCCTTCCGCAACTGCTTCTATATCCAAACCCATCTGATCCTTTCAATGGAGAAGCTGC
CTCTCTCTTGATGCGGGACCGTCCTGCCTATGAGCTGAAAGTCAAAGAATATTGCAAGAG
ATATGCTAAACCAGAAGACATAGGAGCACCTGAGGAGATCTCAAGTGATGATGATGATGA
TGATAGCATGAGCGAACGTGGTTCAGACTCTGATGACAACGATGAAATTGCTGGAAAAGC
TGATCCTTGATGACTTCGTCACAAATCAAATCTCTCTTTGTACTTTGATTTATTAGTCTG
TTTCCAAAAATATAAACCATTGATGTTCATTGCATGGGAGGAGATAAAAACTTTCCTCTG
TAAATGTGTAAAAACTTGTTTTAATTCTTTAGGATCATTGAAACTTTCATTTGCTTCAAA
TGTAAATAACATATAACAATTTGCAACCTTACTACAATAAAACATGAATTCATCTCTCC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 3

CO CL3132Contig1 866 3 9 U
GCCAAATCATAGTTTCTTATGAAAATTAAAAACTTTAAACACCAACAACCAACCTTACTA
CTATTACCATTACAACATTTCTTCGGTTCATAAGTTGTTTACTTTTACAAAACAGAATCA
ACAAACAAACTGTAAAACATCATCTAAACTCTCTCTCCATATCAAAAGCATTAAGTTACC
TCCAAGCACAAGAAGTGATAAGAGGCTGATTCTTCCACCCTAAATACAATGCTCCATCTC
TCTCCTCAAGTGTATACTTCTCTGAATAACTCTCAAGCAACCCTTTGATCGTCGCATTCA
CATAAGAGCTCAACGGATACGGCTTGAAACCCGCCATGTGAAACCTCGACCTCCACTTCC
CCAAAGGCTCGTGCCTCTCTTCTCTTTCAACCCCTTCACAAGCTATAAGATTCACAACTT
CCCTAGCCAGACAGTGCTGCTCCACATTGATCCTCTCCTTGTGATCCCTAGCGAGCTTCA
CATCTATGGACTCAAAAACCGCCAGGTAATGGTTCATCGTCTCCACAAACCGAGGAAGAA
ACGGCGCGGTGTTTGTGTTCGCTTCTTGCTCAACTAGAGTCACAACGTTGGGAGACAAAC
GCTTGACAAGCCTCAGCAACCTGTCTCTGTGATTCTCAACGGTCACGCTCTCATCAGGCA
CGTGGTGAAGGACAAGAGGGAAGTTAACAGCTAAGGCTTCTCCGTTTCTAACTCCAAGCT
GCTCTATTTCCACTTCCGTGCAGCACAAGGCAGCTCCGTGGAACTCAAACGACACACCGC
ACATCTCAGCGAGCTTCCCGAGTCTCTGTCCAACTAACTCAAGCCCTCCTTGTCTAGCAA
ACGATGATCTAGGATCATCAATCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG15JQ U 1
AF RR2D415JQ U 36
AF RR2DG15TF C 72
BS 1 67 RR2DG15JQ
BS 68 68 RR2D415JQ
BS 69 571 RR2DG15JQ
BS 572 660 RR2D415JQ
BS 661 661 RR2DG15TF
BS 662 771 RR2D415JQ
BS 772 772 RR2DG15TF
BS 773 823 RR2D415JQ
BS 824 866 RR2DG15TF

RD RR2DG15JQ 571 0 0
GCCAAATCATAGTTTCTTATGAAAATTAAAAACTTTAAACACCAACAACCAACCTTACTA
CTATTACTATTACAACATTTCTTCGGTTCATAAGTTGTTTACTTTTACAAAACAGAATCA
ACAAACAAACTGTAAAACATCATCTAAACTCTCTCTCCATATCAAAAGCATTAAGTTACC
TCCAAGCACAAGAAGTGATAAGAGGCTGATTCTTCCACCCTAAATACAATGCTCCATCTC
TCTCCTCAAGTGTATACTTCTCTGAATAACTCTCAAGCAACCCTTTGATCGTCGCATTCA
CATAAGAGCTCAACGGATACGGCTTGAAACCCGCCATGTGAAACCTCGACCTCCACTTCC
CCAAAGGCTCGTGCCTCTCTTCTCTTTCAACCCCTTCACAAGCTATAAGATTCACAACTT
CCCTAGCCAGACAGTGCTGCTCCACATTGATCCTCTCCTTGTGATCCCTAGCGAGCTTCA
CATCTATGGACTCAAAAACCGCCAGGTAATGGTTCATCGTCTCCACAAACCGAGGAAGAA
ACGGCGCGGTGTTTGTGTTCGCTTCTTGCTC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2D415JQ 788 0 0
A
AAACACCAACAACCAACCTTACTACTATTACCATTACAACATTTCTTCGGTTCATAAGTT
GTTTACTTTTACAAAACAGAATCAACAAACAAACTGTAAAACATCATCTAAACTCTCTCT
CCATATCAAAAGCATTAAGTTACCTCCAAGTACAAGAAGTGATAAGAGGCTGATTCTTCC
ATCCTAAATACAATGCTCCATCTCTCTCCTCAAGTGTATACTTCTCTGAATAACTCTCAA
GCAACCCTTTGATCGTCGCATTCACATAAGAGCTCAACGGATACGGCTTGAAACCCGCCA
TGTGAAACCTCGACCTCCACTTCCCCAAAGACTCGTGCCTCTCTCCTCTTTCAACCCCTT
CACAAGCTATAAGATTCACAACTTCCCTAGCCAGACAGTGCTGCTCCACATTGATCCTCT
CCTTGTGATCCCTAGCGAGCTTCACATCTATGGACTCAAAAACCGCCAGGTAATGGTTCA
TCGTCTCCACAAACCGAGGAAGAAACGGCGCGGTGTTTGTGTTCGCTTCTTGCTCAACTA
GAGTCACAACGTTGGGAGACAAACGCTTGACAAGCCTCAGCAACCTGTCTCTGTGATTCT
CAACGGTCACGCTCTCATCAGGCATGTGGTGAAGGACAAGAGGGAAGTTAACAGCTAAGG
CTTCTCCGTTTCTAACTCCAAGCTGCTCTATTTCCACTTCCGTGCAGCACAAGGCAGCTC
CGTGGAACTCAAACGGCACACCGCACATCTCAGCGAGCTTCCCGAGTCTCTGTCCAACTA
ACTCAAG

QA 2 788 2 788
DS 

RD RR2DG15TF 795 0 0
TACAACA
TTCTTCGGTTCATAAGTTGTT*ACTTT*ACAAAACAGAATCAACAAACAAACTGTAAAAC
ATCATCTAAACTCTCTCTCCATATCAAAAGCATTAAGTTAC*TCCAAGCACAAGAAGTGA
TAAGAGGCTGATTCTTCCACCCTAAATACAATGCTCCATCTCTCTCCTCAAGTGTATACT
TCTCTGAATAACTCTCAAGCAACCCTTTGATCGTCGCATTCACATAAGAGCTCAACGGAT
ACGGCTTGAAACCCGCCATGTGAAACCTCGACCTCCACTTCCCCAAAGGCTCGTGCCTCT
CTTCTCTTTCAACCCCTTCACAAGCTATAAGATTCACAACTTCCCTAGCCAGACAGTGCT
GCTCCACATTGATCCTCTCCTTGTGATCCCTAGCGAGCTTCACATCTATGGACTCAAAAA
CCGCCAGGTAATGGTTCATCGTCTCCACAAACCGAGGAAGAAACGGCGCGGTGTTTGTGT
TCGCTTCTTGCTCAACTAGAGTCACAACGTTGGGAGACAAACGCTTGACAAGCCTCAGCA
ACCTGTCTCTGTGATTCTCAACGGTCACGCTCTCATCAGGCACGTGGTGAAGGACAAGAG
GGAAGTTAACAGCTAAGGCTTCTCCGTTTCTAACTCCAAGCTTCTCTATTTCCACTTCCG
TGCAGCACAAGGCAGCTCCGTGGAACTCAAACGACACACCGCACATCTCAGCGAGCTTCC
CGAGTCTCTGTCCAACTAACTCAAGCCCTCCTTGTCTAGCAAACGATGATCTAGGATCAT
CAATCCCC

QA 8 795 8 795
DS 



AS 1 3

CO CL3133Contig1 1173 3 17 U
GGCTCTCAAATCGAAAATCAAAATGGCGCTCTTCTCTCAAGGACGCGGCTGGAAGATGCG
ATTAACAAGAACACTACTCGTCTCCGTATCTTCTCCGGCACTGCTAATCCTTCCTTGGCT
CGGGAGATTTCATGCTATTTGGGACTGGAGCTAGGGAAAATCAAGATTAAACGGTTTGCT
GATGGTGAGATCTATGTTCAGCTTCAAGAGAGTGTTAGGGGATGCGATGTATTCCTTGTA
CAGCCTACGTGTCCACCTGCCAATGAGAATCTTATGGAACTGCTCGTTATGATTGATGCC
TGTCGTAGAGCATCTGCCAAAGCCATCACCGCTGTGATTCCTTACTTTGGCTATGCTCGA
GCTGATAGGAAGACTCAGGGACGTGAATCTATTGCTGCCAAGCTTGTCGCGAATCTGATA
ACAGAGTCTGGTGCTGACCGTGTTCTTGCTTGTGACCTTCGCTCTGGACAGTCTATGGGT
TACTTTGATATTCCTGTTGACCATGTTTATGGCCAGCCTGTGATACTTGATTACCTGGCA
AGCAAAGGCATATCCTCTGATGATTTGGTGGTTGTTCCGCCTGATGTTGGTGGAGTCGCA
AGAGCTCGTGCTTTTGCCAAGAAGCTATCCGATGCTCCTTTAGCCATAGTTGACAAAAGA
CGTCATGGACACAATGTTGCCGAGGTGATGAACTTAATTGGGGATGTTAAAGGGAAAGTA
GCTATAATGGTGGATGACATGATTGACACAGCCGGAACCATAAGCAAAGGTGCAGCTCTG
TTACACCAAGAAGGAGCAAGAGAAGTCTACGCATGTACTACTCATGCCGTGTTTAGCCCT
CCTGCAATCAGTAGACTATCGAGCGGTCTGTTTCAAGAGGTGATCATAACCAACACGATT
CCACTGTCGGAGCAAAACTACTTTCCTCAGCTTACAGTTCTCTCAGTAGCAAACCTTCTC
GCGGAGACCACATGGCGTGTTCATGATGATTGTTCGGGAGACATTGAGCCATTTTCGACA
TTGGGGATTGATTGATTGACTGATACAACAATGGTCAAGAATCGACTCAACCTCTCTCAG
TAGTAATGGATTTCTGATCATGTAAATGTTAGACATGTGTGATGTGTGTGTGTGAATGAT
TTTAGAGGAAACAATTTGTAAGATTACATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A620TF U 1
AF RR2C519TF U 353
AF RR2A620JQ C 281
BS 1 765 RR2A620TF
BS 766 970 RR2C519TF
BS 971 971 RR2A620JQ
BS 972 1048 RR2C519TF
BS 1049 1051 RR2A620JQ
BS 1052 1060 RR2C519TF
BS 1061 1061 RR2A620JQ
BS 1062 1069 RR2C519TF
BS 1070 1070 RR2A620JQ
BS 1071 1085 RR2C519TF
BS 1086 1086 RR2A620JQ
BS 1087 1105 RR2C519TF
BS 1106 1106 RR2A620JQ
BS 1107 1109 RR2C519TF
BS 1110 1110 RR2A620JQ
BS 1111 1135 RR2C519TF
BS 1136 1173 RR2A620JQ

RD RR2A620TF 765 0 0
GGCTCTCAAATCGAAAATCAAAATGGCGCTCTTCTCTCAAGGACGCGGCTGGAAGATGCG
ATTAACAAGAACACTACTCGTCTCCGTATCTTCTCCGGCACTGCTAATCCTTCCTTGGCT
CGGGAGATTTCATGCTATTTGGGACTGGAGCTAGGGAAAATCAAGATTAAACGGTTTGCT
GATGGTGAGATCTATGTTCAGCTTCAAGAGAGTGTTAGGGGATGCGATGTATTCCTTGTA
CAGCCTACGTGTCCACCTGCCAATGAGAATCTTATGGAACTGCTCGTTATGATTGATGCC
TGTCGTAGAGCATCTGCCAAAGCCATCACCGCTGTGATTCCTTACTTTGGCTATGCTCGA
GCTGATAGGAAGACTCAGGGACGTGAATCTATTGCTGCCAAGCTTGTCGCGAATCTGATA
ACAGAGTCTGGTGCTGACCGTGTTCTTGCTTGTGACCTTCGCTCTGGACAGTCTATGGGT
TACTTTGATATTCCTGTTGACCATGTTTATGGCCAGCCTGTGATACTTGATTACCTGGCA
AGCAAAGGCATATCCTCTGATGATTTGGTGGTTGTTCCGCCTGATGTTGGTGGAGTCGCA
AGAGCTCGTGCTTTTGCCAAGAAGCTATCCGATGCTCCTTTAGCCATAGTTGACAAAAGA
CGTCATGGACACAATGTTGCCGAGGTGATGAACTTAATTGGGGATGTTAAAGGGAAAGTA
GCTATAATGGTGGATGACATGATTGACACAGCCGGAACCATAAGC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2C519TF 790 0 0
G
TGCTCGAGCTGATAGGAAGACTCAGGGACGTGAATCTATTGCTGCCAAGCTTGTGGCTAA
TCTGATAACGGAGTCTGGTGCTGACCGTGTTCTTGCTTGTGACCTTCACTCTGGACAGTC
TATGGGTTACTTTGATATTCCTGTTGACCATGTTTATGGCCAGCCTGTGATACTTGATTA
CCTAGCAAGCAAAGGCATATCCTCTGATGATTTGGCGGTTGTTTCGCCTGATGTTGGTGG
AGTCGCAAGGGCTCGCGCTTTTGCCAAGAAGCTTTCCGATGCTCCTTTAGCCATAGTTGA
CAAAAGACGTCATGGACACAATGTTGCCGAGGTGATGAACTTAATTGGGGATGTTAAAGG
GAAAGTAGCTATAATGGTGGATGACATGATTGACACAGCCGGAACCATAAGCAAAGGTGC
AGCTCTGTTACACCAAGAAGGAGCAAGAGAAGTCTACGCATGTACTACTCATGCCGTGTT
TAGCCCTCCTGCAATCAGTAGACTATCGAGCGGTCTGTTTCAAGAGGTGATCATAACCAA
CACGATTCCACTGTCGGAGCAAAACTACTTTCCTCAGCTTACAGTTCTCTCAGTAGCAAA
CCTTCTCGCGGAGACCATATGGCGTGTTCATGATGATTGTTCGGGAGACATTGAGCCATT
TTCGACATTGGGGATTGATTGATTGACTGATACAA***TGGTCAAGA*TCGACTCA*CCT
CTCTCAGTAGTA*TGGATTTCTGATCATGTAA*TGT*AGACATGTGTGATGTGTGTGTGT
GA
TGATTTA

QA 2 783 2 783
DS 

RD RR2A620JQ 893 0 0
TGCTCGTTATGATTGATGC*TGTCGTAGAGCATCTGCCAAAGCCATCACCGCTGTGATTC
CTTACTTTGGCTATGCTCGAGCTGATAGGAAGACTCAGGGACGTGAATCTATTGCTGCCA
AGCTTGTCGCGAATCTGATAACAGAGTCTGGTGCTGACCGTGTTCTTGCTTGTGACCTTC
GCTCTGGACAGTCTATGGGTTACTTTGATATTCCTGTTGACCATGTTTATGGCCAGCCTG
TGATACTTGATTACCTGGCAAGCAAAGGCATATCCTCTGATGATTTGGTGGTTGTTCCGC
CTGATGTTGGTGGAGTCGCAAGAGCTCGTGCTTTTGCCAAGAAGCTATCCGATGCTCCTT
TAGCCATAGTTGACAAAAGACGTCATGGACACAATGTTGCCGAGGTGATGAACTTAATTG
GGGATGTTAAAGGGAAAGTAGCTATAATGGTGGATGACATGATTGACACAGCCGGAACCA
TAAGCAAAGGTGCAGCTCTGTTACACCAAGAAGGAGCAAGAGAAGTCTACGCATGTACTA
CTCATGCCGTGTTTAGCCCTCCTGCAATCAGTAGACTATCGAGCGGTCTGTTTCAAGAGG
TGATCATAACCAACACGATTCCACTGTCGGAGCAAAACTACTTTCCTCAGCTTACAGTTC
TCTCAGTAGCAAACCTTCTCGCGGAGACCACATGGCGTGTTCATGATGATTGTTCGGGAG
ACATTGAGCCATTTTCGACATTGGGGATTGATTGATTGACTGATACAACAATGGTCAAGA
ATCGACTCAACCTCTCTCAGTAGTAATGGATTTCTGATCATGTAAATGTTAGACATGTGT
GATGTGTGTGTGTGAATGATTTTAGAGGAAACAATTTGTAAGATTACATTTTC

QA 1 893 1 893
DS 



AS 1 2

CO CL3134Contig1 829 2 4 U
GGATAAATAGCATCGAGGAGAACAGAACACACTATTTCTCTTGTGCATTTTCTTGTTCGT
TGACCTGATAACAAAAAGGCATCGAAGATGAATGTTAGGGTTTTGTTTCTGGCTCTCCTT
CTCCTTGCATCTCCGCTGCTTCAAGTTGCTAGATGTCAAGTAGATGCCGAGGATCATTCA
AGTATTGTTGACGATGTTGTGGGAGAACACAGCGATGATGGTGCTGAGGAAGATGATCAG
GATTTGGATATCAACTTGACCTCTGCTCCTGGAGTTGAGACTGTCTCTGTTTTTCCCCAA
AAACAGTGCCAAATTGGTGCCAGCTGGAGAAGAGACCGAGCTCCTTGTTGCTCTCAAAAA
CGATGGCAAATCTAACGTAGGTGTGATGGGGATTAGGGCCAGCGTCCATCTTCCTTATGA
TCATAAGCTCTTGGTTCAGAATCTTACCATGATGAGATTCAACAATGCGTCCATCCCAAC
TTCTGTTCAAGCAACATTCTCTTACATCTTTGCAGTCAGCCAGTACCTGCAGCCTGGAGC
ATTTGATCTGGTGGGTTATATCATCTACCACGTGGAGGGAAAGACACACCAGAGTGTCTT
CTACAATGGGACCATTGAGGTTGTTGAATCTGGTGGTCTTCTCAGCGGTGAGTCTGTCTT
CCTCATTACACTTGGGATTGCTCTCCTCCTCCTCCTCGGTCTATGGGCATACAGCCAAGT
GCAGCGTCTCACTAAGAAACCAAAAAGTGTCCAAGTGGAAGTAGGATCAGTCTACCGACG
CATCAATGGACGAGTGGCTCGAGGGACTCATTTGGCCAGACATTGTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY86TF U 1
AF RR2GA32TF U 33
BS 1 293 RR2EY86TF
BS 294 294 RR2GA32TF
BS 295 739 RR2EY86TF
BS 740 829 RR2GA32TF

RD RR2EY86TF 750 0 0
GGATAAATAGCATCGAGGAGAACAGAACACACTATTTCTCTTGTGCATTTTCTTGTTCGT
TGACCTGATAACAAAAAGGCATCGAAGATGAATGTTAGGGTTTTGTTTCTGGCTCTCCTT
CTCCTTGCATCTCCGCTGCTTCAAGTTGCTAGATGTCAAGTAGATGCCGAGGATCATTCA
AGTATTGTTGACGATGTTGTGGGAGAACACAGCGATGATGGTGCTGAGGAAGATGATCAG
GATTTGGATATCAACTTGACCTCTGCTCCTGGAGTTGAGACTGTCTCTGTTTT*CCCCAA
AAACAGTGCCAAATTGGTGCCAGCTGGAGAAGAGACCGAGCTCCTTGTTGCTCTCAAAAA
CGATGGCAAATCTAACGTAGGTGTGATGGGGATTAGGGCCAGCGTCCATCTTCCTTATGA
TCATAAGCTCTTGGTTCAGAATCTTACCATGATGAGATTCAACAATGCGTCCATCCCAAC
TTCTGTTCAAGCAACATTCTCTTACATCTTTGCAGTCAGCCAGTACCTGCAGCCTGGAGC
ATTTGATCTGGTGGGTTATATCATCTACCACGTGGAGGGAAAGACACACCAGAGTGTCTT
CTACAATGGGACCATTGAGGTTGTTGAATCTGGTGGTCTTCTCAGCGGTGAGTCTGTCTT
CCTCATTACACTTGGGATTGCTCTCCTCCTCCTCCTCGGTCTATGGGCATACAGCCAAGT
GCAGCGTCTCACTAAGAAA
CCAAAAGTGCC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2GA32TF 797 0 0
G
ATTTCTCTTGTGCATTTTCTTGTTCGTTGACCTGATAACAAAAAGGCATCGAAGATGAAT
GTTAGGGTTTTGTTTCTGGCTCTCCTTCTCCTTGCATCTCCGCTGCTTCAAGTTGCTAGA
TGTCAAGTAGATGCCGAGGATCATTCAAGTATTGTTGACGATGTTGTGGGAGAACACAGC
GATGATGGTGCTGAGGAAGATGATCAGGATTTGGATATCAACTTGACCTCTGCTCCTGGA
GTTGAGACTGTCTCTGTTTTTCCCCAAAAACAGTGCCAAATTGGTGCCAGCTGGAGAAGA
GACCGAGCTCCTTGTTGCTCTCAAAAACGATGGCAAATCTAACGTAGGTGTGATGGGGAT
TAGGGCCAGCGTCCATCTTCCTTATGATCATAAGCTCTTGGTTCAGAATCTTACCATGAT
GAGATTCAACAATGCGTCCATCCCAACTTCTGTTCAAGCAACATTCTCTTACATCTTTGC
AGTCAGCCAGTACCTGCAGCCTGGAGCATTTGATCTGGTGGGTTATATCATCTACCACGT
GGAGGGAAAGACACACCAGAGTGTCTTCTACAATGGGACCATTGAGGTTGTTGAATCTGG
TGGTCTTCTCAGCGGTGAGTCTGTCTTCCTCATTACACTTGGGATTGCTCTCCTCCTCCT
CCTCGGTCTATGGGCATACAGCCAAGTGCAGCGTCTCACTAAGAAACCAAAAAGTGTCCA
AGTGGAAGTAGGATCAGTCTACCGACGCATCAATGGACGAGTGGCTCGAGGGACTCATTT
GGCCAGACATTGTCTG

QA 2 797 2 797
DS 



AS 1 3

CO CL3135Contig1 754 3 8 U
TTTTTTTTTGTCAAACCAATGATTTTCATTCATAACTTAAAACCTTACATGGATTAAAGC
AACATCAAAACAGTGGTGAGCAGTTTTTTTAGGGAAATAAAGAGCAAAGCAAAGTAAAAA
TAAAGACACAAACTTAAATAAGTTTGATAAGATGCCGAAGGTTACAAAGGTGCCACCAGC
GAGTAACCACTAACCACATAATGAAGTTACTGCATCCTTTGAATTTTCCAGACTTGAAAG
TAGTCACCGTATGTCGTGACGTTGAATACTCTTTGGTTTTGGTACCAAGAGAGAGGTACT
TCTCAACGAGAAGAGTTTTGGTGAAGAGATTCACTTCTACAAGGAGAAGAGATGGTGAAA
ATGATCTCTCATGGCCCCGGCATGAGGAAATTTGATTAGCCTTTTCTATGAAAGCTATGG
GACTGCAATCTTCAAGCATTAAAAGACTCCGAACTGCACTTTGAATTTGTCTAGCAGTTT
TACTTGTCGGGTTTTGTGGTTGATGATGAATCTTGCTTGACCTTGGTGCCCTATCACCAC
TGACTGCACCAAAAACATAAAACAATCCATCTATGACCAGAACATAAGTTTTCTCCGATG
AGATTTCCATCTTTGAGTCGGCAGCAGCATTTGACAAATGAGAGCGCAAGACCAAAGTAT
ATAGAAAATGTAGGCGCTGTTGGGAGTGGATAACGGTGGTAAGAGCCACCTTAACTACGG
CATTGAGATAGATGAGCTTGACAAGATTTGACAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D122JQ U 10
AF RR2D122TF C 1
AF RR2A711JQ U 10
BS 1 10 RR2D122TF
BS 11 75 RR2A711JQ
BS 76 76 RR2D122JQ
BS 77 455 RR2A711JQ
BS 456 456 RR2D122JQ
BS 457 530 RR2A711JQ
BS 531 531 RR2D122JQ
BS 532 754 RR2A711JQ

RD RR2D122JQ 585 0 0
G
TCAAACCAATGATTTTCATTCATAACTTAAAACCTTACATGGATTAAAGCAACATCAAAA
CAGTGGTGAGCAGTTTTTTTAGGGAAATAAAGAGCAAAGCAAAGTAAAAATAAAGACACA
AACTTAAATAAGTTTGATAAGATGCCGAAGGTTACAAAGGTGCCACCAGCGAGTAACCAC
TAACCACATAATGAAGTTACTGCATCCTTTGAATTTTCCAGACTTGAAAGTAGTCACCGT
ATGTCGTGACGTTGAATACTCTTTGGTTTTGGTACCAAGAGAGAGGTACTTCTCAACGAG
AAAAGTTTTGGTGAAAAAATTCACTTCTACAAGGAGAAAAAATGGGGAAAATGATCTCTC
ATGGCCCCGGCATGAGGAAATTTGATTAGCCTTTTCTATGAAAGCTATGGGACTGCAATC
TTCAAGCATTAAAAGACTCCGAACTGCACTTTGAATTTGTCTAGCAGTTTTACTTGTCGG
GTTTTGTGGTTGATGATGAATCTTGCTTGACCTTGGTGCCCTATCACCACTGACTGCACC
AAAAACATAAAACAATCCATCTATGACCAGAACATAAGTTTTCT

QA 2 585 2 585
DS 

RD RR2D122TF 739 0 0
TTTTTTTTTGTCAAACCAATGATTTTCATTCATAACTTAAAAC*TTACATGGATTAAAGC
AACATCAAAACAGTGGTGAGCAGTTTTTT*AGGGAAATAAAGAGCAAAGCAAAGTAAAAA
TAAAGACACAAACTTAAATAAGTTTGATAAGATGCCGAAGGTTACAAAGGTGCCACCAGC
GAGTAACCACTAACCACATAATGAAGTTACTGCATCCTTTGAATTTTCCAGACTTGAAAG
TAGTCACCGTATGTCGTGACGTTGAATACTCTTTGGTTTTGGTACCAAGAGAGAGGTACT
TCTCAACGAGAAGAGTTTTGGTGAAGAGATTCACTTCTACAAGGAGAAGAGATGGTGAAA
ATGATCTCTCATGGCCCCGGCATGAGGAAATTTGATTAGCCTTTTCTATGAAAGCTATGG
GACTGCAATCTTCAAGCATTAAAAGACTCCGAACTGCACTTTGAATTTGTCTAGCAGTTT
TACTTGTCGGGTTTTGTGGTTGATGATGAATCTTGCTTGACCTTGGTGCCCTATCACCAC
TGACTGCACCAAAAACATAAAACAATCCATCTATGACCAGAACATAAGTTTTCTCCGATG
AGATTTCCATCTTTGAGTCGGCAGCAGCATTTGACAAATGAGAGCGCAAGACCAAAGTAT
ATAGAAAATGTAGGCGCTGTTGGGAGTGGATAACGGTGGTAAGAGCCACCTTAACTACGG
CATTGAGATAGATGAGCT
C

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2A711JQ 745 0 0
A
TCAAACCAATGATTTTCATTCATAACTTAAAACCTTACATGGATTAAAGCAACATCAAAA
CAGTGATGAGCAGTTTTTTTAGGGAAATAAAGAGCAAAGCAAAGTAAAAATAAAGACACA
AACTTAAATAAGTTTGATAAGATGCCGAAGGTTACAAAGGTGCCACCAGCGAGTAACCAC
TAACCACATAATGAAGTTACTGCATCCTTTGAATTTTCCAGACTTGAAAGTAGTCACCGT
ATGTCGTGACGTTGAATACTCTTTGGTTTTGGTACCAAGAGAGAGGTACTTCTCAACGAG
AAGAGTTTTGGTGAAGAGATTCACTTCTACAAGGAGAAGAGATGGTGAAAATGATCTCTC
ATGGCCCCGGCATGAGGAAATTTGATTAGCCTTTTCTATGAAAGCTATGGGACTGCAATC
TTCAAGCATTAAAAGACTCCGAACTACACTTTGAATTTGTCTAGCAGTTTTACTTGTCGG
GTTTTGTGGTTGATGATGAATCTTGCTTGACCTTGGTGCCATATCACCACTGACTGCACC
AAAAACATAAAACAATCCATCTATGACCAGAACATAAGTTTTCTCCGATGAGATTTCCAT
CTTTGAGTCGGCAGCAGCATTTGACAAATGAGAGCGCAAGACCAAAGTATATAGAAAATG
TAGGCGCTGTTGGGAGTGGATAACGGTGGTAAGAGCCACCTTAACTACGGCATTGAGATA
GATGAGCTTGACAAGATTTGACAA

QA 2 745 2 745
DS 



AS 1 2

CO CL3136Contig1 763 2 8 U
AATCATAAAGATAACCATTAAATGTTTATTACCATTAAATCAGCACAAACAAATTTAAAC
CAAGGGACCAAGTTTAAAAAAGAGAGTAGAAAAGTCCAAACAAGTAGCAGAGATATTTGA
GTTAAACAAACACACATTCATCATCCTCACCAAACCCAAATGTCATTAGAGGTGAGAGAG
AGAGAGAGAAAAGAGAGAGAGAGGCCTTTGTCGACTTCAAATTGTCTACAGCTGAGAGAA
GGAGATTCTGATAATTGAACCTCCTAGAGAGGTCGCATGCTTGCAAACCAGTGCTTCCGC
AGCTTCCTCCTCGTTCTCAAACTGCACCAGAGCTTGCTTTTTCCCGTTCATCTCAAACAC
TTTTGTGTTCAGTATGGCCCCATGCTCTTGGACGTGGTTAACCACTTCTTCCTCTGTCAC
GTCTTGCGGAAGAGTGGACAAGTGAATCATCTTGGTAGGGGAGCAGCAATAGCGGTAGTT
CTTCGCAGCATTGCGGTTGAACCGGTTCAGGTTCGAGTTAACATAATCATGCGAGTCTGT
GCCTGGTGTTATATTTGGATGCTTCGAGTAGTTCACCTCTAGCCGCTTACCAAACAGCAT
CGCTCCCTTGAGGAAATGAACTGCAAGTTCAGCTTGGAAACCATCTCCCATTTGGACAAG
GGCATGGTCAGGTTTGTTTCGAAGAAGCTTTATCCTCACAATGTTCCCGTAAAGAGAAAA
GAGATTGAACAGCTTATCCTCATCAACACTATCTGTATTAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK85JQ U 1
AF RR2EF83JQ U 57
BS 1 227 RR2FK85JQ
BS 228 228 RR2EF83JQ
BS 229 381 RR2FK85JQ
BS 382 382 RR2EF83JQ
BS 383 483 RR2FK85JQ
BS 484 484 RR2EF83JQ
BS 485 666 RR2FK85JQ
BS 667 763 RR2EF83JQ

RD RR2FK85JQ 666 0 0
AATCATAAAGATAACCATTAAATGTTTATTACCATTAAATCAGCACAAACAAATTTAAAC
CAAGGGACCAAGTTTAAAAAAGAGAGTAGAAAAGTCCAAACAAGTAGCAGAGATATTTGA
GTTAAACAAACACACATTCATCATCCTCACCAAACCCAAATGTCATTAGAGGTGAGAGAG
AGAGAGAGAAAAGAGAGAGAGAGGCCTTTGTCGACTTCAAATTGTCTGCAGCTGAGAGAA
GGAGATTCTGATAATTGAACCTCCTAGAGAGGTCGCATGCTTGCAAACCAGTGCTTCCGC
AGCTTCCTCCTCGTTCTCAAACTGCACCAGAGCTTGCTTTTTCCCGTTCATCTCAAACAC
TTTTGTGTTCAGTATGGCCCCCTGCTCTTGGACGTGGTTAACCACTTCTTCCTCTGTCAC
GTCTTGCGGAAGAGTGGACAAGTGAATCATCTTGGTAGGGGAGCAGCAATAGCGGTAGTT
CTTTGCAGCATTGCGGTTGAACCGGTTCAGGTTCGAGTTAACATAATCATGCGAGTCTGT
GCCTGGTGTTATATTTGGATGCTTCGAGTAGTTCACCTCTAGCCGCTTACCAAACAGCAT
CGCTCCCTTGAGGAAATGAACTGCAAGTTCAGCTTGGAAACCATCTCCCATTTGGACAAG
GGCATG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2EF83JQ 707 0 0
AG
ACCAAGGGACCAAGTTTAAAAAAGAGAGTAGAAAAGTCCAAACAAGTAGCAGAGATATTT
GAGTTAAACAAACACACATTCATCATCCTCACCAAACCCAAATGTCATTAGAGGTGAGAG
AGAGAGAGAGAAAAGAGAGAGAGAGGCCTTTGTCGACTTTAAATTGTCTACAGCTGAGAG
AAGGAGATTCTGATAATTGAACCTCCTAGAGAGGTCGCATGCTTGCAAACCAGTGCTTCC
GCAGCTTCCTCCTCGTTCTCAAACTGCACCAGAGCTTGCTTTTTCCCGTTCATCTCAAAC
ACTTTTGTGTTCAGTATGGCCCCATGCTCTTGGACGTGGTTAACCACTTCTTCCTCTGTC
ACGTCTTGCGGAAGAGTGGACAAGTGAATCATCTTGGTAGGGGAGCAGCAATAGCGGTAG
TTCTTCGCAGCATTGCGGTTGAACCGGTTCAGGTTCGAGTTAACATAATCATGCGAGTCT
GTGCCTGGTGTTATATTTGGATGCTTCGAGTAGTTCACCTCTAGCCGCTTACCAAACAGC
ATCGCTCCCTTGAGGAAATGAACTGCAAGTTCAGCTTGGAAACCATCTCCCATTTGGACA
AGGGCATGGTCAGGTTTGTTTCGAAGAAGCTTTATCCTCACAATGTTCCCGTAAAGAGAA
AAGAGATTGAACAGCTTATCCTCATCAACACTATCTGTATTAAGA

QA 3 707 3 707
DS 



AS 1 3

CO CL3137Contig1 1268 3 2 U
GGGGGGTTAAAAACCTATAAAAGAATCAAAACAAACTTTCCAAAATCTCAGCTCATCCGA
TCTGCTGCCTCCTGCCTTTTGACTCCTCCTTGATAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAA
TCCAAAACTTCTCCGATCTTCTTCAAACACCAAAAATAATCCCTAAAAATCAGATCGTTT
GCTTTTTTATATTGATTTGTGGTGGGCAATGGAGTTTAATGGAGATGATGAGTCTAGCTT
CGAGCAGTGTTACCGTTGTTACCCTGTCACATTCATTGAAAAGGCACATCTTGACAAGGG
GGACAAAATTATAATGCCTCCTTCCGCTCTCAACCGTCTTGCTTCTTTGCATATTGAGTA
CCCAATGTTGTTTCAACTGAGTAATGAATCTGTTGGCAAGATCACACATTGTGGTGTACT
CGAGTTCACCGCAGACGAAGGCCTTGTTTACTTTCCCTATTGGATGATGCAAAACATGTC
TCTTCAAGAAGGAGACATTGTGAGAATCAAGAATATGAGTTTGGTGAAAGGGACTTACAT
CAAGCTTCAGCCTCACACTCAAGATTTCTTGGACATTACCAACCCAAAAGCCATCTTGGA
GACTACGCTTAGGAGCTACTCTTGCTTGACCACTGGCGACACAATCATGGTTCCTTACAA
CAACAAGCAGTATTTTATCAATGTGGTTGAAGCGAAGCCGTCGTCAGCTGTGAGTATCAT
AGAAACGGACTGCGAGGTTGATTTCGCTCCTCCTCTTGATTACAAAGAACCTGAGAAGCC
GCAGAAGCTGACTCCTCTAAAGAAGCGAACTCGCCAAGTTGAGGAAGAGGAACCAGCAAT
CAAAGTTCCCAAGTTCACGCCATTCACTGGGTCCGGAAAGCGTTTGGATGGGAAGACACA
AACAGAATCAACTGAACAAGAAGAGAAGCCAACTAAGGGAGAGGATGAAGAGAAGCTGTC
AAGCATAACGCCACCGCAAAAATCAGGGAAGCTTGTCTTTGGCTCAAACAGCAAACAAAC
TTCAAAAGCAAATGTGAAAGTTGATCCAAAGAACGTGGAGCAAGAAAGTTCGACTAAATT
TGATGAAGCTAAGTTTAAAGTGTTTACTGGGAAGAAATACTCACTCAAGGGTTAAGAAAA
AAACATAGGTTTTTTTTTAAAGTTCAATCATCTGCTGATGAATATTTATTAGTTTTTTTT
CTTCCTTTTCACAACATTTATTTGTTAAGCATTTTTTATATTCATATATTATCGAACCAA
TTTATGGG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H313TF U 1
AF RR2FU74TF U 2
AF RR2FU74JQ C 556
BS 1 727 RR2H313TF
BS 728 1268 RR2FU74JQ

RD RR2H313TF 732 0 0
GGGGGGTTAAAAACCTATAAAAGAATCAAAACAAACTTTCCAAAATCTCAGCTCATCCGA
TCTGCTGCCTCCTGCCTTTTGACTCCTCCTTGATAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAA
TCCAAAACTTCTCCGATCTTCTTCAAACACCAAAAATAATCCCTAAAAATCAGATCGTTT
GCTTTTTTATATTGATTTGTGGTGGGCAATGGAGTTTAATGGAGATGATGAGTCTAGCTT
CGAGCAGTGTTACCGTTGTTACCCTGTCACATTCATTGAAAAGGCACATCTTGACAAGGG
GGACAAAATTATAATGCCTCCTTCCGCTCTCAACCGTCTTGCTTCTTTGCATATTGAGTA
CCCAATGTTGTTTCAACTGAGTAATGAATCTGTTGGCAAGATCACACATTGTGGTGTACT
CGAGTTCACCGCAGACGAAGGCCTTGTTTACTTTCCCTATTGGATGATGCAAAACATGTC
TCTTCAAGAAGGAGACATTGTGAGAATCAAGAATATGAGTTTGGTGAAAGGGACTTACAT
CAAGCTTCAGCCTCACACTCAAGATTTCTTGGACATTACCAACCCAAAAGCCATCTTGGA
GACTACGCTTAGGAGCTACTCTTGCTTGACCACTGGCGACACAATCATGGTTCCTTACAA
CAACAAGCAGTATTTTATCAATGTGGTTGAAGCGAAGCCGTCGTCAGCTGTGAGTATCAT
AGAAACG
ACTGC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2FU74TF 731 0 0
GGGGGTTAAAAATCTATAAAAGAATCAAAACAAACTTTCCAAAATCTCAGCTCATCCGAT
CTGCTGCCTCCTGCCTTTTGACTCCTCCTTGATAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA***AT
CCAAAACTTCTCCGATCTTCTTCAAACACCAAAAATAATCCCTAAAAATCAGATCGTTTG
CTTTTTTATATTGATTTGTGGTGGGCAATGGAGTTTAATGGAGATGATGAGTCTAGCTTC
GAGCAGT*TTACCGTTGTTACCCTGTCACATTCATTGAAAAGGCACATCTTGACAAGGGG
GACAAAATTATAATGCCTCCTTCCGCTCTCAACCGTCTTGCTTCTTTGCATATTGAGTAC
CCAATGTTGTTTCAACTGAGTAATGAATCTGTTGGCAAGATCACACATTGTGGTGTACTC
GAGTTCACCGCAGACGAAGGCCTTGTTTACTTTCCCTATTGGATGATGCAAAACATGTCT
CTTCAAGAAGGAGACATTGTGAGAATCAAGAATATGAGTTTGGTGAAAGGGACTTACATC
AAGCTTCAGCCTCACACTCAAGATTTCTTGGACATTACCAACCCAAAAGCCATCTTGGAG
ACTACGCTTAGGAGCTACTCTTGCTTGACCACTGGCGACACAATCATGGTTCCTTACAAC
AACAAGCAGTATTTTATCAATGTGGTTGAAGCGAAGCCGTCGTCAGCTGTGAGTATCATA
GAAACG
GACTG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2FU74JQ 713 0 0
CACTCAAGATTTCTTGGACATTACCAACCCAAAAGCCATCTTGGAGACTACGCTTAGGAG
CTACTCTTGCTTGACCACTGGCGACACAATCATGGTTCCTTACAACAACAAGCAGTATTT
TATCAATGTGGTTGAAGCGAAGCCGTCGTCAGCTGTGAGTATCATAGAAACGGACTGCGA
GGTTGATTTCGCTCCTCCTCTTGATTACAAAGAACCTGAGAAGCCGCAGAAGCTGACTCC
TCTAAAGAAGCGAACTCGCCAAGTTGAGGAAGAGGAACCAGCAATCAAAGTTCCCAAGTT
CACGCCATTCACTGGGTCCGGAAAGCGTTTGGATGGGAAGACACAAACAGAATCAACTGA
ACAAGAAGAGAAGCCAACTAAGGGAGAGGATGAAGAGAAGCTGTCAAGCATAACGCCACC
GCAAAAATCAGGGAAGCTTGTCTTTGGCTCAAACAGCAAACAAACTTCAAAAGCAAATGT
GAAAGTTGATCCAAAGAACGTGGAGCAAGAAAGTTCGACTAAATTTGATGAAGCTAAGTT
TAAAGTGTTTACTGGGAAGAAATACTCACTCAAGGGTTAAGAAAAAAACATAGGTTTTTT
TTTAAAGTTCAATCATCTGCTGATGAATATTTATTAGTTTTTTTTCTTCCTTTTCACAAC
ATTTATTTGTTAAGCATTTTTTATATTCATATATTATCGAACCAATTTATGGG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 3

CO CL3138Contig1 585 3 3 U
GGAAAGAACGGTTTGGGAGAAAGAAGCAAAAGAAGAAGAATGGCAACAGCATTTGCAACC
CCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCACGCATCAACACCAAAGCCTTC
TCTTCATCCTTTCTAAAACCAACATTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAGAGTCAACGGAGTA
TCAGGAGGAAGATTCACTTGCTTTGAGAGGAACTGGTTGAGGAGAGACCTAAACGTGGTG
GGGTTTGGACTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAATGGGAAGAGC
TTGACGGGTCTCTTTTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCA
GCACTCACTTCACAGTTCTGGTTGTGGTTGGTTACGTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGT
CTCATCTCACCTTCGGACAAATCGGATTCAAGGGTAGGACCGAGGATTACTTCGAGAGAT
AAACCATTTCTCGTTGTCCCCTCTCTTGTGTAATATTATTACTCAAAACTAAGCTTTATT
CCTTTGCTATGTTTGATGTTTCATTCAATATCGACAAAAGAGTTT


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE63JQ C 1
AF RR2AE63TF U 1
AF RR2FS77TF U 3
BS 1 4 RR2AE63JQ
BS 5 542 RR2AE63TF
BS 543 585 RR2FS77TF

RD RR2AE63JQ 542 0 0
GGAAAGAACGGTTTGGGAGAAAGAAGCAAAAGAAGAAGAATGGCAACAGCATTTGCAACC
CCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCACGCATCAACACCAAAGCCTTC
TCTTCATCCTTTCTAAAACCAACATTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAGAGTCAACGGAGTA
TCAGGAGGAAGATTCACTTGCTTTGAGAGGAACTGGTTGAGGAGAGACCTAAACGTGGTG
GGGTTTGGACTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAATGGGAAGAGC
TTGACGGGTCTCTTTTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCA
GCACTCACTTCACAGTTCTGGTTGTGGTTGGTTACGTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGT
CTCATCTCACCTTCGGACAAATCGGATTCAAGGGTAGGACCGAGGATTACTTCGAGAGAT
AAACCATTTCTCGTTGTCCCCTCTCTTGTGTAATATTATTACTCAAAACTAAGCTTTATT
CC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2AE63TF 542 0 0
GGAA
AGAACGGTTTGGGAGAAAGAAGCAAAAGAAGAAGAATGGCAACAGCATTTGCAACCCCAT
CGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCACGCATCAACACCAAAGCCTTCTCTT
CATCCTTTCTAAAACCAACATTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAGAGTCAACGGAGTATCAG
GAGGAAGATTCACTTGCTTTGAGAGGAACTGGTTGAGGAGAGACCTAAACGTGGTGGGGT
TTGGACTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAATGGGAAGAGCTTGA
CGGGTCTCTTTTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCAGCAC
TCACTTCACAGTTCTGGTTGTGGTTGGTTACGTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGTCTCA
TCTCACCTTCGGACAAATCGGATTCAAGGGTAGGACCGAGGATTACTTCGAGAGATAAAC
CATTTCTCGTTGTCCCCTCTCTTGTGTAATATTATTACTCAAAACTAAGCTTTATTCC

QA 5 542 5 542
DS 

RD RR2FS77TF 583 0 0
GG
AGAACGGTTTGGGAGAAAGAAGCAAAAGAAGAAGAATGGCAACAGCATTTGCAACCCCAT
CGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCACGCATCAACACCAAAGCCTTCTCTT
CATCCTTTCTAAAACCAACATTAAGAGCAAAGAACCCTCTGAGAGTCAACGGAGCATCAG
GAGGAAGATTCACTTGCTTTGAGAGGAACTGGTTGAGGAGAGACCTAAACGTGGTGGGGT
TTGGACTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAATGGGAAGAGCTTGA
CGGGTCTCTTTTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCAGCAC
TCACTTCACAGTTCTGGTTGTGGTTGGTTACGTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGTCTCA
TCTCACCTTCGGACAAATCGGATTCAAGGGTAGGGCCGAGGATTACTTCGAGAGATAAAC
CATTTCTCGTTGTCCCCTCTCTTGTGTAATATTATTACTCAAAACTAAGCTTTATTCCTT
TGCTATGTTTGATGTTTCATTCAATATCGACAAAAGAGTTT

QA 3 583 3 583
DS 



AS 1 3

CO CL3139Contig1 842 3 4 U
CTCGCCTAATCAAATTATTTATCTGGGATTGTTTAAGCATAGAGAGCTCTTTCGTGCAAA
ATGTGAAAAGAACACAAGAAATACACAACAAAAAGCGAAGAAAGACAGAAAAAGATGCAT
CTCATTATAAGCTAATTCCTAGGGGAAGATGAAGGAGATCGACCACGCAAGAAAATCCAC
GGTCCAGTTCCTGTTGCTATCCTGGCGATTCCAGTAATAGCTCGGAGACCCATATAGATG
GTAAGAGCTATCCATATTCCAAGAAAGCCATTGAACTTTGCCATGTATATTATTGCTGTT
ATGCTTATCCCCGCAACTCCAACCATGGAGTATGCAGTGTAAGCAAAATCAGATGCTCCA
AAATTGACTCCGTCCAACACAAAAGCAAGTGAGTTTATTGGCTGTGTTGCTGCTACAAAC
GGTATTCCAATGGCTATGAGGTGAATAACGGCAGGGTCCTTAGTAAATATTCCAGCACCA
AAGTATAGTCCTAGTCCAACGAAAACGGACAATCCAAGTCCTAGCACAAAACCCATCTGT
AGAACACGGGATGCAGCAAAAGACACTTTGTTATAGTCCTTCTCGGCAAAAGAACAAGCC
AGAATCGCCTGACCGGCTACAGCAAGACCATCGGCAAGGAGAGAAGTAGTTAACCAGACT
TGTAAACAGATCTGAAAAGCAGCCATTGGTGTTGTTCCTAGCCGAGCCGCCATTGCTGCT
GCTAGTGTCTGACAAAACGTCACAGCTATGGTCCTTGCGAGCAATAGTCCCCCATTTTTA
GGACTTGCCGACTGTAAAGCTCCAAAGTTTGGTGGCATCAAATTAACTTTACTAGCGAGG
GG


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2FA37TF C 3
AF RR2BE80JQ U 1
AF RR2CN19JQ U 3
BS 1 320 RR2BE80JQ
BS 321 321 RR2CN19JQ
BS 322 777 RR2BE80JQ
BS 778 842 RR2CN19JQ

RD RR2FA37TF 275 0 0
CGCCTAATCAAATTATTTATCTGGGATTGTTTAAGCATAGAGAGCTCTTTCGTGCAAAAT
GTGAAAAGAACACAAGAAATACACAACAAAAAGCGAAGAAAGACAGAAAAAGATGCATCT
CATTATAAGCTAATTCCTAGGGGAAGATGAAGGAGATCGACCACGCAAGAAAATCCACGG
TCCAGTTCCTGTTGCTATCCTGGCGATTCCAGTAATAGCTCGGAGACCCATATAGATGGT
AAGAGCTATCCATATTCCAAGAAAGCCATTGAAC
C

QA 1 274 1 274
DS 

RD RR2BE80JQ 777 0 0
CTCGCCTAATCAAATTATTTATCTGGGATTGTTTAAGCATAGAGAGCTCTTTCGTGCAAA
ATGTGAAAAGAACACAAGAAATACACAACAAAAAGCGAAGAAAGACAGAAAAAGATGCAT
CTCATTATAAGCTAATTCCTAGGGGAAGATGAAGGAGATCGACCACGCAAGAAAATCCAC
GGTCCAGTTCCTGTTGCTATCCTGGCGATTCCAGTAATAGCTCGGAGACCCATATAGATG
GTAAGAGCTATCCATATTCCAAGAAAGCCATTGAACTTTGCCATGTATATTATTGCTGTT
ATGCTTATCCCCGCAACTCCCACCATGGAGTATGCAGTGTAAGCAAAATCAGATGCTCCA
AAATTGACTCCGTCCAACACAAAAGCAAGTGAGTTTATTGGCTGTGTTGCTGCTACAAAC
GGTATTCCAATGGCTATGAGGTGAATAACGGCAGGGTCCTTAGTAAATATTCCAGCACCA
AAGTATAGTCCTAGTCCAACGAAAACGGACAATCCAAGTCCTAGCACAAAACCCATCTGT
AGAACACGGGATGCAGCAAAAGACACTTTGTTATAGTCCTTCTCGGCAAAAGAACAAGCC
AGAATCGCCTGACCGGCTACAGCAAGACCATCGGCAAGGAGAGAAGTAGTTAACCAGACT
TGTAAACAGATCTGAAAAGCAGCCATTGGTGTTGTTCCTAGCCGAGCCGCCATTGCTGCT
GCTAGTGTCTGACAAAACGTCACAGCTATGGTCCTTGCGAGCAATAGTCCCCCATTT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2CN19JQ 840 0 0
CGCCTAATCAAATTATTTATCTGGGATTGTTTAAGCATAGAGAGCTCTTTCGTGCAAAAT
GTGAAAAGAACACAAGAAATACACAACAAAAAGCGAAGAAAGACAGAAAAAGATGCATCT
CATTATAAGCTAATTCCTAGGGGAAGATGAAGGAGATCGACCACGCAAGAAAATCCACGG
TCCAGTTCCTGTTGCTATCCTGGCGATTCCAGTAATAGCTCGGAGACCCGTATAGATGGT
AAGAGCTATCCATATTCCAAGAAAGCCATTGAACTTTGCCATGTATATTATTGCTGTTAT
GCTTATCCCCGCAACTCCAACCATGGAGTATGCAGTGTAAGTAAAATCAGATGCTCCAAA
ATTGACTCCGTCCAACACAAAAGCAAGTGAGTTTATTGGCTGTGTTGCTGCTACAAACGG
TATTCCAATGGCTATGAGGTGAATAACGGCAGGGTCCTTAGTAAATATTCCAGCACCAAA
GTATAGTCCTAGTCCAACGAAAACGGACAATCCAAGTCCTAGCACAAAACCCATCTGTAG
AACACGGGATGCAGCAGAAGACACTTTGTTATAGTCCTTCTCGGCAAAAGAACAAGCCAG
AATCGCCTGACCGGCTACAGCAAGACCATCGGCAAGGAGAGAAGTAGTTAACCAGACTTG
TAAACAGATCTGAAAAGCAGCCATTGGTGTTGTTCCTAGCCGAGCCGCCATTGCTGCTGC
TAGTGTCTGACAAAACGTCACAGCTATGGTCCTTGCGAGCAATAGTCCCCCATTTTTAGG
ACTTGCCGACTGTAAAGCTCCAAAGTTTGGTGGCATCAAATTAACTTTACTAGCGAGGGG

QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 3

CO CL3140Contig1 961 3 4 U
ATAAATTATAATTCTTCCAGGCATGGAACTGAATTAAAACGAAAGCATACAGAAATGAGT
TGTTTACCAAAATGGATAAGTTTAAAACTTTTAACATTAAATACAGGAATAGTCTTTAAA
TGAATGTAGAAATATGATCTTTTAGTCAGTTTTAATGCAGTTGTCTTAACCTCTTATTCC
TCAGCAATGGTAATTTTTGGTATTAATAAAAATGAAAATTTTTGCCATATGATTTGAGAA
CTATTCGTCAGTCGAGATTGCAGGACAAGTAGGGTTGCAAATAGGCGACGGACAGTCTAT
CTTCTGGAATGCATTCCGACCATAAAACCAGTTTCCTACTGCTTGTGAAATTTTCGAATT
GGCGACTTGGGGACCTTTGGCACCGGACCAAGAGGCGGCGCTTCCGCCTTGGCAATGAGC
GTGACACGAGTCCAAGAACAGTCCTCTCGACGGAGTAGAGTGAACCGGAGACAATGCACG
CATCATCTGATCCCTAAACCCTTGGACGGTTTTGAGCTGAGCGGCCGTACATTTCTTAAG
ATCAAGCTTACAGTTCTTCCACTCCTTACGCTTATCAACAGCAGTTGGAGCCAAAACATT
CTTGATCTGCCAGGAATCGAAGGCAGCATTAATGACAAAGAGTGGTGTTCGCATGGATGG
AACAACGTTTTGCGGGAAGAAACAGAGTTCAGGTTTCATTTTTGAGGTGCATGAAACAGG
AAGAGTCTTTGCAGATCCGTGGAGTGCGACGACTTTACTGTAATACGTTTGGATGTACGA
TCCTCCTGATATATCCTTACCATGAATAAAGTAACCAGCATCAGAAACACATTTGACTCT
AGCAGTTGGGGGAAGTATGGCTCGGAAAGTGTCACAGTGTAGAATCGCGGCCAATGCTCC
GGCTGAACAACCTGAGAGTATCGCGTTTTGAGCGTTTTTCATTCCTTTAGCCATAAGATC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BI53JQ U 62
AF RR2AF96JQ U 1
AF RR2BI53TF C 199
BS 1 558 RR2AF96JQ
BS 559 559 RR2BI53TF
BS 560 708 RR2AF96JQ
BS 709 961 RR2BI53TF

RD RR2BI53JQ 118 0 0
GTTTACCAAAATGGATAAGTTTAAAACTTTTAACATTAAATACAGGAATAGTCTTTAAAT
GAATGTAGAAATATGATCTTTTAGTCAGTTTTAATGCAGTTGTCTTAACCTCTTATTC

QA 1 118 1 118
DS 

RD RR2AF96JQ 708 0 0
ATAAATTATAATTCTTCCAGGCATGGAACTGAATTAAAACGAAAGCATACAGAAATGAGT
TGTTTACCAAAATGGATAAGTTTAAAACTTTTAACATTAAATACAGGAATAGTCTTTAAA
TGAATGTAGAAATATGATCTTTTAGTCAGTTTTAATGCAGTTGTCTTAACCTCTTATTCC
TCAGCAATGGTAATTTTTGGTATTAATAAAAATGAAAATTTTTGCCATATGATTTGAGAA
CTATTCGTCAGTCGAGATTGCAGGACAAGTAGGGTTGCAAATAGGCGACGGACAGTCTAT
CTTCTGGAATGCATTCCGACCATAAAACCAGTTTCCTACTGCTTGTGAAATTTTCGAATT
GGCGACTTGGGGACCTTTGGCACCGGACCAAGAGGCGGCGCTTCCGCCTTGGCAATGAGC
GTGACACGAGTCCAAGAACAGTCCTCTCGACGGAGTAGAGTGAACCGGAGACAATGCACG
CATCATCTGATCCCTAAACCCTTGGACGGTTTTGAGCTGAGCGGCCGTACATTTCTTAAG
ATCAAGCTTACAGTTCTTTCACTCCTTACGCTTATCAACAGCAGTTGGAGCCAAAACATT
CTTGATCTGCCAGGAATCGAAGGCAGCATTAATGACAAAGAGTGGTGTTCGCATGGATGG
AACAACGTTTTGCGGGAAGAAACAGAGTTCAGGTTTCATTTTTGAGGT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2BI53TF 763 0 0
GGTATTAATAAAAATGAAAATTTTTGCCATATGATTTGAGAACTATTCGTCAGTCGAGAT
TGCAGGACAAGTAGGGTTGCAAATAGGCGACGGACAGTCTATCTTCTGGAATGCATTCCG
ACCATAAAACCAGTTTCCTACTGCTTGTGAAATTTTCGAATTGGCGACTTGGGGACCTTT
GGCACCGGACCAAGAGGCGGCGCTTCCGCCTTGGCAATGAGCGTGACACGAGTCCAAGAA
CAGTCCTCTCGACGGAGTAGAGTGAACCGGAGACAATGCACGCATCATCTGATCCCTAAA
CCCTTGGACGGTTTTGAGCTGAGCGGCCGTACATTTCTTAAGATCAAGCTTACAGTTCTT
CCACTCCTTACGCTTATCAACAGCAGTTGGAGCCAAAACATTCTTGATCTGCCAGGAATC
GAAGGCAGCATTAATGACAAAGAGTGGTGTTCGCATGGATGGAACAACGTTTTGCGGGAA
GAAACAGAGTTCAGGTTTCATTTTTGAGGTGCATGAAACAGGAAGAGTCTTTGCAGATCC
GTGGAGTGCGACGACTTTACTGTAATACGTTTGGATGTACGATCCTCCTGATATATCCTT
ACCATGAATAAAGTAACCAGCATCAGAAACACATTTGACTCTAGCAGTTGGGGGAAGTAT
GGCTCGGAAAGTGTCACAGTGTAGAATCGCGGCCAATGCTCCGGCTGAACAACCTGAGAG
TATCGCGTTTTGAGCGTTTTTCATTCCTTTAGCCATAAGATCC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 3

CO CL3141Contig1 833 3 14 U
GGGCCCTCCTCTCCCCCTCACCAAACTCCCTGTTAATGTTCTTGTAAAAGCCGTCATTAC
AAGACCCCCAAGACCTCGAGCCTTGATTACTCGAACAAACAGAGTTCTGTAAAAAAATTC
GATTTGCTTTCAATCTCAATGGCGCAAGCTAGCAGGATCTGCCATGTCCCATGTCTTAAT
ATCTCCAATCTCTCCAAATCAAACCAAAGCAAATCACCCTTCTCCCTCTCGCTGAAGACA
ACGCAGCAGCAGCCTCCTCGAGCTTCCTCGTGGGGATTGAAGAAGAGTGTGATGACGTTA
ACTCGTCCCGTCAAGGTAACAGCTTCCTCCGTTTCCACGGCGGAGAAAGCAGCGTCGGAG
ATTGTGCTTCAACCAATCAGAGAAATCTCGGGTCTTATCAAGCTACCCGGATCCAAATCT
CTCTCCAATCGGATCCTACTTCTCGCCGCTCTATCTGAGGGAACTACTGTAGTGGACAAC
TTGTTGAACAGTGATGACATCAACTACATGCTTGATGCGTTGAAGAAGCTGGGGCTTAAC
GTGGAACGTGACAGCATAAACAACCGTGCGGTTGTCGAAGGATGCGGCGGGATCTTCCCT
GCTTCCTTGGATTCCAAGGGCGATATCGAGCTGTACCTTGGGAATGCAGGAACTGCCATG
CGTCCACTCACCGCTGCTGTTACTGCTGCAGGTGGCAACGCAAGTTATGTGCTTGATGGG
GTGCCTAGAATGAGGGAAAGACCTATAGGAGATTTGGTTGTTGGTCTTAAACAGCTTGGT
GCTGATGTTGAGTGTACTCTGGGAACTAACTGCCCTCCTGTTCGTGTCATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2D571TF U 1
AF RR2FG58TF U 85
AF RR2GH64TF U 131
BS 1 362 RR2D571TF
BS 363 363 RR2FG58TF
BS 364 641 RR2D571TF
BS 642 642 RR2FG58TF
BS 643 649 RR2D571TF
BS 650 650 RR2FG58TF
BS 651 691 RR2D571TF
BS 692 692 RR2FG58TF
BS 693 697 RR2D571TF
BS 698 698 RR2FG58TF
BS 699 732 RR2D571TF
BS 733 733 RR2GH64TF
BS 734 829 RR2FG58TF
BS 830 833 RR2GH64TF

RD RR2D571TF 735 0 0
GGGCCCTCCTCTCCCCCTCACCAAACTCCCTGTTAATGTTCTTGTAAAAGCCGTCATTAC
AAGACCCCCAAGACCTCGAGCCTTGATTACTCGAACAAACAGAGTTCTGTAAAAAAATTC
GATTTGCTTTCAATCTCAATGGCGCAAGCTAGCAGGATCTGCCATGTCCCATGTCTTAAT
ATCTCCAATCTCTCCAAATCAAACCAAAGCAAATCACCCTTCTCCCTCTCGCTGAAGACA
ACGCAGCAGCAGCCTCCTCGAGCTTCCTCGTGGGGATTGAAGAAGAGTGTGATGACGTTA
ACTCGTCCCGTCAAGGTAACAGCTTCCTCCGTTTCCACGGCGGAGAAAGCAGCGTCGGAG
ATCGTGCTTCAACCAATCAGAGAAATCTCGGGTCTTATCAAGCTACCCGGATCCAAATCT
CTCTCCAATCGGATCCTACTTCTCGCCGCTCTATCTGAGGGAACTACTGTAGTGGACAAC
TTGTTGAACAGTGATGACATCAACTACATGCTTGATGCGTTGAAGAAGCTGGGGCTTAAC
GTGGAACGTGACAGCATAAACAACCGTGCGGTTGTCGAAGGATGCGGCGGGATCTTCCCT
GCTTCCTTGGATTCCAAGGGCGATATCGAGCTGTACCTTGGAAATGCAG*AACTGCCATG
CGTCCACTCACCGCTGCTGTTACTGCTGCAG*TGGCA*CGCAAGTTATGTGCTTGATGGG
GTGCCTAGAATG
AGG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2FG58TF 745 0 0
AGGG
ACTCGAACAAACAGAGTTCTGTAAAAAAATTCGATTTGCTTTCAATCTCAATGGCGCAAG
CTAGCAGGATCTGCCATGTCCCATGTCTTAATATCTCCAATCTCTCCAAATCAAACCAAA
GCAAATCACCCTTCTCCCTCTCGCTGAAGACAACGCAGCAGCAGCCTCCTCGAGCTTCCT
CGTGGGGATTGAAGAAGAGTGTGATGACGTTAACTCGTCCCGTCAAGGTAACAGCTTCCT
CCGTCTCCACGGCGGAGAAAGCAGCGTCGGAGATTGTGCTTCAACCAATCAGAGAAATCT
CGGGTCTTATCAAGCTACCCGGATCCAAATCTCTCTCCAATCGGATCCTTCTTCTCGCCG
CTCTATCTGAGGGAACTACGGTAGTGGACAACTTGTTGAACAGTGATGACATCAACTACA
TGCTTGATGCGTTGAAGAAGCTGGGGCTTAACGTGGAACGTGACAGCATAAACAACCGTG
CGGTTGTCGAAGGATGCGGCGGGATCTTCCCTGCTTCCTTGGATTCCAAGGGCGATATCG
AGCTGTACCTTGGGAATGCAGGAACTGCCATGCGTCCACTCACCGCTGCTGTTACTGCTG
CAGGTGACAACGCAAGTTATGTGCTTGATGGGGTGCCTAGAATGTGGGAAAGACCTATAG
GAGATTTGGTTGTTGGTCTTAAACAGCTTGGTGCTGATGTTGAGTGTACTCTGGGAACTA
ACTGCCCTCCTGTTCGTGTCA

QA 5 745 5 745
DS 

RD RR2GH64TF 703 0 0
G
AATCTCAATGGCGCAAGCTAGCAGGATCTGCCATGTCCCATGTCTTAATATCTCCAATCT
CTCCAAATCGAACCAAAGCAAATCACCCTTCTCCCTCTCGCTGAAGACGACGCAGCAGC*
**CTCCTCGAGCTTCTTCGTGGGGATTGAAGAAGAGTGTGATGACGTTAACTCGTCCCGT
CAAGGTAACAGCTTCCTCCGTTTCCACGGCGGAGAAAGCAGCGTCGGAGATTGTGCTTCA
ACCCATCAGAGAAATCTCGGGTCTTATCAAGCTACCCGGATCCAAATCTCTCTCCAATCG
GATCCTCCTTCTCGCCGCTCTATCTGAGGGAACTACTGTAGTGGACAACTTGTTGAACAG
TGATGACATCAACTACATGCTCGATGCGTTGAAGAAGCTGGGGCTTAACGTGGAGCGTGA
CAGTGCAAACAACCGTGCTGTTGTTGAAGGATGCGGTGGGATCTTCCCAGCTTCCTTGGA
TTCCAAGGGCGATATCGAGCTGTACCTTGGGAATGCAGGAACTGCCATGCGTCCACTCAC
CGCTGCTGTTACTGCTGCAGGTGGCAACGCAAGTTATGTGCTTGATGGGGTGCCTAGAAT
GAGGGAAAGACCTATAGGAGATTTGGTTGTTGGTCTTAAGCAGCTTGGTGCTGATGTTGA
GTGTACTCTTGGAACTAACTGCCCTCCTGTTCGTGTCATGCT

QA 2 703 2 703
DS 



AS 1 3

CO CL3142Contig1 1360 3 16 U
GGGGACCTATTCTCTACTCTTATCCCCTAACAAATCTCAAAGACATAGAGAAGTATGTCT
CACAGAAAGTTTGAGCATCCAAGACATGGTTCTTTGGGTTTCCTTCCAAGGAAAAGGGCT
AACAGGCAACGTGGAAAAGTGAAGGCCTTCCCCAAAGATGATCCAACTAAGCCTTGCAGA
CTCACTTCCTTCTTGGGATACAAAGCTGGGATGACACACATTGTCAGAGAAGTTGAGAAA
CCTGGATCAAAGCTCCACAAGAAGGAAACATGTGAAGCTGTGACTGTGATCGAAACGCCT
CCGATGGTGGTCGTTGGCGTGGTTGGGTACGTGAAGACACCCCGTGGTCTCCGCTCTCTA
AGCACCGTCTGGGCTCAGCATCTGAGCGAAGAAGTGAGGAGGAGGTTCTACAAGAACTGG
GCCAAGTCAAAGAAGAAGGCTTTCACCAGATACTCGAAGAAGCACGAAACCGAAGAAGGC
AAAAAAGACATTCAGTCTCAGCTTGACAAGATGAAGAAGTACTGCACAGTCATCAGAGTT
CTTGCCCACACTCAGATAAGGAAAGTGAAAGGACTGAAGCAGAAGAAGGCTCATCTTAAT
GAGATTCAAGTCAACGG*TGGAGATGTTGCAAAGAAAGTTGACTATGCGTACAGCTTATT
CGAGAAGCAAGTCCCTGTAGATGCCATCTTCCAGAAAGACGAGATGATTGATATCATAGG
TGTCACTAAAGGAAAAGGTTACGAAGGTGTGGTGACGAGATGGGGTGTGACGCGTCTTCC
GAGGAAGACACACCGTGGTCTCCGCAAGGTGGCTTGTATTGGAGCTTGGCACCCTGCTAG
AGTCTCTTACACGGTGGCTAGAGCTGGACAGAACGGGTACCACCATCGTACTGAGATGAA
CAAGAAGATTTACAGGCTTGGTAAAGTTGGGGAGGAGACTCACACTGCCATGACGGAGTT
TGATAGGACGGAGAAGGAGATTACTCCCATGGGAGGGTTCCCGCACTATGGGGTGGTGAA
GGATGATTATCTGTTGATCAAGGGGTGTTGCGTGGGGCCGAAGAAACGTGTTGTGACTTT
GAGGCAGACGTTGTTGAAGCAGACTTCTAGGGTTGCGTTGGAGGAGATTAAGCTCAAGTT
TATTGATACAGCGTCCAACGGTGGACACGGTCGTTTCCAGACTGGTGAAGAGAAGGCTAG
GTTCTATGGTAGAGTCACCAAGGCTTAGATTTTTTTATTTTTTCCAAATCCCATTAATAA
ATTGTTTCGACTCTCTTTCTCTTTGTTGGTCGTTGTTCTTCTTTTGACGTTTTACATCCT
CTTCAGTTTTGGTTTAATGTGACATTGATTTTTTTTTGGC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH80TF U 1
AF RR2DU85TF U 2
AF RR2GH80JQB C 495
BS 1 215 RR2GH80TF
BS 216 216 RR2DU85TF
BS 217 368 RR2GH80TF
BS 369 369 RR2DU85TF
BS 370 428 RR2GH80TF
BS 429 429 RR2DU85TF
BS 430 455 RR2GH80TF
BS 456 456 RR2DU85TF
BS 457 617 RR2GH80TF
BS 618 618 RR2DU85TF
BS 619 636 RR2GH80TF
BS 637 637 RR2DU85TF
BS 638 708 RR2GH80TF
BS 709 709 RR2GH80JQB
BS 710 719 RR2GH80TF
BS 720 1360 RR2GH80JQB

RD RR2GH80TF 726 0 0
GGGGACCTATTCTCTACTCTTATCCCCTAACAAATCTCAAAGACATAGAGAAGTATGTCT
CACAGAAAGTTTGAGCATCCAAGACATGGTTCTTTGGGTTTCCTTCCAAGGAAAAGGGCT
AACAGGCAACGTGGAAAAGTGAAGGCCTTCCCCAAAGATGATCCAACTAAGCCTTGCAGA
CTCACTTCCTTCTTGGGATACAAAGCTGGGATGACTCACATTGTCAGAGAAGTTGAGAAA
CCTGGATCAAAGCTCCACAAGAAGGAAACATGTGAAGCTGTGACTGTGATCGAAACGCCT
CCGATGGTGGTCGTTGGCGTGGTTGGGTACGTGAAGACACCCCGTGGTCTCCGCTCTCTA
AGCACCGTGTGGGCTCAGCATCTGAGCGAAGAAGTGAGGAGGAGGTTCTACAAGAACTGG
GCCAAGTCCAAGAAGAAGGCTTTCACCAGATACTCTAAGAAGCACGAAACCGAAGAAGGC
AAAAAAGACATTCAGTCTCAGCTTGACAAGATGAAGAAGTACTGCACAGTCATCAGAGTT
CTTGCCCACACTCAGATAAGGAAAGTGAAAGGACTGAAGCAGAAGAAGGCTCATCTTAAT
GAGATTCAAGTCAACGGGTGGAGATGTTGCAAAGAA*GTTGACTATGCGTACAGCTTATT
CGAGAAGCAAGTCCCTGTAGATGCCATCTTCCAGAAAGACGAGATGAT*GATATCATAG
TGTCACT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2DU85TF 691 0 0
GGGACCTATTCTCTACTCTTATCCCCTAACAAATCTCAAAGACATAGAGAAGTATGTCTC
ACAGAAAGTTTGAGCATCCAAGACATGGTTCTTTGGGTTTCCTTCCAAGGAAAAGTGCTA
ACAGGCGACGTGGAAAAGTGAAGGCCTTCCCCAAAGATGATCCAACTAAGCCTTGCAGAC
TCACTTCCTTCTTGGGATACAAAGCTGGGATGACACACATTGTCAGAGAAGTTGAGAAAC
CTGGATCAAAGCTCCACAAGAAGGAAACATGTGAAGCTGTGACTGTGATCGAAACGCCTC
CGATGGTGGTCGTTGGCGTTGTTGGGTACGTGAAGACACCCCGTGGTCTCCGCTCTCTAA
GCACTGTCTGGGCTCAGCATCTGAGCGAGGAAGTGAGGAGGAGGTTCTACAAGAACTGGG
CCAAGTCAAAGAAGTAGGCTTTCACCAGATACTCGAAGAAGCACGAAACCGAAGAAGGCA
AAAAAGACATTCAGTCTCAGCTGGACAAGATGAAGAAGTACTGCACCGTCATCAGAGTTC
TTGCCCACACTCAGATAAGGAAAGTGAAAGGACTGAAGCAGAAGAAAGCTCATCTGAATG
AGATTCAAGTCAACGG*TGGAGATGTTGCAAAGAAAGTAGACTATGCGTATAGCCTGTTC
GAGAAGCAAGTCTCTGTAGATGCCATCTTCC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2GH80JQB 866 0 0
GTCTCAGCTTGACAAGATGAAGAAGTACTGCACAGTCATCAGAGT*CTTGCCCACACTCA
GATAAGGAAAGTGAAAGGACTGAAGCAGAAGAAGGCTCATCTTAATGAGATTCAAGTCAA
CGG*TGGAGATGTTGCAAAGAAGGTTGACTATGCGTACAGCTTATTCGAGAAGCAAGTCC
CTGTAGATGCCATCTTCCAGAAAGACGAGATGATTGATATCATAGGTGTCACTAAAGGAA
AAGGTTACGAAGGTGTGGTGACGAGATGGGGTGTGACGCGTCTTCCGAGGAAGACACACC
GTGGTCTCCGCAAGGTGGCTTGTATTGGAGCTTGGCACCCTGCTAGAGTCTCTTACACGG
TGGCTAGAGCTGGACAGAACGGGTACCACCATCGTACTGAGATGAACAAGAAGATTTACA
GGCTTGGTAAAGTTGGGGAGGAGACTCACACTGCCATGACGGAGTTTGATAGGACGGAGA
AGGAGATTACTCCCATGGGAGGGTTCCCGCACTATGGGGTGGTGAAGGATGATTATCTGT
TGATCAAGGGGTGTTGCGTGGGGCCGAAGAAACGTGTTGTGACTTTGAGGCAGACGTTGT
TGAAGCAGACTTCTAGGGTTGCGTTGGAGGAGATTAAGCTCAAGTTTATTGATACAGCGT
CCAACGGTGGACACGGTCGTTTCCAGACTGGTGAAGAGAAGGCTAGGTTCTATGGTAGAG
TCACCAAGGCTTAGATTTTTTTATTTTTTCCAAATCCCATTAATAAATTGTTTCGACTCT
CTTTCTCTTTGTTGGTCGTTGTTCTTCTTTTGACGTTTTACATCCTCTTCAGTTTTGGTT
TAATGTGACATTGATTTTTTTTTGGC

QA 1 866 1 866
DS 



AS 1 2

CO CL3143Contig1 615 2 5 U
GCTCAAAAGAACAATCATTTTATTGTCTATGATTAGGACCCCAGTGACAAGAACTATCAA
CCAATGGCCACTAAAAGAACACACAAATGTTCGTTTAACAATTTTAACCAAAAGAAAAGT
GTCATAAAAAGCTTACATGAAAAATAGAAAAGAGACAAGAGACACCATGAAACAATTCAC
AAGAAATAGGGATCTCTAAAACAACATTTCACCGTAATTTTCATAAGCTAAAATTTTCAA
ATCTTTTTCCTTTTCTTTGATCTTCCCCTGCTTTGTTTTCTTGACAAATGGCTTAAATAA
AAACAAAAAAAAACAACACAGATTCTCATATTACATGAGTCTGAATTCGTACTCACCAGC
CATGGTTATATATCTCACCCACGGAAGAACTTGGTAGCCACTCTTTTCAATGATCTTCAG
GTATCGAACCTGTATTCCTGAAACAGTGAAATATGGGATCTCGAATTTGACACGGATAGG
AGCCTTTCTCTCAGGTGTAGCTTCCTCTGCGGTTATGCTTGGAAGATGGAACTCTGCTCT
CAACATATACTCCTTGTTCCCAGGGAAAGATTTGATCTTCCAAACCAATGCATCTTTTTC
GGGAGCATATGCGGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2GD33JQ U 1
AF RR2GM51JQ U 1
BS 1 388 RR2GD33JQ
BS 389 389 RR2GM51JQ
BS 390 483 RR2GD33JQ
BS 484 484 RR2GM51JQ
BS 485 615 RR2GD33JQ

RD RR2GD33JQ 615 0 0
GCTCAAAAGAACAATCATTTTATTGTCTATGATTAGGACCCCAGTGACAAGAACTATCAA
CCAATGGCCACTAAAAGAACACACAAATGTTCGTTTAACAATTTTAACCAAAAGAAAAGT
GTCATAAAAAGCTTACATGAAAAATAGAAAAGAGACAAGAGACACCATGAAACAATTCAC
AAGAAATAGGGATCTCTAAAACAACATTTCACCGTAATTTTCATAAGCTAAAATTTTCAA
ATCTTTTTCCTTTTCTTTGATCTTCCCCTGCTTTGTTTTCTTGACAAATGGCTTAAATAA
AAACAAAAAAAAACAACACAGATTCTCATATTACATGAGTCTGAATTCGTACTCACCAGC
CATGGTTATATATCTCACCCACGGAAGAGCTTGGTAGCCACTCTTTTCAATGATCTTCAG
GTATCGAACCTGTATTCCTGAAACAGTGAAATATGGGATCTCGAATTTGACACGGATAGG
AGCTTTTCTCTCAGGTGTAGCTTCCTCTGCGGTTATGCTTGGAAGATGGAACTCTGCTCT
CAACATATACTCCTTGTTCCCAGGGAAAGATTTGATCTTCCAAACCAATGCATCTTTTTC
GGGAGCATATGCGGC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2GM51JQ 614 0 0
GCTCAAAAGAACAATCATTTTATTGTCTATGATTAGGACCCCAGTGACAAGAACTATCAA
CCAATGGCCACTAAAAGAACACACAAATGTTCGTTTAACAATTTTAACCAAAAGAAAAGT
GTCATAAAAAGCTTACATGAAAAATAGAAAAGAGACAAGAGACACCATGAAACAATTCAC
AAGAAATAGGGATCTCTAAAACAACATTTCACCGTAATTTTCATAAGCTAAAATTTTCAA
ATCTTTTTCCTTTTCTTTGATCTTCCCCTGCTTTGTTTTCTTGACAAATGGCTTAAATAA
AAACAAAAAAAAACAACACAGATTCTCATATTACATGAGTCTGAATTCGTACTCACCAGC
CATGGTTATATATCTCACCCACGGAAGAACTTGGTAGCCACTCTTTTCAATGATCTTCAG
GTATCGAACCTGTATTCCTGAAACAGTGAAATATGGGATCTCGAATTTGACACGGATAGG
AGCCTTTCTCTCAGGTGTAGCTTCCTCTGCGGTTATGCTTGGAAGATGGAACTCTGCTCT
CAACATATACTCCTTGTTCCCAGGGAAAGATTTGATCTTCCAAACCAATGCATCTTTTTC
GGGAGCATATGCGG

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 3

CO CL3144Contig1 685 3 9 U
GGATAGCATCCTATTCGTCAACCACACAAGAAATGGCTAGTTTTATGTCCGGAGCAGTAC
AGTTCAGAAGAGGTCTGAAACCTAAAGGGAAGACTTATGGATTGACCAATCAAAAGAGAA
GAGAGATTGGAGAAATCTTTGATCTCTTCGACATAGACGGTTCAGGTAGCATCGATGCTC
GCGAGCTCAACGTTGCTATGAGGTCTCTGGGGTTTGAAATGACTAATGAGCAAATAAACG
AACTGATGGCAGAGGTGGATAAAAACAATAGTGGAACAATAGATTTCGAGGAGTTTGTGC
ATATGATGACAACTAAATTCGGAGAACGAGACTCTACAGATGAATTGTCTAAAGCATTTA
AGATCATTGATCACGACAACAATGGAAAGATTTCACCTCACGATATAAAGCAGATTGCGA
AGGAGCTAGGAGAAAATTTCACAGATAATGAGATAGAAGAAATGATCGAAGAAGCTGATC
GTGATAAAAATGGAGAAGTTAGTTTGGAGGAGTTCATGAAGATGATGAGGAGAACTTCTT
ACGGCTACTAATAGTATTGCTAGTTGAATATATTAAGTGATCACTATGATTATATAATAA
AACTGATTTGTAGTAAATAAAGAAGTTTGAAGTGTGTTTTGAGAATAAAAATGTAATGAT
GTAATTACATCCATTATTAAGAACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C667TF U 17
AF RR2F171JQ C 1
AF RR2F171TF U 1
BS 1 16 RR2F171TF
BS 17 89 RR2C667TF
BS 90 90 RR2F171TF
BS 91 128 RR2C667TF
BS 129 129 RR2F171TF
BS 130 289 RR2C667TF
BS 290 290 RR2F171TF
BS 291 367 RR2C667TF
BS 368 685 RR2F171TF

RD RR2C667TF 351 0 0
GTCAACCACACAAGAAATGGCTAGTTTTATGTCCGGAGCAGTACAGTTCAGAAGAGGTCT
GAAACCTAAAGGGGAGACTTATGGATTGACCAATCAAAAGAGAAGAGAGATTAGAGAAAT
CTTTGATCTCTTCGACATAGACGGTTCAGGTAGCATCGATGCTCGCGAGCTCAACGTTGC
TATGAGGTCTCTGGGGTTTGAAATGACTAATGAGCAAATAAACGAACTGATGGCAGAGGT
GGATAAAAACAATAGTGGAACAATAGATTTCGAAGAGTTTGTGCATATGATGACAACTAA
ATTCGGAGAACGAGACTCTACAGATGAATTGTCTAAAGCATTTAAGATCAT

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR2F171JQ 685 0 0
GGATAGCATCCTATTCGTCAACCACACAAGAAATGGCTAGTTTTATGTCCGGAGCAGTAC
AGTTCAGAAGAGGTCTGAAACCTAAAGGGAAGACTTATGGATTGACCAATCAAAAGAGAA
GAGAGATTGGAGAAATCTTTGATCTCTTCGACATAGACGGTTCAGGTAGCATCGATGCTC
GCGAGCTCAACGTTGCTATGAGGTCTCTGGGGTTTGAAATGACTAATGAGCAAATAAACG
AACTGATGGCAGAGGTGGATAAAAACAATAGTGGAACAATAGATTTCGAGGAGTTTGTGC
ATATGATGACAACTAAATTCGGAGAACGAGACTCTACAGATGAATTGTCTAAAGCATTTA
AGATCATTGATCACGACAACAATGGAAAGATTTCACCTCACGATATAAAGCAGATTGCGA
AGGAGCTAGGAGAAAATTTCACAGATAATGAGATAGAAGAAATGATCGAAGAAGCTGATC
GTGATAAAAATGGAGAAGTTAGTTTGGAGGAGTTCATGAAGATGATGAGGAGAACTTCTT
ACGGCTACTAATAGTATTGCTAGTTGAATATATTAAGTGATCACTATGATTATATAATAA
AACTGATTTGTAGTAAATAAAGAAGTTTGAAGTGTGTTTTGAGAATAAAAATGTAATGAT
GTAATTACATCCATTATTAAGAACG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2F171TF 685 0 0
GGATAGCATCCTATTCGTCAACCACACAAGAAATGGCTAGTTTTATGTCCGGAGCAGTAC
AGTTCAGAAGAGGTCTGAAACCTAAAGGGAAGACTTATGGATTGACCAATCAAAAGAGAA
GAGAGATTGGAGAAATCTTTGATCTCTTCGACATAGACGGTTCAGGTAGCATCGATGCTC
GCGAGCTCAACGTTGCTATGAGGTCTCTGGGGTTTGAAATGACTAATGAGCAAATAAACG
AACTGATGGCAGAGGTGGATAAAAACAATAGTGGAACAATAGATTTCGAGGAGTTTGTGC
ATATGATGACAACTAAATTCGGAGAACGAGACTCTACAGATGAATTGTCTAAAGCATTTA
AGATCATTGATCACGACAACAATGGAAAGATTTCACCTCACGATATAAAGCAGATTGCGA
AGGAGCTAGGAGAAAATTTCACAGATAATGAGATAGAAGAAATGATCGAAGAAGCTGATC
GTGATAAAAATGGAGAAGTTAGTTTGGAGGAGTTCATGAAGATGATGAGGAGAACTTCTT
ACGGCTACTAATAGTATTGCTAGTTGAATATATTAAGTGATCACTATGATTATATAATAA
AACTGATTTGTAGTAAATAAAGAAGTTTGAAGTGTGTTTTGAGAATAAAAATGTAATGAT
GTAATTACATCCATTATTAAGAACG

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL3145Contig1 866 2 4 U
TTTTATATGTGAAAAAGATATATAAGAATCAAGAGATCATCTTCTTCGAGCTTCATCATC
ATCATCATCAGCGATTTCTCTGCCTCCATTCCGCGAAAACACTTTTCGACTCTCGATAAT
CGGATTCTTTCTCTTCCATTAGCTTAAGTTTCGAGGTCCGATGGCTACTACTTCCGCCCC
TAAATCCGTCCATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATGAGGTGGATCTAAGTAC
TTACAAGGGGAAAGCTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTC
AAACTATACTGAGCTTGCCCAGCTCTATCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCT
TGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCA
GTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGCCGAGTACCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGG
TGACAAGGCTGCTCCAATCTACAAGTTTCTAAAATCAAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAG
CGGCATCAAGTGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGAAATGTCGTTGACCG
TTACGCTCCAACCACTTCTCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGT
TACTGCTAAATAAAAAGAACAACGAAGAGGGCGTTACTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGC
TCATAGTATTGTATTTATCAATACTGTAATATATCTCTTGAGTTCGCAAGTGTGTTTTGG
ATTAGTTGTTTCCTATCACTTAAATTCGTTTGTATTAACGGATAATGTGTAATATACTCT
CCTTTTAATAAAGATGGATATTTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F775TF U 1
AF RR2F775JQ C 191
BS 1 524 RR2F775TF
BS 525 525 RR2F775JQ
BS 526 608 RR2F775TF
BS 609 866 RR2F775JQ

RD RR2F775TF 608 0 0
TTTTATATGTGAAAAAGATATATAAGAATCAAGAGATCATCTTCTTCGAGCTTCATCATC
ATCATCATCAGCGATTTCTCTGCCTCCATTCCGCGAAAACACTTTTCGACTCTCGATAAT
CGGATTCTTTCTCTTCCATTAGCTTAAGTTTCGAGGTCCGATGGCTACTACTTCCGCCCC
TAAATCCGTCCATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATGAGGTGGATCTAAGTAC
TTACAAGGGGAAAGCTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTC
AAACTATACTGAGCTTGCCCAGCTCTATCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCT
TGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCA
GTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGCCGAGTACCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGG
TGACAAGGCTGCTCCAATCTACAAGTTTCTAAAATCAAGCAAAG*CGGGCTTTTTGGAAG
CGGCATCAAGTGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGAAATGTCGTTGACCG
TTACGCTC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2F775JQ 676 0 0
CATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATGAGGTGGATCTAAGTACTTACAAGGGG
AAAGCTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCAAACTATACT
GAGCTTGCCCAGCTCTATCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCT
TGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGT
ACCCGTTTCAAGGCCGAGTACCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCT
GCTCCAATCTACAAGTTTCTAAAATCAAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGCATCAAG
TGGAACTTCTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGAAATGTCGTTGACCGTTACGCTCCA
ACCACTTCTCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAA
TAAAAAGAACAACGAAGAGGGCGTTACTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATT
GTATTTATCAATACTGTAATATATCTCTTGAGTTCGCAAGTGTGTTTTGGATTAGTTGTT
TCCTATCACTTAAATTCGTTTGTATTAACGGATAATGTGTAATATACTCTCCTTTTAATA
AAGATGGATATTTTAG

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 3

CO CL3146Contig1 701 3 13 U
AAGTCAAAAAGAGATCGTATTTCATCCAGTTTTAACATGCGATACATAAAGCTTTGACAC
CATTGCCAATGGAGAGACAAAGCTCAAGACTTTTAGAGGCAAAACGCTGCTAAAGTCTAA
TACTTTTATTTATATACACAGACTCGTGGAAACACTGTGAGCAACTCTCAGACAAATCCT
TCAACCAAAATCGGCTTCCTCTCCTCTTCCTCGTCTTCCTCACTCTGATCCTTCTCCTCC
TTGCTGCTCTCAACACCTTCAACGTCTACATCTCTCAAACCATCACCGCAGCTGCTCCCT
TCTTCTCCTACTTCCCCCGCCACCACCAACGCATCTTCCATCTTCCCGTTACCCTTTCCA
ACTAGACAAGGCCCAGAATCCCTTCCATCATCCCCGCCCACGACGATCGTATCGGAACCT
CCGAGAACTGGCTCCGTCTCCTTCGTTCCCGGCCGCGGATCAGCCACGTAACCACCGCCG
CCTTCTTTTTCCTCGTCGTCGTGCTCGAAAAGCGACGCCGCGCGCGATTTCACGGCGTCT
GCGGCTTTACGAAACGCTTCCTGTATAGAATCAGGCGGCAGAGCACAGTCTTCGAGGCCG
GCATCTGCCAACGCCGGCGGAAGGATCTTGTCAAGCAAGCCGGCTCTTTCTTTCGCAGCC
TCCATAGTATAGATTCAGAGCTTCTCTCCTGTTCTGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E469JQ U 1
AF RR2EX21JQ U 1
AF RR2EX21TF C 2
BS 1 56 RR2E469JQ
BS 57 57 RR2EX21JQ
BS 58 116 RR2E469JQ
BS 117 117 RR2EX21JQ
BS 118 293 RR2E469JQ
BS 294 294 RR2EX21JQ
BS 295 309 RR2E469JQ
BS 310 310 RR2EX21JQ
BS 311 317 RR2E469JQ
BS 318 318 RR2EX21JQ
BS 319 335 RR2E469JQ
BS 336 610 RR2EX21JQ
BS 611 701 RR2EX21TF

RD RR2E469JQ 335 0 0
AAGTCAAAAAGAGATCGTATTTCATCCAGTTTTAACATGCGATACATAAAGCTTTGCCAC
CATTGCCAATGGAGAGACAAAGCTCAAGACTTTTAGAGGCAAAACGCTGCTAAAGTATAA
TACTTTTATTTATATACACAGACTCGTGGAAACACTGTGAGCAACTCTCAGACAAATCCT
TCAACCAAAATCGGCTTCCTCTCCTCTTCCTCGTCTTCCTCACTCTGATCCTTCTCCTCC
TTGCTGCTCTCAACACCTTCAACGTCTACATCTCTCAAACCATCACCGCAGCTCCTCCCT
TCTTCTCCTCCTTCCCCAGCCACCACCAACGCATC

QA 1 335 1 335
DS 

RD RR2EX21JQ 610 0 0
GAGTA
AAAAAGAGATCGTATTTCATCCAGTTTTAACATGCGATACATAAAGCTTTGACACCATTG
CCAATGGAGAGACAAAGCTCAAGACTTTTAGAGGCAAAACGCTGCTAAAGTCTAATACTT
TTATTTATATACACAGACTCGTGGAAACACTGTGAGCAACTCTCAGACAAATCCTTCAAC
CAAAATCGGCTTCCTCTCCTCTTCCTCGTCTTCCTCACTCTGATCCTTCTCCTCCTTGCT
GCTCTCAACACCTTCAACGTCTACATCTCTCAAACCATCACCGCAGCTGCTCCCTTCTTC
TCCTACTTCCCCCGCCACCACCAACGCATCTTCCATCTTCCCGTTACCCTTTCCAACTAG
ACAAGGCCCAGAATCCCTTCCATCATCCCCGCCCACGACGATCGTATCGGAACCTCCGAG
AACTGGCTCCGTCTCCTTCGTTCCCGGCCGCGGATCAGCCACGTAACCACCGCCGCCTTC
TTTTTCCTCGTCGTCGTGCTCGAAAAGCGACGCCGCGCGCGATTTCACGGCGTCTGCGGC
TTTACGAAACGCTTCCTGTATAGAATCAGGCGGCAGAGCACAGTCTTCGAGGCCGGCATC
TGCCA

QA 6 610 6 610
DS 

RD RR2EX21TF 700 0 0
GAGT
AAAAAGAGATCGTATTTCATCCAGTTTTAACATGCGATACATAAAGCTTTGACACCATTG
CCAATGGAGAGACAAAGCTCAAGACTTTTAGAGGCAAAACGCTGCTAAAGTCTAATACTT
TTATTTATATACACAGACTCGTGGAAACACTGTGAGCAACTCTCAGACAAATCCTTCAAC
CAAAATCGGCTTCCTCTCCTCTTCCTCGTCTTCCTCACTCTGATCCTTCTCCTCCTTGCT
GCTCTCAACACCTTCAACGTCTACATCTCTCAAACCATCACCGCAGCTGCTCCCTTCTTC
TCCTACTTCCCCCGCCACCACCAACGCATCTTCCATCTTCCCGTTACCCTTTCCAACTAG
ACAAGGCCCAGAATCCCTTCCATCATCCCCGCCCACGACGATCGTATCGGAACCTCCGAG
AACTGGCTCCGTCTCCTTCGTTCCCGGCCGCGGATCAGCCACGTAACCACCGCCGCCTTC
TTTTTCCTCGTCGTCGTGCTCGAAAAGCGACGCCGCGCGCGATTTCACGGCGTCTGCGGC
TTTACGAAACGCTTCCTGTATAGAATCAGGCGGCAGAGCACAGTCTTCGAGGCCGGCATC
TGCCAACGCCGGCGGAAGGATCTTGTCAAGCAAGCCGGCTCTTTCTTTCGCAGCCTCCAT
AGTATAGATTCAGAGCTTCTCTCCTGTTCTGTGTCC

QA 5 700 5 700
DS 



AS 1 3

CO CL3147Contig1 788 3 10 U
GATATCAAATGAAAAATTTTATTGAAACTTCAATGTGTTTTACAAGTCTTAATTTGTGCA
TGTTCATTAGTTACAAAGAAAGGAGCAAGAATCAAATCTCTAAAGAGTCTAGACTACGTA
AATCTATCAGCAGACAACTGCACTCCCAGCAACCATAACTGGCTTTGTCGATTCCTTTGC
AGGCGCTTTTCGTGGTTCGGGCATACACTTGACATGAGCTATAGGACCAGACCCGTTCAT
GTGCAAGTAGACAGCATCTCTGTACATCCAATCATCTTCTTCATGGCTGAAAAACTCTTC
CAACGATTCCAAGCACAACGCACACATCTTCTGGTTCTCGTCAGCATGCACCATATGTTG
CTGTTGTTTCTCCTCTTCTTTCGTCTTCTGGGTTTCTCCAAAAGCAGGTTTAGCTCCTCC
GACCGTCGCTCCTGTAGCTGCACTGAGCCAAAGAGACGAGCTCGCAAACCATTCACGCGA
CTTCTTCGGTTTCTGGCTCACCCTCGTAGTCATGGCTTTGGTCGCGTCTTTTGCCATCCT
GTTCTTCCTAACATGCCAGTCCATGTGCTTGCTGTGCTCATCCTGACACTTGAATC*AAC
ACCACACGACGAGCATTGCCTCGGCATGTCGGAATAAAGAGACTTAACAACAGATTCACG
TCGCACGTTAAGATTAATTTTATCAAAATCAAGCCCAAGATCACATTCTTTCTCTTTTTC
TTTGTTGTTAAGAACGCTAAGTAAATCTGCTAATTCTTTGCTCACGATAGGTTGTTGTGG
TAATAACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO88JQ U 1
AF RR2AE11JQ U 1
AF RR2AE11TF C 164
BS 1 14 RR2AE11JQ
BS 15 15 RR2FO88JQ
BS 16 27 RR2AE11JQ
BS 28 28 RR2FO88JQ
BS 29 39 RR2AE11JQ
BS 40 41 RR2FO88JQ
BS 42 146 RR2AE11JQ
BS 147 148 RR2FO88JQ
BS 149 766 RR2AE11JQ
BS 767 788 RR2AE11TF

RD RR2FO88JQ 732 0 0
GATATCAAATGAAAATTTTTATTGAAACTTCAATGTGTTTTACAAGTCTTAATTTGTGCA
TGTTCATTAGTTACAAAGAAATGAGCAAGAATCAAATCTCTAA*GAGTCTAGACTACGTA
AATCTATCAGCAGACAACTGCACTCGCAGCAACCATAACTGGCTTTGTCGATTCCTTTGC
AGGCGCTTTTCGTGGTTCGGGCATACACTTGACATGAGCTATAGGACCAGACCCGTTCAT
GTGCAAGTAGACAGCATCTCTGTACATCCAATCATCATCTTCATGGCTGAAAAACTCTTC
CAACGATTCCAAGCACAACGCACACATCTTCTGATTCTCGTCAGCATGCACCATATGTTG
CTGTTGCTTCTCCTCTTCTTTGGTCTTCAGGGTTTCTCCAAAAGCAGGTTTAGCCCCTTC
GACCGTCACTCCTGTAGCTGCACTGAGCCAAAGAGACGAGCTCGCAAACCAATCACGCGA
CTTCTTCGGTTTCTGGCTCGCCCTCGTAGTCATGGCTTTGGTCGCGTCTTTAGCCATCCT
GTTCTTCCTAACATGCCAGTCCATGTGCTTGCTGTGCTCGTCTTGACACTTGAATCTAAC
ACCACACGACGAGCATTGCCTCGGCATATCAGAATAAAGAGACTTAACAACAGATTCATG
TCGCACGTTAAGATTAATTTTATCAAAATCAAGCCCAATATCACATTCTTTCTCTTTTTC
GTTCTCTTTGTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2AE11JQ 766 0 0
GATATCAAATGAAATATTTTATTGAAATTTCAATGTGTT**ACAAGTCTTAATTTGTGCA
TGTTCATTAGTTACAAAGAAAGGAGCAAGAATCAAATCTCTAAAGAGTCTAGACTACGTA
AATCTATCAGCAGACAACTGCACTCCTCGCAACCATAACTGGCTTTGTCGATTCCTTTGC
AGGCGCTTTTCGTGGTTCGGGCATACACTTGACATGAGCTATAGGACCAGACCCGTTCAT
GTGCAAGTAGACAGCATCTCTGTACATCCAATCATCTTCTTCATGGCTGAAAAACTCTTC
CAACGATTCCAAGCACAACGCACACATCTTCTGGTTCTCGTCAGCATGCACCATATGTTG
CTGTTGTTTCTCCTCTTCTTTCGTCTTCTGGGTTTCTCCAAAAGCAGGTTTAGCTCCTCC
GACCGTCGCTCCTGTAGCTGCACTGAGCCAAAGAGACGAGCTCGCAAACCATTCACGCGA
CTTCTTCGGTTTCTGGCTCACCCTCGTAGTCATGGCTTTGGTCGCGTCTTTTGCCATCCT
GTTCTTCCTAACATGCCAGTCCATGTGCTTGCTGTGCTCATCCTGACACTTGAATC*AAC
ACCACACGACGAGCATTGCCTCGGCATGTCGGAATAAAGAGACTTAACAACAGATTCACG
TCGCACGTTAAGATTAATTTTATCAAAATCAAGCCCAAGATCACATTCTTTCTCTTTTTC
TTTGTTGTTAAGAACGCTAAGTAAATCTGCTAATTCTTTGCTCACG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2AE11TF 625 0 0
TTTGTCGATTCCTTTGCAGGCGCTTTTCGTGGTTCGGGCATACACTTGACATGAGCTATA
GGACCAGACCCGTTCATGTGCAAGTAGACAGCATCTCTGTACATCCAATCATCTTCTTCA
TGGCTGAAAAACTCTTCCAACGATTCCAAGCACAACGCACACATCTTCTGGTTCTCGTCA
GCATGCACCATATGTTGCTGTTGTTTCTCCTCTTCTTTCGTCTTCTGGGTTTCTCCAAAA
GCAGGTTTAGCTCCTCCGACCGTCGCTCCTGTAGCTGCACTGAGCCAAAGAGACGAGCTC
GCAAACCATTCACGCGACTTCTTCGGTTTCTGGCTCACCCTCGTAGTCATGGCTTTGGTC
GCGTCTTTTGCCATCCTGTTCTTCCTAACATGCCAGTCCATGTGCTTGCTGTGCTCATCC
TGACACTTGAATC*AACACCACACGACGAGCATTGCCTCGGCATGTCGGAATAAAGAGAC
TTAACAACAGATTCACGTCGCACGTTAAGATTAATTTTATCAAAATCAAGCCCAAGATCA
CATTCTTTCTCTTTTTCTTTGTTGTTAAGAACGCTAAGTAAATCTGCTAATTCTTTGCTC
ACGATAGGTTGTTGTGGTAATAACC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL3148Contig1 780 2 3 U
TTGCATAAACAGACCACGTAATTTATTAAACAAAAATAAAACGATAATATACTTGAGAAA
ACCAAAGAAAAGCTAGTTCTCATCTTGAGCAAAACAAAAGCGTCAAAAGCAAATGTAAAA
AAGAAGAATGTCATCGGACCGGAGACACCATGAAATCCACCTTCTGCTAAACTTCTTCCG
AGCAAGGGGGTAACGCAAACTCAAGCGCAAGACAGTGTGTGTCTCTGTCAGAAGCTAGAC
AAGCTATACACCAGAATCCACGCAAGCAGGAATACACTTAGAGAAGCAAAAAGACCGTCC
TGGAGCAGAGCTGCATGACCACCATAGTCTTCTTCATCGATCTTCAGAGTCAATGCATAG
TAACCGTATACAATCCCTGAAGAAATTGCCAGAAACAGAAGTAACCAAATGCCTCCGACC
AAAGGGATGGCACCCCAAATCAAACCGCAGAGTAATCCAACAACTTGCCTGATCCAATGC
AACACATCTCCTAGTTGGTCCTTGTCCCAGGAAGCATCTGAATCGAACAGTTTGGCGAAT
TTGAAAGAACTGAGATGACTGTTTTGGTGGTGAACATGTTCATCGTGGTCTTGATGATGA
TTCGACTTCCCAGATCTCCCTTCTTTCATATTTTTTTTTGCCGGTTTTGATTAAGATAGA
TCCGATGCAAAGACAGGATCGAGAATCAGAAAACCCTGCTGCTCACGACTGTGAATCGAT
AGAATCTAATCTAGGGTTCTTTGCTATTAAAGGGTTCTGAATTCTGATGATTCAGATCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV17TF C 1
AF RR2AV17JQ U 3
BS 1 2 RR2AV17TF
BS 3 732 RR2AV17JQ
BS 733 780 RR2AV17TF

RD RR2AV17TF 780 0 0
TTGCATAAACAGACCACGTAATTTATTAAACAAAAATAAAACGATAATATACTTGAGAAA
ACCAAAGAAAAGCTAGTTCTCATCTTGAGCAAAACAAAAGCGTCAAAAGCAAATGTAAAA
AAGAAGAATGTCATCGGACCGGAGACACCATGAAATCCAC*TTCTGCTAAACTTCTTCCG
AGCAAGGGGGTAACGCAAACTCAAGCGCAAGACAGTGTGTGTCTCTGTCAGAAGCTAGAC
AAGCTATACACCAGAATCCACGCAAGCAGGAATACACTTAGAGAAGCAAAAAGACCGTCC
TGGAGCAGAGCTGCATGACCACCATAGTCTTCTTCATCGATCTTCAGAGTCAATGCATAG
TAACCGTATACAATCCCTGAAGAAATTGCCAGAAACAGAAGTAACCAAATGCCTCCGACC
AAAGGGATGGCACCCCAAATCAAACCGCAGAGTAATCCAACAACTTGCCTGATCCAATGC
AACACATCTCCTAGTTGGTCCTTGTCCCAGGAAGCATCTGAATCGAACAGTTTGGCGAAT
TTGAAAGAACTGAGATGACTGTTTTGGTGGTGAACATGTTCATCGTGGTCTTGATGATGA
TTCGACTTCCCAGATCTCCCTTCTTTCATATTTTTTTTTGCCGGTTTTGATTAAGATAGA
TCCGATGCAAAGACAGGATCGAGAATCAGAAAACCCTGCTGCTCACGACTGTGAATCGAT
AGAATCTAATCTAGGGTTCTTTGCTATTAAAGGGTTCTGAATTCTGATGATTCAGATCCC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2AV17JQ 730 0 0
GCATAAACAGACCACGTAATTTATTAAACAAAAATAAAACGATAATATACTTGAGAAAAC
CAAAGAAAAGCTAGTTCTCATCTTGAGCAAAACAAAAGCGTCAAAAGCAAATGTAAAAAA
GAAGAATGTCATCGGACCGGAGACACCATGAAATCCACCTTCTGCTAAACTTCTTCCGAG
CAAGGGGGTAACGCAAACTCAAGCGCAAGACAGTGTGTGTCTCTGTCAGAAGCTAGACAA
GCTATACACCAGAATCCACGCAAGCAGGAATACACTTAGAGAAGCAAAAAGACCGTCCTG
GAGCAGAGCTGCATGACCACCATAGTCTTCTTCATCGATCTTCAGAGTCAATGCATAGTA
ACCGTATACAATCCCTGAAGAAATTGCCAGAAACAGAAGTAACCAAATGCCTCCGACCAA
AGGGATGGCACCCCAAATCAAACCGCAGAGTAATCCAACAACTTGCCTGATCCAATGCAA
CACATCTCCTAGTTGGTCCTTGTCCCAGGAAGCATCTGAATCGAACAGTTTGGCGAATTT
GAAAGAACTGAGATGACTGTTTTGGTGGTGAACATGTTCATCGTGGTCTTGATGATGATT
CGACTTCCCAGATCTCCCTTCTTTCATATTTTTTTTTGCCGGTTTTGATTAAGATAGATC
CGATGCAAAGACAGGATCGAGAATCAGAAAACCCTGCTGCTCACGACTGTGAATCGATAG
AATCTAATCT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL3149Contig1 425 2 3 U
GGGATCGCCGCCGGAACTACTCTCTCCTCTCAGATCGATTTTTCCAAGCAACAATCATGC
AGAACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTATACATTCCGAGAAAATGCTCGGCCACAAACA
GGTTGATCACATCAAAGGATCACGCATCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATCTTGATGCCA
ATGGTATCTACACTGGACAGTTCACCACACTTGCTCTCTGTGGTTTCGTCCGTGCTCAGG
GAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAACCAAACAAC
AGTGAGTATGAGAGAATTTAAGCTGCTGCTTGCTTTTCCTCTTGTTATTTTTGGGGATGT
TTCATTGAATTTTCTCTAGATGCGAACTTGTGTTTTGCTGTTCTAATTTTATGAAAAGAT
AATTT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 

AF RR2BP76TF U 1
AF RR2FW72TF U 2
BS 1 119 RR2BP76TF
BS 120 120 RR2FW72TF
BS 121 425 RR2BP76TF

RD RR2BP76TF 425 0 0
GGGATCGCCGCCGGAACTACTCTCTCCTCTCAGATCGATTTTTCCAAGCAACAATCATGC
AGAACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTATACATTCCGAGAAAATGCTCGGCCACAAACG
GGTTGATCACATCAAAGGATCACGCATCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATCTTGATGCCA
ATGGTATCTACACTGGACAGTTCACCACACTTGCTCTCTGTGGTTTCGTCCGTGCTCAGG
GAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAACCAAACAAC
AGTGAGTATGAGAGAATTTAAGCTGCTGCTTGCTTTTCCTCTTGTTATTTTTGGGGATGT
TTCATTGAATTTTCTCTAGATGCGAACTTGTGTTTTGCTGTTCTAATTTTATGAAAAGAT
AATTT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR2FW72TF 424 0 0
GGATCGCCGCCGGAACTACTCTCTCCTCTCAGATCGATTTTTCCAAGCAACAATCATGCA
GAACGAGGAAGGAGTCGTCACAGAGCTATACATTCCGAGAAAATGCTCGGCCACAAACAG
GTTGATCACATCAAAGGATCACGCATCTGTTCAGCTTAACATTGGTCATCTTGATGCCGA
TGGTATCTACACTGGACAGTTCACCACACTTGCTCTCTGTGGTTTCGTCCGTGCTCAGGG
AGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAACCAAACAACA
GTGAGTATGAGAGAATTTAAGCTGCTGCTTGCTTTTCCTCTTGTTATTTTTGGGGATGTT
TCATTGAATTTTCTCTAGATGCGAACTTGTGTTTTGCTGTTCTAATTTTATGAAAAGATA
ATTT

QA 1 424 1 424
DS 



AS 1 3

CO CL3150Contig1 666 3 4 U
TTTTTTTCTTGGGCGATTTTCTCGAGAAAAATCTTTGGTGAAGGGGGAAGATGGAGACGT
CTCTGAGGTATACGTGCAATTCAAAGTCTTTGAAAATCCATGCGAAGGAGAAGCTCCATG
TGAACTCGAAAACCCATTTGCAGCTTCATGGAGAGCTAGATACTGGAACTGGGGCTCCTA
GTTACTTCTGTGCGATGATTAGACACCTTTTCCCCGAGGCTTCAACAGGGCTGGGAGTTG
GATTCCATTATGATAAGCGCCAAAAGCTTCGGTGCCATGTGCGCGGGAAAAAAGAGTTTC
CCGTGAGAGATGATAAGACTGTCACCTTCAATGTCAAAGGCCGGTGTGATTTTGATCAAG
ACTTCAATCAGAGGAACCCTATAGGAGCTGCAGAATTTGCCTGGAACATAATGAATTTTA
AGGAAGATCAGGATGTGGGGATCAAAGTTGGCTACGAAATGTTTGATAAGGTTCCTTATA
TGCAGATTAGAGAAAACAATTGGACTCTTAACGCCAACATGAAGGGGAAATGGAACTTGA
GGTTTGACCTGTAAGGCTGTTAACTGCATTTAATATTTCATCATTATCGTCTGAGAAGTG
TATTAGTACTATTTACGGATAAGAGCACACTTTCATTCAACCCGTTTAGTCAAATTCAGA
GATCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG11JQB C 1
AF RR2GG11TF U 1
AF RR2F280TF U 11
BS 1 554 RR2GG11TF
BS 555 555 RR2F280TF
BS 556 613 RR2GG11TF
BS 614 666 RR2F280TF

RD RR2GG11JQB 638 0 0
TTTTTTTCTTGGGCGATTTTCTCGAGAAAAATCTTTGGTGAAGGGGGAAGATGGAGACGT
CTCTGAGGTATACGTGCAATTCAAAGTCTTTGAAAATCCATGCGAAGGAGAAGCTCCATG
TGAACTCGAAAACCCATTTGCAGCTTCATGGAGAGCTAGATACTGGAACTGGGGCTCCTA
GTTACTTCTGTGCGATGATTAGACACCTTTTCCCCGAGGCTTCAACAGGGCTGGGAGTTG
GATTCCATTATGATAAGCGCCAAAAGCTTCGGTGCCATGTGCGCGGGAAAAAAGAGTTTC
CCGTGAGAGATGATAAGACTGTCACCTTCAATGTCAAAGGCCGGTGTGATTTTGATCAAG
ACTTCAATCAGAGGAACCCTATAGGAGCTGCAGAATTTGCCTGGAACATAATGAATTTTA
AGGAAGATCAGGATGTGGGGATCAAAGTTGGCTACGAAATGTTTGATAAGGTTCCTTATA
TGCAGATTAGAGAAAACAATTGGACTCTTAACGCCAACATGAAGGGGAAATGGAACTTGA
GGTTTGACCTGTAAGGCTGTTAACTGCATTTAATATTTCATCATTATCGTCTGAGAAGTG
TATTAGTACTATTTACGGATAAGAGCACACTTTCAT
CC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2GG11TF 613 0 0
TTTTTTTCTTGGGCGATTTTCTCGAGAAAAATCTTTGGTGAAGGGGGAAGATGGAGACGT
CTCTGAGGTATACGTGCAATTCAAAGTCTTTGAAAATCCATGCGAAGGAGAAGCTCCATG
TGAACTCGAAAACCCATTTGCAGCTTCATGGAGAGCTAGATACTGGAACTGGGGCTCCTA
GTTACTTCTGTGCGATGATTAGACACCTTTTCCCCGAGGCTTCAACAGGGCTGGGAGTTG
GATTCCATTATGATAAGCGCCAAAAGCTTCGGTGCCATGTGCGCGGGAAAAAAGAGTTTC
CCGTGAGAGATGATAAGACTGTCACCTTCAATGTCAAAGGCCGGTGTGATTTTGATCAAG
ACTTCAATCAGAGGAACCCTATAGGAGCTGCAGAATTTGCCTGGAACATAATGAATTTTA
AGGAAGATCAGGATGTGGGGATCAAAGTTGGCTACGAAATGTTTGATAAGGTTCCTTATA
TGCAGATTAGAGAAAACAATTGGACTCTTAACGCCAACATGAAGGGGAAATGGAACTTGA
GGTTTGACCTGTAAAGCTGTTAACTGCATTTAATATTTCATCATTATCGTCTGAGAAGTG
TATTAGTACTATT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2F280TF 656 0 0
GGGCGATTTTCTCGAGAAAAATCTTTGGTGAAGGGGGAAGATGGAGACGTCTCTGAGGTA
TACGTGCAATTCAAAGTCTTTGAAAATCCATGCGAAGGAGAAGCTCCATGTGAACTCGAG
AACCCATTTGCAGCTTCATGGAGAGCTAGATACTAGAACTGGGGCTCCTAGTTACTTCTG
TGCGATGATTAGACACCTTTTCCCCGAGGCTTCAACAGGGCTGGGAGTTGGATTCCATTA
TGATAAGCGCCAAAAGCTTCGGTGCCATGTGCGCGGGAAAAAAGAGTTTCCCGTGAGAGA
TGATAAGACTGTCACCTTCAATGTCAAAGGCCGGTGTGATTTTGATCAAGACTTCAATCA
GAGGAACCCTATAGGAGCTGCAGAATTTGCCTGGAACATAATGAATTTTAAGGAAGATCA
GGATGTGAGGATCAAAGTTGGCTACGAAATGTTTGATAAGGTTCCTTATATGCAGATTAG
AGAAAACAATTGGACTCTTAACGCCAACATGAAGGGGAAATGGAACCTGAGGTTTGACCT
GTAAGGCTGTTAACTGCATTTAATATTTCATTATTATCGTCTGAGAAGTGTATTAGTACT
ATTTACGGATAAGAGCACACTTTCATTCAACCCGTTTAGTCAAATTCAGAGATCTT

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 3

CO CL3151Contig1 733 3 27 U
AATCTTCTGTTTTTCTCAAATAATCAAGAGACTCCCGGAAAAAGAATAGAACAACGGATA
CAACAAATTAAGAAAAAACAAGTCAGAGAAATCCAACAACCCCCAAATAGAAGAACTGTG
GAAACGTAAGAACAAGAATCATCATCTCAACAAAAAAAAGCCCTAGAAAAATACAATCAA
ACCCTCAAAGTTACATTTCAATGCAGAACCATCACCAAAGCCATCACTACCATTGAAAGA
CTCGTGAATCCAATGCTTCTAGTGGCCGATGATGATATCTTTTGTGGCTTTTGTAATTTC
TGTAGAGCACCACAGTAAAGGACATTAGCAGGGGCCCCAAACTCAGTCTTGTTGTTTTCA
TCTGGATTAACAACTCTAACGTAAGTTTCTTGTCCAAGATACCAAGAATCAAGATTCTCT
GTTCTCAGATTCCAAGCCCCAGGATTGTCCAAAGATATCAAGATCGCTGACCATGCCCCT
GGATACACCTGAATAGTTGACCGTGCAATACCGTCCCATTTGTTGTAAGTTCCTCTACTG
TTCTCCGTCCACTCTCCGTAGTCCATTCCGACTGTGAAGAAGGCATAGCCACTCATGTGG
TAGCTTTGCATCTTAGTGTCATTGTTCTGAAGAATGACTTCCATGAAACCGCGGTAAGTG
CCATTGATAATTGAAGTCCCCATCTTAGGTGGTCCAGTCAAAGGTCTCTTAGGGAAATCA
AGCTTATAAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK48JQ U 1
AF RR2EL83JQ U 56
AF RR2BK48TF C 41
BS 1 85 RR2BK48JQ
BS 86 86 RR2EL83JQ
BS 87 87 RR2BK48JQ
BS 88 88 RR2EL83JQ
BS 89 112 RR2BK48JQ
BS 113 113 RR2EL83JQ
BS 114 129 RR2BK48JQ
BS 130 130 RR2EL83JQ
BS 131 165 RR2BK48JQ
BS 166 166 RR2EL83JQ
BS 167 205 RR2BK48JQ
BS 206 206 RR2EL83JQ
BS 207 284 RR2BK48JQ
BS 285 285 RR2EL83JQ
BS 286 397 RR2BK48JQ
BS 398 398 RR2EL83JQ
BS 399 405 RR2BK48JQ
BS 406 406 RR2EL83JQ
BS 407 412 RR2BK48JQ
BS 413 413 RR2EL83JQ
BS 414 427 RR2BK48JQ
BS 428 428 RR2EL83JQ
BS 429 584 RR2BK48JQ
BS 585 632 RR2EL83JQ
BS 633 633 RR2BK48TF
BS 634 684 RR2EL83JQ
BS 685 733 RR2BK48TF

RD RR2BK48JQ 584 0 0
AATCTTCTGTTTTTCTCAAATAATCAAGAGACTCCCGGAAAAAGAATAGAACAACGGATA
CAACAAATTAAGAAAAAACAAGTCAAAAAAATCCAACAACCCCCAAATAGAAAAACTGTG
GAAACGTAAAAACAAGAATCATCATCTCAACAAAAAAAAGCCCTAAAAAAATACAATCAA
ACCCTCAAAGTTACATTTCAATGCAAAACCATCACCAAAGCCATCACTACCATTGAAAGA
CTCGTGAATCCAATGCTTCTAGTGGCCGATGATGATATCTTTTGGGGCTTTTGTAATTTC
TGTAGAGCACCACAGTAAAGGACATTAGCAGGGGCCCCAAACTCAGTCTTGTTGTTTTCA
TCTGGATTAACAACTCTAACGTAAGTTTCTTGTCCAAAATACCAAAAATCAAAATTCTCT
GTTCTCAAATTCCAAGCCCCAGGATTGTCCAAAGATATCAAGATCGCTGACCATGCCCCT
GGATACACCTGAATAGTTGACCGTGCAATACCGTCCCATTTGTTGTAAGTTCCTCTACTG
TTCTCCGTCCACTCTCCGTAGTCCATTCCGACTGTGAAGAAGGC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2EL83JQ 629 0 0
GGATACCACAAATTAAGAAAAAACAAGTCAGAGAAATCCAACAACCCCCAAATAGAAGAA
CTGTGGAAACGTAAGAACAAGAATCATCATCTCAACAAAAAAAAGCCCTAGAAAAATACA
ATCAAACCCTCAAAGTTACATTTCAATGCAGAACCATCACCAAAGCCATCACTACCATTG
AAAGACTCGTGAATCCAATGCTTCTAGTGGCCGATGATGATATCTTTTGTGGCTTTTGTA
ATTTCTGTAGAGCACCACAGTAAAGGACATTAGCAGGGGCCCCAAACTCAGTCTTGTTGT
TTTCATCTGGATTAACAACTCTAACGTAAGTTTCTTGTCCAAGATACCAAGAATCAAGAT
TCTCTGTTCTCAGATTCCAAGCCCCAGGATTGTCCAAAGATATCAAGATCGCTGACCATG
CCCCTGGATACACCTGAATAGTTGACCGTGCAATACCGTCCCATTTGTTGTAAGTTCCTC
TACTGTTCTCCGTCCACTCTCCGTAGTCCATTCCGACTGCGAAGAAGGCATAGCCACTCA
TGTGGTAGCTTTGCATCTTAGTGTCATTGTTCTGAAGGATGACTTCCATGAAACCGCGGT
AAGTGCCATTGATAATTGAAGTCCCCATC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2BK48TF 693 0 0
AAAGAATAGAACAACGGATACAACAAATTAAGAAAAAACAAGTCAGAGAAATCCAACAAC
CCCCAAATAGAAGAACTGTGGAAACGTAAGAACAAGAATCATCATCTCAACAAAGAAAAG
CCCTAGAAAAATACAATCAAACCCTCAAAGTTACATTTCAATGCAGAACCATCACCAAAG
CCATCACTACCATTGAAAGACTCGTGAATCCAATGCTTCTAGTGGCCGATGATGATATCT
TTTGTGGCTTTTGTAATTTCTGTAGAGCACCACAGTAAAGGACATTAGCAGGGGCCCCAA
ACTCAGTCTTGTTGTTTTCATCTGGATTAACAACTCTAACGTAAGTTTCTTGTCCAAGAT
ACCAAGAATCAAGATTCTCTGTTCTCAGATTCCAAGCCCCAGGATTGTCCAAAGATATCA
AGATCGCTGACCATGCCCCTGGATACACCTGAATAGTTGACCGTGCAATACCGTCCCATT
TGTTGTAAGTTCCTCTACTGTTCTCCGTCCACTCTCCGTAGTCCATTCCGACTGTGAAGA
AGGCATAGCCACTCATGTGGTAGCTTTGCATCTTAGTGTCATTGTTCTGAAGAATGACTT
CCATGAAACCGCGGTAAGTGCCATTGATAATTGAAGTCTCCATCTTAGGTGGTCCAGTCA
AAGGTCTCTTAGGGAAATCAAGCTTATAAGCTC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 3

CO CL3152Contig1 778 3 12 U
GGGACATAACTTCCAAGTCCCAGCAGGATGGATGAACCTTATCTCCATGATTACTCTTGC
TGTCTGGATCTCACTATACGAGTGCGTCATCCTACCAATAGCGAGCCTAATCACAGGACG
CAAACAAAGGTTAACTATGAAACAAAGGATCCAAATAGGTATCGTGATGGGGATCGTTTG
TATGCTCGTGGCAGGTTTCTTGGAGAGAAGTCGAAGAGCGGCCGCTCTAAAGAAGGGCTC
GTTTGTGTCTCCCGTTTCCATTGTAATGTTGCTTCCTCGGTTCATGCTTGCTGGTCTAAC
CGAAGCGTTTTCCGCGGTGGCTTTGATGGAGTTTCTGACGGTTAAGATGCCTGAGCATAT
GAAAGCTGTCGCGGGAGCGATCTTCTTCTTGAGCTCGTCGATTGCGAGTTATATATGCAC
ACTTCTTATTATTGTGATTGATAGCGTGACACGCAAGGAAGGGCGCTCGTGGTTAGGAGA
TAAAGACTTGAACAAGAACAGACTTGAGTACTATTTTTTCATAATAGGTGGCGTTCAAGC
CGTGAATCTGCTCTATTTTAGGTTTTTTGCTTCCAGGTTTATCACTGAGAACAACCAGGA
TAATGAGATTTTTAGTTAAGTGGTTGAGATCACCTTTTCATCTTTGTTTTACTGGTTAAA
GCCTTAGAGGTTTATTTCCATTTTTAATAGTATTATTATCACCCCGTGTGCTAAGCACAG
GTCTATTTCTGCTTAATTGTATTTAAATTCTTAAAAAATAAAACTATAGTACTCTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA87TF U 150
AF RR2BB65TF U 1
AF RR2HA87JQ C 113
BS 1 278 RR2BB65TF
BS 279 279 RR2HA87TF
BS 280 329 RR2BB65TF
BS 330 330 RR2HA87TF
BS 331 362 RR2BB65TF
BS 363 363 RR2HA87TF
BS 364 500 RR2BB65TF
BS 501 501 RR2HA87JQ
BS 502 650 RR2BB65TF
BS 651 652 RR2HA87JQ
BS 653 752 RR2BB65TF
BS 753 778 RR2HA87JQ

RD RR2HA87TF 301 0 0
TCCAAATAGGTATCGTGATGGGGATCGTTTGTATGCTCGTGGCAGGTTTCTTGGAGAGAA
GTCGAAGAGCGGCCGCTCTAAAGAAGGGCTCGTTTGTGTCTCCCGTTTCCATTGTAATGT
TGCTTCCTCGGTTCATGCTTGCTGGTCTAACCGAAGCGTTTTCCGCGGTGGCTTTGATGG
AGTTTCTGACGGTTAAGATGCCTGAGCATATGAAAGCTGTCGCGGGAGCGATCTTCTTCT
TGAGCTCGTCGATTGCGAGTTATATATGCACACTTCTTATTATTGTGATTGATAGCGTGA
C

QA 1 301 1 301
DS 

RD RR2BB65TF 752 0 0
GGGACATAACTTCCAAGTCCCAGCAGGATGGATGAACCTTATCTCCATGATTACTCTTGC
TGTCTGGATCTCACTATACGAGTGCGTCATCCTACCAATAGCGAGCCTAATCACAGGACG
CAAACAAAGGTTAACTATGAAACAAAGGATCCAAATAGGTATCGTGATGGGGATCGTTTG
TATGCTCGTGGCAGGTTTCTTGGAGAGAAGTCGAAGAGCGGCCGCTCTAAAGAAGGGCTC
GTTTGTGTCTCCCGTTTCCATTGTAATGTTGCTTCCTCAGTTCATGCTTGCTGGTCTAAC
CGAAGCGTTTTCCGCGGTGGCTTTGATGG*GTTTCTGACGGTTAAGATGCCTGAGCATAT
GAGAGCTGTCGCGGGAGCGATCTTCTTCTTGAGCTCGTCGATTGCGAGTTATATATGCAC
ACTTCTTATTATTGTGATTGATAGCGTGACACGCAAGGAAGGGCGCTCGTGGTTAGGAGA
TAAAGACTTGAACAAGAACATACTTGAGTACTATTTTTTCATAATAGGTGGCGTTCAAGC
CGTGAATCTGCTCTATTTTAGGTTTTTTGCTTCCAGGTTTATCACTGAGAACAACCAGGA
TAATGAGATTTTTAGTTAAGTGGTTGAGATCACCTTTTCATCTTTGTTTT**TGGTTAAA
GCCTTAGAGGTTTATTTCCATTTTTAATAGTATTATTATCACCCCGTGTGCTAAGCACAG
GTCTATTTCTGCTTAATTGTATTTAAATTCTT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2HA87JQ 666 0 0
G
CAGGACGCAAACAAAGGTTAACTATGAAACAAAGGATCCAAATAGGTATCGTGATGGGGA
TCGTTTGTATGCTCGTGGCAGGTTTCTTGGAGAGAAGTCGAAGAGCGGCCGCTCTAAAGA
AGGGCTCGTTTGTGTCTCCCGTTTCCATTGTAATGTTGCTTCCTCGGTTCATGCTTGCTG
GTCTAACCGAAGCGTTTTCCGCGGTGGCTTTGATGGAGTTTCTGACGGTTAAGATGCCTG
AGCATATGAAAGCTGTCGCGGGAGCGATCTTCTTCTTGAGCTCGTCGATTGCGAGTTATA
TATGCACACTTCTTATTATTGTGATTGATAGCGTGACACGCAAGGAAGGGCGCTCGTGGT
TAGGAGATAAAGACTTGAACAAGAACAGACTTGAGTACTATTTTTTCATAATAGGTGGCG
TTCAAGCCGTGAATTTGCTCTATTTTAGGTTTTTTGCTTCCAGGTTTATCACTGAGAACA
ACCAGGATAATGAGATTTTTAGTTAAGTGGTTGAGATCACCTTTTCATCTTTGTTTTACT
GGTTAAAGCCTTAGAGGTTTATTTCCATTTTTAATAGTATTATTATCACCCCGTGTGCTA
AGCACAGGTCTATTTCTGCTTAATTGTATTTAAATTCTTAAAAAATAAAACTATAGTACT
CTCCG

QA 2 666 2 666
DS 



AS 1 3

CO CL3153Contig1 715 3 17 U
ACTGGTAACATGACAAATAAACTTAGGAAACTGAGAACAAAAATTCAAGTTTAAGGCAAC
CCCAAAATTTTGACAGAGACAGAAAGACAAGTAGAATTCAAATCCAGTATACAAGACCAT
CTAACTCCTGAAACCAACAACTGATCATTGGATCGCTTTGACATTTCCGATGGCTTGTTT
TAGTA**ACCAATGCCCGTAAGCAAGTCCAGGACTCACGGGGTTTTTTTGATGATAGTGA
CAAACCAACACCTTTTCAAGAAGCTCCAGGGACAGCAGCCGCTGCAGTAGCATACATGTT
TGAGTCCTGATTCGCATATCCGTTGTTGTAACCTTGTCCTCTTGAGTATCCTCCGTTCCA
TTGGTGGCAAGAGTCATTTCTCCACTGTTTGTTTGGGCTTCTTCCCCAAGAAAGCCGGAC
AGTGTTCTTCCCAATGACTGTCCCGTTCAAGTTCCCTATGGCTTCTTCAGCACTCTGCCT
GTTACCAAATTGGACAAAACCGCATCCTTTTCCTACAGGAATCTTGACCGAAACAACCTC
CCCAAACTGGGAGAAAGGTTGCATGAGGTCTTCTTCAGTAACATCAGCGTCAAGACCTCC
AACAAATATCGTTGAGTTATTTGATTCCCCATCAGCCATAGAACCATCTCCTCCATGTCC
ACCAGCTAGTGTCAGAGCTTGTGAACCATTTTGTTGGCCATAAGCAGCGGCTCTT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX27JQ U 1
AF RR2H129JQ U 1
AF RR2GM14JQ U 2
BS 1 34 RR2FX27JQ
BS 35 35 RR2H129JQ
BS 36 77 RR2FX27JQ
BS 78 78 RR2H129JQ
BS 79 93 RR2FX27JQ
BS 94 94 RR2H129JQ
BS 95 313 RR2FX27JQ
BS 314 314 RR2H129JQ
BS 315 368 RR2FX27JQ
BS 369 369 RR2GM14JQ
BS 370 516 RR2H129JQ
BS 517 517 RR2GM14JQ
BS 518 561 RR2H129JQ
BS 562 562 RR2GM14JQ
BS 563 637 RR2H129JQ
BS 638 638 RR2GM14JQ
BS 639 715 RR2H129JQ

RD RR2FX27JQ 369 0 0
ACTGGTAACATGACAAATAAACTTAGGAAACTGAAAACAAAAATTCAAGTTTAAGGCAAC
CCCAAAATTTTGACAGAAACAGAAAGACAAGTAAAATTCAAATCCAGTATACAAGACCAT
CTAACTCCTGAAACCAACAACTGATCATTGGATCGCTTTGACATTTCCGATGGCTTGTTT
TAGTA**ACCAATGCCCGTAAGCAAGTCCAGGACTCACGGGGTTTTTTTGATGATAGTGA
CAAACCAACACCTTTTCAAGAAGCTCCAGGGACAGCAGCCGCTGCAGTAGCATACATGTT
TGAGTCCTGATTCCCATATCCGTTGTTGTAACCTTGTCCTCTTGAGTATCCTCCGTTCCA
TTGGTGGC
C

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR2H129JQ 715 0 0
C
CTGGTAACATGACAAATAAACTTAGGAAACTGAGAACAAAAATTCAAGTTTAAGGCAACC
CCAAAATTTTGACAGAGACAGAAAGACAAGTAGAATTCAAATCCAGGATAAAAGACCATC
TAACCCCTGAAACCAACAACTGATCATTGGATCGCTTTGACATTTCCGATGGCTTGTTTT
AGTAAAACCAATGCCCGTAAGCAAGTCCAGGACTCACGGGGTTTTTT*GATGATAGTGAC
AAACCAACAC*TTTTCAAGAAGCTCCAGGGACAGCAGCCGCTGCAGTAGCATACATGTTT
GAATCCTGATTCGCATATCCGTTGTTGTAACCTTGTCCTCTTGAGTATCCTCCGTTCCAC
TGGTGGCCAGAGTCATTTCTCCACTGTTTGTTTGGGCTTCTTCCCCAAGAAAGCCGGACA
GTGTTCTTCCCAATGACTGTCCCGTTCAAGTTCCCTATGGCTTCTTCAGCACTCTGCCTG
TTACCAAATTGGACAAAACCGCATCCTTTTCCTACTGGAATCTTGACCGAAACAACCTCC
CCAAACTGGGAGAAAGGTTGGATGAGGTCTTCTTCAGTAACATCAGCGTCAAGACCTCCA
ACAAATATCGTTGAGTTATTTGATTCCCCATCAGCCGTAGAACCATCTCCTCCATGTCCA
CCAGCTAGTGTCAGAGCTTGTGAACCATTTTGTTGGCCATAAGCAGCGGCTCTT

QA 2 715 2 715
DS 

RD RR2GM14JQ 675 0 0
CTGGTAACATGACAAATAAACTTAGGAAACTGAGAACAAAAATTCAAGTTTAAGGCAACC
CCAAAATTTTGACAGAGACAGAAAGACAAGTAGAATTCAAATCCAGTATACAAGACCATC
TAACTCCTGAAACCAACAACTGATCATTGGATCGCTTTGACATTTCCGATGGCTTGTTTT
AGTA**ACCAATGCCCGTAAGCAAGTCCAGGACTCACGGGGTTTTTTTGATGATAGTGAC
AAACCAACACCTTTTCAAGAAGCTCCAGGGACAGCAGCCGCTGCAGTAGCATACATGTTT
GAGTCCTGATTCGCATATCCGTTGTTGTAACCTTGTCCTCTTGAGTATCCTCCGTTCCAT
TGGTGGCAAGAGTCATTTCTCCACTGTTTGTTTGGGCTTCTTCCCCAAGAAAGCCGGACA
GTGTTCTTCCCAATGACTGTCCCGTTCAAGTTCCCTATGGCTTCTTCAGCACTCTGCCTG
TTACCAAATTGGACAAAACCGCATCCTTTTCCTACAGGAATCTTGACCGAAAGAACCTCC
CCAAACTGGGAGAAAGGTTGCATGAGGTCTTCTTCAGTAACATCAGCGTCAAGACCTCCA
ACAAATATCGTTGAGTTATTTGATTCCCCATCAGCCATTGAACCATTTCCTCCATGTCCA
CCAGCTAGTGTCAGA

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 3

CO CL3154Contig1 933 3 6 U
GGGCCTTCATAACACGAGAGAAAGAACCAAGAAGCGAAGCTACAGCAGAGAAAATCAAAA
CACTCTGGTTCAAGTCAAGTCTTTCAGACCAGCCCATCTCATCAATCCTCGGACCAAACT
CATGGCTATGGCTCGGCGGAATTCTCTCATCCTCGTTCTTGATCTTCTTGATAATTATCG
GTATCATCACTGGGTATTACATTTACCCGATCGACCACAACACCAACAAGATCTACTCAT
TGACTTCAAAGACAATCATATACATCTTAGTCATCTGTGTGAGCATCATGGCGACTTCAA
GTGCAGCTATGTTTTGGAACAAGAAGAAGAAGTACGGTAACGTCGACAATAAACAGGTTC
AGAACGTCGACCTTCCATCTCCAACGTCTTCACCAACATCAGGTGGTAACAATTCCTTGA
GAGAAATCGAAAGTTCGCCACAAGAATCGCTCGTGCAGTGCACCAACCTGCACTACGGAG
AAAGACCTAACCTCACGAAACTTATACTTGATGTGGAAGGTTCGAGTGTGGGAGTTCTTG
TGTGTGGTCCGAAGAAGATGAGACAAAAGGTTGCGGAGATTTGTTCCTCTGGTTTGGCTA
AGAATCTCCATTTTGAATCTATCAGTTTCAGCTGGTGAGTGGTGATCATTCTCATCTGTT
GTGGAAGTTGCTTGGACTGCAAGTTAATAAGGTGGTCATGTGATTTGACCTATCTTTCTG
TGCCTCTTACGTTTGACTTTTTCCGGTTTTTTTGTTTTTCTTCTTTAGGAATATTTTAGT
GTGAAAATCCCAACCCTCTCAAAGATACGTACGAGACCCTTTGTTTGTAATCCTTACGTA
CGTTTCTATATGTTACAAACTCGGTCACGAATCGAGGCATGTAGCTTTTGTAAATTGTAA
ATGCTGGAAAATAAAAAGAATCCTTTTTGAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ68TFB U 1
AF RR2BT05TF U 47
AF RR2AZ68JQ C 73
BS 1 690 RR2AZ68TFB
BS 691 691 RR2BT05TF
BS 692 745 RR2AZ68TFB
BS 746 746 RR2AZ68JQ
BS 747 761 RR2AZ68TFB
BS 762 933 RR2AZ68JQ

RD RR2AZ68TFB 761 0 0
GGGCCTTCATAACACGAGAGAAAGAACCAAGAAGCGAAGCTACAGCAGAGAAAATCAAAA
CACTCTGGTTCAAGTCAAGTCTTTCAGACCAGCCCATCTCATCAATCCTCGGACCAAACT
CATGGCTATGGCTCGGCGGAATTCTCTCATCCTCGTTCTTGATCTTCTTGATAATTATCG
GTATCATCACTGGGTATTACATTTACCCGATCGACCACAACACCAACAAGATCTACTCAT
TGACTTCAAAGACAATCATATACATCTTAGTCATCTGTGTGAGCATCATGGCGACTTCAA
GTGCAGCTATGTTTTGGAACAAGAAGAAGAAGTACGGTAACGTCGACAATAAACAGGTTC
AGAACGTCGACCTTCCATCTCCAACGTCTTCACCAACATCAGGTGGTAACAATTCCTTGA
GAGAAATCGAAAGTTCGCCACAAGAATCGCTCGTGCAGTGCACCAACCTGCACTACGGAG
AAAGACCTAACCTCACGAAACTTATACTTGATGTGGAAGGTTCGAGTGTGGGAGTTCTTG
TGTGTGGTCCGAAGAAGATGAGACAAAAGGTTGCGGAGATTTGTTCCTCTGGTTTGGCTA
AGAATCTCCATTTTGAATCTATCAGTTTCAGCTGGTGAGTGGTGATCATTCTCATCTGTT
GTGGAAGTTGCTTGGACTGCAAGTTAATAAAGTGGTCATGTGATTTGACCTATCTTTCTG
TGCCTCTTACGTTTGACTTTTTCCG*TTTTTTTGTTTTTCT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2BT05TF 697 0 0
G
GAGAAAATCAAAACACTCTGGTTCAAGTCAAGTCTTTCAGACCAGCCCATCTCATCAATC
TTCGGACCAAACTCATGGCTATGGCTCGGCGGAATTCTCTCATCCTCGTTCTTGATCTTC
TTGATAATTATCGGTATCATCACTAGGTATTACATTTACCCGATCGACCACAACACCAAC
AAGATCTACTCATTGACTTCAAAGACAATCATATACATCTTAGTCATCTGTGTGAGCATC
ATGGCGACTTCAAGTGCAGCTATGTTTTGGAACAAGAAGAAGAAGTACGGTAACGTCGAC
AATAAACAGGTTCAGAACGTCGACCTTCCATCTCCAACGTCTTCACCAACATCAGGTGGT
AACAATTCCTTGAGAGAAATCGAAAGTTCGCCACAAGAATCGCTCGTGCAGTGCACCAAC
CTGCACTACGGAGAAAGACCTAACCTCACGAAACTTATACTTGATGTGGAAGGTTCGAGT
GTGGGAGTTCTTGTGTGTGGTCCGAAGAAGATGAGACAAAAGGTTGCGGAGATTTGTTCC
TCTGGTTTGGCTAAGAATCTCCATTTTGAATCTATCAGTTTCAGCTGGTGAGTGGTGATC
ATTCTCATCTGTTGTGGAAGTTGCTTGGACTGCAAGTTAATAAGGTGGTCATGTGATTTG
ACCTATCTTTCTGTGCCTCTTACGTTTGACTTTTTC

QA 2 697 2 697
DS 

RD RR2AZ68JQ 861 0 0
AGTCAAGTCTTTCAGACCAGCCCATCTCATCAATCCTCGGACCAAACTCATGGCTATGGC
TCGGCGGAATTCTCTCATCCTCGTTCTTGATCTTCTTGATAATTATCGGTATCATCACTG
GGTATTACATTTACCCGATCGACCACAACACCAACAAGATCTACTCATTGACTTCAAAGA
CAATCATATACATCTTAGTCATCTGTGTGAGCATCATGGCGACTTCAAGTGCAGCTATGT
TTTGGAACAAGAAGAAGAAGTACGGTAACGTCGACAATAAACAGGTTCAGAACGTCGACC
TTCCATCTCCAACGTCTTCACCAACATCAGGTGGTAACAATTCCTTGAGAGAAATCGAAA
GTTCGCCACAAGAATCGCTCGTGCAGTGCACCAACCTGCACTACGGAGAAAGACCTAACC
TCACGAAACTTATACTTGATGTGGAAGGTTCGAGTGTGGGAGTTCTTGTGTGTGGTCCGA
AGAAGATGAGACAAAAGGTTGCGGAGATTTGTTCCTCTGGTTTGGCTAAGAATCTCCATT
TTGAATCTATCAGTTTCAGCTGGTGAGTGGTGATCATTCTCATCTGTTGTGGAAGTTGCT
TGGACTGCAAGTTAATAAGGTGGTCATGTGATTTGACCTATCTTTCTGTGCCTCTTACGT
TTGACTTTTTCCGGTTTTTTTGTTTTTCTTCTTTAGGAATATTTTAGTGTGAAAATCCCA
ACCCTCTCAAAGATACGTACGAGACCCTTTGTTTGTAATCCTTACGTACGTTTCTATATG
TTACAAACTCGGTCACGAATCGAGGCATGTAGCTTTTGTAAATTGTAAATGCTGGAAAAT
AAAAAGAATCCTTTTTGAGTC

QA 1 861 1 861
DS 



AS 1 2

CO CL3155Contig1 581 2 2 U
GCGATCTCTCTCTATCCATTTTCCATTTCGTCGTCATCTTCCTAATCACCAAAAAAATGG
GTCGCCGTAGCTCCGGAGGAAGATCTGCACCTCGTCCTCGCCCACGGGCCCCAGCTCCTC
AACCTGTAAACCGTGCGCCTCCTCCAGCTCCAGCTCAGGCGACCAGTGGTGGCGGTGGCA
TGTTCTCCGGCATTGGTTCCACCATAGCTCAGGGTATGGCTTTTGGAACCGGAAGTGCCG
TTGCTCATAGGGCTGTTGATTCCGTCATGGGCCCGCGTACCATTCAGCATGAAACTGTTG
AGGCTGCCTCTGCTTCTGCTGCTCCTGTCGGAAGCAACATGTTCTCCAGCTCCTGTGACA
TTCATGCTAAGGCTTTCCAGGATTGCATCGGCAGCTATGGAAGCGATATTAGCAAGTGTC
AGTTCTACACGGACATGCTGTCTGAGTGCAAGAAGAACTCCGGTTCCAGTCTTGTTGCTT
GAAGCTTGTTTCATTTCTTATTATGCTTTTGTCTAAACATTATTCAGCTGTTATATGCTG
AGAGTCTGGATGTCATCAAATAACAACAGTTCAGATACTGC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AR76JQ C 1
AF RR2AR76TF U 1
BS 1 4 RR2AR76JQ
BS 5 581 RR2AR76TF

RD RR2AR76JQ 581 0 0
GCGATCTCTCTCTATCCATTTTCCATTTCGTCGTCATCTTCCTAATCACCAAAAAAATGG
GTCGCCGTAGCTCCGGAGGAAGATCTGCACCTCGTCCTCGCCCACGGGCCCCAGCTCCTC
AACCTGTAAACCGTGCGCCTCCTCCAGCTCCAGCTCAGGCGACCAGTGGTGGCGGTGGCA
TGTTCTCCGGCATTGGTTCCACCATAGCTCAGGGTATGGCTTTTGGAACCGGAAGTGCCG
TTGCTCATAGGGCTGTTGATTCCGTCATGGGCCCGCGTACCATTCAGCATGAAACTGTTG
AGGCTGCCTCTGCTTCTGCTGCTCCTGTCGGAAGCAACATGTTCTCCAGCTCCTGTGACA
TTCATGCTAAGGCTTTCCAGGATTGCATCGGCAGCTATGGAAGCGATATTAGCAAGTGTC
AGTTCTACACGGACATGCTGTCTGAGTGCAAGAAGAACTCCGGTTCCAGTCTTGTTGCTT
GAAGCTTGTTTCATTTCTTATTATGCTTTTGTCTAAACATTATTCAGCTGTTATATGCTG
AGAGTCTGGATGTCATCAAATAACAACAGTTCAGATACTGC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2AR76TF 581 0 0
GCGA
TCTCTCTCTATCCATTTTCCATTTCGTCGTCATCTTCCTAATCACCAAAAAAATGGGTCG
CCGTAGCTCCGGAGGAAGATCTGCACCTCGTCCTCGCCCACGGGCCCCAGCTCCTCAACC
TGTAAACCGTGCGCCTCCTCCAGCTCCAGCTCAGGCGACCAGTGGTGGCGGTGGCATGTT
CTCCGGCATTGGTTCCACCATAGCTCAGGGTATGGCTTTTGGAACCGGAAGTGCCGTTGC
TCATAGGGCTGTTGATTCCGTCATGGGCCCGCGTACCATTCAGCATGAAACTGTTGAGGC
TGCCTCTGCTTCTGCTGCTCCTGTCGGAAGCAACATGTTCTCCAGCTCCTGTGACATTCA
TGCTAAGGCTTTCCAGGATTGCATCGGCAGCTATGGAAGCGATATTAGCAAGTGTCAGTT
CTACACGGACATGCTGTCTGAGTGCAAGAAGAACTCCGGTTCCAGTCTTGTTGCTTGAAG
CTTGTTTCATTTCTTATTATGCTTTTGTCTAAACATTATTCAGCTGTTATATGCTGAGAG
TCTGGATGTCATCAAATAACAACAGTTCAGATACTGC

QA 5 581 5 581
DS 



AS 1 2

CO CL3156Contig1 674 2 13 U
ATCAAATACATTTTAATAAGAACAAAGAGGCTTTGATGACATGTCAATTCCTTCTCCATG
TGACAAACAACATAAACTAAATAAAATGCGAGAAAAGAGCAAAACCCAGTCCCGACACAC
TTATATATCATGACCCACATTTGTCCGAAGTAGCAGTTTTCATGTGAGCTTAAGAAAAAA
AGCAGTTAGTAACAACTTTGAAGACGTAAGAAATAAGACACACCTGAAAAATATCAACTA
CTACTACTACTCCCCTTATCTTTTTCTTTCGTGAAGCTGACTAGATTTGCCTACATCTTC
TCCACACATAACTTCTTCATCAGGACCATATTTTAATTTACTAATCGGACTTGATAACTC
CGTTCTGCTTATTGCTCTTCGTGGACGACTCTTTGATCTGCTCAAGAAGCTTCTTTTGGA
ATCGGTAACCCTTGTCAGTTCCATAAATGTAGTCACAATAAGTAAAAACTGAAGCGAAGT
TGCTGTGGCTTTGTCCTCCAACGTAGTGATGGTAGTCATGGTATTCAGCACCACCATAGA
AAGGGATGTATTTTGTTGGACTCCATGGAAAATCATATCCACTGTGAGTCTCTATAGCCT
CAATTTGCCTTAAAGCTATCCACAACCAAAAGGTTATCATGTGACCAGGAGCAATCGCTG
GGTCCCATAAACGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP03JQ U 158
AF RR2H387JQ U 1
BS 1 211 RR2H387JQ
BS 212 212 RR2EP03JQ
BS 213 289 RR2H387JQ
BS 290 290 RR2EP03JQ
BS 291 305 RR2H387JQ
BS 306 306 RR2EP03JQ
BS 307 318 RR2H387JQ
BS 319 319 RR2EP03JQ
BS 320 356 RR2H387JQ
BS 357 357 RR2EP03JQ
BS 358 380 RR2H387JQ
BS 381 381 RR2EP03JQ
BS 382 674 RR2H387JQ

RD RR2EP03JQ 375 0 0
TTTCATGTGAGCTTAAGAAAAAAAGCAGTTAGTAACAACTTTGAAGACGTAAGAAATAAG
ACACACCTGAAAAATATCAACTACTACTACTACTCCCCTTATCTTTTTCTTTCGTGAAGC
TGACTAGATTTGCCTACATCTTCTCCACACATAACTTCTTCATCAGGACCATATTTTAAT
TTACTAATCGGACTTGATAACTCCGTTCTGCTTGTTGCTCTTCGTGGACGACTCTTTGAT
CTGCTCAAGAAGCTTCTTTTGGAATCGGTAACCCTTGTCAGTTCCATAAATGTAGTCACA
ATAAGTAAAAACTGAAGCGAAGTTGCTGTGGCTTTGTCCTCCAACGTAGTGATGGTAGTC
ATGGTATTCAGCACC

QA 1 375 1 375
DS 

RD RR2H387JQ 674 0 0
ATCAAATACATTTTAATAAGAACAAAGAGGCTTTGATGACATGTCAATTCCTTCTCCATG
TGACAAACAACATAAACTAAATAAAATGCGAGAAAAGAGCAAAACCCAGTCCCGACACAC
TTATATATCATGACCCACATTTGTCCGAAGTAGCAGTTTTCATGTGAGCTTAAGAAAAAA
AGCAGTTAGTAACAACTTTGAAGACGTAAGAGATAAGACACACCTGAAAAATATCAACTA
CTACTACTACTCCCCTTATCTTTTTCTTTCGTGAAGCTGACTAGATTTGTCTACATCTTC
TCCACGCATAACTTCTTCGTCAGGACCATATTTTAATTTACTAATCGGACTTGATACCTC
CGTTCTGCTTATTGCTCTTCTTGGACGACTCTTTGATCTGCTCAAGAAGCTTCTTTTGGA
ATCGGTAACCCTTGTCAGTTCCATAAATGTAGTCACAATAAGTAAAAACTGAAGCGAAGT
TGCTGTGGCTTTGTCCTCCAACGTAGTGATGGTAGTCATGGTATTCAGCACCACCATAGA
AAGGGATGTATTTTGTTGGACTCCATGGAAAATCATATCCACTGTGAGTCTCTATAGCCT
CAATTTGCCTTAAAGCTATCCACAACCAAAAGGTTATCATGTGACCAGGAGCAATCGCTG
GGTCCCATAAACGT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 3

CO CL3157Contig1 1242 3 11 U
GGAAAGAGAGAGAGATGGGTTGTATTCACTTCGAGTCATCATCAGATCATGGACACGCTC
TGTCCGAGACGAAGAAACATCCAACACAGTTTCACCACAACACGAGCAAGGAGGAGGAGG
AATCCAAGAAGCTTGGGACGAGATCGAGACTCGCCGAGGTGGTTATTTCGCCGGAGAGAA
TAAGAACAAGCTTGAGAAGAGGAAGAGCCAAGCCTGCTCGAGGGATACGTAGTGGAGGCT
GCTGATCAAGAAGATCTTACGAGAGGTAAGAGTTTGACGGATGACGATCTTGAGGAGCTT
AAAGGCTGCTTGGATCTAGGGTTTGGGTTCAGCTACGACGAGATCCCTGAGCTCTGCAAC
ACTTTGCCTGCTTTGGAGCTTTGTTACTCCATGAGCCAGAAGTTCTTGGATGATAAGCAG
AACCAGATGTGTCCAGCTGAAGAAGATTCGCAGCCACCACCACCGACCACGACCAACCCA
GTTGCAAACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAAAGCAAGACTC
AAATACTGGGCACAAGCCGTAGCTTGCACGGTCCGGTTATGTAGCTGAACAACATTCATC
ATGATCTTGTCTGAACATATTGGTTGAATCAGGAAAAAAAAATCTACTGAGGAAGACCTT
TTCTTTGCATGAATGAAGTCTCTGCCATTGTTAGCTGAGAATAGACCTGCATTGTGTCCA
TGGAGCAACTGGTTTGGTTTTACATTTTTTTTAATTGCATGTTATGTGTATTAGTATTAT
TCGTCTAGTGTTTGTTGATGAAAAATAAATGTGTTACCGAATAAAAAGTTTCAAATTCTT
TGTGCTTTTTTTTTTGCATTTACTTCTTGCAATAAGGGTTTGCTTTAACATCTGACATCT
GAATAGAGTACTTGTCCTCGTTATAATGCAGTGATGAGATCTAGAGAGACAAAGAAACAA
CTCTGTTTTTGAAGTCCTCTGTTTTTGTTTGGCTGAGGGCTCTAGATGATGATAAAGCTC
GTGGCTTTGCTTCGGTTACAGCATGTACTTACTTGTGATTCTTTTTAACCTTTTTTTGTC
TTTCCCGTTTGTGGGAAAAGAATCAGAAACTTTGTGGTCATAAGTCGTGAACACGCTTAA
CGTGTCGTGTACGATAGGGCAAAATGTTAAGACATGATCATCCTTTCCTTTCACGTGTTC
TGTTACGTATACAACTTTTCTAATAACAGCGAATATGATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2BX90TF U 1
AF RR2BX90JQ C 496
AF RR2CZ39TF U 610
BS 1 614 RR2BX90TF
BS 615 615 RR2CZ39TF
BS 616 631 RR2BX90TF
BS 632 632 RR2CZ39TF
BS 633 637 RR2BX90TF
BS 638 853 RR2CZ39TF
BS 854 855 RR2BX90JQ
BS 856 1213 RR2CZ39TF
BS 1214 1214 RR2BX90JQ
BS 1215 1238 RR2CZ39TF
BS 1239 1242 RR2BX90JQ

RD RR2BX90TF 637 0 0
GGAAAGAGAGAGAGATGGGTTGTATTCACTTCGAGTCATCATCAGATCATGGACACGCTC
TGTCCGAGACGAAGAAACATCCAACACAGTTTCACCACAACACGAGCAAGGAGGAGGAGG
AATCCAAGAAGCTTGGGACGAGATCGAGACTCGCCGAGGTGGTTATTTCGCCGGAGAGAA
TAAGAACAAGCTTGAGAAGAGGAAGAGCCAAGCCTGCTCGAGGGATACGTAGTGGAGGCT
GCTGATCAAGAAGATCTTACGAGAGGTAAGAGTTTGACGGATGACGATCTTGAGGAGCTT
AAAGGCTGCTTGGATCTAGGGTTTGGGTTCAGCTACGACGAGATCCCTGAGCTCTGCAAC
ACTTTGCCTGCTTTGGAGCTTTGTTACTCCATGAGCCAGAAGTTCTTGGATGATAAGCAG
AACCAGATGTGTCCAGCTGAAGAAGATTCGCAGCCACCACCACCGACCACGACCAACCCA
GTTGCAAACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAAAGCAAGACTC
AAATACTGGGCACAAGCCGTAGCTTGCACGGTCCGGTTATGTAGCTGAACAACATTCATC
ATGATCTTGTCTGA*CATATTGGTTGAATCACGAAAA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2BX90JQ 747 0 0
ATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAAAGCAAGACTCAAATACTGGGCACAA
GCCGTAGCTTGCACGGTCCGGTTATGTAGCTGAACAACATTCATCATGATCTTGTCTGAA
CATATTGGTTGAATCAGGAAAAAAAAATCTACTGAGGAAGACCTTTTCTTTGCATGAATG
AAGTTTCTGCCATTGTTAGCTGAGAATAGACCTGCATTGTGTCCATGGAGCAACTGGTTT
GGTTTTACATTTTTTTTAATTGCATGTTATGTGTATTAGTATTATTCGTCTAGTGTTTGT
TGATGAAAAATAAATGTGTTACCGAATAAAAAGTTTCAAATTCTTTGTGCTTTTTTTTTT
GCATTTACTTCTTGCAATAAGGGTTTGCTTTAACATCTGACATCTGAATAGAGTACTTGT
CCTCGTTATAATGCAGTGATGAGATCTAGAGAGACAAAGAAACAACTCTGTTTTTGAAGT
CCTCTGTTTTTGTTTGGTTGAGGGCTCTAGATGATGATAAAGCTCGTGGCTTTGCTTCGG
TTACAGCATGTACTTACTTGTGATTCTTTTTAACCTTTTTTTGTCTTTCCCGTTTGTGGG
AAAAGAATCAGAAACTTTGTGGTCATAAGTCGTGAACACGCTTAACGTGTCGTGTACGAT
AGGGCAAAATGTTAAGACATGATCATCCTTTCCTTTCACGTGTTCTGTTACGTATACAAC
TTTTCTAATAACAGCGAATATGATTTC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2CZ39TF 629 0 0
TCTGAACATATTGGTTGAATCAGGAAAAAAAAATCTACTGAGGAAGACCTTTTCTTTGCA
TGAATGAAGTCTCTGCCATTGTTAGCTGAGAATAGACCTGCATTGTGTCCATGGAGCAAC
TGGTTTGGTTTTACATTTTTTTTAATTGCATGTTATGTGTATTAGTATTATTCGTCTAGT
GTTTGTTGATGAAAAATAAATGTGTTACCGAATAAAAAGTTTCAAATTCTTTGTGCTTTT
TTTT**GCATTTACTTCTTGCAATAAGGGTTTGCTTTAACATCTGACATCTGAATAGAGT
ACTTGTCCTCGTTATAATGCAGTGATGAGATCTAGAGAGACAAAGAAACAACTCTGTTTT
TGAAGTCCTCTGTTTTTGTTTGGCTGAGGGCTCTAGATGATGATAAAGCTCGTGGCTTTG
CTTCGGTTACAGCATGTACTTACTTGTGATTCTTTTTAACCTTTTTTTGTCTTTCCCGTT
TGTGGGAAAAGAATCAGAAACTTTGTGGTCATAAGTCGTGAACACGCTTAACGTGTCGTG
TACGATAGGGCAAAATGTTAAGACATGATCATCCTTTCCTTTCACGTGTTCTGTTACGTA
TACA*CTTTTCTAATAACAGCGAATATGA

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 3

CO CL3158Contig1 1330 3 3 U
AAAACGATAAAACGTCTTAATTTCATTTAGATCCAATCCTTAGCAACAAAAAGAACAATT
TGGTGCATATTTCGAAGGTACAAAGAGGGAGATAGAGATTAGAGAACCTATAAGATGAAA
AGAGTAAGAAAACTCAAGTGTGATCGTTTACCGAAAATCACTACGCCAACTAACAAATCC
TCCTTATAGCTGTGAAAAACTGTAAGATACAACAGAAGAGAGAGAGAAGAAACCGGAGAT
GAACATTTGAAAATTTGCCGAGTATTCCAACGAATTCTTCAAGAGTCTTGTGCAGAGTCA
TCATCGGCATTGGCTGTTTGGTCACCAGGAAGACCAAATATCCGTAGGTTACGGTCCATG
GAACCAACTGCAACGTATTGTGCATCTGGACCAAACTTCACACATGTAGCTTTACCAGTG
CCGGAAAGATCAGGGAGTGTCTTAATAAGGTTCCATTCAGCTTTCACACTCCCCGTCTGG
TATAGCCTGATATCTGATGCAGCAACACCAAGATAAGATCCGCTAGGGTCAAACTCCACA
GAGTTTGCATCTGCGGATAAGAATGACTTGAAGTTCCTTAACTTGCGCAGGTCCCACAAC
CTAACACCATCCTCGGCAGCAGTCGCGAGGAAATAACCATTCTCAGAGAAAGATATAGAG
GTAACTTCACCGGTGTGTCCATCAAACTTCGCCACATTTGCCTGACTTTTAACATCCCAA
ATCTTAACAACAGATTGAGAAGTACCGGTTCCGAGAATGAGACCATCAGGATGAAAAGCA
GCAGCCGTGTAATCCACCCTCTCAGAATCATCCGACACCTTTGCAAGGCATAAGCCAGAG
GAAAGATCGTAGAAGCACCATGTACTGTCAAGAGATGCCGACACAAAGTATTTATTTGTG
GCATGCACAGTTACAGCTCGCACCTCTGCAGAATGATCATTCAATGTATGCCCACAAGCA
TAATTCCTATCACCAGAATCCCGCCAGATACGGACTGTCTTGTCAGCCGAAGCAGTTAAA
ACAAGATCACTGTCACCTACAAATTTTACACTTGTAACCTTTTTCGAGTGACCAGTAAGT
GTTGACAAGATTTGCCCTGAAGGGCGATCAAAGATAACAGCAGTTGTATCCACTCCTCCG
GTAGCAATGACATCCTTAGAATGTAGGATGTCCATTGAACAAATGCCCGGTTTGTTGGTC
TTGTGAAGTGGGTGGCTTGATAGCTGAGTGAACCTCTCCAAAGAATCTATTGGAGCCAAT
GTTTCAGGAATCTGTCGCTTTTTGCGCTTCTGGGAGAGAGCAGCATTGCAATCTGTCAGT
TCCGTGATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH16JQ U 1
AF RR2CC90JQ U 1
AF RR2AH16TF C 616
BS 1 641 RR2AH16JQ
BS 642 761 RR2CC90JQ
BS 762 1330 RR2AH16TF

RD RR2AH16JQ 641 0 0
AAAACGATAAAACGTCTTAATTTCATTTAGATCCAATCCTTAGCAACAAAAAGAACAATT
TGGTGCATATTTCGAAGGTACAAAGAGGGAGATAGAGATTAGAGAACCTATAAGATGAAA
AGAGTAAGAAAACTCAAGTGTGATCGTTTACCGAAAATCACTACGCCAACTAACAAATCC
TCCTTATAGCTGTGAAAAACTGTAAGATACAACAGAAGAGAGAGAGAAGAAACCGGAGAT
GAACATTTGAAAATTTGCCGAGTATTCCAACGAATTCTTCAAGAGTCTTGTGCAGAGTCA
TCATCGGCATTGGCTGTTTGGTCACCAGGAAGACCAAATATCCGTAGGTTACGGTCCATG
GAACCAACTGCAACGTATTGTGCATCTGGACCAAACTTCACACATGTAGCTTTACCAGTG
CCGGAAAGATCAGGGAGTGTCTTAATAAGGTTCCATTCAGCTTTCACACTCCCCGTCTGG
TATAGCCTGATATCTGATGCAGCAACACCAAGATAAGATCCGCTAGGGTCAAACTCCACA
GAGTTTGCATCTGCGGATAAGAATGACTTGAAGTTCCTTAACTTGCGCAGGTCCCACAAC
CTAACACCATCCTCGGCAGCAGTCGCGAGGAAATAACCATT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2CC90JQ 761 0 0
AAAACGATAAAACGTCTTAATTTCATTTAGATCCAATCCTTAGCAACAAAAAGAACAATT
TGGTGCATATTTCGAAGGTACAAAGAGGGAGATAGAGATTAGAGAACCTATAAGATGAAA
AGAGTAAGAAAACTCAAGTGTGATCGTTTACCGAAGATCACTACGCCAACTAACAAATCC
TCCTTATAGCTGTGAAAAACTGTAAGATACAACAGAAGAGAGAGAGAAGAAACCGGAGAT
GAACATTTGAAAATTTGCCGAGTATTCCAACGAATTCTTCAAGAGTCTTGTGCAGAGTCA
TCATCGGCATTGGCTGTTTGGTCACCAGGAAGACCAAATATCCGTAGGTTACGGTCCATG
GAACCAACTGCAACGTATTGTGCATCTGGACCAAACTTCACACATGTAGCTTTACCAGTG
CCGGAGAGATCAGGGAGTGTCTTAATAAGGTTCCATTCAGCTTTCACACTCGCCGTCTGG
TATAGCCTGATATCTGATGCAGCAACACCAAGATAAGATCCGCTAGGGTCAAACTCCACA
GAGTTTGCATCTGCGGATAAGAATGACTTGAAGTTCCTTAACTTGCGCAGGTCCCACAAC
CTAACACCATCCTCGGCAGCAGTCGCGAGGAAATAACCATTCTCAGAGAAAGATATAGAG
GTAACTTCACCGGTGTGTCCATCAAACTTCGCCACATTTGCCTGACTTTTAACATCCCAA
ATCTTAACAACAGATTGAGAAGTACCGGTTCCGAGAATGAG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2AH16TF 715 0 0
GCAGCAGTCGCGAGGAAATAACCATTCTCAGAGAAAGATATAGAGGTAACTTCACCGGTG
TGTCCATCAAACTTCGCCACATTTGCCTGACTTTTAACATCCCAAATCTTAACAACAGAT
TGAGAAGTACCGGTTCCGAGAATGAGACCATCAGGATGAAAAGCAGCAGCCGTGTAATCC
ACCCTCTCAGAATCATCCGACACCTTTGCAAGGCATAAGCCAGAGGAAAGATCGTAGAAG
CACCATGTACTGTCAAGAGATGCCGACACAAAGTATTTATTTGTGGCATGCACAGTTACA
GCTCGCACCTCTGCAGAATGATCATTCAATGTATGCCCACAAGCATAATTCCTATCACCA
GAATCCCGCCAGATACGGACTGTCTTGTCAGCCGAAGCAGTTAAAACAAGATCACTGTCA
CCTACAAATTTTACACTTGTAACCTTTTTCGAGTGACCAGTAAGTGTTGACAAGATTTGC
CCTGAAGGGCGATCAAAGATAACAGCAGTTGTATCCACTCCTCCGGTAGCAATGACATCC
TTAGAATGTAGGATGTCCATTGAACAAATGCCCGGTTTGTTGGTCTTGTGAAGTGGGTGG
CTTGATAGCTGAGTGAACCTCTCCAAAGAATCTATTGGAGCCAATGTTTCAGGAATCTGT
CGCTTTTTGCGCTTCTGGGAGAGAGCAGCATTGCAATCTGTCAGTTCCGTGATCC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 3

CO CL3159Contig1 766 3 22 U
GGTCAAATAAAGATCATTTATTCTAGGAGAGTTGTTACAACGGGTTTAGTTATTAAATAA
AATTTATAAAACCATAGGTCTTGGATCTTTGTCTAGTCACTGAATGTTGTTACTCTTCTC
TTCTTGTGTTTCTTTTTCTTCCTTTTCTTCACCTTGAGGAATCTCTTGCTCTTCTTCTGG
TTTTGGATCATCAATATAATGCTGGTAAGCATAAGAAACGAATCCCCATATGGCCAAAAA
CATTGCAATCAACTTGATTCCACTCATCTCATCTCGGAAGAACACAACAGCAAGAACAGG
AACAACAGGTAAACAAAGAGTGCTTATCACGTTTGAGAAAAGAGACGAGACTTCAAGAAT
CAAACCCACACTACCGATCCAACAAGCTTGCCAAGATATCATTGAACCAATATTTATCAA
AAGATAAGAGTGTTTCCCAAGCCTAAACTCTTCCATTTCTGTACTTATCATTTTCCATCC
ACCACTTCCAAAAAGTCCAACCACAACTGCACAAGTAGCAACTAAAGACTGATATGTGAC
CATGTCCAATATAGCCTTGAATGTTTGTTTCTTTAGGATATTTTCGAAAGCGTAGTCTGT
TAAAGAAAGCACTAGAGAATATCCAGCTGAGCTACCGATGGCACAGATGTATCCAATCAC
ATAATTGTATTTGGAAGATGAGTTTGAAGTAGAAGATTGATCAGGCTCAGGTTGGATGAC
AAGAAGTGTTGAAGATGTGGTCAAGAGAACAAGTGAGTTGAGTATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H787JQB U 1
AF RR2D145JQ U 1
AF RR2H787TF C 43
BS 1 342 RR2D145JQ
BS 343 343 RR2H787JQB
BS 344 345 RR2D145JQ
BS 346 346 RR2H787JQB
BS 347 348 RR2D145JQ
BS 349 349 RR2H787JQB
BS 350 431 RR2D145JQ
BS 432 432 RR2H787JQB
BS 433 467 RR2D145JQ
BS 468 468 RR2H787JQB
BS 469 511 RR2D145JQ
BS 512 512 RR2H787JQB
BS 513 519 RR2D145JQ
BS 520 520 RR2H787JQB
BS 521 522 RR2D145JQ
BS 523 523 RR2H787JQB
BS 524 549 RR2D145JQ
BS 550 550 RR2H787JQB
BS 551 579 RR2D145JQ
BS 580 580 RR2H787TF
BS 581 691 RR2D145JQ
BS 692 766 RR2H787TF

RD RR2H787JQB 570 0 0
GGTCAAATAAAGATCATTTATTCTAGGAGAGTTGTTACAACGGGTTTAGTTATTAAATAA
AATTTATAAAACCATAGGTCTTGGATCTTTGTCTAGTCACTGAATGTTGTTACTCTTCTC
TTCTTGTGTTTCTTTTTCTTCCTTTTCTTCACCTTGAGGAATCTCTTGCTCTTCTTCTGG
TTTTGGATCATCAATATAATGCTGGTAAGCATAAGAAACGAATCCCCATATGGCCAAAAA
CATTGCAATCAACTTGATTCCACTCATCTCATCTCGGAAGAACACAACAGCAAGAACAGG
AACAACAGGTAAACAAAGAGTGCTTATCACGTTTGAGAAAAGAGACGAGACTTCAAGAAT
CAAACCCACACTACCGATCCAACAAGCTTGCCAAGATATCATTGAACCAATATTTATCAA
AAGATAAGAGTGTTTCCCAAGCCTAAACTCTTCCATTTCTGTACTTATCATTTTCCATCC
ACCACTTCCAAAAAGTCCAACCACAACTGCACAAGTAGCAACTAAAGACTGATATGTGAC
CATGTCCAATATAGCCTTGAATGTTTGTTT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2D145JQ 691 0 0
GGTCAAATAAAGATCATTTATTCTAGGAGAGTTGTTACAACGGGTTTAGTTATTAAATAA
AATTTATAAAACCATAGGTCTTGGATCTTTGTCTAGTCACTGAATGTTGTTACTCTTCTC
TTCTTGTGTTTCTTTTTCTTCCTTTTCTTCACCTTGAGGAATCTCTTGCTCTTCTTCTGG
TTTTGGATCATCAATATAATGCTGGTAAGCATAAGAAACGAATCCCCATATGGCCAAAAA
CATTGCAATCAACTTGATTCCACTCATCTCATCTCGGAAGAACACAACAGCAAGAACAGG
AACAACAGGTAAACAAAGAGTGCTTATCACGTTTGAGAAAAGCGATGAAACTTCAAGAAT
CAAACCCACACTACCGATCCAACAAGCTTGCCAAGATATCATTGAACCAATATTTATCAA
AAGATAAGAGTATTTCCCAAGCCTAAACTCTTCCATTTCTGTACTTAACATTTTCCATCC
ACCACTTCCAAAAAGTCCAACCACAACTGCAGAAGTAGCTACCAAAGACTGATATGTGAC
CATGTCCAAAATAGCCTTGAATGTTTGTTTCTTTAGGATCTTTTCGAAAGCGTAGTCTGT
TAAAGAAAGCACTAGAGAATATCCAGCTGAGCTACCGATGGCACAGATGTATCCAATCAC
ATAATTGTATTTGGAAGATGAGTTTGAAGTA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2H787TF 724 0 0
GGTTTAGTTATTAAATAAAATTTATAAAACCATAGGTCTTGGATCTTTGTCTAGTCACTG
AATGTTGTTACTCTTCTCTTCTTGTGTTTCTTTTTCTTCCTTTTCTTCACCTTGAGGAAT
CTCTTGCTCTTCTTCTGGTTTTGGATCATCAATATAATGCTGGTAAGCATAAGAAACGAA
TCCCCATATGGCCAAAAACATTGCAATCAACTTGATTCCACTCATCTCATCTCGGAAGAA
CACAACAGCAAGAACAGGAACAACAGGTAAACAAAGAGTGCTTATCACGTTTGAGAAAAG
AGACGAGACTTCAAGAATCAAACCCACACTACCGATCCAACAAGCTTGCCAAGATATCAT
TGAACCAATATTTATCAAAAGATAAGAGTGTTTCCCAAGCCTAAACTCTTCCATTTCTGT
ACTTATCATTTTCCATCCACCACTTCCAAAAAGTCCAACCACAACTGCACAAGTAGCAAC
TAAAGACTGATATGTGACCATGTCCAATATAGCCTTGAATGTTTGTTTCTTTAGGATATT
TTCGAAAGCGTAGTCTGTTAAAGAAAGCACTAGAGAATATCCAGCTGAGCTACCGATGGC
ACAGATGTATCCAATCACATAATTGTATTTGGAAGATGAGTTTGAAGTAGAAGATTGATC
AGGCTCAGGTTGGATGACAAGAAGTGTTGAAGATGTGGTCAAGAGAACAAGTGAGTTGAG
TATC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 3

CO CL3160Contig1 685 3 9 U
GTCGAGAAAGCTAAGTAAAAGATTGATGATTTGAAGAAGTTTTACGGTCGGCTTGCTGAG
ATCCTTCAGAAATGTCCTGGACAGTACTATAGGTACCATGGAGACTGGAGGAGTGAGACA
CAGGCAGTGGTCTCCCAGCTCGCTTTCATGCACTGGCTAGAAACTGGAACTCTCCTTGTG
CATACCGAAGCTGAAGCAAAACTTGGGTTGAACAGTTTGGAGTTTGGACTGGAGACGGAA
GATTATCTGACTGGAATATGCTTCATGTCAAACGATTTGCCTAGGTACGTGGTGAACAGA
GTAACAGCAGGTGACTATGACTGTCCAAGAAAGGTGATGAACTTCTTGACGGATCTTCAT
GCTGCCTTCCGCATGCTCAACCTCAGGAACGATTTTTTGCGCAAGAAATTCGACAGTATG
AAATATGACCTAAGAAGAGTGGAAGAAGTATACTATGATGTTAAGATCCGAGGTTTGATT
TCTGGTGGAGATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCAAGTCCAAGACCAATCCTAAATTAGGATC
TTTCACTCTCGTTTCCTCTCTGCAACTTTGTTTAGCTAATCATGAAACAGCAAGGAGTGT
TTTTCTGTAAGACCTAAAAACAGCAAGGAGTTTGTTTCTGTAAAACTAAAACGGCAAGGA
ATAGGCAGATCATTTTGGTTTCCCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2B160JQ C 1
AF RR2C413TF U 259
AF RR2B160TF U 1
BS 1 259 RR2B160TF
BS 260 318 RR2C413TF
BS 319 319 RR2B160TF
BS 320 378 RR2C413TF
BS 379 379 RR2B160TF
BS 380 497 RR2C413TF
BS 498 498 RR2B160TF
BS 499 683 RR2C413TF
BS 684 685 RR2B160JQ

RD RR2B160JQ 685 0 0
GTCGAGAAAGCTAAGTAAAAGATTGATGATTTGAAGAAGTTTTACGGTCGGCTTGCTGAG
ATCCTTCAGAAATGTCCTGGACAGTACTATAGGTACCATGGAGACTGGAGGAGTGAGACA
CAGGCAGTGGTCTCCCAGCTCGCTTTCATGCACTGGCTAGAAACTGGAACTCTCCTTGTG
CATACCGAAGCTGAAGCAAAACTTGGGTTGAACAGTTTGGAGTTTGGACTGGAGACGGAA
GATTATCTGACTGGAATATGCTTCATGTCAAACGATTTGCCTAGGTACGTGGTGAACAGA
GTAACAGCAGGTGACTATGACTGTCCAAGAAAGGTGATGAACTTCTTGACGGATCTTCAT
GCTGCCTTCCGCATGCTCAACCTCAGGAACGATTTTTTGCGCAAGAAATTCGACAGTATG
AAATATGACCTAAGAAGAGTGGAAGAAGTATACTATGATGTTAAGATCCGAGGTTTGATT
TCTGGTGGAGATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCAAGTCCAAGACCAATCCTAAATTAGGATC
TTTCACTCTCGTTTCCTCTCTGCAACTTTGTTTAGCTAATCATGAAACAGCAAGGAGTGT
TTTTCTGTAAGACCTAAAAACAGCAAGGAGTTTGTTTCTGTAAAACTAAAACGGCAAGGA
ATAGGCAGATCATTTTGGTTTCCCG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2C413TF 427 0 0
G
GCTTCATGTCAAACGATTTGCCTAGGTACGTGGTGAACAGAGTAACAGCAGGTGACTATT
ACTGTCCAAGAAAGGTGATGAACTTCTTGACGGATCTTCATGCTGCCTTCCGCATGCTCG
ACCTCAGGAACGATTTTTTGCGCAAGAAATTCGACAGTATGAAATATGACCTAAGAAGAG
TGGAAGAAGTATACTATGATGTTAAGATCCGAGGTTTGATTTCTGGTGGAGATCCTCCCC
CTCCTCCTCCTCAAGTCCAAGACCAATCCTAAATTAGGATCTTTCACTCTCGTTTCCTCT
CTGCAACTTTGTTTAGCTAATCATGAAACAGCAAGGAGTGTTTTTCTGTAAGACCTAAAA
ACAGCAAGGAGTTTGTTTCTGTAAAACTAAAACGGCAAGGAATAGGCAGATCATTTTGGT
TTCC
TG

QA 2 425 2 425
DS 

RD RR2B160TF 685 0 0
GTCGAGAAAGCTAAGTAAAAGATTGATGATTTGAAGAAGTTTTACGGTCGGCTTGCTGAG
ATCCTTCAGAAATGTCCTGGACAGTACTATAGGTACCATGGAGACTGGAGGAGTGAGACA
CAGGCAGTGGTCTCCCAGCTCGCTTTCATGCACTGGCTAGAAACTGGAACTCTCCTTGTG
CATACCGAAGCTGAAGCAAAACTTGGGTTGAACAGTTTGGAGTTTGGACTGGAGACGGAA
GATTATCTGACTGGAATATGCTTCATGTCAAACGATTTGCCTAGGTACGTGGTGAACAGA
GTAACAGCAGGTGACTATGACTGTCCAAGAAAGGTGATGAACTTCTTGACGGATCTTCAT
GCTGCCTTCCGCATGCTCAACCTCAGGAACGATTTTTTGCGCAAGAAATTCGACAGTATG
AAATATGACCTAAGAAGAGTGGAAGAAGTATACTATGATGTTAAGATCCGAGGTTTGATT
TCTGGTGGAGATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCAAGTCCAAGACCAATCCTAAATTAGGATC
TTTCACTCTCGTTTCCTCTCTGCAACTTTGTTTAGCTAATCATGAAACAGCAAGGAGTGT
TTTTCTGTAAGACCTAAAAACAGCAAGGAGTTTGTTTCTGTAAAACTAAAACGGCAAGGA
ATAGGCAGATCATTTTGGTTTCC
CG

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 3

CO CL3161Contig1 1025 3 10 U
GGACTTCTTTCAGGTTGAAACAAGAAAGAGAATGGCCTACAGCGCATGCTTCTTGCACCA
GAGTGCACTTACCTCCTCCACCGCACGATCATCTTCCTTCCCCTCGTCCCTTCGTCACAT
GACCTTCTCAAGACCCGTCCATGTAGTATGCAGAGCTCAGCAGTCTCAAGAAGACGTTAA
CTCCTCCGTCTCCCGTCGTCTTGCCCTCACCTTCCTCGTCGGTGCTGCAGCCGTCGGATC
CAAAGTCTCTCCTTCTGATGCAGCCTATGGTGAAGCCGCGAATGTGTTTGGTAAGCCAAA
GAAGAACACAGACTTCATGCCGTACAATGGAGAAGGATTCAAAATAGAGATCCCATCAAA
GTGGAACCCAAGCAAAGAAGTTGAGTATCCAGGACAAGTCCTAAGGTTTGAAGACAACTT
TGATGCCACCAGTAACGTCTCTGTAATGATCACTCCTACAGACAAGAAAACCATTACTGA
TTACGGTTCTCCTGAACAGTTCCTTTCTCAGGTCAGTTATCTCCTTGGGAAGCAAGCTTA
CTTTGGCGAAACAGCCTCTGAGGGAGGGTTTGATGCAAATGCAGTAGCAACTGCAAACAT
TCTGGAGACCTCTACACAAGAGATTGATGGGAAAAAGTACTATTACTTGTCGGTTTTGAC
AAGAACAGCTGATGGAGATGAAGGTGGGAAGCATCAGCTGATCACAGCCACTGTGAATGG
TGGAAAGCTTTACATTTGCAAAGCACAAGCAGGAGACAAGAGGTGGTTTAAAGGAGCTAG
GAAGTTCGTCGAGAATGCTGCTTCTTCCTTTAGTGTCGCTTGAAACTAACTAAATAAAAA
AAAACATATGAATGGAATGTTCTGTTAGTTTGTTGTCTTCTTCTCCATTGTCTCTTGAAT
AAAAAAAGTGGATCAAGAAAACAAAACAAGCATTTGAGAACTATGAGTTTTAGGATTCAA
TGGTTGTTAAGTCTTGTGTGATGAAGCCTTCTGTTTTTGTTTTACTGGCAGAACTTTTCA
TTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2DL33TF U 10
AF RR2ES33TF U 1
AF RR2DL33JQ C 393
BS 1 47 RR2ES33TF
BS 48 48 RR2DL33TF
BS 49 354 RR2ES33TF
BS 355 355 RR2DL33TF
BS 356 589 RR2ES33TF
BS 590 590 RR2DL33TF
BS 591 682 RR2ES33TF
BS 683 683 RR2DL33JQ
BS 684 752 RR2ES33TF
BS 753 1025 RR2DL33JQ

RD RR2DL33TF 627 0 0
GG
AGGTTGAAACAAGAAAGAGAATGGCCTACAGCGCATGCTTCTTGCACCAGAGTGCACTTA
CCTCCTCCACCGCACGATCATCTTCCTTCCCCTCGTCCCTTCGTCACATGACCTTCTCAA
GACCCGTCCATGTAGTATGCAGAGCTCAGCAGTCTCAAGAAGACGTTAACTCCTCCGTCT
CCCGTCGTCTTGCCCTCACCTTCCTCGTCGGTGCTGCAGCCGTCGGATCCAAAGTCTCTC
CTTCTGATGCAGCCTATGGTGAAGCCGCGAATGTGTTTGGTAAGCCAAAGAAGAACACAG
ACTTCATGCCGTACAGTGGAGAAGGATTCAAAATAGAGATCCCATCAAAGTGGAACCCAA
GCAAAGAAGTTGAGTATCCAGGACAAGTCCTAAGGTTTGAAGACAACTTTGATGCCACCA
GTAACGTCTCTGTAATGATCACTCCTACAGACAAGAAAACCATTACTGATTACGGTTCTC
CTGAACAGTTCCTTTCTCAGGTCAGTTATCTCCTTGGGAAGCAAGCTTACTTTGGCGAAA
CAGCCTCTGAGGGAGGGTTTGATGCAAATGCAGTAGCAACTGCAAACATTCTGGAGACCT
CTACACAAGAGATTGATGGGAAAAA

QA 3 627 3 627
DS 

RD RR2ES33TF 756 0 0
GGACTTCTTTCAGGTTGAAACAAGAAAGAGAATGGCCTACAGCGCATTCTTCTTGCACCA
GAGTGCACTTACCTCCTCCACCGCACGATCATCTTCCTTCCCCTCGTCCCTTCGTCACAT
GACCTTCTCAAGACCCGTCCATGTAGTATGCAGAGCTCAGCAGTCTCAAGAAGACGTTAA
CTCCTCCGTCTCCCGTCGTCTTGCCCTCACCTTCCTCGTCGGTGCTGCAGCCGTCGGATC
CAAAGTCTCTCCTTCTGATGCAGCCTATGGTGAAGCCGCGAATGTGTTTGGTAAGCCAAA
GAAGAACACAGACTTCATGCCGTACAATGGAGAAGGATTCAAAATAGAGATCCCTTCAAA
GTGGAACCCAAGCAAAGAAGTTGAGTATCCAGGACAAGTCCTAAGGTTTGAAGACAACTT
TGATGCCACCAGTAACGTCTCTGTAATGATCACTCCTACAGACAAGAAAACCATTACTGA
TTACGGTTCTCCTGAACAGTTCCTTTCTCAGGTCAGTTATCTCCTTGGGAAGCAAGCTTA
CTTTGGCGAAACAGCCTCTGAGGGAGGGTTTGATGCAAATGCAGTAGCAGCTGCAAACAT
TCTGGAGACCTCTACACAAGAGATTGATGGGAAAAAGTACTATTACTTGTCGGTTTTGAC
AAGAACAGCTGATGGAGATGAATGTGGGAAGCATCAGCTGATCACAGCCACTGTGAATGG
TGGAAAGCTTTACATTTGCAAAGCACAAGCAG
AGAC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2DL33JQ 633 0 0
GACAAGTCCTAAGGTTTGAAGACAACTTTGATGCCACCAGTAACGTCTCTGTAATGATCA
CTCCTACAGACAAGAAAACCATTACTGATTACGGTTCTCCTGAACAGTTCCTTTCTCAGG
TCAGTTATCTCCTTGGGAAGCAAGCTTACTTTGGCGAAACAGCCTCTGAGGGAGGGTTTG
ATGCAAATGCAGTAGCAACTGCAAACATTCTGGAGACCTCTACACAAGAGATTGATGGGA
AAAAGTACTATTACTTGTCGGTTTTGACAAGAACAGCTGATGGAGATGAAGGTGGGAAGC
ATCAGCTGATCACAGCCACTGTGAATGGTGGAAAGCTTTACATTTGCAAAGCACAAGCAG
GAGACAAGAGGTGGTTTAAAGGAGCTAGGAAGTTCGTCGAGAATGCTGCTTCTTCCTTTA
GTGTCGCTTGAAACTAACTAAATAAAAAAAAACATATGAATGGAATGTTCTGTTAGTTTG
TTGTCTTCTTCTCCATTGTCTCTTGAATAAAAAAAGTGGATCAAGAAAACAAAACAAGCA
TTTGAGAACTATGAGTTTTAGGATTCAATGGTTGTTAAGTCTTGTGTGATGAAGCCTTCT
GTTTTTGTTTTACTGGCAGAACTTTTCATTGCG

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL3162Contig1 911 2 4 U
GGGGATCTCCTCCTTCGTCTTCTTCTTCTGATTTGTGATCCTCGTCGTCCTCCTTCGTCT
TCTTCGAATCAAAGCAGAAGCAAGGTCGTCATTTTCCAATGCGTGGTTTCTCTCTTTCTC
TGGATCTCGTTCAAGGAGTTAAAAGAAGAGAGTGAAGGTTGTTGTAGAAGAAAAGGAATA
AAGATGCCTTTGAATTTCGGCAACGATGTGGATGGATCGTCCCGGATTCTTTTGAATGAG
CCTCGCGGATCTACTGCTCTGGTGCTTCTGTTTGGAGGACAAGTCATCTCTTGGAAAAAT
GAAAGGAGGGAAGAACTTCTTTTTATGAGCACTAAGGCTCAGTATATGCCTCCCAAGATC
ATCAGAGGAGGAATACCTGTTTGCTTTCCTCAGTTTGGAAACTTTGGTGGACTTGAGCGA
CATGGTTTTGCCCGCAACAGATTTTGGTCTCTTGATGACGATCCTTCCCCTCTTCCTCCT
GCTAACAAACAATCATCTGTTGATCTGATTCTCAAGTCCACCGAAGATGACCTCAAGATC
TGGCCTCACAGCTTTGAACTCCGTGTACGAATCTCTATCAGCTCTGGGAAACTTACTTTG
ATCCCTCGTGTGAGGAACATTGACTCAAAGCCATTCTCTTTCATGTTTGCTCTTCGAAAC
TACTTACATGTATCTGACATAAGTGAAGTACGGGTTGAGGGTCTGGAGACTCTTGATTAT
CTATACAACTTGAAAGGTAAAGAAAGATTCACCGAGCAAGCAGACGCAATTACCTTTGAC
GGTGAGATTGACAGGGTGTACTTGAACACACCAACGAAGATTGCGGTCATAGACCATGAG
CGGAAGAGAGCCATCGAACTGCGAAAGGAAAGCATGCCCAATGCAGTAGTGTGGAACCCT
TGGGACAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D251TF U 1
AF RR2GG05TF U 357
BS 1 613 RR2D251TF
BS 614 614 RR2GG05TF
BS 615 654 RR2D251TF
BS 655 911 RR2GG05TF

RD RR2D251TF 654 0 0
GGGGATCTCCTCCTTCGTCTTCTTCTTCTGATTTGTGATCCTCGTCGTCCTCCTTCGTCT
TCTTCGAATCAAAGCAGAAGCAAGGTCGTCATTTTCCAATGCGTGGTTTCTCTCTTTCTC
TGGATCTCGTTCAAGGAGTTAAAAGAAGAGAGTGAAGGTTGTTGTAGAAGAAAAGGAATA
AAGATGCCTTTGAATTTCGGCAACGATGTGGATGGATCGTCCCGGATTCTTTTGAATGAG
CCTCGCGGATCTACTGCTCTGGTGCTTCTGTTTGGAGGACAAGTCATCTCTTGGAAAAAT
GAAAGGAGGGAAGAACTTCTTTTTATGAGCACTAAGGCTCAGTATATGCCTCCCAAGATC
ATCAGAGGAGGAATACCTGTTTGCTTTCCTCAGTTTGGAAACTTTGGTGGACTTGAGCGA
CATGGTTTTGCCCGCAACAGATTTTGGTCTCTTGATGACGATCCTTCCCCTCTTCCTCCT
GCTAACAAACAATCATCTGTTGATCTGATTCTCAAGTCCACCGAAGATGACCTCAAGATC
TGGCCTCACAGCTTTGAACTCCGTGTACGAATCTCTATCAGCTCTGGGAAACTTACTTTG
ATCCCTCGTGTGATGAACATTGACTCAAAGCCATTCTCTTTCATGTTTGCTCTT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2GG05TF 555 0 0
GATCATCAGAGGAGGAATACCTGTTTGCTTTCCTCAGTTTGGAAACTTTGGTGGACTTGA
GCGACATGGTTTTGTCCGCAACAGTTTTTGGTCTCTTGATGACGATCCTTCCCCTCTTCC
TCCTGCTAACAAACAATCATCTGTTGATCTGATTCTCAAGTCCACCGAAGATGACCTCAA
GATCTGGCCTCACAGCTTTGAACTCCGTGTACGAATCTCTATCAGCTCTGGGAAACTTAC
TTTGATCCCTCGTGTGAGGAACATTGACTCAAAGCCATTCTCTTTCATGTTTGCTCTTCG
AAACTACTTACATGTATCTGACATAAGTGAAGTACGGGTTGAGGGTCTGGAGACTCTTGA
TTATCTATACAACTTGAAAGGTAAAGAAAGATTCACCGAGCAAGCAGACGCAATTACCTT
TGACGGTGAGATTGACAGGGTGTACTTGAACACACCAACGAAGATTGCGGTCATAGACCA
TGAGCGGAAGAGAGCCATCGAACTGCGAAAGGAAAGCATGCCCAATGCAGTAGTGTGGAA
CCCTTGGGACAAAAA

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 3

CO CL3163Contig1 818 3 16 U
GCAAGGAGGATGGCAACACCGTTAGCTACAGCTCCTACGAGATGTTGGCTGGTCATGTTT
GGAGGTCTGTGGGTAAGGCCCGCGGGCTTCCCGACGATCAAGAGACCAAACTGCACATTG
CTACCGACGGAAGGTCGAGACTTCGTCCGCAGCTTCCCCCTGGTTACCTTGGTAACGTGA
TATTCACTGCCACGCCACTGGCCGTTGCAGGGGATCTGCTATCGAAACCGACGTGGTATG
CTGCAGGACTGATTCATGATGTTTTGGCTCGCATGGACGATAACTATCTGAGGTCAGCTC
TCGACTACCTGGAGATGCAGCCCGATCTCTCGGCTTTAGTCCGCGGTGCGCATACGTACA
AATGTCCGAATTTGGGAATCACAAGCTGGGTCAGATTGCCTATTTACGATGCAGACTTTG
GTTGGGGACGTCCCATATTTATGGGACCTGGTGGAATTCCATACGAGGGTTTGTCGTTTG
TGCTACCAAGTCCTACAAATGATGGCAGCTTGTCTGTGGCCATTGCTCTCCAAACTGAAC
ACATGAAACTGTTTGAGAAGTATTTGTACGATATATGACAGAGACAAGCAGCAGCAGAAC
AAGAAGAAGATGATGATGATGATTCCTCCTTTTCCCCCCCACTTAAGTGGGGCTTTTTTG
TTGCTTGATGTCGAAGATGATTCGTTATCCTGTATTTTAGAGGGTACAATAAAGTTATGT
CAACACATAAGTTTTTCTTATGGTCTGTGTAACATTTGGATCGGTCATGTAGGAACTTTT
GCTTTTATGTTTATACTGATGATGATAAGTGTTGTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM05TF U 74
AF RR2FS38TF U 1
AF RR2GM05JQ C 253
BS 1 89 RR2FS38TF
BS 90 90 RR2GM05TF
BS 91 113 RR2FS38TF
BS 114 114 RR2GM05TF
BS 115 167 RR2FS38TF
BS 168 168 RR2GM05TF
BS 169 337 RR2FS38TF
BS 338 338 RR2GM05TF
BS 339 611 RR2FS38TF
BS 612 612 RR2GM05TF
BS 613 639 RR2FS38TF
BS 640 640 RR2GM05JQ
BS 641 693 RR2FS38TF
BS 694 695 RR2GM05JQ
BS 696 770 RR2FS38TF
BS 771 818 RR2GM05JQ

RD RR2GM05TF 569 0 0
G
AAGGCCCGCGGGCTTCCCGACGATCAAGAGACCAAACTGCACATTGCTACCGACGGAAGG
TCGAGACTTCGTCCGCAGCTTCCCCCTGGTTACCTTGGTAACGTGATATTCACTGCCACG
CCACTGGCCGTTGCAGGGGATCTGCTATCGAAACCGACGTGGTATGCTGCAGGACTGATT
CATGATGTTTTGGCTCGCATGGACGATAACTATCTGAGGTCAGCTCTCGACTACCTGGAG
ATGCAGCCCGATCTCTCGGCTTTAGTCCGCGGTGCGCATACGTACAAATGTCCGAATTTG
GGAATCACAAGCTGGGTCAGATTGCCTATTTACGATGCAGACTTTGGTTGGGGACGTCCC
ATATTTATGGGACCTGGTGGAATTCCATACGAGGGTTTGTCGTTTGTGCTACCAAGTCCT
ACAAATGATGGCAGCTTGTCTGTGGCCATTGCTCTCCAAACTGAACACATGAAACTGTTT
GAGAAGTATTTGTACGATATATGACAGAGACAAGCAGCAGCAGAACAAGAAGAAGATGAT
GATGATGATTCCTCCTTTTCCCCCC
ACT

QA 2 566 2 566
DS 

RD RR2FS38TF 770 0 0
GCAAGGAGGATGGCAACACCGTTAGCTACAGCTCCTACGAGATGTTGGCTGGTCATGTTT
GGAGGTCTGTGGGTAAGGCCCGCGGGCTTTCCGACGATCAAGAGACCAAACTGTACATTG
CTACCGACGGAAGGTCGAGACTTCGTCCGCAGCTTCCCCCTGGTTACTTTGGTAACGTGA
TATTCACTGCCACGCCACTGGCCGTTGCAGGGGATCTGCTATCGAAACCGACGTGGTATG
CTGCAGGACTGATTCATGATGTTTTGGCTCGCATGGACGATAACTATCTGAGGTCAGCTC
TCGACTACCTGGAGATGCAGCCCGATCTCTCGGCTTTGGTCCGCGGTGCGCATACGTACA
AATGTCCGAATTTGGGAATCACAAGCTGGGTCAGATTGCCTATTTACGATGCAGACTTTG
GTTGGGGACGTCCCATATTTATGGGACCTGGTGGAATTCCATACGAGGGTTTGTCGTTTG
TGCTACCAAGTCCTACAAATGATGGCAGCTTGTCTGTGGCCATTGCTCTCCAAACTGAAC
ACATGAAACTGTTTGAGAAGTATTTGTACGATATATGACAGAGACAAGCAGCAGCAGAAC
AAGAAGAAGATTATGATGATGATTCCTCCTTTTCCCCCC*ACTTAAGTGGGGCTTTTTTG
TTGCTTGATGTCGAAGATGATTCGTTATCCTGT**TTTAGAGGGTACAATAAAGTTATGT
CAACACATAAGTTTTTCTTATGGTCTGTGTAACATTTGGATCGGTCATGT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2GM05JQ 566 0 0
TTCATGATGTTTTGGCTCGCATGGACGATAACTATCTGAGGTCAGCTCTCGACTACCTGG
AGATGCAGCCCGATCTCTCGGCTTTAGTCCGCGGTGCGCATACGTACAAATGTCCGAATT
TGGGAATCACAAGCTGGGTCAGATTGCCTATTTACGATGCAGACTTTGGTTGGGGACGTC
CCATATTTATGGGACCTGGTGGAATTCCATACGAGGGTTTGTCGTTTGTGCTACCAAGTC
CTACAAATGATGGCAGCTTGTCTGTGGCCATTGCTCTCCAAACTGAACACATGAAACTGT
TTGAGAAGTATTTGTACGATATATGACAGAGACAAGCAGCAGCAGAACAAGAAGAAGATG
ATGATGATGATTCCTCCTTTTCCCCCCCACTTAAGTGGGGCTTTTTTGTTGCTTGATGTC
GAAGATGATTCGTTATCCTGTATTTTAGAGGGTACAATAAAGTTATGTCAACACATAAGT
TTTTCTTATGGTCTGTGTAACATTTGGATCGGTCATGTAGGAACTTTTGCTTTTATGTTT
ATACTGATGATGATAAGTGTTGTCCT

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 3

CO CL3164Contig1 927 3 4 U
TTGTAAGTGATGGTGGCGGCGGTAACAACGGTGGATTTAACAAAGGTGGTGGAGGAGGTG
GAGATGGAGGTGACGGTGGAGAAGAAGAAGAGTATGAAGAGAAAGAGTTTGGACCGCTTT
TGAAATTCGAAGAGGTAATGAGAGAGACAGAAGCTAGAGGAGCGACGCTTCCATCTGATA
TGTTAGAGGCTGCTAAGACCTTTGGCATCCGCAAGTTGATTCTCCTTAGGTACTTGGATT
TGCAGAGCTCAGCTGGTCTGCTTGGGTTTGCTATAAGGTCATGGTCTATGCTTCGGAACA
GAATGCTGGCTGATCCATCTTTCCTCTTCAAAATAGGGACTGAGATAGTCATTGATTCTT
GTTGCGCCACTGTTGCTGAAGTTCAAAAGAGAGGGAAAGATTTCTGGGCTGAGTTTGAGC
TCTACGTTGCTGATCTTCTCGTTGGAGTTGTGGTTAACGTTGCTCTCGTCGGTATGTTGG
CTCCTTTTGTCCGTTTTGGCCAACCGTCGTCTGCGTCTAGTGGCTTCTTAGGACGCATGC
TTAATGCTTATAATGCGCTTCCCAGCAGCGTGTTTGAAGCTGAGAGACCAGGATGTAGTT
TCTCTGCTCAACAGAGACTTGCTACCTACTTCTACAAGGGTATAATGTATGGTGCAGTTG
GGTTTGGATGTGGCATTGTAGGTCAAGGCATTGCTAATCTCATCATGACTGCTAAACGGA
GCATAAATAAATCAGAAGAAGACATCCCGGTACCACCTCTCATCAAGAGTGCAGCTCTCT
GGGGTGTATTCTTGAGTGTTTCTTCGAATACTCGTTATCAGATCATCAATGGTTTAGAGA
GAGTGGTTGAAGCATCGCCTTTCGCCAAGAAAGTGCCTCCTGTGGCTTTGGCGTTTACCG
TTGGTGTACGGTTTGCTAATAACATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A141TF U 1
AF RR2A141JQ C 222
AF RR2DE88TF U 272
BS 1 639 RR2A141TF
BS 640 640 RR2DE88TF
BS 641 726 RR2A141TF
BS 727 927 RR2DE88TF

RD RR2A141TF 732 0 0
TTGTAAGTGATGGTGGCGGCGGTAACAACGGTGGATTTAACAAAGGTGGTGGAGGAGGTG
GAGATGGAGGTGACGGTGGAGAAGAAGAAGAGTATGAAGAGAAAGAGTTTGGACCGCTTT
TGAAATTCGAAGAGGTAATGAGAGAGACAGAAGCTAGAGGAGCGACGCTTCCATCTGATA
TGTTAGAGGCTGCTAAGACCTTTGGCATCCGCAAGTTGATTCTCCTTAGGTACTTGGATT
TGCAGAGCTCAGCTGGTCTGCTTGGGTTTGCTATAAGGTCATGGTCTATGCTTCGGAACA
GAATGCTGGCTGATCCATCTTTCCTCTTCAAAATAGGGACTGAGATAGTCATTGATTCTT
GTTGCGCCACTGTTGCTGAAGTTCAAAAGAGAGGGAAAGATTTCTGGGCTGAGTTTGAGC
TCTACGTTGCTGATCTTCTCGTTGGAGTTGTGGTTAACGTTGCTCTCGTCGGTATGTTGG
CTCCTTTTGTCCGTTTTGGCCAACCGTCGTCTGCGTCTAGTGGCTTCTTAGGACGCATGC
TTAATGCTTATAATGCGCTTCCCAGCAGCGTGTTTGAAGCTGAGAGACCAGGATGTAGTT
TCTCTGCTCAACAGAGACTTGCTACCTACTTCTACAAGG*TATAATGTATGGTGCAGTTG
GGTTTGGATGTGGCATTGTAGGTCAAGGCATTGCTAATCTCATCATGACTGCTAAACGGA
GCATAA
TAAATC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2A141JQ 599 0 0
TCT
CTTAGGTACTTGGATTTGCAGAGCTCAGCTGGTCTGCTTGGGTTTGCTATAAGGTCATGG
TCTATGCTTCGGAACAGAATGCTGGCTGATCCATCTTTCCTCTTCAAAATAGGGACTGAG
ATAGTCATTGATTCTTGTTGCGCCACTGTTGCTGAAGTTCAAAAGAGAGGGAAAGATTTC
TGGGCTGAGTTTGAGCTCTACGTTGCTGATCTTCTCGTTGGAGTTGTGGTTAACGTTGCT
CTCGTCGGTATGTTGGCTCCTTTTGTCCGTTTTGGCCAACCGTCGTCTGCGTCTAGTGGC
TTCTTAGGACGCATGCTTAATGCTTATAATGCGCTTCCCAGCAGCGTGTTTGAAGCTGAG
AGACCAGGATGTAGTTTCTCTGCTCAACAGAGACTTGCTACCTACTTCTACAAGGGTATA
ATGTATGGTGCAGTTGGGTTTGGATGTGGCATTGTAGGTCAAGGCATTGCTAATCTCATC
ATGACTGCTAAACGGAGCATAAATAAATCAGAAGAAGACATCCCTGTACCACCTCTCATC
AAGAGTGCAGCTCTCTGGGGTGTATTCTTGAGTGTTTCTTCGAATACTCGTTATCA

QA 4 599 4 599
DS 

RD RR2DE88TF 656 0 0
G
ATAAGGTCATGGTCTATGCTTCGAAACAGAATGCTTGCTGATCCATCTTTCCTCTTCAAA
ATAGGGACTGAGATAGTCATTGATTCTTGTTGTGCAACTGTTGCTGAAATTCAAAAGAGA
GGGAAGGATTTCTGGGCTGAGTTTGAGCTCTATGTTGCTGATCTTCTTGTTGGAGTTGTG
GTTAACGTTGCTCTCGTCGGTATGTTGGCTCCTTTTGTCCGTTTTGGCCAACCGTCTTCT
GCATCTAGTGGCTTCTTAGGACGCATGCTTAATGCTTATAATGCGCTTCCCAGCAGCGTG
TTTGAAGCTGAGAGACCAGGATGTAGTTTCTCTGCTCAACAGAGACTTGCTACCTACTTC
TACAAGGGTATAATGTATGGTGCAGTTGGGTTTGGATGTGGCATTGTAGGTCAAGGCATT
GCTAATCTCATCATGACTGCTAAACGGAGCATAAATAAATCAGAAGAAGACATCCCGGTA
CCACCTCTCATCAAGAGTGCAGCTCTCTGGGGTGTATTCTTGAGTGTTTCTTCGAATACT
CGTTATCAGATCATCAATGGTTTAGAGAGAGTGGTTGAAGCATCGCCTTTCGCCAAGAAA
GTGCCTCCTGTGGCTTTGGCGTTTACCGTTGGTGTACGGTTTGCTAATAACATCT

QA 2 656 2 656
DS 



AS 1 3

CO CL3165Contig1 629 3 1 U
GGAAAGAAACAAAAACAAAAACAAAAGAAAGAAGATGCCGTGCCTTAACATCTCCACCAA
CGTTAGCCTCGACGGCGTCGACACCTCTTCCATTCTCTCCGAAGCTACCTCCTCCGTCGC
CAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACTATGTGATGATTGTGTTGAAAGGATCAGTGCCTAT
GGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTGCCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCATCGGTGGCCT
TAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCTGTCTCCGCCCTCCTTGAGACTAAGCT
CTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCCTCAAGTTTTACGACACCAAGGGATCCTTCTTGGG
TTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTTCGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTGATTTGCCAAT
CTATGAACGTGTGTGGTATTAGTATTTATTTAAGCTTCCCTCATTGTCAACCAACTTTGA
ACTATTTCCAGTTGTAAACACTCCTTATCTTAACGTTTGTCTGTCGGAGTTGCATTAAGA
GAGAAGAACTTTTTAATGTTTTATGATGCTGCTACAGCTCAACTTCAAAGATAAATGATC
TGATCTGATCATATATTAAAAAGAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL94TF U 18
AF RR2EV47TF U 1
AF RR2EV47JQ C 53
BS 1 629 RR2EV47TF

RD RR2CL94TF 540 0 0
GGAAAC
AAAGGAAGAAGATGCCGTGCCTTAACATCTCCACCAACGTTAGCCTCGACGGCGTCGATA
CCTCTTCCATTCTCTCCGAAGCTACCTCCTCCGTCGCCAAAATCATCGGCAAGCCTGAGA
ACTATGTGATGATTGTGTTGAAAGGATCAGTGCCTATGGCATTTGGTGGCACCGAGGACC
CTGCCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCATCGGTGGCCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGC
TCAGCGCTGCCGTCTCCGCCCTCCTTGAGACTAAGCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCT
TCCTCAAGTTTTACGACACCAAGGGATCCTTCTTGGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGA
TTTCGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTGATTTGCCAATCTATGAACGTGTGTGGTATTAGT
ATTTATTTAAGCTTCCCTCATTGTCAACCAACTTTGAACTATTTCCAGTTGTAAACACTC
CTTATCTTAACGTTTGTCTGTCGGAGTTGCATTAAGAGAGAAGAACTTTTTAAT

QA 7 540 7 540
DS 

RD RR2EV47TF 629 0 0
GGAAAGAAACAAAAACAAAAACAAAAGAAAGAAGATGCCGTGCCTTAACATCTCCACCAA
CGTTAGCCTCGACGGCGTCGACACCTCTTCCATTCTCTCCGAAGCTACCTCCTCCGTCGC
CAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACTATGTGATGATTGTGTTGAAAGGATCAGTGCCTAT
GGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTGCCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCATCGGTGGCCT
TAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCTGTCTCCGCCCTCCTTGAGACTAAGCT
CTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCCTCAAGTTTTACGACACCAAGGGATCCTTCTTGGG
TTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTTCGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTGATTTGCCAAT
CTATGAACGTGTGTGGTATTAGTATTTATTTAAGCTTCCCTCATTGTCAACCAACTTTGA
ACTATTTCCAGTTGTAAACACTCCTTATCTTAACGTTTGTCTGTCGGAGTTGCATTAAGA
GAGAAGAACTTTTTAATGTTTTATGATGCTGCTACAGCTCAACTTCAAAGATAAATGATC
TGATCTGATCATATATTAAAAAGAAAAAA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2EV47JQ 565 0 0
TCCACCAACGTTAGCCTCGACGGGGTCGACACCTTTTCCATTCTTTCCGAAGCTACCTCC
TCCGTCGCCAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACTATGTGATGATTGTGTTGAAAGGATCA
GTGCCTATGGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTGCCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCATC
GGTGGCCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCTGTTTCCGCCCTCCTTGAG
ACTAAGCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCCTCAAGTTTTACGACACCAAGGGATCC
TTCTTGGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTTCGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTGAT
TTGCCAATCTATGAACGTGTGTGGTATTAGTATTTATTTAAGCTTCCCTCATTGTCAACC
AACTTTGAACTATTTCCAGTTGTAAACACTCCTTATCTTAACGTTTGTCTGTCGGAGTTG
CATTAAGAGAGAAGAACTTTTTAATGTTTTATGATGCTGCTACAGCTCAACTTCAAAGAT
AAATGATCTGATCTGATCATATATT

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 3

CO CL3166Contig1 564 3 9 U
CGCACAAATCAATCAATTCCAAATCCAAATCCAATGGCGGGTCGTGGCAAAACTCTCGGA
TCCGGCGCCGTGAAGAAGGCAACATCGATAAGCAGCAAAGCCGGTCTCCAGTTCCCGGTG
GGTCGTATCGCCCGTTTCCTGAAGAAAGGCAAGTACGCCGAACGTGTCGGCGCCGGAGCT
CCGGTCTACTTATCCGCCGTTCTCGAATACCTCGCCGCCGAGGTATTGGAGTTGGCTGGA
AACGCGGCGAGGGATAACAAGAAGACGAGGATTGTGCCGAGGCACATCCAGCTGGCGGTG
AGGAACGATGAGGAGCTGAGTAAATT*GCTGGGAGATGTGACGATTGCTAACGGAGGAGT
GATGCCCAATATTCACAACCTTCTTCTTCCTAAGAAGGCTGGCGCTTCTTCCAAGCCATC
TGAGGACGACGATTGATTCATTGATTGGATCCGATCCACTTTGTTGTTTTTGTTTTTGTT
TCTGAATCAGAGAATCTCTGTAACGGTTTTTCAATTGATTGTTCATATGCTTTCAGTTTC
GAATGAAAATTAAATCAAAAGTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C865TF U 276
AF RR2A082JQ C 1
AF RR2A082TF U 1
BS 1 275 RR2A082TF
BS 276 326 RR2C865TF
BS 327 327 RR2A082TF
BS 328 333 RR2C865TF
BS 334 334 RR2A082TF
BS 335 348 RR2C865TF
BS 349 349 RR2A082TF
BS 350 453 RR2C865TF
BS 454 564 RR2A082TF

RD RR2C865TF 178 0 0
GCCGAGGCACATCCAGCTGGCGGTGAGGAACGATGAGGAGCTGAGTAAATTTGCTGGGGG
ATGTGACGATTGCAAACGGAGGAGTGATGCCCAATATTCACAACCTTCTTCTTCCTAAGA
AGGCTGGCGCTTCTTCCAAGCCATCTGAGGACGACGATTGATTCATTGATTGGATCCG

QA 1 178 1 178
DS 

RD RR2A082JQ 550 0 0
CGCACAAATCAATCAATTCCAAATCCAAATCCAATGGCGGGTCGTGGCAAAACTCTCGGA
TCCGGCGCCGTGAAGAAGGCAACATCGATAAGCAGCAAAGCCGGTCTCCAGTTCCCGGTG
GGTCGTATCGCCCGTTTCCTGAAGAAAGGCAAGTACGCCGAACGTGTCGGCGCCGGAGCT
CCGGTCTACTTATCCGCCGTTCTCGAATACCTCGCCGCCGAGGTATTGGAGTTGGCTGGA
AACGCGGCGAGGGATAACAAGAAGACGAGGATTGTGCCGAGGCACATCCAGCTGGCGGTG
AGGAACGATGAGGAGCTGAGTAAATT*GCTGGGAGATGTGACGATTGCTAACGGAGGAGT
GATGCCCAATATTCACAACCTTCTTCTTCCTAAGAAGGCTGGCGCTTCTTCCAAGCCATC
TGAGGACGACGATTGATTCATTGATTGGATCCGATCCACTTTGTTGTTTTTGTTTTTGTT
TCTGAATCAGAGAATCTCTGTAACGGTTTTTCAATTGATTGTTCATATGCTTTCAGTTTC
GAATGAAAAT

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2A082TF 564 0 0
CGCACAAATCAATCAATTCCAAATCCAAATCCAATGGCGGGTCGTGGCAAAACTCTCGGA
TCCGGCGCCGTGAAGAAGGCAACATCGATAAGCAGCAAAGCCGGTCTCCAGTTCCCGGTG
GGTCGTATCGCCCGTTTCCTGAAGAAAGGCAAGTACGCCGAACGTGTCGGCGCCGGAGCT
CCGGTCTACTTATCCGCCGTTCTCGAATACCTCGCCGCCGAGGTATTGGAGTTGGCTGGA
AACGCGGCGAGGGATAACAAGAAGACGAGGATTGTGCCGAGGCACATCCAGCTGGCGGTG
AGGAACGATGAGGAGCTGAGTAAATT*GCTGGGAGATGTGACGATTGCTAACGGAGGAGT
GATGCCCAATATTCACAACCTTCTTCTTCCTAAGAAGGCTGGCGCTTCTTCCAAGCCATC
TGAGGACGACGATTGATTCATTGATTGGATCCGATCCACTTTGTTGTTTTTGTTTTTGTT
TCTGAATCAGAGAATCTCTGTAACGGTTTTTCAATTGATTGTTCATATGCTTTCAGTTTC
GAATGAAAATTAAATCAAAAGTAG

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

CO CL3167Contig1 779 2 2 U
GGTCTCACTACAAAACACAGATCAAAACTTCGTTCTTGTCGGAAATAACAAAAAAAAAAA
TCAATGGCAAACGCCTGGAAAAGAGACAAGAATCAGAAGCTATTATCACCAAAGACCTTA
ATCACTCTCCTCATCCTCCTCTCCATCATCTTCCTCTCCTCTCTCTTTGGTTACTGTGTT
TGATGCTGCTGCTTCTGATAGAAATGGTGATATTACCTTCCATAAGTTGGTAGGGAGGCT
TGACAACAGCGCGGTTTCGGAGGTGGGGGCAAGGCTTGCGTTCAAGTCCAACAAGGAGAT
AGCGGTCCAAGTGAAATCAATACCTCTTGATGAACTCATCCCGCCTTCTCAGCCGATCCT
TCTTGTCAAGATCGATGTCCAGGGCTGGGAGAAGCATGTTTTAAACGGCGCGAAGAAGCT
GCTCTCGAGGAAACCGGCGGAGGCTCCTTATCTGATCTACGAGGAAGATGAGAGATTGCT
CAAGGCGAGCAATAGTAGCTCCAAAGAGATACGAGATTTCCTGAGAAGCGTTGGATATAG
CAAGTGTGTGCAGCATGGCACAGATGCGCATTGCACTAAGGAGTGATGTAGACTGGAACT
TAGCGAGAAGGGGCTAATAAAGATGCCATACGAGTTGAGGAACATGAGAAAATGAGCCAT
TGGTATTTTCTGAGAAAGATCATAAGTTGCTGATGTGGTCAGTCATGTTTGTTTCTCCTT
GTAATATGTATTCAATTTTTTGTGATACCGGTTCTAACTAGTAAAGATATGTTATTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A477JQ C 1
AF RR2A477TF U 1
BS 1 773 RR2A477TF
BS 774 779 RR2A477JQ

RD RR2A477JQ 779 0 0
GGTCTCACTACAAAACACAGATCAAAACTTCGTTCTTGTCGGAAATAACAAAAAAAAAAA
TCAATGGCAAACGCCTGGAAAAGAGACAAGAATCAGAAGCTATTATCACCAAAGACCTTA
ATCACTCTCCTCATCCTCCTCTCCATCATCTTCCTCTCCTCTCTCTTTGGTTACTGTGTT
TGATGCTGCTGCTTCTGATAGAAATGGTGATATTACCTTCCATAAGTTGGTAGGGAGGCT
TGACAACAGCGCGGTTTCGGAGGTGGGGGCAAGGCTTGCGTTCAAGTCCAACAAGGAGAT
AGCGGTCCAAGTGAAATCAATACCTCTTGATGAACTCATCCCGCCTTCTCAGCCGATCCT
TCTTGTCAAGATCGATGTCCAGGGCTGGGAGAAGCATGTTTTAAACGGCGCGAAGAAGCT
GCTCTCGAGGAAACCGGCGGAGGCTCCTTATCTGATCTACGAGGAAGATGAGAGATTGCT
CAAGGCGAGCAATAGTAGCTCCAAAGAGATACGAGATTTCCTGAGAAGCGTTGGATATAG
CAAGTGTGTGCAGCATGGCACAGATGCGCATTGCACTAAGGAGTGATGTAGACTGGAACT
TAGCGAGAAGGGGCTAATAAAGATGCCATACGAGTTGAGGAACATGAGAAAATGAGCCAT
TGGTATTTTCTGAGAAAGATCATAAGTTGCTGATGTGGTCAGTCATGTTTGTTTCTCCTT
GTAATATGTATTCAATTTTTTGTGATACCGGTTCTAACTAGTAAAGATATGTTATTGTT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2A477TF 773 0 0
GGTCTCACTACAAAACACAGATCAAAACTTCGTTCTTGTCGGAAATAACAAAAAAAAAAA
TCAATGGCAAACGCCTGGAAAAGAGACAAGAATCAGAAGCTATTATCACCAAAGACCTTA
ATCACTCTCCTCATCCTCCTCTCCATCATCTTCCTCTCCTCTCTCTTTGGTTACTGTGTT
TGATGCTGCTGCTTCTGATAGAAATGGTGATATTACCTTCCATAAGTTGGTAGGGAGGCT
TGACAACAGCGCGGTTTCGGAGGTGGGGGCAAGGCTTGCGTTCAAGTCCAACAAGGAGAT
AGCGGTCCAAGTGAAATCAATACCTCTTGATGAACTCATCCCGCCTTCTCAGCCGATCCT
TCTTGTCAAGATCGATGTCCAGGGCTGGGAGAAGCATGTTTTAAACGGCGCGAAGAAGCT
GCTCTCGAGGAAACCGGCGGAGGCTCCTTATCTGATCTACGAGGAAGATGAGAGATTGCT
CAAGGCGAGCAATAGTAGCTCCAAAGAGATACGAGATTTCCTGAGAAGCGTTGGATATAG
CAAGTGTGTGCAGCATGGCACAGATGCGCATTGCACTAAGGAGTGATGTAGACTGGAACT
TAGCGAGAAGGGGCTAATAAAGATGCCATACGAGTTGAGGAACATGAGAAAATGAGCCAT
TGGTATTTTCTGAGAAAGATCATAAGTTGCTGATGTGGTCAGTCATGTTTGTTTCTCCTT
GTAATATGTATTCAATTTTTTGTGATACCGGTTCTAACTAGTAAAGATATGTT

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 3

CO CL3168Contig1 809 3 8 U
GGTCCCCTTCATTGGTCGGATCGGACGACGTTTTACATCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTTC
GCATTTTATCAGGGTGAAAAAAAAATGAGCGGAGCCGGTAAGAAAATCGCGGATGTGGCA
TTCAAAGCGTCGAGGACAATAGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTTCTTGTGACCGACGAG
GCTCGAAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGTGCTTTCGATGAGGTTAACGCTCAGCTCCAG
ACCAAGTTCAGCCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGATATGTACAGAAAGGGTATTGGG
TCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTTCGTG
GACACTGTTACTCCTGAATACAAGCCAAAGTTCGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAA
GCAGAACAGAAATCGCTCAAGGAGTCTGAACGTCTGGAGAAAGAAATTGTTGATGTCCAG
GAGATTAGCAAAAAGCTCAGCACCATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCACCCAGAA
CTCAAAAAGAAGTTTGATGATGAAATCCGTAACGACTACTTGGGATACTGATCATTGCTT
CTTGTATCTTCGGCCTGTGAAACATACATTCACTTTTCTTTCTCATTTTTCTCTCTTTCT
TTTGCTGTGATTTTGTGATAATAAGTACACTCAGCTGTTGAGATTCATTGGAGACCCAAT
GAGACAATGACGATAAACCCACTTGGCAGTGCATGTCCCGATTTGTATGACGACTCTAAA
GCGGACAAAAAGAATTTTGCCTCTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F136TF U 67
AF RR2EY64TF U 1
AF RR2EY64JQ C 178
BS 1 77 RR2EY64TF
BS 78 78 RR2F136TF
BS 79 726 RR2EY64TF
BS 727 727 RR2EY64JQ
BS 728 779 RR2EY64TF
BS 780 780 RR2EY64JQ
BS 781 790 RR2EY64TF
BS 791 809 RR2EY64JQ

RD RR2F136TF 466 0 0
G
ATCAGGGTGAAAAAAAAATGAGCGGGGCCGGTAAGAAAATCGCGGATGTGGCATTCAAAG
CGTCGAGGACAATAGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTTCTTGTGACCGACGAGGCTCGAA
GAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGTGCTTTCGATGAGGTTAACACTCAGCTCCAGACCAAGT
TCAGCCAGGAGCCTGGACCCATTGATTGGGATATGTACAGAAAGGGTATTGGGTCTGGCA
TTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTTCGTGGACACTG
TTACTCCTGAATACAAGCCAAAGTTCGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAAGCAGAAC
AGAAATCGCTCAAGGAGTCGGAACGTCTGGAGAAAGAAATTGTTGATGTCCAGGAGATTA
GCAAAAAGCTCAGCACCATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGC

QA 2 466 2 466
DS 

RD RR2EY64TF 798 0 0
GGTCCCCTTCATTGGTCGGATCGGACGACGTTTTACATCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTTC
GCATTTTATCAGGGTGATAAAAAAATGAGCGGAGCCGGTAAGAAAATCGCGGATGTGGCA
TTCAAAGCGTCGAGGACAATAGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTTCTTGTGACCGACGAG
GCTCGAAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGTGCTTTCGATGAGGTTAACGCTCAGCTCCAG
ACCAAGTTCAGCCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGATATGTACAGAAAGGGTATTGGG
TCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTTCGTG
GACACTGTTACTCCTGAATACAAGCCAAAGTTCGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAAGAA
GCAGAACAGAAATCGCTCAAGGAGTCTGAACGTCTGGAGAAAGAAATTGTTGATGTCCAG
GAGATTAGCAAAAAGCTCAGCACCATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCACCCAGAA
CTCAAAAAGAAGTTTGATGATGAAATCCGTAACGACTACTTGGGATACTGATCATTGCTT
CTTGTATCTTCGGCCTGTGAAACATACATTCACTTTTCTTTCTCATTTTTCTCTCTTTCT
TTTGCTGTGATTTTGTGATAATAAGTACACTCAGCTGTTGAGATTCATTGGAGACCCAAT
GAGACA*TGACGATAAACCCACTTGGCAGTGCATGTCCCGATTTGTATGACGACTCTAA*
GCGGACAAAA
GAATTTGC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2EY64JQ 632 0 0
GAGGCTCGAAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGTGCTTTCGATGAGGTTAACGCTCAGCTC
CAGACCAAGTTCAGCCAGGAGCCTGAACCCATTGATTGGGATATGTACAGAAAGGGTATT
GGGTCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCGTTGAGATTCCCAAGTTC
GTGGACACTGTTACTCCTGAATACAAGCCAAAGTTCGATGCTTTGTTGGTGGAACTGAAA
GAAGCAGAACAGAAATCGCTCAAGGAGTCTGAACGTCTGGAGAAAGAAATTGTTGATGTC
CAGGAGATTAGCAAAAAGCTCAGCACCATGACTGCAGATGAGTACTTTGAGAAGCACCCA
GAACTCAAAAAGAAGTTTGATGATGAAATCCGTAACGACTACTTGGGATACTGATCATTG
CTTCTTGTATCTTCGGCCTGTGAAACATACATTCACTTTTCTTTCTCATTTTTCTCTCTT
TCTTTTGCTGTGATTTTGTGATAATAAGTACACTCAGCTGTTGAGATTCATTGGAGACCC
AATGAGACAATGACGATAAACCCACTTGGCAGTGCATGTCCCGATTTGTATGACGACTCT
AAAGCGGACAAAAAGAATTTTGCCTCTTAACC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL3169Contig1 813 2 2 U
GCCCATCCCCAAGATCTCGCTCTCTCTCCTCTCCACCAAGCGCCTCTCTCTCGTCTCCCT
CACTCGAGCCTCCTCCGACAACGGTACGTCAACACCCGCTTCCGCCACAGTCTCTGCAAC
CACCGTGGAGGCTCCAAAGCCTGCTTCGGTCGCTGTAGAGGAAGTTCCGGTAAAATCTCC
GTCTGAAAACGGCGCCGTTGGAGTTGGAGGCGAAGAGACTGACTTGACGACCACGACGAC
GACTGAGATCAAGTTCCAGGATGCGAAGTGGGTTAATGGAACGTGGGATCTGAAACAGTT
CGAGAAAGAAGGCAAAACAGATTGGGACTCTGTTATCGTTGCTGTGGCAAAGAGGAGAAA
GTGGCTTGAAGATAACCCGGAGACAACTACTAATGACGAGCCTGTCCTTTTCGATACCTC
CATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGAGATACCATCTACCCGAAGCTGAACTCCTCAA
TGGTCGTGCGGCGATGGTAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGATAGCCTTACAGGAGT
AGGACTTGTTGATCAAATGGGGAATTTCTTCTGCAAAACACTCTTGTTTGTGGCTGTCGC
CGGAGTTCTTTTCATCCGCAAGAACGAAGATTTAGACAAACTTAAGGGTTTGATTGAAGA
GACAACGTTATATGACAAGCAATGGCAAGCGGCATGGAAAGAGCCGGAATCATCATCATC
AACGGTTTCTTCAAAGAAGTGAAAAAAAAAAAAATGGCTTATGTTTCCTCTTTCGTTATG
TGATGTTTGTGATGATAAGTGAAAGTCCCAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF92TF U 1
AF RR2CF92JQ C 78
BS 1 640 RR2CF92TF
BS 641 813 RR2CF92JQ

RD RR2CF92TF 640 0 0
GCCCATCCCCAAGATCTCGCTCTCTCTCCTCTCCACCAAGCGCCTCTCTCTCGTCTCCCT
CACTCGAGCCTCCTCCGACAACGGTACGTCAACACCCGCTTCCGCCACAGTCTCTGCAAC
CACCGTGGAGGCTCCAAAGCCTGCTTCGGTCGCTGTAGAGGAAGTTCCGGTAAAATCTCC
GTCTGAAAACGGCGCCGTTGGAGTTGGAGGCGAAGAGACTGACTTGACGACCACGACGAC
GACTGAGATCAAGTTCCAGGATGCGAAGTGGGTTAATGGAACGTGGGATCTGAAACAGTT
CGAGAAAGAAGGCAAAACAGATTGGGACTCTGTTATCGTTGCTGTGGCAAAGAGGAGAAA
GTGGCTTGAAGATAACCCGGAGACAACTACTAATGACGAGCCTGTCCTTTTCGATACCTC
CATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGAGATACCATCTACCCGAAGCTGAACTCCTCAA
TGGTCGTGCGGCGATGGTAGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGATAGCCTTACAGGAGT
AGGACTTGTTGATCAAATGGGGAATTTCTTCTGCAAAACACTCTTGTTTGTGGCTGTCGC
CGGAGTTCTTTTCATCCGCAAGAACGAAGATTTAGACAAA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2CF92JQ 736 0 0
ACAACGGTACGTCAACACCCGCTTCCGCCACAGTCTCTGCAACCACCGTGGAGGCTCCAA
AGCCTGCTTCGGTCGCTGTAGAGGAAGTTCCGGTAAAATCTCCGTCTGAAAACGGCGCCG
TTGGAGTTGGAGGCGAAGAGACTGACTTGACGACCACGACGACGACTGAGATCAAGTTCC
AGGATGCGAAGTGGGTTAATGGAACGTGGGATTTGAAACAGTTCGAGAAAGAAGGCAAAA
CAGATTGGGACTCTGTTATCGTTGCTGTGGCAAAGAGGAGAAAGTGGCTTGAAGATAACC
CGGAGACAACTACTAATGACGAGCCTGTCCTTTTCGATACCTCCATCATTCCATGGTGGG
CATGGATGAAGAGATACCATCTACCCGAAGCTGAACTCCTCAATGGTCGTGCGGCGATGG
TAGGGTTTTTCATGGCTTACTTTGTTGATAGCCTTACAGGAGTAGGACTTGTTGATCAAA
TGGGGAATTTTTTTTGCAAAACACTCTTGTTTGTGGCTGTCGCCGGAGTTCTTTTCATCC
GCAAGAACGAAGATTTAGACAAACTTAAGGGTTTGATTGAAGAGACAACGTTATATGACA
AGCAATGGCAAGCGGCATGGAAAGAGCCGGAATCATCATCATCAACGGTTTCTTCAAAGA
AGTGAAAAAAAAAAAAATGGCTTATGTTTCCTCTTTCGTTATGTGATGTTTGTGATGATA
AGTGAAAGTCCCAAGA

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 3

CO CL3170Contig1 985 3 8 U
GGGTCCCGAGAAGTCTATGTTCCTAATTTTGTACTTTGGCAAAACCAAACCTACTTCATA
AAAATCTACGAATGCCCCATATGATCAGTTCCAAATCTCTTTCTCTCTAAGTGCAAAAAA
AAGATATGTCTTCAATAGTTTCTGGTACAGTTCCAACCACCAAATCTTCTGCTTGTTTCA
GAAGAATCCAAAAGTCTGCAACTTTTTCATCTCGGTCAATGTTGTTATCTTCTTCCTCAT
CACCACCTGCATCTGCAAAACTCCTAAACTCTGCCAATGGTTCATCAAGTTCTTCATCTC
CTAAACCCTTCAGACCCGTTATGCGCAGCAGAGAAGCTGATAAACTCGAAGAAGAAAGAC
TTCTCCACGTACAATGGCAAGACGTCACGGTAAAGATGGCAGTGGATGCACCAGCTTCCG
TGGCTTACAAGTTATATGCGGACCGTGAATTGTTCCCTAGGTGGATGCCCTTTTTGTCAT
CTGTTGAGGCAGTGGAGGGCAGTCCAGATTTATCGAGGTATTTGGTGAAATTGGAATCTT
TTGGAAATAAATTTGAATATTATTTTCTCGCAAAAAATTTAGAGCCAATCCCGGATCGAA
AGCTGCATTGGAGATCTATCGAAGGCTTTGCGAATAGAGGCAGTGTTCGATTTTTCCCTA
GAGGCCCTTCCTCGTGCTTGGTAGAGATCAACTTTTCATTTGAGGTTCCACATGCTTTTG
CCCCAGTTGCATTCTTAATGAAACCGTTTATGGAGAGGCTTATTCGTGGAGGATTGGAAC
GTTTTGCTGCCTTCGCGAAGACCACTTAAGGCAGAACACAAAGATTACGTTCTGTGCATT
AATCCAAATAAATTGTTCTTTTTATGTAGTGTGTTCTGTTTTTTCTTTTTTGTTGGGAGG
TAACATGTCCAAACATGATGTAATGTTGTTCTTGTTAAATTACTTTTATATATTAACAAT
TATTTGTTAAATAGAATTCTAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE09TF U 18
AF RR2FD96TF U 1
AF RR2GE09JQ C 345
BS 1 666 RR2FD96TF
BS 667 667 RR2GE09JQ
BS 668 704 RR2FD96TF
BS 705 705 RR2GE09JQ
BS 706 723 RR2FD96TF
BS 724 724 RR2GE09JQ
BS 725 760 RR2FD96TF
BS 761 985 RR2GE09JQ

RD RR2GE09TF 560 0 0
G
GTTCCTAATTTTGTACTTTGGCAAAACCAAACCTACTTCATAAAAATCTACGAATGCCCC
ATATGATCAGTTCCAAATCTCTTTCTCTCTAAGTGCAAAAAAA*GATATGTCTTCAATAG
TTTCTGGTACAGTTCCAACCACCAAATCTTCTGCTTGTTTCAGAAGAATCCAAAAGTCTG
CAACTTTTTCATCTCGGTCAATGTTGTTATCTTCTTCCTCATCACCACCTGCATCTGCAA
AACTCCTAAACTCTGCCAATGGTTCATCAAGTTCTTCATCTCCTAAACCCTTCAGACCCG
TTATGCGCAGCAGAGAAGCTGATAAACTCGAAGAAGAAAGACTTCTCCACGTACAATGGC
AAGACGTCACGGTAAAGATGGCAGTGGATGCACCAGCTTCCGTGGCTTACAAGTTATATG
CGGACCGTGAATTGTTCCCTAGGTGGATGCCCTTTTTGTCATCTGTTGAGGCAGTGGAGG
GCAGTCCAGATTTATCGAGGTATTTGGTGAAATTGGAATCTTTTGGAAATAAATTTGAAT
ATTATTTTCTCGCAAAAAA

QA 2 560 2 560
DS 

RD RR2FD96TF 760 0 0
GGGTCCCGAGAAGTCTATGTTCCTAATTTTGTACTTTGGCAAAACCAAACCTACTTCATA
AAAATCTACGAATGCCCCATATGATCAGTTCCAAATCTCTTTCTCTCTAAGTGCAAAAAA
AAGATATGTCTTCAATAGTTTCTGGTACAGTTCCAACCACCAAATCTTCTGCTTGTTTCA
GAAGAATCCAAAAGTCTGCAACTTTTTCATCTCGGTCAATGTTGTTATCTTCTTCCTCAT
CACCACCTGCATCTGCAAAACTCCTAAACTCTGCCAATGGTTCATCAAGTTCTTCATCTC
CTAAACCCTTCAGACCCGTTATGCGCAGCAGAGAAGCTGATAAACTCGAAGAAGAAAGAC
TTCTCCACGTACAATGGCAAGACGTCACGGTAAAGATGGCAGTGGATGCACCAGCTTCCG
TGGCTTACAAGTTATATGCGGACCGTGAATTGTTCCCTAGGTGGATGCCCTTTTTGTCAT
CTGTTGAGGCAGTGGAGGGCAGTCCAGATTTATCGAGGTATTTGGTGAAATTGGAATCTT
TTGGAAATAAATTTGAATATTATTTTCTCGCAAAAAATTTAGAGCCAATCCCGGATCGAA
AGCTGCATTGGAGATCTATCGAAGGCTTTGCGAATAGAGGCAGTGTTCGATTTTTCCCTA
GAGGCC*TTCCTCGTGCTTGGTAGAGATCAACTTTTCATTTGAG*TTCCACATGCTTTTG
CCC*AGTTGCATTCTTAATGAAACCGTTTATGGAGAGGCT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2GE09JQ 641 0 0
CTCGAAGAAGAAAGACTTCTCCACGTACAATGGCAAGACGTCACGGTAAAGATGGCAGTG
GATGCACCAGCTTCCGTGGCTTACAAGTTATATGCGGACCGTGAATTGTTCCCTAGGTGG
ATGCCCTTTTTGTCATCTGTTGAGGCAGTGGAGGGCAGTCCAGATTTATCGAGGTATTTG
GTGAAATTGGAATCTTTTGGAAATAAATTTGAATATTATTTTCTCGCAAAAAATTTAGAG
CCAATCCCGGATCGAAAGCTGCATTGGAGATCTATCGAAGGCTTTGCGAATAGAGGCAGT
GTTCGATTTTTCCCTAGAGGCCCTTCCTCGTGCTTGGTAGAGATCAACTTTTCATTTGAG
GTTCCACATGCTTTTGCCCCAGTTGCATTCTTAATGAAACCGTTTATGGAGAGGCTTATT
CGTGGAGGATTGGAACGTTTTGCTGCCTTCGCGAAGACCACTTAAGGCAGAACACAAAGA
TTACGTTCTGTGCATTAATCCAAATAAATTGTTCTTTTTATGTAGTGTGTTCTGTTTTTT
CTTTTTTGTTGGGAGGTAACATGTCCAAACATGATGTAATGTTGTTCTTGTTAAATTACT
TTTATATATTAACAATTATTTGTTAAATAGAATTCTAATGT

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL3171Contig1 1360 2 2 U
GGGCATCATCAAGGGCCATATAATAATTAAAAAGTCGTTCCTTTTATCATTCCTTCTTCT
CTCACACTTGTCTTTCCAAATTAAAAAAAAATCCAAGGTGTGATCCTCTTCAAGGGGGAG
CAGGTTCAATACATTCTTACCGATCTAAAGCACTGGGGCACTCTTGTCGGTGAATAGAGA
CAGACAAAAGGAAAAGGATAATGGGGGTTCCGTTAGTATGCCACGGGCATTCTCGTCCCG
TCGTCGACGTTTCTTACAGTCCTGTGACTCCAGATGGATTCTTCCTCATCAGCGCCAGCA
AAGATTCGAACCCAATGTTGAGGAATGGGAAGACTGGTGATTTGATAGGGACTTTTGAAG
GACATAAAGGAGCTGTTTGGAGTTGCAGCCTTGATAAACATGCTATGCGTGCTGCCTCTG
CTTCTGCTGATTTCACTGCGAAAATATGGAATGCATTGACTGGAGATGAATTGCACTCCT
TTGAACACAAGCACATCGTTCGCGCATGTGCCTTCTCTGAGGACACTCACCTTTTGCTTA
CCGGTGGAATGGAGAAGATTCTTCGGATATTCGATATGAATAGGCCAGACGCACCTCCGA
AAGAAGTTGGAAACTCTCCTGGTTCAATCAGAACCGTAGAATGGCTTCACAGTGATAATA
CTATCCTGAGCTCTTGCACAGATACCGGTGACATTAGGTTATGGGACATAAGAAGTGACA
AGATTGTTCAAACGTTAGAAACCAAGTTCCCAGTCACTAGTGCTGAAGTAAGCCAGGATG
GGCGATATATAACTACTGCTGATGGATCTAGTGTTAAGTTTTGGGACGCAACTAATTTTG
GATTGGTTAAGAGCTATGAGATGCCTTGCAACGTTGAATCAGCATCCTTGGAACCGAAAC
ACGGGAACACTTTCATTGCTGGAGGAGAAGACATGTGGGTCCATAGGTTTGATTTCCAGA
CTGGAGAAGAGATTGGGTGTAACAAGGGTCACCACGGACCAGTGCACTGCGTGAGGTATT
CTCCAGGAGGGGGGTCATACACGTCAGGATCAGAAGACGGGACGGTCAGAATATGGGAGG
TCGTTGGTTCGGTGAACCAGGAGGAGAAGGAGAGCGATCAGAGCGGTAACGTGAAGCTTG
TGGCAGAGGAGGTTGTGCGTAAAGCTGAAAGTCTGCGTATCAGTGAGAAAGCTGCCGAAG
CCAAATGAAACATTTGTTACGTATTATTAGCCTTTATGATTATAACTAATAGTTGCAGAA
GAGAATGATCCCTTCAGTTTATCTTTTTTTTTGGCTTACAAGTTTGACCTGTTTTATCTT
TTTTTTTTTCCAATAAATAAATAGGAACACTTCCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI48TF U 1
AF RR2A482JQ C 636
BS 1 693 RR2EI48TF
BS 694 1360 RR2A482JQ

RD RR2EI48TF 693 0 0
GGGCATCATCAAGGGCCATATAATAATTAAAAAGTCGTTCCTTTTATCATTCCTTCTTCT
CTCACACTTGTCTTTCCAAATTAAAAAAAAATCCAAGGTGTGATCCTCTTCAAGGGGGAG
CAGGTTCAATACATTCTTACCGATCTAAAGCACTGGGGCACTCTTGTCGGTGAATAGAGA
CAGACAAAAGGAAAAGGATAATGGGGGTTCCGTTAGTATGCCACGGGCATTCTCGTCCCG
TCGTCGACGTTTCTTACAGTCCTGTGACTCCAGATGGATTCTTCCTCATCAGCGCCAGCA
AAGATTCGAACCCAATGTTGAGGAATGGGAAGACTGGTGATTTGATAGGGACTTTTGAAG
GACATAAAGGAGCTGTTTGGAGTTGCAGCCTTGATAAACATGCTATGCGTGCTGCCTCTG
CTTCTGCTGATTTCACTGCGAAAATATGGAATGCATTGACTGGAGATGAATTGCACTCCT
TTGAACACAAGCACATCGTTCGCGCATGTGCCTTCTCTGAGGACACTCACCTTTTGCTTA
CCGGTGGAATGGAGAAGATTCTTCGGATATTCGATATGAATAGGCCAGACGCACCTCCGA
AAGAAGTTGGAAACTCTCCTGGTTCAATCAGAACCGTAGAATGGCTTCACAGTGATAATA
CTATCCTGAGCTCTTGCACAGATACCGGTGACA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2A482JQ 725 0 0
GTAGAATGGCTTCACAGTGATAATACTATCCTGAGCTCTTGCACAGATACCGGTGACATT
AGGTTATGGGACATAAGAAGTGACAAGATTGTTCAAACGTTAGAAACCAAGTTCCCAGTC
ACTAGTGCTGAAGTAAGCCAGGATGGGCGATATATAACTACTGCTGATGGATCTAGTGTT
AAGTTTTGGGACGCAACTAATTTTGGATTGGTTAAGAGCTATGAGATGCCTTGCAACGTT
GAATCAGCATCCTTGGAACCGAAACACGGGAACACTTTCATTGCTGGAGGAGAAGACATG
TGGGTCCATAGGTTTGATTTCCAGACTGGAGAAGAGATTGGGTGTAACAAGGGTCACCAC
GGACCAGTGCACTGCGTGAGGTATTCTCCAGGAGGGGGGTCATACACGTCAGGATCAGAA
GACGGGACGGTCAGAATATGGGAGGTCGTTGGTTCGGTGAACCAGGAGGAGAAGGAGAGC
GATCAGAGCGGTAACGTGAAGCTTGTGGCAGAGGAGGTTGTGCGTAAAGCTGAAAGTCTG
CGTATCAGTGAGAAAGCTGCCGAAGCCAAATGAAACATTTGTTACGTATTATTAGCCTTT
ATGATTATAACTAATAGTTGCAGAAGAGAATGATCCCTTCAGTTTATCTTTTTTTTTGGC
TTACAAGTTTGACCTGTTTTATCTTTTTTTTTTTCCAATAAATAAATAGGAACACTTCCT
CTCCC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 3

CO CL3172Contig1 599 3 2 U
GGGCCAAGCCGAAAACAAATCAAAATGGCTACCACCACTGCTGCTGCAGCCTCTGGTATC
TTTGGAATCCGGATCCAAGATCCAAGTTCCGGAGCCGGTAGAGTCCAAGCCAAGTTCAAT
TTCAGCTTCGGGAAAAAGAACTGGTGGAAGGTTCGTCGTATTTGGGACAGCCATTACCAT
TTTCCTTGACGACATTGATATGGATCGAGGTGTTAGTGGTCGGTTACATCGAGTTCCAGC
GTAACGCTGAGCTGGATCCGGAGAAACGTATTTACCCTGGTGGGTATTTTGACCCGTTAG
GACTCGCGGCTGACCCAGCGAAGTTGGATACCTTGAAGCTGGCTGAGATCAAGCACTCTC
GTCTCGCCATGATCGCATTCCTCATCTTTTCACTTCAGGCGGCCTTTACCGGCAAAGGCC
CCATCAGCTTCCTTGCTACTTTTAGCAGCTAAAATGAGCCTTTCTATCTTTGTGTTTCTA
TGTATGTTTTCTAAAACCATCTAAAACTAAAAATGTATGTTTATCTTAAAGAGGCTGTGA
TGTACTCTATCGACCGTGTTAATTCCGAACGAGTTTGTTTATTATTTTGGTGGTGTTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI09JQ C 1
AF RR2BI09TF U 1
AF RR2FE43TF U 175
BS 1 547 RR2BI09TF
BS 548 599 RR2FE43TF

RD RR2BI09JQ 548 0 0
GGGCCAAGCCGAAAACAAATCAAAATGGCTACCACCACTGCTGCTGCAGCCTCTGGTATC
TTTGGAATCCGGATCCAAGATCCAAGTTCCGGAGCCGGTAGAGTCCAAGCCAAGTTCAAT
TTCAGCTTCGGGAAAAAGAACTGGTGGAAGGTTCGTCGTATTTGGGACAGCCATTACCAT
TTTCCTTGACGACATTGATATGGATCGAGGTGTTAGTGGTCGGTTACATCGAGTTCCAGC
GTAACGCTGAGCTGGATCCGGAGAAACGTATTTACCCTGGTGGGTATTTTGACCCGTTAG
GACTCGCGGCTGACCCAGCGAAGTTGGATACCTTGAAGCTGGCTGAGATCAAGCACTCTC
GTCTCGCCATGATCGCATTCCTCATCTTTTCACTTCAGGCGGCCTTTACCGGCAAAGGCC
CCATCAGCTTCCTTGCTACTTTTAGCAGCTAAAATGAGCCTTTCTATCTTTGTGTTTCTA
TGTATGTTTTCTAAAACCATCTAAAACTAAAAATGTATGTTTATCTTAAAGAGGCTGTGA
TGTACTC
C

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2BI09TF 548 0 0
GGGCCAAGCCGAAAACAAATCAAAATGGCTACCACCACTGCTGCTGCAGCCTCTGGTATC
TTTGGAATCCGGATCCAAGATCCAAGTTCCGGAGCCGGTAGAGTCCAAGCCAAGTTCAAT
TTCAGCTTCGGGAAAAAGAACTGGTGGAAGGTTCGTCGTATTTGGGACAGCCATTACCAT
TTTCCTTGACGACATTGATATGGATCGAGGTGTTAGTGGTCGGTTACATCGAGTTCCAGC
GTAACGCTGAGCTGGATCCGGAGAAACGTATTTACCCTGGTGGGTATTTTGACCCGTTAG
GACTCGCGGCTGACCCAGCGAAGTTGGATACCTTGAAGCTGGCTGAGATCAAGCACTCTC
GTCTCGCCATGATCGCATTCCTCATCTTTTCACTTCAGGCGGCCTTTACCGGCAAAGGCC
CCATCAGCTTCCTTGCTACTTTTAGCAGCTAAAATGAGCCTTTCTATCTTTGTGTTTCTA
TGTATGTTTTCTAAAACCATCTAAAACTAAAAATGTATGTTTATCTTAAAGAGGCTGTGA
TGTACTC
C

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2FE43TF 425 0 0
G
ACCATTTTCCTTGACGACATTGATATGGATCGAGGTGTTAGTGGTCGGTTACATCGAGTT
CCAGCGTAACGCTGAGCTGGATCCGGAGAAACGTATTTACCCTGGTGGGTATTTTGACCC
GTTAGGACTCGCGGCTGACCCAGCGAAGTTGGATACCTTGAAGCTGGCTGAGATCAAGCA
CTCTCGTCTCGCCATGATCGCATTCCTCATCTTTTCACTTCAGGCGGCCTTTACCGGCAA
AGGCCCCATCAGCTTCCTTGCTACTTTTAGCAGCTAAAATGAGCCTTTCTATCTTTGTGT
TTCTATGTATGTTTTCTAAAACCATCTAGAACTAAAAATGTATGTTTATCTTAAAGAGGC
TGTGATGTACTCTATCGACCGTGTTAATTCCGAACGAGTTTGTTTATTATTTTGGTGGTG
TTGG

QA 2 425 2 425
DS 



AS 1 2

CO CL3173Contig1 607 2 2 U
GGACCATTCAAAACAAAACCATTGATTGGATTTAGACTAGTTGATAGAGCGAAAAATCTG
AGAAAGAAAGAAAAAAAAAACACTCAAAAGTTCCTATCTATTATAAACAGTTAAAATGAA
GTCGACCGTCGTGATCCTCTTCACGTACCTTCTCCTCGCTGCGCCTTGCTTCGCTTTAGG
ATCGGAGAACACGAATTCGGATGTATACGAGATAGATTACAGGGGACCGGAGACTCATAA
CTCTAGACCTCCGCCGGAGACTCTGCACGGCAAGCGACCGTTCATCCACCATAAAACCTC
TGCGGCTGGATCCGCCGGCGCTCATGTTGGAGGACAGCACTAGAAAGAGATTTTTCAAGG
AAGAGGAGAGAGACTAAGAAACTGAGAGTGAAAGAGGAAGTATATGAGTTTGTATAAGAT
GCAAGTACATAATTATTTATACAGTAATACATATTTAATCATATGATCATCGATGTCATC
ATGCCGGTATTTTCTTCATGTACCGTTCTATCTTTTTTTTTTTTTTTGGGTCTGAATCTC
TTGGAAGAAAACTCAAATTAATTCGGGTAATGTGTCGCCATATCAATATCAGTGTCGTTC
TCAGATC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FN04JQ C 1
AF RR2FN04TF U 1
BS 1 5 RR2FN04JQ
BS 6 607 RR2FN04TF

RD RR2FN04JQ 607 0 0
GGACCATTCAAAACAAAACCATTGATTGGATTTAGACTAGTTGATAGAGCGAAAAATCTG
AGAAAGAAAGAAAAAAAAAACACTCAAAAGTTCCTATCTATTATAAACAGTTAAAATGAA
GTCGACCGTCGTGATCCTCTTCACGTACCTTCTCCTCGCTGCGCCTTGCTTCGCTTTAGG
ATCGGAGAACACGAATTCGGATGTATACGAGATAGATTACAGGGGACCGGAGACTCATAA
CTCTAGACCTCCGCCGGAGACTCTGCACGGCAAGCGACCGTTCATCCACCATAAAACCTC
TGCGGCTGGATCCGCCGGCGCTCATGTTGGAGGACAGCACTAGAAAGAGATTTTTCAAGG
AAGAGGAGAGAGACTAAGAAACTGAGAGTGAAAGAGGAAGTATATGAGTTTGTATAAGAT
GCAAGTACATAATTATTTATACAGTAATACATATTTAATCATATGATCATCGATGTCATC
ATGCCGGTATTTTCTTCATGTACCGTTCTATCTTTTTTTTTTTTTTTGGGTCTGAATCTC
TTGGAAGAAAACTCAAATTAATTCGGGTAATGTGTCGCCATATCAATATCAGTGTCGTTC
TCAGATC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2FN04TF 607 0 0
GGACC
ATTCAAAACAAAACCATTGATTGGATTTAGACTAGTTGATAGAGCGAAAAATCTGAGAAA
GAAAGAAAAAAAAAACACTCAAAAGTTCCTATCTATTATAAACAGTTAAAATGAAGTCGA
CCGTCGTGATCCTCTTCACGTACCTTCTCCTCGCTGCGCCTTGCTTCGCTTTAGGATCGG
AGAACACGAATTCGGATGTATACGAGATAGATTACAGGGGACCGGAGACTCATAACTCTA
GACCTCCGCCGGAGACTCTGCACGGCAAGCGACCGTTCATCCACCATAAAACCTCTGCGG
CTGGATCCGCCGGCGCTCATGTTGGAGGACAGCACTAGAAAGAGATTTTTCAAGGAAGAG
GAGAGAGACTAAGAAACTGAGAGTGAAAGAGGAAGTATATGAGTTTGTATAAGATGCAAG
TACATAATTATTTATACAGTAATACATATTTAATCATATGATCATCGATGTCATCATGCC
GGTATTTTCTTCATGTACCGTTCTATCTTTTTTTTTTTTTTTGGGTCTGAATCTCTTGGA
AGAAAACTCAAATTAATTCGGGTAATGTGTCGCCATATCAATATCAGTGTCGTTCTCAGA
TC

QA 6 607 6 607
DS 



AS 1 3

CO CL3174Contig1 555 3 12 U
GGCCTGTCTCTCGACGTTCTTCGAACCAAAGGTAAGAGTTTGAAGAAGTGCATCACAGAC
CAAATAGAGAAGATGTCTGAGAAGAAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGTGACCAGAGAGTAC
ACCATCAACCTTCACAGGCGCCTTCACAGCTGTACCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCT
ATCAAGGAGATACGGAAGTTTGCAGAGAAAGCCATGGGGACAAAGGACGTTAGGGTAGAC
GTGAAGTTGAACAAGCAGATATGGAGCAAAGGAATCAGAGGTCCTCCAAGGAGGATTAGG
GTGCGTGTTGCACGTAAGAGAAACGACGATGAGGACGCTAAGGAAGAGTTTTTCTCACTT
GTCACCGTTGCTGAAATCCCTGCCGAAGGACTCAGTGGACTTGGCACTAAGGTCATTGAC
GAGGAGGATTGAATATCCATGTAGTCACTGAGACTAGTTTTGTGGTTTTTTTTTTGTATT
TCTTGTTGCTTTCATTTCAAAAGTGTCTTTCTTGTTAGTGTGACCATGCAGTTTATTGGA
AAGACTCATTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AJ54TF U 1
AF RR2DT69JQ C 4
AF RR2DT69TF U 4
BS 1 24 RR2AJ54TF
BS 25 25 RR2DT69TF
BS 26 137 RR2AJ54TF
BS 138 138 RR2DT69TF
BS 139 321 RR2AJ54TF
BS 322 322 RR2DT69TF
BS 323 362 RR2AJ54TF
BS 363 363 RR2DT69TF
BS 364 474 RR2AJ54TF
BS 475 475 RR2DT69TF
BS 476 514 RR2AJ54TF
BS 515 555 RR2DT69TF

RD RR2AJ54TF 514 0 0
GGCCTGTCTCTCGACGTTCTTCGAGCCAAAGGTAAGAGTTTGAAGAAGTGCATCACAGAC
CAAATAGAGAAGATGTCTGAGAAGAAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGTGACCAGAGAGTAC
ACCATCAACCTTCACAGACGCCTTCACAGCTGTACCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCT
ATCAAGGAGATACGGAAGTTTGCAGAGAAAGCCATGGGGACAAAGGACGTTAGGGTAGAC
GTGAAGTTGAACAAGCAGATATGGAGCAAAGGAATCAGAGGTCCTCCAAGGAGGATTAGG
GTGCGTGTTGCACGTAAGAGAGACGACGATGAGGACGCTAAGGAAGAGTTTTTCTCACTT
GTTACCGTTGCTGAAATCCCTGCCGAAGGACTCAGTGGACTTGGCACTAAGGTCATTGAC
GAGGAGGATTGAATATCCATGTAGTCACTGAGACTAGTTTTGTGGTTTTTTTTT*GTATT
TCTTGTTGCTTTCATTTCAAAAGTGTCTTTCTTG

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2DT69JQ 552 0 0
GG
GTCTCTCGACGTTCTTCGAACCAAAGGTAAGAGTTTGAAGAAGTGCATCACAGACCAAAT
AGAGAAGATGTCTGAGAAGAAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGTGACCAGAGAGTACACCAT
CAACCTTCACAGGCGCCTTCACAGCTGTACCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCTATCAA
GGAGATACGGAAGTTTGCAGAGAAAGCCATGGGGACAAAGGACGTTAGGGTAGACGTGAA
GTTGAACAAGCAGATATGGAGCAAAGGAATCAGAGGTCCTCCAAGGAGGATTAGGGTGCG
TGTTGCACGTAAGAGAAACGACGATGAGGACGCTAAGGAAGAGTTTTTCTCACTTGTCAC
CGTTGCTGAAATCCCTGCCGAAGGACTCAGTGGACTTGGCACTAAGGTCATTGACGAGGA
GGATTGAATATCCATGTAGTCACTGAGACTAGTTTTGTGGTTTTTTTTTTGTATTTCTTG
TTGCTTTCATTTCAAAAGTGTCTTTCTTGTTAGTGTGACCATGCAGTTTATTGGAAAGAC
TCATTTTCTT

QA 3 552 3 552
DS 

RD RR2DT69TF 552 0 0
GG
GTCTCTCGACGTTCTTCGAACCAAAGGTAAGAGTTTGAAGAAGTGCATCACAGACCAAAT
AGAGAAGATGTCTGAGAAGAAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGTGACCAGAGAGTACACCAT
CAACCTTCACAGGCGCCTTCACAGCTGTACCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCTATCAA
GGAGATACGGAAGTTTGCAGAGAAAGCCATGGGGACAAAGGACGTTAGGGTAGACGTGAA
GTTGAACAAGCAGATATGGAGCAAAGGAATCAGAGGTCCTCCAAGGAGGATTAGGGTGCG
TGTTGCACGTAAGAGAAACGACGATGAGGACGCTAAGGAAGAGTTTTTCTCACTTGTCAC
CGTTGCTGAAATCCCTGCCGAAGGACTCAGTGGACTTGGCACTAAGGTCATTGACGAGGA
GGATTGAATATCCATGTAGTCACTGAGACTAGTTTTGTGGTTTTTTTTTTGTATTTCTTG
TTGCTTTCATTTCAAAAGTGTCTTTCTTGTTAGTGTGACCATGCAGTTTATTGGAAAGAC
TCATTTTCTT

QA 3 552 3 552
DS 



AS 1 3

CO CL3175Contig1 1056 3 6 U
GGAGATCAAAAACCATCTCTGTCTCTCGTTTCCTCAAAGTCGTCGAAAATGCTGGCTAGG
CTCGCTGCGAAGCGTCTCCTCGAGATCCGTCAAGTTCTCCGTCAACCACCATCTTCTACT
CAGGCGTCTCGAAGCTTCTCGACAGCCTTGAACTACCACCTGGATTCTCCTGATAACAAA
CCGGATCTTCCATGGGAGTTTTCTGAGGCTAACAAATCTAAGGTTAAGGAGATACTCTCT
TACTATCCCTCAAACTACAAGCAGTCTGCGGTGATTCCTCTTCTTGATCTTGCCCAACAA
CAGCATGGAGGCTGGCTTCCTGTTTCAGCAATGAATGCGGTTGCTAAAGTTATAGAAGTG
GCTCCTATCCGTGTTTATGAGGTTGCAACGTTTTACTCCATGTTCAACAGAGCAAAGGTC
GGAAAGTACCACCTGTTAGTTTGTGGCACAACACCTTGCATGATCCGTGGTTCACGAGAT
ATCGAATCAGCTT*GCTAGACCACTTGGGTGTGAAGCGCGGCGAAGTCACAAAGGATGGT
TTATTCTCTGTTGGAGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTTAATGCGCCCATGATCACT
GTGGCAGATTACTCCAATGGATCAGAAGGATATACATATAACTATTTCGAAGATGTTACA
CCTGAGAAAGTTGTAGAGATTGTTGAAAAGCTGAGAAAAGGAGAAAAGCCACCGCATGGA
ACTCAAAATCCAAAGAGGATCAAGTGCGGACCTGAAAGAGGAAACACAACACTGCTTGGC
GAGCCAAAGCCACCACAGTTCCGTGATCTCGACGCTTGCTAAGCTGAGTTTTTATACGCC
GACGTTTTTTTATCTTTTGAAGATCAATAACGCAAAAGGCTATAGTGATGTTTGAAGCCT
ATAGCATCAAACTGAGATTGCATACTCTTTGTAGTTTGTCTTCTTGGCTTTAGAATTTCG
ACCCCATTTTAAAACAAATGACCAAAGAGCATTTTTCTTTTGTTATTATCTCCCTTCCAA
GATTCCAAGGTTTATGGTGAAAGTGAATTTTGTTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG96TF U 1
AF RR2B532TF U 1
AF RR2FG96JQ C 422
BS 1 493 RR2B532TF
BS 494 494 RR2FG96TF
BS 495 675 RR2B532TF
BS 676 676 RR2FG96TF
BS 677 783 RR2B532TF
BS 784 1056 RR2FG96JQ

RD RR2FG96TF 751 0 0
GGAGATCAAAAACCATCTCTGTCTCTCGTTTCCTCAAAGTCGTCGAAAATGCTGGCTAGG
CTCGCTGCGAAGCGTCTCCTCGAGATCCGTCAAGTTCTCCGTCAACCACCATCTTCTACT
CAGGCGTCTCGAAGCTTCTCGACAGCCTTGAACTACCACCTGGATTCTCCTGATATCAAA
CCGGATCTTCCATGGGAGTTTTCTGAGGCTAACAAATCTAAGGTTAAGGAGATACTCTCT
TACTATCCCTCAAACTACAAGCAGTCTGCGGTGATTCCTCTTCTTGATCTTGCCCAACAA
CAGCATGGAGGCTGGCTTCCTGTTTCAGCAATGAATGCGGTTGCTAAAGTTATAGAAGTG
GCTCCTATCCGTGTTTATGAGGTTGCAACGTTTTACTCCATGTTCAACAGAGCAAAGGTC
GGAAAGTACCACCTGTTAGTTTGTGGCACAACACCTTGCATGATCCGTGGTTCACGAGAT
ATCGAATCAGCTT*GCTAGACCACTTGGGTGTGAAGCGCGGCGAAGTCACAAAGGATGGT
TTATTCTCTGTTGGAGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTTAATGCGCCCATGATCACT
GTGGCAGATTACTCCAATGGATCAGAAAGATATACATATAACTATTTCGAAGATGTTACA
CCTGAGAAAGTTGTAGAGATTGTTGAAAAGCTGAGAAA*GGAGAAAAGCCACCGCATGGA
ACTCAAA*TCCAAAGAGGATCAAGTGCGGAC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2B532TF 783 0 0
GGAGATCAAAAACCATCTCTGTCTCTCGTTTCCTCAAAGTCGTCGAAAATGCTGGCTAGG
CTCGCTGCGAAGCGTCTCCTCGAGATCCGTCAAGTTCTCCGTCAACCACCATCTTCTACT
CAGGCGTCTCGAAGCTTCTCGACAGCCTTGAACTACCACCTGGATTCTCCTGATAACAAA
CCGGATCTTCCATGGGAGTTTTCTGAGGCTAACAAATCTAAGGTTAAGGAGATACTCTCT
TACTATCCCTCAAACTACAAGCAGTCTGCGGTGATTCCTCTTCTTGATCTTGCCCAACAA
CAGCATGGAGGCTGGCTTCCTGTTTCAGCAATGAATGCGGTTGCTAAAGTTATAGAAGTG
GCTCCTATCCGTGTTTATGAGGTTGCAACGTTTTACTCCATGTTCAACAGAGCAAAGGTC
GGAAAGTACCACCTGTTAGTTTGTGGCACAACACCTTGCATGATCCGTGGTTCACGAGAT
ATCGAATCAGCTTTGCTAGACCACTTGGGTGTGAAGCGCGGCGAAGTCACAAAGGATGGT
TTATTCTCTGTTGGAGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTTAATGCGCCCATGATCACT
GTGGCAGATTACTCCAATGGATCAGAAGGATATACATATAACTATTTCGAAGATGTTACA
CCTGAGAAAGTTGTAAAGATTGTTGAAAAGCTGAGAAAAGGAGAAAAGCCACCGCATGGA
ACTCAAAATCCAAAGAGGATCAAGTGCGGACCTGAAAGAGGAAACACAACACTGCTTGGC
GAG

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2FG96JQ 635 0 0
GAAAGTACCACCTGTTAGTTTGTGGCACAACACCTTGCATGATCCGTGGTTCACGAGATA
TCGAATCAGCTT*GCTAGACCACTTGGGTGTGAAGCGCGGCGAAGTCACAAAGGATGGTT
TATTCTCTGTTGGAGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTTAATGCGCCCATGATCACTG
TGGCAGATTACTCCAATGGATCAGAAGGATATACATATAACTATTTCGAAGATGTTACAC
CTGAGAAAGTTGTAGAGATTGTTGAAAAGCTGAGAAAAGGAGAAAAGCCACCGCATGGAA
CTCAAAATCCAAAGAGGATCAAGTGCGGACCTGAAGGAGGAAACACAACACTGCTTGGCG
AGCCAAAGCCACCACAGTTCCGTGATCTCGACGCTTGCTAAGCTGAGTTTTTATACGCCG
ACGTTTTTTTATCTTTTGAAGATCAATAACGCAAAAGGCTATAGTGATGTTTGAAGCCTA
TAGCATCAAACTGAGATTGCATACTCTTTGTAGTTTGTCTTCTTGGCTTTAGAATTTCGA
CCCCATTTTAAAACAAATGACCAAAGAGCATTTTTCTTTTGTTATTATCTCCCTTCCAAG
ATTCCAAGGTTTATGGTGAAAGTGAATTTTGTTGT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 3

CO CL3176Contig1 574 3 2 U
GGGCCGTCGTCGTTGTCGTCTCACAGAAGAATAAGAAGAAACAAAGAGAGAGGTTGAAAA
CATGGCTTATGCAGCAATGAAGCCCACGAAGGCTGGCTTGGAAGAGCCACTCGAGCAGAT
TCACAAGATCAGGATCACTCTCTCCTCCAAGAACGTCAAGAACCTTGAGAAAGTGTGTGC
TGATTTGGTACGAGGAGCAAAGGACAAGAGACTCAGAACAAAAGGACCAGTGAGGATGCC
CACCAAGGTT*TTAAGATCACTACCCGTAAAGCTCCTTGTGGTGAAGGAACTAACACGTG
GGACAGGTTCGAGTTGAGGGTTCACAAGCGAGTGATTGATCTCTTCAGCTCTCCTGATGT
GGTGAAGCAAATCACTTCCATCACCATTGAACCTGGTGTTGAGGTCGAGGTCACCATCGC
CGACTCTTAGATTTTTTTTTTTTACTTTTTCTGCAAGAAACAGTCTCAACAGTCTCTTAC
ACTTCATTTGGAGTAGACCAATGTTTTGTTGTCGTGAAACTTAGTTCATGTGCTTTCTTA
GTTGAGGAGATTTTGTTTTATCCCAGTCTTTATT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI72JQ C 1
AF RR2EI72TF U 1
AF RR2AP10TF U 2
BS 1 1 RR2EI72JQ
BS 2 574 RR2EI72TF

RD RR2EI72JQ 525 0 0
GGGCCGTCGTCGTTGTCGTCTCACAGAAGAATAAGAAGAAACAAAGAGAGAGGTTGAAAA
CATGGCTTATGCAGCAATGAAGCCCACGAAGGCTGGCTTGGAAGAGCCACTCGAGCAGAT
TCACAAGATCAGGATCACTCTCTCCTCCAAGAACGTCAAGAACCTTGAGAAAGTGTGTGC
TGATTTGGTACGAGGAGCAAAGGACAAGAGACTCAGAACAAAAGGACCAGTGAGGATGCC
CACCAAGGTT*TTAAGATCACTACCCGTAAAGCTCCTTGTGGTGAAGGAACTAACACGTG
GGACAGGTTCGAGTTGAGGGTTCACAAGCGAGTGATTGATCTCTTCAGCTCTCCTGATGT
GGTGAAGCAAATCACTTCCATCACCATTGAACCTGGTGTTGAGGTCGAGGTCACCATCGC
CGACTCTTAGATTTTTTTTTTTTACTTTTTCTGCAAGAAACAGTCTCAACAGTCTCTTAC
ACTTCATTTGGAGTAGACCAATGTTTTGTTGTCGTGAAACTTAGT

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2EI72TF 574 0 0
G
GGCCGTCGTCGTTGTCGTCTCACAGAAGAATAAGAAGAAACAAAGAGAGAGGTTGAAAAC
ATGGCTTATGCAGCAATGAAGCCCACGAAGGCTGGCTTGGAAGAGCCACTCGAGCAGATT
CACAAGATCAGGATCACTCTCTCCTCCAAGAACGTCAAGAACCTTGAGAAAGTGTGTGCT
GATTTGGTACGAGGAGCAAAGGACAAGAGACTCAGAACAAAAGGACCAGTGAGGATGCCC
ACCAAGGTT*TTAAGATCACTACCCGTAAAGCTCCTTGTGGTGAAGGAACTAACACGTGG
GACAGGTTCGAGTTGAGGGTTCACAAGCGAGTGATTGATCTCTTCAGCTCTCCTGATGTG
GTGAAGCAAATCACTTCCATCACCATTGAACCTGGTGTTGAGGTCGAGGTCACCATCGCC
GACTCTTAGATTTTTTTTTTTTACTTTTTCTGCAAGAAACAGTCTCAACAGTCTCTTACA
CTTCATTTGGAGTAGACCAATGTTTTGTTGTCGTGAAACTTAGTTCATGTGCTTTCTTAG
TTGAGGAGATTTTGTTTTATCCCAGTCTTTATT

QA 2 574 2 574
DS 

RD RR2AP10TF 557 0 0
GGCCGTCGTCGTTGTCGTCTCACAGAAGAATAAGAAGAAACAAAGAGAGAGGTTGAAAAC
ATGGCTTATGCAGCAATGAAGCCCACGAAGGCTGGCTTGGAAGAGCCACTCGAGCAGATT
CACAAGATCAGGATCACTCTCTCCTCCAAGAACGTCAAGAACCTTGAGAAAGTGTGTGCT
GATTTGGTACGAGGAGCAAAGGACAAGAGACTCAGAACAAAAGGACCAGTGAGGATGCCC
ACCAAGGTTCTTAAGATCACTACCCGTAAAGCTCCTTGTGGTGAAGGAACTAACACGTGG
GACAGGTTCGAGTTGAGGGTTCACAAGCGAGTGATTGATCTCTTCAGCTCTCCTGATGTG
GTGAAGCAAATCACTTCCATCACCATTGAACCTGGTGTTGAGGTCGAGGTCACCATCGCC
GACTCTTAGATTTTTTTTTTTTACTTTTTCTGCAAGAAACAGTCTCAACAGTCTCTTACA
CTTCATTTGGAGTAGACCAATGTTTTGTTGTCGTGAAACTTAGTTCATGTGCTTTCTTAG
TTGAGGAGATTTTGTTT

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 3

CO CL3177Contig1 794 3 4 U
TTTTAACGTCTGCCAAGTAAAACAAACTGAATAAGATACAGTAAACCGTAGGTTTTAGAG
TACAAAAGGACGTACGTGCAAGGAAAGTTAACCGAAACCGGTTATACAGATAAATGAAAA
AAAAAAACACTGACCATGTGAAAATAAATACTGAGACTCTTTAAAAGGCTTTACACC***
CGGACTTGGATGTTATGAGTCGATTGAGACCGCCAGATTGGTTGTGAACCGCTCTGTACA
ATCGCTATTTCCTCTCCCTTCTTCACCATTCCTTGTTTCAGTAGTGTAGACAAAGCTTTA
GTGAAAGTGTCCTCTGCATCATCTGAGAACTCCATATATATGGGGCACACACCTTGATAC
AAGGCTAATCTTTGCTGTATTTTTTT*CTCATTTGTGAAGGCATAAATTGTGCCAAAAGG
GCGATAGTGACTCAAAAGTATGGCCATGAAACCGGTCCTGGTGAAAACAACAGTTGAAGT
TCCAAGTGTGTTCGACATCATGGTTGCATGGTATGCAAACATCTCACTCATATGGTTCTT
GAAGGCTTGACCAAGATTAGGTGGCATTTCACTACTAGTAGTAATGGTTGCTTCTGTTCG
CAGTGCAACTGTATGCATCACTCCAGCAGCTTTCAACGGGAACTTTCCATGAGCAGTTTC
TCCTGAAAGCATTACTGCATCAGCACCTTCTCTAACAGCTATAGCAATGTCAGAAACCTC
CGCCCGGGTTGGGGTTGGGTGAACTATCATACTCTCAAGCATGTTAGTCGCAACAATAAC
AGCTTTTCCCATGC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ES55JQ U 24
AF RR2BB27TF C 1
AF RR2BB27JQ U 5
BS 1 4 RR2BB27TF
BS 5 326 RR2BB27JQ
BS 327 327 RR2ES55JQ
BS 328 794 RR2BB27JQ

RD RR2ES55JQ 754 0 0
AAACTGAATAAGATACAGTAAACCGTAGGTTTTAGAGTACAAAAGGACGTACGTGCAAGG
AAAGTTAACCGAAACCGGTTTTACAGATAAATGAAAAAAAAA**CACTGACCATGTGAAA
ATAAATACTGAGACTCCTTAAAAGGCTTTACACCTTGCGGACTTGGATGTTATGAGTCGA
TTGAGACCGCCAGATTGGTTGTGAACCGCTCTGTACAATCGCTATTTCCTCTCCCTTCTT
CACCATTCCTTGTTTCAGTAGTGTAGACAAAGCTTTAGTGAAAGTGTCCTCTGCATCATC
TGAGAACTCCATATATATGGGGCACACACCTTGATACAAGGCTAATCTTTGCTGTATTTT
TTTTCTCGTTTGTGAAGGCATAAATTGTGCCAAAAGGGCGATAGTGACTCAAAAGTATGG
CCATGAAACCGGTCCTGGTGAAAACAACAGTTGAAGTTCCAAGTGTGTTCGACATCATGG
TTGCATGGTATGCAAACATCTCACTCATATGGTTCTTGAAGGCTTGACCAAGATTAGGTG
GCATTTCACTACTAGTAGTAATGGTTGCTTCTGTTCGCAGTGCAACTGTATGCATCACTC
CAGCAGCTTTCAACGGGAACTTTCCGTGAGCAGTTTCTCCTGAAAGCATTACTGCATCAG
CACCTTCTCTAACAGCTATAGCAATGTCAGAAACCTCCGCCCGGGTTGGAGTTGGGTGAA
CTATCATACTCTCAAGCATGTTAATCGCAACAAT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2BB27TF 794 0 0
TTTTAACGTCTGCCAAGTAAAACAAACTGAATAAGATACAGTAAACCGTAGGTTTTAGAG
TACAAAAGGACGTACGTGCAAGGAAAGTTAACCGAAACCGGTTATACAGATAAATGAAAA
AAAAAAACACTGACCATGTGAAAATAAATACTGAGACTCTTTAAAAGGCTTTACACC***
CGGACTTGGATGTTATGAGTCGATTGAGACCGCCAGATTGGTTGTGAACCGCTCTGTACA
ATCGCTATTTCCTCTCCCTTCTTCACCATTCCTTGTTTCAGTAGTGTAGACAAAGCTTTA
GTGAAAGTGTCCTCTGCATCATCTGAGAACTCCATATATATGGGGCACACACCTTGATAC
AAGGCTAATCTTTGCTGTATTTTTTT*CTCATTTGTGAAGGCATAGATTGTGCCAGAAGG
GCGATAGTGACTCAAAAGTATGGCCATGAAACCGGTCCTGGTGAAAACAACAGTTGAAGT
TCCAAGTGTGTTCGACATCATGGTTGCATGGTATGCAAACATCTCACTCATATGGTTCTT
GAAGGCTTGACCAAGATTAGGTGGCATTTCACTACTAGTAGTAATGGTTGCTTCTGTTCG
CAGTGCAACTGTATGCATCACTCCAGCAGCTTTCAACGGGAACTTTCCATGAGCAGTTTC
TCCTGAAAGCATTACTGCATCAGCACCTTCTCTAACAGCTATAGCAATGTCAGAAACCTC
CGCCCGGGTTGGGGTTGGGTGAACTATCATACTCTCAAGCATGTTAGTCGCAACAATAAC
AGCTTTTCCCATGC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2BB27JQ 790 0 0
AACGTCTGCCAAGTAAAACAAACTGAATAAGATACAGTAAACCGTAGGTTTTAGAGTACA
AAAGGACGTACGTGCAAGGAAAGTTAACCGAAACCGGTTATACAGATAAATGAAAAAAAA
AAACACTGACCATGTGAAAATAAATACTGAGACTCTTTAAAAGGCTTTACACC***CGGA
CTTGGATGTTATGAGTCGATTGAGACCGCCAGATTGGTTGTGAACCGCTCTGTACAATCG
CTATTTCCTCTCCCTTCTTCACCATTCCTTGTTTCAGTAGTGTAGACAAAGCTTTAGTGA
AAGTGTCCTCTGCATCATCTGAAAACTCCATATATATGGGGCACACACCTTGATACAAGG
CTAATCTTTGCTGTATTTTTTT*CTCATTTGTGAAGGCATAAATTGTGCCAAAAGGGCGA
TAGTGACTCAAAAGTATGGCCATGAAACCGGTCCTGGTGAAAACAACAGTTGAAGTTCCA
AGTGTGTTCGACATCATGGTTGCATGGTATGCAAACATCTCACTCATATGGTTCTTGAAG
GCTTGACCAAGATTAGGTGGCATTTCACTACTAGTAGTAATGGTTGCTTCTGTTCGCAGT
GCAACTGTATGCATCACTCCAGCAGCTTTCAACGGGAACTTTCCATGAGCAGTTTCTCCT
GAAAGCATTACTGCATCAGCACCTTCTCTAACAGCTATAGCAATGTCAGAAACCTCCGCC
CGGGTTGGGGTTGGGTGAACTATCATACTCTCAAGCATGTTAGTCGCAACAATAACAGCT
TTTCCCATGC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 3

CO CL3178Contig1 956 3 4 U
GCATTTTCATGTTTGGAGATGGTGCTACAAAAACCATCATTACTAATGACAAAAGTGTTG
CCCTTAGCAAAACCACTACTTCACTCAGTGCCACCGTTCAGGTTGAATCTGAGGGATTCA
TGGCGAAATGGATCGGATTCCAGAACACTGCTGGTCCATTGGGACACCAAGCGGTCGCAT
TCCGTGTGAACGGAGACCGTGCGGTCATATTCAACTGTAGATTTGACGCTTTCCAAGACA
CACTCTACGTCAACAACGGACGTCAGTTCTACAGGAACATTGTTGTATCCGGTACAGTCG
ATTTCATCTTCGGAAAATCTGCTACCGTGATCCAAACTCTCTAATCCTCATCAGAAAGGG
TAGCCAGGGACAGGCCCACTACGTAACAGCCGACGGTAACATGAAAGGTGAAGCGGTCAA
GATCGGTATCGTTCTTCAGAACTGCCGTATCATGGCAGACAAAGATCTCGAAGCTGAGAA
ACTAACCACCAAATCGTACCTAGGACGCCCGTGGAAGAAATTTTCCACCACCGTTATTAT
TGGAACTGAGATTAGTGATGTGATTAAGCCAGAAGGATGGTCAGAATGGAAAGGAGAAGC
TAACCACAAAACAGCTAAATACATTGAGTTCAATAACCGTGGACCAGGAGCTAACACTGC
TGCTAGGGTTCCTTGGGCTAAGATCGCTAAGTCTGCGGCTGAGGTTGAAAAGTACACCGT
CGCTAAATGGTTGACTCCGGTTAACTGGATTCAAGAAGCCAACGTGCCTGTCCAGCTTGG
ATTGTAAGAAAAACAAACAAACTAAAATTTACTAATAAAACAGTATGTGATTATGTAAAG
AGGTATATACGACCTCGTCTCTGGGGACCAGGGCTCTTTTTGATATTATTATACAATATA
GGGGTTCTAGACATTATGGGATGAAGTTTGTATAAGATTGCTTTTGTTTCACGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DQ44TF U 1
AF RR2CL71TF U 387
AF RR2DQ44JQ C 471
BS 1 575 RR2DQ44TF
BS 576 576 RR2CL71TF
BS 577 663 RR2DQ44TF
BS 664 956 RR2CL71TF

RD RR2DQ44TF 663 0 0
GCATTTTCATGTTTGGAGATGGTGCTACAAAAACCATCATTACTAATGACAAAAGTGTTG
CCCTTAGCAAAACCACTACTTCACTCAGTGCCACCGTTCAGGTTGAATCTGAGGGATTCA
TGGCGAAATGGATCGGATTCCAGAACACTGCTGGTCCATTGGGACACCAAGCGGTCGCAT
TCCGTGTGAACGGAGACCGTGCGGTCATATTCAACTGTAGATTTGACGCTTTCCAAGACA
CACTCTACGTCAACAACGGACGTCAGTTCTACAGGAACATTGTTGTATCCGGTACAGTCG
ATTTCATCTTCGGAAAATCTGCTACCGTGATCCAAACTCTCTAATCCTCATCAGAAAGGG
TAGCCAGGGACAGGCCCACTACGTAACAGCCGACGGTAACATGAAAGGTGAAGCGGTCAA
GATCGGTATCGTTCTTCAGAACTGCCGTATCATGGCAGACAAAGATCTCGAAGCTGAGAA
ACTAACCACCAAATCGTACCTAGGACGCCCGTGGAAGAAATTTTCCACCACCGTTATTAT
TGGAACTGAGATTAGTGATGTGATTAAGCCAGAAG*ATGGTCAGAATGGAAAGGAGAAGC
TAACCACAAAACAGCTAAATACATTGAGTTCAATAACCGTGGACCAGGAGCTAACACTGC
TGC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2CL71TF 570 0 0
G
AGCCGACGGTAACATGAAAGGTGAAGCGGTCAAGATCGGTATCGTTCTTCAGAACTGCCG
TATCATGGCAGACAAAGATCTCGAAGCTGAGAAACTAACCACCAAATCGTACCTAGGACG
CCCGTGGAAGAAATTTTCCACCACCGTTATTATTGGAACTGAGATTAGTGATGTGATTAA
GCCAGAAGGATGGTCAGAATGGAAAGGAGAAGCTAACCACAAAACAGCTAAATACATTGA
GTTCAATAACCGTGGACCAGGAGCTAACACTGCTGCTAGGGTTCCTTGGGCTAAGATCGC
TAAGTCTGCGGCTGAGGTTGAAAAGTACACCGTCGCTAAATGGTTGACTCCGGTTAACTG
GATTCAAGAAGCCAACGTGCCTGTCCAGCTTGGATTGTAAGAAAAACAAACAAACTAAAA
TTTACTAATAAAACAGTATGTGATTATGTAAAGAGGTATATACGACCTCGTCTCTGGGGA
CCAGGGCTCTTTTTGATATTATTATACAATATAGGGGTTCTAGACATTATGGGATGAAGT
TTGTATAAGATTGCTTTTGTTTCACGTGC

QA 2 570 2 570
DS 

RD RR2DQ44JQ 486 0 0
AAGCTGAGAAACTAACCACCAAATCGTACCTAGGACGCCCGTGGAAGAAATTTTCCACCA
CCGTTATTATTGGAACTGAGATTAGTGATGTGATTAAGCCAGAAGGATGGTCAGAATGGA
AAGGAGAAGCTAACCACAAAACAGCTAAATACATTGAGTTCAATAACCGTGGACCAGGAG
CTAACACTGCTGCTAGGGTTCCTTGGGCTAAGATCGCTAAGTTTGCGGCTGAGGTTGAAA
AGTACACCGTCGCTAAATGGTTGACTCCGGTTAACTGGATTCAAGAAGCCAACGTGCCTG
TCCAGCTTGGATTGTAAGAAAAACAAACAAACTAAAATTTACTAATAAAACAGTATGTGA
TTATGTAAAGAGGTATATACGACCTCGTTTTTGGGGACCAGGGCTTTTTTTGATATTATT
ATACAATATAGGGGTTTTAGACATTATGGGATGAAGTTTGTATAAGATTGCTTTTGTTTC
ACGTGC

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 3

CO CL3179Contig1 1164 3 13 U
GGGCTGCTAGCTCCTCCTCTCTGCTTCTTTCTTTCGGATCTGGGCAATCGATCCTTGAAG
AATTTGAAATCCTTTGCAAATATGATGGCGCGACAGAGGAATCATAATCACCGTCGGAAA
ACGTCTTATTCAACTCTCATCTTCACGGTATTGATTATGTTCACTTTTCTGATTTTGTTT
CTTCTCGCGCTTGGAATCCTCTCGCTGCCCACCAACAATGGCGGGTCCTCCAAAGCCAAT
GATCTCACTTCCATTGTTCGCAAAAACCTTCAGAGAAGTGGCAAAGATGTTACGGAGGAG
AACGAGCGTTGGGTTGAAATTATCTCTTGGGAACCCAGAGCTTCTATTTACCACAATTTC
TTGACCAAGGAGGAATGCAAGTATTTAATAGAGCTAGCTAAACCGCATATGGAGAAGTCA
ACTGTTGTCGATCAAAAGACTGGAAAGAGCACAGATAGCAGGGTCAGAACGAGCTCAGGG
ACATTTCTTCCAAGAGGTCGCGACAAAATCATCCGTCAAATCGAGAAAAGGATATCAGAT
TTTACCTTCATACCTGTTGAGCATGGGGAAGGTCTTCAAGTTCTGCACTATGAAATAGGG
CAAAAGTACGAGCCTCACTATGACTACTTTATGGATGAGTATAACACTAGGAACGGAGGG
CAGCGAATAGCCACTGTTCTCATGTACCTGTCAGATGTTGAGGAGGGGGGTGAAACAGTG
TTTCCTTCAGCCAAGGGAAACTATAGCGCAGTGCCATGGTGGAATGAGCTCTCAGAGTGC
GGGAAAGGAGGGCTGTCCGTAAAACCAAAGATGGGAGATGCATTGCTTTTCTGGAGCATG
ACACCTGATGCCACTCTAGACCCATCTAGTCTTCACGGTGGGTGTGCCGTAATCAAAGGG
AACAAGTGGTCATCCACAAAATGGTTGCGTGTACACGAGTACAAAGTTTGATCGAATTAC
TGAGGGAAGGAGGAGGAAGAAGCAAAAAGAGAGACAGAGAGTGAGAGACGAAGCGTAGGA
AAAGGTCAGAAGAATTGGAGCCCTCTGCTTGCATCCTTGAGATACTTTTGTTATATTTAA
GAGTAGATATTTTGTATCTCAAAAAAGACAACCACCATTTGAGTTGATTTTATTTGATTA
ATACCACTACCATTTGATGGGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 0 0 0 0 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV04TF U 1
AF RR2B502TF U 215
AF RR2BV04JQ C 420
BS 1 659 RR2BV04TF
BS 660 660 RR2B502TF
BS 661 685 RR2BV04TF
BS 686 800 RR2B502TF
BS 801 801 RR2BV04JQ
BS 802 842 RR2B502TF
BS 843 843 RR2BV04JQ
BS 844 849 RR2B502TF
BS 850 850 RR2BV04JQ
BS 851 965 RR2B502TF
BS 966 973 RR2BV04JQ
BS 974 1018 RR2B502TF
BS 1019 1164 RR2BV04JQ

RD RR2BV04TF 685 0 0
GGGCTGCTAGCTCCTCCTCTCTGCTTCTTTCTTTCGGATCTGGGCAATCGATCCTTGAAG
AATTTGAAATCCTTTGCAAATATGATGGCGCGACAGAGGAATCATAATCACCGTCGGAAA
ACGTCTTATTCAACTCTCATCTTCACGGTATTGATTATGTTCACTTTTCTGATTTTGTTT
CTTCTCGCGCTTGGAATCCTCTCGCTGCCCACCAACAATGGCGGGTCCTCCAAAGCCAAT
GATCTCACTTCCATTGTTCGCAAAAACCTTCAGAGAAGTGGCAAAGATGTTACGGAGGAG
AACGAGCGTTGGGTTGAAATTATCTCTTGGGAACCCAGAGCTTCTATTTACCACAATTTC
TTGACCAAGGAGGAATGCAAGTATTTAATAGAGCTAGCTAAACCGCATATGGAGAAGTCA
ACTGTTGTCGATCAAAAGACTGGAAAGAGCACAGATAGCAGGGTCAGAACGAGCTCAGGG
ACATTTCTTCCAAGAGGTCGCGACAAAATCATCCGTCAAATCGAGAAAAGGATATCAGAT
TTTACCTTCATACCTGTTGAGCATGGGGAAGGTCTTCAAGTTCTGCACTATGAAATAGGG
CAAAAGTACGAGCCTCACTATGACTACTTTATGGATGAGTATAACACTAGGAACGGAGG*
CAGCGAATAGCCACTGTTCTCATGT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2B502TF 805 0 0
G
CAATGGCGGGTCCTCCAAAGCCAATGATCTCACTTCCATTGTTCGCAAAAACCTTCAGAG
AAGTGGCAAAGATGTTACGGAGGAGAACGAGCGTTGGGTTGAAATTATCTCTTGGGAACC
CAGAGCTTCTATTTACCACAATTTCTTGACCAAGGAGGAATGCAAGTATTTAATAGAGCT
AGCTAAACCGCATATGGAGAAGTCAACTGTTGTCGATCAAAAGACTGGAAAGAGCACAGA
TAGCAGGGTCAGAACGAGCTCAGGGACATTTCTTCCAAGAGGTCGCGACAAAATCATCCG
TCAAATCGAGAAAAGGATATCAGATTTTACCTTCATACCTGTTGAGCATGGGGAAGGTCT
TCAAGTTCTGCACTATGAAATAGGGCAAAAGTACGAGCCTCACTATGACTACTTTATGGA
TGAGTATAACACTAGGAACGGAGGGCAGCGAATAGCCACTGTTCTCATGTACCTGTCAGA
TGTTGAGGAGGGGGGTGAAACAGTGTTTCCTTCAGCCAAGGGAAACTATAGCGCAGTGCC
ATGGTGGAATGAGCTCTCAGAGTGCGGGAAAGGAGGGCTGTCCGTGAAACCAAAGATGGG
AGATGCATTGCTTTTCTGGAGCATGACGCCTGATTCCACTCTAGACCCATCTAGTCTTCA
CGGTGGGTGTGCCGTAATCAAAGGGAACAAGTGGTCATCCACAAAATGGTTGCGTGTACA
CGAGTACAAAGTTTGATCGAATTACTGAGG********AGGAAGAAGCAAAAAGAGAGAC
AGAGAGTGAGAGACGAAGCGTAG
A

QA 2 804 2 804
DS 

RD RR2BV04JQ 745 0 0
AACTGTTGTCGATCAAAAGACTGGAAAGAGCACAGATAGCAGGGTCAGAACGAGCTCAGG
GACATTTCTTCCAAGAGGTCGCGACAAAATCATCCGTCAAATCGAGAAAAGGATATCAGA
TTTTACCTTCATACCTGTTGAGCATGGGGAAGGTCTTCAAGTTCTGCACTATGAAATAGG
GCAAAAGTACGAGCCTCACTATGACTACTTTATGGATGAGTATAACACTAGGAACGGAGG
GCAGCGAATAGCCACTGTTCTCATGTACCTGTCAGATGTTGAGGAGGGGGGTGAAACAGT
GTTTCCTTCAGCCAAGGGAAACTATAGCGCAGTGCCATGGTGGAATGAGCTCTCAGAGTG
CGGGAAAGGAGGGCTGTCCGTAAAACCAAAGATGGGAGATGCATTGCTTTTCTGGAGCAT
GACACCTGATGCCACTCTAGACCCATCTAGTCTTCACGGTGGGTGTGCCGTAATCAAAGG
GAACAAGTGGTCATCCACAAAATGGTTGCGTGTACACGAGTACAAGGTTTGATCGAATTA
CTGAGGGAAGGAGGAGGAAGAAGCAAAAAGAGAGACAGAGAGTGAGAGACGAAGCGTAGG
AAAAGGTCAGAAGAATTGGAGCCCTCTGCTTGCATCCTTGAGATACTTTTGTTATATTTA
AGAGTAGATATTTTGTATCTCAAAAAAGACAACCACCATTTGAGTTGATTTTATTTGATT
AATACCACTACCATTTGATGGGATT

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 3

CO CL3180Contig1 746 3 1 U
AAATATTCCAATGAATTAATAAATTGATGATAAAGTCACAATCTAGTTAACTCACAAACA
AAACAAATGTTTGTGGAAACTTTTGACTTTTTTCGTTATAAAATTAATTATATCAAAAAG
CTTATTTGGGACACATAGGGAAACTAAGTTTTCCACCGAAAATAACGTTGGCGTTGGTAC
AAAGGGCTCCGACCAAACCTCCTGACGACGAGGGATGTCCTCCTTTGTTACCAATGAAGT
TCAAGTTCACGTCAATGACACTGACTCCTGCGCACGGTACTGCTTTGCTGCACATGATCT
GAACTTCATCTTTTGTAATTGTTGTTCCTCTTACGTTCTTGAACAACACATCGCTAATGG
CAACTCTTGATTCTCCGCCTCTTGAGCCGTAGTTTTGGTCAATGATGATTGGGTTCTTCA
CGCTTTCCATTATAATATCTTCAAACTTAATGTCCGTCGCCTTGCTTGGAGACGAACCAC
CCCAACTCTTGATTCGAAGACCATTGTCGGTACCTTTCATCGTGCAGCTCTTAAAGTGAA
TGCCGCTAACATCCTCCTCGTTCGGGTACTTTCCGAGACTACCGACACTTAGGCCGTGTC
CTGGGCCACAAACCACGCGTTCGACAGTTACATTGTTGGAACCACGACCGACAGAAATAC
AATCGTCTCCTGTCCCTATATTACTGTCAACGATGCTAACGTTGTCTGCATTGCTCAAAT
GGATACCATCGGTGTTGGGACTTTCA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H752JQB U 1
AF RR2H752TF C 1
AF RR2GH10JQB U 1
BS 1 746 RR2GH10JQB

RD RR2H752JQB 496 0 0
AAATATTCCAATGAATTAATAAATTGATGATAAAGTCACAATCTAGTTAACTCACAAACA
AAACAAATGTTTGTGGAAACTTTTGACTTTTTTCGTTATAAAATTAATTATATCAAAAAG
CTTATTTGGGACACATAGGGAAACTAAGTTTTCCACCGAAAATAACGTTGGCGTTGGTAC
AAAGGGCTCCGACCAAACCTCCTGACGACGAGGGATGTCCTCCTTTGTTACCAATGAAGT
TCAAGTTCACGTCAATGACACTGACTCCTGCGCACGGTACTGCTTTGCTGCACATGATCT
GAACTTCATCTTTTGTAATTGTTGTTCCTCTTACGTTCTTGAACAACACATCGCTAATGG
CAACTCTTGATTCTCCGCCTCTTGAGCCGTAGTTTTGGTCAATGATGATTGGGTTCTTCA
CGCTTTCCATTATAATATCTTCAAACTTAATGTCCGTCGCCTTGCTTGGAGACGAACCAC
CCCAACTCTTGATTCG

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2H752TF 555 0 0
AAATATTCCAATGAATTAATAAATTGATGATAAAGTCACAATCTAGTTAACTCACAAACA
AAACAAATGTTTGTGGAAACTTTTGACTTTTTTCGTTATAAAATTAATTATATCAAAAAG
CTTATTTGGGACACATAGGGAAACTAAGTTTTCCACCGAAGATAACGTTGGCGTTGGTAC
AAAGGGCTCCGACCAAACCTCCTGACGACGAGGGATGTCCTCCTTTGTTACCAATGAAGT
TCAAGTTCACGTCAATGACACTGACTCCTGCGCACGGTACTGCTTTGCTGCACATGATCT
GAACTTCATCTTTTGTAATTGTTGTTCCTCTTACGTTCTTGAACAACACATCGCTAATGG
CAACTCTTGATTCTCCGCCTCTTGAGCCGTAGTTTTGGTCAATGATGATTGGGTTCTTCA
CGCTTTCCATTATAATATCTTCAAACTTAATGTCCGTCGCCTTGCTTGGAGACGAACCAC
CCCAACTCTTGATTCGAAGACCATTGTCGGTACCTTTCATCGTGCAGCTCTTAAAGTGAA
TGCCGCTAACATCC
C

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2GH10JQB 746 0 0
AAATATTCCAATGAATTAATAAATTGATGATAAAGTCACAATCTAGTTAACTCACAAACA
AAACAAATGTTTGTGGAAACTTTTGACTTTTTTCGTTATAAAATTAATTATATCAAAAAG
CTTATTTGGGACACATAGGGAAACTAAGTTTTCCACCGAAAATAACGTTGGCGTTGGTAC
AAAGGGCTCCGACCAAACCTCCTGACGACGAGGGATGTCCTCCTTTGTTACCAATGAAGT
TCAAGTTCACGTCAATGACACTGACTCCTGCGCACGGTACTGCTTTGCTGCACATGATCT
GAACTTCATCTTTTGTAATTGTTGTTCCTCTTACGTTCTTGAACAACACATCGCTAATGG
CAACTCTTGATTCTCCGCCTCTTGAGCCGTAGTTTTGGTCAATGATGATTGGGTTCTTCA
CGCTTTCCATTATAATATCTTCAAACTTAATGTCCGTCGCCTTGCTTGGAGACGAACCAC
CCCAACTCTTGATTCGAAGACCATTGTCGGTACCTTTCATCGTGCAGCTCTTAAAGTGAA
TGCCGCTAACATCCTCCTCGTTCGGGTACTTTCCGAGACTACCGACACTTAGGCCGTGTC
CTGGGCCACAAACCACGCGTTCGACAGTTACATTGTTGGAACCACGACCGACAGAAATAC
AATCGTCTCCTGTCCCTATATTACTGTCAACGATGCTAACGTTGTCTGCATTGCTCAAAT
GGATACCATCGGTGTTGGGACTTTCA

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 3

CO CL3181Contig1 623 3 12 U
GGGAGATGATTTGAGCGAGAATCGTCGTCTCCCTCCGGCGATCGCCGGAACAAGAAAATG
TTGGCGATCACGAGAGTGATTAGCCGGAGAATCCATGGCAAGGGAGGTGATGCAGCTGTT
CCAAAACTCTCAGGATTCTCTATTGTATCTCCCAAAAACGTTGAGGTAGAGTATGGAGAT
GGGAGCAAGTTCAGTTTCTCATCTGAGTTTCTGAGAGTGCATAGTCCAGCTGCTGATGGG
AAAGTCAGATCAATCGGTGGTGAAAAGGTGATATCTGGAAGGCGGTATGTAGGAATCATG
TCTGCAGAACCAGTGGGAAACTATGGGGTAAGGTTAGTGTTTGATGACTTGCATAGAACA
GGAATATATCCATGGGACTATTTCTACGAGCTTGGGAGCAATAAGTTTGGTCTCATGAGA
AGCTATATCAAGATTCTCCAAAAGCATCATCTCAGCCGTGAACCTCCTCCCAGAAGGATA
TGATTCTGGCCAATGTGTGTGTTTCAAACTCTTTTGGTTCAAAGTGTTTGTTAGAATCCT
TGTTGTGCAGAAACATGGAATCTTGTTTGGCTTCTTTCAGAGTGCAGCCCGTATACATTT
TATATTCATTTGGGCCCAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN81TF U 1
AF RR2H457TF U 42
AF RR2H457JQB C 143
BS 1 71 RR2DN81TF
BS 72 72 RR2H457TF
BS 73 104 RR2DN81TF
BS 105 105 RR2H457TF
BS 106 112 RR2DN81TF
BS 113 113 RR2H457TF
BS 114 282 RR2DN81TF
BS 283 283 RR2H457TF
BS 284 448 RR2DN81TF
BS 449 449 RR2H457TF
BS 450 614 RR2DN81TF
BS 615 623 RR2H457TF

RD RR2DN81TF 614 0 0
GGGAGATGATTTGAGCGAGAATCGTCGTCTCCCTCCGGCGATCGCCGGAACAAGAAAATG
TTGGCGATCAC*AGAGTGATTAGCCGGAGAATCCATGGCAAGGGTGGTGATGTAGCTGTT
CCAAAACTCTCAGGATTCTCTATTGTATCTCCCAAAAACGTTGAGGTAGAGTATGGAGAT
GGGAGCAAGTTCAGTTTCTCATCTGAGTTTCTGAGAGTGCATAGTCCAGCTGCTGATGGG
AAAGTCAGATCAATCGGTGGTGAAAAGGTGATATCTGGAAGGAGGTATGTAGGAATCATG
TCTGCAGAACCAGTGGGAAACTATGGGGTAAGGTTAGTGTTTGATGACTTGCATAGAACA
GGAATATATCCATGGGACTATTTCTACGAGCTTGGGAGCAATAAGTTTGGTCTCATGAGA
AGCTATATCAAGATTCTCCAAAAGCATCGTCTCAGCCGTGAACCTCCTCCCAGAAGGATA
TGATTCTGGCCAATGTGTGTGTTTCAAACTCTTTTGGTTCAAAGTGTTTGTTAGAATCCT
TGTTGTGCAGAAACATGGAATCTTGTTTGGCTTCTTTCAGAGTGCAGCCCGTATACATTT
TATATTCATTTGGG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2H457TF 582 0 0
GG
GCCGGAACAAGAAAATGTTGGCGATCACGAGAGTGATTAGCCGGAGAATCCATGGCAAGG
GAGGTGATGCAGCTGTTCCAAAACTCTCAGGATTCTCTATTGTATCTCCCAAAAACGTTG
AGGTAGAGTATGGAGATGGGAGCAAGTTCAGTTTCTCATCTGAGTTTCTGAGAGTGCATA
GTCCAGCTGCTGATGGGAAAGTCAGATCAATCGGTGGTGAAAAGGTGATATCTGGAAGGC
GGTATGTAGGAATCATGTCTGCAGAACCAGTGGGAAACTATGGGGTAAGGTTAGTGTTTG
ATGACTTGCATAGAACAGGAATATATCCATGGGACTATTTCTACGAGCTTGGGAGCAATA
AGTTTGGTCTCATGAGAAGCTATATCAAGATTCTCCAAAAGCATCATCTCAGCCGTGAAC
CTCCTCCCAGAAGGATATGATTCTGGCCAATGTGTGTGTTTCAAACTCTTTTGGTTCAAA
GTGTTTGTTAGAATCCTTGTTGTGCAGAAACATGGAATCTTGTTTGGCTTCTTTCAGAGT
GCAGCCCGTATACATTTTATATTCATTTGGGCCCAAAAAA

QA 3 582 3 582
DS 

RD RR2H457JQB 475 0 0
TTGTATCTCCCAAAAACGTTGAGGTAGAGTATGGAGATGGGAGCAAGTTCAGTTTTTCAT
CTGAGTTTCTGAGAGTGCATAGTCCAGCTGCTGATGGGAAAGTCAGATCAATCGGTGGTG
AAAAGGTGATATCTGGAAGGCGGTATGTAGGAATCATGTCTGCAGAACCAGTGGGAAACT
ATGGGGTAAGGTTAGTGTTTGATGACTTGCATAGAACAGGAATATATCCATGGGACTATT
TTTACGAGCTTGGGAGCAATAAGTTTGGTCTCATGAGAAGCTATATCAAGATTCTCCAAA
AGCATCATTTCAGCCGTGAACCTCCTCCCAGAAGGATATGATTCTGGCCAATGTGTGTGT
TTCAAACTCTTTTGGTTCAAAGTGTTTGTTAGAATCCTTGTTGTGCAGAAACATGGAATC
TTGTTTGGCTTCTTTCAGAGTGCAGCCCGTATACATTTTATATTCATTTGGG
CCC

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 3

CO CL3182Contig1 591 3 7 U
GGACAAGTTTACATCCACTTCCACAGCAAAAA*GAATACACACACACATCTGTAGATATG
GATCTTGAGTTATTACACGATCTGTCCAAATTCAATATCCCATCAACCATTAAGATCCGA
TCCAAAACCTCTAGAAACAACAACGATGGTGATGATGAGCACGATGGCTTTAGCTGTAGC
ACACCCACATCTCAAGAACACAAGATTCCCTCCGTTCTTGATTCTCCACCTCCCCCGCCA
AGAAAACCTCGTACACTGCCGTCAAAACCGTCGGCTACGGCGGCTATGATGACCAGATCG
TTTAAAAGGAAGCTCTTAGTGTCGACTTGTGAGATTATCATGAACCCGGAAGAGATTGAC
CGTTTCTTCACATCTGTTTATAGTGACACATCGACCACGGCGAAACGGCGGAGATGTTAT
CCTCATACTGCACGAAGATGAGCCTTTAATTAGCTCAAGATTTACATTTTACAATTTTAC
AGTTGATATATTGTCATATAGTATAAGGTTGAAATACTTTTACTTTTTATAAAATGGATG
GATAGCTTTTCTAGAACCGCATATTAATTTCGTATGGAGGGGTCGATTCTG


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX88TF U 1
AF RR2E130JQ C 3
AF RR2E130TF U 3
BS 1 32 RR2DX88TF
BS 33 33 RR2E130TF
BS 34 66 RR2DX88TF
BS 67 67 RR2E130TF
BS 68 301 RR2DX88TF
BS 302 302 RR2E130TF
BS 303 591 RR2DX88TF

RD RR2DX88TF 591 0 0
GGACAAGTTTACATCCACTTCCACAGCAAAAAAGAATACACACACACATCTGTAGATATG
GATCTTTAGTTATTACACGATCTGTCCAAATTCAATATCCCATCAACCATTAAGATCCGA
TCCAAAACCTCTAGAAACAACAACGATGGTGATGATGAGCACGATGGCTTTAGCTGTAGC
ACACCCACATCTCAAGAACACAAGATTCCCTCCGTTCTTGATTCTCCACCTCCCCCGCCA
AGAAAACCTCGTACACTGCCGTCAAAACCGTCGGCTACGGCGGCTATGATGACCAGATCG
TGTAAAAGGAAGCTCTTAGTGTCGACTTGTGAGATTATCATGAACCCGGAAGAGATTGAC
CGTTTCTTCACATCTGTTTATAGTGACACATCGACCACGGCGAAACGGCGGAGATGTTAT
CCTCATACTGCACGAAGATGAGCCTTTAATTAGCTCAAGATTTACATTTTACAATTTTAC
AGTTGATATATTGTCATATAGTATAAGGTTGAAATACTTTTACTTTTTATAAAATGGATG
GATAGCTTTTCTAGAACCGCATATTAATTTCGTATGGAGGGGTCGATTCTG

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2E130JQ 550 0 0
GG
AAGTTTACATCCACTTCCACAGCAAAAA*GAATACACACACACATCTGTAGATATGGATC
TTGAGTTATTACACGATCTGTCCAAATTCAATATCCCATCAACCATTAAGATCCGATCCA
AAACCTCTAGAAACAACAACGATGGTGATGATGAGCACGATGGCTTTAGCTGTAGCACAC
CCACATCTCAAGAACACAAGATTCCCTCCGTTCTTGATTCTCCACCTCCCCCGCCAAGAA
AACCTCGTACACTGCCGTCAAAACCGTCGGCTACGGCGGCTATGATGACCAGATCGTTTA
AAAGGAAGCTCTTAGTGTCGACTTGTGAGATTATCATGAACCCGGAAGAGATTGACCGTT
TCTTCACATCTGTTTATAGTGACACATCGACCACGGCGAAACGGCGGAGATGTTATCCTC
ATACTGCACGAAGATGAGCCTTTAATTAGCTCAAGATTTACATTTTACAATTTTACAGTT
GATATATTGTCATATAGTATAAGGTTGAAATACTTTTACTTTTTATAAAATGGATGGATA
GCTTTTC
C

QA 3 549 3 549
DS 

RD RR2E130TF 550 0 0
GG
AAGTTTACATCCACTTCCACAGCAAAAA*GAATACACACACACATCTGTAGATATGGATC
TTGAGTTATTACACGATCTGTCCAAATTCAATATCCCATCAACCATTAAGATCCGATCCA
AAACCTCTAGAAACAACAACGATGGTGATGATGAGCACGATGGCTTTAGCTGTAGCACAC
CCACATCTCAAGAACACAAGATTCCCTCCGTTCTTGATTCTCCACCTCCCCCGCCAAGAA
AACCTCGTACACTGCCGTCAAAACCGTCGGCTACGGCGGCTATGATGACCAGATCGTTTA
AAAGGAAGCTCTTAGTGTCGACTTGTGAGATTATCATGAACCCGGAAGAGATTGACCGTT
TCTTCACATCTGTTTATAGTGACACATCGACCACGGCGAAACGGCGGAGATGTTATCCTC
ATACTGCACGAAGATGAGCCTTTAATTAGCTCAAGATTTACATTTTACAATTTTACAGTT
GATATATTGTCATATAGTATAAGGTTGAAATACTTTTACTTTTTATAAAATGGATGGATA
GCTTTTC
C

QA 3 549 3 549
DS 



AS 1 3

CO CL3183Contig1 1041 3 8 U
TTTTTTTGATGCAACAAAGGCAAACCACAGTATCTTGATTAACACATAGCGAAACAAAAA
TCAACACACAACAAACATGAAATTGATCTAAAGACCAAATGCGTCTGCACAAGAATCCTC
ATCAATGAACAAACTTGGTAAACACACAAATATTTCAATCCACAATATTAGGATCCAGAC
CTCTTGCCTTTCTCGTCTTCCCCACAAACAGATCCTTAGATTTGAGCAAACCAGGCACGC
AGCCCGAGACTGTCATGAAAGGGAACTGAGCCACCGAGTCCTTTCTTCCCAAAGATATTA
TGGCAATATCTGAACCTGGCTTGTAGCTCGACAGCTTCTTCTCGTTCCCACCTGACATCA
ACAGCTTTATGTTCTTCGCAGCCACCGAGGCATGTTTCTCAGCGATGTATCCTTGTTTCA
TCTCAGGGACGTCAGTGATATCTCCAATCGCGAATACATTCTTGCGACCTTTCACCCTCA
AGTACTCGTCGACCATCAGCCTTCCTTTACCATCCAAACCATCTTTCAGCACAGTTTCTT
TTAGCCATTCTGAAGCCAAAGGCTTTCCCGTGCAGAGGAAATAGCAATCCGCGTGTACCG
TTTCTCCTCCTGATGTTCGGTAAGTTTTATCTCCGTCCAAAGCTGAACTCAGGTCCACCC
TTTTGATTCAGTATCACTTCAACTTTCTTCGTTTTCAGCCAGTCAAATGCTTTGTCTGCA
GCTTTTTGACCAACAAACTCCAATAACCTCGGTCCATTGTGTACTAAAGTAACCTTCTTC
TCCGGGAAATCGACTGCAATCTCAGCGGCGAGCTCGACGCCCGAGGGTCCTCCACCAACA
ATCAGAACTGACTCAGAAGACTTGATCTTCTCATATTCCGATTGGTATTGGGAAAGCTTC
TCTGGTCTGGTTTTGGGAAGCACATCGTTGTGACCTGTAGCAATGACAAGATAATCATAT
CCAAAGAAAAGCCCATCGGCCGTGACTACTTGAGAGTTGGTGATATTGACAGCTGGAGAA
GTCACGACCCGGCCGTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP19JQ U 8
AF RR2C841JQ U 1
AF RR2GP19TF C 281
BS 1 62 RR2C841JQ
BS 63 63 RR2GP19JQ
BS 64 226 RR2C841JQ
BS 227 227 RR2GP19JQ
BS 228 321 RR2C841JQ
BS 322 322 RR2GP19JQ
BS 323 726 RR2C841JQ
BS 727 1041 RR2GP19TF

RD RR2GP19JQ 564 0 0
GATGCAACAAAGGCAAACCACAGTATCTTGATTAACACATAGCGAAACAAAAATCAACAC
ACAACAAACATGAAATTGATCTAAAGACCAAATGCGTCTGCACAAGAATCCTCATCAATG
AACAAACTTGGTAAACACACAAATATTTCAATCCACAATATTAGGATCCAGACCTCTTGC
CTTTCTCGTCTTCCCCACAAACAGATCCTTAGATTTGAGCAAACCAGGCACGCAGCCCGA
GACTGTCATGAAAGGGAACTGAGCCACCGAGTCCTTTCTTCCCAAAGATATTATGGCAAT
ATCTGAACCTGGCTTGTAGCTCGACAGCTTCTTCTCGTTCCCACCTGACATCAACAGCTT
TATGTTCTTCGCAGCCACCGAGGCATGTTTCTCAGCGATGTATCCTTGTTTCATCTCAGG
GACGTCAGTGATATCTCCAATCGCGAATACATTCTTGCGACCTTTCACCCTCAAGTACTC
GTCGACCATCAGCCTTCCTTTACCATCCAAACCATCTTTCAGCACAGTTTCTTTTAGCCA
TTCTGAAGCCAAAGGCTTTCCCGT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2C841JQ 726 0 0
TTTTTTTGATGCAACAAAGGCAAACCACAGTATCTTGATTAACACATAGCGAAACAAAAA
TCGACACACAACAAACATGAAATTGATCTAAAGACCAAATGCGTCTGCACAAGAATCCTC
ATCAATGAACAAACTTGGTAAACACACAAATATTTCAATCCACAATATTAGGATCCAGAC
CTCTTGCCTTTCTCGTCTTCCCCACAAACAGATCCTTAGATTTGAGTAAACCAGGCACGC
AGCCCGAGACTGTCATGAAAGGGAACTGAGCCACCGAGTCCTTTCTTCCCAAAGATATTA
TGGCAATATCTGAACCTGGCTAGTAGCTCGACAGCTTCTTCTCGTTCCCACCTGACATCA
ACAGCTTTATGTTCTTCGCAGCCACCGAGGCATGTTTCTCAGCGATGTATCCTTGTTTCA
TCTCAGGGACGTCAGTGATATCTCCAATCGCGAATACATTCTTGCGACCTTTCACCCTCA
AGTACTCGTCGACCATCAGCCTTCCTTTACCATCCAAACCATCTTTCAGCACAGTTTCTT
TTAGCCATTCTGAAGCCAAAGGCTTTCCCGTGCAGAGGAAATAGCAATCCGCGTGTACCG
TTTCTCCTCCTGATGTTCGGTAAGTTTTATCTCCGTCCAAAGCTGAACTCAGGTCCACCC
TTTTGATTCAGTATCACTTCAACTTTCTTCGTTTTCAGCCAGTCAAATGCTTTGTCTGCA
GCTTTT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2GP19TF 761 0 0
CTTTCTTCCCAAAGATAT*ATG*CAATATCTGA*CCTGGCTTGTAGCTCGACAGCTTCTT
CTCGTTCCCAC*TGACATCAACAGCTTTATGT*CTTCGCAGCCACCGAGGCATGTTTCTC
AGCGATGTATCCTTGTTTCATCTCAGGGACGTCAGTGATATCTCCAATCGCGAATACATT
CTTGCGACCTTTCACCCTCAAGTACTCGTCGACCATCAGCCTTCCTTTACCATCCAAACC
ATCTTTCAGCACAGTTTCTTTTAGCCATTCTGAAGCCAAAGGCTTTCCCGTGCAGAGGAA
ATAGCAATCCGCGTGTACCGTTTCTCCTCCTGATGTTCGGTAAGTTTTATCTCCGTCCAA
AGCTGAACTCAGGTCCACCCTTT*GATTCAGTATCACTTCAACTTTCTTCGTTTTCAGCC
AGTCAAATGCTTTGTCTGCAGCTTTTTGACCAACAAACTCCAATAACCTCGGTCCATTGT
GTACTAAAGTAACCTTCTTCTCCGGGAAATCGACTGCAATCTCAGCGGCGAGCTCGACGC
CCGAGGGTCCTCCACCAACAATCAGAACTGACTCAGAAGACTTGATCTTCTCATATTCCG
ATTGGTATTGGGAAAGCTTCTCTGGTCTGGTTTTGGGAAGCACATCGTTGTGACCTGTAG
CAATGACAAGATAATCATATCCAAAGAAAAGCCCATCGGCCGTGACTACTTGAGAGTTGG
TGATATTGACAGCTGGAGAAGTCACGACCCGGCCGTTTTGC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 3

CO CL3184Contig1 727 3 8 U
GGAATCAATCACTTCTTCCTCATCTTCTTCAAACATTACACACTTTCTCCAGTTTTTTTC
TTCCCTTAATAATTCGGAGAGAAAGCCTTAGTAGCCGGTTAAAATTATCCGGTGAAACAA
TGGCGACTCCGGCATGGAGTCATGCCAAGGGTCAATGGGTAGTAGCCATTTTGGCGCTAC
TTGTTGGCTCGGAAATCACCTCCACCACCTTACTACTACCATTCACCGCCTCCTCCGGTG
AAGTCCCCACCACCACCATACTATTACAACTCTCCACCACCACCAGTAAAATCTCCTCCA
CCTCCAGTATACATCTACGCTTCTCCCCCACCTCCTACCCATTACTAGGCTCATCAAATT
CAACAAAATTTCCGCTTTATTCAAGTTTTCTTTCTAAAAATGAAATAAATGAAGGGTCAA
AGTCAAAGATGAGAAGAAGTGAACCAAATAAGGATCGTCTCGTGGAAACCCTGAACAATA
CATCTCCAACAATGATCCACATCACTTCCTCTTCTTCAATGTCGCTCATCTTCCACTTCT
GCATTATCATCTTCGCGTCTTCGTCAAGTCGATTGTTTCCAAGACCCTTTTAGATCGTAT
CATAGTACTTTTCTTTGTAACCTTTTTTTATCGTTATTTATTTGTTGTGCATACATTTTC
TATCTATTTTTTTATGTAATGAGTGAGGTGTTAGCAAATAAAAAAGATGTTCAGTTTCGT
GTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AC94TF U 1
AF RR2F914JQ C 178
AF RR2F914TF U 178
BS 1 255 RR2AC94TF
BS 256 258 RR2F914TF
BS 259 409 RR2AC94TF
BS 410 410 RR2F914TF
BS 411 590 RR2AC94TF
BS 591 591 RR2F914TF
BS 592 699 RR2AC94TF
BS 700 727 RR2F914TF

RD RR2AC94TF 699 0 0
GGAATCAATCACTTCTTCCTCATCTTCTTCAAACATTACACACTTTCTCCAGTTTTTTTC
TTCCCTTAATAATTCGGAGAGAAAGCCTTAGTAGCCGGTTAAAATTATCCGGTGAAACAA
TGGCGACTCCGGCATGGAGTCATGCCAAGGGTCAATGGGTAGTAGCCATTTTGGCGCTAC
TTGTTGGCTCGGAAATCACCTCCACCACCTTACTACTACCATTCACCGCCTCCTCCGGTG
AAGTCCCCACCACCA***TACTATTACAACTCTCCACCACCACCAGTAAAATCTCCTCCA
CCTCCAGTATACATCTACGCTTCTCCCCCACCTCCTACCCATTACTAGGCTCATCAAATT
CAACAAAATTTCCGCTTTATTCAAGTTTTCTTTCTAAAAATGAAATAAAGGAAGGGTCAA
AGTCAAAGATGAGAAGAAGTGAACCAAATAAGGATCGTCTCGTGGAAACCCTGAACAATA
CATCTCCAACAATGATCCACATCACTTCCTCTTCTTCAATGTCGCTCATCTTCCACTTCT
GCATTATCATCTTCGCGTCTTCGTCAAGTCGATTGTTTCCAAGACCCTTT*AGATCGTAT
CATAGTACTTTTCTTTGTAACCTTTTTTTATCGTTATTTATTTGTTGTGCATACATTTTC
TATCTATTTTTTTATGTAATGAGTGAGGTGTTAGCAAAT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2F914JQ 550 0 0
GCTCCCCCACCAGT
GAAATCACCTCCACCACCTTACTACTACCATTCACCGCCTCCTCCGGTGAAGTCCCCACC
ACCACCATACTATTACAACTCTCCACCACCACCAGTAAAATCTCCTCCACCTCCAGTATA
CATCTACGCTTCTCCCCCACCTCCTACCCATTACTAGGCTCATCAAATTCAACAAAATTT
CCGCTTTATTCAAGTTTTCTTTCTAAAAATGAAATAAATGAAGGGTCAAAGTCAAAGATG
AGAAGAAGTGAACCAAATAAGGATCGTCTCGTGGAAACCCTGAACAATACATCTCCAACA
ATGATCCACATCACTTCCTCTTCTTCAATGTCGCTCATCTTCCACTTCTGCATTATCATC
TTCGCGTCTTCGTCAAGTCGATTGTTTCCAAGACCCTTTTAGATCGTATCATAGTACTTT
TCTTTGTAACCTTTTTTTATCGTTATTTATTTGTTGTGCATACATTTTCTATCTATTTTT
TTATGTAATGAGTGAGGTGTTAGCAAATAAAAAAGATGTTCAGTTTCGTGTTTCAT

QA 15 550 15 550
DS 

RD RR2F914TF 550 0 0
GCTCCCCCACCAGT
GAAATCACCTCCACCACCTTACTACTACCATTCACCGCCTCCTCCGGTGAAGTCCCCACC
ACCACCATACTATTACAACTCTCCACCACCACCAGTAAAATCTCCTCCACCTCCAGTATA
CATCTACGCTTCTCCCCCACCTCCTACCCATTACTAGGCTCATCAAATTCAACAAAATTT
CCGCTTTATTCAAGTTTTCTTTCTAAAAATGAAATAAATGAAGGGTCAAAGTCAAAGATG
AGAAGAAGTGAACCAAATAAGGATCGTCTCGTGGAAACCCTGAACAATACATCTCCAACA
ATGATCCACATCACTTCCTCTTCTTCAATGTCGCTCATCTTCCACTTCTGCATTATCATC
TTCGCGTCTTCGTCAAGTCGATTGTTTCCAAGACCCTTTTAGATCGTATCATAGTACTTT
TCTTTGTAACCTTTTTTTATCGTTATTTATTTGTTGTGCATACATTTTCTATCTATTTTT
TTATGTAATGAGTGAGGTGTTAGCAAATAAAAAAGATGTTCAGTTTCGTGTTTCAT

QA 15 550 15 550
DS 



AS 1 2

CO CL3185Contig1 1156 2 2 U
GGTATTTGGCGAATCAAATATCATGGTATAAGAAAGAATCATTCTGATTAGTTGATAATT
TTGTGAAAGATTCCTGTGAAAAAGGTTAATTAAATCTATTCCTAATTTATGTCGAGTAGA
CCTTGTTGTTTTGTTTTATTGCAAGAATTCTAAATTCATGACTTGTAGGGAGGGACTTAT
GTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGAGTATAA
ATTGAATTATTATACTCTTGAATATGAAACTAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCG
AGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCTGCGGTAGCTGCTGAATC
TTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGACCGTTACAA
AGGCCGATGCTACCATATCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTTATTGCGTATGT
AGCTTACCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGGTCTGTTACTAACATGTTTACCTCAATTGT
GGGTAACGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCGAATCCC
TCCGGCTTATACTAAAACTTTCCAGGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATAA
ATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCTAAGTTGGGGTTATC
CGCGAAGAACTACGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAA
AGATGATGAGAATGTGAACTCTCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTG
AGCCGAAGCTGATAAAATGGAGATGTCACCTGGAAAAATCTCTGAAATCATTCGTCCGGT
AACTCTCCCACTGCTTTATTAGCCACCTTAAATTCCAAAACTTGTGAGTTGTGACTAAAA
ACAAAAATAAGTCACCTAATTATTCCCCTAGAAGGGTGAACGTTGTATATCTTCACTCTC
TTTGGCTGAGAGACCTCGTGTGTAAAATCTACAGGTTAGATTTTAAAAAAATATATATAT
GTAAGACATGAATTGCGGATCTTTGTACCTTCTTCGAGAGAAATTGCAGAGAGTTTGTGT
GTTTGTCTCTTCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO09TF U 1
AF RR2EY18TF U 624
BS 1 683 RR2DO09TF
BS 684 1156 RR2EY18TF

RD RR2DO09TF 694 0 0
GGTATTTGGCGAATCAAATATCATGGTATAAGAAAGAATCATTCTGATTAGTTGATAATT
TTGTGAAAGATTCCTGTGAAAAAGGTTAATTAAATCTATTCCTAATTTATGTCGAGTAGA
CCTTGTTGTTTTGTTTTATTGCAAGAATTCTAAATTCATGACTTGTAGGGAGGGACTTAT
GTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGAGTATAA
ATTGAATTATTATACTCTTGAATATGAAACTAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCG
AGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCTGCGGTAGCTGCTGAATC
TTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGACCGTTACAA
AGGCCGATGCTACCATATCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTTATTGCGTATGT
AGCTTACCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGGTCTGTTACTAACATGTTTACCTCAATTGT
GGGTAACGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCGAATCCC
TCCGGCTTATACTAAAACTTTCCAGGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATAA
ATTGAACAAGTATGGACGTCCCC
AAGTCTGTGAT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2EY18TF 533 0 0
G
GGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGACGTCCCCT
ATTAGGATGTACTATTAAACCTAAGTTGGGGTTATCCGCGAAGAACTACGGTAGAGCAGT
TTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAGAATGTGAACTCTCA
ACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGAGCCGAAGCTGATAAAATGGAGAT
GTCACCTGGAAAAATCTCTGAAATCATTCGTCCGGTAACTCTCCCACTGCTTTATTAGCC
ACCTTAAATTCCAAAACTTGTGAGTTGTGACTAAAAACAAAAATAAGTCACCTAATTATT
CCCCTAGAAGGGTGAACGTTGTATATCTTCACTCTCTTTGGCTGAGAGACCTCGTGTGTA
AAATCTACAGGTTAGATTTTAAAAAAATATATATATGTAAGACATGAATTGCGGATCTTT
GTACCTTCTTCGAGAGAAATTGCAGAGAGTTTGTGTGTTTGTCTCTTCTGTC

QA 2 533 2 533
DS 



AS 1 3

CO CL3186Contig1 909 3 11 U
AAGAAAAATCACAAATCATAAACACAAAGATTAGAGTTATATCACAAGTCCGTTGCCTTT
TCTTTTGGACGCAAACAAACCCATTAAACAACTTATTGCACGAAAAAACATTTAAAAAAA
TACGTATAATCGAAAATAGTCACTGTCCTGAGAAGCTCTTGTTCTTTCTTTTTTTTTTTC
CTTTTTGAAGAAACACAAACATTTTTCTACTTCCAAATCTTTACGGATTTGTCATGACTT
GCAGACGCCATCATTCCTGTCATAGGTGACTGAGCTAATGCAGAGATGACACACTCGTGA
GCCGGTATCGTCATACATTTGTTCTCTTTTGTGTTCCACAGCTCCAGCGACTGGTAGCCA
CCAATGACCAAGAGATTGGGATAAGTAGGGTGAAAAACACAAGAGTGGAACTTGTTCCCA
CTAGAGCTGAGCTCGTGGATGCAATCTCCTGAGCTCAGAGACCATAGTTTAACAGAGTCT
TCGCTAACAGAAGCTATCAACTCTCCGTTTGGGTTCCAACAAACAGAATTCACATCTGAG
GAATGCCCCTTAAACAAGTGGACGCGTCTGTCATTATCATAATCATAAATTGACACAGTG
TTTTCCGAAGCTGCAGCAAGCATTTGTCCAAATCTTGGCTGGAACCGAACCTGCGTGCTA
GCACCCTTTATAACACGAAGGCAATTAGCAGCTTTGATGCTCCAGAAGCGAATCTCGCTG
TTGCCATCACAAGAGCAGAAAAGGTCTGTCTTGTTAGGGTGAAAATCAAGGGACATTACA
GGTGCGGTATGACCAGATATCGTTCTCACAAAGTAACCAGGCTCAGACGCATCCCAGATT
TTGATAGTTTTGTCGAAGGACGACGTAGCGAGTTGAGTTGAATTAGGTCTGAAGCGAACA
TCTGTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE52JQ U 1
AF RR2DE05JQ U 187
AF RR2DE05TF C 182
BS 1 199 RR2EE52JQ
BS 200 200 RR2DE05JQ
BS 201 344 RR2EE52JQ
BS 345 345 RR2DE05JQ
BS 346 375 RR2EE52JQ
BS 376 376 RR2DE05JQ
BS 377 423 RR2EE52JQ
BS 424 424 RR2DE05JQ
BS 425 456 RR2EE52JQ
BS 457 604 RR2DE05JQ
BS 605 909 RR2DE05TF

RD RR2EE52JQ 456 0 0
AAGAAAAATCACAAATCATAAACACAAAGATTAGAGTTATATCACAAGTCCGTTGCCTTT
TCTTTTGGACGCAAACAAACCCATTAAACAACTTATTGCACGAAAAAACATTTAAAAAAA
TACGTATAATCGAAAATAGTCACTGTCCTGAGAAGCTCTTGTTCTTTCTTTTTTTTTTTC
CTTTTTGAAGAAACACAAATATTTTTCTACTTCCAAATCTTTACGGATTTGTCATGACTT
GCAGACGCCATCATTCCTGTCATAGGTGACTGAGCTAATGCAGAGATGACACACTCGTGA
GCCGGTATCGTCATACATTTGTTCTCTTTTGTGTTCCACAGCTCTAGCGACTGGTAGCCA
CCAATGACCAAGAGACTGGGATAAGTAGGGTGAAAAACACAAGAGTGGAACTTGTTCCCA
CTAAAGCTGAGCTCGTGGATGCAATCTCCTGAGCTC

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR2DE05JQ 418 0 0
GAAGAAACACAAACATTTTTCTACTTCCAAATCTTTACGGATTTGTCATGACTTGCAGAC
GCCATCATTCCTGTCATAGGTGACTGAGCTAATGCAGAGATGACACACTCGTGAGCCGGT
ATCGTCATACATTTGTTCTCTTTTGTGTTCCACAGCTCCAGCGACTGGTAGCCACCAATG
ACCAAGAGATTGGGATAAGTAGGGTGAAAAACACAAGAGTGGAACTTGTTCCCACTAGAG
CTGAGCTCGTGGATGCAATCTCCTGAGCTCAGAGACCATAGTTTAACAGAGTCTTCGCTA
ACAGAAGCTATCAACTCTCCGTTTGGGTTCCAACAAACAGAATTCACATCTGAGGAATGC
CCCTTAAACAAGTGGACGCGTCTGTCATTATCATAATCATAAATTGACACAGTGTTTT

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR2DE05TF 728 0 0
TTTTT
GAAGAAACACAAACATTTT*CTACTTCCAAATCTT*ACGGATTTGTCATGACTTGCAGAC
GCCATCATTCCTGTCATAGGTGACTGAGCTAATGCAGAGATGACACACTCGTGAGCCGGT
ATCGTCATACATTTGTTCTCTTTTGTGTTCCACAGCTCCAGCGACTGGTAGCCACCAATG
ACCAAGAGATTGGGATAAGTAGGGTGAAAAACACAAGAGTGGAACTTGTTCCCACTAGAG
CTGAGCTCGTGGATGCAATCTCCTGAGCTCAGAGACCATAGTTTAACAGAGTCTTCGCTA
ACAGAAGCTATCAACTCTCCGTTTGGGTTCCAACAAACAGAATTCACATCTGAGGAATGC
CCCTTAAACAAGTGGACGCGTCTGTCATTATCATAATCATAAATTGACACAGTGTTTTCC
GAAGCTGCAGCAAGCATTTGTCCAAATCTTGGCTGGAACCGAACCTGCGTGCTAGCACCC
TTTATAACACGAAGGCAATTAGCAGCTTTGATGCTCCAGAAGCGAATCTCGCTGTTGCCA
TCACAAGAGCAGAAAAGGTCTGTCTTGTTAGGGTGAAAATCAAGGGACATTACAGGTGCG
GTATGACCAGATATCGTTCTCACAAAGTAACCAGGCTCAGACGCATCCCAGATTTTGATA
GTTTTGTCGAAGGACGACGTAGCGAGTTGAGTTGAATTAGGTCTGAAGCGAACATCTGTG
ATC

QA 6 728 6 728
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3188Contig1 1186 2 8 U
ATAAAACAGGTTCTGTCTTATTGATGTTGTTCATTTATTAGTTAACGTTTATAGATGTTA
CAATGATTAGGAACAACCAGACTGTAATCTTGGTACAAACACCTTGTACCAAAACCGAAT
CGCCACTCACTGAATCTGTAAATTCTCTGCTTCGTATCTAACAAAATCAAACAGTTTGGT
AGATAAATAACGTTCTCCTCCGCTGGGGAAAATTACCGCAATGAGTTTGCCTGCGTTTTC
TGGCCGCTTTGCAACCTTCAACGCAGCAGCAGCTGCTGCTCCAGAGGATATTCCCACCAA
CAATCCTTCTTTGAGAGCAAGAAGCTTGGCTGTTTCAATAGCTTCCTCACCCGTCACTTG
AATGATTTCATCAACAATGGTTAAATCCAAATTGGCTGGTATGATACCAGCACCAATTCC
TTGGATCAAATGTCGACCTGGTTCTCCTCCGCTGAGTACTGGACTTTCCGTAGGTTCCAC
AGCACAAACCTTAATGTCTTTATTCATCTCCTTAAGAAACTTCCCAACTCCAGTAACCGT
TCCACCAGTTCCAACACCAGCAACAAAAATATCTACTTTCCCTGCTGAATCTCTCCATAT
CTCCGGACCAGTGGTTTGGTAATGAATCCCAGGGTTTGCAGGGTTTTCAAACTGCTGTGG
AACGAAACCACCAGGAGTTTTGTTTAGTATCTCTTCGGTTTTCTCCAACAATCCTTTAAT
GCCTATGCTCATATCTGTGAGATGAAGCTCTGCACCTAAAGCTTTTAGAATGACTCTCCT
CTCTAAGCTCATCGTTGAAGGCATCAGAAGGGTTACTTTATAGCCTCTTGCTGCTCCTAT
GCAGGCTAAACCGATGCCAGTGTTACCAGCCGTTGGCTCTATCAATGTACTCTCTCCAGG
CTTAATCAATCCTTTCTCTTCTGCATCTTTGATCATACTATAAGCGATTCCGTCTTTGAC
GCTAGAGCAAGGCTGCATCATCTCAAGCTTGGCGGCTATACGTGCTACACAACCGTCCAC
AACCTTGTTCAGATACACCATTGGTGTGTTACCAATCAATTCAGCGACGTCGTTCTTGAT
CATGCAACGGTCTTCCATACTGGTCGCTCTTTAAAACTCCTTTATAGTTTGGAGGATAGT
ATCAGTGACAAGAGAAAATGAGCCGATGATTCTCTAAATCAACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ01JQ U 1
AF RR2B744TF C 349
BS 1 468 RR2BZ01JQ
BS 469 469 RR2B744TF
BS 470 510 RR2BZ01JQ
BS 511 511 RR2B744TF
BS 512 654 RR2BZ01JQ
BS 655 655 RR2B744TF
BS 656 683 RR2BZ01JQ
BS 684 1186 RR2B744TF

RD RR2BZ01JQ 683 0 0
ATAAAACAGGTTCTGTCTTATTGATGTTGTTCATTTATTAGTTAACGTTTATAGATGTTA
CAATGATTAGGAACAACCAGACTGTAATCTTGGTACAAACACCTTGTACCAAAACCGAAT
CGCCACTCACTGAATCTGTAAATTCTCTGCTTCGTATCTAACAAAATCAAACAGTTTGGT
AGATAAATAACGTTCTCCTCCGCTGGGGAAAATTACCGCAATGAGTTTGCCTGCGTTTTC
TGGCCGCTTTGCAACCTTCAACGCAGCAGCAGCTGCTGCTCCAGAGGATATTCCCACCAA
CAATCCTTCTTTGAGAGCAAGAAGCTTGGCTGTTTCAATAGCTTCCTCACCCGTCACTTG
AATGATTTCATCAACAATGGTTAAATCCAAATTGGCTGGTATGATACCAGCACCAATTCC
TTGGATCAAATGTCGACCTGGTTCTCCTCCGCTGAGTACTGGACTTTCTGTAGGTTCCAC
AGCACAAACCTTAATGTCTTTATTCATCTCTTTAAGAAACTTCCCAACTCCAGTAACCGT
TCCACCAGTTCCAACACCAGCAACAAAAATATCTACTTTCCCTGCTGAATCTCTCCATAT
CTCCGGACCAGTGGTTTGGTAATGAATCCCAGGGTTTGCAGGGTTTTCAAACTGTTGTGG
AACGAAACCACCAGGAGTTTTGT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2B744TF 838 0 0
CACT
GTCACTTGAATGATTTCATCAACAATGGTTAAATCCAAATTGGCTGGTATGATACCAGCA
CCAATTCCTTGGATCAAATGTCGACCTGGTTCTCCTCCGCTGAGTACTGGACTTTCCGTA
GGTTCCACAGCACAAACCTTAATGTCTTTATTCATCTCCTTAAGAAACTTCCCAACTCCA
GTAACCGTTCCACCAGTTCCAACACCAGCAACAAAAATATCTACTTTTCCTGCTGAATCT
CTCCATATCTCCGGACCAGTGGTTTGGTAATGAATCTCAGGGTTTGCAGGGTTTTCAAAC
TGCTGTGGAACGAAACCACCAGGAGTTTTGTTTAGTATCTCTTCGGTTTTCTCCAACAAT
CCTTTAATGCCTATGCTCATATCTGTGAGATGAAGCTCTGCACCTAAAGCTTTTAGAATG
ACTCTCCTCTCTAAGCTCATCGTTGAAGGCATCAGAAGGGTTACTTTATAGCCTCTTGCT
GCTCCTATGCAGGCTAAACCGATGCCAGTGTTACCAGCCGTTGGCTCTATCAATGTACTC
TCTCCAGGCTTAATCAATCCTTTCTCTTCTGCATCTTTGATCATACTATAAGCGATTCCG
TCTTTGACGCTAGAGCAAGGCTGCATCATCTCAAGCTTGGCGGCTATACGTGCTACACAA
CCGTCCACAACCTTGTTCAGATACACCATTGGTGTGTTACCAATCAATTCAGCGACGTCG
TTCTTGATCATGCAACGGTCTTCCATACTGGTCGCTCTTTAAAACTCCTTTATAGTTTGG
AGGATAGTATCAGTGACAAGAGAAAATGAGCCGATGATTCTCTAAATCAACCCC

QA 5 838 5 838
DS 



AS 1 3

CO CL3189Contig1 740 3 14 U
GGCTCAAGTTCTTGAAACATATAAACTTCATGATTACAAGCAAAATAGTATTTTATAGAA
ATACAAATTGGTAGGAAGAAGAGACATGCCATGCCGGTACACATTTTCATAGTCTTCTGT
GTGTTCTAATGAAGTTATTGGTGTTCATTTGTATAGCTCTTAAGCAAGCATAAGCTGAAG
CTGAGCACAACGCAGCTGAACCTAACAGTACAGCCTTCCACTGCCTACTAACCACCAGAA
TGGCCAAAGCCGTCAAGGCCACGGCTGTGCCAAAGAGGATATTTTTCCAGAGTTCAAAAG
ATTTGATCACTTTGCTGCAGCTTCTACAATGGATCACATGTCTGAAGTAGCGGTTAGCCA
AATTGGGAGCCTGCATAGTACCAACTCCACCTTTTGCAGGATAAGAAGCCGAAAGACCTG
CAATGAGTCCCGCAGGGGCGTGTTCCACCACAGGAGGGACCTTCGGGAGAGAGATTGTCC
TATGCCCGAAATGGTAAGGCATCCCATGACCAACTTTGTCCATCCACTTTCTATATTCAG
CAACCCACGTGTCTGATGACTTCAGGTTAAGATACAACTCCTTTGTTGGTACTTTCTCCT
TCATCAAAACCTCGTTTTGTGACGATAGAAACCCCATGTCCTGTTCAAAGACCTTGCATG
CATTCTGATGCCAGAACCATAGAGGTAACACCTGTACTAAAGGCGATCTTTTCGTGACAC
CAAACCTAACTATAAGCATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN84JQ U 1
AF RR2D881JQ U 479
AF RR2EN43JQ U 14
BS 1 220 RR2DN84JQ
BS 221 221 RR2EN43JQ
BS 222 376 RR2DN84JQ
BS 377 377 RR2EN43JQ
BS 378 379 RR2DN84JQ
BS 380 380 RR2EN43JQ
BS 381 412 RR2DN84JQ
BS 413 413 RR2EN43JQ
BS 414 444 RR2DN84JQ
BS 445 445 RR2EN43JQ
BS 446 450 RR2DN84JQ
BS 451 576 RR2EN43JQ
BS 577 577 RR2D881JQ
BS 578 740 RR2EN43JQ

RD RR2DN84JQ 450 0 0
GGCTCAAGTTCTTGAAACATATAAACTTCATGATTACAAGCAAAATAGTATTTTATAGAA
ATACAAATTGGTAGGAAGAAGAGACATGCCATGCCGGTACACATTTTCATAGTCTTCTGT
GTGTTCTAATGAAGTTATTGGTGTTCATTTGTATAGCTCTTAAGCAAGCATAAGCTGAAG
CTGAGCACAACGCAGCTGAACCTAACAGTACAGCCTTCCATTGCCTACTAACCACCAGAA
TGGCCAAAGCCGTCAAGGCCACGGCTGTGCCAAAGAGGATATTTTTCCAGAGTTCAAAAG
ATTTGATCACTTTGCTGCAGCTTCTACAATGGATCACATGTCTGAAGTAGCGGTTAGCCA
AATTGGGAGCCTGCATTGTGCCAACTCCACCTTTTGCAGGATAAGAAGCCGAGAGACCTG
CAATGAGTCCCGCAGGGGCGTGTTTCACCA

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR2D881JQ 141 0 0
ACCTGCAATGAGTCCCGC
AGGCATCCCATGACCAACTTTGTCCATCCACTTTCTATATTCAGCAACCCACGTGTCTGA
TGACTTCAGGTTAAGATACAACTCCTTTGTTGGTACTTTCTCCTTCATCAAAACCTCGTT
TTG

QA 19 141 19 141
DS 

RD RR2EN43JQ 727 0 0
GC
AACATATAAACTTCATGATTACAAGCAAAATAGTATTTTATAGAAATACAAATTGGTAGG
AAGAAGAGACATGCCATGCCGGTACACATTTTCATAGTCTTCTGTGTGTTCTAATGAAGT
TATTGGTGTTCATTTGTATAGCTCTTAAGCAAGCATAAGCTGAAGCTGAGCACAACGCAG
CTGAACCTAACAGTACAGCCTTCCACTGCCTACTAACCACCAGAATGGCCAAAGCCGTCA
AGGCCACGGCTGTGCCAAAGAGGATATTTTTCCAGAGTTCAAAAGATTTGATCACTTTGC
TGCAGCTTCTACAATGGATCACATGTCTGAAGTAGCGGTTAGCCAAATTGGGAGCCTGCA
TAGTACCAACTCCACCTTTTGCAGGATAAGAAGCCGAAAGACCTGCAATGAGTCCCGCAG
GGGCGTGTTCCACCACAGGAGGGACCTTCGGGAGAGAGATTGTCCTATGCCCGAAATGGT
AAGGCATCCCATGACCAACTTTGTCCATCCACTTTCTATATTCAGCAACCCACGTGTCTG
ATGACTTCAGGTTAAGATACAGCTCCTTTGTTGGTACTTTCTCCTTCATCAAAACCTCGT
TTTGTGACGATAGAAACCCCATGTCCTGTTCAAAGACCTTGCATGCATTCTGATGCCAGA
ACCATAGAGGTAACACCTGTACTAAAGGCGATCTTTTCGTGACACCAAACCTAACTATAA
GCATA

QA 3 727 3 727
DS 



AS 1 3

CO CL3190Contig1 450 3 6 U
GGGAGACACGTCTCTCTCTCTCTCTCGTCTCTTCGCTCGTGTTCGAGATACATTGCATAA
ACCCTAGTTCTCCAGAAACCTAAGCTTTGTCCG*****ATTCGAGTGGATAATAATGGAT
CAACAACCAGAACCAGTTACTTACGTCTGCGAAGATTGTGGACAAGAAAACACTTTGAAG
TCAGGGGATGTGATCCAATGCAGAGAGTGTGGCTACCGTATTCTCTACAAGAAGCGTACC
CGTAGAGTTGTCCAGTACGAAGCTCGCTGAGAACCACAACTCACCCCGAAAGATGATTTG
AAAGTCTGTTAAGATGTCATAAAGGCTTTTCCTGCCTATGTTTTGTAATATAATTCAAAC
TCCACTTGAAATTCTTTTTCTTGTTTTTGTTTGATTTGGTTAACAATGAGTGTCACTTTA
TAACCCATTATTGGCTACATCTCTTGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2FB37TF U 1
AF RR2GF95JQ C 33
AF RR2GF95TF U 33
BS 1 93 RR2FB37TF
BS 94 98 RR2GF95TF
BS 99 151 RR2FB37TF
BS 152 152 RR2GF95TF
BS 153 447 RR2FB37TF
BS 448 450 RR2GF95JQ

RD RR2FB37TF 447 0 0
GGGAGACACGTCTCTCTCTCTCTCTCGTCTCTTCGCTCGTGTTCGAGATACATTGCATAA
ACCCTAGTTCTCCAGAAACCTAAGCTTTGTCCGGTCAGATTCGAGTGGATAATAATGGAT
CAACAACCAGAACCAGTTACTTACGTCTGCGGAGATTGTGGACAAGAAAACACTTTGAAG
TCAGGGGATGTGATCCAATGCAGAGAGTGTGGCTACCGTATTCTCTACAAGAAGCGTACC
CGTAGAGTTGTCCAGTACGAAGCTCGCTGAGAACCACAACTCACCCCGAAAGATGATTTG
AAAGTCTGTTAAGATGTCATAAAGGCTTTTCCTGCCTATGTTTTGTAATATAATTCAAAC
TCCACTTGAAATTCTTTTTCTTGTTTTTGTTTGATTTGGTTAACAATGAGTGTCACTTTA
TAACCCATTATTGGCTACATCTCTTGC

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR2GF95JQ 418 0 0
GG
GCTCGTGTTCGAGATACATTGCATAAACCCTAGTTCTCCAGAAACCTAAGCTTTGTCCG*
****ATTCGAGTGGATAATAATGGATCAACAACCAGAACCAGTTACTTACGTCTGCGAAG
ATTGTGGACAAGAAAACACTTTGAAGTCAGGGGATGTGATCCAATGCAGAGAGTGTGGCT
ACCGTATTCTCTACAAGAAGCGTACCCGTAGAGTTGTCCAGTACGAAGCTCGCTGAGAAC
CACAACTCACCCCGAAAGATGATTTGAAAGTCTGTTAAGATGTCATAAAGGCTTTTCCTG
CCTATGTTTTGTAATATAATTCAAACTCCACTTGAAATTCTTTTTCTTGTTTTTGTTTGA
TTTGGTTAACAATGAGTGTCACTTTATAACCCATTATTGGCTACATCTCTTGCTCC

QA 3 418 3 418
DS 

RD RR2GF95TF 418 0 0
GG
GCTCGTGTTCGAGATACATTGCATAAACCCTAGTTCTCCAGAAACCTAAGCTTTGTCCG*
****ATTCGAGTGGATAATAATGGATCAACAACCAGAACCAGTTACTTACGTCTGCGAAG
ATTGTGGACAAGAAAACACTTTGAAGTCAGGGGATGTGATCCAATGCAGAGAGTGTGGCT
ACCGTATTCTCTACAAGAAGCGTACCCGTAGAGTTGTCCAGTACGAAGCTCGCTGAGAAC
CACAACTCACCCCGAAAGATGATTTGAAAGTCTGTTAAGATGTCATAAAGGCTTTTCCTG
CCTATGTTTTGTAATATAATTCAAACTCCACTTGAAATTCTTTTTCTTGTTTTTGTTTGA
TTTGGTTAACAATGAGTGTCACTTTATAACCCATTATTGGCTACATCTCTTGC
TCC

QA 3 415 3 415
DS 



AS 1 2

CO CL3191Contig1 532 2 2 U
GTAATTCTTAATTTAAAATGTATCAACTAGTACTTGTGGGTGAACAAAGAGTTAAAATCT
AAAACCCAAAGTAACAGCTTTCCTCACAAAACAAGTCTTTTAACATACTAATCAATCCTC
CTCCCATATCTTATTCTGCATATTCTGGAGCTCCACCAGGCACCAAAATGGCGATGTTGT
TGCCGTTGAGCAGAATCTGATCAAGCTTTGTGACCCGACTTCCCTCTGCTGTAATCTCAT
ACTCGGTGACATCCTCAAGGACCATGTTGACGTAAACGTCGAAGCCTTTGAGAACACCAA
CGAGCTCCTTATCTCCTTTCATTATCACCCTTATCTTCGATCCTATGCACCTGTCGATTA
GCTCTGATGGAAGAAGCTGCGACGGATTGTTGCTCCGCCCATTTACGAAAGAAAGAGAAG
TAGGAGGAAAAAGAAAAAAGGCGGTTTTCCGAATTTTGGCTTCTGGCTCCCTGGCTCTGT
TCTTTGTTTTAAAGGCTTTTTTTTTTTTCTTCGAACTTTTGGATTTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW11JQ U 1
AF RR2A945TF C 333
BS 1 395 RR2FW11JQ
BS 396 532 RR2A945TF

RD RR2FW11JQ 410 0 0
GTAATTCTTAATTTAAAATGTATCAACTAGTACTTGTGGGTGAACAAAGAGTTAAAATCT
AAAACCCAAAGTAACAGCTTTCCTCACAAAACAAGTCTTTTAACATACTAATCAATCCTC
CTCCCATATCTTATTCTGCATATTCTGGAGCTCCACCAGGCACCAAAATGGCGATGTTGT
TGCCGTTGAGCAGAATCTGATCAAGCTTTGTGACCCGACTTCCCTCTGCTGTAATCTCAT
ACTCGGTGACATCCTCAAGGACCATGTTGACGTAAACGTCGAAGCCTTTGAGAACACCAA
CGAGCTCCTTATCTCCTTTCATTATCACCCTTATCTTCGATCCTATGCACCTGTCGATTA
GCTCTGATGGAAGAAGCTGCGACGGATTGTTGCTC
GCCATTTACGAAGAA

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR2A945TF 200 0 0
TCTTCGATC
CCTATGCACCTGTCGATTAGCTCTGATGGAAGAAGCTGCGACGGATTGTTGCTCCGCCCA
TTTACGAAAGAAAGAGAAGTAGGAGGAAAAAGAAAAAAGGCGGTTTTCCGAATTTTGGCT
TCTGGCTCCCTGGCTCTGTTCTTTGTTTTAAAGGCTTTTTTTTTTTTCTTCGAACTTTTG
GATTTTTTCCC

QA 10 200 10 200
DS 



AS 1 3

CO CL3192Contig1 743 3 16 U
GGACAAAACAATCTTCATCTCTCTACTCTCTCTTCTCGATGGCGAGCAACTGTAATTTAG
TGGGTGTTATAGGGCTACTTCTGGTACTTACACTGCTGCAGAACCCGGTCACTGTCGCCG
GACAAAGAAACTCGGGGGCGGCCTTGTTCACGTTCGGTGACTCCAACTTCGACGCTGGAA
ACAAACAGACTCTCACCAAAACTAGTGTTGCACAAGGTTTCTGGCCTTATGGAAAATCTC
GAGATGATCCCAACGGCAAATTCTCCGACGGTTTCATTGCTCCGGACTTCCTCGCAAAAT
TCATGGGTATTCCGATCGAGATTCCACCTGCACTTGTACCGAACGTCAATGTCTCACGTG
GAGCTAGTTTTGCAGTCGCTGACGCTACTCTCCTCGGAGCTCCGGTGGAATCTCTGACTT
TGAGTCAACAAGTGAGGAAATTCAATCAAATGAAGGCAAACTGGAGTGATGACTTCATCA
AGAAGTCCGCGTTTTTGATATACATTGGTGCAAATGATTACTTGAATTTCTCCAAGAACA
ACCCTAACGCCGATGCATCTGCCCAACAAGCTTTTGTCACTTCCGTGACCAACAAGTTGA
AGAACGATATTAGCTTGCTATATTCATCAGGATCTAGTAAGTTCATTATTCAAACCCTAG
CACCACTGGGTTGCTTACCAATCGTCAGACAAGAATACAAAACCGGGATGGAAAAATGCC
ATGAACCTCTCAACGATTTGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF23TF U 1
AF RR2CB07JQ C 318
AF RR2CB07TF U 318
BS 1 373 RR2EF23TF
BS 374 374 RR2CB07TF
BS 375 382 RR2EF23TF
BS 383 383 RR2CB07TF
BS 384 454 RR2EF23TF
BS 455 455 RR2CB07TF
BS 456 465 RR2EF23TF
BS 466 466 RR2CB07TF
BS 467 598 RR2EF23TF
BS 599 599 RR2CB07TF
BS 600 630 RR2EF23TF
BS 631 631 RR2CB07TF
BS 632 632 RR2EF23TF
BS 633 633 RR2CB07TF
BS 634 691 RR2EF23TF
BS 692 743 RR2CB07TF

RD RR2EF23TF 695 0 0
GGACAAAACAATCTTCATCTCTCTACTCTCTCTTCTCGATGGCGAGCAACTGTAATTTAG
TGGGTGTTATAGGGCTACTTCTGGTACTTACACTGCTGCAGAACCCGGTCACTGTCGCCG
GACAAAGAAACTCGGGGGCGGCCTTGTTCACGTTCGGTGACTCCAACTTCGACGCTGGAA
ACAAACAGACTCTCACCAAAACTAGTGTTGCACAAGGTTTCTGGCCTTATGGAAAATCTC
GAGATGATCCCAACGGCAAATTCTCCGACGGTTTCATTGCTCCGGACTTCCTCGCAAAAT
TCATGGGTATTCCGATCGAGATTCCACCTGCACTTGTACCGAACGTCAATGTCTCACGTG
GAGCTAGTTTTGCCGTCGCTGATGCTACTCTCCTCGGAGCTCCGGTGGAATCTCTGACTT
TGAGTCAACAAGTGAGGAAATTCAATCAAATGAAAGCAAACTGGAATGATGACTTCATCA
AGAAGTCCGCGTTTTTGATATACATTGGTGCAAATGATTACTTGAATTTCTCCAAGAACA
ACCCTAACGCCGATGCATCTGCCCAACAAGCTTTTGTCACTTCCGTGACCAACAAGTTAA
AGAACGATATTAGCTTGCTATATTCATCAG*AGCTAGTAAGTTCATTATTCAAACCCTAG
CACCACTGGGTTGCTTACCAATCGTCAGACA
GAAT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2CB07JQ 378 0 0
GAGATTCCACCTGCACTTGTACCGAACGTCAATGTCTCACGTGGAGCTAGTTTTGCAGTC
GCTGACGCTACTCTCCTCGGAGCTCCGGTGGAATCTCTGACTTTGAGTCAACAAGTGAGG
AAATTCAATCAAATGAAGGCAAACTGGAGTGATGACTTCATCAAGAAGTCCGCGTTTTTG
ATATACATTGGTGCAAATGATTACTTGAATTTCTCCAAGAACAACCCTAACGCCGATGCA
TCTGCCCAACAAGCTTTTGTCACTTCCGTGACCAACAAGTTGAAGAACGATATTAGCTTG
CTATATTCATCAGGATCTAGTAAGTTCATTATTCAAACCCTAGCACCACTGGGTTGCTTA
CCAATCGTCAGACA
AGAA

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR2CB07TF 426 0 0
GAGATTCCACCTGCACTTGTACCGAACGTCAATGTCTCACGTGGAGCTAGTTTTGCAGTC
GCTGACGCTACTCTCCTCGGAGCTCCGGTGGAATCTCTGACTTTGAGTCAACAAGTGAGG
AAATTCAATCAAATGAAGGCAAACTGGAGTGATGACTTCATCAAGAAGTCCGCGTTTTTG
ATATACATTGGTGCAAATGATTACTTGAATTTCTCCAAGAACAACCCTAACGCCGATGCA
TCTGCCCAACAAGCTTTTGTCACTTCCGTGACCAACAAGTTGAAGAACGATATTAGCTTG
CTATATTCATCAGGATCTAGTAAGTTCATTATTCAAACCCTAGCACCACTGGGTTGCTTA
CCAATCGTCAGACAAGAATACAAAACCGGGATGGAAAAATGCCATGAACCTCTCAACGAT
TTGGCT

QA 1 426 1 426
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3194Contig1 593 3 2 U
GGACTCAATATCTTACTTACACACATCTTCTTTTGCAAACCAACAGAAAATATAAGAGAA
AAATGGCTGCTGTAGTGAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCGTGATTGTGGCAGGTC
CCATCACATCGAACGCAGCTCTGACCTGTGGCACCGTTAACAGCAACGTGGCAGCGTGCA
TTGGCTACATAACCCAAGGTGGAACCCTTCCCCGAGCATGCTGCACCGGTGTTAGTAAGC
TTAACGGCATGGCCCGTTCAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGTCGTTGCCTTCAAACTG
CTGCTAGCGCCTTAGGCCCTAATCTCAACGCTGGCCGTGCAGCTGGAATTCCCAAGGCAT
GTGGAGTCAGTGTTCCTTTCCCAATCAGCACCAGCACCAACTGCAACAGCGTGAAATGAG
CGACGGTGTGATGAAGTTTTAGGGGAAGTTTCGGACATTATAGCATGTGGATCAGAATAT
TAAATAAGATGTTCGAATGGCTGTTTTAAAAATGTTTTATAGTTTCCTTTTTTTTATTAT
GGCGATCCTATGGACTGGTCTGTTTGTACTATGTTATCGAACAGCGTTATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR29TF U 1
AF RR2GT17JQB C 230
AF RR2GT17TF U 230
BS 1 506 RR2DR29TF
BS 507 593 RR2GT17TF

RD RR2DR29TF 506 0 0
GGACTCAATATCTTACTTACACACATCTTCTTTTGCAAACCAACAGAAAATATAAGAGAA
AAATGGCTGCTGTAGTGAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCGTGATTGTGGCAGGTC
CCATCACATCGAACGCAGCTCTGACCTGTGGCACCGTTAACAGCAACGTGGCAGCGTGCA
TTGGCTACATAACCCAAGGTGGAACCCTTCCCCGAGCATGCTGCACCGGTGTTAGTAAGC
TTAACGGCATGGCCCGTTCAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGTCGTTGCCTTCAAACTG
CTGCTAGCGCCTTAGGCCCTAATCTCAACGCTGGCCGTGCAGCTGGAATTCCCAAGGCAT
GTGGAGTCAGTGTTCCTTTCCCAATCAGCACCAGCACCAACTGCAACAGCGTGAAATGAG
CGACGGTGTGATGAAGTTTTAGGGGAAGTTTCGGACATTATAGCATGTGGATCAGAATAT
TAAATAAGATGTTCGAATGGCTGTTT

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2GT17JQB 328 0 0
G
GTTAGTAAGCTTAACGGCATGGCCCGTTCAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGTCGTTGC
CTTCAAACTGCTGCTAGCGCCTTAGGCCCTAATTTCAACGCTGGCCGTGCAGCTGGAATT
CCCAAGGCATGTGGAGTCAGTGTTCCTTTCCCAATCAGCACCAGCACCAACTGCAACAGC
GTGAAATGAGCGACGGTGTGATGAAGTTTTAGGGGAAGTTTCGGACATTATAGCATGTGG
ATCAGAATATTAAATAAGATGTTTGAATGGCTGTTTTAAAAATGTTTTATAGTTTCCTTT
TTTTTATTATGGCGATCCTATGGACTG

QA 2 328 2 328
DS 

RD RR2GT17TF 364 0 0
G
GTTAGTAAGCTTAACGGCATGGCCCGTTCAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGTCGTTGC
CTTCAAACTGCTGCTAGCGCCTTAGGCCCTAATCTCAACGCTGGCCGTGCAGCTGGAATT
CCCAAGGCATGTGGAGTCAGTGTTCCTTTCCCAATCAGCACCAGCACCAACTGCAACAGC
GTGAAATGAGCGACGGTGTGATGAAGTTTTAGGGGAAGTTTCGGACATTATAGCATGTGG
ATCAGAATATTAAATAAGATGTTCGAATGGCTGTTTTAAAAATGTTTTATAGTTTCCTTT
TTTTTATTATGGCGATCCTATGGACTGGTCTGTTTGTACTATGTTATCGAACAGCGTTAT
ATG

QA 2 364 2 364
DS 



AS 1 3

CO CL3195Contig1 1198 3 9 U
GAGTGCGATTGAGAGAAATCCAGATGATCATGATGCTTTATACAACTGGGCACTTATTCT
CCAGGAAAGTGCTGATAATGTCAGCCCAGATTCTGTTTCACCCTCTAAGGATGATTTGCT
CGAGGAAGCTTGTAAGAAGTACGATGAGGCTACCCGTCTCTGCCCTACCCTCTATGATGC
TTACTACAACTGGGCTATCGCAATCTCTGATAGAGCAAAGATGCGTGGTCGCACCAAGGA
AGCTGAAGAATTATGGCAACAGGCAACCAATAACTATGAAAAAGCTGTCCAGTTCAACTG
GAACAGTTCCCAGGCTTTAAACAACTGGGGACTGGCGTTGCAGGAACTCAGCCAAATTGT
CCCTGCCAGAGAGAAGGAAAAAGTGGTCAGAACTGCAATTAGCAAGTTTAGGGCGGCAAT
CAGGTTGCAATTTGATTTCCATCGAGCCATATACAACCTTGGAACCGTTCTGTATGGATT
AGCAGAAGACACACTTAGAACGGGGGGTTCAGGAAACGGAAAAGACATTCCTCCGGGTGA
GTTATACAGCCAATCTGCCATCTACATCGCTGCAGCTCATTCGTTGAAGCCAAGTTATTC
GGTTTACAGCAGTGCTTTGAGACTCGTTCGTTCCATGCTACCTCTTCCGCATCTTAAGGT
TGGATATCTGACGGCACCACCAGTGGGAAACTCACTCGCTCCTCACAGTGATTGGAAACG
CACGGAGTTTGAACTCAATCACGAGAGGCTTCTCCAGGTACTGAAACCTGAAGCAAGGGA
AATGGGGAGAAACCTGTCTGGAAAAGCGGAGACAATGAGCACAAACGTGGAGAAGAAGAC
GGTAAAAGTGAACATAACAGAGATAGTGTCAGTGACGACATGTGCTGATCTGACTCTACC
TCCTGGTGCTGGTCTCTGCATTGATACAGTTCATGGCCCAGTTTACTTGGTAGCAGATTC
ATGGGAGGCGTTGGATGGATGGCTGGATGCGATACGTTTGGTGTATACGATTTATGCGAG
AGGGAAGAGTGATGTTTTAGCCGGTATTATTACCGCTTAACTCTGCACACTTTCTTTCTT
TCTATTTCATACTTGGACTCTCTACTTTTTAAAGGTCATATATAGTTTCTATCTTTGTAT
TGACACCACCATAGCCAGCCAGATGTTTTGATTTTGTTTTTGCATGAATTCTCATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC28TF U 1
AF RR2DU84TF U 326
AF RR2FC28JQ C 557
BS 1 712 RR2FC28TF
BS 713 713 RR2DU84TF
BS 714 715 RR2FC28TF
BS 716 716 RR2DU84TF
BS 717 732 RR2FC28TF
BS 733 733 RR2DU84TF
BS 734 744 RR2FC28TF
BS 745 918 RR2DU84TF
BS 919 1198 RR2FC28JQ

RD RR2FC28TF 744 0 0
GAGTGCGATTGAGAGAAATCCAGATGATCATGATGCTTTATACAACTGGGCACTTATTCT
CCAGGAAAGTGCTGATAATGTCAGCCCAGATTCTGTTTCACCCTCTAAGGATGATTTGCT
CGAGGAAGCTTGTAAGAAGTACGATGAGGCTACCCGTCTCTGCCCTACCCTCTATGATGC
TTACTACAACTGGGCTATCGCAATCTCTGATAGAGCAAAGATGCGTGGTCGCACCAAGGA
AGCTGAAGAATTATGGCAACAGGCAACCAATAACTATGAAAAAGCTGTCCAGTTCAACTG
GAACAGTTCCCAGGCTTTAAACAACTGGGGACTGGCGTTGCAGGAACTCAGCCAAATTGT
CCCTGCCAGAGAGAAGGAAAAAGTGGTCAGAACTGCAATTAGCAAGTTTAGGGCGGCAAT
CAGGTTGCAATTTGATTTCCATCGAGCCATATACAACCTTGGAACCGTTCTGTATGGATT
AGCAGAAGACACACTTAGAACGGGGGGTTCAGGAAACGGAAAAGACATTCCTCCGGGTGA
GTTATACAGCCAATCTGCCATCTACATCGCTGCAGCTCATTCGTTGAAGCCAAGTTATTC
GGTTTACAGCAGTGCTTTGAGACTCGTTCGTTCCATGCTACCTCTTCCGCATCTTAAGGT
TGGATATCTGACGGCACCACCAGTGGGAAACTCACTCGCTCCTCACAGTGAT*GGGAACG
CACGGAGTTTGA*CTCAATCACGA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2DU84TF 593 0 0
G
GGGGACTGGCGTTGCAGGAACTCAGCCAAATTGTCCCTGCCAGAGAGAAGGAAAAAGTGG
TCAGAACTGCAATTAGCAAGTTTAGGGCGGCAATCAGGTTGCAATTTGATTTCCATCGAG
CCATATACAACCTTGGAACCGTTCTGTATGGATTAGCAGAAGACACACTTAGAACGGGGG
GTTCAGGAAACGGAAAAGACATTCCTCCGGGTGAGTTATACAGCCAATCTGCCATCTACA
TCGCTGCAGCTCATTCGTTGAAGCCAAGTTATTCGGTTTACAGCAGTGCTTTGAGACTCG
TTCGTTCCATGCTACCTCTTCCGCACCTTAAGGTTGGATATCTGACGGCACCACCAGTGG
GAAACTCACTCGCTCCTCACAGTGATTGGAAACGCACGGAGTTTGAACTCAATCACGAGA
GGCTTCTCCAGGTACTGAAACCTGAAGCAAGGGAAATGGGGAGAAACCTGTCTGGAAAAG
CGGAGACAATGAGCACAAACGTGGAGAAGAAGACGGTAAAAGTGAACATAACAGAGATAG
TGTCAGTGACGACATGTGCTGATCTGACTCTACCTCCTGGTGCTGGTCTCTG

QA 2 593 2 593
DS 

RD RR2FC28JQ 642 0 0
GCCATCTACATCGCTGCAGCTCATTCGTTGAAGCCAAGTTATTCGGTTTACAGCAGTGCT
TTGAGACTCGTTCGTTCCATGCTACCTCTTCCGCATCTTAAGGTTGGATATCTGACGGCA
CCACCAGTGGGAAACTCACTCGCTCCTCACAGTGATTGGAAACGCACGGAGTTTGAACTC
AATCACGAGAGGCTTCTCCAGGTACTGAAACCTGAAGCAAGGGAAATGGGGAGAAACCTG
TCTGGAAAAGCGGAGACAATGAGCACAAACGTGGAGAAGAAGACGGTAAAAGTGAACATA
ACAGAGATAGTGTCAGTGACGACATGTGCTGATCTGACTCTGCCTCCTGGTGCTGGTCTC
TGCATTGATACAGTTCATGGCCCAGTTTACTTGGTAGCAGATTCATGGGAGGCGTTGGAT
GGATGGCTGGATGCGATACGTTTGGTGTATACGATTTATGCGAGAGGGAAGAGTGATGTT
TTAGCCGGTATTATTACCGCTTAACTCTGCACACTTTCTTTCTTTCTATTTCATACTTGG
ACTCTCTACTTTTTAAAGGTCATATATAGTTTCTATCTTTGTATTGACACCACCATAGCC
AGCCAGATGTTTTGATTTTGTTTTTGCATGAATTCTCATTTT

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 3

CO CL3196Contig1 941 3 4 U
GTCTTAACCGTCATTAGTTCATATCATTGTTTAAGCATATATTAAAAGCTTAAAACCAAA
ATACATGCTACATTATCCATATAGTAAAAACTAATCTTTGACATTCTGCTTTTAACTAAA
AGAGTAGAGAAACTCATAAAAACAAGTAAAATCTACAGTTCGTCCTTGGTTGGTGTCTCT
TCCTCAACCTGTTCAGCTTCAATGTTTAGACCACTACCAGCCAAGTCATCTGATTTCGTC
TCAGCAGCCGCCTCCTCACTGGTCCCTGTTTCCTCTGCCTCAACTTCCTCTTCCGCTACA
GCATCAGGGCTGATATTCAGACTGCTCTTGACTGAGTTGTAGATACGCCCTGCAAAGTCT
TTTGGATCGATGAGTATGAATCCACTCTCTATCAAAGCCGTCTGG*ACATAAGCTGAGCT
GTTTCTTTCACACTCTCCTCCTCAGGGTCGCTAGCAACTCTTTCTTTGAGCTCTTTGATG
ATAGGGTGTCGTGGGTTAATCTCCAACACGCGCTTTCCACGCATGTAAGCTTGCTTGTTT
GCATCGGAAAGAGTCTGCGACTGTATGATCCTCTCCATGTTAGCACTCCACCCAAACTTG
GACGTCACAACCACACAGGGAGTGTCGGCCAACCGGTTGCTGATTTTAACATCGTCAACA
TTCTCGCTAGCGAGACTCTCTTTCCACCACTTGGTTAGCTCCTTGAACGCTTCCTTCAGT
TCCTTAACTTTCGAGTCTTTCCCAACCTTCAAGCCTTCTTTCGACACGTTCTGAAACTTC
TTGTCCTCGTAATCCATCAGGTACTGCATCAAGTACTCATCAACGGGGTCTGTGAAGAAG
ATGACCTCATAGCCCTTTTTGATGAGTCTCTCAAGGAACGGAGATTTCTCCAGCTGTTCC
TTGCTGCTTCCTGTGGTGTAGAATACGTCCTTTTGCCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS25JQ U 25
AF RR2B984JQ U 1
AF RR2B984TF C 169
BS 1 800 RR2B984JQ
BS 801 801 RR2B984TF
BS 802 875 RR2B984JQ
BS 876 941 RR2B984TF

RD RR2BS25JQ 691 0 0
CATTGTTTAAGCATATATTAAAAGCTTAAAACCAAAATACATGCTACATTATCCATATAG
TAAAAACTAATCTTTGACATTCTGCTTTTAACTAAAAGAGTAGAGAAACTCATAAAAACA
AGTAAAATCTACAGTTCGTCCTTGGTTGGTGTCTCTTCCTCAACCTGTTCAGCTTCAATG
TTTAGACCACTACCAGCCAAGTCATCTGATTTCGTCTCAGCAGCCGCCTCCTCACTGGTC
TCTGTTTCCTCTGCCTCAACTTCCTCTTCCGCTACAGCATCAGGGCTGATATTCAGACTG
CTCTTGACTGAGTTGTAGATACGCCCTGCAAAGTCTTTTGGATCGACGAGTATGAATCCA
CTCTCTATCAAAGCCGTCTGGTACATAAGCTGAGCTGTTTCTTTCACACTCTCCTCCTCA
GGGTCGCTAGCAACTCTTTCTTTGAGCTCTTTGATGATAGGGTGTCGTGGGTTAATCTCC
AACACGCGCTTTCCACGCATGTAAGCTTGCTTGTTTGCATCGGAAAGAGTCTGCGACTGC
ATGATCCTCTCCATGTTAGCACTCCACCCAAACTTGGACGTCATAACCACACAGGGAGTG
TCGGCCAACCGGTTGCTGATTTTAACATCGTCAACATTCTCGCTAGCGAGACTCTATT*C
CACCACTTGGTTAGCTCCTTGAACGCTTCCT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2B984JQ 877 0 0
GTCTTAACCGTCATTAGTTCATATCATTGTTTAAGCATATATTAAAAGCTTAAAACCAAA
ATACATGCTACATTATCCATATAGTAAAAACTAATCTTTGACATTCTGCTTTTAACTAAA
AGAGTAGAGAAACTCATAAAAACAAGTAAAATCTACAGTTCGTCCTTGGTTGGTGTCTCT
TCCTCAACCTGTTCAGCTTCAATGTTTAGACCACTACCAGCCAAGTCATCTGATTTCGTC
TCAGCAGCCGCCTCCTCACTGGTCCCTGTTTCCTCTGCCTCAACTTCCTCTTCCGCTACA
GCATCAGGGCTGATATTCAGACTGCTCTTGACTGAGTTGTAGATACGCCCTGCAAAGTCT
TTTGGATCGATGAGTATGAATCCACTCTCTATCAAAGCCGTCTGG*ACATAAGCTGAGCT
GTTTCTTTCACACTCTCCTCCTCAGGGTCGCTAGCAACTCTTTCTTTGAGCTCTTTGATG
ATAGGGTGTCGTGGGTTAATCTCCAACACGCGCTTTCCACGCATGTAAGCTTGCTTGTTT
GCATCGGAAAGAGTCTGCGACTGTATGATCCTCTCCATGTTAGCACTCCACCCAAACTTG
GACGTCACAACCACACAGGGAGTGTCGGCCAACCGGTTGCTGATTTTAACATCGTCAACA
TTCTCGCTAGCGAGACTCTCTTTCCACCACTTGGTTAGCTCCTTGAACGCTTCCTTCAGT
TCCTTAACTTTCGAGTCTTTCCCAACCTTCAAGCCTTCTTTCGACACGTTCTGAAACTTC
TTGTCCTCGTAATCCATCAG*TACTGCATCAAGTACTCATCAACGGGGTCTGTGAAGAAG
ATGACCTCATAGCCCTTTTTGATGAGTCTCTCAAG
AA

QA 1 875 1 875
DS 

RD RR2B984TF 773 0 0
GTTGGTGTCTCTTCCTCAACCTGTTCAGCTTCAATGTTTAGACCACTACCAGCCAAGTCA
TCTGATTTCGTCTCAGCAGCCGCCTCCTCACTGGTCCCTGTTTCCTCTGCCTCAACTTCC
TCTTCCGCTACAGCATCAGGGCTGATATTCAGACTGCTCTTGACTGAGTTGTAGATACGC
CCTGCAAAGTCTTTTGGATCGATGAGTATGAATCCACTCTCTATCAAAGCCGTCTGG*AC
ATAAGCTGAGCTGTTTCTTTCACACTCTCCTCCTCAGGGTCGCTAGCAACTCTTTCTTTG
AGCTCTTTGATGATAGGGTGTCGTGGGTTAATCTCCAACACGCGCTTTCCACGCATGTAA
GCTTGCTTGTTTGCATCGGAGAGAGTCTGCGACTGTATGATCCTCTCCATGTTAGCACTC
CACCCAAACTTGGACGTCACAACCACACAGGGAGTGTCGGCCAACCGGTTGCTGATTTTA
ACATCGTCAACATTCTCGCTAGCGAGACTCTCTTTCCACCACTTGGTTAGCTCCTTGAAC
GCTTCCTTCAGTTCCTTAACTTTCGAGTCTTTCCCAACCTTCAAGCCTTCTTTCGACACG
TTCTGAAACTTCTTGTCCTCGTAATCCATCAGGTACTGCATCAAGTACTCATCAACGGGG
TCTGTGAAGAAGATGACCTCATAGCCCTTTTTGATGAGTCTCTCAAGGAACGGAGATTTC
TCCAGCTGTTCCTTGCTGCTTCCTGTGGTGTAGAATACGTCCTTTTGCCCCCC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL3197Contig1 683 2 15 U
CGTGGAAAAACTAATAACATTCGCATACACATAAGACTTTACACAATCCAATTTTTTCGG
TTTGATTCAAAACATTAAAAGAAGATTCCATCAAATACTTTCAACATCCTTCAATGTCTC
TCCACTTGAGATACACAAGCCCTGCTCTATAATGCGTGAAGGCACAGGCAACCACCAAAA
CATGAAACAACTGATGGCTATGTCCAGCTATATCAAACTTACCAGGCATCCATCTCTCAG
GGATCCTAGTCGCATAAACCAAAGCTCCCAACCCGTAAAGCAACCCCATCAAAACCTCAT
ACCCCGTCGTGTGAAGCGCCTCGGGCTGGTCCCAAAAGATGATCAGCTTATGCAGGATCG
GCGCGGCGCCGGAAAATCCCATTCCAAAGAAAAAAGAGGCCCTCACTACACGAAACTCAG
GGCTCTGGAAGACGGGTAAGAACGAGACGAGGACCGTGGAGATTCCCAGGATTGTGATGA
ATCCTAAGTAGAGGTTGCAGAAGAAAGGATCACACATGAAAGAGTAGTAGACGGGAGGGT
AGAAGGAAGTGGAGATGAGAGCTGCGATTCCAGCGTAGTCAAGCCTAAGCATTATGTAAG
AGACACGCTCTGAATGACAGGAGAGGAGGTGGCAGGTGCTGCTTGCTAATAGACAGAACA
TAGCGCCGCCTAGGATTGCATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY69JQ U 67
AF RR2BT42JQ U 1
BS 1 77 RR2BT42JQ
BS 78 78 RR2CY69JQ
BS 79 81 RR2BT42JQ
BS 82 82 RR2CY69JQ
BS 83 165 RR2BT42JQ
BS 166 166 RR2CY69JQ
BS 167 373 RR2BT42JQ
BS 374 374 RR2CY69JQ
BS 375 391 RR2BT42JQ
BS 392 392 RR2CY69JQ
BS 393 393 RR2BT42JQ
BS 394 394 RR2CY69JQ
BS 395 441 RR2BT42JQ
BS 442 442 RR2CY69JQ
BS 443 683 RR2BT42JQ

RD RR2CY69JQ 430 0 0
TCAAAACATTAAAAGAAGATTCCATCAAATACTTTCAACATCCTTCAATGTCTCTCCACT
TGAGATACACAAGCCCTGCTCTATAATGCGTGAAGGCACAGGCAACCACCAAAACATGAA
ACAACTGATGGCTATGTCCAGCTATATCAAACTTACCAGGCATCCATCTCTCAGGGATCC
TAGTCGCATAAACCAAAGCTCCCAACCCGTAAAGCAACCCCATCAAAACCTCATACCCCG
TCGTGTGAAGCGCCTCGGGCTGGTCCCAAAAGATGATCAGCTTATGCAGGATCGGCGCGG
CGCCGGAAAATCCCATTCCAAAGAAAAAAGAGGCCCTCACTACACGAAACTCAGGGCTCT
GGAAGACGGGTAAGAACGAGACGAGGACCGTGGAGATTCCCAGGATTGTGATGAATCCTA
AGTAGAGGTT

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2BT42JQ 683 0 0
CGTGGAAAAACTAATAACATTCGCATACACATAAGACTTTACACAATCCAATTTTTTCGG
TTTGATTCAAAACATTAGAAGGAGATTCCATCAAATACTTTCAACATCCTTCAATGTCTC
TCCACTTGAGATACACAAGCCCTGCTCTATAATGCGTGAAGGCACCGGCAACCACCAAAA
CATGAAACAACTGATGGCTATGTCCAGCTATATCAAACTTACCAGGCATCCATCTCTCAG
GGATCCTAGTCGCATAAACCAAAGCTCCCAACCCGTAAAGCAACCCCATCAAAACCTCAT
ACCCCGTCGTGTGAAGCGCCTCGGGCTGGTCCCAAAAGATGATCAGCTTATGCAGGATCG
GCGCGGCGCCGGAGAATCCCATTCCAAAGAAGAGAGAGGCCCTCACTACACGAAACTCAG
GGCTCTGGAAGACGGGTAAGAGCGAGACGAGGACCGTGGAGATTCCCAGGATTGTGATGA
ATCCTAAGTAGAGGTTGCAGAAGAAAGGATCACACATGAAAGAGTAGTAGACGGGAGGGT
AGAAGGAAGTGGAGATGAGAGCTGCGATTCCAGCGTAGTCAAGCCTAAGCATTATGTAAG
AGACACGCTCTGAATGACAGGAGAGGAGGTGGCAGGTGCTGCTTGCTAATAGACAGAACA
TAGCGCCGCCTAGGATTGCATAG

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 3

CO CL3198Contig1 1058 3 7 U
GCAGTAACCCATATGATAATCAGTATCAACAATCATACACTAATTCTTATGGTGGAGAAT
ATGTGCCCACAGCTTCACATCCACCCATGCAACAAGCAACCATGTTTATGCCTCACCAAG
CTCAGCCAGCACCGCAGCCATCATATCCTCCGTCACATGCAAGCAATGCTCAACCATCCA
TGAGAACTACTTTTGTTCCTTCAACTCCCCCTGCACTGAAGAACGCAGACCAATATCAGC
AGCCTACCATTGGTTCTCATTCATTCACCGGACCATCTAACAATGCATACCCCGCTCCTC
CTGGTCCTGGTTCATATGCATCTTCTGGCCCTTCACAAATCGGGCAATATCCTAACCCCA
GAATGCCCCAAGTAGTTGGTCTAGGAGCTGGACCCGTAGGATTTACACCTATGTCAACTC
CAGGGGTTGCTCCAAGATCTGTTGTAGGTTCTGTGCAACCAGCAAGTCCTCCAACACATC
AGGCAGCTGCGCAGGCAGCCCCTGCTCCTGCAGCTCCTCCACCAACTGTTCAGACTACAG
ATACTTCCAACGTCCCAGCCCACCAGAAACCTGTGATAGCAACACTGACAAGGCTTTTCA
ATGAGACATCGGAAGCACTGGGAGGCGCACGTGCAAATCCTACCAAGAAGCGCGAGATAG
AAGACAACTCAAGGAAATTAGGTGCTTTGTTTGTGAGACTGAATAGCGGAGACATCTCCA
AGAATGCTGCCGATAAACTCGCACAGCTCTGCCATGCTCTGGACAATCATGACTTCGGTG
CAGCCCTTCAAATACAGGTACTTCTGACGACCAGCGAATGGGGATGAATGCAACTTCTGG
CTTTCCACATTGAAGCGGATGATCAAAAGCAGGCAAAATGTGCGGTGATTGCTTTTTATT
TTGGTCTTCATTTCTGGTCGGTAAAATTATAAATCCACAGGAGAGACGCGTGTATCAAAC
TCCTTCTGCTTTCCAGTCTTTTTTTTTCTCTTTTATATATACGTTTAAGAACTCGATTAC
CCAAATTTGTTTGAGATAAGATAGAATCAGATTGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E803TF U 1
AF RR2CK68TF U 454
AF RR2E803JQ C 311
BS 1 493 RR2E803TF
BS 494 494 RR2CK68TF
BS 495 536 RR2E803TF
BS 537 861 RR2CK68TF
BS 862 862 RR2E803JQ
BS 863 876 RR2CK68TF
BS 877 1058 RR2E803JQ

RD RR2E803TF 537 0 0
GCAGTAACCCATATGATAATCAGTATCAACAATCATACACTAATTCTTATGGTGGAGAAT
ATGTGCCCACAGCTTCACATCCACCCATGCAACAAGCAACCATGTTTATGCCTCACCAAG
CTCAGCCAGCACCGCAGCCATCATATCCTCCGTCACATGCAAGCAATGCTCAACCATCCA
TGAGAACTACTTTTGTTCCTTCAACTCCCCCTGCACTGAAGAACGCAGACCAATATCAGC
AGCCTACCATTGGTTCTCATTCATTCACCGGACCATCTAACAATGCATACCCCGCTCCTC
CTGGTCCTGGTTCATATGCATCTTCTGGCCCTTCACAAATCGGGCAATATCCTAACCCCA
GAATGCCCCAAGTAGTTGGTCTAGGAGCTGGACCCGTAGGATTTACACCTATGTCAACTC
CAGGGGTTGCTCCAAGATCTGTTGTAGGTTCTGTGCAACCAGCAAGTCCTCCAACACATC
AGGCAGCTGCGCACGCAGCCCCTGCTCCTGCAGCTCCTCCACCAACTGTTCAGACT
G

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2CK68TF 423 0 0
TGCAACCAGCAAGTCCTCCAACACATCAGGCAGCTGCGCAGGCAGCCCCTGCTCCTGCAG
CTCCTCCACCAACTGTTCAGACTACAGATACTTCCAACGTCCCAGCCCACCAGAAACCTG
TGATAGCAACACTGACAAGGCTTTTCAATGAGACATCGGAAGCACTGGGAGGCGCACGTG
CAAATCCTACCAAGAAGCGCGAGATAGAAGACAACTCAAGGAAATTAGGTGCTTTGTTTG
TGAGACTGAATAGCGGAGACATCTCCAAGAATGCTGCCGATAAACTCGCACAGCTCTGCC
ATGCTCTGGACAATCATGACTTCGGTGCAGCCCTTCAAATACAGGTACTTCTGACGACCA
GCGAATGGGGATGAATGCAACTTCTGGCTTTCCACATTGAAGCGGATGTTCAAAAGCAGG
CAA

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR2E803JQ 748 0 0
TTCATATGCATCTTCTGGCCCTTCACAAATCGGGCAATATCCTAACCCCAGAATGCCCCA
AGTAGTTGGTCTAGGAGCTGGACCCGTAGGATTTACACCTATGTCAACTCCAGGGGTTGC
TCCAAGATCTGTTGTAGGTTCTGTGCAACCAGCAAGTCCTCCAACACATCAGGCAGCTGC
GCAGGCAGCCCCTGCTCCTGCAGCTCCTCCACCAACTGTTCAGACTGCAGATACTTCCAA
CGTCCCAGCCCACCAGAAACCTGTGATAGCAACACTGACAAGGCTTTTCAATGAGGCATC
GGAAGCACTGGGAGGCGCACGTGCAAATCCTACCAAGAAGCGCGAGATAGAAGACAACTC
AAGGAAATTAGGTGCTTTGTTTGTGAGACTGAATATCGGAGACATCTCCAAGAATGCTGC
CGATAAACTCGCACAGCTCTGCCATGCTCTGGACAATCATGACTTCGGTGCAGCCCTTCA
AATACAGGTACTTCTGACGACCAGCGAATGGG*ATGAATGCAACTTCTGGCTTTCCACAT
TGAAGCGGATGATCAAAAGCAGGCAAAATGTGCGGTGATTGCTTTTTATTTTGGTCTTCA
TTTCTGGTCGGTAAAATTATAAATCCACAGGAGAGACGCGTGTATCAAACTCCTTCTGCT
TTCCAGTCTTTTTTTTTCTCTTTTATATATACGTTTAAGAACTCGATTACCCAAATTTGT
TTGAGATAAGATAGAATCAGATTGCTTC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL3199Contig1 516 2 3 U
GTCCTAGCAACAGTCCAGGAAGTTCAAAACATCATCCAAAAATCCTTAGCTGCACATGAC
AAACTGGAAGCATCGCTGCGTGATCTATCAAGAACCGGTGACATTCAAACCTGCAAAGCA
GCTCGCAAATCCACCGACAGTTTGCTCAAAGATCTCTCCAAAGAACTGAGACCTCTTCTG
GCTTCCTTACAATCTTTCCCATCAGCCTCTCAAATATTTCCAAAGGTTGAAGAGCTAGTT
GCGAAAGAGAGAGAACTTCAAGAGAAGTTGATGGCCAAACACACCACTGTTGTTGAAGGG
TACGAGAAGAAATCCTCAGGGCGTGATATCGAAAACCGAATCGCTTTTCAGCAGCAAAAA
ATCATAGCATTGAGGCAAGAAGTAGAAGATTTTTTAGAGTTCATTGATGAAATCTAGAAA
AAGTTATAAGTGTAGCAGATCCCTTTTAAGCTTAAAAACCAGACTTTTAGTTTATCATCA
ACTTTGAAAGACAGCTCTAGTTCCTTCACAACATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG21TF U 12
AF RR2BM85JQ C 1
BS 1 11 RR2BM85JQ
BS 12 206 RR2AG21TF
BS 207 516 RR2BM85JQ

RD RR2AG21TF 196 0 0
AGTCCAGGAAGTTCAAAACATCATCCAAAAATCCTTAGCTGCACATGACAAACTGGAAGC
ATCGCTGCGTGATCTATCAAGAACCGGTGACATTCAAACCTGCAAAGCAGCTCGCAAATC
CACCGACAGTTTGCTCAAAGATCTCTCCAAAGAACTGAGACCTCTTCTGGCTTCCTTACA
ATCTTTCCCATCAGC
C

QA 1 195 1 195
DS 

RD RR2BM85JQ 516 0 0
GTCCTAGCAACAGTCCAGGAAGTTCAAAACATCATCCAAAAATCCTTAGCTGCACATGAC
AAACTGGAAGCATCGCTGCGTGATCTATCAAGAACCGGTGACATTCAAACCTGCAAAGCA
GCTCGCAAATCCACCGACAGTTTGCTCAAAGATCTCTCCAAAGAACTGAGACCTTTTTTG
GCTTCCTTACAATCTTTCCCATCAGCCTCTCAAATATTTCCAAAGGTTGAAGAGCTAGTT
GCGAAAGAGAGAGAACTTCAAGAGAAGTTGATGGCCAAACACACCACTGTTGTTGAAGGG
TACGAGAAGAAATCCTCAGGGCGTGATATCGAAAACCGAATCGCTTTTCAGCAGCAAAAA
ATCATAGCATTGAGGCAAGAAGTAGAAGATTTTTTAGAGTTCATTGATGAAATCTAGAAA
AAGTTATAAGTGTAGCAGATCCCTTTTAAGCTTAAAAACCAGACTTTTAGTTTATCATCA
ACTTTGAAAGACAGCTCTAGTTCCTTCACAACATGA

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 3

CO CL3200Contig1 1300 3 5 U
GCGGGAAGCCATTGTTTCCGGAGAAAAGCGTTGCTCATCAGTTGGAGTTGATTACTGATC
TTCTTGGCACACCCAAATCAGAGACCATCTCTGGAGTTCGAAATGATAAAGCTAGAAAAT
ACTTGAGTGAAATGAGGAAGAAAGAACCAGTCACCTTCTCTCAAAAATTCTCCAAAGCAG
ATCCTTTAGCAGTCCGTCTTTTGCAAAGGCTGTTGGCTTTTGATCCAAAGGATAGACCTA
CTGCTGCAGAGGCGCTGGCTGATCCTTACTTTAAGGGTCTTGCTAAGATTGAAAGAGAAC
CATCGTGTCAGCCAATCTCGAAGATGGAGTCTGAGTTTGAGAGAAGACGGTTGACAAAGG
ACGACATTAGGGAACTTATCTACAGGGAGATATTGGAGTACCATCCTCAGTTGCTCAAGG
ACTATATCAGCGGTTCTGAGGGTTCCAGTTTTGTATATCCTAGCGCCATAGGACATCTTA
GGAAGCAGTTCAATTACTTAGAGGAGAATAGCAGTAGAAATGGGCCGGTTATACCTCCAG
AGAGGAAGCACGTTTCACTTCCTCGGTCTACAGTTCACTCAAGTGTAGTCCATTCCACTA
GCCAACCCAACTTGTGTGCAACGGAGAGTAGACGCGTTCATTTCGAGCAGCCTTCAAGAA
ATGGAGCAGGACCTCCACCAAGAGTACCACCACCATCTGGTAGACCATCTGCATGTTATG
AGAATGGCAGGAACCTCAAAGAAGCTTATTTCAGAAGCACAGTATCATCTCCTCACTGTT
ATTTCAAAGCAAACACCATGATGAGCACACCAGATAAAGCTTCTTCTCAGCCCAAACCGC
AATACAATCACACCGTGCCGCAACCACCTGCTAGGACTAACCAACCAAACGTCGAGACTA
TTATGAACCGCCCAAACCCTTATTTCCAGTCACAGCACCCCAAGATAGACCAATCAAGCA
ACAACAACAACAACACACATAGGGCCATTGATCTGTTGCAAGCACAAACACAGTTTGGTC
CAGCTGGAGCCGCAGCGGTTGCAGTAGCAGCACACCGGAACGTAGTAGGCACAGTCAGTT
ACGGTGCAGCGTCATAAACTCATCAAACAAACAACAACTCGAGATAGATCTTTAACCAAA
ACCAGGTGATTCCGGCACCAGCTTTTTTTCATGTAAAGTATTGTTATTCAGGCAGGCTTT
GATTCGATGTAATAAAGACATTCAGATGTAGTAACTCACAAGAACAAGGTTCGGTTTAAT
TAGATCAGTCTGATCCAGGGTTGTTACCTGTTATCGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B561TF U 1
AF RR2HB36TF U 221
AF RR2B561JQ C 540
BS 1 427 RR2B561TF
BS 428 428 RR2HB36TF
BS 429 665 RR2B561TF
BS 666 929 RR2HB36TF
BS 930 1300 RR2B561JQ

RD RR2B561TF 665 0 0
GCGGGAAGCCATTGTTTCCGGAGAAAAGCGTTGCTCATCAGTTGGAGTTGATTACTGATC
TTCTTGGCACACCCAAATCAGAGACCATCTCTGGAGTTCGAAATGATAAAGCTAGAAAAT
ACTTGAGTGAAATGAGGAAGAAAGAACCAGTCACCTTCTCTCAAAAATTCTCCAAAGCAG
ATCCTTTAGCAGTCCGTCTTTTGCAAAGGCTGTTGGCTTTTGATCCAAAGGATAGACCTA
CTGCTGCAGAGGCGCTGGCTGATCCTTACTTTAAGGGTCTTGCTAAGATTGAAAGAGAAC
CATCGTGTCAGCCAATCTCGAAGATGGAGTCTGAGTTTGAGAGAAGACGGTTGACAAAGG
ACGACATTAGGGAACTTATCTACAGGGAGATATTGGAGTACCATCCTCAGTTGCTCAAGG
ACTATATTAGCGGTTCTGAGGGTTCCAGTTTTGTATATCCTAGCGCCATAGGACATCTTA
GGAAGCAGTTCAATTACTTAGAGGAGAATAGCAGTAGAAATGGGCCGGTTATACCTCCAG
AGAGGAAGCACGTTTCACTTCCTCGGTCTACAGTTCACTCAAGTGTAGTCCATTCCACTA
GCCAACCCAACTTGTGTGCAACGGAGAGTAGACGCGTTCATTTCGAGCAGCCTTCAAGAA
ATGGA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2HB36TF 709 0 0
G
GATCCAAAGGATAGACCTACTGCTGCAGAGGCGCTGGCTGATCCTTACTTTAAGGGTCTT
GCTAAGATTGAAAGAGAACCATCGTGTCAGCCAATCTCGAAGATGGAGTTTGAGTTTGAG
AGAAGACGGTTGACAAAGGACGACATTAGGGAACTTATCTACAGGGAGATATTGGAGTAC
CATCCTCAGTTGCTCAAGGACTATATCAGCGGTTCTGAGGGTTCCAGTTTTGTATATCCT
AGCGCCATAGGACATCTTAGGAAGCAGTTCAATTACTTAGAGGAGAATAGCAGTAGAAGT
GGGCCGGTTATACCTCCAGAGAGGAAGCACGTCTCACTTCCTCGGTCTACAGTTCACTCA
AGTGTAGTCCATTCCACTAGCCAACCCAACTTGTGTGCAACGGAGAGTAGACGTGTTCAT
TTCGAGCAGCCTTCAAGAAATGGAGCAGGACCTCCACCAAGAGTACCACCACCATCTGGT
AGACCATCTGCATGTTATGAGAATGGCAGGAACCTCAAAGAAGCTTATTTCAGAAGCACA
GTATCATCTCCTCACTGTTATTTCAAAGCAAACACCATGATGAGCACACCAGATAAAGCT
TCTTCTCAGCCCAAACCGCAATACAATCACACCGTGCCGCAACCACCTGCTAGGACTAAC
CAACCAAACGTCGAGACTATTATGAACCGCCCAAACCCTTATTTCCAG

QA 2 709 2 709
DS 

RD RR2B561JQ 761 0 0
GAGAGGAAGCACGTTTCACTTCCTCGGTCTACAGTTCACTCAAGTGTAGTCCATTCCACT
AGCCAACCCAACTTGTGTGCAACGGAGAGTAGACGCGTTCATTTCGAGCAGCCTTCAAGA
AATGGAGCAGGACCTCCACCAAGAGTACCACCACCATCTGGTAGACCATCTGCATGTTAT
GAGAATGGCAGGAACCTCAAAGAAGCTTATTTCAGAAGCACAGTGTCATCTCCTCACTGT
TGTTTCAAAGCAAACACCATGATGAGCACACCAGATAAAGCTTTTTTTCAGCCCAAACCG
CAATACAATCACACCGTGCCGCAACCACCTGCTAGGACTAACCAACCAAACGTCGATACT
ATTATGAACCGCCCAAACCCTTATTTCCAGTCACAGCACCCCAAGATAGACCAATCAAGC
AACAACAACAACAACACACATAGGGCCATTGATCTGTTGCAAGCACAAACACAGTTTGGT
CCAGCTGGAGCCGCAGCGGTTGCAGTAGCAGCACACCGGAACGTAGTAGGCACAGTCAGT
TACGGTGCAGCGTCATAAACTCATCAAACAAACAACAACTCGAGATAGATCTTTAACCAA
AACCAGGTGATTCCGGCACCAGCTTTTTTTCATGTAAAGTATTGTTATTCAGGCAGGCTT
TGATTCGATGTAATAAAGACATTCAGATGTAGTAACTCACAAGAACAAGGTTCGGTTTAA
TTAGATCAGTCTGATCCAGGGTTGTTACCTGTTATCGTTTC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL3201Contig1 680 2 7 U
GGACACTACACTTGTTTACTCTCTTGAGCGGCACTCGGGGAATCAGGAAACCCTTTTGCT
TTGCTTGCTATTGCTATGGCTCGTCGTGAGGATCGTTCTCTTCCCAAAGACTCATATTGT
ACCATCGAGTTTGATGGTGCTTCAAGAGGAAGCCCAGGAAGAGCTGGTGCAGGAGCCGTT
CTCCGTGCTCCAGATAACACTGTGATCTACTCTTCTCGCGAGGGTTTGGGTTTTGCTACA
AACAATGTTGCTGAGTATCGAGCTCCCAATCTTGGCCTCGAGTCTGCTCTTAACCAAGGC
TTTACAAATGTGCGCGTACAGGGTGATTCACAGCTTGTCTGTAAGCAGGTTCGAGGTGAA
TGGGCAACCCGAGACCCGAAAATGACTCAGCTTTGTGGACAAGCACAGGAGCTTATGAGT
CAATTTAACTCATGCGATGTTCAACACGTTCCCAGGGAATTCAATTCAGCGGCTGATGCT
CAAGCTAACCGTGCAACCAATCTGGCAGAGGGTGAATATCAGCAAGATAATGCAGGCGGC
CGCTATGGAAGAAGGGGATACTAATATGCATATTCCTGTTTTCTTGTTTTTGGGATCATG
TCTTTTAGCATGTGCTATGTGCTAACATAAACATGAACCCACGATGATCTTATCTCTCTC
TCTCTTATGCTGTGTCCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E789TF U 256
AF RR2CY82TF U 1
BS 1 265 RR2CY82TF
BS 266 266 RR2E789TF
BS 267 374 RR2CY82TF
BS 375 375 RR2E789TF
BS 376 494 RR2CY82TF
BS 495 495 RR2E789TF
BS 496 680 RR2CY82TF

RD RR2E789TF 308 0 0
G
ATCGAGCTCCCAATCTTGGCCTCGAGTCTGCTCTTAACCAAGGCTTTACAAATGTGCGCG
TCCAGGGTGATTCACAGCTTGTCTGTAAGCAGGTTCGAGGTGAATGGGCAACCCGAGACC
CGAAAATGACTCAGCTTTGTGGACAAGCACAGGAGCTTATGAGTCAGTTTAACTCATGCG
ATGTTCAACACGTTCCCAGGGAATTCAATTCAGCGGCTGATGCTCAAGCTAACCGTGCAA
CCAATCTGGCAGAGGGTGAATATCAGCAAGATAATGCAGGCGGCCGCTATGGAAGAAGGG
GATACTA

QA 2 308 2 308
DS 

RD RR2CY82TF 680 0 0
GGACACTACACTTGTTTACTCTCTTGAGCGGCACTCGGGGAATCAGGAAACCCTTTTGCT
TTGCTTGCTATTGCTATGGCTCGTCGTGAGGATCGTTCTCTTCCCAAAGACTCATATTGT
ACCATCGAGTTTGATGGTGCTTCAAGAGGAAGCCCAGGAAGAGCTGGTGCAGGAGCCGTT
CTCCGTGCTCCAGATAACACTGTGATCTACTCTTCTCGCGAGGGTTTGGGTTTTGCTACA
AACAATGTTGCTGAGTATCGAGCTCTCAATCTTGGCCTCGAGTCTGCTCTTAACCAAGGC
TTTACAAATGTGCGCGTACAGGGTGATTCACAGCTTGTCTGTAAGCAGGTTCGAGGTGAA
TGGGCAACCCGAGATCCGAAAATGACTCAGCTTTGTGGACAAGCACAGGAGCTTATGAGT
CAATTTAACTCATGCGATGTTCAACACGTTCCCAGGGAATTCAATTCAGCGGCTGATGCT
CAAGCTAACCGTGCGACCAATCTGGCAGAGGGTGAATATCAGCAAGATAATGCAGGCGGC
CGCTATGGAAGAAGGGGATACTAATATGCATATTCCTGTTTTCTTGTTTTTGGGATCATG
TCTTTTAGCATGTGCTATGTGCTAACATAAACATGAACCCACGATGATCTTATCTCTCTC
TCTCTTATGCTGTGTCCCAC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 3

CO CL3202Contig1 1148 3 11 U
GGTCTTCGCAGATTTGCAGGAAGTGAGAGATATGGATAGTGAGAGAAGAGTGCATCCGGA
CTGTATAAACGCCTCTAATCCTTACCACGAGTGTGTTGAGTATTGCTTTAAGAAAATTGC
TCAAGCAAAGGCCAACTTAGAGAAGCAAGGATTAGTTGAAGCTGTCAGTGGGCAGTCAAG
GGAGCCACCTGCTGATAAAATAATAGAGGAAGAGAGTTCTGAGGAAGAGGATGAAGAAGA
AGATAACCAAGAACCTGAAGTTGACGTCAGCCAACTTACAGGGAGGAAGAAGAAGTTGTA
TGAGCTAAGACTTAAGATGAATGAAGCAAGAAAGTTCAATCAGACAGATGTCGGGTCTGA
AAAGAAGAAAATGGAAGCACCAACTAAGCCAAAAGGAATCTCCAAACAGAAGTGGGTGGA
GGCGAGGCAGAAAAAGATTGGGAAGATTCTCGATGCTAATGGTTTAGATATGTCAAAGGC
TTACATGCTCGATACTCAAGAAACAGCAGAAACCAAATACAAGAAATGGGAAAAGGAACC
CACACCTTCTGGTTGGGATGTCTTCAACCAGAAGACGTTATACAACGCATACAAGAAACG
GACAAAGAACATTCAGGTTGACATTGAGGAGTACAACCGAATGAGAGCAGCTGATCCAGA
GTTTTACCGTGAGGCCTCAAGCTTGCAATACGGCAAGGCACCAAAAATTTCAAAATATAA
GATAGATAAGATGGCGAAGGAGCTCCATGACAGAGAGGAGAAGCGACAGGAGTTTAGCAG
GAGAAGAAAGTTCAGGAAGAAAAGGATATCGATTCGATCAACGACAGAAACGAGCATTTC
AACAAGAAGATCGAGCGTGCGTTTGGGAAGTACACGCTGGAGATCAAAAACAACTTGGAG
CGAGGAACTGCATTACCTGACTAAGTTAACTGAGATCACATGTTATAAACATGAGAATGT
ATTATCTTGTCGAATTATAATGCTTTTGTCTGCTTATCGTCTTTAATAACTTGTAGAATG
TACCACCAAATTCTCTCTTTAGAGAGAAAAACGGTGAGATGGATTTTTTTTTAACCCTTT
GCCAATTCTCTTTTCTACCTTGTCAGAAATTGCATACTACCGACTGGCAAAAAGTCTTAA
ATGTTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E215TF U 1
AF RR2D260TF U 208
AF RR2D260JQ C 454
BS 1 385 RR2E215TF
BS 386 386 RR2D260TF
BS 387 524 RR2E215TF
BS 525 525 RR2D260TF
BS 526 615 RR2E215TF
BS 616 616 RR2D260TF
BS 617 637 RR2E215TF
BS 638 638 RR2D260TF
BS 639 664 RR2E215TF
BS 665 760 RR2D260TF
BS 761 1148 RR2D260JQ

RD RR2E215TF 669 0 0
GGTCTTCGCAGATTTGCAGGAAGTGAGAGATATGGATAGTGAGAGAAGAGTGCATCCGGA
CTGTATAAACGCCTCTAATCCTTACCACGAGTGTGTTGAGTATTGCTTTAAGAAAATTGC
TCAAGCAAAGGCCAACTTAGAGAAGCAAGGATTAGTTGAAGCTGTCAGTGGGCAGTCAAG
GGAGCCACCTGCTGATAAAATAATAGAGGAAGAGAGTTCTGAGGAAGAGGATGAAGAAGA
AGATAACCAAGAACCTGAAGTTGACGTCAGCCAACTTACAGGGAGGAAGAAGAAGTTGTA
TGAGCTAAGACTTAAGATGAATGAAGCAAGAAAGTTCAATCAGACAGATGTCGGGTCTGA
AAAGAAGAAAATGGAAGCACCAACTGAGCCAAAAGGAATCTCCAAACAGAAGTGGGTGGA
GGCGAGGCAGAAAAAGATTGGGAAGATTCTCGATGCTAATGGTTTAGATATGTCAAAGGC
TTACATGCTCGATACTCAAGAAACAGCAGAAACCAAATACAAGAGATGGGAAAAGGAACC
CACACCTTCTGGTTGGGATGTCTTCAACCAGAAGACGTTATACAACGCATACAAGAAACG
GACAAAGAACATTCACGTTGACATTGAGGAGTACAACTGAATGAGAGCAGCTGATCCAGA
GTTT
ACCGT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2D260TF 553 0 0
GGAAGAGAGTTCTGAGGAAGAGGATGAAGAAGAAGATAACCAAGAACCTGAAGTTGACGT
CAGCCAACTTACAGGGAGGAAGAAGAAGTTGTATGAGCTAAGACTTAAGATGAATGAAGC
AAGAAAGTTCAATCAGACAGATGTCGGGTCTGAAAAGAAGAAAATGGAAGCACCAACTAA
GCCAAAAGGAATCTCCAAACAGAAGTGGGTGGAGGCGAGGCAGAAAAAGATTGGGAAGAT
TCTCGATGCTAATGGTTTAGATATGTCAAAGGCTTACATGCTCGATACTCAAGAAACAGC
AGAAACCAAATACAAGAAATGGGAAAAGGAACCCACACCTTCTGGTTGGGATGTCTTCAA
CCAGAAGACGTTATACAACGCATACAAGAAACGGACAAAGAACATTCAGGTTGACATTGA
GGAGTACAACCGAATGAGAGCAGCTGATCCAGAGTTTTACCGTGAGGCCTCAAGCTTGCA
ATACGGCAAGGCACCAAAAATTTCAAAATATAAGATAGATAAGATGGCGAAGGAGCTCCA
TGACAGAGAGGAG

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2D260JQ 695 0 0
TGCTAATGGTTTAGATATGTCAAAGGCTTACATGCTCGATACTCAAGAAACAGCAGAAAC
CAAATACAAGAAATGGGAAAAGGAACCCACACCTTCTGGTTGGGATGTCTTCAACCAGAA
GACGTTATACAACGCATACAAGAAACGGACAAAGAACATTCAGGTTGACATTGAGGAGTA
CAACCGAATGAGAGCAGCTGATCCAGAGTTTTACCGTGAGGCCTCAAGCTTGCAATACGG
CAAGGCACCAAAAATTTCAAAATATAAGATAGATAAGATGGCGAAGGAGCTCCATGACAG
AGAGGAGAAGCGACAGGAGTTTAGCAGGAGAAGAAAGTTCAGGAAGAAAAGGATATCGAT
TCGATCAACGACAGAAACGAGCATTTCAACAAGAAGATCGAGCGTGCGTTTGGGAAGTAC
ACGCTGGAGATCAAAAACAACTTGGAGCGAGGAACTGCATTACCTGACTAAGTTAACTGA
GATCACATGTTATAAACATGAGAATGTATTATCTTGTCGAATTATAATGCTTTTGTCTGC
TTATCGTCTTTAATAACTTGTAGAATGTACCACCAAATTCTCTCTTTAGAGAGAAAAACG
GTGAGATGGATTTTTTTTTAACCCTTTGCCAATTCTCTTTTCTACCTTGTCAGAAATTGC
ATACTACCGACTGGCAAAAAGTCTTAAATGTTAGT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL3203Contig1 427 2 1 U
GGACCATCACGAATCGCGAGAGTTTTCAGAAGCTTGGATTGGATCGATTTGGGAATTTAG
GGTTTTTGTTTCTGCGAAGAAAACGACATAGGATTCGGCCATGACGCCACCTCCAGGACT
TTACTCCGGCACCAGCTCTCTTGCTCTTGTGGCTCGTGCTTCGGCTTTTAGCGTGGGTCT
CGTCTACGGGAGCATGAAGCTCAAGTTCTTGAAGATGGCAAAGCCTAAGGTTGAAGCCAA
TGCTCATCACTAAACCATTTTTTTCTCCCTTTACAATAAAGCAGGGGGGAGGTTATGTCC
CCATCCCGGTTATCAATTTTTCTTATTCATCTTTCAGCGCTAAAAAAGAAAACAACTTTG
TGTCTGAAAAGCTTGTTGTACGTTTCCTAAGACCTTTTTTTGGTGCAAATATTTGCCACT
GGTTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BQ34JQ C 1
AF RR2BQ34TF U 1
BS 1 427 RR2BQ34TF

RD RR2BQ34JQ 427 0 0
GGACCATCACGAATCGCGAGAGTTTTCAGAAGCTTGGATTGGATCGATTTGGGAATTTAG
GGTTTTTGTTTCTGCGAAGAAAACGACATAGGATTCGGCCATGACGCCACCTCCAGGACT
TTACTCCGGCACCAGCTCTCTTGCTCTTGTGGCTCGTGCTTCGGCTTTTAGCGTGGGTCT
CGTCTACGGGAGCATGAAGCTCAAGTTCTTGAAGATGGCAAAGCCTAAGGTTGAAGCCAA
TGCTCATCACTAAACCATTTTTTTCTCCCTTTACAATAAAGCAGGGGGGAGGTTATGTCC
CCATCCCGGTTATCAATTTTTCTTATTCATCTTTCAGCGCTAAAAAAGAAAACAACTTTG
TGTCTGAAAAGCTTGTTGTACGTTTCCTAAGACCTTTTTTTGGTGCAAATATTTGCCACT
GGTTTAC

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR2BQ34TF 427 0 0
GGACCATCACGAATCGCGAGAGTTTTCAGAAGCTTGGATTGGATCGATTTGGGAATTTAG
GGTTTTTGTTTCTGCGAAGAAAACGACATAGGATTCGGCCATGACGCCACCTCCAGGACT
TTACTCCGGCACCAGCTCTCTTGCTCTTGTGGCTCGTGCTTCGGCTTTTAGCGTGGGTCT
CGTCTACGGGAGCATGAAGCTCAAGTTCTTGAAGATGGCAAAGCCTAAGGTTGAAGCCAA
TGCTCATCACTAAACCATTTTTTTCTCCCTTTACAATAAAGCAGGGGGGAGGTTATGTCC
CCATCCCGGTTATCAATTTTTCTTATTCATCTTTCAGCGCTAAAAAAGAAAACAACTTTG
TGTCTGAAAAGCTTGTTGTACGTTTCCTAAGACCTTTTTTTGGTGCAAATATTTGCCACT
GGTTTAC

QA 1 427 1 427
DS 



AS 1 3

CO CL3204Contig1 716 3 1 U
GGAAACTTGCATTGGGTGAATACAAGTCGGCCACCAGTTTGACAGACCAAATTGCTGCTT
TGGCAGCTCTTGCACAAAAGCCGGGTAAAACCCGTGACGAGGTCCTTGCTGACTTCTATA
ACAAGTGGCAGGGCGATTACTTGGTCGTTAATAAATGGTTCCTCCTTCAAGCATCATCCG
ACATTCCCGGGAATGTGGAGAATGTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCGGCTTTTGATCTGC
GCAATCCAAACAAGGTTTACTCGCTCATTGGAGGGTTCTGCGGTTCGCCAGTGAATTTCC
ATGCAAAAGATGGATCAGGTTACAAGTTCTTGGGTGACATTGTTGTCCAGTTAGACAAAA
TCAATCCCCAGGTTGCTTCTCGTATGGTATCTGCCTTTTCGAGGTGGAAGCGCTACGATG
AAACCCGACAAGCTCTGGCCAAGGCACAGTTGGAGATGATAATGTCAGCTAATGGGTTAT
CTGAAAATGTATTTGAGATTGCCTCTAAGAGCTTGGCTGCTTGAGAGACGGCATCTAGAA
TCAATTCTACTCGTAGCTCCGGATTATCATGTTATGAGCTTTTTACATTCAACGCATGCA
CTTTTATAATAAACTGATCCTGAACGTCACATGTTTTTCTTTTTATGTTATGAACTTTGT
CTCCAACGAAATGATGTTTTTCTTTTATATCAAGTTGAAAGAATGAACATTCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2BE12TF U 1
AF RR2BE12JQ C 20
AF RR2C426TF U 141
BS 1 716 RR2BE12TF

RD RR2BE12TF 716 0 0
GGAAACTTGCATTGGGTGAATACAAGTCGGCCACCAGTTTGACAGACCAAATTGCTGCTT
TGGCAGCTCTTGCACAAAAGCCGGGTAAAACCCGTGACGAGGTCCTTGCTGACTTCTATA
ACAAGTGGCAGGGCGATTACTTGGTCGTTAATAAATGGTTCCTCCTTCAAGCATCATCCG
ACATTCCCGGGAATGTGGAGAATGTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCGGCTTTTGATCTGC
GCAATCCAAACAAGGTTTACTCGCTCATTGGAGGGTTCTGCGGTTCGCCAGTGAATTTCC
ATGCAAAAGATGGATCAGGTTACAAGTTCTTGGGTGACATTGTTGTCCAGTTAGACAAAA
TCAATCCCCAGGTTGCTTCTCGTATGGTATCTGCCTTTTCGAGGTGGAAGCGCTACGATG
AAACCCGACAAGCTCTGGCCAAGGCACAGTTGGAGATGATAATGTCAGCTAATGGGTTAT
CTGAAAATGTATTTGAGATTGCCTCTAAGAGCTTGGCTGCTTGAGAGACGGCATCTAGAA
TCAATTCTACTCGTAGCTCCGGATTATCATGTTATGAGCTTTTTACATTCAACGCATGCA
CTTTTATAATAAACTGATCCTGAACGTCACATGTTTTTCTTTTTATGTTATGAACTTTGT
CTCCAACGAAATGATGTTTTTCTTTTATATCAAGTTGAAAGAATGAACATTCACCC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2BE12JQ 697 0 0
ATACAAGTCGGCCACCAGTTTGACAGACCAAATTGCTGCTTTGGCAGCTCTTGCACAAAA
GCCGGGTAAAACCCGTGACGAGGTCCTTGCTGACTTCTATAACAAGTGGCAGGGCGATTA
CTTGGTCGTTAATAAATGGTTCCTCCTTCAAGCATCATCCGACATTCCCGGGAATGTGGA
GAATGTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCGGCTTTTGATCTGCGCAATCCAAACAAGGTTTA
CTCGCTCATTGGAGGGTTCTGCGGTTCGCCAGTGAATTTCCATGCAAAAGATGGATCAGG
TTACAAGTTCTTGGGTGACATTGTTGTCCAGTTAGACAAAATCAATCCCCAGGTTGCTTC
TCGTATGGTATCTGCCTTTTCGAGGTGGAAGCGCTACGATGAAACCCGACAAGCTCTGGC
CAAGGCACAGTTGGAGATGATAATGTCAGCTAATGGGTTATCTGAAAATGTATTTGAGAT
TGCCTCTAAGAGCTTGGCTGCTTGAGAGACGGCATCTAGAATCAATTCTACTCGTAGCTC
CGGATTATCATGTTATGAGCTTTTTACATTCAACGCATGCACTTTTATAATAAACTGATC
CTGAACGTCACATGTTTTTCTTTTTATGTTATGAACTTTGTCTCCAACGAAATGATGTTT
TTCTTTTATATCAAGTTGAAAGAATGAACATTCACCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2C426TF 576 0 0
GG
GGTCGTTAATAAATGGTTCCTCCTTCAAGCATCATCCGACATTCCCGGGAATGTGGAGAA
TGTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCAGCTTTTGATCTGCGCAATCCAAACAAGGTTTACTC
GCTCATTGGAGGGTTCTGCGGTTCGCCAGTGAATTTCCATGCAAAAGATGGATCAGGTTA
CAAGTTCTTGGGTGACATTGTTGTCCAGTTAGACAAAATCAATCCCCAGGTTGCTTCTCG
TATGGTATCTGCCTTTTCGAGGTGGAAGCGCTACGATGAAACCCGACAAGCTCTGGCCAA
GGCACAGTTGGAGATGATAATGTCAGCTAATGGGTTATCTGAAAATGTATTTGAGATTGC
CTCTAAGAGCTTGGCTGCTTGAGAGACGACATCAAGAATCAATTCTACTCGTAGCTCCGG
ATTATCATGTTATGAGCTTTTTACATTCAACGCATGCACTTTTATAATAAACTGATCCTG
AACGTCACATGTTTTTCTTTTTATGTTATGAACTTTGTCTCCAACGAAATGATGTTTTTC
TTTTATATCAAGTTGAAAGAATGAACATTCACCC

QA 3 576 3 576
DS 



AS 1 3

CO CL3205Contig1 1319 3 6 U
GGAAGCAACCTTTCCTTCTTCTTCTCCTCTGTCGCCGTTGTTGCTTCGCCATCGTCGTGC
CAATGGCAAAGAAAAAGGTGAAAGTTGTTGATTCTGGATTGGATACTATGAAGGCAATGG
TTCATCAGCACGGCGAATTTTTCGATACAATGGTGGAGCTCATCCCCGCGAGATTCTACT
TACCTGATGAGACGGAGAGGAAGTGGTTTCCAGGTCTTAGCAAGGCTCAGAAAGCTAGAG
CCAAGAAGAAAACAACCGAGAATCTAAAGAAAGCTAGGAGGGACAGGTTGGATCCTGAGA
AGTCTGCTTTGACTACTCTTGATTTGCTGAAACGGAAGATAGAGAAGGAGAAGAAGTTGA
GTCATAAGATTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATGATGGTGGCAGTGAGGAGGAAA
CTGATAACAAGAAGGGTGAGACTGATTCGGTTACTTACGAGGAGCTGAGGCAACGTCTCC
ACCGCAAGATTGCTGCGCTTAAAGGTGGCCGTGGGGGTTCAGATAGACCAAGAAGTCATG
AGAAGAGGAAGAAGATTGTGCCTAACAAGAGAAAGAGGGAGGAGAAGACTGTGGAGGAGG
AGGAGAGTAAGTTAGCAGATAAAGGTAAGGGTAAGTTGGATGTGGAAGAGGCTGCTAAAG
ACCTTACGTACGGTTACGTCAAGATCGATGACGATGAGGAACACGGAAAGGGTAAGAAGC
GGAGGCTTTCCAAGTCTAGAGAGCTTGAAAGGGCTTTGAAGCTAGAGGCTGCAAAGAAGG
ATCCAGAGAAAGGTGAAGTGATCGCGAAGAAACACTCTTGGCAGGCGGCTACGAGCAGAG
CAGCTGGTATCAAGGTCCACGACGATCCGAAGCTGCTGAAGCAGAGCATCCACAAGGAGA
AGAAGAGGCAGGAGAAGAACGCAGAGAAGTGGAAGGAGAGGGTTGAAGGGCAGCAGAAGG
TTAGAGTTGAGAAGCAGCAGAAGAGATCAGGGAACATTGCGGAGAGGATTGAGCAGAATA
AGATGAGGAAGATCGCTAAGAGGGAGAAGAAGCTCCTTCGCCCTGGCTTTGAAGGTCGTA
AAGAAGGGGTTATCAATGATGGCAAGTAAAAAAAACTCAAATTCTTCCAAAGATGTGATC
ATCATCATCTCAGAGGCTGTGGAGAACATGTTTTGCTATTTTGGTGAATTTTCGTGTAGT
CAAAGTCCCCCTAGCAATATCAGTTATGTTTTTTAGTTCGTTTTGTTTTGCAGTTTGCAG
ACTTTATCAGATGTTTGTTACACAATGTGTTCTTTAAAGTTGATGGTCTTATCAAGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H959TF U 1
AF RR2A525TF U 1
AF RR2A525JQ C 558
BS 1 133 RR2A525TF
BS 134 134 RR2H959TF
BS 135 724 RR2A525TF
BS 725 725 RR2A525JQ
BS 726 775 RR2A525TF
BS 776 1319 RR2A525JQ

RD RR2H959TF 430 0 0
GGAAGCAACCTTTCCTTCTTCTTCTCCTCTGTCGCCGTTGTTGCTTCGCCATCGTCGTGC
CAATGGCAAAGAAAAAGGTGAAAGTTGTTGATTCTGGATTGGATACTATGAAGGCAATGG
TTCATCAGCACGGCGAATTTTTCGATGCAATGGTGGAGCTCATCCCCGCGAGATTCTACT
TACCTGATGAGACGGAGAGGAAGTGGTTTCCAGGTCTTAGCAAGGCTCAGAAAGCTAGAG
CCAAGAAGAAAACAACCGAGAATCTAAAGAAAGCTAGGAGGGACAGGTTGGATCCTGAGA
AGTCTGCTTTGACTACTCTTGATTTGCTGAAACGGAAGATAGAGAAGGAGAAGAAGTTGA
GTCATAAGATTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATGATGGTGGCAGTGAGGAGGAAA
CTGATAACAA

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2A525TF 775 0 0
GGAAGCAACCTTTCCTTCTTCTTCTCCTCTGTCGCCGTTGTTGCTTCGCCATCGTCGTGC
CAATGGCAAAGAAAAAGGTGAAAGTTGTTGATTCTGGATTGGATACTATGAAGGCAATGG
TTCATCAGCACGGTGAATTTTTCGATACAATGGTGGAGCTCATCCCCGCGAGATTCTACT
TACCTGATGAGACGGAGAGGAAGTGGTTTCCAGGTCTTAGCAAGGCTCAGAAAGCTAGAG
CCAAGAAGAAAACAACCGAGAATCTAAAGAAAGCTAGGAGGGACAGGTTGGATCCTGAGA
AGTCTGCTTTGACTACTCTTGATTTGCTGAAACGGAAGATAGAGAAGGAGAAGAAGTTGA
GTCATAAGATTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATGATGGTGGCAGTGAGGAGGAAA
CTGATAACAAGAAGGGTGAGACTGATTCGGTTACTTACGAGGAGCTGAGGCAACGTCTCC
ACCGCAAGATTGCTGCGCTTAAAGGTGGCCGTGGGGGTTCAGATAGACCAAGAAGTCATG
AGAAGAGGAAGAAGATTGTGCCTAACAAGAGAAAGAGGGAGGAGAAGACTGTGGAGGAGG
AGGAGAGTAAGTTAGCAGATAAAGGTAAGGGTAAGTTGGATGTGGAAGAGGCTGCTAAAG
ACCTTACGTACGGTTACGTCAAGATCGATGACGATGAGGAACACGGAAAGGGTAAGAAGC
GGAG*CTTTCCAAGTCTAGAGAGCTTGAAAGGGCTTTGAAGCTAGAGGCTGCAAA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2A525JQ 762 0 0
GTGCCTAACAAGAGAAAGAGGGAGGAGAAGACTGTGGAGGAGGAGGAGAGTAAGTTAGCA
GATAAAGGTAAGGGTAAGTTGGATGTGGAAGAGGCTGCTAAGGACCTTACGTACGGTTAC
GTCAAGATCGATGACGATGAGGAACACGGAAAGGGTAAGAAGCGGAGGCTTTCCAAGTCT
AGAGAGCTTGAAAGGGCTTTGAAGCTAGAGGCTGCAAAGAAGGATCCAGAGAAAGGTGAA
GTGATCGCGAAGAAACACTCTTGGCAGGCGGCTACGAGCAGAGCAGCTGGTATCAAGGTC
CACGACGATCCGAAGCTGCTGAAGCAGAGCATCCACAAGGAGAAGAAGAGGCAGGAGAAG
AACGCAGAGAAGTGGAAGGAGAGGGTTGAAGGGCAGCAGAAGGTTAGAGTTGAGAAGCAG
CAGAAGAGATCAGGGAACATTGCGGAGAGGATTGAGCAGAATAAGATGAGGAAGATCGCT
AAGAGGGAGAAGAAGCTCCTTCGCCCTGGCTTTGAAGGTCGTAAAGAAGGGGTTATCAAT
GATGGCAAGTAAAAAAAACTCAAATTCTTCCAAAGATGTGATCATCATCATCTCAGAGGC
TGTGGAGAACATGTTTTGCTATTTTGGTGAATTTTCGTGTAGTCAAAGTCCCCCTAGCAA
TATCAGTTATGTTTTTTAGTTCGTTTTGTTTTGCAGTTTGCAGACTTTATCAGATGTTTG
TTACACAATGTGTTCTTTAAAGTTGATGGTCTTATCAAGTTT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 3

CO CL3206Contig1 709 3 4 U
GGACAAATCTCCAATCTCCTTTTCCACTTATAAACCACCAGCAATCTTTGTGCAAACAAC
CTTCATCCTGTGCAATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAGGCATTCGGAGGAAGAAAAG
CCGGTGGCCCGAAGACCAAATCAGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAGTTCCCCG
TGGGGAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCTCAGAGACTCGGTGGTGGAG
CTCCGGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCTGCCGAAGTTTTGGAGCTTGCTG
GTAACGCTGCGAGGGACAACAAGAAGTCGAGGATCATCCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGA
TCAGGAACGACGAAGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGAGTCACGATCGCACACGGTGGTG
TATTGCCGAACATCAACTCTGTTCTCTTGCCTAAGAAGTCTGCTAAATCGACTGAGGAAG
TTGCGTCCAAGTCGCCTGCTAAATCTCCCAAGAAAGCTTAATTGTTTTCTCGATTTTGGA
TTCGTTCACCAGTTTAGTTATATGTGTTGGGTGTTTTGTGTTTAAATTGGTGAATGTATA
TGTAGAAAAATCTAGTTTTTTTTTTAAATTATGTAATTTGGATCTGTATTCTCTTCAGAT
CCAACTTTCTCTAGTAACGACTTATAAAATATTCAGTTTGCAAAAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B939TF U 1
AF RR2EN84TF U 1
AF RR2EN84JQ C 150
BS 1 384 RR2B939TF
BS 385 385 RR2EN84TF
BS 386 701 RR2B939TF
BS 702 709 RR2EN84TF

RD RR2B939TF 706 0 0
GGACAAATCTCCAATCTCCTTTTCCACTTATAAACCACCAGCAATCTTTGTGCAAACAAC
CTTCATCCTGTGCAATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAGGCATTCGGAGGAAGAAAAG
CCGGTGGCCCGAAGACCAAATCAGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAGTTCCCCG
TGGGGAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCTCAGAGACTCGGTGGTGGAG
CTCCGGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCTGCCGAAGTTTTGGAGCTTGCTG
GTAACGCTGCGAGGGACAACAAGAAGTCGAGGATCATCCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGA
TCAGGAACGACGAAGAGTTGGGGAGGCTTCTGAGTGGAGTCACGATCGCACACGGTGGTG
TATTGCCGAACATCAACTCTGTTCTCTTGCCTAAGAAGTCTGCTAAATCGACTGAGGAAG
TTGCGTCCAAGTCGCCTGCTAAATCTCCCAAGAAAGCTTAATTGTTTTCTCGATTTTGGA
TTCGTTCACCAGTTTAGTTATATGTGTTGGGTGTTTTGTGTTTAAATTGGTGAATGTATA
TGTAGAAAAATCTAGTTTTTTTTTTAAATTATGTAATTTGGATCTGTATTCTCTTCAGAT
CCAACTTTCTCTAGTAACGACTTATAAAATATTCAGTTTGC
GTTAC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2EN84TF 709 0 0
GGACAAATCTCCAATCTCCTTTTCCACTTATAAACCACCAGCAATCTTTGTGCAAACAAC
CTTCATCCTGTGCAATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAGGCATTCGGAGGAAGAAAAG
CCGGTGGCCCGAAGACCAAATCAGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAGTTCCCCG
TGGGGAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCTCAGAGACTCGGTGGTGGAG
CTCCGGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCTGCCGAAGTTTTGGAGCTTGCTG
GTAACGCTGCGAGGGACAACAAGAAGTCGAGGATCATCCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGA
TCAGGAACGACGAAGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGAGTCACGATCGCACACGGTGGTG
TATTGCCGAACATCAACTCTGTTCTCTTGCCTAAGAAGTCTGCTAAATCGACTGAGGAAG
TTGCGTCCAAGTCGCCTGCTAAATCTCCCAAGAAAGCTTAATTGTTTTCTCGATTTTGGA
TTCGTTCACCAGTTTAGTTATATGTGTTGGGTGTTTTGTGTTTAAATTGGTGAATGTATA
TGTAGAAAAATCTAGTTTTTTTTTTAAATTATGTAATTTGGATCTGTATTCTCTTCAGAT
CCAACTTTCTCTAGTAACGACTTATAAAATATTCAGTTTGCAAAAAAAA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2EN84JQ 552 0 0
AAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAGTTCCCCGTGGGGAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAG
GGACGGTACGCTCAGAGACTCGGTGGTGGAGCTCCGGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGAG
TACCTCGCTGCCGAAGTTTTGGAGCTTGCTGGTAACGCTGCGAGGGACAACAAGAAGTCG
AGGATCATCCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATCAGGAACGACGAAGAGTTGGGGAAGCTT
CTGAGTGGAGTCACGATCGCACACGGTGGTGTATTGCCGAACATCAACTCTGTTCTCTTG
CCTAAGAAGTCTGCTAAATCGACTGAGGAAGTTGCGTCCAAGTCGCCTGCTAAATCTCCC
AAGAAAGCTTAATTGTTTTCTCGATTTTGGATTCGTTCACCAGTTTAGTTATATGTGTTG
GGTGTTTTGTGTTTAAATTGGTGAATGTATATGTAGAAAAATCTAGTTTTTTTTTTAAAT
TATGTAATTTGGATCTGTATTCTCTTCAGATCCAACTTTCTCTAGTAACGACTTATAAAA
TATTCAGTTTGC

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 3

CO CL3207Contig1 1572 3 13 U
GGATTTCGAGGAGAAAGAAGTTTTGGCGATGAAGAAGAACGCACTATGGCTACTGCTCGT
TCTCATGTTGCCGGCGATAGCCTACAGTAGGAAACCGGAGAAGAAGGTAACGGTTTCGTC
GGGAAGGAAAGAGGAAGACCTTGTGACTAGTTTGTCCGGTCAACCACCGGTTAACTTCAG
ACATTACGCCGGTTACGTGGATCTAGGGCCTCGACAGAAGCAAAAGGCACTTTTCTATTG
GTTCTTCGAAGCCCAACACAACTCTTCTGGTCGTCCTCTCGTCCTTTGGCTCAACGGAGG
ACCGGGTTGCTCATCGGTAGCCTATGGAGCTGCACAAGAACTAGGCCCTTTCCTTGTTCG
CACCAACGGTGGCAACCTTACCTTCAATGACTTCTCTTGGAACAAAGAGGCCAATATGTT
GTTCTTGGAAGCACCGGTAGGGGTTGGATTCTCGTACACTAATAACTCAGTGGATCTTGG
AAAGCTTGGGGATCAAATTACTTCAGAGGACTCTCTTACTTTCTTGATCAACTGGTTCAT
GAAATTCCCTGAGTTTCGGTCCAACGACTTCTACCTCACCGGAGAGAGTTACGCCGGTCA
CTATGTTCCTCAGCTTGCGGAGGTCATTTACGACAGGAACAAGAAGGTTCCAAGAGACTC
TCGCATCAATCTCAAGGGTTTCATGATTGGGAATGCGGCTATCAATGAGGAAACAGACAT
GTCAGGACTAGTGGACTACGCATGGAGCCACGCTATAGTATCTGACGAGCTCCATAGTAA
CCTTCATAGCACGTGCCGTCTTGAGGAAGAGCAAACGAGCAACAAGACCATACAATGCAT
CGAAAACATCAAAGCTTTCTCGGAAGCTTACAACGATATCGATATATACAGCATCTATAC
TCCCGTTTGCCTCTCCTCTGATTCGTCGTCTTCTTCTCCAAGAAGACCTAAACTCGTCGT
GTCTCCTAGTCTCTTTACTTATCACGACATGTGGGATAAGTTTCCTGCTGCCGGGTACGA
TCCATGCACAGAAGCCTATACCGAAAACTATTTTAACCGGAAAGATGTGCAGGTGGCGCT
CCATGCGAACGTAACAAACCTTCCTTATCCATACACTCCTTGCAGCGGGGTAATAAGGAG
ATGGGGTGAGGCTCCATCCACCGTGCTGCTCACCATCCAGAAGCTTTTGACGGGCGGCCT
ACGCATCTGGATCTATAGTGGAGATACTGATGGGAGAGTACCAGTAACATCTACGCGTTA
TAGCATAAAGAAGATGGGGCCAAAGGTAATGTTACCGTGGAGGTCATGGTTTCACGAGAG
TCAAGTGGGTGGATGGGTTGAGACTTACGCTGGAGGACTAACGTTTGCTACAGTTAGAGG
AGCTGGTCATCAGGTTTCGGTCTTTGCTCCGGCGCAATCCCTCACCTTATTCTCTCACTT
CCTTTCTTCCACCCCATTGCCTTCAAAACGCTTCTGATCGCCACAGCCAAGTCATAGCAA
GTTGTTGTTGTCTTGAAACCGTAATGTTCCCAATTGATATAATGAGTTTCAGTTAATCAA
ATAAAACATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN82TF U 1
AF RR2F471TF U 268
AF RR2BN82JQ C 926
BS 1 456 RR2BN82TF
BS 457 457 RR2F471TF
BS 458 468 RR2BN82TF
BS 469 469 RR2F471TF
BS 470 496 RR2BN82TF
BS 497 497 RR2F471TF
BS 498 591 RR2BN82TF
BS 592 976 RR2F471TF
BS 977 977 RR2BN82JQ
BS 978 1026 RR2F471TF
BS 1027 1027 RR2BN82JQ
BS 1028 1046 RR2F471TF
BS 1047 1572 RR2BN82JQ

RD RR2BN82TF 591 0 0
GGATTTCGAGGAGAAAGAAGTTTTGGCGATGAAGAAGAACGCACTATGGCTACTGCTCGT
TCTCATGTTGCCGGCGATAGCCTACAGTAGGAAACCGGAGAAGAAGGTAACGGTTTCGTC
GGGAAGGAAAGAGGAAGACCTTGTGACTAGTTTGTCCGGTCAACCACCGGTTAACTTCAG
ACATTACGCCGGTTACGTGGATCTAGGGCCTCGACAGAAGCAAAAGGCACTTTTCTATTG
GTTCTTCGAAGCCCAACACAACTCTTCTGGTCGTCCTCTCGTCCTTTGGCTCAACGGAGG
ACCGGGTTGCTCATCGGTAGCCTATGGAGCTGCACAAGAACTAGGCCCTTTCCTTGTTCG
CACCAACGGTGGCAACCTTACCTTCAATGACTTCTCTTGGAACAAAGAGGCCAATATGTT
GTTCTTGGAAGCACCGGTAGGGGTTGGATTCTCGTATACTAATAACTCGGTGGATCTTGG
AAAGCTTGGGGATCAAGTTACTTCAGAGGACTCTCTTACTTTCTTGATCAACTGGTTCAT
GAAATTCCCTGAGTTTCGGTCCAACGACTTCTACCTCACCGGAGAGAGTTA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2F471TF 784 0 0
G
GGTCGTCCTCTCGTCCTTTGGCTCAACGGAGGACCGGGTTGCTCATCGGTAGCCTATGGA
GCTGCACAAGAACTAGGCCCTTTCCTTGTTCGCACCAACGGTGGCAACCTTACCTTCAAT
GACTTCTCTTGGAACAAAGAGGCCAATATGTTGTTCTTGGAAGCACCGGTAGGGGTTGGA
TTCTCGTACACTAATAACTCAGTGGATCTTGGAAAGCTTGGGGATCAAATTACTTCAGAG
GACTCTCTTACTTTCTTGATCAACTGGTTCATGAAATTCCCTGAGTTTCGGTCCAACGAG
TTCTACCTCACCGGAGAGAGTTACGCCGGTCACTATGTTCCTCAGCTTGCGGAGGTCATT
TACGACAGGAACAAGAAGGTTCCAAGAGACTCTCGCATCAATCTCAAGGGTTTCATGATT
GGGAATGCGGCTATCAATGAGGAAACAGACATGTCAGGACTAGTGGACTACGCATGGAGC
CACGCTATAGTATCTGACGAGCTCCATAGTAACCTTCATAGCACGTGCCGTCTTGAGGAA
GAGCAAACGAGCAACAAGACCATACAATGCATCGAAAACATCAAAGCTTTCTCGGAAGCT
TACAACGATATCGATATATACAGCATCTATACTCCCGTTTGCCTCTCCTCTGATTCGTCG
TCTTCTTCTCCAAGAAGACCTAAACTCGTCGTGTCTCCTAGTCTCTTTGCTTATCACGAC
ATGTGGGATAAGTTTCCTGCTGCCGGGTACGATCCATGTACAGAAGCCTATACCGAAA
CTATT

QA 2 779 2 779
DS 

RD RR2BN82JQ 647 0 0
TCGTCTTCTTCTCCAAGAAGACCTAAACTCGTCGTGTCTCCTAGTCTCTTTACTTATCAC
GACATGTGGGATAAGTTTCCTGCTGCCGGGTACGATCCATGCACAGAAGCCTATACCGAA
AACTATTTTAACCGGAAAGATGTGCAGGTGGCGCTCCATGCGAACGTAACAAACCTTCCT
TATCCATACACTCCTTGCAGCGGGGTAATAAGGAGATGGGGTGAGGCTCCATCCACCGTG
CTGCTCACCATCCAGAAGCTTTTGACGGGCGGCCTACGCATCTGGATCTATAGTGGAGAT
ACTGATGGGAGAGTACCAGTAACATCTACGCGTTATAGCATAAAGAAGATGGGGCCAAAG
GTAATGTTACCGTGGAGGTCATGGTTTCACGAGAGTCAAGTGGGTGGATGGGTTGAGACT
TACGCTGGAGGACTAACGTTTGCTACAGTTAGAGGAGCTGGTCATCAGGTTTCGGTCTTT
GCTCCGGCGCAATCCCTCACCTTATTCTCTCACTTCCTTTCTTCCACCCCATTGCCTTCA
AAACGCTTCTGATCGCCACAGCCAAGTCATAGCAAGTTGTTGTTGTCTTGAAACCGTAAT
GTTCCCAATTGATATAATGAGTTTCAGTTAATCAAATAAAACATTTT

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL3208Contig1 429 2 2 U
CCAAGTGTTGGACACTGGATTAGGAAGAAAGACGAGGTCCAAGCCATCACAGATAAGGTG
AGTCTCACGGCTACTCTTAAATGCTCAGGCACTAAGAAGATCGCAGCCGTTGAGTTCGCT
AGCTTCGGAAACCCTATTGGTGATTGTGGAAACTTCACACTTGGTACTTGTAATGCTCCT
GTTTCAAAGCAAGTCGTTGAGAAGCATTGTTTGGGAAAAGCAGAGTGTGTGATTCCGGTG
AACAAAAGCACATTCCAACAAGACAAGAAGGATTCATGTAAGAACGTTGTGAAGACTCTT
GCCGTGCAAGTCAAGTGTGCTCGTGACAAGAAGAACTGAGGGTTGAATGGTTCATATTTT
GCGTTTATTTTGGCAAAAACAATATTTTGCGTTTAATTGACCAATTTCAAAAATGTTGTG
GCAGTGTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E606TF U 1
AF RR2E606JQ C 1
BS 1 341 RR2E606TF
BS 342 429 RR2E606JQ

RD RR2E606TF 346 0 0
CCAAGTGTTGGACACTGGATTAGGAAGAAAGACGAGGTCCAAGCCATCACAGATAAGGTG
AGTCTCACGGCTACTCTTAAATGCTCAGGCACTAAGAAGATCGCAGCCGTTGAGTTCGCT
AGCTTCGGAAACCCTATTGGTGATTGTGGAAACTTCACACTTGGTACTTGTAATGCTCCT
GTTTCAAAGCAAGTCGTTGAGAAGCATTGTTTGGGAAAAGCAGAGTGTGTGATTCCGGTG
AACAAAAGCACATTCCAACAAGACAAGAAGGATTCATGTAAGAACGTTGTGAAGACTCTT
GCCGTGCAAGTCAAGTGTGCTCGTGACAAGAAGAACTGAGG
TTGAA

QA 1 341 1 341
DS 

RD RR2E606JQ 429 0 0
CCAAGTGTTGGACACTGGATTAGGAAGAAAGACGAGGTCCAAGCCATCACAGATAAGGTG
AGTCTCACGGCTACTTTTAAATGCTCAGGCACTAAGAAGATCGCAGCCGTTGAGTTCGCT
AGCTTCGGAAACCCTATTGGTGATTGTGGAAACTTCACACTTGGTACTTGTAATGCTCCT
GTTTCAAAGCAAGTCGTTGAGAAGCATTGTTTGGGAAAAGCAGAGTGTGTGATTCCGGTG
AACAAAAGCACATTCCAACAAGACAAGAAGGATTCATGTAAGAACGTTGTGAAGACTCTT
GCCGTGCAAGTCAAGTGTGCTCGTGACAAGAAGAACTGAGGGTTGAATGGTTCATATTTT
GCGTTTATTTTGGCAAAAACAATATTTTGCGTTTAATTGACCAATTTCAAAAATGTTGTG
GCAGTGTTG

QA 1 429 1 429
DS 



AS 1 2

CO CL3209Contig1 1193 2 2 U
GAAGAAGATGACGTAGACGTGGAACAGGTGGCTGCTGAAGCGTCGCCGTTTCAGATTCAG
CAGCATCCGTTTCAGCAGATTCAGAAACTCGTTGTTGGGTATGCTCTGACTTCCAAAAAG
AAGAAGAGTTTCTTGCAGCCCAAGCTTGAACTCATGGCTAGGAGAAAAGGCATTTGCTTT
GTCGCCATCGATTTGAACCGTCCACTTTCTGAACAAGGACCATTTGATGTCGTTCTGCAT
AAGTTACTGGGTAAGAGTGGCAAGAAGTTATTGAGGATTACCAGCAGACACACCCGGAAG
TGACTGTGCTTGATCCTCCAAGTGCAATCCAGCGTATATATAATCGACAGTCGATGCTTC
AGGGCATGGCAGATTTGAAGCTGTCTGATTGCAGCGGCAGCATGTTAGTTCCAAAGCAAA
TGGTTGTCTTGAAAGTTTCAGCATCTAGTGCCGATAAAATTGTCGAAGCTGGTCTTAAAT
ATCCACTAGTTGCGAAGCCACTCTGGATCGATGGAACTGCCAAGTCACACCAGTTGTTCT
TAGCTTATGACAGACACTCGCTTGCGGAACTTGATCCTCCTTTAGTCTTGCAAGAGTTTG
TTAACCATGGTGGAGTTATGTTCAAGGTTTTTGTGGTTGGTGATATCATAAAAGTTGTGA
GGCGGTTTTTTTTGCCAAATATAAGTAACTGCGACAAAGCCAAAGTAGATGGCGCCTTCA
AGTTCCCGAGGGTTTCATCTTTTGCTGCTTCAGCGGATAACGCCGACTTGGATCCTACTG
TTGCTGAGCTCCCTCCAAAGTCTTTCCTCGAGGCCCTTGTGAAAGAGCTACGAACCTTAT
TGGGACTTCGGCTTTTCAACATAGACATGATCAGAGAACATGGGAGCGAGAACGTGTTTT
ATGTTATTGACGTGAATTACTTTCCTGGTTATGGAAAGATGCCAGATTACGAGCAAGTGT
TTGTAGATTTTTTTTGCAACCTGGCTCAAGCCAGACATATGAAGAGACATTGTAAATGAA
GAAAGCTTGGAAGAGGAGGGAGGTATCAGGACTACTGATGTGGTGGGGAAAAGAATAATG
ACTAATTATGGATTTGTATAGAATTAGCTTTCCCTTTTGGATGGCTCTATCAGATAACAA
GTTTTTGATTAGTGTTTCTGAAGTTTCTTTTTTTTTTAATTATAATTTAGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO79TF U 1
AF RR2CO79JQ C 523
BS 1 592 RR2CO79TF
BS 593 1193 RR2CO79JQ

RD RR2CO79TF 597 0 0
GAAGAAGATGACGTAGACGTGGAACAGGTGGCTGCTGAAGCGTCGCCGTTTCAGATTCAG
CAGCATCCGTTTCAGCAGATTCAGAAACTCGTTGTTGGGTATGCTCTGACTTCCAAAAAG
AAGAAGAGTTTCTTGCAGCCCAAGCTTGAACTCATGGCTAGGAGAAAAGGCATTTGCTTT
GTCGCCATCGATTTGAACCGTCCACTTTCTGAACAAGGACCATTTGATGTCGTTCTGCAT
AAGTTACTGGGTAAGAGTGGCAAGAAGTTATTGAGGATTACCAGCAGACACACCCGGAAG
TGACTGTGCTTGATCCTCCAAGTGCAATCCAGCGTATATATAATCGACAGTCGATGCTTC
AGGGCATGGCAGATTTGAAGCTGTCTGATTGCAGCGGCAGCATGTTAGTTCCAAAGCAAA
TGGTTGTCTTGAAAGTTTCAGCATCTAGTGCCGATAAAATTGTCGAAGCTGGTCTTAAAT
ATCCACTAGTTGCGAAGCCACTCTGGATCGATGGAACTGCCAAGTCACACCAGTTGTTCT
TAGCTTATGACAGACACTCGCTTGCGGAACTTGATCCTCCTTTAGTCTTGCA
GAGTT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2CO79JQ 671 0 0
AGTCACACCAGTTGTTCTTAGCTTATGACAGACACTCGCTTGCGGAACTTGATCCTCCTT
TAGTCTTGCAAGAGTTTGTTAACCATGGTGGAGTTATGTTCAAGGTTTTTGTGGTTGGTG
ATATCATAAAAGTTGTGAGGCGGTTTTTTTTGCCAAATATAAGTAACTGCGACAAAGCCA
AAGTAGATGGCGCCTTCAAGTTCCCGAGGGTTTCATCTTTTGCTGCTTCAGCGGATAACG
CCGACTTGGATCCTACTGTTGCTGAGCTCCCTCCAAAGTCTTTCCTCGAGGCCCTTGTGA
AAGAGCTACGAACCTTATTGGGACTTCGGCTTTTCAACATAGACATGATCAGAGAACATG
GGAGCGAGAACGTGTTTTATGTTATTGACGTGAATTACTTTCCTGGTTATGGAAAGATGC
CAGATTACGAGCAAGTGTTTGTAGATTTTTTTTGCAACCTGGCTCAAGCCAGACATATGA
AGAGACATTGTAAATGAAGAAAGCTTGGAAGAGGAGGGAGGTATCAGGACTACTGATGTG
GTGGGGAAAAGAATAATGACTAATTATGGATTTGTATAGAATTAGCTTTCCCTTTTGGAT
GGCTCTATCAGATAACAAGTTTTTGATTAGTGTTTCTGAAGTTTCTTTTTTTTTTAATTA
TAATTTAGACT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL3210Contig1 718 2 5 U
GGGGCGAAATGTTGTTCTTGAGAGCAAGTATGGATCACCTAGAATTGTTAATGATGGTGT
CACTGTTGCCAGGGAGGTTGAGTTGGAAGATCCGGTTGAAAACATTGGTGCTAAGCTTGT
CAGGCAAGCTGCTGCCAAGACCAATGACCTGGCTGGTGATGGTACCACAACATCTGTTGT
TCTTGCTCAAGGTTTTATTGCTGAGGGTGTCAAGGTGGTGGCTGCTGGTGCAAACCCTGT
ATTGATCACTAGAGGCATTGAGAAGACAGCAAAGGCTTTGGCTGCCGAGCTCAAGAAAAT
GTCTAAGGAGGTTGAAGACAGTGAACTTGCAGATGTGGCAGCTGTTAGTGCGGGTAACAA
CGAAGAGATTGGAAGTATGATTGCTGAAGCAATGAGCAGAGTGGGCAGGAAGGGTGTGGT
GACACTCGAGGAGGGTAGAAGTGCCGAGAACGCACTCTACGTTGTGGAAGGAATGCAGTT
TGACCGTGGTTACATCTCCCCTTACTTTGTGACAGACAGTGAGAAAATGTCAGTTGAATT
CGACAATTGCAAGTTGCTTCTTGTTGACAAGAAAATTACCAATGCAAGAGATCTTGTTGG
TGTTCTGGAGGATGCGATTAGAGGAGGATACCCAATTTTAATTATTGCAGAAGACATTGA
GCAGAGCTTTAGCGACCCTTGTTGTTAACAAGCTTAGAGCACACTGAAGATGCAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E622TF U 201
AF RR2D744TF U 1
BS 1 537 RR2D744TF
BS 538 538 RR2E622TF
BS 539 615 RR2D744TF
BS 616 616 RR2E622TF
BS 617 718 RR2D744TF

RD RR2E622TF 434 0 0
G
TGAGGGTGTCAAGGTGGTGGCTGCTGGTGCAAACCCTGTATTGATCACTAGAGGCATTGA
GAAGACAGCAAAGGCTTTGGTTGCCGAGCTCAAGAAAATGTCTAAGGAGGTTGAAGACAG
TGAACTTGCAGATGTGGCAGCTGTTAGTGCGGGTAACAACGAAGAGATTGGAAGTATGAT
TGCTGAAGCAATGAGCAGAGTGGGCAGGAAGGGTGTGGTGACACTTGAGGAGGGTAGAAG
TGCCGAGAACGCACTCTACGTTGTGGAAGGAATGCAGTTTGACCGTGGTTACATCTCCCC
TTACTTTGTGACAGACAGTGAGAAAATGTCAGTTGAATTCGACATTTGCAAGTTGCTTCT
TGTTGACAAGAAAATTACCAATGCAAGAGATCTTGTTGGTGTTCTGGAGGATGCGATTAG
AGGAGGATACCCA

QA 2 434 2 434
DS 

RD RR2D744TF 718 0 0
GGGGCGAAATGTTGTTCTTGAGAGCAAGTATGGATCACCTAGAATTGTTAATGATGGTGT
CACTGTTGCCAGGGAGGTTGAGTTGGAAGATCCGGTTGAAAACATTGGTGCTAAGCTTGT
CAGGCAAGCTGCTGCCAAGACCAATGACCTGGCTGGTGATGGTACCACAACATCTGTTGT
TCTTGCTCAAGGTTTTATTGCTGAGGGTGTCAAGGTGGTGGCTGCTGGTGCAAACCCTGT
ATTGATCACTAGAGGCATTGAGAAGACAGCAAAGGCTTTGGCTGCCGAGCTCAAGAAAAT
GTCTAAGGAGGTTGAAGACAGTGAACTTGCAGATGTGGCAGCTGTTAGTGCGGGTAACAA
CGAAGAGATTGGAAGTATGATTGCTGAAGCAATGAGCAGAGTGGGCAGGAAGGGTGTGGT
GACACTCGAGGAGGGTAGAAGTGCCGAGAACGCACTCTACGTTGTGGAAGGAATGCAGTT
TGACCGTGGTTACATCTCCCCTTACTTTGTGACAGACAGTGAGAAAATGTCAGTTGAGTT
CGACAATTGCAAGTTGCTTCTTGTTGACAAGAAAATTACCAATGCAAGAGATCTTGTTGG
TGTTCTGGAGGATGCTATTAGAGGAGGATACCCAATTTTAATTATTGCAGAAGACATTGA
GCAGAGCTTTAGCGACCCTTGTTGTTAACAAGCTTAGAGCACACTGAAGATGCAGCTC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL3211Contig1 1143 2 14 U
GGAATCACTGCTCTTCACATGGCTGCCTTAAACGGATTGTTTGACTGCGTGCAGCTTTTG
CTTGATCTTGAAGCCAATGTTTCCGCTGTGACTTTTCATTATGGAACATCAATGGATATG
ATTGGAGCAGGAAGCACGCCTTTGCACTATGCCGCTTGTGGTGGGAATCTTAAATGTTGT
CAGATTCTCCTTGCAAGAGGTGCAAGAAAGATGACATTGAACTGCAATGGGTGGCTACCT
ATTGACATATCAAGGATGTGGAGTCGTCATTGGTTAGAACCTTTGCTTTCACCAAATTCT
GATGTCGTCATTCCACTCTTCCCTCGTTCCAACTACTTATCATTGCCTCTTTTAAGTATT
CTCAACATCGCTAGAGAGTTCGGGTTGCAGGCAGCAACCATCACAGATGAGGTTGATATC
TGTGCCGTTTGCCTGGAGAGAACATGCACTGTTGCTGCTGAAGGTTGTGAGCATCAGCTA
TGTGTGAGATGCGCGTTATATCTTTGCTCCTCGAGCAATGTCCCTTCGGTGACAGTTGAT
CCTCCCGGTTCAATCCCCTGTCCTCTTTGCAGACACGGAATAGTCTCCTTTAAACGTCTC
CCAACCTCCCTGACAAGAGAACTGAAGCTACCTATGTCGCTTGGTTTCTGTGCGCCGTGT
ATGCTCCACACTGGAGGAGACGCAAGAGATCAATCCTCACCGACCACAGAACAGCAACAG
CGTAGCAGCAGCAAGACTCGAGCGGCCTCGGTTTCGTCTGATATGTTCTGTCCCGGTGAC
GTGCAGTCCGTTCCCTTCAGTCAACATCCCAATGTGCACCTGCAACGATGGAACATGTCC
AAACTTTGAGACGCATGGAGCAGAGAGACATAGTGAAGAACACGACGACGACGAGTCTTC
TCCTCCTCCACGGGCAACGAATGAGCAGGAGAAGGTAGATGAAGGGCAGAGACTTGGGAA
AACAACAACTTGCTCAAGTATGTTTTGGGGAAGAAGAAGCTGTAGCAGAGAGAACCAATG
CAACTCAGAGATCAATGCCTGATCACAAACATTTCTATGTACAGCGAGTGAGAGAGGGGA
TGATGTATACCTTGTTTATTCTTTTATTGAGATGAGAGCCTTTCTTCGTATTGTTTTACT
TTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2A978TF U 1
AF RR2FA78TF U 370
BS 1 443 RR2A978TF
BS 444 444 RR2FA78TF
BS 445 600 RR2A978TF
BS 601 601 RR2FA78TF
BS 602 614 RR2A978TF
BS 615 615 RR2FA78TF
BS 616 707 RR2A978TF
BS 708 708 RR2FA78TF
BS 709 731 RR2A978TF
BS 732 732 RR2FA78TF
BS 733 824 RR2A978TF
BS 825 825 RR2FA78TF
BS 826 850 RR2A978TF
BS 851 1143 RR2FA78TF

RD RR2A978TF 850 0 0
GGAATCACTGCTCTTCACATGGCTGCCTTAAACGGATTGTTTGACTGCGTGCAGCTTTTG
CTTGATCTTGAAGCCAATGTTTCCGCTGTGACTTTTCATTATGGAACATCAATGGATATG
ATTGGAGCAGGAAGCACGCCTTTGCACTATGCCGCTTGTGGTGGGAATCTTAAATGTTGT
CAGATTCTCCTTGCAAGAGGTGCAAGAAAGATGACATTGAACTGCAATGGGTGGCTACCT
ATTGACATATCAAGGATGTGGAGTCGTCATTGGTTAGAACCTTTGCTTTCACCAAATTCT
GATGTCGTCATTCCACTCTTCCCTCGTTCCAACTACTTATCATTGCCTCTTTTAAGTATT
CTCAACATCGCTAGAGAGTTCGGGTTGCAGGCAGCAACCATCACAGATGAGGTTGATATC
TGTGCCGTTTGCCTGGAGAGAACCTGCACTGTTGCTGCTGAAGGTTGTGAGCATCAGCTA
TGTGTGAGATGCGCGTTATATCTTTGCTCCTCGAGCAATGTCCCTTCGGTGACAGTTGAT
CCTCCCGGTTCAATCCCCTGTCCTCTTTGCAGACACGGAATAGTCTCCTTTAAACGTCTC
TCAACCTCCCTGACCAGAGAACTGAAGCTACCTATGTCGCTTGGTTTCTGTGCGCCGTGT
ATGCTCCACACTGGAGGAGACGCAAGAGATCAATCCTCACCGACCACTGAACAGCAACAG
CGTAGCAGCAGTAAGACTCGAGCGGCCTCGGTTTCGTCTGATATGTTCTGTCCCGGTGAC
GTGCAGTCCGTTCCCTTCAGTCAACATCCCAATGTGCACCTGCAGCGATGGAACATGTCC
AAACTTTGAG

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR2FA78TF 774 0 0
GCTAGAGAGTTCGGGTTGCAGGCAGCAACCATCACAGATGAGGTTGATATCTGTGCCGTT
TGCCTGGAGAGAACATGCACTGTTGCTGCTGAAGGTTGTGAGCATCAGCTATGTGTGAGA
TGCGCGTTATATCTTTGCTCCTCGAGCAATGTCCCTTCGGTGACAGTTGATCCTCCCGGT
TCAATTCCTTGTCCTCTTTGCAGACACGGAATAGTCTCCTTTAAACGTCTCCCAAGCTCC
CTGACAAGAGAACTGAAGTTGCCTATGTCGCTTGGTTTCTGTGCGCCGTGTATGCTCCAC
ACTGGAGGAGACGCAAGAGATCAATCCTCACCGACCACAGAACAGCAACAGCGTAGTAGC
AGCAAGACTCGAGCGGCCTCGGTTTCGTCTGATATGTTCTGTCC*GGTGACGTGTAGTCC
GTTCCCTTCGGTCAACATCCCAATGTGCACCTGCAACGATGGAACATGTCCAAACTTTGA
GACGCATGGAGCAGAGAGACATAGTGAAGAACACGACGACGACGAGTCTTCTCCTCCTCC
ACGGGCAACGAATGAGCAGGAGAAGGTAGATGAAGGGCAGAGACTTGGGAAAACAACAAC
TTGCTCAAGTATGTTTTGGGGAAGAAGAAGCTGTAGCAGAGAGAACCAATGCAACTCAGA
GATCAATGCCTGATCACAAACATTTCTATGTACAGCGAGTGAGAGAGGGGATGATGTATA
CCTTGTTTATTCTTTTATTGAGATGAGAGCCTTTCTTCGTATTGTTTTACTTTT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 3

CO CL3212Contig1 471 3 6 U
GGATCTCCCAAACTAACAAAACATTTATTTGCAAAGAAGAAATACAATGTCAACATCCAG
ATTTACTTTATTTTGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAATTTTCACGAAGATGTTAATTT
AAAAGTTGATGCGCGGGGACCATATTGCTATAGAGAAACTGATACTAGATGGTGTTGTAC
TGCACAACCAAAACAGTGCCGAAAGATCAAAGTGGATTGTGATGCGATTTGTAAACCCAA
ACGCCGTCTTTAATTTTCCAGAAGAAATGTTCTATAATTATATATTTCAAATAATTCCGT
ACTTCTATTATTCTAAGTAAGTAATAAATAGCAAATCCTGCTATACAGGAACAACTAGTG
TTGTCTGCTAAAAGACTTATATATTTCTTCGAATTGTTCAATTTTTTTT*CTTTGGTTTA
TGTCTTACTTTCTGCAAGTGTATTTAATAAATCTATATATGTTTTAGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2AP79JQ C 1
AF RR2EA25TF U 8
AF RR2AP79TF U 266
BS 1 10 RR2AP79JQ
BS 11 316 RR2EA25TF
BS 317 317 RR2AP79TF
BS 318 409 RR2EA25TF
BS 410 410 RR2AP79TF
BS 411 471 RR2EA25TF

RD RR2AP79JQ 436 0 0
GGATCTCCCAAACTAACAAAACATTTATTTGCAAAGAAGAAATACAATGTCAACATCCAG
ATTTACTTTATTTTGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCACGAAGATGTTAATTT
AAAAGTTGATGCGCGGGGACCATATTGCTATAGAGAAACTGATGTTAGATGGTGTTGTAC
TGCACAACCAAAACAGTGCCGAAAGATCAAAGTGGATTGTGATGCGATTTGTAAACCCAA
ACGCCGTCTTTAATTTTC*AGAAGAAATGTTCTATAATTATATATTTCAAATAATTCCGT
ACTTCTATTATTCTAAGTAAGTAATAAATAGCAAATCCTGCTATACAGGAACAACTAGTG
TTGTCTGCTAAAAGACTTATATATTTCTTCGAATTGTTCAATTTTTTTT*CTTTGGTTTA
TGTCTTACTTTCTGCA

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR2EA25TF 464 0 0
GGT
AACTAACAAAACATTTATTTGCAAAGAAGAAATACAATGTCAACATCCAGATTTACTTTA
TTTTGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAATTTTCACGAAGATGTTAATTTAAAAGTTGAT
GCGCGGGGACCATATTGCTATAGAGAAACTGATACTAGATGGTGTTGTACTGCACAACCA
AAACAGTGCCGAAAGATCAAAGTGGATTGTGATGCGATTTGTAAACCCAAACGCCGTCTT
TAATTTTCCAGAAGAAATGTTCTATAATTATATATTTCAAATAATTCCGTACTTCTATTA
TTCTAATTAAGTAATAAATAGCAAATCCTGCTATACAGGAACAACTAGTGTTGTCTGCTA
AAAGACTTATATATTTCTTCGAATTGTTCAATTTTTTTTTCTTTGGTTTATGTCTTACTT
TCTGCAAGTGTATTTAATAAATCTATATATGTTTTAGTTAC

QA 4 464 4 464
DS 

RD RR2AP79TF 204 0 0
AATGTTCTATAATTATATATTTCAAATAATTCCGTACTTCTATTATTCTAAGTAAGTAAT
AAATAGCAAATCCTGCTATACAGGAACAACTAGTGTTGTCTGCTAAAAGACTTATATATT
TCTTCGAATTGTTCAATTTTTTTT*CTTTGGTTTATGTCTTACTTTCTGCAAGTGTATTT
AATAAATCTATATATGTTTTAGTT

QA 1 204 1 204
DS 



AS 1 2

CO CL3213Contig1 982 2 4 U
GTGCCTCTAATGCGGTCTCTTCGGTTGCATTGATCATAGGTTGGTCTGTGCTATAAAGGT
CTGTATCCCTCTCCTTTGTTTTTTTTTCTCTACCTCTTAATCTCACTGATACCTAGCATC
GCTAATTCACAATCTTTATCCTCTTCTCTGCTAATGGCTATGACGAAGGTTTTCTTCTCG
GATTTGAAATCTGGCCGGTGCTCCGCCGTCGTTGAGGCGCGACTGCTTCGGTTCTGGGAA
GCAAGAAACGTGAAACGTGGCGGCGAGCTCATGTGGGCTGACCTTCTTTTGGTGGACGTC
AATGGCACTATCATGCAGGCAAGCATAAGCTCTAATCGTCTCCCACGATACCAGGAACAA
CTCATTGCCGGGACAATGTTTTCGATCTCCGGTTTTGACGTCGCTAGGTGTGCGCAGAAC
TTCCGGCTTACGGATTCTTCTCTCCTCATCCGGTTCAGCGAAACAACCTCCTTTAAGGAG
TTGTCTGACCCGGTTTCACCTTTACCCACTGAAGGTTTCCGGTTCCGTAACCAGTCGGAG
TTGCATGGGCTGGCAAACACGAACAGTCACTTACCAGACATCATAGGGGAGATCCTTGGG
GTGAGGAGTACCGTAACTGATCCTCCTGAAGCAAAGAATCGTGTGATGGTGACAATCAGG
CTGGACAGGTATTAGATTGATATATCTGTAGCTCAATTGAATATGTGTGTAGTTACCATA
TTATTTTTTGTTTTGCCCTGTCTTCAAGGAAATCTTCAATGACATCCAAGTGACACAGTG
AATTTAACAAGGATATACACGGTACGGTCAGCGATCAAGCATCGAATCAGCGCGTTCTTC
TGTTTATGTTTGATATGGTTCCTGAAAAACTTAGTTTCGGTTTATTATCAGTACAGACCT
CCAGTGATATATTGGTTGACTTACACATACTGAAAATCGTGCGTTATTATTGAACCCGAG
TTTGCTTACAATTTAAAGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DB23TF U 1
AF RR2D922JQ C 239
BS 1 499 RR2DB23TF
BS 500 500 RR2D922JQ
BS 501 629 RR2DB23TF
BS 630 982 RR2D922JQ

RD RR2DB23TF 629 0 0
GTGCCTCTAATGCGGTCTCTTCGGTTGCATTGATCATAGGTTGGTCTGTGCTATAAAGGT
CTGTATCCCTCTCCTTTGTTTTTTTTTCTCTACCTCTTAATCTCACTGATACCTAGCATC
GCTAATTCACAATCTTTATCCTCTTCTCTGCTAATGGCTATGACGAAGGTTTTCTTCTCG
GATTTGAAATCTGGCCGGTGCTCCGCCGTCGTTGAGGCGCGACTGCTTCGGTTCTGGGAA
GCAAGAAACGTGAAACGTGGCGGCGAGCTCATGTGGGCTGACCTTCTTTTGGTGGACGTC
AATGGCACTATCATGCAGGCAAGCATAAGCTCTAATCGTCTCCCACGATACCAGGAACAA
CTCATTGCCGGGACAATGTTTTCGATCTCCGGTTTTGACGTCGCTAGGTGTGCGCAGAAC
TTCCGGCTTACGGATTCTTCTCTCCTCATCCGGTTCAGCGAAACAACCTCCTTTAAGGAG
TTGTCTGACCCGGTTTCACTTTTACCCACTGAAGGTTTCCGGTTCCGTAACCAGTCGGAG
TTGCATGGGCTGGCAAACACGAACAGTCACTTACCAGACATCATAGGGGAGATCCTTGGG
GTGAGGAGTACCGTAACTGATCCTCCTGA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2D922JQ 744 0 0
AAGCAAGAAACGTGAAACGTGGCGGCGAGCTCATGTGGGCTGACCTTCTTTTGGTGGACG
TCAATGGCACTATCATGCAGGCAAGCATAAGCTCTAATCGTCTCCCACGATACCAGGAGC
AACTCATTGCCGGGACAATGTTTTCGATCTCCGGTTTTGACGTCGCTAGGTGTGCGCAGA
ACTTCCGGCTTACGGATTCTTCTCTCCTCATCCGGTTCAGCGAAACAACCTCCTTTAAGG
AGTTGTCTGACCCGGTTTCACCTTTACCCACTGAAGGTTTCCGGTTCCGTAACCAGTCGG
AGTTGCATGGGCTGGCAAACACGAACAGTCACTTACCAGACATCATAGGGGAGATCCTTG
GGGTGAGGAGTACCGTAACTGATCCTCCTGAAGCAAAGAATCGTGTGATGGTGACAATCA
GGCTGGACAGGTATTAGATTGATATATCTGTAGCTCAATTGAATATGTGTGTAGTTACCA
TATTATTTTTTGTTTTGCCCTGTCTTCAAGGAAATCTTCAATGACATCCAAGTGACACAG
TGAATTTAACAAGGATATACACGGTACGGTCAGCGATCAAGCATCGAATCAGCGCGTTCT
TCTGTTTATGTTTGATATGGTTCCTGAAAAACTTAGTTTCGGTTTATTATCAGTACAGAC
CTCCAGTGATATATTGGTTGACTTACACATACTGAAAATCGTGCGTTATTATTGAACCCG
AGTTTGCTTACAATTTAAAGCACC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 3

CO CL3214Contig1 1437 3 7 U
GGAAAGGCGGAGGAGGCAGTGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCGGAGG
AGGAGGACAAGTAGTAGTGAATCTATCAACCTCCACTTCCTCTCTCATTAATGGCGTCTT
CAAGCCCCCAACATAGCCACATCATCGAGGTTAAAGCAGGCAAATCCGTTGTAGAAAGCA
CGACAAGCCTGGCGAGCAAAGCCTGTGGAGAAGCACCCTGCGGCTTCTCTGATCTCAACA
ACGCTTCCGGTGACGCCCAGGAACGCAATGCTTCCATGAGAAAGCTCTGCATCGCCGTTG
TGCTGTGTCTTCTCTTCATGACCGTTGAAGTCTTTGGTGGCATCAAAGCTAATAGCTTGG
CTATACTCACCGACGCAGCTCACCTTCTCTCTGACGTTGCTGCTTTCGCCATCTCCTTGT
TCTCCTTGTGGGCTGCTGGCTGGGAAGCTACTCCTAGGCAGACTTATGGGTTTTTCAGGG
TTGAGATTCTTGGTGCTCTTGTCTCTATCCAGCTCATTTGGCTGCTTACAGGGATTCTTG
TCTATGAAGCTATCATCAGACTTCTTAGTGAGACCAGTGAGGTTAATGGGTTCCTTATGC
TCCTTGTTGCTGCTTTTGGGTTGCTTGTGAATATCGTGATGGCTGTTCTGTTAGGACATG
ATCACGGTCACGGTCATGGACATGGTCACGGTCATGACCATCACAGTCATGGGG*TGACG
TTTACCACACATCATCATCATGGTCATGATCATGGTCATAGTCATGGAGAGGACAAGCAT
CATCACGCTCACGGGGATGTGACTGAGCAGTTGCTGGACAAATCAGAGAAGAGAAAGAGG
AACATCAACGTCCAAGGAGCTTATCTTCATGTCCTTGGAGACTCAATCCAGAGCGTTGGT
GTTATGATCGGTGGAGCTGTCATTTGGTACAAACCGGAGTGGAAGATAGTTGATCTCATC
TGCACGCTTGTCTTTTCGGTTATTGTCTTGGGGACAACCATCAACATGATCAGAAGCATT
CTTGAGGTGTTGATGGAGAGTACACCGAGAGAGATCGACGCTACTAAGCTGGAAAAGGGT
TTGCTGGAGATGGAAGAAGTGGTGGCTGTTCATGAGCTTCACATTTGGGCTATCACTGTG
GGGAAAGTGCTGCTTGCTTGCCATGTTAATATCACACCAGAGGCAGATGCTGATATGGTG
CTCAACAAGGTCATTGAGTACATCCGCAGGGAGTATAATATCAGTCATGTCACTATACAA
ATCGAGCGTTAAAAGTAAAACATGTTATGAGTATTTTGTATAAGCATTTTCATACATGAT
GATAAAATTCAATAAAGTCTCTATGTTTTTGTTCACTCTCTCTTGTTCCTCAGCTTTAGG
TATATTGGTATGTTTATATGTCATCTTTGTTTGGTTGAGCTCAAGTAAGCACTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE44TF U 1
AF RR2CT24TF U 389
AF RR2AE44JQ C 599
BS 1 714 RR2AE44TF
BS 715 715 RR2CT24TF
BS 716 786 RR2AE44TF
BS 787 813 RR2CT24TF
BS 814 814 RR2AE44JQ
BS 815 975 RR2CT24TF
BS 976 1437 RR2AE44JQ

RD RR2AE44TF 786 0 0
GGAAAGGCGGAGGAGGCAGTGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCGGAGG
AGGAGGACAAGTAGTAGTGAATCTATCAACCTCCACTTCCTCTCTCATTAATGGCGTCTT
CAAGCCCCCAACATAGCCACATCATCGAGGTTAAAGCAGGCAAATCCGTTGTAGAAAGCA
CGACAAGCCTGGCGAGCAAAGCCTGTGGAGAAGCACCCTGCGGCTTCTCTGATCTCAACA
ACGCTTCCGGTGACGCCCAGGAACGCAATGCTTCCATGAGAAAGCTCTGCATCGCCGTTG
TGCTGTGTCTTCTCTTCATGACCGTTGAAGTCTTTGGTGGCATCAAAGCTAATAGCTTGG
CTATACTCACCGACGCAGCTCACCTTCTCTCTGACGTTGCTGCTTTCGCCATCTCCTTGT
TCTCCTTGTGGGCTGCTGGCTGGGAAGCTACTCCTAGGCAGACTTATGGGTTTTTCAGGG
TTGAGATTCTTGGTGCTCTTGTCTCTATCCAGCTCATTTGGCTGCTTACAGGGATTCTTG
TCTATGAAGCTATCATCAGACTTCTTAGTGAGACCAGTGAGGTTAATGGGTTCCTTATGC
TCCTTGTTGCTGCTTTTGGGTTGCTTGTGAATATCGTGATGGCTGTTCTGTTAGGACATG
ATCACGGTCACGGTCATGGACATGGTCACGGTCATGACCATCACAGTCATGGGGGTGACG
TTTACCACACATCATCATCATGGTCATGATCATGGTCATAGTCATGGAGAGGACAAGCAT
CATCAC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2CT24TF 587 0 0
CTCTGACGTTGCTGCTTTCGCCATCTCCTTGTTCTCCTTGTGGGCTGCTGGCTGGGAAGC
TACTCCTAGGCAGACTTATGGGTTTTTCAGGGTTGAGATTCTTGGTGCTCTTGTCTCTAT
CCAGCTCATTTGGCTGCTTACAGGGATTCTTGTCTATGAAGCTATCATCAGACTTCTTAG
TGAGACCAGTGAGGTTAATGGGTTCCTTATGTTCCTTGTTGCTGCTTTTGGGTTGCTTGT
GAATATCGTGATGGCTGTTCTGTTAGGACATGATCACGGTCACGGTCATGGACATGGTCA
CGGTCATGACCATCACAGTCATGGGG*TGACGGTTACCACACATCATCATCATGGTCATG
ATCATGGTCATAGTCATGGAGAGGACAAGTATCATCACGCTCACGGGGATGTGACTGAGC
AGTTGTTGGACAAATCAGAGAAGAGAAAGAGGAACATCAACGTCCAAGGAGCTTATCTTC
ATGTCCTTGGAGACTCAATCCAGAGCGTTGGTGTTATGATCGGTGGAGCTGTCATTTGGT
ACAAACCGGAGTGGAAGATAGTTGATCTCATCTGCACGCTTGTCTTT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2AE44JQ 839 0 0
TGCT
CTTGTTGCTGCTTTTGGGTTGCTTGTGAATATCGTGATGGCTGTTCTGTTAGGACATGAT
CACGGTCACGGTCATGGACATGGTCACGGTCATGACCATCACAGTCATGGGG*TGACGTT
TACCACACATCATCATCATGGTCATGATCATGGTCATAGTCATGGAGAGGACAAGCATCA
TCACGCTCACGGGGATGTGACTGAGCAGTTGCTGGACAAATCAGAGAAGAGAAAGAGGAA
CATCAACGTCCAAGGAGCTTATCTTCATGTCCTTGGAGACTCAATCCAGAGCGTTGGTGT
TATGATCGGTGGAGCTGTCATTTGGTACAAACCGGAGTGGAAGATAGTTGATCTCATCTG
CACGCTTGTCTTTTCGGTTATTGTCTTGGGGACAACCATCAACATGATCAGAAGCATTCT
TGAGGTGTTGATGGAGAGTACACCGAGAGAGATCGACGCTACTAAGCTGGAAAAGGGTTT
GCTGGAGATGGAAGAAGTGGTGGCTGTTCATGAGCTTCACATTTGGGCTATCACTGTGGG
GAAAGTGCTGCTTGCTTGCCATGTTAATATCACACCAGAGGCAGATGCTGATATGGTGCT
CAACAAGGTCATTGAGTACATCCGCAGGGAGTATAATATCAGTCATGTCACTATACAAAT
CGAGCGTTAAAAGTAAAACATGTTATGAGTATTTTGTATAAGCATTTTCATACATGATGA
TAAAATTCAATAAAGTCTCTATGTTTTTGTTCACTCTCTCTTGTTCCTCAGCTTTAGGTA
TATTGGTATGTTTATATGTCATCTTTGTTTGGTTGAGCTCAAGTAAGCACTAAGC

QA 5 839 5 839
DS 



AS 1 3

CO CL3215Contig1 986 3 8 U
GGAAAACAAAAAAAAATCAATCTCTCTCTCTCTTTCTCACACACTTTCTCTCTCCAATGG
CGGCGACACTAGGCAGAGACCAGTACGTCTACATGGCGAAACTCGCCGAGCAGGCCGAGC
GCTACGAGGAGATGGTCCAGTTCATGGAGAGCCTCGTGACGGGCGCCACCCCTTCCTCGG
AGCTCACCGTCGAAGAGAGAAACCTCCTCTCGGTGGCCTACAAGAACGTGATCGGATCCC
TGCGCGCGGCGTGGAGGATCGTGTCCTCGATCGAGCAGAAAGAAGAGAGCAGGAAGAACG
AGGAGCACGTGGGGCTGGTCAAGGACTACAGATCCAAGGTGGAGACGGAGCTCTCCTCCG
TATGCTCCGGGATCCTGAAGCTACTCGAGGAGCACCTGATCCCGTCGGCGGCGGCGAGCG
AGTCGAAGGTGTTTTATCTGAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACATGGCGGAGTTTA
AGTCGGGGGAGGAGAGGAAAGCGGCGGCTGAGGATACCATGGTCGCTTACAAGGCGGCTC
AGGATATTGCTGCTGCTGATATGGCGCCTACTCATCCGATTAGGCTTGGTCTCGCGTTGA
ATTTCTCGGTGTTTTACTATGAGATTCTTAATTCTTCCGACAAAGCTTGTGACATGGCCA
AACAGGCTTTTGAAGAAGCAATAGCTGAGCTTGACACTTTGGGAGAAGAGTCATACAAAG
ACAGCACTCTCATTATGCAGTTGCTTAGGGACAACCTTACCCTCTGGACCTCCGATATGC
AGGAGCAGATGGACGAGGCGTGAGGATCTTGAGGAGGGGGGAGTGGAGAGTGTTATGCGC
CATGTTTCCACCACCGTTTTCGATATCCACATCCATCCCCCGTAGCCTTTGCTCAGAAAA
AGTATTTTTAAGTGTTTATGAAGATTTATGTGCACAGCTTGTGATGATTGATCTACTCTA
TTAATATGTCTTAAACTGTGTTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC91TF U 419
AF RR2G389TF U 1
AF RR2G389JQ C 272
BS 1 532 RR2G389TF
BS 533 533 RR2CC91TF
BS 534 542 RR2G389TF
BS 543 543 RR2CC91TF
BS 544 583 RR2G389TF
BS 584 584 RR2G389JQ
BS 585 661 RR2G389TF
BS 662 986 RR2G389JQ

RD RR2CC91TF 157 0 0
G
GAGTCGAAGGTGTTTTATCTGAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACATGGCGGAGTTT
AAGTCGGGGGAGGAGAGGAAAGCGGCGGCTGAGGATACCATGGTCGCTTACAAGGCGGCT
CAGGATATTGCTGCTGCTG*TATGGCGCCTACTCAT

QA 2 157 2 157
DS 

RD RR2G389TF 674 0 0
GGAAAACAAAAAAAAATCAATCTCTCTCTCTCTTTCTCACACACTTTCTCTCTCCAATGG
CGGCGACACTAGGCAGAGACCAGTACGTCTACATGGCGAAACTCGCCGAGCAGGCCGAGC
GCTACGAGGAGATGGTCCAGTTCATGGAGAGCCTCGTGACGGGCGCCACCCCTTCCTCGG
AGCTCACCGTCGAAGAGAGAAACCTCCTCTCGGTGGCCTACAAGAACGTGATCGGATCCC
TGCGCGCGGCGTGGAGGATCGTGTCCTCGATCGAGCAGAAAGAAGAGAGCAGGAAGAACG
AGGAGCACGTGGGGCTGGTCAAGGACTACAGATCCAAGGTGGAGACGGAGCTCTCCTCCG
TATGCTCCGGGATCCTGAAGCTACTCGAGGAGCACCTGATCCCGTCGGCGGCGGCGAGCG
AGTCGAAGGTGTTTTATCTGAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACATGGCGGAGTTTA
AGTCGGGGGAGGAGAGGAAAGCGGCGGCTGAGGATACCATGGTCGCTTACAAAGCGGCTC
AG*ATATTGCTGCTGCTGATATGGCGCCTACTCATCCGATTAG*CTTGGTCTCGCGTTGA
ATTTCTCGGTGTTTTACTATGAGATTCTTAATTCTTCCGACAAAGCTTGTGACATGGCCA
A
CAGCTTTTGAGAA

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2G389JQ 715 0 0
CGAGCAGAAAGAAGAGAGCAGGAAGAACGAGGAGCACGTGGGGCTGGTCAAGGACTACAG
ATCCAAGGTGGAGACGGAGCTCTCCTCCGTATGCTCCGGGATCCTGAAGCTACTCGAGGA
GCACCTGATCCCGTCGGCGGCGGCGAGCGAGTCGAAGGTGTTTTATCTGAAGATGAAGGG
GGATTACCATAGGTACATGGCGGAGTTTAAGTCGGGGGAGGAGAGGAAAGCGGCGGCTGA
GGATACCATGGTCGCTTACAAGGCGGCTCAGGATATTGCTGCTGCTGATATGGCGCCTAC
TCATCCGATTAGGCTTGGTCTCGCGTTGAATTTCTCGGTGTTTTACTATGAGATTCTTAA
TTCTTCCGACAAAGCTTGTGACATGGCCAAACAGGCTTTTGAAGAAGCAATAGCTGAGCT
TGACACTTTGGGAGAAGAGTCATACAAAGACAGCACTCTCATTATGCAGTTGCTTAGGGA
CAACCTTACCCTCTGGACCTCCGATATGCAGGAGCAGATGGACGAGGCGTGAGGATCTTG
AGGAGGGGGGAGTGGAGAGTGTTATGCGCCATGTTTCCACCACCGTTTTCGATATCCACA
TCCATCCCCCGTAGCCTTTGCTCAGAAAAAGTATTTTTAAGTGTTTATGAAGATTTATGT
GCACAGCTTGTGATGATTGATCTACTCTATTAATATGTCTTAAACTGTGTTCTCT

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 3

CO CL3216Contig1 750 3 4 U
CTTTCTCTCATGAGATTTTGTTTCTTTTCTTCCTGTTCTTGAAGTTACTTGACCGTTCAG
TTTGTGCGGTTCTTCTGGAAAAGGGAGACTAATCAGAAAGCAAAGATTCTCAGGAAAGTG
GATTATCCGCTGGAGTTGGATATTTTTGACCTTTGTTCTGAGGATCTCCGAAAGAAACTG
GAAGCTCCTCGCCAGAAACTAAGAGATGAGGAAGGTAAAAAGCTTGGTCTGCAACCAAAG
AGTAGCTCAAAGGAGACCGATGTGAAAATGACTGATGCAGAGGCGACATCAAATGAAAGT
GGAGAATCATCCACCGTTAATCAACAAGAAGGTGCTTCATCTGAGAAGGGAACTCTTCAC
ATGACCGGAATCTATGACCTGGTCTCTGTCCTAACCCACAAAGGCAGGAGTGCAGACTCT
GGTCATTATGTTGCATGGGTCAAGCAAGAGAGTGGCAAGTGGATTCAATATGACGATAGC
CACCCAAGCCTGCAACGGGAGGAAGACATCACAAAGCTCTCCGGAGGAGGGG*ATTGGCA
TATGGCGTACATCATTATGTACAAAGCCCGCTTCGTCTCGATGTGATCTCTCTTTTACTT
TTGGTTGTTTTTTTGGTTCTTGAAACGTTCAGGATCGTCAAGAGCTTTAAATAGACCACC
TCGGAAGTTTCTGTTTCTTACAATGTTTTAGACTGTATTTTGCCACAGTTATACTACTAT
CCAGACCATCAATGTTTCTTTCGTTTGACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B173JQ C 383
AF RR2B173TF U 1
AF RR2CM10TF U 230
BS 1 532 RR2B173TF
BS 533 533 RR2CM10TF
BS 534 628 RR2B173TF
BS 629 750 RR2CM10TF

RD RR2B173JQ 187 0 0
TT
TCTGTCCTAACCCACAAAGGCAGGAGTGCAGACTCTGGTCATTATGTTGCATGGGTCAAG
CAAGAGAGTGGCAAGTGGATTCAATATGACGATACCCACCCAAGCCTGCAACGGGAGGAA
GACATCACAAAGCTTTCCGGAGGAGGGG*ATTGGCATATGGCGTACATCATTATGTACAA
AGCCC

QA 3 187 3 187
DS 

RD RR2B173TF 628 0 0
CTTTCTCTCATGAGATTTTGTTTCTTTTCTTCCTGTTCTTGAAGTTACTTGACCGTTCAG
TTTGTGCGGTTCTTCTGGAAAAGGGAGACTAATCAGAAAGCAAAGATTCTCAGGAAAGTG
GATTATCCGCTGGAGTTGGATATTTTTGACCTTTGTTCTGAGGATCTCCGAAAGAAACTG
GAAGCTCCTCGCCAGAAACTAAGAGATGAGGAAGGTAAAAAGCTTGGTCTGCAACCAAAG
AGTAGCTCAAAGGAGACCGATGTGAAAATGACTGATGCAGAGGCGACATCAAATGAAAGT
GGAGAATCATCCACCGTTAATCAACAAGAAGGTGCTTCATCTGAGAAGGGAACTCTTCAC
ATGACCGGAATCTATGACCTGGTCTCTGTCCTAACCCACAAAGGCAGGAGTGCAGACTCT
GGTCATTATGTTGCATGGGTCAAGCAAGAGAGTGGCAAGTGGATTCAATATGACGATAGC
CACCCAAGCCTGCAACGGGAGGAAGACATCACAAAGCTCTCCGGAGGAGGGGGATTGGCA
TATGGCGTACATCATTATGTACAAAGCCCGCTTCGTCTCGATGTGATCTCTCTTTTACTT
TTGGTTGTTTTTTTGGTTCTTGAAACGT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2CM10TF 521 0 0
G
GCAACCAAAGAGTAGCTCAAAGGAGACCGATGTGAAAATGACTGATGCAGAGGCGACATC
AAATGAAAGTGGAGAATCATCCACCGTTAATCAACAAGAAGGTGCTTCATCTGAGAAGGG
AACTCTTTACATGACCGGAATCTATGACCTGGTCTCTGTCCTAACCCACAAAGGCAGGAG
TGCAGACTCTGGTCATTATGTTGCATGGGTCAAGCAAGAGAGTGGCAAGTGGATTCAATA
TGACGATAGCCACCCAAGCCTGCAACGGGAGGAAGACATCACAAAGCTCTCCGGAGGAGG
GG*ATTGGCATATGGCGTACATCATTATGTACAAAGCCCGCTTCGTCTCGATGTGATCTC
TCTTTTACTTTTGGTTGTTTTTT*GGTTCTTGAAACGTTCAGGATCGTCAAGAGCTTTAA
ATAGACCACCTCGGAAGTTTCTGTTTCTTACAATGTTTTAGACTGTATTTTGCCACAGTT
ATACTACTATCCAGACCATCAATGTTTCTTTCGTTTGACA

QA 2 521 2 521
DS 



AS 1 3

CO CL3217Contig1 646 3 4 U
GGAAGTCAGTTTTACTGAGTCTCTCACCGTCCGTCCGTTTGCTTCTTCTTCCTCTAGATC
TGATCGCGATTTTCGCCGGAAGAAGTGTGTATCTATGGGTCGTGGAAACAGCTGTGGTGG
AGGTCAAAGCTCACTCAATTATCTCTTTGGTGGTGGTGGTGATGCTCCTCCTCCTAAGCC
CGCTCCAGCTCCTTCTACTGAGCCTGCTGCACCTGCACCAGCACCAGCACCAGCACCTGC
ACCTGTGACTGCCACCGCTACTACCAGCGTTGAACCTGCTGAGCTCAACAAGCAGATTCC
TGCTGGTATCAAAACTCCCGTTAACAACTACGCCCGTGCGGAAGGCCAGAACACCGGAAA
CTTCATCACTGACCGTCCTTCCACTAAAGTCCATGCAGCTCCTGGAGGTGGATCATCCTT
GGATTATCTCTTCACTGGTGGCAAGTAAAGTATCCAAAAGAAAAAACATTAATGTGTAAT
GCAAATGCGTATCCATTCTCTCCTTGTTGCATTCGCACACTACAAAACTGTTTGATGTGA
GAGTCCTTTAATGATAACAAGTCGGTTTCTCGTCAATCTCTCTCGATCGTTTCTCTTGTA
ATATTCTGATCAAAGTGTTCCAATTAGTTTGAATCAAGAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2A189TF U 350
AF RR2FS88TF U 1
AF RR2FS88JQ C 235
BS 1 339 RR2FS88TF
BS 340 340 RR2FS88JQ
BS 341 645 RR2FS88TF
BS 646 646 RR2FS88JQ

RD RR2A189TF 225 0 0
G
ACACCGGAAACTTCATCACTGACCGTCCTTCCACTAAAGTCCATGCAGCTCCTGGAGGTG
GATCATCCTTGGATTATCTCTTCACTGGTGGCAAGTAAAGTATCCAAAAGAAAAAACATT
AATGTGTAATGCAAATGCGTATCCATTCTCTCCTTGTTGCATTCGCACACTACAAAACTG
TTTGATGTGAGAGTCCTTTAATGATAACAAGTCGGTTTCT
TGTC

QA 2 221 2 221
DS 

RD RR2FS88TF 645 0 0
GGAAGTCAGTTTTACTGAGTCTCTCACCGTCCGTCCGTTTGCTTCTTCTTCCTCTAGATC
TGATCGCGATTTTCGCCGGAAGAAGTGTGTATCTATGGGTCGTGGAAACAGCTGTGGTGG
AGGTCAAAGCTCACTCAATTATCTCTTTGGTGGTGGTGGTGATGCTCCTCCTCCTAAGCC
CGCTCCAGCTCCTTCTACTGAGCCTGCTGCACCTGCACCAGCACCAGCACCAGCACCTGC
ACCTGTGACTGCCACCGCTACTACCAGCGTTGAACCTGCTGAGCTCAACAAGCAGATTCC
TGCTGGTATCAAAACTCCCGTTAACAACTACGCCCGTGCTGAAGGCCAGAACACCGGAAA
CTTCATCACTGACCGTCCTTCCACTAAAGTCCATGCAGCTCCTGGAGGTGGATCATCCTT
GGATTATCTCTTCACTGGTGGCAAGTAAAGTATCCAAAAGAAAAAACATTAATGTGTAAT
GCAAATGCGTATCCATTCTCTCCTTGTTGCATTCGCACACTACAAAACTGTTTGATGTGA
GAGTCCTTTAATGATAACAAGTCGGTTTCTCGTCAATCTCTCTCGATCGTTTCTCTTGTA
ATATTCTGATCAAAGTGTTCCAATTAGTTTGAATCAAGAAAAAAA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2FS88JQ 412 0 0
ACCTGCACCTGTGACTGCCACCGCTACTACCAGCGTTGAACCTGCTGAGCTCAACAAGCA
GATTCCTGGTGGTATCAAAACTCCCGTTAACAATTACGCCCGTGGGGAAGGCCAGAACAC
CGGAAATTTCATCACTGACCGTCCTTCCACTAAAGTCCATGCAGCTCCTGGAGGGGGATC
ATCCTTGGATTATCTTTTCACTGGTGGCAAGTAAAGTATCCAAAAGAAAAAACATTAATG
TGTAATGCAAATGCGTATCCATTCTCTCCTTGTTGCATTCGCACACTACAAAACTGTTTG
ATGTGAGAGTCCTTTAATGATAACAAGTCGGTTTCTCGTCAATCTCTCTCGATCGTTTCT
CTTGTAATATTCTGATCAAAGTGTTCCAATTAGTTTGAATCAAGAAAAAAAA

QA 1 412 1 412
DS 



AS 1 2

CO CL3218Contig1 810 2 2 U
GGACCCAAAGCTCTGTTCGCAGCAAATCGCTCGAAAACCCTAAAACAGCCAGCAGTCGCC
AGCCATGGCCAAGTCTAAGAAAGAATCCATTACCAAAGTCGAAGCAGCAGCAGTACTTGA
CTCAAAGACGAAGCCATCGAAGAAGAGTAAGAGAGATGCGGAAGTTGATTCGGACATCCC
AAAGGATCCCAAGAAGCAGAAGAAAGAGTTGATTCAAGCTGTTGAAAAGGCACCACCACC
AAAGAAAAAGGAGAAGAAGAAGAAGAACAAGAAGAATACTAATAGTGAAATGGTGGAGTC
AGACCAGAAATCAGTTGCAAAAGAACCCAAGACGCTATTTGTTGGACATCTTCCCTTTCA
GTTTGAGAAATCTGACTTAAAGAACTTCTTCAAAGAAGTTGGTGAAATCGTCGATGTTAG
ACTTGCTAAGGGATTCGCACATGTAGAGTTTGCTTCTGAAGAAGCTGCTCACAAGGCATT
GGAACTGAATGGTAAACCATTACTAGGCCGCAATATTCTGCTTGATTTTGCTAAGGCGAG
ACCTACTTCACGTCCAGGAAACAAAGTTAAAACGATCTTTGTTACGGGATTCAACAAGTC
TGTTAGTGAAGATGAAATGAAAACTTCCTTGAGAAGTCATTTTGGTGCTTGTGGAGAGAT
CAAAAGGATTTTTTTTCCTTATTACCAAGAGACTGGTGATAGCAAGGGGGTGGCTTACCT
TGATTTTAGTGAGGATGGATTCAACAAGGCATTGGAACTAAACGGAAGTGCACTAGGAGG
AGGGAACATTGTGGTGATTGAAGCTAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G855TF U 1
AF RR2G855JQ C 352
BS 1 658 RR2G855TF
BS 659 810 RR2G855JQ

RD RR2G855TF 658 0 0
GGACCCAAAGCTCTGTTCGCAGCAAATCGCTCGAAAACCCTAAAACAGCCAGCAGTCGCC
AGCCATGGCCAAGTCTAAGAAAGAATCCATTACCAAAGTCGAAGCAGCAGCAGTACTTGA
CTCAAAGACGAAGCCATCGAAGAAGAGTAAGAGAGATGCGGAAGTTGATTCGGACATCCC
AAAGGATCCCAAGAAGCAGAAGAAAGAGTTGATTCAAGCTGTTGAAAAGGCACCACCACC
AAAGAAAAAGGAGAAGAAGAAGAAGAACAAGAAGAATACTAATAGTGAAATGGTGGAGTC
AGACCAGAAATCAGTTGCAAAAGAACCCAAGACGCTATTTGTTGGACATCTTCCCTTTCA
GTTTGAGAAATCTGACTTAAAGAACTTCTTCAAAGAAGTTGGTGAAATCGTCGATGTTAG
ACTTGCTAAGGGATTCGCACATGTAGAGTTTGCTTCTGAAGAAGCTGCTCACAAGGCATT
GGAACTGAATGGTAAACCATTACTAGGCCGCAATATTCTGCTTGATTTTGCTAAGGCGAG
ACCTACTTCACGTCCAGGAAACAAAGTTAAAACGATCTTTGTTACGGGATTCAACAAGTC
TGTTAGTGAAGATGAAATGAAAACTTCCTTGAGAAGTCATTTTGGTGCTTGTGGAGAG

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2G855JQ 459 0 0
TCCCTTTCAGTTTGAGAAATCTGACTTAAAGAACTTCTTCAAAGAAGTTGGTGAAATCGT
CGATGTTAGACTTGCTAAGGGATTCGCACATGTAGAGTTTGCTTCTGAAGAAGCTGCTCA
CAAGGCATTGGAACTGAATGGTAAACCATTATTAGGCCGCAATATTTTGCTTGATTTTGT
TAAGGCGAGACCTACTTCACGTCCAGGAAACAAAGTTAAAACGATTTTTGTTACGGGATT
CAACAAGTCTGTTAGTGAAGATGAAATGAAAACTTCCTTGAGAAGTCATTTTGGTGCTTG
TGGAGAGATCAAAAGGATTTTTTTTCCTTATTACCAAGAGACTGGTGATAGCAAGGGGGT
GGCTTACCTTGATTTTAGTGAGGATGGATTCAACAAGGCATTGGAACTAAACGGAAGTGC
ACTAGGAGGAGGGAACATTGTGGTGATTGAAGCTAGACC

QA 1 459 1 459
DS 



AS 1 2

CO CL3219Contig1 1346 2 2 U
TTTTTTCTTCTTCTTTTGGGGCCAAAAGAGACCAGATTAACGTTTGGTTTCTTCAAAGGC
CAAACCTTTTGTTCTTATTTTTTTTTTTCTCAGGAAACCCTTTTGCCATCTTGGTTTCCA
ATCCATGAAACTGGAGTAACCAATAATCTTCTTGTAGTATCAATCAGAAAGATACATAAA
AACATATACGTTATAAAATGAAACTGAATTGCTTGTTATGTTGCATGTCCGAGAGGCGTT
TTACCAGACGATCATCATCGAGACCAAGCATCAAAGACTGCATTCATGCAAATAACAATC
TTTCTAGATTTGACAACATCTCTTTTAAAACAGATAACAGTAGGCGAAGATACATATCCG
AGGAGATAGCAAAACTCGGGAAAGGGAACATCAGTGCTCAGATCTTTACGTTCAGAGAGC
TCAGTGTCGCAACCAAGAACTTTGATCCCGAGAATCAGCTTCGGAGTCGTGTTCTTGGAG
ATGATCACGGGGAGAAGAGTCATCGACACCACGAAACCAACTCAAGAACAGAATCTAGTG
ACTTGGGCTAGTCCGTTTTTTAAAGATAGGAGAAAGTTCACGTTGATGGCGGATCCGTTG
CTCGAAGGGAAGTATCCGGTAAAGGGATTGTATCAAGCGCTTGCAGTTGCAGCGATGTGT
CTTCAAGAAGATGCGGAAACGAGGCCAATGATGAGCGATGTAGTCACTGCGCTTGAGTTC
TTAGGAACGAACAAAGGAGAAGAAAATAATGAAATAGATAACAACAAGAACAAAGAAAGA
GAAGATGAAAGATCTATGCTTTAAGCATTTTCTTAATGTCTTGATAATACGTTGCACAAA
TCTGTAAAACATCATCATGGAATCAGGTTTTGGAGTTACAACAAATATTATCATGCACAA
ATATCGATCATCAACATTATTTACAGAAAGGATGGCTCTGCAGCATAAAGAGGATTCTCG
AGCAGCATTCCAACTACAAGGGGACGCTTGCACTTGAAGGTACCTACGATAAGATGAGAC
TCTTCTCAGAAAAAAAATCCATCCTGTAGATATAATTTTGAATTTAGTAGCCTAAAGAGA
CAAGCCTAACTCGAGGAGCTTCTTAGAGCCAGCGCTGACTTCACAGGCAACGAGGAGATC
AGTGATCTGATTCTTGGATCACTCACTTAAGGATTGACAAAAATCTTCAATAGCCTCATC
TTACAGAAAAGTCATGTCTGTTTTTGGTACCTACTTGGTAGATCTCAGTTCTGTCTCCAT
ATGTTACTTTTAAGTTTGGTCCAACAATGCCTAACGATGGACTGATCTAATTCTGCAGCT
TTAAAGTAAAGATTGATCTCATTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H815TF U 1
AF RR2H815JQ C 565
BS 1 679 RR2H815TF
BS 680 1346 RR2H815JQ

RD RR2H815TF 679 0 0
TTTTTTCTTCTTCTTTTGGGGCCAAAAGAGACCAGATTAACGTTTGGTTTCTTCAAAGGC
CAAACCTTTTGTTCTTATTTTTTTTTTTCTCAGGAAACCCTTTTGCCATCTTGGTTTCCA
ATCCATGAAACTGGAGTAACCAATAATCTTCTTGTAGTATCAATCAGAAAGATACATAAA
AACATATACGTTATAAAATGAAACTGAATTGCTTGTTATGTTGCATGTCCGAGAGGCGTT
TTACCAGACGATCATCATCGAGACCAAGCATCAAAGACTGCATTCATGCAAATAACAATC
TTTCTAGATTTGACAACATCTCTTTTAAAACAGATAACAGTAGGCGAAGATACATATCCG
AGGAGATAGCAAAACTCGGGAAAGGGAACATCAGTGCTCAGATCTTTACGTTCAGAGAGC
TCAGTGTCGCAACCAAGAACTTTGATCCCGAGAATCAGCTTCGGAGTCGTGTTCTTGGAG
ATGATCACGGGGAGAAGAGTCATCGACACCACGAAACCAACTCAAGAACAGAATCTAGTG
ACTTGGGCTAGTCCGTTTTTTAAAGATAGGAGAAAGTTCACGTTGATGGCGGATCCGTTG
CTCGAAGGGAAGTATCCGGTAAAGGGATTGTATCAAGCGCTTGCAGTTGCAGCGATGTGT
CTTCAAGAAGATGCGGAAA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2H815JQ 782 0 0
GATAGGAGAAAGTTCACGTTGATGGCGGATCCGTTGCTCGAAGGGAAGTATCCGGTAAAG
GGATTGTATCAAGCGCTTGCAGTTGCAGCGATGTGTCTTCAAGAAGATGCGGAAACGAGG
CCAATGATGAGCGATGTAGTCACTGCGCTTGAGTTCTTAGGAACGAACAAAGGAGAAGAA
AATAATGAAATAGATAACAACAAGAACAAAGAAAGAGAAGATGAAAGATCTATGCTTTAA
GCATTTTCTTAATGTCTTGATAATACGTTGCACAAATCTGTAAAACATCATCATGGAATC
AGGTTTTGGAGTTACAACAAATATTATCATGCACAAATATCGATCATCAACATTATTTAC
AGAAAGGATGGCTCTGCAGCATAAAGAGGATTCTCGAGCAGCATTCCAACTACAAGGGGA
CGCTTGCACTTGAAGGTACCTACGATAAGATGAGACTCTTCTCAGAAAAAAAATCCATCC
TGTAGATATAATTTTGAATTTAGTAGCCTAAAGAGACAAGCCTAACTCGAGGAGCTTCTT
AGAGCCAGCGCTGACTTCACAGGCAACGAGGAGATCAGTGATCTGATTCTTGGATCACTC
ACTTAAGGATTGACAAAAATCTTCAATAGCCTCATCTTACAGAAAAGTCATGTCTGTTTT
TGGTACCTACTTGGTAGATCTCAGTTCTGTCTCCATATGTTACTTTTAAGTTTGGTCCAA
CAATGCCTAACGATGGACTGATCTAATTCTGCAGCTTTAAAGTAAAGATTGATCTCATTA
CC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL3220Contig1 1077 2 4 U
GGGCCATTCAAGACCTGTTGTCGATTTGTTCTACAGTCCAATTACCCCTGATGGTTTCTT
CCTCATCAGCGCCAGTAAAGATTCACATCCAATGTTGAGAAACGGGGAGACTGGAGACTG
GATTGGTACCTTTGAAGGTCATAAGGGTGCGGTGTGGAGTTCTTGCCTCGACAACAACGC
CCTACGTGCTGCTTCTGCTTCTGCTGATTTTTCAGCGAAACTCTGGGATGCGTTAACAGG
AGATGTGCTGCATTCTTTTGAGCACAAGCATATTGTTCGAGTATGTGCCTTCTCAGAGGA
TACAAAATTGCTGATCACTGGAGGATTTGAGAAGATACTCCGTGTATTTGACTTGAACCG
GTTGGATGCACCTCCCACAGAAGTCGATAAATCTCCTGGATCCATCAGAACTCTCACATG
GCTTCACAGTGATCAAACAATATTAAGTTCTTGCACTGATATTGGTGGCGTCAGGTTATG
GGATGTTAGGAGTGGGAAGATTGTGCAGACACTGGAGACAAAGTCTCCTGTCACCAGTGC
TGAAGTGAGCCAAGATGGACGATACATTACTACTGCTGATGGGTCAACTGTTAAATTCTG
GGACGCTAACCATTTTGGACTAGTGAAGAGTTATGACATGCCATGCAATATCGAGTCTGC
ATCTCTGGAGCCTAAGTCTGGTGAAAAGTTTGTAGCTGGCGGTGAGGATATGTGGGTCCG
AATGTTTGATTTCTACACCGGCGAGGAGATTGGATGCAACAAGGGGCATCATGGTCCGGT
ACACTGCGTGAGGTTTTCACCGACGGGTGAGTCCTACGCCTCGGGGTCTGAAGACGGGAC
CATCAGGATCTGGCAGACGACACCAAATCATAGTGTGGATGAAGTGGCTAAGAAGATTGA
AGGCTTTCACATCAACAAAGAAGGCAAACCCGCAGAGAAAGTTTCTGATGCTTAGGCAGA
GGAACACGGAAAAGCCTTTTTCTCTTTAGTTCTTGATGTGCTATGTTTCGTGTGTGTTTG
TGTTTCCTGACTGAACATACAGAGAAAAAGAAAAACACAAGGACCGGACCTTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE28TF U 1
AF RR2GE28JQ C 358
BS 1 686 RR2GE28TF
BS 687 687 RR2GE28JQ
BS 688 734 RR2GE28TF
BS 735 1077 RR2GE28JQ

RD RR2GE28TF 734 0 0
GGGCCATTCAAGACCTGTTGTCGATTTGTTCTACAGTCCAATTACCCCTGATGGTTTCTT
CCTCATCAGCGCCAGTAAAGATTCACATCCAATGTTGAGAAACGGGGAGACTGGAGACTG
GATTGGTACCTTTGAAGGTCATAAGGGTGCGGTGTGGAGTTCTTGCCTCGACAACAACGC
CCTACGTGCTGCTTCTGCTTCTGCTGATTTTTCAGCGAAACTCTGGGATGCGTTAACAGG
AGATGTGCTGCATTCTTTTGAGCACAAGCATATTGTTCGAGTATGTGCCTTCTCAGAGGA
TACAAAATTGCTGATCACTGGAGGATTTGAGAAGATACTCCGTGTATTTGACTTGAACCG
GTTGGATGCACCTCCCACAGAAGTCGATAAATCTCCTGGATCCATCAGAACTCTCACATG
GCTTCACAGTGATCAAACAATATTAAGTTCTTGCACTGATATTGGTGGCGTCAGGTTATG
GGATGTTAGGAGTGGGAAGATTGTGCAGACACTGGAGACAAAGTCTCCTGTCACCAGTGC
TGAAGTGAGCCAAGATGGACGATACATTACTACTGCTGATGGGTCAACTGTTAAATTCTG
GGACGCTAACCATTTTGGACTAGTGAAGAGTTATGACATGCCATGCAATATCGAGTCTGC
ATCTCTGGAGCCTAAGTCTGGTGAAA*GTTTGTAGCTGGCGGTGAGGATATGTGGGTCCG
AATGTTTGATTTCT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2GE28JQ 720 0 0
CCGGTTGGATGCACCTCCCACAGAAGTCGATAAATCTCCTGGATCCATCAGAACTCTCAC
ATGGCTTCACAGTGATCAAACAATATTAAGTTCTTGCACTGATATTGGTGGCGTCAGGTT
ATGGGATGTTAGGAGTGGGAAGATTGTGCAGACACTGGAGACAAAGTCTCCTGTCACCAG
TGCTGAAGTGAGCCAAGATGGACGATACATTACTACTGCTGATGGGTCAACTGTTAAATT
CTGGGACGCTAACCATTTTGGACTAGTGAAGAGTTATGACATGCCATGCAATATCGAGTC
TGCATTTCTGGAGCCTAAGTCTGGTGAAAAGTTTGTAGCTGGCGGTGAGGATATGTGGGT
CCGAATGTTTGATTTCTACACCGGCGAGGAGATTGGATGCAACAAGGGGCATCATGGTCC
GGTACACTGCGTGAGGTTTTCACCGACGGGTGAGTCCTACGCCTCGGGGTCTGAAGACGG
GACCATCAGGATCTGGCAGACGACACCAAATCATAGTGTGGATGAAGTGGCTAAGAAGAT
TGAAGGCTTTCACATCAACAAAGAAGGCAAACCCGCAGAGAAAGTTTCTGATGCTTAGGC
AGAGGAACACGGAAAAGCCTTTTTCTCTTTAGTTCTTGATGTGCTATGTTTCGTGTGTGT
TTGTGTTTCCTGACTGAACATACAGAGAAAAAGAAAAACACAAGGACCGGACCTTTCCCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL3221Contig1 730 2 2 U
GGAGAATCGTTAGCACATGTCAACAGAAACAATGCCGGAGAACGCGGAGGAGAGAGATTC
GCAACAAGAGATCGAAGAGACTACACCGCTGCTCGACGGGGAATCGAATGCAAGGACCGC
GACGACCAAGGTTCCGGGGGTGGAGATCCATCTGTACCGGTGTGGAGAAGGTCCGATCGA
CGTGTTCAAGTCGAACCTCGGCGGTTGGGAGCAGAATCAGCTCGAAGTTCGATCTATCCT
TGAGAAATATGGATTGAAATCCATCTTCGCTTTCAACGTCCAGAGAGGTCGAGCCGCCCC
GATCAGATGTCACCCTAGGAATGGCTGGTCTGTGTTGCCTTACAGGGATGGTGCCGTGGT
TTACATCGACGGTGAACCTCAGGATTCTCTGCTCAAACCCATTACAAGAATCGTGCTCGG
AGTCGCGATTGTTATGCTGCTAATAACGTTTCTATTGAAAGACCCTCCAGCGTGGATCAA
GAACAACATCTCCATGGGGAACTTTCCTCCGTGGGTGCTCGCGTGCGTAGTAATAGTAGT
CACCCGAGCGAGGAAGAGAACCAGAGACTTTTTCAAGAAGTGTGGCTGGTGATGTCACAG
ACCTTAATACTCGTTTCCCTTGGAGACGTGGTTGTTTCCCAGACCTTTGATATGGCCTTG
AGGGGCCAAGTTGCTTGCTTTCAGAAGCAATCATTCTCTCCATTTGCATATGTTGAACTT
TATAGTTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H341TF U 1
AF RR2EQ60JQ C 393
BS 1 556 RR2H341TF
BS 557 730 RR2EQ60JQ

RD RR2H341TF 556 0 0
GGAGAATCGTTAGCACATGTCAACAGAAACAATGCCGGAGAACGCGGAGGAGAGAGATTC
GCAACAAGAGATCGAAGAGACTACACCGCTGCTCGACGGGGAATCGAATGCAAGGACCGC
GACGACCAAGGTTCCGGGGGTGGAGATCCATCTGTACCGGTGTGGAGAAGGTCCGATCGA
CGTGTTCAAGTCGAACCTCGGCGGTTGGGAGCAGAATCAGCTCGAAGTTCGATCTATCCT
TGAGAAATATGGATTGAAATCCATCTTCGCTTTCAACGTCCAGAGAGGTCGAGCCGCCCC
GATCAGATGTCACCCTAGGAATGGCTGGTCTGTGTTGCCTTACAGGGATGGTGCCGTGGT
TTACATCGACGGTGAACCTCAGGATTCTCTGCTCAAACCCATTACAAGAATCGTGCTCGG
AGTCGCGATTGTTATGCTGCTAATAACGTTTCTATTGAAAGACCCTCCAGCGTGGATCAA
GAACAACATCTCCATGGGGAACTTTCCTCCGTGGGTGCTCGCGTGCGTAGTAATAGTAGT
CACCCGAGCGAGGAAG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2EQ60JQ 338 0 0
TCAAACCCATTACAAGAATCGTGCTCGGAGTCGCGATTGTTATGCTGCTAATAACGTTTT
TATTGAAAGACCCTCCAGCGTGGATCAAGAACAACATCTCCATGGGGAACTTTCCTCCGT
GGGTGCTCGCGTGCGTAGTAATAGTAGTCACCCGAGCGAGGAAGAGAACCAGAGACTTTT
TCAAGAAGTGTGGCTGGTGATGTCACAGACCTTAATACTCGTTTCCCTTGGAGACGTGGT
TGTTTCCCAGACCTTTGATATGGCCTTGAGGGGCCAAGTTGCTTGCTTTCAGAAGCAATC
ATTCTCTCCATTTGCATATGTTGAACTTTATAGTTTTA

QA 1 338 1 338
DS 



AS 1 3

CO CL3222Contig1 878 3 12 U
GGATGTCTCAGGGAGGTTAATGTTGACAACAACACTGTTGGCTGGCATCAATCCACAGTT
CTTGGGTCCTATCAGACTGTAGAACTCATTGAGACCTTCATGAATTACCAGGAGAACATC
AAGAGGTGTGTTTGCATCATCTATGATCCCTCTAAAGCTGACCTAGGCGTCCTAGCTTTG
AAGGCTTTGAAGCTTTCAGATTCCTTTATGGAGTTGTACCGGGGCGGAAACTTTACAGGC
GACAAGCTGAGAGAGAAAAACTTCTCCTGGATGGATATTTTTGAGGAAATTCCTATTAAG
GTTTCAAACTCTGCACTTGTCAGTGCCTTCATGACGGAACTGGAGACTGATGCGCCTGTC
TCACAGGGTGATTACGATCGTCTGCAGTCATCAACCACTCCTTTCCTTGAGAACAATATG
GAGTTTCTGATTAAATGCATGGATGATTTATCTATGGAACAGCAAAAGTTCCAATACTAC
TACCGGAACCTCTCTCGCCAGCAAGCGCAGCAGCAAGCCTGGCTCCAGAAGAGAAGGACG
GAGAATATGGCTCGTAGGTCAGCTGGGGAAGAGCCTCTACCCGAGGAGGATCCTTCGAAC
CCAATTTTCAAGCCGATCCCTGAACCATCAAGGCTAGAGAGTTTCCTCATCACAAACCAA
GTTTCAAACTTCTGTGGCCAAATCAATGGAGTGGCTGGCCAAAACTTCAGCAGGCTCTAC
CTCACCAAGGCGTTGCACGAGAACTGAGTACGAGAAAGTGAGACTTGGTGGTATAACGGA
TCCTATATTTGTTTTTGCTGGAAGTTTTTCAAGTAGTTTAATAACTTTAAATCGTGAAAG
ATTTACTCTTTTTTTTATAATACACTTTTTGAAAACAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F728TF U 80
AF RR2H130TF U 1
AF RR2F728JQ C 168
BS 1 171 RR2H130TF
BS 172 172 RR2F728TF
BS 173 287 RR2H130TF
BS 288 288 RR2F728TF
BS 289 353 RR2H130TF
BS 354 354 RR2F728TF
BS 355 491 RR2H130TF
BS 492 492 RR2F728JQ
BS 493 533 RR2H130TF
BS 534 534 RR2F728JQ
BS 535 553 RR2H130TF
BS 554 878 RR2F728JQ

RD RR2F728TF 293 0 0
G
AGAACTCATTGAGACCTTCATGAATTACCAGGAGAACATCAAGAGGTGTGTTTGCATCAT
CTATGATCCCTCTAAAGCTGACCTAGGTGTCCTAGCTTTGAAGGCTTTGAAGCTTTCAGA
TTCCTTTATGGAGTTGTACCGGGGCGGAAACTTTACAGGCGACAAGCTGAGAGAGAAAAA
CTTCTCCTGGATGGATATTTTTGAGGAAATTCCTATTAAGGTTTCAAACTCTGCACTTGT
CAGTGCCTTCATGACGGAACTGGAGACTGATGCGCCTGTCTCACAGGGTGAT

QA 2 293 2 293
DS 

RD RR2H130TF 553 0 0
GGATGTCTCAGGGAGGTTAATGTTGACAACAACACTGTTGGCTGGCATCAATCCACAGTT
CTTGGGTCCTATCAGACTGTAGAACTCATTGAGACCTTCATGAATTACCAGGAGAACATC
AAGAGGTGTGTTTGCATCATCTATGATCCCTCTAAAGCTGACCTAGGCGTCTTAGCTTTG
AAGGCTTTGAAGCTTTCAGATTCCTTTATGGAGTTGTACCGGGGCGGAAACTTTACAGGC
GACAAGCTGAGAGAGAAAAACTTCTCCTGGATGGATATTTTTGAGGAGATTCCTATTAAG
GTTTCAAACTCTGCACTTGTCAGTGCCTTCATGACGGAACTGGAGACTGATGCACCTGTC
TCACAGGGTGATTACGATCGTCTGCAGTCATCAACCACTCCTTTCCTTGAGAACAATATG
GAGTTTCTGATTAAATGCATGGATGATTTATCTATGGAACAGCAAAAGTTCCAATACTAC
TACCGGAACCTGTCTCGCCAGCAAGCGCAGCAGCAAGCCTGGCTCCAGAAGAGGAGGACG
GAGAATATGGCTC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2F728JQ 711 0 0
TGTCC
TAGCTTTGAAGGCTTTGAAGCTTTCAGATTCCTTTATGGAGTTGTACCGGGGCGGAAACT
TTACAGGCGACAAGCTGAGAGAGAAAAACTTCTCCTGGATGGATATTTTTGAGGAAATTC
CTATTAAGGTTTCAAACTCTGCACTTGTCAGTGCCTTCATGACGGAACTGGAGACTGATG
CGCCTGTCTCACAGGGTGATTACGATCGTCTGCAGTCATCAACCACTCCTTTCCTTGAGA
ACAATATGGAGTTTCTGATTAAATGCATGGATGATTTATCTATGGAACAGCAAAAGTTCC
AATACTACTACCGGAACCTCTCTCGCCAGCAAGCGCAGCAGCAAGCCTGGCTCCAGAAGA
GAAGGACGGAGAATATGGCTCGTAGGTCAGCTGGGGAAGAGCCTCTACCCGAGGAGGATC
CTTCGAACCCAATTTTCAAGCCGATCCCTGAACCATCAAGGCTAGAGAGTTTCCTCATCA
CAAACCAAGTTTCAAACTTCTGTGGCCAAATCAATGGAGTGGCTGGCCAAAACTTCAGCA
GGCTCTACCTCACCAAGGCGTTGCACGAGAACTGAGTACGAGAAAGTGAGACTTGGTGGT
ATAACGGATCCTATATTTGTTTTTGCTGGAAGTTTTTCAAGTAGTTTAATAACTTTAAAT
CGTGAAAGATTTACTCTTTTTTTTATAATACACTTTTTGAAAACAA

QA 6 711 6 711
DS 



AS 1 2

CO CL3223Contig1 1307 2 2 U
GGATAGCCAAAAAAGAATCCTTCCCCAAATCTGCACCTCTCTCATCTTCATCTTCACTAT
TTGTAACCCTAAATCTATCTAAAGTATGTTAACTTTCTCTCTATCTCCGTCTCTATTTGT
GTGCTTCCCACTTTCGAAGTTCTAACCTTTAAATCGCCGTAGTTGGAGGAGCTATCATCA
GTTTCTCATTCTGAAACTTCCAAAGAGATCTGAAAGTTTTAGACTTTTTTTCCATCACCA
TCGTCATAGTCCGATCATCGTTCCATTGTGTAGGTCACTGAAAGAAAAAAAGAAGATTTT
CTTACTCTGTGTATGGAGTAAGAATGCCAGAGTTAAGAAGTGGAGCACGTAGATTGAGAC
AACCTAACCCTCAGGCGATTGAACCGGCGGAAAACATCGAGCTTCCTCGTCAGCCTGCAA
CAAGGAGAAGAGGTGGTGGTAGAGGAAGGGGAAACGCTGCTGCTCCTCCAAGACCCACTG
GTGGTGCTGCTGGTAGAGGTCGAGGCATCAGGTTGATAGATTTGGAGGCAGAACCTGTTG
TAGGTGAACCTGCTTTTAATCAAGTCGAAGGGGCAGCTGATAAGGATAACGCTATGGAAG
GTGGTAGCGGTGAGAAAGTAGTTGGTGTGGAAGAGGATTTGAGCTCAGCTCCTGTCCCTG
AAAGGGTACAAGTTGGAAACTCTCCTGTTTATAAGACTGAAAGGAAGCTCGGTAAGGGAG
GCTTTGGTCAAGTTTTTGTTGGTAGAAAGGGTGAGTGGTGGCAGCGATAGGATTGGGGCA
GATGCAATTGAGGTGGAGCTTGACTTTTTGTACCCAAGCGATGGGATACATAGGAGGTGG
GAGAATGGGTATAGAATAACATCAATGGCAGCAACTGCAGATCAAGCAGCTTTCATATTA
AGCATACCAAAGCGTAAAATGGTGGATGAAACCCAAGAGACTCTTCGCACCACCGCCTTT
CCAAGCACACATGTCAAGGACAAATGGGCGAAGAATCTGTACATTGCATCAATATGCTAT
GGCAGGACAGTGTGCTGATTGATACACAGTTAGCATCATGTGTTGTGTTAGAAGGCCAAG
CGAGCCTCTCAGGGTCGTCATAATACCAATCAAAAAACGTAAAACCAGACAAAACCTCTT
TTTTGGTTGAATGTAATGAAAGGGATGTGTCTTGGTATCTAATGTATGTACGAGTAACAA
AAGTGAAGATGGAATTAGTAGTAGAAAGATTTGAGAGAGCTTTTTAAGCCCTTCAAGTGT
GTGCTTATTATATAAACCATTTGCTTTGTTCAATGCGTCTCTAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B567TF U 1
AF RR2B567JQ C 388
BS 1 775 RR2B567TF
BS 776 1307 RR2B567JQ

RD RR2B567TF 775 0 0
GGATAGCCAAAAAAGAATCCTTCCCCAAATCTGCACCTCTCTCATCTTCATCTTCACTAT
TTGTAACCCTAAATCTATCTAAAGTATGTTAACTTTCTCTCTATCTCCGTCTCTATTTGT
GTGCTTCCCACTTTCGAAGTTCTAACCTTTAAATCGCCGTAGTTGGAGGAGCTATCATCA
GTTTCTCATTCTGAAACTTCCAAAGAGATCTGAAAGTTTTAGACTTTTTTTCCATCACCA
TCGTCATAGTCCGATCATCGTTCCATTGTGTAGGTCACTGAAAGAAAAAAAGAAGATTTT
CTTACTCTGTGTATGGAGTAAGAATGCCAGAGTTAAGAAGTGGAGCACGTAGATTGAGAC
AACCTAACCCTCAGGCGATTGAACCGGCGGAAAACATCGAGCTTCCTCGTCAGCCTGCAA
CAAGGAGAAGAGGTGGTGGTAGAGGAAGGGGAAACGCTGCTGCTCCTCCAAGACCCACTG
GTGGTGCTGCTGGTAGAGGTCGAGGCATCAGGTTGATAGATTTGGAGGCAGAACCTGTTG
TAGGTGAACCTGCTTTTAATCAAGTCGAAGGGGCAGCTGATAAGGATAACGCTATGGAAG
GTGGTAGCGGTGAGAAAGTAGTTGGTGTGGAAGAGGATTTGAGCTCAGCTCCTGTCCCTG
AAAGGGTACAAGTTGGAAACTCTCCTGTTTATAAGACTGAAAGGAAGCTCGGTAAGGGAG
GCTTTGGTCAAGTTTTTGTTGGTAGAAAGGGTGAGTGGTGGCAGCGATAGGATTG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2B567JQ 920 0 0
GCGG
AAACATCGAGCTTCCTCGTCAGC*TGCAACAAGGAGAAGAGGTGGTGGTAGAGGAAGGGG
AAACGCTGCTGCTCCTCCAAGACCCACTGGTGGTGCTGCTGGTAGAGGTCGAGGCATCAG
GTTGATAGATTTGGAGGCAGAACCTGTTGTAGGTGAACCTGCTTTTAATCAAGTCGAAGG
GGCAGCTGATAAGGATAACGCTATGGAAGGTGGTAGCGGTGAGAAAGTAGTTGGTGTGGA
AGAGGATTTGAGCTCAGCTCCTGTCCCTGAAAGGGTACAAGTTGGAAACTCTCCTGTTTA
TAAGACTGAAAGGAAGCTCGGTAAGGGAGGCTTTGGTCAAGTTTTTGTTGGTAGAA*GGG
TGAGTGGTGGCAGCGATAGGATTGGGGCAGATGCAATTGAGGTGGAGCTTGACTTTTTGT
ACCCAAGCGATGGGATACATAGGAGGTGGGAGAATGGGTATAGAATAACATCAATGGCAG
CAACTGCAGATCAAGCAGCTTTCATATTAAGCATACCAAAGCGTAAAATGGTGGATGAAA
CCCAAGAGACTCTTCGCACCACCGCCTTTCCAAGCACACATGTCAAGGACAAATGGGCGA
AGAATCTGTACATTGCATCAATATGCTATGGCAGGACAGTGTGCTGATTGATACACAGTT
AGCATCATGTGTTGTGTTAGAAGGCCAAGCGAGCCTCTCAGGGTCGTCATAATACCAATC
AAAAAACGTAAAACCAGACAAAACCTCTTTTTTGGTTGAATGTAATGAAAGGGATGTGTC
TTGGTATCTAATGTATGTACGAGTAACAAAAGTGAAGATGGAATTAGTAGTAGAAAGATT
TGAGAGAGCTTTTTAAGCCCTTCAAGTGTGTGCTTATTATATAAACCATTTGCTTTGTTC
AATGCGTCTCTAAATT

QA 5 920 5 920
DS 



AS 1 2

CO CL3224Contig1 1202 2 2 U
GAGAGTGCCATGGCACATAGAAGGTGGAAAACTCCTTCTGGAGCTAAACCGTGTATTGAG
ACCTGGAGGCTTCTTTGTGTGGTCTGCTACTCCTGTTTATCAGAAGAAGACGGAAGATGT
TGAAATCTGGAAAGCTATGAGTGAACTCACAAAGAAAATGTGTTGGGAACTCATATCGAT
TAACAAGGACAAGATCAACAATGTTGGTGTAGCTACTTACAAAAAGCCTACTTCAAATGA
ATGCTACACAAGCAGATCAAAACAAGATCCTCCGATTTGTGCCAACTCTGATGACTCAAA
TGCATCTTGGAAAGTCCCACTTCAAGCATGCATGCACACCGCACCAGAAGACAAAACGCA
ACGTGGGTCTCAGTGGCCCGAGCAATGGCCAGCGAGATTAGATAAACCTCCGTACTGGTT
ATCGAGTTCCCAGACGGGAGTATATGGAAAAGCAGCACCAGAGGATTTCACCGCTGATTA
TGAGCACTGGAAACGTGTAGTGACCAAATCGTACCTTAAAGGTTTAGGTATTAACTGGGG
AACTGTTAGAAATGTCATGGACATGAAAGCCGTTTATGGAGGATTTGCAGCGGCTCTAAG
AGAAATGAAAGTGTGGGTGATGAATGTGGTTCCAATAGATTCACCAGACACGCTAGCAAT
AATCTATGAGCGAGGACTCTTTGGTATCTACCATGATTGGTGTGAATCTTTCAGTACTTA
CCCGAGATCATACGATCTTCTTCACGCCGACCATCTTTTCTCCAAACTCAAACAAAGGTG
CAATCTGACGGCGGTTGTGGCGGAAGTGGATAGGGTGTTGAGACCGGAAGGGAAACTGAT
AGTGAGGGACGATACGGAGACGATACAAGAAGTGGAAGCAATGGTGAAAGCGATGAAATG
GGAAGTGCGTATGACTTTCTCAAAGGAAAAAGAAGGTTTGCTTTCTGTTCAGAAGTCAAT
TTGGCGACCCAAAGATGTAGAGACTCTCACTTATGCTATCGCGGATTGAGTTAGAAGGAA
AAAAAAAGACTCTTTTTGTACGTTAAACACACACAGTCTTGTATTGTCGTAACTCCTCGT
TATCATCGTCTCTCTTTTTCTTCTTTTAGGAAATTTAATTCGTTTATTTTGTAGCGTCGA
GTATGAGTTGAGTCACTTGTTTGAGTATTGCCACTTTTTCTCTTCGTCTAAGATGATGAA
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2DN41TF U 1
AF RR2DN41JQ C 592
BS 1 765 RR2DN41TF
BS 766 1202 RR2DN41JQ

RD RR2DN41TF 768 0 0
GAGAGTGCCATGGCACATAGAAGGTGGAAAACTCCTTCTGGAGCTAAACCGTGTATTGAG
ACCTGGAGGCTTCTTTGTGTGGTCTGCTACTCCTGTTTATCAGAAGAAGACGGAAGATGT
TGAAATCTGGAAAGCTATGAGTGAACTCACAAAGAAAATGTGTTGGGAACTCATATCGAT
TAACAAGGACAAGATCAACAATGTTGGTGTAGCTACTTACAAAAAGCCTACTTCAAATGA
ATGCTACACAAGCAGATCAAAACAAGATCCTCCGATTTGTGCCAACTCTGATGACTCAAA
TGCATCTTGGAAAGTCCCACTTCAAGCATGCATGCACACCGCACCAGAAGACAAAACGCA
ACGTGGGTCTCAGTGGCCCGAGCAATGGCCAGCGAGATTAGATAAACCTCCGTACTGGTT
ATCGAGTTCCCAGACGGGAGTATATGGAAAAGCAGCACCAGAGGATTTCACCGCTGATTA
TGAGCACTGGAAACGTGTAGTGACCAAATCGTACCTTAAAGGTTTAGGTATTAACTGGGG
AACTGTTAGAAATGTCATGGACATGAAAGCCGTTTATGGAGGATTTGCAGCGGCTCTAAG
AGAAATGAAAGTGTGGGTGATGAATGTGGTTCCAATAGATTCACCAGACACGCTAGCAAT
AATCTATGAGCGAGGACTCTTTGGTATCTACCATGATTGGTGTGAATCTTTCAGTACTTA
CCCGAGATCATACGATCTTCTTCACGCCGACCATCTTTTCTCCAA
CTC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2DN41JQ 611 0 0
GGCTCTAAGAGAAATGAAAGTGTGGGTGATGAATGTGGTTCCAATAGATTCACCAGACAC
GCTAGCAATAATCTATGAGCGAGGACTCTTTGGTATCTACCATGATTGGTGTGAATCTTT
CAGTACTTACCCGAGATCATACGATCTTCTTCACGCCGACCATCTTTTCTCCAAACTCAA
ACAAAGGTGCAATCTGACGGCGGTTGTGGCGGAAGTGGATAGGGTGTTGAGACCGGAAGG
GAAACTGATAGTGAGGGACGATACGGAGACGATACAAGAAGTGGAAGCAATGGTGAAAGC
GATGAAATGGGAAGTGCGTATGACTTTCTCAAAGGAAAAAGAAGGTTTGCTTTCTGTTCA
GAAGTCAATTTGGCGACCCAAAGATGTAGAGACTCTCACTTATGCTATCGCGGATTGAGT
TAGAAGGAAAAAAAAAGACTCTTTTTGTACGTTAAACACACACAGTCTTGTATTGTCGTA
ACTCCTCGTTATCATCGTCTCTCTTTTTCTTCTTTTAGGAAATTTAATTCGTTTATTTTG
TAGCGTCGAGTATGAGTTGAGTCACTTGTTTGAGTATTGCCACTTTTTCTCTTCGTCTAA
GATGATGAACT

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 3

CO CL3225Contig1 779 3 6 U
GGACTCCTCTCTCATATCCCAACTTTTACTCAAGATAAGCACTATCAGAGGTAGAAAAAA
TGGCTGAGGCGGCAATAACCAAGGCGTCTACTATGGTCGGGAAACTTGAGACAGACGTGG
AGATCAAAGCTTCGGCTGGACAGTTTCATCACATGTTCGCCGGGAGACCACACCATGTCT
CCAAAGCATCTCCAGGCAAGATTAAAGGTTGTGATCTGCACGAAAGTGACTGGGGCAAGG
TCGGCTCTATCGTCTACTGGAACTACTTTCATGATGGGGAGGCAAAGGTGGCCAAGGAGA
GAATCGAGGCAGTGGAGCCGGAAAAGAACTTGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGTGATC
TGATGAAAGAGTACAAAAGCTTCCTGATCACGATCCAGGTGACCCCTAAGCACGGAGGGC
CAGGGAGTATTGTGCACTGGCACCTTGAGTATGAGAAGATTAGCGACGAGGTTGCTCATC
CCGAGACTCTCCTCCAGTTCTGCGTTGAAGTCTCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGT
CTGAGGAATAGAGGAGAGTACTCCTCGTGCGACTTTCCTATCAGTACTTGTGTGCATGGT
TGAAGCATGTTGATTTCAGTAATAAAAAGTTCAATAAATAACGAGTGTATAATATATATG
AGTGACCTGTGAAATGGAAGTGCTGTATTATATATGCACGTATTCTACTTTCTTGTTTGT
TAAAGTGTATTATGTTTGTCT**AATAAAAGTATAAAGCATGTGATATATGTTCGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT81TF U 1
AF RR2EV33TF U 23
AF RR2FT81JQ C 537
BS 1 41 RR2FT81TF
BS 42 42 RR2EV33TF
BS 43 322 RR2FT81TF
BS 323 323 RR2EV33TF
BS 324 762 RR2FT81TF
BS 763 779 RR2FT81JQ

RD RR2FT81TF 762 0 0
GGACTCCTCTCTCATATCCCAACTTTTACTCAAGATAAGCATTATCAGAGGTAGAAAAAA
TGGCTGAGGCGGCAATAACCAAGGCGTCTACTATGGTCGGGAAACTTGAGACAGACGTGG
AGATCAAAGCTTCGGCTGGACAGTTTCATCACATGTTCGCCGGGAGACCACACCATGTCT
CCAAAGCATCTCCAGGCAAGATTAAAGGTTGTGATCTGCACGAAAGTGACTGGGGCAAGG
TCGGCTCTATCGTCTACTGGAACTACTTTCATGATGGGGAGGCAAAGGTGGCCAAGGAGA
GAATCGAGGCAGTGGAGCCGGATAAGAACTTGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGTGATC
TGATGAAAGAGTACAAAAGCTTCCTGATCACGATCCAGGTGACCCCTAAGCACGGAGGGC
CAGGGAGTATTGTGCACTGGCACCTTGAGTATGAGAAGATTAGCGACGAGGTTGCTCATC
CCGAGACTCTCCTCCAGTTCTGCGTTGAAGTCTCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGT
CTGAGGAATAGAGGAGAGTACTCCTCGTGCGACTTTCCTATCAGTACTTGTGTGCATGGT
TGAAGCATGTTGATTTCAGTAATAAAAAGTTCAATAAATAACGAGTGTATAATATATATG
AGTGACCTGTGAAATGGAAGTGCTGTATTATATATGCACGTATTCTACTTTCTTGTTTGT
TAAAGTGTATTATGTTTGTCT**AATAAAAGTATAAAGCATG

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2EV33TF 743 0 0
T
TTTTACTCAAGATAAGCACTATCAGAGGTGGAAAAAATGGCTGAGGCGGCAATAACCAAG
GCGTCTACTATGGTCGGGAAGCTTGAGACAGACGTGGAGATCAAAGCTTCGGCTGGACAG
TTTCATCACATGTTCGCCGGGAGACCACACCATGTCTCCAAAGCATCTCCAGGCAAGATT
AAAGGTTGTGATCTGCACGAAGGTGACTGGGGCAAGGTCGGCTCTATCGTCTACTGGAAC
TACTTTCATGATGGGGAGGCAAAGGTGGCCAAGGAGAGAATCGAGGCAGTGGAGCCGGAA
AAGAACTTGATCACGTTCAGGGTTATAGAAGGTGATTTGATGAAAGAGTACAAAAGCTTC
CTGATCACGATCCAGGTGACCCCTAAGCACGGAGGGCCAGGGAGTATTGTGCACTGGCAC
CTTGAGTATGAGAAGATTAGCGACGAGGTTGCTCATCCCGAGACTCTCCTCCAGTTCTGC
GTTGAAGTCTCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGTCTGAGGAATAGAGGAGAGTACTC
CTCGTGCGACTTTCCTATCAGTACTTGTGTGCATGGTTGAAGCATGTTGATTTCAGTAAT
AAAAAGTTCAATAAATAACGAGTGTATAATATATATGAGTGACTTGTGAGATGGAAGTGC
TGTATTATATATGCACGTATTCTACTTTCTTGTTTGTTAAAGTGTATTATGTTTGTCTTT
AATAAAAGTATAAAGCATG
TGA

QA 2 740 2 740
DS 

RD RR2FT81JQ 243 0 0
TTGTTTGAGGAATAGAGGAGAGTACTCCTCGTGCGACTTTCCTATCAGTACTTGTGTGCA
TGGTTGAAGCATGTTGATTTCAGTAATAAAAAGTTCAATAAATAACGAGTGTATAATATA
TATGAGTGACCTGTGAAATGGAAGTGCTGTATTATATATGCACGTATTCTACTTTCTTGT
TTGTTAAAGTGTATTATGTTTGTCT**AATAAAAGTATAAAGCATGTGATATATGTTCGG
ATC

QA 1 243 1 243
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3227Contig1 806 2 10 U
CCCAAACCAAAGTTTATAAGTGGCTTTTGCTTTCGGAAATGTTGACCAACCAAAGTGAAA
GAAAAAGAAAACTAAATGACAAAATGTTCTTCAAGTTTTTTTTCTCATGGCTAAAAGAAT
TTCTCACATCTCCCCACACTCTGTAATAACAACAGCAAGCTTAGGACGGTTGTTTGGTCC
AACAGCCACGTTCTCAATCTTCCGCACCACCAATAAACCATCTCCCAGCACTCTCCCAAA
GACAACATGCTTGTTGTCAAGCCAGTCGCATTTTGCACAGCTGATGAAAAACTGGCAACC
ATTAGTGTCTGGCCCACTATTTGCCATGGAGAGCAATCCAGGACCAGTATGTTTGGCAGT
AAAATTCCCATCAGCGAACTGGTGGCCATAGATTGACATGCATCCACTACCATCATTCTT
AAAAAAATCACCACTTTGAATCATAAAATCCTTGATGACTCTGTGAAACTGACATTCTTT
GTAACCAAGAGGCTTCCCAGCCTTTCTGAGTTCACCAGTACAGAACTGCCTGAAGTTTTC
AGCAGTTTTGGGGGCAATGTCAGCGAAAAGCTCCATCTTGATACGACCGGCGGGGATACC
ACCAATAGAGACGTCGAAGAAGACAGCTGGGTTTATAGGGTTAGGTGGTCTGACGTGCCA
CTCCACGTTTCCACCGCCGCTTGAAGGAGCTGCTGATGCAGCTGTTGGTCCAGCCACGAT
TCCCCCTCCTCCTCCAGAACTCATCGGAACTCAAACTTTCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCT
CACTGACTTCGGAGAAAACAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL22JQ U 1
AF RR2FP82TF C 126
BS 1 212 RR2GL22JQ
BS 213 213 RR2FP82TF
BS 214 489 RR2GL22JQ
BS 490 490 RR2FP82TF
BS 491 525 RR2GL22JQ
BS 526 526 RR2FP82TF
BS 527 561 RR2GL22JQ
BS 562 562 RR2FP82TF
BS 563 569 RR2GL22JQ
BS 570 806 RR2FP82TF

RD RR2GL22JQ 569 0 0
CCCAAACCAAAGTTTATAAGTGGCTTTTGCTTTCGGAAATGTTGACCAACCAAAGTGAAA
GAAAAAGAAAACTAAATGACAAAATGTTCTTCAAGTTTTTTTTCTCATGGCTAAAAGAAT
TTCTCACATCTCCCCACACTCTGTAATAACAACAGCAAGCTTAGGACGGTTGTTTGGTCC
AACAGCCACGTTCTCAATCTTCCGCACCACCAGTAAACCATCTCCCAGCACTCTCCCAAA
GACAACATGCTTGTTGTCAAGCCAGTCGCATTTTGCACAGCTGATGAAAAACTGGCAACC
ATTAGTGTCTGGCCCACTATTTGCCATGGAGAGCAATCCAGGACCAGTATGTTTGGCAGT
AAAATTCCCATCAGCGAACTGGTGGCCATAGATTGACATGCATCCACTACCATCATTCTT
AAAAAAATCACCACTTTGAATCATAAAATCCTTGATGACTCTGTGAAACTGACATTCTTT
GTAACCAAGTGGCTTCCCAGCCTTTCTGAGTTCACCAGTACAGAATTGCCTGAAGTTTTC
AGCAGTTTTGGGGGCAATGTCGGCGAAAA

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2FP82TF 681 0 0
ACATCTCCCCACACTCTGTAATAACAACAGCAAGCTTAGGACGGTTGTTTGGTCCAACAG
CCACGTTCTCAATCTTCCGCACCACCAATAACCCATCTCCCAGCACTCTCCCAAAGACAA
CATGCTTGTTGTCAAGCCAGTCGCATTTTGCACAGCTGATGAAGAACTGGCAACCATTAG
TGTCTGGCCCACTATTTGCCATGGAGAGCAGTCCAGGACCAGTATGTTTGGCAGTAAAAT
TCTCATCATGGAACTGGTGGCCATAGATTGACATGCATCCACTCCCATCATTCTTAAGAA
AATCACCACTTTGAATCATAAAATCCTTGATGACTCTGTGAAACTGACATTCTTTGTAAC
CAAGAGGCTTCCCAGCCTTTCTGAGTTCACCAGTACAGAACTGCCTGAAGTTTTCAGCAG
TTTTGGGGGCAATGTCAGCGAAAAGCTCCATCTTGATACGACCGGCGGGGATACCACCAA
TAGAGACGTCGAAGAAGACAGCTGGGTTTATAGGGTTAGGTGGTCTGACGTGCCACTCCA
CGTTTCCACCGCCGCTTGAAGGAGCTGCTGATGCAGCTGTTGGTCCAGCCACGATTCCCC
CTCCTCCTCCAGAACTCATCGGAACTCAAACTTTCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCTCACTG
ACTTCGGAGAAAACAAAAAAA

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 3

CO CL3228Contig1 694 3 5 U
GGGGAGAAAGGTTTCGACTTTCGTTACGAACCAGACGAGTGATTTGAAGAAGATGCATTC
TTTTGGATACAGAGCGAATGCTCTGCTCACGTTCGCTATCACGATACTTGCCTTCATTTG
CGCGATCGCGTCCTTCTCTGATAACTTCAGTAACCAAACACCCTCTGCTCAGATCCAGAT
ATTGAATATCAATTGGTTCCAGAAGCAACCCCATGGCAATGATGAGGTCAGCTTGACCCT
GAACATAACAGCAGACTTGCAGTCACTATTTACTTGGAACA*AAAGCAGGTATTCGCTTT
TGTAGCAGCCGAGTATGAAACCTCAAAGAACTCTCTGAATCAGGTTTCTCTATGGGATGC
CATAATACCAGAGAAGGAGCAAGCCAACTTCTGGATTCAAATCTCAAACAAGTACCGTTT
CATAGACCAGGGACACAACCTCCGAGGGAAAGAGTTCAACTTGACACTGCACTGGCATGT
CATGCCCAAGACTGGCAAGATGTTTGCTGACAAAATAGTTATGTCTGGTTATCGCCTACC
GAATGCATACAGATGATTATGAAGAGGAGGAGGCCTCATGCATATCATCTAGTAGTGAAG
AGAGTTTATATCTCAGTTGAAACATTGTTTTTTAATGGAACTTATGAGCTAATAACTTGT
AGACTAATCCTTTGGATTCAGAACCATAAATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW31JQ C 173
AF RR2CW31TF U 202
AF RR2CI57TF U 1
BS 1 216 RR2CI57TF
BS 217 217 RR2CW31TF
BS 218 281 RR2CI57TF
BS 282 282 RR2CW31TF
BS 283 694 RR2CI57TF

RD RR2CW31JQ 157 0 0
ATCCAGATATTGAATATCAATTGGTTCCAGAAGCAACCCCAGGGCAATGATGAGGTCAGC
TTGACCCTGAACATAACAGCAGACTTGCAGTCACTATTTACTTGGAACA*AAAGCAGGTA
TTCGCTTTTGTAGCAGCCGAGTATGAAACCTCAAAGA

QA 1 157 1 157
DS 

RD RR2CW31TF 367 0 0
GAAGCAACCCCATGGCAATGATGAGGTCAGCTTGACCCTGAACATAACAGCAGACTTGCA
GTCACTATTTACTTGGAACA*AAAGCAGGTATTCGCTTTTGTAGCAGCCGAGTATGAAAC
CTCAAAGAACTCTCTGAATCAGGTTTCTCTATGGGATGCCATAATACCAGAGAAGGAGCA
AGCCAACTTCTGGATTCAAATCTCAAACAAGTACCGTTTCATAGACCAGGGACACAACCT
CCGAGGGAAAGAGTTCAACTTGACACTGCACTGGCATGTCATGCCCAAGACTGGCAAGAT
GTTTGCTGACAAAATAGTTATGTCTGGTTATCGCCTACCGAATGCATACAGATGATTATG
AAGAGGA

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR2CI57TF 694 0 0
GGGGAGAAAGGTTTCGACTTTCGTTACGAACCAGACGAGTGATTTGAAGAAGATGCATTC
TTTTGGATACAGAGCGAATGCTCTGCTCACGTTCGCTATCACGATACTTGCCTTCATTTG
CGCGATCGCGTCCTTCTCTGATAACTTCAGTAACCAAACACCCTCTGCTCAGATCCAGAT
ATTGAATATCAATTGGTTCCAGAAGCAACCCCATGGAAATGATGAGGTCAGCTTGACCCT
GAACATAACAGCAGACTTGCAGTCACTATTTACTTGGAACACAAAGCAGGTATTCGCTTT
TGTAGCAGCCGAGTATGAAACCTCAAAGAACTCTCTGAATCAGGTTTCTCTATGGGATGC
CATAATACCAGAGAAGGAGCAAGCCAACTTCTGGATTCAAATCTCAAACAAGTACCGTTT
CATAGACCAGGGACACAACCTCCGAGGGAAAGAGTTCAACTTGACACTGCACTGGCATGT
CATGCCCAAGACTGGCAAGATGTTTGCTGACAAAATAGTTATGTCTGGTTATCGCCTACC
GAATGCATACAGATGATTATGAAGAGGAGGAGGCCTCATGCATATCATCTAGTAGTGAAG
AGAGTTTATATCTCAGTTGAAACATTGTTTTTTAATGGAACTTATGAGCTAATAACTTGT
AGACTAATCCTTTGGATTCAGAACCATAAATCCT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL3229Contig1 912 2 4 U
GCCTCCACCTCCAACTCCGATCATATCTCAACAGCCACCTTCACCATCTCCCAAAATATC
TCCACAGCCACCAACTTCACCATCTCCTCCATCTCCAACTCCCATAATATCTCCACAGCC
ACCTACACCATCTCCTCCGCCTCCAACTCCCATTATATCTCCACAGCCACATTCACCATC
TCCTCCGCCTCCAACTCCCATTATGTCTCCACTTCCACCTGCACCATCTCCATCTCCCAT
AATATCTTCACCTTTGCCTCCAACTCCCAAAATGTCTCCGCCGCCACCTACACCATCTCC
CCCGCCTTCATCTCCCAAAATATCTCCACCGTCGCCAACACCGTCTCTTGCGCCTCCAAC
TCCAAAGACGTCTCCATCTCCACCGCCACCGACACCGTCTCTTGCGCCTCCAACTCCAAA
GACGTCTCCATCTCAACCGACGCCAACACCATCTCTTCCGCCTCCAACTCCCAAGAAGTC
TCCATCTCCTTCGCCACCAAGCCGTGATGATGATGAGCCATCGTCTCCTAGCCAGCCATC
GATTCCACCTCCGGAACATCATCACCATCACCATCACCATCACCATCAGAATCCATGGGA
ACACTTCAGAAGTTGTGTGAGAAACATGGGACCTGTTGGAGTGTGTCGTGGGCAGATGGC
GTTCAGTTTCTACACTAGGAAGTTTCAAGTCAGTGACTATTGTTGCAAAATTGTCGTCAA
CGTGAAAAATGAATGCGAAGATGCCATTTGGGGATACTTCACCGATCCTTACTTTATTGC
TCTAGTTCGTTTCACTTGTCACATGGCCTACTAGTTTTTTTTCTTCATTTTTATTAGGGT
TTTTTTCTTTAATGGTTTTGTTCTTGTTTTGGTTCGTTTTTAGTTCATGCAATATTGTCG
TCGTCCTCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU76TF U 1
AF RR2GU76JQB C 428
BS 1 678 RR2GU76TF
BS 679 680 RR2GU76JQB
BS 681 706 RR2GU76TF
BS 707 912 RR2GU76JQB

RD RR2GU76TF 706 0 0
GCCTCCACCTCCAACTCCGATCATATCTCAACAGCCACCTTCACCATCTCCCAAAATATC
TCCACAGCCACCAACTTCACCATCTCCTCCATCTCCAACTCCCATAATATCTCCACAGCC
ACCTACACCATCTCCTCCGCCTCCAACTCCCATTATATCTCCACAGCCACATTCACCATC
TCCTCCGCCTCCAACTCCCATTATGTCTCCACTTCCACCTGCACCATCTCCATCTCCCAT
AATATCTTCACCTTTGCCTCCAACTCCCAAAATGTCTCCGCCGCCACCTACACCATCTCC
CCCGCCTTCATCTCCCAAAATATCTCCACCGTCGCCAACACCGTCTCTTGCGCCTCCAAC
TCCAAAGACGTCTCCATCTCCACCGCCACCGACACCGTCTCTTGCGCCTCCAACTCCAAA
GACGTCTCCATCTCAACCGACGCCAACACCATCTCTTCCGCCTCCAACTCCCAAGAAGTC
TCCATCTCCTTCGCCACCAAGCCGTGATGATGATGAGCCATCGTCTCCTAGCCAGCCATC
GATTCCACCTCCGGAACATCATCACCATCACCATCACCATCACCATCAGAATCCATGGGA
ACACTTCAGAAGTTGTGTGAGAAACATGGGACCTGTTGGAGTGTGTCGTGGGCAGATGGC
GTTCAGTTTCTACACTAG**AGTTTCAAGTCAGTGACTATTGTTGC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2GU76JQB 485 0 0
CCATCTCAACCGACGCCAACACCATCTCTTCCGCCTCCAACTCCCAAGAAGTCTCCATCT
CCTTCGCCACCAAGCCGTGATGATGATGAGCCATCGTCTCCTAGCCAGCCATCGATTCCA
CCTCCGGAACATCATCACCATCACCATCACCATCACCATCAGAATCCATGGGAACACTTC
AGAAGTTGTGTGAGAAACATGGGACCTGTTGGAGTGTGTCGTGGGCAGATGGCGTTCAGT
TTCTACACTAGGAGGTTTCAAGTCAGTGACTATTGTTGCAAAATTGTCGTCAACGTGAAA
AATGAATGCGAAGATGCCATTTGGGGATACTTCACCGATCCTTACTTTATTGCTCTAGTT
CGTTTCACTTGTCACATGGCCTACTAGTTTTTTTTCTTCATTTTTATTAGGGTTTTTTTC
TTTAATGGTTTTGTTCTTGTTTTGGTTCGTTTTTAGTTCATGCAATATTGTCGTCGTCCT
CTTTC

QA 1 485 1 485
DS 



AS 1 2

CO CL3230Contig1 1077 2 6 U
GGATTCCTTCAAGAGAAGACATCGCTGTGCCTCCTTCCTTCCAATACTTGTATTTGCTTC
CTACCATCAACCATGGCTTATTCAGCTCCGATATCTCCATCCCTATCCGTCTCCAAAACC
CCACAACTCGCCAGATTCTCCTTCGCTTTCTCCCCGCTATTCTCTCGCCGCCCTAGGATT
CAGAATCTAAGGATGCCCACCAACAAGACGTGGTCGTCCGTGGTGGTGGTGGCGGCGACG
GCGGCAGAGAAGCAGCAGAAGAAGAGATACCCGGGAGAATCGAAAGGGTTTGTGGAGGAG
ATGAGGTTTGTGGCGATGAGACTTCACACGAGAGAGCAGGCCAAGGAAGGAGAGAAAGAG
ACGAAATCTCCCGAGGAACGTCCCGTCGCTAAATGGGAACCCACTGTTGAAGGTTACTTG
AGGTTTTTGGTGGATAGTAAGTTGGTTTATGACACCCTCGAAGGGATTATTCACCAATCC
ACTTTCCCTACTTATGCTGAATTCAAGAACACGGGGCTGGAAAGGGCAGAGAGTCTGGCA
ACTGATTTGAAGTGGTTTGAAGAACAAGGCTACGAGATTCCGGAACCAACTGATTCTGGT
AAAACATATGCTCAGTATCTAAAGGATTTAGCGGAGAAAGATCCTCCTTCATTCATTTGT
CACTTCTACAACATCTACTTCGCCCACAGCGCTGGTGGCCGAATGATTGGAAGAAAGGTA
GCCGAGAGGATTCTGGACAATAGAGAACTCGAGTTTTACAAATGGGGCGGCGAGCTTTCT
CAGTTGTTGCAGAACGTGAGGGAGAAACTGAACAAAGTTGCCGAGGAGTGGACGAGAGAA
GAAAAGGATCATTGTTTGGAAGAGACGGAGAAATCGTTCAAGTATTCTGGTGAGATACTT
CGTCTCATTTTGTCCTGATTTCTCTCTCTCTCTGTCTCTATAAAAGAGCTTGTGGCAAAA
CTAAATCCCCTGCTCAAAGTTGTTAAAATTCCTGTATCATATTTAAACAACTCGCTTCTG
CTTGTTTGTATCAAACTCTTTATTTGCTTAAAAAATCTATTACGACGTTGGAAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DB55TF U 1
AF RR2DB55JQ C 352
BS 1 717 RR2DB55TF
BS 718 718 RR2DB55JQ
BS 719 739 RR2DB55TF
BS 740 740 RR2DB55JQ
BS 741 756 RR2DB55TF
BS 757 1077 RR2DB55JQ

RD RR2DB55TF 771 0 0
GGATTCCTTCAAGAGAAGACATCGCTGTGCCTCCTTCCTTCCAATACTTGTATTTGCTTC
CTACCATCAACCATGGCTTATTCAGCTCCGATATCTCCATCCCTATCCGTCTCCAAAACC
CCACAACTCGCCAGATTCTCCTTCGCTTTCTCCCCGCTATTCTCTCGCCGCCCTAGGATT
CAGAATCTAAGGATGCCCACCAACAAGACGTGGTCGTCCGTGGTGGTGGTGGCGGCGACG
GCGGCAGAGAAGCAGCAGAAGAAGAGATACCCGGGAGAATCGAAAGGGTTTGTGGAGGAG
ATGAGGTTTGTGGCGATGAGACTTCACACGAGAGAGCAGGCCAAGGAAGGAGAGAAAGAG
ACGAAATCTCCCGAGGAACGTCCCGTCGCTAAATGGGAACCCACTGTTGAAGGTTACTTG
AGGTTTTTGGTGGATAGTAAGTTGGTTTATGACACCCTCGAAGGGATTATTCACCAATCC
ACTTTCCCTACTTATGCTGAATTCAAGAACACGGGGCTGGAAAGGGCAGAGAGTCTGGCA
ACTGATTTGAAGTGGTTTGAAGAACAAGGCTACGAGATTCCGGAACCAACTGATTCTGGT
AAAACATATGCTCAGTATCTAAAGGATTTAGCGGAGAAAGATCCTCCTTCATTCATTTGT
CACTTCTACAACATCTACTTCGCCCACAGCGCTGGTGGCCGAATGATTGGAAGAAAG*TA
GCCGAGAGGATTCTGGACA*TAGAGAACTCGAGTTT
ACAATGGGGCGGCGA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2DB55JQ 726 0 0
GAGAAAGAGACGAAATCTCCCGAGGAACGTCCCGTCGCTAAATGGGAACCCACTGTTGAA
GGTTACTTGAGGTTTTTGGTGGATAGTAAGTTGGTTTATGACACCCTCGAAGGGATTATT
CACCAATCCACTTTCCCTACTTATGCTGAATTCAAGAACACGGGGCTGGAAAGGGCAGAG
AGTCTGGCAACTGATTTGAAGTGGTTTGAAGAACAAGGCTACGAGATTCCGGAACCAACT
GATTCTGGTAAAACATATGCTCAGTATCTAAAGGATTTAGCGGAGAAGGATCCTCCTTCA
TTCATTTGTCACTTCTACAACATCTACTTCGCCCACAGCGCTGGTGGCCGAATGATTGGA
AGAAAGGTAGCCGAGAGGATTCTGGACAATAGAGAACTCGAGTTTTACAAATGGGGCGGC
GAGCTTTCTCAGTTGTTGCAGAACGTGAGGGAGAAACTGAACAAAGTTGCCGAGGAGTGG
ACGAGAGAAGAAAAGGATCATTGTTTGGAAGAGACGGAGAAATCGTTCAAGTATTCTGGT
GAGATACTTCGTCTCATTTTGTCCTGATTTCTCTCTCTCTCTGTCTCTATAAAAGAGCTT
GTGGCAAAACTAAATCCCCTGCTCAAAGTTGTTAAAATTCCTGTATCATATTTAAACAAC
TCGCTTCTGCTTGTTTGTATCAAACTCTTTATTTGCTTAAAAAATCTATTACGACGTTGG
AAGTTC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL3231Contig1 403 2 2 U
GCAAGGACGTCCAGTTTGTCCCAAACCGCTGTTGTGAGTATGTCCTTGAGATTGGTAAGC
CTTTGACGATTATTGGCTGAGAGAGACAAAAATGGGGCTCCCACCATCGGACGTGTCTAT
CAGGTCTTTAAAGGACGTAGTATAAACAAAGTTGATGAATTGGTTTCTGATTTGAAATCA
ACTTCAGAGTGTTGTGAGATGTTGAGCTTGTTGTTAACAGGTATCGGTGTGTCTATGTTA
GCTGTGAGCTTTCTGCATAATCATCTAGAGTTCTCCAAGTGAAAAAAAAAAAGACTGCGA
CGACTAAGCTTATAACAACACTTGTTGCTTTCGGGATGGTTTGGTGTGTGTCTGGTTTAT
CATATACCAATTTATATATTTTATGTTAATTATGGTTATGGGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AN48JQ C 1
AF RR2AN48TF U 1
BS 1 1 RR2AN48JQ
BS 2 403 RR2AN48TF

RD RR2AN48JQ 403 0 0
GCAAGGACGTCCAGTTTGTCCCAAACCGCTGTTGTGAGTATGTCCTTGAGATTGGTAAGC
CTTTGACGATTATTGGCTGAGAGAGACAAAAATGGGGCTCCCACCATCGGACGTGTCTAT
CAGGTCTTTAAAGGACGTAGTATAAACAAAGTTGATGAATTGGTTTTTGATTTGAAATCA
ACTTCAGAGTGTTGTGAGATGTTGAGCTTGTTGTTAACAGGTATCGGTGTGTCTATGTTA
GCTGTGAGCTTTCTGCATAATCATCTAGAGTTCTCCAAGTGAAAAAAAAAAAGACTGCGA
CGACTAAGCTTATAACAACACTTGTTGCTTTCGGGATGGTTTGGTGTGTGTCTGGTTTAT
CATATACCAATTTATATATTTTATGTTAATTATGGTTATGGGC

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2AN48TF 403 0 0
G
CAAGGACGTCCAGTTTGTCCCAAACCGCTGTTGTGAGTATGTCCTTGAGATTGGTAAGCC
TTTGACGATTATTGGCTGAGAGAGACAAAAATGGGGCTCCCACCATCGGACGTGTCTATC
AGGTCTTTAAAGGACGTAGTATAAACAAAGTTGATGAATTGGTTTCTGATTTGAAATCAA
CTTCAGAGTGTTGTGAGATGTTGAGCTTGTTGTTAACAGGTATCGGTGTGTCTATGTTAG
CTGTGAGCTTTCTGCATAATCATCTAGAGTTCTCCAAGTGAAAAAAAAAAAGACTGCGAC
GACTAAGCTTATAACAACACTTGTTGCTTTCGGGATGGTTTGGTGTGTGTCTGGTTTATC
ATATACCAATTTATATATTTTATGTTAATTATGGTTATGGGC

QA 2 403 2 403
DS 



AS 1 3

CO CL3232Contig1 1517 3 19 U
GCTTCGATAGTCTCTTTCAAAGTCGAATCCGACGTCGTTTCCTTGGACGGGCACGATTTT
CTTGAAACGGACGCTGAGGTTGGAGACGACGGGAAGTTACACGTCACGGTGAGGAAGTCT
AACGCTTCTCGGAGATCTTTTGTTGGTCCTAATATGACTCCGCGTCCGTCCAATCTCACC
GGAGCTGAGATTTATAGTCTCAGCACGACGCCGAGAGGCTCTAATTTTAACCACTCGGAT
TTTTACTCGGTGATGGGATTTTCCGGTGGCCGGCTCCCGAACTTCGGTCCGGCGGATATG
TACTCTGTTCAGTCGTCGAGGGGACCGACTCCGAGACCTTCGAATTTCGATGAGAGTTGT
GGTATGGCTTCGTCTCCTAGATTCGGGTATTACCCGGGTCCAACCGGGTCGTACCCGGCT
CCGAATCCGGAATTTTCATCCTCGGCCGCTAGTAAAACCGGGGTGAAGTCGAATAGTCAT
GATGCTAAGGAGCTTCATATGTTTGTGTGGGGCTCCAACGGGTCACCCGTTACGGATAGA
CCGGGTCTTCCACTATCCGGGGGAGCTGATAATGGAGCGAGTGAACAAGGTGGAGTATCC
GATCAGGAAGCGAAGGAGATCCGGATGTTAGTTTCTGATCCTCCAGCAGCTGCTCCGACC
AATGGAGACTTTGACGGTGAAGAAGAGTCAGGGAAGGTGAAGGAAGTGCTACACAAGCTT
CGATGTAACTCCACGGCCGAGCTAAACCCTAAAGAAGCGGCGGAAACAGGTGAAACAGGG
CCGGGAAAACATATGCCGCCGGCCAGTGTGATGACTCGGCTGATACTGATAATGGTGTGG
AGGAAACTGATCAGGAACCCAAACACTTACTCTAGTCTCATTGGTCTTATTTGGGCTCTC
GTCGCTTTCCGGTGGAATGTGGCAATGCCTAAAATCATTCAAGGATCAATCTCAATTCTC
TCTGATGCTGGTCTTGGTATGGCAATGTTCAGTTTGGGGTTGTTCATGGCGTTGCAACCT
AAGTTAATAGCTTGCGGAAATTCTACGGCAACTTTTGCAATGGCGGTGAGGTTCTTGACT
GGACCAGCAGTAATGGCCGTTGCAGCCATGGCTATTGGATTACGCGGAGATCTATTACGC
GTGGCCATAGTTCAAGCTGCATTGCCACAAGGAATCGTGCCATTTGTGTTTGCAAAAGAA
TACAATGTTCATCCGGCGATCTTAAGTACAGGGGTGATATTTGGGATGCTTATCGCACTA
CCGATCACACTTGTTTACTACATTCTCCTCGGGCTATAAGCTCACTAGTGGTGAAGTTTT
GCTTCAGACAAAAAACAAGATCGTTCCAAGTTTAGTGGAACAAAACTAGAGAATGTAAAC
ACAAGAGGTTTATTAAAGTTAGTGACCAAGATGTGATTTGAGGATCCAAAGCCCCTTTCT
TGTCAAAACTTTCCTATGGATTATTTGAGAAGAGACAAGCGACGGGAAACAAGGGCAACG
AGACAAAAGAAACCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F351TF U 1
AF RR2FK42TF U 482
AF RR2F351JQ C 786
BS 1 577 RR2F351TF
BS 578 578 RR2FK42TF
BS 579 602 RR2F351TF
BS 603 803 RR2FK42TF
BS 804 804 RR2F351JQ
BS 805 813 RR2FK42TF
BS 814 814 RR2F351JQ
BS 815 902 RR2FK42TF
BS 903 903 RR2F351JQ
BS 904 1118 RR2FK42TF
BS 1119 1119 RR2F351JQ
BS 1120 1173 RR2FK42TF
BS 1174 1174 RR2F351JQ
BS 1175 1196 RR2FK42TF
BS 1197 1197 RR2F351JQ
BS 1198 1204 RR2FK42TF
BS 1205 1205 RR2F351JQ
BS 1206 1215 RR2FK42TF
BS 1216 1517 RR2F351JQ

RD RR2F351TF 602 0 0
GCTTCGATAGTCTCTTTCAAAGTCGAATCCGACGTCGTTTCCTTGGACGGGCACGATTTT
CTTGAAACGGACGCTGAGGTTGGAGACGACGGGAAGTTACACGTCACGGTGAGGAAGTCT
AACGCTTCTCGGAGATCTTTTGTTGGTCCTAATATGACTCCGCGTCCGTCCAATCTCACC
GGAGCTGAGATTTATAGTCTCAGCACGACGCCGAGAGGCTCTAATTTTAACCACTCGGAT
TTTTACTCGGTGATGGGATTTTCCGGTGGCCGGCTCCCGAACTTCGGTCCGGCGGATATG
TACTCTGTTCAGTCGTCGAGGGGACCGACTCCGAGACCTTCGAATTTCGATGAGAGTTGT
GGTATGGCTTCGTCTCCTAGATTCGGGTATTACCCGGGTCCAACCGGGTCGTACCCGGCT
CCGAATCCGGAATTTTCATCCTCGGCCGCTAGTAAAACCGGGGTGAAGTCGAATAGTCAT
GATGCTAAGGAGCTTCATATGTTTGTGTGGGGCTCCAACGGGTCACCCGTTACGGATAGA
CCGGGTCTTCCACTATCCGGGGGAGCTGATAATGGAGGGAGTGAACAAGGTGGAGTATCC
GA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2FK42TF 744 0 0
GG
GCTAAGGAGCTTCATATGTTTGTGTGGGGCTCCAACGGGTCACCCGTTTCGGATAGACCG
GGTCTTCCACTATCCGGGGGAGCTGATAATGGAGCGAGTGAACAAGGTGGAGTATCCGAT
CAGGAAGCGAAGGAGATCCGGATGTTAGTTTCTGATCCTCCAGCAGCTGCTCCGACCAAT
GGAGACTTTGACGGTGAAGAAGAGTCAGGGAAGGTGAAGGAAGTGCTACACAAGCTTCGA
TGTAACTCCACGGCCGAGCTAAACCCTAAAGAAGCGGCGGAAACAGGTGAAACAGGGCCG
GGAAAACATATGCCGCCGGCGAGTGTGATGTCTCGGCTGATACTGATAATGGTGTGGAGG
AAACTGATCAGGAACCCAAACACTTACTCTAGTCTCATTGGTCTTATTTGGGCTCTCGTT
GCTTTCCGGTGGAATGTGGCAATGCCTAAAATCATTCAAGGATCAATCTCAATTCTCTCT
GATGCTGGTCTTGGTATGGCAATGTTCAGTTTGGGGTTGTTCATGGCGTTGCAACCTAAG
TTAATAGCTTGCGGAAATTCTACGGCAACTTTTGCAATGGCGGTGAGGTTCTTGACTGGA
CCAGCAGTAATGGCCGTTGCAGCCATGGCTATTGGGTTACGCGGAGATCTATTACGCGTG
GCCATAGTTCAAGCTGCATTGCCACAAGGA*TCGTGCCATTTGTGTTTGCAAA*GAATAC
A*TGTTCATCCG
CGATCTAAGT

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR2F351JQ 732 0 0
AAAACATATGTCGCCGGCCAGTGTGATGACTCGGCTGATACTGATAATGGTGTGGAGGAA
ACTGATCAGGAACCCAAACACTTACTCTAGTCTCATTGGTCTTATTTGGGCTCTCGTCGC
TTTCCGGTGGAATGTGGCAATGCCTAAAATCATTCAAGGATCAATCTCAATTCTCTCTGA
TGCTGGTCTTGGTATGGCAATGTTCAGTTTGGGGTTGTTCATGGCGTTGCAACCTAAGTT
AATAGCTTGCGGAAATTCTAC**CAACTTTTGCAATGGCGGTGAGGTTCTTGACTGGACC
AGCAGTAATGGCCGTTGCAGCCATGGCTATTGGATTACGCGGAGATCTATTACGCGTGGC
CATAGTTCAAGCTGCATTGCCACAAGGAATCGTGCCATTTGTGTTTGCAAAAGAATACAA
TGTTCATCCGGCGATCTTAAGTACAGGGGTGATATTTGGGATGCTTATCGCACTACCGAT
CACACTTGTTTACTACATTCTCCTCGGGCTATAAGCTCACTAGTGGTGAAGTTTTGCTTC
AGACAAAAAACAAGATCGTTCCAAGTTTAGTGGAACAAAACTAGAGAATGTAAACACAAG
AGGTTTATTAAAGTTAGTGACCAAGATGTGATTTGAGGATCCAAAGCCCCTTTCTTGTCA
AAACTTTCCTATGGATTATTTGAGAAGAGACAAGCGACGGGAAACAAGGGCAACGAGACA
AAAGAAACCGTC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 3

CO CL3233Contig1 392 3 2 U
GGAGATCTACCGTGTCGCTTCCCTTTACTCAGAGATGGCCAAGTCGAAGAATCACACGGC
TCATAACCAGTCGGCTAAGGCCCACAAGAACGGAATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCA
CACTCCCACCAGAGGGATGGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCGAGGAAGCA
CAACGTCAAGAACGGCGAGAATGCCACCGCTGAAGACTAAGCTTTTTGATTCTCTCTGAG
AGGTTTTTTATGAAATTAAGTTTGTTTTTAGACAAAAGAACCAGTTTATTATACATTTCG
CGTTATGTTTGGTTTGATTATGTTTAAGCATGCGGTTTGTGTAACTCTTTTATCCTGGCC
TTAATTTTAATATCATGGATTTTTCATTTCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2AH83TF U 1
AF RR2AR44TF U 1
AF RR2HA59TF U 14
BS 1 389 RR2AH83TF
BS 390 392 RR2HA59TF

RD RR2AH83TF 391 0 0
GGAGATCTACCGTGTCGCTTCCCTTTACTCAGAGATGGCCAAGTCGAAGAATCACACGGC
TCATAACCAGTCGGCTAAGGCCCACAAGAACGGAATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCA
CACTCCCACCAGAGGGATGGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCGAGGAAGCA
CAACGTCAAGAACGGCGAGAATGCCACCGCTGAAGACTAAGCTTTTTGATTCTCTCTGAG
AGGTTTTTTATGAAATTAAGTTTGTTTTTAGACAAAAGAACCAGTTTATTATACATTTCG
CGTTATGTTTGGTTTGATTATGTTTAAGCATGCGGTTTGTGTAACTCTTTTATCCTGGCC
TTAATTTTAATATCATGGATTTTTCATTT
CT

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2AR44TF 389 0 0
GGAGATCTACCGTGTCGCTTCCCTTTACTCAGAGATGGCCAAGTCGAAGAATCACACGGC
TCATAACCAGTCGGCTAAGGCCCACAAGAACGGAATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCA
CACTCCCACCAGAGGGATGGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCGAGGAAGCA
CAACGTCAAGAACGGCGAGAATGCCACCGCTGAAGACTAAGCTTTTTGATTCTCTCTGAG
AGGTTTTTTATGAAATTAAGTTTGTTTTTAGACAAAAGAACCAGTTTATTATACATTTCG
CGTTATGTTTGGTTTGATTATGTTTAAGCATGCGGTTTGTGTAACTCTTTTATCCTGGCC
TTAATTTTAATATCATGGATTTTTCATTT

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2HA59TF 379 0 0
GTCGCTTCCCTTTACTCAGAGATGGCCAAGTCGAAGAATCACA*GGCTCATAACCAGTCG
GCTAAGGCCCACAAGAACGGAATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACTCCCACCAGA
GGGATGGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCGAGGAAGCACAACGTCAAGAAC
GGCGAGAATGCCACCGCTGAAGACTAAGCTTTTTGATTCTCTCTGAGAGGTTTTTTATGA
AATTAAGTTTGTTTTTAGACAAAAGAACCAGTTTATTATACATTTCGCGTTATGTTTGGT
TTGATTATGTTTAAGCATGCGGTTTGTGTAACTCTTTTATCCTGGCCTTAATTTTAATAT
CATGGATTTTTCATTTCTT

QA 1 379 1 379
DS 



AS 1 3

CO CL3234Contig1 1321 3 4 U
GGATTCACTCTCTCCTTCCTCTCTGCTCTCCGCCCAAGTATCGCAGTTCCGGCCACCAGA
GAAACAAAGGGGTATCCAAGTATGGCTTCAGAGTCTCCGGTGAGGCACAGGCAGTCTCCA
CGACGGAGAAGTCCATCTAGAAGAGATGAATCTTCAAGGTCTCCTTCACCACGGACGAAG
AGACTGAGGAGAGCTCAAGGTGAAAGGGAGGCTGGGAGAGGTAGAGAGAGAGAAGACAGC
AGAGGAAGGGAGAAGAGGGGGGAAAGGGAGAGAAGAAGAGAAGGAGACAAGGAGGAGAAG
ACGACGAGGAGGGACGTGACGGATTTGGAAGTTGGGGATAAGAGACGACGCGGCGGCTCA
GGGAGAGAGGAGACTGAAGAAAGGAGAACAGCGGAGGATGAGAGACAAACTAATAGAGGA
AGACGTGAGAGGTCTGCTTCACCGTTTGATAGGAATAGTCGCAAGATTAGGCGTTCAACA
GAGAGACCTTCTGCATCAAGGCATGATGAGGGATCTAATGTAAGAGGGAGGGGCGAGGAA
CCCAATAATGAAGATGATTCAATTGCTAGAATGAAAGCAGCTGAAGAAGCTTTGGCAAAG
AAGAAAAAGGAAGAACCATCGTTTGAGCTATCAGGGAAACTTGCGGAAGAGACCAACAAA
TACAGAGGTATCCCGCTCCTCTTCAATGAGCCACCAGAGGCCAGAAAACCCAACAAAAGA
TGGAGACTTTATGTTTTCAAGGATAGCGAACCACTAGATGAGCCACTCCAGCTCCATCGC
CAAAGCTGCTACCTCTTTGGACGTGAGAGAAGAGTCGCTGACATTCCTACTGATCACCCT
TCTTGCAGCAAGCAGCATGCTGTTATCCAGTACCGGGAAGTGACAGTGGACAAACCAGAT
GGTATGGTGGAGAAGCAAGTGAAGCCTTACCTTACGGATCTTGGCAGCACCAACAAGACT
TACATCAACAAAGACCCTATTGAATCAGAACGCTACTATGAGCTGCGCGAGAAAGATACC
ATCAAGTTTGGTAATAGCAGCCGAGAGTACGTACTGTTGCACGAGGGTTCTGCGGAGTGA
ATTAAATCAGAGTCAAGCAGCAAGGAGATCGCTTTTCTCAGGGGGTTTAAAGGGGGGATA
GTTGAGCAGCTTCGTTTCTACTTTCCTCAGATAGCGTATCTACTGTGTTGGTTACACAGT
CTCGACATTTTGTTAATACTTACCATTTAGAAAGCATTTGCTTACCGACCCCAATGTTAA
ATTTGAAAGAGATTTTAATTTCTAGCTTTTTGTTTTGTAAGGTGACCCTTTGCTAAGAGA
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2E691TF U 38
AF RR2GN26TF U 1
AF RR2E691JQ C 503
BS 1 382 RR2GN26TF
BS 383 383 RR2E691TF
BS 384 699 RR2GN26TF
BS 700 1321 RR2E691JQ

RD RR2E691TF 402 0 0
GG
ATCGCAGTTCCGGCCACCAGAGAAACAAAGGGGTATCCAAGTATGGCTTCAGAGTCTCCG
GTGAGGCACAGGCAGTCTCCACGACGGAGAAGTCCATCTAGAAGAGATGAATCTTCAAGG
TCTCCTTCACCACGGACGAAGAGACTGAGGAGAGCTCAAGGTGAAAGGGAGGCTGGGAGA
GGTAGAGAGAGAGAAGACAGCAGAGGAAGGGAGAAGAGGGGGGAAAGGGAGAGAAGAAGA
GAAGGAGACAAGGAGGAGAAGACGACGAGGAGGGACGTGACGGATTTGGAAGTTGGGGAT
AAGAGACGACGCGGCGGCTCAGGGAGAGAGGAGACTGAAGAAAGGAGAACAGCGGAGGAT
GAGAGATAAACTAATAGAGGAAGACGTGGGAGGTCTGCTT

QA 3 402 3 402
DS 

RD RR2GN26TF 709 0 0
GGATTCACTCTCTCCTTCCTCTCTGCTCTCCGCCCAAGTATCGCAGTTCCGGCCACCAGA
GAAACAAAGGGGTATCCAAGTATGGCTTCAGAGTCTCCGGTGAGGCACAGGCAGTCTCCA
CGACGGAGAAGTCCATCTAGAAGAGATGAATCTTCAAGGTCTCCTTCACCACGGACGAAG
AGACTGAGGAGAGCTCAAGGTGAAAGGGAGGCTGGGAGAGGTAGAGAGAGAGAAGACAGC
AGAGGAAGGGAGAAGAGGGGGGAAAGGGAGAGAAGAAGAGAAGGAGACAAGGAGGAGAAG
ACGACGAGGAGGGACGTGACGGATTTGGAAGTTGGGGATAAGAGACGACGCGGCGGCTCA
GGGAGAGAGGAGACTGAAGAAATGAGAACAGCGGAGGATGAGAGACAAACTAATAGAGGA
AGACGTGAGAGGTCTGCTTCACCGTTTGATAGGAATAGTCGCAAGATTAGGCGTTCAACA
GAGAGACCTTCTGCATCAAGGCATGATGAGGGATCTAATGTAAGAGGGAGGGGCGAGGAA
CCCAATAATGAAGATGATTCAATTGCTAGAATGAAAGCAGCTGAAGAAGCTTTGGCAAAG
AAGAAAAAGGAAGAACCATCGTTTGAGCTATCAGGGAAACTTGCGGAAGAGACCAACAAA
TACAGAGGTATCCCGCTCCTCTTCAATGAGCCACCAGAG
CTAGAAACCA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2E691JQ 819 0 0
ATGATGAGGGATCTAATGTAAGAGGGAGGGGCGAGGAACCCAATAATGAAGATGATTCAA
TTGCTAGAATGAAAGCAGCTGAAGAAGCTTTGGCAAAGAAGAAAAAGGAAGAACCATCGT
TTGAGCTATCAGGGAAACTTGCGGAAGAGACCAACAAATACAGAGGTATCCCGCTCCTCT
TCAATGAGCCACCAGAGGCCAGAAAACCCAACAAAAGATGGAGACTTTATGTTTTCAAGG
ATAGCGAACCACTAGATGAGCCACTCCAGCTCCATCGCCAAAGCTGCTACCTCTTTGGAC
GTGAGAGAAGAGTCGCTGACATTCCTACTGATCACCCTTCTTGCAGCAAGCAGCATGCTG
TTATCCAGTACCGGGAAGTGACAGTGGACAAACCAGATGGTATGGTGGAGAAGCAAGTGA
AGCCTTACCTTACGGATCTTGGCAGCACCAACAAGACTTACATCAACAAAGACCCTATTG
AATCAGAACGCTACTATGAGCTGCGCGAGAAAGATACCATCAAGTTTGGTAATAGCAGCC
GAGAGTACGTACTGTTGCACGAGGGTTCTGCGGAGTGAATTAAATCAGAGTCAAGCAGCA
AGGAGATCGCTTTTCTCAGGGGGTTTAAAGGGGGGATAGTTGAGCAGCTTCGTTTCTACT
TTCCTCAGATAGCGTATCTACTGTGTTGGTTACACAGTCTCGACATTTTGTTAATACTTA
CCATTTAGAAAGCATTTGCTTACCGACCCCAATGTTAAATTTGAAAGAGATTTTAATTTC
TAGCTTTTTGTTTTGTAAGGTGACCCTTTGCTAAGAGAA

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 2

CO CL3235Contig1 567 2 1 U
AGTACTTGTAGTCTATATACATAACCTTGTCTTTTATCAAGTCTGTCGATGGTTCATATT
ATTCCGTACGAATTTTTTTATAGATTCAGTAACCCTGAAGAGCCTAACACAAGAGCCTAA
GCAAATTCGATGGTTTAAACAGTTTAGTAGAGCTGTGATCATGTGGGTGCATGAACTTGC
AGTTGGGACAAACAGGAGTTGATGTGCACAGCATAACCAACATGTGGCATTTCATGCACA
CTTTTGTTACCATCTCTTGCTCCTTTCGATCAACGTCATCATCATCTCCACCTTCAAACG
CAAGCCATGACATTGATCGGTTTAATCCTGTCCCAGTCGTGGTCTTCATCCTCGGGCTTG
TCAGATTGATACCCTTCGATGATGACACGTTTTCATTGTCATTTGAGGATTCTTCTATTT
TAGTTGCGGTGTTTGTAGGTGAATAAGAAGGTGAGAGGTTCAGCTCAAGGTCTAGACTCA
TCTTTGGTCGCTCAACAAGCAACGGATCGTTGGGGTGTCTCGTCCTATGATCCACAGATG
TTCTCGGATAGCTCTTAGCCTCTATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E544JQ U 91
AF RR2C127JQ U 1
BS 1 567 RR2C127JQ

RD RR2E544JQ 190 0 0
AACCCTGAAGAGCCTAACACAAGAGCCTAAGCAAATTCGATGGTTTAAACAGTTTAGTAG
AGCTGTGATCATGTGGGTGCATGAACTTGCAGTTGGGACAAACAGGAGTTGATGTGCACA
GCATAACCAGCATGTGGCATTTCATGCACACTTTTGTTACCATCTCTTGCTCCTTTCGAT
CAAGGTCATC

QA 1 190 1 190
DS 

RD RR2C127JQ 567 0 0
AGTACTTGTAGTCTATATACATAACCTTGTCTTTTATCAAGTCTGTCGATGGTTCATATT
ATTCCGTACGAATTTTTTTATAGATTCAGTAACCCTGAAGAGCCTAACACAAGAGCCTAA
GCAAATTCGATGGTTTAAACAGTTTAGTAGAGCTGTGATCATGTGGGTGCATGAACTTGC
AGTTGGGACAAACAGGAGTTGATGTGCACAGCATAACCAACATGTGGCATTTCATGCACA
CTTTTGTTACCATCTCTTGCTCCTTTCGATCAACGTCATCATCATCTCCACCTTCAAACG
CAAGCCATGACATTGATCGGTTTAATCCTGTCCCAGTCGTGGTCTTCATCCTCGGGCTTG
TCAGATTGATACCCTTCGATGATGACACGTTTTCATTGTCATTTGAGGATTCTTCTATTT
TAGTTGCGGTGTTTGTAGGTGAATAAGAAGGTGAGAGGTTCAGCTCAAGGTCTAGACTCA
TCTTTGGTCGCTCAACAAGCAACGGATCGTTGGGGTGTCTCGTCCTATGATCCACAGATG
TTCTCGGATAGCTCTTAGCCTCTATAG

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL3236Contig1 925 2 4 U
GGGGCTAGCAAAGAGGTTGAAACTGAGGTCCCAGCTGAGGAAGATGAGTCAGCGGAAGAT
GAAACTGAAACTACCTCTACCGAGGAAGAGAAGGAAGAAGATGCTGAGGATAAAGACAGT
GAGAAAAAGCCGAAAACCAAGAAGGTGAAAGAAACAGTTTATGAATGGGAGCTTCTGAAT
GATGTCAAGGCTATATGGCTGAGAAGTCCAAAGGAGGTGACAGAGGAAGAGTACACTAAA
TTCTACCACTCTCTCGCAAAGGATTTCTCTGACGAGAAGCCAATGGCTTGGAGTCACTTC
AATGCTGAAGGTGATGTTGAATTCAAGGCTGTATTGTATGTTCCTCCGAAAGCTGCCCAT
GATCAGTACGAGAGCTACTACAACACTAACAAGGCGAACTTGAAGCTCTATGTTAGGAGG
GTTTTCATCTCGGATGAATTTGATGAGCTTCTACCTAAATATTTGAGTTTCTTGAAGGGT
CTTGTTGATTCTGACACATTGCCTCTAAATGTATCACGAGAAATGCTTCAACAACACAGC
AGCTTAAAGACAATAAAGAAGAAGCTTATCCGAAAGGCCCTTGATATGATCCGCAAGCTT
GCTGAGGAAGACCCTGATGAGGCCCATGACGATGACAAAAAAGATGTGGAGAAGTCTGGT
GAGAATGACGAGAAGAAGGGTCAATACACAAAGTTCTGGAAAGAGTTTGGCAAGTCGATT
AAACTTGGCATCATTGAGGATGCTTCTAACAGGAACCGCCTGGCTAAACTTCTTCGTTTT
GAAACAACAAAGTCCGATGGAAAATTGACTTCACTGGATCAGTACATTAAGAGAATGAAA
AAGGGGCAAAAAGACGTATTTTTATTACGGGAAGCAGCAAGGAGCAACTGGAGAAATCTC
CATTCCTGGAGAGGCTCATCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G682TF U 1
AF RR2BP49TF U 326
BS 1 641 RR2G682TF
BS 642 642 RR2BP49TF
BS 643 679 RR2G682TF
BS 680 925 RR2BP49TF

RD RR2G682TF 684 0 0
GGGGCTAGCAAAGAGGTTGAAACTGAGGTCCCAGCTGAGGAAGATGAGTCAGCGGAAGAT
GAAACTGAAACTACCTCTACCGAGGAAGAGAAGGAAGAAGATGCTGAGGATAAAGACAGT
GAGAAAAAGCCGAAAACCAAGAAGGTGAAAGAAACAGTTTATGAATGGGAGCTTCTGAAT
GATGTCAAGGCTATATGGCTGAGAAGTCCAAAGGAGGTGACAGAGGAAGAGTACACTAAA
TTCTACCACTCTCTCGCAAAGGATTTCTCTGACGAGAAGCCAATGGCTTGGAGTCACTTC
AATGCTGAAGGTGATGTTGAATTCAAGGCTGTATTGTATGTTCCTCCGAAAGCTGCCCAT
GATCAGTACGAGAGCTACTACAACACTAACAAGGCGAACTTGAAGCTCTATGTTAGGAGG
GTTTTCATCTCGGATGAATTTGATGAGCTTCTACCTAAATATTTGAGTTTCTTGAAGGGT
CTTGTTGATTCTGACACATTGCCTCTAAATGTATCACGAGAAATGCTTCAACAACACAGC
AGCTTAAAGACAATAAAGAAGAAGCTTATCCGAAAGGCCCTTGATATGATCCGCAAGCTT
GCTGAGGAAGACCCTGATGAGGCCCATGACGATGACAAAAA*GATGTGGAGAAGTCTGGT
GAGAATGACGAGAAGAAGG
TCATA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2BP49TF 600 0 0
G
GGCTGTATTGTATGTTCCTCCGAAAGCTGCCCATGATCAGTACGAGAGCTACTACAACAC
TAACAAGGCGAACTTGAAGCTCTATGTTAGGAGGGTTTTCATCTCGGATGAATTTGATGA
GCTTCTACCTAAATATTTGAGTTTCTTGAAGGGTCTTGTTGATTCTGACACATTGCCTCT
AAATGTATCACGAGAAATGCTTCAACAACACAGCAGCTTAAAGACAATAAAGAAGAAGCT
TATCCGAAAGGCCCTTGATATGATCCGCAAGCTTGCTGAGGAAGACCCTGATGAGGCCCA
TGACGATGACAAAAAAGATGTGGAGAAGTCTGGTGAGAATGACGAGAAGAAGGGTCAATA
CACAAAGTTCTGGAAAGAGTTTGGCAAGTCGATTAAACTTGGCATCATTGAGGATGCTTC
TAACAGGAACCGCCTGGCTAAACTTCTTCGTTTTGAAACAACAAAGTCCGATGGAAAATT
GACTTCACTGGATCAGTACATTAAGAGAATGAAAAAGGGGCAAAAAGACGTATTTTTATT
ACGGGAAGCAGCAAGGAGCAACTGGAGAAATCTCCATTCCTGGAGAGGCTCATCAAAAA

QA 2 600 2 600
DS 



AS 1 2

CO CL3237Contig1 1109 2 2 U
GGACGATCGGACCAATGGGACTCCCCAAAAGGGTCAGACTCAGACCAAAACTCCAAATGG
TGGAGGGAGTGTGAAGAGTGAGATCAAAGATTTGTCTGATGCGTTCTCTAAGCTCAACCC
GTTGGCTAAGGAGTTTGTTCCTCCTTCACTTGCTCGAACCCAATCTGGAAATGGATTACG
GTTTACTAACAATTTTGCAGATGGGAGTTATCATCTTTCTACAAGGAGAAGGAGTTTTGG
CCAAGGGAAGAGAAGAATGAACAAAAGAACCAGCTTGGCTCAGAAGGATGATATCATCAG
GAGAACTGTATATGTCTCTGACATTGATCAACAGGTTACCGAGGAGAACCTCGCAGGTGT
CTTTGTTAACTGTGGACAGGTAGTTGATTGTCGTGTCTGCGGTGATCCAAAGTCTGTCCT
TCGTTTTGCATTCGTTGAGTTCACCAATGAAGAGGGAGCTAGGGCTGCTTTGAGCATGTC
AGGAACAGTACTTGGTTTTTACCCTCTTAAAGTGCTTCCTTCCAAAACCGCTATCGCCCC
TGTTAACCCCACTTTCCTTCCCCGGTTTGAGGATGAGCGTGAGATGTGCGTGAGGACTGT
TTACTGTACCAACATTGACAAGCGGGTTAGTCAAACTGACTTGAAAGGCTTCTTTGAAAT
GCTTTGCGGAGAGGTTCATCGTTTGAGGCTTGGAGACTATCACCACCAAACCCGCTTCGC
CTTTGTTGAGTTTGCCATGGCGGAAAGTGCAATTGCTGCTTTTAACTACAGTGGTATCGT
ATTGGGAGCACTCCCAATAAGGGTAAGCCCATCAAAGACGCCAGTAAGGCCGCACCTTCC
CCGCCCTGAGTTCAAATGAAATGATGGCAAAGCTGTTGCTGGAGATCCTATAAGAATATT
TATAGAACAAGGTACTTGAGGCGTTTTATTTTAAGTTTGTTACACAGTCAGAGCCTGCCC
GGTATCTTTGAACAACTTTTAAGAACTTTGATATTTAACTTTTTCCTCTTTTCTATAGAG
TTTGCCAAAAACAAATACTGGTTTCCTTTTTCTTTTGTTATTGTTATTGTCCAAGTAACC
TTTTTAGATATTTTTAATGAGACATTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW57TF U 1
AF RR2BW51JQ C 388
BS 1 478 RR2DW57TF
BS 479 1109 RR2BW51JQ

RD RR2DW57TF 478 0 0
GGACGATCGGACCAATGGGACTCCCCAAAAGGGTCAGACTCAGACCAAAACTCCAAATGG
TGGAGGGAGTGTGAAGAGTGAGATCAAAGATTTGTCTGATGCGTTCTCTAAGCTCAACCC
GTTGGCTAAGGAGTTTGTTCCTCCTTCACTTGCTCGAACCCAATCTGGAAATGGATTACG
GTTTACTAACAATTTTGCAGATGGGAGTTATCATCTTTCTACAAGGAGAAGGAGTTTTGG
CCAAGGGAAGAGAAGAATGAACAAAAGAACCAGCTTGGCTCAGAAGGATGATATCATCAG
GAGAACTGTATATGTCTCTGACATTGATCAACAGGTTACCGAGGAGAACCTCGCAGGTGT
CTTTGTTAACTGTGGACAGGTAGTTGATTGTCGTGTCTGCGGTGATCCAAAGTCTGTCCT
TCGTTTTGCATTCGTTGAGTTCACCAATGAAGAGGGAGCTAGGGCTGCTTTGAGCATG

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2BW51JQ 722 0 0
TTGTCGTGTCTGCGGTGATCCAAAGTCTGTCCTTCGTTTTGCATTCGTTGAGTTCACCAA
TGAAGAGGGAGCTAGGGCTGCTTTGAGCATGTCAGGAACAGTACTTGGTTTTTACCCTCT
TAAAGTGCTTCCTTCCAAAACCGCTATCGCCCCTGTTAACCCCACTTTCCTTCCCCGGTT
TGAGGATGAGCGTGAGATGTGCGTGAGGACTGTTTACTGTACCAACATTGACAAGCGGGT
TAGTCAAACTGACTTGAAAGGCTTCTTTGAAATGCTTTGCGGAGAGGTTCATCGTTTGAG
GCTTGGAGACTATCACCACCAAACCCGCTTCGCCTTTGTTGAGTTTGCCATGGCGGAAAG
TGCAATTGCTGCTTTTAACTACAGTGGTATCGTATTGGGAGCACTCCCAATAAGGGTAAG
CCCATCAAAGACGCCAGTAAGGCCGCACCTTCCCCGCCCTGAGTTCAAATGAAATGATGG
CAAAGCTGTTGCTGGAGATCCTATAAGAATATTTATAGAACAAGGTACTTGAGGCGTTTT
ATTTTAAGTTTGTTACACAGTCAGAGCCTGCCCGGTATCTTTGAACAACTTTTAAGAACT
TTGATATTTAACTTTTTCCTCTTTTCTATAGAGTTTGCCAAAAACAAATACTGGTTTCCT
TTTTCTTTTGTTATTGTTATTGTCCAAGTAACCTTTTTAGATATTTTTAATGAGACATTT
GG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3239Contig1 854 3 3 U
GCAAAACAAAAGAATTCGAATTTTAAAATAAATTGCTTTTGTCATAATGGATTATACACC
ATATATTAGCTTCGTGAAGCAAAAACAGAAGCATAAATGTCAACAAATAGCATCTGTTAT
TTTGGAGCACCAATATTATAGAAGGAAACTATACAATTAACTCAGACAAACCCAAAGAAA
CAAAATGAAAAAGAAGAGGAACGATCACAAAGTTTCAAGACAAGTAGAGGGGACACAGCA
AAAGAACAGAACCGCAAGAAGAAAAAAATAGTAAACTAATGCTAATTAGTACTGATCAAA
ACCTCTTTTTGGTAAGGAAACTGCTTAGCATTACGGATTTAATCCAATTTGATTCTATCT
TTCTCTTCTTCTTGCTTCTTTGGTGCTGCCGGAAAATATTTGATTCCGGTAAGGTCACCT
GCTTTGCTTATAACCTTTAGAGCTTTGATAAGATCTTCTCTTGAGTGAGATGCGGATATG
CAAATACGAGCCCTGGCTAGCAATAGAGGTGTAGCTGGGAAGCCAACAACCACAACTGCG
ACGTTTTCTAGCAAGCATTCCCTAGAGAAGGCTGGGATTTTGGCTGGATTGTAAAGCATT
ATTGGCATCACTGGGGAATCATTGTCTCCAAGAACCTCAAATCCCATCTTCTGCAACTCA
GCCCTGAAAAAGTTGCTGTTCTCCCTGATCCTTGCTAACTTTTGCGCACCTATGTTTGAA
CCGTCTTCTCCAAGGATAACTTTTATGGAAGATATGATCTGTTGCGCTGAAGGAGTTGAA
ATTGAAGTTGCGTAAAGGTGAGCAGGGCAATGGTACTTCAAATATTGAATGAGGTCCTTG
GATCCGGAAATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO55JQ U 1
AF RR2BA79JQ U 41
AF RR2AO55TF C 110
BS 1 767 RR2AO55JQ
BS 768 829 RR2BA79JQ
BS 830 854 RR2AO55TF

RD RR2AO55JQ 767 0 0
GCAAAACAAAAGAATTCGAATTTTAAAATAAATTGCTTTTGTCATAATGGATTATACACC
ATATATTAGCTTCGTGAAGCAAAAACAGAAGCATAAATGTCAACAAATAGCATCTGTTAT
TTTGGAGCACCAATATTATAGAAGGAAACTATACAATTAACTCAGACAAACCCAAAGAAA
CAAAATGAAAAAGAAGAGGAACGATCACAAAGTTTCAAGACAAGTAGAGGGGACACAGCA
AAAGAACAGAACCGCAAGAAGAAAAAAATAGTAAACTAATGCTAATTAGTACTGATCAAA
ACCTCTTTTTGGTAAGGAAACTGCTTAGCATTACGGATTTAATCCAATTTGATTCTATCT
TTCTCTTCTTCTTGCTTCTTTGGTGCTGCCGGAAAATATTTGATTCCGGTAAGGTCACCT
GCTTTGCTTATAACCTTTAGAGCTTTGATAAGATCTTCTCTTGAGTGAGATGCGGATATG
CAAATACGAGCCCTGGCTAGCAATAGAGGTGTAGCTGGGAAGCCAACAACCACAACTGCG
ACGTTTTCTAGCAAGCATTCCCTAGAGAAGGCTGGGATTTTGGCTGGATTGTAAAGCATT
ATTGGCATCACTGGGGAATCATTGTCTCCAAGAACCTCAAATCCCATCTTCTGCAACTCA
GCCCTGAAAAAGTTGCTGTTCTCCCTGATCCTTGCTAACTTTTGCGCACCTATGTTTGAA
CCGTCTTCTCCAAGGATAACTTTTATGGAAGATATGATCTGTTGCGC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2BA79JQ 789 0 0
GTCATAATGGATTATACACCATATATTAGCTTCGTGAAGCAAAAACAGAAGCATAAATGT
CAACAAATAGCATCTGTTATTTTGGAGCACCAAT**TATAGAAGGAAACTATACAATTAA
CTCAGACAAACCCAAAGAAACAAAATGAAAAAGAAGAGGAACGATCACAAAGTTTCAAGA
CAAGTAGAGGGGACACAGCAAAAGAACAGAACCGCAAGAAGAAAAAAATAGTAAACTAAT
GCTAATTAGTACTGATCAAAACCTCTTTTTGGTAAGGAAACTGCTTAGCATTACGGATTT
AATCCAATTTGATTCTATCTTTCTCTTCTTCTTGCTTCTTTGGTGCTGCCGGAAAATATT
TGATTCCGGTAAGGTCACCTGCTTTGCTTATAACCTTTAGAGCTTTGATAAGATCTTCTC
TTGAGTGAGATGCGGATATGCAAATACGAGCCCTGGCTAGCAATAGAGGTGTAGCTGGGA
AACCAACAACCACAACTGCGACGTTTTCTCGCAAGCGTTCCCTAGAGAAGGCTGGGATTT
TGGCTGGATTGTAAAGCATTATTGGCATCACTGGGGAATCATTGTCTCCAAGAACCTCAA
ATCCCATCTTCTGCAACTCAGCCCTGAAAAAGTTGCTGTTCTCCCTGATCCTTGCTAACT
TTTGCGCACCTCTGTTTGAACCGTCTTCTCCAAGGATAACTTTTATGGAAGATATGATCT
GTTGCGCTGAAGGAGTTGAAATTGAAGTTGCGTAAAGGTGAGCAGGGCAATGGTACTTCA
AATATTGAA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2AO55TF 745 0 0
GCATCTGTTATTTTGGAGCACCAATATTATAGAAGGAAACTATACAATTAACTCAGACAA
ACCCAAAGAAACAAAATGAAAAAGAAGAGGAACGATCACAAAGTTTCAAGACAAGTAGAG
GGGACACAGCAAAAGAACAGAACCGCAAGAAGAAAAAAATAGTAAACTAATGCTAATTAG
TACTGATCAAAACCTCTTTTTGGTAAGGAAACTGCTTAGCATTACGGATTTAATCCAATT
TGATTCTATCTTTCTCTTCTTCTTGCTTCTTTGGTGCTGCCGGAAAATATTTGATTCCGG
TAAGGTCACCTGCTTTGCTTATAACCTTTAGAGCTTTGATAAGATCTTCTCTTGAGTGAG
ATGCGGATATGCAAATACGAGCCCTGGCTAGCAATAGAGGTGTAGCTGGGAAGCCAACAA
CCACAACTGCGACGTTTTCTAGCAAGCATTCCCTAGAGAAGGCTGGGATTTTGGCTGGAT
TGTAAAGCATTATTGGCATCACTGGGGAATCATTGTCTCCAAGAACCTCAAATCCCATCT
TCTGCAACTCAGCCCTGAAAAAGTTGCTGTTCTCCCTGATCCTTGCTAACTTTTGCGCAC
CTATGTTTGAACCGTCTTCTCCAAGGATAACTTTTATGGAAGATATGATCTGTTGCGCTG
AAGGAGTTGAAATTGAAGTTGCGTAAAGGTGAGCAGGGCAATGGTACTTCAAATATTGAA
TGAGGTCCTTGGATCCGGAAATATC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 3

CO CL3240Contig1 1135 3 5 U
AAAACCAAGATTTCCTTTTATATTTACCTTAAGCTTCCACCACTTTTCTTATAAAAAGAC
GTTGCTGTTACATAGATAGTTCCATTCAAGATATGCAGCAAAAGAAAAACGCAGCAAAGG
CAAAATGTGTAATGCTGGTCACAGCTCTAAGTTTTGTTTCATCTTTTACACAAGATTAAG
TGAATTCGATTACTTGTACATAACTATTAAAGAAAAGAGAGATTGCAATATGATAATAAG
TCACAATTCATTCCGCTACTTGTTCCAGGGCACCAATTTTCGTCTTCCATGAATCATCAT
CTAATCCACTAGCCTGTAATGGTGGCAACGAGAAGACGCTAACTGTTGAGCTACCGCTGC
GGATTTCCTTTAAAACCCTTAGAGCGGAGACAGTGCTCTTCATATACAAGCTCTCCATGT
ACTCAATCTCAGACAAATCTTTTGGAAGTCTGAGAAGATCAGAACTGTTAGTTTCTGACT
TGACAGTTCCAGACGTTGTTGGCTCTGATTTGTCTTCCTCAAGATTCCGTTTTT*GTTAG
ACGGGAAGAGGCGGTCAAGCATAGCCTCACACTCTTTCACAAATGTGTTGAGCAGGTCAG
TGGTGAAGAAAGGTCCTTGCAGAACCTTCTGGATGAATGGTAGTCGGATAAGAGCACCGG
TTCTTTTGTCGTACTTTTTGAGAATCTTAGCTAACCCTGTATAATTGAGAGCACTATAAT
TCATCAGCAGGACCATTTCTCCATGAAAGTCTACAATCTCTCTCTTTATACTAATCATAT
CTCCATTTGAATTGCTTGCCTTTGCCACTTGGTCCTTCAATTCCTTCAATCTGATGATGT
ATTCTTCCTCTTTCTCGACGAAGAAAGAATTGAATTTCTCGAGCTCTTCTTCGAGAAGGC
GAATGAAATCAAGTTCCTCCTTCGTTGGATCTGTGTCGCTGGAATTTGGGTCGGATCTCG
AACGCTTGTTTGGGCGATTGTCGCCGCCACCTAAGGGCTCCAAGAGCTTCAGCTTCTTCT
TGAGCTCCTTGTAGGAGAGAAATTTGTCTTGCCATTCAGGCAAGGTTTCCTCTATCTGGT
TGCTAAGACTCTTGCCGAATTTCATGGCACAAGGAGGCTAACAAAACACACAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP31JQ U 1
AF RR2EE61JQ U 102
AF RR2CP31TF C 389
BS 1 534 RR2CP31JQ
BS 535 535 RR2EE61JQ
BS 536 591 RR2CP31JQ
BS 592 803 RR2EE61JQ
BS 804 1135 RR2CP31TF

RD RR2CP31JQ 591 0 0
AAAACCAAGATTTCCTTTTATATTTACCTTAAGCTTCCACCACTTTTCTTATAAAAAGAC
GTTGCTGTTACATAGATAGTTCCATTCAAGATATGCAGCAAAAGAAAAACGCAGCAAAGG
CAAAATGTGTAATGCTGGTCACAGCTCTAAGTTTTGTTTCATCTTTTACACAAGATTAAG
TGAATTCGATTACTTGTACATAACTATTAAAGAAAAGAGAGATTGCAATATGATAATAAG
TCACAATTCATTCCGCTACTTGTTCCAGGGCACCAATTTTCGTCTTCCATGAATCATCAT
CTAATCCACTAGCCTGTAATGGTGGCAACGAGAAGACGCTAACTGTTGAGCTACCGCTGC
GGATTTCCTTTAAAACCCTTAGAGCGGAGACAGTGCTCTTCATATACAAGCTCTCCATGT
ACTCAATCTCAGACAAATCTTTTGGAAGTCTGAGAAGATCAGAACTGTTAGTTTCTGACT
TGACAGTTCCAGACGTTGTTGGCTCTGATTTGTCTTCCTCAAGATTCCGTTTTTTGTTAG
ACGGGAAGAGGCGGTCAAGCATAGCCTCACACTCTTTCACAAATGTGTTGA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2EE61JQ 702 0 0
CT
GAAAAACGCAGCAAAGGCAAAATGTGTAATGCTGGTCACAGCTCTAAGTTTTGTTTCATC
TTTTACACAAGATTAAGTGAATTCGATTACTTGTACATAACTATTAAAGAAAAGAGAGAT
TGCAATATGATAATAAGTCACAATTCATTCCGCTACTTGTTCCAGGGCACCAATTTTCGT
CTTCCATGAATCATCATCTAATCCACTAGCCTGTAATGGTGGCAACGAGAAGACGCTAAC
TGTTGAGCTACCGCTGCGGATTTCCTTTAAAACCCTTAGAGCGGAGACAGTGCTCTTCAT
ATACAAGCTCTCCA*GTACTCAATCTCAGACAAATCTTTTGGAAGTCTGAGAAGATCAGA
ACTGTTAGTTTCTGACTTGACAGTTCCAGACGTTGTTGGCTCTGATTTGTCTTCCTCAAG
ATTCCGTTTT**GTTAGACGGGAAGAGGCGGTCAAGCATAGCCTCACACTCTTTCACAAA
TGTGTTGAGCAGGTCAGTGGTGAAGAAAGGTCCTTGCAGAACCTTCTGGATGAATGGTAG
TCGGATAAGAGCACCGGTTCTTTTGTCGTACTTTTTGAGAATCTTAGCTAACCCTGTATA
ATTGAGAGCACTATAATTCATCAGCAGGACCATTTCTCCATGAAAGTCTACAATCTCTCT
CTTTATACTAATCATATCTCCATTTGAATTGCTTGCCTTT

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR2CP31TF 747 0 0
GACAGTGCTCTTCATATACAAGCTCTCCATGTACTCA*TCTCAGACAAATCTTT*GGAAG
TCTGAGAAGATCAGAACTGTTAGTTTCTGACT*GACAGTTCCAGACGTTGTTGGCTCTGA
TTTGTCTTCCTCAAGATTCCGTTTTT*GTTAGACGGGAAGAGGCGGTCAAGCATAGCCTC
ACACTCTTTCACAAATGTGTTGAGCAGGTCAGTGGTGAAGAAAGGTTCTTGCAGAACCTT
TTGGATGAATGGTAGTCGGATAAGAGCACCGGTTCTTTTGTCGTACTTTTTGAGAATCTT
AGCTAACCCTGTATAATTGAGAGCACTATAATTCATCAGCAGGACCATTTCTCCATGAAA
GTCTACAATCTCTCTCTTTATACTAATCATATCTCCATTTGAATTGCTTGCCTTTGCCAC
TTGGTCCTTCAATTCCTTCAATCTGATGATGTATTCTTCCTCTTTCTCGACGAAGAAAGA
ATTGAATTTCTCGAGCTCTTCTTCGAGAAGGCGAATGAAATCAAGTTCCTCCTTCGTTGG
ATCTGTGTCGCTGGAATTTGGGTCGGATCTCGAACGCTTGTTTGGGCGATTGTCGCCGCC
ACCTAAGGGCTCCAAGAGCTTCAGCTTCTTCTTGAGCTCCTTGTAGGAGAGAAATTTGTC
TTGCCATTCAGGCAAGGTTTCCTCTATCTGGTTGCTAAGACTCTTGCCGAATTTCATGGC
ACAAGGAGGCTAACAAAACACACAAAA

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 3

CO CL3241Contig1 473 3 6 U
GGAATCGGATTAAAAATGGCGAAGCCTCTCGGTACTACCGGCGAGTTTTTCCGGCGAAGA
GATGAATGGAGGAAGCATCCGATGCTTTCTAATCAAATGAGACACGCTCTCCCCGGTCTC
GGAATCGGAGTCGCCGCCTTCTGCGTCTACCTCGTCGGTGAGCGGATCTACAGCAAAGCT
TTGGCTCCTTCCAAATCATCTCACCACAACCAGAATCAGCCTGCTCCGTCTCACTGAATA
GCATCGATCAGATGCTCGAAACAGTGGGGCACAAGATGAGCTCAAGACTTCTTCTCGGTT
TACTATCTTTCTTTGTGGGTTGTCTTAATAATCTGTTTGTTGTGTCGGACACAAAGAATT
TGATTTTCTGTTGAATTATAACAGCTTGTTGGCTCAAAGTTTCTCTTTTGCATCGCACAT
GTTACATTCTTTTGTCTAACTTGATATTGAAAAAAGTTCTCTGTTATTTGTCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EX07TF U 1
AF RR2D006JQ C 1
AF RR2D006TF U 1
BS 1 157 RR2EX07TF
BS 158 158 RR2D006TF
BS 159 163 RR2EX07TF
BS 164 164 RR2D006TF
BS 165 395 RR2EX07TF
BS 396 473 RR2D006TF

RD RR2EX07TF 395 0 0
GGAATCGGATTAAAAATGGCGAAGCCTCTCGGTACTACCGGCGAGTTTTTCCGGCGAAGA
GATGAATGGAGGAAGCATCCGATGCTTTCTAATCAAATGAGACACGCTCTCCCCGGTCTC
GGAATCGGAGTCGCCGCCTTCTGCGTCTACCTCGTCGTTGAGCAGATCTACAGCAAAGCT
TTGGCTCCTTCCAAATCATCTCACCACAACCAGAATCAGCCTGCTCCGTCTCACTGAATA
GCATCGATCAGATGCTCGAAACAGTGGGGCACAAGATGAGCTCAAGACTTCTTCTCGGTT
TACTATCTTTCTTTGTGGGTTGTCTTAATAATCTGTTTGTTGTGTCGGACACAAAGAATT
TGATTTTCTGTTGAATTATAACAGCTTGTTGGCTC

QA 1 395 1 395
DS 

RD RR2D006JQ 473 0 0
GGAATCGGATTAAAAATGGCGAAGCCTCTCGGTACTACCGGCGAGTTTTTCCGGCGAAGA
GATGAATGGAGGAAGCATCCGATGCTTTCTAATCAAATGAGACACGCTCTCCCCGGTCTC
GGAATCGGAGTCGCCGCCTTCTGCGTCTACCTCGTCGGTGAGCGGATCTACAGCAAAGCT
TTGGCTCCTTCCAAATCATCTCACCACAACCAGAATCAGCCTGCTCCGTCTCACTGAATA
GCATCGATCAGATGCTCGAAACAGTGGGGCACAAGATGAGCTCAAGACTTCTTCTCGGTT
TACTATCTTTCTTTGTGGGTTGTCTTAATAATCTGTTTGTTGTGTCGGACACAAAGAATT
TGATTTTCTGTTGAATTATAACAGCTTGTTGGCTCAAAGTTTCTCTTTTGCATCGCACAT
GTTACATTCTTTTGTCTAACTTGATATTGAAAAAAGTTCTCTGTTATTTGTCC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2D006TF 473 0 0
GGAATCGGATTAAAAATGGCGAAGCCTCTCGGTACTACCGGCGAGTTTTTCCGGCGAAGA
GATGAATGGAGGAAGCATCCGATGCTTTCTAATCAAATGAGACACGCTCTCCCCGGTCTC
GGAATCGGAGTCGCCGCCTTCTGCGTCTACCTCGTCGGTGAGCGGATCTACAGCAAAGCT
TTGGCTCCTTCCAAATCATCTCACCACAACCAGAATCAGCCTGCTCCGTCTCACTGAATA
GCATCGATCAGATGCTCGAAACAGTGGGGCACAAGATGAGCTCAAGACTTCTTCTCGGTT
TACTATCTTTCTTTGTGGGTTGTCTTAATAATCTGTTTGTTGTGTCGGACACAAAGAATT
TGATTTTCTGTTGAATTATAACAGCTTGTTGGCTCAAAGTTTCTCTTTTGCATCGCACAT
GTTACATTCTTTTGTCTAACTTGATATTGAAAAAAGTTCTCTGTTATTTGTCC

QA 1 473 1 473
DS 



AS 1 2

CO CL3242Contig1 1011 2 2 U
GGGACTCCGCACGGAGAGATCTGATTCTTCCCTCACTTCACTTCCCCAAAAATGAAAGAG
ATCGCCGATCAAAACTTCTTCCGCTACTGCCTCCTCGCCCTAATTTACTCCGGCCCACCC
ACCGCCGTCGCTCTCAAATTCCTCCAAGCTCCTTACGGCAAACACAACCGCACCGGTTGG
GGCCCCACTTTATCTCCCCCACTCGCTTGGTTCCTCATGGAGAGCCCCACCTTATTGCTC
TCCCTCCTCCTCTTCCCCTTCGGCCGCCACGCTCTCAATCCAAAATCTCTCCTCCTCTTC
TCGCCTTACCTCATCCACTACTTCCACCGCACGATCGTCTACCCTCTCCGCCTCCTCCGC
AGCTCCTCCTCTAAAAACGGCTTTCCGATCAGCATCGCCGCCATGGCTTTCGCCTTTAAT
CTCCTCAACGCCTATATCCAGGCGAGGTACATTTCTCATTACAAGAACGATTACGAAGGA
GAATGGTTCTGGTGGCGGTTTATCGTTGGTTCGGTGATCTTCGTAACCGGTATGTGGATT
AACATCACGTCGGACCGGACTCTAGTACGGCTGAAGAAGGAGCACTACGGAGTCTATGTG
ATACCGAGAGGAGGCTTGTTCGAGTTTGTAAGCTGTCCTAATTACTTCGGAGAGGTGGTC
GAGTGGTTCGGCTGGGCTGTAATGACTTGGTCTTGGCCCGGGATTGGTTTTTTTCTGTAC
ACGTGTTCCAACTTGATCCCGCGCGCACATGCGAGCCACATATGGTACAATGACAAGTTT
AGGGCCGAGTACCCCAAGACTCGGAAAGCTGTTATTCCTTTTGTGTTCTGAAGAAAAGCA
GAAACCATTTAACCATTTTCTAATTTTAGCTTCGTCTAGATTCTGTAACCGGTTTAGTTC
TCTTAAAGTTGGTTTATCGTTCCGGTTTATGTTGGTGTGTTCTTCAGTAGTTCAAAACTG
TGTATCATTAAGACAAAAGGTTTGAATAAAAGAGTGCCACGTCATAAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC15TF U 1
AF RR2EC15JQ C 334
BS 1 741 RR2EC15TF
BS 742 1011 RR2EC15JQ

RD RR2EC15TF 741 0 0
GGGACTCCGCACGGAGAGATCTGATTCTTCCCTCACTTCACTTCCCCAAAAATGAAAGAG
ATCGCCGATCAAAACTTCTTCCGCTACTGCCTCCTCGCCCTAATTTACTCCGGCCCACCC
ACCGCCGTCGCTCTCAAATTCCTCCAAGCTCCTTACGGCAAACACAACCGCACCGGTTGG
GGCCCCACTTTATCTCCCCCACTCGCTTGGTTCCTCATGGAGAGCCCCACCTTATTGCTC
TCCCTCCTCCTCTTCCCCTTCGGCCGCCACGCTCTCAATCCAAAATCTCTCCTCCTCTTC
TCGCCTTACCTCATCCACTACTTCCACCGCACGATCGTCTACCCTCTCCGCCTCCTCCGC
AGCTCCTCCTCTAAAAACGGCTTTCCGATCAGCATCGCCGCCATGGCTTTCGCCTTTAAT
CTCCTCAACGCCTATATCCAGGCGAGGTACATTTCTCATTACAAGAACGATTACGAAGGA
GAATGGTTCTGGTGGCGGTTTATCGTTGGTTCGGTGATCTTCGTAACCGGTATGTGGATT
AACATCACGTCGGACCGGACTCTAGTACGGCTGAAGAAGGAGCACTACGGAGTCTATGTG
ATACCGAGAGGAGGCTTGTTCGAGTTTGTAAGCTGTCCTAATTACTTCGGAGAGGTGGTC
GAGTGGTTCGGCTGGGCTGTAATGACTTGGTCTTGGCCCGGGATTGGTTTTTTTCTGTAC
ACGTGTTCCAACTTGATCCCG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2EC15JQ 678 0 0
ATCGTCTACCCTCTCCGCCTCCTCCGCAGCTCCTCCTCTAAAAACGGCTTTCCGATCAGC
ATCGCCGCCATGGCTTTCGCCTTTAATCTCCTCAACGCCTATATCCAGGCGAGGTACATT
TCTCATTACAAGAACGATTACGAAGGAGAATGGTTCTGGTGGCGGTTTATCGTTGGTTCG
GTGATCTTCGTAACCGGTATGTGGATTAACATCACGTCGGACCGGACTCTAGTACGGCTG
AAGAAGGAGCACTACGGAGTCTATGTGATACCGAGAGGAGGCTTGTTCGAGTTTGTAAGC
TGTCCTAATTACTTCGGAGAGGTGGTCGAGTGGTTCGGCTGGGCTGTAATGACTTGGTCT
TGGCCCGGGATTGGTTTTTTTCTGTACACGTGTTCCAACTTGATCCCGCGCGCACATGCG
AGCCACATATGGTACAATGACAAGTTTAGGGCCGAGTACCCCAAGACTCGGAAAGCTGTT
ATTCCTTTTGTGTTCTGAAGAAAAGCAGAAACCATTTAACCATTTTCTAATTTTAGCTTC
GTCTAGATTCTGTAACCGGTTTAGTTCTCTTAAAGTTGGTTTATCGTTCCGGTTTATGTT
GGTGTGTTCTTCAGTAGTTCAAAACTGTGTATCATTAAGACAAAAGGTTTGAATAAAAGA
GTGCCACGTCATAAGATC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 3

CO CL3243Contig1 1154 3 2 U
GGTGGAGAAGTCCACCATCATCCAGATTCTTGAGCAGGAGAAGGAAGGGCTCGAGCAGTT
CACTGCTACCGACGGGTATGATTACAGCGGTGGAAGCAACGTGCTGAAGGTCCTTGGTTA
CTTCAGCATGGTCGGTCTCCTTCGTGTTCACTGCCTCTTGGGAGATTACCATACTGGTCT
CAAGTGGCTTCAGCCCATTGACATCACTCAGCAAGGTGTCTACACCAGTGTCATTGGATG
CCACATCGCTACCATCTATCACTACGGATTCGCTAACCTCATGTTGAGGAGGTACGTGGA
TGCGGTTCGTGAGTTCAACAAGATCCTCCTCTACATTTACAAGACGAAGCAGTACCATCA
AAAGTCGCCTCAGTATGAGCAGTTGCTGAAGAAGAATGAGCAGATGTATGCTTTGCTTGC
GGTTTGCCTCTCCCTCTGCCCACAGACGAAGCTCGTTGACGAGTCTGTCAACGCTCAGTT
GCGTGAGAAGTACGGTGAGAAGATGATGAGGATGCAGAGGTACGACGACGAGGCGTTTGG
TATCTATGACGAGCTCTTCTCTTACGCATGCCCTAAGTTTATCACCCCTTCCGCACCAAG
TTTCGAGGAGCCTCTTGTCAATTACAATCAGGATGCGTACAGGCTTCAGTTGAAGATGTT
CCTTTATGAGGTGAAGCAGCAGCAGCTGTTGTCGGGAGTGAGGACATTCCTTAAAGTTTA
CTCCTCTATCTCTCTTGCTAAGCTCGCAAACTACATGGAAGTTGATGAACCAACTCTAAG
GACCATATTGTTAACATACAAGCACAAGACACATTCAGTTGGTTCTGATGGGAAGATCAT
CTCTAATGCAGACATTGATTTCTACATCAACAATGACATGATCTACGTTGTGGAATCAAA
ACCTGCAAAGCGTTATGGAGATTTCTTCTTGCGGCAGATTGCAAAGCTTGAAGGTGTGAT
AAATGACATGTACCGCATCAAGCTGGAATGAGGAAATGTCTGTGTTACCTTCAGCTCTCT
TTATCTAGTGAAACGGTGTTTTTGGTGTTATCGTCTATCTTTTCTTATGAAATACTGTCA
TTTTTCCATTGTGGCATTGCAAGAATATCCCAAAGGATAAAAAACATCTTTGGCTTACTA
GTTTTTGAACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ04TF U 1
AF RR2A304TF U 209
AF RR2BJ04JQ C 199
BS 1 897 RR2BJ04TF
BS 898 1154 RR2BJ04JQ

RD RR2BJ04TF 897 0 0
GGTGGAGAAGTCCACCATCATCCAGATTCTTGAGCAGGAGAAGGAAGGGCTCGAGCAGTT
CACTGCTACCGACGGGTATGATTACAGCGGTGGAAGCAACGTGCTGAAGGTCCTTGGTTA
CTTCAGCATGGTCGGTCTCCTTCGTGTTCACTGCCTCTTGGGAGATTACCATACTGGTCT
CAAGTGGCTTCAGCCCATTGACATCACTCAGCAAGGTGTCTACACCAGTGTCATTGGATG
CCACATCGCTACCATCTATCACTACGGATTCGCTAACCTCATGTTGAGGAGGTACGTGGA
TGCGGTTCGTGAGTTCAACAAGATCCTCCTCTACATTTACAAGACGAAGCAGTACCATCA
AAAGTCGCCTCAGTATGAGCAGTTGCTGAAGAAGAATGAGCAGATGTATGCTTTGCTTGC
GGTTTGCCTCTCCCTCTGCCCACAGACGAAGCTCGTTGACGAGTCTGTCAACGCTCAGTT
GCGTGAGAAGTACGGTGAGAAGATGATGAGGATGCAGAGGTACGACGACGAGGCGTTTGG
TATCTATGACGAGCTCTTCTCTTACGCATGCCCTAAGTTTATCACCCCTTCCGCACCAAG
TTTCGAGGAGCCTCTTGTCAATTACAATCAGGATGCGTACAGGCTTCAGTTGAAGATGTT
CCTTTATGAGGTGAAGCAGCAGCAGCTGTTGTCGGGAGTGAGGACATTCCTTAAAGTTTA
CTCCTCTATCTCTCTTGCTAAGCTCGCAAACTACATGGAAGTTGATGAACCAACTCTAAG
GACCATATTGTTAACATACAAGCACAAGACACATTCAGTTGGTTCTGATGGGAAGATCAT
CTCTAATGCAGACATTGATTTCTACATCAACAATGACATGATCTACGTTGTGGAATC

QA 1 897 1 897
DS 

RD RR2A304TF 689 0 0
CAGCAAGGTGTTTACACCAGTGTCATTGGATGCCACATCGCTACTATCTATCACTACGGA
TTCGCTAACCTCATGTTGAGGAGGTATGTGGATGCGGTTCGTGAGTTCAACAAGATCCTC
CTCTACATTTACAAGACGAAGCAGTACCATCAGAAGTCGCCTCAGTATGAGCAGTTGCTG
AAGAAGAATGAGCAGATGTATGCTTTGCTTGCGGTTTGCCTCTCCCTCTGCCCTCGGACG
AAGCTCGTTGACGAGTCTGTCAACTCTCAGTTGCGTGAGAAGTACGGTGAGAAGATGATG
AGGATGCAGAGGTACGACGATGAGGCGTTTGGTATCTATGACGAGCTCTTCTCTTACGCA
TGCCCTAAGTTTATCACCCCTTCCGCACCAAGTTTCGAGGAGCCTCTTGTCAATTACAAT
CAGGATGCGTACAGGCTTCAGTTGAAGATGTTCCTTTATGAGGTGAAGCAGCAGCAGCTG
TTGTCAGGAGTGAGGACATTCCTTAAAGTTTACTCCTCTATCTCTCTTGCTAAGCTCGCA
AACTACATGGAAGTTGATGAACCAACTCTAAGGACCATATTGTTAACATACAAGCACAAG
ACACATTCAGTTGGTTCTGATGGGAAGATCATCTCTAATGCAGACATTGATTTCTACATC
AACAATGACATGATCTACGTTGTGGAATC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2BJ04JQ 956 0 0
TGACATCACTCAGCAAGGTGTCTACACCAGTGTCATTGGATGCCACATCGCTACCATCTA
TCACTACGGATTCGCTA*CCTCATGTTGAGGAGGTACGTGGATGCGGTTCGTGAGTTCAA
CAAGATCCTCCTCTACATTTACAAGACGAAGCAGTACCATCAAAAGTCGCCTCAGTATGA
GCAGTTGCTGAAGAAGAATGAGCAGATGTATGCTTTGCTTGCGGTTTGCCTCTCCCTCTG
CCCACAGACGAAGCTCGTTGACGAGTCTGTCAACGCTCAGTTGCGTGAGAAGTACGGTGA
GAAGATGATGAGGATGCAGAGGTACGACGACGAGGCGTTTGGTATCTATGACGAGCTCTT
CTCTTACGCATGCCCTAAGTTTATCACCCCTTCCGCACCAAGTTTCGAGGAGCCTCTTGT
CAATTACAATCAGGATGCGTACAGGCTTCAGTTGAAGATGTTCCTTTATGAGGTGAAGCA
GCAGCAGCTGTTGTCGGGAGTGAGGACATTCCTTAAAGTTTACTCCTCTATCTCTCTTGC
TAAGCTCGCAAACTACATGGAAGTTGATGAACCAACTCTAAGGACCATATTGTTAACATA
CAAGCACAAGACACATTCAGTTGGTTCTGATGGGAAGATCATCTCTAATGCAGACATTGA
TTTCTACATCAACAATGACATGATCTACGTTGTGGAATCAAAACCTGCAAAGCGTTATGG
AGATTTCTTCTTGCGGCAGATTGCAAAGCTTGAAGGTGTGATAAATGACATGTACCGCAT
CAAGCTGGAATGAGGAAATGTCTGTGTTACCTTCAGCTCTCTTTATCTAGTGAAACGGTG
TTTTTGGTGTTATCGTCTATCTTTTCTTATGAAATACTGTCATTTTTCCATTGTGGCATT
GCAAGAATATCCCAAAGGATAAAAAACATCTTTGGCTTACTAGTTTTTGAACCTCC

QA 1 956 1 956
DS 



AS 1 2

CO CL3244Contig1 1192 2 4 U
GGGCTCTTGCGTTTCGCGGCAATGGCGGCGGCGACGGAAAATGACGACACCATCCTCGAC
AACCAGCTCAAACCAGATTCCGAACCGGCTCCGGTTAACCCCTCCTCTCTACCCGAAGAG
AAACCTCTCTCTAAAAACGCCCAGAAGAAGCAGCTGAAGCAGCAAAGATACGAGGCGAAG
AAGGCCGAGAAGAAGGCGCAGGAGAAGGAGCACAAGAGGAAAGAAGGCGAGAGAAAACAC
AAGGAGTGGGAAGAAACACTAGCGAAGGCGACGGAGGAAGAGAGGCTGAAGCTTATCGAG
TCGAGAAGGAGTCTCCGGAAGGAGAGAATGGAGAAGAGATCAGAGGAGAAAGAGAAGAAG
ATGGAACGGCTCACTAAAGCTAAAGAAATCGGACAGAACATCGTCATAGATGTCGACTTC
CCGCATCTAATGTCCGAGTCTGAGATCTCCAGCCTCGTTCAGCAGATAATGTATTGTTAT
GCGGTGAATGGGAGGAGCAGTTCTCCTTGTCATCTGTGGCTAACGGGAGTTCAAGGGGAG
ATGAGTACTCAGCTTGATAGGCTTCCAGGCTTTGAGAAATGGTTTATAGAGAAGGAGAGT
CGGTGTTACATTGAGGCCATGGCTGATCGGAAAGAGAATCTGGTGTACCTTACGGCTGAC
TCCGAGACTGTGTTGGAGGATCTTGATCCTAAGGATATCTATATAATTGGTGGGTTGGTT
GATCGGAACAGGTTCAAAGGGATCACCATGAACAAGGCACAAGAACAAGGGATTAAGACA
GCTAAACTTCCTATAGGGGAGTATATGAAAATGTCCAGTTCTCAGGTTCTCACTGTGAAC
CAAGTTTTGGAGATACTCGTGAAGTTTCTTGAGACGAGGGACTGGAAAACATCCTTCTTC
ACTGTGATTCCACAGAGGAAAAGAAGTGGAGTTGATCCTGTAGACTCTTCGAAACTTGAA
CCTCTCTCTGAAGAGCATCAAGAGGAAGAACATGATGATTCTTCGGAGAGGAAAAAGGTA
TGCGTTGAAGCTCCGCTGCAAAGTGGTAGTAGCTAGATGAAGATAAAATGCATGCTTCTG
TTTCTGTTGAACGCTAGTTTCTGTAGCTGAGAATTTGAATTTTGGAATGTTATGTCCTTC
CTTATTATTATTTCTATGTTGAGTCAAGACGCACTACAAGTCATTTCCCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E946TF U 1
AF RR2E946JQ C 510
BS 1 578 RR2E946TF
BS 579 579 RR2E946JQ
BS 580 612 RR2E946TF
BS 613 1192 RR2E946JQ

RD RR2E946TF 612 0 0
GGGCTCTTGCGTTTCGCGGCAATGGCGGCGGCGACGGAAAATGACGACACCATCCTCGAC
AACCAGCTCAAACCAGATTCCGAACCGGCTCCGGTTAACCCCTCCTCTCTACCCGAAGAG
AAACCTCTCTCTAAAAACGCCCAGAAGAAGCAGCTGAAGCAGCAAAGATACGAGGCGAAG
AAGGCCGAGAAGAAGGCGCAGGAGAAGGAGCACAAGAGGAAAGAAGGCGAGAGAAAACAC
AAGGAGTGGGAAGAAACACTAGCGAAGGCGACGGAGGAAGAGAGGCTGAAGCTTATCGAG
TCGAGAAGGAGTCTCCGGAAGGAGAGAATGGAGAAGAGATCAGAGGAGAAAGAGAAGAAG
ATGGAACGGCTCACTAAAGCTAAAGAAATCGGACAGAACATCGTCATAGATGTCGACTTC
CCGCATCTAATGTCCGAGTCTGAGATCTCCAGCCTCGTTCAGCAGATAATGTATTGTTAT
GCGGTGAATGGGAGGAGCAGTTCTCCTTGTCATCTGTGGCTAACGGGAGTTCAAGGGGAG
ATGAGTACTCAGCTTGATAGGCTTCCAGGCTTTGAGAA*TGGTTTATAGAGAAGGAGAGT
CGGTGTTACATT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2E946JQ 683 0 0
TCATCTGTGGCTAACGGGAGTTCAAGGGGAGATGAGTACTCAGCTTGATAGGCTTCCAGG
CTTTGAGAAATGGTTTATAGAGAAGGAGAGTCGGTGTTACATTGAGGCCATGGCTGATCG
GAAAGAGAATCTGGTGTACCTTACGGCTGACTCCGAGACTGTGTTGGAGGATCTTGATCC
TAAGGATATCTATATAATTGGTGGGTTGGTTGATCGGAACAGGTTCAAAGGGATCACCAT
GAACAAGGCACAAGAACAAGGGATTAAGACAGCTAAACTTCCTATAGGGGAGTATATGAA
AATGTCCAGTTCTCAGGTTCTCACTGTGAACCAAGTTTTGGAGATACTCGTGAAGTTTCT
TGAGACGAGGGACTGGAAAACATCCTTCTTCACTGTGATTCCACAGAGGAAAAGAAGTGG
AGTTGATCCTGTAGACTCTTCGAAACTTGAACCTCTCTCTGAAGAGCATCAAGAGGAAGA
ACATGATGATTCTTCGGAGAGGAAAAAGGTATGCGTTGAAGCTCCGCTGCAAAGTGGTAG
TAGCTAGATGAAGATAAAATGCATGCTTCTGTTTCTGTTGAACGCTAGTTTCTGTAGCTG
AGAATTTGAATTTTGGAATGTTATGTCCTTCCTTATTATTATTTCTATGTTGAGTCAAGA
CGCACTACAAGTCATTTCCCTAT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 3

CO CL3245Contig1 639 3 4 U
GTTTTGTCTCTCTCGAATTAATAGAATGGAGCCGAAGCAGATCAAAGCTATGTTCTTTAT
CTTAACAATGATTATGGCTTTGGTTTGTCATCATCGATCAGAAGCTATGCCATATATTGG
TCGACTGAAATGCATTGTATCACTAAGGAGCGTTGAGGGTTGTCTGGAGGCCATAGAGAA
AGCTACAAAGGGAGACAATCGTGGTTTGGATAAGGAATGCTGCGACGCCATTCGTGGCCT
CGCCAATGACTGTTTGCCGATTATCTTCTCCGGAGGACCCGCCATTGACTTAGTCGTTCA
AGCTGCTTGTTCCCGTATATCAGATGACGTTAATTAATTATAGTTCATAAGAGCCAGGTC
ACTAATACAATTGTATCATGCATGGCTTTTTTAAAAAAAAAGAAGGGGGAAAAGAGACAG
ATATGTCAAACGTCAATAAACTGCTATATAATTTTCTTGACCGAAGAGATATGAATCAAA
AAGTAGTAACAATATCTAAAATTGTATTCAACTAAAAAAGATTGTATTGTCAGCTAGAAC
TTTATAAGAAATAACCATAAAAATCAAAAATTTATTTAACTGGTTGAAACAATTCATAGA
TGTAAATTAAAAAATTATAAGAAACAAATAATGTTCTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A783TF U 1
AF RR2A783JQ C 1
AF RR2AC54TF U 211
BS 1 409 RR2A783TF
BS 410 410 RR2AC54TF
BS 411 477 RR2A783TF
BS 478 639 RR2AC54TF

RD RR2A783TF 477 0 0
GTTTTGTCTCTCTCGAATTAATAGAATGGAGCCGAAGCAGATCAAAGCTATGTTCTTTAT
CTTAACAATGATTATGGCTTTGGTTTGTCATCATCGATCAGAAGCTATGCCATATATTGG
TCGACTGAAATGCATTGTATCACTAAGGAGCGTTGAGGGTTGTCTGGAGGCCATAGAGAA
AGCTACAAAGGGAGACAATCGTGGTTTGGATAAGGAATGCTGCGACGCCATTCGTGGCCT
CGCCAATGACTGTTTGCCGATTATCTTCTCCGGAGGACCCGCCATTGACTTAGTCGTTCA
AGCTGCTTGTTCCCGTATATCAGATGACGTTAATTAATTATAGTTCATAAGAGCCAGGTC
ACTAATACAATTGTATCATGCATGGCTTTTTTAAAAAAAAAGAAGGGGGGAAAGAGACAG
ATATGTCAAACGTCAATAAACTGCTATATAATTTTCTTGACCGAAGAGATATGAATC

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2A783JQ 577 0 0
GTTTTGTCTCTCTCGAATTAATAGAATGGAGCCGAAGCAGATCAAAGCTATGTTCTTTAT
CTTAACAATGATTATGGCTTTGGTTTGTCATCATCGATCAGAAGCTATGCCATATATTGG
TCGACTGAAATGCATTGTATCACTAAGGAGCGTTGAGGGTTGTCTGGAGGCCATAGAGAA
AGCTACAAAGGGAGACAATCGTGGTTTGGATAAGGAATGCTGCGACGCCATTCGTGGCCT
CGCCAATGACTGTTTGCCGATTATCTTCTCCGGAGGACCCGCCATTGACTTAGTCGTTCA
AGCTGCTTGTTCCCGTATATCAGATGACGTTAATTAATTATAGTTCATAAGAGCCAGGTC
ACTAATACAATTGTATCATGCATGGCTTTTTTAAAAAAAAAGAAGGGGGAAAAGAGACAG
ATATGTCAAACGTCAATAAACTGCTATATAATTTTCTTGACCGAAGAGATATGAATCAAA
AAGTAGTAACAATATCTAAAATTGTATTCAACTAAAAAAGATTGTATTGTCAGCTAGAAC
TTTATAAGAAATAACCATAAAAATCAAAAATTTATTT

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2AC54TF 429 0 0
G
AAGGAATGCTGCGACGCCATTCGTGGCCTCGCCAATGACTGTTTGCCGATTATCTTCTCC
GGAGGACCCGCCATTGGCTTAGTCGTTCAAGCTGCTTGTTCCCGTATATCAGATGACGTT
AATTAATTATAGTTCATAAGAGCCAGGTCACTAATACAATTGTATCATGCATGGCTTTTT
TAAAAAAAAAGAAGGGGGAAAAGAGACAGATATGTCAAACGTCAATAAACTGCTATATAA
TTTTCTTGACCGAAGAGATATGAATCAAAAAGTAGTAACAATATCTAAAATTGTATTCAA
CTAAAAAAGATTGTATTGTCAGCTAGAACTTTATAAGAAATAACCATAAAAATCAAAAAT
TTATTTAACTGGTTGAAACAATTCATAGATGTAAATTAAAAAATTATAAGAAACAAATAA
TGTTCTTT

QA 2 429 2 429
DS 



AS 1 3

CO CL3246Contig1 668 3 5 U
GATCAAGAAAGGTTTTGAAGGAGAATGGTCCGAGGCGGGACATCATGGTGGAGAAAGCTT
TAGCTTATAAATTCCTTTCGCTGACGACTATATCCATCCCGATACATCTAACTATGGTAG
AAAACAGAAAAGATCTTACGACAAAATATAAGAAAGGGAAAGTAATGTTGATGAAAGAGT
TCCACGGCAACTATAAAGTGGAGCCTATATATGTAGATCAAGAACGGCTGTGCAAAAAGA
AGTCACCAAAGAGTCCAGAAGAATATAAAAAATGTAGCGGTGGCCGAGGAAGGGTTGCGT
CAAAGCTTACAGTAAACCACTACTTCGAGCCATATCCTCCATTTAATATACCGCCGCTTT
CTTGGTTCATCCGTGGGATCACCATCAAAACCTCCAAAAAGCTGCTCAGCGCGCTTCAGG
AGATGGCTTCGATTGTACGAGATGCAAAGCCACCCTCAGAAGAAATCATCAAAGCGAGTG
AGAAAGAGATTATTCAATTACATGATTTTTGAAAAATATAGAACTATAGAAGATTGTCGT
CAAACATACAGTAGCCGTTTACCGCGTATTAGCGATTATCTTGGTATCGACTACGTACCG
CAGCTAATATTGTTTTCTGAAGTTGAAACTACTAAAAAATTATTTGTGATTTAACATATC
ACAAGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ68TF U 1
AF RR2GZ68JQ C 1
AF RR2GD09TF U 173
BS 1 399 RR2GZ68TF
BS 400 400 RR2GZ68JQ
BS 401 449 RR2GD09TF
BS 450 450 RR2GZ68JQ
BS 451 668 RR2GD09TF

RD RR2GZ68TF 400 0 0
GATCAAGAAAGGTTTTGAAGGAGAATGGTCCGAGGCGGGACATCATGGTGGAGAAAGCTT
TAGCTTATAAATTCCTTTCGCTGACGACTATATCCATCCCGATACATCTAACTATGGTAG
AAAACAGAAAAGATCTTACGACAAAATATAAGAAAGGGAAAGTAATGTTGATGAAAGAGT
TCCACGGCAACTATAAAGTGGAGCCTATATATGTAGATCAAGAACGGCTGTGCAAAAAGA
AGTCACCAAAGAGTCCAGAAGAATATAAAAAATGTAGCGGTGGCCGAGGAAGGGTTGCGT
CAAAGCTTACAGTAAACCACTACTTCGAGCCATATCCTCCATTTAATATACCGCCGCTTT
CTTGGTTCATCCGTGGGATCACCATCAAAACCTCCAAAA
A

QA 1 399 1 399
DS 

RD RR2GZ68JQ 652 0 0
GATCAAGAAAGGTTTTGAAGGAGAATGGTCCGAGGCGGGACATCATGGTGGAGAAAGCTT
TAGCTTATAAATTCCTTTCGCTGACGACTATATCCATCCCGATACATCTAACTATGGTAG
AAAACAGAAAAGATCTTACGACAAAATATAAGAAAGGGAAAGTAATGTTGATGAAAGAGT
TCCACGGCAACTATAAAGTGGAGCCTATATATGTAGATCAAGAACGGCTGTGCAAAAAGA
AGTCACCAAAGAGTCCAGAAGAATATAAAAAATGTAGCGGTGGCCGAGGAAGGGTTGCGT
CAAAGCTTACAGTAAACCACTACTTCGAGCCATATCCTCCATTTAATATACCGCCGCTTT
CTTGGTTCATCCGTGGGATCACCATCAAAACCTCCAAAAAGCTGCTCAGCGCGCTTCAGG
AGATGGCTTCGATTGTACGAGATGCAAAGCCACCCTCAGAAGAAATCATCAAAGCGAGTG
AGAAAGAGATTATTCAATTACATGATTTTTGAAAAATATAGAACTATAGAAGATTGTCGT
CAAACATACAGTAGCCGTTTACCGCGTATTAGCGATTATCTTGGTATCGACTACGTACCG
CAGCTAATATTGTTTTCTGAAGTTGAAACTACTAAAAAATTATTTGTGATTT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2GD09TF 496 0 0
GAAAGAGTTCCACGGCAACTATAAAGTGGAGCCTATATATGTAGATCAAGAACGGCTGTG
CAAAAAGAAGTCACCAAAGAGTCCAGAAGAATATAAAAAATGTAGCGGTGGCCGAGGAAG
GGTTGCGTCAAAGCTTACAGTAAACCACTACTTCGAGCCATATCCTCCATTTAATATACC
GCCGCTTTCTTGGTTCATCCGTGGGATCACCATCAAAACCTCCAAAA*GCTGCTCAGCGC
GCTTCAGGAGATGGCTTCGATTGTACGAGATGCAAAGTCACCCTCAGAAGAAATCATCAA
AGCGAGTGAGAAAGAGATTATTCAATTACATGATTTTTGAAAAATATAGAACTATAGAAG
ATTGTCGTCAAACATACAGTAGCCGTTTACCGCGTATTAGCGATTATCTTGGTATCGACT
ACGTACCGCAGCTAATATTGTTTTCTGAAGTTGAAACTACTAAAAAATTATTTGTGATTT
AACATATCACAAGATT

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 2

CO CL3247Contig1 560 2 6 U
AACAACCATGTTCCAAAATCCAAAACAGGACAAGTCTTAGCAAAAATTCAAAAACAAAAG
ATAAATTCGCAGATAAACCTAAGCAGTGAGCACCACGGCACCACCAGCTTCCTTGATCTT
CTTCTCAGCAGTCTTCGAGATCAGCTTCCCCTTCACCACAAAAGGCTTGCCCTCAGGCAA
ATGACCTTTCCCAAGCACCTTAAAGAACCCGTGCTGCGTCACATCAATCATCGGCACCTT
ATCCTTAGTAGCCTTGGCCTTCACATCCTCGGGAACAAGCGACCAGAGCCTGTCGAGGTT
AAACGATCGGGTTGTAAAACTTGTTGCGGAGCTTGTGGAAGTACCTCATACCGAAGTAAC
CAGGATGGTACTTGTCGAAAAGGATCCTGTGGTGGTGCATACCTCCTGCGTTACCACGAC
CTCCGGGATGTTTGCGGTGCTTACCGATACGACCGTGTCCGGCGCTGACGTGACCGCGCT
TCTTCCTGTTCTTCCTGAGTCTGGTCGTCATTTCTGCTGATCTCTCTCGACACCTTCTTT
TCCTCCTTGCGTGCGGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2B671TF C 1
AF RR2B671JQ U 76
BS 1 75 RR2B671TF
BS 76 102 RR2B671JQ
BS 103 103 RR2B671TF
BS 104 462 RR2B671JQ
BS 463 463 RR2B671TF
BS 464 560 RR2B671JQ

RD RR2B671TF 560 0 0
AACAACCATGTTCCAAAATCCAAAACAGGACAAGTCTTAGCAAAAATTCAAAAACAAAAG
ATAAATTCGCAGATAAACCTAAGCAGTGAGCACCACGGCACCACCAGCTTCCTTGATCTT
CTTCTCAGCAGTCTTCGAGATCAGCTTCGCCTTCACCACAAAAGGCTTGCCCTCAGGCAA
ATGACCTTTCCCAAGCACCTTAAAGAACCCGTGCTGCGTCACATCAATCATCGGCACCTT
ATCCTTAGTAGCCTTGGCCTTCACATCCTCGGGAACAAGCGACCAGAGCCTGTCGAGGTT
AAACGATCGGGTTGTAGAACTTGTTGCGGAGCTTGTGGAAGTACCTCATACCGAAGTAAC
CAGGATGGTACTTGTCGAAGAGGATCCTGTGGTGGTGCATACCTCCTGCGTTACCACGAC
CTCCGGGATGTTTGCGGTGCTTACCGATACGACCGTGTCCGGCGCTGACGTGACCGCGCT
TCTTCCTGTTCTTCCTGAGTCTGGTCGTCATTTCTGCTGATCTCTCTCGACACCTTCTTT
TCCTCCTTGCGTGCGGCT
CC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2B671JQ 485 0 0
AACCTAAGCAGTGAGCACCACGGCACCCCCAGCTTCCTTGATCTTCTTCTCAGCAGTCTT
CGAGATCAGCTTCCCCTTCACCACAAAAGGCTTGCCCTCAGGCAAATGACCTTTCCCAAG
CACCTTAAAGAACCCGTGCTGCGTCACATCAATCATCGGCACCTTATCCTTAGTAGCCTT
GGCCTTCACATCCTCGGGAACAAGCGACCAGAGCCTGTCGAGGTTAAACGATCGGGTTGT
AAAACTTGTTGCGGAGCTTGTGGAAGTACCTCATACCGAAGTAACCAGGATGGTACTTGT
CGAAAAGGATCCTGTGGTGGTGCATACCTCCTGCGTTACCACGACCTCCGGGATGTTTGC
GGTGCTTACCGATACGACCGTGTCCGGGGCTGACGTGACCGCGCTTCTTCCTGTTCTTCC
TGAGTCTGGTCGTCATTTCTGCTGATCTCTCTCGACACCTTCTTTTCCTCCTTGCGTGCG
GCTCC

QA 1 485 1 485
DS 



AS 1 2

CO CL3248Contig1 952 2 2 U
GTGCCTACCCGTGGGATTGAAGATCATCCCCGACGGGAACGTTTGGATTTTTATTTTTTT
GTCTCCTCTCCTCCACCATTTAGGTGTTAGCATAACTGCAGAAGATGGTGATGTGGGTCT
TTGGCTATGGGTCTCTTGTGTGGAACCCAGGATTTCACTACGATGAGAAAGTGCTTGGTT
TCATCAAGGGATATAAACGTGTCTTTGATCTTGCTTGCATTGATCACAGAGGTACACCAG
AGCACCCTGCAAGAACTTGCACACTCGAGAAAGACAAAGAAGCCATATGCTGGGGTGCTG
CTTTCTGTGTCCGTGGAGGGCCAGAAGAAGAACGTCTGGCTATGGAGTACTTGGAACGTA
GAGAGTGTGAATATGACCTCAAGACATGTGTAGACTTTTACAAGGAAGATGATCCCCTGA
AGCCATCTGTAAGTGGAGTGATAGTATTCACTTCTACTCCAGACAAGGTCTCCAACAAGT
ATTACCTTGGACCTGCGCCATTAGAAGACATGGCAAGACAAATTGCGACAGCCAATGGAC
CATGTGGTAACAACAGAGATTATCTCTTTCTTCTAGAGAAGGCAATGCACGACATCGGGC
ATGAGGAGGATTATGTAATAGAGCTGGCGAACGAGGTGAGGAAAGTTCTCGCGGAGTCCT
CGACGAAGAAAGTGACACCGGTGAAGGAACGAAGAGCGAGCCGTATTGCTAACAAGTCAA
AGAGCAATGTCCCCACGGCTCATCAGATACTTCCTCATCAACCTGAAGCTGTTGCCACTA
CGATATAGATGCAAGTGATTTGTGAAAGCAGATCGTTTTGCTTCTCTTTTAACAAAGTTC
GGGTTGTTTCTGAGTAGAGAGACACGTAATCGTTGTGCGTTTGGAACTCTGTTGTCTTCC
TTGTTGTCCTAACGAGTGCTCAGCAATCAACTTTTGAAGAAAATAAAATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV84TF U 1
AF RR2EV84JQ C 251
BS 1 563 RR2EV84TF
BS 564 952 RR2EV84JQ

RD RR2EV84TF 567 0 0
GTGCCTACCCGTGGGATTGAAGATCATCCCCGACGGGAACGTTTGGATTTTTATTTTTTT
GTCTCCTCTCCTCCACCATTTAGGTGTTAGCATAACTGCAGAAGATGGTGATGTGGGTCT
TTGGCTATGGGTCTCTTGTGTGGAACCCAGGATTTCACTACGATGAGAAAGTGCTTGGTT
TCATCAAGGGATATAAACGTGTCTTTGATCTTGCTTGCATTGATCACAGAGGTACACCAG
AGCACCCTGCAAGAACTTGCACACTCGAGAAAGACAAAGAAGCCATATGCTGGGGTGCTG
CTTTCTGTGTCCGTGGAGGGCCAGAAGAAGAACGTCTGGCTATGGAGTACTTGGAACGTA
GAGAGTGTGAATATGACCTCAAGACATGTGTAGACTTTTACAAGGAAGATGATCCCCTGA
AGCCATCTGTAAGTGGAGTGATAGTATTCACTTCTACTCCAGACAAGGTCTCCAACAAGT
ATTACCTTGGACCTGCGCCATTAGAAGACATGGCAAGACAAATTGCGACAGCCAATGGAC
CATGTGGTAACAACAGAGATTAT
CTCT

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2EV84JQ 702 0 0
AAGAACTTGCACACTCGAGAAAGACAAAGAAGCCATATGCTGGGGTGCTGCTTTCTGTGT
CCGTGGAGGGCCAGAAGAAGAACGTCTGGCTATGGAGTACTTGGAACGTAGAGAGTGTGA
ATATGACCTCAAGACATGTGTAGACTTTTACAAGGAAGATGATCCCCTGAAGCCATCTGT
AAGTGGAGTGATAGTATTCACTTCTACTCCAGACAAGGTCTCCAACAAGTATTACCTTGG
ACCTGCGCCATTAGAAGACATGGCAAGACAAATTGCGACAGCCAATGGACCATGTGGTAA
CAACAGAGATTATCTCTTTCTTCTAGAGAAGGCAATGCACGACATCGGGCATGAGGAGGA
TTATGTAATAGAGCTGGCGAACGAGGTGAGGAAAGTTCTCGCGGAGTCCTCGACGAAGAA
AGTGACACCGGTGAAGGAACGAAGAGCGAGCCGTATTGCTAACAAGTCAAAGAGCAATGT
CCCCACGGCTCATCAGATACTTCCTCATCAACCTGAAGCTGTTGCCACTACGATATAGAT
GCAAGTGATTTGTGAAAGCAGATCGTTTTGCTTCTCTTTTAACAAAGTTCGGGTTGTTTC
TGAGTAGAGAGACACGTAATCGTTGTGCGTTTGGAACTCTGTTGTCTTCCTTGTTGTCCT
AACGAGTGCTCAGCAATCAACTTTTGAAGAAAATAAAATTTC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 3

CO CL3249Contig1 1139 3 2 U
GAACTGCAAGAAACTCGAAGTACTTGATGTAAGAAACAACAAGTTTTCCGGTCAGATTCC
GGGGAACTTCTCTCGTCTGGTCCGTCTTCGAATCCTCGATCTTTCCTCGAACAAGTTCTC
AGGGAACTTGAACTTCTTGAAGAACTTACGCAACCTGGAGAGTCTCACCGTTGCAAACAA
TCTATTCTCAGGCAAGATCCCTGAAGCAGTTGACTCTTTCCACAATCTCCGGTTCTTTGA
CTTTTCTGAAAACCGGTTTTTAGAAAGTCCGGTTCCGGTTATGAGCAAAACCAAGATTCA
GACCGTTCCACACCAAACAAGACACATTCTTGCTGAAACTCAATCTACAAACTCCACCAA
GAAAGCCAACAACAACACCACCACCACCAACACATCAAAAGCAACTTCAGATCATGATAA
AAAGAAGATGAAGAAGAAGAAGAACAAGAAGAAGAAAGTATTGGCATGGATCTTAGGGTT
CGTCGTTGGAGGCATAGGAGGAACACTCTCTGGCTTCGTCTTCTCTGTTATATTCAGATT
GATTCTTCGAGCAATAAGAGGACCAGAGAAGCCATCAGGTCCTACCCTATTCAGTCCAAT
GATCAAGAAAGCTGAAGATTTAGCTTTCTTGGAGAACGAAGAAGCGTTAGCTTCTCTAGA
GATCATTGGAAAAGGAGGTTGCGGAGAAGTTTTCAAAGCTGAACTACCTAACAGCAACGG
GAAGATCATTGCCGTAAAGAAAGTGACACAACCATCTAAAGAAGCCAATGAACTTGTAGA
CGAAGAGTCCAGGTTTCTGAACAGGTTCATGAGGCAAATCAAATCAGAGACCAACACAGT
GGGTCACATCAGGCACAGGAACCTTCTCCCGTTGTTAGCACACGTTCCCAGACCCGAGTG
CCACTACCTAGTCTACGAGTACATGAAGAACGGGAGTTTGCAAGATATACTGACCGACGT
AGCAGCTGGAAACAGAGATTTAATGTGGCCAGCAAGGCACAAGATTGCTGTAGGTATAGC
TGCAGGGCTCGAGTACCTTCACACGGATCATAAACCAGCAATCATTCACAGAGACTTGAA
GCCAGCAAATATTCTTCTAGATGACGACATGGAGCTAGAATTTCAGATTTCGGGCTGGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B675TF U 1
AF RR2B626TF U 1
AF RR2A158TF U 354
BS 1 799 RR2B626TF
BS 800 1139 RR2A158TF

RD RR2B675TF 698 0 0
GAACTGCAAGAAACTCGAAGTACTTGATGTAAGAAACAACAAGTTTTCCGGTCAGATTCC
GGGGAACTTCTCTCGTCTGGTCCGTCTTCGAATCCTCGATCTTTCCTCGAACAAGTTCTC
AGGGAACTTGAACTTCTTGAAGAACTTACGCAACCTGGAGAGTCTCACCGTTGCAAACAA
TCTATTCTCAGGCAAGATCCCTGAAGCAGTTGACTCTTTCCACAATCTCCGGTTCTTTGA
CTTTTCTGAAAACCGGTTTTTAGAAAGTCCGGTTCCGGTTATGAGCAAAACCAAGATTCA
GACCGTTCCACACCAAACAAGACACATTCTTGCTGAAACTCAATCTACAAACTCCACCAA
GAAAGCCAACAACAACACCACCACCACCAACACATCAAAAGCAACTTCAGATCATGATAA
AAAGAAGATGAAGAAGAAGAAGAACAAGAAGAAGAAAGTATTGGCATGGATCTTAGGGTT
CGTCGTTGGAGGCATAGGAGGAACACTCTCTGGCTTCGTCTTCTCTGTTATATTCAGATT
GATTCTTCGAGCAATAAGAGGACCAGAGAAGCCATCAGGTCCTACCCTATTCAGTCCAAT
GATCAAGAAAGCTGAAGATTTAGCTTTCTTGGAGAACGAAGAAGCGTTAGCTTCTCTAGA
GATCATTGGAAAAGGAGGTTGCGGAGAAGTTTTCA
GAG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2B626TF 799 0 0
GAACTGCAAGAAACTCGAAGTACTTGATGTAAGAAACAACAAGTTTTCCGGTCAGATTCC
GGGGAACTTCTCTCGTCTGGTCCGTCTTCGAATCCTCGATCTTTCCTCGAACAAGTTCTC
AGGGAACTTGAACTTCTTGAAGAACTTACGCAACCTGGAGAGTCTCACCGTTGCAAACAA
TCTATTCTCAGGCAAGATCCCTGAAGCAGTTGACTCTTTCCACAATCTCCGGTTCTTTGA
CTTTTCTGAAAACCGGTTTTTAGAAAGTCCGGTTCCGGTTATGAGCAAAACCAAGATTCA
GACCGTTCCACACCAAACAAGACACATTCTTGCTGAAACTCAATCTACAAACTCCACCAA
GAAAGCCAACAACAACACCACCACCACCAACACATCAAAAGCAACTTCAGATCATGATAA
AAAGAAGATGAAGAAGAAGAAGAACAAGAAGAAGAAAGTATTGGCATGGATCTTAGGGTT
CGTCGTTGGAGGCATAGGAGGAACACTCTCTGGCTTCGTCTTCTCTGTTATATTCAGATT
GATTCTTCGAGCAATAAGAGGACCAGAGAAGCCATCAGGTCCTACCCTATTCAGTCCAAT
GATCAAGAAAGCTGAAGATTTAGCTTTCTTGGAGAACGAAGAAGCGTTAGCTTCTCTAGA
GATCATTGGAAAAGGAGGTTGCGGAGAAGTTTTCAAAGCTGAACTACCTAACAGCAACGG
GAAGATCATTGCCGTAAAGAAAGTGACACAACCATCTAAAGAAGCCAATGAACTTGTAGA
CGAAGAGTCCAGGTTTCTG

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2A158TF 786 0 0
G
CACCAAGAAAGCCAACAACAACACCACCCCCACCAACACATCAAAAGCAACTTCAGATCA
TGATAAAAAGAAGATGAAGAAGAAGAAGAACAAGAAGAAGAAAGTATTGGCATGGATCTT
AGGGTTCGTCGTTGGAGGCATAGGGGGAACACTCTCTGGCTTCGTCTTCTCTGTTATATT
CAGATTGATTCTTCGAGCAATAAGAGGACCAGAGAAGCCATCAGGTCCTACCCTATTCAG
TCCAATGATCAAGAAAGCTGAAGATTTAGCTTTCTTGGAGAACGAAGAAGCGTTAGCTTC
TCTAGAGATCATCGGAAAAGGAGGCTGCGGAGAAGTTTTCAAAGCTGAACTACCTAACAG
CAACGGGAAGATCATTGCCGTAAAGAAAGTGACACAACCATCTAAAGAAGCCAATGAACT
TGTAGATGAAGAGTCCAGGTTTCTGAACAGGTTCATGAGGCAAATCAAATCAGAGACCAA
CACAGTGGGTCACATCAGGCACAGGAACCTTCTCCCGTTGTTAGCACACGTTCCCAGACC
CGAGTGCCACTACCTAGTCTACGAGTACATGAAGAACGGGAGTTTGCAAGATATACTGAC
CGACGTAGCAGCTGGAAACAGAGATTTAATGTGGCCAGCAAGGCACAAGATTGCTGTAGG
TATAGCTGCAGGGCTCGAGTACCTTCACACGGATCATAAACCAGCAATCATTCACAGAGA
CTTGAAGCCAGCAAATATTCTTCTAGATGACGACATGGAGCTAGAATTTCAGATTTCGGG
CTGGC

QA 2 786 2 786
DS 



AS 1 3

CO CL3250Contig1 964 3 9 U
TTCCTTCCACTCTCTCCGGCGAGATCTCATTTCTGATCCTTCACGGTGGCGTCAACGTCA
GAGAAACAAGAAGGTCTCTCAAGAAGGAAGCCTCCATCATCATCATCATCAACTCCTCCT
CCTTCCTCTGATTCCCCCCTACGAACCCCCTCGGCGAGGAAAGCGAGCCCCGAGTTTCCC
TTTTATCAGCAGAACTGGTTCATCGCTCTCCTCTTCCTGATGGCTATGGGATTCTTCTGC
CTCGCTCTCTTTCTTTACCTCAGCCTTGATCCCGATTCCGGCTACACCTCCGCCTCCGCC
GCAGCGCCTTCCGGTAAAGAAGGCGTCGAGGTAAGTTATGGGAGTGCGGTTAAGCTGATG
CACGAGAAAACGAAGTTCCGTCTGCATTCTCACGATGTGCCTTATGGATCCGGCAGTGGT
CAGCAGTCTGTTACTGGCTTTCCTGGCGTCACTGATTCCAACAGCTACTGGATTGTAAAA
CCTGTGCCTGGGACAAAAGCCAAGCAAGGTGATGCGATCAAGAACGGAGAAACCGTTAGA
TTGCAGCACATGAAGACCAGAAAATGGCTCCACAGTCACCTACACGCATCCCCTATCTCA
GGAAACTTAGAGGTTAGCTGCTTTGGAGATGATTCAAATTCCGATACTGGGGATCACTGG
AAGCTTACAATCGAAGGTAGTGGAAAGATATGGAAACAAGACCAAAGAGTCCGTCTTCAG
CACATTGACACTAGTGGCTACCTCCATAGCCACGACAAGAAGTACCAACGCATTGCCGGT
GGTCAGCAAGAGGTCTGTGGAATCCGGGAGAAGCGGGCTGATAATGTTTGGTTGGCAGCA
GAGGGAGTCTACCTTCCCGTTAATGAGAGTAGCAAGTAAGGTGAAGAGTTGTGTTAACTT
ATCTCTGAGGAGACTTTGAATCTCATCTTTTACTCTCTAAACTCATAAACGAAGAAAATA
AAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2CR32TF U 1
AF RR2EH45TF U 1
AF RR2CR32JQ C 420
BS 1 676 RR2CR32TF
BS 677 677 RR2EH45TF
BS 678 695 RR2CR32TF
BS 696 765 RR2EH45TF
BS 766 766 RR2CR32JQ
BS 767 778 RR2EH45TF
BS 779 779 RR2CR32JQ
BS 780 788 RR2EH45TF
BS 789 964 RR2CR32JQ

RD RR2CR32TF 711 0 0
TTCCTTCCACTCTCTCCGGCGAGATCTCATTTCTGATCCTTCACGGTGGCGTCAACGTCA
GAGAAACAAGAAGGTCTCTCAAGAAGGAAGCCTCCATCATCATCATCATCAACTCCTCCT
CCTTCCTCTGATTCCCCCCTACGAACCCCCTCGGCGAGGAAAGCGAGCCCCGAGTTTCCC
TTTTATCAGCAGAACTGGTTCATCGCTCTCCTCTTCCTGATGGCTATGGGATTCTTCTGC
CTCGCTCTCTTTCTTTACCTCAGCCTTGATCCCGATTCCGGCTACACCTCCGCCTCCGCC
GCAGCGCCTTCCGGTAAAGAAGGCGTCGAGGTAAGTTATGGGAGTGCGGTTAAGCTGATG
CACGAGAAAACGAAGTTCCGTCTGCATTCTCACGATGTGCCTTATGGATCCGGCAGTGGT
CAGCAGTCTGTTACTGGCTTTCCTGGCGTCACTGATTCCAACAGCTACTGGATTGTAAAA
CCTGTGCCTGGGACAAAAGCCAAGCAAGGTGATGCGATCAAGAACGGAGAAACCGTTAGA
TTGCAGCACATGAAGACCAGAAAATGGCTCCACAGTCACCTACACGCATCCCCTATCTCA
GGAAACTTAGAGGTTAGCTGCTTTGGAGATGATTCAAATTCCGATACTGGGGATCACTGG
AAGCTTACAATCGAAG*TAGTGGAAAGATATGGAA
CAGACCAAAGAGTCCG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2EH45TF 796 0 0
TTCCTTCCACTCTCTCCGGCGAGATCTCATTTCTGATCCTTCACGGTGGCGTCAACGTCA
GAGAAACAAGAAGGTCTCTCAAGAAGGAAGCCTCCATCATCATCATCATCAACTCCTCCT
CCTTCCTCTGATTCCCCCCTACGAACCCCCTCGGCGAGGAAAGCGAGCCCCGAGTTTCCC
TTTTATCAGCAGAACTGGTTCATCGCTCTCCTCTTCCTGATGGCTATGGGATTCTTCTGC
CTCGCTCTCTTTCTTTACCTCAGCCTTGATCCCGATTCCGGCTACACCTCCGCCTCCGCC
GCAGCGCCTTCCGGTAAAGAAGGCGTCGAGGTAAGTTATGGGAGTGCGGTTAAGCTGATG
CACGAGAAAACGAAGTTCCGTCTGCATTCTCACGATGTGCCTTATGGATCCGGCAGTGGT
CAGCAGTCTGTTACTGGCTTTCCTGGCGTCACTGATTCCAACAGCTACTGGATTGTAAAA
CCTGTGCCTGGGACAAAAGCCAAGCAAGGTGATGCGATCAAGAACGGAGAAACCATTAGA
TTGCAGCACATGAAGACCAGAAAATGGCTCCACAGTCACCTACACGCATCCCCTATCTCA
GGAAACTTAGAGGTTAGCTGCTTTGGAGATGATTCAAATTCCGATACTGGGGATCACTGG
AAGCTTACAATCGAAGGTAGTGGAAAGATATGGAAACAAGACCAAAGAGTCCGTCTTCAG
CACATTGACACTAGTGGCTACCTCCATAGCCACGACAAGAAGTAC*AACGCATTGCCG*T
GGTCAGCA
GAGTCTGT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2CR32JQ 545 0 0
TCAGCAGTCTGTTACTGGCTTTCCTGGCGTCACTGATTCCAACAGCTACTGGATTGTAAA
ACCTGTGCCTGGGACAAAAGCCAAGCAAGGTGATGCGATCAAGAACGGAGAAACCGTTAG
ATTGCAGCACATGAAGACCAGAAAATGGCTCCACAGTCACCTACACGCATCCCCTATCTC
AGGAAACTTAGAGGTTAGCTGCTTTGGAGATGATTCAAATTCCGATACTGGGGATCACTG
GAAGCTTACAATCGAAGGTAGTGGAAAGATATGGAAACAAGACCAAAGAGTCCGTCTTCA
GCACATTGACACTAGTGGCTACCTCCATAGCCACGACAAGAAGTACCAACGCATTGCCGG
TGGTCAGCAAGAGGTCTGTGGAATCCGGGAGAAGCGGGCTGATAATGTTTGGTTGGCAGC
AGAGGGAGTCTACCTTCCCGTTAATGAGAGTAGCAAGTAAGGTGAAGAGTTGTGTTAACT
TATCTCTGAGGAGACTTTGAATCTCATCTTTTACTCTCTAAACTCATAAACGAAGAAAAT
AAAAA

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 2

CO CL3251Contig1 1012 2 8 U
GGTGAGCTGGCGTGATGCCTTGGCCGTTGTGGGTGATATCATCCATCAGGTGAAGTCAGA
TGAGATTGTTGGAATAGCAGGTCAGCTATCCGATGCTGAATCCATGATGGTTTTGAAAGA
CTTCGTTAACAGAATGGGTTCAGACAATGTCTGGTGTGAAGGAACAGCTGTCGGTGTTGA
TGCTGATCTTAGGTACAGCTATCTAATGAACACTAGCATCAGTGGCCTTGAGAACGCCGA
TCTTTTCCTCCTCGTTGGTACCCAGCCTAGAGTTGAAGCTGCAATGGTCAACGCTAGGAT
CTGCAAGACAGTCCGTGCATCCAATGCCAAGGTTGCATACATTGGTCCACCTGCAGATTT
CAACTACGACTGCAAACACCTCGGGACTGGACCTGATACCCTCAAGGAAATCGCTGAGGG
ACGTCACCCCTTCTGCGCTGCTCTCAAGAACGCCAAGAACCCTGCAATCATTGTCGGCGC
CGGTCTCTTCAACAGAACAGACAAAGATGCTATCCTCTCTGCTGTTGAGTCCATTGCACA
AGCCAACAATGTCGTCAGACCAGACTGGAACGGTCTTAACTATCTCCTCCTGTACGCTGC
TCAAGCAGCTGCTCTTGATCTTGGTCTCATTCAACAGTCTGCTAAAGCCCTTGAGTCTGC
AAAATTTGTCTACTTGATGGGAGCAGACGATGTAGATGTTGACAAGATTCCTAAAGACGC
CTTTGTGGTTTACCAAGGTCACCATGGAGACAAAGCAGTTTACCGTGCAAATGTAATCCT
CCCTGCGTCGGCCTTCACCGAGAAAGAGGGAACCTATGAGAACACAGAAGGATTCACCCA
ACAGACTGTCCCCGCTGTCCCAACGGTTGGCGATGCAAGAGATGACTGGAAGATTGTGAG
AGCTTTGTCCGAGGTCTCTGGTGTGAACCTTCCATACACTCCATCGAAGTGTTAGTCAGG
ATCAGAGCGTCGCACCGAATCTAGTCACACAGATGACGAGAGTCAGCTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ53TF U 1
AF RR2EQ76TF U 210
BS 1 312 RR2CJ53TF
BS 313 313 RR2EQ76TF
BS 314 436 RR2CJ53TF
BS 437 437 RR2EQ76TF
BS 438 660 RR2CJ53TF
BS 661 661 RR2EQ76TF
BS 662 704 RR2CJ53TF
BS 705 1012 RR2EQ76TF

RD RR2CJ53TF 720 0 0
GGTGAGCTGGCGTGATGCCTTGGCCGTTGTGGGTGATATCATCCATCAGGTGAAGTCAGA
TGAGATTGTTGGAATAGCAGGTCAGCTATCCGATGCTGAATCCATGATGGTTTTGAAAGA
CTTCGTTAACAGAATGGGTTCAGACAATGTCTGGTGTGAAGGAACAGCTGTCGGTGTTGA
TGCTGATCTTAGGTACAGCTATCTAATGAACACTAGCATCAGTGGCCTTGAGAACGCCGA
TCTTTTCCTCCTCGTTGGTACCCAGCCTAGAGTTGAAGCTGCAATGGTCAACGCTAGGAT
CTGCAAGACAGTTCGTGCATCCAATGCCAAGGTTGCATACATTGGTCCACCTGCAGATTT
CAACTACGACTGCAAACACCTCGGGACTGGACCTGATACCCTCAAGGAAATCGCTGAGGG
ACGTCACCCCTTCTGCTCTGCTCTCAAGAACGCCAAGAACCCTGCAATCATTGTCGGCGC
CGGTCTCTTCAACAGAACAGACAAAGATGCTATCCTCTCTGCTGTTGAGTCCATTGCACA
AGCCAACAATGTCGTCAGACCAGACTGGAACGGTCTTAACTATCTCCTCCTGTACGCTGC
TCAAGCAGCTGCTCTTGATCTTGGTCTCATTCAACAGTCTGCTAAAGCCCTTGAGTCTGC
GAAATTTGTCTACTTGATGGGAGCAGACGATGTAGATGTTGACA
GATCCTAAGACGCCTT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2EQ76TF 803 0 0
G
CACTAGCATCAGTGGCCTTGAGAACGCCGATCTTTTCCTCCTCGTTGGTACCCAGCCTAG
AGTTGAAGCTGCAATGGTGAACGCTAGGATCTGCAAGACAGTCCGTGCATCTAATGCCAA
GGTTGCATACATTGGTCCACCTGCAGATTTCAACTACGACTGCAAACACCTCGGGACTGG
ACCTGATACCCTCAAGGAAATCGCTGAGGGACGTCACCCGTTCTGCGCTGCTCTCAAGAA
CGCCAAGAACCCTGCAATCATTGTTGGCGCCGGTCTCTTCAACAGAACAGACAAAGATGC
TATCCTCTCTGCTGTTGAGTCCATTGCACAAGCCAACAATGTCGTCAGACCAGACTGGAA
CGGTCTTAACTATCTCCTCCTGTACGCTGCTCAAGCAGCTGCTCTTGATCTTGGTCTCAT
TCAACAGTCTGCTAAAGCCCTTGAGTCTGCAAAATTTGTCTACTTGATGGGAGCAGACGA
TGTAGATGTTGACAAGATTCCTAAAGACGCCTTTGTGGTTTACCAAGGTCACCATGGAGA
CAAAGCAGTTTACCGTGCAAATGTAATCCTCCCTGCGTCGGCCTTCACCGAGAAAGAGGG
AACCTATGAGAACACAGAAGGATTCACCCAACAGACTGTCCCCGCTGTCCCAACGGTTGG
CGATGCAAGAGATGACTGGAAGATTGTGAGAGCTTTGTCCGAGGTCTCTGGTGTGAACCT
TCCATACACTCCATCGAAGTGTTAGTCAGGATCAGAGCGTCGCACCGAATCTAGTCACAC
AGATGACGAGAGTCAGCTGCTT

QA 2 803 2 803
DS 



AS 1 3

CO CL3252Contig1 1225 3 9 U
GGGGTTCCTTTCTGCAAGAAGTACTCCATCGAGCCACGAGCTCCTGAGTTCTACTTTTCG
CTTAAAATCGATTACTTGAGGGACAAGGTTCATCCTTCTTTTGTTAAAGAACGTAGAGCC
ATGAAAAGAGATTATGAAGAGTTCAAGATCAGAATGAATGCTTTAGTTGCAAAGGCTCAA
AAGACACCAGAAGAAGGATGGACAATGCAAGATGGAACCTCTTGGCCTGGAAACAATACT
CGTGACCATCCCGGAATGATTCAGGTTTTTCTTGGATATAGCGGTGCGCGTGACGTTGAA
GGAAACGAACTTCCAAGATTAGTATACGTCTCTAGAGAGAAGAGACCTGGATATCAGCAT
CACAAGAAGGCTGGGGCAGAGAACGCATTGGTGAGGGTTTCCGCGGTTTTAACGAATGCT
CCCTTCATTCTCAATCTTGATTGTGATCACTACGTCAACAACAGTAAAGCCGTCCGTGAA
GCAATGTGCTTCTTAATGGATCCAGTTGTTGGTCAAGACGTTTGCTATGTTCAGTTCCCA
CAGAGGTTTGATGGAATCGACAAGAGTGATCGATACGCTAACCGAAACATAGTTTTCTTC
GATGTTAATATGAGAGGGCTTGATGGGATTCAAGGTCCGGTCTACGTTGGAACCGGATGT
GTCTTTAGAAGACAAGCACTGTACGGATATAGTCCACCTTCTAAACCAAAAATGTTACCA
CAATCTTCTTCCTCGTCTTGTTGCTGCTGTCCAAGCAAGAAAAAACAAACACAAGATCCT
TCAGAGATTTACAAAGACGCAAAGCGAGAAGAACTTGATGCAGCAATCTTTAACTTAGGA
GACCTAGACAACTACGATGAGTACGAGAGATCTATGCTCATTTCACAGACAAGCTTTGAG
AAAACGTTTGGTCTCTCTGCGGTTTTCATCGAGTCTACACTTATGGAGAACGGTGGTGTT
CCTGACTCTGTGAATCCTCCAACGCTCATCAAAGAAGCTATCCACGTCATTAGCTGCGGA
TATGAAGAGAAAACTGAATGGGGAAAAGAAATTGGATGGATTTATGGATCAATCACAGAA
GACATTTTGACGGGTTTCAAGATGCATTGCCGTGGATGGAGGTCGATTTACTGTATGCCA
CTAAGACCAGCTTTTAAAGGGTCTGCTCCTATCAATCTATCAGATAGGCTTCACCAGGTT
CTGCGTTGGGCTCTTGGCTCGGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT39TF U 1
AF RR2AT39JQ C 269
AF RR2DY08TF U 763
BS 1 751 RR2AT39TF
BS 752 763 RR2AT39JQ
BS 764 836 RR2DY08TF
BS 837 837 RR2AT39JQ
BS 838 886 RR2DY08TF
BS 887 887 RR2AT39JQ
BS 888 1027 RR2DY08TF
BS 1028 1028 RR2AT39JQ
BS 1029 1225 RR2DY08TF

RD RR2AT39TF 751 0 0
GGGGTTCCTTTCTGCAAGAAGTACTCCATCGAGCCACGAGCTCCTGAGTTCTACTTTTCG
CTTAAAATCGATTACTTGAGGGACAAGGTTCATCCTTCTTTTGTTAAAGAACGTAGAGCC
ATGAAAAGAGATTATGAAGAGTTCAAGATCAGAATGAATGCTTTAGTTGCAAAGGCTCAA
AAGACACCAGAAGAAGGATGGACAATGCAAGATGGAACCTCTTGGCCTGGAAACAATACT
CGTGACCATCCCGGAATGATTCAGGTTTTTCTTGGATATAGCGGTGCGCGTGACGTTGAA
GGAAACGAACTTCCAAGATTAGTATACGTCTCTAGAGAGAAGAGACCTGGATATCAGCAT
CACAAGAAGGCTGGGGCAGAGAACGCATTGGTGAGGGTTTCCGCGGTTTTAACGAATGCT
CCCTTCATTCTCAATCTTGATTGTGATCACTACGTCAACAACAGTAAAGCCGTCCGTGAA
GCAATGTGCTTCTTAATGGATCCAGTTGTTGGTCAAGACGTTTGCTATGTTCAGTTCCCA
CAGAGGTTTGATGGAATCGACAAGAGTGATCGATACGCTAACCGAAACATAGTTTTCTTC
GATGTTAATATGAGAGGGCTTGATGGGATTCAAGGTCCGGTCTACGTTGGAACCGGATGT
GTCTTTAGAAGACAAGCACTGTACGGATATAGTCCACCTTCTAAACCAAAAATGTTACCA
CAATCTTCTTCCTCGTCTTGTTGCTGCTGTC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2AT39JQ 775 0 0
TTCTTGGATATAGCGGTGCGCGTGACGTTGAAGGAAACGAACTTCCAAGATTAGTATACG
TCTCTAGAGAGAAGAGACCTGGATATCAGCATCACAAGAAGGCTGGGGCAGAGAACGCAT
TGGTGAGGGTTTCCGCGGTTTTAACGAATGCTCCCTTCATTCTCAATCTTGATTGTGATC
ACTACGTCAACAACAGTAAAGCCGTCCGTGAAGCAATGTGCTTCTTAATGGATCCAGTTG
TTGGTCAAGACGTTTGCTATGTTCAGTTCCCACAGAGGTTTGATGGAATCGACAAGAGTG
ATCGATACGCTAACCGAAACATAGTTTTCTTCGATGTTAATATGAGAGGGCTTGATGGGA
TTCAAGGTCCGGTCTACGTTGGAACCGGATGTGTCTTTAGAAGACAAGCACTGTACGGAT
ATAGTCCACCTTCTAAACCAAAAATGTTACCACAATCTTCTTCCTCGTCTTGTTGCTGCT
GTCCAAGCAAGAAAAAACAAACACAAGATCCTTCAGAGATTTACAAAGACGCAAAGCGAG
AAGAACTTGATGCAGCAATCTTTAACTTAGGAGACCTAGACAACTACGATGAGTACGAGA
GATCTATGCTCATTTCACAGACAAGCTTTGAGAAAACGTTTGGTCTCTCTGCGGTTTTCA
TCGAGTCTACACTTATGGAGAACGGTGGTGTTCCTGACTCTGTGAATCCTTCAACGCTCA
TCAAAGAAGCTATCCACGTCATTAGCTGCGGATATGAAGAGAAAACTGAATGGGG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2DY08TF 463 0 0
G
AACAAACACAAGATCCTTCAGAGATTTACAAAGACGCAAAGCGAGAAGAACTTGATGCAG
CAATCTTTAACTTGGGAGACCTAGACAACTACGATGAGTACGAGAGATCTATGCTCATTT
CACGGACAAGCTTTGAGAAAACGTTTGGTCTCTCTGCGGTTTTCATCGAGTCTACACTTA
TGGAGAACGGTGGTGTTCCTGACTCTGTGAATCCTCCAACGCTCATCAAAGAAGCTATCC
ACGTCATTAGCTGCGGATATGAAGGGAAAACTGAATGGGGAAAAGAAATTGGATGGATTT
ATGGATCAATCACAGAAGACATTTTGACGGGTTTCAAGATGCATTGCCGTGGATGGAGGT
CGATTTACTGTATGCCACTAAGACCAGCTTTTAAAGGGTCTGCTCCTATCAATCTATCAG
ATAGGCTTCACCAGGTTCTGCGTTGGGCTCTTGGCTCGGTTG

QA 2 463 2 463
DS 



AS 1 3

CO CL3253Contig1 539 3 3 U
GGATAATTAAGTGACACTACAAACTCAAAATACACTGATTGGCAAGTTTTTACACACTAG
TTTCTTTTTAAAGGTCTTTTTATACACGAAGAACTCCAAAATGGCCAGGGTCCAAGGTCT
AGTTCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAGTTATGTTAACCGAGAGCCGAGTGGC
AAGAAAAGACCTGGGGCTTGACCTAGGTGGTATTGGGGTTGGTCTAGGCGTTGGATTAGG
GATTGGTCTTGGCGGCGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCAGGTTCAGGTTCAGGTTCAGG
TTCCAGATCATCATCTAGCTCTAGCTCTAGTTCGTCATCAAGTTCGAGTTCTCGTGGTTC
GGGTGGTTCCAGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATCTGCTGGATCTAGAGCTGGATCAGG
ATCTGGTAACTAAATTATAAAGCACGATATATGTGAAACAAAAAGTATGTTTTATGATGT
TGGTTTGTCGAAATTAATATCGTGTGTATTAAGTTGGATGAATAAATTATCGTCAAAAA


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H729JQB C 1
AF RR2H729TF U 1
AF RR2CE94TF U 2
BS 1 1 RR2H729JQB
BS 2 527 RR2H729TF
BS 528 539 RR2CE94TF

RD RR2H729JQB 527 0 0
GGATAATTAAGTGACACTACAAACTCAAAATACACTGATTGGCAAGTTTTTACACACTAG
TTTCTTTTTAAAGGTCTTTTTATACACGAAGAACTCCAAAATGGCCAGGGTCCAAGGTCT
AGTTCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAGTTATGTTAACCGAGAGCCGAGTGGC
AAGAAAAGACCTGGGGCTTGACCTAGGTGGTATTGGGGTTGGTCTAGGCGTTGGATTAGG
GATTGGTCTTGGCGGCGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCAGGTTCAGGTTCAGGTTCAGG
TTCCAGATCATCATCTAGCTCTAGCTCTAGTTCGTCATCAAGTTCGAGTTCTCGTGGTTC
GGGTGGTTCCAGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATCTGCTGGATCTAGAGCTGGATCAGG
ATCTGGTAACTAAATTATAAAGCACGATATATGTGAAACAAAAAGTATGTTTTATGATGT
TGGTTTGTCGAAATTAATATCGTGTGTATTAAGTTGGATGAATAAAT

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2H729TF 534 0 0
G
GATAATTAAGTGACACTACAAACTCAAAATACACTGATTGGCAAGTTTTTACACACTAGT
TTCTTTTTAAAGGTCTTTTTATACACGAAGAACTCCAAAATGGCCAGGGTCCAAGGTCTA
GTTCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAGTTATGTTAACCGAGAGCCGAGTGGCA
AGAAAAGACCTGGGGCTTGACCTAGGTGGTATTGGGGTTGGTCTAGGCGTTGGATTAGGG
ATTGGTCTTGGCGGCGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCAGGTTCAGGTTCAGGTTCAGGT
TCCAGATCATCATCTAGCTCTAGCTCTAGTTCGTCATCAAGTTCGAGTTCTCGTGGTTCG
GGTGGTTCCAGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATCTGCTGGATCTAGAGCTGGATCAGGA
TCTGGTAACTAAATTATAAAGCACGATATATGTGAAACAAAAAGTATGTTTTATGATGTT
GGTTTGTCGAAATTAATATCGTGTGTATTAAGTTGGATGAATAAAT
TATCGCC

QA 2 527 2 527
DS 

RD RR2CE94TF 538 0 0
GATAATTAAGTGACACTACAAACTCAAAATACACTGATTGGCAAGTTTTTACACACTAGT
TTCTTTTTAAAGGTCTTTTTATACACGAAGAACTCCAAAATGGCCAGGGTCCAAGGTCTA
GTTCTTCTTGGTTTATTAGTAATTTCAAGTTTAGTTATGTTAACCGAGAGCCGAGTGGCA
AGAAAAGACCTGGGGCTTGACCTAGGTGGTATTGGGGTTGGTCTAGGCGTTGGATTAGGG
ATTGGTCTTGGCGGCGGGTCAGGCTCTGGTGCTGGTGCAGGTTCAGGTTCAGGTTCAGGT
TCCAGATCATCATCTAGCTCTAGCTCTAGTTCGTCATCAAGTTCGAGTTCTCGTGGTTCG
GGTGGTTCCAGAGCCGGTTCATCTGCTGGTTCATCTGCTGGATCTAGAGCTGGATCAGGA
TCTGGTAACTAAATTATAAAGCACGATATATGTGAAACAAAAAGTATGTTTTATGATGTT
GGTTTGTCGAAATTAATATCGTGTGTATTAAGTTGGATGAATAAATTATCGTCAAAAA

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 3

CO CL3254Contig1 494 3 22 U
GGCACACTTCACACAAATACATCGAAAACAAATTCCTAATAGTCATGGCCAAGTTTGTTT
CCATCACCACCCTTCTTTTCGTTGCTCTTGTACTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAA
TTGTGGAAGCGCAGAAATTGTGCGAGGGGTCCAGTGGGACATGGTCAGGAGTATGTGGAA
ATAATAGTGCTTGCAAGAACCAGTGCATCAACCTCGAGGGAGCACGACATGGATCTTGCA
ACTATATTTTCCCATATCACAGGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAAAACTC
AATGGTTGTACCAAAACGATGTGGTGCTTGTGTGTTTATTTACATTCAATAAGTCTGTGT
CACTCTATGAGTGACCTTATGACATATACCAAGTATGTTTATGTATGTTTGTATGTTTTC
TGTGATACTATCAAGTATGTTTTATGCATGTTTTCTTTGATAATATAAAGTTTTACGTAC
CACGTACTATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AP19TF U 1
AF RR2CL90JQ C 9
AF RR2CL90TF U 9
BS 1 66 RR2AP19TF
BS 67 67 RR2CL90TF
BS 68 121 RR2AP19TF
BS 122 122 RR2CL90TF
BS 123 136 RR2AP19TF
BS 137 137 RR2CL90TF
BS 138 146 RR2AP19TF
BS 147 147 RR2CL90TF
BS 148 186 RR2AP19TF
BS 187 187 RR2CL90TF
BS 188 274 RR2AP19TF
BS 275 275 RR2CL90TF
BS 276 301 RR2AP19TF
BS 302 302 RR2CL90TF
BS 303 333 RR2AP19TF
BS 334 334 RR2CL90TF
BS 335 372 RR2AP19TF
BS 373 373 RR2CL90TF
BS 374 385 RR2AP19TF
BS 386 386 RR2CL90TF
BS 387 481 RR2AP19TF
BS 482 494 RR2CL90TF

RD RR2AP19TF 481 0 0
GGCACACTTCACACAAATACATCGAAAACAAATTCCTAATAGTCATGGCCAAGTTTGTTT
CCATCATCACCCTTCTTTTCGTTGCTCTTGTACTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAA
TGGTGGAAGCGCAGAAGTTGTGCGAGAGGTCCAGTGGGACATGGTCAGGAGTATGTGGAA
ATAATAATGCTTGCAAGAACCAGTGCATCAACCTCGAGGGAGCACGACATGGATCTTGCA
ACTATATTTTCCCATATCACAGGTGTATCTGCTACTTCCCATGTTAATCTACCAAAACTC
ATTGGTTGTACCAAAACGATGTGGTGCTTGTGTCTTTATTTACATTCAATAAGTCTGTGT
CACTCTATGAGTAACCTTATGACATGTACCAAGTATGTTTATGTATGTTTGTATGTTTTC
TGTGATACTATCAAGTATGTTTTATGCATGTTTTCTTTGATAATATAAAGTTTTACGTAC
C

QA 1 481 1 481
DS 

RD RR2CL90JQ 486 0 0
GG
ACACAAATACATGGAAAACAAATTCCTAATAGTCATGGCCAAGTTTGTTTCCATCACCAC
CCTTCTTTTCGTTGCTCTTGTACTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGC
GCAGAAATTGTGCGAGGGGTCCAGTGGGACATGGTCAGGAGTATGTGGAAATAATAGTGC
TTGCAAGAACCAGTGCATCAACCTCGAGGGAGCACGACATGGATCTTGCAACTATATTTT
CCCATATCACAGGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAAAACTCAATGGTTGTA
CCAAAACGATGTGGTGCTTGTGTGTTTATTTACATTCAATAAGTCTGTGTCACTCTATGA
GTGACCTTATGACATATACCAAGTATGTTTATGTATGTTTGTATGTTTTCTGTGATACTA
TCAAGTATGTTTTATGCATGTTTTCTTTGATAATATAAAGTTTTACGTACCACGTACTAT
GTCC

QA 3 486 3 486
DS 

RD RR2CL90TF 486 0 0
GG
ACACAAATACATCGAAAACAAATTCCTAATAGTCATGGCCAAGTTTGTTTCCATCACCAC
CCTTCTTTTCGTTGCTCTTGTACTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGC
GCAGAAATTGTGCGAGGGGTCCAGTGGGACATGGTCAGGAGTATGTGGAAATAATAGTGC
TTGCAAGAACCAGTGCATCAACCTCGAGGGAGCACGACATGGATCTTGCAACTATATTTT
CCCATATCACAGGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCAAAACTCAATGGTTGTA
CCAAAACGATGTGGTGCTTGTGTGTTTATTTACATTCAATAAGTCTGTGTCACTCTATGA
GTGACCTTATGACATATACCAAGTATGTTTATGTATGTTTGTATGTTTTCTGTGATACTA
TCAAGTATGTTTTATGCATGTTTTCTTTGATAATATAAAGTTTTACGTACCACGTACTAT
GTCC

QA 3 486 3 486
DS 



AS 1 3

CO CL3255Contig1 833 3 4 U
CCAAAAAGCACGAGGACCAAAGTAAATCTCTTTTACATAACAATAATTGTTTTTGTAACT
AGAATGTAATGATACTTTTTGTCACGTTGACATGTAAAGAAAAAGTACAGTCTACAGACC
CCATGGCCACGAAAGAATGAATAAATGAAATAACGAGATTTTGAACATAGCTTGAGCTAA
AGATAAAAAATAAAGAATATGTGTATATACAAAACTTATACACAACCAATACACCAACAA
AAATAATTGTGGGCATGTAAAAGGAATGAATGATACGGGCCGAGGAAATCAGCCCACTTG
GCCCGATGTTGCGGCGGCAAGAACCCAATGAAGGAGATCAAGAATGCGAAACGCGAGAAC
AGAGGAGGAAACGGGAACGCTGATCAAGAGGAGCAGCAGCGTTGAGATTGCGACTGTGGG
GCGAGAATTCGTGAGGAAACTCTGGAAAAGACCAACGGAATCGCAGATCACAGAGTCGTA
GCTGCTGTAGAAACGCTTCTCCCAATCCATCCAGTGAGAAGGAGGCTCGTAGTTTCGCTC
AACCATCTTCATCTCGTGGATTCGTTTCCTCAAAACGATCATGTTCTCGTCAACCAATCT
CCCTCCTCCGTAGTAATGGTCCTTCCCGGAAGACGCGGCAGCAGAAACGCTCATCATCTT
CTTATTCTGTGTCCTAAACGTCATCGTTTTATTCGGGGAGAACACCAATGGATGGAACCG
GAGTGGTGAAATCGATGAGATCAGTGTAGCTTCCATTGTTTCTGAGATCGGATTTTTGAA
ATTTGTTTTATGTGAATTTGGAATGTGTGAAGAAGATCGTTGTTGTGGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2FG22JQ U 235
AF RR2CI87JQ U 1
AF RR2CI87TF C 76
BS 1 802 RR2CI87JQ
BS 803 803 RR2CI87TF
BS 804 829 RR2CI87JQ
BS 830 833 RR2CI87TF

RD RR2FG22JQ 465 0 0
CAACAAAAATAATTGTGGGCATGTAAAAGGAATGAATGATACGGGCCGAGGAAATCAGCC
CACTTGGCCCGATGTTGCGGCGGCAAGAACCCAATGAAGGAGATCAAGAATGCGAAACGC
GAGAACAGAGGAGGAAACGGGAACGCTGATCAAGAGGAGCAGCAGCGTTGAGATTGCGAC
TGTGGGGCGAGAATTCATGAGGAAACTCTGGAAAAGACCAACGGAATCGCAGATCACAGA
GTCGTAGCTGCTGTAAAAACGCTTCTCCCAATCCATCCAGTGAGAAGGAGGCTCGTAGTT
TCGCTCAACCATCTTCATCTCGTGGATTCGTTTCCTCAAAACGATCATGTTCTCGTCAAC
CAATCTCCCTCCTCCGTAGTAATGGTCCTTCCCGGAAGACGCGGCAGTAGAAACGCTCAT
CATCTTCTTATTCTGTGTCCTAAACGTCATCGTTTTATTCGGGGA

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2CI87JQ 829 0 0
CCAAAAAGCACGAGGACCAAAGTAAATCTCTTTTACATAACAATAATTGTTTTTGTAACT
AGAATGTAATGATACTTTTTGTCACGTTGACATGTAAAGAAAAAGTACAGTCTACAGACC
CCATGGCCACGAAAGAATGAATAAATGAAATAACGAGATTTTGAACATAGCTTGAGCTAA
AGATAAAAAATAAAGAATATGTGTATATACAAAACTTATACACAACCAATACACCAACAA
AAATAATTGTGGGCATGTAAAAGGAATGAATGATACGGGCCGAGGAAATCAGCCCACTTG
GCCCGATGTTGCGGCGGCAAGAACCCAATGAAGGAGATCAAGAATGCGAAACGCGAGAAC
AGAGGAGGAAACGGGAACGCTGATCAAGAGGAGCAGCAGCGTTGAGATTGCGACTGTGGG
GCGAGAATTCGTGAGGAAACTCTGGAAAAGACCAACGGAATCGCAGATCACAGAGTCGTA
GCTGCTGTAGAAACGCTTCTCCCAATCCATCCAGTGAGAAGGAGGCTCGTAGTTTCGCTC
AACCATCTTCATCTCGTGGATTCGTTTCCTCAAAACGATCATGTTCTCGTCAACCAATCT
CCCTCCTCCGTAGTAATGGTCCTTCCCGGAAGACGCGGCAGCAGAAACGCTCATCATCTT
CTTATTCTGTGTCCTAAACGTCATCGTTTTATTCGGGGAGAACACCAATGGATGGAACCG
GAGTGGTGAAATCGATGAGATCAGTGTAGCTTCCATTGTTTCTGAGATCGGATTTTTGAA
ATTTGTTTTATGTGAATTTGGA*TGTGTGAAGAAGATCGTTGTTGTGGC

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2CI87TF 758 0 0
TTTTTGTCACGT*GACATGTAAAGAAAAAGTACAGTCTACAGACCCCATGGCCACGAAAG
AATGAATAAATGAAATAACGAGATTTTGAACATAGCTTGAGCTAAAGATAAAAAATAAAG
AATATGTGTATATACAAAACTTATACACAACCAATACACCAACAAAAATAATTGTGGGCA
TGTAAAAGGAATGAATGATACGGGCCGAGGAAATCAGCCCACTTGGCCCGATGTTGCGGC
GGCAAGAACCCAATGAAGGAGATCAAGAATGCGAAACGCGAGAACAGAGGAGGAAACGGG
AACGCTGATCAAGAGGAGCAGCAGCGTTGAGATTGCGACTGTGGGGCGAGAATTCGTGAG
GAAACTCTGGAAAAGACCAACGGAATCGCAGATCACAGAGTCGTAGCTGCTGTAGAAACG
CTTCTCCCAATCCATCCAGTGAGAAGGAGGCTCGTAGTTTCGCTCAACCATCTTCATCTC
GTGGATTCGTTTCCTCAAAACGATCATGTTCTCGTCAACCAATCTCCCTCCTCCGTAGTA
ATGGTCCTTCCCGGAAGACGCGGCAGCAGAAACGCTCATCATCTTCTTATTCTGTGTCCT
AAACGTCATCGTTTTATTCGGGGAGAACACCAATGGATGGAACCGGAGTGGTGAAATCGA
TGAGATCAGTGTAGCTTCCATTGTTTCTGAGATCGGATTTTTGAAATTTGTTTTATGTGA
ATTTGGAATGTGTGAAGAAGATCGTTGTTGTGGCTTCC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 3

CO CL3256Contig1 818 3 7 U
GGAAATGAAACATAATTTGATTTGATATCCCCGACAAATCGTAGTAATGGCGATAACGGC
GACTAGATTGGTATCTCTAACTCTGTTGTGGGTAGTCGTCCTCTTCGTCACACTTGCTCT
CATCCAGATGAAATTGACTGATGTTGCTGATCCTATGGGGAATGAGAAGATTGCTGATCC
TATGGTAGGAGGAGAGGATTTAGATGGAGTTACCCACAAAGTTTACTTTGATATTCAGAT
CAATGGTTCACCTGCAGGGAGGATTCTCATTGGGCTTTTTGGGAATATAGTTCCTAAAAC
CGCAGAGAACTTTCGAGCGCTTTGCACGGGAGAGAAAGGAGTTGGGAACATGGGGAAACC
ACTTTATTTCAAAGGAAGCAGCTTCCATAGGATCATTCCTAGCTTCATGATTCAAGGTGG
AGATTTCACACGAGGCGATGGGAGAGGTGGAGAGTCCATCTATGGCGATAAGTTTGCAGA
TGAGAACTTCAAACTCAAACACACCGGGCCAGGAGTCTTATCAATGGCAAACTCGGGACC
AGACTCCAACGGTTCACAGTTCTTCATCACAACCGTCACCACAAATTGGTTGGACGGACA
TCACGTTGTGTTTGGGAAGGTATTGTCAGGCATGGAAGTAGTGCGGAAGATCGAAGCTCA
AGGACAAAGCAGTGGAGAGCCCAAAGGAAAAGTTATCATTTTGGACAGTGGAGAAGTTCC
TTTGTAATATTTATCTTTCTTCCACTTTAAGAAACTTCTAAGAACTTATGTTTTTCATCG
TTATGAACACACACAAAGATCAAGTGTTACACTCTTCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF88TF U 1
AF RR2AS16TF U 5
AF RR2AF88JQ C 26
BS 1 611 RR2AF88TF
BS 612 662 RR2AS16TF
BS 663 663 RR2AF88JQ
BS 664 718 RR2AS16TF
BS 719 719 RR2AF88JQ
BS 720 744 RR2AS16TF
BS 745 818 RR2AF88JQ

RD RR2AF88TF 611 0 0
GGAAATGAAACATAATTTGATTTGATATCCCCGACAAATCGTAGTAATGGCGATAACGGC
GACTAGATTGGTATCTCTAACTCTGTTGTGGGTAGTCGTCCTCTTCGTCACACTTGCTCT
CATCCAGATGAAATTGACTGATGTTGCTGATCCTATGGGGAATGAGAAGATTGCTGATCC
TATGGTAGGAGGAGAGGATTTAGATGGAGTTACCCACAAAGTTTACTTTGATATTCAGAT
CAATGGTTCACCTGCAGGGAGGATTCTCATTGGGCTTTTTGGGAATATAGTTCCTAAAAC
CGCAGAGAACTTTCGAGCGCTTTGCACGGGAGAGAAAGGAGTTGGGAACATGGGGAAACC
ACTTTATTTCAAAGGAAGCAGCTTCCATAGGATCATTCCTAGCTTCATGATTCAAGGTGG
AGATTTCACACGAGGCGATGGGAGAGGTGGAGAGTCCATCTATGGCGATAAGTTTGCAGA
TGAGAACTTCAAACTCAAACACACCGGGCCAGGAGTCTTATCAATGGCAAACTCGGGACC
AGACTCCAACGGTTCACAGTTCTTCATCACAACCGTCACCACAAATTGGTTGGACGGACA
TCACGTTGTGT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2AS16TF 740 0 0
ATGAAACATAATTTGATTTGATATCCCCGACAAATCGTAGTAATGGCGATAACGGCGACT
AGATTGGTATCTCTAACTCTGTTGTGGGTAGTCGTCCTCTTCGTCACACTTGCTCTCATC
CAGATGAAATTGACTGATGTTGCTGATCCTATGGGGAATGAGAAGATTGCTGATCCTATG
GTAGGAGGAGAGGATTTAGATGGAGTTACCCACAAAGTTTACTTTGATATTCAGATCAAT
GGTTCACCTGCAGGGAGGATTCTCATTGGGCTTTTTGGGAATATAGTTCCTAAAACCGCA
GAGAACTTTCGAGCGCTTTGCACGGGAGAGAAAGGAGTTGGGAACATGGGGAAACCACTT
TATTTCAAAGGAAGCAGCTTCCATAGGATCATTCCTAGCTTCATGATTCAAGGTGGAGAT
TTCACACGAGGCGATGGGAGAGGTGGAGAGTCCATCTATGGCGATAAGTTTGCAGATGAG
AACTTCAAACTCAAACACACCGGGCCAGGAGTCTTATCAATGGCAAACTCGGGACCAGAC
TCCAACGGTTCGCAGTTCTTCATCACAACCGTCACCACAAATTGGTTGGACGGACATCGC
GTTGTGTTTGGGAAGGTATTGTCAGGCATGGAAGTAGTGCGGAAGATCGAAGCTCAAG*A
CAAAGCAGTGGAGAGCCCAAAGGAAAAGTTATCATTTTGGACAGTGGAGAAGTTTCTTTG
TAATATTTATCTTTCTTCCA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2AF88JQ 793 0 0
TATCCCCGACAAATCGTAGTAATGGCGATAACGGCGACTAGATTGGTATCTCTAACTCTG
TTGTGGGTAGTCGTCCTCTTCGTCACACTTGCTCTCATCCAGATGAAATTGACTGATGTT
GCTGATCCTATGGGGAATGAGAAGATTGCTGATCCTATGGTAGGAGGAGAGGATTTAGAT
GGAGTTACCCACAAAGTTTACTTTGATATTCAGATCAATGGTTCACCTGCAGGGAGGATT
CTCATTGGGCTTTTTGGGAATATAGTTCCTAAAACCGCAGAGAACTTTCGAGCGCTTTGC
ACGGGAGAGAAAGGAGTTGGGAACATGGGGAAACCACTTTATTTCAAAGGAAGCAGCTTC
CATAGGATCATTCCTAGCTTCATGATTCAAGGTGGAGATTTCACACGAGGCGATGGGAGA
GGTGGAGAGTCCATCTATGGCGATAAGTTTGCAGATGAGAACTTCAAACTCAAACACACC
GGGCCAGGAGTCTTATCAATGGCAAACTCGGGACCAGACTCCAACGGTTCACAGTTCTTC
ATCACAACCGTCACCACAAATTGGTTGGACGGACATCACGTTGTGTTTGGGAAGGTATTG
TCAGGCATGGAAGTAGTGCGGAAGATCGAAGCTCAAGGACAAAGCAGTGGAGAGCCCAAA
GGAAAAGTTATCATTTTGGACAGTGGAGAAGTTCCTTTGTAATATTTATCTTTCTTCCAC
TTTAAGAAACTTCTAAGAACTTATGTTTTTCATCGTTATGAACACACACAAAGATCAAGT
GTTACACTCTTCC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 3

CO CL3257Contig1 1078 3 5 U
GGACGACACAACAAAGCACAGCCTCTCTCTCTCACATAATCACATGTAGTCATGTACCAA
CTTGGTCAAAAGTCACTTCTTTTTATACAACTCAAAACTCTCCTCACATCTTGATCTCTT
TTCTCTCAGACACACACACATACACCTTCTTCATCATGGGAAGGTCTCCATGTTGCGAGA
AAGCCCACACAAACAAAGGAGCTTGGACCAAAGAAGAAGACCAACGTCTCATCGATTACA
TCCGTAATCACGGCGAAGGTTGCTGGCGTTCACTCCCTAAATCCGCAGGATTGTTACGAT
GTGGTAAGAGTTGTAAATTGAGATGGATTAATTACCTTCGTCCGGATCTCAAACGTGGAA
ATTTTTCTGATGAAGAAGACCAAGTCATCATCAAGCTACATAGCTTACTCGGCAACAAAT
GGTCATTGATCGCTGGAAGATTA***GGAAGAACAGATAATGAAATAAAAAATTATTGGA
ACACTCATATTAAGAGGAAGCTTCTCAGCCACGGAATCGACCCCCAAACACATCGTCCGG
TTAAAGATAACGTCGCCGTGACTGATGCGAAAACGGCGTCGTCACAATTATCAACCACTG
TTATTGTTTCACCTCAAAACTACGCCGTTGAATACGCTTTTATAGTCAAACCGAAGACGG
AAAATTCCTCCGATAACGGCGCGTCCACAAGCAGCACGACAACTGACGAGGATCTCCGAC
AAAACGGAGATAGTTATTACAGAGATAATTCAGGAGATATGGAGCTGAATCTTGACCTAA
CTCTCGGGTCCGGATTCGGGTCGACTTCTTGGGTCGGGTCTAAGCCGTGGCGGGATACGG
CGATGGCGGCGCGTTTGTCACTCTAGTAAGAATTACGAAACGGCAAAAATCCCCCAAAAA
TGGGTGTTTTTTAGATTTTTCTTCTTGTGTGGGTCCTTTTTGAATATCTATAGACATTGT
TTTACTTCAGTTCTTGGCATTTTGTTTTGATTCTGTTACATACTATTATTACCTGTTGAA
GTAAACAATATTACAATTTTTGATATATTGTTTTACCGTTGTGGTAATTTTTTTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC45TF U 1
AF RR2FD92TF U 111
AF RR2CC45JQ C 369
BS 1 321 RR2CC45TF
BS 322 322 RR2FD92TF
BS 323 645 RR2CC45TF
BS 646 749 RR2FD92TF
BS 750 1078 RR2CC45JQ

RD RR2CC45TF 645 0 0
GGACGACACAACAAAGCACAGCCTCTCTCTCTCACATAATCACATGTAGTCATGTACCAA
CTTGGTCAAAAGTCACTTCTTTTTATACAACTCAAAACTCTCCTCACATCTTGATCTCTT
TTCTCTCAGACACACACACATACACCTTCTTCATCATGGGAAGGTCTCCATGTTGCGAGA
AAGCCCACACAAACAAAGGAGCTTGGACCAAAGAAGAAGACCAACGTCTCATCGATTACA
TCCGTAATCACGGCGAAGGTTGCTGGCGTTCACTCCCTAAATCCGCAGGATTGTTACGAT
GTGGTAAGAGTTGTAAATTGATATGGATTAATTACCTTCGTCCGGATCTCAAACGTGGAA
ATTTTTCTGATGAAGAAGACCAAGTCATCATCAAGCTACATAGCTTACTCGGCAACAAAT
GGTCATTGATCGCTGGAAGATTA***GGAAGAACAGATAATGAAATAAAAAATTATTGGA
ACACTCATATTAAGAGGAAGCTTCTCAGCCACGGAATCGACCCCCAAACACATCGTCCGG
TTAAAGATAACGTCGCCGTGACTGATGCGAAAACGGCGTCGTCACAATTATCAACCACTG
TTATTGTTTCACCTCAAAACTACGCCGTTGAATACGCTTTTATAG

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2FD92TF 639 0 0
GG
GATCTCTTTTCTCTCAGACATACACACATACACCTTCTTCATCATGGGAAGGTCTCCATG
TTGCGAGAAAGCCCACACAAACAAAGGAGCTTGGACCAAAGAAGAAGACCAACGTCTCAT
CGATTACATCCGTAATCACGGCGAAGGTTGCTGGCGTTCACTCCCTAAATCCGCAGGATT
GTTACGATGTGGTAAGAGTTGTGGATTGAGATGGGTTAATTACCTTCGTCCGGATCTCAA
ACGTGGAAATTTTTCTGATGAAGAAGACCAAGTCATCATCAAGCTACATAGCTTACTCGG
CAACAAATGGTCATTGATCGCTGGAAGATTACCAGGAAGAACAGATAATGAAATAAAAAA
TTATTGGAACACTCATATTAAGAGGAAGCTTCTCAGCCACGGAATCGATCCCCAAACACA
TCGTCCGGTTAAAGATAACGTCGCCGTGACTGATGCGAAAACGGCGTCGTCGCAATTAAC
AACCGCTGTTATTGTTTCACCTCAAAACTACGCCGTTGAATACGCTTTTATAGTCAAACC
GAAGACGGAAAATTCCTCCGATAACGGCGCGTCCACAAGCAGCACGACAACTGACGAGGA
TCTCCGACAAAACGGAGATAGTTATTACAGAGATAAT

QA 3 639 3 639
DS 

RD RR2CC45JQ 710 0 0
GATGAAGAAGACCAAGTCATCATCAAGCTACATAGCTTACTCGGCAACAAATGGTCATTG
ATCGCTGGAAGATTA***GGAAGAACAGATAATGAAATAAAAAATTATTGGAACACTCAT
ATTAAGAGGAAGCTTCTCAGCCACGGAATCGACCCCCAAACACATCGTCCGGTTAAAGAT
AACGTCGCCGTGACTGATGCGAAAACGGCGTCGTCACAATTATCAACCACTGTTATTGTT
TCACCTCAAAACTACGCCGTTGAATACGCTTTTATAGTCAAACCGAAGACGGAAAATTCC
TCCGATAACGGCGCGTCCACAAGCAGCACGACAACTGACGAGGATTTCCGACAAAACGGA
GATAGTTATTACAGAGATAATTCAGGAGATATGGAGCTGAATCTTGACCTAACTCTCGGG
TCCGGATTCGGGTCGACTTCTTGGGTCGGGTCTAAGCCGTGGCGGGATACGGCGATGGCG
GCGCGTTTGTCACTCTAGTAAGAATTACGAAACGGCAAAAATCCCCCAAAAATGGGTGTT
TTTTAGATTTTTCTTCTTGTGTGGGTCCTTTTTGAATATCTATAGACATTGTTTTACTTC
AGTTCTTGGCATTTTGTTTTGATTCTGTTACATACTATTATTACCTGTTGAAGTAAACAA
TATTACAATTTTTGATATATTGTTTTACCGTTGTGGTAATTTTTTTACAT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 3

CO CL3258Contig1 730 3 10 U
GGGCCGTAAAAATAAACTAAAGCAAAAAAACTCTCTCTATCTGTGTTAGTCAAAAGCTAT
GGAGAAACTCATCTACCGAATAACCCTTGTCTTCACCACTCTCTTCCTCTCATTCTCTCT
CTCCTCACCGTCTTCTCCGACGATCCACGACGTTCTTCGATCAAAAGGTCTCCCCGCGGG
ACTATTACCCCAAGAGGTTGACTCCTACACTCTTTACAACGACGGTCGTCTCGAGGTTTT
CCTCGCGGCTCCGTGTCTCGCCAAGTCCGTGACGGGAATGCGCTTTGACTCTGTAGTGAG
AGCGAATCTGAGCTACGGGAGCCTTGTCGGAGTAGAAGGATTGTCGCAGTTCGAGCTGTT
TTTGTGGCTGTCGGTGAAAGATATTGTCGTCAAGAAACCTGATTCCGGCGTCATTATAAT
CGATATCGGCGTTGCTTATAAACAACTCTCGCGTTCTCTTTTTGAAGATCCTCCCAAGTG
TTTACCTCACGGAGATTTGAGAAAAAAGACGAGAGGATATGAAGGATTTGAAGCTCTCAA
GATGAAAAATTTAAAAGAAGGGTGGATATCTCGATTGTTCTTTTGATTTATTCCATATTA
TGCACTGATCAGAAAAACCAATATGCTAATTATATGAGTCGGTTAGGTTTTTGTTTAAGA
GTTCTTGTAAAGAAAAGATTCTCAATGTTCTATCCTATGTTTTTGTTCCTAGTTTATATT
TTCTGTTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU93TF U 1
AF RR2H955TF U 1
AF RR2GU93JQB C 211
BS 1 30 RR2GU93TF
BS 31 31 RR2H955TF
BS 32 51 RR2GU93TF
BS 52 52 RR2H955TF
BS 53 204 RR2GU93TF
BS 205 205 RR2H955TF
BS 206 538 RR2GU93TF
BS 539 539 RR2GU93JQB
BS 540 707 RR2H955TF
BS 708 730 RR2GU93JQB

RD RR2GU93TF 541 0 0
GGGCCGTAAAAATAAACTAAAGCAAAAAAA*TCTCTCTATCTGTGTTAGTCTAAAGCTAT
GGAGAAACTCATCTACCGAATAACCCTTGTCTTCACCACTCTCTTCCTCTCATTCTCTCT
CTCCTCACCGTCTTCTCCGACGATCCACGACGTTCTTCGATCAAAAGGTCTCCCCGCGGG
ACTATTACCCCAAGAGGTTGACTCTTACACTCTTTACAACGACGGTCGTCTCGAGGTTTT
CCTCGCGGCTCCGTGTCTCGCCAAGTCCGTGACGGGAATGCGCTTTGACTCTGTAGTGAG
AGCGAATCTGAGCTACGGGAGCCTTGTCGGAGTAGAAGGATTGTCGCAGTTCGAGCTGTT
TTTGTGGCTGTCGGTGAAAGATATTGTCGTCAAGAAACCTGATTCCGGCGTCATTATAAT
CGATATCGGCGTTGCTTATAAACAACTCTCGCGTTCTCTTTTTGAAGATCCTCCCAAGTG
TTTACCTCACGGAGATTTGAGAAAAAAGACGAGAGGATATGAAGGATTTGAAGCTCTC
AAG

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2H955TF 707 0 0
GGGCCGTAAAAATAAACTGAAGCAAAAAATCTCTCTCTATCTGTGTTAGTCAAAAGCTAT
GGAGAAACTCATCTACCGAATAGCCCTTGTCTTCACCACTCTCTTCCTCTCATTCTCTCT
CTCCTCACCGTCTTCTCCGACGATCCACGACGTTCTTCGGTCAAAAGGTCTCCCCGCGGG
ACTATTACCCCAAGAGGTTGACTCCTACACTCTTTACAACGACGGTCGTCTCGAGGTTTT
CCTCGCCGCGCCGTGTCTCGCCAAGTCCGTGACGGGAATGCGCTTTGACTCTGTAGTGAG
AGCGAATCTGAGCTACGGGAGCCTTGTCGGAGTAGAAGGATTGTCGCAGTTCGAGCTGTT
TTTGTGGCTGTCGGTGAAAGATATTGTCGTCAAGAAACCTGATTCCGGCGTCATTATAAT
CGATATCGGCGTTGCTTATAAACAACTCTCGCGTTCTCTCTTTGAAGATCCTCCCAAGTG
TTTACCTCACGGCGATTTGAAAAAAAAGACGAGAGGATATGGAGGAATTGAAGCTCTCGA
GATGAAAAATTTAAAAGAAGGGTGGATATCTCGATTGTTCTTTTGATTTATTCCATATTA
TGCACTGATCAGAAAAACCAATATGCTAATTATATGAGTCGGTTAGGTTTTTGTTTAAGA
GTTCTTGTAAAGAAAAGATTCTCAATGTTCTATCCTATGTTTTTGTT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2GU93JQB 520 0 0
TCTTTACAACGACGGTCGTCTCGAGGTTTTCCTCGCGGCTCCGTGTCTCGCCAAGTCCGT
GACGGGAATGCGCTTTGACTCTGTAGTGAGAGCGAATCTGAGCTACGGGAGCCTTGTCGG
AGTAGAAGGATTGTCGCAGTTCGAGCTGTTTTTGTGGCTGTCGGTGAAAGATATTGTCGT
CAAGAAACCTGATTCCGGCGTCATTATAATCGATATCGGCGTTGCTTATAAACAACTCTC
GCGTTCTCTTTTTGAAGATCCTCCCAAGTGTTTACCTCACGGAGATTTGAGAAAAAAGAC
GAGAGGATATGAAGGATTTGAAGCTCTCAAGATGACAAATTTAAAAGAGGGGTGGATATC
TCGATTGTTCTTTTGATTTATTCCATATTATGCACTGATCAGAAAAACCAATATGCTAAT
TATATGAGTCGTTTAGGTTTTTGTT*AAGAGTTCTTGTAAAGAAAAGATTCTCAATGTTC
TATCCTATGTTTTTGTTCCTAGTTTATATTTTCTGTTTCC

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 2

CO CL3259Contig1 527 2 3 U
TTATGAAAGCAAAGCAGAGCAACAAAAAAAGAAGTTTGTTCTCTTCCTATTAGTCTCTAA
TCAAATCTGTAGACACAGCTGCATAACACTGAAGAGTTTTGAATCTCTTTTTCTTAAGTA
GCCTGAGGATGAGAAGCGATAAAGTCAACAGCAAGATCAACGGACTGGATCTTGTCAGCA
TCATTATCAGGGATCTCAAACCCAAACTCTTCCTCCAACGCCATCACAACCTCCACACTG
TCCAAACTGTCTAACCCGAGATCGTTGTGAAAATGGGCTTTTGGTGTTACCTTTGAGGGA
TCGACTCTTTGAAGGTTTTTGACGACGGAGATAACGCGATCTGTGACATCAGATTTGTCT
AGAAACGATCCTCTTACTTCCTCCGAGAAACGCCTAAGAAGTACGGTGGTGAAAGGGAGT
GCAGGTGATGGATTGACGTTGACTCTAAGGTATCGAAGCAGAGCATTTCTCGCCGCCATC
GCTGTGTTTTTCAAAACTAACCCTAGAAGGCGTTTCTCTCTACTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY66JQ U 21
AF RR2EY66TF C 1
BS 1 20 RR2EY66TF
BS 21 395 RR2EY66JQ
BS 396 527 RR2EY66TF

RD RR2EY66JQ 375 0 0
AACAAAAAAAGAAGTTTGTTCTCTTCCTATTAGTCTCTAATCAAATCTGTAGACACAGCT
GCATAACACTGAAGAGTTTTGAATCTCTTTTTCTTAAGTAGCCTGAGGATGAGAAGCGAT
AAAGTCAACAGCAAGATCAACGGACTGGATCTTGTCAGCATCATTATCAGGGATCTCAAA
CCCAAACTCTTCCTCCAACGCCATCACAACCTCCACACTGTCCAAACTGTCTAACCCGAG
ATCGTTGTGAAAATGGGCTTTTGGTGTTACCTTTGAGGGATCGACTCTTTGAAGGTTTTT
GACGACGGAGATAACGCGATCTGTGACATCAGATTTGTCTAGAAACGATCCTCTTACTTC
CTCCGAGAAACGCCT

QA 1 375 1 375
DS 

RD RR2EY66TF 527 0 0
TTATGAAAGCAAAGCAGAGCAACAAAAAAAGAAGTTTGTTCTCTTCCTATTAGTCTCTAA
TCAAATCTGTAGACACAGCTGCATAACACTGAAGAGTTTTGAATCTCTTTTTCTTAAGTA
GCCTGAGGATGAGAAGCGATAAAGTCAACAGCAAGATCAACGGACTGGATCTTGTCAGCA
TCATTATCAGGGATCTCAAACCCAAACTCTTCCTCCAACGCCATCACAACCTCCACACTG
TCCAAACTGTCTAACCCGAGATCGTTGTGAAAATGGGCTTTTGGTGTTACCTTTGAGGGA
TCGACTCTTTGAAGGTTTTTGACGACGGAGATAACGCGATCTGTGACATCAGATTTGTCT
AGAAACGATCCTCTTACTTCCTCCGAGAAACGCCTAAGAAGTACGGTGGTGAAAGGGAGT
GCAGGTGATGGATTGACGTTGACTCTAAGGTATCGAAGCAGAGCATTTCTCGCCGCCATC
GCTGTGTTTTTCAAAACTAACCCTAGAAGGCGTTTCTCTCTACTCCC

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 3

CO CL3260Contig1 1023 3 6 U
GGATAACAGTACATCTCTCCTTAGATCTCATCACGAGATAACCACTACTTGCTTACTAGT
GACACTTTCGATTAGATCTTCTCAAAAACCTCTCCTTTCTTTGTCAATTTCTCCGACCAT
TAGATCTTCTTGTTGTTGTTCTTGTCTGAATTCTGATCCTGCGGTGCCCCATTTCTTGCT
TTGTAAAAGAACATTGGTGATATTAGTGTGTGTGTTAAATTAAGAAAGCACTCTGAGGTT
TTGTGGGTCTGGGGATTCCTTCTTATCTGAATTTTGAGAAAAAAATGGAGGAGAAAGTGG
TGGCTGTGATCATGGTCGGTGGTCCAACCAAAGGTACTCGATTTCGACCATTGTCCCTTA
ATATTCCAAAGCCTCTGTTTCCTATTGCCGGACAACCAATGGTGCATCATCCAATCTCAG
CTTGTAAAAGGATTCCAAACTTGGCTCAAATCTATCTTGTTGGTTTCTATGAGGAAAGGG
AGTTTGCACTTTATGTCTCTGCCATTTCCAATGAACTCAAAGTTCCTGTCAGATATCTGC
GAGAAGATAAGTCACATGGTTCAGCTGGTGGTCTCTATCATTTCAGAAATCTAATCATGG
AAGATGACCCTTCTCATATCTTCCTGCTTAACTGTGATGTTTGCTGCAGTTTCCCCTTGC
CAGAAATGCTCGAGGCTCATAGGAAATATGGTGGAATTGGAACTCTTCTTGTGGTCAAGG
TCTCTCCTGAATCAGCAAGCCAATTTGGAGAACTGGTTGCAGATCCAGTTACTAATGAGC
TGCTTCATTACACCGAGAAACCAGAAACTTTTGTCAGTGACCGTATTAACTGCGGTGTTT
ATGTATTTACACCTGACATTTTTTACTGCCATAAGAGATGTTTCCTCTCAAAGGAAAGAT
ACAGCAATTCTGAGACGTGTTTCCAGCTTTGAAGCTCTTCAACCGGCAACAAAGATCCCA
GCAGATTTTGTAAGACTGGATCAAGACATCCTTTCACCTCTAGCTGGGGAGAGCAGCTAT
ATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2GA26TF U 1
AF RR2C855TF U 180
AF RR2AK81TF U 205
BS 1 441 RR2GA26TF
BS 442 442 RR2C855TF
BS 443 585 RR2GA26TF
BS 586 586 RR2C855TF
BS 587 670 RR2GA26TF
BS 671 1023 RR2AK81TF

RD RR2GA26TF 677 0 0
GGATAACAGTACATCTCTCCTTAGATCTCATCACGAGATAACCACTACTTGCTTACTAGT
GACACTTTCGATTAGATCTTCTCAAAAACCTCTCCTTTCTTTGTCAATTTCTCCGACCAT
TAGATCTTCTTGTTGTTGTTCTTGTCTGAATTCTGATCCTGCGGTGCCCCATTTCTTGCT
TTGTAAAAGAACATTGGTGATATTAGTGTGTGTGTTAAATTAAGAAAGCACTCTGAGGTT
TTGTGGGTCTGGGGATTCCTTCTTATCTGAATTTTGAGAAAAAAATGGAGGAGAAAGTGG
TGGCTGTGATCATGGTCGGTGGTCCAACCAAAGGTACTCGATTTCGACCATTGTCCCTTA
ATATTCCAAAGCCTCTGTTTCCTATTGCCGGACAACCAATGGTGCATCATCCAATCTCAG
CTTGTAAAAGGATTCCAAACTCGGCTCAAATCTATCTTGTTGGTTTCTATGAGGAAAGGG
AGTTTGCACTTTATGTCTCTGCCATTTCCAATGAACTCAAAGTTCCTGTCAGATATCTGC
GAGAAGATAAGTCACATGGTTCAGCTGGTGGTCTCTATCATTTCA*AAATCTAATCATGG
AAGATGACCCTTCTCATATCTTCCTGCTTAACTGTGATGTTTGCTGCAGTTTCCCCTTGC
CAGAAATGCT
CGAGCTC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2C855TF 491 0 0
TTTGTAAAAGAACATTGGTGATATTAGTGTGTGTGTTAAATTAAGAAAGCACTCTGAGGT
TTTGTGGGTCTGGGGATTCCTTCTTATCTGAATTTTGAGAAAAAAATGGAGGAGAAAGTG
GTGGCTGTGATCATGGTCGGTGGTCCAACCAAAGGTACTCGATTTCGACCATTGTCCCTT
AATATTCCAAAGCCTCTGTTTCCTATTGCCGGACAACCAATGGTGCATCATCCAATCTCA
GCTTGTAAAAGGATTCCAAACTTGGCTCAAATCTATCTTGTTGGTTTCTATGAGGAAAGG
GAGTTTGCACTTTATGTCTCTGCCATTTCCAATGAACTCAAAGTTCCTGTCAGATATCTG
CGAGAAGATAAGTCACATGGTTCAGCTGGTGGTCTCTATCATTTCAGAAATCTAATCATG
GAAGATGACCCTTCTCATATCTTCCTGCTTAACTGTGATGTTTGCTGTAGTTTCCCCTTG
CCAGAAATGCT

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2AK81TF 819 0 0
AGTGTGTGTGTTAAATTAAGAAAGCACTCTGAGGTTTTGTGGGTCTGGGGATTCCTTCTT
ATCTGAATTTTGAGAAAAAAATGGAGGAGAAAGTGGTGGCTGTGATCATGGTCGGTGGTC
CAACCAAAGGTACTCGATTTCGACCATTGTCCCTTAATATTCCAAAGCCTCTGTTTCCTA
TTGCCGGACAACCAATGGTGCATCATCCAATCTCAGCTTGTAAAAGGATTCCAAACTTGG
CTCAAATCTATCTTGTTGGTTTCTATGAGGAAAGGGAGTTTGCACTTTATGTCTCTGCCA
TTTCCAATGAACTCAAAGTTCCTGTCAGATATCTGCGAGAAGATAAGTCACATGGTTCAG
CTGGTGGTCTCTATCATTTCAGAAATCTAATCATGGAAGATGACCCTTCTCATATCTTCC
TGCTCAACTGTGATGTTTGCTGCAGTTTCCCCTTGCCAGAAATGCTCGAGGCTCATAGGA
AATATGGTGGAATTGGAACTCTTCTTGTGGTCAAGGTCTCTCCTGAATCAGCAAGCCAAT
TTGGAGAACTGGTTGCAGATCCAGTTACTAATGAGCTGCTTCATTACACCGAGAAACCAG
AAACTTTTGTCAGTGACCGTATTAACTGCGGTGTTTATGTATTTACACCTGACATTTTTT
ACTGCCATAAGAGATGTTTCCTCTCAAAGGAAAGATACAGCAATTCTGAGACGTGTTTCC
AGCTTTGAAGCTCTTCAACCGGCAACAAAGATCCCAGCAGATTTTGTAAGACTGGATCAA
GACATCCTTTCACCTCTAGCTGGGGAGAGCAGCTATATA

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 3

CO CL3261Contig1 1052 3 7 U
GCGAGATTCTCACGGATCGTCTTCACACGTTGCTGCTGAACCATTCTTCAGAAGCGTATT
AGGGCAGATGGAAACGGTTTACCTAAACCGGAACCCGACTCCTAGATCAGTCTTGGAGCT
TGTCCGATCCGTTGATAACGAGCAGCTTTGCTATGATCATCTCGCTTTCAGGACCTTTGG
GATTGGTGGTTATGGGATTGACTCGCTTGCAAGTTTTTTCCTTGACTATGGGTATACCCA
AATGGACGAGCTGAGGTTTCCGGCCAAAAAGCTCCGAACTTTGTGGTTTGCGCCTCCTCA
TGCTTCTGCTGTTCCTGGTGGAAGTGGTGTATACGGTCCTTTGCCAAGAGTTTTTATCTC
AGAGCTTCTAGTCGAGCAGATGAGTACACAGACTCAGGATGTGATCAGAAAATACACCGA
AACATCGCCTAATGGGAAAAAGTATGCTGCTCTCTCTAGTGCCTTGGGTAGTCTGCCCTG
GGAAAAGCCTCAATCTTCCGAGTTTGAACAATTGGCTAGGGAAAGTGAATATGCAGCATG
GACACTTGCGAATGGGTATGCACTAAACCACGTCACTATCTCTGTCCATCGCCTTAAATC
TCATCTCAACAAAATCAAGAAGCTCAATCAGTTCCTTGAAGAAAAAGGTTTTAAATTGAA
CTCAGAAGGAGGAGTCCTTAAAGTTAGTCCTGATGGTGGTTTGCTGCAAAGCTCAACTGT
AGCAGACTCGATTTCTTTCAAGTTCTCTGATGGAGTCACCAAATCTATCCCTTGTTCGTA
CATTGAGTTTGCTGAACGCCCCGTGCTTCCCCAGTTTCAAAATGTACCCGAAAGCGAGAT
AAAGGAGTCTCATCGGCGAGATGGATTTGAGGTTGGAAATGCAGACAAGATCTTCGAGAG
CACAAACCAGGAACAGCTTTCCCGACGAACCGGGTGATGAGCAGGGCTTTGGCCATATGT
TCGTTTCATCATGCCTTTGTACATACACATGTGAAGAATAAGAGCTGAAACTGTTTGTAA
TGTTGTTAATCATAAAGATAAAACTAATCCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D919TF U 1
AF RR2DM38TF U 214
AF RR2D919JQ C 416
BS 1 277 RR2D919TF
BS 278 278 RR2DM38TF
BS 279 614 RR2D919TF
BS 615 887 RR2DM38TF
BS 888 888 RR2D919JQ
BS 889 906 RR2DM38TF
BS 907 1052 RR2D919JQ

RD RR2D919TF 614 0 0
GCGAGATTCTCACGGATCGTCTTCACACGTTGCTGCTGAACCATTCTTCAGAAGCGTATT
AGGGCAGATGGAAACGGTTTACCTAAACCGGAACCCGACTCCTAGATCAGTCTTGGAGCT
TGTCCGATCCGTTGATAACGAGCAGCTTTGCTATGATCATCTCGCTTTCAGGACCTTTGG
GATTGGTGGTTATGGGATTGACTCGCTTGCAAGTTTTTTCCTTGACTATGGGTATACCCA
AATGGACGAGCTGAGGTTTCCGGCCAAAAAGCTCCGAGCTTTGTGGTTTGCGCCTCCTCA
TGCTTCTGCTGTTCCTGGTGGAAGTGGTGTATACGGTCCTTTGCCAAGAGTTTTTATCTC
AGAGCTTCTAGTCGAGCAGATGAGTACACAGACTCAGGATGTGATCAGAAAATACACCGA
AACATCGCCTAATGGGAAAAAGTATGCTGCTCTCTCTAGTGCCTTGGGTAGTCTGCCCTG
GGAAAAGCCTCAATCTTCCGAGTTTGAACAATTGGCTAGGGAAAGTGAATATGCAGCATG
GACACTTGCGAATGGGTATGCACTAAACCACGTCACTATCTCTGTCCATCGCCTTAAATC
TCATCTCAACAAAA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2DM38TF 693 0 0
TTTTTTCCTTGACTATGGGTATACCCAAATGGACGAGCTGAGGTTTCCGGCCAAAAAGCT
CCGAACTTTGTGGTTTGCGCCTCCTCATGCTTCTGCTGTTCCTGGTGGAAGTGGTGTATA
CGGTCCTTTGCCAAGAGTTTTTATCTCAGAGCTTCTAGTCGAGCAGATGAGTACACAGAC
TCAGGATGTGATCAGAAAATACACCGAAACATCGCCTAATGGGAAAAAGTATGCTGCTCT
CTCTAGTGCCTTGGGTAGTCTGCCCTGGGAAAAGCCTCAATCTTCCGAGTTTGAACAATT
GGCTAGGGAAAGTGAATATGCAGCATGGACACTTGCGAATGGGTATGCACTAAACCACGT
CACTATCTCTGTCCATCGCCTTAAATCTCATCTCAACAAAATCAAGAAGCTCAATCAGTT
CCTTGAAGAAAAAGGTTTTAAATTGAACTCAGAAGGAGGAGTCCTTAAAGTTAGTCCTGA
TGGTGGTTTGCTGCAAAGCTCAACTGTAGCAGACTCGATTTCTTTCAAGTTCTCTGATGG
AGTCACCAAATCTATCCCTTGTTCGTACATTGAGTTTGCTGAACGCCCCGTGCTTCCCCA
GTTTCAAAATGTACCCGAAAGCGAGATAAAGGAGTCTCATCGGCGAGATGGATTTGAGGT
TGGAAATGCAGACA*GATCTTCGAGAGCACAAA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2D919JQ 637 0 0
ACCGAAACATCGCCTAATGGGAAAAAGTATGCTGCTCTCTCTAGTGCCTTGGGTAGTCTG
CCCTGGGAAAAGCCTCAATCTTCCGAGTTTGAACAATTGGCTAGGGAAAGTGAATATGCA
GCATGGACACTTGCGAATGGGTATGCACTAAACCACGTCACTATCTCTGTCCATCGCCTT
AAATCTCATCTCAACAAAATCAAGAAGCTCAATCAGTTCCTTGAAGAAAAAGGTTTTAAA
TTGAACTCAGAAGGAGGAGTCCTTAAAGTTAGTCCTGATGGTGGTTTGCTGCAAAGCTCA
ACTGTAGCAGACTCGATTTCTTTCAAGTTTTCTGATGGAGTCACCAAATCTATCCCTTGT
TCGTACATTGAGTTTGCTGAACGCCTCGTGCTTCCCCAGTTTCAAAATGTACCCGAAAGC
GAGATAAAGGAGTCTCATCGGCGAGATGGATTTGAGGTTGGAAATGCAGACAAGATCTTC
GAGAGCACAAACCAGGAACAGCTTTCCCGACGAACCGGGTGATGAGCAGGGCTTTGGCCA
TATGTTCGTTTCATCATGCCTTTGTACATACACATGTGAAGAATAAGAGCTGAAACTGTT
TGTAATGTTGTTAATCATAAAGATAAAACTAATCCGT

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 3

CO CL3262Contig1 555 3 9 U
GGATTGTATTTCATAGGAGTGTAAGATAAACAATATATATTTTTTTGTTTTTAAGAATTG
TCCTCATTTCCAGCCATGAAAAACAGTGTTATGTTAACGGTTTCTTGTCTTCTCACATTT
CTCGTCTTGGATAATAATAAAGTAGAGGTGGAAGCCGGGATGAAACCACTTGGTTGCCCC
ACAGATGAATATTATAAGGGAACATGCGGAAAAAATGGATTAAATTTATGCGTAAATGAC
GTAAAGGCATTTCTTGAAAAAAGTATTGGAAAACCTATGCCAAAGAATTTTGGAATACGT
TGTGACAAATGTATTGATGAAGCTCCAAGAAAAGGTTATCTTCGCATGCATCAATGCATA
TGCAAACATGATTGCTAAATTTCACAATACCTCTCTCTACTAATAACGACATGAGATCAA
TGTAATCGAGAGTTTTTGGCGTATATCTGGCAGGAAAAACAGGTCATGTCTGACCAATAT
GTTTCCCAGTTAGATTAGTTATTGTTCAAAATAAATACAAATTTGAGCTAATAATATCCC
AATTATAATTACCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR17TF U 1
AF RR2G369TF U 1
AF RR2AT58TF U 53
BS 1 336 RR2DR17TF
BS 337 337 RR2G369TF
BS 338 357 RR2DR17TF
BS 358 358 RR2G369TF
BS 359 410 RR2DR17TF
BS 411 411 RR2G369TF
BS 412 421 RR2DR17TF
BS 422 547 RR2G369TF
BS 548 555 RR2AT58TF

RD RR2DR17TF 421 0 0
GGATTGTATTTCATAGGAGTGTAAGATAAACAATATATATTTTTTTGTTTTTAAGAATTG
TCCTCATTTCCAGCCATGAAAAACAGTGTTATGTTAACGGTTTCTTGTCTTCTCACATTT
CTCGTCTTGGATAATAATAAAGTAGAGGTGGAAGCCGGGATGAAACCACTTGGTTGCCCC
ACAGATGAATATTATAAGGGAACATGCGGAAAAAATGGATTAAATTTATGCGTAAATGAC
GTAAAGGCATTTCTTGAAAAAAGTATTGGAAAACCTATGCCAAAGAATTTTGGAATACGT
TGTGACAAATGTATTGATGAAGCTCCAAGAAAAGGT*ATCTTCGCATGCATCAATGC*TA
TGCAAACATGATTGCTAAATTTCACAATACCTCTCTCTACTAATAACGAC*TGAGATCAA
T

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR2G369TF 547 0 0
GGATTGTATTTCATAGGAGTGTAAGATAATCAATATATATTTTTTTGTTTTTAAGAATTG
TCCTCATTTCCAGCCATGAAAAACAGTGTTATGTTAACGGTTTCTTGTCTTCTCACATTT
CTCGTCTTGGATAATAATAAAGTAGAGGTGGAAGCCGGGATGAAACCACTTGGTTGCCCC
ACAGATGAATATTATAAGGGAACATGCGGAAAAAATGGATTAAATTTATGCGTAAATGAC
GTAAAGGCATTTCTTGAAAAAAGTATTGGAAAACCTATGCCAAAGAATTTTGGAATACGT
TGTGACAAATGTATTGATGAAGCTCCAAGAAAAGGTTATCTTCGCATGCATCAATGCATA
TGCAAACATGATTGCTAAATTTCACAATACCTCTCTCTACTAATAACGACATGAGATCAA
TGTAATCGAGAGTTTTTGGCGTATATCTGGCAGGAAAAACAGGTCATGTCTGACCAATAT
GTTTCCCAGTTAGATTAGTTATTGTTCAAAATAAATACAAATTTGAGCTAATAATATCCC
AATTATA

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2AT58TF 503 0 0
AAGAATTGTCCTCATTTCCAGCCATGAAAAACAGTGTTATGTTAACGGTTTCTTGTCTTC
TCACATTTCTCGTCTTGGATAATAATAAAG***AGGTGGAAGCCGGGATGAAACCACTTG
GTTGCCCCACAGATGAATATTATAAGGGAACATGCGGAAAAAATGGATTAAATTTATGCG
TAAATGACGTAAAGGCATTTCTTGAAAAAAGTATTGGAAAACCTATGCCAAAGAATTTTG
GAATACGTTGTGACAAATGTATTGATGAAGCTCCAAGAAAAGGTTATCTTCGCATGCATC
AATGCATATGCAAACATGATTGCTAAATTTCACAATACCTCTCTCTACTAATAACGACAT
GAGATCAATGTAATCGAGAGTTTTTGGCGTATATCTGGCAGGAAAAACAGGTCATGTCTG
ACCAATATGTTTCCCAGTTAGATTAGTTATTGTTCAAAATAAATACAAATTTGAGCTAAT
AATATCCCAATTATAATTACCTT

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL3263Contig1 582 2 3 U
GGATACTCATCATCTCACTCTTGTTCCTCTTTAAACTCCTCCTTTGATTTCTTTTGCTCT
CTTCATGGCGATGTCATTCTCCGGAGCTGTTCTCAGTGGGATTTGTTCTTCTTTCCCCAG
CGGAGCAGCCAAGCAGAGCGGCGTTGGCACCGTCGGTTTTGGCCGGAAAACTGAGCTCGT
CGTCGTCGCTCAGCGCAAGAAGTCGTTGATCTACGCCGATAAAGGTGACGGGAACATTCT
CGATGACGTCAACGAGGCCACAAAGAGAGCTTCGGATTACGTGACAGAGAAGACAAAGGA
GGCGTTGAAAGATGGCGAGAAAGCAAAAGACTACGTTACTGAGAAGAACGTTGAAGCCAA
AGACACTGCATTGGACGAAGCTCAGAAAGTTTTGGATTATGTGAAGGAAAAAGGAAACGA
AGGAGAGGCTAAGGACACCACAAAGGCATGATGATTCAACCACTTAACTAGTATATATAT
TATATATGTATCAATCTTTCAGGTTTCATGTTTAATATTTTACAATAAGATCAGTTTGTT
TATTTCACTATTTGAAATAAAAGATATGTTACTTAACTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG32TF U 1
AF RR2GG32JQB C 1
BS 1 8 RR2GG32JQB
BS 9 501 RR2GG32TF
BS 502 582 RR2GG32JQB

RD RR2GG32TF 501 0 0
GGATACTC
ATCATCTCACTCTTGTTCCTCTTTAAACTCCTCCTTTGATTTCTTTTGCTCTCTTCATGG
CGATGTCATTCTCCGGAGCTGTTCTCAGTGGGATTTGTTCTTCTTTCCCCAGCGGAGCAG
CCAAGCAGAGCGGCGTTGGCACCGTCGGTTTTGGCCGGAAAACTGAGCTCGTCGTCGTCG
CTCAGCGCAAGAAGTCGTTGATCTACGCCGATAAAGGTGACGGGAACATTCTCGATGACG
TCAACGAGGCCACAAAGAGAGCTTCGGATTACGTGACAGAGAAGACAAAGGAGGCGTTGA
AAGATGGCGAGAAAGCAAAAGACTACGTTACTGAGAAGAACGTTGAAGCCAAAGACACTG
CATTGGACGAAGCTCAGAAAGTTTTGGATTATGTGAAGGAAAAAGGAAACGAAGGAGAGG
CTAAGGACACCACAAAGGCATGATGATTCAACCACTTAACTAGTATATATATTATATATG
TATCAATCTTTCA

QA 9 501 9 501
DS 

RD RR2GG32JQB 582 0 0
GGATACTCATCATCTCACTCTTGTTCCTCTTTAAACTCCTCCTTTGATTTCTTTTGCTCT
CTTCATGGCGATGTCATTTTCCGGAGCTGTTTTCAGTGGGATTTGTTTTTCTTTCCCCAG
CGGAGCAGCCAAGCAGAGCGGCGTTGGCACCGTCGGTTTTGGCCGGAAAACTGAGCTTGT
CGTCGTCGCTCAGCGCAAGAAGTCGTTGATTTACGCCGATAAAGGTGACGGGAACATTCT
CGATGACGTCAACGAGGCCACAAAGAGAGCTTCGGATTACGTGACAGAGAAGACAAAGGA
GGCGTTGAAAGATGGCGAGAAAGCAAAAGACTACGTTACTGAGAAGAACGTTGAAGCCAA
AGACACTGCATTGGACGAAGCTCAGAAAGTTTTGGATTATGTGAAGGAAAAAGGAAACGA
AGGAGAGGCTAAGGACACCACAAAGGCATGATGATTCAACCACTTAACTAGTATATATAT
TATATATGTATCAATCTTTCAGGTTTCATGTTTAATATTTTACAATAAGATCAGTTTGTT
TATTTCACTATTTGAAATAAAAGATATGTTACTTAACTACTC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 3

CO CL3264Contig1 833 3 4 U
ACCTTCTAAATCCAAAATCATCAAAGTAGAAAAAAACTTACAGAATAACTGTTACATTAC
ATTTGTTCCAATTAAAACAAGGCACTCGTAAAACAAAACACAGACAACACATAATTTTTT
TTTAAAACACTTCATCCAAACAAAAACCAGTGACTTTGAACATCGATCGACTAACACTTA
GTTAGGACTGAAAAATTTAAGCTCAAGTCCTTGCGTAACCATACTCGATATCCCACCTAT
GGAGAAGGCCAAGCTGAATGCAACTCCTAACCAACCCAACCCCCAATGGAAATACCAACT
GAAACTGCCCTTGGCCGGTTTCTTGATCAAAACCCACATGAAGCAAGGATAAGCAAACGT
GACAGGGAGCGTGAGTCCGCCGAGCAAACCCGCGAGACTAAACAGGAAAGGGAGAGCAAC
GCCGATGAAAAACGAGACGAAACCGAAAAAGACTCTGAAACCTGACCTGACCCAGACCGA
ACATGGTTTGTTGGTTCGGCTAGCGTATCCAGCCTCAAAGCTGTCAAAGGCAGGCATGGA
GTATATCTGAAAGCTGCTCAGGCAGTTGAAGACTACTAAGAGAAAGGCCGTCGCTAACAA
GCCTCGAGGAATGTCGTTAATGTGGAATGCATATAGAGCAGCGAGCATACCTCCAGAAGG
CATGAGGTTCCCATAAGCCCAAAAGCCTCCAATGGAGATTGGAAAGATGCAGAGAGCAAT
GAAGAAGTAAGCAACTTTGGCTCCTCTCCACATTGGTACATGAGCTGGATGCTTAAACGT
TGATGGCATCGTCGACTGAATTTCAAGAACCAAGTTGTGACCTCTGAAGGCAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G439JQ U 1
AF RR2AW36JQ U 1
AF RR2A586JQ U 40
BS 1 12 RR2AW36JQ
BS 13 13 RR2G439JQ
BS 14 537 RR2AW36JQ
BS 538 833 RR2A586JQ

RD RR2G439JQ 246 0 0
ACCTTCTAAATCCAAAATCATCAAAGTAGAAAAAAACTTACAGAATAACTGTTACATTAC
ATTTGTTCCAATTAAAACAAGGCACTCGTAAAACAAAACACAGACAACACATAATTTTTT
TTTAAAACACTTCATCCAAACAAAAACCACTGACTTTGAACATCGATCGACTAACACTTA
GTTAGGACTGAAAAATTTAAGCTCAAGTCCTTGCGTAACCATACTCGATATCCCACCTAT
GGAGAA

QA 1 246 1 246
DS 

RD RR2AW36JQ 537 0 0
ACCTTCTAAATCTAAAATCATCAAAGTAGAAAAAAACTTACAGAATAACTGTTACATTAC
ATTTGTTCCAATTAAAACAAGGCACTCGTAAAACAAAACACAGACAACACATAATTTTTT
TTTAAAACACTTCATCCAAACAAAAACCAGTGACTTTGAACATCGATCGACTAACACTTA
GTTAGGACTGAAAAATTTAAGCTCAAGTCCTTGCGTAACCATACTCGATATCCCACCTAT
GGAGAAGGCCAAGCTGAATGCAACTCCTAACCAACCCAACCCCCAATGGAAATACCAACT
GAAACTGCCCTTGGCCGGTTTCTTGATCAAAACCCACATGAAGCAAGGATAAGCAAACGT
GACAGGGAGCGTGAGTCCGCCGAGCAAACCCGCGAGACTAAACAGGAAAGGGAGAGCAAC
GCCGATGAAAAACGAGACGAAACCGAAAAAGACTCTGAAACCTGACCTGACCCAGACCGA
ACATGGTTTGTTGGTTCGGCTAGCGTATCCAGCCTCAAAGCTGTCAAAGGCAGGCAT

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2A586JQ 794 0 0
G
CAGAATAACTGTTACATTACATTTGTTCCAATTAAAACAAGGCACTCGTAAAACAAAACA
CAGACAACACATAATTTTTTTTTAAAACACTTCATCCAAGCAAAAACCAGTGACTTTGAA
CATCGATCGACTAACACTTAGTTAGGACTGAAAAATTTAAGCTCAAGTCCTTGCGTAACC
ATACTCGATATCCCACCTATGGAGAAGGCCAAGCTGAATGCAACTCCTAACCAACCCAAC
CCCCAATGGAAATACCCACTGAAACTGCCCTTGGCCGGTTTCTTGATCAAAACCCACATG
AAGCAAGGATAAGCAAACGTGACAGGGAGCGTGAGTCCGCCGAGCAAACCCGCGAGACTA
GACAGGAAAGGGAGAGCAACGCCGATGAAAAACGAGACGAAACCGAAAAAGACTCTGAAA
CCTGACCTGACCCAGACCGAACATGGTTTGTTGGTTCGGCTAGTGTATCCAGCCTCAAAG
CTGTCAAAGGCAGGCATGGAGTATATCTGAAAGCTGCTCAGGCAGTTGAAGACTACTAAG
AGAAAGGCCGTCGCTAACAAGCCTCGAGGAATGTCGTTAATGTGGAATGCATATAGAGCA
GCGAGCATACCTCCAGAAGGCATGAGGTTCCCATAAGCCCAAAAGCCTCCAATGGAGATT
GGAAAGATGCAGAGAGCAATGAAGAAGTAAGCAACTTTGGCTCCTCTCCACATTGGTACA
TGAGCTGGATGCTTAAACGTTGATGGCATCGTCGACTGAATTTCAAGAACCAAGTTGTGA
CCTCTGAAGGCAA

QA 2 794 2 794
DS 



AS 1 2

CO CL3265Contig1 638 2 13 U
GGACTTGCAAAGATGTAATAGTTTATAAAGGGTCTGCAATAGACTTTATCAAACCCAAAT
GTTACGTACAATGACACTAGTGTACATAATTGGCATTCTGAATCACAAACACATGCCCAA
ACGTAGTTCACAACAAACACAAATGGCTGCTCGAAAGACACTAAGTTAATAGAGATTGAT
CGCTACACACACAATTGAAGTAAACCAAATAACACAGTAGAAGTAGTTGAAGTAGCTAAC
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGTGAAATCAATTGGACCACACATGAACATAGCCG
TGTCTGTTTCCTGTGTATATCTCATTGCGCTCTTCATCATAGAAGAAAGCCGTTATGTCT
TCCAGAACTTCAGCCACAGCGTTTCTTCTTAGCTTCGAGTTGTTCCCCAAGGAACTACTG
CTACTGCTACCGCTCTCATCTTCTTTTGGAGGTCCACTGCTTGATGTTATCTTAGCTAAG
CATTTCCCAGTCAATATGTTGCTGATGTTGATAGATCCCGCATTTCCTTCTATCCACTGA
TCTTCAGTATCTGCTTTGCAATAAGAGATGATCAGATCTTGATCACTTGTTATGTAGATA
TTGTTTGTGTTACAGTCCGGATGCCATAGGAGATGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ06JQB U 20
AF RR2EC49JQ U 1
BS 1 153 RR2EC49JQ
BS 154 154 RR2GJ06JQB
BS 155 261 RR2EC49JQ
BS 262 267 RR2GJ06JQB
BS 268 346 RR2EC49JQ
BS 347 347 RR2GJ06JQB
BS 348 366 RR2EC49JQ
BS 367 367 RR2GJ06JQB
BS 368 425 RR2EC49JQ
BS 426 428 RR2GJ06JQB
BS 429 563 RR2EC49JQ
BS 564 564 RR2GJ06JQB
BS 565 638 RR2EC49JQ

RD RR2GJ06JQB 552 0 0
G
GTTTATAAAGGGTCTGCAATAGA**TTATCAAACCCAAATGTTACGTACAATGACACTAG
TGTACATAATTGGCATTCTGAATCACAAACACATGCCCAAACGTAGTTCACAACAAACAC
AAATGGCTGCTCGAAAGACACTAGGTTAATAGAGATTGATCGCTACACACACAATTGAAG
TAAACCAAATAACACAGTAGAAGTAGTTGAAGTAGCTAACATGATGATGATGATGATGAT
GATGATGTGAAATCAATTGGACCACACATGAACATAGCCGTGTCTGTTTCCTGTGTATAT
CTCATTGCGCTCTTCATCATAGAAGAAAGCCGTTATGTCTTCCAGAACTTCAGCCACAGC
GTTTCTTCTTTGCTTCGAGTTGTTCCCCAAGGAACTACTGCTACTGCTACTGCTCTCATC
TTCTTTTGGAGGTCCACTGCTTGATGTTATCTTAGCTAAGCATTTCCCAGTCAATATGTT
GCTGATGTTGATAGATCCCGCATTTCCTTCTATCCACTGGTCTTCAGTATCTGCTTTGCA
ATAAGAGATGA

QA 2 552 2 552
DS 

RD RR2EC49JQ 638 0 0
GGACTTGCAAAGATGTAATAGTTTATAAAGGGTCTGCAATAGACTTTATCAAACCCAAAT
GTTACGTACAATGACACTAGTGTACATAATTGGCATTCTGAATCACAAACACATGCCCAA
ACGTAGTTCACAACAAACACAAATGGCTGCTCGGAAGACACTAAGTTAATAGAGATTGAT
CGCTACACACACAATTGAAGTAAACCAAATAACACAGTAGAAGTAGTTGAAGTAGCTAAC
ATGATGATGATGATGATGATG******TGAAATCAATTGGACCACACATGAACATAGCCG
TGTCTGTTTCCTGTGTATATCTCATTGCGCTCTTCATCATAGAAGAGAGCCGTTATGTCT
TCCAGAGCTTCAGCCACAGCGTTTCTTCTTAGCTTCGAGTTGTTCCCCAAGGAACTACTG
CTACT***ACCGCTCTCATCTTCTTTTGGAGGTCCACTGCTTGATGTTATCTTAGCTAAG
CATTTCCCAGTCAATATGTTGCTGATGTTGATAGATCCCGCATTTCCTTCTATCCACTGA
TCTTCAGTATCTGCTTTGCAATAGGAGATGATCAGATCTTGATCACTTGTTATGTAGATA
TTGTTTGTGTTACAGTCCGGATGCCATAGGAGATGATC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL3266Contig1 785 2 8 U
AAGAAACAGATGCTTCACTAGCTTATCGAGAAGCATTATGTTAATAAAGCATTGTGTCTG
TAAAAAAAGAGTTAAAAAATCTGTGGTACATTTTAAACTTACGAGGCAAGATAAATACTT
AAGGGCTAAAAAACAAAACCCTTACTAATAATAAAACTCAATACTAGGAGTACTTCTTTA
GACACGAGACATGCCGAGTTTGCGTTCAAACAAACGACGCAGAAGATAAACTTGGAGGAC
ACTTACCCCGATCAATGCAAACGACTCGAACAAAGCTTTGTGTACTGCCCTTTTGCTCAT
GTTCTCGTTCACAATGGCTTGACGATCGATCTGAGCCTCTAACCAATGCTGTTCAAACTG
AATGTTGTAAAGAGCCTCCTCTAGCTTTGATATTTGCTCCATCAAGGGAGTGAAATGCTC
GTCCTTTGCGTGCTGATCATAGTAGGCAAAGTGACCAAGCTGCACATCGAAGTCGATGGT
TTCGTGATAAGGAGACTTGTTAGTGAAGCAGAAACGGTAAACCCCTTTCCTCTGGACAAC
AAAGTCGTGTTTGGCACTAATATGCTCCCTGAAGTCATGAACTTGTTCCCCTGTTGGCCC
ATGTATCACGAGATCTACACCATCCTCGTCAAAATGCCACTGAGAATCCGACTTGATGAC
GACGAAAGAGACGTGAAGGGTGTCGCCTTCGTATTCAGCCTTGTGGGAGAAGCTTTCTTC
TCTGTCTATCACGAATCTAATCCCTAACGCTGCCTGGAAGCTCCAGGCGAGCCCTAATAT
TAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2D337TF C 1
AF RR2CN05JQ U 56
BS 1 62 RR2D337TF
BS 63 260 RR2CN05JQ
BS 261 261 RR2D337TF
BS 262 370 RR2CN05JQ
BS 371 371 RR2D337TF
BS 372 561 RR2CN05JQ
BS 562 562 RR2D337TF
BS 563 785 RR2CN05JQ

RD RR2D337TF 570 0 0
AAGAAACAGATGCTTCACTAGCTTATCGAGAAGCATTATGTTAATAAAGCATTGTGTCTG
TAAAAAAAGAGTTAAAAAATCTGTGGTACATTTTAAACTTACGAGGCAAGATAAATACTT
AAGGGCTAAAAAACAAAACCCTTACTAATAATAAAACTCAATACTAGGAGTACTTCTTTA
GACACGAGACATGCCGAGTTTGCGTTCAAACAAACGACGCAGAAGATAAACTTGGAGGAC
ACTTGCCCCGATCAATGCAAACGACTCGAACAAAGCTTTGTGTACTGCCCTTTTGCTCAT
GTTCTCGTTCACAATGGCTTGACGATCGGTCTGAGCCTCTAACCAATGCTGTTCAAACTG
AATGTTGTAAAGAGCCTCCTCTAGCTTTGATATTTGCTCCATCAAGGGAGTGAAATGCTC
GTCCTTTGCGTGCTGATCATAGTAGGCAAAGTGACCAAGCTGCACATCGAAGTCGATGGT
TTCGTGATAAGGAGACTTGTTAGTGAAGCAGAAACGGTAAACCCCTTTCTTCTGGACAAC
AAAGTCGTGTTTGGCACTAATATGCTCCC
C

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2CN05JQ 730 0 0
TGTCTGT
AAAAAAGAGTTAAAAAATCTGTGGTACATTTTAAACTTACGAGGCAAGATAAATACTTAA
GGGCTAAAAAACAAAACCCTTACTAATAATAAAACTCAATACTAGGAGTACTTCTTTAGA
CACGAGACATGCCGAGTTTGCGTTCAAACAAACGACGCAGAAGATAAACTTGGAGGACAC
TTACCCCGATCAATGCAAGCGACTCGAACAAAGCTTTGTGTACTGCCCTTTTGCTCATGT
TCTCGTTCACAATGGCTTGACGATCGATCTGAGCCTCTAACCAATGCTGTTCAAACTGAA
TGTTGTAAGGAGCCTCCTCTAGCTTTGATATTTGCTCCATCAAGGGAGTGAAATGCTCGT
CCTTTGCGTGCTGATCATAGTAGGCAAAGTGACCAAGCTGCACATCGAAGTCGATGGTTT
CGTGATAAGGAGACTTGTTAGTGAAGCAGAAACGGTAAACCCCTTTCCTCTGGACAACAA
AGTCGTGTTTGGCACTAATCTGCTCCCTGAAGTCATGAACTTGTTCCCCTGTTGGCCCAT
GTATCACGAGATCTACACCATCCTCGTCAAAATGCCACTGAGAATCCGACTTGATGACGA
CGAAAGAGACGTGAAGGGTGTCGCCTTCGTATTCAGCCTTGTGGGAGAAGCTTTCTTCTC
TGTCTATCACGAATCTAATCCCTAACGCTGCCTGGAAGCTCCAGGCGAGCCCTAATATTA
AGA

QA 8 730 8 730
DS 



AS 1 3

CO CL3267Contig1 569 3 1 U
CAACAAACTTAAACTATCATTAACTAATTTAATTATGCATTACACATCGACAATTTTCTT
CCACACAGAAGCCCCACTTATCCATCGAACTCAACTCCGGAAGATCCCGACATACAAAAC
AAAGACACAAACAGCAACATTAAACCAATTACTAATCAAGCTTATTGGGTCCGGTACAGT
AACTAACCACGTGGTTCCATAACCACTGGATCAAATACCGCCGTCGGATCCCGTTAACAT
TATACGTGGCACCACGATCGTCGTTCAACATCTGTCCAGTGTACGAACCACCACCTCCCG
TACCATAAATACCCTCGCAAAGATCCGCTATCTCAACCGGAGCCACCAGGTCAGCTCCTG
CGTACCAAGCGTTAACCAACGGATTAGTTGCCAGCTCAGCAATCTCGTGAGCGATCACAC
TTATCATCCCATCAACACCAATATCACCGTTCGGCGATTTAACCGGTTTAATCCCCGGTA
TAAACGCCGGTACGGCGAAGGGATAGGCACAGACTCCGGGACAGAACTTCGCCGAGTTCC
CAACCCAAGCGTACGGCAACGTGAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AA50JQ U 203
AF RR2GB81JQ U 1
AF RR2GB81TF C 120
BS 1 569 RR2GB81JQ

RD RR2AA50JQ 189 0 0
CCACTGGATCAAATACCGCCGTCGGATCCCGTTAACATTATACGTGGCACCACGATCGTC
GTTCAACATCTGTCCAGTGTACGAACCACCACCTCCCGTACCAAAAATACCCTCGCAAAG
ATCCGCTATCTCAACCGGAGCCACCGGGTCAGCTCCTGCCTACCAAGCGTTAACCAACGG
ATTAGTTGC

QA 1 189 1 189
DS 

RD RR2GB81JQ 569 0 0
CAACAAACTTAAACTATCATTAACTAATTTAATTATGCATTACACATCGACAATTTTCTT
CCACACAGAAGCCCCACTTATCCATCGAACTCAACTCCGGAAGATCCCGACATACAAAAC
AAAGACACAAACAGCAACATTAAACCAATTACTAATCAAGCTTATTGGGTCCGGTACAGT
AACTAACCACGTGGTTCCATAACCACTGGATCAAATACCGCCGTCGGATCCCGTTAACAT
TATACGTGGCACCACGATCGTCGTTCAACATCTGTCCAGTGTACGAACCACCACCTCCCG
TACCATAAATACCCTCGCAAAGATCCGCTATCTCAACCGGAGCCACCAGGTCAGCTCCTG
CGTACCAAGCGTTAACCAACGGATTAGTTGCCAGCTCAGCAATCTCGTGAGCGATCACAC
TTATCATCCCATCAACACCAATATCACCGTTCGGCGATTTAACCGGTTTAATCCCCGGTA
TAAACGCCGGTACGGCGAAGGGATAGGCACAGACTCCGGGACAGAACTTCGCCGAGTTCC
CAACCCAAGCGTACGGCAACGTGAATCCC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2GB81TF 450 0 0
CAAAGACACAAACAGCAACATTAAACCAATTACTAATCAAGCTTATTGGGTCCGGTACAG
TAACTAACCACGTGGTTCCATAACCACTGGATCAAATACCGCCGTCGGATCCCGTTAACA
TTATACGTGGCACCACGATCGTCGTTCAACATCTGTCCAGTGTACGAACCACCACCTCCC
GTACCATAAATACCCTCGCAAAGATCCGCTATCTCAACCGGAGCCACCAGGTCAGCTCCT
GCGTACCAAGCGTTAACCAACGGATTAGTTGCCAGCTCAGCAATCTCGTGAGCGATCACA
CTTATCATCCCATCAACACCAATATCACCGTTCGGCGATTTAACCGGTTTAATCCCCGGT
ATAAACGCCGGTACGGCGAAGGGATAGGCACAGACTCCGGGACAGAACTTCGCCGAGTTC
CCAACCCAAGCGTACGGCAACGTGAATCCC

QA 1 450 1 450
DS 



AS 1 3

CO CL3268Contig1 815 3 2 U
CGTCTAAAATAAATATTATTAGCAATACAACCTGATAATTTTCGCTACTAATACTTGAGA
ACTACGTCTCCCAAACAACAACACAATATGTAATACAAATACAGGATCCAGCAACAACAA
AGTATAATATAAATACATGATCTAACACAAGCACTTTGAAGTTAACTTGCACATATAGTT
TTCTTATTAGCTATCTTTTTCTCTTAAAATATCGGACCGGCTTGTATCCGCTGTTCATCT
AATAGTACTGTGCGTCTAATGACTCCTTGTTCTTAATCTCGTAGGCGTTGAGGCAAGACC
AATCGAAAGGAGGAACCGCATATGGTCCTTTGAGTAAACCCTCAGCTATCCATCTGTACG
CAGCCTCAGTCATATGGATGCCGTCCCAATTCACATACTTTGAAGGATCTTTACAACATT
CAACTTCTTTTAAACCACATTTTACACCAAAGGTGAAGTTGTACTGTCCTCCTAAACCGC
AACAAACGGGCAAGGGGTTGTTCATAAGCCCGAATTTGGCTGGTTCTTGGATAAGTCGCA
ACAAAGCGTTGTAGTAGTCTCCGTATATGATGTTGACATGAGGATAGAGCTTCCTGAGTC
TATTGAGTTCTGCCTGAAGCTGATCATTGTGGTATTCTGAAAACTCGTTCAACCATGTCA
AACACCCGGTTTGAGGATCGTACTCTTCCTTGTTTGATGTTTGATATAATGTCAAATAGA
TTACTGAGCATCCGAGCGGGAAATTTCCTGGAACTAGGAATGTTCTTCCTCCCATATCGA
CTAGCTCCGTGATTGTTGAAGAAATAGTTGAGATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H219JQ U 1
AF RR2H219TF C 1
AF RR2EA08JQ U 70
BS 1 218 RR2H219JQ
BS 219 815 RR2EA08JQ

RD RR2H219JQ 219 0 0
CGTCTAAAATAAATATTATTAGCAATACAACCTGATAATTTTCGCTACTAATACTTGAGA
ACTACGTCTCCCAAACAACAACACAATATGTAATACAAATACAGGATCCAGCAACAACAA
AGTATAATATAAATACATGATCTAACACAAGCACTTTGAAGTTAACTTGCACATATAGTT
TTCTTATTAGCTATCTTTTTCTCTTAAAATATCGGACC
C

QA 1 218 1 218
DS 

RD RR2H219TF 219 0 0
CGTCTAAAATAAATATTATTAGCAATACAACCTGATAATTTTCGCTACTAATACTTGAGA
ACTACGTCTCCCAAACAACAACACAATATGTAATACAAATACAGGATCCAGCAACAACAA
AGTATAATATAAATACATGATCTAACACAAGCACTTTGAAGTTAACTTGCACATATAGTT
TTCTTATTAGCTATCTTTTTCTCTTAAAATATCGGACC
C

QA 1 218 1 218
DS 

RD RR2EA08JQ 746 0 0
CCCAAACAACAACACAATATGTAATACAAATACAGGATCCAGCAACAACAAAGTATAATA
TAAATACATGATCTAACACAAGCACTTTGAAGTTAACTTGCACATATAGTTTTCTTATTA
GCTATCTTTTTCTCTTAAAATATCGGACCGGCTTGTATCCGCTGTTCATCTAATAGTACT
GTGCGTCTAATGACTCCTTGTTCTTAATCTCGTAGGCGTTGAGGCAAGACCAATCGAAAG
GAGGAACCGCATATGGTCCTTTGAGTAAACCCTCAGCTATCCATCTGTACGCAGCCTCAG
TCATATGGATGCCGTCCCAATTCACATACTTTGAAGGATCTTTACAACATTCAACTTCTT
TTAAACCACATTTTACACCAAAGGTGAAGTTGTACTGTCCTCCTAAACCGCAACAAACGG
GCAAGGGGTTGTTCATAAGCCCGAATTTGGCTGGTTCTTGGATAAGTCGCAACAAAGCGT
TGTAGTAGTCTCCGTATATGATGTTGACATGAGGATAGAGCTTCCTGAGTCTATTGAGTT
CTGCCTGAAGCTGATCATTGTGGTATTCTGAAAACTCGTTCAACCATGTCAAACACCCGG
TTTGAGGATCGTACTCTTCCTTGTTTGATGTTTGATATAATGTCAAATAGATTACTGAGC
ATCCGAGCGGGAAATTTCCTGGAACTAGGAATGTTCTTCCTCCCATATCGACTAGCTCCG
TGATTGTTGAAGAAATAGTTGAGATC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 3

CO CL3269Contig1 908 3 12 U
GGAAGAAGATTACAGAGATACAGTGTTTGAGCATTCTCTCATCTCTCCAAGCCAAACCTC
TCTCTATCTCTCTGTGTGCTTGTGTGTGGACATGGCTAACTCGATAATGGCTTCCTCCAA
ACCTCTCATCTTCCTCTCCTCCTCCTCAACTCAACCAAACCGCGTCCACCTCCCCGCCAA
ACTCCCCCAGATCCCCAAACCCATCTCCTCCGACCTCCGCAGCAAGGCTCTGTCTTTCTC
CTCAGCCACCGTAAAGTCTCTAGCTTTAATCGCCGCCCTCGCTCCTCCCTCGATGGCCGA
AGCGATGGAGAAAGCGCAGCTCTTCGACTTCAACCTGACGCTCCCGATCATCGTGGTGGA
GTTTCTCTTCCTCATGTTCGCGCTGGACAAGGTGTACTACTCGCCGCTGGGGAACTTCAT
GGACAAGAGAGACGGAGAGATCAAGGAGAAGCTGGCGAGCGTGAAGGATACATCCACGGA
GATCAAGGCCCTCGATGAACAAGCTGACTCTGTGATGAGGGCGGCTAGGGCTGAGATCGC
CGCCG*CGCTTAACAAGATGAAGAAAGAGACGGAGGCGGAGGTAGAGGAGCAGCTGGCGG
AAGGAAGGAAGAAGGTGGAGGCGGAGCTGCAGGAGGCGCTAGCGAGCTTGGAGAAGCAGA
AGGAAGTTACCATTAAGGCTCTTGATTCTCAGATCGCTGCTCTTAGTGAAGACATTGTCA
AGAAGGTTCTTCCTTCTTAAAAAGAAACTCTTTCTGTGTTCTCTGCCTTTTCTCAATTCT
CATTTTATAAGACATTACTGTAAATCTCTCTTCTTCTCTCTCTGTGTCTCTCTTGGATTT
GTTCGTTGAATCAAGAAGAACAATTTTATATGTAAGTTTTTTTTATAAATGATTAGCTCT
CTCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN23TF U 1
AF RR2AX81TFB U 114
AF RR2DN23JQ C 329
BS 1 217 RR2DN23TF
BS 218 218 RR2AX81TFB
BS 219 273 RR2DN23TF
BS 274 274 RR2AX81TFB
BS 275 279 RR2DN23TF
BS 280 280 RR2AX81TFB
BS 281 312 RR2DN23TF
BS 313 313 RR2AX81TFB
BS 314 613 RR2DN23TF
BS 614 614 RR2AX81TFB
BS 615 626 RR2DN23TF
BS 627 908 RR2DN23JQ

RD RR2DN23TF 628 0 0
GGAAGAAGATTACAGAGATACAGTGTTTGAGCATTCTCTCATCTCTCCAAGCCAAACCTC
TCTCTATCTCTCTGTGTGCTTGTGTGTGGACATGGCTAACTCGATAATGGCTTCCTCCAA
ACCTCTCATCTTCCTCTCCTCCTCCTCAACTCAACCAAACCGCGTCCACCTCCCCGCCAA
ACTCCCCCAGATCCCCAAACCCATCTCCTCCGACCTCTGCAGCAAGGCTCTGTCTTTCTC
CTCAGCCACCGTAAAGTCTCTAGCTTTAATCGCGGCCCTGGCTCCTCCCTCGATGGCCGA
AGCGATGGAGAAGGCGCAGCTCTTCGACTTCAACCTGACGCTCCCGATCATCGTGGTGGA
GTTTCTCTTCCTCATGTTCGCGCTGGACAAGGTGTACTACTCGCCGCTGGGGAACTTCAT
GGACAAGAGAGACGGAGAGATCAAGGAGAAGCTGGCGAGCGTGAAGGATACATCCACGGA
GATCAAGGCCCTCGATGAACAAGCTGACTCTGTGATGAGGGCGGCTAGGGCTGAGATCGC
CGCCG*CGCTTAACAAGATGAAGAAAGAGACGGAGGCGGAGGTAGAGGAGCAGCTGGCGG
AAGGAAGGAAGAAAGTGGAGGCGGAG
CT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2AX81TFB 513 0 0
CCTCCAAACCTCTCATCTTCCTCTCCTCCTCCTCAACTCAACCAAACCGCGTCCACCTCC
CCGCCAAACTCCCCCAGATCCCCAAACCCATCTCCTCCGACCTCCGCAGCAAGGCTCTGT
CTTTCTCCTCAGCCACCGTAAAGTCTCTAGCTTTAATCGCCGCCTTCGCTCCTCCCTCGA
TGGCCGAAGCGATGGAGAAAGCTCAGCTCTTCGACTTCAACCTGACGCTCCCGATCATCG
TCGTGGAGTTTCTCTTCCTCATGTTCGCGCTGGACAAGGTGTACTACTCGCCGCTGGGGA
ACTTCATGGACAAGAGAGACGGCGAGATCAAGGAGAAGCTGGCGAGCGTGAAGGACACAT
CCACGGAGCTCAAGGGCCTCGATGAACAAGCCGACTCTGTGATGAGGGCGGCTAGGGCTG
AGATCGCCGCCGGCGCTTAACAAGATGAAGAAAGAGACGGAGGCGGAGGTAGAGGAGCAG
CTGGCGGAAGGAAGGAAGAAGGTGGAGGCGGAG

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2DN23JQ 580 0 0
TTCAACCTGACGCTCCCGATCATCGTGGTGGAGTTTCTCTTCCTCATGTTCGCGCTGGAC
AAGGTGTACTACTCGCCGCTGGGGAACTTCATGGACAAGAGAGACGGAGAGATCAAGGAG
AAGCTGGCGAGCGTGAAGGATACATCCACGGAGATCAAGGCCCTCGATGAACAAGCTGAC
TCTGTGATGAGGGCGGCTAGGGCTGAGATCGCCGCCG*CGCTTAACAAGATGAAGAAAGA
GACGGAGGCGGAGGTAGAGGAGCAGCTGGCGGAAGGAAGGAAGAAGGTGGAGGCGGAGCT
GCAGGAGGCGCTAGCGAGCTTGGAGAAGCAGAAGGAAGTTACCATTAAGGCTCTTGATTC
TCAGATCGCTGCTCTTAGTGAAGACATTGTCAAGAAGGTTCTTCCTTCTTAAAAAGAAAC
TCTTTCTGTGTTCTCTGCCTTTTCTCAATTCTCATTTTATAAGACATTACTGTAAATCTC
TCTTCTTCTCTCTCTGTGTCTCTCTTGGATTTGTTCGTTGAATCAAGAAGAACAATTTTA
TATGTAAGTTTTTTTTATAAATGATTAGCTCTCTCTCTCC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 3

CO CL3270Contig1 1159 3 4 U
GGCTCTCAACATACACTTGACCAGAGAGAGTGAAAGAAGAAATTAAAAAAAAAATGGCGA
CTTTTAAAGTTTCTTCTTCGGTTCCTTCCCCATCTGAAGATGCTGAGCAGTTGAAAACCG
CCTTTGAAGGATGGGGTACCAACGAGGACTTGATCATATCAATCTTGGCGCACAGAAACG
CGGAACAGAGGAAGCTGATCAGGCAAACATACCATGAAGTCTTTGGAGAAGACCTTCTCA
AGAGTCTTGACAAGGAACTCTCAAGCGACTTCGAGAGAGCAATCTTGCTCTGGACTATGG
AGCCCGGCGAGCGCGATGCTTTAATGGCTAACGAAGCAACCAAAAGATGGACTTCAAGCA
ACCAAGTGGTTATGGAAGTAGCTTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCTTCACGCTAGGC
AAGCTTACCATGCTCGTTTCAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTTGCTCACCACACCACCG
GTGACTTCAGAAAGCTTTTGGTTTCTCTTATCAGCTCATACAGGTACGAAGGAGACGAGG
TGAACATGACATTGGCAAAGCAAGAAGCTAAGATAATCCATGAGAAAATCAAGGACAAGC
ACTACAACGATGAGGAGGTCATCAGGATTTTGTCCACTAGGAGCAAAGCTCAGATCAATG
CTACTTTCAATCGCTACCAAGATGCTCATGGCGAGGATATCCTCAAGAGTCTTGAGGAAA
GAGATGGGGACGACAAGTTCCTCCAACTGTTGAGGTCAACGATTCAGTGCTTGACAAGAC
CAGAGCTTTACTTTGTGGATGTTTTTCGCTCTGCAGCCAACAAAACCGGAACAGACGAAG
GAGCTCTCACTAGAATTGTGACTACAAGAGCTGAGATTGATTTGAAGGTTATTGGACAAG
AGTTTCAGAGAAGGAACAGCATTTCTCTGGAGAAAGCCATTACCAAAGACACTCGTGGAG
ACTACGAGAAGATGCTCGTCGCACTTCTCGGTGAAGATGATGCTTAAATCAAATAATCCT
CCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTTTTCTCGAAACCGTTTGATGTTGTTCTTTTAAAACTT
TGTTTGTTTGTGTTTTGATTTTCCAAATAATCCAAAAGAGAGAAAAAAAAAGAGGGAACC
AGTGTGGTACCCTAAAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A047TF U 6
AF RR2BB82TF U 1
AF RR2BB82JQ C 309
BS 1 53 RR2BB82TF
BS 54 54 RR2A047TF
BS 55 738 RR2BB82TF
BS 739 1159 RR2BB82JQ

RD RR2A047TF 711 0 0
GG
AACATACACTTGACCAGAGAGAGTGAAAGAAGAAATTAAAAAAAAAATGGCGACTTTTAA
AGTTTCTTCTTCGGTTCCTTCCCCATCTGAAGATGCTGAGCAGTTGAAAACCGCCTTTGA
AGGATGGGGTACCAACGAGGACTTGATCATATCAATCTTGGCGCACAGAAACGCGGAACA
GAGGAAGCTGATCAGGCAAACATACCATGAAGTCTTTGGAGAAGACCTTCTCAAGAGTCT
TGACAAGGAACTCTCAAGCGACTTCGAGAGAGCAATCTTGCTCTGGACTATGGAGCCCGG
CGAGCGCGATGCTTTAATGGCTAACGAAGCGACCAAAAGATGGACTTCAAGCAACCAAGT
GGTTATGGAAGTAGCTTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCTTCACGCTAGGCAAGCTTA
CCATGCTCGTTTCAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTTGCTCACCACACCACCGGTGACTT
CAGAAAGCTTTTGGTTTCTCTTATCAGCTCATACAGGTACGAAGGAGACGAGGTGAACAT
GACATTGGCAAAGCAAGAAGCTAAGATAATCCATGAGAAAATCAAGGACAAGCACTACAA
CGATGAGGAGGTCATCAGGATTTTGTCCACTAGGAGCAAAGCTCAGATCAATGCTACTTT
CAATCGCTACCAAGATGCTCATGGCGAGGATATCCT*AAGAGTCTTGAG

QA 3 711 3 711
DS 

RD RR2BB82TF 738 0 0
GGCTCTCAACATACACTTGACCAGAGAGAGTGAAAGAAGAAATTAAAAAAAAA*TGGCGA
CTTTTAAAGTTTCTTCTTCGGTTCCTTCCCCATCTGAAGATGCTGAGCAGTTGAAAACCG
CCTTTGAAGGATGGGGTACCAACGAGGACTTGATCATATCAATCTTGGCGCACAGAAACG
CGGAACAGAGGAAGCTGATCAGGCAAACATACCATGAAGTCTTTGGAGAAGACCTTCTCA
AGAGTCTTGACAAGGAACTCTCAAGCGACTTCGAGAGAGCAATCTTGCTCTGGACTATGG
AGCCCGGCGAGCGCGATGCTTTAATGGCTAACGAAGCAACCAAAAGATGGACTTCAAGCA
ACCAAGTGGTTATGGAAGTAGCTTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCTTCACGCTAGGC
AAGCTTACCATGCTCGTTTCAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTTGCTCACCACACCACCG
GTGACTTCAGAAAGCTTTTGGTTTCTCTTATCAGCTCATACAGGTACGAAGGAGACGAGG
TGAACATGACATTGGCAAAGCAAGAAGCTAAGATAATCCATGAGAAAATCAAGGACAAGC
ACTACAACGATGAGGAGGTCATCAGGATTTTGTCCACTAGGAGCAAAGCTCAGATCAATG
CTACTTTCAATCGCTACCAAGATGCTCATGGCGAGGATATCCTCAAGAGTCTTGAGGAAA
GAGATGGGGACGACAAGT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2BB82JQ 851 0 0
GAGCGCGATGCTTTAATGGCTAACGAAGCAACCAAAAGATGGACTTCAAGCAACCAAGTG
GTTATGGAAGTAGCTTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTGCTTCACGCTAGGCAAGCTTAC
CATGCTCGTTTCAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTTGCTCACCACACCACCGGTGACTTC
AGAAAGCTTTTGGTTTCTCTTATCAGCTCATACAGGTACGAAGGAGACGAGGTGAACATG
ACATTGGCAAAGCAAGAAGCTAAGATAATCCATGAGAAAATCAAGGACAAGCACTACAAC
GATGAGGAGGTCATCAGGATTTTGTCCACTAGGAGCAAAGCTCAGATCAATGCTACTTTC
AATCGCTACCAAGATGCTCATGGCGAGGATATCCTCAAGAGTCTTGAGGAAGGAGATGGG
GACGACAAGTTCCTCCAACTGTTGAGGTCAACGATTCAGTGCTTGACAAGACCAGAGCTT
TACTTTGTGGATGTTTTTCGCTCTGCAGCCAACAAAACCGGAACAGACGAAGGAGCTCTC
ACTAGAATTGTGACTACAAGAGCTGAGATTGATTTGAAGGTTATTGGACAAGAGTTTCAG
AGAAGGAACAGCATTTCTCTGGAGAAAGCCATTACCAAAGACACTCGTGGAGACTACGAG
AAGATGCTCGTCGCACTTCTCGGTGAAGATGATGCTTAAATCAAATAATCCTCCTCTCTC
TCTTTCTCTCTCTCTTTTCTCGAAACCGTTTGATGTTGTTCTTTTAAAACTTTGTTTGTT
TGTGTTTTGATTTTCCAAATAATCCAAAAGAGAGAAAAAAAAAGAGGGAACCAGTGTGGT
ACCCTAAAAGG

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 3

CO CL3271Contig1 907 3 10 U
GGACCACAATGGAGAGCGGCGATGTTGTGGGAATCGGAGATTACAACGCAGAGACGAAGA
GGGAGAAGCTGAGATCGTTGCTCTCTCAACTACTCGCCGATCCGATTCCCGCCGACGTTC
CGAGGAATCCAACACTCTCGGATGTCGTCACTCTCGTCAGCCTTGAAAAGGGAAGCGCTA
TGCGACTCTCCATCGTCAAACTCGACGGCTCCTCCTTGGATGTGGCGGTTATGAATTCAG
CTACTTTGAAGGATCTGAAGCTTTTGATCAAGAAGAGAGTTAATGAGATGGAGCAAGCAA
ACATGGGTCATCGCCACATCTCTTGGAAGCATGTATGGTCAAACTTCTGTCTTTCATGTA
ATAACGAGAAGTTGCTTGACGATGACGCAGTTCTTCAGGATGTCGGAGTTCGAAATAACT
CTCAGATCGCATTTGTTCCATATGTGATGAAGAAAGGTCCGGGAAGACACTCGAAGAGGA
AGAAGCATCGTCTCTTTCGTTCACTCCACAAGACTTGTTAGATAGTAGCGTTACTTTGAT
TACTTAGTCTGTTACTATTACAGTTGGTGGATTCTGATCAGATTGTCAAGCATCATTAGT
GCATTTCACGCGAACGAGAGGAAAAACAACAACATATTCAGTGGCTGTAACCTATTGAGC
CTTACGATGTATCAGCATGCCGCGCACACAAGCAGAGTAAAGAAAAAAGGCACCAAGTGA
TGATCTA*AATACTGTATGCTCGTGAGTCGTGAGTCGTGATGCCATCAGCAGATGGTGGG
ATTGATCTTTGTTAGAGTGTGAGTTTGTTGAGCTGATGATAATCCGGTTCGGTGCAAAAC
TGTATGTAAGCTGTAAATTAATGGTCGCGGTGTGCCTAACAGAAATAAATGGTGTTGTTT
TCATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2BI40TF U 1
AF RR2EK78JQ C 455
AF RR2EK78TF U 455
BS 1 530 RR2BI40TF
BS 531 531 RR2EK78TF
BS 532 609 RR2BI40TF
BS 610 610 RR2EK78TF
BS 611 727 RR2BI40TF
BS 728 728 RR2EK78TF
BS 729 838 RR2BI40TF
BS 839 839 RR2EK78TF
BS 840 859 RR2BI40TF
BS 860 907 RR2EK78TF

RD RR2BI40TF 859 0 0
GGACCACAATGGAGAGCGGCGATGTTGTGGGAATCGGAGATTACAACGCAGAGACGAAGA
GGGAGAAGCTGAGATCGTTGCTCTCTCAACTACTCGCCGATCCGATTCCCGCCGACGTTC
CGAGGAATCCAACACTCTCGGATGTCGTCACTCTCGTCAGCCTTGAAAAGGGAAGCGCTA
TGCGACTCTCCATCGTCAAACTCGACGGCTCCTCCTTGGATGTGGCGGTTATGAATTCAG
CTACTTTGAAGGATCTGAAGCTTTTGATCAAGAAGAGAGTTAATGAGATGGAGCAAGCAA
ACATGGGTCATCGCCACATCTCTTGGAAGCATGTATGGTCAAACTTCTGTCTTTCATGTA
ATAACGAGAAGTTGCTTGACGATGACGCAGTTCTTCAGGATGTCGGAGTTCGAAATAACT
CTCAGATCGCATTTGTTCCATATGTGATGAAGAAAGGTCCGGGAAGACACTCGAAGAGGA
AGAAGCATCGTCTCTTTCGTTCACTCCACAAGACTTGTTAGATAGTAGCGGTACTTTGAT
TACTTAGTCTGTTACTATTACAGTTGGTGGATTCTGATCAGATTGTCAAGCATCATTAGT
GCATTTCACACGAACGAGAGGAAAAACAACAACATATTCAGTGGCTGTAACCTATTGAGC
CTTACGATGTATCAGCATGCCGCGCACACAAGCAGAGTAAAGAAAAAAGGCACCAAGTGA
TGATCTAGAATACTGTATGCTCGTGAGTCGTGAGTCGTGATGCCATCAGCAGATGGTGGG
ATTGATCTTTGTTAGAGTGTGAGTTTGTTGAGCTGATGATAATCCGGTTCGGTGCAAA*C
TGTATGTAAGCTGTAAATT

QA 1 859 1 859
DS 

RD RR2EK78JQ 453 0 0
G
GGTCCGGGAAGACACTCGAAGAGGAAGAAGCATCGTCTCTTTCGTTCACTCCACAAGACT
TGTTAGATAGTAGCGTTACTTTGATTACTTAGTCTGTTACTATTACAGTTGGTGGATTCT
GATCAGATTGTCAAGCATCATTAGTGCATTTCACGCGAACGAGAGGAAAAACAACAACAT
ATTCAGTGGCTGTAACCTATTGAGCCTTACGATGTATCAGCATGCCGCGCACACAAGCAG
AGTAAAGAAAAAAGGCACCAAGTGATGATCTA*AATACTGTATGCTCGTGAGTCGTGAGT
CGTGATGCCATCAGCAGATGGTGGGATTGATCTTTGTTAGAGTGTGAGTTTGTTGAGCTG
ATGATAATCCGGTTCGGTGCAAAACTGTATGTAAGCTGTAAATTAATGGTCGCGGTGTGC
CTAACAGAAATAAATGGTGTTGTTTTCATTAC

QA 2 453 2 453
DS 

RD RR2EK78TF 453 0 0
G
GGTCCGGGAAGACACTCGAAGAGGAAGAAGCATCGTCTCTTTCGTTCACTCCACAAGACT
TGTTAGATAGTAGCGTTACTTTGATTACTTAGTCTGTTACTATTACAGTTGGTGGATTCT
GATCAGATTGTCAAGCATCATTAGTGCATTTCACGCGAACGAGAGGAAAAACAACAACAT
ATTCAGTGGCTGTAACCTATTGAGCCTTACGATGTATCAGCATGCCGCGCACACAAGCAG
AGTAAAGAAAAAAGGCACCAAGTGATGATCTA*AATACTGTATGCTCGTGAGTCGTGAGT
CGTGATGCCATCAGCAGATGGTGGGATTGATCTTTGTTAGAGTGTGAGTTTGTTGAGCTG
ATGATAATCCGGTTCGGTGCAAAACTGTATGTAAGCTGTAAATTAATGGTCGCGGTGTGC
CTAACAGAAATAAATGGTGTTGTTTTCATTAC

QA 2 453 2 453
DS 



AS 1 3

CO CL3272Contig1 938 3 7 U
GGGAGAGAGCTCGGAGAAGAGAATTATCAATGGCGGAAGATCTGGTTCTCGACACGGCGA
TAAGAGACTGGGTTTTGATCCCTCTCTCAGTCGTGATGGTTCTCATTGGTGTTCTCCGCT
ACTTCGTCTCCAAACTCATGCGTTCGTCTCCGTCTCCCGATGCGAAGATGGTCAAAGAAG
GACAAGTTGTGATTAGGGCTCGGAATCTCAAGGCAGGTGCCAATTTCATCCCGCCTAAGT
CCTTTCGAGCTCGGAGATTCTACTTCAGCAACGAGGAAAACGGATTGTTACATGTTCCTA
AGGACCAAGCTCAGAACCCACAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCTAACATGGCCATGGATA
TGATGAAGAAAAATTTGTCAATGATTATACCACAGACGCTCACTTTTGCATGGGTCAACT
TCTTCTTTTCTGGATTTGTTGCAGCCAAAATACCATTTCCGCTTACTCAGAGATTCAGGT
CAATGTTACAGAACGGTATCGACTTGAGCACTGTTGATGTTAGCTATGTGAGCAGCCGTT
CATGGTACTTCTTGAACTTGTTTGGACTAAGAGGCTTATTCAGCCTCATTCTTGGAGATG
AAAATGCAATTGATGATACACAAAGAATGATGCAAATGGGTGGATTTGGTTTTGATGCAT
CAAAGAACTTGAGCGCAGAGAAGGACGGTCTCGACATTATTCAACATGAATGGGCCTTAC
CACGATTCGAGCACCGTGCAGAATCCGTTTTGAGAAAACTCGTGCACTAGAAACATTCTT
GCCTCTGGTCCCCCCCTAGTTCTCTGCTGGTAGCTAGACTCTTCTGTGTGTCTAATGTCC
TCCATTGTTTTCATAAACATCGTCTACCATATTTTCTTCAGTGACACCATTTGGTTTAGA
TCTCTACTGTTATTACATATAGCTGGTGGTTCCAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D511TF U 1
AF RR2GI68JQB C 215
AF RR2GI68TF U 215
BS 1 683 RR2D511TF
BS 684 684 RR2GI68TF
BS 685 687 RR2D511TF
BS 688 688 RR2GI68TF
BS 689 734 RR2D511TF
BS 735 910 RR2GI68TF
BS 911 938 RR2GI68JQB

RD RR2D511TF 734 0 0
GGGAGAGAGCTCGGAGAAGAGAATTATCAATGGCGGAAGATCTGGTTCTCGACACGGCGA
TAAGAGACTGGGTTTTGATCCCTCTCTCAGTCGTGATGGTTCTCATTGGTGTTCTCCGCT
ACTTCGTCTCCAAACTCATGCGTTCGTCTCCGTCTCCCGATGCGAAGATGGTCAAAGAAG
GACAAGTTGTGATTAGGGCTCGGAATCTCAAGGCAGGTGCCAATTTCATCCCGCCTAAGT
CCTTTCGAGCTCGGAGATTCTACTTCAGCAACGAGGAAAACGGATTGTTACATGTTCCTA
AGGACCAAGCTCAGAACCCACAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCTAACATGGCCATGGATA
TGATGAAGAAAAATTTGTCAATGATTATACCACAGACGCTCACTTTTGCATGGGTCAACT
TCTTCTTTTCTGGATTTGTTGCAGCCAAAATACCATTTCCGCTTACTCAGAGATTCAGGT
CAATGTTACAGAACGGTATCGACTTGAGCACTGTTGATGTTAGCTATGTGAGCAGCCGTT
CATGGTACTTCTTGAACTTGTTTGGACTAAGAGGCTTATTCAGCCTCATTCTTGGAGATG
AAAATGCAATTGATGATACACAAAGAATGATGCAAATGGGTGGATTTGGTTTTGATGCAT
CAAAGAACTTGAGCGCAGAGAAG*ACG*TCTCGACATTATTCAACATGAATGGGCCTTAC
CACGATTCGAGCAC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2GI68JQB 724 0 0
G
GGTGCCAATTTCATCCCGCCTAAGTCCTTTCGAGCTCGGAGATTCTACTTCAGCAACGAG
GAAAACGGATTGTTACATGTTCCTAAGGACCAAGCTCAGAACCCACAAGCTCAGATGTTT
TCTGATCCTAACATGGCCATGGATATGATGAAGAAAAATTTGTCAATGATTATACCACAG
ACGCTCACTTTTGCATGGGTCAACTTCTTCTTTTCTGGATTTGTTGCAGCCAAAATACCA
TTTCCGCTTACTCAGAGATTCAGGTCAATGTTACAGAACGGTATCGACTTGAGCACTGTT
GATGTTAGCTATGTGAGCAGCCGTTCATGGTACTTCTTGAACTTGTTTGGACTAAGAGGC
TTATTCAGCCTCATTCTTGGAGATGAAAATGCAATTGATGATACACAAAGAATGATGCAA
ATGGGTGGATTTGGTTTTGATGCATCAAAGAACTTGAGCGCAGAGAAGGACGGTCTCGAC
ATTATTCAACATGAATGGGCCTTACCACGATTCGAGCACCGTGCAGAATCCGTTTTGAGA
AAACTCGTGCACTAGAAACATTCTTGCCTCTGGTCCCCCCCTAGTTCTCTGCTGGTAGCT
AGACTCTTCTGTGTGTCTAATGTCCTCCATTGTTTTCATAAACATCGTCTACCATATTTT
CTTCAGTGACACCATTTGGTTTAGATCTCTACTGTTATTACATATAGCTGGTGGTTCCAA
TTT

QA 2 724 2 724
DS 

RD RR2GI68TF 699 0 0
G
GGTGCCAATTTCATCCCGCCTAAGTCCTTTCGAGCTCGGAGATTCTACTTCAGCAACGAG
GAAAACGGATTGTTACATGTTCCTAAGGACCAAGCTCAGAACCCACAAGCTCAGATGTTT
TCTGATCCTAACATGGCCATGGATATGATGAAGAAAAATTTGTCAATGATTATACCACAG
ACGCTCACTTTTGCATGGGTCAACTTCTTCTTTTCTGGATTTGTTGCAGCCAAAATACCA
TTTCCGCTTACTCAGAGATTCAGGTCAATGTTACAGAACGGTATCGACTTGAGCACTGTT
GATGTTAGCTATGTGAGCAGCCGTTCATGGTACTTCTTGAACTTGTTTGGACTAAGAGGC
TTATTCAGCCTCATTCTTGGAGATGAAAATGCAATTGATGATACACAAAGAATGATGCAA
ATGGGTGGATTTGGTTTTGATGCATCAAAGAACTTGAGCGCAGAGAAGGACGGTCTCGAC
ATTATTCAACATGAATGGGCCTTACCACGATTCGAGCACCGTGCAGAATCCGTTTTGAGA
AAACTCGTGCACTAGAAACATTCTTGCCTCTGGTCCCCCCCTAGTTCTCTGCTGGTAGCT
AGACTCTTCTGTGTGTCTAATGTCCTCCATTGTTTTCATAAACATCGTCTACCATATTTT
CTTCAGTGACACCATTTGGTTTAGATCTCTACTGT
ATA

QA 2 696 2 696
DS 



AS 1 3

CO CL3273Contig1 750 3 2 U
AGGGATTCATCTAGTTGTTATCTCCACAGAACAAAAAATGAGCAACCTTATTAGTTCTCT
CGAACTCTCATCTCTTACACTCGAAGACCCATGGCCTGCTTTCTAGCCTAATTTTCTTCG
AGGATCTTTTTTTTTAAAATTCTGAACCCTTCTTGGTTTCTTCATCATCTTTCTAAAACG
TTTTCTAAAAATCATGGGGACTGGAGAAAAAACTCTGAAAAGCTTCCATTTACATCGCAA
ACAAACGGCCAAAATCAAAGATGTCCCAAAAGGATGCTTAGCGATCAAAGTTGGATCACA
AGGAGAAGAGCAACAAAGATTTATAGTTCCTATTTTGTATTTTAATCATCCGTTGTTCAT
GCAGCTCTTGAAAGAAGCAGAAGATGAGTATGGATTCGATCAAAAGGGCACCATCACGAT
CCCTTGCCACGTGGCTGAGTTTCGTTACGTTCAAGCTTTGATTGATGGCGAGAGAATTGT
TTATCATGGTAACAATAACCATCTTCATAGACATAGCGGTCGTGACCAGTATCATCCTCT
TGTTGGATGTTTCAGAACGTGATGAATGATGAGGACGAGGAGGATGAATGAATGCTTGTA
TGCGCTAAGTTTTCAATCCATGAGGAGTTGAGGAGCAAAAACTGGCCTAACCCAAGAATA
AAATGATTTTTCTGTTTTCTCTTTGATGATTTTAGTATTTTCTGTAATTTGTATGGAATT
CCAAGTTAAAAGAAAGTTATTTTCTGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2GZ16TF U 1
AF RR2GZ16JQ C 127
AF RR2G473TF U 465
BS 1 571 RR2GZ16TF
BS 572 750 RR2G473TF

RD RR2GZ16TF 571 0 0
AGGGATTCATCTAGTTGTTATCTCCACAGAACAAAAAATGAGCAACCTTATTAGTTCTCT
CGAACTCTCATCTCTTACACTCGAAGACCCATGGCCTGCTTTCTAGCCTAATTTTCTTCG
AGGATCTTTTTTTTTAAAATTCTGAACCCTTCTTGGTTTCTTCATCATCTTTCTAAAACG
TTTTCTAAAAATCATGGGGACTGGAGAAAAAACTCTGAAAAGCTTCCATTTACATCGCAA
ACAAACGGCCAAAATCAAAGATGTCCCAAAAGGATGCTTAGCGATCAAAGTTGGATCACA
AGGAGAAGAGCAACAAAGATTTATAGTTCCTATTTTGTATTTTAATCATCCGTTGTTCAT
GCAGCTCTTGAAAGAAGCAGAAGATGAGTATGGATTCGATCAAAAGGGCACCATCACGAT
CCCTTGCCACGTGGCTGAGTTTCGTTACGTTCAAGCTTTGATTGATGGCGAGAGAATTGT
TTATCATGGTAACAATAACCATCTTCATAGACATAGCGGTCGTGACCAGTATCATCCTCT
TGTTGGATGTTTCAGAACGTGATGAATGATG

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2GZ16JQ 620 0 0
TTTTTTTTTAAAATTCTGAACCCTTCTTGGTTTCTTCATCATCTTTCTAAAACGTTTTCT
AAAAATCATGGGGACTGGAGAAAAAACTCTGAAAAGCTTCCATTTACATCGCAAACAAAC
GGCCAAAATCAAAGATGTCCCAAAAGGATGCTTAGCGATCAAAGTTGGATCACAAGGAGA
AGAGCAACAAAGATTTATAGTTCCTATTTTGTATTTTAATCATCCGTTGTTCATGCAGCT
CTTGAAAGAAGCAGAAGATGAGTATGGATTCGATCAAAAGGGCACCATCACGATCCCTTG
CCACGTGGCTGAGTTTCGTTACGTTCAAGCTTTGATTGATGGCGAGAGAATTGTTTATCA
TGGTAACAATAACCATCTTCATAGACATAGCGGTCGTGACCAGTATCATCCTCTTGTTGG
ATGTTTCAGAACGTGATGAATGATGAGGACGAGGAGGATGAATGAATGCTTGTATGCGCT
AAGTTTTCAATCCATGAGGAGTTGAGGAGCCAAAACTGGCCTAACCCAAGAATAAAATGA
TTTTTCTGTTTTCTCTTTGATGATTTTAGTATTTTCTGTTATTTGTATGGAATTTCAAGT
TAAAAGAAAGTTATTTTCTG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2G473TF 286 0 0
GGCGA
GAGAGAATTGTTTATCATGGTAACAATAACCATCTTCATAGACATAGCGGTCGTGACCAG
TATCATCCTCTTGTTGGATGTTTCAGAACGTGATGAATGATGAGGACGAGGAGGATGAAT
GAATGCTTGTATGCGCTAAGTTTTCAATCCATGAGGAGTTGAGGAGCAAAAACTGGCCTA
ACCCAAGAATAAAATGATTTTTCTGTTTTCTCTTTGATGATTTTAGTATTTTCTGTAATT
TGTATGGAATTCCAAGTTAAAAGAAAGTTATTTTCTGATTT

QA 6 286 6 286
DS 



AS 1 2

CO CL3274Contig1 924 2 6 U
TGAGGCAGCAGACCTTATCAAGAAAGGAAAGATGTGTTGTCTGTTCATCAACGATCTCGA
CGCCGGTGCTGGTCGTATGGGTGGTACCACTCAGTACACTGTCAACAACCAGATGGTTAA
CGCAACCCTCATGAACATTGCTGATAACCCAACCAACGTCCAGCTCCCAGGAATGTACAA
CAAGGAAGAAAACGCGCGTGTCCCCATCATCGTCACCGGTAACGATTTCTCCACTCTCTA
TGCTCCTCTCATCCGTGATGGACGTATGGAGAAGTTCTACTGGGCCCCGACACGTGAAGA
CCGTATTGGTGTCTGCAAGGGTATCTTCAGGACAGATAATGTCCCGGATGAAGACGTTGT
CACCCTTGTTGACAAGTTCCCTGGACAATCTATCGATTTCTTTGGTGCCTTGAGGGCGAG
AGTGTACGATGATGAAGTGAGGAAGTTCGTTGAGGGACTTGGAGTGGAGAAGATAAGCAA
GAGGCTGGTGAACTCAAGGGAAGCTCCTCCAGTGTTTGAGCAACCGAAGATGACTCTTGA
GAAGCTTATGGAGTATGGAAACATGCTTGTGATGGAGCAAGAGAACGTCAAGAGAGTCCA
ACTTGCTGACCAATACCTTAACGAGGCTGCGTTGGGAGACGCAAACGCTGACGCCATTGG
CCGCGGAACTTTCTATGGTTAGATCTCGAGGCAAAGCAGCACAGCAAGTGAACGTTCCTG
TTCCAGAAGGGTGTACTGATCCTCAAGCCGAAAACTTTGATCCAACAGCTAGAAGTGACG
ATGGAACTTGTGCCTACAAGTTTTGAGTTTCCTCCTTGTTAAGTTGCTGTGTTTCTAATG
TTGTTTGTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTCTTTTGTGTTACTGTGGATTGGTTCATGTCCTC
TCTTTTTTTTTGTGATCATGTGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY43TF U 1
AF RR2BY43JQ C 194
BS 1 584 RR2BY43TF
BS 585 585 RR2BY43JQ
BS 586 625 RR2BY43TF
BS 626 626 RR2BY43JQ
BS 627 644 RR2BY43TF
BS 645 924 RR2BY43JQ

RD RR2BY43TF 650 0 0
TGAGGCAGCAGACCTTATCAAGAAAGGAAAGATGTGTTGTCTGTTCATCAACGATCTCGA
CGCCGGTGCTGGTCGTATGGGTGGTACCACTCAGTACACTGTCAACAACCAGATGGTTAA
CGCAACCCTCATGAACATTGCTGATAACCCAACCAACGTCCAGCTCCCAGGAATGTACAA
CAAGGAAGAAAACGCGCGTGTCCCCATCATCGTCACCGGTAACGATTTCTCCACTCTCTA
TGCTCCTCTCATCCGTGATGGACGTATGGAGAAGTTCTACTGGGCCCCGACACGTGAAGA
CCGTATTGGTGTCTGCAAGGGTATCTTCAGGACAGATAATGTCCCGGATGAAGACGTTGT
CACCCTTGTTGACAAGTTCCCTGGACAATCTATCGATTTCTTTGGTGCCTTGAGGGCGAG
AGTGTACGATGATGAAGTGAGGAAGTTCGTTGAGGGACTTGGAGTGGAGAAGATAAGCAA
GAGGCTGGTGAACTCAAGGGAAGCTCCTCCAGTGTTTGAGCAACCGAAGATGACTCTTGA
GAAGCTTATGGAGTATGGAAACATGCTTGTGATGGAGCAAGAGA*CGTCAAGAGAGTCCA
ACTTGCTGACCAATACCTTAACGAG*CTGCGTTGGGAGACGCAA
CGCTGA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2BY43JQ 731 0 0
GCGCGTGTCCCCATCATCGTCACCGGTAACGATTTCTCCACTCTCTATGCTCCTCTCATC
CGTGATGGACGTATGGAGAAGTTCTACTGGGCCCCGACACGTGAAGACCGTATTGGTGTC
TGCAAGGGTATCTTCAGGACAGATAATGTCCCGGATGAAGACGTTGTCACCCTTGTTGAC
AAGTTCCCTGGACAATCTATCGATTTCTTTGGTGCCTTGAGGGCGAGAGTGTACGATGAT
GAAGTGAGGAAGTTCGTTGAGGGACTTGGAGTGGAGAAGATAAGCAAGAGGCTGGTGAAC
TCAAGGGAAGCTCCTCCAGTGTTTGAGCAACCGAAGATGACTCTTGAGAAGCTTATGGAG
TATGGAAACATGCTTGTGATGGAGCAAGAGAACGTCAAGAGAGTCCAACTTGCTGACCAA
TACCTTAACGAGGCTGCGTTGGGAGACGCAAACGCTGACGCCATTGGCCGCGGAACTTTC
TATGGTTAGATCTCGAGGCAAAGCAGCACAGCAAGTGAACGTTCCTGTTCCAGAAGGGTG
TACTGATCCTCAAGCCGAAAACTTTGATCCAACAGCTAGAAGTGACGATGGAACTTGTGC
CTACAAGTTTTGAGTTTCCTCCTTGTTAAGTTGCTGTGTTTCTAATGTTGTTTGTCTCTC
TCTCTTTTTTTTTTCTTTTGTGTTACTGTGGATTGGTTCATGTCCTCTCTTTTTTTTTGT
GATCATGTGCA

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL3275Contig1 1225 2 10 U
GGATCTCAGGGTTTCCTCTCAATAATCTCAACTTGGCCTCTGCTTTCTCATGTTCACTTT
CTCCTCCTCTCCTCTGAAAAAAGCCAAACCATTTACTATTTCCAAAACCTTCTCTCACTA
AAGAGCAAGAACACAAAATGTATGCAGATTCAGGGTTAATGCTCCGTTACATGCAAAACT
ATTCTCCAGATATTCAACAATTTGAGGACCTCTTCAAATCATACAAGCTCTCAGATGCTG
AAATGAACAACGCTTTTGCTGAGTCATCAAACATGCATGAGTATGATATCGGAGAAGAAG
GAGATTTGTTCAAAGCTCCTGATCCAATTCTTGAAGAACCAATCTTAGCCGTTGATCCAC
TCTCAGCTGCTTTAACCATGATCTCTTGCGGCGAAGACTCTTCTCAAGGGCTTTGTGAGC
TTCCTGATCTCGATCTCGGGTCGTTACAAAGTGGTCAGCAGCTCCTTGACAAAGCTTTCT
ATGAATGTGAGCAAGATCTCATGATGAAGTCAGCTATGGAGTCTCCGTTCTCTGATATGT
TAGACATCAAGAACATCTCTGATGTGTTAGATGTCAAGAACGTCTCTGTGGTGAAAGCTA
CAGATGAGAATAAGGATATGCAGAAGAGTGTGAGCTCGGGAAACTTGAGCTGTATGGATT
GGTCACAGGCACAACAAGAAGCTGTTGTGATTCAGAACTTCCCTGATTTTTCTCAATTAG
ATTTCAGTTCTGATTATGGGATGCGAAGAGCCTTTAGTGAAGGCGACATACAGACACTTG
GTAATGGTCTAGCTCAATCTCCATTAGACAGGATTATTGTGAGCTGTACTTCAGAGGATC
GACGTGAGAAGCTTTCACGATACAGGAACAAGAAGAGCAGGCGAAACTTTGGACGCAAAA
TCAAGTATGCTTGTAGGAAAACTCTTGCGGATAGCCAACCGAGGATCCGAGGAAGGTTTG
CGAAAACAGAGGAGAGGAAGTAGAATGGTTTCAAATAAAATGGTGATGGGAGGGTAAGCA
AAAGGAAGAATAAGGAGACAAGGCCCATTTCCTTATAAACTATTTTTGTTATATATGTAT
AATCTTTAAAATATTATATAAGCATTCAAATTAGTTTTTTGTATATTAAGGAGTTCTCTA
AATAAGCTTATAAGGAAATAAATTGTAGCTACATAAGTCATGTAATGGTGCTGAGATGTG
TAGATATATGTCTTTATAATTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F073TF U 1
AF RR2EH84JQ C 595
BS 1 600 RR2F073TF
BS 601 601 RR2EH84JQ
BS 602 607 RR2F073TF
BS 608 608 RR2EH84JQ
BS 609 640 RR2F073TF
BS 641 641 RR2EH84JQ
BS 642 700 RR2F073TF
BS 701 701 RR2EH84JQ
BS 702 759 RR2F073TF
BS 760 1225 RR2EH84JQ

RD RR2F073TF 759 0 0
GGATCTCAGGGTTTCCTCTCAATAATCTCAACTTGGCCTCTGCTTTCTCATGTTCACTTT
CTCCTCCTCTCCTCTGAAAAAAGCCAAACCATTTACTATTTCCAAAACCTTCTCTCACTA
AAGAGCAAGAACACAAAATGTATGCAGATTCAGGGTTAATGCTCCGTTACATGCAAAACT
ATTCTCCAGATATTCAACAATTTGAGGACCTCTTCAAATCATACAAGCTCTCAGATGCTG
AAATGAACAACGCTTTTGCTGAGTCATCAAACATGCATGAGTATGATATCGGAGAAGAAG
GAGATTTGTTCAAAGCTCCTGATCCAATTCTTGAAGAACCAATCTTAGCCGTTGATCCAC
TCTCAGCTGCTTTAACCATGATCTCTTGCGGCGAAGACTCTTCTCAAGGGCTTTGTGAGC
TTCCTGATCTCGATCTCGGGTCGTTACAAAGTGGTCAGCAGCTCCTTGACAAAGCTTTCT
ATGAATGTGAGCAAGATCTCATGATGAAGTCAGCTATGGAGTCTCCGTTCTCTGATATGT
TAGACATCAAGAACATCTCTGATGTGTTAGATGTCAAGAACGTCTCTGTGGTGAAAGCTA
TAGATGATAATAAGGATATGCAGAAGAGTGTGAGCTCGGGGAACTTGAGCTGTATGGATT
GGTCACAGGCACAACAAGAAGCTGTTGTGATTCAGAACTTTCCTGATTTTTCTCAATTAG
ATTTCAGTTCTGATTATGGGATGCGAAGAGCCTTTAGTG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2EH84JQ 631 0 0
AAGCTACAGATGAGAATAAGGATATGCAGAAGAGTGTGAGCTCGGGAAACTTGAGCTGTA
TGGATTGGTCACAGGCACAACAAGAAGCTGTTGTGATTCAGAACTTCCCTGATTTTTCTC
AATTAGATTTCAGTTCTGATTATGGGATGCGAAGAGCCTTTAGTGAAGGCGACATACAGA
CACTTGGTAATGGTCTAGCTCAATCTCCATTAGACAGGATTATTGTGAGCTGTACTTCAG
AGGATCGACGTGAGAAGCTTTCACGATACAGGAACAAGAAGAGCAGGCGAAACTTTGGAC
GCAAAATCAAGTATGCTTGTAGGAAAACTCTTGCGGATAGCCAACCGAGGATCCGAGGAA
GGTTTGCGAAAACAGAGGAGAGGAAGTAGAATGGTTTCAAATAAAATGGTGATGGGAGGG
TAAGCAAAAGGAAGAATAAGGAGACAAGGCCCATTTCCTTATAAACTATTTTTGTTATAT
ATGTATAATCTTTAAAATATTATATAAGCATTCAAATTAGTTTTTTGTATATTAAGGAGT
TCTCTAAATAAGCTTATAAGGAAATAAATTGTAGCTACATAAGTCATGTAATGGTGCTGA
GATGTGTAGATATATGTCTTTATAATTCTAC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL3276Contig1 1246 2 4 U
GGGAAAGAAGTGCTGCTATGTCCAGTTCTCACAGCGTTTCGATGGTATTGACTTGCACGA
TCGATATGCCAACAGGAATATTGTCTTCTTCGATATTAACTTGAAGGGTTTAGATGGTAT
CCAAGGTCCAGTATATGTGGGTACTGGATGTTGTTTCAATAGGCAAGCTCTATATGGATA
TGATCCTGTTTTGACAGAGGAAGATTTACAACCAAATATAATTGTCAAGAGCTGCTGTGG
CTCAAGGAAGAAAGGAAAGAACAGCAAGAAGTATAGCTATGATCAAAAAAGGAGAGGCAT
CAGCAGAAGTAACTCCAATGCTCCACTTTTCAACATGGATGACATCGATGAGGGTTTCGA
AGGATATGACGATGATAGGTCTATTCTAATGTCCCATAAGAGTGTGGAGAAGCGTTTTGG
TCAGTCGCCAGTATTTATTGCGGCCACCTTCATGGAACAAGGTGGCATTCCACCAACAAC
CAATCCAGCTACTCTTCTCAAGGAGGCTATTCATGTTATAAGCTGTGGTTACGAGGACAA
GAGTGAATGGGGGAAAGAGATTGGTTGGATCTACGGTTCAGTGACAGAAGATATTCTTAC
TGGGTTCAAGATGCATGCCCGTGGTTGGATGTCTATCTACCGCAATCCTCCACGACCTGC
GTTCAAGGGATCTGCACCAATCAATCTTTCTGATCGTTTGAACCAAGTTCTTCGATGGGC
ATTGGGATCTATCGAGATTCTTTTGAGCAGACATTGCCCATCTGGTATGGCTACACCGGA
AGGTTGAGACTCTTGGAGAGGCTCGCTTACATCAACACCATTGTATACCCTATTACAGCT
CTCCCTCTCATCGCCTATTGTATCCTTCCAGCTTTTTGCCTCATCACCGACGAGTTCATC
ATACCTGAGATAAGCAACTACGCGAGTATTTGGTTCATTCTACTCTTTATCTCCATTGCT
GTGACTGGAATCCTGGAGTTGAGATGGAGTGGTGTGAGCATTGAAGACTGGTGGATGAAC
GAGCAGTTCTGGGTCATCGGTGGCACATCTGCTCATCTTTTTGCAGTCTTCCAAGGTCTA
CTCAAGGTACTTGCCGGTATCGACACTAACTTCACTGTCACATCCAAAGCCTCTGACGAA
GATGGGGATTTCGCGGAGCTTTACATCTTTAAATGGACAGCTCTTCTCATTCCACCAACC
ACTGTCCTAGTTGTGAACTCATAGCATTGTGGCTGGTGTCTCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF83TF U 1
AF RR2HB68TF U 563
BS 1 640 RR2DF83TF
BS 641 641 RR2HB68TF
BS 642 663 RR2DF83TF
BS 664 1246 RR2HB68TF

RD RR2DF83TF 663 0 0
GGGAAAGAAGTGCTGCTATGTCCAGTTCTCACAGCGTTTCGATGGTATTGACTTGCACGA
TCGATATGCCAACAGGAATATTGTCTTCTTCGATATTAACTTGAAGGGTTTAGATGGTAT
CCAAGGTCCAGTATATGTGGGTACTGGATGTTGTTTCAATAGGCAAGCTCTATATGGATA
TGATCCTGTTTTGACAGAGGAAGATTTACAACCAAATATAATTGTCAAGAGCTGCTGTGG
CTCAAGGAAGAAAGGAAAGAACAGCAAGAAGTATAGCTATGATCAAAAAAGGAGAGGCAT
CAGCAGAAGTAACTCCAATGCTCCACTTTTCAACATGGATGACATCGATGAGGGTTTCGA
AGGATATGACGATGATAGGTCTATTCTAATGTCCCATAAGAGTGTGGAGAAGCGTTTTGG
TCAGTCGCCAGTATTTATTGCGGCCACCTTCATGGAACAAGGTGGCATTCCACCAACAAC
CAATCCAGCTACTCTTCTCAAGGAGGCTATTCATGTTATAAGCTGTGGTTACGAGGACAA
GAGTGAATGGGGGAAAGAGATTGGTTGGATCTACGGTTCAGTGACAGAAGATATTCTTAC
TGGGTTCAAGATGCATGCCCGTGGTTGGATGTCTATCTACTGCAATCCTCCACGACCTGC
GTT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2HB68TF 684 0 0
GGTTGGATCTACGGTTCAGTGACAGAAGATATTCTTACTGGGTTCAAGATGCATGCCCGT
GGTTGGATGTCTATCTACCGCAATCCTCCACGACCTGCGTTCAAGGGATCTGCACCAATC
AATCTTTCTGATCGTTTGAACCAAGTTCTTCGATGGGCATTGGGATCTATCGAGATTCTT
TTGAGCAGACATTGCCCATCTGGTATGGCTACACCGGAAGGTTGAGACTCTTGGAGAGGC
TCGCTTACATCAACACCATTGTATACCCTATTACAGCTCTCCCTCTCATCGCCTATTGTA
TCCTTCCAGCTTTTTGCCTCATCACCGACGAGTTCATCATACCTGAGATAAGCAACTACG
CGAGTATTTGGTTCATTCTACTCTTTATCTCCATTGCTGTGACTGGAATCCTGGAGTTGA
GATGGAGTGGTGTGAGCATTGAAGACTGGTGGATGAACGAGCAGTTCTGGGTCATCGGTG
GCACATCTGCTCATCTTTTTGCAGTCTTCCAAGGTCTACTCAAGGTACTTGCCGGTATCG
ACACTAACTTCACTGTCACATCCAAAGCCTCTGACGAAGATGGGGATTTCGCGGAGCTTT
ACATCTTTAAATGGACAGCTCTTCTCATTCCACCAACCACTGTCCTAGTTGTGAACTCAT
AGCATTGTGGCTGGTGTCTCTTAT

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL3277Contig1 555 2 2 U
GCCACAAACTTCTTGGATAGAAGAACCGAATCAGCATTCCCGCTAGAATACAAAATGAGA
TCTTTCTAAACAACAACATATTAGAAAAAAAAAACCTGAGCAGTAGAAAAAACTTAACAA
GATGAGATCCTATTAAAAACCCTTCACTCTGATCATTCTAGCATCTGATCAGTAGATACT
TGGCCACCGGCTTTCTGACTTTTCTTCTTGTTGCCTTTGTTCTTTAGTTTATTGAGCTTC
AACGTCTTCTTCACGCTAAATTTTCTAGAGGGTTTCTTGGAGTCTTCTGATGCAGCTTCA
GCAGAAGCCATCTCAACATCCTCCATGGTAACAAGACCTTTCTCCACCATATCTTTCTGC
TTTCTGCGCCATTTGCGAAGGAGTTTCTTCTGACGTTTACCGGAAACGGAGACAACGGGA
GCTCTGGTCTTCAATTTATTGGTGAGTGGATCGCCGTGGATAGCTCTCTTCCTATCCGCT
TTCGCCCTCTCTTCTTCTTCGCTATCTCGTTGTATTTCGCCATCTTCAAAGCCAACCAAT
ACCCTCACAACCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A229TF C 1
AF RR2A229JQ U 173
BS 1 175 RR2A229TF
BS 176 555 RR2A229JQ

RD RR2A229TF 548 0 0
GCCACAAACTTCTTGGATAGAAGAACCGAATCAGCATTCCCGCTAGAATACAAAATGAGA
TCTTTCTAAACAACAACATATTAGAAAAAAAAAACCTGAGCAGTAGAAAAAACTTAACAA
GATGAGATCCTATTAAAAACCCTTCACTCTGATCATTCTAGCATCTGATCAGTAGATACT
TGGCCACCGGCTTTCTGACTTTTCTTCTTGTTGCCTTTGTTCTTTAGTTTATTGAGCTTC
AACGTCTTCTTCACGCTAAATTTTCTAGAGGGTTTCTTGGAGTCTTCTGATGCAGCTTCA
GCAGAAGCCATCTCAACATCCTCCATGGTAACAAGACCTTTCTCCACCATATCTTTCTGC
TTTCTGCGCCATTTGCGAAGGAGTTTCTTCTGACGTTTACCGGAGACGGAGACAACGGGA
GCTCTGGTCTTCAATTTATTGGTGAGTGGATCGCCGTGGATAGCTCTCTTCCTATCCGCT
TTCGCCCTCTCTTCTTCTTCGCTATCTCGTTGTATTTCGCCATCTTCAAAGCCAACCAAT
ACCCTCAC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2A229JQ 383 0 0
TAA
ATACTTGGCCACCGGCTTTCTGACTTTTCTTCTTGTTGCCTTTGTTCTTTAGTTTATTGA
GCTTCAACGTCTTCTTCACGCTAAATTTTCTAGAGGGTTTCTTGGAGTCTTCTGATGCAG
CTTCAGCAGAAGCCATCTCAACATCCTCCATGGTAACAAGACCTTTCTCCACCATATCTT
TCTGCTTTCTGCGCCATTTGCGAAGGAGTTTCTTCTGACGTTTACCGGAAACGGAGACAA
CGGGAGCTCTGGTCTTCAATTTATTGGTGAGTGGATCGCCGTGGATAGCTCTCTTCCTAT
CCGCTTTCGCCCTCTCTTCTTCTTCGCTATCTCGTTGTATTTCGCCATCTTCAAAGCCAA
CCAATACCCTCACAACCCCC

QA 4 383 4 383
DS 



AS 1 2

CO CL3278Contig1 891 2 10 U
TCGAAAAATTTCGGAAAATTCTCGACTCGTCTCCGCAAGAAGAAGATGACGGGAGTTGAT
GATGGTAAGGAGTTCAAGGATGAAACCGTGATTCTCAGCGACGACGATAGTGAAGTGGAA
GAAGTTAAAGACGGAGGAGAAGAAGGTTCCGACGAGGAACCAGAAGTCGATGGAAGTGAA
GGTGACGACGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAGGAAGATGACGACGACGAGGTC
CAGGTTTTGCAGTCCTTAGGTGGGCCTCCGGTACAGTCGGCTGAAGATGAAGATGAGGAA
GGAGAGGAAGACGGAAACGGAGACGACGGCGACGACGATGACGATGATGATGACGACGAC
GACGACGATGATGACGAGGACGATGACGGTGAAGATGAGGAGGATCTTGGGACAGAATAC
CTAGTCAGGCCAGTTGGTCGGGCTGAAGACGAAGAGGACGCAAGTGATTTTGAGCCGGAA
GAGAACGGTGTTGAGGAAGACCTTGACGATGGTGAAGACGACGAGAATGATGACTCGGGT
GTTGCTGGAAAATCTGAGGCTCCTCCCAAAAGGAAGAGAGGAGCTGCTGATGAAGAGGAA
GAGGAGGATAGTGATGATGGAGATGATGCAAGACCTCCAAAGAGGTAGTTTTCAAGGAAT
TATAACAACAGCACGGTTCAAACAAACTGAAAGAGAGCTTTATGTTTTTTTTTCCTTTTT
AAGTTTGGAGTCGTGAGATTTGAATCATTGGTTGGGGTTCATGTAAGTTTATTATGGATC
AAGAAGTAGGGCTTTTTATTTTTCATTTTATGCAGATGTTTTCTCTTTTCTAGTGAGTAA
CCAATGTTTCTTGAACGATTTACTGTCTAATGCTTTTTCTTTATTAGAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS17TF U 1
AF RR2CO36TF U 323
BS 1 352 RR2FS17TF
BS 353 354 RR2CO36TF
BS 355 361 RR2FS17TF
BS 362 362 RR2CO36TF
BS 363 681 RR2FS17TF
BS 682 682 RR2CO36TF
BS 683 719 RR2FS17TF
BS 720 720 RR2CO36TF
BS 721 791 RR2FS17TF
BS 792 891 RR2CO36TF

RD RR2FS17TF 791 0 0
TCGAAAAATTTCGGAAAATTCTCGACTCGTCTCCGCAAGAAGAAGATGACGGGAGTTGAT
GATGGTAAGGAGTTCAAGGATGAAACCGTGATTCTCAGCGACGACGATAGTGAAGTGGAA
GAAGTTAAAGACGGAGGAGAAGAAGGTTCCGACGAGGAACCAGAAGTCGATGGAAGTGAA
GGTGACGACGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAGGAAGATGACGACGACGAGGTC
CAGGTTTTGCAGTCCTTAGGTGGGCCTCCGGTACAGTCGGCTGAAGATGAAGATGAGGAA
GGAGAGGAAGACGGAAACGGAGACGACGGCGACGACGATGACGATGATGATGT*GACGAC
GTCGACGATGATGACGAGGACGATGACGGTGAAGATGAGGAGGATCTTGGGACAGAATAC
CTAGTCAGGCCAGTTGGTCGGGCTGAAGACGAAGAGGACGCAAGTGATTTTGAGCCGGAA
GAGAACGGTGTTGAGGAAGACCTTGACGATGGTGAAGACGACGAGAATGATGACTCGGGT
GTTGCTGGAAAATCTGAGGCTCCTCCCAAAAGGAAGAGAGGAGCTGCTGATGAAGAGGAA
GAGGAGGATAGTGATGATGGAGATGATGCAAGACCTCCAAAGAGGTAGTTTTCAAGGAAT
TATAACAACAGCACGGTTCAA*CAAACTGAAAGAGAGCTTTATGTTTTTTTTTCCTTTT*
AAGTTTGGAGTCGTGAGATTTGAATCATTGGTTGGGGTTCATGTAAGTTTATTATGGATC
AAGAAGTAGGG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2CO36TF 569 0 0
G
CGACGGCGACGACGATGACGATGATGATGACGACGACGACGACGATGATGACGAGGACGA
TGACGGTGAAGATGAGGAGGATCTTGGGACAGAATACCTAGTCAGGCCAGTTGGTCGGGC
TGAAGACGAAGAGGACGCAAGTGATTTTGAGCCGGAAGAGAACGGTGTTGAGGAAGACCT
TGACGATGGTGAAGACGACGAGAATGATGACTCGGGTGTTGCTGGAAAATCTGAGGCTCC
TCCCAAAAGGAAGAGAGGAGCTGCTGATGAAGAGGAAGAGGAGGATAGTGATGATGGAGA
TGATGCAAGACCTCCAAAGAGGTAGTTTTCAAGGAATTATAACAACAGCACGGTTCAAAC
AAACTGAAAGAGAGCTTTATGTTTTTTTTTCCTTTTTAAGTTTGGAGTCGTGAGATTTGA
ATCATTGGTTGGGGTTCATGTAAGTTTATTATGGATCAAGAAGTAGGGCTTTTTATTTTT
CATTTTATGCAGATGTTTTCTCTTTTCTAGTGAGTAACCAATGTTTCTTGAACGATTTAC
TGTCTAATGCTTTTTCTTTATTAGAGTT

QA 2 569 2 569
DS 



AS 1 3

CO CL3279Contig1 557 3 10 U
GGACTTATCCATATTCAGTATATCACATGATGTGCATATGATATACTGATACTTTGTGTA
TGTTTATCTTCTTCTTACAGCTTACAAAAATGTTGACATTCCCACTTTGTGGTTGCGAGT
TATCTTCAGAATCCAAGACTCTAGCGTTTGCTGCTCCATTGGTTTCTATCTCGCATACCA
AAAGACAGATTGTGCTGGGACGGCGCGATTCCGTCAAAGTTTCTGCAGCAAAATCCGGAA
ATTTCTCGCTTGGTTCGATATTCAAAAGCTGTGACACTTGTGGAGCCAAAGGAGCAATTG
AATGCCCCGGTTGCAAGG*******TAGAAATAAGAAGAATGGGAATATTTTCGAGAGGT
GGAAATGTTTTGATTGCCAAGGATTCGGTATGAAGAGCTGTCCTAAATGTGGGAAGGGAG
GTTTGACGCCAGAACAGAGAGGGGAAAGATAGAAGAACTATACTACTTGTTTTTAATAAA
CATGTACCTATTTCCATTACTTTTTAGTTGTATAACTTGCAAGATATACTAAAAATTACT
GATAATTTATCTTCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT23TF U 48
AF RR2AR96TF U 1
AF RR2D417TF U 41
BS 1 214 RR2AR96TF
BS 215 215 RR2D417TF
BS 216 288 RR2AR96TF
BS 289 289 RR2D417TF
BS 290 308 RR2AR96TF
BS 309 309 RR2D417TF
BS 310 318 RR2AR96TF
BS 319 325 RR2D417TF
BS 326 547 RR2AR96TF
BS 548 557 RR2D417TF

RD RR2DT23TF 488 0 0
GGG
ACTTTGTGTATGTTCATCTTCTTCTTACAGCTTACAAAAATGTTGACATTCCCACTTTGT
GGTTGCGAGTTATCTTCAGAATCCAAGACTCTAGCGTTTGCTGCTCCATTGGTTTCTATC
TCGCATACCAAAAGACAGATTGTGCTGGGACGGCGCGATTCCGTCAAAGTTTCTGCAGCA
AAATCCGGAAATTTCTCGCTTGGTTCGATATTCAAAAGCTGTGACACTTGTGGAGCCAAA
GGAGCAATTGAATGCCCCGGTTGCAAGG*******TAGAAATAAGAAGAATGGGAATATT
TTCGAGAGGTGGAAATGTTTTGATTGCCAAGGATTCGGTATGAAGAGCTGTCCTAAATGT
GGGAAGGGAGGTTTGACGCCAGAACAGAGAGGGGAAAGATAGAATAACTATACTACTTGT
TTTTAATAAACATGTACCTATTTCCATTACTTTTTAGTTGTATAACTTGCAAGATATACT
AAAAA

QA 4 488 4 488
DS 

RD RR2AR96TF 547 0 0
GGACTTATCCATATTCAGTATATCACATGATGTGCATATGATATACTGATACTTTGTGTA
TGTTTATCTTCTTCTTACAGCTTACAAAAATGTTGACATTCCCACTTTGTGGTTGCGAGT
TATCTTCAGAATCCAAGACTCTAGCGTTTGCTGCTCCATTGGTTTCTATCTCGCATACCA
AAAGACAGATTGTGCTGGGACGGCGCGATTCCGT*AAAGTTTCTGCAGCAAAATCCGGAA
ATTTCTCGCTTGGTTCGATATTCAAAAGCTGTGACACTTGTGGAGCCATAGGAGCAATTG
AATGCCCCTGTTGCAAGGGAACAGGTAGAAATAAGAAGAATGGGAATATTTTCGAGAGGT
GGAAATGTTTTGATTGCCAAGGATTCGGTATGAAGAGCTGTCCTAAATGTGGGAAGGGAG
GTTTGACGCCAGAACAGAGAGGGGAAAGATAGAAGAACTATACTACTTGTTTTTAATAAA
CATGTACCTATTTCCATTACTTTTTAGTTGTATAACTTGCAAGATATACTAAAAATTACT
GATAATT

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2D417TF 517 0 0
GGATACTGAT
ACTTTGTGTATGTTTATCTTCTTCTTACAGCTTACAAAAATGTTGACATTCCCACTTTGT
GGTTGCGAGTTATCTTCAGAATCCAAGACTCTAGCGTTTGCTGCTCCATTGGTTTCTATC
TCGCATACCAAAAGACAGATTGTGCTGGGACGGCGCGATTCCGTCAAAGTTTCTGCAGCA
AAATCCGGAAATTTCTCGCTTGGTTCGATATTCAAAAGCTGTGACACTTGTGGAGCCAAA
GGAGCAATTGAATGCCCCGGTTGCAAGG*******TAGAGATAAGAAGAATGGGAATATT
TTCGAGAGGTGGAAATGTTTTGATTGCCAAGGATTCGGTATGAAGAGCTGTCCTAAATGT
GGGAAGGGAGGTTTGACGCCAGAACAGAGAGGGGAAAGATAGAAGAACTATACTACTTGT
TTTTAATAAACATGTACCTATTTCCATTACTTTTTAGTTGTATAACTTGCAAGATATACT
AAAAATTACTGATAATTTATCTTCTGG

QA 11 517 11 517
DS 



AS 1 3

CO CL3280Contig1 843 3 31 U
GGATTGTTCTGCAGGATCTAAGCAAAAAGCCCTCTCTATTTTCACTGTCTTCAATGCAGT
GACTATCTTTCTCTCTCTCTTTACCCACAACTCTTTGTTAGCTTCAAAACCTTCTCTTCT
CTCTTCCATTCTCTCTCTCCATAAGCTGCATCCAAATCCTGTGCATAGCTCTGGTGCAAA
ACCATGGCTGTTGTTGTTCTTGCTGTGATTTTGTTGGCTATGGTTGTTCACTCAAGTGGG
ACATGGTGTGTATGCAGAGAAGGATTAAGCGAAGCAATGCTGCAGAAGACACTAGACTAC
GCATGTGGCGCAGGAGCTGACTGTGGACCCATTCACCAGAACGGACCATGTTTCAACCCA
AACACCGTCAAGTCTCACTGCTCCTACGCCGTCAACAGCTTCTTCCAGAAGAAAGGTCAG
TCTCAGGGAACTTGTGACTTTGCCGGCACAGCCACCGTCTCAGCCTCTGATCCCAGCTAC
ACTTCTTGCGCTTTTCCTGCAAGTGCCAGTGGAAGTGGGACAATGACACCAGTGACGACA
ACACCATCGACAAGAGTCCCTACGACAACTAATACAAGACCCTACACGGTCACACCTCCA
ACAGGAGGAGGTTTGGGGATTCCAGCTGGTGGTTTCAACCCAGACTACACAGATCCATCC
TATTCCTTTGGACTCAAACTCCAAAACCCAACTTTATTTTTTATCTGGATTCTTCATGCT
CTTCTACTTGTTGATCTAGTAGTGAACAACAACTAAGTTGGACTGTTGCGGATCATGTGA
ATGTGGGTCTCTCACTCTCTCTATCACTAATGGAATCTTTTGAGAGATAGACTTGTTTTG
TTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2ED73TF U 1
AF RR2E986TF U 36
AF RR2E986JQ C 115
BS 1 65 RR2ED73TF
BS 66 67 RR2E986TF
BS 68 84 RR2ED73TF
BS 85 85 RR2E986TF
BS 86 139 RR2ED73TF
BS 140 140 RR2E986TF
BS 141 164 RR2ED73TF
BS 165 165 RR2E986TF
BS 166 179 RR2ED73TF
BS 180 180 RR2E986TF
BS 181 226 RR2ED73TF
BS 227 227 RR2E986TF
BS 228 266 RR2ED73TF
BS 267 267 RR2E986TF
BS 268 308 RR2ED73TF
BS 309 309 RR2E986TF
BS 310 347 RR2ED73TF
BS 348 348 RR2E986TF
BS 349 350 RR2ED73TF
BS 351 351 RR2E986TF
BS 352 485 RR2ED73TF
BS 486 486 RR2E986TF
BS 487 488 RR2ED73TF
BS 489 489 RR2E986TF
BS 490 497 RR2ED73TF
BS 498 498 RR2E986TF
BS 499 561 RR2ED73TF
BS 562 701 RR2E986TF
BS 702 702 RR2E986JQ
BS 703 820 RR2E986TF
BS 821 843 RR2E986JQ

RD RR2ED73TF 561 0 0
GGATTGTTCTGCAGGATCTAAGCAAAAAGCCCTCTCTATTTTCACTGTCTTCAATGCAGT
GACTA**TTTCTCTCTCTCTTTACTCACAACTCTTTGTTAGCTTCAAAACCTTCTCTTCT
CTCTTCCATTCTCTCTCTCTATAAGCTGCATCCAAATCCTGTGCCTAGCTCTGGTGCAAC
ACCATGGCTGTTGTTGTTCTTGCTGTGATTTTGTTGGCTATGGTTGGTCACTCAAGTGGG
ACATGGTGTGTATGCAGAGAAGGATTGAGCGAAGCAATGCTGCAGAAGACACTAGACTAC
GCATGTGGGGCAGGAGCTGACTGTGGACCCATTCACCAGAACGGACCTTGCTTCAACCCA
AACACCGTCAAGTCTCACTGCTCCTACGCCGTCAACAGCTTCTTCCAGAAGAAAGGTCAG
TCTCAGGGAACTTGTGACTTTGCCGGCACAGCCACCGTCTCAGCCTCTGATCCCAGCTAC
ACTTCCTGTGCTTTTCCCGCAAGTGCCAGTGGAAGTGGGACAATGACACCAGTGACGACA
ACACCATCGACAAGAGTCCCT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2E986TF 785 0 0
GG
ATTTTCACTGTCTTCAATGCAGTGACTCTCTTTTTCTCTCTCTTTACCCACAACTCTTT*
*TAGCTTCAAAACCTTCTCTTCTCTCTTCCATTCTCTCTCTCCATAAGCTGCATCCAAAT
CCTGTGCATAGCTCTGGTGCAAAACCATGGCTGTTGTTGTTCTTGCTGTGATTTTGTTGG
CTATGGTTGTTCACTCAAGTGGGACATGGTGTGTATGCAGAGAAGGATTAAGCGAAGCAA
TGCTGCAGAAGACACTAGACTACGCATGTGGCGCAGGAGCTGACTGTGGACCCATTCACC
AGAACGGACCATGTTTCAACCCAAACACCGTCAAGTCTCACTGCTCCTACGCCGTCAACA
GCTTCTTCCAGAAGAAAGGTCAGTCTCAGGGAACTTGTGACTTTGCCGGCACAGCCACCG
TCTCAGCCTCTGATCCCAGCTACACTTCTTGCGCTTTTCCTGCAAGTGCCAGTGGAAGTG
GGACAATGACACCAGTGACGACAACACCATCGACAAGAGTCCCTACGACAACTAATACAA
GACCCTACACGGTCACACCTCCAACAGGAGGAGGTTTGGGGATTCCAGCTGGTGGTTTCA
ACCCAGACTACACAGATCCATCCTATTCCTTTGGACTCAAACTCCAAAACCCAACTTTAT
TTTT*ATCTGGATTCTTCATGCTCTTCTACTTGTTGATCTAGTAGTGAACAACAACTAAG
TTGGACTGTTGCGGATCATGTGAATGTGGGTCTCTCACTCTCTCTATCACTAATGGAATC
TTT

QA 3 785 3 785
DS 

RD RR2E986JQ 729 0 0
TCTTCTCTCTTCCATTCTCTCTCTCCATAAGCTGCATCCAAATCCTGTGCATAGCTCTGG
TGCAAAACCATGGCTGTTGTTGTTCTTGCTGTGATTTTGTTGGCTATGGTTGTTCACTCA
AGTGGGACATGGTGTGTATGCAGAGAAGGATTAAGCGAAGCAATGCTGCAGAAGACACTA
GACTACGCATGTGGCGCAGGAGCTGACTGTGGACCCATTCACCAGAACGGACCATGTTTC
AACCCAAACACCGTCAAGTCTCACTGCTCCTACGCCGTCAACAGCTTCTTCCAGAAGAAA
GGTCAGTCTCAGGGAACTTGTGACTTTGCCGGCACAGCCACCGTCTCAGCCTCTGATCCC
AGCTACACTTCTTGCGCTTTTCCTGCAAGTGCCAGTGGAAGTGGGACAATGACACCAGTG
ACGACAACACCATCGACAAGAGTCCCTACGACAACTAATACAAGACCCTACACGGTCACA
CCTCCAACAGGAGGAGGTTTGGGGATTCCAGCTGGTGGTTTCAACCCAGACTACACAGAT
CCATCCTATTCCTTTGGACTCAAACTCCAAAACCCAACTTTATTTTTTATCTGGATTCTT
CATGCTCTTCTACTTGTTGATCTAGTAGTGAACAACAACTAAGTTGGACTGTTGCGGATC
ATGTGAATGTGGGTCTCTCACTCTCTCTATCACTAATGGAATCTTTTGAGAGATAGACTT
GTTTTGTTC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 3

CO CL3281Contig1 1230 3 5 U
GGACACTGAAATGGAGTTGTGTAATGTTTCTTCTGAGAGGTCCACAGGAGATTTAAACTC
AGCGAGGCTGAAACTCGAATTGGCGCAGGAAAAGCTTTCAGTCTCCGCCAAAACCATTGG
AGTGTTGTTCACTTCGCTTGAAGAGATAATCAAGCTGTCAAAGCAAAGCAGAGAGGCTGA
AAACAAAGTTAAGGAGCATCAGAAGGAGTTAGGATTAATTGAAGCTGTCTCTGATCGAAC
TAATGCAAGAAAAGAAGCTGCAGAGAGAAAACTGGCTGCTCTCAGATACTCGCTATCAAA
CTTCGTATCATCGTCAGATTACTTTCAACAGCGAGAAGAACGGGCAAGGGCGCGTGTGAA
GGCATCTTCAGATCATCTAAACCAGAAAAGTGAAGAGCTCAGCGTTCTCCAATCCAATAA
AAGAGAAATCGACGCGGCAATGGGTAAGATCAAACAGTCCGAGGCAGAGCTGAAGAGTAA
CATTGTAATGCTGAAGATAAAAGTGGATGAAGAGAACAGGAGACACGAGGAAGAGAAGGT
ACTCTGTGCGATTGATAACATTGAAAAGATCAACACTCCTCAGAGAAACACACTACTTTC
AGGGAAAGCCACGGATCTTCTGAGATCCGAAGAAGAGAAAACAAAGCTCCATTCAGAGAT
GCAGCTATCGCGGGAGAAGCTGGCTTCGGTAAGAAAAGAAATCGAAGACATGAACAGAAA
GTCCTCGAAGCTGGAGAAAGAGATCATAACCGTAGAGAAAGAGATAGAGAAGGGATCGAA
GACGAGATCCGAATCAGAGAGGGAACTGGAACATAGGATCCAGGAGAAGCAGTGCCTTGA
AGAGATGGAAGAGGTAGGGATGTGCGAAGTGCAAAACATGATAATGGAGATTCACGAGCT
TGTCTTTGAGTCGGATCTGAGAAAAGAAGAGTTGATGATTGTAAGAGAAGAGCTAGATTC
AGAGGAGCATAGAGCGGAAGAGGTCCACAAGGCTACAATGGAGACAGTCGAAGATGCGTT
GAAGAAACTAGCGAAGGAGAAGAACGGAGGAGAATGTTTGTTATCAGGCAAGGTTGAAGA
AGAAGTAGGCAGTGTGTTGTGTTTGGTTCACGATGCCGCGAAGTTGCTTGAAGATGATTC
TCATTGATTAGGAGGTGTGGCAATTGACTAGCAAGTACGGGATTCTTAGTGTTGTGTATG
AAATTCAAATACATTCCTTTTCTTTATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT24TF U 1
AF RR2GG87TF U 166
AF RR2GG87JQB C 617
BS 1 380 RR2GT24TF
BS 381 381 RR2GG87TF
BS 382 581 RR2GT24TF
BS 582 814 RR2GG87TF
BS 815 1230 RR2GG87JQB

RD RR2GT24TF 581 0 0
GGACACTGAAATGGAGTTGTGTAATGTTTCTTCTGAGAGGTCCACAGGAGATTTAAACTC
AGCGAGGCTGAAACTCGAATTGGCGCAGGAAAAGCTTTCAGTCTCCGCCAAAACCATTGG
AGTGTTGTTCACTTCGCTTGAAGAGATAATCAAGCTGTCAAAGCAAAGCAGAGAGGCTGA
AAACAAAGTTAAGGAGCATCAGAAGGAGTTAGGATTAATTGAAGCTGTCTCTGATCGAAC
TAATGCAAGAAAAGAAGCTGCAGAGAGAAAACTGGCTGCTCTCAGATACTCGCTATCAAA
CTTCGTATCATCGTCAGATTACTTTCAACAGCGAGAAGAACGGGCAAGGGCGCGTGTGAA
GGCATCTTCAGATCATCTAAGCCAGAAAAGTGAAGAGCTCAGCGTTCTCCAATCCAATAA
AAGAGAAATCGACGCGGCAATGGGTAAGATCAAACAGTCCGAGGCAGAGCTGAAGAGTAA
CATTGTAATGCTGAAGATAAAAGTGGATGAAGAGAACAGGAGACACGAGGAAGAGAAGGT
ACTCTGTGCGATTGATAACATTGAAAAGATCAACACTCCTC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2GG87TF 649 0 0
G
AGCAGAGAGGCTGAAAACAAAGTTAAGGAGCATCAGAAGGAGTTAGGATTAATTGAAGCT
GTCTCTGATCGAACTAATGCAAGAAAAGAAGCTGCAGAGAGAAAACTGGCTGCTCTCAGA
TGCTCGCTATCAAACTTCGTATCATCGTCAGATTACTTTCAACAGCGAGAAGAACGGGCA
AGGGCGCGTGTGAAGGCATCTTCAGATCATCTAAACCAGAAAAGTGAAGAGCTCAGCGTT
CTCCAATCCAATAAAAGAGAAATCGACGCGGCAATGGGTAAGATCAAACAGTCCGAGGCA
GAGCTGAAGAGTAACATTGTAATGCTGAAGATAAAAGTGGATGAAGAGAACAGGAGACAC
GAGGAAGAGAAGGTACTCTGTGCGATTGATAACATTGAAAAGATCAACACTCCTCAGAGA
AACACACTACTTTCAGGGAAAGCCACGGATCTTCTGAGATCCGAAGAAGAGAAAACAAAG
CTCCATTCAGAGATGCAGCTATCGCGGGAGAAGCTGGCTTCGGTAAGAAAAGAAATCGAA
GACATGAACAGAAAGTCCTCGAAGCTGGAGAAAGAGATCATAACCGTAGAGAAAGAGATA
GAGAAGGGATCGAAGACGAGATCCGAATCAGAGAGGGAACTGGAACAT

QA 2 649 2 649
DS 

RD RR2GG87JQB 614 0 0
CTTCTGAGATCCGAAGAAGAGAAAACAAAGCTCCATTCAGAGATGCAGCTATCGCGGGAG
AAGCTGGCTTCGGTAAGAAAAGAAATCGAAGACATGAACAGAAAGTCCTCGAAGCTGGAG
AAAGAGATCATAACCGTAGAGAAAGAGATAGAGAAGGGATCGAAGACGAGATCCGAATCA
GAGAGGGAACTGGAACATAGGATCCAGGAGAAGCAGTGCCTTGAAGAGATGGAAGAGGTA
GGGATGTGCGAAGTGCAAAACATGATAATGGAGATTCACGAGCTTGTCTTTGAGTCGGAT
CTGAGAAAAGAAGAGTTGATGATTGTAAGAGAAGAGCTAGATTCAGAGGAGCATAGAGCG
GAAGAGGTCCACAAGGCTACAATGGAGACAGTCGAAGATGCGTTGAAGAAACTAGCGAAG
GAGAAGAACGGAGGAGAATGTTTGTTATCAGGCAAGGTTGAAGAAGAAGTAGGCAGTGTG
TTGTGTTTGGTTCACGATGCCGCGAAGTTGCTTGAAGATGATTCTCATTGATTAGGAGGT
GTGGCAATTGACTAGCAAGTACGGGATTCTTAGTGTTGTGTATGAAATTCAAATACATTC
CTTTTCTTTATAAA

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 3

CO CL3282Contig1 788 3 2 U
AAAAAAAACAGAATCTGCAGTATATTCAGTCTTAGTAATGCAATTTGGAAAGTGAACAGA
GATCTTGTATTAAAACCAACACAAAAAAAAAAAAAATAAGGCTTGTGGAATTTGATTACA
AACATTAAAGTTTACAATGATACAAGTTGACGTCTATGTATGCATATTTGCTTTTCTCTC
CTCAGGTCCGGATTGCTCCGTCCTTGCAGAGGTATCACCGTAAAGTTTTAAACAGAGTAC
AACAAGGAGGCCATCTTCTGCTTCTGCCGTCTACAGTGAAGCTTACCTCGAAGGAGAATA
ATAATAAATAAAAAAAGTTGGAATAATAACAGACGTACGTGGGAGAAATGACCTTTAGCT
TTTAATCAAGTCGCAGCAGCTTCTGTGGTGGATGTTGAATGTGTTGGTTCATCTTCTTCT
TTAGTTTGTTCCTGAACAGCCGTCTCCTTCTGCTGTTCAGCTAGACGGCTTATACGTTCA
AGCAACTGAGCTGCTTTTCTTTTCCCTCTATCTGTTCCGTTCCCTGCTAAATCTATCAAA
GGACCCATAAGTCCGAGTTTCTGAGCTTCCACCAGATGTTGTGGGTTGTCACCAGAACTC
AGGTGAACTAGAACCGCAGCTGCATTCTCTCTGTTCCTAGGCGAACCAGTCCTGATAAAC
TCCACCAGGCTCGGGACTGCGTCCAGTGACCCTATGATCGCTTTCCCTTCGGGATGGCTC
GAGAGAATGGCCAGAATCGCCAGCGCCTCGTCCACCATTCCACTCCCTGGCTCTGTTAAG
AGTCTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV61JQ U 47
AF RR2DS50JQ U 1
AF RR2DS50TF C 59
BS 1 540 RR2DS50JQ
BS 541 788 RR2DS50TF

RD RR2DV61JQ 305 0 0
GGAAAGTGAACAGAGATCTTGTATTAAAACCAACACAAAAAAAAAAAA**TAAGGCTTGT
GGAATTTGATTACAAACATTAAAGTTTACAATGATACAAGTTGACGTCTATGTATGCATA
TTTGCTTTTCTCTCCTCAGGTCCGGATTGCTCCGTCCTTGCAGAGGTATCACCGTAAAGT
TTTAAACAGAGTACAACAAGGAGGCCATCTTCTGCTTCTGCCGTCTACGGTGAAGCTTAC
CTCGAAGGAGAATAATAATAAATAAAAAA*GTTGGAATAATAACAGACGTACGTGGGAGA
AATGA

QA 1 305 1 305
DS 

RD RR2DS50JQ 540 0 0
AAAAAAAACAGAATCTGCAGTATATTCAGTCTTAGTAATGCAATTTGGAAAGTGAACAGA
GATCTTGTATTAAAACCAACACAAAAAAAAAAAAAATAAGGCTTGTGGAATTTGATTACA
AACATTAAAGTTTACAATGATACAAGTTGACGTCTATGTATGCATATTTGCTTTTCTCTC
CTCAGGTCCGGATTGCTCCGTCCTTGCAGAGGTATCACCGTAAAGTTTTAAACAGAGTAC
AACAAGGAGGCCATCTTCTGCTTCTGCCGTCTACAGTGAAGCTTACCTCGAAGGAGAATA
ATAATAAATAAAAAAAGTTGGAATAATAACAGACGTACGTGGGAGAAATGACCTTTAGCT
TTTAATCAAGTCGCAGCAGCTTCTGTGGTGGATGTTGAATGTGTTGGTTCATCTTCTTCT
TTAGTTTGTTCCTGAACAGCCGTCTCCTTCTGCTGTTCAGCTAGACGGCTTATACGTTCA
AGCAACTGAGCTGCTTTTCTTTTCCCTCTATCTGTTCCGTTCCCTGCTAAATCTATCAAA

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2DS50TF 730 0 0
AGAGATC
TGTATTAAAACCAACACAAAAAAAAAAAAAATAAGGCT*GTGGAATTTGATTACAAACAT
TAAAGTTTACAATGATACAAGTTGACGTCTATGTATGCATATTTGCTTTTCTCTCCTCAG
GTCCGGATTGCTCCGTC*TTGCAGAGGTATCACCGTAAAGTTTTAAACAGAGTACAACAA
GGAGGCCATCTTCTGCTTCTGCCGTCTACAGTGAAGCTTACCTCGAAGGAGAATAATAAT
AAATAAAAAAAGTTGGAATAATAACAGACGTACGTGGGAGAAATGACCTTTAGCTTTTAA
TCAAGTCGCAGCAGCTTCTGTGGTGGATGTTGAATGTGTTGGTTCATCTTCTTCTTTAGT
TTGTTCCTGAACAGCCGTCTCCTTCTGCTGTTCAGCTAGACGGCTTATACGTTCAAGCAA
CTGAGCTGCTTTTCTTTTCCCTCTATCTGTTCCGTTCCCTGCTAAATCTATCAAAGGACC
CATAAGTCCGAGTTTCTGAGCTTCCACCAGATGTTGTGGGTTGTCACCAGAACTCAGGTG
AACTAGAACCGCAGCTGCATTCTCTCTGTTCCTAGGCGAACCAGTCCTGATAAACTCCAC
CAGGCTCGGGACTGCGTCCAGTGACCCTATGATCGCTTTCCCTTCGGGATGGCTCGAGAG
AATGGCCAGAATCGCCAGCGCCTCGTCCACCATTCCACTCCCTGGCTCTGTTAAGAGTCT
AGC

QA 8 730 8 730
DS 



AS 1 3

CO CL3283Contig1 945 3 12 U
GGGCAGTGAAACGAAGACTTTGAAGCAACACAGAAGCGAAACCATGGCGGATTTGGAAGA
TGTTCAAACTGTGGATCTCATGTCCAAGCTCCTCCGCCGCCTCAAATGTGCACAAAAGCC
TGACAAACGCCTCATCTTCATTGGACCTCCAGGGTCAGGGAAAGGTACACAATCTCCAAT
AGTGAAGGATGAGTATTGCTTGTGTCACTTATCCACTGGTGACATGTTAAGAGCTGCTGT
TGCTTCTAAGACCCCTCTTGGTCTCAAGGCCAAAGAAGCTATGGACAAGGTAGCGCTTGT
CACTGATGAGTTGGTTGTTGGTATAATTGACGAAGCCATGAACAAGCCAAAATGCCAGAA
AGGTTTCATCCTTGATGGGTTTCCCAGGACTGTTGCTCGGGCAGAGAAGCTAGATGAGAT
GCTTAAGAAGCGTGGAACTGGAATCGACAAAGTTCTCAACTTTGCCATTGATGACTCTGT
CCTAGAGGAAAGAATAACCGGGAGATGGATCCACCCATCGAGTGGCAGAAGTTACCACAC
CAAGTTCGCCCCTCCCAAAACCCCTGGAGTTGATGATATCACCGGAGAGCCTCTGATCCA
ACGCAAGGATGATAATGCTGAGGTTTTAAGGTCGAGGCTCGCTGCTTTCCACAGTCAAAC
TGAACCGGTGATCGACTACTACGCAAAGAAGTCTGTTCTTACAAACATCCACGCCGAGAA
GCCTCCCAAAGAAGTGACATCAGAGGTTCAAAAAGCATTGTCCTGATGATGAAAGATTGC
TCATGCAGTCATCTCCTCTGGTTAGAACCCATTCTTTTTCCTTCCTACAAGAGAGACAAT
CATCTATATATCTACTCATCTGCGGAATGACAGTTTTTGTTTTTCTAGTCTTTTTCTTTA
AAACATCGGCAAAAATAATTGATACATTGGATCGAAACGATCTCG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F712TF U 3
AF RR2BF06TF U 1
AF RR2BF06JQ C 105
BS 1 85 RR2BF06TF
BS 86 86 RR2F712TF
BS 87 745 RR2BF06TF
BS 746 746 RR2BF06JQ
BS 747 812 RR2BF06TF
BS 813 813 RR2BF06JQ
BS 814 829 RR2BF06TF
BS 830 830 RR2BF06JQ
BS 831 838 RR2BF06TF
BS 839 839 RR2BF06JQ
BS 840 870 RR2BF06TF
BS 871 945 RR2BF06JQ

RD RR2F712TF 720 0 0
GG
AGTGAAACGAAGACTTTGAAGCAACACAGAAGCGAAACCATGGCGGATTTGGAAGATGTT
CAAACTGTGGATCTCATGTCCAAGCTCCTCCGCCGCCTCAAATGTGCACAAAAGCCTGAC
AAACGCCTCATCTTCATTGGACCTCCAGGGTCAGGGAAAGGTACACAATCTCCAATAGTG
AAGGATGAGTATTGCTTGTGTCACTTATCCACTGGTGACATGTTAAGAGCTGCTGTTGCT
TCTAAGACCCCTCTTGGTCTCAAGGCCAAAGAAGCTATGGACAAGGGAGCGCTTGTCACT
GATGAGTTGGTTGTTGGTATAATTGACGAAGCCATGAACAAGCCAAAATGCCAGAAAGGT
TTCATCCTTGATGGGTTTCCCAGGACTGTTGCTCAGGCAGAGAAGCTAGATGAGATGCTT
AAGAAGCGTGGAACTGGAATCGACAAAGTTCTCAACTTTGCCATTGATGACTCTGTCCTA
GAGGAAAGAATAACCGGGAGATGGATCCACCCATCGAGTGGCAGAAGTTACCACACCAAG
TTCGCCCCCCCCAAAACCCCTGGAGTTGATGATATCACCGGAGAGCCTCTGATCCAACGC
AAGGATGATAATGCTGAGGTTTTAAAGTCGAGGCTCGCTGCTTTCCACAGTCAAACTGAA
CCGGTGATCGACTACTACGCAAAGAAGTCTGTTCTTACAAACATCCACGCCGAGAAGC

QA 3 720 3 720
DS 

RD RR2BF06TF 870 0 0
GGGCAGTGAAACGAAGACTTTGAAGCAACACAGAAGCGAAACCATGGCGGATTTGGAAGA
TGTTCAAACTGTGGATCTCATGTCCGAGCTCCTCCGCCGCCTCAAATGTGCACAAAAGCC
TGACAAACGCCTCATCTTCATTGGACCTCCAGGGTCAGGGAAAGGTACACAATCTCCAAT
AGTGAAGGATGAGTATTGCTTGTGTCACTTATCCACTGGTGACATGTTAAGAGCTGCTGT
TGCTTCTAAGACCCCTCTTGGTCTCAAGGCCAAAGAAGCTATGGACAAGGTAGCGCTTGT
CACTGATGAGTTGGTTGTTGGTATAATTGACGAAGCCATGAACAAGCCAAAATGCCAGAA
AGGTTTCATCCTTGATGGGTTTCCCAGGACTGTTGCTCGGGCAGAGAAGCTAGATGAGAT
GCTTAAGAAGCGTGGAACTGGAATCGACAAAGTTCTCAACTTTGCCATTGATGACTCTGT
CCTAGAGGAAAGAATAACCGGGAGATGGATCCACCCATCGAGTGGCAGAAGTTACCACAC
CAAGTTCGCCCCTCCCAAAACCCCTGGAGTTGATGATATCACCGGAGAGCCTCTGATCCA
ACGCAAGGATGATAATGCTGAGGTTTTAAGGTCGAGGCTCGCTGCTTTCCACAGTCAAAC
TGAACCGGTGATCGACTACTACGCAAAGAAGTCTGTTCTTACAAACATCCACGCCGAGAA
GCCTCCCAAAGAAGTGACATCAGAG*TTCAAAAAGCATTGTCCTGATGATGAAAGATTGC
TCATGCAGTCATCTCCTCTGGTTAGAACCCAT*CTTTTTCCTTCCTACA*GAGAGACA*T
CATCTATATATCTACTCATCTGCGGAATGA

QA 1 870 1 870
DS 

RD RR2BF06JQ 841 0 0
AATGTGCACAAAAGCCTGACAAACGCCTCATCTTCATTGGACCTCCAGGGTCAGGGAAAG
GTACACAATCTCCAATAGTGAAGGATGAGTATTGCTTGTGTCACTTATCCACTGGTGACA
TGTTAAGAGCTGCTGTTGCTTCTAAGACCCCTCTTGGTCTCAAGGCCAAAGAAGCTATGG
ACAAGGTAGCGCTTGTCACTGATGAGTTGGTTGTTGGTATAATTGACGAAGCCATGAACA
AGCCAAAATGCCAGAAAGGTTTCATCCTTGATGGGTTTCCCAGGACTGTTGCTCGGGCAG
AGAAGCTAGATGAGATGCTTAAGAAGCGTGGAACTGGAATCGACAAAGTTCTCAACTTTG
CCATTGATGACTCTGTCCTAGAGGAAAGAATAACCGGGAGATGGATCCACCCATCGAGTG
GCAGAAGTTACCACACCAAGTTCGCCCCTCCCAAAACCCCTGGAGTTGATGATATCACCG
GAGAGCCTCTGATCCAACGCAAGGATGATAATGCTGAGGTTTTAAGGTCGAGGCTCGCTG
CTTTCCACAGTCAAACTGAACCGGTGATCGACTACTACGCAAAGAAGTCTGTTCTTACAA
ACATCCACGCCGAGAAGCCTCCCAAAGAAGTGACATCAGAGGTTCAAAAAGCATTGTCCT
GATGATGAAAGATTGCTCATGCAGTCATCTCCTCTGGTTAGAACCCATTCTTTTTCCTTC
CTACAAGAGAGACAATCATCTATATATCTACTCATCTGCGGAATGACAGTTTTTGTTTTT
CTAGTCTTTTTCTTTAAAACATCGGCAAAAATAATTGATACATTGGATCGAAACGATCTC
G

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 3

CO CL3284Contig1 565 3 1 U
GTCACCAAGATCTCTCGCTACAACAAAGTGGTGAACATCCCAAACAGCATGACCATACTA
GACGAGCTCTTACCAATCTCAATCGAGATGGCGAAGAGGAACCTGAGGGGGATATGGAAC
TTCACCAATCCTGGAGTGGTGAGCCACAACGAGATACTGGAGATGTACAAGAGCTACATC
GAGCCGGGTTTCAAATGGTCCAACTTCACTTTGGAAGAACAGGCTAAGGTCATTGTCGCG
GCACGGAGCAACAACGAGATGGATGGTGCTAAGCTCAGCAAGGAGTTTCCAGAGATGCTT
TCCATCAAAGACTCGTTGATCAAATACGTCTTCGAACCCAACAAGAGAACGTAAAAGCCT
GGTTAGTTAAACACACACACGCACACTTCCTCTTTCTCTGTTCATTGTTATATTATTATC
CTGCAGGTAGTTTCACTGTAATGATTCTACTATAATTTGATTTTATTTATCATGTAATTC
TTTACTCTCTTTTTGGCACTCTACGACCGAACACATCTTTGTTTACATTAATATTGTTAC
AGATTTATTTGAGTTTTATTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FW39TF U 1
AF RR2GN86TF U 239
AF RR2FW39JQ C 96
BS 1 565 RR2FW39TF

RD RR2FW39TF 565 0 0
GTCACCAAGATCTCTCGCTACAACAAAGTGGTGAACATCCCAAACAGCATGACCATACTA
GACGAGCTCTTACCAATCTCAATCGAGATGGCGAAGAGGAACCTGAGGGGGATATGGAAC
TTCACCAATCCTGGAGTGGTGAGCCACAACGAGATACTGGAGATGTACAAGAGCTACATC
GAGCCGGGTTTCAAATGGTCCAACTTCACTTTGGAAGAACAGGCTAAGGTCATTGTCGCG
GCACGGAGCAACAACGAGATGGATGGTGCTAAGCTCAGCAAGGAGTTTCCAGAGATGCTT
TCCATCAAAGACTCGTTGATCAAATACGTCTTCGAACCCAACAAGAGAACGTAAAAGCCT
GGTTAGTTAAACACACACACGCACACTTCCTCTTTCTCTGTTCATTGTTATATTATTATC
CTGCAGGTAGTTTCACTGTAATGATTCTACTATAATTTGATTTTATTTATCATGTAATTC
TTTACTCTCTTTTTGGCACTCTACGACCGAACACATCTTTGTTTACATTAATATTGTTAC
AGATTTATTTGAGTTTTATTTTACC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2GN86TF 309 0 0
G
GGCACGGAGCAACAACGAGATGGATGGTGCTAAGCTCAGCAAGGAGTTTCCGGAGTTGCT
TTCCATCAAAGACTCGCTGATCAAATACGTCTTCGAACCCAACAAGAGAACGTAAAAGCC
TGGTTAGTTAA*CACACACACGCACACTTCCTCTTTCTCTGTTCATTGTTATATTATTAT
CCTGCAGGTAGTTTCACTGTAATGATTCTACTATAATTTGATTTGATTTATCATGTAATT
CTTTACTCTCTTTTTGGCACTCTACGACCGAACACATCTTTGTTTACATTAATATTATTA
CAGATTT
T

QA 2 308 2 308
DS 

RD RR2FW39JQ 470 0 0
GAGGAACCTGAGGGGGATATGGAACTTCACCAATCCTGGAGTGGTGAGCCACAACGAGAT
ACTGGAGATGTACAAGAGCTACATCGAGCCGGGTTTCAAATGGTCCAACTTCACTTTGGA
AGAACAGGCTAAGGTCATTGTCGCGGCACGGAGCAACAACGAGATGGATGGTGCTAAGCT
CAGCAAGGAGTTTCCAGAGATGCTTTCCATCAAAGACTCGTTGATCAAATACGTTTTCGA
ACCCAACAAGAGAACGTAAAAGCCTGGTTAGTTAAACACACACACGCACACTTCCTCTTT
CTCTGTTCATTGTTATATTATTATCCTGCAGGTAGTTTCACTGTAATGATTCTACTATAA
TTTGATTTTATTTATCATGTAATTCTTTACTCTCTTTTTGGCACTCTACGACCGAACACA
TCTTTGTTTACATTAATATTGTTACAGATTTATTTGAGTTTTATTTTACC

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 3

CO CL3285Contig1 484 3 3 U
GGCAGGCTTCCAACTCTCATAAATAAGAGAGACAAAGAGGTACTACATACTAATGGCTAA
GATGCCAAGTTCATCGAAGCTCCTTGCGGTGATGATTTTCTCAATCATGGCGCTTTTCAT
AATCTCCCAGGCTCGAACCCTTTCTCCTGGTAGGAAATTAACTCAGTACCCGCGGGCTCC
GTCTTACGGACAGTACTCTCCTGTTCCTCCTGGATGTTTCGACCCACCTTATTGTCGTCC
ATGAGAGTTTCAATTTGGTCACATGAACAATTATCAAATAAAATAAGGTGATGTATCATG
TATATGGGTTATGGGTATCTTCATATATTATCATATGATTTGCTGGAGAATAAAACGCTT
GTGAAATCCATGTTATAAATACAGTATGTTGCAGTTTGTAATGAATAAGTGA****TATT
TATGTTTATTTTGTTGGTCATTCATGATGATGTCTCTGTTTAATAAACAAAAGTTACCAT
AATC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2BE04JQ C 1
AF RR2BE04TF U 1
AF RR2F189TF U 2
BS 1 3 RR2BE04JQ
BS 4 480 RR2BE04TF
BS 481 484 RR2F189TF

RD RR2BE04JQ 480 0 0
GGCAGGCTTCCAACTTTCATAAATAAGAGAGACAAAGAGGTACTACATACTAATGGCTAA
GATGCCAAGTTCATCGAAGCTCCTTGCGGTGATGATTTTCTCAATCATGGCGCTTTTCAT
AATCTCCCAGGCTCGAACCCTTTTTCCTGGTAGGAAATTAACTCAGTACCCGCGGGCTCC
GTTTTACGGACAGTACTCTCCTGTTCCTCCTGGATGTTTCGACCCACCTTATTGTCGTCC
ATGAGAGTTTCAATTTGGTCACATGAACAATTATCAAATAAAATAAGGTGATGTATCATG
TATATGGGTTATGGGTATCTTCATATATTATCATATGATTTGCTGGAGAATAAAACGCTT
GTGAAATCCATGTTATAAATACAGTATGTTGCAGTTTGTAATGAATAAGTGA****TATT
TATGTTTATTTTGTTGGTCATTCATGATGATGTCTCTGTTTAATAAACAAAAGTTACCAT

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2BE04TF 480 0 0
GGC
AGGCTTCCAACTCTCATAAATAAGAGAGACAAAGAGGTACTACATACTAATGGCTAAGAT
GCCAAGTTCATCGAAGCTCCTTGCGGTGATGATTTTCTCAATCATGGCGCTTTTCATAAT
CTCCCAGGCTCGAACCCTTTCTCCTGGTAGGAAATTAACTCAGTACCCGCGGGCTCCGTC
TTACGGACAGTACTCTCCTGTTCCTCCTGGATGTTTCGACCCACCTTATTGTCGTCCATG
AGAGTTTCAATTTGGTCACATGAACAATTATCAAATAAAATAAGGTGATGTATCATGTAT
ATGGGTTATGGGTATCTTCATATATTATCATATGATTTGCTGGAGAATAAAACGCTTGTG
AAATCCATGTTATAAATACAGTATGTTGCAGTTTGTAATGAATAAGTGA****TATTTAT
GTTTATTTTGTTGGTCATTCATGATGATGTCTCTGTTTAATAAACAAAAGTTACCAT

QA 4 480 4 480
DS 

RD RR2F189TF 483 0 0
GG
AGGCTTCCAACTCTCATAAATAAGAGAGACAAAGAGGTACTACATACTAATGGCTAAGAT
GCCAAGTTCATCGAAGCTCCTTGCGGTGATGATTTTCTCAATCATGGCGCTTTTCATAAT
CTCCCAGGCTCGAACCCTTTCTCCTGGTAGGAAATTAACTCAGTACCCG***GCTCCGTC
TTACGGACAGTACTCTCCTGTTCCTCCTGGATGTTTCGACCCACCTTATTGTCGTCCATG
AGAGTTTCAATTTGGTCACATGAACAATTATCAAATAAAATAAGGTGATGTATTATGTAT
ATGGGTTATGGGTATCTTCATATATTATCATATGATTTGCTGGAGAATAAAACGCTTGTG
AAATCCATGTTATAAATACAGTATGTTGCAGTTTGTAATGAATAAGTGATACTTATTTAT
GTTTATTTTGTTGGTCATTCATGATGATGTCTCTGTTTAATGAACGAAAGTTACCATAAT
C

QA 3 483 3 483
DS 



AS 1 2

CO CL3286Contig1 1085 2 8 U
GGAAGAATCGAAACCGAAACAGAGGAAACATCACCACACCACCAATGGGATGTTTTACAG
GTTGTTTCGGTCTCTCTTCCAACACAAAACGCAGAAACTCCACCAGGAAGATCCTTCCTC
GACATCAAAGAATCTGTAGCTATGAGCCTCTACTCTCTTCAGATCCGTCAGATTCCATCG
CCACCAATGTAGATAGCCCTGAAAAGATCTCGAGTTCGAACCTCAGGTGTGAGGTGGAGG
AGGCTCAGGAGGAGAAAGGAACAAAGAAGACGAGGAAAAGAGTCAGGTTTAACTTGAATG
TACAAACCTTTGAACCAACAACTCTACCATCAAGATATGAGAATTACTGCAGCGATGATG
ATGATGAAGAGGCAAAAGGAGAAATAAAGAGCAGTAGATCTGTGTATCCTGCAAACTACA
GATACCATAATTGTGTGGATGGTTTAGAAGAAGAAGATGAATTGGGATATGGAGAGAGTG
ATTTGGAGGATGAAGACTATTATTACACAGATGATGAAAACGACTATGAAGACGATGCTG
ATGATGAAGATGAGGAGCAGGATGTGACTCCTCTGTTGAATCCAGTTGAGAACATTGCGC
AGTGGAAAGCGGTTAAAGCAAAGCCAGTGAGAAGAGTTAAAGGGCTAATGAAAGAGAACG
TTGAAGCAGATAGTGGTAGTGATGATCAAGCAAGACCATTACTAAAGAAGGAGATCATCG
TCAATACTAGCCTTGCCGACTGGTTGGCCTCACCGAAGACTTTTCATGGGAATGGTTCAG
CTAAGAGATCCCCAATTGTTGATATCACCAACATGGAGAACAGGTCAAAGGTTTCATAGT
GATTGATTCACCATTGTGAAGGAGGAGAAGAAAGAAACCGTGTGTTTGTTTTGTTGTTTT
TCTTTGTTTTGTGTGTAAGGGATATGGAGGTTTTGTATCAATCTTTCAATGTTTTTGCTA
TCTCTGCTTATGATTTGGTGAGGAGGAAAGCTACTGGAAGCAGAGGAATAAATGGCTGCA
CATTGTTTACAATTGAATCAGCTTGTGGTGTTGTTGCAGTAAAAAGACATACATAGTTTA
CTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2FR37TF U 1
AF RR2FR37JQ C 252
BS 1 710 RR2FR37TF
BS 711 711 RR2FR37JQ
BS 712 723 RR2FR37TF
BS 724 724 RR2FR37JQ
BS 725 753 RR2FR37TF
BS 754 754 RR2FR37JQ
BS 755 773 RR2FR37TF
BS 774 1085 RR2FR37JQ

RD RR2FR37TF 773 0 0
GGAAGAATCGAAACCGAAACAGAGGAAACATCACCACACCACCAATGGGATGTTTTACAG
GTTGTTTCGGTCTCTCTTCCAACACAAAACGCAGAAACTCCACCAGGAAGATCCTTCCTC
GACATCAAAGAATCTGTAGCTATGAGCCTCTACTCTCTTCAGATCCGTCAGATTCCATCG
CCACCAATGTAGATAGCCCTGAAAAGATCTCGAGTTCGAACCTCAGGTGTGAGGTGGAGG
AGGCTCAGGAGGAGAAAGGAACAAAGAAGACGAGGAAAAGAGTCAGGTTTAACTTGAATG
TACAAACCTTTGAACCAACAACTCTACCATCAAGATATGAGAATTACTGCAGCGATGATG
ATGATGAAGAGGCAAAAGGAGAAATAAAGAGCAGTAGATCTGTGTATCCTGCAAACTACA
GATACCATAATTGTGTGGATGGTTTAGAAGAAGAAGATGAATTGGGATATGGAGAGAGTG
ATTTGGAGGATGAAGACTATTATTACACAGATGATGAAAACGACTATGAAGACGATGCTG
ATGATGAAGATGAGGAGCAGGATGTGACTCCTCTGTTGAATCCAGTTGAGAACATTGCGC
AGTGGAAAGCGGTTAAAGCAAAGCCAGTGAGAAGAGTTAAAGGGCTAATGAAAGAGAACG
TTGAAGCAGATAGTGGTAGTGATGATCAAGCAAGACCATTACTAAAGAAG*AGATCATCG
TCA*TACTAGCCTTGCCGACTGGTTGGCCTCAC*GAAGACTTTTCATGGGAAT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2FR37JQ 834 0 0
GAGAAAGGAACAAAGAAGACGAGGAAAAGAGTCAGGTTTAACTTGAATGTACAAAC*TTT
GAACCAACAACTCTACCATCAAGATATGAGAATTACTGCAGCGATGATGATGATGAAGAG
GCAAAAGGAGAAATAAAGAGCAGTAGATCTGTGTATCCTGCAAACTACAGATACCATAAT
TGTGTGGATGGTTTAGAAGAAGAAGATGAATTGGGATATGGAGAGAGTGATTTGGAGGAT
GAAGACTATTATTACACAGATGATGAAAACGACTATGAAGACGATGCTGATGATGAAGAT
GAGGAGCAGGATGTGACTCCTCTGTTGAATCCAGTTGAGAACATTGCGCAGTGGAAAGCG
GTTAAAGCAAAGCCAGTGAGAAGAGTTAAAGGGCTAATGAAGGAGAACGTTGAAGCAGAT
AGTGGTAGTGATGATCAAGCAAGACCATTACTAAAGAAGGAGATCATCGTCAATACTAGC
CTTGCCGACTGGTTGGCCTCACCGAAGACTTTTCATGGGAATGGTTCAGCTAAGAGATCC
CCAATTGTTGATATCACCAACATGGAGAACAGGTCAAAGGTTTCATAGTGATTGATTCAC
CATTGTGAAGGAGGAGAAGAAAGAAACCGTGTGTTTGTTTTGTTGTTTTTCTTTGTTTTG
TGTGTAAGGGATATGGAGGTTTTGTATCAATCTTTCAATGTTTTTGCTATCTCTGCTTAT
GATTTGGTGAGGAGGAAAGCTACTGGAAGCAGAGGAATAAATGGCTGCACATTGTTTACA
ATTGAATCAGCTTGTGGTGTTGTTGCAGTAAAAAGACATACATAGTTTACTGGC

QA 1 834 1 834
DS 



AS 1 3

CO CL3287Contig1 1125 3 7 U
GGATATCACGAGCTAATCGTACAACCAAAATCAGGTCGAAGAATCAGGGTTTTCAGGACA
AAACCGAGTTTCGCTCTCCGTCTTCTATCAAGAATATGCAAGAAGCAGCGTTAGGTATGA
TCGTAGGCGGAGGAGGAGAAGGAGACGCAGCCGTGGCGGCGGAGCAGAATAGACAAATGA
AAGGTGAGATAGCTACACATCCCATGTACGAGCAGCTTTTGGCCGCACACGTGGCATGTC
TGAGAGTGGCGACTCCCATCGACCAGCTTCCGATCATTGAAGCTCAGCTTTCTCACTCTC
ATCATCTTCTCCGATCTTATGCTTCGACAGCCGTTGGATTCTCGCATCATGATCGTCAAG
AGCTCGACAATTTCTTGGCACAATATGTAATGGTGTTGTGATGGCTTGCCGTGAAATTGA
GAACAACCTCCACTCTCTCACAGGAGCGACATTAGGAGAAGGGTCCGGTGCGACGATGTC
CGAGGATGAGGACGATCTTCATATGGATTTCTCATCTGATAATTCCGGCATTGATTTTAG
CGGGGGACACGATATGACGGGATTTGGTCCATTGCTTCCGACTGAATCTGAAAGATCTCT
TATGGAAAGAGTCAGACAAGAGCTGAAACTCGAACTCAAACAGGGTTTTAAATCAAGAAT
TGAAGATGTAAGAGAAGAGATAATGAGGAAAAGAAGGGCTGGGAAATTGCCTGGAGACAC
AACAACTGTCTTGAAAAATTGGTGGCAACAACATTGCAAATGGCCTTACCCTACTGAAGA
CGACAAGGCAAAATTGGTGGAGGAGACAGGATTACAGTTGAAGCAAATCAACAACTGGTT
CATTAATCAACGCAAGAGGAACTGGCACAATAACTCTCATTCCCTCACTTCCTTGAAGTC
CAAGCGCAAACACTGATCTCTTATTACTGGTATACAATTGCCACTACATTTACATATGCC
ACTTACATTCCGCAATATATAGTTCCATTGATTTAGTAATAACGAGGTGTGATTATAAAT
ATCATGTACTTAGCTTATTTTACATCCCAACCACTAAAAAGTTTGTTCTTTAAGTGATTT
ACTTGTTGGTATTGGATTGTGATTCAATACGTGTGCGTTTTACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG71TF U 1
AF RR2FH11TF U 571
AF RR2FG71JQ C 595
BS 1 689 RR2FG71TF
BS 690 902 RR2FH11TF
BS 903 903 RR2FG71JQ
BS 904 935 RR2FH11TF
BS 936 936 RR2FG71JQ
BS 937 1067 RR2FH11TF
BS 1068 1125 RR2FG71JQ

RD RR2FG71TF 689 0 0
GGATATCACGAGCTAATCGTACAACCAAAATCAGGTCGAAGAATCAGGGTTTTCAGGACA
AAACCGAGTTTCGCTCTCCGTCTTCTATCAAGAATATGCAAGAAGCAGCGTTAGGTATGA
TCGTAGGCGGAGGAGGAGAAGGAGACGCAGCCGTGGCGGCGGAGCAGAATAGACAAATGA
AAGGTGAGATAGCTACACATCCCATGTACGAGCAGCTTTTGGCCGCACACGTGGCATGTC
TGAGAGTGGCGACTCCCATCGACCAGCTTCCGATCATTGAAGCTCAGCTTTCTCACTCTC
ATCATCTTCTCCGATCTTATGCTTCGACAGCCGTTGGATTCTCGCATCATGATCGTCAAG
AGCTCGACAATTTCTTGGCACAATATGTAATGGTGTTGTGATGGCTTGCCGTGAAATTGA
GAACAACCTCCACTCTCTCACAGGAGCGACATTAGGAGAAGGGTCCGGTGCGACGATGTC
CGAGGATGAGGACGATCTTCATATGGATTTCTCATCTGATAATTCCGGCATTGATTTTAG
CGGGGGACACGATATGACGGGATTTGGTCCATTGCTTCCGACTGAATCTGAAAGATCTCT
TATGGAAAGAGTCAGACAAGAGCTGAAACTCGAACTCAAACAGGGTTTTAAATCAAGAAT
TGAAGATGTAAGAGAAGAGATAATGAGGA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2FH11TF 497 0 0
GG
TGCTTCCGACTGAATCTGAAAGATCTCTTATGGAAAGAGTCAGACAAGAGCTGAAACTCG
AACTCAAACAGGGTTTTAAATCAAGAATTGAAGATGTAAGAGAAGAGAGAATGAGGAAAA
GAAGGGCTGGGAAATTGCCTGGAGACACAACAACTGTCTTGAAAAATTGGTGGCAACAAC
ATTGCAAATGGCCTTACCCTACTGAAGACGACAAGGCAAAATTGGTGGAGGAGACAGGAT
TACAGTTGAAGCAAATCAACAACTGGTTCATTAATCAACGCAAGAGGAACTGGCACAATA
ACTCTCATTCCCTCACTTCCTTGAAGTCCAGGCGCAAACACTGATCTCTTATTACTGGTA
TACTATTGCCACTACATTTACATATGCCACTTACATTCCGCAATATATAGTTCCATTGAT
TTAGTAATAACGAGGTGTGATTATAAATATCATGTACTTAGCTTATTTTACATCCCAACC
ACTAAAAAGTTTGTT

QA 3 497 3 497
DS 

RD RR2FG71JQ 531 0 0
ATCTCTTATGGAAAGAGTCAGACAAGAGCTGAAACTCGAACTCAAACAGGGTTTTAAATC
AAGAATTGAAGATGTAAGAGAAGAGATAATGAGGAAAAGAAGGGCTGGGAAATTGCCTGG
AGACACAACAACTGTCTTGAAAAATTGGTGGCAACAACATTGCAAATGGCCTTACCCTAC
TGAAGACGACAAGGCAAAATTGGTGGAGGAGACAGGATTACAGTTGAAGCAAATCAACAA
CTGGTTCATTAATCAACGCAAGAGGAACTGGCACAATAACTCTCATTCCCTCACTTCCTT
GAAGTCCAAGCGCAAACACTGATCTCTTATTACTGGTATACAATTGCCACTACATTTACA
TATGCCACTTACATTCCGCAATATATAGTTCCATTGATTTAGTAATAACGAGGTGTGATT
ATGAATATCATGTACTTAGCTTATTTTACATCCCAACCACTAAAAAGTTTGTTCTTTAAG
TGATTTACTTGTTGGTATTGGATTGTGATTCAATACGTGTGCGTTTTACTT

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 2

CO CL3288Contig1 573 2 6 U
GAATTGCTCATTGCAAAGATTTCATTTGCCGGGTCACTGGGCCGCGACCTGATTTAGATA
TCGATGCGGAATACGCAGAAGTTCTTAAAAGTCAATGCAAGGATTACACAGTAGTGAATG
AAACGAGGGGGTCGTTTTTTGATCCGGTGACGCCAGACAAATTCGATAATATGTATTACA
AGAACTTGGAAAACGGGAGGGGACTGTTAGCTTCCGACCACATCTTGTTTAAAGATAATA
GCACGAGACCGTTCGTGGAGTTGTATGCGAATAACCAGACGGTTTTTTTCGAGGATTTCG
CACGTGCCATGGAGAAACTAGGCATGGTCGGTGTTAAGGTCGACAAAAATGGAGACGTGA
GACTCAGATGTGATAACTTAAACAAACCTAAGGAAACAACATTAAGTAAGGAAACAACAT
TAAGAGTATAATTGAGTTCAGTTTTTGTTTTGTTTTGAATAATGTATTTATAAGTTAACG
TAGCAATACCTACAGTGAGAAAAAAAATCACTGAGTGTAATGATATTATATGTTTTGTTT
TTATTATGAAGTTTTGTATGTTAAATGAAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ66JQ C 1
AF RR2DL63TF U 67
BS 1 67 RR2FQ66JQ
BS 68 438 RR2DL63TF
BS 439 441 RR2FQ66JQ
BS 442 461 RR2DL63TF
BS 462 462 RR2FQ66JQ
BS 463 573 RR2DL63TF

RD RR2FQ66JQ 562 0 0
GAATTGCTCATTGCAAAGATTTCATTTGCCGGGTCACTGGGCCGCGACCTGATTTAGATA
TCGATGCGGAATACGCAGAAGTTTTTAAAAGTCAATGCAAGGATTACACAGTAGTGAATG
AAACGAGGGGGTCGTTTTTTGATCCGGTGACGCCAGACAAATTCGATAATATGTATTACA
AGAACTTGGAAAACGGGAGGGGACTGTTAGCTTCCGACCACATTTTGTTTAAAGATAATA
GCACGAGACCGTTCGTGGAGTTGTATGGGAATAACCAGACGGTTTTTTTCGAGGATTTCG
CACGTGCCATGGAGAAACTAGGCATGGTCGGTGTTAAGGTCGACAAAAATGGAGACGTGA
GATTCAGATGTGATAACTTAAACAAACCTAAGGAAACAACATTAAGTAAGGAAACAACAT
TAAGAGTATAATTGAGTTCAGTTTTTGTTTTGTTTTGAATAATGTATTTATAAGTTAACG
TAGCAATACCTACAGTGAGAAAAAAA*TCACTGAGTGTAATGATATTATATGTTTTGTTT
TTATTATGAAGTTTTGTATGTT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2DL63TF 507 0 0
G
GGAATACGCAGAAGTTCTTAAAAGTCAATGCAAGGATTACACAGTAGTGAATGAAACGAG
GGGGTCGTTTTTTGATCCGGTGACGCCAGACAAATTCGATAATATGTATTACAAGAACTT
GGAAAACGGGAGGGGACTGTTAGCTTCCGACCACATCTTGTTTAAAGATAATAGCACGAG
ACCGTTCGTGGAGTTGTATGCGAATAACCAGACGGTTTTTTTCGAGGATTTCGCACGTGC
CATGGAGAAACTAGGCATGGTCGGTGTTAAGGTCGACAAAAATGGAGACGTGAGACTCAG
ATGTGATAACTTAAACAAACCTAAGGAAACAACATTAAGTAAGGAAACAACATTAAGAGT
ATAATTGAGTT***TTTTTGTTTTGTTTTGAATAGTGTATTTATAAGTTAACGTAGCAAT
ACCTACAGTGAGAAAAAAAATCACTGAGTGTAATGATATTATATGTTTTGTTTTTATTAT
GAAGTTTTGTATGTTAAATGAAATGT

QA 2 507 2 507
DS 



AS 1 3

CO CL3289Contig1 804 3 15 U
GGCATCATTTTGCTTCCAATCCTTATGGTGAACAGTCTCCCTCTCTCTCTATCCACCTTC
TCTCTCTCTTTAGCTATTGATTGTTGATTTCTCTCTCTCTCACAACACACCTAACCTTAT
CATTTCAACCTGAAACTCTTGCACGATCCAGGCCATGACTACGGAGGAAGCTAAGGTCGT
CGTGCCAAGGAACTTTAGATTGTTGGAGGAGCTAGAGAGAGGAGAGAAAGGGATCGGAGA
TGGAACCGTAAGCTATGGAATGGACGATGCTGATGATATCTATATGCAGTCCTGGACTGG
CACCATTCTCGGCCCTCACAATACTGCATACGAAGGGAAAATCTTCCAGCTGAAGCTCTT
CTGTGGCAAGGAATACCCAGAAAGTCCACCAACTGTCAGGTTCCAGACCCGGATCAACAT
GGCTTGTGTCAACCCCGAAACTGGAGTCGTTGAACCGAGTCTCTTCCCTATGCTCGCAAA
CTGGCGGCGAGAATACACAATGGAGGACATTCTGATTAAGCTGAAAAAAGAAATGATGAC
TTCCCATAACCGCAAGCTAGCTCAACCCCCGGAAGGTACCGAGGAAGCTAGGGCGGATCC
AAAGGGACCAGCTAAATGTTGTGTGATGTGAAGATAGAGAGAGAGAAGTTGGAGGGAACC
ACGGTCAATTTGTATTAATAGAAGGGATAATGTATATATAAAACATCATTTGAAGCTTTT
GAAATTTGCCTACGACTTTGAATGTTATACTGTTGTTTGAGATTCTATATATATATGTCC
ACCAAAAATAGGTGATTATGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP06TF U 1
AF RR2GY11TF U 147
AF RR2GY11JQ C 462
BS 1 222 RR2EP06TF
BS 223 223 RR2GY11TF
BS 224 243 RR2EP06TF
BS 244 244 RR2GY11TF
BS 245 435 RR2EP06TF
BS 436 436 RR2GY11TF
BS 437 447 RR2EP06TF
BS 448 448 RR2GY11TF
BS 449 543 RR2EP06TF
BS 544 544 RR2GY11TF
BS 545 633 RR2EP06TF
BS 634 635 RR2GY11TF
BS 636 657 RR2EP06TF
BS 658 788 RR2GY11TF
BS 789 804 RR2GY11JQ

RD RR2EP06TF 658 0 0
GGCATCATTTTGCTTCCAATCCTTATGGTGAACAGTCTCCCTCTCTCTCTATCCACCTTC
TCTCTCTCTTTAGCTATTGATTGTTGATTTCTCTCTCTCTCACAACACACCTAACCTTAT
CATTTCAACCTGAAACTCTTGCACGATCCAGGCCATGACTACGGAGGAAGCTAAGGTCGT
CGTGCCAAGGAACTTTAGATTGTTGGAGGAGCTAGAGAGAGGTGAGAAAGGGATCGGAGA
TGGTACCGTAAGCTATGGAATGGACGATGCTGATGATATCTATATGCAGTCCTGGACTGG
CACCATTCTCGGCCCTCACAATACTGCATACGAAGGGAAAATCTTCCAGCTGAAGCTCTT
CTGTGGCAAGGAATACCCAGAAAGTCCACCAACTGTCAGGTTCCAGACCCGGATCAACAT
GGCTTGTGTCAACCCTGAAACTGGAGTGGTTGAACCGAGTCTCTTCCCTATGCTCGCAAA
CTGGCGGCGAGAATACACAATGGAGGACATTCTGATTAAGCTGAAAAAAGAAATGATGAC
TTCACATAACCGCAAGCTAGCTCAACCCCCGGAAGGTACCGAGGAAGCTAGGGCGGATCC
AAAGGGACCAGCTAAATGTTGTGTGATGTGAAG**AGAGAGAGAGAAGTTGGAGGGA
C

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2GY11TF 642 0 0
GGAAGA
CCATGACTACGGAGGAAGCTAAGGTCGTCGTGCCGAGGAACTTTAGATTGTTGGAGGAGC
TAGAGAGAGGAGAGAAAGGGATCGGAGATGGAACTGTAAGCTATGGAATGGACGATGCTG
ATGATATCTATATGCAGTCCTGGACTGGCACCATTCTCGGCCCTCACAATACTGCATACG
AAGGGAAAATCTTCCAGCTGAAGCTCTTCTGTGGCAAGGAATACCCTGAAAGTCCACCAA
CTGTCAGGTTCCAGACCCGGATCAACATGGCTTGTGTCAACCCCGAAACTGGAGTCGTTG
AACCGAGTCTCTTCCCTATGCTCGCAAACTGGCGGCGAGAATACACAATGGAGGACATTC
TGATTAAGCTGAAAAAAGAAATGATGACTTCCCATAACCGCAAGCTAGCTCAACCCCCGG
AAGGTACCGAGGAAGCTAGGGCGGATCCAAAGGGACCAGCTAAATGTTGTGTGATGTGAA
GATAGAGAGAGAGAAGTTGGAGGGAACCACGGTCAATTTGTATTAATAGAAGGGATAATG
TATATATAAAACATCATTTGAAGCTTTTGAAATTTGCCTACGACTTTGAATGTTATACTG
TTGTTTGAGATTCTATATATATATGTCCACCAAAAA

QA 7 642 7 642
DS 

RD RR2GY11JQ 343 0 0
TCTTCCCTATGCTCGCAAACTGGCGGCGAGAATACACAATGGAGGACATTCTGATTAAGC
TGAAAAAAGAAATGATGACTTCCCATAACCGCAAGCTAGCTCAACCCCCGGAAGGTACCG
AGGAAGCTAGGGCGGATCCAAAGGGACCAGCTAAATGTTGTGTGATGTGAAGATAGAGAG
AGAGAAGTTGGAGGGAACCACGGTCAATTTGTATTAATAGAAGGGATAATGTATATATAA
AACATCATTTGAAGCTTTTGAAATTTGCCTACGACTTTGAATGTTATACTGTTGTTTGAG
ATTCTATATATATATGTCCACCAAAAATAGGTGATTATGACCC

QA 1 343 1 343
DS 



AS 1 2

CO CL3290Contig1 988 2 8 U
ATTTTCCAAAAAGCAATAACGTAATAATAACCAAATACTAAACTAACGTACAGTTCAAAA
GAAAAAAAAACTAACGTACAGTTTATGAAGAAAGAGAAGATGAAAAGCAGTACTCTGGGT
CTTATAACAAACCTTTTATTGAAGAATCGTATATTGAACAATACAATGACCTATAGGATC
AACGGCTAAAAGAGAGGTAAGCTTATAGGGAAACGAACTTGCATCCATTGCTTCTCATAC
GTAACCAAATGGCTCCAACCTAACTCCTCCAACAAACCCAGTTTCATTTCGTACAGTTTC
TTATTAGCTGTCTCGTTCTCATTTTGGATCATCTCCTCAAGTACCTTCAATGCAGTCCCG
GGTCGTGAGAGCCGTTTCTCTCTTAGAACAGAGAGAGTACAGAACTTCGATGATTTCAAG
TCTACCCATTTCGCCAGTTCTTTGAAATTTTCTTCGAACTTATCCTTTCGGCTACTTTCT
TCTTGTTCTCCTTCATCTTCCTGCTTACCCTTCAAATTCTAGAGTCTCGCCATGGCTAAC
CCTTTCTGGTATAGCGCTTCTGCCAGTTGGTCACGGGTCATCTCCATTTTCTTCTTTAAA
TTCTCTGCTTCCTCGTCCTCTGGTTCACTTTTTTGTAGCAAGAATCTTGCTAACTCGTCT
ACGTCAACGCTGCTTATTACTTCGTTTGCAGCATCTATAATCTCTTCGTGATGGCTGATT
TTGTTCCCAGCTTCAGACCGAGACAGCAAACTTTCTAAGATCTTAGCAAGCAATCGAGTA
GAGTTTGGGTATTCAGACTTGAGACAAGAACACAACTTTCTCCACTCCGAACGATCTTCC
TCAGTTTCTTGCTTTAGGTTCCCGAGAAATTTGATCTTTATGTCACGAACCTCTTCTTCC
AAGCGTTCTGAAACTGATTTACAGCTACTTGAAGCAGAAGCCGCTTTCTTATCTTCCTCA
GGCTTATTTGGTGGAACCACATATGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT21JQB U 1
AF RR2AL23TF C 174
BS 1 204 RR2GT21JQB
BS 205 205 RR2AL23TF
BS 206 206 RR2GT21JQB
BS 207 207 RR2AL23TF
BS 208 271 RR2GT21JQB
BS 272 272 RR2AL23TF
BS 273 354 RR2GT21JQB
BS 355 988 RR2AL23TF

RD RR2GT21JQB 354 0 0
ATTTTCCAAAAAGCAATAACGTAATAATAACCAAATACTAAACTAACGTACAGTTCAAAA
GAAAAAAAAACTAACGTACAGTTTATGAAGAAAGAGAAGATGAAAAGCAGTACTCTGGGT
CTTATAACAAACCTTTTATTGAAGAATCGTATATTGAACAATACAATGACCTATAGGATC
AACGGCTAAAAGAGAGGTAAGCTTGTTGGGAAACGAACTTGCATCCATTGCTTCTCATAC
GTAACCAAATGGCTCCAACCTAACTCCTCCAGCAAACCCAGTTTCATTTCGTACAGTTTC
TTATTAGCTGTCTCGTTCTCATTTTGGATCATCTCCTCAAGTACCTTCAATGCA

QA 1 354 1 354
DS 

RD RR2AL23TF 815 0 0
AGGATCAAAGGGT
TAAAAGAGAGGTAAGCTTATAGGGAAACGAACTTGCATCCATTGCTTCTCATACGTAACC
AAATGGCTCCAACCTAACTCCTCCAACAAACCCAGTTTCATTTCGTACAGTTTCTTATTA
GCTGTCTCGTTCTCGTTTTGGATCATCTCCTCAAGTACCTTCAATGCAGTCCCGGGTCGT
GAGAGCCGTTTCTCTCTTAGAACAGAGAGAGTACAGAACTTCGATGATTTCAAGTCTACC
CATTTCGCCAGTTCTTTGAAATTTTCTTCGAACTTATCCTTTCGGCTACTTTCTTCTTGT
TCTCCTTCATCTTCCTGCTTACCCTTCAAATTCTAGAGTCTCGCCATGGCTAACCCTTTC
TGGTATAGCGCTTCTGCCAGTTGGTCACGGGTCATCTCCATTTTCTTCTTTAAATTCTCT
GCTTCCTCGTCCTCTGGTTCACTTTTTTGTAGCAAGAATCTTGCTAACTCGTCTACGTCA
ACGCTGCTTATTACTTCGTTTGCAGCATCTATAATCTCTTCGTGATGGCTGATTTTGTTC
CCAGCTTCAGACCGAGACAGCAAACTTTCTAAGATCTTAGCAAGCAATCGAGTAGAGTTT
GGGTATTCAGACTTGAGACAAGAACACAACTTTCTCCACTCCGAACGATCTTCCTCAGTT
TCTTGCTTTAGGTTCCCGAGAAATTTGATCTTTATGTCACGAACCTCTTCTTCCAAGCGT
TCTGAAACTGATTTACAGCTACTTGAAGCAGAAGCCGCTTTCTTATCTTCCTCAGGCTTA
TTTGGTGGAACCACATATGATC

QA 14 815 14 815
DS 



AS 1 2

CO CL3291Contig1 777 2 12 U
GGATCAACAACCCCTTGAGATTTCCGAAGATCACCAATCAAAACCCTAAGAAAGCGAGTG
CGCAGTTCAAGATGGCTTCTTCGAAAAGAATCAACAAGGAGCTTAGGGACCTCCAAAGGG
ATCCTCCTGTCTCATGCAGTGCTGGTCCTGTGGGTGATGATATGTTCCACTGGCAAGCGA
CTATAATGGGTCCAACTGATAGCCCATTCTCTGGAGGTGTGTTTCTTGTTTCCATTCACT
TCCCACCTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTTTCTTTCCGCACCAAGGTTTATCACC
CGAATATCAACAGTAACGGCAGCATCTGTCTTGACATTCTGAAAGAGCAGTGGAGCCCTG
CACTTACCATATCCAAGGTTCTTCTGTCGATTTGCTCGCTACTTACAGATCCAAACCCTG
ATGATCCTCTGGTTCCAGAAATAGCTCATATCTACAAGACAGACCGAGTCAAGTACGAGA
GCACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGATGATGATGATGATTGGCAATAA
TAATCTGCACCAATACATTGCGCATCGTCTTAAGAATAAGTTTGAAAAAAAAAAAAAAAA
CAGAGTGTGGCGTTTGCTTGGTTGCTTTATTAGTTTTATACATCTTAAGCCAGTGTGTTG
GTTGGCGTACTGTACATGAGCTTTATATTGAGACATTTTGAGAGCTTGCAATGCTTTAAA
GCCCAATAATTGTCGTCTATTAACGGTTATGATGAGTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ31TF U 1
AF RR2F239TF U 4
BS 1 60 RR2FZ31TF
BS 61 61 RR2F239TF
BS 62 198 RR2FZ31TF
BS 199 199 RR2F239TF
BS 200 220 RR2FZ31TF
BS 221 221 RR2F239TF
BS 222 301 RR2FZ31TF
BS 302 302 RR2F239TF
BS 303 396 RR2FZ31TF
BS 397 397 RR2F239TF
BS 398 484 RR2FZ31TF
BS 485 777 RR2F239TF

RD RR2FZ31TF 484 0 0
GGATCAACAACCCCTTGAGATTTCCGAAGATCACCAATCAAAACCCTAAGAAAGCGAGTG
GGCAGTTCAAGATGGCTTCTTCGAAAAGAATCAACAAGGAGCTTAGGGACCTCCAAAGGG
ATCCTCCTGTCTCATGCAGTGCTGGTCCTGTGGGTGATGATATGTTCCACTGGCAAGCGA
CTATAATGGGTCCAACTGGTAGCCCATTCTCTGGAGGTGTTTTTCTTGTTTCCATTCACT
TCCCACCTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTTTCTTTCCGCACCAAGGTTTATCACC
CTAATATCAACAGTAACGGCAGCATCTGTCTTGACATTCTGAAAGAGCAGTGGAGCCCTG
CACTTACCATATCCAAGGTTCTTCTGTCGATTTGCTTGCTACTTACAGATCCAAACCCTG
ATGATCCTCTGGTTCCAGAAATAGCTCATATCTACAAGACAGACCGAGTCAAGTACGAGA
GCAC

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2F239TF 774 0 0
GG
AACAACCCCTTGAGATTTCCGAAGATCACCAATCAAAACCCTAAGAAAGCGAGTGCGCAG
TTCAAGATGGCTTCTTCGAAAAGAATCAACAAGGAGCTTAGGGACCTCCAAAGGGATCCT
CCTGTCTCATGCAGTGCTGGTCCTGTGGGTGATGATATGTTCCACTGGCAAGCGACTATA
ATGGGTCCAACTGATAGCCCATTCTCTGGAGGTGTGTTTCTTGTTTCCATTCACTTCCCA
CCTGATTATCCCTTCAAGCCACCAAAGGTTTCTTTCCGCACCAAGGTTTATCACCCGAAT
ATCAACAGTAACGGCAGCATCTGTCTTGACATTCTGAAAGAGCAGTGGAGCCCTGCACTT
ACCATATCCAAGGTTCTTCTGTCGATTTGCTCGCTACTTACAGATCCAAACCCTGATGAT
CCTCTGGTTCCAGAAATAGCTCATATCTACAAGACAGACCGAGTCAAGTACGAGAGCACT
GCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGATGATGATGATGATTGGCAATAATAATC
TGCACCAATACATTGCGCATCGTCTTAAGAATAAGTTTGAAAAAAAAAAAAAAAACAGAG
TGTGGCGTTTGCTTGGTTGCTTTATTAGTTTTATACATCTTAAGCCAGTGTGTTGGTTGG
CGTACTGTACATGAGCTTTATATTGAGACATTTTGAGAGCTTGCAATGCTTTAAAGCCCA
ATAATTGTCGTCTATTAACGGTTATGATGAGTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCT

QA 3 774 3 774
DS 



AS 1 3

CO CL3292Contig1 343 3 2 U
CGTATAAGATTCAATCTTTTATTTCTTTTCAAGAGACTTTAGAAAGACATTCCATCAGAG
AAATAAAGAGACAAAAAGAAACAAACATTACAGCAAATGCATCGAATCTAACTTCGACTA
AAATATTTTTAGAAAGTAATAAAACCAAACAAAAACACAACCGTTATAGATAAAAAGAAC
TCGTTTCCTTGTTCAAATCATTCATTCATCTCATTTTCAAGCTTCTCTTCACTTGGCACT
GGCGAGCTGGGAGCGGATGAGTTTAGCCGCATCAACCATGTTCTTCAGGGCAGGCTTCAC
CTCTGTGTACTTACGGGTCTTGAGACCAAAGTCAGGGTTAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C005TF C 1
AF RR2C005JQ U 1
AF RR2CN17JQ U 77
BS 1 210 RR2C005JQ
BS 211 343 RR2CN17JQ

RD RR2C005TF 161 0 0
CGTATAAGATTCAATCTTTTATTTCTTTTCAAGAGACTTTAGAAAGACATTCCATCAGAG
AAATAAAGAGACAAAAAGAAACAAACATTACAGCAAATGCATCGAATCTAACTTCGACTA
AAATATTTTTAGAAAGTAATAAAACCAAACAAAAACACAAC

QA 1 161 1 161
DS 

RD RR2C005JQ 211 0 0
CGTATAAGATTCAATCTTTTATTTCTTTTCAAGAGACTTTAGAAAGACATTCCATCAGAG
AAATAAAGAGACAAAAAGAAACAAACATTACAGCAAATGCATCGAATCTAACTTCGACTA
AAATATTTTTAGAAAGTAATAAAACCAAACAAAAACACAACCGTTATAGATAAAAAGAAC
TCGTTTCCTTGTTCAAATCATTCATTCATC
C

QA 1 210 1 210
DS 

RD RR2CN17JQ 267 0 0
AGAAACAAACATTACAGCAAATGCATCGAATCTAACTTCGACTAAAATATTTTTAGAAAG
TAATAAAACCAAACAAAAACACAACCGTTATAGATAAAAAGAACTCGTTTCCTTGTTCAA
ATCATTCATTCATCTCATTTTCAAGCTTCTCTTCACTTGGCACTGGCGAGCTGGGAGCGG
ATGAGTTTAGCCGCATCAACCATGTTCTTCAGGGCAGGCTTCACCTCTGTGTACTTACGG
GTCTTGAGACCAAAGTCAGGGTTAACC

QA 1 267 1 267
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3294Contig1 1234 3 3 U
CAAACAATAATAACATATAACATCAACGTTCTTTCCTTGACAACATTTTTTCCACCCATC
CATCCACACAGTACATTCAAACACAAATCAAACAAAGAACGATTAGCATTGCTTATGGCT
CAGGATAAGTTTTTGTTTATCCTAAACCACAGTCACTTTAGGAACTGAAATCTTCTCGAA
CAGTAAATAAACTTAAAAACAGAAAACATCACTGGGATGTTAGATTTAGATTTGTGTTTA
TTTTTTTGTAATCAAAACCGGTTCCATGAGAATGCCACGGGACTTCTTACTTGGTGTTGC
GGATTGCTCCAAGTGATGGATCCATACTCAGCCTTGTTCGTCAAACTCACTCCCTTTTTG
CTTACAAACGTGACCGTGTACCTCTTCTTCTCTCTCACACTTCTAAACGCGAGCTTCGAT
GGTTTAACCGATATCCCAACACTAGGTGCTCCACTAACCACCACTTTATAAACCGAGTTC
GCTTCACCCACGTTGGTTACCTCCCTGGTGTACCGCACAACCCTTTTGCCACCAAACAAA
ACCGAGAAACTTGGGTAATTGAGCTGCCCAGGATTAGAGAACTTCTTCGAGCAGTTAAAG
CTTGGTCGCTTCACAATCGCCACGATGTGATCTACTGTGTAGTCGAGAGAGCACAAGAAC
CTGATGTATTCCTCAGTCGAGATGTCGTAGACAAGACCCGGGGAGAGAGCCTTTTGAGGA
TCTGCGTGGCCCGAGCCGTGAGCGTGTGGGTTGGAGAGGCTGTTATCTGCAGCATCACGG
AGAGGAGAGTTGGTGTTATCAAGATTGTAAGCTGTGGTCATGAGCGCTGATTTGGTGGCG
CTTGGACTCCACTCAGGGTGAGCTGCTTTCAAAAGACCGGCTAAACCACTGATGTGTGGG
CATGACATGGACGTACCTGACATGATGTTGAACTGGGTCCTCCTCGAGTCCTTGTCAAGA
CCAGTAGGACCAATAGCATCAGACCAAGCAGCCAAAATGTTAACTCCAGGACCAATGACG
TCAGGTTTCAAGATCTCAGGAGTGACAGTGTTTGGACCTCTAGAGCTAAACGCAGCAACC
ACAGGAGAAGGACGAACATCAAGAACCGTCCCTTTAAACACAAGAAGAGCGGTCGGATTC
GAATCCGATTTGATGTATTCCCTAAGGAGATCACCTGTCATCTTCCCGACAGCAATAGCC
GGAAGCAAATGACTATCGGCAACAAGCTCCTCAC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F373JQ U 1
AF RR2G408JQ U 1
AF RR2G408TF C 555
BS 1 197 RR2F373JQ
BS 198 785 RR2G408JQ
BS 786 1234 RR2G408TF

RD RR2F373JQ 197 0 0
CAAACAATAATAACATATAACATCAACGTTCTTTCCTTGACAACATTTTTTCCACCCATC
CATCCACACAGTACATTCAAACACAAATCAAACAAAGAACGATTAGCATTGCTTATGGCT
CAGGATAAGTTTTTGTTTATCCTAAACCACAGTCACTTTAGGAACTGAAATCTTCTCGAA
CAGTAAATAAACTTAAA

QA 1 197 1 197
DS 

RD RR2G408JQ 785 0 0
CG
AACAATAATAACATATAACATCGACGTTCTTTCCTTGACAACATTTTTTCTACCCATCCA
TCCACACAGTACATTCAAACACATATCAAACAAAGAACGATTAGCATTGCTTATGGCTCA
GGATAAGTTTTTGTTTATCCTAAACCACAGTCACTTTAGGAACTGAAATCTTCTCGAACA
GTAAATAAACTTAAAAACAGAAAACATCACTGGGATGTTAGATTTAGATTTGTGTTTATT
TTTTTGTAATCAAAACCGGTTCCATGAGAATGCCACGGGACTTCTTACTTGGTGTTGCGG
ATTGCTCCAAGTGATGGATCCATACTCAGCCTTGTTCGTCAAACTCACTCCCTTTTTGCT
TACAAACGTGACCGTGTACCTCTTCTTCTCTCTCACACTTCTAAACGCGAGCTTCGATGG
TTTAACCGATATCCCAACACTAGGTGCTCCACTAACCACCACTTTATAAACCGAGTTCGC
TTCACCCACGTTGGTTACCTCCCTGGTGTACCGCACAACCCTTTTGCCACCAAACAAAAC
CGAGAAACTTGGGTAATTGAGCTGCCCAGGATTAGAGAACTTCTTCGAGCAGTTAAAGCT
TGGTCGCTTCACAATCGCCACGATGTGATCTACTGTGTAGTCGAGAGAGCACAAGAACCT
GATGTATTCCTCAGTCGAGATGTCGTAGACAAGACCCGGGGAGAGAGCCTTTTGAGGATC
TGCGTGGCCCGAGCCGTGAGCGTGTGGGTTGGAGAGGCTGTTATCTGCAGCATCACGGAG
AGG

QA 3 785 3 785
DS 

RD RR2G408TF 680 0 0
GTAATTGAGCTGCCCAGGATTAGAGAACTTCTTCGAGCAGTTAAAGCTTGGTCGCTTCAC
AATCGCCACGATGTGATCTACTGTGTAGTCGAGAGAGCACAAGAACCTGATGTATTCCTC
AGTCGAGATGTCGTAGACAAGACCCGGGGAGAGAGCCTTTTGAGGATCTGCGTGGCCCGA
GCCGTGAGCGTGTGGGTTGGAGAGGCTGTTATCTGCAGCATCACGGAGAGGAGAGTTGGT
GTTATCAAGATTGTAAGCTGTGGTCATGAGCGCTGATTTGGTGGCGCTTGGACTCCACTC
AGGGTGAGCTGCTTTCAAAAGACCGGCTAAACCACTGATGTGTGGGCATGACATGGACGT
ACCTGACATGATGTTGAACTGGGTCCTCCTCGAGTCCTTGTCAAGACCAGTAGGACCAAT
AGCATCAGACCAAGCAGCCAAAATGTTAACTCCAGGACCAATGACGTCAGGTTTCAAGAT
CTCAGGAGTGACAGTGTTTGGACCTCTAGAGCTAAACGCAGCAACCACAGGAGAAGGACG
AACATCAAGAACCGTCCCTTTAAACACAAGAAGAGCGGTCGGATTCGAATCCGATTTGAT
GTATTCCCTAAGGAGATCACCTGTCATCTTCCCGACAGCAATAGCCGGAAGCAAATGACT
ATCGGCAACAAGCTCCTCAC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL3295Contig1 1133 2 8 U
GGAACCAATCTACTACTATCAGCAGCCGGAGACTACCGCCGGCGATTTTTCCGGTTTGGC
AGCTTTTCTCGTCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTTTCGCAGCTTCAAGTTTAATGGAAGCGT
TCATTACTTCAAGGATTATTCCTGTTCAAGTTCCCTGTAGAAAGCTCTCATCTTTTTCTG
CGAGATATCATTGTAGAAGAGGCAGTGTCTCGATCATGAACCATCATCCCAGATTGCTCC
GTCCAGTGACTGCTTCTGTTCAGCCGCAGGAGCTATCAGCTTTGGGGCATGAAGGCAACA
CTTTTCCTTCTAAAGAGGTTCTCGATCTTTGGAGAGGTGTTGAAGCTGTGTGCTTCGATG
TGGATAGCACGGTATGTGTGGATGAAGGTATTGATGAACTTGCTGACTTCTGTGGAGCTG
GAAAGGCTGTTGCTGAATGGACTGCCAGAGCAATGGGTGGATCTGTTCCGTTTGAAGAAG
CTTTAGCCGCAAGACTTTCTTTGTTCAAGCCTTCTCTTTCCAAAGTTGATGAATATCTCC
AAAAGACACCCCCAAGGCTATCCCCTGGCATTGACGAGTTGGTCAAGAAGCTCAGAGCCA
ATAAAATTGATGTGTATTTGATATCCGGAGGTTTTCGACAGATGATCAATCCTGTAGCAT
CGATTCTTGGCATCCCTAGAGAGAACATCTTTGCCAACAATCTTCTATTTGGAAACTCCG
GCGAGTTTGTGGGCTTTGATGAGGAGGAACCTACATCAAGAAGTGGAGGCAAAGCCAAGG
CAGTGCAGCAAATACGAAAGGGTCGTCTTTACAAGACTATGGCCATGATTGGAGATGGAG
CTACTGATCTCGAAGCACGTAGACCTGGTGGCGCGGATTTGTTCATATGCTATGCTGGAG
TTCAGCTTCGTGAAGCTGTTGCAGCACAAGCAGACTGGCTTATCTTCAATTTTGAACCTT
TCATAAACTCCTTGGACTAAAAGCCTTCTCTATACTGATTAGTTTTCCATTATTCATATC
TCAAATTTTGTATTCTCTTTTTTTTTTAATGTGTGAAAATTCCACTGAACCGATACATGT
GTTTGCCAACTATAGCTGTTTCATCTGTTTATTCAAAGCTTTCAATGAACGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H552TF U 1
AF RR2H552JQB C 476
BS 1 684 RR2H552TF
BS 685 685 RR2H552JQB
BS 686 714 RR2H552TF
BS 715 715 RR2H552JQB
BS 716 720 RR2H552TF
BS 721 721 RR2H552JQB
BS 722 739 RR2H552TF
BS 740 1133 RR2H552JQB

RD RR2H552TF 739 0 0
GGAACCAATCTACTACTATCAGCAGCCGGAGACTACCGCCGGCGATTTTTCCGGTTTGGC
AGCTTTTCTCGTCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTTTCGCAGCTTCAAGTTTAATGGAAGCGT
TCATTACTTCAAGGATTATTCCTGTTCAAGTTCCCTGTAGAAAGCTCTCATCTTTTTCTG
CGAGATATCATTGTAGAAGAGGCAGTGTCTCGATCATGAACCATCATCCCAGATTGCTCC
GTCCAGTGACTGCTTCTGTTCAGCCGCAGGAGCTATCAGCTTTGGGGCATGAAGGCAACA
CTTTTCCTTCTAAAGAGGTTCTCGATCTTTGGAGAGGTGTTGAAGCTGTGTGCTTCGATG
TGGATAGCACGGTATGTGTGGATGAAGGTATTGATGAACTTGCTGACTTCTGTGGAGCTG
GAAAGGCTGTTGCTGAATGGACTGCCAGAGCAATGGGTGGATCTGTTCCGTTTGAAGAAG
CTTTAGCCGCAAGACTTTCTTTGTTCAAGCCTTCTCTTTCCAAAGTTGATGAATATCTCC
AAAAGACACCCCCAAGGCTATCCCCTGGCATTGACGAGTTGGTCAAGAAGCTCAGAGCCA
ATAAAATTGATGTGTATTTGATATCCGGAGGTTTTCGACAGATGATCAATCCTGTAGCAT
CGATTCTTGGCATCCCTAGAGAGA*CATCTTTGCCAACAATCTTCTATTTGGAA*CTCCG
*CGAGTTTGTGGGCTTTGA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2H552JQB 658 0 0
AGAAGCTTTAGCCGCAAGACTTTCTTTGTTCAAGCCTTCTCTTTCCAAAGTTGATGAATA
TCTCCAAAAGACACCCCCAAGGCTATCCCCTGGCATTGACGAGTTGGTCAAGAAGCTCAG
AGCCAATAAAATTGATGTGTATTTGATATCCGGAGGTTTTCGACAGATGATCAATCCTGT
AGCATCGATTCTTGGCATCCCTAGAGAGAACATCTTTGCCAACAATCTTCTATTTGGAAA
CTCCGGCGAGTTTGTGGGCTTTGATGAGGAGGAACCTACATCAAGAAGTGGAGGCAAAGC
CAAGGCAGTGCAGCAAATACGAAAGGGTCGTCTTTACAAGACTATGGCCATGATTGGAGA
TGGAGCTACTGATCTCGAAGCACGTAGACCTGGTGGCGCGGATTTGTTCATATGCTATGC
TGGAGTTCAGCTTCGTGAAGCTGTTGCAGCACAAGCAGACTGGCTTATCTTCAATTTTGA
ACCTTTCATAAACTCCTTGGACTAAAAGCCTTCTCTATACTGATTAGTTTTCCATTATTC
ATATCTCAAATTTTGTATTCTCTTTTTTTTTTAATGTGTGAAAATTCCACTGAACCGATA
CATGTGTTTGCCAACTATAGCTGTTTCATCTGTTTATTCAAAGCTTTCAATGAACGTT

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL3296Contig1 1191 2 2 U
GGGTGGCTACCAAGAGAAGATGGCAAGTAACATCATAACTAGCCTGTCAACGACACTAGT
TCTTCCCCAGAGCTTCACTCGACCTGCAAATACGAGAAGTTTTGCGGTCAGGAGGATCAA
CAGTAGATCTCACAAGTTTCTGAGGAAGTCAACGTTAAAATGTTCCTTGGAGAATCCCAT
TGAAAGCAAGGAGACTTTAAGAAAGCATTTTGTTGCAGGCTTTGCTACCATTTTGCTTCT
CTCTCAGGCAGGCCAGGGTGTTGCATTGGATCTCTCATCAGATCAGGATCACAACATTTG
TCAACTGGGAAGTGCTGCTGTGGAAGAAGACAAGCTTACTCTTCCACTTGATAGTGACCC
GGAAGAGATGATGATGATGATGATGAGAGGCTGACTGCCAAGAACTTTGACCCAGTTAGG
TACTCTGGAAGATGGTTTGAAGTAGCTTCTCTTAAGCGTGGCTTTGCTGGTCAAGGCCAA
GAAGATTGCCATTGCACACAGGGAGTATACACGTTTGATATGAAGGAACCAGCTATAAGG
GTAGACACGTTCTGCGTTCACGGTAGCCCTGATGGGTATATAACAGGAATCAGAGGAAAA
GTTCAATGCGTTGGAGCACAAGACCTGGAGAAAACCGAGACTGACTTAGAAAAGCAAGAG
ATGATTAAAGAGAAATGTTACCTTCGATTTCCCGCCATTCCTTTCATCCCCAAGTTGCCT
TATGATGTCATAGCTACAGACTATGACAACTACGCTCTTGTCTCTGGAGCCAAAGACAGG
AGCTTTGTTCAGGTATACTCAAGGACACCTAACCCGGGACCTGAGTTCATAGCCAAGTAC
AAAGACTATTTGGCACAGTTTGGGTACGACCCGGAGAAAATAAAGGATACTCCACAGGAC
TGTGAAGTGATGTCTGATGGTCAGCTAGCTGCTATGATGTCCATGCCAGGTATGGAGAAA
ACGCTGACAAACCAGTTTCCAGATCTTGAACTAAGAAAGGCAGTCCAGTTTGATCCCTTC
ACAAGTGTGTTTGAAACCTTGAAGAAACTGGTCCCACTCTATTTCAAGTAGAGAAGCTTT
TCTGCCCCCTCAAGAGTTTTTTGAATTCTGAATGTAGATTATTTATGCTTGTACACCTGA
CTGAGTGAGTGTATAGATATGAATTATTTTTTAAGATAAAGTCATATGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR47TF U 1
AF RR2BR47JQ C 442
BS 1 690 RR2BR47TF
BS 691 1191 RR2BR47JQ

RD RR2BR47TF 690 0 0
GGGTGGCTACCAAGAGAAGATGGCAAGTAACATCATAACTAGCCTGTCAACGACACTAGT
TCTTCCCCAGAGCTTCACTCGACCTGCAAATACGAGAAGTTTTGCGGTCAGGAGGATCAA
CAGTAGATCTCACAAGTTTCTGAGGAAGTCAACGTTAAAATGTTCCTTGGAGAATCCCAT
TGAAAGCAAGGAGACTTTAAGAAAGCATTTTGTTGCAGGCTTTGCTACCATTTTGCTTCT
CTCTCAGGCAGGCCAGGGTGTTGCATTGGATCTCTCATCAGATCAGGATCACAACATTTG
TCAACTGGGAAGTGCTGCTGTGGAAGAAGACAAGCTTACTCTTCCACTTGATAGTGACCC
GGAAGAGATGATGATGATGATGATGAGAGGCTGACTGCCAAGAACTTTGACCCAGTTAGG
TACTCTGGAAGATGGTTTGAAGTAGCTTCTCTTAAGCGTGGCTTTGCTGGTCAAGGCCAA
GAAGATTGCCATTGCACACAGGGAGTATACACGTTTGATATGAAGGAACCAGCTATAAGG
GTAGACACGTTCTGCGTTCACGGTAGCCCTGATGGGTATATAACAGGAATCAGAGGAAAA
GTTCAATGCGTTGGAGCACAAGACCTGGAGAAAACCGAGACTGACTTAGAAAAGCAAGAG
ATGATTAAAGAGAAATGTTACCTTCGATTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2BR47JQ 750 0 0
GTAGCTTCTCTTAAGCGTGGCTTTGCTGGTCAAGGCCAAGAAGATTGCCATTGCACACAG
GGAGTATACACGTTTGATATGAAGGAACCAGCTATAAGGGTAGACACGTTCTGCGTTCAC
GGTAGCCCTGATGGGTATATAACAGGAATCAGAGGAAAAGTTCAATGCGTTGGAGCACAA
GACCTGGAGAAAACCGAGACTGACTTAGAAAAGCAAGAGATGATTAAAGAGAAATGTTAC
CTTCGATTTCCCGCCATTCCTTTCATCCCCAAGTTGCCTTATGATGTCATAGCTACAGAC
TATGACAACTACGCTCTTGTCTCTGGAGCCAAAGACAGGAGCTTTGTTCAGGTATACTCA
AGGACACCTAACCCGGGACCTGAGTTCATAGCCAAGTACAAAGACTATTTGGCACAGTTT
GGGTACGACCCGGAGAAAATAAAGGATACTCCACAGGACTGTGAAGTGATGTCTGATGGT
CAGCTAGCTGCTATGATGTCCATGCCAGGTATGGAGAAAACGCTGACAAACCAGTTTCCA
GATCTTGAACTAAGAAAGGCAGTCCAGTTTGATCCCTTCACAAGTGTGTTTGAAACCTTG
AAGAAACTGGTCCCACTCTATTTCAAGTAGAGAAGCTTTTCTGCCCCCTCAAGAGTTTTT
TGAATTCTGAATGTAGATTATTTATGCTTGTACACCTGACTGAGTGAGTGTATAGATATG
AATTATTTTTTAAGATAAAGTCATATGAGC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL3297Contig1 1203 2 4 U
GCTCTGAAACTCGAAAATGTAATGGAAACAAGGGTATAAATAGATTGGGAAACAAATATT
ATATAGCTCACAACAAATAAGAACCCACCGTTAACTCGAGACCTCTTTTTGTTTTCTAGT
ATATAATCTATTTTGCTTATGTGTGATGGTTTCTTGAGTTTCACGGCTTATCTCCAGTCG
ATAAAAGACTTGCAAATCCTTGTGAGAGACTTCGCTCAATCATACAATGCGAGTTGGATG
AACATCTTGGACTGTCCTCGGATGATCTCATTCGTTTCAAGTATGGTGAAGAAAAAGAGT
ATCGACTTTTAGATACTTCTTCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCGTAGTCTTTGG
ATGTTTTTCTCTTTAAGCCTGGAACACTTCTTAAACCCGTGTGGTAGCGGCGATCATCTT
TATGATGCTTATCTGAAAGAGGATCTTCGTAAACGCATGATTCAGAGTCTGTGTCCCCAC
AGTTACAGGACAAGCTAGTGTTGTTCTTACTCGGTCCTAGAACACTGTACATATGCTCAA
CAAATTCATCGATGAGGACAGGCCACGCACCTTCAGAGTCATATCCTTCGAGATTCTCAT
GTACACAACGACTAAACGCCAAGACTTGTTGCCATGTATCTTCTGAAATATTGTGCCGTT
GATTTTTCTCGATGAAGTCACACCAGCGGTTAAGTAATCTAAATCTCCCAACCAAAACAA
GTTTCCATGCGGTAATAGCTTTAGATACAGTTATACTCTTCTGCCCATTCTCACGGCACA
TAAAGAACACAAAATCATAAAAGCGGGTAAACTCGGAGAAGTCCACCTACAAAAAGAAGA
ACAAAATCAAAAAGGGTTAGATCACAGGGCAGCTGGTCAAGATAAGAAGAAAAACTTGCC
ATTAAGTCCAGACGTGACATCAACTTGAACAATTCATCAAAAATGGAGTTTCTTGCCTGA
AACTTGGTCTCGACTAGAATAAAGAGGTGAGTTAAAGCTTCTTTAGAATAATTATTACTT
CTGTGTGATTCCTCGTCGTGTTTATAAATAGGACATAAAGCTTGACTTGATCGAGTCTCA
CAAAATCTGCGATATATTTCGAATATATCGAACCGACTCTGAACCGGCGAGGAATCCATG
GATTCTCTCTCGAGCTCGAAGCTTTCTTTCTCTGTTGGGAGAGAGAGGGCGATCGAAACT
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2GZ58JQ U 1
AF RR2AH11TF C 575
BS 1 679 RR2GZ58JQ
BS 680 680 RR2AH11TF
BS 681 727 RR2GZ58JQ
BS 728 1203 RR2AH11TF

RD RR2GZ58JQ 727 0 0
GCTCTGAAACTCGAAAATGTAATGGAAACAAGGGTATAAATAGATTGGGAAACAAATATT
ATATAGCTCACAACAAATAAGAACCCACCGTTAACTCGAGACCTCTTTTTGTTTTCTAGT
ATATAATCTATTTTGCTTATGTGTGATGGTTTCTTGAGTTTCACGGCTTATCTCCAGTCG
ATAAAAGACTTGCAAATCCTTGTGAGAGACTTCGCTCAATCATACAATGCGAGTTGGATG
AACATCTTGGACTGTCCTCGGATGATCTCATTCGTTTCAAGTATGGTGAAGAAAAAGAGT
ATCGACTTTTAGATACTTCTTCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCGTAGTCTTTGG
ATGTTTTTCTCTTTAAGCCTGGAACACTTCTTAAACCCGTGTGGTAGCGGCGATCATCTT
TATGATGCTTATCTGAAAGAGGATCTTCGTAAACGCATGATTCAGAGTCTGTGTCCCCAC
AGTTACAGGACAAGCTAGTGTTGTTCTTACTCGGTCCTAGAACACTGTACATATGCTCAA
CAAATTCATCGATGAGGACAGGCCACGCACCTTCAGAGTCATATCCTTCGAGATTCTCAT
GTACACAACGACTAAACGCCAAGACTTGTTGCCATGTATCTTCTGAAATATTGTGCCGTT
GATTTTTCTCGATGAAGTCGCACCAGCGGTTAAGTAATCTAAATCTCCCAACCAAAACAA
GTTTCCA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2AH11TF 629 0 0
AGAGTCATATCCTTCGAGATTCTCATGTACACAACGACTAAACGCCAAGACTTGTTGCCA
TGTATCTTCTGAAATATTGTGCCGTTGATTTTTCTCGATGAAGTCACACCAGCGGTTAAG
TAATCTAAATCTCCCAACCAAAACAAGTTTCCATGCGGTAATAGCTTTAGATACAGTTAT
ACTCTTCTGCCCATTCTCACGGCACATAAAGAACACAAAATCATAAAAGCGGGTAAACTC
GGAGAAGTCCACCTACAAAAAGAAGAACAAAATCAAAAAGGGTTAGATCACAGGGCAGCT
GGTCAAGATAAGAAGAAAAACTTGCCATTAAGTCCAGACGTGACATCAACTTGAACAATT
CATCAAAAATGGAGTTTCTTGCCTGAAACTTGGTCTCGACTAGAATAAAGAGGTGAGTTA
AAGCTTCTTTAGAATAATTATTACTTCTGTGTGATTCCTCGTCGTGTTTATAAATAGGAC
ATAAAGCTTGACTTGATCGAGTCTCACAAAATCTGCGATATATTTCGAATATATCGAACC
GACTCTGAACCGGCGAGGAATCCATGGATTCTCTCTCGAGCTCGAAGCTTTCTTTCTCTG
TTGGGAGAGAGAGGGCGATCGAAACTCCC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 3

CO CL3298Contig1 783 3 10 U
CGCAGACAGAACATGGCGGCTTCATCTCATCTCTTTGCAATCCCTTCGCGTCTTCAGACA
GCCTCTTCTCCGTTTATCTCCGCACCAAACCGGAATCGAGTTCGTATCCTCACCAAATCA
TGCCCGGACAATCAGAGCTTCGGTTCCAACGATTCGGATACTTCACCGGAGACAACCAAC
GAAACCCAGGGGGAACAGAAATCGATGTCAAGGAGACAGTGGATGATGACATGCGCGTGC
TTATCTCCAGCTTTAATTACCAATGCTTATACCTTTGTCTCTGTACAAAACGCAGCCGCT
TTAGACAAGAAACCAGGTGTTTGCCGTAACTGTCAGGGCATTGGTGCTGTTCTCTGTGAT
ATGTGTGGAGGTACAGGAAAATGGAAAGCTCTCAACCGAAAACGTGCCAAAGATGTATAT
GAGTTTACAGAATGTCCAAACTGTTACGGTCGAGGCAAACTAGTTTGTCCGGTCTGTTTA
GGTACAGGTTTACCAAACAACAAAGGACTCCTTAGAAGGCCTGGTGCTCGTGAGCTACTC
GACAAGATGTACAATGGTCGTCTTCTTCCCAATTCATGAGCAGATTGTTACTGCAAAATT
GCTTTTAAGCACAGAGGCAATAGTTATGAATTATAGATGAGGAAGAAAGCTAATACATTG
TGGACGCATGGGAAGCTATAGGAGAACGTGTTTTTGTAATGCTGCTAGCTTTGTGTTGTA
AATTCGAGTTAAAAATACTCCATGCCATAATGTAAGATGTTAGGCATAAAAAGCATATTA
AAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2CS14TF U 1
AF RR2AG57JQ C 315
AF RR2AG57TF U 315
BS 1 445 RR2CS14TF
BS 446 446 RR2AG57TF
BS 447 500 RR2CS14TF
BS 501 501 RR2AG57TF
BS 502 509 RR2CS14TF
BS 510 510 RR2AG57TF
BS 511 539 RR2CS14TF
BS 540 540 RR2AG57TF
BS 541 613 RR2CS14TF
BS 614 783 RR2AG57TF

RD RR2CS14TF 631 0 0
CGCAGACAGAACATGGCGGCTTCATCTCATCTCTTTGCAATCCCTTCGCGTCTTCAGACA
GCCTCTTCTCCGTTTATCTCCGCACCAAACCGGAATCGAGTTCGTATCCTCACCAAATCA
TGCCCGGACAATCAGAGCTTCGGTTCCAACGATTCGGATACTTCACCGGAGACAACCAAC
GAAACCCAGGGGGAACAGAAATCGATGTCAAGGAGACAGTGGATGATGACATGCGCGTGC
TTATCTCCAGCTTTAATTACCAATGCTTATACCTTTGTCTCTGTACAAAACGCAGCCGCT
TTAGACAAGAAACCAGGTGTTTGCCGTAACTGTCAGGGCATTGGTGCTGTTCTCTGTGAT
ATGTGTGGAGGTACAGGAAAATGGAAAGCTCTCAACCGAAAACGTGCCAAAGATGTATAT
GAGTTTACAGAATGTCCAAACTGTTGCGGTCGAGGCAAACTAGTTTGTCCGGTCTGTTTA
GGTACAGGTTTACCAAACAATAAAGGACTTCTTAGAAGGCCTGGTGCTCGTGAGCTACTT
GACAAGATGTACAATGGTCGTCTTCTTCCCAATTCATGAGCAGATTGTTACTGCAAAATT
GCTTTTAAGCACA
ATAGTTATGAATTATAGA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2AG57JQ 469 0 0
G
GGTGTTTGCCGTAACTGTCAGGGCATTGGTGCTGTTCTCTGTGATATGTGTGGAGGTACA
GGAAAATGGAAAGCTCTCAACCGAAAACGTGCCAAAGATGTATATGAGTTTACAGAATGT
CCAAACTGTTACGGTCGAGGCAAACTAGTTTGTCCGGTCTGTTTAGGTACAGGTTTACCA
AACAACAAAGGACTCCTTAGAAGGCCTGGTGCTCGTGAGCTACTCGACAAGATGTACAAT
GGTCGTCTTCTTCCCAATTCATGAGCAGATTGTTACTGCAAAATTGCTTTTAAGCACAGA
GGCAATAGTTATGAATTATAGATGAGGAAGAAAGCTAATACATTGTGGACGCATGGGAAG
CTATAGGAGAACGTGTTTTTGTAATGCTGCTAGCTTTGTGTTGTAAATTCGAGTTAAAAA
TACTCCATGCCATAATGTAAGATGTTAGGCATAAAAAGCATATTAAAG

QA 2 469 2 469
DS 

RD RR2AG57TF 469 0 0
G
GGTGTTTGCCGTAACTGTCAGGGCATTGGTGCTGTTCTCTGTGATATGTGTGGAGGTACA
GGAAAATGGAAAGCTCTCAACCGAAAACGTGCCAAAGATGTATATGAGTTTACAGAATGT
CCAAACTGTTACGGTCGAGGCAAACTAGTTTGTCCGGTCTGTTTAGGTACAGGTTTACCA
AACAACAAAGGACTCCTTAGAAGGCCTGGTGCTCGTGAGCTACTCGACAAGATGTACAAT
GGTCGTCTTCTTCCCAATTCATGAGCAGATTGTTACTGCAAAATTGCTTTTAAGCACAGA
GGCAATAGTTATGAATTATAGATGAGGAAGAAAGCTAATACATTGTGGACGCATGGGAAG
CTATAGGAGAACGTGTTTTTGTAATGCTGCTAGCTTTGTGTTGTAAATTCGAGTTAAAAA
TACTCCATGCCATAATGTAAGATGTTAGGCATAAAAAGCATATTAAAG

QA 2 469 2 469
DS 



AS 1 3

CO CL3299Contig1 1233 3 7 U
GGAACGGTGACTTGTTCTCTAATCGCTAGACCTATTTCTAGGCTCCTCCTTTGTAGCTGA
GTTTGCAGTTAACAAATTTAACCAGAAATGTCTCAAATGAATCTACCGTTCGAAGTTGGT
CACACCATCGAAGCAAGATCTTTCGAATTGGGTTTCCGTGGAGCATGGTTTCGATGCAAG
ATTACAAAGATATTCAACAAAGGGCGAGCTTTATTCTACGATTTGGAGTACCTTGATTTC
ACAGAAGAAGGAATACACACAACAAAAGTATTCCAAAAACGCCAAGGCGAGAACGAGAGT
ACCCTAATGGTTCGACCCATACGTCCACCTCATGAAAGTGAAGTCCTTGACGAGGAAGAA
GAAGAAGTTGTTGTTGTTGTTAACGGTGTTTGGAAGCTGGGAGACTTGGTGGATTGGTGG
AAAGACGATTGCTATTGGTCTGGGACGGTTCTAGAAGTCAGAGAAGAAGATGAATCGGCT
AAGATTGAGTTGTTGCCTGAACCGTATGGAGAAGGAAAAAACTATGATGCTGTGTTTAAG
GATTTGCGTCCTTCCTTGGAATGGTCACTCGAAGATGGATGGATTGTCCCTTTCTCTAAG
GATGGGGAAAAGAGGCAGTGTGCTAAGCTAATGAAACTTCCAAATGAAGGAGCTGAAGAA
AAAATTAGAGAAGAAGAAAAGCTGAGACCTACAAAGAAGCTAGTAGGAGATGAGGATCTA
GCGTTGAATATCATGGAATCAGAGTTTATAGAAGCCGCTGTGATGGACTTAGAAGAGATA
GTTGTTCGAATAGAGTGGATTAAGGGAATGTTGTCGCTAAATTCAGAAAATTCAACCTGG
ACATATGAGGACTATCATCCATCCTCCTAAAAAAACAATGTGACAGGTAAGATATATTTT
TAACTTTTGCCAATGATCACCATTTTTGATGGATTCTAAAGAAAGGCAGTCCTTAGGGGG
GAGAGGAGTAGAGTAAAAGATGTAAATGAGGGTAAGACCAAGGTGGATCATACCTGACAC
GTTTTGTGAAATTGAAAACAGAACATGACACTGTTTCTTAGTTGTCTTTAGTTTAGGTAT
TTTGGTTTCCCCTGTTTTTTTTCTGTTTGTTGATATACTTTGCAGCTATTTCCTTGTATT
TTACCTCGAACCTACTTTTGGCTTTTAAATTCTTGTTAGTTTCACGCTCAGATCTCCAAG
GCTTCCCTTATTCAGATACAATATTGAGACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG89TF U 1
AF RR2BG89JQ C 625
AF RR2EP75TF U 932
BS 1 702 RR2BG89TF
BS 703 931 RR2BG89JQ
BS 932 958 RR2EP75TF
BS 959 959 RR2BG89JQ
BS 960 967 RR2EP75TF
BS 968 968 RR2BG89JQ
BS 969 1233 RR2EP75TF

RD RR2BG89TF 702 0 0
GGAACGGTGACTTGTTCTCTAATCGCTAGACCTATTTCTAGGCTCCTCCTTTGTAGCTGA
GTTTGCAGTTAACAAATTTAACCAGAAATGTCTCAAATGAATCTACCGTTCGAAGTTGGT
CACACCATCGAAGCAAGATCTTTCGAATTGGGTTTCCGTGGAGCATGGTTTCGATGCAAG
ATTACAAAGATATTCAACAAAGGGCGAGCTTTATTCTACGATTTGGAGTACCTTGATTTC
ACAGAAGAAGGAATACACACAACAAAAGTATTCCAAAAACGCCAAGGCGAGAACGAGAGT
ACCCTAATGGTTCGACCCATACGTCCACCTCATGAAAGTGAAGTCCTTGACGAGGAAGAA
GAAGAAGTTGTTGTTGTTGTTAACGGTGTTTGGAAGCTGGGAGACTTGGTGGATTGGTGG
AAAGACGATTGCTATTGGTCTGGGACGGTTCTAGAAGTCAGAGAAGAAGATGAATCGGCT
AAGATTGAGTTGTTGCCTGAACCGTATGGAGAAGGAAAAAACTATGATGCTGTGTTTAAG
GATTTGCGTCCTTCCTTGGAATGGTCACTCGAAGATGGATGGATTGTCCCTTTCTCTAAG
GATGGGGAAAAGAGGCAGTGTGCTAAGCTAATGAAACTTCCAAATGAAGGAGCTGAAGAA
AAAATTAGAGAAGAAGAAAAGCTGAGACCTACAAAGAAGCTA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2BG89JQ 545 0 0
AAGCTAATGAAACTTCCAAATGAAGGAGCTGAAGAAAAAATTAGAGAAGAAGAAAAGCTG
AGACCTACAAAGAAGCTAGTAGGAGATGAGGATCTAGCGTTGAATATCATGGAATCAGAG
TTTATAGAAGCCGCTGTGATGGACTTAGAAGAGATAGTTGTTCGAATAGAGTGGATTAAG
GGAATGTTGTCGCTAAATTCAGAAAATTCAACCTGGACATATGAGGACTATCATCCATCC
TCCTAAAAAAACAATGTGACAGGTAAGATATATTTTTAACTTTTGCCAATGATCACCATT
TTTGATGGATTTTAAAGAAAGGCAGTCCTTAGGGGGGAGAGGAGTAGAGTAAAAGATGTA
AATGAGGGTAAGACCAAGGTGGATCATACCTGACACGTTTTGTGAAATTGAAAACAGAAC
ATGACACTGTTTTTTAGTTGTCTTTAGTTTAGGTATTTTGGTTTCCCCTGTTTTTTTTCT
GTTTGTTGATATACTTTGCAGCTATTTCCTTGTATTTTACCTCGAACCTACTTTTGGCTT
TTAAA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2EP75TF 302 0 0
GATTCTAAAGAAAGGCAGTCCTTAGGGTGGAGAGGATTAGAGTAAAAGATGTAAATGAGG
GTAAGACCAAGGTGGATCATACCTGACACGTTTTGTGAAATTGAAAACAGAACATGACAC
TGTTTCTTAGTTGTCTTTAGTTTAGGTATTTTGGTTTCCCCTGTTTTTTTTCTGTTTGTT
GATATACTTTGCAGCTATTTCCTTGTATTTTACCTCGAACCTACTTTTGGCTTTTAAATT
CTTGTTAGTTTCACGCTCAGATCTCCAAGGCTTCCCTTATTCAGATACAATATTGAGACT
TT

QA 1 302 1 302
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3301Contig1 219 3 3 U
GGTGGCCATCACTGATGAGTGATGAGGCTCATGATCATACATTCGTACGTTGTTATTATT
TAATTACGTGAAACAGTGAGATTAATTATTGAGTAATTATTCAATAAAATGATACATTAG
CAATTGTGATTTGTGAGTCGTATTGTATGCTATTATTAATTTATTATGTTATGCTTTGGT
TGGTTTCAAGTTTGGTTAATAAAATAGTCGATTTGCGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B849JQ C 1
AF RR2DP47TF U 39
AF RR2B849TF U 1
BS 1 39 RR2B849TF
BS 40 197 RR2DP47TF
BS 198 219 RR2B849TF

RD RR2B849JQ 219 0 0
GGTGGCCATCACTGATGAGTGATGAGGCTCATGATCATACATTCGTACGTTGTTATTATT
TAATTACGTGAAACAGTGAGATTAATTATTGAGTAATTATTCAATAAAATGATACATTAG
CAATTGTGATTTGTGAGTCGTATTGTATGCTATTATTAATTTATTATGTTATGCTTTGGT
TGGTTTCAAGTTTGGTTAATAAAATAGTCGATTTGCGTC

QA 1 219 1 219
DS 

RD RR2DP47TF 159 0 0
G
CATTCGTACGTTGTTATTATTTAATTACGTGAAACAGTGAGATTAATTATTGAGTAATTA
TTCAATAAAATGATACATTAGCAATTGTGATTTGTGAGTCGTATTGTATGCTATTATTAA
TTTATTATGTTATGCTTTGGTTGGTTTCAAGTTTGGTT

QA 2 159 2 159
DS 

RD RR2B849TF 219 0 0
GGTGGCCATCACTGATGAGTGATGAGGCTCATGATCATACATTCGTACGTTGTTATTATT
TAATTACGTGAAACAGTGAGATTAATTATTGAGTAATTATTCAATAAAATGATACATTAG
CAATTGTGATTTGTGAGTCGTATTGTATGCTATTATTAATTTATTATGTTATGCTTTGGT
TGGTTTCAAGTTTGGTTAATAAAATAGTCGATTTGCGTC

QA 1 219 1 219
DS 



AS 1 3

CO CL3302Contig1 1599 3 5 U
CTTCTCCCGGATCAGCCTACCAACTCTTCAGCTCCGGGAACTCCTTCCTTCTCTCTCTAC
TCCGGCCGATTTTCGGAGCTTGTGAGAATATCAAAGAGGAGGGATGAATCGCCCAAAGGT
ACAGCGTCGTATTGGTAAGTATGAGGTTGGGAAAACGATTGGACAAGGCACTTTTGCTAA
AGTTAGGTATGCTAAGAACACCGAGACTGGAGAATCAGTGGCTCTTAAGATCCTTGATAA
AGAGAAGGTTCTCAAGAACAAGATGTCTGAACAGATAAGGAGAGAGATCTCTACTATGAA
GCTGATAAACCATCCTAATGTCGTCCGCCTCTATGAGGTTTTGGCGAGCAAGACAAAGAT
ATACATTGTCCTCGAATTCGGCATTGGTGGAGAGCTTTTTGACAAAATTGTGCATGATGG
GCGGTTGCAAGAAGATGCAGCACGGAAATATTTCCAGCAGCTTATCAATGCTGTTGATTA
CTGCCACAGCAGGGGAGTTTACCACAGAGACTTAAAGCCGGAAAACTTGCTTTTAGATGC
TCAAGGAAATCTGAAAGTCTCTGATTTTGGATTGAGTGCCTTGTCCAGACAAGTCAGGGG
AGATGGTCTTCTGCACACTGCATGCGGAACTCCAAACTATGCTGCTCCTGAGGTTCTTAA
TGATCAAGGCTATGATGGGGCAACCGCAGACTTGTGGTCTTGTGGAGTGATACTCTTTGT
ACTACTTGCTGGTTATTTGCCTTTCGAGGATTCTAATCTCATGACGCTCTATAAAAAGAT
AACAGCTGCTGAATATAACTTTCCTCCTTGGCTGTCTCCTGGCGCCAAGAACTTGATCCA
CCGAATCTTGGATCCAAACCCGGTGACTCGTATCACAGTTCAAGAGATTCTGGAAGATGG
GTGGTTCAAGAAAAACTACAAGCCAGCTGTTTTCGAGGAGAAAGAAGAAGCAAACTTGGA
TGATGTAGAAGCTGTTTTCAAAGACTCAGAAGAGCATCATGTCACAGAAAAGAAAGAGGA
GCAGCCGACTTCTATGAATGCCTTTGAGTTGATATCAATGTCAAGAGCTTTGGATCTTGG
GAACTTGTTTGAAGAAGAAGAGGGATACAAAAGAGAAACAAGATTTGCAGCTACGGGCGC
TGCTAATGAATTAGTCCAGAAGATTGAAGAAGCTTCTAAGCCTCTTGGTTTCGATATTCA
GAAGAAAAACTATAAGATGAGACTTGAAAACGTGAATGCAGGAAGGAAAGGAAACCTAAA
AGTGGCGACTGAGATATTTCAAGTATCACCGTCTCTTCATATGGTGGAAGTCCGGAAAAC
TAAAGGAGATACATTAGAGTTCCATAAGTTCTACAAGAAGCTCTCCACCACACTTAACGA
TGTGGTTTGGAAATCCGGCGAGAGCTCTGGACTAAACAACAAATAAGAACAAAACTGGAT
TCAACTCTCTTTGGTCTTATTCTGTATTATCTTTTGTTTCTTGTTTCTTTTTATTGGACT
CGATTCTTTTCAACAATTTTAGAGACCTTGACTCTCTGTACAATATCCAAGGATGTGCAA
GTGAAGTGTTTATTATATATTTACATACTTCGATTGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG68TF U 1
AF RR2EA61TF U 536
AF RR2EA61JQ C 988
BS 1 612 RR2BG68TF
BS 613 613 RR2EA61TF
BS 614 776 RR2BG68TF
BS 777 1203 RR2EA61TF
BS 1204 1599 RR2EA61JQ

RD RR2BG68TF 777 0 0
CTTCTCCCGGATCAGCCTACCAACTCTTCAGCTCCGGGAACTCCTTCCTTCTCTCTCTAC
TCCGGCCGATTTTCGGAGCTTGTGAGAATATCAAAGAGGAGGGATGAATCGCCCAAAGGT
ACAGCGTCGTATTGGTAAGTATGAGGTTGGGAAAACGATTGGACAAGGCACTTTTGCTAA
AGTTAGGTATGCTAAGAACACCGAGACTGGAGAATCAGTGGCTCTTAAGATCCTTGATAA
AGAGAAGGTTCTCAAGAACAAGATGTCTGAACAGATAAGGAGAGAGATCTCTACTATGAA
GCTGATAAACCATCCTAATGTCGTCCGCCTCTATGAGGTTTTGGCGAGCAAGACAAAGAT
ATACATTGTCCTCGAATTCGGCATTGGTGGAGAGCTTTTTGACAAAATTGTGCATGATGG
GCGGTTGCAAGAAGATGCAGCACGGAAATATTTCCAGCAGCTTATCAATGCTGTTGATTA
CTGCCACAGCAGGGGAGTTTACCACAGAGACTTAAAGCCGGAAAACTTGCTTTTAGATGC
TCAAGGAAATCTGAAAGTCTCTGATTTTGGATTGAGTGCCTTGTCCAGACAAGTCAGGGG
AGATGGTCTTCTTCACACTGCATGCGGAACTCCAAACTATGCTGCTCCTGAGGTTCTTAA
TGATCAAGGCTATGATGGGGCAACCGCAGACTTGTGGTCTTGTGGAGTGATACTCTTTGT
ACTACTTGCTGGTTATTTGCCTTTCGAGGATTCTAATCTCATGACGCTCTATAAAA
G

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2EA61TF 668 0 0
AGATGCA
AAGGAAATCTGAAAGTCTCTGATTTTGGATTGAGTGCCTTGTCCAGACAAGTCAGGGGAG
ATGGTCTTCTGCACACTGCATGCGGAACTCCAAACTATGCTGCTCCTGAGGTTCTTAATG
ATCAAGGCTATGATGGGGCAACCGCAGACTTGTGGTCTTGTGGAGTGATACTCTTTGTAT
TACTTGCTGGTTATTTGCCTTTCGAGGATTCTAATCTCATGACGCTCTATAAAAAGATAA
CAGCTGCTGAATATAACTTTCCTCCTTGGCTGTCTCCTGGCGCCAAGAACTTGATCCACC
GAATCTTGGATCCAAACCCGGTGACTCGTATCACAGTTCAAGAGATTCTGGAAGATGGGT
GGTTCAAGAAAAACTACAAGCCAGCTGTTTTCGAGGAGAAAGAAGAAGCAAACTTGGATG
ATGTAGAAGCTGTTTTCAAAGACTCAGAAGAGCATCATGTCACAGAAAAGAAAGAGGAGC
AGCCGACTTCTATGAATGCCTTTGAGTTGATATCAATGTCAAGAGCTTTGGATCTTGGGA
ACTTGTTTGAAGAAGAAGAGGGATACAAAAGAGAAACAAGATTTGCAGCTACGGGCGCTG
CTAATGAATTAGTCCAGAAGATTGAAGAAGCTTCTAAGCCTCTTGGTTTCGATATTCAGA
A

QA 8 668 8 668
DS 

RD RR2EA61JQ 612 0 0
AGAAGAGCATCATGTCACAGAAAAGAAAGAGGAGCAGCCGACTTCTATGAATGCCTTTGA
GTTGATATCAATGTCAAGAGCTTTGGATCTTGGGAACTTGTTTGAAGAAGAAGAGGGATA
CAAAAGAGAAACAAGATTTGCAGCTACGGGCGCTGCTAATGAATTAGTCCAGAAGATTGA
AGAAGCTTCTAAGCCTCTTGGTTTCGATATTCAGAAGAAAAACTATAAGATGAGACTTGA
AAACGTGAATGCAGGAAGGAAAGGAAACCTAAAAGTGGCGACTGAGATATTTCAAGTATC
ACCGTCTCTTCATATGGTGGAAGTCCGGAAAACTAAAGGAGATACATTAGAGTTCCATAA
GTTCTACAAGAAGCTCTCCACCACACTTAACGATGTGGTTTGGAAATCCGGCGAGAGCTC
TGGACTAAACAACAAATAAGAACAAAACTGGATTCAACTCTCTTTGGTCTTATTCTGTAT
TATCTTTTGTTTCTTGTTTCTTTTTATTGGACTCGATTCTTTTCAACAATTTTAGAGACC
TTGACTCTCTGTACAATATCCAAGGATGTGCAAGTGAAGTGTTTATTATATATTTACATA
CTTCGATTGTAG

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL3303Contig1 769 2 6 U
CGAGAGAAGAGAGACTCATAAGCGCTCTCCCTCTCCCTCTTTCTCTTTATATATTTTTAT
AAATACACATTCTCAGATTCTTTGCCTCCTCTCCTCTCCTCTCCTCGACGTCGTTGATTT
GAGAATAGAAGAATTGGATTTTTTTTTAAAATACAATTAAAAAAAAGAAGAAGAGAGATG
GGTTACATAGGAGCACATGGGGTAGCAGCGCTTCATGGACACAAATACAGTGGTGTGGAT
CACTCTTATCTTGCCAAATACGTTCTCCAACCCTTTTGGAATCGTTTCGTCAAAATCTTC
CCTCTCTGGATGCCACCCAACATGATAACACTTACGGGGTTCATGTTTCTCATCATATCT
GCGCTGTTAGGCTATGTCTACTCACCTCAGTTGAATTCTCCTCCTCCTCGATGGGTTCAC
TTGGTACATGGACTACTTCTCTTTTTGTATCAGACATTTGATGCGGTTGATGGGAAGCAA
GCACGAAGAACTAACTCCAGTAGCCCACTCGGAGAGCTCTTTGATCATGGTTGCGATGCA
CTTGCTTGTGCGTTTGAAACAATGGCGTATGGGAGTACTGCTATGTGTGGAAGAGACACG
TTCTGGTTCTGGATCATTTCAGCTGTTCCATTTATTGGTTCTACATGGGAAACCTATTTT
ACCAATATACTTACTCTTCCGGTAGTCAATGGTCCTACAGAAGGTCTTGCACTTATATAC
TGTGGTCACTTCTTCACACCCATTGTTGGTGCTGAATGGTGGGCTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI62TF U 1
AF RR2EY41TF U 534
BS 1 560 RR2DI62TF
BS 561 561 RR2EY41TF
BS 562 681 RR2DI62TF
BS 682 682 RR2EY41TF
BS 683 694 RR2DI62TF
BS 695 769 RR2EY41TF

RD RR2DI62TF 694 0 0
CGAGAGAAGAGAGACTCATAAGCGCTCTCCCTCTCCCTCTTTCTCTTTATATATTTTTAT
AAATACACATTCTCAGATTCTTTGCCTCCTCTCCTCTCCTCTCCTCGACGTCGTTGATTT
GAGAATAGAAGAATTGGATTTTTTTTTAAAATACAATTAAAAAAAAGAAGAAGAGAGATG
GGTTACATAGGAGCACATGGGGTAGCAGCGCTTCATGGACACAAATACAGTGGTGTGGAT
CACTCTTATCTTGCCAAATACGTTCTCCAACCCTTTTGGAATCGTTTCGTCAAAATCTTC
CCTCTCTGGATGCCACCCAACATGATAACACTTACGGGGTTCATGTTTCTCATCATATCT
GCGCTGTTAGGCTATGTCTACTCACCTCAGTTGAATTCTCCTCCTCCTCGATGGGTTCAC
TTGGTACATGGACTACTTCTCTTTTTGTATCAGACATTTGATGCGGTTGATGGGAAGCAA
GCACGAAGAACTAACTCCAGTAGCCCACTCGGAGAGCTCTTTGATCATGGTTGCGATGCA
CTTGCTTGTGCGTTTGAAACGATGGCGTATGGGAGTACTGCTATGTGTGGAAGAGACACG
TTCTGGTTCTGGATCATTTCAGCTGTTCCATTTATTGGTTCTACATGGGAAACCTATTTT
ACCAATATACTTACTCTTCCG*TAGTCAATGGTC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2EY41TF 236 0 0
G
GATGCACTTGCTTGTGCGTTTGAAACAATGGCGTATGGGAGTACTGCTATGTGTGGAAGA
GACACGTTCTGGTTCTGGATCATTTCAGCTGTTCCATTTATTGGTTCTACATGGGAAACC
TATTTTACCAATATACTTACTCTTCCGGTAGTCAATGGTCCTACAGAAGGTCTTGCACTT
ATATACTGTGGTCACTTCTTCACACCCATTGTTGGTGCTGAATGGTGGGCTCAGC

QA 2 236 2 236
DS 



AS 1 3

CO CL3304Contig1 1016 3 2 U
GGTTTTAGTAGTTAACACCTAAAGTTACTTGTAATGGGTCGAATGATCACGTCAAATATG
GTGCAGGTAACAAATAAAACACACTTATTCGTAGAAGTGTATTATAGTTGCACCCTTACT
CCATTTTCCCACTGATTTGAACGATTATTCTATGTGGTTATAATTTAAAATGAATCTATA
GATATAAACTATTGTAATTTATTTATTTTATCGCTTGTATGCATTAAAGATAACTCGTAA
TTGGCGAGTTCTTTTCAATACGTAAACTACACAAAGAAAAAGAGCTGCACAAACATAAAG
AGAAACCCACAGGCAAAGAGAGAGACAGTAAGTAACAACATCAAAATTGTTCAAAATATT
CTCCATATAAGCCCTTTAGCGTTTCATCAGTTTCTTGTCTTACATTATGAAACATGAGTT
TGGATTCTCGTCGCTGAATAGTTGAGGCGGGTAAGCATGAGGCGGCATTTCCATAGGAGG
GACCGCCACACGCGGTGGTTGGTAATAATAGTAGTAATAAGGATTATCTATCTTCCTCAC
ATCCACAACTTTTCCCTCTTCCTCGCCGCTGCCGCCACCGCTTTCAGCTGCTTTGCCTTC
CCCTTTGTCACCATCCCCTTCTTTCTTTTCTTCCTTCTCTTTGGACTCTCCTCCGCCATT
GTCCCCTTTTCCTTCTTCTTTCTCCTCTGCTTCAGCCGCGGCAGCTGCTTCCTCAGGTGG
CGGTGGAGGTGGTGGGTCAATTTTCATAATGGCAGCATGTTTTCCAGTCCGTTTATAAAT
GTGTTCAACGAGCTTTTGCGGTTCAAACACTCCTTTCACCGTCACTTGAGAACCCTTTAA
ATCAGATTCAGCAGATTCCACTCCTAAAAGTTATACGTTTCAAACAAAAAAGTCATTAAG
AAAAAAGTATAATAGTACTATCAAAGTGAAGGGATGAATGCACTTTGACCCCACTACCCA
TGCTTTCGATAAATAAGATGAGTCAGATGCCATGAATAAATAAATAACACGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A871TF U 1
AF RR2EQ36JQ U 571
AF RR2A871JQ C 489
BS 1 711 RR2A871TF
BS 712 1016 RR2A871JQ

RD RR2A871TF 712 0 0
GGTTTTAGTAGTTAACACCTAAAGTTACTTGTAATGGGTCGAATGATCACGTCAAATATG
GTGCAGGTAACAAATAAAACACACTTATTCGTAGAAGTGTATTATAGTTGCACCCTTACT
CCATTTTCCCACTGATTTGAACGATTATTCTATGTGGTTATAATTTAAAATGAATCTATA
GATATAAACTATTGTAATTTATTTATTTTATCGCTTGTATGCATTAAAGATAACTCGTAA
TTGGCGAGTTCTTTTCAATACGTAAACTACACAAAGAAAAAGAGCTGCACAAACATAAAG
AGAAACCCACAGGCAAAGAGAGAGACAGTAAGTAACAACATCAAAATTGTTCAAAATATT
CTCCATATAAGCCCTTTAGCGTTTCATCAGTTTCTTGTCTTACATTATGAAACATGAGTT
TGGATTCTCGTCGCTGAATAGTTGAGGCGGGTAAGCATGAGGCGGCATTTCCATAGGAGG
GACCGCCACACGCGGTGGTTGGTAATAATAGTAGTAATAAGGATTATCTATCTTCCTCAC
ATCCACAACTTTTCCCTCTTCCTCGCCGCTGCCGCCACCGCTTTCAGCTGCTTTGCCTTC
CCCTTTGTCACCATCCCCTTCTTTCTTTTCTTCCTTCTCTTTGGACTCTCCTCCGCCATT
GTCCCCTTTTCCTTCTTCTTTCTCCTCTGCTTCAGCCGCGGCAGCTGCTTC
T

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2EQ36JQ 118 0 0
GCCGCCACCGCTTTCAGCTGCTTTGCCTTCCCCTTTGTCACCATCCCCTTCCTTCTTTTC
GTCCTTCTCTTTGGACTCTCCTCCGCCGTTGTCCCCTTTTCCTTCTTCTTTCTTCTCT

QA 1 118 1 118
DS 

RD RR2A871JQ 528 0 0
CACGCGGTGGTTGGTAATAATAGTAGTAATAAGGATTATCTATCTTCCTCACATCCACAA
CTTTTCCCTCTTCCTCGCCGCTGCCGCCACCGCTTTCAGCTGCTTTGCCTTCCCCTTTGT
CACCATCCCCTTCTTTCTTTTCTTCCTTCTCTTTGGACTCTCCTCCGCCATTGTCCCCTT
TTCCTTCTTCTTTCTCCTCTGCTTCAGCCGCGGCAGCTGCTTCCTCAGGTGGCGGTGGAG
GTGGTGGGTCAATTTTCATAATGGCAGCATGTTTTCCAGTCCGTTTATAAATGTGTTCAA
CGAGCTTTTGCGGTTCAAACACTCCTTTCACCGTCACTTGAGAACCCTTTAAATCAGATT
CAGCAGATTCCACTCCTAAAAGTTATACGTTTCAAACAAAAAAGTCATTAAGAAAAAAGT
ATAATAGTACTATCAAAGTGAAGGGATGAATGCACTTTGACCCCACTACCCATGCTTTCG
ATAAATAAGATGAGTCAGATGCCATGAATAAATAAATAACACGTGTTT

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 3

CO CL3305Contig1 803 3 4 U
TCTGAAGGCTCTTTGTGAAGATACTAAGAACACTGTGTTTATTGTTAGTGGGAGAGGACC
GGAGTCTTTGAGCGAGTGGTTGTCTCCTTGTGAGAATCTTGGTATAGCTGCTGAACATGG
ATACTTCATAAGGTGGAATAGCAAGAAAGAGTGGGAGACTTGTTACTCGTCAACGGGTAC
AGAGTGGAAGGCAATGGTGGAGCCTGTGATGAGATCATACATGGAGGCAACAGATGGGTC
GAGTATAGAGTTTAAAGAGAGTGCTCTTGTGTGGCATCATCAGGATGCTGATCCGGACTT
TGGATCTTGTCAAGCTAAGGAGCTTCTTGATCATCTAGAGAGTGTGCTTGCGAATGAGCC
TGTTGTTGTCAAGAGAGGTCAACACATTGTTGAAGTAAAACCACAGGGTGTAAGCAAAGG
TCTAGCTTGTGAGAAAGTGATCAGAGGAATGGTTGAACGTGGGGAACCGCCAGAGATGGT
GATATGCATAGGAGATGATAGGTCGGATGAGGATATGTTTGAGGGTATGTTGAGTACTGT
GACAAATCCAGAGCTTCTGATTCAGCCAGAGGTTTTTGCCTGCACTGTTGGGAGAAAACC
AAGTAAGGCTAAGTACTTTTTGGATGATGTAGCTGATGTGCTTAAGCTACTAAAAGGTTT
GGGGGATTCATCGTTGAGCTTGAAGACCACTTCTCACACAGAAGTTGCATTTGAAAGCAT
CTTTTAAAAGTGGGAAGTGTCAAAAAATAACCAGAGTTAAATTTACTTAACATCAAAATG
TAAAAAAAGAAAATGAGAAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AK40TF U 1
AF RR2BN90JQ C 231
AF RR2BN90TF U 231
BS 1 241 RR2AK40TF
BS 242 242 RR2BN90TF
BS 243 316 RR2AK40TF
BS 317 803 RR2BN90TF

RD RR2AK40TF 316 0 0
TCTGAAGGCTCTTTGTGAAGATACTAAGAACACTGTGTTTATTGTTAGTGGGAGAGGACC
GGAGTCTTTGAGCGAGTGGTTGTCTCCTTGTGAGAATCTTGGTATAGCTGCTGAACATGG
ATACTTCATAAGGTGGAATAGCAAGAAAGAGTGGGAGACTTGTTACTCGTCAACGGGTAC
AGAGTGGAAGGCAATGGTGGAGCCTGTGATGAGATCATACATGGAGGCAACAGATGGGTC
GGGTATAGAGTTTAAAGAGAGTGCTCTTGTGTGGCATCATCAGGATGCTGATCCGGACTT
TGGATCTTGTCAAGCT

QA 1 316 1 316
DS 

RD RR2BN90JQ 573 0 0
G
AGATGGGTCGAGTATAGAGTTTAAAGAGAGTGCTCTTGTGTGGCATCATCAGGATGCTGA
TCCGGACTTTGGATCTTGTCAAGCTAAGGAGCTTCTTGATCATCTAGAGAGTGTGCTTGC
GAATGAGCCTGTTGTTGTCAAGAGAGGTCAACACATTGTTGAAGTAAAACCACAGGGTGT
AAGCAAAGGTCTAGCTTGTGAGAAAGTGATCAGAGGAATGGTTGAACGTGGGGAACCGCC
AGAGATGGTGATATGCATAGGAGATGATAGGTCGGATGAGGATATGTTTGAGGGTATGTT
GAGTACTGTGACAAATCCAGAGCTTTTGATTCAGCCAGAGGTTTTTGCCTGCACTGTTGG
GAGAAAACCAAGTAAGGCTAAGTACTTTTTGGATGATGTAGCTGATGTGCTTAAGCTACT
AAAAGGTTTGGGGGATTCATCGTTGAGCTTGAAGACCACTTCTCACACAGAAGTTGCATT
TGAAAGCATCTTTTAAAAGTGGGAAGTGTCAAAAAATAACCAGAGTTAAATTTACTTAAC
ATCAAAATGTAAAAAAAGAAAATGAGAAATGG

QA 2 573 2 573
DS 

RD RR2BN90TF 573 0 0
G
AGATGGGTCGAGTATAGAGTTTAAAGAGAGTGCTCTTGTGTGGCATCATCAGGATGCTGA
TCCGGACTTTGGATCTTGTCAAGCTAAGGAGCTTCTTGATCATCTAGAGAGTGTGCTTGC
GAATGAGCCTGTTGTTGTCAAGAGAGGTCAACACATTGTTGAAGTAAAACCACAGGGTGT
AAGCAAAGGTCTAGCTTGTGAGAAAGTGATCAGAGGAATGGTTGAACGTGGGGAACCGCC
AGAGATGGTGATATGCATAGGAGATGATAGGTCGGATGAGGATATGTTTGAGGGTATGTT
GAGTACTGTGACAAATCCAGAGCTTCTGATTCAGCCAGAGGTTTTTGCCTGCACTGTTGG
GAGAAAACCAAGTAAGGCTAAGTACTTTTTGGATGATGTAGCTGATGTGCTTAAGCTACT
AAAAGGTTTGGGGGATTCATCGTTGAGCTTGAAGACCACTTCTCACACAGAAGTTGCATT
TGAAAGCATCTTTTAAAAGTGGGAAGTGTCAAAAAATAACCAGAGTTAAATTTACTTAAC
ATCAAAATGTAAAAAAAGAAAATGAGAAATGG

QA 2 573 2 573
DS 



AS 1 2

CO CL3306Contig1 1292 2 2 U
CTCCTTCTTCAGCTACAATCTTCCACTCTCCTTTCCTACTCCCTATCACCGGTCAACGGT
CCTTCCCTTCCCCGACTCGAATCCGCTCCTCGCCTCGCGTCGTCCTCAGAGGAATTCATA
GCCGTGAGCTCCACCGTTTCTCTCAGAATGTTACCGCCGGCCGGTTCAATAGCTTCTCGT
GTAACTGCTTATCCGCCGTATCCACCACCACTCTCGATTACGAGTTCACAGATGGTGGCA
AGGAGGTGGAACTGAGATTGAGGTTAAAGACAGGCGAGACACTTTCTCCAAAGGATATAT
CTGTGGACGCAGATGGAACGTCTTTAGCTGTTAAAGAGAAGCGTAACGGCTTGCTTATCA
CGCTTCTTGAGACTAACCAGCTCTTTGACAAGATCATGCCCTCCGAAACCATATGGTACA
TAGATGAAGACCAGTTGGTTGTGAACATGAAGAAGGTGGACGGGGAGTTGAAGTGGCCTG
ATGTTGTTGAGTCGTGGGAGTCTTTGACCGCTGGGATTATGCAGCTTCTTAAAGGGGCTT
CGATCTATGTTGTTGGAGATTCGACTGAGATTAACCAGAAAGTGTCTCGGGAGCTAGCTG
TTGGTCTTGGGTATAGTCCTCTAGACTCGATGGAGTTGCTGGAGAGCTTTTCCAAGCAGA
CAATCGATTCTTGGATTCTTGCAGAAGGGGAGGATTCTGTAGCTGAAGCAGAGAGTTCGG
TGTTGGAAAGCTTGAGCAGCCATGTCCGTACTGTTGTCTCGACTTTGGGAGGTAAACATG
GAGCTGCCGGGAGAGCCGATAAGTGGAGACATCTTTACTCTGGATTTACTGTTTGGGTAT
CACAAACTGAAGCCACAGATGAAGAATCAGCTAAAGAAGAAGCGAGGCGAAACAAGCAAG
AGAGGGAGATTGGGTATTCAAACGCAGACGTGGTGGTGAAGCTCCAAGGTTGGGACCCGA
CGCATGCCAAGAGCGTGGCTCAGGCGTCGTTAAGTGCACTCAAGCAACTGATCATCTCAG
ACAAGGGTCTTCCAGGTAAGAAGAGTCTGTACATAAGGCTGGGTTGCCGTGGTGACTGGC
CCAATATAAAACCGCCGGGATGGGATCCGTCGTCTGACACAGGAGCTCATCCAAGTTTCT
CATAAAGTATTCTTTAAACAAATGCTCTTTTGTTCTCTCTCACATAAAACCTAGCAACAA
GCGTTGTTACTCTTGAAGAGTTAATCACTTTCATAGCCGTTGATAATTTGTGTAGAAGTA
TATTTGATGATTTGAGTTTTGACAATCGAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS46TF U 1
AF RR2AS46JQ C 407
BS 1 681 RR2AS46TF
BS 682 1292 RR2AS46JQ

RD RR2AS46TF 681 0 0
CTCCTTCTTCAGCTACAATCTTCCACTCTCCTTTCCTACTCCCTATCACCGGTCAACGGT
CCTTCCCTTCCCCGACTCGAATCCGCTCCTCGCCTCGCGTCGTCCTCAGAGGAATTCATA
GCCGTGAGCTCCACCGTTTCTCTCAGAATGTTACCGCCGGCCGGTTCAATAGCTTCTCGT
GTAACTGCTTATCCGCCGTATCCACCACCACTCTCGATTACGAGTTCACAGATGGTGGCA
AGGAGGTGGAACTGAGATTGAGGTTAAAGACAGGCGAGACACTTTCTCCAAAGGATATAT
CTGTGGACGCAGATGGAACGTCTTTAGCTGTTAAAGAGAAGCGTAACGGCTTGCTTATCA
CGCTTCTTGAGACTAACCAGCTCTTTGACAAGATCATGCCCTCCGAAACCATATGGTACA
TAGATGAAGACCAGTTGGTTGTGAACATGAAGAAGGTGGACGGGGAGTTGAAGTGGCCTG
ATGTTGTTGAGTCGTGGGAGTCTTTGACCGCTGGGATTATGCAGCTTCTTAAAGGGGCTT
CGATCTATGTTGTTGGAGATTCGACTGAGATTAACCAGAAAGTGTCTCGGGAGCTAGCTG
TTGGTCTTGGGTATAGTCCTCTAGACTCGATGGAGTTGCTGGAGAGCTTTTCCAAGCAGA
CAATCGATTCTTGGATTCTTG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2AS46JQ 886 0 0
AACCATAT
GGTACATAGATGAAGACCAGTTGGTTGTGAACATGAAGAAGGTGGACGGGGAGTTGAAGT
GGCCTGATGTTGTTGAGTCGTGGGAGTCTTTGACCGCTGGGATTATGCAGCTTCTTAAAG
GGGCTTCGATCTATGTTGTTGGAGATTCGACTGAGATTAACCAGAAAGTGTCTCGGGAGC
TAGCTGTTGGTCTTGGGTATAGTCCTCTAGACTCGATGGAGTTGCTGGAGAGCTTTTCCA
AGCAGACAATCGATTCTTGGATTCTTGCAGAAGGGGAGGATTCTGTAGCTGAAGCAGAGA
GTTCGGTGTTGGAAAGCTTGAGCAGCCATGTCCGTACTGTTGTCTCGACTTTGGGAGGTA
AACATGGAGCTGCCGGGAGAGCCGATAAGTGGAGACATCTTTACTCTGGATTTACTGTTT
GGGTATCACAAACTGAAGCCACAGATGAAGAATCAGCTAAAGAAGAAGCGAGGCGAAACA
AGCAAGAGAGGGAGATTGGGTATTCAAACGCAGACGTGGTGGTGAAGCTCCAAGGTTGGG
ACCCGACGCATGCCAAGAGCGTGGCTCAGGCGTCGTTAAGTGCACTCAAGCAACTGATCA
TCTCAGACAAGGGTCTTCCAGGTAAGAAGAGTCTGTACATAAGGCTGGGTTGCCGTGGTG
ACTGGCCCAATATAAAACCGCCGGGATGGGATCCGTCGTCTGACACAGGAGCTCATCCAA
GTTTCTCATAAAGTATTCTTTAAACAAATGCTCTTTTGTTCTCTCTCACATAAAACCTAG
CAACAAGCGTTGTTACTCTTGAAGAGTTAATCACTTTCATAGCCGTTGATAATTTGTGTA
GAAGTATATTTGATGATTTGAGTTTTGACAATCGAGTT

QA 9 886 9 886
DS 



AS 1 2

CO CL3307Contig1 971 2 2 U
GTATGTCTAGCGTTGATTTTGAGGAAGCAGGTCACAAGCTGCTTAAAATTAAACTTGAAC
CAGGCCAAGAGATGGAGCTATGCATAATGCTCCTGGAATGTTGCTCTCAGGAGAGAACGT
ACCTTCGCTACTACGGTTTGCTGGGTCAGCGTTTCTGTATGATCAACAAAATCCATCAGG
AGAATTTTGAGAAGTGTTTTGTTCAGCAGTACTCCATGATCCACCGGCTTGAGACGAACA
AGCTGCGTAATGTGGCTAAGTTCTTCGCCCATTTACTGGGCACGGATGCACTTCCCTGGC
ATGTGCTTGCCTACATTCGGCTAACCGAGGAGGACACAACTTCATCCTCACGTATCTTCA
TTAAGATCCTCTTTCAGGAACTGTCAGAACATTTGGGGATTAGGCTGCTTAATGAGAGGC
TTCAGGATCCAACAATGCAGGAGTCACTTGAATCCATATTCCCTAAAGACAATCCAAAGA
ACACTAGGTTTGCAATCAATTTCTTTACCTCCATTGGTCTTGGAGGCATCACAGAGAATC
TGAGAGAGTACCTGAAGAACATGCCACGACTCATCATGCAACAACAGAAGCAAGTTGCAG
AATCAGAATCAGACAGTTCTGGTTCCGAGTCTGATTCTGAGTCGGATTCATCGTCTTCTT
CTTCTTCTTCTAGTTCGGATGAAAGCGACAGAGACAAGAGGAAGCGAAGAAGAAGATCTT
GAGACGGTGCTCTTTGTTTTTCGGCATCAACCACAATCCTCCAAGTTCTTTTGTTGGTTA
TTCAACTTGAATTTACATGCTCAGTCATGTGGTTCTGTTACTGCATAAGCTCTGATGAAC
AAAAAGACTAGACCAGACCAGCTAAGACAATCAAAGGTTGTGAACAAAATGTTTTCTTCT
TTGTTACTATGATTGTTTTCAAGTTTTTTTTTGTTCAAACGTTTTCAAGTTTAAAATATA
ACCCTTTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW07TF U 1
AF RR2GW07JQ C 425
BS 1 695 RR2GW07TF
BS 696 971 RR2GW07JQ

RD RR2GW07TF 695 0 0
GTATGTCTAGCGTTGATTTTGAGGAAGCAGGTCACAAGCTGCTTAAAATTAAACTTGAAC
CAGGCCAAGAGATGGAGCTATGCATAATGCTCCTGGAATGTTGCTCTCAGGAGAGAACGT
ACCTTCGCTACTACGGTTTGCTGGGTCAGCGTTTCTGTATGATCAACAAAATCCATCAGG
AGAATTTTGAGAAGTGTTTTGTTCAGCAGTACTCCATGATCCACCGGCTTGAGACGAACA
AGCTGCGTAATGTGGCTAAGTTCTTCGCCCATTTACTGGGCACGGATGCACTTCCCTGGC
ATGTGCTTGCCTACATTCGGCTAACCGAGGAGGACACAACTTCATCCTCACGTATCTTCA
TTAAGATCCTCTTTCAGGAACTGTCAGAACATTTGGGGATTAGGCTGCTTAATGAGAGGC
TTCAGGATCCAACAATGCAGGAGTCACTTGAATCCATATTCCCTAAAGACAATCCAAAGA
ACACTAGGTTTGCAATCAATTTCTTTACCTCCATTGGTCTTGGAGGCATCACAGAGAATC
TGAGAGAGTACCTGAAGAACATGCCACGACTCATCATGCAACAACAGAAGCAAGTTGCAG
AATCAGAATCAGACAGTTCTGGTTCCGAGTCTGATTCTGAGTCGGATTCATCGTCTTCTT
CTTCTTCTTCTAGTTCGGATGAAAGCGACAGAGAC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2GW07JQ 547 0 0
GGATCCAACAATGCAGGAGTCACTTGAATCCATATTCCCTAAAGACAATCCAAAGAACAC
TAGGTTTGCAATCAATTTCTTTACCTCCATTGGTCTTGGAGGCATCACAGAGAATCTGAG
AGAGTACCTGAAGAACATGCCACGACTCATCATGCAACAACAGAAGCAAGTTGCAGAATC
AGAATCAGACAGTTCTGGTTCCGAGTCTGATTCTGAGTCGGATTCATCGTCTTCTTCTTC
TTCTTCTAGTTCGGATGAAAGCGACAGAGACAAGAGGAAGCGAAGAAGAAGATCTTGAGA
CGGTGCTCTTTGTTTTTCGGCATCAACCACAATCCTCCAAGTTCTTTTGTTGGTTATTCA
ACTTGAATTTACATGCTCAGTCATGTGGTTCTGTTACTGCATAAGCTCTGATGAACAAAA
AGACTAGACCAGACCAGCTAAGACAATCAAAGGTTGTGAACAAAATGTTTTCTTCTTTGT
TACTATGATTGTTTTCAAGTTTTTTTTTGTTCAAACGTTTTCAAGTTTAAAATATAACCC
TTTCAGC

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 3

CO CL3308Contig1 593 3 4 U
AGACCATCCTCCCTGATTCGGACGGTGCCATAGATGGACACTTGAGGGAAGTGGGACTAA
CCTTCCATTTTTTCAAGGACGTCCCTGGACTCATTTCCAAGAACATTGAAAAGAGTTTAG
ACGAAGCGTTTAAACCGTTGGGGATAAGTGACTGGAACTCCCTTTTCTGGATAGCTCACC
CCGGTGGTCCAGCGATCCTTGACGACGTTGAGAAAAATTTAGGACTCAAGGCTGAGAAGA
TGATAGCCACACGTCACGTGTTGAGTGAGTATGGAAACATGTCTAGCGCGTGCGTCCTCT
TTATCTTGGATGAGATGAGGAGGAAGTCTGTGGCTGATGGTGTGGCCACTACAGGTGAAG
GGTTGGAGTGGGGTGTCTTGTTTGGTTTCGGACCGGGTCTCACCGTAGAGACAGTGGTCC
TACACAGCGTTCCTGTTTAAACAGAAAGCTCTCTTCCTATAAATGCCTACCTACCATCAC
ATACTTACCATCATCTTGTCTTTGTGTTTTCTTTTTCTCCATTTAAGATAATATTTGTAA
TGCAATAATTAAGGAAGCATTCATTTAATGTGTAATATGTGGACTTGCTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ15JQ C 1
AF RR2D950TF U 272
AF RR2CS35TF U 274
BS 1 273 RR2AZ15JQ
BS 274 428 RR2D950TF
BS 429 429 RR2CS35TF
BS 430 593 RR2D950TF

RD RR2AZ15JQ 556 0 0
AGACCATCCTCCCTGATTCGGACGGTGCCATAGATGGACACTTGAGGGAAGTGGGACTAA
CCTTCCATTTTTTCAAGGACGTCCCTGGACTCATTTCCAAGAACATTGAAAAGAGTTTAG
ACGAAGCGTTTAAACCGTTGGGGATAAGTGACTGGAACTCCCTTTTCTGGATAGCTCACC
CCGGTGGTCCAGCGATCCTTGACGACGTTGAGAAAAATTTAGGACTCAAGGCTGAGAAGA
TGATAGCCACACGTCACGTGTTGAGTGAGTATGGAAACATGTCTAGCGCGTGCGTCCTCT
TTATCTTGGATGAGATGAGGAGGAAGCCTGTGGCTGATGGTGTGGCCACTACAGGTGAAG
GGTTGGAGTGGGGTGTCTTGTTTGGTTTCGGACCGGGTCTCACCGTAGAGACAGTGGTCC
TACACAGCGTTCCTGTTTAAACAGAAAGCTCTCTTCCTATAAATGCCTACCTACCATCAC
ATACTTACCATCATCTTGTCTTTGTGTTTTCTTTTTCTCCATTTAAGATAATATTTGTAA
TGCAATAATTAAGGAA

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2D950TF 322 0 0
GG
GAAACATGTCTAGCGCGTGCGTCCTCTTTATCTTGGATGAGATGAGGAGGAAGTCTGTGG
CTGATGGTGTGGCCACTACAGGTGAAGGGTTGGAGTGGGGTGTCTTGTTTGGTTTCGGAC
CGGGTCTCACCGTAGAGACAGTGGTCCTACACAGCATTCCTGTTTAAACAGAAAGCTCTC
TTCCTATAAATGCCTACCTACCATCACATACTTACCATCATCTTGTCTTTGTGTTTTCTT
TTTCTCCATTTAAGATAATATTTGTAATGCAATAATTAAGGAAGCATTCATTTAATGTGT
AATATGTGGACTTGCTTGTT

QA 3 322 3 322
DS 

RD RR2CS35TF 293 0 0
GAAACATGTCTAGCGCGTGCGTCCTCTTTATCTTGGATGA*ATGAGGAGGAAGTCTGTGG
CTGATGGTGTGGCCACTACAGGTGAAGGGTTGGAGTGGGGTGTCTTGTTTGGTTTCGGAC
CGGGTCTCACCGTAGAGACAGTGGTCCTACACAGCGTTCCTGTTTAAACAGAAAGCTTTC
TTCCTATAAATGCCTACCTACCATCACATACTTACCATCATCTTGTCTTTGTGTTTTCTT
TTTCTCCATTTAAGATAATATTTGTAATGCAATAATTAAGGAAGCATTCATTT

QA 1 293 1 293
DS 



AS 1 2

CO CL3309Contig1 756 2 1 U
AGAGGCAAACCTCGTCATACTGTACAAGACTACAACGAAAAAATCAAGTGTGTTCCTTTG
TTAGTTATTACAGACACACAACACAAGAAAGCAAGATATCATATGATTATAGACACAAAA
CACAATCAAACTGAAACATATTGAAAACCAATGTTTCAAGAGTATAATATTATTTCTCAA
ACCGGTTTCCACACCGACAAAACCTCCTGGAACATCTCCAGCATCAGCTCACGATCAGCC
TGCCTGAAGAAACCGCTGATCTCCTCCCTGACATCATAAATCTTTCCGAAATCAAACAAA
TACATCAAACACCCTTTCTTCAGTTTCTCCAGCTGATACAGCCACGCCTCCTGCAGCCTC
TCCAGCACGTTCCCGGAGTTTATATCTTCCATCAGGCTCTCCTCGCAGGCCGCTTTCAGA
TCCGTGATATCGTACTTGTTCGCGGCTCCTAGAAGCGCGAGCCTGTGTTTCCAGAAGTCT
TCCTGCGTTATGCTGCCGTAAAGGTAGATCAGGAGCGCCATGCAGGATTCTCTGGACATG
TCGTCGATGTGGATGGTGGATGACTCTTTCTCCTTGAGGTCGTGGTGGAACATGCTTCTG
AAGACGTTCGAGCTGGCGGAGAGGATGGCTTTGTGAGCAGAGAGCGTCCCTCCGGATGTG
TGGATGGTTACGTCGGAGAGGATGTTTTCTTCTAGCATACGGGATAAGCATTTGAGAGTT
GTTTGAGTTGAGATTGATTGCATTGTTGTATCGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE28JQ U 63
AF RR2BY41JQ U 1
BS 1 756 RR2BY41JQ

RD RR2BE28JQ 195 0 0
AGTTATTACAGACACCCAACACAAGAAAGCAAGATATCATATGATTATAGACACAAAACA
CAATCAAACTGAAACATATTGAAAACCAATGTTTCAAGAGTATAATATTATTTCTCAAAC
CGGTTTCCACACCGACAAAACCTCCTGGAACATCTCCAGCATCAGCTCACGATCAGCCTG
GCTGAAGAAACCGCT

QA 1 195 1 195
DS 

RD RR2BY41JQ 756 0 0
AGAGGCAAACCTCGTCATACTGTACAAGACTACAACGAAAAAATCAAGTGTGTTCCTTTG
TTAGTTATTACAGACACACAACACAAGAAAGCAAGATATCATATGATTATAGACACAAAA
CACAATCAAACTGAAACATATTGAAAACCAATGTTTCAAGAGTATAATATTATTTCTCAA
ACCGGTTTCCACACCGACAAAACCTCCTGGAACATCTCCAGCATCAGCTCACGATCAGCC
TGCCTGAAGAAACCGCTGATCTCCTCCCTGACATCATAAATCTTTCCGAAATCAAACAAA
TACATCAAACACCCTTTCTTCAGTTTCTCCAGCTGATACAGCCACGCCTCCTGCAGCCTC
TCCAGCACGTTCCCGGAGTTTATATCTTCCATCAGGCTCTCCTCGCAGGCCGCTTTCAGA
TCCGTGATATCGTACTTGTTCGCGGCTCCTAGAAGCGCGAGCCTGTGTTTCCAGAAGTCT
TCCTGCGTTATGCTGCCGTAAAGGTAGATCAGGAGCGCCATGCAGGATTCTCTGGACATG
TCGTCGATGTGGATGGTGGATGACTCTTTCTCCTTGAGGTCGTGGTGGAACATGCTTCTG
AAGACGTTCGAGCTGGCGGAGAGGATGGCTTTGTGAGCAGAGAGCGTCCCTCCGGATGTG
TGGATGGTTACGTCGGAGAGGATGTTTTCTTCTAGCATACGGGATAAGCATTTGAGAGTT
GTTTGAGTTGAGATTGATTGCATTGTTGTATCGGTT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL3310Contig1 1006 2 2 U
GGGGTGCGATGTGTGCTCGCATTGGTGTCACGCTGCGTGTGGGATTCGGGAGGGTTTGAT
TAAACCGGGACATAGCGTGAAAGGTCCTCGAGGTAGGACAGAGATGCTGTTCCATTGCAT
TGGATGTGCTCACAAGTCGGAGATGTTTGGGTTCGTTAAGGATGTGTTTGTGTGTTGCGC
TAAGAATTGGGGACATGAGACTCTGATCAAGGAGCTTGACTGCGTTGGGAAGGTGTTCCG
TGGAAGCGATGATGGGAAAGGAAAAGCGTTGCATCTTAAAGCTAATGAAATGGTGAAGAG
GCTGGAGAGTAAACAGATCTCTCCGCAAGATGCCTCTAACTTCATCATTCAGTTTTTCAA
CTATGCAGAGACGGTAACAGAGTTTCCAGAACCGAAAGAGCAAACAGTTGTAGCAGAATC
GAGCTACAGAAAAGACGAGGCATCTGTGATGCCGCCTTCAACAACATCCAAGGATCAGAT
GAAGAAGAAGAGCTTTGCGTTAGCAGATGCAATGATGAATAGTTTCGATAGTTTAGAGAG
CATGGTGAGGATCAAGGAGGCTGAGACGAGAATGTTCCAGAAGAAAGCGGACGAGGCGAG
AATAGAGGCAGAGAGTTTCAAGAGGATGATAGAAATGAAGACGGAGAAGATGGAGGAAGA
GTACACGGAGAAGATAGCGCGGCTGTGTCTGAAGGAGACGGAAGAAAAGAGGAGGAAATG
CTGGATGAATTGAAGAAGCTTGAGAACTCGCATTGCGATTACAAGAACATGAAGCTGAGG
ATGGAGTCTGAGATCGCAGGGTTGCTGAAGAGAATGGAAAGTACAAGACAACAACAATTG
GTATGAGGGAATCGGAAAAACAGTCTCAGTTATGCACTTACAAGACAACAATTGTTTCTT
GCCTTCTAAAATGTCCTTTTTTTAATCTATAACTTCGCTTTTTCCTTTTCTTCTGCTTAT
AATAACAACCATGCATGTCTATTATGTTTATATAATAAATTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET68TF U 1
AF RR2ET68JQ C 451
BS 1 690 RR2ET68TF
BS 691 1006 RR2ET68JQ

RD RR2ET68TF 690 0 0
GGGGTGCGATGTGTGCTCGCATTGGTGTCACGCTGCGTGTGGGATTCGGGAGGGTTTGAT
TAAACCGGGACATAGCGTGAAAGGTCCTCGAGGTAGGACAGAGATGCTGTTCCATTGCAT
TGGATGTGCTCACAAGTCGGAGATGTTTGGGTTCGTTAAGGATGTGTTTGTGTGTTGCGC
TAAGAATTGGGGACATGAGACTCTGATCAAGGAGCTTGACTGCGTTGGGAAGGTGTTCCG
TGGAAGCGATGATGGGAAAGGAAAAGCGTTGCATCTTAAAGCTAATGAAATGGTGAAGAG
GCTGGAGAGTAAACAGATCTCTCCGCAAGATGCCTCTAACTTCATCATTCAGTTTTTCAA
CTATGCAGAGACGGTAACAGAGTTTCCAGAACCGAAAGAGCAAACAGTTGTAGCAGAATC
GAGCTACAGAAAAGACGAGGCATCTGTGATGCCGCCTTCAACAACATCCAAGGATCAGAT
GAAGAAGAAGAGCTTTGCGTTAGCAGATGCAATGATGAATAGTTTCGATAGTTTAGAGAG
CATGGTGAGGATCAAGGAGGCTGAGACGAGAATGTTCCAGAAGAAAGCGGACGAGGCGAG
AATAGAGGCAGAGAGTTTCAAGAGGATGATAGAAATGAAGACGGAGAAGATGGAGGAAGA
GTACACGGAGAAGATAGCGCGGCTGTGTCT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2ET68JQ 556 0 0
GCCGCCTTCAACAACATCCAAGGATCAGATGAAGAAGAAGAGCTTTGCGTTAGCAGATGC
AATGATGAATAGTTTCGATAGTTTAGAGAGCATGGTGAGGATCAAGGAGGCTGAGACGAG
AATGTTCCAGAAGAAAGCGGACGAGGCGAGAATAGAGGCAGAGAGTTTCAAGAGGATGAT
AGAAATGAAGACGGAGAAGATGGAGGAAGAGTACACGGAGAAGATAGCGCGGCTGTGTCT
GAAGGAGACGGAAGAAAAGAGGAGGAAATGCTGGATGAATTGAAGAAGCTTGAGAACTCG
CATTGCGATTACAAGAACATGAAGCTGAGGATGGAGTCTGAGATCGCAGGGTTGCTGAAG
AGAATGGAAAGTACAAGACAACAACAATTGGTATGAGGGAATCGGAAAAACAGTCTCAGT
TATGCACTTACAAGACAACAATTGTTTCTTGCCTTCTAAAATGTCCTTTTTTTAATCTAT
AACTTCGCTTTTTCCTTTTCTTCTGCTTATAATAACAACCATGCATGTCTATTATGTTTA
TATAATAAATTTATAT

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 3

CO CL3311Contig1 1005 3 5 U
GGGTGAAAGATTCCTCCGCCATGGCTGCTCCTTTTCTAAGCTCCCCTCTTCAACTCATAT
CCACTTCTCCGATTCTCTTCACTAAAGTGCCTCCCACAAACCAAATCCAATTCAACCAGA
GAACAACAACAACAGCATGCACATCCTCCAACAAACTCCGTCTCCTCCTCCGCCGTTCCG
CTGCGGCTGGTACCGCCGTGACGGATAAGACAGAAGGAGGAGAGGATGTTCTGCTAAATC
CCACGCCTGAAGAGGAGAAGCGTGAGGAGGTGGTGGATTACGATTGGACAGAGGAGTGGT
ACCCTCTGTACCTCACCAGAGACGTTCCTGACGATGCGCCGCTTGGTCTCACCGTCTTCG
ATCGCCAGATTGTGTTGTACAGAGACGGCGAGGGAACGCTTCGCTGTTACGAAGATCGGT
GTCCACATCGGTTAGCTAAGTTGTCTGAAGGACAACTGATTGATGGGAGGTTGGAATGTT
TGTACCATGGTTGGCAATTTGAAGGAGATGGCAAATGCGTCAAGATACCTCAGCTTCCTG
CGAGTGCCAAGATTCCAAAGGTTGCTTGTGTGAAGACCTACGAGGTGAAGGACTCACAGG
GAGTTGTGTGGGTTTGGATGTCGACGAAGACGCCTCCAGACCCGGAAAAGCTTCCTTGGT
TCGAGAATTTCGCTAGACCTGGTTTCTATGACATCTCGGGTGTTCACGAGCTACCTTACG
ACCACTCCATCCTTCTAGAGAATCTGATGGATCCGGCTCATGTCCCTATCTCTCATGACA
GAACTGACTTCACTGCTAAAAGAGAAGATGCGCAGCCGCTTGTCTTTGAGGTCACGGAGA
GAACTAACCGTGGTTTCGCAGGGACTTGGGGACGGGAGAAAGAAGGCGGGAAAGGGAGTA
ATTTACTCCGGTTCAGTGCTCCATGTGTTCTGCAGAACAACCGAGAGTTTGAGGGAAAGG
ACGGGGTGAAGAACTACTTTTCAGGGCTGTTTCTTTGTAGACCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN84TF U 1
AF RR2EN43TF U 362
AF RR2D881TF U 891
BS 1 592 RR2DN84TF
BS 593 593 RR2EN43TF
BS 594 634 RR2DN84TF
BS 635 996 RR2EN43TF
BS 997 1005 RR2D881TF

RD RR2DN84TF 634 0 0
GGGTGAAAGATTCCTCCGCCATGGCTGCTCCTTTTCTAAGCTCCCCTCTTCAACTCATAT
CCACTTCTCCGATTCTCTTCACTAAAGTGCCTCCCACAAACCAAATCCAATTCAACCAGA
GAACAACAACAACAGCATGCACATCCTCCAACAAACTCCGTCTCCTCCTCCGCCGTTCCG
CTGCGGCTGGTACCGCCGTGACGGATAAGACAGAAGGAGGAGAGGATGTTCTGCTAAATC
CCACGCCTGAAGAGGAGAAGCGTGAGGAGGTGGTGGATTACGATTGGACAGAGGAGTGGT
ACCCTCTGTACCTCACCAGAGACGTTCCTGACGATGCGCCGCTTGGTCTCACCGTCTTCG
ATCGCCAGATTGTGTTGTACAGAGACGGCGAGGGAACGCTTCGCTGTTACGAAGATCGGT
GTCCACATCGGTTAGCTAAGTTGTCTGAAGGACAACTGATTGATGGGAGGTTGGAATGTT
TGTACCATGGTTGGCAATTTGAAGGAGATGGCAAATGCGTCAAGATACCTCAGCTTCCTG
CGAGTGCCAAGATTCCAAAGGTTGCTTGTGTGAAGACCTACGAGGTGAAGGATTCACAGG
GAGTTGTGTGGGTTTGGATGTCGACGAAGACGCC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2EN43TF 635 0 0
G
CGCCAGATTGTGTTGTACAGAGACGGCGAGGGAACGCTTCGCTGTTACGAAGATCGGTGT
CCACATCGGTTAGCTAAGTTGTCTGAAGGACAACTGATTGATGGGAGGTTGGAATGTTTG
TACCATGGTTGGCAATTTGAAGGAGATGGCAAATGCGTCAAGATACCTCAGCTTCCTGCG
AGTGCCAAGATTCCAAAGGTTGCTTGTGTGAAGACCTACGAGGTGAAGGACTCACAGGGA
GTTGTGTGGGTTTGGATGTCGACGAAGACGCCTCCAGACCCGGAAAAGCTTCCTTGGTTC
GAGAATTTCGCTAGACCTGGTTTCTATGACATCTCGGGTGTTCACGAGCTACCTTACGAC
CACTCCATCCTTCTAGAGAATCTGATGGATCCGGCTCATGTCCCTATCTCTCATGACAGA
ACTGACTTCACTGCTAAAAGAGAAGATGCGCAGCCGCTTGTCTTTGAGGTCACGGAGAGA
ACTAACCGTGGTTTCGCAGGGACTTGGGGACGGGAGAAAGAAGGCGGGAAAGGGAGTAAT
TTACTCCGGTTCAGTGCTCCATGTGTTCTGCAGAACAACCGAGAGTTTGAGGGAAAGGAC
GGGGTGAAGAACTACTTTTCAGGGCTGTTTCTTT

QA 2 635 2 635
DS 

RD RR2D881TF 115 0 0
AAAGGGAGTAATTTACTCCGGTTCAGTGCTCCATGTGTTCTGCAGAACAACCGAGAGTTT
GAGGGAAAGGACGGGGTGAAGAACTACTTTTCAGGGCTGTTTCTTTGTAGACCTA

QA 1 115 1 115
DS 



AS 1 3

CO CL3312Contig1 1057 3 2 U
GACACAAAAGAAGAGAACCAAAACATGGCTAACTCTCTCATCTCTCTTCTCCCAATCTTC
CACTTGTTGGTGTTATTAGGATCCTCAGTGGATGCTTATTGGCCACCATCACCTGGTTAC
TGGCCAAGCTCCAAGGTTGGGTCCTTGAACTTCTACAAAGGTTTTAAGAATCTTTGGGGT
CCTCAGCATCAGAGAATAGACCAAAATGCCCTCACCATCTGGCTTGATAGAACCTCTGGA
AGTGGATTCAAGTCAGTGAAGCCATTCAGATCAGGCTACTTTGGAGCATCCATCAAACTC
CAACCTGGTTACACTGCTGGAGTCATCACATCTCTCTATCTATCAAATAATGAGGCACAT
CCAGGATTCCATGATGAGGTGGACATAGAATTCTTGGGGACAACATTTGGGAAGCCTTAC
ACACTTCAGACAAATGTGTACATTAGAGGAAGTGGTGATGGCAAAATCATTGGTCGTGAG
ATGAAGTTTCGCTTGTGGTTTGATCCCACTTCGGATTTTCACCATTATGCTATTCTTTGG
AGCCCTAGAGAAATCATTTTTTTTGGTGGACGATATTCCTATAAGAAGATACCCAAAAAA
GAGTGCGGCTACATTTCCTCTAAGACCAATGTGGCTTTATGGTTCCATATGGGATGCTTC
TTCTTGGGCAACTGAGAATGGTAAATACAAAGCTGACTACAAATATCAACCTTTCACTGC
CAAGTACACCAATTTTAAAGCGATTGGTTGCACCGCCTACTCACCCGCACGGTGCCATCC
ACTGTCAGCTTCACCATACCGTTCTGGCGGATTAACTCGAAAGCAATATCAAGCAATGAG
ATGGGTGCAAACACATAATATGGTATACAATTATTGCAAAGATTATAAACGCGACCATTC
TCTAACACCGGAATGTGGGCGCTAGAAGAAAATTTGAAAAATGTTCTGAAGTTTGAAATT
TTAATTTTCATTAAGAAAGTTTTGCAAAAGAATTGGGAAAATTTCTGAAGGTTTTATGCT
ACTTCATTATCGTCTGTTTTTTTTTGTTTCACAAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB38TF U 1
AF RR2CB38JQ C 611
AF RR2BF49TF U 377
BS 1 641 RR2CB38TF
BS 642 1057 RR2BF49TF

RD RR2CB38TF 641 0 0
GACACAAAAGAAGAGAACCAAAACATGGCTAACTCTCTCATCTCTCTTCTCCCAATCTTC
CACTTGTTGGTGTTATTAGGATCCTCAGTGGATGCTTATTGGCCACCATCACCTGGTTAC
TGGCCAAGCTCCAAGGTTGGGTCCTTGAACTTCTACAAAGGTTTTAAGAATCTTTGGGGT
CCTCAGCATCAGAGAATAGACCAAAATGCCCTCACCATCTGGCTTGATAGAACCTCTGGA
AGTGGATTCAAGTCAGTGAAGCCATTCAGATCAGGCTACTTTGGAGCATCCATCAAACTC
CAACCTGGTTACACTGCTGGAGTCATCACATCTCTCTATCTATCAAATAATGAGGCACAT
CCAGGATTCCATGATGAGGTGGACATAGAATTCTTGGGGACAACATTTGGGAAGCCTTAC
ACACTTCAGACAAATGTGTACATTAGAGGAAGTGGTGATGGCAAAATCATTGGTCGTGAG
ATGAAGTTTCGCTTGTGGTTTGATCCCACTTCGGATTTTCACCATTATGCTATTCTTTGG
AGCCCTAGAGAAATCATTTTTTTTGGTGGACGATATTCCTATAAGAAGATACCCAAAAAA
GAGTGCGGCTACATTTCCTCTAAGACCAATGTGGCTTTATG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2CB38JQ 197 0 0
ACATTTCCTTTAAGACCAATGTGGCTTTATGGTTCCATATGGGATGCTTCTTCTTGGGCA
ACTGAGAATGGTAAATACAAAGCTGACTACAAATATCAACCTTTCACTGCCAAGTACACC
AATTTTAAAGCGATTGGTTGCACCGCCTACTCACCCGCACGGTGCCATCCACTGTCAGCT
TCACCATACCGTTCTGG

QA 1 197 1 197
DS 

RD RR2BF49TF 681 0 0
G
GGTGGACATAGAATTCTTGGGGACAACATTTGGGAAGCCTTACACACTTCAGACAAATGT
GTACATTAGAGGAAGTGGTGATGGCAAAATCATTGGTCGTGAGATGAAGTTTCGCTTGTG
GTTTGATCCCACTTCGGATTTTCACCATTATGCTATTCTTTGTAGCCCTAGAGAAATCAT
TTTTTT*GGTGGACGATATTCCTATAAGAAGATACCCAAAAAAGAGTGCGGCTACATTTC
CTCTAAGACCAATGTGGCTTTATGGTTCCATATGGGATGCTTCTTCTTGGGCAACTGAGA
ATGGTAAATACAAAGCTGACTACAAATATCAACCTTTCACTGCCAAGTACACCAATTTTA
AAGCGATTGGTTGCACCGCCTACTCACCCGCACGGTGCCATCCACTGTCAGCTTCACCAT
ACCGTTCTGGCGGATTAACTCGAAAGCAATATCAAGCAATGAGATGGGTGCAAACACATA
ATATGGTATACAATTATTGCAAAGATTATAAACGCGACCATTCTCTAACACCGGAATGTG
GGCGCTAGAAGAAAATTTGAAAAATGTTCTGAAGTTTGAAATTTTAATTTTCATTAAGAA
AGTTTTGCAAAAGAATTGGGAAAATTTCTGAAGGTTTTATGCTACTTCATTATCGTCTGT
TTTTTTTTGTTTCACAAAAT

QA 2 681 2 681
DS 



AS 1 2

CO CL3313Contig1 1116 2 2 U
GGGCACAATTCACGGCAGAGGTGAAGCCGTATGGGCAGCAGATGGTTGTGGCAAAAAGTT
TAAATGCAATCTTCCCCCAACGTCTCTAAAATTCAGAAACATAGTAAATCTTGAAGTCAG
CGGTATTAGCTCGGTCAACGCAAAGGCCTTCCACATGTTCTTGGTGAAAACCGTGAATGT
CAACATCCACAACATTAAGATTATCGCACCTGCCGAAAGTCCCAACACTGATGGTATCCA
TTTGAGCAATGCCGATAACGTTAAGATCCTCGACAGTTCCATAGGGACAGGAGACGATTG
TGTTTCAGTCGGTCGTGGTTCCAACAATGTAACCGTCGAACGTGTGATTTGTGGTCCTGG
ACACGTCCTAAGTGTTGGTAGTCTTGGTAAGTACCCCAACGAGGAGGACGTTAGCGGCAT
TCACTTTAGGAACTGCACAATGAGAAATACCGACAATGGTCTTAGAATCAAGAGTTGGGG
GTGGTTCGTCACCAAGCAAGGCTATTGACATTCATTTCGAAGATATTATCATGGAAAACG
TCAAGAACCCAATCATCATTGACCAAAACTATGGTTCAAGAGGCGGAGAGTCAAGAGTTG
CCATAAGCGATGTGTTGTTCAAGAACGTGAGAGGAACAACAATTACAAAAGATTTTGTTC
AGTTCATGTGCAGCAAATCGGTACCGTGTAAAGGAGTCAGAGTCGACAATGTGAACCTAA
AATTCGTAGGCCACGTAGGAGGACACCAGTCGTCGTCAGGTGGTTTGATCGGATCTCTTT
GTAATAACGTCAATCTTATCTTTGGTGGAAAGGTTAACTTCCCTCTGTGTCCAAAATAAT
ATTTTTGGTCAAAATAATATAATAAAGGAAGAAAAAAAATCAAAAGTTCCCACAAACATT
TGTTTTGTTTGTGGATTAGTTTGGAAAATTTATCAACATTACAATTGGAATATTTGACTT
TTGATAATGTTGTTTTTCCTAACTTTTTTTGTTTTTTTTTTTACTTTTTCCTGAGTTTGG
GTAATGTATAATAAACAGACCCTTCGGCTGGTTGTTTCTGGTTAGAAATTTGGTCAGTGT
ATACATCATTTTGCGTATAAAAATCTTTCTCTATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E682TF U 1
AF RR2DQ09JQ C 356
BS 1 621 RR2E682TF
BS 622 1116 RR2DQ09JQ

RD RR2E682TF 639 0 0
GGGCACAATTCACGGCAGAGGTGAAGCCGTATGGGCAGCAGATGGTTGTGGCAAAAAGTT
TAAATGCAATCTTCCCCCAACGTCTCTAAAATTCAGAAACATAGTAAATCTTGAAGTCAG
CGGTATTAGCTCGGTCAACGCAAAGGCCTTCCACATGTTCTTGGTGAAAACCGTGAATGT
CAACATCCACAACATTAAGATTATCGCACCTGCCGAAAGTCCCAACACTGATGGTATCCA
TTTGAGCAATGCCGATAACGTTAAGATCCTCGACAGTTCCATAGGGACAGGAGACGATTG
TGTTTCAGTCGGTCGTGGTTCCAACAATGTAACCGTCGAACGTGTGATTTGTGGTCCTGG
ACACGTCCTAAGTGTTGGTAGTCTTGGTAAGTACCCCAACGAGGAGGACGTTAGCGGCAT
TCACTTTAGGAACTGCACAATGAGAAATACCGACAATGGTCTTAGAATCAAGAGTTGGGG
GTGGTTCGTCACCAAGCAAGGCTATTGACATTCATTTCGAAGATATTATCATGGAAAACG
TCAAGAACCCAATCATCATTGACCAAAACTATGGTTCAAGAGGCGGAGAGTCAAGAGTTG
CCATAAGCGATGTGTTGTTCA
GACGTGAGAGGACACATT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2DQ09JQ 761 0 0
TCCTGGACACGG
CTAAGTGTTGGTAGTCTTGGTAATTACCCCAACGAGGAGGACGTTAGCGGCATTCACTTT
AGGAACTGCACAATGAGAAATACCGACAATGGTCTTAGAATCAAGAGTTGGGG*TGGTTC
GTCACCAAGCAAGGCTATTGACATTCATTTCGAAGATATTATCATGGAAAACGTCAAGAA
CCCAATCATCATTGACCAAAACTATGGTTCAAGAGGCGGAGAGTCAAGAGTTGCCATAAG
CGATGTGTTGTTCAAGAACGTGAGAGGAACAACAATTACAAAAGATTTTGTTCAGTTCAT
GTGCAGCAAATCGGTACCGTGTAAAGGAGTCAGAGTCGACAATGTGAACCTAAAATTCGT
AGGCCACGTAGGAGGACACCAGTCGTCGTCAGGTGGTTTGATCGGATCTCTTTGTAATAA
CGTCAATCTTATCTTTGGTGGAAAGGTTAACTTCCCTCTGTGTCCAAAATAATATTTTTG
GTCAAAATAATATAATAAAGGAAGAAAAAAAATCAAAAGTTCCCACAAACATTTGTTTTG
TTTGTGGATTAGTTTGGAAAATTTATCAACATTACAATTGGAATATTTGACTTTTGATAA
TGTTGTTTTTCCTAACTTTTTTTGTTTTTTTTTTTACTTTTTCCTGAGTTTGGGTAATGT
ATAATAAACAGACCCTTCGGCTGGTTGTTTCTGGTTAGAAATTTGGTCAGTGTATACATC
ATTTTGCGTATAAAAATCTTTCTCTATTC

QA 13 761 13 761
DS 



AS 1 3

CO CL3314Contig1 893 3 14 U
GATAATAAAAAGTTTTGTTTGTAAGAAGATGGTTGTTCGTACATGGCGATTAAGAGTAAT
CTGAGAACAGCTTGTTACATACGTAGTAGCAATTTGACTGGCAAAAAAAATGAAAACTGT
GCTCTATTCTCCTTTGTTCTCTGCTTGCAAAAAAGCTTTAACGGATGCTGGATCGTCTTG
GGGCCTCATTGCCGGGAAGAAAATAACTTCCTTGATGTTCTGTGAGTCGGTGAACAGCAT
GGCAAGCCTGTCTATCCCCAATCCCCAACCACCTGTAGGAGCCAGTCCATACTCCAAAGC
ACTGCAGAAAGTCTCATCTAAAGCCATCGCTTCATCGTCTCCAGATTGCCTATCCTTCAG
CTGATCAGCAAACCTTTGACGCTGAACCACAGGATCGTTCAACTCGGTGTAGGCGTTGCA
GAGTTCGTGTTGGTTTATGAACAGCTCGAATCTCTCAGTCAGAACATTGTTCGACCTATG
CCATTTTGCCAAGGGCGACATGATCTCAGGATGGTTGATGATGAACGTTGGGTTCACACA
TGTCACTTCCAGAAACTCTCCAACAAGTTTATCTAGTAAACGAGCTGTAGTCTGAGGAGG
TGGACATTTCACGTCGAACCTGGCACAAGCATCAATCAGATATTTGTTGGCTTCTTCGCT
AGCCAAGTCTTTTGGAATATTGAGGTTAGCCACCTTCTCTAGCTCTCCTATCATCTCAAT
CCTCCTGAATGGAGGAGTGAAGTCGATTTCGATTGGCTCCTTGTCATACCCATTAGCATG
ATACTTGATTTTGTAACCACCTGTTAACTCTTTCACCATGCCACTCAACATATCCTCAGT
CATTTTCATCAGGTCATTGTAGTCTGCGAAAGCCATATAGAACTCGCAAGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DB20JQ U 90
AF RR2DH35JQ U 1
AF RR2DB20TF C 470
BS 1 106 RR2DH35JQ
BS 107 107 RR2DB20JQ
BS 108 108 RR2DH35JQ
BS 109 109 RR2DB20JQ
BS 110 151 RR2DH35JQ
BS 152 152 RR2DB20JQ
BS 153 180 RR2DH35JQ
BS 181 181 RR2DB20JQ
BS 182 200 RR2DH35JQ
BS 201 201 RR2DB20JQ
BS 202 617 RR2DH35JQ
BS 618 618 RR2DB20TF
BS 619 667 RR2DH35JQ
BS 668 893 RR2DB20TF

RD RR2DB20JQ 275 0 0
CAATTTGACTGGCAAAAAAAATGAAAACTGTGCTCTATTCTCCTTTGTTCTCTGCTTGCA
AAAAAGCTTTAACGGATGCTGGATCGTCTTGGGGCCTCCTTGCCGGGAAGAAAATAACTT
CCTTGATGTTCTGTGAGTCGGTGAACAGCATGGCAAGCCTGTCTATCCCCAATCCCCAAC
CACCTGTAGGAGCCAGTCCATACTCCAAAGCACTGCAGAAAGTCTCATCTAAAGCCATCG
CTTCATCGTCTCCAGATTGCCTATCCTTCAGCTGA

QA 1 275 1 275
DS 

RD RR2DH35JQ 667 0 0
GATAATAAAAAGTTTTGTTTGTAAGAAGATGGTTGTTCGTACATGGCGATTAAGAGTAAT
CTGAGAACAGCTTGTTACATACGTAGTAGCAATTTGACTGGCAAAAGAGATGAAAACTGT
GCTCTATTCTCCTTTGTTCTCTGCTTGCAAAGAAGCTTTAACGGATGCTGGATCGTCTTG
TGGCCTCATTGCCGGGAAGAGAATAACTTCCTTGATGTTCTGTGAGTCGGTGAACAGCAT
GGCAAGCCTGTCTATCCCCAATCCCCAACCACCTGTAGGAGCCAGTCCATACTCCAAAGC
ACTGCAGAAAGTCTCATCTAAAGCCATCGCTTCATCGTCTCCAGATTGCCTATCCTTCAG
CTGATCAGCAAACCTTTGACGCTGAACCACAGGATCGTTCAACTCGGTGTAGGCGTTGCA
GAGTTCGTGTTGGTTTATGAACAGCTCGAATCTCTCAGTCAGAACATTGTTCGACCTATG
CCATTTTGCCAAGGGCGACATGATCTCAGGATGGTTGATGATGAACGTTGGGTTCACACA
TGTCACTTCCAGAAACTCTCCAACAAGTTTATCTAGTAAACGAGCTGTAGTCTGAGGAGG
TGGACATTTCACGTCGAGCCTGGCACAAGCATCAATCAGATATTTGTTGGCTTCTTCGCT
AGCCAAG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2DB20TF 424 0 0
TTCGACCTATGCCATTTTGCCAAGGGCGACATGATCTCAGGATGGTTGATGATGAACGTT
GGGTTCACACATGTCACTTCCAGAAACTCTCCAACAAGTTTATCTAGTAAACGAGCTGTA
GTCTGAGGAGGTGGACATTTCACGTCGAACCTGGCACAAGCATCAATCAGATATTTGTTG
GCTTCTTCGCTAGCCAAGTCTTTTGGAATATTGAGGTTAGCCACCTTCTCTAGCTCTCCT
ATCATCTCAATCCTCCTGAATGGAGGAGTGAAGTCGATTTCGATTGGCTCCTTGTCATAC
CCATTAGCATGATACTTGATTTTGTAACCACCTGTTAACTCTTTCACCATGCCACTCAAC
ATATCCTCAGTCATTTTCATCAGGTCATTGTAGTCTGCGAAAGCCATATAGAACTCGCAA
GTGG

QA 1 424 1 424
DS 



AS 1 3

CO CL3315Contig1 1187 3 6 U
GGGTGATCCGGTTATTCAATTTCCGGTTTATTAAGCAGTCGATTTGATGCAAACCTGATT
TTCATCAGGATTTAAAAGTAATAACCAAACAAAGAGAAGATTAGCAAAAAGAAATGGTTT
CTGTAGTGACCATTGAAGAAGAACAAAAGCAAATCTGCAAACACGTTTTCCCTTCTTTTT
ATTCTCACACCCGACGTTTCCTTGGCAATCTGCAACCATTATGAGCTTTCCTAGTAGTGT
CCTCGATGTAGACAATAGGATTCTGATCATTCCTTGAATTGGAGTAACCGCTTCTAAACG
CCACAATGGCGTTCCTCTTCTTCTTGAAATGCGTAAACCCATTCACCTTCACCACCACAG
ATTTCAGACCCATCGCCTTAACTCTCCTCCCAATGTTCTCAGCGGTAGCATCAGCCGTGT
AACTCGTCATCTTCCGCCCACCTTTCAAATCAGGCACACTACCCGACGTAGCCTTGCATT
TGACGTTCCCTTTGGAATCAGTAACCGTGACGAACGTGTTGTTCCTCAGCAGCTTGATGT
GAATGATGTCAGCGTTGGTCTCCAGGTTGGGGCGATGGAAGTGAGAGAACAGCCCTCCTG
TGGCGGCTCTACGTCCTTCGTCCTCCTCTATCACTCCCCTGACAAAGTCCAGGTCTTTGG
AAATCCCACCGGTCCGGAAGTTGTCCTTGAAAAGGTTGGACTGAGTGAAGCTCTGGTAGC
TGGGTGCGGGTGCAGAAGAGAACCCGCTTCCTCCAGTGCTTGGTAAGCCTTCTTCACCGG
ACTGAGGAGGTAAGGTGTTTGGTAAGCGTGATCTAAAGGGATTCTTGAAGGTGGGAGGAG
CATTGGGAGACGGGTAGCCGCCGTCTCCTGCTCTGTTTAACAAGCCTGATCTCAGTTCAC
TGAAACTACTGAAGGTGGAGGAGGTGCCCTTTCCTCCTCCAGAGGAGTTTAGTAAGCCTG
CTTTTATTTCACTGAAGGTTTTGGAGGGTGAAGGATTAGGATCCGGTGAGCTGGACTTGT
TCTCAGAGTTTCCAGGAACTGGTCCTTGCTCTCTCCCACCAGAGAAGCCATCTGATTGAG
ACGAAAATCGACAGACCGACTTGATTCCACCATAGCTTCGGATCAACGAAGGAAGTGGAG
AAGCTCGAAGATGACGAGAAACACCATTCATTTTTCCTCTTACTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN93JQ U 409
AF RR2EB32JQ U 1
AF RR2EB32TF C 496
BS 1 435 RR2EB32JQ
BS 436 436 RR2EN93JQ
BS 437 469 RR2EB32JQ
BS 470 470 RR2EN93JQ
BS 471 764 RR2EB32JQ
BS 765 1187 RR2EB32TF

RD RR2EN93JQ 230 0 0
CATCAGCCGTGTAACTCGTCATCTTCCGCCCACCTTTCAAATCAGGCACACTACCCGACG
TAGCCTTGCATTTGACGTTCCCTTTGGAATCAGTAACCGTGACGAAAGTGTTGTTCCTCA
GCAGCTTGATGTGAATGATGTCGGCGTTGGTCTCCAGGTTGGGGCGATGGAAGTGAGAGA
ACAGCCCTCCTGTGGCGGCTCTACGTCCTTCATCCTCCTCTATCACTCC
T

QA 1 229 1 229
DS 

RD RR2EB32JQ 764 0 0
GGGTGATCCGGTTATTCAATTTCCGGTTTATTAAGCAGTCGATTTGATGCAAACCTGATT
TTCATCAGGATTTAAAAGTAATAACCAAACAAAGAGAAGATTAGCAAAAAGAAATGGTTT
CTGTAGTGACCATTGAAGAAGAACAAAAGCAAATCTGCAAACACGTTTTCCCTTCTTTTT
ATTCTCACACCCGACGTTTCCTTGGCAATCTGCAACCATTATGAGCTTTCCTAGTAGTGT
CCTCGATGTAGACAATAGGATTCTGATCATTCCTTGAATTGGAGTAACCGCTTCTAAACG
CCACAATGGCGTTCCTCTTCTTCTTGAAATGCGTAAACCCATTCACCTTCACCACCACAG
ATTTCAGACCCATCGCCTTAACTCTCCTCCCAATGTTCTCAGCGGTAGCATCAGCCGTGT
AACTCGTCATCTTCCTCCCACCTTTCAAATCAGGCACACTACCCGACGTCGCCTTGCATT
TGACGTTCCCTTTGGAATCAGTAACCGTGACGAACGTGTTGTTCCTCAGCAGCTTGATGT
GAATGATGTCAGCGTTGGTCTCCAGGTTGGGGCGATGGAAGTGAGAGAACAGCCCTCCTG
TGGCGGCTCTACGTCCTTCGTCCTCCTCTATCACTCCCCTGACAAAGTCCAGGTCTTTGG
AAATCCCACCGGTCCGGAAGTTGTCCTTGAAAAGGTTGGACTGAGTGAAGCTCTGGTAGC
TGGGTGCGGGTGCAGAAGAGAACCCGCTTCCTCCAGTGCTTGGT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2EB32TF 692 0 0
AATCAGTAACCGTGACGAACGTGTTGTTCCTCAGCAGCTTGATGTGAATGATGTCAGCGT
TGGTCTCCAGGTTGGGGCGATGGAAGTGAGAGAACAGCCCTCCTGTGGCGGCTCTACGTC
CTTCGTCCTCCTCTATCACTCCCCTGACAAAGTCCAGGTCTTTGGAAATCCCACCGGTCC
GGAAGTTGTCCTTGAAAAGGTTGGACTGAGTGAAGCTCTGGTAGCTGGGTGCGGGTGCAG
AAGAGAACCCGCTTCCTCCAGTGCTTGGTAAGCCTTCTTCACCGGACTGAGGAGGTAAGG
TGTTTGGTAAGCGTGATCTAAAGGGATTCTTGAAGGTGGGAGGAGCATTGGGAGACGGGT
AGCCGCCGTCTCCTGCTCTGTTTAACAAGCCTGATCTCAGTTCACTGAAACTACTGAAGG
TGGAGGAGGTGCCCTTTCCTCCTCCAGAGGAGTTTAGTAAGCCTGCTTTTATTTCACTGA
AGGTTTTGGAGGGTGAAGGATTAGGATCCGGTGAGCTGGACTTGTTCTCAGAGTTTCCAG
GAACTGGTCCTTGCTCTCTCCCACCAGAGAAGCCATCTGATTGAGACGAAAATCGACAGA
CCGACTTGATTCCACCATAGCTTCGGATCAACGAAGGAAGTGGAGAAGCTCGAAGATGAC
GAGAAACACCATTCATTTTTCCTCTTACTCCC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL3316Contig1 702 2 5 U
GGAGAACCAATGGTTCATATCCGCTGCTGCTAATAACCCAAGAAAAAAAAAGTCCCTAAC
TTTGAGTCCCATTTGATGAATACTTCATCTGAATCAGTATTAGCTTTACTTTGTTGCTGA
ATTGGTTATGTTGTTTCACAGTGTGGGACTAGCTCAATGTTCACAGAAGTATATAGTCTT
CCCTAGGGGTTACTACAGATGCATAGTTGTTGGTTCATCTGAAACAGGGTTGTTGAAAAG
AAGACAAGTGTTGGAGCAAGTGGATTCGGAGTTGTCTAGCGGAAACGAGAGAGCTGCTTT
GTCACTTGTCAAAGATCCCCAAGGAAAATCTGGTGGGCTTCGATGTTTTGGAGCAGCAAG
ACAGGTGCCTCAGAGACTCTACACATTGGATGAGCTGAAACTGAATGGCATAAACGCAGC
TTCACTACTCTCCCCAACAGATGCAACACTTGGTTCCATCGAAAGGAACCTCCAGATAGC
TGGTGTCTCAGGAGGGATAGTTGCTTGGAGAGCCTTAGACTTGAGCTCTCAACAGCTCTT
CTATATCTCTCTTGGTCTTTTGTTCCTCTGGACTTTGGATTTGGTCTCATTTAATGGTGG
AATTGGGAGTTTGGTTCTTGATACAATTGGTCATACGTTCAGTCAACGTTACCATAACAG
AGTTGTTCAACATGAAGCAGTCATTTCTTGGTGGCTTACTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C702TF U 97
AF RR2EH07TF U 1
BS 1 282 RR2EH07TF
BS 283 283 RR2C702TF
BS 284 317 RR2EH07TF
BS 318 318 RR2C702TF
BS 319 702 RR2EH07TF

RD RR2C702TF 282 0 0
GG
ATTAGCTTTACTTTGTTGCTGAATTGGTTATGTTGTTTCACAGTGTGGGACTAGCTCCAT
GTTCACAGAAGTATATAGTCTTCCCTAGGGGTTACTACAGATGCATAGTTGTTGGTTCAT
CTGAAACAGGGTTGTTGAAAAGAAGACAAGTGTTGGAGCAAGTGGATTCGGAGTTGTCTA
GCGGAAACGAGAGAGCTGCTTTGTCACTTGTCAAAGATCCCCAAGGAAAATCTGGTGGGC
TTCGATGTTTTGGAGCAGCAAGACAGGTGCCTCAGAGACT

QA 3 282 3 282
DS 

RD RR2EH07TF 702 0 0
GGAGAACCAATGGTTCATATCCGCTGCTGCTAATAACCCAAGAAAAAAAAAGTCCCTAAC
TTTGAGTCCCATTTGATGAATACTTCATCTGAATCAGTATTAGCTTTACTTTGTTGCTGA
ATTGGTTATGTTGTTTCACAGTGTGGGACTAGCTCAATGTTCACAGAAGTATATAGTCTT
CCCTAGGGGTTACTACAGATGCATAGTTGTTGGTTCATCTGAAACAGGGTTGTTGAAAAG
AAGACAAGTGTTGGAGCAAGTGGATTCGGAGTTGTCTAGCGGGAACGAGAGAGCTGCTTT
GTCACTTGTCAAAGATCTCCAAGGAAAATCTGGTGGGCTTCGATGTTTTGGAGCAGCAAG
ACAGGTGCCTCAGAGACTCTACACATTGGATGAGCTGAAACTGAATGGCATAAACGCAGC
TTCACTACTCTCCCCAACAGATGCAACACTTGGTTCCATCGAAAGGAACCTCCAGATAGC
TGGTGTCTCAGGAGGGATAGTTGCTTGGAGAGCCTTAGACTTGAGCTCTCAACAGCTCTT
CTATATCTCTCTTGGTCTTTTGTTCCTCTGGACTTTGGATTTGGTCTCATTTAATGGTGG
AATTGGGAGTTTGGTTCTTGATACAATTGGTCATACGTTCAGTCAACGTTACCATAACAG
AGTTGTTCAACATGAAGCAGTCATTTCTTGGTGGCTTACTTA

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 3

CO CL3317Contig1 837 3 2 U
GTCATCAACTGTTCTTTTCTCTTAACCCAAAGTTGAACATTGTCTAAAAGTACTGTTGAT
AAATAGGAGAGAACCTCCATTGTTCAATGAGGCACAACGCGAACCTATCATTCTCTTCCT
GAGCAAAAAAACGTCTCTATTTATACTTTTACCTTTTTGTCCTCTTTGACCGTTTTGAGA
TTGAGCAAGATTAGTAGTCTAATTGACACAAATCTAAGAAACATATGATCAGAGTTCGTC
GTGCTTCTGAGTTTGGTCTTGGTTCATCATCTTCTCGAGCTTTTCTTGTAGTTCTTTAAG
TTTATCTTCTAGACACCGAGCTGGAGTAGATAAGACTGCCGCATATCCGCAACGACTTGG
TTCATCAACATCCATAAGCTCATTTTTCAACCCACATCTTAGCTTAATCTTCAGGCTTCT
ATCGGGACCGTTCCAACACTTGTCTCCGTTTGTATATGTCATGAACTGGTACGAGTTCTC
AAACTTTTCCCACCCCCCTAGCCGAGTTTTGGAATAGCCCTCCTCTTGTGTTGCTTCTTT
ATATGCGCAGACTTTGTAAGTATACTTGCCCTGTTTGCTCTCAAAACAACGACCATGGAA
TGAATAGAACTCTTTCTCCGGTCCAAAGTCTTGTTTCAGCTTCTTTTCTAAGCTTGATAC
CCTTGACTGTATTTTCTTAAGTTTTGAGCTCGACTCATCGTATTCCTTGCGTACCCGATC
AGCTTCTGATTTGTCCACTGGGGGTGGTTTGGGAATAAATTCACAGCCTGTAAAATGTTC
TTGACAGTCTTTTGTATCTTCTCCAACCAAGTAGGACTTGAGCTTGTCTCTGATAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS70JQ U 1
AF RR2AS70TF C 1
AF RR2EG30JQ U 41
BS 1 699 RR2AS70JQ
BS 700 837 RR2EG30JQ

RD RR2AS70JQ 700 0 0
GTCATCAACTGTTCTTTTCTCTTAACCCAAAGTTGAACATTGTCTAAAAGTACTGTTGAT
AAATAGGAGAGAACCTCCATTGTTCAATGAGGCACAACGCGAACCTATCATTCTCTTCCT
GAGCAAAAAAACGTCTCTATTTATACTTTTACCTTTTTGTCCTCTTTGACCGTTTTGAGA
TTGAGCAAGATTAGTAGTCTAATTGACACAAATCTAAGAAACATATGATCAGAGTTCGTC
GTGCTTCTGAGTTTGGTCTTGGTTCATCATCTTCTCGAGCTTTTCTTGTAGTTCTTTAAG
TTTATCTTCTAGACACCGAGCTGGAGTAGATAAGACTGCCGCATATCCGCAACGACTTGG
TTCATCAACATCCATAAGCTCATTTTTCAACCCACATCTTAGCTTAATCTTCAGGCTTCT
ATCGGGACCGTTCCAACACTTGTCTCCGTTTGTATATGTCATGAACTGGTACGAGTTCTC
AAACTTTTCCCACCCCCCTAGCCGAGTTTTGGAATAGCCCTCCTCTTGTGTTGCTTCTTT
ATATGCGCAGACTTTGTAAGTATACTTGCCCTGTTTGCTCTCAAAACAACGACCATGGAA
TGAATAGAACTCTTTCTCCGGTCCAAAGTCTTGTTTCAGCTTCTTTTCTAAGCTTGATAC
CCTTGACTGTATTTTCTTAAGTTTTGAGCTCGACTCATC
C

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2AS70TF 700 0 0
GTCATCAACTGTTCTTTTCTCTTAACCCAAAGTTGAACATTGTCTAAAAGTACTGTTGAT
AAATAGGAGAGAACCTCCATTGTTCAATGAGGCACAACGCGAACCTATCATTCTCTTCCT
GAGCAAAAAAACGTCTCTATTTATACTTTTACCTTTTTGTCCTCTTTGACCGTTTTGAGA
TTGAGCAAGATTAGTAGTCTAATTGACACAAATCTAAGAAACATATGATCAGAGTTCGTC
GTGCTTCTGAGTTTGGTCTTGGTTCATCATCTTCTCGAGCTTTTCTTGTAGTTCTTTAAG
TTTATCTTCTAGACACCGAGCTGGAGTAGATAAGACTGCCGCATATCCGCAACGACTTGG
TTCATCAACATCCATAAGCTCATTTTTCAACCCACATCTTAGCTTAATCTTCAGGCTTCT
ATCGGGACCGTTCCAACACTTGTCTCCGTTTGTATATGTCATGAACTGGTACGAGTTCTC
AAACTTTTCCCACCCCCCTAGCCGAGTTTTGGAATAGCCCTCCTCTTGTGTTGCTTCTTT
ATATGCGCAGACTTTGTAAGTATACTTGCCCTGTTTGCTCTCAAAACAACGACCATGGAA
TGAATAGAACTCTTTCTCCGGTCCAAAGTCTTGTTTCAGCTTCTTTTCTAAGCTTGATAC
CCTTGACTGTATTTTCTTAAGTTTTGAGCTCGACTCATC
C

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2EG30JQ 797 0 0
C
GTCTAAAAGTACTGTTGATAAATAGGAGAGAACCTCCATTGTTCAATGAGGCACAACGTG
AACCTATCATTCTCTTCCTGAGCAAAAAAACGTCTCTATTTATACTTTTACCTTTTTGTC
CTCTTTGACCGTTTTGAGATTGAGCAAGATTAGTAGTCTAATTGACACAAATCTAAGAAA
CATATGATCAGAGTTCGTCGTGCTTCTGAGTTTGGTCTTGGTTCATCATCTTCTCGAGCT
TTTCTTGTAGTTCTTTAAGTTTATCTTCTAGACACCGAGCTGGAGTAGATAAGACTGCCG
CATATTCGCAACGACTTGGTTCATCAACATCCATAAGCTCATTTTTCAACCCACATCTTA
GCTTAATCTTTAGGCTTCTATCGGGACCGTTCCAACACTTGTCTCCGTTTGTATATGTCA
TGAACTGGTACGAGTTCTCAAACTTTTCCCACCCCCCTAGCCGAGTTTTGGAATAGCCCT
CCTCTTGTGTTGCTTCTTTATATGCGCAGACTTTGTAAGTATACTTGCCCTGTTTGCTCT
CAAAACAACGACCATGGAATGAATAGAACTCTTTCTCCGGTCCAAAGTCTTGTTTCAGCT
TCTTTTCTAAGCTTGATACCCTTGACTGTATTTTCTTAAGTTTTGAGCTCGACTCATCGT
ATTCCTTGCGTACCCGATCAGCTTCTGATTTGTCCACTGGGGGTGGTTTGGGAATAAATT
CACAGCCTGTAAAATGTTCTTGACAGTCTTTTGTATCTTCTCCAACCAAGTAGGACTTGA
GCTTGTCTCTGATAAA

QA 2 797 2 797
DS 



AS 1 3

CO CL3318Contig1 786 3 3 U
GGACACACACACACACACTCATAATGGAAACTCTTTTTATTGTAGCTGTTCTACTTTTGG
CTCTCTCCTCTTCCTCTTTCACACGAGGCCAGAGAATCATACAGATTCCACCCCCACGTC
CATTATGCGTCCCTCAGTACGCTCTGGCTAACTACGCCTGCGCACGTGTCCCAGTGACCA
CTATCCTACCTTCTTCCCCCACTGTCCCACCTTCTCCTGACCATGACCATGATGATGACC
ATGACCATGACCATGATGATGACGACCATGACCACGATGATGACGATGATCACGTCCATG
ATGACGATGACCACCACCACCACCATGATGACGATGACCACGGCCATGATGACGATGACC
ACGACCACGATCATGATGACCATGATCACGGTGACCACGACCACCACGATAATGACGACC
ACCACCACCACCACCATCACCATCATCACCGACACGGAGATGAGACGTATGGTCAACAAG
ATTGCTGCAAGTGGTTGAGGCAAATAGACAACGAGTGCGTGTGCGACCTTCTGGTTACGC
TTCCGCCATTGCTATCAAAACCTGCTCATAACTATACAGTCTTTGTGGACGACTCATGCA
TCGTCACATTCACTTGTGGAGGCAGACTTCTACACTAACTGGCTCGTGTCTCTCTTCTCC
TTGAAAGACCCTTTTGTTTATCCTTTTTTATATATATCTTAGATGTACTACGTTTGTTTA
ATTTCACGCTCTTGAGTTCAGCTGTTGTATGCATTGCTCTCACACTTGACTAGACAAAAG
TCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2G365TF U 1
AF RR2AD94TF U 539
AF RR2G365JQ C 323
BS 1 540 RR2G365TF
BS 541 739 RR2AD94TF
BS 740 786 RR2G365JQ

RD RR2G365TF 540 0 0
GGACACACACACACACACTCATAATGGAAACTCTTTTTATTGTAGCTGTTCTACTTTTGG
CTCTCTCCTCTTCCTCTTTCACACGAGGCCAGAGAATCATACAGATTCCACCCCCACGTC
CATTATGCGTCCCTCAGTACGCTCTGGCTAACTACGCCTGCGCACGTGTCCCAGTGACCA
CTATCCTACCTTCTTCCCCCACTGTCCCACCTTCTCCTGACCATGACCATGATGATGACC
ATGACCATGACCATGATGATGACGACCATGACCACGATGATGACGATGATCACGTCCATG
ATGACGATGACCACCACCACCACCATGATGACGATGACCACGGCCATGATGACGATGACC
ACGACCACGATCATGATGACCATGATCACGGTGACCACGACCACCACGATAATGACGACC
ACCACCACCACCACCATCACCATCATCACCGACACGGAGATGAGACGTATGGTCAACAAG
ATTGCTGCAAGTGGTTGAGGCAAATAGACAACGAGTGCGTGTGCGACCTTCTGGTTACGC

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2AD94TF 201 0 0
GCTTCCGCCATTGCTATCAAAACCTGCTCATAACTATACAGTCTTTGTGGACGACTCATG
CATCGTCACATTCACTTGTGGAGGCAGACTTCTACACTAACTGGCTCGTGTCTCTCTTCT
CCTTGAAAGACCCTTTTGTTTATCCTTTTTTATATATATCTTAGATGTACTACGTTTGTT
TAATTTCACGCTCTTGAGTTC

QA 1 201 1 201
DS 

RD RR2G365JQ 464 0 0
CCATGATGACGATGACCACGGCCATGATGACGATGACCACGACCACGATCATGATGACCA
TGATCACGGTGACCACGACCACCACGATAATGACGACCACCACCACCACCACCATCACCA
TCATCACCGACACGGAGATGAGACGTATGGTCAACAAGATTGCTGCAAGTGGTTGAGGCA
AATAGACAACGAGTGCGTGTGCGACCTTCTGGTTACGCTTCCGCCATTGCTATCAAAACC
TGCTCATAACTATACAGTCTTTGTGGACGACTCATGCATCGTCACATTCACTTGTGGAGG
CAGACTTCTACACTAACTGGCTCGTGTCTCTCTTCTCCTTGAAAGACCCTTTTGTTTATC
CTTTTTTATATATATCTTAGATGTACTACGTTTGTTTAATTTCACGCTCTTGAGTTCAGC
TGTTGTATGCATTGCTCTCACACTTGACTAGACAAAAGTCAACC

QA 1 464 1 464
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3320Contig1 843 3 4 U
CAAGTATCATAAACTCATCGGAATCTAACAAGAATCCGGCCAAAATAAAAATTACAGTAA
CATCTCTCTCGAGTGCCACGTTCAATCTTTCCTTCTTTTATTTAGAAACAAAAAAAAAGA
TCAAAATATAATAACAATGAAATATATAGAACACAAACAAATATAACAGATGAAGGCATA
TAGACGTAGAAGAAGCATCAAGCCATCTCTCATCATCAATTTTTAAGCAAGGTTGATCGT
GAAGGAGACATAAGGATGTGTCTCGGAGTCACCGGCTAAACCAGCCATGGCTCCTCCATC
CTCCTCGCTTTTCCAGTATAAACTGTTGGTAGAATCAGACAAGCGTTCAAGAATGAAGCG
GACTTTCTTTTCACTTTTTACAGCCGGAGATAAGACACATGCCAAGAAAGCCGGAGGAAG
ACCATATCTCATAATGCTCTCAGCGAATATACGAACAGCACAGAAATGCATCCAGGAGCT
GAAAACCTCTCCATAACTGGTGTAGCACCACTGCAAAAGAGAGTTTCTCAAGCTTTCCTG
ATCCCGAACCAACTTTTCTAGCTCTTGTTTGCGAGTCTCTTGTGCTTCGACGCTGTGTTC
AAAATCACGAACTTGGAACCCTTTCTCGCGGGAATTAGTCCTGAAATTGTCTGCAACACG
AGTGAAGAGAGTGACAGTGTAAAGAGCATACTCATTATCCTCAAACAATTTCTTTGACGA
CCTGGGAACCACAAAGTCGGTCAATGTCTCGTAACATGCTAGCCAGTCTTTTTGAGAATA
CTTAAGGAACAACTGCAAGGAGGGTAACGAGATGTTCTGACGAGACAACGTCTTCTGGAT
TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2DZ76JQ U 1
AF RR2AL68JQ U 641
AF RR2AL68TF C 96
BS 1 245 RR2DZ76JQ
BS 246 643 RR2AL68TF
BS 644 794 RR2AL68JQ
BS 795 843 RR2AL68TF

RD RR2DZ76JQ 245 0 0
CAAGTATCATAAACTCATCGGAATCTAACAAGAATCCGGCCAAAATAAAAATTACAGTAA
CATCTCTCTCGAGTGCCACGTTCAATCTTTCCTTCTTTTATTTAGAAACAAAAAAAAAGA
TCAAAATATAATAACAATGAAATATATAGAACACAAACAAATATAACAGATGAAGGCATA
TAGACGTAGAAGAAGCATCAAGCCATCTCTCATCATCAATTTTTAAGCAAGGTTGATCGT
GAAGG

QA 1 245 1 245
DS 

RD RR2AL68JQ 154 0 0
TGA
AAATTGTCTGCAACACGAGTGAAGAGAGTGACAGTGTAAAGAGCATACTCATTATCCTCA
AACAATTTCTTTGACGACCTGGGAACCACAAAGTCGGTCAATGTCTCGTAACATGCTAGC
CAGTCTTTTTGAGAATACTTAAGGAACAACT

QA 4 154 4 154
DS 

RD RR2AL68TF 748 0 0
TTTTATTTAGAAACAAAAAAAAAGATCAAAATATAATAACAATGAAATATATAGAACACA
AACAAATATAACAGATGAAGGCATATAGACGTAGAAGAAGCATCTAGCCATCTCTCATCA
TCAATTTT*ATGCAAGGTTGATCGTGAAGGAGACATAAGGATGTGTCTCGGAGTCACCGG
CTAAACCAGCCATGGCTCCTCCATCCTCCTCGCTTTTCCAGTATAAACTGTTGGTAGAAT
CAGACAAGCGTTCAAGAATGAAGCGGACTTTCTTTTCACTTTTTACAGCCGGAGATAAGA
CACATGCCAAGAAAGCCGGAGGAAGACCATATCTCATAATGCTCTCAGCGAATATACGAA
CAGCACAGAAATGCATCCAGGAGCTGAAAACCTCTCCATAACTGGTGTAGCACCACTGCA
AAAGAGAGTTTCTCAAGCTTTCCTGATCCCGAACCAACTTTTCTAGCTCTTGTTTGCGAG
TCTCTTGTGCTTCGACGCTGTGTTCAAAATCACGAACTTGGAACCCTTTCTCGCGGGAAT
TAGTCCTGAAATTGTCTGCAACACGAGTGAAGAGAGTGACAGTGTAAAGAGCATACTCAT
TATCCTCAAACAATTTCTTTGACGACCTGGGAACCACAAAGTCGGTCAATGTCTCGTAAC
ATGCTAGCCAGTCTTTTTGAGAATACTTA*GGAACAACTGCAAGGAGGGTAACGAGATGT
TCTGACGAGACAACGTCTTCTGGATTCC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL3321Contig1 953 2 2 U
GCAGAGTACTGTGGGAGATGTTATTAAGGAGCTTAAAACAAAGGTGGAGTTATCGCATCC
TGATGCAGAACTGAGGTTGCTAGAGGTGTTTTTCCACAAGATTTACAAGATCTTTACATC
TACGGAAAGAATTGAGAATATCAATGACCAGTACTGGACTTTACGAGCAGAGGAGATACC
TGAGGAAGAGAAGAATATTGGTCCCGGTGATCGATTAGTCCATGTGTACCATTTTACTAA
AGAACAAAATCAATCGCAAGTACAAAATTTCGGGGAGCCGTTCTTTCTGGTAATCCACGA
AGGTGAAACTTTAGAAGAAATCAAGACACGTATCCAAAAGAAACTCCATGTACCTGATGA
GGACTTCGCCAAGTGGAAGTTTGCTTCTTTCTCAATGGGACGTCCCGACTACTTGCAGGA
GACAGATGTCGTTTATGATCGCTTTCAGAGAAGGGATGTATATGGTGCGTGGGAGCAGTA
TCTTGGGTTGGAGCACATTGATAATGCTCCTAAAAGGGCTTATGCTGCAAATCAGAATCG
ACACGCATATGAGAAGCCGGTGAAAATATACAATTAGGAGGAGCAAGAGAGACAGAGAGA
GGATACGTGGCTATCCATGGAGGAAGATCATTAAAGGGTGGTTTTGGTACGAGGAGTAGT
AGGGATATAGAGAGGGTTCCTCACTTTAGATTTTCTTGATAACCAAAAATTAAATATATC
TTTTTAAGGAAAAGGGTTTTTATTTTGGGCCCTGACGGTAGTAAGTGTGGTGCTCTATCT
GGCTTCCAAGTACTATTTTGGTGTTGATATTGGTATTTCTCTAAGACTATACTCAAAATT
ATCATTTTGAAGACGAGAGCTCCGTTCTTGTATTTGGGAGGGCGTTGGCCTTTTTGGTTC
TCAATTAGGATTGTCTATTTTCCCGGGTACAGTTTTTCTATGTTCAAAAAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM54TF U 1
AF RR2EI15TF U 614
BS 1 751 RR2AM54TF
BS 752 953 RR2EI15TF

RD RR2AM54TF 751 0 0
GCAGAGTACTGTGGGAGATGTTATTAAGGAGCTTAAAACAAAGGTGGAGTTATCGCATCC
TGATGCAGAACTGAGGTTGCTAGAGGTGTTTTTCCACAAGATTTACAAGATCTTTACATC
TACGGAAAGAATTGAGAATATCAATGACCAGTACTGGACTTTACGAGCAGAGGAGATACC
TGAGGAAGAGAAGAATATTGGTCCCGGTGATCGATTAGTCCATGTGTACCATTTTACTAA
AGAACAAAATCAATCGCAAGTACAAAATTTCGGGGAGCCGTTCTTTCTGGTAATCCACGA
AGGTGAAACTTTAGAAGAAATCAAGACACGTATCCAAAAGAAACTCCATGTACCTGATGA
GGACTTCGCCAAGTGGAAGTTTGCTTCTTTCTCAATGGGACGTCCCGACTACTTGCAGGA
GACAGATGTCGTTTATGATCGCTTTCAGAGAAGGGATGTATATGGTGCGTGGGAGCAGTA
TCTTGGGTTGGAGCACATTGATAATGCTCCTAAAAGGGCTTATGCTGCAAATCAGAATCG
ACACGCATATGAGAAGCCGGTGAAAATATACAATTAGGAGGAGCAAGAGAGACAGAGAGA
GGATACGTGGCTATCCATGGAGGAAGATCATTAAAGGGTGGTTTTGGTACGAGGAGTAGT
AGGGATATAGAGAGGGTTCCTCACTTTAGATTTTCTTGATAACCAAAAATTAAATATATC
TTTTTAAGGAAAAGGGTTTTTATTTTGGGCC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2EI15TF 340 0 0
GCCAT
GGAGGAAGATCATTAAAGGGTGGTTTTGGTATGAGGAGTAGTAGGGATATAGAGAGGGTT
CCTCACTTTAGATTTTCTTGATAACCAAAAATTAAATATATCTTTTTAAGGAAAAGGGTT
TTTATTTTGGGCCCTGACGGTAGTAAGTGTGGTGCTCTATCTGGCTTCCAAGTACTATTT
TGGTGTTGATATTGGTATTTCTCTAAGACTATACTCAAAATTATCATTTTGAAGACGAGA
GCTCCGTTCTTGTATTTGGGAGGGCGTTGGCCTTTTTGGTTCTCAATTAGGATTGTCTAT
TTTCCCGGGTACAGTTTTTCTATGTTCAAAAAATA

QA 6 340 6 340
DS 



AS 1 2

CO CL3322Contig1 1241 2 6 U
GGACGTTCTCTATTCTCTTCAAACATACGTTATTGACTTTCTCTCTCTATCTCTCTCTCA
GAAGGAGCGGTGAAGCTTGAATCATCATGGCCTCTCGTATTGCTAATGATGTGACCGAAT
TGATTGGGAACACTCCATTGGTGTATCTGAACAGTGTTGCTGAAGGATGTGTTGGTCGTG
TTGCTGCTAAGCTTGAGATGATGGAGCCCTGCTCCAGCGTCAAAGACAGGATTGGTTTTA
GCATGATCTCTGATGCAGAGAAAAAGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGTTGATTG
AGCCAACGAGTGGAAACACCGGAGTTGGGTTAGCATTCACGGCGGCTGCCAAGGGCTACA
AGCTTATTATCACCATGCCAGCTTCAATGAGTGTTGAGAGAAGAATCATTCTCTTAGCTT
TTGGTGTTGAGTTGGTTTTAACTGACCCGGCCAAGGGCATGAAAGGCGCTATCGCAAAGG
CTGAGGAGATTTTGGCTAAAACACCCAATGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTG
CTAACCCAAAGATCCACTATGAGACAACTGGACCTGAGATTTGGAAAGGCACCGGTGGAA
AAATCGATGGCTTTGTCTCTGGGATTGGTACTGGTGGTACCATAACAGGTGCGGGGAAGT
ATCTCAAGGAACAGAACCCCAACGTTAAGCTGTATGGAGTGGAGCCAGTTGAAAGCGCAA
TTCTATCCGGTGGAAAGCCAGGCCCTCACAAGATTCAAGGGATAGGTGCCGGTTTTATAC
CAGGTGTATTGGAGGTTAATCTTATAGATGAAGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCA
TAGACATGGCAAGGCTTCTTGCTCGTAAAGAAGGTCTTCTTGTGGGAATATCATCAGGTG
CAGCAGCTGCCGCAGCAATCAAACTTGCAAAGAGGCCAGAAAACGCCGGGAAGCTTTTTG
TGGCGGTGTTCCCAAGTTTCGGAGAGAGGTACCTGTCGACCGTACTATTCGATGCCACAA
GGAAAGAAGCAGAATCCATGACCTTCGAGGCTTGAATAGCTCTCAGCTGCAAAAGAAAAA
AAAATCTCCATTTCTTTGCTATTAGAGACGCCACAAAATAAAAAATAAAGGATGTTACAG
TTTCTTCCTAAAGAGAATGTTCATCTTCAGTTTCAATGCGTCTTTGTTTTTATTTATGTA
TCTTCTGTGTGTGTGTGAACAAAACTCAAACTCTATTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES16TF U 1
AF RR2ES16JQ C 576
BS 1 647 RR2ES16TF
BS 648 648 RR2ES16JQ
BS 649 729 RR2ES16TF
BS 730 730 RR2ES16JQ
BS 731 754 RR2ES16TF
BS 755 1241 RR2ES16JQ

RD RR2ES16TF 760 0 0
GGACGTTCTCTATTCTCTTCAAACATACGTTATTGACTTTCTCTCTCTATCTCTCTCTCA
GAAGGAGCGGTGAAGCTTGAATCATCATGGCCTCTCGTATTGCTAATGATGTGACCGAAT
TGATTGGGAACACTCCATTGGTGTATCTGAACAGTGTTGCTGAAGGATGTGTTGGTCGTG
TTGCTGCTAAGCTTGAGATGATGGAGCCCTGCTCCAGCGTCAAAGACAGGATTGGTTTTA
GCATGATCTCTGATGCAGAGAAAAAGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGTTGATTG
AGCCAACGAGTGGAAACACCGGAGTTGGGTTAGCATTCACGGCGGCTGCCAAGGGCTACA
AGCTTATTATCACCATGCCAGCTTCAATGAGTGTTGAGAGAAGAATCATTCTCTTAGCTT
TTGGTGTTGAGTTGGTTTTAACTGACCCGGCCAAGGGCATGAAAGGCGCTATCGCAAAGG
CTGAGGAGATTTTGGCTAAAACACCCAATGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTG
CTAACCCAAAGATCCACTATGAGACAACTGGACCTGAGATTTGGAAAGGCACCGGTGGAA
AAATCGATGGCTTTGTCTCTGGGATTGGTACTGGTGGTACCATAACATGTGCGGGGAAGT
ATCTCAAGGAACAGAACCCCAACGTTAAGCTGTATGGAGTGGAGCCAGTTGAAAGCGCAA
TTCTATCCG*TGGAAAGCCAGGCCCTCACAAGAT
CAAGGG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2ES16JQ 666 0 0
GAGATTTGGAAAGGCACCGGTGGAAAAATCGATGGCTTTGTCTCTGGGATTGGTACTGGT
GGTACCATAACAGGTGCGGGGAAGTATCTCAAGGAACAGAACCCCAACGTTAAGCTGTAT
GGAGTGGAGCCAGTTGAAAGCGCAATTCTATCCGGTGGAAAGCCAGGCCCTCACAAGATT
CAAGGGATAGGTGCCGGTTTTATACCAGGTGTATTGGAGGTTAATCTTATAGATGAAGTT
GTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATAGACATGGCAAGGCTTCTTGCTCGTAAAGAAGGT
CTTCTTGTGGGAATATCATCAGGTGCAGCAGCTGCCGCAGCAATCAAACTTGCAAAGAGG
CCAGAAAACGCCGGGAAGCTTTTTGTGGCGGTGTTCCCAAGTTTCGGAGAGAGGTACCTG
TCGACCGTACTATTCGATGCCACAAGGAAAGAAGCAGAATCCATGACCTTCGAGGCTTGA
ATAGCTCTCAGCTGCAAAAGAAAAAAAAATCTCCATTTCTTTGCTATTAGAGACGCCACA
AAATAAAAAATAAAGGATGTTACAGTTTCTTCCTAAAGAGAATGTTCATCTTCAGTTTCA
ATGCGTCTTTGTTTTTATTTATGTATCTTCTGTGTGTGTGTGAACAAAACTCAAACTCTA
TTTCTT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL3323Contig1 363 2 5 U
CGTGAAAACTTCATATATATAGATCTGAATAATTGAGCATTGATAACCAAACAGCTGCAG
GGTTACACATACTAGAACTATAATGGGTGTCGAAGACAAACATACACATAGCAACAACAA
CAGTACAAAGCTTAATAGAAATCATTTACTTTTGCCTCTTAATTTTCAACACAAACACCA
AAAAGCTTCCAAATTTCATCAAGTGGCGATGTCACTTGTGTCTCTGGCGCACCTTGTAAT
GGTCCCACAGCCTCTGCCGTAAGAATTAGCTTGTCCGGATCGGCAATCGTAGTACGAGGC
GCCGGGCTTCTGACAAGGAACCATGTCCCTCCTTAGGGTTTCGTACCCGATGTACCGCTT
CTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2BH55JQ U 192
AF RR2FD84TF C 1
BS 1 191 RR2FD84TF
BS 192 244 RR2BH55JQ
BS 245 245 RR2FD84TF
BS 246 357 RR2BH55JQ
BS 358 363 RR2FD84TF

RD RR2BH55JQ 170 0 0
AATTTCATCAAGTGGCGATGTCACTTGTGTCTCTGGCGCACCTTGTAATGGTCTCACAGC
CTCTGCCGTAAGAATTAGCTTGTCCGGATCGGCAATCGTAGTACGAGGCGCCGGGCTTCT
GACAAGGAACCATGTCCCTCCTTAGGGTTTCGTACCCGATGTACCG
TTTC

QA 1 166 1 166
DS 

RD RR2FD84TF 363 0 0
CGTGAAAACTTCATATATATAGATCTGAATAATTGAGCATTGATAACCAAACAGCTGCAG
GGTTACACATACTAGAACTATAATGGGTGTCGAAGACAAACATACACATAGCAACAACAA
CAGTACAAAGCTTAATAGAAATCATTTACTTTTGCCTCTTAATTTTCAACACAAACACCA
AAAAGCTTCCAAATTTCATCAAGTGGCGATGTCACTTGTGTCTCTGGCGCACCTTGTAAT
GGTCCCACAGCCTCTGCCGTAAGAATTAGCTTGTCCGGATCGGCAATCGTAGTACGAGGC
GCCTGGTTTCTGACAAGGAACCATGTCCCTCCTTAGGGTTTCGTACCCGATGTACCGCTT
CTC

QA 1 363 1 363
DS 



AS 1 2

CO CL3324Contig1 700 2 9 U
GGTAACAGAATCTTAACATTTAGACAGAAAAAAGTTGCAGCTCACTTAGGCTTTGGACCA
AATTCAAAAGTTAACAACACATTGAGACGACTGAGATTTCAACTACAGGTACCAAAAAAC
AGATATCACTTTCTATGTAATAAGAAGCTAGTTGTGAAGATTTTTGTCAAGTCTTTTGAG
TGATGGATCCAAGGATCAAATCACGGACCTCCTCGCTGTTGGCTCTGTCAAGAGCAGTTC
TTCCATCAGCGTCCTTGACAGTGTAGTCAGCACCGGCTCTGAGGAGCTCCTCGATCTTAG
GCTTGTCTCCTTCTGAGGCTGCTAACATCAAAAGGATATCTACAGGATGAATGTTTTGGT
TGAGAAGAGCCTCCATCTTATCATAGGTTCCTTCAACCGCAAGCATCCCCATATAGTTGA
AATACTGTTCGACATCGTCTCTGTCGAAATCATCCCGTGACTGACTGCCATAGATGCCAG
CATTCTCAGCATCGACGCCGTTCTTTCCGAACTTGAACCAGCAAGTGGCTCTAGACCCAT
TGGAGGGTCCGAGTCGGATACTGAGCTTCACAACCCGAGTTCCAAGAAACCGAGAGGAGA
GTCTTACTGAGGAAGGAGAAGAACTGTTGATAGGTTTGGTTGTAGAGAAGAAGAAGCTCG
CAGAAGGAGCTCTGCATGATGAGATGGAAGCCATGGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C743JQ U 192
AF RR2DJ85TF C 1
BS 1 191 RR2DJ85TF
BS 192 213 RR2C743JQ
BS 214 214 RR2DJ85TF
BS 215 267 RR2C743JQ
BS 268 268 RR2DJ85TF
BS 269 316 RR2C743JQ
BS 317 317 RR2DJ85TF
BS 318 347 RR2C743JQ
BS 348 700 RR2DJ85TF

RD RR2C743JQ 156 0 0
AGGATCAAATCACGGACCTCCTGGCTGTTGGCTCTGTCAAGAGCAGTTCTTCCATCAGCG
TCCTTGACAGTGTAGTTAGCACCGGCTCTGAGGAGCTCCTCGATCTTAGGCTTGTCTCCT
TCTGATGCTGCTAACATCAAAAGGATATCTACAGGA

QA 1 156 1 156
DS 

RD RR2DJ85TF 700 0 0
GGTAACAGAATCTTAACATTTAGACAGAAAAAAGTTGCAGCTCACTTAGGCTTTGGACCA
AATTCAAAAGTTAACAACACATTGAGACGACTGAGATTTCAACTACAGGTACCAAAAAAC
AGATATCACTTTCTATGTAATAAGAAGCTAGTTGTGAAGATTTTTGTCAAGTCTTTTGAG
TGATGGATCCAAGGATCAAATCACGGATCTCCTCGCTGTTGGCTCTGTCAAGAGCAGTTC
TTCCATCAGCGTCCTTGACAGTGTAGTCAGCACCGGCTCTGAGGAGCTCCTCGATCTTAG
GCTTGTCTCCTTCTGAGGCTGCTAACATCAAAAGGATATCTACAGGATGAATGTTTTGGT
TGAGAAGAGCCTCCATCTTATCATAGGTTCCTTCAACCGCAAGCATCCCCATATAGTTGA
AATACTGTTCGACATCGTCTCTGTCGAAATCATCCCGTGACTGACTGCCATAGATGCCAG
CATTCTCAGCATCGACGCCGTTCTTTCCGAACTTGAACCAGCAAGTGGCTCTAGACCCAT
TGGAGGGTCCGAGTCGGATACTGAGCTTCACAACCCGAGTTCCAAGAAACCGAGAGGAGA
GTCTTACTGAGGAAGGAGAAGAACTGTTGATAGGTTTGGTTGTAGAGAAGAAGAAGCTCG
CAGAAGGAGCTCTGCATGATGAGATGGAAGCCATGGCTCC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL3325Contig1 1234 2 2 U
TTTTTTATTTTTCCTCTTCTTCGTCGTCCTCTCTCTCTTTCTCTCTAAGAAAGTGTTTTA
CTGTTTTCTCTAAATCACTATATGCTTCAACAGTTACTCCACACATTCATACTTGAGAAT
GTCTGAATCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAGCATGATTACATAGGTTTGTCTGAGTT
TCCAACCATGGAAGCAACACAAATAATGTCTGACAAAACCGAAGACAACAACAACAACGA
CGTTCCGAATTTCAAGGCTACCGAGTTAAGACTCGGTTTACCCGGTTCTGAGTCACCGGA
GCGAGTTGGGTTCATGTCGCTCAAGAGCTCATGTCCTGTGTCAGGTGCCAAAAGGGTGTT
TTCTGACGCCATTAACGGGTCTACCAAATGGGTCTTCTCTCCTGATGTGAAAGACATTAA
ACCGGCCGTTCCGGTTAAGGAGAAGAAGAGCTCTGCTCCAGCTTCCAAGGCACAAGTTGT
GGGTTGGCCACCGATTAGATCATTCAGGAAGAACACAATGGCTTCTTCTCAGTCTCAGAA
ACAAGATGGTTGTGATAATAATAACAACAACACAGAGACTGAAGGTTGTGAAACTAAGTC
TGGACCTGAGCCTTGCTTGTATGCTAAAGTGAGCATGGAAGGTGCTCCATACTTGAGGAA
AATCGATCTCAAGACTTACAAGAGCTACCTTGAACTCTCTTCTGCTCTTGAGAAGATGTT
CAGCTGCTTCACTATTGGTCAGTTTGGGTCTCATGGAGGTTGTGGTCGAGATGGGTTAAA
CGAGAGTCGGTTAACTGATCTCTTGCGTGGTTCTGAGTATGTTGTTACCTATGAAGACAA
AGACAGTGACTGGATGCTGGTCGGTGATGTCCCTTGGGAAATGTTTATATGCTCCTGTAA
GAAGCTGAGGATCATGAAGAGCTTTGAGGCTATAGGCTTAGCTCCAAGGGTGATGGAGAA
ATGTAGAAGCCGGAACTAGTAACTGCAGCACTTTTATGATATGTGATATGATAAAATGAT
TTGGAAGAATGTTATTAAGAAATGTAATAGCCCATTTTGTTTTTCTAAGTATTCTTGTGT
GTGTGTTTTGTGTGCTAAGAGTGATGTTTGATCTTACTTAAAACAGCCTCTACTACTAAT
AAGGCCTATTCTGTCTCTAATCCATCAAATGGGTTTTTGTGTATGTGTGTTTTTTTTTTG
CTAGGTAAGACTTTCATAACTCATATGTATAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT93TF U 1
AF RR2FT93JQ C 507
BS 1 640 RR2FT93TF
BS 641 1234 RR2FT93JQ

RD RR2FT93TF 640 0 0
TTTTTTATTTTTCCTCTTCTTCGTCGTCCTCTCTCTCTTTCTCTCTAAGAAAGTGTTTTA
CTGTTTTCTCTAAATCACTATATGCTTCAACAGTTACTCCACACATTCATACTTGAGAAT
GTCTGAATCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAGCATGATTACATAGGTTTGTCTGAGTT
TCCAACCATGGAAGCAACACAAATAATGTCTGACAAAACCGAAGACAACAACAACAACGA
CGTTCCGAATTTCAAGGCTACCGAGTTAAGACTCGGTTTACCCGGTTCTGAGTCACCGGA
GCGAGTTGGGTTCATGTCGCTCAAGAGCTCATGTCCTGTGTCAGGTGCCAAAAGGGTGTT
TTCTGACGCCATTAACGGGTCTACCAAATGGGTCTTCTCTCCTGATGTGAAAGACATTAA
ACCGGCCGTTCCGGTTAAGGAGAAGAAGAGCTCTGCTCCAGCTTCCAAGGCACAAGTTGT
GGGTTGGCCACCGATTAGATCATTCAGGAAGAACACAATGGCTTCTTCTCAGTCTCAGAA
ACAAGATGGTTGTGATAATAATAACAACAACACAGAGACTGAAGGTTGTGAAACTAAGTC
TGGACCTGAGCCTTGCTTGTATGCTAAAGTGAGCATGGAA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2FT93JQ 728 0 0
GGAAGAACACAATGGCTT*TTCTCAGTCTCAGAAACAAGATGGTTGTGATAATAATAACA
ACAACACAGAGACTGAAGGTTGTGAAACTAAGTCTGGACCTGAGCCTTGCTTGTATGCTA
AAGTGAGCATGGAAGGTGCTCCATACTTGAGGAAAATCGATCTCAAGACTTACAAGAGCT
ACCTTGAACTCTCTTCTGCTCTTGAGAAGATGTTCAGCTGCTTCACTATTGGTCAGTTTG
GGTCTCATGGAGGTTGTGGTCGAGATGGGTTAAACGAGAGTCGGTTAACTGATCTCTTGC
GTGGTTCTGAGTATGTTGTTACCTATGAAGACAAAGACAGTGACTGGATGCTGGTCGGTG
ATGTCCCTTGGGAAATGTTTATATGCTCCTGTAAGAAGCTGAGGATCATGAAGAGCTTTG
AGGCTATAGGCTTAGCTCCAAGGGTGATGGAGAAATGTAGAAGCCGGAACTAGTAACTGC
AGCACTTTTATGATATGTGATATGATAAAATGATTTGGAAGAATGTTATTAAGAAATGTA
ATAGCCCATTTTGTTTTTCTAAGTATTCTTGTGTGTGTGTTTTGTGTGCTAAGAGTGATG
TTTGATCTTACTTAAAACAGCCTCTACTACTAATAAGGCCTATTCTGTCTCTAATCCATC
AAATGGGTTTTTGTGTATGTGTGTTTTTTTTTTGCTAGGTAAGACTTTCATAACTCATAT
GTATAAAA

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

CO CL3326Contig1 772 3 11 U
TTTTTTGGTTCACTTAGTACAGAGTTCGCGATGACAACAGTAGCCTCCGG*CTTCGTATC
ATCTTCGCCGGCGCTGTATCTGGCCAAATCTCGACGGTCCTGTCGCAACAT*CGAACTCG
GTCTGCATGTCTTCCTGTAGCTTCCTCATCGTTAACCCAAGTCGAAGTAGACACAGCAAC
AACAAGCCTCTATTCAAGTATTATCTCGTCAAAACCGATCTCGGAGGCCTTGCATAACAT
ATCTCTAGCAGATCTGGATCCAGGAACTGCAAAGCTTGCGATTGGGATCTTGGGTCCTGC
CTTATCAGCTTTTGGGTTTCTCTTTATTTTGAGGATTGTTATGTCTTGGTACCCGAAGCT
TCCCGTTGACAAGTTCCCTTACGTTTTGGCGTACGCTCCTACCGAACCAATCCTTGTTCA
GACGAGGAAAGTGATTCCGCCACTTGCAGGAGTCGATGTAACTCCAGTGGTTTGGTTCGG
GCTTGTGAGTTTCCTTAGTGAGATTTTGGTTGGTCCACAGGGACTTCTCGTTCTTGTTTC
TCAACAACAAATTAGCTAGAATCTGAGGGTCATACTCCGTAATACATTTGTTTCTGTACA
CTCTTTTGGAATCTGTTGATGGTATCTCTTTGTGTATGTGCTGCTCAGTACTCATTGAAC
TCTGGGCATCGATATTTTGAGATTTTGGTGCAAATACTCAAAAAGTCAAAATGTTGCTTT
TATAAAGCATTCTCACATCCGCAACATCTAAAATGTTTAGCTATTTGATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI24TF U 5
AF RR2H102TF U 1
AF RR2H102JQ C 31
BS 1 693 RR2H102TF
BS 694 694 RR2H102JQ
BS 695 703 RR2H102TF
BS 704 704 RR2H102JQ
BS 705 725 RR2H102TF
BS 726 726 RR2H102JQ
BS 727 743 RR2H102TF
BS 744 744 RR2H102JQ
BS 745 752 RR2H102TF
BS 753 753 RR2H102JQ
BS 754 772 RR2H102TF

RD RR2CI24TF 629 0 0
GG
GGTTCACTTAGTACAGAGTTCGCGATGACAACAGTAGCCTCCGG*CTTCGTATCATTTTC
GCCGGCGCTGTATCTGGCCAAATCTCGACGGTCCTGTCGCAACATTCGAACTCGGTCTGC
ATGTCTTCCTGTAGCTTCCTCATCGTTAACCCAAGTCGAAGTAGACACAGCAACAACAAG
CCTCTATTCAAGTATTATCTCGTCAAAACCGATCTCGGAGGCCTTGCATAACATATCTCT
AGCAGATCTGGATCCAGGAACTGCAAAGCTTGCGATTGGGATCTTGGGTCCTGCCTTATC
AGCTTTTGGGTTTCTCTTTATTTTGAGGATTGTTATGTCTTGGTACCCGAAGCTTCCCGT
TGACAAGTTCCCTTACGTTTTGGCGTACGCTCCTACCGAACCAATCCTTGTTCAGACGAG
GAAAGTGATTCCGCCACTTGCAGGAGTCGATGTAACTCCAGTGGTTTGGTTCGGGCTTGT
GAGTTTCCTTAGTGAGATTTTGGTTGGTCCACAGGGACTTCTCGTTCTTGTTTCTCAACA
ACAAATTAGCTAGAATCTGAGAGTCATACTCCGTAATACATTTGTTTCTGTACACTCTTT
TGGAATCTGTTGATGGTATCTCTTTGT

QA 3 629 3 629
DS 

RD RR2H102TF 772 0 0
TTTTTTGGTTCACTTAGTACAGAGTTCGCGATGACAACAGTAGCCTCCGG*CTTCGTATC
ATCTTCGCCGGCGCTGTATCTGGCCAAATCTCGACGGTCCTGTCGCAACAT*CGAACTCG
GTCTGCATGTCTTCCTGTAGCTTCCTCATCGTTAACCCAAGTCGAAGTAGACACAGCAAC
AACAAGCCTCTATTCAAGTATTATCTCGTCAAAACCGATCTCGGAGGCCTTGCATAACAT
ATCTCTAGCAGATCTGGATCCAGGAACTGCAAAGCTTGCGATTGGGATCTTGGGTCCTGC
CTTATCAGCTTTTGGGTTTCTCTTTATTTTGAGGATTGTTATGTCTTGGTACCCGAAGCT
TCCCGTTGACAAGTTCCCTTACGTTTTGGCGTACGCTCCTACCGAACCAATCCTTGTTCA
GACGAGGAAAGTGATTCCGCCACTTGCAGGAGTCGATGTAACTCCAGTGGTTTGGTTCGG
GCTTGTGAGTTTCCTTAGTGAGATTTTGGTTGGTCCACAGGGACTTCTCGTTCTTGTTTC
TCAACAACAAATTAGCTAGAATCTGAGGGTCATACTCCGTAATACATTTGTTTCTGTACA
CTCTTTTGGAATCTGTTGATGGTATCTCTTTGTGTATGTGCTGCTCAGTACTCATTGAAC
TCTGGGCATCGATATTTTGAGATTTTGGTGCAA*TACTCAAAA*GTCAAAATGTTGCTTT
TATAA*GCATTCTCACATCCGCA*CATCTAAA*TGTTTAGCTATTTGATATG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2H102JQ 732 0 0
ATGACAACAGTAGCCTCCGGGCTTCGTATCATCTTCGCGGGCGCTGTATCTGGCCAAATC
TCGACGGTCCTGTCGCAACAT*CGAACTCGGTCTGCATGTCTTCCTGTAGCTTCCTCATC
GTTAACCCAAGTCGAAGTAGACACAGCAACAACAAGCCTCTATTCAAGTATTATCTCGTC
AAAACCGATCTCGGAGGCCTTGCATAACATATCTCTAGCAGATCTGGATCCAGGAACTGC
AAAGCTTGCGATTGGGATCTTGGGTCCTGCCTTATCAGCTTTTGGGTTTCTCTTTATTTT
GAGGATTGTTATGTCTTGGTACCCGAAGCTTCCCGTTGACAAGTTCCCTTACGTTTTGGC
GTACGCTCCTACCGAACCAATCCTTGTTCAGACGAGGAAAGTGATTCCGCCACTTGCAGG
AGTCGATGTAACTCCAGTGGTTTGGTTCGGGCTTGTGAGTTTCCTTAGTGAGATTTTGGT
TGGTCCACAGGGACTTCTCGTTCTTGTTTCTCAACAACAAATTAGCTAGAATCTGAGGGT
CATACTCCGTAATACATTTGTTTCTGTACACTCTTTTGGAATCTGTTGATGGTATCTCTT
TGTGTATGTGCTGCTCAGTACTCATTGAACTCTGGGCATCGATATTTTGAGATTTTGGTG
CAAATACTCAAAAAGTCAAAATGTTGCTTTTATAAAGCATTCTCACATCCGCAACATCTA
AAATGTTTAGCT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 3

CO CL3327Contig1 1175 3 5 U
GGACTACTGGCGAGAATTGAAAGACGCTTCCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGATTGTCTCACTAAAACCCTAGAGAGTTTGATACACACCACATGGCTTTCTT
AAGTAAAGTTGGAAAGATATTTAGGCAGACCAGCACCCATGTCACTGCCTCCAACTCAAT
GCTACAGAGCATCCGTTGCATGTCTTCGTCCAAAATCTTTGTTGGAGGTATCTCCTACAG
CACTGATGAGTTTGGCTTAAGAGAAGCTTTTAGCAAATATGGAGAAGTTGTTGATGCGAA
GATTATTGTGGGCCGTGAAACTGGTAGATCAAGGGGCTTTGCTTTTGTCACATTTACTTC
TACAGAAGAGGCTAGTAACGCCATGCAATTGGATGGACAGGACCTTCATGGTCGAAGAAT
TAGGGTGAACTACGCAACTGAAAGAGGAAGTGGGTTTGGAGGAAGAGGATTCGGTGGTCC
TGGTGGTGGCAATGCGGGTGGTTACGGTGCTCCATCTGGTGGTTATGGAGGTGGTGGTGG
TTACGGAGGCGGTGCTGGTAGTTACGGAGCTCCAGCTGGTGGTTACGGAGGTGGCTCATC
TTATGGTGGAAATGCTGGTGGTGGTTATGGAGGTAACTCTCCTTATGGTGGCAATTCCGT
TGGGGATGGTTATGGAAGCAACGTTGGCGGTGGATATGGTGTCGCTGGTGGTGTTGGTGG
AAGTGACAACTTTGCTCAAGGCAGTTCCTCTAATGCTGGATTTGATGACAAGTTTAGCAG
CAACGAACCACTAGGCAACGATACGGATCATCAGCTTGAAAGCGCTAGCGATGAGCAGTT
TGGTGGCAGTGACAATCAGTTTGGTGGCTCAGAGAACGGTCAAACAGAGATTGCCCCAGA
CGGGTTTGATCAGCCTGACGATAGCGATGTTGCGAAAAGAGCTTAGTCTCTACAATATTG
CACTGCCTGCGTTACTCTTTGCAGTTTCAGAATAAACTTGTGGAAGTTTCTTAGTTTCTG
TTTTTCAACGTTTGGTGTTGTTTATTATCATATGCAGAGACCTCTCTATTGTTGGTCGTT
TTCTTTACGTTTTGTGACATCTGAGGCTCGCAAATAAAACTGTAATAACTTCTAACAGAC
TTTCCTTTTTGTTCTATTTAAGGGTTCTATACTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ36TF U 1
AF RR2BQ85TF U 461
AF RR2DN29TF U 665
BS 1 471 RR2DQ36TF
BS 472 472 RR2BQ85TF
BS 473 544 RR2DQ36TF
BS 545 739 RR2BQ85TF
BS 740 1175 RR2DN29TF

RD RR2DQ36TF 563 0 0
GGACTACTGGCGAGAATTGAAAGACGCTTCCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGATTGTCTCACTAAAACCCTAGAGAGTTTGATACACACCACATGGCTTTCTT
AAGTAAAGTTGGAAAGATATTTAGGCAGACCAGCACCCATGTCACTGCCTCCAACTCAAT
GCTACAGAGCATCCGTTGCATGTCTTCGTCCAAAATCTTTGTTGGAGGTATCTCCTACAG
CACTGATGAGTTTGGCTTAAGAGAAGCTTTTAGCAAATATGGAGAAGTTGTTGATGCGAA
GATTATTGTGGGCCGTGAAACTGGTAGATCAAGGGGCTTTGCTTTTGTCACATTTACTTC
TACAGAAGAGGCTAGTAACGCCATGCAATTGGATGGACAGGACCTTCATGGTCGAAGAAT
TAGGGTGAACTACGCAACTGAAAGAGGAAGTGGGTTTGGAGGAAGAGGATTTGGTGGTCC
TGGTGGTGGCAATGCGGGTGGTTACGGTGCTCCATCTGGTGGTTATGGAGGTGGTGGTGG
TTAC
AGTGCTCCAGCTGGTGGTT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2BQ85TF 279 0 0
GGAAGAGGATTCGGTGGTCCTGGTGGTGGCAATGCGGGTGGTTACGGTGCTCCATCTGGT
GGTTATGGAGGTGGTGGTGGTTACGGAGGCGGTGCTGGTAGTTACGGAGCTCCAGCTGGT
GGTTACGGAGGTGGCTCATCTTATGGTGGAAATGCTGGTGGTGGTTATGGAGGTAACTCT
CCTTATGGTGGCAATTCCGTTGGGGATGGTTATGGAAGCAACGTTGGCGGTGGATATGGT
GTCGCTGGTGGTGTTGGTGGAAGTGACAACTTTGCTCAA

QA 1 279 1 279
DS 

RD RR2DN29TF 511 0 0
GATGGTTATGGAAGCAACGTTGGCGGTGGATATGGTGTCGCTGGTGGTGTTGGTGGAAGT
GACAACTTTGCTCAAGGCAGTTCCTCTAATGCTGGATTTGATGACAAGTTTAGCAGCAAC
GAACCACTAGGCAACGATACGGATCATCAGCTTGAAAGCGCTAGCGATGAGCAGTTTGGT
GGCAGTGACAATCAGTTTGGTGGCTCAGAGAACGGTCAAACAGAGATTGCCCCAGACGGG
TTTGATCAGCCTGACGATAGCGATGTTGCGAAAAGAGCTTAGTCTCTACAATATTGCACT
GCCTGCGTTACTCTTTGCAGTTTCAGAATAAACTTGTGGAAGTTTCTTAGTTTCTGTTTT
TCAACGTTTGGTGTTGTTTATTATCATATGCAGAGACCTCTCTATTGTTGGTCGTTTTCT
TTACGTTTTGTGACATCTGAGGCTCGCAAATAAAACTGTAATAACTTCTAACAGACTTTC
CTTTTTGTTCTATTTAAGGGTTCTATACTGG

QA 1 511 1 511
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL3330Contig1 1320 2 6 U
GGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGACTGGAGGAGTGGACGAGAACGGGATAACATACTACA
ACAATCTCATTAACGAGTTAAAAGCTAATGGCATAGAACCATTTGTGACTATCTTTCATT
GGGATGTTCCCCAAACTCTAGAAGACGAGTACGGAGGCTTCTTAAGCCCACGTATAGTAG
AGGACTTCAAGAACTACGCCGATCTCCTATTCCAAAGATTCGGAGACAGAGTCAAGTTTT
GGATCACTCTAAACCAGCCTTACTCTCTCGCATCCAAAGGTTACGGAGATGGATCTTATC
CACCGGGAAGGTGCACTGGCTGTGAATTTGGAGGAGATTCTGGAACCGAGCCTTATATAG
TCGCCCATCACCAACTTCTAGCCCATGCAGAAGCTGTATCTTTATACAGAAAAAGATATC
AGAAATTTCAAGGAGGTAAGATAGGAACAACCTTGATCGGGAGATGGTTTACCCCACTAA
ACGAAACTAGCGATCTCGACCAGGCTGCTGCAAAAAGAGCGTTCCAATTCTTTGTTGGAT
GGTTCATGGAACCATTGGTGTACGGGAAATATCCAGTGATAATGAGAACTCTAGTTGGTG
ATAGATTGCCAAAATTCACACCTGAAGAATCAGATTTAGTTAAAGGATCGCTTGATTTTA
TAGGGCTGAACTATTATGTTACACAATATGCGGCCGACGCACCTCCTCCTCTTCCGACAC
AGCCTAACGCCTTAACCGATGCACGAGTTACTCTTGGATTTTATCGCAATGGAGTACCGA
TCGGTGTTGAGGCTCCAAGTTTTGTCTACTATCCTCCAGGGTTCCGTCAGATTCTAAATT
ATATCAAAGACAACTACCAAAACCCACTTACCTACATCACCGAAAACGGAGTGGCTGATT
ATGGAAACTTAACGCTACCAAATGCTCTTGCTGATAACGGACGAATTCAAAATCATTGCA
GCCATCTTTCGTGTCTCAAATGCTCCATCCAGGATGGTTGCAACGTAGCAGGTTATTTTG
CTTGGTCATTGATGGACAATTATGAATTCGGAAATGGTTACACTCTCCGGTTTGGTATGA
ATTGGGTCAATTTTACTAATCCCGCTGATCGAAGACAAAAAGATTCTGGTAAATGGTATT
CTAGGTTCGTCGCAAAATAAGGGGAAGCGATAGACATAAAATAATGATCCAAGCTTTAAT
CCATTAAGTACTGGACATTAATAAAAATTATTTTCTTCAACTTATAAAAGCTTATGTGCT
GTGTGTTATTAATAATGTTGTAATAATGGGACCTTAAATATTGGCAAGTCATAAATAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG52TF U 1
AF RR2EG52JQ C 543
BS 1 625 RR2EG52TF
BS 626 626 RR2EG52JQ
BS 627 645 RR2EG52TF
BS 646 646 RR2EG52JQ
BS 647 659 RR2EG52TF
BS 660 1320 RR2EG52JQ

RD RR2EG52TF 659 0 0
GGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGACTGGAGGAGTGGACGAGAACGGGATAACATACTACA
ACAATCTCATTAACGAGTTAAAAGCTAATGGCATAGAACCATTTGTGACTATCTTTCATT
GGGATGTTCCCCAAACTCTAGAAGACGAGTACGGAGGCTTCTTAAGCCCACGTATAGTAG
AGGACTTCAAGAACTACGCCGATCTCCTATTCCAAAGATTCGGAGACAGAGTCAAGTTTT
GGATCACTCTAAACCAGCCTTACTCTCTCGCATCCAAAGGTTACGGAGATGGATCTTATC
CACCGGGAAGGTGCACTGGCTGTGAATTTGGAGGAGATTCTGGAACCGAGCCTTATATAG
TCGCCCATCACCAACTTCTAGCCCATGCAGAAGCTGTATCTTTATACAGAAAAAGATATC
AGAAATTTCAAGGAGGTAAGATAGGAACAACCTTGATCGGGAGATGGTTTACCCCACTAA
ACGAAACTAGCGATCTCGACCAGGCTGCTGCAAAAAGAGCGTTCCAATTCTTTGTTGGAT
GGTTCATGGAACCATTGGTGTACGGGAAATATCCAGTGATAATGAGAACTCTAGTTGGTG
ATAGATTGCCAAAATTCACACCTGA*GAATCAGATTTAGTTAAAG*ATCGCTTGATTTT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2EG52JQ 778 0 0
TTCATGGAACCATTGGTGTACGGGAAATATCCAGTGATAATGAGAACTCTAGTTGGTGAT
AGATTGCCAAAATTCACACCTGAAGAATCAGATTTAGTTAAAGGATCGCTTGATTTTATA
GGGCTGAACTATTATGTTACACAATATGCGGCCGACGCACCTCCTCCTCTTCCGACACAG
CCTAACGCCTTAACCGATGCACGAGTTACTCTTGGATTTTATCGCAATGGAGTACCGATC
GGTGTTGAGGCTCCAAGTTTTGTCTACTATCCTCCAGGGTTCCGTCAGATTCTAAATTAT
ATCAAAGACAACTACCAAAACCCACTTACCTACATCACCGAAAACGGAGTGGCTGATTAT
GGAAACTTAACGCTACCAAATGCTCTTGCTGATAACGGACGAATTCAAAATCATTGCAGC
CATCTTTCGTGTCTCAAATGCTCCATCCAGGATGGTTGCAACGTAGCAGGTTATTTTGCT
TGGTCATTGATGGACAATTATGAATTCGGAAATGGTTACACTCTCCGGTTTGGTATGAAT
TGGGTCAATTTTACTAATCCCGCTGATCGAAGACAAAAAGATTCTGGTAAATGGTATTCT
AGGTTCGTCGCAAAATAAGGGGAAGCGATAGACATAAAATAATGATCCAAGCTTTAATCC
ATTAAGTACTGGACATTAATAAAAATTATTTTCTTCAACTTATAAAAGCTTATGTGCTGT
GTGTTATTAATAATGTTGTAATAATGGGACCTTAAATATTGGCAAGTCATAAATAAAT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL3331Contig1 696 2 2 U
GGACCTCCATCGTTCTCTTGCCTCTGCTACTGAGAAATTCTCAGGCTTCTTCCATTCACT
CGCCTATAGGAACCCTCTGTTCCAGGAAGCGGTTCGCTTGTCCTCCGAGTTTCGCGGTCT
TTGCGATGAGGTTCGTTTGAGAAACACTACTACAAGGGTGAGTTTTGCGATGGCTAATCA
CGGTTTTGCAGCGGTTCTGCCTGGAGATTCTGTTGCTGGATTGGTGGTTGCTAACGGGTT
GATAAACTTCCTCAACATTTATAGCAACGTTCTTGTTCTCCGTCTAGTACTCACCTGGTT
CCCTACTGCTCCTCCTGTCATTGTTAGCCCCCTCAGCACTTTATGCGATCCATACTTGAA
CTTATTCAGAGGAGTCATACCGCCTCTCGGAGGATTGGATCTGTCTCCCATTTTGGCCTT
CCTTGTGCTCAATGCCTTCACCAGCAGTGCTATGGCGCTTCCTTGTGAGCTCCCTCCAGC
TGAAGGAGCGGCTTCTCCATCATCTCTCGAGACAAAGTGGACGAGAAGGAGAAGGTTGAC
CAGCAACAAGAGGACCATAGACCGATGACCTGAAGCTTTCTAAAAACTCTCCTCTTTTCT
ACCCTTTTAGTCTTGGATAAAAAAGACTTGGTTTCTTATATTCACAACTCTGTAAGACTT
TGCACAATTTCAAGGCAATATTAATCTTTGTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D164TF U 1
AF RR2D164JQ C 512
BS 1 614 RR2D164TF
BS 615 696 RR2D164JQ

RD RR2D164TF 617 0 0
GGACCTCCATCGTTCTCTTGCCTCTGCTACTGAGAAATTCTCAGGCTTCTTCCATTCACT
CGCCTATAGGAACCCTCTGTTCCAGGAAGCGGTTCGCTTGTCCTCCGAGTTTCGCGGTCT
TTGCGATGAGGTTCGTTTGAGAAACACTACTACAAGGGTGAGTTTTGCGATGGCTAATCA
CGGTTTTGCAGCGGTTCTGCCTGGAGATTCTGTTGCTGGATTGGTGGTTGCTAACGGGTT
GATAAACTTCCTCAACATTTATAGCAACGTTCTTGTTCTCCGTCTAGTACTCACCTGGTT
CCCTACTGCTCCTCCTGTCATTGTTAGCCCCCTCAGCACTTTATGCGATCCATACTTGAA
CTTATTCAGAGGAGTCATACCGCCTCTCGGAGGATTGGATCTGTCTCCCATTTTGGCCTT
CCTTGTGCTCAATGCCTTCACCAGCAGTGCTATGGCGCTTCCTTGTGAGCTCCCTCCAGC
TGAAGGAGCGGCTTCTCCATCATCTCTCGAGACAAAGTGGACGAGAAGGAGAAGGTTGAC
CAGCAACAAGAGGACCATAGACCGATGACCTGAAGCTTTCTAAAAACTCTCCTCTTTTCT
ACCCTTTTAGTCTT
GGA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2D164JQ 185 0 0
ACAAAGTGGACGAGAAGGAGAAGGTTGACCAGCAACAAGAGGACCATAGACCGATGCCCT
GAAGCTTTCTAAAAACTCTCCTCTTTTCTACCCTTTTAGTCTTGGATAAAAAAGACTTGG
TTTCTTATATTCACAACTCTGTAAGACTTTGCACAATTTCAAGGCAATATTAATCTTTGT
TCTCC

QA 1 185 1 185
DS 



AS 1 3

CO CL3332Contig1 870 3 4 U
GGGCCCATCTCTCTTCTTGTTCAAGAGCCTAAAGAAGAAATAAAACTTCTTGAAAAAATT
CGGATCTCTCTTATTAATCACTCTCGTTATTCTCCTTTCATCTGAGAGCAACGTGAACAT
GGCGTCTGTTTCTGCTTTGGCAAAGTTTAAGTTGGTCTTCTTAGGAGATCAATCTGTGGG
CAAAACAAGCATCATCACCCGTTTCATGTATGATAAATTCGACACCTCTTACCAGCCTAC
CATTGGGATCGATTTTCTGTCCAAAACAATGTACCTCGAAGACCGAACTGTTCGTTTGCA
GCTTTGGGATACGGCTGGACAAGAAAGATTCAGGAGTCTGATTCCAAGTTACATCAGAGA
CTCTTCTGTTGCAATCGTTGTCTATGATGTAGCCAATAGGCAAACGTTTCTGAATATTCC
GAAATGGATCGATGATGTACACAGAGAAAGAGGTGGTTCAGGCGACGTTATTATTGTCCT
TGTTGGTAACAAAACTGATCTTGTTGATAAAAGACAAGTATCGATCAGTGAAGGGGAAGA
AAAGGGTAAAGAGCATGGCGTGATGTTCATTGAGACCAGCGCCAAAGAAAATTTCAACAT
TAAGGCTTTGTTCAGGAAGATAGCTGCAGCATTGCTTGGGATGGATTCATATTCGTCGGC
GACAAAATCAGATGATATGGTTGATGTGAACCTAAAGAACACTTCAAGTTCATCACAAGG
TGAGCAACAAGGAGGAGGTGGTGGAGGCGGCTGTTCTTGTTGATTCAATAAATTTATTTA
TAAAACATATTCCGTTTAAGACACTTGTGAAGCCAAGAAAACAAAAAAAAAGGACCAAGA
AAGTTTTTTTTTGTGATTTTTCATTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL35TF U 108
AF RR2GO71TF U 1
AF RR2DL35JQ C 658
BS 1 282 RR2GO71TF
BS 283 283 RR2DL35TF
BS 284 714 RR2GO71TF
BS 715 870 RR2DL35JQ

RD RR2DL35TF 218 0 0
GG
AACGTGAACATGGCGTCTGTTTCTGCTTTGGCAAAGTTTAAGTTGGTCTTCTTATGAGAT
CAATCTGTGGGCAAAACAAGCATCATCACCCGTTTCATGTATGATAAATTCGACACCTCT
TACCAGCCTACCATTGGGATCGATTTTCTGTCCAAAACAATGTACCTCGAAGACCGAACT
GTTCGTTTGCAGCTTTGGGATACGGCTGGACAAGAA

QA 3 218 3 218
DS 

RD RR2GO71TF 714 0 0
GGGCCCATCTCTCTTCTTGTTCAAGAGCCTAAAGAAGAAATAAAACTTCTTGAAAAAATT
CGGATCTCTCTTATTAATCACTCTCGTTATTCTCCTTTCATCTGAGAGCAACGTGAACAT
GGCGTCTGTTTCTGCTTTGGCAAAGTTTAAGTTGGTCTTCTTAGGAGATCAATCTGTGGG
CAAAACAAGCATCATCACCCGTTTCATGTATGATAAATTCGACACCTCTTACCAGCCTAC
CATTGGGATCGATTTTCTGTCCAAAACAATGTACCTCGAAGATCGAACTGTTCGTTTGCA
GCTTTGGGATACGGCTGGACAAGAAAGATTCAGGAGTCTGATTCCAAGTTACATCAGAGA
CTCTTCTGTTGCAATCGTTGTCTATGATGTAGCCAATAGGCAAACGTTTCTGAATATTCC
GAAATGGATCGATGATGTACACAGAGAAAGAGGTGGTTCAGGCGACGTTATTATTGTCCT
TGTTGGTAACAAAACTGATCTTGTTGATAAAAGACAAGTATCGATCAGTGAAGGGGAAGA
AAAGGGTAAAGAGCATGGCGTGATGTTCATTGAGACCAGCGCCAAAGAAAATTTCAACAT
TAAGGCTTTGTTCAGGAAGATAGCTGCAGCATTGCTTGGGATGGATTCATATTCGTCGGC
GACAAAATCAGATGATATGGTTGATGTGAACCTAAAGAACACTTCAAGTTCATC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2DL35JQ 213 0 0
GGCGACAAAATCAGATGATTTGGTTGATGTGAACCTAAAGAACACTTCAAGTTCATCACA
AGGTGAGCAACAAGGAGGAGGTGGTGGAGGCGGCTGTTCTTGTTGATTCAATAAATTTAT
TTATAAAACATATTCCGTTTAAGACACTTGTGAAGCCAAGAAAACAAAAAAAAAGGACCA
AGAAAGTTTTTTTTTGTGATTTTTCATTTTTTT

QA 1 213 1 213
DS 



AS 1 2

CO CL3333Contig1 1143 2 4 U
GCATGCGCCGAGTACAAGAAACTGCATCCTAATCCTCCAGCAGATGATGTGAAGCTAAAA
TCTCTGGCAAATAATAAAATGTGGCGCCAATGTGGCAAGTGCCAACACATGATCGAACTT
AGTCAAGGATGCAATCACATCACTTGCAGATGTGGGCATGAGTATTGCTACAACTGTGGA
GGAGGATGGAACAAAAAAACAGGGACTTGTGTTAAGCGATGCCCGATCTGGGACGAAGCA
TACATCATGCGTCAAAATCCAGCACGTGTGTATGTGGCGCCTAACAACTACTTTGATGAA
GCATACATCAGGCGTCAAGATCCAGCGCGTGTGTATGTGGCGCCTAACAACTACTTTGAT
GATCATGATGAGGAGGATGAGGAGGATGGTGAAGATTATGAAACTGATGAAGATTTTGAT
TACGACTATGGTGACTTCCCCTTTAATTTGGGGAATCATATGAATGATGTTAATCCTGAT
GAGCCCTTTGATCCCTTCTTTGATCTGCCAGATGGTGTGGTTTTTTTACCACATATGCTG
TCTCCCAGGAGCCGTCAGCAATTGTACGACTCAGATGATGATTCTGATGAAGAAACAGGT
CAGCCACCTCATTTGAGACAGAGTAACGCCCCTTCTGGTAATGAGACAACAAGAGTTAGT
GCTCCTCCCGTAGGTGAGATCTTTCTCCCACATATGTTGTCTCCCAGGAGCAGTCAGCAA
TTGTATGACTCCGATGATGATTCTGATGAGGAAACGGGTCAACCAGCTCATCTGAGACAG
AGTAACGCCCCGTCTGGTCATGAGGCGACGAGAGTTAATGCTCATTTCACACAGAGTAGT
GACCGGTCTGGTAATGAGACGACAACAAGAGTTTATGCTCCTCCTGAGGAAGAAGAAGAA
GTGGACGACTGCCCATACTTTGAAACTTATGAAGAGGACGGTACAGTATATGACTCGGAC
GGCTATGAAATCGAGGATTACACGAACCCTTACGATTCAGATGACTATTGAGGTGTAATT
TGGAACCAAAGTTGGTCTCTTTCGCTTTATGATCTTTCGGCTGTAAACTCTTTGGTGGAT
CATATGTTTCTATGACTTCTTGTTGCGTTTGAGTTTCGGAGATTCAGGAGTGGGAATTTT
CGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2G806TF U 1
AF RR2AR91JQ C 386
BS 1 417 RR2G806TF
BS 418 419 RR2AR91JQ
BS 420 595 RR2G806TF
BS 596 1143 RR2AR91JQ

RD RR2G806TF 595 0 0
GCATGCGCCGAGTACAAGAAACTGCATCCTAATCCTCCAGCAGATGATGTGAAGCTAAAA
TCTCTGGCAAATAATAAAATGTGGCGCCAATGTGGCAAGTGCCAACACATGATCGAACTT
AGTCAAGGATGCAATCACATCACTTGCAGATGTGGGCATGAGTATTGCTACAACTGTGGA
GGAGGATGGAACAAAAAAACAGGGACTTGTGTTAAGCGATGCCCGATCTGGGACGAAGCA
TACATCATGCGTCAAAATCCAGCACGTGTGTATGTGGCGCCTAACAACTACTTTGATGAA
GCATACATCAGGCGTCAAGATCCAGCGCGTGTGTATGTGGCGCCTAACAACTACTTTGAT
GATCATGATGAGGAGGATGAGGAGGATGGTGAAGATTATGAAACTGATGAAGATTTTTTT
TACGACTATGGTGACTTCCCCTTTAATTTGGGGAATCATATGAATGATGTTAATCCTGAT
GAGCCCTTTGATCCCTTCTTTGATCTGCCAGATGGTGTGGTTTTTTTACCACATATGCTG
TCTCCCAGGAGCCGTCAGCAATTGTACGACTCAGATGATGATTCTGATGAAGAAA

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2AR91JQ 758 0 0
ATGGTGAAGATTATGAAACTGATGAAGATTTTGATTACGACTATGGTGACTTCCCCTTTA
ATTTGGGGAATCATATGAATGATGTTAATCCTGATGAGCCCTTTGATCCCTTCTTTGATC
TGCCAGATGGTGTGGTTTTTTTACCACATATGCTGTCTCCCAGGAGCCGTCAGCAATTGT
ACGACTCAGATGATGATTCTGATGAAGAAACAGGTCAGCCACCTCATTTGAGACAGAGTA
ACGCCCCTTCTGGTAATGAGACAACAAGAGTTAGTGCTCCTCCCGTAGGTGAGATCTTTC
TCCCACATATGTTGTCTCCCAGGAGCAGTCAGCAATTGTATGACTCCGATGATGATTCTG
ATGAGGAAACGGGTCAACCAGCTCATCTGAGACAGAGTAACGCCCCGTCTGGTCATGAGG
CGACGAGAGTTAATGCTCATTTCACACAGAGTAGTGACCGGTCTGGTAATGAGACGACAA
CAAGAGTTTATGCTCCTCCTGAGGAAGAAGAAGAAGTGGACGACTGCCCATACTTTGAAA
CTTATGAAGAGGACGGTACAGTATATGACTCGGACGGCTATGAAATCGAGGATTACACGA
ACCCTTACGATTCAGATGACTATTGAGGTGTAATTTGGAACCAAAGTTGGTCTCTTTCGC
TTTATGATCTTTCGGCTGTAAACTCTTTGGTGGATCATATGTTTCTATGACTTCTTGTTG
CGTTTGAGTTTCGGAGATTCAGGAGTGGGAATTTTCGG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL3334Contig1 1241 2 2 U
GGGCACGTCTCCTCCAGAGAGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGAATCTCATCATCAATCTCC
GGATCCAATCCAATCCAATCCAATACGTATCTTCTATATCTTCCTTCCCTCTTTAACCCA
AAGCAGAGTCCTCTTCAGTTTGGAGAATCTGTGGTAGAAGATGGCTGACAAAGAGGTGGA
GCATCCTCCTCGTGGGAATGAATGGGAAGTTGTCTCCCTTACTTCATCAGCTTATGCTGC
TTCTCCTGGTCCTTATAACGTTGAGTCAAGAAGAGATGAGAGGAAGTCTGATCATGCTTA
CTATGGAGCTGATACTTCGCGTGATTTGTTCATGTCTGACCACTTTGTGTTCCCACCTAG
CCAGCATGAAGATTTACCCCTTGATGATCAACCTGTTTTCCAAGAGGAAGGAAGTAAGGA
TAGCGAAGACTTGATGCCGGAAGGTCAGGGATTGTCTGATGAACAGAGTCTCTATGGTGA
GCCTGCGCTTGGCTCTTCGAGACAGTACATGGAATCAGCTATGTATGATGATCATTCTGA
GCCAGCTGAGTATGCCGAGGAGGACGACTTGGATCTTCGTTCTGATACTGCAAAGGATAC
ACTTGGACATGAGAAGGATGCTAAAGAGGCAAGGCACGACCTTCCTTGCGAAGCTTGGTG
GAGAAAGAGAGCTGTTTCCATGTATATACGCACGAGAGAAGCAAATGCGATGTGGTCTTT
GTTCTTTGCAGCTGCTGTCACAGGGCTAGTAGTTCTCGGTCAACGCTGGCAGCAAGAGAG
GTGGCAGGTTTTGCAGCTCAAGTGGCATTCAAGCATCAGTAGCGAGAAGCTGAGCAGGGT
ACTTGAACCTCTCTCGCGCTTGAAAGGCGTGATTGTGAGAGGTAACCCACAAGCTTCTCT
CGTTAGGAGTGGCACCTCCAGTGAGATCTAGAGACAAACAAAAAGACGCCATTGTCTCAT
TCGTTGCTCAAACAGCACACGTACATACAAACTTGGTCTTGAGTTACATATGTGTGCCTT
AACGTCAAAAGCTTTTGGTTTTCTTCAGCCTATGTTGCTTCATTATCTTGTACCATTAGA
AAGAAGATTCAGTTACCTTCTCGCAAAACTCTCTTTCAGTTCCAAAAGCTTCTCTCTTCT
TTTCTTTTTATTTAGCTTTTTCTCTCTGTCTTATTGTTTATATATAAACCCAGACACATA
CACTTGTTTTTTTCTTATGATTTTTTTCTCATTTTACTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA83TF U 1
AF RR2BA83JQ C 576
BS 1 777 RR2BA83TF
BS 778 1241 RR2BA83JQ

RD RR2BA83TF 777 0 0
GGGCACGTCTCCTCCAGAGAGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGAATCTCATCATCAATCTCC
GGATCCAATCCAATCCAATCCAATACGTATCTTCTATATCTTCCTTCCCTCTTTAACCCA
AAGCAGAGTCCTCTTCAGTTTGGAGAATCTGTGGTAGAAGATGGCTGACAAAGAGGTGGA
GCATCCTCCTCGTGGGAATGAATGGGAAGTTGTCTCCCTTACTTCATCAGCTTATGCTGC
TTCTCCTGGTCCTTATAACGTTGAGTCAAGAAGAGATGAGAGGAAGTCTGATCATGCTTA
CTATGGAGCTGATACTTCGCGTGATTTGTTCATGTCTGACCACTTTGTGTTCCCACCTAG
CCAGCATGAAGATTTACCCCTTGATGATCAACCTGTTTTCCAAGAGGAAGGAAGTAAGGA
TAGCGAAGACTTGATGCCGGAAGGTCAGGGATTGTCTGATGAACAGAGTCTCTATGGTGA
GCCTGCGCTTGGCTCTTCGAGACAGTACATGGAATCAGCTATGTATGATGATCATTCTGA
GCCAGCTGAGTATGCCGAGGAGGACGACTTGGATCTTCGTTCTGATACTGCAAAGGATAC
ACTTGGACATGAGAAGGATGCTAAAGAGGCAAGGCACGACCTTCCTTGCGAAGCTTGGTG
GAGAAAGAGAGCTGTTTCCATGTATATACGCACGAGAGAAGCAAATGCGATGTGGTCTTT
GTTCTTTGCAGCTGCTGTCACAGGGCTAGTAGTTCTCGGTCAACGCTGGCAGCAAGA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2BA83JQ 666 0 0
TTCGTTCTGATACTGCAAAGGATACACTTGGACATGAGAAGGATGCTAAAGAGGCAAGGC
ACGACCTTCCTTGCGAAGCTTGGTGGAGAAGGAGAGCTGTTTCCATGTATATACGCACGA
GAGAAGCAAATGCGATGTGGTCTTTGTTCTTTGCAGCTGCTGTCACAGGGCTAGTAGTTC
TCGGTCAACGCTGGCAGCAAGAGAGGTGGCAGGTTTTGCAGCTCAAGTGGCATTCAAGCA
TCAGTAGCGAGAAGCTGAGCAGGGTACTTGAACCTCTCTCGCGCTTGAAAGGCGTGATTG
TGAGAGGTAACCCACAAGCTTCTCTCGTTAGGAGTGGCACCTCCAGTGAGATCTAGAGAC
AAACAAAAAGACGCCATTGTCTCATTCGTTGCTCAAACAGCACACGTACATACAAACTTG
GTCTTGAGTTACATATGTGTGCCTTAACGTCAAAAGCTTTTGGTTTTCTTCAGCCTATGT
TGCTTCATTATCTTGTACCATTAGAAAGAAGATTCAGTTACCTTCTCGCAAAACTCTCTT
TCAGTTCCAAAAGCTTCTCTCTTCTTTTCTTTTTATTTAGCTTTTTCTCTCTGTCTTATT
GTTTATATATAAACCCAGACACATACACTTGTTTTTTTCTTATGATTTTTTTCTCATTTT
ACTTTC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3336Contig1 1262 2 4 U
GGGGTTTCTCGAAAGCATGATGCTTTCGATGCCACGTGTATAGTCTCTTGCCTGAGGAAC
AGCAATCAGGTGTCTCGTATTGGACTTTGGGGACGATCTATGGGAGCAGTTACCAGCCTT
CTTTATGGAGCAGAGGATCCTTCAATTGCTGGAATGGTCTTAGACAGTGCATTCTCAAAC
TTATTTGATCTGATGATGGAACTAGTGGATGTCTACAAGATCCGACTTCCAAAATTCACA
GTTAAAGTGGCTGTGCAGTACATGCGGCAGGTGATTCAGAAAAAGGCAAAGTTTAATATC
ATGGATCTCAATTGTCTCAAGGTTTCACCGAAGACATTTATTCCAGCTTTATTTGGGCAT
GCAAGTGGAGACAAATTCATCCAACCTCATCACTCTGACCACATTCTCAAGTGCTATGCG
GGAGACAAAAACATCATCAAGTTTGATGGTGATCACAACTCTTCACGGCCGCAGTTTTAC
TATGACTCAGTGTTAATATTCTTCTACAATGTTCTACGCCCGCCTCAAACTTCTTCAGCT
TGCTCTTCTAAACTTGAAAGTTATAGCGCTGCTGGTTTGGACGAGAATTTTCTGTATGAG
ATCATATCTGGTCTTCGTTCGGCATGTCTCGATGTTGCGAGTTCTTCTTCGTCTTCTGTA
CCTCCTGCCTCTTTAACCACAAAGCCAACAAATGAGCTCCTTTCAGAAGCCATGCCCATT
ATGGATACTGATGACGTGCTTGTAGAAGAAGGCAATGATCACAACATTGATGAACCTGAG
GGGATGCCAATTGATCAGTTTGAAGAAGGATGTTCATTCACAAGCTCTAACAGGGAAAGC
TGGGGTAGATGCTCTTCACTAGGAGGTTCTGAAGAAGATGAGAGCTTGACCGTCGACCAT
GGTGATCAGGTTGAGAAATTTGATGTTGGAAACACACACGAGTTGCCAATAGAATCCACT
AGACAAGAACAAGAAGAAGAAAACAAAGAGGAGAGGAAGGAGAAGAAAATGAAGAAAGGA
GTTGAAACAGATGCAAAGAAGCCTAAACGAGAAAGATTGGAGGCCTTCAGCAAAAGACTC
CGGCTTTGCATCATAAAGCGAGTAAACCATGGAAGACATCGTTCTTTGCAACCTTAACAA
ACATAAGTTCAAGAAAATACTCTAATATATTTGTTGTACATCTTCTCTGCATCTTGTCCT
GTACAACATGGAGCCCAATCACATCTGTACTACTGTATCGATTGCAAATGAACTACATTC
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2GI85TF U 1
AF RR2D968JQ C 552
BS 1 751 RR2GI85TF
BS 752 752 RR2D968JQ
BS 753 769 RR2GI85TF
BS 770 1262 RR2D968JQ

RD RR2GI85TF 769 0 0
GGGGTTTCTCGAAAGCATGATGCTTTCGATGCCACGTGTATAGTCTCTTGCCTGAGGAAC
AGCAATCAGGTGTCTCGTATTGGACTTTGGGGACGATCTATGGGAGCAGTTACCAGCCTT
CTTTATGGAGCAGAGGATCCTTCAATTGCTGGAATGGTCTTAGACAGTGCATTCTCAAAC
TTATTTGATCTGATGATGGAACTAGTGGATGTCTACAAGATCCGACTTCCAAAATTCACA
GTTAAAGTGGCTGTGCAGTACATGCGGCAGGTGATTCAGAAAAAGGCAAAGTTTAATATC
ATGGATCTCAATTGTCTCAAGGTTTCACCGAAGACATTTATTCCAGCTTTATTTGGGCAT
GCAAGTGGAGACAAATTCATCCAACCTCATCACTCTGACCACATTCTCAAGTGCTATGCG
GGAGACAAAAACATCATCAAGTTTGATGGTGATCACAACTCTTCACGGCCGCAGTTTTAC
TATGACTCAGTGTTAATATTCTTCTACAATGTTCTACGCCCGCCTCAAACTTCTTCAGCT
TGCTCTTCTAAACTTGAAAGTTATAGCGCTGCTGGTTTGGACGAGAATTTTCTGTATGAG
ATCATATCTGGTCTTCGTTCGGCATGTCTCGATGTTGCGAGTTCTTCTTCGTCTTCTGTA
CCTCCTGCCTCTTTAACCACAAAGCCAACAAATGAGCTCCTTTCAGAAGCCATGCCCATT
ATGGATACTGATGACGTGCTTGTAGAAGAAG*CAATGATCACAACATTG

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2D968JQ 711 0 0
ACTTGAAAGTTATAGCGCTGCTGGTTTGGACGAGAATTTTCTGTATGAGATCATATCTGG
TCTTCGTTCGGCATGTCTCGATGTTGCGAGTTCTTCTTCGTCTTCTGTACCTCCTGCCTC
TTTAACCACAAAGCCAACAAATGAGCTCCTTTCAGAAGCCATGCCCATTATGGATACTGA
TGGCGTGCTTGTAGAAGAAGGCAATGATCACAACATTGATGAACCTGAGGGGATGCCAAT
TGATCAGTTTGAAGAAGGATGTTCATTCACAAGCTCTAACAGGGAAAGCTGGGGTAGATG
CTCTTCACTAGGAGGTTCTGAAGAAGATGAGAGCTTGACCGTCGACCATGGTGATCAGGT
TGAGAAATTTGATGTTGGAAACACACACGAGTTGCCAATAGAATCCACTAGACAAGAACA
AGAAGAAGAAAACAAAGAGGAGAGGAAGGAGAAGAAAATGAAGAAAGGAGTTGAAACAGA
TGCAAAGAAGCCTAAACGAGAAAGATTGGAGGCCTTCAGCAAAAGACTCCGGCTTTGCAT
CATAAAGCGAGTAAACCATGGAAGACATCGTTCTTTGCAACCTTAACAAACATAAGTTCA
AGAAAATACTCTAATATATTTGTTGTACATCTTCTCTGCATCTTGTCCTGTACAACATGG
AGCCCAATCACATCTGTACTACTGTATCGATTGCAAATGAACTACATTCCT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL3337Contig1 754 2 3 U
ACTCGATGTAAGCTGAGATGAGTTCCAAAGCCACCAAAATCTTCGATAAAAGATCTCAAA
ACAAGAACTAGATTTCCATAATTTATCCAAAAGGATCTGTATCAACAACAACAACCATGC
TTGCCATCACTTTTTAGACTATTCGAAACGTCTAAAGATACATACATTAAACTGAGCGTT
TTCTCAATCTTCAGCTGGCACTCTTCAGACGTGCAATGAGCTCATCCTTTCTTCCTTTTG
TTGGAAGACCTTTCTCCTTGACAAGGGCACGGAGCTTCTCCACAGTTAAAGACTGAAAGT
CTTTTTCTCCTGAACGACTGCTTGATCCTTCTTGTCTAGATACAAGAGTAGCAGGTCTTT
TAGCTGAGCTTCTGTCGTCCAGAGCCTTATTTGCAGTCCTCTTTTTAGGACCATCTTCAG
GAGTTCCTTTGGAACTAGATTCTCCTTTTTGCTTCTTTAGCAAGAGGGATCTGATTAGTA
TGTTTTGCTGGTTTGTCTTGATAACCTGTCCTTCAGGGGGAGATGTGTCATGCTCACATA
CGTACACCCGCAAGCTTCCCGGATTGGAGGGGAGGACGGTAGAAGATAAGAAACCGCGGG
ACGGAAGGTCGGAAAGGAACTTGGAAGCAGTTTCATCAGCAGAAGATTCCGATGACCGAG
ACGATGACGCCTCCATTGTTGCCTAACCCACTACTGATAAACCCCAATCCAAAAGGCACA
CAGAGCGAGAGTAGAGAAGAGAGATCGACAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX82JQ U 213
AF RR2D376TF C 1
BS 1 212 RR2D376TF
BS 213 359 RR2AX82JQ
BS 360 754 RR2D376TF

RD RR2AX82JQ 147 0 0
GCAATGAGCTCATCCTTTCTTCCTTTTGTTGGAAGACCTTTCTCCTTGACAAGGGCACGG
AGCTTCTCCACAGTTAAAGACTGAAAGTCTTTTTCTCCTGAACGACTGCTTGATCCTTCT
TGTCTAGATACAAGAGTAGCAGGTCTT

QA 1 147 1 147
DS 

RD RR2D376TF 754 0 0
ACTCGATGTAAGCTGAGATGAGTTCCAAAGCCACCAAAATCTTCGATAAAAGATCTCAAA
ACAAGAACTAGATTTCCATAATTTATCCAAAAGGATCTGTATCAACAACAACAACCATGC
TTGCCATCACTTTTTAGACTATTCGAAACGTCTAAAGATACATACATTAAACTGAGCGTT
TTCTCAATCTTCAGCTGGCACTCTTCAGACGTGCAATGAGCTCATCCTTTCTTCCTTTTG
TTGGAAGACCTTTCTCCTTGAGAAGGGCACGGAGCTTCTCCACAGTTAAAGACTGAAAGT
CTTTTTCTCCTGAACGACTGCTTGATCCTTCTTGTCTAGATACAAGAGTAGCAGGTCTTT
TAGCTGAGCTTCTGTCGTCCAGAGCCTTATTTGCAGTCCTCTTTTTAGGACCATCTTCAG
GAGTTCCTTTGGAACTAGATTCTCCTTTTTGCTTCTTTAGCAAGAGGGATCTGATTAGTA
TGTTTTGCTGGTTTGTCTTGATAACCTGTCCTTCAGGGGGAGATGTGTCATGCTCACATA
CGTACACCCGCAAGCTTCCCGGATTGGAGGGGAGGACGGTAGAAGATAAGAAACCGCGGG
ACGGAAGGTCGGAAAGGAACTTGGAAGCAGTTTCATCAGCAGAAGATTCCGATGACCGAG
ACGATGACGCCTCCATTGTTGCCTAACCCACTACTGATAAACCCCAATCCAAAAGGCACA
CAGAGCGAGAGTAGAGAAGAGAGATCGACAATCC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3339Contig1 1063 3 5 U
CTGTTCTTACTTTTATTATTAGTTTTCTGTCTGTTCTTCATTTTAAACTCATAAAAAAAC
TCATAAAAATCCCTCTTTGTTTCAGGTACAAATCAAGCACCAATACTCTCTCCATCCAGT
CGCCAATCTCTCTCTCTAAAACAACCATCCAGCCAGTTTGGGTTCTTGCCCACAACAATA
AGCATCAGCTCTGGTAGTGTTATCGACTCAATCTTCTTGACACCTCCATCTTGCGTATAA
GTAGAGGAATCACTGGCGCAGTCTGCATCAGCACTTTCAGGTAACCGACGCCTCTGCTAC
TCTCCTTGTCGAAGGAGAAAGTTCAAGAAGCTGAATTTAGGAAGAATCGGCCTCCAACCA
TTTTCGTATTAATGTTTGTCACAACTATGACCTCTGGCTTAAAACCAGTCGAGCCTAATT
TAGTACGTAGTTGCACGGCAAGGCCATTGAAAACACTAACTCACCGTTTTGCAACTGTGA
ATGCGGATGACTGCCATAACACGTTGAGTGGTCTGGGTTTCTTTATTGTAAGTTGTATTC
ATTCCCATGACTTCACCTACGATATCTCTGGAACTAAACGTTAGGAGTTATGTCAATTTA
TGTAAATCTATAAATTAGCAACAACGGTCTAGATCACAATATAAACCCTGGTGCTTCTAT
CCCGACAAACAATGGCTGAAAGAGGACTTCCGAGCAGAACCTTTCTGCACCAATCGGGAT
CACCTGACCATCAGGGAGCTCCTTAGTCTTCTCGATTGCAGAGCTTGATTTCGCTGTCTC
AAATTCCACCGCCACATAGGCAACTTCTCCTTGATGTCCCGTATATATATGAATCTAGAT
CAAGCCCAGAATTACGATTCCCTTCTTTCCAGATATGAACGAAACCTTCAAAATATTCAC
GTCAACCGAAATTATATCAACCCACATGAGTTCACCACGGCGCTTGACATTTCTCGCCTC
CCAGAAACGCAGCACCCTAGCCTCGACGGCGGATGTGCAACCACCGGTCTTCAAGTAGGC
GAAGAAAACTCTTGAATTAGCCATAAGATCGCGATTCAGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT51JQ U 1
AF RR2EM05JQ U 243
AF RR2CT51TF C 419
BS 1 422 RR2CT51JQ
BS 423 423 RR2EM05JQ
BS 424 428 RR2CT51JQ
BS 429 600 RR2EM05JQ
BS 601 1063 RR2CT51TF

RD RR2CT51JQ 428 0 0
CTGTTCTTACTTTTATTATTAGTTTTCTGTCTGTTCTTCATTTTAAACTCATAAAAAAAC
TCATAAAAATCCCTCTTTGTTTCAGGTACAAATCAAGCACCAATACTCTCTCCATCCAGT
CGCCAATCTCTCTCTCTAAAACAACCATCCAGCCAGTTTGGGTTCTTGCCCACAACAATA
AGCATCAGCTCTGGTAGTGTTATCGACTCAATCTTCTTGACACCTCCATCTTGCGTATAA
GTAGAGGAATCACTGGCGCAGTCTGCATCAGCACTTTCAGGTAACCGACGCCTCTGCTAC
TCTCCTTGTCGAAGGAGAAAGTTCAAGAAGCTGAATTTAGGAAGAATCGGCCTCCAACCA
TTTTCGTATTAATGTTTGTCACAACTATGACCTCTGGCTTAAAACCAGTCGAGCCTAATT
TAATACGT

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR2EM05JQ 358 0 0
AGAGGACTCACTGGCGCAGTCTGCATCAGCACTTTCAGGTAACCGACGCCTCTGCTACTC
TCCTTGTCGAAGGAGAAAGTTCAAGAAGCTGAATTTAGGAAGAGTCGGCCTCCCACCATT
TTCGTATTAATGTTTGTCACAACTATGACCTCTGGCTTAAAACCAGTCGAGCCTAATTTA
GTACGTAGTTGCACGGCAAGGCCATTGAAAACACTAACTCACCGTTTTGCAACTGTGAAT
GCGGATGACTGCCATAACACGTTGAGTGGTCTGGGTTTCTTTATTGTAAGTTGTATTCAT
TCCCATGACTTCACCTACGATATCTCTGGAACTAAACGTTAGGAGTTATGTCAATTTA

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR2CT51TF 645 0 0
TTTAGTACGTAGTTGCACGGCAAGGCCATTGAAAACACTAACTCACCGTTTTGCAACTGT
GAATGCGGATGACTGCCATAACACGTTGAGTGGTCTGGGTTTCTTTATTGTAAGTTGTAT
TCATTCCCATGACTTCACCTACGATATCTCTGGAACTAAACGTTAGGAGTTATGTCAATT
TATGTAAATCTATAAATTAGCAACAACGGTCTAGATCACAATATAAACCCTGGTGCTTCT
ATCCCGACAAACAATGGCTGAAAGAGGACTTCCGAGCAGAACCTTTCTGCACCAATCGGG
ATCACCTGACCATCAGGGAGCTCCTTAGTCTTCTCGATTGCAGAGCTTGATTTCGCTGTC
TCAAATTCCACCGCCACATAGGCAACTTCTCCTTGATGTCCCGTATATATATGAATCTAG
ATCAAGCCCAGAATTACGATTCCCTTCTTTCCAGATATGAACGAAACCTTCAAAATATTC
ACGTCAACCGAAATTATATCAACCCACATGAGTTCACCACGGCGCTTGACATTTCTCGCC
TCCCAGAAACGCAGCACCCTAGCCTCGACGGCGGATGTGCAACCACCGGTCTTCAAGTAG
GCGAAGAAAACTCTTGAATTAGCCATAAGATCGCGATTCAGTATC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL3340Contig1 905 2 8 U
GGAGAGCGAGAGAGATGGCGACAGATGCAGGATCAGAGTCGATGGCGACAGTGGCTTCAA
AGGCTCCGGTGACGGCCGAGAGGAGGGTCCGGACTGATCTCGATGATCGTCTCCCAAAAC
CATATGTGCCTCGAGCCATGGTTGCACCTGACATGGAAAATGTTAACGGGACAAGGGGAC
ACAAGCACCAGGACATGTCTGTTCTTCAGCAGCACGTTGCCTTCTTTGACCAAGATGGTG
ATGGTGTCATCTACCCATCGGAGACATTCAAAGGTTATAGAGAACTTGGTTTCAACGTGA
TCTTTAGTTTCTTTCTGACATTCATCGTGCATGTTACCATGAGTTACGCCACATCGCCTA
GTTGGATACCTTCTTTTTCCTTCCCGATTTACATCAAGAACATCCATAGAGCCAAACATG
GAAGCGACACTTCCACTTACGACACTGAAGGAAGGTATATTCCAGCAAATCTTGAGAACA
TGTTTAGTAAGTACGCTCGTACTGTGCCTGATAAGCCAACCCGTTACGAGCTGTGGCAAA
TGACTGAGGCTAACCGCAACGCATTCGATTTCTTTGGCTGGGCAGCGAGTAAAATGGAGT
GGGGAGTACTATACTTACCGGCTAAAGACGAGAATGGCTACTTATCTAAAGAAGCTGTTA
GGAGATGCTTCGATGGGAGCTTGTTTGACTACTGCGCCAAGTCGAGAGCTTCTTCTAAAA
AGACAGATTGATGACATGACGTTTACCATTTTTCTTGCTTAAGTAAACCTTTGTTTAATC
TCTTTACCGGAAACACGAATCAGATCGTATCTTTTTGCTGCCTAAGTTTCTCATCTTTAT
AATGGTTCTTTTGGTTTCTGTATTTTGGCAAACTGCGTTTTTGAAGTATAACAAAATGTA
CGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2GJ95TF U 1
AF RR2EV13TF U 340
BS 1 433 RR2GJ95TF
BS 434 434 RR2EV13TF
BS 435 618 RR2GJ95TF
BS 619 619 RR2EV13TF
BS 620 661 RR2GJ95TF
BS 662 662 RR2EV13TF
BS 663 705 RR2GJ95TF
BS 706 905 RR2EV13TF

RD RR2GJ95TF 705 0 0
GGAGAGCGAGAGAGATGGCGACAGATGCAGGATCAGAGTCGATGGCGACAGTGGCTTCAA
AGGCTCCGGTGACGGCCGAGAGGAGGGTCCGGACTGATCTCGATGATCGTCTCCCAAAAC
CATATGTGCCTCGAGCCATGGTTGCACCTGACATGGAAAATGTTAACGGGACAAGGGGAC
ACAAGCACCAGGACATGTCTGTTCTTCAGCAGCACGTTGCCTTCTTTGACCAAGATGGTG
ATGGTGTCATCTACCCATCGGAGACATTCAAAGGTTATAGAGAACTTGGTTTCAACGTGA
TCTTTAGTTTCTTTCTGACATTCATCGTGCATGTTACCATGAGTTACGCCACATCGCCTA
GTTGGATACCTTCTTTTTCCTTCCCGATTTACATCAAGAACATCCATAGAGCCAAACATG
GAAGCGACACTTCTACTTACGACACTGAAGGAAGGTATATTCCAGCAAATCTTGAGAACA
TGTTTAGTAAGTACGCTCGTACTGTGCCTGATAAGCCAACCCGTTACGAGCTGTGGCAAA
TGACTGAGGCTAACCGCAACGCATTCGATTTCTTTGGCTGGGCAGCGAGTAAAATGGAGT
GGGGAGTACTATACTTACTGGCTAAAGACGAGAATGGCTACTTATCTAAAGAAGCTGTTA
G*AGATGCTTCGATGGGAGCTTGTTTGACTACTGCGCCAAGTCGA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2EV13TF 566 0 0
G
GAGTTACGCCACATCGCCTAGTTGGATACCTTCTTTTTCCTTCCCGATTTACATCAAGAA
CATCCATAGAGCCAAACATGGAAGCGACACTTCCACTTACGACACTGAAGGAAGGTATAT
TCCAGCAAATCTTGAGAACATGTTTAGTAAGTACGCTCGTACTGTGCCTGATAAGCTAAC
CCGTTACGAGCTGTGGCAAATGACTGAGGCTAACCGCAACGCATTCGATTT*TTTGGCTG
GGCAGCGAGTAAAATGGAGTGGGGAGTACTATACTTACCGGCTAAAGACGAGAATGGCTA
CTTATCTAAAGAAGCTGTTAGGAGATGCTTCGATGGGAGCTTGTTTGACTACTGCGCCAA
GTCGAGAGCTTCTTCTAAAAAGACAGATTGATGACATGACGTTTACCATTTTTCTTGCTT
AAGTAAACCTTTGTTTAATCTCTTTACCGGAAACACGAATCAGATCGTATCTTTTTGCTG
CCTAAGTTTCTCATCTTTATAATGGTTCTTTTGGTTTCTGTATTTTGGCAAACTGCGTTT
TTGAAGTATAACAAAATGTACGTGC

QA 2 566 2 566
DS 



AS 1 2

CO CL3341Contig1 1190 2 2 U
GGTCATGAGAAGAACACATTTGGGGTTTATGCACAGTTTCAGACAACCATTTTCTGGTGT
TACAATATCTCCCAAGTTCTGCCACTCCAAAGTTGTAGGATCAAGGGCAATGTCTTCAAG
TGTTTCCAGTACAAAGAGCCAATATGTTTATGGAGAAAGCTTAGCTGCAACTGCAGATTC
AGATTATAAGATGAATGGATTAACCCTAAAAAACAGAATCAGTTCTGTTAAAGAAAGATT
ATTACTTGATGCTTTTGATGATGAGTATGGTGGAGTAGTAGTTGATCATGACAAATTACC
ATCAAACCCTACCGCTTTCACAGCAATGCTTAGAAACTCTCTCTCGGATTGGAGAAGAAA
GGGAAAGAAGGGAGTTTGGTTGAAGTTACCTGTGGAACAATCTGAGTTAGTCCCAGTTGC
TGTAAAGGAAGGATTTGAATATCATCATGCAGAGAAAGGATATGTGATGTTAACTTATTG
GATACCAGAGGAGGAGCCTTGTATGCTTCCTGGAAATGCTTCACATCAAGTTGGTGTTGG
AGGCTTTGTCTTGAATCAATTTAAAGAGGTACTTGTGGTGCAAGAAAAGTATTGTACTTC
ATCAAATACAGGTCTATGGAAATTGCCAACTGGATTTATTAATGAATCAGAAGAGATCTT
TTCTGGAGCTGTAAGAGAAGTCAAGGAAGAAACTGGGGTAGATACAGATTTCCTAGAGGT
TATAGCTTTCAGACATGCACACAACGTTGCGTTTGAGAAGTCTTATCTGTTCTTCATCTG
TATGTTGAAGCCACTTTCTGATAAGATCAGCATCGACAACCTTGAGATCAAAGCCGCTAA
GTGGATGCCATTGACGGAGTTTGTGGAGCAACCAATGATAAAAGGAGACAAAATGTTTAA
GAGAGTGATTGAAATATGTGAAGCGAGATTAAGACATCGTTACTGTGGTCTTTCTCCTCA
TCGACTTGTCTCTGCTTTTGATGGCAGACCTTCTTCTCTCTACTACAACGTTGTTGATGA
TGATGATCCTTCCCACTCCAACTGTACAGCTGAATTTTATTAATAACCGGATCACACCGG
ACCGGAACAAAAGTCAAGTGGTAAGATTCTGTGTATATATAATTCCATGTAATGAATGTT
GTTATTTGAACACTCTTCAGTAAAGTAAATACTAGTAATAGCTCCTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT28TF U 1
AF RR2CT28JQ C 435
BS 1 608 RR2CT28TF
BS 609 1190 RR2CT28JQ

RD RR2CT28TF 608 0 0
GGTCATGAGAAGAACACATTTGGGGTTTATGCACAGTTTCAGACAACCATTTTCTGGTGT
TACAATATCTCCCAAGTTCTGCCACTCCAAAGTTGTAGGATCAAGGGCAATGTCTTCAAG
TGTTTCCAGTACAAAGAGCCAATATGTTTATGGAGAAAGCTTAGCTGCAACTGCAGATTC
AGATTATAAGATGAATGGATTAACCCTAAAAAACAGAATCAGTTCTGTTAAAGAAAGATT
ATTACTTGATGCTTTTGATGATGAGTATGGTGGAGTAGTAGTTGATCATGACAAATTACC
ATCAAACCCTACCGCTTTCACAGCAATGCTTAGAAACTCTCTCTCGGATTGGAGAAGAAA
GGGAAAGAAGGGAGTTTGGTTGAAGTTACCTGTGGAACAATCTGAGTTAGTCCCAGTTGC
TGTAAAGGAAGGATTTGAATATCATCATGCAGAGAAAGGATATGTGATGTTAACTTATTG
GATACCAGAGGAGGAGCCTTGTATGCTTCCTGGAAATGCTTCACATCAAGTTGGTGTTGG
AGGCTTTGTCTTGAATCAATTTAAAGAGGTACTTGTGGTGCAAGAAAAGTATTGTACTTC
ATCAAATA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2CT28JQ 756 0 0
TTGAATATCATCATGCAGAGAAAGGATATGTGATGTTAACTTATTGGATACCAGAGGAGG
AGCCTTGTATGCTTCCTGGAAATGCTTCACATCAAGTTGGTGTTGGAGGCTTTGTCTTGA
ATCAATTTAAAGAGGTACTTGTGGTGCAAGAAAAGTATTGTACTTCATCAAATACAGGTC
TATGGAAATTGCCAACTGGATTTATTAATGAATCAGAAGAGATCTTTTCTGGAGCTGTAA
GAGAAGTCAAGGAAGAAACTGGGGTAGATACAGATTTCCTAGAGGTTATAGCTTTCAGAC
ATGCACACAACGTTGCGTTTGAGAAGTCTTATCTGTTCTTCATCTGTATGTTGAAGCCAC
TTTCTGATAAGATCAGCATCGACAACCTTGAGATCAAAGCCGCTAAGTGGATGCCATTGA
CGGAGTTTGTGGAGCAACCAATGATAAAAGGAGACAAAATGTTTAAGAGAGTGATTGAAA
TATGTGAAGCGAGATTAAGACATCGTTACTGTGGTCTTTCTCCTCATCGACTTGTCTCTG
CTTTTGATGGCAGACCTTCTTCTCTCTACTACAACGTTGTTGATGATGATGATCCTTCCC
ACTCCAACTGTACAGCTGAATTTTATTAATAACCGGATCACACCGGACCGGAACAAAAGT
CAAGTGGTAAGATTCTGTGTATATATAATTCCATGTAATGAATGTTGTTATTTGAACACT
CTTCAGTAAAGTAAATACTAGTAATAGCTCCTCTGC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 3

CO CL3342Contig1 758 3 3 U
GGACTATTGTTCTTGCTTCTAGCTCCGGAAAGTGAGAGACTCTTCTTGAAAGGTTGAAAG
TGAGGTTTGGATTGCTTTTAGAGTGTGAAGAAGAAGAAGATCAAAAAATGGCTTTAGAGT
ACGAGTCTCTGAATGAAAACGTGAAGAAGTGTCAGTATGCTGTAAGAGGTGAACTCTATC
TCCGAGCTTCTGAGCTTCAGAAAGAAGGCAAAAAGATTATTTTCACAAACGTTGGGAACC
CTCATGCTTTAGGACAGAAGCCACTGACATTCCCTCGCCAGGTTGTTGCGCTCTGTCAAG
CTCCCTTTCTACTAGATCACCCCAACGTTGGAATGCTATTTCCAGCTGATGCTATTGCAA
GAGCCAAGCATTATCTTTCCTTGACCTCAGGCGGTTTAGGTGCTTACAGTGACTCGAGAG
GCCTTCCAGGAGTTAGGAAAGAGGTTGCAGAGTTCATTCAAAGACGTGATGGCTATCCAA
GTGATCCAGAGCTCATATTTCTCACTGATGGAGCTAGCAAAGGTGTGATGCAAATCTTGA
ACTGTGTTATACGCGGTGAGAGAGACGGGATTCTAGTTCCGGTTCCACAGTATCCACTCT
ACTCAGCCACCATATCACTCTTAGGTGGTTCTCTTGTTCCTTACTATCTAGATGAGTCTG
AAAACTGGGGGCTTGATGTTAGCAACCTTCGCCAATCCGTTGCTCAGCTCGTTCTCAAGG
AATATCAGTAAGGCAATGGTGATCATTAACCCCGGGAA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E545TF U 4
AF RR2FZ18TF U 3
AF RR2DH55TF U 1
BS 1 556 RR2DH55TF
BS 557 557 RR2FZ18TF
BS 558 758 RR2DH55TF

RD RR2E545TF 575 0 0
GG
ATTGTTCTTGCTTCTAGCTCCGGAACGTGAGACTCTCTTCTTGAA*GGTTGAAAGTGAGG
TTTGGATTGCTTTTAGAGTGTGAAGAAGAAGAAGATCAAAAAATGGCTTTAGAGTACGAG
TCTCCGAATGAAAACGTGAAGAAGTGTCAGTATGCTGTAAGAGGTGAACTCTATCTCCGA
GCTTCTGAGCTTCAGAAAGAAGGCAAAAAGATTATTTTCACAAACGTTGGGAACCCTCAT
GCTTTAGGACAGAAGCCACTGACATTCCCTCGCCAGGTGGTTGCGCTCTGTCAAGCTCCC
TTTCTACTAGATCACCCCAACGTTGGAATGCTATTTCCAGCTGATGCTATTGCAAGAGCC
AAGCATTATCTTTCCTTGACCTCAGGCGGTTTAGGTGCTTACAGTGACTCGAGAGGCCTT
CCAGGAGTTAGGAAAGAGGTTGCAGAGTTCATTCAAAGACGTGATGGCTATCCAAGTGAT
CCAGAGCTCATATTTCTCACTGATGGAGCTAGCAAAGGTGTGATGCAAATCTTGAACTGT
GTTATACGCGGTGAGAGAGACGGGATTCTAGTT

QA 3 575 3 575
DS 

RD RR2FZ18TF 713 0 0
GGT
ATTGTTCTTGCTTCTAGCTCCGGAAAGTGAGAGACTCTTCTTGAAAGGTTGAAAGTGAGG
TTTGGATTGCTTTTAGAGTGTGAAGAAGAAGAAGATCAAAAAATGGCTTTATAGTACGAG
TCTCTGAATGAAAACGTGAAGAAGTGTCAGTATGCTGTAAGAGGTGAACTCTATCTCCGA
GCTTCTGAGCTTCAGAAAGAAGGCAAAAAGATTATTTTCACAAACGTTGGGAACCCTCAT
GCTTTAGGACAGAAGCCACTGACATTCCCTCGCCAGGTTGTTGCGCTCTGTCAAGCTCCC
TTTCTACTAGATCACCCCAACGTTGGAATGCTATTTCCAGCTGATGCTATTGCAAGAGCC
AAGCATTATCTTTCCTTGACCTCAGGCGGTTTAGGTGCTTACAGTGACTCGAGAGGCCTT
CCAGGAGTTAGGAAAGAGGTTGCAGAGTTCATTCAAAGACGTGATGGCTATCCAAGTGAT
CCAGAGCTCATATTTCTCACTGATGGAGCTAGCAAAGGTGTGATGCAAATCTTGAACTGT
GTTATACGCGGTGAGAGAGACGGGATTCTAGTTCCGGTTCCACAGTATCCACTCTACTCA
GCCACCATATCACTCTTAGGTGGTTCTCTTGTTCCTTACTATCTAGATGAGTCTGAAA*C
TGGGGGCTTGATGTTAGCAACCTTCGCCAATCCGTTGCTTAGCTCGTTCT

QA 4 713 4 713
DS 

RD RR2DH55TF 758 0 0
GGACTATTGTTCTTGCTTCTAGCTCCGGAAAGTGAGAGACTCTTCTTGAAAGGTTGAAAG
TGAGGTTTGGATTGCTTTTAGAGTGTGAAGAAGAAGAAGATCAAAAAATGGCTTTAGAGT
ACGAGTCTCTGAATGAAAACGTGAAGAAGTGTCAGTATGCTGTAAGAGGTGAACTCTATC
TCCGAGCTTCTGAGCTTCAGAAAGAAGGCAAAAAGATTATTTTCACAAACGTTGGGAACC
CTCATGCTTTAGGACAGAAGCCACTGACATTCCCTCGCCAGGTTGTTGCGCTCTGTCAAG
CTCCCTTTCTACTAGATCACCCCAACGTTGGAATGCTATTTCCAGCTGATGCTATTGCAA
GAGCCAAGCATTATCTTTCCTTGACCTCAGGCGGTTTAGGTGCTTACAGTGACTCGAGAG
GCCTTCCAGGAGTTAGGAAAGAGGTTGCAGAGTTCATTCAAAGACGTGATGGCTATCCAA
GTGATCCAGAGCTCATATTTCTCACTGATGGAGCTAGCAAAGGTGTGATGCAAATCTTGA
ACTGTGTTATACGCGG*GAGAGAGACGGGATTCTAGTTCCGGTTCCACAGTATCCACTCT
ACTCAGCCACCATATCACTCTTAGGTGGTTCTCTTGTTCCTTACTATCTAGATGAGTCTG
AAAACTGGGGGCTTGATGTTAGCAACCTTCGCCAATCCGTTGCTCAGCTCGTTCTCAAGG
AATATCAGTAAGGCAATGGTGATCATTAACCCCGGGAA

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL3343Contig1 1117 2 8 U
GGACTAAAAAATAATGTCGTCGTGGTTGGAAATGGTCTAAGTTAAAGTTCGTTTCTCTCA
ATTGTGTTGCCTCCGTCTTGTTTCTGGCGATCGTTACAGATTGACGGATTATAAAGGGAC
ACACACTGTTTCTCCTTCTTTGACGAATCCATTCGAAGATCACTGGGGGGTTTGAGTGAA
TGACGGGAAAAGAAGATAGCAGTGAAGAGGTTTGTTCTTCAGAGGATATGGTGACAAATC
TGAAGGCTTCTATAAGAGAATTGAGTGGGAAAGTGAGGGAACAGAATCGGAGAAAATGTG
ATGTTAAGGATAAGCTGCAGCAGTTGCGAGAAAGAATAAACGCTGAAGAAGGTGTTGATG
TTTCAGAGTTGATACCTCTTTTGAGATCACTCAAGGAATTAGAAAAACAGGAATCTGAAG
TCCGGTCTAATTGCGATGCTAAGCGTTCTGCGTTGGAAGATGCAGTTTGTGGTTTGGAGG
AGAGAGTCGCAAAGGGCGAGATTCCCGAGGAAGATTTGGATGTTTTGTTGGTTGAATCAC
TTGATCATCTCACTTCAGCGAAGAAGGAGCTTGCAGCAACGCTAAGAGAAATAGTGTCTC
TGAAGCGACAGATTGATGATGTACCATGCCAATCTGAACTCCTCCAATATGAAAGAAGAT
TCTCAGAGCTTAATGTTTGTATACAGGAGAAGCTTCAACAAACTAGGAAGCTCTATGGGA
CATACAATGCTCTTTCAGAAATAAAAGATTTGATGCTAAAGGAGATTTCATTACTGAATT
CAATAGGTTCACAGTTTCAAGACGTGATTGGTACACCTACTGGCCGCGTGAAGCTAATTG
ATTCAATGGAAGTAGTCATGAAAGGAATCCAACAGAAGCTAGGAAAGGTACAACTTGGGC
TTCAAGAAGAGCAGAGGCTCTGTGGTGCTTCAAAAGAAAAGTATACTGCTGCAGCTGCAG
AGCAAAGAAAATGCTATAATTCTTTCCAAGTATAAGTATTTTCAAAGCCGACATTATTTG
GACTTTTGGTGATTTTAAACAAGTTTGTCTCTTCAGCCTTTGATATCGATAGATAGTTTG
CTGAGTTTGTCCTTTATAAAGTATATTTTCAAGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG19TF U 1
AF RR2EG58JQ C 603
BS 1 706 RR2FG19TF
BS 707 707 RR2EG58JQ
BS 708 745 RR2FG19TF
BS 746 746 RR2EG58JQ
BS 747 786 RR2FG19TF
BS 787 787 RR2EG58JQ
BS 788 801 RR2FG19TF
BS 802 1117 RR2EG58JQ

RD RR2FG19TF 801 0 0
GGACTAAAAAATAATGTCGTCGTGGTTGGAAATGGTCTAAGTTAAAGTTCGTTTCTCTCA
ATTGTGTTGCCTCCGTCTTGTTTCTGGCGATCGTTACAGATTGACGGATTATAAAGGGAC
ACACACTGTTTCTCCTTCTTTGACGAATCCATTCGAAGATCACTGGGGGGTTTGAGTGAA
TGACGGGAAAAGAAGATAGCAGTGAAGAGGTTTGTTCTTCAGAGGATATGGTGACAAATC
TGAAGGCTTCTATAAGAGAATTGAGTGGGAAAGTGAGGGAACAGAATCGGAGAAAATGTG
ATGTTAAGGATAAGCTGCAGCAGTTGCGAGAAAGAATAAACGCTGAAGAAGGTGTTGATG
TTTCAGAGTTGATACCTCTTTTGAGATCACTCAAGGAATTAGAAAAACAGGAATCTGAAG
TCCGGTCTAATTGCGATGCTAAGCGTTCTGCGTTGGAAGATGCAGTTTGTGGTTTGGAGG
AGAGAGTCGCAAAGGGCGAGATTCCCGAGGAAGATTTGGATGTTTTGTTGGTTGAATCAC
TTGATCATCTCACTTCAGCGAAGAAGGAGCTTGCAGCAACGCTAAGAGAAATAGTGTCTC
TGAAGCGACAGATTGATGATGTACCATGCCAATCTGAACTCCTCCAATATGAAAGAAGAT
TCTCAGAGCTTAATGTTTGTATACAGGAGAAGCTTCAACAAACTAG*AAGCTCTATGGGA
CATACAATGCTCTTTCAGAAATAAA*GATTTGATGCTAAAGGAGATTTCATTACTGAATT
CAATAG*TTCACAGTTTCAAG

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2EG58JQ 515 0 0
AAGCGACAGATTGATGATGTACCATGCCAATCTGAACTCCTCCAATATGAAAGAAGATTC
TCAGAGCTTAATGTTTGTATACAGGAGAAGCTTCAACAAACTAGGAAGCTCTATGGGACA
TACAATGCTCTTTCAGAAATAAAAGATTTGATGCTAAAGGAGATTTCATTACTGAATTCA
ATAGGTTCACAGTTTCAAGACGTGATTGGTACACCTACTGGCCGCGTGAAGCTAATTGAT
TCAATGGAAGTAGTCATGAAAGGAATCCAACAGAAGCTAGGAAAGGTACAACTTGGGCTT
CAAGAAGAGCAGAGGCTCTGTGGTGCTTCAAAAGAAAAGTATACTGCTGCAGCTGCAGAG
CAAAGAAAATGCTATAATTCTTTCCAAGTATAAGTATTTTCAAAGCCGACATTATTTGGA
CTTTTGGTGATTTTAAACAAGTTTGTCTCTTCAGCCTTTGATATCGATAGATAGTTTGCT
GAGTTTGTCCTTTATAAAGTATATTTTCAAGCACC

QA 1 515 1 515
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3345Contig1 311 2 3 U
GCCACTTGATGTCTCTAACAAAGACGATGTAGCAGTTGGTAGGATCAGGCGAGACGTGTC
CCAAGATGGCAATTTCGGGCTGGACATATTCGTTTGTGGAGATCAAATACGCAAAGGAGC
TGCTCTAAACGCTGTTCAAATTGCTGAGATGCTTCTCTGATTTCAAATCCCTCACTCTCA
CCTGATTCTTCACATGAGATCTGTGTATCAGATTTGAGCCAAGAACTTATCTCATTTTTC
TTTGTTTTGAGTTTCTTTTGTTTCCCTATTTGGCCAGTTTTGTTACTTTTCGTTGATCAA
GTTATTTCTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AO91JQ C 1
AF RR2AO91TF U 1
BS 1 1 RR2AO91JQ
BS 2 309 RR2AO91TF
BS 310 311 RR2AO91JQ

RD RR2AO91JQ 311 0 0
GCCACTTGATGTCTCTAACAAAGACGATGTAGCAGTTGGTAGGATCAGGCGAGACGTGTC
CCAAGATGGCAATTTCGGGCTGGACATATTCGTTTGTGGAGATCAAATACGCAAAGGAGC
TGCTCTAAACGCTGTTCAAATTGCTGAGATGCTTCTCTGATTTCAAATCCCTCACTCTCA
CCTGATTCTTCACATGAGATCTGTGTATCAGATTTGAGCCAAGAACTTATCTCATTTTTC
TTTGTTTTGAGTTTCTTTTGTTTCCCTATTTGGCCAGTTTTGTTACTTTTCGTTGATCAA
GTTATTTCTCC

QA 1 311 1 311
DS 

RD RR2AO91TF 311 0 0
G
CCACTTGATGTCTCTAACAAAGACGATGTAGCAGTTGGTAGGATCAGGCGAGACGTGTCC
CAAGATGGCAATTTCGGGCTGGACATATTCGTTTGTGGAGATCAAATACGCAAAGGAGCT
GCTCTAAACGCTGTTCAAATTGCTGAGATGCTTCTCTGATTTCAAATCCCTCACTCTCAC
CTGATTCTTCACATGAGATCTGTGTATCAGATTTGAGCCAAGAACTTATCTCATTTTTCT
TTGTTTTGAGTTTCTTTTGTTTCCCTATTTGGCCAGTTTTGTTACTTTTCGTTGATCAAG
TTATTTCT
CC

QA 2 309 2 309
DS 



AS 1 2

CO CL3346Contig1 796 2 6 U
GGAGGACACTCGATCAAACGCATAAACCCTAGCAAATCGTACGAAAAGCTTAAAAATGGC
GGAGCAACAAGAGATAGTCAATACCGTGTCGGCTGAAGTGAACCCAGACACGAAAGCAGA
GATGGAAGTCGAAGCCGAGACTGCTCAGAAGCGAGAGAGAGAGCAGACGGAGGAGGGCGG
AGGCGAATCGAAGAAGCAGAAGGTGGAGGGAGAGGAAGAGAAGTCTAAGGTCCCGGTAAA
GCTGGGTCCGAAGGAGTTCGTTAACTCCGTGGCGATGTTCGACTACTTTACCAAGTTTAT
GCACTTTTGGCCAACTGATCTCGATGTCAACAAGTATGAGCAGATGGTGTTACTAGATCT
GATCAAGAAGGGCCATTCCGAGCCTGACAAGAAGATTGGCGGAGGGATCAGAGCCTTCCA
AGTAAGAACCCACCCAATGTGGAAAAGCAGGTGCTTCTTTCTCGTTAGGGAAGATGACAC
TGCTGACGATTTCAGCTTCAGGAAGTGCGTCGATCAGATCCTCCCCTTGCCTGATAACAT
GAAGGCTCCTGGGTCTAGCGGCAATGGACATGGCGGTGGAGGTCGCGGTGGGGGAAGAAG
AGGCGGTCGTGGTGGTGGTAGAGGAGGGAGATTCAGAAGATGAAATTGCTTGATGATGAC
TTTTGTTACCTTACCTTGCTAAAGAATGGAATTTTGGAGCTTTCATGTTAAAGTTATGTT
GCTAAAAAACTTTTTAAGTTATGATCTTGTCCAATGCTAATGTTATTTTGTCGGAGAAGA
ATTGTTAGTTCGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D053TF U 1
AF RR2D053JQ C 249
BS 1 544 RR2D053TF
BS 545 545 RR2D053JQ
BS 546 581 RR2D053TF
BS 582 582 RR2D053JQ
BS 583 598 RR2D053TF
BS 599 796 RR2D053JQ

RD RR2D053TF 598 0 0
GGAGGACACTCGATCAAACGCATAAACCCTAGCAAATCGTACGAAAAGCTTAAAAATGGC
GGAGCAACAAGAGATAGTCAATACCGTGTCGGCTGAAGTGAACCCAGACACGAAAGCAGA
GATGGAAGTCGAAGCCGAGACTGCTCAGAAGCGAGAGAGAGAGCAGACGGAGGAGGGCGG
AGGCGAATCGAAGAAGCAGAAGGTGGAGGGAGAGGAAGAGAAGTCTAAGGTCCCGGTAAA
GCTGGGTCCGAAGGAGTTCGTTAACTCCGTGGCGATGTTCGACTACTTTACCAAGTTTAT
GCACTTTTGGCCAACTGATCTCGATGTCAACAAGTATGAGCAGATGGTGTTACTAGATCT
GATCAAGAAGGGCCATTCCGAGCCTGACAAGAAGATTGGCGGAGGGATCAGAGCCTTCCA
AGTAAGAACCCACCCAATGTGGAAAAGCAGGTGCTTCTTTCTCGTTAGGGAAGATGACAC
TGCTGACGATTTCAGCTTCAGGAAGTGCGTCGATCAGATCCTCCCCTTGCCTGATAACAT
GAAG*CTCCTGGGTCTAGCGGCAATGGACATGGCGGTGGAG*TCGCGGTGGGGGAAGA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2D053JQ 548 0 0
CGAAGGAGTTCGTTAACTCCGTGGCGATGTTCGACTACTTTACCAAGTTTATGCACTTTT
GGCCAACTGATCTCGATGTCAACAAGTATGAGCAGATGGTGTTACTAGATCTGATCAAGA
AGGGCCATTCCGAGCCTGACAAGAAGATTGGCGGAGGGATCAGAGCCTTCCAAGTAAGAA
CCCACCCAATGTGGAAAAGCAGGTGCTTCTTTCTCGTTAGGGAAGATGACACTGCTGACG
ATTTCAGCTTCAGGAAGTGCGTCGATCAGATCCTCCCCTTGCCTGATAACATGAAGGCTC
CTGGGTCTAGCGGCAATGGACATGGCGGTGGAGGTCGCGGTGGGGGAAGAAGAGGCGGTC
GTGGTGGTGGTAGAGGAGGGAGATTCAGAAGATGAAATTGCTTGATGATGACTTTTGTTA
CCTTACCTTGCTAAAGAATGGAATTTTGGAGCTTTCATGTTAAAGTTATGTTGCTAAAAA
ACTTTTTAAGTTATGATCTTGTCCAATGCTAATGTTATTTTGTCGGAGAAGAATTGTTAG
TTCGTACC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 3

CO CL3347Contig1 745 3 4 U
TCATCCCCAACCGGCAGCAACGTCAGGGCTTAATGCTCATCCCCAACCGGCAGCAAGGTC
AGGGCTTAAGGCTCGTCCCCAACCGGCAGCAACCTTAGGGCTTAACACCCTAGGTCGAAC
CAACTTAGACCCAATGCTTGATCTCAACCCGGCAGCAACTTTATTGGTTCACAATCAGGT
TCGAGCCGAAGTCGGGGTGGCTCCAATGCTGTGGGACTTTAAACTAGCTGCCTTCGCACA
GAACTACGCTAACGTACGAGCCAAAGACTGCGCCCTACGGCATTCGAACGACGAAATGTA
CGGCGAGAATATAGCTGCAGGGTGGCTCAAATCTAAGGAATCAATGAGCGGTCCGATCGC
GGCTAAGTTGTGGTATGGCGAGAAGAAATTTTACAATTATCAAACCAACAAATGTAGTGG
TGTGTGCGGGCATTATACTCAGATGGTGGCTAACCAATCGCACCGAGTTGGTTGTGGTCA
CGTCAGGTGTCATGCAAATACATATCTTTGGGTCGTATGTAACTATGCTCCTAGGCCGAT
GGGTGATGAGAACACACGTCCGTATTAATGAACTTTTGTTTTTAACTAAGACGAGTAGTT
GTCTGATGTAATAAAACTTAACATAATAAGTTACGTACTATAGATAAGACAAGACATTAT
AGTTTGGAGATGTCTGATCATGTAATAAAATTTAACATAATAAGTTCGTGTATGATAGAT
TATATAAGATCCAGAAATTCTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG19TF U 240
AF RR2BG19JQ C 1
AF RR2FT50TF U 381
BS 1 239 RR2BG19JQ
BS 240 514 RR2BG19TF
BS 515 725 RR2FT50TF
BS 726 745 RR2BG19JQ

RD RR2BG19TF 275 0 0
AGAACTACGCTAACGTACGAGCCAAAGACTGCGCCCTACGGCATTCGAACGACGAAATGT
ACGGCGAGAATATAGCTGCAGGGTGGCTCAAATCTAAGGAATCAATGAGCGGTCCGATCG
CGGCTAAGTTGTGGTATGGCGAGAAGAAATTTTACAATTATCAAACCAACAAATGTAGTG
GTGTGTGCGGGCATTATACTCAGATGGTGGCTAACCAATCGCACCGAGTTGGTTGTGGTC
ACGTCAGGTGTCATGCAAATACATATCTTTGGGTC

QA 1 275 1 275
DS 

RD RR2BG19JQ 745 0 0
TCATCCCCAACCGGCAGCAACGTCAGGGCTTAATGCTCATCCCCAACCGGCAGCAAGGTC
AGGGCTTAAGGCTCGTCCCCAACCGGCAGCAACCTTAGGGCTTAACACCCTAGGTCGAAC
CAACTTAGACCCAATGCTTGATCTCAACCCGGCAGCAACTTTATTGGTTCACAATCAGGT
TCGAGCCGAAGTCGGGGTGGCTCCAATGCTGTGGGACTTTAAACTAGCTGCCTTCGCACA
GAACTACGCTAACGTACGAGCCAAAGACTGCGCCCTACGGCATTCGAACGACGAAATGTA
CGGCGAGAATATAGCTGCAGGGTGGCTCAAATCTAAGGAATCAATGAGCGGTCCGATCGC
GGCTAAGTTGTGGTATGGCGAGAAGAAATTTTACAATTATCAAACCAACAAATGTAGTGG
TGTGTGCGGGCATTATACTCAGATGGTGGCTAACCAATCGCACCGAGTTGGTTGTGGTCA
CGTCAGGTGTCATGCAAATACATATCTTTGGGTCGTATGTAACTATGCTCCTAGGCCGAT
GGGTGATGAGAACACACGTCCGTATTAATGAACTTTTGTTTTTAACTAAGACGAGTAGTT
GTCTGATGTAATAAAACTTAACATAATAAGTTACGTACTATAGATAAGGCAAGACATTAT
AGTTTGGAGATGTCTGATCATGTAATAAAATTTAACATAATAAGTTCGTGTATGATAGAT
TATATAAGATCCAGAAATTCTAATT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2FT50TF 345 0 0
G
GAAGAAATTTTACAATTATCAAACCAACAAATGTAGTGGTGTGTGCGGGCATTATACTCA
GATGGTGGCTAACCAATCGCACCGAGTTGGTTGTGGTCACGTCAGGTGTCATGCAAATAC
ATATCTTTGGGTCGTATGTAACTATGCTCCTAGGCCGATGGGTGATGAGAACACACGTCC
GTATTAATGAACTTTTGTTTTTAACTAAGACGAGTAGTTGTCTGATGTAATAAAACTTAA
CATAATAAGTTACGTACTATAGATAAGACAAGACATTATAGTTTGGAGATGTCTGATCAT
GTAATAAAATTTAACATAATAAGTTCGTGTATGATAGATTATAT

QA 2 345 2 345
DS 



AS 1 2

CO CL3348Contig1 888 2 2 U
GGACACACAACACTTAACACTTTAATCACACATCACCAACTGGTCTCTCTCATACCAATC
TAACCAAATGGGTTCTTATTCTACACCTCAAGAAGAGCCTCAACTAGTAGATACACCTGA
TATTGTTCCTTCTCCGATAGCTCAGGAACCGGACAACGATGTACCGGCCCCGGGAAATCA
GTTTGCTGAGTTCGCCGCCGGTTGTTTCTGGGGGGTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATTCC
TGGTGTGACAGAGACTGAGGTTGGGTACACTCAGGGGATCTCTCACAATCCTTCTTACAA
GGATGTCTGCACCAACACAACGAACCATGCAGAGGTTGTAAGGGTCCAGTATGATCCCAA
CGAGTGCACCTATGAGACTCTGCTTGACTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCACCTT
AAATCGTCAGGGAAAACTTGTGGGAGCTCAGTACAGATCAGGTATATACTTCTACACACC
AGAGCAAGAGAGGCTGGCACGTGAATCTCTGGAGACTCAGCAGAAGAAACTAGAGAAGAA
GATTGTGACTGAGATATTACCGGCCAAGAAATTCTACAAAGCTGAGGAATACCATCAGCA
TTACCTCTCTAAAGGTGGGACGAGTGGCCATGCACAGTCCCCTGCAAAGAGCTGCAAAGA
CCCTATCAGCTGCTTTGGCTAAGGAAAAGCATTTGTTCCTCTTCACCCAAACAGAGGATT
CTCTGAGGTTTCGTATCAGTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCCTGCGTGTGTGTG
TGTGTTGATTTTTAAGTCTCAGTTAGTAATAAAGATGCATGTGGGATCATCTCAACTGTG
TAAGTGTAACTTGTCTTAGTTTCTAAACTTTGAACTGATGTTTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH50TF U 1
AF RR2EH50JQ C 168
BS 1 682 RR2EH50TF
BS 683 888 RR2EH50JQ

RD RR2EH50TF 692 0 0
GGACACACAACACTTAACACTTTAATCACACATCACCAACTGGTCTCTCTCATACCAATC
TAACCAAATGGGTTCTTATTCTACACCTCAAGAAGAGCCTCAACTAGTAGATACACCTGA
TATTGTTCCTTCTCCGATAGCTCAGGAACCGGACAACGATGTACCGGCCCCGGGAAATCA
GTTTGCTGAGTTCGCCGCCGGTTGTTTCTGGGGGGTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATTCC
TGGTGTGACAGAGACTGAGGTTGGGTACACTCAGGGGATCTCTCACAATCCTTCTTACAA
GGATGTCTGCACCAACACAACGAACCATGCAGAGGTTGTAAGGGTCCAGTATGATCCCAA
CGAGTGCACCTATGAGACTCTGCTTGACTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCACCTT
AAATCGTCAGGGAAAACTTGTGGGAGCTCAGTACAGATCAGGTATATACTTCTACACACC
AGAGCAAGAGAGGCTGGCACGTGAATCTCTGGAGACTCAGCAGAAGAAACTAGAGAAGAA
GATTGTGACTGAGATATTACCGGCCAAGAAATTCTACAAAGCTGAGGAATACCATCAGCA
TTACCTCTCTAAAGGTGGGACGAGTGGCCATGCACAGTCCCCTGCAAAGAGCTGCAAAGA
CCCTATCAGCTGCTTTGGCTAA
GAAAGCATTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2EH50JQ 721 0 0
CCCCGGGAAATCAGTTTGCTGAGTTCGCCGCCGGTTGTTTCTGGGGGGTGGAGCTTGCTT
TCCAGAGGATTCCTGGTGTGACAGAGACTGAGGTTGGGTACACTCAGGGGATCTCTCACA
ATCCTTCTTACAAGGATGTCTGCACCAACACAACGAACCATGCAGAGGTTGTAAGGGTCC
AGTATGATCCCAACGAGTGCACCTATGAGACTCTGCTTGACTTGTTCTGGTCTAGGCATG
ATCCCACCACCTTAAATCGTCAGGGAAAACTTGTGGGAGCTCAGTACAGATCAGGTATAT
ACTTCTACACACCAGAGCAAGAGAGGCTGGCACGTGAATCTCTGGAGACTCAGCAGAAGA
AACTAGAGAAGAAGATTGTGACTGAGATATTACCGGCCAAGAAATTCTACAAAGCTGAGG
AATACCATCAGCATTACCTCTCTAAAGGTGGGACGAGTGGCCATGCACAGTCCCCTGCAA
AGAGCTGCAAAGACCCTATCAGCTGCTTTGGCTAAGGAAAAGCATTTGTTCCTCTTCACC
CAAACAGAGGATTCTCTGAGGTTTCGTATCAGTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTGTATGTGC
CTGCGTGTGTGTGTGTGTTGATTTTTAAGTCTCAGTTAGTAATAAAGATGCATGTGGGAT
CATCTCAACTGTGTAAGTGTAACTTGTCTTAGTTTCTAAACTTTGAACTGATGTTTGTTT
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 3

CO CL3349Contig1 808 3 9 U
AACTGAAGATTCATATAATGGCAAACTGTAACACTACGTCAATATAAGACTCACAACAGA
ACTATATAATAACTATATATAGAATAAAGTTTCACTCTAGAGATTATTATTTTAAAAAGA
ATAACAATTGAGACCTCGAGCTGAAATCGTTTACAAACTGAATCAGCTGGTTTAATTGAC
CATCTCCTTAGCTCTAAAACGGTCTGGTGCTACGACCGCTAGCTCTACCGCATAGAAGAG
CGTTCTTGGGGATTGGGAACTCATCTCTGAGTGAAGTGGAAGTTGTGTAGACACGTAAAT
AAAACTGTTGCCCTAAGTACTGCCTTGCCCAAAACTCAGATCTTAGGTTCCACATCCCTA
CGTTGTCTAGTGCTATGTATATAGCCGTCCATGAACTCGGATACACCTGAACGGTGCAGC
GAGCTAATGCATCGCGCAAATTGTACTCGTTTCTACTAGCAGGACTCCATTTACCACCGT
CCATTCCAACAACCCAAAAGGAGTAACCATCAAGATGCCAGCTCTGGACTATATTCTCAG
GGTTTTCGAAAACGATCTCCACAAAGGGTCTGTAGTCTGCTTGCATAACAGATGTGTCGA
GGTAAATTCCACCACCAGTGGGTTGGCTCTGTATGCTTCCAACTCTGTAGACACCATCGA
TCTTGAAGAAGTCCGCGAGTTTCAGAGGAGTGTCTGCTGGCTTAAAAGATACGCTGTTCA
CAGCGTATCTTTGCTTCCCGTTGACCTGACCGGCAACGCTAGCAAGTCTGATGGTTCTTG
TGGTGTTTATCATACCGTAGTGGTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H524JQB U 1
AF RR2BK25JQ U 20
AF RR2H524TF C 328
BS 1 40 RR2H524JQB
BS 41 41 RR2BK25JQ
BS 42 133 RR2H524JQB
BS 134 134 RR2BK25JQ
BS 135 233 RR2H524JQB
BS 234 567 RR2BK25JQ
BS 568 568 RR2H524TF
BS 569 682 RR2BK25JQ
BS 683 808 RR2H524TF

RD RR2H524JQB 233 0 0
AACTGAAGATTCATATAATGGCAAACTGTAACACTACGTCGATATAAGACTCACAACAGA
ACTATATAATAACTATATATAGAATAAAGTTTCACTCTAGAGATTATTATTTTAAAAAGA
ATAACAATTGAGATCTCGAGCTGAAATCGTTTACAAACTGAATCAGCTGGTTTAATTGAC
CATCTCCTTAGCTCTAAAACGGTCTGGTGCTACGACCGCTAGCTCTACCGCAT

QA 1 233 1 233
DS 

RD RR2BK25JQ 663 0 0
GGCAAACTGTAACACTACGTCAATATAAGACTCACAACAGAACTATATAATAACTATATA
TAGAATAAAGTTTCACTCTAGAGATTATTATTTTAAAAAGAATAACAATTGAGACCTCGA
GCTGAGATCGTTTACAAACTGAATCAGCTGGTTTAATTGACCATCTCCTTAGCTCTAAAA
CGGTCTGGTGCTACGACCGCTAGCTCTACCGCATAGAAGAGCGTTCTTGGGGATTGGGAA
CTCATCTCTGAGTGAAGTGGAAGTTGTGTAGACACGTAAATAAAACTGTTGCCCTAAGTA
CTGCCTTGCCCAAAACTCAGATCTTAGGTTCCACATCCCTACGTTGTCTAGTGCTATGTA
TATAGCCGTCCATGAACTCGGATACACCTGAACGGTGCAGCGAGCTAATGCATCGCGCAA
ATTGTACTCGTTTCTACTAGCAGGACTCCATTTACCACCGTCCATTCCAACAACCCAAAA
GGAGTAACCATCAAGATGCCAGCTCTGGACTATATTCTCAGGGTTTTCGAAAACGATCTC
CACAAAGGTTCTGTAGTCTGCTTGCATAACAGATGTGTCGAGGTAAATTCCACCACCAGT
GGGTTGGCTCTGTATGCTTCCAACTCTGTAGACACCATCGATCTTGAAGAAGTCCGCGAG
TTT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2H524TF 481 0 0
CCCAAAACTCAGATCTTAGGTTCCACATCCCTACGTTGTCTAGTGCTATGTATATAGCCG
TCCATGAACTCGGATACACCTGAACGGTGCAGCGAGCTAATGCATCGCGCAGATTGTACT
CGTTTCTACTAGCAGGACTCCATTTACCACCGTCCATTCCAACAACCCAAAAGGAGTAAC
CATCAAGATGCCAGCTCTGGACTATATTCTCAGGGTTTTCGAAAACGATCTCCACAAAGG
GTCTGTAGTCTGCTTGCATAACAGATGTGTCGAGGTAAATTCCACCACCAGTGGGTTGGC
TCTGTATGCTTCCAACTCTGTAGACACCATCGATCTTGAAGAAGTCCGCGAGTTTCAGAG
GAGTGTCTGCTGGCTTAAAAGATACGCTGTTCACAGCGTATCTTTGCTTCCCGTTGACCT
GACCGGCAACGCTAGCAAGTCTGATGGTTCTTGTGGTGTTTATCATACCGTAGTGGTATG
C

QA 1 481 1 481
DS 



AS 1 2

CO CL3350Contig1 771 2 11 U
GTAAATGAAACGTAGAAATGAGTTTGTATATATGTAGATAATAGATGACAACTCATAAGA
TCCATACAGAAGAAGATATTGCGTTTTTTCTTTTTGTTGTTGCAACAAAACTTGCATACA
GTTCTCTCGAGTTGCTAATTTTATATCTTAAAAATACTCTGCTCAATGCTCTCATACACT
TTAAAAACTTGCAACCAGAGAGAACTCTGGTTCTTGGGTTCATCTTTCATCAGAGCAACT
CGCAAAAAAAATCAGACCTTCTGGTCACATCCAAGCTTCTGGAACTCGGATTCTAAAGTA
TCGAATATCTTGGTGCCTTCCGTGGCTGGCTCAGGGAACCTAACATGGACCGAACCATGC
CTGACGGGTGCACTCGACGGCCCTTTAACCAAAGCCTGTTGCTTCACATAGTTGTATAAC
TCTTGGTGGAAAGAGTGGTCTAAAGAAAAACAGTTGTCTTCTGCTCCATTAAAGATATGC
CTACCAGATCCAGACCCTTCTCTTCTACAGAAATGTGGCAGTGATTCATAGTCCATTACC
TTAAGCAACTCGTCTTTACCGCAGCCTTTGAGAACTTGAATCTTCTTCTTTGTCCTCTCT
TGCAGCAGAAGCTTTATGGTTTTCCAACAAGCAGAAAATATGTAGGGGACATTGACTATA
TAATATGTCTCCGTCTTCTCTGGATAGTTTAAATCGTCTATTGTGGTTATAGTAGTCATT
AACTTAATTTGACTTAGAGCTGAAAGCTTTAAACCAGACATATCCAAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ62JQ U 237
AF RR2CM39JQ U 1
BS 1 244 RR2CM39JQ
BS 245 245 RR2EQ62JQ
BS 246 246 RR2CM39JQ
BS 247 247 RR2EQ62JQ
BS 248 405 RR2CM39JQ
BS 406 406 RR2EQ62JQ
BS 407 446 RR2CM39JQ
BS 447 447 RR2EQ62JQ
BS 448 471 RR2CM39JQ
BS 472 472 RR2EQ62JQ
BS 473 771 RR2CM39JQ

RD RR2EQ62JQ 366 0 0
AACTCGCAAAAAAAATCAGACCTTCTGGTCACATCCAAGCTTCTGGAACTCGGATTCTAA
AGTATCGAATATCTTGGTGCCTTCCGTGGCTGGCTCAGGGAACCTAACATGGACCGAACC
ATGCCTGACGGGTGCACTCGACGGCCCTTTAACCAAAGCCTGTTGCTTCACATAGTTGTA
TAACTCTTGGTGGAAAGAGTGGTCTAAAGAAAAACAGTTGTCTTCTGCTCCATTAAAGAT
ATGCCTACCAGATCCAGACCCTTCTCTTCTACAGAAATGTGGCAGTGATTCATAGTCCAT
TACCTTAAGCAACTCGTCTTTACCGCAGCCTTTGAGAACTTGAATCTTCTTCTTTGTCCT
CTCTTG

QA 1 366 1 366
DS 

RD RR2CM39JQ 771 0 0
GTAAATGAAACGTAGAAATGAGTTTGTATATATGTAGATAATAGATGACAACTCATAAGA
TCCATACAGAAGAAGATATTGCGTTTTTTCTTTTTGTTGTTGCAACAAAACTTGCATACA
GTTCTCTCGAGTTGCTAATTTTATATCTTAAAAATACTCTGCTCAATGCTCTCATACACT
TTAAAAACTTGCAACCAGAGAGAACTCTGGTTCTTGGGTTCATCTTTCATCAGAGCAACT
CGCAGAGAAAATCAGACCTTCTGGTCACATCCAAGCTTCTGGAACTCGGATTCTAAAGTA
TCGAATATCTTGGTGCCTTCCGTGGCTGGCTCAGGGAACCTAACATGGACCGAACCATGC
CTGACGGGTGCACTCGACGGCCCTTTAACCAAAGCCTGTTGCTTCGCATAGTTGTATAAC
TCTTGGTGGAAAGAGTGGTCTAAAGAGAAACAGTTGTCTTCTGCTCCATTAGAGATATGC
CTACCAGATCCAGACCCTTCTCTTCTACAGAAATGTGGCAGTGATTCATAGTCCATTACC
TTAAGCAACTCGTCTTTACCGCAGCCTTTGAGAACTTGAATCTTCTTCTTTGTCCTCTCT
TGCAGCAGAAGCTTTATGGTTTTCCAACAAGCAGAAAATATGTAGGGGACATTGACTATA
TAATATGTCTCCGTCTTCTCTGGATAGTTTAAATCGTCTATTGTGGTTATAGTAGTCATT
AACTTAATTTGACTTAGAGCTGAAAGCTTTAAACCAGACATATCCAAATTT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 3

CO CL3351Contig1 1502 3 3 U
GTCTTGGCACCCGTGAGCTTCAAAGTTATTACAGTGGAGTCCATGGTAGTCGCAGGGACC
GTCAATTCGTTTTCAGCAGATTCAAATCTTGGAGATCTTACCGAGATGAGAATGCTCTCT
TTACATGCATCTCATTACTTGGGGGTACTAATCATTTAGCAGTCGGTAGTCATGCGGGAG
AAATCAAGATATTCGACACTAGCAGCTGTAGCTTGCTTGAGAGTGTCCCAGGCCACCAGG
CTCCGGTAACACTTGTTCAGCCATATGTCTCTGGTGATACTCAGTTGTTACTTTCTTCTA
GCTTCAGTGATGTGCAGTTGTGGGACGCTTCTTATATAACTAGCGGGTCTAAGCATTCCT
TTGATGGGTGCAAGGCTGCAAAATTCAGCAACTCTGGGCTCTCATGTGAAGGATCAACAA
AAGATGTTCTTCTGTATGACGTAGAGACCTGCATTACTTCCAATAAATTCACTGACACAT
CCACTTCTTCTCGGAGTAGTCCCTATTCTCTTGTACATTTCAGCCCTTGCGATACACTAA
TATTGTGGAATGGTCATCTGTGGGATCGCCGTGTTCCAGATGAGGTCAGTCGGTTTGATC
AATTTACTGATTATGGCGGCGGTGGCTTTCATCCTTCTCGTAACGAGGTGATCATAAACT
CCGAGGTCTGGGATTTGAGGAAAATGAGGCTTCTTCGAAGTGTCCCATCACTGGACCAGA
CAGCTATCACGTTCAACTCCAGGGGTGATGTTATATACGCAATGCTGAGGAGAAACATCG
AGGACGTGATGTCTGCTGTCCACACACGCCGTTCGAAGCATCCGTTGTTTGCTGCATTCC
GAACTCTTGATGCGACCAACTATTCAGACATTGCCACTATACCCGTGGACCGATGTCTTC
TTGACTTTGCCACAGAACCAACAGATTCTTTCCTTGGGCTGATCACAATGGAAGATCAAG
AAGACATGTTTTCCTCAGCCAGGTTGTATGAGATTGGCAGACGTAAACCAACAGATGATG
ACTCGGACCCCGATGATGATGGTGAGACAGAGGATGAAGATGAAGATGATGAAGACGATG
AAGATGACTTGGACCGGATTCTGGGACTAGCTGGAGACGATAGCGGCAGTGGAGATGATG
ATGACATTAGCAGCGAGGACAATGAAGATAATAGTGCAAGCGATTTTGATGATTATGATG
ATGATGGAGATTTGGTCCTTGATGGTGGTGACTTTTTGGAGATTATAAGTGATGGTGATG
AGGAAGATAGTGGTGATGATAATGATGACAATGTTGATGGCGGTTATAATCACGATTCCA
GTGGCGAAGAGGATTTTTTAGACAACATGTAGTCTTTTTAATGTAGTTTTCTTTTCAACT
CTAGATTCTCTTAAGATTGTCACTATCCAAAGTTTTGTTGACAAGTAACTTTGTATTTTT
TTTCTTTTTGAAGTTGCATGTTTATTTGATGATGAGTAATTAAAAGAGAGAGCATATTCT
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2GN73TF U 1
AF RR2F977TF U 492
AF RR2F977JQ C 898
BS 1 675 RR2GN73TF
BS 676 1236 RR2F977TF
BS 1237 1502 RR2F977JQ

RD RR2GN73TF 683 0 0
GTCTTGGCACCCGTGAGCTTCAAAGTTATTACAGTGGAGTCCATGGTAGTCGCAGGGACC
GTCAATTCGTTTTCAGCAGATTCAAATCTTGGAGATCTTACCGAGATGAGAATGCTCTCT
TTACATGCATCTCATTACTTGGGGGTACTAATCATTTAGCAGTCGGTAGTCATGCGGGAG
AAATCAAGATATTCGACACTAGCAGCTGTAGCTTGCTTGAGAGTGTCCCAGGCCACCAGG
CTCCGGTAACACTTGTTCAGCCATATGTCTCTGGTGATACTCAGTTGTTACTTTCTTCTA
GCTTCAGTGATGTGCAGTTGTGGGACGCTTCTTATATAACTAGCGGGTCTAAGCATTCCT
TTGATGGGTGCAAGGCTGCAAAATTCAGCAACTCTGGGCTCTCATGTGAAGGATCAACAA
AAGATGTTCTTCTGTATGACGTAGAGACCTGCATTACTTCCAATAAATTCACTGACACAT
CCACTTCTTCTCGGAGTAGTCCCTATTCTCTTGTACATTTCAGCCCTTGCGATACACTAA
TATTGTGGAATGGTCATCTGTGGGATCGCCGTGTTCCAGATGAGGTCAGTCGGTTTGATC
AATTTACTGATTATGGCGGCGGTGGCTTTCATCCTTCTCGTAACGAGGTGATCATAAACT
CCGAGGTCTGGGATT
GAGGAAAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2F977TF 749 0 0
G
GGAGTAGTCCCTATTCTCTTGTACATTTCAGCCCTTGCGATACACTAATATTGTGGAATG
GTCATCTGTGGGATCGCCGTGTTCCAGATGAGGTCAGTCGGTTTGATCAATTTACTGATT
ATGGCGGCGGTGGCTTTCATCCTTCTCGTAACGAGGTGATCATAAACTCCGAGGTCTGGG
ATTTGAGGAAAATGAGGCTTCTTCGAAGTGTCCCATCACTGGACCAGACAGCTATCACGT
TCAACTCCAGGGGTGATGTTATATACGCAATGCTGAGGAGAAACATCGAGGACGTGATGT
CTGCTGTCCACACACGCCGTTCGAAGCATCCGTTGTTTGCTGCATTCCGAACTCTTGATG
CGACCAACTATTCAGACATTGCCACTATACCCGTGGACCGATGTCTTCTTGACTTTGCCA
CAGAACCAACAGATTCTTTCCTTGGGCTGATCACAATGGAAGATCAAGAAGACATGTTTT
CCTCAGCCAGGTTGTATGAGATTGGCAGACGTAAACCAACAGATGATGACTCGGACCCCG
ATGATGATGGTGAGACAGAGGATGAAGATGAAGATGATGAAGACGATGAAGATGACTTGG
ACCGGATTCTGGGACTAGCTGGAGACGATAGCGGCAGTGGAGATGATGATGACATTAGCA
GCGAGGACAATGAAGATAATAGTGCAAGCGATTTTGATGATTATGATGATGATGGAGATT
TGGTCCTTGATGGTGGTGACTTTT
GGAG

QA 2 745 2 745
DS 

RD RR2F977JQ 605 0 0
TTCTTGACTTTGCCACAGAACCAACAGATTCTTTCCTTGGGCTGATCACAATGGAAGATC
AAGAAGACATGTTTTCCTCAGCCAGGTTGTATGAGATTGGCAGACGTAAACCAACAGATG
ATGACTCGGACCCCGATGATGATGGTGAGACAGAGGATGAAGATGAAGATGATGAAGACG
ATGAAGATGACTTGGACCGGATTCTGGGACTAGCTGGAGACGATAGCGGCAGTGGAGATG
ATGATGACATTAGCAGCGAGGACAATGAAGATAATAGTGCAAGCGATTTTGATGATTATG
ATGATGATGGAGATTTGGTCCTTGATGGTGGTGACTTTTTGGAGATTATAAGTGATGGTG
ATGAGGAAGATAGTGGTGATGATAATGATGACAATGTTGATGGCGGTTATAATCACGATT
CCAGTGGCGAAGAGGATTTTTTAGACAACATGTAGTCTTTTTAATGTAGTTTTCTTTTCA
ACTCTAGATTCTCTTAAGATTGTCACTATCCAAAGTTTTGTTGACAAGTAACTTTGTATT
TTTTTTCTTTTTGAAGTTGCATGTTTATTTGATGATGAGTAATTAAAAGAGAGAGCATAT
TCTCT

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 3

CO CL3352Contig1 842 3 3 U
GAAATCGCTGAACAAAATATATTTATACATTAAGAAAGATTACAAACATTACACGTGAAT
TGCTTTTTGAAGTATATAGTCCGGAGCTACTTGAAGCTTTATACGTGTAACCTTTCATCT
TTGTGGTGTGGTTACATTATATTACTAATTAAAATATATTGGTTAATTCATTCAAGATTG
ATATGAACCCCATCATTGTCAATAGGAGTTAGGGTGTGAAGTCGCGCCTGTGTCTGTTGG
AGGCTTGACCACACAACAAAGCATTTTTGGGCAAAGGATATTCATCTCTGATTGAGTTAG
CCGGAGAGTAAACTCGGAAGTAGAATTGTTGACCTAAGTATTGTCTTGCCCAAAACTCAC
TTCTGAAATTCCACATCCCCACATTATCTAATGCCACATATACAGCCGTCCAAGATTTTT
GATAGACCTGAGTAGTGGAGCGAGAAATAGCATCCTTAAGGTTATACTCTCGTCTGCTCG
CCGGTGACCATGTAGACCATCGATTACCAATCCCAACAACCCAGAAGTTGTATCCATCAA
GGTGGTAAGTCTGGACTATCCTCTCATGGTTTAGTAAAACGATCTCAAGAAAATCCTTGT
GATGTACTCCCATCACTGCTGTTTCTAGTCTGATCCCTGATCTTCCAGGCTTATCAGGGA
TGCTTCCTACTTTGAAAACACCTTTGATCTTAAAGTAATCTGCTAGCTTCAGTGGAGTAT
CAGCAGGAACGAATGATACGCCATTTATGGCATATCGTTGCTTCCTATTCAGAACGCCTG
CTGAGCTTTCAAGTATTAATGTCCTGGAAATCTTGATTCGACCATAATGATATGAGCCCT
CA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2FC84JQ U 19
AF RR2FC84TF C 19
AF RR2AK84JQ U 1
BS 1 62 RR2AK84JQ
BS 63 63 RR2FC84JQ
BS 64 842 RR2AK84JQ

RD RR2FC84JQ 329 0 0
ATATTTATACATTAAGAAAGATTACAAACATTACACGTGAATTGCTTTTTGAAGTATATA
GTCCGGAGCTACTTGAAGCTTTATACGTGTAACCTTTCATCTTTGTGGTGTGGTTACATT
ATATTACTAATTAAAATATATTGGTTAATTCATTCAAGATTGATATGAACCCCATCATTG
TCAATAGGAGTTAGGGTGTGAAGTCGCGCCTGTGTCTGTTGGAGGCTTGACCACACAACA
AAGCATTTTTGGGCAAAGGATATTCATCTCTGATTGAGTTAGCCGGAGAGTAAACTCGGA
AGTAGAATTGTTGACCTAAGTATTGTCT
C

QA 1 328 1 328
DS 

RD RR2FC84TF 329 0 0
ATATTTATACATTAAGAAAGATTACAAACATTACACGTGAATTGCTTTTTGAAGTATATA
GTCCGGAGCTACTTGAAGCTTTATACGTGTAACCTTTCATCTTTGTGGTGTGGTTACATT
ATATTACTAATTAAAATATATTGGTTAATTCATTCAAGATTGATATGAACCCCATCATTG
TCAATAGGAGTTAGGGTGTGAAGTCGCGCCTGTGTCTGTTGGAGGCTTGACCACACAACA
AAGCATTTTTGGGCAAAGGATATTCATCTCTGATTGAGTTAGCCGGAGAGTAAACTCGGA
AGTAGAATTGTTGACCTAAGTATTGTCT
C

QA 1 328 1 328
DS 

RD RR2AK84JQ 842 0 0
GAAATCGCTGAACAAAATATATTTATACATTAAGAAAGATTACAAACATTACACGTGAAT
TGTTTTTTGAAGTATATAGTCCGGAGCTACTTGAAGCTTTATACGTGTAACCTTTCATCT
TTGTGGTGTGGTTACATTATATTACTAATTAAAATATATTGGTTAATTCATTCAAGATTG
ATATGAACCCCATCATTGTCAATAGGAGTTAGGGTGTGAAGTCGCGCCTGTGTCTGTTGG
AGGCTTGACCACACAACAAAGCATTTTTGGGCAAAGGATATTCATCTCTGATTGAGTTAG
CCGGAGAGTAAACTCGGAAGTAGAATTGTTGACCTAAGTATTGTCTTGCCCAAAACTCAC
TTCTGAAATTCCACATCCCCACATTATCTAATGCCACATATACAGCCGTCCAAGATTTTT
GATAGACCTGAGTAGTGGAGCGAGAAATAGCATCCTTAAGGTTATACTCTCGTCTGCTCG
CCGGTGACCATGTAGACCATCGATTACCAATCCCAACAACCCAGAAGTTGTATCCATCAA
GGTGGTAAGTCTGGACTATCCTCTCATGGTTTAGTAAAACGATCTCAAGAAAATCCTTGT
GATGTACTCCCATCACTGCTGTTTCTAGTCTGATCCCTGATCTTCCAGGCTTATCAGGGA
TGCTTCCTACTTTGAAAACACCTTTGATCTTAAAGTAATCTGCTAGCTTCAGTGGAGTAT
CAGCAGGAACGAATGATACGCCATTTATGGCATATCGTTGCTTCCTATTCAGAACGCCTG
CTGAGCTTTCAAGTATTAATGTCCTGGAAATCTTGATTCGACCATAATGATATGAGCCCT
CA

QA 1 842 1 842
DS 



AS 1 2

CO CL3353Contig1 1215 2 2 U
AAAGGATTAGGGATTTCCACACTAAAATGAAACAATGAAAGAGTACAAATCAAATCACAA
AAGAGTCTTTTGAGTCAAAAATGTACATCCAATACAACTGACGAAGAAGCAAACCTTTTA
ATGGACAAAAACAAAAGTAGAACAGATCATAGAGCTTGAGAGAGGGTTAACAGAGTAAAA
TACCCCAAAACCGTTTTGGATAGCCTTTTTATGTGGGAGAAGAAGCTAAGGTGAGTTTTA
GGATGAAACCGATGATAAGTCCAATGAGTCCAACCAAAGCTGCCAACTTCAAGGATAACC
CATTTCCGCTGTTATTTCTTCGTTTCTTCACCATCTCCAATTCATGTTGCAGCTGTTGTG
TTTGCTTTACAGCTGCATCTCGCTCTTCCTTCAACCGCTGAACAGTAGAGATGGTTTCAG
AGGAATTTGCATCGACATTGGCAGCTCCAGAATCAGAGGATCTTTGGGTTGTAGTAGAGG
AGGAGATATAAGAGACCTTGAGCTTACACTCTGTTAATGTTTTCCCACTGTCCTTTGTAA
ATGTGTCTTGGGGAAGATCATCAACATCAGTGTGTGGAGGAACAAGGGTGCTTTGAAGGA
GAAACTTGTCTTTGCACTGCATATCTGGAGGATACTCCCTTTGCGCTTGCAGAGTAACTC
GAATGATGCAGGAGTCCCATGGCTGAATGACACCAGTGTTGGGTCTAACAAAATACTTTT
TTGGAGATGTTGTTTTCACCTTGAAAGCAACATAGTTGTCAGTTTTATTGGCAACTTTAA
GATCACAGTAGCTTTGTTTCTCGAGTTCAAAAAGGAATTTGAGTTCATCAGGTACAATGG
AGATGAGTTGGTTCTCGCCAACGCCAGACATTTCCACACACAATCAATCTCTACAACTTC
GAACCTATACACCACATCCAAATCCAAACCCCTTTTTCAAACAATTCCAGATTCTTCTTT
TCTTTTCTGAAGAAGAAGAAAACAAAAAACAAAAGGTCACGGGTCTAACGTTTGATCAGC
GAAGAAGCTGCTTTTTTTTTTCTCTCTCTCTCTCTGTGTCTTCCGAAAATCGCTCTCCTC
CTCTGGTTCGGGTTGGTGGTGACCAAGTCACGGGAAATTTTCTGAAGAGAGAGAGAGAAA
ACCAAAGCGCTTCGTATAGCGGCCACGTGAAGTCGAAGCAAAGTTCCTCCGGCGTCGTCT
CCGGGAACCACGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C572JQ U 1
AF RR2AT17TF C 463
BS 1 721 RR2C572JQ
BS 722 1215 RR2AT17TF

RD RR2C572JQ 721 0 0
AAAGGATTAGGGATTTCCACACTAAAATGAAACAATGAAAGAGTACAAATCAAATCACAA
AAGAGTCTTTTGAGTCAAAAATGTACATCCAATACAACTGACGAAGAAGCAAACCTTTTA
ATGGACAAAAACAAAAGTAGAACAGATCATAGAGCTTGAGAGAGGGTTAACAGAGTAAAA
TACCCCAAAACCGTTTTGGATAGCCTTTTTATGTGGGAGAAGAAGCTAAGGTGAGTTTTA
GGATGAAACCGATGATAAGTCCAATGAGTCCAACCAAAGCTGCCAACTTCAAGGATAACC
CATTTCCGCTGTTATTTCTTCGTTTCTTCACCATCTCCAATTCATGTTGCAGCTGTTGTG
TTTGCTTTACAGCTGCATCTCGCTCTTCCTTCAACCGCTGAACAGTAGAGATGGTTTCAG
AGGAATTTGCATCGACATTGGCAGCTCCAGAATCAGAGGATCTTTGGGTTGTAGTAGAGG
AGGAGATATAAGAGACCTTGAGCTTACACTCTGTTAATGTTTTCCCACTGTCCTTTGTAA
ATGTGTCTTGGGGAAGATCATCAACATCAGTGTGTGGAGGAACAAGGGTGCTTTGAAGGA
GAAACTTGTCTTTGCACTGCATATCTGGAGGATACTCCCTTTGCGCTTGCAGAGTAACTC
GAATGATGCAGGAGTCCCATGGCTGAATGACACCAGTGTTGGGTCTAACAAAATACTTTT
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2AT17TF 753 0 0
TTTGGGTTGTAGTAGAGGAGGAGATATAAGAGACCTTGAGCTTACACTCTGTTAATGTTT
TCCCACTGTCCTTTGTAAATGTGTCTTGGGGAAGATCATCAACATCAGTGTGTGGAGGAA
CAAGGGTGCTTTGAAGGAGAAACTTGTCTTTGCACTGCATATCTGGAGGATACTCCCTTT
GCGCTTGCAGAGTAACTCGAATGATGCAGGAGTCCCATGGCTGAATGACACCAGTGTTGG
GTCTAACAAAATACTTTTTTGGAGATGTTGTTTTCACCTTGAAAGCAACATAGTTGTCAG
TTTTATTGGCAACTTTAAGATCACAGTAGCTTTGTTTCTCGAGTTCAAAAAGGAATTTGA
GTTCATCAGGTACAATGGAGATGAGTTGGTTCTCGCCAACGCCAGACATTTCCACACACA
ATCAATCTCTACAACTTCGAACCTATACACCACATCCAAATCCAAACCCCTTTTTCAAAC
AATTCCAGATTCTTCTTTTCTTTTCTGAAGAAGAAGAAAACAAAAAACAAAAGGTCACGG
GTCTAACGTTTGATCAGCGAAGAAGCTGCTTTTTTTTTTCTCTCTCTCTCTCTGTGTCTT
CCGAAAATCGCTCTCCTCCTCTGGTTCGGGTTGGTGGTGACCAAGTCACGGGAAATTTTC
TGAAGAGAGAGAGAGAAAACCAAAGCGCTTCGTATAGCGGCCACGTGAAGTCGAAGCAAA
GTTCCTCCGGCGTCGTCTCCGGGAACCACGGGG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 3

CO CL3354Contig1 1581 3 17 U
ACAAGTCGGCGGAGGAGGAGGAGGAGTACAGCGGCTGAGATCCGCAAGACCCACCACAAT
TCACGATTGCGCTCTCTCCGGCGATCTCATATCGTTGCAGAAGCTTCTCAAAGACAACCC
TTCTCTCCTCAACGAACGCGATCCCGTCATGTACCACACGCCACTTCATGTTTCCGCTGG
TAATGGCAATGTTGATATTGTTAAGTATCTCTTAGATTGGCCTGGATCCGATAAAGTTGA
GTTGGAAGCCATGAACACTTATGGTGAAACCCCATTGCACATGGCAGCCAAGAACGGCTG
TAATGAAGCTGCTAAGCTACTCCTTGAGCGTGGTGCTTTTATCGAAGCCAAAGCCAGCAA
CGGTATGACACCATTGCATCTTGCCGTATGGTATTCTATTACCCCCAAAGACATCTCTAC
TGTTAAGACATTGCTCGATAATAACGCTGATTGCAGCGCTAAAGATAACGAAGGGATGAC
TCCTTTGGACCATCTACCACAAGGACAGAGCAGCGAGAAGTTGCGTGAACTGTTGCGTTG
GTTTCTCCAAGAGCAGAGGAAAAAAAGCGCCCTAGAGTCTTGCGGTAAGACCAAAGCCAA
GATGGAACTACTCGAGGAAGAGTTGTCCAATATCGTGGGACTAAACGAGCTCAAGACACA
GCTGAGGAAATGGGCTAAAGGAATGCTTTTAGATGAGAGGCGTAGGGCTCTTGGAATGAA
CATTGGTACTCGAAGGCCTCCGCATATGGCGTTTCTTGGAAACCCTGGGACTGGTAAAAC
CATGGTTGCTCGAGTTCTCGGGAAGTTGCTTCACACTGTTGGAATCTTACCAACCGATAA
GGTAACAGAAGTTCAGCGCACAGACTTGGTTGGTGAGTTTGTCGGTCATACAGGGCCAAA
GACCAGGAGAAAGATCCAAGAAGCTGAGGGAGGAATCCTCTTTGTGGATGAAGCATACAG
GTTGATCCCAATGCAAAAGGCAGACGACAAGGACTACGGTCTAGAAGCTCTGGAAGAAAT
AATGTCGGTCATGGACACGGGGAAGATCGTGGTGATATTCGCGGGATACAGCGAGCCAAT
GAAGCGTGTGATTGCATCTAACGAAGGGTTTCGCAGAAGGGTCACAAAGTTTTTCAACTT
CAGCGACTTCAGTGCAAAGGAACTGGCGCAGATACTTCACATCAAGATGAACAGCCAGGG
AGAGGACACTTTTTTCTATGGTTTCAAGTTGCATGAGTCTTGCACCCTGCAGGAGATAGC
TTCAGTGATCGAGAGAGAGACAACCGAGAAGAAGAGGAAGGAGATGAACGGAGGGTTGGT
GGACACGTTGCTGGTTAACGCAAGGGAGAATCTTGATTTCCGACTTAGCTTTGATTGTGT
TGACACTGAAGAGATTTGTACCATCAGGTTGGAGGATTTAGAGGCTGGTCTTCGTGTTTT
CTCGCAGTGAGAAGATTAGAGATTCAATATCCTGAAAAATGGCCCGAGTATTGGTTAGTA
TTACAAAATTGTACTGATTCAATTCTTTACATATCATATTCTTTATGTTTTGCAACTCTA
TAGATCTTACAGGAGGGAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI68TF U 1
AF RR2DS39TF U 320
AF RR2CI68JQ C 939
BS 1 565 RR2CI68TF
BS 566 566 RR2DS39TF
BS 567 636 RR2CI68TF
BS 637 637 RR2DS39TF
BS 638 651 RR2CI68TF
BS 652 652 RR2DS39TF
BS 653 666 RR2CI68TF
BS 667 667 RR2DS39TF
BS 668 680 RR2CI68TF
BS 681 681 RR2DS39TF
BS 682 690 RR2CI68TF
BS 691 691 RR2DS39TF
BS 692 695 RR2CI68TF
BS 696 979 RR2DS39TF
BS 980 980 RR2CI68JQ
BS 981 1008 RR2DS39TF
BS 1009 1581 RR2CI68JQ

RD RR2CI68TF 695 0 0
ACAAGTCGGCGGAGGAGGAGGAGGAGTACAGCGGCTGAGATCCGCAAGACCCACCACAAT
TCACGATTGCGCTCTCTCCGGCGATCTCATATCGTTGCAGAAGCTTCTCAAAGACAACCC
TTCTCTCCTCAACGAACGCGATCCCGTCATGTACCACACGCCACTTCATGTTTCCGCTGG
TAATGGCAATGTTGATATTGTTAAGTATCTCTTAGATTGGCCTGGATCCGATAAAGTTGA
GTTGGAAGCCATGAACACTTATGGTGAAACCCCATTGCACATGGCAGCCAAGAACGGCTG
TAATGAAGCTGCTAAGCTACTCCTTGAGCGTGGTGCTTTTATCGAAGCCAAAGCCAGCAA
CGGTATGACACCATTGCATCTTGCCGTATGGTATTCTATTACCCCCAAAGACATCTCTAC
TGTTAAGACATTGCTCGATAATAACGCTGATTGCAGCGCTAAAGATAACGAAGGGATGAC
TCCTTTGGACCATCTACCACAAGGACAGAGCAGCGAGAAGTTGCGTGAACTGTTGCGTTG
GTTTCTCCAAGAGCAGAGGAAAAAA*GCGCCCTAGAGTCTTGCGGTAAGACCAAAGCCAA
GATGGAACTACTCGAGGAAGAGTTGTCCAATATCGTTGGACTAAACGAGCTGAAGACACA
GCTGAG*AAATGGGCTAAAG*AATGCTTTTGGATG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2DS39TF 691 0 0
G
TCCTTGAGCGTGGTGCTTTTATCGAAGCCAAAGCCAGCAACGGTATGACACCATTGCATC
TTGCGGTTTGGTATTCTATTACCTCCAAAGACATCTCTACTGTTAAGACATTGCTGGATA
ATAACGCTGATTGCAGCGCTAAAGATAACGAAGGGATGACTCCTTTGGACCATCTACCAC
AAGGACAGAGCAGCGAGAAGTTGCGTGAACTGTTGCGTTGGTTTCTCCAAGAGCAGAGGA
AAAAAAGCGCCCTAGAGTCTTGCGGTAAGACCAAAGCCAAGATGGATCTACTCGAGGAAG
AGTTGTCCAATATCGTGGGACTAAACGAGCTCAAGACACAGCTGAGGAAATGGGCTAAAG
GAATGCTTTTAGATGAGAGGCGTAGGGCTCTTGGAATGAACATTGGTACTCGAAGGCCTC
CGCATATGGCGTTTCTTGGAAACCCTGGGACTGGTAAAACCATGGTTGCTCGAGTTCTCG
GGAAGTTGCTTCACACTGTTGGAATCTTACCAACCGATAAGGTAACAGAAGTTCAGCGCA
CAGACTTGGTTGGTGAGTTTGTCGGTCATACAGGGCCAAAGACCAGGAGAAAGATCCAAG
AAGCTGAGGGAGGAATCCTCTTTGTGGATGAAGCATACAGGTTGATCCCAATGCAAAAG*
CAGACGACAAGGACTACGGTCTAGAAGC
CC

QA 2 689 2 689
DS 

RD RR2CI68JQ 643 0 0
TCTTTGTGGATGAAGCATACAGGTTGATCCCAATGCAAAAGGCAGACGACAAGGACTACG
GTCTAGAAGCTCTGGAAGAAATAATGTCGGTCATGGACACGGGGAAGATCGTGGTGATAT
TCGCGGGATACAGCGAGCCAATGAAGCGTGTGATTGCATCTAACGAAGGGTTTCGCAGAA
GGGTCACAAAGTTTTTCAACTTCAGCGACTTCAGTGCAAAGGAACTGGCGCAGATACTTC
ACATCAAGATGAACAGCCAGGGAGAGGACACTTTTTTCTATGGTTTCAAGTTGCATGAGT
CTTGCACCCTGCAGGAGATAGCTTCAGTGATCGAGAGAGAGACAACCGAGAAGAAGAGGA
AGGAGATGAACGGAGGGTTGGTGGACACGTTGCTGGTTAACGCAAGGGAGAATCTTGATT
TCCGACTTAGCTTTGATTGTGTTGACACTGAAGAGATTTGTACCATCAGGTTGGAGGATT
TAGAGGCTGGTCTTCGTGTTTTCTCGCAGTGAGAAGATTAGAGATTCAATATCCTGAAAA
ATGGCCCGAGTATTGGTTAGTATTACAAAATTGTACTGATTCAATTCTTTACATATCATA
TTCTTTATGTTTTGCAACTCTATAGATCTTACAGGAGGGAGAA

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 3

CO CL3355Contig1 961 3 9 U
CTTGTCCCAGTCCCTTTGTTTCCGAGAGAGATGTCTGTCTTCGATGATTCTTTCGTTATA
CTCGGAGACGATGCATCTGAGTCTGTTCCTGTCTCAGGCTCCTTCCACACCACTACTGAT
CATCACTCCTTCTCACACCACGTAGATGACTCCATCGACGATGTTTTCGCGGCGCCGTCT
TCCGACTACGGAGCTTACACTAACGGAGACGACGTCTTCGGATCCAACGGGGGACACGAC
GGTCCCATCTTGCCACCGCCCTCGGGGATGGAATCTGATGAAGGGTATGCTCTTAGGGAG
TGGAGAAGACACAATGCAGATCTCCTTGAGGAGAAGGAGAAAAAGGAAAAGGAGTTGCGG
AACCAAATCATTGAAGAGGCTAACCAATTCAAAGAGGATTTCCATAAGAAGAGGGAACTA
ACTTGTGAAAACAACAAAGCAGCTAATAGGGAGAAGGAAAAGCTGTATGTGGAGACCCAA
GAGAAGTTCTACGCGGAAGCCAGCAAGAACTACTGGAAGGCAATAGCAGAGCTTGTTCCT
AAGGAAGTTCCAACTATAGAGAAAAGAAGAGGGAAGAAAGAGCAAGACCCTAAGAAGCCA
ACTATCTCTGTCATTCAAGGTCCAAAGCCCGGTAAGCCAACCGATCTCGCTAGAATGAGA
CAGATATTGCTCAAGCTCAAACAGAACCCACCAGCTCACCTGAAACTCGCTCCTCAACCT
CCACCAGAGGCGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTACTACTACTCCTACTCCTCCAAAGAAT
GTTCCTGAAACCAAGCCCACCGAAGCAGTTGCTGCTGCTTAAGAAACCCTCTTTGGTTTT
GTTTTCTTTCATTTGCTTACATCTATGTGATTCTCTCTTTGCATTTCATTATGTGTGTGT
GATATGAACAGCTTATGTACTATCGGATTATACTCTATGACATTCATGTTTGAATTCAAA
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2FN37TF U 1
AF RR2A760TF U 89
AF RR2A760JQ C 212
BS 1 105 RR2FN37TF
BS 106 106 RR2A760TF
BS 107 230 RR2FN37TF
BS 231 231 RR2A760TF
BS 232 265 RR2FN37TF
BS 266 266 RR2A760TF
BS 267 316 RR2FN37TF
BS 317 552 RR2A760TF
BS 553 961 RR2A760JQ

RD RR2FN37TF 316 0 0
CTTGTCCCAGTCCCTTTGTTTCCGAGAGAGATGTCTGTCTTCGATGATTCTTTCGTTATA
CTCGGAGACGATGCATCTGAGTCTGTTCCTGTCTCAGGCTCCTTCGACACCACTACTGAT
CATCACTCCTTCTCACACCACGTAGATGACTCCATCGACGATGTTTTCGCGGCGCCGTCT
TCCGACTACGGAGCTTACACTAACGGAGACGACGTCTTCGGATCCAACGGTGGACACGAC
GGTCCCATCTTGCCACCGCCCTCGGAGATGGAATCTGATGAAGGGTATGCTCTTAGGGAG
TGGAGAAGACACAATG

QA 1 316 1 316
DS 

RD RR2A760TF 464 0 0
G
TGTCTCAGGCTCCTTCCACACCACTACTGATCATCACTCCTTCTCACACCACGTAGATGA
CTCCATCGACGATGTTTTCGCTGCGCCGTCTTCCGACTACGGAGCTTACACTAACGGAGA
CGACGTCTTCGGATCCAACGGGGGACACGACGGTCCCATCTTGCCACCGCCCTCGGGGAT
GGAATCTGATGAAGGGTATGCTCTTAGGGAGTGGAGAAGACACAATGCAGATCTCCTTGA
GGAGAAGGAGAAAAAGGAAAAGGAGTTGCGGAACCAAATCATTGAAGAGGCTAACCAATT
CAAAGAGGATTTCCATAAGAAGAGGGAACTAACTTGTGAAAACAACAAAGCAGCTAATAG
GGAGAAGGAAAAGCTGTATGTGGAGACCCAAGAGAAGTTCTACGCGGAAGCCAGCAAGAA
CTACTGGAAGGCAATAGCAGAGCTTGTTCCTAAGGAAGTTCCA

QA 2 464 2 464
DS 

RD RR2A760JQ 750 0 0
ACGTCTTCGGATCCAACGGGGGACACGACGGTCCCATCTTGCCACCGCCCTCGGGGATGG
AATCTGATGAAGGGTATGCTCTTAGGGAGTGGAGAAGACACAATGCAGATCTCCTTGAGG
AGAAGGAGAAGAAGGAAAAGGAGTTGCGGAACCAAATCATTGAAGAGGCTAACCAATTCA
AAGAGGATTTCCATAAGAAGAGGGAACTAACTTGTGAAAACAACAAAGCAGCTAATAGGG
AGAAGGAAAAGCTGTATGTGGAGACCCAAGAGAAGTTCTACGCGGAAGCCAGCAAGAACT
ACTGGAAGGCAATAGCAGAGCTTGTTCCTAAGGAAGTTCCAACTATAGAGAAAAGAAGAG
GGAAGAAAGAGCAAGACCCTAAGAAGCCAACTATCTCTGTCATTCAAGGTCCAAAGCCCG
GTAAGCCAACCGATCTCGCTAGAATGAGACAGATATTGCTCAAGCTCAAACAGAACCCAC
CAGCTCACCTGAAACTCGCTCCTCAACCTCCACCAGAGGCGGCTGCTGCTGCTGCTGCTG
CTACTACTACTCCTACTCCTCCAAAGAATGTTCCTGAAACCAAGCCCACCGAAGCAGTTG
CTGCTGCTTAAGAAACCCTCTTTGGTTTTGTTTTCTTTCATTTGCTTACATCTATGTGAT
TCTCTCTTTGCATTTCATTATGTGTGTGTGATATGAACAGCTTATGTACTATCGGATTAT
ACTCTATGACATTCATGTTTGAATTCAAAG

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 3

CO CL3356Contig1 1091 3 9 U
GGGGGGGGACCCCAAGAAAAACTCCTCTTCTTTTAGGCAAGTTTTCTATCAGCATTTTTC
TTTTATATCTATCTTTGTGTGATCTCTACTTTACAGCATGGCTATGAAGACTGTCTTTGT
TGTTTCTATGCTTCTCCTTGCCGTCTATTTGCAAACAACACTTGGGAACGATGTCAAGTG
CGAGAATTTGGACAAAGATACGTGCGCATTTGCGGTCTCCTCGACCGGAAAACGGTGCGT
TCTGGAACAGAGCATTAAGAGGAGTGGAATCGAGACGTACACGCGTCGCTCATCGGAGAT
AGAAGCAGACAAGGTCACAAACATTATCGAATCAGACGAGTGCATCAAAGCGTGTGGTCT
AGACCGGAAATCTTTGGGTATATCCTCGGACGCACTATTGGAATCCCGGTTTACTCAGAA
ACTATGCTCATTTAGATGCTTAACCCAATGCCCTAACGTCGTCGATCTCTTCTTCAACCT
TGCTGCTGGCGAAGGTGTATATTTGCCAAAGTTATGTGAATCACAAGAAGGACAATCAAG
AAGAGCAATGTCGGAACTTAGGAGCTTGGGAATTGCGATGGACACCCTTGGACCGGTTGG
ACCTGTCAGGTTGGGCGAGATGGCACCAGAGCCAGCTACTTCAATGGACTACATGCCTTA
CGCGCCGGCACCAGAGCCAGCTACTCCAACGGGCCACATGTCGTACGCGCCCGCCCCTGC
ATCGTATTAATTAATGCAAGCCAGCATGGAGAGAAGACGTACCATGTCTCTCATGAGAGA
TCCGAAGAGAACAATAAAGAACTTTGTGTTTAGTTTTGATGGTTTTATTACATCGTCTAA
TATGTTTGCTTATTATGTATTTCATAACACACACCAGGATGCATAAGGAGACTGTCAGAG
AGTAGTGCTCGATCTGGTGAATTTATACTTGTAATATCGTATTATATGCTAGTAATGAGT
TTGAGGTTACTGATACCTAGATAATCCTCAAAACTGATAACTCATTTATTTACTATTCTC
TAGCAGAACCCCCCTAGCCCCAAGTATGAGAGTTGTTTTTTACTAAAGTATTAGAATTGT
TTTGTGGGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA01TF U 1
AF RR2G281TF U 11
AF RR2G281JQ C 466
BS 1 283 RR2FA01TF
BS 284 284 RR2G281TF
BS 285 315 RR2FA01TF
BS 316 711 RR2G281TF
BS 712 712 RR2G281JQ
BS 713 762 RR2G281TF
BS 763 763 RR2G281JQ
BS 764 785 RR2G281TF
BS 786 1091 RR2G281JQ

RD RR2FA01TF 315 0 0
GGGGGGGGACCCCAAGAAAAACTCCTCTTCTTTTAGGCAAGTTTTCTATCAGCATTTTTC
TTTTATATCTATCTTTGTGTGATCTCTACTTTACAGCATGGCTATGAAGACTGTCTTTGT
TGTTTCTATGCTTCTCCTTGCCGTCTATTTGCAAACAACACTTGGGAACGATGTCAAGTG
CGAGAATTTGGACAAAGATACGTGCGCATTTGCGGTCTCCTCGACCGGAAAACGGTGCGT
TCTGGAACAGAGCATTAAGAGGAGTGGAATCGAGACGTACACGTGTCGCTCATCGGAGAT
AGAAGCAGACAAGGT

QA 1 315 1 315
DS 

RD RR2G281TF 779 0 0
GG
CAAGAAAAACTCCTCTTCTTTTAGGCAAGTTTTCTATCAGCATTTTTCTTTTATATCTAT
CTTTGTGTGATCTCTACTTTACAGCATGGCTATGAAGACTGTCTTTGTTGTTTCTATGCT
TCTCCTTGCCGTCTATTTGCAAACAACACTTGGGAACGATGTCAAGTGCGAGAATTTGGA
CAAAGATACGTGCGCATTTGCGGTCTCCTCGACCGGAAAACGGTGCGTTCTGGAACAGAG
CATTAAGAGGAGTGGAATCGAGACGTACACGCGTCGCTCATCGGAGATAGAAGCAGACAA
GGTCACAAACATTATCGAATCAGACGAGTGCATCAAAGCGTGTGGTCTAGACCGGAAATC
TTTGGGTATATCCTCGGACGCACTATTGGAATCCCGGTTTACTCAGAAACTATGCTCATT
TAGATGCTTAACCCAATGCCCTAACGTCGTCGATCTCTTCTTCAACCTTGCTGCTGGCGA
AGGTGTATATTTGCCAAAGTTATGTGAATCACAAGAAGGACAATCAAGAAGAGCAATGTC
GGAACTTAGGAGCTTGGGAATTGCGATGGACACCCTTGGACCGGTTGGACCTGTCAGGTT
GGGCGAGATGGCACCAGAGCCAGCTACTTCAATGGACTACATGCCTTACGCGCCGGCACC
AGAGCCAGCTACTCCAACGGGCCACATGTCGTACGCGCC*GCCCCTGCATCGTATTAATT
AATGCAAGCCAGCATGGAGAGAAGACGTAC*ATGTCTCTCATGAGAGATCCGA
GAGA

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR2G281JQ 626 0 0
TCTCTTCTTCAACCTTGCTGCTGGGGAAGGTGTATATTTGCCAAAGTTATGTGAATCACA
AGAAGGACAATCAAGAAGAGCAATGTCGGAACTTAGGAGCTTGGGAATTGCGATGGACAC
CCTTGGACCGGTTGGACCTGTCAGGTTGGGCGAGATGGCACCAGAGCCAGCTACTTCAAT
GGACTACATGCCTTACGCGCCGGCACCAGAGCCAGCTACTCCAACGGGCCACATGTCGTA
CGCGCCCGCCCCTGCATCGTATTAATTAATGCAAGCCAGCATGGAGAGAAGACGTACCAT
GTTTTTCATGAGAGATCCGAAGAGAACAATAAAGAACTTTGTGTTTAGTTTTGATGGTTT
TATTACATCGTCTAATATGTTTGCTTATTATGTATTTCATAACACACACCAGGATGCATA
AGGAGACTGTCAGAGAGTAGTGCTCGATCTGGTGAATTTATACTTGTAATATCGTATTAT
ATGCTAGTAATGAGTTTGAGGTTACTGATACCTAGATAATCCTCAAAACTGATAACTCAT
TTATTTACTATTCTCTAGCAGAACCCCCCTAGCCCCAAGTATGAGAGTTGTTTTTTACTA
AAGTATTAGAATTGTTTTGTGGGCTC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 3

CO CL3357Contig1 1686 3 5 U
GGCTCTGAGAGACCAAAAAAAATAATGGAGATATCAGTTGCTCTAGTAACAGTTTCTTTA
GCTATAGTTGTTGCGTCGTGGTGGACGTGGAGAACTTTAAGGTGGGTTTGGTTTAAACCA
AAGATGCTTGAGAGTTACCTGAGAAGTCAAGGTCTTTCCGGTAGTCCTTACACGCCACTC
ATCGGCGACTTGAAGAGGACTTTTAGCATGGCGATGGAGGCAAGACCCAAACCCATCAAT
CTAAGTGATGATATCTCAACACGTGTCGTGCCTTTTCCCTTGGAAATGCTCAAGACTCAC
GGAAGGACATATTTTACATGGCTTGGAACTATACCAACCATCACTATAATGGACCCTGAG
CTAATCAAGGAAGTGTTCAACAAAGTTTATGATTTCCAGAAGCCACATACCTTCCCTTTA
GGTAACGTGATAGCCAAGGGACTCGCTAACTATGATGGTGATAAATGGGCTAAACACAGA
AGAATCATCAACCCTGCTTTCCATCTTGAGAAGATCAAGAACATGGTACCTGCGTTCCAC
CAGAGCTGCAGCGAGGTTGTTGGAAAGTGGGACAAGATAGTCTCGGAGAAAGGGGTGTCC
TGTGAAGTGGACGTGCGGCCAGGGCTTGTGAGTATGACTGCAGATGTGATCTCTCGTACT
GCTTTTGGTAACAGCTACAAAGAAGGGCAGAGGATATTTGAGCTCCAAGAAGAACTAGCA
CAGCTCATCATACTAGCTGTTCTGAAAGCTTTCATCCCTGGATATCTTTATCTCCCAACA
AAGGGCAATAGAAGGATCAAAGCAGCAGCTAAAGAAATCCAAGTTATACTGAAAGGGATA
GTTAACAAAAGGTTAAGGGCTAGAGAAGCTGGTGAAGCACCAAGCGATGACTTGCTAGGT
ATACTTCTTGAATCTAATTTGGGACAAGCTAAAGGAAATGAGATGAGCACTGAGGATGTG
ATGGAGGAGTGCAAGTTGTTCTATTTCGCCGGGCAAGAGACAACTTCAGTACTTCTTGTC
TGGACAATGGTTTTGTTAAGCCAACACCAAGACTGGCAGGCTCGTGCAAGAGAAGAAGTG
AAGCAAGTTTTTGGCGATAAAGAACCTGATGTAGAAGGCCTTAACCAGCTCAAAGTTATG
ATGATGATACTATATGAGGTTCTTAGGCTATACCCACCAGTAGCTCAGCTGACCAGGGCA
ATTCAAAAAGAGATGAAGCTAGGAGACTTGACACTACCACGCGGCGCTCAGATCAGTTTA
CCTATTCTTCTAGTACATCGTGACACACAGCTATGGGGGGAAGACGCGGCGGAGTTTAAG
CCCGAGAGGTTCAAAGACGGTGTCTCAAAGGCAACAAACGGCAAAGTGTCTTTCTTTCCC
TTTGCGTGGGGACCAAGGATCTGTATTGGTCAGAGTTTTGCTCTGTTGGAGACAAAGATG
GCTCTGGCTTTGATTCTACAGAGATTCTCATTTGAGTTATCTCCTTCCTATGTTCATGCG
CCTTACACAGTCATCACACTTCACCCGCAGTTCGGTGCTCATCTTATCTTGCACAAGCTA
TAGTTCTGTACGATGTTTGTCCAATGAACTTATCATCCACAGTGGAAGCTGGTCTAGGTC
ATAACACAACTCAATCTTGTTATGTATTCAAGTCAGAACAGTGTCTTAAAAAACCCTTTG
AGTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2G744TF U 1
AF RR2B287TF U 342
AF RR2B287JQ C 831
BS 1 615 RR2G744TF
BS 616 616 RR2B287TF
BS 617 682 RR2G744TF
BS 683 1113 RR2B287TF
BS 1114 1686 RR2B287JQ

RD RR2G744TF 682 0 0
GGCTCTGAGAGACCAAAAAAAATAATGGAGATATCAGTTGCTCTAGTAACAGTTTCTTTA
GCTATAGTTGTTGCGTCGTGGTGGACGTGGAGAACTTTAAGGTGGGTTTGGTTTAAACCA
AAGATGCTTGAGAGTTACCTGAGAAGTCAAGGTCTTTCCGGTAGTCCTTACACGCCACTC
ATCGGCGACTTGAAGAGGACTTTTAGCATGGCGATGGAGGCAAGACCCAAACCCATCAAT
CTAAGTGATGATATCTCAACACGTGTCGTGCCTTTTCCCTTGGAAATGCTCAAGACTCAC
GGAAGGACATATTTTACATGGCTTGGAACTATACCAACCATCACTATAATGGACCCTGAG
CTAATCAAGGAAGTGTTCAACAAAGTTTATGATTTCCAGAAGCCACATACCTTCCCTTTA
GGTAACGTGATAGCCAAGGGACTCGCTAACTATGATGGTGATAAATGGGCTAAACACAGA
AGAATCATCAACCCTGCTTTCCATCTTGAGAAGATCAAGAACATGGTACCTGCGTTCCAC
CAGAGCTGCAGCGAGGTTGTTGGAAAGTGGGACAAGATAGTCTCGGAGAAAGGGGTGTCC
TGTGAAGTGGACGTGTGGCCAGGGCTTGTGAGTATGACTGCAGATGTGATCTCTCGTACT
GCTTTTGGTAACAGCTACAAAG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2B287TF 772 0 0
GGA
TATAATGGACCCTGAGCTAATCAAGGAAGTGTTCAACAAAGTTTATGATTTCCAGAAGCC
ACATACCTTCCCTTTAGGTAACGTGATAGCCAAGGGACTCGCTAACTATGATGGTGATAA
ATGGGCTAAACACAGAAGAATCATCAACCCTGCTTTCCATCTTGAGAAGATCAAGAACAT
GGTACCTGCGTTCCACCAGAGCTGCAGCGAGGTTGTTGGAAAGTGGGACAAGATAGTCTC
GGAGAAAGGGGTGTCCTGTGAAGTGGACGTGCGGCCAGGGCTTGTGAGTATGACTGCAGA
TGTGATCTCTCGTACTGCTTTTGGTAGCAGCTACAAAGAAGGGCAGAGGATATTTGAGCT
CCAAGAAGAACTAGCACAGCTCATCATACTAGCTGTTCTGAAAGCTTTCATCCCTGGATA
TCTTTATCTCCCAACAAAGGGCAATAGAAGGATCAAAGCAGCAGCTAAAGAAATCCAAGT
TATACTGAAAGGGATAGTTAACAAAAGGTTAAGGGCTAGAGAAGCTGGTGAAGCACCAAG
CGATGACTTGCTAGGTATACTTCTTGAATCTAATTTGGGACAAGCTAAAGGAAATGAGAT
GAGCACTGAGGATGTGATGGAGGAGTGCAAGTTGTTCTATTTCGCCGGGCAAGAGACAAC
TTCAGTACTTCTTGTCTGGACAATGGTTTTGTTAAGCCAACACCAAGACTGGCAGGCTCG
TGCAAGAGAAGAAGTGAAGCAAGTTTTTGGCGATAAAGAACCTGATGTA

QA 4 772 4 772
DS 

RD RR2B287JQ 856 0 0
GAAAGGGATAGTTAACAAAAGGTTAAGGGCTAGAGAAGCTGGTGAAGCACCAAGCGATGA
CTTGCTAGGTATACTTCTTGAATCTAATTTGGGACAAGCTAAAGGAAATGAGATGAGCAC
TGAGGATGTGATGGAGGAGTGCAAGTTGTTCTATTTCGCCGGGCAAGAGACAACTTCAGT
ACTTCTTGTCTGGACAATGGTTTTGTTAAGCCAACACCAAGACTGGCAGGCTCGTGCAAG
AGAAGAAGTGAAGCAAGTTTTTGGCGATAAAGAACCTGATGTAGAAGGCCTTAACCAGCT
CAAAGTTATGATGATGATACTATATGAGGTTCTTAGGCTATACCCACCAGTAGCTCAGCT
GACCAGGGCAATTCAAAAAGAGATGAAGCTAGGAGACTTGACACTACCACGCGGCGCTCA
GATCAGTTTACCTATTCTTCTAGTACATCGTGACACACAGCTATGGGGGGAAGACGCGGC
GGAGTTTAAGCCCGAGAGGTTCAAAGACGGTGTCTCAAAGGCAACAAACGGCAAAGTGTC
TTTCTTTCCCTTTGCGTGGGGACCAAGGATCTGTATTGGTCAGAGTTTTGCTCTGTTGGA
GACAAAGATGGCTCTGGCTTTGATTCTACAGAGATTCTCATTTGAGTTATCTCCTTCCTA
TGTTCATGCGCCTTACACAGTCATCACACTTCACCCGCAGTTCGGTGCTCATCTTATCTT
GCACAAGCTATAGTTCTGTACGATGTTTGTCCAATGAACTTATCATCCACAGTGGAAGCT
GGTCTAGGTCATAACACAACTCAATCTTGTTATGTATTCAAGTCAGAACAGTGTCTTAAA
AAACCCTTTGAGTAGT

QA 1 856 1 856
DS 



AS 1 2

CO CL3358Contig1 530 2 1 U
GGGGACCCACCAGAACCAGAGAGGTCATAGAGGTGCTCGAAGAGGTCATTCCAATGGCCC
CCGAGGAGGTCGAGGTGGTGGCGGTGGAGGCTATTCGAATGGGCGGTATGAATCTTATGA
TAACGCCGGTGGAAACGGTCACCAAAGGAGCTACTACAACAACAGAGGAAGGGGACGTGG
TGGTGGTGGAGGAAATGGTCATTCATACAACAACCACCAAGACTCAAATGTAACTGTTGC
GTCTTAGCCTTTTTAGCTTTTGGGTTGCGTATCTTTGTTTTCCGCTATAACTCATATAAA
GCCTTATCTCGGGGTTTGGAACCTTTGTCATTGCTCTTTTGTTTATGTATGAACTTTTGT
TTTTTTTCTTTTGTGGCCGTCAGTCAATATGATCCTTTGTTCTCTCCATTATAGCCATTT
CTGATTGTCAAAAATACTTTGCGTAGGCAGAGACGTGAGCCCATGTGTGGGGTGTAGTGC
TTTTGTAACTAGTTGTTTAAATAAAGGAAACGAAACTATAGTCGAAGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FX08TF U 1
AF RR2FX08JQ C 165
BS 1 530 RR2FX08TF

RD RR2FX08TF 530 0 0
GGGGACCCACCAGAACCAGAGAGGTCATAGAGGTGCTCGAAGAGGTCATTCCAATGGCCC
CCGAGGAGGTCGAGGTGGTGGCGGTGGAGGCTATTCGAATGGGCGGTATGAATCTTATGA
TAACGCCGGTGGAAACGGTCACCAAAGGAGCTACTACAACAACAGAGGAAGGGGACGTGG
TGGTGGTGGAGGAAATGGTCATTCATACAACAACCACCAAGACTCAAATGTAACTGTTGC
GTCTTAGCCTTTTTAGCTTTTGGGTTGCGTATCTTTGTTTTCCGCTATAACTCATATAAA
GCCTTATCTCGGGGTTTGGAACCTTTGTCATTGCTCTTTTGTTTATGTATGAACTTTTGT
TTTTTTTCTTTTGTGGCCGTCAGTCAATATGATCCTTTGTTCTCTCCATTATAGCCATTT
CTGATTGTCAAAAATACTTTGCGTAGGCAGAGACGTGAGCCCATGTGTGGGGTGTAGTGC
TTTTGTAACTAGTTGTTTAAATAAAGGAAACGAAACTATAGTCGAAGTGG

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2FX08JQ 366 0 0
GAGGAAGGGGACGTGGTGGTGGTGGAGGAAATGGTCATTCATACAACAACCACCAAGACT
CAAATGTAACTGTTGCGTTTTAGCCTTTTTAGCTTTTGGGTTGCGTATCTTTGTTTTCCG
CTATAACTCATATAAAGCCTTATCTCGGGGTTTGGAACCTTTGTCATTGCTCTTTTGTTT
ATGTATGAACTTTTGTTTTTTTTCTTTTGTGGCCGTCAGTCAATATGATCCTTTGTTCTC
TCCATTATAGCCATTTCTGATTGTCAAAAATACTTTGCGTAGGCAGAGACGTGAGCCCAT
GTGTGGGGTGTAGTGCTTTTGTAACTAGTTGTTTAAATAAAGGAAACGAAACTATAGTCG
AAGTGG

QA 1 366 1 366
DS 



AS 1 3

CO CL3359Contig1 681 3 2 U
GGCTAGCTCTCAGACTTCCTAACAAGATCAGATCTGAATCTCTCTGCTCCACTCATTGAA
TTCTTTGGGAAATATGTCAACTTTCTTGATGAGGATACTTCTTTCTTTGCTCGTCTTAGC
ATTGACAATTTCTCAACAGTCAGAGGCAGAGTCGGAACAGTGGTGCATAGCAGATGAACA
AACGCCAGACGATGAGTTGCAAGCAGCCTTAGACTGGGCTTGCTCGAAAGGCGGAGCAGA
CTGCAGCAAAATGCAGCAGGAAAACCAGCCATGCTTCTTGCCCAACACAATCAGGGATCA
TGCCTCTGTTGCCTTTAACAGTTATTACCAAACTTATAAGCACAAAGGTGGCTCTTGTTA
CTTCAAAGGCGCTCCATGATCACTGAGCTTGACCCAAGTCATGGCTCTTGCCACTATGAG
TATAAACCATGATTTAAATGAGGCAGCTAAGACGAGATAAGCAGCAAGAATAAGCAGATA
TGATTTTGTATTGATACTTTTTTCTCACTATGTAATGTTTTCATCCCAAAGAAGTATTCA
TGTAATATGCCACCCATATACTGTTCTCTCATTACTCTTCAGTTTCGGTTAAAAACACTG
AGCTTTCTTCAGAAGCTAATGGAACCAACTTGTGTGTATTGAGGTTTTCGATTGAATCAA
ACAAACTGTTACTGTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2EV03TF U 378
AF RR2ER15TF U 1
AF RR2ER15JQ C 308
BS 1 676 RR2ER15TF
BS 677 681 RR2ER15JQ

RD RR2EV03TF 169 0 0
GATCACTGAGCTTGACCCAAGTCATGGCTCTTGCCAGTATGAGTATAAACCATGATTTAA
ATGAGGCAGCTAAGACGAGGTATGCAGCAAGAATAAGCAGATATGATTTTGTATTGATAC
TTTTTTCTCACTATGTAATGTTTTCATCCCAAAGAAGTATTCATGTAAT

QA 1 169 1 169
DS 

RD RR2ER15TF 676 0 0
GGCTAGCTCTCAGACTTCCTAACAAGATCAGATCTGAATCTCTCTGCTCCACTCATTGAA
TTCTTTGGGAAATATGTCAACTTTCTTGATGAGGATACTTCTTTCTTTGCTCGTCTTAGC
ATTGACAATTTCTCAACAGTCAGAGGCAGAGTCGGAACAGTGGTGCATAGCAGATGAACA
AACGCCAGACGATGAGTTGCAAGCAGCCTTAGACTGGGCTTGCTCGAAAGGCGGAGCAGA
CTGCAGCAAAATGCAGCAGGAAAACCAGCCATGCTTCTTGCCCAACACAATCAGGGATCA
TGCCTCTGTTGCCTTTAACAGTTATTACCAAACTTATAAGCACAAAGGTGGCTCTTGTTA
CTTCAAAGGCGCTCCATGATCACTGAGCTTGACCCAAGTCATGGCTCTTGCCACTATGAG
TATAAACCATGATTTAAATGAGGCAGCTAAGACGAGATAAGCAGCAAGAATAAGCAGATA
TGATTTTGTATTGATACTTTTTTCTCACTATGTAATGTTTTCATCCCAAAGAAGTATTCA
TGTAATATGCCACCCATATACTGTTCTCTCATTACTCTTCAGTTTCGGTTAAAAACACTG
AGCTTTCTTCAGAAGCTAATGGAACCAACTTGTGTGTATTGAGGTTTTCGATTGAATCAA
ACAAACTGTTACTGTT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2ER15JQ 374 0 0
GTTGCCTTTAACAGTTATTACCAAACTTATAAGCACAAAGGTGGCTCTTGTTACTTCAAA
GGCGCTCCATGATCACTGAGCTTGACCCAAGTCATGGCTCTTGCCACTATGAGTATAAAC
CATGATTTAAATGAGGCAGTTAAGACGAGATAAGCAGCAAGAATAAGCAGATATGATTTT
GTATTGATACTTTTTTCTCACTATGTAATGTTTTCATCCCAAAGAAGTATTCATGTAATA
TGCCACCCATATACTGTTCTCTCATTACTCTTCAGTTTCGGTTAAAAACACTGAGCTTTT
TTCAGAAGCTAATGGAACCAACTTGTGTGTATTGAGGTTTTCGATTGAATCAAACAAACT
GTTACTGTTTTTCC

QA 1 374 1 374
DS 



AS 1 2

CO CL3360Contig1 1259 2 6 U
GGCTTTCGATCGCATGCTTCTTGGTGTCGAGCATCCTTATACCTTCAATCCTTATCATAA
AGCTGTTAGAGAACCATTTGACTACTACCAGTTTGTTCAGACCTACATCCGTCCCCTCAT
TGATTTCAAAAATTCTTACGTTGGGAATGTCTATCTTTTCTCTGAGCTGGAAGACAAGAT
TCGGCAGGGACACAATATCTTGTTTATATCAAATCATCAAAGTGAAGCTGATCCCGCTGT
CATTTCACTCTTACTTGAAGCACAATGTCCATACATAGGAGAGAACATTAAATGTGTAGC
TGGTGATAGAGTCATCACTGATCCTCTATGTAAGCCGTTCAGTATGGGAAGGAATCTCAT
ATGTGTTTACTCGAAAAAGCACATGAATGATGATCCTGAGCTTGTTGATATGAAAAGAAA
AGCAAACACACGAAGCTTAAAGGAGATGTCTACACTGCTAAGGTCTGGCTCCCAAGTTAT
ATGGATTGCACCAAGCGGTGGAAGGGACCGCAAGGATCCTTCTACAGGGGAATGGTTTCC
TGCACCCTTTGATTCTTCGTCTGTGGACAACATGAGAAGACTGGTTGAACATTCTGGTGC
TCCTGGACACATCTATCCAATGTCTTTGCTTTGCTATGGCATCATGCCTCCTCCACCCAA
AGTTGAGAAAGAAATTGGAGAGAAAAGATTAGTTGGGTTTCATGGTACCGGACTATCAAT
AGCTCCTGAGATCAGTTTCTCGGATGTCACGGCACACTGCAACAACCCTAACGAGGCGAA
AGAAGCATACAGCCAAGCTATGCACAAGTCGGTCAATGAACAATACAAGACTCTAAACTC
TGCAATCAATCAGGGAAGAGGAATAGGAGCATCAACTTCCACGGTGTCTTTGTCACAGCC
CTGGAATTAGTCTCTCAAGTTTTAGGGATAGACAATCAATCGAAACATAACCTCACACGC
TATCTTCAAAAATTATATTCCAAAGCCTCTCTCTCCCCAGAAAACAAAGAAACAGATTAA
AAAAAAAAGATCAACTGTATCGATGTTAGAATCCACGTTGCAAGGAGAAGAGTGACGTTT
AAGCCTTCCCCATACAACCGATTATATTATTCAGTATGATCATAGTTACGCTTTTTTTTT
TAGGAACCTTAATTCGAAATTTAGAATATTAAATACACTGAATCTAATTTTACATAAAAT
ACCCTCGTTTTACAGAGCTTCTGGCCTCTTTTTTTTCCAAATAGTTATGTGATTTAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B351TF U 1
AF RR2DP05TF U 704
BS 1 802 RR2B351TF
BS 803 803 RR2DP05TF
BS 804 827 RR2B351TF
BS 828 828 RR2DP05TF
BS 829 844 RR2B351TF
BS 845 1259 RR2DP05TF

RD RR2B351TF 848 0 0
GGCTTTCGATCGCATGCTTCTTGGTGTCGAGCATCCTTATACCTTCAATCCTTATCATAA
AGCTGTTAGAGAACCATTTGACTACTACCAGTTTGTTCAGACCTACATCCGTCCCCTCAT
TGATTTCAAAAATTCTTACGTTGGGAATGTCTATCTTTTCTCTGAGCTGGAAGACAAGAT
TCGGCAGGGACACAATATCTTGTTTATATCAAATCATCAAAGTGAAGCTGATCCCGCTGT
CATTTCACTCTTACTTGAAGCACAATGTCCATACATAGGAGAGAACATTAAATGTGTAGC
TGGTGATAGAGTCATCACTGATCCTCTATGTAAGCCGTTCAGTATGGGAAGGAATCTCAT
ATGTGTTTACTCGAAAAAGCACATGAATGATGATCCTGAGCTTGTTGATATGAAAAGAAA
AGCAAACACACGAAGCTTAAAGGAGATGTCTACACTGCTAAGGTCTGGCTCCCAAGTTAT
ATGGATTGCACCAAGCGGTGGAAGGGACCGCAAGGATCCTTCTACAGGGGAATGGTTTCC
TGCACCCTTTGATTCTTCGTCTGTGGACAACATGAGAAGACTGGTTGAACATTCTGGTGC
TCCTGGACACATCTATCCAATGTCTTTGCTTTGCTATGGCATCATGCCTCCTCCACCCAA
AGTTGAGAAAGAAATTGGAGAGAAAAGATTAGTTGGGTTTCATGGTACCGGACTATCAAT
AGCTCCTGAGATCAGTTTCTCGGATGTCACGGCACACTGCAACAACCCTAACGAGGCGAA
AGAAGCATACAGCCAAGCTATGTACAAGTCGGTCAATGAACAATACA*GACTCTAAACTC
TGCA
TCAA

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR2DP05TF 556 0 0
GGTACCGGACTATCAATAGCTCCTGAGATCAGTTTCTCGGATGTCACGGCACACTGCAAC
AACCCTAACGAGGCGAAAGAAGCATACAGCCAAGCTATGCACAAGTCGGTCAATGAACAA
TACAAGACTCTAAACTCTGCAATCAATCAGGGAAGAGGAATAGGAGCATCAACTTCCACG
GTGTCTTTGTCACAGCCCTGGAATTAGTCTCTCAAGTTTTAGGGATAGACAATCAATCGA
AACATAACCTCACACGCTATCTTCAAAAATTATATTCCAAAGCCTCTCTCTCCCCAGAAA
ACAAAGAAACAGATTAAAAAAAAAAGATCAACTGTATCGATGTTAGAATCCACGTTGCAA
GGAGAAGAGTGACGTTTAAGCCTTCCCCATACAACCGATTATATTATTCAGTATGATCAT
AGTTACGCTTTTTTTTTTAGGAACCTTAATTCGAAATTTAGAATATTAAATACACTGAAT
CTAATTTTACATAAAATACCCTCGTTTTACAGAGCTTCTGGCCTCTTTTTTTTCCAAATA
GTTATGTGATTTAAAA

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 3

CO CL3361Contig1 581 3 3 U
CCGACCAAAAAAAAAAGTAAAATAACAGGAACATGAAGAGATTCAGCAACGACTACATAC
GATCCACGACAATAAAAACGAGCACATGAGAAGACAAACTCCATTTTAAACTGACAACTG
AGTGAATCCATGACCACGGACGAGTAACGAAGTTCGAACTTGGCATCCCCACAATATATA
AGTAAAAATATGAACCAATGAGAGAAGAGACAACGAGAGAGACGACCAAAGGTAAATTTT
ATTGAAGCTTATTCCTCAAACTCATGCATGTGATCCAAAAAATAGTTTGCAGCCAACTCT
TCGTTCTTGTTGCACGCAAAGAACACTTCCAAAACCAATGCTCTCTCAAATCCCATCGCT
TCCAGCCTTTCAATTGCGTCACGTTCCTCAGGTGTGACTTGAATCGCCTGTGGTTGTGGC
ATTCCTTCCCCGAAAAGGTTGGCGCCTTCTGCCCCTCCTTCAACGGGTTCATTGATTAAA
CGTAAGAAATCAGCTTGATGTTCTTGAATCAACCGCATCAAGTTTGGGTTTTGCTTTCCC
AGTTCCTGAAGCATAGGCTGCAGAACTTGAGGGTTTGCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG77JQB U 296
AF RR2GR11JQ U 44
AF RR2D021JQ U 1
BS 1 77 RR2D021JQ
BS 78 78 RR2GR11JQ
BS 79 581 RR2D021JQ

RD RR2GG77JQB 130 0 0
ACTCTTCGTTCTTGTTGCACGCAAAGAACACTTCCAAAACCAATGCTCTCTCAAATCCCA
TCGCTTCCATCCTTTCAATTGCTTCACGTTCCTCAGGTGTGACTTGAATCGCCTGTGGTT
GTGGCATTC
C

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR2GR11JQ 381 0 0
CAGCAACGACTACATACGATCCACGACAATAAAAACGAGCACGTGAGAAGACAAACTCCA
TTTTAAACTGACAACTGAGTGAATCCATGACCACGGACGAGTAACGAAGTTCGAACTTGG
CATCCCCACAATATATAAGTAAAAATATGAACCAATGAGAGAAGAGACAACGAGAGAGAC
GACCAAAGGTAAATTTTATTGAAGCTTATTCCTCAAACTCATGCATGTGATCCAGAAGAT
AGTTTGCAGCCAACTCTTCGTTCTTGTTGCACGCAAAGAACACTTCCAAAACCAATGCTC
TCTCAAATCCCATCGCTTCCAGCCTTTCAATTGCGTCACGTTCCTCAGGTGTGACTTGAA
TCGCCTGTGGTTGTGGCATTC

QA 1 381 1 381
DS 

RD RR2D021JQ 581 0 0
CCGACCAAAAAAAAAAGTAAAATAACAGGAACATGAAGAGATTCAGCAACGACTACATAC
GATCCACGACAATAAAA*CGAGCACATGAGAAGACAAACTCCATTTTAAACTGACAACTG
AGTGAATCCATGACCACGGACGAGTAACGAAGTTCGAACTTGGCATCCCCACAATATATA
AGTAAAAATATGAACCAATGAGAGAAGAGACAACGAGAGAGACGACCAAAGGTAAATTTT
ATTGAAGCTTATTCCTCAAACTCATGCATGTGATCCAAAAAATAGTTTGCAGCCAACTCT
TCGTTCTTGTTGCACGCAAAGAACACTTCCAAAACCAATGCTCTCTCAAATCCCATCGCT
TCCAGCCTTTCAATTGCGTCACGTTCCTCAGGTGTGACTTGAATCGCCTGTGGTTGTGGC
ATTCCTTCCCCGAAAAGGTTGGCGCCTTCTGCCCCTCCTTCAACGGGTTCATTGATTAAA
CGTAAGAAATCAGCTTGATGTTCTTGAATCAACCGCATCAAGTTTGGGTTTTGCTTTCCC
AGTTCCTGAAGCATAGGCTGCAGAACTTGAGGGTTTGCTTG

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL3362Contig1 1344 2 2 U
GGGGCTTCGAGATATCGGAAATGGAAGAAGATGCAGCCGCTCCAAATTCAGGTTCCGATT
TGAACCTCGGAGGAAAGCGCGGCAAATCTATCGAAGAATGCCAGGACATGATTCAGCGAA
GTTTCCGAAATCCGATAGTGAAGTTTCTGATGGAGCAAATGGAGAAATCAGGGTGCAGAG
TTGGTGATAACTTCGTCAAGGCGGTTGTGTGTACTGGTCCTGTTGCTGGTGGCTTCACTA
AAGGCAGAGGGATCACTGTGTGCAGTAACTATCTGACCATTCAAGATGAAGTGAACCAAG
TGGTTATACATGAGTTGATCCATGCTTATGACGAGTGCCGTGCCAAGAATCTGGACTGGA
CTAACTGTGTTCATCATGCCTGCAGCGAGATACGTGCAGGTCATTTAAGCGGTGACTGCC
ATTTCAAGAGAGAACTTTTGAGGGGTTTCATTAAATTAAGAGGCCATGAACAAGAATGTA
TAAAAAGAAGAGTGCTGAAATCGCTTCGTGGCAACCCGTATTGCTCTGAAGTAGCAGCTA
AAGACGCCATGGAAGCAGTGTGGGATACTTGTTACAATGACACTAAGCCTTTTGACAGAG
CTCCCTGAAGGTAATTAAATTTCTCTATGTTACTTCTGCTTCAAGGAAATGAACTTCAGC
TTCATCTTTGAAGACCGATATAAAGCTGGCAAAAACTTTGGATCCAGCCGTTGATTTTTT
CTGTCACGTCTCCTATGCATTGTATTGTTCAGAATACAAAGGTCCATTAATGAAAAGACC
GAGTCGCATTCTATTTTTAGTAACTTCAGTTTTCCTCCTTCGATCGCCTAGTTTAAAGCA
TAGCCTCAGCTTTTCTTCACATTCATTCAAATCTCTTTATATAATAACTCTCACGACCAT
CTCACTCCTCCGACCAATCGAAGAAACATTTAAAACAATGGCTGACGCGACAGAAAAAGC
TGAGCACGACCGTATTTTCAAGAAGTTTGATGCTAACGGAGATGGAACAATCTCTTCCAC
CGAGCTTGGAGATGCTCTCAAGAACCTTGGCTCTGTAACGCACGATGACGTTAAGCGTAT
GATGGCTGAGATTGATACCGATGGTGATGGATTCATATCGTACCAAGAGTTTTCTGATTT
CGCTAAGGCTAATCGGGGTCTTATGAAAGATGTCGCCAAGATTTTTTAAGCGATATTTTC
AGATTTATATTGATATATTTTAATCATGTTAAATTTGTGTTTTGTATTGACAATCATTTG
ATTAAGTATGTTTCATTTTTCATTATGTTTTCATTTCATGTATGATATATTGAAGAATTA
TCCTATTCATTAGTGTTTATTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B944TF U 1
AF RR2B944JQ C 520
BS 1 757 RR2B944TF
BS 758 1344 RR2B944JQ

RD RR2B944TF 757 0 0
GGGGCTTCGAGATATCGGAAATGGAAGAAGATGCAGCCGCTCCAAATTCAGGTTCCGATT
TGAACCTCGGAGGAAAGCGCGGCAAATCTATCGAAGAATGCCAGGACATGATTCAGCGAA
GTTTCCGAAATCCGATAGTGAAGTTTCTGATGGAGCAAATGGAGAAATCAGGGTGCAGAG
TTGGTGATAACTTCGTCAAGGCGGTTGTGTGTACTGGTCCTGTTGCTGGTGGCTTCACTA
AAGGCAGAGGGATCACTGTGTGCAGTAACTATCTGACCATTCAAGATGAAGTGAACCAAG
TGGTTATACATGAGTTGATCCATGCTTATGACGAGTGCCGTGCCAAGAATCTGGACTGGA
CTAACTGTGTTCATCATGCCTGCAGCGAGATACGTGCAGGTCATTTAAGCGGTGACTGCC
ATTTCAAGAGAGAACTTTTGAGGGGTTTCATTAAATTAAGAGGCCATGAACAAGAATGTA
TAAAAAGAAGAGTGCTGAAATCGCTTCGTGGCAACCCGTATTGCTCTGAAGTAGCAGCTA
AAGACGCCATGGAAGCAGTGTGGGATACTTGTTACAATGACACTAAGCCTTTTGACAGAG
CTCCCTGAAGGTAATTAAATTTCTCTATGTTACTTCTGCTTCAAGGAAATGAACTTCAGC
TTCATCTTTGAAGACCGATATAAAGCTGGCAAAAACTTTGGATCCAGCCGTTGATTTTTT
CTGTCACGTCTCCTATGCATTGTATTGTTCAGAATAC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2B944JQ 825 0 0
T
TTGCTCTGAAGTAGCAGCTAAAGACGCCATGGAAGCAGTGTGGGATACTTGTTACAATGA
CACTAAGCCTTTTGACAGAGCTCCCTGAAGGTAATTAAATTTCTCTATGTTACTTCTGCT
TCAAGGAAATGAACTTCAGCTTCATCTTTGAAGACCGATATAAAGCTGGCAAAAACTTTG
GATCCAGCCGTTGATTTTTTCTGTCACGTCTCCTATGCATTGTATTGTTCAGAATACAAA
GGTCCATTAATGAAAAGACCGAGTCGCATTCTATTTTTAGTAACTTCAGTTTTCCTCCTT
CGATCGCCTAGTTTAAAGCATAGCCTCAGCTTTTCTTCACATTCATTCAAATCTCTTTAT
ATAATAACTCTCACGACCATCTCACTCCTCCGACCAATCGAAGAAACATTTAAAACAATG
GCTGACGCGACAGAAAAAGCTGAGCACGACCGTATTTTCAAGAAGTTTGATGCTAACGGA
GATGGAACAATCTCTTCCACCGAGCTTGGAGATGCTCTCAAGAACCTTGGCTCTGTAACG
CACGATGACGTTAAGCGTATGATGGCTGAGATTGATACCGATGGTGATGGATTCATATCG
TACCAAGAGTTTTCTGATTTCGCTAAGGCTAATCGGGGTCTTATGAAAGATGTCGCCAAG
ATTTTTTAAGCGATATTTTCAGATTTATATTGATATATTTTAATCATGTTAAATTTGTGT
TTTGTATTGACAATCATTTGATTAAGTATGTTTCATTTTTCATTATGTTTTCATTTCATG
TATGATATATTGAAGAATTATCCTATTCATTAGTGTTTATTTCG

QA 2 825 2 825
DS 



AS 1 2

CO CL3363Contig1 1332 2 2 U
GGATGAAAAAGCAATGTTGTTGTAATGGGGGCTGTAATTGAGTTTTGGGTTTCTTCTTCT
AAATGATTATCGTTAACAGAGTCGTTTCTACAACAAGCCTTGGAAACGTCGCTTGGTTTT
CTCGAATTCGAACCATGAATCGCAAAATTCACTCAACTGTCTCATCTTCTTCTAAACCCA
ACTCCGTGAGAATCCAACGCCCTCGCTCCGAAGTAGATTCAAACCCAGCCAATGGGCCGT
CGGAGACTTTAGTATACACCCGGAAGAAAAGGCTAAAACAGGAGAAAGATTCCAAGCTAC
GTGGATTGCCTGATATAGAAGACTTTGCTTTCAAAAAGAATACTTCATCATCTTCCATGA
GATCAACGGAAACTAACATCACTGTGGCTTCAACCAAAACAGCAGGGAGCTAGTCAACTG
AAACTAACATCACTGTGACTTCAGCCAAAACAGCAGGAAACTCGCCTGAAAACTGGGTAC
AAGTGCTCGAGGGCATTCGTCAAATGAGATCATCTGGAGATGCTCCAGTTGATTCTATGG
GTTGTGATAAAGCTGGTAGCTTCCTACCTCCTACGGAAAGAAGATTTGTTACCTTGTTAG
GATCACTTCTTTCAAGTCAAACAAAAGATCAAGTTAATAACGCTGCAATACATCGTCTTC
ATCAAACGGCCTTCTCACTCCCGAAGCCATTGATAAGGCTGATGAATCAACCATTAAAGA
ACTTATTTATCCCGTTGGATTTTATACAAGGAAGGCAACATATATGAAGAAGATAGCTAA
AATCTGTCTAGAGAGATACAACGGAGACATTCCGAGCTCTTTGGACGATCTACTTGCGCT
TCCGGGGATTGGTCCCAAGATGGCACATTTGATTCTGCATATAGCATGGAATGATGTTCA
AGGTATCTGTGTAGATACACATGTCCATCGCATTTGCAATCGACTTGGTTGGGTTTCTCG
ACCAGGAACCAATCAGAAAACTTCGACTCCAGAGGAAACAAGAGTAGCTCTGCAGCAATG
GCTTCCAAAGGAAGAATGGGTTGCCATTAACCCTCTTCTGGTGGGATTCGGACAAACGGT
TTGCACACCGCTGAGACCTCGTTGCGAAGCCTGCAGTGTTGCTAAGCATTGTCCTGCTGC
TTTCAAAGAGGCTTCAAGTCCATCATCCAAGTTGAAGAAATCTAAGCGAAGCAAAGAACT
ATGATCCGAAGTCAGGGGAACATATGAAGCTAGTTTCACTTTTATTTACTTCTAGGGTCA
TGGGATCGAAAACACTTATTTACGACTGGTTTTCTTTTGTTATCTTATATATTAAAATAG
AATTCATGACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM95TF U 1
AF RR2AM95JQ C 658
BS 1 746 RR2AM95TF
BS 747 1332 RR2AM95JQ

RD RR2AM95TF 746 0 0
GGATGAAAAAGCAATGTTGTTGTAATGGGGGCTGTAATTGAGTTTTGGGTTTCTTCTTCT
AAATGATTATCGTTAACAGAGTCGTTTCTACAACAAGCCTTGGAAACGTCGCTTGGTTTT
CTCGAATTCGAACCATGAATCGCAAAATTCACTCAACTGTCTCATCTTCTTCTAAACCCA
ACTCCGTGAGAATCCAACGCCCTCGCTCCGAAGTAGATTCAAACCCAGCCAATGGGCCGT
CGGAGACTTTAGTATACACCCGGAAGAAAAGGCTAAAACAGGAGAAAGATTCCAAGCTAC
GTGGATTGCCTGATATAGAAGACTTTGCTTTCAAAAAGAATACTTCATCATCTTCCATGA
GATCAACGGAAACTAACATCACTGTGGCTTCAACCAAAACAGCAGGGAGCTAGTCAACTG
AAACTAACATCACTGTGACTTCAGCCAAAACAGCAGGAAACTCGCCTGAAAACTGGGTAC
AAGTGCTCGAGGGCATTCGTCAAATGAGATCATCTGGAGATGCTCCAGTTGATTCTATGG
GTTGTGATAAAGCTGGTAGCTTCCTACCTCCTACGGAAAGAAGATTTGTTACCTTGTTAG
GATCACTTCTTTCAAGTCAAACAAAAGATCAAGTTAATAACGCTGCAATACATCGTCTTC
ATCAAACGGCCTTCTCACTCCCGAAGCCATTGATAAGGCTGATGAATCAACCATTAAAGA
ACTTATTTATCCCGTTGGATTTTATA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2AM95JQ 675 0 0
TTCATCAAACGGCCTTCTCACTCCCGAAGCCATTGATAAGGCTGATGAATCAACCATTAA
AGAACTTATTTATCCCGTTGGATTTTATACAAGGAAGGCAACATATATGAAGAAGATAGC
TAAAATCTGTCTAGAGAGATACAACGGAGACATTCCGAGCTCTTTGGACGATCTACTTGC
GCTTCCGGGGATTGGTCCCAAGATGGCACATTTGATTCTGCATATAGCATGGAATGATGT
TCAAGGTATCTGTGTAGATACACATGTCCATCGCATTTGCAATCGACTTGGTTGGGTTTC
TCGACCAGGAACCAATCAGAAAACTTCGACTCCAGAGGAAACAAGAGTAGCTCTGCAGCA
ATGGCTTCCAAAGGAAGAATGGGTTGCCATTAACCCTCTTCTGGTGGGATTCGGACAAAC
GGTTTGCACACCGCTGAGACCTCGTTGCGAAGCCTGCAGTGTTGCTAAGCATTGTCCTGC
TGCTTTCAAAGAGGCTTCAAGTCCATCATCCAAGTTGAAGAAATCTAAGCGAAGCAAAGA
ACTATGATCCGAAGTCAGGGGAACATATGAAGCTAGTTTCACTTTTATTTACTTCTAGGG
TCATGGGATCGAAAACACTTATTTACGACTGGTTTTCTTTTGTTATCTTATATATTAAAA
TAGAATTCATGACTT

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL3364Contig1 804 2 7 U
TCAACAGCGACGGTGAGTAACTGACCATTTCCAGCGCTATTAACAAACCAAATCACTGTC
TGTCATATCTCCCAAGCATATGTATTTGATCTCATGGTATCGTCCATACGTACTTGGATC
TTCCTTCCAAGACCAGACTGCTTCACTCCCCCGAATGGAGCCACCTCGGTTGATATGATT
CCTTCGTTCACCCCTACAAATCCGTATTCAAGTGCTTCTGAGACACGCCACGACCGTTGC
ACACTGTTTGTGAATATATAAGCAGCAAGTCCTGCAATAGTGTCATTAGCGATTCTGATA
GCGTCCTCCTCAGTTTTGAATCGAATAAGGGGAGCTACTGGTCCAAAAATTTCCTCCTTA
GACATGATCATGTTGCTCGTAACATCACGGATAACAGTAGGCTCATAAAAAGTCATCCCT
AGACTGTGCTTTTTGCCGCCGAGAAGGATTTTTGCTCCCTTGGAAACGGCATCTTCCACG
AATGACTCTACCTTCTGAATTGCTGCATCGTTTATAAGTGGACCCTGGGTTGTCCCCTCC
TTAAAACCATCCCCTACTTCTAATTTTTGGACCGCTTCAGAAAAGGCCTCAGCAAATTTA
TCATAGATACCATCTTGCACAAGTACCCTGTTCGCACAAACACATGTCTGACCACTATTC
CTAAATTTCGCTGCAAGCGTTCCTCTTACTGCTACATCCAGGTCTGCATCATCAAATATT
ATGGAGGGTGCATTGCCGCCTAGTTCTAGAGAAACCTTCTTGACAGTAGGTGCAGCAGCT
GCCATCAACTTCTTCCCAACTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC10JQ U 149
AF RR2E107TF C 1
BS 1 148 RR2E107TF
BS 149 199 RR2EC10JQ
BS 200 200 RR2E107TF
BS 201 336 RR2EC10JQ
BS 337 339 RR2E107TF
BS 340 463 RR2EC10JQ
BS 464 804 RR2E107TF

RD RR2EC10JQ 315 0 0
CCCCGAATGGAGCCACCTCGGTTGATATGATTCCTTCGTTCACCCCTACAAGTCCGTATT
CAAGTGCTTCTGAGACACGCCACGACCGTTGCACACTGTTTGTGAATATATAAGCAGCAA
GTCCTGCAATAGTGTCATTAGCGATTCTGATAGCGTCCTCCTCAGTTTTGAATCGAATAA
GGGGAGCT***GGTCCAAAAATTTCCTCCTTAGACATGATCATGTTGCTCGTAACATCAC
GGATAACAGTAGGCTCATAAAAAGTCATCCCTAGACTGTGCTTTTTGCCGCCGAGAAGGA
TTTTTGCTCCCTTGG

QA 1 315 1 315
DS 

RD RR2E107TF 804 0 0
TCAACAGCGACGGTGAGTAACTGACCATTTCCAGCGCTATTAACAAACCAAATCACTGTC
TGTCATATCTCCCAAGCATATGTATTTGATCTCATGGTATCGTCCATACGTACTTGGATC
TTCCTTCCAAGACCAGACTGCTTCACTCCCCCGAATGGAGCCACCTCTGTTGATATGATT
CCTTCGTTCACCCCTACAAATCCGTATTCAAGTGCTTCTGAGACACGCCACGATCGTTGC
ACACTGTTTGTGAATATATAAGCAGCAAGTCCTGCAATAGTGTCATTAGCGATTCTGATA
GCGTCCTCCTCAGTTTTGAATCGAATAAGGGGAGCTACTGGTCCAAAAATTTCCTCCTTA
GACATGATCATGTTGCTCGTAACATCACGGATAACAGTAGGCTCATAAAAAGTCATCCCT
AGACTGTGCTTTTTGCCGCCGAGAAGGATTTTTGCTCCCTTGGAAACGGCATCTTCCACG
AATGACTCTACCTTCTGAATTGCTGCATCGTTTATAAGTGGACCCTGGGTTGTCCCCTCC
TTAAAACCATCCCCTACTTCTAATTTTTGGACCGCTTCAGAAAAGGCCTCAGCAAATTTA
TCATAGATACCATCTTGCACAAGTACCCTGTTCGCACAAACACATGTCTGACCACTATTC
CTAAATTTCGCTGCAAGCGTTCCTCTTACTGCTACATCCAGGTCTGCATCATCAAATATT
ATGGAGGGTGCATTGCCGCCTAGTTCTAGAGAAACCTTCTTGACAGTAGGTGCAGCAGCT
GCCATCAACTTCTTCCCAACTGCC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL3365Contig1 1130 2 12 U
AGAAGGGAGGAGGTTTGGTAATAAGGAGCTTGATAAAGTGGTGATATGTCAGCGACTGCT
CTCTCAAGATTAAACCCTATTTCTCAATTTGGGTTTCAAGTAGCTGCAAAAAGCAACAGG
AGCTTCTTCTTCTCCCTTTCCGCTGCTCAAAGGAGACTACGAGGAGGAGGAGGAGCCATG
GCTACTTCTGGTTCTTTGCCAGTGTTTGGGGACGCCGCCTGCTTGGACGATTTGTTCACG
GCTTGCGCTAATAACGGTTTAGACTTCGCTAAGAAGCCTTCAACTCCCGGTGGTGGCGCT
GCCTTCTTCACTGCCGCTAGCATGAGACTTGGGAGGAAGAGGAGAGAGCAGTTCAAGAAC
AGATTGGTCTGTCGCTATTCTAGCATTGATCCCCTCGACAAGACTCCTTCGCTCTTCGGG
GGTTTCTCCAAGACGATTCATACCTCTACTGTCTGTTTCTCGGCTCATGAGCTCTCTACT
TCTCAAGACTCCGAGCTTTCACCAACTACTACCACATCTCTTAAGTGTTTGAAGCTGGTC
TCTGGTTCCTATTATCTCCCACATCCCGAGAAAGAAGCTACAGGCGGAGAAGACGCTCAC
TTCATCTGCGAGGAGGAACAAGCTATCGGTGTTGCTGATGGTGTTGGCGGTTGGGCTGAA
GTCGGTGTCAACGCTGGCTTGTTCTCTCGCGAACTCATGTCTTACTCTGTACCAGCCATT
CGAGAACTGGCTAAAGGTTCTTTTATTGACCCGTTGTTGGTTTTAGAGAAAGCTCATTCT
CAAACCAAAGCTCAGGGCTCCTCCACTGCTTGTATCATCGCTTTGACAGACAAGGGACTA
CACGCTATTAATCTCGGAGACAGTGGATTCACGGTGGTTAGAGAAGGGACCACGGTGTTT
CAGTCACCTGTTCAGCAGCACGGATTCAACTTCACTTATCAATTAGGGACTGGAGACAGT
GGTGGCGATATGCCTCGCTCCGGTCAGGTTTTCATGATTGGTGTGGAGGCTGGAGATGTG
ATTTTGGCGGGAACGGACGGTGTGTATGACAATCTATACAACGAAGACATCACAGGGTGG
TGGTTAGCTCGGTCAGAGCTGGACTGGATCCGAAAGGCACGGCTCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA69TF U 1
AF RR2F052TF U 345
BS 1 416 RR2HA69TF
BS 417 417 RR2F052TF
BS 418 512 RR2HA69TF
BS 513 513 RR2F052TF
BS 514 566 RR2HA69TF
BS 567 567 RR2F052TF
BS 568 602 RR2HA69TF
BS 603 603 RR2F052TF
BS 604 725 RR2HA69TF
BS 726 726 RR2F052TF
BS 727 741 RR2HA69TF
BS 742 1130 RR2F052TF

RD RR2HA69TF 741 0 0
AGAAGGGAGGAGGTTTGGTAATAAGGAGCTTGATAAAGTGGTGATATGTCAGCGACTGCT
CTCTCAAGATTAAACCCTATTTCTCAATTTGGGTTTCAAGTAGCTGCAAAAAGCAACAGG
AGCTTCTTCTTCTCCCTTTCCGCTGCTCAAAGGAGACTACGAGGAGGAGGAGGAGCCATG
GCTACTTCTGGTTCTTTGCCAGTGTTTGGGGACGCCGCCTGCTTGGACGATTTGTTCACG
GCTTGCGCTAATAACGGTTTAGACTTCGCTAAGAAGCCTTCAACTCCCGGTGGTGGCGCT
GCCTTCTTCACTGCCGCTAGCATGAGACTTGGGAGGAAGAGGAGAGAGCAGTTCAAGAAC
AGATTGGTCTGTCGCTATTCTAGCATTGATCCCCTCGACAAGACTCCTTCGCTCTTTGGG
GGTTTCTCCAAGACGATTCATACCTCTACTGTCTGTTTCTCGGCTCATGAGCTCTCTACT
TCTCAAGACTCCGAGCTTTCACCAACTACTACTACATCTCTTAAGTGTTTGAAGCTGGTC
TCTGGTTCCTATTATCTCCCACATCCTGAGAAAGAAGCTACAGGCGGAGAAGACGCTCAC
TTTATCTGCGAGGAGGAACAAGCTATCGGTGTTGCTGATGGTGTTGGCGGTTGGGCTGAA
GTCGGTGTCAACGCTGGCTTGTTCTCTCGCGAACTCATGTCTTACTCTGTACCAGCCATT
CGAGA*CTGGCTAAAGGTTCT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2F052TF 786 0 0
AGAGCAGTTCAAGAACAGATTGGTCTGTCGCTATTCTAGCATTGATCCCCTCGACAAGAC
TCCTTCGCTCTTCGGGGGTTTCTCCAAGACTATTCATACCTCTACTGTCTGTTTCTCGGC
TCATGAGCTCTCTACTTCTCAAGACTCTGAGCTTTCACCAACTACTACCACATCTCTTAA
GTGTTTGAAGCTGGTGTCTGGTTCGTATTATCTCCCACATCCCGAGAAAGAAGCTACAGG
CGGAGAAGATGCTCACTTCATCTGCGAGGAGGAACAAGCTATCGGTGTTGCTGATGGTGT
TGGCGGTTGGGCTGAAGTCGGTGTCAACGCTGGCTTGTTCTCTCGCGAACTCATGTCTTA
CTCTGTATCAGCCATTCGAGAACTGGCTAAAGGTTCTTTTATTGACCCGTTGTTGGTTTT
AGAGAAAGCTCATTCTCAAACCAAAGCTCAGGGCTCCTCCACTGCTTGTATCATCGCTTT
GACAGACAAGGGACTACACGCTATTAATCTCGGAGACAGTGGATTCACGGTGGTTAGAGA
AGGGACCACGGTGTTTCAGTCACCTGTTCAGCAGCACGGATTCAACTTCACTTATCAATT
AGGGACTGGAGACAGTGGTGGCGATATGCCTCGCTCCGGTCAGGTTTTCATGATTGGTGT
GGAGGCTGGAGATGTGATTTTGGCGGGAACGGACGGTGTGTATGACAATCTATACAACGA
AGACATCACAGGGTGGTGGTTAGCTCGGTCAGAGCTGGACTGGATCCGAAAGGCACGGCT
CAAAAA

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL3366Contig1 1012 2 2 U
AAAATCAAAGACGACTTGAAAACGCTAATTTCATTGCAGCAATCTTTGTTTATTATCTTG
CTTTGGTAGATTTTCTGTCTAGGAATGTTATTAGCTAACCTGTATTGTAGATGCCCTTTT
TCGATATTTTTGGATTTATTACTTGTTAGCGAAAGTGATGATATGAAATTGTCGCCCCAG
TCTTATTTGCATTCATTGCAACATGGTGATTGACTATTTTCGTCTGATTCTCTCTCAATA
TTTTCTTTAAAAAAGGATTTTCAATAAATTCATTGTTTTTTTGATTTTGTTAATTGGAAG
TGAAGAAAAGGCATGAATTGTTTTGTGACACCCAGTCTGATCTGCTTCTGCTGAATTGAG
TGATTTGCCATGTCCTCTGATCCTTTTTCTATTATAAATATGACTTGTGTTTTTATTATT
GCAAAGTATGGGGAGTGAGGATGTTTATTAAACCATACGTCTGCAAATCTGAACTAAAGT
GTAGATTCATAGACATGCACTACCATCTGACCTCATGTTTTCTAACTATCTTTTGCTTCT
ATTTTTCTTAAACCAGTCTTATAATTTGGTTTGCTGCAATCGATGATGAATAAAATCGTC
CATATTTAATGATAATCCCATGATTATTAAACACTAGATCACCATCTTTCGGCTGAGGTT
GCAGTTTACTCTTCATTTGTTTTATTCCTTTCAAGAAATTTCAATGGTATTTGACCTAAA
CTAATAGGTTGGTGTTTCTATTTTCATAGTTTGCAGGTTACTTTTCATATCTTTATATTG
TTCTTTTGCAGTTAATTGGGGTCTTCTTTATTTATATTACGAGATTACATCTCAGCCAGC
AATATGTTTTGTAATTCATATTTGTAATGTATGTAGTTTTATTTACGTGTTTAAAGATTG
TAAATATAAATTATCTTTTAGTTTATATTGCAAGAGAGATAGCCGTCAGCTTTATTGTTA
TGTTATTGAAAGTTACAGCTTTTTTTCTGAAATACAACAATTATTTGACAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO02TF U 1
AF RR2CO02JQ C 283
BS 1 430 RR2CO02TF
BS 431 1012 RR2CO02JQ

RD RR2CO02TF 430 0 0
AAAATCAAAGACGACTTGAAAACGCTAATTTCATTGCAGCAATCTTTGTTTATTATCTTG
CTTTGGTAGATTTTCTGTCTAGGAATGTTATTAGCTAACCTGTATTGTAGATGCCCTTTT
TCGATATTTTTGGATTTATTACTTGTTAGCGAAAGTGATGATATGAAATTGTCGCCCCAG
TCTTATTTGCATTCATTGCAACATGGTGATTGACTATTTTCGTCTGATTCTCTCTCAATA
TTTTCTTTAAAAAAGGATTTTCAATAAATTCATTGTTTTTTTGATTTTGTTAATTGGAAG
TGAAGAAAAGGCATGAATTGTTTTGTGACACCCAGTCTGATCTGCTTCTGCTGAATTGAG
TGATTTGCCATGTCCTCTGATCCTTTTTCTATTATAAATATGACTTGTGTTTTTATTATT
GCAAAGTATG

QA 1 430 1 430
DS 

RD RR2CO02JQ 730 0 0
GA
TTTTGTTAATTGGAAGTGAAGAAAAGGCATGAATTGTTTTGTGACACCCAGTCTGATCTG
CTTCTGCTGAATTGAGTGATTTGCCATGTCCTCTGATCCTTTTTCTATTATAAATATGAC
TTGTGTTTTTATTATTGCAAAGTATGGGGAGTGAGGATGTTTATTAAACCATACGTCTGC
AAATCTGAACTAAAGTGTAGATTCATAGACATGCACTACCATCTGACCTCATGTTTTCTA
ACTATCTTTTGCTTCTATTTTTCTTAAACCAGTCTTATAATTTGGTTTGCTGCAATCGAT
GATGAATAAAATCGTCCATATTTAATGATAATCCCATGATTATTAAACACTAGATCACCA
TCTTTCGGCTGAGGTTGCAGTTTACTCTTCATTTGTTTTATTCCTTTCAAGAAATTTCAA
TGGTATTTGACCTAAACTAATAGGTTGGTGTTTCTATTTTCATAGTTTGCAGGTTACTTT
TCATATCTTTATATTGTTCTTTTGCAGTTAATTGGGGTCTTCTTTATTTATATTACGAGA
TTACATCTCAGCCAGCAATATGTTTTGTAATTCATATTTGTAATGTATGTAGTTTTATTT
ACGTGTTTAAAGATTGTAAATATAAATTATCTTTTAGTTTATATTGCAAGAGAGATAGCC
GTCAGCTTTATTGTTATGTTATTGAAAGTTACAGCTTTTTTTCTGAAATACAACAATTAT
TTGACAGT

QA 3 730 3 730
DS 



AS 1 3

CO CL3367Contig1 354 3 3 U
GGAACAAAAAGCTGTCGTCACACATTTGCCGGAGGTAGCGCCGATTCAGTCGTCAGAACA
ACTATGGGTAAGGTTCACGGTTCATTGGCTCGTGCCGGTAAGGTGAGAGGACAGACGCCT
AAAGTGGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGCCACGTGGCCGTGCCCACAAACGTCTTCAA
CACAACCGCCGTTTCGTCACCGCCGTTGTTGGATTTGGCAAGAAGAGAGGACCCAACTCA
TCTGAGAAATAGATGATGAACGCTTTGGATTTGAAGTTTTGCGGATTTTGTTTTAATATC
TTTCTTGTTTAATGTGTAAGGCTGCTATTTTCTCAATAAAATTGACTTTTTGAT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2B614JQ C 1
AF RR2B614TF U 1
AF RR2AE10TF U 2
BS 1 1 RR2B614JQ
BS 2 352 RR2B614TF
BS 353 354 RR2AE10TF

RD RR2B614JQ 352 0 0
GGAACAAAAAGCTGTCGTCACACATTTGCCGGAGGTAGCGCCGATTCAGTCGTCAGAACA
ACTATGGGTAAGGTTCACGGTTCATTGGCTCGTGCCGGTAAGGTGAGAGGACAGACGCCT
AAAGTGGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGCCACGTGGCCGTGCCCACAAACGTTTTCAA
CACAACCGCCGTTTCGTCACCGCCGTTGTTGGATTTGGCAAGAAGAGAGGACCCAACTCA
TTTGAGAAATAGATGATGAACGCTTTGGATTTGAAGTTTTGCGGATTTTGTTTTAATATC
TTTCTTGTTTAATGTGTAAGGCTGCTATTTTTTCAATAAAATTGACTTTTTG

QA 1 352 1 352
DS 

RD RR2B614TF 352 0 0
G
GAACAAAAAGCTGTCGTCACACATTTGCCGGAGGTAGCGCCGATTCAGTCGTCAGAACAA
CTATGGGTAAGGTTCACGGTTCATTGGCTCGTGCCGGTAAGGTGAGAGGACAGACGCCTA
AAGTGGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGCCACGTGGCCGTGCCCACAAACGTCTTCAAC
ACAACCGCCGTTTCGTCACCGCCGTTGTTGGATTTGGCAAGAAGAGAGGACCCAACTCAT
CTGAGAAATAGATGATGAACGCTTTGGATTTGAAGTTTTGCGGATTTTGTTTTAATATCT
TTCTTGTTTAATGTGTAAGGCTGCTATTTTCTCAATAAAATTGACTTTTTG

QA 2 352 2 352
DS 

RD RR2AE10TF 353 0 0
GAACAAAAAGCTGTCGTCACACATTTGCCGGAGGTAGCGCCGATTCAGTCGTCAGAACAA
CTATGGGTAAGGTTCACGGTTCATTGGCTCGTGCCGGTAAGGTGAGAGGACAGACGCCTA
AAGTGGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGCCACGTGGCCGTGCCCACAAACGTCTTCAAC
ACAACCGCCGTTTCGTCACCGCCGTTGTTGGATTTGGCAAGAAGAGAGGACCCAACTCAT
CTGAGAAATAGATGATGAACGCTTTGGATTTGAAGTTTTGCGGATTTTGTTTTAATATCT
TTCTTGTTTAATGTGTAAGACTGCTATTTTCTCAATAAAATTGACTTTTTGAT

QA 1 353 1 353
DS 



AS 1 2

CO CL3368Contig1 766 2 1 U
GGACTCTACTATACTACTCTTTAGCGGCACTCGGAATCAGTCAGGAAACCCTTTGATTTG
CTTGCTATGGCTCGTCGTGGTGAATCCGGCTGCCCTCCTCCTCGCAACTTTGCTAAAGAC
ACATGTACCATCGAGTTTGACGGTGCTTCAAAAGGAAACCCTGGGAGAGCTGGTGCAGGA
GCCGTTCTCCGTGCTCCAGATAATACTGTGATCTTCTCTTGTCGCGAGGGTTTAGGCTCT
GCTACAAACAACGTTGCTGAGTATCGAGCTCTCAATCTTGGCCTCGAGTGTGCTCTTAAC
AACGGCTTTAAAAATGTTCACGTCCAGGGTGATTCACAGCTTGTCTGTAACCAGGTTCAA
GGTGCATGGGCAACCAGAAACCCAAATATGACTCAGCTTTGTGGACAAGCACAGGAGCTT
ATGAGTCAGTTCGACTCATGTGATATTCAACACGTTCCCAGGGAATTCAATTCAGCGGCT
GATGCTCAAGCTAGCCTTGCGACCAATCTGGCAGAGGGTGAAACTCATGAAGAGAGTGCA
GGCGGCTATGGAAGAAGGAGATACTAATATCCAAGTGGAGTAATATGCATTTTACGTTTT
CTTGTTTTTGGGATCATCATGTCTTTCTTTTAGCATGTGCTATGTGTTAACATAAACATG
AACACGATGATCTTTTGTCTCTTTTGATTTATCCCACGGCATGTTGACTTACCAAGAATA
TTTCTATGTCGTTTACTACTTAGTCTATTCAATAAGTTTTCTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FY32TF U 1
AF RR2FY32JQ C 69
BS 1 766 RR2FY32TF

RD RR2FY32TF 766 0 0
GGACTCTACTATACTACTCTTTAGCGGCACTCGGAATCAGTCAGGAAACCCTTTGATTTG
CTTGCTATGGCTCGTCGTGGTGAATCCGGCTGCCCTCCTCCTCGCAACTTTGCTAAAGAC
ACATGTACCATCGAGTTTGACGGTGCTTCAAAAGGAAACCCTGGGAGAGCTGGTGCAGGA
GCCGTTCTCCGTGCTCCAGATAATACTGTGATCTTCTCTTGTCGCGAGGGTTTAGGCTCT
GCTACAAACAACGTTGCTGAGTATCGAGCTCTCAATCTTGGCCTCGAGTGTGCTCTTAAC
AACGGCTTTAAAAATGTTCACGTCCAGGGTGATTCACAGCTTGTCTGTAACCAGGTTCAA
GGTGCATGGGCAACCAGAAACCCAAATATGACTCAGCTTTGTGGACAAGCACAGGAGCTT
ATGAGTCAGTTCGACTCATGTGATATTCAACACGTTCCCAGGGAATTCAATTCAGCGGCT
GATGCTCAAGCTAGCCTTGCGACCAATCTGGCAGAGGGTGAAACTCATGAAGAGAGTGCA
GGCGGCTATGGAAGAAGGAGATACTAATATCCAAGTGGAGTAATATGCATTTTACGTTTT
CTTGTTTTTGGGATCATCATGTCTTTCTTTTAGCATGTGCTATGTGTTAACATAAACATG
AACACGATGATCTTTTGTCTCTTTTGATTTATCCCACGGCATGTTGACTTACCAAGAATA
TTTCTATGTCGTTTACTACTTAGTCTATTCAATAAGTTTTCTATAT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2FY32JQ 698 0 0
GGCTCGTCGTGGTGAATCCGGCTGCCCTCCTCCTCGCAACTTTGCTAAAGACACATGTAC
CATCGAGTTTGACGGTGCTTCAAAAGGAAACCCTGGGAGAGCTGGTGCAGGAGCCGTTCT
CCGTGCTCCAGATAATACTGTGATCTTCTCTTGTCGCGAGGGTTTAGGCTCTGCTACAAA
CAACGTTGCTGAGTATCGAGCTCTCAATCTTGGCCTCGAGTGTGCTCTTAACAACGGCTT
TAAAAATGTTCACGTCCAGGGTGATTCACAGCTTGTCTGTAACCAGGTTCAAGGTGCATG
GGCAACCAGAAACCCAAATATGACTCAGCTTTGTGGACAAGCACAGGAGCTTATGAGTCA
GTTCGACTCATGTGATATTCAACACGTTCCCAGGGAATTCAATTCAGCGGCTGATGCTCA
AGCTAGCCTTGCGACCAATCTGGCAGAGGGTGAAACTCATGAAGAGAGTGCAGGCGGCTA
TGGAAGAAGGAGATACTAATATCCAAGTGGAGTAATATGCATTTTACGTTTTCTTGTTTT
TGGGATCATCATGTCTTTCTTTTAGCATGTGCTATGTGTTAACATAAACATGAACACGAT
GATCTTTTGTCTCTTTTGATTTATCCCACGGCATGTTGACTTACCAAGAATATTTCTATG
TCGTTTACTACTTAGTCTATTCAATAAGTTTTCTATAT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL3369Contig1 566 2 2 U
GGGTTCTTCTCGACGTTCTTCAAGCCTAAGGTAAGAGTACATCACAGGACAAAAGAGAAG
ATGTCTGAGAAAAAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGTGACCAGAGAGTACACCATCAACCTC
CACAGACGCCTCCACAGCTGCACCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCCATCAAGGAGATC
AGGAAGTTTGCCGAGAAGGCCATGGGGACAAAGGACGTTAGGGTGGACGTGAAGTTGAAC
AAGCGGATATGGAGCAAAGGAATCAGAGGTCCTCCAAGGAGGATTAGGGTCCGTGTTGCG
CGCAAGAGAAACGACGACGAAGACGCAAAGGAGGAGTTTTTCTCACTCGTGACTGTTGCT
GAGATCCCTGCTGAAGGACTCAGCGGACTTGGCACTAAGGTCATCGATGAGGAGGATTGA
GAAGGGACTAGTCCTGTCATTTAGACAAGTTTTGTGGGTTTTTTAAAAAAATTCTTGTTG
TTTTCGTTCAAAAAAAATCTTCGGTATTTTCTTTGTAGTATGACTTCGCAATGCCTAATG
CAGTTTATTGGAAAGACCTTGAGACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2EK28JQ C 1
AF RR2EK28TF U 1
BS 1 564 RR2EK28TF
BS 565 566 RR2EK28JQ

RD RR2EK28JQ 566 0 0
GGGTTCTTCTCGACGTTCTTCAAGCCTAAGGTAAGAGTACATCACAGGACAAAAGAGAAG
ATGTCTGAGAAAAAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGTGACCAGAGAGTACACCATCAACCTC
CACAGACGCCTCCACAGCTGCACCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCCATCAAGGAGATC
AGGAAGTTTGCCGAGAAGGCCATGGGGACAAAGGACGTTAGGGTGGACGTGAAGTTGAAC
AAGCGGATATGGAGCAAAGGAATCAGAGGTCCTCCAAGGAGGATTAGGGTCCGTGTTGCG
CGCAAGAGAAACGACGACGAAGACGCAAAGGAGGAGTTTTTCTCACTCGTGACTGTTGCT
GAGATCCCTGCTGAAGGACTCAGCGGACTTGGCACTAAGGTCATCGATGAGGAGGATTGA
GAAGGGACTAGTCCTGTCATTTAGACAAGTTTTGTGGGTTTTTTAAAAAAATTCTTGTTG
TTTTCGTTCAAAAAAAATCTTCGGTATTTTCTTTGTAGTATGACTTCGCAATGCCTAATG
CAGTTTATTGGAAAGACCTTGAGACG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2EK28TF 566 0 0
GGGTTCTTCTCGACGTTCTTCAAGCCTAAGGTAAGAGTACATCACAGGACAAAAGAGAAG
ATGTCTGAGAAAAAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGTGACCAGAGAGTACACCATCAACCTC
CACAGACGCCTCCACAGCTGCACCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCCATCAAGGAGATC
AGGAAGTTTGCCGAGAAGGCCATGGGGACAAAGGACGTTAGGGTGGACGTGAAGTTGAAC
AAGCGGATATGGAGCAAAGGAATCAGAGGTCCTCCAAGGAGGATTAGGGTCCGTGTTGCG
CGCAAGAGAAACGACGACGAAGACGCAAAGGAGGAGTTTTTCTCACTCGTGACTGTTGCT
GAGATCCCTGCTGAAGGACTCAGCGGACTTGGCACTAAGGTCATCGATGAGGAGGATTGA
GAAGGGACTAGTCCTGTCATTTAGACAAGTTTTGTGGGTTTTTTAAAAAAATTCTTGTTG
TTTTCGTTCAAAAAAAATCTTCGGTATTTTCTTTGTAGTATGACTTCGCAATGCCTAATG
CAGTTTATTGGAAAGACCTTGAGA
CG

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 3

CO CL3370Contig1 1430 3 2 U
GGAAGCATAGTTTCGAGAACCACCACCACTCTGTCGTCGTCCACAAGAAGAGCCAAGAGT
CTCCCCCCGTGTTCTGCAAACATATAATCCTCCTAGGTTGTGCTTTTTTTTTTTCTCTTG
TAAGAGAAATGGGTGGTGGCTCGTCGGAGACGAAGATCTTGCAAGAACTCATACTTTACG
CGGCGAGCGCTGCTTTCAGCTGCTTGGTCCTGTTTGCTGGGCTCAGACACCTCGACCCTA
ATCGCGAGGCGTCTAAGAAAGCTCTCGAGCATAAGAAAGAAATCTCCAAGCGTCTAGGTC
GTCCTCTTATTCACACCACTCCATACGAGGATGTGATAGCATGTGATGTGATTAATCCAG
ACCATATCGATGTGGAGTTTGGTTCTATTGGAGGATTGGAGACCATCAAGGGGGCTTTAT
ATGAGCTTGTGATTTTGCCGTTGAAAAGGCCTGAGCTTTTTGCTTATGGGAAGCTCCTTG
GACCTCAAAAGGGCGTCTTGCTCTATGGGCCTCCTGGCACTGGGAAGACGATGCTTGCTA
AGGCTATTGCTAAAGAATCAGGAGCTGTTTTCATTAATGTTAGGGTCTCTAATCTGATGA
GCAAGTGGTTTGGTGATGCTCAGAAGCTTGTTGCTGCTGTATTTAGCTTGGCGTACAAAC
TCCAACCTGCTATCATTTTTATTGATGAGGTGGACAGCTTTCTTGGCCAGCGTCGTTCAA
CAGATCATGAAGCCATGGCAAACATGAAGACTGAGTTTATGGCTTTATGGGATGGGTTCT
CTACTGATCCGAATGCGAGGGTGATGGTACTTGCTGCAACTAACAGACCATCAGAGCTCG
ATGAAGCAATATTGAGGCGTCTTCCTCAAGCCTTTGAGATCGGAATGCCTGATCGCAAGG
AGAGAGCAGAGATACTGAAAGTGACACAGAAAGGAGAGAGGGTGGAGCCCGATATTGACT
ATGACCACGTAGCTCGTTTATGCGAAGGCTACACCGGATCAGACATCTTCGAGCTCTGCA
AGAAAGCGGCCTACTTCCCTATCAGAGAGATCCTAGAGGAAGAGAGAAAAGGGAGACCAT
GTCCTGTCCCTAGGCCGTTGTCACAGCTGGATTTGGAGAAAGTTCTTGCAACGTCGAAGA
AGACGCAAGTTGCAGCAGGGGAGTACTGTGGGTTGAGAGTGTCAAGGGAACCAGATGAGG
TGGAAGCAGCTATAAGTGGAATCTCGAAGCTACTGGTCTCTCAGTTCCTTAACCTTCAGT
CAGGCTCTCAGGACTCACGGCACCGGGATCAAGAAGAAGATAACTGATGAAACTCCGGAT
CATTTTTCTTTTGTCATAAACGTTCTGGTTTCATCTGAAAGTTTAGAGCTTTGCCAAAGT
AATACACTCTGTTCTGTAATAATTTTTGTTATAGGATGATATATTTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA59TF U 1
AF RR2B760JQ C 863
AF RR2B760TF U 681
BS 1 788 RR2FA59TF
BS 789 1430 RR2B760TF

RD RR2FA59TF 788 0 0
GGAAGCATAGTTTCGAGAACCACCACCACTCTGTCGTCGTCCACAAGAAGAGCCAAGAGT
CTCCCCCCGTGTTCTGCAAACATATAATCCTCCTAGGTTGTGCTTTTTTTTTTTCTCTTG
TAAGAGAAATGGGTGGTGGCTCGTCGGAGACGAAGATCTTGCAAGAACTCATACTTTACG
CGGCGAGCGCTGCTTTCAGCTGCTTGGTCCTGTTTGCTGGGCTCAGACACCTCGACCCTA
ATCGCGAGGCGTCTAAGAAAGCTCTCGAGCATAAGAAAGAAATCTCCAAGCGTCTAGGTC
GTCCTCTTATTCACACCACTCCATACGAGGATGTGATAGCATGTGATGTGATTAATCCAG
ACCATATCGATGTGGAGTTTGGTTCTATTGGAGGATTGGAGACCATCAAGGGGGCTTTAT
ATGAGCTTGTGATTTTGCCGTTGAAAAGGCCTGAGCTTTTTGCTTATGGGAAGCTCCTTG
GACCTCAAAAGGGCGTCTTGCTCTATGGGCCTCCTGGCACTGGGAAGACGATGCTTGCTA
AGGCTATTGCTAAAGAATCAGGAGCTGTTTTCATTAATGTTAGGGTCTCTAATCTGATGA
GCAAGTGGTTTGGTGATGCTCAGAAGCTTGTTGCTGCTGTATTTAGCTTGGCGTACAAAC
TCCAACCTGCTATCATTTTTATTGATGAGGTGGACAGCTTTCTTGGCCAGCGTCGTTCAA
CAGATCATGAAGCCATGGCAAACATGAAGACTGAGTTTATGGCTTTATGGGATGGGTTCT
CTACTGAT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2B760JQ 357 0 0
TCCTCAAGCCTTTGAGATCGGAATGCCTGATCGCAAGGAGAGAGCAGAGATACTGAAAGT
GACACAGAAAGGAGAGAGGGTGGAGCCCGATATTGACTATGACCACGTAGCTCGTTTATG
CGAAGGCTACACCGGATCAGACATTTTCGAGCTCTGCAAGAAAGCGGCCTACTTCCCTAT
CAGAGAGATCCTAGAGGAAGAGAGAAAAGGGAGACCATGTCCTGTCCCTAGGCCGTTGTC
ACAGCTGGATTTGGAGAAAGTTCTTGCAACGTCGAAGAAGACGCAAGTTGCAGCAGGGGA
GTACTGTGGGTTGAGAGTGTCAAGGGAACCAGATGAGGTGGAAGCAGCTATAAGTGG

QA 1 357 1 357
DS 

RD RR2B760TF 750 0 0
ATTGATGAGGTGGACAGCTTTCTTGGCCAGCGTCGTTCAACAGATCATGAAGCCATGGCA
AACATGAAGACTGAGTTTATGGCTTTATGGGATGGGTTCTCTACTGATCCGAATGCGAGG
GTGATGGTACTTGCTGCAACTAACAGACCATCAGAGCTCGATGAAGCAATATTGAGGCGT
CTTCCTCAAGCCTTTGAGATCGGAATGCCTGATCGCAAGGAGAGAGCAGAGATACTGAAA
GTGACACAGAAAGGAGAGAGGGTGGAGCCCGATATTGACTATGACCACGTAGCTCGTTTA
TGCGAAGGCTACACCGGATCAGACATCTTCGAGCTCTGCAAGAAAGCGGCCTACTTCCCT
ATCAGAGAGATCCTAGAGGAAGAGAGAAAAGGGAGACCATGTCCTGTCCCTAGGCCGTTG
TCACAGCTGGATTTGGAGAAAGTTCTTGCAACGTCGAAGAAGACGCAAGTTGCAGCAGGG
GAGTACTGTGGGTTGAGAGTGTCAAGGGAACCAGATGAGGTGGAAGCAGCTATAAGTGGA
ATCTCGAAGCTACTGGTCTCTCAGTTCCTTAACCTTCAGTCAGGCTCTCAGGACTCACGG
CACCGGGATCAAGAAGAAGATAACTGATGAAACTCCGGATCATTTTTCTTTTGTCATAAA
CGTTCTGGTTTCATCTGAAAGTTTAGAGCTTTGCCAAAGTAATACACTCTGTTCTGTAAT
AATTTTTGTTATAGGATGATATATTTGCTT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 3

CO CL3371Contig1 1076 3 18 U
ATGAATAAAGAAAACCGGATTTTTTAAGTTTCAACCAACCAAATATCAAACCGAACATAT
CCTTGGAGATGAAACTGTGTCTTCCACTAAAACAAAACTAAAGCAGGAACAAGTTTTTTA
AGGATGCAACGGAAAAAAAACAAGCTGGTCATACAAAACTGTATTTTTTTCTTCTGCTTC
TGGGAAAAAAACCAAACAACAGGAACATCAGTTTATCTTTGCGTTTGTGAAGTCCATCTC
TGGATGCAGAAACATGAACTTCTTGAAAATGTCTTGCTTTTGTAGCTCGTCCCTTGTTGG
AAAACCCATTTGCTTTTGCCTTTGATCAAACATCATCTTCTCAACAGTGGAGCGAGTTTC
AGGGTCAAGGTCAGCTAATTTACTGTTCTCCGGTTCAACCTTCTGTGTATCGATCTCAGG
TTCACCTTTCACACAGCACTTCCACCACTCCATCTGATCTTGCTTTGTCAACAGAATCGA
AATCATCTTTTGATCCTCGATATTCCAGTAGCAGTCATCAGGCTTCACAGATCGGTATAG
CTCTCCATCAATGATTGGATCCTGGCCTTTAAGACCAAGCTTGAGACGGTTCTTCTTAAT
CTCGCATACAACAGACCGTGCTTTAGTACCAGTAGGGACTGGAATGTTAACAGTAACCTC
CTGAAGGGTCTGGACCCATGAGTAGCTCTCAAGATCATAACCATTACCCTTGTTAGGTGC
AATGGGACTAGCTTCTTGTTTCTTCTCCTCCACTTCAGTTGGCTCTGAGGTAGAAGCAGC
CATGGTTGGTGGCTTCACGCTCTCTTTCACCACAGGCTTCTTCTTCTCCGGCTTTATCAG
CTTCTCCTTCGCCGCCCTAACCGCGGCGGAGATCTCCTCCTCAGCGGAGGGTTTCTTGAG
AAAATCGCTCTGTTCGCCGAGAAAGTTGAAGACTTTCTCTAAGAAAGCTAGTGGGTTCGA
AGAATCGAGTGTCGCCCTAAACGGTAAGATCGAGGGTCGGGTGCTGCTTTCATCTTCAAC
CTCGGAGATGATCGCCATTGTTGGGTTTTTTTTTTCGTTTCTAGGGTTTTGCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK55JQ U 7
AF RR2EQ23JQ U 1
AF RR2EQ23TF C 430
BS 1 90 RR2EQ23JQ
BS 91 91 RR2DK55JQ
BS 92 187 RR2EQ23JQ
BS 188 188 RR2DK55JQ
BS 189 189 RR2EQ23JQ
BS 190 190 RR2DK55JQ
BS 191 194 RR2EQ23JQ
BS 195 195 RR2DK55JQ
BS 196 250 RR2EQ23JQ
BS 251 251 RR2DK55JQ
BS 252 266 RR2EQ23JQ
BS 267 267 RR2DK55JQ
BS 268 291 RR2EQ23JQ
BS 292 292 RR2DK55JQ
BS 293 302 RR2EQ23JQ
BS 303 303 RR2DK55JQ
BS 304 712 RR2EQ23JQ
BS 713 1076 RR2EQ23TF

RD RR2DK55JQ 363 0 0
AAAA
AAAACCGGATTTTTTAAGTTTCAACCAACCAAATATCAAACCGAACATATCCTTGGAGAT
GAAACTGTGTCTTCCACTAAAACAAAACTAAAGCAGGAACAAGTTTTTTAAGGATGCAAC
GGAAAAAAAACAAGCTGGTCATACAAAACTGTATTTTTTTCTTCTGCTTCTGGGAAAAAA
ACCAAACAACAGGAACATCAGTTTATCTTTGCGTTTGTGAAGTCCATCTCTGGATGCTGA
AACATGAACTTCTTGAAAATGTCTTGCTTTTGTAGCTCGTCCCTTGTTGGAAAACCCATT
TGCTTTTGCCTTTGATCAAACATCATCTTCTCAACAGTGGAGCGAGTTTCAGGGTCAAG

QA 5 363 5 363
DS 

RD RR2EQ23JQ 712 0 0
ATGAATAAAGAAAACCGGATTTTTTAAGTTTCAACCAACCAAATATCAAACCGAACATAT
CCTTGGAGATGAAACTGTGTCTTCCACTAAGACAAAACTAAAGCAGGAACAAGTTTTTTA
AGGATGCAACGGAAAAAAAACAAGCTGGTCATACAAAACTGTATTTTTTTCTTCTGCTTC
TGGGAAAGAGACCAGACAACAGGAACATCAGTTTATCTTTGCGTTTGTGAAGTCCATCTC
TGGATGCAGAGACATGAACTTCTTGAGAATGTCTTGCTTTTGTAGCTCGTCGCTTGTTGG
AAGACCCATTTGCTTTTGCCTTTGATCAAACATCATCTTCTCAACAGTGGAGCGAGTTTC
AGGGTCAAGGTCAGCTAATTTACTGTTCTCCGGTTCAACCTTCTGTGTATCGATCTCAGG
TTCACCTTTCACACAGCACTTCCACCACTCCATCTGATCTTGCTTTGTCAACAGAATCGA
AATCATCTTTTGATCCTCGATATTCCAGTAGCAGTCATCAGGCTTCACAGATCGGTATAG
CTCTCCATCAATGATTGGATCCTGGCCTTTAAGACCAAGCTTGAGACGGTTCTTCTTAAT
CTCGCATACAACAGACCGTGCTTTAGTACCAGTAGGGACTGGAATGTTAACAGTAACCTC
CTGAAGGGTCTGGACCCATGAGTAGCTCTCAAGATCATAACCATTACCCTTG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2EQ23TF 647 0 0
CACACAGCACTTCCACCACTCCATCTGATCTTGCTTTGTCAACAGAATCGAAATCATCTT
TTGATCCTCGATATTCCAGTAGCAGTCATCAGGCTTCACAGATCGGTATAGCTCTCCATC
AATGATTGGATCCTGGCCTTTAAGACCAAGCTTGAGACGGTTCTTCTTAATCTCGCATAC
AACAGACCGTGCTTTAGTACCAGTAGGGACTGGAATGTTAACAGTAACCTCCTGAAGGGT
CTGGACCCATGAGTAGCTCTCAAGATCATAACCATTACCCTTGTTAGGTGCAATGGGACT
AGCTTCTTGTTTCTTCTCCTCCACTTCAGTTGGCTCTGAGGTAGAAGCAGCCATGGTTGG
TGGCTTCACGCTCTCTTTCACCACAGGCTTCTTCTTCTCCGGCTTTATCAGCTTCTCCTT
CGCCGCCCTAACCGCGGCGGAGATCTCCTCCTCAGCGGAGGGTTTCTTGAGAAAATCGCT
CTGTTCGCCGAGAAAGTTGAAGACTTTCTCTAAGAAAGCTAGTGGGTTCGAAGAATCGAG
TGTCGCCCTAAACGGTAAGATCGAGGGTCGGGTGCTGCTTTCATCTTCAACCTCGGAGAT
GATCGCCATTGTTGGGTTTTTTTTTTCGTTTCTAGGGTTTTGCTCCC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 3

CO CL3372Contig1 1307 3 5 U
GGCTGTAAAAATTCTTCTGAATCTCTCTTCTTCCCACAACATTCTCTATATACAATACAA
CTGTCCGATTGTTGCCGGTTCATTTGACGGAAACTCATGAAGAAAAGCATCTCTCTTTAT
TTAAAATCAACACCTCACGAGAATTGACCTGTTGCAATTAAATCGGATTCGATCAAAGTT
TTCACCTTTCGATGGATTTGGATAGCATGGACTGCACTTCAACCATTGATTTAACAGATG
ACGAAGAGAGCCATCAAGATCGCCATTCCTACGCATCGGTTTCAAAGCATCATAGTACTA
ATAACACCAACGCGAATACTGCTTCTGGTCTTCTTCCGACAACCACTAGTGTTCATGAGC
TTCTCGAATGTCCTGTCTGCACCAATTCCATGTACCCTCCTATTCATCAGTGTCAAAACG
GACATACTATATGTTCAACTTGTAAAAACAGAGTTCACAATCGCTGCCCTACATGTAGAC
AAGAGCTAGGTGATATCCGTTGTTTGGCACTCGAAAAAGTAGCCGAGTCTCTTGAGCTAC
CTTGCAAGTACACGCCACTTGGATGTCCGGTGATATTCCCTTATTACAGCAAGCTCGACC
ACGAGACCGTATGTGACTTCAGGCCTTATAACTGTCCGTACGCTGGTTCGGAGTGTTCTG
TCATGGGTGATATCCCTTTCTTAGTTGCTCACCTGAGAGATGACCATAAGGTGGATATGC
ATTCTGGGTGTACTTTCAACCACCGTTACGTCAAGTCTAATCCTCGTGAAGTCGATAACG
CCACGTGGATGTTAACTGTCTTTCACTGTTTTGGTGAATACTTTTGTCTTCACTTTGAGG
CATTCCAGCTCGGAACGGCTCCAGTTTACATGGCGTTCCTGCGTTTCATGGGGGATGAGA
CAGAAGCTCGGAGCTACAATTACAGTTTGGAAGTTGGAGGGTATGGTCGGAAGCTGATTT
GGGAAGGAACACCGAGAAGCGTGAGAGACAGTCACAGGAAAGTTAGAGACAGTCATGATG
GACTAATCATACAGAGGAACATTGCTTTCTTCTTCTCAGGTGGAGACAGGAAAGAGCTGA
AACTGCGAGTCACTGGAAGAATATGGAAAGAACAGCAGCAAAGTGGTGTTGAAGCTCGTG
GAGGAGGAGGAGCTTGTATCCCAAACTTGTCTTAAAAAATTAATTTTTTGAAACTCTTAC
TGACTTGCCGCTGTGTCACAGATGCAGTTACAAATCAAAGCATAAAAGAAAACTAAAACG
ATAACTACATAGAGTAATCCCTTGCTGTCAGATGAGTTTCAAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D060TF U 1
AF RR2GR79TF U 148
AF RR2GR79JQ C 761
BS 1 249 RR2D060TF
BS 250 250 RR2GR79TF
BS 251 445 RR2D060TF
BS 446 829 RR2GR79TF
BS 830 1307 RR2GR79JQ

RD RR2D060TF 446 0 0
GGCTGTAAAAATTCTTCTGAATCTCTCTTCTTCCCACAACATTCTCTATATACAATACAA
CTGTCCGATTGTTGCCGGTTCATTTGACGGAAACTCATGAAGAAAAGCATCTCTCTTTAT
TTAAAATCAACACCTCACGAGAATTGACCTGTTGCAATTAAATCGGATTCGATCAAAGTT
TTCACCTTTCGATGGATTTGGATAGCATGGACTGCACTTCAACCATTGATTTAACAGATG
ACGAAGAGATCCATCAAGATCGCCATTCCTACGCATCGGTTTCAAAGCATCATAGTACTA
ATAACACCAACGCGAATACTGCTTCTGGTCTTCTTCCGACAACCACTAGTGTTCATGAGC
TTCTCGAATGTCCTGTCTGCACCAATTCCATGTACCCTCCTATTCATCAGTGTCAAAACG
GACATACTATATGTTCAACTTGTAA
G

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR2GR79TF 682 0 0
GGG
GTTGCAATTAAATCGGATTCGATCAAAGTTTTCACCTTTCGATGGATTTGGATAGCATGG
ACTGCACTTCAACCATTGATTTAACAGATGACGAAGAGAGCCATCAAGATCGCCATTCCT
ACGCATCGGTTTCAAAGCATCATAGTACTAATAACACCAACGCGAATACTGCTTCTGGTC
TTCTTCCGACAACCACTAGTGTTCATGAGCTTCTCGAATGTCCTGTCTGCACCAATTCCA
TGTACCCTCCTATTCATCAGTGTCAAAACGGACATACTATATGTTCAACTTGTAAAAACA
GAGTTCACAATCGCTGCCCTACATGTAGACAAGAGCTAGGTGATATCCGTTGTTTGGCAC
TCGAAAAAGTAGCCGAGTCTCTTGAGCTACCTTGCAAGTACACGCCACTTGGATGTCCGG
TGATATTCCCTTATTACAGCAAGCTCGACCACGAGACCGTATGTGACTTCAGGCCTTATA
ACTGTCCGTACGCTGGTTCGGAGTGTTCTGTCATGGGTGATATCCCTTTCTTAGTTGCTC
ACCTGAGAGATGACCATAAGGTGGATATGCATTCTGGGTGTACTTTCAACCACCGTTACG
TCAAGTCTAATCCTCGTGAAGTCGATAACGCCACGTGGATGTTAACTGTCTTTCACTGTT
TTGGTGAATACTTTTGTCT

QA 4 682 4 682
DS 

RD RR2GR79JQ 547 0 0
TCCTCGTGAAGTCGATAACGCCACGTGGATGTTAACTGTCTTTCACTGTTTTGGTGAATA
CTTTTGTCTTCACTTTGAGGCATTCCAGCTCGGAACGGCTCCAGTTTACATGGCGTTCCT
GCGTTTCATGGGGGATGAGACAGAAGCTCGGAGCTACAATTACAGTTTGGAAGTTGGAGG
GTATGGTCGGAAGCTGATTTGGGAAGGAACACCGAGAAGCGTGAGAGACAGTCACAGGAA
AGTTAGAGACAGTCATGATGGACTAATCATACAGAGGAACATTGCTTTCTTCTTCTCAGG
TGGAGACAGGAAAGAGCTGAAACTGCGAGTCACTGGAAGAATATGGAAAGAACAGCAGCA
AAGTGGTGTTGAAGCTCGTGGAGGAGGAGGAGCTTGTATCCCAAACTTGTCTTAAAAAAT
TAATTTTTTGAAACTCTTACTGACTTGCCGCTGTGTCACAGATGCAGTTACAAATCAAAG
CATAAAAGAAAACTAAAACGATAACTACATAGAGTAATCCCTTGCTGTCAGATGAGTTTC
AAATCCC

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 3

CO CL3373Contig1 1318 3 2 U
GGGTCCGTCGTCCAAGCATAAAATTAAGGATTCCTCTCTAAAGTGATAAAGGAGAGGAAC
ACAGTTCAGTCCTGAAGCCAGTTTTGTCCGTGTTGTGAAAGTCTGGTACTTGAGTCTTGT
CTACTTGTTCCCCATCCTGTGTTATCTCTAGTCTCAGTCTTATACGAGTATGATAGCTTG
ACAAACCTTCATACAAGTGCATTCTGTGCGGTAAAATGTCTCTTCTTTGCTCTTCATCTT
GTGTAGCTCCTCCCCATTTGCCACAGACCAAACGATCATGCCCAAGTTCTCAGAAACTCA
AAGGACCTACTCTGATTCTATGTTCTTCCATCAGCTACCCTAGATTTACCACTGGTATCA
AGAAGCACATCAGTTACTTGTTTGCGGGACCACATAAGCTTCGTAGGCTAGAAAAGAGTC
AGATATCAGTTAGTCCTGAGTCTTTTACAGAGAACAGCACAGTGGATATTGATTGGGAAG
ATCAGGAGGACGTTGAGGATACTGGTTCACCTTGGGAAGGCTCGGTTATGTATAGGAGAA
ATGCGTCAGTCACACATGTGGAATAC**TACCACTTTGGAGAGGCTTGGGTTGGGGAAGC
TGTCCACTGAGGTCTCGAAGAAGAGGGCTTCTTCAATGGGGCTAAGAATGACGAAAGATG
TCAAGGATTATCCTGAGGGGACACCAGTTCAAGTTTCAGTTGATGTCATAAGGAAGAAGA
AGAAGCTGAGACTCGATGGGATTGTCAGAACTGTTATCACACTTGGATGCAACAGATGTG
GTGAGGAAGCAGGTGAGAGCATTTTCTCCAACTTCTCGTTGCTACTAACCGAAGAGCCGG
TTGAAGAATCGGATGTCATTGATTTAGGATTCACATTCGGTAATGATAAAACCAATTCCT
TCTCTATGGACGACAGAGAAGGAGATGAGGATGATGATGATGAGATAGATTGGGAGGATA
AGCTCCATTTTCCGCCAGAGGTGAAAGAGATAGATATATCAAAGCATATAAGAGACTTGG
TGCATTTAGAGATCACGATGAATGCTATATGCGATCCTGCGTGTAAAGGAATGTGCTTGA
AATGCGGTGCTAATCTGAATAAGAGGAAGTGTGATTGTGACAGTGAAGAGAAGGATAAAG
GATATGGACCTCTTGGAAACCTGAGAAAGCAAATGCAACAGAAAGAGGGTCTTAGAAACT
AGACCCTGAGAACTATTTTTTTTTTTGGATTTGTATCTTTTCTTTCTCGGTATAAAACTC
ACACTTGTTTGTACCCAAAAAAATCAAAAGAGAATCTGCAGTGGCTAAAACTTACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF19TF U 1
AF RR2DM82TF U 8
AF RR2AF19JQ C 481
BS 1 709 RR2AF19TF
BS 710 1318 RR2AF19JQ

RD RR2AF19TF 709 0 0
GGGTCCGTCGTCCAAGCATAAAATTAAGGATTCCTCTCTAAAGTGATAAAGGAGAGGAAC
ACAGTTCAGTCCTGAAGCCAGTTTTGTCCGTGTTGTGAAAGTCTGGTACTTGAGTCTTGT
CTACTTGTTCCCCATCCTGTGTTATCTCTAGTCTCAGTCTTATACGAGTATGATAGCTTG
ACAAACCTTCATACAAGTGCATTCTGTGCGGTAAAATGTCTCTTCTTTGCTCTTCATCTT
GTGTAGCTCCTCCCCATTTGCCACAGACCAAACGATCATGCCCAAGTTCTCAGAAACTCA
AAGGACCTACTCTGATTCTATGTTCTTCCATCAGCTACCCTAGATTTACCACTGGTATCA
AGAAGCACATCAGTTACTTGTTTGCGGGACCACATAAGCTTCGTAGGCTAGAAAAGAGTC
AGATATCAGTTAGTCCTGAGTCTTTTACAGAGAACAGCACAGTGGATATTGATTGGGAAG
ATCAGGAGGACGTTGAGGATACTGGTTCACCTTGGGAAGGCTCGGTTATGTATAGGAGAA
ATGCGTCAGTCACACATGTGGAATAC**TACCACTTTGGAGAGGCTTGGGTTGGGGAAGC
TGTCCACTGAGGTCTCGAAGAAGAGGGCTTCTTCAATGGGGCTAAGAATGACGAAAGATG
TCAAGGATTATCCTGAGGGGACACCAGTTCAAGTTTCAGTTGATGTCAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2DM82TF 707 0 0
GG
GTCCAAGCATAAAATTAAGGATTCCTCTCTAAAGTGATAAAGGAGAGGAACACAGTTCAG
TCCTGAAGCCAGTTTTGTCCGTGTTGTGAAAGTCTGGTACTTGAGTCTTGTCTACTTGTT
CCCCATCCTGTGTTATCTCTAGTCTCAGTCTTATACGAGTATGATAGCTTGACAAACCTT
CATACAAGTGCATTCTGTGCGGTAAAATGTCTCTTCTTTGCTCTTCATCTTGTGTAGCTC
CTCCCCATTTGCCACAGACCAAACGATCATGCCCAAGTTCTCAGAAACTCAAAGGACCTA
CTCTGATTCTATGTTCTTCCATCAGCTACCCTAGATTTACCACTGGTATCAAGAAGCACA
TCAGTTACTTGTTTGCGGGACCACATAAGCTTCGTAGGCTAGAAAAGAGTCAGATATCAG
TTAGTCCTGAGTCTTTTACAGAGAACAGCACAGTGGATATTGATTGGGAAGATCAGGAGG
ACGTTGAGGATACTGGTTCACCTTGGGAAGGCTCGGTTATGTATAGGAGAAATGCGTCAG
TCACACATGTGGAATACTGTACCACTTTGGAGAGGCTTGGGTTGGGGAAGCTGTCCACTG
AGGTCTCGAAGAAGAGGGCTTCTTCAATGGGGCTAAGAGTGACGAAAGATGTCAAGGATT
ATCCGGAGGGGACACCAGTTCAAGTTTCAGTTGATGTCAT
AAGAG

QA 3 702 3 702
DS 

RD RR2AF19JQ 838 0 0
ATCAGGAGGACGTTGAGGATACTGGTTCACCTTGGGAAGGCTCGGTTATGTATAGGAGAA
ATGCGTCAGTCACACATGTGGAATAC**TACCACTTTGGAGAGGCTTGGGTTGGGGAAGC
TGTCCACTGAGGTCTCGAAGAAGAGGGCTTCTTCAATGGGGCTAAGAATGACGAAAGATG
TCAAGGATTATCCTGAGGGGACACCAGTTCAAGTTTCAGTTGATGTCATAAGGAAGAAGA
AGAAGCTGAGACTCGATGGGATTGTCAGAACTGTTATCACACTTGGATGCAACAGATGTG
GTGAGGAAGCAGGTGAGAGCATTTTCTCCAACTTCTCGTTGCTACTAACCGAAGAGCCGG
TTGAAGAATCGGATGTCATTGATTTAGGATTCACATTCGGTAATGATAAAACCAATTCCT
TCTCTATGGACGACAGAGAAGGAGATGAGGATGATGATGATGAGATAGATTGGGAGGATA
AGCTCCATTTTCCGCCAGAGGTGAAAGAGATAGATATATCAAAGCATATAAGAGACTTGG
TGCATTTAGAGATCACGATGAATGCTATATGCGATCCTGCGTGTAAAGGAATGTGCTTGA
AATGCGGTGCTAATCTGAATAAGAGGAAGTGTGATTGTGACAGTGAAGAGAAGGATAAAG
GATATGGACCTCTTGGAAACCTGAGAAAGCAAATGCAACAGAAAGAGGGTCTTAGAAACT
AGACCCTGAGAACTATTTTTTTTTTTGGATTTGTATCTTTTCTTTCTCGGTATAAAACTC
ACACTTGTTTGTACCCAAAAAAATCAAAAGAGAATCTGCAGTGGCTAAAACTTACTCC

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 3

CO CL3374Contig1 1457 3 7 U
GGAACGAAGTCTCCTCTCCTCTCTACAGACGGAGCCAGCGAGAGAAAGCGACTCCACCTT
CTTTGTCTCTTTCGATTCCCTCTCTCTTCTTTAAAGATACAGCAAGAGGCGCACGCGTGC
ATTTTGAGAGTGAATCGAGGGAGAAAGATGGGTAAGTCAAAGTGTTTCATGGACATTAGC
ATTGGAGGCGAGCTTGAAGGGCGAATCATCATCGAGCTTTACGACGACGTCGTCCCCAAA
ACCGCCCAGAATTTCCGATCGCTTTGCACCGGTGACAAAGGCATCGGCCCCAACACCGCC
GTCCCTCTCCACTACAAGGGGAATCGGTTCCATCGTGTAATAAAGGGGTTTATGATTCAA
GGTGGGGACATAACAGCTAACGATGGTACCGGTGGTGAATCTATCTACGGGTTAAAGTTC
GAAGATGAGAACTTTGAGCTGAAACATGAGAGGAAAGGGATGCTCTCTATGGCTAACTCT
GGCCCCAACACCAACGGCTCTCAGTTTTTCATCACCACCACTCGCACTTCTCATCTTGAT
GGCAAGCATGTCGTCTTTGGAAGGGTCACCAAAGGGATGGGAGTGGTTCGTTCCATTGAG
CATGTTTCAACCGAGGAAAACGCTTCTCCTTCTCTCGATGTTGTGATTCATGACTGTGGG
CTCATTCCTGAGGGTGAAGATGATGGGATTTGTAACTTTTTCAAGGACGGTGATGTTTTC
CCTGACTGGCCTATTGATCTTAATGAAAGCCCTGCTGAGCTGTCTTGGTGGATGGAGACT
GTTGATTCTGTCAAGGCTAGTGGTAACGAGCACTTCAAGAAACAAGACTACAAGATGGCT
CTTAGAAAGTACCGCAAGGCTTTGCGTTATCTGGATATTTGCTGGGAGAAAGATGGCATT
GACCAAGAGACGAGCACTGCCTTGCGTAAGACAAAGTCGCAGATCTTCACTAACAGTGCT
GCCTGTAAACTGAAATTTGGAGATGCAAAGGGAGCATTGCTGGACACTGAATTTGCTATG
CGTGATGAAGATAACAATGTCAAAGCATTGTTTCGACAGGGACAGGCACACATGGCTCTC
AATAATATCGATGCTGCTGCTGAAAGCCTGGAGAAAGCTCTTCAGTTCGAACCTAACGAT
GCTGGCCTCAAGAAAGAATATGCTGCTGTAATGAAAAAGATTTCCATTAGAGACAATAAA
GAGAAAAAGCAGTACCGCAAAATGTTTGGATAGAATTGTTTGATACATTTTAGGGGTTTG
GTTGGATAGTGGAGAAGGGACTAACAAAGAAAAGATGAAAAGAGCATATAAAAGAAAGAA
ATATTTAAGACTTTGGGCACTGTTTCTGGTTCCCTCATTTTGGTAAACAATGTTTACTTC
TGCATTTCCAGCAAAGATATGCATAATCTTTTACCCAAGACAGACTATGAGATGACAATT
ATTGCAATTTTGAGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F557TF U 1
AF RR2GC95TF U 620
AF RR2F557JQ C 727
BS 1 673 RR2F557TF
BS 674 674 RR2GC95TF
BS 675 702 RR2F557TF
BS 703 1020 RR2GC95TF
BS 1021 1021 RR2F557JQ
BS 1022 1026 RR2GC95TF
BS 1027 1457 RR2F557JQ

RD RR2F557TF 702 0 0
GGAACGAAGTCTCCTCTCCTCTCTACAGACGGAGCCAGCGAGAGAAAGCGACTCCACCTT
CTTTGTCTCTTTCGATTCCCTCTCTCTTCTTTAAAGATACAGCAAGAGGCGCACGCGTGC
ATTTTGAGAGTGAATCGAGGGAGAAAGATGGGTAAGTCAAAGTGTTTCATGGACATTAGC
ATTGGAGGCGAGCTTGAAGGGCGAATCATCATCGAGCTTTACGACGACGTCGTCCCCAAA
ACCGCCCAGAATTTCCGATCGCTTTGCACCGGTGACAAAGGCATCGGCCCCAACACCGCC
GTCCCTCTCCACTACAAGGGGAATCGGTTCCATCGTGTAATAAAGGGGTTTATGATTCAA
GGTGGGGACATAACAGCTAACGATGGTACCGGTGGTGAATCTATCTACGGGTTAAAGTTC
GAAGATGAGAACTTTGAGCTGAAACATGAGAGGAAAGGGATGCTCTCTATGGCTAACTCT
GGCCCCAACACCAACGGCTCTCAGTTTTTCATCACCACCACTCGCACTTCTCATCTTGAT
GGCAAGCATGTCGTCTTTGGAAGGGTCACCAAAGGGATGGGAGTGGTTCGTTCCATTGAG
CATGTTTCAACCGAGGAAAACGCTTCTCCTTCTCTCGATGTTGTGATTCATGACTGTGGG
CTCATTCCTGAGG*TGAAGATGATGGGATTTGTAACTTTTTC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2GC95TF 407 0 0
G
CGCTTCTCCTTCTCTCGATGTTGTGATTCATGACTGTGGTCTCATTCCTGAGGGTGAAGA
TGATGGGATTTGTAACTTTTTCAAGGACGGTGATGTTTTCCCTGACTGGCCTATTGATCT
TAATGAAAGCCCTGCTGAGCTGTCTTGGTGGATGGAGACTGTTGATTCTGTCAAGGCTAG
TGGTAACGAGCACTTCAAGAAACAAGACTACAAGATGGCTCTTAGAAAGTACCGCAAGGC
TTTGCGTTATCTGGATATTTGCTGGGAGAAAGATGGCATTGACCAAGAGACGAGCACTGC
CTTGCGTAAGACAAAGTCGCAGATCTTCACTAACAGTGCTGCCTGTAAACTGAAATTTGG
AGATGCAAAGGGAGCATTGCTGGACACTGAATTTGCTATGTGTGAT

QA 2 407 2 407
DS 

RD RR2F557JQ 731 0 0
CTGG
CTATTGATCTTAATGAAAGCCCTGCTGAGCTGTCTTGGTGGATGGAGACTGTTGATTCTG
TCAAGGCTAGTGGTAACGAGCACTTCAAGAAACAAGACTACAAGATGGCTCTTAGAAAGT
ACCGCAAGGCTTTGCGTTATCTGGATATTTGCTGGGAGAAAGATGGCATTGACCAAGAGA
CGAGCACTGCCTTGCGTAAGACAAAGTCGCAGATCTTCACTAACAGTGCTGCCTGTAAAC
TGAAATTTGGAGATGCAAAGGGAGCATTGCTGGACACTGAATTTGCTATGCGTGATGAAG
ATAACAATGTCAAAGCATTGTTTCGACAGGGACAGGCACACATGGCTCTCAATAATATCG
ATGCTGCTGCTGAAAGCCTGGAGAAAGCTCTTCAGTTCGAACCTAACGATGCTGGCCTCA
AGAAAGAATATGCTGCTGTAATGAAAAAGATTTCCATTAGAGACAATAAAGAGAAAAAGC
AGTACCGCAAAATGTTTGGATAGAATTGTTTGATACATTTTAGGGGTTTGGTTGGATAGT
GGAGAAGGGACTAACAAAGAAAAGATGAAAAGAGCATATAAAAGAAAGAAATATTTAAGA
CTTTGGGCACTGTTTCTGGTTCCCTCATTTTGGTAAACAATGTTTACTTCTGCATTTCCA
GCAAAGATATGCATAATCTTTTACCCAAGACAGACTATGAGATGACAATTATTGCAATTT
TGAGTAG

QA 5 731 5 731
DS 



AS 1 2

CO CL3375Contig1 1237 2 8 U
CACTGTAACTCTGTAAGTATCATCATTATAGTGAAAAGGAGTTTTACAGAGCAGAAGCTT
ATCTCACAGAGAGTATCTACTGATTACTTATTTTTGGTGTGAATGAACACAATGACAAAT
ATTCCGAAAACCAAACATAGACATAAACGCATATCTTCCGATACTATAATGAGCGCCATT
CATAGCTTGGAGGCATCATCAGCTGTGATCTGATGGCTGAGAGCAACAGCGGCCTTGGAA
CCGTTAGGACGGGCAAGATGCTTGCTGATGAAATCTCCAGCAGCTATAAGCTTTCCCAAA
TCGACGTTGGTTTGGACCCCCAAACCGTTTAACATGTAAACCACATCTTCTGTGGCTACA
TTTCCTGACGCTCCTTTTGCATATGGGCAACCCCCTAATCCAGCAACCGATGAGTCTACT
ATGTTTATTCCCATTTGGAGAGAAACCAATATGTTTGCAAGAGCTTGTCCATAGGTATCG
TGGAAGTGAACAGCCAGCTTTTCCGCTGGCACAGCTGCCATCACGGCTTCAAGCATGGGA
ACCACAGAACCAGGAGTGCCGATTCCAATTGTATCACCAAGAGAAATCTCAAAGCAGCCC
ATGTCACAGAGCTCTTTAGCAACATGCGCTACTTTTGAAGGTGGAACCGCTCCTTCCACT
GGACACCCCACCGCGCAAGATACATACGCACGGACAGGAATGGAAAGCTCCTTTGCAGCG
GTGGAAACAGCACGATATCTCAAGAGACTCTCTTCGATGGAACAGTTAATATTTGACAAA
GAGAATGACTCGGAAGCCGATGCAAAGATTGCAACTTCCTTAGCACCTGCAGACACAGCT
GCTTCAAAACCTTTAAGATTGGGAGTGAGAACAGGCAATCGAGCCGCCCCATGTAGAGTA
TTAACTGCATCCATTGCATTCTTTGCATCTGCAAGCTGGGGAACCCATTTAGGAGAGACA
AAGCTAGTAGCTTCGACAACGGGCAAACCAGCAGAAACCAATCTCCGAATGAGTTCGACC
TTAACAGAAGTGGGAACAATGTTTTTCTCGTTCTGAAGGCCATCCCTTGGACCAACTTCT
ACAATCTTCACAAACTTGGGTACTTCTCTAAGGAGCTTGTTATCACGTGAATGTGGTAAG
GTGTGAAAATGCCTTTTCCAGGGAAATGACTCTTTGCAGAAGCTTTTATCATCATTGCAA
CCTGTTACCCTCCTCTGGATGCTGTCTATGGAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB40JQ U 1
AF RR2EL14TF C 461
BS 1 668 RR2HB40JQ
BS 669 669 RR2EL14TF
BS 670 768 RR2HB40JQ
BS 769 769 RR2EL14TF
BS 770 779 RR2HB40JQ
BS 780 780 RR2EL14TF
BS 781 805 RR2HB40JQ
BS 806 1237 RR2EL14TF

RD RR2HB40JQ 805 0 0
CACTGTAACTCTGTAAGTATCATCATTATAGTGAAAAGGAGTTTTACAGAGCAGAAGCTT
ATCTCACAGAGAGTATCTACTGATTACTTATTTTTGGTGTGAATGAACACAATGACAAAT
ATTCCGAAAACCAAACATAGACATAAACGCATATCTTCCGATACTATAATGAGCGCCATT
CATAGCTTGGAGGCATCATCAGCTGTGATCTGATGGCTGAGAGCAACAGCGGCCTTGGAA
CCGTTAGGACGGGCAAGATGCTTGCTGATGAAATCTCCAGCAGCTATAAGCTTTCCCAAA
TCGACGTTGGTTTGGACCCCCAAACCGTTTAACATGTAAACCACATCTTCTGTGGCTACA
TTTCCTGACGCTCCTTTTGCATATGGGCAACCCCCTAATCCAGCAACCGATGAGTCTACT
ATGTTTATTCCCATTTGGAGAGAAACCAATATGTTTGCAAGAGCTTGTCCATAGGTATCG
TGGAAGTGAACAGCCAGCTTTTCCGCTGGCACAGCTGCCATCACGGCTTCAAGCATGGGA
ACCACAGAACCAGGAGTGCCGATTCCAATTGTATCACCAAGAGAAATCTCAAAGCAGCCC
ATGTCACAGAGCTCTTTAGCAACATGCGCTACTTTTGAAGGTGGAACCGCTCCTTCCACT
GGACACCCGACCGCGCAAGATACATACGCACGGACAGGAATGGAAAGCTCCTTTGCAGCG
GTGGAAACAGCACGATATCTCAAGAGACTCTCTTCGATGGAACAGTTA*TATTTGACAAG
GAGAATGACTCGGAAGCCGATGCAA

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2EL14TF 777 0 0
AAGAGCTGTCCATA
GTATCGTGGAAGTGAACAGCCAG*TTTTCCGCTGGCACAGCTGCCATCACGGCTTCAAGC
ATGGGAACCACAGAACCAGGAGTGC*GATTCCAATTGTATCACCAAGAGAAATCTCAAAG
CAGCCCATGTCACAGAGCTCTTTAGCAACATGCGCTACTTTTGAAGGTGGAACCGCTCCT
TCCACTGGACACCCCACCGCGCAAGATACATACGCACGGACAGGAATGGAATGCTCCTTT
GCAGCGGTGGAAACAGCACGATATCTCAAGAGACTCTCTTCGATGGTACAGTTAATATTT
GACAAAGAGAATGACTCGGAAGCCGATGCAAAGATTGCAACTTCCTTAGCACCTGCAGAC
ACAGCTGCTTCAAAACCTTTAAGATTGGGAGTGAGAACAGGCAATCGAGCCGCCCCATGT
AGAGTATTAACTGCATCCATTGCATTCTTTGCATCTGCAAGCTGGGGAACCCATTTAGGA
GAGACAAAGCTAGTAGCTTCGACAACGGGCAAACCAGCAGAAACCAATCTCCGAATGAGT
TCGACCTTAACAGAAGTGGGAACAATGTTTTTCTCGTTCTGAAGGCCATCCCTTGGACCA
ACTTCTACAATCTTCACAAACTTGGGTACTTCTCTAAGGAGCTTGTTATCACGTGAATGT
GGTAAGGTGTGAAAATGCCTTTTCCAGGGAAATGACTCTTTGCAGAAGCTTTTATCATCA
TTGCAACCTGTTACCCTCCTCTGGATGCTGTCTATGGAGCTCC

QA 15 777 15 777
DS 



AS 1 3

CO CL3376Contig1 392 3 3 U
GGATTCACGTCTGAGCATTCAAAAAATAAAAAATCATGGGGTTTGCGGCGATTTGGAACT
CTCATCCCAAGAAGTACGGGCCTGGTTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATG
GGCTAATCAGGAAGTACGGTCTTAACTGCTGTAGGCAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGG
AAATCGGATTCATCAAGTACCGTTAAAGATCTGGTGTTGTTGATGCAGTTGCAGTCATTT
TGTTTTCTTAAGCTTTTGAGACTTCAATATTGTAATGGATCTTATTAATATGCAATACAT
TTGAGTTGTTGAACGTTTTAGTTTACTTGTTTTAATCCAAAATCTTGGTTCTGCAATTTG
ATCATCTGGTAGATTGGAGTTTCTCTTTACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW53TF U 5
AF RR2DW53JQ C 5
AF RR2FI41TF U 1
BS 1 43 RR2FI41TF
BS 44 44 RR2DW53TF
BS 45 392 RR2FI41TF

RD RR2DW53TF 288 0 0
GG
ACGTCTGAGCATTCAAAAAATAAAAAATCATGGGGTTTGCGGCGATTTGGAACTCTCATC
CCAAGAAGTACGGGCCTGGTTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAA
TCAGGAAGTACGGTCTTAACTGCTGTAGGCAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCG
GATTCATCAAGTACCGTTAAAGATCTGGTGTTGTTGATGCAGTTGCAGTCATTTTGTTTT
CTTAAGCTTTTGAGACTTCAATATTGTAATGGATCTTATTAATATG

QA 3 288 3 288
DS 

RD RR2DW53JQ 315 0 0
GG
ACGTCTGAGCATTCAAAAAATAAAAAATCATGGGGTTTGCGGCGATTTGGAACTCTCATC
CCAAGAAGTACGGGCCTGGTTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAA
TCAGGAAGTACGGTCTTAACTGCTGTAGGCAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCG
GATTCATCAAGTACCGTTAAAGATCTGGTGTTGTTGATGCAGTTGCAGTCATTTTGTTTT
CTTAAGCTTTTGAGACTTCAATATTGTAATGGATCTTATTAATATGCAATACATTTGAGT
TGTTGAACGTTTT

QA 3 315 3 315
DS 

RD RR2FI41TF 392 0 0
GGATTCACGTCTGAGCATTCAAAAAATAAAAAATCATGGGGTT*GCGGCGATTTGGAACT
CTCATCCCAAGAAGTACGGGCCTGGTTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATG
GGCTAATCAGGAAGTACGGTCTTAACTGCTGTAGGCAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGG
AAATCGGATTCATCAAGTACCGTTAAAGATCTGGTGTTGTTGATGCAGTTGCAGTCATTT
TGTTTTCTTAAGCTTTTGAGACTTCAATATTGTAATGGATCTTATTAATATGCAATACAT
TTGAGTTGTTGAACGTTTTAGTTTACTTGTTTTAATCCAAAATCTTGGTTCTGCAATTTG
ATCATCTGGTAGATTGGAGTTTCTCTTTACTT

QA 1 392 1 392
DS 



AS 1 2

CO CL3377Contig1 824 2 2 U
GGCAGAAAAAAATGCACGCTGTTAAAATTCACATAGAAGCCAACTGTTTGTTGTTTTCTT
TTAGATGGGCCTAAACCAAAATCGATGGGCCTCACATAGTAATACACATAGATGAATCGC
AGGAGTGACACGTGAATACCACGCGATAGGTTTGAGATGGTGGTTGTCTCTGTAAAGATC
AGAGCAAGGACTTGACGTGATTCCTAGCTTGGTCGCGTATTTCCCGATTTGGGAACTCCT
CGATCACCTCTGATCCAAAAGAGGAAATGAGAGCTCTTCTTGCAGTCTCCAAGTCGATCC
CACGAGCTTGGAAATAGAAGAGCTGGTCTTCTTCAAGATCACTGATAGCAGCTCCGTGTG
AGCACTTGACATCATCTGCAACGATCTGAAGGTTCGGTTTTATGTTCACGGTGGCTCGAG
GTTTCAAAAGAAGGCTTCTCGTCAGTTGTCCCGCGTCCGTCTGTTGAGCATACTTGTTAA
CTCGGACATTGCCATCGAACACAGCTTGACCAGAGGAGTGAGCAACGATACACTTGTGGA
GCTGACGGGAAGAGCCTCGAGGATGGTCTAAGACAATTCTGCTATGGAGATCAAGAGTCT
GGTCGTTGACGCACATATGAAACGTTGTTAACTCCGTGAGCGTATCGGGCCCGAGTTGCT
GCACATGAACATTGTGCCTCCCTAATCTCCCGCCGGTACTCACTTCTACAAGCTCATACT
CGCTCTCTGCCTCCTGTCGGACGAAAGTCCACTTGATATGAGCAGCAGCCATAGACTCTT
GCTGCAAGTAGGAATGCTTAACCTTGGCATTCTTAAGACAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F180JQ U 1
AF RR2E615TF C 593
BS 1 789 RR2F180JQ
BS 790 824 RR2E615TF

RD RR2F180JQ 789 0 0
GGCAGAAAAAAATGCACGCTGTTAAAATTCACATAGAAGCCAACTGTTTGTTGTTTTCTT
TTAGATGGGCCTAAACCAAAATCGATGGGCCTCACATAGTAATACACATAGATGAATCGC
AGGAGTGACACGTGAATACCACGCGATAGGTTTGAGATGGTGGTTGTCTCTGTAAAGATC
AGAGCAAGGACTTGACGTGATTCCTAGCTTGGTCGCGTATTTCCCGATTTGGGAACTCCT
CGATCACCTCTGATCCAAAAGAGGAAATGAGAGCTCTTCTTGCAGTCTCCAAGTCGATCC
CACGAGCTTGGAAATAGAAGAGCTGGTCTTCTTCAAGATCACTGATAGCAGCTCCGTGTG
AGCACTTGACATCATCTGCAACGATCTGAAGGTTCGGTTTTATGTTCACGGTGGCTCGAG
GTTTCAAAAGAAGGCTTCTCGTCAGTTGTCCCGCGTCCGTCTGTTGAGCATACTTGTTAA
CTCGGACATTGCCATCGAACACAGCTTGACCAGAGGAGTGAGCAACGATACACTTGTGGA
GCTGACGGGAAGAGCCTCGAGGATGGTCTAAGACAATTCTGCTATGGAGATCAAGAGTCT
GGTCGTTGACGCACATATGAAACGTTGTTAACTCCGTGAGCGTATCGGGCCCGAGTTGCT
GCACATGAACATTGTGCCTCCCTAATCTCCCGCCGGTACTCACTTCTACAAGCTCATACT
CGCTCTCTGCCTCCTGTCGGACGAAAGTCCACTTGATATGAGCAGCAGCCATAGACTCTT
GCTGCAAGT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2E615TF 232 0 0
AAGAGTCTGGTCGTTG*CGCACATATGAAACGTTGTTAGCTCCGTGAGCGTATCGGGCCC
GAGTTGCTGCACATGAACATTGTGCCTCCCTAATCTCCCGCCGGTACTCACTTCTACAAG
CTCATACTCGCTCTCTGCCTCCTGTCGGACGAAAGTCCACTTGATATGAGCAGCAGCCAT
AGACTCTTGCTGCAAGTAGGAATGCTTAACCTTGGCATTCTTAAGACAACAC

QA 1 232 1 232
DS 



AS 1 3

CO CL3378Contig1 662 3 4 U
GATCGTGTTGCGACATCTTCTCCTCTCGCAATTCGCAAAACCTAACTTCTCTGAGAGAAT
TTTGATTATTAAGGTTTGTTTTTCTCCTTTTGATTTGGGCGTCGATGGCATCGAACCCTC
ACAGAGGCGGTGCGGGTGGTTCGCTTTACGGAGGCGCCGCTCCGTACAGATCCAGAGATG
GACTTAGCACAAGAACTGCTACAGGTTCAGAGGAAATCCAGCTAAGGATTGATCCCATGC
ACTCTGATCTCGATGATGAGATCACTGGTCTCCATGGCCAAGTCAGGCAATTGAAAAATA
TTGCTCAAGAAATTGGGTCAGAGGCTAAGTTTCAGAGGGATTTCTTGGACGAACTGCAAG
TGACATTGATGAGAGCGCAAGCAGGGGTGAAGAACAACATAAGGAAACTGAACTTGAGCA
TCATACGTAGTGGAAACAACCACATCATGCACGTGGTTCTTTTCGCGCTCCTCTGCTTCT
TCATCCTCTACATGTGGTCCAAAATGTTCAAAAGATGAGAGACTCCTGTTGGAAAGTTGT
AGAAATCTCTTTTTTTAGTTTGTGGTTGGTTCATCTCGTTCCCTGTTATATAGAGTGCTT
TTGTTGAACAAATACAAAGCAAGAAAGATTATATATCACATATCCACATGAGCTGATTCT
GT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2EH59TF U 1
AF RR2CM71JQ C 5
AF RR2CM71TF U 5
BS 1 349 RR2EH59TF
BS 350 350 RR2CM71TF
BS 351 612 RR2EH59TF
BS 613 662 RR2CM71TF

RD RR2EH59TF 612 0 0
GATCGTGTTGCGACATCTTCTCCTCTCGCAATTCGCAAAACCTAACTTCTCTGAGAGAAT
TTTGATTATTAAGGTTTGTTTTTCTCCTTTTGATTTGGGCGTCGATGGCATCGAACCCTC
ACAGAGGCGGTGCGGGTGGTTCGCTTTACGGAGGCGCCGCTCCGTACAGATCCAGAGATG
GACTTAGCACAAGAACTGCTACAGGTTCAGAGGAAATCCAGCTAAGGATTGATCCCATGC
ACTCTGATCTCGATGATGAGATCACTGGTCTCCATGGCCAAGTCAGGCAATTGAAAAATA
TTGCTCAAGAAATTGGGTCAGAGGCTAAGTTTCAGAGGGATTTCTTGGATGAACTGCAAG
TGACATTGATGAGAGCGCAAGCAGGGGTGAAGAACAACATAAGGAAACTGAACTTGAGCA
TCATACGTAGTGGAAACAACCACATCATGCACGTGGTTCTTTTCGCGCTCCTCTGCTTCT
TCATCCTCTACATGTGGTCCAAAATGTTCAAAAGATGAGAGACTCCTGTTGGAAAGTTGT
AGAAATCTCTTTTTTTAGTTTGTGGTTGGTTCATCTCGTTCCCTGTTATATAGAGTGCTT
TTGTTGAACAAA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2CM71JQ 658 0 0
GG
GTTGCGACATCTTCTCCTCTCGCAATTCGCAAAACCTAACTTCTCTGAGAGAATTTTGAT
TATTAAGGTTTGTTTTTCTCCTTTTGATTTGGGCGTCGATGGCATCGAACCCTCACAGAG
GCGGTGCGGGTGGTTCGCTTTACGGAGGCGCCGCTCCGTACAGATCCAGAGATGGACTTA
GCACAAGAACTGCTACAGGTTCAGAGGAAATCCAGCTAAGGATTGATCCCATGCACTCTG
ATCTCGATGATGAGATCACTGGTCTCCATGGCCAAGTCAGGCAATTGAAAAATATTGCTC
AAGAAATTGGGTCAGAGGCTAAGTTTCAGAGGGATTTCTTGGACGAACTGCAAGTGACAT
TGATGAGAGCGCAAGCAGGGGTGAAGAACAACATAAGGAAACTGAACTTGAGCATCATAC
GTAGTGGAAACAACCACATCATGCACGTGGTTCTTTTCGCGCTCCTCTGCTTCTTCATCC
TCTACATGTGGTCCAAAATGTTCAAAAGATGAGAGACTCCTGTTGGAAAGTTGTAGAAAT
CTCTTTTTTTAGTTTGTGGTTGGTTCATCTCGTTCCCTGTTATATAGAGTGCTTTTGTTG
AACAAATACAAAGCAAGAAAGATTATATATCACATATCCACATGAGCTGATTCTGT

QA 3 658 3 658
DS 

RD RR2CM71TF 658 0 0
GG
GTTGCGACATCTTCTCCTCTCGCAATTCGCAAAACCTAACTTCTCTGAGAGAATTTTGAT
TATTAAGGTTTGTTTTTCTCCTTTTGATTTGGGCGTCGATGGCATCGAACCCTCACAGAG
GCGGTGCGGGTGGTTCGCTTTACGGAGGCGCCGCTCCGTACAGATCCAGAGATGGACTTA
GCACAAGAACTGCTACAGGTTCAGAGGAAATCCAGCTAAGGATTGATCCCATGCACTCTG
ATCTCGATGATGAGATCACTGGTCTCCATGGCCAAGTCAGGCAATTGAAAAATATTGCTC
AAGAAATTGGGTCAGAGGCTAAGTTTCAGAGGGATTTCTTGGACGAACTGCAAGTGACAT
TGATGAGAGCGCAAGCAGGGGTGAAGAACAACATAAGGAAACTGAACTTGAGCATCATAC
GTAGTGGAAACAACCACATCATGCACGTGGTTCTTTTCGCGCTCCTCTGCTTCTTCATCC
TCTACATGTGGTCCAAAATGTTCAAAAGATGAGAGACTCCTGTTGGAAAGTTGTAGAAAT
CTCTTTTTTTAGTTTGTGGTTGGTTCATCTCGTTCCCTGTTATATAGAGTGCTTTTGTTG
AACAAATACAAAGCAAGAAAGATTATATATCACATATCCACATGAGCTGATTCTGT

QA 3 658 3 658
DS 



AS 1 3

CO CL3379Contig1 215 3 2 U
CAAGAAGTAAAAAGATAATGTAAAAGGATGTTTTCCATAAATCCAGATAAGTAATTGCAA
AAATCTGAAAAAAAAACCAGTCTGATACACAAAAACTGAGATTCAAAACGATGACAAGAT
AAAAAGAGTTTCTTCTAAGGGGGTTCTCTCACTTCTTCTCTTGACTATGAGTTCTAGTCT
CAATAAGAATGCTAGTTCTTACTGTTCACATGTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX34JQ U 1
AF RR2AW93JQ U 54
AF RR2DX34TF C 1
BS 1 184 RR2DX34JQ
BS 185 215 RR2DX34TF

RD RR2DX34JQ 189 0 0
CAAGAAGTAAAAAGATAATGTAAAAGGATGTTTTCCATAAATCCAGATAAGTAATTGCAA
AAATCTGAAAAAAAAACCAGTCTGATACACAAAAACTGAGATTCAAAACGATGACAAGAT
AAAAAGAGTTTCTTCTAAGGGGGTTCTCTCACTTCTTCTCTTGACTATGAGTTCTAGTCT
CAAT
AAAAA

QA 1 184 1 184
DS 

RD RR2AW93JQ 131 0 0
ATTGCAAAAATCTGAAAAAAAAACCAGTCTGATACACAAAAACTGAAATTCAAAACGATG
ACAAGATAAAAAGAGTTTCTTCTAAGGGGGTTCTCTCACTTCTTCTCTTGACTATGAGTT
CTAGTCTCAAT

QA 1 131 1 131
DS 

RD RR2DX34TF 215 0 0
CAAGAAGTAGAAAGATAATGTAGAAGGATGTTTTCCATAAATCCAGATAAGTAATTGCAA
AAATCTGAAGAAAAAACCAGTCTGATACACAAAAACTGAGATTCAAAACGATGACAAGAT
AAAAAGAGTTTCTTCTAAGGGGGTTCTCTCACTTCTTCTCTTGACTATGAGTTCTAGTCT
CAATAAGAATGCTAGTTCTTACTGTTCACATGTTC

QA 1 215 1 215
DS 



AS 1 2

CO CL3380Contig1 499 2 2 U
ACATGCACTACTACTATACATGGATCTCTATGCTGCTGAGTTCTTTGCTATGTTATGTAC
TAAGCGTGGCTTTTGTTTGTTTAGGTGACAGAATACGGAAGCTATAAGCAAGACTATGAA
GGAGAATATGGGGACATGTATTTGGGAAGAGAGTACGGAGATGGTGAAGATGGGGAAATG
TCGTGGTTCAATGCGGGTGTGAGGGTTGGTGTGGGAATTGGTCTTGGTGTATGTGTAGGT
CTAGGCATTGGGGTTGGCCTGCTTGTGCGTACCTATCAATCAACCACCAGAAACTTCAGA
AGAAGGATTATCTAATCTTCACTCAAATCACCATTAAGCTTATTCACCTTCTCTTTAACT
CCCACACCATTGCAGATCTCTTTTTTTGACTGATAGTCTAATTAAAATACCTAATCATGC
TGTGTAGCATCATTATAATCTTTCTTCTTCGTACGTGTGTTTTTTATATCTTTGTTGCCT
TCAAAATTTTGAAAGGAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU89TF U 1
AF RR2EU89JQ C 1
BS 1 285 RR2EU89TF
BS 286 499 RR2EU89JQ

RD RR2EU89TF 286 0 0
ACATGCACTACTACTATACATGGATCTCTATGCTGCTGAGTTCTTTGCTATGTTATGTAC
TAAGCGTGGCTTTTGTTTGTTTAGGTGACAGAATACGGAAGCTATAAGCAAGACTATGAA
GGAGAATATGGGGACATGTATTTGGGAAGAGAGTACGGAGATGGTGAAGATGGGGAAATG
TCGTGGTTCAATGCGGGTGTGAGGGTTGGTGTGGGAATTGGTCTTGGTGTATGTGTAGGT
CTAGGCATTGGGGTTGGCCTGCTTGTGCGTACCTATCAATCAACC
A

QA 1 285 1 285
DS 

RD RR2EU89JQ 499 0 0
ACATGCACTACTACTATACATGGATCTCTATGCTGCTGAGTTCTTTGTTATGTTATGTAC
TAAGCGTGGCTTTTGTTTGTTTAGGTGACAGAATACGGAAGCTATAAGCAAGACTATGAA
GGAGAATATGGGGACATGTATTTGGGAAGAGAGTACGGAGATGGTGAAGATGGGGAAATG
TCGTGGTTCAATGCGGGTGTGAGGGTTGGTGTGGGAATTGGTCTTGGTGTATGTGTAGGT
CTAGGCATTGGGGTTGGCCTGCTTGTGCGTACCTATCAATCAACCACCAGAAACTTCAGA
AGAAGGATTATCTAATCTTCACTCAAATCACCATTAAGCTTATTCACCTTCTCTTTAACT
CCCACACCATTGCAGATCTCTTTTTTTGACTGATAGTCTAATTAAAATACCTAATCATGC
TGTGTAGCATCATTATAATCTTTCTTCTTCGTACGTGTGTTTTTTATATCTTTGTTGCCT
TCAAAATTTTGAAAGGAAT

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 3

CO CL3381Contig1 1581 3 7 U
GGATAGAAAAGTAGTTTATAAATCTGCAAAAAATCTCTCCTTTTTTCTTTTAATTTCTGT
TTCAAATGGATCAATCAATCTCTTCCGTTTCCAAATAGAAACATTGGATCCTTTTATCTT
ATTTAAACTTGTTAATTCTAGAGATTTGATACTGTAGCCATCTCTCTGTTTTTTGGTAAA
TAAATAAAGTTTGAATCTTTACATTCTAACCATCTCTCTGTTTTTTGGTAAATAAATAAA
GTTTGAATCTTTACATTCTAACCATCTCTCTGTTTTTGCAAAGAAAATAAACGTTATGAT
GCAAATGTTTGGATTCAGTGAGAAATAGAGATTGGTTTTTGGTTCTATTCTTAAATCATA
ATGGTGGAGCCTTACGAGACACGTAACAACAACAACGGTGAAGCTTATCAGATGGTCAGG
TATCAGAGTTATAACCATCACAATCCAATGATATCATCATCATCATCATCGTTACCAGCA
TTGCCATTGCTGGATTTGAGAGTGTTCTATGTCAGAATCAGCAACTTCAAGGTGGATGAT
TCCACACCAGAGGTCCTCACAATCACTCACATCCCTCTTGATCCAGACTCTCTTCTCGAG
ATCAACGGTGTGAGAATGAGCATTCACTCCGAAGGCGTCTCCTCTCAGCTAAGGCGAGAC
CGTGTTGATAAAAAATCAGAGGAAGCCACTTTTATCAGCACAGACAATATCAGGTTATCT
GGTAGTGTTAAGTTCGAGGTATGTGACAAAGACGAGCTTGTTTTGTCTGGAACGCTGGAG
ATGTCCGGTAGTAATGGTTTCACAGGGGAGTCTGCTGCTAAGCATAGCGTGAAGCGGTGG
GGAATGAACTGTGAAGCTGAGATCACTGCAGGGTCTGGTTTCTTGAAAGAGAAACACATT
GGTTGTTCTGAGTTATCATCTCCGTTGCCGAGTATTGAAGTGTACGTTACTGGTTGCTTC
TCTGGAACACCAATCATTCTAACCAAGACGCTGCAGCTTGGTTTCAGGAAGAAGCACAGT
AGAACGAGTGCGTTAGATTCGATTCCAGAGTATGAAAGCGGTGAATCACAGAAAGGCAGC
CCATCTGAGCTTGATTTTCAGGTGACAGAATACGGAAGTTATAAGCAAGACTATGAAGGA
GAATATGGGGACATGTACTTGGGAAGAGAGTACGGAGATGGTGAAGATGGCGAAATGTCG
TGGTTCAATGCGGGTGTGAGGGTTGGTGTGGGAATTGGTCTTGGTGTATGTGTAGGTCTA
GGCATTGGGGTTGGCCTGCTTGTGCGTACCTATCAATCAACCACCAGAAACTTCAGAAGA
AGGATTATCTAATCTTCACTAAAATCACCATTAAGCTTATTCACCTTCTCTTAACTCCCA
CTCCATTGCAGATCTCTTTTTTTGACTGATAGTCTAATTAAAATACCTAATCATGCTGTG
TAGCATCATTATAATCTTTCTTCTTCGTACGTGTGTTTTTTATATCTTTGTTGCCTTCAA
AATTTTGAAAGGAATCATTGCCTTTATGTTCTTGTTGTTTGTTGAGATTCAGACTGAAAG
AAACAAAGTTTGTTATTGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED67TF U 1
AF RR2B247TF U 417
AF RR2B247JQ C 822
BS 1 634 RR2ED67TF
BS 635 635 RR2B247TF
BS 636 653 RR2ED67TF
BS 654 1100 RR2B247TF
BS 1101 1101 RR2B247JQ
BS 1102 1105 RR2B247TF
BS 1106 1581 RR2B247JQ

RD RR2ED67TF 661 0 0
GGATAGAAAAGTAGTTTATAAATCTGCAAAAAATCTCTCCTTTTTTCTTTTAATTTCTGT
TTCAAATGGATCAATCAATCTCTTCCGTTTCCAAATAGAAACATTGGATCCTTTTATCTT
ATTTAAACTTGTTAATTCTAGAGATTTGATACTGTAGCCATCTCTCTGTTTTTTGGTAAA
TAAATAAAGTTTGAATCTTTACATTCTAACCATCTCTCTGTTTTTTGGTAAATAAATAAA
GTTTGAATCTTTACATTCTAACCATCTCTCTGTTTTTGCAAAGAAAATAAACGTTATGAT
GCAAATGTTTGGATTCAGTGAGAAATAGAGATTGGTTTTTGGTTCTATTCTTAAATCATA
ATGGTGGAGCCTTACGAGACACGTAACAACAACAACGGTGAAGCTTATCAGATGGTCAGG
TATCAGAGTTATAACCATCACAATCCAATGATATCATCATCATCATCATCGTTACCAGCA
TTGCCATTGCTGGATTTGAGAGTGTTCTATGTCAGAATCAGCAACTTCAAGGTGGATGAT
TCCACACCAGAGGTCCTCACAATCACTCACATCCCTCTTGATCCAGACTCTCTTCTCGAG
ATCAACGGTGTGAGAATGAGCATTCACTCCGAAG*CGTCTCCTCTCAGCTAAG
CGAGACCG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2B247TF 689 0 0
G
AGGTATCAGAGTTATAACCATCACAATCCAATGATATCATCATCATCATCATCGTTACCA
GCATTGCCATTGCTGGATTTGAGAGTGTTCTATGTCAGAATCAGCAACTTCAAGGTGGAT
GATTCCACACCAGAGGTCCTCACAATCACTCACATCCCTCTTGATCCAGACTCTCTTCTT
GAGATCAACGGTGTGAGAATGAGCATTCACTCCGAAGGCGTTTCCTCTCAGCTAAGGCGA
GACCGTGTTGATAAAAAATCAGAGGAAGCCACTTTTATCAGCACAGACAATATCAGGTTA
TCTGGTAGTGTTAAGTTCGAGGTATGTGACAAAGACGAGCTTGTTTTGTCTGGAACGCTG
GAGATGTCCGGTAGTAATGGTTTCACAGGGGAGTCTGCTGCTAAGCATAGCGTGAAGCGG
TGGGGAATGAACTGTGAAGCTGAGATCACTGCAGGGTCTGGTTTCTTGAAAGAGAAACAC
ATTGGTTGTTCTGAGTTATCATCTCCGTTGCCGAGTATTGAAGTGTACGTTACTGGTTGC
TTCTCTGGAACACCAATCATTCTAACCAAGACGCTGCAGCTTGGTTTCAGGAAGAAGCAC
AGTAGAACGAGTGCGTTAGATTCGATTCCAGAGTATGAAAGCGGTGAATCACAGAAAGGC
AGCCCATCTGAGCTTGATTTTCATGTGA

QA 2 689 2 689
DS 

RD RR2B247JQ 760 0 0
GCATAGCGTGAAGCGGTGGGGAATGAACTGTGAAGCTGAGATCACTGCAGGGTCTGGTTT
CTTGAAAGAGAAACACATTGGTTGTTCTGAGTTATCATCTCCGTTGCCGAGTATTGAAGT
GTACGTTACTGGTTGCTTCTCTGGAACACCAATCATTCTAACCAAGACGCTGCAGCTTGG
TTTCAGGAAGAAGCACAGTAGAACGAGTGCGTTAGATTCGATTCCAGAGTATGAAAGCGG
TGAATCACAGAAAGGCAGCCCATCTGAGCTTGATTTTCAGGTGACAGAATACGGAAGTTA
TAAGCAAGACTATGAAGGAGAATATGGGGACATGTACTTGGGAAGAGAGTACGGAGATGG
TGAAGATGGCGAAATGTCGTGGTTCAATGCGGGTGTGAGGGTTGGTGTGGGAATTGGTCT
TGGTGTATGTGTAGGTCTAGGCATTGGGGTTGGCCTGCTTGTGCGTACCTATCAATCAAC
CACCAGAAACTTCAGAAGAAGGATTATCTAATCTTCACTAAAATCACCATTAAGCTTATT
CACCTTCTCTTAACTCCCACTCCATTGCAGATCTCTTTTTTTGACTGATAGTCTAATTAA
AATACCTAATCATGCTGTGTAGCATCATTATAATCTTTCTTCTTCGTACGTGTGTTTTTT
ATATCTTTGTTGCCTTCAAAATTTTGAAAGGAATCATTGCCTTTATGTTCTTGTTGTTTG
TTGAGATTCAGACTGAAAGAAACAAAGTTTGTTATTGGGC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 3

CO CL3382Contig1 1202 3 4 U
GGTAAGGAATCTCATTACTTATTTGTTATTCCAGATGCATGTATGCACCTAACCAAACCA
AATTTACAACCAAAAACTAATTTTGTTTTATTCCCACTTTTACCCCCTTCAAAGCCCTAT
ATTTACCATTCTACCCTTTATGCATCACATTAATATACAAAGCACATTACATATTCACAG
ACTTTTGCCATTAGTAGGACAAAACCTGTATGACCTTTTCTTCACCTAACAGAGACGAAA
GACCATACCTTGGTATATAAAAAGATAAGAGACAAAGGCTTCTGTCTTAACTAAACCTTT
GTGTGTAATCTTATAGATCAAGAAACTGGTAAATGAGCTTCTGTATTGGCTTTTAACAAT
TTTGCTTCTTCTGTCTTTTATCCCATTGGAGACCGGTGAGGGATTCCCTTTCTTCGCTTG
GCGATTCTGCAATGACTAGATGCAGTAAGTGGAGGTGTTGATGGGCCGAAACTCTGAATG
TTCTTCCCAATTCCAATGCTGCTACTTGAATCATCTGATTCCACCACAAGGTTCTTCCTT
CCCTTTTCATATCCTCTAGAAGATCCAGCAATCTTGCAGCCGAGAGAGCAGAAGCGGAAG
CTATCATCGACGAGGCTACGGTAGCAAACCTTGCAGGTATTGGTCACACCTTTCCCTGGC
CTAGGCTGAGGCCTCTCGTTCAAGAAGATGACTTTAGCACTATTGATCACATAAGTTTGG
ATCCCTGATATATCAATATGCTTTTGTATCTCATTAACCCTTATAACATCATGATATGAA
GATCTCCTTATCTGAATGGTGTGATGATTCTTGTGATGGGCAAGACAGAGAGAGCAAAGC
GGACCGTTGGTACAGTCTAAGCAGTACATATTGCATTCACTCTTGTGAGAGTCTACATGA
AACTTGCAATGACCAAAAAATTTCTCTTGAAGCAGAGGTTTCAGCCATGGCGGCTGCCCG
TTATCTTCCTCCTCTGGTCCACCAGCTCCCATGATTCTTCTGTTCTTAGTCTTGATTTCT
CGGATGGTATTCTCCTGATCCTCGATCGCCATTTTCGTTAAGAAACCTATAAGACAAAGT
CTTTTTCGAGTGAAGCTTCGAACTTTTTCTATAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGTGAGGAGT
TTTGTTGCAGAGAAGGTTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAT
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2F885JQ U 184
AF RR2F886JQ U 1
AF RR2F886TF C 480
BS 1 289 RR2F886JQ
BS 290 290 RR2F885JQ
BS 291 768 RR2F886JQ
BS 769 1202 RR2F886TF

RD RR2F885JQ 252 0 0
TTTGCCATTAGTAGGACAAAACCTGTATGACCTTTTCTTCACCTAACAGAGACGAAAGAC
CATACCTTGGTATATAAAAAGATAATAGACAAAGGCTTCTGTCTTAACTAAACCTTTGTG
TGTAATCTTATAGATCAAGAAACTGGTAAATGAGCTTCTGTATTGGCTTTTAACAATTTT
GCTTCTTCTGTCTTTTATCCCATTGGAGACCGGTGAGGGATTCCCTTTCTTCGCTTGGCG
ATTCTGCAATGA

QA 1 252 1 252
DS 

RD RR2F886JQ 768 0 0
GGTAAGGAATCTCATTACTTATTTGTTATTCCAGATGCATGTATGCACCTAACCAAACCA
AATTTACAACCAAAAACTAATTTTGTTTTATTCCCACTTTTACCCCCTTCAAAGCCCTAT
ATTTACCATTCTACCCTTTATGCATCACATTAATATACAAAGCACATTACATATTCACAG
ACTTTTGCCATTAGTAGGACAAAACCTGTATGACCTTTTCTTCACCTAACAGAGACGAAA
GACCATACCTTGGTATATAAAAAGATAAGAGACAAAGGCTTCTGTCTTAGCTAAACCTTT
GTGTGTAATCTTATAGATCAAGAAACTGGTAAATGAGCTTCTGTATTGGCTTTTAACAAT
TTTGCTTCTTCTGTCTTTTATCCCATTGGAGACCGGTGAGGGATTCCCTTTCTTCGCTTG
GCGATTCTGCAATGACTAGATGCAGTAAGTGGAGGTGTTGATGGGCCGAAACTCTGAATG
TTCTTCCCAATTCCAATGCTGCTACTTGAATCATCTGATTCCACCACAAGGTTCTTCCTT
CCCTTTTCATATCCTCTAGAAGATCCAGCAATCTTGCAGCCGAGAGAGCAGAAGCGGAAG
CTATCATCGACGAGGCTACGGTAGCAAACCTTGCAGGTATTGGTCACACCTTTCCCTGGC
CTAGGCTGAGGCCTCTCGTTCAAGAAGATGACTTTAGCACTATTGATCACATAAGTTTGG
ATCCCTGATATATCAATATGCTTTTGTATCTCATTAACCCTTATAACA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2F886TF 723 0 0
GTTCTTCCCAATTCCAATGCTGCTACTTGAATCATCTGATTCCACCACAAGGTTCTTCCT
TCCCTTTTCATATCCTCTAGAAGATCCAGCAATCTTGCAGCCGAGAGAGCAGAAGCGGAA
GCTATCATCGACGAGGCTACGGTAGCAAACCTTGCAGGTATTGGTCACACCTTTCCCTGG
CCTAGGCTGAGGCCTCTCGTTCAAGAAGATGACTTTAGCACTATTGATCACATAAGTTTG
GATCCCTGATATATCAATATGCTTTTGTATCTCATTAACCCTTATAACATCATGATATGA
AGATCTCCTTATCTGAATGGTGTGATGATTCTTGTGATGGGCAAGACAGAGAGAGCAAAG
CGGACCGTTGGTACAGTCTAAGCAGTACATATTGCATTCACTCTTGTGAGAGTCTACATG
AAACTTGCAATGACCAAAAAATTTCTCTTGAAGCAGAGGTTTCAGCCATGGCGGCTGCCC
GTTATCTTCCTCCTCTGGTCCACCAGCTCCCATGATTCTTCTGTTCTTAGTCTTGATTTC
TCGGATGGTATTCTCCTGATCCTCGATCGCCATTTTCGTTAAGAAACCTATAAGACAAAG
TCTTTTTCGAGTGAAGCTTCGAACTTTTTCTATAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGTGAGGAG
TTTTGTTGCAGAGAAGGTTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAA
TCC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 3

CO CL3383Contig1 778 3 4 U
GGAAAGTTGATGATACGGAGACAACAATCTTGGTGTAGAAGGCGGAGAGAGATAAGAGCC
ATGGAAGCTTTGAAAACCGCTAGCTTTAGTCCTATGTCAGTTCTATCCGACAAAAGGTCA
GAACCAAGAAGACCCTTCTCGCTGCCTAGCCTCCTCCCACAGAAAACACCCAAACCAATC
TCCCAAGAAAACTTCTTCAGGAGCTTCAACGGAGGATTAGCTCTTCTAACCTCTGTCCTA
AGCAGTGCCGCAGCTCCTGCAAAGTCCCTGACCTACGAGGAAGCTCTGCAACAATCAGTG
ACCTCTCCTTCATCTTTTGATTCAGACGGTTTGATCGAAGGGATATCAAGTTTCGTCACT
GACAATCCTCTGGTGATCGCCGGTGGAGTTGCTGCATTTGCTGTCCCTTTTGTTCTCTCT
CAGGTTCTGAACAAGAAGCCCAAATCTTTTGGAGTTGAGTCTGCTAAGAATGCTTATACC
AAGTTGGGCACTGATGAAAATGCCCAGTTGCTTGACATAAGAACCTCTGCTGATTCCAGA
CAAGTGGGTAGTCCTAATGTCAAAGGTCTAGGTAAAAAGACAGTTTCGGTTGTTTATAAC
GGAGAAGACAAAGATGGTTTCTTGAAGAAGCTTTCCTTGAAGTTTAAAGATCCTGAGAAC
ACCACATTGTTCATTCTTGACAAGTTTGATGGAAACTCCGAGCTTGTTGCTGAACTGGTG
ACCCTTAATGGATTCAAACTGCTTACGCTATCAAGATGGTGCAGAGGACTAGGGCTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX24TF U 136
AF RR2DT16TF U 1
AF RR2G790TF U 1
BS 1 204 RR2DT16TF
BS 205 205 RR2CX24TF
BS 206 768 RR2DT16TF
BS 769 778 RR2G790TF

RD RR2CX24TF 541 0 0
GG
CTCGCTGCCTAACCTCCTCCCACAGAAAACACCCAAACCAATCTCCCAAGAAAACTTCTT
CAGGAGCTTCAACGGAGGATTAGCTCTTCTAACCTCTGTCCTAAGCAGTGCCGCAGCTCC
TGCAAAGTCCCTGACCTACGAGGAAGCTCTGCAACAATCAGTGACCTCTCCTTCATCTTT
TGATTCAGACGGTTTGATCGAAGGGATATCAAGTTTCGTCACTGACAATCCTCTGGTGAT
CGCCGGTGGAGTTGCTGCATTTGCTGTCCCTTTTGTTCTCTCTCAGGTTCTGAACAAGAA
GCCCAAATCTTTTGGAGTTGAGTCTGCTAAGAATGCTTATACCAAGTTGGGCACTGATGA
AAATGCCCAGTTGCTTGACATAAGAACCTCTGCTGATTCCAGACAAGTGGGTAGTCCTAA
TGTCAAAGGTCTAGGTAAAAAGACAGTTTCGGTTGTTTATAACGGAGAAGACAAGGATGG
TTTCTTGAAGAAGCTTTCCTTGAAGTTTAAAGATCCTGAGAACACCACATTGTTCATTC

QA 3 541 3 541
DS 

RD RR2DT16TF 768 0 0
GGAAAGTTGATGATACGGAGACAACAATCTTGGTGTAGAAGGCGGAGAGAGATAAGAGCC
ATGGAAGCTTTGAAAACCGCTAGCTTTAGTCCTATGTCAGTTCTATCCGACAAAAGGTCA
GAACCAAGAAGACCCTTCTCGCTGCCTAGCCTCCTCCCACAGAAAACACCCAAACCAATC
TCCCAAGAAAACTTCTTCAGGAGCCTCAACGGAGGATTAGCTCTTCTAACCTCTGTCCTA
AGCAGTGCCGCAGCTCCTGCAAAGTCCCTGACCTACGAGGAAGCTCTGCAACAATCAGTG
ACCTCTCCTTCATCTTTTGATTCAGACGGTTTGATCGAAGGGATATCAAGTTTCGTCACT
GACAATCCTCTGGTGATCGCCGGTGGAGTTGCTGCATTTGCTGTCCCTTTTGTTCTCTCT
CAGGTTCTGAACAAGAAGCCCAAATCTTTTGGAGTTGAGTCTGCTAAGAATGCTTATACC
AAGTTGGGCACTGATGAAAATGCCCAGTTGCTTGACATAAGAACCTCTGCTGATTCCAGA
CAAGTGGGTAGTCCTAATGTCAAAGGTCTAGGTAAAAAGACAGTTTCGGTTGTTTATAAC
GGAGAAGACAAAGATGGTTTCTTGAAGAAGCTTTCCTTGAAGTTTAAAGATCCTGAGAAC
ACCACATTGTTCATTCTTGACAAGTTTGATGGAAACTCCGAGCTTGTTGCTGAACTGGTG
ACCCTTAATGGATTCAAACTGCTTACGCTATCAAGATGGTGCAGAGGA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2G790TF 778 0 0
GGAAAGTTGATGATACGGAGACAACAATCTTGGTGTAGAAGGCGGAGAGAGATAAGAGCC
ATGGAAGCTTTGAAAACCGCTAGCTTTAGTCCTATGTCAGTTCTATCCGACAAAAGGTCA
GAACCAAGAAGACCCTTCTCGCTGCCTAGCCTCCTCCCACAGAAAACACCCAAACCAATC
TCCCAA**AAACTTCTTCAGGAGCTTCAACGGAGGATTAGCTCTTCTAACCTCTGTCCTA
AGCAGTGCCGCAGCTCCTGCAAAGTCCCTGACCTACGAGGAAGCTCTGCAACAATCAGTG
ACCTCTCCTTCATCTTTTGATTCAGACGGTTTGATCGAAGGGATATCAAGTTTCGTCACT
GACAATCCTCTGGTGATCGCCGGTGGAGTTGCTGCATTTGCTGTCCCTTTTGTTCTCTCT
CAGGTTCTGAACAAGAAGCCCAAATCTTTTGGAGTTGAGTCTGCTAAGAATGCTTATACC
AAGTTGGGCACTGATGAAAATGCCCAGTTGCTTGACATAAGAACCTCTGCTGATTCCAGA
CAAGTGGGTAGTCCTAATGTCAAAGGTCTAGGTAAAAAGACAGTTTCGGTTGTTTATAAC
GGAGAAGACAA*GATGGTTTCTTGAAGAAGCTTTCCTTGAAGTTTAAAGATCCTGAGAAC
ACCACATTGTTCATTCTTGACAAGTTTGATGGAAACTCCGAGCTTGTTGCTGA*CTGGTG
ACCCTTAATGGATTCAAACTGCTTACGCTATCAAGATGGTGCAGAGGACTAGGGCTGG

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 3

CO CL3384Contig1 932 3 3 U
TTTTTTCCCGACCGACATGGAGCTTGAGGAGTTCGCTGCTGACGTGGAGATTCTACTCGG
TCACGGGCTAGACACAGAGTCTTATGCGATGGAGGGGCTAGGGTTGTCTAATACAGAGAT
GTTTAAAATCGAAAAAGACGAGATAGAAGAAGAGGAAGGAGAAGAAACGAAAGCCATGAA
CATGGGAATATGCTGCGGTGAGGATCGGGATGATGGGGATGGAACTTTGGCGTTAGAGCT
GAGGTTTGATCACGAGTCACACAACACGTATGAAGAAGAGGCAGTAAAGAATGTTGGTGT
TGGATGTATTAAAGTGAAGGAGGAAGAGCAAAAGAATGTCCTGATGCTGAGTTTAAACTA
CGACTCGGTGATATCCACTTGGGGAGGCCAAGGTCCACCGTGGACATCGGGAGAGCCACC
AGAACGAGACATAGACATCAGTGACAAGCCAGTTGTTTCCATGGAAATAAATGGAGGAGA
AAGTCAACATAAGCATTACGTTGGTGGATGTTTACCATCAACTGGGTTTGGGGATGGAGG
AAGAGAAGCTAGGGTTTCCAGGTACAGAGAGAAGAGGAGGACGAGATTGTTCTCGAAGAA
GATAAGGTACGAGGTACGTAAACTGAATGCAGAGAAACGACCTCGAATGAAAGGGAGATT
GTTAAGAGAGCTTCACTTGCTCTATCTGCTGCAAATTCACCATTAGGTGTGAATTACTGA
ATATCCTAGCTATCTGCAGGCTATATCTCACTTTACCTTTTAAATTGAACGTTTTTGTTG
AACTTTTTTCTTCTGAACGCCAGAAGTTTTTTTTTGCACTTAATTGTGCTTTGTTGGTAT
GTGCATAGAAAAGCCAATAATGTGACTTGTATGGATTAAGCTGATGTATATATTATCTGG
TAATAAGAATGTGACAAGGAACTTTGATTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GV63TF U 1
AF RR2GV63JQB C 289
AF RR2EU28TF U 677
BS 1 572 RR2GV63TF
BS 573 677 RR2GV63JQB
BS 678 932 RR2EU28TF

RD RR2GV63TF 572 0 0
TTTTTTCCCGACCGACATGGAGCTTGAGGAGTTCGCTGCTGACGTGGAGATTCTACTCGG
TCACGGGCTAGACACAGAGTCTTATGCGATGGAGGGGCTAGGGTTGTCTAATACAGAGAT
GTTTAAAATCGAAAAAGACGAGATAGAAGAAGAGGAAGGAGAAGAAACGAAAGCCATGAA
CATGGGAATATGCTGCGGTGAGGATCGGGATGATGGGGATGGAACTTTGGCGTTAGAGCT
GAGGTTTGATCACGAGTCACACAACACGTATGAAGAAGAGGCAGTAAAGAATGTTGGTGT
TGGATGTATTAAAGTGAAGGAGGAAGAGCAAAAGAATGTCCTGATGCTGAGTTTAAACTA
CGACTCGGTGATATCCACTTGGGGAGGCCAAGGTCCACCGTGGACATCGGGAGAGCCACC
AGAACGAGACATAGACATCAGTGACAAGCCAGTTGTTTCCATGGAAATAAATGGAGGAGA
AAGTCAACATAAGCATTACGTTGGTGGATGTTTACCATCAACTGGGTTTGGGGATGGAGG
AAGAGAAGCTAGGGTTTCCAGGTACAGAGAGA

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2GV63JQB 644 0 0
GAATGTTGGTGTTGGATGTATTAAAGTGAAGGAGGAAGAGCAAAAGAATGTCCTGATGCT
GAGTTTAAACTACGACTCGGTGATATCCACTTGGGGAGGCCAAGGTCCACCGTGGACATC
GGGAGAGCCACCAGAACGAGACATAGACATCAGTGACAAGCCAGTTGTTTCCATGGAAAT
AAATGGAGGAGAAAGTCAACATAAGCATTACGTTGGTGGATGTTTACCATCAACTGGGTT
TGGGGATGGAGGAAGAGAAGCTAGGGTTTCCAGGTACAGAGAGAAGAGGAGGACGAGATT
GTTCTCGAAGAAGATAAGGTACGAGGTACGTAAACTGAATGCAGAGAAACGACCTCGAAT
GAAAGGGAGATTGTTAAGAGAGCTTCACTTGCTCTATTTGCTGCAAATTCACCATTAGGT
GTGAATTACTGAATATCCTAGCTATCTGCAGGCTATATCTCACTTTACCTTTTAAATTGA
ACGTTTTTGTTGAACTTTTTTCTTCTGAACGCCAGAAGTTTTTTTTTGCACTTAATTGTG
CTTTGTTGGTATGTGCATAGAAAAGCCAATAATGTGACTTGTATGGATTAAGCTGATGTA
TATATTATCTGGTAATAAGAATGTGACAAGGAACTTTGATTGTT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2EU28TF 256 0 0
G
TGCTCTATCTGCTGCAAATTCACCATTAGGTGTGAATTACTGAATATCCTAGCTATCTGC
AGGCTATATCTCACTTTACCTTTTAAATTGAACGTTTTTGTTGAACTTTTTTCTTCTGAA
CGCCAGAAGTTTTTTTTTGCACTTAATTGTGCTTTGTTGGTATGTGCATAGAAAAGCCAA
TAATGTGACTTGTATGGATTAAGCTGATGTATATATTATCTGGTAATAAGAATGTGACAA
GGAACTTTGATTGTT

QA 2 256 2 256
DS 



AS 1 3

CO CL3385Contig1 1520 3 7 U
GGGCCGTTGACGATGTCGGCCTATTGGTTTTGATAGAGACCCGAATGATTCGAGAGACAG
TCAGGAATCGCTTGTCTTCGAACTTGTCACATCTCTATTTTTATACTAACCCCATTTCAA
TCGCTAAGGTCACCGTCGCTCTTATCCGATTTTCGATTTAGAAATACAGGGAATTTGATC
GAACAATAGAATGGATTTCGTTAAGAATCTTGATACCGACATGTCTCTAGCCATTCTTTC
GTGTCTTGATGACCCATCAGATCTTGTCCGTGCCAGTGCTGTCTCACGCTCCTGGCGTGC
CTTTGTGATTAAATACAGTCTCTCGAAGAACCTGTGCTTGAAGTTGTTCCATCAGCTAAC
TAGTGTGGATCGTATAATAGACACAAGCAATGATATGAAGGAATCCTTTGAAGCCTCCGG
GTCAAGCAGCAGTCTCATGGACGATGATGATGATACAAGGGTACTAGAAAGAGAGCACAG
GGTTTATGCCTTATTGACTAAAGGATGCACATCTTCCCCTATCAGAAGCTGTATTGCTGA
TGCCATTGTAGCCTCCAGTACTGATAATTTCCCAGCAGAGAGCATCTTGAACACACTCGA
CGAAAGAGATAGAATTGGTGGCACCCCTTCGTATTGGTCTAGTACAGGACACCACAGGAC
TTCCGTGCCCGAAACACTTCTTTACCAGCTGAAAGGTGATTTGTGTCTCATTACTGAACT
CAGCGTCCAGCCTTTCCAAGCTTATTTCCAGCCTGGTACTCCGATATACTCTTCACATTA
TGTTCGTTTCCGGTTGGGTCACCTCGACGATAACAATCAAGCTGAGTCAGGAGGAAAGAT
TCCTGTTGAAAACAAATATGTATGGACTTACACTTCACAAGAGTTTCCTATGGCTCAGGA
GAATCGGTTGCAGAACTTTAAGCTTCCAGAACCGGTTCTTTGCACTGGTGGGTATATGCT
AGTGGAGTTTCTAGGTCGGGTCCAGACACAAGAAATGGATGGCTTATACTACATATGCGT
GTCGCATGTGAAAGTGATGGGAAGATCACTAGCAAAATCATTTCAGGTGGTAGATCCGGA
TGAGTCAGGGAAGTTTGGGTTGAAGGTGTTGAGTTACAGTGATCCACAAGAAATGGATGA
GAACGAAGAAGAGGCAGAGGGGCAAAGTCCGTTTAGGCCAATGAGAAACCTTGAACAGCT
CTTGAATTTCCTGCATAGACATCCTCTTGACGTCGAGTATGTTTGGCCTGAATCTGACGA
TGATGAAGAAGATGCTGCTGAATCAGACGGTGAGGTTTAGTGTATGAATCACTACGGGTG
GGGATGCTGAATTGTGTCTCTTTTTCTTTCTTTCTTTGATTTTAGTTTGTATTTGCTTCT
ATTGTTGAAGAATCTTATAGGTTTTTTTCCATCTTTTGTGAGCGGTTTTAAAAGCTTCTT
CTTCCCCTCTCTTACAGTGTGTTGTTGAGAGTTTTCTGAAATAATAACGTTACTACAACT
TATTGTATTCTGTTTCGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET89TF U 1
AF RR2DN48TF U 427
AF RR2DN48JQ C 892
BS 1 594 RR2ET89TF
BS 595 595 RR2DN48TF
BS 596 599 RR2ET89TF
BS 600 600 RR2DN48TF
BS 601 653 RR2ET89TF
BS 654 1063 RR2DN48TF
BS 1064 1520 RR2DN48JQ

RD RR2ET89TF 653 0 0
GGGCCGTTGACGATGTCGGCCTATTGGTTTTGATAGAGACCCGAATGATTCGAGAGACAG
TCAGGAATCGCTTGTCTTCGAACTTGTCACATCTCTATTTTTATACTAACCCCATTTCAA
TCGCTAAGGTCACCGTCGCTCTTATCCGATTTTCGATTTAGAAATACAGGGAATTTGATC
GAACAATAGAATGGATTTCGTTAAGAATCTTGATACCGACATGTCTCTAGCCATTCTTTC
GTGTCTTGATGACCCATCAGATCTTGTCCGTGCCAGTGCTGTCTCACGCTCCTGGCGTGC
CTTTGTGATTAAATACAGTCTCTCGAAGAACCTGTGCTTGAAGTTGTTCCATCAGCTAAC
TAGTGTGGATCGTATAATAGACACAAGCAATGATATGAAGGAATCCTTTGAAGCCTCCGG
GTCAAGCAGCAGTCTCATGGACGATGATGATGATACAAGGGTACTAGAAAGAGAGCACAG
GGTTTATGCCTTATTGACTAAAGGATGCACATCTTCCCCTATCAGAAGCTGTATTGCTGA
TGCCATTGTAGCCTCCAGTACTGATAATTTCCCAGCAGAGAGCATCTTGAACACGCTCGG
CGAAAGAGATAGAATTGGTGGCACCCCTTCGTATTGGTCTAGTACAGGACACC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2DN48TF 637 0 0
G
AGCAGTCTCATGGATGATGATGATGATACAAGGGTACTAGAAAGAGAGCACAGGGTTTAT
GCCTTATTGACTAAAGGATGCACATCTTCCCCTATCAGAAGCTGTATTGCTGATGCCATT
GTAGCCTCCAGTACTGATAATTTCCCAGCAGAGAGCATCTTGAACACACTCGACGAAAGA
GATAGAATTGGTGGCACCCCTTCGTATTTGTCTAGTACAGGACACCACAGGACTTCCGTG
CCCGAAACACTTCTTTACCAGCTGAAAGGTGATTTGTGTCTCATTACTGAACTCAGCGTC
CAGCCTTTCCAAGCTTATTTCCAGCCTGGTACTCCGATATACTCTTCACATTATGTTCGT
TTCCGGTTGGGTCACCTCGACGATAACAATCAAGCTGAGTCAGGAGGAAAGATTCCTGTT
GAAAACAAATATGTATGGACTTACACTTCACAAGAGTTTCCTATGGCTCAGGAGAATCGG
TTGCAGAACTTTAAGCTTCCAGAACCGGTTCTTTGCACTGGTGGGTATATGCTAGTGGAG
TTTCTAGGTCGGGTCCAGACACAAGAAATGGATGGCTTATACTACATATGCGTGTCGCAT
GTGAAAGTGATGGGAAGATCACTAGCAAAATCATTT

QA 2 637 2 637
DS 

RD RR2DN48JQ 629 0 0
GGCTCAGGAGAATCGGTTGCAGAACTTTAAGCTTCCAGAACCGGTTCTTTGCACTGGTGG
GTATATGCTAGTGGAGTTTCTAGGTCGGGTCCAGACACAAGAAATGGATGGCTTATACTA
CATATGCGTGTCGCATGTGAAAGTGATGGGAAGATCACTAGCAAAATCATTTCAGGTGGT
AGATCCGGATGAGTCAGGGAAGTTTGGGTTGAAGGTGTTGAGTTACAGTGATCCACAAGA
AATGGATGAGAACGAAGAAGAGGCAGAGGGGCAAAGTCCGTTTAGGCCAATGAGAAACCT
TGAACAGCTCTTGAATTTCCTGCATAGACATCCTCTTGACGTCGAGTATGTTTGGCCTGA
ATCTGACGATGATGAAGAAGATGCTGCTGAATCAGACGGTGAGGTTTAGTGTATGAATCA
CTACGGGTGGGGATGCTGAATTGTGTCTCTTTTTCTTTCTTTCTTTGATTTTAGTTTGTA
TTTGCTTCTATTGTTGAAGAATCTTATAGGTTTTTTTCCATCTTTTGTGAGCGGTTTTAA
AAGCTTCTTCTTCCCCTCTCTTACAGTGTGTTGTTGAGAGTTTTCTGAAATAATAACGTT
ACTACAACTTATTGTATTCTGTTTCGTTT

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL3386Contig1 831 2 6 U
GGTGTTTTCAGAGATTATGTATTATGAAGTGGTTTAACTACAATAATGAAAAAAAATCAG
ATTAAAACAAACATAGGATCCGTTTTCTCACTTTCTCGACGGGAAACAAAAATTTGGTTT
CTGGTAATCAGTTATCGTGCAATGCCTTGGTCAGGTAGAGCCTGCTGAAGTTCTGGCCAG
CCACTCCATTGATTTGACCACAGAAGTTTGAGACTTGGTTTGTGATGAAAAAACTCTCTA
GCCTTGATGGTTCAGGGATCGGCTTAAAGATTGGGTTTGAAGGATCCTCTTCGGGCAAAG
GCTCTTCTCCAGCTGATCTACGACCCATATTCTCCGTCCTCCTCTTCTGGAGCCAGGCTT
GCTGCTGCGCTTGCTGACGAGACAGGTTTCGGTAGTAATATTGGAACTTTTGCTGTTCCA
TAGATAAATCATCCATGCATTCAATCAGAAAGCTTCAAAGCCTTCAAAGCTAAGACTCCT
AAGTCAGCTTTAGAGGGATCATAGATGATGCACACACACCTCTTGATGTTCTCCTGGTAA
TTCATGAAGGTCTCGATCAATTCAACGGTCTGATAGGATCCAAGAACTGTTGATTGATAC
CAGCCGACAGTGTTGTTGTCGACATTAACCTCTCTCAGACATCTCATCATTTCAAGCTGA
TAATTAGCACCATCGGCTTCAATTTCCTCATCGTCATCTCTCACGGGGAAAGGAAAACAA
TTGGTGACTTCAAGGACACTACCAACGTCAAGTCCAAGAAGCTGCCCTGTGACAAGCGTC
GGTGCAAACTCCTCGCAGTGTTTGATTATCTTTAGCACAGCCAGTCCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G694JQ U 1
AF RR2BM58TF C 119
BS 1 259 RR2G694JQ
BS 260 260 RR2BM58TF
BS 261 265 RR2G694JQ
BS 266 266 RR2BM58TF
BS 267 362 RR2G694JQ
BS 363 831 RR2BM58TF

RD RR2G694JQ 362 0 0
GGTGTTTTCAGAGATTATGTATTATGAAGTGGTTTAACTACAATAATGAAAAAAAATCAG
ATTAAAACAAACATAGGATCCGTTTTCTCACTTTCTCGACGGGAAACAAAAATTTGGTTT
CTGGTAATCAGTTATCGTGCAATGCCTTGGTCAGGTAGAGCCTGCTGAAGTTCTGGCCAG
CCACTCCATTGATTTGACCACAGAAGTTTGAGACTTGGTTTGTGATGAAAAAACTCTCTA
GCCTTGATGGTTCAGGGATTGGCTTGAAGATTGGGTTTGAAGGATCCTCTTCGGGCAAAG
GCTCTTCTCCAGCTGATCTACGACCCATATTCTCCGTCCTCCTCTTCTGGAGCCAGGCTT
GC

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR2BM58TF 713 0 0
GTCTGTGT
ATCAGTTATCGTGCA*TGC*TTGGTCAGGTAGAGC*TGCTGAAGTTCTGGCCAGCCACTC
CATTGATT*GACCACAGAAGTTTGAGACTTGGTTTGTGATGAGGAAACTCTCTAGCCTTG
ATGGTTCAGGGATCGGCTTAAAGATTGGGTTTGAAGGATCCTCTTCGGGCAAAGGCTCTT
CTCCAGCTGATCTACGACCCATATTCTCCGTCCTCCTCTTCTGGAGCCAGGCTTGCTGCT
GCGCTTGCTGACGAGACAGGTTTCGGTAGTAATATTGGAACTTTTGCTGTTCCATAGATA
AATCATCCATGCATTCAATCAGAAAGCTTCAAAGCCTTCAAAGCTAAGACTCCTAAGTCA
GCTTTAGAGGGATCATAGATGATGCACACACACCTCTTGATGTTCTCCTGGTAATTCATG
AAGGTCTCGATCAATTCAACGGTCTGATAGGATCCAAGAACTGTTGATTGATACCAGCCG
ACAGTGTTGTTGTCGACATTAACCTCTCTCAGACATCTCATCATTTCAAGCTGATAATTA
GCACCATCGGCTTCAATTTCCTCATCGTCATCTCTCACGGGGAAAGGAAAACAATTGGTG
ACTTCAAGGACACTACCAACGTCAAGTCCAAGAAGCTGCCCTGTGACAAGCGTCGGTGCA
AACTCCTCGCAGTGTTTGATTATCTTTAGCACAGCCAGTCCTTCC

QA 9 713 9 713
DS 



AS 1 2

CO CL3387Contig1 1157 2 2 U
GGAAACAAAAAAAAAATATGGATGTGAATGAGATCTCAAAATACCTTCAGAGAGACGAAC
AAGAAACCATAAGCTTCATCTCTCACTTCCTTCAGACATAGACTTCAACGGAACCAAGTT
GTTCAAGTACCAATCATGTTGGTACGACAACAAAACTCTGCAAGGAATCCTCAACTTCCA
AAGAGGTTTCAAACCACAAGAAACCGATATAATCATCTCTTCGCTCCCAAAGTCCGGCAC
AACTTGGCTCAAAGCTCTCACAGTAGCTCTCCTATAGAGATCAAAACACTCTACTAACCA
TCCACTTCTATCTGACAACCCTCATGGCCTAGTACCAGTCCTCGAGCTCAGGCTATACAT
CGAAACCTCGAAACCAGATCTGACCAGTTTCTCATCAACAAACCCGAGGCTATTCGCGAC
TCACGTACCGTTCCACACGCTTCAAGAGGCTCTCAAGAACACTCCCTGTAAGGTCGTGTA
CGTTTGGAGGAACGTGAAGGACGCGTTGGTGTCTCTTTGGTTTTTCGAGTGCGCTAATCA
TAAGATCAAGATAGATAAAGAAAGAAGCTTGTTGGACTCCATGCATGTTCGAGTCGTTTT
GTCGTGGAGTTAGTTACTACGGACCGTCTTGGGAACATGTGTTGAGTTATTGGAGAGGAA
GCTTGGAAGACTCCAAGAATGTGCTATTCTTGAGGTACGAGGAGTTGAAGATAGAGCCGA
GTGCTCAGCTTAAGAGACTTGCCGAGTTCTTGGGTGTTCCTTTTTCTGTGGAGGAAGAAG
AGAGTGGATGTGTGGAAAAGATCTTAGACCTTCGCTCATTGGATAACCTGAAGAGCTTGG
AGATAAACAAGACTGGAAAAACGGCTAGAGGCGTGGAACACAGGATTTTTTTCTGTAAAG
GGGAAGCTGGTTACTCAAAGAACTATCTGACTCCTGAAATGGAGAAGAAGATTGACATGA
TCATCGAGGAGAGATTTCGAGGTGCGGATTTGAAATACTGAAGTAAACTATATGTGTCGT
TTTAGATTACTTTGATGAAAGTACTTTCCGTGCACTCTTTTGGTTAATGATTCATGGTGT
GATGTATATGATTTCATTTTTTATTACTTGGATGTTTTGTAATTTATGAATTTCATAGTA
TTAGCTCTATGCCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP68TF U 1
AF RR2DP68JQ C 293
BS 1 618 RR2DP68TF
BS 619 1157 RR2DP68JQ

RD RR2DP68TF 618 0 0
GGAAACAAAAAAAAAATATGGATGTGAATGAGATCTCAAAATACCTTCAGAGAGACGAAC
AAGAAACCATAAGCTTCATCTCTCACTTCCTTCAGACATAGACTTCAACGGAACCAAGTT
GTTCAAGTACCAATCATGTTGGTACGACAACAAAACTCTGCAAGGAATCCTCAACTTCCA
AAGAGGTTTCAAACCACAAGAAACCGATATAATCATCTCTTCGCTCCCAAAGTCCGGCAC
AACTTGGCTCAAAGCTCTCACAGTAGCTCTCCTATAGAGATCAAAACACTCTACTAACCA
TCCACTTCTATCTGACAACCCTCATGGCCTAGTACCAGTCCTCGAGCTCAGGCTATACAT
CGAAACCTCGAAACCAGATCTGACCAGTTTCTCATCAACAAACCCGAGGCTATTCGCGAC
TCACGTACCGTTCCACACGCTTCAAGAGGCTCTCAAGAACACTCCCTGTAAGGTCGTGTA
CGTTTGGAGGAACGTGAAGGACGCGTTGGTGTCTCTTTGGTTTTTCGAGTGCGCTAATCA
TAAGATCAAGATAGATAAAGAAAGAAGCTTGTTGGACTCCATGCATGTTCGAGTCGTTTT
GTCGTGGAGTTAGTTACT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2DP68JQ 865 0 0
ACTAACCATCCACTTCTATCTGACA*CCCTCATGGC*TAGTACCAGTCCTCGAGCTCAGG
CTATACATCGAAACCTCGAAACCAGATCTGACCAGTTTCTCATCAACAAACCCGAGGCTA
TTCGCGACTCACGTACCGTTCCACACGCTTCAAGAGGCTCTCAAGAACACTCCCTGTAAG
GTCGTGTACGTTTGGAGGAACGTGAAGGACGCGTTGGTGTCTCTTTGGTTTTTCGAGTGC
GCTAATCATAAGATCAAGATAGATAAAGAAAGAAGCTTGTTGGACTCCATGCATGTTCGA
GTCGTTTTGTCGTGGAGTTAGTTACTACGGACCGTCTTGGGAACATGTGTTGAGTTATTG
GAGAGGAAGCTTGGAAGACTCCAAGAATGTGCTATTCTTGAGGTACGAGGAGTTGAAGAT
AGAGCCGAGTGCTCAGCTTAAGAGACTTGCCGAGTTCTTGGGTGTTCCTTTTTCTGTGGA
GGAAGAAGAGAGTGGATGTGTGGAAAAGATCTTAGACCTTCGCTCATTGGATAACCTGAA
GAGCTTGGAGATAAACAAGACTGGAAAAACGGCTAGAGGCGTGGAACACAGGATTTTTTT
CTGTAAAGGGGAAGCTGGTTACTCAAAGAACTATCTGACTCCTGAAATGGAGAAGAAGAT
TGACATGATCATCGAGGAGAGATTTCGAGGTGCGGATTTGAAATACTGAAGTAAACTATA
TGTGTCGTTTTAGATTACTTTGATGAAAGTACTTTCCGTGCACTCTTTTGGTTAATGATT
CATGGTGTGATGTATATGATTTCATTTTTTATTACTTGGATGTTTTGTAATTTATGAATT
TCATAGTATTAGCTCTATGCCATCC

QA 1 865 1 865
DS 



AS 1 2

CO CL3388Contig1 762 2 2 U
GGATCACAATAGCCGCCTCCTCTCTTGCGGTCATCTAAACTTTTTTTTTTTGTCATCGAT
TTCTTCAGATCTCGCTTCTATGGCGACGAATCTTTTAATTATAGATTCTTTTTGTAATAG
AGAGCCTTATGTTCTACACATCGGTGTTGATTTTCCAGCGATGTAACCGTTTCGAGATCT
CTCATCGGTAGATCTGACGCAGATCTCATGCAAGCTATGCTTCCTCTACAGATCTGCGGG
TGGTACGATCTCGTGAGGGTTGATGTGAACCGTTTGCTTGCGTTGAAGCGCTTTGAGGCT
GAAACGGATTCATGACGGACGAGAAGGATTGTTCATGTGTGGGTTAAGTTAAAATTAGGA
TGTAGAAGATGTTGAATTGCATCTTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGTCAGGTGCGCTTG
CATGGCAGGTCAAAAACAGATTCTTAATAAAAAAATGTTTTGTGCGTGTCTTGCTCTCAC
CTCTATTTATTATTATGCACCACAACACAAACAGACCATCATGAAACACCACGTAGTTGA
AAGCTAGCTTATCAACCTGGAGCTGTGGCGCTCATATTTCTTCATGACCCAAAGATGGCA
CTCGTAAGTATATTAATTTGCGTTCTTTAGTTTCTGTCAATTATATCGCACATCACAATA
TCGTACCAGAAATATAACTGAAATATAACCTGTCTATTTGGGAAATAGATTATAACCATC
CATCAAGCAATTCTTATTGTTCTTCCCCGCGATTGGTTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT15TF U 1
AF RR2G723TF U 113
BS 1 420 RR2GT15TF
BS 421 762 RR2G723TF

RD RR2GT15TF 420 0 0
GGATCACAATAGCCGCCTCCTCTCTTGCGGTCATCTAAACTTTTTTTTTTTGTCATCGAT
TTCTTCAGATCTCGCTTCTATGGCGACGAATCTTTTAATTATAGATTCTTTTTGTAATAG
AGAGCCTTATGTTCTACACATCGGTGTTGATTTTCCAGCGATGTAACCGTTTCGAGATCT
CTCATCGGTAGATCTGACGCAGATCTCATGCAAGCTATGCTTCCTCTACAGATCTGCGGG
TGGTACGATCTCGTGAGGGTTGATGTGAACCGTTTGCTTGCGTTGAAGCGCTTTGAGGCT
GAAACGGATTCATGACGGACGAGAAGGATTGTTCATGTGTGGGTTAAGTTAAAATTAGGA
TGTAGAAGATGTTGAATTGCATCTTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGTCAGGTGCGCTTG

QA 1 420 1 420
DS 

RD RR2G723TF 650 0 0
G
GTAATAGAGAGCCTTATGTTCTACACATCGGTGTTGATTTTCCAGCGATGTAACCGTTTC
GAGATCTCTCATCGGTAGATCTGACGCAGATCTCATGCAAGCTATGCTTCCTCTACAGAT
CTGCGGGTGGTACGATCTCGTGAGGGTTGATGTGAACCGTTTGCTTGCGTTGAAGCGCTT
TGAGGCTGAAACGGATTCATGACGGACGAGAAGGATTGTTCATGTGTGGGTTAAGTTAAA
ATTAGGATGTAGAAGATGTTGAATTGCATCTTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGTCAGGT
GCGCTTGCATGGCAGGTCAAAAACAGATTCTTAATAAAAAAATGTTTTGTGCGTGTCTTG
CTCTCACCTCTATTTATTATTATGCACCACAACACAAACAGACCATCATGAAACACCACG
TAGTTGAAAGCTAGCTTATCAACCTGGAGCTGTGGCGCTCATATTTCTTCATGACCCAAA
GATGGCACTCGTAAGTATATTAATTTGCGTTCTTTAGTTTCTGTCAATTATATCGCACAT
CACAATATCGTACCAGAAATATAACTGAAATATAACCTGTCTATTTGGGAAATAGATTAT
AACCATCCATCAAGCAATTCTTATTGTTCTTCCCCGCGATTGGTTACTC

QA 2 650 2 650
DS 



AS 1 2

CO CL3389Contig1 848 2 2 U
GAGTTCTGTTAGATCATCAAACAATAAGGTTGAGGAAGAGAATGATATTGGCAAGAAGAA
AGAGTTGAAAGTCTCCAGCATTGATTTCGTTGGACTTGGATTCGCTGATAAGAAGAGCAC
AAGGGGGCTTCCACCGGGGCTGGTTCCTGTTGAGGACTATTTTCCTGGAGGGGACTTGCC
TGAGGTGGAGTTTATAGTTGGTGACAAAACAAGATTTGACAAGACAGGAAAGGAGCTTGA
TCAAGAAGGAAACGAAAACTCTGATGTATATAAGCCCAAAGTTTCGACATGGGGAGTTTT
CCCTAGACCTAAGAACATCTCTAAAACGTTTGGTGGTGGAAGGACACTCCAACCAGGAGA
TTCAATTGAAACCGCTGAAGAGAGGACTGCGAGAGAAGAACGGACAAAACAACTGCTCAC
TGCTTATAAGGAATCAATAGGACTGAATATTGATCCCAAACTCAAACTTGAGTGTGAGGA
GGCACTAGAAAAGGGGAACACCCTTATGGATTCAGGGAGACTCAAAGAAGCTTTGCCATA
CTATGAAAAGGTCATGGAGAAAATAGTCTTTAAGAGCGAGCTTTATGGATTAGCAGCTTT
GCAGTGGTCTATTTGTCAGGATTCACTTAGAAAGGCAGATAAGGCAAGAGGCATGTATGA
GAAGCTTCTGTCTCACCCAAACCCGAGAGTGAGCAAGAAAGCGAGGCAGTTCATGTTCAG
TTTTCAGGCAATGGAGATGCTGAAGGTTCAGGGTTCGAGCTTCATGCAGATAAACCCAGG
CTATGAGGATTACTTTGAAGCCTTTGTCAAGAAAGACAAAGTTGATTACAAAGCTAAGGA
GGGGGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A836TF U 1
AF RR2A836JQ C 482
BS 1 727 RR2A836TF
BS 728 848 RR2A836JQ

RD RR2A836TF 731 0 0
GAGTTCTGTTAGATCATCAAACAATAAGGTTGAGGAAGAGAATGATATTGGCAAGAAGAA
AGAGTTGAAAGTCTCCAGCATTGATTTCGTTGGACTTGGATTCGCTGATAAGAAGAGCAC
AAGGGGGCTTCCACCGGGGCTGGTTCCTGTTGAGGACTATTTTCCTGGAGGGGACTTGCC
TGAGGTGGAGTTTATAGTTGGTGACAAAACAAGATTTGACAAGACAGGAAAGGAGCTTGA
TCAAGAAGGAAACGAAAACTCTGATGTATATAAGCCCAAAGTTTCGACATGGGGAGTTTT
CCCTAGACCTAAGAACATCTCTAAAACGTTTGGTGGTGGAAGGACACTCCAACCAGGAGA
TTCAATTGAAACCGCTGAAGAGAGGACTGCGAGAGAAGAACGGACAAAACAACTGCTCAC
TGCTTATAAGGAATCAATAGGACTGAATATTGATCCCAAACTCAAACTTGAGTGTGAGGA
GGCACTAGAAAAGGGGAACACCCTTATGGATTCAGGGAGACTCAAAGAAGCTTTGCCATA
CTATGAAAAGGTCATGGAGAAAATAGTCTTTAAGAGCGAGCTTTATGGATTAGCAGCTTT
GCAGTGGTCTATTTGTCAGGATTCACTTAGAAAGGCAGATAAGGCAAGAGGCATGTATGA
GAAGCTTCTGTCTCACCCAAACCCGAGAGTGAGCAAGAAAGCGAGGCAGTTCATGTTCAG
TTTTCAG
CAAT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2A836JQ 367 0 0
GCACTAGAAAAGGGGAACACCCTTATGGATTCAGGGAGACTCAAAGAAGCTTTGCCATAC
TATGAAAAGGTCATGGAGAAAATAGTTTTTAAGAGCGAGCTTTATGGATTAGCAGCTTTG
CAGTGGTTTATTTGTCAGGATTCACTTAGAAAGGCAGATAAGGCAAGAGGCATGTATGAG
AAGCTTTTGTTTCACCCAAACCCGAGAGTGAGCAAGAAAGGGAGGCAGTTCATGTTCAGT
TTTCAGGCAATGGAGATGCTGAAGGTTCAGGGTTCGAGCTTCATGCAGATAAACCCAGGC
TATGAGGATTACTTTGAAGCCTTTGTCAAGAAAGACAAAGTTGATTACAAAGCTAAGGAG
GGGGAAG

QA 1 367 1 367
DS 



AS 1 2

CO CL3390Contig1 565 2 2 U
GGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGTATTCAACGAGTTCACACCTTGGCCGACAGGCCCG
GGTAATCTTTGAAATTTCATCGTAATGGGGTGAGAACAAAGCCTAGAAAGATGCAGCAAC
AGCAGCAGCAGCTAGGGCCTAATGGACTCCCTTTACCACACCAGCCACACCAGCCACATG
GAAACCAGAACTACATCGAGGGTCCTAAAGCCGGGGCTGCACCAGGTGGTGGCGGTGGTG
GTTGGGATAATGTATGGGGTAACTAAGTTGCTTCGTTTCTTTAAGCCAAGTCCTTCAACG
TTGCTCTGAATACACAAATGGTAATCAGTTTGGATATGAGTAGATTGTGCAGCGGCCTCC
TAAGCAGATTGGGTTGTTGTTGTACTAAAGCCTGATGTTTGTTTACAAATCGAGTCTCTT
CTTCCTCAGTGTTCTGGTTATGTGATAAAACAAGTTGCAGATATTTATGTCGAACTCAAT
AAAATGGTAAGTTAAGTTGTAAAAGAGTTTCTAAAAGACATATCTGTTGTGTATTCATTT
AATATTATTGGATTCTCTTCTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC58TF U 1
AF RR2BT83TF U 216
BS 1 523 RR2AC58TF
BS 524 565 RR2BT83TF

RD RR2AC58TF 523 0 0
GGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGTATTCAACGAGTTCACACCTTGGCCGACAGGCCCG
GGTAATCTTTGAAATTTCATCGTAATGGGGTGAGAACAAAGCCTAGAAAGATGCAGCAAC
AGCAGCAGCAGCTAGGGCCTAATGGACTCCCTTTACCACACCAGCCACACCAGCCACATG
GAAACCAGAACTACATCGAGGGTCCTAAAGCCGGGGCTGCACCAGGTGGTGGCGGTGGTG
GTTGGGATAATGTATGGGGTAACTAAGTTGCTTCGTTTCTTTAAGCCAAGTCCTTCAACG
TTGCTCTGAATACACAAATGGTAATCAGTTTGGATATGAGTAGATTGTGCAGCGGCCTCC
TAAGCAGATTGGGTTGTTGTTGTACTAAAGCCTGATGTTTGTTTACAAATCGAGTCTCTT
CTTCCTCAGTGTTCTGGTTATGTGATAAAACAAGTTGCAGATATTTATGTCGAACTCAAT
AAAATGGTAAGTTAAGTTGTAAAAGAGTTTCTAAAAGACATAT

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2BT83TF 350 0 0
GCTGCACCAGGTGGTGGCGGTGGTGGTTGGGATAATGTATGGGGTAACTAAGTTGCTTCG
TTTCTTTAAGCCAAGTCCTTCAACGTTGCTCTGAATACACAAATGGTAATCAGTTTGGAT
ATGAGTAGATTGTGCAGCGGCCTCCTAAGCAGATTGGGTTGTTGTTGTACTAAAGCCTGA
TGTTTGTTTACAAATCGAGTCTCTTCTTCCTCAGTGTTCTGGTTATGTGATAAAACAAGT
TGCAGATATTTATGTCGAACTCAATAAAATGGTAAGTTAAGTTGTAAAAGAGTTTCTAAA
AGACATATCTGTTGTGTATTCATTTAATATTATTGGATTCTCTTCTTCTT

QA 1 350 1 350
DS 



AS 1 3

CO CL3391Contig1 1255 3 8 U
GTAGGCCAGCCAAAAATATAAGACATTTATTAAAGAAACTTTTTATCATATATAGTAATC
AGAGATGCCTCTTGACACTTTCTTATTTTACAAAGCATTAAAATTTTAAAACTCCCACCA
CAAAATAAAATTACAACCAACTTCCTCAGAACCACACTTTTCCCTTCTTACTTTGGTTTA
CTTAAGCTGTGTAGAGTTTAGGATCAGACAACCTCGGAACAGGAATAGCCACAAGTGGAC
TCTTCAACTTAAGAACAAGCCCAAACTTCTCCTCAACTTCAAACTTTTGTACTTTAGGAG
CCACCCAATCAAAAGAGTGAAGCAACGACCCAATGTTGAACAGAACAAGCCTCTCAGCCA
TGTTAATCGCCGCGCATATCCTCCTCCCTGATCCAAATGGCAAGTACTTGAAGTCACCAC
CATTGAAGTCAAGAGAGTTCTCAAGAAACCTCTCCGGTTTGAACTCATTTGGCTCATCCC
AATGCTTAGGGTCTCTATGAATGGCCCACACGTTGATGAAGATCTTCGAGTCTTTAGGCA
CGGTGTACCCCGCAACCACAGAGGTCTCACTGTTCCTATGAGGGACAAGAAGAGGAAGCG
TTGGGTGTAGCCTTAGAGTCTCTTTCATAACAGCTTGCAAGTAAGGGAGTTTAGGTAAGT
GTGATCCCTCAACTATACTGTCCGTGCCGACAACTTGATCAAGTTCTTGTCGGATCTTCT
TGAAAACTTCTGGTCTGCTCACGATCTCAGCCATAGCGAACTCAGATGCGTTGACCGACG
TGTCTACACCACCAAGAACCATGTCCATAAGCAGAGACTTGACGTGAGTCAACGAGAGAG
GAGCTTTCTCGTCCTCGTCTTTAACCCTAATCAAGTATTGCAAGAAATCTTCTTCTTCTT
CCGTTTTCTTTCCGACCATCTTGACGTGACTCTCCATGACACGATCGAACAAAAGATCTA
GCTTCTTGACGTGGACCTTCATCTGTTTAACGAGTCCTTGGAAGTCGAACCTTGCGAACC
AAGAAGAAGTCTGAGTAGTTTTGTATCCCTTCTATGTCGGAGATGTCAGAGATTAGGGTT
TTTAGCTCGTTTCCTAAGCTTGTCCTCTCATCTCCTTCAACGGCGAGCATGATGGTGCTG
TATGGATCCTCTGTGTTGAGGATCTTAGAGAAAGTGAAGTTAGAAGTCATAGCATCCATT
TTTTGTGTTCGAGTTCTTTAAAGAAAGAGAAAGGTTTTGTGTTTTGTGGTGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E951JQ U 99
AF RR2F634JQ U 1
AF RR2DA29TF C 616
BS 1 290 RR2F634JQ
BS 291 291 RR2E951JQ
BS 292 329 RR2F634JQ
BS 330 330 RR2E951JQ
BS 331 394 RR2F634JQ
BS 395 395 RR2E951JQ
BS 396 786 RR2F634JQ
BS 787 1255 RR2DA29TF

RD RR2E951JQ 333 0 0
TAAAATTTTAAAACTCCCACCACAAAATAAAATTACAATCAACTTCCTCAGAACCACACT
TTTCCCTTCTTACTTTGGTTTACTTAAGCTGTGTAGAGTTTAGGATCAGACAACCTCGGA
ACAGGAATAGCCACAAGTGGACTCTTCAACTTAAGAACAAGCCCAAACTTCTCCTCAACT
TCAAACTTTTGTACTTTAGGAGCCACCCAATCAAAAGAGTGAAGCAACGACCCAATGTTG
AACAGAACAAGCCTCTCAGCCATGTTAATCGCCGCGCATATCCTCCTCCCTGATCCAAAT
GGCAAGTACTTGAAGTCACCACCATTGAAGTCA

QA 1 333 1 333
DS 

RD RR2F634JQ 786 0 0
GTAGGCCAGCCAAAAATATAAGACATTTATTAAAGAAACTTTTTATCATATATAGTAATC
AGAGATGCCTCTTGACACTTTCTTATTTTACAAAGCATTAAAATTTTAAAACTCCCACCA
CAAAATAAAATTACAACCAACTTCCTCAGAACCACACTTTTCCCTTCTTACTTTGGTTTA
CTTAAGCTGTGTAGAGTTTAGGATCAGACAACCTCGGAACAGGAATAGCCACAAGTGGAC
TCTTCAACTTAAGAACAAGCCCAAACTTCTCCTCAACTTCAAACTTTTGTCCTTTAGGAG
CCACCCAATCAAAAGAGTGAAGCAACGACGCAATGTTGAACAGAACAAGCCTCTCAGCCA
TGTTAATCGCCGCGCATATCCTCCTCCCTGATCCGAATGGCAAGTACTTGAAGTCACCAC
CATTGAAGTCAAGAGAGTTCTCAAGAAACCTCTCCGGTTTGAACTCATTTGGCTCATCCC
AATGCTTAGGGTCTCTATGAATGGCCCACACGTTGATGAAGATCTTCGAGTCTTTAGGCA
CGGTGTACCCCGCAACCACAGAGGTCTCACTGTTCCTATGAGGGACAAGAAGAGGAAGCG
TTGGGTGTAGCCTTAGAGTCTCTTTCATAACAGCTTGCAAGTAAGGGAGTTTAGGTAAGT
GTGATCCCTCAACTATACTGTCCGTGCCGACAACTTGATCAAGTTCTTGTCGGATCTTCT
TGAAAACTTCTGGTCTGCTCACGATCTCAGCCATAGCGAACTCAGATGCGTTGACCGACG
TGTCTA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2DA29TF 640 0 0
GAGTCTCTTTCATAACAGCTTGCAAGTAAGGGAGTTTAGGTAAGTGTGATTCCTCAACTA
TACTGTCCGTGCCGACAACTTGATCAAGTTCTTGTCGGATCT*CTTGAAAACTTCTGGTC
TGCTCACGATCTCAGCCATAGCGAACTCAGATGCGTTGACCGACGTGTCTACACCACCAA
GAACCATGTCCATAAGCAGAGACTTGACGTGAGTCAACGAGAGAGGAGCTTTCTCGTCCT
CGTCTTTAACCCTAATCAAGTATTGCAAGAAATCTTCTTCTTCTTCCGTTTTCTTTCCGA
CCATCTTGACGTGACTCTCCATGACACGATCGAACAAAAGATCTAGCTTCTTGACGTGGA
CCTTCATCTGTTTAACGAGTCCTTGGAAGTCGAACCTTGCGAACCAAGAAGAAGTCTGAG
TAGTTTTGTATCCCTTCTATGTCGGAGATGTCAGAGATTAGGGTTTTTAGCTCGTTTCCT
AAGCTTGTCCTCTCATCTCCTTCAACGGCGAGCATGATGGTGCTGTATGGATCCTCTGTG
TTGAGGATCTTAGAGAAAGTGAAGTTAGAAGTCATAGCATCCATTTTTTGTGTTCGAGTT
CTTTAAAGAAAGAGAAAGGTTTTGTGTTTTGTGGTGGTCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL3392Contig1 940 2 6 U
GGAATCACACATGATAAAGAGATTAAAAAGAAAGATGGATAAGAGATGGAGTCTTCAAGG
TATGACTGCTCTTGTAACCGGTGGAGCCAGCGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAGGAATT
AGCTAGTTTTGGAGCTAGAATCCATGTGTGTGACATATCTGAAACTTTGCTCAATCAAAG
TTTAAGCCAATGGGAGAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGCTCAGTCTGTGATGTAACCTC
TCGTCCCGAGAGAGAAACACTCATGCAAACTGTCTCCTCGCTGTTTGATCGCAAGCTCAA
CATTTTCGTGAACAATGTGGGTGTACTTCGCGGAAAGCCAACAACAGAATATACGGCTGC
AGATTTCTCGTTTCATATCTCCATAAACTTGGAGTCTGCTTATCATCTTAGCCAGCTTTC
ACATCCTCTCCTAAAGGCTTCAGGCTATGGAAGCATCGTCTTCATGTCCTCTGTTGCAGG
AGTTGTATCCATGAGCGGCGGATCCATTTACAGTCTAACCAAAGGAGCTCTATCTCAGCT
AGCTAGAAATTTGGCATGTGAATGGGCAAAAGACGGCATACGAGCCGACGCTGTTGCACC
TAATATCATCAAGACTCCGCTGGCCCAACCTTGTCTTGAGGACGTCGTGTACAGGGAAGA
ACTGTTCGGTAGAACTCCACTTGGTCGAGCTGGAGAGCCGAATGAAGTTGCATCACTAGT
GGTCTTCTTGTGTCTTCCTGCAGCTTCTTATATTACTGGTCAGACCATTTGTGTTGATGG
AGGCCTCACGGTTAACGGTTTCTCCTATCAACCATAAGCTTGAGATTGGTACTGTCACGT
TTTGTAACTGTAATGTTCTCTTTCGAATAAAATTTTCACGCTATATACAACTACGTGTTA
AGAACTTATTTTACCAATTATACAAGCCATATTTATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H374TF U 1
AF RR2H374JQ C 471
BS 1 735 RR2H374TF
BS 736 736 RR2H374JQ
BS 737 765 RR2H374TF
BS 766 766 RR2H374JQ
BS 767 791 RR2H374TF
BS 792 940 RR2H374JQ

RD RR2H374TF 791 0 0
GGAATCACACATGATAAAGAGATTAAAAAGAAAGATGGATAAGAGATGGAGTCTTCAAGG
TATGACTGCTCTTGTAACCGGTGGAGCCAGCGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAGGAATT
AGCTAGTTTTGGAGCTAGAATCCATGTGTGTGACATATCTGAAACTTTGCTCAATCAAAG
TTTAAGCCAATGGGAGAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGCTCAGTCTGTGATGTAACCTC
TCGTCCCGAGAGAGAAACACTCATGCAAACTGTCTCCTCGCTGTTTGATCGCAAGCTCAA
CATTTTCGTGAACAATGTGGGTGTACTTCGCGGAAAGCCAACAACAGAATATACGGCTGC
AGATTTCTCGTTTCATATCTCCATAAACTTGGAGTCTGCTTATCATCTTAGCCAGCTTTC
ACATCCTCTCCTAAAGGCTTCAGGCTATGGAAGCATCGTCTTCATGTCCTCTGTTGCAGG
AGTTGTATCCATGAGCGGCGGATCCATTTACAGTCTAACCAAAGGAGCTCTATCTCAGCT
AGCTAGAAATTTGGCATGTGAATGGGCAAAAGACGGCATACGAGCCGACGCTGTTGCACC
TAATATCATCAAGACTCCGCTGGCCCAACCTTGTCTTGAGGACGTCGTGTACAGGGAAGA
ACTGTTCGGTAGAACTCCACTTGGTCGAGCTGGAGAGCCGAATGAAGTTGCATCACTAGT
GGTCTTCTTGTGTCT*CCTGCAGCTTCTTATATTACTGGTCAGAC*ATTTGTGTTGATGG
AGGCCTCACGG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2H374JQ 470 0 0
CTGTTGCAGGAGTTGTATCCATGAGCGGCGGATCCATTTACAGTCTAACCAAAGGAGCTC
TATCTCAGCTAGCTAGAAATTTGGCATGTGAATGGGCAAAAGACGGCATACGAGCCGACG
CTGTTGCACCTAATATCATCAAGACTCCGCTGGCCCAACCTTGTCTTGAGGACGTCGTGT
ACAGGGAAGAACTGTTCGGTAGAACTCCACTTGGTCGAGCTGGAGAGCCGAATGAAGTTG
CATCACTAGTGGTCTTCTTGTGTCTTCCTGCAGCTTCTTATATTACTGGTCAGACCATTT
GTGTTGATGGAGGCCTCACGGTTAACGGTTTCTCCTATCAACCATAAGCTTGAGATTGGT
ACTGTCACGTTTTGTAACTGTAATGTTCTCTTTCGAATAAAATTTTCACGCTATATACAA
CTACGTGTTAAGAACTTATTTTACCAATTATACAAGCCATATTTATTTTC

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 2

CO CL3393Contig1 1256 2 16 U
GGCACTTGAATCTTGCGAGGGTGGCGAGCTTTTCGACCAAATTACTAGAAAAGGTAGGCT
ATCTGAGGATGAAGCTAGGTTCTACAGTGCACAAGTTGTGGATGCTCTTGAGTATATACA
TAACATGGGACTCATACATCGTGATATCAAGCCGGAGAATCTGTTGCTGACTTCAGATGG
GCACATCAAGATTGCTGATTTTGGAAGTGTGAAGCCTATGCAAGATAGCAGGATCACTGT
TCTTCCTAATGCTGCTTCTGACGATAAGGCGTGCACTTTTGTCGGAACTGCTGCTTATGT
TCCTCCTGAAGTTCTCAACTCTTCTCCCGCAACTTTTGGAAATGATCTCTGGGCTCTGGG
CTGCACTATCTACCAAATGCTTTCAGGGACTTCTCCATTCAAAGACGCAAGTGAATGGCT
GATTTTCCAAAGAATTATAGCCAGAGATATAAAGTTCCCAAGTCATTTCTCAGAAGCAGC
AAGAGACCTCATCGACCGGTTGCTGGATACTGATCCAAGTAGAAGACCAGGTGCTGGATC
AGAAGGTTATGCTGCTCTTAAGAGACATCCTTTCTTTATGGGAGTTGACTGGAAGAATCT
AAGGTCTCAGACTCCTCCAAAACTAGCCCCAGATCCTGCGTCTCAGGCAGCATCTCCTGA
GAGGGATGACGCTCATGGTTCTCCATGGAACCCAACTCATATCGGAGATTCTTCAGCCGC
ACATAACGATGGGCACAGTGCTCCTTCCACACCTTCTGAATCATCGGGTTCCATAACACG
GCTTGCTTCAATAGACTCTTTTGATTCGAGATGGCAACAGTTTCTGGAGCCGGGAGAATC
GGTCCTGATGATATCAGCAGTGAAGAAGCTTCAGAAAATAACGAGCAAGAAGGTGCAGCT
AATACTAACCAACAAACCCAAGCTAATCTATGTTGACCCGTCAAAGCTAGTTGTAAAAGG
GAACATCATCTGGTCTGATAACTCGAATGACCTCAACGTTGTAGTCACTAGCCCTTCTCA
CTTCAAGATTTGCACGCCAAAGAAGGTTTTGTCATTTGAAGACGTGAAACAGAGAGCTTT
GGTGTGGAAAAAAGCAATCGAGACTCTACAGAATCGCTGAGAGAAGCGCTCCTGTTGGGA
AGAATGGTTCTGTTGTTTCTACATTTCTTTGTGTTTCTTTTCTTTTAAAGATATGAACTG
AACAAACTCGATTCATCAGATGTTCTATACCATAGCCGACAAAAGAAATGTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F690TF U 1
AF RR2F690JQ C 458
BS 1 646 RR2F690TF
BS 647 647 RR2F690JQ
BS 648 709 RR2F690TF
BS 710 710 RR2F690JQ
BS 711 747 RR2F690TF
BS 748 748 RR2F690JQ
BS 749 752 RR2F690TF
BS 753 753 RR2F690JQ
BS 754 767 RR2F690TF
BS 768 768 RR2F690JQ
BS 769 769 RR2F690TF
BS 770 771 RR2F690JQ
BS 772 790 RR2F690TF
BS 791 791 RR2F690JQ
BS 792 805 RR2F690TF
BS 806 1256 RR2F690JQ

RD RR2F690TF 808 0 0
GGCACTTGAATCTTGCGAGGGTGGCGAGCTTTTCGACCAAATTACTAGAAAAGGTAGGCT
ATCTGAGGATGAAGCTAGGTTCTACAGTGCACAAGTTGTGGATGCTCTTGAGTATATACA
TAACATGGGACTCATACATCGTGATATCAAGCCGGAGAATCTGTTGCTGACTTCAGATGG
GCACATCAAGATTGCTGATTTTGGAAGTGTGAAGCCTATGCAAGATAGCAGGATCACTGT
TCTTCCTAATGCTGCTTCTGACGATAAGGCGTGCACTTTTGTCGGAACTGCTGCTTATGT
TCCTCCTGAAGTTCTCAACTCTTCTCCCGCAACTTTTGGAAATGATCTCTGGGCTCTGGG
CTGCACTATCTACCAAATGCTTTCAGGGACTTCTCCATTCAAAGACGCAAGTGAATGGCT
GATTTTCCAAAGAATTATAGCCAGAGATATAAAGTTCCCAAGTCATTTCTCAGAAGCAGC
AAGAGACCTCATCGACCGGTTGCTGGATACTGATCCAAGTAGAAGACCAGGTGCTGGATC
AGAAGGTTATGCTGCTCTTAAGAGACATCCTTTCTTTATGGGAGTTGACTGGAAGAATCT
AAGGTCTCAGACTCCTCCAAAACTAGCCCCAGATCCTGCGTCTCAG*CAGCATCTCCTGA
GAGGGATGACGCTCATGGTTCTCCATGGAACCCAACTCATATCGGAGAT*CTTCAGCCGC
ACATAACGATGGGCACAGTGCTCCTTC*ACAC*TTCTGAATCATCGGTT**CATAACACG
GCTTGCTTCA*TAGACTCTTTTGAT
CGA

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2F690JQ 799 0 0
CCAAGTCATTTCTCAGAAGCAGCAAGAGAC*TCATCGACCGGTTGCTGGATACTGATCCA
AGTAGAAGACCAGGTGCTGGATCAGAAGGTTATGCTGCTCTTAAGAGACATCCTTTCTTT
ATGGGAGTTGACTGGAAGAATCTAAGGTCTCAGACTCCTCCAAAACTAGCCCCAGATCCT
GCGTCTCAGGCAGCATCTCCTGAGAGGGATGACGCTCATGGTTCTCCATGGAACCCAACT
CATATCGGAGATTCTTCAGCCGCACATAACGATGGGCACAGTGCTCCTTCCACACCTTCT
GAATCATCGGGTTCCATAACACGGCTTGCTTCAATAGACTCTTTTGATTCGAGATGGCAA
CAGTTTCTGGAGCCGGGAGAATCGGTCCTGATGATATCAGCAGTGAAGAAGCTTCAGAAA
ATAACGAGCAAGAAGGTGCAGCTAATACTAACCAACAAACCCAAGCTAATCTATGTTGAC
CCGTCAAAGCTAGTTGTAAAAGGGAACATCATCTGGTCTGATAACTCGAATGACCTCAAC
GTTGTAGTCACTAGCCCTTCTCACTTCAAGATTTGCACGCCAAAGAAGGTTTTGTCATTT
GAAGACGTGAAACAGAGAGCTTTGGTGTGGAAAAAAGCAATCGAGACTCTACAGAATCGC
TGAGAGAAGCGCTCCTGTTGGGAAGAATGGTTCTGTTGTTTCTACATTTCTTTGTGTTTC
TTTTCTTTTAAAGATATGAACTGAACAAACTCGATTCATCAGATGTTCTATACCATAGCC
GACAAAAGAAATGTTTACC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL3394Contig1 1200 2 2 U
GACAGACTCTTTAAGCTTTGACTTTCTTTCTCGGAAACATGCTCTCGAGAATTTATTTGA
TCCACGTCCTGTGAAACTCGAATTCAGCTTCTGGGTCAGGCTTGGCTACTACTGGTTCGG
AAAAAGATGGGTAACAAGATCATCTCGATGATGAAGAAAGATAGAAAAGAAGGGTCCAAG
AGCATGAGAATGAATCGTTCACAGAGAAAATTGCTGGCTGATGAAGAGATGTTGCATCGA
CGAGCTCTGTCTATGGCCATTCGTCAAACTCAGCTCTCTCAGAGATTCGACGGATCCATG
TCTAAACGGGTCGGGTCTACAAGCACCAGGAAACAACAACGCACCCTCTCTGACCCTTTT
TCAAATGCCAAGCAGGTACCAGACTTTTCATTAGAGAGCTTGACAGTGAAGAAATTCGTC
TTGGTGCATGGTGAAGGCTTTGGGGCATGGTGTTGGTACAAAATTGTTGCTTCATTGGAA
GAGTCAGGACTGTCTCCTATTACAGTCGATCTCACTGGATCTGGATTTAATATGACAGAC
ACAAACACTGTCTCTACTTTGGAGGAATATTCAAAACCACTGATCGAGTACCTTGAATCT
CTCCCTGAAGAAGAAAAGGTTATACTGGTGGGTCATAGCACTGGAGGTGCGTCCATTTCA
TACGCTTTAGAGAGGTTTCCAGAGAAAATCTCGAAAGCTATATTCCTATGTGCAACCATG
GTTTCTGATGGCCAAAGACCCTTTGATGTTTTCTCTGAACAGCTTGGTTCTGCAGAGAGG
TTCATGAAAGAGTCGCAGTTCTTGATCTACGGGAACGGGAAAGACAAGCCTCCTACAGGA
TTCTATGTTCAGACGCTGGACGACCTTTCGCTCTCACCAGACGTTCAAGAGAAGCTAGTG
AGAGAGAACAGCCCTGAAGGAGTCTTTAAGATCAAAGGAAGTGATCATTCTCCTTTCTTC
TCAAAGCCTCAATCGCTTCACAAAATCCTTCTCGAGATTGCACAGATACCGTAAGAAACA
ACATCTCAAGTTTTCTTTAGAGGAGGAGAGGATATTGAAATATAATCTGGATTGAGAATA
CTTGTTCATTGGGATCATTTCAGTTGTATACTCTTTTTTTTAAGAATCGCTTTGAATATA
AAAAAAAGTGGTTGAATACACAAATGTCCATGTATTTGAAAATATATAAAGATAAATACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G035TF U 1
AF RR2G035JQ C 480
BS 1 600 RR2G035TF
BS 601 1200 RR2G035JQ

RD RR2G035TF 600 0 0
GACAGACTCTTTAAGCTTTGACTTTCTTTCTCGGAAACATGCTCTCGAGAATTTATTTGA
TCCACGTCCTGTGAAACTCGAATTCAGCTTCTGGGTCAGGCTTGGCTACTACTGGTTCGG
AAAAAGATGGGTAACAAGATCATCTCGATGATGAAGAAAGATAGAAAAGAAGGGTCCAAG
AGCATGAGAATGAATCGTTCACAGAGAAAATTGCTGGCTGATGAAGAGATGTTGCATCGA
CGAGCTCTGTCTATGGCCATTCGTCAAACTCAGCTCTCTCAGAGATTCGACGGATCCATG
TCTAAACGGGTCGGGTCTACAAGCACCAGGAAACAACAACGCACCCTCTCTGACCCTTTT
TCAAATGCCAAGCAGGTACCAGACTTTTCATTAGAGAGCTTGACAGTGAAGAAATTCGTC
TTGGTGCATGGTGAAGGCTTTGGGGCATGGTGTTGGTACAAAATTGTTGCTTCATTGGAA
GAGTCAGGACTGTCTCCTATTACAGTCGATCTCACTGGATCTGGATTTAATATGACAGAC
ACAAACACTGTCTCTACTTTGGAGGAATATTCAAAACCACTGATCGAGTACCTTGAATCT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2G035JQ 721 0 0
AGAGTCAGGACTGTCTCCTATTACAGTCGATCTCACTGGATCTGGATTTAATATGACAGA
CACAAACACTGTCTCTACTTTGGAGGAATATTCAAAACCACTGATCGAGTACCTTGAATC
TCTCCCTGAAGAAGAAAAGGTTATACTGGTGGGTCATAGCACTGGAGGTGCGTCCATTTC
ATACGCTTTAGAGAGGTTTCCAGAGAAAATCTCGAAAGCTATATTCCTATGTGCAACCAT
GGTTTCTGATGGCCAAAGACCCTTTGATGTTTTCTCTGAACAGCTTGGTTCTGCAGAGAG
GTTCATGAAAGAGTCGCAGTTCTTGATCTACGGGAACGGGAAAGACAAGCCTCCTACAGG
ATTCTATGTTCAGACGCTGGACGACCTTTCGCTCTCACCAGACGTTCAAGAGAAGCTAGT
GAGAGAGAACAGCCCTGAAGGAGTCTTTAAGATCAAAGGAAGTGATCATTCTCCTTTCTT
CTCAAAGCCTCAATCGCTTCACAAAATCCTTCTCGAGATTGCACAGATACCGTAAGAAAC
AACATCTCAAGTTTTCTTTAGAGGAGGAGAGGATATTGAAATATAATCTGGATTGAGAAT
ACTTGTTCATTGGGATCATTTCAGTTGTATACTCTTTTTTTTAAGAATCGCTTTGAATAT
AAAAAAAAGTGGTTGAATACACAAATGTCCATGTATTTGAAAATATATAAAGATAAATAC
A

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 3

CO CL3395Contig1 514 3 5 U
CGACGGCGCAGCAATCATCTTCTTCTGTATTCTCTCGAGTCGAATCTACTTCAAAAGAGC
TCTTTAGTATCCGAAAGGGCAAAGAAAGATGCAGGCAAGTGATAGGTTTAACATCAACTC
ACAGCTTGAACATCTTCAAGCCAAGTATGTTGGTACTGGCCATGCTGATTTGAGCAGATT
TGAATGGGCTGTGAACATTCAGCGTGACAGTTATGCTTCCTACATTGGTCACTACCCCAT
GCTTGCTTACTTTGCTATCGCTGAGAATGAGTCCATTGGACGTGAACGCTACAACTTCAT
GCAGAAAATGCTTCTACCTTGTGGCCTTCCTCCAGAAAGAGAAGACGACTAAAGAGAGAG
ATTTGCAAGTGTTGTGTCGCAACTCGAAAAAGACTTATCTTTCTACTGCATTCTGTCCTA
ATGCATTCATGTATTGAACGTATAAAACTCTCTCTGGCTCTCCCATTGTGTAAACCAAAT
TGTTTTTAATTCAATGAAAAATTCTATGCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F632TF U 17
AF RR2E774TF U 1
AF RR2E774JQ C 332
BS 1 117 RR2E774TF
BS 118 118 RR2F632TF
BS 119 128 RR2E774TF
BS 129 129 RR2F632TF
BS 130 514 RR2E774TF

RD RR2F632TF 325 0 0
ATCTTCTTCTGTATTCTCTCGAGTCGAATCTACTTCAAAAGAGCTCTTTAGTATCCGAAA
GGGCAAAGAAAGATGCAGGCAAGTGATAGGTTTAACATCAACTCACAGCTTGAACATCTT
CAAGCCAAGTATGTTGGTACTGGCCATGCTGATTTGAGCAGATTTGAATGGGCTGTGAAC
ATTCAGCGTGACAGTTATGCTTCCTACATTGGTCACTACCCCATGCTTGCTTACTTTGCT
ATCGCTGAGAATGAGTCCATTGGACGTGAACGCTACAACTTCATGCAGAAAATGCTTCTA
CCTTGTGGCCTTCCTCCAGAAAGAG

QA 1 325 1 325
DS 

RD RR2E774TF 514 0 0
CGACGGCGCAGCAATCATCTTCTTCTGTATTCTCTCGAGTCGAATCTACTTCAAAAGAGC
TCTTTAGTATCCGAAAGGGCAAAGAAAGATGCAGGCAAGTGATAGGTTTAACATCAATTC
ACAGCTTGGACATCTTCAAGCCAAGTATGTTGGTACTGGCCATGCTGATTTGAGCAGATT
TGAATGGGCTGTGAACATTCAGCGTGACAGTTATGCTTCCTACATTGGTCACTACCCCAT
GCTTGCTTACTTTGCTATCGCTGAGAATGAGTCCATTGGACGTGAACGCTACAACTTCAT
GCAGAAAATGCTTCTACCTTGTGGCCTTCCTCCAGAAAGAGAAGACGACTAAAGAGAGAG
ATTTGCAAGTGTTGTGTCGCAACTCGAAAAAGACTTATCTTTCTACTGCATTCTGTCCTA
ATGCATTCATGTATTGAACGTATAAAACTCTCTCTGGCTCTCCCATTGTGTAAACCAAAT
TGTTTTTAATTCAATGAAAAATTCTATGCTTTTT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2E774JQ 183 0 0
CCAGAAAGAGAAGACGACTAAAGAGAGAGATTTGCAAGTGTTGTGTCGCAACTCGAAAAA
GACTTATCTTTTTACTGCATTCTGTCCTAATGCATTCATGTATTGAACGTATAAAACTCT
TTCTGGCTCTCCCATTGTGTAAACCAAATTGTTTTTAATTCAATGAAAAATTTTATGCTT
TTT

QA 1 183 1 183
DS 



AS 1 2

CO CL3396Contig1 1069 2 6 U
GGGTGTATGGAATCTATTTGGAGGGCGTCTGAACTGGGATGATAGGGCAGTAGTTGCAGA
TGACCCTCATTTTCAGGGTAGAGGAAACAAGAGCAGTGGCGATAATTTCCATGCTGCTCC
AAACATAGATCACTCACAGGACTTTGTTAGGAAGGACATCAAGGAATGGCTATGCTGGAT
GAGAGAAGAAGTTGGGTATGATGGATGGAGGCTTGATTTCGTAAGAGGGTTCTGGGGAGG
TTACGTCAAAGACTACATGGATGCTAGCAAACCCTACTTTGCGGTTGGTGAATACTGGGA
TTCCCTAAGTTACACTTATGGAGAAATGGACTACAATCAAGACGCACATCGTCAAAGGAT
TGTTGACTGGATCAATGCAACTAGTGGAGCTGCTGGTGCCTTCGATGTCACAACCAAAGG
AATTCTTCATACGGCGCTTCAAAAATGTGAATATTGGAGACTCTCAGACCCACAAGGGAA
GCCGCCTGGTGTAGTTGGATGGTGGCCGTCACGTGCTGTAACATTCATAGAGAATCATGA
TACTGGCTCTACTCAGGGTCACTGGAGATTCCCAGGAGGGAAGGAGATGCAAGGATATGC
TTACATCTTGACTCATCCAGGAACACCAGCTGTTTTCTTCGACCACATCTACTCAGACTA
CCGTTCCGAGATTTCTTCTCTTCTGTCTCTCAGGAACAGACAGAAACTTCACTGTCGGAG
TGAGGTGAACATAGTAAAGAGCGAGAGAGATGTGTATGCGGCTATAATAGATGAGAAAGT
TGCAATGAAGATCGGACCAGGGCATTACGAACCACCAAGCGGATCTCAGAACTGGTCTGT
AGCCGTTGAAGGCAGAGACTATAAGGTGTGGGAAACATCTTAAGAAGGATGTATTATTCT
AATGTGTGTAGTAAATAAAAATGCTCCCTGGAGAAAATGTGTTATATATGTATCTGTTTC
AGGGAAGAACCAGAAATAAAGATTTACCCCGATTTTTATGAAACTTCAGAACATATTCAT
ATTCTTGTATCAACACTGTCTGTTTGTAAAGTGTATCTGTTAAGGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ06TF U 1
AF RR2CQ06JQ C 405
BS 1 693 RR2CQ06TF
BS 694 694 RR2CQ06JQ
BS 695 717 RR2CQ06TF
BS 718 718 RR2CQ06JQ
BS 719 728 RR2CQ06TF
BS 729 1069 RR2CQ06JQ

RD RR2CQ06TF 732 0 0
GGGTGTATGGAATCTATTTGGAGGGCGTCTGAACTGGGATGATAGGGCAGTAGTTGCAGA
TGACCCTCATTTTCAGGGTAGAGGAAACAAGAGCAGTGGCGATAATTTCCATGCTGCTCC
AAACATAGATCACTCACAGGACTTTGTTAGGAAGGACATCAAGGAATGGCTATGCTGGAT
GAGAGAAGAAGTTGGGTATGATGGATGGAGGCTTGATTTCGTAAGAGGGTTCTGGGGAGG
TTACGTCAAAGACTACATGGATGCTAGCAAACCCTACTTTGCGGTTGGTGAATACTGGGA
TTCCCTAAGTTACACTTATGGAGAAATGGACTACAATCAAGACGCACATCGTCAAAGGAT
TGTTGACTGGATCAATGCAACTAGTGGAGCTGCTGGTGCCTTCGATGTCACAACCAAAGG
AATTCTTCATACGGCGCTTCAAAAATGTGAATATTGGAGACTCTCAGACCCACAAGGGAA
GCCGCCTGGTGTAGTTGGATGGTGGCCGTCACGTGCTGTAACATTCATAGAGAATCATGA
TACTGGCTCTACTCAGGGTCACTGGAGATTCCCAGGAGGGAAGGAGATGCAAGGATATGC
TTACATCTTGACTCATCCAGGAACACCAGCTGTTTTCTTCGACCACATCTACTCAGACTA
CCGTTCCGAGATTTCTTCTCTTCTGTCTCTCAG*AACAGACAGAAACTTCACTGTCG*AG
TGAGGTGA
CATA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2CQ06JQ 665 0 0
ATGTCACAACCAAAGGAATTCTTCATACGGCGCTTCAAAAATGTGAATATTGGAGACTCT
CAGACCCACAAGGGAAGCCGCCTGGTGTAGTTGGATGGTGGCCGTCACGTGCTGTAACAT
TCATAGAGAATCATGATACTGGCTCTACTCAGGGTCACTGGAGATTCCCAGGAGGGAAGG
AGATGCAAGGATATGCTTACATCTTGACTCATCCAGGAACACCAGCTGTTTTCTTCGACC
ACATCTACTCAGACTACCGTTCCGAGATTTCTTCTCTTCTGTCTCTCAGGAACAGACAGA
AACTTCACTGTCGGAGTGAGGTGAACATAGTAAAGAGCGAGAGAGATGTGTATGCGGCTA
TAATAGATGAGAAAGTTGCAATGAAGATCGGACCAGGGCATTACGAACCACCAAGCGGAT
CTCAGAACTGGTCTGTAGCCGTTGAAGGCAGAGACTATAAGGTGTGGGAAACATCTTAAG
AAGGATGTATTATTCTAATGTGTGTAGTAAATAAAAATGCTCCCTGGAGAAAATGTGTTA
TATATGTATCTGTTTCAGGGAAGAACCAGAAATAAAGATTTACCCCGATTTTTATGAAAC
TTCAGAACATATTCATATTCTTGTATCAACACTGTCTGTTTGTAAAGTGTATCTGTTAAG
GTGAC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 3

CO CL3397Contig1 1783 3 13 U
GGAATTCGAAAAGAGAGAGAAAACAATCATATTGTTCATCAAGAAATAAAAGATAATGGT
GGAGGAGACCAGCTCAGGCGGTGGCTCATCAGCTTCTCCGATCAAAACCATCGTCGTTTT
GGTACAAGAGAACAGGTCTTTCGATCACATGTTAGGTTGGTTTAAGGAACTGAACCCGGA
AATCGATGGAGTATCGGAATCTGAACCAAGATCCAACCCGGTGTCCACGTCAGACCCGAA
CTCTGCTCAAGTCTTCTTCGGCAAAGAGTCTCAAAACATTGATCCTGACCCTGGTCACTC
CTTCCAGGCGATCTACGAGCAGGTTTTCGGGAAACCTTTTAGTGACGAGAGCCCATACCC
GGTTCCGACAATGAACGGGTTCGTACAAAACGCAGAGGCCATCACACCAGGTATGTCGGA
GAAAGTAGTCATGCAAGGGTTTCCGCCTGAGAGGCTTCCCGTGTTCAAGGAGCTAGTTCA
AGAATTCGCCGTATGCGATCGGTGGTTCTCGTCGTTGCCGTCGTCAACGCAGCCTAACCG
TCTCTACGTCCACTCAGCGACATCAAACGGTGCGTTCAGCAACGATACCAACACACTGGT
ACGTGGGTTCCCTCAGAAGACAGTGTTCGAATCACTTGAAGAGAGTGGATTCACGTTTGG
GATTTACTACCAATCTTTTCCTAATTGCCTCTTTTACAGGAACATGAGGAAGCTGAAGTA
CGTGGACAACTTCCACCAATACCAATTAAGCTTCAAGAGACACTGCAAAGAAGGGAAGCT
TCCAAACTACGTGGTGATCGAACCGAGATACTTCAAAATTCTGTCTGCTCCGGCCAACGA
TGATCACCCCAAAAACGACGTCGCTGAGGGCCAAAACCTAGTCAAGGAGATCTACGAAGC
CTTAAGAGCTAGCCCTCAGTGGAACGAGATTCTCTTCGTTGTTGTTTATGATGAGCATGG
TGGTTACTATGATCATGTTCCTACTCCAGTCACTGGTGTTCCAAATCCTGATGGTCTTGT
TGGAGGTCCGCCTTTTAACTTTAAATTTGACCGGCTCGGTGTTAGGGTTCCTGCATTGCT
GATCTCACCTTGGATCGAACCTGGAACCGTGTTACACGAGCCAAACGGACCAGAGCCAAC
GTCACAGTTTGAGCATTCATCGATTCCGGCTACACTGAAAAAGATATTCAACCTCAAGAG
CTTTCTTACAAAGCGTGACGAATGGGCTGGAACATTTGATGCTGTCATCAACCGAACCAG
CCCAAGAACCGACTGCCCTGTTACATTACCGGAACTTCCAAGGGCAAGAGCCATTGGAAC
ACAAGAAGAAGATGAAGATCTCACTGATTTTCAGATCGAGTTGATACAAGCAGCGGCTGT
TATAAGAGGTGATCATATCAAAGACATTTACCCGTTGAAACTAGTGGACAACATGAAAGT
TTCAGATGCGGCTAAGTACGTAGAAGAAGCTTTCACTAAGTTTTATGGTGAGTCCAAGAA
GGCTAAAGAGGTAGGTCGTGATGAACATGAGATCATCGATCTTTCTCATGGAACTACTCG
TCACTCGAGTCCAAAATCTTTTATTCAGAAGTTTTTTTCTTGCTTGATTTGTGATAATTG
AACCAAAGCGTTACTATATTCTTCCGAGACTTGTGTGGTGTTTTAATTTTCTGGATTTGA
TGTGAGGACCGTATGAACTATTGTTTTTAGTTTTTTTTTTACAAATGTGTCATGTGTGTT
TGTCTATTCGATATTTTTCTATTCATAATTCTAACTTGGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B357TF U 1
AF RR2D846TF U 418
AF RR2B357JQ C 1037
BS 1 513 RR2B357TF
BS 514 514 RR2D846TF
BS 515 555 RR2B357TF
BS 556 556 RR2D846TF
BS 557 576 RR2B357TF
BS 577 577 RR2D846TF
BS 578 597 RR2B357TF
BS 598 598 RR2D846TF
BS 599 744 RR2B357TF
BS 745 745 RR2D846TF
BS 746 770 RR2B357TF
BS 771 1123 RR2D846TF
BS 1124 1783 RR2B357JQ

RD RR2B357TF 770 0 0
GGAATTCGAAAAGAGAGAGAAAACAATCATATTGTTCATCAAGAAATAAAAGATAATGGT
GGAGGAGACCAGCTCAGGCGGTGGCTCATCAGCTTCTCCGATCAAAACCATCGTCGTTTT
GGTACAAGAGAACAGGTCTTTCGATCACATGTTAGGTTGGTTTAAGGAACTGAACCCGGA
AATCGATGGAGTATCGGAATCTGAACCAAGATCCAACCCGGTGTCCACGTCAGACCCGAA
CTCTGCTCAAGTCTTCTTCGGCAAAGAGTCTCAAAACATTGATCCTGACCCTGGTCACTC
CTTCCAGGCGATCTACGAGCAGGTTTTCGGGAAACCTTTTAGTGACGAGAGCCCATACCC
GGTTCCGACAATGAACGGGTTCGTACAAAACGCAGAGGCCATCACACCAGGTATGTCGGA
GAAAGTAGTCATGCAAGGGTTTCCGCCTGAGAGGCTTCCCGTGTTCAAGGAGCTAGTTCA
AGAATTCGCCGTATGCGATCGGTGGTTCTCGTCTTTGCCGTCGTCAACGCAGCCTAACCG
TCTCTACGTCCACTCGGCGACATCAAACGGTGCGTTTAGCAACGATACCAACACACTTGT
ACGTGGGTTCCCTCAGAAGACAGTGTTCGAATCACTTGAAGAGAGTGGATTCACGTTTGG
GATTTACTACCAATCTTTTCCTAATTGCCTCTTTTACAGGAACATGAGGAAGCTGAAGTA
CGTGGACAACTTCCACCAATACCACTTAAGCTTCAAGAGACACTGCAAAG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2D846TF 706 0 0
GGAGAAAGTAGTCATGCAAGGGTTTCCTCCTGAGAGGCTTCCCGTGTTCAAGGAGCTAGT
TCAAGAATTCGCCGTATGCGATCGGTGGTTCTCGTCGTTGCCGTCGTCGACGCAGCCTAA
CCGTCTCTATGTCCACTCAGCGACATCAAACGGTGCGTTCAGCAACGATACTAACACACT
GGTACGTGGGTTCCCTCAGAAGACAGTGTTCGAATCACTTGAAGAGAGTGGATTCACGTT
TGGGATTTACTACCAATCTTTTCCTAATTGCCTCTTTTACAGGAACATGAGGAAGCTGAA
GTACGTGGACAACTTCCATCAATACCAATTAAGCTTCAAGAGACACTGCAAAGAAGGGAA
GCTTCCAAACTACGTGGTGATCGAACCGAGATACTTCAAAATTCTGTCTGCTCCGGCCAA
CGATGATCACCCCAAAAACGACGTCGCTGAGGGCCAAAACCTAGTCAAGGAGATCTACGA
AGCCTTAAGAGCTAGCCCTCAGTGGAACGAGATTCTCTTCGTTGTTGTTTATGATGAGCA
TGGTGGTTACTATGATCATGTTCCTACTCCAGTCACTGGTGTTCCAAATCCTGATGGTCT
TGTTGGAGGTCCGCCTTTTAACTTTAAATTTGACCGGCTCGGTGTTAGGGTTCCTGCATT
GCTGATCTCACCTTGGATCGAACCTGGAACCGTGTTACACGAGCCA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2B357JQ 747 0 0
AACTTTAAATTTGACCGGCTCGGTGTTAGGGTTCCTGCATTGCTTATCTCACCTTGGATC
GAACCTGGAACCGTGTTACACGAGCCAAACGGACCAGAGCCAACGTCACAGTTTGAGCAT
TCATCGATTCCGGCTACACTGAAAAAGATATTCAACCTCAAGAGCTTTCTTACAAAGCGT
GACGAATGGGCTGGAACATTTGATGCTGTCATCAACCGAACCAGCCCAAGAACCGACTGC
CCTGTTACATTACCGGAACTTCCAAGGGCAAGAGCCATTGGAACACAAGAAGAAGATGAA
GATCTCACTGATTTTCAGATCGAGTTGATACAAGCAGCGGCTGTTATAAGAGGTGATCAT
ATCAAAGACATTTACCCGTTGAAACTAGTGGACAACATGAAAGTTTCAGATGCGGCTAAG
TACGTAGAAGAAGCTTTCACTAAGTTTTATGGTGAGTCCAAGAAGGCTAAAGAGGTAGGT
CGTGATGAACATGAGATCATCGATCTTTCTCATGGAACTACTCGTCACTCGAGTCCAAAA
TCTTTTATTCAGAAGTTTTTTTCTTGCTTGATTTGTGATAATTGAACCAAAGCGTTACTA
TATTCTTCCGAGACTTGTGTGGTGTTTTAATTTTCTGGATTTGATGTGAGGACCGTATGA
ACTATTGTTTTTAGTTTTTTTTTTACAAATGTGTCATGTGTGTTTGTCTATTCGATATTT
TTCTATTCATAATTCTAACTTGGTTTC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 3

CO CL3398Contig1 979 3 25 U
CCAGACCAAACTGACCAATTCTCATAAATCAAGCTTTGTCTTTTTTTTCCAAGTATATTT
CCAGAAATAATAAACTTTTGTTCCTCTTCCGAGTGATAAATGATGAAATAGACAAATCCA
AATTACATGCGCTCAAAAAAGCTCTTATAATCTACATGAAGTCGAAATCGTCCATGGCAT
CATAAGGACCAGCCACTAGATCGTCATTGGCCTTATCTACAATCAGCTGTTTCTTTTTCC
CACCAGTCTTCTTTCTACCAGCAGCAGCTTCTTTCTCCGCCTTGAGATTTTCATTTGCTA
TTGTTGTAATGGAGGAAGCAACATCTTTAACATCTGCTGCCTTCATGTTGGTCACGGAAA
GTCTCATGACGGCTTTGAGTAGCGCAATATAATGGTAACTTTTCTCATATGGTTTAAGCT
TATGAGAAATCATTTCAGCATATTCCAAAAAATCGCTTTCAGACTTGGGGATGAACACAT
CAAGTTTTGTCTCTTCACCTTTCGTTCCAAAGAGCTCAGCAGTTGCCTTGTAGTCAGCTT
CTTCAACAAGCCTCTGCATGCGAAGTTTCTCAGAGATAGGATCCAAATGTTCTTCTTCCT
TTGGTGCTTCTTTGGGAACATCGGCTGCTTTGCCCTTCTTTTCAACAGCTTTGGCTGCTG
CTTTCTTAGGAGGAGCCTTCTCAGTAGCAGGCTTTACCGGAGCAGGTTGGTCGTCATCAT
CGTCATCCTCCCAAGAGTCCTTAATATCATTCTCATCTACATCCTCGTCATCCCAATTAC
TTTTAAGCTCGACTTTAGCTGGAAGTGGTGCAAGCTGCTCATCCTCCCAGTCATCCATAA
TTGCTGCTAGTTATCGAGTAAAAAATTCAATCTGATATGTGAATCCAACTGTAAAACCGA
GACAAGAAGAGATACAGCCGAGGAAGATGAAGGAGCGTGTTCTTTAGATGAGATCGGTCT
CCGATGTAAAGAGGCGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT37JQ U 1
AF RR2ET71JQ U 68
AF RR2ET71TF C 239
BS 1 89 RR2DT37JQ
BS 90 90 RR2ET71JQ
BS 91 133 RR2DT37JQ
BS 134 134 RR2ET71JQ
BS 135 244 RR2DT37JQ
BS 245 245 RR2ET71JQ
BS 246 283 RR2DT37JQ
BS 284 284 RR2ET71JQ
BS 285 286 RR2DT37JQ
BS 287 287 RR2ET71JQ
BS 288 303 RR2DT37JQ
BS 304 304 RR2ET71JQ
BS 305 313 RR2DT37JQ
BS 314 314 RR2ET71JQ
BS 315 363 RR2DT37JQ
BS 364 364 RR2ET71JQ
BS 365 419 RR2DT37JQ
BS 420 420 RR2ET71JQ
BS 421 499 RR2DT37JQ
BS 500 500 RR2ET71JQ
BS 501 514 RR2DT37JQ
BS 515 515 RR2ET71JQ
BS 516 567 RR2DT37JQ
BS 568 700 RR2ET71JQ
BS 701 979 RR2ET71TF

RD RR2DT37JQ 567 0 0
CCAGACCAAACTGACCAATTCTCATAAATCAAGCTTTGTCTTTTTTTTCCAAGTATATTT
CCAGAAATAATAAACTTTTGTTCCTCTTCTGAGTGATAAATGATGAAATAGACAAATCCA
AATTACATGCGCTTAAAAAAGCTCTTATAATCTACATGAAGTCGAAATCGTCCATGGCAT
CATAAGGACCAGCCACTAGATCGTCATTGGCCTTATCTACAATCAGCTGTTTCTTTTTCC
CACCGGTCTTCTTTCTACCAGCAGCAGCTTCTTTCTCCGCCTTAAGTTTTTCATTTGCTA
TTGCTGTAATGGACGAAGCAACATCTTTAACATCTGCTGCCTTCATGTTGGTCACGGAAA
GTCCCATGACGGCTTTGAGTAGCGCAATATAATGGTAACTTTTCTCATATGGTTTAAGCC
TATGAGAAATCATTTCAGCATATTCCAAAAAATCGCTTTCAGACTTGGGGATGAACACAT
CAAGTTTTGTCTCTTCACCCTTCGTTCCAAAGAGTTCAGCAGTTGCCTTGTAGTCAGCTT
CTTCAACAAGCCTCTGCATGCGAAGTT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2ET71JQ 633 0 0
TAATAAACTTTTGTTCTTCTTCCGAGTGATAAATGATGAAATAGACAAATCCAAATTACA
TGCGCTCAAAAAAGGTCTTATAATCTACATGAAGTCGAAATCGTCCATGGCATCATAAGG
ACCAGCCACTAGATCGTCATTGGCCTTATCTACAATCAGTTGTTTCTTTTTCCCACCAGT
CTTCTTTCTACCAGCAGCAGCTTCTTTCTCCGCCTTGAGATTTTCATTTGCTATTGTTGT
AATGGAGGAAGCAACATCTTTAACATCTGCTGCCTTCATGTTGGTCACGGAAAGTCTCAT
GACGGCTTTGAGTAGCGCAATATAATGGTAACTTTTCTCATATGGTTTAAGCTTATGAGA
AATCATTTCAGCATATTCCAAAAAATCGCTTTCAGACTTGGGGATGAACACATCAAGTTT
TGTCTCTTCACCTTTCGTTCCAAAGAGCTCAGCAGTTGCCTTGTAGTCAGCTTCTTCAAC
AAGCCTCTGCATGCGAAGTTTCTCAGAGATAGGATCCAAATGTTCTTCTTCCTTTGGTGC
TTCTTTGGGAACATCGGCTGCTTTGCCCTTCTTTTCAACAGCTTTGGCTGCTGCTTTCTT
AGGAGGAGCCTTCTCAGTAGCAGGCTTTACCGG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2ET71TF 741 0 0
CCCACCAGTCTTCTTTCTACCAGCAGCAGCTTCTTTCTCCGCCTTGAGATTTTCATTTGC
TATTGTTGTAATGGAGGAAGCAACATCTTTAACATCTGCTGCTTTCATGTTGGTCACGGA
AAGTCTCATGACGGCTTTGAGTAGCGCAATATAATGGTAACTTTTCTCATATGGTTTAAG
CTTATGAGAAATCATTTCAGCATATTCCAAAAAATCGCTTTCAGACTTGGGGATGAACAC
ATCAAGTTTTGTCTCTTCACCTTTCGTTCCAAAGAGCTCAGCAGTTGCCTTGTAGTCAGC
TTCTTCAACAAGCCTCTGCATGCGAAGTTTCTCAGAGATAGGATCCAAATGTTCTTCTTC
CTTTGGTGCTTCTTTGGGAACATCGGCTGCTTTGCCCTTCTTTTCAACAGCTTTGGCTGC
TGCTTTCTTAGGAGGAGCCTTCTCAGTAGCAGGCTTTACCGGAGCAGGTTGGTCGTCATC
ATCGTCATCCTCCCAAGAGTCCTTAATATCATTCTCATCTACATCCTCGTCATCCCAATT
ACTTTTAAGCTCGACTTTAGCTGGAAGTGGTGCAAGCTGCTCATCCTCCCAGTCATCCAT
AATTGCTGCTAGTTATCGAGTAAAAAATTCAATCTGATATGTGAATCCAACTGTAAAACC
GAGACAAGAAGAGATACAGCCGAGGAAGATGAAGGAGCGTGTTCTTTAGATGAGATCGGT
CTCCGATGTAAAGAGGCGATC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL3399Contig1 897 2 2 U
GGGCGGGACAAAAAAAAAAAGAAAGAACCAAGACCTCAAGAACTCACAAAGATCAATTAA
ACACAACCTTTTTTCTGCTCTCTATCTCTTTTTCATCCCATATGTTGCTTCCCTAAAGAA
TGTAAAGCAACATCTGAGGATTCATTGAAAACCAGACATAAACTTACATTTAAACAAAAC
AAAACATATTATATTTGTTTGTGTGTGTCTTAATGATGAAATAGAAGATTGAGAGTAAGA
AATAGGTTGATATACCCGCAATGGAGATAGAGAGAATGAGGCAGTTGATGTTCCTTTGGT
CTAATTTGAAGAGCAGCCGCGTTTCTCTCACCGGTGGGAATCACACAGCCGCTAGGTTCT
GCAACCGCTAGTCTCGCCTTTCTCTAACCCTCTCTTCTCTCTTCTCTTCCTTTTTCTTTT
ACCTGTTTTTCTATTCTTATAAATTCCTTTTAGCTTTCTTCTTCTCATCTCTTTTTCCTA
TTAGCTATCAACTTCACTTTTGGGCACGCTCCCCTTTGTCTCCCAGCTTTTAAGACAATA
TCAAAAACAGAAAAAATGGTGTTTGTTACGGTCCAAAACTTTCACTCTATGTGTCAAAAG
CCAAAGGGTTTATGGCTAAAGGGAAGGAAGATGCAGAGTAAGAGTGGTAGGGCTTATTGG
GAGTGTTTGGCTCTATATGGCAAACTTAGAGATGAAGGTGTTGCTGTGCATCAATGGCGG
GGTTGAAGTTAAAGGACAGGGAGATTGACTTGAGATAATATTCATAAACAAGTCTCTTAT
TCTGTTATATTTATGTTTTATTTATTCTGATGTCGAATTTCTTTTTCTTTTGTTAAATCT
TGTGATCATCAATGTATTGTTGTGATTAAAGTATTTTGTGATGTTGTATGTGTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F453TF U 1
AF RR2F453JQ C 3
BS 1 556 RR2F453TF
BS 557 897 RR2F453JQ

RD RR2F453TF 556 0 0
GGGCGGGACAAAAAAAAAAAGAAAGAACCAAGACCTCAAGAACTCACAAAGATCAATTAA
ACACAACCTTTTTTCTGCTCTCTATCTCTTTTTCATCCCATATGTTGCTTCCCTAAAGAA
TGTAAAGCAACATCTGAGGATTCATTGAAAACCAGACATAAACTTACATTTAAACAAAAC
AAAACATATTATATTTGTTTGTGTGTGTCTTAATGATGAAATAGAAGATTGAGAGTAAGA
AATAGGTTGATATACCCGCAATGGAGATAGAGAGAATGAGGCAGTTGATGTTCCTTTGGT
CTAATTTGAAGAGCAGCCGCGTTTCTCTCACCGGTGGGAATCACACAGCCGCTAGGTTCT
GCAACCGCTAGTCTCGCCTTTCTCTAACCCTCTCTTCTCTCTTCTCTTCCTTTTTCTTTT
ACCTGTTTTTCTATTCTTATAAATTCCTTTTAGCTTTCTTCTTCTCATCTCTTTTTCCTA
TTAGCTATCAACTTCACTTTTGGGCACGCTCCCCTTTGTCTCCCAGCTTTTAAGACAATA
TCAAAAACAGAAAAAA

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2F453JQ 895 0 0
GGCGGGAC
AAAAAAAAAAGAAA*AACCA*GACCTCAAGAACTCACAAAGATCAATTAA*CACAAC**T
TTTTCTGCTCTCTATCTCTTTT*CATCCCATATGTTGCT*CCCTAAAGAATGTAAAGCAA
CATCTGAGGATTCATTGAAAACCAGACATAAACTTACATTTAAACAAAACAAAACATATT
ATATTTGTTTGTGTGTGTCTTAATGATGAAATAGAAGATTGAGAGTAAGAAATAGGTTGA
TATACCCGCAATGGAGATAGAGAGAATGAGGCAGTTGATGTTCCTTTGGTCTAATTTGAA
GAGCAGCCGCGTTTCTCTCACCGGTGGGAATCACACAGCCGCTAGGTTCTGCAACCGCTA
GTCTCGCCTTTCTCTAACCCTCTCTTCTCTCTTCTCTTCCTTTTTCTTTTACCTGTTTTT
CTATTCTTATAAATTCCTTTTAGCTTTCTTCTTCTCATCTCTTTTTCCTATTAGCTATCA
ACTTCACTTTTGGGCACGCTCCCCTTTGTCTCCCAGCTTTTAAGACAATATCAAAAACAG
AAAAAATGGTGTTTGTTACGGTCCAAAACTTTCACTCTATGTGTCAAAAGCCAAAGGGTT
TATGGCTAAAGGGAAGGAAGATGCAGAGTAAGAGTGGTAGGGCTTATTGGGAGTGTTTGG
CTCTATATGGCAAACTTAGAGATGAAGGTGTTGCTGTGCATCAATGGCGGGGTTGAAGTT
AAAGGACAGGGAGATTGACTTGAGATAATATTCATAAACAAGTCTCTTATTCTGTTATAT
TTATGTTTTATTTATTCTGATGTCGAATTTCTTTTTCTTTTGTTAAATCTTGTGATCATC
AATGTATTGTTGTGATTAAAGTATTTTGTGATGTTGTATGTGTTGAG

QA 9 895 9 895
DS 



AS 1 2

CO CL3400Contig1 966 2 2 U
GGAACGAAGATCAATATCCATGGCGATAAGATCAGTCAAAGTTAGCAACCTCTCATCAGG
ATCAACAGAGCATGGTATCAAAGAGTTCTTCTCTTTTTCCGGTGAAGTTGAAAGCATTGA
CATCCATGGCAATGAGCATAGTGCTTATGTCACATTCAAAGATCCTCAAGGAGCAGAGAC
CGCTGTGCTCTTATCAGGTGCAAGTATTGCCGATCAATCAGTCATCATTGAGATGGCTCC
TAACTACACTCCACCTGCTGCCCCTCATGCTGAAACACAGAGCGGTGGCGGAGGCGTCGC
AGAATCAGTTGTCCAAAAGGCAGAAGATGTTGTGAGCAGCATGTTAGCAAAGGGTTTCAT
CCTCGGTAAAGACGCTGTCGGCAAAGCAAAAGCGTTCGATGAGAAACTCGGTTTCACTTC
AACCGCAACAGCAGGAGTTGCTTCTATAGACCAAAAGATCGGTCTAACCCAAAAAATCAC
AGCTGGTACAAGCTTGGTGACCGAGAAGATCAAAGGGGTGGACCAAAGCTTCCAGGTCAC
AGAGAGGACCAAGTCTGCCTTTGCGACTGCGGAACAGACTGTGAGCAGCGCGGGAACGGC
CGTGATGAAAAACCGTTTTGTATTAACAGGTGTGAGCTGGGCGGCAAGAGCGTTCAACAG
AGTTGCTAAAGCGGCTGGAGAGGTTAGTCAGAAAACAAAAGAAAAAGTTGAAGCTGAGCA
ACCACCACGACCGTCGCAGACAGAGCATCAACCACCAGAAGGGTATTCTCCGATTCATTC
GTTTGAATCGAAGCACTAAATCTCATTACAGTGAAAAAGGTTGCGTTTTCTTTTTCTTGT
TGGTTTCTTTGATATGAAAAATGTGGGATTTTTTTTTTTGTCTTTTGGATTGTAACATAA
AAGCTATGTTTGGATCTTCTACATTTCTAGTTCGTGTTTCTTATAAGAAATTATATAGTA
TTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD78TF U 1
AF RR2BD78JQ C 60
BS 1 607 RR2BD78TF
BS 608 966 RR2BD78JQ

RD RR2BD78TF 607 0 0
GGAACGAAGATCAATATCCATGGCGATAAGATCAGTCAAAGTTAGCAACCTCTCATCAGG
ATCAACAGAGCATGGTATCAAAGAGTTCTTCTCTTTTTCCGGTGAAGTTGAAAGCATTGA
CATCCATGGCAATGAGCATAGTGCTTATGTCACATTCAAAGATCCTCAAGGAGCAGAGAC
CGCTGTGCTCTTATCAGGTGCAAGTATTGCCGATCAATCAGTCATCATTGAGATGGCTCC
TAACTACACTCCACCTGCTGCCCCTCATGCTGAAACACAGAGCGGTGGCGGAGGCGTCGC
AGAATCAGTTGTCCAAAAGGCAGAAGATGTTGTGAGCAGCATGTTAGCAAAGGGTTTCAT
CCTCGGTAAAGACGCTGTCGGCAAAGCAAAAGCGTTCGATGAGAAACTCGGTTTCACTTC
AACCGCAACAGCAGGAGTTGCTTCTATAGACCAAAAGATCGGTCTAACCCAAAAAATCAC
AGCTGGTACAAGCTTGGTGACCGAGAAGATCAAAGGGGTGGACCAAAGCTTCCAGGTCAC
AGAGAGGACCAAGTCTGCCTTTGCGACTGCGGAACAGACTGTGAGCAGCGCGGGAACGGC
CGTGATG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2BD78JQ 907 0 0
GATCAACAGAGCATGGTATCAAAGAGT*CTTCTCTTTTTCCGGTGAAGTTGAAAGCATTG
ACATCCATGGCAATGAGCATAGTGCTTATGTCACATTCAAAGATCCTCAAGGAGCAGAGA
CCGCTGTGCTCTTATCAGGTGCAAGTATTGCCGATCAATCAGTCATCATTGAGATGGCTC
CTAACTACACTCCACCTGCTGCCCCTCATGCTGAAACACAGAGCGGTGGCGGAGGCGTCG
CAGAATCAGTTGTCCAAAAGGCAGAAGATGTTGTGAGCAGCATGTTAGCAAAGGGTTTCA
TCCTCGGTAAAGACGCTGTCGGCAAAGCAAAAGCGTTCGATGAGAAACTCGGTTTCACTT
CAACCGCAACAGCAGGAGTTGCTTCTATAGACCAAAAGATCGGTCTAACCCAAAAAATCA
CAGCTGGTACAAGCTTGGTGACCGAGAAGATCAAAGGGGTGGACCAAAGCTTCCAGGTCA
CAGAGAGGACCAAGTCTGCCTTTGCGACTGCGGAACAGACTGTGAGCAGCGCGGGAACGG
CCGTGATGAAAAACCGTTTTGTATTAACAGGTGTGAGCTGGGCGGCAAGAGCGTTCAACA
GAGTTGCTAAAGCGGCTGGAGAGGTTAGTCAGAAAACAAAAGAAAAAGTTGAAGCTGAGC
AACCACCACGACCGTCGCAGACAGAGCATCAACCACCAGAAGGGTATTCTCCGATTCATT
CGTTTGAATCGAAGCACTAAATCTCATTACAGTGAAAAAGGTTGCGTTTTCTTTTTCTTG
TTGGTTTCTTTGATATGAAAAATGTGGGATTTTTTTTTTTGTCTTTTGGATTGTAACATA
AAAGCTATGTTTGGATCTTCTACATTTCTAGTTCGTGTTTCTTATAAGAAATTATATAGT
ATTCACG

QA 1 907 1 907
DS 



AS 1 2

CO CL3401Contig1 911 2 6 U
GGATCTCTCAAAGTCGGTCCGAGCAAAACGATCATTAGTTAAGGTCTCTCCTCTGATCGT
CTTCCACCTTCTTCTTCATCTGATCTTTTTTATTTCTTTCTCCGTCCTTTTTGTTAAATC
AAACGATGACCACTGAGACCGGAGAAATCAGCATCGTATGCAACCACTGCGACAGAGACA
TTCCAGCGCAAAACATCGATCTGCATCGTACATTGTGCCCGGAATCTAGAAAAATGTAAG
ATTTGTGGTGATATGGTTCCCAAAAAACATTCTGAGGAACACTTCCTGAACACGCATGCC
CCGGTACCATGCTCGATGTGCAAAGAAACCATAGACCGTGAGGCTTTTGATAGTCATGAA
GGAGAACTTTGCCCAAGAGGATAGTTACGTGTGAGTTCTGTGAGTTTCCGTTGCCTGCTG
CTGATCTTGCTGAGCATCAGGAAGTATGTGGCAACCGCACGGAGCTCTGTTATCAATGCA
ACAGCTATGTCAGATTGCGAGAAACGTACAGTCATCAAACCAAATGCCCTGGTTCTGTTC
TCAACAATGTTGATTCATCCAGAAGGATCCCAAGAGCAGCAGAAGGAGATGGAAATGGCA
GGTGGAGAAGAGACGGGAACGGTTTTTCTAACAAAAGGCTTTTCTTCACTATAGCCATAA
CTGGAATAGCTGTCTTGATAGGATCTCTGTTCTTCCAGAGGAAGCCTGAGACGAGCTAAG
CAGAGAGTTAGCTCGTGTGTAGTTCTGTAAATTTGCTACAAATACTCCCTTCGGACAGAT
TTGAAGGAAGGGTTTTATACGTTCTAGTGCTTACCGAGACAAGAGATGTTCCCTCTCAAA
AGATTGTTTAAGCTGATCATCATGAGACTTTCTTTTATATTTGGTTTCAATAAAAAAGAG
ATTTCGGGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FE47TF U 1
AF RR2FE47JQ C 252
BS 1 761 RR2FE47TF
BS 762 762 RR2FE47JQ
BS 763 788 RR2FE47TF
BS 789 789 RR2FE47JQ
BS 790 802 RR2FE47TF
BS 803 911 RR2FE47JQ

RD RR2FE47TF 802 0 0
GGATCTCTCAAAGTCGGTCCGAGCAAAACGATCATTAGTTAAGGTCTCTCCTCTGATCGT
CTTCCACCTTCTTCTTCATCTGATCTTTTTTATTTCTTTCTCCGTCCTTTTTGTTAAATC
AAACGATGACCACTGAGACCGGAGAAATCAGCATCGTATGCAACCACTGCGACAGAGACA
TTCCAGCGCAAAACATCGATCTGCATCGTACATTGTGCCCGGAATCTAGAAAAATGTAAG
ATTTGTGGTGATATGGTTCCCAAAAAACATTCTGAGGAACACTTCCTGAACACGCATGCC
CCGGTACCATGCTCGATGTGCAAAGAAACCATAGACCGTGAGGCTTTTGATAGTCATGAA
GGAGAACTTTGCCCAAGAGGATAGTTACGTGTGAGTTCTGTGAGTTTCCGTTGCCTGCTG
CTGATCTTGCTGAGCATCAGGAAGTATGTGGCAACCGCACGGAGCTCTGTTATCAATGCA
ACAGCTATGTCAGATTGCGAGAAACGTACAGTCATCAAACCAAATGCCCTGGTTCTGTTC
TCAACAATGTTGATTCATCCAGAAGGATCCCAAGAGCAGCAGAAGGAGATGGAAATGGCA
GGTGGAGAAGAGACGGGAACGGTTTTTCTAACAAAAGGCTTTTCTTCACTATAGCCATAA
CTGGAATAGCTGTCTTGATAGGATCTCTGTTCTTCCAGAGGAAGCCTGAGACGAGCTAAG
CAGAGAGTTAGCTCGTGTGTAGTTCTGTAAATTTGCTACAA*TACTCCCTTCGGACAGAT
TTGAAGGA*GGGTTTTATACGT

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2FE47JQ 660 0 0
TATGGTTCCCAAAAAACATTCTGAGGAACACTTCCTGAACACGCATGCCCCGGTACCATG
CTCGATGTGCAAAGAAACCATAGACCGTGAGGCTTTTGATAGTCATGAAGGAGAACTTTG
CCCAAGAGGATAGTTACGTGTGAGTTCTGTGAGTTTCCGTTGCCTGCTGCTGATCTTGCT
GAGCATCAGGAAGTATGTGGCAACCGCACGGAGCTCTGTTATCAATGCAACAGCTATGTC
AGATTGCGAGAAACGTACAGTCATCAAACCAAATGCCCTGGTTCTGTTCTCAACAATGTT
GATTCATCCAGAAGGATCCCAAGAGCAGCAGAAGGAGATGGAAATGGCAGGTGGAGAAGA
GACGGGAACGGTTTTTCTAACAAAAGGCTTTTCTTCACTATAGCCATAACTGGAATAGCT
GTCTTGATAGGATCTCTGTTCTTCCAGAGGAAGCCTGAGACGAGCTAAGCAGAGAGTTAG
CTCGTGTGTAGTTCTGTAAATTTGCTACAAATACTCCCTTCGGACAGATTTGAAGGAAGG
GTTTTATACGTTCTAGTGCTTACCGAGACAAGAGATGTTCCCTCTCAAAAGATTGTTTAA
GCTGATCATCATGAGACTTTCTTTTATATTTGGTTTCAATAAAAAAGAGATTTCGGGTCT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 3

CO CL3402Contig1 644 3 13 U
GGAGAGCTTAGTTAGAACTTAGAACATTCAGATTTTAGGGAGAGAGAGAATCTGAGGAGA
AAAGGAAGCTATGGAGGAGCCAGAGTTTCGCAGCCGTCTCCAACTCTTTCCCGTTGTGCG
CTCTCGCGACTACCGTGCTGAATTAGATTCATCAAGTTCAAAGCAATCAACTTCACTCTC
AGTTGTTGAGCGAGAGGAGGTAAATGAATGGCACGATGCAACCAGTGTTGTTGAGCCGGA
AGACGTGAAAGATCGGAAGACTAATCAAGATACATTCTGGGAAAATCTGAAAGCGGCTGC
TGAAAAGAAGGTTGGTAAGGTTGAAGCAGAGAGATTTTGCAAGGCTTTCGAGAAACTTCA
CAAGAAACTTGTGTATGAAGAGCTGGATCCAGAAGCTGCAAAGCGATACTTATTAAACTC
TTAAAAAATTCATGTCTTCATTTTTACTATATACTTCCAAAGGTTTGATCTGCGTAGAGA
TACTTCATTTCCCCTTTTTTTTTGCTTTTTAATTATCGCAATTAGGTATGAGTGGTCAAA
AATCTCGTCTCGTGTTCATCTAATCACGATTCTCATCTTATATGGTAGAGAAAAGTTCTG
TTTGTGACATGATTTCTCTTCCTATGTGGAGCAGCAGCAAGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY18JQ C 35
AF RR2DC30TF U 1
AF RR2CY18TF U 35
BS 1 108 RR2DC30TF
BS 109 109 RR2CY18TF
BS 110 452 RR2DC30TF
BS 453 453 RR2CY18TF
BS 454 469 RR2DC30TF
BS 470 470 RR2CY18TF
BS 471 491 RR2DC30TF
BS 492 492 RR2CY18TF
BS 493 493 RR2DC30TF
BS 494 494 RR2CY18TF
BS 495 566 RR2DC30TF
BS 567 567 RR2CY18TF
BS 568 644 RR2DC30TF

RD RR2CY18JQ 431 0 0
GG
AGGGAGAGAGAGAATTTGAGGAGAAAAGGAAGCTATGGAGGAGCCAGAGTTTCGCAGCCG
TCTCCAACTCTTTCCCGTTGTGCGCTCTCGCGACTACCGTGCTGAATTAGATTCATCAAG
TTCAAAGCAATCAACTTCACTCTCAGTTGTTGAGCGAGAGGAGGTAAATGAATGGCACGA
TGCAACCAGTGTTGTTGAGCCGGAAGACGTGAAAGATCGGAAGACTAATCAAGATACATT
CTGGGAAAATCTGAAAGCGGCTGCTGAAAAGAAGGTTGGTAAGGTTGAAGCAGAGAGATT
TTGCAAGGCTTTCGAGAAACTTCACAAGAAACTTGTGTATGAAGAGCTGGATCCAGAAGC
TGCAAAGCGATACTTATTAAACTCTTAAAAAATTCATGTCTTCATTTTTACTATATACTT
CCAAAGGTT

QA 3 431 3 431
DS 

RD RR2DC30TF 644 0 0
GGAGAGCTTAGTTAGAACTTAGAACATTCAGATTTTAGGGAGAGAGAGAATCTGAGGAGA
AAAGGAAGCTATGGAGGAGCCAGAGTTTCGCAGCCGTCTCCAACTCTTCCCCGTTGTGCG
CTCTCGCGACTACCGTGCTGAATTAGATTCATCAAGTTCAAAGCAATCAACTTCACTCTC
AGTTGTTGAGCGAGAGGAGGTAAATGAATGGCACGATGCAACCAGTGTTGTTGAGCCGGA
AGACGTGAAAGATCGGAAGACTAATCAAGATACATTCTGGGAAAATCTGAAAGCGGCTGC
TGAAAAGAAGGTTGGTAAGGTTGAAGCAGAGAGATTTTGCAAGGCTTTCGAGAAACTTCA
CAAGAAACTTGTGTATGAAGAGCTGGATCCAGAAGCTGCAAAGCGATACTTATTAAACTC
TTAAAAAATTCATGTCTTCATTTTTACTATATGCTTCCAAAGGTTTGATTTGCGTAGAGA
TACTTCATTTCTCTTTTTTTTTTGCTTTTTAATTATCGCAATTAGGTATGAGTGGTCAAA
AATCTCGTCTCGTGTTCATCTAATCATGATTCTCATCTTATATGGTAGAGAAAAGTTCTG
TTTGTGACATGATTTCTCTTCCTATGTGGAGCAGCAGCAAGTCT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2CY18TF 572 0 0
GG
AGGGAGAGAGAGAATCTGAGGAGAAAAGGAAGCTATGGAGGAGCCAGAGTTTCGCAGCCG
TCTCCAACTCTTTCCCGTTGTGCGCTCTCGCGACTACCGTGCTGAATTAGATTCATCAAG
TTCAAAGCAATCAACTTCACTCTCAGTTGTTGAGCGAGAGGAGGTAAATGAATGGCACGA
TGCAACCAGTGTTGTTGAGCCGGAAGACGTGAAAGATCGGAAGACTAATCAAGATACATT
CTGGGAAAATCTGAAAGCGGCTGCTGAAAAGAAGGTTGGTAAGGTTGAAGCAGAGAGATT
TTGCAAGGCTTTCGAGAAACTTCACAAGAAACTTGTGTATGAAGAGCTGGATCCAGAAGC
TGCAAAGCGATACTTATTAAACTCTTAAAAAATTCATGTCTTCATTTTTACTATATACTT
CCAAAGGTTTGATCTGCGTAGAGATACTTCATTTTCTCTTTTTTTTTGCTTTTTAATTAT
CGCAATTAGGTATGAGTGGTCAAAAATCTCGTCTCGTGTTCATCTAATCACGATTCTCAT
CTTATATGGTAGAGAAAAGTTCTGTTTG
GG

QA 3 570 3 570
DS 



AS 1 3

CO CL3403Contig1 1187 3 5 U
GGGAAGATGCAAACTTACTTTTGCCGGTACTGATTCCATCATTTGGATTTTCATATTTTC
TCATTCTTCTTTTTTAATGTTAGGTTAATTATACTATTACAGTTTATAAAAAGTATTACA
TAAAATGATTATACACCCGATAATTCTATCTATCCTATTAAAATTCACGTCTTACTGCAT
CATCTCAAGCTATTCCATAAAATCTACGTCCGATAGTATTTCTTGCACCATGCTGAAATC
TTTTATAATCATTTTTTCCATAATATGTGTAATTTGCATGTTTTTGATTTGAACCCCTAA
ATTTTCCATAATTTGGCAAAACATTTGGGAACAAATGTTTGTTTTTAAGAAAGATGTCTC
TTTCTGGATGAGAAGTTATCACGGCGATGCAACACAATGAAGATTCAAATGGTGGGAAGA
TAATGTCTGGGGGATTCGACCGAGGCCAAAAAGACTCTTGGCAATTTAAAATGGCCACAA
TTTTCATTCGTCAAACACCAACCCCACATTGCTCTCGACAATGCATAGTAGGGGTTGTCT
AGGAATCATCCAAGGGCAGCTATCGACGAGATAGATAAAGCAATTGGAAGTATTAACTGT
TCTGTCATGGATAATTTTCCTAATATTTCCTTCACAATTGAGGGAAAGCTTTTTCCACTC
ACTCCAAAAGAGACGGTAGACCAATATGCTGGAATCGTTTTGACGTGGCTCCACGCTGGT
AAGTTGTATCACTTAGCAATTTCCTAAGTTGCTAAACGTAATTACTTGATTTGAGTGTAG
GTTTCTGGGTATAGCTTTCATGCGGGTTTACCACATGGTGTTTGACTACTAGAATTTTAA
GAAACCAAGAATTGATTTATTTTTTTTCTTAAAAAAACGCAAGCCGATTCTTGGTTTCTT
CAAATTTTGATAGTCAAACATCGTATGGTACGCATGCATGAATGCTAGCCTAAAAACCTA
CACTCAAATCAGTGATCATTTAGCAATTATAGAATTAGGAAATTTGTGAGTGAAACAATA
CTTCTTGTTCCTTATAGCCGTGTTGCAGATGGTGGCTAAGTAACTTAAAATCAAATATTA
ATATGTGATATACATGAAAATGATAATGATATTTATCACCAAGTCTATTTTAAGAAAAAA
ATTAAAGTTGTACTCTTCAAAATATTAAAATATAAGAATATTGCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI65TF U 1
AF RR2BI65JQ C 478
AF RR2GA20TF U 923
BS 1 675 RR2BI65TF
BS 676 676 RR2BI65JQ
BS 677 776 RR2BI65TF
BS 777 922 RR2BI65JQ
BS 923 1187 RR2GA20TF

RD RR2BI65TF 776 0 0
GGGAAGATGCAAACTTACTTTTGCCGGTACTGATTCCATCATTTGGATTTTCATATTTTC
TCATTCTTCTTTTTTAATGTTAGGTTAATTATACTATTACAGTTTATAAAAAGTATTACA
TAAAATGATTATACACCCGATAATTCTATCTATCCTATTAAAATTCACGTCTTACTGCAT
CATCTCAAGCTATTCCATAAAATCTACGTCCGATAGTATTTCTTGCACCATGCTGAAATC
TTTTATAATCATTTTTTCCATAATATGTGTAATTTGCATGTTTTTGATTTGAACCCCTAA
ATTTTCCATAATTTGGCAAAACATTTGGGAACAAATGTTTGTTTTTAAGAAAGATGTCTC
TTTCTGGATGAGAAGTTATCACGGCGATGCAACACAATGAAGATTCAAATGGTGGGAAGA
TAATGTCTGGGGGATTCGACCGAGGCCAAAAAGACTCTTGGCAATTTAAAATGGCCACAA
TTTTCATTCGTCAAACACCAACCCCACATTGCTCTCGACAATGCATAGTAGGGGTTGTCT
AGGAATCATCCAAGGGCAGCTATCGACGAGATAGATAAAGCAATTGGAAGTATTAACTGT
TCTGTCATGGATAATTTTCCTAATATTTCCTTCACAATTGAGGGAAAGCTTTTTCCACTC
ACTCCAAAAGAGACG*TAGACCAATATGCTGGAATCGTTTTGACGTGGCTCCACGCTGGT
AAGTTGTATCACTTAGCAATTTCCTAAGTTGCTAAACGTAATTACTTGATTTGAGT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2BI65JQ 643 0 0
CAATTTTCATTCGTCAAACACCAACCCCACATTGCTCTCGACAATGCATAGTAGGGGTTG
TCTAGGAATCATCCAAGGGCAGCTATCGACGAGATAGATAAAGCAATTGGAAGTATTAAC
TGTTCTGTCATGGATAATTTTCCTAATATTTCCTTCACAATTGAGGGAAAGCTTTTTCCA
CTCACTCCAAAAGAGACGGTAGACCAATATGCTGGAATCGTTTTGACGTGGCTCCACGCT
GGTAAGTTGTATCACTTAGCAATTTCCTAAGTTGCTAAACGTAATTACTTGATTTGAGTG
TAGGTTTCTGGGTATAGCTTTCATGCGGGTTTACCACATGGTGTTTGACTACTAGAATTT
TAAGAAACCAAGAATTGATTTATTTTTTTTCTTAAAAAAACGCAAGCCGATTCTTGGTTT
CTTCAAATTTTGATAGTCAAACATCGTATGGTACGCATGCATGAATGCTAGCCTAAAAAC
CTACACTCAAATCAGTGATCATTTAGCAATTATAGAATTAGGAAATTTGTGAGTGAAACA
ATACTTCTTGTTCCTTATAGCCGTGTTGCAGATGGTGGCTAAGTAACTTAAAATCAAATA
TTAATATGTGATATACATGAAAATGATAATGATATTTATCACC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2GA20TF 265 0 0
GTATGGTACGCATGCATGAATGCTAGCCTAAAAACCTACACTCAAATCAGTGATCATTTA
GCAATTATAGAATTAGGAAATTTGTGAGTGAAACAATACTTCTTGTTCCTTATAGCCGTG
TTGCAGATGGTGGCTAAGTAACTTAAAATCAAATATTAATATGTGATATACATGAAAATG
ATAATGATATTTATCACCAAGTCTATTTTAAGAAAAAAATTAAAGTTGTACTCTTCAAAA
TATTAAAATATAAGAATATTGCGAC

QA 1 265 1 265
DS 



AS 1 2

CO CL3404Contig1 1047 2 4 U
GGAGACAAGGAACTCTGCGGCTGACAATGGCCACCGTTACCACCGTGGCTCTCCAGTCTC
TCACAGCCGCAAAACTCAGGCCTCCTTCTCTTAGCGTTTCTAAATCCTTCAAGCCGGTGA
CTAGCCGTGTGTCCTGCTGCCTCCACCATGATCTTAAGAACATGGCTTTAAATTTCGTTG
AGGCTACCAAGATCGCTGGCTTTGCACTCGCCACCTCTGCTCTTGTCGTCTCGGGTGCAA
GTGCAGAAGGAGTGCCAAAGAGGCTAACTTATGAGGAGATACAGAGCAAGACATACATGG
AAGTGAAAGGGACTGGAACCGCGAACCAGTGTCCAACCATTGAAGGTGGATTGGAGTCTT
TTGCCATTAAGCCAGGGAAATACTACGCCAAGAAGTTCTGCTTGGAGCCAACTTCATTCA
CCGTCAAAGCACAAGGTGTTAGCAAGAACGCCACGCCTGATTTTCAGAACACCAAACTCA
TGACTCGTCTTACCTACACACTCGACGAGATCGAAGGCCCTTTTGAAGTAGCATCTGATG
GAACGGTGAGGTTTCTTGAGAAAGACGGTATTGACTACGCTGCAGTGACAGTACAACTTC
CAGGTGGGAAACGTGTACCATTCTTGTTCACCATCAAGCAGCTTGTGGCATCGGGTAAAC
CAGAGAGCTTTGGAGGAGATTTCTTGGTGCCATCTTATAGAGGCTCGTCTTTTTTGGACC
CAAAAGGCCGTGGTGGCTTTACGGGATATGACAATGCAGTTGCGTTACCAGCTCGAGGAG
ACGATGAAGAGTTGGATAAGGAGAACAACAAGAACACAGCTGCTTCCGTCGGTCAGATAA
CATTCAGTGTAACAAAGAGTAAACCCGAGAGCGGTGAAGTGATTGGTGTTTTTGAGAGTA
TTCAGCCTTCGGATACTGATTTGGGTGCTAAGACTCCTAAGGATGTCAAGATTAAAGGTA
TCTGGTATGTTAAACTTGAGCAATAAAACATGCATATATAGTGAATCTGTTTGTTTAGTC
TGATTTTAGTAAATTCTAAATCCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD87TF U 1
AF RR2GD87JQ C 509
BS 1 562 RR2GD87TF
BS 563 563 RR2GD87JQ
BS 564 702 RR2GD87TF
BS 703 1047 RR2GD87JQ

RD RR2GD87TF 707 0 0
GGAGACAAGGAACTCTGCGGCTGACAATGGCCACCGTTACCACCGTGGCTCTCCAGTCTC
TCACAGCCGCAAAACTCAGGCCTCCTTCTCTTAGCGTTTCTAAATCCTTCAAGCCGGTGA
CTAGCCGTGTGTCCTGCTGCCTCCACCATGATCTTAAGAACATGGCTTTAAATTTCGTTG
AGGCTACCAAGATCGCTGGCTTTGCACTCGCCACCTCTGCTCTTGTCGTCTCGGGTGCAA
GTGCAGAAGGAGTGCCAAAGAGGCTAACTTATGAGGAGATACAGAGCAAGACATACATGG
AAGTGAAAGGGACTGGAACCGCGAACCAGTGTCCAACCATTGAAGGTGGATTGGAGTCTT
TTGCCATTAAGCCAGGGAAATACTACGCCAAGAAGTTCTGCTTGGAGCCAACTTCATTCA
CCGTCAAAGCACAAGGTGTTAGCAAGAACGCCACGCCTGATTTTCAGAACACCAAACTCA
TGACTCGTCTTACCTACACACTCGACGAGATCGAAGGCCCTTTTGAAGTAGCATCTGATG
GAACGGTGAGGTTTCTTGAGAA*GACGGTATTGACTACGCTGCAGTGACAGTACAACTTC
CAGGTGGGAAACGTGTACCATTCTTGTTCACCATCAAGCAGCTTGTGGCATCGGGTAAAC
CAGAGAGCTTTGGAGGAGATTTCTTGGTGCCATCTTATAGAG
CTCGT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2GD87JQ 539 0 0
GATCGAAGGCCCTTTTGAAGTAGCATCTGATGGAACGGTGAGGTTTCTTGAGAAAGACGG
TATTGACTACGCTGCAGTGACAGTACAACTTCCAGGTGGGAAACGTGTACCATTCTTGTT
CACCATCAAGCAGCTTGTGGCATCGGGTAAACCAGAGAGCTTTGGAGGAGATTTCTTGGT
GCCATCTTATAGAGGCTCGTCTTTTTTGGACCCAAAAGGCCGTGGTGGCTTTACGGGATA
TGACAATGCAGTTGCGTTACCAGCTCGAGGAGACGATGAAGAGTTGGATAAGGAGAACAA
CAAGAACACAGCTGCTTCCGTCGGTCAGATAACATTCAGTGTAACAAAGAGTAAACCCGA
GAGCGGTGAAGTGATTGGTGTTTTTGAGAGTATTCAGCCTTCGGATACTGATTTGGGTGC
TAAGACTCCTAAGGATGTCAAGATTAAAGGTATCTGGTATGTTAAACTTGAGCAATAAAA
CATGCATATATAGTGAATCTGTTTGTTTAGTCTGATTTTAGTAAATTCTAAATCCCTCC

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 2

CO CL3405Contig1 1221 2 2 U
GGACATCAGTCCCCACTTTCGTTTTAAATTCCAATTTTACCCCTTCCCTTTTTCACTTTC
GCTCGTTTTTCTCCGTCGCCGGTGAATCCCGACTTCAATCGCCGCCGTCCCGCAATCGCT
AAAATTTTCGAAACTGTATCGTTCGAGGATGATGAATCAAATGCAAAGGATCCTCGCTGC
TCGTCGGCTAACTCCCTCAATCATACCTCCGTCGTGCTTTCTTCACCGGCGGTGGTTCTC
GACTTCGGAAACTGATGCTTCGTCTAGGCATCAAAAGATCGAAACTTCGGAAGACAGAGC
TTCATACAAAAGCCGAGTCACACCGTCGACAACCTACTCTTCTCTCAACGAACAGGAACT
TGCCAAATTCTCTGCCATTGCTGATACCTGGTGGCATTCTGAAGGGCCGTTTAAGCCTTT
GCATCTGATGAATCCAACTCGGTTGGCTTTCATCCGCTCCACCTTATGCAGGCATTTCAG
TAAGGATCCGAGTTCCGCTAGGCCTTTTGAAGGACTGAGACTTATTGATGTTGGTTGTGG
CGGTGGACTTCTTTCCGAGCCTCTAGCACGGATGGGAGCAACTGTCACAGGAATTGATGC
TGTTGATAAGAATGTCAAGATTGCTCGTCTTCACGCTGATATGGACCCAATGACTTCAAC
TATTGAATACCAATGTACTACAGCAGAAAAGCTAGTGGAGGAGGGGAGGACGTTTGATGC
TGTTCTTGCCTTAGAGGTCATTGAGCATGTAGCCAACCCTGCAGAGTTCTGCAAGTCCTT
GTCAGCATTGACCATCCCCAACGGAGCCACGATACTTTCCACAATTAACCGCTCTATGCG
AGCATATGCATCAGCCATCGTTGCAGCAGAGTACATTCTACAATGGCTTCCTAAAGGCAC
ACACGAGTGGTCAAGTTTTTTAACTCCTGAAGAACTTACTATGATACTAAAACGCGCTTC
AGTCGATGTGAAGGAGATGGCTGGATTTGTGTACAACCCTATAACAGGAAGATGGTTACT
GTCAGATGACACAAGTGTGAACTTCATCGCTTATGGAACGAGAAAGAATGATATTGGAGA
CGTCTAATAGATTTGTTTCTGCATATCTGCCTCTGGAAGTTACTTAGGACAACAGAACAG
TAGTTAAATTTGCAATAAGTGAGACTGATCTGAGGTTACAGTTCCAAACTTTACTTGTCT
GTTGTTATCCATTCAGTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA85TF U 1
AF RR2AA85JQ C 529
BS 1 699 RR2AA85TF
BS 700 1221 RR2AA85JQ

RD RR2AA85TF 701 0 0
GGACATCAGTCCCCACTTTCGTTTTAAATTCCAATTTTACCCCTTCCCTTTTTCACTTTC
GCTCGTTTTTCTCCGTCGCCGGTGAATCCCGACTTCAATCGCCGCCGTCCCGCAATCGCT
AAAATTTTCGAAACTGTATCGTTCGAGGATGATGAATCAAATGCAAAGGATCCTCGCTGC
TCGTCGGCTAACTCCCTCAATCATACCTCCGTCGTGCTTTCTTCACCGGCGGTGGTTCTC
GACTTCGGAAACTGATGCTTCGTCTAGGCATCAAAAGATCGAAACTTCGGAAGACAGAGC
TTCATACAAAAGCCGAGTCACACCGTCGACAACCTACTCTTCTCTCAACGAACAGGAACT
TGCCAAATTCTCTGCCATTGCTGATACCTGGTGGCATTCTGAAGGGCCGTTTAAGCCTTT
GCATCTGATGAATCCAACTCGGTTGGCTTTCATCCGCTCCACCTTATGCAGGCATTTCAG
TAAGGATCCGAGTTCCGCTAGGCCTTTTGAAGGACTGAGACTTATTGATGTTGGTTGTGG
CGGTGGACTTCTTTCCGAGCCTCTAGCACGGATGGGAGCAACTGTCACAGGAATTGATGC
TGTTGATAAGAATGTCAAGATTGCTCGTCTTCACGCTGATATGGACCCAATGACTTCAAC
TATTGAATACCAATGTACTACAGCAGAAAAGCTAGTGGA
GG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2AA85JQ 693 0 0
TGTTGGTTGTGGCGGTGGACTTCTTTCCGAGCCTCTAGCACGGATGGGAGCAACTGTCAC
AGGAATTGATGCTGTTGATAAGAATGTCAAGATTGCTCGTCTTCACGCTGATATGGACCC
AATGACTTCAACTATTGAATACCAATGTACTACAGCAGAAAAGCTAGTGGAGGAGGGGAG
GACGTTTGATGCTGTTCTTGCCTTAGAGGTCATTGAGCATGTAGCCAACCCTGCAGAGTT
CTGCAAGTCCTTGTCAGCATTGACCATCCCCAACGGAGCCACGATACTTTCCACAATTAA
CCGCTCTATGCGAGCATATGCATCAGCCATCGTTGCAGCAGAGTACATTCTACAATGGCT
TCCTAAAGGCACACACGAGTGGTCAAGTTTTTTAACTCCTGAAGAACTTACTATGATACT
AAAACGCGCTTCAGTCGATGTGAAGGAGATGGCTGGATTTGTGTACAACCCTATAACAGG
AAGATGGTTACTGTCAGATGACACAAGTGTGAACTTCATCGCTTATGGAACGAGAAAGAA
TGATATTGGAGACGTCTAATAGATTTGTTTCTGCATATCTGCCTCTGGAAGTTACTTAGG
ACAACAGAACAGTAGTTAAATTTGCAATAAGTGAGACTGATCTGAGGTTACAGTTCCAAA
CTTTACTTGTCTGTTGTTATCCATTCAGTTCTT

QA 1 693 1 693
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3407Contig1 800 2 2 U
ATTCTCACACAGAGAAAAACTGATGTCCATAGCTTATTACTTCGTGTCAATAACAATATT
GTTGAAGTGTGTATAAAAATGGCAAAAAAGCTTAGCAGAAAGCAACGGCTTTACACTTGA
AATGAAAAATGAAAAACAGAAATAATTTGGTAGCAAGACTCAAGAATTGTTGTATGCATT
TATCGAGAACCTTCTTCATCTCCTATGGATCAAGGTTTTATGTAAGTGGGGCTTTGAGTT
CTTTTCTGTCTGCTCCAAATGACTCAACTCCGCAGTCTTTCACGTACATGTTTGTGAATA
GCTCAAATGGCTCTGGTACAGGGCTCTCCTTGGCCTGAGCTACAGCATCATCTACTTCTT
TCCTCACCTCTTTCTCCATGTCCTTAAGCTCCTTTTCTGTAGCTATGTCAAGGGATAAGA
GCAACTTTCGCACCCTTTCAATAGGGTCACGCACCTGTCTCGCTCCCGAGACTTCGTCAC
GTGTACGGTAGGTACTTCCTGGGTCAAACATCGAGTGGCCGTGGTATCTATAGGTGTCCA
TCTCAAGGACAATAGGTCCATTCTTGAGAGCATGCTCCTTGGCGAACTTGCATGCCTGTT
TCACAGCCAGTGCATCCATACCATCCACCTTCAAGCCAGGAACATAATCCCCACGCTTAA
AATAAGCAGGAGACTTAGCCGACCTCCACGTAGCAGTCCCCATCCCATAGTGGTTATTCT
CGCAAACAAGAATGGCAGGCAAATCCCAAAGAGCAGCAATATTCAAAGCCTCAAACAACT
GACCCTGATTAGCAGCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A356TF C 1
AF RR2A356JQ U 100
BS 1 99 RR2A356TF
BS 100 800 RR2A356JQ

RD RR2A356TF 800 0 0
ATTCTCACACAGAGAAAAACTGATGTCCATAGCTTATTACTTCGTGTCAATAACAATATT
GTTGAAGTGTGTATAAAAATGGCAAAAAAGCTTAGCAGAAAGCAACGGCTTTACACTTGA
AATGAAAAATGAAAAACAGAAATAATTTGGTAGCAAGACTCAAGAATTGTTGTATGCATT
TATCGAGAACCTTCTTCATCTCCTATGGATCAAGGTTTTATGTAAGTGTGGCTTTGAGTT
CTTTTCTGTCTGCTCCAAATGACTCAACTCCGCAGTCTTTCACGTACATGTTTGTGAATA
GCTCAGATGGCTCTGGTACAGGGCTCTCCTTGGCCTGAGCTACAGCATCATCTACTTCTT
TCCTCACCTCTTTCTCCATGTCCTTAAGCTCCTTTTCTGTAGCTATGTCAAGGGATAAGA
GCAACTTTCGCACCCTTTCAATAGGGTCACGCACCTGTCTCGCTCCCGAGACTTCGTCAC
GTGTACGGTAGGTACTTCCTGGGTCAGACATCGAGTGGCCGTGGTATCTATAGGTGTCCA
TCTCAAGGACAATAGGTCCATTCTTGAGAGCATGCTCCTTGGCGAACTTGCATGCCTGTT
TCACAGCCAGTGCATCCATACCATCCACCTTCAAGCCAGGAACATAATCCCCACGCTTAA
AATAAGCAGGAGACTTAGCCGACCTCCACGTAGCAGTCCCCATCCCATAGTGGTTATTCT
CGCAAACAAGAATGGCAGGCAAATCCCAAAGAGCAGCAATATTCAAAGCCTCAAACAACT
GACCCTGATTAGCAGCCCCC

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2A356JQ 701 0 0
AAGCAACGGCTTTACACTTGAAATGAAAAATGAAAAACAGAAATAATTTGGTAGCAAGAC
TCAAGAATTGTTGTATGCATTTATCGAGAACCTTCTTCATCTCCTATGGATCAAGGTTTT
ATGTAAGTGGGGCTTTGAGTTCTTTTCTGTCTGCTCCAAATGACTCAACTCCGCAGTCTT
TCACGTACATGTTTGTGAATAGCTCAAATGGCTCTGGTACAGGGCTCTCCTTGGCCTGAG
CTACAGCATCATCTACTTCTTTCCTCACCTCTTTCTCCATGTCCTTAAGCTCCTTTTCTG
TAGCTATGTCAAGGGATAAGAGCAACTTTCGCACCCTTTCAATAGGGTCACGCACCTGTC
TCGCTCCCGAGACTTCGTCACGTGTACGGTAGGTACTTCCTGGGTCAAACATCGAGTGGC
CGTGGTATCTATAGGTGTCCATCTCAAGGACAATAGGTCCATTCTTGAGAGCATGCTCCT
TGGCGAACTTGCATGCCTGTTTCACAGCCAGTGCATCCATACCATCCACCTTCAAGCCAG
GAACATAATCCCCACGCTTAAAATAAGCAGGAGACTTAGCCGACCTCCACGTAGCAGTCC
CCATCCCATAGTGGTTATTCTCGCAAACAAGAATGGCAGGCAAATCCCAAAGAGCAGCAA
TATTCAAAGCCTCAAACAACTGACCCTGATTAGCAGCCCCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL3408Contig1 1165 2 2 U
GGATAGCACCGATCACAATATACAATACTTTTAAAGGTAATTTGTAAGATTGATCTAACA
GCAAACAAAGATGGCCCAAAAGGTGGATGCACAAGGAGGGAAAGGAGGCAACCAATGGGA
CGATGGATCCGAACACGATGCAGTGACCAAGATTCAGGTCGGAGCAGGTGGAATCGGCAT
TCAATACGTTAAGTTCGATTATGTCAAGAACTGACAAACCGAAGAGGCCCCTCTTCGCGG
TATCAAAGGCCGTAGTATTCCAGCTGATCCTTTTGTGATTAACCATCCTGAGGAGCATCT
AGTTTCTGTAGAAGGTTGGTATAATCCTGACGGTCTCACTCAAGGGCTTAAGTTCAACTC
CAACAAGAAGTCTTCTGATGTCATTGGATACAACGATGGTACTTCATTCACTCTCCAAGT
TCAAGACAAGAAGATCGTTGGTTTTCATGGGTTTGCCGGAGACTATGTCCATTCTCTTGG
AGCTTACTTTGCTCCGTTGACTAGTTCCACCTCGTTGACCCCTGCCGAGAAGCTACCGAC
ACTTGGTAGTGATGAAGGGACTGCATGGGACGATGGTGCTCACCATGGTGTTAAAAAGGT
GTATGTAGGTCAAGGCCATGATGGTGTATCAGCGGTTAAGTTTGAATATGTCAATGGTTC
TGAAGTGGTTGTTGGAGATGAACGTGGAAAGCCTACTCTGCTCGGATTCGAAGAGTTCGA
ACTTGACTATCCAAATGAATACATCACGGTTGTTCATGGCACAGTCGATAAAATCTTTGG
GAGTGACTCTGCCGTCATCACCATGCTAAAGTTCGAGACTAATAAACGAACATCCAATCC
CTTTGGTCTTGAAGCTGGCGAACCTTTCAAAGTCAAAGAGGAAGGCCACAAGATCGTTGG
GTTTCATGGAAAAGCCAATGAGCTACTTCATCAAATTGGAGTCCATGTCCTCCCAATCTT
CATCCCAATCGCCAACTGATGATCATATGACATCTTTCTCTTTGATTCAATCTAATAAGT
TATCATATCTGTCTTTTTATGTTCTAAGTCTGTCATCGGAAGTCCTTTCTATGTTTATGT
CTCTGGTGATCTTTGAATAAGTTCTTTTACTTTTCCTGTTTCTGTTTGAAGCTGCTAAAG
TTTTATATAAGTAATATCTCTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG68TF U 1
AF RR2AG68JQ C 304
BS 1 576 RR2AG68TF
BS 577 1165 RR2AG68JQ

RD RR2AG68TF 576 0 0
GGATAGCACCGATCACAATATACAATACTTTTAAAGGTAATTTGTAAGATTGATCTAACA
GCAAACAAAGATGGCCCAAAAGGTGGATGCACAAGGAGGGAAAGGAGGCAACCAATGGGA
CGATGGATCCGAACACGATGCAGTGACCAAGATTCAGGTCGGAGCAGGTGGAATCGGCAT
TCAATACGTTAAGTTCGATTATGTCAAGAACTGACAAACCGAAGAGGCCCCTCTTCGCGG
TATCAAAGGCCGTAGTATTCCAGCTGATCCTTTTGTGATTAACCATCCTGAGGAGCATCT
AGTTTCTGTAGAAGGTTGGTATAATCCTGACGGTCTCACTCAAGGGCTTAAGTTCAACTC
CAACAAGAAGTCTTCTGATGTCATTGGATACAACGATGGTACTTCATTCACTCTCCAAGT
TCAAGACAAGAAGATCGTTGGTTTTCATGGGTTTGCCGGAGACTATGTCCATTCTCTTGG
AGCTTACTTTGCTCCGTTGACTAGTTCCACCTCGTTGACCCCTGCCGAGAAGCTACCGAC
ACTTGGTAGTGATGAAGGGACTGCATGGGACGATGG

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2AG68JQ 862 0 0
TTCTGTAGAAGGTTGGTATAATC*TGACGGTCTCACTCAAGGGCTTAAGTTCAACTCCAA
CAAGAAGTCTTCTGATGTCATTGGATACAACGATGGTACTTCATTCACTCTCCAAGTTCA
AGACAAGAAGATCGTTGGTTTTCATGGGTTTGCCGGAGACTATGTCCATTCTCTTGGAGC
TTACTTTGCTCCGTTGACTAGTTCCACCTCGTTGACCCCTGCCGAGAAGCTACCGACACT
TGGTAGTGATGAAGGGACTGCATGGGACGATGGTGCTCACCATGGTGTTAAAAAGGTGTA
TGTAGGTCAAGGCCATGATGGTGTATCAGCGGTTAAGTTTGAATATGTCAATGGTTCTGA
AGTGGTTGTTGGAGATGAACGTGGAAAGCCTACTCTGCTCGGATTCGAAGAGTTCGAACT
TGACTATCCAAATGAATACATCACGGTTGTTCATGGCACAGTCGATAAAATCTTTGGGAG
TGACTCTGCCGTCATCACCATGCTAAAGTTCGAGACTAATAAACGAACATCCAATCCCTT
TGGTCTTGAAGCTGGCGAACCTTTCAAAGTCAAAGAGGAAGGCCACAAGATCGTTGGGTT
TCATGGAAAAGCCAATGAGCTACTTCATCAAATTGGAGTCCATGTCCTCCCAATCTTCAT
CCCAATCGCCAACTGATGATCATATGACATCTTTCTCTTTGATTCAATCTAATAAGTTAT
CATATCTGTCTTTTTATGTTCTAAGTCTGTCATCGGAAGTCCTTTCTATGTTTATGTCTC
TGGTGATCTTTGAATAAGTTCTTTTACTTTTCCTGTTTCTGTTTGAAGCTGCTAAAGTTT
TATATAAGTAATATCTCTTTGC

QA 1 862 1 862
DS 



AS 1 3

CO CL3409Contig1 590 3 2 U
GGATGATCAAACTTTCCTTTGGTTCACGGTTTTCTCATTTGGCGATGGCGGCGACATCGG
GAGCGAAGATCACGGCGACTGAGCCACCGACGAAGATAGTATGGAACGCGGGGAAACACC
GATTCGAAACCGAAGATCACGAAGCCTTCATCGACTACAAGCTGAGAAACGACGGAAAAG
CGATGGATCTGGTCCACACCTACGTCCCATCCTCAAAACGAGGGTTAGGTTTAGCTTCTC
TCCTCTGCGTCGCCGCCTTCGAACACGCTTCCTCTCACTCCCTCTCCGTCATCCCTTCCT
GCTCCTACGTTTCCGACACGTTTCTTCCGAGGAACCCAACATGGAAGCCTCTGGTTTACA
CAGAGGATCTTAAGTCTAGCATTTGAATGAAGACACTCGTTTTTTT**AACATTGTTGTT
AAGCTTTGTGTTTTCAATGTCAGTTGTTGGTTG*TGTAATCTTCGGAACCTTGTAATCAA
GATCTGTCGGAGACAAATGTACTGGAAACTGTAATAAAGAAGTCTTTGAATGTCTGTATT
TGACAAAATAATCGTTGATTGATTGATTGTAATGAAATATTTGGCAGACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF75JQ C 1
AF RR2FF75TF U 1
AF RR2AL46TF U 192
BS 1 544 RR2FF75TF
BS 545 590 RR2AL46TF

RD RR2FF75JQ 544 0 0
GGATGATCAAACTTTCCTTTGGTTCACGGTTTTCTCATTTGGCGATGGCGGCGACATCGG
GAGCGAAGATCACGGCGACTGAGCCACCGACGAAGATAGTATGGAACGCGGGGAAACACC
GATTCGAAACCGAAGATCACGAAGCCTTCATCGACTACAAGCTGAGAAACGACGGAAAAG
CGATGGATCTGGTCCACACCTACGTCCCATCCTCAAAACGAGGGTTAGGTTTAGCTTCTC
TCCTCTGCGTCGCCGCCTTCGAACACGCTTCCTCTCACTCCCTCTCCGTCATCCCTTCCT
GCTCCTACGTTTCCGACACGTTTCTTCCGAGGAACCCAACATGGAAGCCTCTGGTTTACA
CAGAGGATCTTAAGTCTAGCATTTGAATGAAGACACTCGTTTTTTT**AACATTGTTGTT
AAGCTTTGTGTTTTCAATGTCAGTTGTTGGTTG*TGTAATCTTCGGAACCTTGTAATCAA
GATCTGTCGGAGACAAATGTACTGGAAACTGTAATAAAGAAGTCTTTGAATGTCTGTATT
TGAC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2FF75TF 544 0 0
GGATGATCAAACTTTCCTTTGGTTCACGGTTTTCTCATTTGGCGATGGCGGCGACATCGG
GAGCGAAGATCACGGCGACTGAGCCACCGACGAAGATAGTATGGAACGCGGGGAAACACC
GATTCGAAACCGAAGATCACGAAGCCTTCATCGACTACAAGCTGAGAAACGACGGAAAAG
CGATGGATCTGGTCCACACCTACGTCCCATCCTCAAAACGAGGGTTAGGTTTAGCTTCTC
TCCTCTGCGTCGCCGCCTTCGAACACGCTTCCTCTCACTCCCTCTCCGTCATCCCTTCCT
GCTCCTACGTTTCCGACACGTTTCTTCCGAGGAACCCAACATGGAAGCCTCTGGTTTACA
CAGAGGATCTTAAGTCTAGCATTTGAATGAAGACACTCGTTTTTTT**AACATTGTTGTT
AAGCTTTGTGTTTTCAATGTCAGTTGTTGGTTG*TGTAATCTTCGGAACCTTGTAATCAA
GATCTGTCGGAGACAAATGTACTGGAAACTGTAATAAAGAAGTCTTTGAATGTCTGTATT
TGAC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2AL46TF 399 0 0
GTCCACACCTACGTCCCATCCTCAAAACGAGGGTTAGGTTTAGCTTCTCTCCTCTGCGTC
GCCGCCTTCGAACACGCTTCCTCTCACTCCCTCTCCGTCATCCCTTCCTGCTCCTACGTT
TCCGACACGTTTCTTCCTAGGAACCCAACATGGAAGCCTCTGGTTTACACAGAGGATCTT
AAGTCTAGCATTTGAATGAAGACACTCGTTTTTTTTTAACATTGTTGTTAAGCTTTGTGT
TTTCAATGTCAGTTGTTGGTTGGTGTAATCTTCGGAACCTTGTAATCAAGATCTGTCGGA
GACAGATGTACTGGAAACTGTAATAAAGAAGTCTTTGAATGTCTGTATTTGACAAAATAA
TCGTTGATTGATTGATTGTAATGAAATATTTGGCAGACC

QA 1 399 1 399
DS 



AS 1 2

CO CL3410Contig1 663 2 12 U
CATAGAAATAATTCACAAGTGTATATATTATTTAGTTTACTTATATAAGTTAAAAATGAT
TGATCTAAGATACATAACAACAGTACAATCTGTTTGGTGTTTGGAATCACTGATGTTGAG
AAGAAATGAAATCACTGGCGAGCGGTCCGACCGGTGGGTGTACCGAGCTTTCCTTGCATC
CAATCCTTGAGCATTTGCAATGCTGCTTTTGGCTGATCCATTGGAACCATGTGTCCAGCA
TCGTGGACCTTGAGGAAAGTGAGTGAACCGTGGTTCTTCATTAAACCGGCTTCTTTATTA
TCTACATTGAATGGAACCGTTGCAGCTGCTACAAACTCTTTTCGCCCTGACCATTCCATC
TCGTGGACCCATTTCGAGTTTCCGAGCCAATTGCAGATGAGATCGTACTCTCCAGCATAG
ATAAGCATCTTGATTCCATCTTCGAGCAGAGCGGGAATCCCGACCTCAAGATTCTTCATC
CAGTCCAGCTGCATTGCATCATAAACGGCGGTACTGCATGACACAAACTTGATATCTCCA
ACACCTAACGCCGTGCGGACGGATCTCTGGTTCAAGAGCTTCTCCATGTTCGAGAAATCA
TAGCACAAGCTTCCTTTACATTGTTTCCTCACGTCGTAGTAGTTTACGTTTCCAGCGATA
TTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2EE55JQ U 1
AF RR2HB94JQ U 5
BS 1 67 RR2EE55JQ
BS 68 68 RR2HB94JQ
BS 69 80 RR2EE55JQ
BS 81 81 RR2HB94JQ
BS 82 86 RR2EE55JQ
BS 87 87 RR2HB94JQ
BS 88 182 RR2EE55JQ
BS 183 183 RR2HB94JQ
BS 184 317 RR2EE55JQ
BS 318 318 RR2HB94JQ
BS 319 466 RR2EE55JQ
BS 467 663 RR2HB94JQ

RD RR2EE55JQ 466 0 0
CATAGAAATAATTCACAAGTGTATATATTATTTAGTTTACTTATATAAGTTAAAAATGAT
TGATCTA*GATACATAACAAGAGTACGATCTGTTTGGTGTTTGGAATCACTGATGTTGAG
AAGAAATGAAATCACTGGCGAGCGGTCCGACCGGTGGGTGTACCGAGCTTTCCTTGCATC
CAGTCCTTGAGCATTTGCAATGCTGCTTTTGGCTGATCCATTGGAACCATGTGTCCAGCA
TCGTGGACCTTGAGGAAAGTGAGTGAACCGTGGTTCTTCATTAAACCGGCTTCTTTATTA
TCTACATTGAATGGAACTGTTGCAGCTGCTACAAACTCTTTTCGCCCTGACCATTCCATC
TCGTGGACCCATTTCGAGTTTCCGAGCCAATTGCAGATGAGATCGTACTCTCCAGCATAG
ATAAGCATCTTGATTCCATCTTCGAGCAGAGCGGGAATCCCGACCT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR2HB94JQ 659 0 0
GAAATAATTCACAAGTGTATATATTATTTAGTTTACTTATATAAGTTAAAAATGAT*GAT
CTAAGATACATAACAACAGTACAATCTGTTTGGTGTTTGGAATCACTGATGTTGAGAAGA
AATTAAATCACTGGCGAGCGGTCCGACCGGTGGGTGTACCGAGCTTTCCTTGCATCCAAT
CCTTGAGCATTTGCAATGCTGCTTTTGGCTGATCCATTGGAACCATGTGTCCAGCATCGT
GGACCTTGAGGAAAGTGAGTGAACCGTGGTTCTTCATTAAACCGGCTTCTTTATTATCTA
CATTGAATGGAACCGTTGCAGCTGCTACAAACTCTTTTCGCCCTGACCATTCCATCTCGT
GGACCCATTTCGAGTTTCCGAGCCAATTGCAGATGAGATCGTACTCTCCAGCATAGATAA
GCATCTTGATTCCATCTTCGAGCAGAGCGGGAATCCCGACCTCAAGATTCTTCATCCAGT
CCAGCTGCATTGCATCATAAACGGCGGTACTGCATGACACAAACTTGATATCTCCAACAC
CTAACGCCGTGCGGACGGATCTCTGGTTCAAGAGCTTCTCCATGTTCGAGAAATCATAGC
ACAAGCTTCCTTTACATTGTTTCCTCACGTCGTAGTAGTTTACGTTTCCAGCGATATTC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 3

CO CL3411Contig1 822 3 6 U
ACTCCAATTACAAGCATTAATTATTGAATATTTTTAGAAAAGATACACGTAGAACATTTT
AGACGACGATTCGTCTAATACATATTTTAGGTAACGGCTTGAATTAAAAGATACACTTAC
TAGATATGACATATGACACTTTTGACACGTGACTTCACTACAAAAGTTATGTCACAAGAA
CCGGATACTTATGAACCGAGTCACCCCACGGGTTTCCCACCAGTGTCACGCTCGCCGAAA
TCGTTCTCAATGCACTCCACACAATACTATTGCATTTAAATCCCGACCCGAACGCCAACT
GCCAAACCCGATCTCCATGCTTGACCCGACACTTAGCCTCTATGTAAGCTAGCTCGTACC
ACAGAGACGAGCTTGAAGTGTTTCCAAACCGGTGCAAAGTCATCCGAGATGGCTCGAGAT
CGACCTCACTGAGGCCAAGACCTTTTTCAACCGCGTCAAGTAACGCTCTACCACCAGCGT
GGATACAGAAGTGCTCGAAACATAGTTTAAAGTTTGGGACATATGGACTGCTCTTTAACC
TAAAAAGCCTACTCTTTACAATAGAGATAATAAACCGGAGCTTTTCAGATAAAGGCAGAA
CAAGGGGACCAAGTGCGGTTAGATTCGTCTTCAACGTGTCACCAGCAACAATGGTTAGTT
CTCTAGATAGTGATACTCCAACAATACCTTTGTCGTCTTCTTTTTGGTCAGCACAAGTGT
AATGTTTGTCGCTAGCGCCTTTGTGGGTCCTAACGAGTTGAGTCAACTCATACTTAGACC
GAACTCTGTCTTGGCTCCGGTTTGAGAGCAAAACCGCCGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D768TF C 143
AF RR2AQ79JQ U 1
AF RR2FV76JQ U 89
BS 1 144 RR2AQ79JQ
BS 145 145 RR2FV76JQ
BS 146 227 RR2AQ79JQ
BS 228 228 RR2D768TF
BS 229 793 RR2AQ79JQ
BS 794 822 RR2FV76JQ

RD RR2D768TF 469 0 0
TTTGTCACGTGATTCA
TACAAAAGTTATGTCACAAGAACCGGATACTTATGAACCGAGTCACCCCACGGGTTTCCC
ACCAGTGTCACGCTCGCCGAAATCGTTCTCAATGCACTCCACACAATACTATTGCATTTA
AATCCCGACCCGAACGCCAACTGCCAAACCCGATCTCCATGCTTGACCCGACACTTAGCC
TCTATGTAAGCTAGCTCGTACCACAGAGACGAGCTTGAAGTGTTTCCAAACCGGTGCAAA
GTCATCCGAGATGGCTCGAGATCGACCTCACTGAGGCCAAGACCTTTTTCAACCGCGTCA
AGTAACGCTCTACCACCAGCGTGGATACAGAAGTGCTCGAAACATAGTTTAAAGTTTGGG
ACATATGGACTGCTCTTTAACCTAAAAAGCCTACTCTTTACAATAGAGATAATAAACCGG
AGCTTTTCAGATAAAGGCAGAACAAGGGGA
TCC

QA 17 466 17 466
DS 

RD RR2AQ79JQ 793 0 0
ACTCCAATTACAAGCATTAATTATTGAATATTTTTAGAAAAGATACACGTAGAACATTTT
AGACGACGATTCGTCTAATACATATTTTAGGTAACGGCTTGAATTAAAAGATACACTTAC
TAGATATGACATATGACACTTTTGTCACGTGACTTCACTACAAAAGTTATGTCACAAGAA
CCGGATACTTATGAACCGAGTCACCCCACGGGTTTCCCACCAGTGTCCCGCTCGCCGAAA
TCGTTCTCAATGCACTCCACACAATACTATTGCATTTAAATCCCGACCCGAACGCCAACT
GCCAAACCCGATCTCCATGCTTGACCCGACACTTAGCCTCTATGTAAGCTAGCTCGTACC
ACAGAGACGAGCTTGAAGTGTTTCCAAACCGGTGCAAAGTCATCCGAGATGGCTCGAGAT
CGACCTCACTGAGGCCAAGACCTTTTTCAACCGCGTCAAGTAACGCTCTACCACCAGCGT
GGATACAGAAGTGCTCGAAACATAGTTTAAAGTTTGGGACATATGGACTGCTCTTTAACC
TAAAAAGCCTACTCTTTACAATAGAGATAATAAACCGGAGCTTTTCAGATAAAGGCAGAA
CAAGGGGACCAAGTGCGGTTAGATTCGTCTTCAACGTGTCACCAGCAACAATGGTTAGTT
CTCTAGATAGTGATACTCCAACAATACCTTTGTCGTCTTCTTTTTGGTCAGCACAAGTGT
AATGTTTGTCGCTAGCGCCTTTGTGGGTCCTAACGAGTTGAGTCAACTCATACTTAGACC
GAACTCTGTCTTG

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2FV76JQ 734 0 0
AGGTAACGGCTTGAATTAAAAGATACACTTACTAGATATGACATATGACACTTTTGACAC
GTGACTTCACTACAAAAGTTATGTCACAAGAACCGGATACTTATGAACCGAGTCACCCCA
CGGGTTTCCCACCAGTGTCTCGCTCGCCGAAATCGTTCTCAATGCACTCCACACAATACT
ATTGCATTTAAATCCCGACCCGAACGCCAACTGCCAAACCCGATCTCCATGCTTGACCCG
ACACTTAGCCTCTATGTAAGCTAGCTCGTACCACAGAGACGAGCTTGAAGTGTTTCCAAA
CCGGTGCAAAGTCATCCGAGATGGCTCGAGATCGACCTCACTGAGGCCAAGACCTTTTTC
AACCGCGTCAAGTAACGCTCTACCACCAGCGTGGATACAGAAGTGCTCGAAACATAGTTT
AAAGTTCGGGACATATGGACTGCTCTTTAACCTAAAAAGCCTACTCTTTACAATAGAGAT
AATAAACCGGAGCTTTTCAGATAAAGGCAGAACAAGGGGACCAAGTGCGGTTAGATTCGT
CTTCAACGTGTCACCAGCAACAATGGTTAGTTCTCTAGATAGTGATACTCCAACGATACC
TTTGTCGTCTTCTTTTTGGTCAGCACAAGTGTAATGTTTGTCGCTAGCGCCTTTGTGGGT
CCTAACGAGTTGAGTCAACTCATACTTAGACCGAACTCTGTCTTGGCTCCGGTTTGAGAG
CAAAACCGCCGCAC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL3412Contig1 674 2 4 U
GTACGGATGCTACTGATTGTCCCACTCCTTGCATACTCAGGACTACAACAAGCATTTGTT
TGGGCTGAGTTTACAAAGGAAATCGTCACACCTGCGATTGGTGTCTCAGGTGTTGGCGGG
GCAATGGCTGTCTACGGAGCTCTTGACGCAGTTTGTTCAATAACCGCTGGACGGTTTACC
TCTGGTCTGTCATCAATCACCGTCATAGTTTCTGGTGGAGCTGTTGCTCAAGCTTCTGTG
TTTCTCTGGCTTCTTCTTGGTTACAGGACAACTAGCGGAGTACTTGGCACAGTTTACCCA
CTTGTAATGGCGGCTGTATTAGGAATCGGTGACGGAATATTAAACACTCAAATCAGTGCT
CTTCTCGCTTTACTCTTCAAACATGACACGGAAGGAGCGTTTGCGCAGCTAAAAGTATGG
CAAAGCGCATCGATAGCGATTGTGTTCTTCCTAAGCCCATATATATCATTGCAAGCCATG
GTCATTGTGATGCTTGTTATGGTCTGTGTTTCTCTCCTCTCTTTCTTGGTTTTAGCTCTT
AAAGTCGAGAGTGTCTTTACACGCGACGAATGAGGATTGATGCTTTTGATTTGTTCACAT
CAACTCAAGCCAAAAAACACTATCCTCAATTCAATTGTAAAGAACTGCTTGTTTTGTAAT
TTGTGCAAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2FV34TF U 1
AF RR2FV34JQ C 556
BS 1 573 RR2FV34TF
BS 574 574 RR2FV34JQ
BS 575 673 RR2FV34TF
BS 674 674 RR2FV34JQ

RD RR2FV34TF 674 0 0
GTACGGATGCTACTGATTGTCCCACTCCTTGCATACTCAGGACTACAACAAGCATTTGTT
TGGGCTGAGTTTACAAAGGAAATCGTCACACCTGCGATTGGTGTCTCAGGTGTTGGCGGG
GCAATGGCTGTCTACGGAGCTCTTGACGCAGTTTGTTCAATAACCGCTGGACGGTTTACC
TCTGGTCTGTCATCAATCACCGTCATAGTTTCTGGTGGAGCTGTTGCTCAAGCTTCTGTG
TTTCTCTGGCTTCTTCTTGGTTACAGGACAACTAGCGGAGTACTTGGCACAGTTTACCCA
CTTGTAATGGCGGCTGTATTAGGAATCGGTGACGGAATATTAAACACTCAAATCAGTGCT
CTTCTCGCTTTACTCTTCAAACATGACACGGAAGGAGCGTTTGCGCAGCTAAAAGTATGG
CAAAGCGCATCGATAGCGATTGTGTTCTTCCTAAGCCCATATATATCATTGCAAGCCATG
GTCATTGTGATGCTTGTTATGGTCTGTGTTTCTCTCCTCTCTTTCTTGGTTTTAGCTCTT
AAAGTCGAGAGTGTCTTTACACGCGACGAATGATGATTGATGCTTTTGATTTGTTCACAT
CAACTCAAGCCAAAAAACACTATCCTCAATTCAATTGTAAAGAACTGCTTGTTTTGTAAT
TTGTGCAAGAAAA
A

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2FV34JQ 119 0 0
TTTCCCCGGGAG
GAATGAGGATTGATGCTTTTGATTTGTTCACATCAACTCAAGCCAAAAAACACTTTCCTC
AATTCAATTGTAAAGAACTGCTTGTTTTGTAATTTGTGCAAGAAAAA

QA 13 119 13 119
DS 



AS 1 3

CO CL3413Contig1 699 3 2 U
GGGGGGGGTCTTAATTATTCCTTTTCCTTTTCTTTTTCCTATTTTCTGAAACGTCAAAAA
GTTGATCTTACCACCAAAGCGAAAGATCGATCCCTCCTTGCGTATAAGCAAAACTCTTAT
CGATAGAGAGGGCTAGGAAAATGGGTTACATGTATAGAGAGACGGAGGAGAGCTCATGGC
GGCGTCTGGCATTCTTAGCTTCGATTTCTCTGCACTTCGTCTTAGGTCTATCAGGCGATT
CCAAGAATACAAACACAGGAGTCAAGGCAGAGTCACACGCTTCTTCCAGCAGAACAGGCA
CAAAAGTATTCCTAATACTGGTCGGATTCGTGGCTGTAGCTATGTTCTCCTTCTTTCTAT
ACAAGCTATGGCAGAAGAAGAAAAGAGACGAGCAGTATGCCCGACTGCTAAAGCTTTTTG
AGGAAGATGATGAACTAGAGGTTGAGCTTGGCCTTCGAGATTAAAAAGTTTCAAGCTGTC
TACCATGTTTGTTTGGGTTGGCTTGTTTTTTCCATGTAAGATAAATTATAGGTGTATTAA
GAAGGATCAGAGCATGTCTTTGGTTAAAGTTTTTACTTTCAAGTGATCTTATGTTTTGTT
ATCTTGGTGAAATATATAATAATGCAGACGAAATTTATTTTTATATATACTTTGAAATGA
TGTAGCAGTGGAATTATTCGAATGAAGTAATGTTGGACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG53TF U 1
AF RR2EG53JQ C 1
AF RR2AJ76TF U 87
BS 1 509 RR2EG53TF
BS 510 699 RR2AJ76TF

RD RR2EG53TF 509 0 0
GGGGGGGGTCTTAATTATTCCTTTTCCTTTTCTTTTTCCTATTTTCTGAAACGTCAAAAA
GTTGATCTTACCACCAAAGCGAAAGATCGATCCCTCCTTGCGTATAAGCAAAACTCTTAT
CGATAGAGAGGGCTAGGAAAATGGGTTACATGTATAGAGAGACGGAGGAGAGCTCATGGC
GGCGTCTGGCATTCTTAGCTTCGATTTCTCTGCACTTCGTCTTAGGTCTATCAGGCGATT
CCAAGAATACAAACACAGGAGTCAAGGCAGAGTCACACGCTTCTTCCAGCAGAACAGGCA
CAAAAGTATTCCTAATACTGGTCGGATTCGTGGCTGTAGCTATGTTCTCCTTCTTTCTAT
ACAAGCTATGGCAGAAGAAGAAAAGAGACGAGCAGTATGCCCGACTGCTAAAGCTTTTTG
AGGAAGATGATGAACTAGAGGTTGAGCTTGGCCTTCGAGATTAAAAAGTTTCAAGCTGTC
TACCATGTTTGTTTGGGTTGGCTTGTTTT

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2EG53JQ 642 0 0
GGGGGGGGTCTTAATTATTCCTTTTCCTTTTCTTTTTCCTATTTTCTGAAACGTCAAAAA
GTTGATCTTACCACCAAAGCGAAAGATCGATCCCTCCTTGCGTATAAGCAAAACTCTTAT
CGATAGAGAGGGCTAGGAAAATGGGTTACATGTATAGAGAGACGGAGGAGAGCTCATGGC
GGCGTCTGGCATTTTTAGCTTCGATTTCTCTGCACTTCGTCTTAGGTCTATCAGGCGATT
CCAAGAATACAAACACAGGAGTCAAGGCAGAGTCACACGCTTCTTCCAGCAGAACAGGCA
CAAAAGTATTCCTAATACTGGTCGGATTCGTGGCTGTAGCTATGTTCTCCTTCTTTCTAT
ACAAGCTATGGCAGAAGAAGAAAAGAGACGAGCAGTATGCCCGACTGCTAAAGCTTTTTG
AGGAAGATGATGAACTAGAGGTTGAGCTTGGCCTTCGAGATTAAAAAGTTTCAAGCTGTC
TACCATGTTTGTTTGGGTTGGCTTGTTTTTTCCATGTAAGATAAATTATAGGTGTATTAA
GAAGGATCAGAGCATGTCTTTGGTTAAAGTTTTTACTTTCAAGTGATCTTATGTTTTGTT
ATCTTGGTGAAATATATAATAATGCAGACGAAATTTATTTTT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2AJ76TF 613 0 0
GG
GATCCCTCCTTGCGTATAAGCAAAACTCTTATCGATAGAGAGGGCTAGGAAAATGGGTTA
CATGTATAGAGAGACGGAGGAGAGCTCATGGCGGCGTCTGGCATTCTTAGCTTCGATTTC
TCTGCACTTCGTCTTAGGTCTATCAGGCGATTCCAAGAATACAAACACAGGAGTCAAGGC
AGAGTCACACGCTTCTTCCAGCAGAACAGGCACAAAAGTATTCCTAATACTGGTCGGATT
CGTGGCTGTAGCTATGTTCTCCTTCTTTCTATACAAGCTATGGCAGAAGAAGAAAGGAGA
CGAGCAGTATGCCCGACTGCTAAAGCTTTTTGAGGAAGATGATGAACTAGAGGTTGAGCT
TGGCCTTCGAGATTAAAAAGTTTCAAGCTGTCTACCATGTTTGTTTGGGTTGGCTTGTTT
TTTCCATGTAAGATAAATTATAGGTGTATTAAGAAGGATCAGAGCATGTCTTTGGTTAAA
GTTTTTACTTTCAAGTGATCTTATGTTTTGTTATCTTGGTGAAATATATAATAATGCAGA
CGAAATTTATTTTTATATATACTTTGAAATGATGTAGCAGTGGAATTATTCGAATGAAGT
AATGTTGGACT

QA 3 613 3 613
DS 



AS 1 3

CO CL3414Contig1 795 3 12 U
GGATACTTGTCCACAACGAAAAACTAGAAGCTTCGTCGTCGCCGAAGATTACAACCAGGT
CTCGTCGATGGCCGCTAGGTTTCTTAGTCTGAGACGCGCCTTATCTCTCTACCTCACTAA
GCAACAGTCTCGGCTTCCTCTGTTCAAAGCAGGTAAGCTTTCACAATCAAAGTCACTATT
GAGCAGAGATCATGCGTATTTGGGATTACTTCATAGGCAGTTCTGTGGATCCCGTGAGGC
TAGTGAAGCTGCTGCAGTAACCAAGTCTTCAAACTCCGTTGCTGAACTCTCCAAAGCTCC
TTCCACTCCCCCTGCAACGGCCTCCGAGGAACTGATTGTGAAATACAAGTCCCAGTTGAA
AATAAACCCGAGGCATGACTTCATGATGGTGTTCACCTGCAAGGTATGCGAGACGAGGTC
CATGAAGATGGCGAGCCGAGAATCATACGAGAAGGGCGTTGTGGTGGTTCGATGCGAGGG
GTGTGATAATCTGCATCTGATTGCAGACCGTCTTGGCTGGTTTGGAGAACCGGGAAGCGT
GGAGGAGCTTCTAGCTGCTCGTGGGGATGAATTCAAGAAAGGATCCATGGATTCTCTTAG
TCTTACAGTTGATGATTTGGCTGGGAAAA*GATGTCCGATGAATAGAGCAAGAAGCTCTT
CGTTGCTCCACTACTAG*ACTTGAACCCTGCGGAAAACATAAAATATTTTCTGTCTTTTA
ATATTAATTTTCGTAACCATATTTGGTATTATAGGTGTAATGTGAATCCACTAAGCTTTG
ATCTTTTAAGCGGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG57TF U 1
AF RR2FH38TF U 1
AF RR2GG57JQB C 79
BS 1 127 RR2FH38TF
BS 128 128 RR2GG57TF
BS 129 476 RR2FH38TF
BS 477 477 RR2GG57TF
BS 478 651 RR2FH38TF
BS 652 653 RR2GG57TF
BS 654 696 RR2FH38TF
BS 697 697 RR2GG57JQB
BS 698 720 RR2FH38TF
BS 721 721 RR2GG57JQB
BS 722 750 RR2FH38TF
BS 751 795 RR2GG57JQB

RD RR2GG57TF 694 0 0
GGATACTTGTCCACAACGAAAAACTAGAAGCTTCGTCGTCGCCGAAGATTACAACCAGGT
CTCGTCGATGGCCGCTAGGTTTCTTAGTCTGAGACGCGCCTTATCTCTCTACCTCACTAA
GCAACAGTCTCGGCTTCCTCTGTTCAAAGCAGGTAAGCTTTCACAATCAAAGTCACTATT
GAGCAGAGATCATGCGTATTTGGGATTACTTCATAGGCAGTTCTGTGGATCCCGTGAGGC
TAGTGAAGCTGCTGCAGTAACCAAGTCTTCAAACTCCGTTGCTGAACTCTCCAAAGCTCC
TTCCACTCCCCCTGCAACGGCCTCCGAGGAACTGATTGTGAAATACAAGTCCCAGTTGAA
AATAAACCCGAGGCATGACTTCATGATGGTGTTCACCTGCAAGGTATGCGAGACGAGGTC
CATGAAGATGGCGAGCCGAGAATCATACGAGAAGGGCGTTGTGGTGGTTCGATGCGAGGG
GTGTGATAATCTGCATCTGATTGCAGACCGTCTTGGCTGGTTTGGAGAACCGGGAAGCGT
GGAGGAGCTTCTAGCTGCTCGTGGGGATGAATTCAAGAAAG*ATCCATGGATTCTCTTAG
TCTTACAGTTGATGATTTGGCTGGGAAAA*GATGTCCGATGAATAGAGCAAGAAGCTCTT
CGTTGCTCCACTACTAG*ACTTGAACCCTGCGGA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2FH38TF 750 0 0
GGATACTTGTCCACAACGAAAAACTAGAAGCTTCGTCGTCGCCGAAGATTACAACCAGGT
CTCGTCGATGGCCGCTAGGTTTCTTAGTCTGAGACGCGCCTTATCTCTCTACCTCACTAA
GCAACAGCCTCGGCTTCCTCTGTTCAAAGCAGGTAAGCTTTCACAATCAAAGTCACTATT
GAGCAGAGATCATGCGTATTTGGGATTACTTCATAGGCAGTTCTGTGGATCCCGTGAGGC
TAGTGAAGCTGCTGCAGTAACCAAGTCTTCAAACTCCGTTGCTGAACTCTCCAAAGCTCC
TTCCACTCCCCCTGCAACGGCCTCCGAGGAACTGATTGTGAAATACAAGTCCCAGTTGAA
AATAAACCCGAGGCATGACTTCATGATGGTGTTCACCTGCAAGGTATGCGAGACGAGGTC
CATGAAGATGGCGAGCCGAGAATCATACGAGAAGGGCGTTGTGGTGGTTCGATGCGGGGG
GTGTGATAATCTGCATCTGATTGCAGACCGTCTTGGCTGGTTTGGAGAACCGGGAAGCGT
GGAGGAGCTTCTAGCTGCTCGTGGGGATGAATTCAAGAAAGGATCCATGGATTCTCTTAG
TCTTACAGTTGATGATTTGGCTGGGAAAA*GATGTCCGATGAATAGAGCAA**AGCTCTT
CGTTGCTCCACTACTAG*ACTTGAACCCTGCGGAAA*CATAAAATATTTTCTGTCTTTTA
*TATTAATTTTCGTAACCATATTTGGTATT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2GG57JQB 717 0 0
GTTTCTTAGTCTGAGACGCGCCTTATCTCTCTACCTCACTAAGCAACAGTCTCGGCTTCC
TCTGTTCAAAGCAGGTAAGCTTTCACAATCAAAGTCACTATTGAGCAGAGATCATGCGTA
TTTGGGATTACTTCATAGGCAGTTCTGTGGATCCCGTGAGGCTAGTGAAGCTGCTGCAGT
AACCAAGTCTTCAAACTCCGTTGCTGAACTCTCCAAAGCTCCTTCCACTCCCCCTGCAAC
GGCCTCCGAGGAACTGATTGTGAAATACAAGTCCCAGTTGAAAATAAACCCGAGGCATGA
CTTCATGATGGTGTTCACCTGCAAGGTATGCGAGACGAGGTCCATGAAGATGGCGAGCCG
AGAATCATACGAGAAGGGCGTTGTGGTGGTTCGATGCGAGGGGTGTGATAATCTGCATCT
GATTGCAGACCGTCTTGGCTGGTTTGGAGAACCGGGAAGCGTGGAGGAGCTTCTAGCTGC
TCGTGGGGATGAATTCAAGAAAGGATCCATGGATTCTCTTAGTCTTACAGTTGATGATTT
GGCTGGGAAAAAGATGTCCGATGAATAGAGCAAGAAGCTCTTCGTTGCTCCACTACTAGG
ACTTGAACCCTGCGGAAAACATAAAATATTTTCTGTCTTTTAATATTAATTTTCGTAACC
ATATTTGGTATTATAGGTGTAATGTGAATCCACTAAGCTTTGATCTTTTAAGCGGCT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL3415Contig1 625 2 4 U
GGCCCTCTTGCCAAATCTCTGCGTCGGCGGCACTACAGGAAGAAGGAAGATCTTACACAT
CCTTTTCTAGCCCTAAAAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCAAAGGAAGAGACAGTG
ACTCTTGGACCAGCTGTTCGTGATGGAGAACAAGTCTTCGGTGTTGTCCACATTTTCGCT
TCCTTCAACGACACTTTCATTCACGTTACTGATTTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTCCGT
ATCACTGGTGGAATGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATG
CTTGCTGCTCAAGATGTTGCTCAGCGTTGCAAGGAGCTTGGAATCACCGCTATGCACGTG
AAGCTCCGTGCGACGGGTGGAAACAAGACCAAGACACCTGGTCCTGGTGCTCAATCCGCT
CTTAGAGCTCTTGCCCGTTCTGGCATGAAGATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCAATC
CCAACTGACAGTACCCGCAGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAGTTCTTTTG
GCTCATTTGTTTCAGTTTGTCAGAACAATGTTTTTTTGAATTTTGTGAAAGAGTTTCGAT
GTTGAATGCTTTTTGTTAATTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA01TF U 1
AF RR2BA92TF U 8
BS 1 249 RR2HA01TF
BS 250 251 RR2BA92TF
BS 252 448 RR2HA01TF
BS 449 625 RR2BA92TF

RD RR2HA01TF 448 0 0
GGCCCTCTTGCCAAATCTCTGCGTCGGCGGCACTACAGGAAGAAGGAAGATCTTACACAT
CCTTTTCTAGCCCTAAAAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCAAAGGAAGAGACAGTG
ACTCTTGGACCAGCTGTTCGTGATGGAGAACAAGTCTTCGGTGTTGTCCACATTTTCGCT
TCCTTCAACGACACTTTCATTCACGTTACTGATTTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTCCGT
ATCACTGGT**AATGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATG
CTTGCTGCTCAAGATGTTGCTCAGCGTTGCAAGGAGCTTGGAATCACCGCTATGCACGTG
AAGCTCCGTGCGACGGGTGGAAACAAGACCAAGACACCTGGTCCTGGTGCTCAATCCGCT
CTTAGAGCTCTTGCCCGTTCTGGCATGA

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR2BA92TF 618 0 0
GG
GCCAAATCTCTGCGTCGGCGGCACTACAGGAAGAAGGAAGATCTTACACATCCTTTTCTA
GCCCTAAAAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCAAAGGAAGAGACAGTGACTCTTGGA
CCAGCTGTTCGTGATGGAGAACAAGTCTTCGGTGTTGTCCACATTTTCGCTTCCTTCAAC
GACACTTTCATTCACGTTACTGATTTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTCCGTATCACTGGT
GGAATGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTTGCTGCT
CAAGATGTTGCTCAGCGTTGCAAGGAGCTTGGAATCACCGCTATGCACGTGAAGCTCCGT
GCGACGGGTGGAAACAAGACCAAGACACCTGGTCCTGGTGCTCAATCCGCTCTTAGAGCT
CTTGCCCGTTCTGGCATGAAGATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCAACTGAC
AGTACCCGCAGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAGTTCTTTTGGCTCATTTG
TTTCAGTTTGTCAGAACAATGTTTTTTTGAATTTTGTGAAAGAGTTTCGATGTTGAATGC
TTTTTGTTAATTTGAG

QA 3 618 3 618
DS 



AS 1 3

CO CL3416Contig1 547 3 3 U
GGATCAACAACTTTCACAAAGCAATTCTCCATTTTACAAACAAAACACAAAGCTAAGAGT
TTCTGCAATTAAGAGAAGTACAGAAAGGAAAGATGAGTTCAAGGAGTAAAGCCTGGTTAG
TGGCAGCAACCATTGGAGCCGTGGAGGCCTCTAAAGACCAATTAGGTCTATGTAGGTGGA
ACTACATGATCCGATCGGTAAATCAACGTATCCGAAACAACGTGAGATCCGCTGCTCAGG
CGAACAGGTTCTCTTCTTCGTCCGTTGCCGCCGGTAAGGATGGTGACAAGGCCAAGCAAG
CCGAGGAGTCTCTCAGGACAGTCATGTACTTGAGCTGTTGGGGTCCTAATTGATGAAGAC
AAATGGATAGAGATTTTTTTCTGCCGTCGATTGGATCCGACAGGTTGTATCTATGTCGGG
GAGCTGTGAAATCGGATTGGACAGAACGCAATGAGTTTTTGGGGTTTTAACGGGTTCGAA
TTGTATAAGGCATAAATGATACTTGTACAGAATTCAGGGATGAATATAAAAGTTTATGTT
TATGTCT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2D462JQ C 1
AF RR2D462TF U 1
AF RR2F214TF U 3
BS 1 5 RR2D462JQ
BS 6 545 RR2D462TF
BS 546 547 RR2D462JQ

RD RR2D462JQ 547 0 0
GGATCAACAACTTTCACAAAGCAATTCTCCATTTTACAAACAAAACACAAAGCTAAGAGT
TTCTGCAATTAAGAGAAGTACAGAAAGGAAAGATGAGTTCAAGGAGTAAAGCCTGGTTAG
TGGCAGCAACCATTGGAGCCGTGGAGGCCTCTAAAGACCAATTAGGTCTATGTAGGTGGA
ACTACATGATCCGATCGGTAAATCAACGTATCCGAAACAACGTGAGATCCGCTGCTCAGG
CGAACAGGTTCTCTTCTTCGTCCGTTGCCGCCGGTAAGGATGGTGACAAGGCCAAGCAAG
CCGAGGAGTCTCTCAGGACAGTCATGTACTTGAGCTGTTGGGGTCCTAATTGATGAAGAC
AAATGGATAGAGATTTTTTTCTGCCGTCGATTGGATCCGACAGGTTGTATCTATGTCGGG
GAGCTGTGAAATCGGATTGGACAGAACGCAATGAGTTTTTGGGGTTTTAACGGGTTCGAA
TTGTATAAGGCATAAATGATACTTGTACAGAATTCAGGGATGAATATAAAAGTTTATGTT
TATGTCT

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2D462TF 547 0 0
GGATC
AACAACTTTCACAAAGCAATTCTCCATTTTACAAACAAAACACAAAGCTAAGAGTTTCTG
CAATTAAGAGAAGTACAGAAAGGAAAGATGAGTTCAAGGAGTAAAGCCTGGTTAGTGGCA
GCAACCATTGGAGCCGTGGAGGCCTCTAAAGACCAATTAGGTCTATGTAGGTGGAACTAC
ATGATCCGATCGGTAAATCAACGTATCCGAAACAACGTGAGATCCGCTGCTCAGGCGAAC
AGGTTCTCTTCTTCGTCCGTTGCCGCCGGTAAGGATGGTGACAAGGCCAAGCAAGCCGAG
GAGTCTCTCAGGACAGTCATGTACTTGAGCTGTTGGGGTCCTAATTGATGAAGACAAATG
GATAGAGATTTTTTTCTGCCGTCGATTGGATCCGACAGGTTGTATCTATGTCGGGGAGCT
GTGAAATCGGATTGGACAGAACGCAATGAGTTTTTGGGGTTTTAACGGGTTCGAATTGTA
TAAGGCATAAATGATACTTGTACAGAATTCAGGGATGAATATAAAAGTTTATGTTTATGT
CT

QA 6 545 6 545
DS 

RD RR2F214TF 545 0 0
GGA
AACAACTTTCACAAAGCAATTCTCCATTTTACAAACAAAACACAAAGCTAAGAGTTTCTG
CAATTAAGAGAAGTACAGAAAGGAAAGATGAGTTCAAGGAGTAAAGCCTGGTTAGTGGCA
GCAACCATTGGAGCCGTGGAGGCCTCTAAAGACCAATTAGGTCTATGTAGGTGGAACTAC
ATGATCCGATCGGTAAATCAACGTATCCGAAACAACGTGAGATCCGCTGCTCAGGCGAAC
AGGTTCTCTTCTTCGTCCGTTGCCGCCGGTAAGGATGGTGACAAGGCCAAGCAAGCCGAG
GAGTCTCTCAGGACAGTCATGTACTTGAGCTGTTGGGGTCCTAATTGATGAAGACAAATG
GATAGAGATTTTTTTCTGCCGTCGATTGGATCCGACAGGTTGTATCTATGTCGGGGAGCT
GTGAAATCGGATTGGACAGAACGCAATGAGTTTTTGGGGTTTTAACGGGTTCGAATTGTA
TAAGGCATAAATGATACTTGTACAGAATTCAGGGATGAATATAAAAGTTTATGTTTATGT
TC

QA 4 543 4 543
DS 



AS 1 2

CO CL3417Contig1 762 2 2 U
GGGAGAGATGGCTTCCATGGTGTCACCGACCACTAGCTTATACCTCCATAAACACCGGAT
AAAGCTTCCCTCCGATGGTCGTCGTCTTCGTATAACCGCTTCGATCCCAGACTCTTCAGA
TGACAACAAACATCCCAAGTTAATTGCTCGAAGAGAGATGATTCTCAAGAGCAGTGAACT
AGCAATGATCGGAGCCATTTTCCAGCTCAGTGGGAAGAAACCAGATTATATTGGAGTACA
GAAGAACGAGAGATTAGCCCTATGTCCTGCTACAAACAACTGTATATCTACTTCTGAGAG
TGTCAGCGATCGAGTTCATTATGCTCCACCACGGAACTATAATGGTGGAAGGAAGACGCC
TGTGAGCAGAGAAGTTGCAATGAAAGAGCTTGTCAATGTGATTAAGTCGACGAAACCTGA
CAAGTTTACTCCTCGGATTGTGGAGAAGAAGGATGACTATGTTCATGTGGAGTATGAAAG
TCCAATCTTAGGTTTAGTAGATGATGTTGAGTTCTTGTTCTCTCCTGGGAAGAACTCGAC
AGTGGAGTATCGGTCTGCATCACGTAAAGGAAACTTCGACTTTGATGTGAACAGAAAGCG
AATCAAGGCACTGCGACAGGAGCTGGAGAAGAAGGGATGGGAATCAGAGAATAGCTTCTG
ATTATGATTAGTCTACTGTTGTTATTCAATTAAGATTTTTCAAGATTCAATGTGTGACTA
GATAACTTGTCATAAATAAGAGGAGGAGAATCTGTTTAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ31TF U 1
AF RR2BQ31JQ C 85
BS 1 631 RR2BQ31TF
BS 632 762 RR2BQ31JQ

RD RR2BQ31TF 631 0 0
GGGAGAGATGGCTTCCATGGTGTCACCGACCACTAGCTTATACCTCCATAAACACCGGAT
AAAGCTTCCCTCCGATGGTCGTCGTCTTCGTATAACCGCTTCGATCCCAGACTCTTCAGA
TGACAACAAACATCCCAAGTTAATTGCTCGAAGAGAGATGATTCTCAAGAGCAGTGAACT
AGCAATGATCGGAGCCATTTTCCAGCTCAGTGGGAAGAAACCAGATTATATTGGAGTACA
GAAGAACGAGAGATTAGCCCTATGTCCTGCTACAAACAACTGTATATCTACTTCTGAGAG
TGTCAGCGATCGAGTTCATTATGCTCCACCACGGAACTATAATGGTGGAAGGAAGACGCC
TGTGAGCAGAGAAGTTGCAATGAAAGAGCTTGTCAATGTGATTAAGTCGACGAAACCTGA
CAAGTTTACTCCTCGGATTGTGGAGAAGAAGGATGACTATGTTCATGTGGAGTATGAAAG
TCCAATCTTAGGTTTAGTAGATGATGTTGAGTTCTTGTTCTCTCCTGGGAAGAACTCGAC
AGTGGAGTATCGGTCTGCATCACGTAAAGGAAACTTCGACTTTGATGTGAACAGAAAGCG
AATCAAGGCACTGCGACAGGAGCTGGAGAAG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2BQ31JQ 678 0 0
TCTTCGTATAACCGCTTCGATCCCAGACTCTTCAGATGACAACAAACATCCCAAGTTAAT
TGCTCGAAGAGAGATGATTCTCAAGAGCAGTGAACTAGCAATGATCGGAGCCATTTTCCA
GCTCAGTGGGAAGAAACCAGATTATATTGGAGTACAGAAGAACGAGAGATTAGCCCTATG
TCCTGCTACAAACAACTGTATATCTACTTCTGAGAGTGTCAGCGATCGAGTTCATTATGC
TCCACCACGGAACTATAATGGTGGAAGGAAGACGCCTGTGAGCAGAGAAGTTGCAATGAA
AGAGCTTGTCAATGTGATTAAGTCGACGAAACCTGACAAGTTTACTCCTCGGATTGTGGA
GAAGAAGGATGACTATGTTCATGTGGAGTATGAAAGTCCAATCTTAGGTTTAGTAGATGA
TGTTGAGTTCTTGTTCTCTCCTGGGAAGAACTCGACAGTGGAGTATCGGTCTGCATCACG
TAAAGGAAACTTCGACTTTGATGTGAACAGAAAGCGAATCAAGGCACTGCGACAGGAGCT
GGAGAAGAAGGGATGGGAATCAGAGAATAGCTTCTGATTATGATTAGTCTACTGTTGTTA
TTCAATTAAGATTTTTCAAGATTCAATGTGTGACTAGATAACTTGTCATAAATAAGAGGA
GGAGAATCTGTTTAACAC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 3

CO CL3418Contig1 895 3 3 U
GGAAATATGGGCAGACGCGTTCTTTGTCTCTCGTCTTGTCGGAAAATGTCGCTTCCAAAC
TCCTGTCGGAATATAATCCCGATTTAACTCCAAAAAAAAAGTTTCTACCTTTTACCGAAA
ATGTCGTCGTCAAACTTCACGGTGGAATCGTGTAAAGTTGATTCGGAGGAAGGGGTGAAG
CTTCACACGAGAATCTTTAAACCCAGAGACGATGATAAAAATCTTGTGATAGTGTTGGTA
CATCCCTTCTCGCTCATGGGTGGTTGTCAAGCTTTGCTCAAGGGCATCGCTTCCGATTTG
GCCTGTAAGGGCTTCTTGTCTGTCACTTTCGACACGAGAGGCGCAGGAAAGTCAACGGGA
AGGGCTACTCTTACTGGCTTCGCTGAGGTCAAGGACGTGATCGCCGTTTGTCGGTGGCTT
TCTCAGGAATACGAGGTTGATAGGATCTTACTCGTGGGTTCTTCTGCCGGTGCACCAATT
GCCGGATCAGCAGTGGAGCAAGTAGAGCAAGTGGTGGGATATGTGAGTTTGGGATACCCA
TTTGGTCTACTAGCATCAGTTCTATTTGGACGGCACCACAAGGCCATTCTCTCATCCCCT
AAACCCAAACTCTTCGTTATGGGAACAAAATACGGCTTCACTAGCGTTAGCCAGCTCAAG
AAGAAGCTTAAATCTGCAGCGGGACGCACAGAAACACACCTCATCGAAGGCGTTAGCCAT
TTCCAGATGGAAGGGCCTGAATATGATTCTCAAATGGCCGATGTCATTTGCAACTTTATT
TCATCCATGTAAAAGAAGTCATACGCAACCTGATGATGAGTATATCCATGTAAGAGTTAA
ACTTAACATCAGATAACAATCTTTGCAGATATTGTATATTCATATAATTGATGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH24TF U 1
AF RR2B276TF U 166
AF RR2BH24JQ C 268
BS 1 679 RR2BH24TF
BS 680 881 RR2B276TF
BS 882 895 RR2BH24JQ

RD RR2BH24TF 679 0 0
GGAAATATGGGCAGACGCGTTCTTTGTCTCTCGTCTTGTCGGAAAATGTCGCTTCCAAAC
TCCTGTCGGAATATAATCCCGATTTAACTCCAAAAAAAAAGTTTCTACCTTTTACCGAAA
ATGTCGTCGTCAAACTTCACGGTGGAATCGTGTAAAGTTGATTCGGAGGAAGGGGTGAAG
CTTCACACGAGAATCTTTAAACCCAGAGACGATGATAAAAATCTTGTGATAGTGTTGGTA
CATCCCTTCTCGCTCATGGGTGGTTGTCAAGCTTTGCTCAAGGGCATCGCTTCCGATTTG
GCCTGTAAGGGCTTCTTGTCTGTCACTTTCGACACGAGAGGCGCAGGAAAGTCAACGGGA
AGGGCTACTCTTACTGGCTTCGCTGAGGTCAAGGACGTGATCGCCGTTTGTCGGTGGCTT
TCTCAGGAATACGAGGTTGATAGGATCTTACTCGTGGGTTCTTCTGCCGGTGCACCAATT
GCCGGATCAGCAGTGGAGCAAGTAGAGCAAGTGGTGGGATATGTGAGTTTGGGATACCCA
TTTGGTCTACTAGCATCAGTTCTATTTGGACGGCACCACAAGGCCATTCTCTCATCCCCT
AAACCCAAACTCTTCGTTATGGGAACAAAATACGGCTTCACTAGCGTTAGCCAGCTCAAG
AAGAAGCTTAAATCTGCAG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2B276TF 716 0 0
GAGGAAGGGGTGAAGCTTCACACGAGAATCTTTAAACCCAGAGACGATGATAAAAATCTT
GTGATAGTGTTGGTACATCCCTTCTCGCTCATGGGTGGTTGTCAAGCTTTGCTCAAGGGC
ATCGCTTCCGATTTGGCCTGTAAGGGCTTCTTGTCTGTCACTTTCGACACGAGAGGCGCA
GGAAAGTCCACGGGAAGGGCTACTCTTACTGGCTTCGCTGAGGTCAAGGACGTGATCGCC
GTTTGTCGGTGGCTTTCTCAGGAATACGAGGTTGATAGGATCTTACTCGTGGGTTCTTCT
GCCGGTGCACCAATTGCCGGATCAGCAGTGGAGCAAGTAGAGCAAGTGGTGGGATATGTG
AGTTTGGGATACCCATTTGGTCTACTAGCATCAGTTCTATTTGGACTGCACCACAAGGCC
ATTCTCTCATCCCCTAAACCCAAACTCTTCGTTATGGGAACAAAAGACGGCTTCACTAGC
GTTAGCCAGCTCAAGAAGAAGCTTAAATCTGCAGCGGGACGCACAGAAACACACCTCATC
GAAGGCGTTAGCCATTTCCAGATGGAAGGGCCTGAATATGATTCTCAAATGGCCGATGTC
ATTTGCAACTTTATTTCATCCATGTAAAAGAAGTCATACGCAACCTGATGATGAGTATAT
CCATGTAAGAGTTAAACTTAACATCAGATAACAATCTTTGCAGATATTGTATATTC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2BH24JQ 628 0 0
CAAGCTTTGCTCAAGGGCATCGCTTCCGATTTGGCCTGTAAGGGCTTCTTGTCTGTCACT
TTCGACACGAGAGGCGCAGGAAAGTCAACGGGAAGGGCTACTCTTACTGGCTTCGCTGAG
GTCAAGGACGTGATCGCCGTTTGTCGGTGGCTTTCTCAGGAATACGAGGTTGATAGGATC
TTACTCGTGGGTTCTTCTGCCGGTGCACCAATTGCCGGATCAGCAGTGGAGCAAGTAGAG
CAAGTGGTGGGATATGTGAGTTTGGGATACCCATTTGGTCTACTAGCATCAGTTCTATTT
GGACGGCACCACAAGGCCATTCTCTCATCCCCTAAACCCAAACTCTTCGTTATGGGAACA
AAATACGGCTTCACTAGCGTTAGCCAGCTCAAGAAGAAGCTTAAATCTGCAGCGGGACGC
ACAGAAACACACCTCATCGAAGGCGTTAGCCATTTCCAGATGGAAGGGCCTGAATATGAT
TCTCAAATGGCCGATGTCATTTGCAACTTTATTTCATCCATGTAAAAGAAGTCATACGCA
ACCTGATGATGAGTATATCCATGTAAGAGTTAAACTTAACATCAGATAACAATCTTTGCA
GATATTGTATATTCATATAATTGATGAT

QA 1 628 1 628
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3420Contig1 775 3 7 U
TTTTTTTTAAAACAAAGAGAGCATTTATAATTAAGCATACAAACAAATTGAAAGAAAGTC
ATATAATACAATCATATTGTTTAATCTTTACCCATTTGTTCCAAAAAAAA**ATCTTACC
CTAAATCTCCCTGCCAAAAACCATTTGACTACCAAGAGAACATAACTCATGGAAATTGAT
TGAAGCTTTTGAGGCAAAAAAAACGATTAAATCCCAAGAATGAATGATTGCTTACAATGA
TCATCAGTCTAGTATCTTCTCAAACCAGAAACCAGTCTTGTTTCTGACTTGAGAACTCTC
TCTCCATAAGTCAATAAAACCTTTCTTGTTTCGATTTTCCCGCCATCTATACCTACATTT
GTTTACCTCTCAAGGAGAAGAATCCACTCAATAGCTTCTGGTTGGGGTGAGTGGGTCGTA
GTCATACGCTTCACCAGCTTTGACAAATCTCCCCTTTACACGCCTTCTCACATCAGCTCT
TGCTTTCCGAGAAGCATACCTCACTCTCTTATCAAACTTGCGAGCCTTCTTCTTTTCCTT
GTAACGCATAACCGCGTTATTACGTGTCACTGAATGTGAACAAGCAGTATGATCCTGTGA
TGATGTTTGAGGATACCATGGTGGCTCTCCCAAGAGCTGCACGGAAGATGATGCACCGCA
TTCTTGGAAATCTCCAGCACTACTTTCTCCAGTGACTCCAGAGAATGATATGTTCTTCGA
CGTGTAGCAAATGATTGGCTCCGTTTTAGAACTCATGAACGAGTCATTACTCTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F072JQ U 9
AF RR2F072TF C 1
AF RR2DR78JQ U 12
BS 1 12 RR2F072TF
BS 13 267 RR2F072JQ
BS 268 268 RR2DR78JQ
BS 269 379 RR2F072JQ
BS 380 380 RR2DR78JQ
BS 381 645 RR2F072JQ
BS 646 775 RR2DR78JQ

RD RR2F072JQ 637 0 0
AAAA
CAAAGAGAGCATTTATAATTAAGCATACAAACAAATTGAAAGAAAGTCATATAATACAAT
CATATTGTTTAATCTTTACCCATTTGTTCCAAAAAAAA**ATCTTACCCTAAATCTCCCT
GCCAAAAACCATTTGACTACCAAGAGAACATAACTCATGGAAATTGATTGAAGCTTTTGA
GGCAAAAAAAACGATTAAATCCCAAGAATGAATGATTGCTTACAATGATCATCAGTCTAG
TATCTTCTCAAACCAAAAACCAGTCTTGTTTCTGACTTGAGAACTCTCTCTCCATAAGTC
AATAAAACCTTTCTTGTTTCGATTTTCCCGCCATCTATACCTACATTTGTTTACCTCTCA
AGGAGAAAAATCCACTCAATAGCTTCTGGTTGGGGTGAGTGGGTCGTAGTCATACGCTTC
ACCAGCTTTGACAAATCTCCCCTTTACACGCCTTCTCACATCAGCTCTTGCTTTCCGAGA
AGCATACCTCACTCTCTTATCAAACTTGCGAGCCTTCTTCTTTTCCTTGTAACGCATAAC
CGCGTTATTACGTGTCACTGAATGTGAACAAGCAGTATGATCCTGTGATGATGTTTGAGG
ATACCATGGTGGCTCTCCCAAGAGCTGCACGGA

QA 5 637 5 637
DS 

RD RR2F072TF 693 0 0
TTTTTTTTAAAACAAAGAGAGCATTTATAATTAAGCATACAAACAAATTGAAAGAAAGTC
ATATAATACAATCATATTGTTTAATCTTTACCCATTTGTTCCAAAAAAAA**ATCTTACC
CTAAATCTCCCTGCCAAAAACCATTTGACTACCAAGAGAACATAACTCATGGAAATTGAT
TGAAGCTTTTGAGGCAAAAAAAACGATTAAATCCCAAGAATGAATGATTGCTTACAATGA
TCATCAGTCTAGTATCTTCTCAAACCAGAGACCAGTCTTGTTTCTGACTTGAGAACTCTC
TCTCCATAAGTCAATAAAACCTTTCTTGTTTCGATTTTCCCGCCATCTATACCTACATTT
GTTTACCTCTCAAGGAGAAGAATCCACTCAATAGCTTCTGGTTGGGGTGAGTGGGTCGTA
GTCATACGCTTCACCAGCTTTGACAAATCTCCCCTTTACACGCCTTCTCACATCAGCTCT
TGCTTTCCGAGAAGCATACCTCACTCTCTTATCAAACTTGCGAGCCTTCTTCTTTTCCTT
GTAACGCATAACCGCGTTATTACGTGTCACTGAATGTGAACAAGCAGTATGATCCTGTGA
TGATGTTTGAGGATACCATGGTGGCTCTCCCAAGAGCTGCACGGAAGATGATGCACCGCA
TTCTTGGAAATCTCCAGCACTACTTTCTCCAG
C

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2DR78JQ 764 0 0
G
CAAAGAGAGCATTTATAATTAAGCATACAAACAAATTGAAAGAAAGTCATATAATACAAT
CATATTGTTTAATCTTTACCCATTTGTTCCAAAAAAAAAAATCTTACCCTAAATCTCCCT
GCCAAAAACCATTTGACTACCAAGAGAACATAACTCATGGAAATTGATTGAAGCTTTTGA
GGCAAAAAAAACGATTAAATCCCAAGAATGAATGATTGCTTACAATGATCATCAGTCTAG
TATCTTCTCAAACCAGAAACCAGTCTTGTTTCTGACTTGAGAACTCTCTCTCCATAAGTC
AATAAAACCTTTCTTGTTTCGATTTTCCCGCCATCTATACCTACATTTGTTTACCTCTCA
AGGAGAAGAATCCACTCAATAGCTTCTGGTTGGGGTGAGTGGGTCGTAGTCATACGCTTC
ACCAGCTTTGACAAATCTCCCCTTTACACGCCTTCTCACATCAGCTCTTGCTTTCCGAGA
AGCATACCTCACTCTCTTATCAAACTTGCGAGCCTTCTTCTTTTCCTTGTAACGCATAAC
CGCGTTATTACGTGTCACTGAATGTGAACAAGCAGTATGATCCTGTGATGATGTTTGAGG
ATACCATGGTGGCTCTCCCAAGAGCTGCACGGAAGATGATGCACCGCATTCTTGGAAATC
TCCAGCACTACTTTCTCCAGTGACTCCAGAGAATGATATGTTCTTCGACGTGTAGCAAAT
GATTGGCTCCGTTTTAGAACTCATGAACGAGTCATTACTCTCA

QA 2 764 2 764
DS 



AS 1 3

CO CL3421Contig1 1314 3 10 U
GAGGACATTGATTAAAAGCACCAACATAATTCTGATAACTTAAAGAAACACAAGGTATCC
AGAAGCAAGAGAGAATCCGACTGAAAACTTAAATAACAGAGTTTGATAAACTGGATCACT
AATTGTAGAGATCATCATCGTCCGCAGCAGCAGCTGCAGACGTGGCAAAAGGATCAGCGA
CTCCAGTGGTTGCACCTGAACCAACATTAGTCTCGAACCTAAACTCGGAACCAAACCCTC
TAAACTGCTGCAGCGTCTGAACAAAGGCTTGGTATTTCCTGATGTCTGCATCGCTCACAC
TCCTGCGTGCGTACTTCATCGACTCCTCAAAGTGGGCAGCTTTTATCTCTGAAACTTCAT
CCACTCCATCTTCCTCCATGGCTTCTGGGTTCTCGCTCCTCCTCTTCTCCTTCTCAATGT
CCTTCTCGATGTTTTCTCTGATGGCGTATTTGCAAGCCCTCTGGCAAATCTCAGTGATAT
CAGCACCACTGAATCCCTGTGTGTACTTAGCGAGAGCGTTGATGTCTACATCTTTAGCAA
TAGGAGACTTTCTCAAGGCGGCCTTGAAGATATTGAGACGTGAATCCTCGTCCGGCAGCG
GTATGTAAATGAGCTGGTCGAGCCTTCCTGGTCGGAGAAGAGCAGAGTCAATAATGTTGG
GTCTGTTGGTTGCTCCGATGATGAAGACGGTTTTCTTGGCGTTCATTCCATCCATCTCAG
TCAAAAGCTGGTTCAGGGCTCTATCAGCTGCACCGCCACCATCACCTCCGCTTCCACCTC
CTCTCTGAGTCGCAATGGAGTCCAGCTCATCAAAGAAGAGAACACATGGAGCAGACTGAC
GAGCCTTGTCAAAGATTTCACGGACATTCGCTTCACTCTCTCCAAACCACATAGTGAGAA
GCTCAGGACCTTTGACACTGATGAAGTTTGCTTGGCACTCATTGGCTATAGCTTTGGCCA
AAAGAGTTTTACCACATCCAGGAGGACCGTAGAAAAGGACACCCTTAGACGGAGACATGC
CGAATTTCTAAAACTCCTCTGGGTGCTCAACCGGGTATTGAACAGTCTCCTGGAGCTCTC
TCTTGACATTCTCAAGACCTCCAATGTCATCCCAAGAAACATTGGGAACCTCAACAACAG
TTTCACGAAGTGCAGACGGGTTGCTGTTCCCTAGAGCAGTGTGGAAGTGTTCATTGGTCA
CTGCCATGGAATTGAGGATTTCAGCATCTATGGAGTCATCTTCCAAATCAATCACATCCA
TCTTCTCCCTGATGCATTGCAGGGCAGCTTCTGTGCACAGAGCTGCAAGATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B081JQ U 188
AF RR2ET45JQ U 1
AF RR2ET45TF C 591
BS 1 242 RR2ET45JQ
BS 243 243 RR2B081JQ
BS 244 260 RR2ET45JQ
BS 261 261 RR2B081JQ
BS 262 334 RR2ET45JQ
BS 335 335 RR2B081JQ
BS 336 352 RR2ET45JQ
BS 353 353 RR2B081JQ
BS 354 685 RR2ET45JQ
BS 686 1314 RR2ET45TF

RD RR2B081JQ 207 0 0
GGTTGCCCCTGAACCAACATTATTCTCGAACCTAAACTCGGAACCAAACCCTCTAAACTG
CTGCAGCGTCTGAACAAAGGCTTGGTATTTCCTGATGTCTGCATCGCTCACACTCCTGCG
TGCGTACTTCATCGACTCCTCAAAGTGGGCAGCTTTTATCTCTGAAACTTCATCCACTCC
ATCTTCCTCCATGGCTTCTGGGTTCTC

QA 1 207 1 207
DS 

RD RR2ET45JQ 685 0 0
GAGGACATTGATTAAAAGCACCAACATAATTCTGATAACTTAAAGAAACACAAGGTATCC
AGAAGCAAGAGAGAATCCGACTGAAAACTTAAATAACAGAGTTTGATAAACTGGATCACT
AATTGTAGAGATCATCATCGTCCGCAGCAGCAGCTGCAGACGTGGCAAAAGGATCAGCGA
CTCCAGTGGTTGCACCTGAACCAACATTAGTCTCGAACCTAAACTCGGAACCAAACCCTC
TAGACTGCTGCAGCGTCTGAGCAAAGGCTTGGTATTTCCTGATGTCTGCATCGCTCACAC
TCCTGCGTGCGTACTTCATCGACTCCTCAAAGTGTGCAGCTTTTATCTCTGATACTTCAT
CCACTCCATCTTCCTCCATGGCTTCTGGGTTCTCGCTCCTCCTCTTCTCCTTCTCAATGT
CCTTCTCGATGTTTTCTCTGATGGCGTATTTGCAAGCCCTCTGGCAAATCTCAGTGATAT
CAGCACCACTGAATCCCTGTGTGTACTTAGCGAGAGCGTTGATGTCTACATCTTTAGCAA
TAGGAGACTTTCTCAAGGCGGCCTTGAAGATATTGAGACGTGAATCCTCGTCCGGCAGCG
GTATGTAAATGAGCTGGTCGAGCCTTCCTGGTCGGAGAAGAGCAGAGTCAATAATGTTGG
GTCTGTTGGTTGCTCCGATGATGAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2ET45TF 724 0 0
TCCGGCAGCGGTATGTAAATGAGCTGGTCGAGC*TTCCTGGTCGGAGAAGAGCAGAGTCA
ATAATGTTGGGTCTGTTGGTTGCTCCGATGATGAAGACGGTTTTCTTGGCGTTCATTCCA
TCCATCTCAGTCAAAAGCTGGTTCAGGGCTCTATCAGCTGCACCGCCACCATCACCTCCG
CTTCCACCTCCTCTCTGAGTCGCAATGGAGTCCAGCTCATCAAAGAAGAGAACACATGGA
GCAGACTGACGAGCCTTGTCAAAGATTTCACGGACATTCGCTTCACTCTCTCCAAACCAC
ATAGTGAGAAGCTCAGGACCTTTGACACTGATGAAGTTTGCTTGGCACTCATTGGCTATA
GCTTTGGCCAAAAGAGTTTTACCACATCCAGGAGGACCGTAGAAAAGGACACCCTTAGAC
GGAGACATGCCGAATTTCTAAAACTCCTCTGGGTGCTCAACCGGGTATTGAACAGTCTCC
TGGAGCTCTCTCTTGACATTCTCAAGACCTCCAATGTCATCCCAAGAAACATTGGGAACC
TCAACAACAGTTTCACGAAGTGCAGACGGGTTGCTGTTCCCTAGAGCAGTGTGGAAGTGT
TCATTGGTCACTGCCATGGAATTGAGGATTTCAGCATCTATGGAGTCATCTTCCAAATCA
ATCACATCCATCTTCTCCCTGATGCATTGCAGGGCAGCTTCTGTGCACAGAGCTGCAAGA
TCAC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 3

CO CL3422Contig1 946 3 4 U
GGAACACTACAATATTGGTTAAAAATCTCCATTCATACATTCTGCTCTCTCTCTTTTAAT
CAAAGCTTGAAAAAAACACAATGGAACGTAACTCCCTCTTAACGGTTGCATTGCTCTGCA
TTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGGCCAATCTCCTGCCTCCTCTCCTACTAAATCTCCCGCCT
CTCCTTCTGCTCCAACTACTTCCCCTGCCAAGCCTCCCGCCGCTACTTCTCCCTCCTCTC
CCGTGGCTAAAACGCCGGCTTCCTCACCAGTGGAAGCACCAAAATCTCCGGCTCCTGTAG
TATCGACTCCACCGCCGACTCCAGTTCCCGAGAGCTCTCCTCCGTCTCCTTCACCAAAGG
CTTCCGCTCCAGTTAGCTCTCCACCTGCTCCAGCACCAGAAGCAATTACTCCTCCGGCTC
CGGTGGCCGCTCCAGTAGCCGCTCCGGCCGCTGATGTACCGGCTCCTGCTCCAAAAAAGC
ATAAGAAGACGAAGAAGCATCAAGCACCGGCCCCAGCACCCGAACTTGACAGCCCACCTG
CACCACCGACAGAAGCTCCTGGCCCTAGCTCCGACGCAAGCTCTCCCGGTCCAGCCGCAT
CCGCCGACGATCAGAGTGGAGCAGAGAGCACAAGAGTGTTGCGGGATGTAGCGGTTGGAG
CGGCTGCAACCGCCTGGGCCGTTCTCGTTATGGCCTTTTAAGTTATTTGTATTTATTTTT
TCGCCCTTAATTCTTTAGTTTTGTTCTTTTAACCCTTCGATTATCTCTTTCTTTTCACGT
TTGAGTAATGAGTATTTATTTCATTGATTATACCGTTTGTTTTATTTTTATTTGTGTGGA
AATAATAATTTTTATTTACTGAAAAGAAAATAAAATTCAGATCTGTCAGTGATGTATCTG
ATGATACTGTTACTAGTTATGACACATTAATTGTTCTTGTTTTAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX12TF U 1
AF RR2AQ73TF U 1
AF RR2FX12JQ C 249
BS 1 218 RR2AQ73TF
BS 219 219 RR2FX12TF
BS 220 802 RR2AQ73TF
BS 803 946 RR2FX12JQ

RD RR2FX12TF 342 0 0
GGAACACTACAATATTGGTTAAAAATCTTCATTCATACATTCTGCTCTCTCTCTTTTAAT
CAAAGCTTGAAAAAAACACAATGGAACGTAACTCCCTCTTAACGGTTGCATTGCTCTGCA
TTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGGCCAATCTCCTGCCTCCTCTCCTACTAAATCTCCCGCCT
CTCCTTCTGCTCCAACTACTTCCCCTGCCAAGCCTCCCGCCGCTACTTCTCCCTCCTCTC
CCGTGGCTAAAACGCCGGCTTCCTCACCAGTGGAAGCACCAAAATCTCCGGCTCCTGTAG
TATCGACTCCACCGCCGACTCCAGTTCCCGAGAGCTCTCCTC

QA 1 342 1 342
DS 

RD RR2AQ73TF 802 0 0
GGAACACTACAATATTGGTTAAAAATCTCCATTCATACATTCTGCTCTCTCTCTTTTAAT
CAAAGCTTGAAAAAAACACAATGGAACGTAACTCCCTCTTAACGGTTGCATTGCTCTGCA
TTGTCGTCGCCGGTGTCGGTGGCCAATCTCCTGCCTCCTCTCCTACTAAATCTCCCGCCT
CTCCTTCTGCTCCAACTACTTCCCCTGCCAAGCCTCCCTCCGCTACTTCTCCCTCCTCTC
CCGTGGCTAAAACGCCGGCTTCCTCACCAGTGGAAGCACCAAAATCTCCGGCTCCTGTAG
TATCGACTCCACCGCCGACTCCAGTTCCCGAGAGCTCTCCTCCGTCTCCTTCACCAAAGG
CTTCCGCTCCAGTTAGCTCTCCACCTGCTCCAGCACCAGAAGCAATTACTCCTCCGGCTC
CGGTGGCCGCTCCAGTAGCCGCTCCGGCCGCTGATGTACCGGCTCCTGCTCCAAAAAAGC
ATAAGAAGACGAAGAAGCATCAAGCACCGGCCCCAGCACCCGAACTTGACAGCCCACCTG
CACCACCGACAGAAGCTCCTGGCCCTAGCTCCGACGCAAGCTCTCCCGGTCCAGCCGCAT
CCGCCGACGATCAGAGTGGAGCAGAGAGCACAAGAGTGTTGCGGGATGTAGCGGTTGGAG
CGGCTGCAACCGCCTGGGCCGTTCTCGTTATGGCCTTTTAAGTTATTTGTATTTATTTTT
TCGCCCTTAATTCTTTAGTTTTGTTCTTTTAACCCTTCGATTATCTCTTTCTTTTCACGT
TTGAGTAATGAGTATTTATTTC

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2FX12JQ 698 0 0
AAAACGCCGGCTTCCTCACCAGTGGAAGCACCAAAATCTCCGGCTCCTGTAGTATCGACT
CCACCGCCGACTCCAGTTCCCGAGAGCTCTCCTCCGTCTCCTTCACCAAAGGCTTCCGCT
CCAGTTAGCTCTCCACCTGCTCCAGCACCAGAAGCAATTACTCCTCCGGCTCCGGTGGCC
GCTCCAGTAGCCGCTCCGGCCGCTGATGTACCGGCTCTTGCTCCAAAAAAGCATAAGAAG
ACGAAGAAGCATCAAGCACCGGCCCCAGCACCCGAACTTGACAGCCCACCTGCACCACCG
ACAGAAGCTCCTGGCCCTAGTTCCGACGCAAGCTCTCCCGGTCCAGCCGCATCCGCCGAC
GATCAGAGTGGAGCAGAGAGCACAAGAGTGTTGCGGGATGTAGCGGTTGGAGCGGCTGCA
ACCGCCTGGGCCGTTCTCGTTATGGCCTTTTAAGTTATTTGTATTTATTTTTTCGCCCTT
AATTCTTTAGTTTTGTTCTTTTAACCCTTCGATTATCTCTTTCTTTTCACGTTTGAGTAA
TGAGTATTTATTTCATTGATTATACCGTTTGTTTTATTTTTATTTGTGTGGAAATAATAA
TTTTTATTTACTGAAAAGAAAATAAAATTCAGATCTGTCAGTGATGTATCTGATGATACT
GTTACTAGTTATGACACATTAATTGTTCTTGTTTTAGC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 3

CO CL3423Contig1 997 3 2 U
CGCGAAAAAAAAATCACATAGAAATTCTGAGTTCCTGTACAGTGTCTGTTACGTATACAG
ATACGAACGTTACGAAACTCTTTCAGTATATTCTTGTTTTGCAAAAAGCTATGTCACAGA
GTTGGAGCAGCAGGGATATATATTCATACAACATATAGAACTCAATGTTTCCTTGTAGTG
TTTTCCATGAACTTCACTAACATTAGCTTTGTTTTAGCCACCAATGTGTATCATTGGCCT
ATTAGCTGTCTTGGCAATGTCAAGCATTCCAGCGTGTGCTGCTTTCTTCCTCTTCACCTG
AAAACCCCCAAGCAGCGCCTATAATTCCCCTTAGCGTTTGGTCATCAGCACCAAACCGGA
TAGGATCTCTCAAACTAACCTCTGAAGGACCGAACAAGCATACTTTGAAGTTCCCATCTG
CAAGTAATCTTAACCTATTGCAGCCAGAACAGAAGTGTTCTGTCATGGATGTGATGAAAG
ACACAGAACCGCAATGCCCATCAATCGTAAAGTTCTTGGCTGTTTCGGTAGGGTGATCTT
GGACACGTTTAATACTCGGAAAGCGCTTTACCTTACCACTTTATCCATCATTTCAGCGTA
AGACACAAGCTTCTTCACATTCCAAACATTTCCATCAAAGGGCATAAACTCTATGAACCT
GACGTTGATAGGCTTATCTCGCGTCAACTCCACAAAATCACAAATCTCATCATCATTCAA
TCCCCTCATGACAACACAGTTGACCTTCACAGGATTGTATCCAAGAGCGATAGCGGAATC
AATAGATTGCATAACCCTCTCGTGCCCTTTACGTCTAGTCAGAAACTCGAACTTCGCAGG
GACAAGAGTATCCAAGCTGATGTTTATAGAATCAAGCCCACATTCTTTAAGCTTCGGTAG
CTTTCTAGCTAGAGTGATGCCATTAGTAGTAATAGCCAGATTCTTCAACCCTTTTAAGCT
AGACAACTGCATACAGATCTCTTCCATGTCTTTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY47JQ U 1
AF RR2CB45JQ U 591
AF RR2FY47TF C 302
BS 1 693 RR2FY47JQ
BS 694 997 RR2FY47TF

RD RR2FY47JQ 699 0 0
CGCGAAAAAAAAATCACATAGAAATTCTGAGTTCCTGTACAGTGTCTGTTACGTATACAG
ATACGAACGTTACGAAACTCTTTCAGTATATTCTTGTTTTGCAAAAAGCTATGTCACAGA
GTTGGAGCAGCAGGGATATATATTCATACAACATATAGAACTCAATGTTTCCTTGTAGTG
TTTTCCATGAACTTCACTAACATTAGCTTTGTTTTAGCCACCAATGTGTATCATTGGCCT
ATTAGCTGTCTTGGCAATGTCAAGCATTCCAGCGTGTGCTGCTTTCTTCCTCTTCACCTG
AAAACCCCCAAGCAGCGCCTATAATTCCCCTTAGCGTTTGGTCATCAGCACCAAACCGGA
TAGGATCTCTCAAACTAACCTCTGAAGGACCGAACAAGCATACTTTGAAGTTCCCATCTG
CAAGTAATCTTAACCTATTGCAGCCAGAACAGAAGTGTTCTGTCATGGATGTGATGAAAG
ACACAGAACCGCAATGCCCATCAATCGTAAAGTTCTTGGCTGTTTCGGTAGGGTGATCTT
GGACACGTTTAATACTCGGAAAGCGCTTTACCTTACCACTTTATCCATCATTTCAGCGTA
AGACACAAGCTTCTTCACATTCCAAACATTTCCATCAAAGGGCATAAACTCTATGAACCT
GACGTTGATAGGCTTATCTCGCGTCAACTCCAC
AAAATC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2CB45JQ 103 0 0
TTTCAGCGTAGGACACAAGCTTCTTCACATTCCAAACATTTCCATCAAAGGGCATAAACT
CTATGAACCTGACGTTGATAGGCTTATCTCGCGTCAACTCCAC

QA 1 103 1 103
DS 

RD RR2FY47TF 696 0 0
AAACCCCCAAGCAGCGC*TATAATTCCCCTTAGCGTTTGGTCATCAGCACCAGACGGGAT
AGGATCTCTCAAACTAAC*TCTGAAGGACCGAACAAGCATACTTTGAAGTTCCCATCTGC
AAGTAATCTTAACCTATTGCAGCCAGAACAGAAGTGTTCTGTCATGGATGTGATGAAAGA
CACAGAACCGCAATGCCCATCAATCGTAAAGTTCTTGGCTGTTTCGGTAGGGTGATCTTG
GACACGTTTAATACTCGGAAAGCGCTTTACCTTACCACTTTATCCATCATTTCAGCGTAA
GACACAAGCTTCTTCACATTCCAAACATTTCCATCAAAGGGCATAAACTCTATGAACCTG
ACGTTGATAGGCTTATCTCGCGTCAACTCCACAAAATCACAAATCTCATCATCATTCAAT
CCCCTCATGACAACACAGTTGACCTTCACAGGATTGTATCCAAGAGCGATAGCGGAATCA
ATAGATTGCATAACCCTCTCGTGCCCTTTACGTCTAGTCAGAAACTCGAACTTCGCAGGG
ACAAGAGTATCCAAGCTGATGTTTATAGAATCAAGCCCACATTCTTTAAGCTTCGGTAGC
TTTCTAGCTAGAGTGATGCCATTAGTAGTAATAGCCAGATTCTTCAACCCTTTTAAGCTA
GACAACTGCATACAGATCTCTTCCATGTCTTTCCTC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 3

CO CL3424Contig1 1063 3 8 U
GTAAAATAGTAGATACCATTTTCTTTGATCAAAAAATCCATTTGAATTCCAAAGGTTGAT
CAAATTGCATATTGCACTAATTAATATTCGTAATCCCCCCAAAAAGATAATAAAAGATCC
CAAAACGAAGACTCAGCTTATTTATTTATACACTTAACCCAACTCTGCTACCTTTCTTGA
TCATAAATCACTTGTGAACCTTTCCTGTCTTGAGTCTTTAAACTTTGGTAGATTCCGGAT
CAGAGTCTGAAACAAGATCAGAAACATATCGGTCGGCTTCGCTCTTGCTTCTACCACTTT
CCGGTCTTCTCCTCCTCTCTCCATCAACGTTTCTTGTGCCTTGGGAATCACTAGGAGCTG
CTTCATATAAAGTTACAGACTTGCCTCTGCTATGGAGATTAGCCATGACTTCCTCCTGAC
CATTACCGTCCTCCTTGAGAGTCTCCAGGACTTCTACCACATGACTCATGAGGGGTCTTC
CTTTAGGGTTTAGGCTTAGGCATTGGTATGCCAAATCAGCTACTTTCATCAACGCCTTGG
TGGTGTACTGCCCATCCATTCGAGGGTCTATGATCCTCAAAAGCTTTTTGTTGTGGTTGA
GTAGCGGTCTTGCCCACTCTGCCAAGTTATGCTCCCGGCAAGGTCTGCTTTTGTCCATGG
CCCTCTTCCCAAGGAGCATCTCAAGGAGAAGTACCCCAAATCCATAAACATCACTTCTCG
ATGTCAAATGTCCTGTCATAACATACTCAGGAGCAGCGTATCCGTAAGTGCCCATAACAC
GTGTGGACACATGCGTTTGATCTCCGCTGGGGCCATCTTTCGCTAGTCCAAAGTCAGCGA
GTTTAGCATTGTAGCACTCGTCGAGCAATATGTTGGCAGTCTTGAGATCTCGATAGATAA
CGGAGCGTTCAGCACCATGAAGAAAGGCGAGACCCTTGGCTGCGTGTAGAGCGATCTTCA
CTCTTTTGGACCATGTCAAAGTGCATCCAACTCTTCGAAAAAGATGTTTCTCGAGGCTTC
CCAAGGACATGTATTCGTAGACTAACAACCTGTGATCATCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF72JQ U 27
AF RR2BX13JQ U 1
AF RR2BX13TF C 438
BS 1 198 RR2BX13JQ
BS 199 199 RR2FF72JQ
BS 200 338 RR2BX13JQ
BS 339 339 RR2FF72JQ
BS 340 813 RR2BX13JQ
BS 814 814 RR2BX13TF
BS 815 826 RR2BX13JQ
BS 827 1063 RR2BX13TF

RD RR2FF72JQ 719 0 0
GC
TCAAAAAATCCATTTGAATTCCAAAGGTTGATCAAATTGCATATTGCACTAATTAATATT
CGTAATCCCCCCAAAAAGATAATAAAAGATCCCAAAACGAAGACTCAGCTTATTTATTTA
TACACTTAACCCAACTCTGCTACCTTTCTTGATCC*AAATCACTTGTGAACCTTTCCTGT
CTTGAGTCTTTAAACTTTGGTAGATTCCGGATCAGAGTCTGAAACAAGATCAGAAACATA
TCGGTCGGCTTCGCTCTTGCTTCTACCACTTTCCGGTCTTCTCCTCCTCTCTCCATCAAC
GTTTCTTGTGCCTTGGGAATCACTAGGAGCTGCTTCATATAAAGTTACAGACTTGCCTCT
GCTATGGAGATTAGCCATGACTTCCTCCTGACCATTACCGTCCTCCTTGAGAGTCTCCAG
GACTTCTACCACATGAATCATGAGGGGTCTTCCTTTAGGGTTTTGGCTTAGGCATTGGTA
TGCCAAATCAGCTACTTTCATCAACGCCTTGGTGGTGTACTGCCCATCCATTCGAGGGTC
TATGATCCTCAAAAGCTTTTTGTTGTGGTTGAGTAGCGGTCTTGCCCACTCTACCAAGTT
ATGCTCCCGGCAAGGTCTGCTTTTGTCCATGGCCCTCTTCCCAAGGAGCATCTCAAGGAG
AAGTACCCCAAATCCATAAACATCACTTCTCGATGTCAAATGTCCTGTCATAACATA

QA 3 719 3 719
DS 

RD RR2BX13JQ 826 0 0
GTAAAATAGTAGATACCATTTTCTTTGATCAAAAAATCCATTTGAATTCCAAAGGTTGAT
CAAATTGCATATTGCACTAATTAATATTCGTAATCCCCCCAAAAAGATAATAAAAGATCC
CAAAACGAAGACTCAGCTTATTTATTTATACACTTAACCCAACTCTGCTACCTTTCTTGA
TCATAAATCACTTGTGAATCTTTCCTGTCTTGAGTCTTTAAACTTTGGTAGATTCCGGAT
CAGAGTCTGAAACAAGATCAGAAACATATCGGTCGGCTTCGCTCTTGCTTCTACCACTTT
CCGGTCTTCTCCTCCTCTCTCCATCAACGTTTCTTGTGTCTTGGGAATCACTAGGAGCTG
CTTCATATAAAGTTACAGACTTGCCTCTGCTATGGAGATTAGCCATGACTTCCTCCTGAC
CATTACCGTCCTCCTTGAGAGTCTCCAGGACTTCTACCACATGACTCATGAGGGGTCTTC
CTTTAGGGTTTAGGCTTAGGCATTGGTATGCCAAATCAGCTACTTTCATCAACGCCTTGG
TGGTGTACTGCCCATCCATTCGAGGGTCTATGATCCTCAAAAGCTTTTTGTTGTGGTTGA
GTAGCGGTCTTGCCCACTCTGCCAAGTTATGCTCCCGGCAAGGTCTGCTTTTGTCCATGG
CCCTCTTCCCAAGGAGCATCTCAAGGAGAAGTACCCCAAATCCATAAACATCACTTCTCG
ATGTCAAATGTCCTGTCATAACATACTCAGGAGCAGCGTATCCGTAAGTGCCCATAACAC
GTGTGGACACATGCGTTTGATCTCCGCTGGGGC*ATCTTTCGCTAG

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2BX13TF 626 0 0
AGAGTCTCCAGGACTTCTACCACATGACTCATGAGGGGTCTTCCTTTAGGGTTTAGGCTT
AGGCATTGGTATGCCAAATCAGCTACTTTCATCAACGCCTTGGTGGTGTACTGCCCATCC
ATTCGAGGGTCTATGATCCTCAAAAGCTTTTTGTTGTGGTTGAGTAGCGGTCTTGCCCAC
TCTGCCAAGTTATGCTCCCGGCAAGGTCTGCTTTTGTCCATGGCCCTCTTCCCAAGGAGC
ATCTCAAGGAGAAGTACCCCAAATCCATAAACATCACTTCTCGATGTCAAATGTCCTGTC
ATAACATACTCAGGAGCAGCGTATCCGTAAGTGCCCATAACACGTGTGGACACATGCGTT
TGATCTCCGCTGGGGCCATCTTTCGCTAGTCCAAAGTCAGCGAGTTTAGCATTGTAGCAC
TCGTCGAGCAATATGTTGGCAGTCTTGAGATCTCGATAGATAACGGAGCGTTCAGCACCA
TGAAGAAAGGCGAGACCCTTGGCTGCGTGTAGAGCGATCTTCACTCTTTTGGACCATGTC
AAAGTGCATCCAACTCTTCGAAAAAGATGTTTCTCGAGGCTTCCCAAGGACATGTATTCG
TAGACTAACAACCTGTGATCATCACC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 3

CO CL3425Contig1 1264 3 16 U
GGAATGAAAATTTCATTCGCAACGACAGACAGACAGACAGTCAAAGAAAGGACAACTAAA
AAAAACCGATTTTAATCGTTGAATCTGTAAAGATTTTTGATTTTTTTTCCGGTGAGACCG
TCGTTTTATTCGATCACCGTCAGAAAGGGATGGGATCTTCGATTTCTTAGTGTCTGGAGT
ATAAATTCAGCGGAGAAGAAGATAGATGGTGGACTCGGAAGAAACCGAAACGGCGTCGTC
TGTGACGAAGAGGAAGAAGCAGAAGAAGAGGGTTTTCTCTTCGTTGGCTTTGAGATCCTG
TACAGCGATCGTTTTCTCCATCATCGGCTTCTTCTTCTTGTCGTTTCTATTAGGGATCTT
AGTGATTCTACTCGGTGAATTGTGGGTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTGCCTCTCT
TGCTTCTCGCTGCAAAATTGTCTCCAGCTCGGTTGATCTAAGGACTTCCAAAGTGTGCGG
GATTGGACTTTTGAACATCAAAGCACAACATGTGTTTTACCCTTTTGAGAGAGATAAATT
CCGATGTCGCTACGATTACTATTGGGCTTCTGTCTTCAAGGTTGAGTATACAGATCATTT
GATGGGTCAAACAAG*CTAGCCTTCTCAGAAGCACCTAACGAAGCTCTTCCTCCTGAGTG
TAGACCTAACTTTGGTGCCGCTTTGCTCACCAGAGATAAATACAAGGTGAATGAAACTTA
TGACTGTTGGTACACACTAGGGATTCCAAAGATTAAGCTTTATCGAGATGGCTTTTTCGG
TTGCCAACCAGATGATCTTTCTTTCACCCACATTTTTAAACAATACGCTGTCTTATTCTC
TAAATTGTTACAATCGTGGTTAAGTGTAAATGGAAGAAGGAAGTACTGGAGATATGATGT
GATCGCTGGCATTGTATCTGGCTTCTCAACTTCCATTATCACGGTCGTCATGGTACGGAT
CTTGAGACATGCGAAATCTTGGTTCCCTCGCGCTTGTTGTTCAGTTAAAAGCCTGCTTTC
TAAAGTGAACCTCTTGGTGCAAGTGAAGCGTGCTTGTTTGGTTGTTGTTTACTTCTCCAT
CCTAGGGTGGATGGCTACACAATACTTGAAAATTCTTTTTCCTAAGGCTTAGAGAAAAAA
AAGAAACACATTCCTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTGTTGAGTATGTAA
TGATTCGTAGAGAGTTGTGTGATGTAATCCTAAACTATTTACAGCAAAAGAAAGCAATTC
AGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2CG44TF U 1
AF RR2GI26TF U 23
AF RR2CG44JQ C 465
BS 1 51 RR2CG44TF
BS 52 52 RR2GI26TF
BS 53 62 RR2CG44TF
BS 63 65 RR2GI26TF
BS 66 205 RR2CG44TF
BS 206 206 RR2GI26TF
BS 207 265 RR2CG44TF
BS 266 266 RR2GI26TF
BS 267 348 RR2CG44TF
BS 349 349 RR2GI26TF
BS 350 459 RR2CG44TF
BS 460 460 RR2GI26TF
BS 461 648 RR2CG44TF
BS 649 649 RR2GI26TF
BS 650 687 RR2CG44TF
BS 688 1264 RR2CG44JQ

RD RR2CG44TF 687 0 0
GGAATGAAAATTTCATTCGCAACGACAGACAGACAGACAGTCAAAGAAAGGGCAACTAAA
AA***CCGATTTTAATCGTTGAATCTGTAAAGATTTTTGATTTTTTTTCCGGTGAGACCG
TCGTTTTATTCGATCACCGTCAGAAAGGGATGGGATCTTCGATTTCTTAGTGTCTGGAGT
ATAAATTCAGCGGAGAAGAAGATAGTTGGTGGACTCGGAAGAAACCGAAACGGCGTCGTC
TGTGACGAAGAGGAAGAAGCAGAAGGAGAGGGTTTTCTCTTCGTTGGCTTTGAGATCCTG
TACAGCGATCGTTTTCTCCATCATCGGCTTCTTCTTCTTGTCGTTTCTCTTAGGGATCTT
AGTGATTCTACTCGGTGAATTGTGGGTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTGCCTCTCT
TGCTTCTCGCTGCAAAATTGTCTCCAGCTCGGTTGATCTGAGGACTTCCAAAGTGTGCGG
GATTGGACTTTTGAACATCAAAGCACAACATGTGTTTTACCCTTTTGAGAGAGATAAATT
CCGATGTCGCTACGATTACTATTGGGCTTCTGTCTTCAAGGTTGAGTATACAGATCATTT
GATGGGTCAAACAAG*CTAGCCTTCTCAGAAGCACCTAACGAAGCTCT*CCTCCTGAGTG
TAGACCTAACTTTGGTGCCGCTTTGCT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2GI26TF 672 0 0
GGAAC
GACAGACGGACAGTCAAAGAAAGGACAACTAAAAAAAACCGATT**AATCGTTGAATCTG
TAAAGATTTTTG***TTTTTTCCGGTGAGACCGTCGTTTTATTCGATCACCGTCAGAAAG
GGATGGGATCTTCGATTTCTTAGTGTCTGGAGTATAAATTCAGCGGAGAAGAAGATAGAT
GG***ACTCGGAAGAAACCGAAACGGCGTCGTCTGTGACGAAGAGGAAGAAGCAGAAGAA
GAGGGTTTTCTCTTCGTTGGCTTTGAGATTCTGTACAGCGATCGTTTTCTCCATCATCGG
CTTCTTCTTCTTGTCGTTTCTATTAGGGATCTTAGTGATTCTACTGGGTGAATTGTGGGT
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTGCCTCTCTTGCTTCTCGCTGCAGAATTGTCTCCAG
CTCGGTTGATCTAAGGTCTTCCAAAGTGTGCGGGATTGGACTTTTGAACATCAAAGCACA
ACATGTGTTTTACCCTTTTGAGAGAGATAAATTCAGATGTCGCTATGATTACTACTGGGC
TTCTGTCTTCAAG*TTGAGTATACAGATCATTTGATGGGTCAAACAAG*CTAGCTTTCTC
AGAAGCACCTAATGAAGCTCTTCCTCCTGAGTGTAGACCTAACTTTGGTGCCGCTTTGCT
CACCAAG

QA 6 665 6 665
DS 

RD RR2CG44JQ 800 0 0
CTTCCAAAGTGTGCGGGATTGGACTTTTGAACATCAAAGCACAACATGTGTTTTACCCTT
TTGAGAGAGATAAATTCCGATGTCGCTACGATTACTATTGGGCTTCTGTCTTCAAGGTTG
AGTATACAGATCATTTGATGGGTCAAACAAGGCTAGCCTTCTCAGAAGCACCTAACGAAG
CTCTTCCTCCTGAGTGTAGACCTAACTTTGGTGCCGCTTTGCTCACCAGAGATAAATACA
AGGTGAATGAAACTTATGACTGTTGGTACACACTAGGGATTCCAAAGATTAAGCTTTATC
GAGATGGCTTTTTCGGTTGCCAACCAGATGATCTTTCTTTCACCCACATTTTTAAACAAT
ACGCTGTCTTATTCTCTAAATTGTTACAATCGTGGTTAAGTGTAAATGGAAGAAGGAAGT
ACTGGAGATATGATGTGATCGCTGGCATTGTATCTGGCTTCTCAACTTCCATTATCACGG
TCGTCATGGTACGGATCTTGAGACATGCGAAATCTTGGTTCCCTCGCGCTTGTTGTTCAG
TTAAAAGCCTGCTTTCTAAAGTGAACCTCTTGGTGCAAGTGAAGCGTGCTTGTTTGGTTG
TTGTTTACTTCTCCATCCTAGGGTGGATGGCTACACAATACTTGAAAATTCTTTTTCCTA
AGGCTTAGAGAAAAAAAAGAAACACATTCCTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
GTTGTTGAGTATGTAATGATTCGTAGAGAGTTGTGTGATGTAATCCTAAACTATTTACAG
CAAAAGAAAGCAATTCAGAG

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 3

CO CL3426Contig1 970 3 3 U
GCAAGGTGGTCTTGGTCAAGGAATGTCGTTTAGAAAGCCTGCAGTAGGGTCAAATTCTGA
TCCTAGGCGACCAGCTGGAGGTTTGAATGGTGTTGGCTCACAAAGACCTGCAAGTCCTGT
TACTCACGGACGGTCAAGTCCTCAAGAGCGGGGATCAGCTTATGTTCACAGGGAGTTCGC
AAGTCTGTCTCGTGCTTCTGAACCGTCATCAGAAGTGCCATCTGCTAGGCAAGTACCGCA
AGGACCATCGGCAGCAGTGAACATCCCTCAGGAACGGTTACAAGATATGTCCTTATCTGC
CATTAAGGAATATTACAGTGCCCGAGACGAGAAGGAGATTGGTTTATGCATAAAAGACAT
GAATTCACCAGATTTCCACCCAACAATGATTTCTCTGTGGGTTACTGATTCTTTTGAGAG
AAAAGACAAAGAAAGAGATCTCTTAGCAAAGCTCCTTGTTAACCTTGTGAAATCTGCTGA
CAACGACTTAACCGGGGCCGAACTAGTGAAAGGGTTTGAAACCGTTTTGACGACACTGGA
GGATGCTGTGAATGATGCTCCAAAAGCAGCAGAGTTTCTAGGCAAAATCTTCGGTGAAAG
TGTGACTGAGAATGTAGTGACATCGGCACAGATTGGTCGGCTAATACGTGAAGGAGGAGA
AGAACCAGGAAGTCTGATGGAGTTTGGGTTAGGAGGTGATGTTCTTGGGAGTGTTTTGGA
GACAATAAAGTTAGAAGCAGGAGAAGAAGCTTTTGTTGAGATTCAAAGGAGCTCAGGTCT
GAGGATTGAAGATTTCAAACCTCCTGCACCTAACAGGTCTAAGATATTAGATAAATTTAC
TTAGGAATCAAAAATGTACGGAGCCATCTTTTGACCGTTCTGTTGCTCTGTCTCTCTTTT
TTTTTTTCAAGTGCTTCAACAAACTAATCTGTTAAAAAAGGAGTTTCTCTATTTTATTTA
TTATAATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H687TF U 1
AF RR2EJ93TF U 323
AF RR2H687JQB C 441
BS 1 653 RR2H687TF
BS 654 939 RR2EJ93TF
BS 940 970 RR2H687JQB

RD RR2H687TF 661 0 0
GCAAGGTGGTCTTGGTCAAGGAATGTCGTTTAGAAAGCCTGCAGTAGGGTCAAATTCTGA
TCCTAGGCGACCAGCTGGAGGTTTGAATGGTGTTGGCTCACAAAGACCTGCAAGTCCTGT
TACTCACGGACGGTCAAGTCCTCAAGAGCGGGGATCAGCTTATGTTCACAGGGAGTTCGC
AAGTCTGTCTCGTGCTTCTGAACCGTCATCAGAAGTGCCATCTGCTAGGCAAGTACCGCA
AGGACCATCGGCAGCAGTGAACATCCCTCAGGAACGGTTACAAGATATGTCCTTATCTGC
CATTAAGGAATATTACAGTGCCCGAGACGAGAAGGAGATTGGTTTATGCATAAAAGACAT
GAATTCACCAGATTTCCACCCAACAATGATTTCTCTGTGGGTTACTGATTCTTTTGAGAG
AAAAGACAAAGAAAGAGATCTCTTAGCAAAGCTCCTTGTTAACCTTGTGAAATCTGCTGA
CAACGACTTAACCGGGGCCGAACTAGTGAAAGGGTTTGAAACCGTTTTGACGACACTGGA
GGATGCTGTGAATGATGCTCCAAAAGCAGCAGAGTTTCTAGGCAAAATCTTCGGTGAAAG
TGTGACTGAGAATGTAGTGACATCGGCACAGATTGGTCGGCTAATACGTGAAG
AGAGAAGA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2EJ93TF 617 0 0
G
GAGATGAGAAGGAGATTGGTTTATGCATAAAAGACATGAATTCACCAGATTTCCACCCAA
CAATGATTTCTCTGTGGGTTACTGATTCTTTTGAGAGAAAAGACAAAGAAAGAGATCTCT
TAGCAAAGCTCCTTGTTAACCTTGTGAAATCTGCTGACAACGACTTAACCGGGGCCGAAC
TAGTGAAAGGGTTTGAAACCGTTTTGACGACACTGGAGGATGCTGTGAATGATGCTCCAA
AAGCAGCAGAGTTTCTAGGCAAAATCTTCGGTGAAAGTGTGACTGAGAATGTAGTGACAT
TGGCACAGATTGGTCGGCTAATACGTGAAGGAGGAGAAGAACCAGGAAGTCTGATGGAGT
TTGGGTTAGGAGGTGATGTTCTTGGGAGTGTTTTGGAGACAATAAAGTTAGAAGCAGGAG
AAGAAGCTTTTGTTGAGATTCAAAGGAGCTCAGGTCTGAGGATTGAAGATTTCAAACCTC
CTGCACCTAACAGGTCTAAGATATTAGATAAATTTACTTAGGAATCAAAAATGTACGGAG
CCATCTTTTGACCGTTCTGTTGCTCTGTCTCTCTTTTTTTTTTTCAAGTGCTTCAACAAA
CTAATCTGTTAAAAAA

QA 2 617 2 617
DS 

RD RR2H687JQB 530 0 0
TCTTAGCAAAGCTCCTTGTTAACCTTGTGAAATCTGCTGACAACGACTTAACCGGGGCCG
AACTAGTGAAAGGGTTTGAAACCGTTTTGACGACACTGGAGGATGCTGTGAATGATGCTC
CAAAAGCAGCAGAGTTTCTAGGCAAAATCTTCGGTGAAAGTGTGACTGAGAATGTAGTGA
CATCGGCACAGATTGGTCGGCTAATACGTGAAGGAGGAGAAGAACCAGGAAGTCTGATGG
AGTTTGGGTTAGGAGGTGATGTTCTTGGGAGTGTTTTGGAGACAATAAAGTTAGAAGCAG
GAGAAGAAGCTTTTGTTGAGATTCAAAGGAGCTCAGGTCTGAGGATTGAAGATTTCAAAC
CTCCTGCACCTAACAGGTCTAAGGTATTAGATAAATTTACTTAGGAA**AAAAATGTACG
GAGCCATCTTTTGACCGTTCTGTTGCTCTGTCTCTCTTTTTTTTTT*CAAGTGCTTCAAC
AAACTAATCTGTTAAAAAAGGAGTTTCTCTATTTTATTTATTATAATATC

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 3

CO CL3427Contig1 1186 3 4 U
GGAAGCCCAAAAAAAAAGTTATCAGAGAGGTTAGAGCAATGGCAGCGGTGAACTGCCTCT
TCTTCAAGCTATCACATTCACGACATCTCAAACCCTCAAGGCCTTCTTTTTCTTGCTCGG
CCTCTCAACCTTCCCAAAACAACATAAAGGTAATCATAAACGGAGCTGCAAAGGAGATAG
GAAGAGCCGCTGTGGTTGCTGTAACTAAAGCCAGGGGAATGGAGTTAGCTGGTGCTGTCG
ACAACCATTTTCTTGGCGAAGATATTGGCTTGCTATGTGACATGGAGGAGCCTCTAGAGA
TACCAGTAGTGAGTGATCTAACAATGGTCTTAGGCTCCATATCTCAGGGAAAAGAAGTCG
GAGTTGTGATCGACTTTACAGACCCATCAACAGTGTATGAGAATGTAAAACAGGCAACGG
CATTTGGGATGAAGAGTGTGGTGTATGTACCTCGGATCAAGCCAGAGACGGTATCAGCGT
TGTCTGCATTATGTGACAAGGCCACCATGGGATGCCTTGTAGCACCAACTCTGTCCATAG
GATCTATACTTCTCCAGCAGGCTGTGATCATGGCTTCCTTCCACTACAACAATGTAGAAA
TCGTGGAGTCAAGGCCGAATGCAATGGATCTTCCTCCTCCAGAAGCTACACAAATTGCAA
ACAACATATCAAATCTTGGTCAGATCTACAACAGAGGAGATAGTTCAACTGATGTTCAGG
CAAGAGGTCAAGTAATAGGAGAAGACGGGGTTCGTGTTCACAGTATGGTTCTACCTGGAC
TACCGTCTAGTACACAAGTCTACTTCTCAAGTCCAGGAGATGTTTACACAGTTAAACACG
ACATAGTTGACGTAAGGTCCCTAATGCCTGGACTACTTCTCGCTATCAGAAAGGTGGTAC
GCCTCAAGAATCTGGTTTATGGCCTCGAGAAATTCTTGTAGGAACTGAAGTGTTTCGCCA
GTCATCAATCAAGATACGAGTCAAATGTTACAATTATCCTGAATTGTAGCTCATGTCATC
CTGCAAGTCACAAAAAGGAAAACACATTAAAAATAAATTATAGAAATAGGTTGATATTTT
CCGTTCATGATAATTTACGCATATTCATTTTTACGGTGGTGGACACTAGCAAATTCAAAT
AAGAAAACAATTATCCTAGGACCTGGCAAATACGATGTTCAATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F103TF U 1
AF RR2C481TF U 3
AF RR2F103JQ C 431
BS 1 392 RR2F103TF
BS 393 393 RR2C481TF
BS 394 711 RR2F103TF
BS 712 1186 RR2F103JQ

RD RR2F103TF 717 0 0
GGAAGCCCAAAAAAAAAGTTATCAGAGAGGTTAGAGCAATGGCAGCGGTGAACTGCCTCT
TCTTCAAGCTATCACATTCACGACATCTCAAACCCTCAAGGCCTTCTTTTTCTTGCTCGG
CCTCTCAACCTTCCCAAAACAACATAAAGGTAATCATAAACGGAGCTGCAAAGGAGATAG
GAAGAGCCGCTGTGGTTGCTGTAACTAAAGCCAGGGGAATGGAGTTAGCTGGTGCTGTCG
ACAACCATTTTCTTGGCGAAGATATTGGCTTGCTATGTGACATGGAGGAGCCTCTAGAGA
TACCAGTAGTGAGTGATCTAACAATGGTCTTAGGCTCCATATCTCAGGGAAAAGAAGTCG
GAGTTGTGATCGACTTTACAGACCCATCAACATTGTATGAGAATGTAAAACAGGCAACGG
CATTTGGGATGAAGAGTGTGGTGTATGTACCTCGGATCAAGCCAGAGACGGTATCAGCGT
TGTCTGCATTATGTGACAAGGCCACCATGGGATGCCTTGTAGCACCAACTCTGTCCATAG
GATCTATACTTCTCCAGCAGGCTGTGATCATGGCTTCCTTCCACTACAACAATGTAGAAA
TCGTGGAGTCAAGGCCGAATGCAATGGATCTTCCTCCTCCAGAAGCTACACAAATTGCAA
ACAACATATCAAATCTTGGTCAGATCTACAACAGAGGAGATAGTTCAACTG
ATGTTC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2C481TF 709 0 0
GGAAGCCC
AAAAAAAGTTATCAGAGAGGTTAGAGCAATGGCAGCGGTGAACTGCCTCTTCTTCAAGCT
ATCACATTCACGACATCTCAAACCCTCAAGGCCTTCTTTTTCTTGCTCGGCCTCTCAACC
TTCCCAAAACAACATAAAGGTAATCATAAACGGAGCTGCAAAGGAGATAGGAAGAGCCGC
TGTGGTTGCTGTAACTAAAGCCAGGGGAATGGAGTTAGCTGGTGCTGTCGACAACCATTT
TCTTGGCGAAGATATTGGCTTGCTATGTGACATGGAGGAGCCTCTAGAGATACCAGTGGT
GAGTGATCTAACAATGGTCTTAGGCTCCATATCTCAGGGAAAAGAAGTCGGAGTTGTGAT
CGACTTTACAGACCCATCAACAGTGTATGAGAATGTAAAACAGGCAACGGCATTTGGGAT
GAAGAGTGTGGTGTATGTACCTCGGATCAAGCCAGAGACGGTATCAGCGTTGTCTGCATT
ATGTGACAAGGCCACCATGGGATGCCTTGTAGCACCAACTCTGTCCATAGGATCTATACT
TCTCCAGCAGGCTGTGATCATGGCTTCCTTCCACTACAACAATGTAGAAATCGTGGAGTC
AAG*CCGAATGCAATGGATCTTCCTTCTCCAGGAGCTACACAAATTGCAAACAACATATC
AAATCTTGGTCAGATCTACAACAGAGAAGATAGTTCAACTG

QA 9 709 9 709
DS 

RD RR2F103JQ 756 0 0
GAAGAGTGTGGTGTATGTACCTCGGATCAAGCCAGAGACGGTATCAGCGTTGTCTGCATT
ATGTGACAAGGCCACCATGGGATGCCTTGTAGCACCAACTCTGTCCATAGGATCTATACT
TCTCCAGCAGGCTGTGATCATGGCTTCCTTCCACTACAACAATGTAGAAATCGTGGAGTC
AAGGCCGAATGCAATGGATCTTCCTCCTCCAGAAGCTACACAAATTGCAAACAACATATC
AAATCTTGGTCAGATCTACAACAGAGGAGATAGTTCAACTGATGTTCAGGCAAGAGGTCA
AGTAATAGGAGAAGACGGGGTTCGTGTTCACAGTATGGTTCTACCTGGACTACCGTCTAG
TACACAAGTCTACTTCTCAAGTCCAGGAGATGTTTACACAGTTAAACACGACATAGTTGA
CGTAAGGTCCCTAATGCCTGGACTACTTCTCGCTATCAGAAAGGTGGTACGCCTCAAGAA
TCTGGTTTATGGCCTCGAGAAATTCTTGTAGGAACTGAAGTGTTTCGCCAGTCATCAATC
AAGATACGAGTCAAATGTTACAATTATCCTGAATTGTAGCTCATGTCATCCTGCAAGTCA
CAAAAAGGAAAACACATTAAAAATAAATTATAGAAATAGGTTGATATTTTCCGTTCATGA
TAATTTACGCATATTCATTTTTACGGTGGTGGACACTAGCAAATTCAAATAAGAAAACAA
TTATCCTAGGACCTGGCAAATACGATGTTCAATGCT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL3428Contig1 642 2 12 U
GGAGAGAGAGAAGTGAGTAAGATAGATAGACCGAAGACGATGAGGAGCTCTGCATCCGCC
ATGAAAGCTGCTGGACTCTTGGTTCTGCTTGCCGTTTTAGCATCAGCTTACGCGAAGAAG
GCAGCTGATGTGACAGAGTTGCAGATTGGTGTTAAGTTCAAGCCTCAAACATGTGATGTC
CAGGCTCACAAAGGGGACAAGATCAAGGTCCACTATCGAGGAAAGTTAACAGATGGAACT
GTGTTTGATTCAAGTTTTGAGAGAGGTGACCCTATTGAGTTTGAGCTTGGGAGTGGTCAA
GTCATTCCAGGATGGGACCAGGGTCTACTTGGAGCTTGTGTAGGTGAGAAGAGAAAGCTG
AAAATCCCTTCCAAGCTTGGTTATGGTGATAATGGCTCACCCCCTAAAATCCCCGGTGGG
GCGACATTGATATTCGACACCGAGCTAGTTGCTGTGAACGGGAAACCATCCAACGAAGGA
AAAACAAAGAGCGAGCTTTGAATGCAACCATCTTCTTCTTAATTTCCTTATGAAACCATG
TTATGTCGTCAGCATTTGAATCTCAAACATGCTAGAGAATAGAGTCGTTTACTTTTTACT
AGTTGTGGACAAAGACAATAATTAATATTATGGTTGCAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2BA29TF U 1
AF RR2B669TF U 143
BS 1 167 RR2BA29TF
BS 168 168 RR2B669TF
BS 169 410 RR2BA29TF
BS 411 411 RR2B669TF
BS 412 434 RR2BA29TF
BS 435 435 RR2B669TF
BS 436 472 RR2BA29TF
BS 473 473 RR2B669TF
BS 474 506 RR2BA29TF
BS 507 507 RR2B669TF
BS 508 639 RR2BA29TF
BS 640 642 RR2B669TF

RD RR2BA29TF 639 0 0
GGAGAGAGAGAAGTGAGTAAGATAGATAGACCGAAGACGATGAGGAGCTCTGCATCCGCC
ATGAAAGCTGCTGGACTCTTGGTTCTGCTTGCCGTTTTAGCATCAGCTTACGCGAAGAAG
GCAGCTGATGTGACAGAGTTGCAGATTGGTGTTAAGTTCAAGCCTCAGACATGTGATGTC
CAGGCTCACAAAGGGGACAAGATCAAGGTCCACTATCGAGGAAAGTTAACAGATGGAACT
GTGTTTGATTCAAGTTTTGAGAGAGGTGACCCTATTGAGTTTGAGCTTGGGAGTGGTCAA
GTCATTCCAGGATGGGACCAGGGTCTACTTGGAGCTTGTGTAGGTGAGAAGAGAAAGCTG
AAAATCCCTTCCAAGCTTGGTTATGGTGATAATGGCTCACCCCCTAAAATTCCCGGTGGG
GCGACATTGATATTTGACACCGAGCTAGTTGCTGTGAACGGGAAACCATCCAGCGAAGGA
AAAACAAAGAGCGAGCTTTGAATGCATCCATCTTCTTCTTAATTTCCTTATGAAACCATG
TTATGTCGTCAGCATTTGAATCTCAAACATGCTAGAGAATAGAGTCGTTTACTTTTTACT
AGTTGTGGACAAAGACAATAATTAATATTATGGTTGCAG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2B669TF 500 0 0
G
GATTGGTGTTAAGTTCAAGCCTCAAACATGTGATGTTCAGGCTCACAAAGGGGACAAGAT
CAAGGTCCATTATCGAGGAAAGTTAACAGATGGAACTGTGTTTGATTCAAGTTTTGAGAG
AGGTGACCCTATTGAGTTTGAGCTTGGGAGTGGTCAAGTCATTCCAGGATGGGACCAGGG
TCTACTTGGAGCTTGTGTAGGTGAGAAGAGAAAGCTGAAAATCCCTTCCAAGCTTGGTTA
TGGTGATAATGGCTCACCCCCTAAAATCTCCGGTGGGGCGACATTGATATTCGACACGGA
GCTAGTTGCTGTGAACGGGAAACCATCCAACGAAGGAAAAACAAAGAGCGAGCTTTGAAT
GCAACCATCTTCTTCTTAATTTCCTTATGAAACCATGTTATGTCGTCAGCATTTGAATCT
CAAACATGCTAGAGACTAGAGTCGTTTACTTTTTACTAGTTGTGGACAAAGACAATAATT
AATATTATGGTTGCAGTTC

QA 2 500 2 500
DS 



AS 1 3

CO CL3429Contig1 827 3 13 U
CGAAAAAAAAGAGATATGAATTAAGTAGAGATAATGGAAATCTTACACATGGGTATATTT
TTTTGTCCTTGACTAAAAAAAAAAGTTGTACATATCTTGTTGTCTATATAAAAGGTATGA
TTCTCTTGAAACTTTTTAGCTTTGTTGTTTGGAATAGTAATGCTGATAGCAATCATGGTG
ATCTTCTTGGCAGCTACTTGATGAGTTTATAAGGGTTTTTGTATGTCTCCTTGTGAGTTT
CATGGTAAAGCTCCTCAAATCAGATTAGAAGGGTTTTGTATTCTTCCAGCAACTTAGGAA
TGTCATCCATCCGCAACTCGGAAGAACTTTTGATGTGATAAAACGTAAAGGTCTTCTTTC
CGGGGAAGCCAAAATCTGCAGATGTTAAGCTGTT*******GTGTATTTTCTGGTCACCA
GTCGCTGATAATCTCGAAGCAAAGAATCAAGCTCTTTTAATTGCAAAGTCTCTGGAGTGG
ACTCTTTCCAATGTTGACGAAGTGCTTCAGCTGCCATCTGAACCATGGAGGATCGATTAT
CAACTACATCTCCCTCAATCAATCTGGTTCCTAACTCAACGAACTCTTGATCTTCTGACT
CCTCGAGGATTTGAAGGCGTAACCCTGATGAAACAGAGATTCCCATTTTCTTTTGCAAGT
CAGCGATAGTGGATCCCTCTTTTCCCCTTTCCGTATCCAAATCTCTCTCTGACTCTTTAG
TCTCAGGAGGATTTTTAAGTTGAGGTACAGAAGACCTCTTGGCTATCGGATCATCTTCAG
GAACAAGCCACCAAAGATCACCAAAGGTTGATTTTCCATCAAAACCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E242JQ U 1
AF RR2F993JQ U 1
AF RR2E242TF C 121
BS 1 262 RR2E242JQ
BS 263 263 RR2F993JQ
BS 264 267 RR2E242JQ
BS 268 268 RR2F993JQ
BS 269 323 RR2E242JQ
BS 324 324 RR2F993JQ
BS 325 380 RR2E242JQ
BS 381 381 RR2F993JQ
BS 382 443 RR2E242JQ
BS 444 444 RR2F993JQ
BS 445 598 RR2E242JQ
BS 599 722 RR2F993JQ
BS 723 827 RR2E242TF

RD RR2E242JQ 598 0 0
CGAAAAAAAAGAGATATGAATTAAGTAGAGATAATGGAAATCTTACACATGGGTATATTT
TTTTGTCCTTGACTAAAAAAAAAAGTTGTACATATCTTGTTGTCTATATAAAAGGTATGA
TTCTCTTGAAACTTTTTAGCTTTGTTGTTTGGAATAGTAATGCTGATAGCAATCATGGTG
ATCTTCTTGGCAGCTACTTGATGAGTTTATAAGGGTTTTTGTATGTCTCCTTGTGAGTTT
CATGGTAAAGCTCCTCAAATCAAATTAAAAGGGTTTTGTATTCTTCCAGCAACTTAGGAA
TGTCATCCATCCGCAACTCGGAAAAACTTTTGATGTGATAAAACGTAAAGGTCTTCTTTC
CGGGGAAGCCAAAATCTGCAAATGTTAAGCTGTT*******GTGTATTTTCTGGTCACCA
GTCGCTGATAATCTCGAAGCAAAAAATCAAGCTCTTTTAATTGCAAAGTCTCTGGAGTGG
ACTCTTTCCAATGTTGACGAAGTGCTTCAGCTGCCATCTGAACCATGGAGGATCGATTAT
CAACTACATCTCCCTCAATCAATCTGGTTCCTAACTCAACGAACTCTTGATCTTCTGA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2F993JQ 722 0 0
A
GAAAAAAAAGAGATATGAATTAAGTAGAGATAATGGAAATCTTACACATGGGTATATTTT
TTTGTCCTTGACTAAAAAAAAA*GTTGTACATATCTTGTTGTCTATATAAGAGGTATGAT
TCTCTTGAGACTTTTTAGCTTTGTTGTTTGGAATAGTAATGCTGATAGCAATCATGGTGA
TCTTCTTGGCAGCTACTTGATGAGTTTATAAGGGTTTTTGTATGTCTCCTTGTGAGTTTC
ATGGTAAAGCTCCTCAAATCAGATTAGAAGGGTTTTGTATTCTTCCAGCAACTTAGGAAT
GTCATCCATCCGCAACTCGGAAGAACTTTTGATGTGATAAAACGTAAAGGTCTTCTTTCC
GGGGAAGCCAAAATCTGCAGATGTTAAGCTGTTCTGTGCTGTGTATTTTCTGGTCACCAG
CCGCTGATAATCTCGAAGCAAAGAATCAAGCTCTTTTAATTGCAAAGTCTCTGGAGTGGA
CTCTTTCCAATGTTGACGAAGTGCTTCAGCTGCCATCTGAACCATGGAGGATCGATTATC
AACTACATCTCCCTCAATCAATCTGGTTCCTAACTCAACGAACTCTTGATCTTCTGACTC
CTCGAGGATTTGAAGGCGTAACCCTGATGAAACAGAGATTCCCATTTTCTTTTGCAAGTC
AGCGATAGTGGATCCCTCTTTTCCCCTTTCCGTATCCAAATCTCTCTCTGACTCTTTAGT
C

QA 2 722 2 722
DS 

RD RR2E242TF 707 0 0
TGATCTCTGAGAC
TTTTAGCTTTGT*GTTTGGAATAGTAATGCTGATAGCAATCATGGTGATCT*CTTGGCAG
CTACTTGATGAGTTTATAAGGGTTTT*GTATGTCTCTTTGTGAGTTTCATGGTAAAGCTC
CTCAAATCAGATTAGAAGGGTTTTGTAT*CTTCCAGCAACTTAGGAATGTCATCCATCCG
CAACTCGGAAGAACTTTTGATGTGATAAAACGTAAAGGTCTTCTTTCCGGGGAAGCCAAA
ATCTGCAGATGTTAAGCTGTT*******GTGTATTTTCTGGTCACCAGTCGCTGATAATC
TCGAAGCAAAGAATCAAGCTCTTTTAATTGCAAAGTCTCTGGAGTGGACTCTTTCCAATG
TTGACGAAGTGCTTCAGCTGCCATCTGAACCATGGAGGATCGATTATCAACTACATCTCC
CTCAATCAATCTGGTTCCTAACTCAACGAACTCTTGATCTTCTGACTCCTCGAGGATTTG
AAGGCGTAACCCTGATGAAACAGAGATTCCCATTTTCTTTTGCAAGTCAGCGATAGTGGA
TCCCTCTTTTCCCCTTTCCGTATCCAAATCTCTCTCTGACTCTTTAGTCTCAGGAGGATT
TTTAAGTTGAGGTACAGAAGACCTCTTGGCTATCGGATCATCTTCAGGAACAAGCCACCA
AAGATCACCAAAGGTTGATTTTCCATCAAAACCC

QA 14 707 14 707
DS 



AS 1 3

CO CL3430Contig1 741 3 3 U
GGGCTCGGCCCCTGATTACATTTGTGCGAGAGAAGCATCCACTGGAGGGAGAGCAGAGGA
GAGCATATGGAGACTGCGATATGTGGGAGATTAGCTCTCGCACCAAACTCTCTCTTCAAT
TCTTCTTTATCAGGAGACAAACATTCTGTCTCAAAAGGACCTCACTCGAGTAACCGTGGA
GTTCTCATGACCATGTCTACTACCTCCGTAGTGGCTAAAGGAGGTGGTGTGTTGGACAAA
CCAATTATAGAAAAAACTACTCCTGGTCGTGAATCCGAGTTTGATTTGAGGAAATCAAAG
AAGATG*CTCCACCTTACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATAT
GTGGTTCAGGTTTTGATGAAGGTCATACCAGGAATGACCGTAGACAACGCAGTTAACATT
ATGCAAGAAGCCCATATCAACGGTTTGGCAGTTGTCATCGTCTGTGCTCAGGCCGATGCA
GAGCAACACTGTATGCAGCTGCGCGGTAACGGTCTTCTCAGTTCTGTTGAACCTGATGGT
GGAGGCTGCTGAAACAAAAACAAAACAAAACAAAACTAGTTTAAATTTCGTATAGGTTTT
TCACACCTCTCAGGACACTCTATTTAGTAAAAAAGAAAATGTCCTTTGGTGTATATAAAT
ATCAGAAAATTTGGTACTAAGACTGTTACTATATGCAGTGAACATTTGCCTTTCTATAGA
TCTTTCGTTGGGTTTATTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM33TF U 1
AF RR2DN49TF U 16
AF RR2GM33JQ C 295
BS 1 560 RR2GM33TF
BS 561 609 RR2DN49TF
BS 610 741 RR2GM33JQ

RD RR2GM33TF 560 0 0
GGGCTCGGCCCCTGATTACATTTGTGCGAGAGAAGCATCCACTGGAGGGAGAGCAGAGGA
GAGCATATGGAGACTGCGATATGTGGGAGATTAGCTCTCGCACCAAACTCTCTCTTCAAT
TCTTCTTTATCAGGAGACAAACATTCTGTCTCAAAAGGACCTCACTCGAGTAACCGTGGA
GTTCTCATGACCATGTCTACTACCTCCGTAGTGGCTAAAGGAGGTGGTGTGTTGGACAAA
CCAATTATAGAAAAAACTACTCCTGGTCGTGAATCCGAGTTTGATTTGAGGAAATCAAAG
AAGATG*CTCCACCTTACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATAT
GTGGTTCAGGTTTTGATGAAGGTCATACCAGGAATGACCGTAGACAACGCAGTTAACATT
ATGCAAGAAGCCCATATCAACGGTTTGGCAGTTGTCATCGTCTGTGCTCAGGCCGATGCA
GAGCAACACTGTATGCAGCTGCGCGGTAACGGTCTTCTCAGTTCTGTTGAACCTGATGGT
GGAGGCTGCTGAAACAAAAA

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2DN49TF 594 0 0
GG
ACATTTGTGTGAGAGAAGCATCCACTGGAGGGAGAGCAGAGGAGAGCATATGGAGACTGC
GATATGTGGGAGATTAGCTCTCGCACCAAACTCTCTCTTCAATTCTTCTTTATCAGGAGA
CAAACATTCTGTCTCAAAAGGACCTCACTCGAGTAACCGTGGAGTTCTCATGACCATGTC
TACTACCTCCGTAGTGGCTAAAGGAGGTGGTGTGTTGGACAAACCAATTATAGAAAAAAC
TACTCCTGGTCGTGAATCCGAGTTTGATTTGAGGAAATCAAAGAAGATGGCTCCACCTTA
CAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATATGTGGTTCAGGTTTTGAT
GAAGGTCATACCAGGAATGACCGTAGACAACGCAGTTAACATTATGCAAGAAGCCCATAT
CAACGGTTTGGCAGTTGTCATCGTCTGTGCTCAGGCCGATGCAGAGCAACACTGTATGCA
GCTGCGCGGTAACGGTCTTCTCAGTTCTGTTGAACCTGATGGTGGAGGCTGCTGAAACAA
AAACAAAACAAAACAAAACTAGTTTAAATTTCGTATAGGTTTTTCACACCTC

QA 3 594 3 594
DS 

RD RR2GM33JQ 447 0 0
TCAAAGAAGATG*CTCCCCCTTACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGAGG
GAATATGTGGTTCAGGTTTTGATGAAGGTCATACCAGGAATGACCGTAGACAACGCAGTT
AACATTATGCAAGAAGCCCATATCAACGGTTTGGCAGTTGTCATCGTCTGTGCTCAGGCC
GATGCAGAGCAACACTGTATGCAGCTGCGCGGTAACGGTCTTTTCAGTTCTGTTGAACCT
GATGGTGGAGGCTGCTGAAACAAAAACAAAACAAAACAAAACTAGTTTAAATTTCGTATA
GGTTTTTCACACCTCTCAGGACACTCTATTTAGTAAAAAAGAAAATGTCCTTTGGTGTAT
ATAAATATCAGAAAATTTGGTACTAAGACTGTTACTATATGCAGTGAACATTTGCCTTTC
TATAGATCTTTCGTTGGGTTTATTATG

QA 1 447 1 447
DS 



AS 1 2

CO CL3431Contig1 897 2 14 U
GGACTTCACCAACATCAACTAGTATCAGCAAGAACAAAACTAGGTTTCTGGTGGTATCTT
CTTCGAAAACCATGGATACAGATGAGACTAGTAGGCCATCGCTGGATCATAGCGAAATGA
TGATGGTTGCTGAGGAGAAGGATTCACTTGAGTCGAGTAGAAGAAAGAGGAAACTGGCAG
CTGAAGAATCAGACTTGTTACCCTTAGCTAAACACTTTTGCCTTGAGCAGCAGCAACAAG
CTTCTCTTCCTGATTGGTCGTGTTCATCCTCAGATATAGAATCCGCGGAATGTTCAAATG
CTATGGAAGACACAAAAAACGGAGATGAGACCTCTTCTTCTGCATATGTGTGCATGTCTA
CTAAAGACTCTTGTTATTCAACCGGAAGTTCAAGTTTGAGTTCCGGTTACGCAGCATCAG
GCATAGAAGAATGCTGTTCCAAAGGTAATGACAAAATGCCAGAAGAATACGTTGAAGACA
TGGAGTTCATTTGTTCCGAGTTTGCTGTTGAAGAGCTTCTAGGCTGTGAAGATTCAGATC
TACAAGGGTCTTCTTACACTCTTTCTTCTTCACGGTGGAGTGTGAGCAACCAAGATATGC
AAGAAGCTACAGCAAAGAAACCAACCATTGATAAAGAGTTTGAGGAGTATTTTTCAACAC
TTATGATGTAAACACAAGAAAGGCTCTTACTACATCGATCTCTAATCGCTGCAATGTTTG
TGTAAATATATGTCAACCTTGTTTCTGATCTAGAAGGAACATCCCTAAGAGCAATTGCAT
TTACAATGTTCATCTGTAAGCTATGAAGTTATCTTGTTCATTCGTTAAAACACTCGCACT
TCTTTTTTTCCTCCCCCAAAATGTAACTGACACTCAATAAAAGAATCAGAGTTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E108TF U 1
AF RR2E108JQ C 247
BS 1 682 RR2E108TF
BS 683 683 RR2E108JQ
BS 684 756 RR2E108TF
BS 757 757 RR2E108JQ
BS 758 767 RR2E108TF
BS 768 768 RR2E108JQ
BS 769 773 RR2E108TF
BS 774 774 RR2E108JQ
BS 775 785 RR2E108TF
BS 786 786 RR2E108JQ
BS 787 798 RR2E108TF
BS 799 799 RR2E108JQ
BS 800 809 RR2E108TF
BS 810 897 RR2E108JQ

RD RR2E108TF 818 0 0
GGACTTCACCAACATCAACTAGTATCAGCAAGAACAAAACTAGGTTTCTGGTGGTATCTT
CTTCGAAAACCATGGATACAGATGAGACTAGTAGGCCATCGCTGGATCATAGCGAAATGA
TGATGGTTGCTGAGGAGAAGGATTCACTTGAGTCGAGTAGAAGAAAGAGGAAACTGGCAG
CTGAAGAATCAGACTTGTTACCCTTAGCTAAACACTTTTGCCTTGAGCAGCAGCAACAAG
CTTCTCTTCCTGATTGGTCGTGTTCATCCTCAGATATAGAATCCGCGGAATGTTCAAATG
CTATGGAAGACACAAAAAACGGAGATGAGACCTCTTCTTCTGCATATGTGTGCATGTCTA
CTAAAGACTCTTGTTATTCAACCGGAAGTTCAAGTTTGAGTTCCGGTTACGCAGCATCAG
GCATAGAAGAATGCTGTTCCAAAGGTAATGACAAAATGCCAGAAGAATACGTTGAAGACA
TGGAGTTCATTTGTTCCGAGTTTGCTGTTGAAGAGCTTCTAGGCTGTGAAGATTCAGATC
TACAAGGGTCTTCTTACACTCTTTCTTCTTCACGGTGGAGTGTGAGCAACCAAGATATGC
AAGAAGCTACAGCAAAGAAACCAACCATTGATAAAGAGTTTGAGGAGTATTTTTCAACAC
TTATGATGTAAACACAAGAAAG*CTCTTACTACATCGATCTCTAATCGCTGCAATGTTTG
TGTAAATATATGTCAACCTTGTTTCTGATCTAGAAG*AACATCCCTA*GAGCA*TTGCAT
TTACA*TGTTCATCTGTA*GCTATGAAGT
ATCTGTTCA

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2E108JQ 651 0 0
TTCCTGATTGGTCGTGTTCATCCTCAGATATAGAATCCGCGGAATGTTCAAATGCTATGG
AAGACACAAAAAACGGAGATGAGACCTCTTCTTCTGCATATGTGTGCATGTCTACTAAAG
ACTCTTGTTATTCAACCGGAAGTTCAAGTTTGAGTTCCGGTTACGCAGCATCAGGCATAG
AAGAATGCTGTTCCAAAGGTAATGACAAAATGCCAGAAGAATACGTTGAAGACATGGAGT
TCATTTGTTCCGAGTTTGCTGTTGAAGAGCTTCTAGGCTGTGAAGATTCAGATCTACAAG
GGTCTTCTTACACTCTTTCTTCTTCACGGTGGAGTGTGAGCAACCAAGATATGCAAGAAG
CTACAGCAAAGAAACCAACCATTGATAAAGAGTTTGAGGAGTATTTTTCAACACTTATGA
TGTAAACACAAGAAAGGCTCTTACTACATCGATCTCTAATCGCTGCAATGTTTGTGTAAA
TATATGTCAACCTTGTTTTTGATCTAGAAGGAACATCCCTAAGAGCAATTGCATTTACAA
TGTTCATCTGTAAGCTATGAAGTTATCTTGTTCATTCGTTAAAACACTCGCACTTCTTTT
TTTCCTCCCCCAAAATGTAACTGACACTCAATAAAAGAATCAGAGTTTCCG

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL3432Contig1 711 2 1 U
GATTGGAAATTTTTTTTATTACTAATAAAGCATATCACTATTCTATCACTAATAACTTTT
CTTGGATTGCACGACATGGAAAACAGAGTAAACTATTGTTACATGAAGACTTAGTTTGGA
ATATTATGACCTCCTTTTCTAATTGGTCCATAGCCTCTGGCTCTCTTCCATTTCTCCACA
TTGATCATCCTAGCGAAGATTTTGCGAATCAAAGTCAGCTTCCGAGACTGCTGAGCAATG
ACGTTAACCGTTGAGGAGCTTTGGCTGAGTATGATCCCATACCCATCTTGAAAATTATCC
ATTCCGTTTCCCAGAAGTTGCCAGAACAGTCCTCCCGCTGCTGCGCCTCCTCGTTTCGCA
GACTCGTATATCTTGGTATACACGGTGTTGAACACAAGGTCTCTCTGTGCGGGAGAGTAG
CCTGCTTTCTTCATTGATTTACCAAACTCTGCTATGATTATGGGTTTGTGAAGAACGTTC
TGAGCGTCTTGGATGTGTGCGTCCACCCATCTGTTTAAGAACTCCATTTGGGATTGCTCG
CTTGCGTCTACAAACCATTCGTCGGGGTAAGAGTGAGCCGTGACGAAATCAATGCCAGGT
ATGCGGTTATTGGCTATGAAATCGGTTCCAAACTGGCCTGGTGGGTTCAGAGTCTTGCTT
TGTGGTGACGTCTGACCGTAGAAACCTTCCAGTCCAGCTTCAAGCAGATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H971JQ U 1
AF RR2EC57JQ U 1
BS 1 711 RR2EC57JQ

RD RR2H971JQ 309 0 0
GATTGGAAA
TTTTTTTTATTACTAATAAAGCATATCACTATTCTATCACTAATAACTTTTCTTGGATTG
CACGACATGGAAAACAGAGTAAACTATTGTTACATGAAGACTTAGTTTGGAATATTATGA
CCTCCTTTTCTAATTGGTCCATAGCCTCTGGCTCTCTTCCATTTCTCCACATTGATCATC
CTAGCGAAGATTTTGCGAATCAAAGTCAGCTTCCGAGACTGCTGAGCAATGAC*TTAACC
GTTGAGGAGCTTTGGCTGA*TATGATCCCATACCCATCTTGAAGATTATCCATTCC
TTTC

QA 10 305 10 305
DS 

RD RR2EC57JQ 711 0 0
GATTGGAAATTTTTTTTATTACTAATAAAGCATATCACTATTCTATCACTAATAACTTTT
CTTGGATTGCACGACATGGAAAACAGAGTAAACTATTGTTACATGAAGACTTAGTTTGGA
ATATTATGACCTCCTTTTCTAATTGGTCCATAGCCTCTGGCTCTCTTCCATTTCTCCACA
TTGATCATCCTAGCGAAGATTTTGCGAATCAAAGTCAGCTTCCGAGACTGCTGAGCAATG
ACGTTAACCGTTGAGGAGCTTTGGCTGAGTATGATCCCATACCCATCTTGAAAATTATCC
ATTCCGTTTCCCAGAAGTTGCCAGAACAGTCCTCCCGCTGCTGCGCCTCCTCGTTTCGCA
GACTCGTATATCTTGGTATACACGGTGTTGAACACAAGGTCTCTCTGTGCGGGAGAGTAG
CCTGCTTTCTTCATTGATTTACCAAACTCTGCTATGATTATGGGTTTGTGAAGAACGTTC
TGAGCGTCTTGGATGTGTGCGTCCACCCATCTGTTTAAGAACTCCATTTGGGATTGCTCG
CTTGCGTCTACAAACCATTCGTCGGGGTAAGAGTGAGCCGTGACGAAATCAATGCCAGGT
ATGCGGTTATTGGCTATGAAATCGGTTCCAAACTGGCCTGGTGGGTTCAGAGTCTTGCTT
TGTGGTGACGTCTGACCGTAGAAACCTTCCAGTCCAGCTTCAAGCAGATGG

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL3433Contig1 398 2 7 U
GGACTGTAATCGTTCACTAAACCCTCGTACTCATCGCCAATCTTCTAGATCTAACTCTCG
AATCGAACCATGGCCACTATCACCGTCGTTAAGGCTAGGCAGATCTTCGACAGCCGTGGC
AACCCCACCGTCGAGGTTGATGTACACACATCCACTGGTGTCAAGGTCACAGCAGCTGTT
CCTAGTGGAGCTTCCACTGGTATCTACGAGGCTCTTGAGCTTAGGGATGGAGGATCTGAC
TACCTTGGAAAGGGTGTCTCTAAGGCTGTTGGCAATGTGAACAACATCATCGGCCCAGCA
TTGATTGGAAAGGACCCAACTCAGCAGACTGCTATTGACAACTTCATGGTCCATGAACTT
GATGGAACCCAGAACGAGTGGGGTTGGTGCAAGCAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA89TF U 1
AF RR2GP90TF U 188
BS 1 233 RR2HA89TF
BS 234 234 RR2GP90TF
BS 235 257 RR2HA89TF
BS 258 258 RR2GP90TF
BS 259 365 RR2HA89TF
BS 366 366 RR2GP90TF
BS 367 398 RR2HA89TF

RD RR2HA89TF 398 0 0
GGACTGTAATCGTTCACTAAACCCTCGTACTCATCGCCAATCTTCTAGATCTAACTCTCG
AATCGAACCATGGCCACTATCACCGTCGTTAAGGCTAGGCAGATCTTCGACAGCCGTGGC
AACCCCACCGTCGAGGTTGATGTACACACATCCACTGGTGTCAAGGTCACAGCAGCTGTT
CCTAGTGGAGCTTCCACTGGTATCTACGAGGCTCTTGAGCTTAGGGATGGAGGTTCTGAC
TACCTTGGAAAGGGTGTTTCTAAGGCTGTTGGCAATGTGAACAACATCATCGGCCCAGCA
TTGATTGGAAAGGACCCAACTCAGCAGACTGCTATTGACAACTTCATGGTCCATGAACTT
GATGGCACCCAGAACGAGTGGGGTTGGTGCAAGCAGAA

QA 1 398 1 398
DS 

RD RR2GP90TF 197 0 0
GAGCTTCCACTGGTATCTACGAGGCTCTTGAGCTTAGGGATGGTGGATCTGACTACCTTG
GAAAGGGTGTCTCTAAGGCTGTTGGCAATGTGAACAACATCATCGGCCCAGCCTTGATTG
GAAAGGACCCAACTCAGCAGACTGCTATTGACAACTTCATGGTCCATGAACTTGATGGAA
CCCAGAACGAGTGGGG
G

QA 1 196 1 196
DS 



AS 1 3

CO CL3434Contig1 1372 3 15 U
GGCTAGCTCAAAAGAAGTAGCTGAGTCTATTTCAGATAAGTCAGTTTTTCAGCCAGAGCA
TGGCAGTGGAAACGAGACAATGATTATTGGAGAAATGTCTGAGACAAGTCAACCATCTAC
AGAGTGGAAGCCTATTGAGAAGGATCTTTACTTGAAGGGAGTCGAAATGTTTGGGAGAAA
CAGCTGTCTTATTGCAAGAAACCTGCTTTCTGGCTTGAAGACATGCCTAGATGTCTCCAG
TTACATGCGTGAAAACGAAGTTTCAGTCATTCGGAGGTCTAGCACTCCAAATTTGCTGTT
GGATGATGACAGGACTGACGTAGGGAATGAGGATGATGAGGTGCCTCCAAGGACAAGATT
GTTCCGTAGAAAAGGCAAAGCCCGGAAGCTGAAATACTCTACAAAGTCAGCTGGTCATCC
ATCTGTCTGGAAAAGAATAGCCGGAGGCAAAAACCAGTCATGTAAGCAATACACACCATG
TGGATGCCAGTCAATGTGCGGAAAGGAATGCCCTTGTCTAACTAATGAAACTTGCTGCGA
GAAATATTGCGGGTGCTCAAAAAGTTGCAAAAACCGTTTCAGAGGATGTCATTGTGCAAA
GAGTCAATGCAGAAGCACGCAGTGTCCGTGCTTTGCCGCTGGCAGAGAATGCGATCCAGA
TGTTTGCAGGAACTGCTGGGTTAGTTGCGGAGATGGTTCTCTGGGAGAAGCACCAAGACG
CGGAGAAGGCCAATGCGGAAACATGAGACTTCTCCTGAGGCAACAACAGAGGATCCTCTT
GGGTAAGTCTGATGTTGCTGGATGGGGTGCGTTTCTAAAGAACTCGGTGAGCAAAAATGA
GTATCTCGGAGAGTACACTGGCGAATTGATCTCACACCGTGAGGCGGATAAGCGTGGGAA
AATATACGACCGTGCAAATTCTTCCTTCCTCTTTGACTTGAATGATCAGTTCGTCCTCGA
TGCTCAACGTAAAGGAGACAAGCTGAAATTTGCCAATCACTCAGCTAAACCCAACTGCTA
CGCTAAGGTAATGTTTGTGGCAGGAGACCACAGGGTGGGAATATTTGCAAACGAGCGTAT
AGAAGCGAGTGAGGAGCTTTTCTATGACTACAGATATGGACCAGACCAAGCACCAGCTTG
GGCTCGCAAACCTGAAGGCTCTTCTAAGAAAGATGATTCATCCATTACTCATCGTCGAGC
CAGAAAGCACCAATCTCATTGACTTTAAAGGCTAAATGTTAAAAGATCATATGTAAGATA
TGATATTGAAGTTAACCTTTTATTTTCAAGTTGGAACTTTGATCTATTGTATAGGAGAAG
GAGACTTGCAGTTTATGAATTATTGGGGTCGGTAAGGATAATTAACAGCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD25TF U 1
AF RR2FW84TF U 339
AF RR2DD25JQ C 683
BS 1 669 RR2DD25TF
BS 670 670 RR2FW84TF
BS 671 686 RR2DD25TF
BS 687 720 RR2FW84TF
BS 721 721 RR2DD25JQ
BS 722 892 RR2FW84TF
BS 893 893 RR2DD25JQ
BS 894 1024 RR2FW84TF
BS 1025 1025 RR2DD25JQ
BS 1026 1043 RR2FW84TF
BS 1044 1044 RR2DD25JQ
BS 1045 1121 RR2FW84TF
BS 1122 1122 RR2DD25JQ
BS 1123 1141 RR2FW84TF
BS 1142 1372 RR2DD25JQ

RD RR2DD25TF 686 0 0
GGCTAGCTCAAAAGAAGTAGCTGAGTCTATTTCAGATAAGTCAGTTTTTCAGCCAGAGCA
TGGCAGTGGAAACGAGACAATGATTATTGGAGAAATGTCTGAGACAAGTCAACCATCTAC
AGAGTGGAAGCCTATTGAGAAGGATCTTTACTTGAAGGGAGTCGAAATGTTTGGGAGAAA
CAGCTGTCTTATTGCAAGAAACCTGCTTTCTGGCTTGAAGACATGCCTAGATGTCTCCAG
TTACATGCGTGAAAACGAAGTTTCAGTCATTCGGAGGTCTAGCACTCCAAATTTGCTGTT
GGATGATGACAGGACTGACGTAGGGAATGAGGATGATGAGGTGCCTCCAAGGACAAGATT
GTTCCGTAGAAAAGGCAAAGCCCGGAAGCTGAAATACTCTACAAAGTCAGCTGGTCATCC
ATCTGTCTGGAAAAGAATAGCCGGAGGCAAAAACCAGTCATGTAAGCAATACACACCATG
TGGATGCCAGTCAATGTGCGGAAAGGAATGCCCTTGTCTAACTAATGAAACTTGCTGCGA
GAAATATTGCGGGTGCTCAAAAAGTTGCAAAAACCGTTTCAGAGGATGTCATTGTGCAAA
GAGTCAATGCAGAAGCACGCAGTGTCCGTGCTTTGCCGCTGGCAGAGAATGCGATCCAGA
TGTTTGCAG*AACTGCTGGGTTAGTT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2FW84TF 803 0 0
G
GGTGCCTCCAAGGACAAGATTGTTCCGTAGAAAAGGCAAAGCCCGGAAGCTGAAATACTC
TACAAAGTCAGCTGGTCATCCATCTGTCTGGAAAAGAATAGCCGGAGGCAAAAACCAGTC
ATGTAAGCAATACACACCATGTGGATGCCAGTCAATGTGCGGAAAGGAATGCCCTTGTCT
AACTAATGAAACTTGCTGCGAGAAATATTGCGGGTGCTCAAAAAGTTGCAAAAACCGTTT
CAGAGGATGTCATTGTGCAAAGAGTCAATGCAGAAGCAGGCAGTGTCCGTGCTTTGCCGC
TGGCAGAGAATGCGATCCAGA*GTTTGCAGGAACTGCTGGGTTAGTTGCGGAGATGGTTC
TCTGGGAGAAGCACCAAGACGTGGAGAAGGCCAATGCGGAAACATGAGACTTCTCCTGAG
GCAACAACAGAGGATCCTCTTGGGTAAGTCTGATGTTGCTGGATGGGGTGCGTTTCTAAA
GAACTCGGTGAGCAAAAATGAGTATCTCGGAGAGTACACTGGCGAATTGATCTCACACCG
TGAGGCGGATAAGTGTGGGAAAATATACGACCGTGCAAATTCTTCCTTCCTCTTTGACTT
GAATGATCAGTTCGTCCTCGATGCTCAACGTAAAGGAGACAAGCTGAAATTTGCCAATCA
CTCAGCTAAACCCAACTGCTACGCTGAGGTAATGTTTGTGGCAG*AGACCACAGGGTGGG
AATATTTGCAAACGAGCGTATAGAAGCGAGTGAGGAGCTTTTCTATGACTACAGATATGG
AC*AGACCAAGCACCAGCTTGG

QA 2 803 2 803
DS 

RD RR2DD25JQ 690 0 0
AGTTGCGGAGATGGTTCTCTGGGAGAAGCACCAAGACGCGGAGAAGGCCAATGCGGAAAC
ATGAGACTTCTCCTGAGGCAACAACAGAGGATCCTCTTGGGTAAGTCTGATGTTGCTGGA
TGGGGTGCGTTTCTAAAGAACTCGGTGAGCAAAAATGAGTATCTCGGAGAGTACACTGGC
GAATTGATCTCACACCGTGAGGCGGATAAGCGTGGGAAAATATACGACCGTGCAAATTCT
TCCTTCCTCTTTGACTTGAATGATCAGTTCGTCCTCGATGCTCAACGTAAAGGAGACAAG
CTGAAATTTGCCAATCACTCAGCTAAACCCAACTGCTACGCTAAGGTAATGTTTGTGGCA
GGAGACCACAGGGTGGGAATATTTGCAAACGAGCGTATAGAAGCGAGTGAGGAGCTTTTC
TATGACTACAGATATGGACCAGACCAAGCACCAGCTTGGGCTCGCAAACCTGAAGGCTCT
TCTAAGAAAGATGATTCATCCATTACTCATCGTCGAGCCAGAAAGCACCAATCTCATTGA
CTTTAAAGGCTAAATGTTAAAAGATCATATGTAAGATATGATATTGAAGTTAACCTTTTA
TTTTCAAGTTGGAACTTTGATCTATTGTATAGGAGAAGGAGACTTGCAGTTTATGAATTA
TTGGGGTCGGTAAGGATAATTAACAGCGTC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3436Contig1 773 3 4 U
GGGCCTCATTTCCTGCCAAACCACTGAGCTCTCTAAGTGTGAAAAATGTCGCTGACTCAT
CAGATAGCTTCTTCCATGATGTCTTCTTCCTCATCCACTTTCTTAGCCCCTTCAAGTTTT
AATCTCAGAAGTCGAAATGCGTGTTTACCAATGCCAAAACGGGTCAACACTTGCAAATGC
GTTGCAACCCCACAAGATAAGATTGAATATAAGACAAATGTGTCACGGAATTCGAACATG
TCAAAACTCCAGGCTGGTTACCTCTTCCCAGAGATTGCAAGAAGAAGGTCTGCACATTTG
CTGAAGTACCCAGATGCGCAAATTATCAGTCTTGGGATAGGTGACACAACTGAGCCAATT
CCAGAAGTGATCACTTCTGCAATGGCAAAGAAAGCTCATGAGTTGTCCACAGTAGAGGGA
TATAGTGGTTATGGTGCCGAACAAGGTGCAAAGCCACTGAGAGCTGCTCTTGCCAAAACA
TACTACAGTGGCCTTGGCATAGGTGAAGATGACATCTTCGTTTCTGATGGTGCCAAATGT
GATATCTCACGTCTCCAGGTTATGTTTGGTTCCAATGTTACAGTTGCTGTTCAAGATCCT
TCATATCCGGCTTATGTCGACTCCAGTGTTATTATGGGTCAGACGGGACA*TTTAACACA
GACGTGCAGAAGTATGGAAACATCGAGTACATGAGATGCACTCCAGAGAACGGCTTCTTC
CCAGACTTATCCACTGTTGGCAGGACGGACATCATTTTCTTCTGTTCCCCAAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN65TF U 1
AF RR2CS27TF U 2
AF RR2BN65JQ C 54
BS 1 653 RR2BN65TF
BS 654 654 RR2CS27TF
BS 655 700 RR2BN65TF
BS 701 773 RR2BN65JQ

RD RR2BN65TF 702 0 0
GGGCCTCATTTCCTGCCAAACCACTGAGCTCTCTAAGTGTGAAAAATGTCGCTGACTCAT
CAGATAGCTTCTTCCATGATGTCTTCTTCCTCATCCACTTTCTTAGCCCCTTCAAGTTTT
AATCTCAGAAGTCGAAATGCGTGTTTACCAATGCCAAAACGGGTCAACACTTGCAAATGC
GTTGCAACCCCACAAGATAAGATTGAATATAAGACAAATGTGTCACGGAATTCGAACATG
TCAAAACTCCAGGCTGGTTACCTCTTCCCAGAGATTGCAAGAAGAAGGTCTGCACATTTG
CTGAAGTACCCAGATGCGCAAATTATCAGTCTTGGGATAGGTGACACAACTGAGCCAATT
CCAGAAGTGATCACTTCTGCAATGGCAAAGAAAGCTCATGAGTTGTCCACAGTAGAGGGA
TATAGTGGTTATGGTGCCGAACAAGGTGCAAAGCCACTGAGAGCTGCTCTTGCCAAAACA
TACTACAGTGGCCTTGGCATAGGTGAAGATGACATCTTCGTTTCTGATGGTGCCAAATGT
GATATCTCACGTCTCCAGGTTATGTTTGGTTCCAATGTTACAGTTGCTGTTCAAGATCCT
TCATATCCGGCTTATGTCGACTCCAGTGTTATTATGGGTCAGACGGGACA*TT*AACACA
GACGTGCAGAAGTATGGAAACATCGAGTACATGAGATGCA
CT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2CS27TF 699 0 0
GGCCTCATTTCCTGCCAAACCACTGAGCTCTCTAAGTGTGAAAAATGTCGCTGACTCATC
AGATAGCTTCTTCCATGATGTCTTCTTCCTCATCCACTTTCTTAGCCCCTTCAAGTTTTA
ATCTCAGAAGTCGAAATGCGTGTTTACCAATGCCAAAACGGGTCAACACTTGCAAATGCG
TTGCAACCCCACAAGATAAGATTGAATATAAGACAAATGTGTCACGGAATTCGAACATGT
CAAAACTCCAGGCTGGTTACCTCTTCCCGGAGATTGCAAGAAGAAGGTCTGCACATTTGC
TGAAGTACCCAGATGCGCAAATTATCAGTCTTGGGATAGGTGACACAACTGAGCCAATTC
CAGAAGTGATCACTTCTGCAATGGCAAAGAAAGCTCATGAGTTGTCCACAGTAGAGGGAT
ATAGTGGTTATGGTGCCGAACAAGGTGCAAAGCCACTGAGAGCTGCTCTTGCCAAAACAT
ACTACAGTGGCCTTGGCATAGGTGAAGATGACATCTTCGTTTCTGATGGTGCCAAATGTG
ATATCTCACGTCTCCAGGTTATGTTTGGTTCCAATGTTACAGTTGCTGTTCAAGATCCTT
CATATCCGGCTTATGTCGACTCCAGTGTTATTATGGGTCAGACGGGACA*TTTAACACAG
ACGTGCAGAAGTATGGAAACATCGAGTACATGAGATGCA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2BN65JQ 720 0 0
GACTCATCAGATAGCTTCTTCCATGATGTCTTCTTCCTCATCCACTTTCTTAGCCCCTTC
AAGTTTTAATCTCAGAAGTCGAAATGCGTGTTTACCAATGCCAAAACGGGTCAACACTTG
CAAATGCGTTGCAACCCCACAAGATAAGATTGAATATAAGACAAATGTGTCACGGAATTC
GAACATGTCAAAACTCCAGGCTGGTTACCTCTTCCCAGAGATTGCAAGAAGAAGGTCTGC
ACATTTGCTGAAGTACCCAGATGCGCAAATTATCAGTCTTGGGATAGGTGACACAACTGA
GCCAATTCCAGAAGTGATCACTTCTGCAATGGCAAAGAAAGCTCATGAGTTGTCCACAGT
AGAGGGATATAGTGGTTATGGTGCCGAACAAGGTGCAAAGCCACTGAGAGCTGCTCTTGC
CAAAACATACTACAGTGGCCTTGGCATAGGTGAAGATGACATCTTCGTTTCTGATGGTGC
CAAATGTGATATCTCACGTCTCCAGGTTATGTTTGGTTCCAATGTTACAGTTGCTGTTCA
AGATCCTTCATATCCGGCTTATGTCGACTCCAGTGTTATTATGGGTCAGACGGGACAATT
TAACACAGACGTGCAGAAGTATGGAAACATCGAGTACATGAGATGCACTCCAGAGAACGG
CTTCTTCCCAGACTTATCCACTGTTGGCAGGACGGACATCATTTTCTTCTGTTCCCCAAA

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL3437Contig1 675 2 6 U
GGAAACCAAAGCTTCTTCTTCAATCTCATAGCCTCACGTCGTCGTCGCCGGACTTGTAGC
TTGTTTTGGTGGAAGATAACGCTATTTCACTTCTTCAACTGTGCGATTCTCACCTTCGGT
CCCCACGCCGTCTACTACTCCGCCACTCCATTATCTGAATATGACACTCTTGGAACCTCC
GTGAAGGCTGCTGTTGTTTACCTAGCTACAGCCCTGGTTAAGCTTGTTTGCTTGGCAACT
TTTCTGCAAGTCTCTGAGACTGAAGTATTTGATCCTTACCAGGAAGCACTGAAAGCAATG
ATTGGCTTCATTGATGTCGCTGGTCTGTACTTTGCTCTGGCTCAGCTGACACACAGGAAC
ATCTCTCAAAACCATAAGTTTCAAGCTGTTGGCCTTGGATGGGCATTTGCGGATTCTGTT
TTGCATAGGTTGGCTCCTCTTTGGGTTGGTGCTCGAGGACTTGAGTTCACCTGGGATTAT
GTTTTGCAAGGGCTTGAAGCCAATGCAAATCTGGTGTTTACTATATCTTTAGCTGCGCTA
GGATCGTTGATTTGGCTACGCAAGAACAAGCCAAAGACTCTGATCCCCATCATATACACG
TGTGCAGTGATCATCGCTACAATGCCTTCAATCACGAGCTATCTAAGAGAGTCATGGGAT
GGCATTCCCCAAAGT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G114TF U 1
AF RR2CG76TF U 2
BS 1 77 RR2G114TF
BS 78 78 RR2CG76TF
BS 79 279 RR2G114TF
BS 280 280 RR2CG76TF
BS 281 528 RR2G114TF
BS 529 675 RR2CG76TF

RD RR2G114TF 528 0 0
GGAAACCAAAGCTTCTTCTTCAATCTCATAGCCTCACGTCGTCGTCGCCGGACTTGTAGC
TTGTTTTGGTGGAAGATGACGCTATTTCACTTCTTCAACTGTGCGATTCTCACCTTCGGT
CCCCACGCCGTCTACTACTCCGCCACTCCATTATCTGAATATGACACTCTTGGAACCTCC
GTGAAGGCTGCTGTTGTTTACCTAGCTACAGCCCTGGTTAAGCTTGTTTGCTTGGCAACT
TTTCTGCAAGTCTCTGAGACTGAAGTATTTGATCCTTACTAGGAAGCACTGAAAGCAATG
ATTGGCTTCATTGATGTCGCTGGTCTGTACTTTGCTCTGGCTCAGCTGACACACAGGAAC
ATCTCTCAAAACCATAAGTTTCAAGCTGTTGGCCTTGGATGGGCATTTGCGGATTCTGTT
TTGCATAGGTTGGCTCCTCTTTGGGTTGGTGCTCGAGGACTTGAGTTCACCTGGGATTAT
GTTTTGCAAGGGCTTGAAGCCAATGCAAATCTGGTGTTTACTATATCT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2CG76TF 674 0 0
GAAACCAAAGCTTCTTCTTCAATCTCATAGCCTCACGTCGTCGTCGCCGGACTTGTAGCT
TGTTTTGGTGGAAGATAACGCTATTTCACTTCTTCAACTGTGCGATTCTCACCTTCGGTC
CCCACGCCGTCTACTACTCCGCCACTCCATTATCTGAATATGACACTCTTGGAACCTCCG
TGAAGGCTGCTGTTGTTTACCTAGCTACAGCCCTGGTTAAGCTTGTTTGCTTGGCAACTT
TTCTGCAAGTCTCTGAGACTGAAGTATTTGATCCTTACCAGGAAGCACTGAAAGCAATGA
TTGGCTTCATTGATGTCGCTGGTCTGTACTTTGCTCTGGCTCAGCTGACACGCAGGAACA
TCTCTCAAAACCATAAGTTTCAAGCTGTTGGCCTTGGATGGGCATTTGCGGATTCTGTTT
TGCATAGGTTGGCTCCTCTTTGGGTTGGTGCTCGAGGACTTGAGTTCACCTGGGATTATG
TTTTGCAAGGGCTTGAAGCCAATGCAAATCTGGTGTTTACTATATCTTTAGCTGCGCTAG
GATCGTTGATTTGGCTACGCAAGAACAAGCCAAAGACTCTGATCCCCATCATATACACGT
GTGCAGTGATCATCGCTACAATGCCTTCAATCACGAGCTATCTAAGAGAGTCATGGGATG
GCATTCCCCAAAGT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL3438Contig1 1426 2 2 U
GATGATACACATTCACGCACACAAGATCTGTTAGAGTTAAACTCTTATTTTGGGATGAAA
CCTACACAAGTACATCTCTTAAAACAGGAAAAAGTTGCATGTCTTGATGACAATGATGCT
AGACTTGCGTTAGACTCCAACAACAAATACAAGATCCAGACAAAGCCTCATGGTCATGGC
GATGTACATTCGCTTCTCTATACCAGTGGTCTTCTTGATAAATGGCTCGATGCTGGTCTA
AAATGGGTTTTGTTTTTCCAAGATACAAATGGACTTCTCTTCAATGCAATTCCAGCTTCT
TTGGGTGTGAGTGCTACTAAACAGTATCATGTTAACTCTCTGGCTGTTCCCCGCAAGGCG
AAAGAAGCTATTGGAGGCATTACTAAACTTACACATGCTGATGGCAGATCTATGGTGATC
AATGTGGAGTATAATCAACTTGATCCTCTACTTAGAGCATCTGGATTCCCTGATGGGGAT
GGTAATTGTGAGACAGGCTATTCCCCTTTCCCTGGAAATATTAATCAATTGATTCTTGAA
CTTGGTCCATACAAAGAAGAGTTGCAGAAAACTGGAGGGGCCATTAAGGAGTTTGTTAAT
CCAAAATACAAGGATAGCACCAAGACATCATTTAAATCCTCAACTCGTCTAGAGTGTATG
ATGCAAGATTATCCAAAGACATTGCCACCTACAGCACGTGTTGGATTCACGGTGATGGAT
ATATGGCTTGCTTATGCTCCCGTTAAGAATAACCCTGAGGATGCTGCTAAGGTACCAAAA
GGAAACCCATACCACAGTGCAACTTCTGGAGAAATGGCCATTTATCGTGCTAACAGCCGT
ATTCTTCAAAAGGCTGGTGTCAAAGTGGAAGAGCCTGTGAAGCAGGTCTTGAACGGCCAA
GAAGTTGAAGTATGGTCTCGTATCACATGGAAACCCAAATGGGGAATGATCTTTTCTGAT
ATCAAAACGAAAGTCAGTGGGAACTGCGAGATCTTTCAGAGATCCACAATGGCTATCAAG
GGTCATAATGTGTTCATTGAAAATCTCTCCCTGGATGGTGCTCTTATTGTAGACTCCATT
GATGATGCAGAGGTAAAACTTGGAGGCTCGATCAAGAACAATGGTTGGACCATGGAAACT
GTAGACTACAAGGACACATCGGTTCCAGAGGAAATAAGAATCAGAGGTTTTAGATTCGAC
AAAGTGGAGCAACTCGAAAAGAAGTTCACTCAACCTGGGAAATTTTCTCTGGAGGATTAA
AAAAAGTTAGCAAATTTGGAAACGCCAAATGATCTATTGTTCCTTCTTTTACACCTTCAT
TCATCCAACGAGACATGTTTTCTTTACGATATTTACTTTAATGTTCATTTACTAACGATA
TTCAATATTTGATTTTATGGTCTTATGAAACATACTGGCCGGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A684TF U 1
AF RR2A684JQ C 623
BS 1 767 RR2A684TF
BS 768 1426 RR2A684JQ

RD RR2A684TF 767 0 0
GATGATACACATTCACGCACACAAGATCTGTTAGAGTTAAACTCTTATTTTGGGATGAAA
CCTACACAAGTACATCTCTTAAAACAGGAAAAAGTTGCATGTCTTGATGACAATGATGCT
AGACTTGCGTTAGACTCCAACAACAAATACAAGATCCAGACAAAGCCTCATGGTCATGGC
GATGTACATTCGCTTCTCTATACCAGTGGTCTTCTTGATAAATGGCTCGATGCTGGTCTA
AAATGGGTTTTGTTTTTCCAAGATACAAATGGACTTCTCTTCAATGCAATTCCAGCTTCT
TTGGGTGTGAGTGCTACTAAACAGTATCATGTTAACTCTCTGGCTGTTCCCCGCAAGGCG
AAAGAAGCTATTGGAGGCATTACTAAACTTACACATGCTGATGGCAGATCTATGGTGATC
AATGTGGAGTATAATCAACTTGATCCTCTACTTAGAGCATCTGGATTCCCTGATGGGGAT
GGTAATTGTGAGACAGGCTATTCCCCTTTCCCTGGAAATATTAATCAATTGATTCTTGAA
CTTGGTCCATACAAAGAAGAGTTGCAGAAAACTGGAGGGGCCATTAAGGAGTTTGTTAAT
CCAAAATACAAGGATAGCACCAAGACATCATTTAAATCCTCAACTCGTCTAGAGTGTATG
ATGCAAGATTATCCAAAGACATTGCCACCTACAGCACGTGTTGGATTCACGGTGATGGAT
ATATGGCTTGCTTATGCTCCCGTTAAGAATAACCCTGAGGATGCTGC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2A684JQ 804 0 0
AGACATCATTTAAATCCTCAACTCGTCTAGAGTGTATGATGCAAGATTATCCAAAGACAT
TGCCACCTACAGCACGTGTTGGATTCACGGTGATGGATATATGGCTTGCTTATGCTCCCG
TTAAGAATAACCCTGAGGATGCTGCTAAGGTACCAAAAGGAAACCCATACCACAGTGCAA
CTTCTGGAGAAATGGCCATTTATCGTGCTAACAGCCGTATTCTTCAAAAGGCTGGTGTCA
AAGTGGAAGAGCCTGTGAAGCAGGTCTTGAACGGCCAAGAAGTTGAAGTATGGTCTCGTA
TCACATGGAAACCCAAATGGGGAATGATCTTTTCTGATATCAAAACGAAAGTCAGTGGGA
ACTGCGAGATCTTTCAGAGATCCACAATGGCTATCAAGGGTCATAATGTGTTCATTGAAA
ATCTCTCCCTGGATGGTGCTCTTATTGTAGACTCCATTGATGATGCAGAGGTAAAACTTG
GAGGCTCGATCAAGAACAATGGTTGGACCATGGAAACTGTAGACTACAAGGACACATCGG
TTCCAGAGGAAATAAGAATCAGAGGTTTTAGATTCGACAAAGTGGAGCAACTCGAAAAGA
AGTTCACTCAACCTGGGAAATTTTCTCTGGAGGATTAAAAAAAGTTAGCAAATTTGGAAA
CGCCAAATGATCTATTGTTCCTTCTTTTACACCTTCATTCATCCAACGAGACATGTTTTC
TTTACGATATTTACTTTAATGTTCATTTACTAACGATATTCAATATTTGATTTTATGGTC
TTATGAAACATACTGGCCGGTTTC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 3

CO CL3439Contig1 770 3 7 U
GGGAGAGAGATAGAAAATGTCAGTGCCACTCAAATTAACGTCTTCCATGTCATCTACTCA
ATCTCAATCTTCATATTCACAAACATCAAGCTCTGTGAAACTCAAGTCCCTGATTCAAAC
TCTCATCATCTCTCAAGTTTGTCGACTAATCCGCAAAATCTACAGAGCTTCGTCCATTCT
TGTTAGAGTCTTGAGGAAGAAGCAATACAGTCTCTTGGCAATGCCTTCTTCGTTCTACCC
AAAAAGAGCCTCAAAGAAACAAAAGAGTAATATATTCTTCGGCTCCTTCAGACTTCACTA
CAACTTTTGCTCTTCTCACGTGGTGCCTGTCTCTGCGCCGGTACGTCTCCCTGAGTAACT
CTACTTGGCACATCTCCAACACGACTCTACTTGGGAGTCAATAATGCATTCGACTGAGTC
GATGGATGATGATGATGATATTCAAGAACCATCTCAGCTCTTTAGCTATCTAAAACAGCT
AGAGGACGATAAAGTGATTAACACAAAAGAAGAAAAAGAAGAAGGGAAAGAGATGAAGAT
GATGAATGAGATCGATAAATTGGCTGATATGTTTATAGCATATAGTCATGAGAAATTCAT
GTTGGAGAAGGTTGATTCGTACAGGAGATTCCAAGAAACGCTGAATACTAGCAGTTGATT
GATGATTATGAATGGACCCCTTTGCATCTTTCATTTCTTTTTATGTAATTTCACTTTTCC
TTCTTTTTTCTTTTGAATTCCTTCCTGGTGTTCTAATTATCTGGAAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F405TF U 1
AF RR2BP69TF U 15
AF RR2F405JQ C 115
BS 1 65 RR2F405TF
BS 66 66 RR2BP69TF
BS 67 607 RR2F405TF
BS 608 610 RR2BP69TF
BS 611 611 RR2F405JQ
BS 612 690 RR2BP69TF
BS 691 770 RR2F405JQ

RD RR2F405TF 607 0 0
GGGAGAGAGATAGAAAATGTCAGTGCCACTCAAATTAACGTCTTCCATGTCATCTACTCA
ATCTCCATCTTCATATTCACAAACATCAAGCTCTGTGAAACTCAAGTCCCTGATTCAAAC
TCTCATCATCTCTCAAGTTTGTCGACTAATCCGCAAAATCTACAGAGCTTCGTCCATTCT
TGTTAGAGTCTTGAGGAAGAAGCAATACAGTCTCTTGGCAATGCCTTCTTCGTTCTACCC
AAAAAGAGCCTCAAAGAAACAAAAGAGTAATATATTCTTCGGCTCCTTCAGACTTCACTA
CAACTTTTGCTCTTCTCACGTGGTGCCTGTCTCTGCGCCGGTACGTCTCCCTGAGTAACT
CTACTTGGCACATCTCCAACACGACTCTACTTGGGAGTCAATAATGCATTCGACTGAGTC
GATGGATGATGATGATGATATTCAAGAACCATCTCAGCTCTTTAGCTATCTAAAACAGCT
AGAGGACGATAAAGTGATTAACACAAAAGAAGAAAAAGAAGAAGGGAAAGAGATGAAGAT
GATGAATGAGATCGATAAATTGGCTGATATGTTTATAGCATATAGTCATGAGAAATTCAT
GTTGGAG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2BP69TF 676 0 0
AAATGTCAGTGCCACTCAAATTAACGTCTTCCATGTCATCTACTCAATCTCAATCTTCAT
TTTCACAAACATCAAGCTCTGTGAAACTCAAGTCCCTGGTTCAAACTCTCATCATCTCTC
AAGTTTGTCGACTAATCCGCAAAATCTATAGAGCTTCGTCCATTCTTGTTAGAGTCTTGA
GGAAGAAGCAATACAATCTCTTGTCAATGCCTTCTTCGTTCTACCCAAAAAGAGCCTCAA
AGAAACAAAAGAGTAATATATTCTTCGGCTCCTTCAGACTTCACTACAACTTTTGCTCTT
CTCACGTGGTGCCTGTCTCTGCGCCGGTACGTCTCCCTGAGGGACTCTACTTGGCACATC
TCCAACACGACTCTACTTGGGAGTCAATAATGCATTCGACTGAGTCGATGGATGATGATG
AT***ATTCAAGAACCATCTCAGCTCTTTAGCTATCTAAAACAGCTAGAGGACGATAAAG
CGATTGACACAAAAGAAGAAAAAGAAGAAGGGAAAGAGATGAAGATGATGAATGAGATCG
ATAAATTGGCTGATATGTTTATAGCCTATAGTCATGAGAAATTCATGTTGGAGAAG*TTG
ATTCGTACAGGAGATTCCAAGAAACGCTGAATACTAGCAGTTGATTGATGATTATGAATG
GACCCCTTTGCATCTT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2F405JQ 656 0 0
TCAAACTCTCATCATCTCTCAAGTTTGTCGACTAATCCGCAAAATCTACAGAGCTTCGTC
CATTCTTGTTAGAGTCTTGAGGAAGAAGCAATACAGTCTCTTGGCAATGCCTTCTTCGTT
CTACCCAAAAAGAGCCTCAAAGAAACAAAAGAGTAATATATTCTTCGGCTCCTTCAGACT
TCACTACAACTTTTGCTCTTCTCACGTGGTGCCTGTCTCTGCGCCGGTACGTCTCCCTGA
GTAACTCTACTTGGCACATCTCCAACACGACTCTACTTGGGAGTCAATAATGCATTCGAC
TGAGTCGATGGATGATGATGATGATATTCAAGAACCATCTCAGCTCTTTAGCTATCTAAA
ACAGCTAGAGGACGATAAAGTGATTAACACAAAAGAAGAAAAAGAAGAAGGGAAAGAGAT
GAAGATGATGAATGAGATCGATAAATTGGCTGATATGTTTATAGCATATAGTCATGAGAA
ATTCATGTTGGAGAAGGTTGATTCGTATAGGAGATTCCAAGAAACGCTGAATACTAGCAG
TTGATTGATGATTATGAATGGACCCCTTTGCATCTTTCATTTCTTTTTATGTAATTTCAC
TTTTCCTTCTTTTTTCTTTTGAATTCCTTCCTGGTGTTCTAATTATCTGGAAATGT

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL3440Contig1 602 2 2 U
GGTACATCCACAAGCCTGGCAAGATTGGGATTGTCTCTCGGTCTGGAACACTGACATATG
AAGCTGTTTTCCAAACAACTGCAGTTGGTCTGGGCCAATCTACTTGTGTAGGAATTGGTG
GAGATCCTTTTAATGGGACCAACTTTGTCGACTGCTTAGAGAAATTCTTTGTTGATCCTC
AAACAGAAGGTGTCGTTCTCATTGGAGAAATTGGAGGCACTGCAGAAGAAGATGCTGCAG
CTTTGATAAAAGAAAGTGGTACTGATAAGCCTGTTGTTGCTTTTATTGCTGGACTCACTG
CACCACCGGGTCGTCGAATGGGTCATGCAGGAGCCATTGTTTCCGGTGGCAAAGGTACAG
CTCAGGACAAGATTAAGAGCTTAAATGATGCAGGAGTGAAGGTTGTTGAATCTCCAGCTA
AAATAGGAGCGGCCATGTATGATCTCTTCAAAGAAAGAGGTCTTTTTGAAGCAGTGAAGT
GAATTTCACTTGCTCACTTTTTTTTCTTTCCATCTTGAAACCTTTCAAGAAGTAAACAAA
AAAGAAACGTAAGCCCTCGCCATTGATGGGTTGCACACCATTTTAGGGTTGTTTTTCTAA
AT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2H191TF U 1
AF RR2H191JQ C 1
BS 1 543 RR2H191TF
BS 544 602 RR2H191JQ

RD RR2H191TF 543 0 0
GGTACATCCACAAGCCTGGCAAGATTGGGATTGTCTCTCGGTCTGGAACACTGACATATG
AAGCTGTTTTCCAAACAACTGCAGTTGGTCTGGGCCAATCTACTTGTGTAGGAATTGGTG
GAGATCCTTTTAATGGGACCAACTTTGTCGACTGCTTAGAGAAATTCTTTGTTGATCCTC
AAACAGAAGGTGTCGTTCTCATTGGAGAAATTGGAGGCACTGCAGAAGAAGATGCTGCAG
CTTTGATAAAAGAAAGTGGTACTGATAAGCCTGTTGTTGCTTTTATTGCTGGACTCACTG
CACCACCGGGTCGTCGAATGGGTCATGCAGGAGCCATTGTTTCCGGTGGCAAAGGTACAG
CTCAGGACAAGATTAAGAGCTTAAATGATGCAGGAGTGAAGGTTGTTGAATCTCCAGCTA
AAATAGGAGCGGCCATGTATGATCTCTTCAAAGAAAGAGGTCTTTTTGAAGCAGTGAAGT
GAATTTCACTTGCTCACTTTTTTTTCTTTCCATCTTGAAACCTTTCAAGAAGTAAACAAA
AAA

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2H191JQ 602 0 0
GGTACATCCACAAGCCTGGCAAGATTGGGATTGTCTCTCGGTCTGGAACACTGACATATG
AAGCTGTTTTCCAAACAACTGCAGTTGGTCTGGGCCAATCTACTTGTGTAGGAATTGGTG
GAGATCCTTTTAATGGGACCAACTTTGTCGACTGCTTAGAGAAATTCTTTGTTGATCCTC
AAACAGAAGGTGTCGTTCTCATTGGAGAAATTGGAGGCACTGCAGAAGAAGATGCTGCAG
CTTTGATAAAAGAAAGTGGTACTGATAAGCCTGTTGTTGCTTTTATTGCTGGACTCACTG
CACCACCGGGTCGTCGAATGGGTCATGCAGGAGCCATTGTTTCCGGTGGCAAAGGTACAG
CTCAGGACAAGATTAAGAGCTTAAATGATGCAGGAGTGAAGGTTGTTGAATCTCCAGCTA
AAATAGGAGCGGCCATGTATGATCTCTTCAAAGAAAGAGGTCTTTT*GAAGCAGTGAAGT
GAATTTCACTTGCTCACTTTTTTTTCTTTCCATCTTGAAACCTTTCAAGAAGTAAACAAA
AAAGAAACGTAAGCCCTCGCCATTGATGGGTTGCACACCATTTTAGGGTTGTTTTTCTAA
AT

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL3441Contig1 939 2 2 U
TGAGGAGTAAGTAAGCACGAAAGCATTTATTCACTATGTTCTCCTCTTCGAAACTGCAAC
CGCCCAAACCTGCAATCTTCCCAAATCCGATTTTCAAACAAGGATTCATCGGCAAAAGTC
CTCCGTTCCGCCGCCGGTACACTCTCCGGCGAGCCTCTCTGCGATTATTCGCCAAGGTTT
CGGACTCAATCGCGTCTCCGTCGCACTCGAATCCGCATGAATCTTCCGAATCGTCATCCC
GTCTGACCTCTTCCGTTGGACAACCTCCTCTCCAGCTCTCTCAATGGACGCTCACGCCGC
AGAGACACTTCGTCTTGCTCAACGTCGTCGCTTGCGTTACGGCGATCTCAGCATCATGGC
TATTCTTAGCTGCGATTCCTACTCTTCTGGCTTTCAAGAAAGCAGCAGAGTCGCTTGAGA
AGCTTTTGGATGTAACCAGAGAAGAGTTACCCGATACAATGGCTGCTCTTCGCTTATCAG
GGATGGAGATCAGTGACTTAACTATGGAGCTTAGTGATTTAGGCCAAGGCATCACTCAAG
GTGTTAAAAGCTCAACACGGGCTATTCGCGTGGCTGAAGATAGACTAAGGCGGTTTACTA
ACATGAATCCAGGAGGAGGAGGACTTGATGCATCAGACCAAGAGAAAGGAAACAGAACCA
GCGGTGGCTAGAGCAGCGAGGAACTTCAAGGAAGGGATCGTTAAGGGACGTTCTTTATGG
CAATTGTTCTTCACATTCGCTCGCTTCTCCAAAACCGCCACGAGTTATTTGGCGAAGCGA
GTTAAGCAGTAGAAGGTTTATAATCACATCCTTGTTTTTCCCTTTGCCCTTTGACAAAAA
CCGAGTCTAGCTCGAGTCTTGGTAGCTTAAGAATACTCTAGTTTGATGGATATGAAACTA
TGAAGATGATATGAATCATAAGACGTGCATCAAGTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO33TF U 1
AF RR2DO33JQ C 252
BS 1 349 RR2DO33TF
BS 350 939 RR2DO33JQ

RD RR2DO33TF 349 0 0
TGAGGAGTAAGTAAGCACGAAAGCATTTATTCACTATGTTCTCCTCTTCGAAACTGCAAC
CGCCCAAACCTGCAATCTTCCCAAATCCGATTTTCAAACAAGGATTCATCGGCAAAAGTC
CTCCGTTCCGCCGCCGGTACACTCTCCGGCGAGCCTCTCTGCGATTATTCGCCAAGGTTT
CGGACTCAATCGCGTCTCCGTCGCACTCGAATCCGCATGAATCTTCCGAATCGTCATCCC
GTCTGACCTCTTCCGTTGGACAACCTCCTCTCCAGCTCTCTCAATGGACGCTCACGCCGC
AGAGACACTTCGTCTTGCTCAACGTCGTCGCTTGCGTTACGGCGATCTC

QA 1 349 1 349
DS 

RD RR2DO33JQ 688 0 0
TCCGTTGGACAAC*TCCTCTCCAGCTCTCTCAATGGACGCTCACGCCGCAGAGACACTTC
GTCTTGCTCAACGTCGTCGCTTGCGTTACGGCGATCTCAGCATCATGGCTATTCTTAGCT
GCGATTCCTACTCTTCTGGCTTTCAAGAAAGCAGCAGAGTCGCTTGAGAAGCTTTTGGAT
GTAACCAGAGAAGAGTTACCCGATACAATGGCTGCTCTTCGCTTATCAGGGATGGAGATC
AGTGACTTAACTATGGAGCTTAGTGATTTAGGCCAAGGCATCACTCAAGGTGTTAAAAGC
TCAACACGGGCTATTCGCGTGGCTGAAGATAGACTAAGGCGGTTTACTAACATGAATCCA
GGAGGAGGAGGACTTGATGCATCAGACCAAGAGAAAGGAAACAGAACCAGCGGTGGCTAG
AGCAGCGAGGAACTTCAAGGAAGGGATCGTTAAGGGACGTTCTTTATGGCAATTGTTCTT
CACATTCGCTCGCTTCTCCAAAACCGCCACGAGTTATTTGGCGAAGCGAGTTAAGCAGTA
GAAGGTTTATAATCACATCCTTGTTTTTCCCTTTGCCCTTTGACAAAAACCGAGTCTAGC
TCGAGTCTTGGTAGCTTAAGAATACTCTAGTTTGATGGATATGAAACTATGAAGATGATA
TGAATCATAAGACGTGCATCAAGTTCCT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 3

CO CL3442Contig1 781 3 6 U
GAAAAAGGTAAAACCTTGAGAATCTGTATTTAAGATGATACACCATTCTAAGATAGCAGT
GCTTTTAAGTTATTACAACCATTTAAGATTTAAATACATTCACAAATATAATATTAACAA
AGGCTATTAACGAAGAGATATTTGTCTAAGCAGATTTGGCGAATCCAACTCTTGCTTTCC
CATAATCGAACACAGTATGGTATGGTCCCATGAAGATATCACCCAAGATCCAGAGAGGTC
CACGAGGTGGAGGGATGTCCATAGCAGTGAAACCACTGGTGCACTGAGACTGAACTCCAT
CCCCAATCTTGAATATATAATCTTGAGGTGAGAGATCAAAGGGTTTGCCACCAATGTTGA
ATGCGACTATAGGCATCGATGAAACCCTCTCACAGTTCACTGCTGTTTGTTGGTTCGGGT
TTGGTATATGGTCGCATAGCTCAGCAGCATAAGTGAGTATACGATCTTGTGTTTCATTCT
GATTCAATTCACTCTGCATCCACACGGTTGCCATTTCACAAACGCTGCACATTGCTTCGT
TTATAAGATCCGATGTTCCATCATCTACAACTGACTTAATCCCCATACTCTGATCGAAAC
CGCAAAGCCCTATCTGTGAGCATACCTTCCTAGGATCCGTCTGAGATAAAAGGGAGTTCA
GCATGGTTTTTCCATATTGACCTATGACGGTTTTGCACTCTTTGCTTGCGACTCCTACTG
CTCCAATCGCATGATTGATCATTGTGATAACACTCGTTGGACCGGTGAGTAGAGAAGTGC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2E650TF C 7
AF RR2GJ41JQB U 1
AF RR2G803JQ U 14
BS 1 212 RR2GJ41JQB
BS 213 213 RR2G803JQ
BS 214 363 RR2GJ41JQB
BS 364 364 RR2G803JQ
BS 365 770 RR2GJ41JQB
BS 771 781 RR2G803JQ

RD RR2E650TF 312 0 0
GGTAAAA
CCTTGAGAATCTGTATTTAAGATGATACACCATTCTAAGATAGCAGTGCTTTTAAGTTAT
TACAACCATTTAAGATTTAAATACATTCACAAATATAATATTAACAAAAGCTATTAACGA
AGAGATATTTGTCTAAGCAGATTTGGCGAATCCAACTCTTGCTTTCCCATAATCGAACAC
AGTATGGTATGGTCCCATGAAGATATCACCCAAGATCCAGAGAGGTCCACGAGGTGGAGG
GATGTCCATAGCAGTGAAACCACTGGTGCACTGAGACTGAACTCCATCCCCAATCTTGAA
TAT
CC

QA 8 310 8 310
DS 

RD RR2GJ41JQB 770 0 0
GAAAAAGGTAAAACCTTGAGAATCTGTATTTAAGATGATACACCATTCTAAGATAGCAGT
GCTTTTAAGTTATTACAACCATTTAAGATTTAAATACATTCACAAATATAATATTAACAA
AGGCTATTAACGAAGAGATATTTGTCTAAGCAGATTTGGCGAATCCAACTCTTGCTTTCC
CATAATCGAACACAGTATGGTATGGTCCCATGGAGATATCACCCAAGATCCAGAGAGGTC
CACGAGGTGGAGGGATGTCCATAGCAGTGAAACCACTGGTGCACTGAGACTGAACTCCAT
CCCCAATCTTGAATATATAATCTTGAGGTGAGAGATCAAAGGGTTTGCCACCAATGTTGA
ATGTGACTATAGGCATCGATGAAACCCTCTCACAGTTCACTGCTGTTTGTTGGTTCGGGT
TTGGTATATGGTCGCATAGCTCAGCAGCATAAGTGAGTATACGATCTTGTGTTTCATTCT
GATTCAATTCACTCTGCATCCACACGGTTGCCATTTCACAAACGCTGCACATTGCTTCGT
TTATAAGATCCGATGTTCCATCATCTACAACTGACTTAATCCCCATACTCTGATCGAAAC
CGCAAAGCCCTATCTGTGAGCATACCTTCCTAGGATCCGTCTGAGATAAAAGGGAGTTCA
GCATGGTTTTTCCATATTGACCTATGACGGTTTTGCACTCTTTGCTTGCGACTCCTACTG
CTCCAATCGCATGATTGATCATTGTGATAACACTCGTTGGACCGGTGAGT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2G803JQ 768 0 0
CCTTGAGAATCTGTATTTAAGATGATACACCATTCTAAGATAGCAGTGCTTTTAAGTTAT
TACAACCATTTAAGATTTAAATACATTCACAAATATAATATTAACAAAGGCTATTAACGA
AGAGATATTTGTCTAAGCAGATTTGGCGAATCCAACTCTTGCTTTCCCATAATCGAACAC
AGTATGGTATGGTCCCATGAAGATATCACCCAAGATCCAGAGAGGTCCACGAGGTGGAGG
GATGTCCATAGCAGTGAAACCACTGGTGCACTGAGACTGAACTCCATCCCCAATCTTGAA
TATATAATCTTGAGGTGAGAGATCAAAGGGTTTGCCACCAATGTTGAATGCGACTATAGG
CATCGATGAAACCCTCTCACAGTTCACTGCTGTTTGTTGGTTCGGGTTTGGTATATGGTC
GCATAGCTCAGCAGCATAAGTGAGTATACGATCTTGTGTTTCATTCTGATTCAATTCACT
CTGCATCCACACGGTTGCCATTTCACAAACGCTGCACATTGCTTCGTTTATAAGATCCGA
TGTTCCATCATCTACAACTGACTTAATCCCCATACTCTGATCGAAACCGCAAAGCCCTAT
CTGTGAGCATACCTTCCTAGGATCCGTCTGAGATAAAAGGGAGTTCAGCATGGTTTTTCC
ATATTGACCTATGACGGTTTTGCACTCTTTGCTTGCGACTCCTACTGCTCCAATCGCATG
ATTGATCATTGTGATAACGCTCGTTGGACCGGTGAGTAGAGAAGTGCC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL3443Contig1 543 2 2 U
GCATGGTAGCACATTTGCAGGGAACCCTCTTGTGTGCAGTACAGCCATCGCTGTTATTGA
TAAAGTATCTAAGCCCTCTTTCTTGTCAAGTGTCGCGAGCAAAGGGCTATACTTCAAGGA
ACTGTTGGTGAAGAAATTAGGAGGGAACTCGCACGTGAAGGAAGTGAGAGGAGAAGGGCT
TATCATAGGAGTGGAGCTTGATGTGCCAGCGAGTCCACTGGTGGATGCTTGCCGTGATTC
AGGTCTTCTGATCCTGACGGCAGGGAAAGGAAACGTTGTCAGGATTGTTCCACCGTTGAT
TATATCGGAAGAGGAGATAGAACGTGCTGTTGAGATTATTTTCCAAAATTTAACTGCTCT
TGGTTGAAGCCTTAAAGGTTGAGCTAGAGAGCACAAGAGCAAATTGTTTATCGACTTTGA
TGTGTCTTTTTAAAAATCTTTACTTGTGTCTTGATTTAAGCTCAAGTGTACTATTGCCTG
TTTGTAAAACTTTCAATGTGATCAAATATGTCCCGCTAGTAACATACCATCAGACATTGT
GAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 

AF RR2GC55TF U 1
AF RR2GC55JQ C 1
BS 1 538 RR2GC55TF
BS 539 543 RR2GC55JQ

RD RR2GC55TF 543 0 0
GCATGGTAGCACATTTGCAGGGAACCCTCTTGTGTGCAGTACAGCCATCGCTGTTATTGA
TAAAGTATCTAAGCCCTCTTTCTTGTCAAGTGTCGCGAGCAAAGGGCTATACTTCAAGGA
ACTGTTGGTGAAGAAATTAGGAGGGAACTCGCACGTGAAGGAAGTGAGAGGAGAAGGGCT
TATCATAGGAGTGGAGCTTGATGTGCCAGCGAGTCCACTGGTGGATGCTTGCCGTGATTC
AGGTCTTCTGATCCTGACGGCAGGGAAAGGAAACGTTGTCAGGATTGTTCCACCGTTGAT
TATATCGGAAGAGGAGATAGAACGTGCTGTTGAGATTATTTTCCAAAATTTAACTGCTCT
TGGTTGAAGCCTTAAAGGTTGAGCTAGAGAGCACAAGAGCAAATTGTTTATCGACTTTGA
TGTGTCTTTTTAAAAATCTTTACTTGTGTCTTGATTTAAGCTCAAGTGTACTATTGCCTG
TTTGTAAAACTTTCAATGTGATCAAATATGTCCCGCTAGTAACATACCATCAGACATT
GTGAC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2GC55JQ 543 0 0
GCATGGTAGCACATTTGCAGGGAACCCTCTTGTGTGCAGTACAGCCATCGCTGTTATTGA
TAAAGTATTTAAGCCCTCTTTCTTGTCAAGTGTCGCGAGCAAAGGGCTATACTTCAAGGA
ACTGTTGGTGAAGAAATTAGGAGGGAACTCGCACGTGAAGGAAGTGAGAGGAGAAGGGCT
TATCATAGGAGTGGAGCTTGATGTGCCAGCGAGTCCACTGGTGGATGCTTGCCGTGATTC
AGGTCTTCTGATCCTGACGGCAGGGAAAGGAAACGTTGTCAGGATTGTTCCACCGTTGAT
TATATCGGAAGAGGAGATAGAACGTGCTGTTGAGATTATTTTCCAAAATTTAACTGCTCT
TGGTTGAAGCCTTAAAGGTTGAGCTAGAGAGCACAAGAGCAAATTGTTTATCGACTTTGA
TGTGTCTTTTTAAAAATCTTTACTTGTGTCTTGATTTAAGCTCAAGTGTACTATTGCCTG
TTTGTAAAACTTTCAATGTGATCAAATATGTCCCGCTAGTAACATACCATCAGACATTGT
GAC

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL3444Contig1 932 2 2 U
GATCTGTCAAGTACACTCGTGGCTCCTTCCTCTGCCCCGGCGGCCAGCCTTTTCCTCACC
GGAGCTTCTCTGAAGAAGTCTCTGTTCTTGATGGTCACTTCTCTAAGCTGGGTTGAACAG
CGTTGCCTACTTGATGGGTAATGATGATGAGACTAAGAAATGGCATGTCTATGCTGCCTC
CTCTGCCCAGTCCTCAAGCAACAACAATGTCTACACGCTCGAGATGTGCATGACTGGTCT
TGACAGGGAGAAGGCTTCTGTCTTCTACAAGAATGAAACTGGGGAGAATGGATCAATGAC
TGACAACTCTGGAATCAGAAAGATCCTCCCCAAGTCCCAGATCTGCGACTTTGAGTTCGA
GCCCTGTGGCTACTCTATGAACTCCATTGAAGGAAATGCAATCTCCACTATCCATGTGAC
CCCTGAGGATGGGTTTAGCTACGCTAGCTTCGAAGCTGTGGGTTATGACTTCAGCACTCT
CGACCTGAGCCAGCTGGTGACGAGGGTTCTGTCTTGCTTTGAGCCAAAGCAATTCTCTGT
GGCCGTGCACTCTAGCGTTGGAGCGAACGCGTACAAGCCTGAGATCAGTGTAGACCTGGA
AGATTATGGATGCAGAGAGAGGACATTTGAGTTTTTAGGAGAAGAGAGTGGGACGGTGAT
GTATCAGACGTTTGAGAAGTTTGGCAAGTACTGTGGATCGCCTAGATTTACCTTGAAGTG
TGAGTGGAGCAGCAACAATAGCTGCAGCAGGGAGGACGAGAAGGACGAGGGAATTTAGCA
GAACTATTTATGAGCTTTTTGTTTTATGCATTTTTTTTTTATTAGTAATGAATAAGGACT
TGTGAAGTTGAGGTACTTTTTTTTTACAAAAGCATGTGTGTTGTTTGTTTCGTACTTTAT
AAGTTTGGGTTTTATTATATGAAAGACTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA48TF U 1
AF RR2HA48JQ C 541
BS 1 632 RR2HA48TF
BS 633 932 RR2HA48JQ

RD RR2HA48TF 634 0 0
GATCTGTCAAGTACACTCGTGGCTCCTTCCTCTGCCCCGGCGGCCAGCCTTTTCCTCACC
GGAGCTTCTCTGAAGAAGTCTCTGTTCTTGATGGTCACTTCTCTAAGCTGGGTTGAACAG
CGTTGCCTACTTGATGGGTAATGATGATGAGACTAAGAAATGGCATGTCTATGCTGCCTC
CTCTGCCCAGTCCTCAAGCAACAACAATGTCTACACGCTCGAGATGTGCATGACTGGTCT
TGACAGGGAGAAGGCTTCTGTCTTCTACAAGAATGAAACTGGGGAGAATGGATCAATGAC
TGACAACTCTGGAATCAGAAAGATCCTCCCCAAGTCCCAGATCTGCGACTTTGAGTTCGA
GCCCTGTGGCTACTCTATGAACTCCATTGAAGGAAATGCAATCTCCACTATCCATGTGAC
CCCTGAGGATGGGTTTAGCTACGCTAGCTTCGAAGCTGTGGGTTATGACTTCAGCACTCT
CGACCTGAGCCAGCTGGTGACGAGGGTTCTGTCTTGCTTTGAGCCAAAGCAATTCTCTGT
GGCCGTGCACTCTAGCGTTGGAGCGAACGCGTACAAGCCTGAGATCAGTGTAGACCTGGA
AGATTATGGATGCAGAGAGAGGACATTTGAGT
CT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2HA48JQ 392 0 0
GGCCGTGCACTCTAGCGTTGGAGCGAACGCGTACAAGCCTGAGATCAGTGTAGACCTGGA
AGATTATGGATGCAGAGAGAGGACATTTGAGTTTTTAGGAGAAGAGAGTGGGACGGTGAT
GTATCAGACGTTTGAGAAGTTTGGCAAGTACTGTGGATCGCCTAGATTTACCTTGAAGTG
TGAGTGGAGCAGCAACAATAGCTGCAGCAGGGAGGACGAGAAGGACGAGGGAATTTAGCA
GAACTATTTATGAGCTTTTTGTTTTATGCATTTTTTTTTTATTAGTAATGAATAAGGACT
TGTGAAGTTGAGGTACTTTTTTTTTACAAAAGCATGTGTGTTGTTTGTTTCGTACTTTAT
AAGTTTGGGTTTTATTATATGAAAGACTATAT

QA 1 392 1 392
DS 



AS 1 2

CO CL3445Contig1 835 2 6 U
AGGGAGTGAAGCATATGGTATTGGTAATCTTGATATGTTCAATTTTATGTTAAAAATGAC
GTCTTAAATGTCACAACAACAACTCCACAAGTCTTATCTTCTTCGGACAAAAACATAAGA
GGTGAATAACTGATACGCTATCAACTCTTTGTCGAAGAATGCAAAGCTAACAGTAGAAAA
GATGATACACGCACGCTGCTGCTTTGTGGTGAGCGATGAAGTTAACCAGTCCCTGATTTA
AGCGTATTACTCAACCAGTCTAGGCCTTCGAAAAGTCCTTCGCCTTTCACAGCACAAGTC
TTGAATATTGCCCATTGACGACTCTTTATCTTGTGCAACTCCAAGGCCTCTGTCACAGCT
GCATCGTCGAGTGCTCCTGGTAGATCCTGCTTGTTTGCAAATATAAGAACCATTGCACCT
TTCAGTTCCTCTTCCTCCAGAATTGCATGGAACTCTTCTTTGGCCACTCCAATTCTATCA
GTATCACTCGAATCAACAACATAAATCACTGCTTGTGTATTTGGGAAATAGCATCTCCAA
TATGGCCTGATACTCGTTTGTCCACCTAAATCCCAGACCTGAAACTTGATATTATTGTAC
TGCACAGTCTCCACGTTAAATCCAATAGTCGGAATAGTGGAGACGACCTCCCCCATCTGA
AGCCGATAGAGGATGGTGGTTTTCCCGGCATTGTCGAGACCGAGGACGAGGATGCGAGCT
TCTTTGTTTCCGAAAACGGAAGAAAACAGCTTGGTGAACACGATTCCCATCTTCCCTTCC
TGAGCTTCGTCTTTGGATCAGATCATACGATCTAAAGAGAGAGATCGTCTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM61JQ U 1
AF RR2AT05TF C 107
BS 1 213 RR2GM61JQ
BS 214 214 RR2AT05TF
BS 215 224 RR2GM61JQ
BS 225 225 RR2AT05TF
BS 226 706 RR2GM61JQ
BS 707 835 RR2AT05TF

RD RR2GM61JQ 706 0 0
AGGGAGTGAAGCATATGGTATTGGTAATCTTGATATGTTCAATTTTATGTTAAAAATGAC
GTCTTAAATGTCACAACAACAACTCCACAAGTCTTATCTTCTTCGGACAAAAACATAAGA
GGTGAATAACTGATACGCTATCAACTCTTTGTCGAAGAATGCAAAGCTAACAGTAGAAAA
GATGATACACGCACGCTGCTGCTTTGTGGTGAGTGATGAAGTTAGCCAGTCCCTGATTTA
AGCGTATTACTCAACCAGTCTAGGCCTTCGAAAAGTCCTTCGCCTTTCACAGCACAAGTC
TTGAATATTGCCCATTGACGACTCTTTATCTTGTGCAACTCCAAGGCCTCTGTCACAGCT
GCATCGTCGAGTGCTCCTGGTAGATCCTGCTTGTTTGCAAATATAAGAACCATTGCACCT
TTCAGTTCCTCTTCCTCCAGAATTGCATGGAACTCTTCTTTGGCCACTCCAATTCTATCA
GTATCACTCGAATCAACAACATAAATCACTGCTTGTGTATTTGGGAAATAGCATCTCCAA
TATGGCCTGATACTCGTTTGTCCACCTAAATCCCAGACCTGAAACTTGATATTATTGTAC
TGCACAGTCTCCACGTTAAATCCAATAGTCGGAATAGTGGAGACGACCTCCCCCATCTGA
AGCCGATAGAGGATGGTGGTTTTCCCGGCATTGTCGAGACCGAGGA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2AT05TF 729 0 0
AAAACATAAGAGGTGGTC
AATAACTGATACGCTATCAGCTCTTTGTCGAAGAATGCAAAGCTAACAGTAGAAAAGATG
ATACACGCACGCTGCTGCTTTGTGGTGAGCGATGAAGTTAACCAGTCCCTGATTTGAGCG
TATTACTCAACCAGTCTAGGCCTTCGAAAAGTCCTTCGCCTTTCACAGCGCAAGTTTTGA
ATATTGCCCATTGACGACTCTTTATCTTGTGCAACTCCAAGGCCTCTGTCACAGCTGCAT
CGTCGAGTGCTCCTGGTAGATCCTGCTTGTTTGCAAATATAAGAACCATTGCACCTTTCA
GTTCTTCTTCCTCCAGAATTGCATGGAACTCTTCTTTGGCCACTCCAATTCTATCAGTAT
CACTCGAATCAACAACATAAATCACTGCTTGTGTATTTGGGAAATAGCATCTCCAATATG
GCCTGATACTCGTTTGTCCACCTAAATCCCAGACCTGAAACTTGATATTATTGTACTGCA
CAGTCTCCACGTTAAATCCAATAGTCGGAATAGTGGAGACGACCTCCCCCATCTGAAGTC
GATAGA***TGGTGGTTTTTCCGGCATTGTCGAGACCGAGGACGAGGATGCGAGCTTCTT
TGTTTCCGAAAACGGAAGAAAACAGCTTGGTGAACACGATTCCCATCTTCCCTTCCTGAG
CTTCGTCTTTGGATCAGATCATACGATCTAAAGAGAGAGATCGTCTCTTCC

QA 19 729 19 729
DS 



AS 1 3

CO CL3446Contig1 936 3 8 U
GTAAGAGTTAACTTCTGAATGTATCTCTCTCAATCTCTAGGGATGTTCTTGTGCTTTTTC
TTATTACAAAGATTTGTAAAACACCAAACCTTATGGTTTCTTTTTCTTTAAGGTCGTCAA
ATGCTATCAAATTATATGTTTCAAACACAATAAAAGACATTGAAACCGAAATGTAAAAAT
TTTTGTGCACCAGTTCTTCAGGGGATGTTCAAGTTTCCAACTTAGCAGCAGCAGATGCAT
AGCTGACACTGCTGTCTCGCATAGTCTTGCACTCGCTTGACTGCTCGTACTTGAGGAAA*
TTGATCTTCATCTTGCTTGAGCTATGTTTTATCATATGGAGAAAAATACTAATGGGGTGG
CGTCCACAAATGGTGTTGTCAAACTCCAAAAGATACTTGTCGAAAGCATCTGGATCACCG
GTCTCTATTATATCCATACCCATCTTGTCTAGTGCCTCAATGGATTTGTGTATTGGACCA
TGATTGTTGTCATAATGCATGTAGTTAAACCTTGAGCCCCAGTGACAAAAGTCAGAGGAG
ACTGAGAAAAAGTTCTTGGGATCATCCACATATTTAGATAGCAACTCACCGTACATGGCT
TCGTTTTCTGGACTTACTGCTCCAACCAAGATGGGTACAACTTTCACATCGTGCCCTTGA
AACACTTTAGCCAGATAAGGCAAGTGCATTTCCATGCTATGCTCAGCTTCGTCGACTCGG
AGATCTATCATTCCAAATTTCCCCATAGCTCTTATCTCTTTAATCATCTCCACGTCAACA
GGTAGATCTCCTATGGGAGTTTTGTAAACTTTTGCAGTGGAAAGTGCACATTTTGGAGTG
TAGTAATGGTGAGATGGACCAAGAATAAATATCCTGGAAATGTTGGTGGGATCAATGTTT
GCAAAGGCATAAGCAGCTGCACGACCCGAGTAGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW30JQ U 1
AF RR2EA09JQ U 21
AF RR2AW30TFB C 206
BS 1 125 RR2AW30JQ
BS 126 126 RR2EA09JQ
BS 127 129 RR2AW30JQ
BS 130 130 RR2EA09JQ
BS 131 175 RR2AW30JQ
BS 176 176 RR2EA09JQ
BS 177 777 RR2AW30JQ
BS 778 936 RR2AW30TFB

RD RR2AW30JQ 777 0 0
GTAAGAGTTAACTTCTGAATGTATCTCTCTCAATCTCTAGGGATGTTCTTGTGCTTTTTC
TTATTACAAAGATTTGTAAAACACCAAACCTTATGGTTTCTTTTTCTTTAAGGTCGTCAA
ATGCTGTCAGATTATATGTTTCAAACACAATAAAAGACATTGAAACCGAAATGTAGAAAT
TTTTGTGCACCAGTTCTTCAGGGGATGTTCAAGTTTCCAACTTAGCAGCAGCAGATGCAT
AGCTGACACTGCTGTCTCGCATAGTCTTGCACTCGCTTGACTGCTCGTACTTGAGGAAA*
TTGATCTTCATCTTGCTTGAGCTATGTTTTATCATATGGAGAAAAATACTAATGGGGTGG
CGTCCACAAATGGTGTTGTCAAACTCCAAAAGATACTTGTCGAAAGCATCTGGATCACCG
GTCTCTATTATATCCATACCCATCTTGTCTAGTGCCTCAATGGATTTGTGTATTGGACCA
TGATTGTTGTCATAATGCATGTAGTTAAACCTTGAGCCCCAGTGACAAAAGTCAGAGGAG
ACTGAGAAAAAGTTCTTGGGATCATCCACATATTTAGATAGCAACTCACCGTACATGGCT
TCGTTTTCTGGACTTACTGCTCCAACCAAGATGGGTACAACTTTCACATCGTGCCCTTGA
AACACTTTAGCCAGATAAGGCAAGTGCATTTCCATGCTATGCTCAGCTTCGTCGACTCGG
AGATCTATCATTCCAAATTTCCCCATAGCTCTTATCTCTTTAATCATCTCCACGTCA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2EA09JQ 757 0 0
GTATCTCTCTCAATCTCTAGGGATGTTCTTGTGCTTTTTCTTATTACAAAGATTTGTAAA
ACACCAAACCTTATGGTTTCTTTTTCTTTAAGGTTGTCAAATGCTATCAAATTATATGTT
TCAAACACAATAAAAGACATTGAAACCGAAATGTAAAAATTTTTGTGCACCAGTTCTTCA
GGGGATGTTCAAGTTTCCAACTTAGCAGCAGCAGATGCATAGCTGACACTGCTGTCTCGC
ATAGTCTTGCACTCGCTTGACTGCTCGTACTTGAGGAAA*TTGATCTTCATCTTGCTTGA
GCTATGTTTTATCATATGGAGAAAAATACTAATGGGGTGGCGTCCACAAATGGTGTTGTC
AAACTCCAAAAGATACTTGTCGAAAGCATCTGGATCACCGGTCTCTATTATATCCATACC
CATCTTGTCTAGTGCCTCAATGGATTTGTGTATTGGACCATGATTGTTGTCATAATGCAT
GTAATTAAACCTTGAGCCCCAGTGACAAAAGTCAGAGGAGACTGAGAAAAAGTTCTTGGG
ATCATCCACATATTTAGATAGCAACTCACCGTACATGGCTTCGTTTTCTGGACTTACTGC
TCCAACCAAGATGGGTACAACTTTCACATCGTGCCCTTGAAACACTTTAGCCAGATAAGG
CAAGTGCATTTCCATGCTATGCTCAGCTTCGTCGACTCGGAGATCCATCATTCCAAATTT
CCCCATAGCTCTTATCTCTTTAATCATCTCCACGTCA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2AW30TFB 731 0 0
TGTTCAAGTTTCCAACTTAGCAGCAGCAGATGCATAGCTGACACTGCTGTCTCGCATAGT
CTTGCACTCGCTTGACTGCTCGTACTTGAGGAAAATTGATCTTCATCTTGCTTGAGCTAT
GTTTTATCATATGGAGAAAAATACTAATGGGGTGGCGTCCACAAATGGTGTTGTCAAACT
CCAAAAGATACTTGTCGAAAGCATCTGGATCACCGGTCTCTATTATATCCATACCCATCT
TGTCTAGTGCCTCAATGGATTTGTGTATTGGACCATGATTGTTGTCATAATGCATGTAGT
TAAACCTTGAGCCCCAGTGACAAAAGTCAGAGGAGACTGAGAAAAAGTTCTTGGGATCAT
CCACATATTTAGATAGCAACTCACCGTACATGGCTTCGTTTTCTGGACTTACTGCTCCAA
CCAAGATGGGTACAACTTTCACATCGTGCCCTTGAAACACTTTAGCCAGATAAGGCAAGT
GCATTTCCATGCTATGCTCAGCTTCGTCGACTCGGAGATCTATCATTCCAAATTTCCCCA
TAGCTCTTATCTCTTTAATCATCTCCACGTCAACAGGTAGATCTCCTATGGGAGTTTTGT
AAACTTTTGCAGTGGAAAGTGCACATTTTGGAGTGTAGTAATGGTGAGATGGACCAAGAA
TAAATATCCTGGAAATGTTGGTGGGATCAATGTTTGCAAAGGCATAAGCAGCTGCACGAC
CCGAGTAGGAC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 3

CO CL3447Contig1 810 3 2 U
ATGAAAGTATATTTTCAAGATGAAAAGAAAAGAAATATCCTTAAGGCAGACATAAAATAC
TACTTAAATTTGTTTTCGTTGTATCAGGTAATTTAATACATTGCAAAAACAAAACAATCT
TAAAACTCTTTTTTTAAAAGACAACACCAGCTTTGGAGTATAGTGAATACATCTTCTAAA
TGGATCCTCAAATGTTACCACATAATCACTCTTCCATGGCTTCGTTTTGAACAGACTTGT
TGCTGGAGACCATAACTTTCACCTTCTCTGAGTCTTGTTGCTGCGAACCTGGTGCCTTGA
TCAAATTAATGTGCTGGTCTATCTCCTTGAGATCACTCTTTAATGCCTTCTGTTTGTTTG
GCTTCAACCTCTTGCTGATGTGGTCAGCTTCTCAAGTGCATCTGATCTTATCAATCTTCT
TAATGGCCTTGAGAGTATCCTCCGTAACGTTCCTATCATACCTCTCGGGTCTGTTTCTCT
TCTTCTCAAACTCAAAAGTTTTATCCAGAGTCATGTCCTTTCCGTGTGCAGCTCTGTATG
CTTTAGTCCACTTCACTTTACGAGGGTTCCTCTTCATCTTGAAGTTCTTGTGGCACTTAG
ACCTACAGAACCGGAAAATCTTTGCATCGTTTCGGACAAACTGAATACCATGTCCAGGAT
ATATCGTAGAAGAGCAAAACCAACACTTGACCAATCTCATCTTGTCTCCTCCTTACAAGT
TCCTCTGCAAGTGATACGAGTCGCAAGCAAATTGCAGAGAGGAGAGTTGTAAGAGACGAC
GGAGGATACAGAGAGGAGAATCTCCCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF85JQ U 93
AF RR2G915JQ U 1
AF RR2G915TF C 47
BS 1 757 RR2G915JQ
BS 758 810 RR2G915TF

RD RR2GF85JQ 504 0 0
TTAATACATTGCAAAAACAAAACAATCTTAAAACTCTTTTTTTAAAAGACAACACCAGCT
TTGGAGTATAGTGAATACATCTTCTAAATGGATCCTCAAATGTTACCACATAATCACTCT
TCCATGGCTTCGTTTTGAACAGACTTGTTGCTGGAGACCATAACTTTCACCTTCTCTGAG
TCTTGTTGCTGCGAACCTGGTGCCTTGATCAAATTAATGTGCTGGTCTATCTCCTTGAGA
TCACTCTTTAATGCCTTCTGTTTGTTTGGCTTCAACCTCTTGCTGATGTGGTCAGCTTCT
CTAGTGCTTCTGATCTTATCAATCTTCTTAATGGCCTTGAAAGTATCCTCCGTAACGTTC
CTATCATACCTCTCGGGTCTGTTTCTCTTCTTCTCAAACTCAAAAGTTTTATCCTGAGTC
ATGTCCTTTCCGTGTGCAGCTCTGTATGCTTTAGTCCACTTCACTTTACGAGGGTTCCTC
TTCATCTTGAAGTTCTTGTGGCAC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2G915JQ 757 0 0
ATGAAAGTATATTTTCAAGATGAAAAGAAAAGAAATATCCTTAAGGCAGACATAAAATAC
TACTTAAATTTGTTTTCGTTGTATCAGGTAATTTAATACATTGCAAAAACAAAACAATCT
TAAAACTCTTTTTTTAAAAGACAACACCAGCTTTGGAGTATAGTGAATACATCTTCTAAA
TGGATCCTCAAATGTTACCACATAATCACTCTTCCATGGCTTCGTTTTGAACAGACTTGT
TGCTGGAGACCATAACTTTCACCTTCTCTGAGTCTTGTTGCTGCGAACCTGGTGCCTTGA
TCAAATTAATGTGCTGGTCTATCTCCTTGAGATCACTCTTTAATGCCTTCTGTTTGTTTG
GCTTCAACCTCTTGCTGATGTGGTCAGCTTCTCAAGTGCATCTGATCTTATCAATCTTCT
TAATGGCCTTGAGAGTATCCTCCGTAACGTTCCTATCATACCTCTCGGGTCTGTTTCTCT
TCTTCTCAAACTCAAAAGTTTTATCCAGAGTCATGTCCTTTCCGTGTGCAGCTCTGTATG
CTTTAGTCCACTTCACTTTACGAGGGTTCCTCTTCATCTTGAAGTTCTTGTGGCACTTAG
ACCTACAGAACCGGAAAATCTTTGCATCGTTTCGGACAAACTGAATACCATGTCCAGGAT
ATATCGTAGAAGAGCAAAACCAACACTTGACCAATCTCATCTTGTCTCCTCCTTACAAGT
TCCTCTGCAAGTGATACGAGTCGCAAGCAAATTGCAG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2G915TF 764 0 0
GCAGACAT
AAATACTACTTAAATTTGTTT*CGT*GTATCAGGTAATTTAATACATTGCAAAA*CAAAA
CAATCTTAAAACTCTTTTTT*AAAAGACAACACCAGCTTTGGAGTATAGTGAATACATCT
TCTAAATGGATCCTCAAATGTTACCACATAATCACTCTTCCATGGCTTCGTTTTGAACAG
ACTTGTTGCTGGAGACCATAACTTTCACCTTCTCTGAGTCTTGTTGCTGCGAACCTGGTG
CCTTGATCAAATTAATGTGCTGGTCTATCTCCTTGAGATCACTCTTTAATGCCTTCTGTT
TGTTTGGCTTCAACCTCTTGCTGATGTGGTCAGCTTCTCAAGTGCATCTGATCTTATCAA
TCTTCTTAATGGCCTTGAGAGTATCCTCCGTAACGTTCCTATCATACCTCTCGGGTCTGT
TTCTCTTCTTCTCAAACTCAAAAGTTTTATCCAGAGTCATGTCCTTTCCGTGTGCAGCTC
TGTATGCTTTAGTCCACTTCACTTTACGAGGGTTCCTCTTCATCTTGAAGTTCTTGTGGC
ACTTAGACCTACAGAACCGGAAAATCTTTGCATCGTTTCGGACAAACTGAATACCATGTC
CAGGATATATCGTAGAAGAGCAAAACCAACACTTGACCAATCTCATCTTGTCTCCTCCTT
ACAAGTTCCTCTGCAAGTGATACGAGTCGCAAGCAAATTGCAGAGAGGAGAGTTGTAAGA
GACGACGGAGGATACAGAGAGGAGAATCTCCCTTCC

QA 9 764 9 764
DS 



AS 1 2

CO CL3448Contig1 715 2 18 U
GGAGAGCAAAAAAACACAGAGTTAGTTCTTACACCAACCAATCAAAAATGTTGCGTATTA
TCTTCCTCTTATCCCTCCTTTTTGCTCTATCCACGGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGTGG
CCAACCTGAAACGCGCTGAAACCCCTGCAGGTTACCCATGCATACGTCCCATTCATGTCA
AAGCCAAGGACTTCATCTTCTCCGGCTTAGGCACTCCTGGTAACACTACCAACATCATCA
GCGCTGCGGTCACACCAGGTTTTGTCGCTCAGTTCCCTGGACTGAACGGTCTAGGACTCT
CTACAGCTAGACTTGACTTAGCTCCAAAAGGCGTGATACCAATGCACACTCACCCGGGTG
CCTCTGAGGTTCTGTTTGTCCTTGACGGCGCCATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGA
ACTCTGCCTACGTACAGACACTAAAGCCGGGACAGGTCATGGTCTTCCCGCAGGGCTTGC
TTCATTTCCAGATCAACGCGGGGAAATCAGCTGCTGCAGCTTTTGTCACTTTCAGCAGCG
CTAGTCCTGGTCTACAGATTCTTGATTTCGCGCTATTTGCTAACGATCTTCCCACTGAAC
TCGTCTCGGGTACTACTTTCCTTGACCCTGCTGTAGTCAAGAAGCTTAAGGGTGTTCTTG
GAGGACCGGCTAAATCAAGACTTGACTATAAACAACAAGCCTGTTTTTCTCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI52TF U 1
AF RR2CQ63TF U 15
BS 1 47 RR2CI52TF
BS 48 48 RR2CQ63TF
BS 49 49 RR2CI52TF
BS 50 50 RR2CQ63TF
BS 51 88 RR2CI52TF
BS 89 89 RR2CQ63TF
BS 90 108 RR2CI52TF
BS 109 109 RR2CQ63TF
BS 110 148 RR2CI52TF
BS 149 149 RR2CQ63TF
BS 150 495 RR2CI52TF
BS 496 497 RR2CQ63TF
BS 498 517 RR2CI52TF
BS 518 518 RR2CQ63TF
BS 519 553 RR2CI52TF
BS 554 554 RR2CQ63TF
BS 555 642 RR2CI52TF
BS 643 715 RR2CQ63TF

RD RR2CI52TF 646 0 0
GGAGAGCAAAAAAACACAGAGTTAGTTCTTACACCAACCAATCAAAATT*TTGCGTATTA
TCTTCCTCTTATCCCTCCTTTTTGCTCTGTCCACGGCCTCTGTTCAAGGCTTCTGTGTGG
CCAACCTGAAACGCGCTGAAACCCCTGCGGGTTACCCATGCATACGTCCCATTCATGTCA
AAGCCAAGGACTTCATCTTCTCCGGCTTAGGCACTCCTGGTAACACTACCAACATCATCA
GCGCTGCGGTCACACCAGGTTTTGTCGCTCAGTTCCCTGGACTGAACGGTCTAGGACTCT
CTACAGCTAGACTTGACTTAGCTCCAAAAGGCGTGATACCAATGCACACTCACCCGGGTG
CCTCTGAGGTTCTGTTTGTCCTTGACGGCGCCATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGA
ACTCTGCCTACGTACAGACACTAAAGCCGGGACAGGTCATGGTCTTCCCGCAGGGCTTGC
TTCATTTCCAGATCAGTGCGGGGAAATCAGCTGCTGCGGCTTTTGTCACTTTCAGCAGCG
CTAGTCCTGGTCTGCAGATTCTTGATTTCGCGCTATTTGCTAACGATCTTCCCACTGAAC
TCGTCTCGGGTACTACTTTCCTTGACCCTGCTGTAGTCAAGA
GCTT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2CQ63TF 701 0 0
G
ACAGAGTTAGTTCTTTCACCAACCAATCAAAAATGTTGCGTATTATCTTCCTCTTATCCC
TCCTTTTTGCTCTATCCACGGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGTGGCCAACCTGAAACGCG
CTGAAACCCCTGCAGGTTACCCATGCATACGTCCCATTCATGTCAAAGCCAAGGACTTCG
TCTTCTCCGGCTTAGGCACTCCTGGTAACACTACCAACATCATCAGCGCTGCGGTTACGC
CAGGTTTTGTCGCTCAGTTCCCTGGTCTGAACGGTTTAGGACTCTCTACAGCTAGACTTG
ACTTAGCTCCAAAAGGTGTGATACCAATGCACACTCACCCGGGTGCCTCTGAGGTTCTTT
TTGTCCTTGACGGCGCCATTACCGCTTGGTTTGTCTCTTCTGCTAACTCTGTCTACGTAC
AGACACTAAAGCCGGGACAGGTCATGGTCTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAGATCA
ACGCGGGGAAATCAGCTGCTGCAGCTTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTCTAC
AGATTCTTGATTTCGCGCTATTTGCTGACGATCTTCCCACTGAACTCGTCTCGGGTATTA
CTTTCCTTGACCCTGCTGTAGTCAAGAAGCTTAAGGGTGTTCTTGGAGGACCGGCTAAAT
CAAGACTTGACTATAAACAACAAGCCTGTTTTTCTCTTTC

QA 2 701 2 701
DS 



AS 1 2

CO CL3449Contig1 765 2 7 U
GAGGTCACAGTTTGTTCAGGTCTTTAACAATAGTCCAGATGAAACTGCATATTTCCGCAT
GCTGCTAAACCGGGAGAATATATCAAATGCAACTGTCATGATCCAGCCATCGCTGACATC
ATATACATTCAGTTCACCACCTCAGCCAGCTTTGCTTGATGTTGCTTCCATTGCAGCCGA
CAGAATTCTTCTGTTAGATGCATATTTTAGTGTTGTTGTCTTCCATGGGATGACAATAGC
ACAATGGCGAAACATGGGTTATCATCATCAAGCTGAACATGAGGCATTTGCTCAGCTACT
GCAAGCTCCTCAAGAGGATTCCCAGATGATAGTCCGGGAGCGTTTCCCAGTCCCGAGATT
AGTTGTGTGTGATCAACATGGATCACAGGCAAGGTTTTTATTGGCAAAGCTGAATCCATC
GGCCACTTACAACAATGCAAACGAGATGTCAGCAGGATCAGATGTAATCTTCACTGACGA
CGTGAGCCTGCAAGTCTTTTTTGAGCATCTTCAGAAACTGGCCGTGCAATCCTGATGGAA
GTAGTCACAGTCGGTCCCAGTTTTTCTTTGGTCGCTTAAATTATATGGTCTTCCATACTA
TTGTACCCAATTTAGAGTTTTTTTTTACTTTTTTTTTCTTTTGTGATATCAGCTCGTTTA
CTTTGCTGTCTCGTTACCATCTTGGTCTCACATAAAAACATCTTGGAACACAAAGTTGTT
TGCATTGGATTTGTCTGAAGGAAAAAGAACTGCTGTTTAATACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK47TF U 140
AF RR2H080JQ C 1
BS 1 140 RR2H080JQ
BS 141 442 RR2DK47TF
BS 443 443 RR2H080JQ
BS 444 626 RR2DK47TF
BS 627 628 RR2H080JQ
BS 629 711 RR2DK47TF
BS 712 765 RR2H080JQ

RD RR2DK47TF 572 0 0
G
CTCAGCCAGCTTTGCTTGATGTTGCTTCCATTGCAGCCGACAGAATTCTTCTGTTAGATG
CATATTTTAGTGTTGTTGTCTTCCATGGGATGACAATAGCACAATGGCGAAACATGGGTT
ATCATCATCAAGCTGAACATGAGGCATTTGCTCAGCTACTGCAAGCTCCTCAAGAGGATT
CCCAGATGATAGTCCGGGAGCGTTTCCCAGTCCCGAGATTAGTTGTGTGTGATCAACATG
GATCACAGGCAAGGTTTTTATTGGCAAAGCTGAATCCATCGGCCACTTACAACAATGCAA
AC*AGATGTCAGCAGGATCAGATGTAATCTTCACTGACGACGTGAGCCTGCAAGTCTTTT
TTGAGCATCTTCAGAAACTGGCCGTGCAATCCTGATGGAAGTAGTCACAGTCGGTCCCAG
TTTTTCTTTGGTCGCTTAAATTATATGGTCTTCCATACTATTGTACCCAATTTAGAGTTT
TTTTTTGTTTTTTTTTTCTTTTGTGATATCAGCTCGTTTACTTTGCTGTCTCGTTACCAT
CTTGGTCTCACATAAAAACATCTTGGAACAC

QA 2 572 2 572
DS 

RD RR2H080JQ 765 0 0
GAGGTCACAGTTTGTTCAGGTCTTTAACAATAGTCCAGATGAAACTGCATATTTCCGCAT
GCTGCTAAACCGGGAGAATATATCAAATGCAACTGTCATGATCCAGCCATCGCTGACATC
ATATACATTCAGTTCACCACCTCAGCCAGCTTTGCTTGATGTTGCTTCCATTGCAGCCGA
CAGAATTCTTCTGTTAGATGCATATTTTAGTGTTGTTGTCTTCCATGGGATGACAATAGC
ACAATGGCGAAACATGGGTTATCATCATCAAGCTGAACATGAGGCATTTGTTCAGCTACT
GCAAGCTCCTCAAGAGGATTCCCAGATGATAGTCCGGGAGCGTTTCCCAGTCCCGAGATT
AGTTGTGTGTGATCAACATGGATCACAGGCAAGGTTTTTATTGGCAAAGCTGAATCCATC
GGCCACTTACAACAATGCAAACGAGATGTCAGCAGGATCAGATGTAATCTTCACTGACGA
CGTGAGCCTGCAAGTCTTTTTTGAGCATCTTCAGAAACTGGCCGTGCAATCCTGATGGAA
GTAGTCACAGTCGGTCCCAGTTTTTCTTTGGTCGCTTAAATTATATGGTCTTTCATACTA
TTGTACCCAATTTAGAGTTTTTTTTTACTTTTTT**TCTTTTGTGATATCAGCTCGTTTA
CTTTGCTGTCTCGTTGCCATCTTGGTCTCACATAAAAACATCTTGGAACACAAAGTTGTT
TGCATTGGATTTGTCTGAAGGAAAAAGAACTGCTGTTTAATACTC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 3

CO CL3450Contig1 677 3 2 U
GGCTCCTCTCTCTCTGAGCTGAATCTTGATTCTGCAGTTGATTCTCTTCCTTTATTCCAA
AGTCTCGTTATTTTTTCTAAGAGATTAGTATAACCAATGGCTTCATACTACGCTGGGTTT
TCAAGTTATGAAGAGCCACACTTTTTGGAATCTTGCTCTCTTTGCCGTAAACACCTTCCT
CGTAACTCAGACATCTTCATGTACAGAGGAGACAAGGCGTTTTGTAGCAATGAGTGTAGA
GAAGAACAGATCGAGTCTGATGAAGCCAAGGAGAAAAGCTGGAAACTTTCTTCAAGATCT
CTCCGTAAAAAATCTTCCGAAGCATCAAAAGATTGCAAAACCGTTCGGACAGGAACCCTC
GTGGTGGCTTAGTTAAAAAAGAAAAAA*GAAAAAAACTTTTATTACATAAAAGCAAATAG
CTTTTTCTATATATATCCTTCGAAAGCCCTTCTTAAGAAGCAACCTGAGTAGATTTGCTC
TGTGTCTCTCTATG***CTGGATCGGAGATGATTAGGGTTCTGGGAAAGCTGTAAAGATC
TGGTTCTGCCTAAATGAACCAAGAGCTTGGGGAGTGGGAGAAGTGTGGTCTAGGGTTTAA
TTGGCGGGGTTTAAATTTTGTTCCATGTTACAACAAGAAACAGAGCATACTATGTTCTAA
TAAATTCAATTTCTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E512TF U 183
AF RR2CT26JQ C 1
AF RR2CT26TF U 1
BS 1 665 RR2CT26TF
BS 666 677 RR2CT26JQ

RD RR2E512TF 457 0 0
G
AACTCAGACATCTTCATGTACAGAGGAGACAAGGCGTTTTGTAGCAATGAGTGTAGAGAA
GAACAGATCGAGTCTGATGAAGCCAAGGAGAAAAGCTGGAAACTTTCTTCAAGATCTCTC
CGTAAAAAATCTTCCGAAGCATCAAAAGATTGCAAAACCGTTCGGACAGGAACCCTCGTG
GTGGCTTAGTTAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAACTTTTATTACATAAAAGCAAATAGCTT
TTTCTATATATATCCTTCGAAAGCCCTTCTTAAGAAACAACCTGAGTAGATTTGCTCTGT
GTCTCTCTATGTATCTGGATCGGAGATGATTAGGGTTCTGGGAAAGCTGTAAAGATCTGG
TTCTGCCTAAATGAACCAAGAGCTTGGGGAGTGGGAGAAGTGTGGTCTAGGGTTTAATTG
GCGGGGTTTAAATTTTGTTCCATGTTACAACAAGAA

QA 2 457 2 457
DS 

RD RR2CT26JQ 677 0 0
GGCTCCTCTCTCTCTGAGCTGAATCTTGATTCTGCAGTTGATTCTCTTCCTTTATTCCAA
AGTCTCGTTATTTTTTCTAAGAGATTAGTATAACCAATGGCTTCATACTACGCTGGGTTT
TCAAGTTATGAAGAGCCACACTTTTTGGAATCTTGCTCTCTTTGCCGTAAACACCTTCCT
CGTAACTCAGACATCTTCATGTACAGAGGAGACAAGGCGTTTTGTAGCAATGAGTGTAGA
GAAGAACAGATCGAGTTTGATGAAGCCAAGGAGAAAAGCTGGAAACTTTTTTCAAGATCT
CTCCGTAAAAAATCTTCCGAAGCATCAAAAGATTGCAAAACCGTTCGGACAGGAACCCTC
GTGGTGGCTTAGTTAAAAAAGAAAAAA*GAAAAAAACTTTTATTACATAAAAGCAAATAG
CTTTTTCTATATATATCCTTCGAAAGCCCTTCTTAAGAAGCAACCTGAGTAGATTTGCTC
TGTGTCTCTCTATG***CTGGATCGGAGATGATTAGGGTTCTGGGAAAGCTGTAAAGATC
TGGTTCTGCCTAAATGAACCAAGAGCTTGGGGAGTGGGAGAAGTGTGGTCTAGGGTTTAA
TTGGCGGGGTTTAAATTTTGTTCCATGTTACAACAAGAAACAGAGCATACTATGTTTTAA
TAAATTCAATTTCTTTT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2CT26TF 665 0 0
GGCTCCTCTCTCTCTGAGCTGAATCTTGATTCTGCAGTTGATTCTCTTCCTTTATTCCAA
AGTCTCGTTATTTTTTCTAAGAGATTAGTATAACCAATGGCTTCATACTACGCTGGGTTT
TCAAGTTATGAAGAGCCACACTTTTTGGAATCTTGCTCTCTTTGCCGTAAACACCTTCCT
CGTAACTCAGACATCTTCATGTACAGAGGAGACAAGGCGTTTTGTAGCAATGAGTGTAGA
GAAGAACAGATCGAGTCTGATGAAGCCAAGGAGAAAAGCTGGAAACTTTCTTCAAGATCT
CTCCGTAAAAAATCTTCCGAAGCATCAAAAGATTGCAAAACCGTTCGGACAGGAACCCTC
GTGGTGGCTTAGTTAAAAAAGAAAAAA*GAAAAAAACTTTTATTACATAAAAGCAAATAG
CTTTTTCTATATATATCCTTCGAAAGCCCTTCTTAAGAAGCAACCTGAGTAGATTTGCTC
TGTGTCTCTCTATG***CTGGATCGGAGATGATTAGGGTTCTGGGAAAGCTGTAAAGATC
TGGTTCTGCCTAAATGAACCAAGAGCTTGGGGAGTGGGAGAAGTGTGGTCTAGGGTTTAA
TTGGCGGGGTTTAAATTTTGTTCCATGTTACAACAAGAAACAGAGCATACTATGTTCTAA
TAAAT

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 3

CO CL3451Contig1 739 3 49 U
GGGCTTGACTTCTCTTTAGATCGCCTCGTGTGTCCTCTCTGTCTCAGATTTCCCTCAACC
ATCAGAGAAGTATGGGACCTGGAGATAGTGAAACAATGGAATGCAAATGTGGTATGCCTC
TTTGCATCTGTGTTGCTCCACCCAAAACCTCACAGGCTACACGGGCTCCTATGGCTCTTT
CTCAGTCAGATCCGAAACCAAAGCCTGACACTTCAGCTAAAAGTAAAGGTTCCACTTCCA
CCAGCAATGCTACTAGATCAGACAAGCCCCAAAAAGACTATGAAGTCAGTGGGGAGGGAT
TAAGAGAAGCAATTAAGAATGGTGACACTGCTGGAGTGAAAAAGCTTCTGAATGAGGGCG
TGGATGCAAATTACCATGACAAGCAGGGAATGTCAGTGCTTCATCTGGCGGTTTTATTCA
ACCAAACTGATATTGCGTTGATGTTAATGGAACATGGAGCAAGCCTTGACTACAAAAATG
CACAAGGAGAAACACCACTAGATTGTGCTCCTGCAACGCTGCAATATAAGATGCGGGAAA
AGATGAAGTCCACTTAATATGAATTCAGGCACAGAGCTACAAATCTTTCCTCAAAAAGTC
TGTAAAGGACAAATCAAGGGGTCGTGAATTTGCTTGTAAGACGTATCTTATTTGACATTC
TGTATGCAATTTCTCCGTCTTGTGTGAACTTTGAAACGTCGGCTTCTTCCACTCTTGTAA
GTCTTTGTGTGTTATCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A742JQ C 21
AF RR2A742TF U 21
AF RR2AC42TF U 1
BS 1 47 RR2AC42TF
BS 48 48 RR2A742TF
BS 49 70 RR2AC42TF
BS 71 71 RR2A742TF
BS 72 100 RR2AC42TF
BS 101 101 RR2A742TF
BS 102 106 RR2AC42TF
BS 107 107 RR2A742TF
BS 108 173 RR2AC42TF
BS 174 174 RR2A742TF
BS 175 193 RR2AC42TF
BS 194 194 RR2A742TF
BS 195 203 RR2AC42TF
BS 204 204 RR2A742TF
BS 205 240 RR2AC42TF
BS 241 241 RR2A742TF
BS 242 257 RR2AC42TF
BS 258 259 RR2A742TF
BS 260 277 RR2AC42TF
BS 278 278 RR2A742TF
BS 279 281 RR2AC42TF
BS 282 282 RR2A742TF
BS 283 288 RR2AC42TF
BS 289 289 RR2A742TF
BS 290 334 RR2AC42TF
BS 335 335 RR2A742TF
BS 336 462 RR2AC42TF
BS 463 463 RR2A742TF
BS 464 551 RR2AC42TF
BS 552 552 RR2A742TF
BS 553 576 RR2AC42TF
BS 577 577 RR2A742TF
BS 578 585 RR2AC42TF
BS 586 586 RR2A742TF
BS 587 623 RR2AC42TF
BS 624 624 RR2A742TF
BS 625 642 RR2AC42TF
BS 643 643 RR2A742TF
BS 644 647 RR2AC42TF
BS 648 648 RR2A742TF
BS 649 660 RR2AC42TF
BS 661 662 RR2A742TF
BS 663 663 RR2AC42TF
BS 664 664 RR2A742TF
BS 665 675 RR2AC42TF
BS 676 676 RR2A742TF
BS 677 704 RR2AC42TF
BS 705 705 RR2A742TF
BS 706 739 RR2AC42TF

RD RR2A742JQ 698 0 0
GG
GCCTCGTGTGTCCTCTCTGTCTCAGATTTCCCTCAACCATCAGAGAAGTATGGGACCTGG
AGATAGTGAAACAATGGAATGCAAATGTGGTATGCCTCTTTGCATCTGTGTTGCTCCACC
CAAAACCTCACAGGCTACACGGGCTCCTATGGCTCTTTCTCAGTCAGATCCGAAACCAAA
GCCTGACACTTCAGCTAAAAGTAAAGGTTCCACTTCCACCAGCAATGCTACTAGATCAGA
CAAGCCCCAAAAAGACTATGAAGTCAGTGGGGAGGGATTAAGAGAAGCAATTAAGAATGG
TGACACTGCTGGAGTGAAAAAGCTTCTGAATGAGGGCGTGGATGCAAATTACCATGACAA
GCAGGGAATGTCAGTGCTTCATCTGGCGGTTTTATTCAACCAAACTGATATTGCGTTGAT
GTTAATGGAACATGGAGCAAGCCTTGACTACAAAAATGCACAAGGAGAAACACCACTAGA
TTGTGCTCCTGCAACGCTGCAATATAAGATGCGGGAAAAGATGAAGTCCACTTAATATGA
ATTCAGGCACAGAGCTACAAATCTTTCCTCAAAAAGTCTGTAAAGGACAAATCAAGGGGT
CGTGAATTTGCTTGTAAGACGTATCTTATTTGACATTCTGTATGCAATTTCTCCGTCTTG
TGTGAACTTTGAAACGTCGGCTTTTTCCACTCTT
GG

QA 3 696 3 696
DS 

RD RR2A742TF 696 0 0
GG
GCCTCGTGTGTCCTCTCTGTCTCAGATTTCCCTCAACCATCAGAGAAGTATGGGACCTGG
AGATAGTGAAACAATGGAATGCAAATGTGGTATGCCTCTTTGCATCTGTGTTGCTCCACC
CAAAACCTCACAGGCTACACGGGCTCCTATGGCTCTTTCTCAGTCAGATCCGAAACCAAA
GCCTGACACTTCAGCTAAAAGTAAAGGTTCCACTTCCACCAGCAATGCTACTAGATCAGA
CAAGCCCCAAAAAGACTATGAAGTCAGTGGGGAGGGATTAAGAGAAGCAATTAAGAATGG
TGACACTGCTGGAGTGAAAAAGCTTCTGAATGAGGGCGTGGATGCAAATTACCATGACAA
GCAGGGAATGTCAGTGCTTCATCTGGCGGTTTTATTCAACCAAACTGATATTGCGTTGAT
GTTAATGGAACATGGAGCAAGCCTTGACTACAAAAATGCACAAGGAGAAACACCACTAGA
TTGTGCTCCTGCAACGCTGCAATATAAGATGCGGGAAAAGATGAAGTCCACTTAATATGA
ATTCAGGCACAGAGCTACAAATCTTTCCTCAAAAAGTCTGTAAAGGACAAATCAAGGGGT
CGTGAATTTGCTTGTAAGACGTATCTTATTTGACATTCTGTATGCAATTTCTCCGTCTTG
TGTGAACTTTGAAACGTCGGCTTCTTCCACTCTT

QA 3 696 3 696
DS 

RD RR2AC42TF 739 0 0
GGGCTTGACTTCTCTTTAGATCGCCTCGTGTGTCCTCTCTGTCTCAGCTTTCCCTCAACC
ATCAGAGAAGAATGGGACCTGGAGATAGTGAAACAATGGAGTGCAAGTGTGGTATGCCTC
TTTGCATCTGTGTTGCTCCACCCAAAACCTCACAGGCTACACGGGCTCCTATGACTCTTT
CTCAGTCAGATCCCAAACCAAAGTCTGACACTTCAGCTAAAAGTAAAGGTTCCACTTCCA
GCAGCAATGCTACTAGACTAGACAAGCCCCAAAAAGAATATCAAGTCAATGGGGAGGGAT
TAAGAGAAGCAATTAAGAATGGTGACACTGCTGGCGTGAAAAAGCTTCTGAATGAGGGCG
TGGATGCAAATTACCATGACAAGCAGGGAATGTCAGTGCTTCATCTGGCGGTTTTATTCA
ACCAAACTGATATTGCGTTGATGTTAATGGAACATGGAGCAAACCTTGACTACAAAAATG
CACAAGGAGAAACACCACTAGATTGTGCTCCTGCAACGCTGCAATATAAGATGCGGGAAA
AGATGAAGTCCGCTTAATATGAATTCAGGCACAGAGTTACAAATCGTTCCTCAAAAAGTC
TGTAAAGGACAAATCAAGGGGTCATGAATTTGCTTGTAAGACATATCATATTTGACATTC
CATGTGCAATTTCTCTGTCTTGTGTGAACTTTGAAACGTCGGCTCCTTCCACTCTTGTAA
GTCTTTGTGTGTTATCCGC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 3

CO CL3452Contig1 796 3 8 U
GGAACATCATCACATTCACAATCTCTATAGCTCATACTATATAAGAATGGCTGGATCTCT
TAGATTTAATCATCACTTCCTCACATCTCTTCTCATTACCATTACGATAACCATGCTCAA
GTCGGTCCATACAGCAACAACAACAAACACGGAGTTCGTAAAATCATCATGCAAATTCAC
AACATATCAAAGACTCTGTGTCACTTCACTCTCAACTCAATCCAGTCTCATCCAAACCAG
CCACAAGCTCATGGCTCAAGCGGCTCTCAACATCACATTAGCCTCGGCTAAAGCCACATC
AGCAATGATGGTACGTCTCTCGAGTAGTCAGCTCAAGCCCAGAGAAGTCTCGGCCATGAG
AGACTGCGTTGAGGAGCTAGGTGACACGTTGGAGGAGCTTAGGAAATCGATAGGTGAGAT
GGGTCTGTTAAGTGACTCGAACTACGAAATCTACATGAGTGATATTCAGACTTGGGTTAG
CGCGGCTCTGACCGATGAGAACACGTGCTCGGATGGTTTTGGAGGAGCTGACATGAATGG
GAAAGTCAAGGATTTGGTTAGAGGGAGGATTTTGGTTATTGCTCATCTAACGAGTAATGC
TTTAGCTTTGATTAATCACTTTGCTTATATTCATGGCTAGAGAGACTAATATATTTTTTA
GTTTCTTTTTATCGAAAATTTCTGTTGCTTTTGTCAGTTTGTGTATATAACAAATAGTAA
TAGTACAATGTATCGCTCGTCTTTAAGATTCCGGAATCAATATGTACCAGAAAATATTCA
ATATTTTTTCTTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM16TF U 1
AF RR2D230TF U 13
AF RR2CM16JQ C 19
BS 1 669 RR2CM16TF
BS 670 670 RR2D230TF
BS 671 713 RR2CM16TF
BS 714 714 RR2D230TF
BS 715 727 RR2CM16TF
BS 728 728 RR2D230TF
BS 729 745 RR2CM16TF
BS 746 796 RR2CM16JQ

RD RR2CM16TF 745 0 0
GGAACATCATCACATTCACAATCTCTATAGCTCATACTATATAAGAATGGCTGGATCTCT
TAGATTTAATCATCACTTCCTCACATCTCTTCTCATTACCATTACGATAACCATGCTCAA
GTCGGTCCATACAGCAACAACAACAAACACGGAGTTCGTAAAATCATCATGCAAATTCAC
AACATATCAAAGACTCTGTGTCACTTCACTCTCAACTCAATCCAGTCTCATCCAAACCAG
CCACAAGCTCATGGCTCAAGCGGCTCTCAACATCACATTAGCCTCGGCTAAAGCCACATC
AGCAATGATGGTACGTCTCTCGAGTAGTCAGCTCAAGCCCAGAGAAGTCTCGGCCATGAG
AGACTGCGTTGAGGAGCTAGGTGACACGTTGGAGGAGCTTAGGAAATCGATAGGTGAGAT
GGGTCTGTTAAGTGACTCGAACTACGAAATCTACATGAGTGATATTCAGACTTGGGTTAG
CGCGGCTCTGACCGATGAGAACACGTGCTCGGATGGTTTTGGAGGAGCTGACATGAATGG
GAAAGTCAAGGATTTGGTTAGAGGGAGGATTTTGGTTATTGCTCATCTAACGAGTAATGC
TTTAGCTTTGATTAATCACTTTGCTTATATTCATGGCTAGAGAGACTAATATATTTTTTA
GTTTCTTTT*ATCGAAAATTTCTGTTGCTTTTGTCAGTTTGTGTATATAACAA*TAGTAA
TAGTACA*TGTATCGCTCGTCTTTA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2D230TF 736 0 0
CATTCA
CAATCTCTATAGCTCATACTATATAAGAATGGCTGGATCTCTTAGATTTAATCATCACTT
CCTCACATCTCTTCTCATTACCATTACGATAACCATGCTCAAGTCGGTCCATACAGCAAC
AACAACAAACACGGAGTTCGTAAAATCATCATGCAAATTCACAACATATCAAAGACTCTG
TGTCACTTCACTCTCGACTCAATCCAGTCTCATCCAAACCAGCCACAAGCTCATGGCTCA
AGCGGCTCTCAACATCACATT*GCCTCGGCTAAAGCCACATCAGCAATGATGGTACGTCT
CTCGAGTAGTCAGCTCAAGCCCAGAGAAGTCTCGGCCATGAGAGACTGCGTTGAGGAGCT
AGGTGACACGTTGGAGGAGCTTAGGAAATCGATAGGTGAGATGGGTCTGTTAAGTGACTC
GAACTACGAAATCTACATGAGTGATATTCAGACTTGGGTTAGCGCGGCTCTGACCGATGA
GAACACGTGCTCGGATGGTTTTGGAGGAGCTGACATGAATGGGAAAGTCAAGGATTTGGT
TAGAGGGAGGATTTTGGTTATTGCTCATCTAACGAGTAATGCTTTAGCTTTGATTAATCA
CTTTGCTTATATTCATGGCTAGAGAGACTAATATATTTTTTAGTTTCTTTTTATCGAAAA
TTTCTGTTGCTTTTGTCAGTTTGTGTATATAACAAATAGTAATAGTACAATGTATCGCTC
GTCTTTA
AGA

QA 7 733 7 733
DS 

RD RR2CM16JQ 778 0 0
CAATCTCTATAGCTCATACTATATAAGAATGGCTGGATCTCTTAGATTTAATCATCACTT
CCTCACATCTCTTCTCATTACCATTACGATAACCATGCTCAAGTCGGTCCATACAGCAAC
AACAACAAACACGGAGTTCGTAAAATCATCATGCAAATTCACAACATATCAAAGACTCTG
TGTCACTTCACTCTCAACTCAATCCAGTCTCATCCAAACCAGCCACAAGCTCATGGCTCA
AGCGGCTCTCAACATCACATTAGCCTCGGCTAAAGCCACATCAGCAATGATGGTACGTCT
CTCGAGTAGTCAGCTCAAGCCCAGAGAAGTTTCGGCCATGAGAGACTGCGTTGAGGAGCT
AGGTGACACGTTGGAGGAGCTTAGGAAATCGATAGGTGAGATGGGTCTGTTAAGTGACTC
GAACTACGAAATCTACATGAGTGATATTCAGACTTGGGTTAGCGCGGCTCTGACCGATGA
GAACACGTGCTCGGATGGTTTTGGAGGAGCTGACATGAATGGGAAAGTCAAGGATTTGGT
TAGAGGGAGGATTTTGGTTATTGCTCATCTAACGAGTAATGCTTTAGCTTTGATTAATCA
CTTTGCTTATATTCATGGCTAGAGAGACTAATATATTTTTTAGTTTCTTTTTATCGAAAA
TTTCTGTTGCTTTTGTCAGTTTGTGTATATAACAAATAGTAATAGTACAATGTATCGCTC
GTCTTTAAGATTCCGGAATCAATATGTACCAGAAAATATTCAATATTTTTTCTTTGCT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 3

CO CL3453Contig1 557 3 1 U
GAAGGATCTTGCTAAGCTCCTCTATTTGCTCAAACAAACAGATCATTCTTCCATCGTGTC
AACGCATCCTTTGATCACACTGCTCCAACAAGTCTGTTCCCAAACATGTATTTCCTTTAG
GACGACTGTCATGTTGTCGTTGTCCGCATCAGTACCAAAACCCAAACCTTCCGGATGGGC
TATAGTCAGCAAACTGGTGATCAAGAACGTTACTAGTACAAGTGCTCAAGTTCAGACCGG
ACAAGGAAACGAGTTCCAGATGATGGACGAAGAGCTACAAAGATTCTGTTCAGCGAAAGA
GATAAAGAAGGAAGGAATCAAGTCTTTGATCACCAGCTTGGATAACGTAGATGTTGCAGT
TGAGGAACTGGAGGAGTCGCTTGAAAGCTTGTACAGGCGTATGATCCAAGCCAGAGTCTC
TCTTTTGAACATACTCTCTTTGCATATATAATCCAATTAGAACTTCTTATTAGATTGTGT
ACGTATACAACTTCACTCATATTTTGATGAAACATGTTACCTTCATAGATTAATGAGGTA
AGTTGTATAATTACACC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RR2G269TF U 1
AF RR2G967JQ C 1
AF RR2G967TF U 1
BS 1 557 RR2G269TF

RD RR2G269TF 557 0 0
GAAGGATCTTGCTAAGCTCCTCTATTTGCTCAAACAAACAGATCATTCTTCCATCGTGTC
AACGCATCCTTTGATCACACTGCTCCAACAAGTCTGTTCCCAAACATGTATTTCCTTTAG
GACGACTGTCATGTTGTCGTTGTCCGCATCAGTACCAAAACCCAAACCTTCCGGATGGGC
TATAGTCAGCAAACTGGTGATCAAGAACGTTACTAGTACAAGTGCTCAAGTTCAGACCGG
ACAAGGAAACGAGTTCCAGATGATGGACGAAGAGCTACAAAGATTCTGTTCAGCGAAAGA
GATAAAGAAGGAAGGAATCAAGTCTTTGATCACCAGCTTGGATAACGTAGATGTTGCAGT
TGAGGAACTGGAGGAGTCGCTTGAAAGCTTGTACAGGCGTATGATCCAAGCCAGAGTCTC
TCTTTTGAACATACTCTCTTTGCATATATAATCCAATTAGAACTTCTTATTAGATTGTGT
ACGTATACAACTTCACTCATATTTTGATGAAACATGTTACCTTCATAGATTAATGAGGTA
AGTTGTATAATTACACC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2G967JQ 557 0 0
GAAGGATCTTGTTAAGCTCCTCTATTTGCTCAAACAAACAGATCATTCTTCCATCGTGTC
AACGCATCCTTTGATCACACTGCTCCAACAAGTCTGTTCCCAAACATGTATTTCCTTTAG
GACGACTGTCATGTTGTCGTTGTCCGCATCAGTACCAAAACCCAAACCTTCCGGATGGGC
TATAGTCAGCAAACTGGTGATCAAGAACGTTACTAGTACAAGTGCTCAAGTTCAGACCGG
ACAAGGAAACGAGTTCCAGATGATGGACGAAGAGCTACAAAGATTCTGTTCAGCGAAAGA
GATAAAGAAGGAAGGAATCAAGTCTTTGATCACCAGCTTGGATAACGTAGATGTTGCAGT
TGAGGAACTGGAGGAGTCGCTTGAAAGCTTGTACAGGCGTATGATCCAAGCCAGAGTCTC
TCTTTTGAACATACTCTCTTTGCATATATAATCCAATTAGAACTTCTTATTAGATTGTGT
ACGTATACAACTTCACTCATATTTTGATGAAACATGTTACCTTCATAGATTAATGAGGTA
AGTTGTATAATTACACC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2G967TF 557 0 0
GAAGGATCTTGCTAAGCTCCTCTATTTGCTCAAACAAACAGATCATTCTTCCATCGTGTC
AACGCATCCTTTGATCACACTGCTCCAACAAGTCTGTTCCCAAACATGTATTTCCTTTAG
GACGACTGTCATGTTGTCGTTGTCCGCATCAGTACCAAAACCCAAACCTTCCGGATGGGC
TATAGTCAGCAAACTGGTGATCAAGAACGTTACTAGTACAAGTGCTCAAGTTCAGACCGG
ACAAGGAAACGAGTTCCAGATGATGGACGAAGAGCTACAAAGATTCTGTTCAGCGAAAGA
GATAAAGAAGGAAGGAATCAAGTCTTTGATCACCAGCTTGGATAACGTAGATGTTGCAGT
TGAGGAACTGGAGGAGTCGCTTGAAAGCTTGTACAGGCGTATGATCCAAGCCAGAGTCTC
TCTTTTGAACATACTCTCTTTGCATATATAATCCAATTAGAACTTCTTATTAGATTGTGT
ACGTATACAACTTCACTCATATTTTGATGAAACATGTTACCTTCATAGATTAATGAGGTA
AGTTGTATAATTACACC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL3454Contig1 1125 2 4 U
GGGAGTGATCCAAGGGACAGCTAGTGAAGCTATTCTCGTTGTTTTGATTGCTGCCCGCGA
TAAGGTCTTAAGAAGAGTTGGCAAGAAGGCACTTGAAAAGCTCGTTGTCTACTCCTCTGA
CCAGACACATTCTTCTTTACTGAAAGCTTGTCAGATAGCAGGAATACATCTAGAGAATTG
CAGAATGCTGAAAACAGATTCCTCTACAAATTACGCTTTGCGACCAGAATCGCTTCAAGA
AGCTGTGTCTGGGGATCTTGAAGCTGGATTGATTCCATTCTTCTTATGTGGCACTGTTGG
AACCATTTCTTCAACAGCAGTTGATCCACTAGCAGCACTGGGAGAGATAGCAAAGAGCAA
TGAGATGTGGTTTCACGTGGATGCAGCGTATGCTGGAAGTGCTTGTATATGTCCAGAGTA
TAGACAGCACATTGACGGTGTAGAAACTGCAGACTCTTTTAACATGAATGCTCACAAATG
GTTGCTCACTAACTTCGATTGTTCCCTACTTTGGGTGAAGGATCAGTATGCTCTCACTGA
AGCTCTTTCAACAAATCCAGAGTTTCTCAAAAACAAGGCGTCTCAGGCAAACTTGGTTGT
TGACTACAAAGATTGGCAGATACCTCTCGGAAGAAGATTCAGGTCATTGAAACTATGGAT
GGGTTTTAAAGCTCTATGGAGCTGAGACCTTGAAGACCTATATTAGAAACCATATCAAAC
TGGCCAAAGATTTCGAACAACTTGTCTCTCTAGATCCTAGCTTTGAGGTTGTCACTCCTA
GGATCTTTTCTCTGGTCTGTTTTCGTATCGCGCCTGTGGATAACGATGAAAAGACATGCA
ACAACCTTAACCGCAACCTCCTAGAGGCATTGAACTCTTCAGGGAAACTCTTCATTTCTC
ACACTATCTTGTCGGGAAAATTCGTACTACGTGTCGCCATAGGAGCGCCATTGACTGAGG
AGAAGCACGTGATGGAGGCATGGAAGGTTATCCAGGAAGAAGCATCATACATACTTGCCT
CTCAAGTAAAATAAGCTAAGAAAAGTTTATGAGAAAACCTCATGTTCTTACCAACAAACC
GAAGCACTTGTTTCGTTTGGTTTAATTTGATTTGATATTATCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF22TF U 1
AF RR2AF22JQ C 315
BS 1 642 RR2AF22TF
BS 643 643 RR2AF22JQ
BS 644 841 RR2AF22TF
BS 842 1125 RR2AF22JQ

RD RR2AF22TF 841 0 0
GGGAGTGATCCAAGGGACAGCTAGTGAAGCTATTCTCGTTGTTTTGATTGCTGCCCGCGA
TAAGGTCTTAAGAAGAGTTGGCAAGAAGGCACTTGAAAAGCTCGTTGTCTACTCCTCTGA
CCAGACACATTCTTCTTTACTGAAAGCTTGTCAGATAGCAGGAATACATCTAGAGAATTG
CAGAATGCTGAAAACAGATTCCTCTACAAATTACGCTTTGCGACCAGAATCGCTTCAAGA
AGCTGTGTCTGGGGATCTTGAAGCTGGATTGATTCCATTCTTCTTATGTGGCACTGTTGG
AACCATTTCTTCAACAGCAGTTGATCCACTAGCAGCACTGGGAGAGATAGCAAAGAGCAA
TGAGATGTGGTTTCACGTGGATGCAGCGTATGCTGGAAGTGCTTGTATATGTCCAGAGTA
TAGACAGCACATTGACGGTGTAGAAACTGCAGACTCTTTTAACATGAATGCTCACAAATG
GTTGCTCACTAACTTCGATTGTTCCCTACTTTGGGTGAAGGATCAGTATGCTCTCACTGA
AGCTCTTTCAACAAATCCAGAGTTTCTCAAAAACAAGGCGTCTCAGGCAAACTTGGTTGT
TGACTACAAAGATTGGCAGATACCTCTCGGAAGAAGATTCAG*TCATTGAAACTATGGAT
GGGTTTTAAAGCTCTATGGAGCTGAGACCTTGAAGACCTATATTAGAAACCATATCAAAC
TGGCCAAAGATTTCGAACAACTTGTCTCTCTAGATCCTAGCTTTGAGGTTGTCACTCCTA
GGATCTTTTCTCTGGTCTGTTTTCGTATCGCGCCTGTGGATAACGATGAAAAGACATGCA
A

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR2AF22JQ 811 0 0
CAGCAGTTGATCCACTAGCAGCACTGGGAGAGATAGCAAAGAGCAATGAGATGTGGTTTC
ACGTGGATGCAGCGTATGCTGGAAGTGCTTGTATATGTCCAGAGTATAGACAGCACATTG
ACGGTGTAGAAACTGCAGACTCTTTTAACATGAATGCTCACAAATGGTTGCTCACTAACT
TCGATTGTTCCCTACTTTGGGTGAAGGATCAGTATGCTCTCACTGAAGCTCTTTCAACAA
ATCCAGAGTTTCTCAAAAACAAGGCGTCTCAGGCAAACTTGGTTGTTGACTACAAAGATT
GGCAGATACCTCTCGGAAGAAGATTCAGGTCATTGAAACTATGGATGG*TTTTAAGGCTC
TATGGAGCTGAGACCTTGAAGACCTATATTAGAAACCATATCAAACTGGCCAAAGATTTC
GAACAACTTGTCTCTCTAGATCCTAGCTTTGAGGTTGTCACTCCTAGGATCTTTTCTCTG
GTCTGTTTTCGTATCGCGCCTGTGGATAACGATGAAAAGACATGCAACAACCTTAACCGC
AACCTCCTAGAGGCATTGAACTCTTCAGGGAAACTCTTCATTTCTCACACTATCTTGTCG
GGAAAATTCGTACTACGTGTCGCCATAGGAGCGCCATTGACTGAGGAGAAGCACGTGATG
GAGGCATGGAAGGTTATCCAGGAAGAAGCATCATACATACTTGCCTCTCAAGTAAAATAA
GCTAAGAAAAGTTTATGAGAAAACCTCATGTTCTTACCAACAAACCGAAGCACTTGTTTC
GTTTGGTTTAATTTGATTTGATATTATCACT

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL3455Contig1 515 2 2 U
TTTTTTTTTAAATAGTTTGCGAGAAGATGTCAGGAAGAGGGAAAGGAGGAAAGGGATTGG
GAAAGGGAGGAGCCAAGAGGCACAGGAAGGTGCTTAGGGACAACATCCAAGGTATCACCA
AGCCTGCCATCCGTCGTCTTGCTCGTCGAGGTGGAGTCAAGCGTATAAGCGGTCTTATCT
ACGAAGAGACCAGAGGAGTCCTCAAGATCTTCCTCGAGAATGTCATCCGCGACGCTGTCA
CCTACACCGAGCACGCTAGGAGGAAGACTGTCACCGCCATGGATGTGGTTTACGCTTTGA
AGAGGCAGGGACGCACTCTCTACGGTTTCGGCGGTTAAATTGAATCGACGGATTTGGGAA
TCAGGGTTTCGAAAATTTGGGGATCTGAAAATTTCTTTGTTTCTGGTTAGCTGAAGTAAA
ATCCACGACTATTGTGTATCGTTTTATGCTATGTTGTTAGCCAATATTATGTTAAATGAA
TCTTAGCGAAACTGATGATGAGAATTTCTAATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ET59JQ C 1
AF RR2ET59TF U 1
BS 1 15 RR2ET59JQ
BS 16 515 RR2ET59TF

RD RR2ET59JQ 515 0 0
TTTTTTTTTAAATAGTTTGCGAGAAGATGTCAGGAAGAGGGAAAGGAGGAAAGGGATTGG
GAAAGGGAGGAGCCAAGAGGCACAGGAAGGTGCTTAGGGACAACATCCAAGGTATCACCA
AGCCTGCCATCCGTCGTCTTGCTCGTCGAGGTGGAGTCAAGCGTATAAGCGGTCTTATCT
ACGAAGAGACCAGAGGAGTCCTCAAGATCTTCCTCGAGAATGTCATCCGCGACGCTGTCA
CCTACACCGAGCACGCTAGGAGGAAGACTGTCACCGCCATGGATGTGGTTTACGCTTTGA
AGAGGCAGGGACGCACTCTCTACGGTTTCGGCGGTTAAATTGAATCGACGGATTTGGGAA
TCAGGGTTTCGAAAATTTGGGGATCTGAAAATTTCTTTGTTTCTGGTTAGCTGAAGTAAA
ATCCACGACTATTGTGTATCGTTTTATGCTATGTTGTTAGCCAATATTATGTTAAATGAA
TCTTAGCGAAACTGATGATGAGAATTTCTAATTAG

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2ET59TF 515 0 0
TTTTTTTTTAAATAG
TTTGCGAGAAGATGTCAGGAAGAGGGAAAGGAGGAAAGGGATTGGGAAAGGGAGGAGCCA
AGAGGCACAGGAAGGTGCTTAGGGACAACATCCAAGGTATCACCAAGCCTGCCATCCGTC
GTCTTGCTCGTCGAGGTGGAGTCAAGCGTATAAGCGGTCTTATCTACGAAGAGACCAGAG
GAGTCCTCAAGATCTTCCTCGAGAATGTCATCCGCGACGCTGTCACCTACACCGAGCACG
CTAGGAGGAAGACTGTCACCGCCATGGATGTGGTTTACGCTTTGAAGAGGCAGGGACGCA
CTCTCTACGGTTTCGGCGGTTAAATTGAATCGACGGATTTGGGAATCAGGGTTTCGAAAA
TTTGGGGATCTGAAAATTTCTTTGTTTCTGGTTAGCTGAAGTAAAATCCACGACTATTGT
GTATCGTTTTATGCTATGTTGTTAGCCAATATTATGTTAAATGAATCTTAGCGAAACTGA
TGATGAGAATTTCTAATTAG

QA 16 515 16 515
DS 



AS 1 3

CO CL3456Contig1 1065 3 13 U
GGCTCCTTGTGTTGTAAATCTCTGCTTAGGGTTTCGTAATTTGTAGCAATCTCTGGGCGA
TGAATCCGTTGACGCAGATAAAGTGGACACAGGCAATAAACGCCAAGGAAGCAGATCTTG
GGATCTCTGAGGAGGCTTCGTGGCACTCAAGGTACAAAAACTCCGCCTACATCTACGCCG
GAGGCTTACCTTTCGACCTCACCGAGGGTGATCTCCTCGCCGTTTTCGCACAATATGGCG
AAGTGGTTGATGTCAATCTCATCAGAGACAAGAGCACTGGAAAATCAAAGGGATTTGCGT
TTCTTGCTTATGAAGATCAGAGAAGCACCATTCTCGCTGTTGATAATCTGAATGGAGCTC
AGGTCTTGGGGAGGACAATTAAGGTGGACCATTGTAGGGAACACAAGAAGCATGAAGAGG
AAGACGAAGAGATGCGGCAGCATAACAGAGAGGCACGTGGCGTGTGCAGAGCTTTTCAGA
GAGGAGAGTGTACCCGTGGTGATTCTTGCAAGTTTTCCCACGACGAGAAAAGAGCTGCAA
ATACTGGTTGGGGTCATGAAGAGGATAAAAGCGCCAAGTGGGGTAATGACAAGTTTAATG
GTGCCAAGAAGGG*TGGTGGTGGCCATCGAGGAGGAGACTTCAAGCCTGACGGGGAAGAG
AAGACTTACAGAGGAACGAGTCATGGAGAAAGAGAGCCAAGGTCGAGAGATTCTTATGAT
AGGGAGGGAAGAAAAGAGATCACGACGTCTCGATGATTCGCAATATAGAAGACACGATGC
TGAAAATGATTATGCAAAGGGAGGACAAGAGATCCAGAACAAACGATAGCGATAAACCGA
AGGAAAGATCTAGAAGGGATTATAACGACAGGGAGAGAGAAGGTTCAAGTCGGCAATCAG
ACTCATCGTCGAGGAGGGATAGTGATTATTCAAGCAGGGATGGTTGCCGTCGCTAAAGGG
ATGGATAATGGGTATATGCTAGAGTCTCTAGGAATGAGATGTGTTGTTCTTTTACAAGAG
AGTTGGTTGTATAAACTGCTTTGTCCTTTAACCGTCATTCTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC25TF U 1
AF RR2B170TF U 41
AF RR2DC25JQ C 459
BS 1 321 RR2DC25TF
BS 322 322 RR2B170TF
BS 323 424 RR2DC25TF
BS 425 425 RR2B170TF
BS 426 610 RR2DC25TF
BS 611 611 RR2B170TF
BS 612 625 RR2DC25TF
BS 626 750 RR2B170TF
BS 751 751 RR2DC25JQ
BS 752 824 RR2B170TF
BS 825 825 RR2DC25JQ
BS 826 841 RR2B170TF
BS 842 1065 RR2DC25JQ

RD RR2DC25TF 625 0 0
GGCTCCTTGTGTTGTAAATCTCTGCTTAGGGTTTCGTAATTTGTAGCAATCTCTGGGCGA
TGAATCCGTTGACGCAGATAAAGTGGACACAGGCAATAAACGCCAAGGAAGCAGATCTTG
GGATCTCTGAGGAGGCTTCGTGGCACTCAAGGTACAAAAACTCCGCCTACATCTACGCCG
GAGGCTTACCTTTCGACCTCACCGAGGGTGATCTCCTCGCCGTTTTCGCACAATATGGCG
AAGTGGTTGATGTCAATCTCATCAGAGACAAGAGCACTGGAAAATCAAAGGGATTTGCGT
TTCTTGCTTATGAAGATCAGATAAGCACCATTCTCGCTGTTGATAATCTGAATGGAGCTC
AGGTCTTGGGGAGGACAATTAAGGTGGACCATTGTAGGGAACACAAGAAGCATGAAGAGG
AAGATGAAGAGATGCGGCAGCATAACAGAGAGGCACGTGGCGTGTGCAGAGCTTTTCAGA
GAGGAGAGTGTACCCGTGGTGATTCTTGCAAGTTTTCCCACGACGAGAAAAGAGCTGCAA
ATACTGGTTGGGGTCATGAAGAGGATAAAAGCGCCAAGTGGGGTAATGACAAGTTTAATG
GTGCCAAGAAAGG*TGGTGGTGGCC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2B170TF 809 0 0
GG
GTAGCAATCTCTGGGCGATGAATCCGTTGACGCAGATAAAGTGGACACAGGCAATAAACG
CCAAGGAAGCAGATCTTGGGATCTCTGAGGAGGCTTCGTGGCACTCAAGGTACAAAAACT
CCGCCTACATCTACGCCGGAGGCTTACCTTTCGACCTCACCGAGGGTGATCTCCTCGCCG
TTTTCGCACAATATGGCGAAGTGGTTGATGTCAATCTCATCAGAGACAAGAGCACTGGAA
AATCAAAGGGATTTGCGTTTCTTGCTTATGAAGATCAGAGAAGCACCATTCTCGCTGTTG
ATAATCTGAATGGAGCTCAGGTCTTGGGGAGGACAATTAAGGTGGACCATTGTAGGGAAT
ACAAGAAGCATGAAGAGGAAGACGAAGAGATGCGGCAGCATAACAGAGAGGCACGTGGCG
TGTGCAGAGCTTTTCAGAGAGGAGAGTGTACCCGTGGTGATTCTTGCAAGTTTTCCCACG
ACGAGAAAAGAGCTGCGAATACTGGTTGGGGTCATGAAGAGGATAAAAGCGCCAAGTGGG
GTAATGACAAGTTTAATGGTGCCAAGAAGGGGTGGTGGTGGCCATCGAGGAGGAGACTTC
AAGCCTGACGGGGAAGAGAAGACTTACAGAGGAACGAGTCATGGAGAAAGAGAGCCAAGG
TCGAGAGATTCTTATGATAGGGAGGGAAGAAAAGAGATCACGACGTCTTGATGATTCGCA
ATATAGAAGACACGATGCTGAAAATGATTATGCAAAGGGAGGACAAGAGATCCAGAACAA
AC*ATAGCGATAAACCGAA
AGAAGATC

QA 3 801 3 801
DS 

RD RR2DC25JQ 607 0 0
GGCGTGTGCAGAGCTTTTCAGAGAGGAGAGTGTACCCGTGGTGATTCTTGCAAGTTTTCC
CACGACGAGAAAAGAGCTGCAAATACTGGTTGGGGTCATGAAGAGGATAAAAGCGCCAAG
TGGGGTAATGACAAGTTTAATGGTGCCAAGAAGGG*TGGTGGTGGCCATCGAGGAGGAGA
CTTCAAGCCTGACGGGGAAGAGAAGACTTACAGAGGAACGAGTCATGGAGAAAGAGAGCC
AAGGTCGGGAGATTCTTATGATAGG*AGGGAAGAAAAGAGATCAGGACGTCTCGATGATT
CGCAATATAGAAGACACGATGCTGAAAATGATTATGCAA*GGGAGGACAAGAGATCCAGA
ACAAACGATAGCGATAAACCGAAGGAAAGATCTAGAAGGGATTATAACGACAGGGAGAGA
GAAGGTTCAAGTCGGCAATCAGACTCATCGTCGAGGAGGGATAGTGATTATTCAAGCAGG
GATGGTTGCCGTCGCTAAAGGGATGGATAATGGGTATATGCTAGAGTCTCTAGGAATGAG
ATGTGTTGTTCTTTTACAAGAGAGTTGGTTGTATAAACTGCTTTGTCCTTTAACCGTCAT
TCTATGT

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 3

CO CL3457Contig1 562 3 1 U
GCCCCAATAGAAAACATATTAAAATCTCGAGATTCAGCAAATGTAACAAAGATGATTTGA
AAAAGAAAAAAAAAGATATTACAACAGGGAGTGTTGGGATAACAACGAAAACACACATCA
AATTTACCAATAAACATACATTATATTTGAAAAAAACTCAAGGTTGCTGTTTGTCTTGGT
GTCTAGTGTCTTGCCTCTAATGTCTCTTGCTCTCAAGTCACAAGAAGATGAAGCCGGGCG
GGTCCAAGACCTTAGATTTCAACACTCCTTTGTGGATCAGAAAGCTGCCCAACCTGCAGC
TCCTGTCGGTCCTGATGATCCCTTTGTTGAAGGAAGATTCTTCTTGAGCTGAGATAGATC
AGACAGAGGATCGTTTCTGCGTCTTGTGTAATCCGCTGGTTCCTTAGAAGAACCGTCAGA
TGCAATCCTTGAAGCGACAGGATCATTCGGTGGAGGCGGTAAAGGAGACCTGATTTTTAT
AGCAGCATTTGGTGGTGGAGCAAGTGCTAGAGGTTTAGGCTTCCCGTTCCCTGAAAGAGC
AGCTGAAAGCATCCCAGTGCCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BH78JQ U 1
AF RR2DY63JQ U 3
AF RR2BH78TF C 1
BS 1 562 RR2BH78JQ

RD RR2BH78JQ 562 0 0
GCCCCAATAGAAAACATATTAAAATCTCGAGATTCAGCAAATGTAACAAAGATGATTTGA
AAAAGAAAAAAAAAGATATTACAACAGGGAGTGTTGGGATAACAACGAAAACACACATCA
AATTTACCAATAAACATACATTATATTTGAAAAAAACTCAAGGTTGCTGTTTGTCTTGGT
GTCTAGTGTCTTGCCTCTAATGTCTCTTGCTCTCAAGTCACAAGAAGATGAAGCCGGGCG
GGTCCAAGACCTTAGATTTCAACACTCCTTTGTGGATCAGAAAGCTGCCCAACCTGCAGC
TCCTGTCGGTCCTGATGATCCCTTTGTTGAAGGAAGATTCTTCTTGAGCTGAGATAGATC
AGACAGAGGATCGTTTCTGCGTCTTGTGTAATCCGCTGGTTCCTTAGAAGAACCGTCAGA
TGCAATCCTTGAAGCGACAGGATCATTCGGTGGAGGCGGTAAAGGAGACCTGATTTTTAT
AGCAGCATTTGGTGGTGGAGCAAGTGCTAGAGGTTTAGGCTTCCCGTTCCCTGAAAGAGC
AGCTGAAAGCATCCCAGTGCCC

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2DY63JQ 541 0 0
CCCAATAGAAAACATATTAAAATCTCGAGATTCAGCAAATGTAACAAAGATGATTTGAAA
AAGAAAAAAAAAGATATTACAACAGGGAGTGTTGGGATAACAACGAAAACACACATCAAA
TTTACCAATAAACATACATTATATTTGAAAAAAACTCAAGGTTGCTGTTTGTCTTGGTGT
CTAGTGTCTTGCCTCTAATGTCTCTTGCTCTCAAGTCACAAGAAGATGAAGCCGGACGGG
TCCAAGACCTTAGATTTCAACACTCCTTTGTGGATCAGAAAGCTGCCCAACCTGCAGCTC
CTGTCGGTCCTGACGATCCCTTTGTTGAAGGAAGATTCTTCTTGAGCTGAGATAGATCAG
ACAGAGGATCGTTTCTGCGTCTTGCGTAATCCGCTGGTTCCTTAGAAGAACCGTCAGATG
CAATCCTTGAAGCGACAGGATCATTCGGTGGAGGCGGTAAAGGAGACCTGATTTTTATAG
CAGCATTTGGTGGTGGAGCAAGTGCTAGAGGTTTAGGCTTCCCGTTCCCTGAAAGAGCAG
C

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR2BH78TF 562 0 0
GC
CCCAATAGAAAACATATTAAAATCTCGAGATTCAGCAAATGTAACAAAGATGATTTGAAA
AAGAAAAAAAAAGATATTACAACAGGGAGTGTTGGGATAACAACGAAAACACACATCAAA
TTTACCAATAAACATACATTATATTTGAAAAAAACTCAAGGTTGCTGTTTGTCTTGGTGT
CTAGTGTCTTGCCTCTAATGTCTCTTGCTCTCAAGTCACAAGAAGATGAAGCCGGGCGGG
TCCAAGACCTTAGATTTCAACACTCCTTTGTGGATCAGAAAGCTGCCCAACCTGCAGCTC
CTGTCGGTCCTGATGATCCCTTTGTTGAAGGAAGATTCTTCTTGAGCTGAGATAGATCAG
ACAGAGGATCGTTTCTGCGTCTTGTGTAATCCGCTGGTTCCTTAGAAGAACCGTCAGATG
CAATCCTTGAAGCGACAGGATCATTCGGTGGAGGCGGTAAAGGAGACCTGATTTTTATAG
CAGCATTTGGTGGTGGAGCAAGTGCTAGAGGTTTAGGCTTCCCGTTCCCTGAAAGAGCAG
CTGAGAGCATCCCAGTGCCC

QA 3 562 3 562
DS 



AS 1 3

CO CL3458Contig1 1392 3 3 U
GGAGTAACAGCGAGTCCACGAATCATGGTCGAACCGTTCGTGAAGACATTCCTAGGAGTC
GATAAAGTTCTTGGGACAGAACTCGAGGTTTCCAAATCGGGTCGAGCAACCGGTTTTGTC
AGAAGACCCGGTGTTCTAGTTGGTCAACACAAACGTGAGGCAGTTTTGAGAGAGTTCGAT
GGCGTTGCGTCTGGTTTACCTGATCTGGGGCTTGGCGATAGTAAGACAGACCACGAATTC
ATGGCAATTTGCAAGGAGGGTTACATGGTACCACGTACAAAATGCGAACCACTACCAAGA
AACAAACTCTTAATCACCATAATATTCCACGAGGGCAGATTAGTCCAGCGTCCAACGCCG
TTAGTTGCTCTGTTAACTCTCCTTTGGCTTCCCATCGGTTTTCTAGTGTCTCTTATCTGT
GTCTACACGAATATTCCGCTACCCGAACGCATTGCACGTTACAACTACAAGCTCACAGGG
ATCAAACTAGTCGTCAACGGCCACCCTCCTCCGCCACCTAAGCCTGGCCAACCAGGCTAT
CTATTGGTCTGCAACCACCGGACCGTCCTAGACCCGGTGGTGACAGCTGTCGTTCTCGGC
CGGAAAATCAGCTGCGTGACATACAGCATCAGCAAATTCTCTGAGATAATCTCTCCAATC
AAAACCGTCGCGTTGACTCGTCAGCGCGATAAAGACGCAGCTAACATCAAGCGTCTCTTG
GAGGAAGGCGATCTTGTGATATGTCCCGAGGGAACCACGTGTCGTGAGCCTTTTCTTCTC
CGGTTTAGCGCCATGTTCGCCGAGCTGACGGACCGGATCGTCCCTGTGGCTATCAACACC
AAACAAAGCATGTTTAATGGTACGACCACACGTGGCTACAAGCTTCTTGATCCTTACTTC
GCTTTCATGAACCCCATTCCCACGTTCGAGATCACTTTCCTTAAGCAGCTACCGGCTGAG
CTGACATGTAAAGGAGGCAAATCGCCGATAGAGGTGGCGAATTACATACAGAGGGTTTTG
GCAGGAACCTTAGGGTTTGAGTGCACCAATTTCACAAGAAAGGACAAGTACGCAATGCTA
GCTGGTACCGACGGTAGGGTTCCGGTGAAGAAGGAAAATATATAATTATCGATTGGATAA
AAGAGAAGAAGAAATAATACAAAGATATGAATATTTTTCATTGGGCTAGTTAGCTATTAC
TGTCTTCTATGTTTCCATATATTTTCTTCGCAAGTTTATATTTGTGATATTTTCAAGGTT
TACTTCAGTACAATAAACTCCAACACGGGGAGAAACTAAAAATGCATAACTAAATGTAAA
AATATTATTATTTAAATGTAATCAAAAATGATAAAATTTAATGACGTTAGAAAAGCAGAC
CAGTGACATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX44TF U 1
AF RR2FX44JQ C 605
AF RR2DB74TF U 807
BS 1 719 RR2FX44TF
BS 720 809 RR2FX44JQ
BS 810 1392 RR2DB74TF

RD RR2FX44TF 719 0 0
GGAGTAACAGCGAGTCCACGAATCATGGTCGAACCGTTCGTGAAGACATTCCTAGGAGTC
GATAAAGTTCTTGGGACAGAACTCGAGGTTTCCAAATCGGGTCGAGCAACCGGTTTTGTC
AGAAGACCCGGTGTTCTAGTTGGTCAACACAAACGTGAGGCAGTTTTGAGAGAGTTCGAT
GGCGTTGCGTCTGGTTTACCTGATCTGGGGCTTGGCGATAGTAAGACAGACCACGAATTC
ATGGCAATTTGCAAGGAGGGTTACATGGTACCACGTACAAAATGCGAACCACTACCAAGA
AACAAACTCTTAATCACCATAATATTCCACGAGGGCAGATTAGTCCAGCGTCCAACGCCG
TTAGTTGCTCTGTTAACTCTCCTTTGGCTTCCCATCGGTTTTCTAGTGTCTCTTATCTGT
GTCTACACGAATATTCCGCTACCCGAACGCATTGCACGTTACAACTACAAGCTCACAGGG
ATCAAACTAGTCGTCAACGGCCACCCTCCTCCGCCACCTAAGCCTGGCCAACCAGGCTAT
CTATTGGTCTGCAACCACCGGACCGTCCTAGACCCGGTGGTGACAGCTGTCGTTCTCGGC
CGGAAAATCAGCTGCGTGACATACAGCATCAGCAAATTCTCTGAGATAATCTCTCCAATC
AAAACCGTCGCGTTGACTCGTCAGCGCGATAAAGACGCAGCTAACATCAAGCGTCTCTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2FX44JQ 766 0 0
AAATCAGCTGCGTGACATACAGCATCAGCAAATTCTCTGAGATAATCTCTCCAATCAAAA
CCGTCGCGTTGACTCGTCAGCGCGATAAAGACGCAGCTAACATCAAGCGTCTCTTGGAGG
AAGGCGATCTTGTGATATGTCCCGAGGGAACCACGTGTCGTGAGCCTTTTCTTCTCCGGT
TTAGCGCCATGTTCGCCGAGCTGACGGACCGGATCGTCCCTGTGGCTATCAACACCAAAC
AAAGCATGTTTAATGGTACGACCACACGTGGCTACAAGCTTCTTGATCCTTACTTCGCTT
TCATGAACCCCATTCCCACGTTCGAGATCACTTTCCTTAAGCAGCTACCGGCTGAGCTGA
CATGTAAAGGAGGCAAATCGCCGATAGAGGTGGCGAATTACATACAGAGGGTTTTGGCAG
GAACCTTAGGGTTTGAGTGCACCAATTTCACAAGAAAGGACAAGTACGCAATGCTAGCTG
GTACCGACGGTAGGGTTCCGGTGAAGAAGGAAAATATATAATTATCGATTGGATAAAAGA
GAAGAAGAAATAATACAAAGATATGAATATTTTTCATTGGGCTAGTTAGCTATTACTGTC
TTCTATGTTTCCATATATTTTCTTCGCAAGTTTATATTTGTGATATTTTCAAGGTTTACT
TCAGTACAATAAACTCCAACACGGGGAGAAACTAAAAATGCATAGCTAAATGTAAAAATA
TTATTATTTAAATGTAATCAAAAATGATAAAATTTAATGACGTTAG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2DB74TF 586 0 0
TGG
GGACCGGATCGTCCCTGTGGCTATCAACACCAAACAAAGCATGTTTAATGGTACGACCAC
ACGTGGCTACAAGCTTCTTGATCCTTACTTCGCTTTCATGAACCCCATTCCCACGTTCGA
GATCACTTTCCTTAAGCAGCTACCGGCTGAGCTGACATGTAAAGGAGGCAAATCGCCGAT
AGAGGTGGCGAATTACATACAGAGGGTTTTGGCAGGAACCTTAGGGTTTGAGTGCACCAA
TTTCACAAGAAAGGACAAGTACGCAATGCTAGCTGGTACCGACGGTAGGGTTCCGGTGAA
GAAGGAAAATATATAATTATCGATTGGATAAAAGAGAAGAAGAAATAATACAAAGATATG
AATATTTTTCATTGGGCTAGTTAGCTATTACTGTCTTCTATGTTTCCATATATTTTCTTC
GCAAGTTTATATTTGTGATATTTTCAAGGTTTACTTCAGTACAATAAACTCCAACACGGG
GAGAAACTAAAAATGCATAACTAAATGTAAAAATATTATTATTTAAATGTAATCAAAAAT
GATAAAATTTAATGACGTTAGAAAAGCAGACCAGTGACATGTG

QA 4 586 4 586
DS 



AS 1 2

CO CL3459Contig1 1072 2 8 U
GGATGCAGAAGATAACATCCCACATCAAGAACCCTTCCAAGTTCTCCAAAGCCTCTAAGC
TTGCAATACGCCTGATTCAAGCTGGAAGCGTGAAGCCTGAGACGAGCAGTTACTTCATCG
CGATGCTCGAAGCTGCAATGTCGTCGAAAACTCCTTGTACAGATCGATTGGTTAGAGCAG
ACTATCATGCTTTGTTCTCAGCTGCTCAGGATGTCGCCGAGTGCCTTGATAAAAGCCAGA
AGAATCTGCTGACCATATGGACTATTAAAGCAGTTGTGGCTAATGACCTCTTTACTGATG
ACAGCTTTATGTTTTCCAAGACTGGTACTCAAATAAAGGAGGCTATATCTGATCTTCCAG
TGGCAACTGAGGAAGATGATGCGGAAGAAGCAGCTGCTCTTGAACAAGAGGCTGTGAAGG
ACAGTGGAGATGGAGAGACAACACAGGACGTGGATGACGCTGCTTCAGCTGGAGGTCAAG
AGGATACCGAGTCTGATCCCTTTGGGTTGGATGCATGGATCCCCAGTGGTGTGAAGAAAA
ATGGTAAAACAAAGATGACGAGAGAAGATACAGATGCCTTGGAGAACAAGAAATTTCTCA
GGTCGAAAAGAGAAGCTTTGATTACATGCCTGGAGATCGCTGCACGCCGTTACAGAGTTC
CATGGTGCCAGACTGTTATAGACATACTGGTGAAACATGCGTTTGAGAACCTGTCGAGGT
TCACATCACAGCAGAGACAAGCAGTGGAAAACTGTGGGCTTCTGTTAGAGAGCAACATCT
CCGTAGGAAGCAAGGCAAATCAGTGACGGGGAAACTGGACGTGACTGCTTTCGAAAGTCT
TCAGGATAAATACGCCAACGAGAAGATGAGCATCCGGCGATCTGTTGGAGCCAACGGTGA
ACGCCGTGCACAACAATGGCTTGGTTGATAAAAACATGTTACCAAAAACAAAAGTGTAAT
TTGTATGATTTTTACACTAAGACAGAAGTAGTAGAAAGCAGATATTTGCTCTGTTTCCTT
CCGATTGTGTCTTGATACAAAAACTTTCAACCTTTATCCAAAAAATATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B113TF U 1
AF RR2B113JQ C 404
BS 1 786 RR2B113TF
BS 787 787 RR2B113JQ
BS 788 844 RR2B113TF
BS 845 845 RR2B113JQ
BS 846 863 RR2B113TF
BS 864 864 RR2B113JQ
BS 865 874 RR2B113TF
BS 875 1072 RR2B113JQ

RD RR2B113TF 874 0 0
GGATGCAGAAGATAACATCCCACATCAAGAACCCTTCCAAGTTCTCCAAAGCCTCTAAGC
TTGCAATACGCCTGATTCAAGCTGGAAGCGTGAAGCCTGAGACGAGCAGTTACTTCATCG
CGATGCTCGAAGCTGCAATGTCGTCGAAAACTCCTTGTACAGATCGATTGGTTAGAGCAG
ACTATCATGCTTTGTTCTCAGCTGCTCAGGATGTCGCCGAGTGCCTTGATAAAAGCCAGA
AGAATCTGCTGACCATATGGACTATTAAAGCAGTTGTGGCTAATGACCTCTTTACTGATG
ACAGCTTTATGTTTTCCAAGACTGGTACTCAAATAAAGGAGGCTATATCTGATCTTCCAG
TGGCAACTGAGGAAGATGATGCGGAAGAAGCAGCTGCTCTTGAACAAGAGGCTGTGAAGG
ACAGTGGAGATGGAGAGACAACACAGGACGTGGATGACGCTGCTTCAGCTGGAGGTCAAG
AGGATACCGAGTCTGATCCCTTTGGGTTGGATGCATGGATCCCCAGTGGTGTGAAGAAAA
ATGGTAAAACAAAGATGACGAGAGAAGATACAGATGCCTTGGAGAACAAGAAATTTCTCA
GGTCGAAAAGAGAAGCTTTGATTACATGCCTGGAGATCGCTGCACGCCGTTACAGAGTTC
CATGGTGCCAGACTGTTATAGACATACTGGTGAAACATGCGTTTGAGAACCTGTCGAGGT
TCACATCACAGCAGAGACAAGCAGTGGAAAACTGTGGGCTTCTGTTAGAGAGCAACATCT
CCGTAG*AAGCAAGGCAAATCAGTGACGGGGAAACTGGACGTGACTGCTTTCGAAAGTCT
TCAG*ATAAATACGCCAACGAGA*GATGAGCATC

QA 1 874 1 874
DS 

RD RR2B113JQ 669 0 0
ACAAGAGGCTGTGAAGGACAGTGGAGATGGAGAGACAACACAGGACGTGGATGACGCTGC
TTCAGCTGGAGGTCAAGAGGATACCGAGTCTGATCCCTTTGGGTTGGATGCATGGATCCC
CAGTGGTGTGAAGAAAAATGGTAAAACAAAGATGACGAGAGAAGATACAGATGCCTTGGA
GAACAAGAAATTTCTCAGGTCGAAAAGAGAAGCTTTGATTACATGCCTGGAGATCGCTGC
ACGCCGTTACAGAGTTCCATGGTGCCAGACTGTTATAGACATACTGGTGAAACATGCGTT
TGAGAACCTGTCGAGGTTCACATCACAGCAGAGACAAGCAGTGGAAAACTGTGGGCTTCT
GTTAGAGAGCAACATCTCCGTAGGAAGCAAGGCAAATCAGTGACGGGGAAACTGGACGTG
ACTGCTTTCGAAAGTCTTCAGGATAAATACGCCAACGAGAAGATGAGCATCCGGCGATCT
GTTGGAGCCAACGGTGAACGCCGTGCACAACAATGGCTTGGTTGATAAAAACATGTTACC
AAAAACAAAAGTGTAATTTGTATGATTTTTACACTAAGACAGAAGTAGTAGAAAGCAGAT
ATTTGCTCTGTTTCCTTCCGATTGTGTCTTGATACAAAAACTTTCAACCTTTATCCAAAA
AATATTTGC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 3

CO CL3460Contig1 722 3 28 U
GAACTTTGTTTAATTTGCTGGTTCCACTTCTGATCATCAATGTAAAAGACAAAACAATAA
TTCGAAAATCTTATCGAAAGATCTCTCAAAGTTGAGATATAAAAGGAATATAAAACAACA
CTTCTTTAGCTAA*TGATACACATTCTCTTGTTTTTCTTT*TTTTCAGTCCGAGCTAGGA
AGGAACTTGGTTCCTGATCTAGTACCGAACCTAGAAGCTGCCGGGATAATCCTCGATGGA
GACAAGACCTGTGCGAACGAGAAGTTGTAAGAATCAGTGCCTAACCGGCTCTGCAACCAT
CCTCTGCCACCAGAGAATCCATCTGTCACGATCCAGCAGTTCTTATACCCGAGAACCTTT
AAGGTTTTCGCCACTATTTTAGCTGAGTCCGAGTACGAGTCCATGATGATGATGTTGGAG
CCTCTGTTGATTCTCTTGAGGTAAGATATCTTTAACGCTGCTATTTCTGCTTCAACACGT
TTCGAGTTCCTCACGATTCCTTTTACTTTGTTCGGTAGCTCTTCTAATGGAATGGCGATC
ATGCTGTTCTTAGCATTTGAAGGGAGACGAGGGATCCCAGCTTTTTCCTTCTCTTTCTCT
GATCTTATATCCACCATCAAGTAGTTCTTGGAACATAGAAGATCAAGTGTTTGAGCCGGT
GTGAGGTCACCTTTGTAACCACGGAAGTTAAAAGATATAGCAGACCAAACAGGAGGGAGG
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM46JQ U 1
AF RR2BT23JQ U 75
AF RR2CG36JQ U 32
BS 1 95 RR2EM46JQ
BS 96 96 RR2CG36JQ
BS 97 133 RR2EM46JQ
BS 134 134 RR2CG36JQ
BS 135 160 RR2EM46JQ
BS 161 161 RR2CG36JQ
BS 162 221 RR2EM46JQ
BS 222 222 RR2CG36JQ
BS 223 260 RR2EM46JQ
BS 261 261 RR2CG36JQ
BS 262 270 RR2EM46JQ
BS 271 271 RR2CG36JQ
BS 272 314 RR2EM46JQ
BS 315 315 RR2CG36JQ
BS 316 352 RR2EM46JQ
BS 353 353 RR2CG36JQ
BS 354 362 RR2EM46JQ
BS 363 363 RR2CG36JQ
BS 364 369 RR2EM46JQ
BS 370 370 RR2CG36JQ
BS 371 411 RR2EM46JQ
BS 412 414 RR2CG36JQ
BS 415 423 RR2EM46JQ
BS 424 424 RR2CG36JQ
BS 425 458 RR2EM46JQ
BS 459 459 RR2CG36JQ
BS 460 583 RR2EM46JQ
BS 584 722 RR2CG36JQ

RD RR2EM46JQ 583 0 0
GAACTTTGTTTAATTTGCTGGTTCCACTTCTGATCATCAATGTAAAAGACAAAACAATAA
TTCGAAAATCTTATCGAAAGATCTCTCAAAGTTGAAATATAAAAGGAATATAAAACAACA
CTTCTTTAGCTAAATGATACACATTCTCTTGTTTTTCTTTGTTTTCAGTCCGAGCTAGGA
AGGAACTTGGTTCCTGATCTAGTACCGAACCTAGAAGCTGCTGGGATAATCCTCGATGGA
GACAAGACCTGTGCGAACGAAAAGTTGTAAAAATCAGTGCCTAACCGGCTCTGCAACCAT
CCTCTGCCACCAGAAAATCCATCTGTCACGATCCAGCAGTTCTTATACCCGAAAACCTTT
AACGTTTTCCCCACTATTTTAGCTGAGTCCGAGTACGAGTCCATGATGATG***TTGGAG
CCTTTGTTGATTCTCTTGAGGTAAGATATCTTTAACGCAGCTATTTCTGCTTCAACACGT
TTCGAGTTCCTCACGATTCCTTTTACTTTGTTCGGTAGCTCTTCTAATGGAATGGCGATC
ATGCTGTTCTTAGCATTTGAAGGGAGACGAGGGATCCCAGCTT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2BT23JQ 562 0 0
CGAAAGATCTCTCAAAGTTGAGATATAAAAGGAATATAAAACAACACTTCTTTAGCTAA*
TGATACACATTCTCTTGTTTTTCTTT*TTTTCAGTCCGAGCTAGGAAGGAACTTGGTTCC
TGATCTAGTACCGAACCTAGAAGCTGCCGGGATAATCCTCGATGGAGACAAGACCTGTGC
GAACGAGAAGTTGTAAGAATCAGTGCCTAACCGGCTCTGCAACCATCCTCTGCCACCAGA
GAATCCATCTGTCACGATCCAGCAGTTCTTATACCCGAGAACCTTTAAGGTTTTCGCCAC
TATTTTAGCTGAGTCCGAGTACGAGTCCATGATGATGATGTTGGAGCCTCTGTTGATTCT
CTTGAGGTAAGATATCTTTAACGCTGCTATTTCTGCTTCAACACGTTTCGAGTTCCTCAC
GATTCCTTTTACTTTGTTCGGTAGCTCTTCTAATGGAATGGCGATCATGCTGTTCTTAGC
ATTTGAAGGGAGACGAGGGATCCCAGCTTTTTCCTTCTCTTTCTCTGATCTTATATCCAC
CATCAAGTAGTTCTTGGAACAT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2CG36JQ 691 0 0
GATCATCAATGTAGAAGACAAAACAATAATTCGAAAATCTTATCGAAAGATCTCTCAAAG
TTGAGATATAAAAGGAATATAAAACAACACTTCTTTAGCTAA*TGATACACATTCTCTTG
TTTTTCTTT*TTTTCAGTCCGAGCTAGGAAGGAACTTGGTTCCTGATCTAGTACCGAACC
TAGAAGCTGCCGGGATAATCCTCGATGGAGACAAGACCTGTGCGAACGAGAAGTTGTAAG
AATCAGTACCTAACCGGCTCTGCAACCATCCTCTGCCACCAGAGAATCCATCTGTCACGA
TCCAGCAGTTCTTATACCCGAGAACCTTTAAGGTTTTCGCCACTATTTTAGCTGAGTCCG
AGTACGAGTCCATGATGATGATGTTGGAGCCTCTGTTGATTCTCTTGAGGTAAGATATCT
TTAACGCTGCTATTTCTGCTTCAACACGTTTCGAGTTCCTCACGATTCCTTTTACTTTGT
TCGGTAGCTCTTCTAATGGAATGGCGATCATGCTGTTCTTAGCATTTGAAGGGAGACGAG
GGATCCCAGCTTTTTCCTTCTCTTTCTCTGATCTTATATCCACCATCAAGTAGTTCTTGG
AACATAGAAGATCAAGTGTTTGAGCCGGTGTGAGGTCACCTTTGTAACCACGGAAGTTAA
AAGATATAGCAGACCAAACAGGAGGGAGGAG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 3

CO CL3461Contig1 1272 3 3 U
GGGAAACTCCACATCTACACAAATAAAATCAGAGAGCGGAAGAGAGAAGAGCCGAGAGAG
TAGAGATGACGCGAAAATATTTTCAGAGAGAGGTGTTGCCGGGGACGGCGCTTGTAATAA
TGGAATGTGCCAACGTGGGTTTAAACACTTTGTTCAAGGCAGCGACTTTACAAGGCATGA
GTTTCCATGTCTTCATCGTTTACTCTTACGGTCTTGCTGCTCTTCTTCTACTCCCTTCTC
TTTTCTTCTCCTACAGATCAAGAACGCTTCCACCGATGAATTTCTCAATTCTCTACAAAG
TCGTGCTTCTTGGGTTAATTGGATGCTGTTCAAACATAATGGGATACACCGGGATTAACT
ATAGCTCTCCAACACTTGCTTCTGCGATCAGCAACCTCACTCCTGCGTTTACCTTCTTGC
TGGCCATCCTTTTCAGGATGGAGAGTGTATCATTCAAGAGAACAAGTAGCGTGGCTAAAA
TGTTAGGAACCGTAGTTTCCATTGGGGGAGCATTTATTGTGACTCTTTACAATGGTCCTG
TGGTGATCGCTATGTCACCACCATCCATTTCTCTACGATCACAGTCGCCTAACCATGATT
GGATCATTGGTGCGGCTTTCCTTGCCGTCGAGTACTTCATGGTTCCGTTGTGGTACATTG
TCCAGACTCAAATCATGAGAGAGTATCCATCCGAGTTCACCGTTGTTTGCTATTATAGCT
TTGGAGTGAGCTTTTGGACCGGGCTGGTCACGTTGTTCACTGAAGGGAGTGACTTGAGTA
CATGGAAGATAAAACCAAATATAGCTTTAGTATCAATCGTTTGCCCGGGATTGTTTGGAT
CTTGCATAAACAATACAATCCACACGTGGGCGTTGCGGATAAAGGGGCCTTTATTCGTTG
CAATGTTCAAGCCTCTGTCCATTGCCATTGCCGTTGCAATGGGCGTGATCTTCCTCCGGG
ATTCTCTTTACATCGGCAGCTTGATAGGGGCAACGGTAATAACCATGGGGTTTTACACGG
TGATGTGGGGCAAAGCCAAGGAAGTGGCCTTAGTCGAAGATGACAACAAGGCTAATAACG
AGGATGCTAACGAAGCTGACCTTGATTCTCCACCAGGTTCACAGAAGGCTCCTCTCTTGG
AAAATTACAAGAACGATGAGCATGTATAAGTATCATCAACCAGTCAATACATCTCTCTAT
ATTTGTGTATGAAAATTTGATATGTAAAAGTCTTTTAATTTATTTGACGATACAAATGTG
ATCTTTAATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AG64TF U 1
AF RR2AG64JQ C 407
AF RR2AJ56TF U 717
BS 1 761 RR2AG64TF
BS 762 1270 RR2AJ56TF
BS 1271 1272 RR2AG64JQ

RD RR2AG64TF 761 0 0
GGGAAACTCCACATCTACACAAATAAAATCAGAGAGCGGAAGAGAGAAGAGCCGAGAGAG
TAGAGATGACGCGAAAATATTTTCAGAGAGAGGTGTTGCCGGGGACGGCGCTTGTAATAA
TGGAATGTGCCAACGTGGGTTTAAACACTTTGTTCAAGGCAGCGACTTTACAAGGCATGA
GTTTCCATGTCTTCATCGTTTACTCTTACGGTCTTGCTGCTCTTCTTCTACTCCCTTCTC
TTTTCTTCTCCTACAGATCAAGAACGCTTCCACCGATGAATTTCTCAATTCTCTACAAAG
TCGTGCTTCTTGGGTTAATTGGATGCTGTTCAAACATAATGGGATACACCGGGATTAACT
ATAGCTCTCCAACACTTGCTTCTGCGATCAGCAACCTCACTCCTGCGTTTACCTTCTTGC
TGGCCATCCTTTTCAGGATGGAGAGTGTATCATTCAAGAGAACAAGTAGCGTGGCTAAAA
TGTTAGGAACCGTAGTTTCCATTGGGGGAGCATTTATTGTGACTCTTTACAATGGTCCTG
TGGTGATCGCTATGTCACCACCATCCATTTCTCTACGATCACAGTCGCCTAACCATGATT
GGATCATTGGTGCGGCTTTCCTTGCCGTCGAGTACTTCATGGTTCCGTTGTGGTACATTG
TCCAGACTCAAATCATGAGAGAGTATCCATCCGAGTTCACCGTTGTTTGCTATTATAGCT
TTGGAGTGAGCTTTTGGACCGGGCTGGTCACGTTGTTCACT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2AG64JQ 866 0 0
GTTTACTTTCTTGCTGGCCATCCTTTTCAGGATGGAGAGTGTATCATTCAAGAGAACAAG
TAGCGTGGCTAAAATGTTAGGAACCGTAGTTTCCATTGGGGGAGCATTTATTGTGACTCT
TTACAATGGTCCTGTGGTGATCGCTATGTCACCACCATCCATTTCTCTACGATCACAGTC
GCCTAACCATGATTGGATCATTGGTGCGGCTTTCCTTGCCGTCGAGTACTTCATGGTTCC
GTTGTGGTACATTGTCCAGACTCAAATCATGAGAGAGTATCCATCCGAGTTCACCGTTGT
TTGCTATTATAGCTTTGGAGTGAGCTTTTGGACCGGGCTGGTCACGTTGTTCACTGAAGG
GAGTGACTTGAGTACATGGAAGATAAAACCAAATATAGCTTTAGTATCAATCGTTTGCTC
GGGATTGTTTGGATCTTGCATAAACAATACAATCCACACGTGGGCGTTGCGGATAAAGGG
GCCTTTATTCGTTGCAATGTTCAAGCCTCTGTCCATTGCCATTGCCGTTGCAATGGGCGT
GATCTTCCTCCGGGATTCTCTTTACATCGGCGGCTTGATAGGGGCAACGGTAATAACCAT
GGGGTTTTACACGGTGATGTGGGGCAAAGCCAAGGAAGTGGCCTTAGTCGAAGATGACAA
CAAGGCTAATAACGAGGATGCTAACGAAGCTGACCTTGATTCTCCACCAGGTTCACAGAA
GGCTCCTCTCTTGGAAAATTACAAGAACGATGAGCATGTATAAGTATCATCAACCAGTCA
ATACATCTCTCTATATTTGTGTATGAAAATTTGATATGTAAAAGTCTTTTAATTTATTTG
ACGATACAAATGTGATCTTTAATTTT

QA 1 866 1 866
DS 

RD RR2AJ56TF 554 0 0
G
GCTTTGGAGTGAGCTTTTGGACCGGGCTGGTCACGTTGTTCACTGAAGGGAGTGACTTGA
GTACATGGAAGATAAAACCAAATATAGCTTTAGTATCAATCGTTTGCCCGGGATTGTTTG
GATCTTGCATAAACAATACAATCCACACGTGGGCGTTGCGGATAAAGGGGCCTTTATTCG
TTGCAATGTTCAAGCCTCTGTCCATTGCCATTGCCGTTGCAATGGGCGTGATCTTCCTCC
GGGATTCTCTTTACATCGGCAGCTTGATAGGGGCAACGGTAATAACCATGGGGTTTTACA
CGGTGATGTGGGGCAAAGCCAAGGAAGTGGCCTTAGTCGAAGATGACAACAAGGCTAATA
ACGAGGATGCTAACGAAGCTGACCTTGATTCTCCACCAGGTTCACAGAAGGCTCCTCTCT
TGGAAAATTACAAGAACGATGAGCATGTATAAGTATCATCAACCAGTCAATACATCTCTC
TATATTTGTGTATGAAAATTTGATATGTAAAAGTCTTTTAATTTATTTGACGATACAAAT
GTGATCTTTAATT

QA 2 554 2 554
DS 



AS 1 3

CO CL3462Contig1 1354 3 7 U
CTGATCTGAACAGTCTTCCCAAGGAGATTTCCTCGAGCCTGAAGAAGTATCAGTTTAGAG
AAGTAGAAATAAAACATCTACAAAAAATCATGAATGCTTCTGACTTCAAAAAAGCTACTG
GCACTACCCGTGAAGGGCGGTTTAAGTTGTCTGATAATGGGAAGATTATGAGGGTGTTTT
GGCAGCTGAACCCAAAAAATGAAGCGAAGAAACCGAAATACATAGACCTTGTGGAACGCC
AATTATGGGAGAAGGTTTCTGGTCCTGTTCGAGACCAGAAGAGACACATCGAGTGTTGGG
CATACAGCTCCACTGATCCCATCTCCACCTTACGAGTTATACTTGAGTTGGATGCCGTTT
TTGTTCCTCTGTCCACGTGGTACCTCCACTCCAACGTGCATCCTGAAAAGATTGGCAAGG
ATCCAAGCGCTCTAAAAGGACATGCCTGTTATTCAACAACTACCAAGGAAGCCTATAGTT
ACATGAAAGACCACGGAGTGCCTAAAGAAAGAGTGCTTGAGTTTGACTGTAAGGAACCCC
ATCCAGGTGATACAGAACCTCACATCACCATCGACGGCTTTGGCACCTTGGAGACCTTAG
AAGACGCACTGCTCCAGCTCCGCAAACAGCCAATCACGGCATCCCTTCTCGAGTACTCTG
AACTTTGGACCCTGGGTCCGGATGAAATTTACCACGGCCCTACAAAGAAGGGTTCATATT
TAATTGGTAGCCATGGAGTCGAGATTGTCGACATCCAGCTTCACGGAGATAAAGATGAAG
TCGTTGCTCTCTGCAAATTTAGCAACGGCGCAAACGTCGGCCGTCTGGGATACTTCCGAG
TCTCACTATGTACTCGCTACATGATCGTTGGCATTGATGCTGAGACAGAGGATATTATAC
CAACGGAAACTCCGCAACCCTTGCTCTTCAATTTCATCTACCCGATCATAGATACTCCAA
AGCCCGAAGGCGAAGGCAAAGCTGAAGGCGAAGGCATAGGTGAAGGCAAAGCTGAAGGCG
GAGCTGAAGGCGAAGGCAAGCCTGAGCCTGAGCCTGAACCCACACACAAGAGGACGCGTC
AGAACTTAGGAAGAAGAGGGCCGTCCCATGACCATGGAGATAAGAAGAAGAAGAAGAAGC
AGAGAAGTGGCTGAGAAGAAGAAGCTGGATTTTGGAGCCGTGTGAGAGAGTGAGAGCTTC
TTTTTTTTTTGGATTATCCTGAAAATAACAAACATCTTTGATTTCGGGAACTTATATCTG
TGTGAGTCATTTACAAGACTTGGTAACTCATCTCTCCTTAGTAATATGTTTTCTAAAATT
GATACTTTATAAATCTATTTAAATTTAGAATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C825TF U 1
AF RR2FK59TF U 58
AF RR2C825JQ C 657
BS 1 187 RR2C825TF
BS 188 188 RR2FK59TF
BS 189 628 RR2C825TF
BS 629 713 RR2FK59TF
BS 714 714 RR2C825JQ
BS 715 754 RR2FK59TF
BS 755 1354 RR2C825JQ

RD RR2C825TF 628 0 0
CTGATCTGAACAGTCTTCCCAAGGAGATTTCCTCGAGCCTGAAGAAGTATCAGTTTAGAG
AAGTAGAAATAAAACATCTACAAAAAATCATGAATGCTTCTGACTTCAAAAAAGCTACTG
GCACTACCCGTGAAGGGCGGTTTAAGTTGTCTGATAATGGGAAGATTATGAGGGTGTTTT
GGCAGCTTAACCCAAAAAATGAAGCGAAGAAACCGAAATACATAGACCTTGTGGAACGCC
AATTATGGGAGAAGGTTTCTGGTCCTGTTCGAGACCAGAAGAGACACATCGAGTGTTGGG
CATACAGCTCCACTGATCCCATCTCCACCTTACGAGTTATACTTGAGTTGGATGCCGTTT
TTGTTCCTCTGTCCACGTGGTACCTCCACTCCAACGTGCATCCTGAAAAGATTGGCAAGG
ATCCAAGCGCTCTAAAAGGACATGCCTGTTATTCAACAACTACCAAGGAAGCCTATAGTT
ACATGAAAGACCACGGAGTGCCTAAAGAAAGAGTGCTTGAGTTTGACTGTAAGGAACCCC
ATCCAGGTGATACAGAACCTCACATCACCATCGACGGCTTTGGCACCTTGGAGACCTTAG
AAGACGCACTGCTCCAGCTCCGCAAACA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2FK59TF 697 0 0
GG
GAAGTAGAAATAAAACATCTACAAAAAATCATGAATGCTTCTGACTTCAAAAAAGCTACT
GGCACTACCCGTGAAGGGCGGTTTAAGTTGTCTGATAATGGGAAGATTATGAGGGTGTTT
TGGCAGCTGAACCCGAAAAATGAAGCGAAGAAACCGAAATACATAGACCTTGTGGAACGC
CAATTATGGGAGAAGGTTTCTGGTCCTGTTCGAGACCAGAAGAGACACATCGAGTGTTGG
GCATACAGCTCCACTGATCCCATCTCCACCTTACGAGTTATACTTGAGTTGGATGCCGTT
TTTGTTCCTCTGTCCACGTGGTACCTCCACTCCAACGTGCATCCTGAAAAGATTGGCAAG
GATCCAAGCGCTCTAAAAGGACATGCCTGTTATTCAACAACTACCAAGGAAGCCTATAGT
TACATGAAAGACCACGGAGTGCCTAAAGAAAGAGTGCTTGAGTTTGACTGTAAGGAACCC
CATCCAGGTGATACAGAACCTCACATCACCATCGACGGCTTTGGCACCTTGGGGACCTTA
GAAGACGCACTGCTCCAGCTCCGCAAACAGCCAATCACGGCATCCCTTCTCGAGTACTCT
GAACTTTGGACCCTGGGTCCGGATGAAATTTACCACGGCCCTACAAAGAAGGGT*CATAT
TTAATTGGTAGCCATGGAGTCGAGATTGTCGACAT

QA 3 697 3 697
DS 

RD RR2C825JQ 698 0 0
TCTGAACTTTGGACCCTGGGTCCGGATGAAATTTACCGCGGCCCTACAAAGAAGGGTTCA
TATTTAATTGGTAGCCATGGAGTCGAGATTGTCGACATCCAGCTTCACGGAGATAAAGAT
GAAGTCGTTGCTCTCTGCAAATTTAGCAACGGCGCAAACGTCGGCCGTCTGGGATACTTC
CGAGTCTCACTATGTACTCGCTACATGATCGTTGGCATTGATGCTGAGACAGAGGATATT
ATACCAACGGAAACTCCGCAACCCTTGCTCTTCAATTTCATCTACCCGATCATAGATACT
CCAAAGCCCGAAGGCGAAGGCAAAGCTGAAGGCGAAGGCATAGGTGAAGGCAAAGCTGAA
GGCGGAGCTGAAGGCGAAGGCAAGCCTGAGCCTGAGCCTGAACCCACACACAAGAGGACG
CGTCAGAACTTAGGAAGAAGAGGGCCGTCCCATGACCATGGAGATAAGAAGAAGAAGAAG
AAGCAGAGAAGTGGCTGAGAAGAAGAAGCTGGATTTTGGAGCCGTGTGAGAGAGTGAGAG
CTTCTTTTTTTTTTGGATTATCCTGAAAATAACAAACATCTTTGATTTCGGGAACTTATA
TCTGTGTGAGTCATTTACAAGACTTGGTAACTCATCTCTCCTTAGTAATATGTTTTCTAA
AATTGATACTTTATAAATCTATTTAAATTTAGAATTTG

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 3

CO CL3463Contig1 572 3 2 U
GGATCCACCCCCAGCTTAAACCTCACACGTCTTGTGTCCTCAGTCTCCAAGCAGTAGAAA
TGACGGTGAAGATCATGCTCGCGCGTTTCGGTTGCAAACACCGACCCTTCTATCGTCTAG
TCGCGGCGGATGACAAATCGCGGAGGGACGGGAAACAAATCGAGGTTTTAGGGTTTTATG
ACCCACTCCAAGGGAAGGACGATGCGAACAGAGTGAGCCTCAAATTCGACAGAATCGAGT
ACTGGTTATCGGTTGGAGCTCAACCAACAGACTCAGTTGAAAACATGCTTTTCAGGGCCG
GTTTGATTCCTCCAAAGTCTATGGTTGTAGTTGGTTCCAAGAACGGACAAAAATCCACCA
ACCACCATGTTTCACCCATTACAGGTGAGATCTTGAACTAGGTGTGTTGGTGCAATCAGC
AAAGAGTTGAGCTTTGTTGTGTCTATCTCAAAGGAGTTTGATGTTATGTTTGGTCTTTTG
TTGTATCTGGACAAAGAAGTTTGTTGAATTCTCAATATGGATTTGTAGCATACTATGAAT
TGGGCTTCGATTTCTTAAGTTGGATATAAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G588JQ C 1
AF RR2G588TF U 1
AF RR2DZ72TF U 9
BS 1 555 RR2G588TF
BS 556 572 RR2DZ72TF

RD RR2G588JQ 556 0 0
GGATCCACCCCCAGCTTAAACCTCACACGTCTTGTGTCCTCAGTCTCCAAGCAGTAGAAA
TGACGGTGAAGATCATGCTCGCGCGTTTCGGTTGCAAACACCGACCCTTCTATCGTCTAG
TCGCGGCGGATGACAAATCGCGGAGGGACGGGAAACAAATCGAGGTTTTAGGGTTTTATG
ACCCACTCCAAGGGAAGGACGATGCGAACAGAGTGAGCCTCAAATTCGACAGAATCGAGT
ACTGGTTATCGGTTGGAGCTCAACCAACAGACTCAGTTGAAAACATGCTTTTCAGGGCCG
GTTTGATTCCTCCAAAGTCTATGGTTGTAGTTGGTTCCAAGAACGGACAAAAATCCACCA
ACCACCATGTTTCACCCATTACAGGTGAGATCTTGAACTAGGTGTGTTGGTGCAATCAGC
AAAGAGTTGAGCTTTGTTGTGTCTATCTCAAAGGAGTTTGATGTTATGTTTGGTCTTTTG
TTGTATCTGGACAAAGAAGTTTGTTGAATTCTCAATATGGATTTGTAGCATACTATGAAT
TGGGCTTCGATTTCT
C

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2G588TF 556 0 0
GGATCCACCCCCAGCTTAAACCTCACACGTCTTGTGTCCTCAGTCTCCAAGCAGTAGAAA
TGACGGTGAAGATCATGCTCGCGCGTTTCGGTTGCAAACACCGACCCTTCTATCGTCTAG
TCGCGGCGGATGACAAATCGCGGAGGGACGGGAAACAAATCGAGGTTTTAGGGTTTTATG
ACCCACTCCAAGGGAAGGACGATGCGAACAGAGTGAGCCTCAAATTCGACAGAATCGAGT
ACTGGTTATCGGTTGGAGCTCAACCAACAGACTCAGTTGAAAACATGCTTTTCAGGGCCG
GTTTGATTCCTCCAAAGTCTATGGTTGTAGTTGGTTCCAAGAACGGACAAAAATCCACCA
ACCACCATGTTTCACCCATTACAGGTGAGATCTTGAACTAGGTGTGTTGGTGCAATCAGC
AAAGAGTTGAGCTTTGTTGTGTCTATCTCAAAGGAGTTTGATGTTATGTTTGGTCTTTTG
TTGTATCTGGACAAAGAAGTTTGTTGAATTCTCAATATGGATTTGTAGCATACTATGAAT
TGGGCTTCGATTTCT
C

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2DZ72TF 564 0 0
GG
CCAGCTTAAACCTCACACGTCTTGTGTCCTCAGTCTCCAAGCAGTAGAAATGACGGTGAA
GATCAGGCTCGCGCGTTTCGGTTGCAAACACCGACCCTTCTATCGTCTAGTCGCGGCGGA
TGACAAATCGCGGAGGGACGGGAAACAAATCGAGGTTTTAGGGTTTTATGACCCACTCCA
AGGGAAGGACGATGCGAACAGAGTGAGCCTCAAATTCGACAGAATCGAGTACTGGTTATC
GGTTGGAGCTCAACCAACAGACTCAGTTGAAAACATGCTTTTCAGGGCCGGTTTGATTCC
TCCAAAGTCTATGGTTGTAGTTGGTTCCAAGAACGGACAAAAATCCACCAACCACCATGT
TTCACCCATTACAGGTGAGATCTTGAACTAGGTGTGTTGGTGTAATCAGCAAAGAGTTGA
GCTTTGTTGTGTCTATCTCAAAGGAGTTTGATGTTATGTTTGGTCTTTTGTTGTATCTGG
ACAAAGAAGTTTGTTGAATTCTCAATATGGATTTGTAGCATACTATGAATTGGGCTTCGA
TTTCTTAAGTTGGATATAAGCC

QA 3 564 3 564
DS 



AS 1 3

CO CL3464Contig1 624 3 7 U
GGGATCCTTGCAAATCTGAGTGAGAAGAAGAAAAGGAAGAAGAAGGAGAAGGGAGGGCAT
GACAATGATAAGATCTTTCTCGATGGCAATGTTGCTCGTCGCACTATTTGTTTCATCCAT
ATTCTCTATTGTTGTTTCTTCCCCAGAAGCAGACTTTGTTCAGAAGACAATCTCTTCCCA
CAAGATCGTCATCTTCTCCAAATCCTACTGCCCGTATTGCAGGAGAGCTAAATCTGTGTT
CATTGAGCTGGATCAGGTTCCTCATGTTGTCGAGCTTGACCAAAGAGAAGATGGTTGGAG
CGTTCAGAGTGCACTTGGAGAGATTGTTGGAAGGCGAACAGTACCACAGGTTTTCATTCA
CGGAAAGCACATCGGTGGATCAGACGATACCGTAGAAGCGCATGAGAGCGGGGAACTGGC
CAAGCTTCTCGGTGTTTCCACAAAAGCTGAACTCTAGGTTCAATCTTAGTTGTAACAAGA
ATTGATAAAACACTATCTCTGTGATACTCGCTCATGTGTTGTAAGCACTTCAATTTCCAT
TTTTATGAATCTTGTAATCTGTTCTGAAAGATTATAAACGTCTTGTTATAGACTACAAGT
TGAGTTATACAAATTACAAAGTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ29JQ C 1
AF RR2EJ29TF U 186
AF RR2A796TF U 1
BS 1 61 RR2A796TF
BS 62 62 RR2EJ29JQ
BS 63 241 RR2A796TF
BS 242 242 RR2EJ29TF
BS 243 479 RR2A796TF
BS 480 480 RR2EJ29TF
BS 481 624 RR2A796TF

RD RR2EJ29JQ 565 0 0
GGGATCCTTGCAAATCTGAGTGAGAAGAAGAAAAGGAAGAAGAAGGAGAAGGGAGGGCAT
GACAATGATAAGATCTTTCTCGATGGCAATGTTGCTCGTCGCACTATTTGTTTCATCCAT
ATTCTCTATTGTTGTTTCTTCCCCAGAAGCAGACTTTGTTCAGAAGACAATTTCTTCCCA
CAAGATCGTCATCTTCTCCAAATCCTACTGCCCGTATTGCAGGAGAGCTAAATCTGTGTT
CATTGAGCTGGATCAGGTTCCTCATGTTGTCGAGCTTGACCAAAGAGAAGATGGTTGGAG
CGTTCAGAGTGCACTTGGAGAGATTGTTGGAAGGCGAACAGTACCACAGGTTTTCATTCA
CGGAAAGCACATCGGTGGATCAGACGATACCGTAGAAGCGCATGAGAGCGGGGAACTGGC
CAAGCTTCTCGGTGTTTCCACAAAAGCTGAACTCTAGGTTCAATCTTAGTTGTAACAAGA
ATTGATAAAACACTATCTCTGTGATACTCGCTCATGTGTTGTAAGCACTTCAATTTCCAT
TTTTATGAATCTTGTAATCTGTTC
C

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2EJ29TF 380 0 0
TCGTCATCTTCTCCAAATCCTACTGCCCGTATTGCAGGAGAGCTAAGTCTGTGTTCATTG
AGCTGGATCAGGTTCCTCATGTTGTCGAGCTTGACCAAAGAGAAGATGGTTGGAGCGTTC
AGAGTGCACTTGGAGAGATTGTTGGAAGGCGAACAGTACCACAGGTTTTCATTCACGGAA
AGCACATCGGTGGATCAGACGATACCGTAAAAGCGCATGAGAGCGGGGAACTGGCCAAGC
TTCTCGGTGTTTCCACAAAAGCTGAACTCTAGGTTCAATCTTAGTTGTAACAAGAATTGA
TAAAACACTATCTCTGTGATACTCGCTCATGTGTTGTAAGCACTGCAATTTCCATTTTTA
TGAATCTTGTAATCTGTTC
C

QA 1 379 1 379
DS 

RD RR2A796TF 624 0 0
GGGATCCTTGCAAATCTGAGTGAGAAGAAGAAAAGGAAGAAGAAGGAGAAGGGAGGGCAT
GGCAATGATAAGATCTTTCTCGATGGCAATGTTGCTCGTCGCACTATTTGTTTCATCCAT
ATTCTCTATTGTTGTTTCTTCCCCAGAAGCAGACTTTGTTCAGAAGACAATCTCTTCCCA
CAAGATCGTCATCTTCTCCAAATCCTACTGCCCGTATTGCAGGAGAGCTAAATCTGTGTT
CTTTGAGCTGGATCAGGTTCCTCATGTTGTCGAGCTTGACCAAAGAGAAGATGGTTGGAG
CGTTCAGAGTGCACTTGGAGAGATTGTTGGAAGGCGAACAGTACCACAGGTTTTCATTCA
CGGAAAGCACATCGGTGGATCAGACGATACCGTAGAAGCGCATGAGAGCGGGGAACTGGC
CAAGCTTCTCGGTGTTTCCACAAAAGCTGAACTCTAGGTTCAATCTTAGTTGTAACAAGG
ATTGATAAAACACTATCTCTGTGATACTCGCTCATGTGTTGTAAGCACTTCAATTTCCAT
TTTTATGAATCTTGTAATCTGTTCTGAAAGATTATAAACGTCTTGTTATAGACTACAAGT
TGAGTTATACAAATTACAAAGTTG

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 3

CO CL3465Contig1 603 3 2 U
GGAATCATCACAATCTCTAACCTCAAACCCTAAAATAAATAAAAGAAAGCTACGTAGAAA
GAGACGGAGAGAAGAATGGGTCGCCAAAACATTGTCATAATTTTTGGTCTCGTGTTCTTG
GCCATCCTTGGTCTTGCCGCAGCTGCCTCTTCTCCGTCTCCTTCAACGTCCCCTTCCAAA
GCTCCGTCTACTTCCATAACTGAGGTCGAAGCTCCAGTGTCCGAGGACACCATTGGAACC
ACCGACGACGATGCAGCTGCTTCTCCTGGTGATGGTGACGTAGCTGTGGCTGGTCCTCTG
GGAAGTGACTCCTCCTATGGTAGCAATGGACCTTCAGGCTCTGCAGATTCTGCTGACAGT
GGCGTGGCTGCTCTTGGAGTATCTGCGGTCGTCGTTGGTGTTACATCCATTGCCGGTTCT
TTCTTGTTTTTCTGAGGTTTGTATTTTCATGAGAATATCAATTTTGAGTAAAAATACTAT
TTATTTATTGATGATTGTGATGATCATATTGTAATTTGTTTCTCCTTGGTTATGAGAGAC
GACGCCTTGAAATAAATTGAAAAAAAAGTTTCCTTTACAGTTATAAATAAAGAATTTACG
GAT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2D523TF U 5
AF RR2E906TF U 1
AF RR2BJ22TF U 5
BS 1 567 RR2E906TF
BS 568 603 RR2BJ22TF

RD RR2D523TF 330 0 0
GG
ATCACAATCTCTAACCTCAAACCCTAAAATAAATAAAAGAAAGCTACGTAGAAAGAGACG
GAGAGAAGAATGGGTCGCCAAAACATTGTCATAATTTTTGGTCTCGTGTTCTTGGCCATC
CTTGGTCTTGCCGCAGCTGCCTCTTCTCCGTCTCCTTCAACGTCCCCTTCCAAAGCTCCG
TCTACTTCCATAACTGAGGTCGAAGCTCCAGTGTCCGAGGACACCATTGGAACCACCGAC
GACGATGCAGCTGCTTCTCCTGGTGATGGTGACGTAACTGTGGCTGGTCCTCTGGGAAGT
GACTCCTCCTATGGTAACCATGGACCTT

QA 3 330 3 330
DS 

RD RR2E906TF 568 0 0
GGAATCATCACAATCTCTAACCTCAAACCCTAAAATAAATAAAAGAAAGCTACGTAGAAA
GAGACGGAGAGAAGAATGGGTCGCCAAAACATTGTCATAATTTTTGGTCTCGTGTTCTTG
GCCATCCTTGGTCTTGCCGCAGCTGCCTCTTCTCCGTCTCCTTCAACGTCCCCTTCCAAA
GCTCCGTCTACTTCCATAACTGAGGTCGAAGCTCCAGTGTCCGAGGACACCATTGGAACC
ACCGACGACGATGCAGCTGCTTCTCCTGGTGATGGTGACGTAGCTGTGGCTGGTCCTCTG
GGAAGTGACTCCTCCTATGGTAGCAATGGACCTTCAGGCTCTGCAGATTCTGCTGACAGT
GGCGTGGCTGCTCTTGGAGTATCTGCGGTCGTCGTTGGTGTTACATCCATTGCCGGTTCT
TTCTTGTTTTTCTGAGGTTTGTATTTTCATGAGAATATCAATTTTGAGTAAAAATACTAT
TTATTTATTGATGATTGTGATGATCATATTGTAATTTGTTTCTCCTTGGTTATGAGAGAC
GACGCCTTGAAATAAATTGAAAAAAAA
A

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2BJ22TF 599 0 0
GG
ATCACAATCTCTAACCTCAAACCCTAAAATAAATAAAAGAAAGCTACGTAGAAAGAGACG
GAGAGAAGAATGGGTCGCCAAAACATTGTCATAATTTTTGGTCTCGTGTTCTTGGCCATC
CTTGGTCTTGCCGCAGCTGCCTCTTCTCCGTCTCCTTCAACGTCCCCTTCCAAAGCTCCG
TCTACTTCCATAACTGAGGTCGAAGCTCCAGTGTCCGAGGACACCATTGGAACCACCGAC
GACGATGCAGCTGCTTCTCCTGGTGATGGTGACGTAGCTGTGGCTGGTCCTCTGGGAAGT
GACTCCTCCTATGGTAGCAATGGACCTTCAGGCTCTGCAGATTCTGCTGACAGTGGCGTG
GCTGCTCTTGGAGTATCTGCGGTCGTCGTTGGTGTTACATCCATTGCCGGTTCTTTCTTG
TTTTTCTGAGGTTTGTATTTTCATGAGAATATCAATTTTGAGTAAAAATACTATTTATTT
ATTGATGATTGTGATGATCATATTGTAATTTGTTTCTCCTTGGTTATGAGAGACGACGCC
TTGAAATAAATTGAAAAAAAAGTTTCCTTTACAGTTATAAATAAAGAATTTACGGAT

QA 3 599 3 599
DS 



AS 1 3

CO CL3466Contig1 920 3 13 U
GGGAGAGGCAGAGATTCAATCATATGCAGAGCAGAGAGGTGAGAGGCTCTGATTGGTTCT
CCTTCTCTCTGCTTTGATCTGCCGATTCGTCTGGTTTTCACGGGAAACCTTCTTCGTTGA
TCTTCCCTCTCTCCCCTCTCTTTGTTTGTTTGATTCCGTCGTGGCGATTCTGTACGCACT
GGTAGCGCGTGGGACGGTGGTGCTGGCGGAGTTCACCGCTACGTCTTCCACGTCTTCCGT
TTGCGTTTCTGGAGGATATTCACCAGAGGTTCGTGAGGACGTACGGGAGGGCAGTTCATA
CAGCACAAGCTTACGCCATGAACGACGAGTTCTCTAGAGTTCTCAGCCAGCAGATTGAGT
ATTACTCTAATGATCCTAACGCCGACAGGATTAATCGGATTAAGGGTGAAATGAGTCAGG
TGCGTGATGTGATGATAGGGAACATTGACAAAGTTCTAGATAGAGGTGAACGCTTGGAGC
TACTTGTCGACAAAACCGCCAATATGCAAGGGAACACATTCCGTTTCAGAAAGCAAGCTC
GCCGTTTCAGAAGCACCGTGTGGTGGAGAAATTGCAAGCTCACGTTCCTCTTAATACTAG
TACTACTGGTGATCATATACATTGCCGTGGCCTTTGTCTGCCACGGACCTCTTCTACCAT
CTTGCATTTAAGTAAGTTGCATCTATCTCTTATAAGGAACCTTTGCCGTTGCTTTGTCTG
CTCTTGTGATTTCAAAAAAAAAGAAGCTTCTCTTACACTCACCTATATAATGGAAGTATT
CTTATTTTTATAGAGCAATGTGAAAGCTCATTGCTTTGCGATTGATTGCAAGATGTGTGT
GAATTTGTACTGTCATCATGTTCTATAACTATTTACATAGTGAGTAATAACAGGCTTGAT
TCGTTTATACAAGTTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT18TF U 1
AF RR2CT18JQ C 161
AF RR2GJ01TF U 277
BS 1 694 RR2CT18TF
BS 695 695 RR2GJ01TF
BS 696 726 RR2CT18TF
BS 727 749 RR2GJ01TF
BS 750 750 RR2CT18JQ
BS 751 769 RR2GJ01TF
BS 770 770 RR2CT18JQ
BS 771 824 RR2GJ01TF
BS 825 828 RR2CT18JQ
BS 829 832 RR2GJ01TF
BS 833 833 RR2CT18JQ
BS 834 904 RR2GJ01TF
BS 905 920 RR2CT18JQ

RD RR2CT18TF 726 0 0
GGGAGAGGCAGAGATTCAATCATATGCAGAGCAGAGAGGTGAGAGGCTCTGATTGGTTCT
CCTTCTCTCTGCTTTGATCTGCCGATTCGTCTGGTTTTCACGGGAAACCTTCTTCGTTGA
TCTTCCCTCTCTCCCCTCTCTTTGTTTGTTTGATTCCGTCGTGGCGATTCTGTACGCACT
GGTAGCGCGTGGGACGGTGGTGCTGGCGGAGTTCACCGCTACGTCTTCCACGTCTTCCGT
TTGCGTTTCTGGAGGATATTCACCAGAGGTTCGTGAGGACGTACGGGAGGGCAGTTCATA
CAGCACAAGCTTACGCCATGAACGACGAGTTCTCTAGAGTTCTCAGCCAGCAGATTGAGT
ATTACTCTAATGATCCTAACGCCGACAGGATTAATCGGATTAAGGGTGAAATGAGTCAGG
TGCGTGATGTGATGATAGGGAACATTGACAAAGTTCTAGATAGAGGTGAACGCTTGGAGC
TACTTGTCGACAAAACCGCCAATATGCAAGGGAACACATTCCGTTTCAGAAAGCAAGCTC
GCCGTTTCAGAAGCACCGTGTGGTGGAGAAATTGCAAGCTCACGTTCCTCTTAATACTAG
TACTACTGGTGATCATATACATTGCCGTGGCCTTTGTCTGCCACGGACCTCTTCTACCAT
CTTGCATTTAAGTAAGTTGCATCTATCTCTTATA*GGAACCTTTGCCGTTGCTTTGTCTG
CTCTTG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2CT18JQ 760 0 0
GTGGCGATTCTGTACGCACTGGTAGCGCGTGGGACGGTGGTGCTGGCGGAGTTCACCGCT
ACGTCTTCCACGTCTTCCGTTTGCGTTTCTGGAGGATATTCACCAGAGGTTCGTGAGGAC
GTACGGGAGGGCAGTTCATACAGCACAAGCTTACGCCATGAACGACGAGTTCTCTAGAGT
TCTCAGCCAGCAGATTGAGTATTACTCTAATGATCCTAACGCCGACAGGATTAATCGGAT
TAAGGGTGAAATGAGTCAGGTGCGTGATGTGATGATAGGGAACATTGACAAAGTTCTAGA
TAGAGGTGAACGCTTGGAGCTACTTGTCGACAAAACCGCCAATATGCAAGGGAACACATT
CCGTTTCAGAAAGCAAGCTCGCCGTTTCAGAAGCACCGTGTGGTGGAGAAATTGCAAGCT
CACGTTCCTCTTAATACTAGTACTACTGGTGATCATATACATTGCCGTGGCCTTTGTCTG
CCACGGACCTCTTCTACCATCTTGCATTTAAGTAAGTTGCATCTATCTCTTATAAGGAAC
CTTTGCCGTTGCTTTGTCTGCTCTTGTGATTTCAAAAAAAAAGAAGCTTCTCTTACACTC
ACCTATATAATGGAAGTATTCTTATTTTTATAGAGCAATGTGAAAGCTCATTGCTTTGCG
ATTGATTGCAAGATGTGTGTGAATTTGTGCTGTCATGATGTTCTATAACTATTTACATAG
TGAGTAATAACAGGCTTGATTCGTTTATACAAGTTTTTGT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2GJ01TF 628 0 0
GGACGTACGGCAGAGCAGTTCATACAGCACAAGCTTACGCCATGAACGACTAGTTCTCTA
GAGTTCTCAGTCAGCAGATTGAGTTTTACTCTAATGATCCTAACGCCGATAGGATTAATC
GGATTAAGGGTGAAATGAGTCAGGTGCGTGACGTCATGATAGAGAACATTGACAAAGTTC
TAGATAGAGGTGAACGCTTGGAGCCACTTGTCGACAAAACCGCCAATATGCAAGGGAACA
CATTCCGTTTCAGGAAGCAAGCTCGCCGTTTCAGAAGCACCGTCTGGTGGAGAAATTGCA
AGCTCACGTTCCTCTTAATACTAGTACTACTGGTGATCATATATATTGCCGTGGCCTTTG
TCTGCCACGGACCTCTTCTACCATCTTGCATTTAAGTAAGTTGCATCTATCTCTTATAAG
GAACCTTTCCCGTTGTTTTGTCTGCTCTTGTGATTTCAAAAAAAAAGAAGCTTGTCTTAC
ACTCACCTATATATTGGAAGTATTCTTATTTTTATAGAGCAATGTGAAAGCTCATTGCTT
TGCGATTG****CAAGCTGTGTGTGAATTTGTACTGTCATCATGTTCTATAACTATTTAC
ATAGTGAGTAATAACAGGCTTGATTCGT

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 3

CO CL3467Contig1 1173 3 23 U
GGGACCAGATTTTAGAACACTGCTTAAAGTTAAAACTGACTCTCTCTCTTTATGTAATAA
TGAAACAGATTTGATGGTAAACTAATGCTAGAGAAGCTCCGGGACAAGAGGCTGGTCTTT
GTTGGGGACTCAATAGGAAGAAACCAATGGGAGTCCCCTCTCTGCTTACTATCTTCTACA
GTCAAGAACGAGAGCTCGGTTTATGAAGTGAATGGAAGTCCCATCACAAAGCACACAGGT
TACTTAGTGTTCAGATTCAAGGACTACAATTGCACAGTGGAGTACTACAGATCACCATTC
TTGGTTCCTCAAACCAGACCACCGGCAAGATCAGCCAATAAAGTTAAGACAACTTTGAAA
CTGGACACTATGGATTGGACTTCTAGCAAATGGAGAGATGCAGATGTTTTAGTGCTCAAT
ACTGGACATTGGTGGAACTATGGGAAGACTATTAGAATGGGATGCTATTTTCAAGAAGGA
GAAGAAGTGAAGCTTAAGATGAGTGTAGATGATGCTTATAAGCGAGCTATGGAGACCGTT
ATGAAATGGATTCAAACGGAGGTTGATTCAGACAAAACGCAAGTCTTCTTCCGCTCATAC
GCTCCTGTGCATTTCAGGGGAGGAGATTGGAGAACAGGAGGAACATGTCACATGGAGACA
TTGCCTGAGATTGGAACCACCTCATTGGTTTCATCAGAGACATGGAACCAGTTAAAGATC
CTGGGAGATGCGTTATCACGTTACTCCAACAGATCAGAGACCGTTGAAGTGAAAGTGTTG
AACATAACAGCAATGTCTGTTCAAAGAAAAGATGGTCACCCGTCTCTTTACTATCTTGGC
TCGCGTGGTCCTGCGCCGCTTCATCGCCAAGACTGTAGCCACTGGTGCCTTCCTGGTGTT
CCTGATACTTGGAACGAACTCATGTATACGTTGTTTATGAAACAAGGAAGAGCCAAAGAA
GCAAATGGTACAGGAAATGTCACAATGTCATGAACCCTGCCGTTTTCCTGAAGATGCTGA
GCTCAAAGATCAAAAAGGGTTTTGGATTTTTTTTTATTATTAGATTAATTGGGTGAGGTT
ATGTAATTAGGTTGATAATCTTAATCTCTGGTTGTAAAGATAGAAAAATCTCAGATATAT
TCAAAGTTTCATAGAGATTGAGAGTTACCTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA83TF U 1
AF RR2AG32TF U 60
AF RR2AG32JQ C 326
BS 1 83 RR2DA83TF
BS 84 84 RR2AG32TF
BS 85 157 RR2DA83TF
BS 158 158 RR2AG32TF
BS 159 161 RR2DA83TF
BS 162 162 RR2AG32TF
BS 163 177 RR2DA83TF
BS 178 178 RR2AG32TF
BS 179 260 RR2DA83TF
BS 261 261 RR2AG32TF
BS 262 467 RR2DA83TF
BS 468 468 RR2AG32TF
BS 469 503 RR2DA83TF
BS 504 504 RR2AG32TF
BS 505 511 RR2DA83TF
BS 512 512 RR2AG32TF
BS 513 578 RR2DA83TF
BS 579 579 RR2AG32TF
BS 580 594 RR2DA83TF
BS 595 595 RR2AG32TF
BS 596 613 RR2DA83TF
BS 614 834 RR2AG32TF
BS 835 1173 RR2AG32JQ

RD RR2DA83TF 613 0 0
GGGACCAGATTTTAGAACACTGCTTAAAGTTAAAACTGACTCTCTCTCTTTATGTAATAA
TGAAACAGATTTGATGGTAAACTGATGCTAGAGAAGCTCCGGGACAAGAGGCTGGTCTTT
GTTGGGGACTCAATAGGAAGAAACCAATGGGAGTCCCTTCTTTGCTTACTATCTTCTGCA
GTCAAGAACGAGAGCTCGGTTTATGAAGTGAATGGAAGTCCCATCACAAAGCACACAGGT
TACTTAGTGTTCAGATTCAATGACTACAATTGCACAGTGGAGTACTACAGATCACCATTC
TTGGTTCCTCAAACCAGACCACCGGCAAGATCAGCCAATAAAGTTAAGACAACTTTGAAA
CTGGACACTATGGATTGGACTTCTAGCAAATGGAGAGATGCAGATGTTTTAGTGCTCAAT
ACTGGACATTGGTGGAACTATGGGAAGACTATTAGAATGGGATGCTACTTTCAAGAAGGA
GAAGAAGTGAAGCTTAAGATGAGCGTAGATGGTGCTTATAAGCGAGCTATGGAGACCGTT
ATGAAATGGATTCAAACGGAGGTTGATTCAGACAAAACACAAGTCTTCTTCCGCACATAC
GCTCCTGTGCATT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2AG32TF 775 0 0
GG
GAAACAGATTTGGTGGTAAACTAATGCTAGAGAAGCTCCGGGACAAGAGGCTGGTCTTTG
TTGGGGACTCAATAGGAAGAAACCAATGGGAGTCTCCTCTCTGCTTACTATCTTCTACAG
TCAAGAACGAGAGCTCGGTTTATGAAGTGAATGGAAGTCCCATCACAAAGCACACAGGTT
ACTTAGTGTTCAGATTCAAGGACTACAATTGCACAGTGGAGTACTACAGATCACCATTCT
TGGTTCCTCAAACCATACCACCGGCAAGATCAGCCAATAAAGTTAAGACAACTTTGAAAC
TGGACACTATGGATTGGACTTCTAGCAAATGGAGAGATGCAGATGTTTTAGTGCTCAATA
CTGGACATTGGTGGAACTATGGGAAGACTATTAGAATGGGATGCTATTTTCAAGAAGGAG
AAGAAGTGAAGCTTAAGATGAGTGTAGATGATGCTTATAAGCGAGCTATGGAGACCGTTA
TGAAATGGATTCAAACGGAGGTTGATTCAGACAAAACGCAAGTCTTCTTCCGCTCATACG
CTCCTGTGCATTTCAGGGGAGGAGATTGGAGAACAGGAGGAACATGTCACATGGAGACAT
TGCCTGAGATTGGAACCACCTCATTGGTTTCATCAGAGACATGGAACCAGTTAAAGATCC
TGGGAGATGCGTTATCACGTTACTCCAACAGATCAGAGACCGTTGAAGTGAAAGTGTTGA
ACATAACAGCAATGTCTGTTCAAAGAAAAGATGGTCACCCGTCTCTTTACTAT

QA 3 775 3 775
DS 

RD RR2AG32JQ 848 0 0
CAAGATCAGCCAATAAAGTTAAGACAACTTTGAAACTGGACACTATGGATTGGACTTCTA
GCAAATGGAGAGATGCAGATGTTTTAGTGCTCAATACTGGACATTGGTGGAACTATGGGA
AGACTATTAGAATGGGATGCTATTTTCAAGAAGGAGAAGAAGTGAAGCTTAAGATGAGTG
TAGATGATGCTTATAAGCGAGCTATGGAGACCGTTATGAAATGGATTCAAACGGAGGTTG
ATTCAGACAAAACGCAAGTCTTCTTCCGCTCATACGCTCCTGTGCATTTCAGGGGAGGAG
ATTGGAGAACAGGAGGAACATGTCACATGGAGACATTGCCTGAGATTGGAACCACCTCAT
TGGTTTCATCAGAGACATGGAACCAGTTAAAGATCCTGGGAGATGCGTTATCACGTTACT
CCAACAGATCAGAGACCGTTGAAGTGAAAGTGTTGAACATAACAGCAATGTCTGTTCAAA
GAAAAGATGGTCACCCGTCTCTTTACTATCTTGGCTCGCGTGGTCCTGCGCCGCTTCATC
GCCAAGACTGTAGCCACTGGTGCCTTCCTGGTGTTCCTGATACTTGGAACGAACTCATGT
ATACGTTGTTTATGAAACAAGGAAGAGCCAAAGAAGCAAATGGTACAGGAAATGTCACAA
TGTCATGAACCCTGCCGTTTTCCTGAAGATGCTGAGCTCAAAGATCAAAAAGGGTTTTGG
ATTTTTTTTTATTATTAGATTAATTGGGTGAGGTTATGTAATTAGGTTGATAATCTTAAT
CTCTGGTTGTAAAGATAGAAAAATCTCAGATATATTCAAAGTTTCATAGAGATTGAGAGT
TACCTCAT

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 3

CO CL3468Contig1 907 3 36 U
GGGAAACACGGTCTGAGTCAATTCTCTCTCGTCTTTTATTTATCTCGATTCGATTGTGGT
TGATTTGGGAAATTAGGGTTTTCTTATCCGGAAGATGACGACTGCAGCTAGGCCAACGTG
GGCTCCGGCGAAGGGAGGTAACGAGCAGGGTGGTGCTCGTATTTTCGGCGCCTCTCAGAA
GTATTCGTCTCGCGATGTCGCCGCTCACACGACTCTAAAGCCAAGGAGGGAAGGGCAACA
CACGCAAGAGGAAGTGGAGAAGAAGAATCTTCGTGATGAGCTTGAGGAGCGTGAGAGGAG
ACACTTCTCTTCCAAAGACAAATCTTTTAGTGATGATAGAGATCGCAGGAGAGGGAATCA
GCTACTCTTGGAAGGATCTAAAAGGGACCCTGAAGATCGGATTCTTCCTCGCAGTGTAGA
CGCTGATGATTCTGATGTTGATATCAAAACTGATGATGATAGTGATGACGAAAGTGATGA
TGATGACGAGGACGACACTGAAGCTCTCATGGCTGAACTCGACCAGATTAAGAAAGAAAG
AGTCGAGGAGAGGCTCAGGAAGGAAAAGCAGCAGCAGATGGAGGAGCTGAACGCCAAAGA
AGAAGAACTTCTCAAAGGAAACCCACTGCTTAATAACAATACTCCGACCTCGTTTAGTGT
CAAAAGGAGGTGGGATGATGATGTGGTGTTCAAGAATCACGCCCGTGGTGAAATGAAAGC
ACCTAAGCGCTTCATCAATGATACAATAAGAAATGACTTCCACAGAAAATTCCTGCACAG
ATACATGAAGTGACTGACCCCGCGTGTGTTACTTGTCTGTATGATAAATGATCTAAGGCT
TTTATTCCTTCTCTTGTACTAATACAGAAGCCAACCAACAACTGTTTTATGTCAAAAGCT
CTTGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G157TF U 1
AF RR2B934TF U 26
AF RR2B934JQ C 135
BS 1 82 RR2G157TF
BS 83 83 RR2B934TF
BS 84 90 RR2G157TF
BS 91 91 RR2B934TF
BS 92 144 RR2G157TF
BS 145 145 RR2B934TF
BS 146 162 RR2G157TF
BS 163 163 RR2B934TF
BS 164 175 RR2G157TF
BS 176 176 RR2B934TF
BS 177 285 RR2G157TF
BS 286 286 RR2B934TF
BS 287 403 RR2G157TF
BS 404 404 RR2B934TF
BS 405 420 RR2G157TF
BS 421 421 RR2B934TF
BS 422 436 RR2G157TF
BS 437 437 RR2B934TF
BS 438 449 RR2G157TF
BS 450 450 RR2B934TF
BS 451 519 RR2G157TF
BS 520 520 RR2B934TF
BS 521 543 RR2G157TF
BS 544 544 RR2B934TF
BS 545 588 RR2G157TF
BS 589 589 RR2B934TF
BS 590 612 RR2G157TF
BS 613 837 RR2B934TF
BS 838 838 RR2B934JQ
BS 839 854 RR2B934TF
BS 855 855 RR2B934JQ
BS 856 880 RR2B934TF
BS 881 881 RR2B934JQ
BS 882 896 RR2B934TF
BS 897 897 RR2B934JQ
BS 898 907 RR2B934TF

RD RR2G157TF 612 0 0
GGGAAACACGGTCTGAGTCAATTCTCTCTCGTCTTTTATTTATCTCGATTCGATTGTGGT
TGATTTGGGAAATTAGGGTTTTTTTATCCG*AAGATGACGACTGCAGCTAGGCCAACGTG
GGCTCCGGCGAAGGGAGGTAACGAACAGGGTGGTGCTCGTATCTTCGGCGCCTCTTAGAA
GTATTCGTCTCGCGATGTCGCCGCTCACACGACTCTAAAGCCAAGGAGGGAAGGGCAACA
CACGCAAGAGGAAGTGGAGAAGAAGAATCTTCGTGATGAGCTTGAAGAGCGTGAGAGGAG
ACACTTCTCTTCCAAAGACAAATCTTTTAGTGATGATAGAGATCGCAGGAGAGGGAATCA
GCTACTCTTGGAAGGATCTAAAAGGGACCCTGAAGATCGGATTATTCCTCGCAGTGTAGA
TGCTGATGATTCTGATATTGATATCAAAAGTGATGATGATAGTGATGACGAAAGTGATGA
TGATGACGAGGACGACACTGAAGCTCTCATGGCTGAACTTGACCAGATTAAGAAAGAAAG
AGTGGAGGAGAGGCTCAGGAAGGAAAAGCAGCAGCAGATGGAGGAGCTAAACGCCAAAGA
AGAAGAACTTCT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2B934TF 882 0 0
GG
CTCGTCTTTTCTTTATCTCGATTCGATTGTGGTTGATTTGGGAATTTAGGGTTTTCTTTT
CCGGAAGATGACGACTGCAGCTAGGCCAACGTGGGCTCCGGCGAAGGGAGGTAACGAGCA
GGGTGGTGCTCGTATTTTCGGCGCCTCTCAGAAGTATTCGTCTCGCGATGTCGCCGCTCA
CACGACTCTAAAGCCAAGGAGGGAAGGGCAACACACGCAAGAGGAAGTGGAGAAGAAGAA
TCTTCGTGATGAGCTTGAGGAGCGTGAGAGGAGACACTTCTCTTCCAAAGACAAATCTTT
TAGTGATGATAGAGATCGCAGGAGAGGGAATCAGCTACTCTTGGAAGGATCTAAAAGGGA
CCCTGAAGATCGGATTCTTCCTCGCAGTGTAGACGCTGATGATTCTGATGTTGATATCAA
AACTGATGATGATAGTGATGACGAAAGTGATGATGATGACGAGGACGACACTGAAGCTCT
CATGGCTGAACTCGACCAGATTAAGAAAGAAAGAGTCGAGGAGAGGCTCAGGAAGGAAAA
GCAGCAGCAGATGGAGGAGCTGAACGCCAAAGAAGAAGAACTTCTCAAAGGAAACCCACT
GCTTAATAACAATACTCCGACCTCGTTTAGTGTCAAAAGGAGGTGGGATGATGATGTGGT
GTTCAAGAATCACGCCCGTGGTGAAATGAAAGCACCTAAGCGCTTCATCAATGATACAAT
AAGAAATGACTTCCACAGAAAATTCCTGCACAGATACATGAAGTGACTGACCCCGCGTGT
GTTACTTGTCTGTATGATAAATGATCTAAG*CTTTTATTCCTTCTCT*GTACTAATACAG
AAGCCAACCAACA*CTGTTTTATGTCAAA*GCTCTTGCAC

QA 3 882 3 882
DS 

RD RR2B934JQ 773 0 0
GAGGTAACGAGCAGGGTGGTGCTCGTATTTTCGGCGCCTCTCAGAAGTATTCGTCTCGCG
ATGTCGCCGCTCACACGACTCTAAAGCCAAGGAGGGAAGGGCAACACACGCAAGAGGAAG
TGGAGAAGAAGAATCTTCGTGATGAGCTTGAGGAGCGTGAGAGGAGACACTTCTCTTCCA
AAGACAAATCTTTTAGTGATGATAGAGATCGCAGGAGAGGGAATCAGCTACTCTTGGAAG
GATCTAAAAGGGACCCTGAAGATCGGATTCTTCCTCGCAGTGTAGACGCTGATGATTCTG
ATGTTGATATCAAAACTGATGATGATAGTGATGACGAAAGTGATGATGATGACGAGGACG
ACACTGAAGCTCTCATGGCTGAACTCGACCAGATTAAGAAAGAAAGAGTCGAGGAGAGGC
TCAGGAAGGAAAAGCAGCAGCAGATGGAGGAGCTGAACGCCAAAGAAGAAGAACTTCTCA
AAGGAAACCCACTGCTTAATAACAATACTCCGACCTCGTTTAGTGTCAAAAGGAGGTGGG
ATGATGATGTGGTGTTCAAGAATCAGGCCCGTGGTGAAATGAAAGCACCTAAGCGCTTCA
TCAATGATACAATAAGAAATGACTTCCACAGAAAATTCCTGCACAGATACATGAAGTGAC
TGACCCCGCGTGTGTTACTTGTCTGTATGATAAATGATCTAAGGCTTTTATTCCTTCTCT
TGTACTAATACAGAAGCCAACCAACAACTGTTTTATGTCAAAAGCTCTTGCAC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL3469Contig1 823 2 8 U
GTGCGCTTGCTCGTGCTCTATTCATAGAGTCTGATTTGTTGTTGCTTGATGAACCTACGA
ATCATCTTGATCTCCACGCTGTCTTATGGTTGGAAACGTATCTAACGAAGTGGCCTAAAA
CATTTATCGTCGTTCCCCATGCTAGAGAATTCTTGAACACGGTGGTAACCGACATCATCC
ATTTGCAAAACCAAAAACTAAGTACCTATAAGGGAAACTATGATACTTTCGAAAGAACAC
GGGAAGAAAACGTGAAGAATCAGCAAAAAGCTTTTGAATCAAGTGAACGATCACGGGCAC
ATATGCAGGCGTTCATTGATAAATTTCGTTTCAATGCGAAGAGGGCGTCGCTTGTTCAGT
CAAGAATCAAGGCATTGGACCGGCTTGCCCATGTGGATCAAGTTATTAATGATCCTGACT
ACAAATTTGAATTCCCAACTCCTGACGATAAGCCTGGACCCCCTATTATCAGTTTCAGTG
ATGCATCATTTGGCTACCCTGGTGGTCCGTTGTTGTTTAAGAACCTGAACTTCGGAATAG
ATCTTGATAGCCGTATTGCAATAGTGGGAGCGAATGGTATTGGTAAATCAACTATTCTCA
AACTTATTTCTGGGGATCTGCAGCCAAGCTCTGGAACAGTTTTCCGTTCTGCTAAGGTTA
GAGTTGCAGTCTTTAGTCAGCACCATGTGGATGGGCTAGACCTTACTTCGAATCCTCTTC
TATATATGATGCGCTGCTACCCTGGAGTACCGGACAAAGCTGAGAGTCACTTGGGTTCTC
TTGGGGTCACTGGAAATCTGGCACTGCACCATGTACACTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD82TF U 1
AF RR2EF33TF U 50
BS 1 166 RR2FD82TF
BS 167 167 RR2EF33TF
BS 168 539 RR2FD82TF
BS 540 541 RR2EF33TF
BS 542 750 RR2FD82TF
BS 751 751 RR2EF33TF
BS 752 795 RR2FD82TF
BS 796 823 RR2EF33TF

RD RR2FD82TF 796 0 0
GTGCGCTTGCTCGTGCTCTATTCATAGAGTCTGATTTGTTGTTGCTTGATGAACCTACGA
ATCATCTTGATCTCCACGCTGTCTTATGGTTGGAAACGTATCTAACGAAGTGGCCTAAAA
CATTTATCGTCGTTCCCCATGCTAGAGAATTCTTGAACACGGTGGTCACCGACATCATCC
ATTTGCAAAACCAAAAACTAAGTACCTATAAGGGAAACTATGATACTTTCGAAAGAACAC
GGGAAGAAAACGTGAAGAATCAGCAAAAAGCTTTTGAATCAAGTGAACGATCACGGGCAC
ATATGCAGGCGTTCATTGATAAATTTCGTTTCAATGCGAAGAGGGCGTCGCTTGTTCAGT
CAAGAATCAAGGCATTGGACCGGCTTGCCCATGTGGATCAAGTTATTAATGATCCTGACT
ACAAATTTGAATTCCCAACTCCTGACGATAAGCCTGGACCCCCTATTATCAGTTTCAGTG
ATGCATCATTTGGCTACCCTGGTGGTCCGTTGTTGTTTAAGAACCTGAACTTCGGAATA*
*TCTTGATAGCCGTATTGCAATAGTGGGAGCGAATGGTATTGGTAAATCAACTATTCTCA
AACTTATTTCTGGGGATCTGCAGCCAAGCTCTGGAACAGTTTTCCGTTCTGCTAAGGTTA
GAGTTGCAGTCTTTAGTCAGCACCATGTGGATGGGCTAGACCTTACTTCGAATCCTCTTC
TATATATGATGCGCTGCTACCCTGGAGTACGGGACAAAGCTGAGAGTCACTTGGGTTCTC
TTGGGGTCACTGGAA
T

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2EF33TF 774 0 0
G
GAACCTACGAATCATCTTGATCTCCACGCTGTCTTATGGTTGGAAACGTATCTAACGAAG
TGGCCTAAAACATTTATCGTCGTTTCCCATGCTAGAGAATTCTTGAACACGGTGGTAACC
GACATCATCCATTTGCAAAACCAAAAACTAAGTACCTATAAGGGAAACTATGATACTTTC
GAAAGAACACGGGAAGAAAACGTGAAGAATCAGCAAAAAGCTTTTGAATCAAGTGAACGA
TCACGGGCACATATGCAGGCGTTCATTGATAAATTTCGTTTCAATGCGAAGAGGGCGTCG
CTTGTTCAGTCAAGAATCAAGGCATTGGACCGGCTTGCCCATGTGGATCAAGTTATTAAT
GATCCTGACTACAAATTTGAATTCCCAACTCCTGACGATAAGCCTGGACCCCCTATTATC
AGTTTCAGTGATGCATCATTTGGCTACCCTGGTGGTCCGTTGTTGTTTAAGAACCTGAAC
TTCGGAATAGATCTTGATAGCCGTATTGCAATGGTGGGAGCGAATGGTATTGGTAAATCA
ACTATTCTCAAACTTATTTCTGGGGATCTGCAGCCAAGCTCTGGAACAGTTTTCCGTTCT
GCTAAGGTTAGAGTTGCAGTCTTTAGTCAGCACCATGTGGATGGGCTAGACCTTACTTCG
AATCCTCTTCTATATATGATGCGCTGCTACCCTGGAGTACCGGACAAAGCTGAGAGTCAC
TTGGGTTCTCTTGGG*TCACTGGAAATCTGGCACTGCACCATGTACACTTTAT

QA 2 774 2 774
DS 



AS 1 2

CO CL3470Contig1 728 2 6 U
GGGTGTTTGTCGCCTCCCGATCGATCGTGTAACTGAGGAGTGAGGACGATGATGCAAGCA
GTTTCCAGGAGATTAGTCCAACGGCCTCTCGCCGGAGGAACTTCGATCTATTCTTCGTCT
TCTCTCAGATCGCTCTATGGAGTCTCCAATCACCTGAATGAAACTGATAATCGTCGCTAC
TCGTCTTCCCTTGCTACAAAGGGCGTTGGACACCTCGCTCGTAAGGGTACTGGTGGCAGA
TCTTCCGTCAGTGGCATTGTAGCTACGGTATTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTAT
CTTGTGCAACAGCTAGCTAAAATGGGATCACAAGTGCTAGTTCCTTTCCGAGGCTCTGAG
GATAACCCTCGACATCTCAAGTTAATGGGAGATTTAGGACAGGTAGTACCAATGAAATTT
GATCCAAGAGATGAAGACTCGATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTCGTTATCAAT
CTCATTGGAAGAGAGTACGAGACCAGGAATTTCAGTTTCGAAGAGGTGAATCATCACATG
GCCGAGAAACTTGCATTGGTGGCTAAGGAACATGGTGGGATAATGAGATTTATTCAGGTT
TCTTGTCTGGGAGCGTCTGCCTCATCTCCTTCAAGAATGCAGAGGGCAAAAGCCGCTGCT
GAGGAAGCTGTCTTCAGCGCGCTGCCTGAGCGACAGTCATGAGACCTGCGACCATGATTG
GCACAGAG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ91TF U 1
AF RR2CA93TF U 2
BS 1 10 RR2AQ91TF
BS 11 11 RR2CA93TF
BS 12 146 RR2AQ91TF
BS 147 147 RR2CA93TF
BS 148 580 RR2AQ91TF
BS 581 728 RR2CA93TF

RD RR2AQ91TF 580 0 0
GGGTGTTTGTTGCCTCCCGATCGATCGTGTAACTGAGGAGTGAGGACGATGATGCAAGCA
GTTTCCAGGAGATTAGTCCAACGGCCTCTCGCCGGAGGAACTTCGATCTATTCTTCGTCT
TCTCTCAGATCGCTCTATGGAGTCTCTAATCACCTGAATGAAACTGATAATCGTCGCTAC
TCGTCTTCCCTTGCTACAAAGGGCGTTGGACACCTCGCTCGTAAGGGTACTGGTGGCAGA
TCTTCCGTCAGTGGCATTGTAGCTACGGTATTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTAT
CTTGTGCAACAGCTAGCTAAAATGGGATCACAAGTGCTAGTTCCTTTCCGAGGCTCTGAG
GATAACCCTCGACATCTCAAGTTAATGGGAGATTTAGGACAGGTAGTACCAATGAAATTT
GATCCAAGAGATGAAGACTCGATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTCGTTATCAAT
CTCATTGGAAGAGAGTACGAGACCAGGAATTTCAGTTTCGAAGAGGTGAATCATCACATG
GCCGAGAAACTTGCATTGGTGGCTAAGGAACATGGTGGGA

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2CA93TF 727 0 0
GGGT
TTTGTCGCCTCTCGATCGATCGTGTAACTGAGGAGTGAGGACGATGATGCAAGCAGTTTC
CAGGAGATTAGTCCAACGGCCTCTCGCCGGAGGAACTTCGATCTATTCTTCGTCTTCTCT
CAGATCGCTTTATGGAGTCTCCAATTACCTGAATGAAACTGATAATCGTCGCTACTCGTC
TTCCCTTGCTACAAAGGGCGTTGGACACCTCGCTCGTAAGGGTACTGGTGGCAGATCTTC
CGTCAGTGGCATTGTAGCTACGGTATTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTATCTTGT
GCAACAGCTAGCTAAAATGGGATCACAAGTGCTAGTTCCTTTCCGAGGCTCTGAGGATAA
CCCTCGACATCTCAAGTTAATGGGAGATTTAGGACAGGTAGTACCAATGAAATTTGATCC
AAGAGATGAAGACTCGATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTCGTTATCAATCTCAT
TGGAAGAGAGTACGAGACCAGGAATTTCAGTTTCGAAGAGGTGAATCATCACATGGCCGA
GAAACTTGCATTGGTGGCTAAGGAACATGGTGGGATAATGAGATTTATTCAGGTTTCTTG
TCTGGGAGCGTCTGCCTCATCTCCTTCAAGAATGCAGAGGGCAAAAGCCGCTGCTGAGGA
AGCTGTCTTCAGCGCGCTGCCTGAGCGACAGTCATGAGACCTGCGACCATGATTGGCACA
GAG

QA 5 727 5 727
DS 



AS 1 2

CO CL3471Contig1 788 2 3 U
TTTTTGAGCGCAAGATATTTTACTTTATTTTTCATTCAAATCTTCAATTACAAATATATA
AAAAGACAAGAAAAAAGTGGTGGAAGAAGATAGAAGAAGAAGGGTTGATATTGACAAAGA
AAAAAAGAAGGGTTGATATATTGTCATCCAAAAACCATCATGCAAATTCTTCAGACCATT
CGTGTAACGTAGGAGTCTTGACGCCGATATTTTTCATGTCCAGAATATTCGCGGTATGAA
TCTCCGGTGTCGCAGCAGCTGTGGCATCTACGATAACAGTTACATCTGGATAATCCAGCT
CCACTGCATCAAACACCGTTTGCCTGATACAATTTGGCGTTTGCACCCCAGCGATGACTA
ACTTGGTAACCCCTGAAGTTTGGAGGAACGAATGAAGATGTGTGCCGAAGAAGGCGCTGA
AACGAGTTTTCACTATCTTATAATCTTCTTCTTCTCTGATGTTCAGTCCATCGACTAGCT
TTGCACCTTTTGTTCCTTTAACAGTCGGTCCAACTTTCTCAGAACTGTAGTGATGACGCC
TGAATATTTCAACATCTCTTCCCTGAGGATCGTGTTCTCTAACAACCCAAACCACGAGAA
CGCCACGCTGCCTCGCGAGTTCGACCACTCTGATAACATTAGGAACTATGGCTTTTCCGC
CTTTCACTTGCGTCACTGAACCTTCCTCTATGAAATCATTCTGCATATCGATGACGAGTA
GAGCCGTGTTCGTCCATCTCTCCGCCATGGTTCCCACGAAGACGATGATAAGCTTTTCCA
GTAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D647JQ U 6
AF RR2D647TF C 1
BS 1 5 RR2D647TF
BS 6 754 RR2D647JQ
BS 755 788 RR2D647TF

RD RR2D647JQ 756 0 0
GAGCGCAAGATATTTTACTTTATTTTTCATTCAAATCTTCAATTACAAATATATAAAAAG
ACAAGAAAAAAGTGGTGGAAGAAGATAGAAGAAGAAGGGTTGATATTGACAAAGAAAAAA
AGAAGGGTTGATATATTGTCATCCAAAAACCATCATGCAAATTCTTCAGACCATTCGTGT
AACGTAGGAGTCTTGACGCCGATATTTTTCATGTCCAGAATATTCGCGGTATGAATCTCC
GGTGTCGCAGCAGCTGTGGCATCTACGATAACAGTTACATCTGGATAATCCAGCTCCACT
GCATCAAACACCGTTTGCCTGATACAATTTGGCGTTTGCACCCCAGCGATGACTAACTTG
GTAACCCCTGAAGTTTGGAGGAACGAATGAAGATGTGTGCCGAAGAAGGCGCTGAAACGA
GTTTTCACTATCTTATAATCTTCTTCTTCTCTGATGTTCAGTCCATCGACTAGCTTTGCA
CCTTTTGTTCCTTTAACAGTCGGTCCAACTTTCTCAGAACTGTAGTGATGACGCCTGAAT
ATTTCAACATCTCTTCCCTGAGGATCGTGTTCTCTAACAACCCAAACCACGAGAACGCCA
CGCTGCCTCGCGAGTTCGACCACTCTGATAACATTAGGAACTATGGCTTTTCCGCCTTTC
ACTTGCGTCACTGAACCTTCCTCTATGAAATCATTCTGCATATCGATGACGAGTAGAGCC
GTGTTCGTCCATCTCTCCGCCATGGTTCC
CACGAAG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2D647TF 788 0 0
TTTTTGAGCGCAAGATATTTTACTTTATTTTTCATTCAAATCTTCAATTACAAATATATA
AAA*GACAAGAAAAAAGTGGTGGAAGAAGATAGAAGAAGAAGGGTTGATATTGACAAAGA
AAAAAAGAAGGGTTGATATATTGTCATCCAAAAACCATCATGCAAATTCTTCAGACCATT
CGTGTAACGTAGGAGTCTTGACGCCGATATTTTTCATGTCCAGAATATTCGCGGTATGAA
TCTCCGGTGTCGCAGCAGCTGTGGCATCTACGATAACAGTTACATCTGGATAATCCAGCT
CCACTGCATCAAACACCGTTTGCCTGATACAATTTGGCGTTTGCACCCCAGCGATGACTA
ACTTGGTAACCCCTGAAGTTTGGAGGAACGAATGAAGATGTGTGCCGAAGAAGGCGCTGA
AACGAGTTTTCACTATCTTATAATCTTCTTCTTCTCTGATGTTCAGTCCATCGACTAGCT
TTGCACCTTTTGTTCCTTTAACAGTCGGTCCAACTTTCTCAGAACTGTAGTGATGACGCC
TGAATATTTCAACATCTCTTCCCTGAGGATCGTGTTCTCTAACAACCCAAACCACGAGAA
CGCCACGCTGCCTCGCGAGTTCGACCACTCTGATAACATTAGGAACTATGGCTTTTCCGC
CTTTCACTTGCGTCACTGAACCTTCCTCTATGAAATCATTCTGCATATCGATGACGAGTA
GAGCCGTGTTCGTCCATCTCTCCGCCATGGTTCCCACGAAGACGATGATAAGCTTTTCCA
GTAAACCC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 3

CO CL3472Contig1 1066 3 7 U
GGGGAAATAAACAAGATTAAAGAGGAAGCACAGAGCCGTAAAGACATCATGGACAGAATT
GACCGTTGGCTCTCTGCATGTGAAGAGGAAAACTGGTTGGAAGAATATAATCTGGATGTG
AACCGTTATAGTGCTGGAAGAGGTGGACATGTAAACCTTAAGCGTGCAGAACGAGCCAGA
GTTACAATCAATAAGATCCCAGCAATGGTTGACAATCTTATTAAGAAAACTCTAGTTTGG
GAAGAGGAAACGCACAAGTCATTTCTCTATGATGGTGTTCGGTTGGTTAACATACTAGAA
GACTACAAGTTAACAAGGAAACAACAGGAAGAGGAAAAGAAAAGATACCGGGACCAAAAG
AAGAGGCAAGATCTCCTACTAACCCAAAGGGAATCCATATATGGATCAAAACCGAGTCCA
AGAAGAAGCAGCAGCTTCAGGAAGCCTAGTGGTTACAGCATTAGCAATGGGAATGGTTCA
ATGCCTCCCACACCTCGCAGAAGCTCAGTGGGGACAACAACACCTGACCTTCTTCTGACC
CCGAGATCTTACTCGGGTCATCATCGCCAAGACGGGTATTTTAAAGAAGTTAGGAGACTC
GCTTCTACTCCCTTAAACTATGTGGCCATACAAAAGGAAGATACTGCTTCTACTACTTAC
ACATCGATCTATAGCTCTGAGCCAGACTCACCTCTCCAAGGCTGACTTTGACTCTCCTTT
GCACTGAGATTCATGTTAGAAGTTGGATATATGTATGTGGTTAAGGATTTGTGAAGTAAT
CTTTAATAATGACGTTATCGTAAAGAAGAAGTCAGTGATGGTTGAAGATGCAGACTTGTG
AATACAGAAAGGTGACTTGACTTGTTTAGGGGAGATATGGAGAGACAATGAGTATAAAAT
AAAACTGTATCTGTAACTCTTTTTTAATCTTTCAGTGAGAAAATACTATTTTTGCCGTGT
GAAAGTGCGTTTGTGTGTGTACTTATTTGTGTATATAAAATATACGTATTTGTTTTGAGA
TGTGATGCTTTGATATTTTTTTGGTGTGGTTTCAGTAATACTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ48TF U 1
AF RR2AJ48JQ C 243
AF RR2AK19TF U 627
BS 1 765 RR2AJ48TF
BS 766 766 RR2AK19TF
BS 767 806 RR2AJ48TF
BS 807 918 RR2AK19TF
BS 919 919 RR2AJ48JQ
BS 920 1059 RR2AK19TF
BS 1060 1066 RR2AJ48JQ

RD RR2AJ48TF 806 0 0
GGGGAAATAAACAAGATTAAAGAGGAAGCACAGAGCCGTAAAGACATCATGGACAGAATT
GACCGTTGGCTCTCTGCATGTGAAGAGGAAAACTGGTTGGAAGAATATAATCTGGATGTG
AACCGTTATAGTGCTGGAAGAGGTGGACATGTAAACCTTAAGCGTGCAGAACGAGCCAGA
GTTACAATCAATAAGATCCCAGCAATGGTTGACAATCTTATTAAGAAAACTCTAGTTTGG
GAAGAGGAAACGCACAAGTCATTTCTCTATGATGGTGTTCGGTTGGTTAACATACTAGAA
GACTACAAGTTAACAAGGAAACAACAGGAAGAGGAAAAGAAAAGATACCGGGACCAAAAG
AAGAGGCAAGATCTCCTACTAACCCAAAGGGAATCCATATATGGATCAAAACCGAGTCCA
AGAAGAAGCAGCAGCTTCAGGAAGCCTAGTGGTTACAGCATTAGCAATGGGAATGGTTCA
ATGCCTCCCACACCTCGCAGAAGCTCAGTGGGGACAACAACACCTGACCTTCTTCTGACC
CCGAGATCTTACTCGGGTCATCATCGCCAAGACGGGTATTTTAAAGAAGTTAGGAGACTC
GCTTCTACTCCCTTAAACTATGTGGCCATACAAAAGGAAGATACTGCTTCTACTACTTAC
ACATCGATCTATAGCTCTGAGCCAGACTCACCTCTCCAAGGCTGACTTTGACTCTCCTTT
GCACTGAGATTCATGTTAGAAGTTGGATATATGTATGTGGTTAAG*ATTTGTGAAGTAAT
CTTTAATAATGACGTTATCGTAAAGA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2AJ48JQ 824 0 0
AGAGGAAACGCACAAGTCATTTCTCTATGATGGTGTTCGGTTGGTTAACATACTAGAAGA
CTACAAGTTAACAAGGAAACAACAGGAAGAGGAAAAGAAAAGATACCGGGACCAAAAGAA
GAGGCAAGATCTCCTACTAACCCAAAGGGAATCCATATATGGATCAAAACCGAGTCCAAG
AAGAAGCAGCAGCTTCAGGAAGCCTAGTGGTTACAGCATTAGCAATGGGAATGGTTCAAT
GCCTCCCACACCTCGCAGAAGCTCAGTGGGGACAACAACACCTGACCTTCTTCTGACCCC
GAGATCTTACTCGGGTCATCATCGCCAAGACGGGTATTTTAAAGAAGTTAGGAGACTCGC
TTCTACTCCCTTAAACTATGTGGCCATACAAAAGGAAGATACTGCTTCTACTACTTACAC
ATCGATCTATAGCTCTGAGCCAGACTCACCTCTCCAAGGCTGACTTTGACTCTCCTTTGC
ACTGAGATTCATGTTAGAAGTTGGATATATGTATGTGGTTAAGGATTTGTGAAGTAATCT
TTAATAATGACGTTATCGTAAAGAAGAAGTCAGTGATGGTTGAAGATTCAGACTTGTGAA
TACAGAAAGGTGACTTGACTTGTTTAGGGGAGATATGGAGAGACAATGAGTATAAAATAA
AACTGTATCTGTAACTCTTTTTTAATCTTTCAGTGAGAAAATACTATTTTTGCCGTGTGA
AAGTGCGTTTGTGTGTGTACTTATTTGTGTATATAAAATATACGTATTTGTTTTGAGATG
TGATGCTTTGATATTTTTTTGGTGTGGTTTCAGTAATACTTTTC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2AK19TF 433 0 0
G
ATACAAAAGGAAGATACTGCTTCTACTACTTACACATCGATCTATAGCTCTGAGCCAGAC
TCACCTCTCCAAGGCTGACTTTGACTCTCCTTTGCACTGAGATTCATGTTAGAAGTTGGA
TATATGTATGTGGTTAAGGATTTGTGAAGTAATCTTTAATAATGACGTTATCGTAAAGAA
GAAGTCAGTGATGGTTGAAGATGCAGACTTGTGAATACAGAAAGGTGACTTGACTTGTTT
AGGGGAGATATGGAGAGACAATGAGTATAAAATAAAACTGTATCTGTAACT*TTTTTTAA
TCTTTCAGTGAGAAAATACTATTTTTGCCGTGTGAAAGTGCGTTTGTGTGTGTACTTATT
TGTGTATATAAAATATACGTATTTGTTTTGAGATGTGATGCTTTGATATTTTTTTGGTGT
GGTTTCAGTAAT

QA 2 433 2 433
DS 



AS 1 3

CO CL3473Contig1 986 3 19 U
GGATCATCATCATAATCTCTTTCTTCTTCAACGAGTTATAAGCAATGGCAAAGTCTCTAG
CTGAGTTGGCGCTTTTGGCCGCTCTTTTTATGGCGGTTGATGCCTTTAGGCCTTCTGGTT
TAACCAATGGCCACGCCACATTCTATGGAGGGAGTGACGCTTCTGGAACAATGGGCGGAG
CTTGTGGGTACGGAGATCTCTACTCGGCGGGGTACGGGATAATGACGGCGGCGTTAAGCA
CGGCTCTGTTTAACAACGGAGCTTCTTGCGGCGAATGCTATAGGATAACGTGTGATTACG
CGGCGGACTCAAGGTGGTGCAAGAAAGGAGCTTCGGTGATCATTACAGCAACCAACTTCT
GCCCACCGAACTTCGCTCTTCCCAATAACGACGGTGGTTGGTGCAACCCGCCACTCAAAC
ATTTCGACATGGCACAACCCGCTTGGGAAAAGATCGGAATCTACAGAGGAGGAATCGTCC
CCGTCGTGTTCCAAAGAGTAAGCTGTTACAAGAGTGGGGGAGTGAGATTCAGAATCAACG
GAAGAGATTACTTCGAGCTAGTGAACATATCGAACGTAGGAGGAGCTGGTTCGATTCAAT
CTGCGTCCATTAAAGGATCAAAGACTGGTTGGTTAGCTATGTCTCGCAATTGGGGAGCTA
ATTGGCAATCAAACGCTTATCTCGATGGTCAATCTCTTTCTTTCTCCATTACTACTACCG
ATGGTGCTACAAGAGTCTTCCTCAATGTTGTTCCTTCTTCTTGGTCTTTCGGACAGACTT
ATTCTTCAAGAGTTCAGTTTTAAGATTGTTTTGTTTGTCTGTCTGTCTGAAAAGTTATTG
GCTGTGGTCGCGCTCTGTGTCTCTGTTTCTTCTCTTCCGGAGCCACCCGCCCGCTTTCGT
TTTTTTTTCTTTCTGGTTTTATGGGGTCTGTTAATGGAGAAGATCCGATTCTATTTGAGG
AAATGATTATATATAATTGTTGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA35TF U 1
AF RR2EF09TF U 223
AF RR2EF09JQ C 345
BS 1 412 RR2DA35TF
BS 413 413 RR2EF09TF
BS 414 517 RR2DA35TF
BS 518 518 RR2EF09TF
BS 519 571 RR2DA35TF
BS 572 572 RR2EF09TF
BS 573 603 RR2DA35TF
BS 604 605 RR2EF09TF
BS 606 628 RR2DA35TF
BS 629 629 RR2EF09TF
BS 630 657 RR2DA35TF
BS 658 658 RR2EF09TF
BS 659 672 RR2DA35TF
BS 673 673 RR2EF09TF
BS 674 718 RR2DA35TF
BS 719 719 RR2EF09TF
BS 720 754 RR2DA35TF
BS 755 902 RR2EF09TF
BS 903 986 RR2EF09JQ

RD RR2DA35TF 754 0 0
GGATCATCATCATAATCTCTTTCTTCTTCAACGAGTTATAAGCAATGGCAAAGTCTCTAG
CTGAGTTGGCGCTTTTGGCCGCTCTTTTTATGGCGGTTGATGCCTTTAGGCCTTCTGGTT
TAACCAATGGCCACGCCACATTCTATGGAGGGAGTGACGCTTCTGGAACAATGGGCGGAG
CTTGTGGGTACGGAGATCTCTACTCGGCGGGGTACGGGATAATGACGGCGGCGTTAAGCA
CGGCTCTGTTTAACAACGGAGCTTCTTGCGGCGAATGCTATAGGATAACGTGTGATTACG
CGGCGGACTCAAGGTGGTGCAAGAAAGGAGCTTCGGTGATCATTACAGCAACCAACTTCT
GCCCACCGAACTTCGCTCTTCCCAATAACGACGGTGGTTGGTGCAACCCGCCGCTCAAAC
ATTTCGACATGGCACAACCCGCTTGGGAAAAGATCGGAATCTACAGAGGAGGAATCGTCC
CCGTCGTGTTCCAAAGAGTAAGCTGTTACAAGAGTGGAGGAGTGAGATTCAGAATCAACG
GAAGAGATTACTTCGAGCTAGTGAACATATCTAACGTAGGAGGAGCTGGTTCGATTCAAT
CTGTATCCATTAAAGGATCAAAGACTGGCTGGTTAGCTATGTCTCGCAATTGGGGAGTTA
ATTGGCAATCAAGCGCTTATCTCGATGGTCAATCTCTTTCTTTCTCCATTACTACTACTG
ATGGTGCTACAAGAGTCTTCCTCAATGTTGTTCC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2EF09TF 680 0 0
G
GACGGCGGCGTTAAGCACGGCTCTGTTTAACAACGGAGCTTCTTGCGGCGAATGCTATAG
GATAACGTGTGATTACGCGGCGGACTCACGGTGGTGCAGGAAAGGAGCTTCGGTGGTCAT
TACAGCAACCAACTTCTGCCCACCGAACTTCGCTCTTCCCAATAACGACGGTGGTTGGTG
CAACCCGCCACTCAAACATTTCGACATGGCACAACCCGCTTGGGAAAAGATCGGAATCTA
CAGAGGAGGAATCGTCCCCGTCGTGTTCCAAAGAGTAAGCTGTTACAAGAGTGGGGGAGT
GAGATTCAGAATCAACGGAAGAGATTACTTCGAGCTAGTGAACATATCGAACGTAGGAGG
AGCTGGTTCGATTCAATCTGCGTCCATTAAAGGATCAAAGACTGGTTGGTTAGCTATGTC
TCGCAATTGGGGAGCTAATTGGCAATCAAACGCTTATCTCGATGGTCAATCTCTTTCTTT
CTCCATTACTACTACCGATGGTGCTACAAGAGTCTTCCTCAATGTTGTTCCTTCTTCTTG
GTCTTTCGGACAGACTTATTCTTCAAGAGTTCAGTTTTAAGATTGTTTTGTTTGTCTGTC
TGTCTGAAAAGTTATTGGCTGTGGTCGCGCTCTGTGTCTCTGTTTCTTCTCTTCCGGAGC
CACCCGCCCGCTTTCGTTT

QA 2 680 2 680
DS 

RD RR2EF09JQ 642 0 0
ACAGCAACCAACTTCTGCCCACCGAACTTCGCTCTTCCCAATAACGACGGTGGTTGGTGC
AACCCGCCACTCAAACATTTCGACATGGCACAACCCGCTTGGGAAAAGATCGGAATCTAC
AGAGGAGGAATCGTCCCCGTCGTGTTCCAAAGAGTAAGCTGTTACAAGAGTGGGGGAGTG
AGATTCAGAATCAACGGAAGAGATTACTTCGAGCTAGTGAACATATCGAACGTAGGAGGA
GCTGGTTCGATTCAATCTGCGTCCATTAAAGGATCAAAGACTGGTTGGTTAGCTATGTCT
CGCAATTGGGGAGCTAATTGGCAATCAAACGCTTATCTCGATGGTCAATCTCTTTCTTTC
TCCATTACTACTACCGATGGTGCTACAAGAGTCTTCCTCAATGTTGTTCCTTCTTCTTGG
TCTTTCGGACAGACTTATTCTTCAAGAGTTCAGTTTTAAGATTGTTTTGTTTGTCTGTCT
GTCTGAAAAGTTATTGGCTGTGGTCGCGCTCTGTGTCTCTGTTTCTTCTCTTCCGGAGCC
ACCCGCCCGCTTTCGTTTTTTTTTCTTTCTGGTTTTATGGGGTCTGTTAATGGAGAAGAT
CCGATTCTATTTGAGGAAATGATTATATATAATTGTTGTGTG

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 3

CO CL3474Contig1 723 3 3 U
GCTCTGTATAAATTCCTTACACGTTTAGTGCTTCTCTTACCAATTTCCACCACTTAAAAG
CACATGCAATCGAGTTTCTCTGCGCAGGCAAGGTCGCCAATAATAAGACCAATGGCTGTG
GCTATATCTCTTTCTAAGTGTTCAAAGAGGCTCCAGCGAAGGATCTCATCGTTCACATGC
ATCAGTTGTTATGATAGCAACGCTGTCGGCATCCTCAGGTATTGGGTGGAGCTTATTGCG
GCAGATGAAAGTGATGAAGCTGTGTTTGTTGGCTTCTGTGGGAAGATGACAAAATTAACT
AATATCAGAACACTTAATCTGGGCATCTTCTGGCTGCAAGTTTTGAAAACCTTGAAGACA
GTCAGCTCCCTCTGTACATTGCTGGCCTTGTGGGCAAGAGTTACATGTTCCAGCTTATTT
TGCCCCACTTCAACTTTACTTCCACACATCAGACGTTCACAACCTCGAGTTTTTTCAACT
AGCGTCAGCGTCTACCAATTTCAGGTTTACTTGTGGGAAAGTAAGCTACTCACTATACAC
ACTTCAACCTTCTTTCCCACATATGGAGATGCCAATATGTTTGTTTGTGATTACAGAACG
GCACTGGTGGCCTTGGTGATGATATGACACTTTTATATCTTCCTCTGCTGTTAAACTATT
TTTTACAACTATAAAACAATTCTTTTTTTGATCAAGCATATCAATGAACCTTTCTGTTTG
CGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2H485TF U 1
AF RR2B839TF U 182
AF RR2H485JQB C 81
BS 1 596 RR2H485TF
BS 597 699 RR2B839TF
BS 700 723 RR2H485JQB

RD RR2H485TF 596 0 0
GCTCTGTATAAATTCCTTACACGTTTAGTGCTTCTCTTACCAATTTCCACCACTTAAAAG
CACATGCAATCGAGTTTCTCTGCGCAGGCAAGGTCGCCAATAATAAGACCAATGGCTGTG
GCTATATCTCTTTCTAAGTGTTCAAAGAGGCTCCAGCGAAGGATCTCATCGTTCACATGC
ATCAGTTGTTATGATAGCAACGCTGTCGGCATCCTCAGGTATTGGGTGGAGCTTATTGCG
GCAGATGAAAGTGATGAAGCTGTGTTTGTTGGCTTCTGTGGGAAGATGACAAAATTAACT
AATATCAGAACACTTAATCTGGGCATCTTCTGGCTGCAAGTTTTGAAAACCTTGAAGACA
GTCAGCTCCCTCTGTACATTGCTGGCCTTGTGGGCAAGAGTTACATGTTCCAGCTTATTT
TGCCCCACTTCAACTTTACTTCCACACATCAGACGTTCACAACCTCGAGTTTTTTCAACT
AGCGTCAGCGTCTACCAATTTCAGGTTTACTTGTGGGAAAGTAAGCTACTCACTATACAC
ACTTCAACCTTCTTTCCCACATATGGAGATGCCAATATGTTTGTTTGTGATTACAG

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2B839TF 518 0 0
G
CAGTTGTTATGATAGCAACGCTGTCGGCATCCTCAGGTATTGGGTGGAGCTTATTGCGGC
AGATGAAAGTGATGAAGCTGTGTTTGTTGGCTTCTGTGGGAAGATGACAAAATTAACTAA
TATCAGAACACTTAATCTGGGCATCTTCTGGCTGCAAGTTTTGAAAACCTTGAAGACAGT
CAGCTCCCTCTGTACATTGCTGACCTTGTGGGCAAGAGTTACATGTTCCAGCTTAGTTTG
CCCCACTTCAACTTTACTTCCACACATCAGACGTTCACAATCTCGAGTTTTTTCAACTAG
CGTCAGCGTCTACCAATTTCAGGTTTACTTGTGGGAAAGTAAGCTACTCACTATACACAC
TTCAACCTTCTTTCCCACATATGGAGATGCCAATATGTTTGTTTGTGATTACAGAACGGC
ACTGGTGGCCTTGGTGATGATATGACACTTTTATATCTTCCTCTGCTGTTAAACTATTTT
TTACAACTATAAAACAATTCTTTTTTTGATCAAGCAT

QA 2 518 2 518
DS 

RD RR2H485JQB 643 0 0
TGCGCAGGCAAGGTCGCCAATAATAAGACCAATGGCTGTGGCTATATCTCTTTCTAAGTG
TTCAAAGAGGCTCCAGCGAAGGATCTCATCGTTCACATGCATCAGTTGTTATGATAGCAA
CGCTGTCGGCATCCTCAGGTATTGGGTGGAGCTTATTGCGGCAGATGAAAGTGATGAAGC
TGTGTTTGTTGGCTTCTGTGGGAAGATGACAAAATTAACTAATATCAGAACACTTAATCT
GGGCATCTTCTGGCTGCAAGTTTTGAAAACCTTGAAGACAGTCAGCTCCCTCTGTACATT
GCTGGCCTTGTGGGCAAGAGTTACATGTTCCAGCTTATTTTGCCCCACTTCAACTTTACT
TCCACACATCAGACGTTCACAACCTCGAGTTTTTTCAACTAGCGTCAGCGTCTACCAATT
TCAGGTTTACTTGTGGGAAAGTAAGCTACTCACTATACACACTTCAACCTTCTTTCCCAC
ATATGGAGATGCCAATATGTTTGTTTGTGATTACAGAACGGCACTGGTGGCCTTGGTGAT
GATATGACACTTTTATATCTTCCTCTGCTGTTAAACTGTTTTTTACAACTATAAAACAAT
TCTTTTTTTGATCAAGCATATCAATGAACCTTTCTGTTTGCGC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL3475Contig1 731 2 1 U
CTTGCTCTCCAAGAAAGATGGCTTCTTCTATTCTCTTTATCACTCTCTTAGTCTCCTTGT
CTCCAATCTTTCTACAGCAGGTTCTCGCTCAAGTCCCAACTACATGCTCCTCAATGCTTC
TTTCGTTGGCTCCATGTGGTCCATTCGTGCAAGGCTTCGTCCAGCTTCCGGCTCAGCCTT
GTTGTGACGGCTTAAACCAGATCTATAGCCAACAACCAAACTGTCTCTGTCTCTTCCTCA
ACAATACTTCTACTTTGTCCCCTGCTTTTCCTATCAACCAGACTCTTGCTCTACAGCTGC
CACCGCTTTGCAATATTCCAACCAATTCTCCCTCTTGCTCTTCCCCTAGAGGAGAGGCGC
CTAGTGATTCATCCTCAGTTGCTCCACCACCCTCTAGCTCAACCAGCTCTCAATATCTCC
AGGTGCAAAGAACCACTCTGCTACCCCAGTGGCTCAACTGGCACCAAGACCCACCAGCTT
AATGGGGCTAGGTTATGATCTGAGATCCTCTGGCTCCAAGTCTAAGATCCAGCTATTCCT
TATGGCACTCGCAGCGATCCTACCAGGAACTCTCCTCATCTGAATCTATCTGCATATTAG
CTACATTCACCTGTTTTGGGTTTTTCTCTATGAATCAATCATCGTTCTTCTGTATGTTAC
TTAACGTTTGCAGTTCTTGATATGAAATCAGAAAACAGAACAATGAATAACAACACTCTT
GTTTAATAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AC63JQ C 1
AF RR2AC63TF U 1
BS 1 731 RR2AC63TF

RD RR2AC63JQ 731 0 0
CTTGCTCTCCAAGAAAGATGGCTTCTTCTATTCTCTTTATCACTCTCTTAGTCTCCTTGT
CTCCAATCTTTCTACAGCAGGTTCTCGCTCAAGTCCCAACTACATGCTCCTCAATGCTTC
TTTCGTTGGCTCCATGTGGTCCATTCGTGCAAGGCTTCGTCCAGCTTCCGGCTCAGCCTT
GTTGTGACGGCTTAAACCAGATCTATAGCCAACAACCAAACTGTCTCTGTCTCTTCCTCA
ACAATACTTCTACTTTGTCCCCTGCTTTTCCTATCAACCAGACTCTTGCTCTACAGCTGC
CACCGCTTTGCAATATTCCAACCAATTCTCCCTCTTGCTCTTCCCCTAGAGGAGAGGCGC
CTAGTGATTCATCCTCAGTTGCTCCACCACCCTCTAGCTCAACCAGCTCTCAATATCTCC
AGGTGCAAAGAACCACTCTGCTACCCCAGTGGCTCAACTGGCACCAAGACCCACCAGCTT
AATGGGGCTAGGTTATGATCTGAGATCCTCTGGCTCCAAGTCTAAGATCCAGCTATTCCT
TATGGCACTCGCAGCGATCCTACCAGGAACTCTCCTCATCTGAATCTATCTGCATATTAG
CTACATTCACCTGTTTTGGGTTTTTCTCTATGAATCAATCATCGTTCTTCTGTATGTTAC
TTAACGTTTGCAGTTCTTGATATGAAATCAGAAAACAGAACAATGAATAACAACACTCTT
GTTTAATAACC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2AC63TF 731 0 0
CTTGCTCTCCAAGAAAGATGGCTTCTTCTATTCTCTTTATCACTCTCTTAGTCTCCTTGT
CTCCAATCTTTCTACAGCAGGTTCTCGCTCAAGTCCCAACTACATGCTCCTCAATGCTTC
TTTCGTTGGCTCCATGTGGTCCATTCGTGCAAGGCTTCGTCCAGCTTCCGGCTCAGCCTT
GTTGTGACGGCTTAAACCAGATCTATAGCCAACAACCAAACTGTCTCTGTCTCTTCCTCA
ACAATACTTCTACTTTGTCCCCTGCTTTTCCTATCAACCAGACTCTTGCTCTACAGCTGC
CACCGCTTTGCAATATTCCAACCAATTCTCCCTCTTGCTCTTCCCCTAGAGGAGAGGCGC
CTAGTGATTCATCCTCAGTTGCTCCACCACCCTCTAGCTCAACCAGCTCTCAATATCTCC
AGGTGCAAAGAACCACTCTGCTACCCCAGTGGCTCAACTGGCACCAAGACCCACCAGCTT
AATGGGGCTAGGTTATGATCTGAGATCCTCTGGCTCCAAGTCTAAGATCCAGCTATTCCT
TATGGCACTCGCAGCGATCCTACCAGGAACTCTCCTCATCTGAATCTATCTGCATATTAG
CTACATTCACCTGTTTTGGGTTTTTCTCTATGAATCAATCATCGTTCTTCTGTATGTTAC
TTAACGTTTGCAGTTCTTGATATGAAATCAGAAAACAGAACAATGAATAACAACACTCTT
GTTTAATAACC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 3

CO CL3476Contig1 1109 3 12 U
GGAAACACAAACACAACAACACACTATGGGTGGTAAAACAACGACACTGCTCTTGGTCTT
GTTCGCTCTTCTACTAACGACATCTTTATCCAAAGACCTCTGTCACAAAGATGACAAAAA
CACCCTCCTCAAGATCCTGAAAGCCATGAACATCTCCTGGGTCCTCGAGGACGACTGCTG
CACCTGGTACTCTGTTGATTGCGACAACGCAAACCGAGTCATCTCTCTAGCCATATCCAA
CATCGACGTCTCCGGTCAGATCCCTTCTGAAGTCGGCGACTTACCGTATCTACAATACCT
CACACTCCGCAAACTCCCTAACCTCACCGGTGAAATCCCACCCACCATTGCCAAGCTCAA
GTATCTCAAATTTCTCTGGCTCAGCTGGAACAACCTGACCGGCCCGGTTCCTGAATTTCT
GAGTCAACTCAAGAATCTAGAGTACATAAACCTTTCCTTCAATAAACTCTCCGGTTCCAT
ACCCGGTTCACTCTCTTTGTTACCTAATCTGACTGCACTAGAACTCAGCAGGAACAAGCT
TACAGGTACGATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGATGTATATGGGATTTACCT
ATCACACAACCAGCTGTCCGGTTCTATACCAAAATCACTAGGCAACCTCGACTTTAACAC
GATTGATCTTTCCCGGAACAAGCTTGAAAGTGATGCGTCGATGTTGTTTGGAGCCAAAA*
GAAGACATGGCACATTGACTTATCTAAAAACATGTTCCAGTTCGATATCTCCAAGGTTAA
GGTTGCTAAGACAGTTCGCTTCTTGGACTTGAATCACAACAGCCTCACAGGGAGTATCTC
GGATCAATGGACCCAACTTGATCTTCAGACTTTCAACGTTAGCTATAACAGATTGTGTGG
ACGCATTCCCCAGGGAGGTGACCTTCAGAGTTTTGATGCTTATGCCTATTTACACAACAA
GTGCTTGTGTGGTGCACCTCTTCCGAGTTGCAACGTGAAGATCAAGCAACCGATCTTTAT
CTAAACTTACCATCATCATAACTTATGTATAAGGACAGCTATATTATCCATTCGGAACAA
TTAATAAAAAATGAATCATATTTCATTTG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C527TF U 1
AF RR2ER60TF U 2
AF RR2ER60JQ C 424
BS 1 619 RR2C527TF
BS 620 620 RR2ER60TF
BS 621 641 RR2C527TF
BS 642 642 RR2ER60TF
BS 643 677 RR2C527TF
BS 678 678 RR2ER60TF
BS 679 688 RR2C527TF
BS 689 689 RR2ER60TF
BS 690 722 RR2C527TF
BS 723 723 RR2ER60TF
BS 724 740 RR2C527TF
BS 741 1109 RR2ER60JQ

RD RR2C527TF 745 0 0
GGAAACACAAACACAACAACACACTATGGGTGGTAAAACAACGACACTGCTCTTGGTCTT
GTTCGCTCTTCTACTAACGACATCTTTATCCAAAGACCTCTGTCACAAAGATGACAAAAA
CACCCTCCTCAAGATCCTGAAAGCCATGAACATCTCCTGGGTCCTCGAGGACGACTGCTG
CACCTGGTACTCTGTTGATTGCGACAACGCAAACCGAGTCATCTCTCTAGCCATATCCAA
CATCGACGTCTCCGGTCAGATCCCTTCTGAAGTCGGCGACTTACCGTATCTACAATACCT
CACACTCCGCAAACTCCCTAACCTCACCGGTGAAATCCCACCCACCATTGCCAAGCTCAA
GTATCTCAAATTTCTCTGGCTCAGCTGGAACAACCTGACCGGCCCGGTTCCTGAATTTCT
GAGTCAACTCAAGAATCTAGAGTACATAAACCTTTCCTTCAATAAACTCTCCGGTTCCAT
ACCCGGTTCACTCTCTTTGTTACCTAATCTGACTGCACTAGAACTCAGCAGGAACAAGCT
TACAGGTACGATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGATGTATATGGGATTTACCT
ATCACACAACCAGCTGTCCCGTTCTATACCAAAATCACTAG*CAACCTCGACTTTAACAC
GATTGATCTTTCCCGGA*CAAGCTTGAA*GTGATGCGTCGATGTTGTTTGGAGCCAAAA*
GA*GACATGGCACATTGACT
ATCTA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2ER60TF 744 0 0
GAAACACAAACACAACAACACACTATGGGTGGTAAAACAACGACACTGCTCTTGGTCTTG
TTCGCTCTTCTACTAACGACATCTTTATCCAAAGACCTCTGTCACAAAGATGACAAAAAC
ACCCTCCTCAAGATCCTGAAAGCCATGAACATCTCCTGGGTCCTCGAGGACGACTGCTGC
ACCTGGTACTCTGTTGATTGCGACAACGCAAACCGAGTCATCTCTCTAGCCATATCCAAC
ATCGACGTCTCCGGTCAGATCCCTTCTGAAGTCGGCGACTTACCGTATCTACAATACCTC
ACACTCCGCAAACTCCCTAACCTCACCGGTGAAATCCCACCCACCATTGCCAAGCTCAAG
TATCTCAAATTTCTCTGGCTCAGCTGGAACAACCTGACCGGCCCGGTTCCTGAATTTCTG
AGTCAACTCAAGAATCTAGAGTACATAAACCTTTCCTTCAATAAACTCTCCGGTTCCATA
CCCGGTTCACTCTCTTTGTTACCTAATCTGACTGCACTAGAACTCAGCAGGAACAAGCTT
ACAGGTACGATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGATGTATATGGGATTTACCTA
TCACACAACCAGCTGTCCGGTTCTATACCAAAATCACTAGGCAACCTCGACTTTAACACG
ATTGATCTTTCCCGGAACAAGCTTGAAAGTGATGCGTCGATGTTGTTTGGAGCCAAAA*G
AAGACATGGCACATTGACT
TATCT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2ER60JQ 686 0 0
TCAACTCAAGAATCTAGAGTACATAAACCTTTCCTTCAATAAACTCTCCGGTTCCATACC
CGGTTCACTCTCTTTGTTACCTAATCTGACTGCACTAGAACTCAGCAGGAACAAGCTTAC
AGGTACGATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGATGTATATGGGATTTACCTATC
ACACAACCAGCTGTCCGGTTCTATACCAAAATCACTAGGCAACCTCGACTTTAACACGAT
TGATCTTTCCCGGAACAAGCTTGAAGGTGATGCGTCGATGTTGTTTGGAGCCAAAAAGAA
GACATGGCACATTGACTTATCTAAAAACATGTTCCAGTTCGATATCTCCAAGGTTAAGGT
TGCTAAGACAGTTCGCTTCTTGGACTTGAATCACAACAGCCTCACAGGGAGTATCTCGGA
TCAATGGACCCAACTTGATCTTCAGACTTTCAACGTTAGCTATAACAGATTGTGTGGACG
CATTCCCCAGGGAGGTGACCTTCAGAGTTTTGATGCTTATGCCTATTTACACAACAAGTG
CTTGTGTGGTGCACCTCTTCCGAGTTGCAACGTGAAGATCAAGCAACCGATCTTTATCTA
AACTTACCATCATCATAACTTATGTATAAGGACAGCTATATTATCCATTCGGAACAATTA
ATAAAAAATGAATCATATTTCATTTG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 3

CO CL3477Contig1 914 3 6 U
GAAGTTTGGTTTAACTCCATTTCTTTAGTTTAGTCCTTTTCGTCTTAAAACCAAAAAGAT
GAGTTACAATTATAAATAAAAATAGTGAGAACATTACACAGCCAACAAACAACTAATCTT
CCTCAGCATCGATGTTTGTTCGAAATAGGTAGTCTTCGCCTTCAAGTTCATCTTGATACA
TGTTTATTGGTGGATCATTATGTTTCTCATCTTCTCCTTTCTCATCAATTCGTCTCTTTC
CCTTTCTTAAGATATAGAAGAAGTAATGGAAGCCATCGCCGAAAGTATTGTACTCCATGG
ACCAATTAAACTTGGGATCCATAAACAAAGGACGCCTGAAATGCGGCTGGCCAAAAGTAA
TGGAAATGAAAATCCCATTTGGTTTTAAAACTCGGTGAACTCCATCTAGAGTAGCCATAA
CTTTGCTAACGGTTTCTTGACGAGGATTCCATGGATCACCAGCATCCACAAACAGTACAT
CCATGGTTCCTTTCTCAATAACCACATCGAAACACTCGCTGTGAAAGGGGAGGTCTAGCA
TGTCAGCTTGCTTCACTTTTATTTCTTTGTAGCCTTTAAACAGCAATCGAGTCTGCATCT
TGTCGACAGCAACAGAAGATAAATCAATGCAGGTGATATCAAGGATCCCATCCTTGTACA
GCTCTTCACACAACTGCGAGTTCCCACATCCCAGCTCCAATACGGAGGAAGAGGTATTGA
TGTTGGATTTGATGAGATGCTGGAAATGAGAGTAGTCTTTGAACCATTCATAGTGTTCCT
CCGGAGAGAACCTCTCGTCCCAGTAGTGAGGATCAAGGTAGGTCAGAGCAGAAGGAGGTC
CGACGGAGTTCGGATCCGGGTTTGAATTAGGATCCGAATCACCATTGGCGGGTCTTGACT
CCATCGCTTGACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C033JQ U 1
AF RR2C933JQ U 9
AF RR2C033TF C 167
BS 1 40 RR2C033JQ
BS 41 41 RR2C933JQ
BS 42 142 RR2C033JQ
BS 143 143 RR2C933JQ
BS 144 647 RR2C033JQ
BS 648 914 RR2C033TF

RD RR2C033JQ 647 0 0
GAAGTTTGGTTTAACTCCATTTCTTTAGTTTAGTCCTTTTTGTCTTAAAACCAAAAAGAT
GAGTTACAATTATAAATAAAAATAGTGAGAACATTACACAGCCAACAAACAACTAATCTT
CCTCAGCATCGATGTTTGTTCGGAATAGGTAGTCTTCGCCTTCAAGTTCATCTTGATACA
TGTTTATTGGTGGATCATTATGTTTCTCATCTTCTCCTTTCTCATCAATTCGTCTCTTTC
CCTTTCTTAAGATATAGAAGAAGTAATGGAAGCCATCGCCGAAAGTATTGTACTCCATGG
ACCAATTAAACTTGGGATCCATAAACAAAGGACGCCTGAAATGCGGCTGGCCAAAAGTAA
TGGAAATGAAAATCCCATTTGGTTTTAAAACTCGGTGAACTCCATCTAGAGTAGCCATAA
CTTTGCTAACGGTTTCTTGACGAGGATTCCATGGATCACCAGCATCCACAAACAGTACAT
CCATGGTTCCTTTCTCAATAACCACATCGAAACACTCGCTGTGAAAGGGGAGGTCTAGCA
TGTCAGCTTGCTTCACTTTTATTTCTTTGTAGCCTTTAAACAGCAATCGAGTCTGCATCT
TGTCGACAGCAACAGAAGATAAATCAATGCAGGTGATATCAAGGATC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2C933JQ 596 0 0
GTTTAACTCCATTTCTTTAGTTTAGTCCTTTTCGTCTTAAAACCAAAAAGATGAGTTACA
ATTATAAATAAAAATATTGAGAACATTACACAGCCAACAAACAACTAATCTTCCTCAGCA
TCGATGTTTGTTCGAAATAGGTAGTCTTCGCCTTCAAGTTCATCTTGATACATGTTTATC
GGTGGATCATTATGTTTCTCATCTTCTCCTTTCTCATCAATTCGTCTCTTTCCCTTTCTT
AAGATATAGAAGAAGTAATGGAAGCCATCGCCAAAAGTATCGTACTCCATGGACCAATTA
AACTTGGGATCCATAAACAAAGGACGCCTGAAATGCGGCTGGCCAAAAGTAATGGAAATG
AAAATCCCATTTGGTTTTAAAACTCGGTGAACTCCATCTAGAGTAGCCATAACTTTGCTA
ACGGTTTCTTGACGAGGATTCCATGGATCACCAGCATCCACAAACAGTACATCCATGGTT
CCTTTCTCAATAACCACATCGAAACACTCGCTGTCAAAAGGGAGGTCTAGCATGTCAGCT
TGCTTCACTTTTATTTCTTTGTAGCCTTTAGACAGCAATCGAGTCTGCATCTTGTC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2C033TF 748 0 0
AGTCATC
TGATACATGTTTATTGT**GATCATTATGTTTCTCATCT*CTCCTTTCTCATCAATTCGT
CTCTT*CCCTTTCTTAAGATATAGAAGAAGTAATGGAAGCCATCGCCGAAAGTATTGTAC
TCCATGGACCAATTAAACTTGGGATCCATAAACAAAGGACGCCTGAAATGCGGCTGGCCA
AAAGTAATGGAAATGAAAATCCCATTTGGTTTTAAAACTCGGTGAACTCCATCTAGAGTA
GCCATAACTTTGCTAACGGTTTCTTGACGAGGATTCCATGGATCACCAGCATCCACAAAC
AGTACATCCATGGTTCCTTTCTCAATAACCACATCGAAACACTCGCTGTGAAAGGGGAGG
TCTAGCATGTCAGCTTGCTTCACTTTTATTTCTTTGTAGCCTTTAAACAGCAATCGAGTC
TGCATCTTGTCGACAGCAACAGAAGATAAATCAATGCAGGTGATATCAAGGATCCCATCC
TTGTACAGCTCTTCACACAACTGCGAGTTCCCACATCCCAGCTCCAATACGGAGGAAGAG
GTATTGATGTTGGATTTGATGAGATGCTGGAAATGAGAGTAGTCTTTGAACCATTCATAG
TGTTCCTCCGGAGAGAACCTCTCGTCCCAGTAGTGAGGATCAAGGTAGGTCAGAGCAGAA
GGAGGTCCGACGGAGTTCGGATCCGGGTTTGAATTAGGATCCGAATCACCATTGGCGGGT
CTTGACTCCATCGCTTGACTT

QA 8 748 8 748
DS 



AS 1 3

CO CL3478Contig1 727 3 4 U
GGAATGGCATGCTTAGAAATATACAACTCTAATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCGAGT
CCTAGAATCTCTTTCTCTAATGATTTCGTTGAGATAAGGACTGAGACGTCAAAGACGGCG
AGATCAAGCCCTCTCTCCAAACCAGAGGGTTCTTCTTCAGCTTCTGAGAATTTTGAGTTT
TCTGTCTCCAACTACACAATGATGCCAGCTGATGAACTTTTCTCTAAAGGAAAGCTGCTG
CCTTTCAAGGAGACTAATCAAGTCCAGAGGACATTGAGAGAAGAGCTTCTCGTTGACGAA
GACGAAGAAGAAAGTCCTCGTGGTGCTACCAACATCTTTTCTCCCAAGCCACCGGTCATC
TCATCTTCTTCTTCATCTAAGGGAAGGTGGAAAGGACTTCTTGGCCTTAAGAGGGCCCAT
GTTGGGTCTAAGAACAGTGAAGAACGACTTGTTCATATGATCAACAACAAACAATCTCAG
GAAGCAATGGGCGGAAGAGAAGGCTCAAGTTGCAGGGACTTGAAGAAGAGTATGTAGAGC
TTATTAAAAAACAGAAAAGCTTTCAGTTTAGCTAGG*AACATGGTTGCTTCCAGATTTTT
AATATGTTACATTTATGTTAATCTTAGATCTAGAAAGTTATTTAAAAAACCTAAAAGAAA
TCAGGCATCATGTGTGTTATTTGACTGAGATGGTTTTATTTCATCAACAACTACTCATGT
TTCATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 
10 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 

AF RR2GZ87TF U 7
AF RR2A680TF U 1
AF RR2A680JQ C 161
BS 1 63 RR2A680TF
BS 64 64 RR2GZ87TF
BS 65 725 RR2A680TF
BS 726 727 RR2A680JQ

RD RR2GZ87TF 650 0 0
GG
ATGCTTAGAAATGTACAACTCTAATGGTGGTGGTGGTGGTGGTG***CGAGTCCTAGAAT
CTCTTTCTCTAATGATTTCGTTGAGATAAGGACTGAGACGTCAAAGACGGCGAGATCAAG
CCCTCTCTCCAAACCAGAGGGTTCTTCTTCAGCTTCCGAGAATTTTGAGTTTTCTGTCTC
CAACTACACAATGATGCCAGCTGATGAACTTTTCTCTAAAGGAAAGCTGCTGCCTTTCAA
GGAGACTAATCAAGTCCAGAGGACATTGAGAGAAGAGCTTCTCGTTGACGAAGACGAAGA
AGAAAGTCCTCGTGGCGCTTCCAACATCTTTTCTCTCAAGCCACCGGTCTTCACATCTTC
TTCTTCGTCTAAGGGAAGGTGGAAAGGGCTTCTGGGCCTTAAGAGGGCCCATGTTGGGTC
TAAGAACAGTGAAGAACCATTTGTTCATATGATCAACAACAAACAATCTCTGGAAGCAAT
GGGCGGAAGAGAAGGCTCAAGTTGCAGGGACTTGAAGAAGAGTATGTAGAGCTTATTAAA
AA*CAGAAAAGCTTTCAGTTTAGCTAGGGAACATGGTTGCTTCCAGATTTTTAATATGTT
ACATTTATGTTAATCTTAGATCTAAAAAGTTATTTAAAA
CCTAAAAAA

QA 3 641 3 641
DS 

RD RR2A680TF 725 0 0
GGAATGGCATGCTTAGAAATATACAACTCTAATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCGAGT
CCTCGAATCTCTTTCTCTAATGATTTCGTTGAGATAAGGACTGAGACGTCAAAGACGGCG
AGATCAAGCCCTCTCTCCAAACCAGAGGGTTCTTCTTCAGCTTCTGAGAATTTTGAGTTT
TCTGTCTCCAACTACACAATGATGCCAGCTGATGAACTTTTCTCTAAAGGAAAGCTGCTG
CCTTTCAAGGAGACTAATCAAGTCCAGAGGACATTGAGAGAAGAGCTTCTCGTTGACGAA
GACGAAGAAGAAAGTCCTCGTGGTGCTACCAACATCTTTTCTCCCAAGCCACCGGTCATC
TCATCTTCTTCTTCATCTAAGGGAAGGTGGAAAGGACTTCTTGGCCTTAAGAGGGCCCAT
GTTGGGTCTAAGAACAGTGAAGAACGACTTGTTCATATGATCAACAACAAACAATCTCAG
GAAGCAATGGGCGGAAGAGAAGGCTCAAGTTGCAGGGACTTGAAGAAGAGTATGTAGAGC
TTATTAAAAAACAGAAAAGCTTTCAGTTTAGCTAGG*AACATGGTTGCTTCCAGATTTTT
AATATGTTACATTTATGTTAATCTTAGATCTAGAAAGTTATTTAAAAAACCTAAAAGAAA
TCAGGCATCATGTGTGTTATTTGACTGAGATGGTTTTATTTCATCAACAACTACTCATGT
TTCAT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2A680JQ 567 0 0
CTTCTGAGAATTTTGAGTTTTCTGTCTCCAACTACACAATGATGCCAGCTGATGAACTTT
TCTCTAAAGGAAAGCTGCTGCCTTTCAAGGAGACTAATCAAGTCCAGAGGACATTGAGAG
AAGAGCTTCTCGTTGACGAAGACGAAGAAGAAAGTCCTCGTGGTGCTACCAACATCTTTT
CTCCCAAGCCACCGGTCATTTCATTTTTTTCTTCATTTAAGGGAAGGTGGAAAGGACTTT
TTGGCCTTAAGAGGGCCCATGTTGGGTTTAAGAACAGTGAAGAACGACTTGTTCATATGA
TCAACAACAAACAATCTCAGGAAGCAATGGGCGGAAGAGAAGGCTCAAGTTGCAGGGACT
TGAAGAAGAGTATGTAGAGCTTATTAAAAAACAGAAAAGCTTTCAGTTTAGCTAGG*AAC
ATGGTTGCTTCCAGATTTTTAATATGTTACATTTATGTTAATCTTAGATCTAGAAAGTTA
TTTAAAAAACCTAAAAGAAATCAGGCATCATGTGTGTTATTTGACTGAGATGGTTTTATT
TCATCAACAACTACTCATGTTTCATTG

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 3

CO CL3479Contig1 986 3 7 U
GGACTGGCTTCTTCTCCGTCGACAAAACTATAGCCGAGGTGCTTCTTCTCAGCACTGCTT
GTCGTCCGAAATGAGTATCTCTGGTGCTGCACTTGGTTCAGGCAGAATTTTAGGAAGAGC
GGTAGAGTTTGGGAAAACTCATGTGGTTAGGCCTAAAGGGAAACACCAAGCTACTATTGT
CTGGCTACATGGTCTTGGCGACAATGGCTCCAGCTGGTCCCAGCTTTTGGAGACACTTCC
CCTTCCAAATATCAAATGGATATGCCCAACTGCTCCTTCTCAACCTATAAGTTTATTTGG
TGGTTTTCCCTCTACTGCTTGGTTTGATGTTGTGGGCATCAATGAAGATGGACCTGATGA
TGTAGAAGGACTGGATGGGGCTGCCGCTCATGTTGCAAATTTGTTGTCGAATGAGCCTGG
TGACATTAAATTAGGCGTTGGAGGGTTCAGCATGGGTGCAGGGACGTCTTTATATTCTGC
GACATGTTTTGCACTCGGTAAATATGGAAATGGCAATCCTTACCCTATCAATTTAAGCAC
AGTCATTGGCTTAAGCGGTTGGCTTCCTTGTGCAAAGACACTGGCTGGCAAACTAGAAGA
GGAACAGATTAAGAACCGAGCCGCGTCCTTACCAATTTTAGTTTGTCATGGAAAAGGTGA
TGATGTGGTACCGTACAAGTTTGGGGAGAAATCATCACAAGCCTTGATATCACATGGGTT
TAAGAAAACGACCTTCAAAGCTTACACTGGACTTGGCCACTATACCATCCCACAGGAGAT
GGATGAGTTATGCTCGTGGTTAACATCTAACCTCGGCCTGGAAGGTTGAAAAGGCTTTCC
AATCATGTCACTTTTTGATGAAAAAACCCCTTCAAAATCTTGAAAGTTTCATTGGTTTTG
ATTAGATCCTTCATTTCATCAAAAAAAAATTAGATCCTGTTTGATACTATGAGAGAGCGT
AACTTTTATTGTCGACCAAATATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF44TF U 1
AF RR2BM71TF U 223
AF RR2CF44JQ C 253
BS 1 656 RR2CF44TF
BS 657 657 RR2BM71TF
BS 658 714 RR2CF44TF
BS 715 838 RR2BM71TF
BS 839 839 RR2CF44JQ
BS 840 865 RR2BM71TF
BS 866 986 RR2CF44JQ

RD RR2CF44TF 714 0 0
GGACTGGCTTCTTCTCCGTCGACAAAACTATAGCCGAGGTGCTTCTTCTCAGCACTGCTT
GTCGTCCGAAATGAGTATCTCTGGTGCTGCACTTGGTTCAGGCAGAATTTTAGGAAGAGC
GGTAGAGTTTGGGAAAACTCATGTGGTTAGGCCTAAAGGGAAACACCAAGCTACTATTGT
CTGGCTACATGGTCTTGGCGACAATGGCTCCAGCTGGTCCCAGCTTTTGGAGACACTTCC
CCTTCCAAATATCAAATGGATATGCCCAACTGCTCCTTCTCAACCTATAAGTTTATTTGG
TGGTTTTCCCTCTACTGCTTGGTTTGATGTTGTGGGCATCAATGAAGATGGACCTGATGA
TGTAGAAGGACTGGATGGGGCTGCCGCTCATGTTGCAAATTTGTTGTCGAATGAGCCTGG
TGACATTAAATTAGGCGTTGGAGGGTTCAGCATGGGTGCAGGGACGTCTTTATATTCTGC
GACATGTTTTGCACTCGGTAAATATGGAAATGGCAATCCTTACCCTATCAATTTAAGCAC
AGTCATTGGCTTAAGCGGTTGGCTTCCTTGTGCAAAGACACTGGCTGGCAAACTAGAAGA
GGAACAGATTAAGAACCGAGCCGCGTCCTTACCAATTTTAGTTTGTCATGGAAAAG*TGA
TGATGTGGTACCGTACAAGTTTGGGGAGAAATCATCACAAGCCTTGATATCACA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2BM71TF 643 0 0
GCTTTTGGAGACACTTCCCCTTCCAAATATCAAATGGATATGCCCAACTGCACCTTCTCA
ACCTATAAGTTTATTTGGTGGTTTTCCCTCTACTGCTTGGTTTGATGTTGTGGGCATCAA
TGAAGATGGACCTGATGATGTAGAAGGACTGGATGGGGCTGCCGCTCATGTTGCAAATTT
GTTGTCGAATGAGCCTGGTGACATTAAATTAGGCGTTGGAGGGTTCAGCATGGGTGCAGG
GACGTCTTTATATTCTGCGACATGTTTTGCACTCGGTAAATGTGGAAATGGCAATCCTTA
CCCTATCAATTTAAGCACAGTCATTGGCTTAAACGGTTGGCTTCCTTGTGCAAAGACACT
GGCTGGCAAACTAGAAGAGGAACAGATTAAGAACCGAGCCGCGTCCTTACCAATTTTAGT
TTGTCATGGAAAAGGTGATGATGTGGTACCGTACAAGTTTGGGGAGAAATCATCACAAGC
CTTGATATCACATGGGTTTAAGAAAACGACCTTCAAAGCTTACACTGGACTTGGCCACTA
TACCATCCCACAGGAGATGGATGAGTTATGCTCGTGGTTAACATCTAACCTCGGCCTGGA
AGGTTGAAAAGGCTTTTCAATCATGTCACTTTTTGATGAAAAA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2CF44JQ 734 0 0
CAAATGGATATGCCCAACTGCTCCTTCTCAACCTATAAGTTTATTTGGTGGTTTTCCCTC
TACTGCTTGGTTTGATGTTGTGGGCATCAATGAAGATGGACCTGATGATGTAGAAGGACT
GGATGGGGCTGCCGCTCATGTTGCAAATTTGTTGTCGAATGAGCCTGGTGACATTAAATT
AGGCGTTGGAGGGTTCAGCATGGGTGCAGGGACGTCTTTATATTCTGCGACATGTTTTGC
ACTCGGTAAATATGGAAATGGCAATCCTTACCCTATCAATTTAAGCACAGTCATTGGCTT
AAGCGGTTGGCTTCCTTGTGCAAAGACACTGGCTGGCAAACTAGAAGAGGAACAGATTAA
GAACCGAGCCGCGTCCTTACCAATTTTAGTTTGTCATGGAAAAGGTGATGATGTGGTACC
GTACAAGTTTGGGGAGAAATCATCACAAGCCTTGATATCACATGGGTTTAAGAAAACGAC
CTTCAAAGCTTACACTGGACTTGGCCACTATACCATCCCACAGGAGATGGATGAGTTATG
CTCGTGGTTAACATCTAACCTCGGCCTGGAAGGTTGAAAAGGCTTTCCAATCATGTCACT
TTTTGATGAAAAAACCCCTTCAAAATCTTGAAAGTTTCATTGGTTTTGATTAGATCCTTC
ATTTCATCAAAAAAAAATTAGATCCTGTTTGATACTATGAGAGAGCGTAACTTTTATTGT
CGACCAAATATCTC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 3

CO CL3480Contig1 772 3 27 U
GCGAGTGAAGAATTCATCTTGAGATGTTATGTAGTACAATCAAGTTGATCAACCAAATAA
AGTGAATGAAGAAAATACTTAAACAAAACCATTCCTCTCCATCTCCTTGTGAAAAACAAT
ATCAAACAAACCAATTCCGAAAAGAATATTTACTTCCTTCTTTTTCTTGGTTGGCATTAA
TAAAACAACCCTATGTTCAAACAATTAAACATAATCCATATTTCACTCCTTGAGGGGAGA
GCCTTCGCTTCCAGAGGAGACTGTACGTTTGTTGAAACCCCCCATCATCATCATTTGCTA
CTCTCTTATGAAGGAAAACAACAAAAAGAAAGGCTTT*CAACGAAATCAAACACACGCAT
AAGTTATAAATAAGAAAGAGTCTCTGATTCAGGCTGTGCAAATGTGTCAGTCAAATCACC
CGGATGAGCTGCACTTACTACCTTCTTTCTCCGGTTCTTCCATCTACGTCGGTAATAGAT
TCAGGAAGCTTCCTTGGTTTGTTGTTGTGCCACCAGATGACTCATCCTCAAAGAGGGACT
TAATCGACGGCCGTTTTGGCTTATTGCTCTTCTTCTTAAGCTCAGCTATCCCAGGTAATT
GGTCATCGTTGACGATTTCGACGTTCTTGTAAGTATAACCCACAAAGTTAATGTCCTTGG
ACGAGAGCATCTTTCCCCATGGACCTGACTTTGATGACTTTGGAACTTGCTTGTCAGTCT
CTTCAAATTTCTCGAAGTTTTGGGTGTCCAACTCATCATTGACTTGAGGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE02JQ U 59
AF RR2GE02TF C 59
AF RR2GW62JQ U 1
BS 1 66 RR2GW62JQ
BS 67 67 RR2GE02JQ
BS 68 121 RR2GW62JQ
BS 122 122 RR2GE02JQ
BS 123 159 RR2GW62JQ
BS 160 160 RR2GE02JQ
BS 161 197 RR2GW62JQ
BS 198 198 RR2GE02JQ
BS 199 215 RR2GW62JQ
BS 216 216 RR2GE02JQ
BS 217 236 RR2GW62JQ
BS 237 237 RR2GE02JQ
BS 238 253 RR2GW62JQ
BS 254 254 RR2GE02JQ
BS 255 282 RR2GW62JQ
BS 283 286 RR2GE02JQ
BS 287 307 RR2GW62JQ
BS 308 308 RR2GE02JQ
BS 309 323 RR2GW62JQ
BS 324 324 RR2GE02JQ
BS 325 337 RR2GW62JQ
BS 338 338 RR2GE02JQ
BS 339 465 RR2GW62JQ
BS 466 466 RR2GE02JQ
BS 467 483 RR2GW62JQ
BS 484 484 RR2GE02JQ
BS 485 772 RR2GW62JQ

RD RR2GE02JQ 435 0 0
AAAGTGAATGAAGAAAATACTTAAACAAAACCATTCCTCTCCATCTCCTTGTGAAAAACA
ATATCAAACAAACCAATTCCGAAAAGAATATTTACTTCCTTCTTTTTCTTGGTTGGCATT
AATAAAACAACCCTATGTTCAAACAATTAAACATAATCCATATTTCACTCCTTGAGGGGA
GAGCCTTCGCTTCCAGAGGAGACTGTACGTTTGTTGAAACCCCCCATCATCATCATTTGC
TACTCTCTTATGAAGGAAAACAACAAAAAGAAAGGCTTT*CAACGAAATCAAACACACGC
ATAAGTTATAAATAAGAAAGAGTCTCTGATTCAGGCTGTGCAAATGTGTCAGTCAAATCA
CCCGGATGAGCTGCACTTACTACCTTCTTTCTCCGGTTCTTCCATCTACGTCGGTAATAG
ATTCAGGAAGCTTCC

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR2GE02TF 435 0 0
AAAGTGAATGAAGAAAATACTTAAACAAAACCATTCCTCTCCATCTCCTTGTGAAAAACA
ATATCAAACAAACCAATTCCGAAAAGAATATTTACTTCCTTCTTTTTCTTGGTTGGCATT
AATAAAACAACCCTATGTTCAAACAATTAAACATAATCCATATTTCACTCCTTGAGGGGA
GAGCCTTCGCTTCCAGAGGAGACTGTACGTTTGTTGAAACCCCCCATCATCATCATTTGC
TACTCTCTTATGAAGGAAAACAACAAAAAGAAAGGCTTT*CAACGAAATCAAACACACGC
ATAAGTTATAAATAAGAAAGAGTCTCTGATTCAGGCTGTGCAAATGTGTCAGTCAAATCA
CCCGGATGAGCTGCACTTACTACCTTCTTTCTCCGGTTCTTCCATCTACGTCGGTAATAG
ATTCAGGAAGCTTCC

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR2GW62JQ 772 0 0
GCGAGTGAAGAATTCATCTTGAGATGTTATGTAGTACAATCAAGTTGATCAACCAAATAA
AGTGAAAGAAGAAAATACTTAAACAAAACCATTCCTCTCCATCTCCTTGTGAAAAACAAT
AACAAACAAACCAATTCCGAAAAGAATATTTACTTCCTT*TTTTTCTTGGTTGGCATTAA
TAAAACAACCCTATGTTGAAACAATTAAACATAATACATATTTCACTCCTTGAGGG*AGA
GCCTTCGCTTCCAAAGGAGACTGTACGTTTGTTGAAACCCCC****ATCATCATTTGCTA
CTCTCTTGTGAAGGAAAACAACAGAAAGAAAGGCTTTTCAACGAAATCAAACACACGCAT
AAGTTATAAATAAGAAAGAGTCTCTGATTCAGGCTGTGCAAATGTGTCAGTCAAATCACC
CGGATGAGCTGCACTTACTACCTTCTTTCTCCGGTTCTTCCATCTGCGTCGGTAATAGAT
TCAAGAAGCTTCCTTGGTTTGTTGTTGTGCCACCAGATGACTCATCCTCAAAGAGGGACT
TAATCGACGGCCGTTTTGGCTTATTGCTCTTCTTCTTAAGCTCAGCTATCCCAGGTAATT
GGTCATCGTTGACGATTTCGACGTTCTTGTAAGTATAACCCACAAAGTTAATGTCCTTGG
ACGAGAGCATCTTTCCCCATGGACCTGACTTTGATGACTTTGGAACTTGCTTGTCAGTCT
CTTCAAATTTCTCGAAGTTTTGGGTGTCCAACTCATCATTGACTTGAGGAAT

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 3

CO CL3481Contig1 941 3 16 U
GCTTGTCCATTGTCTCTGTATTTATTTCCCAATTAAGTAAAAACTTTTTTTTTTTGAACT
TAATTAAGTAAAAACTTGCAAAAAATAAATATCCTTTCACCCAATCCTTTTTATAAATGT
CACATTCGGATTTTAATGAATGTATTCTTACATGTGTGAAATTTAGTTTTTCTAATTCGC
ATAAAAATGCTAGAGAAAATCTATTTTCTAAATACAAATTCATTAAATAATACAAATTAG
CCACACCAACAATGAAAATGATAAAAAGGATTATTATGTGTTTACCACAAGCCAAATAAA
AAAGAGAAGCCGATACAACTTTTTAGCAGCCTATTGTTTTAACAATACCAAATTAAGAAA
TCACACATTACTATATTATCGACCTAACGAGTGAAAAATACAACACCCAGAAAAACTAAG
AGCTTAACACGCATTCAAAGGGGATGTGTAATAAGTACACTATTTTCGTGACTTTTTACT
CCCAACATGTATACAAACACAAAACACGAAAATAAGAACAAATAATTTTTAATAAACTAC
ACAAAAGCATTAGATTATATATGCTGGCTAGATCTCTCAAAGGCGGTGGTGTAAAGCAGA
GACCGGAGCATGAGCGCCGGCAGCTGGAACCGGTGATTTACATTGGTAACACTCAGCAAA
GAGACCAAAAGTATCGACTTGACGAACAAAGTTGGTTACACTTGCCCATCCACCAAACCC
GAATCCGACAATTAGAACCCATATCACCACGAAAGCATTCAACACGTACATCGCCGTCCA
GCTTGGCATGAAGAACGGTGGCTTTTCCGCCACATTCTACAAGAAAAATCCAAAGGATAA
CAAAAATCAAGAACTATTGTAGAGAGAGATAATGAGTGACTGTATGTGTTTGTCGTATGG
TAATGGACAAAAGCCAAAGCTGTGTTGACCCATGAATGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG64JQ U 260
AF RR2FT16TF U 1
AF RR2EG64TF C 302
BS 1 409 RR2FT16TF
BS 410 410 RR2EG64JQ
BS 411 482 RR2FT16TF
BS 483 483 RR2EG64TF
BS 484 538 RR2FT16TF
BS 539 539 RR2EG64TF
BS 540 583 RR2FT16TF
BS 584 584 RR2EG64TF
BS 585 616 RR2FT16TF
BS 617 617 RR2EG64TF
BS 618 653 RR2FT16TF
BS 654 654 RR2EG64TF
BS 655 744 RR2FT16TF
BS 745 745 RR2EG64TF
BS 746 772 RR2FT16TF
BS 773 941 RR2EG64TF

RD RR2EG64JQ 156 0 0
GATAAAAAGGATTATTATGTGTTTACCACAAGCCAAATTAAAAAGAGAAGCCGATACAAC
TTTTTAGCAGCCTATTGTTTTAACAATACCAAATTAAGAAATCACACATTACTATATTAT
CGACCTAACGAGTGAAAAATACAACACCCAGAAAAA

QA 1 156 1 156
DS 

RD RR2FT16TF 772 0 0
GCTTGTCCATTGTCTCTGTATTTATTTCCCAATTAAGTAAAAACTTTTTTTTTTTGAACT
TAATTAAGTAAAAACTTGCAAAAAATAAATATCCTTTCACCCAATCCTTTTTATAAATGT
CACATTCGGATTTTAATGAATGTATTCTTACATGTGTGAAATTTAGTTTTTCTAATTCGC
ATAAAAATGCTAGAGAAAATCTATTTTCTAAATACAAATTCATTAAATAATACAAATTAG
CCACACCAACAATGAAAATGATAAAAAGGATTATTATGTGTTTACCACAAGCCAAATAAA
AAAGAGAAGCCGATACAACTTTTTAGCAGCCTATTGTTTTAACAATACCAAATTAAGAAA
TCACACATTACTATATTATCGACCTAACGAGTGAAAAATACAACACCCAAAAAAACTAAG
AGCTTAACACGCATTCAAAGGGGATGTGTAATAAGTACACTATTTTCGTGACTTTTTACT
CC*AACATGTATACAAACACAAAACACGAAAATAAGAACAAATAATTTTTAATAAACTCC
ACAAAAGCATTAGATTATATATGCTGGCTAGATCTCTCAAAGGTGGTGGTGTAAAGCAGA
GACCGGAGCATGAGCGGCGGCAGCTGGAACCGGTGATTTACATTGGTAACACTTAGCAAA
GAGACCAAAAGTATCGACTTGACGAACAAAGTTGGTTACACTTGCCCATCCACCAAACCC
GAATCCGACAATTAGAACCCATATTACCACGAAAGCATTCAACACGTACATC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2EG64TF 640 0 0
AAGAGAAGCCGATACTACTTTT*AGCAGC*TATTGTTT*AACAATACCAAATTAAGAAAT
CACACATTACTATATTATCGACCTAACGAGTGAAAAATACAACACCCAGAAAAACTAAGA
GCTTAACACGCATTCAAAGGGGATGTGTAATAAGTACACTATTTTCGTGACTTTTTACTC
CCAACATGTATACAAGCACAAAACACGAAAATAAGAACAAATAATTTTTAATAAACTACA
CAAAAGCATTAGATTATATATGCTGGCTAGATCTCTCAAAGGCGGTGGTGTAAAGCAGAG
ACCGGAGCATGAGCGCCGGCAGCTGGAACCGGTGATT*ACATTGGTAACACTCAGCAAAG
AGACCAAAAGTATCGACTTGACGAACAAAGTTGGTTACACTTGCCCATCCACCAAACCCG
AATCCGACTATTAGAACCCATATCACCACGAAAGCATTCAACACGTACATCGCCGTCCAG
CTTGGCATGAAGAACGGTGGCTTTTCCGCCACATTCTACAAGAAAAATCCAAAGGATAAC
AAAAATCAAGAACTATTGTAGAGAGAGATAATGAGTGACTGTATGTGTTTGTCGTATGGT
AATGGACAAAAGCCAAAGCTGTGTTGACCCATGAATGCCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 3

CO CL3482Contig1 729 3 4 U
GTTCGATTGGTTCTACGGAATCTTGGCGTCGTTAGGGTTATGGCAGAAAGAGGCGAAGAT
CTTGTTTCTCGGCCTCGACAATGCCGGAAAAACCACACTCCTTCACATGCTCAAAGACGA
GAGATTGGTTCAGCACCAGCCAACACAACATCCAACCTCTGAGGAACTTAGCATTGGCAA
AATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGTGGCCATCAGATTGCTCGTAGAGTTTGGAAAGA
TTACTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTCTACCTCGTGGATGCTTATGACAAGGAGAGATT
TTCAGAGTCAAAAATAGAGCTAGACGCTCTTCTCTCAGACGAAGCTCTTGCAACCGTGCC
GTTTCTTATCCTCGGAAACAAGATTGATATCCCTTATGCAGCCTCCGAAGACGAGCTTAG
GTATCACTTGGGTCTCACCAACTTCACCACCGGTAAGGGCAAAGTGACAACAGCTGGAGG
AGATTCTGGTGTTCGCCCTCTCGAAGTCTTTATGTGCAGCATTGTCCGTAAAATGGGCTA
CGGCGAGGGATTCAAATGGCTCTCTCAGT*CATCAACTAAAAGAGACATCATCATGTCTG
TCTCTCACTACATCTGTCTTTTCTTGAGTTAAAAGATTTGTCAATGATGATACCATAACA
CTCTTTTCTCCCTTTTTGGTTTTTTGTAGTTTTCTTGTTTTTAATTTAAGTTTGGTGACT
TGCATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A342TF U 1
AF RR2A342JQ C 162
AF RR2AT70TF U 462
BS 1 581 RR2A342TF
BS 582 582 RR2AT70TF
BS 583 652 RR2A342TF
BS 653 729 RR2AT70TF

RD RR2A342TF 656 0 0
GTTCGATTGGTTCTACGGAATCTTGGCGTCGTTAGGGTTATGGCAGAAAGAGGCGAAGAT
CTTGTTTCTCGGCCTCGACAATGCCGGAAAAACCACACTCCTTCACATGCTCAAAGACGA
GAGATTGGTTCAGCACCAGCCAACACAACATCCAACCTCTGAGGAACTTAGCATTGGCAA
AATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGTGGCCATCAGATTGCTCGTAGAGTTTGGAAAGA
TTACTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTCTACCTCGTGGATGCTTATGACAAGGAGAGATT
TTCAGAGTCAAAAATAGAGCTAGACGCTCTTCTCTCAGACGAAGCTCTTGCAACCGTGCC
GTTTCTTATCCTCGGAAACAAGATTGATATCCCTTATGCAGCCTCCGAAGACGAGCTTAG
GTATCACTTGGGTCTCACCAACTTCACCACCGGTAAGGGCAAAGTGACAACAGCTGGAGG
AGATTCTGGTGTTCGCCCTCTCGAAGTCTTTATGTGCAGCATTGTCCGTAAAATGGGCTA
CGGCGAGGGATTCAAATGGCTCTCTCAGT*CATCAACTAAA*GAGACATCATCATGTCTG
TCTCTCACTACATCTGTCTTTTCTTGAGTTAAAAGATTTGTCAATGATGATA
TCAT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2A342JQ 447 0 0
AGGAACTTAGCATTGGCAAAATCAAGTTCAAGGCTTTTGATTTGGGTGGCCATCAGATTG
CTCGTAGAGTTTGGAAAGATTACTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTCTACCTCGTGGATG
CTTATGACAAGGAGAGATTTTCAGAGTCAAAAATAGAGCTAGACGCTCTTCTTTCAGACG
AAGCTCTTGCAACCGTGCCGTTTCTTATCCTCGGAAACAAGATTGATATCCCTTATGCAG
CCTCCGAAGACGAGCTTAGGTATCACTTGGGTCTCACCAACTTCACCACCGGTAAGGGCA
AAGTGACAACAGCTGGAGGAGATTCTGGTGTTCGCCCTCTCGAAGTCTTTATGTGCAGCA
TTGTCCGTAAAATGGGCTACGGCGAGGGATTCAAATGGCTCTCTCAGT*CATCAACTAAA
AGAGACATCATCATGTCTGTCTCTCAC

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR2AT70TF 268 0 0
G
AGTGACAACAGCTGGAGGAGATTCTGGTGTTCGCCCTCTCGAAGTCTTTATGTGCAGCAT
TGTCCGTAAAATGGGCTACGGCGAGGGATTCAAATGGCTCTCTCAGTACATCAACTAAAA
GAGACATCATCATGTCTGTCTCTCACTACATCTGTCTTTTCTTGAGTTAAAAGATTTGTC
AATGATGATACCATAACACTCTTTTCTCCCTTTTTGGTTTTTTGTAGTTTTCTTGTTTTT
AATTTAAGTTTGGTGACTTGCATTTCC

QA 2 268 2 268
DS 



AS 1 3

CO CL3483Contig1 1313 3 9 U
GGAATCACTACAAATTAGATAATAACCGCCTTTTCAATCTTCCGTCTGGCCCTCATCTCT
CTTTCTCACAAACGCAAAGAACTCGTTTTCTCTCTCTCCACCGCGACAATAAATAAAAGA
ATATTTCAAAGCATAAATACACACGGAGCATGACGAAGTTGATGTTTGATTACGATGAGG
AATACATAAGAAACTCGAGAGGCGTCGAGTTGTTCGCTTGCAGATGGGTTCCATCTTCTT
CTTCTCCCAGAGCTCTCATTTTCCTCTGCCATGGCTACGGAATGGAATGCAGCGGCTTCA
TGCGTGAATGCGGATACGACTGGCTTCGGCAGGATATGCGGTATTTGGAATGGACTACGA
AGGTCATGGTCGGTCCAAAGGAGCTCGTTGTTATATCAAGAAGTTCGGTAACTTAGTAAA
CGACTGCTACGACTACTACACCTCAATCTCTGCGCAAGAAGAATACAAAGAGAAAAGCAG
ATTCTTGTATGGAGAATCCATGGGAGGTGCAGTTGCTTTGTTGCTTCACAAGAAAGATCC
TTCTTTCT**AATGGTGCCATTCTCGTCGCTCCCATGTGTAAGATATCAGAGAAGGTGAA
ACCACATCCAGTAGTGATTAATCTATTAACGAGAGTGGAAGAGATTATACCAAAATGGAA
GATCGTGCCCACCAAAGATGTTATCGATGCTGCCTTCAAAGATCCGGTCAAGCGCGAAGA
GATAAGGAACAACAAGCTGATATATCAAGACAAACCAAGACTCAAAACCGCACTTGAGAT
GCTAAGAACGAGCATGAACCTGGAAGACACTCTCCACGAGATCACACTACCTTTCTTTGT
TCTCCACGGTGAAGCAGACACAGTTACCGATCCAGAGATAAGCAAAGCTCTGTTCGAGAA
AGCGAGCACACGTGACAAAACCATCAAACTTTATCCAGGGATGTGACATGGGTTGACTTC
TGGTGAGCCTGACGCTAACGTTGACCTCGTTTTTGCTAACATCATTGGCTGGCTTGATGT
TCGCACGGGAGACGCTGCAAATGTTGAAAAGGTCGCTTGTAACGATCAAGTGGAAGCTAA
AAGAGAACAGGCTAGTCTCCTTGATGGTGGACGCCGTCCGGTCCATCGATCTTCTATGTA
ATTAATCTAAACAGAGAATAATTAGTTTCATTATGTTTGTTTTCTATTAACACTCGTTCT
TGTGCTTAGACCTAGTTTATAGTACCAAAAAATAAAATTATTTGGGTAAAAAGAAATAAA
ATGTGTATAAATAATTCCTACTGGTACTAAATTACATAAAACTCTTTTGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B741TF U 1
AF RR2F328TF U 477
AF RR2B741JQ C 452
BS 1 844 RR2B741TF
BS 845 845 RR2F328TF
BS 846 846 RR2B741JQ
BS 847 945 RR2F328TF
BS 946 946 RR2B741JQ
BS 947 1103 RR2F328TF
BS 1104 1104 RR2B741JQ
BS 1105 1225 RR2F328TF
BS 1226 1313 RR2B741JQ

RD RR2B741TF 844 0 0
GGAATCACTACAAATTAGATAATAACCGCCTTTTCAATCTTCCGTCTGGCCCTCATCTCT
CTTTCTCACAAACGCAAAGAACTCGTTTTCTCTCTCTCCACCGCGACAATAAATAAAAGA
ATATTTCAAAGCATAAATACACACGGAGCATGACGAAGTTGATGTTTGATTACGATGAGG
AATACATAAGAAACTCGAGAGGCGTCGAGTTGTTCGCTTGCAGATGGGTTCCATCTTCTT
CTTCTCCCAGAGCTCTCATTTTCCTCTGCCATGGCTACGGAATGGAATGCAGCGGCTTCA
TGCGTGAATGCGGATACGACTGGCTTCGGCAGGATATGCGGTATTTGGAATGGACTACGA
AGGTCATGGTCGGTCCAAAGGAGCTCGTTGTTATATCAAGAAGTTCGGTAACTTAGTAAA
CGACTGCTACGACTACTACACCTCAATCTCTGCGCAAGAAGAATACAAAGAGAAAAGCAG
ATTCTTGTATGGAGAATCCATGGGAGGTGCAGTTGCTTTGTTGCTTCACAAGAAAGATCC
TTCTTTCT**AATGGTGCCATTCTCGTCGCTCCCATGTGTAAGATATCAGAGAAGGTGAA
ACCACATCCAGTAGTGATTAATCTATTAACGAGAGTGGAAGAGATTATACCAAAATGGAA
GATCGTGCCCACCAAAGATGTTATCGATGCTGCCTTCAAAGATCCGGTCAAGCGCGAAGA
GATAAGGAACAACAAGCTGATATATCAAGACAAACCAAGACTCAAAACCGCACTTGAGAT
GCTAAGAACGAGCATGAACCTGGAAGACACTCTCCACGAGATCACACTACCTTTCTTTGT
TCTC

QA 1 844 1 844
DS 

RD RR2F328TF 749 0 0
GCAGATTCTTGTATGGAGAATCCATGGGAGGTGCAGTTGCTTTGTTGCCTCACAAGAAAG
ATCCTTCTTTCTGGAATGGTGCCATTCTCGTCGCTCC*ATGTGTAAGATATCAGAGAAGG
TGAAACCACATCCAGTAGTGATTAATCTATTAACGAGAGTGGAAGAGATTATACCAAAAT
GGAAGATCGTGCCCACCAAAGATGTTATCGATGCTGCCTTCAAAGATCCGGTCAAGCGCG
AAGAGATAAGGAACAACAAGCTGATATATCAAGACAAACCAAGACTCAAAACCGCACTTG
AGATGCTAAGAACGAGCATGAACCTGGAAGACACTCTCCACGAGATCACACTACCTTTCT
TTGTTCTCCGCGGTGAAGCAGACACAGTTACCGATCCAGAGATAAGCAAAGCTCTGTTCG
AGAAAGCGAGCACACGTGACAAAACCATCAAACTTTATCCAGGGATGTGGCATGGGTTGA
CTTCTGGTGAGCCTGACGCTAACGTTGACCTCGTTTTTGCTAACATCATTGGCTGGCTTG
ATGTTCGCACGGGAGACGCTGCAAATGTTGAAAAGGTCGCTTGTAACGATCAAGTGGAAG
CTAAAAGAGAACAGGCTAGTCTCCTTGGTGGTGGACGCCGTCCGGTCCATCGATCTTCTA
TGTAATTAATCTAAACAGAGAATAATTAGTTTCATTATGTTTGTTTTCTATTAACACTCG
TTCTTGTGCTTAGACCTAGTTTATAGTAC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2B741JQ 862 0 0
GCGCAAGAAGAATACAAAGAGAAAAGCAGATTCTTGTATGGAGAATCCATGGGAGGTGCA
GTTGCTTTGTTGCTTCACAAGAAAGATCCTTCTTTCT**AATGGTGCCATTCTCGTCGCT
CCCATGTGTAAGATATCAGAGAAGGTGAAACCACATCCAGTAGTGATTAATCTATTAACG
AGAGTGGAAGAGATTATACCAAAATGGAAGATCGTGCCCACCAAAGATGTTATCGATGCT
GCCTTCAAAGATCCGGTCAAGCGCGAAGAGATAAGGAACAACAAGCTGATATATCAAGAC
AAACCAAGACTCAAAACCGCACTTGAGATGCTAAGAACGAGCATGAACCTGGAAGACACT
CTCCACGAGATCACACTACCTTTCTTTGTTCTCCACGGTGAAGCAGACACAGTTACCGAT
CCAGAGATAAGCAAAGCTCTGTTCGAGAAAGCGAGCACACGTGACAAAACCATCAAACTT
TATCCAGGGATGTGACATGGGTTGACTTCTGGTGAGCCTGACGCTAACGTTGACCTCGTT
TTTGCTAACATCATTGGCTGGCTTGATGTTCGCACGGGAGACGCTGCAAATGTTGAAAAG
GTCGCTTGTAACGATCAAGTGGAAGCTAAAAGAGAACAGGCTAGTCTCCTTGATGGTGGA
CGCCGTCCGGTCCATCGATCTTCTATGTAATTAATCTAAACAGAGAATAATTAGTTTCAT
TATGTTTGTTTTCTATTAACACTCGTTCTTGTGCTTAGACCTAGTTTATAGTACCAAAAA
ATAAAATTATTTGGGTAAAAAGAAATAAAATGTGTATAAATAATTCCTACTGGTACTAAA
TTACATAAAACTCTTTTGTCTT

QA 1 862 1 862
DS 



AS 1 2

CO CL3484Contig1 442 2 1 U
GGTCTGGCTCTTATTTCTCATGGAAAGCTTCTGCCATGGGAAAGAATGTTTCAAATGCTA
AGACATTTCTTGAGAAGAGGTACACTGAAGATATGGAACTTGATGATGCCATTCACACAG
CGATATTAACTTTGAAGGAAGGTTTTGAGGGAGAAATCTCGAGCAAAAACATTGAGATTG
GCAAGATTGGTGCTGACAAAGTTTTCAGGGTACTAACACCTGCAGAGATCGACGATTACT
TGGCTGAAGTAGAGTAAACTTTCACCTTGCCCGAGCCTGATTTGAATAGTAATGCCATCT
TTTGTTTTCTCTGGCTGGTTGAACAAACTTGATGGTTATTGCTTCTGTAAAACTTTTGGA
ACTTGTTAAGAATCTAAAATTATGTTCAAAATGTCGTGCACTCAAATTACTTCGTGCCAA
AACTTTAATTTTTTTCACTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DU09TF U 1
AF RR2DU09JQ C 12
BS 1 442 RR2DU09TF

RD RR2DU09TF 442 0 0
GGTCTGGCTCTTATTTCTCATGGAAAGCTTCTGCCATGGGAAAGAATGTTTCAAATGCTA
AGACATTTCTTGAGAAGAGGTACACTGAAGATATGGAACTTGATGATGCCATTCACACAG
CGATATTAACTTTGAAGGAAGGTTTTGAGGGAGAAATCTCGAGCAAAAACATTGAGATTG
GCAAGATTGGTGCTGACAAAGTTTTCAGGGTACTAACACCTGCAGAGATCGACGATTACT
TGGCTGAAGTAGAGTAAACTTTCACCTTGCCCGAGCCTGATTTGAATAGTAATGCCATCT
TTTGTTTTCTCTGGCTGGTTGAACAAACTTGATGGTTATTGCTTCTGTAAAACTTTTGGA
ACTTGTTAAGAATCTAAAATTATGTTCAAAATGTCGTGCACTCAAATTACTTCGTGCCAA
AACTTTAATTTTTTTCACTCTC

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR2DU09JQ 431 0 0
TATTTCTCATGGAAAGCTTCTGCCATGGGAAAGAATGTTTCAAATGCTAAGACATTTCTT
GAGAAGAGGTACACTGAAGATATGGAACTTGATGATGCCATTCACACAGCGATATTAACT
TTGAAGGAAGGTTTTGAGGGAGAAATCTCGAGCAAAAACATTGAGATTGGCAAGATTGGT
GCTGACAAAGTTTTCAGGGTACTAACACCTGCAGAGATCGACGATTACTTGGCTGAAGTA
GAGTAAACTTTCACCTTGCCCGAGCCTGATTTGAATAGTAATGCCATCTTTTGTTTTCTC
TGGCTGGTTGAACAAACTTGATGGTTATTGCTTCTGTAAAACTTTTGGAACTTGTTAAGA
ATCTAAAATTATGTTCAAAATGTCGTGCACTCAAATTACTTCGTGCCAAAACTTTAATTT
TTTTCACTCTC

QA 1 431 1 431
DS 



AS 1 3

CO CL3485Contig1 491 3 13 U
GGTCGGAAGATTCGATCGAATTTGGGGGTTAGGGTTTTTTCGCTGCCGACGAACTGCTTG
ATATTCTGATTCAATGACGCCGCCTCCTGGACTTTACTCCGGTAGCAGCACTCTTGCCCT
GGTGGCTCGTGCTTCCGCTTTCGGGCTGGGTCTCGTCTACGGCAACATCAAGCTCAAGGC
CTTGAAGATAAAGAAGAACTCACAGATTAAGGCGGAAGCCAAGGCTCATCACTAAACCAA
ACTTTCTTTCTCTCCCTTCAAAATAAGATGACGAAGAAGCCCAGTGAACGTTCTCCACAA
ATGTAGCTGTTTCTTCTTGAGCTATATCTCTCCCTTGGTGACATTTTTCTGTTTTTCTAT
TTCCTTTTTGGTTATCGTTGACAAAGAAGAACAAAAACTTTTGTCTGAAAAAGCAATCAT
AGTACCATTATGATTTAAACCTGATGCTAGAACACCCATATGTTTATCATTTTAACAAGG
TTGCTTATATA


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB82JQ C 2
AF RR2FB82TF U 2
AF RR2DN54TF U 1
BS 1 24 RR2DN54TF
BS 25 25 RR2FB82TF
BS 26 39 RR2DN54TF
BS 40 40 RR2FB82TF
BS 41 46 RR2DN54TF
BS 47 47 RR2FB82TF
BS 48 59 RR2DN54TF
BS 60 60 RR2FB82TF
BS 61 63 RR2DN54TF
BS 64 64 RR2FB82TF
BS 65 135 RR2DN54TF
BS 136 136 RR2FB82TF
BS 137 491 RR2DN54TF

RD RR2FB82JQ 441 0 0
GGG
GGAAGATTCGATCGAATTTGGGGGTTAGGGTTTTTTCGCTGCCGACGAACTGCTTGATAT
TCTGATTCAATGACGCCGCCTCCTGGACTTTACTCCGGTAGCAGCACTCTTGCCCTGGTG
GCTCGTGCTTCCGCTTTCGGGCTGGGTTTCGTTTACGGCAACATCAAGCTCAAGGCCTTG
AAGATAAAGAAGAACTCACAGATTAAGGCGGAAGCCAAGGCTCATCACTAAACCAAACTT
TCTTTCTCTCCCTTCAAAATAAGATGACGAAGAAGCCCAGTGAACGTTCTCCACAAATGT
AGCTGTTTCTTCTTGAGCTATATCTCTCCCTTGGTGACATTTTTCTGTTTTTCTATTTCC
TTTTTGGTTATCGTTGACAAAGAAGAACAAAAACTTTTGTCTGAAAAAGCAATCATAGTA
CCATTATGATTTAAACC
C

QA 4 440 4 440
DS 

RD RR2FB82TF 441 0 0
GGG
GGAAGATTCGATCGAATTTGGGGGTTAGGGTTTTTTCGCTGCCGACGAACTGCTTGATAT
TCTGATTCAATGACGCCGCCTCCTGGACTTTACTCCGGTAGCAGCACTCTTGCCCTGGTG
GCTCGTGCTTCCGCTTTCGGGCTGGGTCTCGTCTACGGCAACATCAAGCTCAAGGCCTTG
AAGATAAAGAAGAACTCACAGATTAAGGCGGAAGCCAAGGCTCATCACTAAACCAAACTT
TCTTTCTCTCCCTTCAAAATAAGATGACGAAGAAGCCCAGTGAACGTTCTCCACAAATGT
AGCTGTTTCTTCTTGAGCTATATCTCTCCCTTGGTGACATTTTTCTGTTTTTCTATTTCC
TTTTTGGTTATCGTTGACAAAGAAGAACAAAAACTTTTGTCTGAAAAAGCAATCATAGTA
CCATTATGATTTAAACC
C

QA 4 440 4 440
DS 

RD RR2DN54TF 491 0 0
GGTCGGAAGATTCGATCGAATTTGCGGGTTAGGGTTTTT*CGCTGCGGACGAACTGCTTA
ATAATCTGATTCAATGACGCCGCCTCCTGGACTTTACTCCGGTAGCAGCACTCTTGCCCT
GGTGGCTCGTGCTTCTGCTTTCGGGCTGGGTCTCGTCTACGGCAACATCAAGCTCAAGGC
CTTGAAGATAAAGAAGAACTCACAGATTAAGGCGGAAGCCAAGGCTCATCACTAAACCAA
ACTTTCTTTCTCTCCCTTCAAAATAAGATGACGAAGAAGCCCAGTGAACGTTCTCCACAA
ATGTAGCTGTTTCTTCTTGAGCTATATCTCTCCCTTGGTGACATTTTTCTGTTTTTCTAT
TTCCTTTTTGGTTATCGTTGACAAAGAAGAACAAAAACTTTTGTCTGAAAAAGCAATCAT
AGTACCATTATGATTTAAACCTGATGCTAGAACACCCATATGTTTATCATTTTAACAAGG
TTGCTTATATA

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 3

CO CL3486Contig1 964 3 18 U
AACTCCACAAAAGTAATAGAAGCTTCATACTAAAGACGAAATGTAAAAACCGAACCAAAT
TTAAGAACTAAAAGTACACAAACAACACACCATAATAAGTCAACAAGATCCAAAGTTTGT
CAATACAAGCATACAAAAAAACCTGCAACTGGTAGTTGAGGTTTCCTTTTTGATAAAAAA
AAACAAAAAAAAAAAAAAAACGAATGACTAAATTGGTTGAAAAAAGGGTACACACTTACT
CTCAGTACTCCTCCTCCCGTTGGTAATCTCCTTCCTCCTCATCCTCGTACTCACCTTCTT
CATCTGCAGTTGCGTCTTGGTATTGCTGGTACTCTGAGACAAGATCGTTCATGTTGCTCT
CTGCTTCTGTGAACTCCATCTCGTCCATTCCTTCACCTGTGTACCAATGCAAGAAAGCCT
TCCTCCTGAACATCGCTGTGAACTGCACACTCACACGCCTGAACATCTCTTGGATCGATG
TTGAGTTCCCAATGAAAGTGGATGCCATCTTCAGACCGGTGGGAGGGATGTCACAGACTG
TTGATTTCACATTGTTGGGGATCCACTCAACAAAGTAGGAGGAGTTCTTGTTCTGCACGT
TCAGCATCTGCTCGTCGACTTCCTTTGTGCTCATCTTGCCACGGAACATGGCGGAGGCTG
TGAGGTAACGCCCGTGCCTTGGGTCAGCAGCACACATCATGTTCTTGGAGTCCCACATTT
GCTGGGTGAGTTCAGGGACAGTGAGGGAACGGTACTGCTGAGACCCTCTTGAGGTGGGAG
GAGCAAAACCCACCATGAAGAAGTGAAGACGAGGGAATGGAATCAGATTGACAGCAAGCT
TACGGAGGTCAGAGTTAAGCTGACCAGGGAATCTCAGACAGCATGTGACACCAGACATTG
TTGCAGATATCAAATGGTTCAAGTCACCAAAGCTAGGGGTAGTGAGTTTGAGAGTCCTGA
AACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2E031JQ U 63
AF RR2C384JQ U 1
AF RR2E031TF C 288
BS 1 112 RR2C384JQ
BS 113 113 RR2E031JQ
BS 114 136 RR2C384JQ
BS 137 137 RR2E031JQ
BS 138 185 RR2C384JQ
BS 186 186 RR2E031JQ
BS 187 190 RR2C384JQ
BS 191 191 RR2E031JQ
BS 192 192 RR2C384JQ
BS 193 193 RR2E031JQ
BS 194 220 RR2C384JQ
BS 221 221 RR2E031JQ
BS 222 223 RR2C384JQ
BS 224 224 RR2E031JQ
BS 225 433 RR2C384JQ
BS 434 434 RR2E031JQ
BS 435 731 RR2C384JQ
BS 732 964 RR2E031TF

RD RR2E031JQ 388 0 0
AAA
AACTAAAAGTACACAAACAACACACCATAATAAGTCAACAAGATCCAAAGTTTGTCAATA
CAAGCATACAAAAAAACCTGCAACTGGTAGTTGAGGTTTCCTTTTTGATAAAAAAAAACA
AAAAAAAAAAAAAAACGAATGACTAAATTGGTTGAAAAAAGGGTACACACTTACTCTCAG
TACTCCTCCTCCTGTTGGTAATCTCCTTCCTCCTCATCCTCGTACTCACCTTCTTCATCT
GCAGTTGCGTCTTGGTATTGCTGGTACTCTGAAACAAAATCGTTCATGTTGCTCTCTGCT
TCTGTGAACTCCATCTCGTCCATTCCTTCACCTGTGTACCAATGCAAGAAAGCCTTCCTC
CTGAACATCGCTGTGAACTGC
TCAC

QA 4 384 4 384
DS 

RD RR2C384JQ 731 0 0
AACTCCACAAAAGTAATAGAAGCTTCATACTAAAGACGAAATGTAAAAACCGAACCAAAT
TTAAGAACTAAAAGTACACAAACAACACACCATAATAAGTCAACAAGATCCAGAGTTTGT
CAATACAAGCATACAAGAAAACCTGCAACTGGTAGTTGAGGTTTCCTTTTTGATAAAAAA
AAACAGAAAAGAGAAAAAAACGAATGACTAAATTGGTTGAGAAGAGGGTACACACTTACT
CTCAGTACTCCTCCTCCCGTTGGTAATCTCCTTCCTCCTCATCCTCGTACTCACCTTCTT
CATCTGCAGTTGCGTCTTGGTATTGCTGGTACTCTGAGACAAGATCGTTCATGTTGCTCT
CTGCTTCTGTGAACTCCATCTCGTCCATTCCTTCACCTGTGTACCAATGCAAGAAAGCCT
TCCTCCTGAACATAGCTGTGAACTGCACACTCACACGCCTGAACATCTCTTGGATCGATG
TTGAGTTCCCAATGAAAGTGGATGCCATCTTCAGACCGGTGGGAGGGATGTCACAGACTG
TTGATTTCACATTGTTGGGGATCCACTCAACAAAGTAGGAGGAGTTCTTGTTCTGCACGT
TCAGCATCTGCTCGTCGACTTCCTTTGTGCTCATCTTGCCACGGAACATGGCGGAGGCTG
TGAGGTAACGCCCGTGCCTTGGGTCAGCAGCACACATCATGTTCTTGGAGTCCCACATTT
GCTGGGTGAGT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2E031TF 677 0 0
TACTCACTTTCTTCATCTGCAGTTGCGTCTTGGTATTGCTGGTACTCTGAGACAAGATCG
TTCATGTTGCTCTCTGCTTCTGTGAACTCCATCTCGTCCATTCCTTCACCTGTGTACCAA
TGCAAGAAAGCCTTCCTCCTGAACATCGCTGTGAACTGCTCACTCACACGCCTGAACATC
TCTTGGATCGATGTTGAGTTCCCAATGAAAGTGGATGCCATCTTCAGACCGGTGGGAGGG
ATGTCACAGACTGTTGATTTCACATTGTTGGGGATCCACTCAACAAAGTAGGAGGAGTTC
TTGTTCTGCACGTTCAGCATCTGCTCGTCGACTTCCTTTGTGCTCATCTTGCCACGGAAC
ATGGCGGAGGCTGTGAGGTAACGCCCGTGCCTTGGGTCAGCAGCACACATCATGTTCTTG
GAGTCCCACATTTGCTGGGTGAGTTCAGGGACAGTGAGGGAACGGTACTGCTGAGACCCT
CTTGAGGTGGGAGGAGCAAAACCCACCATGAAGAAGTGAAGACGAGGGAATGGAATCAGA
TTGACAGCAAGCTTACGGAGGTCAGAGTTAAGCTGACCAGGGAATCTCAGACAGCATGTG
ACACCAGACATTGTTGCAGATATCAAATGGTTCAAGTCACCAAAGCTAGGGGTAGTGAGT
TTGAGAGTCCTGAAACC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 3

CO CL3487Contig1 825 3 2 U
GGACTTAAGTTTTAGCATCTAAAGCTTCGCCTGTTCGCTGCTGAACATAACAGGGAACCA
AGCGGCTATAAGATCCAGATACATTACATATTATTGTCTCGACCATTATGCGAAAATGAA
AATGAAAAATACTAAATGTCGAGGAAGAATGCATAGATAGAATAATCAACAGTCTTTTAA
CTAAGGTGAGAGATATCAACCTCATCAGGGATCTTGAAGGTATCTGCAGCACCAAACTTT
CTATACTCCTCGCCTTCTTCAGCCACCGAGTCGTCTTCATTATCATCATACTCGTCCTGA
TGGCGGGGTGTAGAAGGGTCGTACACGCTTTTGGACCGGCAGTCATGAGTTGCAAGCATG
TTCACTTGGCCAAGGTGTGAGATCTCTACCATCACCGTTTCATCATCCAT*GGCAGTGGC
TGTTTCCACGGCTCCCCATCCATCCTCATGAATGTATGGTCCGCTGCACCTTTGCGAAAC
TCGAACCGAACCCGGTTTGCCTGGGCAAGTCGTGTGCCGTGCCCCTTTGGAGCGAGTAGG
ACAAGACCGTGCCAAGCGTTTCTGAACCCAACAACCTCAATGAAGCCATCATCAACGAAC
GGTGGAGTCAAGTCTCTATCGCGTTGTTTCCTAGGATTTGGTGTACCCCAAGGGTTTAGT
CCTCCAGAAAAGCTGGGCAGATTCAGACATACAATGGACCTGATGCTATGGGGTATGTGG
GAGGTCATGCCATTGGCCATTTTTATTTGCAATCTTAACCTTTGCAAGCTGAGCTATGTT
CCGTGAAGCAGGTGGAAAAGAGAGGCACAAAACCATCCTTGCGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A993JQ U 1
AF RR2A993TF C 1
AF RR2AX06JQ U 82
BS 1 432 RR2A993JQ
BS 433 825 RR2AX06JQ

RD RR2A993JQ 432 0 0
GGACTTAAGTTTTAGCATCTAAAGCTTCGCCTGTTCGCTGCTGAACATAACAGGGAACCA
AGCGGCTATAAGATCCAGATACATTACATATTATTGTCTCGACCATTATGCGAAAATGAA
AATGAAAAATACTAAATGTCGAGGAAGAATGCATAGATAGAATAATCAACAGTCTTTTAA
CTAAGGTGAGAGATATCAACCTCATCAGGGATCTTGAAGGTATCTGCAGCACCAAACTTT
CTATACTCCTCGCCTTCTTCAGCCACCGAGTCGTCTTCATTATCATCATACTCGTCCTGA
TGGCGGGGTGTAGAAGGGTCGTACACGCTTTTGGACCGGCAGTCATGAGTTGCAAGCATG
TTCACTTGGCCAAGGTGTGAGATCTCTACCATCACCGTTTCATCATCCAT*GGCAGTGGC
TGTTTCCACGGC

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR2A993TF 432 0 0
GGACTTAAGTTTTAGCATCTAAAGCTTCGCCTGTTCGCTGCTGAACATAACAGGGAACCA
AGCGGCTATAAGATCCAGATACATTACATATTATTGTCTCGACCATTATGCGAAAATGAA
AATGAAAAATACTAAATGTCGAGGAAGAATGCATAGATAGAATAATCAACAGTCTTTTAA
CTAAGGTGAGAGATATCAACCTCATCAGGGATCTTGAAGGTATCTGCAGCACCAAACTTT
CTATACTCCTCGCCTTCTTCAGCCACCGAGTCGTCTTCATTATCATCATACTCGTCCTGA
TGGCGGGGTGTAGAAGGGTCGTACACGCTTTTGGACCGGCAGTCATGAGTTGCAAGCATG
TTCACTTGGCCAAGGTGTGAGATCTCTACCATCACCGTTTCATCATCCAT*GGCAGTGGC
TGTTTCCACGGC

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR2AX06JQ 744 0 0
CATTACATATTATTGTCTCGACCATTATGCGAAAATGAAAATGAAAAATACTAAATGTCG
AGGAAGAATGCATAGATAGAATAATCAACAGTCTTTTAACTAAGGTGAGAGATATCAACC
TCATCAGGGATCTTGAAGGTATCTGTAGCACCAAACTTTCTATACTCCTCGCCTTCTTCA
GCCACCGAGTCGTCTTCATTATCATCATACTCGTCCTGATGGCGGGGTGTAGAAGGGTCG
TACACGCTTTTGGACCGGCAGTCATGAGTTGCAAGCATGTTCACTTGGCCAAGGTGTGAG
ATCTCTACCATCACCGTTTCATCATCCATTGGCAGTGGCTGTTTCCACGGCTCCCCATCC
ATCCTCATGAATGTATGGTCCGCTGCACCTTTGCGAAACTCGAACCGAACCCGGTTTGCC
TGGGCAAGTCGTGTGCCGTGCCCCTTTGGAGCGAGTAGGACAAGACCGTGCCAAGCGTTT
CTGAACCCAACAACCTCAATGAAGCCATCATCAACGAACGGTGGAGTCAAGTCTCTATCG
CGTTGTTTCCTAGGATTTGGTGTACCCCAAGGGTTTAGTCCTCCAGAAAAGCTGGGCAGA
TTCAGACATACAATGGACCTGATGCTATGGGGTATGTGGGAGGTCATGCCATTGGCCATT
TTTATTTGCAATCTTAACCTTTGCAAGCTGAGCTATGTTCCGTGAAGCAGGTGGAAAAGA
GAGGCACAAAACCATCCTTGCGTG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3489Contig1 703 2 1 U
GTCCTCACCGTCCTCCAATTTGGAATCCAAAAAACAATTTAAACATCTTTTAATTTCTGC
TGAATTATTCAAACCTCTCGGCGAGGAAGAGAAAGGAGAAGAAGAGAAATGACGATTTGC
ATGTGTTGTGAGTCACAGATTGTACCGAAATCGATAGTGAATCCATGGATATCTCCGAGG
AGAACGAAGCTAGGTTTTCTAGCGATCCGTCCGAGTTCAACCACAATTCGCCGTTTTCCC
CTCACTGTCAGGGCATCAGCGGTCGATTCCCCCGAGAGCTCTTCCAATTTCGCTAAGCGT
ATGGAACAAGCCTGGCTCATCTCTCAGCAACCAAGACCAGTTGGGTGTTCATCGTGCAAT
TCTAAAGGTCATGTTGAATGCAAATGGTGTGCGGGTACAGGATTCTTCATCCTCGGTGAT
AACATGCTTTGCCAGGTTCCTTCAAGGAATACTTCTTGTGTTATCTGCTCCGGGAAGGGT
TCTGCTTGCTGTAGCGATTGCAAGGGAACTGGGTTCCGTGCCAAGTGGTTGGAAAAGCCT
CCAGTGCCATTGTAGTTGATGAACAAAAAGCAAGCTAAGTGTTTTGGTCTTACATGATTT
ATATACGTAGTTCCAAATGTTTACATTGATTCAAGCATTATATGAATCATTTTCTTTGTA
CATGTATTGTGTATAAATATATCAATGTATGTTCATTTAAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AH66TF U 1
AF RR2AH66JQ C 459
BS 1 703 RR2AH66TF

RD RR2AH66TF 703 0 0
GTCCTCACCGTCCTCCAATTTGGAATCCAAAAAACAATTTAAACATCTTTTAATTTCTGC
TGAATTATTCAAACCTCTCGGCGAGGAAGAGAAAGGAGAAGAAGAGAAATGACGATTTGC
ATGTGTTGTGAGTCACAGATTGTACCGAAATCGATAGTGAATCCATGGATATCTCCGAGG
AGAACGAAGCTAGGTTTTCTAGCGATCCGTCCGAGTTCAACCACAATTCGCCGTTTTCCC
CTCACTGTCAGGGCATCAGCGGTCGATTCCCCCGAGAGCTCTTCCAATTTCGCTAAGCGT
ATGGAACAAGCCTGGCTCATCTCTCAGCAACCAAGACCAGTTGGGTGTTCATCGTGCAAT
TCTAAAGGTCATGTTGAATGCAAATGGTGTGCGGGTACAGGATTCTTCATCCTCGGTGAT
AACATGCTTTGCCAGGTTCCTTCAAGGAATACTTCTTGTGTTATCTGCTCCGGGAAGGGT
TCTGCTTGCTGTAGCGATTGCAAGGGAACTGGGTTCCGTGCCAAGTGGTTGGAAAAGCCT
CCAGTGCCATTGTAGTTGATGAACAAAAAGCAAGCTAAGTGTTTTGGTCTTACATGATTT
ATATACGTAGTTCCAAATGTTTACATTGATTCAAGCATTATATGAATCATTTTCTTTGTA
CATGTATTGTGTATAAATATATCAATGTATGTTCATTTAAAAC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2AH66JQ 245 0 0
TGTTATTTGT
TCCGGGAAGGGTTCTGCTTGCTGTAGCGATTGCAAGGGAACTGGGTTCCGTGCCAAGTGG
TTGGAAAAGCCTCCAGTGCCATTGTAGTTGATGAACAAAAAGCAAGCTAAGTGTTTTGGT
CTTACATGATTTATATACGTAGTTCCAAATGTTTACATTGATTCAAGCATTATATGAATC
ATTTTCTTTGTACATGTATTGTGTATAAATATATCAATGTATGTTCATTTAAAAC

QA 11 245 11 245
DS 



AS 1 3

CO CL3490Contig1 887 3 4 U
AGAATGAAGCTTTGCTGTACACAAAATATTTAAGTTTTTTTTACCTTTAGATTCTTTACT
AGAACACCGGTGATTACATAACAAATTCACATCATGAGAAAACCAAACGTGGCCCCAACA
GAGAGATTAATTGAGAAAAATGGGCAGATTTTTACTTGGTTAACCAGTAGATGCATATAA
AAAATGTGCATACAGCCGCAACTAGTGAAAGAATGATTGTATCCATCGACTTTTTCCTCT
TTATCGCCGACAGAATAGTGTTCACCGTGGGTAGACGGCTGGTGACATTGCTAAGCTTAG
AATTGATGCCTCCAAAAGTTGAACGCTGAAACACGAGTGTACCAAGTGTTGCCTGAGCTT
GTGAAATGACACCATCCATCTGCGCTGTGTTGCGGTTGATTCCCACATTTTCTTTGAGCA
AGGCTTGTTCCGTAAAGCCATCCCCATCTTCTAAGTCTAACCTAGTCCGATCAAATTCTC
TAAAGTCCTCAAGAAGTGAAGCATGCTCTTGTTTTGCTTTAAGACTTGAACGGTGTCGAT
AAAACTCCTGTGTGAGATCTTGAAGAATCTCCTGATGACGAGTTAAAGTATGGGAGACCA
TCTCTGAACCAACTGAAGAAACCCAAGCTTGCATTTGCGCATTAACTTGTTGCAGTTGCT
TTAGCAATAAGTCGATCCCAGCTTCAAGGTCACTCTCTGAACCATCAGACTTAATTAAAG
CCTTGGTCGAAACAAGTCTGCGATATGAATGCATCTGCTCGTCAAGCTGAGCTTCAATCT
TTCTAGCCTGTTTGCGTAAAGCATCCCAAGAGCTAGGAACGTCCATGGTGTTCAATTGAA
ATCAGATCCTCCTCCCTTCCTCCTCGTAACCAGACCTTCGACTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC36JQ U 149
AF RR2AS96JQ U 1
AF RR2AS96TF C 154
BS 1 299 RR2AS96JQ
BS 300 300 RR2FC36JQ
BS 301 853 RR2AS96JQ
BS 854 887 RR2AS96TF

RD RR2FC36JQ 202 0 0
TTTTT
ACTTGGTTAACCAGTAAATGAATATAAAAAATGTGCATACAGCCGCAACTAGTGAAAGAA
TGATTGTATCCATCGACTTTTTCCTCTTTATCGCCGACAGAATAGTGTTCACCGTGGGTA
GACGGCTGGTGACATTGCTAAGCTTAGAATTGATGCCTCCAAAAGTTGAACGCTGAAACA
CGAGTGTACCAAGTGTT

QA 6 202 6 202
DS 

RD RR2AS96JQ 853 0 0
AGAATGAAGCTTTGCTGTACACAAAATATTTAAGTTTTTTTTACCTTTAGATTCTTTACT
AGAACACCGGTGATTACATAACAAATTCACATCATGAGAAAACCAAACGTGGCCCCAACA
GAGAGATTAATTGAGAAAAATGGGCAGATTTTTACTTGGTTAACCAGTAGATGCATATAA
AAAATGTGCATACAGCCGCAACTAGTGAAAGAATGATTGTATCCATCGACTTTTTCCTCT
TTATCGCCGACAGAATAGTGTTCACCGTGGGTAGACGGCTGGTGACATTGCTAAGCTTAA
AATTGATGCCTCCAAAAGTTGAACGCTGAAACACGAGTGTACCAAGTGTTGCCTGAGCTT
GTGAAATGACACCATCCATCTGCGCTGTGTTGCGGTTGATTCCCACATTTTCTTTGAGCA
AGGCTTGTTCCGTAAAGCCATCCCCATCTTCTAAGTCTAACCTAGTCCGATCAAATTCTC
TAAAGTCCTCAAGAAGTGAAGCATGCTCTTGTTTTGCTTTAAGACTTGAACGGTGTCGAT
AAAACTCCTGTGTGAGATCTTGAAGAATCTCCTGATGACGAGTTAAAGTATGGGAGACCA
TCTCTGAACCAACTGAAGAAACCCAAGCTTGCATTTGCGCATTAACTTGTTGCAGTTGCT
TTAGCAATAAGTCGATCCCAGCTTCAAGGTCACTCTCTGAACCATCAGACTTAATTAAAG
CCTTGGTCGAAACAAGTCTGCGATATGAATGCATCTGCTCGTCAAGCTGAGCTTCAATCT
TTCTAGCCTGTTTGCGTAAAGCATCCCAAGAGCTAGGAACGTCCATGGTGTTCAATTGAA
ATCAGATCCTCCT

QA 1 853 1 853
DS 

RD RR2AS96TF 734 0 0
ACTTGGTTAACCAGTAGATGCATATAAGAAATGTGCATACAGCCGCAACTAGTGAAAGAA
TGATTGTATCCATCGACTTTTTCCTCTTTATCGCCGACAGAATAGTGTTCACCGTGGGTA
GACGGCTGGTGACATTGCTAAGCTTAGAATTGATGCCTCCAAAAGTTGAACGCTGAAACA
CGAGTGTACCAAGTGTTGCCTGAGCTTGTGAAATGACACCATCCATCTGCGCTGTGTTGC
GGTTGATTCCCACATTTTCTTTGAGCAAGGCTTGTTCCGTAGAGCCATCCCCATCTTCTA
AGTCTAACCTAGTCCGATCAAATTCTCTAAAGTCCTCAAGAAGTGAAGCATGCTCTTGTT
TTGCTTTAAGACTTGAACGGTGTCGATAAAACTCCTGTGTGAGATCTTGAAGAATCTCCT
GATGACGAGTTAAAGTATGGGAGACCATCTCTGAACCAACTGAAGAAACCCAAGCTTGCA
TTTGCGCATTAACTTGTTGCAGTTGCTTTAGCAATAAGTCGATCCCAGCTTCAAGGTCAC
TCTCTGAACCATCAGACTTAATTAAAGCCTTGGTCGAAACAAGTCTGCGATATGAATGCA
TCTGCTCGTCAAGCTGAGCTTCAATCTTTCTAGCCTGTTTGCGTAAAGCATCCCAAGAGC
TAGGAACGTCCATGGTGTTCAATTGAAATCAGATCCTCCTCCCTTCCTCCTCGTAACCAG
ACCTTCGACTCCCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 3

CO CL3491Contig1 1074 3 4 U
CAGCTTTCGATGAACGATCTCGAAAACGAAGAGAAGCCCACGAACGATCAGTCAGTACAC
GTGGCGAAACCGGCTATGTCAGCAGCAGCAGCAGCGATGGATGGTGTGGCGGCTTTGCGA
TCTGTGTTCCAGCGGGTGAACCAGGCGGCGGAGAAAGCGGGTCGCGCGTCGGATCGGATA
CGGGTCGTGGCTGTAAGCAAGACGAAACCGGTTTCTCTGATCCGTCAAGTGTACGACGCT
GGGCACAGGTCGTTCGGAGAGAACTATGTGCAAGAGATCATTGAGAAGGCCCCTCAGCTT
CCTGAAGATATAGAGTGGCATTTCATTGGGAACTTGCAGAGCAACAAAGTGAAGCCTTTG
CTAACTGGAGGGCCTAATCTTGTGATGGTGGAAAGTGTGGACGATGAGAAGATTGCGAAT
ATGCTTGATCGTGTGGTTGGAAACATGGGAAGAAAGCCTCTGAAGGTCTTGGTCCAAGTG
AATACCAGTGGCGAAGAGTGTTAAGAATCTGAGAATCTCCCAATACTTTTTCTTTGCATC
CAATCCAACTCGAGTGATTCCATTTCCACATTTTCTTTACACGGTCATCTCATTTGATAC
TTTGCAGCGAAATTCGGCGTGGAGCCCTCAGGATGCGTAGGACTAGCAAAGCACGTGAAG
GAAGCCTGCTCGAATCTTGAGTTTTCTGGTTTGATGACTATAGGGATGGCTGATTACACT
TCAACCCCAGAGAACTTCAAGATGCTTGCGAAATGCAGAAGTGAAGTGTGTGAGGAGCTT
GGAATACCGGAGGAGCAGTGCGAACTATCGATGGGGATGTCCGGTGACTTTGAGTTAGCC
ATTGAACTAGGAAGCACAAACGTGAGAATCGGATCGACCATCTTCGGGGCGAGAGAGTAT
CCTAAGAAAAAGTGAACTTCTGCAAAAGTCAAAACTGTGACGTAAACTGCAAAACCAGTT
TCGAGGAAGAATAAACAAACTGCTGTTTTATTGTTTGGTTGAATGATGATATGTTGTATA
ACATGATGTTAATCAAAGCCCGTTTATTCAGGCATATTAATAGAAAATGTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR15TF U 1
AF RR2DR15JQ C 463
AF RR2DT55TF U 602
BS 1 579 RR2DR15TF
BS 580 611 RR2DR15JQ
BS 612 1047 RR2DT55TF
BS 1048 1074 RR2DR15JQ

RD RR2DR15TF 579 0 0
CAGCTTTCGATGAACGATCTCGAAAACGAAGAGAAGCCCACGAACGATCAGTCAGTACAC
GTGGCGAAACCGGCTATGTCAGCAGCAGCAGCAGCGATGGATGGTGTGGCGGCTTTGCGA
TCTGTGTTCCAGCGGGTGAACCAGGCGGCGGAGAAAGCGGGTCGCGCGTCGGATCGGATA
CGGGTCGTGGCTGTAAGCAAGACGAAACCGGTTTCTCTGATCCGTCAAGTGTACGACGCT
GGGCACAGGTCGTTCGGAGAGAACTATGTGCAAGAGATCATTGAGAAGGCCCCTCAGCTT
CCTGAAGATATAGAGTGGCATTTCATTGGGAACTTGCAGAGCAACAAAGTGAAGCCTTTG
CTAACTGGAGGGCCTAATCTTGTGATGGTGGAAAGTGTGGACGATGAGAAGATTGCGAAT
ATGCTTGATCGTGTGGTTGGAAACATGGGAAGAAAGCCTCTGAAGGTCTTGGTCCAAGTG
AATACCAGTGGCGAAGAGTGTTAAGAATCTGAGAATCTCCCAATACTTTTTCTTTGCATC
CAATCCAACTCGAGTGATTCCATTTCCACATTTTCTTTA

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2DR15JQ 612 0 0
AAGGTCTTGGTCCAAGTGAATACCAGTGGCGAAGAGTGTTAAGAATCTGAGAATCTCCCA
ATACTTTTTCTTTGCATCCAATCCAACTCGAGTGATTCCATTTCCACATTTTCTTTACAC
GGTCATCTCATTTGATACTTTGCAGCGAAATTCGGCGTGGAGCCCTCAGGATGCGTAGGA
CTAGCAAAGCACGTGAAGGAAGCCTGCTCGAATCTTGAGTTTTCTGGTTTGATGACTATA
GGGATGGCTGATTACACTTCAACCCCAGAGAACTTCAAGATGCTTGCGAAATGCAGAAGT
GAAGTGTGTGAGGAGCTTGGAATACCGGAGGAGCAGTGCGAGCTATCGATGGGGATGTCC
GGTGACTTTGAGTTAGCCATTGAACTAGGAAGCACAAACGTGAGAATCGGATCGACCATC
TTCGGGGCGAGAGAGTATCCTAAGAAAAAGTGAACTTCTGCAAAAGTCAAAACTGTGACG
TAAACTGCAAAACCAGTTTCGAGGAAGAATAAACAAACTGCTGTTTTATTGTTTGGTTGA
ATGATGATATGTTGTATAACATGATGTTAATCAAAGCCCGTTTATTCAGGCATATTAATA
GAAAATGTTACC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2DT55TF 446 0 0
GAGAGTCGAG
ATTCGGCGTGGAGCCCTCAGGATGCGTAGGACTAGCAAAGCACGTGAAGGAAGCCTGCTC
GAATCTTGAGTTTTCTGGTTTGATGACTATAGGGATGGCTGATTACACTTCAACCCCAGA
GAACTTCAAGATGCTTGCGAAATGCAGAAGTGAAGTGTGTGAGGAGCTTGGAATACCGGA
GGAGCAGTGCGAACTATCGATGGGGATGTCCGGTGACTTTGAGTTAGCCATTGAACTAGG
AAGCACAAACGTGAGAATCGGATCGACCATCTTCGGGGCGAGAGAGTATCCTAAGAAAAA
GTGAACTTCTGCAAAAGTCAAAACTGTGACGTAAACTGCAAAACCAGTTTCGAGGAAGAA
TAAACAAACTGCTGTTTTATTGTTTGGTTGAATGATGATATGTTGTATAACATGATGTTA
ATCAAAGCCCGTTTAT

QA 11 446 11 446
DS 



AS 1 3

CO CL3492Contig1 1243 3 4 U
GCAGAAAAAAATGTTTTTATAATTAAATGAATATTCACCTTCCAAAACAATTTAAAACTT
TAAAAAAGAATGAAAAAATTAATGAATTGTGAAAACTATTGCAGATTGGGCAGATAAGGC
ACACCAGTTTGTGGAATCCACGAGCGACCACCCATAAATCTTGCAGGAGCAAATCCAAGA
GCCTGAGGACGAGTAATCCTCTGAATACCAGGCCACTTAACACGTTGGGCTTTGTTCGAC
CCAGGCCCACTGTTCTCATACTCAGCGTAAAAAAGCGTTTTGAGAGCAAAGTCACCGTTC
CATGCAGACCATCCCGCTGGATCAATAACATCGGTTATGGTCGTTCTCATCACTATGGTC
CTCGCAAACTCCTTCCACGGCCTTCCGAGATACGCTTTGTTAATGTGTTTCACCGGAAGA
TACGCCGGTTCTCCGATGATTCGGCAGTTGTGGAGCACGATAGCGGTGGGCTCACGCTTG
TCGCTACGTCCCTGTGCGGTGACCATGCAACCTTGGCCTCCCATGGGTTTCCTCACCACG
ATGATGCAGTTTTGGAAAACGGTGACTGAGTCGCCGAAGATGAAGTCGACGGTTCCTGAG
ATGGTGGAGTCACGGTAGAATTGACGATGGGCATGGGCGTAGAGTGTGTCTTGGTAACCA
TCGATTTGACAGTTGAAGATAACTACTTGGTCGGCAGAGACTCTTAGGGCTACAGCTTGT
CCTCCTTGGGGACCGGCGGTGTTCTCAATCCCGATGTTCTTGGCCAAGAAGTTGTCACCC
TCGACCGTGAGAGAGGATGTGAGGTATGTCCTGACCTTGCCGATAGCAAAGTTGAGATTA
CCGGTGATCTTAGTTTTGGTGGGTCCATCTCCGATGAAAGTGACGTAAAACATTTGTTTT
GTAACAATGACTTTCTCCTTGTAGACACCTTCCTTGATGTAGATAACGAACGGCACTTTG
TTGTTAATAGGCACAGCTTTCAAGGCCTCGTTTATGCTTTTGTACTGACCACTTCCGTCT
TTCGCCACCACCACATTAGGTTTCACACCTCCTAGTGGTGCTGCCATGAGCCGTCGAGAG
TCTGGTCCTACCCAGCTTGGGATACCGTCTTCAGCCGACAAAAGCTTTCTGGAGTTGTTT
CCAAGATCTCCGGTCGCTTCTGTGATGTTGGACTTTCCAAACATGCTGGACATACTGGTA
ATCATTGCAAGACTGTTACTGGTGAGTTCTTTGGATGGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW16JQ U 31
AF RR2AR19JQ U 1
AF RR2GW16TF C 514
BS 1 611 RR2AR19JQ
BS 612 612 RR2GW16TF
BS 613 789 RR2AR19JQ
BS 790 1243 RR2GW16TF

RD RR2GW16JQ 554 0 0
ATATTCACCTTCCAAAACAATTTAAAACTTTAAAAAAGAATGAAAAAATTAATGAATTGT
GAAAACTATTGCAGATTGGGCAGATAAGGCACACCAGTTTGTGGAATCCACGAGCGACCA
CCCATAAATCTTGCAGGAGCAAATCCAAGAGCCTGAGGACGAGTAATCCTCTGAATACCA
GGCCACTTAACACGTTGGGCTTTGTTCGACCCAGGCCCACTGTTCTCATACTCAGCGTAA
AAAAGCGTTTTGAGAGCAAAGTCACCGTTCCATGCAGACCATCCCGCTGGATCAATAACA
TCGGTTATGGTCGTTCTCATCACTATGGTCCTCGCAAACTCCTTCCACGGCCTTCCGAGA
TACGCTTTGTTAATGTGTTTCACCGGAAGATACGCCGGTTCTCCGATGATTCGGCAGTTG
TGGAGCACGATAGCGGTGGGCTCACGCTTGTCGCTACGTCCCTGTGCGGTGACCATGCAA
CCTTGGCCTCCCATGGGTTTCCTCACCACGATGATGCAGTTTTGGAAAACGGTGACTGAG
TCGCCGAAGATGAA

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2AR19JQ 789 0 0
GCAGAAAAAAATGTTTTTATAATTAAATGAATATTCACCTTCCAAAACAATTTAAAACTT
TAAAAAAGAATGAAAAAATTAATGAATTGTGAAAACTATTGCAGATTGGGCAGATAAGGC
ACACCAGTTTGTGGAATCCACGAGCGACCACCCATAAATCTTGCAGGAGCAAATCCAAGA
GCCTGAGGACGAGTAATCCTCTGAATACCAGGCCACTTAACACGTTGGGCTTTGTTCGAC
CCAGGCCCACTGTTCTCATACTCAGCGTAAAAAAGCGTTTTGAGAGCAAAGTCACCGTTC
CATGCAGACCATCCCGCTGGATCAATAACATCGGTTATGGTCGTTCTCATCACTATGGTC
CTCGCAAACTCCTTCCACGGCCTTCCGAGATACGCTTTGTTAATGTGTTTCACCGGAAGA
TACGCCGGTTCTCCGATGATTCGGCAGTTGTGGAGCACGATAGCGGTGGGCTCACGCTTG
TCGCTACGTCCCTGTGCGGTGACCATGCAACCTTGGCCTCCCATGGGTTTCCTCACCACG
ATGATGCAGTTTTGGAAAACGGTGACTGAGTCGCCGAAGATGAAGTCGACGGTTCCTGAG
ATGGTGGAGTCGCGGTAGAATTGACGATGGGCATGGGCGTAGAGTGTGTCTTGGTAACCA
TCGATTTGACAGTTGAAGATAACTACTTGGTCGGCAGAGACTCTTAGGGCTACAGCTTGT
CCTCCTTGGGGACCGGCGGTGTTCTCAATCCCGATGTTCTTGGCCAAGAAGTTGTCACCC
TCGACCGTG

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2GW16TF 730 0 0
TGGCCTCCCATGGGTTTCCTCACCACGATGATGCAGTTT*GGAAAACGGTGACTGAGTCG
CCGAAGATGAAGTCGACGGTTCC*GAGATGGTGGAGTCACGGTAGAATTGACGATGGGCA
TGGGCGTAGAGTGTGTCTTGGTAACCATCGATTTGACAGTTGAAGATAACTACTTGGTCG
GCAGAGACTCTTAGGGCTACAGCTTGTCCTCCTTGGGGACCGGCGGTGTTCTCAATCCCG
ATGTTCTTGGCCAAGAAGTTGTCACCCTCGACCGTGAGAGAGGATGTGAGGTATGTCCTG
ACCTTGCCGATAGCAAAGTTGAGATTACCGGTGATCTTAGTTTTGGTGGGTCCATCTCCG
ATGAAAGTGACGTAAAACATTTGTTTTGTAACAATGACTTTCTCCTTGTAGACACCTTCC
TTGATGTAGATAACGAACGGCACTTTGTTGTTAATAGGCACAGCTTTCAAGGCCTCGTTT
ATGCTTTTGTACTGACCACTTCCGTCTTTCGCCACCACCACATTAGGTTTCACACCTCCT
AGTGGTGCTGCCATGAGCCGTCGAGAGTCTGGTCCTACCCAGCTTGGGATACCGTCTTCA
GCCGACAAAAGCTTTCTGGAGTTGTTTCCAAGATCTCCGGTCGCTTCTGTGATGTTGGAC
TTTCCAAACATGCTGGACATACTGGTAATCATTGCAAGACTGTTACTGGTGAGTTCTTTG
GATGGTTTGC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 3

CO CL3493Contig1 674 3 32 U
GGATAGCCAATTGGTACTTGTTTACATAATTATAGAAACAGAATAATGGAGATGAGGTTC
TTGTTCCGTGCCTTGACTTTGGTGTTAATGGTGGCTTTGGGGGAAGCAGTTGGTGACAGA
ATGAGATGGACAAGAAAGGAGTTGGTGGAGATAGCTGGCTACGGCGAACTCAAACTCTCC
TCCGTCATCCTCACCGCCTCTCTTCTCTCTTCCTCCTCCGACCCTATTTCTGGTGCTACC
GTTGGCATCATGTGCCATACTGGACATAGGAG***ATCCAAAGCGATCAAAGCTGTCACA
AATGAGTTTGGGCAGTTCAACATCGATCTTCCTTCTCACCTACACGCAATTCCTGACCTA
GACAAGGCTTGTTCCATCAAACCCCTCTCTGTTCCTAAACCGTATCATCGATGCTCTCAC
AAGATTCACAGAGGTATCAAACTCGTTTCCTCCTCAAACGGCTTGCGCTTCTACACAGCA
GGCAACATCACCTTATACTGATTTTACCATGTAAATAGAGATTTCAAACATGCCTTTCAT
TTTTTTCTATATGGTTCCTTCTCACTTCTTGAGAGAAAGAGATACAGTCTTTGTATATAA
TGTCTCTTCTTATTTGCTGTAATAAAAATGATAGATGCAGTTTATGTTTGCTTCATGCAC
AGATTTTTTTTGCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CE73TF U 1
AF RR2DA06TF U 1
AF RR2DA06JQ C 227
BS 1 37 RR2CE73TF
BS 38 38 RR2DA06TF
BS 39 197 RR2CE73TF
BS 198 198 RR2DA06TF
BS 199 250 RR2CE73TF
BS 251 251 RR2DA06TF
BS 252 255 RR2CE73TF
BS 256 256 RR2DA06TF
BS 257 272 RR2CE73TF
BS 273 275 RR2DA06TF
BS 276 278 RR2CE73TF
BS 279 279 RR2DA06TF
BS 280 283 RR2CE73TF
BS 284 284 RR2DA06TF
BS 285 294 RR2CE73TF
BS 295 295 RR2DA06TF
BS 296 314 RR2CE73TF
BS 315 315 RR2DA06TF
BS 316 319 RR2CE73TF
BS 320 320 RR2DA06TF
BS 321 344 RR2CE73TF
BS 345 345 RR2DA06TF
BS 346 443 RR2CE73TF
BS 444 444 RR2DA06TF
BS 445 455 RR2CE73TF
BS 456 456 RR2DA06TF
BS 457 526 RR2CE73TF
BS 527 527 RR2DA06TF
BS 528 545 RR2CE73TF
BS 546 546 RR2DA06TF
BS 547 628 RR2CE73TF
BS 629 674 RR2DA06TF

RD RR2CE73TF 628 0 0
GGATAGCCAATTGGTACTTGTTTACATAATTATAGAATCAGAATAATGGAGATGAGGTTC
TTGTTCCGTGCCTTGACTTTGGTGTTAATGGTGGCTTTGGGGGAAGCAGTTGGTGACAGA
ATGAGATGGACAAGAAAGGAGTTGGTGGAGATAGCTGGCTACGGCGAACTCAAACTCTCC
TCCGTCATCCTCACCGCTTCTCTTCTCTCTTCCTCCTCCGACCCTATTTCTGGTGCTACC
GTTGGCATCAAGTGCAATACTGGACATAGGAGGAGATCTAAAGTGATCAAAGCTATCACA
AATGAGTTTGGGCAATTCACCATCGATCTTCCTTCTCACCTACATGCAATTCCTGACCTA
GACAAGGCTTGTTCCATCAAACCCCTCTCTGTTCCTAAACCGTATCATCGATGCTCTCAC
AAGATTCACAGAGGTATCAAACTTGTTTCCTCCTCCAACGGCTTGCGCTTCTACACAGCA
GGCAACATCACCTTATACTGATTTTACCATGTAAATAGAGATTTCAGACATGCCTTTCAT
TTTTT*CTATATGGTTCCTTCTCACTTCTTGAGAGAAAGAGATACAGTCTTTGTATATAA
TGTCTCTTCTTATTTGCTGTAATAAAAA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2DA06TF 674 0 0
GGATAGCCAATTGGTACTTGTTTACATAATTATAGAAACAGAATAATGGAGATGAGGTTC
TTGTTCCGTGCCTTGACTTTGGTGTTAATGGTGGCTTTGGGGGAAGCAGTTGGTGACAGA
ATGAGATGGACCAGAAAGGAGTTGGTGGAGATAGCTGGCTACGGCGAACTCAAACTCTCC
TCCGTCATCCTCACCGCCTCTCTTCTCTCTTCCTCCTCCGACCCTATTTCTGGTGCTACC
GTTGGCATCATGTGCCATACTGGACATAGGAG***ATCCAAAGCGATCAAAGCTGTCACA
AATGAGTTTGGGCAGTTCAACATCGATCTTCCTTCTCACCTACACGCAATTCCTGACCTA
GACAAGGCTTGTTCCATCAAACCCCTCTCTGTTCCTAAACCGTATCATCGATGCTCTCAC
AAGATTCACAGAGGTATCAAACTCGTTTCCTCCTCAAACGGCTTGCGCTTCTACACAGCA
GGCAACATCACCTTATACTGATTTTACCATGTAAATAGAGATTTCAAACATGCCTTTCAT
TTTTTTCTATATGGTTCCTTCTCACTTCTTGAGAGAAAGAGATACAGTCTTTGTATATAA
TGTCTCTTCTTATTTGCTGTAATAAAAATGATAGATGCAGTTTATGTTTGCTTCATGCAC
AGATTTTTTTTGCG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2DA06JQ 448 0 0
TTTT
TGGTGCTACCGTTGGCATCATGTGCCATACTGGACATAGGAG***ATCCAAAGCGATCAA
AGCTGTCACAAATGAGTTTGGGCAGTTCAACATCGATTTTCCTTTTCACCTACACGCAAT
TCCTGACCTAGACAAGGCTTGTTCCATCAAACCCCTCTCTGTTCCTAAACCGTATCATCG
ATGCTCTCACAAGATTCACAGAGGTATCAAACTCGTTTCCTCCTCAAACGGCTTGCGCTT
TTACACAGCAGGCAACATCACCTTATACTGATTTTACCATGTAAATAGAGATTTCAAACA
TGCCTTTCATTTTTTTCTATATGGTTCCTTCTCACTTCTTGAGAGAAAGAGATACAGTCT
TTGTATATAATGTCTCTTCTTATTTGCTGTAATAAAAATGATAGATGCAGTTTATGTTTG
CTTCATGCACAGATTTTTTTTGCG

QA 5 448 5 448
DS 



AS 1 3

CO CL3494Contig1 1214 3 13 U
GGGAGGAAGCATCATCAATGGTGGAAAGCTTGTGATAGCCAAAATCGAGATCTGATCCCC
TAAATGGAGAGCGAGAAGAAGCAGTCATCTGTCTCGGACGTGGGAGCATGGGGTATGAAC
ATCATCAGCTCCGTGGGGATCATCATGGCTAACAAACAGCTCATGTCTTCCTCTGGCTTC
GGATTCAGCTTCGCGACAACACTAACGGGATTCCACTTCGCACTCACGGCGCTTGTTGGT
ATGGTGTCAAACGCTACGGGACTCTCTGCGTCGAAGCACATTCCTCTTTGGGAGCTTCTT
TGGTTCTCTATTGTAGCTAACGTCTCCATCGCTGCTATGAACTTCAGCCTCATGCTCAAC
TCTGTTGGCTTCTACCAGATATCGAAGTTGAGTATGATTCCGGTTGTATGCGTGATGGAA
TGGATACTACATAGCAAGCACTACTCTAGAGAAGTGAAAGCGTCTGTTATGGTTGTGGTT
GTCGGTGTTGGCATCTGTACTGTCACTGATGTCAAAGTTAATGCCAAAGGATTCATTTGT
GCTTGTACTGCCGTCTTCTCCACTTCCCTTCAGCAGATTTCAATAGGCTCTCTGCAGAAG
AAGTACTCAGTAGGGTCTTTTGAATTGCTGAGCAAA*CAGCTCCGATCCAAGCACTTTCA
CTACTCATCTTTGGCCCCTTTGTTGACTATTTCTTGAGCGGCAAGTTCATAACTACTTAC
CACATGACTTATGGTGCCATTTTCTGTATTCTTCTCTCCTGCGCATTAGCCGTTTTCTGT
AACATAAGCCAATACCTCTGCATAGGAAGATTCTCTGCAACATCATTTCAAGTTCTAGGC
CACATGAAAACAGTTTGCGTCCTTACACTTGGATGGCTTCTCTTTGATTCGGAGATGACT
TTCAAGAACATCTCCGGTATGGTCGTAGCTGTTGTCGGAATGTTGATCTATAGTTGGGCG
GTTGATCTAGAGAAACAGAGAAACGCAAAGTCAACTTCTCAAGGGAAAAACAGTGTGGCA
GAAGATGAGATTAAGCCACTCAAGGAAGGAATAGAGCATATCGATTTGAAAGATGTTGAG
CTCGGTGGTGAGACTAAAGTATAGATAGATACAACAATGTGTGCTTTTTTATCAAGTTTC
AAATTACACGTCGAATACTTATTTTTTTTTAAGGCTATAAAAGTATAAACAGTTTCTCCT
CGTCATCAGAGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO52TF U 1
AF RR2DD90TF U 6
AF RR2DD90JQ C 421
BS 1 123 RR2CO52TF
BS 124 124 RR2DD90TF
BS 125 179 RR2CO52TF
BS 180 180 RR2DD90TF
BS 181 670 RR2CO52TF
BS 671 677 RR2DD90TF
BS 678 678 RR2DD90JQ
BS 679 703 RR2DD90TF
BS 704 704 RR2DD90JQ
BS 705 720 RR2DD90TF
BS 721 721 RR2DD90JQ
BS 722 733 RR2DD90TF
BS 734 1214 RR2DD90JQ

RD RR2CO52TF 670 0 0
GGGAGGAAGCATCATCAATGGTGGAAAGCTTGTGATAGCCAAAATCGAGATCTGATCCCC
TAAATGGAGAGCGAGAAGAAGCAGTCATCTGTCTCGGACGTGGGAGCATGGGGTATGAAC
ATCGTCAGCTCCGTGGGGATCATCATGGCTAACAAACAGCTCATGTCTTCCTCTGGCTT*
GGATTCAGCTTCGCGACAACACTAACGGGATTCCACTTCGCACTCACGGCGCTTGTTGGT
ATGGTGTCAAACGCTACGGGACTCTCTGCGTCGAAGCACATTCCTCTTTGGGAGCTTCTT
TGGTTCTCTATTGTAGCTAACGTCTCCATCGCTGCTATGAACTTCAGCCTCATGCTCAAC
TCTGTTGGCTTCTACCAGATATCGAAGTTGAGTATGATTCCGGTTGTATGCGTGATGGAA
TGGATACTACATAGCAAGCACTACTCTAGAGAAGTGAAAGCGTCTGTTATGGTTGTGGTT
GTCGGTGTTGGCATCTGTACTGTCACTGATGTCAAAGTTAATGCCAAAGGATTCATTTGT
GCTTGTACTGCCGTCTTCTCCACTTCCCTTCAGCAGATTTCAATAGGCTCTCTGCAGAAG
AAGTACTCAGTAGGGTCTTTTGAATTGCTGAGCAAA*CAGCTCCGATCCAAGCACTTTCA
CTACTCATCT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2DD90TF 728 0 0
GG
AGCATCATCAATGGTGGAAAGCTTGTGATAGCCAAAATCGAGATCTGATCCCCTAAATGG
AGAGCGAGAAGAAGCAGTCATCTGTCTCGGACGTGGGAGCATGGGGTATGAACATCATCA
GCTCCGTGGGGATCATCATGGCTAACAAACAGCTCATGTCTTCCTCTGGCTTCGGATTCA
GCTTCGCGACAACACTAACGGGATTCCACTTCGCACTCACGGCGCTTGTTGGTATGGTGT
CAAACGCTACGGGACTCTCTGCGTCGAAGCACATTCCTCTTTGGGAGCTTCTTTGGTTCT
CTATTGTAGCTAACGTCTCCATCGCTGCTATGAACTTCAGCCTCATGCTCAACTCTGTTG
GCTTCTACCAGATATCGAAGTTGAGTATGATTCCGGTTGTATGCGTGATGGAATGGATAC
TACATAGCAAGCACTACTCTAGAGAAGTGAAAGCGTCTGTTATGGTTGTGGTTGTCGGTG
TTGGCATCTGTACTGTCACTGATGTCAAAGTTAATGCCAAAGGATTCATTTGTGCTTGTA
CTGCCGTCTTCTCCACTTCCCTTCAGCAGATTTCAATAGGCTCTCTGCAGAAGAAGTACT
CAGTAGGGTCTTTTGAATTGCTGAGCAAA*CAGCTCCGATCCAAGCACTTTCACTACTCA
TCTTTGGCCC*TTTGTTGACTATTTCTTGAGCGGCA*GTTCATAACTACTTAC*ACATGA
CTTATG

QA 3 728 3 728
DS 

RD RR2DD90JQ 794 0 0
TGGATACTACATAGCAAGCACTACTCTAGAGAAGTGAAAGCGTCTGTTATGGTTGTGGTT
GTCGGTGTTGGCATCTGTACTGTCACTGATGTCAAAGTTAATGCCAAAGGATTCATTTGT
GCTTGTACTGCCGTCTTCTCCACTTCCCTTCAGCAGATTTCAATAGGCTCTCTGCAGAAG
AAGTACTCAGTAGGGTCTTTTGAATTGCTGAGCAAAACAGCTCCGATCCAAGCACTTTCA
CTACTCATCTTTGGCCCCTTTGTTGACTATTTCTTGAGCGGCAAGTTCATAACTACTTAC
CACATGACTTATGGTGCCATTTTCTGTATTCTTCTCTCCTGCGCATTAGCCGTTTTCTGT
AACATAAGCCAATACCTCTGCATAGGAAGATTCTCTGCAACATCATTTCAAGTTCTAGGC
CACATGAAAACAGTTTGCGTCCTTACACTTGGATGGCTTCTCTTTGATTCGGAGATGACT
TTCAAGAACATCTCCGGTATGGTCGTAGCTGTTGTCGGAATGTTGATCTATAGTTGGGCG
GTTGATCTAGAGAAACAGAGAAACGCAAAGTCAACTTCTCAAGGGAAAAACAGTGTGGCA
GAAGATGAGATTAAGCCACTCAAGGAAGGAATAGAGCATATCGATTTGAAAGATGTTGAG
CTCGGTGGTGAGACTAAAGTATAGATAGATACAACAATGTGTGCTTTTTTATCAAGTTTC
AAATTACACGTCGAATACTTATTTTTTTTTAAGGCTATAAAAGTATAAACAGTTTCTCCT
CGTCATCAGAGGTT

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 3

CO CL3495Contig1 989 3 2 U
GGAAACTATTGGGCTTGGCTTAAACTGGGCGAATGATAGTTTGTAAACCTGTTAATATCA
CTACAGCTTTCGTCTATTGATAACTCATCATCGAAGAGCTTCTAGATCGGGACTATTCTA
TCACCTCCGAATTCCTAAATCTTTGCTCCGCTTCCAGTTCAGTTTCTCAGGAGAATGAGA
ATAGTGGGTCTAACGGGAGGCATAGCGTCTGGGAAGAGTACAGTCTCCAACCTCTTCAAA
GCTAATGGCATTCCTGTTGTTGATGCTGATGTCATTGCTCGTAATGTACTGAAGAAAGGA
AGCGGTGGATGGAAGAGAGTAGTTGCTGCTTTTGGGGAGGAGATTCTTCTTCCTAGTAGA
GAAGTTGATCGGCCAAAGCTTGGTCAGATGGTCTTCTCTTCCGATTCCAAGCGCCAACTT
CTCAACAAGTTAATGGCTCCGTACATATCATCTGGTATCTTTTGGGAGATACTGAAACAA
TGGGCAAAAGGAGCTAAAGTGATAGTCGTCGATATCCCATTGCTGTTCGAAACTAAGATG
GATAAATGGACTAAACCCGTTGTTGTTGTGTGGGTTAGTCAAGAAACACAGCTCAATAGA
CTGATGGAGAGAGATGGACTGAGTGAGGAAGATGCAAGAAACAGAGTGATGGCTCAGATG
TCTTTGGATTTGAAAAGAAGCAAAGCTGATATTGTGATTGATAATAACGGCGGTCTCAAC
GAGCTCCACCAACAGTTTGACAAGGTTTTGTCTGAGATCAGAAGACCGTTGACGTGGATT
GAGTTTTGGCGTTCAAGGCAAGGCGCCTTCTCGATCCTTGGTTTGGTGACTTCTGGACTA
CTTGTTTGCAAACAACTCAATTAGCTCTTTACCATCTTGTTTTTTTCTTTCTTCCAAACC
ACTTTTGTCTCTTATTTATAATCATTACAACTTTCATATATTTCTCTTCCACAACTAAAA
CAATCTTACCTAATCACTAGTTTGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV59TF U 84
AF RR2AI65TF U 1
AF RR2AI65JQ C 237
BS 1 760 RR2AI65TF
BS 761 989 RR2AI65JQ

RD RR2GV59TF 593 0 0
GG
CATCATCGAAGAGCTTCTAGATCGGGACTATTCTATCACCTCCGAATTCCTAAATCTTTG
CTCCGCTTCCAGTTCAG********GAGAATGAGAATAGTGGGTCTAACGGGAGGCATAG
CGTCTGGGAAGAGTACAGTCTCCAACCTCTTCAAAGCTAATGGCATTCCTGTTGTTGATG
CTGATGTCATTGCTCGTAATGTACTGAAGAAAGGAAGCGGTGGATGGAAGAGAGTAGTTG
CTGCTTTTGGGGAGGAGATTCTTCTTCCTAGTAGAGAAGTTGATCGGCCAAAGCTTGGTC
AGATGGTCTTCTCTTCCGATTCCAAGCGCCAACTTCTCAACAAGTTAATGGCTCCGTACA
TATCATCTGGTATCTTTTGGGAGATACTGAAACAATGGGCAAAAGGAGCTAAAGTGATAG
TCGTCGATATCCCATTGCTGTTCGAAACTAAGATGGATAAATGGACTAAACCCGTTGTTG
TTGTGTGGGTTAGTCAAGAAACACAGCTCAATAGACTGATGGAGAGAGATGGACTGAGTG
AGGAAGATGCAAGAAACAGAGTGATGGCTCAGATGTCTTTGGATTTGAAAA

QA 3 593 3 593
DS 

RD RR2AI65TF 760 0 0
GGAAACTATTGGGCTTGGCTTAAACTGGGCGAATGATAGTTTGTAAACCTGTTAATATCA
CTACAGCTTTCGTCTATTGATAACTCATCATCGAAGAGCTTCTAGATCGGGACTATTCTA
TCACCTCCGAATTCCTAAATCTTTGCTCCGCTTCCAGTTCAGTTTCTCAGGAGAATGAGA
ATAGTGGGTCTAACGGGAGGCATAGCGTCTGGGAAGAGTACAGTCTCCAACCTCTTCAAA
GCTAATGGCATTCCTGTTGTTGATGCTGATGTCATTGCTCGTAATGTACTGAAGAAAGGA
AGCGGTGGATGGAAGAGAGTAGTTGCTGCTTTTGGGGAGGAGATTCTTCTTCCTAGTAGA
GAAGTTGATCGGCCAAAGCTTGGTCAGATGGTCTTCTCTTCCGATTCCAAGCGCCAACTT
CTCAACAAGTTAATGGCTCCGTACATATCATCTGGTATCTTTTGGGAGATACTGAAACAA
TGGGCAAAAGGAGCTAAAGTGATAGTCGTCGATATCCCATTGCTGTTCGAAACTAAGATG
GATAAATGGACTAAACCCGTTGTTGTTGTGTGGGTTAGTCAAGAAACACAGCTCAATAGA
CTGATGGAGAGAGATGGACTGAGTGAGGAAGATGCAAGAAACAGAGTGATGGCTCAGATG
TCTTTGGATTTGAAAAGAAGCAAAGCTGATATTGTGATTGATAATAACGGCGGTCTCAAC
GAGCTCCACCAACAGTTTGACAAGGTTTTGTCTGAGATCA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2AI65JQ 753 0 0
CAAAGCTAATGGCATTCCTGTTGTTGATGCTGATGTCATTGCTCGTAATGTACTGAAGAA
AGGAAGCGGTGGATGGAAGAGAGTAGTTGCTGCTTTTGGGGAGGAGATTCTTCTTCCTAG
TAGAGAAGTTGATCGGCCAAAGCTTGGTCAGATGGTCTTCTCTTCCGATTCCAAGCGCCA
ACTTCTCAACAAGTTAATGGCTCCGTACATATCATCTGGTATCTTTTGGGAGATACTGAA
ACAATGGGCAAAAGGAGCTAAAGTGATAGTCGTCGATATCCCATTGCTGTTCGAAACTAA
GATGGATAAATGGACTAAACCCGTTGTTGTTGTGTGGGTTAGTCAAGAAACACAGCTCAA
TAGACTGATGGAGAGAGATGGACTGAGTGAGGAAGATGCAAGAAACAGAGTGATGGCTCA
GATGTCTTTGGATTTGAAAAGAAGCAAAGCTGATATTGTGATTGATAATAACGGCGGTCT
CAACGAGCTCCACCAACAGTTTGACAAGGTTTTGTCTGAGATCAGAAGACCGTTGACGTG
GATTGAGTTTTGGCGTTCAAGGCAAGGCGCCTTCTCGATCCTTGGTTTGGTGACTTCTGG
ACTACTTGTTTGCAAACAACTCAATTAGCTCTTTACCATCTTGTTTTTTTCTTTCTTCCA
AACCACTTTTGTCTCTTATTTATAATCATTACAACTTTCATATATTTCTCTTCCACAACT
AAAACAATCTTACCTAATCACTAGTTTGATTCC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 3

CO CL3496Contig1 1021 3 6 U
GGAGTTTTCGTGAGGCTTAACTTTCGAACAGAAAATGGGTGTATTCCCTGGGTTTGGTAG
CTGGATCAATCAGAACAGTCAACAGCCTCTTAAAGCAGAGGCCAAGAGATCTGAAAATGT
GGACTCAGAGGAAGACGATTTTAAATATCCTGATAAGATCTATTTTGATCAAAATGACGA
GCAGAAGCAACTAGATCTTTGGCATGAAACAGAGAAGAAGCATCCATGGCATAATGCATC
TCCTAAGATCAAGGTGACACATGAAAATGGTTTTTACCATATGAACATAGAAATGACCGT
AGGGCTGCATCCAGAATTGCTCTACGGCTTTTTAATTGATCCAGGAAGTGGTTCATTTCA
CGATTTGCTTAAACGGCGCCAACTTATGGAAAACAAATCAAGAAAGG*TTTTGTTTGAGA
AAGGTCCGAGGCAATTGATGAGGGTGGAAAAATCTGTGGCTTGTAATGTATTTGGGGGTG
TATTTCCCTATCTCTATGAATCTAATCATCGATGAAAACAGAAAAGATCTTATGACGCAA
TATAAGAAAGAGAAAGTACGATTTATGAAAGCATTCGAGGGTAACTTAAAAGTGGAGCCT
ATATTTGTAGATAAAGAACGTTTATGCAAAAGAAGATACCAATGACTCGAGAAGAGTATA
AAAAATGTAGTGGTGGCCGAGGAAAGATTGCATCAAAACTGACAATAGACCAATACTATA
AGCCATATCCTCCTTTTAATCTACCGCCGCTTTCTTGGTTCATCCGTGGGATGACCATCA
AAACCTCCAAAATTCTGCTTGCACGGATTCAGGACACGTCTATTGCAATGAGAACGGCTA
TACAATTTCCAAAGGAGACAGCAAGTAACGAACATGAAAAACACTAGAGCCTCAATGAAC
ATACACAAATACTCTTAAAAGTTAATAATATTCTCAAAAGTATAAGAATACAATCAACAA
AACAAAATATGTAAATCTGTTTATTAAGAAAATACATAATAATAAAATTCAAATTCAGTT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E880TF U 1
AF RR2FK17TF U 58
AF RR2E880JQ C 332
BS 1 126 RR2E880TF
BS 127 127 RR2FK17TF
BS 128 630 RR2E880TF
BS 631 633 RR2FK17TF
BS 634 652 RR2E880TF
BS 653 1021 RR2E880JQ

RD RR2E880TF 658 0 0
GGAGTTTTCGTGAGGCTTAACTTTCGAACAGAAAATGGGTGTATTCCCTGGGTTTGGTAG
CTGGATCAATCAGAACAGTCAACAGCCTCTTAAAGCAGAGGCCAAGAGATCTGAAAATGT
GGACTCTGAGGAAGACGATTTTAAATATCCTGATAAGATCTATTTTGATCAAAATGACGA
GCAGAAGCAACTAGATCTTTGGCATGAAACAGAGAAGAAGCATCCATGGCATAATGCATC
TCCTAAGATCAAGGTGACACATGAAAATGGTTTTTACCATATGAACATAGAAATGACCGT
AGGGCTGCATCCAGAATTGCTCTACGGCTTTTTAATTGATCCAGGAAGTGGTTCATTTCA
CGATTTGCTTAAACGGCGCCAACTTATGGAAAACAAATCAAGAAAGG*TTTTGTTTGAGA
AAGGTCCGAGGCAATTGATGAGGGTGGAAAAATCTGTGGCTTGTAATGTATTTGGGGGTG
TATTTCCCTATCTCTATGAATCTAATCATCGATGAAAACAGAAAAGATCTTATGACGCAA
TATAAGAAAGAGAAAGTACGATTTATGAAAGCATTCGAGGGTAACTTAAAAGTGGAGCCT
ATATTTGTAGATAAAGAACGTTTATGCAAA**GAGATACCAATGACTCGAGA
GAGTAT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2FK17TF 601 0 0
TAGCTGGATCAATCAGAACAGTCAACAGCCTCTTAAAGCAGAGGCCAAGAGATCTGAAAA
TGTGGACTCAGAGGAAGACGATTTTAAATATCCTGATAAGATCTATTTTGATCAAAATGA
CGAGCAGAAGCAACTAGATCTTTGGCATGAAACAGAGAAGAAGCATCCATGGCATAATGC
ATCTCCTAAGATCAAGGTGACACATGAAAATGGTTTTTACCATATGAACATAGAAATGAC
CGTAGGGCTGCATCCAGAATTGCTCTACGGCTTTTTGATTGATCCAGGAAGTGGTTCATT
TCACGATTTGATTAAACGGCGCCAACTTATGGAAAACAAATCAAGAAAGGGTTTTGTTTG
AGAAAGGTCCGAGGCAATTGATGAGCGTGGAAAAATCTGTGGCTTGTAATGTATTTGGGG
GTGTATTTCCCTATCTCTATGAATCTAATCATCGATGAAAATAGAAAAGATCTTACGACG
CAATATAAGAAAGAGAAAGTAAGATTTATGAAAGCATTCGAGGGTAACTTAAAAGTGGAG
CCTATATTTGTAGATAAAGAACGTTTATGCAAAAGAAGATAC*AATGACTCGAGA
GAGTAT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2E880JQ 690 0 0
TTA
ATTGATCCAGGAAGTGGTTCATTTCACGATTTGCTTAAACGGCGCCAACTTATGGAAAAC
AAATCAAGAAAGG*TTTTGTTTGAGAAAGGTCCGAGGCAATTGATGAGGGTGGAAAAATC
TGTGGCTTGTAATGTATTTGGGG*TGTATTTCCCTATCTCTATGAATCTAATCATCGATG
AAAACAGAAAAGATCTTATGACGCAATATAAGAAAGAGAAAGTACGATTTATGAAAGCAT
TCGAGGGTAACTTAAAAGTGGAGCCTATATTTGTAGATAAAGAACGTTTATGCAAAAGAA
GATACCAATGACTCGAGAAGAGTATAAAAAATGTAGTGGTGGCCGAGGAAAGATTGCATC
AAAACTGACAATAGACCAATACTATAAGCCATATCCTCCTTTTAATCTACCGCCGCTTTC
TTGGTTCATCCGTGGGATGACCATCAAAACCTCCAAAATTCTGCTTGCACGGATTCAGGA
CACGTCTATTGCAATGAGAACGGCTATACAATTTCCAAAGGAGACAGCAAGTAACGAACA
TGAAAAACACTAGAGCCTCAATGAACATACACAAATACTCTTAAAAGTTAATAATATTCT
CAAAAGTATAAGAATACAATCAACAAAACAAAATATGTAAATCTGTTTATTAAGAAAATA
CATAATAATAAAATTCAAATTCAGTTT

QA 4 690 4 690
DS 



AS 1 3

CO CL3497Contig1 817 3 5 U
AAGTAAAAGTATCCATGTAATCACCACAATCTTTTCTACTAGAAAGTCTCCGAAGTCAAC
AACGTTTTAAAAGCTTGAAGAAATCCGAACGAAACTCTTTCTTACAAACTTAGCAACTTA
CAATCTCAAATTACCTTTTTAACACATACGAAAATAAGTGTTTGCAACTCCAGACTGATC
CTAAACGCATCATTTGAAAACCTCTCAAACTTGCTGCACCCTTCTCTGATAGTGTCTTAG
TAGCGGTCATGACGTCTGCGGCGATCAGAATCCCTCGTTCTTCCCCTAGACCGGGACCTC
GAGCTGCGTCGGCTTCTTGAGTCATAGCCACGTGACTGATTATAGTTTCTGTCATGCTCA
CGGTGCCTGTCGCGATCTCTACTTCTACGGTCAATATCTCTTCCACAGTCACGGCTATCT
CCTCTGTCTCTGTCTTTACTTGATTCTCGCTCTCTGCTCCTCTCTTTTGATCTCCTCTCT
TCGACCCGTTCCTTGTGAACTTTGTTCTTTTCCTCCTGAAGCTCTGCTAGTTTATCTCGG
ATCAGCATGTAACCCAGATGAAGCTTCCCTCCGAAATGATCAGCTAACCGACGATCACTG
TCATAGACGCTCAAGAATGCTCCGCATATGTCGCATAGACGCAGCTTCTGGTCCGTAATG
CGCACATCAGCAGCAGTGTATTTGGTTGAATCCACCACAGGTTCTTGTCTAGGAGTAAGC
TTCTTAAGAGCCTCAGCCTCCTCCAGTGCTTTCTGCGCCTCATCAACCATTCCTTGTTCG
CCGAACTCTTCAGCTTTCTTTAATTTCTCATTGATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B177JQ U 1
AF RR2D868JQ U 1
AF RR2B177TF C 37
BS 1 44 RR2B177JQ
BS 45 45 RR2D868JQ
BS 46 722 RR2B177JQ
BS 723 763 RR2D868JQ
BS 764 817 RR2B177TF

RD RR2B177JQ 722 0 0
AAGTAAAAGTATCCATGTAATCACCACAATCTTTTCTACTAGAA*GTCTCCGAAGTCAAC
AACGTTTTAAAAGCTTGAAGAAATCCGAACGAAACTCTTTCTTACAAACTTAGCAACTTA
CAATCTCAAATTACCTTTTTAACACATACGAAAATAAGTGTTTGCAACTCCAGACTGATC
CTAAACGCATCATTTGAAAACCTCTCAAACTTGCTGCACCCTTCTCTGATAGTGTCTTAG
TAGCGGTCATGACGTCTGCGGCGATCAGAATCCCTCGTTCTTCCCCTAGACCGGGACCTC
GAGCTGCGTCGGCTTCTTGAGTCATAGCCACGTGACTGATTATAGTTTCTGTCATGCTCA
CGGTGCCTGTCGCGATCTCTACTTCTACGGTCAATATCTCTTCCACAGTCACGGCTATCT
CCTCTGTCTCTGTCTTTACTTGATTCTCGCTCTCTGCTCCTCTCTTTTGATCTCCTCTCT
TCGACCCGTTCCTTGTGAACTTTGTTCTTTTCCTCCTGAAGCTCTGCTAGTTTATCTCGG
ATCAGCATGTAACCCAGATGAAGCTTCCCTCCGAAATGATCAGCTAACCGACGATCACTG
TCATAGACGCTCAAGAATGCTCCGCATATGTCGCATAGACGCAGCTTCTGGTCCGTAATG
CGCACATCAGCAGCAGTGTATTTGGTTGAATCCACCACAGGTTCTTGTCTAGGAGTAAGC
TT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2D868JQ 763 0 0
AAGTAAAAGTATCCATGTAATCACCACAATCTTTTCTACTAGAAAGTCTCCGAAGTCAAC
AACGTTTTAAAAGCTTGAAGAAATCCGAACGAAACTCTTTCTTACAAACTTAGCAACTTA
CAATCTCAAATTATCTTTTTAACACATACGAAAATAAGTGTTTGCAACTCCAGATTGATC
CTAAACGCATCATTTGAAAACCTCTCAAACTTGTTGCACCCTTCTCTGATAGTGTCTTAG
TAGCGGTCATGACGTCTGCGGCGATCAGAATCCCTCGTTCTTTCCCTAGACCGGGACCTC
GAGCTGCGTCGGCTTCTTGAGTCATAGCCACGTGACTGATTATAGTTTCTGTCATGCTCA
CGGTGCCTGTCGCGATCTCTACTTCTACGGTCAATATCTCTTCCACGGTCACGGCTATCT
CCTCTGTCTCTGTCTTTACTTGATTCTCGCTCTCTGCTCCTCTCTTTTGATCTCCTCTCT
TCGACCCGTTCCTTGTGAACTTTGTTCTTTTCCTCCTGAAGCTCTGCTAGTTTATCTCGG
ATCAGCATGTAACCCAGATGAAGCTTCCCTCCGAAATGATCAGCTAACCGACGATCACTG
TCATAGACGCCCAAGAATGCTCCGCATATGTCGCATAGACGCAGCTTCTGGTCCGTAATG
CGCATATCAGCAGCAGTGTATTTGGTTGAATCCACCACAGGTTCTTGTCTAGGAGTAAGC
TTCTTAAGAGCCTCAGCCTCCTCCAGTGCTTTCTGCGCCTCAT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2B177TF 781 0 0
CTACTAG
AAGTCTCCGAAGTCAACAACGTTTTAAAAGCTTGAAGAAATCCGAACGAAACTCTTTCTT
ACAAACTTAGCAACTTACAATCTCAAATTA*CTTTTTAACACATACGAAAATAAGTGTTT
GCAACTCCAGACTGATCCTAAACGCATCATTTGAAAACCTCTCAAACTTGCTGCACCCTT
CTCTGATAGTGTCTTAGTAGCGGTCATGACGTCTGCGGCGATCAGAATCCCTCGTTCTTC
CCCTAGACCGGGACCTCGAGCTGCGTCGGCTTCTTGAGTCATAGCCACGTGACTGATTAT
AGTTTCTGTCATGCTCACGGTGCCTGTCGCGATCTCTACTTCTACGGTCAATATCTCTTC
CACAGTCACGGCTATCTCCTCTGTCTCTGTCTTTACTTGATTCTCGCTCTCTGCTCCTCT
CTTTTGATCTCCTCTCTTCGACCCGTTCCTTGTGAACTTTGTTCTTTTCCTCCTGAAGCT
CTGCTAGTTTATCTCGGATCAGCATGTAACCCAGATGAAGCTTCCCTCCGAAATGATCAG
CTAACCGACGATCACTGTCATAGACGCTCAAGAATGCTCCGCATATGTCGCATAGACGCA
GCTTCTGGTCCGTAATGCGCACATCAGCAGCAGTGTATTTGGTTGAATCCACCACAGGTT
CTTGTCTAGGAGTAAGCTTCTTAAGAGCCTTGGCCTCCTCCAGTGCTTTCTGCGCCTCAT
CAACCATTCCTTGTTCGCCGAACTCTTCAGCTTTCTTTAATTTCTCATTGATCC

QA 8 781 8 781
DS 



AS 1 2

CO CL3498Contig1 554 2 2 U
GAGAGAGGCAGCTGTCTCGAATGATTCCAAGTTTGACCACATTGAACTAGAAGAGAAGCA
AAAGGTGTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCGTGGATGAGGGAGAAGCAGCAGCAGCA
GGAGGCGCTTCCCAAGTACGCAACACCAGCTTTCCTGTCAGCTGACGTTACGAAGAAGGC
TGAGGCACTGGACAAGTTCTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGTTGCGAAACC
GGAAGCACCACCAGCTAAGGCGGCTGATGAGGAGAAGAGTGAGGCACAGCCAGAACCGGC
CTCTGGTGAAGAACCGATGGAGACTGAGAAGCCTACCGAAGATAGTGCCTAAGAGATGAT
GGTGCTGTGTATCGATTTTGTTTTTACTTTCTTGTTTTCCCTCAAAAGAATCTTATATTG
AAACTCTCTTTTCTTTGCGGTTACAGTTTTCAGGAAGTATTATTTTCTCTCTGTGTTTTC
TTTATAAACTATTTATCGTGTGTGAGATGAGTATTTGTTCTACTTGTTACATGTTTCTGA
GCTGTTTTTTTATC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CN89JQ C 1
AF RR2CN89TF U 1
BS 1 1 RR2CN89JQ
BS 2 554 RR2CN89TF

RD RR2CN89JQ 554 0 0
GAGAGAGGCAGCTGTCTCGAATGATTCCAAGTTTGACCACATTGAACTAGAAGAGAAGCA
AAAGGTGTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCGTGGATGAGGGAGAAGCAGCAGCAGCA
GGAGGCGCTTCCCAAGTACGCAACACCAGCTTTCCTGTCAGCTGACGTTACGAAGAAGGC
TGAGGCACTGGACAAGTTCTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGTTGCGAAACC
GGAAGCACCACCAGCTAAGGCGGCTGATGAGGAGAAGAGTGAGGCACAGCCAGAACCGGC
CTCTGGTGAAGAACCGATGGAGACTGAGAAGCCTACCGAAGATAGTGCCTAAGAGATGAT
GGTGCTGTGTATCGATTTTGTTTTTACTTTCTTGTTTTCCCTCAAAAGAATCTTATATTG
AAACTCTCTTTTCTTTGCGGTTACAGTTTTCAGGAAGTATTATTTTCTCTCTGTGTTTTC
TTTATAAACTATTTATCGTGTGTGAGATGAGTATTTGTTCTACTTGTTACATGTTTCTGA
GCTGTTTTTTTATC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2CN89TF 554 0 0
G
AGAGAGGCAGCTGTCTCGAATGATTCCAAGTTTGACCACATTGAACTAGAAGAGAAGCAA
AAGGTGTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCGTGGATGAGGGAGAAGCAGCAGCAGCAG
GAGGCGCTTCCCAAGTACGCAACACCAGCTTTCCTGTCAGCTGACGTTACGAAGAAGGCT
GAGGCACTGGACAAGTTCTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGTTGCGAAACCG
GAAGCACCACCAGCTAAGGCGGCTGATGAGGAGAAGAGTGAGGCACAGCCAGAACCGGCC
TCTGGTGAAGAACCGATGGAGACTGAGAAGCCTACCGAAGATAGTGCCTAAGAGATGATG
GTGCTGTGTATCGATTTTGTTTTTACTTTCTTGTTTTCCCTCAAAAGAATCTTATATTGA
AACTCTCTTTTCTTTGCGGTTACAGTTTTCAGGAAGTATTATTTTCTCTCTGTGTTTTCT
TTATAAACTATTTATCGTGTGTGAGATGAGTATTTGTTCTACTTGTTACATGTTTCTGAG
CTGTTTTTTTATC

QA 2 554 2 554
DS 



AS 1 2

CO CL3499Contig1 752 2 3 U
GGATTCATCAAAAGCCACATAAGAAGTTGAAGCAGAAGCAAAAAACACCAAGAGAAAAAA
AACCTCTGTTTTTGTTTCTGTAGTCTCTAATGGCTCTCAAGCTTGTTCCCTTTGCTCTTC
TCCTCTGTATCCCAACTTCTCTCTCCTCTTCAGCTTCTAAAGGTAAAGAGAAGAAGTTGA
AGTATAATCCTTATCGTTACACGTTCATCGATAAAGCCAGCACATTCTCAGCATCGTCCT
CGTCTTCATTTTCATCAAGCGGTAAAGATTCGACCTACGACTACATAGTCATCGGAGGTG
GAACCGCAGGCTGTCCACTAGCCGCAACGCTGTCGCGTAATTTCAGCGTTCTTGTTTTGG
AGAGAGGTGGCGTTCCGTTTACAAACGCAAACGTCTCTTTCCTCAGGAACTTCCACATCG
GACTTGCTGACACGTCAGCTTCCTCCGCGTCTCAGGCGTTTGTTTCCACTGACGGCGTTT
ACAACGCTCGTGCTAGAGTTCTCGGCGGCGGTTCTTGTATTAACGCTGGTTTCTACTCCA
GAGCCGATGCTGCGTTTGTGAAGCGAGCGGGATGGGATCCGAAGCTAGTGAATGAGTCGT
ATCCATGGGTGGAGCGAGAGATCGTTCATCAGCCTAAGTTGACGTTGTGGCAGAAAGCTC
TAAGAGACAGTCTTTTAGAAGTTGGAGTTAGACCTTTCAATGGTTTCACTTACGACCACG
TCTCCGCACAAAAGTCGGCGGCACAATCTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C112TF U 1
AF RR2D241TF U 3
BS 1 108 RR2C112TF
BS 109 109 RR2D241TF
BS 110 752 RR2C112TF

RD RR2C112TF 752 0 0
GGATTCATCAAAAGCCACATAAGAAGTTGAAGCAGAAGCAAAAAACACCAAGAGAAAAAA
AACCTCTGTTTTTGTTTCTGTAGTCTCTAATGGCTCTCAAGCTTGTTCTCTTTGCTCTTC
TCCTCTGTATCCCAACTTCTCTCTCCTCTTCAGCTTCTAAAGGTAAAGAGAAGAAGTTGA
AGTATAATCCTTATCGTTACACGTTCATCGATAAAGCCAGCACATTCTCAGCATCGTCCT
CGTCTTCATTTTCATCAAGCGGTAAAGATTCGACCTACGACTACATAGTCATCGGAGGTG
GAACCGCAGGCTGTCCACTAGCCGCAACGCTGTCGCGTAATTTCAGCGTTCTTGTTTTGG
AGAGAGGTGGCGTTCCGTTTACAAACGCAAACGTCTCTTTCCTCAGGAACTTCCACATCG
GACTTGCTGACACGTCAGCTTCCTCCGCGTCTCAGGCGTTTGTTTCCACTGACGGCGTTT
ACAACGCTCGTGCTAGAGTTCTCGGCGGCGGTTCTTGTATTAACGCTGGTTTCTACTCCA
GAGCCGATGCTGCGTTTGTGAAGCGAGCGGGATGGGATCCGAAGCTAGTGAATGAGTCGT
ATCCATGGGTGGAGCGAGAGATCGTTCATCAGCCTAAGTTGACGTTGTGGCAGAAAGCTC
TAAGAGACAGTCTTTTAGAAGTTGGAGTTAGACCTTTCAATGGTTTCACTTACGACCACG
TCTCCGCACAAAAGTCGGCGGCACAATCTTCG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2D241TF 746 0 0
GGATTCATCAAA
CCACATAAGAAGTTGAAGCAGAAGCAAAAAACACCAAGAGAAAAAAAACCTCTGTTTTTG
TTTCTGTAGTCTCTAATGGCTCTCAAGCTTGTTCCCTTTGCTCTTCTCCTCTGTATCCCA
ACTTCTCTCTCCTCTTCAGCTTCTAAAGGTAAAGAGAAGAAGTTGAAGTATAATCCTTAT
CGTTACACGTTCATCGATAAAGCCAGCACATTCTCAGCATCGTCCTCGTCTTCATTTTCA
TCAAGCGGTAAAGATTCGACCTACGACTACATAGTCATCGGAGGTGGAACCGCAGGCTGT
CCACTAGCCGCAACGCTGTCGCGTAATTTCAGCGTTCTTGTTTTGGAGAGAGGTGGCGTT
CCGTTTACAAACGCAAACGTCTCTTTCCTCAGGAACTTCCACATCGGACTTGCTGACACG
TCAGCTTCCTCCGCGTCTCAGGCGTTTGTTTCCACTGACGGCGTTTACAACGCTCGTGCT
AGAGTTCTCGGCGGCGGTTCTTGTATTAACGCTGGTTTCTACTCCAGAGCCGATGCTGCG
TTTGTGAAGCGAGCGGGATGGGATCCGAAGCTAGTGAATGAGTCGTATCCATGGGTGGAG
CGAGAGATCGTTCATCAGCCTAAGTTGACGTTGTGGCAGAAAGCTCTAAGAGACAGTCTT
TTAGAAGTTGGAGTTAGACCTTTCA*TGGTTTCACTTACGACCACGTCTCCGGACAAAAG
TCG
CGGACAATCTT

QA 13 735 13 735
DS 



AS 1 2

CO CL3500Contig1 762 2 2 U
AAGCAGATGATTAGTACTAATTGCATAAATGCTTAATAAGCCAAACCAAGCAGGAAGCAT
GTTCAGAGAACCAAAAACCAAATCCACACACAAGTCATTACAATAACAGATCTAGTCATA
TGAATCTGGCAAAACCAAAGCAAACAAGAATCAGACAGATCTCAAGCCTCACTCTTCTCC
GTCTCAGAAGTCGCGTCGTCTTTCGCACCGTTCTCCACCGCTTCGTTGTTGGCAGCAGAT
CGATCTTTCACAGTCTCAAGCATCCTTTTGCTGATCTCTTTGGAATAAACCTCGAGGATC
TTGATCCCGTCGTCATCGTCAGACACGGCGCTCGACGCGACGCCGTACGCTTCCTCCTCG
ATGGATTTCGCGACGGCGGAAGCTTCGTCGGAGCTGAGCGTTCCGTATCTCTTGGAGAGG
ATGGACTCGGTGGATAGCGTCTCGATCAGGCGGTTCAAGACGGCGTCGCGAGTTTTCTGC
GTCGGCGGCCAGATGCGGAGGGAGATGGATCCTGGCTTTGCGACTGATTCTTCTTCTTCC
TTCTTCAGATCTACGGCTTTGGAGGATTCGTCTGATATCTGATCTGCCGTGGCGGACATT
GCGGTGGAGTCTTCTGATTCGTGCGGCGGAGGTGAGACGGTGGTGTTGATTGATTTCGGC
GGTTTCTGCCATTTTTTTCAAAGTGAATTCAGAGGAAAATTTTCGGAGATTTCTTTTGTT
GGTTTGGTGATGTGATGAGAGGAAAGGATCAGTTGTGATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2A130TF C 1
AF RR2A130JQ U 605
BS 1 604 RR2A130TF
BS 605 762 RR2A130JQ

RD RR2A130TF 761 0 0
AAGCAGATGATTAGTACTAATTGCATAAATGCTTAATAAGCCAAACCAAGCAGGAAGCAT
GTTCAGAGAACCAAAAACCAAATCCACACACAAGTCATTACAATAACAGATCTAGTCATA
TGAATCTGGCAAAACCAAAGCAAACAAGAATCAGACAGATCTCAAGCCTCACTCTTCTCC
GTCTCAGAAGTCGCGTCGTCTTTCGCACCGTTCTCCACCGCTTCGTTGTTGGCAGCAGAT
CGATCTTTCACAGTCTCAAGCATCCTTTTGCTGATCTCTTTGGAATAAACCTCGAGGATC
TTGATCCCGTCGTCATCGTCAGACACGGCGCTCGACGCGACGCCGTACGCTTCCTCCTCG
ATGGATTTCGCGACGGCGGAAGCTTCGTCGGAGCTGAGCGTTCCGTATCTCTTGGAGAGG
ATGGACTCGGTGGATAGCGTCTCGATCAGGCGGTTCAAGACGGCGTCGCGAGTTTTCTGC
GTCGGCGGCCAGATGCGGAGGGAGATGGATCCTGGCTTTGCGACTGATTCTTCTTCTTCC
TTCTTCAGATCTACGGCTTTGGAGGATTCGTCTGATATCTGATCTGCCGTGGCGGACATT
GCGGTGGAGTCTTCTGATTCGTGCGGCGGAGGTGAGACGGTGGTGTTGATTGATT*CGGC
GGTTTCTGCCATTTTTTTCAAAGTGAATTCAGAGGAAAATTTTCGGAGATTTCTTTTGTT
GGTTTGGTGATGTGATGAGAGGAAAGGATCAGTTGTGATC
C

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2A130JQ 158 0 0
TGGAGTCTTCTGATTCGTGCGGCGGAGGTGAGACGGTGGTGTTGATTGATTTCGGCGGTT
TCTGCCATTTTTTTCAAAGTGAATTCAGAGGAAAATTTTCGGAGATTTCTTTTGTTGGTT
TGGTGATGTGATGAGAGGAAAGGATCAGTTGTGATCTC

QA 1 158 1 158
DS 



AS 1 2

CO CL3501Contig1 440 2 1 U
GGAAGGGTTTCGATAGAACTGGAAAGTGCGAATCTTTACGCTCCTGCAGCATTCGGTCAC
TTAAGATACATCAGCAGGTTAAAGAATGTCAGGATTTCCAGGTTTGAGTTTTCTAGGCCC
AAAAAGCAAGAACGCTGTTGTAGCGGGAGGCTTGACAGCTTTTGTTTTTGGGGTATATTT
CTACACGATGAAGGCTGTTGGTGGCACGGACGAGCTTCAAATGGCTATAGACAAGTTTGA
AGACAAGAAACAGGTCGAGACCAACCCCAAGGTTCCATCGAATGTCTGATCTTCACTGGC
TTTGGTATGGTCTAATAAAACATGTTGTTTATCTCTGTCTTCCAAGTTGTTACTTTTTAC
GAGTTTGACTCGTTCCTGACATGGATTAGCATCTATGTTTGAGTCTTAAGTCCAAATCCT
TGATATTATGGTTGGTTAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F974JQ C 1
AF RR2F974TF U 1
BS 1 440 RR2F974TF

RD RR2F974JQ 440 0 0
GGAAGGGTTTCGATAGAACTGGAAAGTGCGAATCTTTACGCTCCTGCAGCATTCGGTCAC
TTAAGATACATCAGCAGGTTAAAGAATGTCAGGATTTCCAGGTTTGAGTTTTCTAGGCCC
AAAAAGCAAGAACGCTGTTGTAGCGGGAGGCTTGACAGCTTTTGTTTTTGGGGTATATTT
CTACACGATGAAGGCTGTTGGTGGCACGGACGAGCTTCAAATGGCTATAGACAAGTTTGA
AGACAAGAAACAGGTCGAGACCAACCCCAAGGTTCCATCGAATGTCTGATCTTCACTGGC
TTTGGTATGGTCTAATAAAACATGTTGTTTATCTCTGTCTTCCAAGTTGTTACTTTTTAC
GAGTTTGACTCGTTCCTGACATGGATTAGCATCTATGTTTGAGTCTTAAGTCCAAATCCT
TGATATTATGGTTGGTTAGT

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR2F974TF 440 0 0
GGAAGGGTTTCGATAGAACTGGAAAGTGCGAATCTTTACGCTCCTGCAGCATTCGGTCAC
TTAAGATACATCAGCAGGTTAAAGAATGTCAGGATTTCCAGGTTTGAGTTTTCTAGGCCC
AAAAAGCAAGAACGCTGTTGTAGCGGGAGGCTTGACAGCTTTTGTTTTTGGGGTATATTT
CTACACGATGAAGGCTGTTGGTGGCACGGACGAGCTTCAAATGGCTATAGACAAGTTTGA
AGACAAGAAACAGGTCGAGACCAACCCCAAGGTTCCATCGAATGTCTGATCTTCACTGGC
TTTGGTATGGTCTAATAAAACATGTTGTTTATCTCTGTCTTCCAAGTTGTTACTTTTTAC
GAGTTTGACTCGTTCCTGACATGGATTAGCATCTATGTTTGAGTCTTAAGTCCAAATCCT
TGATATTATGGTTGGTTAGT

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 3

CO CL3502Contig1 997 3 7 U
CTTTGATCAAAGTCTCTCCCTCTCTCTCTCCTCTCTGGCTCTTTCCATGGGAAATGCGAA
CGGCAAAGAAGAAGACGGCGATGCCACGTCACCTACGGCGATTACGAACGCCGGCGATCC
TTACTCCCACACTCGTCAACGTCGTCCTTCCTCAGAATCTATGAGCAGTTCTCCTCCGGG
AAGCCCAGCTCGATCTCCTTCTCCTTTCTTATTCGCTCCTCAGGTTCCAGTGTCTCCGTT
GCAGAGGACAAACGCCCCTCCTTCGCCTAATAAAATCCAATGGAACCAATCTCAAAGAGT
TTTTGATATTCCGGAAGAGCAAGGG*ATCCCTATTATCATTACATGGAACCAGGGAGGTA
ATGATGTGGCAGTGGAAGGATCTTGGGACAACTGGAGATCAAGGAAGAAGCTGGAGAAAT
CTGGAAAAGACCACTCAATTCTCTTTGTCCTTCCATCTGGCATATACCACTACAAAGTGA
TCGTCGACGGTGGATGCAAATACATCCCAGATTTGCCCTTTGTATCAGACGAAATGGGCA
ATGTCTTTAACATTCTCGATGTTCATAACTTTGTGCCAGAAAACCCAGAAAACATAGCTG
AGTTTGAGGCACCTCCTCCACCAGATCATAGCTACGGACAAGCCCTCCCAACAGCAGAGG
ATTTCACAAAAGATCCACTCGCGGTGCCACCTCAGCTTCGTCTAACACTTGTGGACACTA
GTGACGAAACAGCCAAAGCCACAAAGCCTCAGCATGTGGTGCTTAACCATGTGTTCATAG
AGCAAGGGTGGAGTCCTCAATCCATTGTAGCTTTGGGTTTAACTCACAGGTTCGAGTCTA
AGTACATAACTGTTGTCCTCTACAAACCACTCACACGGTGAACCTAAAGCCCAAATCCAA
TGCCACATTGTCTTCCTTTCTTTTCTTTTTTAATTAATCTGTAACTCTGTGGGAACTTGT
TCGTTGTTGATAGTGAGTGCACAACATTTCTGAGTCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF81TF U 1
AF RR2DJ46TF U 4
AF RR2BF81JQ C 207
BS 1 91 RR2BF81TF
BS 92 92 RR2DJ46TF
BS 93 720 RR2BF81TF
BS 721 733 RR2DJ46TF
BS 734 735 RR2BF81JQ
BS 736 801 RR2DJ46TF
BS 802 997 RR2BF81JQ

RD RR2BF81TF 720 0 0
CTTTGATCAAAGTCTCTCCCTCTCTCTCTCCTCTCTGGCTCTTTCCATGGGAAATGCGAA
CGGCAAAGAAGAAGACGGCGATGCCACGTCATCTACGGCGATTACGAACGCCGGCGATCC
TTACTCCCACACTCGTCAACGTCGTCCTTCCTCAGAATCTATGAGCAGTTCTCCTCCGGG
AAGCCCAGCTCGATCTCCTTCTCCTTTCTTATTCGCTCCTCAGGTTCCAGTGTCTCCGTT
GCAGAGGACAAACGCCCCTCCTTCGCCTAATAAAATCCAATGGAACCAATCTCAAAGAGT
TTTTGATATTCCGGAAGAGCAAGGG*ATCCCTATTATCATTACATGGAACCAGGGAGGTA
ATGATGTGGCAGTGGAAGGATCTTGGGACAACTGGAGATCAAGGAAGAAGCTGGAGAAAT
CTGGAAAAGACCACTCAATTCTCTTTGTCCTTCCATCTGGCATATACCACTACAAAGTGA
TCGTCGACGGTGGATGCAAATACATCCCAGATTTGCCCTTTGTATCAGACGAAATGGGCA
ATGTCTTTAACATTCTCGATGTTCATAACTTTGTGCCAGAAAACCCAGAAAACATAGCTG
AGTTTGAGGCACCTCCTCCACCAGATCATAGCTACGGACAAGCCCTCCCAACAGCAGAGG
ATTTCACAAAAGATCCACTCGCGGTGCCACCTCAGCTTCGTCTAACACTTGTGGACACTA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2DJ46TF 798 0 0
G
GATCAAAGTCTCTCCCTCTCTCTCTCCTCTCTGGCTCTTTCCATGGGAAATGCGAACGGC
AAAGAAGAAGACGGCGATGCCACGTCACCTACGGCGATTACGAACGCCGGCGATCCTTAC
TCCCACACTCGTCAACGTCGTCCTTCCTCAGAATCTATGAGCAGTTCTCCTCCGGGAAGC
CCAGCTCGATCTCCTTCTCCTTTCTTATTCGCTCCTCAGGTTCCAGTGTCTCCGTTGCAG
AGGACAAACGCCCCTCCTTCGCCTAATAAAATCCAATGGAACCAATCTCAAAGAGTTTTT
GATATTCCGGAAGAGCAAGGG*ATCCCTATTATCATTACATGGAACCAGGGAGGTAATGA
TGTGGCAGTGGAAGGATCTTGGGACAACTGGAGATCAAGGAAGAAGCTGGAGAAATCTGG
AAAAGACCACTCAATTCTCTTTGTCCTTCCATCTGGCATATACCACTACAAGGTGATCGT
CGACGGTGAATGCAAATACATCCCAGATTTGCCCTTTGTATCAGACGAAATGGGCAATGT
CTTTAACATTCTCGATGTTCATAACTTTGTGCCAGAAAACCCAGAAAGCATAGCTGAGTT
TGAGGCACCTCCTTCACCTGATCATAGCTACGGACAAGCCCTCCCAACAGCAGAGGATTT
CACAAAAGATCCACTCGCGGTGCCACCTCAGCTTCGTCTAACGCTTGTGGACACTAGTGA
CGAAACAGC**AAGCCACAAAGCCTCAGCATGTGGTGCTTAACCATGTGTTCATAGAGCA
AGGGTGGAGTCCTCAAT

QA 2 798 2 798
DS 

RD RR2BF81JQ 791 0 0
TCTTATTCGCTCCTCAGGTTCCAGTGTCTCCGTTGCAGAGGACAAACGCCCCTCCTTCGC
CTAATAAAATCCAATGGAACCAATCTCAAAGAGTTTTTGATATTCCGGAAGAGCAAGGGG
ATCCCTATTATCATTACATGGAACCAGGGAGGTAATGATGTGGCAGTGGAAGGATCTTGG
GACAACTGGAGATCAAGGAAGAAGCTGGAGAAATCTGGAAAAGACCACTCAATTCTCTTT
GTCCTTCCATCTGGCATATACCACTACAAAGTGATCGTCGACGGTGGATGCAAATACATC
CCAGATTTGCCCTTTGTATCAGACGAAATGGGCAATGTCTTTAACATTCTCGATGTTCAT
AACTTTGTGCCAGAAAACCCAGAAAACATAGCTGAGTTTGAGGCACCTCCTCCACCAGAT
CATAGCTACGGACAAGCCCTCCCAACAGCAGAGGATTTCACAAAAGATCCACTCGCGGTG
CCACCTCAGCTTCGTCTAACACTTGTGGACACTAGTGACGAAACAGGCAAAGCCACAAAG
CCTCAGCATGTGGTGCTTAACCATGTGTTCATAGAGCAAGGGTGGAGTCCTCAATCCATT
GTAGCTTTGGGTTTAACTCACAGGTTCGAGTCTAAGTACATAACTGTTGTCCTCTACAAA
CCACTCACACGGTGAACCTAAAGCCCAAATCCAATGCCACATTGTCTTCCTTTCTTTTCT
TTTTTAATTAATCTGTAACTCTGTGGGAACTTGTTCGTTGTTGATAGTGAGTGCACAACA
TTTCTGAGTCT

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 3

CO CL3503Contig1 895 3 3 U
GGACGAACGGAGGCAAAAGCCGATTCCACGTTTCCATCGTCTCTGAATCTGTTAATAATC
TCTCTCTCTCTCTCGTTCAGGGGAAAACTTTCGTAAAGATTTGGTAGAATCGTGATGGGT
TTATCAAAAGGTAGATTGAAAGCCTGGTTCAATAAGAAAATCACCGATCCTCTCCTCCAG
ATCTTGCGGAGAGGTACTGAGCCTAAGCAGCTTGCTTTCTCCGCTGCACTCGGTATTACC
TTGGGGATATTTCCGATATGCGGTGTTCCTGTGTTTCTATGTGGAGTAGCTATTGCGTTT
CTTGGATCTGCTTGTCATGCTCCTACTGTGATGTTGGCTAACATCATTGCCACTCCAGCT
GAACTTGCTCTCGTGGTGCCTTTCCTAAGACTTGGTGAGAAAGTCACCGGTGGACCTCAT
TTTCCTTTGACATCAGATGCCCTCAAGAAGGTTTTCACTGGTCAAGCCTCCCAGGAAGTC
TTTTTAAACATTGGTAATGCGTTACTAGGGTGGCTTGTAGCAACTCCATTCTTCTTTATT
GCGCTGTACGTTGTGTTGCTTCCGTGTTTCAAGATCCTTGTTCGCAAGTTTGGCGCAGCT
GCTTCAACCCCAAAAATACCAATAAGTATGGAGACAGAGCTCAACCCGAAGCCAAGAGTC
GCTTAGGTTCAACAAGAGTTAGGGTTCTCATTTTTCTGTTAACCCTTGAATTGTAACACT
GAGAGATGCATAGACGACCTAATGTATAGGGGGACACGATTGTACTATCAAATCCTCGCA
CTTTTGTTCAAAAACCTCCTTTAGAAAGTGTCGGCTACCGAAAATATTGGAGGGTTACAT
ATTAATCATTGTATCAAACATAAGCATCAAGTCCATTTCTTGTGTTTTTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ86TF U 1
AF RR2CD30TF U 26
AF RR2GJ86JQB C 148
BS 1 588 RR2GJ86TF
BS 589 665 RR2CD30TF
BS 666 895 RR2GJ86JQB

RD RR2GJ86TF 588 0 0
GGACGAACGGAGGCAAAAGCCGATTCCACGTTTCCATCGTCTCTGAATCTGTTAATAATC
TCTCTCTCTCTCTCGTTCAGGGGAAAACTTTCGTAAAGATTTGGTAGAATCGTGATGGGT
TTATCAAAAGGTAGATTGAAAGCCTGGTTCAATAAGAAAATCACCGATCCTCTCCTCCAG
ATCTTGCGGAGAGGTACTGAGCCTAAGCAGCTTGCTTTCTCCGCTGCACTCGGTATTACC
TTGGGGATATTTCCGATATGCGGTGTTCCTGTGTTTCTATGTGGAGTAGCTATTGCGTTT
CTTGGATCTGCTTGTCATGCTCCTACTGTGATGTTGGCTAACATCATTGCCACTCCAGCT
GAACTTGCTCTCGTGGTGCCTTTCCTAAGACTTGGTGAGAAAGTCACCGGTGGACCTCAT
TTTCCTTTGACATCAGATGCCCTCAAGAAGGTTTTCACTGGTCAAGCCTCCCAGGAAGTC
TTTTTAAACATTGGTAATGCGTTACTAGGGTGGCTTGTAGCAACTCCATTCTTCTTTATT
GCGCTGTACGTTGTGTTGCTTCCGTGTTTCAAGATCCTTGTTCGCAAG

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2CD30TF 643 0 0
GG
ACGTTTCCATCGTCTCTGAATCTGTTAATAATCTCTCTCTCTCTCTCGTTCAGGGGAAAA
CTTTCGTAAAGATTTGGTAGAATCGTGATGGGTTTATCAAAAGGTAGATTGAAAGCCTGG
TTCAATAAGAAAATCACCGATCCTCTCCTCCAGATCTTGCGGAGAGGTACTGAGCCTAAG
CAGCTTGCTTTCTCCGCTGCACTCGGTATTACCTTGGGGATATTTCCGATATGCGGTGTT
CCTGTGTTTCTATGTGGAGTAGCTATTGCGTTTCTTGGATCTGCTTGTCATGCTCCTACT
GTGATGTTGGCTAACATCATTGCCACTCCAGCTGAACTTGCTCTCGTGGTGCCTTTCCTA
AGACTTGGTGAGAAAGTCACCGGTGGACCTCATTTTCCTTCGACATCAGATGCCCTCAAG
AAGGTTTTCACTGGTCAAGCCTCCCAGGAAGTCTTTTTAAGCATTGGTAATGCGTTACTA
GGGTGGCTTGTAGCAACTCCATTCTTCTTTATTGCGCTGTACGTTGTGTTGCTTCCGTGT
TTCAAGATCCTTGTTCGCAAGTTTGGCGCAGCTGCTTCAACCCCAAAAATACCAATAAGT
ATGGAGACAGAGCTCAACCCGAAGCCAAGAGTCGCTTA
TGT

QA 3 640 3 640
DS 

RD RR2GJ86JQB 748 0 0
TTCAATAAGAAAATCACCGATCCTCTCCTCCAGATCTTGCGGAGAGGTACTGAGCCTAAG
CAGCTTGCTTTCTCCGCTGCACTCGGTATTACCTTGGGGATATTTCCGATATGCGGTGTT
CCTGTGTTTCTATGTGGAGTAGCTATTGCGTTTCTTGGATCTGCTTGTCATGCTCCTACT
GTGATGTTGGCTAACATCATTGCCACTCCAGCTGAACTTGCTCTCGTGGTGCCTTTCCTA
AGACTTGGTGAGAAAGTCACCGGTGGACCTCATTTTCCTTTGACATCAGATGCCCTCAAG
AAGGTTTTCACTGGTCAAGCCTCCCAGGAAGTCTTTTTAAACATTGGTAATGCGTTACTA
GGGTGGCTTGTAGCAACTCCATTCTTCTTTATTGCGCTGTACGTTGTGTTGCTTCCGTGT
TTCAAGATCCTTGTTCGCAAGTTTGGCGCAGCTGCTTCAACCCCAAAAATACCAATAAGT
ATGGAGACAGAGCTCAACCCGAAGCCAAGAGTCGCTTAGGTTCAACAAGAGTTAGGGTTC
TCATTTTTCTGTTAACCCTTGAATTGTAACACTGAGAGATGCATAGACGACCTAATGTAT
AGGGGGACACGATTGTACTATCAAATCCTCGCACTTTTGTTCAAAAACCTCCTTTAGAAA
GTGTCGGCTACCGAAAATATTGGAGGGTTACATATTAATCATTGTATCAAACATAAGCAT
CAAGTCCATTTCTTGTGTTTTTTTTTTC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 3

CO CL3504Contig1 984 3 10 U
GTTCAGTGGAATACGAAATTGATTACTACGTCTTTAAAAATAGATACAATCTCATAAATA
GTACAATACACAATGCAAGAGTACTATGTTACAACAACAAATGAATATGCGGAAAAGTTA
CAACACTCCAAGAATCTCCCGTTCTTTTGGACAGAACTACCAATATAAACAGGAAAAGAA
TTTACGGTTCCGGCTGTTAAGATATTGACTGAGTCACGCCCAGGAAAAGACATTATCAAC
AGCGAGAAGATGTGATCACATAAGTAGAAGAGAGGCAAAAACCATTGCAAAAACAGAAAG
GAGAAGAGATAGAGTGAGTCTGGTTTGTCCACTAGGTGGCGGTGCAGTGGTTGATGGTGT
TCCAGGAGTTGCGGTTGGGGCTTTTGCTGTTACCGGAGGTAGTGGTGGCTCAGTGACATC
AGCATCTGTGAAAACAGGGTTTGGAGCTTCAGCTGGAGGTAAGACCGCAGGACTCACAAC
TTTTAAAAGGCCACCCGGTTCGACAGGGGCCATGTAAGATGGAGTTTCTTTGCTGGCCAA
ACATCGATTCCTTCTGTATCTTGCAGCTGTGAATGGGAACTCGGTGATGGTTCCATTTAT
ACCGGGTCCAGTGACATAAGAGTTTATCTCAACAGTTGCGTCAGAGAAGAAGTCATACGG
TTGAGATATAAACTCATTCCGGAACAGCTCCACGTAAACTGGGAGCCGAGACTTCTGTAG
CCTCTCCACCACATTTGTTTGCCCAGTGACGAACCCACCAACGACCGGAAAGACTGATTT
CTTCAAGATATTCACAGCGACCCCTATGGTGGTCGATCCACACACATAATTGCCTTATAG
CTTCTCTTTTCTCTTCTCCAAGTCCCATCAGAGTCTCCTTCATCGTCTCCTTCTCCTTTT
CATCTGCTCGTACCTTTTCTCCAAGTTTCTTCATCTCCTCCTCTTTCCTCTCCATCTCTT
CCTTCATCTTCTCCTTCTCGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D403JQ U 13
AF RR2AZ64JQ U 1
AF RR2AZ64TFB C 186
BS 1 37 RR2AZ64JQ
BS 38 38 RR2D403JQ
BS 39 160 RR2AZ64JQ
BS 161 161 RR2D403JQ
BS 162 891 RR2AZ64JQ
BS 892 892 RR2AZ64TFB
BS 893 899 RR2AZ64JQ
BS 900 900 RR2AZ64TFB
BS 901 913 RR2AZ64JQ
BS 914 984 RR2AZ64TFB

RD RR2D403JQ 244 0 0
ACGAAGTTGATTACTACGTCTTTAAAAATAGATACAATCTCATAAATAGTACAATACACA
ATGCAAGAGTACTATGTTACAACAACAAATGAATATGCGGAAAAGTTACAACACTCCAAG
AATCTCCTGTTCTTTTGGACAGAACTACCAATATAAACAGGAAAAGAATTTACGGTTCCG
GCTGTTAAAATATTGACTGAGTCACGCCCAGGAAAAGACATTATCAACAGCGAGAAAATG
TGAT

QA 1 244 1 244
DS 

RD RR2AZ64JQ 914 0 0
GTTCAGTGGAATACGAAATTGATTACTACGTCTTTAAGAATAGATACAATCTCATAAATA
GTACAATACACAATGCAAGAGTACTATGTTACAACAACAAATGAATATGCGGAAAAGTTA
CAACACTCCAAGAATCTCCCGTTCTTTTGGACAGAACTACGAATATAAACAGGAAAAGAA
TTTACGGTTCCGGCTGTTAAGATATTGACTGAGTCACGCCCAGGAAAAGACATTATCAAC
AGCGAGAAGATGTGATCACATAAGTAGAAGAGAGGCAAAAACCATTGCAAAAACAGAAAG
GAGAAGAGATAGAGTGAGTCTGGTTTGTCCACTAGGTGGCGGTGCAGTGGTTGATGGTGT
TCCAGGAGTTGCGGTTGGGGCTTTTGCTGTTACCGGAGGTAGTGGTGGCTCAGTGACATC
AGCATCTGTGAAAACAGGGTTTGGAGCTTCAGCTGGAGGTAAGACCGCAGGACTCACAAC
TTTTAAAAGGCCACCCGGTTCGACAGGGGCCATGTAAGATGGAGTTTCTTTGCTGGCCAA
ACATCGATTCCTTCTGTATCTTGCAGCTGTGAATGGGAACTCGGTGATGGTTCCATTTAT
ACCGGGTCCAGTGACATAAGAGTTTATCTCAACAGTTGCGTCAGAGAAGAAGTCATACGG
TTGAGATATAAACTCATTCCGGAACAGCTCCACGTAAACTGGGAGCCGAGACTTCTGTAG
CCTCTCCACCACATTTGTTTGCCCAGTGACGAACCCACCAACGACCGGAAAGACTGATTT
CTTCAAGATATTCACAGCGACCCCTATGGTGGTCGATCCACACACATAATTGCCTTATAG
CTTCTCTTTTCTCTTCTCCAAGTCCCATCAGAGTCTCCTTCATCGTCTCCT*CTCCTTT*
CATCTGCTCGTAC
T

QA 1 913 1 913
DS 

RD RR2AZ64TFB 799 0 0
GGTTCCGGCTGTTAAGATATTGACTGAGTCACGCCCAGGAAAAGACATTATCAACAGCGA
GAAGATGTGATCACATAAGTAGAAGAGAGGCAAAAACCATTGCAAAAACAGAAAGGAGAA
GAGATAGAGTGAGTCTGGTTTGTCCACTAGGTGGCGGTGCAGTGGTTGATGGTGTTCCAG
GAGTTGCGGTTGGGGCTTTTGCTGTTACCGGAGGTAGTGGTGGCTCAGTGACATCAGCAT
CTGTGAAAACAGGGTTTGGAGCTTCAGCTGGAGGTAAGACCGCAGGACTCACAACTTTTA
AAAGGCCACCCGGTTCGACAGGGGCCATGTAAGATGGAGTTTCTTTGCTGGCCAAACATC
GATTCCTTCTGTATCTTGCAGCTGTGAATGGGAACTCGGTGATGGTTCCATTTATACCGG
GTCCAGTGACATAAGAGTTTATCTCAACAGTTGCGTCAGAGAAGAAGTCATACGGTTGAG
ATATAAACTCATTCCGGAACAGCTCCACGTAAACTGGGAGCCGAGACTTCTGTAGCCTCT
CCACCACATTTGTTTGCCCAGTGACGAACCCACCAACGACCGGAAAGACTGATTTCTTCA
AGATATTCACAGCGACCCCTATGGTGGTCGATCCACACACATAATTGCCTTATAGCTTCT
CTTTTCTCTTCTCCAAGTCCCATCAGAGTCTCCTTCATCGTCTCCTTCTCCTTTTCATCT
GCTCGTACCTTTTCTCCAAGTTTCTTCATCTCCTCCTCTTTCCTCTCCATCTCTTCCTTC
ATCTTCTCCTTCTCGTGAC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 3

CO CL3505Contig1 505 3 1 U
GGAACCATCGAATCAATAAATGTAAAATTCAAAGGAAAAAAAAATAAACTTGTTTGTAAC
GTAAGAATATTATAAAGAACAATATGTCGTCATCACAGTTCGTTATCTTTTGTATTATCT
TGATTACTTTATTTCCTCATCATGAATTTGTTGATGGCCAAGTTCTTGGTGTGGGTAAAG
AAGCTTGTAAGCAAATCAAATGCGGCGAAAACAATACACTTAATTGTAATTGTTGTGTCT
CCAATGATGGGAATCAGTACAGGTGTTACGCTGAGATGGGATTTTGTAAAGAAATGTGCG
GAAAGATGTTATAAGCTATTCGGAGAACCTACATCAGAGATTATAAATACCTGGATGAAT
AATTTATTTAATACCTTATATCTACTTTCGTTTTCCATTAGTCCAACAAATTCAGTTTAT
GCCTATTGTATTTAGTGTTAGAGACTTTCATATTCTATGTAATGCACAATGGTTTAAGTA
TCTTAACTTCATAGTTTGTTATGAG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E264TF U 1
AF RR2BN73JQ C 1
AF RR2BN73TF U 1
BS 1 505 RR2BN73TF

RD RR2E264TF 478 0 0
GGAACCATCGAATCAATAAATGTAAAATTCAAAAGAAAAAAAAATAAACTTGTTTGTAAC
GTAAGAATATTATAAAGAACAATATGTCGTCATCACAGTTCGTTATCTTTTGTATTATCT
TGATTACTTTATTTCCTCATCATGAATTTGTTGATGGCCAAGTTCTTGGTGTGGGTAAAG
AAGCTTGTAAGCAAATCAAATGCGGCGAAAACAATACACTTAATTGTAATTGTTGTGTCT
CCAATGATGGGAATCAGTACAGGTGTTACGCTGAGATGGGATTTTGTAAAGAAATGTGCG
GAAAGATGTTATAAGCTATTCGGAGAACCTACATCAGAGATTATAAATACCTGGATGAAT
AATTTATTTAATATCTTATATCTACTTTCGTTTTCCATTAGTCCAACAAATTCAGTTTAT
GCCTATTGTATTTAGTGTTAGAGACTTTCATATTCTATGTAATGCACAATGGTTTAAG

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2BN73JQ 505 0 0
GGAACCATCGAATCAATAAATGTAAAATTCAAAGGAAAAAAAAATAAACTTGTTTGTAAC
GTAAGAATTTTATAAAGAACAATATGTCGTCATCACAGTTCGTTATCTTTTGTATTATCT
TGATTACTTTATTTCCTCATCATGAATTTGTTGATGGCCAAGTTCTTGGTGTGGGTAAAG
AAGCTTGTAAGCAAATCAAATGCGGCGAAAACAATACACTTAATTGTAATTGTTGTGTCT
CCAATGATGGGAATCAGTACAGGTGTTACGCTGAGATGGGATTTTGTAAAGAAATGTGCG
GAAAGATGTTATAAGCTATTCGGAGAACCTACATCAGAGATTATAAATACCTGGATGAAT
AATTTATTTAATACCTTATATCTACTTTCGTTTTCCATTAGTCCAACAAATTCAGTTTAT
GCCTATTGTATTTAGTGTTAGAGACTTTCATATTCTATGTAATGCACAATGGTTTAAGTA
TCTTAACTTCATAGTTTGTTATGAG

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR2BN73TF 505 0 0
GGAACCATCGAATCAATAAATGTAAAATTCAAAGGAAAAAAAAATAAACTTGTTTGTAAC
GTAAGAATATTATAAAGAACAATATGTCGTCATCACAGTTCGTTATCTTTTGTATTATCT
TGATTACTTTATTTCCTCATCATGAATTTGTTGATGGCCAAGTTCTTGGTGTGGGTAAAG
AAGCTTGTAAGCAAATCAAATGCGGCGAAAACAATACACTTAATTGTAATTGTTGTGTCT
CCAATGATGGGAATCAGTACAGGTGTTACGCTGAGATGGGATTTTGTAAAGAAATGTGCG
GAAAGATGTTATAAGCTATTCGGAGAACCTACATCAGAGATTATAAATACCTGGATGAAT
AATTTATTTAATACCTTATATCTACTTTCGTTTTCCATTAGTCCAACAAATTCAGTTTAT
GCCTATTGTATTTAGTGTTAGAGACTTTCATATTCTATGTAATGCACAATGGTTTAAGTA
TCTTAACTTCATAGTTTGTTATGAG

QA 1 505 1 505
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3507Contig1 1025 3 6 U
CCAATCAATCGCATAAAACTTATAGAGAGAGAGAAAGATGTCGGCAGAGGAAGAAACCGT
TCCAACCAACGTCGAAGAGACGGTGACTGCACCGGCGGCGAGTGAGAAGAAAGCGAAGAA
GACGAAGGAAGCTAAAGCTCCGAAGAAGAAGCCTGCTGCTCCAAGGAAGAGATCTTCTTC
ATCTCACCCTACCTACGAAGAGATGATTAAAGATGCGATCACGACGTTGAAGGAGAGAAC
CGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATAGAGGAGAAGCAGAAGACGCTTCCTCC
AACGTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTCAATCTCAAGAGACTCGTCGCTTCAGGGAAGCTCGT
CAAAGTCAAAGGCTCCTTCAAGCTCCCCTCCTCCGCTACTAAATCAACCGCCGTTGCTGC
TGCTCCTAAACCGGTGGCTCCGGTTAAGAAGAAGGCGACCGTAGCTAAACCGAAGGCTGT
TAAAGTTGCTAAACCGGCAGCGAAAGGATCCAAGAAGACCAAAGCTGCTGTAGCTGTGAA
ACCAAAGGCTAAAGTCGCTGCTAAACCTAAACCGAAGACGAAGACTGTAGCGGCTGTGTC
CAAGACTAAAGCTGTTGCTGCTGCTGCTAAGCCTAAGGCTAAAGAGAGACCTGCTAAAGC
GGCGAGGACTTCGACTAGAACTTCTCCAGGGAAGAAGGCTGCTCCTGCTGCTGCTAAGAA
AGCAGCGGCTGTAACTAAGAAGGCTCCGGCTAAGAGCGTGAAGGCGAAGGCTGTGAAGTC
TCCGGCGAAGAGGGTTTCAACGAGGAAGGTGAAGAATTGAAAGAAGATGGGGGGGTTTAG
GGTAGTGAATTGGGGGAGATTGAATGAATGAATGAATACATGGGTTGTAATGGTGGTTAG
AGCTTCTCTTAGGGTGTAGTCTTTGTATAATTTGAACCATATCCTTTGAAGAAGCTTTTT
GCTTTTATCTTCGTTTCTGGTTTCTTCTTGAAACCCTTTTGTTGTAATTTTTTGTGTTTG
TTTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2GS49TF U 1
AF RR2FC13TF U 1
AF RR2GS49JQB C 490
BS 1 280 RR2FC13TF
BS 281 281 RR2GS49TF
BS 282 576 RR2FC13TF
BS 577 577 RR2GS49JQB
BS 578 616 RR2FC13TF
BS 617 1025 RR2GS49JQB

RD RR2GS49TF 508 0 0
CCAATCAATCGCATAAAACTTATAGAGAGAGAGAAAGATGTCGGCAGAGGAAGAAACCGT
TCCAACCAACGTCGAAGAGACGGTGACTGCACCGGCGGCGAGTGAGAAGAAAGTGAAGAA
GACGAAGGAAGCTAAAGCTCCGAAGAAGAAGCCTGCTGCTCCAAGGAAGAGATCTTCTTC
ATCTCACCCTACCTACGAAGAGATGATTAAAGATGCGATCACGACGTTGAAGGAGAGAAC
CGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATAGAGGAGAAGCAGAAGACGCTTCCTCC
AACGTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTCAATCTCAAGAGACTCGTCGCTTCAGGGAAGCTCGT
CAAAGTCAAAGGCTCCTTCAAGCTCCCCTCCTCCGCTACTAAATCAACCGCCGTTGCTGC
TGCTCCTAAACCGGTGGCTCCGGTTAAGAAGAAGGCGACCGTAGCTAAACCGAAGGCTGT
TAAAGTTGCTAAACCGGCAGCGAAAGGA

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2FC13TF 616 0 0
CCAATCAATCGCATAAAACTTATAGAGAGAGAGAAAGATGTCGGCAGAGGAAGAAACCGT
TCCAACCAACGTCGAAGAGACGGTGACTGCACCGGCGGCGAGTGAGAAGAAAGCGAAGAA
GACGAAGGAAGCTAAAGCTCCGAAGAAGAAGCCTGCTGCTCCAAGGAAGAGATCTTCTTC
ATCTCACCCTACCTACGAAGAGATGATTAAAGATGCGATCACGACGTTGAAGGAGAGAAC
CGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATAGAGGAGGAGCAGAAGACGCTTCCTCC
AACGTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTCAATCTCAAGAGACTCGTCGCTTCAGGGAAGCTCGT
CAAAGTCAAAGGCTCCTTCAAGCTCCCCTCCTCCGCTACTAAATCAACCGCCGTTGCTGC
TGCTCCTAAACCGGTGGCTCCGGTTAAGAAGAAGGCGACCGTAGCTAAACCGAAGGCTGT
TAAAGTTGCTAAACCGGCAGCGAAAGGATCCAAGAAGACCAAAGCTGCTGTAGCTGTGAA
ACCAAAGGCTAAAGTCGCTGCTAAACCTAAACCGAATACGAAGACTGTAGCGGCTGTGTC
CAAGACTAAAGCTGTT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2GS49JQB 536 0 0
TAAACCGGCAGCGAAAGGATCCAAGAAGACCAAAGCTGCTGTAGCTGTGAAACCAAAGGC
TAAAGTCGCTGCTAAACCTAAACCGAAGACGAAGACTGTAGCGGCTGTGTCCAAGACTAA
AGCTGTTGCTGCTGCTGCTAAGCCTAAGGCTAAAGAGAGACCTGCTAAAGCGGCGAGGAC
TTCGACTAGAACTTCTCCAGGGAAGAAGGCTGCTCCTGCTGCTGCTAAGAAAGCAGCGGC
TGTAACTAAGAAGGCTCCGGCTAAGAGCGTGAAGGCGAAGGCTGTGAAGTCTCCGGCGAA
GAGGGTTTCAACGAGGAAGGTGAAGAATTGAAAGAAGATGGGGGGGTTTAGGGTAGTGAA
TTGGGGGAGATTGAATGAATGAATGAATACATGGGTTGTAATGGTGGTTAGAGCTTCTCT
TAGGGTGTAGTCTTTGTATAATTTGAACCATATCCTTTGAAGAAGCTTTTTGCTTTTATC
TTCGTTTCTGGTTTCTTCTTGAAACCCTTTTGTTGTAATTTTTTGTGTTTGTTTTG

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 3

CO CL3508Contig1 504 3 1 U
GTGAAAAATATAAAGTTTATCAAATCAAATCTCTTTCTATCAGTTTACACGCTTCACATA
GACGTACCCTCAGAGAGTTTTTTTTT*GTTTGTTTAATAATGATACAAACCAACAAAAAC
GAAAACGAAAATGACACATTACAAAACAGAGCTATAGATTAAAACACGCAGATACTGTGA
TGAAACAGCATCTTCTTCTTCTTCCTCTAGTCAACATGGCCGCAAAGCTTTGATTATGGA
ATGTATATCTAAAAAGATATACACACCCGTTGTCTTTAGTTTTGGGATCTTCTGTGCAAA
CTTGGTTTTAGCCAGCCATCCTAGAAACCGAAGTCAATTGGTTGGCTTCTTATTGGAGGA
TACGTTACTTGCTGCCTCCCCGTTGCTGCATTCTCTGTTGGTTTCACTGTTGTTGTAACG
GATTCAGGCGGCGGTGGCTGCGGCATTGTTTGGCTATTACCTTCTGTGGCGGCTAGAACT
GTCTCTGTGTTTGGAGTTGAAGAC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H531JQB U 1
AF RR2BT20JQ U 1
AF RR2BT20TF C 1
BS 1 504 RR2BT20JQ

RD RR2H531JQB 327 0 0
GTGAAAAATATAAAGTTTATCAAATCAAATCTCTTTCTATCAGTTTACACGCTTCACATA
GACGTACCCTCAGAGAGTTTTTTTTTTGTTTGTTTAATAATGATACAAACCAACAAAAAC
GAAAACGAAAATGACACATTACAAAACAGAGCTATAGATTAAAACACGCAGATACTGTGA
TGAAACGGCATCTTCTTCTTCTTCCTCTAGTCAACATGGCCGCAAAGCTTTGATTATGGA
ATGTATATCTAAAAAGATATACACACCCGTTGTCTTTAGTTTTGGGATCTTCTGTGCAAA
CTTGGTTTTAGCCAGCCATCCTA
AAAA

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR2BT20JQ 504 0 0
GTGAAAAATATAAAGTTTATCAAATCAAATCTCTTTCTATCAGTTTACACGCTTCACATA
GACGTACCCTCAGAGAGTTTTTTTTT*GTTTGTTTAATAATGATACAAACCAACAAAAAC
GAAAACGAAAATGACACATTACAAAACAGAGCTATAGATTAAAACACGCAGATACTGTGA
TGAAACAGCATCTTCTTCTTCTTCCTCTAGTCAACATGGCCGCAAAGCTTTGATTATGGA
ATGTATATCTAAAAAGATATACACACCCGTTGTCTTTAGTTTTGGGATCTTCTGTGCAAA
CTTGGTTTTAGCCAGCCATCCTAGAAACCGAAGTCAATTGGTTGGCTTCTTATTGGAGGA
TACGTTACTTGCTGCCTCCCCGTTGCTGCATTCTCTGTTGGTTTCACTGTTGTTGTAACG
GATTCAGGCGGCGGTGGCTGCGGCATTGTTTGGCTATTACCTTCTGTGGCGGCTAGAACT
GTCTCTGTGTTTGGAGTTGAAGAC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2BT20TF 504 0 0
GTGAAAAATATAAAGTTTATCAAATCAAATCTCTTTCTATCAGTTTACACGCTTCACATA
GACGTACCCTCAGAGAGTTTTTTTTT*GTTTGTTTAATAATGATACAAACCAACAAAAAC
GAAAACGAAAATGACACATTACAAAACAGAGCTATAGATTAAAACACGCAGATACTGTGA
TGAAACAGCATCTTCTTCTTCTTCCTCTAGTCAACATGGCCGCAAAGCTTTGATTATGGA
ATGTATATCTAAAAAGATATACACACCCGTTGTCTTTAGTTTTGGGATCTTCTGTGCAAA
CTTGGTTTTAGCCAGCCATCCTAGAAACCGAAGTCAATTGGTTGGCTTCTTATTGGAGGA
TACGTTACTTGCTGCCTCCCCGTTGCTGCATTCTCTGTTGGTTTCACTGTTGTTGTAACG
GATTCAGGCGGCGGTGGCTGCGGCATTGTTTGGCTATTACCTTCTGTGGCGGCTAGAACT
GTCTCTGTGTTTGGAGTTGAAGAC

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL3509Contig1 1001 2 8 U
GGACAAAAACTCAACTCAACTCATCTTATAATTATTCTCTCAGAAAAAGAAACCAAAACC
CAATTTCGTTACCTCTTCCCTCAATCCATAGGTCAAAAAATCATCAAGCTTTAAGCTCAA
AAACTCGATCTAGAACTGGTTTGGAGAAGATGGGCTCTGAAGGACCAAAAGCAATAACGA
TTCACGTGACTGGCTTCAAGAGGTTCCTTGGTGTTTCCGAAAACCCTACCGAGAAAATCG
CTACTAATCTGAAATCATATGTGGAGAAACGAGGGTTGCCTTCTGGGCTGACTCTTGGTA
CCTGCACTGTTCTTGAGTCTGCTGGGGAAGGTGGAAAGGCTCGGCTTTATCAGGTTCTGG
AGTCTAGTGCTGCTGCCGCCTCTGGAGAAGATAACAAGAGTACCAATGGAACTGTTGTTT
GGCTTCATCTTGGAGTGAATAGCGGATCGGAAAAATTCGCAATTGAAAGACAAGCAGTGA
ACGAAGCTCATTTCCGTTGTCCTGATCAATTAGGCTGGCAACCACAGAGGCTTCCTATAG
TTTTTGAAGATGGAAGCATTCTAAAGGCAAAAGAGACTACATGTCCAACAGAGTCGATAT
TCAATATACTAAAGAACAAAGGCTACGACGTTGTTCAATCAGACGACGCTGGACGGTTTG
TGTGCAACTACCTCTACTATCACTCCCTCAGGTTCGCTGAGCAAAAGGGACACAAGTCAC
TCTTCCTCCACGTTCCTTTGTTCTCCAAAATCGATGAAGATACTCAGATGCAGTTCGTGG
TCTCTCTCTTGGAGGCAATTGCAGCTACTTGCTAGTGTACTATTGCTAATGTGTGTAAGT
ATAAATGTATATCCTTCTACGAAGCATTGTGTTCTTTTGTTGGGGGAGTGTGCTTGGTTG
TATTGTAGCTTGTGATAAAAAAAAAAGACTTAATTGCTTTTGGCTCTGAAACTTTCTGGG
TCTTGTAAAGCACACGATTAGGAAAGAAAGAGCCTTTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES20TF U 1
AF RR2ES20JQ C 361
BS 1 691 RR2ES20TF
BS 692 692 RR2ES20JQ
BS 693 741 RR2ES20TF
BS 742 742 RR2ES20JQ
BS 743 749 RR2ES20TF
BS 750 750 RR2ES20JQ
BS 751 779 RR2ES20TF
BS 780 1001 RR2ES20JQ

RD RR2ES20TF 787 0 0
GGACAAAAACTCAACTCAACTCATCTTATAATTATTCTCTCAGAAAAAGAAACCAAAACC
CAATTTCGTTACCTCTTCCCTCAATCCATAGGTCAAAAAATCATCAAGCTTTAAGCTCAA
AAACTCGATCTAGAACTGGTTTGGAGAAGATGGGCTCTGAAGGACCAAAAGCAATAACGA
TTCACGTGACTGGCTTCAAGAGGTTCCTTGGTGTTTCCGAAAACCCTACCGAGAAAATCG
CTACTAATCTGAAATCATATGTGGAGAAACGAGGGTTGCCTTCTGGGCTGACTCTTGGTA
CCTGCACTGTTCTTGAGTCTGCTGGGGAAGGTGGAAAGGCTCGGCTTTATCAGGTTCTGG
AGTCTAGTGCTGCTGCCGCCTCTGGAGAAGATAACAAGAGTACCAATGGAACTGTTGTTT
GGCTTCATCTTGGAGTGAATAGCGGATCGGAAAAATTCGCAATTGAAAGACAAGCAGTGA
ACGAAGCTCATTTCCGTTGTCCTGATCAATTAGGCTGGCAACCACAGAGGCTTCCTATAG
TTTTTGAAGATGGAAGCATTCTAAAGGCAAAAGAGACTACATGTCCAACAGAGTCGATAT
TCAATATACTAAAGAACAAAGGCTACGACGTTGTTCAATCAGACGACGCTGGACGGTTTG
TGTGCAACTACCTCTACTATCACTCCCTCAG*TTCGCTGAGCAAAAGGGACACAAGTCAC
TCTTCCTCCACGTTCCTTTGT*CTCCAAA*TCGATGAAGATACTCAGATGCAGTTCGTG
TCTCTCTC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2ES20JQ 641 0 0
AGTCTAGTGCTGCTGCCGCCTCTGGAGAAGATAACAAGAGTACCAATGGAACTGTTGTTT
GGCTTCATCTTGGAGTGAATAGCGGATCGGAAAAATTCGCAATTGAAAGACAAGCAGTGA
ACGAAGCTCATTTCCGTTGTCCTGATCAATTAGGCTGGCAACCACAGAGGCTTCCTATAG
TTTTTGAAGATGGAAGCATTCTAAAGGCAAAAGAGACTACATGTCCAACAGAGTCGATAT
TCAATATACTAAAGAACAAAGGCTACGACGTTGTTCAATCAGACGACGCTGGACGGTTTG
TGTGCAACTACCTCTACTATCACTCCCTCAGGTTCGCTGAGCAAAAGGGACACAAGTCAC
TCTTCCTCCACGTTCCTTTGTTCTCCAAAATCGATGAAGATACTCAGATGCAGTTCGTGG
TCTCTCTCTTGGAGGCAATTGCAGCTACTTGCTAGTGTACTATTGCTAATGTGTGTAAGT
ATAAATGTATATCCTTCTACGAAGCATTGTGTTCTTTTGTTGGGGGAGTGTGCTTGGTTG
TATTGTAGCTTGTGATAAAAAAAAAAGACTTAATTGCTTTTGGCTCTGAAACTTTCTGGG
TCTTGTAAAGCACACGATTAGGAAAGAAAGAGCCTTTTGTG

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 3

CO CL3510Contig1 1021 3 6 U
CGTGACTAAGTAATGACCCCTTTTGGAAGAGGTTCATATGATTGGGTTTTTTAAAAAAGG
ACACTGACATTTATTTGTACGGGTGAAAATGCAATCGTACATAAATCATATCTTTTGATC
ACACAGAGTTTCTTGAAGCTTTTTGGTTCCTTGACGTAAAGTGATTCCATCACATTATAC
AGCAATTTGGTGAAGACTCAAGCATCTCTGGAGATATTTGGCCTAGGCTTGCGAAATCAA
ACCCTGGATCCATCTCTTGGACGATATCATTAGGTGGTTGTCCACACTCTTGCATCTTCT
GCATGATCTCCATGATCTTAGTTGAATTGTTCGGTTCATCCTCGTAAACCGCATTGAGTT
CTTTGATCAGTTTGTACTGCTGCGAATAGCGGTTGTAGTCCTCTTTGCTTATACTGCCTT
CGTTCTCTTCTAGCCATTTCGGATATCTTGCACCGATCTCCTTCATCGGTTCGTGGAGGA
TATCTTTCGACAGTAGCTGTTGCATCATCGTTTCCACTATTGATTCCAAGTCCTGAGATC
CAGCGAGACTCTCGAATTGCTTGAGAAAATCCTCAACCATAGCATCCTCATCACCAGAAG
CTGCCTGCTGCTGCTTGGAAGAGATAGATTCCACAGTTTCCCTAGTTTGTTCCCTAAGCT
TGTCAAGAGCTTCTGCTACATGATCCTCTTTAGAGACTTTCTGCTTTCCCTTTCCCTTGT
TCTTTATTCTCATATCAGGTAACCCCATTCCAAGTCCTTGAACTCCACTCGGCAATGGAG
ACGGCTCTTCTTTCTTCTTCTTCTTCTCATTCCCCTCTTCGTCTTCACTATGGTTTCTTT
GAGCAAGATTGAGATCTTTGAAGTCATCCAATGCACTATCGAGAAGCTCGTCTAAGTCAT
CGGTGTGATTGCTCGCCATTTTCTTTCTTACAGCGTTTGGTCTCTGTGCGTGTGAACAAT
TCGCAGATTGGGAAGAGGAATCTCAGAAGATTGACAGAAGAAGAAACCTTTTGGTTTTTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2AA59JQ U 1
AF RR2E492JQ U 40
AF RR2AA59TF C 247
BS 1 125 RR2AA59JQ
BS 126 127 RR2E492JQ
BS 128 159 RR2AA59JQ
BS 160 160 RR2E492JQ
BS 161 615 RR2AA59JQ
BS 616 1021 RR2AA59TF

RD RR2AA59JQ 619 0 0
CGTGACTAAGTAATGACCCCTTTTGGAAGAGGTTCATATGATTGGGTTTTTTAAAAAAGG
ACACTGACATTTATTTGTACGGGTGAAAATGCAATCGTACATAAATCATATCTTTTGATC
ACACA**GTTTCTTGAAGCTTTTTGGTTCCTTGACGTAA*GTGATTCCATCACATTATAC
AGCAATTTGGTGAAGACTCAAGCATCTCTGGAGATATTTGGCCTAGGCTTGCGAAATCAA
ACCCTGGATCCATCTCTTGGACGATATCATTAGGTGGTTGTCCACACTCTTGCATCTTCT
GCATGATCTCCATGATCTTAGTTGAATTGTTCGGTTCATCCTCGTAAACCGCATTGAGTT
CTTTGATCAGTTTGTACTGCTGCGAATAGCGGTTGTAGTCCTCTTTGCTTATACTGCCTT
CGTTCTCTTCTAGCCATTTCGGATATCTTGCACCGATCTCCTTCATCGGTTCGTGGAGGA
TATCTTTCGACAGTAGCTGTTGCATCATCGTTTCCACTATTGATTCCAAGTCCTGAGATC
CAGCGAGACTCTCGAATTGCTTGAGAAAATCCTCAACCATAGCATCCTCATCACCAGAAG
CTGCCTGCTGCTGCT
TGGA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2E492JQ 589 0 0
GGTTGGCTCTTC
TAAAAAAGGACACTGACATTTATTTGTATGGGTGAAAATGCAATCGTACATAAATCATAT
CTTTTGATCACACAGAGTTTCTTGAAGCTTTTTGGTTCCTTGACGTAAAGTGATTCCATC
ACATTATACAGCAATTTGGTGAAGACTCGAGCATCTCTGGAGATATTTGGCCTAGGCTTG
CGAAATCAAACCCTGGATCCATCTCTTGGACGATATCATTAGGTGGTTGTCCACACTCTT
GCATCTTCTGCATGATCTCCATTATCTTAGTTGAATTGTTCGGTTCATCCTCGTAAACCG
CATTGAGTTCTTTGATCAGTTCGTACTGTTGCGAATAGCGGTTATAGTCTTCTTTGCTTA
TACTGCCTTCGTTCTCTTCTAGCCATTTCGGATATCTTGCACCGATCTCCTTCATCGGTT
CGTGGAGGGTATCTTTGGACAGCAGCTGTTGCATCATCGTTTCCACTATTGATTCCAAGT
CCTGAGATCCAGCGAGACTCTCGAATTGCTTGAGAAAATCCTCAACCATAGCATCTTCAT
CACCAGAAGCTGACTGCTGCTGCT
GCTTGGAAGAGAT

QA 13 576 13 576
DS 

RD RR2AA59TF 775 0 0
GATCCATCTCTTGGACGATATCATTAGGTGGTTGTCCACACTCTTGCATCTTCTGCATGA
TCTCCATGATCTTAGTTGAATTGTTCGGTTCATCCTCGTAAACCGCATTGAGTTCTTTGA
TCAGTTTGTACTGCTGCGAATAGCGGTTGTAGTCCTCTTTGCTTATACTGCCTTCGTTCT
CTTCTAGCCATTTCGGATATCTTGCACCGATCTCCTTCATCGGTTCGTGGAGGATATCTT
TCGACAGTAGCTGTTGCATCATCGTTTCCACTATTGATTCCAAGTCCTGAGATCCAGCGA
GACTCTCGAATTGCTTGAGAAAATCCTCAACCATAGCATCCTCATCACCAGAAGCTGCCT
GCTGCTGCTTGGAAGAGATAGATTCCACAGTTTCCCTAGTTTGTTCCCTAAGCTTGTCAA
GAGCTTCTGCTACATGATCCTCTTTAGAGACTTTCTGCTTTCCCTTTCCCTTGTTCTTTA
TTCTCATATCAGGTAACCCCATTCCAAGTCCTTGAACTCCACTCGGCAATGGAGACGGCT
CTTCTTTCTTCTTCTTCTTCTCATTCCCCTCTTCGTCTTCACTATGGTTTCTTTGAGCAA
GATTGAGATCTTTGAAGTCATCCAATGCACTATCGAGAAGCTCGTCTAAGTCATCGGTGT
GATTGCTCGCCATTTTCTTTCTTACAGCGTTTGGTCTCTGTGCGTGTGAACAATTCGCAG
ATTGGGAAGAGGAATCTCAGAAGATTGACAGAAGAAGAAACCTTTTGGTTTTTCC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL3511Contig1 711 2 6 U
GGAACTCGAAAAGGTCAGCAGTAATCGAGATCATCATCTCCCTTGAATCGTTTTTCTGGA
ACGAAGCAGATATGGGTTTCGAAGATGATCCGTACCGTGATGTGGATGGGGAGCCGTTGG
TGGACTTGGATGATGACTTCGGAGACGATCGTGAGCCACTTGAGGATTTTGAAGATAACT
TAGCGGATGATATGGGAGACTGGGAAGGTGAAGGTTCACAAACGCCTCTTTACGACAACA
ACGATAAAGTGAAACCAAGGAAACGGTTGGTGAAGAAAGGGTCTAGTAGTGATAGGCAGA
CTATCGATGTTCCTGAGCTTATTGATGAGGATGTGGAGGATGCTGTGTTTGATGAGTACA
TGGAAGGAAGAGGAGGAGGGGGAGGTACAGAGTATGATGATAAGGTTGGTAGGAAGAGGA
AGAAGGAGAAAGAGAGAAGTAGCGGTGGCGGTGGGAAGGAGAAGAGGTATAAGCTCCCAA
GCCGCGGTGAGAGGAAGTCTGAAGAGATTGATGAGATGTGGAAATCTATTGCAGATAATA
ACCCTGAGAATGATGAAGAAGGTGTTAGGACTATGGATGACGATAATTTCATTGATGATA
CTGGGTGTGGATCCTTCTGAGAGGTATGGAGGTGATGGGGGAGACCGCTCTCCAACTCAC
TATCCTCAGGCAGAGGAGGGCGAGGATGATGATGAGGTTAATAACCTTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG91JQB C 1
AF RR2GG91TF U 1
BS 1 669 RR2GG91TF
BS 670 670 RR2GG91JQB
BS 671 679 RR2GG91TF
BS 680 680 RR2GG91JQB
BS 681 696 RR2GG91TF
BS 697 711 RR2GG91JQB

RD RR2GG91JQB 711 0 0
GGAACTCGAAAAGGTCAGCAGTAATCGAGATCATCATCTCCCTTGAATCGTTTTTCTGGA
ACGAAGCAGATATGGGTTTCGAAGATGATCCGTACCGTGATGTGGATGGGGAGCCGTTGG
TGGACTTGGATGATGACTTCGGAGACGATCGTGAGCCACTTGAGGATTTTGAAGATAACT
TAGCGGATGATATGGGAGACTGGGAAGGTGAAGGTTCACAAACGCCTCTTTACGACAACA
ACGATAAAGTGAAACCAAGGAAACGGTTGGTGAAGAAAGGGTCTAGTAGTGATAGGCAGA
CTATCGATGTTCCTGAGCTTATTGATGAGGATGTGGAGGATGCTGTGTTTGATGAGTACA
TGGAAGGAAGAGGAGGAGGGGGAGGTACAGAGTATGATGATAAGGTTGGTAGGAAGAGGA
AGAAGGAGAAAGAGAGAAGTAGCGGTGGCGGTGGGAAGGAGAAGAGGTATAAGCTCCCAA
GCCGCGGTGAGAGGAAGTCTGAAGAGATTGATGAGATGTGGAAATCTATTGCAGATAATA
ACCCTGAGAATGATGAAGAAGGTGTTAGGACTATGGATGACGATAATTTCATTGATGATA
CTGG*TGTGGATCCTTTTGAGAGGTATGGAGGTGATGGGGGAGACCGCTCTCCAACTCAC
TATCCTCAGGCAGAGGAGGGCGAGGATGATGATGAGGTTAATAACCTTTTC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2GG91TF 698 0 0
GGAACTCGAAAAGGTCAGCAGTAATCGAGATCATCATCTCCCTTGAATCGTTTTTCTGGA
ACGAAGCAGATATGGGTTTCGAAGATGATCCGTACCGTGATGTGGATGGGGAGCCGTTGG
TGGACTTGGATGATGACTTCGGAGACGATCGTGAGCCACTTGAGGATTTTGAAGATAACT
TAGCGGATGATATGGGAGACTGGGAAGGTGAAGGTTCACAAACGCCTCTTTACGACAACA
ACGATAAAGTGAAACCAAGGAAACGGTTGGTGAAGAAAGGGTCTAGTAGTGATAGGCAGA
CTATCGATGTTCCTGAGCTTATTGATGAGGATGTGGAGGATGCTGTGTTTGATGAGTACA
TGGAAGGAAGAGGAGGAGGGGGAGGTACAGAGTATGATGATAAGGTTGGTAGGAAGAGGA
AGAAGGAGAAAGAGAGAAGTAGCGGTGGCGGTGGGAAGGAGAAGAGGTATAAGCTCCCAA
GCCGCGGTGAGAGGAAGTCTGAAGAGATTGATGAGATGTGGAAATCTATTGCAGATAATA
ACCCTGAGAATGATGAAGAAGGTGTTAGGACTATGGATGACGATAATTTCATTGATGATA
CTGGGTGTGGATCCTTCTGAGAGGTATGGAGGTGATGGGGGAGACCGCTCTCCAACTCAC
TATCCTCAG*CAGAGGAGG*CGAGGATGATGATGAG
TT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL3512Contig1 1210 2 4 U
GGACAGTATCTCTCTCTCATCTTCAACCACACAAGGGTTCCTGGAAAACAGAGGAAAAAA
AGGAATCTCCTTTCTCCTCCGAGGGAAAATGGGTAGCAAGATGCTGTTCAGTTTAACAAG
CCCTCGACTCTTCTCCGCCGTTTCTCGCAAACCCACCACCCCTCCTTGTTTCTCGTTCAG
GACTCAATGGTCTCAGCTCAGCCCTGGCCCTGGAAGATCGGTTCCCTTGAGAAAAAGATT
CTTCCTGTTGCCTGCAAAAGCCACCACAGAGCAATCAGTGGGAGGGGAAGACGTGGATAG
CAACATCATGCCTTACTGTAGCATCAACAAGGCTGAGAAGAAATCAATTGGGGAAATGGA
ACAAGAGTTTCTCCAAGCCATGCAATCGTTCTATTACGATGGCAAAGCGATCATGTCGAA
TGAGGAGTTTGATAACCTTAAAGAAGAGCTCATGTGGGAAGGAAGCAGCGTTGTCATGCT
GAGTTCTGATGAACAGAGATTCTTGGAAGCTTCGATGGCTTATGTTTCTGGAAATCCAAT
CCTCAATGATGAAGAATTTGATAATCTCAAACTCAAACTAAAGATGGATGGTAGCGAGAT
TGTGTGCGAGGGTCCAAGATGCAGTCTCCGTAGTAAAAAGGTGTATAGTGATCTCGCTGT
AGATTACTTCAAAATGCTATTGCTCAATGTTCCAGCATCCGTTGTTGCTCTTGGACTGTT
TTTCCTCTTGGACGACATTACAGGTTTTGAGATCACATACATCTTGGAGCTTCCAGAGCC
ATTTAGTTTCATATTCACTTGGTTCGCTGCCGTGCCTTTGATCGTATACCTGGCTTCAAC
CATCACCAAACTCATCATCAAAGACTTCCTGATCTTGAAGGGTCCTTGTCCAAATTGTGG
AACAGAGAATGTTTCCTTCTTTGGAACAATTCTTTCAATCTCCAGTGGTGGCAAAACCAA
CAATGTCAAATGCACCAACTGTGGAACCGCGATGGGGTATGACTCTGGTTCTAGGTTGAT
CACATTGCCAGAAGGAATCTAAGCTTGAACCCTGTGAGATGAAGATGGGAAAAGAAAGAA
TGGGTTTTGTCAGAAGCAAAAATGGATTTGATGCCTGTATATTTAAGATCTTCCATGTTA
GCTCTCTATCTCCTTCACATGATTTTTGATTTGTAAGTACTGTGTAAGCAATAAGGGAAA
ATATTTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D772TF U 1
AF RR2D772JQ C 489
BS 1 640 RR2D772TF
BS 641 641 RR2D772JQ
BS 642 718 RR2D772TF
BS 719 1210 RR2D772JQ

RD RR2D772TF 718 0 0
GGACAGTATCTCTCTCTCATCTTCAACCACACAAGGGTTCCTGGAAAACAGAGGAAAAAA
AGGAATCTCCTTTCTCCTCCGAGGGAAAATGGGTAGCAAGATGCTGTTCAGTTTAACAAG
CCCTCGACTCTTCTCCGCCGTTTCTCGCAAACCCACCACCCCTCCTTGTTTCTCGTTCAG
GACTCAATGGTCTCAGCTCAGCCCTGGCCCTGGAAGATCGGTTCCCTTGAGAAAAAGATT
CTTCCTGTTGCCTGCAAAAGCCACCACAGAGCAATCAGTGGGAGGGGAAGACGTGGATAG
CAACATCATGCCTTACTGTAGCATCAACAAGGCTGAGAAGAAATCAATTGGGGAAATGGA
ACAAGAGTTTCTCCAAGCCATGCAATCGTTCTATTACGATGGCAAAGCGATCATGTCGAA
TGAGGAGTTTGATAACCTTAAAGAAGAGCTCATGTGGGAAGGAAGCAGCGTTGTCATGCT
GAGTTCTGATGAACAGAGATTCTTGGAAGCTTCGATGGCTTATGTTTCTGGAAATCCAAT
CCTCAATGATGAAGAATTTGATAATCTCAAACTCAAACTAAAGATGGATGGTAGCGAGAT
TGTGTGCGAGGGTCCAAGATGCAGTCTCCGTAGTAAAAAG*TGTATAGTGATCTCGCTGT
AGATTACTTCAAAATGCTATTGCTCAATGTTCCAGCATCCGTTGTTGCTCTTGGACTG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2D772JQ 722 0 0
ATGAACAGAGATTCTTGGAAGCTTCGATGGCTTATGTTTCTGGAAATCCAATCCTCAATG
ATGAAGAATTTGATAATCTCAAACTCAAACTAAAGATGGATGGTAGCGAGATTGTGTGCG
AGGGTCCAAGATGCAGTCTCCGTAGTAAAAAGGTGTATAGTGATCTCGCTGTAGATTACT
TCAAAATGCTATTGCTCAATGTTCCAGCATCCGTTGTTGCTCTTGGACTGTTTTTCCTCT
TGGACGACATTACAGGTTTTGAGATCACATACATCTTGGAGCTTCCAGAGCCATTTAGTT
TCATATTCACTTGGTTCGCTGCCGTGCCTTTGATCGTATACCTGGCTTCAACCATCACCA
AACTCATCATCAAAGACTTCCTGATCTTGAAGGGTCCTTGTCCAAATTGTGGAACAGAGA
ATGTTTCCTTCTTTGGAACAATTCTTTCAATCTCCAGTGGTGGCAAAACCAACAATGTCA
AATGCACCAACTGTGGAACCGCGATGGGGTATGACTCTGGTTCTAGGTTGATCACATTGC
CAGAAGGAATCTAAGCTTGAACCCTGTGAGATGAAGATGGGAAAAGAAAGAATGGGTTTT
GTCAGAAGCAAAAATGGATTTGATGCCTGTATATTTAAGATCTTCCATGTTAGCTCTCTA
TCTCCTTCACATGATTTTTGATTTGTAAGTACTGTGTAAGCAATAAGGGAAAATATTTAA
TG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 3

CO CL3513Contig1 873 3 4 U
GAGGATACCATTGGATTGGACGACGAGGATTAGTCTAATGTTAGGAGCAGCGAGAGGTTT
GGCGAAGATTCATGACGAGTATAGCATCTCCAAGATTCCTCACGGAAACATCAAGTCCTC
CAACGTTCTACTAGACAGAAACGGCGTCGCATTGATCGCTGATTTCGGATTATCCCTCCT
TTTAAATCCGGTGCATGCTATAGCTCGTCTAGGAGGCTACCGTGCACCGGAACAGTCGGA
GATCAAACGTCTTTCTCAGAAAGCTGACGTGTATAGCTTCGGCGTCCTTCTCCTCGAGGT
TTTGACTGGAAAAGCTCCCTCGGTGTACCCGTCTCCTTCTAGGCCTAGATCAGCGGCTTC
GGTGGCGGTGGAGGAAGAGGAGGAAGCGGTTGTTGACTTGCCGAAATGGGTGAGGTCCGT
GGTGAAGGAGGAATGGACGGCTGAGGTTTTTGATCCGGAGCTTCTGAGGTACAAGAACAT
AGAGGAGGAGATGGTGGCGATGCTGCATATTGGTCTTGCATGCGTCGTTCCGTAGCCGGA
GAAACGGCCAACGATGGCTGAGGTTGTTAAGATGGTTGAGGAGATTAGAGTTGAGCAATC
GCCGGTTGGAGAGGATTTCGATGAGTCAAGGAACTCGTTGTCTCCGTCTTTGGCCACCAT
CGAAGACTTCGGC*ATGTTTGAACTGTATGACGCTTTGTTAATTAA*TATATCTATTGCT
GGATTGTGCCCACTTCAAGTTTCTTGCTTAGATCTCCAGTTTACAACTTTGTCAAAGTTT
TTAGCCATGTAACATGTTATTGTCACCTTCTCATGATGTCATTTTGTAACGTGTTGTGTA
TTGTAGTATTGTGTTAATAAAACCAATTCTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC65TF U 1
AF RR2CC28TF U 377
AF RR2DC65JQ C 257
BS 1 765 RR2DC65TF
BS 766 766 RR2DC65JQ
BS 767 775 RR2DC65TF
BS 776 873 RR2DC65JQ

RD RR2DC65TF 783 0 0
GAGGATACCATTGGATTGGACGACGAGGATTAGTCTAATGTTAGGAGCAGCGAGAGGTTT
GGCGAAGATTCATGACGAGTATAGCATCTCCAAGATTCCTCACGGAAACATCAAGTCCTC
CAACGTTCTACTAGACAGAAACGGCGTCGCATTGATCGCTGATTTCGGATTATCCCTCCT
TTTAAATCCGGTGCATGCTATAGCTCGTCTAGGAGGCTACCGTGCACCGGAACAGTCGGA
GATCAAACGTCTTTCTCAGAAAGCTGACGTGTATAGCTTCGGCGTCCTTCTCCTCGAGGT
TTTGACTGGAAAAGCTCCCTCGGTGTACCCGTCTCCTTCTAGGCCTAGATCAGCGGCTTC
GGTGGCGGTGGAGGAAGAGGAGGAAGCGGTTGTTGACTTGCCGAAATGGGTGAGGTCCGT
GGTGAAGGAGGAATGGACGGCTGAGGTTTTTGATCCGGAGCTTCTGAGGTACAAGAACAT
AGAGGAGGAGATGGTGGCGATGCTGCATATTGGTCTTGCATGCGTCGTTCCGTAGCCGGA
GAAACGGCCAACGATGGCTGAGGTTGTTAAGATGGTTGAGGAGATTAGAGTTGAGCAATC
GCCGGTTGGAGAGGATTTCGATGAGTCAAGGAACTCGTTGTCTCCGTCTTTGGCCACCAT
CGAAGACTTCGGC*ATGTTTGAACTGTATGACGCTTTGTTAATTAA*TATATCTATTGCT
GGATTGTGCCCACTTCAAGTTTCTTGCTTAGATCTCCAGTTTACA*CTTTGTCAA
GTTTTAGC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2CC28TF 372 0 0
GAGGAGGAAGCGGTTGTTGACTTGCCGAAATGGGTGAGGTCCGTGGTGAAGGAGGAATGG
ACGGCTGAGGTTTTTGATCCGGAGCTTCTGAGGTACAAGAACATAGAGGAGGAGATGGTG
GCGATGCTGCATATTGGTCTTGCATGCGTCGTTCCGCAGCCGGAGAAACGGCCAACGTTG
GCTGAGGTTGTTAAGATGTTTGAGGAGATTAGAGTTGAGCAATCGCCGGTTGGAGAGGAT
TTCGATGAGTCAAGGAACTCGTTGTCTCCGTCTTTGGCCACCACCGAAGACTTCGCC*AT
GTTTGAATTGTATGACGCTTTGTTAATTAA*TATATCTATTGCTGGATTGTGCCCACTTC
AAGTTTCTTGCT

QA 1 372 1 372
DS 

RD RR2DC65JQ 617 0 0
CAGAAAGCTGACGTGTATAGCTTCGGCGTCCTTCTCCTCGAGGTTTTGACTGGAAAAGCT
CCCTCGGTGTACCCGTCTCCTTCTAGGCCTAGATCAGCGGCTTCGGTGGCGGTGGAGGAA
GAGGAGGAAGCGGTTGTTGACTTGCCGAAATGGGTGAGGTCCGTGGTGAAGGAGGAATGG
ACGGCTGAGGTTTTTGATCCGGAGCTTTTGAGGTACAAGAACATAGAGGAGGAGATGGTG
GCGATGCTGCATATTGGTCTTGCATGCGTCGTTCCGTAGCCGGAGAAACGGCCAACGATG
GCTGAGGTTGTTAAGATGGTTGAGGAGATTAGAGTTGAGCAATCGCCGGTTGGAGAGGAT
TTCGATGAGTCAAGGAACTCGTTGTCTCCGTCTTTGGCCCCCATCGAAGACTTCGGCCAT
GTTTGAACTGTATGACGCTTTGTTAATTAAATATATCTATTGCTGGATTGTGCCCACTTC
AAGTTTCTTGCTTAGATCTCCAGTTTACAACTTTGTCAAAGTTTTTAGCCATGTAACATG
TTATTGTCACCTTCTCATGATGTCATTTTGTAACGTGTTGTGTATTGTAGTATTGTGTTA
ATAAAACCAATTCTCGC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 3

CO CL3514Contig1 588 3 6 U
CTGGAATTGATCAAAAATTACGAAAATAAAGGTCCGGTAGAGGTTCATAAATAAGAAAAC
TTCGAAACAATCGAGCCCAAAAAAATGGAGAAAACAAAGAAAGCCAAGTTCATATATCTA
GTAACGACCAATACCCCAGACCCTGACAACTCCATCAGTGTAACCACTGAACAATGTGCT
TCCATCTGCACTCCAGTTCAAGCTTGTGCAGTAGTTCACCTTCTTCTGGTTACCAGTTCC
GACACCACCATCACACTTCTCAGCCTCAGCCTTAAGATCAACCTTCAACTCATCAACAAC
ACTCTTACTCTCAAGATCCCAAATCTTAATACTACTCTCCGTCGCAGCACACAGCCAGTA
CCTATTCGGACTAAAGCAAAGCGAGTGAATAATCGATCCACCTTCAAGCGAGTACAACTT
CTTCCCTTCAGCCAAATCCCACAACAGGATCACACCATCTTTCCCACCACTCGCACACAA
AGAACCATCAGGCGAAACCGCCACAGTGTTGAGATAACCAGAGTGCCCCGCGAGAGAGCT
CTTCAGCTTACAGTTCTGCAAATTCCACACCTTCACGGTCTGATCCCA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU73TF C 1
AF RR2DC44JQ U 1
AF RR2FF92JQ U 20
BS 1 54 RR2DC44JQ
BS 55 55 RR2FF92JQ
BS 56 180 RR2DC44JQ
BS 181 181 RR2FF92JQ
BS 182 530 RR2DC44JQ
BS 531 588 RR2FF92JQ

RD RR2BU73TF 434 0 0
CTGGAATTGATCAAAAATTACGAAAATAAAGGTCCGGTAGAGGTTCATAAATAAGAAAAC
TTCGAAACAATCGAGCCCAAAAAAATGGAGAAAACAAAGAAAGCCAAGTTCATATATCTA
GTAACGACCAATACCCCAGACCCTGACAACTCCATCAGTGTAACCACTGAACAATGTGCT
TCCATCTGCACTCCAGTTCAAGCTTGTGCAGTAGTTCACCTTCTTCTGGTTACCAGTTCC
GACACCACCATCACACTTCTCAGCCTCAGCCTTAAGATCAACCTTCAACTCATCAACAAC
ACTCTTACTCTCAAGATCCCAAATCTTAATACTACTCTCCGTCGCAGCACACAGCCAGTA
CCTATTCGGACTAAAGCAAAGCGAGTGAATAATCGATCCACCTTCAAGCGAGTACAACTT
CTTCCCTTCAGCC
C

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR2DC44JQ 530 0 0
CTGGAATTGATCAAAAATTACGAAAATAAAGGTCCGGTAGAGGTTCATAAATAAAAAAAC
TTCGAAACAATCGAGCCCAAAAAAATGGAGAAAACAAAGAAAGCCAAGTTCATATATCTA
GTAACGACCAATACCCCAGACCCTGACAACTCCATCAGTGTAACCACTGAACAATGTGCT
ACCATCTGCACTCCAGTTCAAGCTTGTGCAGTAGTTCACCTTCTTCTGGTTACCAGTTCC
GACACCACCATCACACTTCTCAGCCTCAGCCTTAAGATCAACCTTCAACTCATCAACAAC
ACTCTTACTCTCAAGATCCCAAATCTTAATACTACTCTCCGTCGCAGCACACAGCCAGTA
CCTATTCGGACTAAAGCAAAGCGAGTGAATAATCGATCCACCTTCAAGCGAGTACAACTT
CTTCCCTTCAGCCAAATCCCACAACAGGATCACACCATCTTTCCCACCACTCGCACACAA
AGAACCATCAGGCGAAACCGCCACAGTGTTGAGATAACCAGAGTGCCCCG

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2FF92JQ 569 0 0
ACGAAAATAAAGGTCCGGTAGAGGTTCATAAATAAGAAAACTTCGAAACAATCGAGCCCA
AAAAAATGGAGAAAACAAAGAAAGCCAAGTTCATATATCTAGTAACGACCAATACCCCAG
ACCCTGACAACTCCATCAGTGTAGCCACTGAACAATGTGCTTCCATCTGCACTCCAGTTC
AAGCTTGTGCAGTAGTTCACCTTCTTCTGGTTACCAGTTCCGACACCACCATCACACTTC
TCAGCCTCAGCCTTAAGATCAACCTTCAACTCATCAACAACACTCTTACTCTCAAGATCC
CAAATCTTAATACTACTCTCCGTCGCAGCACACAGCCAGTACCTATTCGGACTAAAGCAA
AGCGAGTGAATAATCGATCCACCTTCAAGCGAGTACAACTTCTTCCCTTCAGCCAAATCC
CACAACAGGATCACACCATCTTTCCCACCACTCGCACACAAAGAACCATCAGGCGAAACC
GCCACAGTGTTGAGATAACCAGAGTGCCCCGCGAGAGAGCTCTTCAGCTTACAGTTCTGC
AAATTCCACACCTTCACGGTCTGATCCCA

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 3

CO CL3515Contig1 1035 3 5 U
AAGAGTAAACCATGATCGCACCAGATCACTGGCTCGCCTGTGTTATACATCATATATCAT
ATAATGCTCTCTGTTTTCTCTCCCAACTCAAATTCAATCCTCTGAAACATTTCATTGGAC
TGGAGAGAGAGAGACTAAAAACAAAACTAAGGGTTTAGGTTCGTCGTCAGACTTTGAAAC
AAAAGATGAAATCAATCATCATTATATCCAAGACTAGTAAAACAACATGATAAACCTTCT
TTGAAGGACAGCACCACCACAAGAATGTTTACCAACCTGGGGGTTTTTTCTTCCGCATTT
CTTACATGAAATCATCTTCGAGTTCTTGAATAAACTTGTTGCTTGAAGCAATGTCTTTGT
TGGACGTCATTTTGTCAGTTACCATTAACCCCTTGTAACTCCTCATATCTGCTTGCCTCT
CCTTCTCAAGCCTCTCAATATCTTCACGTTTCTTCTTCTCCCTCAGGTGTTGTTTCCTCT
CAGCTCTTTCCGCAGCATTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCAAATCAGGGGTTCTCTCAA
CTTTCGTTTTGTTCAACCTGTTAATTATCTCATTGGCTCGCTTCTCCACTCTGATAGTCC
GAACCATCTTTGAATTGTGGAAGCCAACTTGACCAACATCCATGGAGGCAGTCTTCTTCA
AGTTGGACCACGGAGTGTACACAACATCAACGTTGTTGACCTTGTTGCCTTGAATGGAAT
TAGCTTTCACAAGCTGAGCACAATCCTCCAGCACACCTTCGCTTATGTCATCAAAGCCTT
GGCCTTTGTGAAGCCTCGAGTAAACGTGAGCTGACGACATTTTATCAACGTGAAACCAGA
CGTCTTCGGGGAAGCCGTACTTGATGAGCTCCTCGTTCTCGAACTTATCGAGCCCCATGA
AGATGGTGTAGTCCCCAGCATCTGGCCGTGCCTTGAAGTAGAACACCATCGCCTTCGATT
CGAGAAGCGAACCAGATCGAATCTAGGGTTTCCCCCTCTCTCACTTCTCTATCTCTCCTC
TCCCTCTCGACAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G118JQ U 1
AF RR2GK35JQ U 187
AF RR2GK35TF C 397
BS 1 467 RR2G118JQ
BS 468 468 RR2GK35JQ
BS 469 702 RR2G118JQ
BS 703 807 RR2GK35JQ
BS 808 1035 RR2GK35TF

RD RR2G118JQ 702 0 0
AAGAGTAAACCATGATCGCACCAGATCACTGGCTCGCCTGTGTTATACATCATATATCAT
ATAATGCTCTCTGTTTTCTCTCCCAACTCAAATTCAATCCTCTGAAACATTTCATTGGAC
TGGAGAGAGAGAGACTAAAAACAAAACTAAGGGTTTAGGTTCGTCGTCAGACTTTGAAAC
AAAAGATGAAATCAATCATCATTATATCCAAGACTAGTAAAACAACATGATAAACCTTCT
TTGAAGGACAGCACCACCACAAGAATGTTTACCAACCTGGGGGTTTTTTCTTCCGCATTT
CTTACATGAAATCATCTTCGAGTTCTTGAATAAACTTGTTGCTTGAAGCAATGTCTTTGT
TGGACGTCATTTTGTCAGTTACCATTAACCCCTTGTAACTCCTCATATCTGCTTGCCTCT
CCTTCTCAAGCCTCTCAATATCTTCACGTTTCTTCTTCTCCCTCAGGGGTTGTTTCCTCT
CAGCTCTTTCCGCAGCATTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCAAATCAGGGGTTCTCTCAA
CTTTCGTTTTGTTCAACCTGTTAATTATCTCATTGGCTCGCTTCTCCACTCTGATAGTCC
GAACCATCTTTGAATTGTGGAAGCCAACTTGACCAACATCCATGGAGGCAGTCTTCTTCA
AGTTGGACCACGGAGTGTACACAACATCAACGTTGTTGACCT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2GK35JQ 621 0 0
TGAAATCAATCATCATTATATCCAAGACTAGTAGAACAACATGATAAACCTTCTTTGAAG
GACAGCACCACCACAAGAATGTTTACCAACTTGGGGGTTTTTTCTTCCGCATTTCTTACA
TGAAATCATCTTCGAGTTCTTGAATAGACTTGTTGCTTGAAGCAATGTCTTTGTTGGACG
TCATTTTGTCAGTTACCATTAACCCCTTGTAACTCCTCATATCTGCTTGCCTCTCCTTCT
CAAGCCTCTCAATATCTTCACGTTTCTTCTTCTCCCTCAGGTGTTGTTTCCTCTCAGCTC
TTTCCGCAGCATTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCAAATCAGGGGTTCTCTCAACTTTCG
TTTTGTTCAACCTGTTAATTATCTCATTGGCTCGCTTCTCCACTCTGATAGTCCGAACCA
TCTTTGAATTGTGGAAGCCAACTTGACCAACATCCATGGAGGCAGTCTTCTTCAAGTTGG
ACCACGGAGTGTACACAACATCAACGTTGTTGACCTTGTTGCCTTGAATGGAATTAGCTT
TCACAAGCTGAGCACAATCCTCCAGCACACCTTCGCTTATGTCATCAAAGCCTTGGCCTT
TGTGAAGCCTCGAGTAAACGT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2GK35TF 639 0 0
TAACT
CTCATATCTGCTTGCCTCTCATTCTCAAGCCTCTCAATATCTTCACGTTTCTTCTTCTCC
CTCAGGTGTTGTTTCCTCTCAGCTCTTTCCGCAGCATTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTC
AGATCAGGGGTTCTCTCAACTTTCGTTTTGTTCAACCTGTTAATTATCTCATTGGCTCGC
TTCTCCACTCTGATAGTCCGAACCATCTTTGAATTGTGGAAGCCAACTTGACCAACATCC
ATGGAGGCAGTCTTCTTCAAGTTGGACCACGGAGTGTACACAACATCAACGTTGTTGACC
TTGTTGCCTTGAATGGAATTAGCTTTCACAAGCTGAGCACAATCCTCCAGCACACCTTCG
CTTATGTCATCAAAGCCTTGGCCTTTGTGAAGCCTCGAGTAAACGTGAGCTGACGACATT
TTATCAACGTGAAACCAGACGTCTTCGGGGAAGCCGTACTTGATGAGCTCCTCGTTCTCG
AACTTATCGAGCCCCATGAAGATGGTGTAGTCCCCAGCATCTGGCCGTGCCTTGAAGTAG
AACACCATCGCCTTCGATTCGAGAAGCGAACCAGATCGAATCTAGGGTTTCCCCCTCTCT
CACTTCTCTATCTCTCCTCTCCCTCTCGACAATC

QA 6 639 6 639
DS 



AS 1 3

CO CL3516Contig1 1204 3 2 U
CCAGTAAATTTTACTTAGACTATTAAATTGCAAAAATGATCGACAACCAACATGTTTTGA
TAAAATGACATAAGATTCAAAACTTAGCAGCAAACAAAATGGCACCTTCAAAAAACAGAA
TCTCACTATATTATATGTTTAGTGCGTTTCGCAGCAATTCATAGTTATCATAGCAGCAAC
TGTCTCCACACAGGTGTGATGTGATCATGGAAAGCACTGAGGAATGGGATCATGAACCTG
ATCATGGAGAGCTTGTAGCTGTTGAAGAATATACAACTGAAGAGTGTTTGAGTCAAATAA
AGCTGCTATCATCAGATACACTTTCATCTACATTCAAGCTACTCCACCTTCAAGATGATC
ATCATCTAGGCAAGTAGCTTGTGTGTGCTCTTTTCCTAACCTTTGGTTTTGTCCCACTGG
GTTTTCCAAAGGAAGGTTTTTAACGAGGCTACAAGTCTACTTCTCCTATATCCTAGATGA
TTGATCTTGGAAGCCTTTCCAGAATAAGAAGAAGTCCTTCCTAAACGGGAAGCCTTTCCA
GATTAAGAAGAATTCTATTTGTTTTTATCTTATGTTTTTATTTTAGCTATGGTTTATTAT
GTAACACATTAAGAGAACAAGGAGCCTGTTCCTTGCCTTCTCTCTATATATATGTACTCG
GATGCCCTAGTTTCTTTTAAGCAATCTTTTATCAAAACCTTTTGGTTCTTTTCTCTCTTG
TCGTGAGTGAGTGGCTGGTGAGTAGTATCCAGTCTGTTGGTGTGTAATATCCAACGCCCA
AGGTGTCTAAGGAGGTGTGTCATATCCAATCTAGCCATCTAAAAGTGTCAAGGAGTCTCT
TCCGAAACTCTTTGAATCATCCATCATCCCACACGCCTTGGAGCAGATCGAGCCTTGTCT
CTCTGTTTGCAAGGATTATCCTTGTTCTCTCTTCCCAGTTCCAGAGCATCATCCTAGGAT
CTTATCAAGGTGTCAGCTCTTGCCTTGTCAGAATCCAAAACTTACTTTGAAGCTTTGATG
ACAATTTGATTATTGACATAATGCTTAAGACAAACAGGGATATAGACATTAGCCCCACCC
ATCAGCTCGGTTCTGGTGTCACAAGTCTTCCTCACAGTGAAGAAACCTTTCTGTCCACAA
AAATCACACCTTGCAATAAGCTTTGTCGCAGAATCAGTTATTGGTAAATATTCAAGAACG
TCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2E963JQ U 1
AF RR2E963TF C 640
AF RR2FY83JQ U 523
BS 1 777 RR2E963JQ
BS 778 1204 RR2FY83JQ

RD RR2E963JQ 777 0 0
CCAGTAAATTTTACTTAGACTATTAAATTGCAAAAATGATCGACAACCAACATGTTTTGA
TAAAATGACATAAGATTCAAAACTTAGCAGCAAACAAAATGGCACCTTCAAAAAACAGAA
TCTCACTATATTATATGTTTAGTGCGTTTCGCAGCAATTCATAGTTATCATAGCAGCAAC
TGTCTCCACACAGGTGTGATGTGATCATGGAAAGCACTGAGGAATGGGATCATGAACCTG
ATCATGGAGAGCTTGTAGCTGTTGAAGAATATACAACTGAAGAGTGTTTGAGTCAAATAA
AGCTGCTATCATCAGATACACTTTCATCTACATTCAAGCTACTCCACCTTCAAGATGATC
ATCATCTAGGCAAGTAGCTTGTGTGTGCTCTTTTCCTAACCTTTGGTTTTGTCCCACTGG
GTTTTCCAAAGGAAGGTTTTTAACGAGGCTACAAGTCTACTTCTCCTATATCCTAGATGA
TTGATCTTGGAAGCCTTTCCAGAATAAGAAGAAGTCCTTCCTAAACGGGAAGCCTTTCCA
GATTAAGAAGAATTCTATTTGTTTTTATCTTATGTTTTTATTTTAGCTATGGTTTATTAT
GTAACACATTAAGAGAACAAGGAGCCTGTTCCTTGCCTTCTCTCTATATATATGTACTCG
GATGCCCTAGTTTCTTTTAAGCAATCTTTTATCAAAACCTTTTGGTTCTTTTCTCTCTTG
TCGTGAGTGAGTGGCTGGTGAGTAGTATCCAGTCTGTTGGTGTGTAATATCCAACGC

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2E963TF 504 0 0
CTCTCTATATATATGTACTCGGATGCCCTAGTTTCTTTTAAGCAATCTTTTATCAAAACC
TTTTGGTTCTTTTCTCTCTTGTCGTGAGTGAGTGGCTGGTGAGTAGTATCCAGTCTGTTG
GTGTGTAATATCCAACGCCCAAGGTGTCTAAGGAGGTGTGTCATATCCAATCTAGCCATC
TAAAAGTGTCAAGGAGTCTCTTCCGAAACTCTTTGAATCATCCATCATCCCACACGCCTT
GGAGCAGATCGAGCCTTGTCTCTCTGTTTGCAAGGATTATCCTTGTTCTCTCTTCCCAGT
TCCAGAGCATCATCCTAGGATCTTATCAAGGTGTCAGCTCTTGCCTTGTCAGAATCCAAA
ACTTACTTTGAAGCTTTGATGACAATTTGATTATTGACATAATGCTTAAGACAAACAGGG
ATATAGACATTAGCCCCACCCATCAGCTCGGTTCTGGTGTCACAAGTCTTCCTCACAGTG
AAGAAACCTTTCTGTCCACAAAAA

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2FY83JQ 682 0 0
G
AACGGGAAGCCTTTCCAGATTAAGAAGAATTCTATTTGTTTTTATCTTATGTTTTTATTT
TAGCTATGGTTTATTATGTAACACATTAAGAGAACAAGGAGCCTGTTCCTTGCCTTCTCT
CTATATATATGTACTCGGATGCCCTAGTTTCTTCTAAGCAATCTTTTATCAAAACCTTTT
GGTTCTTTTCTCTCTTGTCGTGAGTGAGTGGCTGGTGAGTAGTATCCAGTCTGTTGGTGT
GTAATATCCAACGCCCAAGGTGTCTAAGGAGGTGTGTCATATCCAATCTAGCCATCTAAA
AGTGTCAAGGAGTCTCTTCCGAAACTCTTTGAATCATCCATCATCCCACACGCCTTGGAG
CAGATCGAGCCTTGTCTCTCTGTTTGCAAGGATTATCCTTGTTCTCTCTTCCCAGTTCCA
GAGCATCATCCTAGGATCTTATCAAGGTGTCAGCTCTTGCCTTGTCAGAATCCAAAACTT
ACTTTGAAGCTTTGATGACAATTTGATTATTGACATAATGCTTAAGACAAACAGGGATAT
AGACATTAGCCCCACCCATCAGCTCGGTTCTGGTGTCACAAGTCTTCCTCACAGTGAAGA
AACCTTTCTGTCCACAAAAATCACACCTTGCAATAAGCTTTGTCGCAGAATCAGTTATTG
GTAAATATTCAAGAACGTCAC

QA 2 682 2 682
DS 



AS 1 3

CO CL3517Contig1 857 3 10 U
GTCTCTTAAGTGAATGATTTTTTATGTAAATGATTGTATTGTGATTTGTTGTTGAGTTGA
CATAACATACATGTTTTACTACTTAACATTTCACTTCAAGATTTTAGACTCAATCTCTTC
CAAGCTGAGACCCTTGGTCTCAGGAACTACTAAAACTACAAACAATAGTGATACCAATGC
TATAGCTCCAAAGAGAAGGAAGAGATTCTCTGTTCCAAGATATTCCTTTAAGGGTGAAAA
CGCAAAGGTCACAATGGCATTGGAGCCAAAGTTTGTAAGAACTGCAAGACTGATCCCTCT
CCCTCTTGTGCGAAGCGGGAAAATCTCCGACACCATTAGCCAGCTGATTGGTCCGAATGA
GATCTGATAGCAACCAACATAGAGAAGCAGTGCACCAACTGCGACAAGAGGAAAACCTCC
GAGAAACTTGTAGTATGCTGACAGTAGAAACAAAGACAACGCAATGCCACTGACGCCTCC
AATCAGTAAGGGACGTCTTCCGAGATCATCAACTTTCGCAACAGCCACCCATGTCATCAG
TAACTTAAAGACACCAATGATAACAGAGACTCTGGTTGCATCAGCAGCAGCAGAGAATCC
AGCAGTCTGAAGAATCGAACCCGCGGAGTAAAGAACACTTGGCTGTCCAGTTATCTGCTG
AAAAAGGACTAAACCTCCACCAATAGTCAAAGCTTTCAAGTTAGGCCCTTGGAACACTTC
CAAGAAGTTCCCACCAGACTTCTCATCTTCGTAAGCCGTTTCCACAGACAACAGCGCATC
ATCCACCAGCTTCTCCGACAGTTTATCACCGGGAGGTCTGCCGCGTAGCTTGCTGAGAGC
AAGCATGGCTCTCTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ27JQ U 1
AF RR2EF03JQ U 8
AF RR2EQ27TF C 150
BS 1 381 RR2EQ27JQ
BS 382 382 RR2EF03JQ
BS 383 588 RR2EQ27JQ
BS 589 625 RR2EF03JQ
BS 626 626 RR2EQ27TF
BS 627 662 RR2EF03JQ
BS 663 663 RR2EQ27TF
BS 664 795 RR2EF03JQ
BS 796 796 RR2EQ27TF
BS 797 857 RR2EF03JQ

RD RR2EQ27JQ 588 0 0
GTCTCTTAAGTGAATGATTTTTTATGTAAATGATTGTATTGTGATTTGTTGTTGAGTTGA
CATAACATACATGTTTTACTACTTAACATTTCACTTCAAGATTTTAGACTCAATCTCTTC
CAAGCTGAGACCCTTGGTCTCAGGAACTACTAAAACTACAAACAATAGTGATACCAATGC
TATAGCTCCAAAGAGAAGGAAGAGATTCTCTGTTCCAAGATATTCCTTTAAGGGTGAAAA
CGCAAAGGTCACAATGGCATTGGAGCCAAAGTTTGTAAGAACTGCAAGACTGATCCCTCT
CCCTCTTGTGCGAAGCGGGAAAATCTCCGACACCATTAGCCAGCTGATTGGTCCGAATGA
GATCTGATAGCAACCAACATAAAGAAGCAGTGCACCAACTGCGACAAGAGGAAAACCTCC
GAGAAACTTGTAGTATGCTGACAGTAGAAACAAAGACAACGCAATGCCACTGACGCCTCC
AATCAGTAAGGGACGTCTTCCGAGATCATCAACTTTCGCAACAGCCACCCATGTCATCAG
TAACTTAAAGACACCAATGATAACAGAGACTCTGGTTGCATCAGCAGC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2EF03JQ 850 0 0
AAGTGAATGATTTTTTATGTAAATGATTGTATTGTGATTTGTTGTTGAGTTGACATAACA
TACATGTTTTACTACTTAACATTTCACTTCAAGATTTTAGACTCAATCTCTTCCAAGCTG
AGACCCTTGGTCTCAGGAACTACTAGAACTACAAACAATAGTGATACCAATGCTATAGCT
CCAAAGAGAAGGAAGAGATTCTCTGCTCCAAGATATTCCTTTAAGGGTGAAAACGCAAAG
GTCACAATGGCATTGGAGCCAAAGTTTGTAAGAACTGCAAGACTGATCCCTCTCCCTCTT
GTGCGAAGCGGGAAAATCTCCGACACCATTAGCCAGCTGATTGGTCCGAATGAGATCTGA
TAGCAAACAACATAGAGAAGCAGTGCACCAACTGCGACAAGAGGAAAACCTCCGAGAAAC
TTGTAGTATGCTGACAGTAGAAACAAAGACAACGCAATGCCACTGACGCCTCCAATCAGT
AAGGGACGTCTTCCGAGATCATCAACTTTCGAAACAGCCACCCATGTCATCAGTAACTTA
AAGACACCAATGATAACAGAGACTCTGGTTGCATCAGCAGCAGCAGAGAATCCAGCAGTC
TGAAGAATCGAACCCGCGTAGTAAAGAACACTTGGCTGTCCAGTTATCTGCTGAAGAAGG
ACTAAACCTCCACCAATAGTCAAAGCTTTCAAGTTAGGCCCTTGGAACACTTCCAAGAAG
TTCCCACCAGACTTCTCATCTTCGTAAGCCGTTTCCACAGACAACAGCGCATCATCCACC
AGCTTCTCTGACAGTTTATCACCGGGAGGTCTGCCGCGTAGCTTGCTGAGAGCAAGCATG
GCTCTCTCTT

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR2EQ27TF 703 0 0
CTAG
AACTACAAACAATAGTGATACCAATGCTATAGCTCCAAAGAGAAGGAAGAGATTCTCTGT
TCCAAGATATTCCTTTAAGGGTGAAAACGCAAAGGTCACAATGGCATTGGAGCCAAAGTT
TGTAAGAACTGCAAGACTGATCCCTCTCCCTCTTGTGCGAAGCGGGAAAATCTCCGACAC
CATTAGCCAGCTGATTGGTCCGAATGAGATCTGATAGCAACCAACATAGAGAAGCAGTGC
ACCAACTGCGACAAGAGGAAAACCTCCGAGAAACTTGTAGTATGCTGACAGTAGAAACAA
AGACAACGCAATGCCACTGACGCCTCCAATCAGTAAGGGACGTCTTCCGAGATCATCAAC
TTTCGCAACAGCCACCCATGTCATCAGTAACTTAAAGACACCAATGATAACAGAGACTCT
GGTTGCATCAGCAGCAGCAGAGAATCCAGCAGTCTGAAGAATCGAACCCGCGGAGTAAAG
AACACTTGGCTGTCCAGTTATCTGCTGAAAAAGGACTAAACCTCCACCAATAGTCAAAGC
TTTCAAGTTAGGCCCTTGGAACACTTCCAAGAAGTTCCCACCAGACTTCTCATCTTCGTA
AGCCGTTTCCACAGACAACAGCGCATCATCCACCAGCTTCTCCGACAGTTTATCACCGGG
AGGTCTGCCGCGTAGCTTGCTGAGAGCAAGCATGGCTC
C

QA 5 702 5 702
DS 



AS 1 3

CO CL3518Contig1 924 3 5 U
GGTCCGGCGGAAACCCTCAAAATCATCGATGGCAAGTATGGGGAGAGCATTGTACAGCGT
GGGATTCTGGATCCGGGAAACTGGTCAAGCACTTGATCGTCTCGGTTGTCGCCTCCAAGG
CAAAAATCACTTCCGTGAGCAGCTCTCCAGGCACCGCACCCTTATGAATGTTTTTGACAA
GGCCCCTATCGTCGATAAGGACGCTTTCGTTGCTCCTAGCGCTTCTCTCATTGGCAATGT
CCATCTCGGACCAGCCTCTTCCATTTGGTATGGATGTGTCTTGCGAGGAGATGCTAACAC
CATCACTGTCGGAGCTGGGACCAATATCCAAGACAACTCCCTTGTCCACGTTGCCAAGTC
CAACTTAAACGGCAAGGTCTTGCCTACTCTCATTGGTGACTATGTCACTATTGGTAACAG
TGCTGTTTTACATGGCTGCACTCTCGAAGACGAGTCTTACATTGGTGCTAGTGCAACCGT
CTTGGATGGCGCTCATGTTGAGAAGCATGCCATCGTTGAGTCTGGAGCTCTTGTCAGGCA
GAACACTCGAATTCCCTCCGGCGAGGTTTGGGGAGGGAATCCAGCTAGATTTCTGAGGAA
GGTGACTGAAGAAGAAAGGGCCTTCTTCTCTACTTCGGCTGCGGATTATTCCAACTTAGC
TCAAGTTCACGCTGCGCACAACTCAAAGAACTTGGACGACACTGATTTCAAGAAGCTCCT
TTACAAGAAGAACGCACGTGATGCAGAATATGATTCACTACTCAGTGATTTACTACCCAA
AGCAGCTTGAGACTACTCTTTACGAAGACCAGAAATTCATTTCCTGCTTTTCCAATAAAG
TTTTCTTGTAACTTGAAAGAAAAAAAAAAGGTTGGAACCTTTTCTTCTGATTGTTTTCTA
TAATAAAATTTGTTGGATCAGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA35TF U 1
AF RR2DK43TF U 24
AF RR2DK43JQ C 317
BS 1 436 RR2GA35TF
BS 437 437 RR2DK43TF
BS 438 533 RR2GA35TF
BS 534 707 RR2DK43TF
BS 708 924 RR2DK43JQ

RD RR2GA35TF 533 0 0
GGTCCGGCGGAAACCCTCAAAATCATCGATGGCAAGTATGGGGAGAGCATTGTACAGCGT
GGGATTCTGGATCCGGGAAACTGGTCAAGCACTTGATCGTCTCGGTTGTCGCCTCCAAGG
CAAAAATCACTTCCGTGAGCAGCTCTCCAGGCACCGCACCCTTATGAATGTTTTTGACAA
GGCCCCTATCGTCGATAAGGACGCTTTCGTTGCTCCTAGCGCTTCTCTCATTGGCAATGT
CCATCTCGGACCAGCCTCTTCCATTTGGTATGGATGTGTCTTGCGAGGAGATGCTAACAC
CATCACTGTCGGAGCTGGGACCAATATCCAAGACAACTCCCTTGTCCACGTTGCCAAGTC
CAACTTAAACGGCAAGGTCTTGCCTACTCTCATTGGTGACTATGTCACTATTGGTAACAG
TGCTGTTTTACATGGCCGCACTCTCGAAGACGAGTCTTACATTGGTGCTAGTGCAACCGT
CTTGGATGGCGCTCATGTTGAGAAGCATGCCATCGTTGAGTCTGGAGCTCTTG

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2DK43TF 684 0 0
G
ATCGATGGCAAGTATGGGGAGAGCATTGTACAGCGTGGGATTCTGGATCCGGGAAACTGG
TCAAGCACTTGATCGTCTCGGTTGTCGCCTCCAAGGCAAAAATCACTTCCGTGAGCAGCT
CTCCAGGCACCGCACCCTTATGAATGTTTTTGACAAGGCCCCTATCGTCGATAAGGACGC
TTTCGTTGCTCCTAGCGCTTCTCTCATTGGCAATGTCCATCTCGGACCAGCCTCTTCCAT
TTGGTATGGATGTGTCTTGCGAGGAGATGCTAACACCATCACTGTCGGAGCTGGGACCAA
TATCCAAGACAACTCCCTTGTCCACGTTGCCAAGTCCAACTTAAACGGCAAGGTCTTGCC
TACTCTCATTGGTGACTATGTCACTATTGGTAACAGTGCTGTTTTACATGGCTGCACTCT
CGAAGACGAGTCTTACATTGGTGCTAGTGCAACCGTCTTGGATGGCGCTCATGTTGAGAA
GCATGCCATCGTTGAGTCTGGAGCTCTTGTCAGGCAGAACACTCGAATTCCCTCCGGCGA
GGTTTGGGGAGGGAATCCAGCTAGATTTCTGAGGAAGGTGACTGAAGAAGAAAGGGCCTT
CTTCTCTACTTCGGCTGCGGATTATTCCAACTTAGCTCAAGTTCACGCTGCGCACAACTC
AAAGAACTTGGACGACACTGATT

QA 2 684 2 684
DS 

RD RR2DK43JQ 608 0 0
GGGACCAATATCCAAGACAACTCCCTTGTCCACGTTGCCAAGTCCAACTTAAACGGCAAG
GTCTTGCCTACTCTCATTGGTGACTATGTCACTATTGGTAACAGTGCTGTTTTACATGGC
TGCACTCTCGAAGACGAGTCTTACATTGGTGCTAGTGCAACCGTCTTGGATGGCGCTCAT
GTTGAGAAGCATGCCATCGTTGAGTCTGGAGCTCTTGTCAGGCAGAACACTCGAATTCCC
TCCGGCGAGGTTTGGGGAGGGAATCCAGCTAGATTTTTGAGGAAGGTGACTGAAGAAGAA
AGGGCCTTTTTCTTTACTTCGGCTGCGGATTATTCCAACTTAGCTCAAGTTCACGCTGCG
CACAACTCAAAGAACTTGGACGACACTGATTTCAAGAAGCTCCTTTACAAGAAGAACGCA
CGTGATGCAGAATATGATTCACTACTCAGTGATTTACTACCCAAAGCAGCTTGAGACTAC
TCTTTACGAAGACCAGAAATTCATTTCCTGCTTTTCCAATAAAGTTTTCTTGTAACTTGA
AAGAAAAAAAAAAGGTTGGAACCTTTTCTTCTGATTGTTTTCTATAATAAAATTTGTTGG
ATCAGACG

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 3

CO CL3519Contig1 644 3 23 U
GGTCTCTGCGAAGCGATGAGGCTTTACCCACCAGTGGCGTGGGACTCAAAGCATGCAGCA
AACGACGACGTTTTACCAGACGGGACACGAGTGAAAAAAGGAGACAAGGTTACTTATTTC
CCTTACGGTATGGGAAGGATGGAGAACGTGTGGGGTCGAGATTGGGACGAGTTTAAACCG
AACCGATGGTTTGAGGAGGAACCAAACTACGGTACAAAACCGGTTTTGAAAAGTGTGAGC
TCGTTCAAGTTTCCTGTGTTCCAAGCCGGGCCAAGGGTTTGTATAGGCAAAGAAATGGCG
TTTATGCAGATGAAATACGTGGTTGGTTCGGTTTTGAGCCGGTTTGAGATCATACCGGTT
TGCGAAAACCGACCGGTACTTGTTCCTCTTCTAACGGCTCACATGGCTGGTGGGCTAAAG
GTTAAGATCAAGAGGAGAAATCATTAGTGATGCCCTATTTAATTAATAAGTCATCGTGTC
CTTATAGAATATTCACCGAATATGTAAAATGTGTGGTTTATACATTAAACCCATTAATAT
ATGTGTGTGTGTGATTCACAGTTTTACACAGCTTGCTTGTGAATATAGACTAATTAATAA
ATCAACACTGAAGTCTTATCAAAGTGCATAGATTTCATTATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM93JQ C 17
AF RR2FM93TF U 17
AF RR2EW79TF U 1
BS 1 23 RR2EW79TF
BS 24 24 RR2FM93TF
BS 25 26 RR2EW79TF
BS 27 27 RR2FM93TF
BS 28 43 RR2EW79TF
BS 44 44 RR2FM93TF
BS 45 77 RR2EW79TF
BS 78 79 RR2FM93TF
BS 80 88 RR2EW79TF
BS 89 89 RR2FM93TF
BS 90 98 RR2EW79TF
BS 99 99 RR2FM93TF
BS 100 157 RR2EW79TF
BS 158 158 RR2FM93TF
BS 159 197 RR2EW79TF
BS 198 198 RR2FM93TF
BS 199 270 RR2EW79TF
BS 271 271 RR2FM93TF
BS 272 355 RR2EW79TF
BS 356 356 RR2FM93TF
BS 357 378 RR2EW79TF
BS 379 379 RR2FM93TF
BS 380 644 RR2EW79TF

RD RR2FM93JQ 505 0 0
G
GAGGCTTTACCCACCAGTGGCGTGGGACTCAAAGCATGCAGCAAACGACGACGTTTTACC
AGACGGGACACGAGTGAAAAAAGGAGACAAGGTTACTTATTTCCCTTACGGTATGGGAAG
GATGGAGAACGTGTGGGGTCGAGATTGGGACGAGTTTAAACCGAACCGATGGTTTGAGGA
GGAACCAAACTACGGTACAAAACCGGTTTTGAAAAGTGTGAGCTCGTTCAAGTTTCCTGT
GTTCCAAGCCGGGCCAAGGGTTTGTATAGGCAAAGAAATGGCGTTTATGCAGATGAAATA
CGTGGTTGGTTCGGTTTTGAGCCGGTTTGAGATCATACCGGTTTGCGAAAACCGACCGGT
ACTTGTTCCTCTTCTAACGGCTCACATGGCTGGTGGGCTAAAGGTTAAGATCAAGAGGAG
AAATCATTAGTGATGCCCTATTTAATTAATAAGTCATCGTGTCCTTATAGAATATTCACC
GAATATGTAAAATGTGTGGTTTAT

QA 2 505 2 505
DS 

RD RR2FM93TF 546 0 0
G
GAGGCTTTACCCACCAGTGGCGTGGGACTCAAAGCATGCAGCAAACGACGACGTTTTACC
AGACGGGACACGAGTGAAAAAAGGAGACAAGGTTACTTATTTCCCTTACGGTATGGGAAG
GATGGAGAACGTGTGGGGTCGAGATTGGGACGAGTTTAAACCGAACCGATGGTTTGAGGA
GGAACCAAACTACGGTACAAAACCGGTTTTGAAAAGTGTGAGCTCGTTCAAGTTTCCTGT
GTTCCAAGCCGGGCCAAGGGTTTGTATAGGCAAAGAAATGGCGTTTATGCAGATGAAATA
CGTGGTTGGTTCGGTTTTGAGCCGGTTTGAGATCATACCGGTTTGCGAAAACCGACCGGT
ACTTGTTCCTCTTCTAACGGCTCACATGGCTGGTGGGCTAAAGGTTAAGATCAAGAGGAG
AAATCATTAGTGATGCCCTATTTAATTAATAAGTCATCGTGTCCTTATAGAATATTCACC
GAATATGTAAAATGTGTGGTTTATACATTAAACCCATTAATATATGTGTGTGTG
ATTCACAGTTT

QA 2 535 2 535
DS 

RD RR2EW79TF 644 0 0
GGTCTCTGCGAAGCGATGAGGCTATATCCACCAGTGGCGTGGGGCTCAAAGCATGCAGCA
AACGACGACGTTTTACCGTACGGGACACAAGTGAAAAAGGGAGACAAGGTTACTTATTTC
CCTTACGGTATGGGAAGGATGGAGAACGTGTGGGGTCAAGATTGGGACGAGTTTAAACCG
AACCGATGGTTTGAGGAAGAACCAAACTACGGTACAAAACCGGTTTTGAAAAGTGTGAGC
TCGTTCAAGTTTCCTGTGTTCCAAGCCGGGTCAAGGGTTTGTATAGGCAAAGAAATGGCG
TTTATGCAGATGAAATACGTGGTTGGTTCGGTTTTGAGCCGGTTTGAGATCATACTGGTT
TGCGAAAACCGACCGGTATTTGTTCCTCTTCTAACGGCTCACATGGCTGGTGGGCTAAAG
GTTAAGATCAAGAGGAGAAATCATTAGTGATGCCCTATTTAATTAATAAGTCATCGTGTC
CTTATAGAATATTCACCGAATATGTAAAATGTGTGGTTTATACATTAAACCCATTAATAT
ATGTGTGTGTGTGATTCACAGTTTTACACAGCTTGCTTGTGAATATAGACTAATTAATAA
ATCAACACTGAAGTCTTATCAAAGTGCATAGATTTCATTATATT

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 3

CO CL3520Contig1 1065 3 2 U
GGAGAGGAGGCTGTCCACACATGGAGACTCTCTCAATCCCCGCCGCTGCTTGGTTTTCAA
GCGGCGCCATTACTCCTCCGAACGCGAGGCTTTCTCCGCCGTACCTTCTCCGGAAACCGC
CGAGCAGAAATTCCCGACGCTTGTCCGCCTTTAACGCCGCTTCTCGCTCCGCAGTGAGTG
AGGTTGTGGGGGAGGATGTGCTGCAGATGTTCTTGAAAGACAGAGAAGAAAACGGAGATT
TCATTTCCAAAGTCTCTGATAGGCTCTGGTTAAGGGAAGTTCTCGAATCTATTGATCTCA
ACTCTAATAGTGCTTCTTCAGCTGTTGTCGGACTAGAATATAATCAGGAGAGCTTGATGG
ATCATGATGAGTATGATGAAAGCGGTTTCTTGAAACTTAAACCGACCCAAGAATGGATCG
TTGGGGAAAGTGATTCCGCCCCCATGAATAGGAAAGCTCTGGCTAAGGCATTACTAGATG
ATAGCGAGCGAAGGAAGAAACTGAACTTTCTGAAATATGAAGCTCTGAAGCGTGAACTGA
TGTACCTGTCAATTGTTATTGGAACCGGGTGCAGCGGATATTGCTTACTAGCTTTATCAC
CCCAGGCTGCAGTAAGTTACGGAGTTGGAGTTCTTTTCAGTTGCTTGTACCTCCAGCTTT
TGTACGGATATGCGGATGGTGTTTCACGTGAAGATGTTCCTAATATCTTCCTGAAAAAGA
AGATTAAAAAAATCGGGATAAGAAGTGAAGACCTTGAAGACTTTGTAAAGAGGACAATCA
GAGGCAGTGGAATGGCACTCTCTTCTCCACGTCTAGTGATCCCAGCTGCAATCTATGCTC
TCTGGATTCTCTCGCACAAGTACTTCCAGAATGACGTGTTCGACTTCCAGATAGTTCCAG
CCATGGTTGGTTTGTTTGTATACAAAGCTGCAGCTCTGGTTCAAGTGTACAGAGACAACC
AAGATCTTCAGTTCATTTTCCCAGACGATCTTTGACCTTCCGAGTTAGACGATTTGTGAT
TTGTTTGGTTCATGATCTCAAAGGGTAACAGAAACTGGACTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DR31TF U 1
AF RR2DR31JQ C 334
AF RR2G283TF U 551
BS 1 576 RR2DR31TF
BS 577 1065 RR2G283TF

RD RR2DR31TF 576 0 0
GGAGAGGAGGCTGTCCACACATGGAGACTCTCTCAATCCCCGCCGCTGCTTGGTTTTCAA
GCGGCGCCATTACTCCTCCGAACGCGAGGCTTTCTCCGCCGTACCTTCTCCGGAAACCGC
CGAGCAGAAATTCCCGACGCTTGTCCGCCTTTAACGCCGCTTCTCGCTCCGCAGTGAGTG
AGGTTGTGGGGGAGGATGTGCTGCAGATGTTCTTGAAAGACAGAGAAGAAAACGGAGATT
TCATTTCCAAAGTCTCTGATAGGCTCTGGTTAAGGGAAGTTCTCGAATCTATTGATCTCA
ACTCTAATAGTGCTTCTTCAGCTGTTGTCGGACTAGAATATAATCAGGAGAGCTTGATGG
ATCATGATGAGTATGATGAAAGCGGTTTCTTGAAACTTAAACCGACCCAAGAATGGATCG
TTGGGGAAAGTGATTCCGCCCCCATGAATAGGAAAGCTCTGGCTAAGGCATTACTAGATG
ATAGCGAGCGAAGGAAGAAACTGAACTTTCTGAAATATGAAGCTCTGAAGCGTGAACTGA
TGTACCTGTCAATTGTTATTGGAACCGGGTGCAGCG

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2DR31JQ 732 0 0
TAGAATATAATCAGGAGAGCTTGATGGATCATGATGAGTATGATGAAAGCGGTTTCTTGA
AACTTAAACCGACCCAAGAATGGATCGTTGGGGAAAGTGATTCCGCCCCCATGAATAGGA
AAGCTCTGGCTAAGGCATTACTAGATGATAGCGAGCGAAGGAAGAAACTGAACTTTCTGA
AATATGAAGCTCTGAAGCGTGAACTGATGTACCTGTCAATTGTTATTGGAACCGGGTGCA
GCGGATATTGCTTACTAGCTTTATCACCCCAGGCTGCAGTAAGTTACGGAGTTGGAGTTC
TTTTCAGTTGCTTGTACCTCCAGCTTTTGTACGGATATGCGGATGGTGTTTCACGTGAAG
ATGTTCCTAATATCTTCCTGAAAAAGAAGATTAAAAAA*TCGGGATAAGAAGTGAAGACC
TTGAAGACTTTGTAAAGAGGACAATCAGAGGCAGTGGAATGGCACTCTCTTCTCCACGTC
TAGTGATCCCAGCTGCAATCTATGCTCTCTGGATTCTCTCGCACAAGTACTTCCAGAATG
ACGTGTTCGACTTCCAGATAGTTCCAGCCATGGTTGGTTTGTTTGTATACAAAGCTGCAG
CTCTGGTTCAAGTGTACAGAGACAACCAAGATCTTCGGTTCATTTTCCCAGACGATCTTT
GACCTTCCGAGTTAGACGATTTGTGATTTGTTTGGTTCATGATCTCAAAGGGTAACAGAA
ACTGGACTCATC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2G283TF 515 0 0
G
ATTGTTATTGGAACCGGGTGCAGCGGATATTGCTTACTAGCTTTATCACCCCAGGCTGCA
GTAAGTTACGGAGTTGGAGTTCTTTTCAGTTGCTTGTACCTCCAGCTTTTGTACGGATAT
GCGGATGGTGTTTCACGTGAAGATGTTCCTAATATCTTCCTGAAAAAGAAGATTAAAAAA
ATCGGGATAAGAAGTGAAGACCTTGAAGACTTTGTAAAGAGGACAATCAGAGGCAGTGGA
ATGGCACTCTCTTCTCCACGTCTAGTGATCCCAGCTGCAATCTATGCTCTCTGGATTCTC
TCGCACAAGTACTTCCAGAATGACGTGTTCGACTTCCAGATAGTTCCAGCCATGGTTGGT
TTGTTTGTATACAAAGCTGCAGCTCTGGTTCAAGTGTACAGAGACAACCAAGATCTTCAG
TTCATTTTCCCAGACGATCTTTGACCTTCCGAGTTAGACGATTTGTGATTTGTTTGGTTC
ATGATCTCAAAGGGTAACAGAAACTGGACTCATC

QA 2 515 2 515
DS 



AS 1 3

CO CL3521Contig1 1042 3 15 U
GCATGGTTCAGCCAAACTCGCTCGTCAAGCTCAGAGCAAGGAGAAGACTTTGGCAAAGAT
GGAGAGAGGTGGGCTCACAGAGAAGGTGGCAAGAGACAGTGTTCTCGTTTTCCGTTTTGC
TGATGTCGGGAAGCTTCCACCTCCAGTGCTTCAGTTTGTGGAAGTGTCTTTCGGGTACAC
GCCGGACTATCTTATATACAAGAACATCGACTTTGGTGTTGACTTGGACTCGAGGGTTGC
TCTTGTTGGACCCAACGGAGCTGGGAAGAGTACTTTATTGAAGTTAATGACTGGTGAGCT
GCACCCAACTGAAGGAATGGTGAGGCGTCACAACCACCTGAAGATTGCTCAGTACCATCA
GCATCTAGCTGAGAAGCTAGACCTGGAAGTGCCTGCGCTTATCTACATGATGAATGAGTT
TCCAGGCAACGAAGAGGGGAAGATGAGAGCTGCCATTGGTAGGTTCGGTCTAACCGGTAA
GGCACAGGTGATGCCGATGAAGAATCTTTCCGATGGACAGAGGAGCCGTGTGATATTCGC
GTGGTTGGCTTATAAGCAGCCTAACATGCTTCTGTTGGATGAGCCTACTAACCATTTGGA
TATTGAGACGATTGACTCTCTAGCCGAGGCGTTGAACGAGTGGGATGGTGGTTTGGTTCT
GGTGAGTCATGACTTCAGGTTGATTAACCAAGTGGCTCATGAGATATGGGTGTGTGAGAA
GCAGTGCATAACTAAATGGAATGGTGACATTATGGATTTCAAGAAGCATCTCAAGGCTAA
AGCTGGACTTGAAGATTGAAGATAAAGAGTCAAGTTAGAAGACTGTATTTGGGTCTTCGC
TAGAGAGTGAGAGGGATGGTTTTGGGAATGGTTATTAACGAGTTCTGAAGCCAACACGTT
AGAGGGAAAGAGACACCATGCTCGTAACCTCTGCAACTTCTTACTCATTAAGAGGTCAGT
GGTTCTATATCATTATTAGTAATGTGCACTTTTATTATTGTTCTTGAACGTTTTTTTGAA
GGCGAAACGGAGGTGGAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX85TF U 1
AF RR2EV94TF U 153
AF RR2EV94JQ C 319
BS 1 210 RR2BX85TF
BS 211 211 RR2EV94TF
BS 212 337 RR2BX85TF
BS 338 338 RR2EV94TF
BS 339 390 RR2BX85TF
BS 391 391 RR2EV94TF
BS 392 414 RR2BX85TF
BS 415 415 RR2EV94TF
BS 416 437 RR2BX85TF
BS 438 438 RR2EV94TF
BS 439 621 RR2BX85TF
BS 622 622 RR2EV94TF
BS 623 657 RR2BX85TF
BS 658 830 RR2EV94TF
BS 831 1042 RR2EV94JQ

RD RR2BX85TF 657 0 0
GCATGGTTCAGCCAAACTCGCTCGTCAAGCTCAGAGCAAGGAGAAGACTTTGGCAAAGAT
GGAGAGAGGTGGGCTCACAGAGAAGGTGGCAAGAGACAGTGTTCTCGTTTTCCGTTTTGC
TGATGTCGGGAAGCTTCCACCTCCAGTGCTTCAGTTTGTGGAAGTGTCTTTCGGGTACAC
GCCGGACTATCTTATATACAAGAACATCGATTTTGGTGTTGACTTGGACTCGAGGGTTGC
TCTTGTTGGACCCAACGGAGCTGGGAAGAGTACTTTATTGAAGTTAATGACTGGTGAGCT
GCACCCAACTGAAGGAATGGTGAGGCGTCACAACCACTTGAAGATTGCTCAGTACCATCA
GCATCTAGCTGAGAAGCTAGACCTGGAAGTACCTGCGCTTATCTACATGATGAACGAGTT
TCCAGGCAACGAAGAGGAGAAGATGAGAGCTGCCATTGGTAGGTTCGGTCTAACCGGTAA
GGCACAGGTGATGCCGATGAAGAATCTTTCCGATGGACAGAGGAGCCGTGTGATATTCGC
GTGGTTGGCTTATAAGCAGCCTAACATGCTTCTGTTGGATGAGCCTACTAACCATTTGGA
TATTGAGACGATTGACTCTCTGGCCGAGGCGTTGAACGAGTGGGATGGTGGTTTGGT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2EV94TF 678 0 0
G
GTTTGTGGAAGTGTCTTTCGGGTACACGCCGGACTATCTTATATACAAGAACATCGACTT
TGGTGTTGACTTGGACTCGAGGGTTGCTCTTGTTGGACCCAACGGAGCTGGGAAGAGTAC
TTTATTGAAGTTAATGACTGGTGAGCTGCACCCAACTGAAGGAATGGTGAGGCGTCACAA
CCACCTGAAGATTGCTCAGTACCATCAGCATCTAGCTGAGAAGCTAGACCTGGAAGTGCC
TGCGCTTATCTACATGATGAATGAGTTTCCAGGCAACGAAGAGGGGAAGATGAGAGCTGC
CATTGGTAGGTTCGGTCTAACCGGTAAGGCACAGGTGATGCCGATGAAGAATCTTTCCGA
TGGACAGAGGAGCCGTGTGATATTCGCGTGGTTGGCTTATAAGCAGCCTAACATGCTTCT
GTTGGATGAGCCTACTAACCATTTGGATATTGAGACGATTGACTCTCTAGCCGAGGCGTT
GAACGAGTGGGATGGTGGTTTGGTTCTGGTGAGTCATGACTTCAGGTTGATTAACCAAGT
GGCTCATGAGATATGGGTGTGTGAGAAGCAGTGCATAACTAAATGGAATGGTGACATTAT
GGATTTCAAGAAGCATCTCAAGGCTAAAGCTGGACTTGAAGATTGAAGATAAAGAGTCAA
GTTAGAAGACTGTATTT

QA 2 678 2 678
DS 

RD RR2EV94JQ 724 0 0
GGTGAGGCGTCACAACCAC*TGAAGATTGCTCAGTACCATCAGCATCTAGCTGAGAAGCT
AGACCTGGAAGTGCCTGCGCTTATCTACATGATGAATGAGTTTCCAGGCAACGAAGAGGG
GAAGATGAGAGCTGCCATTGGTAGGTTCGGTCTAACCGGTAAGGCACAGGTGATGCCGAT
GAAGAATCTTTCCGATGGACAGAGGAGCCGTGTGATATTCGCGTGGTTGGCTTATAAGCA
GCCTAACATGCTTCTGTTGGATGAGCCTACTAACCATTTGGATATTGAGACGATTGACTC
TCTAGCCGAGGCGTTGAACGAGTGGGATGGTGGTTTGGTTCTGGTGAGTCATGACTTCAG
GTTGATTAACCAAGTGGCTCATGAGATATGGGTGTGTGAGAAGCAGTGCATAACTAAATG
GAATGGTGACATTATGGATTTCAAGAAGCATCTCAAGGCTAAAGCTGGACTTGAAGATTG
AAGATAAAGAGTCAAGTTAGAAGACTGTATTTGGGTCTTCGCTAGAGAGTGAGAGGGATG
GTTTTGGGAATGGTTATTAACGAGTTCTGAAGCCAACACGTTAGAGGGAAAGAGACACCA
TGCTCGTAACCTCTGCAACTTCTTACTCATTAAGAGGTCAGTGGTTCTATATCATTATTA
GTAATGTGCACTTTTATTATTGTTCTTGAACGTTTTTTTGAAGGCGAAACGGAGGTGGAA
AAAA

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 3

CO CL3522Contig1 975 3 6 U
GGAACCAAAGGTTTGTTCTTTTAGATCTTCGCTTCGCTTCGCTTCGCTTCTAACCCCCCG
CCGTCGCTTCTCACCGCTTTAACAACCCAATGGCCACTCAAGCTGTTGCTGCTGCCTCTT
TCAATGGCAACCTTAAGAAAGCTGTGGCAGGTATCAAGCGTATCAATCTCGACGGTCTTC
GTTGGCGTGTTTTTGATGCCAAAGGCCAGGTTCTCGGTAGACTTGCCTCTCAGATCTCTA
CCGTCCTTCAAGCCAAAGATAAGCCTACTTATTGTCCTAACCGTGATGATGGCGATATTT
GTATCGTTCTCAATGCTAAGGATATCGGCATCACCGGTCGAAAGCTCACCGACAAGTTCT
ACCGCTGGCATACTGGGTACGTTGGACACCTGAAAGAACGGAGTCTCAAAGATCAGATGG
CCAAAGACCCCACCGAGGTCATCCGTAAGGCTGTCTGGCGCATGCTTCCTACTAACAACT
TGCGTGATGATAGAGATCGGAAGCTGAGGATCTTTGAAGGCAATGAGCATCCTTTTGGGG
ACAAGCCACTCGAGCCTTTCGTCATGCCTCCTCGTACCGTGAGAGAGATGCGACCCCGCG
CTAGACGTGCTATGATCCGTGCCCAGAAGAAGGCAGAGCTGGCAGAAAATGGTGGAACTG
AGGTTAAGAAAGGCAAGAAGAGGACTCCCTCTCAAGTAACTACTGCTTAGAAGAAAAGCT
TCAGACAGGAACTTAGTAGTGTGATTCGTGTCTTTATATAATAGGCGGCAGGCGTGGATA
AGCTTGTAAGGTTTTCTTGTTTCTGGATGCCAGACAATAATATACTCTCGTTTCTGTTTA
TCTTCCCCTTTTCTTCCATTTCACACCCAGTGCCCCTGCTCGATTACACAAGTGTCGCTA
GCAGGCTTTTGTTCTCTCGGTCGTTTGTTTGTTATCATCCAAATTTTTATTTTTACATGA
TTGCATTGTTTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ95TF U 47
AF RR2FY79TF U 1
AF RR2FY79JQ C 258
BS 1 230 RR2FY79TF
BS 231 231 RR2BJ95TF
BS 232 241 RR2FY79TF
BS 242 242 RR2BJ95TF
BS 243 662 RR2FY79TF
BS 663 975 RR2FY79JQ

RD RR2BJ95TF 553 0 0
AGATCTTCGCTT
CGCCGTCGCTTCTCACCGCTTTAACAACCCAATGGCCACTCAAGCTG***CTGCTGCCTC
TTTCAATGGCAACCTTAAGAAAGCTGTGGCAGGTATCAAGCGTATCAATCTCGACGGTCT
TCGTTGGCGTGTTTTTGATGCCAAAGGCCAGGTTCTCGGTAGACTTGCCTCTCAGATCTC
TACCGTCCTTCAAGCCAAAGATAAGCCTACTTATTGTCCTAACCGTGATGATGGCGATAT
TTGTATCGTTCTCAATGCTAAGGATATCGGCATCACCGGTCGAAAGCTCACCGACAAGTT
CTACCGCTGGCATACTGGGTACGTTGGACACCTGAAAGAACGGAGTCTCAAAGATCAGAT
GGCCAAAGACCCCACCGAGGTCATCCGTAAGGCTGTCTGGCGCATGCTTCCTACTAACAA
CTTGCGTGATGACAGAGATCGGAAGCTGAGGATCTTTGAAGGCAATGAGCATCCTTTTGG
GGACAAGCCACTCGAGCCATTCGTCATGCCTCCTCGTACCGTGATAGAGATGCGACCCCG
C

QA 13 553 13 553
DS 

RD RR2FY79TF 667 0 0
GGAACCAAAGGTTTGTTCTTTTAGATCTTCGCTTCGCTTCGCTTCGCTTCTAACCCCCCG
CCGTCGCTTCTCACCGCTTTAACAACCCAATGGCCACTCAAGCTGTTGCTGCTGCCTCTT
TCAATGGCAACCTTAAGAAAGCTGTGGCAGGTATCAAGCGTATCAATCTCGACGGTCTTC
GTTGGCGTGTTTTTGATGCCAAAGGCCAGGTTCTCGGTAGACTTGCCTCTTAGATCTCTA
CTGTCCTTCAAGCCAAAGATAAGCCTACTTATTGTCCTAACCGTGATGATGGCGATATTT
GTATCGTTCTCAATGCTAAGGATATCGGCATCACCGGTCGAAAGCTCACCGACAAGTTCT
ACCGCTGGCATACTGGGTACGTTGGACACCTGAAAGAACGGAGTCTCAAAGATCAGATGG
CCAAAGACCCCACCGAGGTCATCCGTAAGGCTGTCTGGCGCATGCTTCCTACTAACAACT
TGCGTGATGATAGAGATCGGAAGCTGAGGATCTTTGAAGGCAATGAGCATCCTTTTGGGG
ACAAGCCACTCGAGCCTTTCGTCATGCCTCCTCGTACCGTGAGAGAGATGCGACCCCGCG
CTAGACGTGCTATGATCCGTGCCCAGAAGAAGGCAGAGCTGGCAGAAAATGGTGGAACTG
AG
TTAAG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2FY79JQ 718 0 0
GATAAGCCTACTTATTGTCCTAACCGTGATGATGGCGATATTTGTATCGTTCTCAATGCT
AAGGATATCGGCATCACCGGTCGAAAGCTCACCGACAAGTTCTACCGCTGGCATACTGGG
TACGTTGGACACCTGAAAGAACGGAGTCTCAAAGATCAGATGGCCAAAGACCCCACCGAG
GTCATCCGTAAGGCTGTCTGGCGCATGCTTCCTACTAACAACTTGCGTGATGATAGAGAT
CGGAAGCTGAGGATCTTTGAAGGCAATGAGCATCCTTTTGGGGACAAGCCACTCGAGCCT
TTCGTCATGCCTCCTCGTACCGTGAGAGAGATGCGACCCCGCGCTAGACGTGCTATGATC
CGTGCCCAGAAGAAGGCAGAGCTGGCAGAAAATGGTGGAACTGAGGTTAAGAAAGGCAAG
AAGAGGACTCCCTCTCAAGTAACTACTGCTTAGAAGAAAAGCTTCAGACAGGAACTTAGT
AGTGTGATTCGTGTCTTTATATAATAGGCGGCAGGCGTGGATAAGCTTGTAAGGTTTTCT
TGTTTCTGGATGCCAGACAATAATATACTCTCGTTTCTGTTTATCTTCCCCTTTTCTTCC
ATTTCACACCCAGTGCCCCTGCTCGATTACACAAGTGTCGCTAGCAGGCTTTTGTTCTCT
CGGTCGTTTGTTTGTTATCATCCAAATTTTTATTTTTACATGATTGCATTGTTTGCTT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 3

CO CL3523Contig1 905 3 19 U
CTGATGGAGAAGATAGCTGAGAAGATCCACGATCACGATTCATCATCGTCGTCGGACTCG
GAGCACGAGAAACCGGAGTCTCCGTCGGCTTTGAAGTCGAAGATATACCGTTTGTTTGGT
AGGGAGAAGCCTGTTCACAAGGTTCTCGGCGGTGGCTTGCCCGCTGATGTGTTCTTGTGG
AGGGACAAAAAGCTCTCAGCCGCTGTTCTCGGTGTAGCGACTGCCATATGGGTTCTGTTC
GAGTTGGTTGAGTATCATTTGTTGAGTCTTGCGTGTCACATTTTGATATTCTCCCTCGCT
GCCATGTTTTTGTGGTCTAATGCTCATGCCTTTATGAAAAAGCCTCCACCTAAAATTCTT
GAGATCCATGTTAAAGAGGAACACTTCCTTTTGATTGCTTCTGCACTGAGAAACGAGCTG
AACCAGGCCTTCGTTATCCTAAGGAGCATTGCATTAGGAAGGGACTTGAAGAAGTTTCTC
ATGGTGGTTGTTGGGCTATGGATAATCTCTGTTGTGGGCAACTGGTTCAATTTCTTGACC
CTTGTCTACATATGTTTTGTGGTGTTGCATACGGTACCTATGCTGTATGAGAAACATGAT
GACAAGGTGGATCCAGTGGCGGAGAAGACGATAAATGAACTGAAGAAACATTACATGGTT
TTCGATGAGAAAGTTCTTTCTAAGATCCCTCTTGCTTCCCTGAAAGCAAAGTTGGGTTAG
ACACTTTATAATGAAAGTAACTATCTCTCTATATCCCCTTTGACGTTTTGTTTTGGTCTT
GGGGCATTTCTGTTTATTTATATTTCTACACAAGACTCGATAAGAATCTGTTACTCTGCT
TTTACTTGTGTTCATTTCTATCATTTGGCGTGAGCATTTTTGGGGGCTATTTGATGTGAA
CGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2AL12TF U 1
AF RR2FC33TF U 36
AF RR2FC33JQ C 137
BS 1 88 RR2AL12TF
BS 89 89 RR2FC33TF
BS 90 95 RR2AL12TF
BS 96 96 RR2FC33TF
BS 97 216 RR2AL12TF
BS 217 217 RR2FC33TF
BS 218 305 RR2AL12TF
BS 306 306 RR2FC33TF
BS 307 358 RR2AL12TF
BS 359 359 RR2FC33TF
BS 360 599 RR2AL12TF
BS 600 600 RR2FC33TF
BS 601 705 RR2AL12TF
BS 706 799 RR2FC33TF
BS 800 800 RR2FC33JQ
BS 801 812 RR2FC33TF
BS 813 813 RR2FC33JQ
BS 814 823 RR2FC33TF
BS 824 905 RR2FC33JQ

RD RR2AL12TF 705 0 0
CTGATGGAGAAGATAGCTGAGAAGATCCACGATCACGATTCATCATCGTCGTCGGACTCG
GAGCACGAGAAACCGGAGTCTCCGTCGGTTTTGAATTCGAAGATATACCGTTTGTTTGGT
AGGGAGAAGCCTGTTCACAAGGTTCTCGGCGGTGGCTTGCCCGCTGATGTGTTCTTGTGG
AGGGACAAAAAGCTCTCAGCCGCTGTTCTCGGTGTAACGACTGCCATATGGGTTCTGTTC
GAGTTGGTTGAGTATCATTTGTTGAGTCTTGCGTGTCACATTTTGATATTCTCCCTCGCT
GCCATTTTTTTGTGGTCTAATGCTCATGCCTTTATGAAAAAGCCTCCACCTAAAATTCCT
GAGATCCATGTTAAAGAGGAACACTTCCTTTTGATTGCTTCTGCACTGAGAAACGAGCTG
AACCAGGCCTTCGTTATCCTAAGGAGCATTGCATTAGGAAGGGACTTGAAGAAGTTTCTC
ATGGTGGTTGTTGGGCTATGGATAATCTCTGTTGTGGGCAACTGGTTCAATTTCTTGACC
CTTGTCTACATATGTTTTGTGGTGTTGCATACGGTACCTATGCTGTATGAGAAACATGAG
GACAAGGTGGATCCAGTGGCGGAGAAGACGATAAATGAACTGAAGAAACATTACATGGTT
TTCGATGAGAAAGTTCTTTCTAAGATCCCTCTTGCTTCCCTGAAA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2FC33TF 790 0 0
G
GATTCATCATCGTCGTCGGACTCGGAGCACGAGAAACCGGAGTCTCCGTCGGCTTTGAAG
TCGAAGATATACCGTTTGTTTGGTAGGGAGAAGCCTGTTCACAAGGTTCTCGGCGGTGGC
TTGCCCGCTGATGTGTTCTTGTGGAGGGACAAAAAGCTCTCAGCCGCTGTTCTCGGTGTA
GCGACTGCCATATGGGTTCTGTTCGAGTTGGTTGAGTATCATTTGTTGAGTCTTGCGTGT
CACATTTTGATATTCTCCCTCGCTGCCATGTTTTTGTGGTCTAATGCTCATGCCTTTATG
AAAAAGCCTCCACCTAAAATTCTTGAGATCCATGTTAAAGAGGAACACTTCCTTTTGATT
GCTTCTGCACTGAGAAACGAGCTGAACCAGGCCTTCGTTATCCTAAGGAGCATTGCATTA
GGAAGGGACTTGAAGAAGTTTCTCATGGTGGTTGTTGGGCTATGGATAATCTCTGTTGTG
GGCAACTGGTTCAATTTCTTGACCCTTGTCTACATATGTTTTGTGGTGTTGCATACGGTA
CCTATGCTGTATGAGAAACATGATGACAAGGTGGATCCAGTGGCGGAGAAGACGATAAAT
GAACTGAAGAAACATTACATGGTTTTCGATGAGAAAGTTCTTTCTAAGATCCCTCTTGCT
TCCCTGAAAGCAAAGTTGGGTTAGACACTTTATAATGAAAGTAACTATCTCTCTATATCC
CCTTTGACGTTTTGTTTTGGTCTTGGGGCATTTCTGTTTATTT*TATTTCTACACA*GAC
TCGATAA
AA

QA 2 788 2 788
DS 

RD RR2FC33JQ 769 0 0
ACAAGGTTCTCGGCGGTGGCTTGCCCGCTGATGTGTTCTTGTGGAGGGACAAAAAGCTCT
CAGCCGCTGTTCTCGGTGTAGCGACTGCCATATGGGTTCTGTTCGAGTTGGTTGAGTATC
ATTTGTTGAGTCTTGCGTGTCACATTTTGATATTCTCCCTCGCTGCCATGTTTTTGTGGT
CTAATGCTCATGCCTTTATGAAAAAGCCTCCACCTAAAATTCTTGAGATCCATGTTAAAG
AGGAACACTTCCTTTTGATTGCTTCTGCACTGAGAAACGAGCTGAACCAGGCCTTCGTTA
TCCTAAGGAGCATTGCATTAGGAAGGGACTTGAAGAAGTTTCTCATGGTGGTTGTTGGGC
TATGGATAATCTCTGTTGTGGGCAACTGGTTCAATTTCTTGACCCTTGTCTACATATGTT
TTGTGGTGTTGCATACGGTACCTATGCTGTATGAGAAACATGATGACAAGGTGGATCCAG
TGGCGGAGAAGACGATAAATGAACTGAAGAAACATTACATGGTTTTCGATGAGAAAGTTC
TTTCTAAGATCCCTCTTGCTTCCCTGAAAGCAAAGTTGGGTTAGACACTTTATAATGAAA
GTAACTATCTCTCTATATCCCCTTTGACGTTTTGTTTTGGTCTTGGGGCATTTCTGTTTA
TTTATATTTCTACACAAGACTCGATAAGAATCTGTTACTCTGCTTTTACTTGTGTTCATT
TCTATCATTTGGCGTGAGCATTTTTGGGGGCTATTTGATGTGAACGATG

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL3524Contig1 911 2 2 U
GACGCTCTGTATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTGTGTTGGT
CTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGGTGGCTTCTCTCCGCATTTA
ACGCTTTCGAAGTTGAAGCAAGCAGCTGCCGAAGAAGAAGGAAGCCGACTCTCTCTCTCT
CTTTTCGCTTAGGCTAATTTGGAAGATCTTTTGGCTCTCAGACCAACTCACAAGCAAGAG
CTTACCGACGAACAATATGTCAGAAAATGGTAAATAGCGTGGAGATGGAAGTGCAGAGCT
GGTAAAATCCTTGGGTGATAAGCACGCCAGTGTTATCAGACCAGCTGCTAGATACTACTC
TGCTATTAAAGATGCTATGGTTTGTGGGAAAGGAAGATATACGCTTGTAAAAGACGTGGA
TGATGTTGAAAATGGAGCGTATGACAAACCTCTCCCATGCTTCGGTTGCGGAATAGGATG
GTTCTCCTTCCTCCTGGGTTTTGTGTTCCCTTTCTTGTGGTACTATGCGACATTTCTCTA
TTTCGGGAACTACTACCGGAAGGATCCTAGAGAAAGAGCCGGCCTTGCTGCTTCCGCAAT
CACTGCGATGGGGTTCTCTCTCTTGCTACTGGTGATTATTGTTTTCAGGTGGTTTTAATG
GCCTTCTTCTTACGTATACACACACCATACTCTTGAGTTATATATGTATGTATAATCTTG
GTCCCGTCCTTGTCAAAAGGATTATAGAGGAGGGACTTAGATATGTGTCTTGTACATTCA
ATATATACCCAAAATACAGATATTATTATATCTCCTGTTTACTTAACCCTCTGTATCATT
TTCTTCTCACAGTCTATAATGTGTACAAAGGAACAGAAAATAAAATAAAACAAATAAATT
GTTGGTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH63TF U 1
AF RR2BH63JQ C 361
BS 1 734 RR2BH63TF
BS 735 911 RR2BH63JQ

RD RR2BH63TF 734 0 0
GACGCTCTGTATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTGTGTTGGT
CTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGGTGGCTTCTCTCCGCATTTA
ACGCTTTCGAAGTTGAAGCAAGCAGCTGCCGAAGAAGAAGGAAGCCGACTCTCTCTCTCT
CTTTTCGCTTAGGCTAATTTGGAAGATCTTTTGGCTCTCAGACCAACTCACAAGCAAGAG
CTTACCGACGAACAATATGTCAGAAAATGGTAAATAGCGTGGAGATGGAAGTGCAGAGCT
GGTAAAATCCTTGGGTGATAAGCACGCCAGTGTTATCAGACCAGCTGCTAGATACTACTC
TGCTATTAAAGATGCTATGGTTTGTGGGAAAGGAAGATATACGCTTGTAAAAGACGTGGA
TGATGTTGAAAATGGAGCGTATGACAAACCTCTCCCATGCTTCGGTTGCGGAATAGGATG
GTTCTCCTTCCTCCTGGGTTTTGTGTTCCCTTTCTTGTGGTACTATGCGACATTTCTCTA
TTTCGGGAACTACTACCGGAAGGATCCTAGAGAAAGAGCCGGCCTTGCTGCTTCCGCAAT
CACTGCGATGGGGTTCTCTCTCTTGCTACTGGTGATTATTGTTTTCAGGTGGTTTTAATG
GCCTTCTTCTTACGTATACACACACCATACTCTTGAGTTATATATGTATGTATAATCTTG
GTCCCGTCCTTGTC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2BH63JQ 551 0 0
TGCTATTAAAGATGCTATGGTTTGTGGGAAAGGAAGATATACGCTTGTAAAAGACGTGGA
TGATGTTGAAAATGGAGCGTATGACAAACCTCTCCCATGCTTCGGTTGCGGAATAGGATG
GTTCTCCTTCCTCCTGGGTTTTGTGTTCCCTTTCTTGTGGTACTATGCGACATTTCTTTA
TTTCGGGAACTACTACCGGAAGGATCCTAGAGAAAGAGCCGGCCTTGCTGCTTCCGCAAT
CACTGCGATGGGGTTCTCTCTCTTGCTACTGGTGATTATTGTTTTCAGGTGGTTTTAATG
GCCTTCTTCTTACGTATACACACACCATACTCTTGAGTTATATATGTATGTATAATCTTG
GTCCCGTCCTTGTCAAAAGGATTATAGAGGAGGGACTTAGATATGTGTCTTGTACATTCA
ATATATACCCAAAATACAGATATTATTATATCTCCTGTTTACTTAACCCTCTGTATCATT
TTCTTCTCACAGTCTATAATGTGTACAAAGGAACAGAAAATAAAATAAAACAAATAAATT
GTTGGTTGTTT

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 3

CO CL3525Contig1 708 3 12 U
GGAATCAATAACAGGAGAAATATGTTTTAAGAATTTTGTTTTGGAAATTGGACTATATAT
ATGTCCTCACTCATATATCCTTGTTCATATTCATAGTGAGCTTAGTCTGCAAAAGAAAAT
ACGTGAGCTTCTTTACAGTCAGTTTCTGTTATCTAAAATGGCAACCAATCTTAACACCAT
TGTTCTCTCCATCGTTATGTTACATCTGGGTCTGACTGCTCAAATGCATCCAATACACTC
TGAGCCTCCTGCCCCACAACCACATCCACCACAGTCCCAACCGCAACCACCGCATCACAA
TAGCTCCCAATACGGTACTACTGAAGGCAGTCTTCAACCCCAAGAGTGTGGGCCACGGTG
TGGAGATAGATGCTCGAATACACAATACAAGAAGCCATGTTTGTTCTTCTGTAACAAATG
TTGTGCCAAGTGCTTGTGTGTGCCTCCAGGTACTTATGGCAACAAGCAAGTCTGTCCTTG
TTACAATAACTGGAAGACTCAGCTCGGTGGACCCAAATGCCCTTGATTTATCCTCTTAAT
GCATAACTCCATGTAGTTTGTTAAACTATCTATACCATAATGTTCTATATGTATTGGACT
CATTGCCGTATTGGCATATATATTCACATCAATAGGACCAAGTCAAAAGTGCTTTGATGC
TTACTTGTACTTTATAAAGACTTTGAGTGCAAATAAAAAATTTCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR25TF U 1
AF RR2CW63TF U 93
AF RR2CW63JQ C 273
BS 1 127 RR2FR25TF
BS 128 128 RR2CW63TF
BS 129 281 RR2FR25TF
BS 282 282 RR2CW63TF
BS 283 532 RR2FR25TF
BS 533 533 RR2CW63TF
BS 534 583 RR2FR25TF
BS 584 592 RR2CW63TF
BS 593 617 RR2FR25TF
BS 618 621 RR2CW63TF
BS 622 682 RR2FR25TF
BS 683 708 RR2CW63TF

RD RR2FR25TF 688 0 0
GGAATCAATAACAGGAGAAATATGTTTTAAGAATTTTGTTTTGGAAATTGGACTATATAT
ATGTCCTCACTCATATATCCTTGTTCATATTCATAGTGAGCTTAGTCTGCAAAAGAAAAT
ACGTGAGTTTCTTTACAGTCAGTTTCTGTTATCTAAAATGGCAACCAATCTTAACACCAT
TGTTCTCTCCATCGTTATGTTACATCTGGGTCTGACTGCTCAAATGCATCCAATACACTC
TGAGCCTCCTGCCCCACAACCACATCCACCACAGTCCCAACTGCAACCACCGCATCACAA
TAGCTCCCAATACGGTACTACTGAAGGCAGTCTTCAACCCCAAGAGTGTGGGCCACGGTG
TGGAGATAGATGCTCGAATACACAATACAAGAAGCCATGTTTGTTCTTCTGTAACAAATG
TTGTGCCAAGTGCTTGTGTGTGCCTCCAGGTACTTATGGCAACAAGCAAGTCTGTCCTTG
TTACAATAACTGGAAGACTCAGCTCGGTGGACCCAAATGCCCTTGATTTATCTTCTTAAT
GCATAACTCCATGTAGTTTGTTAAACTATCTATACCATAATGT*********ATTGGACT
CATTGCCGTATTGGCAT****ATTCACATCAATAGGACCAAGTCAAAAGTGCTTTGATGC
TTACTTGTACTTTATAAAGACT
GAGTGC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2CW63TF 616 0 0
ATAGTGAGCTTAGTCTGCAAAAGAAAATACGTGAGCTTCTTTACAGTCAGTTTCTGTTGT
CTAAAATGTCAACCAATCTTAACACCATTGTTCTCTCCATCGTTATGTTACATCTTGGTC
TGACTGCTCAAATGCATCCAATACACTCTGAGTCTCCTGCCCCACAACCACATCCACCAC
AGTCCCAACCGCAACCACCGCATCACAATAGCTCCCAATACGGTACTACTGAAGGCAGTC
TTCAACCCCAAGAGTGTGGGCCACGGTGTGGAGATAGATGCTCGAATACACAATACAAGA
AGCCATGTTTGTTCTTCTGTAACAAATGTTGTGCCAAGTGCTTGTGTGTGCCTCCAGGTA
CTTATGGCAACAAGCAAGTCTGTCCTTGTTACAATAACTGGAAGACTCAGCTCGGTGGAC
CCAAATGCCCTTGATTTATCCTCTTAATGCATAACTCCATGTAGTTTGTTAAACTATCTA
TACCATAATGTTCTATATGTATTGGACTCATTGCCGTATTGGCATATATATTCACATCAA
TAGGACCAAGTCAAAAGTGCTTTGATGCTTACTTGTACTTTATAAAGACTTTGAGTGCAA
ATAAAAAATTTCTTAT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2CW63JQ 428 0 0
AGTCCCAACCGCAACCACCGCATCACAATAGCTCCCAATACGGTACTACTGAAGGCAGTC
TTCAACCCCAAGAGTGTGGGCCACGGTGTGGAGATAGATGCTCGAATACACAATACAAGA
AGCCATGTTTGTTCTTCTGTAACAAATGTTGTGCCAAGTGCTTGTGTGTGCCTCCAGGTA
CTTATGGCAACAAGCAAGTCTGTCCTTGTTACAATAACTGGAAGACTCAGCTCGGTGGAC
CCAAATGCCCTTGATTTATCCTCTTAATGCATAACTCCATGTAGTTTGTTAAACTATCTA
TACCATAATGTTCTATATGTATTGGACTCATTGCCGTATTGGCATATATATTCACATCAA
TAGGACCAAGTCAAAAGTGCTTTGATGCTTACTTGTACTTTATAAAGACTTTGAGTGCAA
ATAAAAAA

QA 1 428 1 428
DS 



AS 1 3

CO CL3526Contig1 505 3 1 U
CATCAAAAGTATACGTGTTGAGTTACCATTAGTTATCTAAACGTAAACCTACGTGTCAAC
AATAAAACTAACAAACATAACAAACCATCTCGTCATCGGAACCAGCAACAGCTTACTGTC
TCCGGCGAGACTCTCAATTTTTTATCATACACGGTGGCGTCGACGTCCGGCCAACAACAA
GCTCTCTCGAGAAGAAAGCCGCTGCCATCGCCATCATCATCATCTCCTCCTCCTCACTCT
GTTTCGCCTCTGTGAACTCCTCCAGCGA**AAGCTATCCCAGAGTTTCCCTTTTATCAGC
AGAACTGGTTCATCGCTCTTCTCTTAGCGATGGCTCTCGGATTCTTCTCTCTCGCTCTCT
TCCTCTTCCTTAGCGTCGATTCGGATTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCTGGTAAAGAAGGCG
TCGAGGTTTGTGTATACATTGTATCGATTAGGGCTCGTCTTGCTTTAGATTCGAATTCTG
ATTTTTTTTTAATGTCGTGGTTGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DF19TF U 138
AF RR2GX11JQ U 1
AF RR2GX11TF C 1
BS 1 505 RR2GX11JQ

RD RR2DF19TF 222 0 0
TTTTTTATCATACACGGTGGCGTCGACGTCCGGCCAACAACAAGCTCTCTCGAGAAGAAA
GCCGCTGCCGTCACCATCATCATCATCTCCTCCTCCTCACTCTGTTTCGCCTCTGCGAAC
TCCTCCAGCGAGGAAGCTATCCCAGAGTTTCCCTTTTATCAGCAGAACTGGTTC*TCGCT
CTTCTCTTA*CGATGGCTCTCGGATTCTTCTCTCTCGCTCTC

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR2GX11JQ 505 0 0
CATCAAAAGTATACGTGTTGAGTTACCATTAGTTATCTAAACGTAAACCTACGTGTCAAC
AATAAAACTAACAAACATAACAAACCATCTCGTCATCGGAACCAGCAACAGCTTACTGTC
TCCGGCGAGACTCTCAATTTTTTATCATACACGGTGGCGTCGACGTCCGGCCAACAACAA
GCTCTCTCGAGAAGAAAGCCGCTGCCATCGCCATCATCATCATCTCCTCCTCCTCACTCT
GTTTCGCCTCTGTGAACTCCTCCAGCGA**AAGCTATCCCAGAGTTTCCCTTTTATCAGC
AGAACTGGTTCATCGCTCTTCTCTTAGCGATGGCTCTCGGATTCTTCTCTCTCGCTCTCT
TCCTCTTCCTTAGCGTCGATTCGGATTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCTGGTAAAGAAGGCG
TCGAGGTTTGTGTATACATTGTATCGATTAGGGCTCGTCTTGCTTTAGATTCGAATTCTG
ATTTTTTTTTAATGTCGTGGTTGTC

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR2GX11TF 505 0 0
CATCAAAAGTATACGTGTTGAGTTACCATTAGTTATCTAAACGTAAACCTACGTGTCAAC
AATAAAACTAACAAACATAACAAACCATCTCGTCATCGGAACCAGCAACAGCTTACTGTC
TCCGGCGAGACTCTCAATTTTTTATCATACACGGTGGCGTCGACGTCCGGCCAACAACAA
GCTCTCTCGAGAAGAAAGCCGCTGCCATCGCCATCATCATCATCTCCTCCTCCTCACTCT
GTTTCGCCTCTGTGAACTCCTCCAGCGA**AAGCTATCCCAGAGTTTCCCTTTTATCAGC
AGAACTGGTTCATCGCTCTTCTCTTAGCGATGGCTCTCGGATTCTTCTCTCTCGCTCTCT
TCCTCTTCCTTAGCGTCGATTCGGATTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCTGGTAAAGAAGGCG
TCGAGGTTTGTGTATACATTGTATCGATTAGGGCTCGTCTTGCTTTAGATTCGAATTCTG
ATTTTTTTTTAATGTCGTGGTTGTC

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 2

CO CL3527Contig1 1271 2 2 U
GTGTTGAGAGCATATGGGAAGATCACAGGGGACTACTCGTTGCAAGAGAGGGTAGATGTG
CAGACAGGGATAAAGATGATTGCAAACTTGTGTTTAGCTGATGGGTTTGATATGTTTCCA
ACGTTACTAGTCACTGATGGCTCTTGCATGATAGACAGGCGTATGGGTATCCATGGTCAC
CCTCTTGAGATCCAAGCTTTGTTTTATTCTGCTCTTCGGTCTTCTCGCGAGATGATAACT
ATTAATGATAGCTCCAAGAACCTAGTAAGGACCATTAACAACAGGCTCAGTGCAATCTCA
TTCCACATTAGAGAAAACTATTGGGTCGATAAATGCAAAATCAACGAGATTTACCGTTAT
AAAACTGAGGAGTACTCTACTGATGCAACCAACAAGTTCAACATCTACCCGGACCAGGTT
TCTCCCTGGTTAATGGACTGGATTCCTGAAAGCCGTAGGTGTGGCTTTCTTGTGGGAAAC
CTCCAGCCTGCTCACATGGACTTTAGGTTCTTCACTTTGGGAAACCTTTGGTCAGTTATT
TCTTCTTTGGGCACACCAAGACAGAACCAAGCTATACTGAATTTGATTGAAGAGAAATGG
GATGATCTCATTGGACATATGCCACTTAAGATATGTTTCCCAGCTTTGGAGTCTGCAGAG
TGGCATATAATCACTGGGAGTGACCCAAAGAACACGCCTTGGTCTTACCATAATGGCGGG
TCATGGCCAACGCTTCTTTGGCAATTCACACTGGCATGCATGAAGATGGGTAGACCAGAG
CTAGCAGAGAAAGCAGTTGCATTGGCTGAGAAGAGGCTCCAAGCTGACCGGTGGCCTGAG
TACTACGATACAAGATACGGGAAGTTCATCGGAAAAAAGTCCAGGCTTTACCAGACATGG
ACAATTGCTGGTTTCTTGACAGCCAAGCAACTATTGCAGAATCCTGAAATGGCATCTTCC
TTGTTCTGGGAAGAAGATCTTGAGCTTCTAGAGACTTGTGTTTGTGTTCTATCCAAATCA
GGCCGGAAGAGTTGCTCTAGGGCCGCAGCAAAGTCTCAGATTCTTATCTAAATTGGTTTT
GTTGATGAACTCGATTAAGATGTAAAGTTCATGTTGCAACAAATATCATGTGTCTGTATA
TAAGAAATCAGTGGTTGACACTTGACACTAGTAGTACTTTTCTACAATTAGTAAAAGGAT
AAGTACTATGTTGTCTGGTAATGTTCTAACATGTTAACCAAAGTAATATAGTAAATAACA
ATTTTGATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH83TF U 1
AF RR2DH83JQ C 590
BS 1 766 RR2DH83TF
BS 767 1271 RR2DH83JQ

RD RR2DH83TF 766 0 0
GTGTTGAGAGCATATGGGAAGATCACAGGGGACTACTCGTTGCAAGAGAGGGTAGATGTG
CAGACAGGGATAAAGATGATTGCAAACTTGTGTTTAGCTGATGGGTTTGATATGTTTCCA
ACGTTACTAGTCACTGATGGCTCTTGCATGATAGACAGGCGTATGGGTATCCATGGTCAC
CCTCTTGAGATCCAAGCTTTGTTTTATTCTGCTCTTCGGTCTTCTCGCGAGATGATAACT
ATTAATGATAGCTCCAAGAACCTAGTAAGGACCATTAACAACAGGCTCAGTGCAATCTCA
TTCCACATTAGAGAAAACTATTGGGTCGATAAATGCAAAATCAACGAGATTTACCGTTAT
AAAACTGAGGAGTACTCTACTGATGCAACCAACAAGTTCAACATCTACCCGGACCAGGTT
TCTCCCTGGTTAATGGACTGGATTCCTGAAAGCCGTAGGTGTGGCTTTCTTGTGGGAAAC
CTCCAGCCTGCTCACATGGACTTTAGGTTCTTCACTTTGGGAAACCTTTGGTCAGTTATT
TCTTCTTTGGGCACACCAAGACAGAACCAAGCTATACTGAATTTGATTGAAGAGAAATGG
GATGATCTCATTGGACATATGCCACTTAAGATATGTTTCCCAGCTTTGGAGTCTGCAGAG
TGGCATATAATCACTGGGAGTGACCCAAAGAACACGCCTTGGTCTTACCATAATGGCGGG
TCATGGCCAACGCTTCTTTGGCAATTCACACTGGCATGCATGAAGA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2DH83JQ 682 0 0
AAGAGAAATGGGATGATCTCATTGGACATATGCCACTTAAGATATGTTTCCCAGCTTTGG
AGTCTGCAGAGTGGCATATAATCACTGGGAGTGACCCAAAGAACACGCCTTGGTCTTACC
ATAATGGCGGGTCATGGCCAACGCTTCTTTGGCAATTCACACTGGCATGCATGAAGATGG
GTAGACCAGAGCTAGCAGAGAAAGCAGTTGCATTGGCTGAGAAGAGGCTCCAAGCTGACC
GGTGGCCTGAGTACTACGATACAAGATACGGGAAGTTCATCGGAAAAAAGTCCAGGCTTT
ACCAGACATGGACAATTGCTGGTTTCTTGACAGCCAAGCAACTATTGCAGAATCCTGAAA
TGGCATCTTCCTTGTTCTGGGAAGAAGATCTTGAGCTTCTAGAGACTTGTGTTTGTGTTC
TATCCAAATCAGGCCGGAAGAGTTGCTCTAGGGCCGCAGCAAAGTCTCAGATTCTTATCT
AAATTGGTTTTGTTGATGAACTCGATTAAGATGTAAAGTTCATGTTGCAACAAATATCAT
GTGTCTGTATATAAGAAATCAGTGGTTGACACTTGACACTAGTAGTACTTTTCTACAATT
AGTAAAAGGATAAGTACTATGTTGTCTGGTAATGTTCTAACATGTTAACCAAAGTAATAT
AGTAAATAACAATTTTGATTGC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL3528Contig1 751 2 20 U
CGCAACAATAAACTTATACCAATTATATGCTTGAACCGAACATATCACCCAAGCAAGGCA
TAGTTCTAAAGGGGTGAAATATATGAATTCAAGTTCCAAGAGAAACCATTACACAACACA
ACATGACACCAGAGCAACGACAATGAAGAAGAGAGAGAGAGAGGAGTAACAGTTAAGTGA
AAACTCATACAGTAACGCACAACAATCAATGGTTTGCTGCTAAACAACTTGAAATCATTT
TTGTTTGTTTAACTAAGAAACTGCAGAGGAAACGCCGATACACCTGGAAGCACAGATACT
ATCACTCCTCACTAGACAAGCAGACCGTTTCGCTGCTGCATTGCCTACTTGTGTTGTCTT
CTGTGTTGTTGATGATGATGATGATAACCCAGTCTCCTTGTTTGGAGTCTGTGGAGGTGT
AAACACCACAGAGGACGAAGACGGTTGGGCATGAACCGAATCAGCACCCTCATCCTCTGA
TGAACACACCCGTTCTCTGGGGAGTGAAGTGTACTTTCTATGGACTGGTGGGGAGTTAAG
TTCCTCTTCATCTTCCTTGTGATCTTCCAGTCTGGCAAACTCTTGTTTGAACTGTTCAAC
TCCGCTTGGGTAAAGAAAATGAGAGTTGATGTTCTCTTCTCCTTGTACATACTCTTGCAA
CATCTGTGGATGGTACTCCAAAATCTCTCTATACATGAGCTCTCTCACATCATCCCGAGT
CAACTTCCTCCTTTCAAACTCAAACTCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G602JQ U 1
AF RR2CR50JQ U 249
BS 1 339 RR2G602JQ
BS 340 340 RR2CR50JQ
BS 341 408 RR2G602JQ
BS 409 409 RR2CR50JQ
BS 410 429 RR2G602JQ
BS 430 430 RR2CR50JQ
BS 431 513 RR2G602JQ
BS 514 514 RR2CR50JQ
BS 515 519 RR2G602JQ
BS 520 520 RR2CR50JQ
BS 521 538 RR2G602JQ
BS 539 539 RR2CR50JQ
BS 540 663 RR2G602JQ
BS 664 664 RR2CR50JQ
BS 665 690 RR2G602JQ
BS 691 691 RR2CR50JQ
BS 692 705 RR2G602JQ
BS 706 706 RR2CR50JQ
BS 707 716 RR2G602JQ
BS 717 751 RR2CR50JQ

RD RR2G602JQ 716 0 0
CGCAACAATAAACTTATACCAATTATATGCTTGAACCGAACATATCACCCAAGCAAGGCA
TAGTTCTAAAGGGGTGAAATATATGAATTCAAGTTCCAAGAGAAACCATTACACAACACA
ACATGACACCAGAGCAACGACAATGAAGAAGAGAGAGAGAGAGGAGTAACAGTTAAGTGA
AAACTCATACAGTAACGCACAACAATCAATGGTTTGCTGCTAAACAACTTGAAATCATTT
TTGTTTGTTTAACTAAGAAACTGCAGAGGAAACGCCGATACACCTGGAAGCACAGATACT
ATCACTCCTCACTAGACAAGCAGACCGTTTCGCTGCTGCTTTGCCTACTTGTGTTGTCTT
CTGTGTTGTTGATGATGATGATGATAACCCAGTCTCCTTGTTTGGAGTGTGTGGAGGTGT
AAACACCACTGAGGACGAAGACGGTTGGGCATGAACCGAATCAGCACCCTCATCCTCTGA
TGAACACACCCGTTCTCTGGGGAGTGAAGTGTATTTTCTCTGGACTGGTGGGGAGTTACG
TTCCTCTTCATCTTCCTTGTGATCTTCCAGTCTGGCAAACTCTTGTTTGAACTGTTCAAC
TCCGCTTGGGTAAAGAAAATGAGAGTTGATGTTCTCTTCTCCTTGTACATACTCTTGCAA
CATTTGTGGATGGTACTCCAAAATCTCTCTGTACATGAGCTCTCTTACATCATCCC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2CR50JQ 503 0 0
ATG
ACTAAGAGACTGCAGAGGAAACGCCGATACATCTGGAAGCACAGATACTATCACTCCTCA
CTAGACAAGCAGACCGTTTCGCTGCTGCATTGCCTACTTGTGTTGTCTTCTGTGTTGTTG
ATGATGATGATGATAACCCAGTCTCCTTGTTTGGAGTCTGTGGAGGTGTAAACACCACAG
AGGACGAAGACGGTTGGGCATGAACCGAATCAGCACCCTCGTCCTCTGATGAACACACCC
GTTCTCTGGGGAGTGAAGTGTACTTTCTATGGACTGGTGGGGAGTTAAGTTCCTCTTCAT
CTTCCTTGTGATCTTCCAGTCTGGCAAACTCTTGTTTGAACTGTTCAACTCCGCTTGGGT
AAAGAAAATGAGAGTTGATGTTCTCTTCTCCTTGTACATACTCTTGCAACATCTGTGGAT
GGTACTCCAAAATCTCTCTATACATGAGCTCTCTCACATCATCCCGAGTCAACTTCCTCC
TTTCAAACTCAAACTCAAGC

QA 4 503 4 503
DS 



AS 1 3

CO CL3529Contig1 651 3 13 U
GGACGCATAAAAATCAAAACATCTCCTAAAAAATCCCAAAACTTTTAAAATTAGAAAACA
ACCCCAAACATAAAAATGAGAAACAATCTCGTCCCTCTAACTCTCTCCTTCCTCACCATC
ACCATGCTCATAACTCCATCAATGGCAGAACCAGAACCTTCCTTTATCTTCCCCATCCAT
CAACTCCTCAACACAACCAGCTCATGGCTCGACTTTCCGACCAAATTCAACCAACCAAAG
ATCGAACTAACCGCATCAACACTCATCGCCGTTGTACTCTCTTTCCTCGCCGCAACTATC
TCAAGCGCCGGCGGTATCGGCGGAGGAGGGTTATACGTTCCTATAATGACCATCGTCGCC
GGACTAGACCTAAAAACAGCTTCAAGCTTCTCTGCTTTCATGGTAACAGGAGGATCCATA
GCAAACGTGGGGTGCAATCTTTTCCTCAGAAACCCTAAAGCTGGAGGCAAGACGATGATA
GACTTCGACTTAGCTCTGCTTCTTGAACCGTGCATGCTTCTTGGAGTTAGTGTCGGAGTG
ATATGCAACCTCGTGTTCCCGAACTGGCTTACAACGAGTCTCTTCGCCGTGTTTCTTGCG
TGGTCGACGGTGAAGACGTTTGGAAACGGGGTTTATTACTGGACGTTGGAG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C977TF U 166
AF RR2EJ90TF U 3
AF RR2FY70TF U 1
BS 1 32 RR2FY70TF
BS 33 33 RR2EJ90TF
BS 34 48 RR2FY70TF
BS 49 49 RR2EJ90TF
BS 50 161 RR2FY70TF
BS 162 162 RR2EJ90TF
BS 163 323 RR2FY70TF
BS 324 324 RR2EJ90TF
BS 325 371 RR2FY70TF
BS 372 372 RR2EJ90TF
BS 373 480 RR2FY70TF
BS 481 481 RR2EJ90TF
BS 482 651 RR2FY70TF

RD RR2C977TF 115 0 0
ATCTTCCCCATCCATCAACTCCTCAACACAACCAGCTCATGGCTCGAGTTTCCGACCAAA
TTCAACCAACCAAAGATCGAACTAACCGCATCAACACTCATCGCCGTTGTACTCT

QA 1 115 1 115
DS 

RD RR2EJ90TF 555 0 0
GGA
CATAAAAATCTCAACATCTCCTAAAAAATCCCAAAACTTTTAAAATTAGAAAACAACCCC
AAACATAAAAATGAGAAACAATCTCGTCCCTCTATCTCTCTCCTTCCTCACCATCACCAT
GCTCATAACTCCATCAATGGCAGAACCAGAACCTTCCTTTATCTTCCCCATCCATCAACT
CCTCAATACAACCAGCTCATGGCTCGACTTCCCGACCAAATTCAACCAACCAAAGATCGA
ACTAACCGCATCAACACTCATCGCCGTTGTACTCTCTTTCCTCGCCGCAACTATCTCAAG
CGCCGGCGGTATCGGCGGAGGAGGGTTATACGTTCCTATAATGACCATCGTCGCCGGACT
CGACCTAAAAACAGCTTCAAGCTTCTCTGCTTTCATGGTAACAGGAGGATCCATAGCAAA
CGTGGGGTGCAATCTTTTCCTCAGAAACCCTAAAGCTGGAGGCAAGACGATGATAGACTT
CGACTTAGCTCTGCTTCTTGAACCGTGCATGCTTCTTGGAGTTAGTGTCGGAGTGATATG
CAACCTCGTGTT

QA 4 555 4 555
DS 

RD RR2FY70TF 651 0 0
GGACGCATAAAAATCAAAACATCTCCTAAAAA*TCCCAAAACTTTTAATATTAGAAAACA
ACCCCAAACATAAAAATGAGAAACAATCTCGTCCCTCTAACTCTCTCCTTCCTCACCATC
ACCATGCTCATAACTCCATCAATGGCAGAACCAGAACCTTCTTTTATCTTCCCCATCCAT
CAACTCCTCAACACAACCAGCTCATGGCTCGACTTTCCGACCAAATTCAACCAACCAAAG
ATCGAACTAACCGCATCAACACTCATCGCCGTTGTACTCTCTTTCCTCGCCGCAACTATC
TCAAGCGCCGGCGGTATCGGCGGCGGAGGGTTATACGTTCCTATAATGACCATCGTCGCC
GGACTAGACCTGAAAACAGCTTCAAGCTTCTCTGCTTTCATGGTAACAGGAGGATCCATA
GCAAACGTGGGGTGCAATCTTTTCCTCAGAAACCCTAAAGCTGGAGGCAAGACGATGATA
TACTTCGACTTAGCTCTGCTTCTTGAACCGTGCATGCTTCTTGGAGTTAGTGTCGGAGTG
ATATGCAACCTCGTGTTCCCGAACTGGCTTACAACGAGTCTCTTCGCCGTGTTTCTTGCG
TGGTCGACGGTGAAGACGTTTGGAAACGGGGTTTATTACTGGACGTTGGAG

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL3530Contig1 1190 2 6 U
GAAATAAATGGGGTATGAGCCTGATCCAGATGCTCTTCGTTGGGGTCTCCATGATCTAGA
GGTTTGTACACTCACAAACGCTGGTTCTTGTGGCAGCGTGACGCTTTACGGGACGACGGA
TGATGCTGTCGCTGCTCAAGGATATGTTAGAGAAGGTTTCAACCAGCCTCTCACTGGTTA
TGTAGACAATGATGCGGTTATAGCTCAGTTTTACCAAGACGAGTTGTCTAGAGTTGAACG
AGCAGAGGAATCTAATTTGAGGCTCAGTGATAATCCTGTTGTTTCACAGGAGTGGCCTCA
CACTCATCATCGAGGGCAGGATAATAATCAAGGGGAAGCTGTTGATATTTCTCGTGAAAG
TGACATGGAGGATAAGAGTGTTGCAAGGATAGGGTATCGAGGAGAGGGAAGCTCCTTCGC
AGCTCGTGATGATGATGATGATGACTCGGATTGTTCTGTGGAGATAGAGGAAGAATCTTG
GTCTTTGGATTCTGAGGTTGGGAAGCGACTCAACCAAATGATACCGATTGCTCATGTGCC
GAAAATCAATGGGGAGTTACCGTCAGAGGATGAGCAGGTTTCTGATCATGAACGGCTTTT
TCAGAGATTACAGCTTTATGGCTTGGTGGAGAACAAGATAGAAGGAGACGGCAACTGCCA
GTTTCGGTCACTGTCAGATCAGCTTTACCGCTCTCCAGAGCATAATTTTGTCAGAGAACA
AGTTGTTAATCAGCTTGCGTATAATCGAGAGATGTATGAAGGTTATGTTCCAATGGCGTA
CACCGACTATCTTAAAACAATGAAACGGAATGGAGAATGGGGTGATCATGTTACTCTTCA
GGCTGCTGCTGATTGGTATGGTGTTCGGATGTTTGTGATAACTTCATTCAAGAACACATG
TTACATTGAGATCTTGCCTCATTTGCAGAAGTCCAACCGCCTTATATGTTTAAGCTTTTG
GGCTGAGGTTCATTACAATTCAATCTATCCTGAAGGAGAGCTGCCTGAACCGGAGGGGAA
GAAGAAGAAATATTGGGTTTTTTAAGCTCTGTTTCTTCTGTTAAGAAGAAATATATTTAA
CATGTTCGTTCTTTTTACTAACCTAGTATGTTTAGTGCTAGAGAGTATGGTCTTGTACAT
ACTGAACATAATCTCCCACTTAAGGCATTAACTAGACTTATAGTTCGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN14TF U 1
AF RR2A626JQ C 418
BS 1 510 RR2DN14TF
BS 511 511 RR2A626JQ
BS 512 591 RR2DN14TF
BS 592 592 RR2A626JQ
BS 593 639 RR2DN14TF
BS 640 1190 RR2A626JQ

RD RR2DN14TF 639 0 0
GAAATAAATGGGGTATGAGCCTGATCCAGATGCTCTTCGTTGGGGTCTCCATGATCTAGA
GGTTTGTACACTCACAAACGCTGGTTCTTGTGGCAGCGTGACGCTTTACGGGACGACGGA
TGATGCTGTCGCTGCTCAAGGATATGTTAGAGAAGGTTTCAACCAGCCTCTCACTGGTTA
TGTAGACAATGATGCGGTTATAGCTCAGTTTTACCAAGACGAGTTGTCTAGAGTTGAACG
AGCAGAGGAATCTAATTTGAGGCTCAGTGATAATCCTGTTGTTTCACAGGAGTGGCCTCA
CACTCATCATCGAGGGCAGGATAATAATCAAGGGGAAGCTGTTGATATTTCTCGTGAAAG
TGACATGGAGGATAAGAGTGTTGCAAGGATAGGGTATCGAGGAGAGGGAAGCTCCTTCGC
AGCTCGTGATGATGATGATGATGACTCGGATTGTTCTGTGGAGATAGAGGAAGAATCTTG
GTCTTTGGATTCTGAGGTTGGGAAGCGACTTAACCAAATGATACCGATTGCTCATGTGCC
GAAAATCAATGGGGAGTTACCGTCAGAGGATGAGCAGGTTTCTGATCATGAGCGGCTTTT
TCAGAGATTACAGCTTTATGGCTTGGTGGAGAACAAGAT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2A626JQ 773 0 0
CGCAGCTCGTGATGATGATGATGATGACTCGGATTGTTCTGTGGAGATAGAGGAAGAATC
TTGGTCTTTGGATTCTGAGGTTGGGAAGCGACTCAACCAAATGATACCGATTGCTCATGT
GCCGAAAATCAATGGGGAGTTACCGTCAGAGGATGAGCAGGTTTCTGATCATGAACGGCT
TTTTCAGAGATTACAGCTTTATGGCTTGGTGGAGAACAAGATAGAAGGAGACGGCAACTG
CCAGTTTCGGTCACTGTCAGATCAGCTTTACCGCTCTCCAGAGCATAATTTTGTCAGAGA
ACAAGTTGTTAATCAGCTTGCGTATAATCGAGAGATGTATGAAGGTTATGTTCCAATGGC
GTACACCGACTATCTTAAAACAATGAAACGGAATGGAGAATGGGGTGATCATGTTACTCT
TCAGGCTGCTGCTGATTGGTATGGTGTTCGGATGTTTGTGATAACTTCATTCAAGAACAC
ATGTTACATTGAGATCTTGCCTCATTTGCAGAAGTCCAACCGCCTTATATGTTTAAGCTT
TTGGGCTGAGGTTCATTACAATTCAATCTATCCTGAAGGAGAGCTGCCTGAACCGGAGGG
GAAGAAGAAGAAATATTGGGTTTTTTAAGCTCTGTTTCTTCTGTTAAGAAGAAATATATT
TAACATGTTCGTTCTTTTTACTAACCTAGTATGTTTAGTGCTAGAGAGTATGGTCTTGTA
CATACTGAACATAATCTCCCACTTAAGGCATTAACTAGACTTATAGTTCGCCC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 3

CO CL3531Contig1 741 3 27 U
GGGATCCTCTTCCTCTCCACATCTTAAAACGCCCCTTTGAGAAGAAACAAAACAACAAAA
CAATGGCAACTCAAGCCGCCGGAATCTTTAGCTCCGCCGTGACAACCGCCGCAACCTCCG
GCGTAAGAAAACTCCACTTTTTCACCACAACCCACCGTCCAAGATCCCTCACCCTCTCCT
TCACCAAAACCGCAATCCGCGCCGAGAAAACAGACTCCGCCGCTCCAGCCGCCGCCGTGA
AAGAAGAAGCTCCGGTGGGATTCACGCCGCCGCAGCTAGACCCAAACACACCGTCTCCGA
TCTTCGCGGGAAGCACCGGCGGACTTCTCCGTAAGGCCCAGGTGGAAGAGTTCTACGTCA
TTACATGGAACTCGCCGAAAGAACAGATCTTTGAGATGCCGACAGGAGGTGCAGCGATCA
TGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTAGCGAGGAAAGAACAGTGTTTGGCTTTGGGGA
CAAGGCTTAGGTCAAAGTACAAGATCAACTACCAGTTTTACAGGGTGTTCCCTAATGGTG
AGGTGCAGTATCTTCATCCTAAAGACGGTGTTTATCCGGAGAAGGCGAACCCGGGAAGAG
AAGGTGTTGGTCAGAATATGAGGTCTATTGGGAAAAATGTTAGTCCCATTGAAGTTAAGT
TTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAATATGTGAAAACATAAACTATGTAAGAAAGAA
AATAATCACGTCGAGATGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 0 0 0 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2A705TF U 1
AF RR2D032TF U 107
AF RR2D032JQ C 345
BS 1 152 RR2A705TF
BS 153 153 RR2D032TF
BS 154 160 RR2A705TF
BS 161 161 RR2D032TF
BS 162 170 RR2A705TF
BS 171 171 RR2D032TF
BS 172 220 RR2A705TF
BS 221 221 RR2D032TF
BS 222 306 RR2A705TF
BS 307 307 RR2D032TF
BS 308 322 RR2A705TF
BS 323 323 RR2D032TF
BS 324 493 RR2A705TF
BS 494 494 RR2D032TF
BS 495 556 RR2A705TF
BS 557 557 RR2D032TF
BS 558 568 RR2A705TF
BS 569 569 RR2D032TF
BS 570 582 RR2A705TF
BS 583 583 RR2D032TF
BS 584 619 RR2A705TF
BS 620 620 RR2D032TF
BS 621 673 RR2A705TF
BS 674 674 RR2D032TF
BS 675 694 RR2A705TF
BS 695 740 RR2D032TF
BS 741 741 RR2D032JQ

RD RR2A705TF 702 0 0
GGGATCCTCTTCCTCTCCACATCTTAAAACGCCCCTTTGAGAAGAAACAAAACAACAAAA
CAATGGCAACTCAAGCCGCCGGAATCTTTAGCTCCGCCGTGACAACCGCCGCAACCTCCG
GCGTAAGAAAACTCCACTTTTTCACCACAACCTACCGTCCGAGATCCCTCTCCCTCTCCT
TCACCAAAACCGCAATCCGCGCCGAGAAAACAGACTCCGCGGCTCCAGCCGCCGCCGTGA
AAGAAGAAGCTCCGGTGGGATTCACGCCGCCGCAGCTAGACCCAAACACACCGTCTCCGA
TCTTCGTGGGAAGCACCGGCGGCCTTCTCCGTAAGGCCCAGGTGGAAGAGTTCTACGTCA
TTACATGGAACTCGCCGAAAGAACAGATCTTTGAGATGCCGACAGGAGGTGCAGCGATCA
TGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTAGCGAGGAAAGAACAGTGTTTGGCTTTGGGGA
CAAGGCTTAGGTCGAAGTACAAGATCAACTACCAGTTTTACAGGGTGTTCCCTAATGGTG
AGGTGCAGTATCTTCACCCTAAAGACGGAGTTTATCCGGAGAGGGCGAACCCGGGAAGAG
AAGGTGTTGGTCAGAATATTAGGTCTATTGGGAAAAATGTTAGTCCCATTGAAGTTAAGT
TTACTGGGAAACAGAGTTATGATTTGTAATATGT
AAGAAAGA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2D032TF 634 0 0
G
GCCGCAACCTCCGGCGTAAGAAAACTCCACTTTTTCACCACAACCCACCGTCCAAGATCC
CTCACC******TTCACCAAAACCGCAATCCGCGCCGAGAATACAGACTCCGCCGCTCCA
GCCGCCGCCGTGAAAGAAGAAGCTCCGGTGGGATTCACGCCGCCGCAGCTAGACCCAAAC
ACACCGTCTCCGATCTTCGCGGGAAGCACGGG*GGACTTCTCCGTAAGGCCCAGGTGGAA
GAGTTCTACGTCATTACATGGAACTCGCCGAAAGAACAGATCTTTGAGATGCCGACAGGA
GGTGCAGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTAGCGAGGAAAGAACAGTGT
TTGGCTTTGGGGACAAGGCTTAGGTCAAAGTACAAGATCAACTACCAGTTTTACAGGGTG
TTCCCTAATGGTGAGGTGCAGTATCTTCATCCTAAAGACGGTGTTTATCCGGAGAAGGCG
AACCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGGTCTATTGGGAAAAATGTTAGTCCC
ATTGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAATATGTGAAAACATAAACT
ATGTAAGAAAGAAAATAATCACGTCGAGATGAC

QA 2 634 2 634
DS 

RD RR2D032JQ 397 0 0
GAAGAGTTTTACGTCATTACATGGAACTCGCCGAAAGAACAGATTTTTGAGATGCCGACA
GGAGGTGCAGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTAGCGAGGAAAGAACAG
TGTTTGGCTTTGGGGACAAGGCTTAGGTCAAAGTACAAGATCAACTACCAGTTTTACAGG
GTGTTCCCTAATGGTGAGGTGCAGTATTTTCATCCTAAAGACGGTGTTTATCCGGAGAAG
GCGAACCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGGTCTATTGGGAAAAATGTTAGT
CCCATTGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAATATGTGAAAACATAA
ACTATGTAAGAAAGAAAATAATCACGTCGAGATGACC

QA 1 397 1 397
DS 



AS 1 3

CO CL3532Contig1 1130 3 2 U
AATAAAAGTGGTAGTGATTATTTTAGACAAATCCGTGGTGTCAAATATATCTATAACTAA
CACACTCAAGTTTATCTGCTCTCGCATTACATTGAGATATCTGATATTGCAGGCCTAGTG
AAATATGGTGGGCTTTGCTTTGAAAAAGTTTCTTGAAGTGTCCTCAAACGGCTTGGACAA
GCTCAAACTCATTACCATCTGGGAGCTCCTCCATTGGTTCGTGTAGCAATATAATTTCTC
AGGGAGGGAGACTGAGTAAGACCATCAGGTGCCACAGTTGTGTTCAGAGTTCCATTCTTC
TGCTTCATCCTTCTTCTTGCTATGTAGCCTCTGACCCAAGGAGTTACATCCTCGTTGGTC
TTGATCATGATGAAGAAAATGATGCGGTAGATGATAATCATGCTGAGAATCACAGTGAGG
TTAATCCATTTTGACCGGTGCAAGTTGATCTGGAAGACGTTTTCAAGAACGTATTCACCT
GGAATCTTGAAAGCACTCCCTTGGCTGTCAAACATCAAGCCTCTCAGATCATTCTGGTAT
TGACCTTGTAGCGACCAGAAGTGGAAACTAATGTATGACATAGGGTAACGCCAGAAAGGT
TTAGGAATGTCATTTGGAAGCCTAAAGAATCCAGAAACCAACATGAAGATCCCCTGAATC
CCAGCTCCAATGATGATACCCATGAGGAAGTTGGGAACAATGCTAGCTATAGCCATCATC
AAGCTCTCCACAACGGTGACACTTGCATAGAGGCAGAGAACAAAGAAGAGGTAGTGAGTG
AATCCTGGATGCAGACCCACCATGAAGTAACAAATCGTCCCGGAGATGAAAGTTATGATG
ATCAAGAACGGCGTTGCGGCTAGTGTGTTGGCTATCACAAACGCAGCTACTCCGTAGTGA
CCGTTTAGTCTCTCTCTTTGGAAGACCTTCATGTCTTCAACAAACGAAGGAAACCCACCG
ATTGACATGAATGTTACAAAGCCAAAGACGAAAGATGCACATGATCCTCGTGCCTGATTA
CACAAATAGCAAAATGTAAGATTAAAACCTAAGCTCATGTAAGATGGTATTAGCAAATAC
CAGAATGGCGCTGTAGCTAGTCCCAACGTTCCAATAGATGGTTCCAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK37JQ U 25
AF RR2FH21JQ U 1
AF RR2DK37TF C 358
BS 1 601 RR2FH21JQ
BS 602 1130 RR2DK37TF

RD RR2DK37JQ 234 0 0
AGACAAATCCGTGGTGTCAAATATATCTATAACTAACACACTCAAGTTTATCTGCTCTCG
CATTACATTGAGATATCTGATATTGCAGGCCTAGTGAAATATGGTGGGCTTTGCTTTGAA
AAAGTTTCTTGAAGTGTCCTCAAACGGCTTGGACAAGCTCAAACTCATTACCATCTGGGA
GCTCCTCCATTGGTTCGTGTAGCAATATAATTTCTCAGGGAGGGAGACTGAGTA

QA 1 234 1 234
DS 

RD RR2FH21JQ 601 0 0
AATAAAAGTGGTAGTGATTATTTTAGACAAATCCGTGGTGTCAAATATATCTATAACTAA
CACACTCAAGTTTATCTGCTCTCGCATTACATTGAGATATCTGATATTGCAGGCCTAGTG
AAATATGGTGGGCTTTGCTTTGAAAAAGTTTCTTGAAGTGTCCTCAAACGGCTTGGACAA
GCTCAAACTCATTACCATCTGGGAGCTCCTCCATTGGTTCGTGTAGCAATATAATTTCTC
AGGGAGGGAGACTGAGTAAGACCATCAGGTGCCACAGTTGTGTTCAGAGTTCCATTCTTC
TGCTTCATCCTTCTTCTTGCTATGTAGCCTCTGACCCAAGGAGTTACATCCTCGTTGGTC
TTGATCATGATGAAGAAAATGATGCGGTAGATGATAATCATGCTGAGAATCACAGTGAGG
TTAATCCATTTTGACCGGTGCAAGTTGATCTGGAAGACGTTTTCAAGAACGTATTCACCT
GGAATCTTGAAAGCACTCCCTTGGCTGTCAAACATCAAGCCTCTCAGATCATTCTGGTAT
TGACCTTGTAGCGACCAGAAGTGGAAACTAATGTATGACATAGGGTAACGCCAGAAAGGT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2DK37TF 773 0 0
GTCTTGATCATGATGAAGAAAATGATGCGGTAGATGATAATCATGCTGAGAATCACAGTG
AGGTTAATCCATTTTGACCGGTGCAAGTTGATCTGGAAGACGTTTTCAAGAACGTATTCA
CCTGGAATCTTGAAAGCACTCCCTTGGCTGTCAAACATCAAGCCTCTCAGATCATTCTGG
TATTGACCTTGTAGCGCCCAGAAGTGGAAACTAATGTATGACATAGGGTAACGCCAGAAA
GGTTTAGGAATGTCATTTGGAAGCCTAAAGAATCCAGAAACCAACATGAAGATCCCCTGA
ATCCCAGCTCCAATGATGATACCCATGAGGAAGTTGGGAACAATGCTAGCTATAGCCATC
ATCAAGCTCTCCACAACGGTGACACTTGCATAGAGGCAGAGAACAAAGAAGAGGTAGTGA
GTGAATCCTGGATGCAGACCCACCATGAAGTAACAAATCGTCCCGGAGATGAAAGTTATG
ATGATCAAGAACGGCGTTGCGGCTAGTGTGTTGGCTATCACAAACGCAGCTACTCCGTAG
TGACCGTTTAGTCTCTCTCTTTGGAAGACCTTCATGTCTTCAACAAACGAAGGAAACCCA
CCGATTGACATGAATGTTACAAAGCCAAAGACGAAAGATGCACATGATCCTCGTGCCTGA
TTACACAAATAGCAAAATGTAAGATTAAAACCTAAGCTCATGTAAGATGGTATTAGCAAA
TACCAGAATGGCGCTGTAGCTAGTCCCAACGTTCCAATAGATGGTTCCAATGC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 3

CO CL3533Contig1 1071 3 3 U
GAACATAACAATAAGTCTAACAAAGACCACTCAAGTCTACATTAACATCATCAAAGAAGA
ACAAAGCATTATTTCTGGTTTTTGTACCCCCAACATCTTTAGATTCTCTGGAACATTAAT
CAACAAGTTTACACATAGCATAGGAGATCCAAATAGTGTTCTAGCAAGCACACGCTTGTC
CGGCGAACCGGGAAACAACCCATATTATTATCATCATCGTTTTTTGAAACCATACTTCTT
ACGCTCATAGAAGAGATCGGTCTTGGCACTCCCAAGGTTGACGATCTTGGGACAACCATC
TCTGTCTTTCTCCTGTTGCGTACACTCTTTGCAGTAGTAAGCATCCGAGATCCCAACCCC
TCCGCAGATAACACACCGGCCTTGGAACGACCCGTAGTTGCATTCGTCACAGATGCGCAC
CAGAGTGCAGGGACGCACGTAAGAATCACAAACCGCGCATTTGCCGTCGCATTTCTCGCA
CAGTCTTCCGATGGCAATGCCTGGTTGTTTCCGGCACATGATCAGATCAGGGTGATGCTT
TGCCATGGCTAGCGAGACAGAGACCTGAACACACATAAGAGCTTATGGAATCTTTGGAAA
GTTTGAAAACAAGAAACTGAAGAACAAAGAACAACTTAAAGTGTTGTTTTCACTTGTGTC
TTAAACAATCAATTGTAGTGTTTAACTTCTCAGAGGAATATCGTCGAACACCTTACGTGC
ACAAGTCTTAGCCAAACATTACTCTTTCAAGATTGCAGATTCTAGAGACATAATCAATCA
CTTTACCAAAGCTAATTAATACTTTTGAGATGATAAAATAAAGTTAAACAAAAGAAGGAA
ATCAAGAAGCATCACAAACCCTAAAAATTTCAAAATCAAGAAACAAAAGAAGACGACAAG
CAATCTAGAGGACTCCTATTTAGAGATAAAAAGAAATTAAAAGCTTACAGTTAACGGGAG
ATCAAACTTGAGCAAATCAAGAGACTGTTGGGACGAGAAGCGCCAAAGACGAACCAACCA
AGAAAGCTCGGGAAAGAGAACGAAGCAGGAGGAGATTTTTAGCACGAGTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G960JQ U 1
AF RR2H818JQ U 1
AF RR2H818TF C 404
BS 1 410 RR2G960JQ
BS 411 727 RR2H818JQ
BS 728 1071 RR2H818TF

RD RR2G960JQ 410 0 0
GAACATAACAATAAGTCTAACAAAGACCACTCAAGTCTACATTAACATCATCAAAGAAGA
ACAAAGCATTATTTCTGGTTTTTGTACCCCCAACATCTTTAGATTCTCTGGAACATTAAT
CAACAAGTTTACACATAGCATAGGAGATCCAAATAGTGTTCTAGCAAGCACACGCTTGTC
CGGCGAACCGGGAAACAACCCATATTATTATCATCATCGTTTTTTGAAACCATACTTCTT
ACGCTCATAGAAGAGATCGGTCTTGGCACTCCCAAGGTTGACGATCTTGGGACAACCATC
TCTGTCTTTCTCCTGTTGCGTACACTCTTTGCAGTAGTAAGCATCCGAGATCCCAACCCC
TCCGCAGATAACACACCGGCCTTGGAACGACCCGTAGTTGCATTCGTCAC

QA 1 410 1 410
DS 

RD RR2H818JQ 727 0 0
GT
ACATAACAATAAGTCTAACAAAGACCACTCAAGTCTACATTAACATCATCAAAGAAGAAC
AAAGCATTATTTCTGGTTTTTGTACCCCCAACATCTTTAGATTCTCTGGAACATTAATCA
ACAAGTTTACACATAGCATAGGAGATCCAAATAGTGTTCTAGCAAGCACACGCTTGTCCT
GCGAACCGGGAAACAACCCATATTATTATCATCATCGTTTTTTGAAACCATACTTCTTAC
GCTCATAGAAGAGATCGGTCTTGGCACTCCCAAGGTTGACGATCTTGGGACAACCATCTC
TGTCTTTCTCCTGTTGCGTACACTCTTTGCAGTAGTAAGCATCCGAGATCCCAACCCCTC
CGCAGATAACACACCGGCCTTGGAACGACCCGTAGTTGCATTCGTCACAGATGCGCACCA
GAGTGCAGGGACGCACGTAAGAATCACAAACCGCGCATTTGCCGTCGCATTTCTCGCACA
GTCTTCCGATGGCAATGCCTGGTTGTTTCCGGCACATGATCAGATCAGGGTGATGCTTTG
CCATGGCTAGCGAGACAGAGACCTGAACACACATAAGAGCTTATGGAATCTTTGGAAAGT
TTGAAAACAAGAAACTGAAGAACAAAGAACAACTTAAAGTGTTGTTTTCACTTGTGTCTT
AAACAATCAATTGTAGTGTTTAACTTCTCAGAGGAATATCGTCGAACACCTTACGTGCAC
AAGTC

QA 3 727 3 727
DS 

RD RR2H818TF 668 0 0
TCGTCACAGATGCGCACCAGAGTGCAGGGACGCACGTAAGAATCACAAACCGCGCATTTG
CCGTCGCATTTCTCGCACAGTCTTCCGATGGCAATGCCTGGTTGTTTCCGGCACATGATC
AGATCAGGGTGATGCTTTGCCATGGCTAGCGAGACAGAGACCTGAACACACATAAGAGCT
TATGGAATCTTTGGAAAGTTTGAAAACAAGAAACTGAAGAACAAAGAACAACTTAAAGTG
TTGTTTTCACTTGTGTCTTAAACAATCAATTGTAGTGTTTAACTTCTCAGAGGAATATCG
TCGAACACCTTACGTGCACAAGTCTTAGCCAAACATTACTCTTTCAAGATTGCAGATTCT
AGAGACATAATCAATCACTTTACCAAAGCTAATTAATACTTTTGAGATGATAAAATAAAG
TTAAACAAAAGAAGGAAATCAAGAAGCATCACAAACCCTAAAAATTTCAAAATCAAGAAA
CAAAAGAAGACGACAAGCAATCTAGAGGACTCCTATTTAGAGATAAAAAGAAATTAAAAG
CTTACAGTTAACGGGAGATCAAACTTGAGCAAATCAAGAGACTGTTGGGACGAGAAGCGC
CAAAGACGAACCAACCAAGAAAGCTCGGGAAAGAGAACGAAGCAGGAGGAGATTTTTAGC
ACGAGTCC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL3534Contig1 634 2 3 U
AAAGGGTCTCTCAACCCATGCAAACGATCATATTTTGTAACTAAACAGAGTTGTATCGAG
GAGAAATGGTCTTACATTATGACAATAACCATTTGACTAATAAAGATACGAACCCAAAAA
AAAGGAAGTGAATAACGTCTACCAAAACATGTATCAGGGTTCCATCTAAACTGAAAAATT
GCAAAAGCCGTTGGCAAATTTTAACTTAAAAGGAAAAAAAAAAACAATCATAGCGCAAAA
AGCCATCCATCCAGATACTTGAGGTGGTGCTGCCTGTTAAATGGGACTGACATAGTTAGC
AAACCTACCTTCATAAAAGGTGAAATCGGAAGGGAGCTTGGAAACGAGGCAAGCTGCAGC
AACGACCCTGTGAAATGGCTGATGCGTGCTTAGTTCTCGCCGTAGCATAAACCTGGGAGC
GGAAGAAGATTCAATTCGAGTCTGGCGAAGAGGGGACGATGAGGAATTGGGGTTTGGGGA
GGAGATTCTAGGTCTAGGTGGTGAGATCAAGCTTCTTCTGGTAGCGGATCTTAAGATGGA
GGTTGACCTAGAAGCGATGCTCCTTGCACTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTC
TCTCTCTCTGCAAAATCCTCCGTAAACCCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP39JQ U 112
AF RR2EP39TF C 1
BS 1 111 RR2EP39TF
BS 112 424 RR2EP39JQ
BS 425 634 RR2EP39TF

RD RR2EP39JQ 316 0 0
ACCCAAAAAAAAGGAAGTGAATAACGTCTACCAAAACATGTATCAGGGTTCCATCTAAAC
TGAAAAATTGCAAAAGCCGTTGGCAAATTTTAACTTAAAAGGAAAAAAAAAAACAATCAT
AGCGCAAAAAGCCATCCATCCAGATACTTGAGGTGGTGCTGCCTGTTAAATGGGACTGAC
ATAGTTAGCAAACCTACCTTCATAAAAGGTGAAATCGGAAGGGAGCTTGGAAACGAGGCA
AGCTGCAGCAACGACCCTGTGAAATGGCTGATGCGTGCTTAGTTCTCGCCGTAGCATAAA
CCTGGGAGCGGAA
AAA

QA 1 313 1 313
DS 

RD RR2EP39TF 634 0 0
AAAGGGTCTCTCAACCCATGCAAACGATCATATTTTGTAACTAAACAGAGTTGTATCGAG
GAGAAATGGTCTTACATTATGACAATAACCATTTGACTAATAAAGATACGAACCCAAAGA
AAAGGAAGTGAATAACGTCTACCAAAACATGTATCAGGGTTCCATCTAAACTGAAAGATT
GCAAAAGCCGTTGGCAAATTTTAACTTAAAAGGAAGAAAAAAAACAATCATAGCGCAAAA
AGCCATCCATCCAGATACTTGAGGTGGTGCTGCCTGTTAGATGGGACTGACATAGTTAGC
AAACCTACCTTCATAAGAGGTGAGATCGGAAGGGAGCTTGGAAACGAGGCAAGCTGCAGC
AACGACGCTGTGAAATGGCTGATGCGTGCTTAGTTCTCGCCGTAGCATAAACCTGGGAGC
GGAAGAAGATTCAATTCGAGTCTGGCGAAGAGGGGACGATGAGGAATTGGGGTTTGGGGA
GGAGATTCTAGGTCTAGGTGGTGAGATCAAGCTTCTTCTGGTAGCGGATCTTAAGATGGA
GGTTGACCTAGAAGCGATGCTCCTTGCACTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTC
TCTCTCTCTGCAAAATCCTCCGTAAACCCTTCCC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 3

CO CL3535Contig1 792 3 2 U
GCTCCAAAACAAGTTTATACGTTTCTCATTAATAGACTAGTAAAAAATCAAAAGATGATT
TTATTGTAGGATTAGTATTAACTATTAATCATAAAAACTGAGTAAGTAAAATCTAAAATG
TTTTCTACATGAAACATGACTCTAG***CTTCTCTTCCGGCAACCTCGGCGTGATGGTCA
CCTTAAGACCGTACTTCATGTACAAGTTAGTCGTAACTCTCGGGACAACCACATGATCTT
GAGCAACCTTGATTGAGTACTTCAACAAGACTGACGCAGCTATCATCTTCATTTGCAAGT
AAGCAAATGTTTTCCCTATACAAAGCCTAGGTCCAGCATTGAACACAACATATTTGAACT
GGTCGTCACTGACAAACTTCCCTCCTTGGATCCACCTCTCTGGTCTGAACATTTCACAGT
CTTTCCCCCATATTGATTCCATCCTTCCCATGGCATAGATAGAGAAGTAAACCCTTGAAC
CCTTTTTTATAAATGTTCCATCTGGAAACACATCATCTTCAATGGCTTGTTCCATCTCCA
TTGGGATTGGTGGGTAAAGTCTTAGAGTTTCTGAAATCGCTGCTTGTAGATACACCATGT
TGTTTAGTTCTCTGACCGTGAAGAGACTAATGTCTGAAGGATCTCCTCTCTGTTTCATGA
TTTCTCTGATCTCGTGGATGATTTTTTTTTCAACTTGTGGGTGTCTTTGTATCACCCAGA
AGAACCATGAAAGCGCAACAGAACTTGTGTCACGCCCAGCTAAGATGAAACTTGTGCAAA
ACTGTCTAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E115JQ U 1
AF RR2E115TF C 1
AF RR2CR79JQ U 50
BS 1 496 RR2E115JQ
BS 497 792 RR2CR79JQ

RD RR2E115JQ 499 0 0
GCTCCAAAACAAGTTTATACGTTTCTCATTAATAGACTAGTAAAAAATCAAAAGATGATT
TTATTGTAGGATTAGTATTAACTATTAATCATAAAAACTGAGTAAGTAAAATCTAAAATG
TTTTCTACATGAAACATGACTCTAG***CTTCTCTTCCGGCAACCTCGGCGTGATGGTCA
CCTTAAGACCGTACTTCATGTACAAGTTAGTCGTAACTCTCGGGACAACCACATGATCTT
GAGCAACCTTGATTGAGTACTTCAACAAGACTGACGCAGCTATCATCTTCATTTGCAAGT
AAGCAAATGTTTTCCCTATACAAAGCCTAGGTCCAGCATTGAACACAACATATTTGAACT
GGTCGTCACTGACAAACTTCCCTCCTTGGATCCACCTCTCTGGTCTGAACATTTCACAGT
CTTTCCCCCATATTGATTCCATCCTTCCCATGGCATAGATAGAGAAGTAAACCCTTGAAC
CCTTTTTTATAAATGT
CCC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2E115TF 499 0 0
GCTCCAAAACAAGTTTATACGTTTCTCATTAATAGACTAGTAAAAAATCAAAAGATGATT
TTATTGTAGGATTAGTATTAACTATTAATCATAAAAACTGAGTAAGTAAAATCTAAAATG
TTTTCTACATGAAACATGACTCTAG***CTTCTCTTCCGGCAACCTCGGCGTGATGGTCA
CCTTAAGACCGTACTTCATGTACAAGTTAGTTGTAACTCTCGGGACAACCACATGATCTT
GAGCAACCTTGATTGAGTACTTCAACAAGACTGACGCAGCTATCATCTTCATTTGCAAGT
AAGCAAATGTTTTCCCTATACAAAGCCTAGGTCCAGCATTGAACACAACATATTTGAACT
GGTCGTCACTGACAAACTTCCCTCCTTGGATCCACCTCTCTGGTCTGAACATTTCACAGT
CTTTCCCCCATATTGATTCCATCCTTCCCATGGCATAGATAGAGAAGTAAACCCTTGAAC
CCTTTTTTATAAATGT
CCC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2CR79JQ 743 0 0
AAAAGATGATTTTATTGTAGGATTAGTATTAACTATTAATCATAAAAACTGAGTAAGTAA
AATCTAAAATGTTTTCTACATGAAACATGACTCTAGTTTCTTCTCTTCCGGCAACCTTGG
CGTTATGGTCACCTTAAGACCGTACTTCATGTACAAGTTAGTCGTAACTCTCGGGACAAC
CACATGATCTTGAGCAACCTTGATTGAGTACTTCAACAAGACTGACGCAGCTATCATCTT
CATTTGCAAGTAAGCGAATGTTTTCCCTATACACAACCTAGGTCCAGCATTGAACACAAC
GTATTTGAACTGGTCGTCACTGACAAACTTCCCTCCTTGGATCCACCTCTCTGGTCTGAA
CATGTCACAGTCTTTCCCCCATATTGATTCCATCCTTCCCATGGCATAGATAGAGAAGTA
AACCCTTGAACCCTTTTTTATAAATGTTCCATCTGGAAACACATCATCTTCAATGGCTTG
TTCCATCTCCATTGGGATTGGTGGGTAAAGTCTTAGAGTTTCTGAAATCGCTGCTTGTAG
ATACACCATGTTGTTTAGTTCTCTGACCGTGAAGAGACTAATGTCTGAAGGATCTCCTCT
CTGTTTCATGATTTCTCTGATCTCGTGGATGATTTTTTTTTCAACTTGTGGGTGTCTTTG
TATCACCCAGAAGAACCATGAAAGCGCAACAGAACTTGTGTCACGCCCAGCTAAGATGAA
ACTTGTGCAAAACTGTCTAAAAA

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL3536Contig1 716 2 2 U
GGAAACAAATACACAATGTTATCGACTTACCTCGTTGTGTTCGTTCTTCTCTTCAGTGGT
TTCACGGCCAACAAAGAGGCAGATTCTCTGATTCAAAGAAATTGCAAGCGTATATCAATC
ATTCCTAGCGTGGTGGATTCAGAAGATGTCCTTAAGCTTTGCATCACATCTCTTAAAGAG
AATCCAGAGACCAAGAAAGTGAGAAATAAGATTGAATTGGCCGTGGTAGGTACGAATAAC
GCGATATCGAACATAACAAACATGAAAAGAATTGTGGAGAAGTTTATAAAAGAGAAGAGA
TATAAAAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGGAAGTTTGTCTTAACCATTACCAAGATGGC
TATGAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACCTCAAAGAGAAGGATCTTGATTTGTCTTCA
GATGATTTGGGGATGGCAAATAAGGAATTTAACGATTGTAGAGAGAGATTCAAAAAAGGC
GAAATAAATCCCTTCGAAAAAGAGAATGACGTCCTCTACGTAATGACCCGTATTCCTTAC
ATGATTATTTCTATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTTTAC
GGGGGGCACGTGCCCCGATCTCTTTTTTATTTTCCTTCCCTAGTTTACATTGACTTTGTG
AAAGGCTCTCAACTCAAAAGTTAAACATCATGAGAAAATACAATGTGCACTGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET82TF U 1
AF RR2ET82JQ C 84
BS 1 661 RR2ET82TF
BS 662 716 RR2ET82JQ

RD RR2ET82TF 661 0 0
GGAAACAAATACACAATGTTATCGACTTACCTCGTTGTGTTCGTTCTTCTCTTCAGTGGT
TTCACGGCCAACAAAGAGGCAGATTCTCTGATTCAAAGAAATTGCAAGCGTATATCAATC
ATTCCTAGCGTGGTGGATTCAGAAGATGTCCTTAAGCTTTGCATCACATCTCTTAAAGAG
AATCCAGAGACCAAGAAAGTGAGAAATAAGATTGAATTGGCCGTGGTAGGTACGAATAAC
GCGATATCGAACATAACAAACATGAAAAGAATTGTGGAGAAGTTTATAAAAGAGAAGAGA
TATAAAAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGGAAGTTTGTCTTAACCATTACCAAGATGGC
TATGAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACCTCAAAGAGAAGGATCTTGATTTGTCTTCA
GATGATTTGGGGATGGCAAATAAGGAATTTAACGATTGTAGAGAGAGATTCAAAAAAGGC
GAAATAAATCCCTTCGAAAAAGAGAATGACGTCCTCTACGTAATGACCCGTATTCCTTAC
ATGATTATTTCTATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTTTAC
GGGGGGCACGTGCCCCGATCTCTTTTTTATTTTCCTTCCCTAGTTTACATTGACTTTGTG
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2ET82JQ 633 0 0
TTCTCTGATTCAAAGAAATTGCAAGCGTATATCAATCATTCCTAGCGTGGTGGATTCAGA
AGATGTCCTTAAGCTTTGCATCACATCTCTTAAAGAGAATCCAGAGACCAAGAAAGTGAG
AAATAAGATTGAATTGGCCGTGGTAGGTACGAATAACGCGATATCGAACATAACAAACAT
GAAAAGAATTGTGGAGAAGTTTATAAAAGAGAAGAGATATAAAAGTAGGCTTATTAAAAA
GAAGTTGGAAGTTTGTCTTAACCATTACCAAGATGGCTATGAGTGGCTAACCTCAGGTTT
GAATTACCTCAAAGAGAAGGATCTTGATTTGTCTTCAGATGATTTGGGGATGGCAAATAA
GGAATTTAACGATTGTAGAGAGAGATTCAAAAAAGGCGAAATAAATCCCTTCGAAAAAGA
GAATGACGTCCTCTACGTAATGACCCGTATTCCTTACATGATTATTTCTATGGATGATTG
TGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTT*ACGGGGGGCACGTGCCCCGATCTCT
TTTTTATTTTCCTTCCCTAGTTTACATTGACTTTGTGAAAGGCTCTCAACTCAAAAGTTA
AACATCATGAGAAAATACAATGTGCACTGTCTC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 3

CO CL3537Contig1 933 3 4 U
GAACGTTCATCTATAACTCCAATAAATACACTAATTATAGATTTACGTAACTTGAACTGA
AGCCAAAAACAAGCATCTTCAGTTTTGTTTTTTTTTTTTATCACTTTTGAGTAGACAACT
ACAAAAACACAATTACAAAACTCACACATCTTCCAACATACTTACACTTCTTGTTGGTGA
CTCTCTCTCTCTTACGCAATAGACAAAACCTCCAACTCTGCCCACCAAAGAGGCGATAGT
GACGGTGTAGCATCGCTAGGCGATACTCCCGTAATCTCCCGTAACCATCCAGTGACTTCT
TTCATCGTAGGTCTCTCTTTCGGGTCGGTCCTGAGGCATGACTTGATCACCTCACCTATA
TTCTCAATCTTGTCATCGTAAGACTCCAGCGCTGGATCAACCATCTTGGCTAGACTCTCA
CCTCTCAAGAAATCTACTAGTCCGGTATCTACCGAGTCTGGTTTGTTAACCGAATCCACG
AGTTTCCCGGTTATCATTTCGAATAGTATTAAACCGAAGCTGTAGACGTTGTCTTCAGGG
TTTAATGAGTCTGAAATGTCTTTTTCCGCGTTGTTGCTGCACGTCTCTGGCTCAGACGGA
CCAAAACTGAAGTCGGCTAGTTTTACAGCGTAGTCTTCAGTGAGGTGAAGTGATGATGAG
ACGAGGTTTGTGTGAGCTATCGGTGGGCTGAGTTGGTGCATATGGTCAAGGCAATATGTT
AACCCCATTAAGATTCTTAACCTCATTCCCCAGTCCAAGTGTTCTGATTCTTTACTGTGT
AGATGTTCAAAGAGTGAACCGTTTGGAGCATACTCAAAGATCAAGATCCTGGTGAAAGGT
TCGTTTTCTTCACAGTAGCCAAGGAGGTTTACAAAGTTCTTGTGGTTTATCTTGGATAAC
ATCTCAATTTTCTTCCTGAACTGAATCTCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA68JQ U 15
AF RR2GM26JQ U 1
AF RR2BA68TF C 98
BS 1 98 RR2GM26JQ
BS 99 99 RR2BA68JQ
BS 100 591 RR2GM26JQ
BS 592 933 RR2BA68TF

RD RR2BA68JQ 414 0 0
AG
CTCCAATAAATACACTAATTATAGATTTACGTAACTTGAACTGAAGCCAAAAACAAGCAT
CTTCAGTTTTGTTTTTTTTTTTTATCACTTTTGAGTAAACAACTACAAAAACACAATTAC
AAAACTCACACATCTTCCAACATACTTACACTTCTTGTTGGGGACTCTCTCTCTCTTACC
CAATAAACAAAACCTCCAACTCTGCCCACCAAAAAGGCGATAGTGACGGGGTAGCATCCC
TAGGCGAAACTCCCGTAATCTCCCGTAACCATCCAGTGACTTCTTTCATCGTAGGTCTCT
CTTTCGGGTCGGTCCTGAGGCATGACTTGATCACCTCACCTATATTCTCAATCTTGTCAT
CGTAAAACTCCAGCGCTGGATCAACCATCTTGGCTAAACTCTCACCTCTCAA

QA 3 414 3 414
DS 

RD RR2GM26JQ 591 0 0
GAACGTTCATCTATAACTCCAATAAATACACTAATTATAGATTTACGTAACTTGAACTGA
AGCCAAAAACAAGCATCTTCAGTTTTGTTTTTTTTTTT*ATCACTTTTGAGTAGACAACT
ACAAAAACACAATTACAAAACTCACACATCTTCCAACATACTTACACTTCTTGTTGGTGA
CTCTCTCTCTCTTACGCAATAGACAAAACCTCCAACTCTGCCCACCAAAGAGGCGATAGT
GACGGTGTAGCATCGCTAGGCGATACTCCCGTAATCTCCCGTAACCATCCAGTGACTTCT
TTCATCGTAGGTCTCTCTTTCGGGTCGGTCCTGAGGCATGACTTGATCACCTCACCTATA
TTCTCAATCTTGTCATCGTAAGACTCCAGCGCTGGATCAACCATCTTGGCTAGACTCTCA
CCTCTCAAGAAATCTACTAGTCCGGTATCTACCGAGTCTGGTTTGTTAACCGAATCCACG
AGTTTCCCGGTTATCATTTCGAATAGTATTAAACCGAAGCTGTAGACGTTGTCTTCAGGG
TTTAATGAGTCTGAAATGTCTTTTTCCGCGTTGTTGCTGCACGTCTCTGGC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2BA68TF 836 0 0
TTATCACTTTTGAGTAGACAACTACAAAAACACAATTACAAAACTCACACATCTTCCAAC
ATACTTACACTTCTTGTTGGTGACTCTCTCTCTCTTACGCAATAGACAAAACCTCCAACT
CTGCCCACCAAAGAGGCGATAGTGACGGTGTAGCATCGCTAGGCGATACTCCCGTAATCT
CCCGTAACCATCCAGTGACTTCTTTCATCGTAGGTCTCTCTTTCGGGTCGGTCCTGAGGC
ATGACTTGATCACCTCACCTATATTCTCAATCTTGTCATCGTAAGACTCCAGCGCTGGAT
CAACCATCTTGGCTAGACTCTCACCTCTCAAGAAATCTACTAGTCCGGTATCTACCGAGT
CTGGTTTGTTAACCGAATCCACGAGTTTCCCGGTTATCATTTCGAATAGTATTAAACCGA
AGCTGTAGACGTTGTCTTCAGGGTTTAATGAGTCTGAGATGTCTTTTTCCGCGTTGTTGC
TGCACGTCTCTGGCTCAGACGGACCAAAACTGAAGTCGGCTAGTTTTACAGCGTAGTCTT
CAGTGAGGTGAAGTGATGATGAGACGAGGTTTGTGTGAGCTATCGGTGGGCTGAGTTGGT
GCATATGGTCAAGGCAATATGTTAACCCCATTAAGATTCTTAACCTCATTCCCCAGTCCA
AGTGTTCTGATTCTTTACTGTGTAGATGTTCAAAGAGTGAACCGTTTGGAGCATACTCAA
AGATCAAGATCCTGGTGAAAGGTTCGTTTTCTTCACAGTAGCCAAGGAGGTTTACAAAGT
TCTTGTGGTTTATCTTGGATAACATCTCAATTTTCTTCCTGAACTGAATCTCTGTC

QA 1 836 1 836
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3539Contig1 492 3 6 U
GGAAAAGCAGTCATCTGAAACCAACATTTCGAGAGAGAAGAGAGATGAGGTTGTTCGATC
CATGGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCGTTTCTCACCGGATTCG
CCGTAACAGGCGTCCTCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGA
ACTCCAAGTTCGTCCAACAACATAGGCGGTGATCGACTGATGTGAAATCTACTTCGAAGA
GTGCTTCTGGCTTTCAAACTTATTCTAATAAACATTAAAAAGAGAGAACCCTACATACTT
GTTTTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTTTGTCATTTCACAACTCTCGAAACAGTG
CAAGTTTGAAATGGATTGATTCCAGTCTTTTTCCCCCATATGTTTGAAATGGAATTATTC
CTCTCTGTTTGTTAAGTTGAATCGAATGTAGATGGCATACCATCATTAGTAACAAATCTC
ATTACAAGAGGT


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GQ46TF U 1
AF RR2GV08JQB C 2
AF RR2GV08TF U 2
BS 1 48 RR2GQ46TF
BS 49 49 RR2GV08TF
BS 50 223 RR2GQ46TF
BS 224 224 RR2GV08TF
BS 225 439 RR2GQ46TF
BS 440 492 RR2GV08TF

RD RR2GQ46TF 439 0 0
GGAAAAGCAGTCATCTGAAACCAACATTTCGAGAGAGAAGAGAGATGATGTTGTTCGATC
CATGGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCGTTTCTCACCGGATTCG
CCGTAACAGGCGTCCTCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGA
ACTCCAAGTTCGTCCAACAACATAGGCGGTGATCGACTGATGTTAAATCTACTTCGAAGA
GTGCTTCTGGCTTTCAAACTTATTCTAATAAACATTAAAAAGAGAGAACCCTACATACTT
GTTTTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTTTGTCATTTCACAACTCTCGAAACAGTG
CAAGTTTGAAATGGATTGATTCCAGTCTTTTTCCCCCATATGTTTGAAATGGAATTATTC
CTCTCTGTTTGTTAAGTTG

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2GV08JQB 491 0 0
GG
AAAGCAGTCATCTGAAACCAACATTTCGAGAGAGAAGAGAGATGAGGTTGTTCGATCCAT
GGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCGTTTCTCACGGGATTCGCCG
TAACAGGCGTCCTCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGAACT
CCAAGTTCGTCCAACAACATAGGCGGTGATCGACTGATGTGAAATCTACTTCGAAGAGTG
CTTCTGGCTTTCAAACTTATTCTAATAAACATTAAAAAGAGAGAACCCTACATACTTGTT
TTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTTTGTCATTTCACAACTCTCGAAACAGTGCAA
GTTTGAAATGGATTGATTCCAGTCTTTTTCCCCCATATGTTTGAAATGGAATTATTCCTC
TCTGTTTGTTAAGTTGAATCGAATGTAGATGGCATACCATCATTAGTAACAAATCTCATT
ACAAGAGGT

QA 3 491 3 491
DS 

RD RR2GV08TF 491 0 0
GG
AAAGCAGTCATCTGAAACCAACATTTCGAGAGAGAAGAGAGATGAGGTTGTTCGATCCAT
GGCCAGTGTTCTTCAAGAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCGTTTCTCACCGGATTCGCCG
TAACAGGCGTCCTCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGAACT
CCAAGTTCGTCCAACAACATAGGCGGTGATCGACTGATGTGAAATCTACTTCGAAGAGTG
CTTCTGGCTTTCAAACTTATTCTAATAAACATTAAAAAGAGAGAACCCTACATACTTGTT
TTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTTTGTCATTTCACAACTCTCGAAACAGTGCAA
GTTTGAAATGGATTGATTCCAGTCTTTTTCCCCCATATGTTTGAAATGGAATTATTCCTC
TCTGTTTGTTAAGTTGAATCGAATGTAGATGGCATACCATCATTAGTAACAAATCTCATT
ACAAGAGGT

QA 3 491 3 491
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3541Contig1 907 3 13 U
GGAGAAAGGAGAGAGAGAGATGCAACGAAGGCGAGAACACCTTGTGCTTCTCCTCGATGA
ACTTCTGAATCGCGTATTGGTTACCTCCAGCTCTCTCCTTCAACAATACAATCGCATCCT
TGATCATCTTCTTCGGCTTCGCTTTTTTAGCTTTCTTCGTCGTCTTGCCTCCCTTCGCAG
CAGGCTCCGTCGTAACCGTCGTGTTGATTCCGTCCACAAGAGGAGGGATATTCTCTTGAT
CGACCGCTGGACTCGTCATCTGAAACCGTAAACGTAAGCTCTTAAGAGAATATGAGAAGT
TATTATGAGAATGGGTGATGTGATCGTATCATCGGAAACGTCCGATTTATATATTGACTC
AATGATTCAAAGGAAAATTTGTCTTTTCCGCTTGTTTCTTGTGATTGGAATGCGGATGAA
GAGATACTCCTTCTTGAGGCAATTGTGACATATGGGTTTGGGAATTGGAAAGAAGTTGTG
AACTATGTTGGCAGTAAGACGCAGGCTGAGTGTATTGATTACTTCAACTCTGCTTACATG
CAGTCACCTTGCTTTCCCCTTCCGGACTTGTCTCGTACAAATGGAAAGAGCAAAGATGAG
CGTCTTGCTAAGAGTAAAGAGCACGTTGTGAAAATAGAAACACCTCCACTCTTGATAAAC
CTATCTCCAAAAGAAGAGCTGCCAATGTCAGCTGAAATCAAGTATGTAACAACCAGTGTC
CCGTGTGCTATATTCCCCTGGCCTCGACTTGATGCTCTCGCTGCAAATCGGTTCTTTATT
GGTATGCATATATCCTATCACAAGTCTTTTTGATATTCAGATTGTATGGTTATGAAGCTA
TGATTTTGCATTTCATTATCTGATGAATTGGAGTAGTTAGAAGGGGAGAATGAGTTGTAG
TTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM89TF U 1
AF RR2FL33TF U 42
AF RR2GM89JQ C 494
BS 1 206 RR2GM89TF
BS 207 207 RR2FL33TF
BS 208 428 RR2GM89TF
BS 429 429 RR2FL33TF
BS 430 560 RR2GM89TF
BS 561 633 RR2FL33TF
BS 634 634 RR2GM89JQ
BS 635 656 RR2FL33TF
BS 657 657 RR2GM89JQ
BS 658 766 RR2FL33TF
BS 767 767 RR2GM89JQ
BS 768 826 RR2FL33TF
BS 827 907 RR2GM89JQ

RD RR2GM89TF 560 0 0
GGAGAAAGGAGAGAGAGAGATGCAACGAAGGCGAGAACACCTTGTGCTTCTCCTCGATGA
ACTTCTGAATCGCGTATTGGTTACCTCCAGCTCTCTCCTTCAACAATACAATCGCATCCT
TGATCATCTTCTTCGGCTTCGCTTTTTTAGCTTTCTTCGTCGTCTTGCCTCCCTTCGCAG
CAGGCTCCGTCGTAACCGTCGTGTTGTTTCCGTCCACAAGAGGAGGGATATTCTCTTGAT
CGACCGCTGGACTCGTCATCTGAAACCGTAAACGTAAGCTCTTAAGAGAATATGAGAAGT
TATTATGAGAATGGGTGATGTGATCGTATCATCGGAAACGTCCGATTTATATATTGACTC
AATGATTCAAAGGAAAATTTGTCTTTTCCGCTTGTTTCTTGTGATTGGAATGCGGATGAA
GAGATACTTCTTCTTGAGGCAATTGTGACATATGGGTTTGGGAATTGGAAAGAAGTTGTG
AACTATGTTGGCAGTAAGACGCAGGCTGAGTGTATTGATTACTTCAACTCTGCTTACATG
CAGTCACCTTGCTTTCCCCT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2FL33TF 785 0 0
GG
GTGCTTCTCCTCGATGAACTTCTGAATCGCGTATTGGTTAGCTCCAGTTCTCTCCTTCAA
CAATACAATCGCATCCTTGATCATCTTCTTCGGCTTCGCTTTTTTAGCTTTCTTCGTCGT
CTTGCCTCCCTTCGCAGCAGGCTCCGTCGTAACCGTCGTGTTGATTCCGTCCACAGGAGG
AGGGATATTCTCTTGATCGACCGCTGGACTCGTCATCTGAAACCGTAAACGTAAGCTTTT
AAGAGAATATGAGAAGTTATTATGAGAATGGGTGATGTGATCGTATCATCGGAAACGTCC
GATTTATATATTGACTCAATGATTCAAAGGACAATTTGTCTTTTCCGCTTGTTTCTTGTG
ATTGGAATGCGGATGAAGAGATACTCCTTCTTGAGGCAATTGTGACATATGGGTTTGGGA
ATTGGAAAGAAGTTGTGAACTATGTTGGCAGTAAGACGCAGGCTGAGTGTATTGATTACT
TCAACTCTGCTTACATGCAGTCACCTTGCCTTCCCCTTCCGGACTTGTCTCGTACAAATG
GAAAGAGCAAAGATGAGCGTCTTGCTAAGAGTAAAGAGCACGTTGTGAAACTAGAAACAC
CTCCACTCTTGATGAACCTATCTCCAAAAGAAGAGCTGCCAATGTCAGCTGAAATCAAGT
ATGTAACAACCAGTGTCCCGTGTGCTATATTCCCCTGGCCTCGACTTGATGCTCTCGCTG
CAA*TCGGTTCTTTATTGGTATGCATATATCCTATCACAAGTCTTTTTGATATTCAGATT
GTA

QA 3 785 3 785
DS 

RD RR2GM89JQ 414 0 0
GTAAGACGCAGGCTGAGTGTATTGATTACTTCAACTCTGCTTACATGCAGTCACCTTGCT
TTCCCCTTCCGGACTTGTTTCGTACAAATGGAAAGAGCAAAGATGAGCGTCTTGCTAAGA
GTAAAGAGCACGTTGTGAAAATAGAAACACCTGCACTCTTGATAAACCTATCTCCAAAAG
AAGAGCTGTCAATGTCAGCTGAAATCAAGTATGTAACAACCAGTGTCCCGTGTGCTATAT
TCCCCTG*CCTCGACTTGATGCTCTCGCTGCAAATCGGTTCTTTGTTGGTATGCATATAT
CCTATCACAAGTCTTTTTGATATTCAGATTGTATGGTTATGAAGCTATGATTTTGCATTT
CATTATCTGATGAATTGGAGTAGTTAGAAGGGGAGAATGAGTTGTAGTTTTGTT

QA 1 414 1 414
DS 



AS 1 2

CO CL3542Contig1 567 2 6 U
TGCGGATCAGAGCAAGACCACATACCACGAGCTCCAGAGGAAGAAGACTCACCGTTACGT
CGTCTTCAAGATCGACGAGCTCAAAAATCAAGTGGTGGTTGAGAAAACAGGAAACCCAGC
AGAGAGCTACGACGACTTCTTAGCTTCTCTCCCCGACAATGATTGCAGATACGCTGTTTA
CGACTTTGATTTCGTCACCTCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCGTCGCTTG
GTCTCCATCGACATCTAGAATAAGGGCGAAGATGCTATACGCGACATCTAAAGAGAGGTT
TAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCACTACGAGATTCAAGCTACTGATCCTACTGAGGTTGA
TCTTGATGTCCTTCGCGAACGAGCAAACTGAGGGATATTTGTTTGTTCTTATATACTTTT
TATGGTAATGTAATGAAAATAATCATTCGGATTTCTCGTATTCTCGTGGGTGCATTTGTG
TAACCACAGTTTCTTCTTGTTCTATGGACAAGTGTATTAAACTCGGTTGATGTTTCAGAT
TACTCATCTATATACATGCCTCTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G240TF U 1
AF RR2BZ42TF U 58
BS 1 172 RR2G240TF
BS 173 173 RR2BZ42TF
BS 174 323 RR2G240TF
BS 324 324 RR2BZ42TF
BS 325 521 RR2G240TF
BS 522 567 RR2BZ42TF

RD RR2G240TF 521 0 0
TGCGGATCAGAGCAAGACCACATACCACGAGCTCCAGAGGAAGAAGACTCACCGTTACGT
CGTCTTCAAGATCGACGAGCTCAAAAATCAAGTGGTGGTTGAGAAAACAGGAAACCCAGC
AGAGAGCTACGACGACTTCTTAGCTTCTCTCCCCGACAATGATTGCAGATACTCTGTTTA
CGACTTTGATTTCGTCACCTCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCGTCGCTTG
GTCTCCATCGACATCTAGAATAAGGGCGAAGATGCTATACGCGACATCTAAAGAGAGGTT
TAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCGCTACGAGATTCAAGCTACTGATCCTACTGAGGTTGA
TCTTGATGTCCTTCGCGAACGAGCAAACTGAGGGATATTTGTTTGTTCTTATATACTTTT
TATGGTAATGTAATGAAAATAATCATTCGGATTTCTCGTATTCTCGTGGGTGCATTTGTG
TAACCACAGTTTCTTCTTGTTCTATGGACAAGTGTATTAAA

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2BZ42TF 510 0 0
G
GTCGTCTTCAAGATCGACGAGCTCAAAAATCAAGTGGTGGTTGAGAAAACAGGAAACCCA
GCAGAGAGCTACGACGACTTCTTAGCTTCTCTCCCCGACAATGATTGCAGATACGCTGTT
TACGACTTTGATTTCGTCACCTCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCGTCGCT
TGGTCTCCATCGACATCTAGAATAAGGGCGAAGATGCTATACGCGACATCTAAAGAGAGG
TTTAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCACTACGAGATTCAAGCTACTGATCCTACTGAGGTT
GATCTTGATGTCCTTCGCGAACGAGCAAACTGAGGGATATTTGTTTGTTCTTATATACTT
TTTATGGTAATGTAATGAAAATAATCATTCGGATTTCTCGTATTCTCGTGGGTGCATTTG
TGTAACCACAGTTTCTTCTTGTTCTATGGACAAGTGTATTAAACTCGGTTGATGTTTCAG
ATTACTCATCTATATACATGCCTCTTTGT

QA 2 510 2 510
DS 



AS 1 2

CO CL3543Contig1 801 2 16 U
GGATAACAAAGATAGAGAGAAAGCCTTGGTGGGTTCAAAAGATTCTTCTCTTGTCTTGTC
TCGTCAAAGGAGCCAAGCCGTTGGTAAAGATGGAGGAACAGTTCATACTTAGGGTTCCAC
CGTCTGTTTCAGAGCGAATCGATCGCCTTTTAAGCGACGAGGCTTCTTCTACTTCCGACG
AGATCCCTTTAGATTTATGCTTTTCAGAGGATGGGAGAAGCGGGACGTTTGTAATTGGAA
ACGAAGAGTTCCCGGCTTCTCTGCTGGACCTTCCTGCTGTTGTTGAGTCTTTTAAAACTT
ATGATGACTCTGCACTTGTCAAAACTGCTGACATTGGCCAGATGATCATGGTTAGGGAGC
AGGGTGATCCTGCGCCTAATACAGTTGAGTACAGACATGGTCTAACTCCTCCTATGAAGG
ATGCTCGCAAGAGAAGATTTCGTCGAGAGCCTGACCTTAATCCGGAGCTTGTACAGCGCG
TTGAGAGGGACTTGCTGAACATCTTGAGTGGCAGAACTGTCGAAAACGGAAATGAGCAGC
AAGAGGAGACAGTTGCGGAGGAGAATACAAATAAGAAAGTCTCTTCTACTTCTTCACCTG
CTGCTACACCTGTCGAAAAGCCTGAAGAAGCTCCTGAGGCGGGGACTAATAATAATCGTA
ATGCTCCAGCACAAGTTGAGCAGGAGAGAAGTGAATCAGAAGATTCTGATGATTCTATGT
GAAAGTTTGGTTATGTATCTAACGTTTGAAGAAACGAATGCAGCTATGTTTACCACTTTT
ATCATTTATTGGTTCATGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H603TF U 1
AF RR2GB15JQ C 28
BS 1 38 RR2H603TF
BS 39 39 RR2GB15JQ
BS 40 255 RR2H603TF
BS 256 256 RR2GB15JQ
BS 257 543 RR2H603TF
BS 544 544 RR2GB15JQ
BS 545 683 RR2H603TF
BS 684 684 RR2GB15JQ
BS 685 704 RR2H603TF
BS 705 705 RR2GB15JQ
BS 706 713 RR2H603TF
BS 714 714 RR2GB15JQ
BS 715 727 RR2H603TF
BS 728 728 RR2GB15JQ
BS 729 746 RR2H603TF
BS 747 801 RR2GB15JQ

RD RR2H603TF 754 0 0
GGATAACAAAGATAGAGAGAAAGCCTTGGTGGGTTCAATAGATTCTTCTCTTGTCTTGTC
TCGTCAAAGGAGCCAAGCCGTTGGTAAAGATGGAGGAACAGTTCATACTTAGGGTTCCAC
CGTCTGTTTCAGAGCGAATCGATCGCCTTTTAAGCGACGAGGCTTCTTCTACTTCCGACG
AGATCCCTTTAGATTTATGCTTTTCAGAGGATGGGAGAAGCGGGACGTTTGTAATTGGAA
ACGAAGAGTTCCCGGTTTCTCTGCTGGACCTTCCTGCTGTTGTTGAGTCTTTTAAAACTT
ATGATGACTCTGCACTTGTCAAAACTGCTGACATTGGCCAGATGATCATGGTTAGGGAGC
AGGGTGATCCTGCGCCTAATACAGTTGAGTACAGACATGGTCTAACTCCTCCTATGAAGG
ATGCTCGCAAGAGAAGATTTCGTCGAGAGCCTGACCTTAATCCGGAGCTTGTACAGCGCG
TTGAGAGGGACTTGCTGAACATCTTGAGTGGCAGAACTGTCGAAAACGGAAATGAGCAGC
AAG*GGAGACAGTTGCGGAGGAGAATACAAATAAGAAAGTCTCTTCTACTTCTTCACCTG
CTGCTACACCTGTCGAAAAGCCTGAAGAAGCTCCTGAGGCGGGGACTAATAATAATCGTA
ATGCTCCAGCACAAGTTGAGCAG*AGAGAAGTGAATCAGAAGAT*CTGATGAT*CTATGT
GAAAGTT*GGTTATGTATCTAACGTT
GAAGAAAC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2GB15JQ 774 0 0
GGTGGGTTCAAAAGATTCTTCTCTTGTCTTGTCTCGTCAAAGGAGCCAAGCCGTTGGTAA
AGATGGAGGAACAGTTCATACTTAGGGTTCCACCGTCTGTTTCAGAGCGAATCGATCGCC
TTTTAAGCGACGAGGCTTCTTCTACTTCCGACGAGATCCCTTTAGATTTATGCTTTTCAG
AGGATGGGAGAAGCGGGACGTTTGTAATTGGAAACGAAGAGTTCCCGGCTTCTCTGCTGG
ACCTTCCTGCTGTTGTTGAGTCTTTTAAAACTTATGATGACTCTGCACTTGTCAAAACTG
CTGACATTGGCCAGATGATCATGGTTAGGGAGCAGGGTGATCCTGCGCCTAATACAGTTG
AGTACAGACATGGTCTAACTCCTCCTATGAAGGATGCTCGCAAGAGAAGATTTCGTCGAG
AGCCTGACCTTAATCCGGAGCTTGTACAGCGCGTTGAGAGGGACTTGCTGAACATCTTGA
GTGGCAGAACTGTCGAAAACGGAAATGAGCAGCAAGAGGAGACAGTTGCGGAGGAGAATA
CAAATAAGAAAGTCTCTTCTACTTCTTCACCTGCTGCTACACCTGTCGAAAAGCCTGAAG
AAGCTCCTGAGGCGGGGACTAATAATAATCGTAATGCTCCAGCACAAGTTGAGCAGGAGA
GAAGTGAATCAGAAGATTCTGATGATTCTATGTGAAAGTTTGGTTATGTATCTAACGTTT
GAAGAAACGAATGCAGCTATGTTTACCACTTTTATCATTTATTGGTTCATGGTC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL3544Contig1 954 2 20 U
GGGAGGTAGAACAAAATCAAAGCTTTCAGATCTTGAACAAGAACCTCTAATCTCTCTCTC
TCTCTCTCGGTTACTTCGAAAAAGATGACTTTTACTATTCCGATTGATAACGGAGATGCC
GTGAAGAACGCAGAAGCTGATTCACAAAGAACACTGTACCCATATGTCACTGGGGCATCG
ATTGTCGCAATCAAGTACAAAGATGGTGTTCTAATGGCTTCCGACATGGGAGGTTCATAT
GGATCCACCTTAAGATACAAGAACATTGAGAGAGTGAAGGCTATTGGCAAGCATTCTCTC
CTCGGTGCCAGTGGAGAAATCAGCGACTTTCAGGAGATTCTCCGTTATCTTGATGAGCTC
GTCTTGAATGATAACATGTGGGATGATGGTAACTCTTTGGGACCAAAAGAGGTTCACAAC
TATCTGACTCGTGTCATGTACAACCGCCGCAACAAGTTTAACCCTCTCTGGAACACTCTC
GTCCTTGGAGGCGTCAAAAATGGGGAAAGCTACCTCGGCATGGTGTCAATGATTGGTGTT
AGTTTCGAGGACAATCATGTTGCCACTGGATTTGGGAACCACCCAGCTAGGCCAATTCTT
CGTGATGAGTGGCGTGCGGATCTGAGCCTCGAAGAAGGTGTCAAGCTCCTTGAGAAGTGT
ATGCGTGTGCTTCTTTACCGTGACAGATCTGCTATTAACAAGCTTCAGATAGCGAAGATC
ACGGAAGAAGGGGTGACTGTCTCTCAGCCCTACTCGTTGAAGACGTTTTGGGAGTTCCAG
GCTTTCCACAACCCAACTGCTGGTGCTCAAGGCTCGTGGTAAGAAGCCTATTTATCAATC
TTGAGATCAAGCTCTGCCTATTTATTTTATTTCATGTGATGTTGTTAACATACTATGTAT
TGGAGTGGGTTTCCTGGTGGTTATCTCAATGAAAATTTCTGAAGATATTTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E241TF U 1
AF RR2BD56TF U 306
BS 1 491 RR2E241TF
BS 492 492 RR2BD56TF
BS 493 494 RR2E241TF
BS 495 495 RR2BD56TF
BS 496 503 RR2E241TF
BS 504 504 RR2BD56TF
BS 505 583 RR2E241TF
BS 584 584 RR2BD56TF
BS 585 715 RR2E241TF
BS 716 716 RR2BD56TF
BS 717 725 RR2E241TF
BS 726 726 RR2BD56TF
BS 727 730 RR2E241TF
BS 731 731 RR2BD56TF
BS 732 732 RR2E241TF
BS 733 733 RR2BD56TF
BS 734 758 RR2E241TF
BS 759 759 RR2BD56TF
BS 760 774 RR2E241TF
BS 775 954 RR2BD56TF

RD RR2E241TF 774 0 0
GGGAGGTAGAACAAAATCAAAGCTTTCAGATCTTGAACAAGAACCTCTAATCTCTCTCTC
TCTCTCTCGGTTACTTCGAAAAAGATGACTTTTACTATTCCGATTGATAACGGAGATGCC
GTGAAGAACGCAGAAGCTGATTCACAAAGAACACTGTACCCATATGTCACTGGGGCATCG
ATTGTCGCAATCAAGTACAAAGATGGTGTTCTAATGGCTTCCGACATGGGAGGTTCATAT
GGATCCACCTTAAGATACAAGAACATTGAGAGAGTGAAGGCTATTGGCAAGCATTCTCTC
CTCGGTGCCAGTGGAGAAATCAGCGACTTTCAGGAGATTCTCCGTTATCTTGATGAGCTC
GTCTTGAATGATAACATGTGGGATGATGGTAACTCTTTGGGACCAAAAGAGGTTCACAAC
TATCTGACTCGTGTCATGTACAACCGCCGCAACAAGTTTAACCCTCTCTGGAACACTCTC
GTCCTTGGAGGTGTTAAAAATGGTGAAAGCTACCTCGGCATGGTGTCAATGATTGGTGTT
AGTTTCGAGGACAATCATGTTGCCACTGGATTTGGGAACCACCTAGCTAGGCCAATTCTT
CGTGATGAGTGGCGTGCGGATCTGAGCCTCGAAGAAGGTGTCAAGCTCCTTGAGAAGTGT
ATGCGTGTGCTTCTTTACCGTGACAGATCTGCTATTAACAAGCTTCAGATAGCGA*GATC
ACGGA*GAAGTG*TGACTGTCTCTCAGCCCTACTCGTT*AAGACGTTTTGGGAG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2BD56TF 649 0 0
G
GCCAGTGGAGAAATCAGCGACTTTCAGGAGATTCTTCGTTATCTTGATGAGCTCGTCTTG
AATGATAACATGTGGGATGATGGTAACTCTTTGGGACCAAAAGAGGTTCACAACTATCTT
ACTCGTGTCATGTACAACCGTCGCAACAAGTTTAACCCTCTCTGGAACACTCTCGTCCTT
GGAGGCGTCAAAAATGGGGAAAGCTACCTTGGCATGGTGTCAATGATTGGTGTTAGTTTC
GAGGACAATCATGTTGCCACTGGATTTGGGAACCACCCAGCTAGGCCAATTCTTCGTGAT
GAGTGGCGTGCGGATCTGAGCTTCGAAGAAGGTGTCAAGCTCCTTGAGAAGTGTATGCGT
GTGCTTCTTTACCGTGACAGATCTGCTATTAACAAGCTTCAGATAGCGAAGATCACGGAA
GAAGGGGTGACTGTCTCTCAGCCCTATTCGTTGAAGACGTTTTGGGAGTTCCAGGCTTTC
CACAACCCAACTGCTGGTGCTCAAGGCTCGTGGTAAGAAGCCTATTTATCAATCTTGAGA
TCAAGCTCTGCCTATTTATTTTATTTCATGTGATGTTGTTAACATACTATGTATTGGAGT
GGGTTTCCTGGTGGTTATCTCAATGAAAATTTCTGAAGATATTTGGAC

QA 2 649 2 649
DS 



AS 1 3

CO CL3545Contig1 587 3 1 U
GGTAACATTTTTGAATTATAGTCTAAATCAAACTTAATCAATAGTAAATCAAGTTACCAA
TCAAAGCCATAAAATACTAAAGGGACTGTCAAGTTTCACAAACACTTCAAAATTCAAACT
AAAATAGCAAAGAAAACAAAAAGGAAGAAGTTTATGTTGGTGGAGAGCAAAATTTTCTAG
TCAGGAAGTATTTGCTCGTTGTCTGCATCTCCTTCTGTCTAAATGGCAGGCTTTGAAGGT
CCAGCTCCTGGAGCTTGCTTCTTATTGATACCACTCACTATATCATCAATCCTTAGAAGC
ATACACGCCGCTTCAATCGCTGTCTTAAACGTTTGAGCCTTCACATTGTACGCATCCCAT
ATCTTGCTCTCCTTCATGTCAGCTATTGCACCAGTGTTTCCATCGATTCCAGTCCAGGCA
TTCTCACCATTTGCATGCTTTCCTTGCAGTGCTGTCATAGTTCTGATCACGTTAACTCCA
CAGTTCTGTGCTAGAGTACGCGGAATAGCCTCAAAAGCTATGGCAGCTGCTTCATAAGGC
CACTTTTCGATTCCTTCAATCGTTGCACTCTTCTGTTTTAAAGTGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2E415JQ U 1
AF RR2E415TF C 1
AF RR2D293JQ U 20
BS 1 587 RR2E415JQ

RD RR2E415JQ 587 0 0
GGTAACATTTTTGAATTATAGTCTAAATCAAACTTAATCAATAGTAAATCAAGTTACCAA
TCAAAGCCATAAAATACTAAAGGGACTGTCAAGTTTCACAAACACTTCAAAATTCAAACT
AAAATAGCAAAGAAAACAAAAAGGAAGAAGTTTATGTTGGTGGAGAGCAAAATTTTCTAG
TCAGGAAGTATTTGCTCGTTGTCTGCATCTCCTTCTGTCTAAATGGCAGGCTTTGAAGGT
CCAGCTCCTGGAGCTTGCTTCTTATTGATACCACTCACTATATCATCAATCCTTAGAAGC
ATACACGCCGCTTCAATCGCTGTCTTAAACGTTTGAGCCTTCACATTGTACGCATCCCAT
ATCTTGCTCTCCTTCATGTCAGCTATTGCACCAGTGTTTCCATCGATTCCAGTCCAGGCA
TTCTCACCATTTGCATGCTTTCCTTGCAGTGCTGTCATAGTTCTGATCACGTTAACTCCA
CAGTTCTGTGCTAGAGTACGCGGAATAGCCTCAAAAGCTATGGCAGCTGCTTCATAAGGC
CACTTTTCGATTCCTTCAATCGTTGCACTCTTCTGTTTTAAAGTGCC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2E415TF 587 0 0
GGTAACATTTTTGAATTATAGTCTAAATCAAACTTAATCAATAGTAAATCAAGTTACCAA
TCAAAGCCATAAAATACTAAAGGGACTGTCAAGTTTCACAAACACTTCAAAATTCAAACT
AAAATAGCAAAGAAAACAAAAAGGAAGAAGTTTATGTTGGTGGAGAGCAAAATTTTCTAG
TCAGGAAGTATTTGCTCGTTGTCTGCATCTCCTTCTGTCTAAATGGCAGGCTTTGAAGGT
CCAGCTCCTGGAGCTTGCTTCTTATTGATACCACTCACTATATCATCAATCCTTAGAAGC
ATACACGCCGCTTCAATCGCTGTCTTAAACGTTTGAGCCTTCACATTGTACGCATCCCAT
ATCTTGCTCTCCTTCATGTCAGCTATTGCACCAGTGTTTCCATCGATTCCAGTCCAGGCA
TTCTCACCATTTGCATGCTTTCCTTGCAGTGCTGTCATAGTTCTGATCACGTTAACTCCA
CAGTTCTGTGCTAGAGTACGCGGAATAGCCTCAAAAGCTATGGCAGCTGCTTCATAAGGC
CACTTTTCGATTCCTTCAATCGTTGCACTCTTCTGTTTTAAAGTG
CC

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2D293JQ 567 0 0
AGTCTAAATCAAACTTAATCAATAGTAAATCAAGTTACCAATCAAAGCCATAAAATACTA
AAGGGACTGTCAAGTTTCACAAACACTTCAAAATTCAAACTAAAATAGCAAAAAAAACAA
AAAGGAAGAAGTTTATGTTGGTGGAGAGCAAAATTTTCTAGTCAGGAAGTATTTGCTCGT
TGTCTGCATCTCCTTCTGTCTCAATGGTAGGATTTGAAGGTCCAGCTCCTGGAGCTTGCT
TCTTCTTGATACCACTCACTATATCATCAATCCTTAAAAGCATACACGCCGCTTCAATCG
CTGTCTTAAACGTTTGAGCCTTCACATTGTACGCATCCCATATCTTGCTCTCCTTCATGT
CAGCTATTGCACCAGTGTTTCCATCGATTCCAGTCCAGGCATTCTCACCATTTGCATGCT
TTCCTTGCAGTGCTGTCATAGTTCTGATCACGTTAACTCCACAGTTCTGTGCTAGAGTAC
GCGGAATAGCCTCAAAAGCTATGGCAGCTGCTTCATAAGGCCACTTTTCGATTCCTTCAA
TCGTTGCACTCTTCTGTTTTAAAGTG
G

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 3

CO CL3546Contig1 900 3 10 U
GATTATATATCGGGATTTAAAGCCGGAAAACGTATTAATCCAGGAAAATGGAGATATCTC
CCTAACAGATTTCGATCTGTCTTGCTTGACATCTTGTAGACCTCAGCTGTTGATTCCGAG
TATAGATGAAAAAAAGAAGAAGAAGCAACAAAAGAGTCAACAAAGTCCAGTTTTCATGGC
TGAACCTATGCGTGCATCAAACTCATTTGTTGGCACTGAAGAGTATATTGCTCCGGAAAT
TATAACTGGGGCAGGCCATACGAGTGCAGTAGACTGGTGGGCTCTTGGTATCCTTATGTA
CGAAATGTTATACGGATACACTCCATTTAGAGGAAAAACAAGACAGAAGACTTTCGCCAA
TGTTCTTCAGAAAGATCTGAAGTTCCCAGCTAGCATTCCTGCAAGTCTTCAAGTGAAACA
GCTGATTTTTAGGCTGTTACAACGAGATCAGAAGAAGAGACTAGGCTGTCTTGAAGGAGC
AAACGAAGTCAAGAACCATTCTTTCTTCAAAGGCATTAACTGGGCTCTGATTCGATGCAC
GACTCCTCCGGAGCTCGAAACACCGATATTTCCTGGCGAAGCTGAAAACGGAGAGAACGT
CGTGGACCCTGAGCTGGAAGATCTGCAAACAAATGTTTTTTGAAAATTTGAATTGAACAA
CTCTTGTTTCCTTAAAAATGGTTTCAAGAAACCTTTTGAATCTCTTGCTCTCCCAAAGCT
TCACACGAGAGTGCATGTTCTTTTTATTTCGTCTTTTTTCTTCTTCGTTGACATATTGGA
TTAGTTTTCCTACGTGTTCTTCATTTCTTGTGATATGTATTGGTGTGATTTTCTACTTGT
CAATAAAACTAGTCTTTTGTTCCATTTTTAGTATTTATATAATGCAACGAAATTGCTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT86TF U 1
AF RR2CT86JQ C 54
AF RR2GR60TF U 343
BS 1 258 RR2CT86TF
BS 259 343 RR2CT86JQ
BS 344 660 RR2GR60TF
BS 661 661 RR2CT86JQ
BS 662 669 RR2GR60TF
BS 670 670 RR2CT86JQ
BS 671 712 RR2GR60TF
BS 713 713 RR2CT86JQ
BS 714 860 RR2GR60TF
BS 861 900 RR2CT86JQ

RD RR2CT86TF 258 0 0
GATTATATATCGGGATTTAAAGCCGGAAAACGTATTAATCCAGGAAAATGGAGATATCTC
CCTAACAGATTTCGATCTGTCTTGCTTGACATCTTGTAGACCTCAGCTGTTGATTCCGAG
TATAGATGAAAAAAAGAAGAAGAAGCAACAAAAGAGTCAACAAAGTCCAGTTTTCATGGC
TGAACCTATGCGTGCATCAAACTCATTTGTTGGCACTGAAGAGTATATTGCTCCGGAAAT
TATAACTGGGGCAGGCCA

QA 1 258 1 258
DS 

RD RR2CT86JQ 847 0 0
GATATCT
CCTAACAGATTTCGATCTGTCT*GCTTGACATCTTGTAGAC*TCAGCTGTTGATTCCGAG
TATAGATGAAAAAA*GAAGAAGAAGCAACAAAAGAGTCAACAAAGTCCAGTTTTCATGGC
TGAACCTATGCGTGCATCAAACTCATTTGTTGGCACTGAAGAGTATATTGCTCCGGAAAT
TATAACTGGGGCAGGCCATACGAGTGCAGTAGACTGGTGGGCTCTTGGTATCCTTATGTA
CGAAATGTTATACGGATACACTCCATTTAGAGGAAAAACAAGACAGAAGACTTTCGCCAA
TGTTCTTCAGAAAGATCTGAAGTTCCCAGCTAGCATTCCTGCAAGTCTTCAAGTGAAACA
GCTGATTTTTAGGCTGTTACAACGAGATCAGAAGAAGAGACTAGGCTGTCTTGAAGGAGT
AAACGAAGTCAAGAACCATTCTTTCTTCAAAGGCATTAACTGGGCTCTGATTCGATGCAC
GACTCCTCCGGAGCTCGAAACACCGATATTTCCTGGCGAAGCTGAAAACGGAGAGAACGT
CGTGGACCCTGAGCTGGAAGATCTGCAAACAAATGTTTTTTGAAAATTTGAATTGAACAA
CTCTTGTTTCCTTAAAAATGGTTTCAAGAAACCTTTTGAATCTCTTGCTCTCCCAAAGCT
TCACACGAGAGTGCATGTTCTTTTTATTTCGTCTTTTTTCTTCTTCGTTGACATATTGGA
TTGGTTTTCCTACGTGTTCTTCATTTCTTGTGATATGTATTGGTGTGATTTTCTACTTGT
CAATAAAACTAGTCTTTTGTTCCATTTTTAGTATTTATATAATGCAACGAAATTGCTAGC

QA 8 847 8 847
DS 

RD RR2GR60TF 518 0 0
G
CAGAAGACTTTCGCCAATGTTCTTCAGAAAGATCTGAAGTTCCCAGCTAGCATTCCTGCA
AGTCTTCAAGTGAAACAGCTGATTTTTAGGCTGTTACAACGAGATCAGAAGAAGAGACTA
GGCTGTCTTGAAGGAGCAAACGAAGTCAAGAACCATTCTTTCTTCAAAGGCATTAACTGG
GCTCTGATTCGATGCACGACTCCTCCGGAGCTCGAAACACCGATATTTCCTGGCGAAGCT
GAAAACGGAGAGAACGTCGTGGACCCTGAGCTGGAAGATCTGCAAACAAATGTTTTTTGA
AAATTTGAATTGAACAATTCTTGTTTTCTTAAAAATGGTTTCAAGAAACCTTTTGAATCT
CTTGCTCTCTCAAAGCTTCACACGAGAGTGCATGTTCTTTTTATTTCGTCTTTTTTCTTC
TTCGTTGACATATTGGATTAGTTTTCCTACGTGTTCTTCATTTCTTGTGATATGTATTGG
TGTGATTTTCTACTTGTCAATAAAACTAGTCTTTTGT

QA 2 518 2 518
DS 



AS 1 2

CO CL3547Contig1 784 2 2 U
GGCTCTTACTCGTTGGAAGACCCATTTGCTTGGTTCTTTGGACGACCCATCCCATCGGCG
AGCGACTGTGAAAGGGAAAGATGGGGCTGTCATTCGGGAAGTTGTTCAGTAAGCTGTTTG
CAAAGAAAGAGATGAGGATCCTTATGGTTGGTCTCGATGCTGCTGGTAAGACTACCATCC
TCTACAAGCTCAAGCTTGGCGAGATCGTCACCACCATTCCCACCATTGGTTTCAATGTGG
AGACTGTGGAGTACAAGAACATCAGCTTCACCGTCTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGA
TTCGTCCATTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACCCAAGGGCTGATCTTCGTGGTGGACA
GCAATGACCGTGACCGTGTTGTCGAAGCTAGGGACGAGCTTCACAGAATGCTCAACGAAG
ATGAGTTGAGAGATGCAGTGCTTCTTGTCTTTGCTAACAAGCAAGATCTTCCAAACGCCA
TGAACGCCGCTGAGATTACTGACAAACTCGGCCTTCACTCTCTCCGTCAACGACACTGGT
ACATACAGAGCACATGTACTACCTCAGGAGAAGGGCTCTATGAGGGTCTTGATTGGCTCT
CCAACAACATCGCAAACAAGGCTTAGGAGAGCAGTTTGTGGGAGAGTGTCTTGTCTTCTT
GGACTCTGTTTTGTTCTTTCAGTCTCAACACTTTTTTTTTTATCATTTCATACTTTGTTC
TTCGCTCTTTTTTTCTTCTATCCTAAATGCAGAATATTATGAAATGGGACCTACGTTTCG
ACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2BL95TF U 1
AF RR2BL95JQ C 43
BS 1 539 RR2BL95TF
BS 540 784 RR2BL95JQ

RD RR2BL95TF 539 0 0
GGCTCTTACTCGTTGGAAGACCCATTTGCTTGGTTCTTTGGACGACCCATCCCATCGGCG
AGCGACTGTGAAAGGGAAAGATGGGGCTGTCATTCGGGAAGTTGTTCAGTAAGCTGTTTG
CAAAGAAAGAGATGAGGATCCTTATGGTTGGTCTCGATGCTGCTGGTAAGACTACCATCC
TCTACAAGCTCAAGCTTGGCGAGATCGTCACCACCATTCCCACCATTGGTTTCAATGTGG
AGACTGTGGAGTACAAGAACATCAGCTTCACCGTCTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGA
TTCGTCCATTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACCCAAGGGCTGATCTTCGTGGTGGACA
GCAATGACCGTGACCGTGTTGTCGAAGCTAGGGACGAGCTTCACAGAATGCTCAACGAAG
ATGAGTTGAGAGATGCAGTGCTTCTTGTCTTTGCTAACAAGCAAGATCTTCCAAACGCCA
TGAACGCCGCTGAGATTACTGACAAACTCGGCCTTCACTCTCTCCGTCAACGACACTGG

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2BL95JQ 742 0 0
CGACCCATCCCATCGGCGAGCGACTGTGAAAGGGAAAGATGGGGCTGTCATTCGGGAAGT
TGTTCAGTAAGCTGTTTGCAAAGAAAGAGATGAGGATCCTTATGGTTGGTCTCGATGCTG
CTGGTAAGACTACCATCCTCTACAAGCTCAAGCTTGGCGAGATCGTCACCACCATTCCCA
CCATTGGTTTCAATGTGGAGACTGTGGAGTACAAGAACATCAGCTTCACCGTCTGGGATG
TCGGGGGTCAGGACAAGATTCGTCCATTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACCCAAGGGC
TGATCTTCGTGGTGGACAGCAATGACCGTGACCGTGTTGTCGAAGCTAGGGACGAGCTTC
ACAGAATGCTCAACGAAGATGAGTTGAGAGATGCAGTGCTTCTTGTCTTTGCTAACAAGC
AAGATCTTCCAAACGCCATGAACGCCGCTGAGATTACTGACAAACTCGGCCTTCACTCTC
TCCGTCAACGACACTGGTACATACAGAGCACATGTACTACCTCAGGAGAAGGGCTCTATG
AGGGTCTTGATTGGCTCTCCAACAACATCGCAAACAAGGCTTAGGAGAGCAGTTTGTGGG
AGAGTGTCTTGTCTTCTTGGACTCTGTTTTGTTCTTTCAGTCTCAACACTTTTTTTTTTA
TCATTTCATACTTTGTTCTTCGCTCTTTTTTTCTTCTATCCTAAATGCAGAATATTATGA
AATGGGACCTACGTTTCGACGG

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 3

CO CL3548Contig1 1325 3 11 U
GAGTCCGAATCTTCGTCTACCATTAACCCTAATCTCATTGTAGCAAAATCTCCACCAAGA
AAAATCTGAATCGGTCTCGCGAAGATTAAATCCCCCCTCGGAAATCACCGAACATACTTA
ACATTGACTGTAGGGTGCGTTTCGAACCCGTGATGGGTGCTCCTAAGCAGAAATGGACTC
AAGAAGAAGAGTCAGCTCTAAAGTCTGGCGTTGTCAAGCATGGACCTAGTAAATGGCGCA
CCATTCTCAAAGACCCTGAGTTTAGTGGAGTCTTGTACCTCCGTTCCAATGTGGATCTTA
AGGACAAGTGGAGAAATATGAGTGTCATGGCCAATGGGTGGGGATCGCGTGATAAGTCTA
GGTTAGCTCTTAAAAGGACGCACTCGCTTCCTAAACAGGATGATAGCTCACTTGCTAATA
CAAGCTCATTGCAAAGTGATGAAGACATGGCCGATGCTAAGCATTTTTCCACCACCGGCA
CTTCTGCACTACAACTTCCTACTACTCCTACTCCGAGGAGACCTAATGTAAGGCTGGATA
GCCTTATAATGGAAGCAATATCCACCATGAAAGAGCTTGGTGGCTCTAACAAAACAACTA
TTGGTGCCTACATTGAGGAACAATATCACGCTCCGCCAGACTTCAAACGGTTGCTGTCTA
CCAAGCTTAAGTACTTGACAGCTTGTGGTAAACTCATCAAGATTAAACGCAGG*TATAGA
ATTCCACACACCACTCCTTTGTCTTCCCACAGGAGAAGACATTTGGGAACACCGTCTGGA
AAACAGAGTGTTCTTTCTTTGCCTTCACCTAAAACAGAGAGAGATGAAGTGAATGTTCAG
ACAAAGGCTCAGATTGATACAGAGTTAGCCAGAATGAAGACTATGAACGCACACGAGGCG
CAAGCGGCTGCAGAACAGGCAGTTGAGGAGGCAGAAGCTGCCATGGCAGCGGCTGAAGAA
GCTGCAAAGGAAGCAGAGGCAGCAGAAGCCGAAGCAGAAGAAGCTCAAGCTTACGCTGAA
GAAGCTTTGAAGACACTGAGAGGAAGAAACAACTGCAAAATGATGGTCTGCACGTGAGGT
GACAGAGAAGAGGCTCAATGTGTTGCAGATGAAGAGAGAGAAGCGTAGAAGTAGTGTTTG
TGTGTTGATGATTCTCTACTTGGGAACTCTTTTTAGTTGTAAGCCAGTAATCTCAGATGC
TAAAGCCATTGTATTTTTGTTCACACTTTACTTCACAGCCAAAATAAGTTTTAAAAACAT
GTCCACTGCAGCTTTTCGTGTAAAACTTGATAAGAAAGGTGTGAATTTGTGAAAATATTT
TCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2AV67TF U 1
AF RR2AB20TF U 40
AF RR2AB20JQ C 514
BS 1 131 RR2AV67TF
BS 132 132 RR2AB20TF
BS 133 490 RR2AV67TF
BS 491 491 RR2AB20TF
BS 492 623 RR2AV67TF
BS 624 624 RR2AB20TF
BS 625 748 RR2AV67TF
BS 749 752 RR2AB20TF
BS 753 753 RR2AB20JQ
BS 754 813 RR2AB20TF
BS 814 1325 RR2AB20JQ

RD RR2AV67TF 748 0 0
GAGTCCGAATCTTCGTCTACCATTAACCCTAATCTCATTGTAGCAAAATCTCCACCAAGA
AAAATCTGAATCGGTCTCGCGAAGATTAAATCCCCCCTCGGAAATCACCGAACATACTTA
ACATTGACTGTGGGGTGCGTTTCGAACCCGTGATGGGTGCTCCTAAGCAGAAATGGACTC
AAGAAGAAGAGTCAGCTCTAAAGTCTGGCGTTGTCAAGCATGGACCTAGTAAATGGCGCA
CCATTCTCAAAGACCCTGAGTTTAGTGGAGTCTTGTACCTCCGTTCCAATGTGGATCTTA
AGGACAAGTGGAGAAATATGAGTGTCATGGCCAATGGGTGGGGATCGCGTGATAAGTCTA
GGTTAGCTCTTAAAAGGACGCACTCGCTTCCTAAACAGGATGATAGCTCACTTGCTAATA
CAAGCTCATTGCAAAGTGATGAAGACATGGCCGATGCTAAGCATTTTTCCACCACCGGCA
CTTCTGCACTGCAACTTCCTACTACTCCTACTCCGAGGAGACCTAATGTAAGGCTGGATA
GCCTTATAATGGAAGCAATATCCACCATGAAAGAGCTTGGTGGCTCTAACAAAACAACTA
TTGGTGCCTACATTGAGGAACAAAATCACGCTCCGCCAGACTTCAAACGGTTGCTGTCTA
CCAAGCTTAAGTACTTGACAGCTTGTGGTAAACTCATCAAGATTAAACGCAGG*TATAGA
ATTCCACACACCACTCCTTTGTCTTCCC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2AB20TF 780 0 0
GG
AGCAAAATCTCCACCAAGAAAAATCTGAATCGGTCTCGCGAAGATTAAATCCCCCCTCGG
AAATCACCTAACATACTTAACATTGACTGTAGGGTGCGTTTCGAACCCGTGATGGGTGCT
CCTAAGCAGAAATGGACTCAAGAAGAAGAGTCAGCTCTAAAGTCTGGCGTTGTCAAGCAT
GGACCTGGTAAATGGCGCACCATTCTCAAAGACCCTGAGTTTAGTGGAGTCTTGTACCTC
CGTTCCAATGTGGATCTTAAGGACAAGTGGAGAAATATGAGTGTCATGGCCAATGGGTGG
GGATCGCGTGATAAGTCTAGGTTAGCTCTTAAAAGGACGCACTCGCTTCCTAAACAGGAT
GATAGCTCACTTGCTAATACAAGCTCATTGCAAAGTGATGAAGACATGGCTGATGCTAAG
CATTTTTCCACCACCGGCACTTCTGCACTACAACTTCCTACTACTCCTACTCCGAGGAGA
CCTAATGTAAGGCTGGATAGCCTTATAATGGAAGCAATATCCACCATGAAAGAGCTTGGT
GGCTCTAACAAAACAACTATTGGTGCCTACATTGAGGAACAATATCACGCTCCGCCAGAC
TTCAAACGGTTGCTGTCTACCAAGCTTAAGTACTTGACAGCTTGTGGTAAACTCATCAAG
ATTAAACGCAGGGTATAGAATTCCACACACCACTCCTTTGTCTTCCCACAG*AGAAGACA
TTTGGGAACACCGTCTGGAAAACAGAGTGTTCTTTCTTTGCCTTCACCTAAA
CAGAGA

QA 3 774 3 774
DS 

RD RR2AB20JQ 812 0 0
CGAGGAGACCTAATGTAAGGCTGGATAGCCTTATAATGGAAGCAATATCCACCATGAAAG
AGCTTGGTGGCTCTAACAAAACAACTATTGGTGCCTACATTGAGGAACAATATCACGCTC
CGCCAGACTTCAAACGGTTGCTGTCTACCAAGCTTAAGTACTTGACAGCTTGTGGTAAAC
TCATCAAGATTAAACGCAGG*TATAGAATTCCACACACCACTCCTTTGTCTTCCCACAGG
AGAAGACATTTGGGAACACCGTCTGGAAAACAGAGTGTTCTTTCTTTGCCTTCACCTAAA
ACAGAGAGAGATGAAGTGAATGTTCAGACAAAGGCTCAGATTGATACAGAGTTAGCCAGA
ATGAAGACTATGAACGCACACGAGGCGCAAGCGGCTGCAGAACAGGCAGTTGAGGAGGCA
GAAGCTGCCATGGCAGCGGCTGAAGAAGCTGCAAAGGAAGCAGAGGCAGCAGAAGCCGAA
GCAGAAGAAGCTCAAGCTTACGCTGAAGAAGCTTTGAAGACACTGAGAGGAAGAAACAAC
TGCAAAATGATGGTCTGCACGTGAGGTGACAGAGAAGAGGCTCAATGTGTTGCAGATGAA
GAGAGAGAAGCGTAGAAGTAGTGTTTGTGTGTTGATGATTCTCTACTTGGGAACTCTTTT
TAGTTGTAAGCCAGTAATCTCAGATGCTAAAGCCATTGTATTTTTGTTCACACTTTACTT
CACAGCCAAAATAAGTTTTAAAAACATGTCCACTGCAGCTTTTCGTGTAAAACTTGATAA
GAAAGGTGTGAATTTGTGAAAATATTTTCATG

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

CO CL3549Contig1 813 2 2 U
GGGACTTGAGTTCACCATTGTTAGACCATTTAACTGGATTGGACCTAGGATGGATTTCAT
CCCTGGCATTGATGGTCCTAGCGAGGGCGTTCCTCGTGTCCTAGCATGCTTTAGCAACAA
CCTTCTGCGGCGAGAGCCTCTCAAGCTTGTGGATGGTGGAGAATCACAGAGAACCTTCAT
CTACATCAAAGATGCTATTGAAGCTGTCCTTTTGATGATTGAAAATCCAGAGAGAGCCAA
CGGGCATATCTTCAACGTAGGCAACCCAAACAACGAAGTGACAGTAAGACAACTTGCTGA
AATGATGACTGAGGTCTACTCAAAAGTGAGTGGAGAGACGGCGATTGAGAGTCCAACGAT
AGACGTGAGCTCCAAAGAATTTTATGGAGAAGGTTATGATGACAGCGACAAGAGAATCCC
AGACATGACCATCATAAACCGTCAACTTGGATGGAACCCGAAGACGTCTCTCTGGGGACT
TGCTGGAGTCGACCTTAACTTACCAGCACAGGACCTATGCGGAAGCTGTTAAGAAGGCCA
CTTCAAAACCAGTCGCATCTTAGAGGTCATCACCTCGAATCATTTGGTGGCTACCATTCC
ATTCTTTTTGCTTTTTTTCTTCTTCTAAACTTCACCCAAAATTCCCTTACAATAGGCTAT
TCTAAACGAATGATTATAATATCATATGGTGGTTTGGGTACTAGTTTTCGTTTGATTGTA
ATAGTAATTACTGATAATTTCTTTTGAACTCGTTGTTAAAATGCTTCATATCTTTGTATT
TTGTCCGAAACTAAAAAAGGGAATGGTTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG42TF U 1
AF RR2GG42JQB C 53
BS 1 561 RR2GG42TF
BS 562 813 RR2GG42JQB

RD RR2GG42TF 561 0 0
GGGACTTGAGTTCACCATTGTTAGACCATTTAACTGGATTGGACCTAGGATGGATTTCAT
CCCTGGCATTGATGGTCCTAGCGAGGGCGTTCCTCGTGTCCTAGCATGCTTTAGCAACAA
CCTTCTGCGGCGAGAGCCTCTCAAGCTTGTGGATGGTGGAGAATCACAGAGAACCTTCAT
CTACATCAAAGATGCTATTGAAGCTGTCCTTTTGATGATTGAAAATCCAGAGAGAGCCAA
CGGGCATATCTTCAACGTAGGCAACCCAAACAACGAAGTGACAGTAAGACAACTTGCTGA
AATGATGACTGAGGTCTACTCAAAAGTGAGTGGAGAGACGGCGATTGAGAGTCCAACGAT
AGACGTGAGCTCCAAAGAATTTTATGGAGAAGGTTATGATGACAGCGACAAGAGAATCCC
AGACATGACCATCATAAACCGTCAACTTGGATGGAACCCGAAGACGTCTCTCTGGGGACT
TGCTGGAGTCGACCTTAACTTACCAGCACAGGACCTATGCGGAAGCTGTTAAGAAGGCCA
CTTCAAAACCAGTCGCATCTT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2GG42JQB 761 0 0
GATTTTCTC
CCTGGCATTGATGGTCCTAGCGAGGGCGTTCCTCGTGTCCTAGCATGCTTTAGCAACAAC
CTTCTGCGGCGAGAGCCTCTCAAGCTTGTGGATGGTGGAGAATCACAGAGAACCTTCATC
TACATCAAAGATGCTATTGAAGCTGTCCTTTTGATGATTGAAAATCCAGAGAGAGCCAAC
GGGCATATCTTCAACGTAGGCAACCCAAACAACGAAGTGACAGTAAGACAACTTGCTGAA
ATGATGACTGAGGTCTACTCAAAAGTGAGTGGAGAGACGGCGATTGAGAGTCCAACGATA
GACGTGAGCTCCAAAGAATTTTATGGAGAAGGTTATGATGACAGCGACAAGAGAATCCCA
GACATGACCATCATAAACCGTCAACTTGGATGGAACCCGAAGACGTCTCTCTGGG*ACTT
GCTGGAGTCGACCTTAACTTACCAGCACAGGACCTATGCGGAAGCTGTTAAGAAGGCCAC
TTCAAAACCAGTCGCATCTTAGAGGTCATCACCTCGAATCATTTGGTGGCTACCATTCCA
TTCTTTTTGCTTTTTTTCTTCTTCTAAACTTCACCCAAAATTCCCTTACAATAGGCTATT
CTAAACGAATGATTATAATATCATATGGTGGTTTGGGTACTAGTTTTCGTTTGATTGTAA
TAGTAATTACTGATAATTTCTTTTGAACTCGTTGTTAAAATGCTTCATATCTTTGTATTT
TGTCCGAAACTAAAAAAGGGAATGGTTTGTTC

QA 10 761 10 761
DS 



AS 1 3

CO CL3550Contig1 509 3 4 U
GTCGCAGTACATAAAATCTTAGAACATTCAGTGGTCTAAAATGGTTGGGTTACTTCTCCT
ATCATGGGAAAAGAGATACAAATAGGATATTACATACTGGTACACACACACACAAACTTA
CATATATCTAAAGCTCTTTTTGCGTCCTCTCTGTTTTCTTATAACATTTTTATGTTATCT
TCTTTATTATTCCTCTTCTTCTTCAGACAACAGATTAGTCGATCGTCATTGGCTGCGTCA
TGCAACATCTGAAACGGGCTTTTCTCACTGTCGTCATTACCTCGGTTTCAGCAGCCTCAA
GAAGATTGACAATCTCTGCAAAACAAGGACGGACTTCAGGGTTCGCATCCCAGCAACGTG
TCATGATCTCCCCAAGCACAGGGAGACAATCAGCTGGGACTGTTGGACGTACTCCTCGGT
TCACCACAGCAAACGCAGCTTGAACCGCCGTCATGTTCTGGAACGGTAACAGACCCGTTA
TCAGCTCCCACAGCACGATTCCAAAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FV37JQ U 1
AF RR2GB31JQ U 9
AF RR2GB31TF C 9
BS 1 74 RR2FV37JQ
BS 75 75 RR2GB31JQ
BS 76 222 RR2FV37JQ
BS 223 509 RR2GB31JQ

RD RR2FV37JQ 222 0 0
GTCGCAGTACATAAAATCTTAGAACATTCAGTGGTCTAAAATGGTTGGGTTACTTCTCCT
ATCATGGGAAAAGAAATACAAATAGGATATTACATACTGGTACACACACACACAAACTTA
CATATATCTAAAGCTCTTTTTGCGTCCTCTCTGTTTTCTTATAACATTTTTATGTTATCT
TCTTTATTATTCCTCTTCTTCTTCAGACAACAGATTAGTCGA

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR2GB31JQ 501 0 0
ACATAAAATCTTAAAACATTCAGTGGTCTAAAATGGTTGGGTTACTTCTCCTATCATGGG
AAAAGAGATACAAATAGGATATTACATACTGGTACACACACACACAAACTTACATATATC
TAAAGCTCTTTTTGCGTCCTCTCTGTTTTCTTATAACATTTTTATGTTATCTTCTTTATT
ATTCCTCTTCTTCTTCAGACAACAGATTAGTCGATCGTCATTGGCTGCGTCATGCAACAT
CTGAAACGGGCTTTTCTCACTGTCGTCATTACCTCGGTTTCAGCAGCCTCAAGAAGATTG
ACAATCTCTGCAAAACAAGGACGGACTTCAGGGTTCGCATCCCAGCAACGTGTCATGATC
TCCCCAAGCACAGGGAGACAATCAGCTGGGACTGTTGGACGTACTCCTCGGTTCACCACA
GCAAACGCAGCTTGAACCGCCGTCATGTTCTGGAACGGTAACAGACCCGTTATCAGCTCC
CACAGCACGATTCCAAAACTC

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR2GB31TF 501 0 0
ACATAAAATCTTAGAACATTCAGTGGTCTAAAATGGTTGGGTTACTTCTCCTATCATGGG
AAAAGAGATACAAATAGGATATTACATACTGGTACACACACACACAAACTTACATATATC
TAAAGCTCTTTTTGCGTCCTCTCTGTTTTCTTATAACATTTTTATGTTATCTTCTTTATT
ATTCCTCTTCTTCTTCAGACAACAGATTAGTCGATCGTCATTGGCTGCGTCATGCAACAT
CTGAAACGGGCTTTTCTCACTGTCGTCATTACCTCGGTTTCAGCAGCCTCAAGAAGATTG
ACAATCTCTGCAAAACAAGGACGGACTTCAGGGTTCGCATCCCAGCAACGTGTCATGATC
TCCCCAAGCACAGGGAGACAATCAGCTGGGACTGTTGGACGTACTCCTCGGTTCACCACA
GCAAACGCAGCTTGAACCGCCGTCATGTTCTGGAACGGTAACAGACCCGTTATCAGCTCC
CACAGCACGATTCCAAAACTC

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 3

CO CL3551Contig1 849 3 8 U
CGTCGAATAATGAAGTTTATTATAAGTAAAAAGAAAATAAATGACACGCGTTTACACTCT
GCACAAATGAATTACCAAACTGAAAGTGAACATATAACAAACATACAATACAACCATTTC
CGACAGATACATAAAAGTGGAATCATAAATATCTCTTTTTTTTTTTAAAAGACAGTAATA
AATAGAAATACCTCAGCTTCCTCCTCCGTTGGCCACGCCGACGCCGCCACTCTCCACCTT
AGGCGGAGCCGAAAACCGCCGTGGTTTAGGCAATGCAGGCGAAGCAGGATACGAGAGGCG
TTTCTTAGCCGTAAAGCCATCGTTCTCCTGTGTGGTGGTACCACCACCAACCTTGATGGG
CTCTGAGGCTTGTTGACCCTAGCTCTAGCTGATTTAGTTGGAACCATATAGCTCGGGAGA
GTCTGTGAGCCGGCGACGCTCTCGTCATCTCTCACTGATGAACCAGCGATGCTGTGTCTA
CGGTTCCTCTCGGATAGGACCGAGATCGTGCTCTTAGCGTCGTCGTCGGTGGATTTTCTG
GAGGATTGGTTTAGCCTTGAGGGAGTTGGAGGAGAGAAGAAACTGTTTTTGTTTCTTGGA
GTGCCCCCTCTTGCGGATGATGGTGTGTTTGGTTGAGTTGAGTTATTACGGTTAATAGAG
CTCTTGACTGGGGCAGCATTGTCGTTGTTTTGTTCTTTCTCGGAACTGTTGTCCAATGGT
CGACCAGCCATCCATCTCTCTAACCAGCTCCAACCCCATGTCGGATTGCTCGGATCCATG
AACATTGGGTTTCCAGACTTAGAATTGTTCTTCCAGTTTTGCTGATGAGTGTATGCATAA
GCCAATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E824JQ U 9
AF RR2GH92JQB U 1
AF RR2GH92TF C 223
BS 1 165 RR2GH92JQB
BS 166 166 RR2E824JQ
BS 167 212 RR2GH92JQB
BS 213 213 RR2E824JQ
BS 214 349 RR2GH92JQB
BS 350 351 RR2GH92TF
BS 352 572 RR2GH92JQB
BS 573 849 RR2GH92TF

RD RR2E824JQ 333 0 0
AATGAAGTTTATTATAAGTAAAAAGAAAATAAATGACACGCGTTTACACTCTGCACAAAT
GAATTACCAAACTGAAAGTGAACATATAACAAACATACAATACAACCATTTCCGACAGAT
ACATAAAAGTGGAATCATAAATATCTCTTTTTTTTTTTAAAAGACAGTAATAAATAGAAA
TACCTCAGCTTCCTCCTCCGTTGGCCACGCCGACGCCGCCACTCTCCACCTTAGGCGGAG
CCGAAAACCGCCGTGGTTTAGGCAATGCAGGCGAAGCAGGATACGAGAGGCGTTTCTTAG
CCGTAAAGCCATCGTTCTCCTGTGTGGTGGTAC

QA 1 333 1 333
DS 

RD RR2GH92JQB 572 0 0
CGTCGAATAATGAAGTTTATTATAAGTAAAAAGAAAATAAATGACACGCGTTTACACTCT
GCACAAATGAATTACCAAACTGAAAGTGAACATATAACAAACATACAATACAACCATTTC
CGACAGATACATAAAAGTGGAATCATAAATATCTCTTTTTTTTTT*AAAAGACAGTAATA
AATAGAAATACCTCAGCTTCCTCCTCCGTTGGTCACGCCGACGCCGCCACTCTCCACCTT
AGGCGGAGCCGAAAACCGCCGTGGTTTAGGCAATGCAGGCGAAGCAGGATACGAGAGGCG
TTTCTTAGCCGTAAAGCCATCGTTCTCCTGTGTGGTGGTACCACCACCA**CTTGATGGG
CTCTGAGGCTTGTTGACCCTAGCTCTAGCTGATTTAGTTGGAACCATATAGCTCGGGAGA
GTCTGTGAGCCGGCGACGCTCTCGTCATCTCTCACTGATGAACCAGCGATGCTGTGTCTA
CGGTTCCTCTCGGATAGGACCGAGATCGTGCTCTTAGCGTCGTCGTCGGTGGATTTTCTG
GAGGATTGGTTTAGCCTTGAGGGAGTTGGAGG

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2GH92TF 627 0 0
GCCGCCACTCTCCAC*TTAGGCGGAGCCGAGAACCGCCGTGGTTTAGGCAATGCAGGCGA
AGCAGGATACGAGAGGCGTTTCTTAGCCGTAAAGCCATCGTTCTCCTGTGTGGTGGTACC
ACCACCCACCTTGATGGGCTCTGAGGCTTGTTGACCCTAGCTCTAGCTGATTTAGTTGGA
ACCATATAGCTCGGGAGAGTCTGTGAGCCGGCGACGCTCTCGTCATCTCTCACTGATGAA
CCAGCGATGCTGTGTCTACGGTTCCTCTCGGATAGGACCGAGATCGTGCTCTTAGCGTCG
TCGTCGGTGGATTTTCTGGAGGATTGGTTTAGCCTTGAGGGAGTTGGAGGAGAGAAGAAA
CTGTTTTTGTTTCTTGGAGTGCCCCCTCTTGCGGATGATGGTGTGTTTGGTTGAGTTGAG
TTATTACGGTTAATAGAGCTCTTGACTGGGGCAGCATTGTCGTTGTTTTGTTCTTTCTCG
GAACTGTTGTCCAATGGTCGACCAGCCATCCATCTCTCTAACCAGCTCCAACCCCATGTC
GGATTGCTCGGATCCATGAACATTGGGTTTCCAGACTTAGAATTGTTCTTCCAGTTTTGC
TGATGAGTGTATGCATAAGCCAATGCC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL3552Contig1 725 2 4 U
GCGAGAATCTGGAAGCAAGTGTTACTGTTCTCAAAAAGTTCATAGACGAGTGGAAGGAGC
GTTCTGTCAAGCTGACTCCTAGTGAAACCCTCACTCTGAACAGAACAATGAAGAGCCTGA
GGCTAAAGAACGAGGAAGCTCTTGCTGAAGGAGGAGCCAGTGGTGCAAGCCAGTCACTTT
ACAAAGATGCAGACAAATGCTGCAAGGTGATCTCAGGGAAACTATCCAGTGGGAGTGGCT
ACTTCAAAGGTATAGTTATCGCTGCAATTCTGGCAGCTGCAGGTGCTGCTGCTCTGTCTG
CCAACCCGGATGCTATAGACGAGCTGAAGAGCCAGGTGGAATCGTTGGACCTCAGCAAAT
TGACTGAGTCAGTAATGACAGCTTTTAAGAACTAAAGATGAAAACACAGTTGGGGGGACG
ATAATGAAAGAGAAAGTAAGTCTCTCTCCTTATCGTTCTGGGTGTAGAGAAATGTTTGAA
AAGCTCTGCCTTTTTTTATGCTCTCTGATGACAAAGTTTTTGAAACCTGACCACCAGAAG
AATTAGGGTGATGAGTTGTAGAAGTGGGGGAGTTTGTTCAAACAAGTTGTAGAAGGTGTT
GAGAATGTTGTTTCTTTTTTTTTTTTGTCATCGAGAATGTTGTTTCTAACTTGAGATAAT
TGCGGTTTTTTTACGTTCTTTTGTTTTTTTCTTTTCCAGAAACAATAAAAGTTATATTTG
AGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 

AF RR2F133TF U 1
AF RR2F133JQ C 216
BS 1 689 RR2F133TF
BS 690 690 RR2F133JQ
BS 691 720 RR2F133TF
BS 721 725 RR2F133JQ

RD RR2F133TF 725 0 0
GCGAGAATCTGGAAGCAAGTGTTACTGTTCTCAAAAAGTTCATAGACGAGTGGAAGGAGC
GTTCTGTCAAGCTGACTCCTAGTGAAACCCTCACTCTGAACAGAACAATGAAGAGCCTGA
GGCTAAAGAACGAGGAAGCTCTTGCTGAAGGAGGAGCCAGTGGTGCAAGCCAGTCACTTT
ACAAAGATGCAGACAAATGCTGCAAGGTGATCTCAGGGAAACTATCCAGTGGGAGTGGCT
ACTTCAAAGGTATAGTTATCGCTGCAATTCTGGCAGCTGCAGGTGCTGCTGCTCTGTCTG
CCAACCCGGATGCTATAGACGAGCTGAAGAGCCAGGTGGAATCGTTGGACCTCAGCAAAT
TGACTGAGTCAGTAATGACAGCTTTTAAGAACTAAAGATGAAAACACAGTTGGGGGGACG
ATAATGAAAGAGAAAGTAAGTCTCTCTCCTTATCGTTCTGGGTGTAGAGAAATGTTTGAA
AAGCTCTGCCTTTTTTTATGCTCTCTGATGACAAAGTTTTTGAAACCTGACCACCAGAAG
AATTAGGGTGATGAGTTGTAGAAGTGGGGGAGTTTGTTCAAACAAGTTGTAGAAGGTGTT
GAGAATGTTGTTTCTTTTTTTTTTTTGTCATCGAGAATGTTGTTTCTAACTTGAGATAAT
TGCGGTTTTTTTACGTTCTTTTGTTTTTT*CTTTTCCAGAAACAATAAAAGTTATATTTG
AGTCT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2F133JQ 510 0 0
GGGAAACTATCCAGTGGGAGTGGCTACTTCAAAGGTATAGTTATCGCTGCAATTCTGGCA
GCTGCAGGTGCTGCTGCTCTGTCTGCCAACCCGGATGCTATAGACGAGCTGAAGAGCCAG
GTGGAATCGTTGGACCTCAGCAAATTGACTGAGTCAGTAATGACAGCTTTTAAGAACTAA
AGATGAAAACACAGTTGGGGGGACGATAATGAAAGAGAAAGTAAGTCTCTCTCCTTATCG
TTCTGGGTGTAGAGAAATGTTTGAAAAGCTTTGCCTTTTTTTATGCTTTCTGATGACAAA
GTTTTTGAAACCTGACCACCAGAAGAATTAGGGTGATGAGTTGTAGAAGTGGGGGAGTTT
GTTCAAACAAGTTGTAGAAGGTGTTGAGAATGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTGTCATCGAG
AATGTTGTTTCTAACTTGAGATAATTGCGGTTTTTTTACGTTCTTTTGTTTTTTTCTTTT
CCAGAAACAATAAAAGTTATATTTGAGTCT

QA 1 510 1 510
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3554Contig1 830 3 6 U
AGGGGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGATTGTGCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGA
CGAGATTGGTGTACCCTACGATGAGCAAGACAACTACGTCGTGATCAAGCACGCTGCTCT
CTTCACGTCCACCATCATGAGCAAGCTCTTGGCTCGTCCCAACGTGAAGCTCTTCAACGC
AGTTGCTGCAGAGGATCTGATTGTGAAAGGAAACAGAGTCGGTGGTGTGGTGACAAACTG
GTCTCTTGTGTCGCAGAACCACGACACACAGTCTTGCATGGACCCTAACGTGATGGAGGC
CAAGATTGTTGTCAGCTCGTGTGGTCATGATGGTCCTTTTGGAGCCACTGGTGTGAAGAG
GTTGAAGAGCATTGGGTTGATTGATCATGTTCCTGGAATGAAAGCTCTGGACATGAACAC
AGCTGAAGACGCTATTGTGAGGTTGACCAGAGAGGTTGTTCCCGGTTTGATCCTGACCGG
TATGGAAGTTGCTGAGCTCGATGGCGCACCAAGAATGGGACCAACATTCGGAGCTGTGAT
GATATCGGGACAGAAGGCGGCACATCTAGCTCTGAAAGCCTTGGGACAGCCTAATGTGAT
TGATGGATCCTACGCTGGAAACCTAAGCCCTGAGTTGGTCTTAGCTGCTGCTGATTCAGC
TGAAACCGTAGATGCTTAAGGAAAAAGTTTTTTTTTTTTTGTATGTAAGAAAATTTCCCT
TGTTCCTTTTGGTGTGGAAGGAGTTGCAATAAAAGGAGGAGTTAAGGTCTAATGTAATGA
ACTTTGTCTGTGTCTTTGTTTCTTCTGAATGAAAACGTTTCTTCAGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2F787TF U 1
AF RR2F787JQ C 176
AF RR2FR01TF U 545
BS 1 556 RR2F787TF
BS 557 557 RR2FR01TF
BS 558 672 RR2F787TF
BS 673 698 RR2FR01TF
BS 699 700 RR2F787JQ
BS 701 830 RR2FR01TF

RD RR2F787TF 672 0 0
AGGGGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGATTGTGCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGA
CGAGATTGGTGTACCCTACGATGAGCAAGACAACTACGTCGTGATCAAGCACGCTGCTCT
CTTCACGTCCACCATCATGAGCAAGCTCTTGGCTCGTCCCAACGTGAAGCTCTTCAACGC
AGTTGCTGCAGAGGATCTGATTGTGAAAGGAAACAGAGTCGGTGGTGTGGTGACAAACTG
GTCTCTTGTGTCGCAGAACCACGACACACAGTCTTGCATGGACCCTAACGTGATGGAGGC
CAAGATTGTTGTCAGCTCGTGTGGTCATGATGGTCCTTTTGGAGCCACTGGTGTGAAGAG
GTTGAAGAGCATTGGGTTGATTGATCATGTTCCTGGAATGAAAGCTCTGGACATGAACAC
AGCTGAAGACGCTATTGTGAGGTTGACCAGAGAGGTTGTTCCCGGTTTGATCCTGACCGG
TATGGAAGTTGCTGAGCTCGATGGCGCACCAAGAATGGGACCAACATTCGGAGCTGTGAT
GATATCGGGACAGAAG*CGGCACATCTAGCTCTGAAAGCCTTGGGACAGCCTAATGTGAT
TGATGGATCCTACGCTGGAAACCTAAGCCCTGAGTTGGTCTTAGCTGCTGCTGATTCAGC
TGAAACCGTAGA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2F787JQ 653 0 0
AACGCAGTTGCTGCAGAGGATCTGATTGTGAAAGGAAACAGAGTCGGTGGTGTGGTGACA
AACTGGTCTCTTGTGTCGCAGAACCACGACACACAGTCTTGCATGGACCCTAACGTGATG
GAGGCCAAGATTGTTGTCAGCTCGTGTGGTCATGATGGTCCTTTTGGAGCCACTGGTGTG
AAGAGGTTGAAGAGCATTGGGTTGATTGATCATGTTCCTGGAATGAAAGCTCTGGACATG
AACACAGCTGAAGACGCTATTGTGAGGTTGACCAGAGAGGTTGTTCCCGGTTTGATCCTG
ACCGGTATGGAAGTTGCTGAGCTCGATGGCGCACCAAGAATGGGACCAACATTCGGAGCT
GTGATGATATCGGGACAGAAGGCGGCACATCTAGCTCTGAAAGCCTTGGGACAGCCTAAT
GTGATTGATGGATCCTACGCTGGAAACCTAAGCCCTGAGTTGGTCTTAGCTGCTGCTGAT
TCAGCTGAAACCGTAGATGCTTAAGGAAAAAGTTTTTTTTTTTTTGTATGTAAGAAAATT
TCCCTTGTTCCTTTTGGTGTGGAAGGAGTTGCAATAAAAGGAGGAGTTAAGGTCTAATGT
AATGAACTTTGTCTGTGTCTTTGTTTCTTCTGAATGAAAACGTTTCTTCAGTG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2FR01TF 286 0 0
G
CGGGACAGAAGGCGGCACATCTAGCTCTGAAAGCTTTGGGACAGCCTATTGTGATTGATG
GATCCTACGCTGGAAACCTAAGCCCTGAGTTGGTCTTAGCTGCTGCTGATTCAGCTGAAA
CCGTAGATGCTTAAGGAAAAAGTTTTTTTTTTT**GTATGTAAGAAAATTTCCCTTGTTC
CTTTTGGTGTGGAAGGAGTTGCAATAAAAGGAGGAGTTAAGGTCTAATGTAATGAACTTT
GTCTGTGTCTTTGTTTCTTCTGAATGAAAACGTTTCTTCAGTGTT

QA 2 286 2 286
DS 



AS 1 3

CO CL3555Contig1 503 3 2 U
GGGGAAGGCTAAGATTCTGTACGATGCGATCGATGAGAGCGGGGGGTTTTTCAGGTGTCC
GGTTGAGAAGTCTGTGAGGTCTTTGATGAATGTTCCTTTCACGTTGGAGAGGGCGGAGCT
GGAAGGGGAGTTTATCAAGGAAGCTGCTAAGGAGAAGATGGTGCAGCTCAAGGGACATAG
ATCGGTGGGAGGTATGAGGGCTTCTATTTACAATGCAATGCCTTTGGCTGGTGTTGAGAA
GCTCGTTGCTTTCATGAAAGAGTTCCAGGCAAGGCATGCTTGATTTCGATCTTCTTCGTT
GTTTGAGTGAGTATAAGCGTTGAATGCTTATGATTTGAGTTTTTTTTT*CCAATTGGGTG
TGGAACTGTTTCAGTAATAATCTTTTAGCTTATGCTAGATGTCATGTTTAAGCAATAATT
ATTTACGCGTGTTTTTATGTTACTGTCATTTGTCTGAGACTGAAATGAGCTTTTGATAAT
AATTATTATAAGGATCTCATGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RR2B805JQ C 1
AF RR2B805TF U 1
AF RR2B228TF U 51
BS 1 499 RR2B805TF
BS 500 503 RR2B228TF

RD RR2B805JQ 500 0 0
GGGGAAGGCTAAGATTCTGTACGATGCGATCGATGAGAGCGGGGGGTTTTTCAGGTGTCC
GGTTGAGAAGTCTGTGAGGTCTTTGATGAATGTTCCTTTCACGTTGGAGAGGGCGGAGCT
GGAAGGGGAGTTTATCAAGGAAGCTGCTAAGGAGAAGATGGTGCAGCTCAAGGGACATAG
ATCGGTGGGAGGTATGAGGGCTTCTATTTACAATGCAATGCCTTTGGCTGGTGTTGAGAA
GCTCGTTGCTTTCATGAAAGAGTTCCAGGCAAGGCATGCTTGATTTCGATCTTTTTCGTT
GTTTGAGTGAGTATAAGCGTTGAATGCTTATGATTTGAGTTTTTTTTT*CCAATTGGGTG
TGGAACTGTTTCAGTAATAATCTTTTAGCTTATGCTAGATGTCATGTTTAAGCAATAATT
ATTTACGCGTGTTTTTATGTTACTGTCATTTGTCTGAGACTGAAATGAGCTTTTGATAAT
AATTATTATAAGGATCTCA
G

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR2B805TF 500 0 0
GGGGAAGGCTAAGATTCTGTACGATGCGATCGATGAGAGCGGGGGGTTTTTCAGGTGTCC
GGTTGAGAAGTCTGTGAGGTCTTTGATGAATGTTCCTTTCACGTTGGAGAGGGCGGAGCT
GGAAGGGGAGTTTATCAAGGAAGCTGCTAAGGAGAAGATGGTGCAGCTCAAGGGACATAG
ATCGGTGGGAGGTATGAGGGCTTCTATTTACAATGCAATGCCTTTGGCTGGTGTTGAGAA
GCTCGTTGCTTTCATGAAAGAGTTCCAGGCAAGGCATGCTTGATTTCGATCTTCTTCGTT
GTTTGAGTGAGTATAAGCGTTGAATGCTTATGATTTGAGTTTTTTTTT*CCAATTGGGTG
TGGAACTGTTTCAGTAATAATCTTTTAGCTTATGCTAGATGTCATGTTTAAGCAATAATT
ATTTACGCGTGTTTTTATGTTACTGTCATTTGTCTGAGACTGAAATGAGCTTTTGATAAT
AATTATTATAAGGATCTCA
G

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR2B228TF 453 0 0
G
CAGGTGTCCGGTTGAGAAGTCTGTGAGGTCTTTGATGAATGTTCCTTTCACGTTGGAGAG
GGCGGAGCTGGAAGGGGAGTTTATCAAGGAAGCTTCTAAGGAGAAGATGGTGCAGCTCAA
GGGGCATAGATCGGTGGGAGGTATGAGGGCTTCTATTTACAATGCAATGCCTTTGGCTGG
TGTTGAGAAGCTCGTTGCTTTCATGAAAGAGTTCCAGGCAAGGCATGCTTGATTTCGATC
TTCTTCGTTGTTTGAGTGAGTATAAGCGTTGAATGCTTATGATTTTAGTTTTTTTTTTCC
AATTGGGTGTGGAACTGTTTCAGTAATAATCTTTTAGCTTATGCTAGATGTCATGTTTAA
GCAATAATTATTTACGCGTGTTTTTATGTTACTGTCATTTGTCTGATACTGAAATGAGCT
TTTGATAATAATTATTATAAGGATCTCATGTC

QA 2 453 2 453
DS 



AS 1 3

CO CL3556Contig1 743 3 7 U
CACACACGAAAAATAGTTTATAAAGAAAATACAGTACTTCCTGAAAAGAGTTTGAATATA
GATTCTTTTGGGGAAAAACAAGAACCAAGAAAAAAAGTAGAAACAAAATCGATACACAGA
CCACCAACCATCATCTCTTAGGCACTATCTTCGGTGGGCTTCTCAGTCTCCATTGGTTCT
TCACCAGACGCTGATTCTGGCTGTGGCTCACTCTTCTCCTCATCAGCCGCCTTGGCTGGT
GGAGCTTCCGGTTTAGCAACCGGCTTTGGTTTGGTCATTATAGGCCTGCAGAACTTGTCC
AATGCCTCAGCCTTCCTAGTAACATCAGCTGACAAGAAAGCTGGTGTTGCGTACTTGGGA
AGTGCCTCCTGCTGCTGCTGCTTCTCCCTCATCCATGCTTCTGCTTCCACACACTCGTTC
AATACCTTTTGCTTCTCTTCTAGTTCAATGTGGTCAAACTTGGAATCATTAGAGACAGCT
GCCTCTCTGTGGCTGTTAACACAGTGACCAAGGTGTCCAATGACTGTCCCTCTCTCCTGT
GACTCCTTGTACCTCAATTCAACTGGGTCGCCCACCTTCTTGAGCTCTTCGAGCTTTGCA
ACGTAGACACCTTTAGTCTCATCTTCTCCATCTTCATACAACCAGTCCTCCACTTCCTGC
AGCCTTGCCAGGAAGGCTTCTCGCTCTGACTCGGTCATGTACTCATGGTATTTGTCACTC
AGTTTGTTTCGCATATCATAAAC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN86JQ U 2
AF RR2AN86TF C 2
AF RR2E709JQ U 1
BS 1 201 RR2E709JQ
BS 202 202 RR2AN86JQ
BS 203 290 RR2E709JQ
BS 291 291 RR2AN86JQ
BS 292 490 RR2E709JQ
BS 491 491 RR2AN86JQ
BS 492 743 RR2E709JQ

RD RR2AN86JQ 495 0 0
ACACACGAAAAATAGTTTATAAAGAAAATACAGTACTTCCTGAAAAGAGTTTGAATATAG
ATTCTTTTGGGGAAAAACAAGAACCAAGAAAAAAAGTAGAAACAAAATCGATACACAGAC
CACCAACCATCATCTCTTAGGCACTATCTTCGGTGGGCTTCTCAGTCTCCATTGGTTCTT
CACCAGACGCTGATTCTGGCTGTGGCTCACTCTTCTCCTCATCAGCCGCCTTGGCTGGTG
GAGCTTCCGGTTTAGCAACCGGCTTTGGTTTGGTCATTATAGGCCTGCAGAACTTGTCCA
ATGCCTCAGCCTTCCTAGTAACATCAGCTGACAAGAAAGCTGGTGTTGCGTACTTGGGAA
GTGCCTCCTGCTGCTGCTGCTTCTCCCTCATCCATGCTTCTGCTTCCACACACTCGTTCA
ATACCTTTTGCTTCTCTTCTAGTTCAATGTGGTCAAACTTGGAATCATTAGAGACAGCTG
CCTCTCTGTGGCTG
C

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2AN86TF 495 0 0
ACACACGAAAAATAGTTTATAAAGAAAATACAGTACTTCCTGAAAAGAGTTTGAATATAG
ATTCTTTTGGGGAAAAACAAGAACCAAGAAAAAAAGTAGAAACAAAATCGATACACAGAC
CACCAACCATCATCTCTTAGGCACTATCTTCGGTGGGCTTCTCAGTCTCCATTGGTTCTT
CACCAGACGCTGATTCTGGCTGTGGCTCACTCTTCTCCTCATCAGCCGCCTTGGCTGGTG
GAGCTTCCGGTTTAGCAACCGGCTTTGGTTTGGTCATTATAGGCCTGCAGAACTTGTCCA
ATGCCTCAGCCTTCCTAGTAACATCAGCTGACAAGAAAGCTGGTGTTGCGTACTTGGGAA
GTGCCTCCTGCTGCTGCTGCTTCTCCCTCATCCATGCTTCTGCTTCCACACACTCGTTCA
ATACCTTTTGCTTCTCTTCTAGTTCAATGTGGTCAAACTTGGAATCATTAGAGACAGCTG
CCTCTCTGTGGCTG
C

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2E709JQ 743 0 0
CACACACGAAAAATAGTTTATAAAGAAAATACAGTACTTCCTGAAAAGAGTTTGAATATA
GATTCTTTTGGGGAAAAACAAGAACCAAGAAAAAAAGTAGAAACAAAATCGATACACAGA
CCACCAACCATCATCTCTTAGGCACTATCTTCGGTGGGCTTCTCAGTCTCCATTGGTTCT
TCACCAGACGCTGATTCTGGCCGTGGCTCACTCTTCTCCTCATCAGCCGCCTTGGCTGGT
GGAGCTTCCGGTTTAGCAACCGGCTTTGGTTTGGTCATTATAGGCCTGCAAAACTTGTCC
AATGCCTCAGCCTTCCTAGTAACATCAGCTGACAAGAAAGCTGGTGTTGCGTACTTGGGA
AGTGCCTCCTGCTGCTGCTGCTTCTCCCTCATCCATGCTTCTGCTTCCACACACTCGTTC
AATACCTTTTGCTTCTCTTCTAGTTCAATGTGGTCAAACTTGGAATCATTAGAGACAGCT
GCCTCTCTGTAGCTGTTAACACAGTGACCAAGGTGTCCAATGACTGTCCCTCTCTCCTGT
GACTCCTTGTACCTCAATTCAACTGGGTCGCCCACCTTCTTGAGCTCTTCGAGCTTTGCA
ACGTAGACACCTTTAGTCTCATCTTCTCCATCTTCATACAACCAGTCCTCCACTTCCTGC
AGCCTTGCCAGGAAGGCTTCTCGCTCTGACTCGGTCATGTACTCATGGTATTTGTCACTC
AGTTTGTTTCGCATATCATAAAC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3558Contig1 996 3 4 U
CACTTAATTTATCCCACGATAAATTAAATAATAGGTTACATGACTGAGATTTTTTTCCGT
AGTTACATACACTATATAGAGAAACAATAGAATCAGAGATCAATAATGAGAAAAGAAACC
CTGCTAATAAGAGATCAATGTTTTCTAAAAATGTTTCATGCCTTCTTGTTCTTTGCCATG
GCAGCAATAAGGTCGGATGTGGTGTGAGAGCGGAGGACAAGATCAGGCAGTGAGAGCTTG
AGATCAATGGTTAGTCTCTGAAACACCTGAGATAAGAGTAATACATCTGACAATGCTCTG
TGAGCTTCACCATCCCTTACAAAGTTATAGTAATCCCCTAGAGCTGATAATGACGCTTTT
GGCTTCACTGTCGCGTCTACAGACTTCATGCTCTCTCTGGCAAGTGGGAGGGAGTCAAAG
AAGAGCCAGTTAGGAGGAATCTCGTAAGAGCAGCGGTTAAACTCGTTGATCAAGAACTGA
AAATCAAATGTTTTGCCGTTATGTGCAACAATCATCACATACCCTCCAGGCTTCTTCTGT
CTACTCTGAACATACCTCAGAAATATCGGTATCATCTCCTCCATTCTTGGAACCTCAGGT
CGACAAACCATATCGTTCCTGATCCCATGGATGCTAGCATTCAATATAGGAACACCAGGG
TTTACGAGAGTCTGGAACGTGCTGTTCTCACCACCAGCTAGATCCTGAGCAGCGATCTCG
ATGATCCTCTCCTTCACCCTATGCAAGCCGGTCGTCTCGAGATCAGAGACTATAACAGTG
AGGAGATTAGACAGATCTTTGTTTTCAGCAAGACGCTGCTGAAGGTTCCCGAAAGGCTGT
TGTTGTAACTTAGTCGTGCTTTCTGCATCTACTATCACTGCTCCTCCAAGGACACTGCTC
TTGGTGTTGGTCCTACTTCCTTGTGTGGTTGTACTCACGTTTCTCCTGACCCATCTGCTC
TTACTATTATTATTAACCGAGGAGGAGGAGGAGGAG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU80JQ U 6
AF RR2C332JQ U 1
AF RR2C332TF C 537
BS 1 804 RR2C332JQ
BS 805 805 RR2C332TF
BS 806 820 RR2C332JQ
BS 821 996 RR2C332TF

RD RR2FU80JQ 690 0 0
AATTTATCCCACGATAAATTAAATAATAGGTTACATGACTGAGATTTTTTTCCGTAGTTA
CATACACTATATAGAGAAACAATAGAATCAGAGATCAATAATGAGAAAAGAAACCCTGCT
AATAAGAGATCAATGTTTTCTAAAAATGTTTCATGCCTTCTTGTTCTTTGCCATGGCAGC
AATAAGGTCGGATGTGGTGTGAGAGCGGAGGACAAGATCAGGCAGTGAGAGCTTGAGATC
AATGGTTAGTCTCTGAAACACCTGAGATAAGAGTAATACATCTGACAATGCTCTGTGAGC
TTCACCATCCCTTACAAAGTTATAGTAATCCCCTAGAGCTGATAATGACGCTTTTGGCTT
CACTGTCGCGTCTACAGACTTCATGCTCTCTCTGGCAAGTGGGAGGGAGTCAAAGAAGAG
CCAGTTAGGAGGAATCTCGTAAGAGCAGCGGTTAAACTCGTTGATCAAGAACTGAAAATC
AAATGTTTTGCCGTTATGTGCAACAATCATCACATACCCTCCAGGCTTCTTCTGTCTACT
CTGAACATACCTCAGAAATATCGGTATCATCTCCTCCATTCTTGGAACCTCAGGTCGACA
AACCATATCGTTCCTGATCCCATGGATGCTAGCATTCAATATAGGAACACCAGGGTTTAC
GAGAGTCTGGAACGTGCTGTTCTCACCACC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2C332JQ 820 0 0
CACTTAATTTATCCCACGATAAATTAAATAATAGGTTACATGACTGAGATTTTTTTCCGT
AGTTACATACACTATATAGAGAAACAATAGAATCAGAGATCAATAATGAGAAAAGAAACC
CTGCTAATAAGAGATCAATGTTTTCTAAAAATGTTTCATGCCTTCTTGTTCTTTGCCATG
GCAGCAATAAGGTCGGATGTGGTGTGAGAGCGGAGGACAAGATCAGGCAGTGAGAGCTTG
AGATCAATGGTTAGTCTCTGAAACACCTGAGATAAGAGTAATACATCTGACAATGCTCTG
TGAGCTTCACCATCCCTTACAAAGTTATAGTAATCCCCTAGAGCTGATAATGACGCTTTT
GGCTTCACTGTCGCGTCTACAGACTTCATGCTCTCTCTGGCAAGTGGGAGGGAGTCAAAG
AAGAGCCAGTTAGGAGGAATCTCGTAAGAGCAGCGGTTAAACTCGTTGATCAAGAACTGA
AAATCAAATGTTTTGCCGTTATGTGCAACAATCATCACATACCCTCCAGGCTTCTTCTGT
CTACTCTGAACATACCTCAGAAATATCGGTATCATCTCCTCCATTCTTGGAACCTCAGGT
CGACAAACCATATCGTTCCTGATCCCATGGATGCTAGCATTCAATATAGGAACACCAGGG
TTTACGAGAGTCTGGAACGTGCTGTTCTCACCACCAGCTAGATCCTGAGCAGCGATCTCG
ATGATCCTCTCCTTCACCCTATGCAAGCCGGTCGTCTCGAGATCAGAGACTATAACAGTG
AGGAGATTAGACAGATCTTTGTTT*CAGCAAGACGCTGCT

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR2C332TF 460 0 0
CTGTCTACTCTGAACATAC*TCAGAAATATCGGTATCATCTCCTCCATTCTTGGAAC*TC
AGGTCGACAAACCATATCGTTCCTGATCCCATGGATGCTAGCATTCAATATAGGAACACC
AGGGTTTACGAGAGTCTGGAACGTGCTGTTCTCACCACCAGCTAGATCCTGAGCAGCGAT
CTCGATGATCCTCTCCTTCACCCTATGCAAGCCGGTCGTCTCGAGATCAGAGACTATAAC
AGTGAGGAGATTAGACAGATCTTTGTTTTCAGCAAGACGCTGCTGAAGGTTCCCGAAAGG
CTGTTGTTGTAACTTAGTCGTGCTTTCTGCATCTACTATCACTGCTCCTCCAAGGACACT
GCTCTTGGTGTTGGTCCTACTTCCTTGTGTGGTTGTACTCACGTTTCTCCTGACCCATCT
GCTCTTACTATTATTATTAACCGAGGAGGAGGAGGAGGAG

QA 1 460 1 460
DS 



AS 1 3

CO CL3559Contig1 523 3 5 U
GGGAATCATCATAACTAGTAAACGTAAAATTCCAAAAAAAAAAACAAGAATAAACGTATT
TGTATCGTAAGAATATAAAAAGGAACAATATGTCGTCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGTA
TCATCCTGATTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCAT
CCATCTAAAGCAAGTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAAATGTGTTCT
TGTTGTGTCTCCCAAGCTGGAACTGAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGGAGAATGTGCC
GAGAGGTGCGGCAAGCCATTACAAGTTCGAAAACCTACAAAAGGCTAGAATTAAAAGATA
TGAATAAATATTTTATTTAATACCTAATATCTATTTTTGTTTTTTGTTGTATGAATAACA
CTGGAGCTGTCCTTAGAAAGGAATTTTGAAAGCATTAGCTTATAACATCATTTTTGTAAA
CTTTGTTAAGGCATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2E956JQ C 1
AF RR2FQ80TF U 13
AF RR2E956TF U 1
BS 1 13 RR2E956TF
BS 14 96 RR2FQ80TF
BS 97 97 RR2E956TF
BS 98 521 RR2FQ80TF
BS 522 523 RR2E956JQ

RD RR2E956JQ 523 0 0
GGGAATCATCATAACTAGTAAACGTAAAATTCCAAAAAAAAAAACAAGAATAAACGTATT
TGTATCGTAAGAATATAAAAAGGAACAATATGTCGTCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGTA
TCATCCTGATTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCAT
CCATCTAAAGCAAGTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAAATGTGTTCT
TGTTGTGTCTCCCAAGCTGGAACTGAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGGAGAATGTGCC
GAGAGGTGCGGCAAGCCATTACAAGTTCGAAAACCTACAAAAGGCTAGAATTAAAAGATA
TGAATAAATATTTTATTTAATACCTAATATCTATTTTTGTTTTTTGTTGTATGAATAACA
CTGGAGCTGTCCTTAGAAAGGAATTTTGAAAGCATTAGCTTATAACATCATTTTTGTAAA
CTTTGTTAAGGCATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGACC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2FQ80TF 509 0 0
G
ACTAGTAAACGTAAAATTCCAAAAAAAAAAACAAGAATAAACGTATTTGTATCGTAAGAA
TATAAAAAGGAACAATATGTCGTTATCCAAGTTCGCTATCTTTTGTATCATCCTGATTGC
TTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCATCCATCTAAAGCAA
GTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAAATGTGTTCTTGTTGTGTCTCCC
AAGCTGGAACTGAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGGAGAATGTGCCGAGAGGTGCGGCA
AGCCATTACAAGTTCGAAAACCTACAAAAGGCTAGAATTAAAAGATATGAATAAATATTT
TATTTAATACCTAATATCTATTTTTGTTTTTTGTTGTATGAATAACACTGGAGCTGTCCT
TAGAAAGGAATTTTGAAAGCATTAGCTTATAACATCATTTTTGTAAACTTTGTTAAGGCA
TATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGA

QA 2 509 2 509
DS 

RD RR2E956TF 523 0 0
GGGAATCATCATAACTAGTAAACGTAAAATTCCAAAAAAAAAAACAAGAATAAACGTATT
TGTATCGTAAGAATATAAAAAGGAACAATATGTCGTCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGTA
TCATCCTGATTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCAT
CCATCTAAAGCAAGTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAAATGTGTTCT
TGTTGTGTCTCCCAAGCTGGAACTGAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGGAGAATGTGCC
GAGAGGTGCGGCAAGCCATTACAAGTTCGAAAACCTACAAAAGGCTAGAATTAAAAGATA
TGAATAAATATTTTATTTAATACCTAATATCTATTTTTGTTTTTTGTTGTATGAATAACA
CTGGAGCTGTCCTTAGAAAGGAATTTTGAAAGCATTAGCTTATAACATCATTTTTGTAAA
CTTTGTTAAGGCATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGA
CC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 3

CO CL3560Contig1 1215 3 6 U
AGGGCTTTCACATCTCCGCCACCCCTGAAGAAAGCGATAACCCTAGCTTCACCAAGCTCA
CCTACAATGGCGGAAGGACTCGTTTTGAAGGGCACCATGCGTGCACACACCGACATGGTC
ACCGCAATCGCCACCCCCATCGACAACTCAGACACCATCGTCTCGGCTTCCCGAGACAAA
TCCATCATCGTCTGGAAACTCACCAAAGACGACAAGTCCTACGGCGTTGCTCAGAGGCGT
CTCACCGGCCACTCTCACTTCGTCGAGGACGTCGTCCTCTCTTCCGACGGCCAATTCGCC
CTCTCCGGAAGCTGGGACGGCGAGCTCCGCCTCTGGGATCTCGCCGCCGGCGTGTCCACT
CGCAGATTCGTCGGACACACCAAGGACGTCCTCTCCGTCGCGTTCTCGCTCGACAACCGT
CAGATCGTGTCGGCGTCTCGCGACCGTACGATCAAGCTCTGGAACACTCTGGGTGAGTGT
AAGTACACCATCGCCGAGGGAGGTGAGGGACACAATGAGTGGGTTAGCTGCGTCAGGTTC
AGTCCCAACACGCTCCAGCCGACGATCGTGTCGGCTTCTTGGGACAAGACGGTGAAAGTG
TGGAACTTGTCGAACTGCAAGCTCAGGTCGACTCTTGCCGGCCACACTGGGAACGTTAAC
ACTGTTGCTGTTTCGCCTGATGGTTCTCTTTGCGCGAGTGGAGGCAAAGACGGTGTCGTT
TTGCTGTGGGATTTGGCCGAGGGGAAGAAGCTTTACTCTCTTGAGGCGAACTCTGAGATC
CACGCGCTTTGCTTTAGCCCTAACAGGTACTGGCTGTGTGCTGCGACTCAGCAGGGTATT
AAGATTTGGGATCTTGAGAGCAAGAGCGTTGTTGAGGATTTGAAGGTTGATCTCAAGGCT
GAGGCTGAGAAGTCTGACGGAAGTGCTACTGCTGCCAACAAAAGGAAGGTTATTTACTGC
ACCAGCCTGAACTGGAGTGCTGATGGAAGCACTTTGTTCAGTGGTTACACGGACGGAGTT
ATCAGAGTTTGGGGTATTGGCCGTTACTAGTTATCCCATCTCTTCTATGCCTTTCTCCTT
TGTTGGTTTTATCTATCACTCTTTTGTTTTGTGAGCAAACTCATACACGTTGCATCATAA
AGTACTCTGAAGGATATTTTGTTTTATGTCAATTTTAGGTTCGGATCTTTACTTATTTGT
GAGAACTTGCCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B668TF U 1
AF RR2B668JQ C 362
AF RR2DP36TF U 657
BS 1 806 RR2B668TF
BS 807 807 RR2DP36TF
BS 808 830 RR2B668TF
BS 831 1178 RR2DP36TF
BS 1179 1179 RR2B668JQ
BS 1180 1215 RR2DP36TF

RD RR2B668TF 830 0 0
AGGGCTTTCACATCTCCGCCACCCCTGAAGAAAGCGATAACCCTAGCTTCACCAAGCTCA
CCTACAATGGCGGAAGGACTCGTTTTGAAGGGCACCATGCGTGCACACACCGACATGGTC
ACCGCAATCGCCACCCCCATCGACAACTCAGACACCATCGTCTCGGCTTCCCGAGACAAA
TCCATCATCGTCTGGAAACTCACCAAAGACGACAAGTCCTACGGCGTTGCTCAGAGGCGT
CTCACCGGCCACTCTCACTTCGTCGAGGACGTCGTCCTCTCTTCCGACGGCCAATTCGCC
CTCTCCGGAAGCTGGGACGGCGAGCTCCGCCTCTGGGATCTCGCCGCCGGCGTGTCCACT
CGCAGATTCGTCGGACACACCAAGGACGTCCTCTCCGTCGCGTTCTCGCTCGACAACCGT
CAGATCGTGTCGGCGTCTCGCGACCGTACGATCAAGCTCTGGAACACTCTGGGTGAGTGT
AAGTACACCATCGCCGAGGGAGGTGAGGGACACAATGAGTGGGTTAGCTGCGTCAGGTTC
AGTCCCAACACGCTCCAGCCGACGATCGTGTCGGCTTCTTGGGACAAGACGGTGAAAGTG
TGGAACTTGTCGAACTGCAAGCTCAGGTCGACTCTTGCCGGCCACACTGGGAACGTTAAC
ACTGTTGCTGTTTCGCCTGATGGTTCTCTTTGCGCGAGTGGAGGCAAAGACGGTGTCGTT
TTGCTGTGGGATTTGGCCGAGGGGAAGAAGCTTTACTCTCTTGAGGCGAACTCTGAGATC
CACGCGCTTTGCTTTAGCCCTAACAG*TACTGGCTGTGTGCTGCGACTCA

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR2B668JQ 828 0 0
GCAGATTCGTCGGACACACCAAGGACGTCCTCTCCGTCGCGTTCTCGCTCGACAACCGTC
AGATCGTGTCGGCGTCTCGCGACCGTACGATCAAGCTCTGGAACACTCTGGGTGAGTGTA
AGTACACCATCGCCGAGGGAGGTGAGGGACACAATGAGTGGGTTAGCTGCGTCAGGTTCA
GTCCCAACACGCTCCAGCCGACGATCGTGTCGGCTTCTTGGGACAAGACGGTGAAAGTGT
GGAACTTGTCGAACTGCAAGCTCAGGTCGACTCTTGCCGGCCACACTGGGAACGTTAACA
CTGTTGCTGTTTCGCCTGATGGTTCTCTTTGCGCGAGTGGAGGCAAAGACGGTGTCGTTT
TGCTGTGGGATTTGGCCGAGGGGAAGAAGCTTTACTCTCTTGAGGCGAACTCTGAGATCC
ACGCGCTTTGCTTTAGCCCTAACAGGTACTGGCTGTGTGCTGCGACTCAGCAGGGTATTA
AGATTTGGGATCTTGAGAGCAAGAGCGTTGTTGAGGATTTGAAGGTTGATCTCAAGGCTG
AGGCTGAGAAGTCTGACGGAAGTGCTACTGCTGCCAACAAAAGGAAGGTTATTTACTGCA
CCAGCCTGAACTGGAGTGCTGATGGAAGCACTTTGTTCAGTGGTTACACGGACGGAGTTA
TCAGAGTTTGGGGTATTGGCCGTTACTAGTTATCCCATCTCTTCTATGCCTTTCTCCTTT
GTTGGTTTTATCTATCACTCTTTTGTTTTGTGAGCAAACTCATACACGTTGCATCATAAA
GTACTCTGAAGGATATTTTGTTTTATGTCAATTTTAGGTTCGGATCTT

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2DP36TF 559 0 0
G
AACACTGTTGCTGTTTCGCCTGATGGTTCTCTTTGCGCGAGTGGAGGCAAAGACGGTGTC
GTTTTGCCGTGGGATTTGGCCGAGGGGAAGAAGCTTTACTCTCTTGAGGCGAACTCTGAG
ATCCACGCGCTTTGCTTTAGCCCTAACAGGTACTGGCTGTGTGCTGCGACTCAGCAGGGT
ATTAAGATTTGGGATCTTGAGAGCAAGAGCGTTGTTGAGGATTTGAAGGTTGATCTCAAG
GCTGAGGCTGAGAAGTCTGACGGAAGTGCTACTGCTGCCAACAAAAGGAAGGTTATTTAC
TGCACCAGCCTGAACTGGAGTGCTGATGGAAGCACTTTGTTCAGTGGTTACACGGACGGA
GTTATCAGAGTTTGGGGTATTGGCCGTTACTAGTTATCCCATCTCTTCTATGCCTTTCTC
CTTTGTTGGTTTTATCTATCACTCTTTTGTTTTGTGAGCAAACTCATACACGTTGCATCA
TAAAGTACTCTGAAGGATATTTTGTTTTATGTCAATTTTAG*TTCGGATCTTTACTTATT
TGTGAGAACTTGCCTTTC

QA 2 559 2 559
DS 



AS 1 3

CO CL3561Contig1 645 3 5 U
GGGTTGCTAGGAATGATAACTCAGGTGTCACTTTGGAAGGACCCAAGAATCTTCCTCCAC
AGCTAGACTTAAACGGACCTGAAAGAGGTTCAGGGAGCGCAAACAGTGTGGGTTCGAGCA
CTACAAAACCGAAATCTCCGTGGATGCCTTTCCCTACTCTATTTGCAGCGATCTCACATA
AGATTGCAGAGAAAGACATGTCTTTCATTAATGCTGACTACCAACAACTGCGGGAAAAGA
AGATAACGCGAGGAGAGTTTGTGAGGAAGCTGCGAGGGATTGTAGGAGATGATCTGCTTA
GGTCCACCATAACAGTTCTTCAAAACCAGCCAAAGTTGAAGAAGGAGATTCCTGGAAGCC
ACGAGGAAGGTGCAGGTGAGGTGGGTTGTAAAAGTAACGTGGGAATGTGATAATGACGAC
GAATATCATAAGGAAGCTGCTTTATATCTATCTGTCTACCCTTGCCTTTGTGATTCTCCT
TTTGACTTTTATAATATAAAATCTTAAGAGTATGTTAGTAGTAGACTTTTGGGTCTGGGT
CGGGGGGTAAGAGTTGTTGAATGTGCCGACTATTCTGTCGTGGAAAAATACTTTGTTGAT
GACGTTGGGTCTTTTGCTTTTATTATCTGCAAAACATTGTTGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2EO17TF U 1
AF RR2EO17JQ C 48
AF RR2D605TF U 545
BS 1 393 RR2EO17TF
BS 394 544 RR2EO17JQ
BS 545 602 RR2D605TF
BS 603 603 RR2EO17JQ
BS 604 645 RR2D605TF

RD RR2EO17TF 393 0 0
GGGTTGCTAGGAATGATAACTCAGGTGTCACTTTGGAAGGACCCAAGAATCTTCCTCCAC
AGCTAGACTTAAACGGACCTGAAAGAGGTTCAGGGAGCGCAAACAGTGTGGGTTCGAGCA
CTACAAAACCGAAATCTCCGTGGATGCCTTTCCCTACTCTATTTGCAGCGATCTCACATA
AGATTGCAGAGAAAGACATGTCTTTCATTAATGCTGACTACCAACAACTGCGGGAAAAGA
AGATAACGCGAGGAGAGTTTGTGAGGAAGCTGCGAGGGATTGTAGGAGATGATCTGCTTA
GGTCCACCATAACAGTTCTTCAAAACCAGCCAAAGTTGAAGAAGGAGATTCCTGGAAGCC
ACGAGGAAGGTGCAGGTGAGGTGGGTTGTAAAA

QA 1 393 1 393
DS 

RD RR2EO17JQ 593 0 0
AATCTTCCTCCACAGCTAGACTTAAACGGACCTGAAAGAGGTTCAGGGAGCGCAAACAGT
GTGGGTTCGAGCACTACAAAACCGAAATCTCCGTGGATGCCTTTCCCTACTCTATTTGCA
GCGATCTCACATAAGATTGCAGAGAAAGACATGTCTTTCATTAATGCTGACTACCAACAA
CTGCGGGAAAAGAAGATAACGCGAGGAGAGTTTGTGAGGAAGCTGCGAGGGATTGTAGGA
GATGATCTGCTTAGGTCCACCATAACAGTTTTTCAAAACCAGCCAAAGTTGAAGAAGGAG
ATTCCTGGAAGCCACGAGGAAGGTGCAGGTGAGGTGGGTTGTAAAAGTAACGTGGGAATG
TGATAATGACGACGAATATCATAAGGAAGCTGCTTTATATCTATCTGTCTACCCTTGCCT
TTGTGATTCTCCTTTTGACTTTTATAATATAAAATCTTAAGAGTATGTTAGTAGTAGACT
TTTGGGTCTGGGTCGGGGGGTAAGAGTTGTTGAATGTGCCGACTATTCTGTCGTGGAAAA
ATACTTTGTTGATGACGTTGGGTCTTTTGCTTTTATTATCTGCAAAACATTGT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2D605TF 101 0 0
GGGTAAGAGTTGTTGAATGTGCCGACTATTCTGTCGTGGAAAAATACTTTGTTGATGATG
TTGGGTCTTTTGCTTTTATTATCTGCAAAACATTGTTGTGG

QA 1 101 1 101
DS 



AS 1 2

CO CL3562Contig1 636 2 7 U
TGTAGAGTAAACTTGTGAATGAGCTAAAGCATGTGAGTGTAAGAAGAAAGATACATTTGC
TTCTACCACAGGTCCAAGGGCTTGTGGTCAAGAAAATAACAGTTCAACTGAAAACGAAAA
CACATTCCAAGAACAACAACACTTCAACTCAATTACAACTCAAAGTTTGCAGAAATACAA
ATAAACAACCATTCTCTACTCTACCACCTGCGGCGGCGGCGACGGCTGCTGAGACTCCAT
CGGAATCCCAAGATCATTCCTCTTGAGAACAGGAAGGGCGACGAAAGACTTGGTCTTACT
AATGGGCCTGCTCTTTTCAAGCCTCACAACGTCGCCCACTTTGAACACGTTATCAGGGTC
ATGCGCCTGATACTTCTTCTTCATCCTCACGCGCCTCTTGTACTTGGGGTGTGGAGCCAG
CCTCACCACTTCCACCGCCACCGTCTTGTCGTTCGTCGCGCACACCACGCGTCCTTGCAT
CGTCTTCATGGCTCTTATCGCCGGGACTAGACCGGGCTTCCTGGTGTTCGGGAAGGAAAT
GGGTTTGGAGAGGGAAGAGAGTGGAGTGGAGCCATGGGTGAATGGGGAGGAGGAGATCTT
CAGAGACTGCAGAGATGAGGCTAGCGACGCCATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX57JQ U 11
AF RR2FY13TF C 1
BS 1 24 RR2FY13TF
BS 25 163 RR2CX57JQ
BS 164 165 RR2FY13TF
BS 166 213 RR2CX57JQ
BS 214 214 RR2FY13TF
BS 215 279 RR2CX57JQ
BS 280 636 RR2FY13TF

RD RR2CX57JQ 269 0 0
GTATAGTTTTGAAA
TAAAGCATGTGAGTGTAAGAAGAAAGATACATTTGCTTCTACCACAGGTCCAAGGGCTTG
TGGTCAAGAAAATAACAGTTCAACTGAAAACGAAAACACATTCCAAGAACAACAACACTT
CAACTCAATTACAACTCAAGTTTTGCAGAAATACAAATAAACAACCATTCTCTACTCTAC
CACCTGCGGTGGCGGCGACGGCTGCTGAGACTCCATCGGAATCCCAAGATCATTCCTCTT
GAGAACAGGAAGGGC

QA 15 269 15 269
DS 

RD RR2FY13TF 636 0 0
TGTAGAGTAAACTTGTGAATGAGCTAAAGCATGTGAGTGTAAGAAGAGAGATACATTTGC
TTCTACCACAGGTCCAAGGGCTTGTGGTCAAGAAAATAACAGTTCAACTGAAAACGAAAA
CACATTCCAAGAACAACAG***TTCAACTCAATTACAACTCAAAGTTTGCAGAAATACAA
ATAAACAACCATTCTCTACTCTACCACCTGCGGCGGCGGCGACGGCTGCTGAGACTCCAT
CGGAATCCCAAGATCATTCCTCTTGAGAACAGGAAGGGCGACGAAAGACTTGGTCTTACT
AATGGGCCTGCTCTTTTCAAGCCTCACAACGTCGCCCACTTTGAACACGTTATCAGGGTC
ATGCGCCTGATACTTCTTCTTCATCCTCACGCGCCTCTTGTACTTGGGGTGTGGAGCCAG
CCTCACCACTTCCACCGCCACCGTCTTGTCGTTCGTCGCGCACACCACGCGTCCTTGCAT
CGTCTTCATGGCTCTTATCGCCGGGACTAGACCGGGCTTCCTGGTGTTCGGGAAGGAAAT
GGGTTTGGAGAGGGAAGAGAGTGGAGTGGAGCCATGGGTGAATGGGGAGGAGGAGATCTT
CAGAGACTGCAGAGATGAGGCTAGCGACGCCATTCC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3564Contig1 797 3 7 U
GGAACAGGAGAGACAAAAATAGCCACGATGATGAAACCCTCAGCGAAATCAATTCAGAGA
GTTGGTCGTTTCTTAAGGAAGAGCCTTGGAAGCATCAAGTCCACTGTCTGCTTTGGTAAA
TACCACCACAACTTCCCTAACAACAACACTCCACTCTTGAGCCCCTTCTCATGCAGTCTT
GCCCTCTCTTGTCCACAAGATTCCCAGACTGAAGAAACGTACAGCGTTATCTCTTGTGAA
AGCAAGGCTGTTGCAGAAACCAGAGATGAGAGACTCATCAACAAAAACCAACATAAGAAG
AAACCGAAGAAAAAGGTTGCAGTTGCCGAGTCGTTCGAGGAGGCAAAGAGAAGAGGTGAC
AAGTTGGCACAAAAGATGAAAGATCTGAACATGGTTGATCTCAGAGACATTGAGCATGCA
TCGGATGTAAAAGAAGCGCTTAGATGCTATTCAAGCATTAGAAGCCCTGTCTACCTTGAC
ATTGTTGACAATTTCTTCATAGGCATGTACTACGAGTTCTCTGATCCACGCACCTCTTCT
AGTATCAACGGTTCAAGAAGAAAAGCTGGCTCTTTCAGACTCTAAAGACCCTCCATTCAG
CTTCGCTTGCAAGGCCGGGTGAAGCTATCTCGTTTAGAGTATTTCTACTTGAGAAACATT
GTTCGTAAAAGTTGTTTATCCCAATACGCAGCACATATATTTCACTTTGGTAAAATCATT
CGTTACTCTCAGTTGCTACTACGGTACTACCTCATCCTGTAGAGTTTCAAGTGATCAATG
CAACATATATTTAGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2BP59TF U 1
AF RR2AF18JQ C 101
AF RR2AF18TF U 101
BS 1 410 RR2BP59TF
BS 411 411 RR2AF18TF
BS 412 502 RR2BP59TF
BS 503 503 RR2AF18TF
BS 504 555 RR2BP59TF
BS 556 795 RR2AF18TF
BS 796 797 RR2AF18JQ

RD RR2BP59TF 555 0 0
GGAACAGGAGAGACAAAAATAGCCACGATGATGAAACCCTCAGCGAAATCAATTCAGAGA
GTTGGTCGTTTCTTAAGGAAGAGCCTTGGAAGCATCAAGTCCACTGTCTGCTTTGGTAAA
TACCACCACAACTTCCCTAACAACAACACTCCACTCTTGAGCCCCTTCTCATGCAGTCTT
GCCCTCTCTTGTCCACAAGATTCCCAGACTGAAGAAACGTACAGCGTTATCTCTTGTGAA
AGCAAGGCTGTTGCAGAAACCAGAGATGAGAGACTCATCAACAAAAACCAACATAAGAAG
AAACCGAAGAAAAAGGTTGCAGTTGCCGAGTCGTTCGAGGAGGCAAAGAGAAGAGGTGAC
AAGTTGGCACAAAAGATGAAAGATCTGAACATGGTTGATCTCAGAGACATGGAGCATGCA
TCGGATGTAAAAGAAGCGCTTAGATGCTATTCAAGCATTAGAAGCCCTGTCTACCTTGAC
ATTGTTGACAATTTCTTCATAGACATGTACTACGAGTTCTCTGATCCACGCACCTCTTCT
AGTATCAACGGTTCA

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2AF18JQ 697 0 0
GG
ACTGTCTGCTTTGGTAAATACCACCACAACTTCCCTAACAACAACACTCCACTCTTGAGC
CCCTTCTCATGCAGTCTTGCCCTCTCTTGTCCACAAGATTCCCAGACTGAAGAAACGTAC
AGCGTTATCTCTTGTGAAAGCAAGGCTGTTGCAGAAACCAGAGATGAGAGACTCATCAAC
AAAAACCAACATAAGAAGAAACCGAAGAAAAAGGTTGCAGTTGCCGAGTCGTTCGAGGAG
GCAAAGAGAAGAGGTGACAAGTTGGCACAAAAGATGAAAGATCTGAACATGGTTGATTTC
AGAGACATTGAGCATGCATCGGATGTAAAAGAAGCGCTTAGATGCTATTCAAGCATTAGA
AGCCCTGTCTACCTTGACATTGTTGACAATTTCTTCATAGGCATGTACTACGAGTTCTCT
GATCCACGCACCTCTTCTAGTATCAACGGTTCAAGAAGAAAAGCTGGCTCTTTCAGACTC
TAAAGACCCTCCATTCAGCTTCGCTTGCAAGGCCGGGTGAAGCTATCTCGTTTAGAGTAT
TTCTACTTGAGAAACATTGTTCGTAAAAGTTGTTTATCCCAATACGCAGCACATATATTT
CACTTTGGTAAAATCATTCGTTACTCTCAGTTGCTACTACGGTACTACCTCATCCTGTAG
AGTTTCAAGTGATCAATGCAACATATATTTAGTCT

QA 3 697 3 697
DS 

RD RR2AF18TF 695 0 0
GG
ACTGTCTGCTTTGGTAAATACCACCACAACTTCCCTAACAACAACACTCCACTCTTGAGC
CCCTTCTCATGCAGTCTTGCCCTCTCTTGTCCACAAGATTCCCAGACTGAAGAAACGTAC
AGCGTTATCTCTTGTGAAAGCAAGGCTGTTGCAGAAACCAGAGATGAGAGACTCATCAAC
AAAAACCAACATAAGAAGAAACCGAAGAAAAAGGTTGCAGTTGCCGAGTCGTTCGAGGAG
GCAAAGAGAAGAGGTGACAAGTTGGCACAAAAGATGAAAGATCTGAACATGGTTGATCTC
AGAGACATTGAGCATGCATCGGATGTAAAAGAAGCGCTTAGATGCTATTCAAGCATTAGA
AGCCCTGTCTACCTTGACATTGTTGACAATTTCTTCATAGGCATGTACTACGAGTTCTCT
GATCCACGCACCTCTTCTAGTATCAACGGTTCAAGAAGAAAAGCTGGCTCTTTCAGACTC
TAAAGACCCTCCATTCAGCTTCGCTTGCAAGGCCGGGTGAAGCTATCTCGTTTAGAGTAT
TTCTACTTGAGAAACATTGTTCGTAAAAGTTGTTTATCCCAATACGCAGCACATATATTT
CACTTTGGTAAAATCATTCGTTACTCTCAGTTGCTACTACGGTACTACCTCATCCTGTAG
AGTTTCAAGTGATCAATGCAACATATATTTAGT

QA 3 695 3 695
DS 



AS 1 2

CO CL3565Contig1 880 2 2 U
GGACAAACTGTTGCTGCTGCTGCTGCTTCAAACCGACCAAACCGTAAAGATGTTGGCGTC
AAGATCCCTGGCTCTAACAAAACCAAACCAGTTATCCCAGTCGGTCCTGGTTTCCAGGCT
GAAATTCCGGTTTGGATTGCACCTACCAAGAAGGGGAAGTTTTACGGTAGTCCCGGAGAT
TCCGACACTCTTAGGTGGCTTGGAGCTGGTGTGTGGCCTACATATAGCTTAAAGAAGAAA
GTTTACTACAAAAAGATCGGCGAAGGGAGACCAGACTCATGTTCTTGTCCTACTCCAGGT
TCAACCGATTGCGTAAAGCTACACATTAAAGAAGCGAGGGAGCTTCTAGAAAAGGAAACT
GGAGGTGCTTTCTATACTTGGAAGTTTGATGAAATGGGTGAAGTGAGATCAAAGTCATGG
ACGGCCAAGGAAGAGCAAAAGTTTAGATCTCTTGTGAGAAAAAATCCTTTGTCAAATCGT
GATGGGTTTTGGAAGTATGCTTCAAAGGCTTTCCCAAGGAGAAGTGAGAAGGATGTCATT
AGTTACTACTATAATGTCTTCCTTAACCACCGTAACACCGATGATGACCACTATGGTGAC
TTCTTAGCTGGATGAAAGGTAACCCAAGTTTCCAATTTCTTGATACTTAGTGATTCAAGA
ACATGTTCCATTTCCCCCTAAACTTTTCTATCATAGGATTTTTCTTTTTTCAAAAAGAAA
TCCTTATAGGGAAAATGCACCAATCTAAAATGTGTTTTGTTCTCAAATTCTAAATAGGGA
GCTGTTTTCTTCTTCATGAACTTTGTTGCCTTGTTTCACTCAAGAAACAAACTTGAATAT
TTCAAATTTGGAACTTTTATATTCTTAGATCCTTTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C387TF U 1
AF RR2C387JQ C 220
BS 1 696 RR2C387TF
BS 697 880 RR2C387JQ

RD RR2C387TF 701 0 0
GGACAAACTGTTGCTGCTGCTGCTGCTTCAAACCGACCAAACCGTAAAGATGTTGGCGTC
AAGATCCCTGGCTCTAACAAAACCAAACCAGTTATCCCAGTCGGTCCTGGTTTCCAGGCT
GAAATTCCGGTTTGGATTGCACCTACCAAGAAGGGGAAGTTTTACGGTAGTCCCGGAGAT
TCCGACACTCTTAGGTGGCTTGGAGCTGGTGTGTGGCCTACATATAGCTTAAAGAAGAAA
GTTTACTACAAAAAGATCGGCGAAGGGAGACCAGACTCATGTTCTTGTCCTACTCCAGGT
TCAACCGATTGCGTAAAGCTACACATTAAAGAAGCGAGGGAGCTTCTAGAAAAGGAAACT
GGAGGTGCTTTCTATACTTGGAAGTTTGATGAAATGGGTGAAGTGAGATCAAAGTCATGG
ACGGCCAAGGAAGAGCAAAAGTTTAGATCTCTTGTGAGAAAAAATCCTTTGTCAAATCGT
GATGGGTTTTGGAAGTATGCTTCAAAGGCTTTCCCAAGGAGAAGTGAGAAGGATGTCATT
AGTTACTACTATAATGTCTTCCTTAACCACCGTAACACCGATGATGACCACTATGGTGAC
TTCTTAGCTGGATGAAAGGTAACCCAAGTTTCCAATTTCTTGATACTTAGTGATTCAAGA
ACATGTTCCATTTCCCCCTAAACTTTTCTATCATAG
ATTTT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2C387JQ 661 0 0
ACATATAGCTTAAAGAAGAAAGTTTACTACAAAAAGATCGGCGAAGGGAGACCAGACTCA
TGTTCTTGTCCTACTCCAGGTTCAACCGATTGCGTAAAGCTACACATTAAAGAAGCGAGG
GAGCTTCTAGAAAAGGAAACTGGAGGTGCTTTCTATACTTGGAAGTTTGATGAAATGGGT
GAAGTGAGATCAAAGTCATGGACGGCCAAGGAAGAGCAAAAGTTTAGATCTCTTGTGAGA
AAAAATCCTTTGTCAAATCGTGATGGGTTTTGGAAGTATGCTTCAAAGGCTTTCCCAAGG
AGAAGTGAGAAGGATGTCATTAGTTACTACTATAATGTCTTCCTTAACCACCGTAACACC
GATGATGACCACTATGGTGACTTCTTAGCTGGATGAAAGGTAACCCAAGTTTCCAATTTC
TTGATACTTAGTGATTCAAGAACATGTTCCATTTCCCCCTAAACTTTTCTATCATAGGAT
TTTTCTTTTTTCAAAAAGAAATCCTTATAGGGAAAATGCACCAATCTAAAATGTGTTTTG
TTCTCAAATTCTAAATAGGGAGCTGTTTTCTTCTTCATGAACTTTGTTGCCTTGTTTCAC
TCAAGAAACAAACTTGAATATTTCAAATTTGGAACTTTTATATTCTTAGATCCTTTTTCT
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL3566Contig1 1187 2 2 U
GAGTCTAATCTCGTCATGCCTTGTTATTCCCAGAATCCGTTTGTTTATGGCTGATGCCTT
TTGGGAGATAACAAAGTAGAATCAAATCAAGAATAAAAATCGACTTGAAATCTTCCCTTC
TTATGTTGTGCATTTGAAAGTGTGATTCAGAATTTCTGGCTTCACTAGTTTCACGCTCAA
GAAAATATTTCATTTAATCTTCTAATTTGCTGTCATCTTTTTTTTTTCCCATTCAAATAG
GAGTCGCTTGAGAAGCCTGCGGCTTTACAATATCGGACCGATGAACTACAATTCCTTACT
GTCAGTTTGTTCGAATCTCACTGATCTGAGGATTGTTGGATCCTATTGTCCATTTTTGAA
TCTATTTATGACCCTGTCAAAAAAATATCGTCTGATAGAGCACCTGTGCTTAGTGAACCA
TCACCCCGTAGGTAGAATGGACGCGTCAGCAGGTTCACACTTGATAGAGTTGGTGACCAA
GTCCCCCTACTTAACTTCTCTAACACTCGTAGGTTTTCAACTAACCAATGAAATGGCCCG
AAATCTTGTTAAGAATTCTCGAAAACTGAAGTATCTGAATTTGTCCAGATCGCCTAAAAT
CAATGGTCATTTTTTGAGGTATTTGGGAAATAGCTGCAAAGAGAATCCACTTAAGACTCT
AATAATGCGCAACTGCGTTAAACTAGAGGAGACAGAAGTCTTGGAACTTTGTAACTCCTT
AATGAAAGGAAACTTCAAATTCATTCGTCACGTTGATGTTTCCAGCTACAACGGCTTAGT
TTCTGATGGTGGCGTGAGATCTAGATCTTACAACCCTACGTTACCTCTGGAGAAGCTGAA
AGAAGAAAGACCAGATGTGACACTTGTGGCGGATTTTCCATTAGAAAGGTCAGGGAAGCG
TTACCTTGTGGAAGGGGATGACGAAGAGCTGAGGGAGATAGAGATGATGGAAGCCAAGAA
CGATGAAGATGATGATGATGATGAGGACTCCTCTGATGATGACGATGACGTTTAGCTTTG
ATGATTGGAGGAGTTGTTAATCAATCAATCGTCTATATTTCCGGCACGACCAACATATAA
CTATTTTTATTATATTCTTAATAAAACCATAACCGAAGTTCCTCCTTCATACAGAACATA
GAGATTTTATTACTTCATCTTATCTCTTATTAATTTCTCAACTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H029TF U 1
AF RR2H029JQ C 433
BS 1 692 RR2H029TF
BS 693 1187 RR2H029JQ

RD RR2H029TF 698 0 0
GAGTCTAATCTCGTCATGCCTTGTTATTCCCAGAATCCGTTTGTTTATGGCTGATGCCTT
TTGGGAGATAACAAAGTAGAATCAAATCAAGAATAAAAATCGACTTGAAATCTTCCCTTC
TTATGTTGTGCATTTGAAAGTGTGATTCAGAATTTCTGGCTTCACTAGTTTCACGCTCAA
GAAAATATTTCATTTAATCTTCTAATTTGCTGTCATCTTTTTTTTTTCCCATTCAAATAG
GAGTCGCTTGAGAAGCCTGCGGCTTTACAATATCGGACCGATGAACTACAATTCCTTACT
GTCAGTTTGTTCGAATCTCACTGATCTGAGGATTGTTGGATCCTATTGTCCATTTTTGAA
TCTATTTATGACCCTGTCAAAAAAATATCGTCTGATAGAGCACCTGTGCTTAGTGAACCA
TCACCCCGTAGGTAGAATGGACGCGTCAGCAGGTTCACACTTGATAGAGTTGGTGACCAA
GTCCCCCTACTTAACTTCTCTAACACTCGTAGGTTTTCAACTAACCAATGAAATGGCCCG
AAATCTTGTTAAGAATTCTCGAAAACTGAAGTATCTGAATTTGTCCAGATCGCCTAAAAT
CAATGGTCATTTTTTGAGGTATTTGGGAAATAGCTGCAAAGAGAATCCACTTAAGACTCT
AATAATGCGCAACTGCGTTAAACTAGAGGAGA
CAGAGT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2H029JQ 755 0 0
TAGAATGGACGCGTCAGCAGGTTCACACTTGATAGAGTTGGTGACCAAGTCCCCCTACTT
AACTTCTCTAACACTCGTAGGTTTTCAACTAACCAATGAAATGGCCCGAAATCTTGTTAA
GAATTCTCGAAAACTGAAGTATCTGAATTTGTCCAGATCGCCTAAAATCAATGGTCATTT
TTTGAGGTATTTGGGAAATAGCTGCAAAGAGAATCCACTTAAGACTCTAATAATGCGCAA
CTGCGTTAAACTAGAGGAGACAGAAGTCTTGGAACTTTGTAACTCCTTAATGAAAGGAAA
CTTCAAATTCATTCGTCACGTTGATGTTTCCAGCTACAACGGCTTAGTTTCTGATGGTGG
CGTGAGATCTAGATCTTACAACCCTACGTTACCTCTGGAGAAGCTGAAAGAAGAAAGACC
AGATGTGACACTTGTGGCGGATTTTCCATTAGAAAGGTCAGGGAAGCGTTACCTTGTGGA
AGGGGATGACGAAGAGCTGAGGGAGATAGAGATGATGGAAGCCAAGAACGATGAAGATGA
TGATGATGATGAGGACTCCTCTGATGATGACGATGACGTTTAGCTTTGATGATTGGAGGA
GTTGTTAATCAATCAATCGTCTATATTTCCGGCACGACCAACATATAACTATTTTTATTA
TATTCTTAATAAAACCATAACCGAAGTTCCTCCTTCATACAGAACATAGAGATTTTATTA
CTTCATCTTATCTCTTATTAATTTCTCAACTCATC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL3567Contig1 978 2 4 U
TTTTTGCATGCGGTAATGGCAAAGAAGAGGAAAATGCAGATACGGTGTAGGGATATGGAA
TGGTGGATGAAACGTAGGCAGTTGCCTTCTCGGTTAAGACAAAGAGTTAGGAGATTTGAG
AGGCAGAGATGGACTGCCTTAGGTGGAGAATACGAGCTGGAACTTATACAGGATTTGCCT
CCGGGTCTTCGAAGAGATATTAAGCGATATCTTTGCGTTGATCTTATTGAGAAGGTACCA
TTGTTCAGGGGCATGGACGATTTGATCCTAGACAACATTTGCGATCGTGCTAAGCCTCGT
GTCTACTCTAAAGACGAAAAGATCATCCGGGAAGGAGATCCTGTACAGAGAATGATATTC
ATCATGCGTGGGAGAGTCAAACGTGACCAGAGCCTAAGCAAAGGCGTGGTAGCCACGAGT
ACGATCGAACCAGGTGGTTACTTCGGCGACGAGCTACTCTCATGGTGCCTACGGCGTCCA
TTTATCGACCGTCTTCCTCCTTCCACCGCAACATTTGTCTGTCTAGACAACATCGAGGCG
TTCTCCCTCGGATCAGAAGATCTTTGGTACATAACGGATCATTTCCGTTATAAATTCGCA
AACGAGCGTCTTAAGCGGACGGCGAGATACTACTCGAACTGGAGGACGTGGGCTGCGGTG
AATATCCAAATGTCGTGGCGCCGGTACAGGAAGAGAACCTCTGGTGGTGTAGGTGGTTCG
ATGAGTCCTGTGTCGGAACATAGCGTCGAAGGTAACAGTGAACGCCGTTTGCTTCAGTAT
GCCGCGATGTTTATGTCCATCCGACCGCATGATCATCTTGAGTGAAAGTTTTTTAAATAT
GTATGTCGAAATAATTGTTTGTATCCATTGTTCATCCTCGATTGTTTTCGTTCCATTGGT
TGTTTAAACTAAAATCTCTGTTTCGATGATATGTATGTCCCCTTATTTGAGTTTTCTCTT
AATGTACATCTTTACAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F402TF U 1
AF RR2AD78JQ C 292
BS 1 537 RR2F402TF
BS 538 538 RR2AD78JQ
BS 539 557 RR2F402TF
BS 558 978 RR2AD78JQ

RD RR2F402TF 564 0 0
TTTTTGCATGCGGTAATGGCAAAGAAGAGGAAAATGCAGATACGGTGTAGGGATATGGAA
TGGTGGATGAAACGTAGGCAGTTGCCTTCTCGGTTAAGACAAAGAGTTAGGAGATTTGAG
AGGCAGAGATGGACTGCCTTAGGTGGAGAATACGAGCTGGAACTTATACAGGATTTGCCT
CCGGGTCTTCGAAGAGATATTAAGCGATATCTTTGCGTTGATCTTATTGAGAAGGTACCA
TTGTTCAGGGGCATGGACGATTTGATCCTAGACAACATTTGCGATCGTGCTAAGCCTCGT
GTCTACTCTAAAGACGAAAAGATCATCCGGGAAGGAGATCCTGTACAGAGAATGATATTC
ATCATGCGTGGGAGAGTCAAACGTGACCAGAGCCTAAGCAAAGGCGTGGTAGCCACGAGT
ACGATCGAACCAGGTGGTTACTTCGGCGACGAGCTACTCTCATGGTGCCTACGGCGTCCA
TTTATCGACCGTCTTCCTCCTTCCACCGCAACATTTGTCTGTCTAGACAACATCGAG*CG
TTCTCCCTCGGATCAGA
GATCTTA

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2AD78JQ 687 0 0
AAGCCTCGTGTCTACTCTAAAGACGAAAAGATCATCCGGGAAGGAGATCCTGTACAGAGA
ATGATATTCATCATGCGTGGGAGAGTCAAACGTGACCAGAGCCTAAGCAAAGGCGTGGTA
GCCACGAGTACGATCGAACCAGGTGGT*ACTTCGGGGACGAGCTACTCTCATGGTGCCTA
CGGCGTCCATTTATCGACCGTCTTCCTCCTTCCACCGCAACATTTGTCTGTCTAGACAAC
ATCGAGGCGTTCTCCCTCGGATCAGAAGATCTTTGGTACATAACGGATCATTTCCGTTAT
AAATTCGCAAACGAGCGTCTTAAGCGGACGGCGAGATACTACTCGAACTGGAGGACGTGG
GCTGCGGTGAATATCCAAATGTCGTGGCGCCGGTACAGGAAGAGAACCTCTGGTGGTGTA
GGTGGTTCGATGAGTCCTGTGTCGGAACATAGCGTCGAAGGTAACAGTGAACGCCGTTTG
CTTCAGTATGCCGCGATGTTTATGTCCATCCGACCGCATGATCATCTTGAGTGAAAGTTT
TTTAAATATGTATGTCGAAATAATTGTTTGTATCCATTGTTCATCCTCGATTGTTTTCGT
TCCATTGGTTGTTTAAACTAAAATCTCTGTTTCGATGATATGTATGTCCCCTTATTTGAG
TTTTCTCTTAATGTACATCTTTACAGT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 3

CO CL3568Contig1 767 3 7 U
AAAAGTGTTATCTGTCTGATAAATAACATTATTTTAAAAAGAAGTCTTACAAATAGATAA
AACGAAAATATTATGTGGTTTAATATGTATCTAATATGGGAATTTTCAAAATAGCTAAAC
ATATAAATAAAGAGAGCAAGTAATGTATATTAAAATCCTTTTCTTTTTTAACTCTTTAGA
TTATACCACCTGAATAGGGAATCACTTGGTGAATTTTGCGATCAATTTGTCGACATGGAT
GATGATATCGTCAATGCGAGGTCGAACCGCAGCCTGAGGTTGCAGCATCCAAGTCACGAA
CTGGTGAAGTGCTTCAGGATACGAAGCCTTTGGTCCTGCCTTTGGCCATTTGATCTTAGC
GTTAACGATTGCAAGCTGAAGACTTCCATCCGATTCTTCAAGTACATATTCAAACGGAGA
CACACCGTACATTATTGCGTATAGTGTGCAGCCTAGTGACCAGATATCAGTTCTCTCATC
AATATCCGCATGGCTTGGGCAATCCCAGAGCTCGGGAGCTCTAAACGGTGCTGAAGAATG
TTCAGCTGTCCATTCCTGTAACTGTAAGGCCTCTTGACGGGAGCGGATTTGCTTCCGTGC
AGGACGAGCACTCCCAAAGTCCATCAAAATGGCAAGAGGAGTCTGTCCTTTTCTACGTGT
TAAAAGCACGTTTCCAGGTTTGACATCGTTGTGAGCATATGGTGGCTCCAGAGAGTGCAT
GTGTTTAAGTCCATCACAAAGCTGACGAAATATATGCAAGACATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW01JQ U 1
AF RR2BF22JQ U 55
AF RR2BF22TF C 55
BS 1 455 RR2CW01JQ
BS 456 456 RR2BF22JQ
BS 457 539 RR2CW01JQ
BS 540 540 RR2BF22JQ
BS 541 577 RR2CW01JQ
BS 578 745 RR2BF22JQ
BS 746 767 RR2BF22TF

RD RR2CW01JQ 577 0 0
AAAAGTGTTATCTGTCTGATAAATAACATTATTTTAAAAAGAAGTCTTACAAATAGATAA
AACGAAAATATTATGTGGTTTAATATGTATCTAATATGGGAATTTTCAAAATAGCTAAAC
ATATAAATAAAGAGAGCAAGTAATGTATATTAAAATCCTTTTCTTTTTTAACTCTTTAGA
TTATACCACCTGAATAGGGAATCACTTGGTGAATTTTGCGATCAATTTGTCGACATGGAT
GATGATATCGTCAATGCGAGGTCGAACCGCAGCCTGAGGTTGCAGCATCCAAGTCACGAA
CTGGTGAAGTGCTTCAGGATACGAAGCCTTTGGTCCTGCCTTTGGCCATTTGATCTTAGC
GTTAACGATTGCAAGCTGAAGACTTCCATCCGATTCTTCAAGTACATATTCAAACGGAGA
CACACCGTACATTATTGCGTATAGTGTGCAGCCTAATGACCAGATATCAGTTCTCTCATC
AATATCCGCATGGCTTGGGCAATCCCAGAGCTCGGGAGCTCTAAACGGTGCTGAAGAATA
TTCAGCTGTCCATTCCTGTAACTGTAAGGCCTCTTGA

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2BF22JQ 691 0 0
G
GATAAAACGAAAATATTATGTGGTTTAATATGTATCTAATATGGGAATTTTCAAAATAGC
TAAACATATAAATAAAGAGAGCAAGTAATGTATATTAAAATCCTTTTCTTTTTTAACTCT
TTAGATTATACCACCTGAATAGGGAATCACTTGGTGAATTTTGCGATCAATTTGTCGACA
TGGATGATGATATCGTCAATGCGAGGTCGAACCGCAGCCTGAGGTTGCAGCATCCAAGTC
ACGAACTGGTGAAGTGCTTCAGGATACGAAGCCTTTGGTCCTGCCTTTGGCCATTTGATC
TTAGCGTTAACGATTGCAAGCTGAAGACTTCCATCCGATTCTTCAAGTACATATTCAAAC
GGAGACACACCGTACATTATTGCGTATAGTGTGCAGCCTAGTGACCAGATATCAGTTCTC
TCATCAATATCCGCATGGCTTGGGCAATCCCAGAGCTCGGGAGCTCTAAACGGTGCTGAA
GAATGTTCAGCTGTCCATTCCTGTAACTGTAAGGCCTCTTGACGGGAGCGGATTTGCTTC
CGTGCAGGACGAGCACTCCCAAAGTCCATCAAAATGGCAAGAGGAGTCTGTCCTTTTCTA
CGTGTTAAAAGCACGTTTCCAGGTTTGACATCGTTGTGAGCATATGGTGGCTCCAGAGAG
TGCATGTGTTTAAGTCCATCACAAAGCTGA

QA 2 691 2 691
DS 

RD RR2BF22TF 713 0 0
G
GATAAAACGAAAATATTATGTGGTTTAATATGTATCTAATATGGGAATTTTCAAAATAGC
TAAACATATAAATAAAGAGAGCAAGTAATGTATATTAAAATCCTTTTCTTTTTTAACTCT
TTAGATTATACCACCTGAATAGGGAATCACTTGGTGAATTTTGCGATCAATTTGTCGACA
TGGATGATGATATCGTCAATGCGAGGTCGAACCGCAGCCTGAGGTTGCAGCATCCAAGTC
ACGAACTGGTGAAGTGCTTCAGGATACGAAGCCTTTGGTCCTGCCTTTGGCCATTTGATC
TTAGCGTTAACGATTGCAAGCTGAAGACTTCCATCCGATTCTTCAAGTACATATTCAAAC
GGAGACACACCGTACATTATTGCGTATAGTGTGCAGCCTAGTGACCAGATATCAGTTCTC
TCATCAATATCCGCATGGCTTGGGCAATCCCAGAGCTCGGGAGCTCTAAACGGTGCTGAA
GAATGTTCAGCTGTCCATTCCTGTAACTGTAAGGCCTCTTGACGGGAGCGGATTTGCTTC
CGTGCAGGACGAGCACTCCCAAAGTCCATCAAAATGGCAAGAGGAGTCTGTCCTTTTCTA
CGTGTTAAAAGCACGTTTCCAGGTTTGACATCGTTGTGAGCATATGGTGGCTCCAGAGAG
TGCATGTGTTTAAGTCCATCACAAAGCTGACGAAATATATGCAAGACATCAC

QA 2 713 2 713
DS 



AS 1 3

CO CL3569Contig1 1496 3 9 U
CTCTGCCATAGATAACGTCTTCTTTGCCGGAAAATATTTCTATCTTTGATCTATAAGCTC
AAAAACATAAAAGAATCGGAGTTTAATTGTGAATATAGAAGAAAATCATTCTTTTTTAAT
TTTCTTCTAATCTGACCTGCAATTAAAGCTAAACAAATTAAACTTATCAATATCAGAATT
CAATTACAAAATATTAAGAAAACAAAAAAAAAAGATATGGAGAACATCGACGTTATCTCA
CAGGAAAACGCCTCAGGACCACCATCACCACCACCTCCTCCTCCTCCAGTAAAGTCAAAC
TCCGGTTCGAAGAAGTCAACGGTACAAAAATGCGATAGCTTTGCTTCTAAAGCTACAAGA
GATGCATGGGATCGTATGTTCGACGAAGCTCATGGCGCTGATGTTTTGATCCATACGGAT
GATAGTGGCTTGATCTACGCCCATTCTAACGTCATCGGAATGGCTTCTGATGTAATTAGA
GGAATGATGAAACAAGATAAGAGAAACTCTCGCCGCAAATCAATCTCAATCCTCGGCGTT
CCTCACGACGCTGTTCGCGTTTTCGTTAGATTTTTATACTCTTCTTGCTACGAGAAACGA
GACATGGAAGATTTCGCAATGCATCTTCTCGTGCTATCACACGTCTACGTAGTTCCGCAA
CTAAAACGAGTGTGCGAGTCTCATTTCGAAAACACTTTGCTCAACAAAGAGAATGTGATT
GATGTGTTTCAGCTAGCTCTTCTCTGCGACGCTCCTCGTCTAGGTCTTCTCTGTCACAGA
ATGATCCTAAAGAGCTTTGAAGAAGTCTCCACTTCTCAAGGATGGATAGCGATGAAACAA
AGTCACCCTAGTCTTCATAAAGAGCTCTTACGCTCTGTCTCTTACGAACTTAACAGCTTA
AAGCAAAGAAGCAGGAAACAAAAAGAGATACAGACATACACTCAGCTGTATGATGCAATG
GAAGCTTTTGTCCACATATGTAGAGATGGATGCAGAGAGATTGGTCCAACAAAGATCGAA
ACCCCGCATGTCTCTTGTGGGTTTCAAGCGTGCAACGGTTTGGAGATGTTGTTGAAACAT
TTGGCGGTATGTAAACTGAGATCAATCCCTGGTGGCTGCAGCCGTTGTAAGAGAATGTGG
CAGCTTCTTGAGCTTCATTCACGTATTTGTGTAGACTCGGAGCAATGCAAAGTCCCTCTT
TGCAGTAGCTTCAAAGAGAGGATGAAGAAACAAAGCAGGAAAGATGAGAAGAGATGGAAA
CTGTTGGTGAAGAATGTTTTGAGCACCAAGAGAATTGGAGGATCTCCTTTCTTTTTGCAG
GCAATTGATGTTACTATGTGACATTATTATTTTATTTCATAATAGTTATAGATTAGATGT
GTAATATAAATAGGTAGAAGTTTTTTTTTATGAAGAGAGAGATAGAGAAATTCAAACAAT
TTTCACTCTCTAGTTACATCACAAACCTCGTTTAAAAGAGTGTGTTTGATCATAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G110TF U 1
AF RR2BJ20TF U 313
AF RR2BJ20JQ C 688
BS 1 650 RR2G110TF
BS 651 651 RR2BJ20TF
BS 652 659 RR2G110TF
BS 660 660 RR2BJ20TF
BS 661 702 RR2G110TF
BS 703 1134 RR2BJ20TF
BS 1135 1135 RR2BJ20JQ
BS 1136 1214 RR2BJ20TF
BS 1215 1496 RR2BJ20JQ

RD RR2G110TF 702 0 0
CTCTGCCATAGATAACGTCTTCTTTGCCGGAAAATATTTCTATCTTTGATCTATAAGCTC
AAAAACATAAAAGAATCGGAGTTTAATTGTGAATATAGAAGAAAATCATTCTTTTTTAAT
TTTCTTCTAATCTGACCTGCAATTAAAGCTAAACAAATTAAACTTATCAATATCAGAATT
CAATTACAAAATATTAAGAAAACAAAAAAAAAAGATATGGAGAACATCGACGTTATCTCA
CAGGAAAACGCCTCAGGACCACCATCACCACCACCTCCTCCTCCTCCAGTAAAGTCAAAC
TCCGGTTCGAAGAAGTCAACGGTACAAAAATGCGATAGCTTTGCTTCTAAAGCTACAAGA
GATGCATGGGATCGTATGTTCGACGAAGCTCATGGCGCTGATGTTTTGATCCATACGGAT
GATAGTGGCTTGATCTACGCCCATTCTAACGTCATCGGAATGGCTTCTGATGTAATTAGA
GGAATGATGAAACAAGATAAGAGAAACTCTCGCCGCAAATCAATCTCAATCCTCGGCGTT
CCTCACGACGCTGTTCGCGTTTTCGTTAGATTTTTATACTCTTCTTGCTACGAGAAACGA
GACATGGAAGATTTCGCAATGCATCTTCTCGTGCTATCACACGTCTACGTGGTTCCGCA*
CTAAAACGAGTGTGCGAGTCTCATTTCGAAAACACTTTGCTC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2BJ20TF 902 0 0
AGGG
CAACGGTACAAAAATGCGATAGCTTTGCTTCTAAAGCTACAAGAGATGCATGGGATCGTA
TGTTCGACGAAGCTCATGGCGCTGATGTTTTGATCCATACGGATGATAGTGGCTTGATCT
ACGCCCATTCTAACGTCATCGGAATGGCTTCTGATGTAATTAGAGGAATGATGAAACAAG
ATAAGAGAAACTCTCGCCGCAAATCAATCTCAATCCTCGGCGTTCCTCACGACGCTGTTC
GCGTTTTCGTTAGATTTTTATACTCTTCTTGCTACGAGAAACGAGACATGGAAGATTTCG
CAATGCATCTTCTCGTGCTATCACACGTCTACGTAGTTCCGCAACTAAAACGAGTGTGCG
AGTCTCATTTCGAAAACACTTTGCTCAACAAAGAGAATGTGATTGATGTGTTTCAGCTAG
CTCTTCTCTGCGACGCTCCTCGTCTAGGTCTTCTCTGTCACAGAATGATCCTAAAGAGCT
TTGAAGAAGTCTCCACTTCTCAAGGATGGATAGCGATGAAACAAAGTCACCCTAGTCTTC
ATAAAGAGCTCTTACGCTCTGTCTCTTACGAACTTAACAGCTTAAAGCAAAGAAGCAGGA
AACAAAAAGAGATACAGACATACACTCAGCTGTATGATGCAATGGAAGCTTTTGTCCACA
TATGTAGAGATGGATGCAGAGAGATTGGTCCAACAAAGATCGAAACCCCGCATGTCTCTT
GTGGGTTTCAAGCGTGCAACGGTTTGGAGATGTTGTTGAAACATTTGGCGGTATGTAAAC
TGAGATCAATCCCTGGTGGCTGCAGCCGTTGTAAGAGA*TGTGGCAGCTTCTTGAGCTTC
ATTCACGTATTTGTGTAGACTCGGAGCAATGCAAAGTCCCTCTTTGCAGTAGCTTCAA

QA 5 902 5 902
DS 

RD RR2BJ20JQ 809 0 0
GAAAACACTTTGCTCAACAAAGAGAATGTGATTGATGTGTTTCAGCTAGCTCTTCTCTGC
GACGCTCCTCGTCTAGGTCTTCTCTGTCACAGAATGATCCTAAAGAGCTTTGAAGAAGTC
TCCACTTCTCAAGGATGGATAGCGATGAAACAAAGTCACCCTAGTCTTCATAAAGAGCTC
TTACGCTCTGTCTCTTACGAACTTAACAGCTTAAAGCAAAGAAGCAGGAAACAAAAAGAG
ATACAGACATACACTCAGCTGTATGATGCAATGGAAGCTTTTGTCCACATATGTAGAGAT
GGATGCAGAGAGATTGGTCCAACAAAGATCGAAACCCCGCATGTCTCTTGTGGGTTTCAA
GCGTGCAACGGTTTGGAGATGTTGTTGAAACATTTGGCGGTATGTAAACTGAGATCAATC
CCTGGTGGCTGCAGCCGTTGTAAGAGAATGTGGCAGCTTCTTGAGCTTCATTCACGTATT
TGTGTAGACTCGGAGCAATGCAAAGTCCCTCTTTGCAGTAGCTTCAAAGAGAGGATGAAG
AAACAAAGCAGGAAAGATGAGAAGAGATGGAAACTGTTGGTGAAGAATGTTTTGAGCACC
AAGAGAATTGGAGGATCTCCTTTCTTTTTGCAGGCAATTGATGTTACTATGTGACATTAT
TATTTTATTTCATAATAGTTATAGATTAGATGTGTAATATAAATAGGTAGAAGTTTTTTT
TTATGAAGAGAGAGATAGAGAAATTCAAACAATTTTCACTCTCTAGTTACATCACAAACC
TCGTTTAAAAGAGTGTGTTTGATCATAAT

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 3

CO CL3570Contig1 651 3 4 U
GGGATCACTAAAGATTCTCCGACTTTCTCTCCACTTTACAACCTCCGATTTGCTTCGCCG
CCAAAGTTCTCTGAAGGGATCTTCGTTTCTCCGAAAGGGAACTTGTGTCGAAGACTCTGC
TCTACCATGTCAGGAAGAAAGGAAACGGTGTTGGATTTGGCTAAGTTCGTTGACAAGGGT
GTGCAAGTTAAGCTCACCGGTGGTAGACAAGTCACTGGAACTCTCAAGGGGTACGATCAG
TTGCTCAACCTTGTTTTGGATGGGGCTGTAGAGTTTGTTCGAGATCATGATGATCCTTTG
ACGACCACTGACCAGACGAGACCCCTCGGTTTAATTGTTTGCCGTGGAACTGCAGTGATG
CTCGTCTCACCAACGGATGGAACTGAAGAAATCGCTAACCCGTTTGTTCAGACAGAAGCT
CTCTAAAAGAGTTTCTTCCAAAACCATTATGCATCTCTCTCTACTATCTCTATTAGTTTA
ACTTGGGAGTTTAAAGCGTTATGTATCTGAGTATCTCTGCCATAACGTTGGAAACTAAAG
TTTTCTTTATATACCTATTTGGGACATCATATGCTCTTCTTCGTGTCTTTCTCACAACTT
TTCCGACCAAACTTGAATTCAGTTGCTGTAATAAAATCAAGTAACTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DT12TF U 1
AF RR2G608JQ C 15
AF RR2G608TF U 15
BS 1 187 RR2DT12TF
BS 188 188 RR2G608TF
BS 189 562 RR2DT12TF
BS 563 651 RR2G608TF

RD RR2DT12TF 565 0 0
GGGATCACTAAAGATTCTCCGACTTTCTCTCCACTTTACAACCTCCGATTTGCTTCGCCG
CCAAAGTTCTCTGAAGGGATCTTCGTTTCTCCGAAAGGGAACTTGTGTCGAAGACTCTGC
TCTACCATGTCAGGAAGAAAGGAAACGGTGTTGGATTTGGCTAAGTTCGTTGACAAGGGT
GTGCAAGCTAAGCTCACCGGTGGTAGACAAGTCACTGGAACTCTCAAGGGGTACGATCAG
TTGCTCAACCTTGTTTTGGATGGGGCTGTAGAGTTTGTTCGAGATCATGATGATCCTTTG
ACGACCACTGACCAGACGAGACCCCTCGGTTTAATTGTTTGCCGTGGAACTGCAGTGATG
CTCGTCTCACCAACGGATGGAACTGAAGAAATCGCTAACCCGTTTGTTCAGACAGAAGCT
CTCTAAAAGAGTTTCTTCCAAAACCATTATGCATCTCTCTCTACTATCTCTATTAGTTTA
ACTTGGGAGTTTAAAGCGTTATGTATCTGAGTATCTCTGCCATAACGTTGGAAACTAAAG
TTTTCTTTATATACCTATTTGG
AAC

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2G608JQ 637 0 0
GG
CTCCGACTTTCTCTCCACTTTACAACCTCCGATTTGCTTCGCCGCCAAAGTTCTCTGAAG
GGATCTTCGTTTCTCCGAAAGGGAACTTGTGTCGAAGACTCTGCTCTACCATGTCAGGAA
GAAAGGAAACGGTGTTGGATTTGGCTAAGTTCGTTGACAAGGGTGTGCAAGTTAAGCTCA
CCGGTGGTAGACAAGTCACTGGAACTCTCAAGGGGTACGATCAGTTGCTCAACCTTGTTT
TGGATGGGGCTGTAGAGTTTGTTCGAGATCATGATGATCCTTTGACGACCACTGACCAGA
CGAGACCCCTCGGTTTAATTGTTTGCCGTGGAACTGCAGTGATGCTCGTCTCACCAACGG
ATGGAACTGAAGAAATCGCTAACCCGTTTGTTCAGACAGAAGCTCTCTAAAAGAGTTTCT
TCCAAAACCATTATGCATCTCTCTCTACTATCTCTATTAGTTTAACTTGGGAGTTTAAAG
CGTTATGTATCTGAGTATCTCTGCCATAACGTTGGAAACTAAAGTTTTCTTTATATACCT
ATTTGGGACATCATATGCTCTTCTTCGTGTCTTTCTCACAACTTTTCCGACCAAACTTGA
ATTCAGTTGCTGTAATAAAATCAAGTAACTTCTCC

QA 3 637 3 637
DS 

RD RR2G608TF 637 0 0
GG
CTCCGACTTTCTCTCCACTTTACAACCTCCGATTTGCTTCGCCGCCAAAGTTCTCTGAAG
GGATCTTCGTTTCTCCGAAAGGGAACTTGTGTCGAAGACTCTGCTCTACCATGTCAGGAA
GAAAGGAAACGGTGTTGGATTTGGCTAAGTTCGTTGACAAGGGTGTGCAAGTTAAGCTCA
CCGGTGGTAGACAAGTCACTGGAACTCTCAAGGGGTACGATCAGTTGCTCAACCTTGTTT
TGGATGGGGCTGTAGAGTTTGTTCGAGATCATGATGATCCTTTGACGACCACTGACCAGA
CGAGACCCCTCGGTTTAATTGTTTGCCGTGGAACTGCAGTGATGCTCGTCTCACCAACGG
ATGGAACTGAAGAAATCGCTAACCCGTTTGTTCAGACAGAAGCTCTCTAAAAGAGTTTCT
TCCAAAACCATTATGCATCTCTCTCTACTATCTCTATTAGTTTAACTTGGGAGTTTAAAG
CGTTATGTATCTGAGTATCTCTGCCATAACGTTGGAAACTAAAGTTTTCTTTATATACCT
ATTTGGGACATCATATGCTCTTCTTCGTGTCTTTCTCACAACTTTTCCGACCAAACTTGA
ATTCAGTTGCTGTAATAAAATCAAGTAACTTCTCC

QA 3 637 3 637
DS 



AS 1 3

CO CL3571Contig1 1070 3 8 U
GCTCCACAAGGGATGGGGTTGATAGTCCCTAAAACTAAGGATGGTCGTGTTGTCTTCATG
TTACCGTGGTTGGGAAGAACAGTAGCAGGCACTACAGACTCTAACACCTCAATCACTCCG
CTTCCTGAACCTCATGAGGATGAGATTCAGTTTATACTGGATGCAATCAGCGACTATCTT
AACATTAAGGTTCGACGTACTGATGTTCTTTCTGCTTGGAGTGGTATCCGACCATTGGCC
ATGGATCCGACAGCAAGAGTACAGAGAGTATCTCCAGAGACCACGTTGTCTTCGAGGAAA
ACCCTGGTCTAGTCACAATCACTGGTGGAAAATGGACTACTTATCGAAGTATGGCGGAAG
ATGCGGTCGATGCAGCAATCAAATCGGGAAAGCTGCGTCCAACCAATGAGTGTGTAACAC
AGAAGCTACAGATTCTAGGCTCTTATGGATGGGAACCATCTTCTTTCACAGCTCTTGCGC
AGCAGTACGTGCGCATGAAGAAAACATACGGTGGTAAAGTGGTTCCTGGAGCAATGGACA
CAGCTGCTGCTAAGCATTTGTCTCATGCCTATGGTTCAATGGCTGACAGGGTCGCCACCA
TAGCTCAGGAGGAGGGTTTGGGGAAACGATTGGCACATGGACATCCGTTTCTGGAAGCAG
AGGTTGCTTACTGTGCAAGGCACGAGTACTGCGAATCAGCGGTTGATTTCATAGCAAGGA
GATGTAGAATAGCGTTCTTGGACACAAACGCAGCGGCAAGGGCGTTGCAGCGTGTGGTGG
AGATTCTAGCGAGTGAACACAAGTGGGACAAGTCGAGGGAGAAGCAGGAGTTGCAGAAGG
CTAAAGAGTTTCTTCAAACTTTCAAGTCTTCCAAAAACGCACAGTTTAACGACGGCAAAC
ACAACTAAAAGCCCTGCCTCTGAGCAAAAGCTTTAAACTACTCTAATTGAATTTATTATT
TTCTTCTATTTTTCAACTGTTGGCTCTTGGGTAGCCACTGGCGACAAGAAATAAAATGCT
GCTATACGGATGGAATAATACTGCGACTACTGAAGTGATTAAACACTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC49TF U 1
AF RR2GC49JQ C 342
AF RR2BP39TF U 451
BS 1 601 RR2GC49TF
BS 602 628 RR2BP39TF
BS 629 629 RR2GC49JQ
BS 630 694 RR2BP39TF
BS 695 695 RR2GC49JQ
BS 696 746 RR2BP39TF
BS 747 747 RR2GC49JQ
BS 748 1070 RR2BP39TF

RD RR2GC49TF 604 0 0
GCTCCACAAGGGATGGGGTTGATAGTCCCTAAAACTAAGGATGGTCGTGTTGTCTTCATG
TTACCGTGGTTGGGAAGAACAGTAGCAGGCACTACAGACTCTAACACCTCAATCACTCCG
CTTCCTGAACCTCATGAGGATGAGATTCAGTTTATACTGGATGCAATCAGCGACTATCTT
AACATTAAGGTTCGACGTACTGATGTTCTTTCTGCTTGGAGTGGTATCCGACCATTGGCC
ATGGATCCGACAGCAAGAGTACAGAGAGTATCTCCAGAGACCACGTTGTCTTCGAGGAAA
ACCCTGGTCTAGTCACAATCACTGGTGGAAAATGGACTACTTATCGAAGTATGGCGGAAG
ATGCGGTCGATGCAGCAATCAAATCGGGAAAGCTGCGTCCAACCAATGAGTGTGTAACAC
AGAAGCTACAGATTCTAGGCTCTTATGGATGGGAACCATCTTCTTTCACAGCTCTTGCGC
AGCAGTACGTGCGCATGAAGAAAACATACGGTGGTAAAGTGGTTCCTGGAGCAATGGACA
CAGCTGCTGCTAAGCATTTGTCTCATGCCTATGGTTCAATGGCTGACAGGGTCGCCACCA
T
TGC

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2GC49JQ 692 0 0
TATCGAAGTATGGCGGAAGATGCGGTCGATGCAGCAATCAAATCGGGAAAGCTGCGTCCA
ACCAATGAGTGTGTAACACAGAAGCTACAGATTCTAGGCTCTTATGGATGGGAACCATCT
TCTTTCACAGCTCTTGCGCAGCAGTACGTGCGCATGAAGAAAACATACGGTGGTAAAGTG
GTTCCTGGAGCAATGGACACAGCTGCTGCTAAGCATTTGTCTCATGCCTATGGTTCAATG
GCTGACAGGGTCGCCACCATTGCTCAGGAGGAGGGTTTGGGGAAACGATTGGCACATGGA
CATCCGTTTCTGGAAGCAGAGGTTGCTTACTGTGCAAGGCACGAGTACTGCGAATCAGCT
GTTGATTTTATAGCAAGGAGATGTAGAATAGCGTTCTTGGACACAAACGCAGCGGCGAGG
GCGTTGCAGCGTGTGGTGGAGATTCTAGCGAGTGAACACAAGTGGGACAAGTCGAGGGAG
AAGCAGGAGTTGCAGAAGGCTAAAGAGTTTCTTCAAACTTTCAAGTCTTCCAAAAACGCA
CAGTTTAACGACGGCAAACACAACTAAAAGCTCTGCCTCTGAGCAAAAGCTTTAAACTAC
TCTAATTGAATTTATTATTTTCTTCTATTTTTCAACTGTTGGCTCTTGGGTAGCCACTGG
CGACAAGAAATAAAATGCTGCTATACGGATGG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2BP39TF 620 0 0
GGGAACCATCTTCTTTCACAGCTCTTGCGCAGCAGTACGTGCGCATGAAGAAAACCTATG
GTGGTAAAGTGGTTCCTGGAGCAATGGACACAGCTGCTGCTAAGCATTTGTCTCATGCCT
ATGGTTCAATGGCTGACCGAGTCGCAACCATAGCTCAGGAGGAGGGTTTGGGGAAACGGT
TGGCACATGGACATCCGTTTCTGGAAGCAGAGGTTGCTTACTGTGCAAGGCACGAGTACT
GCGAGTCAGCGGTTGATTTCATAGCAAGGAGATGTAGAATAGCGTTCTTGGACACAGACG
CAGCGGCAAGGGCGTTGCAGCGTGTGGTGGAGATTCTAGCGAGTGAACACAAGTGGGACA
AGTCGAGGGAGAAGCAGGAGTTGCAGAAGGCTAAAGAGTTTCTTCAAACTTTCAAGTCTT
CCAAAAACGCACAGTTTAACGACGGCAAACACAACTAAAAGCCCTGCCTCTGAGCAAAAG
CTTTAAACTACTCTAATTGAATTTATTATTTTCTTCTATTTTTCAACTGTTGGCTCTTGG
GTAGCCACTGGCGACAAGAAATAAAATGCTGCTATACGGATGGAATAATACTGCGACTAC
TGAAGTGATTAAACACTTTC

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL3572Contig1 1056 2 6 U
GGATCATCATCAACAATCACTTGCAGCAGCAGCCATAACCTAAACAAACAAATACCTTTC
CCCTCCTTATCTCTCCCTCTCACTGATGGCCTCCAAGGCACTCTCTTCTTTCAGCGCTAA
GCCCGGTGTGTCGCTACTCCCCCATGGCGTCACCTCCTCTGCTGCATCTCCGTCTGTGAT
GCCTATCGGCTTCCCAGACATAATACGGGGGGCAGGGGAGTGGTGGTTGCGTCCTCAACG
GTAGACACAAACAATATGCCGATGACGGGAGTGGTGTTCCAGCCGTTCGAGGAGGTGAAG
AAAGCAGATCTGGCCATTCCAATCACTTCTCACGCCTCCCTCGCTCGCCAGAGGTATGCC
GACGCTAGCGAGGCTGCCATTAACGAGCAAATCAATGTGGAATACAACGTGTCGTATGTG
TACCATTCAATGTACGCCTACTTCGACAGAGACAACGTTGCTCTCAAGGGTCTTGCCAAA
TTTTTCAAGGAATCAAGTGATGAAGAAAGAGAGCACGCAGAGAAGTTTATGGAGTACCAG
AACAAAAGGGGAGGAAGAGTGAAACTCCACCCGATCGTCTCCCCTGTCTCTGATTTCGAA
CATGCTGAAAAAGGAGATGCTTTATATGCAATGGAGTTGGCCCTTTCTCTGGAGAAACTT
ACCAACGAGAAGCTTCTAAACCTTCGCAGAGTGGCATCAGAGAACAATGATCCCCAGTTA
GCTGATTTCGTTGAGAGTGAGTTTCTTGGAGAGCAGATTGAAGCAATCAAGAAGATCTCA
GACTTCATCACCCAGCTAAGGATGGTTGGCAAAGGACACGGAGTGTGGCACTTCGACCAG
ATGCTTTTGAACTAGACTGGGACCTCGCCTTTATGCTCTGGGGAGATTATTAAAAGACAA
GAAACCGAAGAAGATTCTGTAAAAGTTTCTAGAGTGGAAGTTATTATTTGGAGCAAAAAT
AAAAGATTGTAGTAGTAATAGTAGTAAGCTTTTGTGTGTTAAGATGATGGTTTTTGTAAT
AATTTCTTGAGTTTAATCTATGAATGTGTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D577TF U 1
AF RR2D577JQ C 238
BS 1 761 RR2D577TF
BS 762 762 RR2D577JQ
BS 763 769 RR2D577TF
BS 770 772 RR2D577JQ
BS 773 792 RR2D577TF
BS 793 1056 RR2D577JQ

RD RR2D577TF 793 0 0
GGATCATCATCAACAATCACTTGCAGCAGCAGCCATAACCTAAACAAACAAATACCTTTC
CCCTCCTTATCTCTCCCTCTCACTGATGGCCTCCAAGGCACTCTCTTCTTTCAGCGCTAA
GCCCGGTGTGTCGCTACTCCCCCATGGCGTCACCTCCTCTGCTGCATCTCCGTCTGTGAT
GCCTATCGGCTTCCCAGACATAATACGGGGGGCAGGGGAGTGGTGGTTGCGTCCTCAACG
GTAGACACAAACAATATGCCGATGACGGGAGTGGTGTTCCAGCCGTTCGAGGAGGTGAAG
AAAGCAGATCTGGCCATTCCAATCACTTCTCACGCCTCCCTCGCTCGCCAGAGGTATGCC
GACGCTAGCGAGGCTGCCATTAACGAGCAAATCAATGTGGAATACAACGTGTCGTATGTG
TACCATTCAATGTACGCCTACTTCGACAGAGACAACGTTGCTCTCAAGGGTCTTGCCAAA
TTTTTCAAGGAATCAAGTGATGAAGAAAGAGAGCACGCAGAGAAGTTTATGGAGTACCAG
AACAAAAGGGGAGGAAGAGTGAAACTCCACCCGATCGTCTCCCCTGTCTCTGATTTCGAA
CATGCTGAAAAAGGAGATGCTTTATATGCAATGGAGTTGGCCCTTTCTCTGGAGAAACTT
ACCAACGAGAAGCTTCTAAACCTTCGCAGAGTGGCATCAGAGAACAATGATCCCCAGTTA
GCTGATTTCGTTGAGAGTGAGTTTCTTGGAGAGCAGATTGA*GCAATCA**GAGATCTCA
GACTTCATCACC
A

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2D577JQ 819 0 0
ACGGTAGACACAAACAATATGCCGATGACGGGAGTGGTGTTCCAGCCGTTCGAGGAGGTG
AAGAAAGCAGATCTGGCCATTCCAATCACTTCTCACGCCTCCCTCGCTCGCCAGAGGTAT
GCCGACGCTAGCGAGGCTGCCATTAACGAGCAAATCAATGTGGAATACAACGTGTCGTAT
GTGTACCATTCAATGTACGCCTACTTCGACAGAGACAACGTTGCTCTCAAGGGTCTTGCC
AAATTTTTCAAGGAATCAAGTGATGAAGAAAGAGAGCACGCAGAGAAGTTTATGGAGTAC
CAGAACAAAAGGGGAGGAAGAGTGAAACTCCACCCGATCGTCTCCCCTGTTTCTGATTTC
GAACATGCTGAAAAAGGAGATGCTTTATATGCAATGGAGTTGGCCCTTTTTCTGGAGAAA
CTTACCAACGAGAAGCTTTTAAACCTTCGCAGAGTGGCATCAGAGAACAATGATCCCCAG
TTAGCTGATTTCGTTGAGAGTGAGTTTCTTGGAGAGCAGATTGAAGCAATCAAGAAGATC
TCAGACTTCATCACCCAGCTAAGGATGGTTGGCAAAGGACACGGAGTGTGGCACTTCGAC
CAGATGCTTTTGAACTAGACTGGGACCTCGCCTTTATGCTCTGGGGAGATTATTAAAAGA
CAAGAAACCGAAGAAGATTCTGTAAAAGTTTCTAGAGTGGAAGTTATTATTTGGAGCAAA
AATAAAAGATTGTAGTAGTAATAGTAGTAAGCTTTTGTGTGTTAAGATGATGGTTTTTGT
AATAATTTCTTGAGTTTAATCTATGAATGTGTTTTTTTT

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 3

CO CL3573Contig1 969 3 16 U
CCTCTGTCACATGTTTCACATATTTTCGAAAATAAAGAAATAAAAACAGAGAAGTAACAA
AATAAATAAAGGTTTTAGCTCGTTTCGAATAAGAAAAAATAACAACATTTTGTAATTATT
ATATTGTTTCACAAATTGCAGAAAACGTTTTCATCTGAGAATATTAAACCGAATATTACT
AATTCGGTAATTCCACATAAACCAGCTCCAACAGCTCCAACAGTAATCTCTTAGCAGAAG
AACATTCTGGATCAGACGGAGAGTTCGGTCTTGGAGATCAAGATACCATCACTATCAGCA
TAAAGCCATTCACCATCTCTAATCAAAGTCCCTCCAATATAAACCGGCACATTCTTCTCA
CCCTGACCTTTCTTACTAGACTTCAACGGGTTAGAACCCAATGCCCTAACCCCAACATCA
CAGTCATTGATTTCATCCACATCTCTAACGCACCCATTCACCAAAATCCCTACCCACCCG
TTGTTCTGAGCTAACTGTCCGAGGTTTCCTCCAACAAGCGCGCATCTCATGCTTCCACCA
CCGTCTATAACTAAGACTGCGCCTTCTCCTTTTGTCTCTAGTTGGTTTCTGACTAGGACG
TTGTCTTCAAAGACCTTGAGTGTCACGATTGGTCCGGAGAAGCATCTTCTTTGGCCATAG
ATCTTGAAGATTGGTTGGAGAGCCCGTAGGTCTCCGTTTGATATTAGTTCTGCGTTGCTG
TCACACGCTTCTGCGGTTGCAAATGCAGCCATGGGAGATTGTATTCACGCGTCTCGTGTG
TGTGTATGTGTTCAAGGAAAGAGAGAAGGGCTTCCAAAGATTCTTAAACGGCGATTGTAT
ATACAAGTAAGTAACGGGTAAGATCAGCTTTCTCGTGTCAGGCTATCCAACGCACTGAAA
AATCCTCATAGAAACTTGTGCCATTACAGCCACTTGGTCTCCTATCGTGCCATTTACAGC
CACTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF69JQ U 45
AF RR2EE34JQ U 1
AF RR2FF69TF C 173
BS 1 300 RR2EE34JQ
BS 301 301 RR2FF69JQ
BS 302 324 RR2EE34JQ
BS 325 325 RR2FF69JQ
BS 326 410 RR2EE34JQ
BS 411 411 RR2FF69JQ
BS 412 431 RR2EE34JQ
BS 432 432 RR2FF69JQ
BS 433 452 RR2EE34JQ
BS 453 453 RR2FF69JQ
BS 454 578 RR2EE34JQ
BS 579 579 RR2FF69JQ
BS 580 599 RR2EE34JQ
BS 600 600 RR2FF69JQ
BS 601 683 RR2EE34JQ
BS 684 969 RR2FF69TF

RD RR2FF69JQ 566 0 0
G
ACAGAGAGGTAACAAAATAAATAAAGGTTTTAGCTCGTTTCGAATAAGAAAAAATAACAA
CATTTTGTAATTATTATATTGTTTCACAAATTGCAGAAAACGTTTTCATCTGAGAATATT
AAACCGAGTATTACTAATTCGGTAATTCCACATAAACCAGCTCCAACAGCTCCAACAGTA
ATCTCTTAGCAGAAGAACATTCTGGATCAGACGGAGAGTTCGGTCTTGGAGATCAAGATA
CCATCACTATCAGCATAAAGCCATTCACCATCTCTAATCAAAGTCCCTCCAATATAAACC
GGCACATTCTTCTCACCCTGACCTTTCTTACTAGACTTCAACGGGTTAGAACCCAATGCC
CTAACCCCAACATCACAGTCATTGATTTCATCCACATCTCTAACGCACCCATTCACCAAA
ATCCCTACCCACCCGTTGTTCTGAGCTAACTGTCCGAGGTTTCCTCCAACAAGCGCGCAT
CTCATGCTTCCACCACCGTCTATAACTAAGACTGCGCCTTCTCCTTTTGTCTCTAGTTGG
TTTCTGACTAGGACGTTGTCTTCAA

QA 2 566 2 566
DS 

RD RR2EE34JQ 684 0 0
CCTCTGTCACATGTTTCACATATTTTCGAAAATAAAGAAATAAAAACAGAGAAGTAACAA
AATAAATAAAGGTTTTAGCTCGTTTCGAATAAGAAAAAATAACAACATTTTGTAATTATT
ATATTGTTTCACAAATTGCAGAAAACGTTTTCATCTGAGAATATTAAACCGAATATTACT
AATTCGGTAATTCCACATAAACCAGCTCCAACAGCTCCAACAGTAATCTCTTAGCAGAAG
AACATTCTGGATCAGACGGAGAGTTCGGTCTTGGAGATCAAGATACCATCACTATCAGCA
CAAAGCCATTCACCATCTCTAATCGAAGTCCCTCCAATATAAACCGGCACATTCTTCTCA
CCCTGACCTTTCTTACTAGACTTCAACGGGTTAGAACCCAATGCCCTAACTCCAACATCA
CAGTCATTGATCTCATCCACATCTCTAACGCATCCATTCACCAAAATCCCTACCCACCCG
TTGTTCTGAGCTAACTGTCCGAGGTTTCCTCCAACAAGCGCGCATCTCATGCTTCCACCA
CCGTCTATAACTAAGACTGCGCCTTCTCCTTTTGTCTCAAGTTGGTTTCTGACTAGGACA
TTGTCTTCAAAGACCTTGAGTGTCACGATTGGTCCGGAGAAGCATCTTCTTTGGCCATAG
ATCTTGAAGATTGGTTGGAGAGC
T

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2FF69TF 797 0 0
AGTA
TACTAATTCGGTA*TTCCACATAA*CCAGCTCCAACAGCTCCAACAGTA*TCTCTTAGCA
GAAGAACATTCTGGATCAGACGGAGAGTTCGGTCTTGGAGATCAAGATACCATCACTATC
AGCATAAAGCCATTCACCATCTCTAATCAAAGTCCCTCCAATATAAACCGGCACATTCTT
CTCACCCTGACCTTTCTTACTAGACTTCAACGGGTTAGAACCCAATGCCCTAACCCCAAC
ATCACAGTCATTGATTTCATCCACATCTCTAACGCACCCATTCACCAAAATCCCTACCCA
CCCGTTGTTCTGAGCTAACTGTCCGAGGTTTCCTCCAACAAGCGCGCATCTCATGCTTCC
ACCACCGTCTATAACTAAGACTGCGCCTTCTCCTTTTGTCTCTAGTTGGTTTCTGACTAG
GACGTTGTCTTCAAAGACCTTGAGTGTCACGATTGGTCCGGAGAAGCATCTTCTTTGTCC
ATAGATCTTGAAGATTGGTTGGAGAGCCCGTAGGTCTCCGTTTGATATTAGTTCTGCGTT
GCTGTCACACGCTTCTGCGGTTGCAAATGCAGCCATGGGAGATTGTATTCACGCGTCTCG
TGTGTGTGTATGTGTTCAAGGAAAGAGAGAAGGGCTTCCAAAGATTCTTAAACGGCGATT
GTATATACAAGTAAGTAACGGGTAAGATCAGCTTTCTCGTGTCAGGCTATCCAACGCACT
GAAAAATCCTCATAGAAACTTGTGCCATTACAGCCACTTGGTCTCCTATCGTGCCATTTA
CAGCCACTTGTCC

QA 5 797 5 797
DS 



AS 1 3

CO CL3574Contig1 976 3 7 U
GGGTCTCTCGATTACGCTGCGACTTGATAATTCTCAGCGAGTGGAGATTTAAGAACTGAA
TCATCCATCATCAGTGAGTCTCCTCCGTCCGATCGATCGAGTTAGGTAGGGATGGGGAGT
AACAACGGGGAATTGAAGTACGAGACCTCGCAGAACGCGTACATCAAACTCGTTCTCCAC
TCGCTGCGTCACAAGACGGCGGCGGCCAACGGAGTCCTCGTCGGTCGAATCAGCCCTAAG
GACGAAGGCCTCGTGGAGATCTCCGATTCCGTGCCGCTCTTTCACTCTAACCTCGCTCTC
CTTCCTCCTCTCGAGATCTCCCTCATCATGATAGAGGAGCATTACGTGGCTCAAGGTTTG
AGTATTGTTGGCTACTTTCACGCCAACGAGAGGTTCGATGATGTGGAGCTCTGTGGTGTG
GCTAAGAACATTGGTGATCACATCTCTCGCTATTTCCCTCCTGCACCTATTCTCTTGTTG
AATAACAAAAAGCTTGAAGCCTTATCAAAGGGTAAAGATCGAAGCCCTGTGATGCAGCTT
TGTGTGAAAGATGCTTCCAAGAACTGGAGAGTGGTTGGAGCAGATGGAGGAAGCAAGCTA
CTCTTGAAAGAGCCCTCGGCCAATGTAGTTTTGTCAGATTACATTTCATCTGAGAAATGG
AAGGACGTCACAGATGTTGATGATCATCTTGATGATATCACCAAGGACTGGCTAAACCCT
GGACTTTTCAACTGAAGTCTACGGGTAATGCGATATAGTTTTCCTTTCATAATCTTCAGT
CGAGAAACACAAAAAAAAACTCTCGGACAACCTTGTTTACAGTCTTCATTGACTCTTGTT
CAAGAAATTACGCAGCGTAGCTCAACTTATTTAAATTTGTTATAAACCCTAGTTTTGAAT
GATATCTTTTGTGGATTGTCCTCGTGATCCAATTATTTCTCTTTGGTTCCACTTTGATCG
TCTAGTAGGAACTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G596TF U 1
AF RR2BS82TF U 8
AF RR2G596JQ C 379
BS 1 548 RR2G596TF
BS 549 663 RR2BS82TF
BS 664 664 RR2G596JQ
BS 665 705 RR2BS82TF
BS 706 706 RR2G596JQ
BS 707 721 RR2BS82TF
BS 722 976 RR2G596JQ

RD RR2G596TF 548 0 0
GGGTCTCTCGATTACGCTGCGACTTGATAATTCTCAGCGAGTGGAGATTTAAGAACTGAA
TCATCCATCATCAGTGAGTCTCCTCCGTCCGATCGATCGAGTTAGGTAGGGATGGGGAGT
AACAACGGGGAATTGAAGTACGAGACCTCGCAGAACGCGTACATCAAACTCGTTCTCCAC
TCGCTGCGTCACAAGACGGCGGCGGCCAACGGAGTCCTCGTCGGTCGAATCAGCCCTAAG
GACGAAGGCCTCGTGGAGATCTCCGATTCCGTGCCGCTCTTTCACTCTAACCTCGCTCTC
CTTCCTCCTCTCGAGATCTCCCTCATCATGATAGAGGAGCATTACGTGGCTCAAGGTTTG
AGTATTGTTGGCTACTTTCACGCCAACGAGAGGTTCGATGATGTGGAGCTCTGTGGTGTG
GCTAAGAACATTGGTGATCACATCTCTCGCTATTTCCCTCCTGCACCTATTCTCTTGTTG
AATAACAAAAAGCTTGAAGCCTTATCAAAGGGTAAAGATCGAAGCCCTGTGATGCAGCTT
TGTGTGAA

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2BS82TF 714 0 0
GG
GATTACGCTGCGACTTGATAATTCTCAGCGAGTGGAGATTTAAGAACTGAATCATCCATC
ATCAGTGAGTCTCCTCCGTCCGATCGATCGAGTTAGGTAGGGATGGGGAGTAACAACGGG
GAATTGAAGTACGAGATCTCGCAGAACGCGTACATCAAACTCGTTCTCCACTCGCTGCGT
CACAAGACGGCGGCGGTCAACGGAGTCCTCGTCGGTCGAATCAGCCCTAAGGACGAAGGC
CTCGTGGAGATCTCCGATTCCGTGCCGCTCTTTCACTCTAACCTCGCTCTCCTTCCTCCT
CTCGAGATCTCCCTCATCATGATAGAGGAGCATTACGTGGCTCAAGGTTTGAGTATTGTT
GGCTACTTTCACGCCAACGAGAGGTTCGATGATGTGGAGCTCTGTGGTGTGGCTAAGAAC
ATTGGTGATCACATCTCTCGCTATTTCCCTCCTGCACCTATTCTCTTGTTGAATAACAAA
AAGCTTGAAGCCTTATCAAAGGGTAAAGATCGAAGCCCTGTGATGCAGCTTTGTGTGAAA
GATGCTTCCAAGAACTGGAGAGTGGTTGGAGCAGATGGAGGAAGCAAGCTACTCTTGAAA
GAGCCCTCGGCCAATGTAGTTTTGTCAGATTACATTTCATCTGAGAAATGGAAG*ACGTC
ACAGATGTTGATGATCATCTTGATGATATCACCAAG*ACTGGCTAAACCCTG

QA 3 714 3 714
DS 

RD RR2G596JQ 598 0 0
CACGCCAACGAGAGGTTCGATGATGTGGAGCTCTGTGGTGTGGCTAAGAACATTGGTGAT
CACATCTCTCGCTATTTCCCTCCTGCACCTATTCTCTTGTTGAATAACAAAAAGCTTGAA
GCCTTATCAAAGGGTAAAGATCGAAGCCCTGTGATGCAGCTTTGTGTGAAAGATGCTTCC
AAGAACTGGAGAGTGGTTGGAGCAGATGGAGGAAGCAAGCTACTCTTGAAAGAGCCCTCG
GCCAATGTAGTTTTGTCAGATTACATTTCATCTGAGAAATGGAAGGACGTCACAGATGTT
GATGATCATCTTGATGATATCACCAAGGACTGGCTAAACCCTGGACTTTTCAACTGAAGT
CTACGGGTAATGCGATATAGTTTTCCTTTCATAATCTTCAGTCGAGAAACACAAAAAAAA
ACTCTCGGACAACCTTGTTTACAGTCTTCATTGACTCTTGTTCAAGAAATTACGCAGCGT
AGCTCAACTTATTTAAATTTGTTATAAACCCTAGTTTTGAATGATATCTTTTGTGGATTG
TCCTCGTGATCCAATTATTTCTCTTTGGTTCCACTTTGATCGTCTAGTAGGAACTTGC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 3

CO CL3575Contig1 717 3 7 U
GGGGTTTGGATGTTTTGAATGAAAGAATATGTCAAATATTCTTGTTACGTTTATCCTTAT
CGTATATTCCTCTGTTTCTATATTCCCTCCTTGTCTTGAGGATCTACAACTGTAACTAGT
TTATATTGGATCCTCCATGTACGTTTGTGATAAGGTGAGTAAATACAAGCTTTCATTGAA
TAATTTTAGCAGACATGGCAGCGATTTACAGCCTTTACATAATCAACAAATCTGGTGGTT
TGATTTTCTACAAGGACTGTGGAACAAAGGGAAGGATGGATACGAATGATAGCTTGAGGG
TAGCCAGTTTATGGCACTCAATGCACGCCATTTCTCAGCAGCTTTCTCCTGTTAATGGCT
GTTCTGGCATCGACCTTCTCCAAGCTGATACCTTTGATCTCCATTGCTTCCAGTCTCTCC
CAGGAACAAAGTTCTTTGTGGTCTGTGAACCTGGAACCCCCCACATGGAGAACCTCCTCA
GATACATTTATGAACTCTACACCGACTATGTCCTGAAGAATCCTTTCTATGAGATTGAGA
TGCCTATTCGTTGCGAGCTTTTCGACATCAACCTTTCTCAAGCTGTTCAGTCTGACCGCG
TTGCTCTCTTAGGACGATGACCACTAGATTGATTCTCTCACTTCTTTGCCTTTTGTATGT
GACATTTTGTGTCTGAACATTGCAACAAAACCCATCATTTTTTTTCTGTGTTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY46TF U 1
AF RR2DY46JQ C 229
AF RR2BM60TF U 156
BS 1 612 RR2DY46TF
BS 613 613 RR2BM60TF
BS 614 676 RR2DY46TF
BS 677 677 RR2BM60TF
BS 678 689 RR2DY46TF
BS 690 690 RR2BM60TF
BS 691 717 RR2DY46TF

RD RR2DY46TF 717 0 0
GGGGTTTGGATGTTTTGAATGAAAGAATATGTCAAATATTCTTGTTACGTTTATCCTTAT
CGTATATTCCTCTGTTTCTATATTCCCTCCTTGTCTTGAGGATCTACAACTGTAACTAGT
TTATATTGGATCCTCCATGTACGTTTGTGATAAGGTGAGTAAATACAAGCTTTCATTGAA
TAATTTTAGCAGACATGGCAGCGATTTACAGCCTTTACATAATCAACAAATCTGGTGGTT
TGATTTTCTACAAGGACTGTGGAACAAAGGGAAGGATGGATACGAATGATAGCTTGAGGG
TAGCCAGTTTATGGCACTCAATGCACGCCATTTCTCAGCAGCTTTCTCCTGTTAATGGCT
GTTCTGGCATCGACCTTCTCCAAGCTGATACCTTTGATCTCCATTGCTTCCAGTCTCTCC
CAGGAACAAAGTTCTTTGTGGTCTGTGAACCTGGAACCCCCCACATGGAGAACCTCCTCA
GATACATTTATGAACTCTACACCGACTATGTCCTGAAGAATCCTTTCTATGAGATTGAGA
TGCCTATTCGTTGCGAGCTTTTCGACATCAACCTTTCTCAAGCTGTTCAGTCTGACCGCG
TTGCTCTCTTAG*ACGATGACCACTAGATTGATTCTCTCACTTCTTTGCCTTTTGTATGT
GACATTTTGTGTCTGA*CATTGCAACAAA*CCCATCATTTTTTTTCTGTGTTGTTTC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2DY46JQ 453 0 0
AAAT
TGGTGGTTTGATTTTCTACAAGGACTGTGGAACAAAGGGAAGGATGGATA*GAATGATAG
CTTGAGGGTAGCCAGTTTATGGCACTCAATGCACGCCATTT*TCAGCAGCTTTCTCCTGT
TAATGGCTGTTCTGGCATCGACCTTCTCCAAGCTGATACCTTTGATCTCCATTGCTTCCA
GTCTCTCCCAGGAACAAAGTTCTTTGTGGTCTGTGAACCTGGAACCCCCCACATGGAGAA
CCTCCTCAGATACATTTATGAACTCTACACCGA*TATGTCCTGAAGAATCCTTT*TATGA
GATTGAGATGCCTATTCGTTGCGAGCTTTT*GACATCAACCTTTCTCAAGCTGTTCAGTC
TGACCGCGTTGCTCTCTTAGGACGATGACCACTAGATTGATTCTCTCACTTCTTTGCCTT
TTGTATGTGACATTTTGTGT
TGAACATTG

QA 5 444 5 444
DS 

RD RR2BM60TF 550 0 0
G
GAGTAAATACAAGCTTTCATTGAATAATTTTAGCAGACATGGCAGCGATTTACAGCCTTT
ACATAATCAACAAATCTGGTGGTTTGATTTTCTACAAGGACTGTGGAACAAAGGGAAGGA
TGGATACGAATGATAGCTTGAGGGTAGCCAGTTTATGGCACTCAATGCACGCCATTTCTC
AGCAGCTTTCTCCTGTTAATGGCTGTTCTGGCATCGACCTTCTCCAAGCTGATACCTTTG
ATCTCCATTGCTTCCAGTCTCTCCCAGGAACAAAGTTCTTTGTGGTCCGTGAACCTGGAA
CCCCCCACATGGAGAACCTCCTCAGATACATTTATGAACTCTACACCGACTATGTCCTGA
AGAATCCTTTCTATGAGATTGAGATGCCTATTCGTTGCGAGCTTTTCGACATCAACCTTT
CTCAAGCTGTTCAGTCTGACCGCGTTGCTCTCTTAGGACGATGACCACTAGATTGATTCT
CTCACTTCTTTGCCTTTTGTATGTGACATTTTGTGTCTGAACATTGCAACAAAACCCATC
ATTTTTTTT

QA 2 550 2 550
DS 



AS 1 3

CO CL3576Contig1 803 3 2 U
GGGATTTTAATCCTCTCTTCTCTTCCACTCAGGGTTTAAGCGCCTCTATAGGATAAACCT
CACCGCCTTCTTGAGCTACCTCATCCCGTCGAGCTAATCTTCTCTCTCAGAAGCGTGAGT
AATGAGGAAGCTCAAGTACCATGAGAAGAAGGTTCTGAAGAAAGTAAATTTCCTGGAATG
GAAAAGAGAACGTGGTCATCTCGAAAACCTCATCACGGGTCGTTACCACATGGGTGGTCG
TGACGACTACAAAAAATATTCAGGATTGAGTAGGATGGTGCAGAAGCTGACGAATGTATT
GAAACAGATGGATGCAACTGATCCTTTTCGTATTCAGATGACTGATAACCTTCTCGAGAA
GCTATACAACATGGGAGTTATACCGACTAGGAAAAGCTTGGCTTTAACTGATCGGTTATC
AGTTTCCTCCTTCTGTAGGCGTAGGCTATCGACTGTACTGGTTCACCTCAAGTACGCAGA
GCACTTGAAAGAAGCTGTGACATACATAGAGCAAGGACACATTCGTGTAGGACCAGACAC
TATCACTGATCCAGCCTTCTTAGTAACTCGGAACATGGAAGATTTCATCACCTGGGTTGA
TTCTTCCAAGATCAAACGCAAGGTGCTTCAGTACAATGACAAGTTGGATGATTACGACAT
GATGCTTGCTTAACTCAACTCTCTCTTAAGAGAATATTTGTCTTGCTTCTCAAAAGTGTA
AACCTTTTTTTCTATTGCCAAACTAT**GTTTTCATTACTTATCAAACCTTTTGCAATAG
AGTAATCTCAAAAAAGTTGCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY43TFB U 1
AF RR2E786TF U 45
AF RR2AY43JQ C 98
BS 1 787 RR2AY43TFB
BS 788 803 RR2AY43JQ

RD RR2AY43TFB 789 0 0
GGGATTTTAATCCTCTCTTCTCTTCCACTCAGGGTTTAAGCGCCTCTATAGGATAAACCT
CACCGCCTTCTTGAGCTACCTCATCCCGTCGAGCTAATCTTCTCTCTCAGAAGCGTGAGT
AATGAGGAAGCTCAAGTACCATGAGAAGAAGGTTCTGAAGAAAGTAAATTTCCTGGAATG
GAAAAGAGAACGTGGTCATCTCGAAAACCTCATCACGGGTCGTTACCACATGGGTGGTCG
TGACGACTACAAAAAATATTCAGGATTGAGTAGGATGGTGCAGAAGCTGACGAATGTATT
GAAACAGATGGATGCAACTGATCCTTTTCGTATTCAGATGACTGATAACCTTCTCGAGAA
GCTATACAACATGGGAGTTATACCGACTAGGAAAAGCTTGGCTTTAACTGATCGGTTATC
AGTTTCCTCCTTCTGTAGGCGTAGGCTATCGACTGTACTGGTTCACCTCAAGTACGCAGA
GCACTTGAAAGAAGCTGTGACATACATAGAGCAAGGACACATTCGTGTAGGACCAGACAC
TATCACTGATCCAGCCTTCTTAGTAACTCGGAACATGGAAGATTTCATCACCTGGGTTGA
TTCTTCCAAGATCAAACGCAAGGTGCTTCAGTACAATGACAAGTTGGATGATTACGACAT
GATGCTTGCTTAACTCAACTCTCTCTTAAGAGAATATTTGTCTTGCTTCTCAAAAGTGTA
AACCTTTTTTTCTATTGCCAAACTAT**GTTTTCATTACTTATCAAACCTTTTGCAATAG
AGTAATC
TC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2E786TF 748 0 0
GGAAGCGCCTC
AACCTCACCGCCTTCTTGAGCTACCTCATCCCGTCGAGCTAATCTTCTCTCTCAGAAGCG
TGAGTAATGAGGAAGCTCAAGTACCATGAGAAGAAGGTTCTGAAGAAAGTTAATTTCCTG
GAATGGAAAAGAGAACGTGGTCATCTCGAAAACCTCATCACGGGTCGTTACCACATGGGT
GGTCGTGACGACTACAAAAATTATTCAGGATTGAGTAGGATGGTTCAGAAGCTGACGAAT
GTATTGAAACAGATGGATGCAACTGATCCTTTTCGTATTCAGATGACTGATAACCTTCTC
GAGAAGCTATACAACATGGGAGTTATACCGACTAGGAAAAGCTTGGCTTTAACTGATCGG
TTATCAGTCTCCTCCTTCTGTAGGCGTAGGCTATCAACTGTGCTGGTTCACCTCAAGTAC
GCAGAGCACTTGAAAGAAGCTGTGACATACATAGAGCAAGGACACATTCGTGTAGGACCA
GACACTATCACTGATCCAGCCTTCTTAGTAACTCGGAACATGGAAGATTTCATCACTTGG
GTTGATTCTTCCAAGATCAAACGCAAGGTGCTTCAGTACAATGACAAGTTGGATGATTAC
GACATGATGCTTGCTTAACTCAACTCTCTCTTACGATAATATTTGTCTTGCTTCTCAAAA
GTGTAAACCTTTTTCTCTATTGCCAAACTATATGTTTTCATTACTTATCAAACCTTTTGC
AATAGAGTAATC
AAAAA

QA 12 743 12 743
DS 

RD RR2AY43JQ 706 0 0
TCTTCTCTCTCAGAAGCGTGAGTAATGAGGAAGCTCAAGTACCATGAGAAGAAGGTTCTG
AAGAAAGTAAATTTCCTGGAATGGAAAAGAGAACGTGGTCATCTCGAAAACCTCATCACG
GGTCGTTACCACATGGGTGGTCGTGACGACTACAAAAAATATTCAGGATTGAGTAGGATG
GTGCAGAAGCTGACGAATGTATTGAAACAGATGGATGCAACTGATCCTTTTCGTATTCAG
ATGACTGATAACCTTCTCGAGAAGCTATACAACATGGGAGTTATACCGACTAGGAAAAGC
TTGGCTTTAACTGATCGGTTATCAGTTTCCTCCTTCTGTAGGCGTAGGCTATCGACTGTA
CTGGTTCACCTCAAGTACGCAGAGCACTTGAAAGAAGCTGTGACATACATAGAGCAAGGA
CACATTCGTGTAGGACCAGACACTATCACTGATCCAGCCTTCTTAGTAACTCGGAACATG
GAAGATTTCATCACCTGGGTTGATTCTTCCAAGATCAAACGCAAGGTGCTTCAGTACAAT
GACAAGTTGGATGATTACGACATGATGCTTGCTTAACTCAACTCTCTCTTAAGAGAATAT
TTGTCTTGCTTCTCAAAAGTGTAAACCTTTTTTTCTATTGCCAAACTAT**GTTTTCATT
ACTTATCAAACCTTTTGCAATAGAGTAATCTCAAAAAAGTTGCCCC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL3577Contig1 1364 2 8 U
GGAGAAACCCCTTTTCTCCGTTGAATCTCACACTCTGCTCCCCGATTCTTCAGTCGGAAT
CGTCTTTCTCGCTCGCTCTGGGGGCTATTTCGCTCTGAAAGAATCTTTTGGGTTCTTCTT
AATTCGGTTTCTGGGGACTGATTCTGTGGGATGCGAGTGGAAGAGGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGATAAGATGGTGCCTCAAGGAGACGGTGAAGTGGTAGTTGATACGGCGTCGTCTCAA
CAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGGAGAGACTCGTTATAGGGTATGCTTTGACGTCTAAGAAG
AAGCAGAGTTTCTTGCAACCCAAGCTTGAACTTCTTGCTAGGAAGAAAGGCATATCCTTT
GTTTCCATTGACCAGGACAAGCCTCTCTCTGAACAAGGCCCCTTTGATGTTGTTCTCCAT
AAGTTACTGGGAAATGAGTGGCACCATGTTATTCAGGATTACCAGCAAAAGCATCCAGAA
GTGACCGTACTTGATCCACCAGGTGCAATCCAGCGTATATATAATCGACAATCTATGCTC
CAGGGTCTTGCTGATTTAAATCTTGCTGAATGCGACGGCATGATATGTGTTCCGAAACAA
ATGGTTGTGTTACAAGATACAACATCTAGTGCTAATGAAGTTGCAAAAGCCGGTCTCAAG
TTCCCACTTGTTGCAAAGCCACTTTTGGTCGATGGAACTGCAAAGTCACATCAGCTGTTC
TTAGCCTATGACTGTCTCTCGCTTGCAGAACTAGAACCCCCTTTGGTTCTTCAAGAATTT
GTAAACCATGGTGGAGTTCTCTTCAAGGTTTTTGTTGTTGGTGATGTGATAAGGGTAGTC
CGACGTTTCTCTCTACCGAATGTAAGCAATGTTGGAAAGGAGAAAGTTGCTGGTGTGTTT
CAATTCCCAAGGGTATCGTCTGCCGCAGCTTCAGTTGACAAAACAGACTTGGACCCTCGT
GTTGCTGAGCTACCTCCGAAGCCATTACTCGAAGAGCTTGTGAGAGAATTACGTAGCCGA
TTGGGACTCAGGTTGTTCAACATAGACATGATCAGAGAACATGGGAGCCAAGATGTGTTT
ATGTCATTGACATAAACTATTTTCCTGGGTATGGAAAGATGCCAGATTACGAGCAGGTAT
TCATTGATTTCTTCCTCGGTCTGGCGCAAGCGAAGCATGAGAAGGGACTTTGTGTGAAAA
GTGGAATAGGAATGTGAAAGGAGGTTGAAAGTGATAGATGATACGCTTGCGTTCTGAAAT
ATTGTGTTGAGATGATAGCTATGTACAGAAAATAGCTCTTTTTATGTTGCTAGCAGTAGC
AGATAAAAACAAGTTTTGATTAGTGATATACAACTGTGCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY54TF U 1
AF RR2BS88JQ C 642
BS 1 662 RR2FY54TF
BS 663 663 RR2BS88JQ
BS 664 703 RR2FY54TF
BS 704 704 RR2BS88JQ
BS 705 714 RR2FY54TF
BS 715 715 RR2BS88JQ
BS 716 760 RR2FY54TF
BS 761 1364 RR2BS88JQ

RD RR2FY54TF 762 0 0
GGAGAAACCCCTTTTCTCCGTTGAATCTCACACTCTGCTCCCCGATTCTTCAGTCGGAAT
CGTCTTTCTCGCTCGCTCTGGGGGCTATTTCGCTCTGAAAGAATCTTTTGGGTTCTTCTT
AATTCGGTTTCTGGGGACTGATTCTGTGGGATGCGAGTGGAAGAGGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGATAAGATGGTGCCTCAAGGAGACGGTGAAGTGGTAGTTGATACGGCGTCGTCTCAA
CAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGGAGAGACTCGTTATAGGGTATGCTTTGACGTCTAAGAAG
AAGCAGAGTTTCTTGCAACCCAAGCTTGAACTTCTTGCTAGGAAGAAAGGCATATCCTTT
GTTTCCATTGACCAGGACAAGCCTCTCTCTGAACAAGGCCCCTTTGATGTTGTTCTCCAT
AAGTTACTGGGAAATGAGTGGCACCATGTTATTCAGGATTACCAGCAAAAGCATCCAGAA
GTGACCGTACTTGATCCACCAGGTGCAATCCAGCGTATATATAATCGACAATCTATGCTC
CAGGGTCTTGCTGATTTAAATCTTGCTGAATGCGACGGCATGATATGTGTTCCGAAACAA
ATGGTTGTGTTACAAGATACAACATCTAGTGCTAATGAAGTTGCAAAAGCCGGTCTCAAG
TTTCCACTTGTTGCAAAGCCACTTTTGGTCGATGGAACTGCAA*GTCACATCAGTTGTTC
TTAGCCTATGACTGTCTCTCGCTTGCAGAACTAGAACCCC
TT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2BS88JQ 723 0 0
TGCAAAAGCCGGTCTCAAGTTCCCACTTGTTGCAAAGCCACTTTTGGTCGATGGAACTGC
AAAGTCACATCAGCTGTTCTTAGCCTATGACTGTCTCTCGCTTGCAGAACTAGAACCCCC
TTTGGTTCTTCAAGAATTTGTAAACCATGGTGGAGTTCTCTTCAAGGTTTTTGTTGTTGG
TGATGTGATAAGGGTAGTCCGACGTTTCTCTCTACCGAATGTAAGCAATGTTGGAAAGGA
GAAAGTTGCTGGTGTGTTTCAATTCCCAAGGGTATCGTCTGCCGCAGCTTCAGTTGACAA
AACAGACTTGGACCCTCGTGTTGCTGAGCTACCTCCGAAGCCATTACTCGAAGAGCTTGT
GAGAGAATTACGTAGCCGATTGGGACTCAGGTTGTTCAACATAGACATGATCAGAGAACA
TGGGAGCCAAGATGTGTTTATGTCATTGACATAAACTATTTTCCTGGGTATGGAAAGATG
CCAGATTACGAGCAGGTATTCATTGATTTCTTCCTCGGTCTGGCGCAAGCGAAGCATGAG
AAGGGACTTTGTGTGAAAAGTGGAATAGGAATGTGAAAGGAGGTTGAAAGTGATAGATGA
TACGCTTGCGTTCTGAAATATTGTGTTGAGATGATAGCTATGTACAGAAAATAGCTCTTT
TTATGTTGCTAGCAGTAGCAGATAAAAACAAGTTTTGATTAGTGATATACAACTGTGCTT
CCC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 3

CO CL3578Contig1 908 3 8 U
GGATTCAAAACCAAACACCATACAACATGGATCATAAGACAAACACGACACTGCTTTTCT
CGCTCTTGTTTTTCATCACACACCTCACCAACGCGTTATCGAAAGATCTATGTAACCAAA
ACGACAAAAACACCCTCCTCAAGATCAAGAAGTCCCTAAACAACCCTTACCACCTCGCCT
CGTGGCACCCCGAAACCGACTGCTGCTCCTGGTACTGCCTCGAATGCGGCGACGCCACCG
TTAACTACCGCGTCATCTCCCTAACCATATTCGCCGGTCAGATATCCGGTCAGATCCCGC
CTGAAGTCGGTGACTTACCGTATCTTCAGAAACTTACGTTCCACAAGCTTACTAACATCA
CCGGTCAGATCCCATCCACCATCACCAAGCTCAAGCATCTTCGTTTTCTCACGCTTAGCA
GGTTGAACCTCACCGGCCCGGTTCCTGAGTTTCTGAATCAGCTCATGAATCTTGAATACT
TAAACCTTTCCTTCAATCAGCTTTCTGGTTCCATACCTAGCTCCCTTTCCTCGTTACCTA
AACTTACGGGCATTGATATTAGTAGGAATAAGCTTACAGGTACGATACCAGAGTCATTTG
GATCATTTGCAGCAGAAGTTCCTTACCTTATCTTATCACACAACCAGCTCTCCGGTTCGA
TACCCAAATCACTAG*AAACAATGATTTTCAAGATGGCTTCAATGTTAGCTACAACAGAC
TTTGTGGACCCATCCCCACTGGAGGCAGTCTTCAGAGATTTGATTATTATACGTATTTTC
ACAACAAGTGTTTGTGTGGTGCACCTCTTGATAGTTGCAAGTAAAAACCAAGCTTATGTC
TAGGGTTCCTAAAAAAAAAATGTAACATCATCTGGATTTGATTAAATAAAACATGTATCA
CATCTTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G102TF U 1
AF RR2H228TF U 1
AF RR2H228JQ C 159
BS 1 272 RR2G102TF
BS 273 273 RR2H228TF
BS 274 430 RR2G102TF
BS 431 433 RR2H228TF
BS 434 434 RR2G102TF
BS 435 435 RR2H228TF
BS 436 778 RR2G102TF
BS 779 908 RR2H228JQ

RD RR2G102TF 778 0 0
GGATTCAAAACCAAACACCATACAACATGGATCATAAGACAAACACGACACTGCTTTTCT
CGCTCTTGTTTTTCATCACACACCTCACCAACGCGTTATCGAAAGATCTATGTAACCAAA
ACGACAAAAACACCCTCCTCAAGATCAAGAAGTCCCTAAACAACCCTTACCACCTCGCCT
CGTGGCACCCCGAAACCGACTGCTGCTCCTGGTACTGCCTCGAATGCGGCGACGCCACCG
TTAACTACCGCGTCATCTCCCTAACCATATTCTCCGGTCAGATATCCGGTCAGATCCCGC
CTGAAGTCGGTGACTTACCGTATCTTCAGAAACTTACGTTCCACAAGCTTACTAACATCA
CCGGTCAGATCCCATCCACCATCACCAAGCTCAAGCATCTTCGTTTTCTCACGCTTAGCA
GGTTGAACCT***CTGCCCGGTTCCTGAGTTTCTGAATCAGCTCATGAATCTTGAATACT
TAAACCTTTCCTTCAATCAGCTTTCTGGTTCCATACCTAGCTCCCTTTCCTCGTTACCTA
AACTTACGGGCATTGATATTAGTAGGAATAAGCTTACAGGTACGATACCAGAGTCATTTG
GATCATTTGCAGCAGAAGTTCCTTACCTTATCTTATCACACAACCAGCTCTCCGGTTCGA
TACCCAAATCACTAG*AAACAATGATTTTCAAGATGGCTTCAATGTTAGCTACAACAGAC
TTTGTGGACCCATCCCCACTGGAGGCAGTCTTCAGAGATTTGATTATTATACGTATTT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2H228TF 759 0 0
GGATTCAAAACCAAACACCATACAACATGGATCATAAGACAAACACGACACTGCTTTTCT
CGCTCTTGTTTTTCATCACACACCTCACCAACGCGTTATCGAAAGATCTATGTAACCAAA
ACGACAAAAACACCCTCCTCAAGATCAAGAAGTCCCTAAACAACCCTTACCACCTCGCCT
CGTGGCACCCCGAAACCGACTGCTGCTCCTGGTACTGCCTCGAATGCGGCGACGCCACCG
TTAACTACCGCGTCATCTCCCTAACCATATTCGCCGGTCAGATATCCGGTCAGATCCCGC
CTGAAGTCGGTGACTTACCGTATCTTCAGAAACTTACGTTCCACAAGCTTACTAACATCA
CCGGTCAGATCCCATCCACCATCACCAAGCTCAAGCATCTTCGTTTTCTCACGCTTAGCA
GGTTGAACCTCACCGGCCCGGTTCCTGAGTTTCTGAATCAGCTCATGAATCTTGAATACT
TAAACCTTTCCTTCAATCAGCTTTCTGGTTCCATACCTAGCTCCCTTTCCTCGTTACCTA
AACTTACGGGCATTGATATTAGTAGGAATAAGCTTACAGGTACGATACCAGAGTCATTTG
GATCATTTGCAGCAGAAGTTCCTTACCTTATCTTATCACACAACCAGCTCTCCGGTTCGA
TACCCAAATCACTAG*AAACAATGATTTTCAAGATGGCTTCAATGTTAGCTACA*CAGAC
TTTGTGGACCCATCCCCACTGGAGGCAGTCTTCAGAGAT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2H228JQ 750 0 0
ACAACCCT
TTACCACCTCGCCTCGTGGCACCCCGAAACCGACTGCTGCTCCTGGTACTGCCTCGAATG
CGGCGACGCCACCGTTAACTACCGCGTCATCTCCCTAACCATATTCGCCGGTCAGATATC
CGGTCAGATCCCGCCTGAAGTCGGTGACTTACCGTATCTTCAGAAACTTACGTTCCACAA
GCTTACTAACATCACCGGTCAGATCCCATCCACCATCACCAAGCTCAAGCATCTTCGTTT
TCTCACGCTTAGCAGGTTGAACCTCACCGGCCCGGTTCCTGAGTTTCTGAATCAGCTCAT
GAATCTTGAATACTTAAACCTTTCCTTCAATCAGCTTTCTGGTTCCATACCTAGCTCCCT
TTCCTCGTTACCTAAACTTACGGGCATTGATATTAGTAGGAATAAGCTTACAGGTACGAT
ACCAGAGTCATTTGGATCATTTGCAGCAGAAGTTCCTTACCTTATCTTATCACACAACCA
GCTTTCCGGTTCGATACCCAAATCACTAGGAAACAATGATTTTCAAGATGGCTTCAATGT
TAGCTACAACAGACTTTGTGGACCCATCCCCACTGGAGGCAGTCTTCAGAGATTTGATTA
TTATACGTATTTTCACAACAAGTGTTTGTGTGGTGCACCTCTTGATAGTTGCAAGTAAAA
ACCAAGCTTATGTCTAGGGTTCCTAAAAAAAAAATGTAACATCATCTGGATTTGATTAAA
TAAAACATGTATCACATCTTGT

QA 9 750 9 750
DS 



AS 1 3

CO CL3579Contig1 766 3 3 U
TTTTTTTTTCTGATACGACACACTTGCACAACTCAATAATGTCAACAAACAGTACAACTA
CAACATATTCCCAAACTCACAGATCCTTTTATTTTATTTTGCAGCTACAGATAGATCAAA
GATAGTGAATTTTGATTTGTAAACAAAACAAAAGTACAGAGAGAGTCTTCAGGCCGCGGT
AAGATCTTCTTCTACAAATTTGGCAAACTCTTCCCTTGATCTCCCATCTGGATTCTTCTT
CCATTCGATGAACTTCTCTGACGCCTTTATGAACTTTTCCATGTGAAGCTTCTTCCATTC
CTCGAAATCCCATTCTCCATACATATCAGGATCATCCTTGTTAGCCCATACAAAGGTTTC
CACTTGCTTCTTCTCGGAAGTATCAGTCAATACAACTTCAACAGTCTTCCTCACGTATTC
ATCTCCTTCAATCATATCCAAATTCTCTAGCTGAGCATCTGTTAATCCAGTTAGTATCTT
TCCATTGATAAGTCCGTTCTCAGAAGGAGAAATACATGGATGCAAACGCCCTTTGAGCCT
ATATAGATGATAGCCGTGGAGTTGAGCAGAGACGGTGACTGGATTACATTCGAGAATCAA
GTTGACGACGGATGGTTCTTGGAAACTGCCGTAGACAAAGACATTGTGCGACGGAGATTG
ATCAGAACTAGTCATCGTTCTTGAATGAAAGTTATGTGAGAGAGAGAGAGAGAGTTGGTG
CTATGTTTCTTTATTTATTCCCTCTCACTATCACCATCATAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH95JQ U 25
AF RR2FH59JQ U 9
AF RR2FH59TF C 1
BS 1 14 RR2FH59TF
BS 15 707 RR2FH59JQ
BS 708 766 RR2FH59TF

RD RR2CH95JQ 301 0 0
TGCACAACTCAATAATGTCAACAAACAGTACAACTACAACATATTCCCAAACTCACAGAT
CCTTTTATTTTATTTTGCAGCTACAGATAGATCAAAGATAGTGAATCTTGATTTGTAAAC
AAAACAAAAGTACAGAGAGAGTCTTCAGGCCGCGGTAAGATCTTCTTCTACAAATTTGGC
AAACCCTTCCCTTGATCTCCCATCTGGATTCTTCTTCCATTCGATGAACTTCTCTGACGC
CTTTATGAACTTTTCCATGTGAAGCTTCTTCCATTCCTCGAAATCCCATTCTCCATACAT
A

QA 1 301 1 301
DS 

RD RR2FH59JQ 699 0 0
CTGATA
ACGACACACTTGCACAACTCAATAATGTCAACAAACAGTACAACTACAACATATTCCCAA
ACTCACAGATCCTTTTATTTTATTTTGCAGCTACAGATAGATCAAAGATAGTGAATTTTG
ATTTGTAAACAAAACAAAAGTACAGAGAGAGTCTTCAGGCCGCGGTAAGATCTTCTTCTA
CAAATTTGGCAAACTCTTCCCTTGATCTCCCATCTGGATTCTTCTTCCATTCGATGAACT
TCTCTGACGCCTTTATGAACTTTTCCATGTGAAGCTTCTTCCATTCCTCGAAATCCCATT
CTCCATACATATCAGGATCATCCTTGTTAGCCCATACAAAGGTTTCCACTTGCTTCTTCT
CGGAAGTATCAGTCAATACAACTTCAACAGTCTTCCTCACGTATTCATCTCCTTCAATCA
TATCCAAATTCTCTAGCTGAGCATCTGTTAATCCAGTTAGTATCTTTCCATTGATAAGTC
CGTTCTCAGAAGGAGAAATACATGGATGCAAACGCCCTTTGAGCCTATATAGATGATAGC
CGTGGAGTTGAGCAGAGACGGTGACTGGATTACATTCGAGAATCAAGTTGACGACGGATG
GTTCTTGGAAACTGCCGTAGACAAAGACATTGTGCGACGGAGATTGATCAGAACTAGTCA
TCGTTCTTGAATGAAAGTTATGTGAGAGAGAGA

QA 7 699 7 699
DS 

RD RR2FH59TF 766 0 0
TTTTTTTTTCTGATACGACACACTTGCACAACTCAATAATGTCAACAAACAGTACAACTA
CAACATATTCCCAAACTCACAGATC*TTTTATTTTATTTTGCAGCTACAGATAGATCAAA
GATAGTGAATTTTGATTTGTAAACAAAACAAAAGTACAGAGAGAGTCTTCAGGCCGCGGT
AAGATCTTCTTCTACAAATTTGGCAAACTCTTCCCTTGATCTCCCATCTGGATTCTTCTT
CCATTCGATGAACTTCTCTGACGCCTTTATGAACTTTTCCATGTGAAGCTTCTTCCATTC
CTCGAAATCCCATTCTCCATACATATCAGGATCATCCTTGTTAGCCCATACAAAGGTTTC
CACTTGCTTCTTCTCGGAAGTATCAGTCAATACAACTTCAACAGTCTTCCTCACGTATTC
ATCTCCTTCAATCATATCCAAATTCTCTAGCTGAGCATCTGTTAATCCAGTTAGTATCTT
TCCATTGATAAGTCCGTTCTCAGAAGGAGAAATACATGGATGCAAACGCCCTTTGAGCCT
ATATAGATGATAGCCGTGGAGTTGAGCAGAGACGGTGACTGGATTACATTCGAGAATCAA
GTTGACGACGGATGGTTCTTGGAAACTGCCGTAGACAAAGACATTGTGCGACGGAGATTG
ATCAGAACTAGTCATCGTTCTTGAATGAAAGTTATGTGAGAGAGAGAGAGAGAGTTGGTG
CTATGTTTCTTTATTTATTCCCTCTCACTATCACCATCATAATCCC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL3580Contig1 828 2 9 U
GATGTGTAACTCAGGATTTTTTTTCAATAAATAGAAAATGAAAGTGTTGCAAGAGTATAA
GAACAGTTCGTACATCAAAAATAAATAAAGTTTTCAAAACAACAACATACCATTCAGATA
AAATCTACCTGGAACGATAATTTCTTTTCCCTTGTCTCTTGTCAAAACCGGGAGCGACAT
TAAGACCAGGAACGTTTTTGAGACCCATCTTGCCAATAACATTTATAGGGATAGCTGGAG
GGGTGTCGAGTCCCATACTCCGGCTAAACTCATTGGCTAACTCCACCAGTCTGGTTGTGT
CTCTTGCAATCTTCTTCTGAGATTTGTAGTAACCCAACCATGCCTGATATGCCGCCTCCT
TGTTCGTCATTTCCACTTGGCTAAGCGCCTTCTGTACCTTCTTCACAGCATCATGATCTA
TCGGCGGCAAAGCAGACTTGGTGATGGGCAAGTCTTTAACAGATGACAGAAAGTACTCTT
CCCAAGGTGCCAACAAAAGTACACCTTCCCCTTCCTTACCTTTCCTCCCGGTTCTGCCAA
GTCTATGTATGTATTGTTCTCTGTCTGATGGCAACCCCATCTGTACGACTAGTGACACAT
CAGGGTAATCTACACCACGAGCAGATACATCAGATGTTACAAGGATAATACGCTTGGACT
TCCGGAACTCATCAGAAACTCTGGTTCTGTAACTCTGAGGTTTTCTAGAATGGATCTCTC
TGACGTTCATGCTTAGTTTACCAAGCAGATCGGCCACCAATCTTGTAACCATAGCAGTTG
TACAGAAAATTATCCCCTTATAGTCTGAATTGTCTGCGATGTGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU53JQ U 121
AF RR2AJ06JQ U 1
BS 1 246 RR2AJ06JQ
BS 247 247 RR2EU53JQ
BS 248 429 RR2AJ06JQ
BS 430 430 RR2EU53JQ
BS 431 495 RR2AJ06JQ
BS 496 497 RR2EU53JQ
BS 498 661 RR2AJ06JQ
BS 662 662 RR2EU53JQ
BS 663 828 RR2AJ06JQ

RD RR2EU53JQ 546 0 0
AAATCTACCTGGAACGATAATTTCTTTTCCCTTGTCTCTTGTCAAAACCGGGAGCGACAT
TAAGACCAGGAACGTTTTTGAGACCCATCTTGCCAATAACATTTATAGGGATAGCTGGAG
GGGTGTCGAGTCCCATACTCCGGCTAAACTCATTGGCTAACTCCACCAGTCTGGTTGTGT
CTCTTGCAATCTTCTTCTGAGATTTGTAGTAACCCAACCATGCCTGATATGCCGCCTCCT
TGTTCGTCATTTCCACTTGGCTAAGCGCCTTCTGTACCTTCTTCACAGCATCATGATCTA
TCGGCGGCAAAGCAGACTTGGTGATGGGCAAGTCTTTAACAGATGACAGAAAGTACTCTT
CCCAAGGTGCCAACAAAAGTACACCTTCCCCTTCCTTACCTTTCCTCCCGGTTCTGCCAA
GTCTATGTATGTATTGTTCTCTGTCTGATGGCAACCCCATCTGTACGACTAGTGACACAT
CAGGGTAATCTACACCACGAGCAGATACATCAGATGTTACAAGGATAATACGCTTGGACT
TCCGGA

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2AJ06JQ 828 0 0
GATGTGTAACTCAGGATTTTTTTTCAATAAATAGAAAATGAAAGTGTTGCAAGAGTATAA
GAACAGTTCGTACATCAAAAATAAATAAAGTTTTCAAAACAACAACATACCATTCAGATA
AAATCTACCTGGAACGATAATTTCTTTTCCCTTGTCTCTTGTCAAAACCGGGAGCGACAT
TAAGACCAGGAACGTTTTTGAGACCCATCTTGCCAATAACATTTATAGGGATAGCTGGAG
GGGTGTTGAGTCCCATACTCCGGCTAAACTCATTGGCTAACTCCACCAGTCTGGTTGTGT
CTCTTGCAATCTTCTTCTGAGATTTGTAGTAACCCAACCATGCCTGATATGCCGCCTCCT
TGTTCGTCATTTCCACTTGGCTAAGCGCCTTCTGTACCTTCTTCACAGCATCATGATCTA
TCGGCGGCAGAGCAGACTTGGTGATGGGCAAGTCTTTAACAGATGACAGAAAGTACTCTT
CCCAAGGTGCCAACATTAGTACACCTTCCCCTTCCTTACCTTTCCTCCCGGTTCTGCCAA
GTCTATGTATGTATTGTTCTCTGTCTGATGGCAACCCCATCTGTACGACTAGTGACACAT
CAGGGTAATCTACACCACGAGCAGATACATCAGATGTTACAAGGATAATACGCTTGGACT
TGCGGAACTCATCAGAAACTCTGGTTCTGTAACTCTGAGGTTTTCTAGAATGGATCTCTC
TGACGTTCATGCTTAGTTTACCAAGCAGATCGGCCACCAATCTTGTAACCATAGCAGTTG
TACAGAAAATTATCCCCTTATAGTCTGAATTGTCTGCGATGTGTTTTT

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 2

CO CL3581Contig1 784 2 2 U
GGATAACTTCGAAACTCTTGTCTAAATAATCTATAAGAAAATGAAGATGATAATCCACAT
TTTCTTCATACTCTCCCTAGTTTCATCCATCTCTTTTGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGT
AGCTGATCCCAAGGGTCCTCAAAGCCCATCAGGTTACTCTTGCAAGAACCCTGACCAAGT
CACCGAAAATGATTTCGCATTCTCCGGCCTCGCCAAAGCTGGAAACACATCGAACATCAT
TAAAGCCGCGGTGACACCAGCCTTTGCGCCTGCTTTCGCTGGCACCAATGGTCTTGGAGT
CTCGATGGCTCGTCTTGACTTAGCCGGTGGCGGTGTCATCCCTCTTCACACTCACCCTGG
TGCGTCTGAGGTTCTTGTAGTCATACAAGGAACCATTTGCGCCGGGTTTATTTCCTCTGC
TAATAAAGTATACTTGAAGACTCTCCAGAGAGGCGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCT
TCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAAGGCCCTGCCTTGGCCTTTGTTGCCTTTGGGAG
CTCATCCCCGGGACTTCAGATTCTACCCTTTGCTCTGTTTGCAAATGATTTGCCTTCAGA
ACTCGTTGAAGCCACCACCTTCCTTAGTGATGAACAAGTTAAGAAGCTTAAGGGCGTGCT
TGGAGGAACTAACTAAGCTTCTCTTTCGTTTTATTTTTTCTAAGTTTTTGTGTGTGAGTG
CGTTTATGCGTTCTTTTCAAGTTGGTTTAGCATTCTGATTTTTACCGTAATGGTTGTCTT
TCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2D686TF U 1
AF RR2D686JQ C 163
BS 1 691 RR2D686TF
BS 692 784 RR2D686JQ

RD RR2D686TF 694 0 0
GGATAACTTCGAAACTCTTGTCTAAATAATCTATAAGAAAATGAAGATGATAATCCACAT
TTTCTTCATACTCTCCCTAGTTTCATCCATCTCTTTTGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGT
AGCTGATCCCAAGGGTCCTCAAAGCCCATCAGGTTACTCTTGCAAGAACCCTGACCAAGT
CACCGAAAATGATTTCGCATTCTCCGGCCTCGCCAAAGCTGGAAACACATCGAACATCAT
TAAAGCCGCGGTGACACCAGCCTTTGCGCCTGCTTTCGCTGGCACCAATGGTCTTGGAGT
CTCGATGGCTCGTCTTGACTTAGCCGGTGGCGGTGTCATCCCTCTTCACACTCACCCTGG
TGCGTCTGAGGTTCTTGTAGTCATACAAGGAACCATTTGCGCCGGGTTTATTTCCTCTGC
TAATAAAGTATACTTGAAGACTCTCCAGAGAGGCGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCT
TCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAAGGCCCTGCCTTGGCCTTTGTTGCCTTTGGGAG
CTCATCCCCGGGACTTCAGATTCTACCCTTTGCTCTGTTTGCAAATGATTTGCCTTCAGA
ACTCGTTGAAGCCACCACCTTCCTTAGTGATGAACAAGTTAAGAAGCTTAAGGGCGTGCT
TGGAGGAACTAACTAAGCTTCTCTTTCGTTT
ATT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2D686JQ 622 0 0
CAAGAACCCTGACCAAGTCACCGAAAATGATTTCGCATTCTCCGGCCTCGCCAAAGCTGG
AAACACATCGAACATCATTAAAGCCGCGGTGACACCAGCCTTTGCGCCTGCTTTCGCTGG
CACCAATGGTCTTGGAGTCTCGATGGCTCGTCTTGACTTAGCCGGTGGCGGTGTCATCCC
TCTTCACACTCACCCTGGTGCGTCTGAGGTTCTTGTAGTCATACAAGGAACCATTTGCGC
CGGGTTTATTTCCTCTGCTAATAAAGTATACTTGAAGACTCTCCAGAGAGGCGATTCTAT
GGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAAGGCCCTGCCTTGGC
CTTTGTTGCCTTTGGGAGCTCATCCCCGGGACTTCAGATTCTACCCTTTGCTCTGTTTGC
AAATGATTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCACCACCTTCCTTAGTGATGAACAAGTTAA
GAAGCTTAAGGGCGTGCTTGGAGGAACTAACTAAGCTTCTCTTTCGTTTTATTTTTTCTA
AGTTTTTGTGTGTGAGTGCGTTTATGCGTTCTTTTCAAGTTGGTTTAGCATTCTGATTTT
TACCGTAATGGTTGTCTTTCTT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL3582Contig1 1023 2 4 U
GATACACATCCTCCTCTTCCTTCACCTAATAACAATTCCATTTCTACTTTCTCTCTCACC
TTTTTTTCAAATCATTACACAAACAAAGAAACTTTGTTCACATGCGTTTCACTGAACACA
TGGGAGACAGGAACCACGACCTGAACGGCGCCTACTACGGCCCACCGATTCCTCCGCCGA
GAAAGTCTCCCACAGCCACGGCAGAGGCGGCGGTGGATGCTGCGGCTGCATAGGCGACTG
TCTCGGCTGCTGCGGATGCTGCATCTTGAGCGTCATCTTCAACATCCTCATAACCATAGC
CATCATCCTAGGCATCGCCGCTCTGATCGTCTGGCTTATCTTCCGACCAAACGCCATCAA
GTTCCACGTCACCGACGCCAAGCTCACGCAGTTCACACTCGGCGCGGACAACAACCTCCA
GTACAACCTCGACCTCAATTTCACGATCCGGAACCCTAACAGACGGATCGGCGTCTACTA
CGACCAGATCGAGGTCAGAGGGTACTACGGAGACCAGCGGTTCGGTAACGGTAACATCTC
GCCGTTTTACCAGGGGCACAAGAACACGACCGATGTTGGGAGTAAACTGTCGGGACAGAG
CTTGGTGTTGCTCGACGGCGGAGATCGGAAGAATCTCGACGAGGATCTGAAGTCGGGGAT
ATACAGGATCGATGCGAAGCTGAGGCTTAGGGTTAGGTTTAAGTTCGGGTTGATCAAGTC
GTGGAGGTTCAAGCCCAAGGTTAGGTGTTATCTCAAGGTTCCTCTCGGTTCCTCTAATGT
AACCAGCGGGTTTCAGTTTCAGAGGACCAAGTGTGACATTGACTTTTGATGCTACTAGTC
AAAGTCAATGGTATTGTCTTGGAATTCTGTTTTCATTTATATGCACTTGTTTATTTTATC
TTTTAGATTGCTTATCTTCATTATTTTCGTACATGACTTTATGTGATATTGTCGGAGAGG
TATATGTTTTGTGTAATAATCTTTTAGTGTATGGTTCCATGTAAATAAAATAGTTTTTCT
TAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2FN79TF U 1
AF RR2FN79JQ C 201
BS 1 666 RR2FN79TF
BS 667 667 RR2FN79JQ
BS 668 682 RR2FN79TF
BS 683 1023 RR2FN79JQ

RD RR2FN79TF 682 0 0
GATACACATCCTCCTCTTCCTTCACCTAATAACAATTCCATTTCTACTTTCTCTCTCACC
TTTTTTTCAAATCATTACACAAACAAAGAAACTTTGTTCACATGCGTTTCACTGAACACA
TGGGAGACAGGAACCACGACCTGAACGGCGCCTACTACGGCCCACCGATTCCTCCGCCGA
GAAAGTCTCCCACAGCCACGGCAGAGGCGGCGGTGGATGCTGCGGCTGCATAGGCGACTG
TCTCGGCTGCTGCGGATGCTGCATCTTGAGCGTCATCTTCAACATCCTCATAACCATAGC
CATCATCCTAGGCATCGCCGCTCTGATCGTCTGGCTTATCTTCCGACCAAACGCCATCAA
GTTCCACGTCACCGACGCCAAGCTCACGCAGTTCACACTCGGCGCGGACAACAACCTCCA
GTACAACCTCGACCTCAATTTCACGATCCGGAACCCTAACAGACGGATCGGCGTCTACTA
CGACCAGATCGAGGTCAGAGGGTACTACGGAGACCAGCGGTTCGGTAACGGTAACATCTC
GCCGTTTTACCAGGGGCACAAGAACACGACCGATGTTGGGAGTAAACTGTCGGGACAGAG
CTTGGTGTTGCTCGACGGCGGAGATCGGAAGAATCTCGACGAGGATCTGAAGTCGGGGAT
ATACAG*ATCGATGCGAAGCTG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2FN79JQ 823 0 0
GCAGAGGCGGCGGTGGATGCTGCGGCTGCATAGGCGACTGTCTCGGCTGCTGCGGATGCT
GCATCTTGAGCGTCATCTTCAACATCCTCATAACCATAGCCATCATC*TAGGCATCGCCG
CTCTGATCGTCTGGCTTATCTTCCGACCAAACGCCATCAAGTTCCACGTCACCGACGCCA
AGCTCACGCAGTTCACACTCGGCGCGGACAACAACCTCCAGTACAACCTCGACCTCAATT
TCACGATCCGGAACCCTAACAGACGGATCGGCGTCTACTACGACCAGATCGAGGTCAGAG
GGTACTACGGAGACCAGCGGTTCGGTAACGGTAACATCTCGCCGTTTTACCAGGGGCACA
AGAACACGACCGATGTTGGGAGTAAACTGTCGGGACAGAGCTTGGTGTTGCTCGACGGCG
GAGATCGGAAGAATCTCGACGAGGATCTGAAGTCGGGGATATACAGGATCGATGCGAAGC
TGAGGCTTAGGGTTAGGTTTAAGTTCGGGTTGATCAAGTCGTGGAGGTTCAAGCCCAAGG
TTAGGTGTTATCTCAAGGTTCCTCTCGGTTCCTCTAATGTAACCAGCGGGTTTCAGTTTC
AGAGGACCAAGTGTGACATTGACTTTTGATGCTACTAGTCAAAGTCAATGGTATTGTCTT
GGAATTCTGTTTTCATTTATATGCACTTGTTTATTTTATCTTTTAGATTGCTTATCTTCA
TTATTTTCGTACATGACTTTATGTGATATTGTCGGAGAGGTATATGTTTTGTGTAATAAT
CTTTTAGTGTATGGTTCCATGTAAATAAAATAGTTTTTCTTAT

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL3583Contig1 774 2 1 U
GCTGTATGGGATGTTGTGAAAGGAAAGCTTTTAGATTCTTTAGACGCCATTAAGAGTGAG
AGTACACTTGGAAACAGAGTCCTGAAACCCAAACCGCCCCAAGGGAAGCCTCCGCTGAGC
TTGTATGCGATATCCGAAAGGCCACAGTTGTACTTGCTCTGGTCTTGCTTTCAGAAACTT
GAAGAAGAGACAAATAAGATATCTAACACAATCAACTCGGATGAGTGGATGGTTAGCTTT
AAGGATATTGTCAGTGAAGCATATGACGGAGCATGCACAGCTTGGCTAAAGAGGGAACTG
TGTGTGGAAGACACTGATTCTGACAAGGCGATGACTCCTTTGCTGATGAAAATGCTAAAT
GAAAAGGAAGCTATGTTTGATAAAATAAGAAAATCAGGCAAGGGGGATCTGTTTGCAGAG
TTCTTGTACTTCCATAGATTTGGATCTTTAAGGAGAGCTTCCTGCTACGACCTGAGCTTG
TTTCGCACTCATGGAGTCGCCATTTTGGAAGACTTGATGATAACATTAGCTGATGGGGTG
GCTAGCATCTATCTAGAGCTCATTTCTGTTGACAGCAAGTTCTCAGATGAAATGAACAGT
GGAGGAGGGTTAGATATCTGTAACCTTTCTAGTAGAGCACTTCAAAAACTACGCAATGAG
GTAGCTCTATACCAGTGGTTACATCAGACATGGAAGCAGTGGTGTCGATGTACGAGGATC
GCTTTGACCTCTACATTCTTCAACTCAGCTGATCACACCCTGATGGTGGTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA52TF U 60
AF RR2DE44TF U 1
BS 1 774 RR2DE44TF

RD RR2CA52TF 123 0 0
GAGTACACTTGGAAACAGAGTCCTGAAACCCAAACCGCCCCAAGGGAAGCCTCCGCTGAG
CTTGTATGCGATATCCGAAAGGCCACAGTTGTACTTGCTCTGGTCTTGCTTTCAGAAACT
TGA

QA 1 123 1 123
DS 

RD RR2DE44TF 774 0 0
GCTGTATGGGATGTTGTGAAAGGAAAGCTTTTAGATTCTTTAGACGCCATTAAGAGTGAG
AGTACACTTGGAAACAGAGTCCTGAAACCCAAACCGCCCCAAGGGAAGCCTCCGCTGAGC
TTGTATGCGATATCCGAAAGGCCACAGTTGTACTTGCTCTGGTCTTGCTTTCAGAAACTT
GAAGAAGAGACAAATAAGATATCTAACACAATCAACTCGGATGAGTGGATGGTTAGCTTT
AAGGATATTGTCAGTGAAGCATATGACGGAGCATGCACAGCTTGGCTAAAGAGGGAACTG
TGTGTGGAAGACACTGATTCTGACAAGGCGATGACTCCTTTGCTGATGAAAATGCTAAAT
GAAAAGGAAGCTATGTTTGATAAAATAAGAAAATCAGGCAAGGGGGATCTGTTTGCAGAG
TTCTTGTACTTCCATAGATTTGGATCTTTAAGGAGAGCTTCCTGCTACGACCTGAGCTTG
TTTCGCACTCATGGAGTCGCCATTTTGGAAGACTTGATGATAACATTAGCTGATGGGGTG
GCTAGCATCTATCTAGAGCTCATTTCTGTTGACAGCAAGTTCTCAGATGAAATGAACAGT
GGAGGAGGGTTAGATATCTGTAACCTTTCTAGTAGAGCACTTCAAAAACTACGCAATGAG
GTAGCTCTATACCAGTGGTTACATCAGACATGGAAGCAGTGGTGTCGATGTACGAGGATC
GCTTTGACCTCTACATTCTTCAACTCAGCTGATCACACCCTGATGGTGGTGATG

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 3

CO CL3584Contig1 739 3 12 U
GGGTTCCAATACGATAGAGGACGCGGAGCTGAACAGAACCCTCAATGCCAACACCAGCAG
CAGTGACGACGACGAGGTTGTGGTTGGAGTAGAAGACGATGATCTAACCAAGAATCCAAA
GGATACCGCATTCCAAACGGAGAGTCCAATGGGGTTCTTCGACTTCAACACGTTGGAGAA
AACCGAAGAAGCTTTTGCAGAACAGCCACCCGGATGGGTTGGGTGGGACGAACCATCATC
CGATATGCAAGTGAGTGGCAGAGGTCTCAACCCATTCATCGATGATGATGATGATGACAA
CAAAAACGTGATGAACCTTGACATACCAATGCTTGAACCTGTGATTCCAAACGGGTCGTC
GTCTCCTACGGAAAGATCTCCGTTCGTGAAGGATGTGGAGTTTGTGGGAGTTGTAGCAGA
AGGGACAGAGAAAGCAATGGAGCAAGCGATGAAGGAAGGGATAGTAGGAGAAGCTGGAGC
CAAGAAGAGAAAGATGGAGACGGGTGAAGGTAACCAAAAGGCGGAGGAGGAAAGTTCGGA
AGGGAAAGAGTTCAACGATAACAACTACTGGAAAGTTGATCAAGATGTCGGAGTTTTAGA
GTAATGTTTTTTTATCTTGTACAGTGTGGTTTTGTATGAGAGTTGTGTTTATGTAAGAAA
ACTTGTTTCAAGTTGAAATTTGATGTAAGTCACTGAAAAAAGCATGTCTCTGTAAAAAAA
TGGACCTAACTTGAAACTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FO96TF U 1
AF RR2FO96JQ C 1
AF RR2H847TF U 316
BS 1 316 RR2FO96TF
BS 317 386 RR2H847TF
BS 387 387 RR2FO96TF
BS 388 466 RR2H847TF
BS 467 467 RR2FO96TF
BS 468 468 RR2H847TF
BS 469 469 RR2FO96TF
BS 470 473 RR2H847TF
BS 474 474 RR2FO96TF
BS 475 482 RR2H847TF
BS 483 483 RR2FO96TF
BS 484 739 RR2H847TF

RD RR2FO96TF 523 0 0
GGGTTCCAATACGATAGAGGACGCGGAGCTGAACAGAACCCTCAATGCCAACACCAGCAG
CAGTGACGACGACGAGGTTGTGGTTGGAGTAGAAGACGATGATCTAACCAAGAATCCAAA
GGATACCGCATTCCAAACGGAGAGTCCAATGGGGTTCTTCGACTTCAACACGTTGGAGAA
AACCGAAGAAGCTTTTGCAGAACAGCCACCCGGATGGGTTGGGTGGGACGAACCATCATC
CGATATGCAAGTGAGTGGCAGAGGTCTCAACCCATTCATCGATGATGATGATGATGACAA
CAAAAACGTGATGAACCTTGACATACCAATGCTTGAACCTGTGATTCCAAACGGGTCGTC
GTCTCCTACGGAAAGATCTCCGTTCGTGAAGGATGTGGAGTTTGTGGGAGTTGTAGCAGA
AGGGACAGAGAAAGCAATGGAGCAAGCGATGAAGGAAGGGATAGTAGGAGAAGCTGGAGC
CAAGAAGAGAAAGATGGAGACGGGTGAAGGTAACCAAAAG
CGG

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2FO96JQ 739 0 0
GGGTTCCAATACGATAGAGGACGCGGAGCTGAACAGAACCCTCAATGCCAACACCAGCAG
CAGTGACGACGACGAGGTTGTGGTTGGAGTAGAAGACGATGATCTAACCAAGAATCCAAA
GGATACCGCATTCCAAACGGAGAGTCCAATGGGGTTCTTCGACTTCAACACGTTGGAGAA
AACCGAAGAAGCTTTTGCAGAACAGCCACCCGGATGGGTTGGGTGGGACGAACCATCATC
CGATATGCAAGTGAGTGGCAGAGGTCTCAACCCATTCATCGATGATGATGATGATGACAA
CAAAAACGTGATGAACCTTGACATACCAATGCTTGAACCTGTGATTCCAAACGGGTCGTC
GTCTCCTACGGAAAGATCTCCGTTCGTGAAGGATGTGGAGTTTGTGGGAGTTGTAGCAGA
AGGGACAGAGAAAGCAATGGAGCAAGCGATGAAGGAAGGGATAGTAGGAGAAGCTGGAGC
CAAGAAGAGAAAGATGGAGACGGGTGAAGGTAACCAAAAGGCGGAGGAGGAAAGTTCGGA
AGGGAAGGAGTTCAACGATAACAACTACTGGAAAGTTGATCAAGATGTCGGAGTTTTAGA
GTAATGTTTTTTTATCTTGTACAGTGTGGTTTTGTATGAGAGTTGTGTTTATGTAAGAAA
ACTTGTTTCAAGTTGAAATTTGATGTAAGTCACTGAAAAAAGCATGTCTCTGTAAAAAAA
TGGACCTAACTTGAAACTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2H847TF 424 0 0
G
CTTGACATACCAATGCTTGAACCTGTGATTCCAAACGGGTCGTCGTCTCCTACGGAAAGA
TCTCCGTTCGAGAAGGATGTGGAGTTTGTGGGAGTTGTAGCAGAAGGGACAGAGAAAGCA
ATGGAGCAAGCGATGAAGGAAGGGATAGTACG*GAAG*TGGAGCCATGAAGAGAAAGATG
GAGACGGGTGAAGGTAACCAAAAGGCGGAGGAGGAAAGTTCGGAAGGGAAAGAGTTCAAC
GATAACAACTACTGGAAAGTTGATCAAGATGTCGGAGTTTTAGAGTAATGTTTTTTTATC
TTGTACAGTGTGGTTTTGTATGAGAGTTGTGTTTATGTAAGAAAACTTGTTTCAAGTTGA
AATTTGATGTAAGTCACTGAAAAAAGCATGTCTCTGTAAAAAAATGGACCTAACTTGAAA
CTT

QA 2 424 2 424
DS 



AS 1 2

CO CL3585Contig1 694 2 1 U
GGGCATCAACCAAAGCAAAGCAGAACAAGAAAAAACTAAAACATCAAGAAAAATGGCTCA
TACTCTCGACCTCGAAGGCATAACCAAAGCAATCTCAGGAATGGGTGTTGATGAGGGAGC
ATTAATAAGTACTCTGGGGAACTCACACAAGGATCATCGCAAGTTGTTTAGGAAAGCAAG
CAAGAGTTTCTTTGTGGAAGATGAAGAAAGAGCTTTTGAGAAATGCCATGATCACTTTGT
CAAACATCTCAAGCTTGAGTTCTCTCGTTTCACTAACGCGGTAGTGATGTGGTCGATGCA
TCCATGGGAGAGAGACGCAAGATTGGTGAAGAAAGCACTTAAGAAAGGAGATGAATCTTA
CAACCTCATCGTAGAGGTGTCATGCACTCGCTCCTCTGAGGATCTCCTAGGGGCACGCAA
AGCTTACCACTCTCTCTTCGACCAGTCCATGGAAGAAGACATCGCCTCTCACATCCATGG
CCCGCAACGCAAGCTGCTTGTGGGGCTCGTGAGTGCTTATACATACGAAGGGAACAAGGT
GAAGGAAGATTCAGCCAAATCCGACGCTAAGATTTTGGCCGAGGCTGTGGCTTCTTCAGG
AGAGAGAGCCATAGAGAATGATGAGGTTGTTAGGATTCTGACGACAAGAAGCAAACTCCA
TCTCCAACATCTCTACAAACACTTTAACCAAATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AF66TF U 1
AF RR2AF91TF U 1
BS 1 694 RR2AF66TF

RD RR2AF66TF 694 0 0
GGGCATCAACCAAAGCAAAGCAGAACAAGAAAAAACTAAAACATCAAGAAAAATGGCTCA
TACTCTCGACCTCGAAGGCATAACCAAAGCAATCTCAGGAATGGGTGTTGATGAGGGAGC
ATTAATAAGTACTCTGGGGAACTCACACAAGGATCATCGCAAGTTGTTTAGGAAAGCAAG
CAAGAGTTTCTTTGTGGAAGATGAAGAAAGAGCTTTTGAGAAATGCCATGATCACTTTGT
CAAACATCTCAAGCTTGAGTTCTCTCGTTTCACTAACGCGGTAGTGATGTGGTCGATGCA
TCCATGGGAGAGAGACGCAAGATTGGTGAAGAAAGCACTTAAGAAAGGAGATGAATCTTA
CAACCTCATCGTAGAGGTGTCATGCACTCGCTCCTCTGAGGATCTCCTAGGGGCACGCAA
AGCTTACCACTCTCTCTTCGACCAGTCCATGGAAGAAGACATCGCCTCTCACATCCATGG
CCCGCAACGCAAGCTGCTTGTGGGGCTCGTGAGTGCTTATACATACGAAGGGAACAAGGT
GAAGGAAGATTCAGCCAAATCCGACGCTAAGATTTTGGCCGAGGCTGTGGCTTCTTCAGG
AGAGAGAGCCATAGAGAATGATGAGGTTGTTAGGATTCTGACGACAAGAAGCAAACTCCA
TCTCCAACATCTCTACAAACACTTTAACCAAATC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2AF91TF 694 0 0
GGGCATCAACCAAAGCAAAGCAGAACAAGAAAAAACTAAAACATCAAGAAAAATGGCTCA
TACTCTCGACCTCGAAGGCATAACCAAAGCAATCTCAGGAATGGGTGTTGATGAGGGAGC
ATTAATAAGTACTCTGGGGAACTCACACAAGGATCATCGCAAGTTGTTTAGGAAAGCAAG
CA*GAGTTTCTTTGTGGAAGATGAAGAAAGAGCTTTTGAGAAATGCCATGATCACTTTGT
CAAACATCTCAAGCTTGAGTTCTCTCGTTTCACTAACGCGGTAGTGATGTGGTCGATGCA
TCCATGGGAGAGAGACGCAAGATTGGTGAAGAAAGCACTTAAGAAAGGAGATGAATCTTA
CAACCTCATCGTAGAGGTGTCATGCACTCGCTCCTCTGAGGATCTCCTAGGGGCACGCAA
AGCTTACCACTCTCTCTTCTACCAGTCCATGGAAGAAGACATTGCCTCTCACATCCATGG
CCCGCAACGCAAGCTGCTTGTGGGGCTCGTGAGTGCTTATAGATACGAAGGGAACAAGGT
GAAGGAAGATTCAGCCAAATCCGACGCTAAGATTTTGGCCGAGGCTGTGGCTTCTTCAGG
AGAGAGAGCCATAGAGAATGATGAGGTTGTTAGGATTCTGACGACAAGAAGCAAACTCCA
TCTCCAACATCTCTACAAACACTTTAACCAAATC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 3

CO CL3586Contig1 1163 3 9 U
GGGGAATCTAATAGGGATCACTGTTGGTTACACCATCACTGCTTCCATTAGCTTGGTAGC
GGTGGGGAAAGCAAACTGTTTCCACGAGAAAGGGCACGAGGCAGACTGCACCATATCGAA
TTATCCATATATGGCAGTTTTCGGGATCATTCAGATAATTCTTTCAGATCCCGAACTTCC
ACAAGCTCTCTTTTCTCTCCCTTATAGCTGCGGTGATGTCCTTCACTTACGCAACTATTG
GGATTGGCCTAGCCATTGCGACGGTCGCAGGTGGGAAAGTGGGTAAGACGAATATGACAG
GCACGGTGGTAGGAGTTGATGTGACTGCGGCTCAGAAGATATGGAGATCGTTCCAAGCGG
TAGGGGACATTGCGTTTGCATATGCTTACGCAACCGTTCTCATCGAGATTCAGGATACAT
TGAAATCTAGCCCAGCAGAGAACAAAGCTATGAAAAGAGCAAGCCTTGTGGGAGTATCAA
CCACCACTTTCTTCTACATCTTATGCGGTTGTCTTGGCTATGCTGCATTTGGAAACAAAG
CACCAGGAGATCTCCTCACAGATTTTGGGTTTTACGAGCCCTTTTGGCTCATCGACTTTG
CGAATGCTTGCATTGCTGTCCACCTTATCGGTGCTTATCAGGTGTTTGCGCAGCCGATCT
TCCAGTTTGTTGAGAAGAGATGCAATAGAAACTGGCCTGACAACAAGTTCATCACTTCTG
AGTATTCAGTAAACGTACCTTTCCTTGGAAAATTCAACATCAGCCTCTTCAGATTGGTGT
GGAGGACAGCTTACGTGGTTATAACCACTGTGGTAGCTATGATATTCCCTTTCTTCAATG
CGATCTTGGGTCTTATCGGTGCAGCTTCTTTCTGGCCTTTAACGGTTTATTTCCCCGTGG
AGATGCACATTGCACAGACTAAGGCTAAGAAGTACTCTCCTAGATGGATCGGACTGAAAA
TGTTGTGCTGGGTCTGCTTGATCGTCTCGCTCTTAGCTGCTGCTGGATCCATCGCTGGAC
TGATAGGTAGTGTCAAGACATACAAGCCTTTCCGAACTATCCACGAGTGAGAGTTTCAGA
CTAAAAATAAAGTTATGTAGTATTTTGGTCTTTCTTTGTAAACTACTTGGTATCTATGTC
CAAATGAAAATGCTTTTATTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F675TF U 1
AF RR2DQ74TF U 383
AF RR2F675JQ C 469
BS 1 628 RR2F675TF
BS 629 927 RR2DQ74TF
BS 928 928 RR2F675JQ
BS 929 949 RR2DQ74TF
BS 950 950 RR2F675JQ
BS 951 952 RR2DQ74TF
BS 953 953 RR2F675JQ
BS 954 1009 RR2DQ74TF
BS 1010 1163 RR2F675JQ

RD RR2F675TF 628 0 0
GGGGAATCTAATAGGGATCACTGTTGGTTACACCATCACTGCTTCCATTAGCTTGGTAGC
GGTGGGGAAAGCAAACTGTTTCCACGAGAAAGGGCACGAGGCAGACTGCACCATATCGAA
TTATCCATATATGGCAGTTTTCGGGATCATTCAGATAATTCTTTCAGATCCCGAACTTCC
ACAAGCTCTCTTTTCTCTCCCTTATAGCTGCGGTGATGTCCTTCACTTACGCAACTATTG
GGATTGGCCTAGCCATTGCGACGGTCGCAGGTGGGAAAGTGGGTAAGACGAATATGACAG
GCACGGTGGTAGGAGTTGATGTGACTGCGGCTCAGAAGATATGGAGATCGTTCCAAGCGG
TAGGGGACATTGCGTTTGCATATGCTTACGCAACCGTTCTCATCGAGATTCAGGATACAT
TGAAATCTAGCCCAGCAGAGAACAAAGCTATGAAAAGAGCAAGCCTTGTGGGAGTATCAA
CCACCACTTTCTTCTACATCTTATGCGGTTGTCTTGGCTATGCTGCATTTGGAAACAAAG
CACCAGGAGATCTCCTCACAGATTTTGGGTTTTACGAGCCCTTTTGGCTCATCGACTTTG
CGAATGCTTGCATTGCTGTCCACCTTAT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2DQ74TF 631 0 0
G
GCTTACGCAACCGTTCTCATCGAGATTCAGGATACATTGAAATCTAGCCCAGCAGAGAAC
AAAGCTATGAAAAGAGCAAGCCTTGTGGGAGTATCAACCACCACTTTCTTCTACATCTTA
TGTGGTTGTCTTGGCTATGCTGCATTTGGAAACAAAGCACCAGGAGATCTCCTCACAGAT
TTCGGGTTTTACGAGCCCTTTTGGCTCATCGACTTTGCGAATGCTTGCATTGCTGTCCAC
CTTATCGGTGCTTATCAGGTGTTTGCGCAGCCGATCTTCCAGTTTGTTGAGAAGAGATGC
AATAGAAACTGGCCTGACAACAAGTTCATCACTTCTGAGTATTCAGTAAACGTACCTTTC
CTTGGAAAATTCAACATCAGCCTCTTCAGATTGGTGTGGAGGACAGCTTACGTGGTTATA
ACCACTGTGGTAGCTATGATATTCCCTTTCTTCAATGCGATCTTGGGTCTTATCGGTGCA
GCTTCTTTCTGGCCTTTAACGGTTTATTTCCCCGTGGAGATGCACATTGCACAGACTAAG
GCTATGAAGTACTCTCCTAGATGGATTGGGCTGAAAATGTTGTGCTGGGTCTGCTTGATC
GTCTCGCTCTTAGCTGCTGCTGGATC
TATC

QA 2 627 2 627
DS 

RD RR2F675JQ 695 0 0
TGGGAGTATCAACCACCACTTTCTTCTACATCTTATGCGGTTGTCTTGGCTATGCTGCAT
TTGGAAACAAAGCACCAGGAGATCTCCTCACAGATTTTGGGTTTTACGAGCCCTTTTGGC
TCATCGACTTTGCGAATGCTTGCATTGCTGTCCACCTTATCGGTGCTTATCAGGTGTTTG
CGCAGCCGATCTTCCAGTTTGTTGAGAAGAGATGCAATAGAAACTGGCCTGACAACAAGT
TCATCACTTCTGAGTATTCAGTAAACGTACCTTTCCTTGGAAAATTCAACATCAGCCTCT
TCAGATTGGTGTGGAGGACAGCTTACGTGGTTATAACCACTGTGGTAGCTATGATATTCC
CTTTCTTCAATGCGATCTTGGGTCTTATCGGTGCAGCTTCTTTCTGGCCTTTAACGGTTT
ATTTCCCCGTGGAGATGCACATTGCACAGACTAAGGTTAAGAAGTACTCTCCTAGATGGG
TCGGACTGAAAATGTTGTGCTGGGTCTGCTTGATCGTCTCGCTCTTAGCTGCTGCTGGAT
CCATCGCTGGACTGATAGGTAGTGTCAAGACATACAAGCCTTTCCGAACTATCCACGAGT
GAGAGTTTCAGACTAAAAATAAAGTTATGTAGTATTTTGGTCTTTCTTTGTAAACTACTT
GGTATCTATGTCCAAATGAAAATGCTTTTATTGTT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL3587Contig1 534 2 4 U
GATCCAATAGTCATCATTTCATTAACACAACAGAACATCTCTTTCTTTTTTTTCACATAA
TCTCTTCAACTATCTAGATTCATTTTCTTCTCATCACAGCAAGTGAAGTAGTAGTACTTG
CAAAAATTCACAAGAGCTTTTACTCTGAGAGATCTCTTTCTCATTTTATCATATACACAA
TATTATAATATTCTCTCTGCATCTCATTTCACAGCAACAACCCCAGTTTCAGAGCCCATC
TTCTTCCTCCTCTCCATGAAACTTCCACCACATGCAGAGAAACCAGGAAGACAACGATGA
TGCTGCCAGTTAGACTTCTTTTTCTCTTCCTTCACACCAGCGTCTTCTTCTATGGCGACC
TTGTTGAATTCGCGTGAGTTTTCACCAGAGAGATAGGGAGAGCTTAGAGATGATGACCCT
CCGCTTTCCTCTCGATCTTCTCTTATACTTTCTCTGAAAAGATCACCAAGCTTCTTCCTC
CTCGGTTTTGGCGCTGGAGAAGAGCCTCGAGAAGGCTTCTTCTCGTGGAATATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ33JQ U 1
AF RR2CO15JQ U 20
BS 1 29 RR2FQ33JQ
BS 30 30 RR2CO15JQ
BS 31 231 RR2FQ33JQ
BS 232 534 RR2CO15JQ

RD RR2FQ33JQ 241 0 0
GATCCAATAGTCATCATTTCATTAACACACCAGAACATCTCTTTCTTTTTTTTCACATAA
TCTCTTCAACTATCTAGATTCATTTTCTTCTCATCACAGCAAGTGAAGTAGTAGTACTTG
CAAAAATTCACAAGAGCTTTTACTCTGAGAGATCTCTTTCTCATTTTATCATATACACAA
TATTATAATATTCTCTCTGCATCTCATTTCACAGCAACAACCCCAGTTTCA
AGAGCTCATC

QA 1 231 1 231
DS 

RD RR2CO15JQ 515 0 0
CATTAACACAACAGCACATCTCTTTCTTTTTTTTCACATAATCTCTTCAACTATCTAGAT
TCATTTTCTTCTCATCACAGCAAGTGAAGTAGTAGTACTTGCAAAAATTCACAAGAGCTT
TTACTCTGAGAGATCTCTTTCTCATTTTATCATATACACAATATTATAATATTCTCTCTG
CATCTCATTTCACAGCAACAACCCCAGTTTCAGAGCCCATCTTCTTCCTCCTCTCCATGA
AACTTCCACCACATGCAGAGAAACCAGGAAGACAACGATGATGCTGCCAGTTAGACTTCT
TTTTCTCTTCCTTCACACCAGCGTCTTCTTCTATGGCGACCTTGTTGAATTCGCGTGAGT
TTTCACCAGAGAGATAGGGAGAGCTTAGAGATGATGACCCTCCGCTTTCCTCTCGATCTT
CTCTTATACTTTCTCTGAAAAGATCACCAAGCTTCTTCCTCCTCGGTTTTGGCGCTGGAG
AAGAGCCTCGAGAAGGCTTCTTCTCGTGGAATATA

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

CO CL3588Contig1 669 2 3 U
GATAGTCAGAGGCACCGTCTCGGACCAAACTATCTGCAACTACCTGTCAATGCCCCCAAA
TGTGCTCACCACAACAATCACCATGAAGGTTTTATGAACTTCATGCACAGAGATGAGGAG
GTCAATTACTTCCCTTCAAGGTTGAATCCGGTTCGCCATGCTGACAAATACCCTACAACT
CCTGTTTTCTGCTCTGGAAATCGTGAGAAGTGCATGATTGAGAAGGAGAACAACTTTCAG
CAGCCAGGGGAACGATACCGGTCCTGGGATGCAGACAGGCAAGAGCGTTTCGTGAAGCGT
TTTGTCGAAGCGCTTGCTGAGCCTCGTGTCACCCACGAGATCCGCAGCATTTGGATATCT
TACTGGTCTCAGGCAGACAAATCTCTTGGACAGAAACTAGCTACTCGTCTTAACGTGAAA
CCAAAGTTCTGAATGGTTATCATCTCAAAAGACTATTAAGTAAAACCCAATATGTGCTCA
CATATTGCGCTTTGGTTTCTATGTAAGCTATTTGGTAATAGTTCATTTAAATAATCCGTG
ACAATGAAATGTGTAAAGAAGGATACTTCTAGTTCATGTTGTAATCTTCTATTCACAATG
TTAACGAATATTTTCTAAGGCAAGTAATAAAAAGCTATGCGTTATGTAAGCTTATAAGTT
ATGACAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY39TF U 117
AF RR2BN78JQ C 1
BS 1 116 RR2BN78JQ
BS 117 633 RR2BY39TF
BS 634 669 RR2BN78JQ

RD RR2BY39TF 517 0 0
GGAGGTCAATTACTTCCCTTCAAGGTTGAATCCGGTTCGCCATGCTGACAAATACCCTAC
AACTCCTGTTTTCTGCTCTGGAAATCGTGAGAAGTGCATGATTGAGAAGGAGAACAACTT
TCAGCAGCCAGGGGAACGATACCGGTCCTGGGATGCAGACAGGCAAGAGCGTTTCGTGAA
GCGTTTTGTCGAAGCGCTTGCTGAGCCTCGTGTCACCCACGAGATCCGCAGCATTTGGAT
ATCTTACTGGTCTCAGGCAGACAAATCTCTTGGACAGAAACTAGCTACTCGTCTTAACGT
GAAACCAAAGTTCTGAATGGTTATCATCTCAAAAGACTATTAAGTAAAACCCAATATGTG
CTCACATATTGCGCTTTGGTTTCTATGTAAGCTATTTGGTAATAGTTCATTTAAATAATC
CGTGACAATGAAATGTGTAAAGAAGGATACTTCTAGTTCATGTTGTAATCTTCTATTCAC
AATGTTAACGAATATTTTCTAAGGCAAGTAATAAAAA

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2BN78JQ 669 0 0
GATAGTCAGAGGCACCGTCTCGGACCAAACTATCTGCAACTACCTGTCAATGCCCCCAAA
TGTGCTCACCACAACAATCACCATGAAGGTTTTATGAACTTCATGCACAGAGATGAGGAG
GTCAATTACTTCCCTTCAAGGTTGAATCCGGTTCGCCATGCTGACAAATACCCTACAACT
CCTGTTTTCTGCTCTGGAAATCGTGAGAAGTGCATGATTGAGAAGGAGAACAACTTTCAG
CAGCCAGGGGAACGATACCGGTCCTGGGATGCAGACAGGCAAGAGCGTTTCGTGAAGCGT
TTTGTCGAAGCGCTTGCTGAGCCTCGTGTCACCCACGAGATCCGCAGCATTTGGATATCT
TACTGGTCTCAGGCAGACAAATCTCTTGGACAGAAACTAGCTACTCGTCTTAACGTGAAA
CCAAAGTTCTGAATGGTTATCATCTCAAAAGACTATTAAGTAAAACCCAATATGTGCTCA
CATATTGCGCTTTGGTTTCTATGTAAGCTATTTGGTAATAGTTCATTTAAATAATCCGTG
ACAATGAAATGTGTAAAGAAGGATACTTCTAGTTCATGTTGTAATCTTCTATTCACAATG
TTAACGAATATTTTTTAAGGCAAGTAATAAAAAGCTATGCGTTATGTAAGCTTATAAGTT
ATGACAAAA

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 3

CO CL3589Contig1 764 3 31 U
AACAGTTAACTTGTTGGATTCCTGATTTTATTTTGGGATAAAAAATCTGTCAACTCAACG
TAAAGAATGGCAAGAGCAAGCAAACTTTGGAAGGCATGCACATGGCTAAAGGGAACAAAT
CTGGTAGGAACTGTCAAACCAGAGAAATTTCATGTCATACTCTTATGAGTTTTATCTTTG
ACGTGTGTGTGTGTGTGGAGTTTAGAGCAACATAGACTCTGGGGTCTCGATGTAGCCCTT
GAATGCTTTCAACCATTCAGCTCCAATGGCACCATCTATTACACGGTGGTCACAGCTAAG
TGTTACAGGCATGTAAGAAGCCACGTTGAATTGGTCAGGGCCACTACCAGCAACAACTCT
CTTCTCAGCGGATCCGATCGCTAGAATAGCAGCTTGAGGTGGATTGATGACAGCGCAAAA
CTGTTTGATGCCAAAAGGTCCGCCGAGGTTAGAAACTGTGAATGTTCCTCCCTCGTAATC
TTCAGGCTTCAAGCTGTTTTCTTTAGCCTTCTGAGCCAAGAATCGAACCTCTTCTCCAAT
TGTAGACAGCCCTTTCTTGTCCGCGTCCTTGACAACAGGAACGTAAAGCCCGTTTTCTGT
TTGCACTGCGACATTGATGTTCACATTGCTAAATTGGCGGATGTATTCGTCTGTCCATGA
ACTATTGCACTGAGGAACTTTCCGTAGAGCCAATGCAGCAGCCTTAATAACAAGACCATT
TACAGATATACGTTTCCCGCCTGAAGCCTCTTGAAATGAATTCA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH48JQ U 1
AF RR2E828JQ U 1
AF RR2EH48TF C 1
BS 1 80 RR2E828JQ
BS 81 81 RR2EH48JQ
BS 82 112 RR2E828JQ
BS 113 113 RR2EH48JQ
BS 114 134 RR2E828JQ
BS 135 135 RR2EH48JQ
BS 136 143 RR2E828JQ
BS 144 144 RR2EH48JQ
BS 145 270 RR2E828JQ
BS 271 271 RR2EH48JQ
BS 272 286 RR2E828JQ
BS 287 287 RR2EH48JQ
BS 288 308 RR2E828JQ
BS 309 309 RR2EH48JQ
BS 310 316 RR2E828JQ
BS 317 317 RR2EH48JQ
BS 318 321 RR2E828JQ
BS 322 322 RR2EH48JQ
BS 323 411 RR2E828JQ
BS 412 412 RR2EH48JQ
BS 413 441 RR2E828JQ
BS 442 442 RR2EH48JQ
BS 443 444 RR2E828JQ
BS 445 445 RR2EH48JQ
BS 446 450 RR2E828JQ
BS 451 451 RR2EH48JQ
BS 452 561 RR2E828JQ
BS 562 562 RR2EH48JQ
BS 563 675 RR2E828JQ
BS 676 676 RR2EH48JQ
BS 677 764 RR2E828JQ

RD RR2EH48JQ 681 0 0
AACAGTTAACTTGTTGGATTCCTGATTTTATTTTGGGATAAAAAATCTGTCAACTCAACG
TAAAGAATGGCAAGAGCAAGCAAACTTTGGAAGGCATGCACATGGCTAAAGGGAACAAAT
CTGGTAGGAACTGTCAAACCAGAGAAATTTCATGTCATACTCTTATGAGTTTTATCTTTG
ACGTGTGTGTGTGTGTGGAGTTTAGAGCAACATAGACTCTGGGGTCTCGATGTAGCCCTT
GAATGCTTTCAACCATTCAGCTCCAATGGCACCATCTATTACACGGTGGTCACAGCTAAG
TGTTACAGGCATGTAAGAAGCCACGTTGAATTGGTCAGGGCCACTACCAGCAACAACTCT
CTTCTCAGCGGATCCGATCGCTAGAATAGCAGCTTGAGGTGGATTGATGACAGCGCAAAA
CTGTTTGATGCCAAAAGGTCCGCCGAGGTTAGAAACTGTGAATGTTCCTCCCTCGTAATC
TTCAGGCTTCAAGCTGTTTTCTTTAGCCTTCTGAGCCAAGAATCGAACCTCTTCTCCAAT
TGTAGACAGCCCTTTCTTGTCCGCGTCCTTGACAACAGGAACGTAAAGCCCGTTTTCTGT
TTGCACTGCGACATTGATGTTCACATTGCTAAATTGGCGGATGTATTCGTCTGTCCATGA
ACTATTGCACTGAGGAACTTT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2E828JQ 764 0 0
AACAGTTAACTTGTTGGATTCCTGATTTTATTTTGGGATAAAAAATCTGTCAACTCAACG
TAAAGAATGGCAAGAGCAAGTAAACTTTGGAAGGCATGCACATGGCTAAAGG*AACAAAT
CTGGTAGGAACTGTTAAACCAGAAAAATTTCATGTCATACTCTTATGAGTTTTATCTTTG
ACGTGTGTGTGTGTGTGGAGTTTAGAGCAACATAGACTCTGGGGTCTCGATGTAGCCCTT
GAATGCTTTCAACCATTCAGCTCCAATGGCGCCATCTATTACACGGGGGTCACAGCTAAG
TGTTACAGACATGTAAAAAGCAACGTTGAATTGGTCAGGGCCACTACCAGCAACAACTCT
CTTCTCAGCGGATCCGATCGCTAGAATAGCAGCTTGAGGTGGATTGATGACGGCGCAAAA
CTGTTTGATGCCAAAAGGTCCTCCCAGGTTGGAAACTGTGAATGTTCCTCCCTCGTAATC
TTCAGGCTTCAAGCTGTTTTCTTTAGCCTTCTGAGCCAAGAATCGAACCTCTTCTCCAAT
TGTAGACAGCCCTTTCTTGTCAGCGTCCTTGACAACAGGAACGTAAAGCCCGTTTTCTGT
TTGCACTGCGACATTGATGTTCACATTGCTAAATTGGCGGATGTATTCGTCTGTCCATGA
ACTATTGCACTGAGGGACTTTCCGTAGAGCCAATGCAGCAGCCTTAATAACAAGACCATT
TACAGATATACGTTTCCCGCCTGAAGCCTCTTGAAATGAATTCA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2EH48TF 733 0 0
AACAGTTAACTTGTTGGATTCCTGATTTTATTTTGGGATAAAAAATCTGTCAACTCAACG
TAAAGAATGGCAAGAGCAAGCAAACTTTGGAAGGCATGCACATGGCTAAAGGGAACAAAT
CTGGTAGGAACTGTCAAACCAGAGAAATTTCATGTCATACTCTTATGAGTTTTATCTTTG
ACGTGTGTGTGTGTGTGGAGTTTAGAGCAACATAGACTCTGGGGTCTCGATGTAGCCCTT
GAATGCTTTCAACCATTCAGCTCCAATGGCACCATCTATTACACGGTGGTCACAGCTAAG
TGTTACAGGCATGTAAGAAGCCACGTTGAATTGGTCAGGGCCACTACCAGCAACAACTCT
CTTCTCAGCGGATCCGATCGCTAGAATAGCAGCTTGAGGTGGATTGATGACAGCGCAGAA
CTGTTTGATGCCAAAAGGTCCGCCGAGGTTAGAAACTGTGAATGTTCCTCCCTCGTAATC
TTCAGGCTTCAAGCTGTTTTCTTTAGCCTTCTGAGCCAAGAATCGAACCTCTTCTCCAAT
TGTAGACAGCCCTTTCTTGTCCGCGTCCTTGACAACAGGAACGTAAAGCCCGTTTTCTGT
TTGCACTGCGACATTGATGTTCACATTGCTAAATTGGCGGATGTATTCGTCTGTCCATGA
ACTATTGCACTGAGGAACTTTTCGTAGAGCCAATGCAGCAGCCTTAATAACAAGATCATT
TACAGATATACGT

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL3590Contig1 1260 2 2 U
GAAAGAAGAAGGGCTTAAATGGAGAAACAATGTAGTTTTTTTTTCTCTATACAAAAAGTT
TCTCTACACAAAACTCATCCTGAGACATCTCTTCCAAAAAGTGCGCTGATACCTTGCCCT
GGATCACTTTGTTTAACAAGAGATTCACCCACTAAAACTGCTTTGACACCAGCTTGTTGT
ACGAATGCAATGTCTTCTGGTGTGAATAACCCAGATTCTCCAACCACGAGGATGTCTTTC
TGACGGATCAATTCACCACGCTCTCCTTCCAGGAGCCTCTTTGTGATGCCAATATCTACC
TCAAATGTTTCAAGGTTGCGGTTATTGATGCCAATGAGCTCGACTCCTTCAATTGCTAGA
ACGCGATCCATCTCCCTTTCGTCGTGAACCTCCACAAGAGTAGCCATTCCAAGTATTTTG
CAAATCTTAATCATGTATTTGATGTCAAGGTCAGGTAACACAGAAGCGATCAACAGAACA
GCGTCTGCGCCTTTGCTTCTCCCATAGTATATCTGCCATGCTTCTACGATGAACTCTTTG
CAAAGTAAAGGGCACTTCACACCAGCGTCCCTTATAGCTTGCAGATTCTCAAAGCTTCCC
TTGAAGTATTTCTCATCAGTCAAAACACTAAGACATGCAGCTCCACCCTTCTCATAAGCT
TGAGCAATTGCAACAGGGTCAAAATCCTCTCTGAGGATTCCTCTGCTCGGAGAAGCTTTC
TTGACCTCAGCTATTAAACCAGGGAGGCCGGTTCTCTGATGAGCAGATCTAAGAGCACCA
ATGAAGTCTCTAGGAGGAGGAACATTTTCGAGAGCCTTCTTCAGGGTATAGAGAGGCCTT
TTCTCCTTCATCAGAGTAACTTCTTTGTCCTTGTGCCATACGATCTCCTCCAAGATGTTG
CGAGGAGTGTTACCCTCGTTCTGTAACCGGAACTCAAAAGGTCCAACGTAATGCAATGGA
GGACCAGTAGGTGGTCTTCTCCTTATCCTAATACCTTGACTAGAAACTACTTCATTCTGA
TACAACATACCCACTTCTTGCTCACTCGCTTTACCCTCCAATGCCGAAGAAACACTTTCT
GAACCTCCCGTGATTCCAGACTGTTGAGCACGAAGAGGAGGAGCACAAGAGGAGGAGGAG
GAGGGGAATCTGGTGGTGAGGTAAACCGTAGAGAGACGCCGTTGAATGACGGATGAGGGG
AAGGGCTGAATGGAAACAAGTCCTTCCATCTTTTTTTTTTCTTTCTGAACTCTCTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN52JQ U 1
AF RR2DG08TF C 573
BS 1 668 RR2FN52JQ
BS 669 1260 RR2DG08TF

RD RR2FN52JQ 668 0 0
GAAAGAAGAAGGGCTTAAATGGAGAAACAATGTAGTTTTTTTTTCTCTATACAAAAAGTT
TCTCTACACAAAACTCATCCTGAGACATCTCTTCCAAAAAGTGCGCTGATACCTTGCCCT
GGATCACTTTGTTTAACAAGAGATTCACCCACTAAAACTGCTTTGACACCAGCTTGTTGT
ACGAATGCAATGTCTTCTGGTGTGAATAACCCAGATTCTCCAACCACGAGGATGTCTTTC
TGACGGATCAATTCACCACGCTCTCCTTCCAGGAGCCTCTTTGTGATGCCAATATCTACC
TCAAATGTTTCAAGGTTGCGGTTATTGATGCCAATGAGCTCGACTCCTTCAATTGCTAGA
ACGCGATCCATCTCCCTTTCGTCGTGAACCTCCACAAGAGTAGCCATTCCAAGTATTTTG
CAAATCTTAATCATGTATTTGATGTCAAGGTCAGGTAACACAGAAGCGATCAACAGAACA
GCGTCTGCGCCTTTGCTTCTCCCATAGTATATCTGCCATGCTTCTACGATGAACTCTTTG
CAAAGTAAAGGGCACTTCACACCAGCGTCCCTTATAGCTTGCAGATTCTCAAAGCTTCCC
TTGAAGTATTTCTCATCAGTCAAAACACTAAGACATGCAGCTCCACCCTTCTCATAAGCT
TGAGCAAT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2DG08TF 688 0 0
TATAGCTTGCAGATTCTCAAAGCTTCCCTTGAAGTATTTCTCATCAGTCAAAACACTAAG
ACATGCAGCTCCACCCTTCTCATAAGCTTGAGCAATTGCAACAGGGTCAAAATCCTCTCT
GAGGATTCCTCTGCTCGGAGAAGCTTTCTTGACCTCAGCTATTAAACCAGGGAGGCCGGT
TCTCTGATGAGCAGATCTAAGAGCACCAATGAAGTCTCTAGGAGGAGGAACATTTTCGAG
AGCCTTCTTCAGGGTATAGAGAGGCCTTTTCTCCTTCATCAGAGTAACTTCTTTGTCCTT
GTGCCATACGATCTCCTCCAAGATGTTGCGAGGAGTGTTACCCTCGTTCTGTAACCGGAA
CTCAAAAGGTCCAACGTAATGCAATGGAGGACCAGTAGGTGGTCTTCTCCTTATCCTAAT
ACCTTGACTAGAAACTACTTCATTCTGATACAACATACCCACTTCTTGCTCACTCGCTTT
ACCCTCCAATGCCGAAGAAACACTTTCTGAACCTCCCGTGATTCCAGACTGTTGAGCACG
AAGAGGAGGAGCACAAGAGGAGGAGGAGGAGGGGAATCTGGTGGTGAGGTAAACCGTAGA
GAGACGCCGTTGAATGACGGATGAGGGGAAGGGCTGAATGGAAACAAGTCCTTCCATCTT
TTTTTTTTCTTTCTGAACTCTCTTCCCC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 3

CO CL3591Contig1 802 3 11 U
GGTCTCTTCGTCGTTGCTCGAGATTGAAATCGAAACATGGCTCACAGGATACTGAGAGAT
CACGACGCCGATGGATGGGAACGCTCGGACTTCCCAATCGTCTGCGAGTCTTGCCTCGGT
GACAATCCCTACGTTCGAATGACTAAGGCGGAGTATGATAAGGAGTGTAAGATATGCACA
AGACCTTTCACTGTGTTTAGGTGGAGACCTGGGAGAGACGCTAGGTACAAGAAAACCGAG
ATTTGTCAGACTTGCTGCAAGCTGAAGAACGTGTGTCAAGTCTGCCTTCTGGATCTTGAG
TATGGTCTTCCTGTTCAAGCTAGGGATACTGCGCTCAACATTACTACTCATGACTCTATC
CCAAAGAGTGATGTCAACAGAGAGTACTTCGCTGAGGAGCATGACAGGAAGACTAGAGCT
GGACTGGATTATGAATCTTCGTTTGGGAAGATGCGTCCTAATGATACTATTCTAAAGCTT
CAGAGGACAACACCTTACTATAAGAGGAACAGAGCGCATGTTTGTAGTTTCTACATCAGG
GGTGAGTGTACTAGAGGTGATGAATGTCCGTACCGGCATGAGATGCCTGAAACAGGAGAG
CTTTCGCAGCAGAACATTAAAGACCGTTATTATGG*TGTTAATGATCCAGTTGCGATGAA
GTTACTTGGAAAAGCTGGTGAGATGGGCACGTTAGAATCACCAGACGACGAAAGCATCAA
ACTCTCTACGTCGTGGACTTAACTCGAGATCCTCGAGCAGACTTACGAGACAGTTCCCCG
CTTATGGAGAGATCGAGTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C534TF U 8
AF RR2DI13TF U 8
AF RR2DV90TF U 1
BS 1 113 RR2DV90TF
BS 114 114 RR2C534TF
BS 115 271 RR2DV90TF
BS 272 272 RR2C534TF
BS 273 417 RR2DV90TF
BS 418 418 RR2C534TF
BS 419 635 RR2DV90TF
BS 636 636 RR2C534TF
BS 637 696 RR2DV90TF
BS 697 697 RR2C534TF
BS 698 802 RR2DV90TF

RD RR2C534TF 730 0 0
GGGTCGTTG
CTCGAGATTGAAATCGAAACATGGCTCACAGGATACTGAGAGATCACGACGCCGATGTAT
GGGAACGCTCGGACTTCCCAATCGTCTGCGAGTCTTGCCTCGGTGACAATCCCTACGCTC
GAATGACTAAGGCGGAGTATGATAAGGAGTGTAAGATATGCACAAGACCTTTCACTGTGT
TTAGGTGGAGACCTGGGAGAGACGCTAGGTACAAGAAAACCGAGATTTGTCGGACTTGCT
GCAAGCTGAAGAACGTGTGTCAAGTCTGCCTTCTGGATCTTAAGTATGGTCTTCCTGTTC
AAGCTAGGGATACTGCGCTCAACATTACTACTCATGACTCTATCCCAAAGAGTGATGTCA
ACAGAGAGTACTTCGCTGAGGAGCATGACAGGAAGACTAGAGCTGGACTGGATTATGAAT
CTTCGTTTGGGAAGATGCGTCCTAATGATACTATTCTAAAGCTTCAGAGGACAACACCTT
ACTATAAGAGGAACAGAGCGCATGTTTGTAGTTTCTACATCAGGGGTGAGTGTACTAGAG
GTGATGAATGTCCGTACCGGCATGAGATGCCTGAAACAGGAGAGCTTTCGCAGCAGAACA
TTAAAGACCGTTATTATGG*TGTTAATGATCCAGTTGCGATGAAGTTACTTGGAAA*GCT
GGTGAGATGGGCACGTTGGAATCACCAGACGACGAA*GCATCAAACTCTCTACGTCGTGG
A

QA 10 730 10 730
DS 

RD RR2DI13TF 775 0 0
GGGGTCGTA
CTCGAGATTGAAATCGAAACATGGCTCACAGGATACTGAGAGATCATGACGCCGATGGAT
GGGAACGCTCCGATTTCCCAATCGTCTGCGAGTCTTGCCTCGGTGACAATCCCTACGTTC
GAATGACGAAGGCGGAGTATGATAAGGAGTGTAAGATATGCACAAGACCTTTCACTGTCT
TTAGGTGGAGACCTGGCAGAGACGCTAGGTACAAGAAAACCGAGATTTGTCAGACTTGCT
GCAAGCTGAAGAACGTGTGTCAAGTCTGTCTTCTGGATCTTGAGTATGGTCTTCCTGTTC
AAGCTAGGGACACTGCCCTCAACATCACTACTCATGACTCTATCCCAAAGAGTGATGTCA
ACAGAGAGTACTTCGCTGAGGAGCATGACAGGAAGACTAGAGCTGGACTGGATTATGAAT
CTTCGTTTGGGAAGATGCGTCCTAATGATACTATTCTAAAGCTTCAAAGGACAACACCGT
ACTATAAGAGGAACAGAGCGCATGTTTGTAGTTTCTACATTAGGGGTGAGTGTACTAGAG
GTGAGGAATGTCCGTATCGGCATGAGATGCCTGAAACAGGAGAGCTTTCGCAGCAGAACA
TTAAAGACCGTTATTATGG*TGTTAATGATCCAGTTGCGATGAAGTTACTTGGAAAAGCT
GGTGAGATGGGCACGTTAGAATCACCAGACGACGAAAGCATCAAACACTTTACGTCGTGG
ACTTAACTCGAGATCCTCGAGCAGACTTACGTGACAGTTC
TACGCT

QA 10 769 10 769
DS 

RD RR2DV90TF 802 0 0
GGTCTCTTCGTCGTTGCTCGAGATTGAAATCGAAACATGGCTCACAGGATACTGAGAGAT
CACGACGCCGATGGATGGGAACGCTCGGACTTCCCAATCGTCTGCGAGTCTTGTCTCGGT
GACAATCCCTACGTTCGAATGACTAAGGCGGAGTATGATAAGGAGTGTAAGATATGCACA
AGACCTTTCACTGTGTTTAGGTGGAGACCTGGGAGAGACGCTAGGTACAAGAAAACCGAG
ATTTGTCAGACTTGCTGCAAGCTGAAGAACGCGTGTCAAGTCTGCCTTCTGGATCTTGAG
TATGGTCTTCCTGTTCAAGCTAGGGATACTGCGCTCAACATTACTACTCATGACTCTATC
CCAAAGAGTGATGTCAACAGAGAGTACTTCGCTGAGGAGCATGACAGGAAGACTAGATCT
GGACTGGATTATGAATCTTCGTTTGGGAAGATGCGTCCTAATGATACTATTCTAAAGCTT
CAGAGGACAACACCTTACTATAAGAGGAACAGAGCGCATGTTTGTAGTTTCTACATCAGG
GGTGAGTGTACTAGAGGTGATGAATGTCCGTACCGGCATGAGATGCCTGAAACAGGAGAG
CTTTCGCAGCAGAACATTAAAGACCGTTATTATGGGTGTTAATGATCCAGTTGCGATGAA
GTTACTTGGAAAAGCTGGTGAGATGGGCACGTTAGA*TCACCAGACGACGAAAGCATCAA
ACTCTCTACGTCGTGGACTTAACTCGAGATCCTCGAGCAGACTTACGAGACAGTTCCCCG
CTTATGGAGAGATCGAGTCATC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 3

CO CL3592Contig1 439 3 7 U
GAAGAGTCCAGAATCATCAAGAGAAGTTCTATTTTAATTTAGTTTTTAAACATAAATATT
TTCTTACAAATTCAAAGAGCTTGAAAAATGAGTACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTCTG
GCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCGTATTTCTCAAATTTGGCTTAAAGGTTGAGTTTTGG
ATATGTTTGATCTTGACGCTGTTTGGTTATCTTCCCGGGATCCTTTACGCTCTTTATATC
ATCACCAAGGACTGATTTTCATCTCATTTGTTCTTCCTCTCGGTCTCCTTGAGGAACAGC
TGTTTCGTCGTCGTGATCTCCTATTTGGGACTGTTTCGTCATTTGTTTTATATGCTCTGA
GTAATTAATTATCATTGTTGTATTTGTATTATTATTTACTTTATGCTGATATATATAAAG
AAATTCGTTGGTTTAAAAG


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG54JQ C 1
AF RR2DW08TF U 2
AF RR2BG54TF U 1
BS 1 3 RR2BG54JQ
BS 4 168 RR2DW08TF
BS 169 169 RR2BG54TF
BS 170 359 RR2DW08TF
BS 360 360 RR2BG54TF
BS 361 432 RR2DW08TF
BS 433 439 RR2BG54JQ

RD RR2BG54JQ 439 0 0
GAAGAGTCCAGAATCATCAAGAGAAGTTCTATTTTAATTTAGTTTTTAAACATAAATATT
TTCTTACAAATTCAAAGAGCTTGAAAAATGAGTACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTCTG
GCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCGTATTTCTCAAATTTGGCTTAAAGGTTGAGTTTTGG
ATATGTTTGATCTTGACGCTGTTTGGTTATCTTCCCGGGATCCTTTACGCTCTTTATATC
ATCACCAAGGACTGATTTTCATCTCATTTGTTCTTCCTCTCGGTCTCCTTGAGGAACAGC
TGTTTCGTCGTCGTGATCTCCTATTTGGGACTGTTTCGTCATTTGTTTTATATGCTCTGA
GTAATTAATTATCATTGTTGTATTTGTATTATTATTTACTTTATGCTGATATATATAAAG
AAATTCGTTGGTTTAAAAG

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2DW08TF 431 0 0
GG
GAGTCCAGAATCATCAAGAGAAGTTCTATTTTAATTTAGTTTTTAAACATAAATATTTTC
TTACAAATTCAAAGAGCTTGAAAAATGAGTACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTCTGGCT
ATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCGTATTTCTCAAATTTGGCTTAAAGTTTGAGTTTTGGATA
TGTTTGATCTTGACGCTGTTTGGTTATCTTCCCGGGATCCTTTACGCTCTTTATATCATC
ACCAAGGACTGATTTTCATCTCATTTGTTCTTCCTCTCGGTCTCCTTGAGGAACAGCTGT
TTCGTCGTCGTGATCTCCTATTTGGGACTGTTTCGTCATTTGTTTTATATGCTCTGGGTA
ATTAATTATCATTGTTGTATTTGTATTATTATTTACTTTATGCTGATATATATAAAGAAA
TTCGTTGGT

QA 3 431 3 431
DS 

RD RR2BG54TF 439 0 0
GAA
GAGTCCAGAATCATCAAGAGAAGTTCTATTTTAATTTAGTTTTTAAACATAAATATTTTC
TTACAAATTCAAAGAGCTTGAAAAATGAGTACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTCTGGCT
ATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCGTATTTCTCAAATTTGGCTTAAAGGTTGAGTTTTGGATA
TGTTTGATCTTGACGCTGTTTGGTTATCTTCCCGGGATCCTTTACGCTCTTTATATCATC
ACCAAGGACTGATTTTCATCTCATTTGTTCTTCCTCTCGGTCTCCTTGAGGAACAGCTGT
TTCGTCGTCGTGATCTCCTATTTGGGACTGTTTCGTCATTTGTTTTATATGCTCTGAGTA
ATTAATTATCATTGTTGTATTTGTATTATTATTTACTTTATGCTGATATATATAAAGAAA
TTCGTTGGT
TTAAAAG

QA 4 432 4 432
DS 



AS 1 3

CO CL3593Contig1 900 3 6 U
CTTGTATTTTACTTTAAAGTTTAAACATCTCAAGGTATCCAAAACACGATCAAGAATCAA
GATCAAGATCGGCTCCAACAGGTGCAATCAATAATCAACGGGCTGAGAAAAAGCGTCGTC
TAACGTTTGAACAAGTAAGTATATAATAAGACAAGAGTCAGAGAATGAAACGGTCTTTGC
TGCTTTAGGTTTTGATTCCTTTTATGTTAGGTGAATATGTTGGAGAAGAGTTTTGAAGAA
GACAACAAACTGGAACCAGAGAGAAAGACTGAGCTAGCTAAAGTGCTTGGATTGCCTAAA
CGACAAGTTGCTGTTTGGTTTCAGAATCGAAAAGCTCGGTGCAAGGTCAAGCAGATCGAA
AGAGATTATGATGTTCTCAAGGCTTGTTATGATTCCCTACTGGCTAAACATGAATCAGTC
ATCTCAGAGAATGAGAAACTCATATCTAAAGTAAGAGCAAACGCTCCTCTTTCTATGGCC
TTCTATCGAGCTCAGTTTCTAACATTGGAGACTTTTTTTACAGGTCTTAACTTTGACTAA
GATGCTTCCTCTTGCAACAAACCAAACCCAAAGAAACTTCCAAGTCAAGCTTAACTCTAA
AGGCGATGATGAAAGTATGAGCTCTTCCGCTGCTTTAGTTCCATTGGCAAATGACCATTA
CTTTACCAACGTTGATGAAACATTCGGCTGGTGGGTTTGGCCATCGAATCTTATGTAAAA
ATCTGATGATCCAGGACCGATTTAAAGCGCAAGAGAGAGAGAGAGAGACTTAGTATTCCA
AGCTTCTGTTCTAAACATGGGCAAATGTTGAATAGACTACAGAACATAGTGTTCATCAGA
GAAATAAGAATGTTTCAAAAGCTACTTCAATCACTATTTTAAATAAATATATCATATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C621JQ U 1
AF RR2C851JQ U 71
AF RR2C621TF C 146
BS 1 162 RR2C621JQ
BS 163 163 RR2C851JQ
BS 164 323 RR2C621JQ
BS 324 324 RR2C851JQ
BS 325 623 RR2C621JQ
BS 624 900 RR2C621TF

RD RR2C621JQ 630 0 0
CTTGTATTTTACTTTAAAGTTTAAACATCTCAAGGTATCCAAAACACGATCAAGAATCAA
GATCAAGATCGGCTCCAACAGGTGCAATCAATAATCAACGGGCTGAGAAAAAGCGTCGTC
TAACGTTTGAACAAGTAAGTATATAATAAGACAAGAGTCAGAAAATGAAACGGTCTTTGC
TGCTTTAGGTTTTGATTCCTTTTATGTTAGGTGAATATGTTGGAGAAGAGTTTTGAAGAA
GACAACAAACTGGAACCAGAGAGAAAGACTGAGCTAGCTAAAGTGCTTGGATTGCCTAAA
CGACAAGTTGCTGTTTGGTTTCAAAATCGAAAAGCTCGGTGCAAGGTCAAGCAGATCGAA
AGAGATTATGATGTTCTCAAGGCTTGTTATGATTCCCTACTGGCTAAACATGAATCAGTC
ATCTCAGAGAATGAGAAACTCATATCTAAAGTAAGAGCAAACGCTCCTCTTTCTATGGCC
TTCTATCGAGCTCAGTTTCTAACATTGGAGACTTTTTTTACAGGTCTTAACTTTGACTAA
GATGCTTCCTCTTGCAACAAACCAAACCCAAAGAAACTTCCAAGTCAAGCTTAACTCTAA
AGGCGATGATGAAAGTATGAGCT
CTTCCGC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2C851JQ 553 0 0
GGCTCCAACAGGTGCAATCAATAATCAACGGGCTGAGAAAAAGCGTCGTCTAACGTTTGA
ACAAGTAAGTATATAATAAGACAAGAGTCAGAGAATGAAACGGTCTTTGCTGCTTTAGGT
TTTGATTTCTTTTATGTTAGGTGAATATGTTGGAGAAGAGTTTTGAAAAAAACAACAAAC
TGGAACCAGAGAGAAAGACTGAGCTAGCTAAAGGGCTTGGATTGCCTAAACGACAAGTTG
CTGTTTGGTTTCAGAATCGAAAAGCTCGGTGCAAGGTCAAGCAAATCGAAAGAGATTATG
ATGTTCTCAAGGCTTGTTATGATTCCCTACTGGCTAAACATAAATCAGTCATCTCAGAGA
ATGAGAAACTCATATCTAAAGTAAGAGCAAACGCTCCTCTTTCTATGGCTTTCTATTGAG
CTCAGTTTCTAACATTGGAGACTTTTTTTACAGGTCTTAACTTTGACTAAGATGCTTCCT
CCTGCAACAAACCAAACCCAAAGAAACTTCCAAGTCAAGCTTAACTCTAAAGGCGATGAT
GAAAGTATGAGCT

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2C621TF 755 0 0
ATAAGACAAGAGTCAGAGAATGAAACGGTCTTTGCTGCTTTAGGTTTTGATTCGTTTTAT
GTTAGGTGAATATGTTGGAGAAGAGTTTTGAAGAAGACAACAAACTGGAACCAGAGAGAA
AGACTGAGCTAGCTAAAGTGCTTGGATTGCCTAAACGACAAGTTGCTGTTTGGTTTCAGA
ATCGAAAAGCTCGGTGCAAGGTCAAGCAGATCGAAAGAGATTATGATGTTCTCAAGGCTT
GTTATGATTCCCTACTGGCTAAACATGAATCAGTCATCTCAGAGAATGAGAAACTCATAT
CTAAAGTAAGAGCAAACGCTCCTCTTTCTATGGCCTTCTATCGAGCTCAGTTTCTAACAT
TGGAGACTTTTTTTACAGGTCTTAACTTTGACTAAGATGCTTCCTCTTGCAACAAACCAA
ACCCAAAGAAACTTCCAAGTCAAGCTTAACTCTAAAGGCGATGATGAAAGTATGAGCTCT
TCCGCTGCTTTAGTTCCATTGGCAAATGACCATTACTTTACCAACGTTGATGAAACATTC
GGCTGGTGGGTTTGGCCATCGAATCTTATGTAAAAATCTGATGATCCAGGACCGATTTAA
AGCGCAAGAGAGAGAGAGAGAGACTTAGTATTCCAAGCTTCTGTTCTAAACATGGGCAAA
TGTTGAATAGACTACAGAACATAGTGTTCATCAGAGAAATAAGAATGTTTCAAAAGCTAC
TTCAATCACTATTTTAAATAAATATATCATATGCC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL3594Contig1 883 2 2 U
GGTAAAAAAAATTGTAATACAATATAATAAATTAATGTTATAGAAAATAGATAAAACATG
CATGTTTAGGCTTCTAGCCCTCAACTAACATAAAGTGTGCAAAAAAAATGTAAACAAGAA
AGAAAGGAGATGAGGAAATGAATTATGGTTCCTTTTTTTTTTGAACACCAAGGAAGTGGA
TGAGTCAAAAAGCTCAAATAAGCTTCTTCTTCTCAAAGTAATGCTTCAAGTAGACTACTT
GTAATCCAGAGACAACAATGCAAATAGCTAGCGACATCATACTGCACCAAGCTACTCGCG
AGTTCGTTTTCTCGCTCACTGTCCTCATGTTTGTTTCTTAGGTAGATTAGATTTTCATGG
ATGGCTTCGACTGCGCCTTCAAGTTTCCTAATCTCCAGCTCCACTCCCTCGAGCTTCTCT
TTCTTAGCAATAGAAGCCCAATCCTTAGTAGCGATTCCAGTTTTCCATTCAACGTTGATG
CTAACGTCCTTGTTGCCGTGACTCTTTGCATCTGCCCAGAAGCAGGCTATGTAGTTCCCT
GATTCTTTTGTTGTAAATGCAAATTCTCCATGCGTCACGTTTTCCGAATGGTGCAGATTG
TTTCCGTATGGGGACGTCACCTTGGCGGATATAGTGGGTTTGATGGAATGATCCTCGGAG
ATGATGATGTAATCGGCCAAGACGACAATATTGCTCTGTATTTCTTCAGACACGCACTTT
GTTCCCGAGGGAGGCACGTCTAGCCAAATCGCCTCACTGACCGGAACCATAACGAACAAA
AGGAGCGCTGTCGTGAGGCCGTGGCGCATCTTAGCAGACATCTTCGTCATGGAGCTTTCA
AACTTTACTATTCTTTTCATCGATCCGTGTCTTGTGGTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM02JQ U 1
AF RR2E249TF C 209
BS 1 700 RR2FM02JQ
BS 701 883 RR2E249TF

RD RR2FM02JQ 700 0 0
GGTAAAAAAAATTGTAATACAATATAATAAATTAATGTTATAGAAAATAGATAAAACATG
CATGTTTAGGCTTCTAGCCCTCAACTAACATAAAGTGTGCAAAAAAAATGTAAACAAGAA
AGAAAGGAGATGAGGAAATGAATTATGGTTCCTTTTTTTTTTGAACACCAAGGAAGTGGA
TGAGTCAAAAAGCTCAAATAAGCTTCTTCTTCTCAAAGTAATGCTTCAAGTAGACTACTT
GTAATCCAGAGACAACAATGCAAATAGCTAGCGACATCATACTGCACCAAGCTACTCGCG
AGTTCGTTTTCTCGCTCACTGTCCTCATGTTTGTTTCTTAGGTAGATTAGATTTTCATGG
ATGGCTTCGACTGCGCCTTCAAGTTTCCTAATCTCCAGCTCCACTCCCTCGAGCTTCTCT
TTCTTAGCAATAGAAGCCCAATCCTTAGTAGCGATTCCAGTTTTCCATTCAACGTTGATG
CTAACGTCCTTGTTGCCGTGACTCTTTGCATCTGCCCAGAAGCAGGCTATGTAGTTCCCT
GATTCTTTTGTTGTAAATGCAAATTCTCCATGCGTCACGTTTTCCGAATGGTGCAGATTG
TTTCCGTATGGGGACGTCACCTTGGCGGATATAGTGGGTTTGATGGAATGATCCTCGGAG
ATGATGATGTAATCGGCCAAGACGACAATATTGCTCTGTA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2E249TF 675 0 0
CTTCTCAAAGTAATGCTTCAAGTAGACTACTTGTAATCCAGAGACAACAATGCAAATAGC
TAGCGACATCATACTGCACCAAGCTACTCGCGAGTTCGTTTTCTCGCTCACTGTCCTCAT
GTTTGTTTCTTAGGTAGATTAGATTTTCATGGATGGCTTCGACTGCGCCTTCAAGTTTCC
TAATCTCCAGCTCCACTCCCTCGAGCTTCTCTTTCTTAGCAATAGAAGCCCAATCCTTAG
TAGCGATTCCAGTTTTCCATTCAACGTTGATGCTAACGTCCTTGTTGCCGTGACTCTTTG
CATCTGCCCAGAAGCAGGCTATGTAGTTCCCTGATTCTTTTGTTGTAAATGCAAATTCTC
CATGCGTCACGTTTTCCGAATGGTGCAGATTGTTTCCGTATGGGGACGTCACCTTGGCGG
ATATAGTGGGTTTGATGGAATGATCCTCGGAGATGATGATGTAATCGGCCAAGACGACAA
TATTGCTCTGTATTTCTTCAGACACGCACTTTGTTCCCGAGGGAGGCACGTCTAGCCAAA
TCGCCTCACTGACCGGAACCATAACGAACAAAAGGAGCGCTGTCGTGAGGCCGTGGCGCA
TCTTAGCAGACATCTTCGTCATGGAGCTTTCAAACTTTACTATTCTTTTCATCGATCCGT
GTCTTGTGGTTGTCC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 3

CO CL3595Contig1 541 3 5 U
GGACACATCAAAAACATCAACACCACAACAATACACACCAAAACCTCCTTTTTCTTCTCT
TCATCTGCTCTCTCTGAGTCTCAAATCCAAAATACCAACAATGGAGGCAATGAAGATGAA
GCTTTTCGTAGCGGTTATGATTGCATTGGTAGCGTTTTCTGCGGTTCAACAGTCGGCTGC
AGCGGTTGACGCACCTGCCCCGAGCCCTACCTCCGATGCATCCTCGTTTATCCCTACTTT
CTTTGCCTCCGTCACGGTTTTGGCCTTTGGATTACTATTTTAAGAAGTTTTCCCCCTTCT
TATGTTATTTTTTTGAAAAAAGTTCCCCTTCCTATGTTTTAAGTTATTTAAATAAAATCA
TTTAACCGTTGTTTTAAGCCTCGTCTTGTAACTCTTGTTTGCGTCTCGTTGAGTTCTTGT
TGATTTTATGTCTTCAGTTTGATCTATATTTCTTCCATGTAACGTTATTGAAATAGACTC
GTCCTAATATCAATAATAATTGTTTCCCTCTTTTGATATATTAATTCATTATCTTAAAAG
G


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2H263JQ C 1
AF RR2H263TF U 1
AF RR2G679TF U 1
BS 1 95 RR2G679TF
BS 96 96 RR2H263TF
BS 97 313 RR2G679TF
BS 314 314 RR2H263TF
BS 315 541 RR2G679TF

RD RR2H263JQ 510 0 0
GGACACATCAAAAACATCAACACCACAACAATACACACCAAAACCTCCTTTTTCTTCTCT
TCATCTGCTCTCTCTGAGTCTCAAATCCAAAATACCAACAATGGAGGCAATGAAGATGAA
GCTTTTCGTAGCGGTTATGATTGCATTGGTAGCGTTTTCTGCGGTTCAACAGTCGGCTGC
AGCGGTTGACGCACCTGCCCCGAGCCCTACCTCCGATGCATCCTCGTTTATCCCTACTTT
CTTTGCCTCCGTCACGGTTTTGGCCTTTGGATTACTATTTTAAGAAGTTTTCCCCCTTCT
TATGTTATTTTTTTGAAAAAAGTTCCCCTTCCTATGTTTTAAGTTATTTAAATAAAATCA
TTTAACCGTTGTTTTAAGCCTCGTCTTGTAACTCTTGTTTGCGTCTCGTTGAGTTCTTGT
TGATTTTATGTCTTCAGTTTGATCTATATTTCTTCCATGTAACGTTATTGAAATAGACTC
GTCCTAATATCAATAATAATTGTTTCCCTC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2H263TF 510 0 0
GGACACATCAAAAACATCAACACCACAACAATACACACCAAAACCTCCTTTTTCTTCTCT
TCATCTGCTCTCTCTGAGTCTCAAATCCAAAATACCAACAATGGAGGCAATGAAGATGAA
GCTTTTCGTAGCGGTTATGATTGCATTGGTAGCGTTTTCTGCGGTTCAACAGTCGGCTGC
AGCGGTTGACGCACCTGCCCCGAGCCCTACCTCCGATGCATCCTCGTTTATCCCTACTTT
CTTTGCCTCCGTCACGGTTTTGGCCTTTGGATTACTATTTTAAGAAGTTTTCCCCCTTCT
TATGTTATTTTTTTGAAAAAAGTTCCCCTTCCTATGTTTTAAGTTATTTAAATAAAATCA
TTTAACCGTTGTTTTAAGCCTCGTCTTGTAACTCTTGTTTGCGTCTCGTTGAGTTCTTGT
TGATTTTATGTCTTCAGTTTGATCTATATTTCTTCCATGTAACGTTATTGAAATAGACTC
GTCCTAATATCAATAATAATTGTTTCCCTC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2G679TF 541 0 0
GGACACATCAAAAACATCAACACCACAACAATACACACCAAAACCTCCTTTTTCTTCTCT
TCATCTGCTCTCTCTGAGTCTCAAATCCAAAATACTAACAATGGAGGCAATGAAGATGAA
GCTTTTCGTAGCGGTTATGATTGCATTGGTAGCGTTTTCTGCGGTTCAACAGTCGGCTGC
AGCGGTTGACGCACCTGCCCCGAGCCCTACCTCCGATGCATCCTCGTTTATCCCTACTTT
CTTTGCCTCCGTCACGGTTTTGGCCTTTGGATTACTATTTTAAGAAGTTTTCCCCCTTCT
TATGTTATTTTTT*GAAAAAAGTTCCCCTTCCTATGTTTTAAGTTATTTAAATAAAATCA
TTTAACCGTTGTTTTAAGCCTCGTCTTGTAACTCTTGTTTGCGTCTCGTTGAGTTCTTGT
TGATTTTATGTCTTCAGTTTGATCTATATTTCTTCCATGTAACGTTATTGAAATAGACTC
GTCCTAATATCAATAATAATTGTTTCCCTCTTTTGATATATTAATTCATTATCTTAAAAG
G

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 3

CO CL3596Contig1 737 3 2 U
GGAAGTCTGAGATTTATCAGAAGAATCGTTCTTCCTTGAGAAGGAGACGAAAATGCAGAG
GCTTAGCACAAAGCTGCGTTCCATTTCATTCCATTCTAATCGGAGTCTCTCTTTCGTCGG
CGTTCCTCGCCGTCTCATCCACCATTCTCCCACTCCTCAGCTAACCCTAGGTTTCTCCAC
GCCCACCAAATGGAGCTTCTTTCCCTCCTCCTCCCTCCGCGGAGTTTCTCCCTCCATGGG
CTCTGCCTTCCTTCCTCATCATCTTCTTCAAGTTCGGAATATCACTTCCAAAGACAAAAT
GGCAAAATGGAAGAAGAAGTGGAGGCCTAGGACTCCAATCACCTCCAAAGTCAAGAAAGT
CAAGATCAAGTTCTATTCGTCATACAAAGACAGGTTTAAGCCACTGAATGATGGTACCAT
CCGTCGCTGGAAAGAAGGCAAGAGCCACAACGCTCACTTGAAGTCAAATAAATCAAAGCG
TAGATTGAGACAGCCTGGACTAGTCCCACCAGCATATGCCAAAGTCATGAAGAAACTCAA
TTTCTGCAATTGATAGATTAAGTATAAGAAACAGTTCAGTCTCTTCCAGTTTTCCTTGAT
AATACTCACCTGATACGTGGTACCCAAAGATTTAATCAAACTTCATTTCTTTTGTTGTTG
TTTCAGTTTCAACCTTATCTCCAAGTAATAAATTGGCACTTTGATCCTTTTCCCTTAGGG
TCAGTATCAGTTGAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU69TF U 1
AF RR2BU69JQ C 98
AF RR2F380TF U 17
BS 1 704 RR2BU69TF
BS 705 737 RR2F380TF

RD RR2BU69TF 713 0 0
GGAAGTCTGAGATTTATCAGAAGAATCGTTCTTCCTTGAGAAGGAGACGAAAATGCAGAG
GCTTAGCACAAAGCTGCGTTCCATTTCATTCCATTCTAATCGGAGTCTCTCTTTCGTCGG
CGTTCCTCGCCGTCTCATCCACCATTCTCCCACTCCTCAGCTAACCCTAGGTTTCTCCAC
GCCCACCAAATGGAGCTTCTTTCCCTCCTCCTCCCTCCGCGGAGTTTCTCCCTCCATGGG
CTCTGCCTTCCTTCCTCATCATCTTCTTCAAGTTCGGAATATCACTTCCAAAGACAAAAT
GGCAAAATGGAAGAAGAAGTGGAGGCCTAGGACTCCAATCACCTCCAAAGTCAAGAAAGT
CAAGATCAAGTTCTATTCGTCATACAAAGACAGGTTTAAGCCACTGAATGATGGTACCAT
CCGTCGCTGGAAAGAAGGCAAGAGCCACAACGCTCACTTGAAGTCAAATAAATCAAAGCG
TAGATTGAGACAGCCTGGACTAGTCCCACCAGCATATGCCAAAGTCATGAAGAAACTCAA
TTTCTGCAATTGATAGATTAAGTATAAGAAACAGTTCAGTCTCTTCCAGTTTTCCTTGAT
AATACTCACCTGATACGTGGTACCCAAAGATTTAATCAAACTTCATTTCTTTTGTTGTTG
TTTCAGTTTCAACCTTATCTCCAAGTAATAAATTGGCACTTTGA
CAAAAAAAA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2BU69JQ 609 0 0
AATCGGAGTCTCTCTTTCGTCGGCGTTCCTCGCCGTCTCATCCACCATTCTCCCACTCCT
CAGCTAACCCTAGGTTTCTCCACGCCCACCAAATGGAGCTTCTTTCCCTCCTCCTCCCTC
CGCGGAGTTTCTCCCTCCATGGGCTCTGCCTTCCTTCCTCATCATCTTCTTCAAGTTCGG
AATATCACTTCCAAAGACAAAATGGCAAAATGGAAGAAGAAGTGGAGGCCTAGGACTCCA
ATCACCTCCAAAGTCAAGAAAGTCAAGATCAAGTTCTATTCGTCATACAAAGACAGGTTT
AAGCCACTGAATGATGGTACCATCCGTCGCTGGAAAGAAGGCAAGAGCCACAACGCTCAC
TTGAAGTCAAATAAATCAAAGCGTAGATTGAGACAGCCTGGACTAGTCCCACCAGCATAT
GCCAAAGTCATGAAGAAACTCAATTTCTGCAATTGATAGATTAAGTATAAGAAACAGTTC
AGTCTCTTCCAGTTTTCCTTGATAATACTCACCTGATACGTGGTACCCAAAGATTTAATC
AAACTTCATTTCTTTTGTTGTTGTTTCAGTTTCAACCTTATCTCCAAGTAATAAATTGGC
ACTTTGA
CC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2F380TF 721 0 0
GG
AGAAGAATCGTTCTTCCTTGAGAAGGAGACGAAAATGCAGAGGCTTAGCACAAAGCTGCG
TTCCATTTCATTCCATTCTAATCGGAGTCTCTCTTTCGTCGGCGTTCCTCGCCGTCTCAT
CCACCATTCTCCCACTCCTCAGCTAACCCTAGGTTTCTCCACGCCCACCAAATGGAGCTT
CTTTCCCTCCTCCTCCCTCCGCGGAGTTTCTCCCTCCATGGGCTCTGCCTTCCTTCCTCA
TCATCTTCTTCAAGTTCGGAATATCACTTCCAAAGACAAAATGGCAAAATGGAAGAAGAA
GTGGAGGCCTAGGACTCCAATCACCTCCAAAGTCAAGAAAGTCAAGATCAAGTTCTATTC
GTCATACAAAGACAGGTTTAAGCCACTGAATGATGGTACCATCCGTCGCTGGAAAGAAGG
CAAGCGCCACAACGCTCACTTGAAGTCAAAGAAATCAAAGCGTAGATTGAGACAGCCTGG
ACTAGTCCCACCAGCATATGCCAAAGTCATGAAGAAACTCAATTTCTGCAATTGATAGAT
TAAGTATAAGAAACAGTTCAGTCTCTTCCAGTTTTCCTTGATAATACTCACCTGATACGT
GGTACCCAAAGATTTAATCAAACTTCATTTCTTTTGTTGTTGTTTCAGTTTCAACCTTAT
CTCCAAGTAATAAATTGGCACTTTGATCCTTTTCCCTTAGGGTCAGTATCAGTTGAAAC

QA 3 721 3 721
DS 



AS 1 3

CO CL3597Contig1 967 3 10 U
CAAGAAACTTGATTACGTTATTGTTTTCAGTAAAACCAAGTCTCAACTGAATCATAGCAT
TAGAAAGGATGTAAAGGCAATATAATAAGGATATTACTAGCCCTACTTATCATGTGCTAA
CACAAAACAATGCACGATTCTGTTCCACTTTTTTTTTTTTTATCTACAAATGTTTCTGAC
AGAAAACAGTTGGTTTGAAAATTGAGTTTGCGAACACTCCTTTCAAGTCTAGGAAGTTGG
GACAGGAAGATATCCTGCACGGGCTCTTAATGTTTCGGTTCTTTTGCTTCTCTCCATAAC
TCCCACCAGCCATTCTATGCTCTCTTTGATTCCTCGCCCATCATATCCAGAAGCTGCTTC
AAACATGTACACCCTTTCATCTAGTTTCTTGAGATCTAGGTATCGGTCTAGCTCCTCAGC
CGAGACAGCATTTGGGAGATCTTGCTTGTTTGCCAATATCAAAAGAGGCGCTCCTTGCAA
ATCCTCATGCCGCAGGGCTTTCTCTAGAGCAGATTTGGAGTCTTCAAAGCGAGATGGGCA
AGCTGCGTCGATCAAATATATCAATGCGTGTGCTTCTTCATAATACTTTTCCCAAATCGA
ACGCAAACCAGGCTGACCACCAAGGTCCCAGAAGACGATTTTAGCATTGGCGACTTCAAT
ACGACCGATGTTAAGGCCAACAGTAGGAACAATACGATCATGTGGAAGACCTTCAGAGAT
TGAGTAAATCGTCTTCGGTTTCTCCAAAAACGTCGTTTTGCCAGCTTTGTCGATACCAAG
AATGAGGACATGGAACTCAGTCTTGCTGAACATGTAAGTCCAGAGTCCATGCATAAGAGA
AAACATCACCTTCCTCTTCCTTTGGATTCTTTTAATTTACTTGGATCTTCTCTTTTGAGT
TGAGAAGAAGATCGGGGAGAAGGACAAGGAGAGAAAGATCTGGTTTTGCACTCAAACTCT
GTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM22JQ U 1
AF RR2GW10JQ U 80
AF RR2CM22TF C 264
BS 1 139 RR2CM22JQ
BS 140 140 RR2GW10JQ
BS 141 423 RR2CM22JQ
BS 424 424 RR2GW10JQ
BS 425 506 RR2CM22JQ
BS 507 507 RR2GW10JQ
BS 508 511 RR2CM22JQ
BS 512 512 RR2GW10JQ
BS 513 627 RR2CM22JQ
BS 628 967 RR2CM22TF

RD RR2CM22JQ 630 0 0
CAAGAAACTTGATTACGTTATTGTTTTCAGTAAAACCAAGTCTCAACTGAATCATAGCAT
TAGAAAGGATGTAAAGGCAATATAATAAGGATATTACTAGCCCTACTTATCATGTGCTAA
CACAAAACAATGCACGATTTTGTTCCACTTTTTTTTTTTTTATCTACAAATGTTTCTGAC
AGAAAACAGTTGGTTTGAAAATTGAGTTTGCGAACACTCCTTTCAAGTCTAGGAAGTTGG
GACAGGAAGATATCCTGCACGGGCTCTTAATGTTTCGGTTCTTTTGCTTCTCTCCATAAC
TCCCACCAGCCATTCTATGCTCTCTTTGATTCCTCGCCCATCATATCCAGAAGCTGCTTC
AAACATGTACACCCTTTCATCTAGTTTCTTGAGATCTAGGTATCGGTCTAGCTCCTCAGC
CGAAACAGCATTTGGGAGATCTTGCTTGTTTGCCAATATCAAAAGAGGCGCTCCTTGCAA
ATCCTCATGCCGCAGGGCTTTCTCTAAAGCAAATTTGGAGTCTTCAAAGCGAGATGGGCA
AGCTGCGTCGATCAAATATATCAATGCGTGTGCTTCTTCATAATACTTTTCCCAAATCGA
ACGCAAACCAGGCTGACCACCAAGGTC
CCA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2GW10JQ 548 0 0
ATATAATAAGGATATTACTAGCCCTACTTATCATGTGCTAACACAAAACAATGCACGATT
CTGTTCCACTTTTTTTTTT***ATCTACAAATGTTTCTGACAGAAAACAGTTGGTTTGAG
AATTGAGTTTGCGAACACTCCTTTCAAGTCTAGGAAGTTGGGACAGGAAGATATCCTGCA
CGGGCTCTTAATGTTTCGGTTCTTTTGCTTCTCTCCATAACTCCCACCAGCCATTCTATG
CTCTCTTTGATTCCTCGCCCATCATATCCAGAAGCTGCTTCAAACATGTACACCCTTTCA
TCTAGTTTCTTGAGATCTAGGTATCGGTCTAGCTCCTCAGCCGAGACAGCATTTGGGAAA
TCTTGCTTGTTTGCCAATATCAAAAGAGGCGCTCCTTGCAAATCCTCATGCCGCAGGGCT
TTCTCTAGAGCAGATTTGGAGTCTTCAAAGCGAGATGGGCAAGCTGCGTCGATCAAATAT
ATCAATGCGTGTGCTTCTTCATAATACTTTTCCCAAATCGAACGCAAACCAGGCTGACCA
CCAAGGTC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RR2CM22TF 704 0 0
CTCTTAATGTTTCGGTTCTTT*GCTTCTCTCCATAACTCCCACCAGCCATTCTATGCTCT
CTTTGATTCCTCGCCCATCATATCCAGAAGCTGCTTCAAACATGTACACCCTTTCATCTA
GTTTCTTGAGATCTAGGTATCGGTCTAGCTCCTCAGCCGAGACAGCATTTGGGAGATCTT
GCTTGTTTGCCAATATCAAAAGAGGCGCTCCTTGCAAATCCTCATGCCGCAGGGCTTTCT
CTAGAGCAGATTTGGAGTCTTCAAAGCGAGATGGGCAAGCTGCGTCGATCAAATATATCA
ATGCGTGTGCTTCTTCATAATACTTTTCCCAAATCGAACGCAAACCAGGCTGACCACCAA
GGTCCCAGAAGACGATTTTAGCATTGGCGACTTCAATACGACCGATGTTAAGGCCAACAG
TAGGAACAATACGATCATGTGGAAGACCTTCAGAGATTGAGTAAATCGTCTTCGGTTTCT
CCAAAAACGTCGTTTTGCCAGCTTTGTCGATACCAAGAATGAGGACATGGAACTCAGTCT
TGCTGAACATGTAAGTCCAGAGTCCATGCATAAGAGAAAACATCACCTTCCTCTTCCTTT
GGATTCTTTTAATTTACTTGGATCTTCTCTTTTGAGTTGAGAAGAAGATCGGGGAGAAGG
ACAAGGAGAGAAAGATCTGGTTTTGCACTCAAACTCTGTGTTCC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL3598Contig1 794 2 3 U
GGCCAAAACACATGACACTTTAGTTATACTCAAGAGCATAGTGGCACATGAAGTTTGAAA
ATGCATAATTTTTAAGGGGACCAAATCGTCCCATCAAGACAGATATCGCCCCCTCTCTAA
CTTATGTGATACACTTTTTGTCCAGAACACAAGAAAGAGGAGAACCATTTTATTATTTGA
CAGAAGCAAATGAAAAGGCATCAAAATACCAAATCTGGTTTCCGCAATTTCATTGTGAGA
AAATAATTAGTCCAGGAAAACGACCTTGAAGCAGAAGCAGCATCAATTGTAGAAGTCTGT
TGGTATCTTTTCACTCACAGTAGAACCGAAGTTAGGACCACCTTTGCGATATTGGATAAG
AAACTCCACTGGATATCCCTTCAACTTATGAGGGACAAGGTCCAAATCCTGAAACGTCAA
GGCCTTGTCAGATACAAGTGTATCTGTCGTAAGCGCATTGATTTGATCCAGATTGAAGAT
CTGGGGTGAGGGTAGAGGAAACGGGACTTTGTTCACCATGAAATCCCGAGGACCCGCCAT
TGCCTTAGCAATTGGAAATGGAAGCTTAACATATCGAGGCCATTCACGGATCATATCAAA
CATGATCTCTGCCAAATCATGAGGGGTAAAGACATCTGGACCACCCAATTCGTAGGTTTT
ACCCATGCTAGAGCCATCATCCTTGAGAGCTGCAACAATTGCAGCAGCAACATCAACCAC
ATATACGGGCTGGAATTTGTTGGTCCCACCACCTATGAGCGGGAGGAAACCATATTTCTT
AACGAACATTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E025JQ U 72
AF RR2AU50JQ U 1
BS 1 455 RR2AU50JQ
BS 456 456 RR2E025JQ
BS 457 794 RR2AU50JQ

RD RR2E025JQ 704 0 0
T
TAAGGGGACCAAATCGTCCCATCAAGACAGATATCGCCCCCTCTCTAACTTATGTGCTAC
ACTTTTTGTCCAGAACACAAGAAAGAGGAGAACCATTTTATTATTTGACAGAAGCAAATG
AAAAGGCATCAAAATACCAAATCTGGTTTCCGCAATTTCATTGTGAGAAAATAATTAGTC
CAGGAAAACGACCTTGAAGCAGAAGCAGCATCAATTGTAGAAGTCTGTTGGTATCTTT*C
ACTCACAGTAGAACCGAAGTTAGGACCACCTTTGCGATATTGGATAAGAAACTCCACTGG
ATATCCCTTCAACTTATGAGGGACAAGGTCCAAATCCTGAAACGTCAAGGCCTTGTCAGA
TACAAGTGTATCTGTCGTAAGCGCATTGATTTGATCCAGATTGAAGATCTGGGGTGAGGG
TAGAGGAAACGGGACTTTGTTCACCATGAAATCCCGAGGACCCGCCATTGCCTTAGCAAT
TGGAAATGGAAGCTTAACATATCGAGGCCATTCACGGATCATATCAAACATGATCTCTGC
CAAATCATGAGGGGTAAAGACATCTGGACCACCCAATTCGTAGGTTTTACCCATGCTAGA
GCCATCATCCTTGAGAGCTGCAACAATTGCAGCAGCAACATCAACCACATATACGGGCTG
GAATTTGTTGGTCCCACCACCTATGAGCGGGAGGAAACCATAT

QA 2 704 2 704
DS 

RD RR2AU50JQ 794 0 0
GGCCAAAACACATGACACTTTAGTTATACTCAAGAGCATAGTGGCACATGAAGTTTGAAA
ATGCATAATTTTTAAGGGGACCAAATCGTCCCATCAAGACAGATATCGCCCCCTCTCTAA
CTTATGTGATACACTTTTTGTCCAGAACACAAGAAAGAGGAGAACCATTTTATTATTTGA
CAGAAGCAAATGAAAAGGCATCAAAATACCAAATCTGGTTTCCGCAATTTCATTGTGAGA
AAATAATTAGTCCAGGAAAACGACCTTGAAGCAGAAGCAGCATCAATTGTAGAAGTCTGT
TGGTATCTTTTCACTCACAGTAGAACCGAAGTTAGGACCACCTTTGCGATATTGGATAAG
AAACTCCACTGGATATCCCTTCAACTTATGAGGGACAAGGTCCAAATCCTGAAACGTCAA
GGCCTTGTCAGATACAAGTGTATCTGTCGTAAGCGTATTGATTTGATCCAGATTGAAGAT
CTGGGGTGAGGGTAGAGGAAACGGGACTTTGTTCACCATGAAATCCCGAGGACCCGCCAT
TGCCTTAGCAATTGGAAATGGAAGCTTAACATATCGAGGCCATTCACGGATCATATCAAA
CATGATCTCTGCCAAATCATGAGGGGTAAAGACATCTGGACCACCCAATTCGTAGGTTTT
ACCCATGCTAGAGCCATCATCCTTGAGAGCTGCAACAATTGCAGCAGCAACATCAACCAC
ATATACGGGCTGGAATTTGTTGGTCCCACCACCTATGAGCGGGAGGAAACCATATTTCTT
AACGAACATTGCCC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 3

CO CL3599Contig1 828 3 2 U
ATAATGTGGTATTAATATAATTCGAGTAAGAAATACATAAAGCTATTACAATTACCTCAC
GCACTAATCACTATGTATCTTTATATATATACACATGTTTGCAATAAGCAATTGAGATTC
ACGTACAAGACGAGTGAGTATAACCAAAGAATCTTTATATACAATCCTCCAATGGTGAAA
TCTATGCGATTGATGTCTTGTCGGTAACTCGTACACTGTAAGAATCTGGTTTGGTCCGAA
CCGAAGGGTTTCCAGTATCATCGAGAACCACAAATGCCGTGTCACCGGGCTTGAAGCTCC
CAGCAAGAAAGGCTTCGCTGAGTGGATCTTCCACAATCTCTGTGACGGTTCTACACAGTG
GTCGTGCACCGTAAGCCGGATCATAGCCTTGTCTGCATATAAGCTCCTTGACAGGTTCAG
ACACCTCTAAACCGACTCCAAGTGCCACAAGCCTCGACTTCAAGTCTTGTAACATCAGGT
TCAGGATCTCCATCATCTGAGCCTGCTCGAGCTGTCTGAAGATGACGATTTCGTCTATCC
GGTTCAAGAGCTCTGGACGGAAGTAGTTCTTGAGTTCTTCGACTACCAAAGCTTTCATTC
CTGCGTAAGATGCTTCCTCTTCGTTATCGTCGAGGATAAAACCTATTTGCCTTTGTCTTC
CCTTGGCAATGGCTGATGATCCAACGTTAGAGGTCATTATGATCAGTGCGTTCTTGAAAG
ATACTCTCCTTCCCTGTGAATCGGTAAGATGGCCGTCTTCGAACAGCTGGAGAAGAATAT
TGAAAATATCGGGATGGGCTTTCTCTATCTCATCGAACAAAACCACTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B774JQ U 1
AF RR2B774TF C 1
AF RR2A132JQ U 117
BS 1 748 RR2B774JQ
BS 749 828 RR2A132JQ

RD RR2B774JQ 749 0 0
ATAATGTGGTATTAATATAATTCGAGTAAGAAATACATAAAGCTATTACAATTACCTCAC
GCACTAATCACTATGTATCTTTATATATATACACATGTTTGCAATAAGCAATTGAGATTC
ACGTACAAGACGAGTGAGTATAACCAAAGAATCTTTATATACAATCCTCCAATGGTGAAA
TCTATGCGATTGATGTCTTGTCGGTAACTCGTACACTGTAAGAATCTGGTTTGGTCCGAA
CCGAAGGGTTTCCAGTATCATCGAGAACCACAAATGCCGTGTCACCGGGCTTGAAGCTCC
CAGCAAGAAAGGCTTCGCTGAGTGGATCTTCCACAATCTCTGTGACGGTTCTACACAGTG
GTCGTGCACCGTAAGCCGGATCATAGCCTTGTCTGCATATAAGCTCCTTGACAGGTTCAG
ACACCTCTAAACCGACTCCAAGTGCCACAAGCCTCGACTTCAAGTCTTGTAACATCAGGT
TCAGGATCTCCATCATCTGAGCCTGCTCGAGCTGTCTGAAGATGACGATTTCGTCTATCC
GGTTCAAGAGCTCTGGACGGAAGTAGTTCTTGAGTTCTTCGACTACCAAAGCTTTCATTC
CTGCGTAAGATGCTTCCTCTTCGTTATCGTCGAGGATAAAACCTATTTGCCTTTGTCTTC
CCTTGGCAATGGCTGATGATCCAACGTTAGAGGTCATTATGATCAGTGCGTTCTTGAAAG
ATACTCTCCTTCCCTGTGAATCGGTAAG
C

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2B774TF 749 0 0
ATAATGTGGTATTAATATAATTCGAGTAAGAAATACATAAAGCTATTACAATTACCTCAC
GCACTAATCACTATGTATCTTTATATATATACACATGTTTGCAATAAGCAATTGAGATTC
ACGTACAAGACGAGTGAGTATAACCAAAGAATCTTTATATACAATCCTCCAATGGTGAAA
TCTATGCGATTGATGTCTTGTCGGTAACTCGTACACTGTAAGAATCTGGTTTGGTCCGAA
CCGAAGGGTTTCCAGTATCATCGAGAACCACAAATGCCGTGTCACCGGGCTTGAAGCTCC
CAGCAAGAAAGGCTTCGCTGAGTGGATCTTCCACAATCTCTGTGACGGTTCTACACAGTG
GTCGTGCACCGTAAGCCGGATCATAGCCTTGTCTGCATATAAGCTCCTTGACAGGTTCAG
ACACCTCTAAACCGACTCCAAGTGCCACAAGCCTCGACTTCAAGTCTTGTAACATCAGGT
TCAGGATCTCCATCATCTGAGCCTGCTCGAGCTGTCTGAAGATGACGATTTCGTCTATCC
GGTTCAAGAGCTCTGGACGGAAGTAGTTCTTGAGTTCTTCGACTACCAAAGCTTTCATTC
CTGCGTAAGATGCTTCCTCTTCGTTATCGTCGAGGATAAAACCTATTTGCCTTTGTCTTC
CCTTGGCAATGGCTGATGATCCAACGTTAGAGGTCATTATGATCAGTGCGTTCTTGAAAG
ATACTCTCCTTCCCTGTGAATCGGTAAG
C

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2A132JQ 712 0 0
ATTCACGTACAAGACGAGTGAGTATAACCAAAGAATCTTTATATACAATCCTCCAATGGT
GAAATCTATGCGATTGATGTCTTGTCTGTAACTCGTACACTGTGAGAATCTGGTTTGGTC
CGAACCGAAGGGTTTCCAGTATCACCGAGAACCACAAAGGCGGTGTCACCGGGCTTGAAG
CTCCCAGCAAGAAAGGCTTCGCTGAGTGGATCTTCCACAATCTCTGTGACGGTTCTACGG
AGTGGTCGTGCACCGTAGGCCGGATCATAGCCTTGTCTGCATATAAGCTCCTTGACAGGT
TCAGACACTTCTAAACCGACTCCAAGTGCCACAAGCCTCGACTTCAAGTCTTGTAACATC
AGGTTCAGGATCTCCATCATCTGAGCCTGCTCGAGCTGTATGAAGATGACGATTTCGTCT
ATCCGGTTCAAGAGCTCTGGACGGAAGTAGTTCTTGAGTTCTTCGACTACCAAAGCTTTC
ATTCCTGCGTAAGATGCTTCCTCTTCGTTATCGTCGAGGATAAAACCTATTTGCCTTTGT
CTTCCCTTGGCAATGGCTGATGATCCAACGTTAGAGGTCATTATGATCAGTGCGTTCTTG
AAAGATACTCTCCTTCCCTGTGAATCGGTAAGATGGCCGTCTTCGAACAGCTGGAGAAGA
ATATTGAAAATATCGGGATGGGCTTTCTCTATCTCATCGAACAAAACCACTG

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 3

CO CL3600Contig1 726 3 5 U
GGAGGGTTTGGTTTCAGAGGAAGGAAAGAACGACGAACGAAGATCAAATCAAGAGGGTTG
GATGGATCGTGACAGTAATGATGGACGTATTCCCTTAAGCAGCCTTTCCTGCTACAAAGA
AATGTGTATCCTTGCTGATAAGGATTGTCACTTTTCCACAGTTGGACGTCCTCCCCTTTT
GTTCGGAGACGTGTACGAGATGGTGAATGATCCTTCAACTGATTCAGTTGTCTCCTGGGG
TGATATCGGCAAGAGCTTCATCGTCTGGAATGAATCTGAGTTCCTCGGAGATGTT*TTCC
TAGGTGCTTATCCTACGATTACAAAGATATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCATGCCCT
CGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTTGGTAAG
AGGACAGCCTCCCCCCCC*TAAGGATCCATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTTTGACGA
TGGTTACTCCAGAATATGCCAAAATGTACGAGTGGTCCTTAGCTTACATTAAGGATCGCA
AACAATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCGATGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTTCTTAAT
CGTATTTTATCGTCCTGTTTGAAAACATTGGGTTTGGTCTCTCTCTCCTTTTCTTTTAAC
TTATGGTTGTAAGATAAAAGATGTTTGCATTTTAATAAAAGGTAGATCATTATGATCTTT
TGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2AX83TFB U 75
AF RR2AX83JQ C 1
AF RR2BE11TF U 13
BS 1 12 RR2AX83JQ
BS 13 78 RR2BE11TF
BS 79 80 RR2AX83JQ
BS 81 697 RR2AX83TFB
BS 698 726 RR2BE11TF

RD RR2AX83TFB 623 0 0
GTAATG
ATGGACGTATTCCCTTAAGCAGCCTTTCCTGCTACAAAGAAATGTGTATCCTTGCTGATA
AGGATTGTCACTTTTCCACAGTTGGACGTCCTCCCCTTTTGTTCGGAGACGTGTACGAGA
TGGTGAATGATCCTTCAACTGATTCAGTTGTCTCCTGGGGTGATATCGGCAAGAGCTTCA
TCGTCTGGAATGAATCTGAGTTCCTCGGAGATGTT*TTCCTAGGTGCTTATCCTACGATT
ACAAAGATATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCATGCCCTCGGCTATAATAAAGTTGAAG
AATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTTGGTAAGAGGACAGCCTCCCCCCCC*T
AAGGATCCATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTTTGACGATGGTTACTCCAGAATATGCC
AAAATGTACGAGTGGTCCTTAGCTTACATTAAGGATCGCAAACAATAAGCTCTGTTGGTT
CTGTTCGATGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTTCTTAATCGTATTTTATCGTCCTGTTT
GAAAACATTGGGTTTGGTCTCTCTCTCCTTTTCTTTTAACTTATGGTTGTAAGATAAAAG
ATGTTTGCATTTTAATA

QA 7 623 7 623
DS 

RD RR2AX83JQ 726 0 0
GGAGGGTTTGGTTTCAGAGGAAGGAAAGAACGACGAACGAAGATCAAATCAAGAGGGTTG
GATGGATCGTGACAGTAATGATGGACGTATTCCCTTAAGCAGCCTTTCCTGCTACAAAGA
AATGTGTATCCTTGCTGATAAGGATTGTCACTTTTCCACAGTTGGACGTCCTCCCCTTTT
GTTCGGAGACGTGTACGAGATGGTGAATGATCCTTCAACTGATTCAGTTGTCTCCTGGGG
TGATATCGGCAAGAGCTTCATCGTCTGGAATGAATCTGAGTTCCTCGGAGATGTT*TTCC
TAGGTGCTTATCCTACGATTACAAAGATATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCATGCCCT
CGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTTGGTAAG
AGGACAGCCTCCCCCCCC*TAAGGATCCATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTTTGACGA
TGGTTACTCCAGAATATGCCAAAATGTACGAGTGGTCCTTAGCTTACATTAAGGATCGCA
AACAATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCGATGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTTCTTAAT
CGTATTTTATCGTCCTGTTTGAAAACATTGGGTTTGGTCTCTCTCTCCTTTTCTTTTAAC
TTATGGTTGTAAGATAAAAGATGTTTGCATTTTAATAAAAGGTAGATCATTATGATCTTT
TGGTTC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2BE11TF 714 0 0
TTCAGAGGAAGGAAAGAACGACGAACGAAGATCAAATCAAGAGGGTTGGATGGATCGTGA
CAGTAA**ATGGACGTATTCCCTTAAGCAGCCTTTCCTGCTACAAAGAAATGTGTATCCT
TGCTGATAAGGATTGTCACTTTTCCACAGTTGGACGTCCTCCCCTTTTGTTCGGAGACGT
GTACGAGATGGTGAATGATCCTTCAACTGATTCAGTTGTCTCCTGGGGTGATAGCGGCAA
GAGCTTCATCGTCTGGAATGAATCTGAGTTCCTCGGAGATGTTCTTCCTAGGTGCTTATC
CTACGATTACAAAGATATGACATCTTTCACCACCAAGTTTCATGCCCTCGGCTATAATAA
AGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCAATTATTTGGTAAGAGGACAGCCTCC
CCCCCCCTAAGGATCCATCCCCATGTACTTCTGCTGATCTTTTGACGATGGTTACTCCAG
AATATGCCAAAATGTACGAGTGGTCCTTAGCTTACATTAAGGATCGCAAACAATAAGCTC
TGTTGGTTCTGTTCGATGGAGTTGCTTTGCTCTCGTTGTTTTCTTAATCGTATTTTATCG
TCCTGTTTGAAAACATTGGGTTTGGTCTCTCTCTCCTTTTCTTTTAACTTATGGTTGTAA
GATAAAAGATGTTTGCATTTTAATAAAAGGTAGATCATTATGATCTTTTGGTTC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 3

CO CL3601Contig1 962 3 3 U
GGATCTTCACCATCAACTTCTCTATAACCAATACCTTTCCTTTCTTCTCCTGTGTGAAAA
TGGATGAGTTTGTTAACCTAGAGGCAACCGAGCTGAGGCTGGGATTACCAGGAACAGACG
ATGTATGTGAAGGAAGAGAAAGAGTCTCTTGCAATAAAAGAGCATTACAAGGTGCCGCTG
AGAATGAGACTTAATCATCAACGATGAAAACGGAAACGTCCCCTCCACGCAAGGCTCAGA
TTGTTGGATGGCCACCAGTTAGGTCTTTCAGGAAGAACATCGTTCAAACAAAGAAGAACG
AATCTGAGAGTGAGGGTGGTCGAGGACTCTATGTGAAAGTAAGTATGGATGGTGCACCAT
ACTTGAGGAAAATAGATTTGAGTTGTTACAAAGGATACTCAGAGTTACTAAAAGCTGTAG
AGATGATGTTCAATTTCTCGGTGGGAGAGTATTTTGAGAGAGAAGGATATAAAGGTTCAG
AGTTTGTGCCTACTTATGAAGATAAAGATGGTGACTGGATGCTCATTGGAGATGTTCCAT
GGGAGATGTTTGTATGCACTTGCAAGAGACTGAGGATCATGAAAGGATCAGAGGCCAAAG
GTTTAGGATGTGATGTATGAGACAAAGATTCATGAAGCCTAAAAGAGGCACAAGAACCTA
AAGAGAGCAGAGTTTCTTTTGGTCAAGAAAAAATCTGGTTGTGCTCGGGTTGTCGGGGAA
GATCTATGTTCAGGATACCTCATCGGTGAATTCGAATGTAGAGATGCTTAATGGTATTAA
GCACATAAAACTGGAACCTTAATACTTTCTTTTCTTTTGTTTCAGAAACAGGGCAAACGG
TTGTCCTTAAGTCTTTGGTTATGTACTACATTTTTAAAATTTGTGTTGTGAAGATTGAAG
AGTTATTCTTATGTTTGTAGCATTATTTTTGTGTTCTCATTGATCAAAAGAGATTTTCAA
GC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2FT94TF U 1
AF RR2FT94JQ C 226
AF RR2FJ18TF U 752
BS 1 745 RR2FT94TF
BS 746 752 RR2FT94JQ
BS 753 962 RR2FJ18TF

RD RR2FT94TF 745 0 0
GGATCTTCACCATCAACTTCTCTATAACCAATACCTTTCCTTTCTTCTCCTGTGTGAAAA
TGGATGAGTTTGTTAACCTAGAGGCAACCGAGCTGAGGCTGGGATTACCAGGAACAGACG
ATGTATGTGAAGGAAGAGAAAGAGTCTCTTGCAATAAAAGAGCATTACAAGGTGCCGCTG
AGAATGAGACTTAATCATCAACGATGAAAACGGAAACGTCCCCTCCACGCAAGGCTCAGA
TTGTTGGATGGCCACCAGTTAGGTCTTTCAGGAAGAACATCGTTCAAACAAAGAAGAACG
AATCTGAGAGTGAGGGTGGTCGAGGACTCTATGTGAAAGTAAGTATGGATGGTGCACCAT
ACTTGAGGAAAATAGATTTGAGTTGTTACAAAGGATACTCAGAGTTACTAAAAGCTGTAG
AGATGATGTTCAATTTCTCGGTGGGAGAGTATTTTGAGAGAGAAGGATATAAAGGTTCAG
AGTTTGTGCCTACTTATGAAGATAAAGATGGTGACTGGATGCTCATTGGAGATGTTCCAT
GGGAGATGTTTGTATGCACTTGCAAGAGACTGAGGATCATGAAAGGATCAGAGGCCAAAG
GTTTAGGATGTGATGTATGAGACAAAGATTCATGAAGCCTAAAAGAGGCACAAGAACCTA
AAGAGAGCAGAGTTTCTTTTGGTCAAGAAAAAATCTGGTTGTGCTCGGGTTGTCGGGGAA
GATCTATGTTCAGGATACCTCATCG

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2FT94JQ 737 0 0
CACGCAAGGCTCAGATTGTTGGATGGCCACCAGTTAGGTCTTTCAGGAAGAACATCGTTC
AAACAAAGAAGAACGAATCTGAGAGTGAGGGTGGTCGAGGACTCTATGTGAAAGTAAGTA
TGGATGGTGCACCATACTTGAGGAAAATAGATTTGAGTTGTTACAAAGGATACTCAGAGT
TACTAAAAGCTGTAGAGATGATGTTCAATTTCTCGGTGGGAGAGTATTTTGAGAGAGAAG
GATATAAAGGTTCAGAGTTTGTGCCTACTTATGAAGATAAAGATGGTGACTGGATGCTCA
TTGGAGATGTTCCATGGGAGATGTTTGTATGCACTTGCAAGAGACTGAGGATCATGAAAG
GATCAGAGGCCAAAGGTTTAGGATGTGATGTATGAGACAAAGATTCATGAAGCCTAAAAG
AGGCACAAGAACCTAAAGAGAGCAGAGTTTCTTTTGGTCAAGAAAAAATCTGGTTGTGCT
CGGGTTGTCGGGGAAGATCTATGTTCAGGATACCTCATCGGTGAATTCGAATGTAGAGAT
GCTTAATGGTATTAAGCACATAAAACTGGAACCTTAATACTTTCTTTTCTTTTGTTTCAG
AAACAGGGCAAACGGTTGTCCTTAAGTCTTTGGTTATGTACTACATTTTTAAAATTTGTG
TTGTGAAGATTGAAGAGTTATTCTTATGTTTGTAGCATTATTTTTGTGTTCTCATTGATC
AAAAGAGATTTTCAAGC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2FJ18TF 211 0 0
G
CGAATGTAGAGATGCTTAATGGTATTAAGCACATAAAACTGGAACCTTAATACTTTCTTT
TCTTTTGTTTCAGAAACAGGGCAAACGGTTGTCCTTAAGTCTTTGGTTATGTACTACATT
TTTAAAATTTGTGTTGTGAAGATTGAAGAGTTATTCTTATGTTTGTAGCATTATTTTTGT
GTTCTCATTGATCAAAAGAGATTTTCAAGC

QA 2 211 2 211
DS 



AS 1 3

CO CL3602Contig1 644 3 9 U
CGCAATTTTAATTTTTATTCCAATTAGCATAAGCTTAAACTTGTTTACAATTTTTTTTTT
TTCATTTGAAGTTAAAGAAAAAGTTCCATCGGAATCAGATTCTAATGCTCAAAGAATGTT
TCAAGTCCCCCACATGAAGACGATGCTGACCCAAACCAACCTTCCTCTTCCCGATCTCAT
CCACAACGCTAAGGTCTTTACAGACGTCAACCTTAAACTTAACAACAGCTTCTTCCATCT
TCCCCAAACGAATCTTCTCAAACCCCAAAAGATGCTTCCTCGGCGACCCGTGAACCTCCG
GCGGCGTCGTGAACAGAAACACCGTGTGAACCCCTTCTCTATCTCCGCCGTTTCGCACCT
TTATCTGAACCTCGAAACCGGAGACAGTGTTCTCGCAGTGCGGTCCGAACGCGTCCAAAG
ATTGACACTCCGATGATCGGCAAACGTGATTCTCTTCGACACGGAGAGAGACGACACGTG
GAGGAGCTTTGACTAAGCTGTGGCTGAACTTGGTGTAGCTGAGTCCACCACCGAAGGAAT
AAACCGTTTCTCCGGTGTAGAACCGGTAAGTCCGACCCGGGTACCCGTTCGATGTATCGG
GTCTCATGTTCATATTAGTCATCGGAACTTTCTCCACGTAGGAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FW63JQ U 1
AF RR2A232TF C 1
AF RR2A232JQ U 121
BS 1 2 RR2A232TF
BS 3 303 RR2FW63JQ
BS 304 304 RR2A232JQ
BS 305 330 RR2FW63JQ
BS 331 331 RR2A232JQ
BS 332 382 RR2FW63JQ
BS 383 383 RR2A232JQ
BS 384 464 RR2FW63JQ
BS 465 644 RR2A232JQ

RD RR2FW63JQ 464 0 0
CA
CAATTTTAATTTTTATTCCAATTAGCATAAGCTTAAACTTGTTTACAATTTTTTTTTTTT
CATTTGAAGTTAAAGAAAAAGTTCCATCGGAATCAGATTCTAATGCTCAAAGAATGTTTC
AAGTCCCCCACATGAAGACGATGCTGACCCAAACCAACCTTCCTCTTCCCGATCTCATCC
ACAACGCTAAGGTCTTTACAGACGTCAACCTTAAACTTAACAACAGCTTCTTCCATCTTC
CCCAAACGAATCTTCTCAAACCCCAAAAGATGCTTCCTCGGCGACCCGTGAACCTCCGGC
GACGTCGTGAACAGAAACACCGTGTGAAACCCTTCTCTATCTCCGCCGTTTCGCACCTTT
ATCTGAACCTCGAAACCGGAAACAGTGTTCTCGCAGTGCGGTCCGAACGCGTCCAAAGAT
TGACACTCCGATGATCGGCAAACGTGATTCTCTTCGACACGG

QA 3 464 3 464
DS 

RD RR2A232TF 644 0 0
CGCAATTTTAATTTTTATTCCAATTAGCATAAGCTTAAACTTGTTTACAATTTTT****T
TTCATTTGAAGTTAAAGAAAAAGTTCCATCGGAATCAGATTCTAATGCTCAAAGAATGTT
TCAAGTCCCCCACATGAAGACGATGCTGACCCAAACCAACCTTCCTCTTCCCGATCTCAT
CCACAACGCTAAGGTCTTTACAGACGTCAACCTTAAACTTAACAACAGCTTCTTCCATCT
TCCCCAAACGAATCTTCTCAAACCCCAAAAGATGCTTCCTCGGCGACCCGTGAACCTCCG
GCGGCGTCGTGAACAGAAACACCGTGTGAACCCCTTCTCTATCTCCGCCGTTTCGCACCT
TTATCTGAACCTCGAAACCGGAGACAGTGTTCTCGCAGTGCGGTCCGAACGCGTCCAAAG
ATTGACACTCCGATGATCGGCAAACGTGATTCTCTTCGACACGGAGAGAGACGACACGTG
GAGGAGCTTTGACTAAGCTGTGGCTGAACTTGGTGTAGCTGAGTCCACCACCGAAGGAAT
AAACCGTTTCTCCGGTGTAGAACCGGTAAGTCCGACCCGGGTACCCGTTCGATGTATCGG
GTCTCATGTTCATATTAGTCATCGGAACTTTCTCCACGTAGGAC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2A232JQ 524 0 0
TCAAGTCCCCCACATGAAGACGATGCTGACCCAAACCAACCTTCCTCTTCCCGAACTCAT
CCACAACGCTAAGGTCTTTACAGACGTCAACCTTAAACTTAACAACAGCTTCTTCCATCT
TCCCCAAACGAATCTTCTCAAACCCCAAAAGATGCTTCCTCGGCGACCCGTGAACCTCCG
GCGGCGTCGTGAACAGAAACACCGTGTGAACCCCTTCTCTATCTCCGCCGTTTCGCACCT
TTATCTGAACCTCGAAACCGGAGACAGTGTTCTCGCAGTGCGGTCCGAACGCGTCCAAAG
ATTGACACTCCGATGATCGGCAAACGTGATTCTCTTCGACACGGAGAGAGACGACACGTG
GAGGAGCTTTGACTAAGCTGTGGCTGAACTTGGTGTAGCTGAGTCCACCACCGAAGGAAT
AAACCGTTTCTCCGGTGTAGAACCGGTAAGTCCGACCCGGGTACCCGTTCGATGTATCGG
GTCTCATGTTCATATTAGTCATCGGAACTTTCTCCACGTAGGAC

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 3

CO CL3603Contig1 569 3 6 U
GGAAACTCTACCGAACCTCAAAATCTCTCTGTAGCCGGAGACTTGATTCACCGAGAGAGA
AAGAGAGGAGAAGAGTTTAGAAGCAATGGTGGGAGCAGAAGAAGCTGGAGCGGAGATCAT
GGTCGATTCAAAGGACTTACAGCAACAAAGCAAAGCTCTCGACAAGCTTACCGATCGCGT
CGAGGATCGCCAGCTCGATTCTAATCGTGTTCAATCGGCTATGGCTTCGATTGGTGCTTC
TAGGGAGGCTGATCTTAATGCTAAGAGATTGAGGGAGAAGGAATTGGCTTCTGTTAAAAT
CAATGCCGCTGATGTTGAGCTCATTGTTAACGAACTTGAGCTGGAGAAGAATGTGGTGGA
GAGAACTCTAAGGGAGCACAAAGGCGATGCAGTTGCTGCAACTAGGGAGCTGCTTTCACG
ATATCCTCTATGATTGACCACTACGATCAAGTTCTTTTGTGTGTGTGCGGTTTGAGACAC
CGTGAGATTATGTATCCAAATATTTTCAACTGAGTTTTGAAATTTCATATCTGAATCACT
CTCTTCCCTCAATAAATTGTTCGCTCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A260TF U 1
AF RR2GF69JQ C 51
AF RR2GF69TF U 51
BS 1 89 RR2A260TF
BS 90 90 RR2GF69TF
BS 91 532 RR2A260TF
BS 533 533 RR2GF69TF
BS 534 541 RR2A260TF
BS 542 569 RR2GF69TF

RD RR2A260TF 541 0 0
GGAAACTCTACCGAACCTCAAAATCTCTCTGTAGCCGGAGACTTGATTCACCGAGAGAGA
AAGAGAGGAGAAGAGTTTAGAAGCAATGGAGGGAGCAGAAGAAGCTGGAGCGGAGATCAT
GGTCGATTCAAAGGACTTACAGCAACAAAGCAAAGCTCTCGACAAGCTTACCGATCGCGT
CGAGGATCGCCAGCTCGATTCTAATCGTGTTCAATCGGCTATGGCTTCGATTGGTGCTTC
TAGGGAGGCTGATCTTAATGCTAAGAGATTGAGGGAGAAGGAATTGGCTTCTGTTAAAAT
CAATGCCGCTGATGTTGAGCTCATTGTTAACGAACTTGAGCTGGAGAAGAATGTGGTGGA
GAGAACTCTAAGGGAGCACAAAGGCGATGCAGTTGCTGCAACTAGGGAGCTGCTTTCACG
ATATCCTCTATGATTGACCACTACGATCAAGTTCTTTTGTGTGTGTGCGGTTTGAGACAC
CGTGAGATTATGTATCCAAATATTTTCAACTGAGTTTTGAAATTTCATATCTTAATCACT
C

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR2GF69JQ 519 0 0
GG
GAGAGAGAAAGAGAGGAGAAGAGTTTAGAAGCAATGGTGGGAGCAGAAGAAGCTGGAGCG
GAGATCATGGTCGATTCAAAGGACTTACAGCAACAAAGCAAAGCTCTCGACAAGCTTACC
GATCGCGTCGAGGATCGCCAGCTCGATTCTAATCGTGTTCAATCGGCTATGGCTTCGATT
GGTGCTTCTAGGGAGGCTGATCTTAATGCTAAGAGATTGAGGGAGAAGGAATTGGCTTCT
GTTAAAATCAATGCCGCTGATGTTGAGCTCATTGTTAACGAACTTGAGCTGGAGAAGAAT
GTGGTGGAGAGAACTCTAAGGGAGCACAAAGGCGATGCAGTTGCTGCAACTAGGGAGCTG
CTTTCACGATATCCTCTATGATTGACCACTACGATCAAGTTCTTTTGTGTGTGTGCGGTT
TGAGACACCGTGAGATTATGTATCCAAATATTTTCAACTGAGTTTTGAAATTTCATATCT
GAATCACTCTCTTCCCTCAATAAATTGTTCGCTCTGG

QA 3 519 3 519
DS 

RD RR2GF69TF 519 0 0
GG
GAGAGAGAAAGAGAGGAGAAGAGTTTAGAAGCAATGGTGGGAGCAGAAGAAGCTGGAGCG
GAGATCATGGTCGATTCAAAGGACTTACAGCAACAAAGCAAAGCTCTCGACAAGCTTACC
GATCGCGTCGAGGATCGCCAGCTCGATTCTAATCGTGTTCAATCGGCTATGGCTTCGATT
GGTGCTTCTAGGGAGGCTGATCTTAATGCTAAGAGATTGAGGGAGAAGGAATTGGCTTCT
GTTAAAATCAATGCCGCTGATGTTGAGCTCATTGTTAACGAACTTGAGCTGGAGAAGAAT
GTGGTGGAGAGAACTCTAAGGGAGCACAAAGGCGATGCAGTTGCTGCAACTAGGGAGCTG
CTTTCACGATATCCTCTATGATTGACCACTACGATCAAGTTCTTTTGTGTGTGTGCGGTT
TGAGACACCGTGAGATTATGTATCCAAATATTTTCAACTGAGTTTTGAAATTTCATATCT
GAATCACTCTCTTCCCTCAATAAATTGTTCGCTCTGG

QA 3 519 3 519
DS 



AS 1 3

CO CL3604Contig1 953 3 7 U
AAAACTTAAAAGCATACAATAGAAGAAAGAAGAGTAACAAGAGGCTACAACAGAGGTAAA
TCCACAACGTTGGATCAAATCTTATACACCATAACTTACTTTTCTTTAAATCGGTTAAAA
ATATCGGTTTTACATCGGTTAAAAGGACAGTTTTCCTGCGTCCCAAGAAAGAGCCTCTAA
AGGAAATGAGATATAGCTTAAGTAGTAGCACCTTTGGGCTTAGGAGATGGAAGCTGGTGA
CGATACGGTGAAGAACCAGCTTGACCATGAGGACTAGACAGAGTCCGGAACACGGGTTGC
CCATTTCTTGACCCCAAGCCACGACCTGAGCCAGAGCCAGACCCAGCTTTCAATCGCTCG
GCTTGCATTGTCTGGAAGTAATAGGAAGAGCTAGCCATGTCTTTGAGCATTGGGAGTGGT
TTAAGGACTTCAACCACTTGACTCATTTTGGGTCTCATCTTGAAGTCGCGGCTAAGGCAT
TGGGCTGCAAGCTGGGTTACTTTCTGAGCTCCTTTGATGGAGAAATGACCTTCCAGCCTC
GGATCAAGGAGTCGGTAGAATCTTCTTCTGTCAAGGAGATGCGGTCTTGCCCATTCCACG
AGGTTGTGTTCACCGCTTGGTCGGTTTTTGTCCATGGATCTTCTACCGGTCAGTATTTCG
AGTAAAACCACACCGAAGCTGTAAACATCGCTCATCGATGTCAAGTGACCAGTCATAACA
TACTCAGGAGCAGCGTAACCATAAGTGCCCATGACTCGAGTAGACACATGTGTTTTGCCT
TCATCAGGAGCATCTTTGGCAAGCCCAAAATCTGATAGTTTTGCATTGTAGTCAGCATCG
AGTAGAATGTTGGAGGTTTTGAAATCACGATAGATGACAGGCTTAAGAGCTTCTTCGTGA
AGGAAACTGAGACCCTTTGCAGCACCTAATGCAATCCTCATCCGAATCGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E143JQ U 1
AF RR2DE22JQ U 29
AF RR2DE22TF C 179
BS 1 393 RR2E143JQ
BS 394 394 RR2DE22JQ
BS 395 475 RR2E143JQ
BS 476 476 RR2DE22JQ
BS 477 532 RR2E143JQ
BS 533 598 RR2DE22JQ
BS 599 953 RR2DE22TF

RD RR2E143JQ 532 0 0
AAAACTTAAAAGCATACAATAGAAGAAAGAAGAGTAACAAGAGGCTACAACAGAGGTAAA
TCCACAACGTTGGATCAAATCTTATACACCATAACTTACTTTTCTTTAAATCGGTTAAAA
ATATCGGTTTTACATCGGTTAAAAGGACAGTTTTCCTGCGTCCCAAGAAAGAGCCTCTAA
AGGAAATGAGATATAGCTTAAGTAGTAGCACCTTTGGGCTTAGGAGATGGAAGCTGGTGA
CGATACGGTGAAGAACCAGCTTGACCATGAGGACTAGACAGAGTCCGGAACACGGGTTGC
CCATTTCTTGACCCCAAGCCACGACCTGAGCCAGAGCCAGACCCAGCTTTCAATCGCTCG
GCTTGCATTGTCTGGAAGTAATAGGAAGAGCTAACCATGTCTTTGAGCATTGGGAGTGGT
TTAAGGACTTCAACCACTTGACTCATTTTGGGTCTCATCTTGAAGTCGCGGCTAAAGCAT
TGGGCTGCAAGCTGGGTTACTTTCTGAGCTCCTTTGATGGAGAAATGACCTT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2DE22JQ 570 0 0
GAAGAGTAACAAGAGGCTACAACAGAGGTAAATCCACAACGTTGGATCAAATCTTATACA
CCATAACTTACTTTTCTTTAAATCGGTTAAAAATATCGGTTTTACATCGGTTAAAAGGAC
AGTTTTCCTGCGTCCCAAGAAAGAGCCTCTAAAGGAAATGAGATATAGCTTAAGTAGTAG
CACCTTTGGGCTTAGGAGATGGAAGCTGGTGACGATACGGTGAAGAACCAGCTTGACCAT
GAGGACTAGACAGAGTCCGGAACACGGGTTGCCCATTTCTTGACCCCAAGCCACGACCTG
AGCCAGAGCCAGACCCAGCTTTCAATCGCTCGGCTTGCATTGTCTGGAAGTAATAGGAAG
AGCTAGCCATGTCTTTGAGCATTGGGAGTGGTTTAAGGACTTCAACCACTTGACTCATTT
TGGGTCTCATCTTGAAGTCGCGGCTAAGGCATTGGGCTGCAAGCTGGGTTACTTTCTGAG
CTCCTTTGATGGAGAAATGACCTTCCAGCCTCGGATCAAGGAGTCGGTAGAATCTTCTTC
TGTCAAGGAGATGCGGTCTTGCCCATTCCA

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2DE22TF 775 0 0
AAAGGAAATGAGATATAGCTTAAGTAGTAGCAC*TTTGGGCTTAGGAGATGGAAGCTGGT
GACGATACGGTGAAGAACCAGCTTGACCATGAGGACTAGACAGAGTCCGGAACACGGGTT
GCCCATTTCTTGACCCCAAGCCACGACGTGAGCCAGAGCCAGACCCAGCTTTCAATCGCT
CGGCTTGCATTGTCTGGAAGTAATAGGAAGAGCTAGCCATGTCTTTGAGCATTGGGAGTG
GTTTAAGGACTTCAACCACTTGACTCATTTTGGGTCTCATCTTGAAGTCGCGGCTAAGGC
ATTGGGCTGCAAGCTGGGTTACTTTCTGAGCTCCTTTGATGGAGAAATGACCTTCCAGCC
TCGGATCAAGGAGTCGGTAGAATCTTCTTCTGTCAAGGAGATGCGGTCTTGCCCATTCCA
CGAGGTTGTGTTCACCGCTTGGTCGGTTTTTGTCCATGGATCTTCTACCGGTCAGTATTT
CGAGTAAAACCACACCGAAGCTGTAAACATCGCTCATCGATGTCAAGTGACCAGTCATAA
CATACTCAGGAGCAGCGTAACCATAAGTGCCCATGACTCGAGTAGACACATGTGTTTTGC
CTTCATCAGGAGCATCTTTGGCAAGCCCAAAATCTGATAGTTTTGCATTGTAGTCAGCAT
CGAGTAGAATGTTGGAGGTTTTGAAATCACGATAGATGACAGGCTTAAGAGCTTCTTCGT
GAAGGAAACTGAGACCCTTTGCAGCACCTAATGCAATCCTCATCCGAATCGACCC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 3

CO CL3605Contig1 788 3 12 U
GATTTGGGCATGCTAGGAACCTGCAAAAGGGTCACTGTCTCCAAGGACGACACTGTTATT
CTGGATGGGGCTGGCGACAAGACAGCCATTGAAGAAAGATGCGAGCAGATTAGGTCAGCA
ATTGAACTGAGCACCTCAGATTATGACAAGGAGAAACTGCAAGAAAGGTTGGCTAAGCTC
TCTGGAGGAGTTGCTGTTTTGAAGATTGGGGGAGCAAGTGAAGCTGAGGTTGGTGAAAAG
AAAGACAGAGTGACAGATGCTTTGAATGCCACTAAAGCAGCTGTTGAAGAGCGTATCTTA
CCAGGAGGAGGTGTGGCTCTTCTATACGCAGCGAGAGAGTTGGAGAAACTTCCAACAGCC
AACTTCGACCAGAAGATTGGTGTGCAGATCATTCAGAACGCTTTGAAGACTCCTGTTCAC
ACAATTACTTCAAACGCTGGAGTGGAAGGTGCTGTTATAGTTGGCAAGCTCTTGGAGCAA
GATAACACAGACCTCGGTTATGATGCTGCTAAAGGTGAATATGTGGATATGGTGAAAGCT
GGTATCATAGATCCTCTGAAAGTGATCAGGACTGCTCTAGTTGATGCTGCCAGTGTGTCA
TCTCTGTTGACGACGACTGAAGCTGTAGTGGTGGATCTTCCCAAAGACGAAAGCGAGTCA
GCAGGAGCTGGAGCAGGCATGGGTGGAATGGGAGGCATGGATTATTAAATTACATTCACT
AAAACTCTTTTGTCTTTTATTCACCAATCATCATCACCTTAACTTGAGAAAAGAGAGACT
ATTCGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX54JQ C 456
AF RR2FH47TF U 1
AF RR2BX54TF U 142
BS 1 296 RR2FH47TF
BS 297 297 RR2BX54TF
BS 298 299 RR2FH47TF
BS 300 300 RR2BX54TF
BS 301 387 RR2FH47TF
BS 388 388 RR2BX54TF
BS 389 664 RR2FH47TF
BS 665 665 RR2BX54TF
BS 666 676 RR2FH47TF
BS 677 677 RR2BX54TF
BS 678 690 RR2FH47TF
BS 691 788 RR2BX54TF

RD RR2BX54JQ 145 0 0
TATAGTTGGCAAGCTCTTGGAGCAAGATAACACAGACCTCGGTTATGATGCTGCTAAAGG
TGAATATGTGGATATGGTGAAAGCTGGTATCATAGATCCTTTGAAAGTGATCAGGACTGC
TTTAGTTGATGCTGCCAGTGTGTCA

QA 1 145 1 145
DS 

RD RR2FH47TF 690 0 0
GATTTGGGCATGCTAGGAACCTGCAAAAGGGTCACTGTCTCCAAGGACGACACTGTTATT
CTGGATGGGGCTGGCGACAAGACAGCCATTGAAGAAAGATGCGAGCAGATTAGGTCAGCA
ATTGAACTGAGCACCTCAGATTATGACAAGGAGAAACTGCAAGAAAGGTTGGCTAAGCTC
TCTGGAGGAGTTGCTGTTTTGAAGATTGGGGGAGCAAGTGAAGCTGAGGTTGGTGAAAAG
AAAGACAGAGTGACAGATGCTTTGAATGCCACTAAAGCAGCTGTTGAAGAGCGTATTTTG
CCAGGAGGAGGTGTGGCTCTTCTATACGCAGCGAGAGAGTTGGAGAAACTTCCAACAGCC
AACTTCGACCAGAAGATTGGTGTGCAGGTCATTCAGAACGCTTTGAAGACTCCTGTTCAC
ACAATTACTTCAAACGCTGGAGTGGAAGGTGCTGTTATAGTTGGCAAGCTCTTGGAGCAA
GATAACACAGACCTCGGTTATGATGCTGCTAAAGGTGAATATGTGGATATGGTGAAAGCT
GGTATCATAGATCCTCTGAAAGTGATCAGGACTGCTCTAGTTGATGCTGCCAGTGTGTCA
TCTCTGTTGACGACGACTGAAGCTGTAGTGGTGGATCTTCCCAAAGACGAAAGCGAGTCA
GCAG*AGCTGGAGCAG*CATGGGTGGAATG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2BX54TF 647 0 0
G
ATGACAAGGAGAAACTGCAAGAAAGGTTGGCTAAGCTCTCTGGAGGAGTTGCTGTTTTGA
AGATTGGGGGAGCAAGTGAAGCTGAGGTTGGTGAAAAGAAAGACAGAGTGACAGATGCTT
TGAATGCCACTAAAGCAGCTGTTGAAGAGGGTATCTTACCAGGAGGAGGTGTGGCTCTTC
TATACGCAGCGAGAGAGTTGGAGAAACTTCCAACAGCCAACTTTGACCAGAAGATTGGTG
TGCAGATCATTCAGAACGCTTTGAAGACTCCTGTTCACACAATTGCTTCAAACGCTGGAG
TGGAAGGTGCTGTTATAGTTGGCAAGCTCTTGGAGCAAGATAACACAGACCTCGGTTATG
ATGCTGCTAAAGGTGAATATGTGGATATGGTGAAAGCTGGTATCATAGATCCTCTGAAAG
TGATCAGGACTGCTCTAGTTGATGCTGCCAGTGTGTCATCTCTGTTGACGACGACTGAAG
CTGTAGTGGTGGATCTTCCCAAAGACGAAAGCGAGTCAGCAGGAGCTGGAGCAGGCATGG
GTGGAATGGGAGGCATGGATTATTAAATTACATTCACTAAAACTCTTTTGTCTTTTATTC
ACCAATCATCATCACCTTAACTTGAGAAAAGAGAGACTATTCGTTT

QA 2 647 2 647
DS 



AS 1 3

CO CL3606Contig1 528 3 2 U
AGGGAATCTCAGGTAGGATTGTGAAATCGAAGAGAGAGAGAGAGAGTCTGAAAATTGCAG
TGCGAATCGGGAATCTCTAGGTTTTTTGTAGAAAATGGGTGGCGGAGGAGGTATAACATA
CAAGGGAGTCACTGTTCACACTCCCAAGACGTGGCACACCGTCGCCGGAAAGGGCTTGTG
CGGCGTTATGTGGTTTTGGATTCTGTACAGGGCAAAGCAAGATGGTCCTGTAGTCATGGG
ATGGAGGCACCCATGGGATGGCCATGGTGATCATGGTCACGGAGATCATCACTAGGTCTC
GTCGAACCTTCGAAGATCATGGCGAAAAAATGTACGTCTCTTTTTTT**CTTCTTTTCAG
CTTCAATATGTCGAAATAAAGATAA*CTGTGAAAGAAGACATCAATTGTTTTTGTACACT
GCTTTTGTAAGACTTGCTGCTTTTGTCTTAAGTTGCTACTTGGATTGCACTTCACTTCCT
T*ATGTTTTT*ACGTCTACAAATGAATTTAAACAGTTATGGTTCCTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2GN79JQ C 1
AF RR2GN79TF U 1
AF RR2DB40TF U 36
BS 1 525 RR2GN79TF
BS 526 528 RR2GN79JQ

RD RR2GN79JQ 528 0 0
AGGGAATCTCAGGTAGGATTGTGAAATCGAAGAGAGAGAGAGAGATTCTGAAAATTGCAG
TGCGAATCGGGAATCTTTAGGTTTTTTGTAGAAAATGGGTGGCGGAGGAGGTATAACATA
CAAGGGAGTCACTGTTCACACTCCCAAGACGTGGCACACCGTCGCCGGAAAGGGCTTGTG
CGGCGTTATGTGGTTTTGGATTCTGTACAGGGCAAAGCAAGATGGTCCTGTAGTCATGGG
ATGGAGGCACCCATGGGATGGCCATGGTGATCATGGTCACGGAGATCATCACTAGGTCTC
GTCGAACCTTCGAAGATCATGGCGAAAAAATGTACGTCTCTTTTTTT**CTTCTTTTCAG
CTTCAATATGTCGAAATAAAGATAA*CTGTGAAAGAAGACATCAATTGTTTTTGTACACT
GCTTTTGTAAGACTTGCTGCTTTTGTCTTAAGTTGCTACTTGGATTGCACTTCACTTCCT
T*ATGTTTTT*ACGTCTACAAATGAATTTAAACAGTTATGGTTCCTCC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2GN79TF 527 0 0
AGGGAATCTCAGGTAGGATTGTGAAATCGAAGAGAGAGAGAGAGAGTCTGAAAATTGCAG
TGCGAATCGGGAATCTCTAGGTTTTTTGTAGAAAATGGGTGGCGGAGGAGGTATAACATA
CAAGGGAGTCACTGTTCACACTCCCAAGACGTGGCACACCGTCGCCGGAAAGGGCTTGTG
CGGCGTTATGTGGTTTTGGATTCTGTACAGGGCAAAGCAAGATGGTCCTGTAGTCATGGG
ATGGAGGCACCCATGGGATGGCCATGGTGATCATGGTCACGGAGATCATCACTAGGTCTC
GTCGAACCTTCGAAGATCATGGCGAAAAAATGTACGTCTCTTTTTTT**CTTCTTTTCAG
CTTCAATATGTCGAAATAAAGATAA*CTGTGAAAGAAGACATCAATTGTTTTTGTACACT
GCTTTTGTAAGACTTGCTGCTTTTGTCTTAAGTTGCTACTTGGATTGCACTTCACTTCCT
T*ATGTTTTT*ACGTCTACAAATGAATTTAAACAGTTATGGTTCC
TC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2DB40TF 490 0 0
GGGGGG
GAGAGTCTGAAAATTGCAGTGCGAATCGGGAATCTCTAGGTTTT**GTAGAAAATGGGTG
GCGGAGGAGGTATAACATACAAGGGAATCACTGTTCACACTCCCAAGATGTGGCACACCG
TCGCCGGAAAGGGCTTGTGCGGCGTTATGTGGTTTTGGATTCTGTACAGAGCAAAGCAAG
ATGGTCCTGTAGTCATGGGATGGAGGCACCCATGGGATGGCCATGGTGATCATGGTCACG
GAGATCATCACTAGGTCTCGTCGAACCTTCGAAGATCATGGCGAAAAA*TGTACGTCTCT
TTTTTTTTCTTCTTTTCAGCTTCAATATGTCGAAATAAAGATAAACTGTGAAAGTAGACA
TCAATTGTTTTTGTACACAGCTTTTGTAAGACTTGCTGCTTTTGTCTTAAGTTGCTACTT
GGATTGCACTTCACTTCCTTGATGTTTTTTACGTCTACAAATGAATTTAAACGGTTATGG
TTCC

QA 7 490 7 490
DS 



AS 1 3

CO CL3607Contig1 976 3 3 U
GATTCCCATTAGTGGAATTCGAAAGAGACAAAGAAACATCATTATTATTCCAAGTAGTCC
AAACAAAAACATTCACTCACGCCTACAACTTCCAAGTGTCTTTCTTCAAAACACGATTAC
ATTGAAAGAGACTCTGATAACATCTCAAACCCTTCACTCAGTTGGACTGACGCAGCTCTG
GTCGAACAAAATCTGCATCTTGAGGCACTGAGATATCCACGGTGGGCCTGAGCTCCGCAC
AGACCTGGATAGCACCATGGACTGGATCAGCGAAGAAGTTGCTGATCAAGTCTTTGTTGA
TTGGTGCACCATTGTCCACAGCCACCAAAGCTTGTTGTGTCAGGTTGTAGTCGAACCGTG
GTGCCCATTTCCTCGATCCCAATCTTGCTGTGGTCGAGCAGTTGTCCACCATGAAGGACA
CTCCTCTAGCGTGCATAAACGGGTTCAGAGAATCAACAGACTCAATCACACTCTCGTCGA
TGATCTCCGAGTAGGAGTGACCCTTCTTCCTCAAGATCTCAATCTGAGCCAGCATAAGAG
CAACGTAAACTCCAGCGGTGAAGGGATACAAGGGACCCAAGTCACCAGCTGGTCTGGACT
TCCTGGCGCGTTCACCGACCTTCCACATTCTTGTCTGATCAATCTTTCCCATTGGGAATG
CAGGTAAGCCCTCCTTATCGTAGAAGCGACGACCGGCTAAGACAACGCTCCTGATTTCGC
TGCCAGCTGCTACATCCTCGTAACATTCGTAGAGGATCTCCATACAAGGGTAGAAGGATG
CACTGTATGCAGTCTCGAAGTCCTTTTTGCCTTCTTCAGACAAGGAGTTGTTGACAGCCA
ACATTCCCTGGGTAGAGATAGTCCTTGAGATGTTTCCTGTGATGCACTCTACGGTGTTAT
TGTAAGCCAAGTCTTCACTCATTCCATTTTCGGTGTACCTTCTGAACAGAGACTCCACGA
TTCCGTGAACAGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN43JQ U 1
AF RR2B423JQ U 23
AF RR2BN43TF C 268
BS 1 732 RR2BN43JQ
BS 733 819 RR2B423JQ
BS 820 976 RR2BN43TF

RD RR2BN43JQ 732 0 0
GATTCCCATTAGTGGAATTCGAAAGAGACAAAGAAACATCATTATTATTCCAAGTAGTCC
AAACAAAAACATTCACTCACGCCTACAACTTCCAAGTGTCTTTCTTCAAAACACGATTAC
ATTGAAAGAGACTCTGATAACATCTCAAACCCTTCACTCAGTTGGACTGACGCAGCTCTG
GTCGAACAAAATCTGCATCTTGAGGCACTGAGATATCCACGGTGGGCCTGAGCTCCGCAC
AGACCTGGATAGCACCATGGACTGGATCAGCGAAGAAGTTGCTGATCAAGTCTTTGTTGA
TTGGTGCACCATTGTCCACAGCCACCAAAGCTTGTTGTGTCAGGTTGTAGTCGAACCGTG
GTGCCCATTTCCTCGATCCCAATCTTGCTGTGGTCGAGCAGTTGTCCACCATGAAGGACA
CTCCTCTAGCGTGCATAAACGGGTTCAGAGAATCAACAGACTCAATCACACTCTCGTCGA
TGATCTCCGAGTAGGAGTGACCCTTCTTCCTCAAGATCTCAATCTGAGCCAGCATAAGAG
CAACGTAAACTCCAGCGGTGAAGGGATACAAGGGACCCAAGTCACCAGCTGGTCTGGACT
TCCTGGCGCGTTCACCGACCTTCCACATTCTTGTCTGATCAATCTTTCCCATTGGGAATG
CAGGTAAGCCCTCCTTATCGTAGAAGCGACGACCGGCTAAGACAACGCTCCTGATTTCGC
TGCCAGCTGCTA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2B423JQ 797 0 0
GTT
AGACAAAGAAACATCATTATTATTCCAAGTAGTCCAAACAAAAACATTCACTCACGCCTA
CAACTTCCAAGTGTCTTTCTTCAAAACACGATTACATTGAAAGAGACT**GATAACATCT
CAAACCCTTCACTCAGTTGGACTGACGCAGCTCTGGTCGAACAAAATCTGCATCTTGAGG
CACTGAGATATCCACGGTGG*CCTGAGCTCCGCACAGACCTGGATAGCACCATGGACTGG
ATCAGCGAAGAAGTTGCTGATCAAGTCTTTGTTGATTGGTGCACCATTGTCCACAGCCAC
CAAAGCTTGTTGTGTCAGGTTGTAGTCGAACCGTGGTGCCCATTTCCTCGATCCCAATCT
TGCTGTGGTCGAGCAGTTGTCCACCATGAAGGACACTCCTCTAGCGTGCATAAACGGGTT
CAGAGAATCAACAGACTCAATCACACTCTCGTTGATGATCTCCGAGTAGGAGTGACCCTT
CTTCCTCAAGATCTCAATCTGAGCCATCATAAGAGCAACGTAAACTCCAGCGGTGAAGGG
ATACAAGGGACCCAAGTCACCAGCTGGTCTGGACTTCCTGACGCGTTCACCGACCTTCCA
CATTCTTGTCTGATCAATCTTTCCCATTGGGAATGCAGGTAAGCCCTCCTTATCGTAGAA
GAGACGACCGGCTAAGACAACGCTCCTGATTTCGCTGCCAGCTGCTACATCCTCGTAACA
TTCGTAGAGGATCTCCATACAAGGGTAGAAGGATGCACTGTATGCAGTCTCGAAGTCCTT
TTTGCCTTCTTCAG

QA 4 797 4 797
DS 

RD RR2BN43TF 709 0 0
CAGCGAAGAAGT*GCTGATCAAGTCTTTGTTGATTG*TGCACCATTGTCCACAGCCACCA
AAGCTTGT*GTGTCAGGTTGTAGTCGAACCGTGGTGCCCATTTCCTCGATCCCAATCTTG
CTGTGGTCGAGCAGTTGTCCACCATGAAGGACACTCCTCTAGCGTGCATAAACGGGTTCA
GAGAATCAACAGACTCAATCACACTCTCGTCGATGATCTCCGAGTAGGAGTGACCCTTCT
TCCTCAAGATCTCAATCTGAGCCAGCATAAGAGCAACGTAAACTCCAGCGGTGAAGGGAT
ACAAGGGACCCAAGTCACCAGCTGGTCTGGACTTCCTGGCGCGTTCACCGACCTTCCACA
TTCTTGTCTGATCAATCTTTCCCATTGGGAATGCAGGTAAGCCCTCCTTATCGTAGAAGC
GACGACCGGCTAAGACAACGCTCCTGATTTCGCTGCCAGCTGCTACATCCTCGTAACATT
CGTAGAGGATCTCCATACAAGGGTAGAAGGATGCACTGTATGCAGTCTCGAAGTCCTTTT
TGCCTTCTTCAGACAAGGAGTTGTTGACAGCCAACATTCCCTGGGTAGAGATAGTCCTTG
AGATGTTTCCTGTGATGCACTCTACGGTGTTATTGTAAGCCAAGTCTTCACTCATTCCAT
TTTCGGTGTACCTTCTGAACAGAGACTCCACGATTCCGTGAACAGCACC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL3608Contig1 515 2 1 U
GGGCAAACAACTGCTACATTTTCCCAGGTCTCGGTCTTGGTTTGATCATGTCCGGTGCCA
TTCGTGTCCGTGATGACATGCTTCTAGCAGCTTCGGAAGCTCTGGCCTCGCAAGTGACTG
AAGAGAACTTTGCGGACGGGTTGATCTATCCGCCTTTTACAAACATCAGAAAGATCTCTG
CTAACATTGCAGCCAGTGTGGGAGCCAAAACTTATGAACTTGGACTGGCATCGAACCTGC
CTCGTCCTAAGGACCTGGTCAAGATGGCAGAGAGCTGCATGTACAGCCCTGTCTACAGAA
ACTTCCGCTAAAGATTCTTTTCCACCATCCATTTTGTCCCCCCCAACCCCCAGCTTTTCT
TCTTTTCTTTTTACTTTTTGCTTCTTCGGTTTTGCTGGTACACGACACACAAATTTTTTT
TTCCTGTTTGATCGTTTTTTAAAATATAATTTCAACTTGAAGTACTGAAATATAATACTT
TTTCTCTTTTATGAATAGTAAAATATACATGACTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DB72JQ C 1
AF RR2DB72TF U 1
BS 1 515 RR2DB72TF

RD RR2DB72JQ 515 0 0
GGGCAAACAACTGCTACATTTTCCCAGGTCTCGGTCTTGGTTTGATCATGTCCGGTGCCA
TTCGTGTCCGTGATGACATGCTTCTAGCAGCTTCGGAAGCTCTGGCCTCGCAAGTGACTG
AAGAGAACTTTGCGGACGGGTTGATCTATCCGCCTTTTACAAACATCAGAAAGATCTCTG
CTAACATTGCAGCCAGTGTGGGAGCCAAAACTTATGAACTTGGACTGGCATCGAACCTGC
CTCGTCCTAAGGACCTGGTCAAGATGGCAGAGAGCTGCATGTACAGCCCTGTCTACAGAA
ACTTCCGCTAAAGATTCTTTTCCACCATCCATTTTGTCCCCCCCAACCCCCAGCTTTTCT
TCTTTTCTTTTTACTTTTTGCTTCTTCGGTTTTGCTGGTACACGACACACAAATTTTTTT
TTCCTGTTTGATCGTTTTTTAAAATATAATTTCAACTTGAAGTACTGAAATATAATACTT
TTTCTCTTTTATGAATAGTAAAATATACATGACTC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2DB72TF 515 0 0
GGGCAAACAACTGCTACATTTTCCCAGGTCTCGGTCTTGGTTTGATCATGTCCGGTGCCA
TTCGTGTCCGTGATGACATGCTTCTAGCAGCTTCGGAAGCTCTGGCCTCGCAAGTGACTG
AAGAGAACTTTGCGGACGGGTTGATCTATCCGCCTTTTACAAACATCAGAAAGATCTCTG
CTAACATTGCAGCCAGTGTGGGAGCCAAAACTTATGAACTTGGACTGGCATCGAACCTGC
CTCGTCCTAAGGACCTGGTCAAGATGGCAGAGAGCTGCATGTACAGCCCTGTCTACAGAA
ACTTCCGCTAAAGATTCTTTTCCACCATCCATTTTGTCCCCCCCAACCCCCAGCTTTTCT
TCTTTTCTTTTTACTTTTTGCTTCTTCGGTTTTGCTGGTACACGACACACAAATTTTTTT
TTCCTGTTTGATCGTTTTTTAAAATATAATTTCAACTTGAAGTACTGAAATATAATACTT
TTTCTCTTTTATGAATAGTAAAATATACATGACTC

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 3

CO CL3609Contig1 631 3 3 U
GGGTTTTGTTTTGCAATAATCTCGATTCTCCAAAAAAAAAAAAAAATCTCTGATCACGGA
AGAAGAGAAATGAGCTACGAGAGAGTTCCACCGGAATCGTATCCTCCTCCAGGATACCAA
TCTCATTATCCGCCTCCTGGTTATCCATCGGCGCCTCCGCCGCATCACGAAGGCTATCCA
CCACCTCAGCCTCACGGATATCCACCGTACCCACCGCCGCGTCCTTACGAAGGCGGTTAT
CGAGGCTACTTCGCCGGTAACTATCCTCCTCCTCCACCTCCGCCGCAGCAGTGCAATCAC
TACCAGCACGATCACCACCATTACGAGGATTCAAACTCTGATTGCTCTTCTTTCCTCCGT
GGCTGTCTTGCTGCTCTGTGCTGTTGCTGTTTGTTGGAGGAATGCTTCTGAAAATTCCCC
TTACTTCTCCCCGGATCATCTCTTGTTACTATCGTCATTTACAGTAACATTATATGTTAA
ATCAAATCCAAGACATGCCATAACGTCTCTATGTCTTTATGTACTGTGAAATGTTTCATT
GTCTGTTAATGCTGTACCTCTTTGTTTGAAAGTGGAACATGGATCAGAAGAATCCTATGT
ATGTTCTTTGTAATTTATCTGAATTATTTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD03TF U 1
AF RR2DX76TF U 14
AF RR2FD03JQ C 1
BS 1 288 RR2FD03TF
BS 289 541 RR2DX76TF
BS 542 631 RR2FD03JQ

RD RR2FD03TF 288 0 0
GGGTTTTGTTTTGCAATAATCTCGATTCTCCAAAAAAAAAAAAAAATCTCTGATCACGGA
AGAAGAGAAATGAGCTACGAGAGAGTTCCACCGGAATCGTATCCTCCTCCAGGATACCAA
TCTCATTATCCGCCTCCTGGTTATCCATCGGCGCCTCCGCCGCATCACGAAGGCTATCCA
CCACCTCAGCCTCACGGATATCCACCGTACCCACCGCCGCGTCCTTACGAAGGCGGTTAT
CGAGGCTACTTCGCCGGTAACTATCCTCCTCCTCCACCTCCGCCGCAG

QA 1 288 1 288
DS 

RD RR2DX76TF 528 0 0
CAATAATCTCGATTCTCCAAAAAAAAAAAAA**TCTCTGATCACGGAAGAAGAGAAATGA
GCTACGAGAGAGTTCCACCGGAATCGTATCCTCCTCCAGGATACCAATCTCATTATCCGC
CTCCTGGTTATCCATCGGCGCCTCCGCCGCATCACGAAGGCTATCCACCACCTCAGCCTC
ACGGATATCCACCGTACCCACCGCCGCGTCCTTACGAAGGCGGTTATCAAGGCTACTTCG
CCGGTAACTATCCTCCTCCTCCACCTCCGCCGCAGCAGTGCAATCACTACCAGCACGATC
ACCACCATTACGAGGATTCAAACTCTGATTGCTCTTCTTTCCTCCGTGGCTGTCTTGCTG
CTCTGTGCTGTTGCTGTTTGTTGGAGGAATGCTTCTGAAAATTCCCCTTACTTCTCCCCG
GATCATCTCTTGTTACTATCGTCATTTACAGTAACATTATATGTTAAATCAAATCCAAGA
CATGCCATAACGTCTCTATGTCTTTATGTACTGTGAAATGTTTCATTG

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2FD03JQ 631 0 0
GGGTTTTGTTTTGCAATAATCTCGATTCTCCAAAAAAAAAAAAAAATCTCTGATCACGGA
AGAAGAGAAATGAGCTACGAGAGAGTTCCACCGGAATCGTATCCTCCTCCAGGATACCAA
TCTCATTATCCGCCTCCTGGTTATCCATCGGCGCCTCCGCCGCATCACGAAGGCTATCCA
CCACCTCAGCCTCACGGATATCCACCGTACCCACCGCCGCGTCCTTACGAAGGCGGTTAT
CGAGGCTACTTCGCCGGTAACTATCCTCCTCCTCCACCTCCGCCGCAGCAGTGCAATCAC
TACCAGCACGATCACCACCATTACGAGGATTCAAACTCTGATTGCTCTTCTTTCCTCCGT
GGCTGTCTTGCTGCTCTGTGCTGTTGCTGTTTGTTGGAGGAATGCTTCTGAAAATTCCCC
TTACTTCTCCCCGGATCATCTCTTGTTACTATCGTCATTTACAGTAACATTATATGTTAA
ATCAAATCCAAGACATGCCATAACGTCTCTATGTCTTTATGTACTGTGAAATGTTTCATT
GTCTGTTAATGCTGTACCTCTTTGTTTGAAAGTGGAACATGGATCAGAAGAATCCTATGT
ATGTTCTTTGTAATTTATCTGAATTATTTGG

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 3

CO CL3610Contig1 618 3 6 U
GGGTGGACATGGAAAAGAAACTGATAATGCTAATGTTGCTTCTGCAACTTCTGTCCTTAA
ACTCTTTGTCTCTGGTTCAGTCCTCATCCATACCAACTGCAAATACCACTGTAATGGGTC
TTGTTTATTGCGATGTCTGTTCCAACAACAGTTTCTCCAAACACAGCTACTTCATGTCCG
GCGTGGAAGTGAGAATAATCTGCAGATTTAAGACAGCTTCATCGAAAACTAGGGAGATGA
TCACGTTCTCTGCAAATCGAACCACGAACGAGCTTGGACTCTACAAGGTAGATATAAAAT
CTGTGGAAGGTGTTTCTTGCGCCACAGAAGCGAACAAAGATTCTCTAGTGGCTTCTTGTC
AGGCGAGCTTGATCGGTAGCTCATCGGATTCCTGCAACGTTCCTGGCTACAAAACTACAA
CGGAACAGGTTAAGTCCAAGAGGTCTAATCTCTGTGTCTACCGATTTACCGCCTTGAATT
TCAGACCGTTTAAGAAGAATATTGACTTGTGTGGCAAGCAATAGAAAATAAGCTGCAAAT
TTCTATCACTGTTTTTACTTCTACTAGAACTTGTTTCTTATCCTCTGTTATTTATCTAAA
TATAATATTACCGTACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2G903TF U 1
AF RR2BH41TF U 88
AF RR2G903JQ C 180
BS 1 105 RR2G903TF
BS 106 106 RR2BH41TF
BS 107 173 RR2G903TF
BS 174 174 RR2BH41TF
BS 175 616 RR2G903TF
BS 617 618 RR2G903JQ

RD RR2G903TF 618 0 0
GGGTGGACATGGAAAAGAAACTGATAATGCTAATGTTGCTTCTGCAACTTCTGTCCTTAA
ACTCTTTGTCTCTGGTTCAGTCCTCATCCATACCAACTGCAAATATCACTGTAATGGGTC
TTGTTTATTGCGATGTCTGTTCCAACAACAGTTTCTCCAAACACAGCTACTTCGTGTCCG
GCGTGGAAGTGAGAATAATCTGCAGATTTAAGACAGCTTCATCGAAAACTAGGGAGATGA
TCACGTTCTCTGCAAATCGAACCACGAACGAGCTTGGACTCTACAAGGTAGATATAAAAT
CTGTGGAAGGTGTTTCTTGCGCCACAGAAGCGAACAAAGATTCTCTAGTGGCTTCTTGTC
AGGCGAGCTTGATCGGTAGCTCATCGGATTCCTGCAACGTTCCTGGCTACAAAACTACAA
CGGAACAGGTTAAGTCCAAGAGGTCTAATCTCTGTGTCTACCGATTTACCGCCTTGAATT
TCAGACCGTTTAAGAAGAATATTGACTTGTGTGGCAAGCAATAGAAAATAAGCTGCAAAT
TTCTATCACTGTTTTTACTTCTACTAGAACTTGTTTCTTATCCTCTGTTATTTATCTAAA
TATAATATTACCGTAC
CG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2BH41TF 530 0 0
GG
ATACCAACTGCAAATACCACTGTAATGGGTCTTGTTTATTGCGATGTCTGTTCCAACAAC
AGTTTCTCCAAACACAGCTACTTCATGTCCGGTGTGGAAGTGAGAATAATCTGCAGATTT
AAGACAGCTTCATCGAAAACTAGGGAGATGATCACGTTCTCTGCAAATCGAACCACGAAC
GAGCTTGGACTCTACAAGGTAGATATAAAATCTGTGGAAGGTGTTTCTTGCGCCACAGAA
GCGAACAAAGATTCTCTAGTGGCTTCTTGTCAGGCGAGCTTGATCGGTAGCTCATCGGAT
TCCTGCAACGTTCCTGGCTACAAAACTACAACGGAACAGGTTAAGTCCAAGAGGTCTAAT
CTCTGTGTCTACCGATTTACCGCCTTGAATTTCAGACCGTTTAAGAAGAATATTGACTTG
TGTGGCAAGCAATAGAAAATAAGCTGCAAATTTCTATCACTGTTTTTACTTCTACTAGAA
CTTGTTTCTTATCCTCTGTTATTTATCTAAATATAATATTACCGTAC
T

QA 3 529 3 529
DS 

RD RR2G903JQ 439 0 0
GGC
GTGGAAGTGAGAATAATCTGCAGATTTAAGACAGCTTCATCGAAAACTAGGGAGATGATC
ACGTTCTCTGCAAATCGAACCACGAACGAGCTTGGACTCTACAAGGTAGATATAAAATCT
GTGGAAGGTGTTTCTTGCGCCACAGAAGCGAACAAAGATTCTCTAGTGGCTTCTTGTCAG
GCGAGCTTGATCGGTAGCTCATCGGATTCCTGCAACGTTCCTGGCTACAAAACTACAACG
GAACAGGTTAAGTCCAAGAGGTCTAATCTCTGTGTCTACCGATTTACCGCCTTGAATTTC
AGACCGTTTAAGAAGAATATTGACTTGTGTGGCAAGCAATAGAAAATAAGCTGCAAATTT
CTATCACTGTTTTTACTTCTACTAGAACTTGTTTCTTATCCTCTGTTATTTATCTAAATA
TAATATTACCGTACCG

QA 4 439 4 439
DS 



AS 1 2

CO CL3611Contig1 906 2 2 U
GGGAGCAAGTGCATCATTTCACTTTGCTAGATGGAGAAATGGTTATTGATATTCCGAAAG
ATGAAAAAGGGCAGGCCAGGAGGAGGTACCTCGTATATGATCTGGTTGCAAATAACGGTG
AATCAGTCGTAGAGCGGAGTTTCTGTGAAAGATGGAACATGATCGTGCGTGAGGTGATTG
GACCCCGGGAAGCTGAAAAGCACAAAATTCTTTGCTACAGATACGACCTGGAGCCGTTCG
GAGTGCGGCCGAAGGGATTTTGGTTACTTTCTACTGTTGAGAAGCTATTGAAGAGCACCA
TCCCATCCCTTTCCCATGAATCTGATGGCCTAATATTTCAGGGTTGGGACGATCCTTATG
TTCCACGAACCCATAAAGGTCTACTAAAGTGGAAGTACGCTGATATGAACTCAGTTGACT
TTCTATTTGAGATGGGAAAGGATGATGGACGAGGAATGCTCTACTTGAACGAGAGAGGAA
AGAAAAAGCTTATAAGGCTATTCGGTTGAGTTTAGAGATGCAGACCCTGAACCTGCCTTT
TACTGTGGTAAGATTATAGAGTGTTCATGGGATATGGAGAAGCAAGTTTGGGTTTACATG
CGGACCAGAGTTGATAAGTATACACCAAACGATATCCATATCGCTTGTAATGTGATTAAA
AGCATAACCGACAACATCACAGAAGATGTGCTGCTTCAGGAAATAAGAGAGATTATCTGT
CTTCCAATGTATGTAGATCGAATTCAAATTGACCTTCGAGCCGCTGCCGCTGCACGCCGA
AGGTGTGACGAATTTACTAATAGGGTATCAGTTTTTATTTAATAGTACTAGGTGTTGTTC
AGTGTCTCTGTTGTTTGAAAATGGTTGTCCATAGATGTTGTTCTGTTTCAACGTCTCTGT
TGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI32TF U 1
AF RR2GI32JQB C 94
BS 1 673 RR2GI32TF
BS 674 906 RR2GI32JQB

RD RR2GI32TF 679 0 0
GGGAGCAAGTGCATCATTTCACTTTGCTAGATGGAGAAATGGTTATTGATATTCCGAAAG
ATGAAAAAGGGCAGGCCAGGAGGAGGTACCTCGTATATGATCTGGTTGCAAATAACGGTG
AATCAGTCGTAGAGCGGAGTTTCTGTGAAAGATGGAACATGATCGTGCGTGAGGTGATTG
GACCCCGGGAAGCTGAAAAGCACAAAATTCTTTGCTACAGATACGACCTGGAGCCGTTCG
GAGTGCGGCCGAAGGGATTTTGGTTACTTTCTACTGTTGAGAAGCTATTGAAGAGCACCA
TCCCATCCCTTTCCCATGAATCTGATGGCCTAATATTTCAGGGTTGGGACGATCCTTATG
TTCCACGAACCCATAAAGGTCTACTAAAGTGGAAGTACGCTGATATGAACTCAGTTGACT
TTCTATTTGAGATGGGAAAGGATGATGGACGAGGAATGCTCTACTTGAACGAGAGAGGAA
AGAAAAAGCTTATAAGGCTATTCGGTTGAGTTTAGAGATGCAGACCCTGAACCTGCCTTT
TACTGTGGTAAGATTATAGAGTGTTCATGGGATATGGAGAAGCAAGTTTGGGTTTACATG
CGGACCAGAGTTGATAAGTATACACCAAACGATATCCATATCGCTTGTAATGTGATTAAA
AGCATAACCGACA
CATCAC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2GI32JQB 813 0 0
TATATGATCTGGT*GCAAATAACGGTGAATCAGTCGTAGAGCGGAGTTTCTGTGAAAGAT
GGAACATGATCGTGCGTGAGGTGATTGGACCCCGGGAAGCTGAAAAGCACAAAATTCTTT
GCTACAGATACGACCTGGAGCCGTTCGGAGTGCGGCCGAAGGGATTTTGGTTACTTTCTA
CTGTTGAGAAGCTATTGAAGAGCACCATCCCATCCCTTTCCCATGAATCTGATGGCCTAA
TATTTCAGGGTTGGGACGATCCTTATGTTCCACGAACCCATAAAGGTCTACTAAAGTGGA
AGTACGCTGATATGAACTCAGTTGACTTTCTATTTGAGATGGGAAAGGATGATGGACGAG
GAATGCTCTACTTGAACGAGAGAGGAAAGAAAAAGCTTATAAGGCTATTCGGTTGAGTTT
AGAGATGCAGACCCTGAACCTGCCTTTTACTGTGGTAAGATTATAGAGTGTTCATGGGAT
ATGGAGAAGCAAGTTTGGGTTTACATGCGGACCAGAGTTGATAAGTATACACCAAACGAT
ATCCATATCGCTTGTAATGTGATTAAAAGCATAACCGACAACATCACAGAAGATGTGCTG
CTTCAGGAAATAAGAGAGATTATCTGTCTTCCAATGTATGTAGATCGAATTCAAATTGAC
CTTCGAGCCGCTGCCGCTGCACGCCGAAGGTGTGACGAATTTACTAATAGGGTATCAGTT
TTTATTTAATAGTACTAGGTGTTGTTCAGTGTCTCTGTTGTTTGAAAATGGTTGTCCATA
GATGTTGTTCTGTTTCAACGTCTCTGTTGTTTG

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

CO CL3612Contig1 1082 2 6 U
GGATCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCGTTAATTTTATCTCCGGCGAGTTAATGGCGATGCT
TCAAGCGAATCTTGGCTTCCTTAAATCTCCGACATTTTCGTTTCCTTCGTCGAATTTGTA
TCCGAAGCTTTCAGTCAAGTCGACATCACTCTGTCTGAGCTTCAGCTGTCGTCCCTCTGT
TCAAAAAATGGATTTTTCGAAAAGGGCTAGCAGAAGAGAACAGTCAGTCAAATGTTCTTC
ATCGTCTGAGTTTGATAATAGTAAAACAGTTGTGAAGGAGAAGAGTGTCTCAGTGATTCT
CTTAGCTGGTGGTCAAGGGAAGAGAATGAAAATGACCATACCAAAACAGTATATACCACT
CCTTGGTCAGCCAATTGCTCTCTACAGCTTTTTCACGTTTCCACGTATGCCTGAAGTGAA
GGAGATTGTAGTTGTGTGCGATCCATTTTTCCGAGATATTTTTGAAGAATATGAAGAATC
AATAGATGTTGATCTTAAATTCGCTCTTCCTGGTAAAGAAAGGCAAGACTCTGTTCTCAG
TGGACTTCAGGAAATAGATGCGAACGCTGAACTTGTTTGCATCCACGACTCAGCCAGACC
GTTGGTGGACACTGAAGATGTCGAAAAGGTACTTAAAGATGGATGGGCGGTTGGAGCAGC
CGTTCTTGGTGTCCCAGCGAAAGCTACTATCAAAGAGGTCAATTCAGATTCACTCGTGGT
GAAAACTCTTGACAGGAAAACCCTTTGGGAAATGCAAACACCACAGGTGATCAAACCCGA
GCTGTTGAAGAGAGGTTTCGAGCTTGTGAAAAGAGAAGGTCTAGAGGTAACAGATGATGT
TTCGATTGTTGAATACCTCAAGCACCCTGTTTATGTCACTCAAGGATTTTACACAAACAT
CAAGGTTACAACACCTGATGATTTACTGCTTGCTGAGAGAATTTTGAGCATGGACTCATG
AGGATGTAGTACGACTTGGTTTTTTGATTTAATTGTCAGCCTTACTGTATTTGTAGACAA
TAATGTTTTAAGATTTTACAAAAAAAGTGTTGAGACATTTGGAAAAGAAGAATCAAAAGA
AT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2FC96TF U 1
AF RR2D962JQ C 576
BS 1 642 RR2FC96TF
BS 643 643 RR2D962JQ
BS 644 735 RR2FC96TF
BS 736 736 RR2D962JQ
BS 737 788 RR2FC96TF
BS 789 1082 RR2D962JQ

RD RR2FC96TF 797 0 0
GGATCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCGTTAATTTTATCTCCGGCGAGTTAATGGCGATGCT
TCAAGCGAATCTTGGCTTCCTTAAATCTCCGACATTTTCGTTTCCTTCGTCGAATTTGTA
TCCGAAGCTTTCAGTCAAGTCGACATCACTCTGTCTGAGCTTCAGCTGTCGTCCCTCTGT
TCAAAAAATGGATTTTTCGAAAAGGGCTAGCAGAAGAGAACAGTCAGTCAAATGTTCTTC
ATCGTCTGAGTTTGATAATAGTAAAACAGTTGTGAAGGAGAAGAGTGTCTCAGTGATTCT
CTTAGCTGGTGGTCAAGGGAAGAGAATGAAAATGACCATACCAAAACAGTATATACCACT
CCTTGGTCAGCCAATTGCTCTCTACAGCTTTTTCACGTTTCCACGTATGCCTGAAGTGAA
GGAGATTGTAGTTGTGTGCGATCCATTTTTCCGAGATATTTTTGAAGAATATGAAGAATC
AATAGATGTTGATCTTAAATTCGCTCTTCCTGGTAAAGAAAGGCAAGACTCTGTTCTCAG
TGGACTTCAGGAAATAGATGCGAACGCTGAACTTGTTTGCATCCACGACTCAGCCAGACC
GTTGGTGGACACTGAAGATGTCGAAAAGGTACTTAAAGATGGTTGGGCGGTTGGAGCAGC
CGTTCTTGGTGTCCCAGCGAAAGCTACTATCAAAGAGGTCAATTCAGATTCACTCGTGGT
GAAAACTCTTGACAG*AAAACCCTTTGGGAAATGCAAACACCACAGGTGATCAAACCCGA
GCTGTTGA
AGAGGGGTT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2D962JQ 507 0 0
TTTGCATCCACGATTCAGCCAGACCGTTGGTGGACACTGAAGATGTCGAAAAGGTACTTA
AAGATGGATGGGCGGTTGGAGCAGCCGTTTTTGGTGTTCCAGGGAAAGCTACTATCAAAG
AGGTCAATTCAGATTCACTCGTGGTGAAAACTCTTGACAGGAAAACCCTTTGGGAAATGC
AGACACCACAGGTGATCAAACCCGAGCTGTTGAAGAGAGGTTTCGAGCTTGTGAAAAGAG
AAGGTCTAGAGGTAACAGATGATGTTTCGATTGTTGAATACCTCAAGCACCCTGTTTATG
TCACTCAAGGATTTTACACAAACATCAAGGTTACAACACCTGATGATTTACTGCTTGCTG
AGAGAATTTTGAGCATGGACTCATGAGGATGTAGTACGACTTGGTTTTTTGATTTAATTG
TCAGCCTTACTGTATTTGTAGACAATAATGTTTTAAGATTTTACAAAAAAAGTGTTGAGA
CATTTGGAAAAGAAGAATCAAAAGAAT

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 3

CO CL3613Contig1 650 3 30 U
GCTTTGGATTTTAATCACATATTCTCCACACACAAAACAATCCCAATACTGAAAACAAAA
CAAACAATTCCAGCAAACACACAACCAGCTTTTGAGATTTCAAAATTACATATCAAATAA
CAAACTAATTAAATTAATTAAAAATTTGTTCTCCCAAATACTTCCTCCTTAGATTTGGGT
TGTGGCAAGTGATATATGGTCTCGGATATGATTTCAAAGATCAGACCTTGGTTGCGTTTT
GAACCTGTAAAGCACTTTCTTCTTCTTGGAAGTCTGGTTATCGATTGTGATCACAATCTT
CCCCGGTTCACCCACCTTAAATGAATCGGTTATCACCGGCTCATCAGTTAACCCAATCTT
ACGGTTTTTAGAAACTATCACAACATAGCTTCCCTCTGTGGTCGGTTCAAACTGAGTCCC
ATAGCTCACATCTGCACCCAAGACCCTAAGCTCCCACGAGAGTGTGCAAGCCTCAGAAGC
AGGCAACTCTATGGTGTATTTAGCTGCTGGTTTAACAATGGCTTCGGTGACAGTGTCGCC
ACTGGTTAAAGAAATATCATTGCTAAGTCCGCCGTACTTAACCGGGACTTGTTCAGGAGA
AATGTATTTGAAAATGGTGTCAACAGACTTGGATGGACCAGCAAGGACCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CK19TF C 1
AF RR2CI05JQ U 127
AF RR2CK19JQ U 6
BS 1 5 RR2CK19TF
BS 6 126 RR2CK19JQ
BS 127 186 RR2CI05JQ
BS 187 187 RR2CK19JQ
BS 188 273 RR2CI05JQ
BS 274 274 RR2CK19JQ
BS 275 288 RR2CI05JQ
BS 289 289 RR2CK19JQ
BS 290 291 RR2CI05JQ
BS 292 292 RR2CK19JQ
BS 293 300 RR2CI05JQ
BS 301 301 RR2CK19JQ
BS 302 321 RR2CI05JQ
BS 322 322 RR2CK19JQ
BS 323 339 RR2CI05JQ
BS 340 340 RR2CK19JQ
BS 341 345 RR2CI05JQ
BS 346 346 RR2CK19JQ
BS 347 375 RR2CI05JQ
BS 376 376 RR2CK19JQ
BS 377 416 RR2CI05JQ
BS 417 417 RR2CK19JQ
BS 418 441 RR2CI05JQ
BS 442 442 RR2CK19JQ
BS 443 530 RR2CI05JQ
BS 531 531 RR2CK19JQ
BS 532 541 RR2CI05JQ
BS 542 542 RR2CK19JQ
BS 543 622 RR2CI05JQ
BS 623 650 RR2CK19JQ

RD RR2CK19TF 650 0 0
GCTTTGGATTTTAATCACATATTCTCCACACACAAAACAATCCCAATACTGAAAACAAAA
CAAACAATTCCAGCAAACACACAACCAGCTTTTGAGATTTCAAAATTACATATCAAATAA
CAAACTAATTAAATTAATTAAAAATTTGTTCTCCCAAATACTTCCTCCTTAGATTTGGGT
TGTGGCAAGTGATATATGGTCTCGGATATGATTTCAAAGATCAGACCTTGGTTGCGTTTT
GAACCTGTAAAGCACTTTCTTCTTCTTGGAAGTCTGGTTATCGATTGTGATCACAATCTT
CCCCGGTTCACCCACCTTAAATGAATCGGTTATCACCGGCTCATCAGTTAACCCAATCTT
ACGGTTTTTAGAAACTATCACAACATAGCTTCCCTCTGTGGTCGGTTCAAACTGAGTCCC
ATAGCTCACATCTGCACCCAAGACCCTAAGCTCCCACGAGAGTGTGCAAGCCTCAGAAGC
AGGCAACTCTATGGTGTATTTAGCTGCTGGTTTAACAATGGCTTCGGTGACAGTGTCGCC
ACTGGTTAAAGAAATATCATTGCTAAGTCCGCCGTACTTAACCGGGACTTGTTCAGGAGA
AATGTATTTGAAAATGGTGTCAACAGACTTGGATGGACCAGCAAGGACCC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2CI05JQ 496 0 0
AATTAAATTAATTAAAAATTTGTTCTCCCAAATACTTCCTCCTTAGATTTGGGTTGTGGC
GAGTGATATATGGTCTCGGATATGATTTCAAAGATCAGACCTTGGTTGCGTTTTGAACCT
GTAAAGCACTTTCTTCTTCTTGGAAGTTTGGTTATCGATTGTAATAACAATCTTTCCCGG
TTCACCCACCTTAAAAGAATCGGTTATCACCGGTTCATCGGTTAACCCAATCTTACGGTT
TTTAGAAACAATCACAACATAGCTTCCCTCTGTGGTCGGTTCAAACTGAGCCCCATAGCT
CACATCTGCACCCAAAACCCTAAGCTCCCACGAGAGTGTGCAAGCCTCAGAAGCAGGCAA
CTCTATGGTGTATTTAGCTGCTGGTTTAACAATGGCTTCGGTGATAGTGTCGCCAGTGGT
TAAAGAAATATCATTGCTAAGTCCGCCGTACTTAACCGGGACTTGTTCAGGAGAAATGTA
TTTGAAAATGGTGTCA

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2CK19JQ 645 0 0
GGATTTTAATCACATATTCTCCACACACAAAACAATCCCAATACTGAAAACAAAACAAAC
AATTCCAGCAAACACACAACCAGCTTTTGAGATTTCAAAATTACATATCAAATAACAAAC
TAATTAAATTAATTAAAAATTTGTTCTCCCAAATACTTCCTCCTTAGATTTGGGTTGTGG
CAAGTGATATATGGTCTCGGATATGATTTCAAAGATCAGACCTTGGTTGCGTTTTGAACC
TGTAAAGCACTTTCTTCTTCTTGGAAGTCTGGTTATCGATTGTGATCACAATCTTCCCCG
GTTCACCCACCTTAAATGAATCGGTTATCACCGGCTCATCAGTTAACCCAATCTTACGGT
TTTTAGAAACTATCACAACATAGCTTCCCTCTGTGGTCGGTTCAAACTGAGTCCCATAGC
TCACATCTGCACCCAAGACCCTAAGCTCCCACGAGAGTGTGCAAGCCTCATAAGCAGGCA
ACTCTATGGTGTATTTAGCTGCTGGTTTAACAATGGCTTCGGTGACAGTGTCGCCACTGG
TTAAAGAAATATCATTGCTAAGTCCGCCGTACTTAACCGGGACTTGTTCAAGAGAAATGT
ATTTGAAAATGGTGTCAACAGACTTGGATGGACCAGCAAGGACCC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 3

CO CL3614Contig1 1093 3 24 U
GGGCAGAAAGAAAACATCATCTTTTAATCAGTCGCTTTCGTGAATTCAAAGCTGCTTCAA
ATTCATTTTCAACGTTGAAGCTTCTAGAGATTCGATCAGGTTTCGAATTTTGTAAGAATC
TCTGTTCAATTTGTCTAGTGGTGGTCGGATTGAATTCGATTGGGAATGGCTCAAGCTGTA
GAAGAATGGTACAAACAGATGCCGATCATAACCCGGTCGTATCTGACGGCGGCTGTTGTC
ACCACCGTCGGATGTTCCCTCGAGATAATATCTCCTTATAACCTATACCTAAACCCTACT
CTTGTGGTGAAGCAATACCAGTTCTGGCGCCTCGTTACTAACTTCCTTTATTTCCGTAAC
ATGGATTTGGACTTCCTGTTCCATATGTTCTTTCTAGCTAGATACTGCAAACTCCTTGAA
GAAAACTCCTTCAGGGGAAAGACTGCTGATTTCCTTTACATGCTCTTATTCGGGGCAACT
GTTCTCACCGGTATTGTTCTCGTTGGTGGGATGATACCTTACTTGTCCGTCTCTTTCTCC
AAAATCATCTTCCTCAGCAACTCTTTGACCTTCATGATGGTCTATGTATGGAGCAAGCAA
AATCCTTACATCCACATGAGTTTCCTTGGCCTTTTCACTTTTACTGCAGCTTATTTACCA
TGGGTGCTTCTTGGGTTCTCTGTCCTTGTTGGTGCAAGTCCCTGGGGGGATTTACTGGGA
ATGATAGCAGGTCACGCGTACTACTTCTTGGCATTTGTGTATCCACGAATGACTGATAGA
CGACCCTTGAAAACTCCATCTTTCCTCAAAGCCCTATTCGCCGATGAGCCTGTTGTTGTT
GCACGGCCAGAAGATGTGAGGTTTGCTCATGCGCCCTTTGATGAAATCCACCAAGACTGA
ATCTTTATCGTCCACACAAACACGGTTCAAGTCTGTTCAGATCATGTTAAAAGGGCAAAT
GATGTAACTCACTCATGGACTCTTGTTTTACATAGTTGTTGATAACGTGGAAGTTTTTGT
TAGTTTTGTTTTCTTATGTCCGACTTATATGTGTTTACCTCGTTGTTCTACATAGTCTTC
CAACACTCTAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H501TF U 12
AF RR2C131TF U 1
AF RR2H501JQB C 575
BS 1 114 RR2C131TF
BS 115 115 RR2H501TF
BS 116 131 RR2C131TF
BS 132 132 RR2H501TF
BS 133 136 RR2C131TF
BS 137 137 RR2H501TF
BS 138 169 RR2C131TF
BS 170 170 RR2H501TF
BS 171 222 RR2C131TF
BS 223 223 RR2H501TF
BS 224 239 RR2C131TF
BS 240 240 RR2H501TF
BS 241 602 RR2C131TF
BS 603 603 RR2H501TF
BS 604 676 RR2C131TF
BS 677 677 RR2H501TF
BS 678 711 RR2C131TF
BS 712 712 RR2H501TF
BS 713 730 RR2C131TF
BS 731 731 RR2H501JQB
BS 732 760 RR2C131TF
BS 761 761 RR2H501JQB
BS 762 767 RR2C131TF
BS 768 1093 RR2H501JQB

RD RR2H501TF 705 0 0
GGAAGAAAGAAAA
TAATCAGTCGCTTTCGTGAATTCAAAGCTGCTTCAAATTCATTTTCAACGTTGAAGCTTC
TAGAGATTCGATTAGGTTTCGAATTTTGTAAGAATCTCTGTTCAATTTGTCTAGTGGTGG
TCGGATTGAATTCGATTGGGAATGGCTCAAGCTGTAGAAGAATGGTACAAACAGATGCCG
ATCATAACCCGGTCGTATCTGACGGCGGCTGTTGTCACCACCGTCGGATGTTCCCTCGAG
ATAATATCTCCTTATAACCTATACCTAAACCCTACTCTTGTGGTGAAGCAATACCAGTTC
TGGCGCCTCGTTACTAACTTCCTTTATTTCCGTAACATGGATTTGGACTTCTTGTTCCAT
ATGTTCTTTCTAGCTAGATACTGCAAACTCCTTGAAGAAAACTCCTTCAGGGGAAAGACT
GCTGATTTCCTTTACATGCTTTTATTCGGGGCAACTGTTCTCACCGGTATTGTTCTCGTT
GGTGGGATGATACCTTACTTGTCCGTCTCTTTCTCCAAAATCATCTTCCTCAGCAACTCT
TTGACTTTCATGATGGTCTATGTATGGAGCAAGCAAAATCCTTACATCCACATGAGTTTC
CTTGGCCTTTTCACTTTTACTGCAGCTTATTTACCATGGGTGCTTCTTGGGTTCTCTGTC
CTTGTTGGTGCAAGTCCCTGGGGGGATTTACT

QA 14 705 14 705
DS 

RD RR2C131TF 767 0 0
GGGCAGAAAGAAAACATCATCTTTTAATCAGTCGCTTTCGTGAATTCAAAGCTGCTTCAA
ATTCATTTTCAACGTTGAAGCTTCTAGAGATTCGATCAGGTTTCGAATTTTGTAGGAATC
TCTGTTCAATT*GTCTCGTGGTGGTCGGATTGAATTCGATTGGGAATGGTTCAAGCTGTA
GAAGAATGGTACAAACAGATGCCGATCATAACCCGGTCGTATTTGACGGCGGCTGTTGTT
ACCACCGTCGGATGTTCCCTCGAGATAATATCTCCTTATAACCTATACCTAAACCCTACT
CTTGTGGTGAAGCAATACCAGTTCTGGCGCCTCGTTACTAACTTCCTTTATTTCCGTAAC
ATGGATTTGGACTTCCTGTTCCATATGTTCTTTCTAGCTAGATACTGCAAACTCCTTGAA
GAAAACTCCTTCAGGGGAAAGACTGCTGATTTCCTTTACATGCTCTTATTCGGGGCAACT
GTTCTCACCGGTATTGTTCTCGTTGGTGGGATGATACCTTACTTGTCCGTCTCTTTCTCC
AAAATCATCTTCCTCAGCAACTCTTTGACCTTCATGATGGTCTATGTATGGAGCAAGCAA
AACCCTTACATCCACATGAGTTTCCTTGGCCTTTTCACTTTTACTGCAGCTTATTTACCA
TGGGTGCTTCTTGGGT*CTCTGTCCTTGTTGGTGCAAGTCCCTGGGGGGATCTACTGGGA
ATGATAGCAG*TCACGCGTACTACTTCTTGGCATTTGTGTTTCCACG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2H501JQB 519 0 0
TGATGGTCTATGTATGGAGCAAGCAAAATCCTTACATCCACATGAGTTTCCTTGGCCTTT
TCACTTTTACTGCAGCTTATTTACCATGGGTGCTTCTTGGGTTCTCTGTCCTTGTTGGTG
CAAGTCCCTGGGGGGATTTACTGGGAATGATAGCAGGTCACGCGTACTACTTCTTGGCAT
TTGTGTATCCACGAATGACTGATAGACGACCCTTGAAAACTCCATCTTTCCTCAAAGCCC
TATTCGCCGATGAGCCTGTTGTTGTTGCACGGCCAGAAGATGTGAGGTTTGCTCATGCGC
CCTTTGATGAAATCCACCAAGACTGAATCTTTATCGTCCACACAAACACGGTTCAAGTCT
GTTCAGATCATGTTAAAAGGGCAAATGATGTAACTCACTCATGGACTCTTGTTTTACATA
GTTGTTGATAACGTGGAAGTTTTTGTTAGTTTTGTTTTCTTATGTCCGACTTATATGTGT
TTACCTCGTTGTTCTACATAGTCTTCCAACACTCTAGTT

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 3

CO CL3615Contig1 1118 3 21 U
GATTCAAGTCTACTCTTAACTTCAGGATCCAGAACCACAAGATGAAGCTTGTGGAGATGG
AAGGCTCTCATGTTCTTCAGAACGACTATGACTCACTCGATGTCCACGTTGGCCAGTGCT
TTTCAGTTCTCGTGACTGCTGACCAAGCAGCTAAGGACTACTACATGGTTGCATCCACTA
GGTTCCTGAAAAGGGAACTAATCACTGTTGGTGTGATCCGGTACGCAGGAAGCAACGTCC
AGGCCTCAACAGAGCTTCCCAAGACTCCTGTTGGTTGGGCTTGGTCTATGAACCAGTTCA
GATCTTTCAGGTGGAACCTCACCGCTAGTGCTGCAAGGCCCAACCCACAGGGATCATACC
ATTATGGAAAGATCAACATCACCCGCAGCATCAAGCTTGTCAACAGCAAGAACGTGGTGA
ACGGTAAAGTCAGGTTTGGGTTCAACGGTGTATCACACGTTGACACCGAGACTCCTTTGA
AGCTGGCTGAGTACTTTCAGATGGCAGAGAAGGTGTTCAAGTACAACGTCATCAAGGACG
AGCCTGCAGCACAAATCACAGCATTGAACGTGCAGCCTAATGTGCTCAACATCACTTTCC
GTACCTTTGTAGAGATCATATTCGAGAACCATGAGAAGAGCATGGAGTCATTCCATTTGG
ATGGTTACTCCTTCTTCGCAGTCGCCTCTGAGCCAGGGAGGTGGACACCTGAAAAGAGAA
AGAACTACAACTTGCTCGATGCGGTTAGCAGACACACGGTCCAAGTCTACCCAAAGTCTT
GGTCAGCTATCCTCTTGACATTCGACAACGCC*GGTATGTGGAACATCAGGTCTGAGAAC
TTGGAGAGGAGATACCTTGGACAACAATTGTATGTGAGTGTTCTGTCACCAGAGAAGTCT
CTAAGGGACGAGTACAACATCCCCCTCAACACTAACCTCTGTGGCATCGTCAAGGGCTTG
CCATTGTCTGCAAGCTACACTTAAGTTAAGTAACTATACTCCACAAAGTGGGGTGTATCA
TTAATTTTCTAATTAACCCTTTTCCTAATTTTAATGTTTGTAATATGTAAACTACCAGTT
CTTACTTGTTTTCATATACTATATCATTAACCACAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B894TF U 1
AF RR2BM04TF U 280
AF RR2BM04JQ C 279
BS 1 496 RR2B894TF
BS 497 497 RR2BM04TF
BS 498 562 RR2B894TF
BS 563 563 RR2BM04TF
BS 564 567 RR2B894TF
BS 568 568 RR2BM04TF
BS 569 570 RR2B894TF
BS 571 571 RR2BM04TF
BS 572 604 RR2B894TF
BS 605 605 RR2BM04TF
BS 606 736 RR2B894TF
BS 737 737 RR2BM04TF
BS 738 788 RR2B894TF
BS 789 789 RR2BM04TF
BS 790 812 RR2B894TF
BS 813 813 RR2BM04TF
BS 814 826 RR2B894TF
BS 827 955 RR2BM04TF
BS 956 956 RR2BM04JQ
BS 957 972 RR2BM04TF
BS 973 1118 RR2BM04JQ

RD RR2B894TF 826 0 0
GATTCAAGTCTACTCTTAACTTCAGGATCCAGAACCACAAGATGAAGCTTGTGGAGATGG
AAGGCTCTCATGTTCTTCAGAACGACTATGACTCACTCGATGTCCACGTTGGCCAGTGCT
TTTCAGTTCTCGTGACTGCTGACCAAGCAGCTAAGGACTACTACATGGTTGCATCCACTA
GGTTCCTGAAAAGGGAACTAATCACTGTTGGTGTGATCCGGTACGCAGGAAGCAACGTCC
AGGCCTCAACAGAGCTTCCCAAGACTCCTGTTGGTTGGGCTTGGTCTATGAACCAGTTCA
GATCTTTCAGGTGGAACCTCACCGCTAGTGCTGCAAGGCCCAACCCACAGGGATCATACC
ATTATGGAAAGATCAACATCACCCGCAGCATCAAGCTTGTCAACAGCAAGAACGTGGTGA
ACGGTAAAGTCAGGTTTGGGTTCAACGGTGTATCACACGTTGACACCGAGACTCCTTTGA
AGCTGGCTGAGTACTTCCAGATGGCAGAGAAGGTGTTCAAGTACAACGTCATCAAGGACG
AGCCTGCAGCACAAATCACAGC*TTGACCGCGCAGCCTAATGTGCTCAACATCACTTTCC
GTACTTTTGTAGAGATCATATTCGAGAACCATGAGAAGAGCATGGAGTCATTCCATTTGG
ATGGTTACTCCTTCTTCGCAGTCGCCTCTGAGCCAGGGAGGTGGACACCTGAAAAGAGAA
AGAACTACAACTTGCTGGATGCGGTTAGCAGACACACGGTCCAAGTCTACCCAAAGTCTT
GGTCAGCTGTCCTCTTGACATTCGACAACGCCCGGTATGTGGAACA

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2BM04TF 697 0 0
CTTG
GTCTATGAACCAGTTCAGATCTTTCAGGTGGAACCTCACCGCTAGTGCTGCAAGGCCTAA
CCCACAGGGATCATACCATTATGGAAAGATCAACATCACCCGCAGCATCAAGCTTGTCAA
CAGCAAGAACGTGGTGAACGGTAAAGTCAGGTTTGGGTTCAACGGTGTATCACACGTTGA
CACCGAGACTCCTTTGAAGCTGGCTGAGTACTTTCAGATGGCAGAGAAGGTGTTCAAGTA
CAACGTCATCAAGGACGAGCCTGCAGCACAAATCACAGCATTGAACGTGCAGCCTAATGT
GCTCAACATCACTTTCCGTACCTTTGTAGAGATCATATTCGAGAACCATGAGAAGAGCAT
GGAGTCATTCCATTTGGATGGTTACTCCTTCTTCGCAGTCGCCTCTGAGCCAGGGAGGTG
GACACCTGAAAAGAGAAAGAACTACAACTTGCTCGATGCGGTTAGCAGACACACGGTCCA
AGTCTACCCAAAGTCTTGGTCAGCTATCCTCTTGACATTCGACAACGCC*GGTATGTGGA
ACATCAGGTCTGAGAACTTGGAGAGGAGATACCTTGGACAACAATTGTATGTGAGTGTTC
TGTCACCAGAGAAGTCTCTAAGGGACGAGTACAACATCCCCCTCAACACTAACCTCTGTG
GCATCGTCAAGG*CTTGCCATTGTCTGCA
GCTA

QA 5 693 5 693
DS 

RD RR2BM04JQ 840 0 0
GGCTT
GTCTATGAACCAGTTCAGATCTTTCAGGTGGAAC*TCACCGCTAGTGCTGCAAGGCT*AA
CCCACAGGGATCATACCATTATGGAAAGATCAACATCACCCGCAGCATCAAGCTTGTCAA
CAGCAAGAACGTGGTGAACGGTAAAGTCAGGTTTGGGTTCAACGGTGTATCACACGTTGA
CACCGAGACTCCTTTGAAGCTGGCTGAGTACTTTCAGATGGCAGAGAAGGTGTTCAAGTA
CAACGTCATCAAGGACGAGCCTGCAGCACAAATCACAGCATTGAACGTGCAGCCTAATGT
GCTCAACATCACTTTCCGTACCTTTGTAGAGATCATATTCGAGAACCATGAGAAGAGCAT
GGAGTCATTCCATTTGGATGGTTACTCCTTCTTCGCAGTCGCCTCTGAGCCAGGGAGGTG
GACACCTGAAAAGAGAAAGAACTACAACTTGCTCGATGCGGTTAGCAGACACACGGTCCA
AGTCTACCCAAAGTCTTGGTCAGCTATCCTCTTGACATTCGACAACGCC*GGTATGTGGA
ACATCAGGTCTGAGAACTTGGAGAGGAGATACCTTGGACAACAATTGTATGTGAGTGTTC
TGTCACCAGAGAAGTCTCTAAGGGACGAGTACAACATCCCCCTCAACACTAACCTCTGTG
GCATCGTCAAGGGCTTGCCATTGTCTGCAAGCTACACTTAAGTTAAGTAACTATACTCCA
CAAAGTGGGGTGTATCATTAATTTTCTAATTAACCCTTTTCCTAATTTTAATGTTTGTAA
TATGTAAACTACCAGTTCTTACTTGTTTTCATATACTATATCATTAACCACAATC

QA 6 840 6 840
DS 



AS 1 3

CO CL3616Contig1 900 3 19 U
TTTTTCTTTCAATTCAGTTTGGTTCCGATGGTTGTTTTACTTGTTGAATTCGCGTATGCG
TAAGAGCACATATCGAAGGCTTGCAGATAACGTATTGTTAAATCGCCTGTGAGCTCAATA
TTTGTGCGAAACCCTAAAACCATCCATTGAGATTTTAAAAAGATCTCTGTGTTA***GAA
TCTCTCTTTTCTTATCGACAATTCTAATGAATGGGACATTTCTTAGTACTTGAATCGCTA
ATTGTTTTGATTTCTTCAGACAGTAGTAAGAACTTAGTTATATCTACTGTAGTTTTAAGT
GTTCACTAAGTGGTGATGACTACACAAGTAGTTTGAGAGATTTGGTTGATGGATCTGTTG
TAGATATAACAAAGCATTATGTATAGATCCACGGCTCTAGTTTCTTGCATTGAGTTGCTT
GATCATGTTGTGATGGAGCTATTTGCAGATGTGACACCGAGAAGGGAGTTGGGAGGGCAT
GGAAGGCATTACACACTACAAAGGCTCAGCCTTTCACTGTATAATCCCAGGGTTCACGGT
GCCAAGGTGTAGATTTCACACGTGGTGAATCGATTTATGGGACTAAGTTTCAGGAAGAGA
GATCTTTAAGTTGAAGCATAAAGGGTCCAGGGATTTTGTCTATGGCTAATTCAGGTCCCA
ACAGTTCTTTGTTTGCACGGAGAAGACCTCATGGCTTTGGTTTTGTGTTTTGGAAAGTTG
TGGATGGGGTACAATGTGGTGAAGCCAAATGGAGTAGAGTTCTGGATACTACATAAATAT
CAAACAAGTTGGGGATTTTCGTTTTTGTGGTTTCTAGTTATGTGTTTGTAATCTAAGTTG
TACAATTGTAAGACTTTCGGGATGTGTATATAAGTTATAATGGATCGTCTGGTTCCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D095TF U 1
AF RR2AU90TF U 6
AF RR2AU90JQ C 111
BS 1 174 RR2D095TF
BS 175 177 RR2AU90TF
BS 178 455 RR2D095TF
BS 456 456 RR2AU90TF
BS 457 499 RR2D095TF
BS 500 500 RR2AU90TF
BS 501 534 RR2D095TF
BS 535 593 RR2AU90TF
BS 594 594 RR2AU90JQ
BS 595 654 RR2AU90TF
BS 655 655 RR2AU90JQ
BS 656 715 RR2AU90TF
BS 716 716 RR2AU90JQ
BS 717 733 RR2AU90TF
BS 734 734 RR2AU90JQ
BS 735 745 RR2AU90TF
BS 746 747 RR2AU90JQ
BS 748 776 RR2AU90TF
BS 777 900 RR2AU90JQ

RD RR2D095TF 534 0 0
TTTTTCTTTCAATTCAGTTTGGTTCCGATGGTTGTTTTACTTGTTGAATTCGCGTATGCG
TAAGAGCACATATCGAAGGCTTGCAGATAACGTATTGTTAAATCGCCTGTGAGCTCAATA
TTTGTGCGAAACCCTAAAACCATCCATTGAGATTTTAAAAAGATCTCTGTGTTATAAGAA
TCTCTCTTTTCTTATCGACAATTCTAATGAATGGGACATTTCTTAGTACTTGAATCGCTA
ATTGTTTTGATTTCTTCAGACAGTAGTAAGAACTTAGTTATATCTACTGTAGTTTTAAGT
GTTCACTAAGTGGTGATGACTACACAAGTAGTTTGAGAGATTTGGTTGATGGATCTGTTG
TAGATATAACAAAGCATTATGTATAGATCCACGGCTCTAGTTTCTTGCATTGAGTTGCTT
GATCATGTTGTGATGGAGCTATTTGCAGATGTGAC*CCGAGAAGGGAGTTGGGAGGGCAT
GGAAGGCATTACACACTACCAAGGCTCAGCCTTTCACTGTATAATCCCAGGGTT

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2AU90TF 786 0 0
CTTTCAATTCAGTTTGGTTCCGATGGTTGTTTTACTTGTTGAATTCGCGTATGCGTAAGA
GCACATATCGAAGGCTTGCAGATAACGTATTGTTAAATCGCCTGTGAGCTCAATATTTGT
GCGAAACCCTAAAACCATCCATTGAGATTTTAAAAAGATCTCTGTGTTA***GAATCTCT
CTTTTCTTATCGACAATTCTAATGAATGGGACATTTCTTAGTACTTGAATCGCTAATTGT
TTTGATTTCTTCAGACAGTAGTAAGAACTTAGTTATATCTACTGTAGTTTTAAGTGTTCA
CTAAGTGGTGATGACTACACAAGTAGTTTGAGAGATTTGGTTGATGGATCTGTTGTAGAT
ATAACAAAGCATTATGTATAGATCCACGGCTCTAGTTTCTTGCATTGAGTTGCTTGATCA
TGTTGTGATGGAGCTATTTGCAGATGTGACACCGAGAAGGGAGTTGGGAGGGCATGGAAG
GCATTACACACTACAAAGGCTCAGCCTTTCACTGTATAATCCCAGGGTTCACGGTGCCAA
GGTGTAGATTTCACACGTGGTGAATCGATTTATGGGACTAAGTTTCAG*AAGAGAGATCT
TTAAGTTGAAGCATAAAGGGTCCAGGGATTTTGTCTATGGCTAATTCAG*TCCCAACAGT
TCTTTGTTTGCACGGAGAAGACCTCATGGCTTTGGTTTTGTGTTTTGGAA*GTTGTGGAT
GGGGTACA*TGTGGTGAAGC**AATGGAGTAGAGTTCTGGATACTACATAA
TATCAACAGTTGGGG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2AU90JQ 790 0 0
GAGCTCAATATTTGTGCGAAACCCTAAAACCATCCATTGAGATTTTAAAAAGATCTCTGT
GTTA***GAATCTCTCTTTTCTTATCGACAATTCTAATGAATGGGACATTTCTTAGTACT
TGAATCGCTAATTGTTTTGATTTCTTCAGACAGTAGTAAGAACTTAGTTATATCTACTGT
AGTTTTAAGTGTTCACTAAGTGGTGATGACTACACAAGTAGTTTGAGAGATTTGGTTGAT
GGATCTGTTGTAGATATAACAAAGCATTATGTATAGATCCACGGCTCTAGTTTCTTGCAT
TGAGTTGCTTGATCATGTTGTGATGGAGCTATTTGCAGATGTGACACCGAGAAGGGAGTT
GGGAGGGCATGGAAGGCATTACACACTACAAAGGCTCAGCCTTTCACTGTATAATCCCAG
GGTTCACGGTGCCAAGGTGTAGATTTCACACGTGGTGAATCGATTTATGGGACTAAGTTT
CAGGAAGAGAGATCTTTAAGTTGAAGCATAA*GGGTCCAGGGATTTTGTCTATGGCTAAT
TCAGGTCCCAACAGTTCTTTGTTTGCACGGAGAAGACCTCATGGCTTTGGTTTTGTGTTT
TGGAAAGTTGTGGATGGGGTACAATGTGGTGAAGGCAAATGGAGTAGAGTTCTGGATACT
ACATAAATATCAAACAAGTTGGGGATTTTCGTTTTTGTGGTTTCTAGTTATGTGTTTGTA
ATCTAAGTTGTACAATTGTAAGACTTTCGGGATGTGTATATAAGTTATAATGGATCGTCT
GGTTCCTGTC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL3617Contig1 762 2 2 U
AGAGGATACAACAAAATCACAAAGGGCCAACAACAATAAGAAACTGATAAAACAGAGGAT
ATAATTGATACAAATCACAGCAAGAAACCACAAAAATTGCATAAAAACAAATTCATAAAC
TTCTTGAATACTTGCATCTAGTGTAATCCAAAGGATCACAATCACTGCACCTGCAGAAAT
GGACATTACTTGGAAGGATGATCCTTGCAATACCAACAACACTTGAGCTTCCAATTCACT
CCATACGAAAAGAAATATAGGAAAAATAAATTGCTCCAAACCGGAAACAACTGAAAAGTT
TGTATCCATCAACAACATATTCACCAAGTGAAATATGTGAATGAGTTTCTCTCCAACTGG
AGAACCGTATGAGGAGACGGAAGAAGAAGTCCGAGATAAAATCTGAGAGAAGACCAGTCC
TCGCCTCGACAATGAGACATGTATACCACAGGAAATAAACGCCCATAGGCGAAAGGAGTG
TCACCGGTTGACACAAAAGGAGCACCACCACCATTGACCTCTGTCACCATTGTTGGACAA
GCAAGCATCACAACAAAGGTTTGGGTAAACTCTTGAAGAGAGGGCTTGGCAAAGGTGTTG
AGGATCTGAAGAGGAGTAAAGAGATAGACCGTGTCTGGAGGGTCTGGAGGTTCCGGTGGA
GTGATGAGAGAGAGATCTTCAACCAAATGAAACTCGTACGGCGGTGGATCCGGAGGAGGT
CTGAAACGGGATGGAGGAGAAGCAGTCACCATCAGGGCCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H041JQ U 1
AF RR2GU36TF C 163
BS 1 391 RR2H041JQ
BS 392 762 RR2GU36TF

RD RR2H041JQ 391 0 0
AGAGGATACAACAAAATCACAAAGGGCCAACAACAATAAGAAACTGATAAAACAGAGGAT
ATAATTGATACAAATCACAGCAAGAAACCACAAAAATTGCATAAAAACAAATTCATAAAC
TTCTTGAATACTTGCATCTAGTGTAATCCAAAGGATCACAATCACTGCACCTGCAGAAAT
GGACATTACTTGGAAGGATGATCCTTGCAATACCAACAACACTTGAGCTTCCAATTCACT
CCATACGAAAAGAAATATAGGAAAAATAAATTGCTCCAAACCGGAAACAACTGAAAAGTT
TGTATCCATCAACAACATATTCACCAAGTGAAATATGTGAATGAGTTTCTCTCCAACTGG
AGAACCGTATGAGGAGACGGAAGAAGAAGTC

QA 1 391 1 391
DS 

RD RR2GU36TF 600 0 0
CACTGCACG
TGCAGAGATGGACATTACTTGGAAGGATGATCCTTGCAATACCAACAACACTTGAGCTTC
CAATTCACTCCATACGAGAAGAAATATAGGAAAAATAAATTGCTCCAAACCGGAGACAAC
TGAGAAGTTTGTATCCATCAACAACATATTCACCAAGTGAAATATGTGAATGAGTTTCTC
TCCAACTGGAGAACCGTATGAGGAGACGGAAGAGGAAGTCCGAGATAAAATCTGAGAGAA
GACCAGTCCTCGCCTCGACAATGAGACATGTATACCACAGGAAATAAACGCCCATAGGCG
AAAGGAGTGTCACCGGTTGACACAAAAGGAGCACCACCACCATTGACCTCTGTCACCATT
GTTGGACAAGCAAGCATCACAACAAAGGTTTGGGTAAACTCTTGAAGAGAGGGCTTGGCA
AAGGTGTTGAGGATCTGAAGAGGAGTAAAGAGATAGACCGTGTCTGGAGGGTCTGGAGGT
TCCGGTGGAGTGATGAGAGAGAGATCTTCAACCAAATGAAACTCGTACGGCGGTGGATCC
GGAGGAGGTCTGAAACGGGATGGAGGAGAAGCAGTCACCATCAGGGCCATC

QA 10 600 10 600
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3619Contig1 673 3 11 U
GGTAGGAAGCAGCATCAATCATGGTGGGCATCCTTCAACTGTAACATCATCATGCACTTA
CACATCTATAAATACAAACTATCACTCGCAGTTTTGGCTAAAAATTACAACCATGGATAA
AGAGATTTACACATAAGCAGATGACAAAGAGTCTTTGTTTACCGACCACCACCGGGAACT
CTGTTCCAGGACAAGTAAGTAGGATCTCCAAGTCGCCTTGGTTTCACAAGATACATGATG
GTAAATACAAGTGCCAAGAAAAAACAGATTCCTCCAACAGTGAGGTAAGCAATGCCGAGG
AAATCATTCTTTCCACCGAGCCAACTAGTTGTTGACAAAACAAGCTTCTTCTTCCCATCG
AAACTGTATGTGTTGTAGTTGTTCTTCAGAATCACATTTATGGTATCACCTTTCTCCAGG
TCACTCTCAATCTTCCCGTATAGTTTTCTAAATGTTGGCAAAGCTGCAGTTCTCATCCAC
ACAATCAGATCCTCTTGCTCACTCAGCGATTTATTTGGATCTAGCTTGCCACCACCGGTG
AGATTGCCCGTCTGGAAGTTCTTGGGAAATACATTTTTGCCAAACTTGTGTTCCCTGTCA
CTCTTCCACGCAATGCCTCTCTTGCTTACATTCAAAGGCTGGTTGTTTTTGGACAAAGCG
TATGTGTCATTAA


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI67JQB U 1
AF RR2GH12JQB U 1
AF RR2FJ66JQ U 1
BS 1 32 RR2FJ66JQ
BS 33 33 RR2GI67JQB
BS 34 260 RR2FJ66JQ
BS 261 261 RR2GI67JQB
BS 262 509 RR2FJ66JQ
BS 510 510 RR2GI67JQB
BS 511 584 RR2FJ66JQ
BS 585 585 RR2GI67JQB
BS 586 586 RR2FJ66JQ
BS 587 587 RR2GI67JQB
BS 588 673 RR2FJ66JQ

RD RR2GI67JQB 656 0 0
GA
TAGGAAGCAGCATCAATCATGGTGGGCATCCTTCAACTGTAACATCATCATGCACTTACA
CATCTATAAATACAAACTATCACTCGCAGTTTTGGCTAAAAATTACAACCATGGATAAAG
AGATTTACACATAAGCAGATGACAAAGAGTCTTTGTTTACCGACCACCACCGGGAACTCT
GTTCCAGGACAAGTAAGTAGGATCTCCAAGTCGCCTTGGTTTCACAAGATACATGATGGT
AAATACAAGTGCCAAGAAAAAACAGATTCCTCCAACAGTGAGGTAAGCAATGCCGAGGAA
ATCATTCTTTCCACCGAGCCAACTAGTTGTTGACAAAACAAGCTTCTTCTTCCCATCGAA
ACTGTATGTGTTGTAGTTGTTCTTCAGAATCACATTTATGGTATCACCTTTCTCCAGGTC
ACTCTCAATCTTCCCGTATAGTTTTCTAAATGTTGGCAAAGCTGCAGTTCTCATCCACAC
AATCAGATCCTCTTGCTCACTCAGCGATTTATTTGGATCTAGCTTGCCACCACCGGTGAG
ATTGCCCGTCTGGAAGTTCTTGGGAAATACATTTTTGCCAAACTTGTGTTCCCTGTCACT
CTTCCACGCAATGCCTCTCTTGCTTACATTCAAAGGCTGGTTGTTTTTGGACAA

QA 3 656 3 656
DS 

RD RR2GH12JQB 640 0 0
GA
TAGGAAGCAGCATCAATCATGGTGGGCATCCTTCAACTGTAACATCATCATGCACTTACA
CATCTATAAATACAAACTATCACTCGCAGTTTTGGCTAAAAATTACAACCATGGATAAAG
AGATTTACACATAAGCAGATGACAAAGAGTCTTTGTTTACCGACCACCACCGGGAACTCT
GTTCCAGGACAAGTAAGTAGGATCTCCAAGTCGCCTTGGTTTCACAAGATACATGATGGT
AAATACAAGTGCCAAGAAAAAACAGATTCCTCCAACAGTGAGGTAAGCAATGCCGAGGAA
ATCATTCTTTCCACCGAGCCAACTAGTTGTTGACAAAACAAGCTTCTTCTTCCCATCGAA
ACTGTATGTGTTGTAGTTGTTCTTCAGAATCACATTTATGGTATCACCTTTCTCCAGGTC
ACTCTCAATCTTCCCGTATAGTTTTCTAAATGTTGGCAAAGCTGCAGTTCTCATCCACAC
AATCAGATCCTCTTGCTCACTCAGCGATTTATTTGGATCTAGCTTGCCACCACCGGTGAG
ATTGCCCGTCTGGAAGTTCTTGGGAAATACATTTTTGCCAAACTTGTGTTCCCTGTCACT
CTTCCACGCAATGCCTCTCTTGCTTACATTCAAAGGCT

QA 3 640 3 640
DS 

RD RR2FJ66JQ 673 0 0
GGTAGGAAGCAGCATCAATCATGGTGGGCATCTTTCAACTGTAACATCATCATGCACTTA
CACATCTATAAATACAAACTATCACTCGCAGTTTTGGCTAAAAATTACAACCATGGATAA
AGAGATTTACACATAAGCAGATGACAAAGAGTCTTTGTTTACCGACCACCACCGGGAACT
CTGTTCCAGGACAAGTAAGTAGGATCTCCAAGTCGCCTTGGTTTCACAAGATACATGATG
GTAAATACAAGTGCCAAGAAGAAACAGATTCCTCCAACAGTGAGGTAAGCAATGCCGAGG
AAATCATTCTTTCCACCGAGCCAACTAGTTGTTGACAAAACAAGCTTCTTCTTCCCATCG
AAACTGTATGTGTTGTAGTTGTTCTTCAGAATCACATTTATGGTATCACCTTTCTCCAGG
TCACTCTCAATCTTCCCGTATAGTTTTCTAAATGTTGGCAAAGCTGCAGTTCTCATCCAC
ACAATCAGATCCTCTTGCTCACTCAGCGACTTATTTGGATCTAGCTTGCCACCACCGGTG
AGATTGCCCGTCTGGAAGTTCTTGGGAAATACATTTTTGCCAAAAT*GTGTTCCCTGTCA
CTCTTCCACGCAATGCCTCTCTTGCTTACATTCAAAGGCTGGTTGTTTTTGGACAAAGCG
TATGTGTCATTAA

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 3

CO CL3620Contig1 1049 3 4 U
ACTCCAGACAAGGGATTGAGAACTTTGCTGATGTGTATGGGAGAAGCATTGAGGACAATA
GCTTTCAAAGTTAGGACAGCTTCCTGTGGTGGAACAGCTTGTGTTAACTCCTTTGGCGAT
GAACAACTTGCTGTTGATATGCTCGCTGATAAGCTTCTCTTTGAGGCTTTGCAATACTCG
CATGTGTGTAAGTACGCATGCTCTGAAGGAGTACCTGAGCTTCAAGACATGGGAGGTCCA
GTGGAAGGTGGGTTTAGTGTGGCGTTTGATCCACTGGATGGATCCAGCATTGTGGATACA
AACTTCACTGTGGGAACGATCTTTGGGGTTTGGCCTGGTGGCAAGTTAACAGGAGTCACA
GGAGGAGATCAAGTGGCTGCAGCCATGGGAATCTATGGTCCAAGAACCACTTATGTTGTG
GCTATTAAAGGGTTTCCAGGAACTCATGAATTCTTGCTTCTTGATGAAGGGAAATGGCAG
CATGTTAAGGAGACAACAGAGATTAATGAAGGGAAGATGTTCTCACCTGGAAACTTGAGA
GCCACGTTTGACAACTCTGAATACAGCAAGCTGATTGATTACTATGTGAAAGAGAAGTAC
ACACTGCGATACACCGGAGGAATGGTTCCTGATGTTAACCAGATTATTGTGAAGGAGAAA
GGAATCTTCACGAACGTGACTTCTCCTACGGCTAAGGCAAAGTTGAGGCTGTTGTTCGAG
GTGGCTCCTCTTGGCCTGCTCATTGAGAATGCTGGTGGGTTCAGCAGTGATGGACAAAAC
TCCGTGCTTGACAAGACCATCGTCAACCTGGACGATAGAACTCAAGTTGCTTATGGTTCA
AAGAACGAGATCATTCGCTTCGAAGAAACCCTTTACGGAACTTCAAGACTCAAGACTGCT
CCCGTTGGAGTTACTGCTTAGAACTCCCTTTTTAAATATAAACTGGAAGCATGTTGATTT
CTCCTTTTTTCCAACAAAAAACGGATAATGTATGTACTTTTGCTATTGGGGTTATATATA
TGAGAAGCAACAAAACCATCAGCAATGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY11TFB U 1
AF RR2AY11JQ C 293
AF RR2CV80TF U 363
BS 1 369 RR2AY11TFB
BS 370 505 RR2CV80TF
BS 506 506 RR2AY11JQ
BS 507 1049 RR2CV80TF

RD RR2AY11TFB 369 0 0
ACTCCAGACAAGGGATTGAGAACTTTGCTGATGTGTATGGGAGAAGCATTGAGGACAATA
GCTTTCAAAGTTAGGACAGCTTCCTGTGGTGGAACAGCTTGTGTTAACTCCTTTGGCGAT
GAACAACTTGCTGTTGATATGCTCGCTGATAAGCTTCTCTTTGAGGCTTTGCAATACTCG
CATGTGTGTAAGTACGCATGCTCTGAAGGAGTACCTGAGCTTCAAGACATGGGAGGTCCA
GTGGAAGGTGGGTTTAGTGTGGCGTTTGATCCACTGGATGGATCCAGCATTGTGGATACA
AACTTCACTGTGGGAACGATCTTTGGGGTTTGGCCTGGTGGCAAGTTAACAGGAGTCACA
GGAGGAGAT

QA 1 369 1 369
DS 

RD RR2AY11JQ 749 0 0
TGGATACAAACTTCACTGTGGGAACGATCTTTGGGGTTTGGCCTGGTGGCAAGTTAACAG
GAGTCACAGGAGGAGATCAAGTGGCTGCAGCCATGGGAATCTATGGTCCAAGAACCACTT
ATGTTGTGGCTATTAAAGGGTTTCCAGGAACTCATGAATTCTTGCTTCTTGATGAAGGGA
AATGGCAGCATGTTAAGGAGACAACAGAGATTAATGAAGGGAAGATGTTCTCACCTGGAA
ACTTGAGAGCCACGTTTGACAACTCTGAATACAGCAAGCTGATTGATTACTATGTGAAAG
AGAAGTACACACTGCGATACACCGGAGGAATGGTTCCTGATGTTAACCAGATTATTGTGA
AGGAGAAAGGAATCTTCACGAACGTGACTTCTCCTACGGCTAAGGCAAAGTTGAGGCTGT
TGTTCGAGGTGGCTCCTCTTGGCCTGCTCATTGAGAATGCTGGTGGGTTCAGCAGTGATG
GACAAAACTCCGTGCTTGACAAGACCATCGTCAACCTGGACGATAGAACTCAAGTTGCTT
ATGGTTCAAAGAACGAGATCATTCGCTTCGAAGAAACCCTTTACGGAACTTCAAGACTCA
AGACTGCTCCCGTTGGAGTTACTGCTTAGAACTCCCTTTTTAAATATAAACTGGAAGCAT
GTTGATTTCTCCTTTTTTCCAACAAAAAACGGATAATGTATGTACTTTTGCTATTGGGGT
TATATATATGAGAAGCAACAAAACCATCA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2CV80TF 687 0 0
G
GGAGATCAAGTGGCTGCAGCCATGGGAATCTATGGTCCAAGAACCACTTATGTTGTGGCT
ATTAAAGGGTTTCCAGGAACTCATGAATTCTTGCTTCTTGATGAAGGGAAATGGCAGCAT
GTTAAGGAGACAACAGAGATTAGTGAAGGGAAGATGTTCTCACCTGGAAACTTGAGAGCC
ACGTTTGACAACTCTGAATACAGCAAGCTGATTGATTACTATGTGAAAGAGAAGTACACA
CTGCGATACACCGGAGGAATGGTTCCTGATGTTAACCAGATTATTGTGAAGGAGAAAGGA
ATCTTCACGAACGTGACTTCTCCTACGGCTAAGGCAAAGTTGAGGCTGTTGTTCGAGGTG
GCTCCTCTTGGCCTGCTCATTGAGAATGCTGGTGGGTTCAGCAGTGATGGACAAAACTCC
GTGCTTGACAAGACCATCGTCAACCTGGACGATAGAACTCAAGTTGCTTATGGTTCAAAG
AACGAGATCATTCGCTTCGAAGAAACCCTTTACGGAACTTCAAGACTCAAGACTGCTCCC
GTTGGAGTTACTGCTTAGAACTCCCTTTTTAAATATAAACTGGAAGCATGTTGATTTCTC
CTTTTTTCCAACAAAAAACGGATAATGTATGTACTTTTGCTATTGGGGTTATATATATGA
GAAGCAACAAAACCATCAGCAATGGT

QA 2 687 2 687
DS 



AS 1 3

CO CL3621Contig1 945 3 3 U
GAGTAAAAAGTGTTGAATATTGAAACCATTGTACATAGTCAAAATAAACAACCATTGTAC
ATAGTCAAAGTAAACAAACCTTGGAGCTGTTTTATTGTTTTAACTTTTAAGAGTTCTTTT
GAGCATTCAGGACGAAACAAAGCACAAAGATCAGATCCACGCAGGGTTATTAAGCGGAGT
GACGACTGCCTTGACCTGCAAGTAGTTGTTGAGACTGTAAATACCTTTCTCTCTTCCGTT
GCCGCTCATCTTGTAACCACCAAAGGGAATGGCTGCGTCAAAGACATCGAAACAGTTGAC
CCAAACGGTGCCAGCTTTCAAAGCCCTCGAGACCCTATTTGCAGTGTCTAGGCTCTTTGT
GAAAACCCCTGCGGCTAGCCCGTATCTAGTGTTGTTAGCCCTCCTTATCACCTCATCAAC
ATCACTGAACTTCAAGATGGATTGGACTGGACCGAAAATCTCGTCTTGAGCAATAAGCAT
GTCATCCTTAACATTAAAAAAAAATGTAGGTTGGATGAAGTAACCTTTGTCGCCAAACTG
CCCACCACCACATTCAAGAGTAGCATTGCTTTCCACTCCTGACCTTATGTACTTCATAAC
TTTCTGAAATTGCTTTGAATCGATCTGAGGACCCTGTTCAATGCCTTTCTTGAAAGGATC
ACCAACGACACGTTTTAGTGCGCGTGCCTTTGCTTTCTCAACGAACTCATCATACACTTT
CTCATGAACATGTGTCCGAGACCCCGCGCAGCAACATTGCCCCTGATTAAAGAAGAGAGC
AAAGTGAGCAAGCTCCACAGCTTTATCGACATCAGCATCTTCGAATACAATGAAGGGTGA
TTTCCCTCCAAGTTCCAGAGTCACCGGCTTTAGATTGCTGTTAGCAGCTAGTCCAAGTAT
AACTTTGCCCGTATCAGTCGATCCTAGACAAGCAAGCTTATCTAC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ96JQ U 1
AF RR2B622JQ U 2
AF RR2B622TF C 161
BS 1 488 RR2DZ96JQ
BS 489 806 RR2B622JQ
BS 807 945 RR2B622TF

RD RR2DZ96JQ 488 0 0
GAGTAAAAAGTGTTGAATATTGAAACCATTGTACATAGTCAAAATAAACAACCATTGTAC
ATAGTCAAAGTAAACAAACCTTGGAGCTGTTTTATTGTTTTAACTTTTAAGAGTTCTTTT
GAGCATTCAGGACGAAACAAAGCACAAAGATCAGATCCACGCAGGGTTATTAAGCGGAGT
GACGACTGCCTTGACCTGCAAGTAGTTGTTGAGACTGTAAATACCTTTCTCTCTTCCGTT
GCCGCTCATCTTGTAACCACCAAAGGGAATGGCTGCGTCAAAGACATCGAAACAGTTGAC
CCAAACGGTGCCAGCTTTCAAAGCCCTCGAGACCCTATTTGCAGTGTCTAGGCTCTTTGT
GAAAACCCCTGCGGCTAGCCCGTATCTAGTGTTGTTAGCCCTCCTTATCACCTCATCAAC
ATCACTGAACTTCAAGATGGATTGGACTGGACCGAAAATCTCGTCTTGAGCAATAAGCAT
GTCATCCT

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2B622JQ 805 0 0
G
GTAAAAAGTGTTGAATATTGAAACCATTGTACATAGTCAAAATAAACAACCATTGTACAT
AGTCAAAGTAAACAAACCTTGGAGCTGTTTTATTGTTTTAACTTTTAAGAGTTCTTTTGA
GCATTCAGGACGAAACAAAGCACAAAGATCAGATCCACGCAGGGTTATTAAGCGGAGTGA
CGACTGCCTTGACCTGCAAGTAGTTGTTGAGACTGTAAATACCTTTCTCTCTTCCGTTGC
CGCTCATCTTGTAACCACCAAAGGGAATGGCTGCGTCAAAGACATCGAAACAGTTGACCC
AAACGGTGCCAGCTTTCAAAGCCCTCGAGACCCTATTTGCAGTGTCTAGGCTCTTTGTGA
AAACCCCTGCGGCTAGCCCGTATCTAGTGTTGTTAGCCCTCCTTATCACCTCATCAACAT
CACTGAACTTCAAGATGGATTGGACTGGACCGAAAATCTCGTCTTGAGCAATAAGCATGT
CATCCTTAACATTAAAAAAAAATGTAGGTTGGATGAAGTAACCTTTGTCGCCAAACTGCC
CACCACCACATTCAAGAGTAGCATTGCTTTCCACTCCTGACCTTATGTACTTCATAACTT
TCTGAAATTGCTTTGAATCGATCTGAGGACCCTGTTCAATGCCTTTCTTGAAAGGATCAC
CAACGACACGTTTTAGTGCGCGTGCCTTTGCTTTCTCAACGAACTCATCATACACTTTCT
CATGAACATGTGTCCGAGACCCCGCGCAGCAACATTGCCCCTGATTAAAGAAGAGAGCAA
AGTGAGCAAGCTCCACAGCTTTAT

QA 2 805 2 805
DS 

RD RR2B622TF 785 0 0
GCAGGGTTATTAAGCGGAGTGACGACTGCCTTGACGTGCAAGTAGTTGTTGAGACTGTAA
ATACCTTTCTCTCTTCCGTTGCCGCTCATCTTGTAACCACCAAAGGGAATGGCTGCGTCA
AAGACATCGAAACAGTTGACCCAAACGGTGCCAGCTTTCAAAGCCCTCGAGACCCTATTT
GCAGTGTCTAGGCTCTTTGTGAAAACCCCTGCGGCTAGCCCGTATCTAGTGTTGTTAGCC
CTCCTTATCACCTCATCAACATCACTGAACTTCAAGATGGATTGGACTGGACCGAAAATC
TCGTCTTGAGCAATAAGCATGTCATCCTTAACATTAGAAAAAAATGTAGGTTGGATGAAG
TAACCTTTGTCGCCAAACTGCCCACCACCACATTCAAGAGTAGCATTGCTTTCCACTCCT
GACCTTATGTACTTCATAACTTTCTGAAATTGCTTTGAATCGATCTGAGGACCCTGTTCA
ATGCCTTTCTTGAAAGGATCACCAACGACACGTTTTAGTGCGCGTGCCTTTGCTTTCTCA
ACGAACTCATCATACACTTTCTCATGAACATGTGTCCGAGACCCCGCGCAGCAACATTGC
CCCTGATTAAAGAAGAGAGCAAAGTGAGCAAGCTCCACAGCTTTATCGACATCAGCATCT
TCGAATACAATGAAGGGTGATTTCCCTCCAAGTTCCAGAGTCACCGGCTTTAGATTGCTG
TTAGCAGCTAGTCCAAGTATAACTTTGCCCGTATCAGTCGATCCTAGACAAGCAAGCTTA
TCTAC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 3

CO CL3622Contig1 1021 3 7 U
GAGCTCAGTGGTTGTGAAGATAACTGCGATTTGTCCCATCAGTCTTCTAAAACGAGTGAG
TGATTTGCTTCGATGGGAATACAAGACTAAGAACTTCAATCTCTCGTGGAAGCTCAAATC
CTTCCCGGTTTTCTCCGATTCAAGCCCTCTCTACCACACAAACTCAACCGGAACCGTTAA
CCGCCGAAGAAGAACGGGAGCTAGCAGCAGCTCATGTAAGGATCCAAGACATCTGTAGGA
AATGCCAAGAGTCCAATGTACCTTTGCTGGTCGATGCGGAAGACACAATTCTCCAACCCG
CGATCGACTACATGGCTTACTCATCAGCGATCTTGTTCAATGCGGACAAAGACAGACCTA
TTGTTTACAACACGATTCAGGCCTACTTGCGAGACGCTGGTGAGAGGTTGCATTTGGCTG
TACAAGAAGCCGAGAAAGAAAATGTTCCAATGGGGTTTAAGTTGGTGAGAGGTGCTTATA
TGTCTAGCGAAGCTAAGTTGGCAGATTCCTTGGGACACAAGTCACCAGTTCACGATACAA
TTCAGAACACGCACGATTGCTACAATAACTGCATGACTTTCCTAATGGAGAAAGCCTCGA
ACGGTTCGGGCTTTGGTGTGGTTCTTGCAACACATAACGCTGATTCTGGGAGACTTGCAT
CAAAGAAGGCGAGTGAGCTCAATATCGATAAAGAGAATGGGAAGATAGAGTTTGCGCAGC
TATACGGTATGTCAGATGCATTGTCCTTCGGTTTAAAGAGAGCCGGGTTCAATGTTAGCA
AGTACATGCCATTCGGACCGGTCGAAACCGCTATACCTTATCTTGTCCGACGTGCTTATG
AGAACCGAGGAATGATGGCCACTGGCGCCACTGACCGTCAACTCATGAGGATGGAACTTA
AGAGGAGATTACTCGCCGGAAATGCGTGAAGAGAAGAGTTTAATTGCCCTTATGTATGGA
GCCATTAAATGGAATTGGGAAATGTAGATCAACAAATTTGTTCTGTGTAACAAATTTTAG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2CM85TF U 1
AF RR2D743TF U 287
AF RR2GS21JQB C 329
BS 1 389 RR2CM85TF
BS 390 390 RR2D743TF
BS 391 643 RR2CM85TF
BS 644 644 RR2D743TF
BS 645 722 RR2CM85TF
BS 723 1009 RR2D743TF
BS 1010 1021 RR2GS21JQB

RD RR2CM85TF 722 0 0
GAGCTCAGTGGTTGTGAAGATAACTGCGATTTGTCCCATCAGTCTTCTAAAACGAGTGAG
TGATTTGCTTCGATGGGAATACAAGACTAAGAACTTCAATCTCTCGTGGAAGCTCAAATC
CTTCCCGGTTTTCTCCGATTCAAGCCCTCTCTACCACACAAACTCAACCGGAACCGTTAA
CCGCCGAAGAAGAACGGGAGCTAGCAGCAGCTCATGTAAGGATCCAAGACATCTGTAGGA
AATGCCAAGAGTCCAATGTACCTTTGCTGGTCGATGCGGAAGACACAATTCTCCAACCCG
CGATCGACTACATGGCTTACTCATCAGCGATCTTGTTCAATGCGGACAAAGACAGACCTA
TTGTTTACAACACGATTCAGGCCTACTTGAGAGACGCTGGTGAGAGGTTGCATTTGGCTG
TACAAGAAGCCGAGAAAGAAAATGTTCCAATGGGGTTTAAGTTGGTGAGAGGTGCTTATA
TGTCTAGCGAAGCTAAGTTGGCAGATTCCTTGGGACACAAGTCACCAGTTCACGATACAA
TTCAGAACACGCACGATTGCTACAATAACTGCATGACTTTCCTAATGGAGAAAGCCTCGA
ACGGTTCGGGCTTTGGTGTGGTTCTTGCAACACATAACGCTGACTCTGGGAGACTTGCAT
CAAAGAAGGCGAGTGAGCTCAATATCGATAAAGAGAATGGGAAGATAGAGTTTGCGCAGC
TA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2D743TF 734 0 0
G
ATTCTCCAACCCGCGATCGATTACATGGCTTACTCATCAGCGATCTTGTTCAATGCGGAC
AAAGACAGACCTATTGTCTACAACACGATTCAGGCCTACTTGCGAGACGCTGGTGAGAGG
TTGCATTTGGCTGTACAAGAAGCCGAGAAAGAAAATGTTCCAATGGGGTTTAAGTTGGTG
AGAGGTGCCTATATGTCTAGCGAAGCTAAGTTGGCAGATTCCTTGGGACACAAGTCACCA
GTTCACGATACAATTCAGAACACGCACGATTGCTACAATAACTGCATGACTTTCCTAATG
GAGAAAGCCTCGAACGGTTCGGGCTTTGGTGTGGTTCTTGCAACACATAACGCTGATTCT
GGGAGACTTGCATCAAAGAAGGCGAGTGAGCTCAATATCGATAAAGAGAATGGGAAGATA
GAGTTTGCGCAGCTATACGGTATGTCAGATGCATTGTCCTTCGGTTTAAAGAGAGCCGGG
TTCAATGTTAGCAAGTACATGCCATTCGGACCGGTCGAAACCGCTATACCTTATCTTGTC
CGACGTGCTTATGAGAACCGAGGAATGATGGCCACTGGCGCCACTGACCGTCAACTCATG
AGGATGGAACTTAAGAGGAGATTACTCGCCGGAAATGCGTGAAGAGAAGAGTTTAATTGC
CCTTATGTATGGAGCCATTAAATGGAATTGGGAAATGTAGATCAACAAATTTGTTCTGTG
TA
GATTATAAGAA

QA 2 723 2 723
DS 

RD RR2GS21JQB 693 0 0
GATCTTGTTCAATGCGGACAAAGACAGACCTATTGTTTACAACACGATTCAGGCCTACTT
GCGAGACGCTGGTGAGAGGTTGCATTTGGCTGTACAAGAAGCCGAGAAAGAAAATGTTCC
TATGGGGTTTAAGTTGGTGAGAGGTGCTTATATGTCTAGCGAAGCTAAGTAGGCAGATTC
CTTGGGACACAAGTCACCAGTTCATGATACAATTCAGAACACGCACGATTGCTACAATAA
CTGCATGACTTTCCTAATGGAGAAAGCCTCGAACGGTTCGGGCTTTGGTGTGGTTCTTGC
AACACATAACGCTGATTCTGGGAGACTTGCATCAAAGAAGGCGAGTGAGCTCAATATCGA
TAAAGAGAATGGGAAGATAGAGTTTGCGCAGCTATACGGTATGTCAGATGCATTGTCCTT
CGGTTTAAAGAGAGCCGGGTTCAATGTTAGCAAGTACATGCCATTCGGACCGGTCGAAAC
CGCTATACCTTATCTTGTCCGACGTGCTTATGAGAACCGAGGAATGATGGCCACTGGCGC
CACTGACCGTCAACTCATGAGGATGGAACTTAAGAGGAGATTACTCGCCGGAAATGCGTG
AAGAGAAGAGTTTAATTGCCCTTATGTATGGAGCCATTAAATGGAATTGGGAAATGTAGA
TCAACAAATTTGTTCTGTGTAACAAATTTTAGC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 3

CO CL3623Contig1 1372 3 7 U
AGGAACAAAAGAGAGAAGCAGAGGAGATGAACAGTATCTTCTCCATAGACGATTTCTCCG
ATCCCTTTTGGGAATCATCTCCGCCTCTCGATTCGGACTCGGCCAAGGTTGTCACGGCGG
AGGAATGGACCGTCGAGATGTTTCTCGAAGAGATCGCTTCCTCTGTGAGCTCGGAGCCTG
TCGGAAACAATAACGAGAAGAACAACAACAACGCGATCGTCGGTGTCTCGTCGGCGCAGT
CTCTTCCTTCCGTCTCCGGACAGAACGATTTCGAAGAAGACAGTCGGTTTCGCCGCGATT
CCGATGAGTACCGTCGCGTTCTTGAGAACAAGCTCGAGACTGAGTGTGCTACTGTTGTAG
CTCTTAGGGCTGGTTCTGTGAGGCCTGAAGATTCGACTGGTTCTCCTGAAACTCTGTTCC
CACCAGCTCAATCTAGTCCTCTTACTCAAGGTTCTTTGGTGACGCCTGGAGAAGTTGGTG
TCACTTCTTCATTACTGGCTGAGGTGAAAAAATCTGGTGTACCGATCAAGCACGTTACTA
GTGGATCATCGAGAGATTATTCTGATGATGATGACCTTGATGAAGAGAATGAGACCACTG
GTTCCTTGAAACCAGAGGACGTTAAAAAATCCAGAAGGATGCTGTCAAATCGAGAGTCTG
CTAGGCGGTCTAGAAGGAGAAAACAGGAGCAAACATGTGATCTTGAGACACAGGTCAATG
AGCTAAAAGGTGAACATTCATCACTTCTCAAGCAACTGAGCAATATGAATCACAAGTATG
ATGACGCTGCTGTTGGCAATAGAATACTAAAAGCCGACATTGAGACATTAAGAGCTAAGG
TGAAAATGGCGGAAGAGACCGTTAAGAGAGTAACAGGAATGAATCCTATGCTTCTCGGTA
GATCAAATGGACATAGCAACAACAATAGAATGCCATTAACTGGTAGCACCAGGATGGCTT
CTTCATGCCTTCCACCTTTTCAACCACAATCAAACCTAAACATGGGGGGACTACCAACCA
TTCCATCTCCAAGACTCGAAAACAGTTTCATTCCTACTCCTTCCTTAAACTCCCAAACTA
ACTCTCATTTGCAGAGAATAAGAAACACTCAAACTCACCATCCTGCTCCAACCACTAATC
CCTATGGCTGGACTACTGAAACTCAGAACGATTCAGCATGGCCGAAAAAATGTGTGGACT
GATGAAACAAGAAGCGGGCTTTATACAACTTAATATTGATATATCTATGCATCTCTCATT
TGTAAATTTAACCATGAGAAAAAACATTTGTGAGAACAGTCTCATGGCTTGCTTATACAG
TCTGTCTTGTTAACATTACAAGACTATTATTAATAAGAGAACCTGTCTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E717TF U 1
AF RR2DQ52TF U 471
AF RR2E717JQ C 609
BS 1 617 RR2E717TF
BS 618 1009 RR2DQ52TF
BS 1010 1010 RR2E717JQ
BS 1011 1112 RR2DQ52TF
BS 1113 1113 RR2E717JQ
BS 1114 1189 RR2DQ52TF
BS 1190 1372 RR2E717JQ

RD RR2E717TF 623 0 0
AGGAACAAAAGAGAGAAGCAGAGGAGATGAACAGTATCTTCTCCATAGACGATTTCTCCG
ATCCCTTTTGGGAATCATCTCCGCCTCTCGATTCGGACTCGGCCAAGGTTGTCACGGCGG
AGGAATGGACCGTCGAGATGTTTCTCGAAGAGATCGCTTCCTCTGTGAGCTCGGAGCCTG
TCGGAAACAATAACGAGAAGAACAACAACAACGCGATCGTCGGTGTCTCGTCGGCGCAGT
CTCTTCCTTCCGTCTCCGGACAGAACGATTTCGAAGAAGACAGTCGGTTTCGCCGCGATT
CCGATGAGTACCGTCGCGTTCTTGAGAACAAGCTCGAGACTGAGTGTGCTACTGTTGTAG
CTCTTAGGGCTGGTTCTGTGAGGCCTGAAGATTCGACTGGTTCTCCTGAAACTCTGTTCC
CACCAGCTCAATCTAGTCCTCTTACTCAAGGTTCTTTGGTGACGCCTGGAGAAGTTGGTG
TCACTTCTTCATTACTGGCTGAGGTGAAAAAATCTGGTGTACCGATCAAGCACGTTACTA
GTGGATCATCGAGAGATTATTCTGATGATGATGACCTTGATGAAGAGAATGAGACCACTG
GTTCCTTGAAACCAGAG
ACGTTA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2DQ52TF 719 0 0
GAAGTTGGTGTCACTTCTTCATTACTGGCTGAGGTGAAAAAATCTGGTGTACCGATCAAG
CAGGTTACTAGTGGATCATCGAGAGATTATTCTGATGATGATGACCTTGATGAAGAGAAT
GAGACCACTGGTTCCTTGAAACCAGAGGACGTTAAAAAATCCAGAAGGATGCTGTCAAAT
CGAGAGTCTGCTAGGCGGTCTAGAAGGAGAAAACAGGAGCAAACATGTGATCTTGAGACA
CAGGTCAATGAGCTAAAAGGTGAACATTCATCACTTCTCAAGCAACTGAGCAATATGAAT
CACAAGTATGATGACGCTGCTGTTGGCAATAGAATACTAAAAGCCGACATTGAGACATTA
AGAGCTAAGGTGAAAATGGCGGAAGAGACCGTTAAGAGAGTAACAGGAATGAATCCTATG
CTTCTCGGTAGATCAAATGGACATAGCAACAACAATAGAATGCCATTAACTGGTAGCACC
AGGATGGCTTCTTCATGCCTTCCACCTTTTCAACCACAATCAAACCTAAACATGGGGGGG
CTACCAACCATTCCATCTCCAAGACTCGAAAACAGTTTCATTCCTACTCCTTCCTTAAAC
TCCCAAACTAACTCTCATTTGCAGAGAATAAGAAACACTCAA*CTCACCATCCTGCTCCA
ACCACTAATCCCTATGGCTGGACTACTGAAACTCAGAACGATTCAGCATGGCCGAAAAA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2E717JQ 764 0 0
AAACCAGAGGACGTTAAAAAATCCAGAAGGATGCTGTCAAATCGAGAGTCTGCTAGGCGG
TCTAGAAGGAGAAAACAGGAGCAAACATGTGATCTTGAGACACAGGTTAATGAGCTAAAA
GGTGAACATTCATCACTTCTCAAGCAACTGAGCAATATGAATCACAAGTATGATGACGCT
GCTGTTGGCAATAGAATACTAAAAGCCGACATTGAGACATTAAGAGCTAAGGTGAAAATG
GCGGAAGAGACCGTTAAGAGAGTAACAGGAATGAATCCTATGCTTCTCGGTAGATCAAAT
GGACATAGCAACAACAATAGAATGCCATTAA*TGGTAGCACCAGGATGGCTTCTTCATGC
CTTCCACCTTTTCAACCACAATCAAACCTAAACATGGGGGGACTACCAACCATTCCATCT
CCAAGACTCGAAAACAGTTTCATTCCTACTCCTTCCTTAAACTCCCAAACTAACTCTCAT
TTGCAGAGAATAAGAAATACTCAAACTCACCATCCTGCTCCAACCACTAATCCCTATGGC
TGGACTACTGAAACTCAGAACGATTCAGCATGGCCGAAAAAATGTGTGGACTGATGAAAC
AAGAAGCGGGCTTTATACAACTTAATATTGATATATCTATGCATCTCTCATTTGTAAATT
TAACCATGAGAAAAAACATTTGTGAGAACAGTCTCATGGCTTGCTTATACAGTCTGTCTT
GTTAACATTACAAGACTATTATTAATAAGAGAACCTGTCTTTCT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL3624Contig1 1056 2 2 U
GGGATCCATCTCCGATCTGTTCTCTTTGTGGCTAATCTATCGTCTCCATTTTCAGTTACT
TCTTCCGATCGCCGGAGGAAATCACCGTGGTCTCGCCGCAAAAGAAAATGGCCTTTGACG
CCTCATCAATGGAGGAGTTTGTTTACACCTGAGGGTAAGCTCCGTGACGGTGGAGTTGGG
TTTCTCAAGAGAGTTAGAAGCAGAGGTGTTGATCCAAGTATACGTGCAGAAGTGTGGCTC
TTCCTACTCGGAGTCTATGATTTGAACAGTACTAGTGAAGAACGGGAAGCGGTGAATACT
CAAAAAAGGAAGGAGTATGAGAAACTACAGAAACGGCGCAAGATGCTTCTCAATCGCGGC
ACCGATGATCTCGAGGAGGAAGAAGCAGAAGATCAGTGCGTTAGATTCATGGATGATTAC
AAGACTCCCGGACCAATGACAAATCAAATCCAAAGACTCCCAACTCTACAAACACTTGGA
GAATCTCCAGGCCGAGGATTGTAGTTTCGTTTACAGGATGGTTTTGGTTATGTTTAGGAG
GGAGTTGAGTTTTGAGCAGACGCTTTGTCTGTTGCTCTACGCGATCTCGGCGTTGGTTCT
GAGGAGGAAGCTGATCATACAGAAGTACAGTAGTATGGATGAGATTGTGGAAGAGTGTAA
TAGCATGGCTGGTCAGCTTGATGTCTGGAAGCTTCTTGATGATGCGCATCACCTTGTCGT
GACGCTCCATGATAAGATCGAAACTCTTTCCTCTCAATCTCTCAGTATTTGATGGAGAAA
GTGTTTTGTTCAAAGCCAGAAATGAAGTGCTCTCTACTACACAAATGGATACCTTTTGGC
AAGGTTTGGTTCTTTACCGTTTTACTTGTCCCTCAGCTTTTCCTTCTTTCTGTTTTCATC
ATCACAGAGACAACATGATACTACTATTTATCTATCAAGTTTATTGTAGTAGTAGTGATG
ATAAGAACGACAATAGCATGTTGGGAGAAAAATGTAAGGGGTTGAGTCCAAAGCTACTAT
CTTTTTCCACAATTGTATTATGGATAATCTATGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV11TF U 1
AF RR2AV11JQ C 252
BS 1 709 RR2AV11TF
BS 710 1056 RR2AV11JQ

RD RR2AV11TF 709 0 0
GGGATCCATCTCCGATCTGTTCTCTTTGTGGCTAATCTATCGTCTCCATTTTCAGTTACT
TCTTCCGATCGCCGGAGGAAATCACCGTGGTCTCGCCGCAAAAGAAAATGGCCTTTGACG
CCTCATCAATGGAGGAGTTTGTTTACACCTGAGGGTAAGCTCCGTGACGGTGGAGTTGGG
TTTCTCAAGAGAGTTAGAAGCAGAGGTGTTGATCCAAGTATACGTGCAGAAGTGTGGCTC
TTCCTACTCGGAGTCTATGATTTGAACAGTACTAGTGAAGAACGGGAAGCGGTGAATACT
CAAAAAAGGAAGGAGTATGAGAAACTACAGAAACGGCGCAAGATGCTTCTCAATCGCGGC
ACCGATGATCTCGAGGAGGAAGAAGCAGAAGATCAGTGCGTTAGATTCATGGATGATTAC
AAGACTCCCGGACCAATGACAAATCAAATCCAAAGACTCCCAACTCTACAAACACTTGGA
GAATCTCCAGGCCGAGGATTGTAGTTTCGTTTACAGGATGGTTTTGGTTATGTTTAGGAG
GGAGTTGAGTTTTGAGCAGACGCTTTGTCTGTTGCTCTACGCGATCTCGGCGTTGGTTCT
GAGGAGGAAGCTGATCATACAGAAGTACAGTAGTATGGATGAGATTGTGGAAGAGTGTAA
TAGCATGGCTGGTCAGCTTGATGTCTGGAAGCTTCTTGATGATGCGCAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2AV11JQ 805 0 0
AGTCTATGATTTGAACAGTACTAGTGAAGAACGGGAAGCGGTGAATACTCAAAAAAGGAA
GGAGTATGAGAAACTACAGAAACGGCGCAAGATGCTTCTCAATCGCGGCACCGATGATCT
CGAGGAGGAAGAAGCAGAAGATCAGTGCGTTAGATTCATGGATGATTACAAGACTCCCGG
ACCAATGACAAATCAAATCCAAAGACTCCCAACTCTACAAACACTTGGAGAATCTCCAGG
CCGAGGATTGTAGTTTCGTTTACAGGATGGTTTTGGTTATGTTTAGGAGGGAGTTGAGTT
TTGAGCAGACGCTTTGTCTGTTGCTCTACGCGATCTCGGCGTTGGTTCTGAGGAGGAAGC
TGATCATACAGAAGTACAGTAGTATGGATGAGATTGTGGAAGAGTGTAATAGCATGGCTG
GTCAGCTTGATGTCTGGAAGCTTCTTGATGATGCGCATCACCTTGTCGTGACGCTCCATG
ATAAGATCGAAACTCTTTCCTCTCAATCTCTCAGTATTTGATGGAGAAAGTGTTTTGTTC
AAAGCCAGAAATGAAGTGCTCTCTACTACACAAATGGATACCTTTTGGCAAGGTTTGGTT
CTTTACCGTTTTACTTGTCCCTCAGCTTTTCCTTCTTTCTGTTTTCATCATCACAGAGAC
AACATGATACTACTATTTATCTATCAAGTTTATTGTAGTAGTAGTGATGATAAGAACGAC
AATAGCATGTTGGGAGAAAAATGTAAGGGGTTGAGTCCAAAGCTACTATCTTTTTCCACA
ATTGTATTATGGATAATCTATGTTC

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 3

CO CL3625Contig1 1173 3 12 U
GGTGGCGTCATCGCCAAAACCGTTTCACTAGACGCATCCAAAGTCATCAACGTAACGCCT
CGGTACGCCAGGCTACGAACTGGATCAGCCAAAACAGATGTAATCGGGTGGCAGAACATA
GAACTCATCAGCGACCGTCCTCTCGAAACCATGCTCAAAGAGTTCAAGCAGCTGAAACAA
GAGTACCCTGACCGGATCCTCATCGCTTCCATCATGGAGGAATACACCAAAACCGGATGG
GAAGAGCTCATTGACCGCGTTGAACAAACCGGCGTTGATGCTTTAGAGATCAACTTCTCG
TGTCCTCATGGTATGCCAGAGCGCAGAATGGGTGCAGCTGTTGGACAAGACTGTGCGCTT
CTTGAGGAGGTTTGCGGATGGATTAATGCTAAAGCTACTGTTCCTGTCTGGGCCAAGATG
ACTCCTAATATTACTGACATTACTGAGCCGGCGAGGGTATCTCTAAAATCAGGATGTGAA
GGGATCGCAGCCATCAACACAATCATGAGTGTGATGGGAATCGATATGAAGACACTGCAT
CCTGAGCCATGCGTTGAAGGTTACTCAACTCCAGGAGGCTACTCTTATAAGGCTGTTCGC
CCCATTGCGCTTGCGAAAGTTATGAACATTGCTAAGATGATGAGAGATGAGTTCAGTGAG
AAAGAGTGCTCGCTTTCGGGTATTGGAGGTGTTGAAACCGGCTATGATGCAGCTGAGTTC
ATTCTCCTCGGATCAAACACTGTCCAGGTATGCACTGGTGTGATGGTGCATGGCTATGGT
CACGTGAAAACTCTATGCGCCGAGCTTCAAGATTTTATGAAACAACATAACTTCTCAACA
ATAGAAGAGTTTAGAGGACATTCGCTTCAGTACTTTACAACACACACAGATTTAGTCAGG
AGACAGAAAGAAGCTATTGAGCAGAGAAAAGCGGAGAGGAGAGGCTTGAAATCTGATAAA
GATTGGACCGGAGATGGATTCGTGAAGGAGACTGAGAGTATGGTTTCTAACTAACTTCAG
TAGCCATGATCAAGTGATGGACCCAAAATACTTAAATAAAGTTCCCAACTTCTTCATTCA
CAGCCAAATGGCAAAGGCTTTTTCCTTTCTATCTTTCACGTCAACCTCTTTACCTCTCTC
ATTTGAAAAGAAAAGAAAACTAAAGTTGATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW70TF U 1
AF RR2D655TF U 107
AF RR2FW70JQ C 433
BS 1 131 RR2FW70TF
BS 132 132 RR2D655TF
BS 133 272 RR2FW70TF
BS 273 273 RR2D655TF
BS 274 323 RR2FW70TF
BS 324 324 RR2D655TF
BS 325 688 RR2FW70TF
BS 689 689 RR2D655TF
BS 690 789 RR2FW70TF
BS 790 790 RR2FW70JQ
BS 791 798 RR2D655TF
BS 799 1173 RR2FW70JQ

RD RR2FW70TF 804 0 0
GGTGGCGTCATCGCCAAAACCGTTTCACTAGACGCATCCAAAGTCATCAACGTAACGCCT
CGGTACGCCAGGCTACGAACTGGATCAGCCAAAACAGATGTAATCGGGTGGCAGAACATA
GAACTCATCAGTGACCGTCCTCTCGAAACCATGCTCAAAGAGTTCAAGCAGCTGAAACAA
GAGTACCCTGACCGGATCCTCATCGCTTCCATCATGGAGGAATACACCAAAACCGGATGG
GAAGAGCTCATTGACCGCGTTGAACAAACCGGTGTTGATGCTTTAGAGATCAACTTCTCG
TGTCCTCATGGTATGCCAGAGCGTAGAATGGGTGCAGCTGTTGGACAAGACTGTGCGCTT
CTTGAGGAGGTTTGCGGATGGATTAATGCTAAAGCTACTGTTCCTGTCTGGGCCAAGATG
ACTCCTAATATTACTGACATTACTGAGCCGGCGAGGGTATCTCTAAAATCAGGATGTGAA
GGGATCGCAGCCATCAACACAATCATGAGTGTGATGGGAATCGATATGAAGACACTGCAT
CCTGAGCCATGCGTTGAAGGTTACTCAACTCCAGGAGGCTACTCTTATAAGGCTGTTCGC
CCCATTGCGCTTGCGAAAGTTATGAACATTGCTAAGATGATGAGAGATGAGTTCAGTGAG
AAAGAGTGCTCGCTTTCGGGTATTGGAG*TGTTGAAACCGGCTATGATGCAGCTGAGTTC
ATTCTCCTCGGATCAAACACTGTCCAGGTATGCACTGGTGTGATGGTGCATGGCTATGGT
CACGTGAAA
CTCTATGCCCGAGCT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2D655TF 693 0 0
GGTGGCAGAACATAGAACTCATCAGCGACCGTCCTCTCGAAACCATGCTCAAAGAGTTCA
AGCAGCTGAAACAAGAGTACCCTGACCGGATCCTCATCGCTTCCATCATGGAGGAATACA
CCAAAACCGGATGGGAAGAGCTCATTGACCGCGTTGAGCAAACCGGCGTTGATGCTTTAG
AGATCAACTTCTCGTGTCCTCATGGTATGCCAGAGCGCAGAATGGGTGCAGCTGTTGGAC
AAGACTGTGCGCTTCTTGAGGAGGTTTGCGGATGGATTAATGCTAAAGCTACTGTTCCTG
TCTGGGCCAAGATGACTCCTAATATTACTGACATTACTGAGCCGGCGAGGGTATCTCTAA
AATCAGGATGTGAAGGGATCGCAGCCATCAATACAATCATGAGTGTGATGGGAATTGATC
TGAAGACACTGCATCCTGAGCCATGCGTTGAAGGTTACTCAACTCCAGGAGGCTATTCTT
ATAAGGCTGTTCGCCCCATTGCGCTTGCGAAAGTTATGAACATTGCTAAGATGATGAGAG
ATGAGTTCAGTGAGAAAGATTGCTCGCTTTCGGGTATTGGAGGTGTTGAAACTGGCTATG
ATGCAGCTGAGTTCATTCTCCTCGGATCAAACACTGTCCAGGTATGCACTGGTGTGATGG
TGTATGGCTATGGTCATGTGAAA*CTCTATGC
G

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2FW70JQ 741 0 0
ACTGACATTACTGAGCCGGCGAGGGTATCTCTAAAATCAGGATGTGAAGGGATCGCAGCC
ATCAACACAATCATGAGTGTGATGGGAATCGATATGAAGACACTGCATCCTGAGCCATGC
GTTGAAGGTTACTCAACTCCAGGAGGCTACTCTTATAAGGCTGTTCGCCCCATTGCGCTT
GCGAAAGTTATGAACATTGCTAAGATGATGAGAGATGAGTTCAGTGAGAAAGAGTGCTCG
CTTTCGGGTATTGGAGGTGTTGAAACCGGCTATGATGCAGCTGAGTTCATTCTCCTCGGA
TCAAACACTGTCCAGGTATGCACTGGTGTGATGGTGCATGGCTATGGTCACGTGAAAACT
CTATGCGCCGAGCTTCAAGATTTTATGAAACAACATAACTTCTCAACAATAGAAGAGTTT
AGAGGACATTCGCTTCAGTACTTTACAACACACACAGATTTAGTCAGGAGACAGAAAGAA
GCTATTGAGCAGAGAAAAGCGGAGAGGAGAGGCTTGAAATCTGATAAAGATTGGACCGGA
GATGGATTCGTGAAGGAGACTGAGAGTATGGTTTCTAACTAACTTCAGTAGCCATGATCA
AGTGATGGACCCAAAATACTTAAATAAAGTTCCCAACTTCTTCATTCACAGCCAAATGGC
AAAGGCTTTTTCCTTTCTATCTTTCACGTCAACCTCTTTACCTCTCTCATTTGAAAAGAA
AAGAAAACTAAAGTTGATTGT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3627Contig1 663 3 1 U
GGGCTTCTTCTGTAGACGAAGACAAAACTTCTTCTATGTATTCCTCGGGAAAAGAGTGTA
TGCCTACAGAATGGACCGATGAGAAGCATAGTCTGTATCTTAAATCAATGGAAGCTTCAT
TCGTGGACCAGCTTTATAGCTCCCTCGGTTCGAGTTTGATGAGCAAGGAGAATGTAGGAG
GAAACCCATCTGAAGAACAGAAGAGTAATGTAAGACAGCCTGAGCATCGTCTCAAAGGAA
GAAGACACGGTGGTGGTTCTAACCATGAGTTTCTTAAGAGTCCGTGGATCAAGCACTATA
GGACCATAGGAGAGGTATCTGACCAGAACTTTGCCAACGAAGTAACAAAAGGCGAAAATG
GAAGCTCGAAGAAGATGAAGACAGTGGTGATGAACGGATCGTCTAGTACTGATCAGGTTG
TCCCACTCAGAAAAACTCCAGCAGACATGACGTAAACTGAACCCTCATCGTTAGTTGAAA
CACAGTGTTTTTGTGGTAGCCGGTCTCCCTTTGTAATCCATATATATAGCACTGCTTTTG
CTGATACCAAGACTAGATGTTCGGACAAGAACCCTGTGCCGCAAGAAGATTACCACGAAT
GCGTTTGCATCTGGTTTTATCGTGTGATGTGTTTGCTTTTAAATCAAAACTCCTTTTTAT
GCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2EC03TF U 1
AF RR2BH92TF U 1
AF RR2BH92JQ C 29
BS 1 663 RR2BH92TF

RD RR2EC03TF 281 0 0
GGGCTTCTTCTGTAGACGAAGACAAAACTTCTTCTATGTATTCCTCGGGAAAAGAGTGTA
TGCCTACAGAATGGACCGATGAGAAGCATAGTCTGTATCTTAAATCAATGGAAGCTTCAT
TCGTAGACCAGCTTTATAGCTCCCTCGGTTCGAGTTTGATGAGCAAGGAGAACGTAGGAG
GAAACCCATCTGAAGAACAGAAGAGTAATGTAAGACAGCCTGATTATCGTCTCAAAGGAA
GAAGACACGGTGGTGGTTCTAACCATGAGTTTCTTAAGAGT

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR2BH92TF 663 0 0
GGGCTTCTTCTGTAGACGAAGACAAAACTTCTTCTATGTATTCCTCGGGAAAAGAGTGTA
TGCCTACAGAATGGACCGATGAGAAGCATAGTCTGTATCTTAAATCAATGGAAGCTTCAT
TCGTGGACCAGCTTTATAGCTCCCTCGGTTCGAGTTTGATGAGCAAGGAGAATGTAGGAG
GAAACCCATCTGAAGAACAGAAGAGTAATGTAAGACAGCCTGAGCATCGTCTCAAAGGAA
GAAGACACGGTGGTGGTTCTAACCATGAGTTTCTTAAGAGTCCGTGGATCAAGCACTATA
GGACCATAGGAGAGGTATCTGACCAGAACTTTGCCAACGAAGTAACAAAAGGCGAAAATG
GAAGCTCGAAGAAGATGAAGACAGTGGTGATGAACGGATCGTCTAGTACTGATCAGGTTG
TCCCACTCAGAAAAACTCCAGCAGACATGACGTAAACTGAACCCTCATCGTTAGTTGAAA
CACAGTGTTTTTGTGGTAGCCGGTCTCCCTTTGTAATCCATATATATAGCACTGCTTTTG
CTGATACCAAGACTAGATGTTCGGACAAGAACCCTGTGCCGCAAGAAGATTACCACGAAT
GCGTTTGCATCTGGTTTTATCGTGTGATGTGTTTGCTTTTAAATCAAAACTCCTTTTTAT
GCC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2BH92JQ 635 0 0
TTCTTCTATGTATTCCTCGGGAAAAGAGTGTATGCCTACAGAATGGACCGATGAGAAGCA
TAGTCTGTATCTTAAATCAATGGAAGCTTCATTCGTGGACCAGCTTTATAGCTCCCTCGG
TTCGAGTTTGATGAGCAAGGAGAATGTAGGAGGAAACCCATCTGAAGAACAGAAGAGTAA
TGTAAGACAGCCTGAGCATCGTCTCAAAGGAAGAAGACACGGTGGTGGTTCTAACCATGA
GTTTCTTAAGAGTCCGTGGATCAAGCACTATAGGACCATAGGAGAGGTATCTGACCAGAA
CTTTGCCAACGAAGTAACAAAAGGCGAAAATGGAAGCTCGAAGAAGATGAAGACAGTGGT
GATGAACGGATCGTCTAGTACTGATCAGGTTGTCCCACTCAGAAAAACTCCAGCAGACAT
GACGTAAACTGAACCCTCATCGTTAGTTGAAACACAGTGTTTTTGTGGTAGCCGGTCTCC
CTTTGTAATCCATATATATAGCACTGCTTTTGCTGATACCAAGACTAGATGTTCGGACAA
GAACCCTGTGCCGCAAGAAGATTACCACGAATGCGTTTGCATCTGGTTTTATCGTGTGAT
GTGTTTGCTTTTAAATCAAAACTCCTTTTTATGCC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL3628Contig1 638 2 2 U
GGACAGCTACAACAAAAGAAAACATCTTCACGCAAAGATTTTCCCATTTTTGGTAATTAA
AAAGGAATTTTTCTTTCTTTTTTCTCTTCTTCACACTTCTAGAGTTTTCCAGGCAAACGT
ACCTGAAAAGAAACAGAGACAAGCCAGAAGCAATATATAAACACAAAAGGTGTCTCAGAG
AGTTGGAGTGAGAAAGAAGCAATAATGTGTTTGGAGTTTGTGTATCACGAGGAGAAAACA
GATCTTGGTCGGCAACAAGCACCGGGTGTGTGTCCGTATTGCGGCGGAAAAGTGGCGGCG
GTAGATATTGAGACCAAGTGGCTGTTCTGTTTCTTGCCACTCTGTTTCAAGGTCAAACGC
AAGTACACTTGTTCTTCCTGTGATCGTCGTCTCGTCTTGTATTATTGAAAGAAACAGAGC
AAATGAAGAAAGAATATATATTTTATTTATTTGTTGGTTTTACTCTCGGTGTTGAGGTTT
TCGCAGATTTTCCCCTGTTTCTTATTTGCTACCAACACCCCTCTTGGTGGTGACATTGGT
TAAGTTCATTGAGATTTTGTGGGTTTAATGTAAATAATTTCGTTGATTACATGAGCTGAA
TTCAGCTTTGTTAATTAAATAAAGATTTTGTCATTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B683JQ C 1
AF RR2B683TF U 1
BS 1 9 RR2B683JQ
BS 10 638 RR2B683TF

RD RR2B683JQ 638 0 0
GGACAGCTACAACAAAAGAAAACATCTTCACGCAAAGATTTTCCCATTTTTGGTAATTAA
AAAGGAATTTTTCTTTCTTTTTTCTCTTCTTCACACTTCTAGAGTTTTCCAGGCAAACGT
ACCTGAAAAGAAACAGAGACAAGCCAGAAGCAATATATAAACACAAAAGGTGTCTCAGAG
AGTTGGAGTGAGAAAGAAGCAATAATGTGTTTGGAGTTTGTGTATCACGAGGAGAAAACA
GATCTTGGTCGGCAACAAGCACCGGGTGTGTGTCCGTATTGCGGCGGAAAAGTGGCGGCG
GTAGATATTGAGACCAAGTGGCTGTTCTGTTTCTTGCCACTCTGTTTCAAGGTCAAACGC
AAGTACACTTGTTCTTCCTGTGATCGTCGTCTCGTCTTGTATTATTGAAAGAAACAGAGC
AAATGAAGAAAGAATATATATTTTATTTATTTGTTGGTTTTACTCTCGGTGTTGAGGTTT
TCGCAGATTTTCCCCTGTTTCTTATTTGCTACCAACACCCCTCTTGGTGGTGACATTGGT
TAAGTTCATTGAGATTTTGTGGGTTTAATGTAAATAATTTCGTTGATTACATGAGCTGAA
TTCAGCTTTGTTAATTAAATAAAGATTTTGTCATTCTT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2B683TF 638 0 0
GGACAGCTA
CAACAAAAGAAAACATCTTCACGCAAAGATTTTCCCATTTTTGGTAATTAAAAAGGAATT
TTTCTTTCTTTTTTCTCTTCTTCACACTTCTAGAGTTTTCCAGGCAAACGTACCTGAAAA
GAAACAGAGACAAGCCAGAAGCAATATATAAACACAAAAGGTGTCTCAGAGAGTTGGAGT
GAGAAAGAAGCAATAATGTGTTTGGAGTTTGTGTATCACGAGGAGAAAACAGATCTTGGT
CGGCAACAAGCACCGGGTGTGTGTCCGTATTGCGGCGGAAAAGTGGCGGCGGTAGATATT
GAGACCAAGTGGCTGTTCTGTTTCTTGCCACTCTGTTTCAAGGTCAAACGCAAGTACACT
TGTTCTTCCTGTGATCGTCGTCTCGTCTTGTATTATTGAAAGAAACAGAGCAAATGAAGA
AAGAATATATATTTTATTTATTTGTTGGTTTTACTCTCGGTGTTGAGGTTTTCGCAGATT
TTCCCCTGTTTCTTATTTGCTACCAACACCCCTCTTGGTGGTGACATTGGTTAAGTTCAT
TGAGATTTTGTGGGTTTAATGTAAATAATTTCGTTGATTACATGAGCTGAATTCAGCTTT
GTTAATTAAATAAAGATTTTGTCATTCTT

QA 10 638 10 638
DS 



AS 1 2

CO CL3629Contig1 1058 2 6 U
AAAAGAGAAAAGTGAGAGTCAGAGGCTGGCAATGGAGAGACTTACTCAGATCGAGCGGGC
CGAGAGACATGCGGAAAACTTAGAAAGGCAGAAAAACGACTTGGAAGATGAATTGCACAG
GCTCCGTGTGTCTGAGAGGGAGGCTGTCTCCAAGGTTACAGTGTTAGAAGCAAGAGTCGG
AGAACGAGAGAAAGAGATCGAGTCCTTGTTAAAGGAAACCAACGAGCAGAGAGCGCATAA
CGTGAAGTCACTGGAGAAGCTGTTGGATGAAGAGCGTAAGGCTCATATAGCTGCAAACCG
AAGAGCCGAAGCTCTTTCTCTTGAGCTTCAAGCCGCTCAAGCAACCGTTGATAATCTTCA
GCAAGAATTAGCTCAAGCTAGGTTGAAAGAAACTGCGCTTGACAACAGAATCAGAGCTGC
TAGTTCTTCACGTGGGAAACGGACCAGGGTCGAAGATGTTGTTGATATGGATATTGAAGG
AGCAAGTGATAGAATCTTGAAAACTAATAAACGGTCTCGGAGCGCAAGAGGAGATGATAA
TGGTGCTTATGAGGATGATGTTTCGGTTTCCAGAGGAGGTGAAGACGAGGAGGAAGCAGA
AGATTACAAGAAGCTAACGGTGCAGAAGCTTAGGCATGAACTGACGAAGTATGATTGCGG
GCATTTGATACTGAACCAAGGCCATCAGAACAAGAAAGAGATTCTTGCTTTGTATGAAGC
TCATGTTCTTCCCAAGAAAGAGGAAGAGAGAAAGAGACAGAGAGAAGCTACTTCTTAGGA
CAAAACTCTGTATTAGAGTGAGACGATAAAAACATGCTTTGATCTTGAAGAGATTAGTAA
AGACTAAAAGAGTTGGACTTAGAAAGGCTCTGACATTTTAAGTATTGTTTTACCGTACTG
GAGCAAGTTGTGTATTGATTCTGAGGTTTAGGGTTTCTGAGTTTGTCTTTGTGTTGGTAT
TAATTTGGGTGTGCGGTTTGAGTCGGTTTTGGTGTTGGACTTTTGATTTGTAGACCATAT
CTTTCTTCAGAAATTATGGTGATTGATTGTTGAGTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E701TF U 1
AF RR2E701JQ C 311
BS 1 633 RR2E701TF
BS 634 634 RR2E701JQ
BS 635 680 RR2E701TF
BS 681 681 RR2E701JQ
BS 682 732 RR2E701TF
BS 733 1058 RR2E701JQ

RD RR2E701TF 736 0 0
AAAAGAGAAAAGTGAGAGTCAGAGGCTGGCAATGGAGAGACTTACTCAGATCGAGCGGGC
CGAGAGACATGCGGAAAACTTAGAAAGGCAGAAAAACGACTTGGAAGATGAATTGCACAG
GCTCCGTGTGTCTGAGAGGGAGGCTGTCTCCAAGGTTACAGTGTTAGAAGCAAGAGTCGG
AGAACGAGAGAAAGAGATCGAGTCCTTGTTAAAGGAAACCAACGAGCAGAGAGCGCATAA
CGTGAAGTCACTGGAGAAGCTGTTGGATGAAGAGCGTAAGGCTCATATAGCTGCAAACCG
AAGAGCCGAAGCTCTTTCTCTTGAGCTTCAAGCCGCTCAAGCAACCGTTGATAATCTTCA
GCAAGAATTAGCTCAAGCTAGGTTGAAAGAAACTGCGCTTGACAACAGAATCAGAGCTGC
TAGTTCTTCACGTGGGAAACGGACCAGGGTCGAAGATGTTGTTGATATGGATATTGAAGG
AGCAAGTGATAGAATCTTGAAAACTAATAAACGGTCTCGGAGCGCAAGAGGAGATGATAA
TGGTGCTTATGAGGATGATGTTTCGGTTTCCAGAGGAGGTGAAGACGAGGAGGAAGCAGA
AGATTACAAGAAGCTAACGGTGCAGAAGCTTAG*CATGAACTGACGAAGTATGATTGCGG
GCATTTGATACTGAACCAAG*CCATCAGAACAAGAAAGAGATTCTTGCTTTGTATGAAGC
TCATGTTCTTCC
AAGA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2E701JQ 748 0 0
GCTCTTTCTCTTGAGCTTCAAGCCGCTCAAGCAACCGTTGATAATCTTCAGCAAGAATTA
GCTCAAGCTAGGTTGAAAGAAACTGCGCTTGACAACAGAATCAGAGCTGCTAGTTCTTCA
CGTGGGAAACGGACCAGGGTCGAAGATGTTGTTGATATGGATATTGAAGGAGCAAGTGAT
AGAATCTTGAAAACTAATAAACGGTCTCGGAGCGCAAGAGGAGATGATAATGGTGCTTAT
GAGGATGATGTTTCGGTTTCCAGAGGAGGTGAAGACGAGGAGGAAGCAGAAGATTACAAG
AAGCTAACGGTGCAGAAGCTTAGGCATGAACTGACGAAGTATGATTGCGGGCATTTGATA
CTGAACCAAGGCCATCAGAACAAGAAAGAGATTCTTGCTTTGTATGAAGCTCATGTTCTT
CCCAAGAAAGAGGAAGAGAGAAAGAGACAGAGAGAAGCTACTTCTTAGGACAAAACTCTG
TATTAGAGTGAGACGATAAAAACATGCTTTGATCTTGAAGAGATTAGTAAAGACTAAAAG
AGTTGGACTTAGAAAGGCTCTGACATTTTAAGTATTGTTTTACCGTACTGGAGCAAGTTG
TGTATTGATTCTGAGGTTTAGGGTTTCTGAGTTTGTCTTTGTGTTGGTATTAATTTGGGT
GTGCGGTTTGAGTCGGTTTTGGTGTTGGACTTTTGATTTGTAGACCATATCTTTCTTCAG
AAATTATGGTGATTGATTGTTGAGTTCG

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 3

CO CL3630Contig1 858 3 4 U
GGGCGGAAGGAGTGAGTTGGGAAATCAATAATTCATTCATTTTTAGGGTTTTAGCTTTTG
TCTCTCCTCTGAAACGAAGAATGGCTATGTATCTTCTCTACGAGTCTTCTTCTGGCTATG
GCCTCTTCGAGGCCCACGGTCTTGATGAGATCGGACAGAACACCGAGGCCGTACGGAGCT
CAGTCTCGGACCTCAGTCGCTTTGGTCGTGTTGTCCAGCTGACCGCTTTTCATCCCTTCG
AGTCTGCCCTCGATGCCCTCAACCAAGTTAACGCCGTCTCTGAAGGGGTTATGACTGAGG
AGCTTAGAAGTTTCCTGGAGTTGAATCTTCCTAAAGTCAAAGAAGGCAAGAAGCCCAAGT
TCAGCTTAGGAACCTCCGAGCCTAAACTCGGTTCCCATATCTTGGAGGCCACTAAAATCC
CCTGCCAGAGCAATGAGTTCGTTCTTGAGCTTCTCCGTGGTGTTCGCCTTCATTTTGACA
GGTTCATCAAGGACCTCAAGCCTGGTGATCTGGAAAAATCTCAACTTGGGTTAGCTCACA
GCTACAGCAGAGCCAAGGTCAAGTTCAATGTTAACCGAGTCGATAACATGGTTATTCAAG
CCATTTTCCTCCTTGACACTCTTGATAAGGATATCAACTCCTTTGCCATGAGAGTCAGGG
AATGGTATTCGTGGCACTTCCCCGAGCTTGTGAAGATTGTCAATGACAATTATCTTTACG
CCCGTGTTTCAAAGATGATTGAAGACAAGTCTAAGCTGACTGATGACCACATCCCTGTGC
TTACTGAAGTCTTAGGGGATGAGGATAAAGCAAAGGAGTCGTCGAAGCTGGAAAGCATCC
ATGGGCCAGGATTTATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AU79TF U 61
AF RR2CT82TF U 1
AF RR2EW96TF U 59
BS 1 404 RR2CT82TF
BS 405 405 RR2AU79TF
BS 406 728 RR2CT82TF
BS 729 858 RR2EW96TF

RD RR2AU79TF 586 0 0
TCTCTCCTCTGAAACGAAGAATGGCTATGTATCTTCTCTACGAGTCATCTTCTGGCTATG
GCCTCTTCGAGGCGCACGGTCTTGATGAGATCGGACAGAACACAGAGGCCGTCCGGAGCT
CAATCTCGGACCTCAGTCGCTTTGGTCGTGTTGTCCAGCTGACCGCTTTTCATCCCTTTG
AGTCTGCCCTTGATGCCCTAAACCAAGTTAACGCCGTCTCTGAAGGGGTTATGACTGACG
AGCTTAGAAGTTTCCTGGAGTTGAATCTTCCTAAAGTTAAAGAAGGCAAGAAGCCCAAGT
TCAGCCTAGGGACCTCTGAGCCTAAACTCGTTTCTCATATCTTGGAAGCCACTAAAATCC
CCTGCCAGAGCAATGAGTTCGTTCTTGAGCTTCTCCGTGGTGTTCGCCTTCATTTTGACA
GGTTCATCAAGGACCTCAAGCCTGGTGATCTGGAAAAATCTCAACTTGGGTTAGCTCACA
GCTACAGCAGAGCCAAGGTCAAGTTCAATGTTAACCGGGTGGACAACATGGTTATTCAAG
CCATTTTCCTCCTTGACACCCTTGATAAAGATATCAACTCCTTTGC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2CT82TF 728 0 0
GGGCGGAAGGAGTGAGTTGGGAAATCAATAATTCATTCATTTTTAGGGTTTTAGCTTTTG
TCTCTCCTCTGAAACGAAGAATGGCTATGTATCTTCTCTACGAGTCTTCTTCTGGCTATG
GCCTCTTCGAGGCCCACGGTCTTGATGAGATCGGACAGAACACCGAGGCCGTACGGAGCT
CAGTCTCGGACCTCAGTCGCTTTGGTCGTGTTGTCCAGCTGACCGCTTTTCATCCCTTCG
AGTCTGCCCTCGATGCCCTCAACCAAGTTAACGCCGTCTCTGAAGGGGTTATGACTGAGG
AGCTTAGAAGTTTCCTGGAGTTGAATCTTCCTAAAGTCAAAGAAGGCAAGAAGCCCAAGT
TCAGCTTAGGAACCTCCGAGCCTAAACTCGGTTCCCATATCTTGTAGGCCACTAAAATCC
CCTGCCAGAGCAATGAGTTCGTTCTTGAGCTTCTCCGTGGTGTTCGCCTTCATTTTGACA
GGTTCATCAAGGACCTCAAGCCTGGTGATCTGGAAAAATCTCAACTTGGGTTAGCTCACA
GCTACAGCAGAGCCAAGGTCAAGTTCAATGTTAACCGAGTCGATAACATGGTTATTCAAG
CCATTTTCCTCCTTGACACTCTTGATAAGGATATCAACTCCTTTGCCATGAGAGTCAGGG
AATGGTATTCGTGGCACTTCCCCGAGCTTGTGAAGATTGTCAATGACAATTATCTTTACG
CCCGTGTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2EW96TF 800 0 0
GG
TCTCTCCTCTGAAACGAAGAATGGCTATGTATCTTCTCTACGAGTCTTCTTCTGGCTATG
GCCTCTTCGAGGCCCACGGTCTTGATGAGATCGGACAGAACACCGAGGCCGTACGGAGCT
CAGTCTCGGACCTCAGTCGCTTTGGTCGTGTTGTCCAGCTGACCGCTTTTCATCCCTTCG
AGTCTGCCCTCGATGCCCTCAACCAAGTTAACGCCGTCTCTGAAGGGGTTATGACTGAGG
AGCTTAGAAGTTTCCTGGAGTTGAATCTTCCTAAAGTCAAAGAAGGCAAGAAGCCCAAGT
TCAGCTTAGGAACCTCCGAGCCTAAACTCGGTTCCCATATCTTGGAGGCCACTAAAATCC
CCTGCCAGAGCAATGAGTTCGTTCTTGAGCTTCTCCTTGGTGTTCGCCTTCATTTTGACA
GGTTCATCAAGGACCTCAAGCCTGGTGATCTGGAAAAATCTCAACTTGGGTTAGCTCACA
GCTACAGCAGAGCCAAGGTCAAGTTCAATGTTAACCGAGTCGATAACATGGTTATTCAAG
CCATTTTCCTCCTTGACACTCTTGATAAGGATATCAACTCCTTTGCCATGAGAGTCAGGG
AATGGTATTCGTGGCACTTCCCCGAGCTTGTGAAGATTGTCAATGACAATTATCTTTACG
CCCGTGTTTCAAAGATGATTGAAGACAAGTCTAAGCTGACTGATGACCACATCCCTGTGC
TTACTGAAGTCTTAGGGGATGAGGATAAAGCAAAGGAGTCGTCGAAGCTGGAAAGCATCC
ATGGGCCAGGATTTATCA

QA 3 800 3 800
DS 



AS 1 3

CO CL3631Contig1 759 3 3 U
TGGGAAAGGCGCATAGAAGGGAAGAATATGAGAGAAATATGGAAGCTTTGACCGCCATTG
ATTCTCTACACTAACCTCATCTCTTCTTCATCTCATTTCCCAATTCTCTCTCTTCTCTCT
TCTCTCTTCTCTCTGATGCGTGCTCTTCTCTTTCCTTTAAGATTCTTTGGCTCAGATCAG
TCACAGAGCCAAATAGAAGAATAAAGAAGGTCCTGCTGGGATTTTCTTACATTGACAAAC
TGCCAAGTCGACACTGAAACTTTTTTTTGCAATAGAGATGGCAGAAGTTGATAATCAACT
AGAGATCAAGTTTAGGTTAACCGATGGTTCTGATATCGGCCCTAAAGCATTTCCCGATGC
TACAACTGTTGCTGCATTGAAGGAAACTGTTATTTCTCAATGGCCTAGAGAAAAGGAAAA
TGGACCGAAGACAGTGAAAGAGGTCAAGTTGATAAGCGCAGGGAAAGTTTTGGACAACAA
CAAGACTGTTAAAGACTACCGAAGCCCTGTCTCTAATCTCGTTGGCGCTGTCACCACAAT
GCACGTTATCATCCAACCTCTCATTACTGAAAAAGAAAAGAAGCCTAAAGGTGATGATCC
AAAGATGAACAAATGTGTCTGCTCAGTCATGTAAGACAAACGCAAAATCTCAACAAAGAC
TGCTCTGTTCCCTCATGTGGTTTGGTATAGATTGTTTATTGATGCATAACCATAAGTGTT
GAACCGTTTTTTTAAAGTATAAATCAAATATCTATTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO11JQ C 261
AF RR2BL62TF U 412
AF RR2BO11TF U 1
BS 1 290 RR2BO11TF
BS 291 291 RR2BO11JQ
BS 292 759 RR2BO11TF

RD RR2BO11JQ 254 0 0
TTTTTTTTGCAATAGAGATGGCAGAAGTTGATAATCAACTAGAGATCAAGTTTAGGTTAA
CCGATGGTTTTGATATCGGCCCTAAAGCATTTCCCGATGCTACAACTGTTGCTGCATTGA
AGGAAACTGTTATTTCTCAATGGCCTAGAGAAAAGGAAAATGGACCGAAGACAGTGAAAG
AGGTCAAGTTGATAAGCGCAGGGAAAGTTTTGGACAACAACAAGACTGTTAAAGACTACC
GAAGCCCTGTCT
TT

QA 1 252 1 252
DS 

RD RR2BL62TF 149 0 0
AAAGGAAAATGGACCGAAGACAGTGAAAGAGGTCAAGTTGATAAGCGCAGGGAAAGTTTT
GGACAACAACAAGACTGTTAAAGACTACCGAAACCCTGTCTCTAATCTCGTTGGCGCTGT
CACCACAATGCACGTTATCATCCAACCTC

QA 1 149 1 149
DS 

RD RR2BO11TF 759 0 0
TGGGAAAGGCGCATAGAAGGGAAGAATATGAGAGAAATATGGAAGCTTTGACCGCCATTG
ATTCTCTACACTAACCTCATCTCTTCTTCATCTCATTTCCCAATTCTCTCTCTTCTCTCT
TCTCTCTTCTCTCTGATGCGTGCTCTTCTCTTTCCTTTAAGATTCTTTGGCTCAGATCAG
TCACAGAGCCAAATAGAAGAATAAAGAAGGTCCTGCTGGGATTTTCTTACATTGACAAAC
TGCCAAGTCGACACTGAAACTTTTTTTTGCAATAGAGATGGCAGAAGTTGGTAATCAACT
AGAGATCAAGTTTAGGTTAACCGATGGTTCTGATATCGGCCCTAAAGCATTTCCCGATGC
TACAACTGTTGCTGCATTGAAGGAAACTGTTATTTCTCAATGGCCTAGAGAAAAGGAAAA
TGGACCGAAGACAGTGAAAGAGGTCAAGTTGATAAGCGCAGGGAAAGTTTTGGACAACAA
CAAGACTGTTAAAGACTACCGAAGCCCTGTCTCTAATCTCGTTGGCGCTGTCACCACAAT
GCACGTTATCATCCAACCTCTCATTACTGAAAAAGAAAAGAAGCCTAAAGGTGATGATCC
AAAGATGAACAAATGTGTCTGCTCAGTCATGTAAGACAAACGCAAAATCTCAACAAAGAC
TGCTCTGTTCCCTCATGTGGTTTGGTATAGATTGTTTATTGATGCATAACCATAAGTGTT
GAACCGTTTTTTTAAAGTATAAATCAAATATCTATTTAC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 3

CO CL3632Contig1 724 3 2 U
CGGCTTCAAATACGTTACATAAGCCACACAACTAGAAGTTCTTACAACAGTTTTAGAAAC
ATACATTAACATATACACACACACAATATTATAGAAAGGCAGGACTTAAAATATGGTACA
TAAGCCACGTGACTAGAAGTTCTTACAATCTTTCAGAAACATACATAGACACACACACAC
AAAGAGAGGAGATAGAGTTTGAACAAGTGGGTTTAGTTGCCAAAACCCATCATTGTTCTT
TACTAGTTTAAACTAGTTTCACACTGAGATAAAATGCAAGGCTCCGTTCACCTGACGATG
AAGAAGCCTTAGGTATCGAATGAGCCAAAGATGAGTTGCCAGTTCACAGTCAGATGGAAC
CAAGAACAAAAGAAAAACTCAAAATGTCTTTTATCAAGACAATAGAGTTCTCCCTCTCTC
GGTCTGACTGTGAACTACAATAAAAGTATCAGGTCTTGAAATTACAGCAGCCATTATCCA
TTGCTGCTGCTGCTGTGATCCACTTGCTAGGCATTACCATGCCACCAAGGGGATGCACTG
AAGAGCCTAAAAAGTAGTTCATGCTTGTAACTTCTGATCCTAGTCGGTTTGATAAGTTCA
TGGTCATGCTTTCAGGATGAAGAACATCTGAATCCTGAGAGTTACTTCGCTGAGGCTGAG
GCTGAGGCATAGTCTGCTTAGTTCCATCAGCTTTCTTTGCATTGTTCTGGGTTTTAGTGT
TCAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 

AF RR2DR01JQ U 85
AF RR2G259JQ U 1
AF RR2H562JQB U 1
BS 1 721 RR2G259JQ
BS 722 724 RR2H562JQB

RD RR2DR01JQ 528 0 0
AATATTATAGGAAGGCAGGATTTAAAATATGGTACATAAGCCACGTGACTAGAAGTTCTT
ACAATCTTTCAAAAACATACATAGACACACACACA**AAGAGAGGAGATAGAGTTTGAAC
AAGTGGGTTTAGTTGCCCAAACCCATCATTGTTCTTTACTAGCTTAAACTAATTTCACAC
TGAAATAAAATGCAAGGCTCCGTTCACCTGACGATGAAAAAGCCTTAGGTATCGAATGAG
CCAAAAATGAGTTGCCAGTTCACAGTCAGATGGAACCAAAAACAAAAGAAAAACTCAAAA
TGTCTTTTATCAAGACAATAAAGTTCTCCCTCTCTCGGTCTGCCTGTGAACTACAATAAA
AGTATCAGGTCTTGAAATTACAGCAGCCATTATCCATTGCTGCTGCTGCTGTGATCCACT
TGCTAGGCATTACCATGCCACCAAGGGGATGCACTGAAGAGCCAAAAAAGCAGCTCATGC
TTGTAACTTCTGATCCTAGTCGGTTTGATAAGTTCATGGTCATGCTTT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2G259JQ 721 0 0
CGGCTTCAAATACGTTACATAAGCCACACAACTAGAAGTTCTTACAACAGTTTTAGAAAC
ATACATTAACATATACACACACACAATATTATAGAAAGGCAGGACTTAAAATATGGTACA
TAAGCCACGTGACTAGAAGTTCTTACAATCTTTCAGAAACATACATAGACACACACACAC
AAAGAGAGGAGATAGAGTTTGAACAAGTGGGTTTAGTTGCCAAAACCCATCATTGTTCTT
TACTAGTTTAAACTAGTTTCACACTGAGATAAAATGCAAGGCTCCGTTCACCTGACGATG
AAGAAGCCTTAGGTATCGAATGAGCCAAAGATGAGTTGCCAGTTCACAGTCAGATGGAAC
CAAGAACAAAAGAAAAACTCAAAATGTCTTTTATCAAGACAATAGAGTTCTCCCTCTCTC
GGTCTGACTGTGAACTACAATAAAAGTATCAGGTCTTGAAATTACAGCAGCCATTATCCA
TTGCTGCTGCTGCTGTGATCCACTTGCTAGGCATTACCATGCCACCAAGGGGATGCACTG
AAGAGCCTAAAAAGTAGTTCATGCTTGTAACTTCTGATCCTAGTCGGTTTGATAAGTTCA
TGGTCATGCTTTCAGGATGAAGAACATCTGAATCCTGAGAGTTACTTCGCTGAGGCTGAG
GCTGAGGCATAGTCTGCTTAGTTCCATCAGCTTTCTTTGCATTGTTCTGGGTTTTAGTGT
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2H562JQB 724 0 0
CGGCTTCAAATACGTTACATAAGCCACACAACTAGAAGTTCTTACAACAGTTTTAGAAAC
ATACATTAACATATACACACACACAATATTATAGAAAGGCAGGACTTAAAATATGGTACA
TAAGCCACGTGACTAGAAGTTCTTACAATCTTTCAGAAACATACATAGACACACACACAC
AAAGAGAGGAGATAGAGTTTGAACAAGTGGGTTTAGTTGCCAAAACCCATCATTGTTCTT
TACTAGTTTAAACTAGTTTCACACTGAGATAAAATGCAAGGCTCCGTTCACCTGACGATG
AAGAAGCCTTAGGTATCGAATGAGCCAAAGATGAGTTGCCAGTTCACAGTCAGATGGAAC
CAAGAACAAAAGAAAAACTCAAAATGTCTTTTATCAAGACAATAGAGTTCTCCCTCTCTC
GGTCTGACTGTGAACTACAATAAAAGTATCAGGTCTTGAAATTACAGCAGCCATTATCCA
TTGCTGCTGCTGCTGTGATCCACTTGCTAGGCATTACCATGCCACCAAGGGGATGCACTG
AAGAGCCTAAAAAGTAGTTCATGCTTGTAACTTCTGATCCTAGTCGGTTTGATAAGTTCA
TGGTCATGCTTTCAGGATGAAGAACATCTGAATCCTGAGAGTTACTTCGCTGAGGCTGAG
GCTGAGGCATAGTCTGCTTAGTTCCATCAGCTTTCTTTGCATTGTTCTGGGTTTTAGTGT
TCAA

QA 1 724 1 724
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3634Contig1 720 3 4 U
GGAAAGCGAAGTGGGTTATGTCTAGGAACTGAAGAGATAAGAGGGTGGACGAACGATGTC
TGCGACCACAACTCCATATCTCTCTCTTCCGAGTTTCAGACCAAGATTCCAAAATCCAGC
TAAAACCCACCAATTATCTCCACTCTCTTGGTCTGTTTCGAGGAGAAAGATCTTGTCTTC
CGACAGACAACAAGCTCCTTCTGCTCTTATTCTGCTTCACCAGGAAAAAAACCAATCATG
GAGACTGTCTGCAACTCCAGAGGAGATATCCCAGGAGATAGTTTCTTCTGATACTTCATC
TACAGAAGCTATTGTCTCTGGTGGTGGTAGTCAAGATGGTGTTGCTTTGATTATACAAGT
GCTTCTCATTGCCGCTTTTCTTGCTCTCAGTGTTCTCACCATTGGTGTTGTTTACATCGG
AGTGACTGAGTTTCTTGGGAAGAGGGAGAGAGAGAAGTTTGAGAAAGAAGAGGCAGCAAA
GAAGTCTAAGAAAAGTGGCAAGAAGAAACCAATGAGAGCCAAAGCTGGACCAAGGGGGTT
CGGTCAGAAGATTGAAGATGATGACTTTGACATTGATCTTGAATGATTCTTTTTGTTCCA
TTGCGAGAGAGAGAGAGGGACAAGATTGATCTCTGTTTGTAAGTTCTGCGATTGTCATAT
CTATCATACTTTTCTTACTTGACAAGCAATATAAACAGAAAACTGCTAAAGAGTGCCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H319TF U 49
AF RR2H055TF U 1
AF RR2BM76TF U 32
BS 1 423 RR2H055TF
BS 424 424 RR2BM76TF
BS 425 683 RR2H055TF
BS 684 720 RR2BM76TF

RD RR2H319TF 591 0 0
GG
GAACGATGTCTGCGACCACAACTCCATATCTCTCTCTTCCGAGTTTCAGACCAAGATTCC
AAAATCCAGCTAAAACCCACCAATTATCTCCACTCTCTTGGTCTGTTTCGAGGAGAAAGA
TCTTGTCTTCCGACAGACAACAAGCTCCTTCTGCTCTTATTCTGCTTCACCAGGAAAAAA
ACCAATCATGGAGACTGCCTGCAACTCCAGAGGAGATATCCCAGGAGATAGTTTCTTCTG
ATACTTCATCTACAGAAGCTATTGTCTCTGGTGGTGGTAGTCAAGATGGTGTTGCTTTGA
TTATACAAGTGCTTCTCATTGCCGCTTTTCTTGCTCTCAGTGTTCTCACCATTGGTGTTG
TTTACATCGGAGTGACTGAGTTTCTTGGGAAGAGGGAGAGAGAGAAGTTTGAGAAAGAAG
AGGCAGCAAAGAAGTCTAAGAAAAGTGGCAAGAAGAAACCAATGAGAGCCAAAGCTGGAC
CAAGGGGGTTCGGTCAGAAGATTGAAGATGATGACTTTGACATTGATCTTGAATGATTCT
TTTTGTTCCATTGCGAGAGAGAGAGAGGGACAAGATTGATCTCTGTTTG

QA 3 591 3 591
DS 

RD RR2H055TF 683 0 0
GGAAAGCGAAGTGGGTTATGTCTAGGAACTGAAGAGATAAGAGGGTGGACGAACGATGTC
TGCGACCACAACTCCATATCTCTCTCTTCCGAGTTTCAGACCAAGATTCCAAAATCCAGC
TAAAACCCACCAATTATCTCCACTCTCTTGGTCTGTTTCGAGGAGAAAGATCTTGTCTTC
CGACAGACAACAAGCTCCTTCTGCTCTTATTCTGCTTCACCAGGAAAAAAACCAATCATG
GAGACTGTCTGCAACTCCAGAGGAGATATCCCAGGAGATAGTTTCTTCTGATACTTCATC
TACAGAAGCTATTGTCTCTGGTGGTGGTAGTCAAGATGGTGTTGCTTTGATTATACAAGT
GCTTCTCATTGCCGCTTTTCTTGCTCTCAGTGTTCTCACCATTGGTGTTGTTTACATCGG
AGTTACTGAGTTTCTTGGGAAGAGGGAGAGAGAGAAGTTTGAGAAAGAAGAGGCAGCAAA
GAAGTCTAAGAAAAGTGGCAAGAAGAAACCAATGAGAGCCAAAGCTGGACCAAGGGGGTT
CGGTCAGAAGATTGAAGATGATGACTTTGACATTGATCTTGAATGATTCTTTTTGTTCCA
TTGCGAGAGAGAGAGAGGGACAAGATTGATCTCTGTTTGTAAGTTCTGCGATTGTCATAT
CTATCATACTTTTCTTACTTGAC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2BM76TF 689 0 0
G
AGAGATAAGAGGGTGGACGAACGATGTCTGCGACCACAACTCCATATCTCTCTCTTCCGA
GTTTCAGACCAAGATTCCAAAATCCAGCTAAAACCCACCAATTATCTCCACTCTCTTGGT
CTGTTTCGAGGAGAAAGATCTTGTCTTCCGACAGACAACAAGCTCCTTCTGCTCTTATTC
TGCTTCACCAGGAAAAAAACCAATCATGGAGACTGTCTGCAACTCCAGAGGAGATATCCC
AGGAGATAGTTTCTTCTGATACTTCATCTACAGAAGCTATTGTCTCTGGTGGTGGTAGTC
AAGATGGTGTTGCTTTGATTATACAAGTGCTTCTCATTGCCGCTTTTCTTGCTCTCAGTG
TTCTCACCATTGGTGTTGTTTACATCGGAGTGACTGAGTTTCTTGGGAAGAGGGAGAGGG
AGAAGTTTGAGAAAGAAGAGGCAGCAAAGAAGTCTAAGAAAAGTGGCAAGAAGAAACCAA
TGAGAGCCAAAGCTGGACCAAGGGGGTTCGGTCAGAAGATTGAAGATGATGACTTTGACA
TTGATCTTGAATGATTCTTTTTGTTCCATTGCGAGAGAGAGAGAGGGACAAGATTGATCT
CTGTTTGTAAGTTCTGCGATTGTCATATCTATCATACTTTTCTTACTTGACAAGCAATAT
AAACAGAAAACTGCTAAAGAGTGCCTTT

QA 2 689 2 689
DS 



AS 1 2

CO CL3635Contig1 818 2 16 U
TTTTTTGTTTTTAGGGTTTCTCCTTTTCTCCTCCTAACTCACACAACACTCTCCCGAGGT
TAAAGCGACGGCGCTACTTCGCTGTCCGCCTTGTACGAGCTCGAGCTTCGTCTAGGCCCT
CCCTCACTTTTTATTTTATCTTTATACCATCCTCTCTCAATCAAAATGGCGGTGAAAGCA
ACAAAGGCGGAGAAGAAGATCGTGTACGACTCGAAGCTGTGCCAGCTTCTGAATGAGTAC
CCTCAGATCCTCATCGTCGCGGCGGATAACGTAGGGTCCACTCAGCTTCAGAACATACGG
AAAGGTCTCCGCGGAGACTCCGTCGTTCTCATGGGGAAGAACACTATGATGAAGAGATCC
GTTAAGCTTCATGCTCAGAAGACGGGGAACGATGGGTTCCTCAATCTCATGCCTCTCCTT
CAGGGGAACGTTGGGCTTATCTTTACCAAGGGTGACTTGAAGGAAGTCAGTGAGGAGGTT
GCTAAGTACAAGGTTGGAGCTCCAGCTCGTGTTGGCTTAGTCGCTCCAATCGATGTAGTT
GTGCAACCAGGCAACACTGGCCTCGACCCATCGCAGACCTCTTTCTTCCAAGTGCTCAAC
ATTCCAACCAAGATCAACAAAGGCACGGTTGAGATCATAACCCCAGTGGAGCTCATCAAG
AAGGGCGACAAGGTCGGTTCATCCGAGCAGCTCTTCTAGCCAGGCTTGGAATCAGCCGTT
CTCTTATGGTCTCGTCGTGGAGTCGTCTACGACAACGGCTCTGTGTTTGACTCTGAGTGC
TTAACCTCACTGAAGACGACCTTGTTGAAAGTTTGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA27TF U 1
AF RR2C312TF U 51
BS 1 161 RR2EA27TF
BS 162 162 RR2C312TF
BS 163 218 RR2EA27TF
BS 219 219 RR2C312TF
BS 220 257 RR2EA27TF
BS 258 258 RR2C312TF
BS 259 317 RR2EA27TF
BS 318 318 RR2C312TF
BS 319 320 RR2EA27TF
BS 321 321 RR2C312TF
BS 322 416 RR2EA27TF
BS 417 417 RR2C312TF
BS 418 644 RR2EA27TF
BS 645 645 RR2C312TF
BS 646 650 RR2EA27TF
BS 651 818 RR2C312TF

RD RR2EA27TF 650 0 0
TTTTTTGTTTTTAGGGTTTCTCCTTTTCTCCTCCTAACTCACACAACACTCTCCCGAGGT
TAAAGCGACGGCGCTACTTCGCTGTCCGCCTTGTACGAGCTCGAGCTTCGTCTAGGCCCT
CCCTCACTTTTTATTTTATCTTTATACCATCCTCTCTCAATTAAAATGGCGGTGAAAGCA
ACAAAGGCGGAGAAGAAGATCGTGTACGACTCGAAGCTTTGCCAGCTTCTGAATGAGTAC
CCTCAGATCCTCATCGTGGCGGCGGATAACGTAGGGTCCACTCAGCTTCAGAACATACGG
AAAGGTCTCCGCGGAGATTCGGTCGTTCTCATGGGGAAGAACACTATGATGAAGAGATCC
GTTAAGCTTCATGCTCAGAAGACGGGGAACGATGGGTTCCTCAATCTCATGCCTCTTCTT
CAGGGGAACGTTGGGCTTATCTTTACCAAGGGTGACTTGAAGGAAGTCAGTGAGGAGGTT
GCTAAGTACAAGGTTGGAGCTCCAGCTCGTGTTGGCTTAGTCGCTCCAATCGATGTAGTT
GTGCAACCAGGCAACACTGGCCTCGACCCATCGCAGACCTCTTTCTTCCAAGTGCTCAAC
ATTCCAACCAAGATCAACAAAGGCACGGTTGAGATCATAACCCCTGTGGA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2C312TF 768 0 0
GCT
CCGAGGTTAAAGCGACGGCGCTACTTCGCTGTCCGCCTTGTACGAGCTCGAGCTTCGTCT
AGGCCCTCCCTCACTTTTTATTTTATCTTTA**CCATCCTCTCTCAATCAAAATGGCGGT
GAAAGCAACAAAGGCGGAGAAGAAGATCGTGTACGACTCGAAGCTGTGCCAGCTTCTGAA
TGAGTACCCTCAGATCCTCATCGTCGCGGCGGATAACGTCGGGTCCACTCAGCTTCAGAA
CATACGGAAAGGTCTCCGCGGAGACTCCGTCGTTCTCATGGGGAAGAACACTATGATGAA
GAGATCTGTTAAGCTTCATGCTCAGAAGACGGGGAACGATGGGTTCCTCAATCTCATGCC
TCTCCTTCAGGGGAACGTTGGGCTTATCTTTACCAAGGGTGACTTGAAGGAAGTCAGTGA
GGAGGTTGCTAAGTACAAGGTTGGAGCTCCAGCTCGTGTTGGCTTAGTTGCTCCAATCGA
TGTGGTTGTGCAACCAGGCAACACTGGCCTCGACCCATCGCAGACCTCTTTCTTCCAGGT
GCTCAACATTCCAACCAAGATCAACAAAGGCACGGTTGAGATCATAACCCCAGTGGAGCT
CATCAAGAAGGGCGACAAGGTCGGTTCATCCGAGCAGCTCTTCTAGCCAGGCTTGGAATC
AGCCGTTCTCTTATGGTCTCGTCGTGGAGTCGTCTACGACAACGGCTCTGTGTTTGACTC
TGAGTGCTTAACCTCACTGAAGACGACCTTGTTGAAAGTTTGCTG

QA 4 768 4 768
DS 



AS 1 3

CO CL3636Contig1 1274 3 10 U
AGGAGGCGAAGGAAGGGAACTCCAACTGACTGGAACCAATCGTGTTCTCTGACGCTCTTG
CAAAATCAAAACGAGAGGACTGATTCTGGAGCTGAAGACAAAAGAGAAGAGAGATGGGGA
GCACAAGCACGAGCTCTGCTGCTCTAATCCACCATTTCCACCTCACAAGTCTTGACATGG
GTTCGCCTAGAAAGCGTCCCTACACTCTGAACTTCTGTAACTCGTGGAAGGAAGGTGGAC
TCCGACACGGATTGACGCGATGGAGGAGTAGCAAAGTCTTAAGACCCGTGGTCCGCTTGT
CAGCTCTCGATGAAAATTCAGGCGATAGACCAACGGAGAGCAGTCCTAGGTTTGGCTCTG
CTGTAGAAGACAGACCAGGTGTGGAAGAAGATGCATCCTTTGAGCAAGAAGATAAATCAA
GTTCCATCTATGAGTTTCTTTATCCAGATAAAGAGGAGCTCCCTGATGACAAAGAGATGA
CTATATTCGATCACCTGGAGGAGCTCCGTGAGAGAATCTTCGTCTCTGTTTTGGCTGTGG
GAGCTGCCATCACGGGTTGCTTCGCCTTCTCCAAAGATCTAATCGTCTTTCTTGAAGCCC
CTGTCAAAAATCAGGGCGTGAGGTTTCTTCAGCTAGCTCCTGGCGAGTTTTTCTTCACTA
CTTTAAAGGTTTCAGGTTACTGTGGGCTTCTACTAGGGAGTCCAGTGATCTTGTATGAGA
TCATAGCTTTTGTACTTCCTGGTCTGACACGAGCTGAGAGAAGGTTTCTCGGGCCGATTG
TGTTTGGTTCCTCCTTGCTCTTCTACGCTGGACTTGCCTTCTCCTACTGGGTGTTAACCC
CTGCTGCCTTGAACTTCTTTGTGAATTACGCTGAAGGTGTGGTTGAATCTCTCTGGTCTA
TCGACCAGTACTTTGAGTTTGTGCTAGTTCTTATGTTCAGCACCGGCTTGTCTTTCCAGG
TCCCGGTAATTCAGTTACTCCTGGGACAAGTAGGGGTGGTGTCTGGAGATCAAATGCTTT
CAATATGGAGATATGTGGTGGTGGGTGCGGTGGTTGTAGCAGCTGTGGTCACGCCCTCGA
CAGACCCTGTCACTCAAATGCTCCTAGCAACGCCGCTTCTGGGGCTATACTTGGGTGGTG
CGTGGATGGTGAAGCTCACAGGTCGGTGAGGAACTTGGCTGTTCAAAGACAAATAAAGTC
ATGTATCTTGTAGAGTATATGTATCACTTTCCATGCAAGAGACCCCACAGTTTGGTACCT
AAAGTGTTTATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO55TF U 66
AF RR2FX37TF U 1
AF RR2BO55JQ C 572
BS 1 98 RR2FX37TF
BS 99 99 RR2BO55TF
BS 100 675 RR2FX37TF
BS 676 676 RR2BO55TF
BS 677 697 RR2FX37TF
BS 698 698 RR2BO55TF
BS 699 763 RR2FX37TF
BS 764 764 RR2BO55JQ
BS 765 786 RR2FX37TF
BS 787 1274 RR2BO55JQ

RD RR2BO55TF 700 0 0
G
CAAAACGAGAGGACTGATTCTGGAGCTGAAGACAAAAGAGAAGAGAGATGGGGAGCACAA
GCACGAGCTCTGCTGCTCTAATCCACCATTTCCACCTCACAAGTCTTGACATGGGTTCGC
CTAGAAAGCGTCCCTACACTCTGAACTTCTGTAATTCGTGGAAGGAAGGTGGACTCCGAC
ACGGATTGACGCGATGGAGGAGTAGCAAAGTCTTAAGACCCGTGGTCCGCTTGTCAGCTC
TCGATGAAAATTCAGGCGATAGACCAACGGAGAGCAGTCCTAGGTTTGGCTCTGCTGTAG
AAGACAGACCAGGTGTGGAAGAAGATGCATCCTTTGAGCAAGAAGATAAATCAAGTTCCA
TCTATGAGTTTCTTTATCCAGATAAAGAGGAGCTCCCTGATGACAAAGAGATGACTATAT
TCGATCACCTGGAGGAGCTCCGTGAGAGAATCTTCGTCTCTGTTTTGGCTGTGGGAGCTG
CCATCACGGGTTGCTTCGCCTTCTCCAAAGATCTAATCGTCTTTCTTGAAGCCCCTGTCA
AAAATCAGGGCGTGAGGTTTCTTCAGCTAGCTCCTGGCGAGTTTTTCTTCACTACTTTAA
AGGTTTCAGGTTACTGTGGGCTTCTACTAGGGAGTCCAGTGATCTTGTATGAGATCATAG
CTTTTGTACTTCCTGGTCTGACACGAGCTGAAAGAA
AGT

QA 2 697 2 697
DS 

RD RR2FX37TF 786 0 0
AGGAGGCGAAGGAAGGGAACTCCAACTGACTGGAACCAATCGTGTTCTCTGACGCTCTTG
CAAAATCAAAACGAGAGGACTGATTCTGGAGCTGAAGA*AAAAGAGAAGAGAGATGGGGA
GCACAAGCACGAGCTCTGCTGCTCTAATCCACCATTTCCACCTCACAAGTCTTGACATGG
GTTCGCCTAGAAAGCGTCCCTACACTCTGAACTTCTGTAACTCGTGGAAGGAAGGTGGAC
TCCGACACGGATTGACGCGATGGAGGAGTAGCAAAGTCTTAAGACCCGTGGTCCGCTTGT
CAGCTCTCGATGAAAATTCAGGCGATAGACCAACGGAGAGCAGTCCTAGGTTTGGCTCTG
CTGTAGAAGACAGACCAGGTGTGGAAGAAGATGCATCCTTTGAGCAAGAAGATAAATCAA
GTTCCATCTATGAGTTTCTTTATCCAGATAAAGAGGAGCTCCCTGATGACAAAGAGATGA
CTATATTCGATCACCTGGAGGAGCTCCGTGAGAGAATCTTCGTCTCTGTTTTGGCTGTGG
GAGCTGCCATCACGGGTTGCTTCGCCTTCTCCAAAGATCTAATCGTCTTTCTTGAAGCCC
CTGTCAAAAATCAGGGCGTGAGGTTTCTTCAGCTAGCTCCTGGCGAGTTTTTCTTCACTA
CTTTAAAGGTTTCAG*TTACTGTGGGCTTCTACTAGG*AGTCCAGTGATCTTGTATGAGA
TCATAGCTTTTGTACTTCCTGGTCTGACACGAGCTGAGAGAAG*TTTCTCGGGCCGATTG
TGTTTG

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2BO55JQ 703 0 0
CAAAGATCTAATCGTCTTTCTTGAAGCCCCTGTCAAAAATCAGGGCGTGAGGTTTCTTCA
GCTAGCTCCTGGCGAGTTTTTCTTCACTACTTTAAAGGTTTCAGGTTACTGTGGGCTTCT
ACTAGGGAGTCCAGTGATCTTGTATGAGATCATAGCTTTTGTACTTCCTGGTCTGACACG
AGCTGAGAGAAGGTTTCTCGGGCCGATTGTGTTTGGTTCCTCCTTGCTCTTCTACGCTGG
ACTTGCCTTCTCCTACTGGGTGTTAACCCCTGCTGCCTTGAACTTCTTTGTGAATTACGC
TGAAGGTGTGGTTGAATCTCTCTGGTCTATCGACCAGTACTTTGAGTTTGTGCTAGTTCT
TATGTTCAGCACCGGCTTGTCTTTCCAGGTCCCGGTAATTCAGTTACTCCTGGGACAAGT
AGGGGTGGTGTCTGGAGATCAAATGCTTTCAATATGGAGATATGTGGTGGTGGGTGCGGT
GGTTGTAGCAGCTGTGGTCACGCCCTCGACAGACCCTGTCACTCAAATGCTCCTAGCAAC
GCCGCTTCTGGGGCTATACTTGGGTGGTGCGTGGATGGTGAAGCTCACAGGTCGGTGAGG
AACTTGGCTGTTCAAAGACAAATAAAGTCATGTATCTTGTAGAGTATATGTATCACTTTC
CATGCAAGAGACCCCACAGTTTGGTACCTAAAGTGTTTATGTG

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 3

CO CL3637Contig1 693 3 7 U
GGGTTTCTGGAGAGAATATAAAATCTGGATTTCCATCTGCTATGGCCTCTAACCATCATT
GGAGCTTTTCTTTGTTCTTTGTGCTCTGCTTCTGAAGGAATAAAAGAGAAGATTTTTGAT
CTTGGTGGAAAAAAAAAGTAACCGAACATGGAAGGAGATGTGATTTCGGGATTTGGAGAG
AGACACAACAATGTAGATGGGAAAGTGCTGCAGAGTTTCAAGAAGAGCTTTGTGGATGTT
CAAGACATTTTAGATCAGAACCGGCTTTTGATCAACGAGATCAATCAGAACCATGAGTCC
AATCAACCCGATAACTTGAGTCGAAACGTTGGTCTTATCAAAGAGCTCAACAACAATATA
AGAAGAGTAGCTAGCCTTTACGGTGATCTCTCTCATTCTTTCTCAAGATCAGTGGATGCT
TCATCAGAAGGTGAATCTGGTGGAACCATTGGGATAGCTAACCAGAAGAGATTTAGATCC
GGTTAGTAGAATATATTTCCGAGAACCACCCACCAAAGTTGATCATTGTAGACTTCATAT
ATTCAAAGAATACTCAAAGGTAATTGATTGAGTAGAAAGAAAGATGAGTTATACTACTGT
AATATCACTGTTTGAATGATAGTTTTACTACCTATGTTTTCACCAAGATGATATTCAGAT
TAAGACAGTTCTTAATTGTTTTTTTTTTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD74TF U 1
AF RR2F403JQ C 24
AF RR2F403TF U 24
BS 1 251 RR2AD74TF
BS 252 252 RR2F403TF
BS 253 345 RR2AD74TF
BS 346 346 RR2F403TF
BS 347 612 RR2AD74TF
BS 613 613 RR2F403TF
BS 614 693 RR2AD74TF

RD RR2AD74TF 693 0 0
GGGTTTCTGGAGAGAATATAAAATCTGGATTTCCATCTGCTATGGCCTCTAACCATCATT
GGAGCTTTTCTTTGTTCTTTGTGCTCTGCTTCTGAAGGAATAAAAGAGAAGATTTTTGAT
CTTGGTGGAAAAAAAAAGTAACCGAACATGGAAGGAGATGTGATTTCGGGATTTGGAGAG
AGACACAACAATGTAGATGGGAAAGTGCTGCAGAGTTTCAAGAAGAGCTTTGTGGATGTT
CAAGACATTTTGGATCAGAACCGGCTTTTGATCAACGAGATCAATCAGAACCATGAGTCC
AATCAACCCGATAACTTGAGTCGAAACGTTGGTCTTATCAAAGAGTTCAACAACAATATA
AGAAGAGTAGCTAGCCTTTACGGTGATCTCTCTCATTCTTTCTCAAGATCAGTGGATGCT
TCATCAGAAGGTGAATCTGGTGGAACCATTGGGATAGCTAACCAGAAGAGATTTAGATCC
GGTTAGTAGAATATATTTCCGAGAACCACCCACCAAAGTTGATCATTGTAGACTTCATAT
ATTCAAAGAATACTCAAAGGTAATTGATTGAGTAGAAAGAAAGATGAGTTATACTACTGT
AATATCACTGTTCGAATGATAGTTTTACTACCTATGTTTTCACCAAGATGATATTCAGAT
TAAGACAGTTCTTAATTGTTTTTTTTTTTGTTT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2F403JQ 647 0 0
TCTGGATTTCCATCTGCTATGGCCTCTAACCATCATTGGAGCTTTTCTTTGTTCTTTGTG
CTCTGCTTCTGAAGGAATAAAAGAGAAGATTTTTGATCTTGGTGGAAAAAAAAAGTAACC
GAACATGGAAGGAGATGTGATTTCGGGATTTGGAGAGAGACACAACAATGTAGATGGGAA
AGTGCTGCAGAGTTTCAAGAAGAGCTTTGTGGATGTTCAAGACATTTTAGATCAGAACCG
GCTTTTGATCAACGAGATCAATCAGAACCATGAGTCCAATCAACCCGATAACTTGAGTCG
AAACGTTGGTCTTATCAAAGAGCTCAACAACAATATAAGAAGAGTAGCTAGCCTTTACGG
TGATCTCTCTCATTCTTTCTCAAGATCAGTGGATGCTTCATCAGAAGGTGAATCTGGTGG
AACCATTGGGATAGCTAACCAGAAGAGATTTAGATCCGGTTAGTAGAATATATTTCCGAG
AACCACCCACCAAAGTTGATCATTGTAGACTTCATATATTCAAAGAATACTCAAAGGTAA
TTGATTGAGTAGAAAGAAAGATGAGTTATACTACTGTAATATCACTGTTTGAATGATAGT
TTTACTACCTATGTTTTCACCAAGATGATATTCAGATTAAGACA
GTT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2F403TF 644 0 0
TCTGGATTTCCATCTGCTATGGCCTCTAACCATCATTGGAGCTTTTCTTTGTTCTTTGTG
CTCTGCTTCTGAAGGAATAAAAGAGAAGATTTTTGATCTTGGTGGAAAAAAAAAGTAACC
GAACATGGAAGGAGATGTGATTTCGGGATTTGGAGAGAGACACAACAATGTAGATGGGAA
AGTGCTGCAGAGTTTCAAGAAGAGCTTTGTGGATGTTCAAGACATTTTAGATCAGAACCG
GCTTTTGATCAACGAGATCAATCAGAACCATGAGTCCAATCAACCCGATAACTTGAGTCG
AAACGTTGGTCTTATCAAAGAGCTCAACAACAATATAAGAAGAGTAGCTAGCCTTTACGG
TGATCTCTCTCATTCTTTCTCAAGATCAGTGGATGCTTCATCAGAAGGTGAATCTGGTGG
AACCATTGGGATAGCTAACCAGAAGAGATTTAGATCCGGTTAGTAGAATATATTTCCGAG
AACCACCCACCAAAGTTGATCATTGTAGACTTCATATATTCAAAGAATACTCAAAGGTAA
TTGATTGAGTAGAAAGAAAGATGAGTTATACTACTGTAATATCACTGTTTGAATGATAGT
TTTACTACCTATGTTTTCACCAAGATGATATTCAGATTAAGACA

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 3

CO CL3638Contig1 828 3 11 U
GGAGGAGGAGCGTGATGTCGAAGTCAATGACATGGAGCCTAAGGTTTTCAAGGCTTTGCT
TCATTACATATACAAGGATGCTCTTATCGAAGATGCGGAGTCAGCATCCTCTTCTGGTTC
TTCTGTTGGTCCATTAGCGTCAGATACATTAGCTGCGAAGCTGTTAGGAGCCGTTGATAA
ATACAAGTTGCCTAGACTGAGCTTAATGTGCGAGTCTGTGCTCTGCAAGGATATCTCAGT
AGATTCCGTCGCTAATATCTTAGCTCTTGCTGACCGTTACAATGCTTCTGCCTTGAAATC
CGTTTGTCTGAAATTCGCAGCGGAGAATCTCATCGCTGTGATGAGGTCAGATGGGTTTGA
CTATTTGAGGGAACACTGCCCATCGCTTCAGTCTGAGCTTCTGAAAACAGTTGCGGGGTG
TGAAGAGGAGCTAAGCGGAGGAGCAGGAGGAGGAGGGAAGACGAGAAGCGTGTGGGGGCA
ATTCTCAGACGGTGGAGCTGATACAAACAGGCAACAACAGACATGGGGAGAGGTCAACGG
AGCAGAGAGAAGCCAGAGTGTTTGGGTTCAAGTTGTGAACGCTAATGCAAACGGTAGAAA
CAATGATGATGATGATGACAACAACGAGAACGGTGATGACGATGACCCCATGGCAGAAGA
TTGAGCAAATAAAAGAGTAATAAATTTCCAAAAGGAGAATCCAAGGACCAGATCAGAGAT
TGGTGTTGAGATGTTTGTTTGTCTTGCGTCGTCTTTTATGTTGTGTAATAATTGGAGTCA
GTTTGATAAACTAAACACACTCATCATCAAATATAACTAAGAATCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG24TF U 1
AF RR2C277TF U 24
AF RR2C277JQ C 25
BS 1 59 RR2GG24TF
BS 60 60 RR2C277TF
BS 61 173 RR2GG24TF
BS 174 174 RR2C277TF
BS 175 423 RR2GG24TF
BS 424 424 RR2C277TF
BS 425 575 RR2GG24TF
BS 576 657 RR2C277TF
BS 658 658 RR2C277JQ
BS 659 679 RR2C277TF
BS 680 828 RR2C277JQ

RD RR2GG24TF 575 0 0
GGAGGAGGAGCGTGATGTCGAAGTCAATGACATGGAGCCTAAGGTTTTCAAGGCTTTGCC
TCATTACATATACAAGGATGCTCTTATCGAAGATGCGGAGTCAGCATCCTCTTCTGGTTC
TTCTGTTGGTCCATTAGCGTCAGATACATTAGCTGCGAAGCTGTTAGGAGCCGCTGATAA
ATACAAGTTGCCTAGACTGAGCTTAATGTGCGAGTCTGTGCTCTGCAAGGATATCTCAGT
AGATTCCGTCGCTAATATCTTAGCTCTTGCTGACCGTTACAATGCTTCTGCCTTGAAATC
CGTTTGTCTGAAATTCGCAGCGGAGAATCTCATCGCTGTGATGAGGTCAGATGGGTTTGA
CTATTTGAGGGAACACTGCCCATCGCTTCAGTCTGAGCTTCTGAAAACAGTTGCGGGGTG
TGAGGAGGAGCTAAGCGGAGGAGCAGGAGGAGGAGGGAAGACGAGAAGCGTGTGGGGGCA
ATTCTCAGACGGTGGAGCTGATACAAACAGGCAACAACAGACATGGGGAGAGGTCAACGG
AGCAGAGAGAAGCCAGAGTGTTTGGGTTCAAGTTG

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2C277TF 656 0 0
GTA
ATGACATGGAGCCTAAGGTTTTCAAGGCTTTGCTTCATTACATATACAAGGATGCTCTTA
TCGAAGATGCGGAGTCAGCATCCTCTTCTGGTTCTTCTGTTGGTCCATTAGCGTCAGATA
CATTAGCTGCGAAGCTGTTAGGAGCCGTTGATAAATACAAGTTGCCTAGACTGAGCTTAA
TGTGCGAGTCTGTGCTCTGCAAGGATATCTCAGTAGATTCCGTCGCTAATATCTTAGCTC
TTGCTGACCGTTACAATGCTTCTGCCTTGAAATCCGTTTGTCTGAAATTCGCAGCGGAGA
ATCTCATCGCTGTGATGAGGTCAGATGGGTTTGACTATTTGAGGGAACACTGCCCATCGC
TTCAGTCTGAGCTTCTGAAAACAGTTGCGGGGTGTGAAGAGGAGCTAAGCGGAGGAGCAG
GAGGAGGAGGGAAGACGAGAAGCGTGTGGGGGCAATTCTCAGACGGTGGAGCTGATACAA
ACAGGCAACAACAGACATGGGGAGAGGTCAACGGAGCAGAGAGAAGCCAGAGTGTTTGGG
TTCAAGTTGTGAACGCTAATGCAAACGGTAGAAACAATGATGATGATGATGACAACAACG
AGAACGGTGATGACGATGACCCCATGGCAGA*GATTGAGCAAATAAAAGAGTA

QA 4 656 4 656
DS 

RD RR2C277JQ 804 0 0
GT
ATGACATGGAGCCTAAGGTTT*CAAGGCTTTGCTTCATTACATATACAAGGATGCTCTTA
TCGAAGATGCGGAGTCAGCATCCTCTTCTGGTTCTTCTGTTGGTCCATTAGCGTCAGATA
CATTAGCTGCGAAGCTGTTAGGAGCCGTTGATAAATACAAGTTGCCTAGACTGAGCTTAA
TGTGCGAGTCTGTGCTCTGCAAGGATATCTCAGTAGATTCCGTCGCTAATATCTTAGCTC
TTGCTGACCGTTACAATGCTTCTGCCTTGAAATCCGTTTGTCTGAAATTCGCAGCGGAGA
ATCTCATCGCTGTGATGAGGTCAGATGGGTTTGACTATTTGAGGGAACACTGCCCATCGC
TTCAGTCTGAGCTTCTGAAAACAGTTGCGGGGTGTGAAGAGGAGCTAAGCGGAGGAGCAG
GAGGAGGAGGGAAGACGAGAAGCGTGTGGGGGCAATTCTCAGACGGTGGAGCTGATACAA
ACAGGCAACAACAGACATGGGGAGAGGTCAACGGAGCAGAGAGAAGCCAGAGTGTTTGGG
TTCAAGTTGTGAACGCTAATGCAAACGGTAGAAACAATGATGATGATGATGACAACAACG
AGAACGGTGATGACGATGACCCCATGGCAGAAGATTGAGCAAATAAAAGAGTAATAAATT
TCCAAAAGGAGAATCCAAGGACCAGATCAGAGATTGGTGTTGAGATGTTTGTTTGTCTTG
CGTCGTCTTTTATGTTGTGTAATAATTGGAGTCAGTTTGATAAACTAAACACACTCATCA
TCAAATATAACTAAGAATCTGT

QA 3 804 3 804
DS 



AS 1 3

CO CL3639Contig1 671 3 7 U
GAAAAAGAGGGAGAGAGAATCCCCCACCCGAAATTCGACGAGGAAGATGATGACGCGGTG
GTTCCGAGGAAGCACTGTTTCTAAGATGGGGAGAAGAAATCGTGATTTTTCATCCGTGAG
CGAGAAAGATGTGCCAATGGGAGATTTGGAGCTGTTTGTGAACAACGTGGCTGGTCTTTG
CTTTAAAGGGGTCTCGGGTGTTGTTGGATTCATGATCGCTGGTTTGACAGCTCCTGGGGT
TTCAGAGAATGTTAAGAACGACGAAGAGATGCTCATACACTTGAAACAAAACAATGATAA
ACGCGAAGTGAATATGGAGCAAATGCGGATAAACCAGCTGGAAAGGAATCGCAAATACTT
GTCAAGGAAAAGATCATATGCCTCCTATCAAGGGACAGATTAGCTCCATCTGATGATGAC
CAGAGAGCTCTGAATTATCCTCAACCTTTGTCAGTGTCTTTCATATCTTGGGATTTTCAT
GTGTCTTTGTATGACTTGTGAACCAAAACGTCAACCTTTTTCACTGCTTCCTCTTTTCTC
ACTACTGTATTCTATAATTCCATTTGCTGCCAAGCCTGCCATGATGGGG*TCTGTTGGTT
AGAAGAAACCTTGTCTGTGTATAGTTAGTCAAAGATACAAGTCAGCGAAAAGATTAAGGC
TGTCATTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H988TF U 6
AF RR2AO48JQ C 1
AF RR2AO48TF U 1
BS 1 6 RR2AO48JQ
BS 7 15 RR2H988TF
BS 16 16 RR2AO48TF
BS 17 157 RR2H988TF
BS 158 158 RR2AO48TF
BS 159 600 RR2H988TF
BS 601 671 RR2AO48TF

RD RR2H988TF 595 0 0
G
GAGGGAGAGGGAATCCCCCACCCGAAATTCGACGAGGAAGATGATGACGCGGTGGTTCCG
AGGAAGCACTGTTTCTAAGATGGGGAGAAGAAATCGTGATTTTTCATCCGTGAGCGAGAA
AGATGTGCCAATGGGAGATTTGGAGCTGTTTATGAACAACGTGGCTGGTCTTTGCTTTAA
AGGGGTCTCGGGTGTTGTTGGATTCATGATCGCTGGTTTGACAGCTCCTGGGGTTTCAGA
GAATGTTAAGAACGACGAAGAGATGCTCATACACTTGAAACAAAACAATGATAAACGCGA
AGTGAATATGGAGCAAATGCGGATAAACCAGCTGGAAAGGAATCGCAAATACTTGTCAAG
GAAAAGATCATATGCCTCCTATCAAGGGACAGATTAGCTCCATCTGATGATGACCAGAGA
GCTCTGAATTATCCTCAACCTTTGTCAGTGTCTTTCATATCTTGGGATTTTCATGTGTCT
TTGTATGACTTGTGAACCAAAACGTCAACCTTTTTCACTGCTTCCTCTTTTCTCACTACT
GTATTCTATAATTCCATTTGCTGCCAAGCCTGCCATGATGGGG*TCTGTTGGTT

QA 2 595 2 595
DS 

RD RR2AO48JQ 671 0 0
GAAAAAGAGGGAGAGAGAATCCCCCACCCGAAATTCGACGAGGAAGATGATGACGCGGTG
GTTCCGAGGAAGCACTGTTTCTAAGATGGGGAGAAGAAATCGTGATTTTTCATCCGTGAG
CGAGAAAGATGTGCCAATGGGAGATTTGGAGCTGTTTGTGAACAACGTGGCTGGTCTTTG
CTTTAAAGGGGTCTCGGGTGTTGTTGGATTCATGATCGCTGGTTTGACAGCTCCTGGGGT
TTCAGAGAATGTTAAGAACGACGAAGAGATGCTCATACACTTGAAACAAAACAATGATAA
ACGCGAAGTGAATATGGAGCAAATGCGGATAAACCAGCTGGAAAGGAATCGCAAATACTT
GTCAAGGAAAAGATCATATGCCTCCTATCAAGGGACAGATTAGCTCCATCTGATGATGAC
CAGAGAGCTCTGAATTATCCTCAACCTTTGTCAGTGTCTTTCATATCTTGGGATTTTCAT
GTGTCTTTGTATGACTTGTGAACCAAAACGTCAACCTTTTTCACTGCTTCCTCTTTTCTC
ACTACTGTATTCTATAATTCCATTTGCTGCCAAGCCTGCCATGATGGGG*TCTGTTGGTT
AGAAGAAACCTTGTCTGTGTATAGTTAGTCAAAGATACAAGTCAGCGAAAAGATTAAGGC
TGTCATTTTGT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2AO48TF 671 0 0
GAAAAA
GAGGGAGAGAGAATCCCCCACCCGAAATTCGACGAGGAAGATGATGACGCGGTGGTTCCG
AGGAAGCACTGTTTCTAAGATGGGGAGAAGAAATCGTGATTTTTCATCCGTGAGCGAGAA
AGATGTGCCAATGGGAGATTTGGAGCTGTTTGTGAACAACGTGGCTGGTCTTTGCTTTAA
AGGGGTCTCGGGTGTTGTTGGATTCATGATCGCTGGTTTGACAGCTCCTGGGGTTTCAGA
GAATGTTAAGAACGACGAAGAGATGCTCATACACTTGAAACAAAACAATGATAAACGCGA
AGTGAATATGGAGCAAATGCGGATAAACCAGCTGGAAAGGAATCGCAAATACTTGTCAAG
GAAAAGATCATATGCCTCCTATCAAGGGACAGATTAGCTCCATCTGATGATGACCAGAGA
GCTCTGAATTATCCTCAACCTTTGTCAGTGTCTTTCATATCTTGGGATTTTCATGTGTCT
TTGTATGACTTGTGAACCAAAACGTCAACCTTTTTCACTGCTTCCTCTTTTCTCACTACT
GTATTCTATAATTCCATTTGCTGCCAAGCCTGCCATGATGGGGGTCTGTTGGTTAGAAGA
AACCTTGTCTGTGTATAGTTAGTCAAAGATACAAGTCAGCGAAAAGATTAAGGCTGTCAT
TTTGT

QA 7 671 7 671
DS 



AS 1 3

CO CL3640Contig1 620 3 2 U
GGATTACAAAACATTGTCTTCATCTGAAGTTTCTCTTCTACAACTTTCCCTGAAAAACAG
GAATTTCACAAAACCCAATCTCGAGAAAAATGCATGATTTCTGCTTCACAATCCCGTACG
GGATGCTTCTAATCGGCGGTGGGTTCATAGGGTACATGAAGAAAGGAAGTATTACATCTT
TCGCCGGAGGTGCAGGCACTGGGTTACTACTCATCCTCGCTGGATATCTCAGTCTCAAAG
CTTTCGAGAAGAAGAAGAATTCATCCATCGCTGTTGTTCTTCAGACAGTTATCTCAGCTG
CCCTCACACTAGTCATGGGACAGCGTTACTTGCTCACTCAAAAGGTTATGCCAGCTGGTC
TAGTTGCTGGGATCAGTGCCCTCATGACCTGTTTTTACGTATACAAGATCGCTACTGGTG
GCAATAAAATCCCATCAAAATCTGAATGATGGTTGTGCAACTATGCTTTTTTTTCCCTTT
TCTTTTGGATTATAAATATCTTATGTGTTTCTGAGATTATTTTGTATTAGTTGTAGAAAG
AACTTCATATAGTCATATGTGTTCTGAGATAGTTTCTTGTCATCGTCTTATTGTTAATAA
CAAACTGTTTTTGAGTCACG


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DN32TF U 1
AF RR2AC76JQ C 4
AF RR2AC76TF U 4
BS 1 231 RR2DN32TF
BS 232 620 RR2AC76TF

RD RR2DN32TF 242 0 0
GGATTACAAAACATTGTCTTCATCTGAAGTTTCTCTTCTACAACTTTCCCTGAAAAACAG
GAATTTCACAAAACCCAATCTCGAGAAAAATGCATGATTTCTGCTTCACAATCCCGTACG
GGATGCTTCTAATCGGCGGTGGGTTCATAGGGTACATGAAGAAAGGAAGTATTACATCTT
TCGCCGGAGGTGCAGGCACTGGGTTACTACTCATCCTCGCTGGATATCTCA
TCTCAAGCTTT

QA 1 231 1 231
DS 

RD RR2AC76JQ 617 0 0
GG
ACAAAACATTGTCTTCATCTGAAGTTTCTCTTCTACAACTTTCCCTGAAAAACAGGAATT
TCACAAAACCCAATCTCGAGAAAAATGCATGATTTTTGCTTCACAATCCCGTACGGGATG
CTTCTAATCGGCGGTGGGTTCATAGGGTACATGAAGAAAGGAAGTATTACATCTTTCGCC
GGAGGTGCAGGCACTGGGTTACTACTCATCCTCGCTGGATATCTCAGTCTCAAAGCTTTC
GAGAAGAAGAAGAATTCATCCATCGCTGTTGTTCTTCAGACAGTTATTTCAGCTGCCCTC
ACACTAGTCATGGGACAGCGTTACTTGCTCACTCAAAAGGTTATGCCAGCTGGTCTAGTT
GCTGGGATCAGTGCCCTCATGACCTGTTTTTACGTATACAAGATCGCTACTGGTGGCAAT
AAAATCCCATCAAAATCTGAATGATGGTTGTGCAACTATGCTTTTTTTTCCCTTTTCTTT
TGGATTATAAATATCTTATGTGTTTCTGAGATTATTTTGTATTAGTTGTAGAAAGAACTT
CATATAGTCATATGTGTTCTGAGATAGTTTCTTGTCATCGTCTTATTGTTAATAACAAAC
TGTTTTTGAGTCACG

QA 3 617 3 617
DS 

RD RR2AC76TF 617 0 0
GG
ACAAAACATTGTCTTCATCTGAAGTTTCTCTTCTACAACTTTCCCTGAAAAACAGGAATT
TCACAAAACCCAATCTCGAGAAAAATGCATGATTTCTGCTTCACAATCCCGTACGGGATG
CTTCTAATCGGCGGTGGGTTCATAGGGTACATGAAGAAAGGAAGTATTACATCTTTCGCC
GGAGGTGCAGGCACTGGGTTACTACTCATCCTCGCTGGATATCTCAGTCTCAAAGCTTTC
GAGAAGAAGAAGAATTCATCCATCGCTGTTGTTCTTCAGACAGTTATCTCAGCTGCCCTC
ACACTAGTCATGGGACAGCGTTACTTGCTCACTCAAAAGGTTATGCCAGCTGGTCTAGTT
GCTGGGATCAGTGCCCTCATGACCTGTTTTTACGTATACAAGATCGCTACTGGTGGCAAT
AAAATCCCATCAAAATCTGAATGATGGTTGTGCAACTATGCTTTTTTTTCCCTTTTCTTT
TGGATTATAAATATCTTATGTGTTTCTGAGATTATTTTGTATTAGTTGTAGAAAGAACTT
CATATAGTCATATGTGTTCTGAGATAGTTTCTTGTCATCGTCTTATTGTTAATAACAAAC
TGTTTTTGAGTCACG

QA 3 617 3 617
DS 



AS 1 2

CO CL3641Contig1 1066 2 6 U
CGGAAAAGGGAAAGAAGTTGCATTAAGAGTATCCAGCAAAATGATACAATCTTGTAGCTC
AAAAGGAAAACAAAGAAGAAACAAGAGTTTTAAACTGCAACAAGATCAGGTGTCTTAGCC
TCAACGGACAACAAGGTCGTGTGAACCTTATCAACCCAGCTATCTAGCTGATCCCTCAAT
GACTTGATCTGCGGTATCCCTAGCACCCTCGGTTGCGCCCATGACACATGCACCGTTCCA
TCCACCTGGTCTATTATTCCCTCTATCAAGTGCACGGATAAGCTCTTCATGAGAAGGTGC
TCAACATCTTCGATTGAGAGCTTAGTACGCTCAGCAATGACACTCAATGGTATGGTCCTA
TCTTCAGCTGGTCGGCTAAAAATGATCTCAATAAGGCAGAGAATGTTGATCTTCTCCAAC
AGCTTCTTCTCATTCTCAACCAATGCCGGCTGTGCGCTCAAGGCTGCATTGTGAACACGG
CAGAGTTCTTGGTACTGAACCAAATCACCGTGGTTGAACGCCTGTAGAATGTGGTAAAGC
CACTCCACATTTGTTCCAAGCAGACTCTTCAGAACTGGATGGGCTAACAGTTCCCCAAAG
TTGTAAATATTCTCTCCCAATAGAGCTGACAGCGACAGATCAAAAGCCAAGTCCAGCTTA
AACGATTCAGAGAGTGACTCCACAGAAGTATACGCAAGATAAAGAAGAGCATTCTTGTAG
AAATCAGAAAACTCCTGACGGAACTTATGGTACTGAGAAGACACCCAGAAGAAGTTGGCA
TACACCGACGGATCGATATCGGTCATACTATCGAGAGAGCTTTTAACATCGTCTAGTATC
TTCTTGCACTCCTTCTGGTCACCTTGCTCAAGCTTGAACAAAGCTATCTGCGTTTCTACA
TAGCTAACCGGCTCACTGATGCGTGACTCCTTAGTCGCTCTAAGCTTCTCAATCACTCCT
TGGAGATAACTAACCGCAGCTTTTCTCAGGGTACTGCCTGGAGACAACGACCGCGAAGTG
GGCTAGCTTCAGGAGGTTGATCTTGGTCTCGAAGTCGGTTATGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS08JQ U 1
AF RR2DB67TF C 285
BS 1 416 RR2DS08JQ
BS 417 417 RR2DB67TF
BS 418 605 RR2DS08JQ
BS 606 606 RR2DB67TF
BS 607 619 RR2DS08JQ
BS 620 1066 RR2DB67TF

RD RR2DS08JQ 619 0 0
CGGAAAAGGGAAAGAAGTTGCATTAAGAGTATCCAGCAAAATGATACAATCTTGTAGCTC
AAAAGGAAAACAAAGAAGAAACAAGAGTTTTAAACTGCAACAAGATCAGGTGTCTTAGCC
TCAACGGACAACAAGGTCGTGTGAACCTTATCAACCCAGCTATCTAGCTGATCCCTCAAT
GACTTGATCTGCGGTATCCCTAGCACCCTCGGTTGCGCCCATGACACATGCACCGTTCCA
TCCACCTGGTCTATTATTCCCTCTATCAAGTGCACGGATAAGCTCTTCATGAGAAGGTGC
TCAACATCTTCGATTGAGAGCTTAGTACGCTCAGCAATGACACTCAATGGTATGGTCCTA
TCTTCAGCTGGTCGGCTAAAAATGATCTCAATAAGGCAGAGAATGTTGATCTTCTCTAAC
AGCTTCTTCTCATTCTCAACCAATGCCGGCTGTGCGCTCAAGGCTGCATTGTGAACACGG
CAGAGTTCTTGGTACTGAACCAAATCACCGTGGTTGAACGCCTGTAGAATGTGGTAAAGC
CACTCCACATTTGTTCCAAGCAGACTCTTCAGAACTGGATGGGCTAACAGTTCCCCAAAG
TTGTAGATATTCTCTCCCA

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2DB67TF 782 0 0
CTTCATGAGAAGGTGCTCAACATCTTCGATTGAGAGCTTAGTACGCTCAGCAATGACACT
CAATGGTATG*TCCTATCTTCAGCTGGTCGGCTGAAAATGATCTCAATAAGGCAGAGAAT
GTTGATCTTCTCCAACAGCTTCTTCTCATTCTCAACCAATGCTGGCTGTGCGCTCAAGGC
TGCATTGTGAACACGGCAGAGTTCTTGGTGCTGAACCAAATCACCGTGGTTGAACGCCTG
TAGAATGTGGTAAAGCCACTCCACATTTGTTCCAAGCAGACTCTTCAGAACTGGATGGGC
TAACAGTTCCCCAAAGTTGTAAATATTCTCTCCCAATAGAGCTGACAGCGACAGATCAAA
AGCCAAGTCCAGCTTAAACGATTCAGAGAGTGACTCCACAGAAGTATACGCAAGATAAAG
AAGAGCATTCTTGTAGAAATCAGAAAACTCCTGACGGAACTTATGGTACTGAGAAGACAC
CCAGAAGAAGTTGGCATACACCGACGGATCGATATCGGTCATACTATCGAGAGAGCTTTT
AACATCGTCTAGTATCTTCTTGCACTCCTTCTGGTCACCTTGCTCAAGCTTGAACAAAGC
TATCTGCGTTTCTACATAGCTAACCGGCTCACTGATGCGTGACTCCTTAGTCGCTCTAAG
CTTCTCAATCACTCCTTGGAGATAACTAACCGCAGCTTTTCTCAGGGTACTGCCTGGAGA
CAACGACCGCGAAGTGGGCTAGCTTCAGGAGGTTGATCTTGGTCTCGAAGTCGGTTATGA
AC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL3642Contig1 806 2 15 U
AGAGAATTACAGGTTGACCCATGGGGGAGCTCGGCATAAGGGTGTTTTCTCAAGGGTTGA
ATATCAATCTAGACGATCTATCAGTGGTTCATCCTCTTTCAATTCGCTCCTTGCAGTACT
TCCTCCCAGAGTTAACTCTGTCTACTACAGGGATGACATTGGAAACATCTCAACTTCCCA
TTTGCGTACAGGCTTTAAGAAGTCAGAACTTGAATTTGAACCGCGATACCCATTATTTGG
AGGATGGAGAGCAACCTTTGTCATCAGCTATCGAGTCCCATTGGAGGACTACCTTTTTGA
AGCACCCGATGGCAGACGTTACTTGAACTTTACCTTTGGCTGTCCGCTCGTTGAAACTAT
AGTTAACAAGTCGACTCTCAAAGTCGTGCTCCCTGAAGGATCAAAGGACCCTTCTGCTGT
TTTGCCCTTCACAGTGAATCAAGACTTACAGGTCAAATACTCATACCTTGACATCGTGGG
GAGAACCGTGGTTGTGTTGCAAAAGGATAATGTAGTTCCTACTCACAACGTACCTTTCCA
GGTGTACTATACGTTCAAACCAATATACATGCTTGCGGAACCACTCATGCTTGTATCAGC
CTTCTTCTTTGTCTTTGTTGCTTCTCTTGCGTATGTACACATCGATCTCAATATCGTCAA
GAAGTAGACATCTCAGAGAAAAGTCCTTCGCTTACATTTAATAGAGTCCTAAAAGATATA
GACGTTTTATAATGACTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTGTTAAAAACAAAAGAGTTTTGTA
GTTGATCTTTTTACTCTATAACACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H567TF U 33
AF RR2BJ64JQ C 1
BS 1 32 RR2BJ64JQ
BS 33 243 RR2H567TF
BS 244 244 RR2BJ64JQ
BS 245 265 RR2H567TF
BS 266 266 RR2BJ64JQ
BS 267 371 RR2H567TF
BS 372 372 RR2BJ64JQ
BS 373 640 RR2H567TF
BS 641 641 RR2BJ64JQ
BS 642 649 RR2H567TF
BS 650 650 RR2BJ64JQ
BS 651 713 RR2H567TF
BS 714 714 RR2BJ64JQ
BS 715 735 RR2H567TF
BS 736 806 RR2BJ64JQ

RD RR2H567TF 703 0 0
GGCATAAGGGTGTTTTCTCAAGGGTTGAATATCAATCTAGACGATCTATCAGTGGTTCAT
CCTCTTTCAATTCGCTCCTTGCAGTACTTCCTCCCAGAGTTAACTCTGTCTACTACAGGG
ATGACATTGGAAACATCTCAACTTCCCATTTGCGTACAGGCTTTAAGAAGTCAGAACTTG
AATTTGAACCGCGATACCCATTATTTGGAGGGTGGAGAGCAACCTTTGTCATCGGCTATC
GAGTCCCATTGGAGGACTACCTTTTTGAAGCACCCGATGGCAGACGTTACTTGAACTTTA
CCTTTGGCTGTCCGCTCGTTGAAACTATAGTTAACAAGTTGACTCTCAAAGTCGTGCTCC
CTGAAGGATCAAAGGACCCTTCTGCTGTTTTGCCCTTCACAGTGAATCAAGACTTACAGG
TCAAATACTCATACCTTGACATCGTGGGGAGAACCGTGGTTGTGTTGCAAAAGGATAATG
TAGTTCCTACTCACAACGTACCTTTCCAGGTGTACTATACGTTCAAACCAATATACATGC
TTGCGGAACCACTCATGCTTGTATCAGCCTTCTTCTTTGTCTTTGTTGCTTCTCTTGCGT
ATGTACACGTCGATCTCCATATCGTCAAGAAGTAGACATCTCAGAGAAAAGTCCTTCGCT
TACATTTAATAGAGTCCTAAA*GATATAGACGTTTTATAATGA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2BJ64JQ 806 0 0
AGAGAATTACAGGTTGACCCATGGGGGAGCTCGGCATAAGGGTGTTTTCTCAAGGGTTGA
ATATCAATCTAGACGATCTATCAGTGGTTCATCCTCTTTCAATTCGCTCCTTGCAGTACT
TCCTCCCAGAGTTAACTCTGTCTACTACAGGGATGACATTGGAAACATCTCAACTTCCCA
TTTGCGTACAGGCTTTAAGAAGTCAGAACTTGAATTTGAACCGCGATACCCATTATTTGG
AGGATGGAGAGCAACCTTTGTCATCAGCTATCGAGTCCCATTGGAGGACTACCTTTTTGA
AGCACCCGATGGCAGACGTTACTTGAACTTTACCTTTGGCTGTCCGCTCGTTGAAACTAT
AGTTAACAAGTCGACTCTCAAAGTCGTGCTCCCTGAAGGATCAAAGGACCCTTCTGCTGT
TTTGCCCTTCACAGTGAATCAAGACTTACAGGTCAAATACTCATACCTTGACATCGTGGG
GAGAACCGTGGTTGTGTTGCAAAAGGATAATGTAGTTCCTACTCACAACGTACCTTTCCA
GGTGTACTATACGTTCAAACCAATATACATGCTTGCGGAACCACTCATGCTTGTATCAGC
CTTCTTCTTTGTCTTTGTTGCTTCTCTTGCGTATGTACACATCGATCTCAATCTCGTCAA
GAAGTAGACATCTCAGAGAAAAGTCCTTCGCTTACATTTAATAGAGTCCTAAAAGATATA
GACGTTTTATAATGACTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTGTTAAAAACAAAAGAGTTTTGTA
GTTGATCTTTTTACTCTATAACACAC

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 3

CO CL3643Contig1 800 3 4 U
GGGTGAGGGGAAGGACTGAGATGAAGAGGATAGAAAACGCAACGAGTAGGCAAGTGACCT
TTTCCAAGAGAAGAAATGGACTTTTGAAGAAAGCTTTCGAGTTATCAGTCCTTTGTGATG
CTGAAGTTGCTTTAATCATCTTCTCTCCAACATCCAAACTCTATGAGTTCTCTAGCTGTA
GTATAGCGAAAACAATAGATCGATATCAGAAACGAGTCAAAGAAATTGGAACTAGTAAGA
GAGATGCTGATCATTCCCAGCAAGCAAGAGGCGAAACATATGGATTGACAAAAAAGATTG
AGCAGCTTGGAATATCTAAACGAAAATTGCTCGGAGAAGGTATTGATGTATGTTCTATTG
AAGAGCTACACCAGTTAGAAAATCAGTTGGAGCGAGGCTTGACCAGGATAAGAGCAAAGA
AGTACCAATTACTCCGTGAAGAAATTGAGAAGTTGAAGGAAGAGGAGATGAATCTTATTA
AGGAAAATAAAGAACTGAATGAAAAGTTGAGTGGAACGGGAGCAATAGTAGTAGCATCAT
CATCATCAACTTTAACATCATCAGAAGTGAACACTGATGGCAATGACAATACGGAAGTGG
AGACTGGTTTGTTCATTGGACCTCCTGAGCCAAGACAAACCAAGAAAATCTATCCTCAAA
GTTAATCTCAGAACTTAAAAAAAGAATGCTATTTAAGAACTTTTTGTTTTTATATTTTCT
TTCAAAATATCAGAGATGCCAATAAATTGTGAACATATGTGG*TAATTTGTTCTTAATCT
GGGAGATCTCTAAGCTTAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH76JQ C 1
AF RR2BH76TF U 1
AF RR2A080TF U 122
BS 1 726 RR2BH76TF
BS 727 727 RR2A080TF
BS 728 775 RR2BH76TF
BS 776 800 RR2A080TF

RD RR2BH76JQ 775 0 0
GGGTGAGGGGAAGGACTGAGATGAAGAGGATAGAAAACGCAACGAGTAGGCAAGTGACCT
TTTCCAAGAGAAGAAATGGACTTTTGAAGAAAGCTTTCGAGTTATCAGTCCTTTGTGATG
CTGAAGTTGCTTTAATCATCTTCTCTCCAACATCCAAACTCTATGAGTTCTCTAGCTGTA
GTATAGCGAAAACAATAGATCGATATCAGAAACGAGTCAAAGAAATTGGAACTAGTAAGA
GAGATGCTGATCATTCCCAGCAAGCAAGAGGCGAAACATATGGATTGACAAAAAAGATTG
AGCAGCTTGGAATATCTAAACGAAAATTGCTCGGAGAAGGTATTGATGTATGTTCTATTG
AAGAGCTACACCAGTTAGAAAATCAGTTGGAGCGAGGCTTGACCAGGATAAGAGCAAAGA
AGTACCAATTACTCCGTGAAGAAATTGAGAAGTTGAAGGAAGAGGAGATGAATCTTATTA
AGGAAAATAAAGAACTGAATGAAAAGTTGAGTGGAACGGGAGCAATAGTAGTAGCATCAT
CATCATCAACTTTAACATCATCAGAAGTGAACACTGATGGCAATGACAATACGGAAGTGG
AGACTGGTTTGTTCATTGGACCTCCTGAGCCAAGACAAACCAAGAAAATCTATCCTCAAA
GTTAATCTCAGAACTTAAAAAAAGAATGCTATTTAAGAACTTTTTGTTTTTATATTTTCT
TTCAAAATATCAGAGATGCCAATAAATTGTGAACATATGTGG*TAATTTGTTCTT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2BH76TF 775 0 0
GGGTGAGGGGAAGGACTGAGATGAAGAGGATAGAAAACGCAACGAGTAGGCAAGTGACCT
TTTCCAAGAGAAGAAATGGACTTTTGAAGAAAGCTTTCGAGTTATCAGTCCTTTGTGATG
CTGAAGTTGCTTTAATCATCTTCTCTCCAACATCCAAACTCTATGAGTTCTCTAGCTGTA
GTATAGCGAAAACAATAGATCGATATCAGAAACGAGTCAAAGAAATTGGAACTAGTAAGA
GAGATGCTGATCATTCCCAGCAAGCAAGAGGCGAAACATATGGATTGACAAAAAAGATTG
AGCAGCTTGGAATATCTAAACGAAAATTGCTCGGAGAAGGTATTGATGTATGTTCTATTG
AAGAGCTACACCAGTTAGAAAATCAGTTGGAGCGAGGCTTGACCAGGATAAGAGCAAAGA
AGTACCAATTACTCCGTGAAGAAATTGAGAAGTTGAAGGAAGAGGAGATGAATCTTATTA
AGGAAAATAAAGAACTGAATGAAAAGTTGAGTGGAACGGGAGCAATAGTAGTAGCATCAT
CATCATCAACTTTAACATCATCAGAAGTGAACACTGATGGCAATGACAATACGGAAGTGG
AGACTGGTTTGTTCATTGGACCTCCTGAGCCAAGACAAACCAAGAAAATCTATCCTCAAA
GTTAATCTCAGAACTTAAAAAAAGAATGCTATTTAAGAACTTTTTGTTTTTATATTTTCT
TTCAAA*TATCAGAGATGCCAATAAATTGTGAACATATGTGG*TAATTTGTTCTT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2A080TF 679 0 0
TGAAGTTGCTTTAATCATCTTCTCTCCAACATCCAAACTCTATGAGTTCTCTAGCTGTAG
TATAGCGAAAACAATAGATCGATATCAGAAACGAGTCAAAGAAATTGGAACTAGTAAGAG
AGATGCTGATCATTCCCAGCAAGCAAGAGGCGAAACATATGGATTGACAAAAAAGATTGA
GCAGCTTGGAATATCTAAACGAAAATTGCTCGGAGAAGGTATTGATGTATGTTCTATTGA
AGAGCTACACCAGTTAGAAAATCAGTTGGAGCGAGGCTTGACCAGGATAAGAGCAAAGAA
GTACCAATTACTCCGTGAAGAAATTGAGAAGTTGAAGGAAGAGGAGATGAATCTTATTAA
GGAAAATAAAGAACTAAATGAAAAGTTGAGTGGAACGGGAGCAATAGTAGTAGCATCATC
ATCATCAACTTTAACATCATCAGAAGTGAACACTGATGGCAATGACAATATGGAAGTGGA
GACTGGTTTGTTCATTGGACCTCCTGAGCCAAGACAAACCAAGAAAATCTATCCTCAAAG
TTAATCTCAGAACTTAAAAAAAGAATGCTATTTAAGAACTTTTTGTTTTTATATTTTCTT
TCAAAATATCAGAGATGTCAATAAATTGTGAACATATGTGGGTAATTTGTTCTTAATCTG
GGAGATCTCTAAGCTTAGC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 3

CO CL3644Contig1 556 3 3 U
GGACGGAGGAGTCGCATTAGGAAGCATCAGCAAAAATGGCGGTTCCGTTGCTTACGAAGA
AGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGTAGAATAACCG
TCAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGATTCCAGGGTCAGAAGGAAGTTCAAAG
GTGTGACGTTGATGCCCAATGTCGGTTACGGATCCGACAAGAAGACACGTCACTATCTGC
CCAATGGATTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACAAGAGTGATCTGGAGTTGTTGATGATGC
ACAACAGGACTTACTGCGCGGAGATTGCTCACAACGTCTCTACCAAGAAGAGGAAGGCTA
TTGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTAGACATTGTTGTTACCAACAGGCTTGCTAGGCTCCGTA
GCCAGGAAGACGAGTGAAGAAGACTAGACCACTTGAGAGAGATATCTTATTGTTTCTGGT
TTGTTACTCTGTTTTGTGTTTAACAAACATGAGTTTTGGTTTTCAGACCGTTTCTTGGAT
TATTTCTTATTTCAGT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DE06TF U 1
AF RR2EF32JQ C 1
AF RR2B958TF U 1
BS 1 273 RR2B958TF
BS 274 274 RR2EF32JQ
BS 275 556 RR2B958TF

RD RR2DE06TF 217 0 0
GGACGGAGGAGTCGCATTAGGAAGCATCAGCAAAAATGGCGGTTCCGTTGCTTACGAAGA
AGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGTAGAATAACCG
TCAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGATTCCAGGGTCAGAAGGAAGTTCAAAG
GTGTGACGTTGATGCCCAATGTCGGTTACGGATCCGA

QA 1 217 1 217
DS 

RD RR2EF32JQ 469 0 0
GGACGGAGGAGTCGCATTAGGAAGCATCAGTAAAAATGGCGGTTCCGTTGCTTACGAAGA
AGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGTAGAATAACCG
TCAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGATTCCAGGGTCAGAAGGAAGTTCAAAG
GTGTGACGTTGATGCCCAATGTCGGTTACGGATCCGACAAGAAGACACGTCACTATCTGC
CCAATGGATTCAAGAAGTTTGTTGTTCACAACAAGAGTGATCTGGAGTTGTTGATGATGC
ACAACAGGACTTACTGCGCGGAGATTGCTCACAACGTCTCTACCAAGAAGAGGAAGGTTA
TTGTCGAGAGAGCTTTTCAGCTAGACATTGTTGTTACCAACAGGCTTGCTAGGCTCCGTA
GCCAGGAAGACGAGTGAAGAAGACTAGACCACTTGAGAGAGATATCTTA

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR2B958TF 556 0 0
GGACGGAGGAGTCGCATTAGGAAGCATCAGCAAAAATGGCGGTTCCGTTGCTTACGAAGA
AGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGTAGAATAACCG
TCAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGATTCCAGGGTCAGAAGGAAGTTCAAAG
GTGTGACGTTGATGCCCAATGTCGGTTACGGATCCGACAAGAAGACACGTCACTATCTGC
CCAATGGATTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGATCTGGAGTTGTTGATGATGC
ACAACAGGACTTACTGCGCGGAGATTGCTCACAACGTCTCTACCAAGAAGAGGAAGGCTA
TTGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTAGACATTGTTGTTACCAACAGGCTTGCTAGGCTCCGTA
GCCAGGAAGACGAGTGAAGAAGACTAGACCACTTGAGAGAGATATCTTATTGTTTCTGGT
TTGTTACTCTGTTTTGTGTTTAACAAACATGAGTTTTGGTTTTCAGACCGTTTCTTGGAT
TATTTCTTATTTCAGT

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 2

CO CL3645Contig1 641 2 2 U
TTTTTTCCGACTAATAATAGGAGCAAAGAAGGAAAACGAGACCCTAGCTGAGTGGTGTGA
GTGAGAGCGAGAAACATGGAAGGAGTTGAGCTGGAACTAGAGAGAAGAAGCAAGTACTTG
AACAGCTTGATACAGCAGAAGAAGAAGACTAAAGAGGAGCAGGACCAGAAAGACGAGTTC
AATGTCCGAGTTCGAGCATCCGACATGCCTCTGTCAGTGCAAAACAGAGCCTTCAGTTTG
TCCCGTGAGCTCTTGAATGCTACTTCTGGAAAGGCCGACAACAAACGACTCGCTCTCGCC
CTTAAAAAGGACTTCGATTCTGCCTATGGCCCTGCATGGCACTGCATTGTTGGGACCAGC
TTTGGTTCATACGTGACTCATTCCGTTGGAGGATTCATATATTTCCAGATCGACAAGGTT
TATGTTCTTCTATTCAAGACTGCTGTGGAACCTTTAGACCACCAATAAGAATGTTGATCA
TGTATTATTTATTCACTCTATTTATTTTCAAGTTTGATGTGTTAGTCAATCTCCTAGACG
AAAATCTTTGATGCAAATCAAGAATAGGTTTGTGATTCGTGTTGTGTAATTACAAATGAA
CTTTGATAAGTATGTTCTTTAGAAACTTCTCTTTTCTGGGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2BV36JQ C 1
AF RR2BV36TF U 1
BS 1 639 RR2BV36TF
BS 640 641 RR2BV36JQ

RD RR2BV36JQ 641 0 0
TTTTTTCCGACTAATAATAGGAGCAAAGAAGGAAAACGAGACCCTAGCTGAGTGGTGTGA
GTGAGAGCGAGAAACATGGAAGGAGTTGAGCTGGAACTAGAGAGAAGAAGCAAGTACTTG
AACAGCTTGATACAGCAGAAGAAGAAGACTAAAGAGGAGCAGGACCAGAAAGACGAGTTC
AATGTCCGAGTTCGAGCATCCGACATGCCTCTGTCAGTGCAAAACAGAGCCTTCAGTTTG
TCCCGTGAGCTCTTGAATGCTACTTCTGGAAAGGCCGACAACAAACGACTCGCTCTCGCC
CTTAAAAAGGACTTCGATTCTGCCTATGGCCCTGCATGGCACTGCATTGTTGGGACCAGC
TTTGGTTCATACGTGACTCATTCCGTTGGAGGATTCATATATTTCCAGATCGACAAGGTT
TATGTTCTTCTATTCAAGACTGCTGTGGAACCTTTAGACCACCAATAAGAATGTTGATCA
TGTATTATTTATTCACTCTATTTATTTTCAAGTTTGATGTGTTAGTCAATCTCCTAGACG
AAAATCTTTGATGCAAATCAAGAATAGGTTTGTGATTCGTGTTGTGTAATTACAAATGAA
CTTTGATAAGTATGTTCTTTAGAAACTTCTCTTTTCTGGGT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2BV36TF 641 0 0
TTTTTTCCGACTAATAATAGGAGCAAAGAAGGAAAACGAGACCCTAGCTGAGTGGTGTGA
GTGAGAGCGAGAAACATGGAAGGAGTTGAGCTGGAACTAGAGAGAAGAAGCAAGTACTTG
AACAGCTTGATACAGCAGAAGAAGAAGACTAAAGAGGAGCAGGACCAGAAAGACGAGTTC
AATGTCCGAGTTCGAGCATCCGACATGCCTCTGTCAGTGCAAAACAGAGCCTTCAGTTTG
TCCCGTGAGCTCTTGAATGCTACTTCTGGAAAGGCCGACAACAAACGACTCGCTCTCGCC
CTTAAAAAGGACTTCGATTCTGCCTATGGCCCTGCATGGCACTGCATTGTTGGGACCAGC
TTTGGTTCATACGTGACTCATTCCGTTGGAGGATTCATATATTTCCAGATCGACAAGGTT
TATGTTCTTCTATTCAAGACTGCTGTGGAACCTTTAGACCACCAATAAGAATGTTGATCA
TGTATTATTTATTCACTCTATTTATTTTCAAGTTTGATGTGTTAGTCAATCTCCTAGACG
AAAATCTTTGATGCAAATCAAGAATAGGTTTGTGATTCGTGTTGTGTAATTACAAATGAA
CTTTGATAAGTATGTTCTTTAGAAACTTCTCTTTTCTGG
GT

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 3

CO CL3646Contig1 746 3 6 U
GAAGTCAGTTCCGTGGCCGTAGCTTAACCTATGACCCGATTTTTCTGTCGGGTCTCGTCG
GAACCGGTTTGGTGGCTGCAACGTTCATGGCGGGAGGAGGACCTGGTAGTACTGCTATGG
CTGCGGTTGATTCTCTTCAGCTAAGCGAACCGGCTAATGCGTTGTCTTTACCCACTTGGG
CTGTTCATGTTTCCAGCGTCGTCGAATGGATTACGGCGATGGCGTTGGTGTGGAAATATG
GAGAAAGAAAGGGTTATGAGTCATGGAAAGGTCTCTCATGGGGAATGGTGCCTTTGCTTG
GTGGAGCTCTTTGCGCATGCACATGGCATTTCTTTACAATGCTGAATCTCTTGAGGTGCT
GGTCGCGCTTCAGGGAGCACTAACTGTGATTGGTAATATTACTTTGTGCATCGCTGCCTT
TAGGATCAACAAGTCTGCATCCAAAATGGAAACCTCTGAAAAGCCGTGAGGGTGCTAAAC
ACACATGCATCTTTGTGTTTAAAATAAGGTCAAGGGGATGATATGTTTTCAATAGTTTCT
GAAGGAATCCGAGTGTAGCGTTCTTGGAGAGTCGTGAGTTAGAGAAGCAATTAGCTCTTT
GGATGTGGTATTACCGGAAAGATGATTGTTTTATATCTCTTGATTGCTCTAAACATGTTT
CTTGAGCGTGTGTGTATATCGCGTGTGTGTATATCTATATTATTAGAAGTATCAAAATCC
CAATAAATTACTCTCATTTTTCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU45TF U 72
AF RR2DJ80TF U 1
AF RR2CU45JQ C 286
BS 1 716 RR2DJ80TF
BS 717 717 RR2CU45JQ
BS 718 722 RR2DJ80TF
BS 723 723 RR2CU45JQ
BS 724 740 RR2DJ80TF
BS 741 746 RR2CU45JQ

RD RR2CU45TF 636 0 0
GTGGCTGCAACGTTCATGGCGGGAGGAGGACCTGGTAGTACTGCTATGGCTGCGGTTGAT
TCTCTTCAGCTAAGCGAACCGGCTAATGCGTTGTCTTTACCCACTTGGGCTGTTCATGTT
TCCAGCGTCGTCGAATGGATTACGGCGATGGCGTTGGTGTGGAAATATGGAGAAAGAAAG
GGTTATGAGTCATGGAAAGGTCTCTCATGGGGAATGGTGCCTTTGCTTGGTGGAGCTCTT
TGCGCATGCACATGGCATTTCTTTACAATGCTGAATCTCTTGAGGTGCTGGTCGCGCTTC
AGGGAGCACTAACTGTGATTGGTAATATTACTTTGTGCATCGCTGCCTTTAGGATCAACA
AGTCTGCATCCAAAATGGAAACCTCTGAAAAGCCGTGAGGGTGCTAAACACACATGCATC
TTTGTGTTTAAAATAAGGTCAAGGGGATGATATGTTTTCAATAGTTTCTGAAGGAATCCG
AGTGTAGCGTTCTTGGAGAGTCGTGAGTTAGAGAAGCAATTAGCTCTTTGGATGTGGTAT
TACCGGAAAGATGATTGTTTTATATCTCTTGATTGCTCTAAACATGTTTCTTGAGCGTGT
GTGTATATCGCGTGTGTGTATATCTATATTATTAGA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2DJ80TF 740 0 0
GAAGTCAGTTCCGTGGCCGTAGCTTAACCTATGACCCGATTTTTCTGTCGGGTCTCGTCG
GAACCGGTTTGGTGGCTGCAACGTTCATGGCGGGAGGAGGACCTGGTAGTACTGCTATGG
CTGCGGTTGATTCTCTTCAGCTAAGCGAACCGGCTAATGCGTTGTCTTTACCCACTTGGG
CTGTTCATGTTTCCAGCGTCGTCGAATGGATTACGGCGATGGCGTTGGTGTGGAAATATG
GAGAAAGAAAGGGTTATGAGTCATGGAAAGGTCTCTCATGGGGAATGGTGCCTTTGCTTG
GTGGAGCTCTTTGCGCATGCACATGGCATTTCTTTACAATGCTGAATCTCTTGAGGTGCT
GGTCGCGCTTCAGGGAGCACTAACTGTGATTGGTAATATTACTTTGTGCATCGCTGCCTT
TAGGATCAACAAGTCTGCATCCAAAATGGAAACCTCTGAAAAGCCGTGAGGGTGCTAAAC
ACACATGCATCTTTGTGTTTAAAATAAGGTCAAGGGGATGATATGTTTTCAATAGTTTCT
GAAGGAATCCGAGTGTAGCGTTCTTGGAGAGTCGTGAGTTAGAGAAGCAATTAGCTCTTT
GGATGTGGTATTACCGGAAAGATGATTGTTTTATATCTCTTGATTGCTCTAAACATGTTT
CTTGAGCGTGTGTGTATATCGCGTGTGTGTATATCTATATTATTAGAAGTATCAAA*TCC
CA*TAAATTACTCTCATTTT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2CU45JQ 461 0 0
TGGTGCCTTTGCTTGGTGGAGCTCTTTGCGCATGCACATGGCATTTCTTTACAATGCTGA
ATCTCTTGAGGTGCTGGTCGCGCTTCAGGGAGCACTAACTGTGATTGGTAATATTACTTT
GTGCATCGCTGCCTTTAGGATCAACAAGTCTGCATCCAAAATGGAAACCTCTGAAAAGCC
GTGAGGGTGCTAAACACACATGCATCTTTGTGTTTAAAATAAGGTCAAGGGGATGATATG
TTTTCAATAGTTTCTGAAGGAATCCGAGTGTAGCGTTCTTGGAGAGTCGTGAGTTAGAGA
AGCAATTAGCTCTTTGGATGTGGTATTACCGGAAAGATGATTGTTTTATATCTCTTGATT
GCTCTAAACATGTTTCTTGAGCGTGTGTGTATATCGCGTGTGTGTATATCTATATTATTA
GAAGTATCAAAATCCCAATAAATTACTCTCATTTTTCAACC

QA 1 461 1 461
DS 



AS 1 3

CO CL3647Contig1 703 3 2 U
GATTAAATCAAATCCATTTTACAAGAATATATCATTCACTCACAGTCTAGTCTTGGCACT
CACTTAACAAGCAGCAGCAACAGGTAAAGAGAATATATAAGAAAGAAAAATGATAAGCTG
ATCAATCCATGCTTGCGCAAGTCCTCTCAATCACCTTTGAATCAGTTCTAAAAGACTGCT
TCGATGGAGAGCTTGATCCTCTCGATGAACTCTGATGATTATTCCCAAAGAAGCTTAGTT
TCCCCATCTTCTTTGAGAAGCTGCTCATGAATTTGCGCGAGTGAGACCTCTGCATATCTC
TCTTCATGCACACATGCTCCTTCTCTAGATCGTTGAGTCTCATCCTCAACCTAGTCAACT
CCAGTTTCAGCTCCCTGTTCTCTCTCCTCAGAGACGCGTAGTTGTCTTTTGGTGACATTG
CTGCGCTGAGAGCTCCGCTGTTGATTCTCCATGACTGTTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCT
GCTGCTGCTTTGGCTTTGTCTCTTCGTCTGAGTAAGAAGTGCACAAGGAGCTTCTGAGCT
TAAGCTGCTCAAAGTAGAGAACCTGAACTATTGACTGCAGAGGAAGCCGCTCGTTCTGCG
CAGCGTGTGCTCCTGCCTCTTGTGAGAGTTTCTGGAAGTCAATAAGTTTTGACAGCTTCT
TCTTGTCTGAATCTGATATTCCTTGATGTGCCTTAAGATCCCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GX49JQ U 1
AF RR2GX54JQ U 1
AF RR2GX49TF C 65
BS 1 363 RR2GX49JQ
BS 364 703 RR2GX54JQ

RD RR2GX49JQ 363 0 0
GATTAAATCAAATCCATTTTACAAGAATATATCATTCACTCACAGTCTAGTCTTGGCACT
CACTTAACAAGCAGCAGCAACAGGTAAAGAGAATATATAAGAAAGAAAAATGATAAGCTG
ATCAATCCATGCTTGCGCAAGTCCTCTCAATCACCTTTGAATCAGTTCTAAAAGACTGCT
TCGATGGAGAGCTTGATCCTCTCGATGAACTCTGATGATTATTCCCAAAGAAGCTTAGTT
TCCCCATCTTCTTTGAGAAGCTGCTCATGAATTTGCGCGAGTGAGACCTCTGCATATCTC
TCTTCATGCACACATGCTCCTTCTCTAGATCGTTGAGTCTCATCCTCAACCTAGTCAACT
CCA

QA 1 363 1 363
DS 

RD RR2GX54JQ 703 0 0
GATTAAATCAAATCCATTTTACAAGAATATATCATTCACTCACAGTCTAGTCTTGGCACT
CACTTAACAAGCAGCAGCAACAGGTAAAGAGAATATATAAGAAAGAAAAATGATAAGCTG
ATCAATCCATGCTTGCGCAAGTCCTCTCAATCACCTTTGAATCAGTTCTAAAAGACTGCT
TCGATGGAGAGCTTGATCCTCTCGATGAACTCTGATGATTATTCCCAAAGAAGCTTAGTT
TCCCCATCTTCTTTGAGAAGCTGCTCATGAATTTGCGCGAGTGAGACCTCTGCATATCTC
TCTTCATGCACACATGCTCCTTCTCTAGATCGTTGAGTCTCATCCTCAACCTAGTCAACT
CCAGTTTCAGCTCCCTGTTCTCTCTCCTCAGAGACGCGTAGTTGTCTTTTGGTGACATTG
CTGCGCTGAGAGCTCCGCTGTTGATTCTCCATGACTGTTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCT
GCTGCTGCTTTGGCTTTGTCTCTTCGTCTGAGTAAGAAGTGCACAAGGAGCTTCTGAGCT
TAAGCTGCTCAAAGTAGAGAACCTGAACTATTGACTGCAGAGGAAGCCGCTCGTTCTGCG
CAGCGTGTGCTCCTGCCTCTTGTGAGAGTTTCTGGAAGTCAATAAGTTTTGACAGCTTCT
TCTTGTCTGAATCTGATATTCCTTGATGTGCCTTAAGATCCCG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2GX49TF 639 0 0
TAACAAGCAGCAGCAACAGGTAAAGAGAATATATAAGAAAGAAAAATGATAAGCTGATCA
ATCCATGCTTGCGCAAGTCCTCTCAATCACCTTTGAATCAGTTCTAAAAGACTGCTTCGA
TGGAGAGCTTGATCCTCTCGATGAACTCTGATGATTATTCCCAAAGAAGCTTAGTTTCCC
CATCTTCTTTGAGAAGCTGCTCATGAATTTGCGCGAGTGAGACCTCTGCATATCTCTCTT
CATGCACACATGCTCCTTCTCTAGATCGTTGAGTCTCATCCTCAACCTAGTCAACTCCAG
TTTCAGCTCCCTGTTCTCTCTCCTCAGAGACGCGTAGTTGTCTTTTGGTGACATTGCTGC
GCTGAGAGCTCCGCTGTTGATTCTCCATGACTGTTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG
CTGCTTTGGCTTTGTCTCTTCGTCTGAGTAAGAAGTGCACAAGGAGCTTCTGAGCTTAAG
CTGCTCAAAGTAGAGAACCTGAACTATTGACTGCAGAGGAAGCCGCTCGTTCTGCGCAGC
GTGTGCTCCTGCCTCTTGTGAGAGTTTCTGGAAGTCAATAAGTTTTGACAGCTTCTTCTT
GTCTGAATCTGATATTCCTTGATGTGCCTTAAGATCCCG

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 3

CO CL3648Contig1 652 3 22 U
AAAAAAATTGATATTTATTATTTTTCTTGTCAGCAATTGATGTTATCTTACAAAACTCGA
AATCATATAGGTTCGAAGAAATTAAGAGGTAAGGTAATTTTTTTTTTTTTACACAAGATT
GATGAAAGAAACAAAAATGAACATATAAATATAAAAATATTTGTAATAATAAAAGGTTTT
GTGGGAGAATTTTAAAGAATGGTTGAGAAGCTTTCAATAGGATCAGATTCCTCAAGCATG
GAAGCAGCTTGGAAGCAATCAGTAGCATCAGCTATACGTCCATCGTACTTATGAACCAAT
CCTAAGTAATACCAAGCTTTTCTGTTCGTCGGATCGATCCTCAATGCATCAGACAGCAAG
CTTCTCGCCACAGGAAGCGTTGGTTGATGTTCTTTCCCTCTTTCAGACAACAAGGCTCCA
ACCGCTACTTTGCAAGGAACCGATGATTCGTCTAGTAATAAACCGTCCAAGAAAGCTGCT
AACGCTGGTTTAAACTCCTTCCTCCCTTCCCACATTCGACCTTCTGTATGTAGCATTGAA
GCAAAGTACTGTTTCAGCTCGCCAGCTTTCTTTAGACAGACTTCTACATCGTTCCAATGC
GAAAGACTCGAGTAAAGATAAACCAAACCATGCCACACTTCAAACTCGTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC89JQ U 1
AF RR2BC89TF C 27
AF RR2EE14JQ U 53
BS 1 77 RR2BC89JQ
BS 78 78 RR2EE14JQ
BS 79 85 RR2BC89JQ
BS 86 86 RR2EE14JQ
BS 87 94 RR2BC89JQ
BS 95 95 RR2EE14JQ
BS 96 112 RR2BC89JQ
BS 113 113 RR2EE14JQ
BS 114 181 RR2BC89JQ
BS 182 182 RR2EE14JQ
BS 183 186 RR2BC89JQ
BS 187 187 RR2EE14JQ
BS 188 196 RR2BC89JQ
BS 197 197 RR2EE14JQ
BS 198 206 RR2BC89JQ
BS 207 207 RR2EE14JQ
BS 208 225 RR2BC89JQ
BS 226 226 RR2EE14JQ
BS 227 350 RR2BC89JQ
BS 351 543 RR2EE14JQ
BS 544 544 RR2BC89TF
BS 545 652 RR2EE14JQ

RD RR2BC89JQ 350 0 0
AAAAAAATTGATATTTATTATTTTTCTTGTCAGCAATTGATGTTATCTTACAAAACTCGA
AATCATATAGGTTCGAAAAAATTAAAAGGTAAGGGAATTTTTTTTTTTTTACCCAAGATT
GATGAAAGAAACAAAAATGAACATATAAATATAAAAATATTTGTAATAATAAAAGGTTTT
GGGGGAAAATTTTAAAAAATGGTTGAAAAGCTTTCAATAGGATCAAATTCCTCAAGCATG
GAAGCAGCTTGGAAGCAATCAGTAGCATCAGCTATACGTCCATCGTACTTATGAACCAAT
CCTAAGTAATACCAAGCTTTTCTGTTCGTCGGATCGATCCTCAATGCATC

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR2BC89TF 607 0 0
C
TGTCAGCAATTGATGTTATCTTACAAAACTCGAAATCATATAGGTTCGAAGAAATTAAGA
GGTAAGGTAATTTTTTTTTTTTTACACAAGATTGATGAAAGAAACAAAAATGAACATATA
AATATAAAAATATTTGTAATAATAAAAGGTTTTGTGGGAGAATTTTAAAGAATGGTTGAG
AAGCTTTCAATAGGATCAGATTCCTCAAGCATGGAAGCAGCTTGGAAGCAATCAGTAGCA
TCAGCTATACGTCCATCGTACTTATGAACCAATCCTAAGTAATACCAAGCTTTTCTGTTC
GTCGGATCGATCCTCAATGCATCAGACAGCAAGCTTCTCGCCACAGGAAGCGTTGGTTGA
TGTTCTTTCCCTCTTTCAGACAACAAGGCTCCAACCGCTACTTTGCAAGGAACCGATGAT
TCGTCTAGTAATAAACCGTCCAAGAAAGCTGCTAACGCTGGTTTAAACTCCTTCCTCCCT
TCCCACATTCGACCTTCTGTATGTAGCATTGAAGCAAAGTACTGTTTCAGCTCGCCAGCT
TTCTTTAGACAGACTTCTACATCGTTCCAATGCGAAAGACTCGAGTAAAGATAAGCCAAA
CCATGC

QA 2 607 2 607
DS 

RD RR2EE14JQ 600 0 0
AAACTCGAAATCATATAGGTTCGAAGAAATTAAGAGGTAAGGTAATTTTTTTTTTTT*AC
ACAAGATTGATGAAAGAAACAAAAATGAACATATAAATATAAAAATATTTGTAATAATAA
AAGGTTTTGTGGGAGAATTTTAAAGAATGGTTGAGAAGCTTTCAATAGGATCAGATTCCT
CAAGCATGGAAGCAGCTTGGAAGCAATCAGTAACATCAGCTATACGTCCATCGTACTTAT
GAACCAATCCTAAGTAATACCAAGCTTTTCTGTTCGTCGGATCGATCCTCAATGCATCAG
ACAGCAAGCTTCTCGCCACAGGAAGCGTTGGTTGATGTTCTTTCCCTCTTTCAGACAACA
AGGCTCCAACCGCTACTTTGCAAGGAACCGATGATTCGTCTAGTAATAAACCGTCCAAGA
AAGCTGCTAACGCTGGTTTAAACTCCTTCCTCCCTTCCCACATTCGACCTTCTGTATGTA
GCATTGAAGCAGAGTACTGTTTCAGCTCGCCAGCTTTCTTTAGACAGACTTCTACATCGT
TCCAATGCGAAAGACTCGAGTAAAGATAAACCAAACCATGCCACACTTCAAACTCGTTCA

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

CO CL3649Contig1 1000 2 2 U
GCACTCCTCGAATTGCCCTCACAACCGCAGAATATTTAGCTTATGAATGTGGGAAGCATG
TGCTTGTCATATTGACAGACATGAGCTCTTATGCAGATGCTCTTCATGAGGTCTCTGCTG
CTCGAGAAGAGGTACCTGGAAGACGTGGATATCCGGGTTATATGTATACAGATCTTGCAA
CTATTTATGAGCGTGCAGGGCGTATTGAAGGAAGAAAGGGTTCCATTACCCAAATCCCTA
TCCTGACTATGCCCAATGATGATATCACTCACCCTACTCCGGATCTTACTGGTTACATTA
CTGAGGGTCAGATATACATTGACAGGCAGCTTCACAACAGACAGATATATCCACCCATCA
ACGTGCTTCCATCACTCTCTCGATTAATGAAGAGTGCTATTGGTGAGGGAACGACTCGCC
GTGACCATTCTGATGTCTCCAACCAGTTGTACGCAAACTATGCCATCGGTAAGGATGTTC
AAGCCATGAAAGCTGTAGTTGGAGAAGAAGCTCTGTCTTCAGAAGATCTGCTGTATTTAG
AGTTTCTGGACAAATTTGAGAGGAAGTTTGTGATGCAAGGAGCATACGACACAAGAAACA
TCTTCCAGTCACTTGATTTGGCATGGACACTGCTCCGTATCTTCCCACGTGAGCTTCTTC
ACCGTATCCCTGCCAAAACACTTGATCAGTTCTACAGCCGCGACTCCACTAGCTAAGCCT
TTTGAAGGAGCCTCCATGCTTCTCCCTTCTCATCTTATTTGGAAGTTAAATCATGTCGAG
AGAAGAAAAGACTCAGAGAATCGTGAACTTGGGATTTATTCTTTTGCTTTTTTTCTTCTC
ATTTGTATTTACAATAAAGGTTAAAACTTCGTACCAAAACGCTATTTATAAGCCTGTTTG
TGTTTCTGTCTTCGAAACTGGTGAATCATGTCTTTTTGCTGCTGTGTAATAAGGATCTAT
TCCCTCACATTCTTATTATACATATTGCCATCAGTTTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO32TF U 1
AF RR2AO32JQ C 152
BS 1 817 RR2AO32TF
BS 818 1000 RR2AO32JQ

RD RR2AO32TF 817 0 0
GCACTCCTCGAATTGCCCTCACAACCGCAGAATATTTAGCTTATGAATGTGGGAAGCATG
TGCTTGTCATATTGACAGACATGAGCTCTTATGCAGATGCTCTTCATGAGGTCTCTGCTG
CTCGAGAAGAGGTACCTGGAAGACGTGGATATCCGGGTTATATGTATACAGATCTTGCAA
CTATTTATGAGCGTGCAGGGCGTATTGAAGGAAGAAAGGGTTCCATTACCCAAATCCCTA
TCCTGACTATGCCCAATGATGATATCACTCACCCTACTCCGGATCTTACTGGTTACATTA
CTGAGGGTCAGATATACATTGACAGGCAGCTTCACAACAGACAGATATATCCACCCATCA
ACGTGCTTCCATCACTCTCTCGATTAATGAAGAGTGCTATTGGTGAGGGAACGACTCGCC
GTGACCATTCTGATGTCTCCAACCAGTTGTACGCAAACTATGCCATCGGTAAGGATGTTC
AAGCCATGAAAGCTGTAGTTGGAGAAGAAGCTCTGTCTTCAGAAGATCTGCTGTATTTAG
AGTTTCTGGACAAATTTGAGAGGAAGTTTGTGATGCAAGGAGCATACGACACAAGAAACA
TCTTCCAGTCACTTGATTTGGCATGGACACTGCTCCGTATCTTCCCACGTGAGCTTCTTC
ACCGTATCCCTGCCAAAACACTTGATCAGTTCTACAGCCGCGACTCCACTAGCTAAGCCT
TTTGAAGGAGCCTCCATGCTTCTCCCTTCTCATCTTATTTGGAAGTTAAATCATGTCGAG
AGAAGAAAAGACTCAGAGAATCGTGAACTTGGGATTT

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2AO32JQ 849 0 0
TCCGGGTTATATGTATACAGATCTTGCAACTATTTATGAGCGTGCAGGGCGTATTGAAGG
AAGAAAGGGTTCCATTACCCAAATCCCTATCCTGACTATGCCCAATGATGATATCACTCA
CCCTACTCCGGATCTTACTGGTTACATTACTGAGGGTCAGATATACATTGACAGGCAGCT
TCACAACAGACAGATATATCCACCCATCAACGTGCTTCCATCACTCTCTCGATTAATGAA
GAGTGCTATTGGTGAGGGAACGACTCGCCGTGACCATTCTGATGTCTCCAACCAGTTGTA
CGCAAACTATGCCATCGGTAAGGATGTTCAAGCCATGAAAGCTGTAGTTGGAGAAGAAGC
TCTGTCTTCAGAAGATCTGCTGTATTTAGAGTTTCTGGACAAATTTGAGAGGAAGTTTGT
GATGCAAGGAGCATACGACACAAGAAACATCTTCCAGTCACTTGATTTGGCATGGACACT
GCTCCGTATCTTCCCACGTGAGCTTCTTCACCGTATCCCTGCCAAAACACTTGATCAGTT
CTACAGCCGCGACTCCACTAGCTAAGCCTTTTGAAGGAGCCTCCATGCTTCTCCCTTCTC
ATCTTATTTGGAAGTTAAATCATGTCGAGAGAAGAAAAGACTCAGAGAATCGTGAACTTG
GGATTTATTCTTTTGCTTTTTTTCTTCTCATTTGTATTTACAATAAAGGTTAAAACTTCG
TACCAAAACGCTATTTATAAGCCTGTTTGTGTTTCTGTCTTCGAAACTGGTGAATCATGT
CTTTTTGCTGCTGTGTAATAAGGATCTATTCCCTCACATTCTTATTATACATATTGCCAT
CAGTTTAAT

QA 1 849 1 849
DS 



AS 1 3

CO CL3650Contig1 1262 3 5 U
GGAACTTACGAAGTACAAACATCTAATTACCCTAATGGCTCTCTCTTGTCCCACAAGAAT
CCTCTATTTTGCTCTTGCCTTATCTGCTGCATATCTCTCTTTCGCTGCTTCCCACGACTT
CTCCATCGTTGGATACTCCCCCGAGGACTTGGAGTCTCATGACAAGCTCATAGAACTCTT
CGAAAACTGGATCTCCAACTTCGAGAAAGCCTACGAAACCGTTGAAGAGAAGTTTCGTAG
GTTCGAAGTTTTCAAGGATAACCTAAAACACATCGATGAAACCAACAAGAAAGCGAAAAG
CTACTGGCTTGGTCTCAACGAGTTTGCGGATTTGAGCCACGAAGAGTTCAAGAACAAGTA
CTTAGGGCTCAAGACTGATATAGCCAGACGCCAAGATGAAAGATCTTACCAAGAGTTCTC
TTATAAGAATGTTGACGTTGAGGCTTTGCCTAAATCTGTTGACTGGAGAAAGAAAGGAGC
TGTGAGCTACGTCAAGAACCAAGGCTCTTGCGGAAGTTGTTGGGCGTTTTCGACAGTAGC
TGCAGTGGAAGGTATAAACAAGATTGTGACAGGAAACTTGACAACACTGTCTGAACAAGA
ACTCATAGATTGTGACACAACTTTCAACAATGGCTGCAACGGTGGTCTCATGGATTATGC
TTTTGAGTACATTGTCAAGAACGGAGGCCTTCGCAAGGAAGAGGATTATCCTTACTCCAT
GGAAGAAGGAACTTGCGAGACGCAAAAGGATGAATCTGAAATGGTGACTATCAGTGGACA
CCAAGATGCACCTAGGAACGATGAGAAAAGTCTCTTGAAGGCATTGGCTCATCAACCTCT
CAGTGTTGCTATTGATGCCTCTGGTAGAGAGTTCCAGTTCTATAGTGGTGGTGTCTTTGA
TGGACGGTGCGGGGTTGATTTGGACCACGGTGTGGCTGCGGTTGGGTACGGATCAAGCAA
GGGTTCGGATTACATCATTGTGAAGAATTCTTGGGGACCAACATGGGGAGAGAAAGGTTA
CATTAGGATGAAGAGGAACACTGGAAAACCAGAAGGTCTCTGTGGAATCAATAAGATGGC
TTCTTTCCCCACCAAAACTAAATAATGAAATTATTCTATCTTATCTGTATTTGATCGTTA
TCTTCCTATCGATATGAATGTTGTCATGAAATTGTAATATTAATTATGTTCTCTTTTGAT
TTATGGTTAGAAATATTGTAACAACTGAATACAAAAGGGTGACTTTTTTTAATAAAGAAA
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2B348TF U 1
AF RR2A101TF U 490
AF RR2B348JQ C 555
BS 1 652 RR2B348TF
BS 653 790 RR2A101TF
BS 791 791 RR2B348JQ
BS 792 1250 RR2A101TF
BS 1251 1262 RR2B348JQ

RD RR2B348TF 652 0 0
GGAACTTACGAAGTACAAACATCTAATTACCCTAATGGCTCTCTCTTGTCCCACAAGAAT
CCTCTATTTTGCTCTTGCCTTATCTGCTGCATATCTCTCTTTCGCTGCTTCCCACGACTT
CTCCATCGTTGGATACTCCCCCGAGGACTTGGAGTCTCATGACAAGCTCATAGAACTCTT
CGAAAACTGGATCTCCAACTTCGAGAAAGCCTACGAAACCGTTGAAGAGAAGTTTCGTAG
GTTCGAAGTTTTCAAGGATAACCTAAAACACATCGATGAAACCAACAAGAAAGCGAAAAG
CTACTGGCTTGGTCTCAACGAGTTTGCGGATTTGAGCCACGAAGAGTTCAAGAACAAGTA
CTTAGGGCTCAAGACTGATATAGCCAGACGCCAAGATGAAAGATCTTACCAAGAGTTCTC
TTATAAGAATGTTGACGTTGAGGCTTTGCCTAAATCTGTTGACTGGAGAAAGAAAGGAGC
TGTGAGCTACGTCAAGAACCAAGGCTCTTGCGGAAGTTGTTGGGCGTTTTCGACAGTAGC
TGCAGTGGAAGGTATAAACAAGATTGTGACAGGAAACTTGACAACACTGTCTGAACAAGA
ACTCATAGATTGTGACACAACTTTCAACAATGGCTGCAACGGTGGTCTCATG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2A101TF 761 0 0
G
GTCAAGAACCAAGGCTCTTGCGGAAGTTGTTGGGCGTTTTCGACAGTAGCTGCAGTGGAA
GGTATAAACAAGATTGTGACAGGAAACTTGACAACACTGTCTGAACAAGAACTCATAGAT
TGTGACACAACTTTCAACAATGGCTGCAACGGTGGTCTCATGGATTATGCTTTTGAGTAC
ATTGTCAAGAACGGAGGCCTTCGCAAGGAAGAGGATTATCCTTACTCCATGGAAGAAGGA
ACTTGCGAGACGCAAAAGGATGAATCTGAAATGGTGACTATCAGTGGACACCAAGATGCA
TCTAGGAACGATGAGAAAAGTCTCTTGAAGGCATTGGCTCATCAACCTCTCAGTGTTGCT
ATTGATGCCTCTGGTAGAGAGTTCCAGTTCTATAGTGGTGGTGTCTTTGATGGACGGTGC
GGGGTTGATTTGGACCACGGTGTGGCTGCGGTTGGGTACGGATCAAGCAAGGGTTCGGAT
TACATCATTGTGAAGAATTCTTGGGGACCAACATGGGGAGAGAAAGGTTACATTAGGATG
AAGAGGAACACTGGAAAACCAGAAGGTCTCTGTGGAATCAATAAGATGGCTTCTTTCCCC
ACCAAAACTAAATAATGAAATTATTCTATCTTATCTGTATTTGATCGTTATCTTCCTATC
GATATGAATGTTGTCATGAAATTGTAATATTAATTATGTTCTCTTTTGATTTATGGTTAG
AAATATTGTAACAACTGAATACAAAAGGGTGACTTTTTTT

QA 2 761 2 761
DS 

RD RR2B348JQ 708 0 0
TAAACAAGATTGTGACAGGAAACTTGACAACACTGTCTGAACAAGAACTCATAGATTGTG
ACACAACTTTCAACAATGGCTGCAACGGTGGTCTCATGGATTATGCTTTTGAGTACATTG
TCAAGAACGGAGGCCTTCGCAAGGAAGAGGATTATCCTTACTCCATGGAAGAAGGAACTT
GCGAGACGCAAAAGGATGAATCTGAAATGGTGACTATCAGTGGGCACCAAGATGTACCTA
GGAACGATGAGAAAAGTCTCTTGAAGGCATTGGCTCATCAACCTCTCAGTGTTGCTATTG
ATGCCTCTGGTAGAGAGTTCCAGTTCTATAGTGGTGGTGTCTTTGATGGACGGTGCGGGG
TTGATTTGGACCACGGTGTGGCTGCGGTTGGGTACGGATCAAGCAAGGGTTCGGATTACA
TCATTGTGAAGAATTCTTGGGGACCAACATGGGGAGAGAAAGGTTACATTAGGATGAAGA
GGAACACTGGAAAACCAGAGGGTCTCTGTGGAATCAATAAGATGGCTTCTTTCCCCACCA
AAACTAAATAATGAAATTATTCTATCTTATCTGTATTTGATCGTTATCTTCCTATCGATA
TGAATGTTGTCATGAAATTGTAATATTAATTATGTTCTCTTTTGATTTGTGGTTAGAAAT
ATTGTAACAACTGAATACAAAAGGGTGACTTTTTTTAATAAAGAAATC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 3

CO CL3651Contig1 942 3 10 U
TTTTTGTCTGTCTGTCTGTCTCCAAAACTCAGTGAAGAACACATGTCGGGACCTCAGTGC
TGCGAAAACCCGCCGGCTCTTAACCCGGTCTCCGGGTCGGGTCATGTGGAGAAGCTGGGG
GGGCTTGATGCTTACGTCTCTGGCTCTCCCGATTCCTCCAAGTTGTGCGTCATCCTCATC
TCTGATGTTTTTGGGTATGAAGCTCCAAACTTGAGGGCGCTTGCGGATAAGGTTGTAACT
TCTGGATTCTATGTCGTGGTTCCAGATTACTTCTACGGAGAGCCTTTTGATCCTTCTAAT
CAAGAGAGACCCATCTCTCTCTGGCTCAAAGATCATGGCGCTGATAAGGGATTTGAAGAC
ACAAAGCCAGTAATTGAAGCCTTAAAGAGCAAAGGCATAACCGCTATTGGAGCTGCAGGG
ATGTGTTGGGGTGCAAAAGTGGTGGTGGAATTGTCTAAGCAAGAGCTTGTTCAAGCAGCT
GTTCTGCTTCATCCTTCTTTTGTCACGGTT*ATGATATCAAGGGTGTGAAGGTGCCAATT
GCTATACTAGGAGCTGAGATTGATCAGTTGTCTCCACCTGCGCTCTTGAAGCAATTTGAG
GAGATTCTTGCTGCCAAACCTGAGGTGAATAGTTATGTGAAGATACACCCGAAAGTAGCA
CACGGTTGGACAGTTAGGTACAAGACGGATGACCCAGAGGCGGTTAAAGCTGCAGAAGAA
GCTCACAAGGAGATGCTTGATTGGTTTGTGACTTACGTTAAATGAATGATCAAATTGGCT
GCAACTACTACTAGTAGTAGTGTTTATAAATTAAAAATAAAGAGAGAGACTTAAGTATGA
AACTCTTTGTTGGTGTCTTCACTCACTATACCTGTTTGGAAGTTGCTACGTTGTGAGTTT
GGTCTATGATGCTGAACATCTATAAAAAAACGTATTTTGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV60TF U 18
AF RR2CE88TF U 1
AF RR2CE88JQ C 194
BS 1 119 RR2CE88TF
BS 120 120 RR2CV60TF
BS 121 678 RR2CE88TF
BS 679 679 RR2CV60TF
BS 680 699 RR2CE88TF
BS 700 700 RR2CE88JQ
BS 701 719 RR2CE88TF
BS 720 720 RR2CE88JQ
BS 721 729 RR2CE88TF
BS 730 942 RR2CE88JQ

RD RR2CV60TF 678 0 0
GGGTCTCTAAACT
AGTGAAGAACACATGTCGGGACCTCAGTGCTGCGAAAACCCGCCGGCTCTTAATCCGGTC
TCCGGGTCGGGTCATGTGGAGAAGCTGGGGGGGCTTGATGCTTACGTCTCTGGCTCTCCC
GATTCCTCCAAGTTGTGCGTCATCCTCATCTCTGATGTTTTTGGGTATGAAGCTCCAAAC
TTGAGGGCGCTTGCGGATAAGGTTGCAACTTCTGGATTCTATGTCGTGGTTCCAGATTAC
TTCTACGGAGATCCTTTTGATCCTTCTAATCAAGAGAGACCCATCCCTCTCTGGCTCAAA
GACCATGGCGCTGATAAGGGATTTGAAGACACAAAGCCAGTAATTGAAGCCTTAAAGAGC
AAAGGCATAACTGCTATTGGAGCAGCAGGGATGTGTTGGGGTGCAAAAGTGGTGGTGGAA
CTTTCTAAGCAAGAGCTTGTTCAAGCAGCTGTTCTGCTTCATCCTTCTTTTGTCACGGTC
GATGATATCAAGGGTGTGAAGGTGCCAATTGCTATACTAGGAGCTGAGATTGATCAGTTG
TCTCCACCTGCGCTCTTGAAGCAATTTGAGGATATTCTTGCTGCCAAACCTGAGGTGAAT
AGTTATGTGAAGATACACCCTAAAGTAGCACACGGTTGGACAGTTAGGTACAAGACGGAT
GACCC

QA 14 678 14 678
DS 

RD RR2CE88TF 737 0 0
TTTTTGTCTGTCTGTCTGTCTCCAAAACTCAGTGAAGAACACATGTCGGGACCTCAGTGC
TGCGAAAACCCGCCGGCTCTTAACCCGGTCTCCGGGTCGGGTCATGTGGAGAAGCTGGGT
GGGCTTGATGCTTACGTCTCTGGCTCTCCCGATTCCTCCAAGTTGTGCGTCATCCTCATC
TCTGATGTTTTTGGGTATGAAGCTCCAAACTTGAGGGCGCTTGCGGATAAGGTTGTAACT
TCTGGATTCTATGTCGTGGTTCCAGATTACTTCTACGGAGAGCCTTTTGATCCTTCTAAT
CAAGAGAGACCCATCTCTCTCTGGCTCAAAGATCATGGCGCTGATAAGGGATTTGAAGAC
ACAAAGCCAGTAATTGAAGCCTTAAAGAGCAAAGGCATAACCGCTATTGGAGCTGCAGGG
ATGTGTTGGGGTGCAAAAGTGGTGGTGGAATTGTCTAAGCAAGAGCTTGTTCAAGCAGCT
GTTCTGCTTCATCCTTCTTTTGTCACGGTT*ATGATATCAAGGGTGTGAAGGTGCCAATT
GCTATACTAGGAGCTGAGATTGATCAGTTGTCTCCACCTGCGCTCTTGAAGCAATTTGAG
GAGATTCTTGCTGCCAAACCTGAGGTGAATAGTTATGTGAAGATACACCCGAAAGTAGCA
CACGGTTGGACAGTTAGG*ACAAGACGGATGACCCAGAG*CGGTTAAAGCTGCAGAAGA*
GCTCACAAG
AGATGCTT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2CE88JQ 749 0 0
GGTATGAAGCTCCAAACTTGAGGGCGCTTGCGGATAAGGTTGTAACTTCTGGATTCTATG
TCGTGGTTCCAGATTACTTCTACGGAGAGCCTTTTGATCCTTCTAATCAAGAGAGACCCA
TCTCTCTCTGGCTCAAAGATCATGGCGCTGATAAGGGATTTGAAGACACAAAGCCAGTAA
TTGAAGCCTTAAAGAGCAAAGGCATAACCGCTATTGGAGCTGCAGGGATGTGTTGGGGTG
CAAAAGTGGTGGTGGAATTGTCTAAGCAAGAGCTTGTTCAAGCAGCTGTTTTGCTTCATC
CTTCTTTTGTCACGGTT*ATGATATCAAGGGTGTGAAGGTGCCAATTGCTATACTAGGAG
CTGAGATTGATCAGTTGTCTCCACCTGCGCTCTTGAAGCAATTTGAGGAGATTCTTGCTG
CCAAACCTGAGGTGAATAGTTATGTGAAGATACACCCGAAAGTAGCACACGGTTGGACAG
TTAGGTACAAGACGGATGACCCAGAGGCGGTTAAAGCTGCAGAAGAAGCTCACAAGGAGA
TGCTTGATTGGTTTGTGACTTACGTTAAATGAATGATCAAATTGGCTGCAACTACTACTA
GTAGTAGTGTTTATAAATTAAAAATAAAGAGAGAGACTTAAGTATGAAACTCTTTGTTGG
TGTCTTCACTCACTATACCTGTTTGGAAGTTGCTACGTTGTGAGTTTGGTCTATGATGCT
GAACATCTATAAAAAAACGTATTTTGGCG

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 3

CO CL3652Contig1 1094 3 6 U
GGAAAGCTCCGAAGTAAAAAAGAAATAGCCATGGCTGGGATAACCAGCACCGTTGGATTC
AACGCCGTTTTCGCCGGAATCACCAAAACTTTACCATTCTCCGTTGCATCTATCGATTCC
AAACTATACGGTCTCCGTCTCTCCACGGCCGAGCTGCCATTTCCCAATTCTACTCGCCGT
AGGCTCGCCATCACTTGCCGTTACGGTGGTGGAGGCGGAGGAGGTTATCGTTTCTCTGGA
GACTCTAGGAGAGGTAGGCCGAAAGAGTCGGAAGTAGATGAAGCGCTCGATATCGCCTCG
ATTAGGTCAGCTACTGTGAGGCTAATCGATGGGCAACAGAACATGCTTGGTTTAGTGTCT
AAAGACGAAGCTGTTCGAAGAGCTGAAGATGCTGAGCTTGATTTGGTGATACTATCGCCT
GATGCTGATCCTCCGGTTGTTAAAATGATGGACTACAGTAAATATAGGTATGAGCAGCAA
AAGAAGAAGAAGGATCAACAAAAGAAAACTACTCGCATGGACTTAAAGGAGCTTAAAATG
GGTTATAACATTGATCAGCATGATTATTCAGTTCGTATGAAAGCTGCCCAAAAGTTCTTG
CAAGATGGTGACAAGGTTAAGGTGATTGTGAGCATGAAGGGCCGAGAAAATGAGTTTAGA
AATATTGCTATTGAACTTCTCAGACGTTTCCAAACCGAAGTAGGAGAGCTTGCGACTGAA
GAGAGCAAGAACTTTAGGGACAGAAACTTGTTCATCATTTTGGTACCAAACAAAGAAATG
ATCCGGAAACCACAAGAACCATCCTCCAGAAAGAAGAAGAAAATAGCTGCAGAAAATGAA
GTTTTACCTGAGGAAAACGGAATTTCGACTGCGGAAAATGAAGTTTTGACTGCAGAAAAT
GAAGTTTCTGCTGCAGACATAACGACGGGTCCATAAAATGTCTGTCTGCAAATCTAGTAT
GGGAGTTTACATCGTGAGGTTAAGGATTTGAGAGTTAAAAGAGTTTTGTATATTTATTTT
TCTAGCAGAGCTGTAACAAATAGAACTAGTCCTTACTTGAATGATGTTCTTCGTATATTG
ATCTCTCATTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE31TF U 1
AF RR2BE31JQ C 236
AF RR2A902TF U 381
BS 1 788 RR2BE31TF
BS 789 800 RR2A902TF
BS 801 801 RR2BE31JQ
BS 802 1053 RR2A902TF
BS 1054 1054 RR2BE31JQ
BS 1055 1094 RR2A902TF

RD RR2BE31TF 795 0 0
GGAAAGCTCCGAAGTAAAAAAGAAATAGCCATGGCTGGGATAACCAGCACCGTTGGATTC
AACGCCGTTTTCGCCGGAATCACCAAAACTTTACCATTCTCCGTTGCATCTATCGATTCC
AAACTATACGGTCTCCGTCTCTCCACGGCCGAGCTGCCATTTCCCAATTCTACTCGCCGT
AGGCTCGCCATCACTTGCCGTTACGGTGGTGGAGGCGGAGGAGGTTATCGTTTCTCTGGA
GACTCTAGGAGAGGTAGGCCGAAAGAGTCGGAAGTAGATGAAGCGCTCGATATCGCCTCG
ATTAGGTCAGCTACTGTGAGGCTAATCGATGGGCAACAGAACATGCTTGGTTTAGTGTCT
AAAGACGAAGCTGTTCGAAGAGCTGAAGATGCTGAGCTTGATTTGGTGATACTATCGCCT
GATGCTGATCCTCCGGTTGTTAAAATGATGGACTACAGTAAATATAGGTATGAGCAGCAA
AAGAAGAAGAAGGATCAACAAAAGAAAACTACTCGCATGGACTTAAAGGAGCTTAAAATG
GGTTATAACATTGATCAGCATGATTATTCAGTTCGTATGAAAGCTGCCCAAAAGTTCTTG
CAAGATGGTGACAAGGTTAAGGTGATTGTGAGCATGAAGGGCCGAGAAAATGAGTTTAGA
AATATTGCTATTGAACTTCTCAGACGTTTCCAAACCGAAGTAGGAGAGCTTGCGACTGAA
GAGAGCAAGAACTTTAGGGACAGAAACTTGTTCATCATTTTGGTACCAAACAAAGAAATG
ATCCGGAA
CCGCAAG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2BE31JQ 842 0 0
CTGGAGACTCTAGGAGAGGTAGGCCGAAAGAGTCGGAAGTAGATGAAGCGCTCGATATCG
CCTCGATTAGGTCAGCTACTGTGAGGCTAATCGATGGGCAACAGAACATGCTTGGTTTAG
TGTCTAAAGACGAAGCTGTTCGAAGAGCTGAAGATGCTGAGCTTGATTTGGTGATACTAT
CGCCTGATGCTGATCCTCCGGTTGTTAAAATGATGGACTACAGTAAATATAGGTATGAGC
AGCAAAAGAAGAAGAAGGATCAACAAAAGAAAACTACTCGCATGGACTTAAAGGAGCTTA
AAATGGGTTATAACATTGATCAGCATGATTATTCAGTTCGTATGAAAGCTGCCCAAAAGT
TCTTGCAAGATGGTGACAAGGTTAAGGTGATTGTGAGCATGAAGGGCCGAGAAAATGAGT
TTAGAAATATTGCTATTGAACTTTTCAGACGTTTCCAAACCGAAGTAGGAGAGCTTGCGA
CTGAAGAGAGCAAGAACTTTAGGGACAGAAACTTGTTCATCATTTTGGTACCAAACAAAG
AAATGATCCGGAAACCGCAAGAACCATCCTCCAGAAAGAAGAAGAAAATAGCTGCAGAAA
ATGAAGTTTTACCTGCGGAAAACGGAATTTCGACTGCGGAAAATGAAGTTTTGACTGCAG
AAAATGAAGTTTCTGCTGCAGACATAACGACGGGTCCATAAAATGTCTGTCTGCAAATCT
AGTATGGGAGTTTACATC*TGAGGTTAAGGATTTGAGAGTTGAAAG**TTTTGTATATTT
ATTTTTCTAGCAGAGCTGTAACAAATAGAACTAGTCCTTACTTGAATGATGTTCTTCGTA
AT

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2A902TF 714 0 0
G
GCTGAAGATGCTGAGCTTGATTTGGTGATACTATCGCCTGATGCTGATCCTCCGGTTGTT
AAAATGATGGATTACAGTAAATATAGATATGAGCAGCAAAAGAAGAATAAGGATCAACAA
AAGAAAACTACTCGCATGGACTTAAAGGAGCTTAAAATGGGTTATAACATTGATCAGCAT
GATTATTCAGTTCATATGAAAGCTGCCCAAAAGTTCTTGCAAGATGGGGACAAGGTTAAG
GTGATTGTGAGCATGAAGGGCCGAGAAAACGAGTTTAGAAATATTGCTATTGAACTCCTC
AGACGTTTCCAAACCGAAGTAGGGGAGCTTGCGACTGAAGAGAGCAAGAACTTTAGGGAC
AGAAACTTGTTCATCATTTTGGTACCAAACAAAGAAATGATCCGGAAACCACAAGAACCG
TCCTCCAGAAAGAAGAAGAAAATAGCTGCAGAAAATGAAGTTTTACCTGAGGAAAACGGA
ATTTCGACTGCGGAAAATGAAGTTTTGACTGCAGAAAATGAAGTTTCTGCTGCAGACATA
ACGACGGGTCCATAAAATGTCTGTCTGCAAATCTAGTATGGGAGTTTACATCGTGAGGTT
AAGGATTTGAGAGTTAAAAGAGTTTTGTATATTTATTTTTCTAGCAGAGCTGTAACAAAT
AGAACTAGTCCT*ACTTGAATGATGTTCTTCGTATATTGATCTCTCATTTTTT

QA 2 714 2 714
DS 



AS 1 2

CO CL3653Contig1 1192 2 2 U
GGAAACGAAGAGAGATCGCTTGTTGCTGAAGAAGAAGAAGATGATTGGAGGCACTCTAAC
CTCTTCTTCGTCCTCCTCAACCAAGATCATTCTCAATGATTCCCCTACATGGATTTTCCG
TCGCGGTGGAGCTGGCGCTGAGATATTCCCTTGTGTTGTTGTTCCCAGGAAAACGTTTTT
ACGTCTAGATTCTTCTGTTCGCAGCAAGATTCTTAAGCCGATGATTCCTCTTCGTGCATC
GTCGTCAGAGGAGGTAAATAAAGAAGAAGATGCTGAAACTGAAGCTGTAGAGAAATCCCC
CGGAAGTACTGTGCGTGTAAGGTTCCAGCTGCGGAGAGAGTGTGTCTTTGGAGAACATTT
CTTCATCCTTGGTGAACATCCCGTCTTTGGCGGCGGTCTTTGGGATCCTGAAAATGCCTT
GCCTCTGAACTGGTCTGATGGCCATGTCTGGACACTAGATCTGGATCTGCCTGTTGGAAG
ATTGGTTGAATTCAAGTTCATTCTCAAGGCAGAGACAGGGGAGATCTTGTGGCAACCAGG
TCCAAACCGTGCTATTAAAACCTGGCAAACTAACAAGACTATCATCAGAATATGTGAAGA
CTGGGATAATGCTGATCTCCAAATGATGAGGGAGGAAGCTTTTGTGCCACTCCTCAGTCA
AGAGGAAAAACAGTCTTCTTTTAGCTTGGATGATATGCCCTTAGTTTCCGAAAATATCAC
ACATCCAGAGCAAAGCGTGACGCTTCTCACCAATGCTTCACCAAACGGTGCAGGAGAGGA
GGTCCAAGTGCTTGGTACCGTACAAAAGATTTCTTCGGTAGTAGCTGTAGATGATGAACC
TGAGGAAAGCTCGAGTGGAGCTCCGACTGCTTGTCAGGATTAAAAATGTGACCGAAGAAG
CAGCCATGTTTACTGAAGAAGAAAGTCCAGTTTTGGTACCAGGATTGTTTCCTCTGACCG
ATATGGAAAATGAAGAAGTGAGTGGACCCATCGCTCAGGTGTCAGCTGAAGTTATTAACG
AAGGTAAAGCCGAAACGTTACCAGAGGTAATTATAACCTGATGGTTCCTGTTTTTGTTTA
CGACACAACGAAACCTGTGCAGATTATGCTTTGAGACATGTTTCTTCACTCTAGAATAAA
TCTGTCCTTACAGTGTATACTGTTACTCCAGTTCATAAAAAGTTCCCTTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR70TF U 1
AF RR2AR70JQ C 481
BS 1 752 RR2AR70TF
BS 753 1192 RR2AR70JQ

RD RR2AR70TF 753 0 0
GGAAACGAAGAGAGATCGCTTGTTGCTGAAGAAGAAGAAGATGATTGGAGGCACTCTAAC
CTCTTCTTCGTCCTCCTCAACCAAGATCATTCTCAATGATTCCCCTACATGGATTTTCCG
TCGCGGTGGAGCTGGCGCTGAGATATTCCCTTGTGTTGTTGTTCCCAGGAAAACGTTTTT
ACGTCTAGATTCTTCTGTTCGCAGCAAGATTCTTAAGCCGATGATTCCTCTTCGTGCATC
GTCGTCAGAGGAGGTAAATAAAGAAGAAGATGCTGAAACTGAAGCTGTAGAGAAATCCCC
CGGAAGTACTGTGCGTGTAAGGTTCCAGCTGCGGAGAGAGTGTGTCTTTGGAGAACATTT
CTTCATCCTTGGTGAACATCCCGTCTTTGGCGGCGGTCTTTGGGATCCTGAAAATGCCTT
GCCTCTGAACTGGTCTGATGGCCATGTCTGGACACTAGATCTGGATCTGCCTGTTGGAAG
ATTGGTTGAATTCAAGTTCATTCTCAAGGCAGAGACAGGGGAGATCTTGTGGCAACCAGG
TCCAAACCGTGCTATTAAAACCTGGCAAACTAACAAGACTATCATCAGAATATGTGAAGA
CTGGGATAATGCTGATCTCCAAATGATGAGGGAGGAAGCTTTTGTGCCACTCCTCAGTCA
AGAGGAAAAACAGTCTTCTTTTAGCTTGGATGATATGCCCTTAGTTTCCGAAAATATCAC
ACATCCAGAGCAAAGCGTGACGCTTCTCACCA
A

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2AR70JQ 712 0 0
ATTGGTTGAATTCAAGTTCATTCTCAAGGCAGAGACAGGGGAGATCTTGTGGCAACCAGG
TCCAAACCGTGCTATTAAAACCTGGCAAACTAACAAGACTATCATCAGAATATGTGAAGA
CTGGGATAATGCTGATCTCCAAATGATGAGGGAGGAAGCTTTTGTGCCACTCCTCAGTCA
AGAGGAAAAACAGTCTTCTTTTAGCTTGGATGATATGCCCTTAGTTTCCGAAAATATCAC
ACATCCAGAGCAAAGCGTGACGCTTCTCACCAATGCTTCACCAAACGGTGCAGGAGAGGA
GGTCCAAGTGCTTGGTACCGTACAAAAGATTTCTTCGGTAGTAGCTGTAGATGATGAACC
TGAGGAAAGCTCGAGTGGAGCTCCGACTGCTTGTCAGGATTAAAAATGTGACCGAAGAAG
CAGCCATGTTTACTGAAGAAGAAAGTCCAGTTTTGGTACCAGGATTGTTTCCTCTGACCG
ATATGGAAAATGAAGAAGTGAGTGGACCCATCGCTCAGGTGTCAGCTGAAGTTATTAACG
AAGGTAAAGCCGAAACGTTACCAGAGGTAATTATAACCTGATGGTTCCTGTTTTTGTTTA
CGACACAACGAAACCTGTGCAGATTATGCTTTGAGACATGTTTCTTCACTCTAGAATAAA
TCTGTCCTTACAGTGTATACTGTTACTCCAGTTCATAAAAAGTTCCCTTAAC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 3

CO CL3654Contig1 831 3 9 U
GGGAGGCGAATGCGAGACGGAGTGGTACACAACCTTGTTCCTTCCTTGGAAAAGAGAAGA
TAAGAGCTTCTTCTTCTTCCTGGTCGTTTAAGAAAAAGAAGTCTCTCTCCTTCCCTTTTT
AGATCTCTGAAAAAAAAAAAAGAATCTGTCTTTGCAATGGATCAGATGTTCAACAAGGTT
GGATCCTACTGGTTAGGTCATAAGGCGAACAAGCAGTTTGACTCTGTTGGTGACGATATC
AACTCGATATCAACGAGCATCGAAGGAGGAACAAAATGGTTGGTCAACAAAATCAAAGGA
ACAATGCAGAAGCCGTTGCCTGAGCTGCTGAAAGAATATGATTTGCCTGTGGGTATCTTC
CCACGGGATGCTACAAACTACGAGTTCGATGAACAGACCAAGAAACTGACGGTGCTGATC
CCATCTGTCTGCGAAGTTGGCTACAAGGACTCATCCGTCCTCAAATTCACCGCAACAGTA
ACGGGATATCTCGAGAAAGGGAAGCTATGTGACGTGGAAGGGATGAAGACAAAAGTGATG
ATATGGATCAAAGTCACAAGCATCTCTGCGGACTCATCAAAGGTGTATTTCACTGCGGGG
ATGAAGAAGAGCAGAAACCGAGATGCTTATGAGGTTCTAAGAGATGGCGTTCGAGTTGAT
AAATTCTAACTCCTTCTGCTGATGAGAGTATACATATATATATTCTCATCTGTTATCAAT
TAAATTATTAAGTTTTAAGCTTTTTATGGGTTTGCATGATGGTGTTATGATCTGAAGAAT
TAACTTGTGCTGTATGGATTCGATTGATGAAGGGTATTCTTGGTTTTGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2DR75TF U 1
AF RR2G082TF U 131
AF RR2G082JQ C 137
BS 1 187 RR2DR75TF
BS 188 188 RR2G082TF
BS 189 321 RR2DR75TF
BS 322 322 RR2G082TF
BS 323 471 RR2DR75TF
BS 472 472 RR2G082TF
BS 473 516 RR2DR75TF
BS 517 826 RR2G082TF
BS 827 831 RR2G082JQ

RD RR2DR75TF 516 0 0
GGGAGGCGAATGCGAGACGGAGTGGTACACAACCTTGTTCCTTCCTTGGAAAAGAGAAGA
TAAGAGCTTCTTCTTCTTCCTGGTCGTTTAAGAAAAAGAAGTCTCTCTCCTTCCCTTTTT
AGATCTCTGAAAAAAAAAAAAGAATCTGTCTTTGCAATGGATCAGATGTTCAACAAGGTT
GGATCCTGCTGGTTAGGTCATAAGGCGAACAAGCAGTTTGACTCTGTTGGTGACGATATC
AACTCGATATCAACGAGCATCGAAGGAGGAACAAAATGGTTGGTCAACAAAATCAAAGGA
ACAATGCAGAAGCCGTTGCCTAAGCTGCTGAAAGAATATGATTTGCCTGTGGGTATCTTC
CCACGGGATGCTACAAACTACGAGTTCGATGAACAGACCAAGAAACTGACGGTGCTGATC
CCATCTGTCTGCGAAGTTGGCTACAAGGACTCATCCGTCCTCAAATTCACCACAACAGTA
ACGGGATATCTCGAGAAAGGGAAGCTATGTGACGTG

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2G082TF 700 0 0
GGGAAA
AAAAAGAATCTGTCTTTGCAATGGATCAGATGTTCAACAAGGTTGGATCCTACTGGTTAG
GTCATAAGGCGAACAAGCAGTTTGACTCTGTTGGTGACGATATCAACTCGATATCAACGA
GCATCGAAGGAGGAACAAAATGGTTGGTCAACAAAATCAAAGGAACAATGCAGAAGCCGT
TGCCTGAGCTGCTGAAAGAATATGATTTGCCTGTGGGTATCTTCCCACGGGATGCTACAA
ACTACGAGTTCGATGAACAGACCAAGAAACTGACGGTGCTGATCCCATCTGTCTGCGAAG
TTGGCTACAAGGACTCATCCGTCCTCAAATTCACCGCAACAGTAACGGGATATCTCGAGA
AAGGGAAGCTATGTGACGTGGAAGGGATGAAGACAAAAGTGATGATATGGATCAAAGTCA
CAAGCATCTCTGCGGACTCATCAAAGGTGTATTTCACTGCGGGGATGAAGAAGAGCAGAA
ACCGAGATGCTTATGAGGTTCTAAGAGATGGCGTTCGAGTTGATAAATTCTAACTCCTTC
TGCTGATGAGAGTATACATATATATATTCTCATCTGTTATCAATTAAATTATTAAGTTTT
AAGCTTTTTATGGGTTTGCATGATGGTGTTATGATCTGAAGAATTAACTTGTGCTGTATG
GATTCGATTGATGAAGGGTATTCTTGGTTT
GTAC

QA 7 696 7 696
DS 

RD RR2G082JQ 695 0 0
AAAAAGAATCTGTCTTTGCAATGGATCAGATGTTCAACAAGGTTGGATCCTACTGGTTAG
GTCATAAGGCGAACAAGCAGTTTGACTCTGTTGGTGACGATATCAACTCGATATCAACGA
GCATCGAAGGAGGAACAAAATGGTTGGTCAACAAAATCAAAGGAACAATGCAGAAGCCGT
TGCCTGAGCTGCTGAAAGAATATGATTTGCCTGTGGGTATCTTCCCACGGGATGCTACAA
ACTACGAGTTCGATGAACAGACCAAGAAACTGACGGTGCTGATCCCATCTGTCTGCGAAG
TTGGCTACAAGGACTCATCCGTCCTCAAATTCACCGCAACAGTAACGGGATATCTCGAGA
AAGGGAAGCTATGTGACGTGGAAGGGATGAAGACAAAAGTGATGATATGGATCAAAGTCA
CAAGCATCTCTGCGGACTCATCAAAGGTGTATTTCACTGCGGGGATGAAGAAGAGCAGAA
ACCGAGATGCTTATGAGGTTCTAAGAGATGGCGTTCGAGTTGATAAATTCTAACTCCTTC
TGCTGATGAGAGTATACATATATATATTCTCATCTGTTATCAATTAAATTATTAAGTTTT
AAGCTTTTTATGGGTTTGCATGATGGTGTTATGATCTGAAGAATTAACTTGTGCTGTATG
GATTCGATTGATGAAGGGTATTCTTGGTTTTGTAC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 3

CO CL3655Contig1 856 3 6 U
GATGACAACATGATGTATATAAAACCATATTCCCAATATTTTAAGAGACATTGCAAAAGC
CAAATCATGAAAGCCGTGGGACAACAGATGTTCTTCTCAAAGATCAGCAAAGACTGTGAA
TATGTTACCGTTGATGTAATCATTCTCAACCAAACTCACCAAATAGTAACTGTTCTTAAC
CTCTTCGAGCAAGTTTCTTGAAGGGTCAGATTCAGGGTACAAGTTAGACCAGCTTCTTGA
CCAAGTCTCAAACGCTTCATCTTTCCACACTTTGAAGCTAGCCGGATCCACAATGGTTGG
TTGAATGATCTCCTTAGCCGGGAAAACTCCCCAAGTAACAGCATTCACATCGGATTGAGC
AGTGTTTGAAACCCAGTTGTCTCCTTTGTCCACAGCTATGTAAGTTATAGATGGCAAAGC
TTTGCATTTCTCAACAACTGCATCTAACTTCTCCTTTGAGCAGAAGAACTCTAGGTAAGC
CTTTTGGTATACGTATCCACCAGGACCACCCCATCCAACAGTTGAGGAATCAGATCTCTC
TGCGTTGACAGATGGTTGGCTATTGATGGTCAAGAAGCCTTTGGAGTTGATTTTCACCAG
CTGCTCGTTTATGATCTTTGTCTCTGGCTGGAGTCCGTCCAGTTCAGACCATGGACTGCT
TTTT*AAGTTTCCAAGACAGAGCTCCTTGAATTTCTCCTGAATATCTTCAACGCTTTTCA
ATGGGACAACCCATTCTTGTTGAAGCTTCTTGTCACGTGCTCGTGGACGTGAGAACTGAT
GATCCGTGAGTGCACCATATGAGGCACTGCGTGAATCACCCCACCGGCCTTGTGGGAGTC
TTCCCATCCCTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ51JQ U 50
AF RR2CC20JQ U 1
AF RR2A844JQ U 175
BS 1 205 RR2CC20JQ
BS 206 206 RR2CJ51JQ
BS 207 534 RR2CC20JQ
BS 535 535 RR2CJ51JQ
BS 536 801 RR2CC20JQ
BS 802 856 RR2A844JQ

RD RR2CJ51JQ 650 0 0
ATTGCAAAAGCCAAATCATGAAAGCCGTGGGACAACAGATGTTCTTCTCAAAGATCAGCA
AAGACTGTGAATATGTTACCGTTGATGTAATCATTCTCAACCAAACTCACCAAATAGTAA
CTGTTCTTAACCTCTTCGAGCAAGTTTCTTGAAGGGTCAGATTCAGGGTACAAGTTAGAC
CAGCTTCTTGACCAAGTCTCAAACGCTTCATCTTTCCACACTTTGAAGCTAGCCGGATCC
ACAATGGTTGGTTGAATGATCTCCTTAGCCGGGAAAACTCCCCAAGTAACAGCATTCACA
TCGGATTGAGCAGTGTTTGACACCCAGTTGTCTCCTTTGTCCACAGCTATGTAAGTTATA
GATGGCAAAGCTTTGCATTTCTCAACAACTGCATCTAACTTCTCCTTTGAGCAGAAGAAC
TCTAGGTAAGCCTTTTGGTATACGTATCCACCAGGACCACCCCATCCAACAGTTAAGGAA
TCAGATCTCTCTGCGTTGACAGATGGTTGGCTATTGATGGTCAAGAAGCCTTTGGAGTTG
ATTTTCACCAGCTGCTCGTTTATGATCTTTGTCTCTGGCTGGAGTCCGTCCAGTTCAGAC
CATGGACTGCTTTTT*AAGTTTCCAAGACAGAGCTCCTTGAATTTCTCCT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2CC20JQ 801 0 0
GATGACAACATGATGTATATAAAACCATATTCCCAATATTTTAAGAGACATTGCAAAAGC
CAAATCATGAAAGCCGTGGGACAACAGATGTTCTTCTCAAAGATCAGCAAAGACTGTGAA
TATGTTACCGTTGATGTAATCATTCTCAACCAAACTCACCAAATAGTAACTGTTCTTAAC
CTCTTCGAGCAAGTTTCTTGAAGGGCCAGATTCAGGGTACAAGTTAGACCAGCTTCTTGA
CCAAGTCTCAAACGCTTCATCTTTCCACACTTTGAAGCTAGCCGGATCCACAATGGTTGG
TTGAATGATCTCCTTAGCCGGGAAAACTCCCCAAGTAACAGCATTCACATCGGATTGAGC
AGTGTTTGAAACCCAGTTGTCTCCTTTGTCCACAGCTATGTAAGTTATAGATGGCAAAGC
TTTGCATTTCTCAACAACTGCATCTAACTTCTCCTTTGAGCAGAAGAACTCTAGGTAAGC
CTTTTGGTATACGTATCCACCAGGACCACCCCATCCAACAGTTGAGGAATCAGACCTCTC
TGCGTTGACAGATGGTTGGCTATTGATGGTCAAGAAGCCTTTGGAGTTGATTTTCACCAG
CTGCTCGTTTATGATCTTTGTCTCTGGCTGGAGTCCGTCCAGTTCAGACCATGGACTGCT
TTTT*AAGTTTCCAAGACAGAGCTCCTTGAATTTCTCCTGAATATCTTCAACGCTTTTCA
ATGGGACAACCCATTCTTGTTGAAGCTTCTTGTCACGTGCTCGTGGACGTGAGAACTGAT
GATCCGTGAGTGCACCATATG

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2A844JQ 682 0 0
CTTAACCTCTTCGAGCAAGTTTCTTGAAGGGTCAGATTCAGGGTACAAGTTAGCCCAGCT
TCTTGACCAAGTCTCAAACGCTTCATCTTTCCAGACTTTTAAGCTAGCCGGATCCACAAT
GGTTGGTTGAATGATCTCCTTAGCCGGGAAAACTCCCCAAGTAACAGCATTCACATCGGA
CTGAGCAGTGTTTGATACCCAGTTGTCTCCTTTGTTGACAGCTATGTAAGTTATAGATGG
CAAAGCTTTGCATTTCTCAACAATTGCATCTAACTTCTCCTTTGAGCAGAAGAACTCTAG
GTAAGCCTTTTGGTATACATACCCACCAGGACCACCCCATCCAACAGTTGAGGAATCAGA
TCTCTCTGCGTTGACAGATGGTTGGCTATTGATGGTCAAGAAGCCTTTGGAGTTGATTTT
CACCAGCTGCTCGTTTATGATCTTTGTCTCTGGCTGGAGCCCGTCCAGTTCAGACCATGG
ACTGCTTTTTCAAGTTTCCAAGACAGAGCTCCTTGAATTTCTCCTGGATATCTTCAACGC
TTTTCAATGGGACAACCCATTCTTGTTGAAGCTTCTTGTCACGTGCTCGTTGACGTGAGA
ACTGATGATCCGTGAGTGCACCATATGAGGCACTGCGTGAATCACCCCACCGGCCTTGTG
GGAGTCTTCCCATCCCTTGGTT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 3

CO CL3656Contig1 755 3 7 U
GGACCATAAACACACTGAACATTTATCAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTACAGAAA
ATTGTTACAATGTCAACATCTAAAATTACTATTTTTTTGTATTGTCTTACTTTTTCTCAC
TAGTTTTCATGAATGTGTCAACCTGAAAAAAAACTACTGCAGCATGCCTCTCTAGACCAC
AACATAAAGATTGGTGCTGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAAT
GCGAGAGAATTTGTATCCAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAACAGTGACGTTAGTGG
CTCCTAGCTCTCTTGTCAGTTTGTCACGTTATGCTTACCTCTTCAGTCCTATTGGTACGA
AGCGATGACAGAGACCAAAACGGCACAAATTCAGAAGTCTCCTAATAAAAGAATCCAACA
CACACACTTGTGATTACGTAAATTTCACACTTGTGATTACGTAAATGAAGATGCTAACTA
AAATGAAGATGTTGTCGAAGAAAAACTAAAATGTAGATCCATGTATCACACTTGTGATTA
CGTAAATTTCCTTACCACCAGTCCAATTTCTAACACGAAGGACTATAAATACTATTATTT
TACTTTAAATATAGAGGAAAAATAATAGTACTTTATATAATAGAATTGTTCCAGTTTTAG
AAAAAAAATATAGCTCCACTTGTTTGTTGCTCGTGTACTTAGGAGTGAACTTTGTGATGT
CTTGGCTCCCCCCTACTGCTGTCTGCAGTTTCAGT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H347JQ C 4
AF RR2H347TF U 4
AF RR2B118TF U 1
BS 1 97 RR2B118TF
BS 98 98 RR2H347TF
BS 99 108 RR2B118TF
BS 109 109 RR2H347TF
BS 110 152 RR2B118TF
BS 153 153 RR2H347TF
BS 154 755 RR2B118TF

RD RR2H347JQ 633 0 0
GG
ATAAACACACTGAACATTTATCAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTACAGAAAATTGT
TACAATGTCAACATCTAAAATTACTATTTTTTTGTATTGTCTTACTTTTTCTCACTAGTT
TTCATGAATGTGTCAACCTGAAAAAAAACTACTGCAGCATGCCTCTCTAGACCACAACAT
AAAGATTGGTGCTGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAATGCGAG
AGAATTTGTATCCAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAACAGTGACGTTAGTGGCTCCT
AGCTCTCTTGTCAGTTTGTCACGTTATGCTTACCTCTTCAGTCCTATTGGTACGAAGCGA
TGACAGAGACCAAAACGGCACAAATTCAGAAGTCTCCTAATAAAAGAATCCAACACACAC
ACTTGTGATTACGTAAATTTCACACTTGTGATTACGTAAATGAAGATGCTAACTAAAATG
AAGATGTTGTCGAAGAAAAACTAAAATGTAGATCCATGTATCACACTTGTGATTACGTAA
ATTTCCTTACCACCAGTCCAATTTCTAACACGAAGGACTATAAATACTATTATTTTACTT
TAAATATAGAGGAAAAATAATAGTACTTTAT

QA 3 633 3 633
DS 

RD RR2H347TF 633 0 0
GG
ATAAACACACTGAACATTTATCAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTACAGAAAATTGT
TACAATGTCAACATCTAAAATTACTATTTTTTTGTATTGTCTTACTTTTTCTCACTAGTT
TTCATGAATGTGTCAACCTGAAAAAAAACTACTGCAGCATGCCTCTCTAGACCACAACAT
AAAGATTGGTGCTGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAATGCGAG
AGAATTTGTATCCAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAACAGTGACGTTAGTGGCTCCT
AGCTCTCTTGTCAGTTTGTCACGTTATGCTTACCTCTTCAGTCCTATTGGTACGAAGCGA
TGACAGAGACCAAAACGGCACAAATTCAGAAGTCTCCTAATAAAAGAATCCAACACACAC
ACTTGTGATTACGTAAATTTCACACTTGTGATTACGTAAATGAAGATGCTAACTAAAATG
AAGATGTTGTCGAAGAAAAACTAAAATGTAGATCCATGTATCACACTTGTGATTACGTAA
ATTTCCTTACCACCAGTCCAATTTCTAACACGAAGGACTATAAATACTATTATTTTACTT
TAAATATAGAGGAAAAATAATAGTACTTTAT

QA 3 633 3 633
DS 

RD RR2B118TF 755 0 0
GGACCATAAACACACTGAACATTTATCAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTACAGAAA
ATTGTTACAATGTCAACATCTAAAATTACTATTTTTT*GTATTGTCTT*CTTTTTCTCAC
TAGTTTTCATGAATGTGTCAACCTGAAAAAAA*CTACTGCAGCATGCCTCTCTAGACCAC
AACATAAAGATTGGTGCTGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAAT
GCGAGAGAATTTGTATCCAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAACAGTGACGTTAGTGG
CTCCTAGCTCTCTTGTCAGTTTGTCACGTTATGCTTACCTCTTCAGTCCTATTGGTACGA
AGCGATGACAGAGACCAAAACGGCACAAATTCAGAAGTCTCCTAATAAAAGAATCCAACA
CACACACTTGTGATTACGTAAATTTCACACTTGTGATTACGTAAATGAAGATGCTAACTA
AAATGAAGATGTTGTCGAAGAAAAACTAAAATGTAGATCCATGTATCACACTTGTGATTA
CGTAAATTTCCTTACCACCAGTCCAATTTCTAACACGAAGGACTATAAATACTATTATTT
TACTTTAAATATAGAGGAAAAATAATAGTACTTTATATAATAGAATTGTTCCAGTTTTAG
AAAAAAAATATAGCTCCACTTGTTTGTTGCTCGTGTACTTAGGAGTGAACTTTGTGATGT
CTTGGCTCCCCCCTACTGCTGTCTGCAGTTTCAGT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 3

CO CL3657Contig1 913 3 11 U
CGATGATAATCAGTGTTTTTTATTTTTACTTTTAAAAGCACAGCAACAAATCTTTGTATC
GACGAAGAAAGAATGGTGTCTTGAGACGTAAACTTTGACAATTCGGACAAAGTTACAAAA
CGAAGAAGAATGATGTCTTTGTGAAACTGGTCAAAGTAATTGCCAATCATCTTCATGCTC
CTCACCAGATATCTCTGTAGATGATGCCACAGCGCTGGTTTCTGCAATTCCACGCTCACC
ACCTCTGTGAGATTGAGTCACCGTGAACAAAGGAGCGCCGTTGGAGTCTCCTGCTAGCTT
CGTTGCTCGGATACAGAAATCCTCAAAATCATCTTTGTCCCGGCAATAGAATCCAAGAGC
TAGCGATGGGTCTAGTGACTCCAACGGAACATAACGAAGTGTATTGCAATGGTAAGACGA
TGTGTCAACATCTTGAGTTTCTTTGTTCACTGTCACTACCTGTTGAACATCGTGTGGGTC
AAGGTAGAAACCTTTGTCTTCTTGAACTCCAACTATGTAAGTTGATGCACCTGGTTTGCC
ACCCAAAATCCCAAGGCTTTGAGGGAAACTGAAAGTGGCTATCAGAGATGGAATGTACCT
TGGGTTCACTTTGTCAAGTCCAAGAACCAGTGGGACCAAGAGAAGAATTGAAGTCCACTC
AGTTTCTCCTTTTGAATATTCCAAACAAGTTTTGGTGACATCTTCTATACAGAGAATTGG
AGCTCCACCTCTCTCCCCATCTTCACTACCAGAAACGATATGAACAGCCATGGAACACGA
GCGGTCTTTGACCTTAGTTTCTTCTCTTTTCTTCCGAGCTAATGATTCCCATGATCGACA
AACTGCATACGGTCCTACCCATGACCCAGCAGCCAAGCCATAAGATTCTCCAGCTAGTAT
AAGATTATGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D912JQ U 1
AF RR2A035JQ U 250
AF RR2A035TF C 28
BS 1 224 RR2D912JQ
BS 225 225 RR2A035TF
BS 226 301 RR2D912JQ
BS 302 302 RR2A035JQ
BS 303 377 RR2D912JQ
BS 378 378 RR2A035JQ
BS 379 583 RR2D912JQ
BS 584 584 RR2A035JQ
BS 585 722 RR2D912JQ
BS 723 880 RR2A035JQ
BS 881 913 RR2A035TF

RD RR2D912JQ 722 0 0
CGATGATAATCAGTGTTTTTTATTTTTACTTTTAAAAGCACAGCAACAAATCTTTGTATC
GACGAAGAAAGAATGGTGTCTTGAGACGTAAACTTTGACAATTCGGACAAAGTTACAAAA
CGAAGAAGAATGATGTCTTTGTGAAACTGGTCAAAGTAATTGCCAATCATCTTCATGCTC
CTCACCAGATATCTCTGTAGATGATGCCACAGCGCTGGTTTCTGTAATTCCACGCTCACC
ACCTCTGTGAGATTGAGTCACCGTGAACAAAGGAGCGCCGTTGGAGTCTCCTGCTAGCTT
CATTGCTCGGATACAGAAATCCTCAAAATCATCTTTGTCCCGGCAATAGAATCCAAGAGC
TAGCGATGGGTCTAGTGGCTCCAACGGAACATAACGAAGTGTATTGCAATGGTAAGACGA
TGTGTCAACATCTTGAGTTTCTTTGTTCACTGTCACTACCTGTTGAACATCGTGTGGGTC
AAGGTAGAAACCTTTGTCTTCTTGAACTCCAACTATGTAAGTTGATGCACCTGGTTTGCC
ACCCAAAATCCCAAGGCTTTGAGGGAAACTGAAAGTGGCTATCGGAGATGGAATGTACCT
TGGGTTCACTTTGTCAAGTCCAAGAACCAGTGGGACCAAGAGAAGAATTGAAGTCCACTC
AGTTTCTCCTTTTGAATATTCCAAACAAGTTTTGGTGACATCTTCTATACAGAGAATTGG
AG

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2A035JQ 631 0 0
AGATTGAGTCACCGTGAACAAAGGAGCGCCGTTGGAGTCTCCTGCTAGCTTCGTTGCTCG
GATACAGAAATCCTCAAAATCATCTTTGTCCCGGCAATAGAATCCAAGAGCTAGCGATGG
GTCTAGTGACTCCAACGGAACATAACGAAGTGTATTGCAATGGTAAGACGATGTGTCAAC
ATCTTGAGTTTCTTTGTTCACTGTCACTACCTGTTGAACATCGTGTGGGTCAAGGTAGAA
ACCTTTGTCTTCTTGAACTCCAACTATGTAAGTTGATGCACCTGGTTTGCCACCCAAAAT
CCCAAGGCTTTGAGGGAAACTGAAAGTGGCTATCAAAGATGGAATGTACCTTGGGTTCAC
TTTGTCAAGTCCAAGAACCAGTGGGACCAAGAGAAGAATTGAAGTCCACTCAGTTTCTCC
TTTTGAATATTCCAAACAAGTTTTGGTGACATCTTCTATACAGAGAATTGGAGCTCCACC
TCTCTCCCCATCTTCACTACCAGAAACGATATGAACAGCCATGGAACACGAGCGGTCTTT
GACCTTAGTTTCTTCTCTTTTCTTCCGAGCTAATGATTCCCATGATCGACAAACTGCATA
CGGTCCTACCCATGACCCAGCAGCCAAGCCA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2A035TF 886 0 0
TAC
TTTAAAAGCACAGCAACAAATCTTTGTATCGACGAAGAAAGAATG*TGTCT*GAGACGTA
AACTTTGACAATTCGGACAAAGTTACAAAACGAAGAAGAATGATGTCTTTGTGAAACTGG
TCAAAGTAATTGCCAATCATCTTCATGCTCCTCACCAGATATCTCTGTAGATGATGCCAC
AGCGCTGGTTTCTGCAATTCCACGCTCACCACCTTTGTGAGATTGAGTCACCGTGAACAA
AGGAGCGCCGTTGGAGTCTCCTGCTAGCTTCGTTGCTCGGATACAGAAATCCTCAAAATC
ATCTTTGTCCCGGCAATAGAATCCAAGAGCTAGCGATGGGTCTAGTGACTCCAACGGAAC
ATAACGAAGTGTATTGCAATGGTAAGACGATGTGTCAACATCTTGAGTTTCTTTGTTCAC
TGTCACTACCTGTTGAACATCGTGTGGGTCAAGGTAGAAACCTTTGTCTTCTTGAACTCC
AACTATGTAAGTTGATGCACCTGGTTTGCCACCCAAAATCCCAAGGCTTTGAGGGAAACT
GAAAGTGGCTATCAGAGATGGAATGTACCTTGGGTTCACTTTGTCAAGTCCAAGAACCAG
TGGGACCAAGAGAAGAATTGAAGTCCACTCAGTTTCTCCTTTTGAATATTCCAAACAAGT
TTTGGTGACATCTTCTATACAGAGAATTGGAGCTCCACCTCTCTCCCCATCTTCACTACC
AGAAACGATATGAACAGCCATGGAACACGAGCGGTCTTTGACCTTAGTTTCTTCTCTTTT
CTTCCGAGCTAATGATTCCCATGATCGACAAACTGCATACGGTCCTACCCATGACCCAGC
AGCCAAGCCATAAGATTCTCCAGCTAGTATAAGATTATGTATC

QA 4 886 4 886
DS 



AS 1 3

CO CL3658Contig1 1311 3 6 U
GGATCCCATCTCTCTCGTCTGCCTTCTTTCTCAAAAACTTTCTCGTTCTTTCCGTCCAAA
ACCATGTCTGCCTTCACCAGCAAATTCGCCGATGAGCTGATCGCCAACGCTGCCTACATC
GGCACACCTGGAAAAGGTATTCTCGCCGCCGACGAGTCCACCGGTACCATCGGAAAGCGT
CTCGCGAGCATCAACGTCGAGAACGTTGAGACCAACAGACGTGCTCTCCGTGAGCTTCTC
TTCACCGCCCCTGGTGCTCTCCCTTGCCTCAGCGGTGTCATCCTCTTCGAGGAGACTCTT
TACCAAAAGAGTTCCGATGGTAAGCTGTTCGTTGATATCTTGAAGGAAGGAGGAGTCCTC
CCAGGTATCAAAGTCGACAAGGGTACCGTTGAGCTAGCCGGAACCAACGATGAGACCACC
ACCCAAGGTCTCGACGGTCTCGGTGAGCGTTGCAAGAAGTACTACGAAGCCGGTGCCCGT
TTCGCCAAGTGGCGTGCGGTCCTCAAGATCGGGGAGAACGAGCCATCAGAACTTTCCATC
CACGAGAACGCTTACGGATTGGCTAGATACTGTTATCTGCCAGGAGAACGGTCTTGTACC
AATCGTTGAGCCTGAGATCCTCGTCGACGGGTCCCATGACATCCACAAGTGTGCTGCCGT
CACCGAGCGTGTCCTCGCAGCTTGCTACAAGCTCTTAGCGACCACCACGTTTTGCTCGAG
GGGACTCTCTTGAAGCCTAACATGGTCACACCTGGATCCGACAGTGCCAAGGTTGCGCCA
GAGGTTATCGCTGAGCACACCGTCCGTGCTCTTCAGAGGACGGTACCAGCAGCTGTTCCA
GCCATCGTGTTTTTGTCCGGTGGACAGAGCGAGGAGGAGGCGACTAAGAACTTGAACGCG
ATGAACCAGTTGAAGACCAAGAAGCCATGGTCGTTGTCTTTCTCGTTCGGACGTGCGTTG
CAACAGAGCACTTTGAAGACATGGGCAGGGAAAGAGGAGAATGTTAAGGCTGCTCAGGAG
GCGTTGTATGTGAGGTGCAAGGCTAACTCTGAAGCCACACTCGGAACGTACAAAGGTGAT
GCTAAGCTTGGTGATGGTGCCGCGGAGAGCCTTCACGTGAAGGACTACAAGTACTGAGAG
AATCGTCTGTGACGTCCTCATTAAACACCCTCGATATATTTCTATGGGTTTCTTCTACAT
TTTGCTTTGACATTATCGGCTGTTCGATTTGTGTTTTGATTTCTGTTGCGTGTTCAATTT
TAGAATGATGAGTGGTTTAAAAACGCCCAAATAAAAAGACCATTTGAGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS28TF U 1
AF RR2DS28JQ C 716
AF RR2G955TF U 1185
BS 1 766 RR2DS28TF
BS 767 1185 RR2DS28JQ
BS 1186 1221 RR2G955TF
BS 1222 1222 RR2DS28JQ
BS 1223 1297 RR2G955TF
BS 1298 1311 RR2DS28JQ

RD RR2DS28TF 766 0 0
GGATCCCATCTCTCTCGTCTGCCTTCTTTCTCAAAAACTTTCTCGTTCTTTCCGTCCAAA
ACCATGTCTGCCTTCACCAGCAAATTCGCCGATGAGCTGATCGCCAACGCTGCCTACATC
GGCACACCTGGAAAAGGTATTCTCGCCGCCGACGAGTCCACCGGTACCATCGGAAAGCGT
CTCGCGAGCATCAACGTCGAGAACGTTGAGACCAACAGACGTGCTCTCCGTGAGCTTCTC
TTCACCGCCCCTGGTGCTCTCCCTTGCCTCAGCGGTGTCATCCTCTTCGAGGAGACTCTT
TACCAAAAGAGTTCCGATGGTAAGCTGTTCGTTGATATCTTGAAGGAAGGAGGAGTCCTC
CCAGGTATCAAAGTCGACAAGGGTACCGTTGAGCTAGCCGGAACCAACGATGAGACCACC
ACCCAAGGTCTCGACGGTCTCGGTGAGCGTTGCAAGAAGTACTACGAAGCCGGTGCCCGT
TTCGCCAAGTGGCGTGCGGTCCTCAAGATCGGGGAGAACGAGCCATCAGAACTTTCCATC
CACGAGAACGCTTACGGATTGGCTAGATACTGTTATCTGCCAGGAGAACGGTCTTGTACC
AATCGTTGAGCCTGAGATCCTCGTCGACGGGTCCCATGACATCCACAAGTGTGCTGCCGT
CACCGAGCGTGTCCTCGCAGCTTGCTACAAGCTCTTAGCGACCACCACGTTTTGCTCGAG
GGGACTCTCTTGAAGCCTAACATGGTCACACCTGGATCCGACAGTG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2DS28JQ 596 0 0
TCGAGGGGACTCTCTTGAAGCCTAACATGGTCACACCTGGATCCGACAGTGCCAAGGTTG
CGCCAGAGGTTATCGCTGAGCACACCGTCCGTGCTCTTCAGAGGACGGTACCAGCAGCTG
TTCCAGCCATCGTGTTTTTGTCCGGTGGACAGAGCGAGGAGGAGGCGACTAAGAACTTGA
ACGCGATGAACCAGTTGAAGACCAAGAAGCCATGGTCGTTGTCTTTCTCGTTCGGACGTG
CGTTGCAACAGAGCACTTTGAAGACATGGGCAGGGAAAGAGGAGAATGTTAAGGCTGCTC
AGGAGGCGTTGTATGTGAGGTGCAAGGCTAACTCTGAAGCCACACTCGGAACGTACAAAG
GTGATGCTAAGCTTGGTGATGGTGCCGCGGAGAGCCTTCACGTGAAGGACTACAAGTACT
GAGAGAATCGTCTGTGACGTCCTCATTAAACACCCTCGATATATTTCTATGGGTTTCTTC
TACATTTTGCTTTGACATTATCGGCTGTTCGATTTGTGTTTTGATTTCTGTTGCGTGTTC
AATTTTAGAATGATGAGTGGTTTAAAAACGCCCAAATAAAAAGACCATTTGAGGTT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2G955TF 113 0 0
G
GGGTTTCTTCTACATTTTGCTTTGACATTATCGGCTTTTCGATTTGTGTTTTGATTTCTG
TTGCGTGTTCAATTTTAGAATGATGAGTGGTTTAAAAACGCCCAAATAAAAA

QA 2 113 2 113
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3660Contig1 1001 2 18 U
GGATTTTCTCTCAGTCTGTGTAAACCCTAAACCCAATTCGAGCTCTCCGATGGCGAGCCT
TCGATGCCTTCGCGAGCTAAGCCGCCGCGCCACGACGGTCCTATCAATCAACCAGACGCG
ATTGATCTCTTCACTTCGAAGCTTAGAGCCTTTCGGTACCAGCATTACTCATGGAACTCC
AATTCCGGATCGATCTCTCACTAGAGATCTCCCCATGGTACACTCGCTCCCCGAGGTCGC
CTCTTGTCTTCGAAAACAAACGATACTGAAAAGCAGCGAAGGAGAAGATGATGATGATGA
GTACGAGGATTCGGCGGAGATGGAAGTAGAAAAGGGAATATTCACCGGCGGAGAAAGTGG
AAGCCGCGGCGGAGATAGGGTACAAGGTGATGGGTCCTCTCAAACCTTCGGAGAGACTAT
TCAAACCCTATGAGCCAGTGTTCGCCGTTGTTCAGATTGGCTCGCATCAGTTCAAAGTAA
GCAACGGAGACTCCATCTTCACGGAGAAGTTGAAGTTCTGTGACATCAATGATAAGTTGG
TACTGACTAAGGTGCTATTACTGGGCTCCGCAAGCCAGACGATTATTGGTAGGCCTATCT
TGCCTGATGCTACTGTTCATGCTGTTGTGGAAGAGCATGCATTGGATGAAAAAGTGCTCA
TTTTCAAAAAGAAACGAAAGAAGAATTATAGGAGAACCACAGGGCATCGACAGGAATTGA
CAAAGTTGAGGATAACCGATATACAAGGAATTGAGAAACCAGAGCCGACGATTGTCCATA
AGCCTTCCAAGCCAGCTGATACAGAGTAACCAGAGCCTGAGCTAGTTGGTTAGAGACAAG
AATCCCTTCTTTTTTCTTTTGTTGCTGATGCCAATACTTTGAAGTAAGTTCATCAAACAG
TTGCCGATTTGGGCTTCCCCTTTTTTGAAGTTTTTTTACAACTAGTAGCTGAAAAGGCTT
TCTTTGTAGTTAATGGCAATGTTGATACTAAGATATGAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM78TF U 1
AF RR2AM78JQ C 184
BS 1 213 RR2AM78TF
BS 214 214 RR2AM78JQ
BS 215 231 RR2AM78TF
BS 232 232 RR2AM78JQ
BS 233 332 RR2AM78TF
BS 333 333 RR2AM78JQ
BS 334 730 RR2AM78TF
BS 731 731 RR2AM78JQ
BS 732 747 RR2AM78TF
BS 748 748 RR2AM78JQ
BS 749 830 RR2AM78TF
BS 831 831 RR2AM78JQ
BS 832 838 RR2AM78TF
BS 839 839 RR2AM78JQ
BS 840 847 RR2AM78TF
BS 848 848 RR2AM78JQ
BS 849 859 RR2AM78TF
BS 860 1001 RR2AM78JQ

RD RR2AM78TF 868 0 0
GGATTTTCTCTCAGTCTGTGTAAACCCTAAACCCAATTCGAGCTCTCCGATGGCGAGCCT
TCGATGCCTTCGCGAGCTAAGCCGCCGCGCCACGACGGTCCTATCAATCAACCAGACGCG
ATTGATCTCTTCACTTCGAAGCTTAGAGCCTTTCGGTACCAGCATTACTCATGGAACTCC
AATTCCGGATCGATCTCTCACTAGAGATCTCCC*ATGGTACACTCGCTCCC*GAGGTCGC
CTCTTGTCTTCGAAAACAAACGATACTGAAAAGCAGCGAAGGAGAAGATGATGATGATGA
GTACGAGGATTCGGCGGAGATGGAAGTAGAAA*GGGAATATTCACCGGCGGAGAAAGTGG
AAGCCGCGGCGGAGATAGGGTACAAGGTGATGGGTCCTCTCAAACCTTCGGAGAGACTAT
TCAAACCCTATGAGCCAGTGTTCGCCGTTGTTCAGATTGGCTCGCATCAGTTCAAAGTAA
GCAACGGAGACTCCATCTTCACGGAGAAGTTGAAGTTCTGTGACATCAATGATAAGTTGG
TACTGACTAAGGTGCTATTACTGGGCTCCGCAAGCCAGACGATTATTGGTAGGCCTATCT
TGCCTGATGCTACTGTTCATGCTGTTGTGGAAGAGCATGCATTGGATGAAAAAGTGCTCA
TTTTCAAAAAGAAACGAAAGAAGAATTATAGGAGAACCACAGGGCATCGACAGGAATTGA
CAAAGTTGAG*ATAACCGATATACAAG*AATTGAGAAACCAGAGCCGACGATTGTCCATA
AGCCTTCCAAGCCAGCTGATACAGAGTAACCAGAGCCTGAGCTAGTTGGT*AGAGACA*G
AATCCCT*CTTTTTTCTTT
GTGCTGATG

QA 1 859 1 859
DS 

RD RR2AM78JQ 818 0 0
TCCGGATCGATCTCTCACTAGAGATCTCCCCATGGTACACTCGCTCCCCGAGGTCGCCTC
TTGTCTTCGAAAACAAACGATACTGAAAAGCAGCGAAGGAGAAGATGATGATGATGAGTA
CGAGGATTCGGCGGAGATGGAAGTAGAAAAGGGAATATTCACCGGCGGAGAAAGTGGAAG
CCGCGGCGGAGATAGGGTACAAGGTGATGGGTCCTCTCAAACCTTCGGAGAGACTATTCA
AACCCTATGAGCCAGTGTTCGCCGTTGTTCAGATTGGCTCGCATCAGTTCAAAGTAAGCA
ACGGAGACTCCATCTTCACGGAGAAGTTGAAGTTCTGTGACATCAATGATAAGTTGGTAC
TGACTAAGGTGCTATTACTGGGCTCCGCAAGCCAGACGATTATTGGTAGGCCTATCTTGC
CTGATGCTACTGTTCATGCTGTTGTGGAAGAGCATGCATTGGATGAAAAAGTGCTCATTT
TCAAAAAGAAACGAAGGAAGAATTATAGGAGAACCCCAGGGCATCGACAGGAATTGACAA
AGTTGAGGATAACCGATATACAAGGAATTGAGAAACCAGAGCCGACGATTGTCCATAAGC
CTTCCAAGCCAGCTGATACAGAGTAACCAGAGCCTGAGCTAGTTGGTTAGAGACAAGAAT
CCCTTCTTTTTTCTTTTGTTGCTGATGCCAATACTTTGAAGTAAGTTCATCAAACAGTTG
CCGATTTGGGCTTCCCCTTTTTTGAAGTTTTTTTACAACTAGTAGCTGAAAAGGCTTTCT
TTGTAGTTAATGGCAATGTTGATACTAAGATATGAACT

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 3

CO CL3661Contig1 799 3 6 U
GGAATTCTGAATCTTCCTCGAAGCAACCGCAAGTCTTTGTAGGTCTCTAGGGCGATTGAT
TGATGCATCTATCTATGGCGGACGTTGAGAATCAACAAGACTCTTCGTTTCCAGTGAAGA
GGAAATCGGATCTCTGTTGCCAAGACCAGGATAATGTGGCTAACAAGGCTCAGAAGCTTA
ATCCTTCGTCGAGTTCTCCTGATTCTGAGTCCAAAGACGGACAAGTTAATGGAAACGGCG
TCGAGAATCTGAATTCCTCAACTGATGAAAAACTAGGGACAGAATCATCGCTTGAGAAGG
AAGCTGAAGATAAGCAAGAAGTGGAAGACGAAGAGGAAGATGAAGAGGAAGAGGAGGAGG
ATTTGATTGAAGCTGAGATTGACAGGAAAGGTAAAGGCATAGCGAGAGAGGACAAAGGAA
AAGGAAAACTGATCGAATTTGATGAAAGTGACGATAGCGATGATGATGAAGACGACGAAG
ATGGTGATGAGTACGACGAAAGTGATTTGTCCGACGATCCATTGGCGGAGGTGGATTTGG
ATAACATCCTTCCGTCGAGGACTAGGAGACGATCGATCCAGCCTGGAGTCTTCATCTCCA
ATGACCGTATTGGAAACCACGAGGATGATGATGATGATGATAGCAGTGATGATAGTGATG
CTTAAGGTTAGTGCTAAGAAATCAAGATGTAGTTCCTTTTATTCTAAAATATGTTACAAT
GGTTGTTGGTTATAATCTAAATGTTTTCCAACGCTTGGACCAAAAGTTAGCTAATATATC
TATCATGTTATTTGCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL32TF U 128
AF RR2GT52TF U 1
AF RR2GT52JQB C 69
BS 1 623 RR2GT52TF
BS 624 624 RR2GT52JQB
BS 625 666 RR2GT52TF
BS 667 667 RR2GT52JQB
BS 668 678 RR2GT52TF
BS 679 799 RR2GT52JQB

RD RR2DL32TF 336 0 0
GGATCTCTGTTGCCAAGACCAGGATAATGTGGCTAACAAGGCTCAGAAGCTTAATCCTTC
GTCGAGTTCTCCTGATTCTGAGTCCAAAGACGGACAAGTTAATGGAAACGGCGTCGAGAA
TCTGAATTCCTCAACTGATGAAAAACTAGGGACAGAATCATTGCTTGAGAAGGAAACTGA
AGATAAGCAAGAAGTGGAAGACGAAGAGGAAGATGAAGAGGAAGAGGAGGAGGATC*GAT
TGAAGCTGAGATTGACAGGAAAGG*AAAGGCATAGCGAGAGAGGACAAAGGAAAGG**AA
ACTGATCGA*TTTGATGAAAGTGACGATAGCGATGA

QA 1 336 1 336
DS 

RD RR2GT52TF 678 0 0
GGAATTCTGAATCTTCCTCGAAGCAACCGCAAGTCTTTGTAGGTCTCTAGGGCGATTGAT
TGATGCATCTATCTATGGCGGACGTTGAGAATCAACAAGACTCTTCGTTTCCAGTGAAGA
GGAAATCGGATCTCTGTTGCCAAGACCAGGATAATGTGGCTAACAAGGCTCAGAAGCTTA
ATCCTTCGTCGAGTTCTCCTGATTCTGAGTCCAAAGACGGACAAGTTAATGGAAACGGCG
TCGAGAATCTGAATTCCTCAACTGATGAAAAACTAGGGACAGAATCATCGCTTGAGAAGG
AAGCTGAAGATAAGCAAGAAGTGGAAGACGAAGAGGAAGATGAAGAGGAAGAGGAGGAGG
ATTTGATTGAAGCTGAGATTGACAGGAAAGGTAAAGGCATAGCGAGAGAGGACAAAGGAA
AAGGAAAACTGATCGAATTTGATGAAAGTGACGATAGCGATGATGATGAAGACGACGAAG
ATGGTGATGAGTACGACGAAAGTGATTTGTCCGACGATCCATTGGCGGAGGTGGATTTGG
ATAACATCCTTCCGTCGAGGACTAGGAGACGATCGATCCAGCCTGGAGTCTTCATCTCCA
ATGACCGTATTGGAAACCACGAG*ATGATGATGATGATGATAGCAGTGATGATAGTGATG
CTTAAG*TTAGTGCTAAG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2GT52JQB 731 0 0
CTATCTATGGCGGACGTTGAGAATCAACAAGACTCTTCGTTTCCAGTGAAGAGGAAATCG
GATCTCTGTTGCCAAGACCAGGATAATGTGGCTAACAAGGCTCAGAAGCTTAATCCTTCG
TCGAGTTCTCCTGATTCTGAGTCCAAAGACGGACAAGTTAATGGAAACGGCGTCGAGAAT
CTGAATTCCTCAACTGATGAAAAACTAGGGACAGAATCATCGCTTGAGAAGGAAGCTGAA
GATAAGCAAGAAGTGGAAGACGAAGAGGAAGATGAAGAGGAAGAGGAGGAGGATTTGATT
GAAGCTGAGATTGACAGGAAAGGTAAAGGCATAGCGAGAGAGGACAAAGGAAAAGGAAAA
CTGATCGAATTTGATGAAAGTGACGATAGCGATGATGATGAAGACGACGAAGATGGTGAT
GAGTACGACGAAAGTGATTTGTCCGACGATCCATTGGCGGAGGTGGATTTGGATAACATC
CTTCCGTCGAGGACTAGGAGACGATCGATCCAGCCTGGAGTCTTCATCTCCAATGACCGT
ATTGGAAACCACGAGGATGATGATGATGATGATAGCAGTGATGATAGTGATGCTTAAGGT
TAGTGCTAAGAAATCAAGATGTAGTTCCTTTTATTCTAAAATATGTTACAATGGTTGTTG
GTTATAATCTAAATGTTTTCCAACGCTTGGACCAAAAGTTAGCTAATATATCTATCATGT
TATTTGCAATT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 3

CO CL3662Contig1 704 3 1 U
GGAAGGCATATCATTCGATCAGATTCGAGAATGGGTCGCCGCGGATACGGTGGTGGAGGA
CGCAGATCATATTCAACTCGGCCTAAAGTTCGATCTACATCATTTTTTCATAAGAAAGCT
AAGCCTGCCAAAGATGAGAAAGATGAAAAAGCGCCTCCTCCTGCTAAAGTTTCCCCTAAA
GTTGAGACGATTCATTGTGAATCTAGTCGTGGAAGTTTTTTTTCATCCATAGCTGATGGG
TTTAATTGGGGAGCTGGAAATGCGATGGGACACAGATTCGTTGAATCCATTTTTGGTCCT
AGAACCATTAAAACAGAAGCTGTTTTACCAGAGAGAGTTGAAGTAGCTGCTGTCTCTGCC
GTTGATGATAACGATAAATACAAGGACTACACTGAATCATGTAGCATAAGCTATAATGCA
TTTCAAGAATGCTTGAACGTGGAAGGGAATAAACTAAGCAAATGTCACGTATTCATGGAT
TCGCTCTTCGAGTGCAGGAAGAACTCTAGTTCCTTCAACTTCTAAGTTGGGATTTTATAA
TTCTCTTTTTCTTTCTTAGTTAGTGTTTTCCAATAAATTAAGATTTAAAAACTCTCGTTG
ATTAAATCGTTTATCATGTGGCTGTGTTTCTTGGTTAATTTGACCACCATGTCTATGAAT
TATCGTATGTCTTGGATAAAATAAAGTCTTTAATTTTGTGTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2GZ14TF U 1
AF RR2GZ14JQ C 121
AF RR2BL33TF U 6
BS 1 704 RR2GZ14TF

RD RR2GZ14TF 704 0 0
GGAAGGCATATCATTCGATCAGATTCGAGAATGGGTCGCCGCGGATACGGTGGTGGAGGA
CGCAGATCATATTCAACTCGGCCTAAAGTTCGATCTACATCATTTTTTCATAAGAAAGCT
AAGCCTGCCAAAGATGAGAAAGATGAAAAAGCGCCTCCTCCTGCTAAAGTTTCCCCTAAA
GTTGAGACGATTCATTGTGAATCTAGTCGTGGAAGTTTTTTTTCATCCATAGCTGATGGG
TTTAATTGGGGAGCTGGAAATGCGATGGGACACAGATTCGTTGAATCCATTTTTGGTCCT
AGAACCATTAAAACAGAAGCTGTTTTACCAGAGAGAGTTGAAGTAGCTGCTGTCTCTGCC
GTTGATGATAACGATAAATACAAGGACTACACTGAATCATGTAGCATAAGCTATAATGCA
TTTCAAGAATGCTTGAACGTGGAAGGGAATAAACTAAGCAAATGTCACGTATTCATGGAT
TCGCTCTTCGAGTGCAGGAAGAACTCTAGTTCCTTCAACTTCTAAGTTGGGATTTTATAA
TTCTCTTTTTCTTTCTTAGTTAGTGTTTTCCAATAAATTAAGATTTAAAAACTCTCGTTG
ATTAAATCGTTTATCATGTGGCTGTGTTTCTTGGTTAATTTGACCACCATGTCTATGAAT
TATCGTATGTCTTGGATAAAATAAAGTCTTTAATTTTGTGTTAA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2GZ14JQ 582 0 0
AAGCCTGCCAAAGATGAGAAAGATGAAAAAGCGCCTCCTCCTGCTAAAGTTTCCCCTAAA
GTTGAGACGATTCATTGTGAATCTAGTCGTGGAAGTTTTTTTTCATCCATAGCTGATGGG
TTTAATTGGGGAGCTGGAAATGCGATGGGACACAGATTCGTTGAATCCATTTTTGGTCCT
AGAACCATTAAAACAGAAGCTGTTTTACCAGAGAGAGTTGAAGTAGCTGCTGTCTCTGCC
GTTGATGATAACGATAAATACAAGGACTACACTGAATCATGTAGCATAAGCTATAATGCA
TTTCAAGAATGCTTGAACGTGGAAGGGAATAAACTAAGCAAATGTCACGTATTCATGGAT
TCGCTCTTCGAGTGCAGGAAGAACTCTAGTTCCTTCAACTTCTAAGTTGGGATTTTATAA
TTCTCTTTTTCTTTCTTAGTTAGTGTTTTCCAATAAATTAAGATTTAAAAACTCTCGTTG
ATTAAATCGTTTATCATGTGGCTGTGTTTCTTGGTTAATTTGACCACCATGTCTATGAAT
TATCGTATGTCTTGGATAAAATAAAGTCTTTAATTTTGTGTT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2BL33TF 673 0 0
GG
ATATCATTCGATCAGATTCGAGAATGGGTCGCCGCGGATACGGTGGTGGAGGACGCAGAT
CATATTCAACTCGGCCTAAAGTTCGATCTACATCATTTTTTCATAAGAAAGCTAAGCCTG
CCAAAGATGAGAAAGATGAAAAAGCGCCTCCTCCTGCTAAAGTTTCCCCTAAAGTTGAGA
CGATTCATTGTGAATCTAGTCGTGGAAGTTTTTTTTCATCCATAGCTGATGGGTTTAATT
GGGGAGCTGGAAATGCGATGGGACACAGATTCGTTGAATCCATTTTTGGTCCTAGAACCA
TTAAAACAGAAGCTGTTTTACCAGAGAGAGTTGAAGTAGCTGCTGTCTCTGCCATTGATG
ATAACGATAAATACAAGGACTACATTGAATCATGTAGCATAAGCTATAATGCATTTCAAG
AATGCTTGAACGTGGAAGGGAATAAACTAAGCAAATGTCACGTATTCATGGATTCGCTCT
TCGAGTGCAGGAAGAACTCTAGTTCCTTCAACTTCTAAGTTGGGATTTTATAATTCTCTT
TTTCTTTCTTAGTTAGTGTTTTCCAATAAATTAAGATTTAAAAACTCTCGTTGATTAAAT
CGTTTATCATGTGGCTGTGTTTCTTGGTTAATTTGACCACCCTGTCTATGAATTATCGTA
TGTCTTGGATA

QA 3 673 3 673
DS 



AS 1 3

CO CL3663Contig1 731 3 2 U
GGACCATATGGGGAAATCACTCAACGACTCAGGTGCCAGACTTCTTGAATGCCAGAATCA
ATGGCCGGCCAGTGAAGGAGGTTATTACAGATCACAAGTGGTTAGAAGAGGGATTCACTG
AGAGTGTGCAGAAGAGAGGTGGCTTACTAATTCAGAAATGGGGTCGATCTTCTGCTGCTT
CTACCGCTGTTTCCATTGTTGATGCTATAAAGTCTCTTGTAACTCCTACTCCTGAGGGTG
ACTGGTTTTCGACTGGGGTGTACACAAATGGAAATCCTTATGGTATTGCAGAGGACCTCG
TCTTCAGCATGCCATGCCGGTCAAAGGGAGATGGAGATTATGAGCTTGTCAAGGATGTAG
AGATTGATGACTACCTTCGCAAACGAATCGCCAAGTCGGAAGCAGAACTGTTGGCTGAGA
AGAAATGTGTTGCACACCTCACTGGAGATGGCATCGCCTACTGTGATCTTGGTCCGGTAG
ATACTATGCTTCCCGGTGAAGTTT*GATTTT*GGTGAGGACGCTGAGCATCACAAGTAAG
CATTATCTTTTGGGTTGTTAGCTGTTGTACATAGCACACCCATATTACTCATGTTGACTG
GTTGGAATAAGTGAATTAAACTCTTCACATTTTACTTCTTATTTATACATGTGAG*TTAC
TTGAGCAATAGAGCAAACTCATGTTATACAATAGCGTCTGTACACACTTGAAAATGTCCT
CTGCTTATTGA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO73JQ C 1
AF RR2BO73TF U 1
AF RR2DH87TF U 423
BS 1 666 RR2BO73TF
BS 667 731 RR2DH87TF

RD RR2BO73JQ 666 0 0
GGACCATATGGGGAAATCACTCAACGACTCAGGTGCCAGACTTCTTGAATGCCAGAATCA
ATGGCCGGCCAGTGAAGGAGGTTATTACAGATCACAAGTGGTTAGAAGAGGGATTCACTG
AGAGTGTGCAGAAGAGAGGTGGCTTACTAATTCAGAAATGGGGTCGATCTTCTGCTGCTT
CTACCGCTGTTTCCATTGTTGATGCTATAAAGTCTCTTGTAACTCCTACTCCTGAGGGTG
ACTGGTTTTCGACTGGGGTGTACACAAATGGAAATCCTTATGGTATTGCAGAGGACCTCG
TCTTCAGCATGCCATGCCGGTCAAAGGGAGATGGAGATTATGAGCTTGTCAAGGATGTAG
AGATTGATGACTACCTTCGCAAACGAATCGCCAAGTCGGAAGCAGAACTGTTGGCTGAGA
AGAAATGTGTTGCACACCTCACTGGAGATGGCATCGCCTACTGTGATCTTGGTCCGGTAG
ATACTATGCTTCCCGGTGAAGTTT*GATTTT*GGTGAGGACGCTGAGCATCACAAGTAAG
CATTATCTTTTGGGTTGTTAGCTGTTGTACATAGCACACCCATATTACTCATGTTGACTG
GTTGGAATAAGTGAATTAAACTCTTCACATTTTACTTCTTATTTATACATGTGAGGTTAC
TTGAGC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2BO73TF 666 0 0
GGACCATATGGGGAAATCACTCAACGACTCAGGTGCCAGACTTCTTGAATGCCAGAATCA
ATGGCCGGCCAGTGAAGGAGGTTATTACAGATCACAAGTGGTTAGAAGAGGGATTCACTG
AGAGTGTGCAGAAGAGAGGTGGCTTACTAATTCAGAAATGGGGTCGATCTTCTGCTGCTT
CTACCGCTGTTTCCATTGTTGATGCTATAAAGTCTCTTGTAACTCCTACTCCTGAGGGTG
ACTGGTTTTCGACTGGGGTGTACACAAATGGAAATCCTTATGGTATTGCAGAGGACCTCG
TCTTCAGCATGCCATGCCGGTCAAAGGGAGATGGAGATTATGAGCTTGTCAAGGATGTAG
AGATTGATGACTACCTTCGCAAACGAATCGCCAAGTCGGAAGCAGAACTGTTGGCTGAGA
AGAAATGTGTTGCACACCTCACTGGAGATGGCATCGCCTACTGTGATCTTGGTCCGGTAG
ATACTATGCTTCCCGGTGAAGTTT*GATTTT*GGTGAGGACGCTGAGCATCACAAGTAAG
CATTATCTTTTGGGTTGTTAGCTGTTGTACATAGCACACCCATATTACTCATGTTGACTG
GTTGGAATAAGTGAATTAAACTCTTCACATTTTACTTCTTATTTATACATGTGAG*TTAC
TTGAGC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2DH87TF 309 0 0
AAATGTGTTGCACACCTCACTGGAGATGGCATCGCCTACTGTGATCTTGGTCCGGTAGAT
ACTATGCTTCCCGGTGAAGTTTTGATTTTTGGTGAGGACGCTGAGCATCACAAGTAAGCA
TTATCTTTTGGGTTGTTAGCTGTTGTACATAGCACACCCATATTACTCATGTTGACTGGT
TGGAATAAGTGAATTAAACTCTTCACATTTTACTTCTTATTTATACATGTGAG*TTACTT
GAGCAATAGAGCAAACTCATGTTATACAATAGCGTCTGTACACACTTGAAAATGTCCTCT
GCTTATTGA

QA 1 309 1 309
DS 



AS 1 2

CO CL3664Contig1 781 2 2 U
GGGCCTCTCACTTGAATCTGCGTACAAATCACGAACACGTTGAACTCCTATTGCTTTCTC
TCTCTCAAACCCTACGATCTTCCTCAAGATTAGATAACGAAAGGAGGCAAATCAAAGACC
GAAACCAGGAGCTCTAAGCTCTCTGTGACCAAGAAGCCTGCGAAGGCAGCAGGCCGTAGC
AAAGCGGCTGCTAAGGATCCAAACAAACCAAAGAGGCCTGCCAGTGCCTTCTTCGTTTTC
ATGGAAGACTTCCGTCAGACTTTCAAGAAGGAACACCCCAAGAACAAATCTGTTGCTGCT
GTTGGAAAAGCTGCTGGAGACAAGTGGAAATCACTATCAGACGCTGAGAAGGCACCTTAC
GTTGCTAAGGCTGAGCAGCGCAAGGTCGACTATGAGAAGAACATGAAGGCCTACAACAAG
AAACAGGAGGAAGGTCCGAAAGAAGATGAGGAATCTGACAAGTCAGTTTCAGAAGTTAAT
GATGAAGATGATGCTGAGGATGGTAGTGATGAGGAGGAGGATGATGACTAATAAGTTGGA
AGTTTGTAAACATTAGTATAGATGGCTGCAAAGATCTCTCTCTGTTTTCTTTTATCTTAA
AATGTTTATGGGGCTGATTAAAAGGTGTCTTTTATCTTTCTTTTCGTTTTGGTACTTCCC
ACAACCTATATCCCATGTTACCAAGCCCCTTTGTATGGAGAAAGTGAAATGTAGAATGTG
TAGATGGTGAAAGAGAGACTTGCAGCTCTGTACTCTTGTGTTCTATAAAACGATTTACCC
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2CL35TF U 1
AF RR2CL35JQ C 50
BS 1 713 RR2CL35TF
BS 714 781 RR2CL35JQ

RD RR2CL35TF 713 0 0
GGGCCTCTCACTTGAATCTGCGTACAAATCACGAACACGTTGAACTCCTATTGCTTTCTC
TCTCTCAAACCCTACGATCTTCCTCAAGATTAGATAACGAAAGGAGGCAAATCAAAGACC
GAAACCAGGAGCTCTAAGCTCTCTGTGACCAAGAAGCCTGCGAAGGCAGCAGGCCGTAGC
AAAGCGGCTGCTAAGGATCCAAACAAACCAAAGAGGCCTGCCAGTGCCTTCTTCGTTTTC
ATGGAAGACTTCCGTCAGACTTTCAAGAAGGAACACCCCAAGAACAAATCTGTTGCTGCT
GTTGGAAAAGCTGCTGGAGACAAGTGGAAATCACTATCAGACGCTGAGAAGGCACCTTAC
GTTGCTAAGGCTGAGCAGCGCAAGGTCGACTATGAGAAGAACATGAAGGCCTACAACAAG
AAACAGGAGGAAGGTCCGAAAGAAGATGAGGAATCTGACAAGTCAGTTTCAGAAGTTAAT
GATGAAGATGATGCTGAGGATGGTAGTGATGAGGAGGAGGATGATGACTAATAAGTTGGA
AGTTTGTAAACATTAGTATAGATGGCTGCAAAGATCTCTCTCTGTTTTCTTTTATCTTAA
AATGTTTATGGGGCTGATTAAAAGGTGTCTTTTATCTTTCTTTTCGTTTTGGTACTTCCC
ACAACCTATATCCCATGTTACCAAGCCCCTTTGTATGGAGAAAGTGAAATGTA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2CL35JQ 732 0 0
ATTGCTT
TCTCTCTCTCAAACCCTACGATCTTCCTCAAGATTAGATAACGAAAGGAGGCAAATCAAA
GACCGAAACCAGGAGCTCTAAGCTCTCTGTGACCAAGAAGCCTGCGAAGGCAGCAGGCCG
TAGCAAAGCGGCTGCTAAGGATCCAAACAAACCAAAGAGGCCTGCCAGTGCCTTCTTCGT
TTTCATGGAAGACTTCCGTCAGACTTTCAAGAAGGAACACCCCAAGAACAAATCTGTTGC
TGCTGTTGGAAAAGCTGCTGGAGACAAGTGGAAATCACTATCAGACGCTGAGAAGGCACC
TTACGTTGCTAAGGCTGAGCAGCGCAAGGTCGACTATGAGAAGAACATGAAGGCCTACAA
CAAGAAACAGGAGGAAGGTCCGAAAGAAGATGAGGAATCTGACAAGTCAGTTTCAGAAGT
TAATGATGAAGATGATGCTGAGGATGGTAGTGATGAGGAGGAGGATGATGACTAATAAGT
TGGAAGTTTGTAAACATTAGTATAGATGGCTGCAAAGATCTCTCTCTGTTTTCTTTTATC
TTAAAATGTTTATGGGGCTGATTAAAAGGTGTCTTTTATCTTTCTTTTCGTTTTGGTACT
TCCCACAACCTATATCCCATGTTACCAAGCCCCTTTGTATGGAGAAAGTGAAATGTAGAA
TGTGTAGATGGTGAAAGAGAGACTTGCAGCTCTGTACTCTTGTGTTCTATAAAACGATTT
ACCCT

QA 8 732 8 732
DS 



AS 1 3

CO CL3665Contig1 816 3 5 U
GTCAATCAAAAGTGAAACTCACTAAGTAAAAACAGAAAAGAGTACAAAGATCATCGTTGA
TTATTATGAATACAAATAAGAAACTTAAGAAGTGAAACATATAATCCAA*CCATAAGTCT
CAACACAAACCAGAAGGAGCATTTAAAGTAAAAAGACAGAGTAAAGGCTTTT*ATGCAGC
TGCAGTGATGTATTCGATTGCCTCCTTGCAGATACCTGTCATTGTTGCTTCAGGACCATA
CACCTCGATGGGGACACCGATTTCATCTCCAAGGGATCTCATTTTAGCAAGTCCCTTTTG
GTAGTTTGGTCCTCCTCTCCTCACATATATATGCATCCTTGCTGCTTTCAGCTTTGCTTC
CTTTTCCTTGAGAGCTCGGATAATGCCATTGAAGGTAGCAGCAACATCGGTGAAGTTCGC
AATTCCACCTCCGATCACTAGTGCTCTGGTTTTTCCATCCGGATTCGCTGTAGCACAATC
AATGACAACTCTAGCGTACTGTAAAACCTCGTCTTCTTTGGGTGCTCCACTGTATTCAGC
ATAGTTTCCAAGCTCAGATGCATACCCGAGATCTCCAACCGTATCGGCATAGATGACACT
TGCACCTCCTCCAGCGACCATAGTCCAAATCCTTCCCTTGGGATTCAGAACAGTGAACTT
CAAAGATGCGCTTGTCTTCTCATCTAGACCGTGGATGAAGCTCTCGGTGGGGCTCATCAC
TCTTCCAAATGGCATGGGGAATTCAATGTCTCCCCACTTCTTAAAGTTTTTGAAAGCAGC
GGTGTCATCAAGCTCACCCCTCATATCCAGAGGATA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2BX75JQ U 1
AF RR2AK06JQ U 1
AF RR2AR14JQ U 11
BS 1 204 RR2AK06JQ
BS 205 205 RR2BX75JQ
BS 206 206 RR2AK06JQ
BS 207 207 RR2BX75JQ
BS 208 816 RR2AK06JQ

RD RR2BX75JQ 738 0 0
GA
CAATCAAAAGTGAAACTCACTAAGTAAAAACAGAAAAGAGTACAAAGATCATCGTTGATT
ATTATGAATACAAATAAGAAACTTAAGAAGTGAAACATATAATCCAA*CCATAAGTCTCA
ACACAAACCAGAAGGAGCATTTAAAGTAAAAAGACAGAGTAAAGGCTTTT*ATGCAGCTG
CAGTGATGTATTCGATTGCCTCCTTGCAGATACCTGTCATTGTTGCTTCAGGACCATACA
CCTCGATGGGGACACCGATTTCATATCCAAGGGATCCCATTTTAGCAAGTCCCTTTTGGT
AGTTTGGTCCTCCTCTCCTCACATATATATGCATCCTTGCTGCTTTCAGCTTTGCTTCCT
TTTCCTTGAGAGCTCGGATGATGCCATTGAAGGTAGCAGCAACATCGGTGAAGTTCGCAA
TTCCACCTCCGATCACTAGTGCTCTGGTTTTTCCATCCGGATTCGCAGTAGCACAATCAA
TGACAACTCTAGCGTACTGTAAAACCTCGTCTTCTTTGGGTGCTCCACTGTATTCAGCAT
AGTTTCCAAGCTCAGATGCATACCCGAGATCTCCAACCGTATCGGCATAGATGACACTTG
CACCTCCTCCAGCGACCATAGTCCAAATCCTTCCCTTGGGATTCAGAACAGTGAACTTCA
AAGATGCGCTTGTCTTCTCATCTAGACCGTGGATGAAGCTCTCGGTGGGGCTCATCACTC
TTCCAAATGGCATGGG

QA 3 738 3 738
DS 

RD RR2AK06JQ 816 0 0
GTCAATCAAAAGTGAAACTCACTAAGTAAAAACAGAAAAGAGTACAAAGATCATCGTTGA
TTATTATGAATACAAATAAGAAACTTAAGAAGTGAAACATATAATCCAA*CCATAAGTCT
CAACACAAACCAGAAGGAGCATTTAAAGTAAAAAGACAGAGTAAAGGCTTTT*ATGCAGC
TGCAGTGATGTATTCGATTGCCTCAT*GCAGATACCTGTCATTGTTGCTTCAGGACCATA
CACCTCGATGGGGACACCGATTTCATCTCCAAGGGATCTCATTTTAGCAAGTCCCTTTTG
GTAGTTTGGTCCTCCTCTCCTCACATATATATGCATCCTTGCTGCTTTCAGCTTTGCTTC
CTTTTCCTTGAGAGCTCGGATAATGCCATTGAAGGTAGCAGCAACATCGGTGAAGTTCGC
AATTCCACCTCCGATCACTAGTGCTCTGGTTTTTCCATCCGGATTCGCTGTAGCACAATC
AATGACAACTCTAGCGTACTGTAAAACCTCGTCTTCTTTGGGTGCTCCACTGTATTCAGC
ATAGTTTCCAAGCTCAGATGCATACCCGAGATCTCCAACCGTATCGGCATAGATGACACT
TGCACCTCCTCCAGCGACCATAGTCCAAATCCTTCCCTTGGGATTCAGAACAGTGAACTT
CAAAGATGCGCTTGTCTTCTCATCTAGACCGTGGATGAAGCTCTCGGTGGGGCTCATCAC
TCTTCCAAATGGCATGGGGAATTCAATGTCTCCCCACTTCTTAAAGTTTTTGAAAGCAGC
GGTGTCATCAAGCTCACCCCTCATATCCAGAGGATA

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR2AR14JQ 803 0 0
AA
TGAAACACACTATGTAAAAACAGAAAAGAGTACAAAGATCCTCGTTGATTATTATGAATA
CAAATAAGAAACTTAAGAAGTGAAACATATAATCCAAACCATTAGTCTCAACACAAACCA
GAAGGAGCATTTAAAGTAACAAGATAGAGTAAAGGCTTTTTATGCAGCTGCAGTGATGTA
TTCGATTGCCTCCTTGCAGATACCTGTCATTGTTGCTTCAGGACCATACACCTCGATGGG
GACACCGATTTCATCTCCAAGGGATCTCATTTTAGCAAGTCCCTTTTGGTAGTTTGGTCC
TCCTCTCCTCACATATATATGCATCCTTGCTGCTTTCAGCTTTGCTTCCTTTTCCTTGAG
AGCTCGGATAATGCCATTGAAGGTAGCAGCAACGTCGGTGAAGTTAGCAATTCCACCTCC
GATCACTAGTGCTCTGGTTTTTCCATCAGGATTCGCTGTAGCACAATCAATGACGACTCT
AGCGTACTGCAAAACCTCGTCTTCTTTTGGTGCTCCACTGTATTCAACATAGTTTCCAAG
CTCAGATGCATACCCGAGATCTCCAACCGTATCGACATAGATGACACTTGCACCTCCTCC
AGCGACCATAGTCCAAATCCTTCCCTTGGGATTCAGAACAGTGAACTTCAAAGATGCGCT
TGTCTTCTCATCTAGACCGTGGATGAAGCTCTCTGTGGGGCTCATCACTCTTCCAAATGG
CATGGGGAATTCAATGTCTCCCCACTTCTTAAAGTTTTTGAAAGCAGCGGTGTCATCAAG
CTCACCCCTCATATCCAGAGG

QA 3 803 3 803
DS 



AS 1 3

CO CL3666Contig1 877 3 2 U
GGTATTGAAAGACACTGACAGCTGAGCAGAGTTCCAGAAAATAACGAAAACACACAAGGT
AAGTGAGAGAGAATATAACACAACGACAATGCCATTTTCATTCCTTGCACTGGCAAAAAA
AAGACAAGACACAAGCCCTAAAAGTCTCAAAAAACTCACTTGAGCTTAGATTTCGAAGAG
CTCATGAGAGGTTTAGCAATGGGACGAGCAGGAGCAGCAGCCCTCGTGGCTTTCTTCAAG
TTATAATTTATCATAGAGAAAGCGCAGATCACCGCAACCACCATGGTCGGGTACACATAA
ACGGTTCTAGCTGGGTCGGTATTAGCTGGCTTCTTCAAGATCCCTTCTTTGACAAGACCC
CAAACCAGCAGCAACGACCCAAACATGCCCATCCTACCAGGCTTCAGCAAACCGATAAAG
GCCCCAGCTACAGAGAAGTAGCTCCCTGCAAGAACCTCTAGGCGCTGAAGATCGGGAACT
GCAGATGCTTCTTTGACGTTGGTGAGATTGTAAATATCTAACACATTCTCCCACTTTGGA
AACGTCATGTTGGTGGCGAGACCATGGACAATAGCACCAGGGTATAAGAGAGCCTTGATA
ACCGGAACGGGAAAGATGTCACTTGAAATCAACTGAGAGGATGTCACATGGATCGGTGAC
ATACACATTCCAGATCTACACGGTACCCTGAAGAGAGGGATCTGGAGGATGATCAAGAGG
AAGTAAACCCATGAAGCTATCGACGAAAAGTTCTTAAGCCATCCCTTTGATTGTGCTGGA
TTCGCCATTATCAAGCCCCGGAAGGAAAACAATCTAGAGAGAGATTAGTTCCTTTGTTGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGTGGACCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO59JQ U 22
AF RR2BR11JQ U 1
AF RR2BR11TF C 143
BS 1 809 RR2BR11JQ
BS 810 877 RR2BR11TF

RD RR2EO59JQ 100 0 0
CTGAGCAGAGTTCCAGAAAATAACGAAAACACACAAGGTAAGTGAGAGAGAATATAACAC
AACGACAATGCCATTTTCATTCCTTGCACTGGCAAAAAAA

QA 1 100 1 100
DS 

RD RR2BR11JQ 811 0 0
GGTATTGAAAGACACTGACAGCTGAGCAGAGTTCCAGAAAATAACGAAAACACACAAGGT
AAGTGAGAGAGAATATAACACAACGACAATGCCATTTTCATTCCTTGCACTGGCAAAAAA
AAGACAAGACACAAGCCCTAAAAGTCTCAAAAAACTCACTTGAGCTTAGATTTCGAAGAG
CTCATGAGAGGTTTAGCAATGGGACGAGCAGGAGCAGCAGCCCTCGTGGCTTTCTTCAAG
TTATAATTTATCATAGAGAAAGCGCAGATCACCGCAACCACCATGGTCGGGTACACATAA
ACGGTTCTAGCTGGGTCGGTATTAGCTGGCTTCTTCAAGATCCCTTCTTTGACAAGACCC
CAAACCAGCAGCAACGACCCAAACATGCCCATCCTACCAGGCTTCAGCAAACCGATAAAG
GCCCCAGCTACAGAGAAGTAGCTCCCTGCAAGAACCTCTAGGCGCTGAAGATCGGGAACT
GCAGATGCTTCTTTGACGTTGGTGAGATTGTAAATATCTAACACATTCTCCCACTTTGGA
AACGTCATGTTGGTGGCGAGACCATGGACAATAGCACCAGGGTATAAGAGAGCCTTGATA
ACCGGAACGGGAAAGATGTCACTTGAAATCAACTGAGAGGATGTCACATGGATCGGTGAC
ATACACATTCCAGATCTACACGGTACCCTGAAGAGAGGGATCTGGAGGATGATCAAGAGG
AAGTAAACCCATGAAGCTATCGACGAAAAGTTCTTAAGCCATCCCTTTGATTGTGCTGGA
TTCGCCATTATCAAGCCCCGGAAGGAAAA
AA

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2BR11TF 735 0 0
AAGTCTC
AAAAACTCACTTGAGCTTAGATT*CGAAGAGCTCATGAGAGGTTTAGCAATGGGACGAGC
AGGAGCAGCAGCCCTCGTGGCTTTCTTCAAGTTATAATTTATCATAGAGAAAGCGCAGAT
CACCGCAACCACCATGGTCGGGTACACATAAACGGTTCTAGCTGGGTCGGTATTAGCTGG
CTTCTTCAAGATCCCTTCTTTGACAAGACCCCAAACCAGCAGCAACGACCCAAACATGCC
CATCCTACCAGGCTTCAGCAAACCGATAAAGGCCCCAGCTACAGAGAAGTAGCTCCCTGC
AAGAACCTCTAGGCGCTGAAGATCGGGAACTGCAGATGCTTCTTTGACGTTGGTGAGATT
GTAAATATCTAACACATTCTCCCACTTTGGAAACGTCATGTTGGTGGCGAGACCATGGAC
AATAGCACCAGGGTATAAGAGAGCCTTGATAACCGGAACGGGAAAGATGTCACTTGAAAT
CAACTGAGAGGATGTCACATGGATCGGTGACATACACATTCCAGATCTACACGGTACCCT
GAAGAGAGGGATCTGGAGGATGATCAAGAGGAAGTAAACCCATGAAGCTATCGACGAAAA
GTTCTTAAGCCATCCCTTTGATTGTGCTGGATTCGCCATTATCAAGCCCCGGAAGGAAAA
CAATCTAGAGAGAGATTAGTTCCTTTGTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGTG
GACCCTCC

QA 8 735 8 735
DS 



AS 1 2

CO CL3667Contig1 1275 2 2 U
GGACACACTGCAATACGAACTACAGATCAACAAGTTTTTTTTTCTTAAACGAGAGCTGCA
GTGTTTTAGACGACCAACATCTTGAAATGGGTCAAACTTTGTCACCTGAAGACACCGTTA
GAGCAGAGGCAAAGAGCCACAACAACGTTCACTTAATGTTGGTTGATGGAATGTCTAAGG
TAATGACTCGACAAGTTGAGAATTGTGTGTCATCGGATATCTACGTTGGTGGTCTAAAAT
GGAACATCGTTATCTTGACACAGCAGGACTGCCTATACTATGCTCTGGTTATCACCGACA
GCAAGTGTATCGGTTCTAGTTGGAAAGTCAATTGCAACGTCAAACTTACCATATACTCTG
CTACTTCTTCAATCCTTAACTACAACCGCTGGACGTGGTTTTGTTTCGACGCAAACAATT
CTACATTATTGGTAAGCATCCCACTCAACAACACGAAGGATTTATACACTGTGAACGACA
AATCAGTTTTCTCAGCCGAGATCACAAACGTCAACCCGCAATCCCTCGACGTTAGCTGGA
CCCCTCGAACTATAGGGACAGCAGAAAGCATTAAACTGATAGAGGTGGAGAGAAACAAGT
CTAAATTCACTTGGAAGATTACTCACTTCTCCACCTTCATTGGTGAACATCATTCCTCGT
ATCAGTTCACCGCTGGACCACGCAGATGGTACCTACGGATGTACCCGAAAGGAACCTTAG
AGGGGAAAGGAAATTCATTGTCTTTGTATTTGCATGCGTCTGATTACGTGACGAGTCCAA
ATACAAAAACTCTGGCCGTCTTTAAACTGCGAGTGTTGGACCAATTCAAACGCAATCACC
ATGAAATAGGCCAGCACTTTTGGTTTGGCTTTGATGGGCAGAAGGGAGAATCCAAATTTT
TGGCGCTGGAGGAATTGCACAAGGCTTCAAACGGATTTTTGGTGAAAGACGAGATATATA
TTGGTGTTGAGTTTTTCTATATCTCCACCACCCAGAATATGATATGATTGTTATCAATGA
ATCAATTAAGACCACAAGAATAAATAGCTCCTGGAGAGGAACTTATCTACCTATTCGTGA
CAAAAAAATCTACTTATCCCCTAATTTGCATATCATGGTGTGTTTAGAAATGCAAAAATA
AAACGATCAAATCGGTTGCTTGTACTTTCTGGCATTATAACATTCAACCGAATTTGATGC
TATGTTTTATGTATTCTCATAAGGAGAAAGTTGCTTTGTATGTGTGCTTATGTTCCTTTT
TTTTCTGTACATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C520TF U 1
AF RR2C520JQ C 501
BS 1 695 RR2C520TF
BS 696 1275 RR2C520JQ

RD RR2C520TF 695 0 0
GGACACACTGCAATACGAACTACAGATCAACAAGTTTTTTTTTCTTAAACGAGAGCTGCA
GTGTTTTAGACGACCAACATCTTGAAATGGGTCAAACTTTGTCACCTGAAGACACCGTTA
GAGCAGAGGCAAAGAGCCACAACAACGTTCACTTAATGTTGGTTGATGGAATGTCTAAGG
TAATGACTCGACAAGTTGAGAATTGTGTGTCATCGGATATCTACGTTGGTGGTCTAAAAT
GGAACATCGTTATCTTGACACAGCAGGACTGCCTATACTATGCTCTGGTTATCACCGACA
GCAAGTGTATCGGTTCTAGTTGGAAAGTCAATTGCAACGTCAAACTTACCATATACTCTG
CTACTTCTTCAATCCTTAACTACAACCGCTGGACGTGGTTTTGTTTCGACGCAAACAATT
CTACATTATTGGTAAGCATCCCACTCAACAACACGAAGGATTTATACACTGTGAACGACA
AATCAGTTTTCTCAGCCGAGATCACAAACGTCAACCCGCAATCCCTCGACGTTAGCTGGA
CCCCTCGAACTATAGGGACAGCAGAAAGCATTAAACTGATAGAGGTGGAGAGAAACAAGT
CTAAATTCACTTGGAAGATTACTCACTTCTCCACCTTCATTGGTGAACATCATTCCTCGT
ATCAGTTCACCGCTGGACCACGCAGATGGTACCTA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2C520JQ 775 0 0
ATCACAAACGTCAACCCGCAATCCCTCGACGTTAGCTGGACCCCTCGAACTATAGGGACA
GCAGAAAGCATTAAACTGATAGAGGTGGAGAGAAACAAGTCTAAATTCACTTGGAAGATT
ACTCACTTCTCCACCTTCATTGGTGAACATCATTCCTCGTATCAGTTCACCGCTGGACCA
CGCAGATGGTACCTACGGATGTACCCGAAAGGAACCTTAGAGGGGAAAGGAAATTCATTG
TCTTTGTATTTGCATGCGTCTGATTACGTGACGAGTCCAAATACAAAAACTCTGGCCGTC
TTTAAACTGCGAGTGTTGGACCAATTCAAACGCAATCACCATGAAATAGGCCAGCACTTT
TGGTTTGGCTTTGATGGGCAGAAGGGAGAATCCAAATTTTTGGCGCTGGAGGAATTGCAC
AAGGCTTCAAACGGATTTTTGGTGAAAGACGAGATATATATTGGTGTTGAGTTTTTCTAT
ATCTCCACCACCCAGAATATGATATGATTGTTATCAATGAATCAATTAAGACCACAAGAA
TAAATAGCTCCTGGAGAGGAACTTATCTACCTATTCGTGACAAAAAAATCTACTTATCCC
CTAATTTGCATATCATGGTGTGTTTAGAAATGCAAAAATAAAACGATCAAATCGGTTGCT
TGTACTTTCTGGCATTATAACATTCAACCGAATTTGATGCTATGTTTTATGTATTCTCAT
AAGGAGAAAGTTGCTTTGTATGTGTGCTTATGTTCCTTTTTTTTCTGTACATACC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 3

CO CL3668Contig1 633 3 1 U
AACAACCATCAAAACTCCCAAATATATCATTTCATCATAACCAAATATCATTTCACCATA
ACAGACGAAAGAAAATATCTTATGAAATTTTGCGAAGTGATAAAACAACGAAATGAGACC
AAAGAAGGTCGCATATTGTTTCTTCCTCTTTACTCCTCGGCCTTCTCGGCGGCGACTTCC
CCAGCAGCGACAACTTCCTCTGACTCAGTCTTCTCCTCCTCCACAACAGCCGGAGTTTCA
GTCACCTCCTCCTTCTTTTCTATCTTTGCCTCCTCCTCCTCAGCCAACGGAGCTTCCGCC
TTCTCTTCTTCCTGTGGCTCTTTTATTTCTTCATCTTTTTTCTCTGCCTCTTCAACAACC
ACTTCTTTGCTCGTTTCTACGACTGGTGATTCAGATTCTTGTTCAGTTACGGCGGCTGGA
GCAGCAGCAGATTCTGTCGTGGCGGCCACGACTTCTTCCGGCTGTTTGGTCTCCACGTCT
GGATCCACCACTGCCTTTGCTGCCACCTCAACGTTCTCTGCTGCTGGAGCAATCACTTGT
TCAACCTCAACGGTGGCCATTTCCAAACGACGAGCTAAAGATGATAGATATAAAGAGAAA
TAGAAGAGAAGTAAAATGTATTTGATGCTTTCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FE92JQ U 4
AF RR2AH29JQ U 1
AF RR2AH29TF C 1
BS 1 633 RR2AH29JQ

RD RR2FE92JQ 376 0 0
AACCATCAAAACTCCCAAATATATCATTTCATCATAACCAAATATCATTTCATCATAACA
GACGAAAGAAAATATCTTATGAAATTTTGCGAAGTGATAAAACAACGAAATGAGACCAAA
GAAGGTCGCATATTGTTTCTTCCTCTTTACTCCTCGGCCTTCTCGGCGGCGACTTCCCCA
GCAGCGACAACTTCCTCTGACTCAGTCTTCTCCTCCTCCACAACAGCCGGAGTTTCAGTC
ACCTCCTCCTTCTTTTCTATCTTTGCCTCCTCCTCCTCAGCCAACGGAGCTTCCGCCTTC
TCTTCTTCCTGTGGCTCTTTTATTTCTTCATCTTTTTTCTCTGCCTCTTCAACAACCACT
TCTTTGCTCGTTTCTA

QA 1 376 1 376
DS 

RD RR2AH29JQ 633 0 0
AACAACCATCAAAACTCCCAAATATATCATTTCATCATAACCAAATATCATTTCACCATA
ACAGACGAAAGAAAATATCTTATGAAATTTTGCGAAGTGATAAAACAACGAAATGAGACC
AAAGAAGGTCGCATATTGTTTCTTCCTCTTTACTCCTCGGCCTTCTCGGCGGCGACTTCC
CCAGCAGCGACAACTTCCTCTGACTCAGTCTTCTCCTCCTCCACAACAGCCGGAGTTTCA
GTCACCTCCTCCTTCTTTTCTATCTTTGCCTCCTCCTCCTCAGCCAACGGAGCTTCCGCC
TTCTCTTCTTCCTGTGGCTCTTTTATTTCTTCATCTTTTTTCTCTGCCTCTTCAACAACC
ACTTCTTTGCTCGTTTCTACGACTGGTGATTCAGATTCTTGTTCAGTTACGGCGGCTGGA
GCAGCAGCAGATTCTGTCGTGGCGGCCACGACTTCTTCCGGCTGTTTGGTCTCCACGTCT
GGATCCACCACTGCCTTTGCTGCCACCTCAACGTTCTCTGCTGCTGGAGCAATCACTTGT
TCAACCTCAACGGTGGCCATTTCCAAACGACGAGCTAAAGATGATAGATATAAAGAGAAA
TAGAAGAGAAGTAAAATGTATTTGATGCTTTCC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2AH29TF 633 0 0
AAC
AACCATCAAAACTCCCAAATATATCATTTCATCATAACCAAATATCATTTCACCATAACA
GACGAAAGAAAATATCTTATGAAATTTTGCGAAGTGATAAAACAACGAAATGAGACCAAA
GAAGGTCGCATATTGTTTCTTCCTCTTTACTCCTCGGCCTTCTCGGCGGCGACTTCCCCA
GCAGCGACAACTTCCTCTGACTCAGTCTTCTCCTCCTCCACAACAGCCGGAGTTTCAGTC
ACCTCCTCCTTCTTTTCTATCTTTGCCTCCTCCTCCTCAGCCAACGGAGCTTCCGCCTTC
TCTTCTTCCTGTGGCTCTTTTATTTCTTCATCTTTTTTCTCTGCCTCTTCAACAACCACT
TCTTTGCTCGTTTCTACGACTGGTGATTCAGATTCTTGTTCAGTTACGGCGGCTGGAGCA
GCAGCAGATTCTGTCGTGGCGGCCACGACTTCTTCCGGCTGTTTGGTCTCCACGTCTGGA
TCCACCACTGCCTTTGCTGCCACCTCAACGTTCTCTGCTGCTGGAGCAATCACTTGTTCA
ACCTCAACGGTGGCCATTTCCAAACGACGAGCTAAAGATGATAGATATAAAGAGAAATAG
AAGAGAAGTAAAATGTATTTGATGCTTTCC

QA 4 633 4 633
DS 



AS 1 3

CO CL3669Contig1 797 3 2 U
AAATGGAACCCTTTTTCTTTGGTTTATTTTCCACATTAAATAATACAATGAAAATAAATT
GAAAAAAAAACCATTACAGCAACACCAGATTCAGTTTATGTCTTCCCATTGATGTATGAT
ATATAAATCACATGCATCCAAATAGCTTTTTAGGTGCCGTTCCAGTGGCACGGTACTTGG
CAGCTAATTCCTCGGCTTTGAGAACCTCTTCTCCACGTCTAGCTTCGATCATGGCTCTCT
TCTCTTCTGCCTGTTTGTGGATTTGAGCTATTTTGTTCTTCATTTGCTCCACATACTCTG
CCTTCTTCTTCTCCAATTGTTCCTCCATTTTCTTGAGCTCAGCTTCCACTGCTGCTTTCT
TGTTGTTCTCCAATGACTCAATTGAAGAAAGTTTCTTCTCAGCTTTGTTCTCCACTTTGC
ACTTCTCAGCCTCTTCCCAAGCTTTGATAAGTGACATCCTCTTTTCTGTCTCAACTCTAG
CCAGGACCGCATCTCGATTAACCGAGCCTTCTTTCTTTTCTTCCCCTGCTTCCTTTGCGA
CGATGGGAACAATAGCCTTGGAGTCCTCTAGCTTCTCCTCTGCAGGCGCCGGAGATGGAA
GAACTGGTGGTGGAGCCACAGGCTTCTCCTGTGGAGCAACATCGACCGCAGCAAGAGGTT
TCTCCTCCGGAGCTGGCGCTGATGGAGTTGGTTCAGACACGGTAGGAACGTTCTCCGTCA
CCTTCTTCTGTTCCTCTTCGGCCATGTCGTATATGACGTCAGGTATAACAACTAAAGATT
ACAAGAGAACAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E989JQ U 157
AF RR2H520JQB U 1
AF RR2H520TF C 98
BS 1 737 RR2H520JQB
BS 738 797 RR2H520TF

RD RR2E989JQ 278 0 0
CCGTTCCAGTGGCACGGTACTTGGCAGCTAATTCCTCGGCTTTGAGAACCTCTTCTCCAC
GTCTAGCTTCGATCATGGCTCTCTTCTCTTCTGCCTGTTTGTGGATTTGAGCTATTTTGT
TCTTCATTTGCTCCACATACTCTGCCTTCTTCTTCTCCAATTGTTCCTCCATTTTCTTGA
GCTCAGCTTCCACTGCTGCTTTCTTGTTGTTCTCCCATGACTCAATTGAAGAAAGTTTCT
TCTCAGCTTTGTTCTCCACTTTGCACTTCTCAACCTCT

QA 1 278 1 278
DS 

RD RR2H520JQB 737 0 0
AAATGGAACCCTTTTTCTTTGGTTTATTTTCCACATTAAATAATACAATGAAAATAAATT
GAAAAAAAAACCATTACAGCAACACCAGATTCAGTTTATGTCTTCCCATTGATGTATGAT
ATATAAATCACATGCATCCAAATAGCTTTTTAGGTGCCGTTCCAGTGGCACGGTACTTGG
CAGCTAATTCCTCGGCTTTGAGAACCTCTTCTCCACGTCTAGCTTCGATCATGGCTCTCT
TCTCTTCTGCCTGTTTGTGGATTTGAGCTATTTTGTTCTTCATTTGCTCCACATACTCTG
CCTTCTTCTTCTCCAATTGTTCCTCCATTTTCTTGAGCTCAGCTTCCACTGCTGCTTTCT
TGTTGTTCTCCAATGACTCAATTGAAGAAAGTTTCTTCTCAGCTTTGTTCTCCACTTTGC
ACTTCTCAGCCTCTTCCCAAGCTTTGATAAGTGACATCCTCTTTTCTGTCTCAACTCTAG
CCAGGACCGCATCTCGATTAACCGAGCCTTCTTTCTTTTCTTCCCCTGCTTCCTTTGCGA
CGATGGGAACAATAGCCTTGGAGTCCTCTAGCTTCTCCTCTGCAGGCGCCGGAGATGGAA
GAACTGGTGGTGGAGCCACAGGCTTCTCCTGTGGAGCAACATCGACCGCAGCAAGAGGTT
TCTCCTCCGGAGCTGGCGCTGATGGAGTTGGTTCAGACACGGTAGGAACGTTCTCCGTCA
CCTTCTTCTGTTCCTCT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2H520TF 700 0 0
TATGTC
TCCCATTGATGTATGATATATAAATCACATGCATCCAAATAGCTTTT*AGGTGCCGTTCC
AGTGGCACGGTACTTGGCAGCTAATTCCTCGGCTTTGAGAACCTCTTCTCCACGTCTAGC
TTCGATCATGGCTCTCTTCTCTTCTGCCTGTTTGTGGATTTGAGCTATTTTGTTCTTCAT
TTGCTCCACATACTCTGCCTTCTTCTTCTCCAATTGTTCCTCCATTTTCTTGAGCTCAGC
TTCCACTGCTGCTTTCTTGTTGTTCTCCAATGACTCAATTGAAGAAAGTTTCTTCTCAGC
TTTGTTCTCCACTTTGCACTTCTCAGCCTCTTCCCAAGCTTTGATAAGTGACATCCTCTT
TTCTGTCTCAACTCTAGCCAGGACCGCATCTCGATTAACCGAGCCTTCTTTCTTTTCTTC
CCCTGCTTCCTTTGCGACGATGGGAACAATAGCCTTGGAGTCCTCTAGCTTCTCCTCTGC
AGGCGCCGGAGATGGAAGAACTGGTGGTGGAGCCACAGGCTTCTCCTGTGGAGCAACATC
GACCGCAGCAAGAGGTTTCTCCTCCGGAGCTGGCGCTGATGGAGTTGGTTCAGACACGGT
AGGAACGTTCTCCGTCACCTTCTTCTGTTCCTCTTCGGCCATGTCGTATATGACGTCAGG
TATAACAACTAAAGATTACAAGAGAACAAAAAAA

QA 7 700 7 700
DS 



AS 1 2

CO CL3670Contig1 822 2 2 U
GGAGCCGTCACCCCCGTTAAAAACCAGGGTTTGTGCGGATCATGCTGGTCGTTTAGCGCC
ACAGGAGCTCTTGAAGGAGCACATTTTCTAGCGACTAAAGAGCTCGTCAGCCTCAGCGAG
CAGCAGCTCATAGACTGCGACCATACGTGTGATCCACAAGAAGCCAGTTCATGTGACAGT
GGTTGCAGAGGAGGACTAATGAACAACGCTTTTGAGTACACTTTCAAAACCGGCGGTCTT
ATGAAGGAACAAGACTATCCTTATACAGGACGTGACCGTTCTGTTTGCAAATTCGACAAG
ACCATGATCGCCGCTAAAGTGTCTAACTTCAGCGTTGTCTCTGCGGATGAAGACCAAATC
GCTGCAAATCTAGTCCAGAACGGTCCTCTTGCTATTGCTATAAACGCATTGTGGATGCAA
ACTTACATAGGAGGAGTGTCGTGCCCGTATGTATGTTCCAAGAGCCAAGACCACGGAGTG
CTCTTGGTTGGGTTTGGTTCATCGGGCTATGCACCACTCCGTCTTGAGGATAAGCCTTAT
TGGATCATTAAGAATTCATGGGGATCCATGTGGGGAGAGAAGGGTTACTACAAAATCTGC
AGGGGAAGTCAGAACATCTGCGGTGTGGACACGATGGTATCTACCGTTGCTGCTGTTCAT
ACAACACCTCAGTAGGACTATTAGGACACTACTGGGGTTTACATGTCCTTGTATATATAT
GTATGTATCTGTATAAACACTATCAACTGCTAGTATTAGTATCTTTGATGAACAATGATA
CACCTATTATAAGATGGAATAACATTAAGTTATATATTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA52TF U 1
AF RR2AA52JQ C 27
BS 1 675 RR2AA52TF
BS 676 822 RR2AA52JQ

RD RR2AA52TF 679 0 0
GGAGCCGTCACCCCCGTTAAAAACCAGGGTTTGTGCGGATCATGCTGGTCGTTTAGCGCC
ACAGGAGCTCTTGAAGGAGCACATTTTCTAGCGACTAAAGAGCTCGTCAGCCTCAGCGAG
CAGCAGCTCATAGACTGCGACCATACGTGTGATCCACAAGAAGCCAGTTCATGTGACAGT
GGTTGCAGAGGAGGACTAATGAACAACGCTTTTGAGTACACTTTCAAAACCGGCGGTCTT
ATGAAGGAACAAGACTATCCTTATACAGGACGTGACCGTTCTGTTTGCAAATTCGACAAG
ACCATGATCGCCGCTAAAGTGTCTAACTTCAGCGTTGTCTCTGCGGATGAAGACCAAATC
GCTGCAAATCTAGTCCAGAACGGTCCTCTTGCTATTGCTATAAACGCATTGTGGATGCAA
ACTTACATAGGAGGAGTGTCGTGCCCGTATGTATGTTCCAAGAGCCAAGACCACGGAGTG
CTCTTGGTTGGGTTTGGTTCATCGGGCTATGCACCACTCCGTCTTGAGGATAAGCCTTAT
TGGATCATTAAGAATTCATGGGGATCCATGTGGGGAGAGAAGGGTTACTACAAAATCTGC
AGGGGAAGTCAGAACATCTGCGGTGTGGACACGATGGTATCTACCGTTGCTGCTGTTCAT
ACAACACCTCAGTAG
ACTA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2AA52JQ 796 0 0
GGGTTTGTGCGGATCATGCTGGTCGTTTAGCGCCACAGGAGCTCTTGAAGGAGCACATTT
TCTAGCGACTAAAGAGCTCGTCAGCCTCAGCGAGCAGCAGCTCATAGACTGCGACCATAC
GTGTGATCCACAAGAAGCCAGTTCATGTGACAGTGGTTGCAGAGGAGGACTAATGAACAA
CGCTTTTGAGTACACTTTCAAAACCGGCGGTCTTATGAAGGAACAAGACTATCCTTATAC
AGGACGTGACCGTTCTGTTTGCAAATTCGACAAGACCATGATCGCCGCTAAAGTGTCTAA
CTTCAGCGTTGTCTCTGCGGATGAAGACCAAATCGCTGCAAATTTAGTCCAGAACGGTCC
TCTTGCTATTGCTATAAACGCATTGTGGATGCAAACTTACATAGGAGGAGTGTCGTGCCC
GTATGTATGTTCCAAGAGCCAAGACCACGGAGTGCTCTTGGTTGGGTTTGGTTCATCGGG
CTATGCACCACTCCGTCTTGAGGATAAGCCTTATTGGATCATTAAGAATTCATGGGGATC
CATGTGGGGAGAGAAGGGTTACTACAAAATCTGCAGGGGAAGTCAGAACATCTGCGGTGT
GGACACGATGGTATCTACCGTTGCTGCTGTTCATACAACACCTCAGTAGGACTATTAGGA
CACTACTGGGGTTTACATGTCCTTGTATATATATGTATGTATCTGTATAAACACTATCAA
CTGCTAGTATTAGTATCTTTGATGAACAATGATACACCTATTATAAGATGGAATAACATT
AAGTTATATATTATGC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 3

CO CL3671Contig1 745 3 9 U
TAAATACTCTGCTCTCAACTTCTCAGAGTCGGCTAGGGTTTTAGCTTTATCTGAAGAACA
ATGGCCATGTATCTTCTTTACGAATCATCTTCCGGGTACGGCCTGTTCGAAGCACACGGC
CTCGATGAGATAGGGCAGAACACAGAGGCAGTTCGAAGCTCCGTCTCGGACCTGAGTCGG
TTCGGTCGTGTCGCCCAGCTCACTGCTTTCCACCCATCCGAGTCTGCACTCGATGCTCTT
AACCAAATCAACGCCGTCTCCGAAGGGTATATGAGTGATGAGCTGAGAAGTTTTCTGGAG
TTGAACCTTCCGAAAGTGAAGGAAGGCAAGAAGCCCAAGTTCAGCTTAGGAGTCTCTGAG
CCAAAGATTGGTTCTTGCATCTTTGAAGTCACCAAGATTCCATGCCAGAGCAATGAGTTC
GTTCATGAGCTTCTTAGAGGTGTTCGTCAGCATTTTGATAGGTTCATCAAGGACCTAAAG
CCTGGCGATTTGGAGAAAGCACAACTTGGACTAGCTCACAGCTACAGCAGAGCAAAGGTG
AAGTTCAATGTTAACCGTGTGGATAACATGGTTATTCAAGCCATTTTCATGCTTGATACT
CTTGATAAG*ATATCAACTCCTTTGCCATGAGAGTCAGAGAATGGTACTCGTGGCACTTC
CCAGAGCTAGTGAAGATAGTAAATGACAACTACCTTTACGCCCGAGTCTCAAGATGATTG
AGACAGTCAAAGCTCTCTGAGAGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G381TF U 29
AF RR2GJ15TF U 29
AF RR2G520TF U 1
BS 1 115 RR2G520TF
BS 116 116 RR2G381TF
BS 117 193 RR2G520TF
BS 194 194 RR2G381TF
BS 195 388 RR2G520TF
BS 389 389 RR2G381TF
BS 390 620 RR2G520TF
BS 621 621 RR2G381TF
BS 622 745 RR2G520TF

RD RR2G381TF 690 0 0
GG
GGCTAGGGTTTTAGCTTTATCTGAAGAACAATGGCCATGTATCTTCTTTACGAATCATCT
TCCGGGTACGGCCTGTTCGAAGCACACGGCCTCGATGAGATAGGGCAGAACACAGAGGCA
GTTCGAAGCTCCGTCTCGGACCTGAGTCGGTTCGGTCGTGTCGCCCAGCTCACTGCTTTC
CACCCATCCGAGTCTGCACTCGATGCTCTTAACCAAATCAACGCCGTCTCCGAAGGGTAT
ATGAGTGATGAGCTGAGAAGTTTTCTGGAGTTGAACCTTCCGAAAGTGAAGGAAGGCAAG
AAGCCCAAGTTCAGCTTAGGAGTCTCTGAGCCAAAGATTGGTTCTTGCATCTTTGAAGTC
ACCAAGATTCCATGCCAGAGCAATGAGTTCGTTCATGAGCTTCTTAGAGGTGTTCGTCAG
CATTTTGATAGGTTCATCAAGGACCTAAAGCCTGGCGATTTGGAGAAAGCACAACTTGGA
CTAGCTCACAGCTACAGCAGAGCAAAGGTGAAGTTCAATGTTAACCGTGTGGATAACATG
GTTATTCAAGCCATTTTCATGCTTGATACTCTTGATAAGGATATCAACTCCTTTGCCATG
AGAGTCAGAGAATGGTACTCGTGGCACTTCCCAGAGCTAGTGAAGATAGTAAATGACAAC
TACCTTTACGCCCGAGTCTCAA
AGATGA

QA 3 684 3 684
DS 

RD RR2GJ15TF 650 0 0
GG
GGCTAGGGTTTTAGCTTTATCTGAAGAACAATGGCCATGTATCTTCTTTACGAATCATCT
TCCGGGTACGGCCTGTTCGAAGCACACGGCCTCGATGAGATAGGGCAGAACACAGAGGCA
GTTCGAAGCTCCGTCTCGGACCTGAGTCGGTTCGGTCGTGTCGCCCAGCTCACTGCTTTC
CACCCATCCGAGTCTGCACTCGATGCTCTTAACCAAATCAACGCCGTCTCCGAAGGGTAT
ATGAGTGATGAGCTGAGAAGTTTTCTGGAGTTGAACCTTCCGAAAGTGAAGGAAGGCAAG
AAGCCCAAGTTCAGCTTAGGAGTCTCTGAGCCAAAGATTGGTTCTTGCATCTTTGAAGTC
ACCAAGATTCCATGCCAGAGCAATGAGTTCGTTCATGAGCTTCTTAGAGGTGTTCGTCAG
CATTTTGATAGGTTCATCAAGGACCTAAAGCCTGGCGATTTGGAGAAAGCACAACTTGGA
CTAGCTCACAGCTACAGCAGAGCAAAGGTGAAGTTCAATGTTAACCGTGTGGATAACATG
GTTATTCAAGCCATTTTCATGCTTGATACTCTTGATAAG*ATATCAACTCCTTTGCCATG
AGAGTCAGAGAATGGTACTCGTGGCACTTCCCAGAGCTAGTGAAGATA

QA 3 650 3 650
DS 

RD RR2G520TF 745 0 0
TAAATACTCTGCTCTCAACTTCTCAGAGTCGGCTAGGGTTTTAGCTTTATCTGAAGAACA
ATGGCCATGTATCTTCTTTACGAATCATCTTCCGGGTACGGCCTGTTCGAAGCACGCGGC
CTCGATGAGATAGGGCAGAACACAGAGGCAGTTCGAAGCTCCGTCTCGGACCTGAGTCGG
TTCGGTCGTGTCGTCCAGCTCACTGCTTTCCACCCATCCGAGTCTGCACTCGATGCTCTT
AACCAAATCAACGCCGTCTCCGAAGGGTATATGAGTGATGAGCTGAGAAGTTTTCTGGAG
TTGAACCTTCCGAAAGTGAAGGAAGGCAAGAAGCCCAAGTTCAGCTTAGGAGTCTCTGAG
CCAAAGATTGGTTCTTGCATCTTTGAAGCCACCAAGATTCCATGCCAGAGCAATGAGTTC
GTTCATGAGCTTCTTAGAGGTGTTCGTCAGCATTTTGATAGGTTCATCAAGGACCTAAAG
CCTGGCGATTTGGAGAAAGCACAACTTGGACTAGCTCACAGCTACAGCAGAGCAAAGGTG
AAGTTCAATGTTAACCGTGTGGATAACATGGTTATTCAAGCCATTTTCATGCTTGATACT
CTTGATAAG*ATATCAACTCTTTTGCCATGAGAGTCAGAGAATGGTACTCGTGGCACTTC
CCAGAGCTAGTGAAGATAGTAAATGACAACTACCTTTACGCCCGAGTCTCAAGATGATTG
AGACAGTCAAAGCTCTCTGAGAGCA

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 3

CO CL3672Contig1 742 3 25 U
GCTCGAAATTATTCAAATAATAATCACCAACAAGGGGAGAACATATGTATCATCCCAAAC
ATAAAACTTACAACCAAGAAAGAGAGCAAGCAAGTCTAGGCCACAACAACCATAACAACA
CCAAGAAGTTTCAAATGCAACTACCAAGAGAGTTTGCTTATTTTATGCATTATAGACTCT
AATTATACATTAAAAAAAACCCACCAGGCCGGGAGTTTTTCACTGAAGGACAAGGCACTC
AGAGGCAGTCCCGTTCGTGATAGGACCTCCATGGGCGGTTCGGTTGCTTTTCTGGTTAAC
ACTGCCACTAGGGTTGTCCTGTTCAACTATGGTTCCTTCAACCTCCTCCTCTTGGTAACT
ACAACCTATGGCTTCAAAGATGAGAGCATAAACCTCCTTGAACCTTTCCTCTGACAGAGA
AGCTTCTGCGAGGAGCCTCCATGCGTTCTCCTCCGAAGCTCCTTCGTAATCCTCTTTCCT
CTTGAGCACCATGTGACCACTTATCTCCCACACAGCTGGGTTCACTTGAGTTTCCAAAAC
CTCCGGGCTTACTTCACCTAGTGCCTGTTTCTCTGCGTAACACTGTGGCATCAGGAAGAT
CTGCCTTCCACAATCAGCAATGAGAATGTTGAAAGGAATGTTGTTGTTCTGGAGGCAAAC
GCAGGCATCTGATACAGTATCAGATAGGTCTTGCATAGAGCTCCCACCTTCAAAGAGAAG
ACTTCTCACAGGGTAACTCAGA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G183JQ U 1
AF RR2G183TF C 1
AF RR2F560JQ U 1
BS 1 75 RR2F560JQ
BS 76 76 RR2G183JQ
BS 77 87 RR2F560JQ
BS 88 88 RR2G183JQ
BS 89 124 RR2F560JQ
BS 125 125 RR2G183JQ
BS 126 190 RR2F560JQ
BS 191 191 RR2G183JQ
BS 192 199 RR2F560JQ
BS 200 200 RR2G183JQ
BS 201 331 RR2F560JQ
BS 332 332 RR2G183JQ
BS 333 333 RR2F560JQ
BS 334 334 RR2G183JQ
BS 335 345 RR2F560JQ
BS 346 346 RR2G183JQ
BS 347 483 RR2F560JQ
BS 484 484 RR2G183JQ
BS 485 498 RR2F560JQ
BS 499 499 RR2G183JQ
BS 500 537 RR2F560JQ
BS 538 538 RR2G183JQ
BS 539 543 RR2F560JQ
BS 544 544 RR2G183JQ
BS 545 742 RR2F560JQ

RD RR2G183JQ 562 0 0
GCTCGAAATTATTCAAATAATAATCACCAACAAGGGGAGAACATATGTATCATCCCAAAC
ATAAAACTTACAACCAAGAAAGAGAGCAAGCAAGTCTAGGCCACAACAACCATAACAACA
CCAAGAAGTTTCAAATGCAACTACCAAGAGAGTTTGCTTATTTTATGCATTATAGACTCT
AATTATACATTAAAAAAAACCCACCAGGCCGGGAGTTTTTCACTGAAGGACAAGGCACTC
AGAGGCAGTCCCGTTCGTGATAGGACCTCCATGGGCGGTTCGGTTGCTTTTCTGGTTAAC
ACTGCCACTAGGGTTGTCCTGTTCAACTATGGTTCCTTCAACCTCCTCCTCTTGGTAACT
ACAACCTATGGCTTCAAAGATGAAAGCATAAACCTCCTTGAACCTTTCCTCTGACAGAAA
AGCTTCTGCGAGGAGCCTCCATGCGTTCTCCTCCGAAGCTCCTTCGTAATCCTCTTTCCT
CTTGAGCACCATGTGACCACTTATCTCCCACACAGCTGGGTTCACTTGAGTTTCCAAAAC
CTCCGGGCTTACTTCACCTAGT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2G183TF 562 0 0
GCTCGAAATTATTCAAATAATAATCACCAACAAGGGGAGAACATATGTATCATCCCAAAC
ATAAAACTTACAACCAAGAAAGAGAGCAAGCAAGTCTAGGCCACAACAACCATAACAACA
CCAAGAAGTTTCAAATGCAACTACCAAGAGAGTTTGCTTATTTTATGCATTATAGACTCT
AATTATACATTAAAAAAAACCCACCAGGCCGGGAGTTTTTCACTGAAGGACAAGGCACTC
AGAGGCAGTCCCGTTCGTGATAGGACCTCCATGGGCGGTTCGGTTGCTTTTCTGGTTAAC
ACTGCCACTAGGGTTGTCCTGTTCAACTATGGTTCCTTCAACCTCCTCCTCTTGGTAACT
ACAACCTATGGCTTCAAAGATGAGAGCATAAACCTCCTTGAACCTTTCCTCTGACAGAGA
AGCTTCTGCGAGGAGCCTCCATGCGTTCTCCTCCGAAGCTCCTTCGTAATCCTCTTTCCT
CTTGAGCACCATGTGACCACTTATCTCCCACACAGCTGGGTTCACTTGAGTTTCCAAAAC
CTCCGGGCTTACTTCACCTAGT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2F560JQ 742 0 0
GCTCGAAATTATTCAAATAATAATCACCAACAAGGGGAGAACATATGTATCATCCCAAAC
ATAAAACTTACAACCGAGAAAGAGAGCCAGCAAGTCTAGGCCACAACAACCATAACAACA
CCAACAAGTTTCAAATGCAACTACCAAGAGAGTTTGCTTATTTTATGCATTATAGACTCT
AATTATACAT*AAAAAAAAACCACCAGGCCGGGAGTTTTTCACTGAAGGACAAGGCACTC
AGAGGCAGTCCCGTTCGTGATAGGACCTCCATGGGCGGTTCGGTTGCTTTTCTGGTTAAC
ACTGCCACTAGGGTTGTCCTGTTCAACTATGCTACCTTCAACCTCTTCCTCTTGGTAACT
ACAACCTATGGCTTCAAAGATGAGAGCATAAACCTCCTTGAACCTTTCCTCTGACAGAGA
AGCTTCTGCGAGGAGCCTCCATGCGTTCTCCTCCGAAGCTCCTTCGTAATCCTCTTTCCT
CTTCAGCACCATGTGACCGCTTATCTCCCACACAGCTGGGTTCACTTGAGTTTCCAACAC
CTCGGGGCTTACTTCACCTAGTGCCTGTTTCTCTGCGTAACACTGTGGCATCAGGAAGAT
CTGCCTTCCACAATCAGCAATGAGAATGTTGAAAGGAATGTTGTTGTTCTGGAGGCAAAC
GCAGGCATCTGATACAGTATCAGATAGGTCTTGCATAGAGCTCCCACCTTCAAAGAGAAG
ACTTCTCACAGGGTAACTCAGA

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 3

CO CL3673Contig1 940 3 4 U
CGTTTCTGAATGAATTTTAATGAAGACACGAAAGGACCAGACAGAGTTCTTGAACTGTAT
TTAAGTTATCAATGACAGAAGCTATACTATTAAGCAGAAAATAAAGAAGAAGAAGAAATG
TTTTAAGTGGAAGAAGGAGGAGCAGAGTTCTTGCGTATCTTCAAATATCCAAACTTGCCA
GCTCCAGGAGATGATCCTTCAAACACATATGGCACAAACCCTGTTGCTTCCTTGTACTTT
CTCTGTATCTCAAGAATCTGTTCACTGCTTCTCAAACTGCTCCTT*CCAATAACACATAC
TGTTCCGCCGCTACCACCTCCTGTGATCTTGGCCCCGTAGAGAGTCCCGTTCTCGGTTTT
AGAGTGCTTCAACTTCTCCATTTTCTGTACTAGTCTCACTAACCTGTCTGTACCATCAGA
GCCAAGCCCACACGCGCTGTAGCTATCATGGCACTGGTACATAAGCTCCCCTAGACCAAT
GACCTGTTCTTCTGATGGAGTTGCTGTCAACAATGCTTTGAAAGCCTGGACACGGAAGTT
CTCATAGATTGGATGTTTAGTCGGCGCCATTATGTGGTAAGTACCTTTCCTGTCAATGGT
TGTGACAGAATCACCATGATCACCATACTTCTCGATGAATTCTTCTCCGGTGATAACCTG
TGGGAGCTTACTTGCGTATAGAGCTCGAAATCTATGAGGTGAAAGGTTGCATAAGTAATC
CAAAGAAGCATCGTATTCAATCAACTCCGAGCTCTCCTCTTCACCCTCTCCGGAGTTGGT
TAATGTAGAAGATGCAAAAGCTCTTATCATTGTTTTGCCAATAAAAGCTCCTATCCTCAC
AGAACCATAGTCTGAACCACCAACACTGCAGAGTAAAAACTTATTGTTTTCAGAACAAAG
TGTAAATGAGAGTGTTAAATGAAAAAAAAAGGAAATTTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY61JQ U 1
AF RR2AM47JQ U 1
AF RR2AM47TF C 235
BS 1 114 RR2AM47JQ
BS 115 117 RR2BY61JQ
BS 118 828 RR2AM47JQ
BS 829 940 RR2AM47TF

RD RR2BY61JQ 760 0 0
CGTTTCTGAATGAATTTTAATGAAGACACGAAAGGACCAGACAGAGTTCTTGAACTGTAT
TTAAGTTATCAATGACAGAAGCTATACTATTAAGCAGAAAATAAAGAAGAAGAAGAAATG
TTTTAAGTGGAAGAAGGAGGAGCAGAGTTCTTGCGTATCTTCAAATATCCAAACTTGCCA
GCTCCAGGAGATGATCCTTCAAACACATATGGCATAAACCCTGTTGCTTCCTTGTACTTT
CTCTGTATCTCAAGAATCTGTTCACTGCTTCTCAAACTGCTCCTT*CCAATAACACATAC
TGTTCCGCCGCTACCACCTCCTGTGATCTTGGCCCCGTAGAGAGTCCCGTTCTCGGTTTT
AGAGTGCTTCAACTTCTCCATTTTCTGTACTAGTCTCACTAACCTGTCTGTACCATCAGA
GCCAAGCCCACACGCGCTGTAGCTATCATGGCACTGGTACATAAGCTCCCCTAGACCAAT
GACCTGTTCTTCTGATGGAGTTGCTGTCAACAATGCTTTGAAAGCCTGGACACGGAAGTT
CTCATAGATTGGATGTTTAGTCGGCGCCATTATGTGGTAAGTACCTTTCCTGTCAATGGT
TGTGACAGAATCACCATGATCACCATACTTCTCGATGAATTCTTCTCCTGTGATAACCTG
TGGGAGCTTACTTGCGTATAGAGCTTGAAATCTATGAGGTGAAAGGTTGCATAAGTAATC
CAAAGAAGCATCGTATTCAATCAACTCCGAGCTCTCCTCT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2AM47JQ 828 0 0
CGTTTCTGAATGAATTTTAATGAAGACACGAAAGGACCAGACAGAGTTCTTGAACTGTAT
TTAAGTTATCAATGACAGAAGCTATACTATTAAGCAGAAAATAAAGAAGAAGAA***ATG
TTTTAAGTGGAAGAAGGAGGAGCAGAGTTCTTGCGTATCTTCAAATATCCAAACTTGCCA
GCTCCAGGAGATGATCCTTCAAACACATATGGCACAAACCCTGTTGCTTCCTTGTACTTT
CTCTGTATCTCAAGAATCTGTTCACTGCTTCTCAAACTGCTCCTT*CCAATAACACATAC
TGTTCCGCCGCTACCACCTCCTGTGATCTTGGCCCCGTAGAGAGTCCCGTTCTCGGTTTT
AGAGTGCTTCAACTTCTCCATTTTCTGTACTAGTCTCACTAACCTGTCTGTACCATCAGA
GCCAAGCCCACACGCGCTGTAGCTATCATGGCACTGGTACATAAGCTCCCCTAGACCAAT
GACCTGTTCTTCTGATGGAGTTGCTGTCAACAATGCTTTGAAAGCCTGGACACGGAAGTT
CTCATAGATTGGATGTTTAGTCGGCGCCATTATGTGGTAAGTACCTTTCCTGTCAATGGT
TGTGACAGAATCACCATGATCACCATACTTCTCGATGAATTCTTCTCCGGTGATAACCTG
TGGGAGCTTACTTGCGTATAGAGCTCGAAATCTATGAGGTGAAAGGTTGCATAAGTAATC
CAAAGAAGCATCGTATTCAATCAACTCCGAGCTCTCCTCTTCACCCTCTCCGGAGTTGGT
TAATGTAGAAGATGCAAAAGCTCTTATCATTGTTTTGCCAATAAAAGC

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2AM47TF 706 0 0
TACTTTCTCTGTATCTCAAGAATCTGTTCACTGCTTCTCAAACTGCTCCTTTCCAATAAC
ACATACTGTTCCGCCGCTACCACCTCCTGTGATCTTGGCCCCGTAGAGAGTCCCGTTCTC
GGTTTTAGAGTGCTTCAACTTCTCCATTTTCTGTACTAGTCTCACTAACCTGTCTGTACC
ATCAGAGCCAAGCCCACACGCGCTGTAGCTATCATGGCACTGGTACATAAGCTCCCCTAG
ACCAATGACCTGTTCTTCTGATGGAGTTGCTGTCAACAATGCTTTGAAAGCCTGGACACG
GAAGTTCTCATAGATTGGATGTTTAGTCGGCGCCATTATGTGGTAAGTACCTTTCCTGTC
AATGGTTGTGACAGAATCACCATGATCACCATACTTCTCGATGAATTCTTCTCCGGTGAT
AACCTGTGGGAGCTTACTTGCGTATAGAGCTCGAAATCTATGAGGTGAAAGGTTGCATAA
GTAATCCAAAGAAGCATCGTATTCAATCAACTCCGAGCTCTCCTCTTCACCCTCTCCGGA
GTTGGTTAATGTAGAAGATGCAAAAGCTCTTATCATTGTTTTGCCAATAAAAGCTCCTAT
CCTCACAGAACCATAGTCTGAACCACCAACACTGCAGAGTAAAAACTTATTGTTTTCAGA
ACAAAGTGTAAATGAGAGTGTTAAATGAAAAAAAAAGGAAATTTAC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 3

CO CL3674Contig1 886 3 11 U
GGATACAAAAAAAAAAGATTAAAAATAAAAACAATCTCGGAAAAAAA*CACAAAGACAGA
ATGTTGTGTTCCAGATCTAAAACAGTGTTCATACTTTTTTCATTTCTTCTTGTCGCCGGT
GCAATATCTATTTCTGAAAGTGTTGAAGAAGAATGGGGGACAAGTGTAAAAGAAAGGTTT
ATGGCAGAGAAAAATGGAGAGAACTCGTCTCTGATTCTGGCTGCAAAGAGAACAAAGAGG
AAAGATCCCACTGATAATTTCAACCTTTACACTGGTGGATGGAACATAAGCAATACCCAT
TACTGGACTTCTGTTGCTTATACGGCAGTGCCTTTCTTTGTGATAGCAGGAGTCTGGTTT
GTGTTCTTCGGGCTATCCTTGTCTCTCATTTGCCTTTGCTATTGCTGCTGTGCCCGTCAG
CCTTACGGATATTCCAGGGCTGCTTATGCTCTCTCCCTTATCCTCCTCTTAACATTCACA
ATCGCTGCAATTGTGGGATGTGTTTTCCTTTACACGGGTCAAGGGAAATTTCATGCAAGC
ACAACAGATACTTTGGACTATGTGGTGAGACAGGCAAATTTCACGTCAGAAAGCCTCAGG
AATGTGTCAGATTATCTCAATGCAGCTAAGAAAGTGGATGTGCAATCCATCGTTCTTCCA
GGGGATGTTTTGTCGAGCATCGACAACATACAAAGGAAAGATCAACTCCTCTGCAACTAC
TCTTTCTGTTCAAACAATGGAGAACCAAGACAGGATTCAAAATGTCTTGGACGACATGAG
ACTTGCACTCATCATCATCGCTGCTGTGATGCTTTTTCTTGCTTCATGGATTCTACTCTC
ATCTTTGGACTGCAGTGCCTTGTATATACATTGGTGATCCTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI89TF U 31
AF RR2DV62TF U 4
AF RR2A579TF U 1
BS 1 28 RR2A579TF
BS 29 29 RR2DV62TF
BS 30 341 RR2A579TF
BS 342 342 RR2CI89TF
BS 343 514 RR2A579TF
BS 515 515 RR2CI89TF
BS 516 580 RR2A579TF
BS 581 581 RR2CI89TF
BS 582 632 RR2A579TF
BS 633 633 RR2DV62TF
BS 634 886 RR2A579TF

RD RR2CI89TF 597 0 0
GGAATCTCGG
AAAAAAA*CACAAAGACAGAATGTTGTGTTCCAGATCTAAAACAGTGTTCATACTTTTTT
CATTTCTTCTTGTCGCCGGTGCAATATCTATTTCTGAAAGTGTTGAAGAAGAATGGGGGA
CAAGTGTAAAAGAAAGGTTTATGGCAGAGAAAAATGGAGAGAACTCGTCTCTGATTCTGG
CTGCAAAGAGAACAAAGAGGAAAGATCCCACTGATAATTTCAACCTTTACACTGGTGGAT
GGAACATAAGCAATACCCATTACTGGACTTCTGTTGCTTATACGGCAGTGCCTTTCTTTG
TGATAGCAGGAGTCTGGTTTGTGTTCTTCGGGCTATCCTTGTCTCTCATTTGCCTTTGCT
ATTGCTGCTGTGCCCGTCAGCCTTACGGATATTCCAGGGCTGCTTATGCTCTCTCCCTTA
TCCTCCTCTTAACATTCACAATCGCTGCAATTGTGGGATGTGTTTTCCTTTACACGGGTC
AAGGGAAATTTCATGCAAGCACAACAGATACTTTGGACTATGTGGTGAGACAGGCAAATT
TCACGTCAGAAAGCCTCAGGAATGTGTCAGATTATCTCAATGCAGCT

QA 11 597 11 597
DS 

RD RR2DV62TF 686 0 0
GGATAC
AAAAAAAGATTAAAAATAAAAACAATCTCGGAAAAAAAACACAAAGACAGAATGTTGTGT
TCCAGATCTAAAACAGTGTTCGTACTTTTTTCATTTCTTCTTGTCGCCGGTGCAATATCT
ATTTCTGAAAGTGTTGAAGAAGAATGGGGGACAAGTGAAAAAGAAAGGTTTATGGCAGAG
GAAAAGGGAGAGAACTCGTCTCTGGTTCTGGCTGCAAAGAGAACAAAGAGGAAAGATCCC
ACTGAGAATTTCAACCTTTACACTGGTGGATGGAACATAAGCAATACCCATTACTGGACT
TCTGTTGCTTATACGGCGGTGCCTTTCTTTGCGATAGCAGGAGTCTGGTTTGTGTTCTTC
GGGCTATCCTTGTCTCTCATTTGCCTCTGCTATTGCTGCTGTGCTCGTCAGCCTTACGGA
TATTCCAGGGTTGCTTATGCTCTCTCCCTTATCCTCCTCTTAACATTCACAATCGCTGCA
ATTGTGGGATGTGTTTTCCTTTACACGGGTCAAGGGAAATTTCATGCAAGCACAACAGAT
ACTTTGGACTATGTGGTGAGACAGGCAAATTTCACGTCAGAAAGCCTGAGGAATGTGTCA
GATTATCTCAATGCAGCTAAGAAAGTGGATGTGCAATCCATCGTTCTTCCAGGGGATGTT
TTGTCGAGCATCGACA
CATA

QA 7 682 7 682
DS 

RD RR2A579TF 886 0 0
GGATACAAAAAAAAAAGATTAAAAATAAGAACAATCTCGGAAAAAAA*CACAAAGACAGA
ATGTTGTGTTCCAGATCTAAAACAGTGTTCATACTTTTTTCATTTCTTCTTGTCGCCGGT
GCAATATCTATTTCTGAAAGTGTTGAAGAAGAATGGGGGACAAGTGTAAAAGAAAGGTTT
ATGGCAGAGAAAAATGGAGAGAACTCGTCTCTGATTCTGGCTGCAAAGAGAACAAAGAGG
AAAGATCCCACTGATAATTTCAACCTTTACACTGGTGGATGGAACATAAGCAATACCCAT
TACTGGACTTCTGTTGCTTATACGGCAGTGCCTTTCTTTGTAATAGCAGGAGTCTGGTTT
GTGTTCTTCGGGCTATCCTTGTCTCTCATTTGCCTTTGCTATTGCTGCTGTGCCCGTCAG
CCTTACGGATATTCCAGGGCTGCTTATGCTCTCTCCCTTATCCTCCTCTTAACATTCACA
ATCGCTGCAATTGTGGGATGTGTTTTCCTTTACATGGGTCAAGGGAAATTTCATGCAAGC
ACAACAGATACTTTGGACTATGTGGTGAGACAGGCAAATTACACGTCAGAAAGCCTCAGG
AATGTGTCAGATTATCTCAATGCAGCTAAGAAGGTGGATGTGCAATCCATCGTTCTTCCA
GGGGATGTTTTGTCGAGCATCGACAACATACAAAGGAAAGATCAACTCCTCTGCAACTAC
TCTTTCTGTTCAAACAATGGAGAACCAAGACAGGATTCAAAATGTCTTGGACGACATGAG
ACTTGCACTCATCATCATCGCTGCTGTGATGCTTTTTCTTGCTTCATGGATTCTACTCTC
ATCTTTGGACTGCAGTGCCTTGTATATACATTGGTGATCCTTGGTT

QA 1 886 1 886
DS 



AS 1 2

CO CL3675Contig1 846 2 8 U
GGAACAACAAAACAAATATTTTCTCTTATCAATCTAGCAAAAAATGGATCCTTCTATAGC
TCAAGAAGAGTCTAAGTTATTAGATACACCTGCCACTGACCCTTCTCCTACAGCTCAAGA
AGAGCAAGAAGAGCCTCAGTTAGTAGACACACCTGCTATAGTTCCTTCTCCGATAGCACA
GGAGCCTGACAACGATGTTCCAGCACCGGGAACCCAGTTTGCTGAGTTCGCCGCTGGATG
CTTCTGGGGACTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATCCCTGGGGTGATCGAGACCGAGGTCGG
GTACACTCAAGGGATCTCACATAATCCTACATACAAGGTTGTCCGCACGAACAAAACGAA
CCATGCAGAGGTTGTAAGGGTTCAGTATGATCCCAATGAGTGCAGCTATGAGACCCTGCT
TGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCTCCTTAAATCGTCAGGGAGAGCTTGTGGG
AGCTCAATACCGATCAGGGATATACTTCTATACACCAGAGCAAGAGAAGCTAGCACGTGA
GTCTCTAGAGAATCAGCAGAAAAAGCTTGAGGAGAAGATTGTGACTGAGATCTTACCAGT
GAAGAAGTTCTACAAAGCCGAAGAATACCATCAGCATTACCTCGTCAAACGTGGCATGTA
TGGCAATGCACAATCTCCTGCAAAGAGCTGCAAGGACCCTATCCGTTGCTACGGCTAAGT
ATAAAGACTTCTGTAGCTATTTCATCCCAAAACAGAGGAGTGTTCTCTGTTTGTATGTAT
GTACGTATGTTTGTGTTGTTGATTTGTAATTCTCAGCTCATAATAAAGATGTGGAAATAT
TACAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH49TF U 1
AF RR2GH49JQB C 190
BS 1 694 RR2GH49TF
BS 695 695 RR2GH49JQB
BS 696 713 RR2GH49TF
BS 714 714 RR2GH49JQB
BS 715 724 RR2GH49TF
BS 725 725 RR2GH49JQB
BS 726 745 RR2GH49TF
BS 746 846 RR2GH49JQB

RD RR2GH49TF 745 0 0
GGAACAACAAAACAAATATTTTCTCTTATCAATCTAGCAAAAAATGGATCCTTCTATAGC
TCAAGAAGAGTCTAAGTTATTAGATACACCTGCCACTGACCCTTCTCCTACAGCTCAAGA
AGAGCAAGAAGAGCCTCAGTTAGTAGACACACCTGCTATAGTTCCTTCTCCGATAGCACA
GGAGCCTGACAACGATGTTCCAGCACCGGGAACCCAGTTTGCTGAGTTCGCCGCTGGATG
CTTCTGGGGACTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATCCCTGGGGTGATCGAGACCGAGGTCGG
GTACACTCAAGGGATCTCACATAATCCTACATACAAGGTTGTCCGCACGAACAAAACGAA
CCATGCAGAGGTTGTAAGGGTTCAGTATGATCCCAATGAGTGCAGCTATGAGACCCTGCT
TGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCTCCTTAAATCGTCAGGGAGAGCTTGTGGG
AGCTCAATACCGATCAGGGATATACTTCTATACACCAGAGCAAGAGAAGCTAGCACGTGA
GTCTCTAGAGAATCAGCAGAAAAAGCTTGAGGAGAAGATTGTGACTGAGATCTTACCAGT
GAAGAAGTTCTACAAAGCCGAAGAATACCATCAGCATTACCTCGTCAAACGTGGCATGTA
TGGCAATGCACAATCTCCTGCAAAGAGCTGCAAG*ACCCTATCCGTTGCTACG*CTAAGT
ATAA*GACTTCTGTAGCTATTTCAT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2GH49JQB 657 0 0
CAACGATGTTCCAGCACCGGGAACCCAGTTTGCTGAGTTCGCCGCTGGATGCTTCTGGGG
ACTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATCCCTGGGGTGATCGAGACCGAGGTCGGGTACACTCA
AGGGATCTCACATAATCCTACATACAAGGTTGTCCGCACGAACAAAACGAACCATGCAGA
GGTTGTAAGGGTTCAGTATGATCCCAATGAGTGCAGCTATGAGACCCTGCTTGATTTGTT
CTGGTCTAGGCATGATCCCACCTCCTTAAATCGTCAGGGAGAGCTTGTGGGAGCTCAATA
CCGATCAGGGATATACTTCTATACACCAGAGCAAGAGAAGCTAGCACGTGAGTCTCTAGA
GAATCAGCAGAAAAAGCTTGAGGAGAAGATTGTGACTGAGATCTTACCAGTGAAGAAGTT
CTACAAAGCCGAAGAATACCATCAGCATTACCTCGTCAAAGGTGGCATGTATGGCAATGC
ACAATCTCCTGCAAAGAGCTGCAAGGACCCTATCCGTTGCTACGGCTAAGTATAAAGACT
TCTGTAGCTATTTCATCCCAAAACAGAGGAGTGTTCTCTGTTTGTATGTATGTACGTATG
TTTGTGTTGTTGATTTGTAATTCTCAGCTCATAATAAAGATGTGGAAATATTACAGC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 3

CO CL3676Contig1 971 3 6 U
GGAGGAAATTAATCGGATTCTTTCTCTCTTTTCTTTCAGGGTTGATCGATTCATATTGCA
GTTTTCTGTTTGATTATTGATACAGCCATGGATTTAGAGAGCTTCAGGGTAGGTCTTACC
CCAACAGTCTTCTACATTCCTGGTTTCATCACTGACCAAGAGCAAACTCAGCTCCTCAAT
CATATATATGGAGCATCTGGTTCCAAGTGGAAGACGTTAAAGAACAGAAGATTACAGAAC
TGGGGTGGTATGGTCCATGAAAAGGGTCTTGTTCCCCAAGAGTTGCCTTCTTGGCTGACA
AAGATTACCGAGAAAATTCATGAAAGCTCGGGTCTGTTCCCTTCTGCTATAAATCATGTC
CTCATTAATGAATACCATCCTGACCAAGGGATAATGCCGCACCAAGATGGACCAGCTTAT
TTTCCTGTTGTAGCTATCCTGTCTCTAGGTTCACCTGTCGTTATGGAGTTCAGTCCCCAT
TTGAGATTAATATCAGGCGATGACGACATTTCCAGAGATCAAAGTGGAAAGAGTGGTGTG
TCTGAGAGAGAGAATCAAAACTCATTCTCTGTTTTGATGATGCCTCGAAGCCTACTAATC
TTCAAAGATGAGGCTTACTCAGATTACCTCCACGGCATTAGCGATAGCCCAACACATTGC
TACAAACAGGTCGTTAATGAAGCTGAAGCTTTGGCTTACTCTAGTGGAGATTCAAGAAAA
GGTGCTGATAAGATTCTTCACAGAGACCACACTCGCGTGTCACTTACCTGCCGTTTAGTG
CCCAAAGTCCATAAGAATCTTTTCAGGTTTTAGAGAAAACATAACAATGTAGTTTCCCTT
CAGACATTCTGGTTGTCTTGCCGTTTTGAGTGGGGAAACCGGCAGGATTTGTAAACATGG
GAACCGAAAACGGTACGATTTGTGTGTTTGTGAAGAGATAGGATTATAATATGAGCCCTA
CATTTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP77TF U 80
AF RR2A094TF U 1
AF RR2BP77JQ C 302
BS 1 443 RR2A094TF
BS 444 444 RR2BP77TF
BS 445 721 RR2A094TF
BS 722 722 RR2BP77JQ
BS 723 793 RR2A094TF
BS 794 971 RR2BP77JQ

RD RR2BP77TF 637 0 0
GG
ACAGCCATGGATTTAGAGAGCTTCAGGGTAGGTCTTACCCCAACAGTCTTCTACATTCCT
GGTTTCATCACTGACCAAGAGCAAACTCAGCTCCTCAATCATATATATGGAGCATCTGGT
TCCAAGTGGAAGACGTTAAAGATCAGAAGATTACAGAACTGGGGTGGTATGGTCCATGAA
AAGGGTCTTGTTCCCCAAGAGTTGCCTTCTTGGCTGACAAAGATTACCGAGAAAATTCAT
GAAAGCTCGGGTCTGTTCCCTTCTGCTATAAATCATGTCCTCATTAATGAATACCATCCT
GACCAAGGGATAATGCCGCACCAAGATGGACCAGCTTATTTTCCTGTTGTAGCTATCCTG
TCTCTAGGTTCACCTGTCGTTATGGAGTTCAGTCCCCATTTGAGATTAATATCAGGCGAT
GACGACATTTCCAGAGATCAAAGTGGAAAGAGTGGTGTGTCTGAGAGAGAGAATCAAAAC
TCATTCTCTGTTTTGATGATGCCTCGAAGCCTACTAATCTTCAAAGATGAGGCTTACTCA
GATTACCTCCACGGCATTAGCGATAGCCCAACACATTGCTACAAACAGGTCGTTAATGAA
GCTGAAGCTTTGGCTTACTCTAGTGGAGAT
CAAGA

QA 3 632 3 632
DS 

RD RR2A094TF 800 0 0
GGAGGAAATTAATCGGATTCTTTCTCTCTTTTCTTTCAGGGTTGATCGATTCATATTGCA
GTTTTCTGTTTGATTATTGATACAGCCATGGATTTAGAGAGCTTCAGGGTAGGTCTTACC
CCAACAGTCTTCTACATTCCTGGTTTCATCACTGACCAAGAGCAAACTCAGCTCCTCAAT
CATATATATGGAGCATCTGGTTCCAAGTGGAAGACGTTAAAGAACAGAAGATTACAGAAC
TGGGGTGGTATGGTCCATGAAAAGGGTCTTGTTCCCCAAGAGTTGCCTTCTTGGCTGACA
AAGATTACCGAGAAAATTCATGAAAGCTCGGGTCTGTTCCCTTCTGCTATAAATCATGTC
CTCATTAATGAATACCATCCTGACCAAGGGATAATGCCGCACCAAGATGGACCAGCTTAT
TTTCCTGTTGTAGCTATCCTGTCCCTAGGTTCACCTGTCGTTATGGAGTTCAGTCCCCAT
TTGAGATTAATATCAGGCGATGACGACATTTCCAGAGATCAAAGTGGAAAGAGTGGTGTG
TCTGAGAGAGAGAATCAAAACTCATTCTCTGTTTTGATGATGCCTCGAAGCCTACTAATC
TTCAAAGATGAGGCTTACTCAGATTACCTCCACGGCATTAGCGATAGCCCAACACATTGC
TACAAACAGGTCGTTAATGAAGCTGAAGCTTTGGCTTACTCTAGTGGAGATTCAAGAAAA
G*TGCTGATAAGATTCTTCACAGAGACCACACTCGCGTGTCACTTACCTGCCGTTTAGTG
CCCAAAGTCCATA
GATCTTT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2BP77JQ 670 0 0
AGATTACCGAGAAAATTCATGAAAGCTCGGGTCTGTTCCCTTCTGCTATAAATCATGTCC
TCATTAATGAATACCATCCTGACCAAGGGATAATGCCGCACCAAGATGGACCAGCTTATT
TTCCTGTTGTAGCTATCCTGTCTCTAGGTTCACCTGTCGTTATGGAGTTCAGTCCCCATT
TGAGATTAATATCAGGCGATGACGACATTTCCAGAGATCAAAGTGGAAAGAGTGGTGTGT
TTGAGAGAGAGAATCAAAACTCATTTTCTGTTTTGATGATGCCTCGAAGCCTACTAATCT
TCAAAGATGAGGCTTACTCAGATTACCTCCACGGCATTAGCGATAGCCCAACACATTGCT
ACAAACAGGTCGTTAATGAAGCTGAAGCTTTGGCTTACTCTAGTGGAGATTCAAGAAAAG
GTGCTGATAAGATTCTTCACAGAGACCACACTCGCGTGTCACTTACCTGCCGTTTAGTGC
CCAAAGTCCATAAGAATCTTTTCAGGTTTTAGAGAAAACATAACAATGTAGTTTCCCTTC
AGACATTCTGGTTGTCTTGCCGTTTTGAGTGGGGAAACCGGCAGGATTTGTAAACATGGG
AACCGAAAACGGTACGATTTGTGTGTTTGTGAAGAGATAGGATTATAATATGAGCCCTAC
ATTTTTTTTC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL3677Contig1 688 2 2 U
GGGAGATAGAGGAGAGAGAAAGATGATGGCGTTGGCTCTTCGCAGACTCTCAAATTCCCT
TAAGAAGCCCATATTCTCTAATGGCCGTTCTATGTCTTCTTTGTCAACCTCAGCTATGGC
GGACTCGGAGAGATCTCGTTCCAGTTGGGTAAAGCAGCTGAATGCACCTCTGGAAGAAGT
CGATCCAGAGGTTAACAAACAAGGCAAAGAGGTCATGTATGACTATGAGGACAGAATTAA
CGCAGCTGTCTTCCCTGGACTTCAAGGTGGTCCACATAATCACACTATAACAGGTCTAGC
AGTTGCTCTGAAGCAGGTGAAAACGCCCGAGTATAAGGCCTACCAGGATCAAGTACTCAG
TAATTGCTCAAAGTTTGCAGAGTCTTTGCTATCAAAAGGATATGACTTAGTGTCTGGAGG
CACTGACAATCATTTAGTCTTGGTGAACTTGAAAAATAAGGGGATAGATGGATCAAGAGT
GGAGAAGGTATTAGAATCAGTACATATTGCAGCAAACAAGAATACTGTTCCGGGTGATGT
TTCCGCCATGGTTCCAGGTGGCATCCGTATGGGAACACCAGCTCTCACATCGAGAGGATT
CATTGAAGAAGATTTTGCAAAAGTGGCCGAATACTTTGATTTAGCTGTCAAGATAGCCTT
GAAAATCAAGGCAGAGTCTCAAGGACAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA24TF U 1
AF RR2ER56TF U 1
BS 1 661 RR2DA24TF
BS 662 688 RR2ER56TF

RD RR2DA24TF 661 0 0
GGGAGATAGAGGAGAGAGAAAGATGATGGCGTTGGCTCTTCGCAGACTCTCAAATTCCCT
TAAGAAGCCCATATTCTCTAATGGCCGTTCTATGTCTTCTTTGTCAACCTCAGCTATGGC
GGACTCGGAGAGATCTCGTTCCAGTTGGGTAAAGCAGCTGAATGCACCTCTGGAAGAAGT
CGATCCAGAGGTTAACAAACAAGGCAAAGAGGTCATGTATGACTATGAGGACAGAATTAA
CGCAGCTGTCTTCCCTGGACTTCAAGGTGGTCCACATAATCACACTATAACAGGTCTAGC
AGTTGCTCTGAAGCAGGTGAAAACGCCCGAGTATAAGGCCTACCAGGATCAAGTACTCAG
TAATTGCTCAAAGTTTGCAGAGTCTTTGCTATCAAAAGGATATGACTTAGTGTCTGGAGG
CACTGACAATCATTTAGTCTTGGTGAACTTGAAAAATAAGGGGATAGATGGATCAAGAGT
GGAGAAGGTATTAGAATCAGTACATATTGCAGCAAACAAGAATACTGTTCCGGGTGATGT
TTCCGCCATGGTTCCAGGTGGCATCCGTATGGGAACACCAGCTCTCACATCGAGAGGATT
CATTGAAGAAGATTTTGCAAAAGTGGCCGAATACTTTGATTTAGCTGTCAAGATAGCCTT
G

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2ER56TF 688 0 0
GGGAGATAGAGGAGAGAGAAAGATGATGGCGTTGGCTCTTCGCAGACTCTCAAATTCCCT
TAAGAAGCCCATATTCTCTAATGGCCGTTCTATGTCTTCTTTGTCAACCTCAGCTATGGC
GGACTCGGAGAGATCTCGTTCCAGTTGGGTAAAGCAGCTGAATGCACCTCTGGAAGAAGT
CGATCCAGAGGTTAACAAACAAGGCAAAGAGGTCATGTATGACTATGAGGACAGAATTAA
CGCAGCTGTCTTCCCTGGACTTCAAGGTGGTCCACATAATCACACTATAACAGGTCTAGC
AGTTGCTCTGAAGCAGGTGAAAACGCCCGAGTATAAGGCCTACCAGGATCAAGTACTCAG
TAATTGCTCAAAGTTTGCAGAGTCTTTGCTATCAAAAGGATATGACTTAGTGTCTGGAGG
CACTGACAATCATTTAGTCTTGGTGAACTTGAAAAATAAGGGGATAGATGGATCAAGAGT
GGAGAAGGTATTAGAATCAGTACATATTGCAGCAAACAAGAATACTGTTCCGGGTGATGT
TTCCGCCATGGTTCCAGGTGGCATCCGTATGGGAACACCAGCTCTCACATCGAGAGGATT
CATTGAAGAAGATTTTGCAAAAGTGGCCGAATACTTTGATTTAGCTGTCAAGATAGCCTT
GAAAATCAAGGCAGAGTCTCAAGGACAA

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL3678Contig1 742 2 14 U
GGATGAAAGTCATCTTCTCTACAAGCAACTCAAACTCCAGTTAAAGAAACAAAATTGAGA
CGATGATGAAATCAAAGAGCATAGCTGCAGCTTCTGCATCATGTTTTCTTATTATGAGCT
TGTTATGCAACTACATTAGTGGCGACCAAAATGAGACTAATTATGAAGGACTATCTTACA
ATTACTACGAGAAAACATGTCCAAGACTCGAAGAGATCGTGAGATCTTCTATTTCACCAA
TGTTTGCTACTGATCCTACGGCTCCTGCCGCCTTGCTAAGGCTTATGTTTCATGACTGTC
AAGTTCAGGGATGTGACGCATCTATCCTAATCGAGACAAGTGGGGACCAGCAGTTCACGG
AGCTTGACTCAGCCAAGAACTTCGGAATCAGAAAGAGGGAACTCATTGGCTCAATCAAAA
CCTCACTAGAGGTCGAATGTCCCCAGCAAGTCTCTTGCTCTGACCTCATCATCCTCGCGG
CAAGAGAAGCCGTCGCTCTCACTGGTGGCCCACTCATCGCAGTGCCATTAGGAAGAAAAG
ACTCTCTCTCCACTCCCAGCAAACACGTGGCCGACTCTGAGCTTCCTTCCTCCACTGCTG
ATGTCGACTCTATCTTAAATCTCTTTGCTAGCATAGACATGACCATCGAGGAATCCGTTG
CCATTATGGGTTCACATTCAATAGGAGTGACACACTGTAACAACGTATTATCGCGATTTG
ATAACGAAAACGCAACGAACAC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD28TF U 1
AF RR2DN36TF U 2
BS 1 20 RR2CD28TF
BS 21 21 RR2DN36TF
BS 22 24 RR2CD28TF
BS 25 25 RR2DN36TF
BS 26 170 RR2CD28TF
BS 171 173 RR2DN36TF
BS 174 249 RR2CD28TF
BS 250 250 RR2DN36TF
BS 251 571 RR2CD28TF
BS 572 572 RR2DN36TF
BS 573 658 RR2CD28TF
BS 659 659 RR2DN36TF
BS 660 673 RR2CD28TF
BS 674 742 RR2DN36TF

RD RR2CD28TF 673 0 0
GGATGAAAGTCATCTTCTCTTCAATCAACTCAAACTCCAGTTAAAGAAACAAAATTGAGA
CGATGATGAAATCAAAGAGCATAGCTGCAGCTTCTGCATCATGTTTTCTTATTATGAGCT
TGTTATGCAACTACATTAGTGGCGACCAAAATGAGACTAATTATGAAGGA***TCTTACA
ATTACTACGAGAAAACATGTCCAAGACTCGAAGAGATCGTGAGATCTTCTATTTCACCAA
TGTTTGCTATTGATCCTACGGCTCCTGCCGCCTTGCTAAGGCTTATGTTTCATGACTGTC
AAGTTCAGGGATGTGACGCATCTATCCTAATCGAGACAAGTGGGGACCAGCAGTTCACGG
AGCTTGACTCAGCCAAGAACTTCGGAATCAGAAAGAGGGAACTCATTGGCTCAATCAAAA
CCTCACTAGAGGTCGAATGTCCCCAGCAAGTCTCTTGCTCTGACCTCATCATCCTCGCGG
CAAGAGAAGCCGTCGCTCTCACTGGTGGCCCACTCATCGCAGTGCCATTAGGAAGAAAAG
ACTCTCTCTCCACTCCCAGCAAACACGTGGCTGACTCTGAGCTTCCTTCCTCCACTGCTG
ATGTCGACTCTATCTTAAATCTCTTTGCTAGCATAGACATGACCATCGAGGAATCCGT*G
CCATTATGGGTTC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2DN36TF 741 0 0
GATGAAAGTTATCTTCTCTACAAGCAACTCAAACTCCAGTTAAAGAAACAAAATTGAGAC
GATGATGAAATCAAGGAGCGTAGCTGCAGCTTCTGCATCATGTTTTCTTATTATGAGCTT
GTTATGCAACTACATTAGTGGCGACCAAAATGAGACTAATTATGAAGGACTATCTTACAA
TTACTACGAGAAAACATGTCCAAGACTCGAAGAGATCGTGAGATCTTCTATTTCACCAAT
GTTTGCTACTGATCCTACGGCTCCTGCCGCCTTGCTAAGGCTTATGTTTCATGACTGTCA
AGTTCAGGGATGTGACGCATCTATCCTAATCGAGACAAGTGGGGACCAGCAGTTCACGGA
GCTTGACTCAGCCAAGAACTTCGGAATCAGAAAGAGGGAACTCATTGGCTCAATCAAAAC
CTCACTAGAGGTCGAATGTCCCCAGCAAGTCTCTTGCTCTGACCTCATCATCCTCGCGGC
AAGAGAAGCCGTCGCTCTCACTGGTGGCCCACTCATCGCAGTGCCATTAGGAAGAAAAGA
CTCTCTCTCCACTCCTAGCAAACACGTGGCCGACTCTGAGCTTCCTTCCTCCACTGCTGA
TGTCGACTCTATCTTAAATCTCTTTGCTAGCATAGACATGACCATCGAGGAATCCGTTGC
CATTATGGGTTCACATTCAATAGGAGTGACACACTGTAACAACGTATTATCGCGATTTGA
TAACGAAAACGCAACGAACAC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 3

CO CL3679Contig1 700 3 11 U
GGATCACTTCAAAGTCGGGATCCCGACAAGAATCCGGTGATCGAAACTCTCACACAAAGG
AGTAATCGTAAAAGATGCATTCTTTTGGTTACAGAGCAAACGCTCTGCTCACGTTCTCCC
TCACTGCCCTCGCGTTCATCTGCGCAATCGCGTCTTTCTCAGACAATTTCAGCAACCAGA
ATCCTTCTGCTGAGATCCAGATAGTTAACATCAATCGGTTTAAGAAGCAATCCTATGGAA
ACGATGAGGTCAGTTTGACATTGGACATAACTGCAGACTTGCAGTCACTTTTTACTTGGA
ACACTAAACAGGTTTTCGCTTTCGTGGCAGCAGAATATGAAACCCCAAAGAACTCCCTGA
ATCAGGTTTCTCTATGGGATGCGATTATCCCTGATAAAGAACATGCCAAGTTCCGGGTTC
AAACCTCAAACAAGTACCGTTTCATTGATCAGGGACATAACCTTCGTGGAAAAGAGTTCA
ACTTGACGTTACACTGGCATGTCATGCCCAAGACCGGCAAGATGTTTGCTGACAAGATTG
TCATGCCTGGTTACAGTTTGCCAGATGCATACAAATGATGAAGATTGAAGATTACTTCTA
AGAGTTTTTTTTTCGTATTTCGTTTTTTTTCTTTTCATGGAAAAGATTCAGTCTTCCTTT
TATTCTGTGAACTAGAAAAGTAATCTCAAAGTACTATTGA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX21TF U 1
AF RR2FA41TF U 1
AF RR2H150TF U 4
BS 1 307 RR2DX21TF
BS 308 308 RR2FA41TF
BS 309 368 RR2DX21TF
BS 369 369 RR2FA41TF
BS 370 416 RR2DX21TF
BS 417 417 RR2FA41TF
BS 418 583 RR2DX21TF
BS 584 584 RR2FA41TF
BS 585 605 RR2DX21TF
BS 606 629 RR2FA41TF
BS 630 700 RR2H150TF

RD RR2DX21TF 605 0 0
GGATCACTTCAAAGTCGGGATCCCGACAAGAATCCGGTGATCGAAACTCTCACACAAAGG
AGTAATCGTAAAAGATGCATTCTTTTGGTTACAGAGCAAACGCTCTGCTCACGTTCTCCC
TCACTGCCCTCGCGTTCATCTGCGCAATCGCGTCTTTCTCAGACAATTTCAGCAACCAGA
ATCCTTCTGCTGAGATCCAGATAGTTAACATCAATCGGTTTAAGAAGCAATCCTATGGAA
ACGATGAGGTCAGTTTGACATTGGACATAACTGCAGACTTGCAGTCACTTTTTACTTGGA
ACACTAAGCAGGTTTTCGCTTTCGTGGCAGCAGAATATGAAACCCCAAAGAACTCCCTGA
ATCAGGTTCCTCTATGGGATGCGATTATCCCTGATAAAGAACATGCCAAGTTCCGGATTC
AAACCTCAAACAAGTACCGTTTCATTGATCAGGGACATAACCTTCGTGGAAAAGAGTTCA
ACTTGACGTTACACTGGCATGTCATGCCCAAGACCGGCAAGATGTTTGCTGACAAGATTG
TCATGCCTGGTTACAGTTTGCCAGATGCATACAAATGATGAAG*TTGAAGATTACTTCTA
AGAGT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2FA41TF 629 0 0
GGATC
ACTTCAAAGTCGGGATCCCGACAAGAATCCGGTGATCGAAACTCTCACACAAAGGAGTAA
TCGTAAAAGATGCATTCTTTTGGTTACAGAGCAAACGCTCTGCTCACGTTCTCCCTCACT
GCCCTCGCGTTCATCTGCGCAATCGCGTCTTTCTCAGACAATTTCAGCAACCAGAATCCT
TCTGCTGAGATCCAGATAGTTAACATCAATCGGTTTAAGAAGCAATCCTATGGAAACGAT
GAGGTCAGTTTGACATTGGACATAACTGCAGACTTGCAGTCACTTTTTACTTGGAACACT
AAACAGGTTTTCGCTTTCGTGGCAGCAGAATATGAAACCCCAAAGAACTCCCTGAATCAG
GTTTCTCTATGGGATGCGATTATCCCTGATAAAGAACATGCCAAGTTCCGGGTTCAAACC
TCAAACAAGTACCGTTTCATTGATCAGGGACATAACCTTCGTGGAAAAGAGTTCAACTTG
ACGTTACACTGGCATGTCATGCCCAAGACCGGCAAGATGTTTGCTGACAAGATTGTCATG
CCTGGTTACAGTTTACCAGATGCATACAAATGATGAAGATTGAAGATTACTTCTAAGAGT
TTTTTTTTCGTATTTCGTTTTTTT

QA 6 629 6 629
DS 

RD RR2H150TF 697 0 0
GG
ACTTCAAAGTCGGGATCCCGACAAGAATCCGGTGATCGAAACTCTCACACAAAGGAGTAA
TCGTAAAAGATGCATTCTTTTGGTTACAGAGCAAACGCTCTGCTCACGTTCTCCCTCACT
GCCCTTGCGTTCATCTGCGCAATCGCGTCTTTCTCAGACAATTTCAGCAACCAGAATCCT
TCTGCTGAGATCCAGATAGTTAACATCAATCGGTTTAAGAAGCAATCCTATGGAAACGAT
GAGGTCAGTTTGACATTGGACATAACTGCAGACTTGCAGTCACTTTTTACTTGGAACACT
AAACAGGTTTTCGCTTTCGTGGCAGCAGAATATGAAACCCCAAAGAACTACCTGAATCAG
GTTTCTCTATGGGATGCGATTATCCCTGATAAAGAACATGCCAAGTTCCGGGTTCAAACC
TCAAACAAGTACCGTTTCATTGATCAGGGACATAACCTTCGTGGAAAAGAGTTCAACTTG
ACGTTACACTGGCATGTCATGCCCAAGACCGGCAAGATGTTTGCTGACAAGATTGTCATG
CCTGGTTACAGTTTGCCAGATGCATACAAATGATGAAGGTTGAAGATTACTTCTAAGAGT
TTTTTTTTTGTATTTCGTTTTTTTTCTTTTCATGGAAAAGATTCAGTCTTCCTTTTATTC
TGTGAACTAGAAAAGTAATCTCAAAGTACTATTGA

QA 3 697 3 697
DS 



AS 1 3

CO CL3680Contig1 670 3 31 U
GGAGATTTCGTCTCCTCGTCGTCTCAGGGATCTAGAAGTGAAGATGGCAGGCAAGGGAGG
GAAAGGGCTCGTAGCTGCAAAGACGATGGCTTCTAACAAGGACAAAGACAAGGGCAAGAT
GAAACCCATCTCTCGATCTGCTCGTGCCGGTATTCAGTTTCCAGTGGGTCGTATCCATAG
GCAACTCAAGACCAGGGTTTCAGCACACGGAAGAGTTGGTGCCACTGCTGCTGTTTACAC
TGCTTCGATTCTGGAGTACTTGACTGCGGAAGTTCTCGAGTTAGCTGGGAACGCAAGCAA
AGATCTGAAAGTGAAGAGGATAACTCCAAGGCATCTGCAGTTGGCAATCAGAGGAGATGA
GGAGCTTGACACGCTCATCAAAGGAACCATTGCCGGAGGTGGTGTCATCCCTCACATCCA
CAAGTCTCTCATCAACAAAACCACCACTGAGTGATTTGTTGTTAAAGTGATCTTACTAGT
TAGTTGCTCATTGTGTGTTGGTGTTTTGTTAACGTCTTGAACTGCTTTTCCCTTCCCTTT
ATTAGTGTTGCCTTTTATTGGACATCTTCAGGTGTACATGAGTTAATTTGAACTCTTCTG
CTTCTCTGTTTAGCAAATCTTGTCTTTGTGGTTAGCTTCTTTCAAGTAAACCAGTTTAAT
TACCGGTGTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H409TF U 1
AF RR2E162TF U 1
AF RR2E162JQ C 1
BS 1 252 RR2H409TF
BS 253 253 RR2E162TF
BS 254 267 RR2H409TF
BS 268 268 RR2E162TF
BS 269 276 RR2H409TF
BS 277 277 RR2E162TF
BS 278 288 RR2H409TF
BS 289 289 RR2E162TF
BS 290 300 RR2H409TF
BS 301 301 RR2E162TF
BS 302 334 RR2H409TF
BS 335 335 RR2E162TF
BS 336 345 RR2H409TF
BS 346 346 RR2E162TF
BS 347 405 RR2H409TF
BS 406 406 RR2E162TF
BS 407 474 RR2H409TF
BS 475 475 RR2E162TF
BS 476 491 RR2H409TF
BS 492 492 RR2E162TF
BS 493 529 RR2H409TF
BS 530 530 RR2E162TF
BS 531 532 RR2H409TF
BS 533 533 RR2E162TF
BS 534 534 RR2H409TF
BS 535 535 RR2E162TF
BS 536 548 RR2H409TF
BS 549 549 RR2E162TF
BS 550 567 RR2H409TF
BS 568 604 RR2E162TF
BS 605 670 RR2E162JQ

RD RR2H409TF 567 0 0
GGAGATTTCGTCTCCTCGTCGTCTCAGGGATCTAGAAGTGAAGATGGCAGGCAAGGGAGG
GAAAGGGCTCGTAGCTGCAAAGACGATGGCTTCTAACAAGGACAAAGACAAGGGCAAGAT
GAAACCCATCTCTCGATCTGCTCGTGCCGGTATTCAGTTTCCAGTGGGTCGTATCCATAG
GCAACTCAAGACCAGGGTTTCAGCACACGGAAGAGTTGGTGCCACTGCTGCTGTTTACAC
TGCTTCGATTCTCGAGTACTTGACTGCAGAAGTTCTTGAGTTAGCTGGAAACGCAAGCAA
GGATCTGAAAGTGAAGAGGATAACTCCAAGGCATTTGCAGTTGGCGATCAGAGGAGATGA
GGAGCTTGACACGCTCATCAAAGGAACCATTGCCGGAGGTGGTGTGATCCCTCACATCCA
CAAGTCTCTCATCAACAAAACCACCACTGAGTGATTTGTTGTTAAAGTGATCTTGCTAGT
TAGTTGCTCATCGTGTGTTGGTGTTTTGTTAACGTCTTGAACTGCTTTTTCCCTTCCTTT
ATTAGTGTCGCCTTTTATTGGACATCT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2E162TF 604 0 0
GGAGATTTCGTCTCCTCGTCGTCTCAGGGATCTAGAAGTGAAGATGGCAGGCAAGGGAGG
GAAAGGGCTCGTAGCTGCAAAGACGATGGCTTCTAACAAGGACAAAGACAAGGGCAAGAT
GAAACCCATCTCTCGATCTGCTCGTGCCGGTATTCAGTTTCCAGTGGGTCGTATCCATAG
GCAACTCAAGACCAGGGTTTCAGCACACGGAAGAGTTGGTGCCACTGCTGCTGTTTACAC
TGCTTCGATTCTGGAGTACTTGACTGCGGAAGTTCTCGAGTTAGCTGGGAACGCAAGCAA
AGATCTGAAAGTGAAGAGGATAACTCCAAGGCATCTGCAGTTGGCAATCAGAGGAGATGA
GGAGCTTGACACGCTCATCAAAGGAACCATTGCCGGAGGTGGTGTCATCCCTCACATCCA
CAAGTCTCTCATCAACAAAACCACCACTGAGTGATTTGTTGTTAAAGTGATCTTACTAGT
TAGTTGCTCATTGTGTGTTGGTGTTTTGTTAACGTCTTGAACTGCTTTTCCCTTCCCTTT
ATTAGTGTTGCCTTTTATTGGACATCTTCAGGTGTACATGAGTTAATTTGAACTCTTCTG
CTTC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2E162JQ 670 0 0
GGAGATTTCGTCTCCTCGTCGTCTCAGGGATCTAGAAGTGAAGATGGCAGGCAAGGGAGG
GAAAGGGCTCGTAGCTGCAAAGACGATGGCTTCTAACAAGGACAAAGACAAGGGCAAGAT
GAAACCCATCTCTCGATCTGCTCGTGCCGGTATTCAGTTTCCAGTGGGTCGTATCCATAG
GCAACTCAAGACCAGGGTTTCAGCACACGGAAGAGTTGGTGCCACTGCTGCTGTTTACAC
TGCTTCGATTCTGGAGTACTTGACTGCGGAAGTTCTCGAGTTAGCTGGGAACGCAAGCAA
AGATCTGAAAGTGAAGAGGATAACTCCAAGGCATCTGCAGTTGGCAATCAGAGGAGATGA
GGAGCTTGACACGCTCATCAAAGGAACCATTGCCGGAGGTGGTGTCATCCCTCACATCCA
CAAGTCTCTCATCAACAAAACCACCACTGAGTGATTTGTTGTTAAAGTGATCTTACTAGT
TAGTTGCTCATTGTGTGTTGGTGTTTTGTTAACGTCTTGAACTGCTTTTCCCTTCCCTTT
ATTAGTGTTGCCTTTTATTGGACATCTTCAGGTGTACATGAGTTAATTTGAACTCTTCTG
CTTCTCTGTTTAGCAAATCTTGTCTTTGTGGTTAGCTTCTTTCAAGTAAACCAGTTTAAT
TACCGGTGTC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL3681Contig1 887 2 2 U
GGGGGTTCTCTTTAAACTAAGCGAAAACATAAACTGCAGTTCTGTTTCTCTTTCTTTCTC
GATGGAGCACGATAAGGATCAGGCTATGTCGGAGAATAAAAATAACAGCAACAAGGCTCA
AGATATAAATCCTAGATTTGCTAGCGAAGGTTGCAGCGTGTTGCTTGACGTGAACGATGG
CGATCGCCTCGTCTTCGCTCGTCTATCTGGTGGCGCTGGATTGAAAATAGGGAATACGAG
ATACTCGTTAAAGCCATTGATCGGAGCTCCGTTTGGATCTCTGTTCCAAGTCGAAAGCGG
AGAAGATGGTTCTTTCCTCTCTCGCATTCTTCCCATCAAAAAAGAAAGTTCTAGTAATAA
CGTTACCGAAGATACTAGAGATAATCGCGAACTTATCGACAACAATGAAGCTCAAAACCT
TACTGAAGAAGAAATTGAAGCTATGCGAAGAGAGGGTGCAAAAGGAGATGAGATTATTGA
AGCACTGATTGCAAACAGCAAAACATTTGACAAGAAGTTTCAGCTGTCTCAGGATAAATA
TAAGCTTAAGAAGCAGAAGAAGTATGCACCTAAGGTGCTTCTGAGGCGTCCTTTTGCTCG
AAGTATCTGTGAAGCTTATTTCAGGAAATATCCAGCCAGAATCGGATTCTTGCGAGTAGG
TGCGTTATCTCTTCTGTTAACAATGGCTAATGTCACCCTCACATGCAGATGAGCTCTTTT
GGTGGCTATGTTCTTAGCGGCATCAGAATCTCCACCACTTGATGATTCTTATCTCCCAAA
CCTTACCATTTTCACAAAAGGTCTTTGTATTTGTTTGTTGTTGAGATATAAAACTGAGAT
TTTTCATGCTTTTCACACCTATTGTTCTCTGTTGATCTAATAAAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK92TF U 1
AF RR2DK92JQ C 135
BS 1 606 RR2DK92TF
BS 607 887 RR2DK92JQ

RD RR2DK92TF 606 0 0
GGGGGTTCTCTTTAAACTAAGCGAAAACATAAACTGCAGTTCTGTTTCTCTTTCTTTCTC
GATGGAGCACGATAAGGATCAGGCTATGTCGGAGAATAAAAATAACAGCAACAAGGCTCA
AGATATAAATCCTAGATTTGCTAGCGAAGGTTGCAGCGTGTTGCTTGACGTGAACGATGG
CGATCGCCTCGTCTTCGCTCGTCTATCTGGTGGCGCTGGATTGAAAATAGGGAATACGAG
ATACTCGTTAAAGCCATTGATCGGAGCTCCGTTTGGATCTCTGTTCCAAGTCGAAAGCGG
AGAAGATGGTTCTTTCCTCTCTCGCATTCTTCCCATCAAAAAAGAAAGTTCTAGTAATAA
CGTTACCGAAGATACTAGAGATAATCGCGAACTTATCGACAACAATGAAGCTCAAAACCT
TACTGAAGAAGAAATTGAAGCTATGCGAAGAGAGGGTGCAAAAGGAGATGAGATTATTGA
AGCACTGATTGCAAACAGCAAAACATTTGACAAGAAGTTTCAGCTGTCTCAGGATAAATA
TAAGCTTAAGAAGCAGAAGAAGTATGCACCTAAGGTGCTTCTGAGGCGTCCTTTTGCTCG
AAGTAT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2DK92JQ 753 0 0
GATTTGCTAGCGAAGGT*GCAGCGTGTTGCTTGACGTGAACGATGGCGATCGCCTCGTCT
TCGCTCGTCTATCTGGTGGCGCTGGATTGAAAATAGGGAATACGAGATACTCGTTAAAGC
CATTGATCGGAGCTCCGTTTGGATCTCTGTTCCAAGTCGAAAGCGGAGAAGATGGTTCTT
TCCTCTCTCGCATTCTTCCCATCAAAAAAGAAAGTTCTAGTAATAACGTTACCGAAGATA
CTAGAGATAATCGCGAACTTATCGACAACAATGAAGCTCAAAACCTTACTGAAGAAGAAA
TTGAAGCTATGCGAAGAGAGGGTGCAAAAGGAGATGAGATTATTGAAGCACTGATTGCAA
ACAGCAAAACATTTGACAAGAAGTTTCAGCTGTCTCAGGATAAATATAAGCTTAAGAAGC
AGAAGAAGTATGCACCTAAGGTGCTTCTGAGGCGTCCTTTTGCTCGAAGTATCTGTGAAG
CTTATTTCAGGAAATATCCAGCCAGAATCGGATTCTTGCGAGTAGGTGCGTTATCTCTTC
TGTTAACAATGGCTAATGTCACCCTCACATGCAGATGAGCTCTTTTGGTGGCTATGTTCT
TAGCGGCATCAGAATCTCCACCACTTGATGATTCTTATCTCCCAAACCTTACCATTTTCA
CAAAAGGTCTTTGTATTTGTTTGTTGTTGAGATATAAAACTGAGATTTTTCATGCTTTTC
ACACCTATTGTTCTCTGTTGATCTAATAAAACA

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 3

CO CL3682Contig1 464 3 30 U
GGCACAAAGATAAGAGCTCTCGAGACGCGGAAAACATAGAGAGAAGAAACACGCATACCT
CAAAAGCGCAATACACAAAAAGAAAAAGTACATCTTTAGTTTTCTCCTACAAATTAAACG
CAATATGGTGTCTCAAAAGCTGGAGATCTGCATCGAGTTAGTGAAGACTGCCGTCTTTTT
TGTAGCCACCGTGGCTGAAACAGTAGAAGAAGCTTTCCGTAAGCCTCCACCGGCGCTTCC
GGTAGCTCATGATGGTCGCCGGAACAGTTACGCCGACGTTCCCATTCCGCTTGTTGGATT
CATGTGATGAGCTTTTTGTGTTTGTTAAACTTCTTTTCTTGAGTTTTGGCCTCGTTTGGC
TCTCGTGCCATGAGGCGTTTTGGAATGTTGTTGATATATGTATATAAATATAACCAAATG
AATCATGAAGAGTTACAGATAAATCAAATCGTCGATGTTTATAT


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2AD89TF U 1
AF RR2AH05JQ C 2
AF RR2AH05TF U 2
BS 1 119 RR2AD89TF
BS 120 120 RR2AH05TF
BS 121 184 RR2AD89TF
BS 185 185 RR2AH05TF
BS 186 228 RR2AD89TF
BS 229 229 RR2AH05TF
BS 230 242 RR2AD89TF
BS 243 243 RR2AH05TF
BS 244 288 RR2AD89TF
BS 289 289 RR2AH05TF
BS 290 332 RR2AD89TF
BS 333 333 RR2AH05TF
BS 334 340 RR2AD89TF
BS 341 341 RR2AH05TF
BS 342 395 RR2AD89TF
BS 396 396 RR2AH05TF
BS 397 397 RR2AD89TF
BS 398 398 RR2AH05TF
BS 399 407 RR2AD89TF
BS 408 413 RR2AH05TF
BS 414 417 RR2AD89TF
BS 418 418 RR2AH05TF
BS 419 424 RR2AD89TF
BS 425 425 RR2AH05TF
BS 426 440 RR2AD89TF
BS 441 441 RR2AH05TF
BS 442 444 RR2AD89TF
BS 445 445 RR2AH05TF
BS 446 462 RR2AD89TF
BS 463 464 RR2AH05JQ

RD RR2AD89TF 462 0 0
GGCACAAAGATAAGAGCTCTCGAGACGCGGAAAACATAGAGAGAAGAAACACGCATACCT
CAAAAGCGCAATACACAAAAAGAAAAAGTACATCTTTAGTTTTCTCCTACAAATTAAACA
CAATATGGTGTCTCAAAAGCTGGAGATCTGCATCGAGTTAGTGAAGACTGCCGTCTTTTT
TGTATCCACCGTGGCTGAAACAGTAGAAGAAGCTTTCCGTAAGCCTCCGCCGGCGCTTCC
GGCAGCTCATGATGGTCGCCGGAACAGTTACGCCGACGTTCCCATTCCTCTTGTTGGATT
CATGTGATGAGCTTTTTGTGTTTGTTAAACTTTTTTTCTTTAGTTTTGGCCTCGTTTGGC
TCTCGTGCCATGAGGCGTTTTGGAATGTTGTTGATTTGTGTATATAA******CCAAGTG
AATCTTGAAGAGTTACAGATGAATTAAATCGTCGATGTTTAT

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2AH05JQ 463 0 0
GG
ACAAAGATAAGAGCTCTCGAGACGCGGAAAACATAGAGAGAAGAAACACGCATACCTCAA
AAGCGCAATACACAAAAAGAAAAAGTACATCTTTAGTTTTTTCCTACAAATTAAACGCAA
TATGGTGTCTCAAAAGCTGGAGATCTGCATCGAGTTAGTGAAGACTGCCGTCTTTTTTGT
AGCCACCGTGGCTGAAACAGTAGAAGAAGCTTTCCGTAAGCCTCCACCGGCGCTTCCGGT
AGCTCATGATGGTCGCCGGAACAGTTACGCCGACGTTCCCATTCCGCTTGTTGGATTCAT
GTGATGAGCTTTTTGTGTTTGTTAAACTTCTTTTCTTGAGTTTTGGCCTCGTTTGGCTCT
CGTGCCATGAGGCGTTTTGGAATGTTGTTGATATATGTATATAAATATAACCAAATGAAT
CATGAAGAGTTACAGATAAATCAAATCGTCGATGTTTATAT

QA 3 463 3 463
DS 

RD RR2AH05TF 463 0 0
GG
ACAAAGATAAGAGCTCTCGAGACGCGGAAAACATAGAGAGAAGAAACACGCATACCTCAA
AAGCGCAATACACAAAAAGAAAAAGTACATCTTTAGTTTTCTCCTACAAATTAAACGCAA
TATGGTGTCTCAAAAGCTGGAGATCTGCATCGAGTTAGTGAAGACTGCCGTCTTTTTTGT
AGCCACCGTGGCTGAAACAGTAGAAGAAGCTTTCCGTAAGCCTCCACCGGCGCTTCCGGT
AGCTCATGATGGTCGCCGGAACAGTTACGCCGACGTTCCCATTCCGCTTGTTGGATTCAT
GTGATGAGCTTTTTGTGTTTGTTAAACTTCTTTTCTTGAGTTTTGGCCTCGTTTGGCTCT
CGTGCCATGAGGCGTTTTGGAATGTTGTTGATATATGTATATAAATATAACCAAATGAAT
CATGAAGAGTTACAGATAAATCAAATCGTCGATGTTTAT
AT

QA 3 461 3 461
DS 



AS 1 2

CO CL3683Contig1 803 2 10 U
GGGAACAAGCAAGAGTTGAAAACAAAATACTCTCACTTTGCAGATCGCCAACTTCCTTCC
CACGCTTAGCTAGAGGAGGAATCTATACTTAGTCTTCTTCTACATCTCTGATTTGTAACC
AACGATTCTGCTTCGAGAAGTGAAATCAATTCTGAAGAACCAGACAACATCCTTCAGATG
GGAGATACTTCATTTCTCGATAGAATGCTTCTCCAGCTTCGTTCCACTTGCAAGTACTAC
AGTGGTTACCCTAAGGATCTAGGGCCATCGCGGGTTATCCATTTCACATCAGAAAGAGAG
TTTGTCCAGCTCCTTCACCAGGGCTATCCTGTCGTTGTCGCATTCACCATTAGAAGTAAC
TACACACAACATCTTGACCGGATGCTTGAGGAAGCTGCTGCTGAGTTCTATCCCAACATC
AAGTTTATGCGTGTTGAGTGCCCCAAGTATCCTGGATTCTGCATAACTCGCCAGAAAAGC
GAATATCCCTTCATTGAAATATTCCATAGCCCACAACAAGCGGGTAATGAAGGAAAGGTA
CAGGACCCAAATATCACCCGCTATTCTGTGAAAGTCGTACCTTACAATTATGATATGAGC
CCTTATGGGTTCAGAGAGTTCTTCAAGCGCCAGGGAGTTCGTACTTCGGATCCTAAATGA
ACAACTTGAAGGTTTGGTGCGTATTCAAAAACCTTTTGAGTGTATCAATGGCTTCTATTA
GCTACCAATGATTTGTTTTTTTAAGAACTATTGTAATACTATACTTCACTTCCCTCTTCC
TTCAAAATAAATAAACTTTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H406TF U 1
AF RR2H406JQB C 221
BS 1 660 RR2H406TF
BS 661 661 RR2H406JQB
BS 662 671 RR2H406TF
BS 672 672 RR2H406JQB
BS 673 690 RR2H406TF
BS 691 691 RR2H406JQB
BS 692 718 RR2H406TF
BS 719 719 RR2H406JQB
BS 720 741 RR2H406TF
BS 742 803 RR2H406JQB

RD RR2H406TF 742 0 0
GGGAACAAGCAAGAGTTGAAAACAAAATACTCTCACTTTGCAGATCGCCAACTTCCTTCC
CACGCTTAGCTAGAGGAGGAATCTATACTTAGTCTTCTTCTACATCTCTGATTTGTAACC
AACGATTCTGCTTCGAGAAGTGAAATCAATTCTGAAGAACCAGACAACATCCTTCAGATG
GGAGATACTTCATTTCTCGATAGAATGCTTCTCCAGCTTCGTTCCACTTGCAAGTACTAC
AGTGGTTACCCTAAGGATCTAGGGCCATCGCGGGTTATCCATTTCACATCAGAAAGAGAG
TTTGTCCAGCTCCTTCACCAGGGCTATCCTGTCGTTGTCGCATTCACCATTAGAAGTAAC
TACACACAACATCTTGACCGGATGCTTGAGGAAGCTGCTGCTGAGTTCTATCCCAACATC
AAGTTTATGCGTGTTGAGTGCCCCAAGTATCCTGGATTCTGCATAACTCGCCAGAAAAGC
GAATATCCCTTCATTGAAATATTCCATAGCCCACAACAAGCGGGTAATGAAGGAAAGGTA
CAGGACCCAAATATCACCCGCTATTCTGTGAAAGTCGTACCTTACAATTATGATATGAGC
CCTTATGGGTTCAGAGAGTTCTTCAAGCGCCAGGGAGTTCGTACTTCGGATCCTAAATGA
*CAACTTGAAG*TTTGGTGCGTATTCAAAA*CCTTTTGAGTGTATCAATGGCTTCTAT*A
GCTACCAATGATTTGTTTTTT
A

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2H406JQB 583 0 0
GTTCCACTTGCAAGTACTACAGTGGTTACCCTAAGGATCTAGGGCCATCGCGGGTTATCC
ATTTCACATCAGAAAGAGAGTTTGTCCAGCTCCTTCACCAGGGCTATCCTGTCGTTGTCG
CATTCACCATTAGAAGTAACTACACACAACATCTTGACCGGATGCTTGAGGAAGCTGCTG
CTGAGTTCTATCCCAACATCAAGTTTATGCGTGTTGAGTGCCCCAAGTATCCTGGATTCT
GCATAACTCGCCAGAAAAGCGAATATCCCTTCATTGAAATATTCCATAGCCCACAACAAG
CGGGTAATGAAGGAAAGGTACAGGACCCAAATATCACCCGCTATTCTGTGAAAGTCGTAC
CTTACAATTATGATATGAGCCCTTATGGGTTCAGAGAGTTCTTCAAGCGCCAGGGAGTTC
GTACTTCGGATCCTAAATGAACAACTTGAAGGTTTGGTGCGTATTCAAAAACCTTTTGAG
TGTATCAATGGCTTCTATTAGCTACCAATGATTTGTTTTTTTAAGAACTATTGTAATACT
ATACTTCACTTCCCTCTTCCTTCAAAATAAATAAACTTTTGTG

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 3

CO CL3684Contig1 708 3 9 U
GGACAACTAAATTGTTTCAAATTTCTCAATAAATATTTATTCAAGGCTAAGTAATTATCA
ATATTGTTACAAAAAAGAGTAATTATTAATACCAACTAATCAATCAAAAAATGAAGACCA
TTCCGTTAATGTGCATCGCCTTCGTCATACTCTTGACATCGTTCCCGGCTACGATCAAGA
GTAACAAGCTCGCAGATGTTTGCAAAACAAGTCTTGATTTCTGCATGCGCGAAATTCCAA
AAAATAACCACCACAAAGCCAGATGTTGTGAACAACATACAGGAATACAAAGACCTCCAT
CAAGATCATGTTACTGTATATTATCAAAAGATGCAGCTAGTTTTTTTCGTCTTGCCAAAC
TTTTCAATTTATGTGGAAAAGCTGTTTTGAATGATCCTAACCCGTGTTAATGATGCGAGC
GTAAGATAGCCAACCAACCAAACCCCAAGAATCTTCAAACCAAATTGGAGATATTTTATC
GTCAGTTATTTCCTAATTTTGTTTTGATCATTTTAATTAAGTTATTGTTCAATAGGAGAG
ATTATTGGTCTTGTTTATGTTCACGAACCATCTCTCTCCCACTTTTATCTTGCTCGTTTG
AATTACGATTCCATGTTCTTTATTTGTTTTTTTTCTTTTTATGTATTTTCTTAAATAAAA
CTGAAAAGGTATAGTCTTTTGCAATGATCAATAAATTTAAAATTTCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2CS17TF U 1
AF RR2FV12TF U 1
AF RR2CS17JQ C 10
BS 1 633 RR2CS17TF
BS 634 634 RR2FV12TF
BS 635 659 RR2CS17TF
BS 660 660 RR2FV12TF
BS 661 666 RR2CS17TF
BS 667 667 RR2FV12TF
BS 668 684 RR2CS17TF
BS 685 705 RR2FV12TF
BS 706 708 RR2CS17JQ

RD RR2CS17TF 684 0 0
GGACAACTAAATTGTTTCAAATTTCTCAATAAATATTTATTCAAGGCTAAGTAATTATCA
ATATTGTTACAAAAAAGAGTAATTATTAATACCAACTAATCAATCAAAAAATGAAGACCA
TTCCGTTAATGTGCATCGCCTTCGTCATACTCTTGACATCGTTCCCGGCTACGATCAAGA
GTAACAAGCTCGCAGATGTTTGCAAAACAAGTCTTGATTTCTGCATGCGCGAAATTCCAA
AAAATAACCACCACAAAGCCAGATGTTGTGAACAACATACAGGAATACAAAGACCTCCAT
CAAGATCATGTTACTGTATATTATCAAAAGATGCAGCTAGTTTTTTTCGTCTTGCCAAAC
TTTTCAATTTATGTGGAAAAGCTGTTTTGAATGATCCTAACCCGTGTTAATGATGCGAGC
GTAAGATAGCCAACCAACCAAACCCCAAGAATCTTCAAACCAAATTGGAGATATTTTATC
GTCAGTTATTTCCTAATTTTGTTTTGATCATTTTAATTAAGTTATTGTTCAATAGGAGAG
ATTATTGGTCTTGTTTATGTTCACGAACCATCTCTCTCCCACTTTTATCTTGCTCGTTTG
AATTACGATTCCATGTTCTTTATTTGTTTTTTT*CTTTTTATGTATTTTCTTAAATAAA*
CTGAAA*GGTATAGTCTTTTGCAA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2FV12TF 705 0 0
GGACAACTAAATTGTTTCAAATTTCTCAATAAATATTTATTCAAGGCTAAGTAATTATCA
ATATTGTTACAAAAAAGAGTAATTATTAATACCAACTAATCAATCAAAAAATGAAGACCA
TTCCGTTAATGTGCATCGCCTTCGTCATACTCTTGACATCGTTCCCGGCTACGATCAAGA
GTAACAAGCTCGCAGATGTTTGCAAAACAAGTCTTGATTTCTGCATGCGCGAAATTCCAA
AAAATAACCACCACAAAGCCAGATGTTGTGAACAACATACAGGAATACAAAGACCTCCAT
CAAGATCATGTTACTGTATATTATCAAAAGATACAGCTAGTTTTTTTCGTCTTGCCAAAC
TTTTCAATTTATGTGGAAAAGCTGTTTTGATTGATCCTAATCCGTGTTAATGATGCGAGC
GTAAGATAGCCAACCAACCAAACCCCAAGAATCTTCAAACCAAATTGGAGATATTTTATC
GTCAGTTATTTCCTAATTTTGTTGTGATCATTTTAATTAAGTTATTGTTCAATAGGAGAG
ATTATTGGTCTTGTTTATGTTCACGAACCATCTCTCTCCCACTTTTATCTTGCCCGTTTG
AATTACGATTCCATGTTCTTTATTTGTTTTTTTTCTTTTTATGTATTTTCTTAAATAAAA
CTGAAAAGGTATAGTCTTTTGCAATGATCAATAAATTTAAAATTT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2CS17JQ 699 0 0
AATTGTTTCAAATTTCTCAATAAATATTTATTCAAGGCTAAGTAATTATCAATATTGTTA
CAAAAAAGAGTAATTATTAATACCAACTAATCAATCAAAAAATGAAGACCATTCCGTTAA
TGTGCATCGCCTTCGTCATACTCTTGACATCGTTCCCGGCTACGATCAAGAGTAACAAGC
TCGCAGATGTTTGCAAAACAAGTCTTGATTTCTGCATGCGCGAAATTCCAAAAAATAACC
ACCACAAAGCCAGATGTTGTGAACAACATACAGGAATACAAAGACCTCCATCAAGATCAT
GTTACTGTATATTATCAAAAGATGCAGCTAGTTTTTTTCGTCTTGCCAAACTTTTCAATT
TATGTGGAAAAGCTGTTTTGAATGATCCTAACCCGTGTTAATGATGCGAGCGTAAGATAG
CCAACCAACCAAACCCCAAGAATCTTCAAACCAAATTGGAGATATTTTATCGTCAGTTAT
TTCCTAATTTTGTTTTGATCATTTTAATTAAGTTATTGTTCAATAGGAGAGATTATTGGT
CTTGTTTATGTTCACGAACCATCTCTCTCCCACTTTTATCTTGCTCGTTTGAATTACGAT
TCCATGTTCTTTATTTGTTTTTTTTCTTTTTATGTATTTTCTTAAATAAAACTGAAAAGG
TATAGTCTTTTGCAATGATCAATAAATTTAAAATTTCAT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 3

CO CL3685Contig1 1102 3 11 U
GGGAGTTGTCGAAGCCGCTTCTTCATCTTCTTCATCTCCCTAGCTGTTGCTCGTTCGTCA
GCAGCAGCTTTTGAAGATCACCAAACCATGGCTGTCGGGAAGAACAAGAGGATCTCAAAG
GGTCGTAAAGGAGGGAAGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATTGGTATGAC
ATCAAGGCTCCCTCCAACTTCACTCACAGAAATGTCGGAAAGACACTTGTTTCCAGAACT
CAGGGTACCAAGATTGCCTCTGAGGGGTTGAAACACAGAGTTTTCGAGGTGTCTCTTGCT
GATCTCAACAAGGATGAGGACCACTCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTC
CAGGGCAGGAATGTCTTGACCCAGTTCTGGGGTATGGACTTCACAACTGACAAGCTGAGG
TCATTGGTGAAGAAGTGGCAGACACTGATTGAAGCCCATGTAGATGTGAAGACCACTGAC
AGTTACACCTTGAGGCTGTTCTGCATTGGTTTCACCAAGAGGCGTGCTAACCAGGTCAAG
CGTACTTGTTATGCTCAATCCAGCCAAGTCCGCCAGATTCGCAGGAAGATGAGTGAGATT
ATGGTCAAGGAGGCTTCGTCTTGTGACCTTAAGGAGCTTGTGGCCAAGTTCATCCCTGAG
GCCATTGGAAA*GAGATTGAGAAGGCGACTCAGAACATCTACCCGTTGCAGAACGTGTTC
ATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAAGGCTCCCAAGTTTGACCTCGGCAAGCTCATGGAGGTT
CATGGTGACTACACAGCAGAGGATGTTGGTGTGAAAGTAGACAGGCCAGATGAAACAGTG
GCTGAGGAACCAACCGAAATCATCGGAGCTTAGAGGATTATAGATTTGTTTCTTTCTTTC
TTTTTTCGTTATGTAGCCATTGATGTGGAGTTCTTTGATGAGAGAACTTCCACTTCAGTG
TGACTGTTTTGGGCCTCGTTTTGATGGATTATTACTCTTGTTTATCCTGTTTTTTTATAT
TAAGTACCTCATTTCTATTATTCACTCCTGGATTTTAACTGTCAAATTTTGTTCTGGAGA
AAATAAGTTATCCAATAGATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF47TF U 1
AF RR2E562TF U 71
AF RR2AF47JQ C 264
BS 1 194 RR2AF47TF
BS 195 195 RR2E562TF
BS 196 208 RR2AF47TF
BS 209 209 RR2E562TF
BS 210 744 RR2AF47TF
BS 745 764 RR2E562TF
BS 765 765 RR2AF47JQ
BS 766 779 RR2E562TF
BS 780 780 RR2AF47JQ
BS 781 804 RR2E562TF
BS 805 1102 RR2AF47JQ

RD RR2AF47TF 748 0 0
GGGAGTTGTCGAAGCCGCTTCTTCATCTTCTTCATCTCCCTAGCTGTTGCTCGTTCGTCA
GCAGCAGCTTTTGAAGATCACCAAACCATGGCTGTCGGGAAGAACAAGAGGATCTCAAAG
GGTCGTAAAGGAGGGAAGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATTGGTATGAC
ATCAAGGCTCCCTCTAACTTCACTCACA*AAATGTCGGAAAGACACTTGTTTCCAGAACT
CAGGGTACCAAGATTGCCTCTGAGGGGTTGAAACACAGAGTTTTCGAGGTGTCTCTTGCT
GATCTCAACAAGGATGAGGACCACTCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTC
CAGGGCAGGAATGTCTTGACCCAGTTCTGGGGTATGGACTTCACAACTGACAAGCTGAGG
TCATTGGTGAAGAAGTGGCAGACACTGATTGAAGCCCATGTAGATGTGAAGACCACTGAC
AGTTACACCTTGAGGCTGTTCTGCATTGGTTTCACCAAGAGGCGTGCTAACCAGGTCAAG
CGTACTTGTTATGCTCAATCCAGCCAAGTCCGCCAGATTCGCAGGAAGATGAGTGAGATT
ATGGTCAAGGAGGCTTCGTCTTGTGACCTTAAGGAGCTTGTGGCCAAGTTCATCCCTGAG
GCCATTGGAAA*GAGATTGAGAAGGCGACTCAGAACATCTACCCGTTGCAGAACGTGTTC
ATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAAG
CTCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2E562TF 734 0 0
GG
GAAGATCACCAAACCATGGCTGTCGGGAAGAACAAGAGGATCTCAAAGGGTCGTAAAGGA
GGGAAGAAGAAGGTTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATTGGTATGACATCAAGGCTCCC
TCCAACTTCACTCACAGAAATGTCGGAAAGACACTTGTTTCCAGAACTCAGGGTACCAAG
ATTGCCTCTGAGGGGTTGAAACACAGAGTTTTCGAGGTGTCTCTTGCTGATCTCAACAAG
GATGAGGACCACTCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTCCAGGGCAGGAAT
GTCTTGACCCAGTTCTGGGGTATGGACTTCACAACTGACAAGCTGAGGTCACTGGTGAAG
AAGTGGCAGACGCTGATTGAAGCCCATGTAGATGTGAAGACCACTGACAGTTACACCTTG
AGGCTGTTCTGCATTGGTTTCACCAAGAGGCGTGCTAACCAGGTCAAGCGTACTTGTTAT
GCTCAATCCAGCCAAGTCCGCCAGATCCGCAGGAAGATGAGTGAGATTATGGTCAAGGAG
GCTTCGTCTTGTGACCTTAAAGAGCTTGTGGCTAAGTTCATCCCTGAG*CCATTGGAAAA
GAGATTGAGAAAGCGACTCAGAACATCTACCCGTTGCAGAACGTGTTCATCCGTAAAGTC
AAGATCCTCAAGGCTCCCAAGTTTGACCTCGG*AAGCTCATGGAGGT*CATGGTGACTAC
ACAGCAGAGGAT

QA 3 734 3 734
DS 

RD RR2AF47JQ 839 0 0
GGGGTTGAAACACAGAGTTTTCGAGGTGTCTCTTGCTGATCTCAACAAGGATGAGGACCA
CTCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTCCAGGGCAGGAATGTCTTGACCCA
GTTCTGGGGTATGGACTTCACAACTGACAAGCTGAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGAC
ACTGATTGAAGCCCATGTAGATGTGAAGACCACTGACAGTTACACCTTGAGGCTGTTCTG
CATTGGTTTCACCAAGAGGCGTGCTAACCAGGTCAAGCGTACTTGTTATGCTCAATCCAG
CCAAGTCCGCCAGATTCGCAGGAAGATGAGTGAGATTATGGTCAAGGAGGCTTCGTCTTG
TGACCTTAAGGAGCTTGTGGCCAAGTTCATCCCTGAGGCCATTGGAAA*GAGATTGAGAA
GGCGACTCAGAACATCTACCCGTTGCAGAACGTGTTCATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAA
GGCTCCCAAGTTTGACCTCGGCAAGCTCATGGAGGTTCATGGTGACTACACAGCAGAGGA
TGTTGGTGTGAAAGTAGACAGGCCAGATGAAACAGTGGCTGAGGAACCAACCGAAATCAT
CGGAGCTTAGAGGATTATAGATTTGTTTCTTTCTTTCTTTTTTCGTTATGTAGCCATTGA
TGTGGAGTTCTTTGATGAGAGAACTTCCACTTCAGTGTGACTGTTTTGGGCCTCGTTTTG
ATGGATTATTACTCTTGTTTATCCTGTTTTTTTATATTAAGTACCTCATTTCTATTATTC
ACTCCTGGATTTTAACTGTCAAATTTTGTTCTGGAGAAAATAAGTTATCCAATAGATAC

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 3

CO CL3686Contig1 1231 3 10 U
TTTACACTCGAGACTGCAGATGTCATCATTGGTCTGGTCACAAATGTACTCACCGTAACG
ACAGCAGATAACACATTTAGGCTCCCCCAGAAGAGGCCATCTTTGATCTTTACACTTTTG
TTTGATACCATCTACAAAAAAAGATAGATAAATAAATAAAGAGACGATGAACGACAAGCA
AGTCCTAGACTCCTAGGTCTAAGAGATGCAAATTGTTATAAGATAATAGACTACTAACCA
TAGAGGTAAGGGACGCAGCCATCTTCTTCGTTCATATCCTTAAGATCGATCGATCGATCT
ATTTACTCAGAGAAACCGAACCAGCTTATGTGCACAAATGCGCACAACGCCAATCAGACA
AAGAGAGAATTCAATCTAACTTCAAAACAGTAATTGAAAGAATCAAAATCATCCGAGGCT
GAGAGAATATACAGACTCGCTCGCAACACAAACACAAGGATTTTCCAATCGGGACAAGAA
GAAGAAGAGCAAACTAATTACTGGACGCGTAGATACATATGGACTAGTATACACATAAAT
GGGCCGTCAATATTATTTAAAGTATACACACAAATGGGCTTTTTATTGGGCCATACACGA
TCGG*TTCAGAGTGATTTTGGCAGCGAGCGAGCCCAAAAAAAATACCAGAAAACTACATT
TTACACACTATTCAACTCCCAACAAAACTTCACCAACTCGCATTTGGTTGATGATCTCAA
CGCAAAACATGCCCAGAGAGATGGACAGTTTTCATCACTGCTTCGTCATGAAATCCTTAA
CAAAAATTTAAGTTCGAGTAGCTAGCTGCCTGATTAAAATGCTCCCCTTTGTATATATTT
ATACACAAAATCATTACTCTTCTGTGTTCTATATTCTATGAAGAAAACTCCATAAGTGAG
TGCTGAGGTACCCCTAGCTCTCCTTCTAAAACATCCTAGGTGCAAGAGAGACTGGCTTAG
TATTTGATAAGAGCAGGGAGTGATGCATGCAGTTCTGACAAGCACTGGAACATCCAGTTC
AGTAACTGTTCTCTTGGTAGCTCCAACAGAAGTTCCGCCATTATTTGATCTCCTTCGTAT
ATTAAGGAGCTTCGGTAAACGTCACAAGTCATGGAATCTGTGATCAGCTTGAACACCTTC
TTACTCATATTTGTTTTCATCACAACCATCTTCCCTGATGCATAAATTCTGTTTACTCCA
AGATCAGCCGCCATGCGTCTCACATACAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DN22TF U 1
AF RR2DO18JQ U 532
AF RR2DO18TF C 560
BS 1 604 RR2DN22TF
BS 605 605 RR2DO18JQ
BS 606 631 RR2DN22TF
BS 632 632 RR2DO18JQ
BS 633 642 RR2DN22TF
BS 643 643 RR2DO18JQ
BS 644 681 RR2DN22TF
BS 682 684 RR2DO18JQ
BS 685 700 RR2DN22TF
BS 701 1231 RR2DO18JQ

RD RR2DN22TF 700 0 0
TTTACACTCGAGACTGCAGATGTCATCATTGGTCTGGTCACAAATGTACTCACCGTAACG
ACAGCAGATAACACATTTAGGCTCCCCCAGAAGAGGCCATCTTTGATCTTTACACTTTTG
TTTGATACCATCTACAAAAAAAGATAGATAAATAAATAAAGAGACGATGAACGACAAGCA
AGTCCTAGACTCCTAGGTCTAAGAGATGCAAATTGTTATAAGATAATAGACTACTAACCA
TAGAGGTAAGGGACGCAGCCATCTTCTTCGTTCATATCCTTAAGATCGATCGATCGATCT
ATTTACTCAGAGAAACCGAACCAGCTTATGTGCACAAATGCGCACAACGCCAATCAGACA
AAGAGAGAATTCAATCTAACTTCAAAACAGTAATTGAAAGAATCAAAATCATCCGAGGCT
GAGAGAATATACAGACTCGCTCGCAACACAAACACAAGGATTTTCCAATCGGGACAAGAA
GAAGAAGAGCAAACTAATTACTGGACGCGTAGATACATATGGACTAGTATACACATAAAT
GGGCCGTCAATATTATTTAAAGTATACACACAAATGGGCTTTTTATTGGGCCATACACGA
TCGGGTTCAGAGTGATTTTGGCAGCGAGCGAACCCAAAAAAA*TACCAGAAAACTACATT
TTACACACTATTCAACTCCCAC**AAACTTCACCAACTCG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2DO18JQ 700 0 0
CACATAAATGGGCCGTCAATATTATTTAAAGTATACACACAAATGGGCTTTTTATTGGGC
CATACACGATCGG*TTCAGAGTGATTTTGGCAGCGAGCGAGCCCAAAAAAAATACCAGAA
AACTACATTTTACACACTATTCAACTCCCAACAAAACTTCACCAACTCGCATTTGGTTGA
TGATCTCAACGCAAAACATGCCCAGAGAGATGGACAGTTTTCATCACTGCTTCGTCATGA
AATCCTTAACAAAAATTTAAGTTCGAGTAGCTAGCTGCCTGATTAAAATGCTCCCCTTTG
TATATATTTATACACAAAATCATTACTCTTCTGTGTTCTATATTCTATGAAGAAAACTCC
ATAAGTGAGTGCTGAGGTACCCCTAGCTCTCCTTCTAAAACATCCTAGGTGCAAGAGAGA
CTGGCTTAGTATTTGATAAGAGCAGGGAGTGATGCATGCAGTTCTGACAAGCACTGGAAC
ATCCAGTTCAGTAACTGTTCTCTTGGTAGCTCCAACAGAAGTTCCGCCATTATTTGATCT
CCTTCGTATATTAAGGAGCTTCGGTAAACGTCACAAGTCATGGAATCTGTGATCAGCTTG
AACACCTTCTTACTCATATTTGTTTTCATCACAACCATCTTCCCTGATGCATAAATTCTG
TTTACTCCAAGATCAGCCGCCATGCGTCTCACATACAGCC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2DO18TF 672 0 0
AAGTATACACACAAATGGGCTTTT*ATTGGGCCATACACGATCGG*TTCAGAGTGATTT*
GGCAGCGAGCGAGCCCAAAAAAAATACCAGAAAACTACATTTTACACACTATTCAACTCC
CAACAAAACTTCACCAACTCGCATTTGGTTGATGATCTCAACGCAAAACATGCCCAGAGA
GATGGACAGTTTTCATCACTGCTTCGTCATGAAATCCTTAACAAAAATTTAAGTTCGAGT
AGCTAGCTGCCTGATTAAAATGCTCCCCTTTGTATATATTTATACACAAAATCATTACTC
TTCTGTGTTCTATATTCTATGAAGAAAACTCCATAAGTGAGTGCTGAGGTACCCCTAGCT
CTCCTTCTAAAACATCCTAGGTGCAAGAGAGACTGGCTTAGTATTTGATAAGAGCAGGGA
GTGATGCATGCAGTTCTGACAAGCACTGGAACATCCAGTTCAGTAACTGTTCTCTTGGTA
GCTCCAACAGAAGTTCCGCCATTATTTGATCTCCTTCGTATATTAAGGAGCTTCGGTAAA
CGTCACAAGTCATGGAATCTGTGATCAGCTTGAACACCTTCTTACTCATATTTGTTTTCA
TCACAACCATCTTCCCTGATGCATAAATTCTGTTTACTCCAAGATCAGCCGCCATGCGTC
TCACATACAGCC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 3

CO CL3687Contig1 566 3 1 U
GGATCTATCTTCTTCTTCTACTCATTCCACATCTGACATCTCCTAGTTTATTTCTTTTTA
GAATGGCTAAATCACTTTTCTTTTTCTTCTTAGCCGTCTCTCTTATGTTTCTTCTTGCAG
CGGCTTCGACAACTGCAGCTGCAGTGAACGCCACAAGTGGGTTGAGATATGGCGGATGTG
CTCCCGGAGACACTGTTAGAGAATGCATAACGGCGGAGATTGAGGAGGATGGAGTTGAGG
CTTTGGTGCGGCGGATTCTACAGCAACAGAGGAATAAAGTAAGCTTCTTAGTTCTACAGA
AGCAGAGGCCAGCGTCGAACTGTAAGATCATTGCTAATTGCATCGGAATAGCTAATCAGA
AAAACGCACCTTGCACTTCCTACGAAAGATGCAAACGTGCCACTGGCTAATATTTCGTTT
ATTTTCTCTCTTGATTATGTGTGTGTTTGAGATCCCTTCTTTTGTTTATCTTTTAAAGAA
TCTAATGTAACAATAAGAACGTCTGTCGGTTGGAATAAATGTGCAAAAAACATTGCTTAT
ATAATACATTGATGAAATTTTTAGTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AJ33TF U 1
AF RR2AD06JQ C 1
AF RR2AD06TF U 1
BS 1 566 RR2AD06TF

RD RR2AJ33TF 511 0 0
GGATCTATCTTCTTCTTCTACTCATTCCACATCTGACATCTCCTAGTTTATTTCTTTTTA
GAATGGCTAAATCACTTTTCTTTTTCTTCTTAGCCGTCTCTCTTATGTTTCTTCTTGCAG
CGGCTTCGACAACTGCAGCTGCAGTGAACGCCACAAGTGGGTTGAGATATGGCGGATGTG
CTCCCGGAGACACTGTTAGAGAATGCATAACGGCGGAGATTGAGGAGGATGGAGTTGAGG
CTTTGGTGCGGCGGATTCTACAGCAACAGAGGAATAAAGTAAGCTTCTTAGTTCTACAGA
AGCAGAGGCCAGCGTCGAACTGTAAGATCATTGCTAATTGCATCGGAATAGCTAATCAGA
AAAACGCACCTTGCACTTCCTACGAAAGATGCAAACGTGCCACTGGCTAATATTTCGTTT
ATTTTCTCTCTTGATTATGTGTGTGTTTGAGATCCCTTCTTTTGTTTATCTTTTAAAGAA
TCTAATGTAACAATAAGAACGCCTGTCGGTT

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2AD06JQ 566 0 0
GGATCTATCTTCTTCTTCTACTCATTCCACATCTGACATCTCCTAGTTTATTTCTTTTTA
GAATGGCTAAATCACTTTTCTTTTTCTTCTTAGCCGTCTCTCTTATGTTTCTTCTTGCAG
CGGCTTCGACAACTGCAGCTGCAGTGAACGCCACAAGTGGGTTGAGATATGGCGGATGTG
CTCCCGGAGACACTGTTAGAGAATGCATAACGGCGGAGATTGAGGAGGATGGAGTTGAGG
CTTTGGTGCGGCGGATTCTACAGCAACAGAGGAATAAAGTAAGCTTCTTAGTTCTACAGA
AGCAGAGGCCAGCGTCGAACTGTAAGATCATTGCTAATTGCATCGGAATAGCTAATCAGA
AAAACGCCCCTTGCACTTCCTACGAAAGATGCAAACGTGCCACTGGCTAATATTTCGTTT
ATTTTCTCTCTTGATTATGTGTGTGTTTGAGATCCCTTCTTTTGTTTATCTTTTAAAGAA
TCTAATGTAACAATAAGAACGTCTGTCGGTTGGAATAAATGTGCAAAAAACATTGCTTAT
ATAATACATTGATGAAATTTTTAGTT

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2AD06TF 566 0 0
GGATCTATCTTCTTCTTCTACTCATTCCACATCTGACATCTCCTAGTTTATTTCTTTTTA
GAATGGCTAAATCACTTTTCTTTTTCTTCTTAGCCGTCTCTCTTATGTTTCTTCTTGCAG
CGGCTTCGACAACTGCAGCTGCAGTGAACGCCACAAGTGGGTTGAGATATGGCGGATGTG
CTCCCGGAGACACTGTTAGAGAATGCATAACGGCGGAGATTGAGGAGGATGGAGTTGAGG
CTTTGGTGCGGCGGATTCTACAGCAACAGAGGAATAAAGTAAGCTTCTTAGTTCTACAGA
AGCAGAGGCCAGCGTCGAACTGTAAGATCATTGCTAATTGCATCGGAATAGCTAATCAGA
AAAACGCACCTTGCACTTCCTACGAAAGATGCAAACGTGCCACTGGCTAATATTTCGTTT
ATTTTCTCTCTTGATTATGTGTGTGTTTGAGATCCCTTCTTTTGTTTATCTTTTAAAGAA
TCTAATGTAACAATAAGAACGTCTGTCGGTTGGAATAAATGTGCAAAAAACATTGCTTAT
ATAATACATTGATGAAATTTTTAGTT

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 3

CO CL3688Contig1 779 3 2 U
GCACCGTCGTGCGTTAACTACAGTTTCTGGCCAAAGAATCCACCTGAGTACAGGGAGGTG
AACGAAGAGTACGCATTGCATGTGAAGAAGCTGTCGGAGACATTGTTAGGTATTCTCTCG
GAAGGGTTGGGGTTAAGTCGTGAGGCGTTGAGAGAAGGTCTCGGCGGAGATCTGGCGGAG
TATATGATGAAGATTAACTACTATCCCCCGTGTCCTCGGCCGGATTTAGCATTAGGAGTA
CCGGCGCACACCGATCTCAGTGGGATCACTCTGCTTGTACCTAACGAAGTTCCTGGACTT
CAAGTCTTCAAAGACGATCACTGGTTCGACGCCGAGTATATTCCTTCCGCCGTCATTGTT
CACATCGGTGACCAGATTCTGAGGCTGAGTAATGGGAGATATAAGAATGTGTTGCATAGG
ACGACGGTGGATAAAGACAGGACAAGGATGTCGTGGCCAGTTTTCTTGGAGCCTCACCGT
GAAATGGTCGTCGGGCCATTACCGGAGCTTATTAGCGATGGTAATCCTCCAAAGTACAAG
CCTTTTGCTTTCAAGGACTACAGTTACCGCAAGCTCAATAAGCTTCCTCTGGATTAAGGA
GGAAAAAGAAAATCAAAAGTATGAAGAAAAGTGTTGATGAATTTGAATTAATTTATTTTA
AAAACTGTTGTATTTGAAATAAGGTGTGGTTGTTGTTTTTTCGCGATAAAAAGTTTCTAT
GTGTCTCTTCTTGTGTTCGTTATTTATGATTAAATAAAGACTAAAGACATGTAGTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG11TF U 1
AF RR2DG11JQ C 48
AF RR2FJ51TF U 439
BS 1 651 RR2DG11TF
BS 652 779 RR2FJ51TF

RD RR2DG11TF 651 0 0
GCACCGTCGTGCGTTAACTACAGTTTCTGGCCAAAGAATCCACCTGAGTACAGGGAGGTG
AACGAAGAGTACGCATTGCATGTGAAGAAGCTGTCGGAGACATTGTTAGGTATTCTCTCG
GAAGGGTTGGGGTTAAGTCGTGAGGCGTTGAGAGAAGGTCTCGGCGGAGATCTGGCGGAG
TATATGATGAAGATTAACTACTATCCCCCGTGTCCTCGGCCGGATTTAGCATTAGGAGTA
CCGGCGCACACCGATCTCAGTGGGATCACTCTGCTTGTACCTAACGAAGTTCCTGGACTT
CAAGTCTTCAAAGACGATCACTGGTTCGACGCCGAGTATATTCCTTCCGCCGTCATTGTT
CACATCGGTGACCAGATTCTGAGGCTGAGTAATGGGAGATATAAGAATGTGTTGCATAGG
ACGACGGTGGATAAAGACAGGACAAGGATGTCGTGGCCAGTTTTCTTGGAGCCTCACCGT
GAAATGGTCGTCGGGCCATTACCGGAGCTTATTAGCGATGGTAATCCTCCAAAGTACAAG
CCTTTTGCTTTCAAGGACTACAGTTACCGCAAGCTCAATAAGCTTCCTCTGGATTAAGGA
GGAAAAAGAAAATCAAAAGTATGAAGAAAAGTGTTGATGAATTTGAATTAA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2DG11JQ 682 0 0
GTACAGGGAGGTGAACGAAGAGTACGCATTGCATGTGAAGAAGCTGTCGGAGACATTGTT
AGGTATTCTCTCGGAAGGGTTGGGGTTAAGTCGTGAGGCGTTGAGAGAAGGTCTCGGCGG
AGATCTGGCGGAGTATATGATGAAGATTAACTACTATCCCCCGTGTCCTCGGCCGGATTT
AGCATTAGGAGTACCGGCGCACACCGATCTCAGTGGGATCACTCTGCTTGTACCTAACGA
AGTTCCTGGACTTCAAGTCTTCAAAGACGATCACTGGTTCGACGCCGAGTATATTCCTTC
CGCCGTCATTGTTCACATCGGTGACCAGATTCTGAGGCTGAGTAATGGGAGATATAAGAA
TGTGTTGCATAGGACGACGGTGGATAAAGACAGGACAAGGATGTCGTGGCCAGTTTTCTT
GGAGCCTCACCGTGAAATGGTCGTCGGGCCATTACCGGAGCTTATTAGCGATGGTAATCC
TCCAAAGTACAAGCCTTTTGCTTTCAAGGACTACAGTTACCGCAAGCTCAATAAGCTTCC
TCTGGATTAAGGAGGAAAAAGAAAATCAAAAGTATGAAGAAAAGTGTTGATGAATTTGAA
TTAATTTATTTTAAAAATTGTTGTATTTGAAATAAGGTGTGGTTGTTGTTTTTTCGCGAT
AAAAAGTTTCTATGTGTCTC
CT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2FJ51TF 341 0 0
G
GGACAAGGTTGTCGTGGCCAGTTTTCTTGGAGCCTCACCGTGAAATGGTCGTCGGGCCAT
TACCGGAGCTTATTAGCGATGGTAATCCTCCAAAGTACAAGCCTTTTGCTTTCAAGGACT
ACAGTTACCGCAAGCTCAATAAGCTTCCTCTGGATTAAGGAGGAAAAAGAAAATCAAAAG
TATGAAGAAAAGTGTTGATGAATTTGAATTAATTTATTTTAAAAACTGTTGTATTTGAAA
TAAGGTGTGGTTGTTGTTTTTTCGCGATAAAAAGTTTCTATGTGTCTCTTCTTGTGTTCG
TTATTTATGATTAAATAAAGACTAAAGACATGTAGTAGCT

QA 2 341 2 341
DS 



AS 1 3

CO CL3689Contig1 648 3 34 U
GGAACGGGCTGATAAATAAAACCGAGTCGAGTTTGATTCTCTCCGGGAAGGAGAGAGTGA
GAGATTGTTTGAAT*CTTCCGATGGAGGAGCAGATCGGAGGGAGCGAGGATCGATGGAAG
GGATCGTTAGAGAACATAACGGAGATGGCTTCGAATCTCGATGCTCTGCAGAAGCTTCTC
CTCAAGAAAGCTGTCTTCGTTGAAGAAGACACTTTCGCTAGAGCTTCTCTCATCTCCGAA
CAATCCCGAACAATCAAGGTTCTTGACCAAAGGGTACAAACACTAGAAAGAGAACTAGAT
GCTGCTATTACAGCTGCTGCTCATGCTCGCTCAGAGAAACGCCAGGCTGAGTCCTCTCAA
AAAGCTGCTGAATCACGTGCCCAAGAGGTCACAAAAGAACTCGAAAACACCACGAATGTT
TTCAAGCTGCATATGGAAGAGCTCCGAGGTATGCAAGAACAGATATCCAAACGCGATAAC
GAGATTAAGCTCTTGGAATCTATAATTCAAACGCTTGGCGGAAAAGAGCGATTGGGAAAA
AGCGGTGTGAGTGGATGATGCGTTTTTCACTTGTAAAAAATTTGTAACCCGAGTTTGTGA
CAGTTTATGTATTACACGACACTCCTCTTAGAAGATGCCCATTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RR2G455TF U 1
AF RR2DK18JQ C 45
AF RR2DK18TF U 45
BS 1 62 RR2G455TF
BS 63 64 RR2DK18TF
BS 65 65 RR2G455TF
BS 66 66 RR2DK18TF
BS 67 74 RR2G455TF
BS 75 75 RR2DK18TF
BS 76 167 RR2G455TF
BS 168 168 RR2DK18TF
BS 169 185 RR2G455TF
BS 186 186 RR2DK18TF
BS 187 236 RR2G455TF
BS 237 237 RR2DK18TF
BS 238 344 RR2G455TF
BS 345 345 RR2DK18TF
BS 346 356 RR2G455TF
BS 357 357 RR2DK18TF
BS 358 359 RR2G455TF
BS 360 360 RR2DK18TF
BS 361 362 RR2G455TF
BS 363 363 RR2DK18TF
BS 364 398 RR2G455TF
BS 399 399 RR2DK18TF
BS 400 416 RR2G455TF
BS 417 417 RR2DK18TF
BS 418 497 RR2G455TF
BS 498 498 RR2DK18TF
BS 499 503 RR2G455TF
BS 504 504 RR2DK18TF
BS 505 506 RR2G455TF
BS 507 507 RR2DK18TF
BS 508 524 RR2G455TF
BS 525 525 RR2DK18TF
BS 526 645 RR2G455TF
BS 646 648 RR2DK18JQ

RD RR2G455TF 645 0 0
GGAACGGGCTGATAAATAAAACCGAGTCGAGTTTGATTCTCTCCGGGAAGGAGAGAGTGA
GA**TCGTTTGAATTCTTCCGATGGAGGAGCAGATCGGAGGGAGCGAGGATCGATGGAAG
GGATCGTTAGAGAACATAACGGAGATGGCTTCGAATCTCGATGCTCTACAGAAGCTTCTC
CTCAAAAAAGCTGTCTTCGTTGAAGAAGACACTTTCGCTAGAGCTTCTCTCATCTCTGAA
CAATCCCGAACAATCAAGGTTCTTGACCAAAGGGTACAAACACTAGAAAGAGAACTAGAT
GCTGCTATTACAGCTGCTGCTCATGCTCGCTCAGAGAAACGCCAAGCTGAGTCCTCCCAG
AAGGCTGCTGAATCACGTGCCCAAGAGGTCACAAAAGAGCTCGAAAACACCACGAAGGTT
TTCAAGCTGCATATGGAAGAGCTCCGAGGTATGCAAGAACAGATATCCAAACGCGATAAC
GAGATTAAGCTCTTGGAGTCTATCATCCAAACGCTTGGCGGAAA*GAGCGATTGGGAAAA
AGCGGTGTGAGTGGATGATGCGTTTTTCACTTGTAAAAAATTTGTAACCCGAGTTTGTGA
CAGTTTATGTATTACACGACACTCCTCTTAGAAGATGCCCATTTT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2DK18JQ 604 0 0
GGGAAGGAGAGAGTGAGAGATTGTTTGAAT*CTTCCGATGGAGGAGCAGATCGGAGGGAG
CGAGGATCGATGGAAGGGATCGTTAGAGAACATAACGGAGATGGCTTCGAATCTCGATGC
TCTGCAGAAGCTTCTCCTCAAGAAAGCTGTCTTCGTTGAAGAAGACACTTTCGCTAGAGC
TTCTCTCATCTCCGAACAATCCCGAACAATCAAGGTTCTTGACCAAAGGGTACAAACACT
AGAAAGAGAACTAGATGCTGCTATTACAGCTGCTGCTCATGCTCGCTCAGAGAAACGCCA
GGCTGAGTCCTCTCAAAAAGCTGCTGAATCACGTGCCCAAGAGGTCACAAAAGAACTCGA
AAACACCACGAATGTTTTCAAGCTGCATATGGAAGAGCTCCGAGGTATGCAAGAACAGAT
ATCCAAACGCGATAACGAGATTAAGCTCTTGGAATCTATAATTCAAACGCTTGGCGGAAA
AGAGCGATTGGGAAAAAGCGGTGTGAGTGGATGATGCGTTTTTCACTTGTAAAAAATTTG
TAACCCGAGTTTGTGACAGTTTATGTATTACACGACACTCCTCTTAGAAGATGCCCATTT
TACC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2DK18TF 604 0 0
GGGAAGGAGAGAGTGAGAGATTGTTTGAAT*CTTCCGATGGAGGAGCAGATCGGAGGGAG
CGAGGATCGATGGAAGGGATCGTTAGAGAACATAACGGAGATGGCTTCGAATCTCGATGC
TCTGCAGAAGCTTCTCCTCAAGAAAGCTGTCTTCGTTGAAGAAGACACTTTCGCTAGAGC
TTCTCTCATCTCCGAACAATCCCGAACAATCAAGGTTCTTGACCAAAGGGTACAAACACT
AGAAAGAGAACTAGATGCTGCTATTACAGCTGCTGCTCATGCTCGCTCAGAGAAACGCCA
GGCTGAGTCCTCTCAAAAAGCTGCTGAATCACGTGCCCAAGAGGTCACAAAAGAACTCGA
AAACACCACGAATGTTTTCAAGCTGCATATGGAAGAGCTCCGAGGTATGCAAGAACAGAT
ATCCAAACGCGATAACGAGATTAAGCTCTTGGAATCTATAATTCAAACGCTTGGCGGAAA
AGAGCGATTGGGAAAAAGCGGTGTGAGTGGATGATGCGTTTTTCACTTGTAAAAAATTTG
TAACCCGAGTTTGTGACAGTTTATGTATTACACGACACTCCTCTTAGAAGATGCCCATTT
T
ACC

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL3690Contig1 797 2 4 U
GGACCATAAACTCAGTCAGTACTAAATGTGAAGAAACAGTTTGCAGACAACATAGAGGAG
AAGCACCATTAAATAAAGTCTTTGTCCTCTTCTTTTTTCTCTATCACATTGATTTGTGAA
GAAGAAGAGTGGCAGAGAAGAAACCCATGGCTATGGCGGAGATGGCAATGAAGTCTTCAG
TAACTGCAAACCTCACTATTCCTCCTCCTTCCTCTTCTTCGTCGTGTAAGAAGAGAGTGA
GGCAAATCTCTGTCGCACTTCCAACAACAACCTCAATCTCTCTTCTATCTGTCTTCTCAT
CTCCTCCTCCTGAAGCTAAAGCTGCCGTTTCCATTTCCAAGGACCAGATCGTCTCCTCTC
TCACCGAAGTGGAGAAAACAATCAACCAAGTCCAAGAAACAGGTTCGAGTGTTTTCGACG
CAACGCAGCGTGTTTTCCAAGTAGTAGGAGACGCACTTAAACCAGCCTTGGACACTGCTC
TGCCCATCGCAAAGCAAGCCGGGGAAGAGGCCTTGAAGCTTGCCTCTCCCGCTTTCTCAG
AGGCTTCGAAGAAAGCTCAAGAAGCAATGCAAAGCTCTGGTATCGATGCGGAGCCTGTCT
TTAATGCTGCAAAGACAGTCACAGATGTGGCCCAACAGACAACAAAAGCTATTGAAGATG
CTAAGCCCATTGCTTCATCGACCATGGAGACGATATCTTCAGCTGATCCTAGTGTCATTG
TTGTTGCTGCTGGTGCTGCCTTTATTGCTTACCTTCTCCTCCCTCCTGTTTGGTCTGCTA
TATCTTTAACTTCCGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG36TF U 1
AF RR2BT23TF U 353
BS 1 706 RR2CG36TF
BS 707 707 RR2BT23TF
BS 708 752 RR2CG36TF
BS 753 797 RR2BT23TF

RD RR2CG36TF 752 0 0
GGACCATAAACTCAGTCAGTACTAAATGTGAAGAAACAGTTTGCAGACAACATAGAGGAG
AAGCACCATTAAATAAAGTCTTTGTCCTCTTCTTTTTTCTCTATCACATTGATTTGTGAA
GAAGAAGAGTGGCAGAGAAGAAACCCATGGCTATGGCGGAGATGGCAATGAAGTCTTCAG
TAACTGCAAACCTCACTATTCCTCCTCCTTCCTCTTCTTCGTCGTGTAAGAAGAGAGTGA
GGCAAATCTCTGTCGCACTTCCAACAACAACCTCAATCTCTCTTCTATCTGTCTTCTCAT
CTCCTCCTCCTGAAGCTAAAGCTGCCGTTTCCATTTCCAAGGACCAGATCGTCTCCTCTC
TCACCGAAGTGGAGAAAACAATCAACCAAGTCCAAGAAACAGGTTCGAGTGTTTTCGACG
CAACGCAGCGTGTTTTCCAAGTAGTAGGAGACGCACTTAAACCAGCCTTGGACACTGCTC
TGCCCATCGCAAAGCAAGCCGGGGAAGAGGCCTTGAAGCTTGCCTCTCCCGCTTTCTCAG
AGGCTTCGAAGAAAGCTCAAGAAGCAATGCAAAGCTCTGGTATCGATGCGGAGCCTGTCT
TTAATGCTGCAAAGACAGTCACAGATGTGGCCCAACAGACAACAAAAGCTATTGAAGATG
CTAAGCCCATTGCTTCATCGACCATGGAGACGATATCTTCAGCTGA*CCTAGTGTCATTG
TTGTTGCTGCTGGTGCTGCCTTTATTGCTTAC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2BT23TF 445 0 0
CTCCTCTCTCACCGAAGTGGAGAAAACAATCAACCAAGTCCAAGAAACAGGTTCGAGTGT
TTTCGACGCAACGCAGCGTGTTTTCCAAGTAGTAGGAGACGCACTTAAACCAGCCTTGGA
CACTGCTCTGCCCATCGCAAAGCAAGCCGGGGAAGAGGCCTTGAAGCTTGCCTCTCCCGC
TTTCTCAGAGGCTTCGAAGAAAGCTCAAGAAGCAATGCAAAGCTCTGGTATCGATGCGGA
GCCTGTCTTTAATGCTGCAAAGACAGTCACAGATGTGGCCCAACAGACAACAAAAGCTAT
TGAAGATGCTAAGCCCATTGCTTCATCGACCATGGAGACGATATCTTCAGCTGATCCTAG
TGTCATTGTTGTTGCTGCTGGTGCTGCCTTTATTGCTTACCTTCTCCTCCCTCCTGTTTG
GTCTGCTATATCTTTAACTTCCGTG

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 3

CO CL3691Contig1 776 3 13 U
GGGCCAGGGGAACGTTTGCTAACATCCGCATCGTTAACAAGCTCATGAATGGGGAAGTTG
GACCCAAGACTGTTCACATTCCTTCTGGAGAGAAGCTATCAGTATTTGACGCAGTCATGA
GGTACAAATCATCTGGAGAAGACACGATTATTCTAGCTGGAGTCGAGTATGGAAGTGGTA
GCTCACGTGATTGGGCTGCTAAGGGACCTATGCTACAGGATGTGAAAGCAGTGATTTCAA
AGAGTTTTGAAAGGATTCACCGAAGCAACTTGGTGGGAATGGGAATCATCCCGTTGTGCT
TCAAGTCGGGTGAAGATGCAGACACACTTGGATTGACGGGTCATGAGCGTTACACAATCC
ACCTCCCAACCGATATATCAGAGATAAGACCTGGCCAAGATGTTACCGTCACTACAGACA
ACGGAAAGTCTTTCACTTGCACAGTCCGCTTCGACACTGAGGTGGAATTGGCATACTTCA
ACCATGGAGGTATACTTCCATATGTCATCAGAAACTTGAGCAAGCAGTAGTGAAAAGGTG
AAAGGAACTCACGCATCTTTTTTTAATAAAGAGAAAAGGAGCTTTACGACCTGTCTTCAA
AATGTTATTTTGTTTGAAAAAGAGGCAGATAAGTCTGTCGAGGAGATCGATTTCCTGCAC
TATGAGATTTCAGTTGTTAGTTTACTCGTATCGCTCCCTTTATGTTTGTGCAACTTGCAG
*ACATGAATATATTATTGTTGATTATTTTCTGAATAATAAAAACGGATTCTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ53TF U 1
AF RR2FO86TF U 44
AF RR2FO86JQ C 81
BS 1 114 RR2GZ53TF
BS 115 115 RR2FO86TF
BS 116 162 RR2GZ53TF
BS 163 163 RR2FO86TF
BS 164 219 RR2GZ53TF
BS 220 220 RR2FO86TF
BS 221 483 RR2GZ53TF
BS 484 484 RR2FO86TF
BS 485 718 RR2GZ53TF
BS 719 719 RR2FO86TF
BS 720 741 RR2GZ53TF
BS 742 763 RR2FO86TF
BS 764 776 RR2FO86JQ

RD RR2GZ53TF 741 0 0
GGGCCAGGGGAACGTTTGCTAACATCCGCATCGTTAACAAGCTCATGAATGGGGAAGTTG
GACCCAAGACTGTTCACATTCCTTCTGGAGAGAAGCTATCAGTATTTGACGCAGCCATGA
GGTACAAATCATCTGGAGAAGACACGATTATTCTAGCTGGAGCCGAGTATGGAAGTGGTA
GCTCACGTGATTGGGCTGCTAAGGGACCTATGCTACAGGGTGTGAAAGCAGTGATTTCAA
AGAGTTTTGAAAGGATTCACCGAAGCAACTTGGTGGGAATGGGAATCATCCCGTTGTGCT
TCAAGTCGGGTGAAGATGCAGACACACTTGGATTGACGGGTCATGAGCGTTACACAATCC
ACCTCCCAACCGATATATCAGAGATAAGACCTGGCCAAGATGTTACCGTCACTACAGACA
ACGGAAAGTCTTTCACTTGCACAGTCCGCTTCGACACTGAGGTGGAATTGGCATACTTCA
ACCGTGGAGGTATACTTCCATATGTCATCAGAAACTTGAGCAAGCAGTAGTGAAAAGGTG
AAAGGAACTCACGCATCTTTTTTTAATAAAGAGAAAAGGAGCTTTACGACCTGTCTTCAA
AATGTTATTTTGTTTGAAAAAGAGGCAGATAAGTCTGTCGAGGAGATCGATTTCCTGCAC
TATGAGATTTCAGTTGTTAGTTTACTCGTATCGCTCCCTTTATGTTTGTGCAACTTGCGG
*ACATGAATATATTATTGTTG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2FO86TF 720 0 0
G
ATGAATGGGGAAGTTGGACCCAAGACTGTTCACATTCCTTCTGGAGAGAAGCTATCAGTA
TTTGACGCAGTCATGAGGTACAAATCATCTGGAGAAGACACGATTATTCTAGCTGGAGTC
GAGTATGGAAGTGGTAGCTCACGTGATTGGGCTGCTAAGGGACCTATGCTACAGGATGTG
AAAGCAGTGATTTCAAAGAGTTTTGAAAGGATTCACCGAAGCAACTTGGTGGGAATGGGA
ATCATCCCGTTGTGCTTCAAGTCGGGTGAAGATGCAGACACACTTGGATTGACGGGTCAT
GAGCGTTACACAATCCACCTCCCAACCGATATATCAGAGATAAGACCTGGCCAAGATGTT
ACCGTCACTACAGACAACGGAAAGTCTTTCACTTGCACAGTCCGCTTCGACACTGAGGTG
GAATTGGCATACTTCAACCATGGAGGTATACTTCCATATGTCATCAGAAACTTGAGCAAG
CAGTAGTGAAAAGGTGAAAGGAACTCACGCATCTTTTTTTAATAAAGAGAAAAGGAGCTT
TACGACCTGTCTTCAAAATGTTATTTTGTTTGAAAAAGAGGCAGATAAGTCTGTCGAGGA
GATCGATTTCCTGCACTATGAGATTTCAGTTGTTAGTTTACTCGTATCGCTCCCTTTATG
TTTGTGCAACTTGCAG*ACATGAATATATTATTGTTGATTATTTTCTGAATAATAAAAA

QA 2 720 2 720
DS 

RD RR2FO86JQ 696 0 0
CT
TTCTGGAGAGAAGCTATCAGTATTTGACGCAGTCATGAGGTACAAATCATCTGGAGAAGA
CACGATTATTCTAGCTGGAGTCGAGTATGGAAGTGGTAGCTCACGTGATTGGGCTGCTAA
GGGACCTATGCTACAGGATGTGAAAGCAGTGATTTCAAAGAGTTTTGAAAGGATTCACCG
AAGCAACTTGGTGGGAATGGGAATCATCCCGTTGTGCTTCAAGTCGGGTGAAGATGCAGA
CACACTTGGATTGACGGGTCATGAGCGTTACACAATCCACCTCCCAACCGATATATCAGA
GATAAGACCTGGCCAAGATGTTACCGTCACTACAGACAACGGAAAGTCTTTCACTTGCAC
AGTCCGCTTCGACACTGAGGTGGAATTGGCATACTTCAACCATGGAGGTATACTTCCATA
TGTCATCAGAAACTTGAGCAAGCAGTAGTGAAAAGGTGAAAGGAACTCACGCATCTTTTT
TTAATAAAGAGAAAAGGAGCTTTACGACCTGTCTTCAAAATGTTATTTTGTTTGAAAAAG
AGGCAGATAAGTCTGTCGAGGAGATCGATTTCCTGCACTATGAGATTTCAGTTGTTAGTT
TACTCGTATCGCTCCCTTTATGTTTGTGCAACTTGCAGGACATGAATATATTATTGTTGA
TTATTTTCTGAATAATAAAAACGGATTCTCTCTC

QA 3 696 3 696
DS 



AS 1 3

CO CL3692Contig1 703 3 5 U
CCATAAACTAGAAACTATGCTCAATTCTAAAGGCCAACAGTACACCATTCATTACATCAT
CAACCAAACAAAGACGTGAACCAAAACACCCCAAACAAAAAAAGGTCCACCGAATAATTA
ATTTGACACCCAAGCTTTAAATAAAAATAAACATCAATAACAGGGACACACTAAAATAAA
CATCAATTACTTTCCCTCAAATCCATAAATAAAGATTCTAGAACAACGAACAAAACCAAG
AAGTGAACTACAGAAGCGAAGAAGAAGCAAACAAGCAGAACAAGCTCACCACCAAACCAG
CCGTTGCTCCTCCGACGATCCTAACTGCACTGGCTTCATCAGCAGTCGCGTCATCCGCGT
CTCCATCAGGCCCTTCAGCAGGTGAATCCGAACCACCGAAAGAATCATCATCAGGTGACG
GTGCAGCCTTCTTCTTCTTCCCCTTCCCTTTCCCTTTAGCCGGTTTAGGAGAATCCGCAA
CATCGCCCTCCGGCGCCGGAGCAGGAGCCGGTGCTTCAACAGCCGAAGCCTTAAACAGCT
CTTTAGGCAGTAAAACCTTATCCGTCGCGTAAATAGCCAAAGGCTGCTCGTCGATCAGAG
TATCAATGATCTGGACAGTGTTGATCCTTGTTCTGAGGGTAACTTTCTCTCCATCGTTCT
GTACAGTGAGCTCGAACTTGTTGGCTCCGTCCGTGGCTAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F570JQ U 1
AF RR2G558JQ U 30
AF RR2G558TF C 32
BS 1 48 RR2F570JQ
BS 49 49 RR2G558JQ
BS 50 639 RR2F570JQ
BS 640 688 RR2G558JQ
BS 689 703 RR2G558TF

RD RR2F570JQ 646 0 0
CCATAAACTAGAAACTATGCTCAATTCTAAAGGCCAACAGTACACCATCCATTACATCAT
CAACCAAACAAAGACGTGAACCAAAACACCCCAAACAAAAAAAGGTCCACCGAATAATTA
ATTTGACACCCAAGCTTTAAATAAAAATAAACATCAATAACAGGGACACACTAAAATAAA
CATCAATTACTTTCCCTCAAATCCATAAATAAAGATTCTAGAACAACGAACAAAACCAAG
AAGTGAACTACAGAAGCGAAGAAGAAGCAAACAAGCAGAACAAGCTCACCACCAAACCAG
CCGTTGCTCCTCCGACGATCCTAACTGCACTGGCTTCATCAGCAGTCGCGTCATCCGCGT
CTCCATCAGGCCCTTCAGCAGGTGAATCCGAACCACCGAAAGAATCATCATCAGGTGACG
GTGCAGCCTTCTTCTTCTTCCCCTTCCCTTTCCCTTTAGCCGGTTTAGGAGAATCCGCAA
CATCGCCCTCCGGCGCCGGAGCAGGAGCCGGTGCTTCAACAGCCGAAGCCTTAAACAGCT
CTTTAGGCAGTAAAACCTTATCCGTCGCGTAAATAGCCAAAGGCTGCTCGTCGATCAGAG
TATCAATGATCTGGACAGTGTTGATCCTTGTTCTGAGGG
GTAACTT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2G558JQ 659 0 0
AA
GGCCAACAGTACACCATTCATTACATCATCAACCAAACAAAGACGTGAACCAAAACACCC
CAAACAAAAAAAGGTCCACCGAATAATTAATTTGACACCCAAGCTTTAAATAAAAATAAA
CATCAATAACAGGGACACACTAAAATAAACATCAATTACTTTCCCTCAAATCCATAAATA
AAGATTCTAGAACAACGAACAAAACCAAGAAGTGAACTACAGAAGCGAAGAAAAAGCAAA
CAAGCAGAACAAGCTCACCACCAAACCAGCCGTTGCTCCTCCGACGATCCTAACTGCACT
GGCTTCATCAGCAGTCGCGTCATCCGCGTCTCCATCAGGCCCTTCAGCAGGGGAATCCGA
ACCACCGAAAGAATCATCATCAGGTGACGGTGCAGCCTTCTTCTTCTTCCCCTTCCCTTT
CCCTTTAGCCGGTTTAGGAGAATCCGCAACATCGCCCTCCGGCGCCGGAGCAGGAGCCGG
TGCTTCAACAGCCGAAGCCTTAAACAGCTCTTTAGGCAGTAAAACCTTATCCGTCGCGTA
AATAGCCAAAGGCTGCTCGTCGATCAGAGTATCAATGATCTGGACAGTGTTGATCCTTGT
TCTGAGGGTAACTTTCTCTCCATCGTTCTGTACAGTGAGCTCGAACTTGTTGGCTCC

QA 3 659 3 659
DS 

RD RR2G558TF 672 0 0
GGCCAACAGTACACCATTCATTACATCATCAACCAAACAAAGACGTGAACCAAAACACCC
CAAACAAAAAAAGGTCCACCGAATAATTAATTTGACACCCAAGCTTTAAATAAAAATAAA
CATCAATAACAGGGACACACTAAAATAAACATCAATTACTTTCCCTCAAATCCATAAATA
AAGATTCTAGAACAACGAACAAAACCAAGAAGTGAACTACAGAAGCGAAGAAGAAGCAAA
CAAGCAGAACAAGCTCACCACCAAACCAGCCGTTGCTCCTCCGACGATCCTAACTGCACT
GGCTTCATCAGCAGTCGCGTCATCCGCGTCTCCATCAGGCCCTTCAGCAGGTGAATCCGA
ACCACCGAAAGAATCATCATCAGGTGACGGTGCAGCCTTCTTCTTCTTCCCCTTCCCTTT
CCCTTTAGCCGGTTTAGGAGAATCCGCAACATCGCCCTCCGGCGCCGGAGCAGGAGCCGG
TGCTTCAACAGCCGAAGCCTTAAACAGCTCTTTAGGCAGTAAAACCTTATCCGTCGCGTA
AATAGCCAAAGGCTGCTCGTCGATCAGAGTATCAATGATCTGGACAGTGTTGATCCTTGT
TCTGAGGGTAACTTTCTCTCCATCGTTCTGTACAGTGAGCTCGAACTTGTTGGCTCCGTC
CGTGGCTAGTGC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL3693Contig1 1040 2 4 U
GGAGCTCGTCTCTGTTGCATCCCAAACGATCGTATGCTCCGGTCAGCACCGAAGATCCAG
GGAGTTCGAGTAGAGGAGCAGTAACAGTGGGATTACCACCAGATTGGGTTGATGTCTCTG
AGGAGATTTCAGTGAACATTCAGCGTGCGAGGACCAAAATGGCTGAACTGGGGAAGGCTC
ATGCGAAAGCCTTGATGCCTACGTTTGGTGATGGTAAAGAAGATCAGCATCAGATCGAGT
CTTTGGCGCAGGAGATTACTTTCCTGTTGAGGAAATCAGAGAAGCAGCTTCAGAAGCTAT
CTGCAGCTGGACCTTCTGAAGATTCAAATGTCAAAAAAACGTGCAGAGATCTCTTGCTAC
TGATCTCCAATTCCTTTCTATGGAGCTCCGCAAGAAACAGTCTACATATCTCAAACGCTT
GAGACTACAAAAAGAGGATGGAGGGGATTTAGAGATGAATCTCAACGGAAGCAGCTCTAG
AGCAGATGATGATGACTTTGATGATATATTATTTAGTGAGCATCAGATGAGCAAGATCAA
AAAGAGCGAGGCAATATCCGTAGAGAGGGAGAAAGAGATTCAGCAGGTTGTTGAATCTGT
AAACGAGCTCGCTCAGATAATGAAGGATCTTTCTGCACTTGTAATTGACCAGGGTACGAT
TGTTGATCGGATCGACTATAACATCCAGAACGTTGCTAGTACAGTTGAAGATGGTCTCAA
ACAGCTGCAAAAGGCAGAACGTACACAGAGAAATGGAGGTATGGTTATGTGTGCGTCAGT
TCTTGTTATCCTCTGCTTCATCATGATAGTACTCTTAATCCTTAAAGAGATTTTCTTGTG
ACTCAAGAAAGAGGTTGATCCCTCATTCTTTTATTCTTTCATAATGGGAAACCCAACAAT
GTTTGCGTTGCTCATTGTTCTGCTGTATCCACCAAAATTGTCTGAATGAATATAAATTCG
AATTGCGTTCTCTTTAGTATTTGGATTTTGAGGAGTTTGTTTGTAAGGGTTTATTTACAT
GTAAAGAAGTTTTTAACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP17TF U 1
AF RR2AP17JQ C 211
BS 1 853 RR2AP17TF
BS 854 854 RR2AP17JQ
BS 855 869 RR2AP17TF
BS 870 1040 RR2AP17JQ

RD RR2AP17TF 869 0 0
GGAGCTCGTCTCTGTTGCATCCCAAACGATCGTATGCTCCGGTCAGCACCGAAGATCCAG
GGAGTTCGAGTAGAGGAGCAGTAACAGTGGGATTACCACCAGATTGGGTTGATGTCTCTG
AGGAGATTTCAGTGAACATTCAGCGTGCGAGGACCAAAATGGCTGAACTGGGGAAGGCTC
ATGCGAAAGCCTTGATGCCTACGTTTGGTGATGGTAAAGAAGATCAGCATCAGATCGAGT
CTTTGGCGCAGGAGATTACTTTCCTGTTGAGGAAATCAGAGAAGCAGCTTCAGAAGCTAT
CTGCAGCTGGACCTTCTGAAGATTCAAATGTCAAAAAAACGTGCAGAGATCTCTTGCTAC
TGATCTCCAATTCCTTTCTATGGAGCTCCGCAAGAAACAGTCTACATATCTCAAACGCTT
GAGACTACAAAAAGAGGATGGAGGGGATTTAGAGATGAATCTCAACGGAAGCAGCTCTAG
AGCAGATGATGATGACTTTGATGATATATTATTTAGTGAGCATCAGATGAGCAAGATCAA
AAAGAGCGAGGCAATATCCGTAGAGAGGGAGAAAGAGATTCAGCAGGTTGTTGAATCTGT
AAACGAGCTCGCTCAGATAATGAAGGATCTTTCTGCACTTGTAATTGACCAGGGTACGAT
TGTTGATCGGATCGACTATAACATCCAGAACGTTGCTAGTACAGTTGAAGATGGTCTCAA
ACAGCTGCAAAAGGCAGAACGTACACAGAGAAATGGAGGTATGGTTATGTGTGCGTCAGT
TCTTGTTATCCTCTGCTTCATCATGATAGTACTCTTAATCCTTAAAGAGATTTTCTTGTG
ACTCAAGAAAGAG*TTGATCCCTCATTCT

QA 1 869 1 869
DS 

RD RR2AP17JQ 830 0 0
ATGGTAAAGAAGATCAGCATCAGATCGAGTCTTTGGCGCAGGAGATTACTTTCCTGTTGA
GGAAATCAGAGAAGCAGCTTCAGAAGCTATCTGCAGCTGGACCTTCTGAAGATTCAAATG
TCAAAAAAACGTGCAGAGATCTCTTGCTACTGATCTCCAATTCCTTTCTATGGAGCTCCG
CAAGAAACAGTCTACATATCTCAAACGCTTGAGACTACAAAAAGAGGATGGAGGGGATTT
AGAGATGAATCTCAACGGAAGCAGCTCTAGAGCAGATGATGATGACTTTGATGATATATT
ATTTAGTGAGCATCAGATGAGCAAGATCAAAAAGAGCGAGGCAATATCCGTAGAGAGGGA
GAAAGAGATTCAGCAGGTTGTTGAATCTGTAAACGAGCTCGCTCAGATAATGAAGGATCT
TTCTGCACTTGTAATTGACCAGGGTACGATTGTTGATCGGATCGACTATAACATCCAGAA
CGTTGCTAGTACAGTTGAAGATGGTCTCAAACAGCTGCAAAAGGCAGAACGTACACAGAG
AAATGGAGGTATGGTTATGTGTGCGTCAGTTCTTGTTATCCTCTGCTTCATCATGATAGT
ACTCTTAATCCTTAAAGAGATTTTCTTGTGACTCAAGAAAGAGGTTGATCCCTCATTCTT
TTATTCTTTCATAATGGGAAACCCAACAATGTTTGCGTTGCTCATTGTTCTGCTGTATCC
ACCAAAATTGTCTGAATGAATATAAATTCGAATTGCGTTCTCTTTAGTATTTGGATTTTG
AGGAGTTTGTTTGTAAGGGTTTATTTACATGTAAAGAAGTTTTTAACTAC

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 3

CO CL3694Contig1 852 3 12 U
GGACCACTCCTTTCATATAACCCACTAATCAATTACCTCCTACTCCTCTCTCTCTCTCTT
TCAACAACCAAGAAGCGAGACACAGAGGAGAGAGACTTCTTTGTTTTGCCTCTCTGGCTT
ATATATTCAGACACTGTCTTAACATAAACAAAACAACACAACACAAAATTTGTGTTCTTT
TGACTCTTCTTTCCTCCTTTTAAGACATCAATGGCTGGGACTGGAATTTTCACAGAGATT
CTAGACGGAGAAGTCTACAAGTACTACTCTGATGGAGAGTGGAAAACTTCTTCCTCCGGT
AAGAGTGTGGCCATCGTTAACCCAGCCACGAGGAAGACACAGTACAAGGTTCAAGCATGC
ACGCAAGAAGAAGTGAACAAGGTGATGGAGATGGCTAAATCTGCTCAGAAGTCATGGGCA
AAGACTCCTCTTTGGAAAAGAGCTGAGCTTCTTCACAAAGCTGCTGCGATCCTCAAAGAC
AACAAAGCTCCCATCGCTGAGTCTCTTGTCAAGGAAATTGCTAAACCAGCCAAAGATTCT
GTCACTGAGGTTGTGAGGTCTGGAGATTTGATCTCTTATTGTGCTGAAGAAGGTGTTAGG
ATCTTAGGTGAAGGGAAGTTCCTGCTCTCTGATAGCTTCCCTGGTAATGAACGTACCAAG
TACTGCCTCACTTCCAAGATCCCACTCGGTGTGGTTTTGGCTATTCCTCCATTCAACTAC
CCTGTCAATCTCGCTGTCTCAAAGATCGCTCCTGCTTTGATAGCTGGAAACTCCCTTGTC
CTGAAACCTCCCACTCAAGGAGCTGTTTCTTGCCTTCATATGGTGCATTGCTTTCACTTA
GCTGGTTTCCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV46TF U 1
AF RR2F705TF U 64
AF RR2BI43TF U 40
BS 1 332 RR2BV46TF
BS 333 333 RR2BI43TF
BS 334 476 RR2BV46TF
BS 477 477 RR2BI43TF
BS 478 578 RR2BV46TF
BS 579 579 RR2BI43TF
BS 580 620 RR2BV46TF
BS 621 621 RR2BI43TF
BS 622 641 RR2BV46TF
BS 642 642 RR2BI43TF
BS 643 676 RR2BV46TF
BS 677 852 RR2BI43TF

RD RR2BV46TF 683 0 0
GGACCACTCCTTTCATATAACCCACTAATCAATTACCTCCTACTCCTCTCTCTCTCTCTT
TCAACAACCAAGAAGCGAGACACAGAGGAGAGAGACTTCTTTGTTTTGCCTCTCTGGCTT
ATATATTCAGACACTGTCTTAACATAAACAAAACAACACAACACAAAATTTGTGTTCTTT
TGACTCTTCTTTCCTCCTTTTAAGACATCAATGGCTGGGACTGGAATTTTCACAGAGATT
CTAGACGGAGAAGTCTACAAGTACTACTCTGATGGAGAGTGGAAAACTTCTTCCTCCGGT
AAGAGTGTGGCCATCGTTAACCCAGCCACGAGAAAGACACAGTACAAGGTTCAAGCATGC
ACGCAAGAAGAAGTGAACAAGGTGATGGAGATGGCTAAATCTGCTCAGAAGTCATGGGCA
AAGACTCCTCTTTGGAAAAGAGCTGAGCTTCTTCACAAAGCTGCTGCGATCCTCAAGGAC
AACAAAGCTCCCATCGCTGAGTCTCTTGTCAAGGAAATTGCTAAACCAGCCAAAGATTCT
GTCACTGAGGTTGTGAGGTCTGGAGATTTGATCTCTTACTGTGCTGAAGAAGGTGTTAGG
ATCTTAGGTGAAGGGAAGTTTCTGCTCTCTGATAGCTTCCCCGGTAATGAACGTACCAAG
TACTGCCTCACTTCCA
GATCCCT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2F705TF 777 0 0
GG
AACCATGAAGCGAGACACAGAGGAGAGAGACTTCTTTGTTTTGCCTCTCTGGCTTATATA
TTCAGACACTGTCTTAACATAAACAAAACAACACAACACAAAATTTGTGTTCTTTTGACT
CTTCTTTCCTCCTTTTAAGACATCAATGGCTGGGACTGGAATTTTCACAGAGATTCTAGA
CGGAGAAGTCTACAAGTACTACTCTGATGGAGAGTGGAAAACTTCTTCCTCCGGTAAGAG
TGTGGCCATCGTTAACCCAGCCACGAGGAAGACACAGTACAAGGTTCAAGCATGCGCGCA
AGAAGAAGTGAACAAGGTGATGGAGATGGCTAAATCTGCTCAGAAGTCATGGGCAAAGAC
TCCTCTTTGTAAAAGAGCTGAGCTTCTTCACAAAGCTGCTGCGATCCCCAAAGACAACAA
AGCTCCCATCGCTGAGTCTCTTGTCAAGGAAATTGCTAAACCAGCCAAAGATTCTGTCAC
TGAGGTTGTGAGGTCTGGAGATTTGATCTCTTATTGTGCTGAAGAAGGTGTTAGGATCTT
AGGTGAAGGGAAGTTCCTGCTCTCTGATAGCTTCCCTGGTAATGAACGTACCAAGTACTG
CCTCACTTCCAAGATCCCACTCGGTGTGGTTTTGTCTATTCCTCCATTCAACTACCCTGT
CAATCTCGCTGTCTCAAAGATCGCTCCTGCTTTGATAGCTGGAAACTCCCTTGTCCTGAA
ACCTCCCACTCAAGGAGCTGTTTCTTGCCTTCATATGGTGCATTGCTTTCACTTA

QA 3 777 3 777
DS 

RD RR2BI43TF 813 0 0
GG
ACTCCTCTCTCTCTCTCTTTCAACAACCAAGAAGCGAGACACAGAGGAGAGAGACTTCTT
TGTTTTGCCTCTCTGGCTTATATATTCAGACACTGTCTTAACATAAACAAAACAACACAA
CACAAAATTTGTGTTCTTTTGACTCTTCTTTCCTCCTTTTAAGACATCAATGGCTGGGAC
TGGAATTTTCACAGAGATTCTAGACGGAGAAGTCTACAGGTACTACTCTGATGGAGAGTG
GAAAACTTCTTCCTCCGGTAAGAGTGTGGCCATCGTTAACCCAGCCACGAGGAAGACACA
GTACAAGGTTCAAGCATGCACGCAAGAAGAAGTGAATAAGGTGATGGAGATGGCTAAATC
TGCTCAGAAGTCATGGGCAAAGACTCCTCTTTGGAAAAGAGCTGAGCTTCTTCACAAAGC
TGCTGCGATCCTCAAAGACAACAAAGCTCCCATCGCTGAGTCTCTTGTCAAGGAAATTGC
TAAACCAGCCAAAGATTCTGTCACTGAGGTTGTGAGGTCTGGAGATTTGATCTCTTATTG
TGCTGAAGAAGGTGTTAGGATCTTAGGTGAAGGGAAGTTCCTGCTCTCTGATAACTTCCC
TGGTAATGAACGTACCAAGTACTGCCTCACTTCCAAGATCCCACTCGGTGTGGTTTTGGC
TATTCCTCCATTCAACTACCCTGTCAATCTCGCTGTCTCAAAGATCGCTCCTGCTTTGAT
AGCTGGAAACTCCCTTGTCCTGAAACCTCCCACTCAAGGAGCTGTTTCTTGCCTTCATAT
GGTGCATTGCTTTCACTTAGCTGGTTTCCCA

QA 3 813 3 813
DS 



AS 1 3

CO CL3695Contig1 950 3 2 U
TAGCACACAGAATCTTGAAAGAATCAAAACTCCATCGTCTCCTCCTCCCCTGAAACTCCT
CTGATCGTGTGAGCTCCGTCGACCGGCGCGTGGTGGCTCTGTCAGCACCGGCGCCGGTCC
ATGTCTCTGTCCTTTTTATTCTATGCTTGGTTGTAGTTTGGTTCGTGACTGAGACTCCAA
TTTTGAGAGATATGCTTCAAATCAATGAAACTTCCAGATCTGCTGCAGATCTTTGATAAA
GGGTCCGGATCTGGCGATTAACGGTGTGGCCTAGCTACAAAGCTTTTATTACACAAGTCT
CAGTCTAGATCTGGTCAGTTTTGTTGTGTTGCCTATCTCTGGATTTCTTGTGTGGATCTC
TCTATTTCAGGTTTATCTAAATGGTTAGAGGTTTCTATGGATTCCTACGATCCGTCTTTA
TGTCATTCGTGGCCTGTGTTCTTTGTGCTCCGGATCAAGTGGGCTTGGCTCCTAGTAGTT
TGTTCAGATCTCGTGGAGATTTGATCTAGTTGTGGCTTCATTCCTTGGCGTTTATCAGTC
GTCTGCGACTCAGCCGTGTCCGGAAGTTGTGAGAATCTGAAGAATTCTTCCTTGCCGGTT
TGTGAAGCTCGTGTTACGTGGTTATGAGGTGTGTCCTCGTTGTACTAGGAGGGAGTGGTT
TTTCGATGGTTTGGCCGGGGGCATTCACGTTAAACAAATTTCATAGATTTTCTACCATTT
GAATTTCTCTGTGTTATTGAGAGGACTACCAGTTGTCTTTGAGTCTTGTTGCTTAGTTTT
AAGTGTGTATTTGTAGCTGCCCTGGTTTGTTGTTGTTTGGGCTTATGCATCCCTTTATGG
GTTTTAGATTCCGGAGATATTGTGTTGTCTGCCGGCTTAGCTTACCATGGACATTCCTTC
GTCCGTTGGTCTTTGTATCTGTTTCATCTCATCTATAAAATCAGTGACGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C578TF U 133
AF RR2AM11TF U 1
AF RR2AM11JQ C 185
BS 1 720 RR2AM11TF
BS 721 950 RR2AM11JQ

RD RR2C578TF 514 0 0
TTTTTATTCTATGCTTGGTTGTAGTTTGGTTCGTGACTGAGACTCCAATTTTGAGAGATA
TGCTTCAAATCAATGAAACTTCCAGATCTGCTGTAGATCTTTGATAAAGGATCCGGATCT
GGCGATTAACGGTGTGGCCTAGCTACAAAGCTTTTATTACACAAGTCTCAGTCTAGATCT
GGTCAGTTTTGTTGTGTTGCCTATCTCTGGATTTCTTGTGTGGATCTCTCTATTTCAGGT
TTATCTAAATGGTTAGAGGTTTCTATGGATTCCTACGATCCGTCTTTATGCCATTCGTGG
CCTGTGTTCTTTGTGCTCCGGATCAAGTGGGCTTGGCTCCTAGTAGTTTGTTCAGATCTC
GTGGAGATTTGATCTAATTGTGGCTTCATTCCTAGGCGTTTATCAGTCGTCTGCGACTCA
GCCGGGTCCGGAAGTTGTGAGAATCTGAAAGATTCTTCCTTGCCGGTTTGTGAAGCTCGT
GTTACGTGGTTAAGAGGTGTGTCCTCGTTGTA
TA

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2AM11TF 720 0 0
TAGCACACAGAATCTTGAAAGAATCAAAACTCCATCGTCTCCTCCTCCCCTGAAACTCCT
CTGATCGTGTGAGCTCCGTCGACCGGCGCGTGGTGGCTCTGTCAGCACCGGCGCCGGTCC
ATGTCTCTGTCCTTTTTATTCTATGCTTGGTTGTAGTTTGGTTCGTGACTGAGACTCCAA
TTTTGAGAGATATGCTTCAAATCAATGAAACTTCCAGATCTGCTGCAGATCTTTGATAAA
GGGTCCGGATCTGGCGATTAACGGTGTGGCCTAGCTACAAAGCTTTTATTACACAAGTCT
CAGTCTAGATCTGGTCAGTTTTGTTGTGTTGCCTATCTCTGGATTTCTTGTGTGGATCTC
TCTATTTCAGGTTTATCTAAATGGTTAGAGGTTTCTATGGATTCCTACGATCCGTCTTTA
TGTCATTCGTGGCCTGTGTTCTTTGTGCTCCGGATCAAGTGGGCTTGGCTCCTAGTAGTT
TGTTCAGATCTCGTGGAGATTTGATCTAGTTGTGGCTTCATTCCTTGGCGTTTATCAGTC
GTCTGCGACTCAGCCGTGTCCGGAAGTTGTGAGAATCTGAAGAATTCTTCCTTGCCGGTT
TGTGAAGCTCGTGTTACGTGGTTATGAGGTGTGTCCTCGTTGTACTAGGAGGGAGTGGTT
TTTCGATGGTTTGGCCGGGGGCATTCACGTTAAACAAATTTCATAGATTTTCTACCATTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2AM11JQ 766 0 0
GAGAGATATGCTTCAAATCAATGAAACTTCCAGATCTGCTGCAGATCTTTGATAAAGGGT
CCGGATCTGGCGATTAACGGTGTGGCCTAGCTACAAAGCTTTTATTACACAAGTCTCAGT
CTAGATCTGGTCAGTTTTGTTGTGTTGCCTATCTCTGGATTTCTTGTGTGGATCTCTCTA
TTTCAGGTTTATCTAAATGGTTAGAGGTTTCTATGGATTCCTACGATCCGTCTTTATGTC
ATTCGTGGCCTGTGTTCTTTGTGCTCCGGATCAAGTGGGCTTGGCTCCTAGTAGTTTGTT
CAGATCTCGTGGAGATTTGATCTAGTTGTGGCTTCATTCCTTGGCGTTTATCAGTCGTCT
GCGACTCAGCCGTGTCCGGAAGTTGTGAGAATCTGAAGAATTCTTCCTTGCCGGTTTGTG
AAGCTCGTGTTACGTGGTTATGAGGTGTGTCCTCGTTGTACTAGGAGGGAGTGGTTTTTC
GATGGTTTGGCCGGGGGCATTCACGTTAAACAAATTTCATAGATTTTCTACCATTTGAAT
TTCTCTGTGTTATTGAGAGGACTACCAGTTGTCTTTGAGTCTTGTTGCTTAGTTTTAAGT
GTGTATTTGTAGCTGCCCTGGTTTGTTGTTGTTTGGGCTTATGCATCCCTTTATGGGTTT
TAGATTCCGGAGATATTGTGTTGTCTGCCGGCTTAGCTTACCATGGACATTCCTTCGTCC
GTTGGTCTTTGTATCTGTTTCATCTCATCTATAAAATCAGTGACGT

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 3

CO CL3696Contig1 767 3 9 U
CGAACCACAACCATGACAAAATATATTCAAATAGAGTGTTACACATGACTATATATAAGC
ATACGACACAGGAGACAAGAACATCTTCTCTTGCCTTCAACTGTACACATATATTACACA
CAACAAATAAAGTAATCAATGTTACAATCTCACACACATGCACACAACCAAATCCTTCGA
ACCAAATTCACAAACTCATGGCAACTTAAATACTTCAGCGGACCAAGTTTCAAAGTGTTT
TCTTTTAACCCAATCACACAAACTCACACCTCACGAGAAGCTTGACGGATTTGTACTTCT
CCCCTTTGCGGTTATGCAAAGGAAACGCTCTTATTCCTTCCTTTAACTCCCAAACAGGCA
AGCATGTCTGCCCTCCAAAATCATCCTTCTCCGACATGTCATACTCGTGCACTTCTAATC
TCAGTAGAGCCAGCTCCGGAACCGTTAATGGGAACTCAAACACCTCGTCCCAAGCTGGTA
CCCAATTATCCTCCAACGTCTTTGTCTTCTTCATGACTGTATCCGCTGGAACTCCAGCTA
TCCCAACCCTTGTGTAGAAGTCAGGAGGTGAGTATTGATCGAAGTGGGTGTGGCGGAAAT
CGAAGTACCAGCCTTCTCCCATGTATACAGTCACCCTGAGTGTTGTTTTTACAGGCAGAG
TAGCTTTTGGGTCAAAGATGTCACTGTCCGAGCCACCACCTTTCAGCAGAATATCAGGTT
TCTTGATGTATCCACATCCCCCATTGGCTCTAAACATCCCTTGCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC85JQ U 27
AF RR2DC85TF C 27
AF RR2CU66JQ U 1
BS 1 72 RR2CU66JQ
BS 73 73 RR2DC85JQ
BS 74 284 RR2CU66JQ
BS 285 285 RR2DC85JQ
BS 286 436 RR2CU66JQ
BS 437 437 RR2DC85JQ
BS 438 530 RR2CU66JQ
BS 531 531 RR2DC85JQ
BS 532 767 RR2CU66JQ

RD RR2DC85JQ 654 0 0
C
CAAATAGAGTGTTACACATGACTATATATAAGCATACGACACAGGAGACAAGAACATCTT
CTCTTGCCTTCAACTGTACACATATATTACACACAACAAATAAAGTAATCAATGTTACAA
TCTCACACACATGCACACAACCAAATCCTTCGAACCAAATTCACAAACTCATGGCAACTT
AAATACTTCAGCGGACCAAGTTTCAAAGTGTTTTCTTTTAACCCAATCACACAAACTCAC
ACCTCACGAGAAGCTTGACGGATTTGTACTTCTCCCCTTTGCGGTTATGCAAAGGAAACG
CTCTTATTCCTTCCTTTAACTCCCAAACAGGCAAGCATGTCTGCCCTCCAAAATCATCCT
TCTCCGACATGTCATACTCGTGCACTTCTAATCTCAGTAGAGCCAGCTCCGGAACCGTTA
ATGGGAACTCAAACACCTCGTCCCAAGCTGGTACCCAATTATCCTCCAACGTCTTTGTCT
TCTTCATGACTGTATCCGCTGGAACTCCAGCTATCCCAACCCTTGTGTAGAAGTCAGGAG
GTGAGTATTGATCGAAGTGGGTGTGGCGGAAATCGAAGTACCAGCCTTCTCCCATGTATA
CAGTCACCCTGAGTGTTGTTTTTACAGGCAGAGTAGCTTTTGGGTCAAAGAT
C

QA 2 653 2 653
DS 

RD RR2DC85TF 654 0 0
C
CAAATAGAGTGTTACACATGACTATATATAAGCATACGACACAGGAGACAAGAACATCTT
CTCTTGCCTTCAACTGTACACATATATTACACACAACAAATAAAGTAATCAATGTTACAA
TCTCACACACATGCACACAACCAAATCCTTCGAACCAAATTCACAAACTCATGGCAACTT
AAATACTTCAGCGGACCAAGTTTCAAAGTGTTTTCTTTTAACCCAATCACACAAACTCAC
ACCTCACGAGAAGCTTGACGGATTTGTACTTCTCCCCTTTGCGGTTATGCAAAGGAAACG
CTCTTATTCCTTCCTTTAACTCCCAAACAGGCAAGCATGTCTGCCCTCCAAAATCATCCT
TCTCCGACATGTCATACTCGTGCACTTCTAATCTCAGTAGAGCCAGCTCCGGAACCGTTA
ATGGGAACTCAAACACCTCGTCCCAAGCTGGTACCCAATTATCCTCCAACGTCTTTGTCT
TCTTCATGACTGTATCCGCTGGAACTCCAGCTATCCCAACCCTTGTGTAGAAGTCAGGAG
GTGAGTATTGATCGAAGTGGGTGTGGCGGAAATCGAAGTACCAGCCTTCTCCCATGTATA
CAGTCACCCTGAGTGTTGTTTTTACAGGCAGAGTAGCTTTTGGGTCAAAGAT
C

QA 2 653 2 653
DS 

RD RR2CU66JQ 767 0 0
CGAACCACAACCATGACAAAATATATTCAAATAGAGTGTTACACATGACTATATATAAGC
ATACGACACAGGTGACAAGAACATCTTCTCTTGCCTTCAACTGTACACATATATTACACA
CAACAAATAAAGTAATCAATGTTACAATCTCACACACATGCACACAACCAAATCCTTCGA
ACCAAATTCACAAACTCATGGCAACTTAAATACTTCAGCGGACCAAGTTTCAAAGTGTTT
TCTTTTAACCCAATCACACAAACTCACACCTCACGAGAAGCTTGTCGGATTTGTACTTCT
CCCCTTTGCGGTTATGCAAAGGAAACGCTCTTATTCCTTCCTTTAACTCCCAAACAGGCA
AGCATGTCTGCCCTCCAAAATCATCCTTCTCCGACATGTCATACTCGTGCACTTCTAATC
TCAGTAGAGCCAGCTCAGGAACCGTTAATGGGAACTCAAACACCTCGTCCCAAGCTGGTA
CCCAATTATCCTCCAACGTCTTTGTCTTCTTCATGACTGTATCCGCTGGAGCTCCAGCTA
TCCCAACCCTTGTGTAGAAGTCAGGAGGTGAGTATTGATCGAAGTGGGTGTGGCGGAAAT
CGAAGTACCAGCCTTCTCCCATGTATACAGTCACCCTGAGTGTTGTTTTTACAGGCAGAG
TAGCTTTTGGGTCAAAGATGTCACTGTCCGAGCCACCACCTTTCAGCAGAATATCAGGTT
TCTTGATGTATCCACATCCCCCATTGGCTCTAAACATCCCTTGCATT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL3697Contig1 943 2 2 U
GGGCCTCTCTCTCTCTCTCACACAAAAATCTTGTCTGTCATCGTTCTCTCTCTCCCCTCT
CTCGGAGATTTTACTCAGGGCGTTGATCAAAGATGAATCAATACAACCTTCAGCAGAAGA
ACAACGCCTTCATGTCTCGCGAGGAGGAGATGATGGGACTTGATCGCAGCAACAAGGAGG
ATCTTGTCGTTTGTCCTAAGCCTAGACGTGTCGGCTTACTCGCCACTCGCCCTCTTAGAT
TACATTTGAGTCAAGCTGCTGCTGATCTGTGTGATTCCAAAGCGGGCGCAGAGCTTTTGG
ACATCATCCGTAGAAAGGAGGAGAATGGTACAATAGGGCAGGTACTACTACCTTCATCTC
CACCGTACTTTCCCGGTTCGCCTCCGAGCAGAGCAGCGAACCCATTAGCCCAAGATGCAC
GCTTTCGTGACGGCGAGAAGCTCAACTACCCACTCGCTTCACCCAACTCTCCTTTCCTTC
AGCCCGGTTCATCATCATCAGCCGGCTTCCCTTATCCATCACCATCAACATCGTCTTCGT
CGTCGTCTCGTGGTTGCGCTCGAATGAAATTTGGGCTCAAACCACCTGCAGTTAGAGTAG
AAGGGTTCGATTGCTTGAACCGTGACCGCCAGAGCTCCAGCATCCCCGCCGTGGCTTAGT
AGACCAAAGCCAACAAAAAAAACAAGTGTATATAGAGAGAGATTCCGGACCAAGGCCCTA
ACAGAGAGAGAGAAAGATTTGATTACTAGTGTTACTACTACATTTTTGAAGCAAATGAAT
ATGTGATATCTATTTAGTGTTTTCTTTTTTTTCATCTTTTCCTGAGAGAGAGGGAGGGAG
GATGAAGATGAAGAACGGTCACCGTTTTGTTTATACATCTACTCTATTAATTTAGAGTCC
TTAATTTTATCTACTTAAAAAGTTGTCATTTAATTTTGCACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG73TF U 1
AF RR2AG73JQ C 133
BS 1 765 RR2AG73TF
BS 766 943 RR2AG73JQ

RD RR2AG73TF 765 0 0
GGGCCTCTCTCTCTCTCTCACACAAAAATCTTGTCTGTCATCGTTCTCTCTCTCCCCTCT
CTCGGAGATTTTACTCAGGGCGTTGATCAAAGATGAATCAATACAACCTTCAGCAGAAGA
ACAACGCCTTCATGTCTCGCGAGGAGGAGATGATGGGACTTGATCGCAGCAACAAGGAGG
ATCTTGTCGTTTGTCCTAAGCCTAGACGTGTCGGCTTACTCGCCACTCGCCCTCTTAGAT
TACATTTGAGTCAAGCTGCTGCTGATCTGTGTGATTCCAAAGCGGGCGCAGAGCTTTTGG
ACATCATCCGTAGAAAGGAGGAGAATGGTACAATAGGGCAGGTACTACTACCTTCATCTC
CACCGTACTTTCCCGGTTCGCCTCCGAGCAGAGCAGCGAACCCATTAGCCCAAGATGCAC
GCTTTCGTGACGGCGAGAAGCTCAACTACCCACTCGCTTCACCCAACTCTCCTTTCCTTC
AGCCCGGTTCATCATCATCAGCCGGCTTCCCTTATCCATCACCATCAACATCGTCTTCGT
CGTCGTCTCGTGGTTGCGCTCGAATGAAATTTGGGCTCAAACCACCTGCAGTTAGAGTAG
AAGGGTTCGATTGCTTGAACCGTGACCGCCAGAGCTCCAGCATCCCCGCCGTGGCTTAGT
AGACCAAAGCCAACAAAAAAAACAAGTGTATATAGAGAGAGATTCCGGACCAAGGCCCTA
ACAGAGAGAGAGAAAGATTTGATTACTAGTGTTACTACTACATTT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2AG73JQ 811 0 0
TGTCTCGCGAGGAGGAGATGATGGGACTTGATCGCAGCAACAAGGAGGATCTTGTCGTTT
GTCCTAAGCCTAGACGTGTCGGCTTACTCGCCACTCGCCCTCTTAGATTACATTTGAGTC
AAGCTGCTGCTGATCTGTGTGATTCCAAAGCGGGCGCAGAGCTTTTGGACATCATCCGTA
GAAAGGAGGAGAATGGTACAATAGGGCAGGTACTACTACCTTCATCTCCACCGTACTTTC
CCGGTTCGCCTCCGAGCAGAGCAGCGAACCCATTAGCCCAAGATGCACGCTTTCGTGACG
GCGAGAAGCTCAACTACCCACTCGCTTCACCCAACTCTCCTTTCCTTCAGCCCGGTTCAT
CATCATCAGCCGGCTTCCCTTATCCATCACCATCAACATCGTCTTCGTCGTCGTCTCGTG
GTTGCGCTCGAATGAAATTTGGGCTCAAACCACCTGCAGTTAGAGTAGAAGGGTTCGATT
GCTTGAACCGTGACCGCCAGAGCTCCAGCATCCCCGCCGTGGCTTAGTAGACCAAAGCCA
ACAAAAAAAACAAGTGTATATAGAGAGAGATTCCGGACCAAGGCCCTAACAGAGAGAGAG
AAGGATTTGATTACTAGTGTTACTACTACATTTTTGAAGCAAATGAATATGTGATATCTA
TTTAGTGTTTTCTTTTTTTTCATCTTTTCCTGAGAGAGAGGGAGGGAGGATGAAGATGAA
GAACGGTCACCGTTTTGTTTATACATCTACTCTATTAATTTAGAGTCCTTAATTTTATCT
ACTTAAAAAGTTGTCATTTAATTTTGCACCG

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL3698Contig1 728 2 2 U
GGAAGGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGCTCGAGCATCGTCGAAGATGGTTGTTTT
ATCAGCGAAAATGATGGTGATGATCTTGATGTTGACATCGACGATCTCAGCAAAAGAGCA
GCTGAGCACTAAGGAGTGCGAGGATCTAGGATTCACCGGTCTTGCTCTCTGCTCCGATTG
CCACTCTCTCTCTGAATACGTCAAGGACCAAGAGTTGGTATCTGACTGCTTGAAATGCTG
CGCTGATGATTCTGAGGATTCCATGAGTAAGGTTACCTATTCGGGCGCTATATTGGAGGT
GTGCATGAGAAAGCTGGTTTTCTATCCTGAGATTGTTGGTTTTATTGAAGAAGAGAAACA
AAACTTCCCTACCCTAAAAGTTGAGTACGTTTTCAACTCACCACCCAAGTTGATCATGCT
CGATGGAGATGATGAACGTAAGGAAACAATCAGAATCGACAACTGGAAACGCGAGCATCT
ACTCCAGTATATGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACTTCATCAAGTTAGTCTAAATCACTATG
TAGGAGGGACTGAATCACCTATTCCAAAGCAGCATTGTGATCTAATAGTTAAATAACGCA
TTGTGATTGACTTGTCTCTAAGCTATTTGGTCCCTCGGCGTCAGTAGTCTGTGTGTTCTG
AATCTTTGCAATCTCGGTGTTAATGTCTTCTATTCTATCCAATGTTCTTATAAAATGGCA
ACTTTTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG14TF U 1
AF RR2CG14JQ C 1
BS 1 650 RR2CG14TF
BS 651 728 RR2CG14JQ

RD RR2CG14TF 658 0 0
GGAAGGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGCTCGAGCATCGTCGAAGATGGTTGTTTT
ATCAGCGAAAATGATGGTGATGATCTTGATGTTGACATCGACGATCTCAGCAAAAGAGCA
GCTGAGCACTAAGGAGTGCGAGGATCTAGGATTCACCGGTCTTGCTCTCTGCTCCGATTG
CCACTCTCTCTCTGAATACGTCAAGGACCAAGAGTTGGTATCTGACTGCTTGAAATGCTG
CGCTGATGATTCTGAGGATTCCATGAGTAAGGTTACCTATTCGGGCGCTATATTGGAGGT
GTGCATGAGAAAGCTGGTTTTCTATCCTGAGATTGTTGGTTTTATTGAAGAAGAGAAACA
AAACTTCCCTACCCTAAAAGTTGAGTACGTTTTCAACTCACCACCCAAGTTGATCATGCT
CGATGGAGATGATGAACGTAAGGAAACAATCAGAATCGACAACTGGAAACGCGAGCATCT
ACTCCAGTATATGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACTTCATCAAGTTAGTCTAAATCACTATG
TAGGAGGGACTGAATCACCTATTCCAAAGCAGCATTGTGATCTAATAGTTAAATAACGCA
TTGTGATTGACTTGTCTCTAAGCTATTTGGTCCCTCGGCGTCAGTAGTCT
GTGTGTTC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2CG14JQ 728 0 0
GGAAGGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGCTCGAGCATCGTCGAAGATGGTTGTTTT
ATCAGCGAAAATGATGGTGATGATCTTGATGTTGACATCGACGATCTCAGCAAAAGAGCA
GCTGAGCACTAAGGAGTGCGAGGATCTAGGATTCACCGGTCTTGCTCTCTGCTCCGATTG
CCACTCTCTCTCTGAATACGTCAAGGACCAAGAGTTGGTATCTGACTGCTTGAAATGCTG
CGCTGATGATTTTGAGGATTCCATGAGTAAGGTTACCTATTCGGGCGCTATATTGGAGGT
GTGCATGAGAAAGCTGGTTTTCTATCCTGAGATTGTTGGTTTTATTGAAGAAGAGAAACA
AAACTTCCCTACCCTAAAAGTTGAGTACGTTTTCAACTCACCACCCAAGTTGATCATGCT
CGATGGAGATGATGAACGTAAGGAAACAATCAGAATCGACAACTGGAAACGCGAGCATCT
ACTCCAGTATATGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACTTCATCAAGTTAGTCTAAATCACTATG
TAGGAGGGACTGAATCACCTATTCCAAAGCAGCATTGTGATCTAATAGTTAAATAACGCA
TTGTGATTGACTTGTCTTTAAGCTATTTGGTCCCTCGGCGTCAGTAGTCTGTGTGTTCTG
AATCTTTGCAATCTCGGTGTTAATGTCTTCTATTCTATCCAATGTTCTTATAAAATGGCA
ACTTTTGG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

CO CL3699Contig1 772 3 17 U
GTCCCGCGGGAGGGAAACCAATTATTACTCTGACCAGAAGAAAGTAAAAGAGTTACACAC
AACAAAAGTTACATGTATCCCACAAAAGGGTTTATCCAAACACAACAGAGAGATAGAAAA
GAGTATTTACAAGTGAAGTAGAGAAACAGAGAGAGT**TTTCAACGAACGGCCAAGCGAT
CAGAGCCAAAGGGCGACGACTTCAACGAAGACAGTAGATGAAGTTTCTCAACAAAAAGCG
TCAACACTTTTGCTTCTTCTTCATCAAATGCAAAGGCTATACATATGCTAAGCTCTTGAA
TCGCCTCTCTACTTTGCCTGGCGTAGTAGTGCATCATACCAAGATCTCTTCGAAGTCGCC
AGTTAAGAGGTTCCAATATTAACAGCCTTTCAGCAGCCGCAATAGCCAACCTAAGATCTT
GAGGTCGCAACAATGGAAAATTAGAAACACTGATGCTGTTAAGTTGACTAAGAGGAGAAG
TCAGCATTAGTCCAGGTGATGGCTTCGAAGCACGTCTCCAGTGAACCCTAATCAAGTTGG
CGAGAGCAATCCCTATAATGTCTCTGTTTGTAGCAACATCAAGGTCTAGAAGTGACTTTC
CGGTTAAATCTGATGCCATTGAACCAGGATCATCGACGCACCTTCCATTGATAATAGCAA
ACAAGCTCTGTCCTGAAGTCACTTTGAAGAGTTCTTCAGGATTCTCCGTCTTAGGCCAAA
TCAAAAACTCTTCCCCAACTCGAGCTCCCACAATAGGCAAACCGAGACGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H137JQ U 3
AF RR2FX18JQ U 1
AF RR2BV45JQ U 21
BS 1 61 RR2FX18JQ
BS 62 62 RR2H137JQ
BS 63 156 RR2FX18JQ
BS 157 158 RR2H137JQ
BS 159 357 RR2FX18JQ
BS 358 358 RR2H137JQ
BS 359 376 RR2FX18JQ
BS 377 377 RR2H137JQ
BS 378 379 RR2FX18JQ
BS 380 380 RR2H137JQ
BS 381 535 RR2FX18JQ
BS 536 536 RR2H137JQ
BS 537 588 RR2FX18JQ
BS 589 589 RR2H137JQ
BS 590 649 RR2FX18JQ
BS 650 650 RR2H137JQ
BS 651 772 RR2FX18JQ

RD RR2H137JQ 708 0 0
GTCCCATGGGGGATAT
CAATTATTACTCTGACCAGAAGAAAGTAAAAGAGTTACACACAACAACAGTTACATGTAT
CCCACAAAAGGGTTTATCCAAACACAGCAGAAAGA**GAAAAGAGTATTTACAAGTGAAG
TAGAGAAACAGAGAGAGT**TTTCAACGAACGGCCAAGCGATCAGAGCCGAAGGGCGACG
ACTTCAACGAAGACAGTAGATGAAGTTTCTCAACAAAAAGCGTCAACACTTTTGCTTCTT
CTTCATCAAATGCAAAGGCTATACATATGCTAAGCTCTTGAATCGCCTCTCTACTTTGCC
TGGCGTAGTAGTGCATCATACCAAGATCTCTTCGGAGTCGCCAGTTAAGAGGTTCCAATA
TTAACAGCCTTTCAGCAGCCGCAATAGCCAACCTAAGATCTTGAGGTCGCAACAATGGAA
AATTAGAAACACTGATGTTGTTAAGTTGACTAAGAGGAGAAGTCAGCATTAGTCCAGGTG
ATGGCTTCGAAGCACGTCTCCAGTGAACCCTAATCAAGTTGGCGAGAGCAATCCCTATAA
TGTCTCTGTTCGTAGCAACATCAAGGTCAAGAAGTGACTTTCCGGTTAAATCTGATGCCA
TTGAACCAGGATCATCAACGCACCTTCCATTGATAATAGCAAACAAGCTCTGTCCTGAAG
TCACTTTGAAGAGCTCTTCAGGATTCTCCGTC

QA 17 708 17 708
DS 

RD RR2FX18JQ 772 0 0
GTCCCGCGGGAGGGAAACCAATTATTACTCTGACCAGAAGAAAGTAAAAGAGTTACACAC
AGCAAAAGTTACATGTATCCCACAAAAGGGTTTATCCAAACACAACAGAGAGATAGAAAA
GAGTATTTACAAGTGAAGTAGAGAAACAGAGAGAGTGTTTTCAACGAACGGCCAAGCGAT
CAGAGCCAAAGGGCGACGACTTCAACGAAGACAGTAGATGAAGTTTCTCAACAAAAAGCG
TCAACACTTTTGCTTCTTCTTCATCAAATGCAAAGGCTATACATATGCTAAGCTCTTGAA
TCGCCTCTCTACTTTGCCTGGCGTAGTAGTGCATCATACCAAGATCTCTTCGAAGTCTCC
AGTTAAGAGGTTCCAAAATCAACAGCCTTTCAGCAGCCGCAATAGCCAACCTAAGATCTT
GAGGTCGCAACAATGGAAAATTAGAAACACTGATGCTGTTAAGTTGACTAAGAGGAGAAG
TCAGCATTAGTCCAGGTGATGGCTTCGAAGCACGTCTCCAGTGAACCCTAATCAAATTGG
CGAGAGCAATCCCTATAATGTCTCTGTTTGTAGCAACATCAAGGTCTAAAAGTGACTTTC
CGGTTAAATCTGATGCCATTGAACCAGGATCATCGACGCACCTTCCATTAATAATAGCAA
ACAAGCTCTGTCCTGAAGTCACTTTGAAGAGTTCTTCAGGATTCTCCGTCTTAGGCCAAA
TCAAAAACTCTTCCCCAACTCGAGCTCCCACAATAGGCAAACCGAGACGCTG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2BV45JQ 707 0 0
ATTATTACTCTGACCAGAAGAAAGTAAAAGAGTTACACACAACAAAAGTTACATGTATCC
CACAAAAGGGTTTATCCAAACACAACAGAGAGATAGAAAAGAGTATTTACAAGTGAAGTA
GAGAAACAGAGAGAGA**TCTCAACGAACGGCCAAGCGATCAGAGCCAAAGGGCGACGAC
TTCAACGAAGACAGTAGATGAAGTTTCTCAACAAAAAGCGTCAACACTTTTGCTTCTTCT
TCATCAAATGCAAAGGCTATACATATGCTAAGCTCTTGAATCGCCTCTCTACTTTGCCTG
GCGTAGTAGTGCATCATACCAAGGTCTCTTCGAAGTCGCCAGTTAAGAGGTTCCAATATT
AACAGCCTTTCAGCAGCCGCAATAGCCAACCTAAGATCTTGAGGTCGCAACAATGGAAAA
TTAGAAACACTGATGCTGTTAAGTTGGCTAAGAGGAGAAGTCAGCATTAGTCCAGGTGAT
GGCTTCGAAGCACGTCTCCAGTGAACCCTAATCAAGTTGGCGAGAGCAATCCCTATAATG
TCTCTGTTTGTAGCAACATCAAGGTCTAGAAGTGACTTTCCGGTTAAATCTGATGCCATT
GAACCAGGATCATCGACGCACCTTCCATTGATAATAGCAAACAAGCTCTGTCCTGAAGTC
ACTTTAAAGAGTTCTTCAGGATTCTCCGTCTTAGGCCAAATCAAAAA

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 3

CO CL3700Contig1 718 3 14 U
GGGGTGTCCTTGAGACAAATAGCCCCAATGAAGTTATCATGTAGGACATCATTAGACGCT
AATTTCTCAGACACCATTCATTGCTTTGTCCTTGATTTAGTTTCTATAACCAAAGCCATG
TGCTTGTAATGGGAAACCTCCTAGAAAGAGCTTAATTTCTGAGAATTTATTTAACATATT
GTGTTTATATAACAAGTAACACATAATCCTTTTTGATGCACAAGCTAAAAAAAGATCCAT
AAAAATTTCTTAAAGCTTTTTGCAAGAACAAGAAATCAAGAAAACGTATCAGACGAATGG
TTATTTTGAAAAGTTTCTTGGGCAGTATGCAAATAGTGCGGAGGGAATCATCTTCAACAA
TACCAAGAGGATTCACGGCAGTTTATGTAAGAGAGAATGATGAGAAGAAGAAGAGATACG
TTGTGCCAGTTTCATACTTGAACCAACCTTTGTTTCAAGACTTGTTGAGTAAATCAGAGG
AAGAGTTTGGGATTTGATCATCCTATTGCCGGCTTAACCATCCCATGCCATGAGTCTTTG
TTCTTCACCGTCACATCTCAGATTCGATAAATTTCAACAACGTTCCATTTTTTTTTTGTT
TATATAAACTGTTATTTCAATATGTATACACAATGTAGATATGAGAATTTGCTACTTATT
TTTTTCCTGGAAATAATTGTAAATTGTTTCAAAGAGAGGGATATTCATCATACATGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2DD70TF U 1
AF RR2GZ29TF U 24
AF RR2GZ29JQ C 163
BS 1 321 RR2DD70TF
BS 322 322 RR2GZ29TF
BS 323 327 RR2DD70TF
BS 328 328 RR2GZ29TF
BS 329 492 RR2DD70TF
BS 493 493 RR2GZ29TF
BS 494 531 RR2DD70TF
BS 532 532 RR2GZ29TF
BS 533 557 RR2DD70TF
BS 558 558 RR2GZ29TF
BS 559 692 RR2DD70TF
BS 693 693 RR2GZ29TF
BS 694 706 RR2DD70TF
BS 707 718 RR2GZ29TF

RD RR2DD70TF 706 0 0
GGGGTGTCCTTGAGACAAATAGCCCCAATGAAGTTATCATGTAGGACATCATTAGACGCT
AATTTCTCAGACACCATTCATTGCTTTGTCCTTGATTTAGTTTCTATAACCAAAGCCATG
TGCTTGTAATGGGAAACCTCCTAGAAAGAGCTTAATTTCTGAGAATTTATTTAACATATT
GTGTTTATATAACAAGTAACACATAATCCTTTTTGATGCACAAGCTAAAAAAAGATCCAT
AAAAATTTCTTAAAGCTTTTTGCAAGAACAAGAAATCAAGAAAACGTATCAGACGAATGG
TTATTTTGAAAAGTTTCTTGGTCAGTAAGCAAATAGTGCGGAGGGAATCATCTTCAACAA
TACCAAGAGGATTCACGGCAGTTTATGTAAGAGAGAATGATGAGAAGAAGAAGAGATACG
TTGTGCCAGTTTCATACTTGAACCAACCTTTGTTTCAAGACTTGTTGAGTAAATCAGAGG
AAGAGTTTGGGAATTGATCATCCTATTGCCGGCTTAACCATCCCATGCCATTAGTCTTTG
TTCTTCACCGTCACATCCCAGATTCGATAAATTTCAACAACGTTCCATTTTTTTTTTGTT
TATATAAACTGTTATTTCAATATGTATACACAATGTAGATATGAGAATTTGCTACTTATT
TTTTTCCTGGAAATAATTGTAAATTGTTTCAA*GAGAGGGATATTC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2GZ29TF 695 0 0
CCCAATGAAGTTATCATGTAGGACATCATTAGACGCTAATTTCTCAGACACCATTCATTG
CTTTGTTCTTGATTTAGTTTCTATAACCAAAGCCATTTGCTTGTAATGGGAAACCTCCTA
GAAAGAGCTTAATTTCTGAGAATTTATTTAACATATTGTGTTTATATAACAAGTAACACA
TAATCCTTTTTGATGCACAAGCTAAAAAAAGATCCATAAAAATTTCTTAAAGCTTTTTGC
AAGAACAAGAAATCAAGAAAACGTATCAGACGAATGGTTATTTTGAAAAGTTTCTTGGGC
AGTATGCAAATAGTGCGGAGGGAATCATCTTCAACAATACCAAGAGGATTCACGGCAGTT
TATGTAAGAGAGAATGATGAGAAGAAGAAGAGATACGTTGTGCCAGTTTCATACTTGAAC
CAACCTTTGTTTCAAGACTTGTTGAGTAAATCAGAGGAAGAGTTTGGGATTTGATCATCC
TATTGCCGGCTTAACCATCCCATGCCATGAGTCTTTGTTCTTCACCGTCACATCTCAGAT
TCGATAAATTTCAACAACGTTCCATTTTTTTTTTGTTTATATAAACTGTTATTTCAATAT
GTATACACAATGTAGATATGAGAATTTGCTACTTATTTTTTTCCTGGAAATAATTGTAAA
TTGTTTCAAAGAGAGGGATATTCATCATACATGAA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2GZ29JQ 554 0 0
GAATTTATTTAACATATTGTGTTTATATAACAAGTAACACATAATCCTTTTTGATGCACA
AGCTAAAAAAAGATCCATAAAAATTTCTTAAAGCTTTTTGCAAGAACAAGAAATCAAGAA
AACGTATCAGACGAATGGTTATTTTGAAAAGTTTCTTGGGCAGTATGCAAATAGTGCGGA
GGGAATCATTTTCAACAATACCAAGAGGATTCACGGCAGTTTATGTAAGAGAGAATGATG
AGAAGAAGAAGAGATACGTTGTGCCAGTTTCATACTTGAACCAACCTTTGTTTCAAGACT
TGTTGAGTAAATCAGAGGAAGAGTTTGGGATTTGATCATCCTATTGCCGGCTTAACCATC
CCATGCCATGAGTCTTTGTTTTTCACCGTCACATTTCAGATTCGATAAATTTCAACAACG
TTCCATTTTTTTTTTGTTTATATAAACTGTTATTTCAATATGTATACACAATGTAGATAT
GAGAATTTGCTACTTATTTTTTTCCTGGAAATAATTGTAAATTGTTTCAAAGAGAGGGAT
ATTCATCATACATG

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 3

CO CL3701Contig1 784 3 5 U
GGGACACTTGAATTTTCTTCTTTCTCCTCTTAAGGTTTAAGAATCTGTACTGCCATTTTC
TCGGTAAAATGGGAACCCGCATTCAATCCTTCTTGCTCCTGTTATTGCTTTCATGTTTAA
TCTTTATATCGGCGACCTCATCCGAGCAAAAAGGTGATGGAACCCTTAGAATTGGATTGA
AGAAAAGGAAACTAGACCGGGCCAACAGGCTAGCTTCTCAGCTTTTTTTGAAAAACCGAG
GGTCTTGGTCTTCCAAAGGTTTTTTTCACCTGCTTAATGATGGCAATTCGGATACTGTTC
CACTGAAAAACTATTTGGATGCTCAATACTATGGTGACATTACCATTGGTACACCACCTC
AGAAGTTTACTGCCATTTTTGATACTGGAAGCTCCAATCTCTGGATGCCATCTTCTAAAT
GCTACTTATCGATTGCTTGTTATTTTCATTCGAAGTACTCAGCTAGTGAGTCATCAACAT
ACAAAAAGAACGGAAAACCTGCATCAATCCGCTATGGGACAGGTGCTATATCTGGTTACT
TTAGCAATGATGATGTTAAAGTTGGTGATCTTGTTATCAAGGATCAGGAATTCATAGAGG
CTACCAATGAACCTGGTATTACATTCTTGGTAGCCAAGTTTGATGGAATCCTAGGGTTAG
GATTCAAAGAGATTGCTGTTGGAAATCAACACCGGTTTGGTATAACATGGTAGAAAAGTC
TGGTTAAGAACCGATTTTTTCGTTTGGCTTACCGTACCCGCAGATCGAGAAGTGGTGAGA
TTGT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2D319TF U 3
AF RR2G803TF U 4
AF RR2GJ41TF U 1
BS 1 497 RR2GJ41TF
BS 498 498 RR2D319TF
BS 499 739 RR2GJ41TF
BS 740 740 RR2G803TF
BS 741 784 RR2GJ41TF

RD RR2D319TF 630 0 0
GAC
ACTTGAATTTTCTTCTTTCTCCTCTTAAGGTTTAAGAATCTGTACTGCCATTTTCTCGGT
AAAATGGGAACCCGCATTCAATCCTTCTTGCTCCTGTTATTGCTTTCATGTTTAATCTTT
ATATCGGCGACCACATCCGAGCAAAAAGGTGATGGAACCCTTAGAATTGGATTGAAGAAA
AGGAAACTAGACCGGGCCAACAGGCTAGCTTCTCAGCTTTTTTTGAAAAACCGAGGGTCT
TGGTCTTCCAAAGGTTTTTTTCACCTGCTTAATGATGGCAATTCGGATACTGTTCCCCTG
AAAAACTATTTGGATGCTCAATACTATGGTGACATTACCATTGGTACACCACCTCAGAAG
TTTACTGCCATTTTTGATACTGGAAGCTCCAATCTCTGGATGCCATCTTCTAAATGCTAC
TTATCGATTGCTTGTTATTTTCATTCGAAGTACTCAGCTAGTGAGTCATCAACATACAAA
AAGAACGGAAAACCTGCATCAATCCGCTATGGGACAGGTGCTATATCTGGTTACTTTAGC
AATGATGATGTTAAAATTGGTAATCTTGTTATCAAGGATCAGGAATTCATAGAGGCTACC
AATGAACCTGGTATTACATTCTTGGTA

QA 4 630 4 630
DS 

RD RR2G803TF 761 0 0
GG
ACTTGAATTTTCTTCTTTCTCCTCTTAAGGTTTAAGAATCTGTACTGCCATTTCCTCGGT
AAAATGGGAACCCGCATTCAATCCTTCTTGCTCCTGTTATTGCTTTCATGTTTAATCTTT
ATATCGGCGACCTCATCCGAGCAAAAAGGTGATGGAACCCTTAGAATTGGATTGAAGAAA
AGGAAACTAGACCGGGCCAACAGGCTAGCTTCTCAGCTTTTTTTGAAAAACCGAGGGTCT
TGGTCTTCCAAAGGTTTTTTTCACCTGCTTAATGATGGCAATTCGGATACTGTTCCACTG
AAAAACTATTTGGATGCTCAATACTATGGTGACATTACCATTGGTACACCACCTCAGAAG
TTTACTGCCATTTTTGATACTGGAAGCTCCAATCTCTGGATGCCATCTTCTAAATGCTAC
TTATCGATTGCTTGTTATTTTCATTCGAAGTACTCAGCTAGTGAGTCATCAACATACAAA
AAGAACGGAAAACCTGCATCAATCCGCTATGGGACAGGTGCTATATCTGGTTACTTTAGC
AATGATGATGTTAAAGTTGGTGATCTTGTTATCAAGGATCAGGAATTCATAGAGGCTACC
AATGAACCTGGTATTACATTCTTGGTAGCCAAGTTTGATGGAATCCTAGGGTTAGGATTC
AAAGAGATTGCTGTTGGAAATCAGCACCGGTTTGGTATA*CATGGTAGAAAAGTCTGGTT
AAGAACCGATTTTTTCGTTTGGCTTACCGTACCCGCAGA

QA 3 761 3 761
DS 

RD RR2GJ41TF 784 0 0
GGGACACTTGAATTTTCTTCTTTCTCCTCTTAAGGTTTAAGAATCTGTACTGCCATTTTC
TCGGTAAAATGGGAACCCGCATTCAATCCTTCTTGCTCCTGTTATTGCTTTCATGTTTAA
TCTTTATATCGGCGACCTCATCCGAGCAAAAAGGTGATGGAACCCTTAGAATTGGATTGA
AGAAAAGGAAACTAGACCGGGCCAACAGGCTAGCTTCTCAGCTTTTTTTGAAAAACCGAG
GGTCTTGGTCTTCCAAAGGTTTTTTTCACCTGCTTAATGATGGCAATTCGGATACTGTTC
CACTGAAAAACTATTTGGATGCTCAATACTATGGTGACATTACCATTGGTACACCACCTC
AGAAGTTTACTGCCATTTTTGATACTGGAAGCTCCAATCTCTGGATGCCATCTTCTAAAT
GCTACTTATCGATTGCTTGTTATTTTCATTCGAAGTACTCAGCTAGTGAGTCATCAACAT
ACAAAAAGAACGGAAAATCTGCATCAATCCGCTATGGGACAGGTGCTATATCTGGTTACT
TTAGCAATGATGATGTTAAAGTTGGTGATCTTGTTATCAAGGATCAGGAATTCATAGAGG
CTACCAATGAACCTGGTATTACATTCTTGGTAGCCAAGTTTGATGGAATCCTAGGGTTAG
GATTCAAAGAGATTGCTGTTGGAAATCAACACCGGTTTGGTATAACATGGTAGAAAAGTC
TGGTTAAGAACCGATTTTT*CGTTTGGCTTACCGTACCCGCAGATCGAGAAGTGGTGAGA
TTGT

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL3702Contig1 810 2 20 U
TGCCAAATTGTAATATCAAATCATGTCAACAAGGGAGCTTCTCAAAAGCCCCGGAAGAGA
AAGATGGTGAAAAAAAAAACATAAGCAACACACAACAAATCCAGACTAGCCTTAGAGGCC
ACAACAAAATATAGTAAGCTTAAACGAAGTCTAAGGACAAGGAATGATACAAGGGATATA
CCTCACTGTTCCCTCTTCACATTGTTCTCTGAGGTGGAAGCGTTTGAACCGTGCATAAGC
CAATCCTTGGCGCAAAAAAAAGCTTCCAAGGTCACATGTCCAAGAAAGCTCCTGTAGTTG
TCCATCTTTTTCACGTCAGTGTCAAAAACAGAGTCAGGAGAGACGGTGCAAAACGGTAAG
GACAAGACATCAGCTGCCATCTTGGAGAGGGTAGGATACTTGGTTCGGTTCAGGCTCCAC
CAGCTCAAAACCTCAAAGTCTGGAGACCGCGGTATCAGAGATTCCTCCAGGTATTGGTCG
AGCTCCGATTTCATCTGCTCACGACTCCCTACCTCGGAGATGTAAAGCTCAAAGTCTGAG
AATCCATCTCCAATGGTGATGAGAGGAAACTCCTGAGAAGATGCTTCAAGGTGATGGCCT
TCCTGGAGAAGGACGTCCACGTGGTGACCTTCTTGAGAGATTGTAAACGCAGCTTCTTCC
TGCGGCATTGCATGTAATTGAGATTCACCGTTTTGTGGATTTTTGGGCTCCACTGGTTGT
GCCTCCTGTGCCAAATCCTCAACTGGCTGAGTGTCCTCTATCATTTCCTCTACTGGCTGC
GTCTCATGTTCTGCTTCTTCAACATGCTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E035JQ U 1
AF RR2FQ42JQ U 1
BS 1 75 RR2E035JQ
BS 76 76 RR2FQ42JQ
BS 77 81 RR2E035JQ
BS 82 83 RR2FQ42JQ
BS 84 93 RR2E035JQ
BS 94 94 RR2FQ42JQ
BS 95 105 RR2E035JQ
BS 106 106 RR2FQ42JQ
BS 107 236 RR2E035JQ
BS 237 237 RR2FQ42JQ
BS 238 257 RR2E035JQ
BS 258 258 RR2FQ42JQ
BS 259 285 RR2E035JQ
BS 286 286 RR2FQ42JQ
BS 287 395 RR2E035JQ
BS 396 396 RR2FQ42JQ
BS 397 605 RR2E035JQ
BS 606 606 RR2FQ42JQ
BS 607 733 RR2E035JQ
BS 734 810 RR2FQ42JQ

RD RR2E035JQ 735 0 0
TGCCAAATTGTAATATCAAATCATGTCAACAAGGGAGCTTCTCAAAAGCCCCGGAAGAGA
AAGATGGTGAAAAAAGAAACA**AGCAACACACGACAAATCCAGATTAGCCTTAGAGGCC
ACAACAAAATATAGTAAGCTTAAACGAAGTCTAAGGACAAGGAATGATACAAGGGATATA
CCTCACTGTTCCCTCTTCACATTGTTCTCTGAGGTGGAAGCGTTTGAACCGTGCATGAGC
CAATCCTTGGCGCAAAAGAAAGCTTCCAAGGTCACATGTCCAAGAGAGCTCCTGTAGTTG
TCCATCTTTTTCACGTCAGTGTCAAAAACAGAGTCAGGAGAGACGGTGCAAAACGGTAAG
GACAAGACATCAGCTGCCATCTTGGAGAGGGTAGGGTACTTGGTTCGGTTCAGGCTCCAC
CAGCTCAAAACCTCAAAGTCTGGAGACCGCGGTATCAGAGATTCCTCCAGGTATTGGTCG
AGCTCCGATTTCATCTGCTCACGACTCCCTACCTCGGAGATGTAAAGCTCAAAGTCTGAG
AATCCATCTCCAATGGTGATGAGAGGAAACTCCTGAGAAGATGCTTCAAGGTGATGGCCT
TCCTGTAGAAGGACGTCCACGTGGTGACCTTCTTGAGAGATTGTAAACGCAGCTTCTTCC
TGCGGCATTGCATGTAATTGAGATTCACCGTTTTGTGGATTTTTGGGCTCCACTGGTTGT
GCCTCCTGTGCCA
TA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2FQ42JQ 810 0 0
TGCCAAATTGTAATATCAAATCATGTCAACAAGGGAGCTTCTCAAAAGCCCCGGAAGAGA
AAGATGGTGAAAAAAAAAACATAAGCAACACACAACAAATCCAGACTAGCCTTAGAGGCC
ACAACAAAATATAGTAAGCTTAAACGAAGTCTAAGGACAAGGAATGATACAAGGGATATA
CCTCACTGTTCCCTCTTCACATTGTTCTCTGAGGTGGAAGCGTTTGAACCGTGCATAAGC
CAATCCTTGGCGCAAAAAAAAGCTTCCAAGGTCACATGTCCAAGAAAGCTCCTGTAGTTG
TCCATCTTTTTCACGTCAGTGTCAAAAACAGAGTCAGGAGAGACGGTGCAAAACGGTAAG
GACAAGACATCAGCTGCCATCTTGGAGAGGGTAGGATACTTGGTTCGGTTCAGGCTCCAC
CAGCTCAAAACCTCAAAGTCTGGAGACCTCGGTATCAGAGATTCCTCCAGGTATTGGTCG
AGCTCCGATTTCATCTGCTCCCGACTCCCTACCTCGGAGATGTAAAGCTCAAAGTCTGAG
AATCCATCTCCAATGGTGATGAGGGGAAACTCCTGCGAAGATGCTTCAAGGTGATGGCCT
TCCTGGAGAAGGACGTCGACGTGGTGACCTTCTTGAGAGATTGTAAACGCAGCTTCTTCC
TGCGGCATTGCATGTGATTGAGATTCACCGTTTTGTGGATTTTTGGGCTCCACTGGTTGT
GCCTCCTGTGCCAAATCCTCAACTGGCTGAGTGTCCTCTATCATTTCCTCTACTGGCTGC
GTCTCATGTTCTGCTTCTTCAACATGCTGA

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 3

CO CL3703Contig1 837 3 8 U
ATAATAAACTCTTTAGACTTTATTTTATAACATAACTGTGGTGATAATGATAATTATTAC
AGTGATTTTCAAAACACTAGTGTTTTGTAAATATGATGGTAACTGTCTCGAGCATATGAA
CCAAAACATTGCTCAGGATCACACAAAGGAAGTATAAATATCTATTCCGCTTGAAGTGCA
GAAAGTTTAGAGACATTTGGCTTCAATTTCCTCAAGAGTGAGACCCTTTGTTTCTGGCAC
AATGAAGTATATGAAGAGCAGAGACAAGACACATATCACACCAAACCCCATAAACAGTAT
CCCAGCTCCAAACAACTCCTTTAGAGGCGAAAATGCAAATGTCACTAGAGCGTTTGCACC
GAAATTCACAAGAACTGCTAGACTGAGCCCTCGACCTCTTAATTTAAGGGGAAATATCTC
TGAAATCATCAGCCAACCAATCGGACCAAAGGATAGCTGGTAACAGCCCACATAGAGCAG
TAGTGCAACCACAGCAACAGCTGGAGCGGCGCTGAAAAAGATGTAGTATGACCCCAGCAG
GAATAATGAGACAACCATGCCACCAACACCACCAAGAAGTAAGGGTCTTCTTCCAAGTCT
GTCGATAACTACAACAGCTACTCCTGTCATAATCAACTTCAATAGACCAAGTAGAATTGA
GACCCTTGTTGCATCACCTGCGGCAGAGAATCCAGCAGTCTGCAGTATCGATGGTGCATA
ATAAAGAACACTCGGTTGCCCAGTTATCTGCTGAAACAGGACCAGACCTCCTCCTATGAT
GAGAGCTTTCTTGCACTTCCCTTGAAACAGTTCACCAACGTGGCTTCTTTATCTCTC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX87TF C 1
AF RR2D196JQ U 3
AF RR2EK15JQ U 1
BS 1 4 RR2DX87TF
BS 5 62 RR2EK15JQ
BS 63 63 RR2D196JQ
BS 64 245 RR2EK15JQ
BS 246 246 RR2D196JQ
BS 247 423 RR2EK15JQ
BS 424 424 RR2D196JQ
BS 425 837 RR2EK15JQ

RD RR2DX87TF 361 0 0
ATAATAAACTCTTTAGACTTTATTTTATAACATAACTGTGGTGATAATGATAATTATTAC
AGTGATTTTCAAAACACTAGTGTTTTGTAAATATGATGGTAACTGTCTCGAGCATATGAA
CCAAAACATTGCTCAGGATCACACAAAGGAAGTATAAATATCTATTCCGCTTGAAGTGCA
GAAAGTTTAGAGACATTTGGCTTCAATTTCCTCAAGAGTGAGACCCTTTGTTTCTGGCAC
AATGAAGTATATGAAGAGCAGAGACAAGACACATATCACACCAAACCCCATAAACAGTAT
CCCAGCTCCAAACAACTCCTTTAGAGGCGAAAATGCAAATGTCACTAGAGCGTTTGCACC
C

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR2D196JQ 752 0 0
AG
TAAACTCTTTAGACTTTATTTTATAACATAACTGTGGTGATAATGATAATTATTACAGTG
ATTTTCAAAACACTAGTGTTTTGTAAATATGATGGTAACTGTCTCGAGCATATGAACCAA
AACATTGCTCAGGATCACACAAAGGAAGTATAAATATCTATTCCGCTTGAAGTGCAGAAA
GTTTAGAGACATTTGGCTTCAATTTCCTCAAGAGTGAGACCCTTTGTTTCTGGCACAATG
AAGTATATGAAGAGCAGAGACAAGACACATATCACACCAAACCCCATAAACAGTATCCCA
GCTCCAAACAACTCCTTTAGAGGCGAAAATGCAAATGTCACTAGAGCGTTTGCACCGAAA
TTCACAAGAACTGCTAGACTGAGCCCTCGACCTCTTAATTTAAGGGGAAATATCTCTGAA
ATCATCAGCCAACCAATCGGACCAAAGGATAGCTGGTAACAGCCCACATAGAGCAGTAGT
GCAACCACAGCAACAGCTGGAGCGGCGCTGAAAAAGATGTAGTATGACCCCAGCAGGAAT
AATGAGACAACCATGCCACCAACACCACCAAGAAGTAAGGGTCTTCTTCCAAGTCTGTCG
ATAACTACAACAGCTACTCCTGTCATAATCAACTTCAATAGACCAAGTAGAATTGAGACC
CTTGTTGCATCACCTGCGGCAGAGAATCCAGCAGTCTGCAGTATCGATGGTGCATAATAA
AGAACACTCGGTTGCCCAGTTATCTGCTGA

QA 3 752 3 752
DS 

RD RR2EK15JQ 837 0 0
ATAA
TAAACTCTTTAGACTTTATTTTATAACATAACTGTGGTGATAATGATAATTATTACAGCG
ATTTTCAAAACACTAGTGTTTTGTAAATATGATGGTAACTGTCTCGAGCATATGAACCAA
AACATTGCTCAGGATCACACAAAGGAAGTATAAATATCTATTCCGCTTGAAGTGCAGAAA
GTTTAGAGACATTTGGCTTCAATTTCCTCAAGAGTGAGACCCTTTGTTTCTGGCACAATG
AGGTATATGAAGAGCAGAGACAAGACACATATCACACCAAACCCCATAAACAGTATCCCA
GCTCCAAACAACTCCTTTAGAGGCGAAAATGCAAATGTCACTAGAGCGTTTGCACCGAAA
TTCACAAGAACTGCTAGACTGAGCCCTCGACCTCTTAATTTAAGGGGAAATATCTCTGAG
ATCATCAGCCAACCAATCGGACCAAAGGATAGCTGGTAACAGCCCACATAGAGCAGTAGT
GCAACCACAGCAACAGCTGGAGCGGCGCTGAAAAAGATGTAGTATGACCCCAGCAGGAAT
AATGAGACAACCATGCCACCAACACCACCAAGAAGTAAGGGTCTTCTTCCAAGTCTGTCG
ATAACTACAACAGCTACTCCTGTCATAATCAACTTCAATAGACCAAGTAGAATTGAGACC
CTTGTTGCATCACCTGCGGCAGAGAATCCAGCAGTCTGCAGTATCGATGGTGCATAATAA
AGAACACTCGGTTGCCCAGTTATCTGCTGAAACAGGACCAGACCTCCTCCTATGATGAGA
GCTTTCTTGCACTTCCCTTGAAACAGTTCACCAACGTGGCTTCTTTATCTCTC

QA 5 837 5 837
DS 



AS 1 3

CO CL3704Contig1 920 3 22 U
ATAAATGTATAACAAATACTTTTATTTCTTTCCTTGATCATCAACCAAAGAGAGATACCG
TTTTACAATTATGTGGTTCACTCGGAGTCTTTTCTTCTTTACAAGATTTCCACAACTCAA
CAAACTTGTGACAAATGAAGCATTTACCAAAGCTGCGATCACATGCCACCAAAAGGGTTG
CTGCTGTCATATTGCTGATGACCACTTGCTGAGTTATTAGCTGGATATCCCCCAAAACCA
GTGTTCTTTTGCGGCTCTGAAGCCGTTATTACTGAAAATTCCCCAAAACCGGAGTTCTTC
TGCTCTTCTGAAACTGGCACTACTGGACCGGATGTCTTTTGCGGTTCTGAAACCAAGAAT
GCTGGAAATTCCTCAAAACCGGATGTCATCATTTGCGGTTCTGAAACCGCAGCCACTGGG
GAATCCCCAAAACCAGACGTCTTTTGCGGTTCTGAAACAGCGAATGCTGGAAATTCGCCA
AAACCGGATGTCATCATCTGCGGTTCCGAAACCGTTGCTACTGGAAATTCCGTAAAACCG
GTGGTCATTTGTGGTTCTGAAACAGCGAATACTGGAAATTCCCCAAAACCGGTGGTCATT
TGTGGTTCTGAAACCGCGGTAACTGGAAGTTCCCCTAAACCGGTGGTCACTTGTGGTTGT
GAAACTGCAGCTACCGGAAAGTCTCCAAAACCAGTGGTCATTTGTGGTTCTGAAACAGCG
AATACTGGAAACTCCCCAAAACCGGTAGTCATTTGTGGTTCTGAAACGGCAACTGGAAGT
TCCCCTAAACCGGTGGTCATTTGTGGTTGTGAAACTGCAGCTACCGGAAAGTCTCCAAAT
CCGGTGGTCATTTGTGGTTCTGAAACAACTGGAAATTGCCCAAAACCGGTGGTCTTTGGC
GGTTCTGAAACCGCAACTAC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C722JQ U 1
AF RR2BL35JQ U 2
AF RR2D887TF C 124
BS 1 32 RR2C722JQ
BS 33 33 RR2BL35JQ
BS 34 111 RR2C722JQ
BS 112 112 RR2BL35JQ
BS 113 317 RR2C722JQ
BS 318 318 RR2BL35JQ
BS 319 354 RR2C722JQ
BS 355 356 RR2BL35JQ
BS 357 372 RR2C722JQ
BS 373 373 RR2BL35JQ
BS 374 419 RR2C722JQ
BS 420 420 RR2BL35JQ
BS 421 488 RR2C722JQ
BS 489 489 RR2BL35JQ
BS 490 506 RR2C722JQ
BS 507 507 RR2BL35JQ
BS 508 619 RR2C722JQ
BS 620 620 RR2BL35JQ
BS 621 689 RR2C722JQ
BS 690 690 RR2BL35JQ
BS 691 704 RR2C722JQ
BS 705 920 RR2D887TF

RD RR2C722JQ 704 0 0
ATAAATGTATAACAAATACTTTTATTTCTTTCTTTGATCATCAACCAAAGAGAGATACCG
TTTTACAATTATGTGGTTCACTCGGAGTCTTTTCTTCTTTACAAGATTTCCGCAACTCAA
CAAACTTGTGACAAATGAAGCATTTACCAAAGCTGCGATCACATGCCACCAAAAGGGTTG
CTGCTGTCATATTGCTGATGACCACTTGCTGAGTTATTAGCTGGATATCCCCCAAAACCA
GTGTTCTTTTGCGGCTCTGAAGCCGTTATTACTGAAAATTCCCCAAAACCGGAGTTCTTC
TGCTCTTCTGAAACTGGGACTACTGGACCGGATGTCTTTTGCGGTTCTGAAACCGCGAAT
GCTGGAAATTCCCCAAAACCGGATGTCATCATTTGCGGTTCTGAAACCGCAGCCACTGGA
GAATCCCCAAAACCAGACGTCTTTTGCGGTTCTGAAACAGCGAATGCTGGAAATTCGCCA
AAACCGGAAGTCATCATCTGCGGTTCTGAAACCGTTGCTACTGGAAATTCCGTAAAACCG
GTGGTCATTTGTGGTTCTGAAACAGCGAATACTGGAAATTCCCCAAAACCGGTGGTCATT
TGTGGTTCTGAAACCGCGGCAACTGGAAGTTCCCCTAAACCGGTGGTCACTTGTGGTTGT
GAAACTGCAGCTACCGGAAAGTCTCCAAA*CCAGTGGTCATTTG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2BL35JQ 703 0 0
A
AAATGTATAACAAATACTTTTATTTCTTTCCTTGCTCATCAACCAAAGAGAGATACCGTT
TTACAATTATGTGGTTCACTCGGAGTCTTTTCTTCTTTACAAGATTTCCATAACTCAACA
AACTTGTGACAAATGAAGCATTTACCAAAGCTGCGATCACATGCCACCAAAAGGGTTGCT
GCTGTCATATTGCTGATGACCACTTGCTGAGTTATTAGCTGGATATCCCCCAAAACCAGT
GTTCTTTTGCGGCTCTGAAGCCGTTATTACTGAAAATTCCCCAAAACCGGAGTTCTTCTG
CTCTTCTGAAACTGGCACTACTGGACCGGATGTCTTTTGCGGTTCTGAAACCAAGAATGC
TGGAAATTCCTCAAAACCGGATGTCATCATTTGCGGTTCTGAAACCGCAGCCACTGGGGA
ATCCCCAAAACCAGACGTCTTTTGCGGTTCTGAAACAGCGAATGCTGGAAATTCGCCAAA
ACCGGATGTCATCATCTGCGGTTCCGAAACCGTTGCTACTGGAAATTCCGTAAAACCGGT
GGTCATTTGTGGTTCTGAAACAGCGAATACTGGAAATTCCCCAAAACCGGTGGTCATTTG
TGGTTCTGAAACCGCGGTAACTGGAAGTTCCCCTAAACCGGTGGTCACTTGTGGTTGTGA
AACTGCAGCTACCGGAAAGTCTCCAAAACCAGTGGTCATTTG

QA 2 703 2 703
DS 

RD RR2D887TF 797 0 0
ACTTGTGACAAATGAAGCATT*ACCAAAGCTGCGATCACATGCCACCAAAAGGGT*GCTG
CTGTCATATTGCTGATGACCACTTGCTGAGTTATTAGCTGGATATCCCCCAAAACCAGTG
TTCTTT*GCGGCCCTGAAGCCGTTATTACTGAGAATTCCCCAAAACCGGAGTTCTTCTGC
TCTTCTGAAACTGGCACTACTGGACCGGATGTCTTTTGCGGTTCTGAAACCAAGAATGCT
GGAAATTCCTCAAAACCGGATGTCATCATTTGCGGTTCTGAAACCGCAGCCACTGGGGAA
TCCCCAAAACCAGACGTCTTTTGCGGTTCTGAAACAGCGAATGCTGGAAATTCGCCAAAA
CCGGATGTCATCATCTGCGGTTCCGAAACCGTTGCTACTGGAAATTCCGTAAAACCGGTG
GTCATTTGTGGTTCTGAAACAGCGAATACTGGAAATTCCCCAAAACCGGTGGTCATTTGT
GGTTCTGAAACCGCGGTAACTGGAAGTTCCCCTAAACCGGTGGTCACTTGTGGTTGTGAA
ACTGCAGCTACCGGAAAGTCTCCAAAACCAGTGGTCATTTGTGGTTCTGAAACAGCGAAT
ACTGGAAACTCCCCAAAACCGGTAGTCATTTGTGGTTCTGAAACGGCAACTGGAAGTTCC
CCTAAACCGGTGGTCATTTGTGGTTGTGAAACTGCAGCTACCGGAAAGTCTCCAAATCCG
GTGGTCATTTGTGGTTCTGAAACAACTGGAAATTGCCCAAAACCGGTGGTCTTTGGCGGT
TCTGAAACCGCAACTAC

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 3

CO CL3705Contig1 942 3 6 U
ATAGCTCTTTTCCTGGTGTATTATAAATTTAAATGTTTTGAACATGGAAATGATATGAGT
ACTGGACATACTGAGGGAACAACATTCACTCGCAAATACGAAGATGTATTATTGACTTTG
ACACACAAGTTACAGAGACAAATCACAAAACTAGATTTTACTTTAGCACAAACTTTTTTG
ACATGAACTATTTGAATACAACAACCACAAGACTGGATCAAGCCAGCTGCAACAACTCTT
CACGTTTAATATCAAACACCTTCACCAAAACATCTTCCACGACCTTATCTGGAGTTGATG
CACCTGATGTCACACCGATGGTTATTGGCCCCTTTGGAAGAAAGTTCTCCTTCTCCACCA
GCTCTCCGTAGTGGAGCTTATAGGCTATTTTGTTCCCAGGACCTATCCGTTGCTCACTGT
CGATCCAGTAAGATGGGATTCCACGGACCTCTGAGATCTCCTGAAGGTGAGAAGTGTTGC
TTGAGTTCCACCCACCTACCACTAGCATGAGGTCTATCTTCTCTTCCACTAGCTCATAGA
TTGCATCTTGCCTCTCTTGAGTAGCGCCGCATATGGTGTTGAAGCTGATGAAATGTCCAT
TCACATTTTCCACTCCATACTTTCGCATCATTGTCCTCTCAATTAATTTTCCAATCTCCT
CTGTTTCTCCCTTGAGCATTGTAGTTTGGTTTGCGATACCCACTTTGATAAGGTCATTGT
CAGGGTCAAAACCCTTTGACACAGCATATTTGAATTTCTCCATGAATTCCTCTTTAGTGG
AGCTAGATCCATCGAGTTCACCACCAAGAATGTAATCACAAACGTAATTCGCCTCTTTCA
TGTTCTTTACAATGATGTACTTCCCTACAAAAGATGCAGTTGCAATGGTCTCCTCATGAT
TATATTTACCGTGAATGACCGATGTATATTCCCCCTTCTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H889TF C 120
AF RR2BK67JQ U 1
AF RR2AF56JQ U 40
BS 1 456 RR2BK67JQ
BS 457 457 RR2AF56JQ
BS 458 601 RR2BK67JQ
BS 602 602 RR2AF56JQ
BS 603 708 RR2BK67JQ
BS 709 942 RR2AF56JQ

RD RR2H889TF 435 0 0
GACACACAAGTTACAGAGACGAATCACAAAACTAGATTTTACTTTAGCACAAACTTTTT*
GACATGAACTATTTGAATACAACAACCACAAGACTGGATCAAGCCAGCTGCAACAACTCT
TCACGTTTAATATCAAACACCTTCACCAAAACATCTTCCACGACCTTATCTGGAGTTGAT
GCACCTGATGTCACACCGATGGTTATTGGCCCCTTTGGAAGAAAGTTCTCCTTCTCCACC
AGTTCTCCGTAGTGGAGCTTATAGGCTATTTTGTTCCCAGGACCTATCCGTTGCTCACTG
TCGATCCAGTAAGATGGGATTCCACGGACCTCTGAGATCTCCTGAAGGTGAGAAGTGTTG
CTTGAGTTCCACCCACCTACCACTAGCATGAGGTCTATCTTCTCTTCCACTAGCTCATAG
ATTGCATCTTGCCTC

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR2BK67JQ 708 0 0
ATAGCTCTTTTCCTGGTGTATTATAAATTTAAATGTTTTGAACATGGAAATGATATGAGT
ACTGGACATACTGAGGGAACAACATTCACTCGCAAATACGAAGATGTATTATTGACTTTG
ACACACAAGTTACAGAGACAAATCACAAAACTAGATTTTACTTTAGCACAAACTTTTTTG
ACATGAACTATTTGAATACAACAACCACAAGACTGGATCAAGCCAGCTGCAACAACTCTT
CACGTTTAATATCAAACACCTTCACCAAAACATCTTCCACGACCTTATCTGGAGTTGATG
CACCTGATGTCACACCGATGGTTATTGGCCCCTTTGGAAGAAAGTTCTCCTTCTCCACCA
GCTCTCCGTAGTGGAGCTTATAGGCTATTTTGTTCCCAGGACCTATCCGTTGCTCACTGT
CGATCCAGTAAGATGGGATTCCACGGACCTCTGAGACCTCCTGAAGGTGAGAAGTGTTGC
TTGAGTTCCACCCACCTACCACTAGCATGAGGTCTATCTTCTCTTCCACTAGCTCATAGA
TTGCATCTTGCCTCTCTTGAGTAGCGCCGCATATGGTGTTGAAGCTGATGAAATGTCCAT
TTACATTTTCCACTCCATACTTTCGCATCATTGTCCTCTCAATTAATTTTCCAATCTCCT
CTGTTTCTCCCTTGAGCATTGTAGTTTGGTTTGCGATACCCACTTTGA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2AF56JQ 903 0 0
GAACATGGAAATGATATGAGTACTGGACATACTGGGGGAATAACATTCACTCGCAAATAC
GAAGATGTATTATTGACTTTGACACACAAGTTACAGAGACAAATCACAAAACTAGATTTT
ACTTTAGCACAAACTTTTTTGACATGAACTATTTGAATACAACAACCACAAGACTGGATC
AAGCCAGCTGCAACAACTCTTCACGTTTAATATCAAACACCTTCACCAAAACATCTTCCA
CGACCTTATCTGGAGTTGATGCACCTGATGTCACACCGATGGTTATTGGCCCCTTTGGAA
GAAAGTTCTCCTTCTCCACCAGCTCTCCGTAGTGGAGCTTATAGGCTATTTTGTTCCCAG
GACCTATCCGTTGCTCACTGTCGATCCAGTAAGATGGGATTCCACGGACCTCTGAGATCT
CCTGAAGGTGAGAAGTGTTGCTTGAGTTCCACCCACCTACCACTAGCATGAGGTCTATCT
TCTCTTCCACTAGCTCATAGATTGCATCTTGCCTCTCTTGAGTAGCGTCGCATATGGTGT
TGAAGCTGATGAAATGTCCATTCACATTTTCCACTCCATACTTTCGCATCATTGTCCTCT
CAATTAATTTTCCAATCTCCTCTGTTTCTCCCTTGAGCATTGTAGTTTGGTTTGCGATAC
CCACTTTGATAAGGTCATTGTCAGGGTCAAAACCCTTTGACACAGCATATTTGAATTTCT
CCATGAATTCCTCTTTAGTGGAGCTAGATCCATCGAGTTCACCACCAAGAATGTAATCAC
AAACGTAATTCGCCTCTTTCATGTTCTTTACAATGATGTACTTCCCTACAAAAGATGCAG
TTGCAATGGTCTCCTCATGATTATATTTACCGTGAATGACCGATGTATATTCCCCCTTCT
TGT

QA 1 903 1 903
DS 



AS 1 3

CO CL3706Contig1 693 3 2 U
GGGTTCAACTTCTCCCAACATGGAGTAATTACATTATTTACAAAGACAAGTGAACATATG
AATGGAAAACGACGATGAACAATTCAGTTCTTAAACCAAGGAAATTACATAAACACTGAA
AAATCTTTCAATTTTTTTTTGTTTTGGAATATCAGAAATACGAAAGACGAATATATTAGA
TGCTTTGATGACAAATCAACGAAAATATCTAGAGAGCTCGGCTTTTGATAATGTCGAAAC
TCATCTCGCTAGGATCAGTGGCTTGCAACTCCACCTGAATCCCATCCAATTCTCTCTTGA
ACCTATTCTTAGAGCTTGCGTACACCATCTTCATCCTCACTCTAGATGAATCCGGTGACC
AGGCGATGAAGAAGATTTTGCTCTTCTGGCAATTTTCATTGGTGGTAAAGTCGAAATCGA
AAACGGCATAGCGGCACTCGTCGGCAGGGAGGGAAGCGGTGAAATCATCGTAAGTCTCTT
GGGGGTTTCCTAACTTTTCCACCACCACTTGCTGCCCGTCTATCCTGAATATTATGAAAC
GATAGGTTCTTTTCTTTAGCTCCAAAAACTTCAGCTTGCAGTTGTCCTCCACTGCCATCC
CCGATGCCGCGTTGGCCATTGCTTTTGTTTAGTTTTTATGGTAAAGCTTGAGGAAGAGGA
ACTTGTTTTGTATGAATATTGATTGTCCTCTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW68JQ U 1
AF RR2GW68TF C 1
AF RR2BV59JQ U 146
BS 1 669 RR2GW68JQ
BS 670 693 RR2BV59JQ

RD RR2GW68JQ 671 0 0
GGGTTCAACTTCTCCCAACATGGAGTAATTACATTATTTACAAAGACAAGTGAACATATG
AATGGAAAACGACGATGAACAATTCAGTTCTTAAACCAAGGAAATTACATAAACACTGAA
AAATCTTTCAATTTTTTTTTGTTTTGGAATATCAGAAATACGAAAGACGAATATATTAGA
TGCTTTGATGACAAATCAACGAAAATATCTAGAGAGCTCGGCTTTTGATAATGTCGAAAC
TCATCTCGCTAGGATCAGTGGCTTGCAACTCCACCTGAATCCCATCCAATTCTCTCTTGA
ACCTATTCTTAGAGCTTGCGTACACCATCTTCATCCTCACTCTAGATGAATCCGGTGACC
AGGCGATGAAGAAGATTTTGCTCTTCTGGCAATTTTCATTGGTGGTAAAGTCGAAATCGA
AAACGGCATAGCGGCACTCGTCGGCAGGGAGGGAAGCGGTGAAATCATCGTAAGTCTCTT
GGGGGTTTCCTAACTTTTCCACCACCACTTGCTGCCCGTCTATCCTGAATATTATGAAAC
GATAGGTTCTTTTCTTTAGCTCCAAAAACTTCAGCTTGCAGTTGTCCTCCACTGCCATCC
CCGATGCCGCGTTGGCCATTGCTTTTGTTTAGTTTTTATGGTAAAGCTTGAGGAAGAGGA
ACTTGTTTT
CC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2GW68TF 671 0 0
GGGTTCAACTTCTCCCAACATGGAGTAATTACATTATTTACAAAGACAAGTGAACATATG
AATGGAAAACGACGATGAACAATTCAGTTCTTAAACCAAGGAAATTACATAAACACTGAA
AAATCTTTCAATTTTTTTTTGTTTTGGAATATCAGAAATACGAAAGACGAATATATTAGA
TGCTTTGATGACAAATCAACGAAAATATCTAGAGAGCTCGGCTTTTGATAATGTCGAAAC
TCATCTCGCTAGGATCAGTGGCTTGCAACTCCACCTGAATCCCATCCAATTCTCTCTTGA
ACCTATTCTTAGAGCTTGCGTACACCATCTTCATCCTCACTCTAGATGAATCCGGTGACC
AGGCGATGAAGAAGATTTTGCTCTTCTGGCAATTTTCATTGGTGGTAAAGTCGAAATCGA
AAACGGCATAGCGGCACTCGTCGGCAGGGAGGGAAGCGGTGAAATCATCGTAAGTCTCTT
GGGGGTTTCCTAACTTTTCCACCACCACTTGCTGCCCGTCTATCCTGAATATTATGAAAC
GATAGGTTCTTTTCTTTAGCTCCAAAAACTTCAGCTTGCAGTTGTCCTCCACTGCCATCC
CCGATGCCGCGTTGGCCATTGCTTTTGTTTAGTTTTTATGGTAAAGCTTGAGGAAGAGGA
ACTTGTTTT
CC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2BV59JQ 548 0 0
GGAATATCAGAAATACGAAAGACGAATATATTAAATGCTTTGATGACAAATCAACGAAAA
TATCTAGAGAGCTCGGCTTTTGATAATGTCGAAACTCATCTCGCTAGGATCAGTGGCTTG
CAACTCCACCTGAATCCCATCCAATTCTCTCTTGAACCTATCCTTAAAGCTTGCGTACAC
CATCTTCATCCTCACTCTAGATGAATCCGGTGACCAGGCGATGAAGAAGATTTTGCTCTT
CTGGCAATTTTCATTGGTGGTAAAGTCGAAATCGAAAACGGCATAGCGGCACTCGTCGGC
AGGGAGGGAAGCGGTGAAATCATCGTAAGTCTCTTGGGGGTTTCCTAACTTTTCCACCAC
CACTTGCTGCCCGTCTATCCTGAATATTATGAACCGATAGGTTCTTTTCTTTAGCTCCAA
AAACTTCAGCTTGCAGTTGTCCTCCACTGCCATCCCCGATGCCGCGTTGGCCATTGCTCT
TGTTTAGTTTTTATGGTAAAGCTTGAGGAAGAGGAACTTGTTTTGTATGAATATTGATTG
TCCTCTCC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 3

CO CL3707Contig1 1115 3 12 U
GGACAGTCGAGAGAAAAAAAAAACGAAAATGGAGAAACTAACTTTCCTCTCGCTCCTCTT
GCACTTCGTCGTCTTCATCGCTAGCACATCTCAGTCATCTTCTATTATACTGAACGATCG
CAGCTTCGAGATACCGAGCTTGCCCTCATCGCGCGCCGAGAAGCTGATCCGGGAGCTAAA
CCTCTTTCCGAATCTGGAGGTGAACGTGATCGATGTCTCGACTCTCGCTTCCGACGTGGA
GGAGGTAGCATCGATTGTCGAACGGAGATTCATATTCCCGAATATTCTTTCCGATGTCGG
CGACGGCAGCCCTTCCCTCGAGGATCTAGGTCATCATGCTGGTTACTACAAGCTCCCCAA
ATCTCAAGGCGCAAGGATGTTCTACTTATTCTTCGAGTCACGCAACAAGAAGGATGCTCC
TCTCGTGATTTGGTTGACGGGAGGGCCTGGATGCAGCAGTGAATTGGCTATGTTCTATGA
GAACGGTCCTTTCAAGCTCAATAATAACATGTCTCTTACTTGGAATGAGTATGGATGGGA
CCAGGCTTCCAATCTCCTGTATGTAGACCAGCCTGTTGGAACTGGTTTCAGCTACACCAG
TGACAAAACTGATATCCGTCATGACCAAACCGGAGTTAGCGATGATCTCTATGATTTTCT
GCAGGCTTTCTTGGCGGAGCATCCTAAGTTGGCGAATAAGGACTTTTACATAACCGGAGA
GTCATACGCTGGGCATTACATTCCGGCTAAGGAAGTTCCCTTTTTGGTTGATGGCAAAGA
AGCAGGCAAGTTAAAGAGTTATGAACAACTCAGTTTCCTCAAGGTGCACGATGCGGGACA
CATGGTTCCAATGGACCAGCCAAAAGCTGCGTTGAAAATGTTGGAGGGATGGATGAAGAA
GTCGCTTGGTGGAGAACATCCTGTAGGTACTACAGAAGGCGATGATCTGGTTGCTCAGAT
GTAATAGCAGCAAACAAAGAAAATGTGTAGACTGTGTGTTTTGTAAACACTTTACGTTTC
CTTCTGTAATTTGATCTCTAAAGAAAAGAAAACTATATGTAGGGGTTGTAAAGGTTACGT
GTAAGTCAAAACGCTTATGAACCAAAACATATTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN77TF U 1
AF RR2DF71TF U 1
AF RR2DU92TF U 365
BS 1 144 RR2DF71TF
BS 145 145 RR2EN77TF
BS 146 664 RR2DF71TF
BS 665 665 RR2DU92TF
BS 666 695 RR2DF71TF
BS 696 696 RR2DU92TF
BS 697 698 RR2DF71TF
BS 699 700 RR2DU92TF
BS 701 706 RR2DF71TF
BS 707 707 RR2DU92TF
BS 708 736 RR2DF71TF
BS 737 1115 RR2DU92TF

RD RR2EN77TF 662 0 0
GGACAGTCGAGAGAAAAAAAAA*CGAAAATGGAGAAACTAACTTTCCTCTCGCTCCTCTT
GCACTTCGTCGTCTTCATCGCTAGCACATCTCAGTCATCTTCTATTATACTGAACGATCG
CAGCTTCGAGATACCGAGCTTGCCCTCATCGCGCGCCGAGAAGCTGATCCGGGAGCTAAA
CCTCTTTCCGAATCTGGAGGTGAACGTGATCGATGTCTCGACTCTCGCTTCCGACGTGGA
GGAGGTAGCATCGATTGTCGAACGGAGATTCATATTCCCGAATATTCTTTCCGATGTCGG
CGGCGGCAGCCCTTCCCTCGAGGATCTAGGTCATCATGCTGGTTACTACAAGCTCCCCAA
ATCTCAAGGCGCAAGGATGTTCTACTTATTCTTCGAGTCACGCAACAAGAAGGATGCTCC
TCTCGTGATTTGGTTGACGGGAGGGCCTGGATGCAGCAGTGAATTGGCTATGTTCTATGA
GAACGGTCCTTTCAAGCTCAATAATAACATGTCTCTTACTTGGAATGAGTATGGATGGGA
CCAGGCTTCCAATCTCCTGTATGTAGACCAGCCTGTTGGAACTGGTTTCAGCTACACCAG
TGACAAAACTGATATCCGTCATGACCAAACCGGAGTTAGCGATGATCTCTATGATTTTCT
GC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2DF71TF 746 0 0
GGACAGTCGAGAGAAAAAAAAAACGAAAATGGAGAAACTAACTTTCCTCTCGCTCCTCTT
GCACTTCGTCGTCTTCATCGCTAGCACATCTCAGTCATCTTCTATTATACTGAACGATCG
CAGCTTCGAGATACCGAGCTTGCCTTCATCGCGCGCCGAGAAGCTGATCCGGGAGCTAAA
CCTCTTTCCGAATCTGGAGGTGAACGTGATCGATGTCTCGACTCTCGCTTCCGACGTGGA
GGAGGTAGCATCGATTGTCGAACGGAGATTCATATTCCCGAATATTCTTTCCGATGTCGG
CGACGGCAGCCCTTCCCTCGAGGATCTAGGTCATCATGCTGGTTACTACAAGCTCCCCAA
ATCTCAAGGCGCAAGGATGTTCTACTTATTCTTCGAGTCACGCAACAAGAAGGATGCTCC
TCTCGTGATTTGGTTGACGGGAGGGCCTGGATGCAGCAGTGAATTGGCTATGTTCTATGA
GAACGGTCCTTTCAAGCTCAATAATAACATGTCTCTTACTTGGAATGAGTATGGATGGGA
CCAGGCTTCCAATCTCCTGTATGTAGACCAGCCTGTTGGAACTGGTTTCAGCTACACCAG
TGACAAAACTGATATCCGTCATGACCAAACCGGAGTTAGCGATGATCTCTATGATTTTCT
GCAG*CTTTCTTGGCGGAGCATCCTAAGTTGGCGA*TA**GACTTT*ACATAACCGGAGA
GTCATACGCTGGGCAT
ACATCCGCTT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2DU92TF 751 0 0
G
AAGGCGCAAGGATGTTCTACTTATTCCTCGAGTCACGCAACAAGAAGGATGCTCCTCTCG
TGATTTGGTTGACGGGAGGGCCTGGATGCAGCAGTGAATTGGCTATGTTCTATGAGAACG
GTCCTTTCAAGCTCAATAATAACATGTCTCTTACTTGGAATGAGTATGGATGGGACCAGG
CTTCCAATCTCCTGTATGTAGACCAGCCTGTTGGAACTGGTTTCAGCTACACCAGTGACA
AAACTGATATCCGTCATGACCAAACCGGAGTTAGCGATGATCTCTATGATTTTCTGCAGG
CTTTCTTGGCGGAGCATCCTAAGTTGGCGAATAAGGACTTTTACATAACCGGAGAGTCAT
ACGCTGGGCATTACATTCCGGCTAAGGAAGTTCCCTTTTTGGTTGATGGCAAAGAAGCAG
GCAAGTTAAAGAGTTATGAACAACTCAGTTTCCTCAAGGTGCACGATGCGGGACACATGG
TTCCAATGGACCAGCCAAAAGCTGCGTTGAAAATGTTGGAGGGATGGATGAAGAAGTCGC
TTGGTGGAGAACATCCTGTAGGTACTACAGAAGGCGATGATCTGGTTGCTCAGATGTAAT
AGCAGCAAACAAAGAAAATGTGTAGACTGTGTGTTTTGTAAACACTTTACGTTTCCTTCT
GTAATTTGATCTCTAAAGAAAAGAAAACTATATGTAGGGGTTGTAAAGGTTACGTGTAAG
TCAAAACGCTTATGAACCAAAACATATTCT

QA 2 751 2 751
DS 



AS 1 2

CO CL3708Contig1 951 2 2 U
GGACCGTCGAGTTTACTTACTCTCTCTTTCTCTCTCTCCTCGGTCTCAGATTGCTTCTCC
GTTCGGTAAAACTCCAATCTTTTCCCTCAGAAAACCCTAATCTTCCCGATGTCGATCTTC
GAGTACAATGGAAGTGCCGTTGTGGCTATGGTTGGGAAGAACTGCTTCGCCATCGCCAGT
GATCGTAGGCTCGGTGTGCAGCTCCAGACCATCGCTACCGATTTCCAGAGAATCTCCAAG
ATCCACGACCGTGTCTTCATCGGCCTCTCTGGTCTCGCCACCGATGTCCAAACACTGTAC
CAGCGCTTGGTGTTTCGTCATAAGCTGTATCAGCTTCGTGAAGAGAGAGACATGAAGCCT
GAGACTTTCGCCAGTCTCGTCTCCGCCGTTCTCTACGAGAAAAGATTTGGTCCATACTTA
TGCCAACCAGTGATTGCCGGATTGGGAGAAGATGACAAGCCTTTCATCTGCACCATGGAC
TCCATTGGAGCCAAGGAGTTGGCTAAAGATTTTGTTGTCTCTGGAACTGCTTCAGAATCA
CTTTATGGTGCCTGCGAAGCTATGTACAAGCCAGATATGGAAGCTGAGGAATTGTTCGAG
ACTATTTCACAGGCACTTCTATCGTCAGTTGACCGTGATTGTCTGAGTGGTTGGGGAGGA
CATGTTTACGTTGTATCACCAACGGAGATTAAAGAGAGGATCCTAAAGGGAAGGATGGAC
TGATCCGATTCGCCATCATCATCGATCATCTGCTTTCATCCAAGATAATGCTTTCATCCA
AGATGTTTTTCGCTGTAATCCGGTTTAATCATAGAACCATTCATTCTCTGAAGTTTGACT
TGTGGATGAAGTTTGAATTTCCCTCTCTTTGGATATTTTATTTTAATTCCTACTAGAGTT
AACGCTTGCACTGTCTGTACCACAATGGTTCCATCTTCATTTTAATTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G372TF U 1
AF RR2G372JQ C 385
BS 1 608 RR2G372TF
BS 609 951 RR2G372JQ

RD RR2G372TF 608 0 0
GGACCGTCGAGTTTACTTACTCTCTCTTTCTCTCTCTCCTCGGTCTCAGATTGCTTCTCC
GTTCGGTAAAACTCCAATCTTTTCCCTCAGAAAACCCTAATCTTCCCGATGTCGATCTTC
GAGTACAATGGAAGTGCCGTTGTGGCTATGGTTGGGAAGAACTGCTTCGCCATCGCCAGT
GATCGTAGGCTCGGTGTGCAGCTCCAGACCATCGCTACCGATTTCCAGAGAATCTCCAAG
ATCCACGACCGTGTCTTCATCGGCCTCTCTGGTCTCGCCACCGATGTCCAAACACTGTAC
CAGCGCTTGGTGTTTCGTCATAAGCTGTATCAGCTTCGTGAAGAGAGAGACATGAAGCCT
GAGACTTTCGCCAGTCTCGTCTCCGCCGTTCTCTACGAGAAAAGATTTGGTCCATACTTA
TGCCAACCAGTGATTGCCGGATTGGGAGAAGATGACAAGCCTTTCATCTGCACCATGGAC
TCCATTGGAGCCAAGGAGTTGGCTAAAGATTTTGTTGTCTCTGGAACTGCTTCAGAATCA
CTTTATGGTGCCTGCGAAGCTATGTACAAGCCAGATATGGAAGCTGAGGAATTGTTCGAG
ACTATTTC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2G372JQ 567 0 0
GCCGTTCTCTACGAGAAAAGATTTGGTCCATACTTATGCCAACCAGTGATTGCCGGATTG
GGAGAAGATGACAAGCCTTTCATCTGCACCATGGACTCCATTGGAGCCAAGGAGTTGGCT
AAAGATTTTGTTGTCTCTGGAACTGCTTCAGAATCACTTTATGGTGCCTGCGAAGCTATG
TACAAGCCAGATATGGAAGCTGAGGAATTGTTCGAGACTATTTCACAGGCACTTCTATCG
TCAGTTGACCGTGATTGTCTGAGTGGTTGGGGAGGACATGTTTACGTTGTATCACCAACG
GAGATTAAAGAGAGGATCCTAAAGGGAAGGATGGACTGATCCGATTCGCCATCATCATCG
ATCATCTGCTTTCATCCAAGATAATGCTTTCATCCAAGATGTTTTTCGCTGTAATCCGGT
TTAATCATAGAACCATTCATTCTCTGAAGTTTGACTTGTGGATGAAGTTTGAATTTCCCT
CTCTTTGGATATTTTATTTTAATTCCTACTAGAGTTAACGCTTGCACTGTCTGTACCACA
ATGGTTCCATCTTCATTTTAATTTTAC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL3709Contig1 698 2 5 U
ACTTGCATTACAAGGGTAGGCCAAAGTGTTTTCCATTGGATAGTGAGGAACAAAATGTGA
AGTTCAAGAAGAGAGTTTTGAAGAGTGACTTCGAAGATAATACAAACCAAACCATACATC
TTTTCTCATGTCTGTTTCATGTGTCTGGGTCCTAAAGTTAGAGATGCAGATCTTCAATGT
CTCTAAGTGGTTCCGGAGTTCTCTTGCTGTCAGGTTGGTTCACAACTAGCTGACCACAAG
CACCACTAATATCCTGACCCACTTCTTTGCGAACCGTGGTTCGTATATTGTAGGTTTCCC
TCAGGATCTTTTGGAAGCTTGAGACGCTTTGTTTAGTACTGGTTTTGAACTGGCTCGTGG
ACCCAATTGGGTTGAATGGTATCAAATTTATCACCACTTGAAATGTCTTTAGCAACTCGC
CAAGTTGATGAGCGTTCTCCTCTTGATCATTTACTCCATCAAGCATGATGTACTCAATGA
AGATCTTCTGCTGACTGTTTTTCTGGAAAGCTTGAAGTGCATCCATAAGCTTTTGAAGAG
GAAAGGCTCTAGCTGCTGGCATGATCTGGCAGCGGATTTCTTGAACTGGTGCATGAAGAG
ATACCGCTAAACTTATACCTGGTAGATCATTGTGAAGCTTGTTTATCGCATGAACAACTC
CAACAGTTGAAATGGTAATTCTCTTGGGAGAGAGCTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ82JQ U 1
AF RR2H331JQ U 1
BS 1 206 RR2BZ82JQ
BS 207 207 RR2H331JQ
BS 208 261 RR2BZ82JQ
BS 262 262 RR2H331JQ
BS 263 698 RR2BZ82JQ

RD RR2BZ82JQ 698 0 0
ACTTGCATTACAAGGGTAGGCCAAAGTGTTTTCCATTGGATAGTGAGGAACAAAATGTGA
AGTTCAAGAAGAGAGTTTTGAAGAGTGACTTCGAAGATAATACAAACCAAACCATACATC
TTTTCTCATGTCTGTTTCATGTGTCTGGGTCCTAAAGTTAGAGATGCAGATCTTCAATGT
CTCTAAGTGGTTCCGGAGTTCTCTTGTTGTCAGGTTGGTTCACAACTAGCTGACCACAAG
CACCACTAATATCCTGACCCATTTCTTTGCGAACCGTGGTTCGTATATTGTAGGTTTCCC
TCAGGATCTTTTGGAAGCTTGAGACGCTTTGTTTAGTACTGGTTTTGAACTGGCTCGTGG
ACCCAATTGGGTTGAATGGTATCAAATTTATCACCACTTGAAATGTCTTTAGCAACTCGC
CAAGTTGATGAGCGTTCTCCTCTTGATCATTTACTCCATCAAGCATGATGTACTCAATGA
AGATCTTCTGCTGACTGTTTTTCTGGAAAGCTTGAAGTGCATCCATAAGCTTTTGAAGAG
GAAAGGCTCTAGCTGCTGGCATGATCTGGCAGCGGATTTCTTGAACTGGTGCATGAAGAG
ATACCGCTAAACTTATACCTGGTAGATCATTGTGAAGCTTGTTTATCGCATGAACAACTC
CAACAGTTGAAATGGTAATTCTCTTGGGAGAGAGCTGA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2H331JQ 667 0 0
ACTTGCATTACAAGGGTAGGCCAAAGTGTTTTCCATTGGATAGTGAGGAACAAAATGTGA
AGTTCAAGAAGAGAGTTTTGAAGAGTGACTTCGAAGATAATACAAACCAAACCATACATC
TTTTCTCATGTCTGTTTCATGTGTCTGGGTCCTAAAGTTAGAGATGCAGATCTTCAATGT
CTCTAAGTGGTTCCGGAGTTCTCTTGCTGTCAGGTTGGTTCACAACTAGCTGACCACAAG
CACCACTAATATCCTGACCCACTTCTTTGCGAACCGTGGTTCGTATATTGTAGGTTTCCC
TCAGGATCTTTTGGAAGCTTGAGACGCTTTGTTTAGTACTGGTTTTGAACTGGCTCGTGG
ACCCAATTGGGTTGAATGGTATCAAATTTATCACCACTTGAAATGTCTTTAGCAACTCGC
CAAGTTGATGAGCGTTCTCCTCTTGATCATTTACTCCATCAAGCATGATGTACTCAATGA
AGATCTTCTGCTGACTGTTTTTCTGGAAAGCTTGAAGTGCATCCATAAGCTTTTGAAGAG
GAAAGGCTCTAGCTGCTGGCATGATCTGGCTGCGGATTTCTTGAACTGGTGCATGAAGAG
ATACCGCTAAACTTATACCTGGTAGATCATTGTGAAGCTTGTTTATCGCATGAACAACTC
CAACAGT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 3

CO CL3710Contig1 1090 3 5 U
GACAAAAAAAAAAAATATATTTCCTTCGACTCATCTATTCAAGTAACGTGGGACATCTCT
CTCTTCTACCTGTCCCTTCTCTCTTGCAGAAAACCCTAGCCGCCGCGAGTTTCGGCCAAC
GTCCGATGGCTTTCGAGCATCGGCGTTGTGCTTTTTAGTTGCTTTGCTTTGTCTAATAAG
TCTCATCGTTCGTCCTTGGTGTGGTCCGTGAAGCATCGGCGGGTCGTGTGCGAGTTACTT
GTGGTTCGTCTCGATCCATTAGCGGTGGTCCAGATCCGGAGGAGGGATACCACGGAGGAG
TTATTTTGCTCCTCCTACTCTTATTTCTAGTCTTGGTTGTGGAGATAAGTGAATAGTTCA
GTGGAAGCGCTTGAGGCGCGTGGGGCTTATCTTCTCTCTGCTAACCAGGCTCGGTGTGTT
TCATTGTTGACTGAGTAGTGGCTTTTGTGGTCTTCCTTCCCGGTGGAGGGGGTCTCTGTT
TTCTGGCTACACGTTCTGCTCTTGGGACGAGTGGAGATGGAGCGTCATGTGGCTCTGAGT
GGTTATTCTCCTATGAAGCAGTTTCACTGTTCCTTGCTTGTCGTTCTATTTGCTCCGGGT
TCGATCTCCTCCTTATCGCGTTCGTGCGTATCGGATTGGTCCGGTGTAGATATTGGCTCT
CCCTGACTTTTT*ATGAGACTTGATCGTGGTCTCTATCTTACTTTGCTTTCCGGTTTGGT
GAGCGGTGGTAGATTTCTTGCAGTTCCTCGCCATTTCCGGTTTGATTGAGTTTTCGGACT
GAAGGTCGTTTACTCTCGCCGGTTTCAAAAGCATAAGGTTCTCTGTGTTATATGTTTGGG
CTTATTTTAAGGGGAGGTCTCAATTTGTTCGTTTCTGGACTTGTATGGAGTAGTGTTGAT
GTGTTTCTTGTTGTGATCACTTATTCTATGGTGTTGCTCTGTTTCTTTTTGAGTTAGTTT
GATGTTCTATCCTATGTCCCTTTGTGTAATGGGGCTTAGTCTCCGGGGAAGTTTGTTTCC
TCCGGTTCAGGTTCCGGTATCTCTTTCGGCTTTGTATCCATCTATGTTTCAATGAAAGTG
TTTTAAAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D935TF U 1
AF RR2BR15TF U 43
AF RR2D935JQ C 475
BS 1 710 RR2D935TF
BS 711 711 RR2BR15TF
BS 712 713 RR2D935JQ
BS 714 730 RR2BR15TF
BS 731 1090 RR2D935JQ

RD RR2D935TF 717 0 0
GACAAAAAAAAAAAATATATTTCCTTCGACTCATCTATTCAAGTAACGTGGGACATCTCT
CTCTTCTACCTGTCCCTTCTCTCTTGCAGAAAACCCTAGCCGCCGCGAGTTTCGGCCAAC
GTCCGATGGCTTTCGAGCATCGGCGTTGTGCTTTTTAGTTGCTTTGCTTTGTCTAATAAG
TCTCATCGTTCGTCCTTGGTGTGGTCCGTGAAGCATCGGCGGGTCGTGTGCGAGTTACTT
GTGGTTCGTCTCGATCCATTAGCGGTGGTCCAGATCCGGAGGAGGGATACCACGGAGGAG
TTATTTTGCTCCTCCTACTCTTATTTCTAGTCTTGGTTGTGGAGATAAGTGAATAGTTCA
GTGGAAGCGCTTGAGGCGCGTGGGGCTTATCTTCTCTCTGCTAACCAGGCTCGGTGTGTT
TCATTGTTGACTGAGTAGTGGCTTTTGTGGTCTTCCTTCCCGGTGGAGGGGGTCTCTGTT
TTCTGGCTACACGTTCTGCTCTTGGGACGAGTGGAGATGGAGCGTCATGTGGCTCTGAGT
GGTTATTCTCCTATGAAGCAGTTTCACTGTTCCTTGCTTGTCGTTCTATTTGCTCCGGGT
TCGATCTCCTCCTTATCGCGTTCGTGCGTATCGGATTGGTCCGGTGTAGATATTGGCTCT
CCCTGACTTTTT*ATGAGACTTGATCGTGGTCTCTATCTTACTTTGCTTT
TCGTTTG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2BR15TF 688 0 0
GG
AACGTGGGACATCTCTCTCTTCTACCTGTCCCTTCTCTCTTGCAGAAAACCCTAGCCGCC
GCGAGTTTCGGCCAACGTCCGATGGCTTTCGAGCATCGGCGTTGTGCTTTTTAGTTGTTT
TGCTTTGTCTAATAAGTCTCATCGTTCGTCCTTGGTGTGGTCCGTGAAGCATCGGCGGGT
CGTGTGCGAGTTACTTGTGGTTCGTCTCGATCCATTAGCGGTGGTCCAGATCCGGAGGAG
GGATACCACGGAGGAGTTATTTTGCTCCTCCTACTCTTATTTCTAGTCTTGGTTGTGGAG
ATAAGTGAATAGTTCAGTGGAAGCGCTTGAGGCGCGTGGGGCTTATCTTCTCTCTGCTAA
CCAGGCTCGGTGTGTTTCATTGTTGACTGAGTAGTTGCTTTTGTGGTCTTCCTTCCCGGT
GGAGGGGGTCTCTGTTTTCTGGCTACACGTTCTGCTCTTGGGACGAGTGGAGATGGAGCG
TCATGTGGCTCTGAGTGGTTATTCTCCTATGAAGCAGTTTCACTGTTCCTTGCTTGTCGT
TCTATTTGCTCCGGGTTCGATCTCCTCCTTATCGCGTTCGTGCGTATCGGGTTGGTCCGG
TGTAGATATTGGCTCTCCCTGACTTTTT*ATGAGACTTGATCGTGGTCTCTATCTTACTT
TGCTTTC**GTTTGGTGAGCGGTGGT

QA 3 688 3 688
DS 

RD RR2D935JQ 616 0 0
TCTGTTTTCTGGCTACACGTTCTGCTCTTGGGACGAGTGGAGATGGAGCGTCATGTGGCT
CTGAGTGGTTATTCTCCTATGAAGCAGTTTCACTGTTCCTTGCTTGTCGTTCTATTTGCT
CCGGGTTCGATCTCCTCCTTATCGCGTTCGTGCGTATCGGATTGGTCCGGTGTAGATATT
GGCTCTCCCTGACTTTTTTATGAGACTTGATCGTGGTCTCTATCTTACTTTGCTTTTCGG
TTTGGTGAGCGGTGGTAGATTTCTTGCAGTTCCTCGCCATTTCCGGTTTGATTGAGTTTT
CGGACTGAAGGTCGTTTACTCTCGCCGGTTTCAAAAGCATAAGGTTCTCTGTGTTATATG
TTTGGGCTTATTTTAAGGGGAGGTCTCAATTTGTTCGTTTCTGGACTTGTATGGAGTAGT
GTTGATGTGTTTCTTGTTGTGATCACTTATTCTATGGTGTTGCTCTGTTTCTTTTTGAGT
TAGTTTGATGTTCTATCCTATGTCCCTTTGTGTAATGGGGCTTAGTCTCCGGGGAAGTTT
GTTTCCTCCGGTTCAGGTTCCGGTATCTCTTTCGGCTTTGTATCCATCTATGTTTCAATG
AAAGTGTTTTAAAGCG

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 3

CO CL3711Contig1 1342 3 5 U
GGGATTCAAACCAGAACCTAACTAATCCTTTAAAACCGTCTTCATCCGTTACTTCCCCCT
CCCCCCACTCAACCACACTTCTAAATGGCTTCTTGTCTGAATCTCTTCGTCTTCTCCTTC
CTTTCCGTTCTACTCATTTCAAATTCACAGATATCTGATTCATTTAACGGCGTCGTTTTC
CCTGTTACTCGCGACGTACATACCGGTCAATACATCGCACAGATTCTTCTCGGCGACTCC
TCGGAGCCCATCAAGCTCGTCGTGGATCTCTCTGGTCCGCTTCTATGGTTCGATCGTTCC
TCTGGTTCTCGGAATCTTATCTCCGCCAGCTCTAGCGGCTGCCTTAAGGCGAAGGTCGGA
AATGACTTGGTATCGCGTGGAGGATACCACAACGCCGCGGATTGCCAATTGCTCGTGAGA
AACGGCGCCGTTGGCATCACCGCGAGAGGAGAGCTTGCAAGAGACGTCTTGTCGTTCGGA
TCTGCTTCCGTTGGTATCCTCTTCGCTTGTGCTCCTCCGTCGCTTCTACTTGGGCTCGCT
AGTGGAGCCCGAGGAGTCATGGGCCTAGGAAGGGCCCAGATCTCTCTTCCCTCCCAACTC
GCAGCTGAAACCGACGAACGTCGTCGTTTAACGCTTTACCTGTCGCCGTCGAACGGCATC
GTATCGACGAGTTCGGTTGAATATGTTTTCGGAGTTGCCGCGTCGAGATCGCTGGTCTAC
ACGCCTCTGTCAACCGGCGGCTCGAGTGGCAACAATTACGTGATTAACGTGAAATCGATA
AGAGTCAACGGGAAGAAGGTCTCCGTGGAGGGTCCATTGTCGGCGGAACTAAGCACGTTG
GTCCCTTACACGATGCTGGAGAGCTCCATCTACTCCGTCTTTGCAGAAGCTTACACTAAA
GCTGCTGTTAACGCTAAGTTGGTAGCTACCGTAGCACCGTTCAGTCTCTGCTTCACGTCT
TCGAGTGAGGTGGATTTTCCGGAGGTGGATCTTGCGTTGCAGAGCGAGATGGTGAGGTGG
ATAATTCAGGGGAGGAATCTAATGGTGGATGTTGGTGGTGGAGTCCGATGCTTGGGGATC
GTCGACGGCGGGTTGAACCCGGTCAGCCCGATTATAATGGGTGGGCTTCAGTTAGAAGGC
TTTGTGTTGGACTTCGATTTGGGTAACTCGATGCTGGGGTTCGAACAAAGAACACTCTCT
TCAACTTCAGATTCCTTGCAACCAGAAGCTTTGTAGTGAAACCATCTATAGTTTTAACTC
GTAGATATACTCAGTTTTGCTCTCTTTGTTTGTGTGTTTGTTAAGATACCTTTTTATCTG
TAAGCCACTACGCATTTACACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D530TF U 1
AF RR2BC79TF U 6
AF RR2BC79JQ C 562
BS 1 294 RR2D530TF
BS 295 295 RR2BC79TF
BS 296 671 RR2D530TF
BS 672 793 RR2BC79TF
BS 794 1342 RR2BC79JQ

RD RR2D530TF 671 0 0
GGGATTCAAACCAGAACCTAACTAATCCTTTAAAACCGTCTTCATCCGTTACTTCCCCCT
CCCCCCACTCAACCACACTTCTAAATGGCTTCTTGTCTGAATCTCTTCGTCTTCTCCTTC
CTTTCCGTTCTACTCATTTCAAATTCACAGATATCTGATTCATTTAACGGCGTCGTTTTC
CCTGTTACTCGCGACGTACATACCGGTCAATACATCGCACAGATTCTTCTCGGCGACTCC
TCGGAGCCCATCAAGCTCGTCGTGGATCTCTCTGGTCCGCTTCTATGGTTCGATTGTTCC
TCTGGTTCTCGGAATCTTATCTCCGCCAGCTCTAGCGGCTGCCTTAAGGCGAAGGTCGGA
AATGACTTGGTATCGCGTGGAGGATACCACAACGCCGCGGATTGCCAATTGCTCGTGAGA
AACGGCGCCGTTGGCATCACCGCGAGAGGAGAGCTTGCAAGAGACGTCTTGTCGTTCGGA
TCTGCTTCCGTTGGTATCCTCTTCGCTTGTGCTCCTCCGTCGCTTCTACTTGGGCTCGCT
AGTGGAGCCCGAGGAGTCATGGGCCTAGGAAGGGCCCAGATCTCTCTTCCCTCCCAACTC
GCAGCTGAAACCGACGAACGTCGTCGTTTAACGCTTTACCTGTCGCCGTCGAACGGCATC
GTATCGACGAG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2BC79TF 788 0 0
GG
AAACCAGAACCTAACTAATCCTTTAAAACCGTCTTCATCCGTTACTTCCCC*TCCCCCCA
CTCAACCACACTTCTAAATGGCTTCTTGTCTGAATCTCTTCGTCTTCTCCTTCCTTTCCG
TTCTACTCATTTCAAATTCACAGATATCTGATTCATTTAACGGCGTCGTTTTCCCTGTTA
CTCGCGACGTACATACCGGTCAATACATCGCACAGATTCTTCTCGGCGACTCCTCGGAGC
CCATCAAGCTCGTCGTGGATCTCTCTGGTCCGCTTCTATGGTTCGATCGTTCCTCTGGTT
CTCGGAATCTTATCTCCGCCAGCTCTAGCGGCTGCCTTAAGGCGAAGGTCGGAAATGACT
TGGTATCGCGTGGAGGATACCACAACGCCGCGGATTGCCAATTGCTCGTGAGAAACGGCG
CCGTTGGCATCACCGCGAGAGGAGAGCTTGCAAGAGACGTCTTGTCGTTCGGATCTGCTT
CCGTTGGTATCCTCTTCGCTTGTGCTCCTCCGTCGCTTCTACTTGGGCTCGCTAGTGGAG
CCCGAGGAGTCATGGGCCTAGGAAGGGCCCAGATCTCTCTTCCCTCCCAACTCGCAGCTG
AAACCGACGAACGTCGTCGTTTAACGCTTTACCTGTCGCCGTCGAACGGCATCGTATCGA
CGAGTTCGGTTGAATATGTTTTCGGAGTTGCCGCGTCGAGATCGCTGGTCTACACGCCTC
TGTCAACCGGCGGCTCGAGTGGCAACAATTACGTGATTAACGTGAAATCGATAAGAGTCA
ACGGGA

QA 3 788 3 788
DS 

RD RR2BC79JQ 781 0 0
GGCCTAGGAAGGGCCCAGATCTCTCTTCCCTCCCAACTCGCAGCTGAAACCGACGAACGT
CGTCGTTTAACGCTTTACCTGTCGCCGTCGAACGGCATCGTATCGACGAGTTCGGTTGAA
TATGTTTTCGGAGTTGCCGCGTCGAGATCGCTGGTCTACACGCCTCTGTCAACCGGCGGC
TCGAGTGGCAACAATTACGTGATTAACGTGAAATCGATAAGAGTCAACGGGAAGAAGGTC
TCCGTGGAGGGTCCATTGTCGGCGGAACTAAGCACGTTGGTCCCTTACACGATGCTGGAG
AGCTCCATCTACTCCGTCTTTGCAGAAGCTTACACTAAAGCTGCTGTTAACGCTAAGTTG
GTAGCTACCGTAGCACCGTTCAGTCTCTGCTTCACGTCTTCGAGTGAGGTGGATTTTCCG
GAGGTGGATCTTGCGTTGCAGAGCGAGATGGTGAGGTGGATAATTCAGGGGAGGAATCTA
ATGGTGGATGTTGGTGGTGGAGTCCGATGCTTGGGGATCGTCGACGGCGGGTTGAACCCG
GTCAGCCCGATTATAATGGGTGGGCTTCAGTTAGAAGGCTTTGTGTTGGACTTCGATTTG
GGTAACTCGATGCTGGGGTTCGAACAAAGAACACTCTCTTCAACTTCAGATTCCTTGCAA
CCAGAAGCTTTGTAGTGAAACCATCTATAGTTTTAACTCGTAGATATACTCAGTTTTGCT
CTCTTTGTTTGTGTGTTTGTTAAGATACCTTTTTATCTGTAAGCCACTACGCATTTACAC
G

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 3

CO CL3712Contig1 1109 3 24 U
GGGGAATTAAAACATCCCAACCCCCACAAACAAACCCCAATCCTCAAAGTGGTGGGTGAT
GTCTCTCACACGGAACCTAATCAGAGACGAAGAGCTCGGAGCCATGTCAGACGACGACGA
TTCACCCTCCGGAAAGCGATCTAAACTCGATCGGTTCCCTCTCAGCCGATGGGAACTCGC
GGTGTCTCTCGGCGTCTTCCTCGTCTTCTCCTCTGGTCTCTTCTGCATCTACATGACAAT
GCCCGCTGCCCAATTCGGCAAGCTCAAGCTCCCCAGAAGCATCTCTGACCTCCGCCTGCT
CAAAGACAATCTTGCTGACTATGCGAATGAGTACCCGGCGCAGTTCGTTTTAGGGTACTG
TGCGACCTACATTTTCATGCAGACGTTTATGATCCCAGGGACTATCTTTATGTCGCTTTT
GGCGGGAGCTCTCTTTGGGGTTATCAAAGGTGTTGTCTTGGTTGTTTTCAACGCAACCGC
AGGAGCTACTTGCTGCTTCTTTTTGTCTAAGTTGATTGGTAGGCCGTTGATCACTTGGCT
GTGGCCTGACAAGTTGAGATTCTTTCAGGCTGAGATTGGTAAGCGAAGAGATGAGCTTCT
GAATTATATGTTGTTTCTGAGGATAACACCAACACTGCCAAATCCGTTCATCAATTTGGC
TTCTCCCATTGTTGATGTACCTTTTCATATCTTCTTTTTGGCGACATTGGTCGGTCTCAT
TCCCGCAGCTTACATAACCGTTAGAGCTGGACTTGCTATTGGAGATCTCAAATCGGTGAA
GGACCTGTATGATTTCAAGACATTGTCAGTGCTTTTCCTCATTGGGTTTATCTCCATACT
CCCAACAATACTGAAAAGAAAGAAGATATATGAATAGCCAAAGAGAAGTCCCTTTACAAT
ACACAGGCTTGCTTAACCTTCGATGTCATAAAGCCTTACAGAGAGGACAAGGCTACAATT
TTAACTGATTTAGAGGACACAGCAGAAACAATAATGGCTGACTCGTTTATACTTTTTGTG
TGTTTGTGTGTTTCCATTTGAGAGTAGAACTGAGGAAGATATCATAGAATCAAATACATT
TTTTTCTGAATCAAGTTATTATTTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G601TF U 1
AF RR2DJ01TF U 44
AF RR2DJ01JQ C 500
BS 1 108 RR2G601TF
BS 109 109 RR2DJ01TF
BS 110 474 RR2G601TF
BS 475 475 RR2DJ01TF
BS 476 480 RR2G601TF
BS 481 481 RR2DJ01TF
BS 482 495 RR2G601TF
BS 496 496 RR2DJ01TF
BS 497 516 RR2G601TF
BS 517 517 RR2DJ01TF
BS 518 520 RR2G601TF
BS 521 521 RR2DJ01TF
BS 522 585 RR2G601TF
BS 586 586 RR2DJ01TF
BS 587 592 RR2G601TF
BS 593 593 RR2DJ01TF
BS 594 644 RR2G601TF
BS 645 645 RR2DJ01TF
BS 646 698 RR2G601TF
BS 699 699 RR2DJ01TF
BS 700 726 RR2G601TF
BS 727 727 RR2DJ01TF
BS 728 776 RR2G601TF
BS 777 1109 RR2DJ01JQ

RD RR2G601TF 776 0 0
GGGGAATTAAAACATCCCAACCCCCACAAACAAACCCCAATCCTCAAAGTGGTGGGTGAT
GTCTCTCACACGGAACCTAATCAGAGACGAAGAGCTCGGAGCCATGTCTGACGACGACGA
TTCACCCTCCGGAAAGCGATCTAAACTCGATCGGTTCCCTCTCAGCCGATGGGAACTCGC
GGTGTCTCTCGGCGTCTTCCTCGTCTTCTCCTCTGGTCTCTTCTGCATCTACATGACAAT
GCCCGCTGCCCAATTCGGCAAGCTCAAGCTCCCCAGAAGCATCTCTGACCTCCGCCTGCT
CAAAGACAATCTTGCTGACTATGCGAATGAGTACCCGGCGCAGTTCGTTTTAGGGTACTG
TGCGACCTACATTTTCATGCAGACGTTTATGATCCCAGGGACTATCTTTATGTCGCTTTT
GGCGGGAGCTCTCTTTGGGGTTATCAAAGGTGTTGTCTTGGTTGTTTTCAACGCGACCGC
TGGAGCTACTTGCTGTTTCTTTTTGTCTAAGTTGATCGGTCGGCCGTTGATCACTTGGCT
GTGGCCTGACAAGTTGAGATTCTTTCAGGCTGAGATTGGTAAGCGTAGAGATAAGCTTCT
GAATTATATGTTGTTTCTGAGGATAACACCAACACTGCCAAATCTGTTCATCAATTTGGC
TTCTCCCATTGTTGATGTACCTTTTCATATCTTCTTTT*GGCGACATTGGTCGGTCTCAT
TCCCGCTGCTTACATAACCGTTAGAGCTGGACTTGCTATTGGAGATCTCAAATCGG

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2DJ01TF 714 0 0
GG
AAAGTGGTGGGTGATGTCTCTCACACGGAACCTAATCAGAGACGGAGAGCTCGGAGCCAT
GTCAGACGACGACGATTCACCCTCCGGAAAGCGATCTAAACTCGATCGGTTCCCTCTCAG
CCGATGGGAACTCGCGGTGTCTCTCGGCGTCTTCCTCGTCTTCTCCTCTGGTCTCTTCTG
CATCTACATGACAATGCCCGCTGCCCAATTCGGCAAGCTCAAGCTCCCCAGAAGCATCTC
TGACCTCCGCTTGCTCAAAGACAATCT*GCTGACTATGCGAATGAGTACCCGGCGCAGTT
CGTTTTAGGGTACTGTGCGACCTACATTTTCATGCAGACGTTTATGATTCCAGGGACTAT
CTTTATGTCGCTTTTGGCGGGAGCTCTCTTTGGGGTTATCAAAGGTGTTGTCTTGGTTGT
TTTCAACGCAACCGCAGGAGCTACTTGCTGCTTCTTTTTGTCTAAGTTGATTGGTAGGCC
GTTGATCACTTGGCTGTGGCCTGACAAGTTGAGATTCTTTCAGGCTGAGATTGGTAAGCG
AAGAGATGAGCTTCTGAATTATATGTTGTTTCTGAGGATAACACCAACACTGCCAAATCC
GTTCATCAATTTGGCTTCTCCCATTGTTGATGTACCTTTTCATATCTTCTTTTTGGCGAC
ATTGGTCGGTCTCATTCCCGCAGCTTACATAACCGTTAGAGCTGGACTTGCT

QA 3 714 3 714
DS 

RD RR2DJ01JQ 610 0 0
TTTTTGTCTAAGTTGATTGGTAGGCCGTTGATCACTTGGCTGTGGCCTGACAAGTTGAGA
TTCTTTCAGGCTGAGATTGGTAAGCGAAGAGATGAGCTTCTGAATTATATGTTGTTTCTG
AGGATAACACCAACACTGCCAAATCCGTTCATCAATTTGGCTTCTCCCATTGTTGATGTA
CCTTTTCATATCTTCTTTTTGGCGACATTGGTCGGTCTCATTCCCGCAGCTTACATAACC
GTTAGAGCTGGACTTGCTATTGGAGATCTCAAATCGGTGAAGGACCTGTATGATTTCAAG
ACATTGTCAGTGCTTTTCCTCATTGGGTTTATCTCCATACTCCCAACAATACTGAAAAGA
AAGAAGATATATGAATAGCCAAAGAGAAGTCCCTTTACAATACACAGGCTTGCTTAACCT
TCGATGTCATAAAGCCTTACAGAGAGGACAAGGCTACAATTTTAACTGATTTAGAGGACA
CAGCAGAAACAATAATGGCTGACTCGTTTATACTTTTTGTGTGTTTGTGTGTTTCCATTT
GAGAGTAGAACTGAGGAAGATATCATAGAATCAAATACATTTTTTTCTGAATCAAGTTAT
TATTTTCTTC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 3

CO CL3713Contig1 756 3 38 U
GACGCACATACACAGTCACATTAATGTATAGAAAACAAGATTATGACACAACAACATATA
TAAACTTGGATTTTT*CATTACAGTTTTACAACACAACTTCATTAGAACTTTTGAGTTTG
GTGATTATATCTTACTTTAAGCTCCGGCACTAAATGCATTTACTCCAGCAAAGTTAAAGG
CAGCATCAAAGGGAGCTGATGATGGAGAGAAAAGATTCTGACTCATACACATCAGTCCCT
CCTCGGCTTTATCATTTTCGATAAACCCTAAATCCGGAAGGATATCTCTATGATCAGAAA
AGGACCGGTTGAGATTGGCATTTAGAAGGTTGACGGTTGTGATGTCATGGATGCTTGGCC
GGCGCTTATCCTTGGCTCCTGAGAGTTGTCTCTGGTGATACTTTTGGGCATGGCTTGCCA
CTTGCGTTGGGGTCTTCGACACCACGAAGTTTCTCGATATGTTTCTCCAGTCACCTTTCC
CGTACTTGAGAAGCCCTAGCAAGAATCTCCTGTGTTCTTCCTCTGTCCAAGGGACTCCTT
TCTTCCGTTCGTGATCAGATCCTCTGGCTCCATTAGGTCGCTTTCGACACGTGTCCTGGG
TGAACCCTAAGGGAGAAGGGTAACCAGGAATGGGGACACGTCCTTCTTCAATATCGAATA
CGTCTTCTTCGAGCTTACTGTATTGCTTCATTACATCAAAAACAGTCTTTCCAGGGATCA
TGGAAGCAATCTTGAACCAGCGATCGGGTGAGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2GQ28JQ U 1
AF RR2FV75TF C 7
AF RR2FV75JQ U 10
BS 1 22 RR2GQ28JQ
BS 23 23 RR2FV75JQ
BS 24 50 RR2GQ28JQ
BS 51 51 RR2FV75JQ
BS 52 69 RR2GQ28JQ
BS 70 70 RR2FV75JQ
BS 71 232 RR2GQ28JQ
BS 233 233 RR2FV75JQ
BS 234 277 RR2GQ28JQ
BS 278 278 RR2FV75JQ
BS 279 304 RR2GQ28JQ
BS 305 305 RR2FV75JQ
BS 306 312 RR2GQ28JQ
BS 313 313 RR2FV75JQ
BS 314 324 RR2GQ28JQ
BS 325 325 RR2FV75JQ
BS 326 396 RR2GQ28JQ
BS 397 397 RR2FV75JQ
BS 398 412 RR2GQ28JQ
BS 413 413 RR2FV75JQ
BS 414 472 RR2GQ28JQ
BS 473 473 RR2FV75JQ
BS 474 565 RR2GQ28JQ
BS 566 566 RR2FV75JQ
BS 567 567 RR2GQ28JQ
BS 568 568 RR2FV75JQ
BS 569 575 RR2GQ28JQ
BS 576 576 RR2FV75JQ
BS 577 589 RR2GQ28JQ
BS 590 590 RR2FV75JQ
BS 591 601 RR2GQ28JQ
BS 602 602 RR2FV75JQ
BS 603 658 RR2GQ28JQ
BS 659 659 RR2FV75JQ
BS 660 742 RR2GQ28JQ
BS 743 743 RR2FV75JQ
BS 744 754 RR2GQ28JQ
BS 755 756 RR2FV75JQ

RD RR2GQ28JQ 754 0 0
GACGCACATACACAGTCACATTCATGTATAGAAAACAAGATTATGACACAGCAACATATA
TAAACTTGGGTTTTT*CATTACAGTTTTACAACACAACTTCATTAGAACTTTTGAGTTTG
GTGATTATATCTTACTTTAAGCTCCGGCACTAAATGCATTTACTCCAGCAAAGTTAAAGG
CAGCATCAAAGGGAGCTGATGATGGAGAGAAAAGATTCTGACTCATACACATTAGTCCCT
CCTCGGCTTTATCATTTTCGATAAACCCTAAATCCGGGAGGATATCTCTATGATCAGAAA
AGGAACGGTTGAAATTGGCATTTAAAAGGTTGACGGTTGTGATGTCATGGATGCTTGGCC
GGCGCTTATCCTTGGCTCCTGAGAGTTGTCTCTGGTAATACTTTTGGGCATGACTTGCCA
CTTGCGTTGGGGTCTTCGACACCACGAAGTTTCTCGATATGTTTCTCCAGTCCCCTTTCC
CGTACTTGAGAAGCCCTAGCAAGAATCTCCTGTGTTCTTCCTCTGTCCAAGGGACTCCTT
TCTTCCGTTCGTGATCAGATCCTCTAGTTCCATTATGTCGCTTTCGACAAGTGTCCTGGG
TAAACCCTAAGGGAGAAGGGTAACCAGGAATGGGGACACGTCCTTCTTCAATATCGAAAA
CGTCTTCTTCGAGCTTACTGTATTGCTTCATTACATCAAAAACAGTCTTTCCAGGGATCA
TGGAAGCAATCTTGAACCAGCGGTCGGGTGAGTC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2FV75TF 750 0 0
TTT
ACACAGTCACATTAATGTATAGAAAACAAGATTATGACACAACAACATATATAAACTTGG
ATTTTT*CATTACAGTTTTACAACACAACTTCATTAGAACTTTTGAGTTTGGTGATTATA
TCTTACTTTAAGCTCCGGCACTAAATGCATTTACTCCAGCAAAGTTAAAGGCAGCATCAA
AGGGAGCTGATGATGGAGAGAAAAGATTCTGACTCATACACATCAGTCCCTCCTCGGCTT
TATCATTTTCGATAAACCCTAAATCCGGAAGGATATCTCTATGATCAGAAAAGGACCGGT
TGAGATTGGCATTTAGAAGGTTGACGGTTGTGATGTCATGGATGCTTGGCCGGCGCTTAT
CCTTGGCTCCTGAGAGTTGTCTCTGGTGATACTTTTGGGCATGGCTTGCCACTTGCGTTG
GGGTCTTCGACACCACGAAGTTTCTCGATATGTTTCTCCAGTCACCTTTCCCGTACTTGA
GAAGCCCTAGCAAGAATCTCCTGTGTTCTTCCTCTGTCCAAGGGACTCCTTTCTTCCGTT
CGTGATCAGATCCTCTGGCTCCATTAGGTCGCTTTCGACACGTGTCCTGGGTGAACCCTA
AGGGAGAAGGGTAACCAGGAATGGGGACACGTCCTTCTTCAATATCGAATACGTCTTCTT
CGAGCTTACTGTATTGCTTCATTACATCAAAAACAGTCTTTCCAGGGATCATGGAAGCAA
TCTTGAACCAGCGATCGGGTGAGTC
TC

QA 4 748 4 748
DS 

RD RR2FV75JQ 747 0 0
ACACAGTCACATTAATGTATAGAAAACAAGATTATGACACAACAACATATATAAACTTGG
ATTTTTTCATTACAGTTTTACAACACAACTTCATTAGAACTTTTGAGTTTGGTGATTATA
TCTTACTTTAAGCTCCGGCACTAAATGCATTTACTCCAGCAAAGTTAAAGGCAGCATCAA
AGGGAGCTGATGATGGAGAGAAAAGATTCTGACTCATACACATCAGTCCCTCCTCGGCTT
TATCATTTTCGATAAACCCTAAATCCGGAAGGATATCTCTATGATCAGAAAAGGACCGGT
TGAGATTGGCATTTAGAAGGTTGACGGTTGTGATGTCATGGATGCTTGGCCGGCGCTTAT
CCTTGGCTCCTGAGAGTTGTCTCTGGTGATACTTTTGGGCATGGCTTGCCACTTGCGTTG
GGGTCTTCGACACCACGAAGTTTCTCGATATGTTTCTCCAGTCACCTTTCCCGTACTTGA
GAAGCCCTAGCAAGAATCTCCTGTGTTCTTCCTCTGTCCAAGGGACTCCTTTCTTCCGTT
CGTGATCAGATCCTCTGGCTCCATTAGGTCGCTTTCGACACGTGTCCTGGGTGAACCCTA
AGGGAGAAGGGTAACCAGGAATGGGGACACGTCCTTCTTCAATATCGAATACGTCTTCTT
CGAGCTTACTGTATTGCTTCATTACATCAAAAACAGTCTTTCCAGGGATCATGGAAGCAA
TCTTGAACCAGCGATCGGGTGAGTCTC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 3

CO CL3714Contig1 948 3 5 U
GGCTGTATCAATTTTTTTGTATTATAATCAAATATCAAATTAAGTTCGAAGAATGTGAAA
TTTTTTCTTTGGTTGAATCAAACCAAGTAAAGAGAGAAGAAAACAATACAAAAGATGTCT
TCAGTACTTGTGACTTTTGCCATGACTCTGCTTCTTGTTCCTCTCATGTGTTTTCTCTAC
ATGCTCCACAAGAACCGCAACCGAAGAGAATCTCGCACCGCACTGTGGACACACCTCCAC
CATACCACCATTGCCACTGCTACCGCTGCTGCTACTCGAAAACTGAAGCTTATTGCTAAT
GTCATTACCGAGCTTGCTGATTCCAGCTTCTGCCGAAGATAAAAGATTAGACCATCTCGA
AAAAGAAGAAGATTTGTTGTTGGGTCTTGTCGTTTTAGCTTCTTTCTTGCTACTACTACT
CCCACTAGTCATGAAACTCAGGAAGCTTGGTTCGGGTTTTCTAGGTCCAGGACAAGTGTG
ATCAGGTCCGAAACGGTGTTTTAAGCAGTGATCCACGTTGCAGTCGCGGCACTTGATGGT
GTTGGAGAACGTTAGCTGCTCCTTGCATCTAGGAACAGGGCATTTCTTCTTCTTTGTGGC
TTTCTCGTAATTTGATGGGTCGCAGTCCGTGTTGACATGTTTCTCCCATGTGATGTTTGG
GTCTTCGTTAGGGTTTAACCTGACTCCTTTGGCACAGAGCGGGCAGATAACGACCGTTAC
ATCTTCTCTGTCGCCTTTGGGGCAGCTGTGTTTCATATAGCTCCGATGATCCAAACAAAA
AACCTGGAGGCAGCGGTCGCAGGTGAAAGGCAAGAAATCGATTTGCTTGCAGATATCGAC
GGAGCAGTGTTTCCCTAGATCTGGAAACTCCGGAGTCCCCATTGCTTCCGACACAAAGAG
AGAGAGACAGCTTCTCACGATTCCGACAATAACTGAAAAGAACCCAAC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY73JQ U 1
AF RR2BG32JQ U 5
AF RR2BG32TF C 160
BS 1 520 RR2AY73JQ
BS 521 521 RR2BG32JQ
BS 522 609 RR2AY73JQ
BS 610 776 RR2BG32JQ
BS 777 948 RR2BG32TF

RD RR2AY73JQ 613 0 0
GGCTGTATCAATTTTTTTGTATTATAATCAAATATCAAATTAAGTTCGAAGAATGTGAAA
TTTTTTCTTTGGTTGAATCAAACCAAGTAAAGAGAGAAGAAAACAATACAAAAGATGTCT
TCAGTACTTGTGACTTTTGCCATGACTCTGCTTCTTGTTCCTCTCATGTGTTTTCTCTAC
ATGCTCCACAAGAACCGCAACCGAAGAGAATCTCGCACCGCACTGTGGACACACCTCCAC
CATACCACCATTGCCACTGCTACCGCTGCTGCTACTCGAAAACTGAAGCTTATTGCTAAT
GTCATTACCGAGCTTGCTGATTCCAGCTTCTGCCGAAGATAAAAGATTAGACCATCTCGA
AAAAGAAGAAGATTTGTTGTTGGGTCTTGTCGTTTTAGCTTCTTTCTTGCTACTACTACT
CCCACTAGTCATGAAACTCAGGAAGCTTGGTTCGGGTTTTCTAGGTCCAGGACAAGTGTG
ATCAGGTCCGAAACGGTGTTTTAAGCAGTGATCCACGTTGTAGTCGCGGCACTTGATGGT
GTTGGAGAACGTTAGCTGCTCCTTGCATCTAGGAACAGGGCATTTCTTCTTCTTTGTGGC
TTTCTCGTA
ATTT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2BG32JQ 772 0 0
GTATCAATTTTTTTGTATTATAATCAAATATCAAATTAAGTTCGAAGAATGTGAAATTTT
TTCTTTGGTTGAATCAAACCAAGTAAAGAGAGAAGAAAACAATACAAAAGATGTTTTCAG
TACTTGTGACTTTTGCCATGACTCTGCTTCTTGTTCCTCTCATGTGTTTTCTCTACATGC
TCCACAAGAACCGCAACCGAAGAGAATCTCGCACCGCACTGTGGACACACCTCCACCATA
CCACCATTGCCACTGCTACCGCTGCTGCTACTCGAAAACTGAAGCTTATTGCTAATGTCA
TTACCGAGCTTGCTGATTCCAGCTTCTGCCGAAGATAAAAGATTAGACCATCTCGAAAAA
GAAGAAGATTTGTTGTTGGGTCTTGTCGTTTTAGCTTCTTTCTTGCTACTACTACTCCCA
CTAGTCATGAAACTCAGGAAGCTTGGTTCGGGTTTTCTAGGTCCAGGACAAGTGTGATCA
GGTCCGAAACGGTGTTTTAAGCAGTGATCCACGTTGCAGTCGCGGCACTTGATGGTGTTG
GAGAACGTTAGCTGCTCCTTGCATCTAGGAACAGGGCATTTCTTCTTCTTTGTGGCTTTC
TCGTAATTTGATGGGTCGCAGTCCGTGTTGACATGTTTCTCCCATGTGATGTTTGGGTCT
TCGTTAGGGTTTAACCTGACTCCTTTGGCACAGAGCGGGCAGATAACGACCGTTACATCT
TCTCTGTCGCCTTTGGGGCAGCTGTGTTTCATATAGCTCCGATGATCCAAAC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2BG32TF 789 0 0
CCTCTCATGTGTTT*CTCTACATGCTCCACAAGAACCGCAACCGAAGAGAATCTCGCACC
GCACTGTGGACACACCTCCACCATACCACCATTGCCACTGCTACCGCTGCTGCTACTCGA
AAACTGAAGCTTATTGCTAATGTCATTACCGAGCTTGCTGATTCCAGCTTCTGCCGAAGA
TAAAAGATTAGACCATCTCGAAGAAGAAGAAGATTTGTTGTTGGGTCTTGTCGTTTTAGC
TTCTTTCTTGCTACTACTACTCCCACTAGTCATGAAACTCAGGAAGCTTGGTTCGGGTTT
TCTAGGTCCAGGACAAGTGTGATCAGGTCCGAAACGGTGTTTTAAGCAGTGATCCACGTT
GCAGTCGCGGCACTTGATGGTGTTGGAGAACGTTAGCTGCTCCTTGCATCTAGGAACAGG
GCATTTCTTCTTCTTTGTGGCTTTCTCGTAGTTTGATGGGTCGCAGTCCGTGTTGACATG
TTTCTCCCATGTGATGTTTGGGTCTTCGTTAGGGTTTAACCTGACTCCTTTGGCACAGAG
CGGGCAGATAACGACCGTTACATCTTCTCTGTCGCCTTTGGGGCAGCTGTGTTTCATATA
GCTCCGATGATCCAAACAAAAAACCTGGAGGCAGCGGTCGCAGGTGAAAGGCAAGAAATC
GATTTGCTTGCAGATATCGACGGAGCAGTGTTTCCCTAGATCTGGAAACTCCGGAGTCCC
CATTGCTTCCGACACAAAGAGAGAGAGACAGCTTCTCACGATTCCGACAATAACTGAAAA
GAACCCAAC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL3715Contig1 790 2 2 U
GGATTGAAACATAACCAAACTAAAGACAATGACTACTCCAATCACATTTACAACCCTAGC
CCTCGTGACCCTCTCGGTGTTACTTGTTTCCTCCTCTCTCGGCGGCGTCACGGCAAAGGA
AGATCGTCGGAACTCTGAGGAAGTGAAGATGTTCGAGCGGTGGCTTGTGGAGAATCACAA
GAACTACAACGGTCTAGGAGAGAAGGATAAACGGTTCGAGATCTTCATGGACAACTTGAA
GTTCGTGCAAGAGCACAACTCTGTCCCGAACCAGAGTTACGAGCTCGGGTTGACCCGGTT
CGCCGATCTGACGAACGAAGAGTTTCGGGCGATGTACTTGAGGAGGAAGATGGAGAGGAC
TAGAGATTCGGTGAAGACAGAGAGGTATCTACATAACGTTGGAGACAGTTTACCTGATGA
AGTTGACTGGAGAGCCAAAGGGGCCGTTGTTCCAGTCAAAGATCAAGGATCATGTGGAAG
TTGTTGGTCATTTTCGGCGATTGGAGCGGTTGAAGGGATAAACCAGATCAAGACAGGGGA
GTTGATATCTCTGTCGGAGCAAGAACTTGTTGATTGTGACACAAGTTACAACAGTGGATG
TAATGGTGGTCTCATGGACTATGCTTTTCAGTTCATTATTAACAACGGCGGTATTGATAC
AGAGGAAGATTATCCTTATACCGCCACTGATGATAACATATGCAATACCGATAGAGAACA
CTCGTGTTGTTACCATCGATGGTTATGAGATGTCCTGAAACGAGAATCATTGAGAAGCTG
TGCTATCAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM68TF U 1
AF RR2DB65TF U 1
BS 1 660 RR2CM68TF
BS 661 790 RR2DB65TF

RD RR2CM68TF 660 0 0
GGATTGAAACATAACCAAACTAAAGACAATGACTACTCCAATCACATTTACAACCCTAGC
CCTCGTGACCCTCTCGGTGTTACTTGTTTCCTCCTCTCTCGGCGGCGTCACGGCAAAGGA
AGATCGTCGGAACTCTGAGGAAGTGAAGATGTTCGAGCGGTGGCTTGTGGAGAATCACAA
GAACTACAACGGTCTAGGAGAGAAGGATAAACGGTTCGAGATCTTCATGGACAACTTGAA
GTTCGTGCAAGAGCACAACTCTGTCCCGAACCAGAGTTACGAGCTCGGGTTGACCCGGTT
CGCCGATCTGACGAACGAAGAGTTTCGGGCGATGTACTTGAGGAGGAAGATGGAGAGGAC
TAGAGATTCGGTGAAGACAGAGAGGTATCTACATAACGTTGGAGACAGTTTACCTGATGA
AGTTGACTGGAGAGCCAAAGGGGCCGTTGTTCCAGTCAAAGATCAAGGATCATGTGGAAG
TTGTTGGTCATTTTCGGCGATTGGAGCGGTTGAAGGGATAAACCAGATCAAGACAGGGGA
GTTGATATCTCTGTCGGAGCAAGAACTTGTTGATTGTGACACAAGTTACAACAGTGGATG
TAATGGTGGTCTCATGGACTATGCTTTTCAGTTCATTATTAACAACGGCGGTATTGATAC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2DB65TF 790 0 0
GGATTGAAACATAACCAAACTAAAGACAATGACTACTCCAATCACATTTACAGCCCTAGT
CCTCGTGACCCTCTCGGTGTTACTTGTTTCCTCCTCTCTCGGCGGCGTCACGGCAAAGGA
AGATCGTCGGAACTCTGAGGAAGTGAAGATGTTCGAGCGGTGGCTTGTGGAGAATCACAA
GAACTACAACGGTCTAGGAGAGAAGGATAAACGGTTCGAGATCTTCATGGACAACTTGAA
GTTCGTGCAAGAGCACAACTCTGTCCCGAACCAGAGTTACGAGCTCGGGTTGACCCGGTT
CGCCGATCTGACGAACGAAGAGTTTCGGGCGATGTACTTGAGGAGGAAGATGGAGAGGAC
TAGAGATTCGGTGAAGACAGAGAGGTATCTACATAACGTTGGAGACAGTTTACCTGATGA
AGTTGACTGGAGAGCCAAAGGGGCCGTTGTTCCAGTCAAAGATCAAGGATCATGTGGAAG
TTGTTGGTCATTTTCGGCGATTGGAGCGGTTGAAGGGATAAACCAGATCAAGACAGGGGA
GTTGATATCTCTGTCGGAGCAAGAACTTGTTGATTGTGACACAAGTTACAACAGTGGATG
TAATGGTGGTCTCATGGACTATGCTTTTCAGTTCATTATTAACAACGGTGGTATTGATAC
AGAGGAAGATTATCCTTATACCGCCACTGATGATAACATATGCAATACCGATAGAGAACA
CTCGTGTTGTTACCATCGATGGTTATGAGATGTCCTGAAACGAGAATCATTGAGAAGCTG
TGCTATCAAC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 3

CO CL3716Contig1 1175 3 15 U
CTTTTCCTTCTGGGTTTCGAGAAAAAAAGATGCTGAGAACATTGGTTATGTCATACCAAC
GCCGGTGAGGACATTTCATTCAAGATTATGAGAAGCATAATAAGTACACAGGGTTTCCTG
TGATTGGGATTGAGTGGCAGAAGATGGAGAATCCAGACTTGCGTAAGAAGATGGGAATGG
AGTCTCATCAAAAGGGAGTGAGGATAAGGAGAATCGAGCCAACAGCCCCGGAATCACAGG
TTTTGAAGCCGTCTGATATCATACTTAGCTTTGACGGAGTTAATATTGCTAATGATGGAA
CTGTTCCATTTAGGCACGGAGAACGAATTGGGTTTAGCTACCTTATATCTCAAAAGTACA
CTGGAGATTCTGCGCTTGTGAAGATTCTGCGTAACAAAGAGATTCTCGAGTTCAACATAA
AACTCGCAATCCACAAGAAGCTAATCCCTGGTCACATAGGTGGCAAACCTCCTTCCTACT
TCATTGTTGCTGGCTTTGTGTTTACAACTGTCTCTGTTCCTTATCTTCGCTCTGAGTATG
GAAAAGAATATGAATTTGATGCGCCTGTCAAGCTTTTGGATAAACATCTTCACGCAATGG
CTCAATCCGTGGACGAGCAGCTTGTTGTCGTTTCACAGGTTCTTGTTTCTGACATCAACA
TTGGTTATGAGGAGATTGTCAATACTCAGGTTCTTGCTTTCAATGGTAAACCTGTGAAAA
ACTTGAAATGTTTGGCTGAGATGGTGGAGAATTGTGATGATGAATACATGGAGTTCAGTC
TTGATTATGATCAGATTGTTGTTCTGCAAACGAAGACTGCTAAAGAGGCAACTTTAGATA
TTCTGACCACACATTGCATACCTTCTGCTATGTCTGATGATCTGAAGAATTGAACAAGAA
TCTGAAACAGTAGCAGCCATAATCATAACATGGAAGGAGAAAGAGAGATTTTGCTCCATG
GAAGCCACACAGAAGCAAATACAGAGTCATGGAAGACGGAGCTTTGAAAGCTCAAACCAT
ATCATTTATCTTCTTTGATTCTTACTCTGTTACACTTTTGTACTTTTGGCAAAATATGCA
CTCGCAGGTTGACCAGACGAAGCATTGAAAAAAAGAAAAAGTTTTTAAGAACCGTTGTGT
GTTGTGGTTGCTACTAAAATTTACTCAAGTAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW78TFB U 1
AF RR2ED37TF U 161
AF RR2AW78JQ C 478
BS 1 223 RR2AW78TFB
BS 224 224 RR2ED37TF
BS 225 322 RR2AW78TFB
BS 323 323 RR2ED37TF
BS 324 340 RR2AW78TFB
BS 341 341 RR2ED37TF
BS 342 424 RR2AW78TFB
BS 425 425 RR2ED37TF
BS 426 478 RR2AW78TFB
BS 479 479 RR2ED37TF
BS 480 567 RR2AW78TFB
BS 568 634 RR2ED37TF
BS 635 635 RR2AW78JQ
BS 636 685 RR2ED37TF
BS 686 1175 RR2AW78JQ

RD RR2AW78TFB 567 0 0
CTTTTCCTTCTGGGTTTCGAGAAAAAAAGATGCTGAGAACATTGGTTATGTCATACCAAC
GCCGGTGAGGACATTTCATTCAAGATTATGAGAAGCATAATAAGTACACAGGGTTTCCTG
TGATTGGGATTGAGTGGCAGAAGATGGAGAATCCAGACTTGCGTAAGAAGATGGGAATGG
AGTCTCATCAAAAGGGAGTGAGGATAAGGAGAATCGAGCCAACCGCCCCGGAATCACAGG
TTTTGAAGCCGTCTGATATCATACTTAGCTTTGACGGAGTTAATATTGCTAATGATGGAA
CTGTTCCATTTAGGCACGGAGAGCGAATTGGGTTTAGCTATCTTATATCTCAAAAGTACA
CTGGAGATTCTGCGCTTGTGAAGATTCTGCGTAACAAAGAGATTCTCGAGTTCAACATAA
AACTTGCAATCCACAAGAAGCTAATCCCTGGTCACATAGGTGGCAAACCTCCTTCCTATT
TCATTGTTGCTGGCTTTGTGTTTACAACTGTCTCTGTTCCTTATCTTCGCTCTGAGTATG
GAAAAGAATATGAATTTGATGCGCCTG

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2ED37TF 526 0 0
GCGTAAGAAGATGGGAATGGAGTCTCATCAAAAGGGAGTGAGGATAAGGAGAATCGAGCC
TACAGCCCCGGAATCACAGGTTTTGAAGCCGTCTGATATCATACTTAGCTTTGATGGAGT
TAATATTGCTAATGATGGAACTGTTCCATTTAGGCATGGAGAACGAATTGGTTTTAGCTA
CCTTATATCTCAAAAGTACACTGGAGATTCTGTGCTTGTGAAGATTCTGCGTAACAAAGA
GATTCTCGAGTTCAACATAAAACTCGCAATCCACAAGAAGCTAATCCCTGGTCACATAGG
TGGCAAACCTCCTTCCTACTTCATTGTTGCTGGCTTTGTGTTCACAACTGTCTCTGTTCC
TTATCTTCGCTCTGAGTATGGAAAAGAATATGAATTTGATGCGCCTGTCAAGCTTTTGGA
TAAACATCTTCACGCAATGGCTCAATCCGTGGACGAGCAGCTTGTTGTCGTTTCGCAGGT
TCTTGTTTCTGACATCAACATTGGTTATGAGGAGATTGTCAATAC
C

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2AW78JQ 698 0 0
AT
TTCATTGTTGCTGGCTTTGTGTTTACAACTGTCTCTGTTCCTTATCTTCGCTCTGAGTAT
GGAAAAGAATATGAATTTGATGCGCCTGTCAAGCTTTTGGATAAACATCTTCATGCAATG
GCTCAATCCGTGGACGAGCAGCTTGTTGTCGTTTCACAGGTTCTTGTTTCTGACATCAAC
ATTGGTTATGAGGAGATTGTCAATACTCAGGTTCTTGCTTTCAATGGTAAACCTGTGAAA
AACTTGAAATGTTTGGCTGAGATGGTGGAGAATTGTGATGATGAATACATGGAGTTCAGT
CTTGATTATGATCAGATTGTTGTTCTGCAAACGAAGACTGCTAAAGAGGCAACTTTAGAT
ATTCTGACCACACATTGCATACCTTCTGCTATGTCTGATGATCTGAAGAATTGAACAAGA
ATCTGAAACAGTAGCAGCCATAATCATAACATGGAAGGAGAAAGAGAGATTTTGCTCCAT
GGAAGCCACACAGAAGCAAATACAGAGTCATGGAAGACGGAGCTTTGAAAGCTCAAACCA
TATCATTTATCTTCTTTGATTCTTACTCTGTTACACTTTTGTACTTTTGGCAAAATATGC
ACTCGCAGGTTGACCAGACGAAGCATTGAAAAAAAGAAAAAGTTTTTAAGAACCGTTGTG
TGTTGTGGTTGCTACTAAAATTTACTCAAGTAGTTC

QA 3 698 3 698
DS 



AS 1 2

CO CL3717Contig1 962 2 6 U
GGGATTTGGGAGAAAACGCGTTCGGTATAGACTTCCATCCATCGAAGAATCTTGTAGCTG
CTGGTCTCATCGATGGACACTTGCATCTATACCGTTACGGAGTCTTGCAGAGCTGTTCGG
TTCATTGATGATGGCCAAAGTTTGTCCCTTTAGCACTGATTTGAGCTCATGTCCGAGCAA
TTGTAGTTGTTGGCTTTACATTTTATTCTTTGTCATGGGTTTATGGATGGTTGTTAACCC
TATAAACAGAAACTTTTCAATTGCAGATTGATCTCATAATTAACTGATGGGTTCCAAAAT
CGTCTTTCGATCCCTCACCGAGTTATTCCCACAGATTGATGCAAGGATTCCAAAAGCTGT
AGCTATTGAGCACCCTAAAGATGCTGATGTTGCTGCAGCTATTGTTATCTCTGAGATTGT
TCCCAAGTTTTACCCTGATTTGGCTGATGATCCTTCTTCCCAACCTGACAACAAGACACC
AGTGAAGGTCCCAGACAACAAAGTAGGACATGATATGGCAATTAGTGCGCCCTCTTCTTC
AGTAACAAGGGATCAGTTGTCAAAAGTGATTCCGAATGGTGACGTTGATGTTCAGAGCAA
AGCTCCGCGTGATTACAGAAGAATCAGTAGAAGTTGATGATACCAAGAGTTACGTTAGAG
TTACACCCACGCCAACTCTTCCACATTGTCACGTCTGCGAGCTTATTGGCTTTGCATCTT
CACAAAACTTCTTAAAAGCCATCCTTCTCGATTTAAGGTTACAAGTAACTGTTGCGGCTG
AAGATTAGTCTGTTGCATATTGTATAGTTTCTGCTCTGAGTCATTCTTCTCGAAGATTAG
TCTGTTGCATATTGTATAGTTTCTGCTCTGAATCATTCTTCTCGCAAGTTTTTGCTCTTA
GACTTGTGTGCATACAATATAACAAAGTTTAAATTCCTAAGGACTCTATCTTGAGTTACA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2EC13TF U 1
AF RR2EC13JQ C 214
BS 1 726 RR2EC13TF
BS 727 727 RR2EC13JQ
BS 728 739 RR2EC13TF
BS 740 740 RR2EC13JQ
BS 741 755 RR2EC13TF
BS 756 962 RR2EC13JQ

RD RR2EC13TF 755 0 0
GGGATTTGGGAGAAAACGCGTTCGGTATAGACTTCCATCCATCGAAGAATCTTGTAGCTG
CTGGTCTCATCGATGGACACTTGCATCTATACCGTTACGGAGTCTTGCAGAGCTGTTCGG
TTCATTGATGATGGCCAAAGTTTGTCCCTTTAGCACTGATTTGAGCTCATGTCCGAGCAA
TTGTAGTTGTTGGCTTTACATTTTATTCTTTGTCATGGGTTTATGGATGGTTGTTAACCC
TATAAACAGAAACTTTTCAATTGCAGATTGATCTCATAATTAACTGATGGGTTCCAAAAT
CGTCTTTCGATCCCTCACCGAGTTATTCCCACAGATTGATGCAAGGATTCCAAAAGCTGT
AGCTATTGAGCACCCTAAAGATGCTGATGTTGCTGCAGCTATTGTTATCTCTGAGATTGT
TCCCAAGTTTTACCCTGATTTGGCTGATGATCCTTCTTCCCAACCTGACAACAAGACACC
AGTGAAGGTCCCAGACAACAAAGTAGGACATGATATGGCAATTAGTGCGCCCTCTTCTTC
AGTAACAAGGGATCAGTTGTCAAAAGTGATTCCGAATGGTGACGTTGATGTTCAGAGCAA
AGCTCCGCGTGATTACAGAAGAATCAGTAGAAGTTGATGATACCAAGAGTTACGTTAGAG
TTACACCCACGCCAACTCTTCCACATTGTCACGTCTGCGAGCTTATTGGCTTTGCATCTT
CACAAA*CTTCTTAAAAGC*ATCCTTCTCGATTTA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2EC13JQ 749 0 0
CATGGGTTTATGGATGGTTGTTAACCCTATAAACAGAAACTTTTCAATTGCAGATTGATC
TCATAATTAACTGATGGGTTCCAAAATCGTCTTTCGATCCCTCACCGAGTTATTCCCACA
GATTGATGCAAGGATTCCAAAAGCTGTAGCTATTGAGCACCCTAAAGATGCTGATGTTGC
TGCAGCTATTGTTATCTCTGAGATTGTTCCCAAGTTTTACCCTGATTTGGCTGATGATCC
TTCTTCCCAACCTGACAACAAGACACCAGTGAAGGTCCCAGACAACAAAGTAGGACATGA
TATGGCAATTAGTGCGCCCTCTTCTTCAGTAACAAGGGATCAGTTGTCAAAAGTGATTCC
GAATGGTGACGTTGATGTTCAGAGCAAAGCTCCGCGTGATTACAGAAGAATCAGTAGAAG
TTGATGATACCAAGAGTTACGTTAGAGTTACACCCACGCCAACTCTTCCACATTGTCACG
TCTGCGAGCTTATTGGCTTTGCATCTTCACAAAACTTCTTAAAAGCCATCCTTCTCGATT
TAAGGTTACAAGTAACTGTTGCGGCTGAAGATTAGTCTGTTGCATATTGTATAGTTTCTG
CTCTGAGTCATTCTTCTCGAAGATTAGTCTGTTGCATATTGTATAGTTTCTGCTCTGAAT
CATTCTTCTCGCAAGTTTTTGCTCTTAGACTTGTGTGCATACAATATAACAAAGTTTAAA
TTCCTAAGGACTCTATCTTGAGTTACACC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 3

CO CL3718Contig1 898 3 2 U
AGAAAAATAGAAATTTCATTCTCTCAACAATCGGAATACAACGCATTAGCCTTGCCTGAG
AGGCAAATGATCAAATAAAAACAAAGACGAATGGATTGAAATAACAAAGAAGCAAAAGCG
CACCTAAAATCAAAATGACAGTAAGAATCAAAAGAGATTTTTTTTTATTCTTCTTCACAC
ACTGCAACCTCTTTCTCTCTTCAAGCTCTTTATAATGGTTCCGCATCTCCTTCATTCCTC
CTCGGCAAGAGGAACAGCCTTAGCCAGTGGGCGATACTTCAATGCATAGAACATCTCAAG
GTAACGACGGCTCTCAAGACGGTCAAGGTTCGATACATGCTTCCAGAATCCATACACACC
AGTCAATGTCAGAAGCCTCTGTGAGTATATCTGCCACGTGTATTTCTCCTCAATCCTCTG
AAGCCCTCCCTTTGAGATCTCATCCCAGTGAGATGGATCTTCTTTACACTTAGTGAAGAA
GTCAGCAAGAGTATCAGCAGCCTGATCACCATGGTAAGGGTCAATATGGAAGCCAGATTT
GCCGTGCACAATGATCTCAGCTGGACCACCTTTGCAAGTGGCGAAAGTCGGCAAACCACA
GGTCATGGCCTCCACAACAGTCAGACCAAAGGCTTCATACAACGCAGGCTGCACGAAGGC
GCCCTTGGTGTCACAGATGTAACGGTAGAGCTCACCGTTCCTAACCCTGTTCATCTGAGA
AGAGATCCACCTGAACTGACCGTTGAGGTTTTGGATTTTCTCGTTCAGCATCAGAGTCTT
TCCCTGGTGGCTGTGTAGTTGAAGGAACTTAAGCAAAGGAAGCAAACTGTCCTTTTCATG
GAAGAGCTTAGCTGAGAGGTGACGGTTAAGGAACTCAACACCATCTCCAATGTACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER89JQ U 36
AF RR2DN71JQ U 1
AF RR2DN71TF C 158
BS 1 671 RR2DN71JQ
BS 672 898 RR2DN71TF

RD RR2ER89JQ 583 0 0
ATACAACGCATTATCCTTGCCTGAGAGGCAAATGATCAAATAAGAACAAAGACGAATGGA
TTGAAATAACAAAGAAGCAAAAGCGCTCCTAAAATCAAAATGACAGTAAGAATCAAAAGA
GATTTTTTTTTATTCTTCTTCGCACACTGCAACCTCTTTCTCTCTTCAAGCTCTTTATAA
TGGTTCCGCATCTCCTTCATTCCTCCTCGGCAAGAGGAACAGCCTTAGCCAGTGGGCGAT
ACTTCAATGCATAGAACATCTCAAGGTAACGACGGCTCTCAAGACGGTCAAGGTTCGATA
CATGCTTCCAGAATCCATACACACCAGTCAATGTCAGAAGCCTCTGTGAGTATATCTACC
ACGTGTATTTCTCCTCAATCCTCTGAAGCCCTCCCTTTGAGATCTCATCCCAGTGAGATG
GATCTTCTTTACACTTAGTGAAGAAGTCAGCAAGAGTATCAGCAGCCTGATCACCACGGT
AAGGGTCAATATGGAAGCCAGATTTGCCGTGCACAATGATCTCAGCTGGACCACCTTTGC
AAGTGGCGAAAGTCGGCAAACCACAGGTCATGGCCTCCACAAC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2DN71JQ 671 0 0
AGAAAAATAGAAATTTCATTCTCTCAACAATCGGAATACAACGCATTAGCCTTGCCTGAG
AGGCAAATGATCAAATAAAAACAAAGACGAATGGATTGAAATAACAAAGAAGCAAAAGCG
CACCTAAAATCAAAATGACAGTAAGAATCAAAAGAGATTTTTTTTTATTCTTCTTCACAC
ACTGCAACCTCTTTCTCTCTTCAAGCTCTTTATAATGGTTCCGCATCTCCTTCATTCCTC
CTCGGCAAGAGGAACAGCCTTAGCCAGTGGGCGATACTTCAATGCATAGAACATCTCAAG
GTAACGACGGCTCTCAAGACGGTCAAGGTTCGATACATGCTTCCAGAATCCATACACACC
AGTCAATGTCAGAAGCCTCTGTGAGTATATCTGCCACGTGTATTTCTCCTCAATCCTCTG
AAGCCCTCCCTTTGAGATCTCATCCCAGTGAGATGGATCTTCTTTACACTTAGTGAAGAA
GTCAGCAAGAGTATCAGCAGCCTGATCACCATGGTAAGGGTCAATATGGAAGCCAGATTT
GCCGTGCACAATGATCTCAGCTGGACCACCTTTGCAAGTGGCGAAAGTCGGCAAACCACA
GGTCATGGCCTCCACAACAGTCAGACCAAAGGCTTCATACAACGCAGGCTGCACGAAGGC
GCCCTTGGTGT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2DN71TF 741 0 0
TTTTTTTTTATTCTTCTTCACACACTGCA*CCTCTTTCTCTCTTCAAGCTCTT*ATAATG
GTTCCGCATCTCGTTCAT*CCTCCTCGGCAAGAGGAACAGC*TTAGCCAGTGGGCGATAC
TTCAATGCATAGAACATCTCAAGGTAACGACGGCTCTCAAGACGGTCAAGGTTCGATACA
TGCTTCCAGAATCCATACACACCAGTCAATGTCAGAAGCCTCTGTGAGTATATCTGCCAC
GTGTATTTCTCCTCAATCCTCTGAAGCCCTCCCTTTGAGATCTCATCCCAGTGAGATGGA
TCTTCTTTACACTTAGTGAAGAAGTCAGCAAGAGTATCAGCAGCCTGATCACCATGGTAA
GGGTCAATATGGAAGCCAGATTTGCCGTGCACAATGATCTCAGCTGGACCACCTTTGCAA
GTGGCGAAAGTCGGCAAACCACAGGTCATGGCCTCCACAACAGTCAGACCAAAGGCTTCA
TACAACGCAGGCTGCACGAAGGCGCCCTTGGTGTCACAGATGTAACGGTAGAGCTCACCG
TTCCTAACCCTGTTCATCTGAGAAGAGATCCACCTGAACTGACCGTTGAGGTTTTGGATT
TTCTCGTTCAGCATCAGAGTCTTTCCCTGGTGGCTGTGTAGTTGAAGGAACTTAAGCAAA
GGAAGCAAACTGTCCTTTTCATGGAAGAGCTTAGCTGAGAGGTGACGGTTAAGGAACTCA
ACACCATCTCCAATGTACTTC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 3

CO CL3719Contig1 795 3 18 U
GGAGTCGAAGGAAAAAGAAGAAGAAGACAATGGATAACAAAGGCGAGAAGAGCAAGAAAG
TTACGAGTAAATCACCATCCTTCAGCCTACGAAGCCCAAGCTTGAACGCTCTTCGTCTCC
AACGCATCTTCGACTTATTCGATCACAACGGCGACGGTTTCATCACCCTCGAGGAGCTAA
ACCAAGCTCTCTCTCGTCTCGGCCTCAACGCCAATCTCTCCGACCTCAAGTCCACCGTCG
AGTCCTACATCCAGCCTGGTAACACCGGTCTCAACTTCGAAGACTTTTCCTCTCTCCACA
AGACGCTCGACGATTGTTTCTTCGCCGGAGATGACGATGGTTTGGCCTCCCCCGCAGCAG
CTGACGAATCTAACCTCGCGGAGGCGTTTAAGGTGTTTGATGAGAACGGTGATGGGTTCA
TCTGCGCTAGGGAGTTGCAGGCGGTTCTGAAGAAGCTAGGTTTGCCTGAAGGTGGAGAGA
TGGAGAGAGTGGAGAGGATGATTATTTCTGTTGACCGGAACAAGGATGGTCGCGTCGACT
TTTTTGAATTCAAGAACATGATGCGCACCGTGAAACAAATTTCATGAACAAATTTATCAT
CTTCTTGATTTATTTTCATCAAAACAACTTTATCACAAGATTATTAATTAATTTGTTTTT
TT*ATTTATCTATGTAATACTATCAAGTTTCAGATAGATTTATCTATGTAATGATTTCTA
ATAAAGTGTCCACGTGGAGTCTGTTTTCTTATTTAACATCTTTCCAGAAAGAAAAGAAAC
CTTTTTTTTTTGAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B640TF U 1
AF RR2B817TF U 1
AF RR2B817JQ C 202
BS 1 339 RR2B640TF
BS 340 340 RR2B817TF
BS 341 341 RR2B640TF
BS 342 342 RR2B817TF
BS 343 371 RR2B640TF
BS 372 372 RR2B817TF
BS 373 373 RR2B640TF
BS 374 374 RR2B817TF
BS 375 446 RR2B640TF
BS 447 447 RR2B817TF
BS 448 596 RR2B640TF
BS 597 597 RR2B817TF
BS 598 627 RR2B640TF
BS 628 628 RR2B817TF
BS 629 662 RR2B640TF
BS 663 663 RR2B817TF
BS 664 703 RR2B640TF
BS 704 795 RR2B817TF

RD RR2B640TF 703 0 0
GGAGTCGAAGGAAAAAGAAGAAGAAGACAATGGATAACAAAGGCGAGAAGAGCAAGAAAG
TTACGAGTAAATCACCATCCTTCAGCCTACGAAGCCCAAGCTTGAACGCTCTTCGTCTCC
AACGCATCTTCGACTTATTCGATCACAACGGCGACGGTTTCATCACCCTCGAGGAGCTAA
ACCAAGCTCTCTCTCGTCTCGGCCTCAACGCCAATCTCTCCGACCTCAAGTCCACCGTCG
AGTCCTACATCCAGCCTGGTAACACCGGTCTCAACTTCGAAGACTTTTCCTCTCTCCACA
AGACGCTCGACGATTGTTTCTTCGCCGGAGATGACGATGATCTGGCCTCCCCCGCAGCAG
CTGACGAATCTGATCTCGCGGAGGCGTTTAAGGTGTTTGATGAGAACGGTGATGGGTTCA
TCTGCGCTAGGGAGTTGCAGGCGGTTTTGAAGAAGCTAGGTTTGCCTGAAGGTGGAGAGA
TGGAGAGAGTGGAGAGGATGATTATTTCTGTTGACCGGAACAAGGATGGTCGCGTCGACT
TTTTTGAATTCAAGAACATGATGCGCACCGTGAAACAAATTTCATGAACAAATTTACCAT
CTTCTTGATTTATTTTCATCAAAACAAATTTATCACAAGATTATTAATTAATTTGTTTTT
TTTATTTATCTATGTAATACTATCAAGTTTCAGATAGATTTAT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2B817TF 795 0 0
GGAGTCGAAGGAAAAAGAAGAAGAAGACAATGGATAACAAAGGCGAGAAGAGCAAGAAAG
TTACGAGTAAATCACCATCCTTCAGCCTACGAAGCCCAAGCTTGAACGCTCTTCGTCTCC
AACGCATCTTCGACTTATTCGATCACAACGGCGACGGTTTCATCACCCTCGAGGAGCTAA
ACCAAGCTCTCTCTCGTCTCGGCCTCAACGCCAATCTCTCCGACCTCAAGTCCACCGTCG
AGTCCTACATCCAGCCTGGTAACACCGGTCTCAACTTCGAAGACTTTTCCTCTCTCCACA
AGACGCTCGACGATTGTTTCTTCGCCGGAGATGACGATGGTTTGGCCTCCCCCGCAGCAG
CTGACGAATCTAACCTCGCGGAGGCGTTTAAGGTGTTTGATGAGAACGGTGATGGGTTCA
TCTGCGCTAGGGAGTTGCAGGCGGTTCTGAAGAAGCTAGGTTTGCCTGAAGGTGGAGAGA
TGGAGAGAGTGGAGAGGATGATTATTTCTGTTGACCGGAACAAGGATGGTCGCGTCGACT
TTTTTGAATTCAAGAACATGATGCGCACCGTGAAACAAATTTCATGAACAAATTTATCAT
CTTCTTGATTTATTTTCATCAAAACAACTTTATCACAAGATTATTAATTAATTTGTTTTT
TT*ATTTATCTATGTAATACTATCAAGTTTCAGATAGATTTATCTATGTAATGATTTCTA
ATAAAGTGTCCACGTGGAGTCTGTTTTCTTATTTAACATCTTTCCAGAAAGAAAAGAAAC
CTTTTTTTTTTGAAC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2B817JQ 594 0 0
GCCTCAACGCCAATCTTTCCGACCTCAAGTCCACCGTCGAGTCCTACATCCAGCCTGGTA
ACACCGGTCTCAACTTCGAAGACTTTTCCTCTCTCCACAAGACGCTCGACGATTGTTTCT
TCGCCGGAGATGACGATGGTTTGGCCTCCCCCGCAGCAGCTGACGAATCTAACCTCGCGG
AGGCGTTTAAGGTGTTTGATGAGAACGGTGATGGGTTCATCTGCGCTAGGGAGTTGCAGG
CGGTTCTGAAGAAGCTAGGTTTGCCTGAAGGTGGAGAGATGGAGAGAGTGGAGAGGATGA
TTATTTCTGTTGACCGGAACAAGGATGGTCGCGTCGACTTTTTTGAATTCAAGAACATGA
TGCGCACCGTGAAACAAATTTCATGAACAAATTTATCATCTTCTTGATTTATTTTCATCA
AAACAACTTTATCACAAGATTATTAATTAATTTGTTTTTTT*ATTTATCTATGTAATACT
ATCAAGTTTCAGATAGATTTATCTATGTAATGATTTCTAATAAAGTGTCCACGTGGAGTC
TGTTTTCTTATTTAACATCTTTCCAGAAAGAAAAGAAACCTTTTTTTTTTGAAC

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

CO CL3720Contig1 628 2 2 U
AGATGCAGATCTTCGTGAAAACCTTGACCGGAAAAACCATAACCCTAGAGGTTGAAAGCA
GCGACACCATCGACAATGTCAAGTCCAAAATTCAGGACAAAGAGGGGATACCACCAGATC
AACAGAGACTCATCTTTGCTGGGAAACAACTTGAGGATGGTCGAACGCTTTCTGACTACA
ACATTCAGAAAGAGTCCACTCTTCACTTGGTTCTGAGGCTTAGGGGTGGGACCATGATCA
AGGTCAAGACTCTCACTGGTAAAGAAATCGAGATTGATATCGAACCAACCGATACTATTG
ATCGCATCAAGGAACGTGTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTTCAACAAAGGCTCA
TCTACGCTGGGAAACAGCTAGCTGATGACAAAACCGCAAAGGACTACAACATAGAGGGAG
GCTCTGTTCTTCATCTGGTCCTTGCTCTTAGGGGTGGTTCTTGTCTGTAAACTCTTTCTC
TTATCGCAGCTCTTTATTTGCCCTAGAGCATATCCCTTTCTATGTCTTTGGTTGAGTCCG
AGTGAACGCAATTTGGGTTTTTGATGCTTTATTTTGCTGTTTTAGTGGGTTTGGATTAAT
TTACTAATAATATGTTCAATATCGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2CE96TF U 1
AF RR2CE96JQ C 18
BS 1 626 RR2CE96TF
BS 627 628 RR2CE96JQ

RD RR2CE96TF 626 0 0
AGATGCAGATCTTCGTGAAAACCTTGACCGGAAAAACCATAACCCTAGAGGTTGAAAGCA
GCGACACCATCGACAATGTCAAGTCCAAAATTCAGGACAAAGAGGGGATACCACCAGATC
AACAGAGACTCATCTTTGCTGGGAAACAACTTGAGGATGGTCGAACGCTTTCTGACTACA
ACATTCAGAAAGAGTCCACTCTTCACTTGGTTCTGAGGCTTAGGGGTGGGACCATGATCA
AGGTCAAGACTCTCACTGGTAAAGAAATCGAGATTGATATCGAACCAACCGATACTATTG
ATCGCATCAAGGAACGTGTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTTCAACAAAGGCTCA
TCTACGCTGGGAAACAGCTAGCTGATGACAAAACCGCAAAGGACTACAACATAGAGGGAG
GCTCTGTTCTTCATCTGGTCCTTGCTCTTAGGGGTGGTTCTTGTCTGTAAACTCTTTCTC
TTATCGCAGCTCTTTATTTGCCCTAGAGCATATCCCTTTCTATGTCTTTGGTTGAGTCCG
AGTGAACGCAATTTGGGTTTTTGATGCTTTATTTTGCTGTTTTAGTGGGTTTGGATTAAT
TTACTAATAATATGTTCAATATCGGA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2CE96JQ 611 0 0
AAAACCTTGACCGGAAAAACCATAACCCTAGAGGTTGAAAGCAGCGACACCATCGACAAT
GTCAAGTCCAAAATTCAGGACAAAGAGGGGATACCACCAGATCAACAGAGACTCATTTTT
GCTGGGAAACAACTTGAGGATGGTCGAACGCTTTCTGACTACAACATTCAGAAAGAGTCC
ACTTTTCACTTGGTTTTGAGGCTTAGGGGTGGGACCATGATCAAGGTCAAGACTCTCACT
GGTAAAGAAATCGAGATTGATATCGAACCAACCGATACTATTGATCGCATCAAGGAACGT
GTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTTCAACAAAGGCTCATTTACGCTGGGAAACAG
CTAGCTGATGACAAAACCGCAAAGGACTACAACATAGAGGGAGGCTCTGTTTTTCATCTG
GTCCTTGCTTTTAGGGGTGGTTTTTGTCTGTAAACTCTTTTTTTTATCGCAGCTCTTTAT
TTGCCCTAGAGCATATCCCTTTTTATGTCTTTGGTTGAGTCCGAGTGAACGCAATTTGGG
TTTTTGATGCTTTATTTTGCTGTTTTAGTGGGTTTGGATTAATTTACTAATAATATGTTC
AATATCGGATC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 3

CO CL3721Contig1 773 3 2 U
GGACGCCGGCGACAATCAGAGGCGGTTGTTCGACAGAAATAACGAATCGTTTCTTTGGAG
ACTCGAAGCGAATTTCGATAAGCTCGTCTCTTCGGCTCTAGGGTATCGTGGGGACTGCTT
GATTTTCACGTCTTTTTTGGTTGTTACTGAAAACTATAGGAGACGAACTCTAATGGGTGA
GTCTGCTGGATCGAGCAGTTCATGGGCTGCAATCAGTTCTTCCAACATTGGGTTTCAGCT
CTTAAAGAAGCAAGGCTGGAAGGAAGGCACTGGTCTTGGAGTCGCTGAACAGGGTATACT
GGTGCCAGTACAAACAGAGCCGAAAAATAACAAACGAGGACTGGGAGCTGCAGCTGAAAA
*CCAAAACCAACCAAGAGAAAAGCCGTGAAACCTAGTACAGATTCTGGAAAGGAGGAAGA
GGTCTCTAAGCAATCGAAGAAACTTTCAAAGAAAATGCGGAAGTTGATGGAGCACGAAAA
ACAGCTACAGGAAAAGGAATTCGAGCGAGCCTTCTTCAGAGAGTTTTGGCCTGATAATGT
TTAAAGATTGCTGCGCAAAATCTGTATATGCTAGTCTTAGAACTCAGTATTTGAAAACAT
TGTTCCTTAAATCCACTTTTGAGTTCAACTGACAAAGGAAAAGAGAACGAATTTATGTAG
ACAGAGAGAAGCTAATGGTTTCTTTTGTAAAATTCTATTCTATATGTTCATGCAACGTGC
TTTGCATTGGCTTGCTATGCTTCTAGCATGACTATTCTATCTGAATATTGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI44TF U 1
AF RR2EI44JQ C 89
AF RR2CN49TF U 159
BS 1 655 RR2EI44TF
BS 656 773 RR2CN49TF

RD RR2EI44TF 655 0 0
GGACGCCGGCGACAATCAGAGGCGGTTGTTCGACAGAAATAACGAATCGTTTCTTTGGAG
ACTCGAAGCGAATTTCGATAAGCTCGTCTCTTCGGCTCTAGGGTATCGTGGGGACTGCTT
GATTTTCACGTCTTTTTTGGTTGTTACTGAAAACTATAGGAGACGAACTCTAATGGGTGA
GTCTGCTGGATCGAGCAGTTCATGGGCTGCAATCAGTTCTTCCAACATTGGGTTTCAGCT
CTTAAAGAAGCAAGGCTGGAAGGAAGGCACTGGTCTTGGAGTCGCTGAACAGGGTATACT
GGTGCCAGTACAAACAGAGCCGAAAAATAACAAACGAGGACTGGGAGCTGCAGCTGAAAA
*CCAAAACCAACCAAGAGAAAAGCCGTGAAACCTAGTACAGATTCTGGAAAGGAGGAAGA
GGTCTCTAAGCAATCGAAGAAACTTTCAAAGAAAATGCGGAAGTTGATGGAGCACGAAAA
ACAGCTACAGGAAAAGGAATTCGAGCGAGCCTTCTTCAGAGAGTTTTGGCCTGATAATGT
TTAAAGATTGCTGCGCAAAATCTGTATATGCTAGTCTTAGAACTCAGTATTTGAAAACAT
TGTTCCTTAAATCCACTTTTGAGTTCAACTGACAAAGGAAAAGAGAACGAATTTA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2EI44JQ 634 0 0
TCTTCGGCTCTAGGGTATCGTGGGGACTGCTTGATTTTCACGTCTTTTTTGGTTGTTACT
GAAAACTATAGGAGACGAACTCTAATGGGTGAGTCTGCTGGATCGAGCAGTTCATGGGCT
GCAATCAGTTCTTCCAACATTGGGTTTCAGCTCTTAAAGAAGCAAGGCTGGAAGGAAGGC
ACTGGTCTTGGAGTCGCTGAACAGGGTATACTGGTGCCAGTACAAACAGAGCCGAAAAAT
AACAAACGAGGACTGGGAGCTGCAGCTGAAAA*CCAAAACCAACCAAGAGAAAAGCCGTG
AAACCTAGTACAGATTCTGGAAAGGAGGAAGAGGTCTCTAAGCAATCGAAGAAACTTTCA
AAGAAAATGCGGAAGTTGATGGAGCACGAAAAACAGCTACAGGAAAAGGAATTCGAGCGA
GCCTTCTTCAGAGAGTTTTGGCCTGATAATGTTTAAAGATTGCTGCGCAAAATCTGTATA
TGCTAGTCTTAGAACTCAGTATTTGAAAACATTGTTCCTTAAATCCACTTTTGAGTTCAA
CTGACAAAGGAAAAGAGAACGAATTTATGTAGACAGAGAGAAGCTAATGGTTTCTTTTGT
AAAATTCTATTCTATATGTTCATGCAACGTGC
AG

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2CN49TF 615 0 0
GGAGACGAACTCTAATGGGTGAGTCTGCTGGATCGAGCAGTTCATAGGCTGCAATCAGTT
CTTCCAACATTGGGTTTCAGCTCTTAAAGAAGCAAGGCTGGAAGGAAGGCACTGGTCTTG
TAGTCGCTGAACAGGGTATACTGGTGCCAGTACAAACAGAGCCGAAAAATAACAAACGAG
GACTGGGAGCTGCAGCTGAAAAACCAAAACCAACCAAGAGAAAAGCCGTGAAACCTAGTA
CAGATTCTGGAAAGGAGGAAGAAGTCTCTAAGCAATCGAAGAAACTTTCGAAGAAAATGC
GGAAGTTGATGGAGCACGAAAAACAGCTACAGGAAAAGGAATTCGAGCGAGCCTTCTTCA
GAGAGTTTTGGCCTGATAATGTATAAAGATTGCTGCGCAAAATCTGTATATGCTAGTCTT
AGAACTCAGTATTTGAAAACATTGTTCCTTAAATCCACTTTTGAGTTCAACTGACAAAGG
AAAAGAGAACGAATTTATGTAGACAGAGAGAAGCTAATGGTTTCTTTTGTAAAATTCTAT
TCTATATGTTCATGCAACGTGCTTTGCATTGGCTTGCTATGCTTCTAGCATGACTATTCT
ATCTGAATATTGAAC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL3722Contig1 721 2 7 U
GGGAAGGAAAACGGAACAGCTGGTGCCTTCCCTTCCTCGTAGCGTCTCTGTAAATTTTCC
TGCTCAGATGAACTTTGGGTTACCGAGTATCTCCTGGTTTAACAGCAACAGCTCAAAGAA
AGATGTAGCCATGGTAGAAACCGTGACATCCACGACTTCTTCTCTCCTTGACCAGCAAGA
CCAAGGGCAAAGCTTGTTTGGTATAAAGATATGGACTTTCTCCCTAGCTTCTGTTTTTCC
TTCACGTGATGGGAAGCAGCAGAAACCCACTACTATAAACAGAGGGTTAAAAAGGCATGC
CGTGTCTCGCAGGTCATCGAGAGTGAATACTGTGACTACTAGTGTTTATCGGTTTAGACC
CTACGTGTCGAAGGTGCCATGGCACACGGGACCGAGGGCGTTTCTTTCGCAGCTTTTCCC
GAGATACGGGCATTACTGTGGACCCAACTGGTCAAGTGGGAAAGATGGGGGTTCACCAAT
TTGGGATCAGAGACCTATCGATTGGTTAGACCATTGCTGTTATTGCCATGATATTGGTTA
TGATACTCATGACCAGGCTGAGTTGCTGAAAGCCGACATGGCGTTTCTTGAGTGTTTGGA
ATCCAACAAGCGCCTTGTTACCAGGGGTGATGCTCAAGTTGCTCACTTTTATAAGACAAT
GTGCATAACGGGTCTCAAGAACATACTGATACCTTACAGAAGCTACCTCGTGAAGATACA
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2AY37TFB U 415
AF RR2ET25TF U 1
BS 1 470 RR2ET25TF
BS 471 471 RR2AY37TFB
BS 472 477 RR2ET25TF
BS 478 478 RR2AY37TFB
BS 479 603 RR2ET25TF
BS 604 604 RR2AY37TFB
BS 605 721 RR2ET25TF

RD RR2AY37TFB 297 0 0
TTTCCCGAGGTACGGGCATTACTGTGGACCCAACTGGTCAAGTGGGAAAGATGGGGGTTC
ACCAATTTGGGATCAGAGACCTATTGATTGGTTAGACCATTGCTGTTATTGCCATGATAT
TGGTTATGATACTCATGACCAGGCTGAGTTGCTGAAAGCCGACATGGCGTTTCTTGAGTG
TTTGGAATCCAACAAGCGCCTTGTTACCAGGGGTGATGCTCAAGTTGCTCACTTTTATAA
GACAATGTGCATTACGGGTCTCAAGAACATACTGTTACCTTACAGAAGCTATCTCGT

QA 1 297 1 297
DS 

RD RR2ET25TF 721 0 0
GGGAAGGAAAACGGAACAGCTGGTGCCTTCCCTTCCTCGTAGCGTCTCTGTAAATTTTCC
TGCTCAGATGAACTTTGGGTTACCGAGTATCTCCTGGTTTAACAGCAACAGCTCAAAGAA
AGATGTAGCCATGGTAGAAACCGTGACATCCACGACTTCTTCTCTCCTTGACCAGCAAGA
CCAAGGGCAAAGCTTGTTTGGTATAAAGATATGGACTTTCTCCCTAGCTTCTGTTTTTCC
TTCACGTGATGGGAAGCAGCAGAAACCCACTACTATAAACAGAGGGTTAAAAAGGCATGC
CGTGTCTCGCAGGTCATCGAGAGTGAATACTGTGACTACTAGTGTTTATCGGTTTAGACC
CTACGTGTCGAAGGTGCCATGGCACACGGGACCGAGGGCGTTTCTTTCGCAGCTTTTCCC
GAGATACGGGCATTACTGTGGACCCAACTGGTCAAGTGGGAAAGATGGGG*TTCACCGAT
TTGGGATCAGAGACCTATCGATTGGTTAGACCATTGCTGTTATTGCCATGATATTGGTTA
TGATACTCATGACCAGGCTGAGTTGCTGAAAGCCGACATGGCGTTTCTTGAGTGTTTGGA
ATCGAACAAGCGCCTTGTTACCAGGGGTGATGCTCAAGTTGCTCACTTTTATAAGACAAT
GTGCATAACGGGTCTCAAGAACATACTGATACCTTACAGAAGCTACCTCGTGAAGATACA
A

QA 1 721 1 721
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3724Contig1 612 3 3 U
GGACGCTCCAAGCCAAAATCGCGCGACTAGAAGAAGAGCTGCTGCTTGTGCTAAGAAAAG
GAAAAAAAA*CCTTATCTCGCAATGGCTTCTTCCACTTTCGTCTCTCTACCAAAACCCTT
CTTCGCTTTTCCGGCTAAAACCAATGCTGCTTCTCTAGCTAACCACAAGCTTCTCGGAAG
TCGAAGAGGCTGTCTGAGAGTTAAAGCGATCTCCACTAAATGGGAACCCTCAAAGGTTGT
TCCTCAAGCCGACAGGGTTCTTGTTCGTCTTGAAGAGCTTGCTCAGACAACCTCGGGTGG
AGTGTTGTTGCCCAAAGCAGCTGTTAAGTTTGAGAGGTATCTAACCGGAGAGGTTGTCTC
TGTTGGTTCTGAGGTCGGACAACAAGTTGGGCCTGGAAAGAAGGTTCTGTTCTCTGACGT
GAGTGCATATGAGGTGGATTTGGGTACCGGTGCTAGGCATTGCTTTTGTAAAGAGAGCGA
CTTGTTGGCCCTCGTGGAGTGAGAGATATTGTCTAATGTTTCTTCAAGATTTTTAGTTGT
TTCCTGTAATTCTCAGACGGCACATCTTGTTTTGTGACAGTTTTCTTCAATTTAATATCA
TTTTGAAGACAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RR2DN13JQ C 1
AF RR2DN13TF U 1
AF RR2C294TF U 8
BS 1 9 RR2DN13JQ
BS 10 610 RR2DN13TF
BS 611 612 RR2C294TF

RD RR2DN13JQ 610 0 0
GGACGCTCCAAGCCAAAATCGCGCGACTAGAAGAAGAGCTGCTGCTTGTGCTAAGAAAAG
GAAAAAAAA*CCTTATCTCGCAATGGCTTCTTCCACTTTCGTCTCTCTACCAAAACCCTT
CTTCGCTTTTCCGGCTAAAACCAATGCTGCTTCTCTAGCTAACCACAAGCTTCTCGGAAG
TCGAAGAGGCTGTCTGAGAGTTAAAGCGATCTCCACTAAATGGGAACCCTCAAAGGTTGT
TCCTCAAGCCGACAGGGTTCTTGTTCGTCTTGAAGAGCTTGCTCAGACAACCTCGGGTGG
AGTGTTGTTGCCCAAAGCAGCTGTTAAGTTTGAGAGGTATCTAACCGGAGAGGTTGTCTC
TGTTGGTTCTGAGGTCGGACAACAAGTTGGGCCTGGAAAGAAGGTTCTGTTTTCTGACGT
GAGTGCATATGAGGTGGATTTGGGTACCGGTGCTAGGCATTGCTTTTGTAAAGAGAGCGA
CTTGTTGGCCCTCGTGGAGTGAGAGATATTGTCTAATGTTTCTTCAAGATTTTTAGTTGT
TTCCTGTAATTCTCAGACGGCACATCTTGTTTTGTGACAGTTTTCTTCAATTTAATATCA
TTTTGAAGAC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2DN13TF 610 0 0
GGACGCTCC
AAGCCAAAATCGCGCGACTAGAAGAAGAGCTGCTGCTTGTGCTAAGAAAAGGAAAAAAAA
*CCTTATCTCGCAATGGCTTCTTCCACTTTCGTCTCTCTACCAAAACCCTTCTTCGCTTT
TCCGGCTAAAACCAATGCTGCTTCTCTAGCTAACCACAAGCTTCTCGGAAGTCGAAGAGG
CTGTCTGAGAGTTAAAGCGATCTCCACTAAATGGGAACCCTCAAAGGTTGTTCCTCAAGC
CGACAGGGTTCTTGTTCGTCTTGAAGAGCTTGCTCAGACAACCTCGGGTGGAGTGTTGTT
GCCCAAAGCAGCTGTTAAGTTTGAGAGGTATCTAACCGGAGAGGTTGTCTCTGTTGGTTC
TGAGGTCGGACAACAAGTTGGGCCTGGAAAGAAGGTTCTGTTCTCTGACGTGAGTGCATA
TGAGGTGGATTTGGGTACCGGTGCTAGGCATTGCTTTTGTAAAGAGAGCGACTTGTTGGC
CCTCGTGGAGTGAGAGATATTGTCTAATGTTTCTTCAAGATTTTTAGTTGTTTCCTGTAA
TTCTCAGACGGCACATCTTGTTTTGTGACAGTTTTCTTCAATTTAATATCATTTTGAAGA
C

QA 10 610 10 610
DS 

RD RR2C294TF 605 0 0
GG
AAGCCAAAATCGCGCGACTAGAAGAAGAGCTGCTGCTTGTGCTAAGAAAAGGAAAAAAAA
GCCTTATCTCGCAATGGCTTCTTCCACTTTCGTCTCTCTACCAAAACCCTTCTTCGCTTT
TCCGGCTAAAACCAATGCTGCTTCTCTAGCTAACCACAAGCTTCTCGGAAGTCGAAGAGG
CTGTCTGAGAGTTAAAGCGATCTCCACTAAATGGGAACCCTCAAAGGTTGTTCCTCAAGC
CGACAGGGTTCTTGTTCGTCTTGAAGAGCTTGCTCAGACAACCTCGGGTGGAGTGTTGTT
GCCCAAAGCAGCTGTTAAGTTTGAGAGGTATCTAACCGGAGAGGTTGTCTCTGTTGGTTC
TGAGGTCGGACAACAAGTTGGGCCTGGAAAGAAGGTTCTGTTCTCTGACGTGAGTGCATA
TGAGGTGGATTTGGGTACCGGTGCTAGGCATTGCTTTTGTAAAGAGAGCGACTTGTTGGC
CCTCGTGGAGTGAGAGATATTGTCTAATGTTTCTTCAAGATTTTTAGTTGTTTCCTGTAA
TTCTCAGACGGCACATCTTGTTTTGTGACAGTTTTCTTCAATTTAATATCATTTTGAAGA
CAA

QA 3 605 3 605
DS 



AS 1 3

CO CL3725Contig1 464 3 3 U
GGGAACTATCAAATAATAAATCTAAAATAAAATAAAAATAAATGTGTGTATAAAAAAATA
TCACAAAAAATAATATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTTAATTGTTT
TATTTCCTCTTCATGAGTTTGTCGATGGCCAAATTATTGAACGTCCATTCATGCCACCTG
AAAAAACTTGCACGGAAATCCAATGCCCCTCAGCCAGAGACAAAAACCGTAAGTGCTTTT
GTTGTGGAGTTAACGAGCAGAGAACATGTTACGAGGACCCAAGAATGTGTGCGGATGACT
GTGGTAGACGATAATAAGTTATCTCAAGAACCTACATCAAAGATATAAAAAGCCTTAATA
ATCGTTTTTACTTTCTAATATTTTTTTTTGTTTTATATGAATAACACATGTTTATTTGAA
GTCCAGCATATATAATATATGCCTATTGACTAATTTTTTTCGTT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ50JQ C 1
AF RR2AZ50TFB U 1
AF RR2DA79TF U 2
BS 1 1 RR2AZ50JQ
BS 2 416 RR2AZ50TFB
BS 417 464 RR2DA79TF

RD RR2AZ50JQ 417 0 0
GGGAACTATCAAATAATAAATCTAAAATAAAATAAAAATAAATGTGTGTATAAAAAAATA
TCACAAAAAATAATATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTTAATTGTTT
TATTTCCTCTTCATGAGTTTGTCGATGGCCAAATTATTGAACGTCCATTCATGCCACCTG
AAAAAACTTGCACGGAAATCCAATGCCCCTCAGCCAGAGACAAAAACCGTAAGTGCTTTT
GTTGTGGAGTTAACGAGCAGAGAACATGTTACGAGGACCCAAGAATGTGTGCGGATGACT
GTGGTAGACGATAATAAGTTATCTCAAGAACCTACATCAAAGATATAAAAAGCCTTAATA
ATCGTTTTTACTTTCTAATATTTTTTTTTGTTTTATATGAATAACACATGTTTATT
G

QA 1 416 1 416
DS 

RD RR2AZ50TFB 418 0 0
G
GGAACTATCAAATAATAAATCTAAAATAAAATAAAAATAAATGTGTGTATAAAAAAATAT
CACAAAAAATAATATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTTAATTGTTTT
ATTTCCTCTTCATGAGTTTGTCGATGGCCAAATTATTGAACGTCCATTCATGCCACCTGA
AAAAACTTGCACGGAAATCCAATGCCCCTCAGCCAGAGACAAAAACCGTAAGTGCTTTTG
TTGTGGAGTTAACGAGCAGAGAACATGTTACGAGGACCCAAGAATGTGTGCGGATGACTG
TGGTAGACGATAATAAGTTATCTCAAGAACCTACATCAAAGATATAAAAAGCCTTAATAA
TCGTTTTTACTTTCTAATATTTTTTTTTGTTTTATATGAATAACACATGTTTATT
TG

QA 2 416 2 416
DS 

RD RR2DA79TF 463 0 0
GGAACTATCAAATAATAAATCTAAAATAAAATAAAAATAAATGTGTGTATAAAAAAATAT
CACAAAAAATAATATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTTAATTGTTTT
ATTTCCTCTTCATGAGTTTGTCGATGGCCAAATTATTGAACGTCCATTCATGCCACCTGA
AAAAACTTGCACGGAAATCCAATGCCCCTCAGCCAGAGACAAAAACCGTAAGTGCTTTTG
TTGTGGAGTTAACGAGCAGAGAACATGTTACGAGGACCCAAGAATGTGTGCGGATGACTG
TGGTAGACGATAATAAGTTATCTCAAGAACCTACATCAAAGATATAAAAAGCCTTAATAA
TCGTTTTTACTTTCTAATATTTTTTTTTGTTTTATATGAATAACACATGTTTATTTGAAG
TCCAGCATATATAATATATGCCTATTGACTAATTTTTTTCGTT

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 3

CO CL3726Contig1 749 3 10 U
GGGCGAAGTAAGTTAAGAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGTAGTAATGGCTTCCTCTATGC
TTTCCTCCGCTGCTGTTGTTACCTCACCCGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACCG
GCTTGAAGTCATCCGCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACATTACTTCCA
TTGCAAGCAACGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGA
AGTTTGAGACCCTCTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCG
ACTACCTTCTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTG
TGTACCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATACTATGATGGACGGTACTGGACAATGTGGA
AACTTCCCTTGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCA
AAAAAGAGTACCCTAACGCCTTCATCAGGATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAGGTTC
AGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAACCACCAAGTTTCACCGATGCTTAATTTGCTATGT
CATTCACATAATAATAATCCCTGCTCATTTCATTTCCAATTCTGTTTTCGTTCCCCTTTG
GATTTCTGTTTCTCAGACATTCTATATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTGAACATGTAA
TTTCTATATTGCTTCTTCGTCTTGGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CO29TF U 1
AF RR2AA61JQ C 8
AF RR2AA61TF U 8
BS 1 208 RR2CO29TF
BS 209 209 RR2AA61TF
BS 210 256 RR2CO29TF
BS 257 257 RR2AA61TF
BS 258 361 RR2CO29TF
BS 362 362 RR2AA61TF
BS 363 637 RR2CO29TF
BS 638 638 RR2AA61TF
BS 639 649 RR2CO29TF
BS 650 749 RR2AA61TF

RD RR2CO29TF 649 0 0
GGGCGAAGTAAGTTAAGAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGTAGTAATGGCTTCCTCTATGC
TTTCCTCCGCTGCTGTTGTTACCTCACCCGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACCG
GCTTGAAGTCATCCGCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACATTACTTCCA
TTGCAAGCAACGGAGGAAGAGTTAGCTGTATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGA
AGTTTGAGACCCTCTCCTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCG
ACTACCTTCTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTG
TATACCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATACTATGATGGACGGTACTGGACAATGTGGA
AACTTCCCTTGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCA
AAAAAGAGTACCCTAACGCCTTCATCAGGATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAGGTTC
AGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAACCACCAAGTTTCACCGATGCTTAATTTGCTATGT
CATTCACATAATAATAATCCCTGCTCATTTCATTTCCCATTCTGTTTTC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2AA61JQ 742 0 0
GG
AAGTTAAGAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGTAGTAATGGCTTCCTCTATGCTTTCCTCCG
CTGCTGTTGTTACCTCACCCGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGT
CATCCGCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACATTACTTCCATTGCAAGCA
ACGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGA
CCCTCTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTC
TCCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTG
AGCACGGAAGCACACCCGGATACTATGATGGACGGTACTGGACAATGTGGAAACTTCCCT
TGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCAAAAAAGAGT
ACCCTAACGCCTTCATCAGGATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAGGTTCAGTGCATCA
GTTTCATCGCCTACAAACCACCAAGTTTCACCGATGCTTAATTTGCTATGTCATTCACAT
AATAATAATCCCTGCTCATTTCATTTCCAATTCTGTTTTCGTTCCCCTTTGGATTTCTGT
TTCTCAGACATTCTATATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTGAACATGTAATTTCTATAT
TGCTTCTTCGTCTTGGTTAC

QA 3 742 3 742
DS 

RD RR2AA61TF 742 0 0
GG
AAGTTAAGAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGTAGTAATGGCTTCCTCTATGCTTTCCTCCG
CTGCTGTTGTTACCTCACCCGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGT
CATCCGCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACATTACTTCCATTGCAAGCA
ACGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGA
CCCTCTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTC
TCCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTG
AGCACGGAAGCACACCCGGATACTATGATGGACGGTACTGGACAATGTGGAAACTTCCCT
TGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCAAAAAAGAGT
ACCCTAACGCCTTCATCAGGATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAGGTTCAGTGCATCA
GTTTCATCGCCTACAAACCACCAAGTTTCACCGATGCTTAATTTGCTATGTCATTCACAT
AATAATAATCCCTGCTCATTTCATTTCCAATTCTGTTTTCGTTCCCCTTTGGATTTCTGT
TTCTCAGACATTCTATATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTGAACATGTAATTTCTATAT
TGCTTCTTCGTCTTGGTTAC

QA 3 742 3 742
DS 



AS 1 3

CO CL3727Contig1 913 3 6 U
GGACAGCAAAGGCACCGCACAAGAGAGAAGAGAAGAAGAAAACTTTACCGTCGCCGATCT
CCCTCTGCGATGGGCCGTGTTTGTCACCGCCGCTACGTGAAGGAGAATCTTCTCCACCTC
TTTAGTTTGATCTAAGTTTTATTTGGTTTCGTCTTTTTAGGTGTAGTTTCGGTTTGGAGA
GTTGGGTTCAGTGATGAGTCTGGCACCATATGTCAGGTCGAGGACCTGTTGACGGTGCGG
TGTAGCTGCTTGGGGCAGTGAAGGTGCTTTCACTGACGTCGTCTTTGGACTTTCTTCAAC
TCTAGTTATTTTACTACTCATCGTTTCTGCAAAGAGTTTTGGTTCTCGGTTGAGTCGTTG
AGTCAACTTGGTTTTTCTGAGTGTGTTTTCAGGTGCCTATATCCCGAGCTTGGTTTCGCG
TCTCCTATTTTGTTTCTTCAGATGGTGCTTTCAAGATTATGGCTTTCTCTAATTGGCTCT
TGTTTGGTGCGAAATGGTATGTTTCTTTGAGGGTTTTCTGCAACTGTGGAGCGTCTCGAG
GATACTTGTGGTGCTATTGGCTTCTCTCTGGTGAAAAGGTCTGATTTGAGGTGTGTTGTA
TTTCGTCCTGCTGTGTGTTGGTGGGTGGACCTGTTTCTGTTATGTGGTTTGGTTGTCAAG
TTCTCATGTGTTGTTTGTCTGTCCTTATTGGAGGCTCATCCTCTTTTTGTTTGGCTGTCT
ACTTGTAAGCCTCCGGTGGTTCTAATGGTCATGGTTACTATCTCTTCCATCCTCTCTTTT
GTGCTCCCAGTACTGTGGGATTTAAGTTTCGAATATCCCCTATATATTAAAAGAGAAGCA
CTTTTAAAAGTTTCCTTAATAGTGTATTGGCAAGGTGTGACGTGGCTTCATGAGAATGTT
TTATTTATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C019TF U 1
AF RR2F861TF U 17
AF RR2C019JQ C 116
BS 1 67 RR2C019TF
BS 68 68 RR2F861TF
BS 69 707 RR2C019TF
BS 708 708 RR2F861TF
BS 709 763 RR2C019TF
BS 764 913 RR2C019JQ

RD RR2C019TF 763 0 0
GGACAGCAAAGGCACCGCACAAGAGAGAAGAGAAGAAGAAAACTTTACCGTCGCCGATCT
CCCTCTGTGATGGGCCGTGTTTGTCACCGCCGCTACGTGAAGGAGAATCTTCTCCACCTC
TTTAGTTTGATCTAAGTTTTATTTGGTTTCGTCTTTTTAGGTGTAGTTTCGGTTTGGAGA
GTTGGGTTCAGTGATGAGTCTGGCACCATATGTCAGGTCGAGGACCTGTTGACGGTGCGG
TGTAGCTGCTTGGGGCAGTGAAGGTGCTTTCACTGACGTCGTCTTTGGACTTTCTTCAAC
TCTAGTTATTTTACTACTCATCGTTTCTGCAAAGAGTTTTGGTTCTCGGTTGAGTCGTTG
AGTCAACTTGGTTTTTCTGAGTGTGTTTTCAGGTGCCTATATCCCGAGCTTGGTTTCGCG
TCTCCTATTTTGTTTCTTCAGATGGTGCTTTCAAGATTATGGCTTTCTCTAATTGGCTCT
TGTTTGGTGCGAAATGGTATGTTTCTTTGAGGGTTTTCTGCAACTGTGGAGCGTCTCGAG
GATACTTGTGGTGCTATTGGCTTCTCTCTGGTGAAAAGGTCTGATTTGAGGTGTGTTGTA
TTTCGTCCTGCTGTGTGTTGGTGGGTGGACCTGTTTCTGTTATGTGGTTTGGTTGTCAAG
TTCTCATGTGTTGTTTGTCTGTCCTTATTGGAGGCTCATCCTCTTTT*GTTTGGCTGTCT
ACTTGTAAGCCTCCGGTGGTTCTAATGGTCATGGTTACTATCT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2F861TF 709 0 0
GG
ACAAGAGAGAAGAGAAGAAGAAAACTTTACCGTCGCCGATCTCCCTCTGCGATGGGCCGT
GTTTGTCACCGCCGCTACGTGAAGGAGAATCTTCTCCACCTCTTTAGTTTGATCTAAGTT
TTATTTGGTTTCGTCTTTTTAGGTGTAGTTTCGGTTTGGAGAGTTGGGTTCAGTGATGAG
TCTGGCACCATATGTCAGGTCGAGGACCTGTTGACGGTGCGGTGTAGCTGCTTGGGGCAG
TGAAGGTGCTTTCACTGACGTCGTCTTTGGACTTTCTTCAACTCTAGTTATTTTACTACT
CATCGTTTCTGCAAAGAGTTTTGGTTCTCGGTTGAGTCGTTGTGTCAACTTGGTTTTTCT
GAGTGTGTTTTCAGGTGCCTATATCCCGAGCTTGGTTTCGCGTCTCCTATTTTGTTTCTT
CAGATGGTGCTTTCAAGATTATGGCTTTCTCTAATTGGTTCTTGTTTGGTGTGGAATGGT
ATGTTTCTTTGAGGTTTTTCTGCAACGGTGGAGCGTCTCGAGGATACTTGTGGTGCTATT
GGCTTCTCTCTGGTGAAAAGGTCTGATTTGAGGTGTGTTGTATTTCGTCCTGCTGTGTGT
TGGTGGGTGGACCTGTTTCTGTTATGTGGTTTGGTTGTCAAGTTCTCATGTGTTGTTTGT
CTGTCCTTATTGGAG*CTCATCCTCTTTTTGTTTGGCTGTCTACTTG

QA 3 709 3 709
DS 

RD RR2C019JQ 798 0 0
ACCTCTTTAGTTTGATCTAAGTTTTATTTGGTTTCGTCTTTTTAGGTGTAGTTTCGGTTT
GGAGAGTTGGGTTCAGTGATGAGTCTGGCACCATATGTCAGGTCGAGGACCTGTTGACGG
TGCGGTGTAGCTGCTTGGGGCAGTGAAGGTGCTTTCACTGACGTCGTCTTTGGACTTTCT
TCAACTCTAGTTATTTTACTACTCATCGTTTCTGCAAAGAGTTTTGGTTCTCGGTTGAGT
CGTTGAGTCAACTTGGTTTTTCTGAGTGTGTTTTCAGGTGCCTATATCCCGAGCTTGGTT
TCGCGTCTCCTATTTTGTTTCTTCAGATGGTGCTTTCAAGATTATGGCTTTCTCTAATTG
GCTCTTGTTTGGTGCGAAATGGTATGTTTCTTTGAGGGTTTTCTGCAACTGTGGAGCGTC
TCGAGGATACTTGTGGTGCTATTGGCTTCTCTCTGGTGAAAAGGTCTGATTTGAGGTGTG
TTGTATTTCGTCCTGCTGTGTGTTGGTGGGTGGACCTGTTTCTGTTATGTGGTTTGGTTG
TCAAGTTCTCATGTGTTGTTTGTCTGTCCTTATTGGAGGCTCATCCTCTTTTTGTTTGGC
TGTCTACTTGTAAGCCTCCGGTGGTTCTAATGGTCATGGTTACTATCTCTTCCATCCTCT
CTTTTGTGCTCCCAGTACTGTGGGATTTAAGTTTCGAATATCCCCTATATATTAAAAGAG
AAGCACTTTTAAAAGTTTCCTTAATAGTGTATTGGCAAGGTGTGACGTGGCTTCATGAGA
ATGTTTTATTTATAAAAA

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 3

CO CL3728Contig1 875 3 2 U
AGATGACCCCTTCCAGTTTTATTTATGTATAACATCAAACGGAGTTCAAATATATATCAA
GGATTTAGATCATTAATATTACATTTAAATTATATCCCCAAACCTCTAAGCAACGAGGCA
AAAACCATATACATGTCACTTACTAATTACAGTAATCCTAAAAATCACAAATCTCAAAGT
AATATTCCATATTTCTGATCCATCTTGACTAATCAATTGCCATTGAGTAAATGCATTGAT
GACCAAATATCATCCATGCCCCAATAGTTTTCACCGGTTTGATCATCAACAGTCATTGGA
ATTGAATAATCTGCCGTTGCAGTCGCAGTCCCAGTAGCAGCAGACGCAGAGTAGTTACTA
TAGTTGAAATCCATGTTGGTATGTTGATAGGACGTAGTTGAAGGAGAATATGTCTCCATC
GCTTGATCTTGTGTACAAAAAACATTATGGTTCGACGTACTTGCAGCTTGATCGTTGATT
TCTGAGCTGTGATGAGATCCAACGGAGGACGTTGTTGTTGCTGTCACATCGGTTTGTTTA
ATGTATTTTTGGATTCTTGTCCTCCAGAAATTCTTGATTTCGTTGTCGGTTCTTCCTGGA
AGGTGTTTAGCGATTTTCGACCACCTGTTTCCCTACTTAGCATGAAGTTCCATGATGGTG
AGCTGTTCCTCCGGCGTGATGTTTCCACGTCGTACGTCAGGGCGGAGATAGTTGAGCCAC
CGGAGCCGGCAACTTTTTCCGGTGCGTTTGAGACCTGCAGATTTGGCGAGAGTGTTCCAA
ACGCCATCGCCGTGGTTGGCAATATAATTGATAAGAATAAGATCTTCTTCCATCGTCCAC
GGTCCTTTTCGCACCTCTGCTTCTCCTGATGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FI86JQ U 40
AF RR2CU31JQ U 1
AF RR2CU31TF C 162
BS 1 738 RR2CU31JQ
BS 739 875 RR2CU31TF

RD RR2FI86JQ 665 0 0
CGGAGTTCAAATATATATCAAGGATTTAGATCATTAATATTACATTTAAATTATATCCCC
AAACCTCTAAGCAACGAGGCAAAAACCATATACATGTCACTTACTAATTACAGTAATCCT
AAAAATCACAAATCTCAAAGTAATATTCCATATTTCTGATCCATCTTGACTAATCAATTG
CCATTGAGTAAATGCATTGATGACCAAATATCATCCATGCCCCAATAGTTTTCACCGGTT
TGATCATCAACAGTCATTGGAATTGAATAATCTGCCGTTGCAGTCGCAGTCCCAGTAGCA
GCAGACGCAAAGTAGTTACTATAGTTGAAATCCATGTTGGTATGTTGATAGGACGTAGTT
GAAGGAGAATATGTCTCCATCGCTTGATCTTGTGTACAAAAAACATTATGGTTCGACGTA
CTTGCAGCTTGATCGTTGATTTCTGAGCTGTGATGAGATCCAACGGAGGACGTTGTTGTT
GCTGTCACATCGGTTTGTTTAATGTATTTTTGGATTCTTGTCCTCCAGAAATTCTTGATT
TCGTCGTCGGTTCTTCCTGGAAGGTGTTTAGCGATTTTCGACCACCTGTTTCCCCACTTA
GCATGAAGTTCCATGATGGTGAGCTGTTCCTCCGGCGTGATGTTTCCACGTCGTACGTCA
GGGCG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2CU31JQ 738 0 0
AGATGACCCCTTCCAGTTTTATTTATGTATAACATCAAACGGAGTTCAAATATATATCAA
GGATTTAGATCATTAATATTACATTTAAATTATATCCCCAAACCTCTAAGCAACGAGGCA
AAAACCATATACATGTCACTTACTAATTACAGTAATCCTAAAAATCACAAATCTCAAAGT
AATATTCCATATTTCTGATCCATCTTGACTAATCAATTGCCATTGAGTAAATGCATTGAT
GACCAAATATCATCCATGCCCCAATAGTTTTCACCGGTTTGATCATCAACAGTCATTGGA
ATTGAATAATCTGCCGTTGCAGTCGCAGTCCCAGTAGCAGCAGACGCAGAGTAGTTACTA
TAGTTGAAATCCATGTTGGTATGTTGATAGGACGTAGTTGAAGGAGAATATGTCTCCATC
GCTTGATCTTGTGTACAAAAAACATTATGGTTCGACGTACTTGCAGCTTGATCGTTGATT
TCTGAGCTGTGATGAGATCCAACGGAGGACGTTGTTGTTGCTGTCACATCGGTTTGTTTA
ATGTATTTTTGGATTCTTGTCCTCCAGAAATTCTTGATTTCGTTGTCGGTTCTTCCTGGA
AGGTGTTTAGCGATTTTCGACCACCTGTTTCCCTACTTAGCATGAAGTTCCATGATGGTG
AGCTGTTCCTCCGGCGTGATGTTTCCACGTCGTACGTCAGGGCGGAGATAGTTGAGCCAC
CGGAGCCGGCAACTTTTT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2CU31TF 714 0 0
AAATCACAAATCTCAAAGTAATATTCCATATTTCTGATCCATCTTGACTAATCAATTGCC
ATTGAGTAAATGCATTGATGACCAAATATCATCCATGCCCCAATAGTTTTCACCGGTTTG
ATCATCAACAGTCATTGGAATTGAATAATCTGCCGTTGCAGTCGCAGTCCCAGTAGCAGC
AGACGCAGAGTAGTTACTATAGTTGAAATCCATGTTGGTATGTTGATAGGACGTAGTTGA
AGGAGAATATGTCTCCATCGCTTGATCTTGTGTACAAAAAACATTATGGTTCGACGTACT
TGCAGCTTGATCGTTGATTTCTGAGCTGTGATGAGATCCAACGGAGGACGTTGTTGTTGC
TGTCACATCGGTTTGTTTAATGTATTTTTGGATTCTTGTCCTCCAGAAATTCTTGATTTC
GTTGTCGGTTCTTCCTGGAAGGTGTTTAGCGATTTTCGACCACCTGTTTCCCTACTTAGC
ATGAAGTTCCATGATGGTGAGCTGTTCCTCCGGCGTGATGTTTCCACGTCGTACGTCAGG
GCGGAGATAGTTGAGCCACCGGAGCCGGCAACTTTTTCCGGTGCGTTTGAGACCTGCAGA
TTTGGCGAGAGTGTTCCAAACGCCATCGCCGTGGTTGGCAATATAATTGATAAGAATAAG
ATCTTCTTCCATCGTCCACGGTCCTTTTCGCACCTCTGCTTCTCCTGATGATCC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 3

CO CL3729Contig1 855 3 10 U
GAACAAACCTTAAATCAAATAGAGGATACAAGACGTAGCCACACTTCACTGTTTTACTTG
AATGGAAGATAATAAATTGCACTTCATATATAAATGCAAACATGTCACTACTACATAGGG
ATAATAGTATAATACTTATACATAAACCCGGCAATTATAAAAGCCATCTATAAGACAATA
GTCACACATCTAGCTTACAACTGAATGTGGCCAACAGGCTGACGATAACAGTGATCGATC
ACCCATTACAAACATGGTAAACTTAGTACCTATAATCGTCATCAAAGGTCATGTAATCAT
TGCTTCCTCCTCCTCTCCTCCCTCTTTCATAACTATCCTTCCTGACGATCATTCGCTCAA
ATGCATCAGTGCCGTGTTTTTCCATGTATTTCTCAGCAGCAGTGAGGATGTCATCGTCGC
CACGTTTGGGGAAGAAATTCAATTTCTTTTGGGGAACGTACCAAATATTGGTGGAAGCTC
TTTGAGGATTCATGTAGAATGGCCTGATGAAATGTCTGTAGACATGTTCTGCTCCATTAA
ACTGTGGTAGCACAAGCCAGCATATCCCGATGAGCTTCAAGAACGGCCATATCGGAAACC
AATCAAGAAGTTTGGAGAAAATGAGTTCGAAGAGGGAGATGATTGCGTAGAGAACCCAGT
AGGTGAGCCATTGCTCGTCTTCTGCTAATGATTTTGTCTCTATCGTTTTCACTGACGCAT
ATAGAGGGTAGACGAGAGCAACCAATGGGAGAGCAAGGACATCGAAGTTCTTGATGAGAA
CTTGAAGAACATTATCATCTCCAGGATTAGAAGGCATTGTTACTACCCTCCAGTTTTAAG
TTTTAACACTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C274JQ U 1
AF RR2AC50JQ U 90
AF RR2AC50TF C 90
BS 1 274 RR2C274JQ
BS 275 275 RR2AC50JQ
BS 276 419 RR2C274JQ
BS 420 420 RR2AC50JQ
BS 421 451 RR2C274JQ
BS 452 452 RR2AC50JQ
BS 453 705 RR2C274JQ
BS 706 706 RR2AC50JQ
BS 707 803 RR2C274JQ
BS 804 855 RR2AC50JQ

RD RR2C274JQ 803 0 0
GAACAAACCTTAAATCAAATAGAGGATACAAGACGTAGCCACACTTCACTGTTTTACTTG
AATGGAAGATAATAAATTGCACTTCATATATAAATGCAAACATGTCACTACTACATAGGG
ATAATAGTATAATACTTATACATAAACCCGGCAATTATAAAAGCCATCTATAAGACAATA
GTCACACATCTAGCTTACAACTGAATGTGGCCAACAGGCTGACGATAACAGTGATCGATC
ACCCATTACAAACATGGTAAACTTAGTACCTATAGTCGTCATCAAAGGTCATGTAATCAT
TGCTTCCTCCTCCTCTCCTCCCTCTTTCATAACTATCCTTCCTGACGATCATTCGCTCAA
ATGCATCAGTGCCGTGTTTTTCCATGTATTTCTCAGCAGCAGTGAGGATGTCATCGTCGT
CACGTTTGGGGAAGAAATTCAATTTCTTTTGAGGAACGTACCAAATATTGGTGGAAGCTC
TTTGAGGATTCATGTAGAATGGCCTGATGAAATGTCTGTAGACATGTTCTGCTCCATTAA
ACTGTGGTAGCACAAGCCAGCATATCCCGATGAGCTTCAAGAACGGCCATATCGGAAACC
AATCAAGAAGTTTGGAGAAAATGAGTTCGAAGAGGGAGATGATTGCGTAGAGAACCCAGT
AGGTGAGCCATTGCTCGTCTTCTGCTAATGATTTTGTCTCTATCGCTTTCACTGACGCAT
ATAGAGGGTAGACGAGAGCAACCAATGGGAGAGCAAGGACATCGAAGTTCTTGATGAGAA
CTTGAAGAACATTATCATCTCCA

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2AC50JQ 766 0 0
ATAAATGCAAACATGTCACTACTACATAGGGATAATAGTATAATACTTATACATAAACCC
GGCAATTATAAAAGCCATCTATAAGACAATAGTCACACATCTAGCTTACAACTGAATGTG
GCCAACAGGCTGACGATAACAGTGATCGATCACCCATTACAAACATGGTAAACTTAGTAC
CTATAATCGTCATCAAAGGTCATGTAATCATTGCTTCCTCCTCCTCTCCTCCCTCTTTCA
TAACTATCCTTCCTGACGATCATTCGCTCAAATGCATCAGTGCCGTGTTTTTCCATGTAT
TTCTCAGCAGCAGTGAGGATGTCATCGTCGCCACGTTTGGGGAAGAAATTCAATTTCTTT
TGGGGAACGTACCAAATATTGGTGGAAGCTCTTTGAGGATTCATGTAGAATGGCCTGATG
AAATGTCTGTAGACATGTTCTGCTCCATTAAACTGTGGTAGCACAAGCCAGCATATCCCG
ATGAGCTTCAAGAACGGCCATATCGGAAACCAATCAAGAAGTTTGGAGAAAATGAGTTCG
AAGAGGGAGATGATTGCGTAGAGAACCCAGTAGGTGAGCCATTGCTCGTCTTCTGCTAAT
GATTTTGTCTCTATCGTTTTCACTGACGCATATAGAGGGTAGACGAGAGCAACCAATGGG
AGAGCAAGGACATCGAAGTTCTTGATGAGAACTTGAAGAACATTATCATCTCCAGGATTA
GAAGGCATTGTTACTACCCTCCAGTTTTAAGTTTTAACACTTCTCC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2AC50TF 766 0 0
ATAAATGCAAACATGTCACTACTACATAGGGATAATAGTATAATACTTATACATAAACCC
GGCAATTATAAAAGCCATCTATAAGACAATAGTCACACATCTAGCTTACAACTGAATGTG
GCCAACAGGCTGACGATAACAGTGATCGATCACCCATTACAAACATGGTAAACTTAGTAC
CTATAATCGTCATCAAAGGTCATGTAATCATTGCTTCCTCCTCCTCTCCTCCCTCTTTCA
TAACTATCCTTCCTGACGATCATTCGCTCAAATGCATCAGTGCCGTGTTTTTCCATGTAT
TTCTCAGCAGCAGTGAGGATGTCATCGTCGCCACGTTTGGGGAAGAAATTCAATTTCTTT
TGGGGAACGTACCAAATATTGGTGGAAGCTCTTTGAGGATTCATGTAGAATGGCCTGATG
AAATGTCTGTAGACATGTTCTGCTCCATTAAACTGTGGTAGCACAAGCCAGCATATCCCG
ATGAGCTTCAAGAACGGCCATATCGGAAACCAATCAAGAAGTTTGGAGAAAATGAGTTCG
AAGAGGGAGATGATTGCGTAGAGAACCCAGTAGGTGAGCCATTGCTCGTCTTCTGCTAAT
GATTTTGTCTCTATCGTTTTCACTGACGCATATAGAGGGTAGACGAGAGCAACCAATGGG
AGAGCAAGGACATCGAAGTTCTTGATGAGAACTTGAAGAACATTATCATCTCCAGGATTA
GAAGGCATTGTTACTACCCTCCAGTTTTAAGTTTTAACACTTCTCC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL3730Contig1 934 2 4 U
GGTTAACAAAAAGTTTGTGTTGCTATTAAGTTCAGAGATAAATATTCTTGAAAAAAGGTT
GCTGCCGTCATAAAGAACACCACCAGGTAAATTTTTATTAACTTCTGATCTTTTTCTTTT
TTTTTTTTTTTGCTAAAAAGGCTAATATCAGATTTTACAAAATGTTAAATCTAAAGTAAC
TCTACCAAGACAAGAAAACAGAGTAAAAACAAGATAGAGCAATATCGATTAAGAACCCCG
AAGTTTAGATTATCCAACCAGCAAGGAGAGATTTTAATTGTTTCCTCTTTCTCTTAGCCA
TGATTGTGTTCCTCACTTCTGATCCTCTTAAATATTGTTAACCCTAGTTAAATAAGAATC
TTAAGAAAAAAAAGTTGCTTTCGCTTGTTAACCTTTTTTCATATTACTAGAAAGATGTGT
TATTTATTAAACTTTTTATTTTATTTAATCTTGTTTTAGTGATTTTAAATTATACAAATC
AACTATTTTTGCAGTTGAGGATTAGATATGTTAGGAAGAATCGATATCTCTTTAAATCAC
GGGTCTTTTAACTATTTTTTTACCCAATTACAAAGTTCATAAATCACTAAATTTCGAGAA
ATAATTAGAAGAAAAATAGCAACATTCCATATATATTTATGAATTCAACTTTTTTGTTTT
TTAATCTCTTTTGTTGTCGTCGAAACCAGCCAGTCCAATACAGTGACAATCTGATCCTCA
ATTCGCATCGACGACCTTACAAAATTCGTTCGGTTCAGATTAATTAGGCACAACAAAATT
AAACCGGAAAACTCAGAAAGCGCCACGTGGCAGTTGTACCTTACCCAAAAGGGCCACACA
CACACACTCCATATAAGTCCTCTTCTCCAACCTTTTCAACTCCACCAACGTGTGATTGTT
CCTCCACTCACTTCAATTAATCAAAACCAAACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK86TF U 1
AF RR2AK86JQ C 128
BS 1 767 RR2AK86TF
BS 768 768 RR2AK86JQ
BS 769 786 RR2AK86TF
BS 787 934 RR2AK86JQ

RD RR2AK86TF 786 0 0
GGTTAACAAAAAGTTTGTGTTGCTATTAAGTTCAGAGATAAATATTCTTGAAAAAAGGTT
GCTGCCGTCATAAAGAACACCACCAGGTAAATTTTTATTAACTTCTGATCTTTTTCTTTT
TTTTTTTTTTTGCTAAAAAGGCTAATATCAGATTTTACAAAATGTTAAATCTAAAGTAAC
TCTACCAAGACAAGAAAACAGAGTAAAAACAAGATAGAGCAATATCGATTAAGAACCCCG
AAGTTTAGATTATCCAACCAGCAAGGAGAGATTTTAATTGTTTCCTCTTTCTCTTAGCCA
TGATTGTGTTCCTCACTTCTGATCCTCTTAAATATTGTTAACCCTAGTTAAATAAGAATC
TTAAGAAAAAAAAGTTGCTTTCGCTTGTTAACCTTTTTTCATATTACTAGAAAGATGTGT
TATTTATTAAACTTTTTATTTTATTTAATCTTGTTTTAGTGATTTTAAATTATACAAATC
AACTATTTTTGCAGTTGAGGATTAGATATGTTAGGAAGAATCGATATCTCTTTAAATCAC
GGGTCTTTTAACTATTTTTTTACCCAATTACAAAGTTCATAAATCACTAAATTTCGAGAA
ATAATTAGAAGAAAAATAGCAACATTCCATATATATTTATGAATTCAACTTTTTTGTTTT
TTAATCTCTTTTGTTGTCGTCGAAACCAGCCAGTCCAATACAGTGACAATCTGATCCTCA
ATTCGCATCGACGACCTTACAAAATTCGTTCGGTTCAGATTAATTAG*CACAACAAAATT
AAACCG

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2AK86JQ 807 0 0
TTTTGCTAAAAAGGCTAATATCAGATTTTACAAAATGTTAAATCTAAAGTAACTCTACCA
AGACAAGAAAACAGAGTAAAAACAAGATAGAGCAATATCGATTAAGAACCCCGAAGTTTA
GATTATCCAACCAGCAAGGAGAGATTTTAATTGTTTCCTCTTTCTCTTAGCCATGATTGT
GTTCCTCACTTCTGATCCTCTTAAATATTGTTAACCCTAGTTAAATAAGAATCTTAAGAA
AAAAAAGTTGCTTTCGCTTGTTAACCTTTTTTCATATTACTAGAAAGATGTGTTATTTAT
TAAACTTTTTATTTTATTTAATCTTGTTTTAGTGATTTTAAATTATACAAATCAACTATT
TTTGCAGTTGAGGATTAGATATGTTAGGAAGAATCGATATCTCTTTAAATCACGGGTCTT
TTAACTATTTTTTTACCCAATTACAAAGTTCATAAATCACTAAATTTCGAGAAATAATTA
GAAGAAAAATAGCAACATTCCATATATATTTATGAATTCAACTTTTTTGTTTTTTAATCT
CTTTTGTTGTCGTCGAAACCAGCCAGTCCAATACAGTGACAATCTGATCCTCAATTCGCA
TCGACGACCTTACAAAATTCGTTCGGTTCAGATTAATTAGGCACAACAAAATTAAACCGG
AAAACTCAGAAAGCGCCACGTGGCAGTTGTACCTTACCCAAAAGGGCCACACACACACAC
TCCATATAAGTCCTCTTCTCCAACCTTTTCAACTCCACCAACGTGTGATTGTTCCTCCAC
TCACTTCAATTAATCAAAACCAAACAT

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

CO CL3731Contig1 845 2 6 U
AGGGGACAGACCGGACAGTATCTTCAGACTTCAACTTCTTAGCTATGTCGGCCGATGATT
CTTCAAATGTTACAGATATCGACGGGAAGCTAGAGTTCAATTCAAACCTTAACTCTGACG
GTGACGATGCAGCCGATAATGATTCATCAAGGGCATTGACTATTCCTGCTCCCGCCGTTT
GTCTTGTTCGGTTTGCTGGAGATGCAGCTGGTGGTGCCGTCATGGGCTCTATCTTTGGAT
ATGGTTCAGGATTGTTCAAGAAGAAAGGCTTTAAAGGATCATTTGCAGATGCGGGGCAGT
CTGCAAAGACTTTTGCTGTTTTGTCTGGAGTACACAGTTTGGTTGTTTGCCTTCTGAAAC
AACTCAGAGGGAAAGATGACGCCATTAATGTTGGAGTTGCTGGGTGCTGCACCGGTCTTG
CTCTTAGTTTCCCTGGTGCTCCACAAGCTCTTCTACAGAGTTGCCTCACTTTTGGGGCTT
TCTCTTTTATCCTTGAGGGACTAAACAAAAGACAAACAGCTTTGGCTCACTCTGTCTCCT
TGAGAAACCAAACCGGAAACTTTGGAGATCATCACCGTTCTTCACCACTCTCCCTGGCTC
TCCCGATCCATGAAGAAATCAGAGGAGCCTTCTCTTCTTTCTGCAAGTCCTTAGCTAAAC
CCAAGAAGATCTAGTTTCCCTATGGTTCTCCTTTTCTAGCACCTTAGGTTCTCTCTGTAG
ATTGTTTGTTGATCATTCCCTGCTTTTGTTCTACTTTGTGAGAGAACGTTTTATGAATTG
AAAAGGTTAATTGATGTACTCTGTGTACCGTTTGCTCCATAAATACGATCTTTTTTTTTG
GTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2C243TF U 1
AF RR2C243JQ C 132
BS 1 707 RR2C243TF
BS 708 708 RR2C243JQ
BS 709 765 RR2C243TF
BS 766 766 RR2C243JQ
BS 767 775 RR2C243TF
BS 776 845 RR2C243JQ

RD RR2C243TF 775 0 0
AGGGGACAGACCGGACAGTATCTTCAGACTTCAACTTCTTAGCTATGTCGGCCGATGATT
CTTCAAATGTTACAGATATCGACGGGAAGCTAGAGTTCAATTCAAACCTTAACTCTGACG
GTGACGATGCAGCCGATAATGATTCATCAAGGGCATTGACTATTCCTGCTCCCGCCGTTT
GTCTTGTTCGGTTTGCTGGAGATGCAGCTGGTGGTGCCGTCATGGGCTCTATCTTTGGAT
ATGGTTCAGGATTGTTCAAGAAGAAAGGCTTTAAAGGATCATTTGCAGATGCGGGGCAGT
CTGCAAAGACTTTTGCTGTTTTGTCTGGAGTACACAGTTTGGTTGTTTGCCTTCTGAAAC
AACTCAGAGGGAAAGATGACGCCATTAATGTTGGAGTTGCTGGGTGCTGCACCGGTCTTG
CTCTTAGTTTCCCTGGTGCTCCACAAGCTCTTCTACAGAGTTGCCTCACTTTTGGGGCTT
TCTCTTTTATCCTTGAGGGACTAAACAAAAGACAAACAGCTTTGGCTCACTCTGTCTCCT
TGAGAAACCAAACCGGAAACTTTGGAGATCATCACCGTTCTTCACCACTCTCCCTGGCTC
TCCCGATCCATGAAGAAATCAGAGGAGCCTTCTCTTCTTTCTGCAAGTCCTTAGCTAAAC
CCAAGAAGATCTAGTTTCCCTATGGTTCTCCTTTTCTAGCACCTTAG*TTCTCTCTGTAG
ATTGTTTGTTGATCATTCCCTGCTTTTGTTCTACTTTGTGAGAGA*CGTTTTATG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2C243JQ 714 0 0
GCCGATAATGATTCATCAAGGGCATTGACTATTCCTGCTCCCGCCGTTTGTCTTGTTCGG
TTTGCTGGAGATGCAGCTGGTGGTGCCGTCATGGGCTCTATCTTTGGATATGGTTCAGGA
TTGTTCAAGAAGAAAGGCTTTAAAGGATCATTTGCAGATGCGGGGCAGTCTGCAAAGACT
TTTGCTGTTTTGTCTGGAGTACACAGTTTGGTTGTTTGCCTTCTGAAACAACTCAGAGGG
AAAGATGACGCCATTAATGTTGGAGTTGCTGGGTGCTGCACCGGTCTTGCTCTTAGTTTC
CCTGGTGCTCCACAAGCTCTTCTACAGAGTTGCCTCACTTTTGGGGCTTTCTCTTTTATC
CTTGAGGGACTAAACAAAAGACAAACAGCTTTGGCTCACTCTGTCTCCTTGAGAAACCAA
ACCGGAAACTTTGGAGATCATCACCGTTCTTCACCACTCTCCCTGGCTCTCCCGATCCAT
GAAGAAATCAGAGGAGCCTTCTCTTCTTTCTGCAAGTCCTTAGCTAAACCCAAGAAGATC
TAGTTTCCCTATGGTTCTCCTTTTCTAGCACCTTAGGTTCTCTCTGTAGATTGTTTGTTG
ATCATTCCCTGCTTTTGTTCTACTTTGTGAGAGAACGTTTTATGAATTGAAAAGGTTAAT
TGATGTACTCTGTGTACCGTTTGCTCCATAAATACGATCTTTTTTTTTGGTTCC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 3

CO CL3732Contig1 1162 3 10 U
GACCTTCCATTTTCTGCAACTTCTCCAAATCTCATACTTTCCAGAAAATCATTTTCCCAA
GAGAAATAAAACTTTCCTCTTTGTTCATCTCTCCCCCCCCAACAGCAAACATGGCGTACC
AGATGGAGCTAGGAGGAGATTCCTCTCCATAGAGGAAAGCTGGGAGAGGGAAGATCGAAA
TCAAACGGATCGAGAACACAACAAATCGTCAAGTTACTTTCTGCAAACGCAGAAATGGTT
TGCTCAAGAAAGCTTACGAACTCTCTGTTCTTTGTGATGCTGAAGTCGCACTCATCGTCT
TCTCTAGCCGTGGCCGTCTCTATGAGTACTCAAACAACAGTGTAAAAGGGACAATTGAGA
GGTACAAGAAAGCAATATCGGATAATACTAACACCGGATCCGTGGCAGAAATTAATGCAC
AGTATTATCAACAAGAATCTGCCAAATTGCGTCAACAAATTATCAGCATACAAAACTCGA
ACAGGCAATTGATGGGTGAGACTATTGGATCAATGTCTCCCAAAGAACTTAGGAACTTGG
AAGGCAGATTAGACAGAAGTGTTAATCGAATCCGATCCAAGAAGAATGAACTCTTATTCG
CCGAAATTGACTACATGCAGAAGAGATCTGTGCAGGAAGTTGATTTGCATAACGATAACC
AGCTTCTTCGTGCTAAGATAGCTGAAAATGAGAGGAACAATCCAAGTATGAGTCTGATGC
CAGGAGGATCTAACTACGAGCAGATTATGCCACCGCCTCAAACGCAGCCTCAACCGTTTG
ACTCACGGAACTATTTCCAAGTGGCGGCACTGCAACCTAACAATCACCATTACTCATCCG
CAGGTCGCGAAGACCAAACCGCTCTTCAGTTAGTATAATATTGGCTGAAACATGAAGGAG
CAAGGACTGAATAAAAACCAGGATTGGGTTTAAGGAATGAGCAATATAAAGCTGATGCAT
TGTTATATAAATATTTATATATTTATTTCACGAATGTTCTGTGGATGATTTCTACATTTT
ATTTAAATTGCTTATGTTGATGTGAAATTAATATCTTAAAAGACATGGCATTAATGTGCT
TAAGTTTGTTTTAAAGACAATTGCATGTGTATAACTGTGTATTATTAGCTCAATTGTCTT
ATAGAAGTTGTCAATTGTAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP49TF U 1
AF RR2CP49JQ C 335
AF RR2EA51TF U 433
BS 1 696 RR2CP49TF
BS 697 697 RR2EA51TF
BS 698 745 RR2CP49TF
BS 746 746 RR2EA51TF
BS 747 761 RR2CP49TF
BS 762 762 RR2EA51TF
BS 763 774 RR2CP49TF
BS 775 775 RR2EA51TF
BS 776 789 RR2CP49TF
BS 790 1162 RR2EA51TF

RD RR2CP49TF 794 0 0
GACCTTCCATTTTCTGCAACTTCTCCAAATCTCATACTTTCCAGAAAATCATTTTCCCAA
GAGAAATAAAACTTTCCTCTTTGTTCATCTCTCCCCCCCCAACAGCAAACATGGCGTACC
AGATGGAGCTAGGAGGAGATTCCTCTCCATAGAGGAAAGCTGGGAGAGGGAAGATCGAAA
TCAAACGGATCGAGAACACAACAAATCGTCAAGTTACTTTCTGCAAACGCAGAAATGGTT
TGCTCAAGAAAGCTTACGAACTCTCTGTTCTTTGTGATGCTGAAGTCGCACTCATCGTCT
TCTCTAGCCGTGGCCGTCTCTATGAGTACTCAAACAACAGTGTAAAAGGGACAATTGAGA
GGTACAAGAAAGCAATATCGGATAATACTAACACCGGATCCGTGGCAGAAATTAATGCAC
AGTATTATCAACAAGAATCTGCCAAATTGCGTCAACAAATTATCAGCATACAAAACTCGA
ACAGGCAATTGATGGGTGAGACTATTGGATCAATGTCTCCCAAAGAACTTAGGAACTTGG
AAGGCAGATTAGACAGAAGTGTTAATCGAATCCGATCCAAGAAGAATGAACTCTTATTCG
CCGAAATTGACTACATGCAGAAGAGATCTGTGCAGGAAGTTGATTTGCATAACGATAACC
AGCTTCTTCGTGCTAAGATAGCTGAAAATGAGAGGA*CAATCCAAGTATGAGTCTGATGC
CAGGAGGATCTAACTACGAGCAGAT*ATGCCACCGCCTCAA*CGCAGCCTCAAC*GTTTG
ACTCACGGA
CTATT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2CP49JQ 758 0 0
CAACAGTGTAAAAGGGACAATTGAGAGGTACAAGAAAGCAATATCGGATAATACTAACAC
CGGATCCGTGGCAGAAATTAATGCACAGTATTATCAACAAGAATCTGCCAAATTGCGTCA
ACAAATTATCAGCATACAAAACTCGAACAGGCAATTGATGGGTGAGACTATTGGATCAAT
GTCTCCCAAAGAACTTAGGAACTTGGAAGGCAGATTAGACAGAAGTGTTAATCGAATCCG
ATCCAAGAAGAATGAACTCTTATTCGCCGAAATTGACTACATGCAGAAGAGATCTGTGCA
GGAAGTTGATTTGCATAACGATAACCAGCTTCTTCGTGCTAAGATAGCTGAAAATGAGAG
GAACAATCCAAGTATGAGTCTGATGCCAGGAGGATCTAACTACGAGCAGATTATGCCACC
GCCTCAAACGCAGCCTCAACCGTTTGACTCACGGAACTATTTCCAAGTGGCGGCACTGCA
ACCTAACAATCACCATTACTCATCCGCAGGTCGCGAAGACCAAACCGCTCTTCAGTTAGT
ATAATATTGGCTGAAACATGAAGGAGCAAGGACTGAATAAAAACCAGGATTGGGTTTAAG
GAATGAGCAATATAAAGCTGATGCATTGTTATATAAATATTTATATATTTATTTCACGAA
TGTTCTGTGGATGATTTCTACATTTTATTTAAATTGCTTATGTTGATGTGAAATTAATAT
CTTAAAAGACATGGCATTAATGTGCTTAAGTTTGTTTT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2EA51TF 730 0 0
G
AGAATCTGCAAAATTGCGTCAACAAATTATCAGCATACAAAACTCGAACAGGCAATTGAT
GGGTGAGACTATTGGATCAATGTCTCCCAAAGAACTTAGGAACTTGGAAGGCAGATTAGA
CAGAAGTGTTAATCGAATCCGATCCAAGAAGAATGAACTCTTATTCGCCGAAATTGACTA
CATGCAGAAGAGATCTGTGCAGGAAGTTGATTTGCATAACGATAACCAGCTTCTTCGTGC
TAAGATAGCTGAAAATGAGAGGAACAATCCAAGTATGAGTCTGATGCCAGGAGGATCTAA
CTACGAGCAGATTATGCCACCGCCTCAAACGCAGCCTCAACCGTTTGACTCACGGAACTA
TTTCCAAGTGGCGGCACTGCAACCTAACAATCACCATTACTCATCCGCAGGTCGCGAAGA
CCAAACCGCTCTTCAGTTAGTATAATATTGGCTGAAACATGAAGGAGCAAGGACTGAATA
AAAACCAGGATTGGGTTTAAGGAATGAGCAATATAAAGCTGATGCATTGTTATATAAATA
TTTATATATTTATTTCACGAATGTTCTGTGGATGATTTCTACATTTTATTTAAATTGCTT
ATGTTGATGTGAAATTAATATCTTAAAAGACATGGCATTAATGTGCTTAAGTTTGTTTTA
AAGACAATTGCATGTGTATAACTGTGTATTATTAGCTCAATTGTCTTATAGAAGTTGTCA
ATTGTAACT

QA 2 730 2 730
DS 



AS 1 3

CO CL3733Contig1 805 3 5 U
GGACCACAGACTCATACAACTAAAGCAAACAAAACAACCCTTAATCAGCTGCATTCTTGC
AATGGTCCGCGCAGAGATCGACACTGGAGCTCCTTTCCGGTCTGTTAAAGAAGCCGTCAC
TCTCTTCGGCGAGAGAATACTTCTCGGAGATAATTACATCAACAAGTCTCTAGAGATAAA
CGGAATTAGAAACAAAACCATAGAAGCAGAGCTTGATGAAGTAAAGGAGAATCTTAGGAA
AGCAGAAGAAGAGAACAAGGTTTTGTCTCAACCTATCGAAACCCTCACACAAGAGCTTGA
AACGGCTAAGGAAAAGCTAAGGCACTCGGTCAGAAAATCCCCTGAACACCCTCAAGTTGA
AGATGACCTCAAATTTATAGAGCAATCCAGGGTTATTGAACAGGATAGAATAACCGAGAT
CAAGATGAACCGGTTTGACGAAAATGAGGTGTGTGATGAGGATCGTTTTGAGAGGAGACG
TTCGGTGAAGTTTGCGAATCCACCATTGTTAGCGAAAGTCATTGAGAGCAAAGAGGAGAA
GAAGAAGAACCAAGTTATGGTGAAAAAGCAGACAAAGAAGATGAAGCCATTGGCTGCTTG
GCTCTTCGCAAGAAAATTGGTCTAGTTAACCACTTTTAGCAATGCTTGTCTCGCGTTTAT
ATGCCTTACATATTCTGAAATAATAATCCCAAAACTGAAATAGTTCTTATTTTGGGGATT
CATGCAACTTAAATTTGTAACAGTTTTCTTGTCGATTTGTAAGCAACTACATAGACAAAC
TGGATCGTGTCAAATGTTTTAAGGG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A249TF U 1
AF RR2CM06TF U 4
AF RR2A249JQ C 499
BS 1 690 RR2A249TF
BS 691 719 RR2CM06TF
BS 720 720 RR2A249JQ
BS 721 752 RR2CM06TF
BS 753 805 RR2A249JQ

RD RR2A249TF 690 0 0
GGACCACAGACTCATACAACTAAAGCAAACAAAACAACCCTTAATCAGCTGCATTCTTGC
AATGGTCCGCGCAGAGATCGACACTGGAGCTCCTTTCCGGTCTGTTAAAGAAGCCGTCAC
TCTCTTCGGCGAGAGAATACTTCTCGGAGATAATTACATCAACAAGTCTCTAGAGATAAA
CGGAATTAGAAACAAAACCATAGAAGCAGAGCTTGATGAAGTAAAGGAGAATCTTAGGAA
AGCAGAAGAAGAGAACAAGGTTTTGTCTCAACCTATCGAAACCCTCACACAAGAGCTTGA
AACGGCTAAGGAAAAGCTAAGGCACTCGGTCAGAAAATCCCCTGAACACCCTCAAGTTGA
AGATGACCTCAAATTTATAGAGCAATCCAGGGTTATTGAACAGGATAGAATAACCGAGAT
CAAGATGAACCGGTTTGACGAAAATGAGGTGTGTGATGAGGATCGTTTTGAGAGGAGACG
TTCGGTGAAGTTTGCGAATCCACCATTGTTAGCGAAAGTCATTGAGAGCAAAGAGGAGAA
GAAGAAGAACCAAGTTATGGTGAAAAAGCAGACAAAGAAGATGAAGCCATTGGCTGCTTG
GCTCTTCGCAAGAAAATTGGTCTAGTTAACCACTTTTAGCAATGCTTGTCTCGCGTTTAT
ATGCCTTACATATTCTGAAATAATAATCCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2CM06TF 749 0 0
GG
ACAGACTCATACAACTAAAGCAAACAAAACAACCCTTAATCAGCTGCATTCTTGCAATGG
TTCGCGCAGAGATCGACACTGGAGCTCCTTTCCGGTCTGTTAAAGAAGCCGTCACTCTCT
TCGGCGAGAGAATTCTTCTCGGAGATAATTACATCAACAAGTCTCTAGAGATAAACGGAA
TTAGAAACAAAACCATAGAAGCAGAGCTTGATGAAGTAAAGGAGAATCTTAGGAAAGCAG
AAGAAGAGAACAAGGTTTTGTCTCAACTTATCGAAACCCTCACACAAGAGCTTGAAACGG
CTAAGGAAAAGCTAAGGCACTCGGTCAGAAAATCCCCTGAACACCCTCAAGTTGAGGATG
ACCTCAAATTTATAGAGCAATCCAGGGTTATTGAACAGGATAGAATAACCGAGATCAAGA
TGAACCGGTTTGACGAAAATGAGGTGTGTGATGAGGATCGTTTTGAGAGGAGACGTTCGG
TGAAGTTTGCGAATCCACCATTGTTAACGAAGGTCATTGAGAGCAAAGAGGAGAAGAAGA
AGAACCAAGTTATGGTGAAAAAGCAGACAAAGAAGATGAAGCCATTGGCTGCTTGGCTCT
TCGCAAGAAAATTGGTCTAGCTAACCACTTTTAGCAATGCTTGTCTCGCGTTTATATGCC
TTACATATTCTGAAATAATAATCCCAAAACTGAAATAGTTCTTATTTTGGGGAT*CATGC
AACTTAAATTTGTAACAGTTTTCTTGT

QA 3 749 3 749
DS 

RD RR2A249JQ 307 0 0
TCCACCATTGTTAGCGAAAGTCATTGAGAGCAAAGAGGAGAAGAAGAAGAACCAAGTTAT
GGTGAAAAAGCAGACAAAGAAGATGAAGCCATTGGCTGCTTGGCTCTTCGCAAGAAAATT
GGTCTAGTTAACCACTTTTAGCAATGCTTGTCTCGCGTTTATATGCCTTACATATTTTGA
AATAATAATCCCAAAACTGAAATAGTTTTTATTTTGGGGATTCATGCAACTTAAATTTGT
AACAGTTTTCTTGTCGATTTGTAAGCAACTACATAGACAAACTGGATCGTGTCAAATGTT
TTAAGGG

QA 1 307 1 307
DS 



AS 1 2

CO CL3734Contig1 822 2 22 U
GGGCTCTACTCACTTCCACCATGTCTGCAGCACTGAGCTCGTCTCTCTACATCTCCCCAA
AGAAACCTTCACCATGTCCACCACAGCAATCTCTATCCACGAAACCCACAACCATCAAAA
CCACTCTCCACAGCCACCCACTCTTCTCCGTAGCCGACCAAGGCGTAACCCTCCAGATGA
AAGAGAAGATCCTATGCCTCGAGCTCATGGGAATCGACTCCGGCAAAGCCCTCTCTCTCA
ACCCTATCCTCCGCTCGGCCTCTCTCGACTCCGTCGAGTCCGTCCTCAACTTCCTCCAGT
CAAAAGGAATCTACCCGAACGACCTCCCGAGGATCTTGGGGATGTGTCCTAAGATCCTCA
CCTCCGACATCAGAACAGAACTCAACCCCGTTTTCGTGTTCCTGTCGAGCGATCTCCGAG
TCCCCGACAATGCGTTCAGAAGAGTGGTCAAGAAATGCCCGAGGCTGCTGATCAGCAGCG
TGGAAGACCAGCTCAAGCCTGCGCTGTTCTACTTGCAGAGACTTGGTTTCAAGGATCTCG
ATGCTCTTGCTTACCAGGATCCTGTCTTGTTGGTCTCTAGTGTTGAACACACTCTCATCC
CAAAGCTTAGGTTCTTGGAGAGTATAGGGTTTACGAGATCAGAGGCGATTGGAATGATAC
TTAGATGTCCAGCTCTGTTCACATTCAGCATAGAGAACAACTTTAAACCAAAGCTCGATT
ACTTCATGTGCGAGATCAAAGGTAGACTGGAGAGTCTGAAGGAGTTTCCGCAGTATTTTG
CGTTCAGTCTAGAGAAAAGGATAAAGCCGAGCACGTGGAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH95TF U 1
AF RR2AR56TF U 4
BS 1 245 RR2EH95TF
BS 246 246 RR2AR56TF
BS 247 388 RR2EH95TF
BS 389 389 RR2AR56TF
BS 390 418 RR2EH95TF
BS 419 419 RR2AR56TF
BS 420 475 RR2EH95TF
BS 476 476 RR2AR56TF
BS 477 478 RR2EH95TF
BS 479 479 RR2AR56TF
BS 480 538 RR2EH95TF
BS 539 539 RR2AR56TF
BS 540 542 RR2EH95TF
BS 543 543 RR2AR56TF
BS 544 574 RR2EH95TF
BS 575 575 RR2AR56TF
BS 576 658 RR2EH95TF
BS 659 659 RR2AR56TF
BS 660 715 RR2EH95TF
BS 716 716 RR2AR56TF
BS 717 738 RR2EH95TF
BS 739 822 RR2AR56TF

RD RR2EH95TF 738 0 0
GGGCTCTACTCACTTCCACCATGTCTGCAGCACTGAGCTCGTCTCTCTACATCTCCCCAA
AGAAACCTTCACCATGTCCACCACAGCAATCTCTATCCACGAAACCCACAACCATCAAAA
CCACTCTCCACAGCCACCCACTCTTCTCCGTAGCCGACCAAGGCGTAACCCTCCAGATGA
AAGAGAAGATCCTATGCCTCGAGCTCATGGGAATCGACTCCGGCAAAGCCCTCTCTCTCA
ACCCTTTCCTCCGCTCGGCCTCTCTCGACTCCGTCGAGTCCGTCCTCAACTTCCTCCAGT
CAAAAGGAATCTACCCGAACGACCTCCCGAGGATCTTGGGGATGTGTCCTAAGATCCTCA
CCTCCGACATCAGAACAGAACTCAACCCTGTTTTCGTGTTCCTGTCGAGCGATCTCCGCG
TCCCCGACAATGCGTTCAGAAGAGTGGTCAAGAAATGCCCGAGGCTGCTGATCAGTAGTG
TGGAAGACCAGCTCAAGCCTGCGCTGTTCTACTTGCAGAGACTTGGTTTCAAGGATCTTG
ATTCTCTTGCTTACCAGGATCCTGTCTTGTTGGTGTCTAGTGTTGAACACACTCTCATCC
CAAAGCTTAGGTTCTTGGAGAGTATAGGGTTTACGAGATCAGAGGCGATTGGAATGATCC
TTAGATGTCCAGCTCTGTTCACATTCAGCATAGAGAACAACTTTAAACCAAAGCTTGATT
ACTTCATGTGCGAGATCA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2AR56TF 819 0 0
GGGA
ACTCACTTCCACCATGTCTGCAGCACTGAGCTCGTCTCTCTACATCTCCCCAAAGAAACC
TTCATCATGTCCACCACAGCAATCTCTATCCACGAAACCCACAACCATCAAAACCACTCT
CCACAGCCACCCTCTCTTCTCCGTAGCCGACCAAGGCGTAACCCTCCAGATGAAAGAGAA
GATCCTATGCCT*GAGCTCATGGGAATCGACTCCGGCAAAGCCCTCTCTCTCAACCCTAT
CCTCCGCTCGGCCTCTCTCGACTCCGTCGAGTCCGTCCTCAACTTCCTCCAGTCAAAA**
AATCTACCCGAACGACCTCCCGAGGATCTTGGGGATGTGTCCTAAGATCCTCACTTCCGA
CGTCAGAACAGAACTCAATCCCGTTTTCGTGTTCCTGTCGAGCGATCTCCGAGTCCCCGA
CAATGCGTTCAGAAGAGTGGTCAAGAAATGCCCGAGGCTGCTGATCAGCAGCGTGGAAGA
CCAGCTCAAGCCTGCGCTGTTCTACTTGCAGAGACTTGGTTTCAAGGATCTCGATGCTCT
TGCTTACCAGGATCCTGTCTTGTTGGTCTCTAGTGTTGAACACACTCTCATCCCAAAGCT
TAGGTTCTTGGAGAGTATAGGGTTTACGAGATCAGAGGCGATTGGAATGATACTTAGATG
TCCAGCTCTGTTCACATTCAGCATAGAGAACAACTTTAAACCAAAGCTCGATTACTTCAT
GTGCGAGATCAAAGGTAGACTGGAGAGTCTGAAGGAGTTTCCGCAGTATTTTGCGTTCAG
TCTAGAGAAAAGGATAAAGCCGAGCACGTGGAGTC

QA 5 819 5 819
DS 



AS 1 3

CO CL3735Contig1 1040 3 26 U
GCAAAGCGAAAATAAATTTACTTTTGAATTATTACAAAAGAGTGCTTTGTACACATTCCT
TGCCTCTTTTACATGTCTTTGTAAGCTGCAAGTAACCTTGTTCCCAGGTTTGTTCCAAGC
TTCTCCTTTAAGTTCACACAGCCACTGTCTCTGGTCTCTTGCTAGTTTTGATTCCTTTTA
TAGCTTCAGCGTAGTATTTGGCTCCAAAGACAGCTGATCCAGCCACTAAAGCATTTGCTC
CAGCCTCAATAACCTTGTAAGCATTTTTGGGAGTGACTCCACCGTCCACTTCAATCCATG
GGTTTACTCCCAGCTCCACACACATTCTTCTCAAGTCTGCTATTTTCTTCACTTGGCTTT
CGATAAAGCTCTGCCCACCAAACCCAGGGTTCACAGACATTATCAAGATCAGATCAACAC
AGTCTAATACATATTCGATTGCAGTCAATGGAGTGCCAGGATTAAGCACAACTCCAGCTT
TAGCTCCCAAGCTTTTAATTTGATTGACTGTACGGTGTAAATGGATGGTAGAGGACTGCT
CACAATGTACACTAACTATATCTGCACCTGCTTTGATAAAATCAGGCACTCTCTGCTCAG
GTTCCACTATCATAAGATGAACATCCAACGGAAGATCTGTAACAGGGCGTAGAGCGTCAA
CCACTAGCGGTCCAATAGTAATGTTGGGAACAAAACGACCATCCATCACATCAACATGAA
TCCAATCACAACCTGCTAACTCCACAGCTTTTACCTGCTCGCCCAATTTGGAGAAGTTGG
CAGATAGAATCGATGGAGAAACAATGATATCGGTTTTCGAGAACTTATCAACCCGAGCTG
AGGCCTTAACAGCAACGTGAGTGCTGTTCCTTCTGGAGGAAGGAAAGGAAGTGGGCTGGT
AAAGAAGCGACCTTTGCGGTCTCAGGCCAACCCCAGTGACCAACGAAGCAGCTAAGCTCG
ACATGTCTAATCCAATAGCTTAATCTCTCACTATTGATTTGATTTGGGTTGTGAGAGAAA
GTCAAAACCTTCGATATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C110JQ U 1
AF RR2C201JQ U 14
AF RR2C201TF C 639
BS 1 76 RR2C110JQ
BS 77 77 RR2C201JQ
BS 78 104 RR2C110JQ
BS 105 106 RR2C201JQ
BS 107 125 RR2C110JQ
BS 126 126 RR2C201JQ
BS 127 195 RR2C110JQ
BS 196 196 RR2C201JQ
BS 197 247 RR2C110JQ
BS 248 248 RR2C201JQ
BS 249 286 RR2C110JQ
BS 287 287 RR2C201JQ
BS 288 502 RR2C110JQ
BS 503 503 RR2C201JQ
BS 504 540 RR2C110JQ
BS 541 541 RR2C201JQ
BS 542 628 RR2C110JQ
BS 629 629 RR2C201JQ
BS 630 649 RR2C110JQ
BS 650 650 RR2C201JQ
BS 651 670 RR2C110JQ
BS 671 672 RR2C201JQ
BS 673 742 RR2C110JQ
BS 743 743 RR2C201JQ
BS 744 751 RR2C110JQ
BS 752 1040 RR2C201TF

RD RR2C110JQ 751 0 0
GCAAAGCGAAAATAAATTTACTTTTGAATTATTACAAAAGAGTGCTTTGTACACATTCCT
TGCCTCTTTTACATGTTTTTGTAAGCTGCAAGTAACCTTGTTCCGGGGTTTGTTCCAAGC
TTCTCTTTTAAGTTCACACAGCCACTGTCTCTGGTCTCTTGCTAGTTTTGATTCCTTTTA
TAGCTTCAGCGTAGTCTTTGGCTCCAAAGACAGCTGATCCAGCCACTAAAGCATTTGCTC
CAGCCTCGATAACCTTGTAAGCATTTTTGGGAGTGACTCCACCGTCGACTTCAATCCATG
GGTTTACTCCCAGCTCCACACACATTCTTCTCAAGTCTGCTATTTTCTTCACTTGGCTTT
CGATAAAGCTCTGCCCACCAAACCCAGGGTTCACAGACATTATCAAGATCAGATCAACAC
AGTCTAATACATATTCGATTGCAGTCAATGGAGTGCCAGGATTAAGCACAACTCCAGCTT
TAGCTCCCAAGCTTTTAATTTGGTTGACTGTACGGTGTAAATGGATGGTAGAGGACTGCT
*ACAATGTACACTAACTATATCTGCACCTGCTTTGATAAAATCAGGCACTCTCTGCTCAG
GTTCCACTATCATAAGATGAACATCCAATGGAAGATCTGTAACAGGGCGCAGAGCGTCAA
CCACTAGCGGCTCAATAGTAATGTTGGGAACAAAACGACCATCCATCACATCAACATGAA
TCCAATCACAACCTGCTAACTCAACAGCTTT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2C201JQ 739 0 0
TTACTTTTCAAATTGTTTG
TACAAAAGAGTGCTTTGTACACATTCCTTGCCTCTTTTACATGTCTTTGTAAGCTGCAAG
TAACCTTGTTCCCAGGTTTGTTCCAAGCTTCTCCTTTAAGTTCACACAGCCACTGTCTCT
GGTCTCTTGCTAGTTTTGATTCCTTTTATAGCTTCGGCGTAGTATTTGGCTCCAAAGACA
GCTGATCCAGCCACTAAAGCATTTGCTCCAGCCTCAATAACCTTGTAAGCATTTTTGGGA
GTGACTCCACCGTCCACTTCAATCCATGGGTTTACTCCCAGCTCCACACACATTCTTCTC
AAGTCTGCTATTTTCTTCACTTGGCTTTTGATAAAGCTCTGCCCACCAAACCCAGGGTTC
ACAGACATTATCAAGATCAGATCAACACAGTCTAATACATATTCGATTGCAGTCAATGGA
GTGCCAGGATTAAGCACAACTCCAGCTTTAGCTCCCAAGCTTTTAATTTGATTGACTGTA
CGGTGTAAATGGATGGTAGAGGACTGCTCACAATGTACACTAACTATATCTGCACCTGCT
TTGATGAAATCAGGCACTCTCTGCTCAGGTTCCACTATCATGAGATGAACATCCAACGGA
AGATCTGTAACAGGGCGTAGAGCGTCAACCACTAGCGGTCCAATAGTAATGTTGGGAACA
AAACGACCATCCATCACATCAACATGAATCCAATCACAACCTGCTAACTCCACAGCTTT
T

QA 20 738 20 738
DS 

RD RR2C201TF 402 0 0
GTAACAGGGCGTAGAGCGTCAACCACTAGCGGTCCAATAGTAATGTTGGGAACAAAACGA
CCATCCATCACATCAACATGAATCCAATCACAACCTGCTAACTCCACAGCTTTTACCTGC
TCGCCCAATTTGGAGAAGTTGGCAGATAGAATCGATGGAGAAACAATGATATCGGTTTTC
GAGAACTTATCAACCCGAGCTGAGGCCTTAACAGCAACGTGAGTGCTGTTCCTTCTGGAG
GAAGGAAAGGAAGTGGGCTGGTAAAGAAGCGACCTTTGCGGTCTCAGGCCAACCCCAGTG
ACCAACGAAGCAGCTAAGCTCGACATGTCTAATCCAATAGCTTAATCTCTCACTATTGAT
TTGATTTGGGTTGTGAGAGAAAGTCAAAACCTTCGATATCTC

QA 1 402 1 402
DS 



AS 1 3

CO CL3736Contig1 685 3 2 U
AATCTAAAGTAGAATGCTTATTTGGAAACTGAAGTTGATACTTGCTTAGTAAGTAAATAA
AAGCCTCATTGGACATAAAAGGGAAGGGGATACAGCACAATTGTTATTATACAGTGAACA
AAAATCCATTTTAAGACAAGATCGGGCAGCAGGGTCTGCAGTCTCCACAAGTAACTTATG
TTATATGTCTCTTCATAATCAGATCCAACAAGTTTGGTTTATATATGAGTCGAGAATCAA
GGCTGATCTAGAAGGGAAGGCCTGTAGAATGCATGACTCTGTGCAATCTCAATTCGGTCT
CTAGGATCATTCAATGTTTCATCCCTTAACGCTTGCAGAATCGCTTGTGTTGATTGTTCT
CTTGTGATGAGTATCTTGTAGAGTGTCTTCAAAATAGGACATGACTCAACCGGAGCTACA
GGTTTCTTCTCTTCAGGATGCAATATGCTCAGGCTAGACTGACTAAGCAATTGATAAAAC
GCTCCCACTGCAGAGACACCCTGAATCATTCCCTTTCCACTTATACTATCACCCATGTCT
CTATTTATTTCCCCTTTAGCAAGCATCTGACCATACCACGCATTACGCCCTTTCAACAAG
GTCACATAAGTGTCAGGATTGGGTAATTAGCGCACCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAG
CCGTTTCTCAGGCTCCCTCTCCGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H563JQB U 82
AF RR2DM81JQ U 1
AF RR2DM81TF C 1
BS 1 650 RR2DM81JQ
BS 651 685 RR2DM81TF

RD RR2H563JQB 409 0 0
GGAAGGGGATACAGCACAATTGTTATTATACAGTGAACAAAAATCCATTTTAAGACAAGA
TCGGGCAGCAGGGTCTGCAGTCTCCACAAGTAACTTATGTTATATGTCTCTTCATAATCA
GATCCAACAAGTTTGGTTTATATATGAGTTGAGAATCAAGGCTGATCTAGAAGGGAAGGC
CTGTAGAATGCATGACTCTGTGCAATCTCAATTCGGTCTCTAGGATCATTCAATGTTTCA
TCCCTTAACGCTTGCAGAATCGCTTGTGTTGATTGTTCTCTTGTGATGAGTATCTTGTAG
AGTGTCTTCAAAATAGGACATGACTCAACCAGAGCTACAGGTTTCTTCTCTTCAGGATGC
AATATGCTCAGGCTAGACTGACTAAGCAATTGATAAAACGCTCCCACTG

QA 1 409 1 409
DS 

RD RR2DM81JQ 650 0 0
AATCTAAAGTAGAATGCTTATTTGGAAACTGAAGTTGATACTTGCTTAGTAAGTAAATAA
AAGCCTCATTGGACATAAAAGGGAAGGGGATACAGCACAATTGTTATTATACAGTGAACA
AAAATCCATTTTAAGACAAGATCGGGCAGCAGGGTCTGCAGTCTCCACAAGTAACTTATG
TTATATGTCTCTTCATAATCAGATCCAACAAGTTTGGTTTATATATGAGTCGAGAATCAA
GGCTGATCTAGAAGGGAAGGCCTGTAGAATGCATGACTCTGTGCAATCTCAATTCGGTCT
CTAGGATCATTCAATGTTTCATCCCTTAACGCTTGCAGAATCGCTTGTGTTGATTGTTCT
CTTGTGATGAGTATCTTGTAGAGTGTCTTCAAAATAGGACATGACTCAACCGGAGCTACA
GGTTTCTTCTCTTCAGGATGCAATATGCTCAGGCTAGACTGACTAAGCAATTGATAAAAC
GCTCCCACTGCAGAGACACCCTGAATCATTCCCTTTCCACTTATACTATCACCCATGTCT
CTATTTATTTCCCCTTTAGCAAGCATCTGACCATACCACGCATTACGCCCTTTCAACAAG
GTCACATAAGTGTCAGGATTGGGTAATTAGCGCACCTGCTGCCTTCCTTG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2DM81TF 685 0 0
AATCTAAAGTAGAATGCTTATTTGGAAACTGAAGTTGATACTTGCTTAGTAAGTAAATAA
AAGCCTCATTGGACATAAAAGGGAAGGGGATACAGCACAATTGTTATTATACAGTGAACA
AAAATCCATTT*AAGACAAGATCGGGCAGCAGGGTCTGCAGTCTCCACAAGTAACTTATG
TTATATGTCTCTTCATAATCAGATCCAACAAGTTTGGTTTATATATGAGTCGAGAATCAA
GGCTGATCTAGAAGGGAAGGCCTGTAGAATGCATGACTCTGTGCAATCTCAATTCGGTCT
CTAGGATCATTCAATGTTTCATCCCTTAACGCTTGCAGAATCGCTTGTGTTGATTGTTCT
CTTGTGATGAGTATCTTGTAGAGTGTCTTCAAAATAGGACATGACTCAACCGGAGCTACA
GGTTTCTTCTCTTCAGGATGCAATATGCTCAGGCTAGACTGACTAAGCAATTGATAAAAC
GCTCCCACTGCAGAGACACCCTGAATCATTCCCTTTCCACTTATACTATCACCCATGTCT
CTATTTATTTCCCCTTTAGCAAGCATCTGACCATACCACGCATTACGCCCTTTCAACAAG
GTCACATAAGTGTCAGGATTGGGTAATTAGCGCACCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAG
CCGTTTCTCAGGCTCCCTCTCCGGC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 3

CO CL3737Contig1 1370 3 20 U
GTGTAATGGTTGGTTTTATTGTAAAAATTGTTACGACAGGAAGAACTCAAGGGAAAAACA
AAACTTCGAACAAAATGAAATAAAGTTACTAAAAAAAAAACAAATGAAAATAGTAACGGC
TAACTCCAAATCTGCTTCAGGAACATAAACAGAAAACGAAAAAAAAAACACAGGTCCTTG
AGAAAAGTCTCTGCCTCACTCAAAGATGATTTGAGATCCCCATCTGAAAAAGCTTTTAAG
CCTCAAACCAATAAATAAAACACAGACCAGAGATAGGAACGGAACCACGATGGGGATACT
CTTTATCGGTTCTATTCGTTGGCTCTCTCCGAGGCTGAATCAACCTTCTGTTTTATCATC
GTCTCACCTTGTTGGATTGCTCTCTGTGACCCTGTGATACTCACTTTCCTATCAATGGTT
CCAAACATGAAATCACCTCGGTCTGATATTTTAATTCGGGCACCGGTCATCTGAGTGATT
TCCATGATGTTTCTTCCCCCACGGCCAAGGACCAATCCTATATGCTCATCCGCCACACCA
ATCGTCACCGTGGTGCTAGCTTCTTCCTTGTGGTTCTGATACCTGCCTCCAGAACCGTTA
GGAGCGTAGTTGGGTGCATAGTTAACCGCATTGTATCCCGCTGCATACGAATATGGGGAA
TGTACATTCTGGGAGTAATGATCGTCCTCGGTGAGCTTAGCCAAAATCAAATCAATCGCC
CGCATCTGCTCTTCGATGGTTCCAGATAATGTCACTAGCCTGTCACTCAACCCATAGTAG
GTATTATCCAGAGGGGATATCTTAATCCCAGCTTTAGATTCCTCAATGAATGACTTGATG
GTGGCTCCTCCTTTTCCAATAATGCCTCCACAAGAACTGTTAGGGACCACAAGCCTTAGT
CTTCTCCTAGGCTCAACATCACTTCCCTCTTCAGCATGAAGCTCACTGTGCAATTTATCA
AGGATAAGTTCCAGTCCACTGACAACTTCTTTAATGGAGCCAGAAATCATAATGATTCTA
TCATTCGTCGAGCCTCCTTTGCCTATGACGGAACCAGCCGCCGCATTGGATACAAGAAAC
CGTATGTGTGTTGGCTTCTCAGCATAGTCAGCTTCCGAATCATCGTGAGGTTCCGGGGAT
CTCTTGGTAAGCTCTTCAGGGGAAGCTGCTGCCGCATATGAGTCGGTGGAGGCCATTTTT
TCCGTTGTTCTCTCGCACAATTTCGAATCTCCTCCTTTTCGAGCTTGTGGATTTCTGAAT
CTGAGAGAAGAGTTTGAAGTCTCTCGATGTGCTCTCTCGTCTGGGATTCCTCCGCTTCGT
CGTCTTTGTCGCCGAGCGGTTTGTGAAGTGAAGGAGGAAGGTGGCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F809JQ U 46
AF RR2AA53JQ U 1
AF RR2AA53TF C 587
BS 1 92 RR2AA53JQ
BS 93 93 RR2F809JQ
BS 94 107 RR2AA53JQ
BS 108 108 RR2F809JQ
BS 109 161 RR2AA53JQ
BS 162 162 RR2F809JQ
BS 163 164 RR2AA53JQ
BS 165 165 RR2F809JQ
BS 166 183 RR2AA53JQ
BS 184 184 RR2F809JQ
BS 185 366 RR2AA53JQ
BS 367 367 RR2F809JQ
BS 368 414 RR2AA53JQ
BS 415 415 RR2F809JQ
BS 416 423 RR2AA53JQ
BS 424 424 RR2F809JQ
BS 425 542 RR2AA53JQ
BS 543 543 RR2F809JQ
BS 544 850 RR2AA53JQ
BS 851 1370 RR2AA53TF

RD RR2F809JQ 556 0 0
CTCAAGGGAAAAACAAAACTTCGAACAAAATGAAATAAAGTTACTAAAAAAAAAACAAAT
GAAAATAGTAACGGCTAACTCCAAATCTGCTTCAGGAACATAAACAGAAAACGAAAAAAA
AAACACAGGTCCTTGAGAAAAGTCTCTGCCTCACTCAAAGATGATTTGAGATCCCCATCT
GAAAAAGCTTTTAAGCCTCAAACCAATAAATAAAACACAGACCAGAGATAGGAACGGAAC
CACGATGGGGATACTCTTTATCGGTTCTATTCGTTGGCTCTCTCCGAGGCTGAATCAACC
TTCTGTTTTATCATCTTCTCACCTTGTTGGATTGCTCTCTGTGACCCTGTGATACTCACT
TTCCTATCAATGGTTCCAAACATGAAATCACCTCGGTCTGATATTTTAATTCGGGCACCG
GTCATCTGAGTGATTTCCATGATGTTTCTTCCCCCACGGCCAAGGACCAATCCTATATGC
TCATCCGCCACACCAATCGTCACCGTGGTGCTAGCTTCTTCCTTGTGGTTCTGATACCTG
CCTCCAGAACCGTTAG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2AA53JQ 850 0 0
GTGTAATGGTTGGTTTTATTGTAAAAATTGTTACGACAGGAAGAACTCAAGGGAAAAACA
AAACTTCGAACAAAATGAAATAAAGTTACTAAGAAAAAAACAAATGAGAATAGTAACGGC
TAACTCCAAATCTGCTTCAGGAACATAAACAGAAAACGAAAGAAGAAACACAGGTCCTTG
AGAGAAGTCTCTGCCTCACTCAAAGATGATTTGAGATCCCCATCTGAAAAAGCTTTTAAG
CCTCAAACCAATAAATAAAACACAGACCAGAGATAGGAACGGAACCACGATGGGGATACT
CTTTATCGGTTCTATTCGTTGGCTCTCTCCGAGGCTGAATCAACCTTCTGTTTTATCATC
GTCTCAGCTTGTTGGATTGCTCTCTGTGACCCTGTGATACTCACTTTCCTATCAGTGGTT
CCAGACATGAAATCACCTCGGTCTGATATTTTAATTCGGGCACCGGTCATCTGAGTGATT
TCCATGATGTTTCTTCCCCCACGGCCAAGGACCAATCCTATATGCTCATCCGCCACACCA
ATTGTCACCGTGGTGCTAGCTTCTTCCTTGTGGTTCTGATACCTGCCTCCAGAACCGTTA
GGAGCGTAGTTGGGTGCATAGTTAACCGCATTGTATCCCGCTGCATACGAATATGGGGAA
TGTACATTCTGGGAGTAATGATCGTCCTCGGTGAGCTTAGCCAAAATCAAATCAATCGCC
CGCATCTGCTCTTCGATGGTTCCAGATAATGTCACTAGCCTGTCACTCAACCCATAGTAG
GTATTATCCAGAGGGGATATCTTAATCCCAGCTTTAGATTCCTCAATGAATGACTTGATG
GTGGCTCCTC

QA 1 850 1 850
DS 

RD RR2AA53TF 784 0 0
CTCCAGAACCGTTAGGAGCGTAGTTGGGTGCATAGTTAACCGCATTGTATCCCGCTGCAT
ACGAATATGGGGAATGTACATTCTGGGAGTAATGATCGTCCTCGGTGAGCTTAGCCAAAA
TCAAATCAATCGCCCGCATCTGCTCTTCGATGGTTCCAGATAATGTCACTAGCCTGTCAC
TCAACCCATAGTAGGTATTATCCAGAGGGGATATCTTAATCCCAGCTTTAGATTCCTCAA
TGAATGACTTGATGGTGGCTCCTCCTTTTCCAATAATGCCTCCACAAGAACTGTTAGGGA
CCACAAGCCTTAGTCTTCTCCTAGGCTCAACATCACTTCCCTCTTCAGCATGAAGCTCAC
TGTGCAATTTATCAAGGATAAGTTCCAGTCCACTGACAACTTCTTTAATGGAGCCAGAAA
TCATAATGATTCTATCATTCGTCGAGCCTCCTTTGCCTATGACGGAACCAGCCGCCGCAT
TGGATACAAGAAACCGTATGTGTGTTGGCTTCTCAGCATAGTCAGCTTCCGAATCATCGT
GAGGTTCCGGGGATCTCTTGGTAAGCTCTTCAGGGGAAGCTGCTGCCGCATATGAGTCGG
TGGAGGCCATTTTTTCCGTTGTTCTCTCGCACAATTTCGAATCTCCTCCTTTTCGAGCTT
GTGGATTTCTGAATCTGAGAGAAGAGTTTGAAGTCTCTCGATGTGCTCTCTCGTCTGGGA
TTCCTCCGCTTCGTCGTCTTTGTCGCCGAGCGGTTTGTGAAGTGAAGGAGGAAGGTGGCT
CTCC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL3738Contig1 993 2 2 U
GGGTTGGTTGTCTCCTAGTAAAATGGCTCCTTTATTGTATAAAGGGATGAGATAGTGGAA
GCAAGCTCCAAGACTCTAGGATGACGTCTCTAGATTCTCCTCCACTGATGAAGAAGCTCC
TTAGTTTCTTTTTATCTACTCTTTTTCTCACCATCGTCAACTCGGAAACCAAATGCCGGA
ATTTCAAATCCATCATCAGCTTCGGCGATTCCATTGCCGACACTGGAAACTTGCTCGGTC
TCTCTAATCCTGACGATCTTCCTAAAGTAGCGTTTCTGCCGTATGGAGAAACATTCTTCC
ATCATCCCACGGGCCGTTTCTCAAACGGTCGACTCATCATCGATTTCATTGGTACAGTCT
CTCTACTTCTTAGCCTTTACTATGAAGTAATGTGAATGAGTGAGTATACATCTTCCGAAC
AGTTCGAGCTTTGTTTTCTATTGTAGTACAAAACAGAAAATACAGTACCTTTTTCTGATT
CTTGTCGGAATCTGTGAGGAAAAACAAAAAACAAGAATTACTAATAGTTATCCTCTGCTC
TTTTTTATTGCTTGTGTATCACTCCTACGTACAACATCTTCTGGATTGTCATGTCCCTTG
ATAGCAATAAACCTTGAAAATATCTAAATACAAAACCATTAATTGTTGTTAAGACTTCCT
ATTTGTGTGGGATTTAGGAAGTCTCGTTGATGTATATATACGGCAGAAGCCGATGTTAAT
AAAACACAAGTGTTCGATATCTTATTCTACACGTGGCATGTTGCCATTGCGTGGGGAGAG
TTGTGTTTTTTTTTTTTTTGAACAGAGCTGTGTTTCGTTTGATTTTTTGTTTCCTGTGAA
TCTTCTTCTCCATCGTTCGAATCGCCACCTCCTCGCCTCCGATCCGGTGAGTCTTCTTCT
CCATCATCCTGATTATATATGATTTTTGTTTCCTGTGTTTGATTTCCTGATTAAAAGAAT
CAAACTTTTAAAACAGAGCTTGACGATTTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK65TF U 1
AF RR2B940TF U 160
BS 1 239 RR2DK65TF
BS 240 993 RR2B940TF

RD RR2DK65TF 239 0 0
GGGTTGGTTGTCTCCTAGTAAAATGGCTCCTTTATTGTATAAAGGGATGAGATAGTGGAA
GCAAGCTCCAAGACTCTAGGATGACGTCTCTAGATTCTCCTCCACTGATGAAGAAGCTCC
TTAGTTTCTTTTTATCTACTCTTTTTCTCACCATCGTCAACTCGGAAACCAAATGCCGGA
ATTTCAAATCCATCATCAGCTTCGGCGATTCCATTGCCGACACTGGAAACTTGCTCGGT

QA 1 239 1 239
DS 

RD RR2B940TF 834 0 0
AGGG
GGAAACCAAATGCCGGAATTTCAAATCCATCATCAGCTTCGGCGATTCCATTGCCGACAC
TGGAAACTTGCTCGGTCTCTCTAATCCTGACGATCTTCCTAAAGTAGCGTTTCTGCCGTA
TGGAGAAACATTCTTCCATCATCCCACGGGCCGTTTCTCAAACGGTCGACTCATCATCGA
TTTCATTGGTACAGTCTCTCTACTTCTTAGCCTTTACTATGAAGTAATGTGAATGAGTGA
GTATACATCTTCCGAACAGTTCGAGCTTTGTTTTCTATTGTAGTACAAAACAGAAAATAC
AGTACCTTTTTCTGATTCTTGTCGGAATCTGTGAGGAAAAACAAAAAACAAGAATTACTA
ATAGTTATCCTCTGCTCTTTTTTATTGCTTGTGTATCACTCCTACGTACAACATCTTCTG
GATTGTCATGTCCCTTGATAGCAATAAACCTTGAAAATATCTAAATACAAAACCATTAAT
TGTTGTTAAGACTTCCTATTTGTGTGGGATTTAGGAAGTCTCGTTGATGTATATATACGG
CAGAAGCCGATGTTAATAAAACACAAGTGTTCGATATCTTATTCTACACGTGGCATGTTG
CCATTGCGTGGGGAGAGTTGTGTTTTTTTTTTTTTTGAACAGAGCTGTGTTTCGTTTGAT
TTTTTGTTTCCTGTGAATCTTCTTCTCCATCGTTCGAATCGCCACCTCCTCGCCTCCGAT
CCGGTGAGTCTTCTTCTCCATCATCCTGATTATATATGATTTTTGTTTCCTGTGTTTGAT
TTCCTGATTAAAAGAATCAAACTTTTAAAACAGAGCTTGACGATTTTGAT

QA 5 834 5 834
DS 



AS 1 3

CO CL3739Contig1 894 3 2 U
GTCATCGATCAAGATCATCATCATCAGATTCCCCAGAAAGGAGTAGGGAAGAAGAACAGG
AAGAATCAGAAGAACAACAACAACAACAACAAGGAAGATGAGAAGAACACCAACAACGAG
AAGAGGTTTAAGACTCTTCCTCCCGCGGAGGCACTTCCGAGGAACGAGACCATCGGTGGT
TACATCTTCGTGTGCAACAACGACACCATGGAGGAGAATCTGAAGCGCCAGCTTTTCGGT
TTGCCTCCGAGATACAGGGACTCGGTTGGAGCCATCACTCCCGGTCTTCCTCTCTTCCTC
TACAACTACTCCACTCACCAGCTCCACGGTGTTTACCAGGCCGCTAGCTTCGGTGGGACT
AACATTGAGCTCAACGCTTTCGAAGACAAGAAATGTCCTGGCGAATCTCGGTTCCCTGCT
CAGGTCAGGGCCATCACCAGGAAAGTTTGTTTGCCTTTGGAAGAAGATTCTTTCCGTCCT
ATTCTCCATCACTACGACGGCCCTAAGTTCCGCCTCGAACTCACCGTCCCTGAGGTTCTT
TCTCTTTTGGACATTTTTGATGAGCAAAACCCTTGAGTTCGTTTGGGTTGGGATTTAAAG
AAAACAACAACAACAATACGAAGACACAGACTAAAAGTTCCCTTTTACCATATCCATAAA
GAGAGAGATATTTACATATCATCATCCTACGTATATTATTAGTAATTGTCTCAAGAAAAT
GGTACTAGTTTATATACTTTTCGGGTTTATTTTCTTTAATATTTTTACAAGAGGGGATGT
TTTAAATTAGATATGAGATGGGGCTACATTTGCGTGGGTGAGATGAACAAAAAACAAATC
ATGTCTTTCACTTGTGTTTGTGTAAAGTAAATAAAGTTTCATGTGTTACACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C784TF U 1
AF RR2AW77JQ C 293
AF RR2AW77TFB U 423
BS 1 734 RR2C784TF
BS 735 894 RR2AW77TFB

RD RR2C784TF 734 0 0
GTCATCGATCAAGATCATCATCATCAGATTCCCCAGAAAGGAGTAGGGAAGAAGAACAGG
AAGAATCAGAAGAACAACAACAACAACAACAAGGAAGATGAGAAGAACACCAACAACGAG
AAGAGGTTTAAGACTCTTCCTCCCGCGGAGGCACTTCCGAGGAACGAGACCATCGGTGGT
TACATCTTCGTGTGCAACAACGACACCATGGAGGAGAATCTGAAGCGCCAGCTTTTCGGT
TTGCCTCCGAGATACAGGGACTCGGTTGGAGCCATCACTCCCGGTCTTCCTCTCTTCCTC
TACAACTACTCCACTCACCAGCTCCACGGTGTTTACCAGGCCGCTAGCTTCGGTGGGACT
AACATTGAGCTCAACGCTTTCGAAGACAAGAAATGTCCTGGCGAATCTCGGTTCCCTGCT
CAGGTCAGGGCCATCACCAGGAAAGTTTGTTTGCCTTTGGAAGAAGATTCTTTCCGTCCT
ATTCTCCATCACTACGACGGCCCTAAGTTCCGCCTCGAACTCACCGTCCCTGAGGTTCTT
TCTCTTTTGGACATTTTTGATGAGCAAAACCCTTGAGTTCGTTTGGGTTGGGATTTAAAG
AAAACAACAACAACAATACGAAGACACAGACTAAAAGTTCCCTTTTACCATATCCATAAA
GAGAGAGATATTTACATATCATCATCCTACGTATATTATTAGTAATTGTCTCAAGAAAAT
GGTACTAGTTTATA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2AW77JQ 602 0 0
G
CTTCCTCTACAACTACTCCACTCACCAGCTCCACGGTGTTTACCAGGCCGCTAGCTTCGG
TGGGACTAACATTGAGCTCAACGCTTTGGAAGACAAGAAATGTCCTGGCGAATCTCGGTT
CCCTGCTCAGGTCAGGGCCATCACCAGGAAAGTTTGTTTGCCTTTGGAAGAAGATTCTTT
CCGTCCTATTCTCCATCACTACGACGGCCCTAAGTTCCGCCTCGAACTCACCGTCCCTGA
GGTTCTTTCTCTTTTGGACATTTTTGATGAGCAAAACCCTTGAGTTCGTTTGGGTTGGGA
TTTAAAGAAAACAACAACAACAATACGAAGACACAGACTAAAAGTTCCCTTTTACCATAT
CCATAAAGAGAGAGATATTTACATATCATCATCCTACGTATATTATTAGTAATTGTCTCA
AGAAAATGGTACTAGTTTATATACTTTTCGGGTTTATTTTCTTTAATATTTTTACAAGAG
GGGATGTTTTAAATTAGATATGAGATGGGGCTACATTTGCGTGGGTGAGATGAACAAAAA
ACAAATCATGTCTTTCACTTGTGTTTGTGTAAAGTAAATAAAGTTTCATGTGTTACACCC
C

QA 2 602 2 602
DS 

RD RR2AW77TFB 472 0 0
GGTCAGGGCCATCACCAGGAAAGTTTGTTTGCCTTTGGAAGAAGATTCTTTCCGTCCTAT
TCTCCATCACTACGACGGCCCTAAGTTCCGCCTCGAACTCACCGTCCCTGAGGTTCTTTC
TCTTTTGGACATTTTTGATGAGCAAAACCCTTGAGTTCGTTTGGGTTGGGATTTAAAGAA
AACAACAACAACAATACGAAGACACAGACTAAAAGTTCCCTTTTACCATATCCATAAAGA
GAGAGATATTTACATATCATCATCCTACGTATATTATTAGTAATTGTCTCAAGAAAATGG
TACTAGTTTATATACTTTTCGGGTTTATTTTCTTTAATATTTTTACAAGAGGGGATGTTT
TAAATTAGATATGAGATGGGGCTACATTTGCGTGGGTGAGATGAACAAAAAACAAATCAT
GTCTTTCACTTGTGTTTGTGTAAAGTAAATAAAGTTTCATGTGTTACACCCC

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 3

CO CL3740Contig1 1104 3 2 U
ACTAAAACGTTTTATTTATTTTAGTCATTATCATAACATTTTAAATTATCTCAATAAGCT
TATTTCATTAAATGTCATTTTCCTCCGACATCATCTCCAGTGACCTGCATTCGCTGCTAC
AGAAGGCTCTATCTCCCCTGTACATGAAAATATCATCACGAAGTCCAAGATTCTTCTTAC
AGTTACAGCAGGTACTGAGAAAGCTGTCGGATGGTAAACAATCCGATTCGTTAACCGGGT
CGGAGCTCCTGAAGTAAACGACGCCGGGTTGGCTCTCAACGATACAGTTATCGAATATAT
GGATCGTTCTCGGGTTAGGCCCGTGACACGTAACGCACGTGTAGTCTTCCGATAATTCCA
TATCGCTGGTCGAGAAATAGCCGGTGAAGATACGGGGCGACCCAAGATCCGACCCGGAAG
CCGTTTTCTTCATCTCTTCCGGCGGAGGGGAGACCGGAGGATTCTTTGTTTTGATCCCAA
AATCCGACGAGGAGCGTGGAGGATCCAGGACCCGGATCCGGAGCTGAAACCCGAATAGAA
TTGTCCCGGATCTTGGTCGGGAGAACCCGGGTTCTTGGTTTTCTTCCTGGATGAGAGAAT
CGACAATAGCGAGTCCGATTCTTTTGGGTTCGAGCTTGAGCCGGGTCTCGGGTTCGTGGG
GTTTCGGGTTATCGGATCCAAAAGGGTTTTTCAAAACGGTGAAAGGTTTTGTGTCGAGGA
TGGAGGTGGGACTCGCGACGGCGTCGTTTTCAGTGAAGCTTTTAAAGCTGCTGAAAGCTG
TGAAGAGCCGTGGAAACGGCGTCGGTTTGCTCTGTTTCTGGTTGGTGTCCGCCATTAACA
AAGCCTGCTTGCTTCTTGATCTTTTCTTCAGCATAACTCACTGCTCAATCACGCAAAAGA
AAATCAAAACTTTAAGCTAAAAATCTCTTCGTTATTTGCAAAACTGAGACAGAACACGAG
AAAGAACCTAAGAAGCTAACCTCAACAATCAGAAAAGTTTCGGACTTGTGGGAACTTTCA
GAGGAAATAAAAGATATGGAGATCTGTTGCCTCCATGATTGAGAAAATAAAATAAAATTG
GAGAGAAAAAACAAAACAAATAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN33JQ U 101
AF RR2A053JQ U 1
AF RR2A053TF C 295
BS 1 800 RR2A053JQ
BS 801 1104 RR2A053TF

RD RR2BN33JQ 491 0 0
TGACCTGCATTCGCTGCTACAGAAGGCTCTATCTCCCCTGTACATGAAAATATCATCACG
AAGTCCAAGATTCTTCTTACAGTTACAGCAGGTACTGAGAAAGCTGTCGGATGGTAAACA
ATCCGATTCGTTAACCGGGTCGGAGCTCCTGAAGTAAACGACGCCGGGTTGGCTCTCAAC
GATACAGTTATCGAATATATGGATCGTTCTCGGGTTAGGCCCGTGACACGTAACGCACGT
GTAGTCTTCCGATAATTCCATATCGCTGGTCGAGAAATAGCCGGTGAAGATACGGGGCGA
CCCAAGATCCGACCCGGAAGCCGTTTTCTTCATCTCTTCCGGCGGAGGGGAGACCGGAGG
ATTCTTTGTTTTGATCCCAAAATCCGACGAGGAGCGTGGAGGATCCAGGACCCGGATCCG
GAGCTGAAACCCGAATAGAATTGTCCCGGATCTTGGTCGGGAGAACCCGGGTTCTTGGTT
TTCTTCCTGGA

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2A053JQ 800 0 0
ACTAAAACGTTTTATTTATTTTAGTCATTATCATAACATTTTAAATTATCTCAATAAGCT
TATTTCATTAAATGTCATTTTCCTCCGACATCATCTCCAGTGACCTGCATTCGCTGCTAC
AGAAGGCTCTATCTCCCCTGTACATGAAAATATCATCACGAAGTCCAAGATTCTTCTTAC
AGTTACAGCAGGTACTGAGAAAGCTGTCGGATGGTAAACAATCCGATTCGTTAACCGGGT
CGGAGCTCCTGAAGTAAACGACGCCGGGTTGGCTCTCAACGATACAGTTATCGAATATAT
GGATCGTTCTCGGGTTAGGCCCGTGACACGTAACGCACGTGTAGTCTTCCGATAATTCCA
TATCGCTGGTCGAGAAATAGCCGGTGAAGATACGGGGCGACCCAAGATCCGACCCGGAAG
CCGTTTTCTTCATCTCTTCCGGCGGAGGGGAGACCGGAGGATTCTTTGTTTTGATCCCAA
AATCCGACGAGGAGCGTGGAGGATCCAGGACCCGGATCCGGAGCTGAAACCCGAATAGAA
TTGTCCCGGATCTTGGTCGGGAGAACCCGGGTTCTTGGTTTTCTTCCTGGATGAGAGAAT
CGACAATAGCGAGTCCGATTCTTTTGGGTTCGAGCTTGAGCCGGGTCTCGGGTTCGTGGG
GTTTCGGGTTATCGGATCCAAAAGGGTTTTTCAAAACGGTGAAAGGTTTTGTGTCGAGGA
TGGAGGTGGGACTCGCGACGGCGTCGTTTTCAGTGAAGCTTTTAAAGCTGCTGAAAGCTG
TGAAGAGCCGTGGAAACGGC

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2A053TF 810 0 0
ATATATGGATCGT*CTCGGGTTAGGCCCGTGACACGTAACGCACGTGTAGTCTTCCGATA
ATTCCATATCGCTGGTCGAGAAATAGCCGGTGAAGATACGGGGCGACCCAAGATCCGACC
CGGAAGCCGTTTTCTTCATCTCTTCCGGCGGAGGGGAGACCGGAGGATTCTTTGTTTTGA
TCCCAAAATCCGACGAGGAGCGTGGAGGATCCAGGACCCGGATCCGGAGCTGAGACCCGA
ATAGAATTGTCCCGGATCTTGGTCGGGAGAACCCGGGTTCTTGGTTTTCTTCCTGGATGA
GAGAATCGACAATAGCGAGTCCGATTCTTTTGGGTTCGAGCTTGAGCCGGGTCTCGGGTT
CGTGGGGTTTCGGGTTATCGGATCCAAAAGGGTTTTTCAAAACGGTGAAAGGTTTTGTGT
CGAGGATGGAGGTGGGACTCGCGACGGCGTCGTTTTCAGTGAAGCTTTTAAAGCTGCTGA
AAGCTGTGAAGAGCCGTGGAAACGGCGTCGGTTTGCTCTGTTTCTGGTTGGTGTCCGCCA
TTAACAAAGCCTGCTTGCTTCTTGATCTTTTCTTCAGCATAACTCACTGCTCAATCACGC
AAAAGAAAATCAAAACTTTAAGCTAAAAATCTCTTCGTTATTTGCAAAACTGAGACAGAA
CACGAGAAAGAACCTAAGAAGCTAACCTCAACAATCAGAAAAGTTTCGGACTTGTGGGAA
CTTTCAGAGGAAATAAAAGATATGGAGATCTGTTGCCTCCATGATTGAGAAAATAAAATA
AAATTGGAGAGAAAAAACAAAACAAATAAG

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 3

CO CL3741Contig1 1447 3 8 U
GGAGCTGAGAGAAGAGGCGAGGGCTGTGTGTGATCGTTGGAGTTAGAGATGTCGAGCTCA
CAGTTCCGGTACACGCAGACGCCGTCGAAGGGGGTGCACCTGCGGAATCTACCGTGGGAA
TGCGTGGAAGAAGAGCTGATCGACCTGTGCAAACGATTCGGAAAGATCGTCAATACGAAG
ACCAATGTCGGCGCCAATCGCAACCAAGCCTTCGTTGAATTCGCTGAGTTGAATCAGGCG
ATATCAATGGTGTCGTATTATGCATCATCTTCGGAGCCGGCACAGATTCGTGGGAAAACT
ATTTATATACAGTACTCTAATCGGCATGAGATTGTGAACAATCAGAGTCCTGGCGAAGTC
CCTGGAAACGTCCTCTTGGTTACTTTTGAAGGAGTCGAATCTCACCATCTCAGCATCGAT
GTTATCCATCTGGTGTTTTCTGCTTTTGGATTCGTGCACAAAATTGCCACTTTTGAGAAA
GCTGCTGGTTTCCAGGCACTAGTTCAGTTTACTGATGTGGAAACTGCTTCAGCGGCTAGG
AGTGCGCTAGATGGTAGAAGTATACCCAAATATCTGCTTCCAGAACATGTTGCCTCTTGC
AATTTGCGAATGTCTTATTCAGCTCATACTGATCTAAACATCAAGTTTCAGTCCCACCGT
AGCAGGGATTACACGAATCCATACCTTCCAGTGAATCATACCGCAATGGACGGGTCTATG
CAGCCTGCTTTGGGTGCTGATGGGAAGAAGGTAGAAACTCAGAGCAATGTCCTACTTGCT
TTAATTGAGAACATGCAGTATGCTGTCACCGTGGATGTTCTTCACACGGTATTTTCCGCG
TACGGAACTGTCCAGAAGATTGCTATATTTGAGAAGAATGGTTCAACACAAGCTTTAATT
CAATACTCTGATATAGCAACGGCGGCAATAGCTAAAGAAGCACTGGAAGGACACTGCATA
TATGACGGTGGCTACTGTAAGCTTCGACTATCATACTCTCGTCATACTGATCTCAATGTT
AAGGCATTTAGCGACAAAAGCAGAGACTACACACTACCTGATCTGAGCCTACTCGTGGGC
CAAAAAGTTCCCGGAGTGGCTGAAGCTTCTGCGCCAACAACAGGTGGTTGGCAGAATGGG
CAGGTGCAAACACAATACGCAGGTTATGGTGGAAGTCCATATATGTACCCATCAGCTGAT
CCCACAGGGGCTTCACCTTCTTCTGGTCATCCTCCTTACTATGGCTGATTGATATATTGC
TTTCTACATAAATTACGGATTTAATGTCAGTCCAAAGACCGATTTGGGAGTTTCTATGTC
GTAGGTTTCACCAGTTTGTTATGTTTCATTTAAAAGTGTGTGTGATTGTTCTTGTTTTTT
CTCTGGTTTATTAGACAGAAACAAGTGTGGGAAAACAGTAATAAAATCAAAACGTGCTTC
AGGCGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB58TF U 5
AF RR2BC85TF U 1
AF RR2HB58JQ C 663
BS 1 223 RR2BC85TF
BS 224 224 RR2HB58TF
BS 225 263 RR2BC85TF
BS 264 264 RR2HB58TF
BS 265 353 RR2BC85TF
BS 354 354 RR2HB58TF
BS 355 748 RR2BC85TF
BS 749 1447 RR2HB58JQ

RD RR2HB58TF 673 0 0
GG
GAGAGAAGAGGCGAGGGCTGTGTGTGATCGTTGGAGTTAGAGATGTCGAGCTCACAGTTC
CGGTACACGCAGACGCCGTCGAAGGTGGTGCACCTGCGGAATCTACCGTGGGAATGCGTG
GAAGAAGAGCTGATCGACCTGTGCAAACGATTCGGAAAGATCGTCAATACGAAGACCAAT
GTCGGCGCCAATCGCAACCAAGCCTTCGTTGAATTCGCTGAGTTGAATCAGGCGATATCA
ATGGTGTCGTATTATGCATCATCTTCGGAGCCGGCACAGATTCGTGGGAAAACTATTTAT
ATACAGTACTCTAATCGGCATGAGATTGTGAACAATCAGAGTCCTGGCGAAGTCCCTGGA
AACGTCCTCTTGGTTACTTTTGAAGGAGTCGAATCTCACCATCTCAGCATCGATGTTATC
CATCTGGTGTTTTCTGCTTTTGGATTCGTGCACAAAATTGCCACTTTTGAGAAAGCTGCT
GGTT*CCAGGCACTAGTTCAGTTTACTGATGTGGAAACTGCTTCAGCGGCTAGGAGTGCG
CTAGATGGTAGAAGTATACCCAAATATCTGCTTCCAGAACATGTTGCCTCTTGCAATTTG
CGAATGTCTTATTCAGCTCATACTGATCTAAACATCAAGTTTCAGTCCCACCGTAGCAGG
*ATTACACGAA

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR2BC85TF 748 0 0
GGAGCTGAGAGAAGAGGCGAGGGCTGTGTGTGATCGTTGGAGTTAGAGATGTCGAGCTCA
CAGTTCCGGTACACGCAGACGCCGTCGAAGGGGGTGCACCTGCGGAATCTACCGTGGGAA
TGCGTGGAAGAAGAGCTGATCGACCTGTGCAAACGATTCGGAAAGATCGTCAATACGAAG
ACCAATGTCGGCGCCAATCGCAACCAAGCCTTCGTTGAATTCGTTGAGTTGAATCAGGCG
ATATCAATGGTGTCGTATTATGCTTCATCTTCGGAGCCGGCACAGATTCGTGGGAAAACT
ATTTATATACAGTACTCTAATCGGCATGAGATTGTGAACAATCAGAGTCCTGGTGAAGTC
CCTGGAAACGTCCTCTTGGTTACTTTTGAAGGAGTCGAATCTCACCATCTCAGCATCGAT
GTTATCCATCTGGTGTTTTCTGCTTTTGGATTCGTGCACAAAATTGCCACTTTTGAGAAA
GCTGCTGGTTTCCAGGCACTAGTTCAGTTTACTGATGTGGAAACTGCTTCAGCGGCTAGG
AGTGCGCTAGATGGTAGAAGTATACCCAAATATCTGCTTCCAGAACATGTTGCCTCTTGC
AATTTGCGAATGTCTTATTCAGCTCATACTGATCTAAACATCAAGTTTCAGTCCCACCGT
AGCAGGGATTACACGAATCCATACCTTCCAGTGAATCATACCGCAATGGACGGGTCTATG
CAGCCTGCTTTGGGTGCTGATGGGAAGA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2HB58JQ 785 0 0
GCAGGGA
TACACGAATCCATACCTTCCAGTGAATCATACCGCAATGGACGGGTCTATGCAGC*TGCT
TTGGGTGCTGATGGGAAGAAGGTAGAAACTCAGAGCAATGTCCTACTTGCTTTAATTGAG
AACATGCAGTATGCTGTCACCGTGGATGTTCTTCACACGGTATTTTCCGCGTACGGAACT
GTCCAGAAGATTGCTATATTTGAGAAGAATGGTTCAACACAAGCTTTAATTCAATACTCT
GATATAGCAACGGCGGCAATAGCTAAAGAAGCACTGGAAGGACACTGCATATATGACGGT
GGCTACTGTAAGCTTCGACTATCATACTCTCGTCATACTGATCTCAATGTTAAGGCATTT
AGCGACAAAAGCAGAGACTACACACTACCTGATCTGAGCCTACTCGTGGGCCAAAAAGTT
CCCGGAGTGGCTGAAGCTTCTGCGCCAACAACAGGTGGTTGGCAGAATGGGCAGGTGCAA
ACACAATACGCAGGTTATGGTGGAAGTCCATATATGTACCCATCAGCTGATCCCACAGGG
GCTTCACCTTCTTCTGGTCATCCTCCTTACTATGGCTGATTGATATATTGCTTTCTACAT
AAATTACGGATTTAATGTCAGTCCAAAGACCGATTTGGGAGTTTCTATGTCGTAGGTTTC
ACCAGTTTGTTATGTTTCATTTAAAAGTGTGTGTGATTGTTCTTGTTTTTTCTCTGGTTT
ATTAGACAGAAACAAGTGTGGGAAAACAGTAATAAAATCAAAACGTGCTTCAGGCGCT

QA 8 785 8 785
DS 



AS 1 3

CO CL3742Contig1 845 3 4 U
GGAACGCAGTCCCCGTATTGTCTATTTATACCCAACATAAGGTTTTATTGTGCGTTGCTT
ATAAATTAAAACCTACCCAATAACCAAGTGTTTTTCATATTGTTCATTTCAATGGCAAAT
TTCAAGTTTCCTCTGCTTATACTGTTCGTTCTATATTTTTCCCAGCTTCATCTACTTCAG
TTTCACCATGACTTCTTCTCTTCTTTTCCGGTCAAGATCGGTCTACTCATCATATCCATC
CTCCTCTATGCTTACTCAAGCACCCGGTCTAAACCAGTTTACCTTGTCGACTTCTCATGT
CACCAACCCACCGACTCATGCAAAATCTCATCCGAAACGTTCTTCAACATGGCCAAAGGT
GCTCAACTCTACACCGAAGAAACAATCCAATTCATGACGAGGATACTAAACCGGTCCGGT
TTAGGAGAGGATACGTACGCCCCACGTTGCATGTTGACATCTCCACCAACACCATCAATG
TTTGAGGCAAGACATGAAGCCGAATTAGTCATATTCGGAGCTCTTAACTCGCTATTCAAG
AAAACCGGAGTTGAGCCGAGAGAAGTTGGAATCTTCATTGTAAACTGCAGCTTGTTTAAC
CCTAACCCATCTCTCTCTTCCATGATCGTAAATCGGTACAAGCTCAAAACCGACGTGAAA
ACATACAATCTCTCCGGTATGGGATGCAGCGCCGGCGCAATCTCTGTAGATCTCGCCACG
CATCTTCTTAAAGCAAACCCTAATACCTATGCAGTCATTGTTAGCACAGAGAACATGACT
CTTAGCATGTATCGAGGCAACGACCGGTCCATGCTAGTCCCTAACTGTCTATTTCGAGTA
GAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2G773TF U 1
AF RR2AQ79TF U 95
AF RR2FV76TF U 55
BS 1 694 RR2G773TF
BS 695 695 RR2FV76TF
BS 696 761 RR2G773TF
BS 762 845 RR2FV76TF

RD RR2G773TF 761 0 0
GGAACGCAGTCCCCGTATTGTCTATTTATACCCAACATAAGGTTTTATTGTGCGTTGCTT
ATAAATTAAAACCTACCCAATAACCAAGTGTTTTTCATATTGTTCATTTCAATGGCAAAT
TTCAAGTTTCCTCTGCTTATACTGTTCGTTCTATATTTTTCCCAGCTTCATCTACTTCAG
TTTCACCATGACTTCTTCTCTTCTTTTCCGGTCAAGATCGGTCTACTCATCATATCCATC
CTCCTCTATGCTTACTCAAGCACCCGGTCTAAACCAGTTTACCTTGTCGACTTCTCATGT
CACCAACCCACCGACTCATGCAAAATCTCATCCGAAACGTTCTTCAACATGGCCAAAGGT
GCTCAACTCTACACCGAAGAAACAATCCAATTCATGACGAGGATACTAAACCGGTCCGGT
TTAGGAGAGGATACGTACGCCCCACGTTGCATGTTGACATCTCCACCAACACCATCAATG
TTTGAGGCAAGACATGAAGCCGAATTAGTCATATTCGGAGCTCTTAACTCGCTATTCAAG
AAAACCGGAGTTGAGCCGAGAGAAGTTGGAATCTTCATTGTAAACTGCAGCTTGTTTAAC
CCTAACCCATCTCTCTCTTCCATGATCGTAAATCGGTACAAGCTCAAAACCGACGTGAAA
ACATACAATCTCTCCGGTATGGGATGCAGCGCCG*CGCAATCTCTGTAGATCTCGCCACG
CATCTTCTTAAAGCAAACCCTAATACCTATGCAGTCATTGT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2AQ79TF 744 0 0
GG
ATATTGTTCATTTCAATGGCA**TTTCAAGTCTCCTCTGCTTATACTGTTCGTTCTATAT
TTTTCCCAGCTTCATCTACTTCAGTTTCACCATGACTTCTTCTCTTCTTTTCCGGTCAAG
ATCGGTCTACTCATCATATCCATCCTCCTCTATGCTTACTCAAGCACCCGGTCTAAACCA
GTTTACCTTGTCGACTTCTCATGTCACCAACCCACCGACTCATGCAAAATCTCATCCGAA
GCGTTCTTCAACATGGCCAAAGGTGCTCAACTCTACACCGAAGAAACAATCCAATTCATG
ACGAGGATACTAAACCGGTCCGGTTTAGGAGAGGATACGTACGCCCCACGTTGCATGTTG
ACATCTCCACCAACACCATCAATGTTTGAGGCAAGACATGAAGCCGAATTAGTCATATTC
GGAGCTCTTAACTCGCTATTCAAGAAAACCGGAGTTGAGCCGAGAGAAGTTGGAATCTTC
ATTGTAAACTGCAGCTTGTTTAACCCTAACCCATCTCTCTCTTCCATGATCGTAAATCGG
TACAAGCTCAAAACCGACGTGAAAGCATACAATCTCTCCGGTATGGGATGCAGCGCCGGC
GCAATCTCTGTAGATCTCGCCACGCATCTTCTTAAAGCAAACCCTAATACCTATGCAGTC
ATTGTTAGCACAGAGAACATGACTCTTAGCATGTATCGAGGCAACGACCGGTCCATGCTA
GTCCCTAACTGTCTATTTCGAG

QA 3 744 3 744
DS 

RD RR2FV76TF 791 0 0
GG
GCTTATAAATTAAAACCTACCCAATAACCAAGTGTTTTTCATATTGTTCATTTCAATGGC
AAATTTCAAGTTTCCTCTGCTTATACTGTTCGTTCTATATTTTTCCCAGCTTCATCTACT
TCAGTTTCACCATGACTTCTTCTCTTCTTTTCCGGTCAAGATCGGTCTACTCATCATATC
CATCCTCCTCTATGCTTACTCAAGCACCCGGTCTAAACCAGTTTACCTTGTCGACTTCTC
ATGTCACCAACCCACCGACTCATGCAAAATCTCATCCGAAACGTTCTTCAACATGGCCAA
AGGTGCTCAACTCTACACCGAAGAAACAATCCAATTCATGACGAGGATACTAAACCGGTC
CGGTTTAGGAGAGGATACGTACGCCCCACGTTGCATGTTGACATCTCCACCAACACCATC
AATGTTTGAGGCAAGACATGAAGCCGAATTAGTCATATTCGGAGCTCTTAACTCGCTATT
CAAGAAAACCGGAGTTGAGCCGAGAGAAGTTGGAATCTTCATTGTAAACTGCAGCTTGTT
TAACCCTAACCCATCTCTCTCTTCCATGATCGTAAATCGGTACAAGCTCAAAACCGACGT
GAAAACATACAATCTCTCCGGTATGGGATGCAGCGCCGGCGCAATCTCTGTAGATCTCGC
CACGCATCTTCTTAAAGCAAACCCTAATACCTATGCAGTCATTGTTAGCACAGAGAACAT
GACTCTTAGCATGTATCGAGGCAACGACCGGTCCATGCTAGTCCCTAACTGTCTATTTCG
AGTAGAAGT

QA 3 791 3 791
DS 



AS 1 3

CO CL3743Contig1 1245 3 9 U
TTTTTTATCAGACGGAGAAGAATCTATCCCGTGATCCTGCTTCTATAATATTCGATCACT
GATTTGGAGATGGACAAGTACGAGGTCGTGAAGGATCTGGGGACTGGAAACTTCGGTGTG
GCTCGCCTTCTAAGGCACAAGGAAACCAATGAGCTCGTCGCCATGAAATACATCGAGAGA
GGCCGAAAGATAGATGAGAACGTGGCTAGAGAGATTATCAATCACAGATCACTTAAGCAT
CCTAATATCATTCGCTTCAAGGAGAGCTCTTTGAGAGGATCTGCACTGCCGGTAGATTCA
GTGAAGCTGAGGCTAAGTACTTCTTTCAACAGCTGATTTGTGGCGTCGACTACTGCCACT
CCTTGCAAATATGCCACAGAGATCTGAAGCTTGAGAACACACTGCTTGATGGCAGCCCCG
CTCCGCTTTTGAAAATCTGTGATTTTGGTTACTCCAAGTCATCTATACTACATTCCATTC
CTAAATCGACTGTTGGAACTCCAGCATACATAGCACCTGAAGTTCTTTCCCGTAAAGAAT
ATGATGGCAAGCACGCGGATGTGTGGTCATGTGGTGTAACCCTTTATGTGATGCTGGTTG
TAGCTTACCCGTTTGAGGACCCTAATGATCCAAAGAACTTCAGGAAAACTATCCAACGTA
TAATGGCTATACAATATAAGATTCCGGACTACGTTCACATATCTCAGGAATGCAAGCACC
TTCTCTCCCGCATATTCGTCACTAACCCCGCTAAGAGAATCACGCTTAAGGAAATCAAAA
ATCATCCGTGGTACACAAAGAATCTGCCAAAGGAGCTTCTGGAGTCTGCTCAAGCAGTGT
ATTACAAGAGAGACAACACGAGCTATTCTCTTCAAAGCGTAGAGGACATAATGAAGATAG
TTGGAGAAGCTAGGAATCCAGCTTCTTCTTCAAGTGTCATCAAAAGCTTAGGATCAGGTG
CTGAGGAAGAAGAGGAAGAGGACGTTGAAGCTGAAGTGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGATGAATACGAGAAGCATGTCAAAGAGGCACATTCTTCTA
TTCAAGAGCCTCTCGGAGCGTTAGAAATAAAATGATCACCTCATCACCGTTGATCCTACA
AAAGCCAAAGGGTGTAAACTACTTGGTACATGCTATTTCACTTTTTAGATTTGATGTCTG
AAAACATTCTCGTTTCAGTCAACTGTCACTAGGTGGTTCCTCAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA08TF U 1
AF RR2CL96TF U 432
AF RR2CL96JQ C 485
BS 1 600 RR2GA08TF
BS 601 601 RR2CL96TF
BS 602 643 RR2GA08TF
BS 644 644 RR2CL96TF
BS 645 707 RR2GA08TF
BS 708 708 RR2CL96TF
BS 709 752 RR2GA08TF
BS 753 1142 RR2CL96TF
BS 1143 1245 RR2CL96JQ

RD RR2GA08TF 752 0 0
TTTTTTATCAGACGGAGAAGAATCTATCCCGTGATCCTGCTTCTATAATATTCGATCACT
GATTTGGAGATGGACAAGTACGAGGTCGTGAAGGATCTGGGGACTGGAAACTTCGGTGTG
GCTCGCCTTCTAAGGCACAAGGAAACCAATGAGCTCGTCGCCATGAAATACATCGAGAGA
GGCCGAAAGATAGATGAGAACGTGGCTAGAGAGATTATCAATCACAGATCACTTAAGCAT
CCTAATATCATTCGCTTCAAGGAGAGCTCTTTGAGAGGATCTGCACTGCCGGTAGATTCA
GTGAAGCTGAGGCTAAGTACTTCTTTCAACAGCTGATTTGTGGCGTCGACTACTGCCACT
CCTTGCAAATATGCCACAGAGATCTGAAGCTTGAGAACACACTGCTTGATGGCAGCCCCG
CTCCGCTTTTGAAAATCTGTGATTTTGGTTACTCCAAGTCATCTATACTACATTCCATTC
CTAAATCGACTGTTGGAACTCCAGCATACATAGCACCTGAAGTTCTTTCCCGTAAAGAAT
ATGATGGCAAGCACGCGGATGTGTGGTCATGTGGTGTAACCCTTTATGTGATGCTGGTTG
GAGCTTACCCGTTTGAGGACCCTAATGATCCAAAGAACTTCAG*AAAACTATCCAACGTA
TAATGGCTATACAATATAAGATTCCGGACTACGTTCACATATCTCAG*AATGCAAGCACC
TTCTCTCCCGCATATTCGTCACTAACCCCGCT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2CL96TF 711 0 0
G
AAATCTGTGATTTTGGTTACTCCAAGTCATCTATACTACATTCCATTCCTAAATCGACTG
TTGGAACTCCAGCATACATAGCACCTGAAGTTCTTTCCCGTAAAGAATATGATGGCAAGC
ACGCGGATGTGTGGTCATGTGGTGTAACCCTTTATGTGATGCTGGTTGTAGCTTACCCGT
TTGAGGACCCTAATGATCCAAAGAACTTCAGGAAAACTATCCAACGTATAATGGCTATAC
AATATAAGATTCCGGACTACGTTCACATATCTCAGGAATGCAAGCACCTTCTCTCCCGCA
TATTCGTCACTAACCCCGCTAAGAGAATCACGCTTAAGGAAATCAAAAATCATCCGTGGT
ACACAAAGAATCTGCCAAAGGAGCTTCTGGAGTCTGCTCAAGCAGTGTATTACAAGAGAG
ACAACACGAGCTATTCTCTTCAAAGCGTAGAGGACATAATGAAGATAGTTGGAGAAGCTA
GGAATCCAGCTTCTTCTTCAAGTGTCATCAAAAGCTTAGGATCAGGTGCTGAGGAAGAAG
AGGAAGAGGACGTTGAAGCTGAAGTGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAG
AGGAAGAAGATGAATACGAGAAGCATGTCAAAGAGGCACATTCTTCTATTCAAGAGCCTC
TCGGAGCGTTAGAAATAAAATGATCACCTCATCACCGTTGATCCTACAAA

QA 2 711 2 711
DS 

RD RR2CL96JQ 761 0 0
ATCGACTGTTGGAACTCCAGCATACATAGCACCTGAAGTTCTTTCCCGTAAAGAATATGA
TGGCAAGCACGCGGATGTGTGGTCATGTGGTGTAACCCTTTATGTGATGCTGGTTGTAGC
TTACCCGTTTGAGGACCCTAATGATCCAAAGAACTTCAGGAAAACTATCCAACGTATAAT
GGCTATACAATATAAGATTCCGGACTACGTTCACATATCTCAGGAATGCAAGCACCTTCT
CTCCCGCATATTCGTCACTAACCCCGCTAAGAGAATCACGCTTAAGGAAATCAAAAATCA
TCCGTGGTACACAAAGAATCTGCCAAAGGAGCTTCTGGAGTCTGCTCAAGCAGTGTATTA
CAAGAGAGACAACACGAGCTATTCTCTTCAAAGCGTAGAGGACATAATGAAGATAGTTGG
AGAAGCTAGGAATCCAGCTTCTTCTTCAAGTGTCATCAAAAGCTTAGGATCAGGTGCTGA
GGAAGAAGAGGAAGAGGACGTTGAAGCTGAAGTGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGA
AGAGGAAGAGGAAGAAGATGAATACGAGAAGCATGTCAAAGAGGCACATTCTTCTATTCA
AGAGCCTCTCGGAGCGTTAGAAATAAAATGATCACCTCATCACCGTTGATCCTACAAAAG
CCAAAGGGTGTAAACTACTTGGTACATGCTATTTCACTTTTTAGATTTGATGTCTGAAAA
CATTCTCGTTTCAGTCAACTGTCACTAGGTGGTTCCTCAAT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 3

CO CL3744Contig1 1195 3 13 U
GGTTTCAATCCAAAGCTTAATGTAAATTTATCCACAACAATCGTACATGAAATTTTGAGT
TACTACATACATTCCATTTTTAGACATTACATGATACAAACATATTAATAATCACTTTTC
TGCGTTTTGGTTCCATTATCCCATTCTCCGAAATAAAAAGTAAAGAAAGGGAAAAGAGAC
AACACGCATCGTTTCTTGTGAGTCATCTTGTGTACTGGAGCAAGTATGTATCATCTGATG
ATTGAGACTGTCCCATTTCAACGACCTCGAAACCAGTCTTCTGGTATAGTTCTTGAGCAA
CTAAATTGTTTCTATGTACATGAACATATACTTGCTCAACTCCACTCAATCTGGCTGATT
CGACAGCGAAACGTAACATGTTGCAAGCAATACCCTGGCGGCGTGCTGATTTGGCAACAC
ATAGATTAGCAATATAACCATACCTATTTGAACCTTCCCGATTAATGGTGCAAAACAATT
GAAACTTCACCTTTTCCCCAGGAAAGGTCTCTCCTTGCAAGAAAAAACGAATGTTCAAAT
CAAGCGTCCCAACCACACTTTTGATTACAGAACGTTTAATGTGCTTCTCTTCCTTCTTTA
CCGCAACGATACAGGAACATTTCTGGCTTTGGAGCCCATTGCATCTTCTTTTTATTGCAT
TGAACTCCTGATCTGCAAATTTCCTTTTGAAGTTGTCAACATACCTTTCATTGTCACGAT
CTTCCCAGTGACTCTCTGCACGTAGCCACGCTGCTGTCCAGTATTCTTCATCAAGAATGG
CTTCTCGTGCTACGAATTTACCAAAATCCAATCGATCTTGCTCAGGCTCGGGAGGCTGCA
AACGGTCGAATCTCAAACCCTCAGGTCTTAATTGATCAACTTGAGGAATCTTTACAGAGA
GTTCGTCCTTTTTAGTCGCGTCAGAAGATCTCGAATTGATCATCATCCGCCATGCTGGAA
TAGTTCTCCTATATCGCTGCCGAGAAATTCGCGAGCGATTGTGCGTGATTCTAAGCAGCT
CAGTCCGATGGATTGAAATCGTCGACATCGCAGCTGCCAAGAAGAAATCTTCTCCGTGTC
GCAAGCAATTTGACCTTAGAATTTGAAAAAAAAAAAAAAATCCTCCAAGAGATGTCTTTC
TTTCAATGGAGAGAGAAAAGTTGGATGAAAGGATAAACACTCACGATAAGCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO57JQ U 1
AF RR2H354JQ U 21
AF RR2BO57TF C 519
BS 1 24 RR2BO57JQ
BS 25 25 RR2H354JQ
BS 26 229 RR2BO57JQ
BS 230 230 RR2H354JQ
BS 231 375 RR2BO57JQ
BS 376 376 RR2H354JQ
BS 377 472 RR2BO57JQ
BS 473 473 RR2H354JQ
BS 474 482 RR2BO57JQ
BS 483 483 RR2H354JQ
BS 484 765 RR2BO57JQ
BS 766 816 RR2H354JQ
BS 817 1195 RR2BO57TF

RD RR2BO57JQ 765 0 0
GGTTTCAATCCAAAGCTTAATGTAGATTTATCCACAACAATCGTACATGAAATTTTGAGT
TACTACATACATTCCATTTTTAGACATTACATGATACAAACATATTAATAATCACTTTTC
TGCGTTTTGGTTCCATTATCCCATTCTCCGAAATAAAAAGTAAAGAAAGGGAAAAGAGAC
AACACGCATCGTTTCTTGTGAGTCATCTTGTGTACTGGAGCAAGTATGTGTCATCTGATG
ATTGAGACTGTCCCATTTCAACGACCTCGAAACCAGTCTTCTGGTATAGTTCTTGAGCAA
CTAAATTGTTTCTATGTACATGAACATATACTTGCTCAACTCCACTCAATCTGGCTGATT
CGACAGCGAAACGTAGCATGTTGCAAGCAATACCCTGGCGGCGTGCTGATTTGGCAACAC
ATAGATTAGCAATATAACCATACCTATTTGAACCTTCCCGATTAATGGTGCAGAACAATT
GAGACTTCACCTTTTCCCCAGGAAAGGTCTCTCCTTGCAAGAAAAAACGAATGTTCAAAT
CAAGCGTCCCAACCACACTTTTGATTACAGAACGTTTAATGTGCTTCTCTTCCTTCTTTA
CCGCAACGATACAGGAACATTTCTGGCTTTGGAGCCCATTGCATCTTCTTTTTATTGCAT
TGAACTCCTGATCTGCAAATTTCCTTTTGAAGTTGTCAACATACCTTTCATTGTCACGAT
CTTCCCAGTGACTCTCTGCACGTAGCCACGCTGCTGTCCAGTATT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2H354JQ 796 0 0
TGTAAATTTATCCACAACAATCGTACATGAAATTTTGAGTTACTACATACATTCCATTTT
TAGACATTACATGATACAAACATATTAATAATCACTTTTCTGCGTTTTGGTTCCATTATC
CCATTCTCCGAAATAAAAAGTAAAGAAAGGGAAAAGAGACAACACGCATCGTTTCTTGTG
AGTCATCTTGTGTACTGGAGCAAGTATGTATCATCTGATGATTGAGACTGTCCCATTTCA
ACGACCTCGAAACCAGTCTTCTGGTATAGTTCTTGAGCAACTAAATTGTTTCTATGTACA
TGAACATATACTTGCTCAACTCCACTCAATCTGGCTGATTCGACAGCGAAACGTAACATG
TTGCAAGCAATACCCTGGCGGCGTGCTGATTTGGCAACACATAGATTAGCAATATAACCA
TACCTATTTGAACCTTCCCGGTTAATGGTGCAAAACAATTGAAACTTCACCTTTTCCCCA
GGAAAGGTCTCTCCTTGCAAGAAAAAACGAATGTTCAAATCAAGCGTCCCAACCACACTT
TTGATTACAGAACGTTTAATGTGCTTCTCTTCCTTCTTTACCGCAACGATACAGGAACAT
TTCTGGCTTTGGAGCCCATTGCATCTTCTTTTTATTGCATTGAACTCCTGATCTGCAAAT
TTCCTTTTGAAGTTGTCAACATACCTTTCATTGTCACGATCTTCCCAGTGACTCTCTGCA
CGTAGCCACGCTGCTGTCCAGTATTCTTCATCAAGAATGGCTTCTCGTGCTACGAATTTA
CCAAAATCCAATCGAT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2BO57TF 677 0 0
AAGAAAAAACGAATGTTCAAATCAAGCGTCCCAACCACACTTTTGATTACAGAACGTTTA
ATGTGCTTCTCTTCCTTCTTTACCGCAACGATACAGGAACATTTCTGGCTTTGGAGCCCA
TTGCATCTTCTTTTTATTGCATTGAACTCCTGATCTGCAAATTTCCTTTTGAAGTTGTCA
ACATACCTTTCATTGTCACGATCTTCCCAGTGACTCTCTGCACGTAGCCACGCTGCTGTC
CAGTATTCTTCATCAAGAATGGCTTCTCGTGCTACGAATTTACCAAAATCCAATCGATCT
TGCTCAGGCTCGGGAGGCTGCAAACGGTCGAATCTCAAACCCTCAGGTCTTAATTGATCA
ACTTGAGGAATCTTTACAGAGAGTTCGTCCTTTTTAGTCGCGTCAGAAGATCTCGAATTG
ATCATCATCCGCCATGCTGGAATAGTTCTCCTATATCGCTGCCGAGAAATTCGCGAGCGA
TTGTGCGTGATTCTAAGCAGCTCAGTCCGATGGATTGAAATCGTCGACATCGCAGCTGCC
AAGAAGAAATCTTCTCCGTGTCGCAAGCAATTTGACCTTAGAATTTGAAAAAAAAAAAAA
AATCCTCCAAGAGATGTCTTTCTTTCAATGGAGAGAGAAAAGTTGGATGAAAGGATAAAC
ACTCACGATAAGCACCC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 3

CO CL3745Contig1 889 3 3 U
TTTTTTTCACTTCATCAGTCTGAGACATGCCTAAATCAAAGAGAGACAGACCAGTTACTT
TATCAAAGACAAAGAAGAAAGGAAGAGAGCACAAGGAGACTATTGTGAATGGAATCAGAG
AGGCTGTTGAAAAATATAATTCTGTCTACGTTTTCTCTTTTGAGAACATGAGAAACATCA
AGTTCAAGGAGTTTAGACAGCAGTTTAGACACAACGGAAAGTTCTTCCTCGGTTCGAACA
AAGTGATGCAGGTTGCTCTTGGTCGTTCGGCTTCTGATGAAATCCGTTCTGGCATCTTTA
AAGCCTCCAAGCTGCTTCATGGTGATGCTGGACTTCTTGTAACAGATATGCCAAAGGAAG
AGGTCGAAAGCTTGTTTAATGCTTATGAGGATTCAGACTTTTCAAGGACCGGAAGCACTG
CAGTAGAAACGGTTGAGCTGAAGGAAGGTCCTCTAGAACAGTTCACTCATGAGATGGAAC
CGTTTCTTAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGGCTCAACAAAGGTACGGTAGAGTTACTCT
CGGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAGGCAAACCTCTTTCACCAGAATCTTCTCGCATTTTGC
GACTGTTGGGAATAAAGTTGGCTACTTTCAAACTCAACTTAGTCTGCAGATGGAGCCCTA
ATGACTTTGAGCTTTACCGAGAAAGTTTGGATCTCTCGGACGTCGAAACCTCTTAAAAAA
GCTTGTTTATCAAACTCTTTAAAGTTTTTGTATCGTATCTATCATTCACTTGGATGATGC
TTGCTCTCTGTGGTTGTGTTTGCAGTTTTATGTCCAAGTTTTGTTGCTTTAGTGTTTGTA
GAATATCAGATTATCTTCTTGAGTTCCCTTCTTCTAGTATTCTCGACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC70TF U 1
AF RR2AE05TF U 8
AF RR2CC70JQ C 86
BS 1 672 RR2CC70TF
BS 673 704 RR2AE05TF
BS 705 889 RR2CC70JQ

RD RR2CC70TF 672 0 0
TTTTTTTCACTTCATCAGTCTGAGACATGCCTAAATCAAAGAGAGACAGACCAGTTACTT
TATCAAAGACAAAGAAGAAAGGAAGAGAGCACAAGGAGACTATTGTGAATGGAATCAGAG
AGGCTGTTGAAAAATATAATTCTGTCTACGTTTTCTCTTTTGAGAACATGAGAAACATCA
AGTTCAAGGAGTTTAGACAGCAGTTTAGACACAACGGAAAGTTCTTCCTCGGTTCGAACA
AAGTGATGCAGGTTGCTCTTGGTCGTTCGGCTTCTGATGAAATCCGTTCTGGCATCTTTA
AAGCCTCCAAGCTGCTTCATGGTGATGCTGGACTTCTTGTAACAGATATGCCAAAGGAAG
AGGTCGAAAGCTTGTTTAATGCTTATGAGGATTCAGACTTTTCAAGGACCGGAAGCACTG
CAGTAGAAACGGTTGAGCTGAAGGAAGGTCCTCTAGAACAGTTCACTCATGAGATGGAAC
CGTTTCTTAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGGCTCAACAAAGGTACGGTAGAGTTACTCT
CGGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAGGCAAACCTCTTTCACCAGAATCTTCTCGCATTTTGC
GACTGTTGGGAATAAAGTTGGCTACTTTCAAACTCAACTTAGTCTGCAGATGGAGCCCTA
ATGACTTTGAGC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2AE05TF 697 0 0
CACTTCATCAGTCTGAGGCATGCCTAAATCAAAGAGAGACAGACCAGTTACTTTATCAAA
GACAAAGAAGAAAGGAAGAGAGCACAAGGAGACTATTGTGAATGGAATCAGAGAGGCTGT
TGAAAAATATAATTCTGTCTACGTTTTCTCTTTTGAGAACATGAGAAACATCAAGTTCAA
GGAGTTTAGACAGCAGTTTAGACACAACGGAAAGTCCTTCCTCGGTTCGAACAAAGTGAT
GCGGGTTGCTCTTGGTCGTTCGGCTTCTGATGAAATCCGTTCTGGCATCTTTAAAGCCTC
CAAGCTGCTTCATGGTGATGCTGGACTTCTTGTAACAGGTATGCCAAAGGAAGAGGTCGA
AAGCTTGTTTAATGCTTATGAGGATTCAGACTTTTCAAGGACCGGAAGCACTGCAGTAGA
AACGGTTGAGCTGAAGGAAGGTCCTCTAGAACAGTTCACTCATGAGATGGAACCGTTTCT
TAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGGCTCAACAAAGGTACGGTAGAGTTACTCTCGGACTT
TGTAGTTTGTGAAGAAGGCAAACCTCTTTCACCAGAATCTTCTCCCATTTTGCGACTGTT
GGGAATAAAGTTGGCTACTTTCAAACTCAACTTAGTCTGCAGATGGAGCCCTAATGACTT
TGAGCTTTACCGAGAAAGTTTGGATCTCTCGGACGTC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2CC70JQ 804 0 0
AGAGCACAAGGAGACTATTGTGAATG*AATCAGAGAGGCTGTTGAAAAATATAATTCTGT
CTACGTTTTCTCTTTTGAGAACATGAGAAACATCAAGTTCAAGGAGTTTAGACAGCAGTT
TAGACACAACGGAAAGTTCTTCCTCGGTTCGAACAAAGTGATGCAGGTTGCTCTTGGTCG
TTCGGCTTCTGATGAAATCCGTTCTGGCATCTTTAAAGCCTCCAAGCTGCTTCATGGTGA
TGCTGGACTTCTTGTAACAGATATGCCAAAGGAAGAGGTCGAAAGCTTGTTTAATGCTTA
TGAGGATTCAGACTTTTCAAGGACCGGAAGCACTGCAGTAGAAACGGTTGAGCTGAAGGA
AGGTCCTCTAGAACAGTTCACTCATGAGATGGAACCGTTTCTTAGGAAGCAGGGTATGCC
TGTTCGGCTCAACAAAGGTACGGTAGAGTTACTCTCGGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAGG
CAAACCTCTTTCACCAGAATCTTCTCGCATTTTGCGACTGTTGGGAATAAAGTTGGCTAC
TTTCAAACTCAACTTAGTCTGCAGATGGAGCCCTAATGACTTTGAGCTTTACCGAGAAGG
TTTGGATCTCTCGGACGTCGAAACCTCTTAAAAAAGCTTGTTTATCAAACTCTTTAAAGT
TTTTGTATCGTATCTATCATTCACTTGGATGATGCTTGCTCTCTGTGGTTGTGTTTGCAG
TTTTATGTCCAAGTTTTGTTGCTTTAGTGTTTGTAGAATATCAGATTATCTTCTTGAGTT
CCCTTCTTCTAGTATTCTCGACCT

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 3

CO CL3746Contig1 999 3 13 U
CATTTCAATTCCCATTCCTTAGAGAGATTCGTCAAAGGAAAACAATAACAAAAATAAATA
AAAACGAAAACATTCTAAATATACACATCATTTGCATTACAATTTTCCATATCTCAAATA
CATATAGCCAAACGTCAAACATATTTTTTTAGCAACACACGAATAATAATCTCATCCTAC
AAAATCATGTAGAAACTGAGGATTACTACCTCCAATAAAGTCTCTCCCAAACTGACGATT
TTGCACTTCATACCCACCGCCACCACCGTAAGACTCCCCTCCTCCACCGCTACTGCCACC
GTCAAGTCCAAACCTCTGAGCAGTTGTCATCGGAAAAGGCTCCGGCAACCCAATCTGATG
ATGAAGCCCTAACGTCGACGACACTCCTCCATTTGTGCTGCTACTCATCCCCGCTACATT
CGACGACGCAATACCGTAGGAGAAGCCAACCGCGCCGCCGCTACCACTGTTTCCAGCGTT
CATAAAGTTGTTATTATTGTTGGTGGTGGTACCATGAACGCCGTCGTTTTGCACCGGCCT
TGCGGGAGATGAGTTGTTGTTAGCCCTTTGTTGAGCCGGGGAGGAAGAAGGGTTGTTGTT
ATCGGGGAGGACGGCGGTGGTGTTACGTTCGTCTCTCCAAGAAGAAGAAGAAGGTCTCTG
AGATTGTCGAGTCTCTAGCATATGAATCTCTTCCACCATCGGCTTCCATACCCTAACTCG
TGCGTTTATGAACCAATTCGATACCTGATTTCTGGAGAGACCTGTCTGTTTAGCCAACAT
CAGTTTGTCTGTATCAGTTGGATAAGGATGCAAGAAGTGATCGAAGAGCCAAGCCCTTAG
CACGGTGACTGCACGTTCTGGTAAGCCCCGGTGCGGTCTCCAGACAGGAGCATGGTTGTC
AGGAAATCCATGTCTTTGACCAGCAGAACACAAGCCTCTACTACTATCACTTCCTCCAAA
TCGCATAGACTCGGTTCTATTCTCAGTTATCATCAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN79JQ U 1
AF RR2BE50JQ U 71
AF RR2EN79TF C 285
BS 1 151 RR2EN79JQ
BS 152 152 RR2BE50JQ
BS 153 179 RR2EN79JQ
BS 180 180 RR2BE50JQ
BS 181 190 RR2EN79JQ
BS 191 191 RR2BE50JQ
BS 192 261 RR2EN79JQ
BS 262 262 RR2BE50JQ
BS 263 768 RR2EN79JQ
BS 769 771 RR2BE50JQ
BS 772 772 RR2EN79TF
BS 773 900 RR2BE50JQ
BS 901 999 RR2EN79TF

RD RR2EN79JQ 768 0 0
CATTTCAATTCCCATTCCTTAGAGAGATTCGTCAAAGGAAAACAATAACAAAAATAAATA
AAAACGAAAACATTCTAAATATACACATCATTTGCATTACAATTTTCCATATCTCAAATA
CATATAGCCAAACGTCAAACATATTTTTTTATCAACACACGAATAATAATCTCATCCTAT
AAAATCATGTGGAAACTGAGGATTACTACCTCCAATAAAGTCTCTCCCAAACTGACGATT
TTGCACTTCATACCCACCGCCGCCACCGTAAGACTCCCCTCCTCCACCGCTACTGCCACC
GTCAAGTCCAAACCTCTGAGCAGTTGTCATCGGAAAAGGCTCCGGCAACCCAATCTGATG
ATGAAGCCCTAACGTCGACGACACTCCTCCATTTGTGCTGCTACTCATCCCCGCTACATT
CGACGACGCAATACCGTAGGAGAAGCCAACCGCGCCGCCGCTACCACTGTTTCCAGCGTT
CATAAAGTTGTTATTATTGTTGGTGGTGGTACCATGAACGCCGTCGTTTTGCACCGGCCT
TGCGGGAGATGAGTTGTTGTTAGCCCTTTGTTGAGCCGGGGAGGAAGAAGGGTTGTTGTT
ATCGGGGAGGACGGCGGTGGTGTTACGTTCGTCTCTCCAAGAAGAAGAAGAAGGTCTCTG
AGATTGTCGAGTCTCTAGCATATGAATCTCTTCCACCATCGGCTTCCATACCCTAACTCG
TGCGTTTATGAACCAATTCGATACCTGATTTCTGGAGAGACCTGTCTG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2BE50JQ 830 0 0
CATTCTAAATATACACATCATTTGCATTACAATTTTCCATATCTCAAATACATATAGCCA
AACGTCAAACATATTTTTTTAGCAACACACGAATAATAATCTCATCCTACAAAATCATGT
AGAAACTGAGGATTACTACCTCCAATAAAGTCTCTCCCAAACTGACGATTTTGCACTTCA
TACCCACCGCCACCACCGTAAGACTCCCCTCCTCCACCACTACTGCCACCGTCAAGTCCA
AACCTCTGAGCAGTTGTCATCGGAAAAGGCTCCGGCAACCCAATCTGATGATGAAGCCCT
AACGTCAACGACACTCCTCCATTTGTGCTGCTACTCATCCCCGCTACATTCGACGACGCA
ATACCGTAGGAGAAGCCAACCGCGCCGCCGCTACCACTGCTTCCAGCGTTCATAAAGTTG
TTATTATTGTTGGTGGTGGTACCATGAACGCCGTCGTTTTGCACCCGCCTTGCGGGAGAT
GAGTTGTTGTTAGCCCTTTGTTGAGCCGGGGAGGAAGAAGGGTTGTTGTTATCGGGGAGG
ACGGCGGTGGTGTTACGTTCGTCTCTCCAAGAAGAAGAAGAAGGTCTCTGAGATTGTCGA
GTCTCTAGCATATGAATCTCTTCCACCATCGGCTTCCATACCCTAACTCGTGCGTTTATG
AACCAATTCGATACCTGATTTCTGGAGAGACCTGTCTGTTTGGCCAACATCAGTTTGTCT
GTATCAGTTGGATAAGGATGCAAGAAGTGATCGAAGAGCCAAGCCCTTAGCACGGTGACT
GCACGTTCTGGTAAGCCCCGGTGCGGTCTCCAGACAGGAGCATGGTTGTC

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR2EN79TF 715 0 0
CACCGCTACTGCCAC*GTCAAGTCCAA*CCTCTGAGCAGT*GTCATCGGAAAAGGCTCCG
GCAACCCAATCTGATGATGAAGCCCTAACGTCGACGACACTCCTCCATTTGTGCTGCTAC
TCATCCCCGCTACATTCGACGACGCAATACCGTAGGAGAAGCCAACCGCGCCGCCGCTAC
CACTGTTTCCAGCGTTCATAAAGTTGTTATTATTGTTGGTGGTGGTACCATGAACGCCGT
CGTTTTGCACCGGCCTTGCGGGAGATGAGTTGTTGTTAGCCCTTTGTTGAGCCGGGGAGG
AAGAAGGGTTGTTGTTATCGGGGAGGACGGCGGTGGTGTTACGTTCGTCTCTCCAAGAAG
AAGAAGAAGGTCTCTGAGATTGTCGAGTCTCTAGCATATGAATCTCTTCCACCATCGGCT
TCCATACCCTAACTCGTGCGTTTATGAACCAATTCGATACCTGATTTCTGGAGAGACCTG
TCTGTTTAGCCAACATGAGTTTGTCTGTATCAGTTGGATAAGGATGCAAGAAGTGATCGA
AGAGCCAAGCCCTTAGCACGGTGACTGCACGTTCTGGTAAGCCCCGGTGCGGTCTCCAGA
CAGGAGCATGGTTGTCAGGAAATCCATGTCTTTGACCAGCAGAACACAAGCCTCTACTAC
TATCACTTCCTCCAAATCGCATAGACTCGGTTCTATTCTCAGTTATCATCAGATC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 3

CO CL3747Contig1 999 3 35 U
GGTGAATTACTGAAATTGAAGAAATACTGATACAATCCGATAGGGTAATTCTCAACAGAA
CAAAATACAACTCCAAGAAAATCTCAACAAGAGTTTTATTAAAGTAAAGAGAAAAACATG
AACCAAAAACCAAATAACATAAAACATCCTTCTCCTGCATTCATCAGCAGAGGGAGTTGC
AGGCATATACTCAGTACATGCTGTACTTGTCACTGGCCCCTTCAGGTCGAATGAGCTTGT
AGATGGACATAGCAATTGGAAGAATGGCAGTGAGAGCAATCTGCAACTGATCCGAGCTGC
TGGTTCGGACTGTGATCTGCCCGCTCATCTTGTTGTTAAGCCCTGCGCGAAGCGCTATCT
TTGAGTTCCTTCCAACAGAAACTTGAGATTGAAGGTTGCCTCCGAGGGCTAAATCACCTC
TCCACTTCACCAGAAACAGTCCTAAAGAGTGTTGGTCCTGGCCTATTGGGAAATCAGCTT
CCTTGAGCCTGGCCTCCAGGTTCGCACCATAAGCCGCGTCTCCCTGTGATCGCATGGTCC
CTGTACTGCCCACAAGCACAAATCTTTTACCAAGTGATATTTGGTCCTCGACTTTGACAC
CAGTGGCAATGTTCTCGCCCAAGAAAGTCACTGAACCTCCGAGAGTTGTCTTGTTCTTCT
TAAAGTTCTTGAATTTGGTTTCTCCTCTGACCACATATGCAAGCTGCTTACCTACATTCT
GGATATCGAAACCTGCCATGGTGGAGCCACTTTCACCGTGCTTAGCAGACTCGGATGAGT
CCAGATGAATGTTGAACTCTTTCTTGTCCTTGGTGGTTTGGACAGTAGCTGTACAGGGAA
CCGGCTTGCTATAGCAAGACTGTATTCTGCATTGACACCGTCATACCCACAGTCATGGTC
CCAACCATGGGTATCCAATACCGGCCTGGTTAGGAGCTGTGAAGTGGGTTCCAGGAAACG
GTATCGGTAAGCTGAATTATCACTGTCAAATGAAGGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC52JQ U 1
AF RR2FP79JQ U 29
AF RR2FP79TF C 309
BS 1 72 RR2AC52JQ
BS 73 73 RR2FP79JQ
BS 74 106 RR2AC52JQ
BS 107 107 RR2FP79JQ
BS 108 223 RR2AC52JQ
BS 224 224 RR2FP79JQ
BS 225 320 RR2AC52JQ
BS 321 321 RR2FP79JQ
BS 322 346 RR2AC52JQ
BS 347 347 RR2FP79JQ
BS 348 388 RR2AC52JQ
BS 389 389 RR2FP79JQ
BS 390 391 RR2AC52JQ
BS 392 392 RR2FP79JQ
BS 393 415 RR2AC52JQ
BS 416 416 RR2FP79JQ
BS 417 451 RR2AC52JQ
BS 452 452 RR2FP79JQ
BS 453 491 RR2AC52JQ
BS 492 492 RR2FP79JQ
BS 493 517 RR2AC52JQ
BS 518 518 RR2FP79JQ
BS 519 562 RR2AC52JQ
BS 563 563 RR2FP79JQ
BS 564 568 RR2AC52JQ
BS 569 569 RR2FP79JQ
BS 570 576 RR2AC52JQ
BS 577 577 RR2FP79JQ
BS 578 640 RR2AC52JQ
BS 641 641 RR2FP79JQ
BS 642 661 RR2AC52JQ
BS 662 662 RR2FP79JQ
BS 663 745 RR2AC52JQ
BS 746 832 RR2FP79JQ
BS 833 999 RR2FP79TF

RD RR2AC52JQ 745 0 0
GGTGAATTACTGAAATTGAAGAAATACTGATACAATCCGATAGGGTAATTCTCAACAGAA
CAAAATACAACTTCAAGAAAATCTCAACAAGAGTTTTATTAAAGTAGAGAGAAAAACATG
AACCAAAAACCAAATAACATAAAACATCCTTCTCCTGCATTCATCAGCAGAGGGAGTTGC
AGGCATATACTCAGTACATGCTGTACTTGTCACTGGCCCCTTCTGGTCGAATGAGCTTGT
AGATGGACATAGCAATTGGAAGAATGGCAGTGAGAGCAATCTGCAACTGATCCGAGCTGC
TGGTTCGGACTGTGATCTGCTCGCTCATCTTGTTGTTAAGCCCTGCACGAAGCGCTATCT
TTGAGTTCCTTCCAACAGAAACTTGAGACTGGAGGTTGCCTCCGAGGGCTAAATCGCCTC
TCCACTTCACCAGAAACAGTCCTAAAGAGTGCTGGTCCTGGCCTATTGGGAAATCAGCTT
CCTTGAGCCTGACCTCCAGGTTCGCACCATAAGCCGCATCTCCCTGTGATCGCATGGTCC
CTGTACTGCCCACAAGCACAAACCTTTTCCCAAGTGTTATTTGGTCCTCGACTTTGACAC
CAGTGGCAATGTTCTCGCCCAAGAAAGTCACTGAACCTCCAAGAGTTGTCTTGTTCTTCT
TCAAGTTCTTGAATTTGGTTTCTCCTCTGACCACATATGCAAGCTGCTTACCTACATTCT
GGATATCGAAACCTGCCATGGTGGA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2FP79JQ 804 0 0
GG
TACAATCCGATAGGGTAATTCTCAACAGAACAAAATACAACTCCAAGAAAATCTCAACAA
GAGTTTTATTAAAGTAAAGAGAAAAACATGAACCAAAAACCAAATAACATAAAACATCCT
TCTCCTGCATTCATCAGCAGAGGGAGTTGCAGGCATATACTCAGTACATGCTGTACTTGT
CACTGGCCCCTTCAGGTCGAATGAGCTTGTAGATGGACATAGCAATTGGAAGAATGGCAG
TGAGAGCAATCTGCAACTGATCCGAGCTGCTGGTTCGGACTGTGATCTGCCCGCTCATCT
TGTTGTTAAGCCCTGCGCGAAGCGCTATCTTTGAGTTCCTTCCAACAGAAACTTGAGATT
GAAGGTTGCCTCCGAGGGCTAAATCACCTCTCCACTTCACCAGAAACAGTCCTAAAGAGT
GTTGGTCCTGGCCTATTGGGAAATCAGCTTCCTTGAGCCTGGCCTCCAGGTTCGCACCAT
AAGCCGCGTCTCCCTGTGATCGCATGGTCCCTGTACTGCCCACAAGCACAAATCTTTTAC
CAAGTGATATTTGGTCCTCGACTTTGACACCAGTGGCAATGTTCTCGCCCAAGAAAGTCA
CTGAACCTCCGAGAGTTGTCTTGTTCTTCTTAAAGTTCTTGAATTTGGTTTCTCCTCTGA
CCACATATGCAAGCTGCTTACCTACATTCTGGATATCGAAACCTGCCATGGTGGAGCCAC
TTTCACCGTGCTTAGCAGACTCGGATGAGTCCAGATGAATGTTGAACTCTTTCTTGTCCT
TGGTGGTTTGGACAGTAGCTGT

QA 3 804 3 804
DS 

RD RR2FP79TF 691 0 0
ACTGTGATCTGCCCGCTCATCT*GTTGTTAAGCC*TGCGCGAAGCGCTATCTTTGAGT*C
CTTCCAACAGAGACTTGAGATTGAAGGTTGCCTCCGAGGGCTAAATCACCTCTCCACTTC
ACCAGAGACAGTCCTAAAGAGTGTTGGTCCTGGCCTATTGGGAAATCAGCTTCCTTGAGC
CTGGCCTCCAGGTTCGCACCATAAGCCGCGTCTCCCTGTGATCGCATGGTCCCTGTACTG
CCCACAAGCACAAATCTTTTACCAAGTGATATTTGGTCCTCGACTTTGACACCAGTGGCA
ATGTTCTCGCCCAAGAAAGTCACTGAACCTCCGAGAGTTGTCTTGTTCTTCTTAAAGTTC
TTGAATTTGGTTTCTCCTCTGACCACATATGCAAGCTGCTTACCTACATTCTGGATATCG
AAACCTGCCATGGTGGAGCCACTTTCACCGTGCTTAGCAGACTCGGATGAGTCCAGATGA
ATGTTGAACTCTTTCTTGTCCTTGGTGGTTTGGACAGTAGCTGTACAGGGAACCGGCTTG
CTATAGCAAGACTGTATTCTGCATTGACACCGTCATACCCACAGTCATGGTCCCAACCAT
GGGTATCCAATACCGGCCTGGTTAGGAGCTGTGAAGTGGGTTCCAGGAAACGGTATCGGT
AAGCTGAATTATCACTGTCAAATGAAGGTGC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL3748Contig1 684 2 2 U
GGAATGCGAAGAGAGACAGGGATGGCTCGAGCGTGGACGAAGACGATGGTGATGATTATG
ATGTTGACATCGACGATCTCAGCGAAAGAGCAGCTAAGCACTAAAGAGTGCGAGGATCTA
GGGTTCACCGGTCTCGCTCTCTGCTCCGATTGCCACTCACTCTCTGAATACGTCAAGGAT
CAAGAGTTGGTATCTGATTGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATTCTGAGGATTCCATGAGT
AAGGTTACTTACTCAGGGGCTATATTAGAGGTGTGTATGAGGAAGCTGGTTTTCTACCCT
GAGATTGTTGGTTTTATTGAAGAAGAGAAAGAAAAGTTCCCTAGCGTTAATGTTCAGTAC
ATTTTCAACTCACCACCCAAGTTGATCATGCTGGATGAAGATGGTGAACATAAGGAAACT
ATAAGAATCGACAACTGGAAACGTGAACATCTTCTGCAGTACATGCGGGAGAAGATCAAG
CCTACTTCAGCAAGTTAGTGTGATCACTATGTTGTGCTGAGTACCTTTTTCAAACAGTTC
ATCTTATGGTTAAACAACACATTGTGGTCGTTACTATCTCCCAGCTATTTGCGTTAGTAG
TCTGTATGTTCTGAACCTTTGCAATCTCATAATTAATGACTATTATTTGATGCTGTTATG
AAAGGGTAATGAGAATCTTGTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DJ18JQ C 1
AF RR2DJ18TF U 8
BS 1 10 RR2DJ18JQ
BS 11 684 RR2DJ18TF

RD RR2DJ18JQ 684 0 0
GGAATGCGAAGAGAGACAGGGATGGCTCGAGCGTGGACGAAGACGATGGTGATGATTATG
ATGTTGACATCGACGATCTCAGCGAAAGAGCAGCTAAGCACTAAAGAGTGCGAGGATCTA
GGGTTCACCGGTCTCGCTCTCTGCTCCGATTGCCACTCACTCTCTGAATACGTCAAGGAT
CAAGAGTTGGTATCTGATTGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATTCTGAGGATTCCATGAGT
AAGGTTACTTACTCAGGGGCTATATTAGAGGTGTGTATGAGGAAGCTGGTTTTCTACCCT
GAGATTGTTGGTTTTATTGAAGAAGAGAAAGAAAAGTTCCCTAGCGTTAATGTTCAGTAC
ATTTTCAACTCACCACCCAAGTTGATCATGCTGGATGAAGATGGTGAACATAAGGAAACT
ATAAGAATCGACAACTGGAAACGTGAACATCTTCTGCAGTACATGCGGGAGAAGGTCAAG
CCTACTTCAGCAAGTTAGTGTGATCACTATGTTGTGCTGAGTACCTTTTTCAAACAGTTC
ATCTTATGGTTAAACAACACATTGTGGTCGTTACTATCTCCCAGCTATTTGCGTTAGTAG
TCTGTATGTTCTGAACCTTTGCAATCTCATAATTAATGACTATTATTTGATGCTGTTATG
AAAGGGTAATGAGAATCTTGTACT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2DJ18TF 677 0 0
GAA
GAGAGACAGGGATGGCTCGAGCGTGGACGAAGACGATGGTGATGATTATGATGTTGACAT
CGACGATCTCAGCGAAAGAGCAGCTAAGCACTAAAGAGTGCGAGGATCTAGGGTTCACCG
GTCTCGCTCTCTGCTCCGATTGCCACTCACTCTCTGAATACGTCAAGGATCAAGAGTTGG
TATCTGATTGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATTCTGAGGATTCCATGAGTAAGGTTACTT
ACTCAGGGGCTATATTAGAGGTGTGTATGAGGAAGCTGGTTTTCTACCCTGAGATTGTTG
GTTTTATTGAAGAAGAGAAAGAAAAGTTCCCTAGCGTTAATGTTCAGTACATTTTCAACT
CACCACCCAAGTTGATCATGCTGGATGAAGATGGTGAACATAAGGAAACTATAAGAATCG
ACAACTGGAAACGTGAACATCTTCTGCAGTACATGCGGGAGAAGATCAAGCCTACTTCAG
CAAGTTAGTGTGATCACTATGTTGTGCTGAGTACCTTTTTCAAACAGTTCATCTTATGGT
TAAACAACACATTGTGGTCGTTACTATCTCCCAGCTATTTGCGTTAGTAGTCTGTATGTT
CTGAACCTTTGCAATCTCATAATTAATGACTATTATTTGATGCTGTTATGAAAGGGTAAT
GAGAATCTTGTACT

QA 4 677 4 677
DS 



AS 1 3

CO CL3749Contig1 1003 3 16 U
ACAACGAAATGACAATTTTATTCAATACTTCATTAAACCATCCCAAAGGGCATATACATA
ACTTAGTACAGTGTTCACACAGATCGTAATACAGTGCCTGGGCAAAAAAAAACACGAGGG
CTCTGGCAAAAAAAGAAAAACAACAAAGAAAAAACTCTATAATAGAGTGAGTTTGTTGCA
ACAAAAGCCAGAGCAAAACCTCTAAGAAAGAACCCATGGCAACCTGAACAAGAATCTTGA
ACACGTACACGTCACACAAAGACCCTTTCGAGGAAAACCAAACTTCAACAAGACAAAAGC
AACGCATAAAACAAACCAAACAGGAGATGATAAACCCTAAAATCTC*GGTAATACCCGGT
AAAGTATATTCTCAAGCAACCACACGACATTTCCGGTTTCATGGTAAGCTAGGGTTTCAG
GGAAACTCTAGCAAAAACAACATTGACTGGAAAAAGAAACCGGAAGCCGAACCACTTGGA
AAAACCGGGTAATACCTGAGCCTAGCGAGAGAGAGACACACCTGAAAAGGAAGCTGACAC
TTAACTTGGAACAGTACTATTATTATAGGGTGGATAAAGTTGAACGTGGAATTGGTGGGA
TCAGGAGAGGATGTCGCATTTGTAAAGCCTCTCGACTAAGAAGTCGACAGTGGAAGTGGA
AATGGATCGGCACTGTTGGAGATTTAATCCGAGTAAAGTCGAACCCAGCTTAACGATTGC
TGGTAAGCTCTTGTCAGTGACCATAGAGCAACCCGCCACGGATAGGATCTGCAGTTTGAG
TTTTTCAGAGGAAGCCAACGCTTGAACTCCGGAATCTGAGACCGAGCATTTCGAAAGATC
CAAGTCGCTTAGAATCTGGCAGTTCGCTGCGATGGAGACTAGGCTGGCGTCAGAGATCTT
GCTACATCCATCCATGTTCAAGACTTCGAGAGTCGAGCCGTTACGAGCAGAGATGGCGGA
GACAACTCTGTCTGTCAAACCGGAACAGCCATTGAAGTTAACC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB76JQ U 1
AF RR2C818JQ U 1
AF RR2AB76TF C 239
BS 1 12 RR2AB76JQ
BS 13 13 RR2C818JQ
BS 14 102 RR2AB76JQ
BS 103 103 RR2C818JQ
BS 104 132 RR2AB76JQ
BS 133 133 RR2C818JQ
BS 134 134 RR2AB76JQ
BS 135 135 RR2C818JQ
BS 136 137 RR2AB76JQ
BS 138 138 RR2C818JQ
BS 139 197 RR2AB76JQ
BS 198 198 RR2C818JQ
BS 199 241 RR2AB76JQ
BS 242 242 RR2C818JQ
BS 243 863 RR2AB76JQ
BS 864 1003 RR2AB76TF

RD RR2AB76JQ 878 0 0
ACAACGAAATGATAATTTTATTCAATACTTCATTAAACCATCCCAAAGGGCATATACATA
ACTTAGTACAGTGTTCACACAGATCGTAATACAGTGCCTGGGGAAAAAAAAACACGAGGG
CTCTGGCAAAAAGA*AACAACAACAAAGAAAAAACTCTATAATAGAGTGAGTTTGTTGCA
ACAAAAGCCAGAGCAAA*CCTCTAAGAAAGAACCCATGGCAACCTGAACAAGAATCTTGA
AGACGTACACGTCACACAAAGACCCTTTCGAGGAAAACCAAACTTCAACAAGACAAAAGC
AACGCATAAAACAAACCAAACAGGAGATGATAAACCCTAAAATCTC*GGTAATACCCGGT
AAAGTATATTCTCAAGCAACCACACGACATTTCCGGTTTCATGGTAAGCTAGGGTTTCAG
GGAAACTCTAGCAAAAACAACATTGACTGGAAAAAGAAACCGGAAGCCGAACCACTTGGA
AAAACCGGGTAATACCTGAGCCTAGCGAGAGAGAGACACACCTGAAAAGGAAGCTGACAC
TTAACTTGGAACAGTACTATTATTATAGGGTGGATAAAGTTGAACGTGGAATTGGTGGGA
TCAGGAGAGGATGTCGCATTTGTAAAGCCTCTCGACTAAGAAGTCGACAGTGGAAGTGGA
AATGGATCGGCACTGTTGGAGATTTAATCCGAGTAAAGTCGAACCCAGCTTAACGATTGC
TGGTAAGCTCTTGTCAGTGACCATAGAGCAACCCGCCACGGATAGGATCTGCAGTTTGAG
TTTTTCAGAGGAAGCCAACGCTTGAACTCCGGAATCTGAGACCGAGCATTTCGAAAGATC
CAAGTCGCTTAGAATCTGGCAGT
TCGCTGCGATGGAGA

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR2C818JQ 875 0 0
G
CAACGAAATGACAATTTTATTCAATACTTCATTAAACCATCCCAAAGGGCATATACATAA
CTTAGTACAGTGTTCATACAGATCGTAATACAGTGCCTGGGCAAAAAAAAACACGAGGGC
TCTGGCAAAAAAAGAAAAACAACAAAGAAAAAACTCTATAATAGAGTGAGTTTGTTGCAA
CAAAAGCCAGAGCAAAACCTCTAAGAAAGAACCCATGGCAACCTGAACAAGAATCTTGAA
CACGTACACATCACACAAAGACCCTTTCGAGGAAAACCAAACTTCAACAAGACAAA*GCA
ACGCATAAAACAAACCAAACAGGAGATGATAAACCCTAAAATCTCAGGTAATACCCGGGT
AAGTATATTCTCAAGCAACCACACGACATTTCCGGTTTCATGGTAAGCTAGAGTTTCAGG
GAAACTCT*GCAAAAACAACATTGACTGGAAAAAGAAACCGGAAGCCGAACCACTTGGAA
AAACCGGGTAATACCTGAGCCTAGCGAGAGAGA**CACACCTGAAAAGGAAGCTGACACT
TAACTTGGAACAGTACTATTATTATAGGGTGGATAAAGTTGAACGTGGAATTGGTGGGAT
CAGGAGAGGATGTCGCATTTGTAAAGCCTCTCAACTAAGAAGTCGACAGTGGAAGTGGAA
ATGGATCGACACTGTTGGAGATTTAATCCCAGTAGAGTCGAACCCAGCTTAACGATGGCT
GGTAAGCTCTTGTCAGTGACCATAGAGCAACCCGCCATGGATAGGATCTGCAGTTTGAGT
TTTTCAGAGGAAGCCAACGCTTGAACTCCGGAATCTGAGACTGAGCATTTCGAAAGATCC
AAGTCGCTTAGAATCTGGCAGT
CACTGCATGGAG

QA 2 863 2 863
DS 

RD RR2AB76TF 765 0 0
GAAG
ACGTACACGTCACACAAAGACCCTTTCGAGGAAAACCAAACTTCAACAAGACAAAAGCAA
CGCATAAAACAAACCAAACAGGAGATGATAAACCCTAAAATCTC*GGTAATACCCGGTAA
AGTATATTCTCAAGCAACCACACGACATTTCCGGTTTCATGGTAAGCTAGGGTTTCAGGG
AAACTCTAGCAAAAACAACATTGACTGGAAAAAGAAACCGGAAGCCGAACCACTTGGAAA
AACCGGGTAATACCTGAGCCTAGCGAGAGAGAGACACACCTGAAAAGGAAGCTGACACTT
AACTTGGAACAGTACTATTATTATAGGGTGGATAAAGTTGAACGTGGAATTGGTGGGATC
AGGAGAGGATGTCGCATTTGTAAAGCCTCTCGACTAAGAAGTCGACAGTGGAAGTGGAAA
TGGATCGGCACTGTTGGAGATTTAATCCGAGTAAAGTCGAACCCAGCTTAACGATTGCTG
GTAAGCTCTTGTCAGTGACCATAGAGCAACCCGCCACGGATAGGATCTGCAGTTTGAGTT
TTTCAGAGGAAGCCAACGCTTGAACTCCGGAATCTGAGACCGAGCATTTCGAAAGATCCA
AGTCGCTTAGAATCTGGCAGTTCGCTGCGATGGAGACTAGGCTGGCGTCAGAGATCTTGC
TACATCCATCCATGTTCAAGACTTCGAGAGTCGAGCCGTTACGAGCAGAGATGGCGGAGA
CAACTCTGTCTGTCAAACCGGAACAGCCATTGAAGTTAACC

QA 5 765 5 765
DS 



AS 1 2

CO CL3750Contig1 815 2 4 U
GAAGAAGTTCAAGACCATCATTCACCCTGGAGAGGTTAACAGAATCAGGGAACTCCCACA
AAACAGTAAGATTATTGCTACTCACACTGATAGTCCTGATGTTCTCATTTGGGATGTTGA
CACCCAACCAAACCGTCATGCTGTGCTTGGTGCTGCAAATTCCCGTCCTGATTTGATACT
AACTGGACACCAAGACAATGCTGAATTTGCTCTTGCAATGTGCTCAACCGAACCCTTCGT
CCTCTCTGGAGGCAAGGACAAGTTAGTGGTTTTGTGGAGCATCCAGGACCACATCACAAC
GGTTGGTACTGATTCCAAATCATCTGGATCAATCATCAAACAGACTGGTGATAAGAGTGA
GAGTCCTTCTGTTGGCCCACGTGGTGTGTATCAAGGCCATGAAGATACGGTTGAAGATGT
CGCATTCAGCCCGACTAGTGCACAAGAATTCTGCAGTGTTGGTGACGATTCTTGCCTTAT
ACTGTGGGATGCAAGAACTGGGACTAGCCCTGTCACGAAGGTTGAAAAGGCGCATGATGC
TGATGTTCATTGTGTTGATTGGAATCCTCATGACGACAATCTGATCTTGACAGGGTCTGC
AGACAACACTGTCCGGTTGTATGATCGTAGGAACCTTACCTCAAATGGAGTTGGTACGCC
TATATACAAATTTGAGGGCCACAAAGCTGCTGTTCTTTGCGTTCAGTGGTCTCCTGATAA
GGCATCTGTTTTTGGGAGTTCCGCAGAGATGGTCTCTTGACATCTGGGATATGACAGGTC
AGTAAGAAGTCTGATCGTGCAGCTAAAACCCTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ83TF U 1
AF RR2C049TF U 45
BS 1 679 RR2EZ83TF
BS 680 680 RR2C049TF
BS 681 731 RR2EZ83TF
BS 732 815 RR2C049TF

RD RR2EZ83TF 731 0 0
GAAGAAGTTCAAGACCATCATTCACCCTGGAGAGGTTAACAGAATCAGGGAACTCCCACA
AAACAGTAAGATTATTGCTACTCACACTGATAGTCCTGATGTTCTCATTTGGGATGTTGA
CACCCAACCAAACCGTCATGCTGTGCTTGGTGCTGCAAATTCCCGTCCTGATTTGATACT
AACTGGACACCAAGACAATGCTGAATTTGCTCTTGCAATGTGCTCAACCGAACCCTTCGT
CCTCTCTGGAGGCAAGGACAAGTTAGTGGTTTTGTGGAGCATCCAGGACCACATCACAAC
GGTTGGTACTGATTCCAAATCATCTGGATCAATCATCAAACAGACTGGTGATAAGAGTGA
GAGTCCTTCTGTTGGCCCACGTGGTGTGTATCAAGGCCATGAAGATACGGTTGAAGATGT
CGCATTCAGCCCGACTAGTGCACAAGAATTCTGCAGTGTTGGTGACGATTCTTGCCTTAT
ACTGTGGGATGCAAGAACTGGGACTAGCCCTGTCACGAAGGTTGAAAAGGCGCATGATGC
TGATGTTCATTGTGTTGATTGGAATCCTCATGACGACAATCTGATCTTGACAGGGTCTGC
AGACAACACTGTCCGGTTGTATGATCGTAGGAACCTTACCTCAAATGGAGTTGGTACGCC
TATATACAAATTTGAGGGC*ACAAAGCTGCTGTTCTTTGCGTTCAGTGGTCTCCTGATAA
GGCATCTGTTT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2C049TF 771 0 0
G
CAGGGAACTCCCACAAAACAGTAAGATTATTGCTACTCACACTGATAGTCCTGATGTTCT
CATTTGGGATGTTGACACCCAACCAAACCGTCATGCTGTGCTTGGTGCTGCAAATTCCCG
TCCTGATTTGATACTAACTGGACACCAAGACAATGCTGAATTTGCTCTTGCAATGTGCTC
AACCGAACCCTTCGTCCTCTCTGGAGGCAAGGACAAGTTAGTGGTTTTGTGGAGCATCCA
GGACCACATCACAACGGTTGGTACTGATTCCAAATCATCTGGATCAATCATCAAACAGAC
TGGTGATAAGAGTGAGAGTCCTTCTGTTGGCCCACGTGGTGTGTATCAAGGCCATGAAGA
TACGGTTGAAGATGTCGCATTCAGCCCGACTAGTGCACAAGAATTCTGCAGTGTTGGTGA
CTATTCTTGCCTTATACTGTGGGATGCAAGAACTGGGACTAGCCCTGTCACGAAGGTTGA
AAAGGCGCATGATGCTGATGTTCATTGTGTTGATTGGAATCCTCATGACGACAATCTGAT
CTTGACAGGGTCTGCAGACAACACTGTCCGGTTGTATGATCGTAGGAACCTTACCTCAAA
TGGAGTTGGTACGCCTATATACAAATTTGAGGGCCACAAAGCTGCTGTTCTTTGCGTTCA
GTGGTCTCCTGATAAG*CATCTGTTTTTGGGAGTTCCGCAGAGATGGTCTCTTGACATCT
GGGATATGACAGGTCAGTAAGAAGTCTGATCGTGCAGCTAAAACCCTGCG

QA 2 771 2 771
DS 



AS 1 3

CO CL3751Contig1 670 3 1 U
GGACACGGCGTTGCGTGACACTATTATTCTCCTCCCTCCCTTTTTGTCTCTTCAATTATT
CTTCTCCGAGCTGTAAAAAGATTCTCTCCCAACTCTCTCTCGCCGGCTCTTCAATGGAAG
ACTACAACCGTCAAAGAGCCTACGGAGACGGAGGGATGCAGATCCAGCCTTACAACGGCG
GCGGTCCGGGAACCGGCGACTTCAGGAGCTATAGCACCTCGTACGCGACGGAGAACAACA
TCTACGATATCAAGAAGGAGAAATCTATAGCTAGGTCGAAGTCTTGGGGGATAACGGACC
CGGAGCTATTGAGAAAGAAAAGGGTCGCGAGCTACAAGATGTATAGTGTTGAAGGCAAAG
TCAAAGGCTCTTTTAGAAAAAGTTTCAGATGGCTTAAGCAGAGGTACACACAGGTCGTCT
ATGGCTGGTGGTGATCAAAGAGTTTCCCACCTTTTTAATCTTATTTGAGCTTTGAGTGTT
CTTTCTAATTTGATCTTGATTTCGTCAAGTAATTATAATTGTGTTTGCTCGCTTATATAT
CTTTTTTTTTTCTTTTTACAAACTCTCTTATATATCGTTTTTTGGGTCGAAATTCTCTTA
TATATTTATGTGTCGTTTTCTTCAATGTAATTGTGCTGCCCGCAAATTATATATGATCAT
TAGTTTGCAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2CU63JQ C 1
AF RR2CU63TF U 1
AF RR2B687TF U 336
BS 1 670 RR2CU63TF

RD RR2CU63JQ 654 0 0
GGACACGGCGTTGCGTGACACTATTATTCTCCTCCCTCCCTTTTTGTCTCTTCAATTATT
CTTCTCCGAGCTGTAAAAAGATTCTCTCCCAACTCTCTCTCGCCGGCTCTTCAATGGAAG
ACTACAACCGTCAAAGAGCCTACGGAGACGGAGGGATGCAGATCCAGCCTTACAACGGCG
GCGGTCCGGGAACCGGCGACTTCAGGAGCTATAGCACCTCGTACGCGACGGAGAACAACA
TCTACGATATCAAGAAGGAGAAATCTATAGCTAGGTCGAAGTCTTGGGGGATAACGGACC
CGGAGCTATTGAGAAAGAAAAGGGTCGCGAGCTACAAGATGTATAGTGTTGAAGGCAAAG
TCAAAGGCTCTTTTAGAAAAAGTTTCAGATGGCTTAAGCAGAGGTACACACAGGTCGTCT
ATGGCTGGTGGTGATCAAAGAGTTTCCCCCCTTTTTAATCTTATTTGAGCTTTGAGTGTT
CTTTCTAATTTGATCTTGATTTCGTCAAGTAATTATAATTGTGTTTGCTCGCTTATATAT
CTTTTTTTTTTCTTTTTACAAACTCTCTTATATATCGTTTTTTGGGTCGAAATTCTCTTA
TATATTTATGTGTCGTTTTCTTCAATGTAATTGTGCTGCCCGCAAA
ATTATATA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2CU63TF 670 0 0
GGACACGGCGTTGCGTGACACTATTATTCTCCTCCCTCCCTTTTTGTCTCTTCAATTATT
CTTCTCCGAGCTGTAAAAAGATTCTCTCCCAACTCTCTCTCGCCGGCTCTTCAATGGAAG
ACTACAACCGTCAAAGAGCCTACGGAGACGGAGGGATGCAGATCCAGCCTTACAACGGCG
GCGGTCCGGGAACCGGCGACTTCAGGAGCTATAGCACCTCGTACGCGACGGAGAACAACA
TCTACGATATCAAGAAGGAGAAATCTATAGCTAGGTCGAAGTCTTGGGGGATAACGGACC
CGGAGCTATTGAGAAAGAAAAGGGTCGCGAGCTACAAGATGTATAGTGTTGAAGGCAAAG
TCAAAGGCTCTTTTAGAAAAAGTTTCAGATGGCTTAAGCAGAGGTACACACAGGTCGTCT
ATGGCTGGTGGTGATCAAAGAGTTTCCCACCTTTTTAATCTTATTTGAGCTTTGAGTGTT
CTTTCTAATTTGATCTTGATTTCGTCAAGTAATTATAATTGTGTTTGCTCGCTTATATAT
CTTTTTTTTTTCTTTTTACAAACTCTCTTATATATCGTTTTTTGGGTCGAAATTCTCTTA
TATATTTATGTGTCGTTTTCTTCAATGTAATTGTGCTGCCCGCAAATTATATATGATCAT
TAGTTTGCAT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2B687TF 333 0 0
G
AGATGTATAGTGTTGAAGGCAAAGTCAAAGGCTCTTTTAGAAAAAGTTTCAGATGGCTTA
AGCAGAGGTACACGCAGGTCGTCTATGGCTGGTGGTGATCAAAGAGTTTCCCACCTTTTT
AATCTTATTTGAGCTTTGAGTGTTCTTTCTATTTTGATCTTGATTTCGTCAAGTAATTAT
AATTGTGTTTGCTCGCTTATATATCTTTTTTTTT*CTTTTTACAAACTCTCTTATATATC
GTTTTTTGGGTCGAAATTCTCTTATATATTTATGTGTCGTTTTCTTCAATGTAATTGTGC
TGCCCGCAAATTATATATGATCATTAGTTTGC

QA 2 333 2 333
DS 



AS 1 3

CO CL3752Contig1 965 3 4 U
GGTAGAAAACTCTTCTTTTTTTTTGCGTTTCTTATATACATCTGCTGACTAAACATTACA
TTATGACGGTATCCTATATTAAGGAGTGTGTAATTGTCAAAGCAAAATAAAAAAAAAGTG
TTGTACTTTACATGAAAGTTGAGAGGAGGACCAGATTAGGTGCTAAGTGCTGTGTGTAGA
CGTACATGAGCTGCACGGTTTGATTGCATTATGAGAGATGGACGATGAAGAGAGAATCAG
AGGTCACGTCTACACATGGGACAAGAACCGTGCCTAAGGAGCCATTTGTCTATGCAAGGT
AAGTGGAACATGTGATGACAATGAGGCAAGCTTCTTACTGTTTCACCTAGCTGGAAATCC
TGAAGACAAACAGAACAGGAGTCTCTGCTCTCTGATGCATCTGTGTTGTTGTTGCCAGTG
ATAGTCAACTTTGGGATCTTCTCAACAAGGTCTCCTGTTAGACCCTTTGGGCCTCCTGTC
TCGAATAGGCTCGAGAGATCGTCATAGGATGCATCCAAAGCTCCCATTTGACTTTGCACT
GCGCTTAGCATTGCAGGACCTATGCGCTCCCTTACGAGTCTCCCGCTCAAAAGACTAACA
ATGACATCAATCAAGTAGAGAAGGCATCCGAAACAAGACTCATCAGATTTCCAAAGATCG
AGGGATGATTCAAAGACCTCTATGGAGAAAACAGCTCCTGAAATGGCACCAATGGCTGCT
CCTCTGATGAACCCGCTCTCTGTTTCTTGGCCTATCAAAGCTCCTGTAAGTGCCCCTAAC
AATGTGCCCACTAGGGAGAAGAAGAAGGTTAAGATCACGGATACGATGGTGCCAAGAACA
GCGGAGACGAGGAAATGACAAGCGTCTTTGATCCGTTCGACGAAGTTATCAAGAAGAGAG
GGACACGGCGAGAGAGGACAAAACCCAGATTGGAATCTGTAATAAGATGCCATGTTTTCT
GGTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2FW58JQ U 4
AF RR2C305JQ U 1
AF RR2C305TF C 166
BS 1 116 RR2C305JQ
BS 117 117 RR2FW58JQ
BS 118 790 RR2C305JQ
BS 791 965 RR2C305TF

RD RR2FW58JQ 293 0 0
AGAAAACTCTTCTTTTTTTTTGCGTTTCTTATATACATCTGCTGACTAAACATTACATTA
TGACGGTATCCTATATTAAGGAGTGTGTAATTGTCAAAGCAAAATAAAAAAAAAGTGTTG
TACTTTACATGAAAGTTGAGAGGAGGACCAGATTAGGTGCTAAGTGCTGTGTGTAGACGT
ACATGAGCTGCACGGTTTGATTGCATTATGAGAGATGGACGATGAAGAGAGAATCAGAGG
TCACGTCTACACATGGGACAAGAACCGTGCCTAAGGAGCCATTTGTCTATGCA

QA 1 293 1 293
DS 

RD RR2C305JQ 790 0 0
GGTAGAAAACTCTTCTTTTTTTTTGCGTTTCTTATATACATCTGCTGACTAAACATTACA
TTATGACGGTATCCTATATTAAGGAGTGTGTAATTGTCAAAGCAAAATAAAAAAAA*GTG
TTGTACTTTACATGAAAGTTGAGAGGAGGACCAGATTAGGTGCTAAGTGCTGTGTGTAGA
CGTACATGAGCTGCACGGTTTGATTGCATTATGAGAGATGGACGATGAAGAGAGAATCAG
AGGTCACGTCTACACATGGGACAAGAACCGTGCCTAAGGAGCCATTTGTCTATGCAAGGT
AAGTGGAACATGTGATGACAATGAGGCAAGCTTCTTACTGTTTCACCTAGCTGGAAATCC
TGAAGACAAACAGAACAGGAGTCTCTGCTCTCTGATGCATCTGTGTTGTTGTTGCCAGTG
ATAGTCAACTTTGGGATCTTCTCAACAAGGTCTCCTGTTAGACCCTTTGGGCCTCCTGTC
TCGAATAGGCTCGAGAGATCGTCATAGGATGCATCCAAAGCTCCCATTTGACTTTGCACT
GCGCTTAGCATTGCAGGACCTATGCGCTCCCTTACGAGTCTCCCGCTCAAAAGACTAACA
ATGACATCAATCAAGTAGAGAAGGCATCCGAAACAAGACTCATCAGATTTCCAAAGATCG
AGGGATGATTCAAAGACCTCTATGGAGAAAACAGCTCCTGAAATGGCACCAATGGCTGCT
CCTCTGATGAACCCGCTCTCTGTTTCTTGGCCTATCAAAGCTCCTGTAAGTGCCCCTAAC
AATGTGCCCA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2C305TF 800 0 0
AGTGCTGTGTGTAGACGTACATGAGCTGCACGGTTTGATTGCAT*ATGAGAGATGGACGA
TGAAGAGAGAATCAGAGGTCACGTCTACACATGGGACAAGAACCGTGC*TAAGGAGCCAT
TTGTCTATGCAAGGTAAGTGGAACATGTGATGACAATGAGGCAAGCTTCTTACTGTTTCA
CCTAGCTGGAAATCCTGAAGACAAACAGAACAGGAGTCTCTGCTCTCTGATGCATCTGTG
TTGTTGTTGCCAGTGATAGTCAACTTTGGGATCTTCTCAACAAGGTCTCCTGTTAGACCC
TTTGGGCCTCCTGTCTCGAATAGGCTCGAGAGATCGTCATAGGATGCATCCAAAGCTCCC
ATTTGACTTTGCACTGCGCTTAGCATTGCAGGACCTATGCGCTCCCTTACGAGTCTCCCG
CTCAAAAGACTAACAATGACATCAATCAAGTAGAGAAGGCATCCGAAACAAGACTCATCA
GATTTCCAAAGATCGAGGGATGATTCAAAGACCTCTATGGAGAAAACAGCTCCTGAAATG
GCACCAATGGCTGCTCCTCTGATGAACCCGCTCTCTGTTTCTTGGCCTATCAAAGCTCCT
GTAAGTGCCCCTAACAATGTGCCCACTAGGGAGAAGAAGAAGGTTAAGATCACGGATACG
ATGGTGCCAAGAACAGCGGAGACGAGGAAATGACAAGCGTCTTTGATCCGTTCGACGAAG
TTATCAAGAAGAGAGGGACACGGCGAGAGAGGACAAAACCCAGATTGGAATCTGTAATAA
GATGCCATGTTTTCTGGTCC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL3753Contig1 757 2 5 U
TCTCTGTTCTCGGAAAATTCGGAGCTGTGTTTGCGTCAATCCCTGCACCCATTATTGCTG
CTCTATACTGTCTCTTCTTTGCCTACGTAGGAGCTGGAGGATTGAGTTTTCTTCAGTTCT
GCAACTTAAACAGCTTCAGGACTAAGTTCATCTTAGGCTTCTCTGTCTTTCTTGGCTTGT
CAATCCCTCAGTACTTCAACGATATGGTGAATGTCCCGTTGTCATCAGAACCTTTTGTTG
CTGGCATGGTGGCCTTCTTCCTGGACAACACACTGCACAAGAAAGATTCATCGATAAGGA
AAGACAGAGGAAAGCATTGGTGGGACAAGTTTAGATCTTTCAAAGGTGACACAAGAAGTG
AAGAGTTCTACTCTCTTCCTTTCAACCTCAACAAGTATTTCCCTTCTGTCTAGAAGAGAA
GAGAAGAAAGAGAAGAAGAAGCAAAGAGTTTACCGGGAAAAGAAAAACAAAGAAAATGGT
GAAAAGTGAAAACTCAAGAGTTTCTCATTGTTGCCTCGAGTTTCTTGACAACCTCTGTGT
CTTGGTTCTTTTGTTCTGTTCTGTTCCGTTCACAACTTCGGAAACCTTTTTAAATATCTT
TCACATTTTATAGTCTTTCTTGTTTACGATCATGAATCTAAGAATCTTCAGTTGTATTGT
TGCTTACTATCTCTCCCTAATGCGTTTGTCTTTGTAAATCTGAGGGTACACGACTTTGTT
ATTTTGATTAGTTTCTAAATAAGTATTTAGTTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN39TF U 352
AF RR2C202JQ C 1
BS 1 351 RR2C202JQ
BS 352 422 RR2BN39TF
BS 423 423 RR2C202JQ
BS 424 610 RR2BN39TF
BS 611 757 RR2C202JQ

RD RR2BN39TF 259 0 0
CAAGAAGTGAAGAGTTCTACTCTCTTCCTTTCAACCTCAACAAGTATTTCCCTTCTGTCT
AGAAGAGAAGATAAGAAAGAGAAGAAGAAGCAAAGAGTTTACCGGGAAAAGAAAAACAAA
GAAAATGGTGAAAAGTGAAAACTCAAGAGTTTCTCATTGTTGCCTCGAGTTTCTTGACAA
CCTCTGTGTCTTGGTTCTTTTGTTCTGTTCTGTTCCGTTCACAACTTCGGAAACCTTTTT
AAATATCTTTCACATTTTA

QA 1 259 1 259
DS 

RD RR2C202JQ 757 0 0
TCTCTGTTCTCGGAAAATTCGGAGCTGTGTTTGCGTCAATCCCTGCACCCATTATTGCTG
CTCTATACTGTCTCTTCTTTGCCTACGTAGGAGCTGGAGGATTGAGTTTTCTTCAGTTCT
GCAACTTAAACAGCTTCAGGACTAAGTTCATCTTAGGCTTCTCTGTCTTTCTTGGCTTGT
CAATCCCTCAGTACTTCAACGATATGGTGAATGTCCCGTTGTCATCAGAACCTTTTGTTG
CTGGCATGGTGGCCTTCTTCCTGGACAACACACTGCACAAGAAAGATTCATCGATAAGGA
AAGACAGAGGAAAGCATTGGTGGGACAAGTTTAGATCTTTCAAAGGTGACACAAGAAGTG
AAGAGTTCTACTCTCTTCCTTTCAACCTCAACAAGTATTTCCCTTCTGTCTAGAAGAGAA
GGGAAGAAAGAGAAGAAGAAGCAAAGAGTTTACCGGGAAAAGAAAAACAAAGAAAATGGT
GAAAAGTGAAAACTCAAGAGTTTCTCATTGTTGCCTCGAGTTTCTTGACGACCTCTGTGT
CTTGGTTCTTTTGTTCTGTTCTGTTCCGTTCACAACTTCGGAAACCTTTTTAAATATCTT
TCACATTTTATAGTCTTTCTTGTTTACGATCATGAATCTAAGAATCTTCAGTTGTATTGT
TGCTTACTATCTCTCCCTAATGCGTTTGTCTTTGTAAATCTGAGGGTACACGACTTTGTT
ATTTTGATTAGTTTCTAAATAAGTATTTAGTTTGATC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL3754Contig1 762 2 3 U
GGAATCTTTCGAATCCCCTCCGACCAATGGCTCTCCAAGCCACCACTACTACCTTCTCCT
TCTCCGCTCCTACTCTCCGATCAACTCCTCCTCCTCACGCATTCACTTCAAAGCGTCGTC
TCTCCTTCAAATCTTCTTCTTCGGGACTCTCTTCTCCTCCTCCTCCTCCCCTCCTCTCTC
TTTCACGATCTAATCTCAAAGGAAGAGCCTTTTCAAGCGATGGCTCAACAACGCAAGAGT
CTCCCTCAGTGGTCTGTTTCGGAGAAATGCTGATCGATTTCGTACCAACCACTAGTGGGC
TTTCATTGGCCCAAGCACCAGCTTTCAAAAAGGCTCCAGGTGGCGCCCCTGCTAATGTCG
CCGTTGGTATCACTCGTCTCGGTGGTTCTTCAGCCTTCATTGGCAAGGTCGGTGAAGATG
AGTTTGGTTACATGCTTGCAAACATTCTCAAGGATAACAACGTGAACAATGAAGGCATGC
GTTTTGACCCTGGAGCCAGAACCGCTCTAGCTTTCGTCACTCTGACTAGCGAAGACGAGC
GTGAGTTCATGTTCTATCGAAACCCCAGCGCCGACATGCTGTTAAAAGAGTCTGAGCTTG
ATTTGGATTTGATTAAAAAGGCGAAGATATTCCATTACGGTTCGATAAGTCTGATCACGG
AACCGTGCAAGTCAGCTCACATAGCTGCGGCGAAGCAGCTAAGAAGCTGGTGTGATTCTT
TCGTACGATCCTAACCTTAGCTCCCTTGTGGCCTTCTGCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP85TF U 9
AF RR2G647TF U 1
BS 1 371 RR2G647TF
BS 372 372 RR2GP85TF
BS 373 762 RR2G647TF

RD RR2GP85TF 685 0 0
GG
GAATCTCCTCCGACCAATGGCTCTCCAAGCCACCACTACTACCTTCTCCTTCTCCGCTCC
TACTCTCCGATCAACTCCTCCTCCTCACGCATTCACTTCAAAGCGTCGTCTCTCCTTCAA
ATCTTCTTCTTCGGGACTCTCTTCTCCTCCTCCTCCTCCCCTCCTCTCTCTTTCACGATC
TAATCTCAAAGGAAGAGCCTTTTCAAGCGATGGCTCAACAACGCAAGAGTCTCCCTCAGT
GGTCTGTTTCGGAGAAATGCTGATCGATTTCGTACCAACCACTAGTGGGCTTTCATTGGC
CCAAGCACCAGCTTTCAAAAAGGCTCCAGGTGGCGCCCCTGCTAATGTCGCCGTTGGTAT
CACTCGTCTCGGTGGTTCTTCAGCCTTCATTGGCAAGGTCGGTGAAGATGAGTTTGGTTA
CATGCTTGCAAACATTCTCAAGGATAACAACGTGAACAATGAAGGCATGCGTTTTGACCC
TGGAGCCAGAACCGCTCTAGCTTTCGTCACTCTGACTAGCGAAGGCGAGCGTGAGTTCAT
GTTCTATCGAAACCCCAGCGCCGACATGCTGTTAAAAGAGTCTGAGCTTGATTTGGATTT
GATTAAAAAGGCGAAGATATTCCATTACGGTTCGATAAGTCTGATCACGGAACCGTGCAA
GTCAGCTCACATAGCTGCGGCGA

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR2G647TF 762 0 0
GGAATCTTTCGAATCCCCTCCGACCAATGGCTCTCCAAGCCACCACTACTACCTTCTCCT
TCTCCGCTCCTACTCTCCGATCAACTCCTCCTCCTCACGCATTCACTTCAAAGCGTCGTC
TCTCCTTCAAATCTTCTTCTTCGGGACTCTCTTCTCCTCCTCCTCCTCCCCTCCTCTCTC
TTTCACGATCTAATCTCAAAGGAAGAGCCTTTTCAAGCGATGGCTCAACAACGCAAGAGT
CTCCCTCAGTGGTCTGTTTCGGAGAAATGCTGATCGATTTCGTACCAACCACTAGTGGGC
TTTCATTGGCCCAAGCACCAGCTTTCAAAAAGGCTCCAGGTGGCGCCCCTGCTAATGTCG
CCGTTGGTATCGCTCGTCTCGGTGGTTCTTCAGCCTTCATTGGCAAGGTCGGTGAAGATG
AGTTTGGTTACATGCTTGCAAACATTCTCAAGGATAACAACGTGAACAATGAAGGCATGC
GTTTTGACCCTGGAGCCAGAACCGCTCTAGCTTTCGTCACTCTGACTAGCGAAGACGAGC
GTGAGTTCATGTTCTATCGAAACCCCAGCGCCGACATGCTGTTAAAAGAGTCTGAGCTTG
ATTTGGATTTGATTAAAAAGGCGAAGATATTCCATTACGGTTCGATAAGTCTGATCACGG
AACCGTGCAAGTCAGCTCACATAGCTGCGGCGAAGCAGCTAAGAAGCTGGTGTGATTCTT
TCGTACGATCCTAACCTTAGCTCCCTTGTGGCCTTCTGCAGA

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 3

CO CL3755Contig1 968 3 27 U
GGAGTGAGACACAGAGACAGAGAGTATGGCGACCACACTTCATTGTCTCTCCACACTCCA
TCTTCTTCCACGAACCCATCGTCCTAAAACTCTCAACTCTCTCAAACCAACCTCCAAATC
ACAACCTTGCAAGACCCCAGAACTACCCAACCCCCTCCAGATCCTTAAATCATCACCCCT
CCCTCTAGCACTCACCGCATTGCCCTTTCTCGTCGATCCACAGGATGCAGCAGCAGCTGG
AGGACAGTTTGGGATCTTGGAAGGACGATCGTTCGCGTTGATACACCCGATAGTGATGGG
AGGTTTGTTCGTATACACTCTATACGCTGGTTACTTAGGTTGGCAATGGAGACGTGTGCG
TACCATCCAAAGCGAGATCAACGAGCTCAAGAAACAGGTTAAGCCGACTCCTGTTTCTCC
CGATGGATCCGCGGTCGTTGGCCCTCCTTCTGCGACTGAGCTTGAGATCCGACGGTTGAC
GGAAGAGAGGAAAGAGTTGGTCAAAGGGTCTTACAGAGACAAACACTTTGACGCGGGCTC
TGTTTTGTTAGGGCTTGGTGTTTTGGAAGCTGTGTTTGGTGGTCTTAACACTTATCTTCG
TACCGGTAAACTCTTCCCCGGTCCTCATCTTTACGCCGGTGCAGGGATAACGGTACTATG
GGCTGCTGCAGCGGCTTTGGTACCGGCAATGCAAAAAGGGAATGAGACGGCGAGGAATCT
ACACATTGCGTTGAACGGTCTCAATGTTCTTCTTTTCATTTGGCAAATCCCAACAGGTTT
TGATATCGTACTTAAGGTCTTTGAGTTCACGAAATGGCCTTAAACCCTTCACTCCTTGTT
TGTGGTCTCTTTCGCTTTTGTTTTTTTTTTCTTTGTCTTTACAGTTCTATGTAGTTGTTG
GACTTGTAATATGAGTCTTGACTCTATATATAAGCAAAGTCTTCTGCAAACTTTTTTTTT
GTTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY23TF U 1
AF RR2BP78TF U 13
AF RR2BP78JQ C 208
BS 1 73 RR2EY23TF
BS 74 74 RR2BP78TF
BS 75 134 RR2EY23TF
BS 135 135 RR2BP78TF
BS 136 174 RR2EY23TF
BS 175 175 RR2BP78TF
BS 176 186 RR2EY23TF
BS 187 187 RR2BP78TF
BS 188 211 RR2EY23TF
BS 212 212 RR2BP78TF
BS 213 335 RR2EY23TF
BS 336 336 RR2BP78TF
BS 337 351 RR2EY23TF
BS 352 352 RR2BP78TF
BS 353 422 RR2EY23TF
BS 423 424 RR2BP78TF
BS 425 430 RR2EY23TF
BS 431 431 RR2BP78TF
BS 432 440 RR2EY23TF
BS 441 441 RR2BP78TF
BS 442 534 RR2EY23TF
BS 535 535 RR2BP78TF
BS 536 553 RR2EY23TF
BS 554 554 RR2BP78TF
BS 555 603 RR2EY23TF
BS 604 683 RR2BP78TF
BS 684 968 RR2BP78JQ

RD RR2EY23TF 610 0 0
GGAGTGAGACACAGAGACAGAGAGTATGGCGACCACACTTCATTGTCTCTCCACACTCCA
TCTTCTTCCACGATCCCATCGTCCTAAAACTCTCAACTCTCTCAAACCAACCTCCAAATC
ACAACCTTGCAAGATCCCAGAACTACCCAACCCCCTCCAGATCCTTAAATCATCTCCCCT
CCCTCTCGCACTCACCGCATTGCCCTTTCTCATCGATCCACAGGATGCAGCAGCAGCTGG
AGGACAGTTTGGGATCTTGGAAGGACGATCGTTCGCGTTGATACACCCGATAGTGATGGG
AGGTTTGTTCGTATACACTCTATACGCTGGTTACTGAGGTTGGCAATGGAGGCGTGTGCG
TACCATCCAAAGCGAGATCAACGAGCTCAAGAAACAGGTTAAGCCGACTCCTGTTTCTCC
CGGCGGATCCACGGTCGTTGACCCTCCTTCTGCGACTGAGCTTGAGATCCGACGGTTGAC
GGAAGAGAGGAAAGAGTTGGTCAAAGGGTCTTACAGAGACAAACACTTTGACGCAGGCTC
TGTTTTGTTAGGGTTTGGTGTTTTGGAAGCTGTGTTTGGTGGTCTTAACACTTATCTTCG
TAC
TGGAAAA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2BP78TF 671 0 0
AGAGACAGAGAGTATGGCGACCACACTTCATTGTCTCTCCACACTCCATCTTCTTCCTCG
CACCCATCGTCCTAAAACTCTTAACTCTCTCAAACCAACCTCCAGATCACAACCTTGCAA
GACCCCAGAACTACCCAACCCCCTCCAGATCCTTAAATCATCACCCCTCCCTCTAGCACT
CACCGCATTGCCCTTTCTCGTCGATCCACAGGATGCAGCAGCAGCTGGAGGACAGTTTGG
GATCTTGGAAGGACGATCGTTCGCGTTGATACACCCGATAGTGATGGGAGGTTTGTTCGT
ATACACTCTATACGCTGGTTACTTAGGTTGGCAATGGAGACGTGTGCGTACCATCCAAAG
CGAGATCAACGAGCTCAAGAAACAGGTTAAGCCGACTCCTGTTTCTCCCGATGGATCCGC
GGTCGTTGGCCCTCCTTCTGCGACTGAGCTTGAGATCCGACGGTTGACGGAAGAGAGGAA
AGAGTTGGTCAAAGGGTCTTACAGAGACAAACACTTTGACGCGGGCTCTGTTTTGTTAGG
GCTTGGTGTTTTGGAAGCTGTGTTTGGTGGTCTTAACACTTATCTTCGTACCGGTAAACT
CTTCCCCGGTCCTCATCTTTACGCCGGTGCAGGGATAACGGTACTATGGGCTGCTGCAGC
GGCTTTGGTAC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2BP78JQ 761 0 0
TCTCGTCGATCCACAGGATGCAGCAGCAGCTGGAGGACAGTTTGGGATCTTGGAAGGACG
ATCGTTCGCGTTGATACACCCGATAGTGATGGGAGGTTTGTTCGTATACACTCTATACGC
TGGTTACTTAGGTTGGCAATGGAGACGTGTGCGTACCATCCAAAGCGAGATCAACGAGCT
CAAGAAACAGGTTAAGCCGACTCCTGTTTCTCCCGATGGATCCGCGGTCGTTGGCCCTCC
TTCTGCGACTGAGCTTGAGATCCGACGGTTGACGGAAGAGAGGAAAGAGTTGGTCAAAGG
GTCTTACAGAGACAAACACTTTGACGCGGGCTCTGTTTTGTTAGGGCTTGGTGTTTTGGA
AGCTGTGTTTGGTGGTCTTAACACTTATCTTCGTACCGGTAAACTCTTCCCCGGTCCTCA
TCTTTACGCCGGTGCAGGGATAACGGTACTATGGGCTGCTGCAGCGGCTTTGGTACCGGC
AATGCAAAAAGGGAATGAGACGGCGAGGAATCTACACATTGCGTTGAACGGTCTCAATGT
TCTTCTTTTCATTTGGCAAATCCCAACAGGTTTTGATATCGTACTTAAGGTCTTTGAGTT
CACGAAATGGCCTTAAACCCTTCACTCCTTGTTTGTGGTCTCTTTCGCTTTTGTTTTTTT
TTTCTTTGTCTTTACAGTTCTATGTAGTTGTTGGACTTGTAATATGAGTCTTGACTCTAT
ATATAAGCAAAGTCTTCTGCAAACTTTTTTTTTGTTTTTGT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 3

CO CL3756Contig1 1426 3 5 U
TTTTTACTCACACCGAGTATCTGATATCAGCAACTAAAATTGCTTGATAGGTTCACGAAG
GGTTTAGTTTCACGTTTAGGGACCAGAAGATCCACACCTGAACTTGTAGCTTCTGCTACT
TCAACAGAGCACTGAAACTCAGGTGGTGTTGAGTTCTCTCTCAAAAACATGAGCTTGGCA
ATAAGTTCCCCTGGGAGATCAATGTCAAGCTTATAATCTGCTACAAGTTCAACGATGGCT
CTCAATCTTCCAACATCCTTGTTTTTAACTTTTCCCATGGCAGAGTGTCTCAAAACGGTG
ATCTCTTTCATTAATAGAGTCGTGGCTGAAAAGTCTTTAAGCTTGAGCAAACATATTATC
CGGACCGCAGGTATGTACTGATGATCCTTTATGAGATCTGTAACAAATTCTGGGATTTTA
CGTTTGAGACCAAAGAAGTGAAAGAGTTTTGGACCTTGTGTGTAATGAAAAGCAGACGAG
ACAAGTAGCGCAGTCTCCTCTTCATTGATCAAGCTCCTCAATCCAAATGCCACAAGGAAT
AACAAGAAAGCCAAAGCCTCAAGAGATGAACTTGGAGCTTCGATTGTTATATTCTCTTTC
CATATACTCGCCAACTCTTCGGCCTTCAACTGCATTTGAGGATTTTCTGATCCTCTAATT
CTTGCTAGCTCCTCAAAAAAACAGAACCAAGTTCTTCACGACTGACTCTTGTAACCCCAG
CTTTTGTCTTCCATAAGCAGTTCTAAGCTGTCTGTCCACTAGATCCCAGAACAAATTTCG
CTGGATTAGATATAGCTGTAAGATAAGTGGACACTTCACGACGACCCAAGAGCTTCTGAT
GAGAATTCATGAAGCAGGAGAGCATCTCCAGTAGACAAAAAGTTCAGTCTCTGCTGCAAA
TGGGCTGTGGCTCGTGCTTAACAAACACACTGCTTCTCAGTCTCGAACTCTGTCTTCTTC
AGCTCGAGTTCGTTTCCAGTGTTCTTCAGTGATGTCCTAAGCTCAGTGAGTGTTTTTTCT
TCCGACTTGATCTGGTTCTTTATCAAACCAAAGTGCCTTTTCTTTATCCCTTGCTTCAAC
CTCTGTTGAGTTAAGTTTATCTGTCTGTTGCTCGATCTGCTTCTGGATCTCAGCCAACTT
TAAACTCAGAACTTGAAGCTGTTTTTCCTTCAGCTCAACCTCCTCAACGACCATGTCCAG
ATGGTTGTGTAAAGCCTTCAACATCTGGGAAGAATCAGTCTTTAGTTTCTTAGCACCAGT
AACTGCTGCCTCATCTTCAACTCTTCTTTTCTCCATCGCCACTAGCCAAATGGATTCAAC
AGCAACAGAGAACAAGAGAAGTTTTGCGTGGCGTAGTGACTCAGTGTGATTCTGCACAAA
GTAGATACCAAAGACTGAAGTAAAAGACGAACCCATGAACGGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY85JQ U 1
AF RR2AK27JQ U 6
AF RR2AK27TF C 662
BS 1 87 RR2EY85JQ
BS 88 88 RR2AK27JQ
BS 89 269 RR2EY85JQ
BS 270 720 RR2AK27JQ
BS 721 1426 RR2AK27TF

RD RR2EY85JQ 276 0 0
TTTTTACTCACACCGAGTATCTGATATCAGCAACTAAAATTGCTTGATAGGTTCACGAAG
GGTTTAGTTTCACGTTTAGGGACCAGACGATCCACACCTGAACTTGTAGCTTCTGCTACT
TCAACAGAGCACTGAAACTCAGGTGGTGTTGAGTTCTCTCTCAAAAACATGAGCTTGGCA
ATAAGTTCCCCTGGGAGATCAATGTCAAGCTTATAATCTGCTACAAGTTCAACGATGGCT
CTCAATCTTCCAACATCCTTGTTTTTAAC
CTAAAAA

QA 1 269 1 269
DS 

RD RR2AK27JQ 715 0 0
ACA
CACACCGAGTATCTGATATTAGCAACTAAAATTGCTTGATAGGTTCACGAAGGGTTTAGT
TTCACGTTTAGGGACCAGAAGATCCACACCTGAACTTGTAGCTTCTGCTACTTCAACAGA
GCAGTGAAGCTCAGGTGGTGTTGAGTTCTCTCTCAGAAACATGAGCTTGGCAATAAGTTC
CCCTGGGAGATCAATGTCAAGCTTATAATCTGCTACAAGTTCAACGATGGCTCTCAATCT
TCCAACATCCTTGTTTTTAACTTTTCCCATGGCAGAGTGTCTCAAAACGGTGATCTCTTT
CATTAATAGAGTCGTGGCTGAAAAGTCTTTAAGCTTGAGCAAACATATTATCCGGACCGC
AGGTATGTACTGATGATCCTTTATGAGATCTGTAACAAATTCTGGGATTTTACGTTTGAG
ACCAAAGAAGTGAAAGAGTTTTGGACCTTGTGTGTAATGAAAAGCAGACGAGACAAGTAG
CGCAGTCTCCTCTTCATTGATCAAGCTCCTCAATCCAAATGCCACAAGGAATAACAAGAA
AGCCAAAGCCTCAAGAGATGAACTTGGAGCTTCGATTGTTATATTCTCTTTCCATATACT
CGCCAACTCTTCGGCCTTCAACTGCATTTGAGGATTTTCTGATCCTCTAATTCTTGCTAG
CTCCTCAAAAAAACAGAACCAAGTTCTTCACGACTGACTCTTGTAACCCCAG

QA 4 715 4 715
DS 

RD RR2AK27TF 765 0 0
TTGCTAGCTCCTCAAAAAAACAGAACCAAGTTCTTCACGACTGACTCTTGTAACCCCAGC
TTTTGTCTTCCATAAGCAGTTCTAAGCTGTCTGTCCACTAGATCCCAGAACAAATTTCGC
TGGATTAGATATAGCTGTAAGATAAGTGGACACTTCACGACGACCCAAGAGCTTCTGATG
AGAATTCATGAAGCAGGAGAGCATCTCCAGTAGACAAAAAGTTCAGTCTCTGCTGCAAAT
GGGCTGTGGCTCGTGCTTAACAAACACACTGCTTCTCAGTCTCGAACTCTGTCTTCTTCA
GCTCGAGTTCGTTTCCAGTGTTCTTCAGTGATGTCCTAAGCTCAGTGAGTGTTTTTTCTT
CCGACTTGATCTGGTTCTTTATCAAACCAAAGTGCCTTTTCTTTATCCCTTGCTTCAACC
TCTGTTGAGTTAAGTTTATCTGTCTGTTGCTCGATCTGCTTCTGGATCTCAGCCAACTTT
AAACTCAGAACTTGAAGCTGTTTTTCCTTCAGCTCAACCTCCTCAACGACCATGTCCAGA
TGGTTGTGTAAAGCCTTCAACATCTGGGAAGAATCAGTCTTTAGTTTCTTAGCACCAGTA
ACTGCTGCCTCATCTTCAACTCTTCTTTTCTCCATCGCCACTAGCCAAATGGATTCAACA
GCAACAGAGAACAAGAGAAGTTTTGCGTGGCGTAGTGACTCAGTGTGATTCTGCACAAAG
TAGATACCAAAGACTGAAGTAAAAGACGAACCCATGAACGGAGCC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 3

CO CL3757Contig1 793 3 15 U
GGACCTGGTTTGTTGTCACCTCCACACAGAAATAAAATAAAATAGAATGAGCAGCTTGAT
AAGTTCTCTCGAACTCTCATCTCTTACGCTTGAAGAGCCATGGCCTGCTTTCTAGCCTAA
ATTTCCTCGAGATTTTCGTTTTTTTCGATCTTGAGTCTTTCTTGGTTTCTTCATCATCTT
CTTAAAAACGTTTTCTAAAATCATGGGGACTGGAGAAAAATCTTTGAAAGGCTTCCATTT
ACTTCGCAAAGTCAAAAACAAAGATGTTCCAAAAGGATGCTTAGCGATCAAAGTTGGATC
ACAAGGAGAAGAGCAACAAAGATTTGTAGTTCCTGTTTTGTATTTTAACCATCCTTTGTT
CATGCAGCTATTGAAGGAAGCAGAAGATGAGTATGGATTCGATCAAAAGGGAACCATCAC
GATTCCATGCGAAGTAGCGGAGTTTCGTTACGTTCAAGATTTGATTGAAGGAGAGAGATC
GATTAATCATAACCATCATCATAGACATAGCGGTCGTGATCAGTATCATCATCTTGTTGG
ATGCTTCAGAACGTGAAGGATGATGAAGATAAATTGAGAATGGTTAATGAATGAATGATT
GTTTGTGTTTTTACATTTTCGATATTTTTTTATGTGTGTTGATCCTGTGGAGTTGAGGAG
CCAAAACATGGCCTAACCCAAGAAAGAAGTGAATTTCTGAATGTTTTTCTGTAGTTTAAT
GGAATTTTAAGATTAAAAAATATTTATTCTGATTTTCATCTATTTGTTCTGAATTTTGAA
TGACTGAAGATAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA30TF U 1
AF RR2HA30JQ C 140
AF RR2FI72TF U 1
BS 1 147 RR2FI72TF
BS 148 148 RR2HA30TF
BS 149 175 RR2FI72TF
BS 176 176 RR2HA30TF
BS 177 550 RR2FI72TF
BS 551 551 RR2HA30TF
BS 552 577 RR2FI72TF
BS 578 578 RR2HA30TF
BS 579 590 RR2FI72TF
BS 591 591 RR2HA30TF
BS 592 592 RR2FI72TF
BS 593 593 RR2HA30TF
BS 594 623 RR2FI72TF
BS 624 624 RR2HA30TF
BS 625 793 RR2FI72TF

RD RR2HA30TF 692 0 0
GGACCTGGTTTGTTGTCACCTCCACACAGAAATAAAATAAAATAGAATGAGCAGCTTGAT
AAGTTCTCTCGAACTCTCATCTCTTACGCTTGAAGAGCCATGGCCTGCTTTCTAGCCTAA
ATTTCCTCGAGATTTTCGTTTTTTTTTATCTTGAGTCTTTCTTGGTTTCTTCATCATCTT
CTTAAAAACGTTTTCTAAAATCATGGGGACTGGAGAAAAATCTTTGAAAGGCTTCCATTT
ACTTCGCAAAGTCAAAAACAAAGATGTTCCAAAAGGATGCTTAGCGATCAAAGTTGGATC
ACAAGGAGAAGAGCAACAAAGATTTGTAGTTCCTGTTTTGTATTTTAACCATCCTTTGTT
CATGCAGCTATTGAAGGAAGCAGAAGATGAGTATGGATTCGATCAAAAGGGAACCATCAC
GATTCCATGCGAAGTAGCGGAGTTTCGTTACGTTCAAGATTTGATTGAAGGAGAGAGATC
GATTAATCATAACCATCATCATAGACATAGCGGTCGTGATCAGTATCATCATCTTGTTGG
ATGCTTCAGAACGTGAAGGATGATGAAGATAAATTGAGAATGGTTAATGAATGAATGATT
GTTTGTGTTTTTACATTTTCGATATTTTTTTATGTGTGTTGATCCTGTGGAGTTGAGGAG
CCAAAACATGGCCTAACCCAAGAAAGAAGTGA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2HA30JQ 619 0 0
TTTTTTTTA
TCTTGAGTCTTTCTTGGTTTCTTCATCATCTTCTTAAAAACGTTTTCTAAAATCATGGGG
ACTGGAGAAAAATCTTTGAAAGGCTTCCATTTACTTCGCAAAGTCAAAAACAAAGATGTT
CCAAAAGGATGCTTAGCGATCAAAGTTGGATCACAAGGAGAAGAGCAACAAAGATTTGTA
GTTCCTGTTTTGTATTTTAACCATCCTTTGTTCATGCAGCTATTGAAGGAAGCAGAAGAT
GAGTATGGATTCGATCAAAAGGGAACCATCACGATTCCATGCGAAGTAGCGGAGTTTCGT
TACGTTCAAGATTTGATTGAAGGAGAGAGATCGATTAATCATAACCATCATCATAGACAT
AGCGGTCGTGATCAGTATCATCATCTTGTTGGATGCTTCAGAACGTGAAGGATGATGAAG
ATAAATTGAGAATGGTTAATGAATGAATGATTGTTTGTGTTTTTACATTTTCGATATTTT
TTTATGTGTGTTGATCCTGTGGAGTTGAGGAGCCAAAACATGGCCTAACCCAAGAAAGAA
GTGAATTTCTGAATGTTTTTCTGTAGTTTAATGGAATTTTAAGATTAAAAAATATTTATT
CTGATTTTC
G

QA 10 618 10 618
DS 

RD RR2FI72TF 793 0 0
GGACCTGGTTTGTTGTCACCTCCACACAGAAATAAAATAAAATAGAATGAGCAGCTTGAT
AAGTTCTCTCGAACTCTCATCTCTTACGCTTGAAGAGCCATGGCCTGCTTTCTAGCCTAA
ATTTCCTCGAGATTTTCGTTTTTTTCG*TCTTGAGTCTTTCTTGGTTTCTTCATCGTCTT
CTTAAAAACGTTTTCTAAAATCATGGGGACTGGAGAAAAATCTTTGAAAGGCTTCCATTT
ACTTCGCAAAGTCAAAAACAAAGATGTTCCAAAAGGATGCTTAGCGATCAAAGTTGGATC
ACAAGGAGAAGAGCAACAAAGATTTGTAGTTCCTGTTTTGTATTTTAACCATCCTTTGTT
CATGCAGCTATTGAAGGAAGCAGAAGATGAGTATGGATTCGATCAAAAGGGAACCATCAC
GATTCCATGCGAAGTAGCGGAGTTTCGTTACGTTCAAGATTTGATTGAAGGAGAGAGATC
GATTAATCATAACCATCATCATAGACATAGCGGTCGTGATCAGTATCATCATCTTGTTGG
ATGCTTCAGAGCGTGAAGGATGATGAAGATAAATTGATAATGGTTAATGA*TAAATGATT
GTTTGTGTTTTTACATTTTCGATCTTTTTTTATGTGTGTTGATCCTGTGGAGTTGAGGAG
CCAAAACATGGCCTAACCCAAGAAAGAAGTGAATTTCTGAATGTTTTTCTGTAGTTTAAT
GGAATTTTAAGATTAAAAAATATTTATTCTGATTTTCATCTATTTGTTCTGAATTTTGAA
TGACTGAAGATAA

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL3758Contig1 821 2 3 U
ATAAGCTACAAAATCCAGTAACCAGAGTCACAGCAACACAATTCTTACTACTTTCAAATA
TGTCTGAAATAAAAGTAAAAGGGCAAGTGTAATAGCCACCATAGAAGCAGCTGCGAGAGC
TCAGAAGATTCTTTGTGGTGGTCCCATTGTGCTCTTGAGGTACAAACACCTCACGTTTTG
CCAGTTCTTCTTCAAGAGAGAGACGAGGAAGTTGACACTCATCTGGACATTCTGAAAGAT
GTGCTTCTCCTCCATGGAGAGGTTACCAACAGCGACACCCATACACAGAACCTTCTTCAG
CTGAAACTTTACCGTAGCCTTCGTTTCGTTCACCTTCCCCTCTAGCGATTCCTGGTGGCT
CACGAGCGTCGGGAACTTGCCAGCCTTGTTGAAACCAGGACCGAGAAGACGAGGAATCTG
CTTGATGACGGATTCAGATGCCAAGAAAGCGTGGTACTTCTTGGCAAGCTTCTTGACGAG
CTTCTTATTCTTGTTCAGCTTTTTCAGAGACTCCACATCCATAGAGTCCAGCCCCATTTT
CTCAGCCTCCTCGACGTGCTGGGCGTCTCCGAGCATGCAGATCTTCATCTTGGGACGGGG
AATGTGTGGTAACTTGACAGAACCGCTGAAACGCTTGTCCTTTTGAGGGTCATAATTTTT
CAGACCAATCTGGAGCTCGAGAGTCTCCACAAAGTTGCGTTTCTTCTCTTCGGATTTTCC
TCGGATGACAGTTATGGCTTCTTTAACGGCCTCACTCTGAAGCTTACTCATTTTGAGCTT
GTCTCAAAAATATCTGATCCTGAATGATGAGACGGAAGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A175JQ U 126
AF RR2A175TF C 1
BS 1 140 RR2A175TF
BS 141 404 RR2A175JQ
BS 405 821 RR2A175TF

RD RR2A175JQ 282 0 0
AAATTCTTTGTGGTG
GTCCCATTGTGCTCTTGAGGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAAGAGAG
AGACGAGGAAGTTGACACTCATCTGGACATTCTGAAAGATGTGCTTCTCCTCCATGGAGA
GGTTACCAACAGCGACACCCATACACAGAACCTTCTTCAGCTGAAACTTTACCGTAGCCT
TCGTTTCGTTCACCTTCCCCTCTAGCGATTCCTGGTGGCTCACGAGCGTCGGGAACTTGC
CAGCCTTGTTGAAACCAGGACCGA
AAA

QA 16 279 16 279
DS 

RD RR2A175TF 821 0 0
ATAAGCTACAAAATCCAGTAACCAGAGTCACAGCAACACAATTCTTACTACTTTCAAATA
TGTCTGAAATAAAAGTAAAAGGGCAAGTGTAATAGCCACCATAGAAGCAGCTGCGAGAGC
TCAGAAGATTCTTTGTGGTGGTCCCATTGTGCTCTTGAGGTACAAACACCTCACGTTTTG
CCAGTTCTTCTTCAAGAGAGAGACGAGGAAGTTGACACTCATCTGGACATTCTGAAAGAT
GTGCTTCTCCTCCATGGAGAGGTTACCAACAGCGACACCCATACACAGAACCTTCTTCAG
CTGAAACTTTACCGTAGCCTTCGTTTCGTTCACCTTCCCCTCTAGCGATTCCTGGTGGCT
CACGAGCGTCGGGAACTTGCCAGCCTTGTTGAGACCAGGACCGAGAAGACGAGGAATCTG
CTTGATGACGGATTCAGATGCCAAGAAAGCGTGGTACTTCTTGGCAAGCTTCTTGACGAG
CTTCTTATTCTTGTTCAGCTTTTTCAGAGACTCCACATCCATAGAGTCCAGCCCCATTTT
CTCAGCCTCCTCGACGTGCTGGGCGTCTCCGAGCATGCAGATCTTCATCTTGGGACGGGG
AATGTGTGGTAACTTGACAGAACCGCTGAAACGCTTGTCCTTTTGAGGGTCATAATTTTT
CAGACCAATCTGGAGCTCGAGAGTCTCCACAAAGTTGCGTTTCTTCTCTTCGGATTTTCC
TCGGATGACAGTTATGGCTTCTTTAACGGCCTCACTCTGAAGCTTACTCATTTTGAGCTT
GTCTCAAAAATATCTGATCCTGAATGATGAGACGGAAGGCC

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 3

CO CL3759Contig1 689 3 3 U
GGATCCCAACTAAACAAGACTCTCTCTCTCTCTCATCTCTTGTCTCTCTTCTATCTCTTT
TCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTAAATCAATTATGCAAAAAGCAATAAGACCATCCGAGTC
ATCGTGGACGAAGACCACACCGGGCAGCATCTTCCGTCCAAAGAATGAAGATAAAACATC
ATCATCATTATCATGGCTAACATCATCACCATCACCACAAAAGACACCATTTTCAAGCAC
TAAGAAATCAAGCTATAACGTTTTGGTGATGGAGAATGCTGTGGTGGTGTTTGCGAGGAG
AGGCTGTTGTATGGGACATGTGGTAAAAAAGTTGCTACTGACACACGGCGTGAACCCATT
GGTCGTTGAGATTGATGCAGAAGACAACAACGATGACAATATCATCATAAGTGAATTGGG
TAAAACCGTAATTAATAAAGAGAACTTACCAGTCATGTTCATAGGAGGAAAGTTGTTTGG
AGGATTGGAGAATCTGATGGCTGCTCATATTAATGGTGATTTAGTGCCTACTCTCAGACA
AGCAGGGGCTTTATGGCTTTGATTCATGATTTTCTTCCTAGTCTTTCTCCTTGTTGCATT
ATTTGTTATATATGTTTTCGGTGATGTTTCAAACTATCTGAATTTGTAACTAATGTTATG
TGATTCGTTTGATCATAGAGAAACACATA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE74TF U 1
AF RR2EA02TF U 1
AF RR2EA02JQ C 1
BS 1 32 RR2BE74TF
BS 33 33 RR2EA02TF
BS 34 689 RR2BE74TF

RD RR2BE74TF 689 0 0
GGATCCCAACTAAACAAGACTCTCTCTCTCTCCCATCTCTTGTCTCTCTTCTATCTCTTT
TCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTAAATCAATTATGCAAAAAGCAATAAGACCATCCGAGTC
ATCGTGGACGAAGACCACACCGGGCAGCATCTTCCGTCCAAAGAATGAAGATAAAACATC
ATCATCATTATCATGGCTAACATCATCACCATCACCACAAAAGACACCATTTTCAAGCAC
TAAGAAATCAAGCTATAACGTTTTGGTGATGGAGAATGCTGTGGTGGTGTTTGCGAGGAG
AGGCTGTTGTATGGGACATGTGGTAAAAAAGTTGCTACTGACACACGGCGTGAACCCATT
GGTCGTTGAGATTGATGCAGAAGACAACAACGATGACAATATCATCATAAGTGAATTGGG
TAAAACCGTAATTAATAAAGAGAACTTACCAGTCATGTTCATAGGAGGAAAGTTGTTTGG
AGGATTGGAGAATCTGATGGCTGCTCATATTAATGGTGATTTAGTGCCTACTCTCAGACA
AGCAGGGGCTTTATGGCTTTGATTCATGATTTTCTTCCTAGTCTTTCTCCTTGTTGCATT
ATTTGTTATATATGTTTTCGGTGATGTTTCAAACTATCTGAATTTGTAACTAATGTTATG
TGATTCGTTTGATCATAGAGAAACACATA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2EA02TF 674 0 0
GGATCCCAACTAAACAAGACTCTCTCTCTCTCTCATCTCTTGTCTCTCTTCTATCTCTTT
TCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTAAATCAATTATGCAAAAAGCAATAAGACCATCCGAGTC
ATCGTGGACGAAGACCACACCGGGCAGCATCTTCCGTCCAAAGAATGAAGATAAAACATC
ATCATCATTATCATGGCTAACATCATCACCATCACCACAAAAGACACCATTTTCAAGCAC
TAAGAAATCAAGCTATAACGTTTTGGTGATGGAGAATGCTGTGGTGGTGTTTGCGAGGAG
AGGCTGTTGTATGGGACATGTGGTAAAAAAGTTGCTACTGACACACGGCGTGAACCCATT
GGTCGTTGAGATTGATGCAGAAGACAACAACGATGACAATATCATCATAAGTGAATTGGG
TAAAACCGTAATTAATAAAGAGAACTTACCAGTCATGTTCATAGGAGGAAAGTTGTTTGG
AGGATTGGAGAATCTGATGGCTGCTCATATTAATGGTGATTTAGTGCCTACTCTCAGACA
AGCAGGGGCTTTATGGCTTTGATTCATGATTTTCTTCCTAGTCTTTCTCCTTGTTGCATT
ATTTGTTATATATGTTTTCGGTGATGTTTCAAACTATCTGAATTTGTAACTAATGTTATG
TGATTCGTTTG
AAA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2EA02JQ 671 0 0
GGATCCCAACTAAACAAGACTCTCTCTCTCTCTCATCTCTTGTCTCTCTTCTATCTCTTT
TCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTAAATCAATTATGCAAAAAGCAATAAGACCATCCGAGTC
ATCGTGGACGAAGACCACACCGGGCAGCATCTTCCGTCCAAAGAATGAAGATAAAACATC
ATCATCATTATCATGGCTAACATCATCACCATCACCACAAAAGACACCATTTTCAAGCAC
TAAGAAATCAAGCTATAACGTTTTGGTGATGGAGAATGCTGTGGTGGTGTTTGCGAGGAG
AGGCTGTTGTATGGGACATGTGGTAAAAAAGTTGCTACTGACACACGGCGTGAACCCATT
GGTCGTTGAGATTGATGCAGAAGACAACAACGATGACAATATCATCATAAGTGAATTGGG
TAAAACCGTAATTAATAAAGAGAACTTACCAGTCATGTTCATAGGAGGAAAGTTGTTTGG
AGGATTGGAGAATCTGATGGCTGCTCATATTAATGGTGATTTAGTGCCTACTCTCAGACA
AGCAGGGGCTTTATGGCTTTGATTCATGATTTTCTTCCTAGTCTTTCTCCTTGTTGCATT
ATTTGTTATATATGTTTTCGGTGATGTTTCAAACTATCTGAATTTGTAACTAATGTTATG
TGATTCGTTTG

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 3

CO CL3760Contig1 1362 3 5 U
GTCCGAAGAAGTCTCTATTCCTCCTCATTTGATGATCAGTGGTTCAGATGAACTGTTCAA
TTTTATAGCTGAGGCGCTTGCGAAGTTCGTGGCTACAGAAGGAGAGGACTTTCATCTCCC
AGAGGGTAGACAAAGGGAGTTGGGTTTCACTTTCTCGTTTCCGGTTAAGCAGACATCTTT
GTCCTCTGGCACTCTCATCAAGTGGACCAAAGGCTTCTCCATTGAAGATACAGTTGGACA
AGATGTGGTGGGGGAGCTTGTTAAAGCTATGGAAAGAGTTGGGCTTGACATGAACGTCAC
AGCCCTTGTTAATGATACGGTTGGAACACTAGCTGGTGGTAGATACAATAACCCGGATGT
TGTAGCCGCTGTTATCTTAGGCACTGGCACTAATGCAGCTTATGTCGAACGAGCACATGC
CATTCCAAAATGGCACGGCTTACTTCCCAAATCCGGAGAAATGGTGATCAACATGGAGTG
GGGAAACTTCAGGTCATCACATCTTCCATTGACAGAGTACGACCACTTGCTTGATTTCGA
CAGGCTGAATGTTGGTGAACAGATTCTTGAGAAAATCATTTCGGGTATGTATCTGGGAGA
AATCTTGCGGAGAGTTCTTCTGAAAATGGCTGACGAGGCTGCTTTCTTTGGTGACTCTGT
CCCACCTAAGCTGAGAATACCATTCATTATAAGGACACCAAACATGTCTGCTATGCACAG
CGACACTTCTCCGGATTTGAAGGTTGTTGGAAGCAAGTTAAAGGACATATTGGAGGTCCC
TACCACTTCTCTGAAGATGAGAAAAGTTGTGATCCGTCTCTGTGACATCATTGCTAGCCG
AGGAGCTCGTCTATCAGCTGCAGGGATCTACGGAATCCTCAAGAAGATAGGAAGAGACAC
ACCAAAAGACGGAGAAACGCAGAAATCTGTTATAGCCATGGACGGTGGGCTGTTTGAGCA
CTACACTCAGTTCAGCGAGTGTATGGAGAGCTCATTGAAAGAGTTGCTTGGTGATGAAGC
ATCAGAGAGCGTTGATGTGATTCATTCGAATGATGGATCTGGCGTTGGAGCTGCGCTACT
CGCTGCGTCGCACTCTCAGTATCTCGAGGACTCTGAAACAGGTTAAGTTTAAAGATCTTT
TATCAAAGACTCTTTTGTTTGCCTTTAGGGTTTAAACAAATAAAAGAGAGAAAAAAGGTC
AAGCCCTTTTGAGGAAAGTTATTTTATTTTTGTTATCCAAGTACGAGAACAGTAATAAAC
CCTGGATGATTTCTTCTTCAGGGGTATGGCAAACTTCAAGAATCAGCCAAATGTTGTAGA
ACTATATATTTCTGAGTTCTATATATAAAATGATCATTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A880TF U 1
AF RR2AF42TF U 347
AF RR2AF42JQ C 465
BS 1 405 RR2A880TF
BS 406 406 RR2AF42TF
BS 407 477 RR2A880TF
BS 478 1117 RR2AF42TF
BS 1118 1362 RR2AF42JQ

RD RR2A880TF 477 0 0
GTCCGAAGAAGTCTCTATTCCTCCTCATTTGATGATCAGTGGTTCAGATGAACTGTTCAA
TTTTATAGCTGAGGCGCTTGCGAAGTTCGTGGCTACAGAAGGAGAGGACTTTCATCTCCC
AGAGGGTAGACAAAGGGAGTTGGGTTTCACTTTCTCGTTTCCGGTTAAGCAGACATCTTT
GTCCTCTGGCACTCTCATCAAGTGGACCAAAGGCTTCTCCATTGAAGATACAGTTGGACA
AGATGTGGTGGGGGAGCTTGTTAAAGCTATGGAAAGAGTTGGGCTTGACATGAACGTCAC
AGCCCTTGTTAATGATACGGTTGGAACACTAGCTGGTGGTAGATACAATAACCCGGATGT
TGTAGCCGCTGTTATCTTAGGCACTGGCACTAATGCAGCTTATGTGGAACGAGCACATGC
CATTCCAAAATGGCACGGCTTACTTCCCAAATCCGGAGAAATGGTGATCAACATGGA

QA 1 477 1 477
DS 

RD RR2AF42TF 771 0 0
GG
TAACCCGGATGTTGTAGCCGCTGTTATCTTAGGCACTGGCACTAATGCAGCTTATGTCGA
ACGAGCACATGCCATTCCAAAATGGCACGGCTTACTTCCCAAATCCGGAGAAATGGTGAT
CAACATGGAGTGGGGAAACTTCAGGTCATCACATCTTCCATTGACAGAGTACGACCACTT
GCTTGATTTCGACAGGCTGAATGTTGGTGAACAGATTCTTGAGAAAATCATTTCGGGTAT
GTATCTGGGAGAAATCTTGCGGAGAGTTCTTCTGAAAATGGCTGACGAGGCTGCTTTCTT
TGGTGACTCTGTCCCACCTAAGCTGAGAATACCATTCATTATAAGGACACCAAACATGTC
TGCTATGCACAGCGACACTTCTCCGGATTTGAAGGTTGTTGGAAGCAAGTTAAAGGACAT
ATTGGAGGTCCCTACCACTTCTCTGAAGATGAGAAAAGTTGTGATCCGTCTCTGTGACAT
CATTGCTAGCCGAGGAGCTCGTCTATCAGCTGCAGGGATCTACGGAATCCTCAAGAAGAT
AGGAAGAGACACACCAAAAGACGGAGAAACGCAGAAATCTGTTATAGCCATGGACGGTGG
GCTGTTTGAGCACTACACTCAGTTCAGCGAGTGTATGGAGAGCTCATTGAAAGAGTTGCT
TGGTGATGAAGCATCAGAGAGCGTTGATGTGATTCATTCGAATGATGGATCTGGCGTTGG
AGCTGCGCTACTCGCTGCGTCGCACTCTCAGTATCTCGAGGACTCTGAA

QA 3 771 3 771
DS 

RD RR2AF42JQ 898 0 0
TGATCAACATGGAGTGGGGAAACTTCAGGTCATCACATCTTCCATTGACAGAGTACGACC
ACTTGCTTGATTTCGACAGGCTGAATGTTGGTGAACAGATTCTTGAGAAAATCATTTCGG
GTATGTATCTGGGAGAAATCTTGCGGAGAGTTCTTCTGAAAATGGCTGACGAGGCTGCTT
TCTTTGGTGACTCTGTCCCACCTAAGCTGAGAATACCATTCATTATAAGGACACCAAACA
TGTCTGCTATGCACAGCGACACTTCTCCGGATTTGAAGGTTGTTGGAAGCAAGTTAAAGG
ACATATTGGAGGTCCCTACCACTTCTCTGAAGATGAGAAAAGTTGTGATCCGTCTCTGTG
ACATCATTGCTAGCCGAGGAGCTCGTCTATCAGCTGCAGGGATTTACGGAATCCTCAAGA
AGATAGGAAGAGACACACCAAAAGACGGAGAAACGCAGAAATCTGTTATAGCCATGGACG
GTGGGCTGTTTGAGCACTACACTCAGTTCAGCGAGTGTATGGAGAGCTCATTGAAAGAGT
TGCTTGGTGATGAAGCATCAGAGAGCGTTGATGTGATTCATTCGAATGATGGATCTGGCG
TTGGAGCTGCGCTACTCGCTGCGTCGCACTCTCAGTATCTCGAGGACTCTGAAACAGGTT
AAGTTTAAAGATCTTTTATCAAAGACTCTTTTGTTTGCCTTTAGGGTTTAAACAAATAAA
AGAGAGAAAAAAGGTCAAGCCCTTTTGAGGAAAGTTATTTTATTTTTGTTATCCAAGTAC
GAGAACAGTAATAAACCCTGGATGATTTCTTCTTCAGGGGTATGGCAAACTTCAAGAATC
AGCCAAATGTTGTAGAACTATATATTTCTGAGTTCTATATATAAAATGATCATTATTT

QA 1 898 1 898
DS 



AS 1 3

CO CL3761Contig1 520 3 4 U
GGGTTGTATAGATAAAAGTCTGCGTTAAACAAACGAGAAATCGAGAGGGGGCTAGGGTTT
GTGATTCGATTCCAAGAAAGAAAGAGGGGAAAAAGGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGAT
CGACTGGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGTGATCTGAAG
AAGCTGGTGGCGGCCCAGACGGGTACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATCCAGAAGTGGTAC
AACATCTACAAGGATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATTCACGACGGCATGGGTCTC
GAGCTCTACTACAATTAAGGCGAACCGTAGGGGTGCTAAGTAAGTGTGTGCTGAAGGAAT
GTTGTTGATTTGCGCACCTCCATAAACAACAATAAATATGTCTGTAAAATTGGGTAATTG
GTTTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAACTAAAATCAGATGTGTGTAATAAGCTACTCT
TCCAACTTTTGTCTACGGTAAGTCTCTCGGTGTTGTGCGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DD19TF U 1
AF RR2AR10JQ C 1
AF RR2AR10TF U 1
BS 1 327 RR2DD19TF
BS 328 328 RR2AR10TF
BS 329 332 RR2DD19TF
BS 333 520 RR2AR10TF

RD RR2DD19TF 339 0 0
GGGTTGTATAGATAAAAGTCTGCGTTAAACAAACGAGAAATCGAGAGGGGGCTAGGGTTT
GTGATTCGATTCCAAGAAAGAAAGAGGGGAAAAAGGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGAT
CGACTGGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGTGATCTGAAG
AAGCTGGTGGCGGCCCAGACGGGTACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATCCAGAAGTGGTAC
AACATCTACAAGGATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATTCACGACGGCATGGGTCTC
GAGCTCTACTACAATTAAGGCGAACCGGAGGG
TGCTAAG

QA 1 332 1 332
DS 

RD RR2AR10JQ 520 0 0
GGGTTGTATAGATAAAAGTCTGCGTTAAACAAACGAGAAATCGAGAGGGGGCTAGGGTTT
GTGATTCGATTCCAAGAAAGAAAGAGGGGAAAAAGGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGAT
CGACTGGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGTGATCTGAAG
AAGCTGGTGGCGGCCCAGACGGGTACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATCCAGAAGTGGTAC
AACATCTACAAGGATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATTCACGACGGCATGGGTCTC
GAGCTCTACTACAATTAAGGCGAACCGTAGGGGTGCTAAGTAAGTGTGTGCTGAAGGAAT
GTTGTTGATTTGCGCACCTCCATAAACAACAATAAATATGTCTGTAAAATTGGGTAATTG
GTTTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAACTAAAATCAGATGTGTGTAATAAGCTACTCT
TCCAACTTTTGTCTACGGTAAGTCTCTCGGTGTTGTGCGC

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2AR10TF 520 0 0
GGGTTGTATAGATAAAAGTCTGCGTTAAACAAACGAGAAATCGAGAGGGGGCTAGGGTTT
GTGATTCGATTCCAAGAAAGAAAGAGGGGAAAAAGGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGAT
CGACTGGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGTGATCTGAAG
AAGCTGGTGGCGGCCCAGACGGGTACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATCCAGAAGTGGTAC
AACATCTACAAGGATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATTCACGACGGCATGGGTCTC
GAGCTCTACTACAATTAAGGCGAACCGTAGGGGTGCTAAGTAAGTGTGTGCTGAAGGAAT
GTTGTTGATTTGCGCACCTCCATAAACAACAATAAATATGTCTGTAAAATTGGGTAATTG
GTTTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAACTAAAATCAGATGTGTGTAATAAGCTACTCT
TCCAACTTTTGTCTACGGTAAGTCTCTCGGTGTTGTGCGC

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 3

CO CL3762Contig1 792 3 7 U
GGGCAGTGAGCACACAAGAAGCAGAACCTGTGAGCAGGGAACATGAAGGTGATAGACAAG
ATCCAGTCCCTAGCCGAAGAAGGCAAGACAGCCTTCTCCTTCGAGTTCTTCCCTCCCAAG
ACCGAAGATGGAGTCGACAACCTCTTCGAGCGGATGGACCGTATGGTCGCTCACGGTCCA
ACTTTCTGCGACATCACTTGGGGAGCTGGTGGATCCACTGCTGATCTCACCCTCGACATC
GCTTCCAGGATGCAGAACGTTGTCTGCGTGGAGAGCATGATGCATCTCACTTGCACTAAC
ATGCCTGTGGAGAAGATAGACCACGCGCTTGAGACGATCAGAGCCAATGGGATTCAGAAC
GTGCTTGCTCTTAGAGGTGATCCTCCTCATGGTCATGATAAGTTCGTTCAGGTTGAAGGA
*GGGTTTGGTTGTGCTTTGGATCTTGTGAATCATATTAGGAGCAAGTATGGTGATTACTT
TGGGATCACTGTTGCTGGCTATCCAGAGGCTCATCCTGATGTTATTGGTGAGAATGGTCT
TGCATCAAGTGAAGCTTACCAGAGTGATCTTGAGTACTTGAAGAGAAAGGTTGATGCTGG
AGCTGATCTGATTGTTACTCAGCTTTTCTATGATACTGATGTTTTCCTCAAGTTTGTGAA
TGACTGTCGGCAAATTGGG*ATTAAGTGTCCCATTGTTCCTGGGATTATGCCCATTAATA
ACTACAAAGGGTTCTTGCGTATGACTGGTTTCTGTAAGACCAAGATACCAGCTGAGGTCA
TGGCTGCCTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ51TF U 1
AF RR2CC20TF U 24
AF RR2A844TF U 65
BS 1 29 RR2CJ51TF
BS 30 30 RR2CC20TF
BS 31 690 RR2CJ51TF
BS 691 727 RR2CC20TF
BS 728 728 RR2A844TF
BS 729 745 RR2CC20TF
BS 746 792 RR2A844TF

RD RR2CJ51TF 690 0 0
GGGCAGTGAGCACACAAGAAGCAGAACCTTTGAGCAGGGAACATGAAGGTGATAGACAAG
ATCCAGTCCCTAGCCGAAGAAGGCAAGACAGCCTTCTCCTTCGAGTTCTTCCCTCCCAAG
ACCGAAGATGGAGTCGACAACCTCTTCGAGCGGATGGACCGTATGGTCGCTCACGGTCCA
ACTTTCTGCGACATCACTTGGGGAGCTGGTGGATCCACTGCTGATCTCACCCTCGACATC
GCTTCCAGGATGCAGAACGTTGTCTGCGTGGAGAGCATGATGCATCTCACTTGCACTAAC
ATGCCTGTGGAGAAGATAGACCACGCGCTTGAGACGATCAGAGCCAATGGGATTCAGAAC
GTGCTTGCTCTTAGAGGTGATCCTCCTCATGGTCATGATAAGTTCGTTCAGGTTGAAGGA
*GGGTTTGGTTGTGCTTTGGATCTTGTGAATCATATTAGGAGCAAGTATGGTGATTACTT
TGGGATCACTGTTGCTGGCTATCCAGAGGCTCATCCTGATGTTATTGGTGAGAATGGTCT
TGCATCAAGTGAAGCTTACCAGAGTGATCTTGAGTACTTGAAGAGAAAGGTTGATGCTGG
AGCTGATCTGATTGTTACTCAGCTTTTCTATGATACTGATGTTTTCCTCAAGTTTGTGAA
TGACTGTCGGCAAATTGGG*ATTAAGTGTC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2CC20TF 722 0 0
GG
ACCTGTGAGCAGGGAACATGAAGGTGATAGACAAGATCCAGTCCCTAGCCGAAGAAGGCA
AGACAGCCTTCTCCTTCGAGTTCTTCCCTCCCAAGACCGAAGATGGAGTCGACAACCTCT
TCGAGCGGATGGACCGTATGGTCGCTCACGGTCCAACTTTCTGCGACATCACTTGGGGAG
CTGGTGGATCCACTGCTGATCTCACCCTCGACATCGCTTCCAGGATGCAGAACGTTGTCT
GCGTGGAGAGCATGATGCATCTCACTTGCACTAACATGCCTGTGGAGAAGATAGACCACG
CGCTTGAGACGATCAGAGCCAATGGGATTCAGAACGTGCTTGCTCTTAGAGGTGATCCTC
CTCATGGTCATGATAAGTTCGTTCAGGTTGAAGGA*GGGTTTGGTTGTGCTTTGGATCTT
GTGAATCATATTAGGAGCAAGTATGGTGATTACTTTGGGATCACTGTTGCTGGCTATCCA
GAGGCTCATCCTGATGTTATTGGTGAGAATGGCCTTGCATCAAGTGAAGCTTACCAGAGT
GATCTTGAGTACTTGAAGAGAAAGGTTGATGCTGGAGCTGATCTGATTGTTACTCAGCTT
TTCTATGATACTGATGTTTTCCTCAAGTTTGTGAATGACTGTCGGCAAATTGGG*ATTAA
GTGTCCCATTGTTCCTGGGATTATGCCCATTAATAACTACAA*GGGTTCTTGCGTATGAC

QA 3 722 3 722
DS 

RD RR2A844TF 728 0 0
AGTCCCTAGCCGAAGAAGGCAAGACAGCCTTCTCCTTCGAGTTCTTCCCTCCCAAGACCG
AAGATGGAGTCGACAATCTCTTCGAGCGTATGGACCGTATGGTCGCTTACGGTCCAACTT
TCTGCGACATCACTTGGGGAGCTGGTGGATCCACTGCTGATCTCACGCTCGACATCGCTT
CCAGGATGCAGAACGTTGTCTGCGTGGAGAGCATGATGCATCTCACCTGCACCAACATGC
CTGTGGAGAAGATAGACCACGCGCTTGAGACGATCAGAGCCAATGGGATTCAGAACGTGC
TTGCTCTCAGAGGTGATCCTCCTCATGGTCATGATAAGTTCGTTCAGGTTGAAGGAAGGG
TTTGGTTGTGCGTTGGATCTTGTGAATCATATTAGGAGCAAGTATGGTGATTACTTTGGG
ATCACTGTTGCTGGTTATCCAGAGGCTCATCCTGATGTTATTGGTGAGAATGGTCTTGCA
TCAAGCGAAGCTTACCAGAGTGATCTTGAGTACTTGAAGAGAAAGGTTGATGCTGGAGCT
GATCTGATTGTTACTCAGCTTTTCTATGATACTGATGTCTTCCTCAAGTTTGTGAATGAC
TGTCGGCAAATTGGGGATTAAGTGTCCCATTGTTCCTGGGATTATGCCCATTAATAACTA
CAAAGGGTTCTTGCGTATGACTGGTTTCTGTAAGACCAAGATACCAGCTGAGGTCATGGC
TGCCTTGG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

CO CL3763Contig1 877 3 4 U
GGAGATCTCATTATAATACATTTCTTCCCCTTCTTCATTTAAACATATAAACCTGTTTTA
ATGAAGTTCGGTAAGAGGATTAAGGAGCAGATACAAGAGTCGCTGCCGGAGTGGCGTGAC
AAGTTTTTGCGTTACAAAGAACTCAAGAATCTGATCTCTTCTCCTGCTCCAGCTGAATCT
ATCTTCGTCTGTTTGTTGAACGCGGAGATTGAGAAGTTTAATGCTTTCTTCGTCGAGCAA
GAAGAAGATTTCATCACCCACCATAAGGAATTGCAATATCGGATTCAGAGATTGGTAGAA
AAATGTGGAGATAGTGATGATGTAATGTTCAGAGAAGAGATTGGTGAGATCAGAAAGGAT
ATTGTTAACTTCCATGGGGAGATGGTACTTCTCGTTAATTACAGCAACATAAACTACACT
GGGTTAGCAAAGATTCTGAAGAAGTACGACAAGAGAACAGGAGGAGCATTGCGATCGCCG
TTTATCCAAAAAGTTCTTCGTCAGCCGTTTTTCAAGACTGATCTGGTGTCGAGGCTCGTG
AGAGAGTGGGAGACGACGATGGACGCGATGTTTCCGGCGCTGACTAGGGAGGTGGAGGGA
TACGAGAGATCTGCGGCGGTGAGTTCGGCTGCGGCGGGAGAAGGGATATTTAGGAATACG
GTTGCGGCGTTGATGACGATGAGAGAGATGAGAAGAGGGAGTTCTACTTACGGTGCCTAC
TCGCTTCCGCCGCTTAATCTTTCTGATTCCGATCTTGTTTTACGGCCGGTCCACGTCCCT
TCTCCGATACCTATTCCTTATTGATAAATCTTAATAGATATTTAATCACACGGGAAATGG
ACTTATCATAATATTTGTATTTTTTTCGTTTGACTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU55TF U 1
AF RR2CG34TF U 1
AF RR2BU55JQ C 168
BS 1 102 RR2BU55TF
BS 103 103 RR2CG34TF
BS 104 649 RR2BU55TF
BS 650 877 RR2BU55JQ

RD RR2BU55TF 656 0 0
GGAGATCTCATTATAATACATTTCTTCCCCTTCTTCATTTAAACATATAAACCTGTTTTA
ATGAAGTTCGGTAAGAGGATTAAGGAGCAGATACAAGAGTCGTTGCCGGAGTGGCGTGAC
AAGTTTTTGCGTTACAAAGAACTCAAGAATCTGATCTCTTCTCCTGCTCCAGCTGAATCT
ATCTTCGTCTGTTTGTTGAACGCGGAGATTGAGAAGTTTAATGCTTTCTTCGTCGAGCAA
GAAGAAGATTTCATCACCCACCATAAGGAATTGCAATATCGGATTCAGAGATTGGTAGAA
AAATGTGGAGATAGTGATGATGTAATGTTCAGAGAAGAGATTGGTGAGATCAGAAAGGAT
ATTGTTAACTTCCATGGGGAGATGGTACTTCTCGTTAATTACAGCAACATAAACTACACT
GGGTTAGCAAAGATTCTGAAGAAGTACGACAAGAGAACAGGAGGAGCATTGCGATCGCCG
TTTATCCAAAAAGTTCTTCGTCAGCCGTTTTTCAAGACTGATCTGGTGTCGAGGCTCGTG
AGAGAGTGGGAGACGACGATGGACGCGATGTTTCCGGCGCTGACTAGGGAGGTGGAGGGA
TACGAGAGATCTGCGGCGGTGAGTTCGGCTGCGGCGGGAGAAGGGATAT
TTAGGAA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2CG34TF 649 0 0
GGAGATCTCATTATAATACATTTCTTCCCCTTCTTCATTTAAACATATACACCTGTTTTA
ATGAAGTTCGGTAAGAGGATTAAGGAGCAGATACAAGAGTCGCTGCCGGAGTGGCGTGAC
AAGTTTTTGCGTTACAAAGAACTCAAGAATCTGATCTCTTCTCCTGCTCCAGCTGAATCT
ATCTTCGTCTGTTTGTTGAACGCGGAGATTGAGAAGTTTAATGCTTTCTTCGTCGAGCAA
GAAGAAGATTTCATCATCCACCATAAGGAATTGCAATATCGGATTCAGAGGTTGGTAGAA
AAATGTGGAGACAATGATGATGTAATGTTCAGAGAAGAGATTGGCGAGATCAGAAAGGAT
ATTGTTAACTTCCATGGGGAGATGGTACTTCTCGTTAATTACAGCAACATAAACTACACT
GGGTTAGCAAAGATTCTGAAGAAGTACGACAAGAGAACAGGAGGAGCATTGCGATCACCG
TTTATCCAAAAAGTTCTTCGTCAGCCGTTTTTCAAGACTGATCTGGTGTCGAGGCCCGTG
AGAGAGTGGGAGACGACGATGGACGCGATGTTTCCGGCGCTGACTAGGGAGGTGGAGGGA
TACGAGAGATCTGTGGCGGTGAGTTCGGCTGCGGCGGGAGAAGGGATAT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2BU55JQ 710 0 0
TCCAGCTGAATCTATCTTCGTCTGTTTGTTGAACGCGGAGATTGAGAAGTTTAATGCTTT
CTTCGTCGAGCAAGAAGAAGATTTCATCACCCACCATAAGGAATTGCAATATCGGATTCA
GAGATTGGTAGAAAAATGTGGAGATAGTGATGATGTAATGTTCAGAGAAGAGATTGGTGA
GATCAGAAAGGATATTGTTAACTTCCATGGGGAGATGGTACTTCTCGTTAATTACAGCAA
CATAAACTACACTGGGTTAGCAAAGATTTTGAAGAAGTACGACAAGAGAACAGGAGGAGC
ATTGCGATCGCCGTTTATCCAAAAAGTTTTTCGTCAGCCGTTTTTCAAGACTGATCTGGT
GTCGAGGCTCGTGAGAGAGTGGGAGACGACGATGGACGCGATGTTTCCGGCGCTGACTAG
GGAGGTGGAGGGATACGAGAGATCTGCGGCGGTGAGTTCGGCTGCGGCGGGAGAAGGGAT
ATTTAGGAATACGGTTGCGGCGTTGATGACGATGAGAGAGATGAGAAGAGGGAGTTCTAC
TTACGGTGCCTACTCGCTTCCGCCGCTTAATCTTTCTGATTCCGATCTTGTTTTACGGCC
GGTCCACGTCCCTTCTCCGATACCTATTCCTTATTGATAAATCTTAATAGATATTTAATC
ACACGGGAAATGGACTTATCATAATATTTGTATTTTTTTCGTTTGACTTC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3765Contig1 850 3 19 U
TTTTTGAGCGCCATGGCTTCCTTATCTCCGATGACTCAGCCGTCTTTAGTACACATTCCC
GGCGAATCCGTCCCCCATCATCACGTACTACCAAGCACTTGCTCTTTCCCGCGGAAACCA
ACAACCACGAAACGGATTATCTGTTCGCCGACAAGGAGTTCCGATGAGACGTCGACGGAT
GGAGAAACAAACGGCGGAGGATCTAGCACCACTGCCGTCGATGAAGCGCCGAAAGAGACT
CCATCTTTGATCTCCGCTCTCAACGTCGAACGTGCTCTCCGTGGCCTTCCCATTACAGAT
GTGGATCATTACGGTCGGCTTGGACTTTCTAGAAACTGCTCTTATGATCAGGTAAGAATT
GGTTACCAAGATAGAGTTAAGGGGTTAATGGGACAAGGGCTAGACGAAGAACAACTCAAG
AACAAGATGGAGCTTGTCAAAGATTCATATACGATCTTGTCGTCGGTGGAAGAGAGAAGG
ATGTACGATTGGAGTCTAGCCAGAAGCGAAAAAGCAGAGCGGTACATATGGCCGTTCGAG
GTTGGCATCATGGAACCCTCCAGGGAAGAGCCTCCTCCTCAGGAACCAGAAGATGTAGGA
CCAACGAGGATTCTTGGATACTTCATTGGGGCGTGGCTTGTCCTTGGTGTTGCCCTTTCT
GTTGCATTCAATCGTTAGCCACTTCGTTTCTTTCACCATCTTCTTCCTCACCTTAAATTA
AATCATTTCGAGAAAATGTATATTTAGTAGTCGTTTATATACTTAAGTGTATTAATTGTC
TGACGAATGTTCAAGCTACTGATTGTAATAAATATTGTGTATCTACAAAGTAAAACGGTC
TGTCAGTGCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW67TF U 1
AF RR2B445TF U 6
AF RR2B445JQ C 65
BS 1 150 RR2FW67TF
BS 151 151 RR2B445TF
BS 152 327 RR2FW67TF
BS 328 328 RR2B445TF
BS 329 382 RR2FW67TF
BS 383 383 RR2B445TF
BS 384 544 RR2FW67TF
BS 545 545 RR2B445TF
BS 546 706 RR2FW67TF
BS 707 707 RR2B445TF
BS 708 716 RR2FW67TF
BS 717 717 RR2B445TF
BS 718 718 RR2FW67TF
BS 719 720 RR2B445TF
BS 721 735 RR2FW67TF
BS 736 736 RR2B445TF
BS 737 755 RR2FW67TF
BS 756 806 RR2B445TF
BS 807 850 RR2B445JQ

RD RR2FW67TF 761 0 0
TTTTTGAGCGCCATGGCTTCCTTATCTCCGATGACTCAGCCGTCTTTAGTACACATTCCC
GGCGAATCCGTCCCCCATCATCACGTACTACCAAGCACTTGCTCTTTCCCGCGGAAACCA
ACAACCACGAAACGGATTATCTGTTCGCCGGCAAGGAGTTCCGATGAGACGTCGACGGAT
GGAGAAACAAACGGCGGAGGATCTAGCACCACTGCCGTCGATGAAGCGCCGAAAGAGACT
CCATCTTTGATCTCCGCTCTCAACGTCGAACGTGCTCTCCGTGGCCTTCCCATTACAGAT
GTGGATCATTACGGTCGGCTTGGACTTCCTAGAAACTGCTCTTATGATCAGGTAAGAATT
GGTTACCAAGATAGAGTTAAGGAGTTAATGGGACAAGGGCTAGACGAAGAACAACTCAAG
AACAAGATGGAGCTTGTCAAAGATTCATATACGATCTTGTCGTCGGTGGAAGAGAGAAGG
ATGTACGATTGGAGTCTAGCCAGAAGCGAAAAAGCAGAGCGGTACATATGGCCGTTCGAG
GTTGACATCATGGAACCCTCCAGGGAAGAGCCTCCTCCTCAGGAACCAGAAGATGTAGGA
CCAACGAGGATTCTTGGATACTTCATTGGGGCGTGGCTTGTCCTTGGTGTTGCCCTTTCT
GTTGCATTCAATCGTTAGCCACTTCGTTTCTTTCACCATCTTCTTC*TCACCTTAATT**
AATCATTTCGAGAAA*TGTATATTTAGTAGTCGTT
ATATAC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2B445TF 801 0 0
GAGCGCCATGGCTTCCTTATCTCCGATGACTCAGCCGTCTTTAGTACACATTCCCGGCGA
ATCCGTCCCCCATCATCACGTACTACCAAGCACTTGCTCTTTCCCGCGGAAACCAACAAC
CACGAAACGGATTATCTGTTCGCCGACAAGGAGTTCCGATGAGACGTCGACGGATGGAGA
AACAAACGGCGGAGGATCTAGCACCACTGCCGTCGATGAAGCGCCGAAAGAGACTCCATC
TTTGATCTCCGCTCTCAACGTCGAACGTGCTCTCCGTGGCCTTCCCATTACAGATGTGGA
TCATTACGGTCGGCTTGGACTTTCTAGAAACTGCTCTTATGATCAGGTAAGAATTGGTTA
CCAAGATAGAGTTAAGGGGTTAATGGGACAAGGGCTAGACGAAGAACAACTCAAGAACAA
GATGGAGCTTGTCAAAGATTCATATACGATCTTGTCGTCGGTGGAAGAGAGAAGGATGTA
CGATTGGAGTCTAGCCAGAAGCGAAAAAGCAGAGCGGTACATATGGCCGTTCGAGGTTGG
CATCATGGAACCCTCCAGGGAAGAGCCTCCTCCTCAGGAACCAGAAGATGTAGGACCAAC
GAGGATTCTTGGATACTTCATTGGGGCGTGGCTTGTCCTTGGTGTTGCCCTTTCTGTTGC
ATTCAATCGTTAGCCACTTCGTTTCTTTCACCATCTTCTTCCTCACCTTAAATTAAATCA
TTTCGAGAAAATGTATATTTAGTAGTCGTTTATATACTTAAGTGTATTAATTGTCTGACG
AATGTTCAAGCTACTGATTGT

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2B445JQ 786 0 0
AATCCGTCCCCCATCATCACGTACTACCAAGCACTTGCTCTTTCCCGCGGAAACCAACAA
CCACGAAACGGATTATCTGTTCGCCGACAAGGAGTTCCGATGAGACGTCGACGGATGGAG
AAACAAACGGCGGAGGATCTAGCACCACTGCCGTCGATGAAGCGCCGAAAGAGACTCCAT
CTTTGATCTCCGCTCTCAACGTCGAACGTGCTCTCCGTGGCCTTCCCATTACAGATGTGG
ATCATTACGGTCGGCTTGGACTTTCTAGAAACTGCTCTTATGATCAGGTAAGAATTGGTT
ACCAAGATAGAGTTAAGGGGTTAATGGGACAAGGGCTAGACGAAGAACAACTCAAGAACA
AGATGGAGCTTGTCAAAGATTCATATACGATCTTGTCGTCGGTGGAAGAGAGAAGGATGT
ACGATTGGAGTCTAGCCAGAAGCGAAAAAGCAGAGCGGTACATATGGCCGTTCGAGGTTG
GCATCATGGAACCCTCCAGGGAAGAGCCTCCTCCTCAGGAACCAGAAGATGTAGGACCAA
CGAGGATTCTTGGATACTTCATTGGGGCGTGGCTTGTCCTTGGTGTTGCCCTTTCTGTTG
CATTCAATCGTTAGCCACTTCGTTTCTTTCACCATCTTCTTCCTCACCTTAAATTAAATC
ATTTCGAGAAAATGTATATTTAGTAGTCGTTTATATACTTAAGTGTATTAATTGTCTGAC
GAATGTTCAAGCTACTGATTGTAATAAATATTGTGTATCTACAAAGTAAAACGGTCTGTC
AGTGCT

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 3

CO CL3766Contig1 653 3 13 U
GGGAGTGGGCAAAAAA*CAAAGAACAGAACCAGAGTTACACATATGGGGTCAATAAAGAT
TCCCAAAACCCTCAACGGGCACTTTTCTCTTGTACTTATTATCATCACAATAGTGATGGT
GACTCACTCCCATGGATTTCAACTACAGATCAAGAACGAGCTCTCAGGTCGGTACAGGAG
GCTTGCGTACAAATGCTGGTCCCGCGACAACGATCTAGGGTGGCGAGAAGACTGGCCAGA
TCAACACAAGGAATGGTCCTTCGCCATGTCGCTATTCCACACATTTTTCTACTGCAACTT
CCATACAGGATACGGACGTGTGGACAAGCAGCTAGTTGCGTCGTGGGAGATGAAAGAGCA
GTGTGGGGACAGGGAGAAATGCACTTGGGTCGTTAAGAAGGATGGACTCTACCTGAGACA
GTGGAAGACCAAATTTCTTAGTAACAAGTACGGTAACGAGAGGTGGAATGAGTATGTTGA
ACATGATGTCCTCCAGAAAGCTTGGAGCTAATTAACAATTTCACGATGTTGATCAGTATG
AAGATCGTAACAGTGTCGTGATTTTCGTCTCTGTATGTTGTTATTCGTGTTAATAAAACC
GAAAAATATGATGTGTAACTTTATAAATGGTGAAAATGAGAAAGAACATATCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2DF59TF U 1
AF RR2GC22JQ C 1
AF RR2GC22TF U 1
BS 1 16 RR2DF59TF
BS 17 17 RR2GC22TF
BS 18 79 RR2DF59TF
BS 80 80 RR2GC22TF
BS 81 242 RR2DF59TF
BS 243 243 RR2GC22TF
BS 244 339 RR2DF59TF
BS 340 340 RR2GC22TF
BS 341 436 RR2DF59TF
BS 437 437 RR2GC22TF
BS 438 585 RR2DF59TF
BS 586 651 RR2GC22TF
BS 652 653 RR2GC22JQ

RD RR2DF59TF 585 0 0
GGGAGTGGGCAAAAAAACAAAGAACAGAACCAGAGTTACACATATGGGGTCAATAAAGAT
TCCCAAAACCCTCAACGGGTACTTTTCTCTTGTACTTATTATCATCACAATAGTGATGGT
GACTCACTCCCATGGATTTCAACTACAGATCAAGAACGAGCTCTCAGGTCGGTACAGGAG
GCTTGCGTACAAATGCTGGTCCCGCGACAACGATCTAGGGTGGCGAGAAGACTGGCCAGA
TCGACACAAGGAATGGTCCTTCGCCATGTCGCTATTCCACACATTTTTCTACTGCAACTT
CCATACAGGATACGGACGTGTGGACAAGCAGCTAGTTGCATCGTGGGAGATGAAAGAGCA
GTGTGGGGACAGGGAGAAATGCACTTGGGTCGTTAAGAAGGATGGACTCTACCTGAGACA
GTGGAAGACCAAATTTTTTAGTAACAAGTACGGTAACGAGAGGTGGAATGAGTATGTTGA
ACATGATGTCCTCCAGAAAGCTTGGAGCTAATTAACAATTTCACGATGTTGATCAGTATG
AAGATCGTAACAGTGTCGTGATTTTCGTCTCTGTATGTTGTTATT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2GC22JQ 653 0 0
GGGAGTGGGCAAAAAA*CAAAGAACAGAACCAGAGTTACACATATGGGGTCAATAAAGAT
TCCCAAAACCCTCAACGGGCACTTTTCTCTTGTACTTATTATCATCACAATAGTGATGGT
GACTCACTCCCATGGATTTCAACTACAGATCAAGAACGAGCTCTCAGGTCGGTACAGGAG
GCTTGCGTACAAATGCTGGTCCCGCGACAACGATCTAGGGTGGCGAGAAGACTGGCCAGA
TCAACACAAGGAATGGTCCTTCGCCATGTCGCTATTCCACACATTTTTTTACTGCAACTT
CCATACAGGATACGGACGTGTGGACAAGCAGCTAGTTGCGTCGTGGGAGATGAAAGAGCA
GTGTGGGGACAGGGAGAAATGCACTTGGGTCGTTAAGAAGGATGGACTCTACCTGAGACA
GTGGAAGACCAAATTTCTTAGTAACAAGTACGGTAACGAGAGGTGGAATGAGTATGTTGA
ACATGATGTCCTCCAGAAAGCTTGGAGCTAATTAACAATTTCACGATGTTGATCAGTATG
AAGATCGTAACAGTGTCGTGATTTTCGTCTCTGTATGTTGTTATTCGTGTTAATAAAACC
GAAAAATATGATGTGTAACTTTATAAATGGTGAAAATGAGAAAGAACATATCC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2GC22TF 651 0 0
GGGAGTGGGCAAAAAA*CAAAGAACAGAACCAGAGTTACACATATGGGGTCAATAAAGAT
TCCCAAAACCCTCAACGGGCACTTTTCTCTTGTACTTATTATCATCACAATAGTGATGGT
GACTCACTCCCATGGATTTCAACTACAGATCAAGAACGAGCTCTCAGGTCGGTACAGGAG
GCTTGCGTACAAATGCTGGTCCCGCGACAACGATCTAGGGTGGCGAGAAGACTGGCCAGA
TCAACACAAGGAATGGTCCTTCGCCATGTCGCTATTCCACACATTTTTCTACTGCAACTT
CCATACAGGATACGGACGTGTGGACAAGCAGCTAGTTGCGTCGTGGGAGATGAAAGAGCA
GTGTGGGGACAGGGAGAAATGCACTTGGGTCGTTAAGAAGGATGGACTCTACCTGAGACA
GTGGAAGACCAAATTTCTTAGTAACAAGTACGGTAACGAGAGGTGGAATGAGTATGTTGA
ACATGATGTCCTCCAGAAAGCTTGGAGCTAATTAACAATTTCACGATGTTGATCAGTATG
AAGATCGTAACAGTGTCGTGATTTTCGTCTCTGTATGTTGTTATTCGTGTTAATAAAACC
GAAAAATATGATGTGTAACTTTATAAATGGTGAAAATGAGAAAGAACATAT

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 3

CO CL3767Contig1 810 3 21 U
ACTGCTTCAAGAAACATTGATTTATTCTTAAGAAATTACAAAGAGAGTGACAGTAAAACA
TGAAGGAAACATCGTTTTAGAGGATTACAAGCATTACTATTATACATAGACGAAATAAAT
AACCCAAGAAAATCATATTTTTGAGGAATGTAACGACCAACAGATGATAGATTTGATCAC
GATTGTACTTTCCGGGCAATAAGCAAATACGAAGATTACATGCTTGGCCTAACGTTGAGA
CGGCTTGCAAGCTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCCTGAGACCAGTAAGAGATCCAGATG
CTACGGATCTCATGCGTGAGACGTGGCTCTGACAGAATCTCTACCCATCTCTTAACGAAC
CGGTCTTGCCTGTCTGGTGCCCATGATCTGTATCTATCTCCAGGTTGCTTGAAGTTGTTC
TCCTTCTTGATGATGCACTTTGTTCGGATTCCAGTGTAAGACTTGGTAGGGATAGGAACT
TTCTCAGCACAGCGGACAGGATCAAACTTTGAGGGGTAGTAGTTGATCTCCTCGTCTCTA
TGCATGAAGTTCATAAAACCTTCATGGTGATTGTTGTGGTGAGCACATTTAGGAGCATTA
ACCGGTAACTGCAAATAGTTAGGTCCAAGACGATGTCTCTGAGTGTCACCATAAGCAAAG
ATCCTACACTGGAGAAGCTTATCATCTGAGTAGTAGATCCCAGGAACCACAAGACCAGGG
TTGAAAGCAAGCTGCTCAGTTTCATTGAAGAAGTTATCAATGGTCCTGTTCAGAACCAAA
CGACCAACTGGCTGCAAAGGCAAGATATCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB34TF C 2
AF RR2GB34JQ U 4
AF RR2AT57JQ U 1
BS 1 172 RR2AT57JQ
BS 173 174 RR2GB34JQ
BS 175 209 RR2AT57JQ
BS 210 210 RR2GB34JQ
BS 211 233 RR2AT57JQ
BS 234 234 RR2GB34JQ
BS 235 296 RR2AT57JQ
BS 297 297 RR2GB34JQ
BS 298 323 RR2AT57JQ
BS 324 324 RR2GB34JQ
BS 325 326 RR2AT57JQ
BS 327 327 RR2GB34JQ
BS 328 335 RR2AT57JQ
BS 336 336 RR2GB34JQ
BS 337 356 RR2AT57JQ
BS 357 357 RR2GB34JQ
BS 358 607 RR2AT57JQ
BS 608 608 RR2GB34JQ
BS 609 617 RR2AT57JQ
BS 618 618 RR2GB34JQ
BS 619 810 RR2AT57JQ

RD RR2GB34TF 766 0 0
TT
GCTTCAAGAAACATTGATTTAT*CTTAAGAAAT*ACAAAGAGAGTGACAGTAAAACATGA
AGGAAACATCGTTTTAGAGGATTACAAGCATTACTATTATACATAGACGAAATAAATAAC
CCAAGAAAATCATATTTTTGAGGAATGTAACGACCAACAGATGATAGATTTGATCACGAT
TGTACTTTCCGGGCAATAAGCAAATACGAAGATTACATGCTTGGCCTAACGTTGAGACGG
CTTGCAAGCTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCCTGAGACCAGTAAGAGATCCAGATGCTA
CGGATCTCATGCGTGAGACGTGGCTCTGACAGAATCTCTACCCATCTCTTAACGAACCGG
TCTTGCCTGTCTGGTGCCCATGATCTGTATCTATCTCCAGGTTGCTTGAAGTTGTTCTCC
TTCTTGATGATGCACTTTGTTCGGATTCCAGTGTAAGACTTGGTAGGGATAGGAACTTTC
TCAGCACAGCGGACAGGATCAAACTTTGAGGGGTAGTAGTTGATCTCCTCGTCTCTATGC
ATGAAGTTCATAAAACCTTCATGGTGATTGTTGTGGTGAGCACATTTAGGAGCATTAACC
GGTAACTGCAAATAGTTAGGTCCAAGACGATGTCTCTGAGTGTCACCATAAGCAAAGATC
CTACACTGGAGAAGCTTATCATCTGAGTAGTAGATCCCAGGAACCACAAGACCAGGGTTG
AAAGCAAGCTGCTCAGTTTCATTGAAGAAGTTATCAATGGTCC
C

QA 3 765 3 765
DS 

RD RR2GB34JQ 763 0 0
GCTTCAAGAAACATTGATTTATTCTTAAGAAATTACAAAGAGAGTGACAGTAAAACATGA
AGGAAACATCGTTTTAGAGGATTACAAGCATTACTATTATACATAGACGAAATAAATAAC
CCAAGAAAATCATATTTTTGAGGAATGTAACGACCAACAGATGATAGATTTGATCACGAT
TGTACTTTCCGGGCAATAAGCAAATACGAAGATTACATGCTTGGCCTAACGTTGAGACGG
CTTGCAAGCTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCCTGAGACCAGTAAGAGATCCAGATGCTA
CGGATCTCATGCGTGAGACGTGGCTCTGACAGAATCTCTACCCATCTCTTAACGAACCGG
TCTTGCCTGTCTGGTGCCCATGATCTGTATCTATCTCCAGGTTGCTTGAAGTTGTTCTCC
TTCTTGATGATGCACTTTGTTCGGATTCCAGTGTAAGACTTGGTAGGGATAGGAACTTTC
TCAGCACAGCGGACAGGATCAAACTTTGAGGGGTAGTAGTTGATCTCCTCGTCTCTATGC
ATGAAGTTCATAAAACCTTCATGGTGATTGTTGTGGTGAGCACATTTAGGAGCATTAACC
GGTAACTGCAAATAGTTAGGTCCAAGACGATGTCTCTGAGTGTCACCATAAGCAAAGATC
CTACACTGGAGAAGCTTATCATCTGAGTAGTAGATCCCAGGAACCACAAGACCAGGGTTG
AAAGCAAGCTGCTCAGTTTCATTGAAGAAGTTATCAATGGTCC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2AT57JQ 810 0 0
ACTGCTTCAAGAAACATTGATTTATTCTTAAGAAATTACAAAGAGAGTGACAGTAAAACA
TGAAGGAAACATCGTTTTAGAGGATTACAAGCATTACTATTATACATAGACGAAATAAAT
AACCCAAGAAAATCATATTTTTGAGGAATGTAACGACCAACAGATGATAGATC*GATCAC
GATTGTACTTTCCGGGCAATAAGCAAATATGAAGATTACATGCTTGGCCTAACATTGAGA
CGGCTTGCAAGCTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCCTGAGACCAGTAAGAGATCCATATG
CTACGGATCTCATGCGTGAGACGCGGTTCTGACAGGATCTCTACCCATCTCTTAACAAAC
CGGTCTTGCCTGTCTGGTGCCCATGATCTGTATCTATCTCCAGGTTGCTTGAAGTTGTTC
TCCTTCTTGATGATGCACTTTGTTCGGATTCCAGTGTAAGACTTGGTAGGGATAGGAACT
TTCTCAGCACAGCGGACAGGATCAAACTTTGAGGGGTAGTAGTTGATCTCCTCGTCTCTA
TGCATGAAGTTCATAAAACCTTCATGGTGATTGTTGTGGTGAGCACATTTAGGAGCATTA
ACCGGTAGCTGCAAATAATTAGGTCCAAGACGATGTCTCTGAGTGTCACCATAAGCAAAG
ATCCTACACTGGAGAAGCTTATCATCTGAGTAGTAGATCCCAGGAACCACAAGACCAGGG
TTGAAAGCAAGCTGCTCAGTTTCATTGAAGAAGTTATCAATGGTCCTGTTCAGAACCAAA
CGACCAACTGGCTGCAAAGGCAAGATATCC

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 3

CO CL3768Contig1 783 3 5 U
GAAGCTTCATATTACTGGAAAGCTTTTCCACAGCGGTTTAGCTCATAAGGCTATTAACGC
GATGGAGTTGGGAATGGAAGGGCTTAAGGAGATCCAGTCTCGGTTCTACAGAGACTTTCC
GCCACACGAGCAAGAGAAAGTTTATGGTTTCGCGACGCCTTCCACCATGAAGCCAACTCA
ATGGAGTTATCCGGGAGGCGGAATCAACCAAATCCCTGGAGACTGTACCGTTTCCGGTGA
TGTCAGGTTGACTCCTTTCTATGACGTGAAGGAAGTGATGAAGAAGCTGCAAGAGTATGT
TGACGACATAAACACCAACATTGAGAAACTCGCTACTCGTGGTCCTGTTTCGAAATACGT
ATTGCCTGAAGAGAATTTACGTGGAAGGCTCACGTTAAGCTTTGACGAAGCATCAGCTGG
AGTTGCGTGTAACCTTGATTCCCGCGGCTTTCACGTTCTATGCAAAGCAACTGAAGAAGT
TGTCGGGCACGTGAAGCCTTACTCCATCACCGGTACTCTGCCTCTTATCCGAGACCTCAA
GGATGAAGGTTTCGATGTGCAAACGTCAGGATACGGTCTGATGGCTACATATCATGCAAA
GAACGAGTACTGCCTTCTTACAGACATGTGCCAAGGCTTTGATGTCTTCGTTAAGATCAT
TTCTCAGCTTGAACAAGACTAATGCAATAAAAGCTTCACATAGCTTCTCTCTTTATTATT
AGCTAATGGTTCTATCTATACACTTTGCTTTCTATCTATTTGTACATGTCACTGGTTGCT
CAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2CW26TF U 1
AF RR2CW26JQ C 73
AF RR2CP58TF U 122
BS 1 564 RR2CW26TF
BS 565 565 RR2CW26JQ
BS 566 710 RR2CP58TF
BS 711 711 RR2CW26JQ
BS 712 783 RR2CP58TF

RD RR2CW26TF 565 0 0
GAAGCTTCATATTACTGGAAAGCTTTTCCACAGCGGTTTAGCTCATAAGGCTATTAACGC
GATGGAGTTGGGAATGGAAGGGCTTAAGGAGATCCAGTCTCGGTTCTACAGAGACTTTCC
GCCACACGAGCAAGAGAAAGTTTATGGTTTCGCGACGCCTTCCACCATGAAGCCAACTCA
ATGGAGTTATCCGGGAGGCGGAATCAACCAAATCCCTGGAGACTGTACCGTTTCCGGTGA
TGTCAGGTTGACTCCTTTCTATGACGTGAAGGAAGTGATGAAGAAGCTGCAAGAGTATGT
TGACGACATAAACACCAACATTGAGAAACTCGCTACTCGTGGTCCTGTTTCGAAATACGT
ATTGCCTGAAGAGAATTTACGTGGAAGGCTCACGTTAAGCTTTGACGAAGCATCAGCTGG
AGTTGCGTGTAACCTTGATTCCCGCGGCTTTCACGTTCTATGCAAAGCAACTGAAGAAGT
TGTCGGGCACGTGAAGCCTTACTCCATCACCGGTACTCTGCCTCTTATCCGAGACCTCAA
GGATGAAGGTTTCGATGTGCAAAC
G

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2CW26JQ 665 0 0
AATGGAAGGGCTTAAGGAGATCCAGTCTCGGTTCTACAGAGACTTTCCGCCACACGAGCA
AGAGAAAGTTTATGGTTTCGCGACGCCTTCCACCATGAAGCCAACTCAATGGAGTTATCC
GGGAGGCGGAATCAACCAAATCCCTGGAGACTGTACCGTTTCCGGTGATGTCAGGTTGAC
TCCTTTCTATGACGTGAAGGAAGTGATGAAGAAGCTGCAAGAGTATGTTGACGACATAAA
CACCAACATTGAGAAACTCGCTACTCGTGGTCCTGTTTCGAAATACGTATTGCCTGAAGA
GAATTTACGTGGAAGGCTCACGTTAAGCTTTGACGAAGCATCAGCTGGAGTTGCGTGTAA
CCTTGATTCCCGCGGCTTTCACGTTCTATGCAAAGCAACTGAAGAAGTTGTCGGGCACGT
GAAGCCTTACTCCATCACCGGTATTCTGCCTCTTATCCGAGACCTCAAGGATGAAGGTTT
CGATGTGCAAACGTCAGGATACGGTCTGATGGCTACATATCATGCAAAGAACGAGTACTG
CCTTCTTACAGACATGTGCCAAGGCTTTGATGTCTTCGTTAAGATCATTTTTCAGCTTGA
ACAAGACTAATGCAATAAAAGCTTCACATAGCTTCTCTCTTTATTATTAGCTAATGGTTC
TATCT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2CP58TF 662 0 0
GG
ACACGAGCAAGAGAAAGTTTATGGTTTCGCGACGCCTTCCACCATGAAGCCAACTCAATG
GAGTTATCCGGGAGGTGGAATCAACCAAATCCCTGGAGACTGTACCGTATCCGGTGATGT
CAGGTTGACTCCTTTCTATGACGTGAAGGAAGTGATGAAGAAGCTGCAAGAGTATGTTGA
CGACATAAACACCAACATTGAGAAACTCGCGACCCGTGGTCCTGTTTCGAAATACGTCTT
GCCTGAAGAGAATCTACGTGGAAGGCTCACGTTAAGCTTTGATGAAGCATCAGCTGGAGT
TGCGTGTAACCTCGATTCCCGCGGCTTTCACGTACTATGCAAAGCAACCGAAGAAGTTGT
CGGCCACGTGAAGCCTTACTCCATCACCGGTACTCTACCTCTTATCCGAGATCTCAAGGA
TGAAGGTTTCGATGTGCAAACTTCAGGATACGGTCTGATGGCTACATATCATGCAAAGAA
CGAGTACTGCCTTCTTACAGACATGTGCCAAGGCTTTGATGTCTTCGTTAAGATCATTTC
TCAGCTTGAACAAGACTAATGCAATAAAAGCTTCACATAGCTTCTCT*TTTATTATTAGC
TAATGGTTCTATCTATACACTTTGCTTTCTATCTATTTGTACATGTCACTGGTTGCTCAT

QA 3 662 3 662
DS 



AS 1 3

CO CL3769Contig1 744 3 3 U
GGAACTACGGTCGGCTTTTCTGCAGCGTCGCCCTCGATCTCTTCAATTACTGCCTTTCTA
GGTCTCTC******TCTCTCCCTCTCCGTCGATTTTCCCCCGACCCAGCGCCGTCGATTT
CGTATCCAACAAACGATGAAGCTCACCGTTAAGACTCTCATGGGTCGTCAGTTTGAAATT
AGGGTTCAGTCCTCCGATACGATAATGGCGGTGAAGAAGAATATAGAGGATTCACAAGGG
AAGGATAATTATCCATGTGGGCAGCAATTGTTGATTCACAATGGGAAAGTTTTGAAAGAT
GAAACTACTCTTGTGGAGAACAAGGTTACTGAGGAAGGCTTTCTTGTCGTCATGCTTAGC
AAGAGCCGAACTGCAGGTTCAGCTGGTCAGTCGTCGACTCAGCCTGCTTCCACTACTACT
AATACGTCTACCACATCTTCTACTAAGCCTGCAGCTCCATCTACAGCCCAGTCTACAGCT
GTACCTGCTTCACCTATTCCTGCTCAAGAACAACCAGCGACACAGACTGACACCTTTGGA
CAAGCTGCTTCAACCGTGGTTAGTGGCAATCGTCTTGAGCCATTGGTACAACAATTAATG
GACATGGGAGGCGGGAGCTGGGACAAAGAAACTGTTACTCGTGCACTTCGTGCTGCTCAT
AACAACCCTGACAGAGCAGTGGATTATCTATACTCTGGGATTCCTGAAACTGCTGAAGTA
GCTGTGGCAGGGTCTGGTGCAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS24TF U 31
AF RR2G057TF U 5
AF RR2BD65TF U 1
BS 1 66 RR2BD65TF
BS 67 68 RR2BS24TF
BS 69 744 RR2BD65TF

RD RR2BS24TF 686 0 0
GG
CTCGATCTCTTCAATTACTGCCTTTCTAGGTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCCGTCGA
TTTTCCCCCGACCCAGCGCCGTCGATTTCGTATCCAACAAACGATGAAGCTCACCGTTAA
GACTCTCATGGGTCGTCAGTTTGAAATTAGGGTTCAGTCCTCCGATACGATAATGGCGGT
GAAGAAGAATATAGAGGATTCACAAGGGAAGGATAATTATCCATGTGGGCAGCAATTGTT
GATTCACAATGGGAAAGTTTTGAAAGATGAAACTACTCTTGTGGAGAACAAGGTTACTGA
GGAAGGCTTTCTTGTCGTCATGCTTAGCAAGAGCCGAACTGCAGGTTCAGCTGGTCAGTC
GTCGACTCAGCCTGCTTCCACTACTACTAATACGTCTACCACATCTTCTACTAAGCCTGC
AGCTCCATCTACAGCCCAGTCTACAGCTGTACCTGCTTCACCTATTCCTGCTCAAGAACA
ACCAGCGACACAGACTGACACCTTTGGACAAGCTGCTTCAACCGTGGTTAGTGGCAATCG
TCTTGAGCCATTGGTACAACAATTAATGGACATGGGAGGCGGGAGCTGGGACAAAGAAAC
TGTTACTCGTGCACTTCGTGCTGCTCATAACAACCCTGACAGAGCAGTGGATTATCTATA
CTCTGGGATTCCTGAA
CTGCTGAA

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR2G057TF 673 0 0
GG
ACGGTCGGCTTTTCTGCAGCGTCGCCCTCGATCTCTTCAATTACTGCCTTTCTAGGTCTC
TC******TCTCTCCCTCTCCGTCGATTTTCCCCCGACCCAGCGCCGTCGATTTCGTATC
CAACAAACGATGAAGCTCACCGTTAAGACTCTCATGGGTCGTCAGTTTGAAATTAGGGTT
CAGTCCTCCGATACGATAATGGCGGTGAAGAAGAATATAGAGGATTCACAAGGGAAGGAT
AATTATCCATGTGGGCAGCAATTGTTGATTCACGATGGGAAAGTTTTGAAAGATGAAACT
ACTCTTGTGGAGAACAAGGTTACTGAGGAAGGCTTTCTTGTCGTCATGCTTAGCAAGAGC
CGAACTGCAGGTTCAGCTGGTCAGTCGTCGACTCAGCCTGCTTCCACTACTACTAATACG
CCTACCACATCTTCTACTAAGCCTGCAGCTCCATCTACAGCCCAGTCTACAGCTGTACCT
GCTTCACCTATTCCTGCTCAAGAACAACCAGCGACACAGACTGACACCTTTGGACAAGCT
GCTTCAACCGTGGTTAGTGGCAATCGTCTTGAGCCATTGGTACAACAATTAATGGACATG
GGAGGCGGGAGCTGGGACAAAGAAACTGTTACTCGTGCACTTCGTGCTGCTCATAACAAC
CCTGACAGAGC

QA 3 673 3 673
DS 

RD RR2BD65TF 744 0 0
GGAACTACGGTCGGCTTTTCTGCAGCGTCGCCCTCGATCTCTTCAATTACTGCCTTTCTA
GGTCTC********TCTCTCCCTCTCCGTCGATTTTCCCCCGACCCAGCGCCGTCGATTT
CGTATCCAACAAACGATGAAGCTCACCGTTAAGACTCTCATGGGTCGTCAGTTTGAAATT
AGGGTTCAGTCCTCCGATACGATAATGGCGGTGAAGAAGAATATAGAGGATTCACAAGGG
AAGGATAATTATCCATGTGGGCAGCAATTGTTGATTCACAATGGGAAAGTTTTGAAAGAT
GAAACTACTCTTGTGGAGAACAAGGTTACTGAGGAAGGCTTTCTTGTCGTCATGCTTAGC
AAGAGCCGAACTGCAGGTTCAGCTGGTCAGTCGTCGACTCAGCCTGCTTCCACTACTACT
AATACGTCTACCACATCTTCTACTAAGCCTGCAGCTCCATCTACAGCCCAGTCTACAGCT
GTACCTGCTTCACCTATTCCTGCTCAAGAACAACCAGCGACACAGACTGACACCTTTGGA
CAAGCTGCTTCAACCGTGGTTAGTGGCAATCGTCTTGAGCCATTGGTACAACAATTAATG
GACATGGGAGGCGGGAGCTGGGACAAAGAAACTGTTACTCGTGCACTTCGTGCTGCTCAT
AACAACCCTGACAGAGCAGTGGATTATCTATACTCTGGGATTCCTGAAACTGCTGAAGTA
GCTGTGGCAGGGTCTGGTGCAGCC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 3

CO CL3770Contig1 941 3 21 U
GGGGCGTCAAAAAACGGTTACTCACTAAACCGGTGGGAGAAACAGAAACGGAGAAGCAGT
TTGGTGATGAGGCCGCAGATAGTTCTGTTCGGCGATTCAATAACTGCGCAATCGTTCAGA
TCCGGCGGATGAGGATCTGCTCTCGCCGACGCCTACTCTCGCAAATCTGATGTCGTTGTG
CGTGGCTACGGAGGCTACAACACCAGATGGGCTCTCTTCTTGCTTCATCACATTTTCCCT
CTCGGATCTTTGACTCCACCTGTTGCTACGACCATATTCTTCGGTGCAAACGATGCAGCT
CTCAAAGGAAGGACCAGTGATAGGCAGTATGTGCCCGTGGAAGAGTACACGGATAACATC
AGAACAATTGTTCAGCATCTCAAGAAATGTTCACCTACCATGCTAATTGTGCTTGTAACT
CCACCGCCAATTGATGAAGCTGGACGCCAGAGCTATGCAGAATCAATCTACGGTGAGAAA
GCTATGAAGGAGCCTGAGCGAACAAACGAAACCACAGGTATCTACGCACAACATTGTGTT
GCATTAGCAGAGGAACTCGGTCTGCGATCTATCAACCTTTGGTCCAAAATGCAGGAGACT
GATGATTGGCATAAAAAATACCTCAGTGATGGACTCCACCTCACGCCTGAAG*CAATGGA
GTTGTTTATGAAGAAGTTTCGAGAGTGTTTAGAGAAGCTTGGCTCTCTCCTGAAGAAATG
CCTTTTGATTTCCCTCACCATTCTCAGATCGACG*TGATAACCCATCCAAAGCTTTCCAA
GAGCGTTGCTTATAAGAGATTTGATCGATTACAGCTCTTCTTTTGAGTTTTTATGCCATG
TTTTTATTACACCGACACATTTATAACTCTGATAAATTCTCCAAATTCTCTTGTTTCAAA
ATGATTTATATTTTTTTTTCAAAAAAAAAATATTTGTTTTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E280TF U 1
AF RR2BA22TF U 2
AF RR2BA22JQ C 157
BS 1 131 RR2E280TF
BS 132 132 RR2BA22TF
BS 133 165 RR2E280TF
BS 166 166 RR2BA22TF
BS 167 327 RR2E280TF
BS 328 328 RR2BA22TF
BS 329 425 RR2E280TF
BS 426 426 RR2BA22TF
BS 427 497 RR2E280TF
BS 498 498 RR2BA22TF
BS 499 650 RR2E280TF
BS 651 651 RR2BA22TF
BS 652 717 RR2E280TF
BS 718 718 RR2BA22TF
BS 719 760 RR2E280TF
BS 761 761 RR2BA22TF
BS 762 779 RR2E280TF
BS 780 794 RR2BA22TF
BS 795 795 RR2BA22JQ
BS 796 823 RR2BA22TF
BS 824 941 RR2BA22JQ

RD RR2E280TF 791 0 0
GGGGCGTCAAAAAACGGTTACTCACTAAACCGGTGGGAGAAACAGAAACGGAGAAGCAGT
TTGGTGATGAGGCCGCAGATAGTTCTGTTCGGCGATTCAATAACTGCGCAATCGTTCAGA
TCCGGCGGATGGGGATCTGCTCTCGCCGACGCCTACTCTCGCAAAGCTGATGTCGTTGTG
CGTGGCTACGGAGGCTACAACACCAGATGGGCTCTCTTCTTGCTTCATCACATTTTCCCT
CTCGGATCTTTGACTCCACCTGTTGCTACGACCATATTCTTCGGTGCAAACGATGCAGCT
CTCAAAGGAAGGACCAGTGATAGGCAGCATGTGCCCGTGGAAGAGTACACGGATAACATC
AGAACAATTGTTCAGCATCTCAAGAAATGTTCACCTACCATGCTAATTGTGCTTGTAACT
CCACCACCAATTGATGAAGCTGGACGCCAGAGCTATGCAGAATCAATCTACGGTGAGAAA
GCTATGAAGGAGCCTGATCGAACAAACGAAACCACAGGTATCTACGCACAACATTGTGTT
GCATTAGCAGAGGAACTCGGTCTGCGATCTATCAACCTTTGGTCCAAAATGCAGGAGACT
GATGATTGGCATAAAAAATACCTCAGTGATGGACTCCACCTCACGCCTGAGG*CAATGGA
GTTGTTTATGAAGAAGTTTCGAGAGTGTTTAGAGAAGCTTGGCTCTCTCCTGAAGAA*TG
CCTTTTGATTTCCCTCACCATTCTCAGATCGACG*TGATA*CCCATCCAAAGCTTTCCA
GAGCGTGCTTAT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2BA22TF 827 0 0
GGGCGTCAAAAAACGGTTACTCACTAAACCGGTGGGAGAAACAGAAACGGAGAAGCAGTT
TGGTGATGAGGCCGCAGATAGTTCTGTTCGGCGATTCAATAACTGCGCAGTCGTTCAGAT
CCGGCGGATGAGGATCTGCTCTCGCCGACGCCTACTCTCGCAAATCTGATGTCGTTGTGC
GTGGCTACGGAGGCTACAACACCAGATGGGCTCTCTTCTTGCTTCATCACATTTTCCCTC
TCGGATCTTTGACTCCACCTGTTGCTACGACCATATTCTTCGGTGCAAACGATGCAGCTC
TCAAAGGAAGGACCAGTGATAGGCAGTATGTGCCCGTGGAAGAGTACACGGATAACATCA
GAACAATTGTTCAGCATCTCAAGAAATGTTCACCTACCATGCTAATTGTGCTTGTAACTC
CACCGCCAATTGATGAAGCTGGACGCCAGAGCTATGCAGAATCAATCTACGGTGAGAAAG
CTATGAAGGAGCCTGAGCGAACAAACGAAACCACAGGTATCTACGCACAACATTGTGTTG
CATTAGCAGAGGAACTCGGTCTGCGATCTATCAACCTTTGGTCCAAAATGCAGGAGACTG
ATGATTGGCATAAAAAATACCTCAGTGATGGACTCCACCTCACGCCTGAAG*CAATGGAG
TTGTTTATGAAGAAGTTTCGAGAGTGTTTAGAGAAGCTTGGCTCTCTCCTGAAGAAATGC
CTTTTGATTTCCCTCACCATTCTCAGATCGACG*TGATAACCCATCCAA*GCTTTCCAAG
AGCGTTGCTTATA*GAGATTTGATCGATTACAGCTCTTCTTT
GAGTT

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR2BA22JQ 785 0 0
TCTCGCAAATCTGATGTCGTTGTGCGTGGCTACGGAGGCTACAACACCAGATGGGCTCTC
TTCTTGCTTCATCACATTTTCCCTCTCGGATCTTTGACTCCACCTGTTGCTACGACCATA
TTCTTCGGTGCAAACGATGCAGCTCTCAAAGGAAGGACCAGTGATAGGCAGTATGTGCCC
GTGGAAGAGTACACGGATAACATCAGAACAATTGTTCAGCATCTCAAGAAATGTTCACCT
ACCATGCTAATTGTGCTTGTAACTCCACCGCCAATTGATGAAGCTGGACGCCAGAGCTAT
GCAGAATCAATCTACGGTGAGAAAGCTATGAAGGAGCCTGAGCGAACAAACGAAACCACA
GGTATCTACGCACAACATTGTGTTGCATTAGCAGAGGAACTCGGTCTGCGATCTATCAAC
CTTTGGTCCAAAATGCAGGAGACTGATGATTGGCATAAAAAATACCTCAGTGATGGACTC
CACCTCACGCCTGAAGGCAATGGAGTTGTTTATGAAGAAGTTTCGAGAGTGTTTAGAGAA
GCTTGGCTCTCTCCTGAAGAAATGCCTTTTGATTTCCCTCACCATTCTCAGATCGACGGT
GATAACCCATCCAAAGCTTTCCAAGAGCGTTGCTTATAAGAGATTTGATCGATTACAGCT
CTTCTTTTGAGTTTTTATGCCATGTTTTTATTACACCGACACATTTATAACTCTGATAAA
TTCTCCAAATTCTCTTGTTTCAAAATGATTTATATTTTTTTTTCAAAAAAAAAATATTTG
TTTTC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 3

CO CL3771Contig1 387 3 11 U
GGAGATTTAGGGTCTCCCTCTGTTTCGGCTCGGTCCCAGAACTTCAAGATGCCGTCGCAC
AAGTCATTCATGATCAAGAAGAAGCTCGCCAAGAAAATTAGGCAGAACAGGCCAATCCCT
CACTGGATTCGTCTTCGCACTGACAACACCATCAGGTACAACGCAAAGCGTAGACACTGG
CGCAGAACCAAGCTTGGATTCTAAGCTGTCTTAACTTTGCATATTTGTGAAAGCTCTGTT
CTTTCTAAGACATTGTTTTCCTTTGTTTGGTTCTTTAGTGTTTTGTTTTCTCAGTTTTGA
TTGTGACAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTATGACAATCTTTTTATCAGTTATGTTTCCA
GACTATCTATCCAAGAGTAGTTGTGTT


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD35TF U 1
AF RR2F120JQ C 3
AF RR2F120TF U 3
BS 1 13 RR2BD35TF
BS 14 14 RR2F120TF
BS 15 16 RR2BD35TF
BS 17 17 RR2F120TF
BS 18 84 RR2BD35TF
BS 85 85 RR2F120TF
BS 86 98 RR2BD35TF
BS 99 99 RR2F120TF
BS 100 256 RR2BD35TF
BS 257 257 RR2F120TF
BS 258 387 RR2BD35TF

RD RR2BD35TF 387 0 0
GGAGATTTAGGGTTTCTCTCTGTTTCGGCTCGGTCCCAGAACTTCAAGATGCCGTCGCAC
AAGTCATTCATGATCAAGAAGAAGTTCGCCAAGAAAATGAGGCAGAACAGGCCAATCCCT
CACTGGATTCGTCTTCGCACTGACAACACCATCAGGTACAACGCAAAGCGTAGACACTGG
CGCAGAACCAAGCTTGGATTCTAAGCTGTCTTAACTTTGCATATTTGTGAAAGCTCTGTT
CTTTCTAAGACATTGTCTTCCTTTGTTTGGTTCTTTAGTGTTTTGTTTTCTCAGTTTTGA
TTGTGACAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTATGACAATCTTTTTATCAGTTATGTTTCCA
GACTATCTATCCAAGAGTAGTTGTGTT

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR2F120JQ 366 0 0
G
GATTTAGGGTCTCCCTCTGTTTCGGCTCGGTCCCAGAACTTCAAGATGCCGTCGCACAAG
TCATTCATGATCAAGAAGAAGCTCGCCAAGAAAATTAGGCAGAACAGGCCAATCCCTCAC
TGGATTCGTCTTCGCACTGACAACACCATCAGGTACAACGCAAAGCGTAGACACTGGCGC
AGAACCAAGCTTGGATTCTAAGCTGTCTTAACTTTGCATATTTGTGAAAGCTCTGTTCTT
TCTAAGACATTGTTTTCCTTTGTTTGGTTCTTTAGTGTTTTGTTTTCTCAGTTTTGATTG
TGACAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTATGACAATCTTTTTATCAGTTATGTTTCCAGAC
TATCT

QA 2 366 2 366
DS 

RD RR2F120TF 366 0 0
G
GATTTAGGGTCTCCCTCTGTTTCGGCTCGGTCCCAGAACTTCAAGATGCCGTCGCACAAG
TCATTCATGATCAAGAAGAAGCTCGCCAAGAAAATTAGGCAGAACAGGCCAATCCCTCAC
TGGATTCGTCTTCGCACTGACAACACCATCAGGTACAACGCAAAGCGTAGACACTGGCGC
AGAACCAAGCTTGGATTCTAAGCTGTCTTAACTTTGCATATTTGTGAAAGCTCTGTTCTT
TCTAAGACATTGTTTTCCTTTGTTTGGTTCTTTAGTGTTTTGTTTTCTCAGTTTTGATTG
TGACAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTATGACAATCTTTTTATCAGTTATGTTTCCAGAC
TATCT

QA 2 366 2 366
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 3

CO CL3774Contig1 738 3 4 U
GGACCTCTCTCCGCCTCCATAACACTCTTTCTAGCTGCGACTCCTCTCTTCGTCTCGAGC
CTCCGTAACAGATGGCGAGCAGTATAATCTTGTTCGAGGACATCTTCGTGGTCGATAAGC
TTGACCCTGATGGCAAAAAGTTCGATAAAGTTACGCGTGTTGAAGCAACTAGCCACAACT
TGGACATGTTTATGCATTTGGATGTGAACACAGAGGTTTATCCAATGGCTGTTGGTGATA
AGTTCACACTGGCGATGGCTCCTACTCTTAATCTCGATGGAATCCCTGACACCGGATATT
TTACTCCGGGAGCAAAGAAAACGCTTGCTGATAAGTACGAATACGTTATGCACGGGAAGC
TTTACAAGATCACTGAGCGTGACGGCCAAACTCCAAAAGCAGAGATGTATGTTTCTTTCG
GCGGCCTCCTAATGTTGCTTCGTGGCGATCCAGCTCACATTTCTCACTTTGAACTCGACC
AGAGGCTCTTCCTTCTCATGAGGAAGCTGTGAAAGATTCCCTTGTCTGATCATTTTGTGG
TTTAGAAAACTGAATAAACAGAGAGTTTGATTAAGCTTTATCTTATGTTCAACTTTGCCT
TTGATGTTATGCTCACGAAGCAGCAGCTCTTGTACCAAATCAAGTTATCACTACTGTTTA
AACACCTTGCATAATTTAACTACTGCTACTGAAATATTTTCGTAGCTCTAAGCTTTTAAA
GATTAACGCTTCAGAGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH10TF U 1
AF RR2DH10JQ C 105
AF RR2G220TF U 1
BS 1 574 RR2DH10TF
BS 575 651 RR2G220TF
BS 652 654 RR2DH10JQ
BS 655 738 RR2G220TF

RD RR2DH10TF 574 0 0
GGACCTCTCTCCGCCTCCATAACACTCTTTCTAGCTGCGACTCCTCTCTTCGTCTCGAGC
CTCCGTAACAGATGGCGAGCAGTATAATCTTGTTCGAGGACATCTTCGTGGTCGATAAGC
TTGACCCTGATGGCAAAAAGTTCGATAAAGTTACGCGTGTTGAAGCAACTAGCCACAACT
TGGACATGTTTATGCATTTGGATGTGAACACAGAGGTTTATCCAATGGCTGTTGGTGATA
AGTTCACACTGGCGATGGCTCCTACTCTTAATCTCGATGGAATCCCTGACACCGGATATT
TTACTCCGGGAGCAAAGAAAACGCTTGCTGATAAGTACGAATACGTTATGCACGGGAAGC
TTTACAAGATCACTGAGCGTGACGGCCAAACTCCAAAAGCAGAGATGTATGTTTCTTTCG
GCGGCCTCCTAATGTTGCTTCGTGGCGATCCAGCTCACATTTCTCACTTTGAACTCGACC
AGAGGCTCTTCCTTCTCATGAGGAAGCTGTGAAAGATTCCCTTGTCTGATCATTTTGTGG
TTTAGAAAACTGAATAAACAGAGAGTTTGATTAA

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2DH10JQ 591 0 0
TTCGTGGTCGATAAGCTTGACCCTGATGGCAAAAAGTTCGATAAAGTTACGCGTGTTGAA
GCAACTAGCCACAACTTGGACATGTTTATGCATTTGGATGTGAACACAGAGGTTTATCCA
ATGGCTGTTGGTGATAAGTTCACACTGGCGATGGCTCCTACTCTTAATCTCGATGGAATC
CCTGACACCGGATATTTTACTCCGGGAGCAAAGAAAACGCTTGCTGATAAGTACGAATAC
GTTATGCACGGGAAGCTTTACAAGATCACTGAGCGTGACGGCCAAACTCCAAAAGCAGAG
ATGTATGTTTCTTTCGGCGGCCTCCTAATGTTGCTTCGTGGCGATCCAGCTCACATTTCT
CACTTTGAACTCGACCAGAGGCTCTTCCTTCTCATGAGGAAGCTGTGAAAGATTCCCTTG
TCTGATCATTTTGTGGTTTAGAAAACTGAATAAACAGAGAGTTTGATTAAGCTTTATCTT
ATGTTCAACTTTGCCTTTGATGTTATGCTCACGAAGCAGCAGCTCTTGTACCAAATCAAG
TTATCACTACTGTTTAAACACCTTGCATAATTTAACTACTGCTACTG
GTAT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2G220TF 738 0 0
GGACCTCTCTCCGCCTCCATAACACTCTTTCTAGCTGCGACTCCTCTCTTCGTCTCGAGT
CTCCGTAACAGATGGCGAGCAGTATAATCTTGTTCGAGGACATCTTCGTGGTCGATAAGC
TTGACCCTGATGGCAAAAAGTTCGATAAAGTTACGCGTGTTGAAGCTACTAGCCACAACT
TGGACATGTTTATGCATTTGGATGTGAACACAGAGGTTTATCCAATGGCTGTTGGTGATA
AGTTCACACTGGCGATGGCTCCTACTCTTAATCTCGATGGAACCCCTGACACCGGATATT
TTACTCCGGGAGCAAAGAAAACGCTTGCTGACAAGTATGAATACGTGATGCACGGGAAGC
TTTACAAGATCACTGAGCGTGACGGCCAAACTCCAAAAGCAGAGATGTATGTTTCTTTCG
GTGGCCTCCTAATGTTGCTTCGTGGAGATCCAGCTCACATTTCTCACTTTGAACTCGACC
AGAGGCTCTTCCTTCTCATGAGGAAGCTGTGAAAGATTCCCTTGTCTGATCATTTTGTGG
TTTAGAAAACTGAATAAACAGAGAGTTTGATTAAGCTTTATCTTATGTTCAACTTTGCCT
TTGATGTTATGCTCACGAAGCAGCAGCTCTTGTACCAAATCAAGTTATCAC***TGTTTA
AACACCTTGCATAATTTAACTACTGCTACTGAAATATTTTCGTAGCTCTAAGCTTTTAAA
GATTAACGCTTCAGAGCC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 3

CO CL3775Contig1 879 3 5 U
TTTTTAAGTGTTAAAACCACTCCCTTATCCACACGCCCAGAAACGTTCTCCTCCGGTCTG
AAAGAAAAAATGGCGACTGCAAACGCTCTCACTTCCGCCTCTGTCCTCTGCTCCTCACGA
CAGGGAAAGCTGAGTGGTGGAAGTCAGCAGAAAGGTCAAAGAGTAAGCTACAGGAAAGCA
AACAGACGTTTCAGCGTTAGAGCTAACGTGAAGGAGATTGCTTTCGACCAGAGCTCCAGA
GCTGCTCTTCAAGCTGGTATCGATAAGCTTGCTGATGCTGTTGGTCTCACCCTTGGCCCT
AGAGGGAGGAATGTTGTGTTGGATGAGTTTGGAAGTCCCAAGGTTGTGAACGATGGAGTC
ACCATTGCTAGGGCTATTGAGTTACCTGACGCCATGGAGAATGCTGGTGCTGCACTTATC
CGTGAGGTTGCGAGTAAGACTAATGACTCAGCTGGTGATGGGACAACCACTGCCTCTGTC
CTGGCTCGGGAAATCATCAAACACGGATTGTTGAGCGTCACTTCTGGCGCCAATCCCGTC
TCCCTCAAGCGAGGAATCGACAAGACTGTTCAAGGTCTGATCGAAGAGCTTGAGAAGAGA
GCTAGACCTGTCAAAGGCGGTAGCGACATCAGAGCCGTGGCTACAATCTCAGCTGGAAAC
GATGAGCTAGTGGGAGCAATGATCGCCGACGCCATCGACAAAGTTGGACCTGATGGTGTT
CTCTCCATTGAGTCTTCATCTTCCTTTGAGACCACCGTCGAAGTCGAAGAAGGATGGAGA
TTGACAGAGCTACATCTCTCCTCAGTTCGTTACCAACCCTGAGAGCTGCTGGTTGAGTCG
AGATGCTAGAGTGTGATCACTGATCAGAGATCACTGCAT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET06TF U 1
AF RR2C236TF U 4
AF RR2B963TF U 6
BS 1 656 RR2ET06TF
BS 657 668 RR2C236TF
BS 669 669 RR2B963TF
BS 670 697 RR2C236TF
BS 698 879 RR2B963TF

RD RR2ET06TF 656 0 0
TTTTTAAGTGTTAAAACCACTCCCTTATCCACACGCCCAGAAACGTTCTCCTCCGGTCTG
AAAGAAAAAATGGCGACTGCAAACGCTCTCACTTCCGCCTCTGTCCTCTGCTCCTCACGA
CAGGGAAAGCTGAGTGGTGGAAGTCAGCAGAAAGGTCAAAGAGTAAGCTACAGGAAAGCA
AACAGACGTTTCAGCGTTAGAGCTAACGTGAAGGAGATTGCTTTCGACCAGAGCTCCAGA
GCTGCTCTTCAAGCTGGTATCGATAAGCTTGCTGATGCTGTTGGTCTCACCCTTGGCCCT
AGAGGGAGGAATGTTGTGTTGGATGAGTTTGGAAGTCCCAAGGTTGTGAACGATGGAGTC
ACCATTGCTAGGGCTATTGAGTTACCTGACGCCATGGAGAATGCTGGTGCTGCACTTATC
CGTGAGGTTGCGAGTAAGACTAATGACTCAGCTGGTGATGGGACAACCACTGCCTCTGTC
CTGGCTCGGGAAATCATCAAACACGGATTGTTGAGCGTCACTTCTGGCGCCAATCCCGTC
TCCCTCAAGCGAGGAATCGACAAGACTGTTCAAGGTCTGATCGAAGAGCTTGAGAAGAGA
GCTAGACCTGTCAAAGGCGGTAGCGACATCAGAGCCGTGGCTACAATCTCAGCTGG

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2C236TF 694 0 0
GG
AAGTGTTAAAACCACTCCCTTATCCACACGCCCAGAAACGTTCTCCTCCGGTCTGAAAGA
AAAAATGGCGACTGCAAACGCTCTCACTTCCGCCTCTGTCCTCTGCTCCTCACGACAGGG
AAAGCTGAGTGGTGGAAGTCAGCAGAAAGGTCAAAGAGTAAGCTACAGGAAAGCAAACAG
ACGTTTCGGCGTTAGAGCTAACGTGAAGGAGATTGCTTTCGACCAGAGCTCCAGAGCTGC
TCTTCAAGCTGGTATCGATAAGCTTGCTGATGCTGTTGGTCTCACCCTTGGCCCTAGAGG
GAGGAATGTTGTGTTGGATGAGTTTGGAAGTCCCAAGGTTGTGAACGATGGAGTCACCAT
TGCTAGGGCTATTGAGTTACCTGACGCCGTGGAGAATGCTGGTGCTGCACTTATCCGTGA
GGTTGCGAGTAAGACTAATGACTCAGCTGGTGATGGGACAACCACTGCCACTGTCCTGGC
TCGGGAAATCATCAAACACGGATTGTTGAGCGTCACTTCTGGCGCCAATCCCGTCTCCCT
CAAGCGAGGAATCGACAAGACTGTTCAAGGTCTGATCGAAGAGCTTGAGGAGAGAGCTAG
ACCTGTCAAAGGCGGTAGCGACATCAGAGCCGTGGCTACGATCTCAGCTGGAAACGATGA
GCTCGTGGGAGCAATGATCGCCGACGCCATCG

QA 3 694 3 694
DS 

RD RR2B963TF 874 0 0
AAGTGTTAAAACCACTCCCTTATCCACACGCCCAGAAACGTTCTCCTCCGGCCTGAAAGA
AAAAATGGCGACTGCAAACGCTCTCACTTCCGCCTCTGTCCTCTGCTCCTCACGACAGGG
AAAGCTGAGTGGTGGAAGTCAGCAGAAAGGTCAAAGAGTAAGCTACAGGAAAGCAAACAG
ACGTTTCAGCGTTAGAGCTAACGTGAAGGAGATTGCTTTCGACCAGAGCTCCAGAGCTGC
TCTTCAAGCTGGTATCGATAAGCTTGCTGATGCTGTTGGTCTCACCCTTGGCCCTAGGGG
GAGGAATGTTGTGTTGGATTAGTTTGGAAGTCCCAAGGTTGTGAACGATGGAGTCACCAT
TGCTAGGGCTATTGAGTTACCTGACGCCATGGAGAATGCCGGTGCTGCACTTATCCGTGA
GGTTGCGAGTAAGACTAATGACTCAGCTGGTGATGGGACAACCACTGCCTCTGTCCTGGC
TCGGGAAATCATCAAACACGGATTGTTGAGCGTCACTTCTGGCGCCAATCCCGTCTCCCT
CAAGCGAGGAATCGACAAGACTGTTCAAGGTCTGATCGAAGAGCTTGAGAAGAGAGCTAG
ACCTGTCAAAGGCGGTAGCGACATCAGAGCCGTGGCTACAATTTCAGCTGGAAACGATGA
GCTAGTGGGAGCTATGATTGCTGATGCCATCGACAAAGTTGGACCTGATGGTGTTCTCTC
CATTGAGTCTTCATCTTCCTTTGAGACCACCGTCGAAGTCGAAGAAGGATGGAGATTGAC
AGAGCTACATCTCTCCTCAGTTCGTTACCAACCCTGAGAGCTGCTGGTTGAGTCGAGATG
CTAGAGTGTGATCACTGATCAGAGATCACTGCAT

QA 1 874 1 874
DS 



AS 1 3

CO CL3776Contig1 1131 3 5 U
AAAGGCTTCTCAGTTGCAAATGATTTAATAAGAAGCAACTTCGATTCTGATTACAAATCA
CCATTTGAATAGTACATATATCGTCAGGTTCGAGCAAATTATCAGACAATGAACAAGAAG
GTGCATAAAACCAAGCGAGGACAGGAGATTCGAACCGTCCAAAACCAAACAACGTAACTG
AACCATTCTTGAACCAGCTAAGCCTTGATTCACATATCTTACAATAACTTTGATAGCTTC
CCTCTTTAAATCAAGATTAAAAACTCGTAAACACACAAACCAGAAGCCTGTCATCATTTG
ATGATTTGTGGTCGGTTGCTGCGAGTATTGGATCTGGTTCTGTGGACTTTTGGTGGTGTA
TCAACCGTTAAAGCATACATTTTCACAGCAAACAACTCTTGAGGAAGACCCTTCTGATCC
ATTGTTTGATAGACATGTAACCCACATCGACGAAAGAGCTCTTTAAAGTACGGATTGGAT
CTGGTGATGCTACGATCCTCTTTATCCAAAACAAATCCTTTCTTAGCGAGATTCTCTTTC
ACAACAAAAAAACCACCGGGTTTAAGGCATCCCTTTGCCCGGTTGAAGAAAGAGACAAAA
TCATCGTCAGTGAGATGACCAATGCACCATTGAACCCATATGACATCGTACCTTTGAGCA
GCTGGAGTAAACTCCTGAAGAGGTACACAGAAAAAGTTAGTTGCTTTGTGGGTTTCTGAG
CCAATAGATGCCAAATTCTCACGTGCAGCATCAAGAAACTGCGCTACAGGCTCAAGAAGA
TCAACCTCGTTGAAGTACCGTATCAGAAGATTCTTAGTGATCTCTTCCAATACCAGAACC
ACAATCAAGAGCTACTAGATGCTGATTTGTTCCTTCATTGACTAATCTTTCTTGCATAAG
AGTCTTGAGAAAAACCTCACTTCCTGTAATATCAGCATCATTCACATGCCCATATCCTCC
TAATACTCCATCAACTGAAGCTTCAACACCTTCCCAGTAAGAAACACCGTCTCTGTACCA
TTGGGTTTTCTTCGTTTCATCTCCTTCTTCCCCAATAGCTTCTCTCCACATCTCTTGAGC
GCTGTTAAACTCTTTACCCTCGGAATCTACGCCACAGACTTCCATTATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ77JQ U 1
AF RR2FX36JQ U 30
AF RR2DJ77TF C 457
BS 1 36 RR2DJ77JQ
BS 37 37 RR2FX36JQ
BS 38 663 RR2DJ77JQ
BS 664 678 RR2FX36JQ
BS 679 1131 RR2DJ77TF

RD RR2DJ77JQ 663 0 0
AAAGGCTTCTCAGTTGCAAATGATTTAATAAGAAGCGACTTCGATTCTGATTACAAATCA
CCATTTGAATAGTACATATATCGTCAGGTTCGAGCAAATTATCAGACAATGAACAAGAAG
GTGCATAAAACCAAGCGAGGACAGGAGATTCGAACCGTCCAAAACCAAACAACGTAACTG
AACCATTCTTGAACCAGCTAAGCCTTGATTCACATATCTTACAATAACTTTGATAGCTTC
CCTCTTTAAATCAAGATTAAAAACTCGTAAACACACAAACCAGAAGCCTGTCATCATTTG
ATGATTTGTGGTCGGTTGCTGCGAGTATTGGATCTGGTTCTGTGGACTTTTGGTGGTGTA
TCAACCGTTAAAGCATACATTTTCACAGCAAACAACTCTTGAGGAAGACCCTTCTGATCC
ATTGTTTGATAGACATGTAACCCACATCGACGAAAGAGCTCTTTAAAGTACGGATTGGAT
CTGGTGATGCTACGATCCTCTTTATCCAAAACAAATCCTTTCTTAGCGAGATTCTCTTTC
ACAACAAAAAAACCACCGGGTTTAAGGCATCCCTTTGCCCGGTTGAAGAAAGAGACAAAA
TCATCGTCAGTGAGATGACCAATGCACCATTGAACCCATATGACATCGTACCTTTGAGCA
GCT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2FX36JQ 649 0 0
AAGAAGCAACTTCGATTCTGATTACAAATCACCATTTGAATAGTACATATATCGTCAGGT
TCGAGCAAATTATCAGACAATGAACAAGAAGGTGCATAAAACCAAGCGAGGACAGGAGAT
TCGAACCGTCCAAAACCAAACAACGTAACTGAACCATTCTTGAACCAGCTAAGCCTTGAT
TCACATATCTTACAATAACTTTGATAGCTTCCCTCTTTAAATCAAGATTAAAAACTCGTA
AACACACAAACCAGAAGCCTGTCATCATTTGATGATTTGTGGTCGGTTGCTGCGAGTATT
GGATCTGGTTCTGTGGACTTTTGGTGGTGTATCAACCGTTAAAGCATACATTTTCACAGC
AAACAACTCTTGAGGAAGACCCTTCTGATCCATTGTTTGATAGACATGTAACCCACATCG
ACGAAAGAGCTCTTTAAAGTACGGATTGGATCTGGTGATGCTACGATCCTCTTTATCCAA
AACAAATCCTTTCTTAGCGAGATTCTCTTTCACAACAAAAAAACCACCGGGTTTAAGGCA
TCCCTTTGCCCGGTTGAAGAAAGAGACAAAATCATCGTCAGTGAGATGACCAATGCACCA
TTGAACCCATATGACATCGTACCTTTGAGCAGCTGGAGTAAACTCCTGA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2DJ77TF 675 0 0
AGCTCTTTAAAGTACGGATTGGATCTGGTGATGCTACGATCCTCTTTATCCAAA*CAAAT
CCTTTCTTAGCGAGAT*CTCTTTCACAACAAAAAAACCACCGGGTTTAAGGCATCCCTTT
GCCCGGTTGAAGAAAGAGACAAAATCATCGTCAGTGAGATGACCAATGCACCATTGAACC
CATATGACATCGTACCTTTGAGCAGCTGGAGTAAACTCCTGAAGAGGTACACAGAAAAAG
TTAGTTGCTTTGTGGGTTTCTGAGCCAATAGATGCCAAATTCTCACGTGCAGCATCAAGA
AACTGCGCTACAGGCTCAAGAAGATCAACCTCGTTGAAGTACCGTATCAGAAGATTCTTA
GTGATCTCTTCCAATACCAGAACCACAATCAAGAGCTACTAGATGCTGATTTGTTCCTTC
ATTGACTAATCTTTCTTGCATAAGAGTCTTGAGAAAAACCTCACTTCCTGTAATATCAGC
ATCATTCACATGCCCATATCCTCCTAATACTCCATCAACTGAAGCTTCAACACCTTCCCA
GTAAGAAACACCGTCTCTGTACCATTGGGTTTTCTTCGTTTCATCTCCTTCTTCCCCAAT
AGCTTCTCTCCACATCTCTTGAGCGCTGTTAAACTCTTTACCCTCGGAATCTACGCCACA
GACTTCCATTATTGG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 3

CO CL3777Contig1 674 3 6 U
GGATCTCGGCGATAGAGAGAGATCTAGAGAGAATGGATCAGATCTTGAACAAGGTGGGAT
CGTACTGGCTAGGGAAGAAGGCAAACAAGCAGCTCGATTCCGTTGGTGACGATATCAACT
CTCTGTCTACGAGCATCGAAGGAGGAACAAAATGGCTAGTGAACAAAATCAAAGGGAAAA
TGCAGAAGCCACTACCCGAGTTACTAAAGGAGTTCGGCTTACCTATTGGGATCTTTCCAC
GAGACGCAACCAACTACGAGTTCAACGAGCAGACGAGGAAACTCACCGTCTTCATCCCAA
CGGTCTGCGAAGTCGGCTACAAAGACTCGTCCGTCTTGAGGTTCACCACGACGGTCACGG
GGTTCTTGGAGAAAGGGAAGCTAGCCGATGTCGAAGGGATGAAAACAAAAGTAATGATTT
GGGTGAAAGTCACGAGCGTCTCTGCTGACTATTCGAAGGTTCATTTCACTGCAGGGATGA
AGAAAAGCAGAAGCCGTGATGCTTATGAGGTTTTGAGAGATGGCGTTGAGATTGATAAAT
TCTAAGCTCTCTCTTTCTGTTTGTCCCTGCTTCCATCTTCATATGTCTTTTGTATATGCA
ATTAAACTTTGGTGTTCATGAATCTCATGAATTGAATTGGTATCAATATTCAAAGTTTCA
TATAACATACACAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG69TF U 1
AF RR2DM42JQ C 445
AF RR2DM42TF U 13
BS 1 302 RR2CG69TF
BS 303 303 RR2DM42TF
BS 304 622 RR2CG69TF
BS 623 623 RR2DM42TF
BS 624 659 RR2CG69TF
BS 660 674 RR2DM42TF

RD RR2CG69TF 659 0 0
GGATCTCGGCGATAGAGAGAGATCTAGAGAGAATGGATCAGATCTTGAACAAGGTGGGAT
CGTACTGGCTAGGGAAGAAGGCAAACAAGCAGCTCGATTCCGTTGGTGACGATATCAACT
CTCTGTCTACGAGCATCGAAGGAGGAACAAAATGGCTAGTGAACAAAATCAAAGGGAAAA
TGCAGAAGCCACTACCCGAGTTACTAAAGGAGTTCGGCTTACCTATTGGGATCTTTCCAC
GAGACGCAACCAACTACGAGTTCAACGAGCAGACGAGGAAACTCACCGTCTTCATCCCAA
CGTTCTGCGAAGTCGGCTACAAAGACTCGTCCGTCTTGAGGTTCACCACGACGGTCACGG
GGTTCTTGGAGAAAGGGAAGCTAGCCGATGTCGAAGGGATGAAAACAAAAGTAATGATTT
GGGTGAAAGTCACGAGCGTCTCTGCTGACTATTCGAAGGTTCATTTCACTGCAGGGATGA
AGAAAAGCAGAAGCCGTGATGCTTATGAGGTTTTGAGAGATGGCGTTGAGATTGATAAAT
TCTAAGCTCTCTCTTTCTGTTTGTCCCTGCTTCCATCTTCATATGTCTTTTGTATATGCA
ATTAAACTTTGGTGTTCATGAACCTCATGAATTGAATTGGTATCAATATTCAAAGTTTC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2DM42JQ 218 0 0
CTGACTATTCGAAGGTTCATTTCACTGCAGGGATGAA*AAAAGCAGAAGCCGTGATGCTT
ATGAGGTTTTGAGAGATGGCGTTGAGATTGATAAATTCTAAGCTCTCTCTTTCTGTTTGT
CCCTGCTTCCATCTTCATATGTCTTTTGTATATGCAATTAAACTTTGGTGTTCATGAATC
TCATGAATTGAATTGGTATCAATATTCAAAGTTTC
ATA

QA 1 215 1 215
DS 

RD RR2DM42TF 662 0 0
TAGAGAGAGATCTAGAGAGAATGGATCAGATCTTGAACAAGGTGGGATCGTACTGGCTAG
GGAAGAAGGCAAACAAGCAGCTCGATTCCGTTGGTGACGATATCAACTCTCTGTCTACGA
GCATCGAAGGAGGAACAAAATGGCTAGTGAACAAAATTAAAGGGAAAATGCAGAAGCCAC
TACCCGAGTTACTAAAGGAGTTCGGCTTACCTATTGGGATCTTTCCACGAGACGCAACCA
ACTACGAGTTCAACGAGCAGACGAGGAAACTCACCGTCTTCATCCCAACGGTCTGCGAAG
TCGGCTACAAAGACTCGTCCGTCTTGAGGTTCACCACGACGGTCACGGGGTTCTTGGAGA
AAGGGAAGCTAGCCGATGTCGAAGGGATGAAAGCAAAAGTAATGATTTGGGTGAAAGTCA
CGAGCGTCTCTGCTGACTATTCGAAGGTTCATTTCACTGCAGGGATGAAGAAAAGCAGAA
GCCGTGATGCTTATGAGGTTTTGAGAGATGGCGTTGAGATTGATAAATTCTAAGCTCTCT
CTTTCTGTTTGTCCCTGCTTCCATCTTCATATGTCTTTTGTATATGCAATTAAACTTTGG
TGTTCATGAATCTCATGAATTGAATTGGTATCAATATTCAAAGTTTCATATAACATACAC
AA

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL3778Contig1 1183 2 2 U
GGAAATTAGAGAAGTAGGGCTTCTCCGTTGGGTAATAGGGTTACGAAGAGCATAGAGATA
TAATGCCTTCGGTGCCCTCAAAGCTTCTCCTTTTGGCTCCTTCTTTGACTCCTTATCATT
CTGGTTTGTCTTCCCATCGTCTTAAACCTCTTCAAAAGTCTGATTGGCGTGGTAATCTTA
GTTAACATCTCTTCCTTCTTCCTCCTCTTCTTCTCTCCTCCTCCTCTGATCCCTCTGAGA
TTCTCCTTTAGCTCCATCATCGAAAGAGACCAAACTTTACTTGATCTTTGGTGTGTTTGA
TTTGCATCCTCACGAAAGTTACTACTACTAGTTTGATCTCCTGCTATTAGTTGGATATGA
GCTCTGTTTCTGGTAAAGGTGAAGACTTTGACATCTCGGCTTCGAGTCCCACGCACTGCT
GTAATGGCTCCAAGCATTCCTCTCATGCTGGAGCTGAAGAATCTCTGGAACCCGATGGCG
ATGAAACTGGTTATATAAACCAAAGTGCGAATGAAGAATCATCAGATACGAATAATGAGC
TAGAATCAGCTGCCACTGAGGATCTCGGCAAATCCACTTTAGCTTCCAAGTCTTCAGATG
ATGAAGACAAGGATCAGAGCCTTAGCCTTACTACTACTACACCAGTTGTTCTCATCCCCG
CCATAAAAGGCAGCCGGGAGAAGCATGGCTTGACACTGAGGAAGACGAGTGTTTCATGGG
CGGATGACGTGTATGATCCTCCTCCCTCCATAGCCTCGCACACAAGAAACAAGAAACAGC
AGCAGCAGCAGAAATCAAAGAGCAAAGACAGCCACAGGAAGAACGGAAAGAAAGGACAGA
AGGGCAAAGACAGCTCTAATTCCTCTCGTAGTGGCAAGGACAAGAAGCAAGCTTCTCGCA
GCAAACACAGCCGCGACAAGTTTGATTGGGTTACTCAGATGCCTATAGTTGCTGCATCTT
CTTGAATGCGCATTGGCTTGCTAATAACCAAGGCACATCTTCACACATCAATGAGATGTG
CTCCCACTCTTTGTTTAATAAATAATCAAAATCACTTTGTGTGTGTGTTTTCTTTCTTAT
GTATAATGGTTGATCCTAAGTACTATTGTGAAGCTTTTTGTTGAAGTTTATTTTGAGATA
AAGTTTCACTTTTGTTAAGAACTCAATGGAGCTTTGTTATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT88TF U 1
AF RR2CT88JQ C 401
BS 1 607 RR2CT88TF
BS 608 1183 RR2CT88JQ

RD RR2CT88TF 607 0 0
GGAAATTAGAGAAGTAGGGCTTCTCCGTTGGGTAATAGGGTTACGAAGAGCATAGAGATA
TAATGCCTTCGGTGCCCTCAAAGCTTCTCCTTTTGGCTCCTTCTTTGACTCCTTATCATT
CTGGTTTGTCTTCCCATCGTCTTAAACCTCTTCAAAAGTCTGATTGGCGTGGTAATCTTA
GTTAACATCTCTTCCTTCTTCCTCCTCTTCTTCTCTCCTCCTCCTCTGATCCCTCTGAGA
TTCTCCTTTAGCTCCATCATCGAAAGAGACCAAACTTTACTTGATCTTTGGTGTGTTTGA
TTTGCATCCTCACGAAAGTTACTACTACTAGTTTGATCTCCTGCTATTAGTTGGATATGA
GCTCTGTTTCTGGTAAAGGTGAAGACTTTGACATCTCGGCTTCGAGTCCCACGCACTGCT
GTAATGGCTCCAAGCATTCCTCTCATGCTGGAGCTGAAGAATCTCTGGAACCCGATGGCG
ATGAAACTGGTTATATAAACCAAAGTGCGAATGAAGAATCATCAGATACGAATAATGAGC
TAGAATCAGCTGCCACTGAGGATCTCGGCAAATCCACTTTAGCTTCCAAGTCTTCAGATG
ATGAAGA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2CT88JQ 783 0 0
TTCGAGTCCCACGCACTGCTGTAATGGCTCCAAGCATTCCTCTCATGCTGGAGCTGAAGA
ATCTCTGGAACCCGATGGCGATGAAACTGGTTATATAAACCAAAGTGCGAATGAAGAATC
ATCAGATACGAATAATGAGCTAGAATCAGCTGCCACTGAGGATCTCGGCAAATCCACTTT
AGCTTCCAAGTCTTCAGATGATGAAGACAAGGATCAGAGCCTTAGCCTTACTACTACTAC
ACCAGTTGTTCTCATCCCCGCCATAAAAGGCAGCCGGGAGAAGCATGGCTTGACACTGAG
GAAGACGAGTGTTTCATGGGCGGATGACGTGTATGATCCTCCTCCCTCCATAGCCTCGCA
CACAAGAAACAAGAAACAGCAGCAGCAGCAGAAATCAAAGAGCAAAGACAGCCACAGGAA
GAACGGAAAGAAAGGACAGAAGGGCAAAGACAGCTCTAATTCCTCTCGTAGTGGCAAGGA
CAAGAAGCAAGCTTCTCGCAGCAAACACAGCCGCGACAAGTTTGATTGGGTTACTCAGAT
GCCTATAGTTGCTGCATCTTCTTGAATGCGCATTGGCTTGCTAATAACCAAGGCACATCT
TCACACATCAATGAGATGTGCTCCCACTCTTTGTTTAATAAATAATCAAAATCACTTTGT
GTGTGTGTTTTCTTTCTTATGTATAATGGTTGATCCTAAGTACTATTGTGAAGCTTTTTG
TTGAAGTTTATTTTGAGATAAAGTTTCACTTTTGTTAAGAACTCAATGGAGCTTTGTTAT
TTG

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL3779Contig1 847 2 2 U
GGGGCGTGTACACGAGGACGGTACTCTTACTGTTGGCGGCCAAGCAGTCTCGGTGGTTTA
TTACAGATCAGGCTATACTCCTAGAGATTATCCGTCTGAATCAGAATGGAATGCTAGGTT
GCTTATAGAGCAGTCCTCAGCTGTCAAGTGCCCTTCTATATCTTATCACTTAGCTGGCAC
CAAGAAAATCCAGCAGGAACTCGCTAAACCAGGTGTTCTCGAGAGGTTTATGGACAACAA
AGATGACATAGCTAAGCTGAGGAAATGCTTTGCTGGGCTGTGGAGCTTGGACGATCAAGA
AATCATCAAGAAAGCTATTGAAAAACCCGAGTTGTTTGTCATGAAGCCTCAGAGAGAAGG
AGGAGGTAATAACATCTATGGAGATGATGTGAGGGAAAATCTTCTGAGATTGCAGAGAGA
AGGAGAGGAAGAAAACGCTGCGTATATCCTGATGCAGAGGATATTCCCAAAAGTGTCAAA
CGTGTTCTTGCTGCGAGACGGTGTTTACCATAAAGATCAAGCTATATCAGAACTTGGAGT
CTATGGGGCTTACCTCAGGAACAAGGAGAGAGTTATAATAAACGAGCAGAGTGGTTATCT
GATGCGCACAAAGGTCTCTTCATCAGATGAAAGTGGTGTTGCGGCTGGTTTTGCTGTACT
GGACAGCATTTATCTGAATTGAGATGGGATCATATTCACTAACCATCCTGATTGATTCAT
GTTTATGCTGGTTCATTTTCTTTTTTTCTTTAGTCTTCCTGCTTGCTTGTTTAAGATTTG
TGTACTGATTCATGAAGATCTATAAAACAAGATTAGACAGAGCTCTTTAAAATTATTTGA
ACAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ41TFB U 1
AF RR2AZ41JQ C 101
BS 1 740 RR2AZ41TFB
BS 741 847 RR2AZ41JQ

RD RR2AZ41TFB 740 0 0
GGGGCGTGTACACGAGGACGGTACTCTTACTGTTGGCGGCCAAGCAGTCTCGGTGGTTTA
TTACAGATCAGGCTATACTCCTAGAGATTATCCGTCTGAATCAGAATGGAATGCTAGGTT
GCTTATAGAGCAGTCCTCAGCTGTCAAGTGCCCTTCTATATCTTATCACTTAGCTGGCAC
CAAGAAAATCCAGCAGGAACTCGCTAAACCAGGTGTTCTCGAGAGGTTTATGGACAACAA
AGATGACATAGCTAAGCTGAGGAAATGCTTTGCTGGGCTGTGGAGCTTGGACGATCAAGA
AATCATCAAGAAAGCTATTGAAAAACCCGAGTTGTTTGTCATGAAGCCTCAGAGAGAAGG
AGGAGGTAATAACATCTATGGAGATGATGTGAGGGAAAATCTTCTGAGATTGCAGAGAGA
AGGAGAGGAAGAAAACGCTGCGTATATCCTGATGCAGAGGATATTCCCAAAAGTGTCAAA
CGTGTTCTTGCTGCGAGACGGTGTTTACCATAAAGATCAAGCTATATCAGAACTTGGAGT
CTATGGGGCTTACCTCAGGAACAAGGAGAGAGTTATAATAAACGAGCAGAGTGGTTATCT
GATGCGCACAAAGGTCTCTTCATCAGATGAAAGTGGTGTTGCGGCTGGTTTTGCTGTACT
GGACAGCATTTATCTGAATTGAGATGGGATCATATTCACTAACCATCCTGATTGATTCAT
GTTTATGCTGGTTCATTTTC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2AZ41JQ 747 0 0
TCAGAATGGAATGCTAGGTTGCTTATAGAGCAGTCCTCAGCTGTCAAGTGCCCTTCTATA
TCTTATCACTTAGCTGGCACCAAGAAAATCCAGCAGGAACTCGCTAAACCAGGTGTTCTC
GAGAGGTTTATGGACAACAAAGATGACATAGCTAAGCTGAGGAAATGCTTTGCTGGGCTT
TGGAGCTTGGACGATCAAGAAATCATCAAGAAAGCTATTGAAAAACCCGAGTTGTTTGTC
ATGAAGCCTCAGAGAGAAGGAGGAGGTAATAACATCTATGGAGATGATGTGAGGGAAAAT
CTTCTGAGATTGCAGAGAGAAGGAGAGGAAGAAAACGCTGCGTATATCCTGATGCAGAGG
ATATTCCCAAAAGTGTCAAACGTGTTCTTGCTGCGAGACGGTGTTTACCATAAAGATCAA
GCTATATCAGAACTTGGAGTCTATGGGGCTTACCTCAGGAACAAGGAGAGAGTTATAATA
AACGAGCAGAGTGGTTATCTGATGCGCACAAAGGTCTCTTCATCAGATGAAGGTGGTGTT
GCGGCTGGTTTTGCTGTACTGGACAGCATTTATCTGAATTGAGATGGGATCATATTCACT
AACCATCCTGATTGATTCATGTTTATGCTGGTTCATTTTCTTTTTTTCTTTAGTCTTCCT
GCTTGCTTGTTTAAGATTTGTGTACTGATTCATGAAGATCTATAAAACAAGATTAGACAG
AGCTCTTTAAAATTATTTGAACAAAGC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL3780Contig1 845 2 13 U
GGATACTCAAAAAGGAAAAAATATGTATACAGAGGAAAAGAAGAAAGACAAAAACTATGG
CTCGATCTTTGTCTACTGCGTCCTCTGCTTCGTACTCATCGTGGAAGTTTCAAGATTCGC
TAAACCTTATCACAGCAACCTTCAGAACCTAATGGAGACAGAAGCATTAGTAGTAGAAGA
AGGATTCGTGGACGTCGTGAACTCAGGGAAACTTCCATGTCCCTTCAAAACATCTAGCTC
TGCCTCTGCTAGGAGTCACGAGAAGCTCTCGGGACTAATAAGACGAGAGGATAGAGCTCG
TCCTCCATCTTCGTACTGCGTGAAGTTCCAGAATTTTGCCACTATGGCGAAACTGGTCAA
AGACAACGGTGACAAGTACGAGTCACGTCCTTTCTCCGTCGGTGGATACAACTGGACGTT
ACTAATCTACCCTAACGAGAACAAGCCAGTGGGCTCGGGTGGATTCGTTTCGATGTACGT
TAGAATCGATAACTCAAGCCTCATAGCCAACCCACACGATGTGTACGCAGAGATCACATT
CCTCACCTATAAAAGCACTATAGACAGATACCATTTTCTTCAGGAGACCGATGCGCAGCG
GTTTCATTTGTTTAAACAACAATATGGACAGCTAAACTTTCTTGAGATTGGTTACTACAG
AGATCCAGGACATGGATTTATTTCCGACGGTGGACAAAGTGTTTTTGGTGTTGACATCCT
CGTTGCTAACCCCTTTGAGAAGTGGGAAGTTTTCTCTTACGAAGAAACATTCGTGACCCT
CTTTTCACTGGGAAGCTCACTAAATTCTCTACATGTAATCTTGACTCTTACACTTCTGAT
TCGTT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2FV16TF U 2
AF RR2AK24TF U 1
BS 1 21 RR2AK24TF
BS 22 22 RR2FV16TF
BS 23 125 RR2AK24TF
BS 126 126 RR2FV16TF
BS 127 224 RR2AK24TF
BS 225 225 RR2FV16TF
BS 226 228 RR2AK24TF
BS 229 229 RR2FV16TF
BS 230 284 RR2AK24TF
BS 285 285 RR2FV16TF
BS 286 683 RR2AK24TF
BS 684 684 RR2FV16TF
BS 685 845 RR2AK24TF

RD RR2FV16TF 793 0 0
GATACTCAAAAAGGAAAAAATATGTATACAGAGGAAAAGAAGAAAGACAAAAACTATGGC
TCGATCTTTGTCTACTGCGTCCTCTGCTTCGTACTCATCGTGGAAGTTTCAAGATTCGCT
AAACCTTATCACAGCAACCTTCAGAACCTAATGGAGACAGAAGCATTAGTAGTAGAAGAA
GGATTCGTGGACGTCGTGAACTCAGGGAAACTTCCATGTCCCTTCAAAACATCTAGCTCT
GCCTCTGCTAGGAGTCACGAGAAGCTCTCGGGACTAATAAGACGAGAGGATAGAGCTCGT
CCTCCATCTTCGTACTGCGTGAAGTTCCAGAATTTTGCCACTATGGCGAAACTGGTCAAA
GACAACGGTGACAAGTACGAGTCACGTCCTTTCTCCGTCGGTGGATACAACTGGACGTTA
CTAATCTACCCTAACGAGAACAAGCCAGTGGGCTCGGGTGGATTCGTTTCGATGTACGTT
AGAATCGATAACTCAAGCCTCATAGCCAACCCACACGATGTGTACGCAGAGATCACATTC
CTCACCTATAAAAGCACTATAGACAGATACCATTTTCTTCAGGAGACCGATGCGCAGCGG
TTTCATTTGTTTAAACAACAATATGGACAGCTAAACTTTCTTGAGATTGGTTACTACAGA
GATCCAGGACATGGATTTATTTCCGACG*TGGACAAAGTGTTTTTGGTGTTGACATCCTC
GTTGCTA*CCCCTTTGAGAAGTGGGAAGTTT*CTCTTACGAAGAAACATTCGTGACC
TTTTCCACTGGAAGCT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2AK24TF 845 0 0
GGATACTCAAAAAGGAAAAAA*ATGTATACAGAGGAAAAGAAGAAAGACAAAAACTATGG
CTCGATCTTTGTCTACTGCGTCCTCTGCTTCGTACTCATCGTGGAAGTTTCAAGATTCGC
TAAACTTTATCACAGCAACCTTCAGAACCTAATGGAGACAGAAGCATTAGTAGTAGAAGA
AGGATTCGTGGACGTCGTGAACTCAGGGAAACTTCCATGTCCCT*CAAGACATCTAGCTC
TGCCTCTGCTAGGAGTCACGAGAAGCTCTCGGGACTAATAAGACTAGAGGATAGAGCTCG
TCCTCCATCTTCGTACTGCGTGAAGTTCCAGAATTTTGCCACTATGGCGAAACTGGTCAA
AGACAACGGTGACAAGTACGAGTCACGTCCTTTCTCCGTCGGTGGATACAACTGGACGTT
ACTAATCTACCCTAACGAGAACAAGCCAGTGGGCTCGGGTGGATTCGTTTCGATGTACGT
TAGAATCGATAACTCAAGCCTCATAGCCAACCCACACGATGTGTACGCAGAGATCACATT
CCTCACCTATAAAAGCACTATAGACAGATACCATTTTCTTCAGGAGACCGATGCGCAGCG
GTTTCATTTGTTTAAACAACAATATGGACAGCTAAACTTTCTTGAGATTGGTTACTACAG
AGATCCAGGACATGGATTTATTTTCGACGGTGGACAAAGTGTTTTTGGTGTTGACATCCT
CGTTGCTAACCCCTTTGAGAAGTGGGAAGTTTTCTCTTACGAAGAAACATTCGTGACCCT
CTTTTCACTGGGAAGCTCACTAAATTCTCTACATGTAATCTTGACTCTTACACTTCTGAT
TCGTT

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

CO CL3781Contig1 1288 2 2 U
GGGAGACACAAAGAAAATATCATCCAAGAGCTTCTTCTAGGGCTTCGACGCGACAACGGC
TGCCAACTACTTCAGTTTCATAACTGCACAGGAATCATGAAGCCAGTCTTCTGTGGGAAC
TTTGAGTATGATGCACGTGAGGGCGATCTTGAAAGACTATTCAGGAAATACGGAAGGGTC
GAGAGGGTTGATATGAAAGCTGGGTTTGCTTTCGTGTACATGGAAGACGAGAGGGATGCT
GAGGATGCAATCCGAGCCCTTGACCGCATTGAATTTGGGCGCAAGGGACGCAGACTCCGT
GTTGAGTGGACAAAGGGTGAGCGTGGAGGCGACAGAAGATCTGGTGGTGGTGGTGGTTCA
AGGAGATCTTCATCCTTGAGGCCTTCCAAGACTCTGTTTGTGATCAACTTTGATGCGGAC
AATACTAGGACTCGGGATCTAGAGAGACACTTTGAACCGTATGGCAAAATTGTAAACGTT
AGGATCAGGAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAGGAGCAAGAGGATGCCACTCGAGCT
CTTGAGGCTACAAACAACAGTAAGCTGATGGATAAGGTGATCTCGGTGGAGTATGCAATG
AAAGATGATGATGCAAGAGGGAACGGACACAGTCCCGAAAGACGCCGTGATGGGTCACCA
GAAAGGAGAAGGCGATCGCCTAGTCCTTACAAGAGAGAGAGAGGGAGCCCTGATTATGGC
CGAGGGGGTAGTCCTGTTGCTGCATACAAAAGGGAAAGGACCAGTCCTGACTACGGGAGA
AGACGTAGCCCAAGTCCTTACAAGAGAACAAGGCGTAGTAGTCCAGAGTATGGTCGCGAC
CACCGCCACAGAGGCAATGAGAGCCCTAGGAGGAGGGAGAGAGTTGCTAGCCCCAGGTAC
AGTCGAAGTCCTGATAACAAGAGAGAGAGGGTGAGTCCTGACCGCAGCCCGTTTAAGAAG
GAAAGTTTGAAGAACGGAGATGGTGAAGTTGATAGCCCAAGGAGGGAGAGATCAAGGTCT
AGCCCTGGGAATGGGCAAGTTGAAAGCCCTGGCTCTATAGGGAGAAGGGACAGTGATGGT
GGCTACGATGGTGCAGATAGCCCCCCGATGCAGAAGAGCCGGTCTCGTTCGCCTCCAGCT
GAAGAGTGAATGAAAAGTGGATACATCAAAGTAGGGTGATGTAGTCAAACTCTCTGTGTC
ATGTGTTGTGTTTAGTTTCTTTGCTATTTGATACATTTGAACTAGGATCTCTTTTTATTG
TTGGATTGAAGAAAACTTATCTTGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC72TF U 1
AF RR2DC72JQ C 500
BS 1 662 RR2DC72TF
BS 663 1288 RR2DC72JQ

RD RR2DC72TF 663 0 0
GGGAGACACAAAGAAAATATCATCCAAGAGCTTCTTCTAGGGCTTCGACGCGACAACGGC
TGCCAACTACTTCAGTTTCATAACTGCACAGGAATCATGAAGCCAGTCTTCTGTGGGAAC
TTTGAGTATGATGCACGTGAGGGCGATCTTGAAAGACTATTCAGGAAATACGGAAGGGTC
GAGAGGGTTGATATGAAAGCTGGGTTTGCTTTCGTGTACATGGAAGACGAGAGGGATGCT
GAGGATGCAATCCGAGCCCTTGACCGCATTGAATTTGGGCGCAAGGGACGCAGACTCCGT
GTTGAGTGGACAAAGGGTGAGCGTGGAGGCGACAGAAGATCTGGTGGTGGTGGTGGTTCA
AGGAGATCTTCATCCTTGAGGCCTTCCAAGACTCTGTTTGTGATCAACTTTGATGCGGAC
AATACTAGGACTCGGGATCTAGAGAGACACTTTGAACCGTATGGCAAAATTGTAAACGTT
AGGATCAGGAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAGGAGCAAGAGGATGCCACTCGAGCT
CTTGAGGCTACAAACAACAGTAAGCTGATGGATAAGGTGATCTCGGTGGAGTATGCAATG
AAAGATGATGATGCAAGAGGGAACGGACACAGTCCCGAAAGACGCCGTGATGGGTCACCA
GA
A

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2DC72JQ 789 0 0
CATTTATCCAATACGAGGAGCAAGAGGATGCCACTCGAGCTCTTGAGGCTACAAACAACA
GTAAGCTGATGGATAAGGTGATCTCGGTGGAGTATGCAATGAAAGATGATGATGCAAGAG
GGAACGGACACAGTCCCGAAAGACGCCGTGATGGGTCACCAGAAAGGAGAAGGCGATCGC
CTAGTCCTTACAAGAGAGAGAGAGGGAGCCCTGATTATGGCCGAGGGGGTAGTCCTGTTG
CTGCATACAAAAGGGAAAGGACCAGTCCTGACTACGGGAGAAGACGTAGCCCAAGTCCTT
ACAAGAGAACAAGGCGTAGTAGTCCAGAGTATGGTCGCGACCACCGCCACAGAGGCAATG
AGAGCCCTAGGAGGAGGGAGAGAGTTGCTAGCCCCAGGTACAGTCGAAGTCCTGATAACA
AGAGAGAGAGGGTGAGTCCTGACCGCAGCCCGTTTAAGAAGGAAAGTTTGAAGAACGGAG
ATGGTGAAGTTGATAGCCCAAGGAGGGAGAGATCAAGGTCTAGCCCTGGGAATGGGCAAG
TTGAAAGCCCTGGCTCTATAGGGAGAAGGGACAGTGATGGTGGCTACGATGGTGCAGATA
GCCCCCCGATGCAGAAGAGCCGGTCTCGTTCGCCTCCAGCTGAAGAGTGAATGAAAAGTG
GATACATCAAAGTAGGGTGATGTAGTCAAACTCTCTGTGTCATGTGTTGTGTTTAGTTTC
TTTGCTATTTGATACATTTGAACTAGGATCTCTTTTTATTGTTGGATTGAAGAAAACTTA
TCTTGTGTG

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 3

CO CL3782Contig1 802 3 8 U
GAACGTCCAAAACATCAAGCTTATTGCCCCTGCTGAAAGTCCCAACACCGATGGTATCCA
TTTGAGCAATGCGGTCAACGTTCACATCGCTGACAGTTTAATAGCGACAGGAGACGATTG
TATCTCAGTCGGTCGTGGTTCCACCGATGTAACCGTCGAACGCGTGACTTGTGGCCCAGG
ACACGGCCTAAGTGTCGGTAGTCTTGGTAAGTACCCGAACGAGGAGAATGTTGCCGATAT
TCACTTTAGGAACTGCACCATGAAAGATACCGACAATGGTCTTAGAATCAAGAGTTGGGG
TGGTTCGTCTCCAAGCACAGCTGTGGACATCACCTATGAAGATATTATTATGACAAACGT
CAAGAACCCAATCATCATTGACCAAAACTACGGCACAAGAGGCGGAGATTCAAAAGTTGC
GATAAGCAATGTGCTGTTCAAGAACGTAAGAGGAACAACAATTTCAAAAGATGAAGTTCA
GATCATGTGCAGCAAAGCAGTACCGTGCAAAGGAGTCAGCGTCGTTGATGTGGAGTTGAA
CTTCGTAGGTAACAAAGGAGGACATCCCTCGTCGTCAGGAGGTTTGGTCGGATCTCTTTG
TACCAACGCCAATGTTATCTTCGGTGGAAAACTTAGCTTCCCTATTCCCAAATAAGCTTT
TT*GGTATAAGTAATTTGATGTTGAAAAACAAATCAAAAATTTCCACAAACATTTTTTTG
TTTATGTTTGTGAGTTAGTTTGTGTGTTTATCAACAATAATTGGAATATATGATTTTTTA
TAATATATGATTTTTTATAATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B439JQ C 1
AF RR2BT03TF U 311
AF RR2B439TF U 1
BS 1 311 RR2B439TF
BS 312 510 RR2BT03TF
BS 511 511 RR2B439TF
BS 512 556 RR2BT03TF
BS 557 557 RR2B439TF
BS 558 781 RR2BT03TF
BS 782 791 RR2B439TF
BS 792 802 RR2B439JQ

RD RR2B439JQ 802 0 0
GAACGTCCAAAACATCAAGCTTATTGCCCCTGCTGAAAGTCCCAACACCGATGGTATCCA
TTTGAGCAATGCGGTCAACGTTCACATCGCTGACAGTTTAATAGCGACAGGAGACGATTG
TATCTCAGTCGGTCGTGGTTCCACCGATGTAACCGTCGAACGCGTGACTTGTGGCCCAGG
ACACGGCCTAAGTGTCGGTAGTCTTGGTAAGTACCCGAACGAGGAGAATGTTGCCGATAT
TCACTTTAGGAACTGCACCATGAAAGATACCGACAATGGTCTTAGAATCAAGAGTTGGGG
TGGTTCGTCTCCAAGCACAGCTGTGGACATCACCTATGAAGATATTATTATGACAAACGT
CAAGAACCCAATCATCATTGACCAAAACTACGGCACAAGAGGCGGAGATTCAAAAGTTGC
GATAAGCAATGTGCTGTTCAAGAACGTAAGAGGAACAACAATTTCAAAAGATGAAGTTCA
GATCATGTGCAGCAAAGCAGTACCGTGCAAAGGAGTCAGCGTCGTTGATGTGGAGTTGAA
CTTCGTAGGTAACAAAGGAGGACATCCCTCGTCGTCAGGAGGTTTGGTCGGATCTCTTTG
TACCAACGCCAATGTTATTTTCGGTGGAAAACTTAGCTTCCCTATTCCCAAATAAGCTTT
TT*GGTATAAGTAATTTGATGTTGAAAAACAAATCAAAAATTTCCACAAACATTTTTTTG
TTTATGTTTGTGAGTTAGTTTGTGTGTTTATCAACAATAATTGGAATATATGATTTTTTA
TAATATATGATTTTTTATAATT

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2BT03TF 471 0 0
G
CAAGCACAGCTGTGGACATCACCTATGAAGATATTATTATGACAAACGTCAAGAACCCAA
TCATCATTGACCAAAACTACGGCACAAGAGGCGGAGATTCAAAAGTTGCGATAAGCAATG
TGCTGTTCAAGAACGTAAGAGGAACAACAATTTCAAAAGATGAAGTTCAGATCATGTGCA
GCAAAGCAGTACCGTGCAATGGAGTCAGCGTCGTTGATGTGGAGTTGAACTTCGTAGGTA
ACAAAAGAGGACATCCCTCGTCGTCAGGAGGTTTGGTCGGATCTCTTTGTACCAACGCCA
ATGTTATCTTCGGTGGAAAACTTAGCTTCCCTATTCCCAAATAAGCTTTTT*GGTATAAG
TAATTTGATGTTGAAAAACAAATCAAAAATTTCCACAAACATTTTTTTGTTTATGTTTGT
GAGTTAGTTTGTGTGTTTATCAACAATAATTGGAATATATGATTTTTTAT

QA 2 471 2 471
DS 

RD RR2B439TF 791 0 0
GAACGTCCAAAACATCAAGCTTATTGCCCCTGCTGAAAGTCCCAACACCGATGGTATCCA
TTTGAGCAATGCGGTCAACGTTCACATCGCTGACAGTTTAATAGCGACAGGAGACGATTG
TATCTCAGTCGGTCGTGGTTCCACCGATGTAACCGTCGAACGCGTGACTTGTGGCCCAGG
ACACGGCCTAAGTGTCGGTAGTCTTGGTAAGTACCCGAACGAGGAGAATGTTGCCGATAT
TCACTTTAGGAACTGCACCATGAAAGATACCGACAATGGTCTTAGAATCAAGAGTTGGGG
TGGTTCGTCTCCAAGCACAGCTGTGGACATCACCTATGAAGATATTATTATGACAAACGT
CAAGAACCCAATCATCATTGACCAAAACTACGGCACAAGAGGCGGAGATTCAAAAGTTGC
GATAAGCAATGTGCTGTTCAAGAACGTAAGAGGAACAACAATTTCAAAAGATGAAGTTCA
GATCATGTGCAGCAAAGCAGTACCGTGCAAAGGAGTCAGCGTCGTTGATGTGGAGTTGAA
CTTCGTAGGTAACAAAGGAGGACATCCCTCGTCGTCAGGAGGTTTGGTCGGATCTCTTTG
TACCAACGCCAATGTTATCTTCGGTGGAAAACTTAGCTTCCCTATTCCCAAATAAGCTTT
TTTGGTATAAGTAATTTGATGTTGAAAAACAAATCAAAAATTTCCACAAACATTTTTTTG
TTTATGTTTGTGAGTTAGTTTGTGTGTTTATCAACAATAATTGGAATATATGATTTTTTA
TAATATATGAT

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 3

CO CL3783Contig1 1269 3 3 U
GGTAATATACAGTTTGATTTTGCTCTATTCCAAGGGTAATAACATATATAAAAGAAATGG
AGTTCGGACTAACATCCACAGCTATTTCACCTAAGCAAAGCACTATGCATGAAGTACTAT
CCCTTGGCTCAATAACAAATTTGTGAGTTTCTCAGATATATATAATATTATGTAATCATT
CCGCATCAGCCGGTCGGGTATGCCAATCTCCAATTTGAGCAACCAGAAAACCAAACATTG
CTGCTGTGTTGGGAAAAAGAAATTGAATCTTCCGGGGGTATCTATGTTTTTCGAACTACT
GAGAACCCAGAGTTCACCGTCAGCTGCACGGAGCATACATATTGCATTGGTTAAGTACCA
GAGTAAACTTATCTTGGCGGAAATCCAGCTTGGCGTGCCCGATGGCCTCTATCAGATGGT
GGAGGGCCCAGTATGCCCAGTGAGTTAGAGCTGTTGCTTATCGGTGGTCGCTCAGATTGA
TGATGAACATCATAGTTTTCTGTTCTTTTTCTCCTTTTCCATGCTTCAAATTTTGCTGTG
TCAATGCCCTTGTGAACTTGCGGAGGTCCTGGTGTTTTGAATCTTTGTTGCCTCCTACCG
GCTGTTGAGCCATTGAGTTGCGATGGTCCAACCCCTTCTTCCTCCTCTCTCTCCTGCTTC
AATTTGGAGTAGATCTGATTGAGTCTATCCCCTGATAGGTTTGAGAAGGTTGAAACATAG
TTCCATAATCTCATTGTCATTCTATCTTGCTTATACGAATCCTCTTAGTGTTCTAAAACA
ACTTCATCTATTCTCCTCCCAAGGATTTGCAAATATCTCCGGATTTTGAAAAGCACCTTC
TCCTTTGGCAGATCCGCACTAATTGTTTGCAATCTTTGTAGACGTTCAAGTGTCTTGATT
TCACCAGCCAATACATCTTCACACCATTCCATCCATTTCTGCTCCTTAAACTGCTCGTAA
ACTTCCTCATCATCAGACATTTCTCCCTCTTCCTTCACCAACGGCTCAGCGTTTTGGGTT
CTCCGAGTTCCAACAACATCTTTTGTTGTTGTCAGATTGGCAGGACCAGATTTCCCTTTT
CGGTCTCTTGCAGGTGCTTTCAATTGATTGATAACAACCTTTTTGGAATTTTTACGTGAT
GCTTTGGCATTTGTGTTTTTCCCTCCTGCTGCAGAAAGTTCCATTTCAAGAAGTGCAGTA
GCACGCTCCTTTAGGTTTGGAGCACGAGGTAAAAAAGTCTCATGGTGTTGAAGTTCAACA
GGAGCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU55JQ U 1
AF RR2DU55TF C 331
AF RR2EL73JQ U 520
BS 1 413 RR2DU55JQ
BS 414 519 RR2DU55TF
BS 520 1269 RR2EL73JQ

RD RR2DU55JQ 413 0 0
GGTAATATACAGTTTGATTTTGCTCTATTCCAAGGGTAATAACATATATAAAAGAAATGG
AGTTCGGACTAACATCCACAGCTATTTCACCTAAGCAAAGCACTATGCATGAAGTACTAT
CCCTTGGCTCAATAACAAATTTGTGAGTTTCTCAGATATATATAATATTATGTAATCATT
CCGCATCAGCCGGTCGGGTATGCCAATCTCCAATTTGAGCAACCAGAAAACCAAACATTG
CTGCTGTGTTGGGAAAAAGAAATTGAATCTTCCGGGGGTATCTATGTTTTTCGAACTACT
GAGAACCCAGAGTTCACCGTCAGCTGCACGGAGCATACATATTGCATTGGTTAAGTACCA
GAGTAAACTTATCTTGGCGGAAATCCAGCTTGGCGTGCCCGATGGCCTCTATC

QA 1 413 1 413
DS 

RD RR2DU55TF 637 0 0
GAGCATACATATTGCATTGGTTAAGTACCAGAGTAAACTTATCTTGGCGGAAATCCAGCT
TGGCGTGCCCGATGGCCTCTATCAGATGGTGGAGGGCCCAGTATGCCCAGTGAGTTAGAG
CTGTTGCTTATCGGTGGTCGCTCAGATTGATGATGAACATCATAGTTTTCTGTTCTTTTT
CTCCTTTTCCATGCTTCAAATTTTGCTGTGTCAATGCCCTTGTGAACTTGCGGAGGTCCT
GGTGTTTTGAATCTTTGTTGCCTCCTACCGGCTGTTGAGCCATTGAGTTGCGATGGTCCA
ACCCCTTCTTCCTCCTCTCTCTCCTGCTTCAATTTGGAGTAGATCTGATTGAGTCTATCC
CCTGATAGGTTTGAGAAGGTTGAAACATAGTTCCATAATCTCATTGTCATTCTATCTTGC
TTATACGAATCCTCTTCGTGTTCTAAAACAACTTCATCTATTCTCCTCCCAAGGATTTGC
AAATATCTCCGGATTTTGAAAAGCACCTTCTCCTTTGGCAGATCCGCACTAATTGTTTGC
AATCTTTGTAGACGTTCAAGTGTTTTGATTTCACCAGCCAATACATCTTCACACCATTCC
ATCCATTTCTGCTCCTTAAACTGCTCGTAAACTTCC
C

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2EL73JQ 750 0 0
CATGCTTCAAATTTTGCTGTGTCAATGCCCTTGTGAACTTGCGGAGGTCCTGGTGTTTTG
AATCTTTGTTGCCTCCTACCGGCTGTTGAGCCATTGAGTTGCGATGGTCCAACCCCTTCT
TCCTCCTCTCTCTCCTGCTTCAATTTGGAGTAGATCTGATTGAGTCTATCCCCTGATAGG
TTTGAGAAGGTTGAAACATAGTTCCATAATCTCATTGTCATTCTATCTTGCTTATACGAA
TCCTCTTAGTGTTCTAAAACAACTTCATCTATTCTCCTCCCAAGGATTTGCAAATATCTC
CGGATTTTGAAAAGCACCTTCTCCTTTGGCAGATCCGCACTAATTGTTTGCAATCTTTGT
AGACGTTCAAGTGTCTTGATTTCACCAGCCAATACATCTTCACACCATTCCATCCATTTC
TGCTCCTTAAACTGCTCGTAAACTTCCTCATCATCAGACATTTCTCCCTCTTCCTTCACC
AACGGCTCAGCGTTTTGGGTTCTCCGAGTTCCAACAACATCTTTTGTTGTTGTCAGATTG
GCAGGACCAGATTTCCCTTTTCGGTCTCTTGCAGGTGCTTTCAATTGATTGATAACAACC
TTTTTGGAATTTTTACGTGATGCTTTGGCATTTGTGTTTTTCCCTCCTGCTGCAGAAAGT
TCCATTTCAAGAAGTGCAGTAGCACGCTCCTTTAGGTTTGGAGCACGAGGTAAAAAAGTC
TCATGGTGTTGAAGTTCAACAGGAGCAATC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 3

CO CL3784Contig1 983 3 6 U
GGACTCCATCAAAGCAACAGCGAAGAGAGAAAAAAAAACATAAACAAAACAATGGACTCA
TCTCCAAAACCCAACAACAATGCTGCCTACCAACACGTGTTCGTGATGCGTCACGGCGAT
CGAATCGACAACTTCGAGCCACTCTGGGTCTCGACAGCTGCCAGACCTTGGGATCCGCCT
CTCTTTCAAGACGGTTTTATTCGAGCTTTCAGAACCGGTCAAAGGATCCGATCTCAGATC
GGGTTCCCGGTTCACCGCGTCTTCGTCTCCCCTTTCCTCCGTTGCATTCAGACAGCTTCC
GAGGTTGTCTCAGCTCTCTCGGCGATTAATGTTGACCCCAACGCCATGTCTTCCAAAGAC
GTACCTTCCGTTGATACATCTAAGCTCAAGGTTGCTATTGAGTATGGTTTGTGTGAGATG
TTGAACTCAGTGGCTATAAGGCGGGAGGTTGCTCCTAAAGATGGAAACTTTGACTTTAGG
TTATCAGATCTTGAAGCTCTGTTTCCTGAAGGGATGGTTGATCATAACGTGGATATGGTT
TATAAAGAGATGCCAAAATGGGAAGAGACTGTGGAAGATTGTAGAGAACGTTATGTTAAA
ATTGTAAAGGCTCTGGCTGATAAGTATCCTACAGAGAACTTGCTCTTAGTCACCCACGGG
GAAGGAGTAGGAGCTACATTTTCGAAGTTCTATAGAGATACAACTGTGTACGAAGTTGAT
TACTGCGCTTATGTTGAGTTGAGAAGAGAGGTTTCGAGTAAAGATGGGTCTGTTGAAACT
GGGGAGTATTAGGTGGTTTTGAGTCATGGTCAAGCTGGAATCAGGTTTAGTCGTGATCAT
TTTAGTGAAGATGATCCTGTCATAAGCCGAACACCCGTTTAGTCAATGCTAATTCAAATT
CCTCTGTTTCTATCTGTACTTTTGGTTGTATCTGAAATGTTTCTGTATGAGTGTTATGAA
TCATGCTTTCGAAGTTTTCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF86TF U 22
AF RR2FP14TF U 1
AF RR2FP14JQ C 246
BS 1 76 RR2FP14TF
BS 77 77 RR2EF86TF
BS 78 720 RR2FP14TF
BS 721 721 RR2FP14JQ
BS 722 738 RR2FP14TF
BS 739 983 RR2FP14JQ

RD RR2EF86TF 647 0 0
GGAAGAGAG
AAAAAAAACATAAACAAA*CAATGGACTCATCTCCAAAACCCAACAACAATGCTGCCTAC
CAACACGTGTTCGTGATGCGTCACGGCGATCGAATCGACAACTTCGAGCCACTCTGGGTC
TCGACAGCTGCCAGACCTTGGGATCCGCCTCTCTTTCAAGACGGTTTTATTCGAGCTTTC
AGAACCGGTCAAAGGATCCGATCTCAGATCGGGTTCCCGGTTCACCGCGTCTTCGTCTCC
CCTTTCCTCCGTTGCATTCAGACAGCTTCCGAGGTTGTCTCGGCTCTCTCGGCTGTTAAT
GTTGACCCCAACGCCATGTCTTCCAAAGACGTCCCTTCCGTTGATACATCTAAACTCAAG
GTTGCTATTGAGTATGGTTTGTGTGAGATGTTGAACACAGTGGCTATAAGGCGTGAGCTT
GCTCCTAAAGATGGAAACTTTGACTTTAGGTTATCAGATCTTGAAGCTCTGTTTCCTGAA
GGGATGGTTGATCATAACGTGGATATGGTTTATAAAGAGATGCCAAAATGGGAAGAGACT
GTGGAAGATTGTAGAGAACGTTATGTTAAAATTGTAAAGGCTCTGGCTGATAAGTATCCT
ACAGAGAACTTGCTCTTAGTCACCCACGGGGAAAGAGT

QA 10 647 10 647
DS 

RD RR2FP14TF 738 0 0
GGACTCCATCAAAGCAACAGCGAAGAGAGAAAAAAAAACATAAACAAAACAATGGACTCA
TCTCCAAAACCCAACAGCAATGCTGCCTACCAACACGTGTTCGTGATGCGTCACGGCGAT
CGAATCGACAACTTCGAGCCACTCTGGGTCTCGACAGCTGCCAGACCTTGGGATCCGCCT
CTCTTTCAAGACGGTTTTATTCGAGCTTTCAGAACCGGTCAAAGGATCCGATCTCAGATC
GGGTTCCCGGTTCACCGCGTCTTCGTCTCCCCTTTCCTCCGTTGCATTCAGACAGCTTCC
GAGGTTGTCTCAGCTCTCTCGGCGATTAATGTTGACCCCAACGCCATGTCTTCCAAAGAC
GTACCTTCCGTTGATACATCTAAGCTCAAGGTTGCTATTGAGTATGGTTTGTGTGAGATG
TTGAACTCAGTGGCTATAAGGCGGGAGGTTGCTCCTAAAGATGGAAACTTTGACTTTAGG
TTATCAGATCTTGAAGCTCTGTTTCCTGAAGGGATGGTTGATCATAACGTGGATATGGTT
TATAAAGAGATGCCAAAATGGGAAGAGACTGTGGAAGATTGTAGAGAACGTTATGTTAAA
ATTGTAAAGGCTCTGGCTGATAAGTATCCTACAGAGAACTTGCTCTTAGTCACCCACGGG
GAAGGAGTAGGAGCTACATTTTCGAAGTTCTATAGAGATACAACTGTGTACGAAGTTGAT
*ACTGCGCTTATGTTGAG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2FP14JQ 738 0 0
CCCGGTTCACCGCGTCTTCGTCTCCCCTTTCCTCCGTTGCATTCAGACAGCTTCCGAGGT
TGTCTCAGCTCTCTCGGCGATTAATGTTGACCCCAACGCCATGTCTTCCAAAGACGTACC
TTCCGTTGATACATCTAAGCTCAAGGTTGCTATTGAGTATGGTTTGTGTGAGATGTTGAA
CTCAGTGGCTATAAGGCGGGAGGTTGCTCCTAAAGATGGAAACTTTGACTTTAGGTTATC
AGATCTTGAAGCTCTGTTTCCTGAAGGGATGGTTGATCATAACGTGGATATGGTTTATAA
AGAGATGCCAAAATGGGAAGAGACTGTGGAAGATTGTAGAGAACGTTATGTTAAAATTGT
AAAGGCTCTGGCTGATAAGTATCCTACAGAGAACTTGCTCTTAGTCACCCACGGGGAAGG
AGTAGGAGCTACATTTTCGAAGTTCTATAGAGATACAACTGTGTACGAAGTTGATTACTG
CGCTTATGTTGAGTTGAGAAGAGAGGTTTCGAGTAAAGATGGGTCTGTTGAAACTGGGGA
GTATTAGGTGGTTTTGAGTCATGGTCAAGCTGGAATCAGGTTTAGTCGTGATCATTTTAG
TGAAGATGATCCTGTCATAAGCCGAACACCCGTTTAGTCAATGCTAATTCAAATTCCTCT
GTTTCTATCTGTACTTTTGGTTGTATCTGAAATGTTTCTGTATGAGTGTTATGAATCATG
CTTTCGAAGTTTTCATTT

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL3785Contig1 821 2 8 U
TTTTTGTTACCTATAAATTATAACATACGATGACAGGAACAAAAACAATAACTTCTTGAT
GATCATATGATAACACTTTTAGGATCATCTTATGTTCTAATCATCTCGCCAAGAGAATCT
TATTAACAACCGTCTCAAAATTCACGACCGACGAACCACACGGATCTTCTGTCGCTTTCT
CTGCCAAACGCCGCCACTCCTCCGCCTTCTCTCTTAACTTCTTTCCCTTTTCTCCATCCA
TCAGCTCTCTTACCACCACCTCAACCTCTTCTCTTTTCACATCCCCGCCAATCTCCATTC
CCACTCCCCACTCGTCGCAACAGAACTTCGCGTTCGTTTGCTGCTCCGCAAAAAAAGGCC
AACACACCATTGGAACTCCGGCAGATATACTCTCTAACGTTGAGTTCCATCCATTATGTG
TTAAAAATCCTCCGACCGCCGGATGAGACAGGACTTTCTCCTGAGGACACCAACTCAACA
ACATTCTTCTACCTTCCGTCTCTGTTAAAAACTCTGTCGGAATCATCGCCGCTTCTCCAG
CTACTAAATCTGGTCGGATCACCCATAAAAACTCTTTTCTTGATGCTGCCAACCCCCAAG
CGAACTCCACGAGCTGCTTCGCGGTCATTACCGTTATGCTCCCAAAGTTAACGTAAACAA
CGGTGTTTCGAGCCTTGGTATCGAGCCAGTCCAAACACTCTGTCTCCTCTCTCCAAAGGT
TTGATCCTAGCCTTTGTGTCTCACTACCTTCTTCAATTTCCCGGTTTACTAAGAGGTGAA
GCGGTCCAAGAGAATAAACCGGTGGTAAAATGGACTGCATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL10JQ U 1
AF RR2GX02JQ U 31
BS 1 235 RR2EL10JQ
BS 236 236 RR2GX02JQ
BS 237 530 RR2EL10JQ
BS 531 531 RR2GX02JQ
BS 532 608 RR2EL10JQ
BS 609 609 RR2GX02JQ
BS 610 770 RR2EL10JQ
BS 771 821 RR2GX02JQ

RD RR2EL10JQ 770 0 0
TTTTTGTTACCTATAAATTATAACATACGATGACAGGAACAAAAACAATAACTTCTTGAT
GATCATATGATAACACTTTTAGGATCATCTTATGTTCTAATCATCTCGCCAAGAGAATCT
TATTAACAACCGTCTCAAAATTCACGACCGACGAACCACACGGATCTTCTGTCGCTTTCT
CTGCCAAACGCCGCCACTCCTCCGCCTTCTCTCTTAACTTCTTTCCCTTTTCTCCGTCCA
TCAGCTCTCTTACCACCACCTCAACCTCTTCTCTTTTCACATCCCCGCCAATCTCCATTC
CCACTCCCCACTCGTCGCAACAGAACTTCGCGTTCGTTTGCTGCTCCGCAAAAAAAGGCC
AACACACCATTGGAACTCCGGCAGATATACTCTCTAACGTTGAGTTCCATCCATTATGTG
TTAAAAATCCTCCGACCGCCGGATGAGACAGGACTTTCTCCTGAGGACACCAACTCAACA
ACATTCTTCTACCTTCCGTCTCTGTTAAAAACTCTGTCGGAATCATCGCCTCTTCTCCAG
CTACTAAATCTGGTCGGATCACCCATAAAAACTCTTTTCTTGATGCTGCCAACCCCCAAG
CGAACTCCGCGAGCTGCTTCGCGGTCATTACCGTTATGCTCCCAAAGTTAACGTAAACAA
CGGTGTTTCGAGCCTTGGTATCGAGCCAGTCCAAACACTCTGTCTCCTCTCTCCAAAGGT
TTGATCCTAGCCTTTGTGTCTCACTACCTTCTTCAATTTCCCGGTTTACT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2GX02JQ 791 0 0
C
GACAGGAACAAAAACAATAACTTCTTGATGATCATATGATAACACTTTTAGGATCATCTT
ATGTTCTAATCATCTCGCCAAGAGAATCTTATTAACAACCGTCTCAAAATTCACGACCGA
CGAACCACACGGATCTTCTGTCGCTTTCTCTGCCAAACGCCGCCACTCCTCCGCCTTCTC
TCTTAACTTCTTTCCCTTTTCTCCATCCATCAGCTCTCTTACCACCACCTCAACCTCTTC
TCTTTTCACATCCTCGCCAATCTCCATTCCCACTCCCCACTCGTCGCAACAGAACTTCGC
GTTCGTTTGCTGCTCCGCAAAAAAAGGCCAACACACCATTGGAACTCCGGCAGATATACT
CTCTAACGTTGAGTTCCATCCATTATGTGTTAAAAATCCTCCGACCGCCGGATGAGACAG
GACTTTCTCCTGAGGACACCAACTCAACAACATTCTTCTACCTTCCGTCTCTGTTAAAAA
CTCTGTCGGAATCATCGCCGCTTCTCCAGCTACTAAATCTGGTCGGATCACCCATAAAAA
CTCTTTTCTTGATGCTGCCAACCCCCAAGCGAACTCCACGAGCTGCTTCGCGGTCATTAC
CGTTATGCTCCCAAAGTTAACGTAAACAACGGTGTTTCGAGCCTTGGTATCGAGCCAGTC
CAAACACTCTGTCTCCTCTCTCCAAAGGTTTGATCCTAGCCTTTGTGTCTCACTACCTTC
TTCAATTTCCCGGTTTACTAAGAGGTGAAGCGGTCCAAGAGAATAAACCGGTGGTAAAAT
GGACTGCATA

QA 2 791 2 791
DS 



AS 1 2

CO CL3786Contig1 615 2 2 U
GGAGTAGTCACACACTTCTCCTTCCGTTTGCTTCCGTTAGATCTGATCGCCAATTTCACC
CCCCTAAGGTTTATAAAGTCTGTCAGTTTATTATACAAATGGGTCGTGGGAACAGCTGTG
GTGGAGGTCAAAGCTCACTTAATTATCTCTTTGGCGGTGGTGATGCTCCTCCTCCTCCTC
CTAAGCCCGCTCCAGCTCCCACTGCTGAGAGTAACAACAGGACTGCTGCACCTGCACCTG
CACCAGCTACTGCTGTTGAACCAGCAGTACAGATCAACAAGGAGATCCCTGCTGGTATCA
AAACTCCTGTCAACAACTACGCCCGAGCTGAAGGACAAAACACCGGAAACTTCCTCACTG
ACCGTCCTTCCACCAAGGTTCATGCAGCTCCTGGAGGTGGATCATCTCTTGATTATCTCT
TCACTGGTGGCAAGTAAAACAACCATACATACATTCTGTGTGTAGTAATGCAAATTCGTA
TCCATTCTGTTTCTCTTCTCAATTTTTAAACTGTTTCATGTCATGATGGTTTCTTGTCAA
CCCTCGTTTTATCTTGTATTCTGCTGAAAAAATGTTCATAGCATTTGAATCAAAGACCAC
TTCAAGTTCTCTCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2EI61JQ C 1
AF RR2EI61TF U 1
BS 1 613 RR2EI61TF
BS 614 615 RR2EI61JQ

RD RR2EI61JQ 615 0 0
GGAGTAGTCACACACTTCTCCTTCCGTTTGCTTCCGTTAGATCTGATCGCCAATTTCACC
CCCCTAAGGTTTATAAAGTCTGTCAGTTTATTATACAAATGGGTCGTGGGAACAGCTGTG
GTGGAGGTCAAAGCTCACTTAATTATCTCTTTGGCGGTGGTGATGCTCCTCCTCCTCCTC
CTAAGCCCGCTCCAGCTCCCACTGCTGAGAGTAACAACAGGACTGCTGCACCTGCACCTG
CACCAGCTACTGCTGTTGAACCAGCAGTACAGATCAACAAGGAGATCCCTGCTGGTATCA
AAACTCCTGTCAACAACTACGCCCGAGCTGAAGGACAAAACACCGGAAACTTCCTCACTG
ACCGTCCTTCCACCAAGGTTCATGCAGCTCCTGGAGGTGGATCATCTCTTGATTATCTCT
TCACTGGTGGCAAGTAAAACAACCATACATACATTCTGTGTGTAGTAATGCAAATTCGTA
TCCATTCTGTTTCTCTTCTCAATTTTTAAACTGTTTCATGTCATGATGGTTTCTTGTCAA
CCCTCGTTTTATCTTGTATTCTGCTGAAAAAATGTTCATAGCATTTGAATCAAAGACCAC
TTCAAGTTCTCTCTT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2EI61TF 613 0 0
GGAGTAGTCACACACTTCTCCTTCCGTTTGCTTCCGTTAGATCTGATCGCCAATTTCACC
CCCCTAAGGTTTATAAAGTCTGTCAGTTTATTATACAAATGGGTCGTGGGAACAGCTGTG
GTGGAGGTCAAAGCTCACTTAATTATCTCTTTGGCGGTGGTGATGCTCCTCCTCCTCCTC
CTAAGCCCGCTCCAGCTCCCACTGCTGAGAGTAACAACAGGACTGCTGCACCTGCACCTG
CACCAGCTACTGCTGTTGAACCAGCAGTACAGATCAACAAGGAGATCCCTGCTGGTATCA
AAACTCCTGTCAACAACTACGCCCGAGCTGAAGGACAAAACACCGGAAACTTCCTCACTG
ACCGTCCTTCCACCAAGGTTCATGCAGCTCCTGGAGGTGGATCATCTCTTGATTATCTCT
TCACTGGTGGCAAGTAAAACAACCATACATACATTCTGTGTGTAGTAATGCAAATTCGTA
TCCATTCTGTTTCTCTTCTCAATTTTTAAACTGTTTCATGTCATGATGGTTTCTTGTCAA
CCCTCGTTTTATCTTGTATTCTGCTGAAAAAATGTTCATAGCATTTGAATCAAAGACCAC
TTCAAGTTCTCTC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

CO CL3787Contig1 731 2 2 U
GGGTCTTTAGTAGTAAGTGAAAGAGAATGTCAGAGATTGTAAACTTGTCGTCGTCCCTGA
GATCTTTAAAACCAAAGGTCTCACCTTTGGTTCCTCCTCCTCCTCCTCGTGAAGTGTCTA
GCTCGTCGCAGAGATTAAAGTTTCTATCTTTTCCCGGGAAAATCAGTTTGGCAACGGGGA
GAATCCGAGCAATCGATGCCGAGGAGAAGCGGCAAGAGGTAGATGATGACTCGCCTGTCT
CGATCGAGCTAGGTCCGATAAGTAGCGAGAGCCACTTCGATGAGGTGATGGAGGAAGCTC
AGAAGGTCGGTGAATCTGTTGTCATCGTCTGGATGGCAGCTTGGTCAGGAAATGTATTTA
CTTGAGGCCCAAACTCGAAAAGCTCGCTGCTGAGTTCTACCCAAGGCTGCGGTTTTATCA
TGTTGATGTCAACGCTGTGCCGTACAGACTTGTTTCTCGTGCAGGAGTTACGAAAATGCC
AACGATACAGCTATGGAGAGATGACCAGAAACAAGCTGAAGTCATTGGTGGTCACAAAGC
GCATTTTGTGGTTAACGAAGTGCGGGAGATGATAGAGAATGATTCAATCACTTGAAAAGT
TAACGGGACACTCTGCTCTCTTTTTTGTTTTCCCCTCTGATTGTTCTTAGTTTTTGGGAG
TCCTCCTGGTTTTGAAAGACACGATTGTAGTAGATTAGTAGTATATTGCAATATCAAACG
CTTTTGGCACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F091JQ C 1
AF RR2F091TF U 1
BS 1 724 RR2F091TF
BS 725 731 RR2F091JQ

RD RR2F091JQ 731 0 0
GGGTCTTTAGTAGTAAGTGAAAGAGAATGTCAGAGATTGTAAACTTGTCGTCGTCCCTGA
GATCTTTAAAACCAAAGGTCTCACCTTTGGTTCCTCCTCCTCCTCCTCGTGAAGTGTCTA
GCTCGTCGCAGAGATTAAAGTTTCTATCTTTTCCCGGGAAAATCAGTTTGGCAACGGGGA
GAATCCGAGCAATCGATGCCGAGGAGAAGCGGCAAGAGGTAGATGATGACTCGCCTGTCT
CGATCGAGCTAGGTCCGATAAGTAGCGAGAGCCACTTCGATGAGGTGATGGAGGAAGCTC
AGAAGGTCGGTGAATCTGTTGTCATCGTCTGGATGGCAGCTTGGTCAGGAAATGTATTTA
CTTGAGGCCCAAACTCGAAAAGCTCGCTGCTGAGTTCTACCCAAGGCTGCGGTTTTATCA
TGTTGATGTCAACGCTGTGCCGTACAGACTTGTTTCTCGTGCAGGAGTTACGAAAATGCC
AACGATACAGCTATGGAGAGATGACCAGAAACAAGCTGAAGTCATTGGTGGTCACAAAGC
GCATTTTGTGGTTAACGAAGTGCGGGAGATGATAGAGAATGATTCAATCACTTGAAAAGT
TAACGGGACACTCTGCTCTCTTTTTTGTTTTCCCCTCTGATTGTTCTTAGTTTTTGGGAG
TCCTCCTGGTTTTGAAAGACACGATTGTAGTAGATTAGTAGTATATTGCAATATCAAACG
CTTTTGGCACC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2F091TF 724 0 0
GGGTCTTTAGTAGTAAGTGAAAGAGAATGTCAGAGATTGTAAACTTGTCGTCGTCCCTGA
GATCTTTAAAACCAAAGGTCTCACCTTTGGTTCCTCCTCCTCCTCCTCGTGAAGTGTCTA
GCTCGTCGCAGAGATTAAAGTTTCTATCTTTTCCCGGGAAAATCAGTTTGGCAACGGGGA
GAATCCGAGCAATCGATGCCGAGGAGAAGCGGCAAGAGGTAGATGATGACTCGCCTGTCT
CGATCGAGCTAGGTCCGATAAGTAGCGAGAGCCACTTCGATGAGGTGATGGAGGAAGCTC
AGAAGGTCGGTGAATCTGTTGTCATCGTCTGGATGGCAGCTTGGTCAGGAAATGTATTTA
CTTGAGGCCCAAACTCGAAAAGCTCGCTGCTGAGTTCTACCCAAGGCTGCGGTTTTATCA
TGTTGATGTCAACGCTGTGCCGTACAGACTTGTTTCTCGTGCAGGAGTTACGAAAATGCC
AACGATACAGCTATGGAGAGATGACCAGAAACAAGCTGAAGTCATTGGTGGTCACAAAGC
GCATTTTGTGGTTAACGAAGTGCGGGAGATGATAGAGAATGATTCAATCACTTGAAAAGT
TAACGGGACACTCTGCTCTCTTTTTTGTTTTCCCCTCTGATTGTTCTTAGTTTTTGGGAG
TCCTCCTGGTTTTGAAAGACACGATTGTAGTAGATTAGTAGTATATTGCAATATCAAACG
CTTT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL3788Contig1 465 2 1 U
GGAGAGGTCACTCTCTTTTCTATTCAAAGAAATGGAGACACAGCCTCTTAAGAAGTTCTT
GGCCATTTCCATCATCTTCCTCTACCTTCTTGGACACGTCATGTCCAAGTCATCATCACC
ATCTTTGTGCAATAGTTCAGATGGGAAGTGCAGCACCGTGGTGGAGGCTGAAGAAATGAC
GGTGATAATGGAGTCATGGTCAAGCCAGAGATTGATGGAGGAGCAGACGCAGACGCTTTC
ATATAAAGCTTTGAGGAGGAATCAGCCTGCTTGCGATGGTGGCAACCGCGGTGAGTCTTA
CTCCAGCAAATGTCTTCCTCCGCCGTCTAATCCTTATAGTAGAGGCTGCTCTAAGCACTA
CCGTTGCAGGGGTGATTCTTGACCATTCACCATCATTTATGACTCTTTTATGTTATTTAA
TTGTATACTCATTTTCTTTTAATCTGATGTTTGTGAATTTGAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CR21TF U 1
AF RR2CR21JQ C 16
BS 1 465 RR2CR21TF

RD RR2CR21TF 465 0 0
GGAGAGGTCACTCTCTTTTCTATTCAAAGAAATGGAGACACAGCCTCTTAAGAAGTTCTT
GGCCATTTCCATCATCTTCCTCTACCTTCTTGGACACGTCATGTCCAAGTCATCATCACC
ATCTTTGTGCAATAGTTCAGATGGGAAGTGCAGCACCGTGGTGGAGGCTGAAGAAATGAC
GGTGATAATGGAGTCATGGTCAAGCCAGAGATTGATGGAGGAGCAGACGCAGACGCTTTC
ATATAAAGCTTTGAGGAGGAATCAGCCTGCTTGCGATGGTGGCAACCGCGGTGAGTCTTA
CTCCAGCAAATGTCTTCCTCCGCCGTCTAATCCTTATAGTAGAGGCTGCTCTAAGCACTA
CCGTTGCAGGGGTGATTCTTGACCATTCACCATCATTTATGACTCTTTTATGTTATTTAA
TTGTATACTCATTTTCTTTTAATCTGATGTTTGTGAATTTGAATT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RR2CR21JQ 450 0 0
TTTTTTATTCAAAGAAATGGAGACACAGCCTCTTAAGAAGTTCTTGGCCATTTCCATCAT
CTTCCTCTACCTTCTTGGACACGTCATGTCCAAGTCATCATCACCATCTTTGTGCAATAG
TTCAGATGGGAAGTGCAGCACCGTGGTGGAGGCTGAAGAAATGACGGTGATAATGGAGTC
ATGGTCAAGCCAGAGATTGATGGAGGAGCAGACGCAGACGCTTTCATATAAAGCTTTGAG
GAGGAATCAGCCTGCTTGCGATGGTGGCAACCGCGGTGAGTCTTACTCCAGCAAATGTCT
TCCTCCGCCGTCTAATCCTTATAGTAGAGGCTGCTCTAAGCACTACCGTTGCAGGGGTGA
TTCTTGACCATTCACCATCATTTATGACTCTTTTATGTTATTTAATTGTATACTCATTTT
CTTTTAATCTGATGTTTGTGAATTTGAATT

QA 1 450 1 450
DS 



AS 1 2

CO CL3789Contig1 467 2 1 U
GGGCCGTACGAATCAACGAGAAGCTTGTAAAGGCATTTTTGATTGTTTGATGGAACAACA
CAGCAACGATATCTCTCAAGAACAAGCTCGTGAGTCTCTCATTGCTAACGCCTATACTTC
ACCAGAGGAGGTTGAAGAGTCTCTAACGCCCTCAGATGTGAAACCTGTCGTCCCCACCAC
AAACGGAGTCTCCAAAACAAACTCTGAAGCTGCGGAAAAGCTCAGATCTGAGCTGATCTC
CATCTCCTACGACGAGTCACCGTCCCCCTCACCTGATGTATCTGTTTCTCCGACCTTGCC
CAACGGTGTCTGATAGCAGTAACTGTACAGATCAAAGTGTGTTCCTTATCCATGCATACA
ACTTTGGTTTGGTGATATCTTAATGTTTTCTTTCATCTAACTGTATGAAAGTTTTTCTTG
TTTGTGTTGTTTTAAAGTTAAAAGCTCTCTTGAGTCTTATTTGAATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FG69JQ C 1
AF RR2FG69TF U 1
BS 1 467 RR2FG69TF

RD RR2FG69JQ 467 0 0
GGGCCGTACGAATCAACGAGAAGCTTGTAAAGGCATTTTTGATTGTTTGATGGAACAACA
CAGCAACGATATCTCTCAAGAACAAGCTCGTGAGTCTCTCATTGCTAACGCCTATACTTC
ACCAGAGGAGGTTGAAGAGTCTCTAACGCCCTCAGATGTGAAACCTGTCGTCCCCACCAC
AAACGGAGTCTCCAAAACAAACTTTGAAGCTGCGGAAAAGCTCAGATTTGAGCTGATCTC
CATCTCCTACGACGAGTCACCGTCCCCCTCACCTGATGTATCTGTTTTTCCGACCTTGCC
CAACGGTGTTTGATAGCAGTAACTGTACAGATCAAAGTGTGTTCCTTATCCATGCATACA
ACTTTGGTTTGGTGATATCTTAATGTTTTCTTTCATCTAACTGTATGAAAGTTTTTCTTG
TTTGTGTTGTTTTAAAGTTAAAAGCTCTCTTGAGTCTTATTTGAATG

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2FG69TF 467 0 0
GGGCCGTACGAATCAACGAGAAGCTTGTAAAGGCATTTTTGATTGTTTGATGGAACAACA
CAGCAACGATATCTCTCAAGAACAAGCTCGTGAGTCTCTCATTGCTAACGCCTATACTTC
ACCAGAGGAGGTTGAAGAGTCTCTAACGCCCTCAGATGTGAAACCTGTCGTCCCCACCAC
AAACGGAGTCTCCAAAACAAACTCTGAAGCTGCGGAAAAGCTCAGATCTGAGCTGATCTC
CATCTCCTACGACGAGTCACCGTCCCCCTCACCTGATGTATCTGTTTCTCCGACCTTGCC
CAACGGTGTCTGATAGCAGTAACTGTACAGATCAAAGTGTGTTCCTTATCCATGCATACA
ACTTTGGTTTGGTGATATCTTAATGTTTTCTTTCATCTAACTGTATGAAAGTTTTTCTTG
TTTGTGTTGTTTTAAAGTTAAAAGCTCTCTTGAGTCTTATTTGAATG

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 2

CO CL3790Contig1 657 2 1 U
GGATCATCGAGAAAGAGAAAGAAAGATAGAGAGATAAATGGTGAAGGCACGTACCGTGGG
TGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACGGCGGAGAATCT
CCTTGACGATGGAGATACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACGCTGGGCACAC
CCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGGAATTTAGAGA
GGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTGATGTTCTTGA
TACTCTTTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGGGAGATCCAAG
AGAGAAACTTTGTGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTCTTGGCAGTCG
AGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATGTGGTGACAAA
TGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCTTCAAAATTTG
GAACCAGCGTGTGGAATGTGTGAACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCCATACATTAGT
CTTTCAATAAACTAAAGTTAAATGAAATCTGTAGTTATCAATTGTCACTTGTTCTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AR24JQ C 1
AF RR2AR24TF U 1
BS 1 657 RR2AR24TF

RD RR2AR24JQ 657 0 0
GGATCATCGAGAAAGAGAAAGAAAGATAGAGAGATAAATGGTGAAGGCACGTACCGTGGG
TGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACGGCGGAGAATCT
CCTTGACGATGGAGATACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACGCTGGGCACAC
CCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGGAATTTAGAGA
GGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTGATGTTCTTGA
TACTCTTTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGGGAGATCCAAG
AGAGAAACTTTGTGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTCTTGGCAGTCG
AGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATGTGGTGACAAA
TGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCTTCAAAATTTG
GAACCAGCGTGTGGAATGTGTGAACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCCATACATTAGT
CTTTCAATAAACTAAAGTTAAATGAAATCTGTAGTTATCAATTGTCACTTGTTCTAT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2AR24TF 657 0 0
GGATCATCGAGAAAGAGAAAGAAAGATAGAGAGATAAATGGTGAAGGCACGTACCGTGGG
TGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACGGCGGAGAATCT
CCTTGACGATGGAGATACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACGCTGGGCACAC
CCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGGAATTTAGAGA
GGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTGATGTTCTTGA
TACTCTTTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGGGAGATCCAAG
AGAGAAACTTTGTGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTCTTGGCAGTCG
AGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATGTGGTGACAAA
TGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCTTCAAAATTTG
GAACCAGCGTGTGGAATGTGTGAACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCCATACATTAGT
CTTTCAATAAACTAAAGTTAAATGAAATCTGTAGTTATCAATTGTCACTTGTTCTAT

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL3791Contig1 1132 2 2 U
GGATTCGATTTAGGGTTTCTATAGCTCCTCTCTATTTTTCCTTCTCCCAAATTTCCCCAA
ATTAATTCTCTTTTACAAGAAAATTTTTAATTTCCTCAATTCCGAAACCCAAAAGTGAAT
TCTGATCTTCTGGGATCCTTTTCGTTTCCTTGAGACATTCTTTCCGAAACTTTTATTTCA
ACCGGGACAGTCACCTTAGCCGGCGATTGTTAGGCTAATTTATCATCCGGTCAGTGAAGT
TGATAAAAAAAAAGAATGGAGGGGATTACTACTCAACATACACCACGAACTGTGGAAGAG
GTATTTATCGACTTCAGAGGTAGACGAGCTGGTCTCATTAAGGCTCTCACTATCGATATG
GTGAAGTTTCACCAAACGTGCGATCCTGAGAAGGAGAACTTGTCTCTGTATGGACTTCCA
AATGAGACATGGGAGGTTAATCTTCCCGTGGAGGAAGTTCCTCCCGAGCTTCCTGAACCA
GCTCTAGGCATCAATTTCGCTAGAGACGGCATGCAAGAAAAGGACTGGGTCTCTTTGGTC
GCTGTTCACAGTGATTCCTGGCTGCTTTCTGTTGCCTTCTACTTTGGTGCACGTTTCGGT
TTTGGTAAGAATGATAGGAAGAGACTCTTCCAGATGATAAACGATCTCCCAACCATTTTC
GAGGTTGTGATGGGCAATGCTAAGCAATCCAAAGATCATTCTGGTACCAACAACAATAAT
AGCAAAAGCAAACCTAGCGGCTTGAAGGTTTCGAAGATGTCATCTCCACCGCCTAAAGAA
GAAGATGAGAGTGAAGACGAGGAGGACGAAGAAGAACAAGGTGCGGTTTGTGGCGCCTGT
GGAGACAACAACGGTACAGATGAGTTTTGGATATGCTGCGACGCGTGTGAGAAATGGTTC
CATGGAAAATGTGTCCAGATAACACCTGCAAAAGCAGAGCACATCAAGCACTACAAGTGC
CCAAGTTGCACTAACAAGAGAGCCAGACCTTGATGTTACTTAAACAACCAGAAGAAAAAG
AAAAAAAAGGTTAAAGTCAGATGAATTTTCTTCTTGTTAATGTCAATACTACAAATACTA
ATGTTATATTTGAGGTTCCTTTTCGTCTACGGTAATTGTTGTTTTTGGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B270TF U 1
AF RR2B270JQ C 390
BS 1 587 RR2B270TF
BS 588 1132 RR2B270JQ

RD RR2B270TF 587 0 0
GGATTCGATTTAGGGTTTCTATAGCTCCTCTCTATTTTTCCTTCTCCCAAATTTCCCCAA
ATTAATTCTCTTTTACAAGAAAATTTTTAATTTCCTCAATTCCGAAACCCAAAAGTGAAT
TCTGATCTTCTGGGATCCTTTTCGTTTCCTTGAGACATTCTTTCCGAAACTTTTATTTCA
ACCGGGACAGTCACCTTAGCCGGCGATTGTTAGGCTAATTTATCATCCGGTCAGTGAAGT
TGATAAAAAAAAAGAATGGAGGGGATTACTACTCAACATACACCACGAACTGTGGAAGAG
GTATTTATCGACTTCAGAGGTAGACGAGCTGGTCTCATTAAGGCTCTCACTATCGATATG
GTGAAGTTTCACCAAACGTGCGATCCTGAGAAGGAGAACTTGTCTCTGTATGGACTTCCA
AATGAGACATGGGAGGTTAATCTTCCCGTGGAGGAAGTTCCTCCCGAGCTTCCTGAACCA
GCTCTAGGCATCAATTTCGCTAGAGACGGCATGCAAGAAAAGGACTGGGTCTCTTTGGTC
GCTGTTCACAGTGATTCCTGGCTGCTTTCTGTTGCCTTCTACTTTGG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2B270JQ 743 0 0
GAAGGAGAACTTGTCTCTGTATGGACTTCCAAATGAGACATGGGAGGTTAATCTTCCCGT
GGAGGAAGTTCCTCCCGAGCTTCCTGAACCAGCTCTAGGCATCAATTTCGCTAGAGACGG
CATGCAAGAAAAGGACTGGGTCTCTTTGGTCGCTGTTCACAGTGATTCCTGGCTGCTTTC
TGTTGCCTTCTACTTTGGTGCACGTTTCGGTTTTGGTAAGAATGATAGGAAGAGACTCTT
CCAGATGATAAACGATCTCCCAACCATTTTCGAGGTTGTGATGGGCAATGCTAAGCAATC
CAAAGATCATTCTGGTACCAACAACAATAATAGCAAAAGCAAACCTAGCGGCTTGAAGGT
TTCGAAGATGTCATCTCCACCGCCTAAAGAAGAAGATGAGAGTGAAGACGAGGAGGACGA
AGAAGAACAAGGTGCGGTTTGTGGCGCCTGTGGAGACAACAACGGTACAGATGAGTTTTG
GATATGCTGCGACGCGTGTGAGAAATGGTTCCATGGAAAATGTGTCCAGATAACACCTGC
AAAAGCAGAGCACATCAAGCACTACAAGTGCCCAAGTTGCACTAACAAGAGAGCCAGACC
TTGATGTTACTTAAACAACCAGAAGAAAAAGAAAAAAAAGGTTAAAGTCAGATGAATTTT
CTTCTTGTTAATGTCAATACTACAAATACTAATGTTATATTTGAGGTTCCTTTTCGTCTA
CGGTAATTGTTGTTTTTGGTCCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL3792Contig1 446 2 1 U
GGATGAAACTGATGAATATGTTGACGTACATAAAAGGATTCGAGTAGCAGCAGCTGCTGC
CGCCTCATCAATAGCTCGAGCTCCTTCAAGCAGGAGACTGATTGCACAAAAGGGAGCTGG
TGGTGGACAAAATAGGCAAGCGCAGACGACAAAAGGTTCTTCTCAAGAACAGGATAAAAT
GGTTGGGACTGTTGAGGGAAAGCAACCGGTATAATGGATGTTGTGTCGTTGCTTGAAGGG
GTAAAGCTCTAGTTTGCTGTTATAAGAAAGGAACATAGAATAAAGTAAAGATCCAAGTCT
TGACCACGTTCTGTTCCATTGGAAAATTCATCATATAAGAGATGGTTCGTCCCAGTTTTT
GCTCTACAAGTGCGTACAATTTGTATTATACTCCCTCTCCACTTATTCTTTTATACGTGT
GTGTGTTTAATTGAGATATTTCTACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AS79JQ C 1
AF RR2AS79TF U 1
BS 1 446 RR2AS79TF

RD RR2AS79JQ 446 0 0
GGATGAAACTGATGAATATGTTGACGTACATAAAAGGATTCGAGTAGCAGCAGCTGCTGC
CGCCTCATCAATAGCTCGAGCTCCTTCAAGCAGGAGACTGATTGCACAAAAGGGAGCTGG
TGGTGGACAAAATAGGCAAGCGCAGACGACAAAAGGTTCTTCTCAAGAACAGGATAAAAT
GGTTGGGACTGTTGAGGGAAAGCAACCGGTATAATGGATGTTGTGTCGTTGCTTGAAGGG
GTAAAGCTCTAGTTTGCTGTTATAAGAAAGGAACATAGAATAAAGTAAAGATCCAAGTCT
TGACCACGTTCTGTTCCATTGGAAAATTCATCATATAAGAGATGGTTCGTCCCAGTTTTT
GCTCTACAAGTGCGTACAATTTGTATTATACTCCCTCTCCACTTATTCTTTTATACGTGT
GTGTGTTTAATTGAGATATTTCTACC

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR2AS79TF 446 0 0
GGATGAAACTGATGAATATGTTGACGTACATAAAAGGATTCGAGTAGCAGCAGCTGCTGC
CGCCTCATCAATAGCTCGAGCTCCTTCAAGCAGGAGACTGATTGCACAAAAGGGAGCTGG
TGGTGGACAAAATAGGCAAGCGCAGACGACAAAAGGTTCTTCTCAAGAACAGGATAAAAT
GGTTGGGACTGTTGAGGGAAAGCAACCGGTATAATGGATGTTGTGTCGTTGCTTGAAGGG
GTAAAGCTCTAGTTTGCTGTTATAAGAAAGGAACATAGAATAAAGTAAAGATCCAAGTCT
TGACCACGTTCTGTTCCATTGGAAAATTCATCATATAAGAGATGGTTCGTCCCAGTTTTT
GCTCTACAAGTGCGTACAATTTGTATTATACTCCCTCTCCACTTATTCTTTTATACGTGT
GTGTGTTTAATTGAGATATTTCTACC

QA 1 446 1 446
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3794Contig1 642 2 4 U
GAAAAGATAAAATAGCTGAAGCCTGTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTT
CAACACACTCTCGTTTCGTTCCAAGAAAGCCATTCAATTGATGGAAAAACCGATTGGAGA
GAGGGATGGGTCAAGAGGCTCCTCTTGTAGGCAGTGGAGCGAGTGGCAATTACTGGATTC
CATTTTACCAACAGGAGGCTTCGCTCATTCCTTGGGTCTCGAAGCATCCGTTCAGACACG
GTTAGTTTCGTCTCCAACAGATCTGGAAACCCACATCACCCATCTCCTGGACAACACAGC
CAGCTTACTCCTCCCTTTCGTCTACTCTTCCCACAAATCTCCCGACACAGAGACATGGCA
AAAACTCGATCTACTCCTCGACGCGACCTTAACAAACCAAGTCTCCTCAAAGGCATCCAT
CTCCCAAGGATCAGCCTTGTTCCGCGTAGCTGCTTCTGTCTTCACCGAGATGTTGTCTCG
GCTGCGACGAGGTTGAACTTAGTGGGACCCATGGGTGCTTCGGTGATGCAGCATCGTATC
GCTGCGGTTGTGGGTGAAACCGTTTTGGAGAAGTGGGGATCGTGATGCTGGTGAGGCGTG
TCAGACGTCTCCGTTGCTGGATGTTGTGCAAGTTGTCACGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV49TF U 1
AF RR2C491TF U 12
BS 1 342 RR2GV49TF
BS 343 343 RR2C491TF
BS 344 471 RR2GV49TF
BS 472 642 RR2C491TF

RD RR2GV49TF 480 0 0
GAAAAGATAAAATAGCTGAAGCCTGTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTT
CAACACACTCTCGTTTCGTTCCAAGAAAGCCATTCAATTGATGGAAAAACCGATTGGAGA
GAGGGATGGGTCAAGAGGCTCCTCTTGTAGGCAGTGGAGCGAGTGGCAATTACTGGATTC
CATTTTACCAACAGGAGGCTTCGCTCATTCCTTGGGTCTCGAAGCATCCGTTCAGACACG
GTTAGTTTCGTCTCCAACAGATCTGGAAACCCACATCACCCATCTCCTGGACAACACAGC
CAGCTTACTCCTCCCTTTCGTCTACTCTTCCCACAAATCTCCTGACACAGAGACATGGCA
AAAACTCGATCTACTCCTCGACGCGACCTTAACAAACCAAGTCTCCTCAAAGGCATCCAT
CTCCCAAGGATCAGCCTTGTTCCGCGTAGCTGCTTCTGTCTTCACCGAGAT
CCCATCTCT

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR2C491TF 631 0 0
GG
AGCTGAAGCCTGTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTTCAACACACTCTCG
TTTCGTTTCAAGAAAGCCATTCAATTGATGGAAAAACCGATTGGAGAGAGGGATGGGTCA
AGAGGCTCCTCTTGTAGGCAGTGGAGCGAGTGGCAATTACTGGATTCCATTTTACCAACA
GGAGGCTTCGCTCATTCCTTGGGTCTCGAAGCATCCGTTCAGACACGGTTAGTTTCGTCT
CCAACAGATCTGGAAACCCACATCATCCATCTCCTGGACAACACAGCCAGCTTACTCCTC
CCTTTCGTCTACTCTTCCCACAAATCTCCCGACACAGAGACATGGCAAAAACTCGATCTA
CTCCTCGACGCGACCTTAACAAACCAAGTCTCCTCAAAGGCATCCATCTCCCAAGGATCA
GCCTTGTTCCGCGTAGCTGCTTCTGTCTTCACCGAGATGTTGTCTCGGCTGCGACGAGGT
TGAACTTAGTGGGACCCATGGGTGCTTCGGTGATGCAGCATCGTATCGCTGCGGTTGTGG
GTGAAACCGTTTTGGAGAAGTGGGGATCGTGATGCTGGTGAGGCGTGTCAGACGTCTCCG
TTGCTGGATGTTGTGCAAGTTGTCACGGT

QA 3 631 3 631
DS 



AS 1 2

CO CL3795Contig1 772 2 3 U
GCAGCTGATGGAGTGACATTTCACAAGTCTTGCTTCAAATGCTCTCACTGCAAAACCACT
CTGCAACTGAGCAATTACTCATCAATGGAAGGAGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTTTGAG
CAGCTGTTCAAGGAGACTGGTAGCTTCAACAAGAACTTTCAGTCACCTGCAAAGCCATTA
ACTGACAAGCCAGCTCCTGAGCTGACAAGGACACCTAGCCGAGTTGCTGGAATGTTCTCT
GGAACTCAAGATAAATGCGCTACTTGCAATAAAACCGTGTACCCTATCGAAAAGGTGACT
GTGGAGAGCCAGTGTTACCATAAGTCCTGCTTCAAATGTTCACATGGAGGCTGTGCGCTT
TCTCCATCCAACTATGCAGCTCTCGAGGGGATATTGTACTGCAAACACCATTTCGCTCAG
CTTTTCAAGGAGAAGGGAAGTTACAATCACCTCATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCT
GCTGCTGCCGCTACTGCTGAAGCTGCTGCTGCTGTCGAAGCTGTACCTGAATCTTAAAAA
TTTGAAATTCTCCAACCAGTGTCAACTTTTAAAAAGGGCTACTACCAAACTGGTTTCACT
TTGCCTTGGTGTATGTGATATGTTTGTTTTACTTGTATTCATTCACTTCTTCATGTTCTT
GTCTTCCAAAATGAACCCGGCCTTCTCGTTGTGTAAACTACTTGGCTTAGTCTGGTCTAT
GGTCGGTTCCCTCTTGACCGGACCGGTATAAAAAGAATCTGACTTTCATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW86TFB U 217
AF RR2AW86JQ C 1
BS 1 216 RR2AW86JQ
BS 217 662 RR2AW86TFB
BS 663 772 RR2AW86JQ

RD RR2AW86TFB 446 0 0
AGCCGAGTTGCTGGAATGTTCTCTGGAACTCAAGATAAATGCGCTACTTGCAATAAAACC
GTGTACCCTATCGAAAAGGTGACTGTGGAGAGCCAGTGTTACCATAAGTCCTGCTTCAAA
TGTTCACATGGAGGCTGTGCGCTTTCTCCATCCAACTATGCAGCTCTCGAGGGGATATTG
TACTGCAAACACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAGAAGGGAAGTTACAATCACCTCATC
AAATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCTGCTGCCGCTACTGCTGAAGCTGCTGCTGCTGTC
GAAGCTGTACCTGAATCTTAAAAATTTGAAATTCTCCAACCAGTGTCAACTTTTAAAAAG
GGCTACTACCAAACTGGTTTCACTTTGCCTTGGTGTATGTGATATGTTTGTTTTACTTGT
ATTCATTCACTTCTTCATGTTCTTGT

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR2AW86JQ 772 0 0
GCAGCTGATGGAGTGACATTTCACAAGTCTTGCTTCAAATGCTCTCACTGCAAAACCACT
CTGCAACTGAGCAATTACTCATCAATGGAAGGAGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTTTGAG
CAGCTGTTCAAGGAGACTGGTAGCTTCAACAAGAACTTTCAGTCACCTGCAAAGCCATTA
ACTGACAAGCCAGCTCCTGAGCTGACAAGGACACCTAGCCGAGTTGCTGGAATGTTCTCT
GGAACTCAAGATAAATGCGCTACTTGCAATAAAACCGTGTACCCTATCGAAAAGGTGACT
GTGGAGAGCCAGTGTTACCATAAGTCCTGCTTCAAATGTTCACATGGAGGCTGTGCGCTT
TCTCCATCCAACTATGCAGCTCTCGAGGGGATATTGTACTGCAAACACCATTTCGCTCAG
CTTTTCAAGGAGAAGGGAAGTTACAATCACCTCATCAAATCTGCTTCCATCAAACGCTCT
GCTGCTGCCGCTACTGCTGAAGCTGCTGCTGCTGTCGAAGCTGTACCTGAATCTTAAAAA
TTTGAAATTCTCCAACCAGTGTCAACTTTTAAAAAGGGCTACTACCAAACTGGTTTCACT
TTGCCTTGGTGTATGTGATATGTTTGTTTTACTTGTATTCATTCACTTCTTCATGTTCTT
GTCTTCCAAAATGAACCCGGCCTTCTCGTTGTGTAAACTACTTGGCTTAGTCTGGTCTAT
GGTCGGTTCCCTCTTGACCGGACCGGTATAAAAAGAATCTGACTTTCATGTC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL3796Contig1 488 2 2 U
GTCTCTGAGATTGGGGAGCTCAAACGTTATGCGATTCATTTTGATAAAAATGGGCGTCCA
ACTGGCACAGCGGAAGTAGTGTATCCAAGAAGAGGTGATGCAATTCAAGCTCTGAAGAAA
TACAACAATGTGTTGTTGGATGGAAGGCCAATGAGACTTGAGATTTCGTGGTGGTAGAGG
GCGAGGTGGACGTGGTCGTGGTGGTGGTGGTGGAAGAGGGAATGGGAAGAAGGCAATGGA
GAAATCTGCTGCTGACCTTGACAAGGATCTTGAGAGCTATCACGCAGATGCCATGAACAC
TTCTTAAAAAGCCTCGAAAGAGAATTCAATGTTTGTTTGTTACTACTTAGGCTTGTGTGT
TTGTTTGTACCAAGTAAGTACGTAGTTACAGTGTTTGAGATATGATGTGGTGTGCTCTTT
GTTTCCAGTGATTTTAGTTTTGTTCGGTGGTTGGCACTAGTGTTAAGTAAGTGAGGAATG
TTTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2AP37TF U 1
AF RR2AP37JQ C 306
BS 1 487 RR2AP37TF
BS 488 488 RR2AP37JQ

RD RR2AP37TF 487 0 0
GTCTCTGAGATTGGGGAGCTCAAACGTTATGCGATTCATTTTGATAAAAATGGGCGTCCA
ACTGGCACAGCGGAAGTAGTGTATCCAAGAAGAGGTGATGCAATTCAAGCTCTGAAGAAA
TACAACAATGTGTTGTTGGATGGAAGGCCAATGAGACTTGAGATTTCGTGGTGGTAGAGG
GCGAGGTGGACGTGGTCGTGGTGGTGGTGGTGGAAGAGGGAATGGGAAGAAGGCAATGGA
GAAATCTGCTGCTGACCTTGACAAGGATCTTGAGAGCTATCACGCAGATGCCATGAACAC
TTCTTAAAAAGCCTCGAAAGAGAATTCAATGTTTGTTTGTTACTACTTAGGCTTGTGTGT
TTGTTTGTACCAAGTAAGTACGTAGTTACAGTGTTTGAGATATGATGTGGTGTGCTCTTT
GTTTCCAGTGATTTTAGTTTTGTTCGGTGGTTGGCACTAGTGTTAAGTAAGTGAGGAATG
TTTGTTT

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR2AP37JQ 183 0 0
AAAAAGCCTCGAAAGAGAATTCAATGTTTGTTTGTTACTACTTAGGCTTGTGTGTTTGTT
TGTACCAAGTAAGTACGTAGTTACAGTGTTTGAGATATGATGTGGTGTGCTTTTTGTTTC
CAGTGATTTTAGTTTTGTTCGGTGGTTGGCACTAGTGTTAAGTAAGTGAGGAATGTTTGT
TTC

QA 1 183 1 183
DS 



AS 1 2

CO CL3797Contig1 764 2 3 U
GTAAACAGCCTGCAATGAGCTTATGCAGATCATTATTCATTGGAACTGTCTCACAACTAA
AGGCTAAAAACACAATTCAACAATTAAAAAAAAAATTTCAGATTCATGAAGCTATTTGTT
CCAAAACCCACACACAACTCGAGTCTCAAAACTTTTTTTTTTAAATAATAACGGTTAAAA
CAAAAAAGCTCATGACCCCTAGTCCATCTTTATCAATTGTGACCAGTAATATATAAGCAA
AAAAAGGGACACTAAAGCTTCAACTTCTTATTGGGTCTCTTCAACTTGGCATCTTCATCG
ACTATGATCTTATGCTTTTTGTTTTTCCCCTTCTTTTTCTCTTCTTTTTGCTTCTTTGCG
TTTTTCTTTTTCTTTTTGGTAAGCTTAATGTTCTCTATCTTATCTTCATCAGAAGATACC
TCGACGTCTTCAAATGAGGCAACGTGTTGGATTCTTCTTCCTGAACTCGAAGCCCCACTG
GAAATAACGGTGTCTCTGGCGTTTTTGACGGCCAATTCGATAAGATCAGGGTCAATGGAA
GACAACCCATTGGGATCCTGCAGCTTCCGTTCTAGAAACTTGGCTAAAGCAGCCGCCTTG
TTCGTCTTCAAGGGCCCACCTGGATGAGCTAATCTGGGCGGCTTAGAGCGAGAAGTGGAG
GGAAGAGAAGTAAGCGGAGCGAATTTGCTTCCTCTCAGAGCTCTCTTCTCGTCTTCAGTC
AGCTCCTCCACGCCTCCTCCTCCCATTGCAATTTCCGACGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H215JQ U 113
AF RR2H215TF C 1
BS 1 114 RR2H215TF
BS 115 396 RR2H215JQ
BS 397 764 RR2H215TF

RD RR2H215JQ 284 0 0
TT
TTTGTTCCAAAACCCACACACAACTCGAGTCTCAAAACTTTTTTTTTTAAATAATAACGG
TTAAAACAAAAAAGCTCATGACCCCTAGTCCATCTTTATCAATTGTGACCAGTAATATAT
AAGCAAAAAAAGGGACACTAAAGCTTCAACTTCTTATTGGGTCTCTTCAACTTGGCATCT
TCATCGACTATGATCTTATGCTTTTTGTTTTTCCCCTTCTTTTTCTCTTCTTTTTGCTTC
TTTGCGTTTTTCTTTTTCTTTTTGGTAAGCTTAATGTTCTCT

QA 3 284 3 284
DS 

RD RR2H215TF 764 0 0
GTAAACAGCCTGCAATGAGCTTATGCAGATCATTATTCATTGGAACTGTCTCACAACTAA
AGGCTAAAAACACAATTCAACAATTAAAAAAAAAATTTCAGATTCATGAAGCTATTTGTT
CCAAAACCCACACACAACTCGAGTCTCAGAACTTTTTTTTTTAAATAATAACGGTTAAAA
CAAGAAAGCTCATGACCCCTAGTCCATCTTTATCAATTGTGACCAGTAATATATAAGCAA
AAAAAGGGACACTAAAGCTTCAACTTCTTATTGGGTCTCTTCAACTTGGCATCTTCATCG
ACTATGATCTTATGCTTTTTGTTTTTCCTCTTCTTTTTCTCTTCTTTTTGCTTCTTTGCG
TTTTTCTTTTTCTTTTTGGTAAGCTTAATGTTCTCTATCTTATCTTCATCAGAAGATACC
TCGACGTCTTCAAATGAGGCAACGTGTTGGATTCTTCTTCCTGAACTCGAAGCCCCACTG
GAAATAACGGTGTCTCTGGCGTTTTTGACGGCCAATTCGATAAGATCAGGGTCAATGGAA
GACAACCCATTGGGATCCTGCAGCTTCCGTTCTAGAAACTTGGCTAAAGCAGCCGCCTTG
TTCGTCTTCAAGGGCCCACCTGGATGAGCTAATCTGGGCGGCTTAGAGCGAGAAGTGGAG
GGAAGAGAAGTAAGCGGAGCGAATTTGCTTCCTCTCAGAGCTCTCTTCTCGTCTTCAGTC
AGCTCCTCCACGCCTCCTCCTCCCATTGCAATTTCCGACGGCCC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL3798Contig1 959 2 2 U
GGAACCATTTCTTTCTTTCAATGACTTTCCTCTTATCAAAAACATTTGTCTCTCTCACAC
TACTCAGACCTTCCTCTTCGATTTCCATGGCGAATCTCACCACCAACGCCTCCAAATCTC
GCCTGAGAGGCGTCGTATTCGACATGGACGGAACTCTGACGGTTCCGGTCATCGATTTCG
CGGCAATGTACAGGTCCGTCCTCGGCGAAGACGAGTACAAGCGAATCAAGGCGGAGAGCC
CTACCGGAATCGATATTCTTCACCACATCGAGTCGTGGAGCGTCGATAAACAGCAGAAGG
CCTATGAAACCATCGCTGATTACGAGAAACAGGGAATCGATAAGCTCCAAATCATGCCCG
GTACTGCTGAGCTATGTGGCTTTCTTGACTCCAAAAAGATAAAGAGGGGGCTGATTACAC
GAAATGTTAAGAAGGCGATCGACATCTTCCACCAACGTTTTGAGGTTATATTTACTCCGG
CACTAGGCAGAGAGTTTCGTCCATATAAACCAAACCCAGATCCGCTGTTACATATATGTT
CTACCTGGGACGTCCCACCTAGCGAAGTAATGATGGTTGGTGACAGTTTAAAAGATGATA
TAGCATGTGGGAAAGCAGCTGGAGCCTTCACATGTTTGCTAGATGAATCCGGAAGGTATG
GAGCAGATGATTTCTCTGTCACCGGGCTGCATCCTGATTTCAAGGTTGATTCCCTGTCCA
AAATTCACAACATATTGGAGACAAACTTCGACCTGAGCCCATAGCTTTTTTTCTTTCCAA
GTTCCTCGTCTTGTAGTCTCAGTGACCAAAATAGTCTCTTATTCAACAACACAAAGGCAG
CAGAATTACACTATTGTAAGAGAGATAATGCCATTACAGAGTATTTATTCAGGCTAGCCA
TAAAATACAAAATGACATAGTTGTCTAGTAAATCCAAGATTTCTATTTTTTTTTTGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO72TF U 1
AF RR2BO72JQ C 201
BS 1 651 RR2BO72TF
BS 652 959 RR2BO72JQ

RD RR2BO72TF 651 0 0
GGAACCATTTCTTTCTTTCAATGACTTTCCTCTTATCAAAAACATTTGTCTCTCTCACAC
TACTCAGACCTTCCTCTTCGATTTCCATGGCGAATCTCACCACCAACGCCTCCAAATCTC
GCCTGAGAGGCGTCGTATTCGACATGGACGGAACTCTGACGGTTCCGGTCATCGATTTCG
CGGCAATGTACAGGTCCGTCCTCGGCGAAGACGAGTACAAGCGAATCAAGGCGGAGAGCC
CTACCGGAATCGATATTCTTCACCACATCGAGTCGTGGAGCGTCGATAAACAGCAGAAGG
CCTATGAAACCATCGCTGATTACGAGAAACAGGGAATCGATAAGCTCCAAATCATGCCCG
GTACTGCTGAGCTATGTGGCTTTCTTGACTCCAAAAAGATAAAGAGGGGGCTGATTACAC
GAAATGTTAAGAAGGCGATCGACATCTTCCACCAACGTTTTGAGGTTATATTTACTCCGG
CACTAGGCAGAGAGTTTCGTCCATATAAACCAAACCCAGATCCGCTGTTACATATATGTT
CTACCTGGGACGTCCCACCTAGCGAAGTAATGATGGTTGGTGACAGTTTAAAAGATGATA
TAGCATGTGGGAAAGCAGCTGGAGCCTTCACATGTTTGCTAGATGAATCCG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2BO72JQ 759 0 0
CTCGGCGAAGACGAGTACAAGCGAATCAAGGCGGAGAGCCCTACCGGAATCGATATTCTT
CACCACATCGAGTCGTGGAGCGTCGATAAACAGCAGAAGGCCTATGAAACCATCGCTGAT
TACGAGAAACAGGGAATCGATAAGCTCCAAATCATGCCCGGTACTGCTGAGCTATGTGGC
TTTCTTGACTCCAAAAAGATAAAGAGGGGGCTGATTACACGAAATGTTAAGAAGGCGATC
GACATCTTCCACCAACGTTTTGAGGTTATATTTACTCCGGCACTAGGCAGAGAGTTTCGT
CCATATAAACCAAACCCAGATCCGCTGTTACATATATGTTCTACCTGGGACGTCCCACCT
AGCGAAGTAATGATGGTTGGTGACAGTTTAAAAGATGATATAGCATGTGGGAAAGCAGCT
GGAGCCTTCACATGTTTGCTAGATGAATCCGGAAGGTATGGAGCAGATGATTTCTCTGTC
ACCGGGCTGCATCCTGATTTCAAGGTTGATTCCCTGTCCAAAATTCACAACATATTGGAG
ACAAACTTCGACCTGAGCCCATAGCTTTTTTTCTTTCCAAGTTCCTCGTCTTGTAGTCTC
AGTGACCAAAATAGTCTCTTATTCAACAACACAAAGGCAGCAGAATTACACTATTGTAAG
AGAGATAATGCCATTACAGAGTATTTATTCAGGCTAGCCATAAAATACAAAATGACATAG
TTGTCTAGTAAATCCAAGATTTCTATTTTTTTTTTGGAT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL3799Contig1 667 2 2 U
GGGTCATCAGATTCCCTCACCCTACCCGACGCTTCTTCTTCTTCAGATTCTCTCTTTTAT
TAGGGTTACCGATTATCAGCGATCAAAAGTCGATGGCTTCTCTCGATTCAGACGTGAACA
TGGTTCCCGCAGGAGAACCCTCAGCCCCTTCGTCGTCGTCTGCGAAGAAGGCGAAGAGAT
TCGAAGTGAAGAAGTGGAGTGCCGTGGCTCTCTGGGCTTGGGATATCGTTGTTGATAATT
GCGCCATCTGCAGAAACCACATCATGGATCTCTGCATTGAATGTCAGGCTAATCAGGCTA
GTGCGACGAGTGAGGAATGCACTGTTGCTTGGGGGGTTTGCAACCACGCCTTCCACTTTC
ACTGCATCAGCAGATGGCTAAAGACTCGTCAAGTTTGTCCATTAGATAACAGTGAGTGGG
AGTTCCAGAAGTATGGTCACTAAACCATCCTATCGTACCAGCTAAATATGTGTCCAATCA
AAGATATCAGGGTCATTTGGTTGCCGCATATGAGATGCTGATATCGCTCAAAGTTCTTTT
GTTTTTTTTTTTTTTAATTTGGTTTGTCGCAAGTTGTCAAAACAGAGATATTACTCTTCA
CTGAACCTATTATGTTTTGCTTTGGGCGATGTCTTTAATTTCAAGAAAATATATAGTTAC
TGCGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK48TF U 1
AF RR2GK48JQ C 159
BS 1 581 RR2GK48TF
BS 582 667 RR2GK48JQ

RD RR2GK48TF 581 0 0
GGGTCATCAGATTCCCTCACCCTACCCGACGCTTCTTCTTCTTCAGATTCTCTCTTTTAT
TAGGGTTACCGATTATCAGCGATCAAAAGTCGATGGCTTCTCTCGATTCAGACGTGAACA
TGGTTCCCGCAGGAGAACCCTCAGCCCCTTCGTCGTCGTCTGCGAAGAAGGCGAAGAGAT
TCGAAGTGAAGAAGTGGAGTGCCGTGGCTCTCTGGGCTTGGGATATCGTTGTTGATAATT
GCGCCATCTGCAGAAACCACATCATGGATCTCTGCATTGAATGTCAGGCTAATCAGGCTA
GTGCGACGAGTGAGGAATGCACTGTTGCTTGGGGGGTTTGCAACCACGCCTTCCACTTTC
ACTGCATCAGCAGATGGCTAAAGACTCGTCAAGTTTGTCCATTAGATAACAGTGAGTGGG
AGTTCCAGAAGTATGGTCACTAAACCATCCTATCGTACCAGCTAAATATGTGTCCAATCA
AAGATATCAGGGTCATTTGGTTGCCGCATATGAGATGCTGATATCGCTCAAAGTTCTTTT
GTTTTTTTTTTTTTTAATTTGGTTTGTCGCAAGTTGTCAAA

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2GK48JQ 509 0 0
TCTGCGAAGAAGGCGAAGAGATTCGAAGTGAAGAAGTGGAGTGCCGTGGCTTTCTGGGCT
TGGGATATCGTTGTTGATAATTGCGCCATCTGCAGAAACCACATCATGGATCTCTGCATT
GAATGTCAGGCTAATCAGGCTAGTGCGACGAGTGAGGAATGCACTGTTGCTTGGGGGGTT
TGCAACCACGCCTTCCACTTTCACTGCATCAGCAGATGGCTAAAGACTCGTCAAGTTTGT
CCATTAGATAACAGTGAGTGGGAGTTCCAGAAGTATGGTCACTAAACCATCCTATCGTAC
CAGCTAAATATGTGTCCAATCAAAGATATCAGGGTCATTTGGTTGCCGCATATGAGATGC
TGATATCGCTCAAAGTTCTTTTGTTTTTTTTTTTTTTAATTTGGTTTGTCGCAAGTTGTC
AAAACAGAGATATTACTCTTCACTGAACCTATTATGTTTTGCTTTGGGCGATGTCTTTAA
TTTCAAGAAAATATATAGTTACTGCGGAG

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 2

CO CL3800Contig1 1064 2 6 U
GCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGG
TAGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACG
AGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTACGTGGAGGCATCCCTTCACGGCCGGCTTCTTAGAGG
GACTATGGCCGTTTCGGCCGGGGGATTCACGGCCAATCCTCGCTCTCTGTCTCTCTCTCC
ATCGCTGAGGCCAGTGTACCGACTCCGAGTAGCGTAAACCCCAGCGACTGCATCAATGGT
CTAGATTCAACTGGATCGTTTCGTGGTTTTATCAGAGGGAGGTGACACTTTGTTGAGTAT
TTGTAGAATACAAATTCAAACACCAAATGGATTCAGACTTCGATGATGAACCTGCTGCAC
CTGCAGCTAGGGCTGGTGCAAGGTTTAAGCCGAGAGGGAGACCACAACCCAAGAAGAAGC
AAGTCTCTATCTCTACCTCACAGACAACAACACTCTCTTCTGATGCTGCTGCCAAGGAGA
CACTCTCCACACAAGGCAAAGATTCATCATCATCAACTTATCCCAGCAATGTTTCAACTT
CCGAGACTATTGTTGTCCCTGATGGTGGTGGAACCATTAGCCAATCCACCATGGGAACTA
TATCTAAAGAGAATTTAGATGTATTCTCAGGAGTTTCTGTTCTTCGTGCTTGTACTAACG
TAAATTCTCAGGAGGCGGCACCTGCATGTCCTGATGATGACCCTAGAAGACAAGATTCTG
CAACGTTTGGAGATTTTGTTACTAGTGAAACTGATGAAGTTATTAATGCTGAAACTCAAA
GGATGCAAACAGGGGAAGAAGGAGAAGAATGTCATTGGAACATGGAAACTCTTGATATTG
TACAGGAGGAAAGCATCACCAGTACTTATGAGCAACATACTGGAAAGTTCCAACCAAAGC
CTAGACTGCTCGACACTGTGATTGAAGAGACCAGTGTCTCATTACTCTGTTGATGATACA
TGGATGCAGCTAACAGTCTGAGTTATGGTCATGAGATCAGAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW71TF U 1
AF RR2FE61TF U 260
BS 1 358 RR2EW71TF
BS 359 360 RR2FE61TF
BS 361 690 RR2EW71TF
BS 691 691 RR2FE61TF
BS 692 727 RR2EW71TF
BS 728 1064 RR2FE61TF

RD RR2EW71TF 727 0 0
GCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGG
TAGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACG
AGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTACGTGGAGGCATCCCTTCACGGCCGGCTTCTTAGAGG
GACTATGGCCGTTTCGGCCGGGGGATTCACGGCCAATCCTCGCTCTCTGTCTCTCTCTCC
ATCGCTGAGGCCAGTGTACCGACTCCGAGTAGCGTAAACCCCAGCGACTGCATCAATGGT
CTAGATTCAACTGGATCGTTTCGTGGTTTTATCAGAGGGAGGTGACACTTTGTTGAGT**
TTGTAGAATACAAATTCAAACACCAAATGGATTCAGACTTCGATGATGAACCTGCTGCAC
CTGCAGCTAGGGCTGGTGCAAGGTTTAAGCCGAGAGGGAGACCACAACCCAAGAAGAAGC
AAGTCTCTATCTCTACCTCACAGACAACAACACTCTCTTCTGATGCTGCTGCCAAGGAGA
CACTCTCCACACAAGGCAAAGATTCATCATCATCAACTTATCCCAGCAATGTTTCAACTT
CCGAGACTATTGTTGTCCCTGATGGTGGTGGAACCATTAGCCAATCCACCATGGGAACTA
TATCTAAAGAGAATTTAGATGTATTCTCAG*AGTTTCTGTTCTTCGTGCTTGTACTAACG
TAAATTC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2FE61TF 805 0 0
G
GACTCCGAGTAGCGTAAACCCCAGCGACTGCATCAATGGTCTAGATTCAACTGGATCGTT
TCGTGGTTTTATCAGAGGGAGGTGACACTTTGTTGAGTATTTGTAGAATACAAATTCAAA
CATCAAATGGATTCAGACTTCGATGATGAACCTGCTGCACCTGCAGCTAGGGCTGGTGCA
AGGTTTAAGCCGAGAGGGAGACCACAACCCAAGAAGAAGCAAGTCTCTATCTCTACCTCA
CAGACAACAACACTCTCTTCTGATGCTGCTGCCAAGGAGACACTCTCCACACAAGGCAAA
GATTCATCATCATCAACTTATCCCAGCAATGTTTCAACTTCCGAGACTATTGTTGTCCCT
GATGGTGGTGGAACCATTAGCCAATCCACCATGGGAACTATATCTAAAGAGAGTTTAGAT
GTATTCTCAGGAGTTTCTGTTCTTCGTGCTTGTACTAACGTAAATTCTCAGGAGGCGGCA
CCTGCATGTCCTGATGATGACCCTAGAAGACAAGATTCTGCAACGTTTGGAGATTTTGTT
ACTAGTGAAACTGATGAAGTTATTAATGCTGAAACTCAAAGGATGCAAACAGGGGAAGAA
GGAGAAGAATGTCATTGGAACATGGAAACTCTTGATATTGTACAGGAGGAAAGCATCACC
AGTACTTATGAGCAACATACTGGAAAGTTCCAACCAAAGCCTAGACTGCTCGACACTGTG
ATTGAAGAGACCAGTGTCTCATTACTCTGTTGATGATACATGGATGCAGCTAACAGTCTG
AGTTATGGTCATGAGATCAGAACA

QA 2 805 2 805
DS 



AS 1 2

CO CL3801Contig1 798 2 2 U
AGGGGATGGTTTCTTCTTTATCTTCGCTTCCCTTCTCCTTCCTCACTCCCTCCTCTCCCT
CTCTTTGGACTTGCTTTGCTCTGCCCTAAAAACAAAGGAACAGAATACAGAGCACATACA
CTGACAGGATGTTGCTCGGAAAGAGACGACGACCACCGATCAACAGAACAACGAGCCTAT
CGGAGATAAAGTTCGATCTCAACCTTCCCGGAGAATCTGAGGTATCATCAACTCAGCAGA
GTCCAAGCCAAAACACCATGGTTGAACCATACGTTTCCAACGGCCAACTCGTAGCAGCAG
CCGTCGATCGACGGCTCTTAGCTATGGTCTCACCGAGAGGTAACTTAAGGAGACATTCGG
GAGGTTTTTCTGACGCTGGACATTTCTTGAGATCTTGCTCGCTCTGCGAACGCTTACTTG
TTCCTGGCCGCGACATCTATATGTATAGGGGAGATAAGGCATTTTGTAGCTTGGACTGCA
GGCAACAGCAAATAGCACAAGACGAGTTGAAAGATAAAAGTAAACCGGCAAAGGAATCGA
CGGTGGCGACCACCAGCAAAGCCGCCAAGGGAGGGCGAGCGCCAACCGCCGTGTAATCTC
CCATCTTCACGTACATTATATATTGTTATATTTGTTATGTGTGGCTTGCTATGTGTTTGT
ATATTATGATTATAGTGGTGGGGTAAAACATATTAAAGCTTTGAGCGTTAATTGACTTGG
TCAATCCCTCTCGTGTGTTGTGTTGGGATTATATGTTTTTCGAGGGGTTTTTCAGATTTT
AGTACAAGTTTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX29TF U 1
AF RR2CX29JQ C 200
BS 1 664 RR2CX29TF
BS 665 798 RR2CX29JQ

RD RR2CX29TF 672 0 0
AGGGGATGGTTTCTTCTTTATCTTCGCTTCCCTTCTCCTTCCTCACTCCCTCCTCTCCCT
CTCTTTGGACTTGCTTTGCTCTGCCCTAAAAACAAAGGAACAGAATACAGAGCACATACA
CTGACAGGATGTTGCTCGGAAAGAGACGACGACCACCGATCAACAGAACAACGAGCCTAT
CGGAGATAAAGTTCGATCTCAACCTTCCCGGAGAATCTGAGGTATCATCAACTCAGCAGA
GTCCAAGCCAAAACACCATGGTTGAACCATACGTTTCCAACGGCCAACTCGTAGCAGCAG
CCGTCGATCGACGGCTCTTAGCTATGGTCTCACCGAGAGGTAACTTAAGGAGACATTCGG
GAGGTTTTTCTGACGCTGGACATTTCTTGAGATCTTGCTCGCTCTGCGAACGCTTACTTG
TTCCTGGCCGCGACATCTATATGTATAGGGGAGATAAGGCATTTTGTAGCTTGGACTGCA
GGCAACAGCAAATAGCACAAGACGAGTTGAAAGATAAAAGTAAACCGGCAAAGGAATCGA
CGGTGGCGACCACCAGCAAAGCCGCCAAGGGAGGGCGAGCGCCAACCGCCGTGTAATCTC
CCATCTTCACGTACATTATATATTGTTATATTTGTTATGTGTGGCTTGCTATGTGTTTGT
ATAT
ATGATTAT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2CX29JQ 599 0 0
CAACCTTCCCGGAGAATTTGAGGTATCATCAACTCAGCAGAGTCCAAGCCAAAACACCAT
GGTTGAACCATACGTTTCCAACGGCCAACTTGTAGCAGCAGCCGTCGATTGACGGCTTTT
AGCTATGGTCTCACCGAGAGGTAACTTAAGGAGACATTCGGGAGGTTTTTTTGACGCTGG
ACATTTCTTGAGATCTTGCTCGCTTTGCGAACGCTTACTTGTTCCTGGCCGCGACATCTA
TATGTATAGGGGAGATAAGGCATTTTGTAGCTTGGACTGCAGGCAACAGCAAATAGCACA
AGACGAGTTGAAAGATAAAAGTAAACCGGCAAAGGAATCGACGGTGGCGACCACCAGCAA
AGCCGCCAAGGGAGGGCGAGCGCCAACCGCCGTGTAATCTCCCATCTTCACGTACATTAT
ATATTGTTATATTTGTTATGTGTGGCTTGCTATGTGTTTGTATATTATGATTATAGTGGT
GGGGTAAAACATATTAAAGCTTTGAGCGTTAATTGACTTGGTCAATCCCTCTCGTGTGTT
GTGTTGGGATTATATGTTTTTCGAGGGGTTTTTCAGATTTTAGTACAAGTTTTTTTTTT

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL3802Contig1 613 2 2 U
GGGGGAGGCGCAGGCAACAGGAGGAATGGGATGGAATCATCTGCAGCGCCATTGGATTCA
TCTGCAATCTCTCACAATGCTTCTCAGAAGCCACCACTCCTCCCCATTTCTAAGCTCTCC
TCTGCCTTGGCTCTGGCCAGCCCCGCCAATCACCCACAGATGCTTGGGGAACAGCTCTTC
CCACTTGTGGAGAAGGAGGAGCCAGTTCATACCGCCAAAGTTGCAGGAATGTTGCTGCAG
ATGGACCAAGCGGAGATCTTGCACCTTCTCGAGTCACCTGAAGCTCTTAAGGCTAAAGTT
TCAGAGGCTTTGGATGCGCTCAGACTCTCTGCTAATCCACCAGCTGTGTCCTCCGTTGAT
GACCAGTTTGCTCCCTCCTCAACTGAGTGAACCAGCTTTTTAATTATTAGTCAAGACAAA
CATTTGTTCTGGCTTTATTAGACAGTCTTAAAAAAACATTTAGGAACTCCTCTTAAACTA
GTTATCTTGTTTTTTTTTTCTCGTTTGCAAGGTTGGTTTGTTTTGAGTTTTAATACCCAC
AGGTTTTTTTTCTTTAACTCTTAGCACTTTATGTAGTTATGAGCCTATCTAATGATAGAA
CTCTTTTACCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ13TF U 1
AF RR2GQ13JQ C 129
BS 1 577 RR2GQ13TF
BS 578 613 RR2GQ13JQ

RD RR2GQ13TF 577 0 0
GGGGGAGGCGCAGGCAACAGGAGGAATGGGATGGAATCATCTGCAGCGCCATTGGATTCA
TCTGCAATCTCTCACAATGCTTCTCAGAAGCCACCACTCCTCCCCATTTCTAAGCTCTCC
TCTGCCTTGGCTCTGGCCAGCCCCGCCAATCACCCACAGATGCTTGGGGAACAGCTCTTC
CCACTTGTGGAGAAGGAGGAGCCAGTTCATACCGCCAAAGTTGCAGGAATGTTGCTGCAG
ATGGACCAAGCGGAGATCTTGCACCTTCTCGAGTCACCTGAAGCTCTTAAGGCTAAAGTT
TCAGAGGCTTTGGATGCGCTCAGACTCTCTGCTAATCCACCAGCTGTGTCCTCCGTTGAT
GACCAGTTTGCTCCCTCCTCAACTGAGTGAACCAGCTTTTTAATTATTAGTCAAGACAAA
CATTTGTTCTGGCTTTATTAGACAGTCTTAAAAAAACATTTAGGAACTCCTCTTAAACTA
GTTATCTTGTTTTTTTTTTCTCGTTTGCAAGGTTGGTTTGTTTTGAGTTTTAATACCCAC
AGGTTTTTTTTCTTTAACTCTTAGCACTTTATGTAGT

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2GQ13JQ 485 0 0
GGCTCTGGCCAGCCCCGCCAATCACCCACAGATGCTTGGGGAACAGCTCTTCCCACTTGT
GGAGAAGGAGGAGCCAGTTCATACCGCCAAAGTTGCAGGAATGTTGCTGCAGATGGACCA
AGCGGAGATCTTGCACCTTCTCGAGTCACCTGAAGCTCTTAAGGCTAAAGTTTCAGAGGC
TTTGGATGCGCTCAGACTTTCTGCTAATCCACCAGCTGTGTCCTCCGTTGATGACCAGTT
TGCTCCCTCCTCAACTGAGTGAACCAGCTTTTTAATTATTAGTCAAGACAAACATTTGTT
CTGGCTTTATTAGACAGTCTTAAAAAAACATTTAGGAACTCCTCTTAAACTAGTTATCTT
GTTTTTTTTTTCTCGTTTGCAAGGTTGGTTTGTTTTGAGTTTTAATACCCACAGGTTTTT
TTTCTTTAACTCTTAGCACTTTATGTAGTTATGAGCCTATCTAATGATAGAACTCTTTTA
CCTGC

QA 1 485 1 485
DS 



AS 1 2

CO CL3803Contig1 737 2 2 U
GGGAAGAAGATGACTGATCCAAAGAAGGGACGTGTACAATGGGATGAAGCTAATATAGTG
GAAATTGAATCCAACAAACCTGTTAGGCAGAAGATCACTGAACCAAAGACTCCCTACCAC
CCCATGATGCATGATGATGATGACGATGTTGATGATGGTACTTTGTCTCCAAGAGGAGGA
AGATCGTTCAACGAATGCGTTGATGATATGCAACGCGCGGAAGAACTGAAGAACGCTCTG
AATGGTGAACCAGCTTCTTCCAGTAGAAATGCTAGCCAGGGCTCTGGTTCTGGTGGTGGC
TGGAGCTCGGCTGAGGATGAAGAAGCAGATCCAATGGATCAAGATGATGAAGGTTTGGAA
GGTGAGAAAAATGAGAGGTTCACTGAACACAGAAGAGTGCATTACAATGAGTTCCACAAG
GTGAAGGAACTGAGGTCCTTGGGGTCCTTCTATGATGATGGAGAAGAAGAGGACGAGGGT
GATGATGGCTCGAAAGGAAGTGAAGCAGAGACAACAACCTCACCACACAGCAAAGGCGTT
AACAAAGAGGTAGACGCAGCTGGAAAGTCATCTTCATCCTCCAATTGATGATATGATAAT
GATACCTCTGTGTTCAATCAAAATGTGTACTCTTGTCCAGGTCTTATAGATCTCTCTCTC
TCTATCTTTAAACTTTTTTGAAAGGAAGAGGAAACTATGTTATGTTGTTACAGCATTTTA
ATGCAATTGCTTAGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY03TF U 1
AF RR2FY03JQ C 231
BS 1 671 RR2FY03TF
BS 672 737 RR2FY03JQ

RD RR2FY03TF 679 0 0
GGGAAGAAGATGACTGATCCAAAGAAGGGACGTGTACAATGGGATGAAGCTAATATAGTG
GAAATTGAATCCAACAAACCTGTTAGGCAGAAGATCACTGAACCAAAGACTCCCTACCAC
CCCATGATGCATGATGATGATGACGATGTTGATGATGGTACTTTGTCTCCAAGAGGAGGA
AGATCGTTCAACGAATGCGTTGATGATATGCAACGCGCGGAAGAACTGAAGAACGCTCTG
AATGGTGAACCAGCTTCTTCCAGTAGAAATGCTAGCCAGGGCTCTGGTTCTGGTGGTGGC
TGGAGCTCGGCTGAGGATGAAGAAGCAGATCCAATGGATCAAGATGATGAAGGTTTGGAA
GGTGAGAAAAATGAGAGGTTCACTGAACACAGAAGAGTGCATTACAATGAGTTCCACAAG
GTGAAGGAACTGAGGTCCTTGGGGTCCTTCTATGATGATGGAGAAGAAGAGGACGAGGGT
GATGATGGCTCGAAAGGAAGTGAAGCAGAGACAACAACCTCACCACACAGCAAAGGCGTT
AACAAAGAGGTAGACGCAGCTGGAAAGTCATCTTCATCCTCCAATTGATGATATGATAAT
GATACCTCTGTGTTCAATCAAAATGTGTACTCTTGTCCAGGTCTTATAGATCTCTCTCTC
TCTATCTTTAA
CTTTTTTG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2FY03JQ 507 0 0
GAACGCTCTGAATGGTGAACCAGCTTCTTCCAGTAGAAATGCTAGCCAGGGCTCTGGTTC
TGGTGGTGGCTGGAGCTCGGCTGAGGATGAAGAAGCAGATCCAATGGATCAAGATGATGA
AGGTTTGGAAGGTGAGAAAAATGAGAGGTTCACTGAACACAGAAGAGTGCATTACAATGA
GTTCCACAAGGTGAAGGAACTGAGGTCCTTGGGGTCCTTCTATGATGATGGAGAAGAAGA
GGACGAGGGTGATGATGGCTCGAAAGGAAGTGAAGCAGAGACAACAACCTCACCACACAG
CAAAGGCGTTAACAAAGAGGTAGACGCAGCTGGAAAGTCATCTTCATCCTCCAATTGATG
ATATGATAATGATACCTCTGTGTTCAATCAAAATGTGTACTCTTGTCCAGGTCTTATAGA
TCTCTCTCTCTCTATCTTTAAACTTTTTTGAAAGGAAGAGGAAACTATGTTATGTTGTTA
CAGCATTTTAATGCAATTGCTTAGAGT

QA 1 507 1 507
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3805Contig1 664 2 6 U
GGAGTGAACAGTGAACAGTGAACAGTGAATTCAATAGCTTCCTGTTTCATTATATTACAA
ACAACTCCCAATTCATTTAATCGAATCGTTCGAAACCAAACGCAGCTATGGCGTTTGATC
CAGAGCAGCAGCAAGTACCAACCTCTTCTGCTTTCGTAGAGGTTGGTAAATCATCATCAG
GTGAGATCATCAGCTCAGAAGGGGAGCCTCTTCTTAATCACACCCCTGGAGAAAACTACC
CTGTCCTTGCAGCCATCTTCCCGTTTCTCTTTCCAGCTCTGGGAGGACTCCTTTATGGTT
ATGAAATCGGTGCAACTTCATGTGCAACTATTTCACTTCAGTCGCCTTCATTAAGTGGAA
TTTCATGGCACAACTTGTCCTCGTTGGATGTTGGTCTAGTTACCAGTGGCTCACTTTATG
GTGCATTAGTTGGCTCTGCTGTGGCTTTTAGTATTGCTGACGTTATAGGAAGAAGAAAGG
AGCTGATTCTGGCTGCACTTTTTTTCCTCGTTGGAGCCATTGCTACTACACTATCACCAA
TCTACTCCGTTCTGATAATCGGACGAGTAACTTATGGAGTTGGAGTTGGACTGGCAATGC
ATGCGGCTCCCATGTACATTGCAGAGACTGCTCCAAGCCAGATACGTGGGCAGCTGGTAT
CACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2D196TF U 1
AF RR2EK15TF U 81
BS 1 286 RR2D196TF
BS 287 287 RR2EK15TF
BS 288 504 RR2D196TF
BS 505 505 RR2EK15TF
BS 506 535 RR2D196TF
BS 536 664 RR2EK15TF

RD RR2D196TF 535 0 0
GGAGTGAACAGTGAACAGTGAACAGTGAATTCAATAGCTTCCTGTTTCATTATATTACAA
ACAACTCCCAATTCATTTAATCGAATCGTTCGAAACCAAACGCAGCTATGGCGTTTGATC
CAGAGCAGCAGCAAGTACCAACCTCTTCTGCTTTCGTAGAGGTTGGTAAATCATCATCAG
GTGAGATCATCAGCTCAGAAGGGGAGCCTCTTCTTAATCACACCCCTGGAGAAAACTACC
CTGTCCTTGCAGCCATCTTCCCGTTTCTCTTTCCAGCTCTGGGAGGGCTCCTTTATGGTT
ATGAAATCGGTGCAACTTCATGTGCAACTATTTCACTTCAGTCGCCTTCATTAAGTGGAA
TTTCATGGCACAACTTGTCCTCGTTGGATGTTGGTCTAGTTACCAGTGGCTCACTTTATG
GTGCATTAGTTGGCTCTGCTGTGGCTTTTAGTATTGCTGACGTTATAGGAAGAAGAAAGG
AGCTGATTCTGGCTGCACTTTTTT*CCTCGTTGGAGCCATTGCTACTACACTATC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2EK15TF 584 0 0
GG
GAATCGTTCGAAACCAAACGCAGCTATGGCGTTTGATCCAGAGCAGCAGCAAGTACCAAC
CTCTTCTGCTTTCGTAGAGGTTGGTAAATCATCATCAGGTGAGATCATCAGCTCAGAAGG
GGAGCCTCTTCTTAATCACACCCCTGGAGAAAACTACTCTGTCCTTGCAGCCATCTTCCC
GTTTCTCTTTCCAGCTCTGGGAGGACTCCTTTATGGTTATGAAATCGGTGCAACTTCATG
TGCAACTATTTCACTTCAGTCGCCTTCATTAAGTGGAATTTCATGGTACAACTTGTCCTC
GTTGGATGTTGGTCTAGTTACCAGTGGCTCACTTTATGGTGCATTAGTTGGCTCTGCTGT
GGCTTTTAGTATTGCTGACGTTATAGGAAGAAGAAAGGAGCTGATTCTGGCTGCACTTTT
TTTCCTCGTTGGAGCCATTGCTACTACACTATCACCAATCTACTCCGTTCTGATAATCGG
ACGAGTAACTTATGGAGTTGGAGTTGGACTGGCAATGCATGCGGCTCCCATGTACATTGC
AGAGACTGCTCCAAGCCAGATACGTGGGCAGCTGGTATCACT

QA 3 584 3 584
DS 



AS 1 2

CO CL3806Contig1 936 2 2 U
GGTATCACTAATGCAATTGAGATCTATAACAAACCCAGTGGTGCGCTTCATTTCACGGCC
TCAAATAATGATTGTGGAGTCAGAGATTTTGATATGGAGAGATATCAGCTTGTTAACTAT
TTTCGGTTTCCGTGGCCAGTCAATCACACATCTCTGAGCCCTGATGGTAAGTTATTAACG
ATTGTGGGAGACAACCCAGAGGGCCTTCTGGTAGACCCCAACACGGGAAAGACACTGGGA
ACGCTAGCAGGACATTTGGACTTTTCCTTTGCATCGGCATGGCACCCAGATGGGCGTACT
TTCTCTACAGGTAACCAAGACAAGACCTGCCGGGTTTGGGACATTCGTAACCTGTCTAAA
TCAGTTGCTGTCTTGAGGGGTAACCTTGGAGCAATACGATCCATCCGGTACACGTCAGAT
GGGAAATACATGGCCATGGCAGAGCCGGCTGACTTTGTCCATGTGTACGACGTCTCAAAA
GGGTATGAAACAGAGCAGGAGATCGATTTCTTTGGGGAGATATCGGGAATCTCATTCAGC
CCTGACACAGAAGCGCTCTTCATCGGTGTTTGGGACCGCACTTACGGTAGTCTCCTTGAG
TATGGCCGCCACCACAACTACTCCTACCTCGATTCATATCTGTAATCGCATTCGAGGCCA
TCTGAAGAATAAAAGAGCCTATGGACTCTCCCGTCATAATAAAAAAAAAAAGAAAAAGTA
TGATCAAATCTCTAATGATGTAAATGAGGTGTTGTTGTGCAACTACTAGGATTTCACAGA
GAGTCAGATTTAGTTTAAGCTTTTGAGTGTTGTCGAGGTTCATGTATGTGTACATAAGTG
TTTGAGTTTCAGCTTGAGTTTGCATAAACTCTTTACTCTGGTTTCATCCTTTTAAGCTGT
TTCTGTGTTGTATTTCGACGAATTAAATTGAACGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK68TF U 1
AF RR2DK68JQ C 215
BS 1 652 RR2DK68TF
BS 653 936 RR2DK68JQ

RD RR2DK68TF 652 0 0
GGTATCACTAATGCAATTGAGATCTATAACAAACCCAGTGGTGCGCTTCATTTCACGGCC
TCAAATAATGATTGTGGAGTCAGAGATTTTGATATGGAGAGATATCAGCTTGTTAACTAT
TTTCGGTTTCCGTGGCCAGTCAATCACACATCTCTGAGCCCTGATGGTAAGTTATTAACG
ATTGTGGGAGACAACCCAGAGGGCCTTCTGGTAGACCCCAACACGGGAAAGACACTGGGA
ACGCTAGCAGGACATTTGGACTTTTCCTTTGCATCGGCATGGCACCCAGATGGGCGTACT
TTCTCTACAGGTAACCAAGACAAGACCTGCCGGGTTTGGGACATTCGTAACCTGTCTAAA
TCAGTTGCTGTCTTGAGGGGTAACCTTGGAGCAATACGATCCATCCGGTACACGTCAGAT
GGGAAATACATGGCCATGGCAGAGCCGGCTGACTTTGTCCATGTGTACGACGTCTCAAAA
GGGTATGAAACAGAGCAGGAGATCGATTTCTTTGGGGAGATATCGGGAATCTCATTCAGC
CCTGACACAGAAGCGCTCTTCATCGGTGTTTGGGACCGCACTTACGGTAGTCTCCTTGAG
TATGGCCGCCACCACAACTACTCCTACCTCGATTCATATCTGTAATCGCATT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2DK68JQ 722 0 0
ACCCCAACACGGGAAAGACACTGGGAACGCTAGCAGGACATTTGGACTTTTCCTTTGCAT
CGGCATGGCACCCAGATGGGCGTACTTTCTCTACAGGTAACCAAGACAAGACCTGCCGGG
TTTGGGACATTCGTAACCTGTCTAAATCAGTTGCTGTCTTGAGGGGTAACCTTGGAGCAA
TACGATCCATCCGGTACACGTCAGATGGGAAATACATGGCCATGGCAGAGCCGGCTGACT
TTGTCCATGTGTACGACGTCTCAAAAGGGTATGAAACAGAGCAGGAGATCGATTTCTTTG
GGGAGATATCGGGAATCTCATTCAGCCCTGACACAGAAGCGCTCTTCATCGGTGTTTGGG
ACCGCACTTACGGTAGTCTCCTTGAGTATGGCCGCCACCACAACTACTCCTACCTCGATT
CATATCTGTAATCGCATTCGAGGCCATCTGAAGAATAAAAGAGCCTATGGACTCTCCCGT
CATAATAAAAAAAAAAAGAAAAAGTATGATCAAATCTCTAATGATGTAAATGAGGTGTTG
TTGTGCAACTACTAGGATTTCACAGAGAGTCAGATTTAGTTTAAGCTTTTGAGTGTTGTC
GAGGTTCATGTATGTGTACATAAGTGTTTGAGTTTCAGCTTGAGTTTGCATAAACTCTTT
ACTCTGGTTTCATCCTTTTAAGCTGTTTCTGTGTTGTATTTCGACGAATTAAATTGAACG
TT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3808Contig1 879 2 2 U
GGGAAGTTGATTCAGTCTCACTCTTTCTCAGTGGAGCTCCATCAATGGCTTCACCAATCC
TCTTCAACTTTGCTTTCTTTCTTCTTCTGTCTCACGCTTCAGCTTCAACGGTAGTATTCT
TCAACAAATGCAGATACCCAGTGTGGCCAGGGATCCAGCCCAGCGCCGGCCAAAACATAC
TCGCCGACGGTGGATTTAAGCTTCCGTCTAACAAAGCCTACACCCTTCAGCTCCCACCGC
TTTGGTCAGGCCGCTTCTGGGGTCGCCACGACTGCACATTCGACAGATCTGGCCGTGGTC
GCTGCGCCACCGGAGATTGCGGTGGTTCTCTCAACTGCAACGGAGCCGGCGGTTCACCTC
CGGCCACTCTCGCGGAAATCACTCTAGGCCAAGAGCTTGACTTCTATGACGTCAGCCTCG
TCGACGGGTCTGTAAACTTCTAACATCAACTTCACTTCTCTTTTTTTTATTACAGATGCA
ACTAAAGTGTTGTTTTGTTTTGTGTAATGACAGTTATAACCTCGCGATGTCGATAATGCC
GGTGAAAGGCAAAGGTCAGTGTAGCTACGCCGGTTGTGTAAGCGATCTAAACCGGATGTG
TCCGGTTGGGTTACAAGTCCGGTCACGCAACGGGAAACGGGTGTTAGCCTGTAAAAGCGC
TTGCTCTGCCTTCAACTCACCGCAGTACTGTTGTACCGGCACGTTCGGTAACCCACTCAC
CTGCAAGCCAACGTCTTATTCCAGAATCTTCAAGGTTGCTTGCCCTAAAGCTTATTCTTA
TGCCTACGACGATCCAACCAGCATCGCAACTTGTTCCAAGGCTAACTACATTGTCACCTT
TTGCCCTCACCATCGCCGTTAAAATCACTACTATTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV60TF U 1
AF RR2GV60JQB C 522
BS 1 618 RR2GV60TF
BS 619 879 RR2GV60JQB

RD RR2GV60TF 618 0 0
GGGAAGTTGATTCAGTCTCACTCTTTCTCAGTGGAGCTCCATCAATGGCTTCACCAATCC
TCTTCAACTTTGCTTTCTTTCTTCTTCTGTCTCACGCTTCAGCTTCAACGGTAGTATTCT
TCAACAAATGCAGATACCCAGTGTGGCCAGGGATCCAGCCCAGCGCCGGCCAAAACATAC
TCGCCGACGGTGGATTTAAGCTTCCGTCTAACAAAGCCTACACCCTTCAGCTCCCACCGC
TTTGGTCAGGCCGCTTCTGGGGTCGCCACGACTGCACATTCGACAGATCTGGCCGTGGTC
GCTGCGCCACCGGAGATTGCGGTGGTTCTCTCAACTGCAACGGAGCCGGCGGTTCACCTC
CGGCCACTCTCGCGGAAATCACTCTAGGCCAAGAGCTTGACTTCTATGACGTCAGCCTCG
TCGACGGGTCTGTAAACTTCTAACATCAACTTCACTTCTCTTTTTTTTATTACAGATGCA
ACTAAAGTGTTGTTTTGTTTTGTGTAATGACAGTTATAACCTCGCGATGTCGATAATGCC
GGTGAAAGGCAAAGGTCAGTGTAGCTACGCCGGTTGTGTAAGCGATCTAAACCGGATGTG
TCCGGTTGGGTTACAAGT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2GV60JQB 358 0 0
TCGCGATGTCGATAATGCCGGTGAAAGGCAAAGGTCAGTGTAGCTACGCCGGTTGTGTAA
GCGATCTAAACCGGATGTGTCCGGTTGGGTTACAAGTCCGGTCACGCAACGGGAAACGGG
TGTTAGCCTGTAAAAGCGCTTGCTCTGCCTTCAACTCACCGCAGTACTGTTGTACCGGCA
CGTTCGGTAACCCACTCACCTGCAAGCCAACGTCTTATTCCAGAATCTTCAAGGTTGCTT
GCCCTAAAGCTTATTCTTATGCCTACGACGATCCAACCAGCATCGCAACTTGTTCCAAGG
CTAACTACATTGTCACCTTTTGCCCTCACCATCGCCGTTAAAATCACTACTATTGATC

QA 1 358 1 358
DS 



AS 1 2

CO CL3809Contig1 1101 2 4 U
GGGCTCTCCCCCAAACGCAAACCAGAACAGAGAATTAAAAACATCTCCGGCGATTCTCTC
GTCTCCCCCGACGGCTGTCGCTTCGTCAGAGTCGCCTTGAGATCCTGCATTCTCAATCAG
TTCAGTAAAAGGTCTGCAAAATGGTTGCTCAGGGATTCACTGTGGATCTTAACAAGCCCC
TTGTATTTCAGGTTGGCCATCTTGGTGAAGAGTACGAGGAATGGGTTCACCAACCCATTG
TTTCAAAGGAAGGCCCTCGGTTTTTCCACAGTGACTTTTGGGAGTTCTTGACCCTTACAA
GATGGTGGGTGGTTCCTCTAATTTGGTTGCCAGTTTCACTCTGGTGCATCTCCATGTCAG
TAAGCAGGGGCCTTTCACTTCCAGAAATCGTCCCATTGATACCCTTGGGCATATTTATCT
GGACGTTTATTGAATATACTCTCCACCGGTTCCTTTTCCACATAAAGACCAAGAGTTACT
GGGGAAACACGGCACACTATCTTCTTCACGGATGCCATCACAAGCACCCCATGGACCACC
TAAGACTCGTCTTTCCTCCTACTGCAACAGCAATTTTATGCTTTCCTTTCTGGAACCTTG
TGAAGCTATTCACTACTCCTGCAGTCACACCAGCGTTATTTGGAGGCGGCATGCTCGGGT
ACGTGATGTACGATATTACTCACTACTACCTTCATCATGCCCAACCAACTAAAGCAGTGA
CCAAAAACCTCAAGAAGTACCATTTGAACCATCACTTCAGGATCCAGGACAAGGGTTTTG
GTATAACATCGTCGCTATGGGACATAGTGTTTGGGACACTTCCCACCACAAAAGCCCCTA
AAAGAGAGCAATAGTAGTGTACTAAGACGCAAAACGAAAAGGATTATTTGCAATACAGTT
GAATCTTAAATTTATTAATCATCATCCCTCATGAGTTTTGAGACGTTTGTCTGGGGTTTC
ATTTGGACCACTGTCTTTGTAAATCAATGCTTTATGTCATGTTTTACTAGTTTTGGTGTG
TTTCTCAGCGAAAGCAATCAAAAATATCTACTAACATGTAATGTGTGGATTGGGTCTTAT
ATCTTTTGAATCTTACTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF67TF U 1
AF RR2BF67JQ C 376
BS 1 760 RR2BF67TF
BS 761 761 RR2BF67JQ
BS 762 826 RR2BF67TF
BS 827 1101 RR2BF67JQ

RD RR2BF67TF 826 0 0
GGGCTCTCCCCCAAACGCAAACCAGAACAGAGAATTAAAAACATCTCCGGCGATTCTCTC
GTCTCCCCCGACGGCTGTCGCTTCGTCAGAGTCGCCTTGAGATCCTGCATTCTCAATCAG
TTCAGTAAAAGGTCTGCAAAATGGTTGCTCAGGGATTCACTGTGGATCTTAACAAGCCCC
TTGTATTTCAGGTTGGCCATCTTGGTGAAGAGTACGAGGAATGGGTTCACCAACCCATTG
TTTCAAAGGAAGGCCCTCGGTTTTTCCACAGTGACTTTTGGGAGTTCTTGACCCTTACAA
GATGGTGGGTGGTTCCTCTAATTTGGTTGCCAGTTTCACTCTGGTGCATCTCCATGTCAG
TAAGCAGGGGCCTTTCACTTCCAGAAATCGTCCCATTGATACCCTTGGGCATATTTATCT
GGACGTTTATTGAATATACTCTCCACCGGTTCCTTTTCCACATAAAGACCAAGAGTTACT
GGGGAAACACGGCACACTATCTTCTTCACGGATGCCATCACAAGCACCCCATGGACCACC
TAAGACTCGTCTTTCCTCCTACTGCAACAGCAATTTTATGCTTTCCTTTCTGGAACCTTG
TGAAGCTATTCACTACTCCTGCAGTCACACCAGCGTTATTTGGAGGCGGCATGCTCGGGT
ACGTGATGTACGATATTACTCACTACTACCTTCATCATGCCCAACCAACTAAAGCAGTGA
CCAAAAACCTCAAGAAGTACCATTTGAACCATCACTTCAG*ATCCAGGACAAGGGTTTTG
GTATAACATCGTCGCTATGGGACATAGTGTTTGGGACACTTCCCAC

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2BF67JQ 726 0 0
CACTTCCAGAAATCGTCCCATTGATACCCTTGGGCATATTTATCTGGACGTTTATTGAAT
ATACTCTCCACCGGTTCCTTTTCCACATAAAGACCAAGAGTTACTGGGGAAACACGGCAC
ACTATCTTCTTCACGGATGCCATCACAAGCACCCCATGGACCACCTAAGACTCGTCTTTC
CTCCTACTGCAACAGCAATTTTATGCTTTCCTTTCTGGAACCTTGTGAAGCTATTCACTA
CTCCTGCAGTCACACCAGCGTTATTTGGAGGCGGCATGCTCGGGTACGTGATGTACGATA
TTACTCACTACTACCTTCATCATGCCCAACCAACTAAAGCAGTGACCAAAAACCTCAAGA
AGTACCATTTGAACCATCACTTCAGGATCCAGGACAAGGGTTTTGGTATAACATCGTCGC
TATGGGACATAGTGTTTGGGACACTTCCCACCACAAAAGCCCCTAAAAGAGAGCAATAGT
AGTGTACTAAGACGCAAAACGAAAAGGATTATTTGCAATACAGTTGAATCTTAAATTTAT
TAATCATCATCCCTCATGAGTTTTGAGACGTTTGTCTGGGGTTTCATTTGGACCACTGTC
TTTGTAAATCAATGCTTTATGTCATGTTTTACTAGTTTTGGTGTGTTTCTCAGCGAAAGC
AATCAAAAATATCTACTAACATGTAATGTGTGGATTGGGTCTTATATCTTTTGAATCTTA
CTCATC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL3810Contig1 767 2 18 U
GGAAATCATTTCTTCTTTTCGTTTCTCTGACTGGTAGATAAGCTGTATCGCCAAAAAGAG
TAGAAGAACGAGAAGATTGAGAATGGAGAACGATGGTGGATGTAGTAGCCACAAAAGTCT
TTACGAGGCTATGGGAGTGGGAGCAACAGCAACTCAACAGGAGATAAGGAAAGCTTACCA
CAAGTTGGCTCTCAGGCTTCATCCTGACAAAAACAAGGACGACCAGGAAGCAAAAGAGAA
ATTTCAGCAGCTGCAGAAGGTGATATCGATTCTCGGTGATGAAGAGAAAAGGGCTGTCTA
TGATCAAACCGGCTCCGTCGATGATGCTGATCTTTCGGGAGATGTGGTTGACAACTTGAG
GGACTTCTTCAAGGCAATGTACAAGAAGGTCACCGAGGAAGATATTGAAGAGTTTGAGGC
AAACTACAGGGGCTCTGAGTCCAAGAAGAATGATCTGATCGAGCTCTACACCAAGTTTAA
GGGTAAAATGAGCAGGCTTTTCTGCTCAATGCTTTGCTCCGACCCCAAGCTCGATTCACA
CCGTTTCAAAGATATCATCGATGAGGCCATTGCAGCAGGAGAAGTGAAGTCAACAAAAGC
TTACAAGAAATGGGCAAAGGAAATCTCAGAAATAAAACGCCCCACTAGTCCCCAAAAGAT
GAGACAGAAGAAAGCTAAAGCGAGCGCAGAGACGGATCTCTACGCTCTAATTTCACAGCG
AAGAGATTCGAGGAAAGAGAAGTCGATACAATGTTCTCATCACTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED32TF U 1
AF RR2CZ03TF U 68
BS 1 128 RR2ED32TF
BS 129 129 RR2CZ03TF
BS 130 132 RR2ED32TF
BS 133 133 RR2CZ03TF
BS 134 223 RR2ED32TF
BS 224 224 RR2CZ03TF
BS 225 231 RR2ED32TF
BS 232 232 RR2CZ03TF
BS 233 309 RR2ED32TF
BS 310 310 RR2CZ03TF
BS 311 336 RR2ED32TF
BS 337 337 RR2CZ03TF
BS 338 375 RR2ED32TF
BS 376 376 RR2CZ03TF
BS 377 442 RR2ED32TF
BS 443 443 RR2CZ03TF
BS 444 574 RR2ED32TF
BS 575 767 RR2CZ03TF

RD RR2ED32TF 574 0 0
GGAAATCATTTCTTCTTTTCGTTTCTCTGACTGGTAGATAAGCTGTATCGCCAAAAAGAG
TAGAAGAACGAGAAGATTGAGAATGGAGAACGATGGTGGATGTAGTAGCCACAAAAGTCT
TTACGAGGTTATTGGAGTGGGAGCAACAGCAACTCAACAGGAGATAAGGAAAGCTTACCA
CAAGTTGGCTCTCAGGCTTCATCCTGACAAAAACAAGGACGACGAGGAAGCTAAAGAGAA
ATTTCAGCAGCTGCAGAAGGTGATATCGATTCTCGGTGATGAAGAGAAAAGGGCTGTCTA
TGATCAAACTGGCTCCGTCGATGATGCTGATCTTTCTGGAGATGTGGTTGACAACTTGAG
GGACTTCTTCAAGGCCATGTACAAGAAGGTCACCGAGGAAGATATTGAAGAGTTTGAGGC
AAACTACAGGGGCTCTGAGTCCGAGAAGAATGATCTGATCGAGCTCTACACCAAGTTTAA
GGGTAAAATGAGCAGGCTTTTCTGCTCAATGCTTTGCTCCGACCCCAAGCTCGATTCACA
CCGTTTCAAAGATATCATCGATGAGGCCATTGCA

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2CZ03TF 700 0 0
GG
GAGAAGATTGAGAATGGAGAACGATGGTGGATGTAGTAGCCACAAAAGTCTTTACGAGGC
TCTGGGAGTGGGAGCAACAGCAACTCAACAGGAGATGAGGAAAGCTTACCACAAGTTGGC
TCTTAGGCTTCATCCTGACAAAAACAAGGACGACCAGGAAGCAAAAGAGAAATTTCAGCA
GCTGCAGAAGGTGATTTCGATTCTCGGTGATGAAGAGAAAAGGGCTGTCTATGATCAAAC
CGGCTCCGTCGATGATGCTGATCTTTCGGGAGATGTGGTTGACAACTTGAGGGACTTCTT
CAAGGCAATGTACAAGAAGGTCACTGAGGAAGATATTGAAGAGTTTGAGGCAAACTACAG
GGGCTCTGAGTCTAAGAAGAATGATCTGATTGAGCTCTACACCAAGTTTAAGGGTAAAAT
GAGCAGGCTTTTCTGCTCAATGCTTTGCTCCGACCCCAAGCTCGATTCACACCGTTTCAA
AGATATCATCGATGAGGCCATTGCAGCAGGAGAAGTGAAGTCAACAAAAGCTTACAAGAA
ATGGGCAAAGGAAATCTCAGAAATAAAACGCCCCACTAGTCCCCAAAAGATGAGACAGAA
GAAAGCTAAAGCGAGCGCAGAGACGGATCTCTACGCTCTAATTTCACAGCGAAGAGATTC
GAGGAAAGAGAAGTCGATACAATGTTCTCATCACTTGC

QA 3 700 3 700
DS 



AS 1 2

CO CL3811Contig1 544 2 1 U
GGGAAATCTGAAAAATCCCAAGCTCTCGTCATTGGAAGCTTCTCACCGTCTATCTGAAGC
TCGAAATATCGCCGGAAAATAAACCGTAACTGAAGCACGATGCCAACTCTACAAGGCTCT
TTGCCTCCTGAGCTCGCTAACAATGTGGTTAGGTTGTACCGAGAATGTCTTCGTAGAGCT
ACATTCATTGGTAAGCAGCAACACAACACTGAGCTGGTGGTTGGTATGGTGAGGCAGCAA
TTTAAAAAACACATGAACGATACCGACCCCGAGAAGATTCAGAAATTAAAGGATGATGCT
GCTCGGGGACTCATTAACCACATGTTGTTTGAGTCAGAGAAGCTAACAGGGCGCAAGGTT
AGCCAGAGAACCTGATGCAGCCTCGTTGCAGAATCTCATTGTTTTACTCTCTCTCTCTGG
TTCATTGTTAGCCAATGATGCAGCTAGTTTGGCTTTAATAAAAGAGTTTGTCATAGCTTA
AATGTTTCATAACATTGATCAAAGTGGTTCTGTACTTCAAATCGAGCCATACAGTTCTTC
CCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2E323TF U 1
AF RR2E323JQ C 178
BS 1 544 RR2E323TF

RD RR2E323TF 544 0 0
GGGAAATCTGAAAAATCCCAAGCTCTCGTCATTGGAAGCTTCTCACCGTCTATCTGAAGC
TCGAAATATCGCCGGAAAATAAACCGTAACTGAAGCACGATGCCAACTCTACAAGGCTCT
TTGCCTCCTGAGCTCGCTAACAATGTGGTTAGGTTGTACCGAGAATGTCTTCGTAGAGCT
ACATTCATTGGTAAGCAGCAACACAACACTGAGCTGGTGGTTGGTATGGTGAGGCAGCAA
TTTAAAAAACACATGAACGATACCGACCCCGAGAAGATTCAGAAATTAAAGGATGATGCT
GCTCGGGGACTCATTAACCACATGTTGTTTGAGTCAGAGAAGCTAACAGGGCGCAAGGTT
AGCCAGAGAACCTGATGCAGCCTCGTTGCAGAATCTCATTGTTTTACTCTCTCTCTCTGG
TTCATTGTTAGCCAATGATGCAGCTAGTTTGGCTTTAATAAAAGAGTTTGTCATAGCTTA
AATGTTTCATAACATTGATCAAAGTGGTTCTGTACTTCAAATCGAGCCATACAGTTCTTC
CCCC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2E323JQ 367 0 0
GCTACATTCATTGGTAAGCAGCAACACAACACTGAGCTGGTGGTTGGTATGGTGAGGCAG
CAATTTAAAAAACACATGAACGATACCGACCCCGAGAAGATTCAGAAATTAAAGGATGAT
GCTGCTCGGGGACTCATTAACCACATGTTGTTTGAGTCAGAGAAGCTAACAGGGCGCAAG
GTTAGCCAGAGAACCTGATGCAGCCTCGTTGCAGAATCTCATTGTTTTACTCTCTCTCTC
TGGTTCATTGTTAGCCAATGATGCAGCTAGTTTGGCTTTAATAAAAGAGTTTGTCATAGC
TTAAATGTTTCATAACATTGATCAAAGTGGTTCTGTACTTCAAATCGAGCCATACAGTTC
TTCCCCC

QA 1 367 1 367
DS 



AS 1 2

CO CL3812Contig1 975 2 2 U
TTACTAAGATTATTTTCTCCGGCGGCCGCCACTTAATTACGCTTTCGCGGCCGCCGGATC
CTTTCTATCGTATCTGTTCTCCTCCCTTTTTCTCCGTCGTCCTTGCCTCTCTGTCTTTTG
TAACTATGGATTATGTCGTTGGCTGGTGAAATCTAACCTTGGAAAAAGAACTGGTGTTGA
TCGTTTTAGATCTGGTGGAACTTGACGGGTGTCGGTGGTGTTTGGGGACAGCGGCTCCAA
ATCGTGGGGATTTTCCCCTATGAGCTTGTCTAGGCATCCACTATGGCATGGCAGGTGGTA
TTCGTGAGCTCATGAAGGGTTTGGTGCGTGCGTACCTCTCGTTTTACACTTTGAGTTTTC
CCTCTGGCCTTGGCTTCTCTACCTTCAATGATGGAGTGTGTGGTGCCTCGGTTTTAGGGT
CGTGGTTTTTCATTTTGTGGTCTCTAATGGCGTTAGATGTGGCTATCTCTGGCATCGGTT
GATCTGGGCATTGGCTGGGATTGGTCTTTTCTGTTACCGTTGTCGTTTTGTCTTTGTTTT
GTAACTTGTATCGGCTTTGTTTCCGGATTGGAAGTTCAACGGTCAGCTGCTACCGGATCC
GAAGGTCGACGGTGTGCACTTCTCATGGAGACACAACAACGCCTCTATCATTCAATGCTC
TTTTGGTTCTTTTGATCAGAATTCTATTCTGACTATGTTCGTGCTTCAGTATATGCTCTG
CAGTTTCAAGCTGTTATCTGAGTGGTGAAGATGATAAAGACACATACACTGAGAGATTTG
GTATATCCTCTTTTATGTCGTAGGACATTAGTGTCTTTCAACTAAGATCTAGAAATTTAC
ACATTACTATAGCCCCTATTGGTGTGCATGTAATTGTTTAGTTTCTCATCTACTTCTACT
GTATTCCCATTTTACCTTCCGGTAGACGGTGTTTGAACTTTATGAAATAAAATATTCTTC
AGTGTTAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B152TF U 1
AF RR2B152JQ C 271
BS 1 721 RR2B152TF
BS 722 975 RR2B152JQ

RD RR2B152TF 721 0 0
TTACTAAGATTATTTTCTCCGGCGGCCGCCACTTAATTACGCTTTCGCGGCCGCCGGATC
CTTTCTATCGTATCTGTTCTCCTCCCTTTTTCTCCGTCGTCCTTGCCTCTCTGTCTTTTG
TAACTATGGATTATGTCGTTGGCTGGTGAAATCTAACCTTGGAAAAAGAACTGGTGTTGA
TCGTTTTAGATCTGGTGGAACTTGACGGGTGTCGGTGGTGTTTGGGGACAGCGGCTCCAA
ATCGTGGGGATTTTCCCCTATGAGCTTGTCTAGGCATCCACTATGGCATGGCAGGTGGTA
TTCGTGAGCTCATGAAGGGTTTGGTGCGTGCGTACCTCTCGTTTTACACTTTGAGTTTTC
CCTCTGGCCTTGGCTTCTCTACCTTCAATGATGGAGTGTGTGGTGCCTCGGTTTTAGGGT
CGTGGTTTTTCATTTTGTGGTCTCTAATGGCGTTAGATGTGGCTATCTCTGGCATCGGTT
GATCTGGGCATTGGCTGGGATTGGTCTTTTCTGTTACCGTTGTCGTTTTGTCTTTGTTTT
GTAACTTGTATCGGCTTTGTTTCCGGATTGGAAGTTCAACGGTCAGCTGCTACCGGATCC
GAAGGTCGACGGTGTGCACTTCTCATGGAGACACAACAACGCCTCTATCATTCAATGCTC
TTTTGGTTCTTTTGATCAGAATTCTATTCTGACTATGTTCGTGCTTCAGTATATGCTCTG
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2B152JQ 705 0 0
TAGGCATCCACTATGGCATGGCAGGTGGTATTCGTGAGCTCATGAAGGGTTTGGTGCGTG
CGTACCTCTCGTTTTACACTTTGAGTTTTCCCTCTGGCCTTGGCTTCTCTACCTTCAATG
ATGGAGTGTGTGGTGCCTCGGTTTTAGGGTCGTGGTTTTTCATTTTGTGGTCTCTAATGG
CGTTAGATGTGGCTATCTCTGGCATCGGTTGATCTGGGCATTGGCTGGGATTGGTCTTTT
CTGTTACCGTTGTCGTTTTGTCTTTGTTTTGTAACTTGTATCGGCTTTGTTTCCGGATTG
GAAGTTCAACGGTCAGCTGCTACCGGATCCGAAGGTCGACGGTGTGCACTTCTCATGGAG
ACACAACAACGCCTCTATCATTCAATGCTCTTTTGGTTCTTTTGATCAGAATTCTATTCT
GACTATGTTCGTGCTTCAGTATATGCTCTGCAGTTTCAAGCTGTTATCTGAGTGGTGAAG
ATGATAAAGACACATACACTGAGAGATTTGGTATATCCTCTTTTATGTCGTAGGACATTA
GTGTCTTTCAACTAAGATCTAGAAATTTACACATTACTATAGCCCCTATTGGTGTGCATG
TAATTGTTTAGTTTCTCATCTACTTCTACTGTATTCCCATTTTACCTTCCGGTAGACGGT
GTTTGAACTTTATGAAATAAAATATTCTTCAGTGTTAAAAAAAAA

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL3813Contig1 817 2 4 U
GGGTAAAGAAATCTGTTTCCTTCTTCTCAACTGAAACTTCTTCAGCGGATCTGAATCATT
TTGACTCAAAACTACAAGGAAGGGAAGAGAAAGAACAATCAATCATGGGTTGGATCGGAG
AAACAATGGATTCCATCAAATCAATCAAGATCCGCCAGCTTCTCACTCAGGCCGTCACCC
TCGGTATGATCGTGACGTCGGCATTGATAATATGGAAGGGGTTGATGTGTGTGACTGGCA
CTGAATCTCCAGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGCATGGAACCTGGCTTTCAGAGAGGGG
ATATATTGTTCTTGACCATGACCAAAGATCCCATTAGAACTGGCGAGATTGTTGTTTTCA
AAATTGATGGTCGTGATATACCCATCGTCCACCGTGCAATCGAAGTTCATGAGAGGAAAA
CTACTGGAGCAGTTGATGTTCTAACAAAAGGTGACAACAATGAGGTGGATGACATCGGTC
TCTATGCTGATGGACAAATGTGGCTTCATCGTCACCATATAATGGGCAGAGCTGTTGGGT
TCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACAATTATCATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATA
TACTCATTGGTGCATTGGGTCTGCTCGTTATAACATCCAAAGACTGAGACAACAATACAT
AAAGACAGGTCTATGGTGGTGGTGGGGAAGTGGCTCCTGCAACTGCAACCCTCATCATCT
TTTGAACTCATTCCTTAAACCAAAGAAACAAAACCAATTTTATAATTGAATTTTAGAATC
TTATTAAGCCAAATTTAATAAATGTATAAGTTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM63TF U 1
AF RR2FM63JQ C 219
BS 1 651 RR2FM63TF
BS 652 652 RR2FM63JQ
BS 653 668 RR2FM63TF
BS 669 817 RR2FM63JQ

RD RR2FM63TF 675 0 0
GGGTAAAGAAATCTGTTTCCTTCTTCTCAACTGAAACTTCTTCAGCGGATCTGAATCATT
TTGACTCAAAACTACAAGGAAGGGAAGAGAAAGAACAATCAATCATGGGTTGGATCGGAG
AAACAATGGATTCCATCAAATCAATCAAGATCCGCCAGCTTCTCACTCAGGCCGTCACCC
TCGGTATGATCGTGACGTCGGCATTGATAATATGGAAGGGGTTGATGTGTGTGACTGGCA
CTGAATCTCCAGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGCATGGAACCTGGCTTTCAGAGAGGGG
ATATATTGTTCTTGACCATGACCAAAGATCCCATTAGAACTGGCGAGATTGTTGTTTTCA
AAATTGATGGTCGTGATATACCCATCGTCCACCGTGCAATCGAAGTTCATGAGAGGAAAA
CTACTGGAGCAGTTGATGTTCTAACAAAAGGTGACAACAATGAGGTGGATGACATCGGTC
TCTATGCTGATGGACAAATGTGGCTTCATCGTCACCATATAATGGGCAGAGCTGTTGGGT
TCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACAATTATCATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATA
TACTCATTGGTGCATTGGGTCTGCTCGTTATAACATCCAAAGACTGAGACA*CAATACAT
AAAGACAG
TCTATGG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2FM63JQ 599 0 0
GGGTTGATGTGTGTGACTGGCACTGAATCTCCAGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGCATG
GAACCTGGCTTTCAGAGAGGGGATATATTGTTCTTGACCATGACCAAAGATCCCATTAGA
ACTGGCGAGATTGTTGTTTTCAAAATTGATGGTCGTGATATACCCATCGTCCACCGTGCA
ATCGAAGTTCATGAGAGGAAAACTACTGGAGCAGTTGATGTTCTAACAAAAGGTGACAAC
AATGAGGTGGATGACATCGGTCTTTATGCTGATGGACAAATGTGGCTTCATCGTCACCAT
ATAATGGGCAGAGCTGTTGGGTTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACAATTATCATGACA
GAAAAGCCTATCATCAAGTATATACTCATTGGTGCATTGGGTCTGCTCGTTATAACATCC
AAAGACTGAGACAACAATACATAAAGACAGGTCTATGGTGGTGGTGGGGAAGTGGCTCCT
GCAACTGCAACCCTCATCATCTTTTGAACTCATTCCTTAAACCAAAGAAACAAAACCAAT
TTTATAATTGAATTTTAGAATCTTATTAAGCCAAATTTAATAAATGTATAAGTTTTGGC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL3814Contig1 1313 2 2 U
TCAAGAGGAGAGGAGAGGAGAGAAGAGGAGGGCGATACACTCGAGTTTTTGAATTGAATG
CTTCCTCTTCTACATTACATTGAATCCTTCTGCTAGATATGGATCTCCGTCTTCTTCTAT
CATCTCTCATTCCCTCATTGCAATCCGTTTACGTGCTGGTGTTTTACTTCGTCTACTTGG
CCGTCGCCGGAGAAATCCTCCCTGGAAAAGTTATCCGCGGCGTCGTTTTGTCAGCTGGCT
CTCACCTTCGTTACCGATGCAATGGTCTACTGGCACTAACAATGCTGGTCACTATTTTGG
GAGTTTCTGCAAAACTCGGCGTTTTGTCACCACTTGTGGTTGCTGATAGAGGACTTGAGT
TGCTCTCTGCTACTTTTATCTTCTGTGTTTTGGTGACACTTGTATTGTATATTACTGGGC
GCAATTCTTCGGATAAGAGTTCTTCCCTAAAGCCTCATATCTCAGGAAATCTTGTACATG
ACTGGTGGTTTGGAATACAGCTGAATCCTCAGTTTATGAACATCGATCTCAAGTTTTTCT
TTGTCAGAGCCGGGATGATGGGATGGCTGCTTATCAATCTCTCTATTCTGGCAAAAAGTT
TTCAGGACGGTTCCGTGAGTCAGTCCATGATTCTTTACCAGATCTTCTGTGCGTTATATA
TATTGGACTACTTTGTTCATGAAGAGTATATGACCTCTACGTGGGACATAATTGCAGAGA
GGTTGGGGTTCATGCTGGTGTTTGGAGATCTCTTGTGGATTCCTTTCACTTTAGCATCCA
GGGCTGGTGGCTTTTGCACAACAAAGTAGAACTAACAGCTCCTGCTATTGTAGCCAACTG
CTTTGTGTTCTTGATAGGGTACATGGTTTTTAGAGGGGCTAACAAACAAAAACATATCTT
TAAGAAGAACCCTAAAACACCTATATGGGGTAAGCCTCCAGTGGTGGTTGGTGGAAAGTT
GCTTGCTTCAGGCTATTGGGGAATCGCAAGGCACTGTAATTACCTTGGCGACTTGATGCT
TGCTCTGTCTTTCAGTTTGCCCTGTGGAATAAGTTCTCCGGTTCCATATTTCTACCCGAT
ATACCTCCTGATACTGTTGATATGGAGAGAGCGAAGAGACGAGGAACGATGTGCAGAGAA
GTACAAGGAGATTTGGGCTGAGTATCTTAGACTGGTCCCCTATAGAATCCTTCCTTATGT
TTATTAATAACAGTGCATTGTCATGGATCCTTTGAGATTCATTTTATCCTCTTGTGTCTT
TCTTTCGTTTTCTTGTTTCTAATGTGACATTAGAATATTCCATTGTAGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH89TF U 1
AF RR2CH89JQ C 503
BS 1 586 RR2CH89TF
BS 587 1313 RR2CH89JQ

RD RR2CH89TF 586 0 0
TCAAGAGGAGAGGAGAGGAGAGAAGAGGAGGGCGATACACTCGAGTTTTTGAATTGAATG
CTTCCTCTTCTACATTACATTGAATCCTTCTGCTAGATATGGATCTCCGTCTTCTTCTAT
CATCTCTCATTCCCTCATTGCAATCCGTTTACGTGCTGGTGTTTTACTTCGTCTACTTGG
CCGTCGCCGGAGAAATCCTCCCTGGAAAAGTTATCCGCGGCGTCGTTTTGTCAGCTGGCT
CTCACCTTCGTTACCGATGCAATGGTCTACTGGCACTAACAATGCTGGTCACTATTTTGG
GAGTTTCTGCAAAACTCGGCGTTTTGTCACCACTTGTGGTTGCTGATAGAGGACTTGAGT
TGCTCTCTGCTACTTTTATCTTCTGTGTTTTGGTGACACTTGTATTGTATATTACTGGGC
GCAATTCTTCGGATAAGAGTTCTTCCCTAAAGCCTCATATCTCAGGAAATCTTGTACATG
ACTGGTGGTTTGGAATACAGCTGAATCCTCAGTTTATGAACATCGATCTCAAGTTTTTCT
TTGTCAGAGCCGGGATGATGGGATGGCTGCTTATCAATCTCTCTAT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2CH89JQ 811 0 0
GAATCCTCAGTTTATGAACATCGATCTCAAGTTTT*CTTTGTCAGAGCCGGGATGATGGG
ATGGCTGCTTATCAATCTCTCTATTCTGGCAAAAAGTTTTCAGGACGGTTCCGTGAGTCA
GTCCATGATTCTTTACCAGATCTTCTGTGCGTTATATATATTGGACTACTTTGTTCATGA
AGAGTATATGACCTCTACGTGGGACATAATTGCAGAGAGGTTGGGGTTCATGCTGGTGTT
TGGAGATCTCTTGTGGATTCCTTTCACTTTAGCATCCAGGGCTGGTGGCTTTTGCACAAC
AAAGTAGAACTAACAGCTCCTGCTATTGTAGCCAACTGCTTTGTGTTCTTGATAGGGTAC
ATGGTTTTTAGAGGGGCTAACAAACAAAAACATATCTTTAAGAAGAACCCTAAAACACCT
ATATGGGGTAAGCCTCCAGTGGTGGTTGGTGGAAAGTTGCTTGCTTCAGGCTATTGGGGA
ATCGCAAGGCACTGTAATTACCTTGGCGACTTGATGCTTGCTCTGTCTTTCAGTTTGCCC
TGTGGAATAAGTTCTCCGGTTCCATATTTCTACCCGATATACCTCCTGATACTGTTGATA
TGGAGAGAGCGAAGAGACGAGGAACGATGTGCAGAGAAGTACAAGGAGATTTGGGCTGAG
TATCTTAGACTGGTCCCCTATAGAATCCTTCCTTATGTTTATTAATAACAGTGCATTGTC
ATGGATCCTTTGAGATTCATTTTATCCTCTTGTGTCTTTCTTTCGTTTTCTTGTTTCTAA
TGTGACATTAGAATATTCCATTGTAGTTTTT

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL3815Contig1 794 2 11 U
GGGAAATACGGGCGCTTGAAAAGGTTAAGCTGAGTTTTGTTGGACATTCAATCGGCAATG
TCATCATCAGAACTGCACTAGCAGATAGTTTGATGGATCCATACAGGAAGTATCTATATA
CATATATATCGCTTTCGGGTCCACACTTGGGTTATCTATACAGTTCAAATTCATTGTTTA
ACTCTGGACTTTGGCTCCTGAAGAAGTTAAAGAGTACTCAGGTTATTCATCAGCTTACGC
TCACAGATGATCCTGATCTCCAGAATACTTTCTTTTACAAGCTCTGCAAGCAAAAGACTC
TAGACGGTTTCAAAAACATAATTCTCCTGTCTTCGCCTCAGGATGGGTATGTTCCATATC
ACTCAGCTAGGATCGAATCGTGCCAACCAGCTTCATTCGACAACTCAAAAAGAGGAGTCG
CTTTCTTGGAGATGCTTAATAGCTGTATGGACCAAATACGTGGGCCATCCCCGGAAACGC
CTCACCACCAGAGAGTGTTCATGCGCTGCGACGTCAATTTCGACACGACCTTATACGGTC
GTAACCTCAACTCGTTCATTGGTAGAGCTGCTCACATCGAGTTCTTGGAGTCTGATATCT
TTGCAAGATTCATAATGTGGTCATTCCAAGATCTATTCCGCTGACAAAAAATCTTGGTTA
CTGAGAATTCTTCTCTTTTTTTTAGATAGAGAATGATACAAAAACTGTTGTATATTTGTA
GTTTAACTCTTTGGTTGCAGCAGAAGCGGTAATATTGTATGTTAACCACAACTCTGGGCT
CTGTATTGTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C055TF U 253
AF RR2C055JQ C 1
BS 1 252 RR2C055JQ
BS 253 650 RR2C055TF
BS 651 651 RR2C055JQ
BS 652 682 RR2C055TF
BS 683 683 RR2C055JQ
BS 684 692 RR2C055TF
BS 693 693 RR2C055JQ
BS 694 703 RR2C055TF
BS 704 704 RR2C055JQ
BS 705 719 RR2C055TF
BS 720 794 RR2C055JQ

RD RR2C055TF 467 0 0
CTGATCTCCAGAATACTTTCTTTTACAAGCTCTGCAAGCAAAAGACTCTAGACGGTTTCA
AAAACATAATTCTCCTGTCTTCGCCTCAGGATGGGTATGTTCCATATCACTCAGCTAGGA
TCGAATCGTGCCAACCAGCTTCATTCGACAACTCAAAAAGAGGAGTCGCTTTCTTGGAGA
TGCTTAATAGCTGTATGGACCAAATACGTGGGCCATCCCCGGAAACGCCTCACCACCAGA
GAGTGTTCATGCGCTGCGACGTCAATTTCGACACGACCTTATACGGTCGTAACCTCAACT
CGTTCATTGGTAGAGCTGCTCACATCGAGTTCTTGGAGTCTGATATCTTTGCAAGATTCA
TAATGTGGTCATTCCAAGATCTATTCCGCTGACAAAAA*TCTTGGTTACTGAGAATTCTT
CTCTTTTTTT*AGATAGAGA*TGATACAAAA*CTGTTGTATATTTGT

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2C055JQ 794 0 0
GGGAAATACGGGCGCTTGAAAAGGTTAAGCTGAGTTTTGTTGGACATTCAATCGGCAATG
TCATCATCAGAACTGCACTAGCAGATAGTTTGATGGATCCATACAGGAAGTATCTATATA
CATATATATCGCTTTCGGGTCCACACTTGGGTTATCTATACAGTTCAAATTCATTGTTTA
ACTCTGGACTTTGGCTCCTGAAGAAGTTAAAGAGTACTCAGGTTATTCATCAGCTTACGC
TCACAGATGATCCTGATCTCCAGAATACTTTCTTTTACAAGCTCTGCAAGCAAAAGACTC
TAGACGGTTTCAAAAACATAATTCTCCTGTCTTCGCCTCAGGATGGGTATGTTCCATATC
ACTCAGCTAGGATCGAATCGTGCCAACCAGCTTCATTCGACAACTCAAAAAGAGGAGTCG
CTTTCTTGGAGATGCTTAATAGCTGTATGGACCAAATACGTGGGCCATCCCCGGAAACGC
CTCACCACCAGAGAGTGTTCATGCGCTGCGACGTCAATTTCGACACGACCTTATACGGTC
GTAACCTCAACTCGTTCATTGGTAGAGCTGCTCACATCGAGTTCTTGGAGTCTGATATCT
TTGCAAGATTCATAATGTGGTCATTCCAAGATCTATTCCGCTGACAAAAAATCTTGGTTA
CTGAGAATTCTTCTCTTTTTTTTAGATAGAGAATGATACAAAAACTGTTGTATATTTGTA
GTTTAACTCTTTGGTTGCAGCAGAAGCGGTAATATTGTATGTTAACCACAACTCTGGGCT
CTGTATTGTGTTTT

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL3816Contig1 450 2 1 U
GGGGAGGAGCACGATCCAGAGACAAGAAGAAGATGGCAACTCCGCAGGTGAAGACCGGTT
TGTTCGTCGGTTTGAACAAAGGCCATGTTGTCACCAGACGCGAGTTGGCTCCTCGTCCCC
GTGCTCGCAAAGGAAAAACAAGCAAGAGGACAATCTTCATCAGATCTTTGATCAGGGAAG
TTGCTGGTTTTGCTCCCTACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTAAAAGTTGGTAAAGACA
AGCGTGCTCTTAAGGTGGCCAAGCGAAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGAGGAAGA
GAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGGTGGTGTAACCGAGA
AGAAGAAATGAGCTTGGCAAGAGAACCACTCGAATTGTTTGTGTTTATTGTTTTGGATCT
AAAGAGTTTTGTTTTGTCCATGACCGTTGA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AQ70JQ C 1
AF RR2AQ70TF U 1
BS 1 450 RR2AQ70TF

RD RR2AQ70JQ 450 0 0
GGGGAGGAGCACGATCCAGAGACAAGAAGAAGATGGCAACTCCGCAGGTGAAGACCGGTT
TGTTCGTCGGTTTGAACAAAGGCCATGTTGTCACCAGACGCGAGTTGGCTCCTCGTCCCC
GTGCTCGCAAAGGAAAAACAAGCAAGAGGACAATCTTCATCAGATCTTTGATCAGGGAAG
TTGCTGGTTTTGCTCCCTACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTAAAAGTTGGTAAAGACA
AGCGTGCTCTTAAGGTGGCCAAGCGAAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGAGGAAGA
GAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGGTGGTGTAACCGAGA
AGAAGAAATGAGCTTGGCAAGAGAACCACTCGAATTGTTTGTGTTTATTGTTTTGGATCT
AAAGAGTTTTGTTTTGTCCATGACCGTTGA

QA 1 450 1 450
DS 

RD RR2AQ70TF 450 0 0
GGGGAGGAGCACGATCCAGAGACAAGAAGAAGATGGCAACTCCGCAGGTGAAGACCGGTT
TGTTCGTCGGTTTGAACAAAGGCCATGTTGTCACCAGACGCGAGTTGGCTCCTCGTCCCC
GTGCTCGCAAAGGAAAAACAAGCAAGAGGACAATCTTCATCAGATCTTTGATCAGGGAAG
TTGCTGGTTTTGCTCCCTACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTAAAAGTTGGTAAAGACA
AGCGTGCTCTTAAGGTGGCCAAGCGAAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGAGGAAGA
GAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAGATGAGGTCTGGTGGTGGTGGTGTAACCGAGA
AGAAGAAATGAGCTTGGCAAGAGAACCACTCGAATTGTTTGTGTTTATTGTTTTGGATCT
AAAGAGTTTTGTTTTGTCCATGACCGTTGA

QA 1 450 1 450
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3818Contig1 1437 2 2 U
GGGTCGAACCATTTACCAAAGCTTAAACACTAAGCAGAGATATAGCAACTTCAAAAATTC
TCTCTCTCTCTCTACTTTCCCAACTTCGTCGCCAAACAGTTAACTTGTCGTGTAGTAGAA
GAGTTAGTTGTTGTAGTCATGAGCTGTTTCGGTTGGTGTGGGAACGATGATGGTTTCCGT
AATGCTGATGATACTAGACCAATGCCAACCCTCATCCCTGCAGGTGACAGTGGAAGCCAC
TATCTAAGATCTGATCCACCCATGAATCAGCCTGTTCTTCAGATGGAGCCTATTGCTGTA
CCAGCCATTCCTGCTGATGAGCTTAGTGATGTAACAGATAACTACGGTTCCAAGGCCTTG
GTCGGTGAGGGTTCTTATGGAAGGGTGTTTCACGGTGTTCTTAAAAGCGGTGTAACATCT
GCTATCAAGAAGCTTGACTCTAGCAAGCAGCCTGACCAAGAGTTTCTTTCCCAGATATCA
ATGGTTTCGAGATTGCGACACGAAAATGTTATTGCACTTGTGGGTTATTGTGTTGATGGC
CCTCTCCGTGTTCTTGCTTATGAGTATGCTCCTAACGGATCTCTTCATGATGTTCTTCAT
GGCCGAAAAGGTGTGAAAGGAGCGCTGCGGGGTCCTGTTATGACGTGGCAACAGAGAGTC
AAAATCGCTGTTGGTGCAGCCAGAGGACTCGAGTACTTGCACGAGAAGGTCAACCCTCAG
GTTATCCACCGGGACATCAAATCCAGCAACGTCCTTCTCTTTGATGATGATGTTGCCAAG
ATTGGTGATTTCGATCTCTCTAATCAAGCCCCTGACATGGCTGCTCGGCTTCACTCAACT
CGTGTCCTAGGAACCTTTGGCTATCACGCTCCTGAGTATGCAATGACTGGAACATTGAGC
ACAAAGAGCGACGTGTACAGTTTTGGCGTTGTTCTGTTGGAGCTCCTTACTGGTCGTAAA
CCAGTCGACCATACCTTACCTCGTGGACAACAAAGTCTAGTGACATGGGCAACCCCTAAA
CTGAGCGAAGACAAGGTGAAGCTATGTGTTGATGCAAGATTACTCGGAGAGTACCCTTCC
AAAGCTGTTGCCAAGCTAGCTGCGGTGGCTGCCCTGTGCGTGCAGTATGAGGCAAACTTT
AGACCAAACATGAGCATTGTGGTGAAGGCACTTCAACCTCTTCTAAACCATCCTCGTTCT
ACTCCACATAGAAACCCTTACTGATCATCAGGTCTCCAAACCACATTTCAGCTGCTACTT
CACAATGATTAATCAAATGTGTATTCATTTTGGTTTTGTATTTAAGTCCCACTTTTGAAG
AGTTGTGTATGTATTTCTCAAAATTATCTGTATTCTGTTATGTAATTTCAGAGGTGGGAA
GACAAAACCAAATTATATTTTGTTTATTGTTAACTTAATAATGATTTCACAAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO34TF U 1
AF RR2EO34JQ C 614
BS 1 708 RR2EO34TF
BS 709 1437 RR2EO34JQ

RD RR2EO34TF 715 0 0
GGGTCGAACCATTTACCAAAGCTTAAACACTAAGCAGAGATATAGCAACTTCAAAAATTC
TCTCTCTCTCTCTACTTTCCCAACTTCGTCGCCAAACAGTTAACTTGTCGTGTAGTAGAA
GAGTTAGTTGTTGTAGTCATGAGCTGTTTCGGTTGGTGTGGGAACGATGATGGTTTCCGT
AATGCTGATGATACTAGACCAATGCCAACCCTCATCCCTGCAGGTGACAGTGGAAGCCAC
TATCTAAGATCTGATCCACCCATGAATCAGCCTGTTCTTCAGATGGAGCCTATTGCTGTA
CCAGCCATTCCTGCTGATGAGCTTAGTGATGTAACAGATAACTACGGTTCCAAGGCCTTG
GTCGGTGAGGGTTCTTATGGAAGGGTGTTTCACGGTGTTCTTAAAAGCGGTGTAACATCT
GCTATCAAGAAGCTTGACTCTAGCAAGCAGCCTGACCAAGAGTTTCTTTCCCAGATATCA
ATGGTTTCGAGATTGCGACACGAAAATGTTATTGCACTTGTGGGTTATTGTGTTGATGGC
CCTCTCCGTGTTCTTGCTTATGAGTATGCTCCTAACGGATCTCTTCATGATGTTCTTCAT
GGCCGAAAAGGTGTGAAAGGAGCGCTGCGGGGTCCTGTTATGACGTGGCAACAGAGAGTC
AAAATCGCTGTTGGTGCAGCCAGAGGACTCGAGTACTTGCACGAGAAG
TCAACCC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2EO34JQ 824 0 0
TGAAAGGAGCGCTGCGGGGTC*TGTTATGACGTGGCAACAGAGAGTCAAAATCGCTGTTG
GTGCAGCCAGAGGACTCGAGTACTTGCACGAGAAGGTCAACCCTCAGGTTATCCACCGGG
ACATCAAATCCAGCAACGTCCTTCTCTTTGATGATGATGTTGCCAAGATTGGTGATTTCG
ATCTCTCTAATCAAGCCCCTGACATGGCTGCTCGGCTTCACTCAACTCGTGTCCTAGGAA
CCTTTGGCTATCACGCTCCTGAGTATGCAATGACTGGAACATTGAGCACAAAGAGCGACG
TGTACAGTTTTGGCGTTGTTCTGTTGGAGCTCCTTACTGGTCGTAAACCAGTCGACCATA
CCTTACCTCGTGGACAACAAAGTCTAGTGACATGGGCAACCCCTAAACTGAGCGAAGACA
AGGTGAAGCTATGTGTTGATGCAAGATTACTCGGAGAGTACCCTTCCAAAGCTGTTGCCA
AGCTAGCTGCGGTGGCTGCCCTGTGCGTGCAGTATGAGGCAAACTTTAGACCAAACATGA
GCATTGTGGTGAAGGCACTTCAACCTCTTCTAAACCATCCTCGTTCTACTCCACATAGAA
ACCCTTACTGATCATCAGGTCTCCAAACCACATTTCAGCTGCTACTTCACAATGATTAAT
CAAATGTGTATTCATTTTGGTTTTGTATTTAAGTCCCACTTTTGAAGAGTTGTGTATGTA
TTTCTCAAAATTATCTGTATTCTGTTATGTAATTTCAGAGGTGGGAAGACAAAACCAAAT
TATATTTTGTTTATTGTTAACTTAATAATGATTTCACAAATCCC

QA 1 824 1 824
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3820Contig1 551 2 5 U
GCAAATCGTGTTGCCTCTTTAAACGCACCAAAGGCGTATATATCTATATGGTACTGTTAC
ATCAAACAACACCTCTCTATTGTCTATGCATCTTAAATCTATTAAGATGAAATATACGGC
ACATTTACAAGGCAGTGAAAAGTTTGTAAAGTCCCCTCTGCGGTCTACAAGATAAGCCAG
GAATCGAGAACCAATGGAATCATGGGACACAGATTTTCATACAGAACATATCAAAATCTG
CTTCAGGATTTTATGCTCCAGATTGGGCTTGGTTTCCGATGTTGAGCATTCTCGATCGAA
TAAACAAAAAGGGCTCCATCTTTGGTCCCTGCTAAAAAACACTCTTCTTGAGTTACAGTC
AAAGAAGTGATTATTTTCCCAGCTCCGTTATACCGTCTTACTACTTCAAGGGAGTTCATA
AACCGAACAACTATTTGTCCTTGGTCTCCGGCACTAACCAAAAACTCTCCACACTTACTT
AGTTCAAGACAATTGATGCGTCCATTTGACTCGGAGCTAGCGAGATGTTTTCCGTTAATG
GAATAGAGGTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H739JQB U 1
AF RR2GP95JQ U 1
BS 1 110 RR2GP95JQ
BS 111 111 RR2H739JQB
BS 112 139 RR2GP95JQ
BS 140 140 RR2H739JQB
BS 141 551 RR2GP95JQ

RD RR2H739JQB 464 0 0
GCAAATCGTGTTGCCTCTTTAAACGCACCAAAGGCGTATATATCTATATGGTACTGTTAC
ATCAAACAACACCTCTCTATTGTCTATGCATCTTAAATCTATTAAGATGAAATATACGGC
ACATTTACAAGGCAGTGAAAAGTTTGTAAAGTCCCCTCTGCGGTCTACAAGATAAGCCAG
GAATCGAGAACCAATGGAATCATGGGACACAGATTTTCATACAGAACATATCAAAATCTG
CTTCAGGATTTTATGCTCCAGATTGGGCTTGGTTTCCGATGTTGAGCATTCTCGATCGAA
TAAACAAAAAGGGCTCCATCTTTGGTCCCTGCTAAAAAACACTCTTCTTGAGTTACAGTC
AAAGAGGTGATTATTTTCCCAGCTCCGTTATACCGTCTTACTACTTCAAGGGAGTTCATA
GACCGAACAACTATTTGTCCTTGGTCTCCGGCACTAACCAAAAA

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2GP95JQ 551 0 0
GCAAATCGTGTTGCCTCTTTAAACGCACCAAAGGCGTATATATCTATATGGTACTGTTAC
ATCAAACAACACCTCTCTATTGTCTATGCATCTTAAATCTATTAAGATGAGATATACGGC
ACATTTACAAGGCAGTGAAGAGTTTGTAAAGTCCCCTCTGCGGTCTACAAGATAAGCCAG
GAATCGAGAACCAATGGAATCATGGGACACAGATTTTCATACAGAACATATCAAAATCTG
CTTCAGGATTTTATGCTCCAGATTGGGCTTGGTTTCCGATGTTGAGCATTCTCGATCGAA
TAAACAAAAAGGGCTCCATCTTTGGTCCCTGCTAAAAAACACTCTTCTTGAGTTACAGTC
AAAGAAGTGATTATTTTCCCAGCTCCGTTATACCGTCTTACTACTTCAAGGGAGTTCATA
AACCGAACAACTATTTGTCCTTGGTCTCCGGCACTAACCAAAAACTCTCCACACTTACTT
AGTTCAAGACAATTGATGCGTCCATTTGACTCGGAGCTAGCGAGATGTTTTCCGTTAATG
GAATAGAGGTG

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

CO CL3821Contig1 1009 2 2 U
AGGGGAGTCTCTTCCTCAGAACAAAGTTGCCATCTCAATTCCTCGCCGTCGAGAGCCAAA
CATGGTTTTCTGGGGAATCGAAGTGAAACCTGGGGAACCTCAAGCTTACGATCCCAAAAA
CGAAGAAAGGAAGCTTCACCTGACCCAGGCAACACTAGGTGCTGGTTCAGGGAAAGAGAA
GAGTGTGATTCAGTGCTCCGTAGGAGGAAACTCACCCGTTTACTTGTGTTCATTGTTGCC
TAACAAATCCGAATGCTGTCCTCTGAAGCTTGAGTTCGACTATAACGACGAGGCAGTTGA
GTTCTCAGTCACTGGTGACAGAAGCATCCACCTGTCTGGGTTCTTGGAGGCTTATGATGA
GGAGGAGTGTGAAGATCAGTATGATGATGAAGATGATTCAGATGGTATCGATATTGGTGA
CGACTCTGAGTCTGGGGAGTCTGAGTATGATAGTGAAGAGGATGAGGATGATTTGGAGGA
CTTCATTGATCACAATCTTGATATGTATCGGCAATCTTCTGTCCCAAACAGTGGAGTTGT
AATTGAGGAGATAGAAGATGAGGAGAAGCCCGTCATCAAAGATGATAAGACAAAACGATC
CAAGAAGAAGAGTCAAGCTAGCAAAGATGAGAACGCGAATAAGCAAATCATTGTCAAAGA
GAGTGACCCTGCTCCAGTTCTGGAAAGCGAAGATGAAGATGGTCTTCCTATTTCTAAAGA
AAAAACACCTGAACCAGAGAAGAAGTCTGCCGCGGAGGTGGGTGATGACGAACAAGGTAG
CAACAAAAAACGCAAGGCCAAGGCTCCTCAGCAAGAAAGTGTAAACAAGAACAAAAAGAA
GAAAAATCGGAAAGAAAAGAAGAATGAGGAAGCGGATGAAAAGGTAGAGACAGAGGATGT
GCTGAAAAAGGAGGAGACCGGCCAAAGTTCTTTAAACCCAAACGCTCAAACTGGAGCTGT
TAACAATGCCATGGGTGATAGCTCCGAGACTCCAGTGCAATCTGCTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD54TF U 1
AF RR2CD54JQ C 244
BS 1 697 RR2CD54TF
BS 698 1009 RR2CD54JQ

RD RR2CD54TF 697 0 0
AGGGGAGTCTCTTCCTCAGAACAAAGTTGCCATCTCAATTCCTCGCCGTCGAGAGCCAAA
CATGGTTTTCTGGGGAATCGAAGTGAAACCTGGGGAACCTCAAGCTTACGATCCCAAAAA
CGAAGAAAGGAAGCTTCACCTGACCCAGGCAACACTAGGTGCTGGTTCAGGGAAAGAGAA
GAGTGTGATTCAGTGCTCCGTAGGAGGAAACTCACCCGTTTACTTGTGTTCATTGTTGCC
TAACAAATCCGAATGCTGTCCTCTGAAGCTTGAGTTCGACTATAACGACGAGGCAGTTGA
GTTCTCAGTCACTGGTGACAGAAGCATCCACCTGTCTGGGTTCTTGGAGGCTTATGATGA
GGAGGAGTGTGAAGATCAGTATGATGATGAAGATGATTCAGATGGTATCGATATTGGTGA
CGACTCTGAGTCTGGGGAGTCTGAGTATGATAGTGAAGAGGATGAGGATGATTTGGAGGA
CTTCATTGATCACAATCTTGATATGTATCGGCAATCTTCTGTCCCAAACAGTGGAGTTGT
AATTGAGGAGATAGAAGATGAGGAGAAGCCCGTCATCAAAGATGATAAGACAAAACGATC
CAAGAAGAAGAGTCAAGCTAGCAAAGATGAGAACGCGAATAAGCAAATCATTGTCAAAGA
GAGTGACCCTGCTCCAGTTCTGGAAAGCGAAGATGAA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2CD54JQ 766 0 0
CAAATCCGAATGCTGTCCTCTGAAGCTTGAGTTCGACTATAACGACGAGGCAGTTGAGTT
CTCAGTCACTGGTGACAGAAGCATCCACCTGTCTGGGTTCTTGGAGGCTTATGATGAGGA
GGAGTGTGAAGATCAGTATGATGATGAAGATGATTCAGATGGTATCGATATTGGTGACGA
CTCTGAGTCTGGGGAGTCTGAGTATGATAGTGAAGAGGATGAGGATGATTTGGAGGACTT
CATTGATCACAATCTTGATATGTATCGGCAATTTTCTGTCCCAAACAGTGGAGTTGTAAT
TGAGGAGATAGAAGATGAGGAGAAGCCCGTCATCAAAGATGATAAGACAAAACGATCCAA
GAAGAAGAGTCAAGCTAGCAAAGATGAGAACGCGAATAAGCAAATCATTGTCAAAGAGAG
TGACCCTGCTCCAGTTCTGGAAAGCGAAGATGAAGATGGTCTTCCTATTTCTAAAGAAAA
AACACCTGAACCAGAGAAGAAGTCTGCCGCGGAGGTGGGTGATGACGAACAAGGTAGCAA
CAAAAAACGCAAGGCCAAGGCTCCTCAGCAAGAAAGTGTAAACAAGAACAAAAAGAAGAA
AAATCGGAAAGAAAAGAAGAATGAGGAAGCGGATGAAAAGGTAGAGACAGAGGATGTGCT
GAAAAAGGAGGAGACCGGCCAAAGTTCTTTAAACCCAAACGCTCAAACTGGAGCTGTTAA
CAATGCCATGGGTGATAGCTCCGAGACTCCAGTGCAATCTGCTGAG

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL3822Contig1 1360 2 4 U
GGACCACCGAAACAGAAGCTCCTCGATTAGGCGCTCTTCGTTGCCAAGCAAAGTCAGAAT
CTTCCAAATCCAGTGATGAGGACTCGTGGGGCCTCGCCTAACCATTTAAACGACAGATCC
AGGTCCGATGAGTCGCTCGTTTTTTAATTGCCTGGAGAAGGGGACAAGAAATAGTTTTGT
TTCGTCTAGAAGTTTCGATGATTTGTTGTCTGAGTGTACTTATAAAGGTGGGAAGAGGAA
GACATGCAATGGGTTTGGATGTAATCTTGTTACTTCAGGGAACACTGTAAAGGAACAACC
TTTTGATGATGAATCTCACGGAAGGCAAGAATGTAGTGAATCTCTGACTCAAGTAAGAAG
AGTTTCTCCGTACTTCCAGGGAGTAACTGTTTCAGAACAGCACAAACAAGGGTGTAATTC
TGATAGTGTTTCTTCTAAAACTCAAAGTGGAATAAGCTGTACTAGGAAAGCTAAAGTCCA
AAGAGTTTCTCCATACTTCCAGGGAGCAACTAGTTCACCGTGTGATTCTGACAACTTTGC
TTCTCAAAGTGGAAGAAAACCTAGGAAAAGATGCAGCAAAGCTCTACCTAATGTCCGAAA
AGTTTCTCCATATTTCCAGGGATCAACTGTTTCAGAACAGCCAAGAGATTTGCGTCAACA
TTTTAAGGTCGCGAAAGTTTCAAGATATTTCCATGGCCTGTCTGCGGATGGAATCCAAGT
AAATGAATCACAAAAGGAGATATCAAGAAGGGTGAGGAAAACTCCTCTTGTGAGCCCTTC
ACTCTCTAAGCGTCAGAAGACTGATGAGGCATACCTGCGGAAAACGCCTGATAATACATG
GGTCCCTCCACGTTCTCCATGTAATCTACTTCAAGAAGATCACTGGCATGATCCATGGCG
GGTGTTGGTCATATTTATGCTTCTCAACAAAACTTCTGGTGCCCAGGCGCGAAGGGTGAT
ATCAGACCTGTTTGCGCTGTGTCCTAATGCAATGACTGCTACACAAGTCGAAGAGAAAGA
GATAGAGACTCTGATAACACCTCTTGGACTACAGAAGAAGAGAGCCAAAATGATACAACG
GCTTTCTCTCGAGTATCTTCAAGAGAGCTGGACTCATGTCACTCAACTGCATGGAGTTGG
AAAGTATGCAGCGGATGCATATGCCATATTCTGTAATGGGAAGTGGGATTGTGTGAAACC
TGATGATCATATGCTAAACTATTACTGGGAATTCCTCAGGATTCGGTATAAGTTATGAGT
GGGAAGATACATGTATGTATTGTGCTAATAATATTTTTGTGACTAAGTGATGACAGTATG
TTTCAATTGCTTTTTGAATTTACTTTAGATGTGAATCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU90TF U 1
AF RR2DU90JQ C 622
BS 1 736 RR2DU90TF
BS 737 737 RR2DU90JQ
BS 738 751 RR2DU90TF
BS 752 1360 RR2DU90JQ

RD RR2DU90TF 757 0 0
GGACCACCGAAACAGAAGCTCCTCGATTAGGCGCTCTTCGTTGCCAAGCAAAGTCAGAAT
CTTCCAAATCCAGTGATGAGGACTCGTGGGGCCTCGCCTAACCATTTAAACGACAGATCC
AGGTCCGATGAGTCGCTCGTTTTTTAATTGCCTGGAGAAGGGGACAAGAAATAGTTTTGT
TTCGTCTAGAAGTTTCGATGATTTGTTGTCTGAGTGTACTTATAAAGGTGGGAAGAGGAA
GACATGCAATGGGTTTGGATGTAATCTTGTTACTTCAGGGAACACTGTAAAGGAACAACC
TTTTGATGATGAATCTCACGGAAGGCAAGAATGTAGTGAATCTCTGACTCAAGTAAGAAG
AGTTTCTCCGTACTTCCAGGGAGTAACTGTTTCAGAACAGCACAAACAAGGGTGTAATTC
TGATAGTGTTTCTTCTAAAACTCAAAGTGGAATAAGCTGTACTAGGAAAGCTAAAGTCCA
AAGAGTTTCTCCATACTTCCAGGGAGCAACTAGTTCACCGTGTGATTCTGACAACTTTGC
TTCTCAAAGTGGAAGAAAACCTAGGAAAAGATGCAGCAAAGCTCTACCTAATGTCCGAAA
AGTTTCTCCATATTTCCAGGGATCAACTGTTTCAGAACAGCCAAGAGATTTGCGTCAACA
TTTTAAGGTCGCGAAAGTTTCAAGATATTTCCATGGCCTGTCTGCGGATGGAATCCAAGT
AAATGAATCACAAAAG*AGATATCAAGAAGG
TGAGGA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2DU90JQ 739 0 0
ATCAACTGTTTCAGAACAGCCAAGAGATTTGCGTCAACATTTTAAGGTCGCGAAAGTTTC
AAGATATTTCCATGGCCTGTCTGCGGATGGAATCCAAGTAAATGAATCACAAAAGGAGAT
ATCAAGAAGGGTGAGGAAAACTCCTCTTGTGAGCCCTTCACTCTCTAAGCGTCAGAAGAC
TGATGAGGCATACCTGCGGAAAACGCCTGATAATACATGGGTCCCTCCACGTTCTCCATG
TAATCTACTTCAAGAAGATCACTGGCATGATCCATGGCGGGTGTTGGTCATATTTATGCT
TCTCAACAAAACTTCTGGTGCCCAGGCGCGAAGGGTGATATCAGACCTGTTTGCGCTGTG
TCCTAATGCAATGACTGCTACACAAGTCGAAGAGAAAGAGATAGAGACTCTGATAACACC
TCTTGGACTACAGAAGAAGAGAGCCAAAATGATACAACGGCTTTCTCTCGAGTATCTTCA
AGAGAGCTGGACTCATGTCACTCAACTGCATGGAGTTGGAAAGTATGCAGCGGATGCATA
TGCCATATTCTGTAATGGGAAGTGGGATTGTGTGAAACCTGATGATCATATGCTAAACTA
TTACTGGGAATTCCTCAGGATTCGGTATAAGTTATGAGTGGGAAGATACATGTATGTATT
GTGCTAATAATATTTTTGTGACTAAGTGATGACAGTATGTTTCAATTGCTTTTTGAATTT
ACTTTAGATGTGAATCTTC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL3823Contig1 798 2 1 U
GGATCAATTCCCAAGATGGATTGCCAATTGATTGTGTTGTGAAAAAGGAGAAAAAAGCTA
AGAAGATAATAGAGGAGGATCTTGCGAACAAGAAGGTGAAAAATACTGAGAAGAAAGCTG
GAATTCCACTTAAAAAAGTGAAGCAAGAGAAGGCCTTCAGTATCCCACAACTAAATGATG
AATCCATATCATCAGAAGGTTGGGAAAATCATCTACAGTGGGAGAAGAGTGTAAACTGCA
GGGTGGTGTTGGAAGCACTTGCTTCATCTTTGGAGGAGCCTACACGCAAACGCAAGCCTC
AGTTGACAAAGACTCAAGTTTGGCCATATGTTGGAAATTCAACAGTGAAGCGTATCATAA
CTGGTGAGAAAGTCTCGAAGGAACCTTATGATCCATTAGCTAAGGTTGAGGCAGAGAAAG
TGCAAAAAGTTTTGGACTTCATCAAGACTGATTTGGAAGCAAAGGAACCTGGTGCTGGAG
ATGAAAGCGCTGGATTTTTTTTGAAGTTAGTGATACCAAGGGATTCTTGGCCAACAAAAA
ACTACGGCTGGCTGCATGACTCTCACATTGCAGCAGCAATGCTTATGTTTCACCGACGCT
CCATGCAAGAACAGTCTCCGTATTTCTCTTCTCGAATTGCATTTCTGTCTCACTGGTTTG
TGAACTCATGGGTGAACGACTACAAGAAGTGGGAACAGAACATGAGTGAGTTGTCAGAAA
TGTACAGCAAAGCTTTTGATGGAGAACACCCAGCAGATTTTGTCACGGGTAGAGTGGTTC
GCAGATGTCGATGATCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H769TF U 1
AF RR2GJ80TF U 1
BS 1 798 RR2GJ80TF

RD RR2H769TF 763 0 0
GGATCAATTCCCAAGATGGATTGCCAATTGATTGTGTTGTGAAAAAGGAGAAAAAAGCTA
AGAAGATAATAGAGGAGGATCTTGCGAACAAGAAGGTGAAAAATACTGAGAAGAAAGCTG
GAATTCCACTTAAAAAAGTGAAGCAAGAGAAGGCCTTCAGTATCCCACAACTAAATGATG
AATCCATATCATCAGAAGGTTGGGAAAATCATCTACAGTGGGAGAAGAGTGTAAACTGCA
GGGTGGTGTTGGAAGCACTTGCTTCATCTTTGGAGGAGCCTACACGCAAACGCAAGCCTC
AGTTGACAAAGACTCAAGTTTGGCCATATGTTGGAAATTCAACAGTGAAGCGTATCATAA
CTGGTGAGAAAGTCTCGAAGGAACCTTATGATCCATTAGCTAAGGTTGAGGCAGAGAAAG
TGCAAAAAGTTTTGGACTTCATCAAGACTGATTTGGAAGCAAAGGAACCTGGTGCTGGAG
ATGAAAGCGCTGGATTTTTTTTGAAGTTAGTGATACCAAGGGATTCTTGGCCAACAAAAA
ACTACGGCTGGCTGCATGACTCTCACATTGCAGCAGCAATGCTTATGTTTCACCGACGCT
CCATGCAAGAACAGTCTCCGTATTTCTCTTCTCGATTTGCATTTCTGTCTCACTGGTTTG
TGAACTCATGGGTGAACGACTACAAGAAGTGGGAACAGAACATGAGTGAGTTGTCAGAAA
TGTACAGCAAAGCTTTTGATGGAGA*CACCCAGCAGATTTTGT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2GJ80TF 798 0 0
GGATCAATTCCCAAGATGGATTGCCAATTGATTGTGTTGTGAAAAAGGAGAAAAAAGCTA
AGAAGATAATAGAGGAGGATCTTGCGAACAAGAAGGTGAAAAATACTGAGAAGAAAGCTG
GAATTCCACTTAAAAAAGTGAAGCAAGAGAAGGCCTTCAGTATCCCACAACTAAATGATG
AATCCATATCATCAGAAGGTTGGGAAAATCATCTACAGTGGGAGAAGAGTGTAAACTGCA
GGGTGGTGTTGGAAGCACTTGCTTCATCTTTGGAGGAGCCTACACGCAAACGCAAGCCTC
AGTTGACAAAGACTCAAGTTTGGCCATATGTTGGAAATTCAACAGTGAAGCGTATCATAA
CTGGTGAGAAAGTCTCGAAGGAACCTTATGATCCATTAGCTAAGGTTGAGGCAGAGAAAG
TGCAAAAAGTTTTGGACTTCATCAAGACTGATTTGGAAGCAAAGGAACCTGGTGCTGGAG
ATGAAAGCGCTGGATTTTTTTTGAAGTTAGTGATACCAAGGGATTCTTGGCCAACAAAAA
ACTACGGCTGGCTGCATGACTCTCACATTGCAGCAGCAATGCTTATGTTTCACCGACGCT
CCATGCAAGAACAGTCTCCGTATTTCTCTTCTCGAATTGCATTTCTGTCTCACTGGTTTG
TGAACTCATGGGTGAACGACTACAAGAAGTGGGAACAGAACATGAGTGAGTTGTCAGAAA
TGTACAGCAAAGCTTTTGATGGAGAACACCCAGCAGATTTTGTCACGGGTAGAGTGGTTC
GCAGATGTCGATGATCTT

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

CO CL3824Contig1 509 2 1 U
GGAAGAACACACCTAACCAAAAAATACGATCATTTTTGGAGCCATGAGCACTAGGAAGAT
CCACGGGGGCTACGAAAAGCTCGGGGAAGAAGAAACTAGTTTGAAGAGTGTCTGGAGCGT
TCCGGGTAGTGTTTCTGGTAATTCAAGAAAGCCGATTCAAGAGGTGAAGAAGACGCCGAT
AGTGACACAAACCGGTGGTTCTGTTCACCCTTTGCTAAGTTTCTTGGACGTTCATTTCCA
AAAGAAGAAGAAGAAGACGAAGAAGAACTTGGCGACGGCAAAACCTGAGTTTGCTAGGTA
TATGGAGTATTTGAAGGAAGGAGGTGTATGGGATCCTAATTCTAACGCACCTGTGATTCA
TTACAAATAGTTTGGGTGAATGAAGATGAATAAAGACGTTTGCATATTTTTTGAATAATC
TATAAGGAAACAAATAACAACTAGTGATCGGATTTAAAAGGGATCAAACTATGAATTTGT
CATGTATGACGAGTTATTTTCTTAAGAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EJ56JQ C 1
AF RR2EJ56TF U 1
BS 1 509 RR2EJ56TF

RD RR2EJ56JQ 509 0 0
GGAAGAACACACCTAACCAAAAAATACGATCATTTTTGGAGCCATGAGCACTAGGAAGAT
CCACGGGGGCTACGAAAAGCTCGGGGAAGAAGAAACTAGTTTGAAGAGTGTCTGGAGCGT
TCCGGGTAGTGTTTCTGGTAATTCAAGAAAGCCGATTCAAGAGGTGAAGAAGACGCCGAT
AGTGACACAAACCGGTGGTTCTGTTCACCCTTTGCTAAGTTTCTTGGACGTTCATTTCCA
AAAGAAGAAGAAGAAGACGAAGAAGAACTTGGCGACGGCAAAACCTGAGTTTGCTAGGTA
TATGGAGTATTTGAAGGAAGGAGGTGTATGGGATCCTAATTCTAACGCACCTGTGATTCA
TTACAAATAGTTTGGGTGAATGAAGATGAATAAAGACGTTTGCATATTTTTTGAATAATC
TATAAGGAAACAAATAACAACTAGTGATCGGATTTAAAAGGGATCAAACTATGAATTTGT
CATGTATGACGAGTTATTTTCTTAAGAGC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2EJ56TF 509 0 0
GGAAGAACACACCTAACCAAAAAATACGATCATTTTTGGAGCCATGAGCACTAGGAAGAT
CCACGGGGGCTACGAAAAGCTCGGGGAAGAAGAAACTAGTTTGAAGAGTGTCTGGAGCGT
TCCGGGTAGTGTTTCTGGTAATTCAAGAAAGCCGATTCAAGAGGTGAAGAAGACGCCGAT
AGTGACACAAACCGGTGGTTCTGTTCACCCTTTGCTAAGTTTCTTGGACGTTCATTTCCA
AAAGAAGAAGAAGAAGACGAAGAAGAACTTGGCGACGGCAAAACCTGAGTTTGCTAGGTA
TATGGAGTATTTGAAGGAAGGAGGTGTATGGGATCCTAATTCTAACGCACCTGTGATTCA
TTACAAATAGTTTGGGTGAATGAAGATGAATAAAGACGTTTGCATATTTTTTGAATAATC
TATAAGGAAACAAATAACAACTAGTGATCGGATTTAAAAGGGATCAAACTATGAATTTGT
CATGTATGACGAGTTATTTTCTTAAGAGC

QA 1 509 1 509
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL3827Contig1 921 2 6 U
GGATATCTCTAAGTGTCTTTACACAATACTTCCTTACATTTCAGTTTTCTTATCTTTCTG
CTTCCACACCTTCAACAAAATATAATAAACCCTCTAGATATACTGGCTATATAGACTCCC
ATTTTTTTCACAAACTTAACTCCCTTATTAAGTATTATAGCCTTTTTGTCTCTCGTTACT
TCTCCAGAGAAAGAGAGAAAGTACACAGCTTAAGTTTCACTTTCTTGCGACATAGTAGTG
TTACAACTAAGCAACAAGTAATCTACAAAAATGTCTAACAGAAGATCAAGACAATCTTCA
AGTACTCTGAGGATTTCCGATGACCAGATGATCAACCTAGTAAGTAAGCTCCGTCTTCTT
TTGCCTGAGATTCGTGAACGGCACCGTTCTGATAAGGTAATACATAACATCAATTTCGTC
CGACCTCTTTATATATAGTTCAATTTTCCCCTTTTGAAAAGGAAGAAAATTTACTTTTTT
CTTTCGTTAGAAAGAAGGTGGAAAACAAAATTAATCAAACTAAACGTCGAAACTTTTGAC
TGCTTCAAACATACTTGTTTTCTACTTTGACCAAATGGAAACGTCTAAAAAATCATGTTT
GCGCGATGTCGGTTCATGTATGTGGTCTTGATTATGTTTGCGCATAATATAATATTAGGT
GTCCGCATCGAAGGTACTACAAGAGACATGCAACTACATAAGAAAGCTGCATAGAGAAGT
TGACAATCTCAGTGACCGTTTGTCCCAGCTGCTCGACTCGGTTGATGAAGATAGTCAAGA
AGCTGCCGTCATTAGAAGCTTACTTATGTAACCTTCCAATATAATGATTTATTACAATTT
GATATTATTTATATTAACTTATATGTAATATGTCGATCGTCCTTAATATATTATCAAGCG
ACGTATTTTTAATGAGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA87TF U 1
AF RR2FA87JQ C 306
BS 1 673 RR2FA87TF
BS 674 674 RR2FA87JQ
BS 675 736 RR2FA87TF
BS 737 737 RR2FA87JQ
BS 738 764 RR2FA87TF
BS 765 921 RR2FA87JQ

RD RR2FA87TF 764 0 0
GGATATCTCTAAGTGTCTTTACACAATACTTCCTTACATTTCAGTTTTCTTATCTTTCTG
CTTCCACACCTTCAACAAAATATAATAAACCCTCTAGATATACTGGCTATATAGACTCCC
ATTTTTTTCACAAACTTAACTCCCTTATTAAGTATTATAGCCTTTTTGTCTCTCGTTACT
TCTCCAGAGAAAGAGAGAAAGTACACAGCTTAAGTTTCACTTTCTTGCGACATAGTAGTG
TTACAACTAAGCAACAAGTAATCTACAAAAATGTCTAACAGAAGATCAAGACAATCTTCA
AGTACTCTGAGGATTTCCGATGACCAGATGATCAACCTAGTAAGTAAGCTCCGTCTTCTT
TTGCCTGAGATTCGTGAACGGCACCGTTCTGATAAGGTAATACATAACATCAATTTCGTC
CGACCTCTTTATATATAGTTCAATTTTCCCCTTTTGAAAAGGAAGAAAATTTACTTTTTT
CTTTCGTTAGAAAGAAGGTGGAAAACAAAATTAATCAAACTAAACGTCGAAACTTTTGAC
TGCTTCAAACATACTTGTTTTCTACTTTGACCAAATGGAAACGTCTAAAAAATCATGTTT
GCGCGATGTCGGTTCATGTATGTGGTCTTGATTATGTTTGCGCATAATATAATATTAGGT
GTCCGCATCGAAG*TACTACAAGAGACATGCAACTACATAAGAAAGCTGCATAGAGAAGT
TGACAATCTCAGTGAC*GTTTGTCCCAGCTGCTCGACTCGGTTG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2FA87JQ 616 0 0
TCTGAGGATTTCCGATGACCAGATGATCAACCTAGTAAGTAAGCTCCGTCTTCTTTTGCC
TGAGATTCGTGAACGGCACCGTTCTGATAAGGTAATACATAACATCAATTTCGTCCGACC
TCTTTATATATAGTTCAATTTTCCCCTTTTGAAAAGGAAGAAAATTTACTTTTTTCTTTC
GTTAGAAAGAAGGTGGAAAACAAAATTAATCAAACTAAACGTCGAAACTTTTGACTGCTT
CAAACATACTTGTTTTCTACTTTGACCAAATGGAAACGTCTAAAAAATCATGTTTGCGCG
ATGTCGGTTCATGTATGTGGTCTTGATTATGTTTGCGCATAATATAATATTAGGTGTCCG
CATCGAAGGTACTACAAGAGACATGCAACTACATAAGAAAGCTGCATAGAGAAGTTGACA
ATCTCAGTGACCGTTTGTCCCAGCTGCTCGACTCGGTTGATGAAGATAGTCAAGAAGCTG
CCGTCATTAGAAGCTTACTTATGTAACCTTCCAATATAATGATTTATTACAATTTGATAT
TATTTATATTAACTTATATGTAATATGTCGATCGTCCTTAATATATTATCAAGCGACGTA
TTTTTAATGAGCTTCC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL3828Contig1 1099 2 4 U
GGACCATCACAATACGGTGAAGTTCTCTGCTTGAATCGTCTTCTTCTTCGAGAGACGTCA
CACGCTTGTTTCCAATCAGAAATGGTTGACCTGTCAACTCTATCTCCTTCGGAGATCACG
GTGATGGGATCCGTGTTCTGCGTTTTGCTCTCTATGCACTTCACGATGCAGCTCATCTCC
CAGCATCTCTTCTACTGGAAGAACCCTAAACAACAGAGAGCCATTCTCTTCATTGTACTC
ATGGCTCCTGTTTACGCTGTCAGCTCCTTTTTGGGCTTGCTTGATGCTAAAGGAAGCAAA
CCCTTGTTCATGTTCCTAGACGCCGTTAAAGATTGCTATGAGGCACTTGTCATTGCTAAG
TTCTTGGAGTTGATGTATAGTTACATCAACATATCGATGAGTGGAATGACTATCCCTGAT
GAGATCAAATGGAGAGAGATCCACCATTCGTTTCCAATGACGCTGTTCGTTCCTCGGACA
ACGCACCTGGATCACCGCACGCTGACGCAGCTCAAGCATTGGACGTGGCAGTTCTGTGTT
ATTCGCCCAGTGTGTTCCTTCTTGATCATAGCACTGCAGCCTCTCGGGGTTTATCCACCG
TGGCTGAGCTGGATCTTCACCGTTATTCTGAACGTCTCGGTGTCACTGGCTTTGTATTCT
TTGGTGAAGTTCTTCCATGTTTTTGCTAAAGAGTTGGAGCCTCATAAGCCGCTTACGAAG
TTCATGTGCATTCAAGGGATAGTCTTCTTCTGCTTTTTGGCAGGGAGTAGTGCTGGAGGT
ATTGGTGGGATTGGGGTTAGTTAAGGCGCATCATTTCTGGTTGGAGGTGGAGCAGCTTGG
GGAAGCTCTGCAAAACGTGCTTGTGGTTCTTGAGATGATTGTCTTCTCCGTTATGCAGCA
ATACGCTTTTCACGTTGCTCCCTACAGTGGAGAAACCGAAGCTAAGATGAGAATGAGCAA
GAGGGATTGATTCTAAAAGAGGATTTAGACCAGGAAGATTTTTGTTTTTTTTTGGTTGTT
TATGTTTAATGTGAATGTTACTGATTTTCTCTTACGAACATTTGGATAGTGATTAATAAA
TGTATCAGTCTTCTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ44TF U 1
AF RR2FJ44JQ C 299
BS 1 731 RR2FJ44TF
BS 732 732 RR2FJ44JQ
BS 733 757 RR2FJ44TF
BS 758 1099 RR2FJ44JQ

RD RR2FJ44TF 772 0 0
GGACCATCACAATACGGTGAAGTTCTCTGCTTGAATCGTCTTCTTCTTCGAGAGACGTCA
CACGCTTGTTTCCAATCAGAAATGGTTGACCTGTCAACTCTATCTCCTTCGGAGATCACG
GTGATGGGATCCGTGTTCTGCGTTTTGCTCTCTATGCACTTCACGATGCAGCTCATCTCC
CAGCATCTCTTCTACTGGAAGAACCCTAAACAACAGAGAGCCATTCTCTTCATTGTACTC
ATGGCTCCTGTTTACGCTGTCAGCTCCTTTTTGGGCTTGCTTGATGCTAAAGGAAGCAAA
CCCTTGTTCATGTTCCTAGACGCCGTTAAAGATTGCTATGAGGCACTTGTCATTGCTAAG
TTCTTGGAGTTGATGTATAGTTACATCAACATATCGATGAGTGGAATGACTATCCCTGAT
GAGATCAAATGGAGAGAGATCCACCATTCGTTTCCAATGACGCTGTTCGTTCCTCGGACA
ACGCACCTGGATCACCGCACGCTGACGCAGCTCAAGCATTGGACGTGGCAGTTCTGTGTT
ATTCGCCCAGTGTGTTCCTTCTTGATCATAGCACTGCAGCCTCTCGGGGTTTATCCACCG
TGGCTGAGCTGGATCTTCACCGTTATTCTGAACGTCTCGGTGTCACTGGCTTTGTATTCT
TTGGTGAAGTTCTTCCATGTTTTTGCTAAAGAGTTGGAGCCTCATAAGCCGCTTACGAAG
TTCATGTGCAT*CAAGGGATAGTCTTCTTCTGCTTTT
GGCAGGAGTAGTGCT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2FJ44JQ 801 0 0
AACCCTTGTTCATGTTCCTAGACGCCGTTAAAGATTGCTATGAGGCACTTGTCATTGCTA
AGTTCTTGGAGTTGATGTATAGTTACATCAACATATCGATGAGTGGAATGACTATCCCTG
ATGAGATCAAATGGAGAGAGATCCACCATTCGTTTCCAATGACGCTGTTCGTTCCTCGGA
CAACGCACCTGGATCACCGCACGCTGACGCAGCTCAAGCATTGGACGTGGCAGTTCTGTG
TTATTCGCCCAGTGTGTTCCTTCTTGATCATAGCACTGCAGCCTCTCGGGGTTTATCCAC
CGTGGCTGAGCTGGATCTTCACCGTTATTCTGAACGTCTCGGTGTCACTGGCTTTGTATT
CTTTGGTGAAGTTTTTCCATGTTTTTGCTAAAGAGTTGGAGCCTCATAAGCCGCTTACGA
AGTTCATGTGCATTCAAGGGATAGTCTTTTTTTGCTTTTTGGCAGGGAGTAGTGCTGGAG
GTATTGGTGGGATTGGGGTTAGTTAAGGCGCATCATTTCTGGTTGGAGGTGGAGCAGCTT
GGGGAAGCTCTGCAAAACGTGCTTGTGGTTCTTGAGATGATTGTCTTCTCCGTTATGCAG
CAATACGCTTTTCACGTTGCTCCCTACAGTGGAGAAACCGAAGCTAAGATGAGAATGAGC
AAGAGGGATTGATTCTAAAAGAGGATTTAGACCAGGAAGATTTTTGTTTTTTTTTGGTTG
TTTATGTTTAATGTGAATGTTACTGATTTTCTCTTACGAACATTTGGATAGTGATTAATA
AATGTATCAGTCTTCTGTTTT

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL3829Contig1 1331 2 2 U
GCCTCCACACCGGCGGCGAGGAGGCTCCCGTTGCAGCAGCGCCATAGCGGAAGCCTAACA
ACCTCTTCATCTCTCGCCAGAGAACCCTCGGATCAATCCGATAACGGCGGTGGAGCGAAG
ATGAAGGGTCTCTTCAAGTCCAAGCCTCGCACCCCTGCTGACATCGTCCGTCAGACCCGT
GATCTCTTTCTCTACGCTGATCGATCCAACTCTTTGCCTGACCTCCGTGAATCCAAACGC
GAAGAAAAGATGGCGGAGCTAAGCAAGAACATCCGTGATATGAAGTCTATTCTCTACGGA
AACAGCGAGGCTGAGCCTGTGGCTGAAGCTTGTGCTCAATTGACTCAAGAGTTCTTTAGA
GAGGATACTCTACGTCTCTTGACCACTTGTCTCCCTAAGCTCAACTTGGAGACTAGGAAA
GATGCTACGCAGCTTGTTGCAAATCTACAGAGACAACAAGTGAATTCACGGTTGATTGCT
TCTGATTATCTGGACGCCAACCTTGACCTCATGGATGTTTTGATGGAAGGCTTTGAGAAT
ATGGACTTGGCTTTGCATTATGGTGCTATGTTTAGGGAGTGCATCCGCCATCAGATTGTT
GCCAAATATGTTTTGGAGTCTGAGCATGTGAAGAAGTTCTTCGATTACATACAGCTTCCT
AATTTCGACATTGCTGCCGATGCTGCTGCAACTTTTAAGGAACTGCTAACAAGGCATAAG
TCTACCGTTGCCGAGTTCCTCACCAAGAACGAAGATTGGTTTTTCGCAGACTACAACTCA
AAGCTTCTTGAATCAAGTAATTATATAACCAGACGGCAAGCTATTAAGTTGTTGGGTGAC
ATATTACTGGATAGATCAAATTCAGCTGTGATGACGAGATATGTGAGCTCAAGGGATAAC
TTGAGGATTCTAATGAATCTTCTTAGAGAGTCAAGCAAGAGCATCCAGATCGAAGCATTT
CATGTTTTCAAGCTGTTTGCAGCGAACCAAAACAAGCCTTCAGATATAGTCAACATTCTG
GTGGCAAACAAAAGCAAGCTTCTTAGATTGTTGGCTGACTTGAAACCAGACAAAGAGGAT
GAGAGGTTTGAAGCAGACAAGAGTCAGGTCTTGAAAGAAATTGCAGCCCTTGAGCCGCGA
GATCTTGCTTGAACCAACATATATATGCTCCTTCTTTCCCTTTTTTTAAACATTCAAAAA
GACATTTTTGAAGCATCAAAGTTTGTTGTTTTTTTTTCCTTTATTAGGTAAAACATTTCT
TTCATTTCTCTTACATACTCAGAGACAATATATTCATTTGATTATGAAAATCACTTTTCA
TTGTTGATGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A677TF U 1
AF RR2A677JQ C 550
BS 1 696 RR2A677TF
BS 697 1331 RR2A677JQ

RD RR2A677TF 696 0 0
GCCTCCACACCGGCGGCGAGGAGGCTCCCGTTGCAGCAGCGCCATAGCGGAAGCCTAACA
ACCTCTTCATCTCTCGCCAGAGAACCCTCGGATCAATCCGATAACGGCGGTGGAGCGAAG
ATGAAGGGTCTCTTCAAGTCCAAGCCTCGCACCCCTGCTGACATCGTCCGTCAGACCCGT
GATCTCTTTCTCTACGCTGATCGATCCAACTCTTTGCCTGACCTCCGTGAATCCAAACGC
GAAGAAAAGATGGCGGAGCTAAGCAAGAACATCCGTGATATGAAGTCTATTCTCTACGGA
AACAGCGAGGCTGAGCCTGTGGCTGAAGCTTGTGCTCAATTGACTCAAGAGTTCTTTAGA
GAGGATACTCTACGTCTCTTGACCACTTGTCTCCCTAAGCTCAACTTGGAGACTAGGAAA
GATGCTACGCAGCTTGTTGCAAATCTACAGAGACAACAAGTGAATTCACGGTTGATTGCT
TCTGATTATCTGGACGCCAACCTTGACCTCATGGATGTTTTGATGGAAGGCTTTGAGAAT
ATGGACTTGGCTTTGCATTATGGTGCTATGTTTAGGGAGTGCATCCGCCATCAGATTGTT
GCCAAATATGTTTTGGAGTCTGAGCATGTGAAGAAGTTCTTCGATTACATACAGCTTCCT
AATTTCGACATTGCTGCCGATGCTGCTGCAACTTTT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2A677JQ 782 0 0
GCTTTGCATTATGGTGCTATGTTTAGGGAGTGCATCCGCCATCAGATTGTTGCCAAATAT
GTTTTGGAGTCTGAGCATGTGAAGAAGTTCTTCGATTACATACAGCTTCCTAATTTCGAC
ATTGCTGCCGATGCTGCTGCAACTTTTAAGGAACTGCTAACAAGGCATAAGTCTACCGTT
GCCGAGTTCCTCACCAAGAACGAAGATTGGTTTTTCGCAGACTACAACTCAAAGCTTCTT
GAATCAAGTAATTATATAACCAGACGGCAAGCTATTAAGTTGTTGGGTGACATATTACTG
GATAGATCAAATTCAGCTGTGATGACGAGATATGTGAGCTCAAGGGATAACTTGAGGATT
CTAATGAATCTTCTTAGAGAGTCAAGCAAGAGCATCCAGATCGAAGCATTTCATGTTTTC
AAGCTGTTTGCAGCGAACCAAAACAAGCCTTCAGATATAGTCAACATTCTGGTGGCAAAC
AAAAGCAAGCTTCTTAGATTGTTGGCTGACTTGAAACCAGACAAAGAGGATGAGAGGTTT
GAAGCAGACAAGAGTCAGGTCTTGAAAGAAATTGCAGCCCTTGAGCCGCGAGATCTTGCT
TGAACCAACATATATATGCTCCTTCTTTCCCTTTTTTTAAACATTCAAAAAGACATTTTT
GAAGCATCAAAGTTTGTTGTTTTTTTTTCCTTTATTAGGTAAAACATTTCTTTCATTTCT
CTTACATACTCAGAGACAATATATTCATTTGATTATGAAAATCACTTTTCATTGTTGATG
AG

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL3830Contig1 624 2 1 U
GTCCTCAAGAAAGAGTCCTTCAAGTCTGATACCATGACGAACATGATATCCATCTCCTTC
GGCGTCTCGATCGCTGCCTACGGCGAGGCGAGATTCGATGTGTTTGGCGTGATGCTCCAG
CTTGGTGCTGTTGCTTTCGAGGCGACACGTTTGGTTCTGATTCAGATCTTGTTAACGTCC
AAAGGCATCAACCTCAACCCCATAACGTCTCTCTACTACGTCGCTCCTTGCTGTTTAGCT
TTCTTGTTTATCCCCTGGATCTGCGTGGAGCTCCCTGTTCTTAGAGACACGTCTAGCTTC
CACTTCGATTACGTCGTCTTCGGGACCAACTCGTTGTGTGCGTTTGCTTTGAACCTCGCT
GTGTTTCTCCTCGTTGGGAAGACTTCGGCGTTGACTATGAATGTTGCTGGTGTGGTTAAG
GATTGGCTGTTGGTCGCTTTCTCGTGGTCTGTGATTAAGGATACTGTGACTCCTGTTAAC
CTTTTTGGGTACGGGGTAGCGTTCTTGGGTTTTGCGTATTATAATCACGCGAAGTTGCAG
GCGTTGAAGGCGAAAGAGGCTCAGAAGAAGGTTCAGCAAGGGGATGAAGAGAGTGGGAGG
TTGTTGGAGTGAGGGAAGGTGGTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN55TF U 1
AF RR2GM32TF U 1
BS 1 624 RR2GM32TF

RD RR2GN55TF 610 0 0
GTCCTCAAGAAAGAGTCCTTCAAGTCTGATACCATGACGAACATGATATCCATCTCCTTC
GGCGTCTCGATCGCTGCCTACGGCGAGGCGAGATTCGATGTGTTTGGCGTGATGCTCCAG
CTTGGTGCTGTTGCTTTCGAGGCGACACGTTTGGTTCTGATTCAGATCTTGTTAACGTCC
AAAGGCATCAACCTCAACCCCATAACGTCTCTCTACTACGTCGCTCCTTGCTGTTTAGCT
TTCTTGTTTATCCCCTGGATCTGCGTGGAGCTCCCTGTTCTTAGAGACACGTCTAGCTTC
CACTTCGATTACGTCGTCTTCGGGACCAACTCGTTGTGTGCGTTTGCTTTGAACCTCGCT
GTGTTTCTCCTCGTTGGGAAGACTTCGGCGTTGACTATGAATGTTGCTGGTGTGGTTAAG
GATTGGCTGTTGGTCGCTTTCTCGTGGTCTGTGATTAAGGATACTGTGACTCCTGTTAAC
CTTTTTGGGTACGGGGTAGCGTTCTTGGGTTTTGCGTATTATAATCACGCGAAGTTGCAG
GCGTTGAAGGCGAAAGAGGCTCAGAAGAAG*TTCAGCAAGGGGATGAAGAGAGTGGGAG
TTGTTGGAAGT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2GM32TF 624 0 0
GTCCTCAAGAAAGAGTCCTTCAAGTCTGATACCATGACGAACATGATATCCATCTCCTTC
GGCGTCTCGATCGCTGCCTACGGCGAGGCGAGATTCGATGTGTTTGGCGTGATGCTCCAG
CTTGGTGCTGTTGCTTTCGAGGCGACACGTTTGGTTCTGATTCAGATCTTGTTAACGTCC
AAAGGCATCAACCTCAACCCCATAACGTCTCTCTACTACGTCGCTCCTTGCTGTTTAGCT
TTCTTGTTTATCCCCTGGATCTGCGTGGAGCTCCCTGTTCTTAGAGACACGTCTAGCTTC
CACTTCGATTACGTCGTCTTCGGGACCAACTCGTTGTGTGCGTTTGCTTTGAACCTCGCT
GTGTTTCTCCTCGTTGGGAAGACTTCGGCGTTGACTATGAATGTTGCTGGTGTGGTTAAG
GATTGGCTGTTGGTCGCTTTCTCGTGGTCTGTGATTAAGGATACTGTGACTCCTGTTAAC
CTTTTTGGGTACGGGGTAGCGTTCTTGGGTTTTGCGTATTATAATCACGCGAAGTTGCAG
GCGTTGAAGGCGAAAGAGGCTCAGAAGAAGGTTCAGCAAGGGGATGAAGAGAGTGGGAGG
TTGTTGGAGTGAGGGAAGGTGGTG

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL3831Contig1 1185 2 4 U
GGGAAGAAACAAAAAAAAATTCTCAGAGAAAATGGATCAAGAATCATCTGAGTGTCCCTT
CGTTGCGGAAAGCATCATCCAAAAGTGCCCTTTCCTCAGAAACATCAACAAGCCAACCAG
CTTCTCCCTCTCCTCCTTGAGTTTTCCAGTTCCTGTGCAAGAAGGTAGCAAAGGCCCGAT
TTTTGAGGATGGTCCTGGCTTTAATTCAGCTTTCAAGCTCTTCCATGGCAAAGACGGTAT
TGTTCCGTTATCTGGACATTCCACTTTCAGAGATGATCTCCAAGACGAGACTCCACTGTT
CAATCCTCTTGCGGGGAAGGTTGCTACCATAAGCCTATCATCAGCTTTTGGTCCTGGAGG
ACCTTTTGGGTTTGGTCCTTTCTCTGACAAGTTCAAGAAGAACACCAAAAAACAAGAGTC
TGGGGACTCATCCAAGCACGAGGCAGTTGGTGACGAATGGTTAAAAAACGGGAACTGTCC
GATCGCGAAATCATACAGAGCGGCGAGCAAAGTCATGCCTCTTGTGGCGAAAGCATTACA
GCCACCACCTGGTATGAAGTTTAGATGTCCAGCTCCTATAGTAGCTGCAAGAGCTGCGCT
TTCCAAGACCCTTTTGGTCAAAAGCCTTCGCCCTCAGCCTTTACCTGAAAAGATGCTCGC
CATCGCTCTCATGGGGATGGCTGCAAACGTGCCTCTCGGTGTTTGGAGGGAACACACCAT
TAAGTTTTCTCCTTCATGGTTTGTGGCGGTTCATGCTGCTGTGCCTTTCATAGCTATGCT
CAGGAAATCTGTGCTCATGCCTAAAGCAGCCATGGCTTTGACTATCGGAGCGTCCATCTT
GGGACAGGTGATTGGGTCGAGAGCTGAACGGTACCGTCTCAGAGCGTTAGCTGCGAATAC
GGTTGCTGAAGCATCGACTGTTACTGCTGGTGATGGACACAACGACCAGGTGTCTGATGG
TTCAGGCTTTGCTAAAGGACATTGTGGTGCAGGGGAAGGAGTGAAGGAGGTTTATTACAA
TGTGAATATTGGTGAACCAGCTAAATCAACTGGACTCTGCTATTGATATATGTTCTTATT
AAAACTACAAAATTACTATGTTACAATTGCAATGTTTTGTGTGGAAAAGTTAATTCAGTA
ATATTGTGTAAGACATAATAATAAAAGGTGAATAATTCCCTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ95TF U 1
AF RR2FJ95JQ C 412
BS 1 711 RR2FJ95TF
BS 712 712 RR2FJ95JQ
BS 713 725 RR2FJ95TF
BS 726 1185 RR2FJ95JQ

RD RR2FJ95TF 725 0 0
GGGAAGAAACAAAAAAAAATTCTCAGAGAAAATGGATCAAGAATCATCTGAGTGTCCCTT
CGTTGCGGAAAGCATCATCCAAAAGTGCCCTTTCCTCAGAAACATCAACAAGCCAACCAG
CTTCTCCCTCTCCTCCTTGAGTTTTCCAGTTCCTGTGCAAGAAGGTAGCAAAGGCCCGAT
TTTTGAGGATGGTCCTGGCTTTAATTCAGCTTTCAAGCTCTTCCATGGCAAAGACGGTAT
TGTTCCGTTATCTGGACATTCCACTTTCAGAGATGATCTCCAAGACGAGACTCCACTGTT
CAATCCTCTTGCGGGGAAGGTTGCTACCATAAGCCTATCATCAGCTTTTGGTCCTGGAGG
ACCTTTTGGGTTTGGTCCTTTCTCTGACAAGTTCAAGAAGAACACCAAAAAACAAGAGTC
TGGGGACTCATCCAAGCACGAGGCAGTTGGTGACGAATGGTTAAAAAACGGGAACTGTCC
GATCGCGAAATCATACAGAGCGGCGAGCAAAGTCATGCCTCTTGTGGCGAAAGCATTACA
GCCACCACCTGGTATGAAGTTTAGATGTCCAGCTCCTATAGTAGCTGCAAGAGCTGCGCT
TTCCAAGACCCTTTTGGTCAAAAGCCTTCGCCCTCAGCCTTTACCTGAAAAGATGCTCGC
CATCGCTCTCATGGGGATGGCTGCAAACGTGCCTCTCGGTGTTTGGAGGGA*CACACCAT
TAAGT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2FJ95JQ 774 0 0
ACAAGAGTCTGGGGACTCATCCAAGCACGAGGCAGTTGGTGACGAATGGTTAAAAAACGG
GAACTGTCCGATCGCGAAATCATACAGAGCGGCGAGCAAAGTCATGCCTCTTGTGGCGAA
AGCATTACAGCCACCACCTGGTATGAAGTTTAGATGTCCAGCTCCTATAGTAGCTGCAAG
AGCTGCGCTTTCCAAGACCCTTTTGGTCAAAAGCCTTCGCCCTCAGCCTTTACCTGAAAA
GATGCTCGCCATCGCTCTCATGGGGATGGCTGCAAACGTGCCTCTCGGTGTTTGGAGGGA
ACACACCATTAAGTTTTCTCCTTCATGGTTTGTGGCGGTTCATGCTGCTGTGCCTTTCAT
AGCTATGCTCAGGAAATCTGTGCTCATGCCTAAAGCAGCCATGGCTTTGACTATCGGAGC
GTCCATCTTGGGACAGGTGATTGGGTCGAGAGCTGAACGGTACCGTCTCAGAGCGTTAGC
TGCGAATACGGTTGCTGAAGCATCGACTGTTACTGCTGGTGATGGACACAACGACCAGGT
GTCTGATGGTTCAGGCTTTGCTAAAGGACATTGTGGTGCAGGGGAAGGAGTGAAGGAGGT
TTATTACAATGTGAATATTGGTGAACCAGCTAAATCAACTGGACTCTGCTATTGATATAT
GTTCTTATTAAAACTACAAAATTACTATGTTACAATTGCAATGTTTTGTGTGGAAAAGTT
AATTCAGTAATATTGTGTAAGACATAATAATAAAAGGTGAATAATTCCCTCAGC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL3832Contig1 832 2 20 U
ACCCCCAACTGGCATTACTTATGGTTGAATCTAATAATCTACATAGCAATATTATATACA
CACAAGTTTCTTTGCTTATAACGTATTTTAGTTTTTCACTCTTTGTTCTTGGAAGATCGG
TCTTTTCTTTGACCACCAAGGATACGCGAAATCTGCAAACCTCTACTAAACGCTTGGTTA
AAGAGCATTCTTGTCTGAAACTCAAACACGAACGGGAACCAAGCCAAGAACGCCACCGGA
GTGAACAAAAGCAAACCCATCAGAATCTCATAGCCTCGTGCCAACGTCCGAACCGACGAC
CAGATCCCCAGCCGTTGAATCAGAGGCTTACACGCTTGTGCAATAAGTAACATTCCCCAT
CCGGTAGGCATGAAAGCAAGCATACAAAGGAAAATGTCTTTAGGTGTTAAGAAACGAAGA
GCTATGAAAGTAATGAGGATTGCAAGGAACGTGAGGAACACAAGACCCTTGATGATCCTG
AAGAGAAGCTGGAAGTTTGTGCTGAACCGTCTCCTTCCCATACCCAAACCCTTCACAATG
AGTAAAATGAACAAGATGACGAACCACGAAGCTCCATATATCCACAAACTTTGGTTTTCC
TGATTAAATTTGCTGAGCTGATACACGAGCCCATACTGAAAGATGAAGAAACGCAAAGCC
GAAACAATCTCAAGAATGATACCACGTTTCCCCGAGTGTCTAAGATGCTCTATCTCCTTC
TCCCACCAAGACTCCCAACTCTTCTCCGGAGGAACACCGATCCCTCCTCGGTTATATATC
CACTTGTTCCAGTCCGTCCAATCATCCACAATCTTCTGCCACTCGAATCCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA21JQ U 1
AF RR2BI70JQ U 74
BS 1 233 RR2AA21JQ
BS 234 234 RR2BI70JQ
BS 235 253 RR2AA21JQ
BS 254 254 RR2BI70JQ
BS 255 296 RR2AA21JQ
BS 297 297 RR2BI70JQ
BS 298 302 RR2AA21JQ
BS 303 303 RR2BI70JQ
BS 304 308 RR2AA21JQ
BS 309 309 RR2BI70JQ
BS 310 332 RR2AA21JQ
BS 333 333 RR2BI70JQ
BS 334 365 RR2AA21JQ
BS 366 366 RR2BI70JQ
BS 367 419 RR2AA21JQ
BS 420 420 RR2BI70JQ
BS 421 485 RR2AA21JQ
BS 486 486 RR2BI70JQ
BS 487 575 RR2AA21JQ
BS 576 832 RR2BI70JQ

RD RR2AA21JQ 576 0 0
ACCCCCAACTGGCATTACTTATGGTTGAATCTAATAATCTACATAGCAATATTATATACA
CACAAGTTTCTTTGCTTATAACGTATTTTAGTTTTTCACTCTTTGTTCTTGGAAGATCGG
TCTTTTCTTTGACCACCAAGGATACGCGAAATCTGCAAACCTCTACTAAACGCTTGGTTA
AAGAGCATTCTTGTCTGAAACTCAAACACGAACGGGAACCAAGCCAAGAACGCTACCGGA
GTGAACAAAAGCAGACCCATCAGAATCTCATAGCCTCGTGCCAACGTCCGAACCGATGAC
CATATCCCTAGCCGTTGAATCAGAGGCTTACATGCTTGTGCAATAAGTAACATTCCCCAT
CCGGTTGGCATGAAAGCAAGCATACAAAGGAAAATGTCTTTAGGTGTTAAGAAACGAAGT
GCTATGAAAGTAATGAGGATTGCAAGGAACGTGAGGAACACAAGACCCTTGATGATCCTG
AAGAGTAGCTGGAAGTTTGTGCTGAACCGTCTCCTTCCCATACCCAAACCCTTCACAATG
AGTAAAATGAACAAGATGACGAACCACGAAGCTCC
C

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2BI70JQ 759 0 0
GCTTATAACGTATTTTAGTTTTTCACTCTTTGTTCTTGGAAGATCGGTCTTTTCTTTGAC
CACCAAGGATACGCGAAATCTGCAAACCTCTACTAAACGCTTGGTTAAAGAGCATTCTTG
TCTGAAACTCAGACACGAACGGGAACCAAGCCAAGAACGCCACCGGAGTGAACAAAAGTA
AACCCATCAGTATCTCATAGCCTCGTGCCAACGTCCGAACCGACGACCAGATCCCCAGCC
GTTGAATCAGAGGCTTACACGCTTGTGCAATAAGTAACATTCCCCATCCGGTAGGCATGA
AAGCGAGCATACAAAGGAGAATGTCTTTAGGTGTTAAGAAACGCAGAGCTATGAAAGTAA
TGAGGATTGCAAGGAATGTGAGGAACACAAGACCCTTGATGATCCTGAAGAGAAGCTGGA
AGTTTGTGCTGAACCGTCTCCTTCCCATACCCAAACCCTTCACAATGAGTAAAATGAACA
AGATGACGAACCATGAAGCTCCATATATCCACAAACTTTGGTTTTCCTGATTAAATTTGC
TGAGCTGATACACGAGCCCATACTGAAAGATGAAGAAACGCAAAGCCGAAACAATCTCAA
GAATGATACCACGTTTCCCCGAGTGTCTAAGATGCTCTATCTCCTTCTCCCACCAAGACT
CCCAACTCTTCTCCGGAGGAACACCGATCCCTCCTCGGTTATATATCCACTTGTTCCAGT
CCGTCCAATCATCCACAATCTTCTGCCACTCGAATCCAG

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL3833Contig1 539 2 4 U
GGAGGAGATTCCAATCGAACACCGGAGAAAATGGCGAAGCCTTTAGGTACTACCGGCGAG
TTTTTCCGGCGAAGAGACGAATGGAGGAAGCACCCGATGCTTTCGAATCAAATGAGGCAC
GCTCTTCCCGGGCTCGGCATCGGCGTCGCCGCCTTCTGCGTGTACCTCGTGGGTGAGCAG
ATCTACAGCAAAGCCTTGGCTCCTTCCAAATCATCATCTCACCACAATCAGAAACAGCCT
GCTCCTTCTCACTGAAATGGCTTTTGATCAGATGCTCGAAAGTCGAAACAGTGGGCACAA
GATGAACACCAAGGCTTCTTCTGGGCTTGTATTAATAATATGTTGGTTGTGTTGGACACA
AGTTTTTCGATTTCTCTGTTGAATTTTAAAGCTTGTTGAGTTCAAAGTTACTCTTTGTCT
CCCGTAAGTTATGTTTTTTTCTTCTAAACGTTGAAGGTTGATTTGTCTTGTTTGATTGTC
TTTTGTAATCGTGACTTGTTGCTGAGTAGACACTCAGCTAAAAATGCGTCGTTTTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2H472TF U 1
AF RR2H472JQB C 61
BS 1 523 RR2H472TF
BS 524 524 RR2H472JQB
BS 525 535 RR2H472TF
BS 536 539 RR2H472JQB

RD RR2H472TF 535 0 0
GGAGGAGATTCCAATCGAACACCGGAGAAAATGGCGAAGCCTTTAGGTACTACCGGCGAG
TTTTTCCGGCGAAGAGACGAATGGAGGAAGCACCCGATGCTTTCGAATCAAATGAGGCAC
GCTCTTCCCGGGCTCGGCATCGGCGTCGCCGCCTTCTGCGTGTACCTCGTGGGTGAGCAG
ATCTACAGCAAAGCCTTGGCTCCTTCCAAATCATCATCTCACCACAATCAGAAACAGCCT
GCTCCTTCTCACTGAAATGGCTTTTGATCAGATGCTCGAAAGTCGAAACAGTGGGCACAA
GATGAACACCAAGGCTTCTTCTGGGCTTGTATTAATAATATGTTGGTTGTGTTGGACACA
AGTTTTTCGATTTCTCTGTTGAATTTTAAAGCTTGTTGAGTTCAAAGTTACTCTTTGTCT
CCCGTAAGTTATGTTTTTTTCTTCTAAACGTTGAAGGTTGATTTGTCTTGTTTGATTGTC
TTTTGTAATCGTGACTTGTTGCTGAGTAGACACTCAGCTAAAACTGCGTCGTTTT

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2H472JQB 479 0 0
TTTTTCCGGCGAAGAGACGAATGGAGGAAGCACCCGATGCTTTCGAATCAAATGAGGCAC
GCTCTTCCCGGGCTCGGCATCGGCGTCGCCGCCTTCTGCGTGTACCTCGTGGGTGAGCAG
ATTTACAGCAAAGCCTTGGCTCCTTCCAAATCATCATCTCACCACAATCAGAAACAGCCT
GCTCCTTTTCACTGAAATGGCTTTTGATCAGATGCTCGAAAGTCGAAACAGTGGGCACAA
GATGAACACCAAGGCTTTTTTTGGGCTTGTATTAATAATATGTTGGTTGTGTTGGACACA
AGTTTTTCGATTTCTCTGTTGAATTTTAAAGCTTGTTGAGTTCAAAGTTACTCTTTGTCT
CCCGTAAGTTATGTTTTTTTTTTTTAAACGTTGAAGGTTGATTTGTCTTGTTTGATTGTC
TTTTGTAATCGTGACTTGTTGCTGAGTAGACACTCAGCTAAAAATGCGTCGTTTTTTGG

QA 1 479 1 479
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3835Contig1 952 2 8 U
GAAGCTCTCATTTACTCCTTCATGGACCAACGAGAAGTATATGTCTAAGGATGTTAAGCC
TAAAGTGGCTGTGATCCGAGAGGAAGGCAGCAATGGAGACAGAGAAATGTCAGCTGCATT
TTTCGCTGCAGGTTTCGAACCGTGGGACGTGACAGTGTCTGATCTTCTAGCTGGAGCAAT
CACTCTTGATCAGTTCCGTGGGATTGTGTTTGTTGGAGGGTTCAGCTACGCTGACGTCCT
TGACTCAGCCAAAGGATGGGCTGCTTCGATAAGATTCAACTCTCCTCTCCTCAGCCAGTT
CCAAGAGTTCTACAAAAGACCAGACACGTTCAGCCTCGGAATCTGCAATGGCTGTCAACT
TATGGCATTGTTAGGATGGGTTCCAGGCCCTCAAGTCGGCGGGTCACTCGACACGGCCCA
GCCAAGGTTCGTTCACAACGAGTCAGGAAGGTTTGAGTGCAGGTTCACAAGCGTGACCAT
TAAGGACTCGCCATCGATAATGCTGAAAGGAATGGAAGGAAGCACCTTAGGAGTAGGGGC
GGCTCATGGAGAAGGAAGAGCTTATTTCCCTGACGAAGGAGTGTTGGACCATATGCTTCA
CTCGGATTTGGCTCCGTTGAGATACTGTGATGATGATGGGAGTGTGACTGAAGCTTACCC
TTTTCACCTCAACGGCTCACCGTTGGGAATAGCGGCTATATGTTCACCTGATGGAAGACA
TCTTGCGATGATGCCTCATCCTGAACGTTGTTTCTTGATGTGGCAGTACCCGTGGTATCC
GAAGAGCTGGGAGGTTGAGAAAGCTGGGCCGAGTCCGTGGTTGAAGATGTTCCAGAATGC
TAGGGACTGGTGCTCTAAGCTGTAGAGTCATGTTTAAGTTTGGTGATGGTTAGTGAGAGT
GTTCTGACAATTGGGTCTACGTTTTGTTTTTACTTGATAATACATTCTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT30TF U 1
AF RR2BT30JQ C 311
BS 1 671 RR2BT30TF
BS 672 672 RR2BT30JQ
BS 673 688 RR2BT30TF
BS 689 689 RR2BT30JQ
BS 690 715 RR2BT30TF
BS 716 716 RR2BT30JQ
BS 717 732 RR2BT30TF
BS 733 952 RR2BT30JQ

RD RR2BT30TF 732 0 0
GAAGCTCTCATTTACTCCTTCATGGACCAACGAGAAGTATATGTCTAAGGATGTTAAGCC
TAAAGTGGCTGTGATCCGAGAGGAAGGCAGCAATGGAGACAGAGAAATGTCAGCTGCATT
TTTCGCTGCAGGTTTCGAACCGTGGGACGTGACAGTGTCTGATCTTCTAGCTGGAGCAAT
CACTCTTGATCAGTTCCGTGGGATTGTGTTTGTTGGAGGGTTCAGCTACGCTGACGTCCT
TGACTCAGCCAAAGGATGGGCTGCTTCGATAAGATTCAACTCTCCTCTCCTCAGCCAGTT
CCAAGAGTTCTACAAAAGACCAGACACGTTCAGCCTCGGAATCTGCAATGGCTGTCAACT
TATGGCATTGTTAGGATGGGTTCCAGGCCCTCAAGTCGGCGGGTCACTCGACACGGCCCA
GCCAAGGTTCGTTCACAACGAGTCAGGAAGGTTTGAGTGCAGGTTCACAAGCGTGACCAT
TAAGGACTCGCCATCGATAATGCTGAAAGGAATGGAAGGAAGCACCTTAGGAGTAGGGGC
GGCTCATGGAGAAGGAAGAGCTTATTTCCCTGACGAAGGAGTGTTGGACCATATGCTTCA
CTCGGATTTGGCTCCGTTGAGATACTGTGATGATGATGGGAGTGTGACTGAAGCTTACCC
TTTTCACCTCA*CGGCTCACCGTTGGGA*TAGCGGCTATATGTTCACCTGATGGA*GACA
TCTTGCGATGAT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2BT30JQ 642 0 0
TACAAAAGACCAGACACGTTCAGCCTCGGAATCTGCAATGGCTGTCAACTTATGGCATTG
TTAGGATGGGTTCCAGGCCCTCAAGTCGGCGGGTCACTCGACACGGCCCAGCCAAGGTTC
GTTCACAACGAGTCAGGAAGGTTTGAGTGCAGGTTCACAAGCGTGACCATTAAGGACTCG
CCATCGATAATGCTGAAAGGAATGGAAGGAAGCACCTTAGGAGTAGGGGCGGCTCATGGA
GAAGGAAGAGCTTATTTCCCTGACGAAGGAGTGTTGGACCATATGCTTCACTCGGATTTG
GCTCCGTTGAGATACTGTGATGATGATGGGAGTGTGACTGAAGCTTACCCTTTTCACCTC
AACGGCTCACCGTTGGGAATAGCGGCTATATGTTCACCTGATGGAAGACATCTTGCGATG
ATGCCTCATCCTGAACGTTGTTTCTTGATGTGGCAGTACCCGTGGTATCCGAAGAGCTGG
GAGGTTGAGAAAGCTGGGCCGAGTCCGTGGTTGAAGATGTTCCAGAATGCTAGGGACTGG
TGCTCTAAGCTGTAGAGTCATGTTTAAGTTTGGTGATGGTTAGTGAGAGTGTTCTGACAA
TTGGGTCTACGTTTTGTTTTTACTTGATAATACATTCTTCAG

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL3836Contig1 621 2 3 U
TTTTTTGGCAAAATAAACAAAATCGATGCATTAAAACATTAATATCTGAACACTCGAATG
TAGAATTCTTCCATGGATAAAAGGGATAAAAGCATCCAAAAACATAAACTAAGCTGAAAA
GCCCCGTTCTTACATTCCAGTAAAAGCCTTCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAAT
CACCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAGCATGGTGAGACA
TGAGCAGGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTCGTACCTCTGATACTTCTTGACAAAGTGGAGA
TAGTTCCTTCTCACGATGATGGTCCTCTGCATCTTGGCGCTGTGGCAAGTACCAGCTAAA
AAACGGCCTCTGATGGAAACAGTTCCGGTGAAGGGACATTTTCTGTCAATGTAAGTTCCT
TGAATGGCTTCACGAGGAATCTTGAAGCCCAAACCGATGTTCTTGGAGAAACGGTTTCCA
CCCTTTCCAGGTCGCTTTCCCTTTCCAGATATCTTCGAGCTAAGGAAGACCTTAGGTTGC
TTTAGAAAAGCCTTCTCAGTCTGTTCCGCCATGGTTGCTGTTTTGTGAAAGCTTGAGGAA
AGAACGTAGGAGACGATAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK70JQ U 7
AF RR2BK70TF C 1
BS 1 6 RR2BK70TF
BS 7 461 RR2BK70JQ
BS 462 621 RR2BK70TF

RD RR2BK70JQ 455 0 0
GGCAAAATAAACAAAATCGATGCATTAAAACATTAATATCTGAACACTCGAATGTAGAAT
TCTTCCATGGATAAAAGGGATAAAAGCATCCAAAAACATAAACTAAGCTGAAAAGCCCCG
TTCTTACATTCCAGTAAAAGCCTTCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAATCACCTG
CATTGGCCGATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAGCATGGTGAGACATGAGCA
GGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTCGTACCTCTGATACTTCTTGACAAAGTGGAGATAGTTC
CTTCTCACGATGATGGTCCTCTGCATCTTGGCGCTGTGGCAAGTACCAGCTAAAAAACGG
CCTCTGATGGAAACAGTTCCGGTGAAGGGACATTTTCTGTCAATGTAAGTTCCTTGAATG
GCTTCACGAGGAATCTTGAAGCCCAAACCGATGTT

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR2BK70TF 621 0 0
TTTTTTGGCAAAATAAACAAAATCGATGCATTAAAACATTAATATCTGAACACTCGAATG
TAGAATTCTTCCATGGATAAAAGGGATAAAAGCATCCAAAAACATAAACTAAGCTGAAAA
GCCCCGTTCTTACATTCCAGTAAAAGCCTTCTTCGCGAAAGCAGAAGCACCAGCTGGAAT
CACCTGCATTGGCCGATGATGACATGGTCTCCTTCCTTGACACGGAAGCATGGTGAGACA
TGAGCAGGGATGTTCGAGTGCCTCTTCTCGTACCTCTGATACTTCTTGACAAAGTGGAGA
TAGTTCCTTCTCACGATGATGGTCCTCTGCATCTTGGCGCTGTGGCAAGTACCAGCTAAG
ATACGGCCTCTGATGGAAACAGTTCCGGTGAAGGGACATTTTCTGTCAATGTAAGTTCCT
TGAATGGCTTCACGAGGAATCTTGAAGCCCAAACCGATGTTCTTGGAGAAACGGTTTCCA
CCCTTTCCAGGTCGCTTTCCCTTTCCAGATATCTTCGAGCTAAGGAAGACCTTAGGTTGC
TTTAGAAAAGCCTTCTCAGTCTGTTCCGCCATGGTTGCTGTTTTGTGAAAGCTTGAGGAA
AGAACGTAGGAGACGATAGAG

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

CO CL3837Contig1 1226 2 2 U
GAAGACTGAAGGAGAGGAGAACATCACTAGTTCATCAGGAGGTAACAACGAGTCTGTTGA
AACAAGAACTGAGAGTGAGAGCGAGAGTGTGGTGTTGGCAAAGGGATTCTCTGATTCCAA
TGGTGAATTGCCTGAGAGCAACCAGTCGGCTTCTAATGCAACTGAAACTACAGAGTCAAC
TGAAAAGACCACTGGTTATCAAGAAACTAAAAACGAAGAAGACGAGCGGGAGAAGACACA
ATCTTCTCAACTCTCATCTGAAGTGGAAAGTAAAAGCAAAGAAGAGTTCTTGTCCCAAGA
CGACAGTAAAGAGGAAGAACCCCAGAAAAAGAAGAAAGAGGACTCTTCATCCCAAGAGGA
GAGTAAAGAGGAAGAGCCACATAACAAGGAGAAAGAAGAGACTTCACAACAAGAGGAAAA
GGAGAAAGGAGAGGCTTCTTCGCAAGAGGAGAATGAAAACAAAGAAACTGAGAACAAGGA
GAAAGGTGAGTCTTCGTCCCAAGAGGAGAGTGAGAGCAAAGAAACTGAGAACAAGGAGAA
AGGAGAGGCTTCTTCACAGGAAGAGAATGAAAGCAAAGAAACTGAGAACATTGAGAAAGT
AGAGTCTTCGTCCCAAGAGGAGGGTGTGAGCAAAGAAACTGAGAACAAGGAGAAAGGAGA
GGCTTCTCTAAAAGAGGAGAACACTGAGAAAGGCCAGTCTTCGTCCCACGAGGAGAATGT
GAGTAAAGAAGCCGAGAAGAGGGAGAAAGAAGAGTCCTCAGAGTCTCAGCAAACGGAAAA
CACTAACAGCGAGAAGACCATTGAACAGGTGGAATCTACTGATTCTTCAAACAAACAGGA
GAAGAGTGACGAACATGAAACTGAGGGAAACAAGAGTCAATCTGGCAACGAGCACAGCAA
ATCAGGTTCTTCTGATGACGAAAAGAAAACAGAGAATGACACATCAAAAACAGAGTCGGA
CAAGGAGAAGAAAGACAACAAAACTGGTGATCACGAACATACTAAGGATGCTGCTGGAAC
AGAACTGAAAACTCAGCCCGAGTCTAACAATGGATTCACCAACGACAAAGTTGCTGCTGA
GTGAGTCCCTTTAACCAAATTTGTCTGTCATGTACTGTATACTACTACATACTCTAAAAA
ATACTTTTTTCATATCACGGGAACTAATCCCCAATTGGTAGAACTGAGTTTTGAAACAAA
TCAATGTATGAAATAAAACCTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR06TF U 1
AF RR2AR06JQ C 386
BS 1 833 RR2AR06TF
BS 834 1226 RR2AR06JQ

RD RR2AR06TF 833 0 0
GAAGACTGAAGGAGAGGAGAACATCACTAGTTCATCAGGAGGTAACAACGAGTCTGTTGA
AACAAGAACTGAGAGTGAGAGCGAGAGTGTGGTGTTGGCAAAGGGATTCTCTGATTCCAA
TGGTGAATTGCCTGAGAGCAACCAGTCGGCTTCTAATGCAACTGAAACTACAGAGTCAAC
TGAAAAGACCACTGGTTATCAAGAAACTAAAAACGAAGAAGACGAGCGGGAGAAGACACA
ATCTTCTCAACTCTCATCTGAAGTGGAAAGTAAAAGCAAAGAAGAGTTCTTGTCCCAAGA
CGACAGTAAAGAGGAAGAACCCCAGAAAAAGAAGAAAGAGGACTCTTCATCCCAAGAGGA
GAGTAAAGAGGAAGAGCCACATAACAAGGAGAAAGAAGAGACTTCACAACAAGAGGAAAA
GGAGAAAGGAGAGGCTTCTTCGCAAGAGGAGAATGAAAACAAAGAAACTGAGAACAAGGA
GAAAGGTGAGTCTTCGTCCCAAGAGGAGAGTGAGAGCAAAGAAACTGAGAACAAGGAGAA
AGGAGAGGCTTCTTCACAGGAAGAGAATGAAAGCAAAGAAACTGAGAACATTGAGAAAGT
AGAGTCTTCGTCCCAAGAGGAGGGTGTGAGCAAAGAAACTGAGAACAAGGAGAAAGGAGA
GGCTTCTCTAAAAGAGGAGAACACTGAGAAAGGCCAGTCTTCGTCCCACGAGGAGAATGT
GAGTAAAGAAGCCGAGAAGAGGGAGAAAGAAGAGTCCTCAGAGTCTCAGCAAACGGAAAA
CACTAACAGCGAGAAGACCATTGAACAGGTGGAATCTACTGATTCTTCAAACA

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2AR06JQ 841 0 0
AAGGAGAAAGAAGAGACTTCACAACAAGAGGAAAAGGAGAAAGGAGAGGCTTCTTCGCAA
GAGGAGAATGAAAACAAAGAAACTGAGAACAAGGAGAAAGGTGAGTCTTCGTCCCAAGAG
GAGAGTGAGAGCAAAGAAACTGAGAACAAGGAGAAAGGAGAGGCTTCTTCACAGGAAGAG
AATGAAAGCAAAGAAACTGAGAACATTGAGAAAGTAGAGTCTTCGTCCCAAGAGGAGGGT
GTGAGCAAAGAAACTGAGAACAAGGAGAAAGGAGAGGCTTCTCTAAAAGAGGAGAACACT
GAGAAAGGCCAGTCTTCGTCCCACGAGGAGAATGTGAGTAAAGAAGCCGAGAAGAGGGAG
AAAGAAGAGTCCTCAGAGTCTCAGCAAACGGAAAACACTAACAGCGAGAAGACCATTGAA
CAGGTGGAATCTACTGATTCTTCAAACAAACAGGAGAAGAGTGACGAACATGAAACTGAG
GGAAACAAGAGTCAATCTGGCAACGAGCACAGCAAATCAGGTTCTTCTGATGACGAAAAG
AAAACAGAGAATGACACATCAAAAACAGAGTCGGACAAGGAGAAGAAAGACAACAAAACT
GGTGATCACGAACATACTAAGGATGCTGCTGGAACAGAACTGAAAACTCAGCCCGAGTCT
AACAATGGATTCACCAACGACAAAGTTGCTGCTGAGTGAGTCCCTTTAACCAAATTTGTC
TGTCATGTACTGTATACTACTACATACTCTAAAAAATACTTTTTTCATATCACGGGAACT
AATCCCCAATTGGTAGAACTGAGTTTTGAAACAAATCAATGTATGAAATAAAACCTTTTA
T

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 2

CO CL3838Contig1 1127 2 2 U
TGGATGGGTTGGTAGTGTATTTCATGTTTGGTAGAAGAATTAATCTTCTTCATGACAGTC
TGTTAATTTCCTTATTTGGGATGTCGTGTACAAAGAGATACACTCTTCCTCTTTTCTTGA
ATACTTGCTCATCCTCATCCTCTTTCTGCTCAAACAGCTGAGAATCATGGCGAAGAAGAA
AGGCGTCAAGTACTTTGTGGTGGATGCTTTCACTGATTCTGCTTTCAAAGGGAACCCAGC
AGCCGTTTGTTTCCTCAACAACAACAACGACGGAGACGACACGTGGCTTCAGTCTATCGC
CACCGAATTCAACATCTCCCAAACTAGTTTCCTTACTCCCATCACCGGTTTCCAATCTCG
CTTCAATCTCCGTTGGTTTACCCCTCTAGCCGAGGTGGATCTTTGTGGACATGCGACTTT
GGCATCTGCTCATTGTCTCTTCTCCAATGATTTGGTTGATTCAGACAATGTCGAGTTTGT
CACAAGGTCAGGGGTTCTTACAGCCAAGCGAGTCTCAGAGCTCAATGATGATGGTGAAGT
GAAAAGAGGATCCTTTTTGATCGAGCTGAATTTCCCTGTGGTTCCAACTTGCGATATCGA
TCTCACTGATGCTTCCTCCTCCTTGATCGCCAAGGCCTTGAACGGAGCTACCATTCTTGA
TACTAAAGCTACTGCGACCAACAACATCCTCGTTGTGCTTCCATCTTTGGAATCTGTCGC
CGAGTTGCAGCCAAGAATGGATGATATATTGAAATGTCCTTGCGATGGCATCATCGTCAC
AGCTGCTGGTTCTGCCGGATCAGCTTATGATTTTCACAGTCGTTACTTTGCTCCTAAACT
TGGTGTCGATGAGGATCCTGTCTGTGGAAGTGCACATTGTGCGTTGGCACATTATTGGAG
CCTCAAGATGAACAAGTGTGGCTTCTTAGCTCACCAAGCTTCGCGTAGGAGTGGAACACT
TGGGATTCATTTAGACAAGGAGAAGCAGAGGGTTCTCCTGAGAGGCAAAGCCGTTACTGT
TATGGAAGGCCATGTCTTGGTCTAATCTGAGATCATGTATGGCTACACAAAAACAAAAAA
AACAAGCTCCTTCCACTAATGAATAAAGACAGAAAACCACTGATAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS60TF U 1
AF RR2AS60JQ C 385
BS 1 703 RR2AS60TF
BS 704 1127 RR2AS60JQ

RD RR2AS60TF 703 0 0
TGGATGGGTTGGTAGTGTATTTCATGTTTGGTAGAAGAATTAATCTTCTTCATGACAGTC
TGTTAATTTCCTTATTTGGGATGTCGTGTACAAAGAGATACACTCTTCCTCTTTTCTTGA
ATACTTGCTCATCCTCATCCTCTTTCTGCTCAAACAGCTGAGAATCATGGCGAAGAAGAA
AGGCGTCAAGTACTTTGTGGTGGATGCTTTCACTGATTCTGCTTTCAAAGGGAACCCAGC
AGCCGTTTGTTTCCTCAACAACAACAACGACGGAGACGACACGTGGCTTCAGTCTATCGC
CACCGAATTCAACATCTCCCAAACTAGTTTCCTTACTCCCATCACCGGTTTCCAATCTCG
CTTCAATCTCCGTTGGTTTACCCCTCTAGCCGAGGTGGATCTTTGTGGACATGCGACTTT
GGCATCTGCTCATTGTCTCTTCTCCAATGATTTGGTTGATTCAGACAATGTCGAGTTTGT
CACAAGGTCAGGGGTTCTTACAGCCAAGCGAGTCTCAGAGCTCAATGATGATGGTGAAGT
GAAAAGAGGATCCTTTTTGATCGAGCTGAATTTCCCTGTGGTTCCAACTTGCGATATCGA
TCTCACTGATGCTTCCTCCTCCTTGATCGCCAAGGCCTTGAACGGAGCTACCATTCTTGA
TACTAAAGCTACTGCGACCAACAACATCCTCGTTGTGCTTCCA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2AS60JQ 743 0 0
TCTAGCCGAGGTGGATCTTTGTGGACATGCGACTTTGGCATCTGCTCATTGTCTCTTCTC
CAATGATTTGGTTGATTCAGACAATGTCGAGTTTGTCACAAGGTCAGGGGTTCTTACAGC
CAAGCGAGTCTCAGAGCTCAATGATGATGGTGAAGTGAAAAGAGGATCCTTTTTGATCGA
GCTGAATTTCCCTGTGGTTCCAACTTGCGATATCGATCTCACTGATGCTTCCTCCTCCTT
GATCGCCAAGGCCTTGAACGGAGCTACCATTCTTGATACTAAAGCTACTGCGACCAACAA
CATCCTCGTTGTGCTTCCATCTTTGGAATCTGTCGCCGAGTTGCAGCCAAGAATGGATGA
TATATTGAAATGTCCTTGCGATGGCATCATCGTCACAGCTGCTGGTTCTGCCGGATCAGC
TTATGATTTTCACAGTCGTTACTTTGCTCCTAAACTTGGTGTCGATGAGGATCCTGTCTG
TGGAAGTGCACATTGTGCGTTGGCACATTATTGGAGCCTCAAGATGAACAAGTGTGGCTT
CTTAGCTCACCAAGCTTCGCGTAGGAGTGGAACACTTGGGATTCATTTAGACAAGGAGAA
GCAGAGGGTTCTCCTGAGAGGCAAAGCCGTTACTGTTATGGAAGGCCATGTCTTGGTCTA
ATCTGAGATCATGTATGGCTACACAAAAACAAAAAAAACAAGCTCCTTCCACTAATGAAT
AAAGACAGAAAACCACTGATAAG

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL3839Contig1 956 2 2 U
CTCTCTCCATTCTTAAAACAAGATAGATAAACAATGGTTGGTGACTACAGAGATAACTAT
AGCAAGAGCTCCGACGATTCTTCTTCTTCTGTAGAGGAACAGACTACTTCTTCAATGTAT
TCTGCAGGAAAAGAAGATACGCACACAGAATGGACCGATGAGAAGCATAGTTTGTATCTT
AAATCCATGGAAGCTTCCTTCGTTGATCAGCTCTACAACTCCCTCGGTTTGCTCGGTTCC
AAAAACAACAAGGATACTGTCGGACCATCATCGAGAAGGTTCATTAACGGTGGAAAACCT
TCTGAAGAACAGAAGATGAACGTGAGACAACCTGAGTATCGTCTCAGTGGGAGACACGGT
CGTAGTTCTCACGAGTTTCTTAGGAGTCCGTGGATCAAGCACTATAAGCCTTCACCAAAG
ACCCTTGAAAATCAAGTTGTTAGCTCAAAGGGTATAGTCATATGCAGCTCTGGTTTACGA
GAAGGCTGCTCTCATTCACGTGACCGGGATCAAATCAGCGTGGGAGAAGAAGCAGAAGTA
TCTGACCAGAACTTTGTCAATGAAGTAACAAAATGCCAAAACGGAAGCTCCAATAAGATG
AAGACTGTGATGAGTGGATCGTCTAGTACTGATCAGGTTGTTCCACTCAGAAAAAATCAT
GCAAACATGATCACTTAAATTTTAAGTCCATTGCTGGGTGAGGTCATTGAAGCTGGTTAC
GCAGGGAGATTTTTGTTATGTTAATAGAATTTGAGTAACTAAAATTAAAACAAAAGTCAT
CTTACTATGATTAGTAGTTGCATGTGTCTTCATCATATAACCCTAACTATAAATATTTTA
TATCCGCATGTGAGTGGATTCATATGTAATGTGAACCTTTTATTTGCATCAAGTTATTTA
GTTTTTGTTGTTTATTGTTAGTGCCAGTCTAATATAGTCTATTACGTTGAACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B360TF U 1
AF RR2B360JQ C 203
BS 1 650 RR2B360TF
BS 651 956 RR2B360JQ

RD RR2B360TF 650 0 0
CTCTCTCCATTCTTAAAACAAGATAGATAAACAATGGTTGGTGACTACAGAGATAACTAT
AGCAAGAGCTCCGACGATTCTTCTTCTTCTGTAGAGGAACAGACTACTTCTTCAATGTAT
TCTGCAGGAAAAGAAGATACGCACACAGAATGGACCGATGAGAAGCATAGTTTGTATCTT
AAATCCATGGAAGCTTCCTTCGTTGATCAGCTCTACAACTCCCTCGGTTTGCTCGGTTCC
AAAAACAACAAGGATACTGTCGGACCATCATCGAGAAGGTTCATTAACGGTGGAAAACCT
TCTGAAGAACAGAAGATGAACGTGAGACAACCTGAGTATCGTCTCAGTGGGAGACACGGT
CGTAGTTCTCACGAGTTTCTTAGGAGTCCGTGGATCAAGCACTATAAGCCTTCACCAAAG
ACCCTTGAAAATCAAGTTGTTAGCTCAAAGGGTATAGTCATATGCAGCTCTGGTTTACGA
GAAGGCTGCTCTCATTCACGTGACCGGGATCAAATCAGCGTGGGAGAAGAAGCAGAAGTA
TCTGACCAGAACTTTGTCAATGAAGTAACAAAATGCCAAAACGGAAGCTCCAATAAGATG
AAGACTGTGATGAGTGGATCGTCTAGTACTGATCAGGTTGTTCCACTCAG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2B360JQ 754 0 0
TTGATCAGCTCTACAACTCCCTCGGTTTGCTCGGTTCCAAAAACAACAAGGATACTGTCG
GACCATCATCGAGAAGGTTCATTAACGGTGGAAAACCTTCTGAAGAACAGAAGATGAACG
TGAGACAACCTGAGTATCGTCTCAGTGGGAGACACGGTCGTAGTTCTCACGAGTTTCTTA
GGAGTCCGTGGATCAAGCACTATAAGCCTTCACCAAAGACCCTTGAAAATCAAGTTGTTA
GCTCAAAGGGTATAGTCATATGCAGCTCTGGTTTACGAGAAGGCTGCTCTCATTCACGTG
ACCGGGATCAAATCAGCGTGGGAGAAGAAGCAGAAGTATCTGACCAGAACTTTGTCAATG
AAGTAACAAAATGCCAAAACGGAAGCTCCAATAAGATGAAGACTGTGATGAGTGGATCGT
CTAGTACTGATCAGGTTGTTCCACTCAGAAAAAATCATGCAAACATGATCACTTAAATTT
TAAGTCCATTGCTGGGTGAGGTCATTGAAGCTGGTTACGCAGGGAGATTTTTGTTATGTT
AATAGAATTTGAGTAACTAAAATTAAAACAAAAGTCATCTTACTATGATTAGTAGTTGCA
TGTGTCTTCATCATATAACCCTAACTATAAATATTTTATATCCGCATGTGAGTGGATTCA
TATGTAATGTGAACCTTTTATTTGCATCAAGTTATTTAGTTTTTGTTGTTTATTGTTAGT
GCCAGTCTAATATAGTCTATTACGTTGAACTTCC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL3840Contig1 397 2 1 U
GTGGCTTCGAGGGAAACAGGCGCACTGAAAGAGGCAAAGGATATACTTGAAAAGAAAGTA
GAAGAACTCACATACCGTGTGCAGTTGGAGAAACGTTTAAGGACCGACCTGGAAGAAGAA
AAGACTCAAGAGATAACGAAGCTGCAGAGTTCGATGGAGGAACTGAGGAAGAAAGTGGAG
GAAACAAATGTGTTGCTTGTTAAAGAACGTGAAGCTGCAAAGAAAGCCATCGAAGAAGCG
CCTCCTGTTGTAACAGAAACGCAGGTCGTTGTCGAAGATACACAAAAGATTGAGTCATTG
ACAGAACAAGTGGAAGGTCTAAAGACTGATCTCGAACAAGAGAAACAAAGGGCCGATGAT
GCAGCAAGAAAGTTTGATGAAGCTCAAGAATCTAGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B416JQ C 1
AF RR2B416TF U 1
BS 1 397 RR2B416TF

RD RR2B416JQ 397 0 0
GTGGCTTCGAGGGAAACAGGCGCACTGAAAGAGGCAAAGGATATACTTGAAAAGAAAGTA
GAAGAACTCACATACCGTGTGCAGTTGGAGAAACGTTTAAGGACCGACCTGGAAGAAGAA
AAGACTCAAGAGATAACGAAGCTGCAGAGTTCGATGGAGGAACTGAGGAAGAAAGTGGAG
GAAACAAATGTGTTGCTTGTTAAAGAACGTGAAGCTGCAAAGAAAGCCATCGAAGAAGCG
CCTCCTGTTGTAACAGAAACGCAGGTCGTTGTCGAAGATACACAAAAGATTGAGTCATTG
ACAGAACAAGTGGAAGGTCTAAAGACTGATCTCGAACAAGAGAAACAAAGGGCCGATGAT
GCAGCAAGAAAGTTTGATGAAGCTCAAGAATCTAGTG

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR2B416TF 397 0 0
GTGGCTTCGAGGGAAACAGGCGCACTGAAAGAGGCAAAGGATATACTTGAAAAGAAAGTA
GAAGAACTCACATACCGTGTGCAGTTGGAGAAACGTTTAAGGACCGACCTGGAAGAAGAA
AAGACTCAAGAGATAACGAAGCTGCAGAGTTCGATGGAGGAACTGAGGAAGAAAGTGGAG
GAAACAAATGTGTTGCTTGTTAAAGAACGTGAAGCTGCAAAGAAAGCCATCGAAGAAGCG
CCTCCTGTTGTAACAGAAACGCAGGTCGTTGTCGAAGATACACAAAAGATTGAGTCATTG
ACAGAACAAGTGGAAGGTCTAAAGACTGATCTCGAACAAGAGAAACAAAGGGCCGATGAT
GCAGCAAGAAAGTTTGATGAAGCTCAAGAATCTAGTG

QA 1 397 1 397
DS 



AS 1 2

CO CL3841Contig1 839 2 4 U
GGTTGGAGACCAGGCCCTGAGTTTGAAGAATCTCTTGCGGCTGCTGCAGCAGCGGCTGCA
AATGCAAACATCTGCAGCAACTGCGTGTCGAACCGCACCTCGATGGGGTCCGTGATGGAT
TTCTTGAGGACAAACCCTGGAGCAAACGTTGCACAATGTTGCAGAAACGGGTGTGGTGAG
ACTCACGGTCGGTTTGAAGAGATTACAATAAGAGAAACCGAGGTTCGTCTTAGAGAGATA
TGGAGGCTGCAGCAACAGCAGGAAAGCAGGGAGCTTAGCTCGATAGACTCAGGACAAAAC
CATTCAAAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGTGTATGAAACCCTGAAATCACGTTTCCGT
GTGAAGCAAGTAACACGCTGAACCATTTAACTGGCTCTGGATCGTTCTCGTTTTTGCCTT
CTTTATACTGTGATGAGGTAGCTGAGAAGACTGAACATCAGGTCCAACAAGAGTTAAGAT
GGCTTAAAGCCAAGTGCCAAATCGAGGTCAGAGATGAGCAGTTAAAATCTAGGTGGCGGC
CGGGACAAAACCACTCGGAAGATGAGGTGAAAGAGAAGATGTGTGGAGAGAGATTGCTAC
CAAAATGTCTTAAAAGGACAACTTCACTTCATGTTGATGACATTGAATCTTAAATTACGT
TGTGTTTTTTGTCTATGTATACATATTGTTTCGTGTTACAAGACTGTTACAGGGTAACCA
GATGAGTATACTTAAGAGAGAGCCTCGTTAATTTTGTTGGGGTTATTCTTTCTTGCAACA
ATATACCACTCTGTCCACTCGAGAATTTAGTTTGTGAAAAAAATTGATAAAGTTTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D901TF U 1
AF RR2D901JQ C 236
BS 1 460 RR2D901TF
BS 461 461 RR2D901JQ
BS 462 700 RR2D901TF
BS 701 839 RR2D901JQ

RD RR2D901TF 706 0 0
GGTTGGAGACCAGGCCCTGAGTTTGAAGAATCTCTTGCGGCTGCTGCAGCAGCGGCTGCA
AATGCAAACATCTGCAGCAACTGCGTGTCGAACCGCACCTCGATGGGGTCCGTGATGGAT
TTCTTGAGGACAAACCCTGGAGCAAACGTTGCACAATGTTGCAGAAACGGGTGTGGTGAG
ACTCACGGTCGGTTTGAAGAGATTACAATAAGAGAAACCGAGGTTCGTCTTAGAGAGATA
TGGAGGCTGCAGCAACAGCAGGAAAGCAGGGAGCTTAGCTCGATAGACTCAGGACAAAAC
CATTCAAAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGTGTATGAAACCCTGAAATCACGTTTCCGT
GTGAAGCAAGTAACACGCTGAACCATTTAACTGGCTCTGGATCGTTCTCGTTTTTGCCTT
CTTTATACTGTGATGAGGTAGCTGAGAAGACTGAACATCATGTCCAACAAGAGTTAAGAT
GGCTTAAAGCCAAGTGCCAAATCGAGGTCAGAGATGAGCAGTTAAAATCTAGGTGGCGGC
CGGGACAAAACCACTCGGAAGATGAGGTGAAAGAGAAGATGTGTGGAGAGAGATTGCTAC
CAAAATGTCTTAAAAGGACAACTTCACTTCATGTTGATGACATTGAATCTTAAATTACGT
TGTGTTTTTTGTCTATGTATACATATTGTTTCGTGTTACA
GACTGT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2D901JQ 604 0 0
AGATATGGAGGCTGCAGCAACAGCAGGAAAGCAGGGAGCTTAGCTCGATAGACTCAGGAC
AAAACCATTCAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGTGTATGAAACCCTGAAATCACGTT
TCCGTGTGAAGCAAGTAACACGCTGAACCATTTAACTGGCTTTGGATCGTTCTCGTTTTT
GCCTTCTTTATACTGTGATGAGGTAGGTGAGAAGACTGAACATCAGGTCCAACAAGAGTT
AAGATGGCTTAAAGCCAAGTGCCAAATCGAGGTCAGAGATGAGCAGTTAAAATTTAGGTG
GCGGCCGGGACAAAACCACTCGGAAGATGAGGTGAAAGAGAAGATGTGTGGAGAGAGATT
GCTACCAAAATGTCTTAAAAGGACAACTTCACTTCATGTTGATGACATTGAATCTTAAAT
TACGTTGTGTTTTTTGTCTATGTATACATATTGTTTCGTGTTACAAGACTGTTACAGGGT
AACCAGATGAGTATACTTAAGAGAGAGCCTCGTTAATTTTGTTGGGGTTATTCTTTCTTG
CAACAATATACCACTCTGTCCACTCGAGAATTTAGTTTGTGAAAAAAATTGATAAAGTTT
TACG

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL3842Contig1 692 2 4 U
CGCAACAAAAATCAAAAGACATTAACAAAATTACATAGTTTCATAAAAACATTAAATGTC
ATTGGAAGGGGAAACGAAAACAAAAACATTGAAGAGCATTTAGCAAATGGAGGTGCAGCA
TTACCACTTTATAATAATTTACGTAAACACTCAGACCATGATTATTGGTGAGATTGGGAC
AAGTCCCTTATGTAAGGGATTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGTTTGGTCAAATAAACCCA
AGGGACCTCCCATTTCTTCCCTTATATAAAAAAGTTTTTCCCTTTCTTTCCCTTTCTTTC
CTCTGTTTTGTGGTCCCCTCCTCCCTTAAAAGATCTCTTAAACCATGATTATTGGTATGC
CTTAAGGCATCCCTTAAGGAGGGAGCACTAGGACCAAGAAAGAAAAAATGGGAAAAAACC
CCTAATTAAGGGATGTTCCTTATGATTTCATGACCAAACAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAA
AAGATTAGGGACTTTCATCATTCATCCAATAATGATGCTCTTAAAGGATACTGATAATGT
TGCTCTGATAGAGCATGTTCGTTAAGAACTCCATGACCACTGCGTCTAAATTCATCATCC
ATAAATCCTTCAAAGAAGGCTTCTCGAGTACTGTTTCTTTTTGGATCGAAATATAGAATA
TAACGATTCAACAAAACTTTTTGGTGCAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU53JQB U 1
AF RR2H742JQB U 1
BS 1 399 RR2GU53JQB
BS 400 400 RR2H742JQB
BS 401 455 RR2GU53JQB
BS 456 692 RR2H742JQB

RD RR2GU53JQB 455 0 0
CGCAACAAAAATCAAAAGACATTAACAAAATTACATAGTTTCATAAAAACATTAAATGTC
ATTGGAAGGGGAAACGAAAACAAAAACATTGAAGAGCATTTAGCAAATGGAGGTGCAGCA
TTACCACTTTATAATAATTTACGTAAACACTCAGACCATGATTATTGGTGAGATTGGGAC
AAGTCCCTTATGTAAGGGATTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGTTTGGTCAAATAAACCCA
AGGGACCTCCCATTTCTTCCCTTATATAAAAAAGTTTTTCCCTTTCTTTCCCTTTCTTTC
CTCTGTTTTGTGGTCCCCTCCTCCCTTAAAAGATCTCTTAAACCATGATTATTGGTATGC
CTTAAGGCATCCCTTAAGGAGGGAGCACTAGGACCAAGAGAGAAAAAATGGGAAAAAACC
CCTAATTAAGGGATGTTCCTTATGATTTCATGACC

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR2H742JQB 692 0 0
CGCAACAAAAATCAAAAGACATTAACAAAATTACATAGTTTCATAAAAACATTAAATGTC
ATTGGAAGGGGAAACGAAAACAAAAACATTGAAGAGCATTTAGCAAATGGAGGTGCAGCA
TTACCACTTTATAATAATTTACGTAAACACTCAGACCATGATTATTGGTGAGATTGGGAC
AAGTCCCTTATGTAAGGGATTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGTTTGGTCAGATAAACCCA
AGGGACCTCCCATTTCTTCCCTTATATAAAAAAGTTTTTCCCTTTCTTTCCCTTTCTTTC
CTCTGTTTTGTGGTCCCCTCCTCCCTTAAAAGATCTCTTAAACCATGATTATTGGTATGC
CTTAAGGCATCCCTTAAGGAGGGAGCACTAGGACCAAGAAAGAAAAAATGGGAAAAAACC
CCTAATTAAGGGATGTTCCTTATGATTTCATGACCAAACAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAA
AAGATTAGGGACTTTCATCATTCATCCAATAATGATGCTCTTAAAGGATACTGATAATGT
TGCTCTGATAGAGCATGTTCGTTAAGAACTCCATGACCACTGCGTCTAAATTCATCATCC
ATAAATCCTTCAAAGAAGGCTTCTCGAGTACTGTTTCTTTTTGGATCGAAATATAGAATA
TAACGATTCAACAAAACTTTTTGGTGCAAAAA

QA 1 692 1 692
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3844Contig1 436 2 1 U
GTAGCAAGAAAAGAGCAAAAAAAAGAAGAAGAACCGTTCAAGAGCTTATCAAACATTATG
GCTATCGAAAAGAAAACCCTGATCGCCTCATTCATCATCGTTTTGATGATGGTAATGATG
ATCGTGACCGAGGTCGAGGCAAGGAAACATGTCACAATCAAGCCGCCTCCAAAGTGATAT
ATAGTCTTTGTTGTTTTCAAATCCATGGTTGCTTCAGCTAGGAGCTTCAAGCATGCCTGG
CTTAACTAAATTTTATTATTATATATCATTTTTGTTCATTTTCTTATTAATTTGCTTAGT
TGTGGAAGTATTATTACTTACAAATAATGTTTTACATATGTCAAATTAATATGTGAATGA
AATGTACTAGTTTTATATTTCATATGTAGAGATTTATTTTATAATCTCTCTAGAAATTGA
CAACATAAGTGTTCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A476JQ C 1
AF RR2A476TF U 1
BS 1 436 RR2A476TF

RD RR2A476JQ 436 0 0
GTAGCAAGAAAAGAGCAAAAAAAAGAAGAAGAACCGTTCAAGAGCTTATCAAACATTATG
GCTATCGAAAAGAAAACCCTGATCGCCTCATTCATCATCGTTTTGATGATGGTAATGATG
ATCGTGACCGAGGTCGAGGCAAGGAAACATGTCACAATCAAGCCGCCTCCAAAGTGATAT
ATAGTCTTTGTTGTTTTCAAATCCATGGTTGCTTCAGCTAGGAGCTTCAAGCATGCCTGG
CTTAACTAAATTTTATTATTATATATCATTTTTGTTCATTTTCTTATTAATTTGCTTAGT
TGTGGAAGTATTATTACTTACAAATAATGTTTTACATATGTCAAATTAATATGTGAATGA
AATGTACTAGTTTTATATTTCATATGTAGAGATTTATTTTATAATCTCTCTAGAAATTGA
CAACATAAGTGTTCAC

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR2A476TF 436 0 0
GTAGCAAGAAAAGAGCAAAAAAAAGAAGAAGAACCGTTCAAGAGCTTATCAAACATTATG
GCTATCGAAAAGAAAACCCTGATCGCCTCATTCATCATCGTTTTGATGATGGTAATGATG
ATCGTGACCGAGGTCGAGGCAAGGAAACATGTCACAATCAAGCCGCCTCCAAAGTGATAT
ATAGTCTTTGTTGTTTTCAAATCCATGGTTGCTTCAGCTAGGAGCTTCAAGCATGCCTGG
CTTAACTAAATTTTATTATTATATATCATTTTTGTTCATTTTCTTATTAATTTGCTTAGT
TGTGGAAGTATTATTACTTACAAATAATGTTTTACATATGTCAAATTAATATGTGAATGA
AATGTACTAGTTTTATATTTCATATGTAGAGATTTATTTTATAATCTCTCTAGAAATTGA
CAACATAAGTGTTCAC

QA 1 436 1 436
DS 



AS 1 2

CO CL3845Contig1 428 2 1 U
GCTTGAGCCTGGTGGTGGCAGTCTCTGCCTTATGGATTACTCTTTTGCAGGCTGCAATTG
TTCCACAAAGTCATACATGGTCGCTACCGATATACTTTGTACTGTCACTTGGATGCTATG
GTCTACTAATGGTTGGAGTCGGGATAATGCAGTTCCCTACCTGTCCTCGAGAAGCAGTTC
TCTTGAACCATGACATTGCAGAGGCAAAAGACTTCTTAAGCACAAACGGAATAGATATTG
GAACGTATTGACACATTCTGTGTTTGACTCCTTAAAGCTTTTAACATGTTTCTCGTTCTG
TAATATTTTCTAAAGTTTAAGTCTTGTTTAGATTCAAGGTGAACTCCTCTACTTGGTGCA
TTTCAGATAGTTGTACGGTATAAAATTGGTTTGATTGTAAACAGCAGCTGAATCAAACTA
ACAATTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G768JQ C 1
AF RR2G768TF U 1
BS 1 428 RR2G768TF

RD RR2G768JQ 428 0 0
GCTTGAGCCTGGTGGTGGCAGTCTCTGCCTTATGGATTACTCTTTTGCAGGCTGCAATTG
TTCCACAAAGTCATACATGGTCGCTACCGATATACTTTGTACTGTCACTTGGATGCTATG
GTCTACTAATGGTTGGAGTCGGGATAATGCAGTTCCCTACCTGTCCTCGAGAAGCAGTTC
TCTTGAACCATGACATTGCAGAGGCAAAAGACTTTTTAAGCACAAACGGAATAGATATTG
GAACGTATTGACACATTCTGTGTTTGACTCCTTAAAGCTTTTAACATGTTTCTCGTTCTG
TAATATTTTCTAAAGTTTAAGTCTTGTTTAGATTCAAGGTGAACTCCTCTACTTGGTGCA
TTTCAGATAGTTGTACGGTATAAAATTGGTTTGATTGTAAACAGCAGCTGAATCAAACTA
ACAATTTG

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR2G768TF 428 0 0
GCTTGAGCCTGGTGGTGGCAGTCTCTGCCTTATGGATTACTCTTTTGCAGGCTGCAATTG
TTCCACAAAGTCATACATGGTCGCTACCGATATACTTTGTACTGTCACTTGGATGCTATG
GTCTACTAATGGTTGGAGTCGGGATAATGCAGTTCCCTACCTGTCCTCGAGAAGCAGTTC
TCTTGAACCATGACATTGCAGAGGCAAAAGACTTCTTAAGCACAAACGGAATAGATATTG
GAACGTATTGACACATTCTGTGTTTGACTCCTTAAAGCTTTTAACATGTTTCTCGTTCTG
TAATATTTTCTAAAGTTTAAGTCTTGTTTAGATTCAAGGTGAACTCCTCTACTTGGTGCA
TTTCAGATAGTTGTACGGTATAAAATTGGTTTGATTGTAAACAGCAGCTGAATCAAACTA
ACAATTTG

QA 1 428 1 428
DS 



AS 1 2

CO CL3846Contig1 883 2 2 U
GGATATGGAGATTACTCGTCCACAAGAGGGATCTTGGCCATGGAAACGTTTACTTTTGAC
GACGAGAACTCGGTTTCGGGTATAGGGTTTGGGTGTGGGGATGAGAACAAAGGAGATGGG
TTCTCTCAAGGTTCAGGTCTTGTAGGTCTTGGTAGAGGATCACTCTCTCTTATCTCTCAG
CTCAAGGAGACTAAGTTCTCTTATTGCTTAACATCTATTGAGGATAGCGAAGCGTCTAGC
TCGCTGTTTATTGGATCTCTAGCGTCTAATATCGTTAAGAAAACAGGTGCAAGTTTGGCA
GGTGAAGTCACCAAAACGATGTCGCTGCTACGAAACCCTAACCAGCCTTCTTTCTATTAC
CTTGACTTGCAAGGCATCACCGTTGGATCAAAACGCCTGCCCATTGAAAAGTCTACTTTC
GAACTAGCGGAAGATGGAACAGGAGGTATGATCATCGACTCTGGCACGACCGTCACGTAC
CTCGAGGAGGCAGCGTTTAAGGCCTTGAGTAAGGAGTTCACTTCTCGGATGAGTTTACCG
GTCGATGACTCGGGATCCACAGGACTTGACTTGTGCTACACGTTACCTAGTAACGCCAAT
AAAATTTCTGTTCCTAAGCTCGTTTTTCATTTTAAAGACGCGGATTTGGAGCTTCCTGGG
GAGAACTACATGGTGGCGGATTCGAGTACAGGCGTTTTGTGTTTGGTCATGGGGAGTTCT
AATGGGATGTCTATTTTCGGAAATGTTCAGCAGCAGAATTTTAATGTAGTTCATGATCTT
GAGAAAGATACCGTGTCGTTTGTTCCCACTGAATGTGGAAAACTGTAGATTTTTAATTGT
TTCCTTATTTTTATTATTAATGAACCTTTATACTTTTTTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ45TF U 1
AF RR2FJ45JQ C 260
BS 1 687 RR2FJ45TF
BS 688 883 RR2FJ45JQ

RD RR2FJ45TF 687 0 0
GGATATGGAGATTACTCGTCCACAAGAGGGATCTTGGCCATGGAAACGTTTACTTTTGAC
GACGAGAACTCGGTTTCGGGTATAGGGTTTGGGTGTGGGGATGAGAACAAAGGAGATGGG
TTCTCTCAAGGTTCAGGTCTTGTAGGTCTTGGTAGAGGATCACTCTCTCTTATCTCTCAG
CTCAAGGAGACTAAGTTCTCTTATTGCTTAACATCTATTGAGGATAGCGAAGCGTCTAGC
TCGCTGTTTATTGGATCTCTAGCGTCTAATATCGTTAAGAAAACAGGTGCAAGTTTGGCA
GGTGAAGTCACCAAAACGATGTCGCTGCTACGAAACCCTAACCAGCCTTCTTTCTATTAC
CTTGACTTGCAAGGCATCACCGTTGGATCAAAACGCCTGCCCATTGAAAAGTCTACTTTC
GAACTAGCGGAAGATGGAACAGGAGGTATGATCATCGACTCTGGCACGACCGTCACGTAC
CTCGAGGAGGCAGCGTTTAAGGCCTTGAGTAAGGAGTTCACTTCTCGGATGAGTTTACCG
GTCGATGACTCGGGATCCACAGGACTTGACTTGTGCTACACGTTACCTAGTAACGCCAAT
AAAATTTCTGTTCCTAAGCTCGTTTTTCATTTTAAAGACGCGGATTTGGAGCTTCCTGGG
GAGAACTACATGGTGGCGGATTCGAGT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2FJ45JQ 624 0 0
TAGCGTCTAATATCGTTAAGAAAACAGGTGCAAGTTTGGCAGGTGAAGTCACCAAAACGA
TGTCGCTGCTACGAAACCCTAACCAGCCTTCTTTCTATTACCTTGACTTGCAAGGCATCA
CCGTTGGATCAAAACGCCTGCCCATTGAAAAGTCTACTTTCGAACTAGCGGAAGATGGAA
CAGGAGGTATGATCATCGACTCTGGCACGACCGTCACGTACCTCGAGGAGGCAGCGTTTA
AGGCCTTGAGTAAGGAGTTCACTTTTCGGATGAGTTTACCGGTCGATGACTCGGGATCCA
CAGGACTTGACTTGTGCTACACGTTACCTAGTAACGCCAATAAAATTTCTGTTCCTAAGC
TCGTTTTTCATTTTAAAGACGCGGATTTGGAGCTTCCTGGGGAGAACTACATGGTGGCGG
ATTCGAGTACAGGCGTTTTGTGTTTGGTCATGGGGAGTTCTAATGGGATGTCTATTTTCG
GAAATGTTCAGCAGCAGAATTTTAATGTAGTTCATGATCTTGAGAAAGATACCGTGTCGT
TTGTTCCCACTGAATGTGGAAAACTGTAGATTTTTAATTGTTTCCTTATTTTTATTATTA
ATGAACCTTTATACTTTTTTCACT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL3847Contig1 797 2 2 U
GATCTGCACCACGACTGCAGTCCGAGGATCATACACCGAGACGTCAAGTCTTCCAATATT
CTTTTGGACAAGGACTTGGAGGCTCGTCTGACGGATTTCGGGATTGCGAAAAGCTTGTGC
GTCTCCAAGTCGCATACTTCGACTTACATCATGGGCACAATTGGTTACATAGACCCTGAG
TACGCACGCACTTCGCGTCTCACCGAGAAGTCCGATGTCTACAGCTATGGAATAGTGCTG
CTCGAGTTGTTGACCTCGAGGAAAGCCGTTGATGATGAGTTCAACCTCCACCATCTGATA
ATGTCCAAGACAGTGAACAATGCGGTCATGGAAATGGCGGATCCAGACATCATTTCGACT
TGTAAGGATCTCTCGGTGGTGAAGAAAGTTTTCCAGCTTGCTCTGCTGTGCACCAAAAAG
CAGCCGACCGATCGACCCACGATGCACCAGGTGGTTCGTGTCCTCGGCAGCTTTATGTCG
TCTGAACAACCACCAGACTCCGCAGCAGCAGCGGCAGCTACGTCAGCAACGCTGACCTCT
TCGTGCTACGTTGATGAGTATGCAAATCTCAAGACTCCTCACAATGTCAATTGCTCTTCC
ATGAGTGCTTCGGATGCAGAGCTCTTCCTTCGATTTGGACAAGTCATTTCTCAGAACAGT
GTGTGAGAAACAAATGAATGTTGGTGCATTTTTCTAGGAGAATGTTAGAAAAAAACGAGT
ATTGTCTTTTGTTAAAACACTGTGCACGACGACCTTTATTATTAGATAAGAGTGTGAATA
AATTTTCAGACAAGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E550TF U 1
AF RR2E550JQ C 145
BS 1 568 RR2E550TF
BS 569 797 RR2E550JQ

RD RR2E550TF 568 0 0
GATCTGCACCACGACTGCAGTCCGAGGATCATACACCGAGACGTCAAGTCTTCCAATATT
CTTTTGGACAAGGACTTGGAGGCTCGTCTGACGGATTTCGGGATTGCGAAAAGCTTGTGC
GTCTCCAAGTCGCATACTTCGACTTACATCATGGGCACAATTGGTTACATAGACCCTGAG
TACGCACGCACTTCGCGTCTCACCGAGAAGTCCGATGTCTACAGCTATGGAATAGTGCTG
CTCGAGTTGTTGACCTCGAGGAAAGCCGTTGATGATGAGTTCAACCTCCACCATCTGATA
ATGTCCAAGACAGTGAACAATGCGGTCATGGAAATGGCGGATCCAGACATCATTTCGACT
TGTAAGGATCTCTCGGTGGTGAAGAAAGTTTTCCAGCTTGCTCTGCTGTGCACCAAAAAG
CAGCCGACCGATCGACCCACGATGCACCAGGTGGTTCGTGTCCTCGGCAGCTTTATGTCG
TCTGAACAACCACCAGACTCCGCAGCAGCAGCGGCAGCTACGTCAGCAACGCTGACCTCT
TCGTGCTACGTTGATGAGTATGCAAATC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2E550JQ 653 0 0
TACATCATGGGCACAATTGGTTACATAGACCCTGAGTACGCACGCACTTCGCGTCTCACC
GAGAAGTCCGATGTCTACAGCTATGGAATAGTGCTGCTCGAGTTGTTGACCTCGAGGAAA
GCCGTTGATGATGAGTTCAACCTCCACCATCTGATAATGTCCAAGACAGTGAACAATGCG
GTCATGGAAATGGCGGATCCAGACATCATTTCGACTTGTAAGGATCTCTCGGTGGTGAAG
AAAGTTTTCCAGCTTGCTCTGCTGTGCACCAAAAAGCAGCCGACCGATCGACCCACGATG
CACCAGGTGGTTCGTGTCCTCGGCAGCTTTATGTCGTCTGAACAACCACCAGACTCCGCA
GCAGCAGCGGCAGCTACGTCAGCAACGCTGACCTCTTCGTGCTACGTTGATGAGTATGCA
AATCTCAAGACTCCTCACAATGTCAATTGCTCTTCCATGAGTGCTTCGGATGCAGAGCTC
TTCCTTCGATTTGGACAAGTCATTTCTCAGAACAGTGTGTGAGAAACAAATGAATGTTGG
TGCATTTTTCTAGGAGAATGTTAGAAAAAAACGAGTATTGTCTTTTGTTAAAACACTGTG
CACGACGACCTTTATTATTAGATAAGAGTGTGAATAAATTTTCAGACAAGACG

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL3848Contig1 697 2 2 U
GGGTTCGCAAATCGGTGAAGAGAGAGAGATCGCAAAGATGTCGTCGTTTCTAAAAACCTT
CCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTATGCACATGAAAGCCGTCTCCACTCGCCT
CCGTAGATACGGTCTGAGGTACGATGATACGTACGATCAGTATTACCACATGGACATCAA
AGAGGCCCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGTCGATGCTCGTAACCAGCGTCTCAAGCG
TGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTATCTTTCCGAGGAGCTTCAGGCGTTGCAGAC
TCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAGAGGGAAAGAAAGGAACG
TGAAGCGTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCGCACTCTTCCTTAAGCATATTTCCCCAC
CCTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCTCTGCATAAAACTCATCTCCAAATGGATG
ACATTTATATTTTCGAAATCATATTCCGAACCCGAGCTATTTACTTTCTTAAAACGCACA
AGTCTTGTGATAGTTTTTCTAAACCTGGGATATGTTGCTTCTTGTTACATTTTCATGTCC
TGCTGGCTTGAATAAAATCGAAACTCAAACTCGTTTTTTCAGTTTGCTGTAAACAGTGAA
AGACATCCCACATACATATTATGAGTTTTAATTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU19TF U 1
AF RR2GB32TF U 213
BS 1 637 RR2DU19TF
BS 638 697 RR2GB32TF

RD RR2DU19TF 637 0 0
GGGTTCGCAAATCGGTGAAGAGAGAGAGATCGCAAAGATGTCGTCGTTTCTAAAAACCTT
CCTCGATCCAAAGAAGAACTTCCTCGCTCGTATGCACATGAAAGCCGTCTCCACTCGCCT
CCGTAGATACGGTCTGAGGTACGATGATACGTACGATCAGTATTACCACATGGACATCAA
AGAGGCCCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGTCGATGCTCGTAACCAGCGTCTCAAGCG
TGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTATCTTTCCGAGGAGCTTCAGGCGTTGCAGAC
TCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAGAGGGAAAGAAAGGAACG
TGAAGCGTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCGCACTCTTCCTTAAGCATATTTCCCCAC
CCTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCTCTGCATAAAACTCATCTCCAAATGGATG
ACATTTATATTTTCGAAATCATATTCCGAACCCGAGCTATTTACTTTCTTAAAACGCACA
AGTCTTGTGATAGTTTTTCTAAACCTGGGATATGTTGCTTCTTGTTACATTTTCATGTCC
TGCTGGCTTGAATAAAATCGAAACTCAAACTCGTTTT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2GB32TF 485 0 0
G
CGATGCTCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGATCTCTCCATGAAGCACGAGTATCT
TTCCGAGGAGCTTCAGGCGTTGCAGACTCCATTCCGTAGCTACCTTCAGGAGATGCTGGC
TCTCGTTGAGAGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCGTTGGGAGCTTTGCCACTCTACCAGCG
CACTCTTCCTTAAGCATATTTCCCCACCCTTTCTTATGATGATGATCAACTCTTCTTCTC
TGCATAAAACTCATCTCCAAATGGATGACATTTATATTTTCGAAATCATATTCCGAACCC
GAGCTATTTACTTTCTTAAAACGCACAAGTCTTGTGATAGTTTTTCTAAACCTGGGATAT
GTTGCTTCTTGTTACATTTTCATGTCCTGCTGGCTTGAATAAAATCGAAACTCAAACTCG
TTTTTTCAGTTTGCTGTAAACAGTGAAAGACATCCCACATACATATTATGAGTTTTAATT
TGGC

QA 2 485 2 485
DS 



AS 1 2

CO CL3849Contig1 955 2 2 U
GTCGCAAAATCAAGGAGAAGCCACACCGACTCTCAAGACTTATCCTCCTTTCACCTGCCG
GCTTTCACGAGGACTCCAACTTAATTTTCACCATTGTTGAGTACATATTCCTTTTTGTGA
GTCCTGTATTGGCTTGCATCGTTCCCGCGTTCTACATACCTACAAGGTTCTTCAGGATGC
TTCTTAACAAGCTAGTACGTGACTTTCACAACTATCCTGCTCTTGTCGGACTTGTCCAAA
CCCTGATGAGTTACGTAGTTGGTGGAGACAGCTCGAACTGGGTCGGTGTCTTGGGGACGC
CTCACTACAACATGAACGATATGCCAGCTGTCTCCTTCGGTGTTGCGAAACATCTTGCTC
AGATCAAACACACTGGTAAGTTCAAAATGTTTGATTACGGGAGCAGGACAGCTAACATGG
AGGTTTACGGCTCTCCTGAACCGCTTGATCTAGGGGAGTCTTACGAGTACATCGATATGC
CTGTGGATTTAGTTGCGGGGAAGAAAGACAAGGTGATTCGGCCTTCCATGGTGAGGAAAC
GCTACAAGGTGATGAGAGATGCAGGGGTTGATGTGTCGTTTAATGAGTTCGAGTATGCTC
ACCTTGATTTCACATTCTCTCACCGGGAAGAGCTTTTGACGTATGTCATGTCGAGGCTGC
TGCTTGTGGAAGTGACACCAAGTCAACAGAGGCAGAGCAGCCAGAAAGGTATGAAACTGA
AGAAGAAGAAAAAGGAGGCATAGTAGTGTAAGTAGCTAGAAACCAAACCATGGCCACTGT
GGTCAATGCCCAATAGAGTTTGGAGTCTTTGTATTGTGATGTTGTGCGTTTGAGCTTCAT
CTGTGCATTCTACGTTGATCTTCCTGTAGGTGTACATAGTGTAAAGTTTGATCGCTTGAT
GAAATGATCTTGTTGTCAGAGATGCTTTTTTCAGCAATATGATGTATATGTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED24TF U 1
AF RR2ED24JQ C 247
BS 1 670 RR2ED24TF
BS 671 955 RR2ED24JQ

RD RR2ED24TF 670 0 0
GTCGCAAAATCAAGGAGAAGCCACACCGACTCTCAAGACTTATCCTCCTTTCACCTGCCG
GCTTTCACGAGGACTCCAACTTAATTTTCACCATTGTTGAGTACATATTCCTTTTTGTGA
GTCCTGTATTGGCTTGCATCGTTCCCGCGTTCTACATACCTACAAGGTTCTTCAGGATGC
TTCTTAACAAGCTAGTACGTGACTTTCACAACTATCCTGCTCTTGTCGGACTTGTCCAAA
CCCTGATGAGTTACGTAGTTGGTGGAGACAGCTCGAACTGGGTCGGTGTCTTGGGGACGC
CTCACTACAACATGAACGATATGCCAGCTGTCTCCTTCGGTGTTGCGAAACATCTTGCTC
AGATCAAACACACTGGTAAGTTCAAAATGTTTGATTACGGGAGCAGGACAGCTAACATGG
AGGTTTACGGCTCTCCTGAACCGCTTGATCTAGGGGAGTCTTACGAGTACATCGATATGC
CTGTGGATTTAGTTGCGGGGAAGAAAGACAAGGTGATTCGGCCTTCCATGGTGAGGAAAC
GCTACAAGGTGATGAGAGATGCAGGGGTTGATGTGTCGTTTAATGAGTTCGAGTATGCTC
ACCTTGATTTCACATTCTCTCACCGGGAAGAGCTTTTGACGTATGTCATGTCGAGGCTGC
TGCTTGTGGA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2ED24JQ 709 0 0
TGAGTTACGTAGTTGGTGGAGACAGCTCGAACTGGGTCGGTGTCTTGGGGACGCCTCACT
ACAACATGAACGATATGCCAGCTGTCTCCTTCGGTGTTGCGAAACATCTTGCTCAGATCA
AACACACTGGTAAGTTCAAAATGTTTGATTACGGGAGCAGGACAGCTAACATGGAGGTTT
ACGGCTCTCCTGAACCGCTTGATCTAGGGGAGTCTTACGAGTACATCGATATGCCTGTGG
ATTTAGTTGCGGGGAAGAAAGACAAGGTGATTCGGCCTTCCATGGTGAGGAAACGCTACA
AGGTGATGAGAGATGCAGGGGTTGATGTGTCGTTTAATGAGTTCGAGTATGCTCACCTTG
ATTTCACATTCTCTCACCGGGAAGAGCTTTTGACGTATGTCATGTCGAGGCTGCTGCTTG
TGGAAGTGACACCAAGTCAACAGAGGCAGAGCAGCCAGAAAGGTATGAAACTGAAGAAGA
AGAAAAAGGAGGCATAGTAGTGTAAGTAGCTAGAAACCAAACCATGGCCACTGTGGTCAA
TGCCCAATAGAGTTTGGAGTCTTTGTATTGTGATGTTGTGCGTTTGAGCTTCATCTGTGC
ATTCTACGTTGATCTTCCTGTAGGTGTACATAGTGTAAAGTTTGATCGCTTGATGAAATG
ATCTTGTTGTCAGAGATGCTTTTTTCAGCAATATGATGTATATGTTTCT

QA 1 709 1 709
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3851Contig1 659 2 2 U
GGACAATCAAACACAAACAAAAAACCATAAGAACAGATCTATAAGCTCAACACTGTTGAT
TCATGTCTACAACCGGACAGATTATTCGATGCAAAGCTGCTGTGGCATGGGAAGCTGGAA
AGCCACTGGTGATGGAGGAAGTAGAGGTTGCTCCACCGCAGAAGCACGAAGTTCGTATCA
AGATTCTCTTCACTTCTCTCTGTCACACTGATGTTTACTTCTGGGAAGCAAAGGGACAAA
CGCCTTTGTTTCCACGTATCTTCGGACATGAAGCTGGAGGGATTGTGGAGAGTGTTGGAG
AAGGAGTGACAGATCTTCAACCAGGAGACCACGTCCTCCCAATCTTCACCGGAGAATGCG
GAGACTGCCGTCACTGCCACTCGGAGGAATCCAACATGTGCGACCTTCTCAGGATCAACA
CGGAGAGAGGAGGGATGATACACGACGGCCAATCCAGATTCTCAATCAACGGCAAACCGG
TCCACCATTTCCTCGGTACCTCCACCTTCAGCGAGTACACCGTGGTCCACTCGGGGCAGG
TCGCCAAGATCAACCCCGAAGCTCCTCTCGACAAAGTCTGCATCGTCAGCTGCGGTTTGT
CCACCGGGATGGGAGCGACTTTGAACGTGGCGAAACCGAAGAAAGGTCAGAGCGTTGCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2EK91TF U 1
AF RR2FQ90TF U 1
BS 1 657 RR2EK91TF
BS 658 659 RR2FQ90TF

RD RR2EK91TF 657 0 0
GGACAATCAAACACAAACAAAAAACCATAAGAACAGATCTATAAGCTCAACACTGTTGAT
TCATGTCTACAACCGGACAGATTATTCGATGCAAAGCTGCTGTGGCATGGGAAGCTGGAA
AGCCACTGGTGATGGAGGAAGTAGAGGTTGCTCCACCGCAGAAGCACGAAGTTCGTATCA
AGATTCTCTTCACTTCTCTCTGTCACACTGATGTTTACTTCTGGGAAGCAAAGGGACAAA
CGCCTTTGTTTCCACGTATCTTCGGACATGAAGCTGGAGGGATTGTGGAGAGTGTTGGAG
AAGGAGTGACAGATCTTCAACCAGGAGACCACGTCCTCCCAATCTTCACCGGAGAATGCG
GAGACTGCCGTCACTGCCACTCGGAGGAATCCAACATGTGCGACCTTCTCAGGATCAACA
CGGAGAGAGGAGGGATGATACACGACGGCCAATCCAGATTCTCAATCAACGGCAAACCGG
TCCACCATTTCCTCGGTACCTCCACCTTCAGCGAGTACACCGTGGTCCACTCGGGGCAGG
TCGCCAAGATCAACCCCGAAGCTCCTCTCGACAAAGTCTGCATCGTCAGCTGCGGTTTGT
CCACCGGGATGGGAGCGACTTTGAACGTGGCGAAACCGAAGAAAGGTCAGAGCGTTG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2FQ90TF 659 0 0
GGACAATCAAACACAAACAAAAAACCATAAGAACAGATCTATAAGCTCAACACTGTTGAT
TCATGTCTACAACCGGACAGATTATTCGATGCAAAGCTGCTGTGGCATGGGAAGCTGGAA
AGCCACTGGTGATGGAGGAAGTAGAGGTTGCTCCACCGCAGAAGCACGAAGTTCGTATCA
AGATTCTCTTCACTTCTCTCTGTCACACTGATGTTTACTTCTGGGAAGCAAAGGGACAAA
CGCCTTTGTTTCCACGTATCTTCGGACATGAAGCTGGAGGGATTGTGGAGAGTGTTGGAG
AAGGAGTGACAGATCTTCAACCAGGAGACCACGTCCTCCCAATCTTCACCGGAGAATGCG
GAGACTGCCGTCACTGCCACTCGGAGGAATCCAACATGTGCGACCTTCTCAGGATCAACA
CGGAGAGAGGAGGGATGATACACGACGGCCAATCCAGATTCTCAATCAACGGCAAACCGG
TCCACCATTTCCTCGGTACCTCCACCTTCAGCGAGTACACCGTGGTCCACTCGGGGCAGG
TCGCCAAGATCAACCCCGAAGCTCCTCTCGACAAAGTCTGCATCGTCAGCTGCGGTTTGT
CCACCGGGATGGGAGCGACTTTGAACGTGGCGAAACCGAAGAAAGGTCAGAGCGTTGCG

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL3852Contig1 1221 2 2 U
GGGTCTCAACACTGTTGTGGGAGGCCCTTCTTTCGTCACGTGCGTTGTTGTTTGGATCAT
AAGCATCTCGTTGCGTAGTAGACGTGTAAGGATCGAGAGGTCTGCTTTTATAAGAGACGT
TCGCTTCTTCTGTGCGGCGATTGGTTCCTTGGGTTTGATTTTGGTTTACGGAAAGATCAA
TTTCTGGGGCGCTCTTGTGTTCTGTTCGTTGTATGCTGTTTATGTCGCGTTTGTGTATCT
CTCTTGGAGGTTTGGTGGTGATGGTGGCGAGTTTGATCTTGAGTCGGTTCATAAGCGTGG
GAGTAGTCTTAGTGAACCAATCTTGCATAGAGACGATCTTGATCATGATGAGCGCGTTGA
AGACGTTGTTGTTGTTAATGATCATCAGCGATATTACTTGAAGTTGGTGGTTTGGGTGAT
CACTCTGCCTATCTACTTGCCAAGGACACTGACGATTCCTGTTGTGAGTGAAGCTAAATG
GTCTAAACCAACAGCTGTTGCCTCGGTCACGCTTGCTCCGGTTCTGTTGTCGTTTCTATG
GAACTGGAAGAGGAGTCCAACGAGTTTTGAGGCAGGGATTGTGTATCTAACTGGGTGTTT
GATCGGTATAGCTCTCGGACTCACTGCATTAGCCACGACAAAGAAGTCAAACCCACCAAA
GAAATGGTTACTACCTTGGTTAGCAGGAGGGTTTGTTATGAGCATGACATGGAGTTACAT
CTCAGCGCAAGAGCTAGTCGCGCTTCTAACTTCACTAGGTTACATTTTCGGCGTAAGCCC
GTCGATCTTAGGCTTAACGGTCCTCGCGTGGGGGAACTCGATAGGAGATCTTATAACCAA
CGTGACGATGGCGTTGCACGATGGGGACGAAGGAGCTCAAGTGGCTGTATCGGGATGTTA
CGCGGGTCCCATCTTTAATACGTTGTTTGCTCTCGGGATATCGCTTGTGGGATGTGCGTG
GGAGGTTTATCCGTTGAGTATTGTGATAAAGACAGATCCTCGTTTGTTGGAAAGTCTTGG
GTTTCTGGTTATAGGACTGGTTTGGTCGTTCTTGGTTCTGTTTAGTAACCGGATGAGACT
TGGTGGTGTGATGGGGGTAGGGCTTTTGGTTATTTACTTAGCTTCTTTGTCTATAAGAAT
TGTACAAACAGTTGGAGATTCTTACTAACATTTGATTTCAATTCATCGTTTCATACGTAT
AATTCAATGTACAATCTTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH07TF U 1
AF RR2AH07JQ C 355
BS 1 682 RR2AH07TF
BS 683 1221 RR2AH07JQ

RD RR2AH07TF 682 0 0
GGGTCTCAACACTGTTGTGGGAGGCCCTTCTTTCGTCACGTGCGTTGTTGTTTGGATCAT
AAGCATCTCGTTGCGTAGTAGACGTGTAAGGATCGAGAGGTCTGCTTTTATAAGAGACGT
TCGCTTCTTCTGTGCGGCGATTGGTTCCTTGGGTTTGATTTTGGTTTACGGAAAGATCAA
TTTCTGGGGCGCTCTTGTGTTCTGTTCGTTGTATGCTGTTTATGTCGCGTTTGTGTATCT
CTCTTGGAGGTTTGGTGGTGATGGTGGCGAGTTTGATCTTGAGTCGGTTCATAAGCGTGG
GAGTAGTCTTAGTGAACCAATCTTGCATAGAGACGATCTTGATCATGATGAGCGCGTTGA
AGACGTTGTTGTTGTTAATGATCATCAGCGATATTACTTGAAGTTGGTGGTTTGGGTGAT
CACTCTGCCTATCTACTTGCCAAGGACACTGACGATTCCTGTTGTGAGTGAAGCTAAATG
GTCTAAACCAACAGCTGTTGCCTCGGTCACGCTTGCTCCGGTTCTGTTGTCGTTTCTATG
GAACTGGAAGAGGAGTCCAACGAGTTTTGAGGCAGGGATTGTGTATCTAACTGGGTGTTT
GATCGGTATAGCTCTCGGACTCACTGCATTAGCCACGACAAAGAAGTCAAACCCACCAAA
GAAATGGTTACTACCTTGGTTA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2AH07JQ 867 0 0
CGTTGAAGACGTTGTTGTTGTTAATGATCATCAGCGATATTACTTGAAGTTGGTGGTTTG
GGTGATCACTCTGCCTATCTACTTGCCAAGGACACTGACGATTCCTGTTGTGAGTGAAGC
TAAATGGTCTAAACCAACAGCTGTTGCCTCGGTCACGCTTGCTCCGGTTCTGTTGTCGTT
TCTATGGAACTGGAAGAGGAGTCCAACGAGTTTTGAGGCAGGGATTGTGTATCTAACTGG
GTGTTTGATCGGTATAGCTCTCGGACTCACTGCATTAGCCACGACAAAGAAGTCAAACCC
ACCAAAGAAATGGTTACTACCTTGGTTAGCAGGAGGGTTTGTTATGAGCATGACATGGAG
TTACATCTCAGCGCAAGAGCTAGTCGCGCTTCTAACTTCACTAGGTTACATTTTCGGCGT
AAGCCCGTCGATCTTAGGCTTAACGGTCCTCGCGTGGGGGAACTCGATAGGAGATCTTAT
AACCAACGTGACGATGGCGTTGCACGATGGGGACGAAGGAGCTCAAGTGGCTGTATCGGG
ATGTTACGCGGGTCCCATCTTTAATACGTTGTTTGCTCTCGGGATATCGCTTGTGGGATG
TGCGTGGGAGGTTTATCCGTTGAGTATTGTGATAAAGACAGATCCTCGTTTGTTGGAAAG
TCTTGGGTTTCTGGTTATAGGACTGGTTTGGTCGTTCTTGGTTCTGTTTAGTAACCGGAT
GAGACTTGGTGGTGTGATGGGGGTAGGGCTTTTGGTTATTTACTTAGCTTCTTTGTCTAT
AAGAATTGTACAAACAGTTGGAGATTCTTACTAACATTTGATTTCAATTCATCGTTTCAT
ACGTATAATTCAATGTACAATCTTAAT

QA 1 867 1 867
DS 



AS 1 2

CO CL3853Contig1 835 2 2 U
GGATTCTTCTCTCCAAAGTCCAAACCAACAAAAAGAAATATGGCTTACCAAACCAACTTT
CATCAAACGCCACCGTTCTTCGTCGCTCTTCGTCGGTGGTGGTCACGACCAATGGTGACT
GTCCCACCATATGATGAACGTAGTCACACTGGCAAAGAAATGGTGGCTATGTATGCACCT
TGTAGTGGCGGTGTCTTCACCGTTTTGGTCGTGTTCTTGATCTTTTTGTTCATCGACAAA
GCTCACTCCCACGCCAAAATCTCCCTCCAATCCCTAGCCGTCTCCTCAGCAACGTGGCAA
GTCGATTTTCTAGTGAAAAAACTGAGCTCGAGGTATTCTATCTACTACGACGGCGATGAC
GCTGCGGTGAGGCTCGGCTCTCAAAATGTTGCCGTTTTAAACATCACTAGTGAACGTGTT
TCTAGAGATCACACCGCTTTCTCGTTGTCTTTCGTTGCTGAGGAGGGTAATCGGAGCGAT
GTCGTATCAGAAGAGCTTAAGATCAAACTCAGGGCGAGGCATAAGCGTTACGTGCATGAT
GATGAAGCTGGACACTTTAATATACGGTGCCAAAATGTGTTTCGAGACCGTGAGAAGATT
ATATGCGAATCCTCTTTTACAGTTTTTAGGTCGTTTCTTTTAATGAGACAACTAGGGACA
ATTGAAACAAAAGAATGATTTTTTTTTTCTGAACACATAACAAACAAAAGAATGATTGTT
TATAGTTTTTGCTTTAGTTTTGTTTTTTTTCTAAAAACCATTCTTTGCCTTTAGTTTTTA
TTTTTGTTAAAACCATTTGATTTGCTAATCAAGCTTTTTAATAAATAAATTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A556TF U 1
AF RR2A556JQ C 96
BS 1 752 RR2A556TF
BS 753 835 RR2A556JQ

RD RR2A556TF 752 0 0
GGATTCTTCTCTCCAAAGTCCAAACCAACAAAAAGAAATATGGCTTACCAAACCAACTTT
CATCAAACGCCACCGTTCTTCGTCGCTCTTCGTCGGTGGTGGTCACGACCAATGGTGACT
GTCCCACCATATGATGAACGTAGTCACACTGGCAAAGAAATGGTGGCTATGTATGCACCT
TGTAGTGGCGGTGTCTTCACCGTTTTGGTCGTGTTCTTGATCTTTTTGTTCATCGACAAA
GCTCACTCCCACGCCAAAATCTCCCTCCAATCCCTAGCCGTCTCCTCAGCAACGTGGCAA
GTCGATTTTCTAGTGAAAAAACTGAGCTCGAGGTATTCTATCTACTACGACGGCGATGAC
GCTGCGGTGAGGCTCGGCTCTCAAAATGTTGCCGTTTTAAACATCACTAGTGAACGTGTT
TCTAGAGATCACACCGCTTTCTCGTTGTCTTTCGTTGCTGAGGAGGGTAATCGGAGCGAT
GTCGTATCAGAAGAGCTTAAGATCAAACTCAGGGCGAGGCATAAGCGTTACGTGCATGAT
GATGAAGCTGGACACTTTAATATACGGTGCCAAAATGTGTTTCGAGACCGTGAGAAGATT
ATATGCGAATCCTCTTTTACAGTTTTTAGGTCGTTTCTTTTAATGAGACAACTAGGGACA
ATTGAAACAAAAGAATGATTTTTTTTTTCTGAACACATAACAAACAAAAGAATGATTGTT
TATAGTTTTTGCTTTAGTTTTGTTTTTTTTCT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2A556JQ 740 0 0
GTGGTGGTCACGACCAATGGTGACTGTCCCACCATATGATGAACGTAGTCACACTGGCAA
AGAAATGGTGGCTATGTATGCACCTTGTAGTGGCGGTGTCTTCACCGTTTTGGTCGTGTT
CTTGATCTTTTTGTTCATCGACAAAGCTCACTCCCACGCCAAAATCTCCCTCCAATCCCT
AGCCGTCTCCTCAGCAACGTGGCAAGTCGATTTTCTAGTGAAAAAACTGAGCTCGAGGTA
TTCTATCTACTACGACGGCGATGACGCTGCGGTGAGGCTCGGCTCTCAAAATGTTGCCGT
TTTAAACATCACTAGTGAACGTGTTTCTAGAGATCACACCGCTTTCTCGTTGTCTTTCGT
TGCTGAGGAGGGTAATCGGAGCGATGTCGTATCAGAAGAGCTTAAGATCAAACTCAGGGC
GAGGCATAAGCGTTACGTGCATGATGATGAAGCTGGACACTTTAATATACGGTGCCAAAA
TGTGTTTCGAGACCGTGAGAAGATTATATGCGAATCCTCTTTTACAGTTTTTAGGTCGTT
TCTTTTAATGAGACAACTAGGGACAATTGAAACAAAAGAATGATTTTTTTTTTCTGAACA
CATAACAAACAAAAGAATGATTGTTTATAGTTTTTGCTTTAGTTTTGTTTTTTTTCTAAA
AACCATTCTTTGCCTTTAGTTTTTATTTTTGTTAAAACCATTTGATTTGCTAATCAAGCT
TTTTAATAAATAAATTCCCT

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL3854Contig1 642 2 2 U
GATTCCCTGAGGTTCGGTTGAAGAGATACATGGAGATGAGAGGCGCTGATGGAGGTCCCT
GGAGGAGGTTGTGCGCCCTTCCAGCTTTCTGGGTGGGTTTGTTATATGATGAGGACGTTC
TCCAAGCTGCCTTGGATCTGACAGCTGACTGGACTCCAGCAGAAAGAGATATGCTAAGGA
ACAAAGTTCCAGTAACTGGTTTAAAGACACCATTTAGAGATGGTTTGTTGAAGCATGTAG
CTGAAGATGTTCTGAAACTCGCAAAGGATGGTCTAGAGCGTAGGGGCTACAAGGAAGTTG
GTTTCTTAAACGCTGTGGATGAAGTGGTCAGAACAGGAGTTACGCCGGCGGAGAATCTCT
TGGAAATGTACAATGGGGAATGGGGACAAAGCGTAGATCCTGTGTTCCAGGAACTCCTGT
ACTGAGAGGGATCAACCCAAACCTTTTAGGTGTGAGTTTGTGCTATCTATGGAACTCAAG
TCTCTCTCTCATGAATAAGGTTTTCTTATTTGTTGTAATTCGGATTTGAGAACTGATTTT
TATTTTCTTTTTTAATTTGAAGCGGTCAAAATAAAAAGTAAACATCTGCACTGAAGGATT
TCGATGTGTGGAAATCGTCTTTGAATAAAAATTATTTCTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN07TF U 1
AF RR2DN07JQ C 140
BS 1 564 RR2DN07TF
BS 565 642 RR2DN07JQ

RD RR2DN07TF 564 0 0
GATTCCCTGAGGTTCGGTTGAAGAGATACATGGAGATGAGAGGCGCTGATGGAGGTCCCT
GGAGGAGGTTGTGCGCCCTTCCAGCTTTCTGGGTGGGTTTGTTATATGATGAGGACGTTC
TCCAAGCTGCCTTGGATCTGACAGCTGACTGGACTCCAGCAGAAAGAGATATGCTAAGGA
ACAAAGTTCCAGTAACTGGTTTAAAGACACCATTTAGAGATGGTTTGTTGAAGCATGTAG
CTGAAGATGTTCTGAAACTCGCAAAGGATGGTCTAGAGCGTAGGGGCTACAAGGAAGTTG
GTTTCTTAAACGCTGTGGATGAAGTGGTCAGAACAGGAGTTACGCCGGCGGAGAATCTCT
TGGAAATGTACAATGGGGAATGGGGACAAAGCGTAGATCCTGTGTTCCAGGAACTCCTGT
ACTGAGAGGGATCAACCCAAACCTTTTAGGTGTGAGTTTGTGCTATCTATGGAACTCAAG
TCTCTCTCTCATGAATAAGGTTTTCTTATTTGTTGTAATTCGGATTTGAGAACTGATTTT
TATTTTCTTTTTTAATTTGAAGCG

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2DN07JQ 503 0 0
GACAGCTGACTGGACTCCAGCAGAAAGAGATATGCTAAGGAACAAAGTTCCAGTAACTGG
TTTAAAGACACCATTTAGAGATGGTTTGTTGAAGCATGTAGCTGAAGATGTTCTGAAACT
CGCAAAGGATGGTCTAGAGCGTAGGGGCTACAAGGAAGTTGGTTTCTTAAACGCTGTGGA
TGAAGTGGTCAGAACAGGAGTTACGCCGGCGGAGAATCTCTTGGAAATGTACAATGGGGA
ATGGGGACAAAGCGTAGATCCTGTGTTCCAGGAACTCCTGTACTGAGAGGGATCAACCCA
AACCTTTTAGGTGTGAGTTTGTGCTATCTATGGAACTCAAGTCTCTCTCTCATGAATAAG
GTTTTCTTATTTGTTGTAATTCGGATTTGAGAACTGATTTTTATTTTCTTTTTTAATTTG
AAGCGGTCAAAATAAAAAGTAAACATCTGCACTGAAGGATTTCGATGTGTGGAAATCGTC
TTTGAATAAAAATTATTTCTCTT

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL3855Contig1 866 2 4 U
GGAAGGCGTCGACGAGCTGATAACGGCGATGCTCTCTCCGGGAGCCGAGTTGCCAACCAT
AACAATGCTACGAACCAATTTCTGCATTTCAAATCGCTCTTGCACGGCGAAGCAACCTTC
GCTCTTTAGGGCACATCACCGTGTTTCCTCTGTTCGCATCACCAATTGCAGTGGTGGTGG
TGGTGCTACCGCCGTCTCCTCCTCTTCCCGCCTCCGTGATCTCGTTTTCGTCGTGAACCC
TCAAGGAGCAAATGGTAGAACAGCTCAGGAATGGAAGAAGTTGCTTCCTTACCTTCAATC
TCGTCTTGGTAAAGACTGTAATATATGTGAGTCCTTAACATCTGGTCCTTCTCATGCCAT
TGACATTACAAGAGAGGCTATTAGGGATGGTGCAGATGCTGTCATTGCGGTAGGAGGTGA
TGGAACATTGCATGAGGTTGTTAATGGATTCTTTTGGGAGGGGAAACCTGTCTGTAATCT
CAATAGCGAAGCTGGCCATTCGGCTGCACTTGGTCTGATTCCGTTAGGTACTGGTTCGGA
TTTTGCTAGGACATTTGGTTGGAAAAATGATCCTCGTGAAGCTGTGGAGCACATTGCTAA
AGGGATACGATCACGGGTTGATGTCGGTGTTATCGGCCAGGAAGGAAGCGATTCACATTA
CTTCATTAACGTTGCTGATGTTCATCTGAGTGCAAAAGCAGGCTTTTACGCTTCAAAGTA
CAAGAAATTTGGAAACTTGTGCTATGTTATTGGTGCCCTCCAGGCTTTCATGGGACATGA
CAACCAAGATATGAGGATTAAGGTCAATGGGGGTGAATGGGAACTATATCCACAAGTCAC
GGCTCTTTGTGTTGGAAATGCTAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU16TF U 1
AF RR2E284TF U 242
BS 1 644 RR2DU16TF
BS 645 645 RR2E284TF
BS 646 696 RR2DU16TF
BS 697 866 RR2E284TF

RD RR2DU16TF 701 0 0
GGAAGGCGTCGACGAGCTGATAACGGCGATGCTCTCTCCGGGAGCCGAGTTGCCAACCAT
AACAATGCTACGAACCAATTTCTGCATTTCAAATCGCTCTTGCACGGCGAAGCAACCTTC
GCTCTTTAGGGCACATCACCGTGTTTCCTCTGTTCGCATCACCAATTGCAGTGGTGGTGG
TGGTGCTACCGCCGTCTCCTCCTCTTCCCGCCTCCGTGATCTCGTTTTCGTCGTGAACCC
TCAAGGAGCAAATGGTAGAACAGCTCAGGAATGGAAGAAGTTGCTTCCTTACCTTCAATC
TCGTCTTGGTAAAGACTGTAATATATGTGAGTCCTTAACATCTGGTCCTTCTCATGCCAT
TGACATTACAAGAGAGGCTATTAGGGATGGTGCAGATGCTGTCATTGCGGTAGGAGGTGA
TGGAACATTGCATGAGGTTGTTAATGGATTCTTTTGGGAGGGGAAACCTGTCTGTAATCT
CAATAGCGAAGCTGGCCATTCGGCTGCACTTGGTCTGATTCCGTTAGGTACTGGTTCGGA
TTTTGCTAGGACATTTGGTTGGAAAAATGATCCTCGTGAAGCTGTGGAGCACATTGCTAA
AGGGATACGATCACGGGTTGATGTCGGTGTTATCGGCCAGGAAG*AAGCGATTCACATTA
CTTCATTAACGTTGCTGATGTTCATCTGAGTGCAAA
GCAGC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2E284TF 625 0 0
G
AAGGAGCAAATGGTAGAACAGCTGAGGAATGGAAGAAGTTGCTTCCTTACCTTCAATCTC
GTCTTGGTAAAGACTGTAATATATGTGAGTCCTTAACATCTGGTCCTTCTCATGCCATTG
ACATTACAAGAGAGGCTATTAGGGATGGTGCAGATGCTGTCATTGCGGTAGGAGGTGATG
GAACATTGCATGAGGTTGTTAATGGTTTCTTTTGGGAGGGGAAACCTGTCTGTAATCTCA
ATAGCGAAGCTGGCCATTCGGCTGCACTTGGTCTGAT*CCGTTAGGTACTGGTTCGGATT
TTGCTAGGACATTTGGTTGGAAAAATGATCCTCGTGAAGCTGTGGAGCGCATTGCTAAAG
GGATACGATCACGGGTTGATGTCGGTGTTATCGGCCAGGAAGGAAGGGATTCACGTTACT
TCATTAACGTTGCTGATGTTCATCTGAGTGCAAAAGCAGGCTTTTACGCTTCAAAGTACA
AGAAATTTGGAAACTTGTGCTATGTTATTGGTGCCCTCCAGGCTTTCATGGGACATGACA
ACCAAGATATGAGGATTAAGGTCAATGGGGGTGAATGGGAACTATATCCACAAGTCACGG
CTCTTTGTGTTGGAAATGCTAAGT

QA 2 625 2 625
DS 



AS 1 2

CO CL3856Contig1 669 2 2 U
GGAATCTCATCTCAGCTTTCCAAACAAAACTAGAATCTTTATAAAGTTTCTCATTACACT
TAAAACCCCTTGTCTTTCTTGAAATGTCGGAAGAATTCGACGAATCCGATATCATTTTCT
CCGACAGTTTCTTTCCGACTCGCCGGCGTGACGACATGAACGAGAAAGAAAACCGTCCGG
TTGGTTTCCGAGAAAACTCCAAAAATAAACCGAGGCGGATCAAAACGACGCCGTTACCTT
CACCAGCGGCATTCTCGACTTCTCTACCAGTGAATATACCGGGTAATGTGATGCGAAGGT
ACACGGATGAAGAGGAATATTCCGATGACGGAGGAAGGAACATGGTTCCGCCGCATCTGA
TTGTCGGACGGAGGATGGAAGGTTGTCAAATGGCGTTTTCCGTTTGTACAGGTAACGGAA
GGACTCTCAAAGGACGGGATCTTAGCCGGGTTCGTAATTCGGTTCTTAGGTTAACCGGTT
TTCTGGAGGGTTAAAGTCGTTAACCGGGTTGTCCAAACAAAAAAAACTCGTTAATAGGAT
TTTATCAAAATTTTCGTCTCTTGTTAGCTTAAGGACTATTGAAATTCAAAAGGAAAATGT
CAAAAAAGAACATTTAATTCCTTGTATATTTATTTAAATTCTTAATTTGATTGTTCTTAA
ATGTAATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI96TF U 1
AF RR2GI96JQB C 38
BS 1 452 RR2GI96TF
BS 453 669 RR2GI96JQB

RD RR2GI96TF 452 0 0
GGAATCTCATCTCAGCTTTCCAAACAAAACTAGAATCTTTATAAAGTTTCTCATTACACT
TAAAACCCCTTGTCTTTCTTGAAATGTCGGAAGAATTCGACGAATCCGATATCATTTTCT
CCGACAGTTTCTTTCCGACTCGCCGGCGTGACGACATGAACGAGAAAGAAAACCGTCCGG
TTGGTTTCCGAGAAAACTCCAAAAATAAACCGAGGCGGATCAAAACGACGCCGTTACCTT
CACCAGCGGCATTCTCGACTTCTCTACCAGTGAATATACCGGGTAATGTGATGCGAAGGT
ACACGGATGAAGAGGAATATTCCGATGACGGAGGAAGGAACATGGTTCCGCCGCATCTGA
TTGTCGGACGGAGGATGGAAGGTTGTCAAATGGCGTTTTCCGTTTGTACAGGTAACGGAA
GGACTCTCAAAGGACGGGATCTTAGCCGGGTT

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2GI96JQB 632 0 0
TTTATAAAGTTTCTCATTACACTTAAAACCCCTTGTCTTTCTTGAAATGTCGGAAGAATT
CGACGAATCCGATATCATTTTCTCCGACAGTTTCTTTCCGACTCGCCGGCGTGACGACAT
GAACGAGAAAGAAAACCGTCCGGTTGGTTTCCGAGAAAACTCCAAAAATAAACCGAGGCG
GATCAAAACGACGCCGTTACCTTCACCAGCGGCATTCTCGACTTCTCTACCAGTGAATAT
ACCGGGTAATGTGATGCGAAGGTACACGGATGAAGAGGAATATTCCGATGACGGAGGAAG
GAACATGGTTCCGCCGCATCTGATTGTCGGACGGAGGATGGAAGGTTGTCAAATGGCGTT
TTCCGTTTGTACAGGTAACGGAAGGACTCTCAAAGGACGGGATCTTAGCCGGGTTCGTAA
TTCGGTTCTTAGGTTAACCGGTTTTCTGGAGGGTTAAAGTCGTTAACCGGGTTGTCCAAA
CAAAAAAAACTCGTTAATAGGATTTTATCAAAATTTTCGTCTCTTGTTAGCTTAAGGACT
ATTGAAATTCAAAAGGAAAATGTCAAAAAAGAACATTTAATTCCTTGTATATTTATTTAA
ATTCTTAATTTGATTGTTCTTAAATGTAATCT

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL3857Contig1 1201 2 2 U
GGAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGCAACAGTTTCAACCTCCAAAGATTCGA
TCTCTGCTCCTCAACTCCTCCGTCAGATTCCTCAACTCACTGTTCTTCTCTTTTCTTCTC
CTCACCGCAAAGCTCGAGCTTCCATGGAGAGGAAGTCGGAATCATTTGATTAGGGTTTCG
GAAGCTGAAAGCATAGCGTTTGATAACAATGGGGTGTGTGTTCTCGTCCTCTAAGGCGGC
GACGACATCTGAAATTAAACTAGCAAAGACCTCCAAAACAGGAGAAACTGTGCAAGCGAG
TGATGTAGAGAAGAAGAAGCATGACGAGGAAGAAGCTCCTCCTCCCAAGGAAGATAAGAA
ACCATCAAAAGGAGATCGGAGAAGGTCAACAAAGCCAAACCCACGCCTGAGTAATCCCTC
TAAGCATTGGCGAGGCGAACAGGTCGCTGCTGGTTGGCCTTCTTGGCTCTCTGATGCTTG
TGGTGAAGCTCTTAACGGCTGGGTTCCTAGAAAGGCCGACACTTTCGAGAAGATCGATAA
GATTGGACAAGGAACGTACAGTAATGTATACAAAGCTAAGGATATGCTGACTGGTAAAAT
CGTGGCGCTTAAGAAGGTTCGGTTTGATAACTTGGAGCCTGAAAGCGTCAAGTTTATGGC
TAGAGAGATTCTTGTACTGCGCAGGCTTGATCATCCCAATGTGGTTAAGTTGGAAGGTTT
GGTTACCTCCAGGATGTCTTGTAGCTTGTACCTTGTGTTTCAGTACATGGATCATGATTT
GGCTGGTCTTGCTTCTAGCCCTCTTGTTAACTTCTCTCAACCTGAGGTGAAATGTTTAAT
GCGTCAGTTGTTATCTGGTATGGAGCATTGTCATAGCCGTGGTGTGCTTCATCGTGACAT
CAAAGGATCGAATCTTCTTATTGACGACGGTGGGGTCCTCAAGATTGCTGATTTTGGACT
GGCCACTATTTTTGATCCTAATCACAAGCGGGCCATGACTAGCCGAGTGGTCACGCTATG
GTACCGAGCTCCCGAGCTTCTTCTTGGGGCCACTGACTATGGTGTTGGTATTGATCTTTG
GAGCGCCGGCTGTATTTTAGCTGAGCTTTTGGCCGGAAGACCTATTATGCCTGGTCGAAC
AGAGGTGGAGCAGCTCCATAAGATTTACAAGCTATGTGGTTCACCATCAGAGGACTACTG
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2A456TF U 1
AF RR2A456JQ C 389
BS 1 813 RR2A456TF
BS 814 1201 RR2A456JQ

RD RR2A456TF 813 0 0
GGAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGCAACAGTTTCAACCTCCAAAGATTCGA
TCTCTGCTCCTCAACTCCTCCGTCAGATTCCTCAACTCACTGTTCTTCTCTTTTCTTCTC
CTCACCGCAAAGCTCGAGCTTCCATGGAGAGGAAGTCGGAATCATTTGATTAGGGTTTCG
GAAGCTGAAAGCATAGCGTTTGATAACAATGGGGTGTGTGTTCTCGTCCTCTAAGGCGGC
GACGACATCTGAAATTAAACTAGCAAAGACCTCCAAAACAGGAGAAACTGTGCAAGCGAG
TGATGTAGAGAAGAAGAAGCATGACGAGGAAGAAGCTCCTCCTCCCAAGGAAGATAAGAA
ACCATCAAAAGGAGATCGGAGAAGGTCAACAAAGCCAAACCCACGCCTGAGTAATCCCTC
TAAGCATTGGCGAGGCGAACAGGTCGCTGCTGGTTGGCCTTCTTGGCTCTCTGATGCTTG
TGGTGAAGCTCTTAACGGCTGGGTTCCTAGAAAGGCCGACACTTTCGAGAAGATCGATAA
GATTGGACAAGGAACGTACAGTAATGTATACAAAGCTAAGGATATGCTGACTGGTAAAAT
CGTGGCGCTTAAGAAGGTTCGGTTTGATAACTTGGAGCCTGAAAGCGTCAAGTTTATGGC
TAGAGAGATTCTTGTACTGCGCAGGCTTGATCATCCCAATGTGGTTAAGTTGGAAGGTTT
GGTTACCTCCAGGATGTCTTGTAGCTTGTACCTTGTGTTTCAGTACATGGATCATGATTT
GGCTGGTCTTGCTTCTAGCCCTCTTGTTAACTT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2A456JQ 813 0 0
ACAAAGCCAAACCCACGCCTGAGTAATCCCTCTAAGCATTGGCGAGGCGAACAGGTCGCT
GCTGGTTGGCCTTCTTGGCTCTCTGATGCTTGTGGTGAAGCTCTTAACGGCTGGGTTCCT
AGAAAGGCCGACACTTTCGAGAAGATCGATAAGATTGGACAAGGAACGTACAGTAATGTA
TACAAAGCTAAGGATATGCTGACTGGTAAAATCGTGGCGCTTAAGAAGGTTCGGTTTGAT
AACTTGGAGCCTGAAAGCGTCAAGTTTATGGCTAGAGAGATTCTTGTACTGCGCAGGCTT
GATCATCCCAATGTGGTTAAGTTGGAAGGTTTGGTTACCTCCAGGATGTCTTGTAGCTTG
TACCTTGTGTTTCAGTACATGGATCATGATTTGGCTGGTCTTGCTTCTAGCCCTCTTGTT
AACTTCTCTCAACCTGAGGTGAAATGTTTAATGCGTCAGTTGTTATCTGGTATGGAGCAT
TGTCATAGCCGTGGTGTGCTTCATCGTGACATCAAAGGATCGAATCTTCTTATTGACGAC
GGTGGGGTCCTCAAGATTGCTGATTTTGGACTGGCCACTATTTTTGATCCTAATCACAAG
CGGGCCATGACTAGCCGAGTGGTCACGCTATGGTACCGAGCTCCCGAGCTTCTTCTTGGG
GCCACTGACTATGGTGTTGGTATTGATCTTTGGAGCGCCGGCTGTATTTTAGCTGAGCTT
TTGGCCGGAAGACCTATTATGCCTGGTCGAACAGAGGTGGAGCAGCTCCATAAGATTTAC
AAGCTATGTGGTTCACCATCAGAGGACTACTGG

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

CO CL3858Contig1 987 2 4 U
GGACGTTGAGTCGTTTACGTCTCCTCCCACTGATTTTTCCCGAGAAAATTGAAAGAAAGT
TGATTCGATTCGATTCAATGGAGTCGCTAGCATCTATTTCTACTTCCATAATACTACCTC
CAACAATCACGACTACGATCTCCGTTTCAACTTCACGATCAGTATTGATTCCTCTTCCTT
CCCACCGTTGTTGTTCCACCTTCTCCAGCTTAGGGAGACGGATCTCGATTCCGAGAAGAA
GACACTTCTCGAGCTGTAAATCGAGTGCCAGCGGCGGCGGCGGTGGAGGAGGATCAGATA
AACAGGGTGGCGATGAAGAGGAAAGAAGCGAGGAAGTGGAGAAGGCACTTAACTTGGACG
GTACGATCCCTGGGACTTCCGACGAGTTTGTGAGGCAAGTCTCATCACGTGCCTACGACA
TGCGTCGGAAACTAGAGCAGACGTTTGATTCCACCAGCTATGACGTGCTGGAGTCTAACC
CTTGGAGAGGAGACTCAAAGCCGGTTTATGTACTAACACAGAGAGAAAACCAGATCTGCA
CCATGAAAACTAGAACAACCCACAGTGAAGTAGAGAAAGAGCTTGGACTGTTGTTCTCTA
AAAGGATCAGCAACCAGAAAAAACAATCTAGACCCGAAACTAAGTTCGATATGCTCGTTG
AAGACATTCGAGATGGAGTTTTGGTTTTTGAAGATGTGAATGAGGCTGTTCGATACTGTG
ATCTGCTACAAGGTGGAGGAAAAGGGTGTGAAGGCGTGGCTGAGATTGAAGCCTCATCTG
TTTTTGATCTTTGCCGGAAAACGAGGTCTCTGGCGGTTCTATTCCGCCGTGGAAGAACAC
CACCAACACCACAGACGCTGGAGCGTAATTTGGGATCCCGTAAGCGTTCTCTTGAGGACT
TGAGGGACAATAAATAGCTTGTACATCATCTTAATAGTACTTACAATTATCTGGGAAAAA
AACTTGTATAAACAAGTGTAATTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM93TF U 1
AF RR2DG89JQ C 242
BS 1 616 RR2GM93TF
BS 617 617 RR2DG89JQ
BS 618 679 RR2GM93TF
BS 680 987 RR2DG89JQ

RD RR2GM93TF 679 0 0
GGACGTTGAGTCGTTTACGTCTCCTCCCACTGATTTTTCCCGAGAAAATTGAAAGAAAGT
TGATTCGATTCGATTCAATGGAGTCGCTAGCATCTATTTCTACTTCCATAATACTACCTC
CAACAATCACGACTACGATCTCCGTTTCAACTTCACGATCAGTATTGATTCCTCTTCCTT
CCCACCGTTGTTGTTCCACCTTCTCCAGCTTAGGGAGACGGATCTCGATTCCGAGAAGAA
GACACTTCTCGAGCTGTAAATCGAGTGCCAGCGGCGGCGGCGGTGGAGGAGGATCAGATA
AACAGGGTGGCGATGAAGAGGAAAGAAGCGAGGAAGTGGAGAAGGCACTTAACTTGGACG
GTACGATCCCTGGGACTTCCGACGAGTTTGTGAGGCAAGTCTCATCACGTGCCTACGACA
TGCGTCGGAAACTAGAGCAGACGTTTGATTCCACCAGCTATGACGTGCTGGAGTCTAACC
CTTGGAGAGGAGACTCAAAGCCGGTTTATGTACTAACACAGAGAGAAAACCAGATCTGCA
CCATGAAAACTAGAACAACCCACAGTGAAGTAGAGAAAGAGCTTGGACTGTTGTTCTCTA
AAAGGATCAGCAACCA*AAAAAACAATCTAGACCCGAAACTAAGTTCGATATGCTCGTTG
AAGACATTCGAGATGGAGT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2DG89JQ 746 0 0
ACACTTCTCGAGCTGTAAATCGAGTGCCAGCGGCGGCGGCGGTGGAGGAGGATCGGATAA
ACAGGGTGGCGATGAAGAGGAAAGAAGCGAGGAAGTGGAGAAGGCGCTTAACTTGGACGG
TACGATCCCTGGGACTTCCGACGAGTTTGTGAGGCAAGTCTCATCACGTGCCTACGACAT
GCGTCGGAAACTAGAGCAGACGTTTGATTCCACCAGCTATGACGTGCTGGAGTCTAACCC
TTGGAGAGGAGACTCAAAGCCGGTTTATGTACTAACACAGAGAGAAAACCAGATCTGCAC
CATGAAAACTAGAACAACCCACAGTGAAGTAGAGAAAGAGCTTGGACTGTTGTTCTCTAA
AAGGATCAGCAACCAGAAAAAACAATCTAGACCCGAAACTAAGTTCGATATGCTCGTTGA
AGACATTCGAGATGGAGTTTTGGTTTTTGAAGATGTGAATGAGGCTGTTCGATACTGTGA
TCTGCTACAAGGTGGAGGAAAAGGGTGTGAAGGCGTGGCTGAGATTGAAGCCTCATCTGT
TTTTGATCTTTGCCGGAAAACGAGGTCTCTGGCGGTTCTATTCCGCCGTGGAAGAACACC
ACCAACACCACAGACGCTGGAGCGTAATTTGGGATCCCGTAAGCGTTCTCTTGAGGACTT
GAGGGACAATAAATAGCTTGTACATCATCTTAATAGTACTTACAATTATCTGGGAAAAAA
ACTTGTATAAACAAGTGTAATTAATC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL3859Contig1 791 2 3 U
TTTTTTTTTGCAAAAGATAAATGAATTCACTTAAAAACATATTACAAGAATTTGAGTTTG
TACAGTAACTTTCTAAGACTATATTCTTTGACCAATCAGTGACAACTTTTAACTATTTCT
CTTCACTGTCTACATAGCTCAGAGAAAGAGCTTTCTCTAGACATCTGAAAGCTTTCTGGT
AGCTCAAGAATCCCATGAACCAGAAGTCGAAACCATCGACCGTGACTACTTCCATGTACT
TCTGTGACGGTTTCTTTGTGTTCTGACTCTGGTTCACTCTCTCGATCTTGCACAAAGGGA
TTGACACTTTGTAGTGAACCCTGATCATGTCTCCTTGAGGGGAAGCCACCTTAATCGATC
TCTCGCTGCAGAAGGCTATTTTCTCGGAAGAAATGAAGAGAAGGCCTGCAATGGGACCAG
CTGTGGTGGACAGGTAACACTGGAATGTTTTGAAGAGTTTCTCATCTTCGTTGACTCTGA
AGAGCCGCTTGTAGATCTTCTCTAAACCTCCCACCTGAAGAATCCTAGCCCCCAAAGATA
GCTTTCTCTTCACCGTTTCGGTTAGCTTTGGTCTTAGCTTGCTCTGGTCTCTGGACCTAT
TATTGAAACCATCGGGTTTCTTCCTTTTAAGAACTGATTTTGTGTTGTTACTCGAAGCCG
GATCAGGTAAATAACCAACCGGATAAGTAATAACTTGTTGCTCAGTTCTGATCATGTTCA
TCTTTAGAGGATTAATGAGAGTAATCTTGATCTTGTTGGTGTTGTGTGATTTGTAAAATG
AAGCTGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC89TF C 1
AF RR2FC89JQ U 9
BS 1 11 RR2FC89TF
BS 12 782 RR2FC89JQ
BS 783 791 RR2FC89TF

RD RR2FC89TF 791 0 0
TTTTTTTTTGCAAAAGATAAATGAATTCACTTAAAAACATAT*ACAAGAATTTGAGTTTG
TACAGTAACTTTCTAAGACTATATTCTTTGACCAATCAGTGACAACTTTTAACTATTTCT
CTTCACTGTCTACATAGCTCAGAGAAAGAGCTTTCTCTAGACATCTGAAAGCTTTCTGGT
AGCTCAAGAATCCCATGAACCAGAAGTCGAAACCATCGACCGTGACTACTTCCATGTACT
TCTGTGACGGTTTCTTTGTGTTCTGACTCTGGTTCACTCTCTCGATCTTGCACAAAGGGA
TTGACACTTTGTAGTGAACCCTGATCATGTCTCCTTGAGGGGAAGCCACCTTAATCGATC
TCTCGCTGCAGAAGGCTATTTTCTCGGAAGAAATGAAGAGAAGGCCTGCAATGGGACCAG
CTGTGGTGGACAGGTAACACTGGAATGTTTTGAAGAGTTTCTCATCTTCGTTGACTCTGA
AGAGCCGCTTGTAGATCTTCTCTAAACCTCCCACCTGAAGAATCCTAGCCCCCAAAGATA
GCTTTCTCTTCACCGTTTCGGTTAGCTTTGGTCTTAGCTTGCTCTGGTCTCTGGACCTAT
TATTGAAACCATCGGGTTTCTTCCTTTTAAGAACTGATTTTGTGTTGTTACTCGAAGCCG
GATCAGGTAAATAACCAACCGGATAAGTAATAACTTGTTGCTCAGTTCTGATCATGTTCA
TCTTTAGAGGATTAATGAGAGTAATCTTGATCTTGTTGGTGTTGTGTGATTTGTAAAATG
AAGCTGATTCC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2FC89JQ 774 0 0
GCA
AAAAGATAAATGAATTCACTTAAAAACATATTACAAGAATTTGAGTTTGTACAGTAACTT
TCTAAGACTATATTCTTTGACCAATCAGTGACAACTTTTAACTATTTCTCTTCACTGTCT
ACATAGCTCAGAGAAAGAGCTTTCTCTAGACATCTGAAAGCTTTCTGGTAGCTCAAGAAT
CCCATGAACCAGAAGTCGAAACCATCGACCGTGACTACTTCCATGTACTTCTGTGACGGT
TTCTTTGTGTTCTGACTCTGGTTCACTCTCTCGATCTTGCACAAAGGGATTGACACTTTG
TAGTGAACCCTGATCATGTCTCCTTGAGGGGAAGCCACCTTAATCGATCTCTCGCTGCAG
AAGGCTATTTTCTCGGAAGAAATGAAGAGAAGGCCTGCAATGGGACCAGCTGTGGTGGAC
AGGTAACACTGGAATGTTTTGAAGAGTTTCTCATCTTCGTTGACTCTGAAGAGCCGCTTG
TAGATCTTCTCTAAACCTCCCACCTGAAGAATCCTAGCCCCCAAAGATAGCTTTCTCTTC
ACCGTTTCGGTTAGCTTTGGTCTTAGCTTGCTCTGGTCTCTGGACCTATTATTGAAACCA
TCGGGTTTCTTCCTTTTAAGAACTGATTTTGTGTTGTTACTCGAAGCCGGATCAGGTAAA
TAACCAACCGGATAAGTAATAACTTGTTGCTCAGTTCTGATCATGTTCATCTTTAGAGGA
TTAATGAGAGTAATCTTGATCTTGTTGGTGTTGTGTGATTTGTAAAATGAA

QA 4 774 4 774
DS 



AS 1 2

CO CL3860Contig1 838 2 2 U
GGACCTTTACACAGAAATCTAATACAAAAAGTATATTCCAATGAGGAGTCTTATATTTTT
CACAATTTTTTCTCTCTTGGCTTTAACCTTTCCAGTAGCCATTGCTTCTGACCCAAGCCC
CGTTCAAGACTTTTGTGTGGGCGTAAACACCCCGGCCGATGGTGTGTTTGTTAACGGAAA
GTTCTGCAAAGACCCAAAGCTCGCCACAGTAGACGACTTCTTTTTCACAGGGCTTGACAG
GCAAAGAATCGCAACTAATGCGGCTGGAACAAATGTGACACCCGTCTTTTCTGATAACCT
TCCTGGGCTCAACACCCTTGGAATAGCATTTGCTCGTGTAGATTATGCACTAAACGGGCT
GATCCCACCTCACACCCATCCACGTGCCAGCGAGTTCTTGATTGTCCAAGAAGGAACGCT
TTTCGCGGGTTTTGTCTCGTCAGACCAAGACGGAAATCGTCTATTCTCCAAAATACTCAA
CAAGGGTGATCTGATTGTGTTTCCAGTGGGACTCATCCATTTCCATGTCAATGTGGGACA
ATGTCCAGCAGTTGCATTCACTGCTTTTAGCAGCCAAAACCCAGGTCTCATCACTGTTTC
TAAAAGCGTGTTTGGGTCTAACCCACGGATAAACCCAAATGTTCTTGCAAAAGCATTCCA
GTTGGATCCTACGATTGTCATGAGCCTACAGACCAAATTCTGATCATGGAATGAAATGAA
AAATATTGAGCTTTTAACTGTTTTCTATTTCTTTACCGTTGTCTAAATAAGGATCGTGTA
TTATCCATCAGTGCATCAATAAAGTGACATAAAGTAATGCTTACAAAATTACTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX34TF U 1
AF RR2EX34JQ C 197
BS 1 620 RR2EX34TF
BS 621 838 RR2EX34JQ

RD RR2EX34TF 620 0 0
GGACCTTTACACAGAAATCTAATACAAAAAGTATATTCCAATGAGGAGTCTTATATTTTT
CACAATTTTTTCTCTCTTGGCTTTAACCTTTCCAGTAGCCATTGCTTCTGACCCAAGCCC
CGTTCAAGACTTTTGTGTGGGCGTAAACACCCCGGCCGATGGTGTGTTTGTTAACGGAAA
GTTCTGCAAAGACCCAAAGCTCGCCACAGTAGACGACTTCTTTTTCACAGGGCTTGACAG
GCAAAGAATCGCAACTAATGCGGCTGGAACAAATGTGACACCCGTCTTTTCTGATAACCT
TCCTGGGCTCAACACCCTTGGAATAGCATTTGCTCGTGTAGATTATGCACTAAACGGGCT
GATCCCACCTCACACCCATCCACGTGCCAGCGAGTTCTTGATTGTCCAAGAAGGAACGCT
TTTCGCGGGTTTTGTCTCGTCAGACCAAGACGGAAATCGTCTATTCTCCAAAATACTCAA
CAAGGGTGATCTGATTGTGTTTCCAGTGGGACTCATCCATTTCCATGTCAATGTGGGACA
ATGTCCAGCAGTTGCATTCACTGCTTTTAGCAGCCAAAACCCAGGTCTCATCACTGTTTC
TAAAAGCGTGTTTGGGTCTA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2EX34JQ 642 0 0
AAGCTCGCCACAGTAGACGACTTCTTTTTCACAGGGCTTGACAGGCAAAGAATCGCAACT
AATGCGGCTGGAACAAATGTGACACCCGTCTTTTCTGATAACCTTCCTGGGCTCAACACC
CTTGGAATAGCATTTGCTCGTGTAGATTATGCACTAAACGGGCTGATCCCACCTCACACC
CATCCACGTGCCAGCGAGTTCTTGATTGTCCAAGAAGGAACGCTTTTCGCGGGTTTTGTC
TCGTCAGACCAAGACGGAAATCGTCTATTCTCCAAAATACTCAACAAGGGTGATCTGATT
GTGTTTCCAGTGGGACTCATCCATTTCCATGTCAATGTGGGACAATGTCCAGCAGTTGCA
TTCACTGCTTTTAGCAGCCAAAACCCAGGTCTCATCACTGTTTCTAAAAGCGTGTTTGGG
TCTAACCCACGGATAAACCCAAATGTTCTTGCAAAAGCATTCCAGTTGGATCCTACGATT
GTCATGAGCCTACAGACCAAATTCTGATCATGGAATGAAATGAAAAATATTGAGCTTTTA
ACTGTTTTCTATTTCTTTACCGTTGTCTAAATAAGGATCGTGTATTATCCATCAGTGCAT
CAATAAAGTGACATAAAGTAATGCTTACAAAATTACTTCTCC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3862Contig1 423 2 1 U
GGATCAATCGAAACACATCAAAATTCATATAAACAAAATATCTGCTTAAGAAAAATGGCA
GACAACAAGCAAAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAAT
GTGCTGGTGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGTCTGCTCAAACCGCA
GGACAGAAGATATCGGAGACCGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTGGC
ATGAACAAGTAGTGGACTCTGAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATCA
ATTGTTGTGGTTTTAAATAAAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTTCATCATAGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGTTTAGCGATTTAAATACTTGAATTAATTGTTTCT
CTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2D477JQ C 1
AF RR2D477TF U 1
BS 1 423 RR2D477TF

RD RR2D477JQ 423 0 0
GGATCAATCGAAACACATCAAAATTCATATAAACAAAATATCTGCTTAAGAAAAATGGCA
GACAACAAGCAAAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAAT
GTGCTGGTGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGTCTGCTCAAACCGCA
GGACAGAAGATATCGGAGACCGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTGGC
ATGAACAAGTAGTGGACTCTGAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATCA
ATTGTTGTGGTTTTAAATAAAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTTCATCATAGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGTTTAGCGATTTAAATACTTGAATTAATTGTTTCT
CTC

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR2D477TF 423 0 0
GGATCAATCGAAACACATCAAAATTCATATAAACAAAATATCTGCTTAAGAAAAATGGCA
GACAACAAGCAAAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAAT
GTGCTGGTGGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGTCTGCTCAAACCGCA
GGACAGAAGATATCGGAGACCGCAGGGGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTGGC
ATGAACAAGTAGTGGACTCTGAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATCA
ATTGTTGTGGTTTTAAATAAAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTTCATCATAGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGTTTAGCGATTTAAATACTTGAATTAATTGTTTCT
CTC

QA 1 423 1 423
DS 



AS 1 2

CO CL3863Contig1 985 2 2 U
TGGTGCAGACGTGGTGGGCCTCCTCGTGGCTCATTTAACCCCGGTGGAAACAGACCTCAT
GATCCAAAGGATGGACCAAAGGATGGAGAAAGAAACGGTGGGTTTCGTGGATACCGTGAG
AGTGGTGGTCGTGGAGGTCACATTGGTGGATTTGCTAATGGTAAAACTGGTGATGTTGAT
CGCCCAAAGAGGGTCTTTGACCGCCGTAGTGCAACAGGTCGTAGTAATGACCTGAAACGT
GAGGGGTGGTGGTCGTGGAAACTGGGGTACTCCTGAAGATGATGTTCAGCCAGCAACTGA
CGGACCCACAACAGAAGTTGAGAAGAGCCCAGTTGCTGACAAGGAAGGCGGTGAGGGTGC
TACCACTGATGCAAAGAAAGAATTTCCTGAAGTTGAGCAAGAGCCTGAAGACAAGGAGAT
GACTCTGGAAGAGTATGAGAAGATTTTGGAGGAGAAGAAGAAAGCTTTGCAAGCCACCAA
GGTTGAGGAGAGGAAAGTTGACACCAAAGTGTTTGAGTTTATGCAACAGCTCTCTAACAA
GAAGACCAATGATGAGGAAATTTTCATCAAGCTGGGATCCGACAAGGACAAACGCAAAGA
TGCTGCTGAGAAAGAAGAGAAGGCCAAGAAGTCGTTGAGCATTAACGAGTTTTTGAAGCC
TGCTAATGGAGAGAACTACAACCCAAGAGGTGGATACCGTGGAAGAGGAGGTCGCGGTGG
TGGTCGTGGACAGAGAGATGGAAAAGCCAACGGAGGAGGAAACCAAAGGAATGGTGGAGG
AGCTCCTGCTCCAGCTATCGGAGACAGTGATCAGTTCCCATCGTTGGGCAAGTAAAGACA
CCCTTTTCGGGTCCTACAAACATCTATCTATCTATCTACCTCCACTCTCTCTTTAGTTTA
ATTTTGTTGCCTTAGTTCTACTTCTCCATCATTTTTGTTACACTTTCACTACAAAACATG
TTTGGTAGCTTTGACTTTATGATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA65TF U 1
AF RR2CA65JQ C 237
BS 1 339 RR2CA65TF
BS 340 985 RR2CA65JQ

RD RR2CA65TF 339 0 0
TGGTGCAGACGTGGTGGGCCTCCTCGTGGCTCATTTAACCCCGGTGGAAACAGACCTCAT
GATCCAAAGGATGGACCAAAGGATGGAGAAAGAAACGGTGGGTTTCGTGGATACCGTGAG
AGTGGTGGTCGTGGAGGTCACATTGGTGGATTTGCTAATGGTAAAACTGGTGATGTTGAT
CGCCCAAAGAGGGTCTTTGACCGCCGTAGTGCAACAGGTCGTAGTAATGACCTGAAACGT
GAGGGGTGGTGGTCGTGGAAACTGGGGTACTCCTGAAGATGATGTTCAGCCAGCAACTGA
CGGACCCACAACAGAAGTTGAGAAGAGCCCAGTTGCTGA

QA 1 339 1 339
DS 

RD RR2CA65JQ 749 0 0
AACGTGA
GGGTGGTGGTCGTGGAAACTGGGGTACTCCTGAAGATGATGTTCAGCCAGCAACTGACGG
ACCCACAACAGAAGTTGAGAAGAGCCCAGTTGCTGACAAGGAAGGCGGTGAGGGTGCTAC
CACTGATGCAAAGAAAGAATTTCCTGAAGTTGAGCAAGAGCCTGAAGACAAGGAGATGAC
TCTGGAAGAGTATGAGAAGATTTTGGAGGAGAAGAAGAAAGCTTTGCAAGCCACCAAGGT
TGAGGAGAGGAAAGTTGACACCAAAGTGTTTGAGTTTATGCAACAGCTCTCTAACAAGAA
GACCAATGATGAGGAAATTTTCATCAAGCTGGGATCCGACAAGGACAAACGCAAAGATGC
TGCTGAGAAAGAAGAGAAGGCCAAGAAGTCGTTGAGCATTAACGAGTTTTTGAAGCCTGC
TAATGGAGAGAACTACAACCCAAGAGGTGGATACCGTGGAAGAGGAGGTCGCGGTGGTGG
TCGTGGACAGAGAGATGGAAAAGCCAACGGAGGAGGAAACCAAAGGAATGGTGGAGGAGC
TCCTGCTCCAGCTATCGGAGACAGTGATCAGTTCCCATCGTTGGGCAAGTAAAGACACCC
TTTTCGGGTCCTACAAACATCTATCTATCTATCTACCTCCACTCTCTCTTTAGTTTAATT
TTGTTGCCTTAGTTCTACTTCTCCATCATTTTTGTTACACTTTCACTACAAAACATGTTT
GGTAGCTTTGACTTTATGATGG

QA 8 749 8 749
DS 



AS 1 2

CO CL3864Contig1 983 2 8 U
GGATTTTAGAATATTATTTTCCAAAATTAATTTCCGCCGCTTTGTGCGGTCGCCGGATCC
GTCTCTCGTTTCTATGTTGTATCAAATCTGCGGTTAACTCTGCTTGTCGTGAAGGTCTCA
GGTCCATAAAGACCCTTAGCGGTGGTTTGTGTGGCGGTTGAAAGTGGTGGGCTGGGTCAG
CCTTCATCTTTTCGGTGCAGCACGTCTGGCTCTGTTGCCTTCGTTCTTGTGCAGATCAGT
CCGTGTCGCACTGTGCGTTTGTATGTTCGGGTTTGGGTCTTTTTGTGGTTTCTAATCCGA
TTTGAAAGCTGCTGGCTCCTAGTGGAGCGATGGTATTGTCGTTCATTTCCGGTTCCTTGT
GGAGCTACGGTCTGTGTGTTTGTTGACTTGCTCTATTTCCTATCTCCTTCGACTATCTGA
TGGCAGGTTGGTTACATTCTCTGTCTAATAAATCTATGGCGACTATTAGGTTATCATAGG
CCGGAATTAGTGGAACTGGTTTTTAGAGACGGATCTCAAAATTTGTGTTCCTTTCAAGCC
GCTAATGTGGATAAAAAGGAACTAGTTTCAAGGATCCGAGCTTGTGCGTTATCAGTCTGA
TCCCTAATTTTGGATTTTTGATATCAAAGGCAAATGACACATAACTGCATCATCTTTGTG
TCCTCATCTGCTCAGGCTTAAGATGTGATCTTGTACCTGTCGTAGTATTCATGCTTAGAA
AATGGCATGATATTTAGTGTTACAAGTGACCACTGTTATCAAGCGTTCAATGGCTTGACC
TCACTATCTGAGAAGAGGCATCCAACTATGGCGTATAGTCACATGGATGTGGCGCTGTGG
ATATTCTGCTCTCCATGCAGTTATCCTTCGCTTCTTCAGTTCACTTCGATTTGATATGGC
ATCTAATGGTGTTTTTTTCTTTATCATGTTTTTTTTATCTTTTTTCAATCCTCTGCTTGT
GAGGTATGTGTGGCGATGTTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR04TF U 1
AF RR2CR04JQ C 317
BS 1 675 RR2CR04TF
BS 676 676 RR2CR04JQ
BS 677 704 RR2CR04TF
BS 705 705 RR2CR04JQ
BS 706 721 RR2CR04TF
BS 722 722 RR2CR04JQ
BS 723 750 RR2CR04TF
BS 751 983 RR2CR04JQ

RD RR2CR04TF 755 0 0
GGATTTTAGAATATTATTTTCCAAAATTAATTTCCGCCGCTTTGTGCGGTCGCCGGATCC
GTCTCTCGTTTCTATGTTGTATCAAATCTGCGGTTAACTCTGCTTGTCGTGAAGGTCTCA
GGTCCATAAAGACCCTTAGCGGTGGTTTGTGTGGCGGTTGAAAGTGGTGGGCTGGGTCAG
CCTTCATCTTTTCGGTGCAGCACGTCTGGCTCTGTTGCCTTCGTTCTTGTGCAGATCAGT
CCGTGTCGCACTGTGCGTTTGTATGTTCGGGTTTGGGTCTTTTTGTGGTTTCTAATCCGA
TTTGAAAGCTGCTGGCTCCTAGTGGAGCGATGGTATTGTCGTTCATTTCCGGTTCCTTGT
GGAGCTACGGTCTGTGTGTTTGTTGACTTGCTCTATTTCCTATCTCCTTCGACTATCTGA
TGGCAGGTTGGTTACATTCTCTGTCTAATAAATCTATGGCGACTATTAGGTTATCATAGG
CCGGAATTAGTGGAACTGGTTTTTAGAGACGGATCTCAAAATTTGTGTTCCTTTCAAGCC
GCTAATGTGGATAAAAAGGAACTAGTTTCAAGGATCCGAGCTTGTGCGTTATCAGTCTGA
TCCCTAATTTTGGATTTTTGATATCAAAGGCAAATGACACATAACTGCATCATCTTTGTG
TCCTCATCTGCTCAG*CTTAAGATGTGATCTTGTACCTGTCGTA*TATTCATGCTTAGAA
A*TGGCATGATATTTAGTGTTACAAGTGAC
ACTGT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2CR04JQ 667 0 0
TCCTAGTGGAGCGATGGTATTGTCGTTCATTTCCGGTTCCTTGTGGAGCTACGGTCTGTG
TGTTTGTTGACTTGCTCTATTTCCTATCTCCTTCGACTATCTGATGGCAGGTTGGTTACA
TTCTCTGTCTAATAAATCTATGGCGACTATTAGGTTATCATAGGCCGGAATTAGTGGAAC
TGGTTTTTAGAGACGGATCTCAAAATTTGTGTTCCTTTCAAGCCGCTAATGTGGATAAAA
AGGAACTAGTTTCAAGGATCCGAGCTTGTGCGTTATCAGTCTGATCCCTAATTTTGGATT
TTTGATATCAAAGGCAAATGACACATAACTGCATCATCTTTGTGTCCTCATCTGCTCAGG
CTTAAGATGTGATCTTGTACCTGTCGTAGTATTCATGCTTAGAAAATGGCATGATATTTA
GTGTTACAAGTGACCACTGTTATCAAGCGTTCAATGGCTTGACCTCACTATCTGAGAAGA
GGCATCCAACTATGGCGTATAGTCACATGGATGTGGCGCTGTGGATATTCTGCTCTCCAT
GCAGTTATCCTTCGCTTCTTCAGTTCACTTCGATTTGATATGGCATCTAATGGTGTTTTT
TTCTTTATCATGTTTTTTTTATCTTTTTTCAATCCTCTGCTTGTGAGGTATGTGTGGCGA
TGTTAAA

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL3865Contig1 1307 2 2 U
ACTGAGCCAACCGATTCTCCCAGAGGCAATGAAGAAGGAAGTGAGAAGAGCTTGCCAATT
GCTGCATCAAATATTCTTGGTGGAATCACTGGTGAAACGAGTTTGGCAAATGATAGATAT
TTTGGCTGGAAACACTAGTGAAAAGAGTTTTGCAAGTGATAAAGTAGATAATCTGCCTGG
AAGCACTAGTGACACAGTCCTCCCCACATCTACGGCGTTGGCACCGACTCCGCAATCCGT
GGAACCTCCACCGAAATTACAGCAGCCACTGAAAGAAGTAACAGAACCTGTAAAACGGGG
ACGTGGCAGGCCAAAAAGAGCTGATAAAACGCCGAATCAATTATCTGCATCAGTTGCAGG
CAGGACACATGCGACAGTGGATGCCAGATCACCATCAGTTATTGGTTCCGATGTTACCTC
TGGAAGTCTTGCTTCCCCTGATTTATCTGTTCCGCCTGGTTTTCAACCACTTCCATCTTC
CAGTTCTCCCGCAATGCCAACGAGAGGTCGGGGCAGGGGAAGAGGCAGGGGACGTGGCGC
GGGAAGAGGAAGGAGAGTGGATAATATGTTACATGGCGCTGACAGTTCCATAGGTACTCA
GAGAACTAATGCCCGAGCATCTCTTTCTGGTGATCCTGTAGCGTCCAATTTAGCAACTCT
TCCCGTCTCTTTGGTTGATATTGATACAAAAGTCCCTAAGCCTGATACCACTGCGCTGCA
GCCCTCTCCCACTGTCTCTCTACCAGAAAGTAGCCTGCTAGATGCACCGCCTGGTTTTGG
TTCTGGATCACATGTTCAGCCGCTAAATGTATCGGAGGATTCCTTGGTAAAAAAGGCAGC
TGCTATAAAGAGCAAGCCTGCTGTTCCAGATGTTAGAAATAACCAGGGTTCAGGAGTTCT
AAAACAGCCAGTTAACATTCCAAGCGCTACTGCTTTAGGCCCAGGTCAAAGTCAGACAAC
TGCACCTTTAAATACTAATCAGCCATTTAGTCCCCACCTTGTTGGTTCTACAGTTGAAGC
TCAAGGCGCCAGTGTTCTTTCTCCTCCTGCACCCATGCCTGTGAAGAGGCAAGGTCGGAA
GACGCCAAACAGAGGAGACACTCCTAGACGGCGAGGAAGAAGACATGTTCAAGCTTCACC
CGCTGCTGATGGCTCTTCTGCACGGAGTGCAGTATCAACACCACAAACTGAGGTCAAGGT
TGGTGATTCATCAGGATCCAAAATTACATCAGTTGGTGACGCTGTTGTCCAAGAACAACC
CCATTTCAACCCGTCAGTTGCACACTCGTCTGCCAGTACAAGTCAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW63TFB U 1
AF RR2AW63JQ C 491
BS 1 589 RR2AW63TFB
BS 590 1307 RR2AW63JQ

RD RR2AW63TFB 589 0 0
ACTGAGCCAACCGATTCTCCCAGAGGCAATGAAGAAGGAAGTGAGAAGAGCTTGCCAATT
GCTGCATCAAATATTCTTGGTGGAATCACTGGTGAAACGAGTTTGGCAAATGATAGATAT
TTTGGCTGGAAACACTAGTGAAAAGAGTTTTGCAAGTGATAAAGTAGATAATCTGCCTGG
AAGCACTAGTGACACAGTCCTCCCCACATCTACGGCGTTGGCACCGACTCCGCAATCCGT
GGAACCTCCACCGAAATTACAGCAGCCACTGAAAGAAGTAACAGAACCTGTAAAACGGGG
ACGTGGCAGGCCAAAAAGAGCTGATAAAACGCCGAATCAATTATCTGCATCAGTTGCAGG
CAGGACACATGCGACAGTGGATGCCAGATCACCATCAGTTATTGGTTCCGATGTTACCTC
TGGAAGTCTTGCTTCCCCTGATTTATCTGTTCCGCCTGGTTTTCAACCACTTCCATCTTC
CAGTTCTCCCGCAATGCCAACGAGAGGTCGGGGCAGGGGAAGAGGCAGGGGACGTGGCGC
GGGAAGAGGAAGGAGAGTGGATAATATGTTACATGGCGCTGACAGTTCC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2AW63JQ 817 0 0
GCAATGCCAACGAGAGGTCGGGGCAGGGGAAGAGGCAGGGGACGTGGCGCGGGAAGAGGA
AGGAGAGTGGATAATATGTTACATGGCGCTGACAGTTCCATAGGTACTCAGAGAACTAAT
GCCCGAGCATCTCTTTCTGGTGATCCTGTAGCGTCCAATTTAGCAACTCTTCCCGTCTCT
TTGGTTGATATTGATACAAAAGTCCCTAAGCCTGATACCACTGCGCTGCAGCCCTCTCCC
ACTGTCTCTCTACCAGAAAGTAGCCTGCTAGATGCACCGCCTGGTTTTGGTTCTGGATCA
CATGTTCAGCCGCTAAATGTATCGGAGGATTCCTTGGTAAAAAAGGCAGCTGCTATAAAG
AGCAAGCCTGCTGTTCCAGATGTTAGAAATAACCAGGGTTCAGGAGTTCTAAAACAGCCA
GTTAACATTCCAAGCGCTACTGCTTTAGGCCCAGGTCAAAGTCAGACAACTGCACCTTTA
AATACTAATCAGCCATTTAGTCCCCACCTTGTTGGTTCTACAGTTGAAGCTCAAGGCGCC
AGTGTTCTTTCTCCTCCTGCACCCATGCCTGTGAAGAGGCAAGGTCGGAAGACGCCAAAC
AGAGGAGACACTCCTAGACGGCGAGGAAGAAGACATGTTCAAGCTTCACCCGCTGCTGAT
GGCTCTTCTGCACGGAGTGCAGTATCAACACCACAAACTGAGGTCAAGGTTGGTGATTCA
TCAGGATCCAAAATTACATCAGTTGGTGACGCTGTTGTCCAAGAACAACCCCATTTCAAC
CCGTCAGTTGCACACTCGTCTGCCAGTACAAGTCAGG

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

CO CL3866Contig1 426 2 1 U
GGGAGATTAAGCACACGTATCAGCTTACTGCGGCCGTCTGGAGAAAAAAAAAAAACAGTG
ACGCAATACAGCCATGGGCAAAGTTCACGGATCTTTGGCACGTGCCGGTAAGGTGAGAGG
ACAGACACCGAAGGTAGCGAAGCAAGATAAGAAGAAGAAACCTAGAGGACGTGCTCACAA
GCGTCTCCAGCACAATCGCCGTTTCGTTACCGCCGTTGTGGGCTTTGGTAAGAAGAGAGG
ACCCAACTCTTCTGAGAAGTAGAAGAAGAAGATAATATGTGCTGGGAAAAGCTTCTCATA
ATGGCTGTTCTGTGCATTTCTCTTCTTTTGTTTCTTTGGCACTAAACTTATATATGTTTT
GATTCTATTATGAATTACGACTTTACTCCTGAATCGGATTCTCAACTTTCAATGGCAATA
GTTTTA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2EG03JQ C 1
AF RR2EG03TF U 1
BS 1 426 RR2EG03TF

RD RR2EG03JQ 426 0 0
GGGAGATTAAGCACACGTATCAGCTTACTGCGGCCGTTTGGAGAAAAAAAAAAAACAGTG
ACGCAATACAGCCATGGGCAAAGTTCACGGATCTTTGGCACGTGCCGGTAAGGTGAGAGG
ACAGACACCGAAGGTAGCGAAGCAAGATAAGAAGAAGAAACCTAGAGGACGTGCTCACAA
GCGTCTCCAGCACAATCGCCGTTTCGTTACCGCCGTTGTGGGCTTTGGTAAGAAGAGAGG
ACCCAACTCTTCTGAGAAGTAGAAGAAGAAGATAATATGTGCTGGGAAAAGCTTCTCATA
ATGGCTGTTCTGTGCATTTCTCTTCTTTTGTTTCTTTGGCACTAAACTTATATATGTTTT
GATTCTATTATGAATTACGACTTTACTCCTGAATCGGATTCTCAACTTTCAATGGCAATA
GTTTTA

QA 1 426 1 426
DS 

RD RR2EG03TF 426 0 0
GGGAGATTAAGCACACGTATCAGCTTACTGCGGCCGTCTGGAGAAAAAAAAAAAACAGTG
ACGCAATACAGCCATGGGCAAAGTTCACGGATCTTTGGCACGTGCCGGTAAGGTGAGAGG
ACAGACACCGAAGGTAGCGAAGCAAGATAAGAAGAAGAAACCTAGAGGACGTGCTCACAA
GCGTCTCCAGCACAATCGCCGTTTCGTTACCGCCGTTGTGGGCTTTGGTAAGAAGAGAGG
ACCCAACTCTTCTGAGAAGTAGAAGAAGAAGATAATATGTGCTGGGAAAAGCTTCTCATA
ATGGCTGTTCTGTGCATTTCTCTTCTTTTGTTTCTTTGGCACTAAACTTATATATGTTTT
GATTCTATTATGAATTACGACTTTACTCCTGAATCGGATTCTCAACTTTCAATGGCAATA
GTTTTA

QA 1 426 1 426
DS 



AS 1 2

CO CL3867Contig1 756 2 2 U
GGGGAAGAAAGAGAGAGAGAGATAGAGCAACAATGGCGTTGAACGTCATCTCATCATCAT
CTTCAGCCACTTGTATGACCTTCGCTTCCACCATCAAAGCATTCGTTAGACCTTCTCTCT
CCCTCAGAACCACTGGACTCACTCTCTCTCCTTCGAATCCTAACGTCCTTCCTGCATCAT
TTCCTCTGCTCCGTCTTCGCAGCCGAGGTTTCCAAGGTGGTCGTGTCAAAGCGATGGCTT
CTTCTGCTCCCGGATCGGTCAACAAGCCAGAGGAAGAGTGGCGTGCGATCCTGTCTCCTG
AGCAATTCAGGATTCTGAGGCAGAAAGGCACCGAATATCCAGGAACAGGAGAATACAACA
AACTATTCGAAGACGGCATATATTCCTGTGCAGGATGTGGAACTCCTCTATACAAATCCG
CCACCAAATTCGATTCCGGTTGTGGCTGGCCTGCCTTCTTCGACGGCATTCCCGGTGCTA
TAAACCGAACTCCTGATCCAGATGGGAGAAGAATCGAGATCACTTGTGCGGCTTGTGGAG
GTCATCTCGGCCATGTTTTCAAAGGAGAAAGTTTCCCTACACCTACCGATGAGCGACACT
GTGTGAACAGTGTCTCTCTCAAGTTCGCACCAGGGAATTCAACCTTTTAATAATGCACTT
GTGTTGTGTAATGCATCTATCTATTTCTTGTGTCGTCCTGCTCCTTGTAACCGGTGTTTA
GTCCCATTAATGTCATAATCATATATAAGATTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E444TF U 1
AF RR2E444JQ C 200
BS 1 629 RR2E444TF
BS 630 756 RR2E444JQ

RD RR2E444TF 629 0 0
GGGGAAGAAAGAGAGAGAGAGATAGAGCAACAATGGCGTTGAACGTCATCTCATCATCAT
CTTCAGCCACTTGTATGACCTTCGCTTCCACCATCAAAGCATTCGTTAGACCTTCTCTCT
CCCTCAGAACCACTGGACTCACTCTCTCTCCTTCGAATCCTAACGTCCTTCCTGCATCAT
TTCCTCTGCTCCGTCTTCGCAGCCGAGGTTTCCAAGGTGGTCGTGTCAAAGCGATGGCTT
CTTCTGCTCCCGGATCGGTCAACAAGCCAGAGGAAGAGTGGCGTGCGATCCTGTCTCCTG
AGCAATTCAGGATTCTGAGGCAGAAAGGCACCGAATATCCAGGAACAGGAGAATACAACA
AACTATTCGAAGACGGCATATATTCCTGTGCAGGATGTGGAACTCCTCTATACAAATCCG
CCACCAAATTCGATTCCGGTTGTGGCTGGCCTGCCTTCTTCGACGGCATTCCCGGTGCTA
TAAACCGAACTCCTGATCCAGATGGGAGAAGAATCGAGATCACTTGTGCGGCTTGTGGAG
GTCATCTCGGCCATGTTTTCAAAGGAGAAAGTTTCCCTACACCTACCGATGAGCGACACT
GTGTGAACAGTGTCTCTCTCAAGTTCGCA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2E444JQ 557 0 0
CAGCCGAGGTTTCCAAGGTGGTCGTGTCAAAGCGATGGCTTCTTCTGCTCCCGGATCGGT
CAACAAGCCAGAGGAAGAGTGGCGTGCGATCCTGTCTCCTGAGCAATTCAGGATTCTGAG
GCAGAAAGGCACCGAATATCCAGGAACAGGAGAATACAACAAACTATTCGAAGACGGCAT
ATATTCCTGTGCAGGATGTGGAACTCCTCTATACAAATCCGCCACCAAATTCGATTCCGG
TTGTGGCTGGCCTGCCTTCTTCGACGGCATTCCCGGTGCTATAAACCGAACTCCTGATCC
AGATGGGAGAAGAATCGAGATCACTTGTGCGGCTTGTGGAGGTCATTTCGGCCATGTTTT
CAAAGGAGAAGGTTTCCCTACACCTACCGATGAGCGACACTGTGTGAACAGTGTCTCTCT
CAAGTTCGCACCAGGGAATTCAACCTTTTAATAATGCACTTGTGTTGTGTAATGCATCTA
TCTATTTCTTGTGTCGTCCTGCTCCTTGTAACCGGTGTTTAGTCCCATTAATGTCATAAT
CATATATAAGATTTTAC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL3868Contig1 412 2 2 U
GCAACAAGTGGAAGATCCTTTGCTTTCCCAGTATTACAGTCAGAATGGAACAGTAGTCCT
GTAAGAATGGCCAAACCAGAGAAGAGAAGACAGAAAGGATGGAGACAGATTCTTCTTTGC
TGTAGATCATCTTGATGAACTACTTCAAAAGCTACTTTACTTTGAAAGCTCAGAGGAAGA
AGGAGAGATGACATTTTACAATATTTTTCTTTTAAAAGGGATGTTTTATATTTTAAGTGC
TGAAGTAAATATTTCTTTTTCTTTTTTTTTGGGTGGTTTATAGTTATGCCATGGTGTGTG
TAGTTGGCATTTTGGAAGTAGTATTAACAGCTAGGGGTTTTTGAGATTGGTTAAAGATGC
TACATGGTCGGTGTTATGTAACCGATGAGTTTATTATAACTTCATTTTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BV39JQ C 1
AF RR2BV39TF U 19
BS 1 18 RR2BV39JQ
BS 19 412 RR2BV39TF

RD RR2BV39JQ 412 0 0
GCAACAAGTGGAAGATCCTTTGCTTTCCCAGTATTACAGTCAGAATGGAACAGTAGTCCT
GTAAGAATGGCCAAACCAGAGAAGAGAAGACAGAAAGGATGGAGACAGATTCTTCTTTGC
TGTAGATCATCTTGATGAACTACTTCAAAAGCTACTTTACTTTGAAAGCTCAGAGGAAGA
AGGAGAGATGACATTTTACAATATTTTTCTTTTAAAAGGGATGTTTTATATTTTAAGTGC
TGAAGTAAATATTTCTTTTTCTTTTTTTTTGGGTGGTTTATAGTTATGCCATGGTGTGTG
TAGTTGGCATTTTGGAAGTAGTATTAACAGCTAGGGGTTTTTGAGATTGGTTAAAGATGC
TACATGGTCGGTGTTATGTAACCGATGAGTTTATTATAACTTCATTTTCATT

QA 1 412 1 412
DS 

RD RR2BV39TF 394 0 0
TTTGCTTTCCCAGTATTACAGTCAGAATGGAACAGTAGTCCTGTAAGAATGGCCAAACCA
GAGAAGAGAAGACAGAAAGGATGGAGACAGATTCTTCTTTGCTGTAGATCATCTTGATGA
ACTACTTCAAAAGCTACTTTACTTTGAAAGCTCAGAGGAAGAAGGAGAGATGACATTTTA
CAATATTTTTCTTTTAAAAGGGATGTTTTATATTTTAAGTGCTGAAGTAAATATTTCTTT
TTCTTTTTTTTTGGGTGGTTTATAGTTATGCCATGGTGTGTGTAGTTGGCATTTTGGAAG
TAGTATTAACAGCTAGGGGTTTTTGAGATTGGTTAAAGATGCTACATGGTCGGTGTTATG
TAACCGATGAGTTTATTATAACTTCATTTTCATT

QA 1 394 1 394
DS 



AS 1 2

CO CL3869Contig1 780 2 6 U
GGAAACAAACATCTCTCCAACCACATTCATAACAGTAAATCTACGAATAATTTTCTAATT
TTGTTTTCCACTAGTAACTATTTTCAAATACTCTGTTCGATTCTGCATAAATGGCTTATT
TTTCATCCCTTGTGGCTATCATCTTCTTCTTATGCTCTCTCGCCGCTGCAAATGAAGTAA
CCGTCGGTGGTACATCCGGCCACTGGAAAGTCCCTCCTTCCTCTTCTAACTCATTCACGG
AATGGGCTCAAAGCTCGCTTCAAAGTCGGCGACTTTATCGTTTTCCGGTATGAAGCGGGT
AAAGACTCTGTTTTGCAAGTAACACGGGAAGCATACAAGAGCTGCAACACCACGAACCCT
TTAGCTAACTACACCGATGGAGAGACCAAGGTGGAATTGGACAGGTCCGGTCCATTTTAC
TTCATTAGTGGGGTCGATGGTCACTGTGAGAAAGGTCAGAAGGTGAGCCTCGTCGTGGTT
AGTCCGCGTAACAAAGCTATTTCTCAGGCTCCTTCTCCGGTTGAGTTCGAAGATGGTCCA
TCCGTGGCTCCAGCTCCGACTAGTGGCTCAGCTAGGCTTGGCAGTGGGTTTGTTGCTATG
TTAGGTCTTGTTCTTGGTCTATGGGCTTGGTTCTAATTTGGAACCATGTGGGTTATGCTT
TATGGATGAGCTTTTTGTTTCAGAAAAGCTCTTTCTTTTAGTTTCTGTTTTTATGATTAC
ATCCTGAGTTTAGAGATCTGTTCCTCACTACTATTTTATAATTAAATTAAATTTATTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ65TF U 1
AF RR2BQ65JQ C 228
BS 1 604 RR2BQ65TF
BS 605 605 RR2BQ65JQ
BS 606 642 RR2BQ65TF
BS 643 643 RR2BQ65JQ
BS 644 668 RR2BQ65TF
BS 669 780 RR2BQ65JQ

RD RR2BQ65TF 668 0 0
GGAAACAAACATCTCTCCAACCACATTCATAACAGTAAATCTACGAATAATTTTCTAATT
TTGTTTTCCACTAGTAACTATTTTCAAATACTCTGTTCGATTCTGCATAAATGGCTTATT
TTTCATCCCTTGTGGCTATCATCTTCTTCTTATGCTCTCTCGCCGCTGCAAATGAAGTAA
CCGTCGGTGGTACATCCGGCCACTGGAAAGTCCCTCCTTCCTCTTCTAACTCATTCACGG
AATGGGCTCAAAGCTCGCTTCAAAGTCGGCGACTTTATCGTTTTCCGGTATGAAGCGGGT
AAAGACTCTGTTTTGCAAGTAACACGGGAAGCATACAAGAGCTGCAACACCACGAACCCT
TTAGCTAACTACACCGATGGAGAGACCAAGGTGGAATTGGACAGGTCCGGTCCATTTTAC
TTCATTAGTGGGGTCGATGGTCACTGTGAGAAAGGTCAGAAGGTGAGCCTCGTCGTGGTT
AGTCCGCGTAACAAAGCTATTTCTCAGGCTCCTTCTCCGGTTGAGTTCGAAGATGGTCCA
TCCGTGGCTCCAGCTCCGACTAGTGGCTCAGCTAGGCTTGGCAGTGGGTTTGTTGCTATG
TTAG*TCTTGTTCTTGGTCTATGGGCTTGGTTCTAATTTGGA*CCATGTGGGTTATGCTT
TATGGATG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2BQ65JQ 553 0 0
AACTCATTCACGGAATGGGCTCAAAGCTCGCTTCAAAGTCGGCGACTTTATCGTTTTCCG
GTATGAAGCGGGTAAAGACTCTGTTTTGCAAGTAACACGGGAAGCATACAAGAGCTGCAA
CACCACGAACCCTTTAGCTAACTACACCGATGGAGAGACCAAGGTGGAATTGGACAGGTC
CGGTCCATTTTACTTCATTAGTGGGGTCGATGGTCACTGTGAGAAAGGTCAGAAGGTGAG
CCTCGTCGTGGTTAGTCCGCGTAACAAAGCTATTTTTCAGGCTCCTTCTCCGGTTGAGTT
CGAAGATGGTCCATCCGTGGCTCCAGCTCCGACTAGTGGCTCAGCTAGGCTTGGCAGTGG
GTTTGTTGCTATGTTAGGTCTTGTTCTTGGTCTATGGGCTTGGTTTTAATTTGGAACCAT
GTGGGTTATGCTTTATGGATGAGCTTTTTGTTTCAGAAAAGCTCTTTCTTTTAGTTTCTG
TTTTTATGATTACATCCTGAGTTTAGAGATCTGTTCCTCACTACTATTTTATAATTAAAT
TAAATTTATTGTT

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL3870Contig1 741 2 1 U
GGACATTGCTAGTGAGGATGGTGATACCTTTGAGGCATCATCGATGGCAGATGATGGTAG
CAGCGAGCAGAGTTGGTCGTTGAGAGCCTTATCTGAGTCCAGTGTAGCTTGTATAACCGG
TGACTACGCGATGCAAAATGTTATTATTCAAATGGGTTTGCGTTTGCTTGCACCGGGAGG
TATGCAAATTCGCCAACTAAACAGGTGGGTGTTGAAATGCCATGCTTGCTACACAGTAAC
TCCTGAAATTGGAAGAATCTTCTGTCCCAAGTGCGGTAATGGCGGCACTCTGCGCAAAGT
AGCGGTTACAATAGGCGAGAATGGCACCATCATAGCTGCACGTAAGCCACGTGTAACACT
TCGAGGGACTAAATTTTCGATACCGATGCCTAAAAGCGGAAGAGACGCAATCACCAAGAA
TCTGGTTCTTAGGGAAGATCAACTTCCTCAAAAGTACCTCCATCCCAAGACCAAGAAGAA
AGCAAGCAAAGCGGGAGATGAGTATTTTATATCAGACGATGTGTTCATGAACCATCACAG
TGATAAAAAGGCACCATTGCAGCCTCCAGTGAGAAAAGCTACGGCGGTTTTCAGTCAGAA
ACGAAACCCTAATGACAACCATTACTCGCGTTCTATGCACTGATCTATTTGTTTCTACCC
GCATAACAAGCATCTCTTCTATGAGAACAATTGTATTGTGTTTATGTTTGCTATTTTCTA
TGACAACCATCTCTTCATTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AE47JQ C 1
AF RR2AE47TF U 1
BS 1 741 RR2AE47TF

RD RR2AE47JQ 741 0 0
GGACATTGCTAGTGAGGATGGTGATACCTTTGAGGCATCATCGATGGCAGATGATGGTAG
CAGCGAGCAGAGTTGGTCGTTGAGAGCCTTATCTGAGTCCAGTGTAGCTTGTATAACCGG
TGACTACGCGATGCAAAATGTTATTATTCAAATGGGTTTGCGTTTGCTTGCACCGGGAGG
TATGCAAATTCGCCAACTAAACAGGTGGGTGTTGAAATGCCATGCTTGCTACACAGTAAC
TCCTGAAATTGGAAGAATCTTCTGTCCCAAGTGCGGTAATGGCGGCACTCTGCGCAAAGT
AGCGGTTACAATAGGCGAGAATGGCACCATCATAGCTGCACGTAAGCCACGTGTAACACT
TCGAGGGACTAAATTTTCGATACCGATGCCTAAAAGCGGAAGAGACGCAATCACCAAGAA
TCTGGTTCTTAGGGAAGATCAACTTCCTCAAAAGTACCTCCATCCCAAGACCAAGAAGAA
AGCAAGCAAAGCGGGAGATGAGTATTTTATATCAGACGATGTGTTCATGAACCATCACAG
TGATAAAAAGGCACCATTGCAGCCTCCAGTGAGAAAAGCTACGGCGGTTTTCAGTCAGAA
ACGAAACCCTAATGACAACCATTACTCGCGTTCTATGCACTGATCTATTTGTTTCTACCC
GCATAACAAGCATCTCTTCTATGAGAACAATTGTATTGTGTTTATGTTTGCTATTTTCTA
TGACAACCATCTCTTCATTTC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2AE47TF 741 0 0
GGACATTGCTAGTGAGGATGGTGATACCTTTGAGGCATCATCGATGGCAGATGATGGTAG
CAGCGAGCAGAGTTGGTCGTTGAGAGCCTTATCTGAGTCCAGTGTAGCTTGTATAACCGG
TGACTACGCGATGCAAAATGTTATTATTCAAATGGGTTTGCGTTTGCTTGCACCGGGAGG
TATGCAAATTCGCCAACTAAACAGGTGGGTGTTGAAATGCCATGCTTGCTACACAGTAAC
TCCTGAAATTGGAAGAATCTTCTGTCCCAAGTGCGGTAATGGCGGCACTCTGCGCAAAGT
AGCGGTTACAATAGGCGAGAATGGCACCATCATAGCTGCACGTAAGCCACGTGTAACACT
TCGAGGGACTAAATTTTCGATACCGATGCCTAAAAGCGGAAGAGACGCAATCACCAAGAA
TCTGGTTCTTAGGGAAGATCAACTTCCTCAAAAGTACCTCCATCCCAAGACCAAGAAGAA
AGCAAGCAAAGCGGGAGATGAGTATTTTATATCAGACGATGTGTTCATGAACCATCACAG
TGATAAAAAGGCACCATTGCAGCCTCCAGTGAGAAAAGCTACGGCGGTTTTCAGTCAGAA
ACGAAACCCTAATGACAACCATTACTCGCGTTCTATGCACTGATCTATTTGTTTCTACCC
GCATAACAAGCATCTCTTCTATGAGAACAATTGTATTGTGTTTATGTTTGCTATTTTCTA
TGACAACCATCTCTTCATTTC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL3871Contig1 1033 2 6 U
GGATCCAACAACTACATGTAAAGTATAATCTCCATATCTGTGCCAACAAATCCAATCTTT
CTTGAACCATTCTTGATTGTTTATACAGAAGATGGATAATGATAAGAATCACAAGGCAGA
GGAAGCTAAACCGAGATTGAGATGGAGTTATGAGCTTCATCACAGGTTCATCGACGCCGT
TAATCAACTCGGGGGACCAAACAAGGCGACGCCTAAGGGTTTGATGAGGATTCTTGAGAT
TCCTGAGCTTACTTTGTACCATCTCAAGAGTCATTTACAGAAATATCGGCTCGAGATAAG
CGAGAGATTCATTGTTTCTTCAGCTGCAAAATCCCAAGAACGTCAGAGTCAAAAATATTT
TGGAGATCAACTTGACGTCATTGTCACAGAAGAAAAAGATGACGAACCTAACAAAAACTT
GCAAATCAAGGAAGCGATAGAAATACAATTGGGAGTCCAGAAGAAGCTTCACGAACAAAT
CGAAAGGAAGTTACAGGACAGGATAGAGGCACAAGGGAAATATTTAGAGTCAGTGTTAAT
GAAAGCTCAAGAAACTCTCTCCGCCTCCGGTTACAAATATTCTAATCTCTATGGAGTAGC
ATGGACGGAGAATAGAAGTTGTCTCAGTTCTGAAGATGACGAGACTGAGGAAGAATACGA
TTTCTTGGGTCCCAAGAGAGCAGAAAACAAAGGGATTGAACCGACGAGAAGTTCGGTTGA
CTGTTCGTTGGGATCATCAGAATGCTCAGAAGCAGAACAGGATATTCATTCTCAGACCAT
TACTAGGAGATCAAACAAGCTTCAGTTTACGGAGATAAAACCAGAGGAAGTGATGGATCG
GAAGAAGAGAAGGTGGGACGATGTCCTTTGCGTGGAACAATCTATCCGGAAGAGAGCCTT
TTAAAGACCACGACGGTTAGGACTTGGGTCTGAGTTTAAATAGTTTGAAGGTCATGGAAA
CATGTTCCAAGTCCAACAAATAGGACTAGTCTATTAGGTTACAGGAGACCCGAGCCTTTT
AATAAGATAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G069TF U 1
AF RR2G069JQ C 248
BS 1 607 RR2G069TF
BS 608 608 RR2G069JQ
BS 609 649 RR2G069TF
BS 650 650 RR2G069JQ
BS 651 685 RR2G069TF
BS 686 1033 RR2G069JQ

RD RR2G069TF 685 0 0
GGATCCAACAACTACATGTAAAGTATAATCTCCATATCTGTGCCAACAAATCCAATCTTT
CTTGAACCATTCTTGATTGTTTATACAGAAGATGGATAATGATAAGAATCACAAGGCAGA
GGAAGCTAAACCGAGATTGAGATGGAGTTATGAGCTTCATCACAGGTTCATCGACGCCGT
TAATCAACTCGGGGGACCAAACAAGGCGACGCCTAAGGGTTTGATGAGGATTCTTGAGAT
TCCTGAGCTTACTTTGTACCATCTCAAGAGTCATTTACAGAAATATCGGCTCGAGATAAG
CGAGAGATTCATTGTTTCTTCAGCTGCAAAATCCCAAGAACGTCAGAGTCAAAAATATTT
TGGAGATCAACTTGACGTCATTGTCACAGAAGAAAAAGATGACGAACCTAACAAAAACTT
GCAAATCAAGGAAGCGATAGAAATACAATTGGGAGTCCAGAAGAAGCTTCACGAACAAAT
CGAAAGGAAGTTACAGGACAGGATAGAGGCACAAGGGAAATATTTAGAGTCAGTGTTAAT
GAAAGCTCAAGAAACTCTCTCCGCCTCCGGTTACAAATATTCTAATCTCTATGGAGTAGC
ATGGACG*AGAATAGAAGTTGTCTCAGTTCTGAAGATGACGAGACTGAG*AAGAATACGA
TTTCTTGGGTCCCAAGAGAGCAGAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2G069JQ 786 0 0
CTTACTTTGTACCATCTCAAGAGTCATT*ACAGAAATATCGGCTCGAGATAAGCGAGAGA
TTCATTGTTTCTTCAGCTGCAAAATCCCAAGAACGTCAGAGTCAAAAATATTTTGGAGAT
CAACTTGACGTCATTGTCACAGAAGAAAAAGATGACGAACCTAACAAAAACTTGCAAATC
AAGGAAGCGATAGAAATACAATTGGGAGTCCAGAAGAAGCTTCACGAACAAATCGAAAGG
AAGTTACAGGACAGGATAGAGGCACAAGGGAAATATTTAGAGTCAGTGTTAATGAAAGCT
CAAGAAACTCTCTCCGCCTCCGGTTACAAATATTCTAATCTCTATGGAGTAGCATGGACG
GAGAATAGAAGTTGTCTCAGTTCTGAAGATGACGAGACTGAGGAAGAATACGATTTCTTG
GGTCCCAAGAGAGCAGAAAACAAAGGGATTGAACCGACGAGAAGTTCGGTTGACTGTTCG
TTGGGATCATCAGAATGCTCAGAAGCAGAACAGGATATTCATTCTCAGACCATTACTAGG
AGATCAAACAAGCTTCAGTTTACGGAGATAAAACCAGAGGAAGTGATGGATCGGAAGAAG
AGAAGGTGGGACGATGTCCTTTGCGTGGAACAATCTATCCGGAAGAGAGCCTTTTAAAGA
CCACGACGGTTAGGACTTGGGTCTGAGTTTAAATAGTTTGAAGGTCATGGAAACATGTTC
CAAGTCCAACAAATAGGACTAGTCTATTAGGTTACAGGAGACCCGAGCCTTTTAATAAGA
TAAGTT

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL3872Contig1 706 2 3 U
GGCATGCACGAGCTCACACGATCTTGTTTTCTGTATTTGTTTATAAACCAAACATCATTT
GTTTCTTTACCAAAGCTAAGAATTAACACCAAAAGCAAAAATCTAAGATTAATAATATAA
TTCTATAATCTTGTTACACTTAAATTTTACAACCCTTAAGAAATCAGATTCATTAGGCTT
TGATCAGTAAAACTGAAATTCAAACGCGTCTTAGTTTATGCTTTATATCTCGAATCCTGA
TAATTAAAGTACTATCTCTAATACTTTCACTTTCTTACTTAATTTGTAGTATATATCTCT
AATACAGTAACAAAAAAATCTCAAAATTAAGAGAGGGACTATAGTTTACCATATGAAATG
GAATTAATGAAAAGATTCTATTTCCTTATGTTTTGAAAAAGTTATATTCTCTTATGCTAT
ATGTAATTTGCTTGTAATAATAAATAAAAGATACAGAATATCCGTGAGAATTATTCCTTC
TTCCTATAATAACAAGACGGATTTTACGAATAATGTTTTCACTACATACAAGTTTATGTT
TTATAAAAAAAATTAATTCGCAGATATAAACTCACAATAATACTCCAACAAAGAATATGA
TAAAAAATAAGAAAGTAATATCGAAATAATTAAATCTCATTAAAAAAGCGCGCATCTCTC
GGCCAACACTCTGTCTATGAATCAAACGCTCAGGTACTCCTGCCCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AN54JQ C 1
AF RR2AN54TF U 1
BS 1 693 RR2AN54TF
BS 694 694 RR2AN54JQ
BS 695 706 RR2AN54TF

RD RR2AN54JQ 706 0 0
GGCATGCACGAGCTCACACGATCTTGTTTTCTGTATTTGTTTATAAACCAAACATCATTT
GTTTCTTTACCAAAGCTAAGAATTAACACCAAAAGCAAAAATCTAAGATTAATAATATAA
TTCTATAATCTTGTTACACTTAAATTTTACAACCCTTAAGAAATCAGATTCATTAGGCTT
TGATCAGTAAAACTGAAATTCAAACGCGTCTTAGTTTATGCTTTATATCTCGAATCCTGA
TAATTAAAGTACTATCTCTAATACTTTCACTTTCTTACTTAATTTGTAGTATATATCTCT
AATACAGTAACAAAAAAATCTCAAAATTAAGAGAGGGACTATAGTTTACCATATGAAATG
GAATTAATGAAAAGATTCTATTTCCTTATGTTTTGAAAAAGTTATATTCTCTTATGCTAT
ATGTAATTTGCTTGTAATAATAAATAAAAGATACAGAATATCCGTGAGAATTATTCCTTC
TTCCTATAATAACAAGACGGATTTTACGAATAATGTTTTCACTACATACAAGTTTATGTT
TTATAAAAAAAATTAATTCGCAGATATAAACTCACAATAATACTCCAACAAAGAATATGA
TAAAAAATAAGAAAGTAATATCGAAATAATTAAATCTCATTAAAAAAGCGCGCATCTCTC
GGCCAACACTCTGTCTATGAATCAAACGCTCAGGTACTCCTGCCCG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2AN54TF 706 0 0
GGCATGCACGAGCTCACACGATCTTGTTTTCTGTATTTGTTTATAAACCAAACATCATTT
GTTTCTTTACCAAAGCTAAGAATTAACACCAAAAGCAAAAATCTAAGATTAATAATATAA
TTCTATAATCTTGTTACACTTAAATTTTACAACCCTTAAGAAATCAGATTCATTAGGCTT
TGATCAGTAAAACTGAAATTCAAACGCGTCTTAGTTTATGCTTTATATCTCGAATCCTGA
TAATTAAAGTACTATCTCTAATACTTTCACTTTCTTACTTAATTTGTAGTATATATCTCT
AATACAGTAACAAAAAAATCTCAAAATTAAGAGAGGGACTATAGTTTACCATATGAAATG
GAATTAATGAAAAGATTCTATTTCCTTATGTTTTGAAAAAGTTATATTCTCTTATGCTAT
ATGTAATTTGCTTGTAATAATAAATAAAAGATACAGAATATCCGTGAGAATTATTCCTTC
TTCCTATAATAACAAGACGGATTTTACGAATAATGTTTTCACTACATACAAGTTTATGTT
TTATAAAAAAAATTAATTCGCAGATATAAACTCACAATAATACTCCAACAAAGAATATGA
TAAAAAATAAGAAAGTAATATCGAAATAATTAAATCTCATTAAAAAAGCGCGCATCTCTC
GGCCAACACTCTGTCTATGAATCAAACGCTCAG*TACTCCTGCCCG

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL3873Contig1 1094 2 2 U
GGACCACACATGTATTCATCTCCTTCTTCTTCTAAATTATCTTTCCTCTTCTTCCTTCTA
ATTTCCCCAAGAGACAATTAGCCCTTTCAAGTAACCATGGGCGTCGCTGTTCTAAATCCC
CAGGACTGTCTGAAGCATCCTTTGTCTCACATGAAACATCCCCGCAACCCTAGCGAATGC
CCCAACAGGCAGAAAAAACCGGTCTCGAACCGCACCCGCAGGAGCCCGCCGCGAAAACAA
ACCTCACCGTCTCCTCCTGTATCACCGCCGCGTCCTCCTCTCGCTGCGGCGAAGAAGAGC
CCTAACGACAACAACGTTGGCCAGGTTAGAATCCTGAAGCGCGGCGAGGAGATCCCTAAG
AAGACATCATCAGATCTGGTCGTCGAAAAGCCAGATCTTGTCTCCCCTCGTAGGATCGGA
CCGGATCCGGAAATGATTCCGAGTCAGATCCGTTTACCCGCCCGCAAATCGAATAAGGTG
CCGTTTTACGCCGGTCCCGTGACCATGACATCTCCTCCTCCTAGCGACGTCCCTCTTCCG
GCCTTTTTCGCCGCGAAGAAGAGCGTCTCTCTGTTCCAAGCCACCAACGCTACCAGCGAA
CTCATCAAGATTCTCCGCCTAGACATCGCGATCGCTTGACCGCTTATGTCTCATCTCATT
CGCCGATGTTCCGCTACTGTCCAAAACTGTTCCATTTTCGGATCGAATCTTCAGTAATAA
AATCATCTACAGTCGATGAGTCGAGAAGATGAAGAAACGCATCTTCGTTATGAAACCGTT
TCGAATCTTCCCTTATTTTTTCAAGGGGCAAGGTCGAAATATCTTCTTAACAGGTCTTAG
TTTCTCTTCGAGTCTAGTGTTTGTATAGAGTATTTGTTCATAGGCTTTTTTTATAATTGT
CTCCTGTTTTAGGTGTCTGTTTACTTTTTAGGTTGGTCTTTCTTCTTGTTTCTCATCTTT
CCTATAGTTCTAAGACAAAAGTATCAGAGATATGTATCTGACTGGCAATATGCAGATTAC
AGTTTCTGTATTACTTTGATCCTTCGATGTAAGATCATTATTTGCATCTTTATATTAAAT
AAAAATTAAGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC79TF U 1
AF RR2FC79JQ C 269
BS 1 696 RR2FC79TF
BS 697 1094 RR2FC79JQ

RD RR2FC79TF 696 0 0
GGACCACACATGTATTCATCTCCTTCTTCTTCTAAATTATCTTTCCTCTTCTTCCTTCTA
ATTTCCCCAAGAGACAATTAGCCCTTTCAAGTAACCATGGGCGTCGCTGTTCTAAATCCC
CAGGACTGTCTGAAGCATCCTTTGTCTCACATGAAACATCCCCGCAACCCTAGCGAATGC
CCCAACAGGCAGAAAAAACCGGTCTCGAACCGCACCCGCAGGAGCCCGCCGCGAAAACAA
ACCTCACCGTCTCCTCCTGTATCACCGCCGCGTCCTCCTCTCGCTGCGGCGAAGAAGAGC
CCTAACGACAACAACGTTGGCCAGGTTAGAATCCTGAAGCGCGGCGAGGAGATCCCTAAG
AAGACATCATCAGATCTGGTCGTCGAAAAGCCAGATCTTGTCTCCCCTCGTAGGATCGGA
CCGGATCCGGAAATGATTCCGAGTCAGATCCGTTTACCCGCCCGCAAATCGAATAAGGTG
CCGTTTTACGCCGGTCCCGTGACCATGACATCTCCTCCTCCTAGCGACGTCCCTCTTCCG
GCCTTTTTCGCCGCGAAGAAGAGCGTCTCTCTGTTCCAAGCCACCAACGCTACCAGCGAA
CTCATCAAGATTCTCCGCCTAGACATCGCGATCGCTTGACCGCTTATGTCTCATCTCATT
CGCCGATGTTCCGCTACTGTCCAAAACTGTTCCATT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2FC79JQ 826 0 0
CGCGTCCTCCTCTCGCTGCGGCGAAGAAGAGCCCTAACGACAACAACGTTGGCCAGGTTA
GAATC*TGAAGCGCGGCGAGGAGATCCCTAAGAAGACATCATCAGATCTGGTCGTCGAAA
AGCCAGATCTTGTCTCCCCTCGTAGGATCGGACCGGATCCGGAAATGATTCCGAGTCAGA
TCCGTTTACCCGCCCGCAAATCGAATAAGGTGCCGTTTTACGCCGGTCCCGTGACCATGA
CATCTCCTCCTCCTAGCGACGTCCCTCTTCCGGCCTTTTTCGCCGCGAAGAAGAGCGTCT
CTCTGTTCCAAGCCACCAACGCTACCAGCGAACTCATCAAGATTCTCCGCCTAGACATCG
CGATCGCTTGACCGCTTATGTCTCATCTCATTCGCCGATGTTCCGCTACTGTCCAAAACT
GTTCCATTTTCGGATCGAATCTTCAGTAATAAAATCATCTACAGTCGATGAGTCGAGAAG
ATGAAGAAACGCATCTTCGTTATGAAACCGTTTCGAATCTTCCCTTATTTTTTCAAGGGG
CAAGGTCGAAATATCTTCTTAACAGGTCTTAGTTTCTCTTCGAGTCTAGTGTTTGTATAG
AGTATTTGTTCATAGGCTTTTTTTATAATTGTCTCCTGTTTTAGGTGTCTGTTTACTTTT
TAGGTTGGTCTTTCTTCTTGTTTCTCATCTTTCCTATAGTTCTAAGACAAAAGTATCAGA
GATATGTATCTGACTGGCAATATGCAGATTACAGTTTCTGTATTACTTTGATCCTTCGAT
GTAAGATCATTATTTGCATCTTTATATTAAATAAAAATTAAGTTTC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL3874Contig1 1088 2 2 U
GGGATTCAATTCGATTCATCGAACTCAACCCCCTGTAGTATCCCACCCGGATTACGATTC
AATCTCGTGATTTTTCTCTTGTTTTTAGGGTTCAGATGATGGTCACAAAGCGCTAGAGAG
ATTAATCTACCGATTCAAGATTTAGATTACTGCGATAAAATGTCGCGATTCGCTCGTGGG
TTCGTGGAGAATTCATCGATGGAGGAACCCGAAACGCCTCCTCTTCGTCGTCGTCGTCCG
AGTATTTGTTTCAGGCCGATAAACCCTCCTGATTTAGAACGTCTTGAGCAGATCCATCGC
GACTTGTTCCCAATCAGGTATGAGTCTGAGTTTTTTCAGAACGTTGTGAATGGAGGTGAT
ATCGTTTCGTGGGCTGCTGTTGATCGGAGCCGTCCTGATGGTTACTCTGAGGAGCTTATC
GGTTTTGTTACTGCTAAATTCGTGCTTGCCACAGAAAGTGAAATATCAGATTTAATAAGA
TATGACTCGTCCAAGGGAGAGGAGACTTTGGTGTATATCCTAACACTCGGAGTTGTAGAA
ACCTACAGAAAACTCGGAGTAGCTAAGTCACTTATTAAGGAAGTCATCAAATACGCTTCT
AGTATCCCCGTGTGCCGTGGTGTTTACCTTCATGTGATTGCACACAACAACCCCGCAATC
AGATTGTACAAAAGAATGTCTTTCAGATGTGTGAGGAGACTACACGGATTCTACCTAATC
AACGGCCAGCATTTCGATTCTTACTTGTTCGTCTACTTTGTCAACGGTTCTCGCTCTCCT
TTCTCACCCTTAGATCTCGTGGTGTCGGTTCTGAACTATGTGAGGAGTGGGATCAAAGTA
GTGGCATCAAAGCTGACAATGAAGCAAGAAGAGAAAGGCTTGAAAGGGCTTAAATGCAAA
GACAACACGCGGCGTTTATTGCCAAATCAGACCAAACGAAACCTTGCTTCATCCGAAAGA
GTATCATCAGGAGGGTACGATTACGTTTAGTGTTTGTAAACTTAATTCATTTCCATGTCC
TTAATAATTTAATGTAATAAAAAAGTAAATATTGTGAATGATGTAGTCGAAAAAAACTTA
TCTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO17TF U 1
AF RR2AO17JQ C 416
BS 1 858 RR2AO17TF
BS 859 1088 RR2AO17JQ

RD RR2AO17TF 873 0 0
GGGATTCAATTCGATTCATCGAACTCAACCCCCTGTAGTATCCCACCCGGATTACGATTC
AATCTCGTGATTTTTCTCTTGTTTTTAGGGTTCAGATGATGGTCACAAAGCGCTAGAGAG
ATTAATCTACCGATTCAAGATTTAGATTACTGCGATAAAATGTCGCGATTCGCTCGTGGG
TTCGTGGAGAATTCATCGATGGAGGAACCCGAAACGCCTCCTCTTCGTCGTCGTCGTCCG
AGTATTTGTTTCAGGCCGATAAACCCTCCTGATTTAGAACGTCTTGAGCAGATCCATCGC
GACTTGTTCCCAATCAGGTATGAGTCTGAGTTTTTTCAGAACGTTGTGAATGGAGGTGAT
ATCGTTTCGTGGGCTGCTGTTGATCGGAGCCGTCCTGATGGTTACTCTGAGGAGCTTATC
GGTTTTGTTACTGCTAAATTCGTGCTTGCCACAGAAAGTGAAATATCAGATTTAATAAGA
TATGACTCGTCCAAGGGAGAGGAGACTTTGGTGTATATCCTAACACTCGGAGTTGTAGAA
ACCTACAGAAAACTCGGAGTAGCTAAGTCACTTATTAAGGAAGTCATCAAATACGCTTCT
AGTATCCCCGTGTGCCGTGGTGTTTACCTTCATGTGATTGCACACAACAACCCCGCAATC
AGATTGTACAAAAGAATGTCTTTCAGATGTGTGAGGAGACTACACGGATTCTACCTAATC
AACGGCCAGCATTTCGATTCTTACTTGTTCGTCTACTTTGTCAACGGTTCTCGCTCTCCT
TTCTCACCCTTAGATCTCGTGGTGTCGGTTCTGAACTATGTGAGGAGTGGGATCAAAGTA
GTGGCATCAAAGCTGACA
TGAAGCAGAAGAGAA

QA 1 858 1 858
DS 

RD RR2AO17JQ 673 0 0
TTATCGGTTTTGTTACTGCTAAATTCGTGCTTGCCACAGAAAGTGAAATATCAGATTTAA
TAAGATATGACTCGTCCAAGGGAGAGGAGACTTTGGTGTATATCCTAACACTCGGAGTTG
TAGAAACCTACAGAAAACTCGGAGTAGCTAAGTCACTTATTAAGGAAGTCATCAAATACG
CTTTTAGTATCCCCGTGTGCCGTGGTGTTTACCTTCATGTGATTGCACACAACAACCCCG
CAATCAGATTGTACAAAAGAATGTTTTTCAGATGTGTGAGGAGACTACACGGATTTTACC
TAATCAACGGCCAGCATTTCGATTTTTACTTGTTTGTTTACTTTGTCAACGGTTCTCGCT
CTCCTTTCTCACCCTTAGATCTCGTGGTGTCGGTTTTGAACTATGTGAGGAGTGGGATCA
AAGTAGTGGCATCAAAGCTGACAATGAAGCAAGAAGAGAAAGGCTTGAAAGGGCTTAAAT
GCAAAGACAACACGCGGCGTTTATTGCCAAATCAGACCAAACGAAACCTTGCTTCATCCG
AAAGAGTATCATCAGGAGGGTACGATTACGTTTAGTGTTTGTAAACTTAATTCATTTCCA
TGTCCTTAATAATTTAATGTAATAAAAAAGTAAATATTGTGAATGATGTAGTCGAAAAAA
ACTTATCTTTTGC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL3875Contig1 737 2 2 U
GGACCCAATTTGTCAACAGCCACTAAACCGGAAAGAAGGAATCATCAGTTAGTGCTAATT
TTTGAGATCCGTTTTTGTTCAACAATGGAGTCACCAGCAGCAGCAGCGAAGCCGGCGAGA
GGCGCCTGAGGAAGGAAAGGAGGAGACAGGAAGAAGAGCGTCACCAAATCCGTCAAAGCC
GGTCTCCAGTTCCCCGTCGGTCGTATCTCTCGCCACCTCAAAAAAGGCCGTTACGCCGTC
AGGTACGGCGCCGGCGCTCCCGTTTACCTCGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCCGCCGAG
GTTTTGGAGCTGGCGGGGAACGCAGCGAGGGATAACAAGAAGAACAGAATAAACCCTAGG
CATCTCTGCTTGGCGATAAGGAACGACGAGGAGCTGGGGAAGCTGCTTTCCGGAGTCACC
ATCTCGAGCGGAGGAGTGCTGCCAAACATCAACCCGGTTCTTCTTCCCAAGAGAGCTGCA
GCGTCTGAGAAAGCTGAGAAGCCTGAGAAAGCTGCCAAATCTCCCAAGAAGGCTTGAGGA
AATGCTATTTACTGTTCTTAGGAATCTGTTGTTGCTATCGGTCTCTAGATGAAGAAACAT
CTTATTTTTTTAAAATATTTTGGGTATTAGGGATTATGTACGTTGTTGTCGTTCATCTCC
GTTTGGTTTGTTTATAAATCCGATGGAAAGATTATGTTATTAAAGCCATTTTGTAATCAA
TGAAGTAATTTTTGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G036TF U 1
AF RR2G036JQ C 247
BS 1 705 RR2G036TF
BS 706 737 RR2G036JQ

RD RR2G036TF 705 0 0
GGACCCAATTTGTCAACAGCCACTAAACCGGAAAGAAGGAATCATCAGTTAGTGCTAATT
TTTGAGATCCGTTTTTGTTCAACAATGGAGTCACCAGCAGCAGCAGCGAAGCCGGCGAGA
GGCGCCTGAGGAAGGAAAGGAGGAGACAGGAAGAAGAGCGTCACCAAATCCGTCAAAGCC
GGTCTCCAGTTCCCCGTCGGTCGTATCTCTCGCCACCTCAAAAAAGGCCGTTACGCCGTC
AGGTACGGCGCCGGCGCTCCCGTTTACCTCGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCCGCCGAG
GTTTTGGAGCTGGCGGGGAACGCAGCGAGGGATAACAAGAAGAACAGAATAAACCCTAGG
CATCTCTGCTTGGCGATAAGGAACGACGAGGAGCTGGGGAAGCTGCTTTCCGGAGTCACC
ATCTCGAGCGGAGGAGTGCTGCCAAACATCAACCCGGTTCTTCTTCCCAAGAGAGCTGCA
GCGTCTGAGAAAGCTGAGAAGCCTGAGAAAGCTGCCAAATCTCCCAAGAAGGCTTGAGGA
AATGCTATTTACTGTTCTTAGGAATCTGTTGTTGCTATCGGTCTCTAGATGAAGAAACAT
CTTATTTTTTTAAAATATTTTGGGTATTAGGGATTATGTACGTTGTTGTCGTTCATCTCC
GTTTGGTTTGTTTATAAATCCGATGGAAAGATTATGTTATTAAAG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2G036JQ 491 0 0
GGCGCCGGCGCTCCCGTTTACCTCGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCCGCCGAGGTTTTG
GAGCTGGCGGGGAACGCAGCGAGGGATAACAAGAAGAACAGAATAAACCCTAGGCATTTT
TGCTTGGCGATAAGGAACGACGAGGAGCTGGGGAAGCTGCTTTCCGGAGTCACCATCTCG
AGCGGAGGAGTGCTGCCAAACATCAACCCGGTTTTTTTTCCCAAGAGAGCTGCAGCGTTT
GAGAAAGCTGAGAAGCCTGAGAAAGCTGCCAAATTTCCCAAGAAGGCTTGAGGAAATGCT
ATTTACTGTTTTTAGGAATCTGTTGTTGCTATCGGTCTTTAGATGAAGAAACATTTTATT
TTTTTAAAATATTTTGGGTATTAGGGATTATGTACGTTGTTGTCGTTCATCTCCGTTTGG
TTTGTTTATAAATCCGATGGAAAGATTATGTTATTAAAGCCATTTTGTAATCAATGAAGT
AATTTTTGGGT

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 2

CO CL3876Contig1 783 2 2 U
GGATTCATCCCAATCGAAGAAACCAAATAAGGATTGGATCTCGTCCTTTCCCAAACTCCT
CAATTTTGCACTCTGTATATCAAGCATCTTCGTCTCCACCAACGCTAAACCTCGATCTCT
CCTTGAACGACGATTACGTCTCATAATCATCTCCGCAAGACCTCGCAAACCCCTCAATTT
CACTCCTTCATGCGTCTCCTCAGATCCCAATGCCTCTGATTCGATAAAGAGAGACGGATG
CACCAGTAGCCATGGTTGAACAGACTGAGACAGCTTTTCTTAAGGAACCCGAGGTCGTCT
TAAGCTAGAAGAAATCTGGGAAAGGAAAGAAACATGTTAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGA
AGAACATTGGTTTGGGTTTCCAGACTCCCCATGACGCCATTGAAGATGAGCTTAAAGCAG
TTGGAGTTGATGGAGTGGTTCTGGCCACCAATTACCAACCAGAAGTGATGCTTAACTTTT
TGAAAGACTTTGAAGCAAAGCTAGAAAGCAATCACTTGCTCACAAAGACTGAGCGTATGG
GTACAATTGAGTTCAGCTTGGGAAATATTAAGGAAGTTATTAGTCTTATATATGTTGGTA
TATTTGTTAGCTTATGAATTATTTTGGCCTTATGTATATTTTGGATGGTAGTTAGTGGAT
GTAGTAGTTGCCTTGGAGATGCAGAGGAAGTCTCGATTGCCATTGATATTATTATGGCAT
TAGTAGTTTTTATATGTTGGATCACTTCTGTTTCTAATGAGCAAGATTATGTTTAAAGTG
GTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2GI55TF U 1
AF RR2GI55JQB C 1
BS 1 650 RR2GI55TF
BS 651 783 RR2GI55JQB

RD RR2GI55TF 650 0 0
GGATTCATCCCAATCGAAGAAACCAAATAAGGATTGGATCTCGTCCTTTCCCAAACTCCT
CAATTTTGCACTCTGTATATCAAGCATCTTCGTCTCCACCAACGCTAAACCTCGATCTCT
CCTTGAACGACGATTACGTCTCATAATCATCTCCGCAAGACCTCGCAAACCCCTCAATTT
CACTCCTTCATGCGTCTCCTCAGATCCCAATGCCTCTGATTCGATAAAGAGAGACGGATG
CACCAGTAGCCATGGTTGAACAGACTGAGACAGCTTTTCTTAAGGAACCCGAGGTCGTCT
TAAGCTAGAAGAAATCTGGGAAAGGAAAGAAACATGTTAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGA
AGAACATTGGTTTGGGTTTCCAGACTCCCCATGACGCCATTGAAGATGAGCTTAAAGCAG
TTGGAGTTGATGGAGTGGTTCTGGCCACCAATTACCAACCAGAAGTGATGCTTAACTTTT
TGAAAGACTTTGAAGCAAAGCTAGAAAGCAATCACTTGCTCACAAAGACTGAGCGTATGG
GTACAATTGAGTTCAGCTTGGGAAATATTAAGGAAGTTATTAGTCTTATATATGTTGGTA
TATTTGTTAGCTTATGAATTATTTTGGCCTTATGTATATTTTGGATGGTA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2GI55JQB 783 0 0
GGATTCATCCCAATCGAAGAAACCAAATAAGGATTGGATCTCGTCCTTTCCCAAACTCCT
CAATTTTGCACTCTGTATATCAAGCATCTTCGTCTCCACCAACGCTAAACCTCGATCTCT
CCTTGAACGACGATTACGTCTCATAATCATCTCCGCAAGACCTCGCAAACCCCTCAATTT
CACTCCTTCATGCGTCTCCTCAGATCCCAATGCCTCTGATTCGATAAAGAGAGACGGATG
CACCAGTAGCCATGGTTGAACAGACTGAGACAGCTTTTCTTAAGGAACCCGAGGTCGTCT
TAAGCTAGAAGAAATCTGGGAAAGGAAAGAAACATGTTAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGA
AGAACATTGGTTTGGGTTTCCAGACTCCCCATGACGCCATTGAAGATGAGCTTAAAGCAG
TTGGAGTTGATGGAGTGGTTCTGGCCACCAATTACCAACCAGAAGTGATGCTTAACTTTT
TGAAAGACTTTGAAGCAAAGCTAGAAAGCAATCACTTGCTCACAAAGACTGAGCGTATGG
GTACAATTGAGTTCAGCTTGGGAAATATTAAGGAAGTTATTAGTCTTATATATGTTGGTA
TATTTGTTAGCTTATGAATTATTTTGGCCTTATGTATATTTTGGATGGTAGTTAGTGGAT
GTAGTAGTTGCCTTGGAGATGCAGAGGAAGTCTCGATTGCCATTGATATTATTATGGCAT
TAGTAGTTTTTATATGTTGGATCACTTCTGTTTCTAATGAGCAAGATTATGTTTAAAGTG
GTC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL3879Contig1 579 2 7 U
GGTAGAATTAAAGTTATTTTATATTAATTAAAATTATTTGTAGCAACTTGTAGACATAAT
CAAAACACCCTTGTGCGGTGACTTGTGGGAACAGGGCCTGAGCTTCCGGATTCTCACATG
TACTCGGCGAATGGACCATCCGGCCTAGGAGGGACGAGAGACATTCCAAGACCTTGGAAA
CACTTTCGGGCAGTCATCTCCAACAAAGGATCTTCGAAAAAGTAACTACAACAGATCTGA
TCAACGCGAGCCTTGAGCTCAGCCAGCGAGCCTCCTTCATTTAGAATCTTCTCACCAGTT
TTAAAAATGTAGGAGCTCAGTGCATCGTTGATATGACCCACTAAATCCGCCTGGGAGAAG
AGATTATACATCCTATAAAGTCCCTCACAGTGTCTATCATCCATTAGCTTCGCAAAACCC
TTTTCAAGAATGGCACAAGCATGAACCCCCAGGAGTTCCCTGTTGACAACTTCAAGCAGC
TCATCCTCGAACTTAGAGAAAAAGGGGAAGATTCTGCATTTTTCCTTCTCCTCACAAACC
CTTTGATGGACATGTTTCAAGTAGTGGGGAAGATCAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX76JQ U 48
AF RR2FG27JQ U 1
BS 1 97 RR2FG27JQ
BS 98 98 RR2BX76JQ
BS 99 227 RR2FG27JQ
BS 228 228 RR2BX76JQ
BS 229 233 RR2FG27JQ
BS 234 234 RR2BX76JQ
BS 235 579 RR2FG27JQ

RD RR2BX76JQ 456 0 0
TTGTAGACATAATCAAAACACCCTTGTGCGGTGACTTGTGGGAACAGGGCCTGAGCTTCC
GGATTCTCACATGTACTCGGCGAATGGACCATCCGGCCTAGGAGGGACGAGAGACATTCC
AAGACCTTGGAAACACTTTCGGGCAGTCATCTCCAACAAAGGATCTTCGAAAAAGTAACT
ACAACAGATCTGATCAACGCGAGCCTTGAGCTCAGCCAGCGAGCCTCCTTCATTTAGAAT
CTTCTCACCAGTTTTAAAAATGTAGGAGCTCAGTGCATCGTTGATATGACCCACTAAATC
CGCCTGGGAGAAGAGATTATACATCCTATAAAGTCCCTCACAGTGTCTATCATCCATTAG
CTTCGCAAAACCCTTTTCAAGAATGGCACAAGCATGAACCCCCAGGAGTTCCCTGTTGAC
AACTTCAAGCAGCTCATCCTCGAACTTAGAGAAAAA

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR2FG27JQ 579 0 0
GGTAGAATTAAAGTTATTTTATATTAATTAAAATTATTTGTAGCAACTTGTAGACATAAT
CAAAACACCCTTGTGCGGTGACTTGTGGGAACAGGGCGTGAGCTTCCGGATTCTCACATG
TACTCGGCGAATGGACCATCCGGCCTAGGAGGGACGAGAGACATTCCAAGACCTTGGAAA
CACTTTCGGGCAGTCATCTCCAACAAAGGATCTTCGAAAAAGTAACTGCAACATATCTGA
TCAACGCGAGCCTTGAGCTCAGCCAGCGAGCCTCCTTCATTTAGAATCTTCTCACCAGTT
TTAAAAATGTAGGAGCTCAGTGCATCGTTGATATGACCCACTAAATCCGCCTGGGAGAAG
AGATTATACATCCTATAAAGTCCCTCACAGTGTCTATCATCCATTAGCTTCGCAAAACCC
TTTTCAAGAATGGCACAAGCATGAACCCCCAGGAGTTCCCTGTTGACAACTTCAAGCAGC
TCATCCTCGAACTTAGAGAAAAAGGGGAAGATTCTGCATTTTTCCTTCTCCTCACAAACC
CTTTGATGGACATGTTTCAAGTAGTGGGGAAGATCAGAA

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL3880Contig1 803 2 4 U
GGGTCCATCTCTCTCTCACTGCACTTCTCTCGGCGAGCTCAGATCTCTGATCTAGGGCTA
CATCGTGCTCATCGGACATGTCGATCTCCGCTCAAAATCCGGATATCTCCGGCGATAGGC
AATCCGGCCAAGATGTTCGTACTCAGAACGTGATGGCTTGTCAAGCTATTTCAAACATCG
TTAAGACCTCGCTTGGTCCCGTTGGACTCGACAAGATGTTAGTGGATGATATTGGTGATG
TGACCATCACAAACGACGGAGCTACTATTCTTCGGATGTTGGAGGTCGAACACCCTGCTG
CTAAGGTTCTCGTCGAGTTGGCTGAACTCCAGGATAGAGAAGTTGGTGATGGGACTACCT
CTGTTGTTATTGTCGCTGCTGAGTTGCTCAAGAGGGCAAATGATTTGGTCAGGAACAAAA
TACATCCAACATCTATTATTAGTGGATACAGGCTAGCGATGAGAGAAGCTTGCAAATACA
TTGATGAGAAGTTGGTGACTAAGGTCGAAAAGCTTGGGAAAGCTCCATTGATAAACTGTG
CTAAAACCAGCATGTCCTCCAAACTGATATCTTCTGACAGCGACTTCTTTGCCAACTCTG
TTGTGGATGCCGTTCTGTCAGTGAAGATGACAAATCAGCGAGGGGAGATAAAGTACCCTA
TTAAGGGATCAATATTCTGAAAGCACATGGACAAAGTGCGCGAGACAGCTATTTGTTGAT
GGATATGCACTCATACTGGCCGCGCTGCCCAAGGATGCCACTACGAGTTTCTCCAGCCAA
GATGCTTGCCTTGACTCATCTCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H491TF U 1
AF RR2G164TF U 5
BS 1 694 RR2H491TF
BS 695 695 RR2G164TF
BS 696 749 RR2H491TF
BS 750 803 RR2G164TF

RD RR2H491TF 749 0 0
GGGTCCATCTCTCTCTCACTGCACTTCTCTCGGCGAGCTCAGATCTCTGATCTAGGGCTA
CATCGTGCTCATCGGACATGTCGATCTCCGCTCAAAATCCGGATATCTCCGGCGATAGGC
AATCCGGCCAAGATGTTCGTACTCAGAACGTGATGGCTTGTCAAGCTATTTCAAACATCG
TTAAGACCTCGCTTGGTCCCGTTGGACTCGACAAGATGTTAGTGGATGATATTGGTGATG
TGACCATCACAAACGACGGAGCTACTATTCTTCGGATGTTGGAGGTCGAACACCCTGCTG
CTAAGGTTCTCGTCGAGTTGGCTGAACTCCAGGATAGAGAAGTTGGTGATGGGACTACCT
CTGTTGTTATTGTCGCTGCTGAGTTGCTCAAGAGGGCAAATGATTTGGTCAGGAACAAAA
TACATCCAACATCTATTATTAGTGGATACAGGCTAGCGATGAGAGAAGCTTGCAAATACA
TTGATGAGAAGTTGGTGACTAAGGTCGAAAAGCTTGGGAAAGCTCCATTGATAAACTGTG
CTAAAACCAGCATGTCCTCCAAACTGATATCTTCTGACAGCGACTTCTTTGCCAACTCTG
TTGTGGATGCCGTTCTGTCAGTGAAGATGACAAATCAGCGAGGGGAGATAAAGTACCCTA
TTAAGGGATCAATATTCTGAAAGCACATGGACAA*GTGCGCGAGACAGCTATTTGTTGAT
GGATATGCACTCATACTGGCCGCGCTGCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2G164TF 799 0 0
CCATCTCTCTCTCACTGCACTTCTCTCGGCGAGCTCAGATCTCTGATCTAGGGCTACATC
GTGCTCATCGGACATGTCGATCTCCGCTCAAAATCCGGATATCTCCGGCGATAGGCAATC
CGGCCAAGATGTTCGTACTCAGAACGTGATGGCTTGTCAAGCTATTTCAAACATCGTTAA
GACCTCGCTTGGTCCCGTTGGACTCGACAAGATGTTAGTGGATGATATTGGTGATGTGAC
CATCACAAACGACGGAGCTACTATTCTTCGGATGTTGGAGGTCGAACACCCTGCTGCTAA
GGTTCTCGTCGAGTTGGCTGAACTCCAGGATAGAGAAGTTGGTGATGGGACTACCTCTGT
TGTTATTGTCGCTGCTGAGTTGCTCAAGAGGGCAAATGATTTGGTCAGGAACAAAATACA
TCCAACATCTATTATTAGTGGATACAGGCTAGCGATGAGAGAAGCTTGCAAATACATTGA
TGAGAAGTTGGTGACTAAGGTCGAAAAGCTTGGGAAAGCTCCATTGATAAACTGTGCTAA
AACCAGCATGTCCTCCAAACTGATATCTTCTGACAGCGACTTCTTTGCCAACTCTGTTGT
GGATGCCGTTCTGTCAGTGAAGATGACAAATCAGCGAGGGGAGATAAAGTACCCTATTAA
GGGATCAATATTCTGAAAGCACATGGACAAAGTGCGCGAGACAGCTATTTGTTGATGGAT
ATGCACTCATACTGGCCGCGCTGCCCAAGGATGCCACTACGAGTTTCTCCAGCCAAGATG
CTTGCCTTGACTCATCTCC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL3881Contig1 1308 2 2 U
GGAGAATACATCACAATTTCATTTCCCTAACTTTCTTCCACTTTATCATTCTCTTTCTCA
AAAAGAGAAGTCTTTGCTCTGAAATCTTGAAAATGGATTCTTTGATCAAACTCTTTTTAT
GCCTCTATGGAGTTCTATTCACTTCTCTACTCTTTGCTGAAATTAATGGAGTTGAGGGCT
CAGACAAGAATTATCGTTTGTACGGATTCAGACCAACGAAGCTGTTTGTGTTCGGAGACT
CTTATGCAGACACAGGGAACATTAAGAAGTCTCTCTCTAGTTCTTGGAAATTTCCTTATG
GTATCACTTTCCCCGGTAAACCCGCTGGCCGTTTTTCCGATGGCCGCGTCGCCACTGATT
TTCTAGCAAAATTCGTGGGGATAAAATCACCAATCCCATACTTCTGGAAAAAATACGCGG
GAAAGAAACGTTTACAGTACGGAATGAACTTTGCGTACGGAGGAACAGGAGTGTTCAAGA
CTCAAGTTCCATTGCCCAATATGACCACTCAAATCGATTTCTTCCAGAACATTCTCACCG
CCGGCCACATCTACACTCCCTCCAACCTTATCTCCTCCGTCGCTCTCGTCAGCGTCGCCG
GCAACGACTATTCCACTTTCATCTCCCAAAACCGCCCTGCCTCGGACTTTCCAGCATTCA
TAAAGCAAGTGGTGGATCAAACAGAGGTGAATCTGAGGCGGATCCACGCCTTGGGAGTAA
AGAAAGTAGCAGTACCGTTGCTGCAGCCTCTCGGTTGCCTCCCTGGCATCACCTTTGCCT
CCTCGTTCCAGCGTTGTAACGAGACACAAAACGCTTTAGTGAGACTCCACAACCGCTTGT
TGCAACAAGCCGTGATAAAGCTCAATAACGAAACCAAACAGTCCACTTTCATCATCATTG
ATCTTTACAACGCTTTCTTGAACGTTTTCAACAACAAAGGAGCAAATCCAGGGAGTACGA
CGTTTCAGAGCCCGTTGAAACCGTGCTGCGTAGGCGTGAGCAGTGAGTATTTCTGTGGAA
GTGTGGATGAAAAGGGTTTGAAGAAGTATATGATATGTGATGATCCTAAGTCTGCCTTCT
TTTGGGATGATAGTCCCCCTACAGAAGAAGGATGGAGATCGGTTTACTCTGTTTTACACG
AAAGTTTTACAGCCTCTTTTATGAAAGCGTGAGGAGGAAGAAACAAAAAAAAAAACACTT
TTAGGGTTCTTCTCAGTTGTTTGTTCTTTCTCTGTTTTGTTCAGTATCACTTCATTCATT
TTGTGTTTCTATGTTCTGTGTTAAAAGTCTTTGCCACTAAATAAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AI38TF U 1
AF RR2AI38JQ C 698
BS 1 789 RR2AI38TF
BS 790 1308 RR2AI38JQ

RD RR2AI38TF 789 0 0
GGAGAATACATCACAATTTCATTTCCCTAACTTTCTTCCACTTTATCATTCTCTTTCTCA
AAAAGAGAAGTCTTTGCTCTGAAATCTTGAAAATGGATTCTTTGATCAAACTCTTTTTAT
GCCTCTATGGAGTTCTATTCACTTCTCTACTCTTTGCTGAAATTAATGGAGTTGAGGGCT
CAGACAAGAATTATCGTTTGTACGGATTCAGACCAACGAAGCTGTTTGTGTTCGGAGACT
CTTATGCAGACACAGGGAACATTAAGAAGTCTCTCTCTAGTTCTTGGAAATTTCCTTATG
GTATCACTTTCCCCGGTAAACCCGCTGGCCGTTTTTCCGATGGCCGCGTCGCCACTGATT
TTCTAGCAAAATTCGTGGGGATAAAATCACCAATCCCATACTTCTGGAAAAAATACGCGG
GAAAGAAACGTTTACAGTACGGAATGAACTTTGCGTACGGAGGAACAGGAGTGTTCAAGA
CTCAAGTTCCATTGCCCAATATGACCACTCAAATCGATTTCTTCCAGAACATTCTCACCG
CCGGCCACATCTACACTCCCTCCAACCTTATCTCCTCCGTCGCTCTCGTCAGCGTCGCCG
GCAACGACTATTCCACTTTCATCTCCCAAAACCGCCCTGCCTCGGACTTTCCAGCATTCA
TAAAGCAAGTGGTGGATCAAACAGAGGTGAATCTGAGGCGGATCCACGCCTTGGGAGTAA
AGAAAGTAGCAGTACCGTTGCTGCAGCCTCTCGGTTGCCTCCCTGGCATCACCTTTGCCT
CCTCGTTCC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2AI38JQ 611 0 0
GCGGATCCACGCCTTGGGAGTAAAGAAAGTAGCAGTACCGTTGCTGCAGCCTCTCGGTTG
CCTCCCTGGCATCACCTTTGCCTCCTCGTTCCAGCGTTGTAACGAGACACAAAACGCTTT
AGTGAGACTCCACAACCGCTTGTTGCAACAAGCCGTGATAAAGCTCAATAACGAAACCAA
ACAGTCCACTTTCATCATCATTGATCTTTACAACGCTTTCTTGAACGTTTTCAACAACAA
AGGAGCAAATCCAGGGAGTACGACGTTTCAGAGCCCGTTGAAACCGTGCTGCGTAGGCGT
GAGCAGTGAGTATTTCTGTGGAAGTGTGGATGAAAAGGGTTTGAAGAAGTATATGATATG
TGATGATCCTAAGTCTGCCTTCTTTTGGGATGATAGTCCCCCTACAGAAGAAGGATGGAG
ATCGGTTTACTCTGTTTTACACGAAAGTTTTACAGCCTCTTTTATGAAAGCGTGAGGAGG
AAGAAACAAAAAAAAAAACACTTTTAGGGTTCTTCTCAGTTGTTTGTTCTTTCTCTGTTT
TGTTCAGTATCACTTCATTCATTTTGTGTTTCTATGTTCTGTGTTAAAAGTCTTTGCCAC
TAAATAAAACT

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL3882Contig1 442 2 1 U
GGATCAAAAAGTAAATCAGAACTCTCTCTCTCTCGTCTCATACAATATGGAGAAAGATTC
TTGGGCAGATCTGTGGGACAACAATCAATCGACGGCGAAAACAACCGACGACGGTAAAAG
CGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGTGCGTCGGGTAAATACAAAGAGAAGATGGAGGCTGGACT
AGGGAAGACGAAAGCGGCGGCGAGTTCGGGGTTTAAGAAAGTGAAGGCGGGAACGTCGTT
GGGTCTTAGCTGGGTCAAAGACAAGTACGCCAAACCACCGCCAAGAAGAATTGATTTCTT
TTGCGTTTCCTTTCCCATTAAGTAATAAAAGTTTTTTTGTATAATCGAACAGATCTGATG
ATATCGAATATTATTTGTTTTGGATTCTTCTTGTGATGTTGTTGACAGATTCGGTTGTTT
GATCATGTGAAGAAGATTCACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G942JQ C 1
AF RR2G942TF U 1
BS 1 442 RR2G942TF

RD RR2G942JQ 442 0 0
GGATCAAAAAGTAAATCAGAACTCTCTCTCTCTCGTCTCATACAATATGGAGAAAGATTC
TTGGGCAGATCTGTGGGACAACAATCAATCGACGGCGAAAACAACCGACGACGGTAAAAG
CGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGTGCGTCGGGTAAATACAAAGAGAAGATGGAGGCTGGACT
AGGGAAGACGAAAGCGGCGGCGAGTTCGGGGTTTAAGAAAGTGAAGGCGGGAACGTCGTT
GGGTCTTAGCTGGGTCAAAGACAAGTACGCCAAACCACCGCCAAGAAGAATTGATTTCTT
TTGCGTTTCCTTTCCCATTAAGTAATAAAAGTTTTTTTGTATAATCGAACAGATCTGATG
ATATCGAATATTATTTGTTTTGGATTCTTCTTGTGATGTTGTTGACAGATTCGGTTGTTT
GATCATGTGAAGAAGATTCACC

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR2G942TF 442 0 0
GGATCAAAAAGTAAATCAGAACTCTCTCTCTCTCGTCTCATACAATATGGAGAAAGATTC
TTGGGCAGATCTGTGGGACAACAATCAATCGACGGCGAAAACAACCGACGACGGTAAAAG
CGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGTGCGTCGGGTAAATACAAAGAGAAGATGGAGGCTGGACT
AGGGAAGACGAAAGCGGCGGCGAGTTCGGGGTTTAAGAAAGTGAAGGCGGGAACGTCGTT
GGGTCTTAGCTGGGTCAAAGACAAGTACGCCAAACCACCGCCAAGAAGAATTGATTTCTT
TTGCGTTTCCTTTCCCATTAAGTAATAAAAGTTTTTTTGTATAATCGAACAGATCTGATG
ATATCGAATATTATTTGTTTTGGATTCTTCTTGTGATGTTGTTGACAGATTCGGTTGTTT
GATCATGTGAAGAAGATTCACC

QA 1 442 1 442
DS 



AS 1 2

CO CL3883Contig1 1136 2 2 U
GAGGATGAAGAAGAAGAAGGGCAGAGAAACGAGTCTGTTACTACTACTACTATGGATGAG
CAATGGTGTGAGTTGAATCCAAACGGTGAACAGCTTCCAGAGATGTACCTGCCTCTTAAA
CAAGCCTTGCTCAAGTCTTGTCAGCAGATAGATAAAGAGCTTAAAATGCACCCTACTATC
GATTGTTTCTGCAGCGGCACAACTTCAGTCACTTTGATCAAACAGGGCGAGGACTTGGTG
GTCGGAAACATCGGTGACTCTAGAGCCGTTCTTGCCACAAGAGACCAAGACAATGCTTTG
GTCGCTGTACAATTAACCATAGACTTAAAACCAGACCTGCCAAGTGAATCAGCGAGAATC
CAAAAATGTAAAGGCAGAGTGTTTGCGTTGCAAGATGAGCCAGAGGTAGCTCGTGTATGG
CTACCAAACAGTGACTCACCTGGTTTAGCAATGGCTCGAGCTTTCGGCGACTTCTGTCTC
AAAGATTACGGTCTTATCTCGGTCCCTGACATCAACTACCGCCGCCTTACAGAAGGAGAT
GAGTTCATTATTCTTGCTAGCGACGGGGTATGGGATGTGTTGTCGAACAAAGAAGCTGTG
GACATTGTTGCTTCAGCTCCTAGTCGAAGCACAGCAGCTAGAGCTTTAGTGGACACAGCG
GTTAGATCATGGAGAATCAAGTATCCAACTTCCAAAAACGATGACTGTACTGTAGTCTGC
CTCTTTCTCCAAGATTCAAGCAATGTAGTAAAGGATTCACACAAAGAAGAGAGTGTCAGT
ATCAGTAACAAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGAGATTGTGCAGGTTAAAGAGGAAAGTACA
CCTAAGAGTTGTGGGATTGAGTCGAAGGTGATGACAATGACACTTGCTGAATGTATATCG
GTTGCACAGGATGATGAAGAGTGGTCTGCTTTGGAAGGGTTGACTAGGGTTAATAGTTTG
TTGAGCATTCCAAGGTTGTTCTCTGGTGAGCTTAGATCAACTAGTTGGAGGAAATGGTTG
TGACTTCTTTTATGTTATTTTTTTGTTACTTGTGTGCTTCTTAAGTTAAAACCTACACAA
ACACCACGCATCATCACCATGTTCGTTGTTTCATATCCAACTTTTTTTCTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A269TF U 1
AF RR2A269JQ C 344
BS 1 785 RR2A269TF
BS 786 1136 RR2A269JQ

RD RR2A269TF 785 0 0
GAGGATGAAGAAGAAGAAGGGCAGAGAAACGAGTCTGTTACTACTACTACTATGGATGAG
CAATGGTGTGAGTTGAATCCAAACGGTGAACAGCTTCCAGAGATGTACCTGCCTCTTAAA
CAAGCCTTGCTCAAGTCTTGTCAGCAGATAGATAAAGAGCTTAAAATGCACCCTACTATC
GATTGTTTCTGCAGCGGCACAACTTCAGTCACTTTGATCAAACAGGGCGAGGACTTGGTG
GTCGGAAACATCGGTGACTCTAGAGCCGTTCTTGCCACAAGAGACCAAGACAATGCTTTG
GTCGCTGTACAATTAACCATAGACTTAAAACCAGACCTGCCAAGTGAATCAGCGAGAATC
CAAAAATGTAAAGGCAGAGTGTTTGCGTTGCAAGATGAGCCAGAGGTAGCTCGTGTATGG
CTACCAAACAGTGACTCACCTGGTTTAGCAATGGCTCGAGCTTTCGGCGACTTCTGTCTC
AAAGATTACGGTCTTATCTCGGTCCCTGACATCAACTACCGCCGCCTTACAGAAGGAGAT
GAGTTCATTATTCTTGCTAGCGACGGGGTATGGGATGTGTTGTCGAACAAAGAAGCTGTG
GACATTGTTGCTTCAGCTCCTAGTCGAAGCACAGCAGCTAGAGCTTTAGTGGACACAGCG
GTTAGATCATGGAGAATCAAGTATCCAACTTCCAAAAACGATGACTGTACTGTAGTCTGC
CTCTTTCTCCAAGATTCAAGCAATGTAGTAAAGGATTCACACAAAGAAGAGAGTGTCAGT
ATCAG

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2A269JQ 793 0 0
GTGAATCAGCGAGAATCCAAAAATGTAAAGGCAGAGTGTTTGCGTTGCAAGATGAGCCAG
AGGTAGCTCGTGTATGGCTACCAAACAGTGACTCACCTGGTTTAGCAATGGCTCGAGCTT
TCGGCGACTTCTGTCTCAAAGATTACGGTCTTATCTCGGTCCCTGACATCAACTACCGCC
GCCTTACAGAAGGAGATGAGTTCATTATTCTTGCTAGCGACGGGGTATGGGATGTGTTGT
CGAACAAAGAAGCTGTGGACATTGTTGCTTCAGCTCCTAGTCGAAGCACAGCAGCTAGAG
CTTTAGTGGACACAGCGGTTAGATCATGGAGAATCAAGTATCCAACTTCCAAAAACGATG
ACTGTACTGTAGTCTGCCTCTTTCTCCAAGATTCAAGCAATGTAGTAAAGGATTCACACA
AAGAAGAGAGTGTCAGTATCAGTAACAAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGAGATTGTGCAGG
TTAAAGAGGAAAGTACACCTAAGAGTTGTGGGATTGAGTCGAAGGTGATGACAATGACAC
TTGCTGAATGTATATCGGTTGCACAGGATGATGAAGAGTGGTCTGCTTTGGAAGGGTTGA
CTAGGGTTAATAGTTTGTTGAGCATTCCAAGGTTGTTCTCTGGTGAGCTTAGATCAACTA
GTTGGAGGAAATGGTTGTGACTTCTTTTATGTTATTTTTTTGTTACTTGTGTGCTTCTTA
AGTTAAAACCTACACAAACACCACGCATCATCACCATGTTCGTTGTTTCATATCCAACTT
TTTTTCTTCTTCC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL3884Contig1 687 2 3 U
CGTGGATGATAGCTGAAAAGGATGATTGGGTCCAACGCAGTGTCGCGCCTTTCATGTGGC
TGAATCAAGACTCAACTAGTGATCACGACAGCAGCTTCGAAGCTGCAGAAGGGAAAGCTA
AAGCTGAACAAACGAAGAAAACTACCAACGGTCCACAGAAACCAAGAGTTGAGGAAGAAC
CTGTGGCTGCACAACCACCACCTAGCTCAGCAGCTCTTACAGTAGAAAGTGACAAATCCT
TGGAAGAACTCGAGACTCCGCTTCTGGAAAGCAGCGAGAAGCAGGAAACAGTAGCAGGAG
GAGGAGGGGGAGGGAACGAGGGGGAGATTGTTCCGGTTAGTGTCCAGCCACAGTCGAGGT
CTATTGTGCCAACCAATGAAGAGGTTGATACGAGCTTCAAGGGAAAGAAAATGGGAACAA
AGGAGAGGATGTTTGATTTTAGGAAGAAAGTTGGGGAGAAGTTTGAAGAGAAGAAGCGTC
ATATGGAGGAAAGAAGTAGACAGATTGTTGAAAAGATGAGAGGACCTTGAAGAAGAAGCT
TCTTTTTTCAGGTTTCAGACCAAAAGAACAAGAAAGTCAAATATAGAGATTAGATTAGGA
CATTGTTGTTACTTTTGTATCCGTATATGTTTGGTGAAAAATATCAAAAAGAACTCATTG
CGGTATCTCTCTTTATTCTTATTATTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL80TF U 182
AF RR2BL80JQ C 1
BS 1 181 RR2BL80JQ
BS 182 577 RR2BL80TF
BS 578 687 RR2BL80JQ

RD RR2BL80TF 396 0 0
TGTGGCTGCACAACCACCACCTAGCTCAGCAGCTCTTACAGTAGAAAGTGACAAATCCTT
GGAAGAACTCGAGACTCCGCTTCTGGAAAGCAGCGAGAAGCAGGAAACAGTAGCAGGAGG
AGGAGGGGGAGGGAACGAGGGGGAGATTGTTCCGGTTAGTGTCCAGCCACAGTCGAGGTC
TATTGTGCCAACCAATGAAGAGGTTGATACGAGCTTCAAGGGAAAGAAAATGGGAACAAA
GGAGAGGATGTTTGATTTTAGGAAGAAAGTTGGGGAGAAGTTTGAAGAGAAGAAGCGTCA
TATGGAGGAAAGAAGTAGACAGATTGTTGAAAAGATGAGAGGACCTTGAAGAAGAAGCTT
CTTTTTTCAGGTTTCAGACCAAAAGAACAAGAAAGT

QA 1 396 1 396
DS 

RD RR2BL80JQ 687 0 0
CGTGGATGATAGCTGAAAAGGATGATTGGGTCCAACGCAGTGTCGCGCCTTTCATGTGGC
TGAATCAAGACTCAACTAGTGATCACGACAGCAGCTTCGAAGCTGCAGAAGGGAAAGCTA
AAGCTGAACAAACGAAGAAAACTACCAACGGTCCACAGAAACCAAGAGTTGAGGAAGAAC
CTGTGGCTGCACAACCACCACCTAGCTCAGCAGCTCTTACAGTAGAAAGTGACAAATCCT
TGGAAGAACTCGAGACTCCGCTTCTGGAAAGCAGCGAGAAGCAGGAAACAGTAGCAGGAG
GAGGAGGGGGAGGGAACGAGGGGGAGATTGTTCCGGTTAGTGTCCAGCCACAGTCGAGGT
CTATTGTGCCAACCAATGAAGAGGTTGATACGAGCTTCAAGGGAAAGAAAATGGGAACAA
AGGAGAGGATGTTTGATTTTAGGAAGAAAGTTGGGGAGAAGTTTGAAGAGAAGAAGCGTC
ATATGGAGGAAAGAAGTAGACAGATTGTTGAAAAGATGAGAGGACCTTGAAGAAGAAGCT
TCTTTTT*CAGGTTTCAGACCAAAAGAACAAGAAAGTCAAATATAGAGATTAGATTAGGA
CATTGTTGTTACTTTTGTATCCGTATATGTTTGGTGAAAAATATCAAAAAGAACTCATTG
CGGTATCTCTCTTTATTCTTATTATTA

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL3885Contig1 1264 2 2 U
GGGAACCACATGCTCCGTTCCAGATCCGTTGCTACAACCGCCGTAAGATCCATCAGCTAC
CTCCGTCAGTCTCCCGCTCTTGTTCACTCTCCACTTCTCTCCGGCGCCACCGCCGCCACT
ACCTCCGTCCGCCACTTCAGCTCTCCTGCTCCCGGTCATGCTTTCAACAGCTACCAAATA
AAGCCTCCGACGAACTGGGGAATCCGTATCGTGTCGGAGAAGAAGGCGTGCGTGATCGAG
AGGTTCGGGAAATACGTCAAGACTCTGGACTCAGGGATTCACTTCCTTGTCCCAGGCGTG
GACCGGATCGCGTATGTTCATTCCCTCAAGGAGGAAGCGATTCCGATTGGGAACCAGACT
GCCATTACCAAGGATAACGTCAGCATCCACATCGACGGTGTTCTTTACGTCAAGATTGTG
AATCCACATTTGGCGTCTTATGGCGTTGAGAATCCCATTTACGCTGTTATGCAGTTGGCT
CAGACAACTATGCGTAGTGAGCTTGGGAAGATTACTCTTGATAAGACGTTTGAGGAGCGT
GATACGCTGAACGAGAAGATTGTGGAAGCTATTAATGTTGCTGCAAAAGATTGGGGTCTT
GAGTGCCTTCGTTATGAGATTAGGGATATCATGCCTCCTAATGGAGTGAGGGTTGCTATG
GAAATGCAAGCTGAAGCTGAACGTAGAAAGAGAGCTCAGATTCTTGAGTCTGAAGGAGAG
CGCCAAGCCCATATCAACATCGCTGATGGTAAGAAAAGTTCTGTGATCTTGGAATCAGAA
GCTGCAAAGATAAACCAGGTCAATCGAGCATCAGGTGAGGCAGAAGCAATAATAGCCAGA
GCACAAGCCACAGCCAGGGGGCTGACCATGTTGTCTCAATCCCTCAATGAAACTGGTGGA
ATGGAGGCTGCGAGTATGAGAGTTGCGGAGCAATACATTCAAGCTTTTGGCAACATTGCT
AAGGAGGGTACAACAATGCTGCTTCCGAGTTCTGCTGCAAATCCTGCTAACATGATAGCT
CAAGCTTTGACAATGTACAAAAGCCTCGTCCCCAATGGTGGTATCCAGGAAACTTCAGCA
GTGGAATCCTCTTCTAAATCGGCGAAGACGTGTGGTAAAAGAAAGAACTAGGAAACAATA
ATAACTCTTTTGACATAGGAACAGCTTTTGAGTATGACATGAGAAACAGTTATCTTACCT
TTATTTCTAGTCTGCAACCAGAAAACAGATGTAAACCCTAATTTCTGAAAGGAGATTTTG
CACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2EL02TF U 1
AF RR2EL02JQ C 495
BS 1 665 RR2EL02TF
BS 666 1264 RR2EL02JQ

RD RR2EL02TF 665 0 0
GGGAACCACATGCTCCGTTCCAGATCCGTTGCTACAACCGCCGTAAGATCCATCAGCTAC
CTCCGTCAGTCTCCCGCTCTTGTTCACTCTCCACTTCTCTCCGGCGCCACCGCCGCCACT
ACCTCCGTCCGCCACTTCAGCTCTCCTGCTCCCGGTCATGCTTTCAACAGCTACCAAATA
AAGCCTCCGACGAACTGGGGAATCCGTATCGTGTCGGAGAAGAAGGCGTGCGTGATCGAG
AGGTTCGGGAAATACGTCAAGACTCTGGACTCAGGGATTCACTTCCTTGTCCCAGGCGTG
GACCGGATCGCGTATGTTCATTCCCTCAAGGAGGAAGCGATTCCGATTGGGAACCAGACT
GCCATTACCAAGGATAACGTCAGCATCCACATCGACGGTGTTCTTTACGTCAAGATTGTG
AATCCACATTTGGCGTCTTATGGCGTTGAGAATCCCATTTACGCTGTTATGCAGTTGGCT
CAGACAACTATGCGTAGTGAGCTTGGGAAGATTACTCTTGATAAGACGTTTGAGGAGCGT
GATACGCTGAACGAGAAGATTGTGGAAGCTATTAATGTTGCTGCAAAAGATTGGGGTCTT
GAGTGCCTTCGTTATGAGATTAGGGATATCATGCCTCCTAATGGAGTGAGGGTTGCTATG
GAAAT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2EL02JQ 770 0 0
TAGTGAGCTTGGGAAGATTACTCTTGATAAGACGTT*GAGGAGCGTGATACGCTGAACGA
GAAGATTGTGGAAGCTATTAATGTTGCTGCAAAAGATTGGGGTCTTGAGTGCCTTCGTTA
TGAGATTAGGGATATCATGCCTCCTAATGGAGTGAGGGTTGCTATGGAAATGCAAGCTGA
AGCTGAACGTAGAAAGAGAGCTCAGATTCTTGAGTCTGAAGGAGAGCGCCAAGCCCATAT
CAACATCGCTGATGGTAAGAAAAGTTCTGTGATCTTGGAATCAGAAGCTGCAAAGATAAA
CCAGGTCAATCGAGCATCAGGTGAGGCAGAAGCAATAATAGCCAGAGCACAAGCCACAGC
CAGGGGGCTGACCATGTTGTCTCAATCCCTCAATGAAACTGGTGGAATGGAGGCTGCGAG
TATGAGAGTTGCGGAGCAATACATTCAAGCTTTTGGCAACATTGCTAAGGAGGGTACAAC
AATGCTGCTTCCGAGTTCTGCTGCAAATCCTGCTAACATGATAGCTCAAGCTTTGACAAT
GTACAAAAGCCTCGTCCCCAATGGTGGTATCCAGGAAACTTCAGCAGTGGAATCCTCTTC
TAAATCGGCGAAGACGTGTGGTAAAAGAAAGAACTAGGAAACAATAATAACTCTTTTGAC
ATAGGAACAGCTTTTGAGTATGACATGAGAAACAGTTATCTTACCTTTATTTCTAGTCTG
CAACCAGAAAACAGATGTAAACCCTAATTTCTGAAAGGAGATTTTGCACC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3887Contig1 1087 2 2 U
GCATTTCTCGAGTGATAAGAAGTTTTGTTGTTACGTTGTCTGATTTTACATTTTATAAAA
CTTAACCTTTACTCATTTAAACATTTATATATAAGCCACACTTTCAAACTAGTACTAATA
TTTTAAACACCTTTCTGTAGTAATATTATTTTTGTTATGCATTTTTTTTTTGAAAGAAAC
CACTAGACCACAGAGAAGTTTATTTATTTATTTATATTTATACGTTACAACCATCCATAA
TTCAGATTATGTATCTACTATATAATTAGGTGGCATAGTGTAAATACTGTATGTGTACAG
AAAATACATGTGTAGAATATGCGCTAATGTTGATTCGAAAGCAAGGTTTAGCAGTTATTA
AACTTAAGTTTTACAATGTGAAATTACTTTTTTCAGTGAAGAAGTTGATATTCGAAGTAG
AAAACTGACTACACATAGCTCATTGCTTTCTTATGAATCATATTCCATGTCCAATTCCTT
TTGATTTAATGTTTCTACAATGAATATTTGATAACTGAAAAAAATGTTTGACCAAAAAAA
AAAATGTTTGACCAAAAGATAACTGAAAAATATATGAAAAACATAACCTGTATATATGAG
CTATACATAATTTAAAAAGTCACCTGGATTTATTCGTAAATAGTGTGGTAGCCGACGATT
AATTTTCTATTATCATACTGATGATGCTTGGTGTCGTAAAAGAAACTTGGGTACAAAGGG
AGGTTCTTCTGATTTATGGCATAGGGCCACTGCTACACTAAATTTCCAATTTAATTTCTT
GTCTGGTGTAGATGATAATGTCGATAATCAAGTTAGCCTCGGGGCCACGAAACCAGAACT
ACATATATAAGAATGGTCCAATCTTGAACGTATTCACCTTTCAACTGGTAATATGTAAAA
TGAAGACATGCTAGCGAAACTGAACGATCAAAACAGCACAAGGCTTTGTTTTGTTTTGGT
TTCATGGTTTGTAATTAACCATTGGAGAGAGTTACCATGCACAGAGAGCAATAAACACAA
AACAAGTGATTGGAGTACCTTTTTACTACAAAAAAAGGAGTACCTTTCTACTAGACAACA
TTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO12TF U 1
AF RR2AO12JQ C 338
BS 1 713 RR2AO12TF
BS 714 1087 RR2AO12JQ

RD RR2AO12TF 713 0 0
GCATTTCTCGAGTGATAAGAAGTTTTGTTGTTACGTTGTCTGATTTTACATTTTATAAAA
CTTAACCTTTACTCATTTAAACATTTATATATAAGCCACACTTTCAAACTAGTACTAATA
TTTTAAACACCTTTCTGTAGTAATATTATTTTTGTTATGCATTTTTTTTTTGAAAGAAAC
CACTAGACCACAGAGAAGTTTATTTATTTATTTATATTTATACGTTACAACCATCCATAA
TTCAGATTATGTATCTACTATATAATTAGGTGGCATAGTGTAAATACTGTATGTGTACAG
AAAATACATGTGTAGAATATGCGCTAATGTTGATTCGAAAGCAAGGTTTAGCAGTTATTA
AACTTAAGTTTTACAATGTGAAATTACTTTTTTCAGTGAAGAAGTTGATATTCGAAGTAG
AAAACTGACTACACATAGCTCATTGCTTTCTTATGAATCATATTCCATGTCCAATTCCTT
TTGATTTAATGTTTCTACAATGAATATTTGATAACTGAAAAAAATGTTTGACCAAAAAAA
AAAATGTTTGACCAAAAGATAACTGAAAAATATATGAAAAACATAACCTGTATATATGAG
CTATACATAATTTAAAAAGTCACCTGGATTTATTCGTAAATAGTGTGGTAGCCGACGATT
AATTTTCTATTATCATACTGATGATGCTTGGTGTCGTAAAAGAAACTTGGGTA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2AO12JQ 750 0 0
AAAGCAAGGTTTAGCAGTTATTAAACTTAAGTTTTACAATGTGAAATTACTTTTTTCAGT
GAAGAAGTTGATATTCGAAGTAGAAAACTGACTACACATAGCTCATTGCTTTCTTATGAA
TCATATTCCATGTCCAATTCCTTTTGATTTAATGTTTCTACAATGAATATTTGATAACTG
AAAAAAATGTTTGACCAAAAAAAAAAATGTTTGACCAAAAGATAACTGAAAAATATATGA
AAAACATAACCTGTATATATGAGCTATACATAATTTAAAAAGTCACCTGGATTTATTCGT
AAATAGTGTGGTAGCCGACGATTAATTTTCTATTATCATACTGATGATGCTTGGTGTCGT
AAAAGAAACTTGGGTACAAAGGGAGGTTCTTCTGATTTATGGCATAGGGCCACTGCTACA
CTAAATTTCCAATTTAATTTCTTGTCTGGTGTAGATGATAATGTCGATAATCAAGTTAGC
CTCGGGGCCACGAAACCAGAACTACATATATAAGAATGGTCCAATCTTGAACGTATTCAC
CTTTCAACTGGTAATATGTAAAATGAAGACATGCTAGCGAAACTGAACGATCAAAACAGC
ACAAGGCTTTGTTTTGTTTTGGTTTCATGGTTTGTAATTAACCATTGGAGAGAGTTACCA
TGCACAGAGAGCAATAAACACAAAACAAGTGATTGGAGTACCTTTTTACTACAAAAAAAG
GAGTACCTTTCTACTAGACAACATTGTTCC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL3888Contig1 930 2 2 U
GGGATTGTTTATCCTCTCTCCTCAATTTCTCTCTCGCTTCTATCTAAAAGTTTACATCTT
TGATCACCGTTTCACCGGCCGACGGGTGGGCTTCCATAGCCACCGTCGGTCCGGTCTTGA
TTTTCGTTTCTCCGTTTGTATATCTTTCGGCTCGGTTCAAAGTTTCCTGTGTAGATTCTA
GATCTAGATTATCAGATCGGTTTTGTTGAAGATAGTTTGACGGTGGTGGCTTCTCGTTGT
TTCTGGGATGTTCGCTTGTTCCGTTCTTCTCTTATCTCTTGGCTTTCTCTCGTGGTCTTC
AGTATCCTGTGTCTTACTCTATAGGATCTGATTTCTGTTGTGAGATTTGCCTCTTCGATC
TGTTTGCATGTTGATGGATGCCTCTTCTGGTGGATTTACTAAGGCTTGTAAGGTTGTGCT
TATCCTTGATTTCGTTTGCGACGGGTCAGATTCAGTTTGCAATCTTCACGGATCCGGCTC
GTCTTTAAGGATATGGGGCTTCGGCCTTTCTGCATCTTGGCGTGGAGTTTGGAGTGAAAA
AAAATGGTCCTCCTCCTCCTGGGATTATTGTACCTTTGCTTGCTCATGGCTCGTCAGATG
GTTTCGGAGCAGTATGTTGAGAGGCAGGTCTCCCTTAATAAATCTCGTCGATGGATGTGC
GCTTACTTCTTCCTTCTTGCCTTAGTGGTCCATTTGCTTGGGTGTTTTACTTTTATGATC
TAGATTTATTTTCAGTTTGTACTTTGAACTCTGTTACTTATGTTCTGTTTTAGCTTCCAG
AGATTTCAGTTAAATCTGCTGGCCTTTGTTTCCAGAGGATGATCTTGTATCCTACTGGCT
TAGTTTCTAGGGGTATTGTTTACTCGCTAGCTTTGGTGTCTTTCCTTGTGTATTACTCTG
TTTCTTTATCAATGAAAATAATCAGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FE62TF U 1
AF RR2FE62JQ C 181
BS 1 624 RR2FE62TF
BS 625 930 RR2FE62JQ

RD RR2FE62TF 624 0 0
GGGATTGTTTATCCTCTCTCCTCAATTTCTCTCTCGCTTCTATCTAAAAGTTTACATCTT
TGATCACCGTTTCACCGGCCGACGGGTGGGCTTCCATAGCCACCGTCGGTCCGGTCTTGA
TTTTCGTTTCTCCGTTTGTATATCTTTCGGCTCGGTTCAAAGTTTCCTGTGTAGATTCTA
GATCTAGATTATCAGATCGGTTTTGTTGAAGATAGTTTGACGGTGGTGGCTTCTCGTTGT
TTCTGGGATGTTCGCTTGTTCCGTTCTTCTCTTATCTCTTGGCTTTCTCTCGTGGTCTTC
AGTATCCTGTGTCTTACTCTATAGGATCTGATTTCTGTTGTGAGATTTGCCTCTTCGATC
TGTTTGCATGTTGATGGATGCCTCTTCTGGTGGATTTACTAAGGCTTGTAAGGTTGTGCT
TATCCTTGATTTCGTTTGCGACGGGTCAGATTCAGTTTGCAATCTTCACGGATCCGGCTC
GTCTTTAAGGATATGGGGCTTCGGCCTTTCTGCATCTTGGCGTGGAGTTTGGAGTGAAAA
AAAATGGTCCTCCTCCTCCTGGGATTATTGTACCTTTGCTTGCTCATGGCTCGTCAGATG
GTTTCGGAGCAGTATGTTGAGAGG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2FE62JQ 750 0 0
GATCTAGATTATCAGATCGGTTTTGTTGAAGATAGTTTGACGGTGGTGGCTTCTCGTTGT
TTCTGGGATGTTCGCTTGTTCCGTTCTTCTCTTATCTCTTGGCTTTCTCTCGTGGTCTTC
AGTATCCTGTGTCTTACTCTATAGGATCTGATTTCTGTTGTGAGATTTGCCTCTTCGATC
TGTTTGCATGTTGATGGATGCCTCTTCTGGTGGATTTACTAAGGCTTGTAAGGTTGTGCT
TATCCTTGATTTCGTTTGCGACGGGTCAGATTCAGTTTGCAATCTTCACGGATCCGGCTC
GTCTTTAAGGATATGGGGCTTCGGCCTTTCTGCATCTTGGCGTGGAGTTTGGAGTGAAAA
AAAATGGTCCTCCTCCTCCTGGGATTATTGTACCTTTGCTTGCTCATGGCTCGTCAGATG
GTTTCGGAGCAGTATGTTGAGAGGCAGGTCTCCCTTAATAAATCTCGTCGATGGATGTGC
GCTTACTTCTTCCTTCTTGCCTTAGTGGTCCATTTGCTTGGGTGTTTTACTTTTATGATC
TAGATTTATTTTCAGTTTGTACTTTGAACTCTGTTACTTATGTTCTGTTTTAGCTTCCAG
AGATTTCAGTTAAATCTGCTGGCCTTTGTTTCCAGAGGATGATCTTGTATCCTACTGGCT
TAGTTTCTAGGGGTATTGTTTACTCGCTAGCTTTGGTGTCTTTCCTTGTGTATTACTCTG
TTTCTTTATCAATGAAAATAATCAGTGTTT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL3889Contig1 648 2 1 U
GGGTGTCGAATCGAATTGGGCGTTAGGGTTTCTTCATCAATCTCTTGGGAGACGACAAAG
ATGGTGTGCGATAAGTGTGAGAAGAAGTTATCAAAGGTGATAGTTCCAGATAAGTGGAAG
GACGGTGCTCGTAATGTTACCGAAGGCGGTGGCCGCAAGATCAACGAGAACAAACTTCTC
TCCAAGAAGAACAGATGGACACCTTACGGTACTGCTACCACCAAGTGCACGATCTGCAAG
CAGCAAGTGCATCAAGATGGTAAATATTGTCACACTTGTGCCTATAGCAAAGGAGTGTGT
GCCATGTGCGGGAAGCAAGTGTTGGACACGAAGATGTATAAGCAGAGCAATGTTTGACCA
AATCTACTAGTTTTTCACCCTGCTAGCGCAACCAGGGGAGACTTATCTGGTGATCTTTGA
ACAATCTCTGTCATGTGTTGATCTCTGTACCTCTCCCTTTTGTTTCTAGTAATAACAAAC
AGAAGCTTCCCTCTTTTATGTGATCATTATAGTGTTCTAATCTTTCGTATTATATCATGT
CGTTTCTCTGTGTTCATTGGGTGAACATGCTCATAATCAAACGTGAGCCAACAACTTTGT
ATACGCTAAACTGAGATTTGATTCGTGGTTAATACCATCTCTTCTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EE16TF U 1
AF RR2EE16JQ C 205
BS 1 648 RR2EE16TF

RD RR2EE16TF 648 0 0
GGGTGTCGAATCGAATTGGGCGTTAGGGTTTCTTCATCAATCTCTTGGGAGACGACAAAG
ATGGTGTGCGATAAGTGTGAGAAGAAGTTATCAAAGGTGATAGTTCCAGATAAGTGGAAG
GACGGTGCTCGTAATGTTACCGAAGGCGGTGGCCGCAAGATCAACGAGAACAAACTTCTC
TCCAAGAAGAACAGATGGACACCTTACGGTACTGCTACCACCAAGTGCACGATCTGCAAG
CAGCAAGTGCATCAAGATGGTAAATATTGTCACACTTGTGCCTATAGCAAAGGAGTGTGT
GCCATGTGCGGGAAGCAAGTGTTGGACACGAAGATGTATAAGCAGAGCAATGTTTGACCA
AATCTACTAGTTTTTCACCCTGCTAGCGCAACCAGGGGAGACTTATCTGGTGATCTTTGA
ACAATCTCTGTCATGTGTTGATCTCTGTACCTCTCCCTTTTGTTTCTAGTAATAACAAAC
AGAAGCTTCCCTCTTTTATGTGATCATTATAGTGTTCTAATCTTTCGTATTATATCATGT
CGTTTCTCTGTGTTCATTGGGTGAACATGCTCATAATCAAACGTGAGCCAACAACTTTGT
ATACGCTAAACTGAGATTTGATTCGTGGTTAATACCATCTCTTCTTGT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2EE16JQ 444 0 0
TACGGTACTGCTACCACCAAGTGCACGATCTGCAAGCAGCAAGTGCATCAAGATGGTAAA
TATTGTCACACTTGTGCCTATAGCAAAGGAGTGTGTGCCATGTGCGGGAAGCAAGTGTTG
GACACGAAGATGTATAAGCAGAGCAATGTTTGACCAAATCTACTAGTTTTTCACCCTGCT
AGCGCAACCAGGGGAGACTTATCTGGTGATCTTTGAACAATCTCTGTCATGTGTTGATCT
CTGTACCTCTCCCTTTTGTTTCTAGTAATAACAAACAGAAGCTTCCCTCTTTTATGTGAT
CATTATAGTGTTCTAATCTTTCGTATTATATCATGTCGTTTCTCTGTGTTCATTGGGTGA
ACATGCTCATAATCAAACGTGAGCCAACAACTTTGTATACGCTAAACTGAGATTTGATTC
GTGGTTAATACCATCTCTTCTTGT

QA 1 444 1 444
DS 



AS 1 2

CO CL3890Contig1 489 2 2 U
ACCTAAAGAAAAAAATTGACATTGTAAGAAGATAATGAAAGGTTTGGTTCAACAAAAGGC
TTACAAATGAATTGAACCGAGATAAAAGAACAGGGAGTGCAATGAATTAAAAACAAACAT
GTAACCAACAAGAATCATAAGTAGACAAAAAAAAAACACATATATGGTTGTTCATTGGTT
GAGAGAAGAAGGGGGTCAGTAGTCTTCACCTTCATCATCTTCATCGTCTCCACCTTCAGA
ACCCACCTCTTCATAATCTTTCTCCAGTGCGGCCAAGTCTTCACGTGCCTCCGAGAATTC
ACCTTCCTCCATTCCCTCACCCACGTACCAGTGCACAAACGCCCTCTTCGCGTACATGAG
ATCAAACTTGTGGTCGATCCGTGAAAACACCTCCGCAACAGCTGTGTTGTTGCTTATCAT
GCACACCGCTCTCTGAACCTTAGCGAGGTCACCTCCAGGGACAACCGTTGGAGGCTGGTA
GTTGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GD50TF C 1
AF RR2GD50JQ U 42
BS 1 41 RR2GD50TF
BS 42 489 RR2GD50JQ

RD RR2GD50TF 489 0 0
ACCTAAAGAAAAAAATTGACATTGTAAGAAGATAATGAAAGGTTTGGTTCAACAAAAGGC
TTACAAATGAATTGAACCGAGATAAAAGAACAGGGAGTGCAATGAATTAAAAACAAACAT
GTAACCAACAAGAATCATAAGTAGACAAAAAAAAAACACATATATGGTTGTTCATTGGTT
GAGAGAAGAAGGTGGTCAGTAGTCTTCACCTTCATCATCTTCATCGTCTCCACCTTCAGA
ACCCACCTCTTCATAATCTTTCTCCAGTGCGGCCAAGTCTTCACGTGCCTCCGAGAATTC
ACCTTCCTCCATTCCCTCACCCACGTACCAGTGCACAAACGCCCTCTTCGCGTACATGAG
ATCAAACTTGTGGTCGATCCGTGAAAACACCTCCGCAACAGCTGTGTTGTTGCTTATCAT
GCACACCGCTCTCTGAACCTTAGCGAGGTCACCTCCAGGGACAACCGTTGGAGGCTGGTA
GTTGATTCC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2GD50JQ 448 0 0
GTTTGGTTCAACAAAAGGCTTACAAATGAATTGAACCGAGATAAAAGAACAGGGAGTGCA
ATGAATTAAAAACAAACATGTAACCAACAAGAATCATAAGTAGACAAAAAAAAAACACAT
ATATGGTTGTTCATTGGTTGAGAGAAGAAGGGGGTCAGTAGTCTTCACCTTCATCATCTT
CATCGTCTCCACCTTCAGAACCCACCTCTTCATAATCTTTCTCCAGTGCGGCCAAGTCTT
CACGTGCCTCCGAGAATTCACCTTCCTCCATTCCCTCACCCACGTACCAGTGCACAAACG
CCCTCTTCGCGTACATGAGATCAAACTTGTGGTCGATCCGTGAAAACACCTCCGCAACAG
CTGTGTTGTTGCTTATCATGCACACCGCTCTCTGAACCTTAGCGAGGTCACCTCCAGGGA
CAACCGTTGGAGGCTGGTAGTTGATTCC

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 2

CO CL3891Contig1 667 2 14 U
GGGTAACCGGAGAAGACGAAGGTGGTAGATAAGATCAAGTCATGGACCGACGAAGGCAAA
ACGACCTTCTCCTTCGAGTTCTTCCCACCGAGGACGGAAGATGGAGTCGACAACCTCTTC
GAGCGTATGGATCGTCTCGTCGCATACGGTCCAGCCTTCTGCGACATCACGTGGGGAGCT
GGTGGAACAACGGCGGATCTCACGCTCGACATCGTCTCGAGGATGCAAAACGTTGTCCGC
GTCGAGAGCATGATGCATCTCACGTGCACTAACATGCCTGTTGAGAAGATCGATCATGCG
CTCGAGACGATAAGGTCTAATGGGATTCAGAACGTTCTTGCACTTAGAGGAGATCCTCCT
CACGGTGAGAACAAGTTTGTTCAGGTTGAAGGAGGGTTTGGCTGCGCTTTGGATCTTGTG
AATCATATTAGGAGCAAGTATGGTGATTACTTTGGTGTCGCCGTTGCTGGTTATCCTGAG
GCTCATCCTGATGTCATTGGTGAAAATGGCCTAGCGTCCAAGGAAGCTTATGAGAGTGAT
CTTCAGTACCTTAAGAAAAAGGTTGTTGCTGGAGCTGATCTGATTGTTACTCAGCTTTTC
TTTGACACTGATATACTCTTAAAGTTTGTGAATGACTGTCGGCAAATTGGTATCAAGTGT
CCCATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G912TF U 1
AF RR2AW71TFB U 68
BS 1 98 RR2G912TF
BS 99 99 RR2AW71TFB
BS 100 209 RR2G912TF
BS 210 210 RR2AW71TFB
BS 211 212 RR2G912TF
BS 213 213 RR2AW71TFB
BS 214 227 RR2G912TF
BS 228 228 RR2AW71TFB
BS 229 237 RR2G912TF
BS 238 238 RR2AW71TFB
BS 239 350 RR2G912TF
BS 351 351 RR2AW71TFB
BS 352 551 RR2G912TF
BS 552 667 RR2AW71TFB

RD RR2G912TF 551 0 0
GGGTAACCGGAGAAGACGAAGGTGGTAGATAAGATCAAGTCATGGACCGACGAAGGCAAA
ACGACCTTCTCCTTCGAGTTCTTCCCACCGAGGACGGAGGATGGAGTCGACAACCTCTTC
GAGCGTATGGATCGTCTCGTCGCATACGGTCCAGCCTTCTGCGACATCACGTGGGGAGCT
GGTGGAACAACGGCGGATCTCACGCTCGATATTGTCTCGAGGATGCAGAACGTTGTCTGC
GTCGAGAGCATGATGCATCTCACGTGCACTAACATGCCTGTTGAGAAGATCGATCATGCG
CTCGAGACGATAAGGTCTAATGGGATTCAGAACGTTCTTGCACTTAGAGGTGATCCTCCT
CACGGTGAGAACAAGTTTGTTCAGGTTGAAGGAGGGTTTGGCTGCGCTTTGGATCTTGTG
AATCATATTAGGAGCAAGTATGGTGATTACTTTGGTGTCGCCGTTGCTGGTTATCCTGAG
GCTCATCCTGATGTCATTGGTGAAAATGGCCTAGCGTCCAAGGAAGCTTATGAGAGTGAT
CTTCAGTACCT

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2AW71TFB 600 0 0
TCTCCTTCGAGTTCTTCCCACCGAGGACGGAAGATGGAGTCGACAACCTCTTCGAGCGTA
TGGATCGTCTCGTCGCATACGGTCCAGCCTTCTGCGACATCACGTGGGGAGCTGGTGGAA
CAACGGCGGATCTCACGCTCGACATCGTCTCGAGGATGCAAAACGTTGTCCGCGTCGAGA
GCATGATGCATCTCACGTGCACTAACATGCCTGTTGAGAAGATCGATCATGCGCTCGAGA
CGATACGGTCTAATGGGATTCAGAACGTTCTTGCGCTTAGAGGAGATCCTCCTCATGGTG
AGAACAAGTTTGTTCAGGTTGAAGGAGGGTTTGGCTGCGCTTTGGATCTTGTGAATCATA
TTAGGAGCAAGTATGGTGATTACTTTGGTGTCGCCGTTGCTGGTTATCCTGAGGCTCATC
CTGATGTCATTGGTGAAAATGGCCTAGCGTCCAAGGAAGCTTATGAGAGTGATCTTGAGT
ACCTTAAGAAAAAGGTTGTTGCTGGAGCTGATCTGATTGTTACTCAGCTTTTCTTTGACA
CTGATATACTCTTAAAGTTTGTGAATGACTGTCGGCAAATTGGTATCAAGTGTCCCATTG

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

CO CL3892Contig1 713 2 3 U
CCATTATTTAGTGTATTGATACATAGTGAACAATTATTCTAGAGATGTTCTATTTTACTA
TGTTGAAATAACTTTTGATTAAAAAAAAGAATAAGAGAAAACAAACAACCAACTTGGCAA
TTTGCGATTAATGTGGCATGTTTGAGTATAAGAGAGCAAAAAAGAGTTGAACTTCAGGCA
AATCTCGGATGCGTTGCAAAAACCGGTTCTTGTCCGGTACAGCTGAAATCTCCGGCACCG
TCTTCTCAATCTGTGGTAAAAGCTTCCCCAATTGTATCCCTGTGGCCATACCGGGCTGTG
TTTCCATCTCCTCTGCTAACCCTACGGTACAAAACTTGAGTGCGATCTCTGCTACATTTG
TAAACTCAGTGCTTGGGAGTACTTCACGTGTCTCGGTAACGAGTAAATGAAACTTGGTGA
CAGTTGCATCTGAAAAGGAAACATCAGTGGTGGTGTCATGAGCCATCATTAAATAATCTA
TCCAGTGGTGTGGACTTCCAGTGCTCATAAACACATCAAGAATCCGGATCACAGTTTCTT
CAAGAGTTCTTGTGGTTAGCACGTCTTTTAACTGCTTTCTTTTAAGAACTTCTTTCACAG
CACTCTTCATATGGAAAATCAAACTCGGCATGCTATTGGTTGCAAGATAATCAGCACTTG
TCAAAAACTTTTGTTCATCCTCTCTATCTATGAGATCTAACTCTTCAAGTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI02JQ U 148
AF RR2CI02TF C 1
BS 1 154 RR2CI02TF
BS 155 441 RR2CI02JQ
BS 442 713 RR2CI02TF

RD RR2CI02JQ 294 0 0
ATAAAAA
AGCAAAAAAGAGTTGAACTTCAGGCAAATCTCGGATGCGTTGCAAAAACCGGTTCTTGTC
CGGTACAGCTGAAATCTCCGGCACCGTCTTCTCAATCTGTGGTAAAAGCTTCCCCAATTG
TATCCCTGTGGCCATACCGGGCTGTGTTTCCATCTCCTCTGCTAACCCTACGGTACAAAA
CTTGAGTGCGATCTCTGCTACATTTGTAAACTCAGTGCTTGGGAGTACTTCACGTGTCTC
GGTAACGAGTAAATGAAACTTGGTGACAGTTGCATCTGAAAAGGAAA

QA 8 294 8 294
DS 

RD RR2CI02TF 713 0 0
CCATTATTTAGTGTATTGATACATAGTGAACAATTATTCTAGAGATGTTCTATTTTACTA
TGTTGAAATAACTTTTGATTAAAAAAAAGAATAAGAGAAAACAAACAACCAACTTGGCAA
TTTGCGATTAATGTGGCATGTTTGAGTATAAGAGAGCAAAAAAGAGTTGAACTTCAGGCA
AATCTCGGATGCGTTGCAAGAACCGGTTCTTGTCCGGTACAGCTGAAATCTCCGGCACCG
TCTTCTCAATCTGTGGTAAGAGCTTCGCCAATTGTATCCCTGTGGCCATACCGGGCTGTG
TTTCCATCTCCTCTGCTAACGCTACGGTACAAGACTTGAGTGCGATCTCTGCTACATTTG
TAAACTCAGTGCTTGTGAGTACTTCACGTGTCTCGGTAACGAGTAGATGAAACTTGGTGA
CAGTTGCATCTGAAGAGGAAACATCAGTGGTGGTGTCATGAGCCATCATTAAATAATCTA
TCCAGTGGTGTGGACTTCCAGTGCTCATAAACACATCAAGAATCCGGATCACAGTTTCTT
CAAGAGTTCTTGTGGTTAGCACGTCTTTTAACTGCTTTCTTTTAAGAACTTCTTTCACAG
CACTCTTCATATGGAAAATCAAACTCGGCATGCTATTGGTTGCAAGATAATCAGCACTTG
TCAAAAACTTTTGTTCATCCTCTCTATCTATGAGATCTAACTCTTCAAGTAAC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL3893Contig1 426 2 1 U
GGGCTGCTAGTCGTCCATCGTCTCTCCACCAACTCTCATCTCCTTTTTCCCCATTTCGCG
TCAAACCCTAGCTAGCTCTACAAACCAGTCATGTCGTCCAAGCAAGGAGGAAAGGCGAAA
CCTTTGAAGCAGCCAAAGGCTGATAAGAAGGAATACGATGAGCATGACATGGCTAACCTG
CAGAAGAAGAAAGACGAGGAAAAGGCACTTAAGGAACTAAGAGCTAAGGCGTCACAGAAG
GGATCCTTTGGAGGCTCTGGCCTTAAGAAGAGCGGCAAGAAATGATCCGTTTTATCCATG
TAGCCTGAGTGCAAATTTATCAACTTAATAAATGATAACAGATAATTGTGTGTTGTGTAA
ACTTGTATCATGTTCGCTTCCGCCACTTTTTCATGATAAAAGATAAATGGTTTCCTTACC
GCTGGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2AR26JQ C 1
AF RR2AR26TF U 1
BS 1 426 RR2AR26TF

RD RR2AR26JQ 426 0 0
GGGCTGCTAGTCGTCCATCGTCTCTCCACCAACTCTCATCTCCTTTTTCCCCATTTCGCG
TCAAACCCTAGCTAGCTCTACAAACCAGTCATGTCGTCCAAGCAAGGAGGAAAGGCGAAA
CCTTTGAAGCAGCCAAAGGCTGATAAGAAGGAATACGATGAGCATGACATGGCTAACCTG
CAGAAGAAGAAAGACGAGGAAAAGGCACTTAAGGAACTAAGAGCTAAGGCGTCACAGAAG
GGATCCTTTGGAGGCTCTGGCCTTAAGAAGAGCGGCAAGAAATGATCCGTTTTATCCATG
TAGCCTGAGTGCAAATTTATCAACTTAATAAATGATAACAGATAATTGTGTGTTGTGTAA
ACTTGTATCATGTTCGCTTCCGCCACTTTTTCATGATAAAAGATAAATGGTTTCCTTACC
GCTGGT

QA 1 426 1 426
DS 

RD RR2AR26TF 426 0 0
GGGCTGCTAGTCGTCCATCGTCTCTCCACCAACTCTCATCTCCTTTTTCCCCATTTCGCG
TCAAACCCTAGCTAGCTCTACAAACCAGTCATGTCGTCCAAGCAAGGAGGAAAGGCGAAA
CCTTTGAAGCAGCCAAAGGCTGATAAGAAGGAATACGATGAGCATGACATGGCTAACCTG
CAGAAGAAGAAAGACGAGGAAAAGGCACTTAAGGAACTAAGAGCTAAGGCGTCACAGAAG
GGATCCTTTGGAGGCTCTGGCCTTAAGAAGAGCGGCAAGAAATGATCCGTTTTATCCATG
TAGCCTGAGTGCAAATTTATCAACTTAATAAATGATAACAGATAATTGTGTGTTGTGTAA
ACTTGTATCATGTTCGCTTCCGCCACTTTTTCATGATAAAAGATAAATGGTTTCCTTACC
GCTGGT

QA 1 426 1 426
DS 



AS 1 2

CO CL3894Contig1 426 2 1 U
ATATATACTCGATAATAACAAGATTGTGTAGTACTTAGTCAGATAAAGAAATGGCGAAGT
TCACAACTTTCTTCTTCATCGCTGCCCTCCTCCTCTGCTCCACGCTAACATACGCATCAG
CCCGGCCCATTTCAACCTCCGTTGATGCAGAAGAAATCTCCGTTGAGAAACTAGAACAAG
AAGAGGTAAACTGTGAAGGTGTTGGAGAAGAAGAGTGTGTCTTGATACACAGAACTTTAG
TTGCTCACACTGATTACATCTATACCCAAAACCACAATCCTTAAATGATTAGTTACTTTA
TAATCCTTTGAGCAATTCCCCGTAATGATATTGTGTCATTGTAATTTCTTTATTACTAGT
CAGACTTCATCATATTTGTAATCATCGCTGCCACTTAATAATATTAATATACTATGGGTT
TTGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2FD88JQ C 1
AF RR2FD88TF U 1
BS 1 426 RR2FD88TF

RD RR2FD88JQ 426 0 0
ATATATACTCGATAATAACAAGATTGTGTAGTACTTAGTCAGATAAAGAAATGGCGAAGT
TCACAACTTTCTTCTTCATCGCTGCCCTCCTCCTCTGCTCCACGCTAACATACGCATCAG
CCCGGCCCATTTCAACCTCCGTTGATGCAGAAGAAATCTCCGTTGAGAAACTAGAACAAG
AAGAGGTAAACTGTGAAGGTGTTGGAGAAGAAGAGTGTGTCTTGATACACAGAACTTTAG
TTGCTCACACTGATTACATCTATACCCAAAACCACAATCCTTAAATGATTAGTTACTTTA
TAATCCTTTGAGCAATTCCCCGTAATGATATTGTGTCATTGTAATTTCTTTATTACTAGT
CAGACTTCATCATATTTGTAATCATCGCTGCCACTTAATAATATTAATATACTATGGGTT
TTGATT

QA 1 426 1 426
DS 

RD RR2FD88TF 426 0 0
ATATATACTCGATAATAACAAGATTGTGTAGTACTTAGTCAGATAAAGAAATGGCGAAGT
TCACAACTTTCTTCTTCATCGCTGCCCTCCTCCTCTGCTCCACGCTAACATACGCATCAG
CCCGGCCCATTTCAACCTCCGTTGATGCAGAAGAAATCTCCGTTGAGAAACTAGAACAAG
AAGAGGTAAACTGTGAAGGTGTTGGAGAAGAAGAGTGTGTCTTGATACACAGAACTTTAG
TTGCTCACACTGATTACATCTATACCCAAAACCACAATCCTTAAATGATTAGTTACTTTA
TAATCCTTTGAGCAATTCCCCGTAATGATATTGTGTCATTGTAATTTCTTTATTACTAGT
CAGACTTCATCATATTTGTAATCATCGCTGCCACTTAATAATATTAATATACTATGGGTT
TTGATT

QA 1 426 1 426
DS 



AS 1 2

CO CL3895Contig1 1288 2 4 U
GGACGGTAAAACAGATAGAAATGGATCTCTGGATGGTTCACCCAGAACCAAAGATACGCG
GAGCGAAAATGGCCATGATGATGGTGAATCTACTGCTTCTGCTGGAAAAACTGTAAAAGA
ACCTAGTTATGACTCTCACGATGAGACCGATTCAGTTTCAAGCCTCAACCCTGACAACGG
AAAGGACAAGAAGCATGATACTGATTTTGGATTCGGGTTCGGATTCGATGACTTCAGCAT
TAAACCTATAAAAACGGGTTCCACCCTATCAAATGACTTCCTCCCTCCAAAGCTATCTAT
ATTTTCTGATTCTGTCCCAAGTCCCCCGGCAAATGCCAACGACGGTTTCACTGCAAAACC
TTCCTTGTTTGCTGATTCCGTCCCCAGCACCCCAGCAACAACCACTGCCTCTTACCCAGG
CAATAAATCATATTTCGACGAGTCTGTTCCAAGCACTCCTGCTTACGCAGGTACATCATA
CTTCGATGAGTCTGTTCCAAGCACTCCTGCGTATCCTGGAACCTTGTTTCCCGAGAAGAA
ATCATATTTCGACGACTCTGTACCAAGCACTCCTGCTTATCCTGGAAACTTGTTTCCCGA
GAAGAAATCCTTCTTCGACGACTCTGTCCCAAGCACTCCTGCTTATAGCACGTCTGATTT
TGGTGGGAAGCCGTTTGCATCAGAGACTCCACGTTCGGACAACTTGTTCCCAGGAAGAAG
TCCCTTCATGTTCGATTCTGTCCCAAGCACACCTGCTGCACACGATGACTACTCTTCCAA
CAGCTTCTCCCGCTTCGATTCATTCAACAGCAATATCAGCAACAACGACGCTTTCTCTCT
ATCCCGCTCAGACTCGATGCGCAGCACAAGCGAGCCAGACCCATTCGCATCAAGGTTTGA
TTCTTTCAACTATCAGAGATACGATTCCTTCAATGCACAAAGCTATGACCACAACAACAA
CGCATCCGAGACACCTAAAGCCTCGTTGACGAGGTTTGACTCGATTGGAAGCACGAGAGA
CTCTGATTACAGTCAGGGGTTTGGGTTCGATGACCATGACCCGTTCGGTTCTACGGGACC
ATTCAAAACAACGACAAATACAGCTGAGACACCTCGGAGCTCTGATCACTGGAATGCCTT
CTAGCCCCCATGCCCACGTTTGATGCGAGTATGATCACATATCATATAGTTTGCTATTTT
TCTCACAGTCGGAAGAGTTTTATGTACCTTGTTTGGTTTTCTCTCTGTTTGCTTATTTTT
GTTGTTGATATATAATAGTTATTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL21TF U 1
AF RR2CL21JQ C 623
BS 1 709 RR2CL21TF
BS 710 710 RR2CL21JQ
BS 711 717 RR2CL21TF
BS 718 1288 RR2CL21JQ

RD RR2CL21TF 717 0 0
GGACGGTAAAACAGATAGAAATGGATCTCTGGATGGTTCACCCAGAACCAAAGATACGCG
GAGCGAAAATGGCCATGATGATGGTGAATCTACTGCTTCTGCTGGAAAAACTGTAAAAGA
ACCTAGTTATGACTCTCACGATGAGACCGATTCAGTTTCAAGCCTCAACCCTGACAACGG
AAAGGACAAGAAGCATGATACTGATTTTGGATTCGGGTTCGGATTCGATGACTTCAGCAT
TAAACCTATAAAAACGGGTTCCACCCTATCAAATGACTTCCTCCCTCCAAAGCTATCTAT
ATTTTCTGATTCTGTCCCAAGTCCCCCGGCAAATGCCAACGACGGTTTCACTGCAAAACC
TTCCTTGTTTGCTGATTCCGTCCCCAGCACCCCAGCAACAACCACTGCCTCTTACCCAGG
CAATAAATCATATTTCGACGAGTCTGTTCCAAGCACTCCTGCTTACGCAGGTACATCATA
CTTCGATGAGTCTGTTCCAAGCACTCCTGCGTATCCTGGAACCTTGTTTCCCGAGAAGAA
ATCATATTTCGACGACTCTGTACCAAGCACTCCTGCTTATCCTGGAAACTTGTTTCCCGA
GAAGAAATCCTTCTTCGACGACTCTGTCCCAAGCACTCCTGCTTATAGCACGTCTGATTT
TGGTGGGAAGCCGTTTGCATCAGAGACTCCACGTTCGGACAACTTGTTCTCAGGAAG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2CL21JQ 666 0 0
TCTGTCCCAAGCACTCCTGCTTATAGCACGTCTGATTTTGGTGGGAAGCCGTTTGCATCA
GAGACTCCACGTTCGGACAACTTGTTCCCAGGAAGAAGTCCCTTCATGTTCGATTCTGTC
CCAAGCACACCTGCTGCACACGATGACTACTCTTCCAACAGCTTCTCCCGCTTCGATTCA
TTCAACAGCAATATCAGCAACAACGACGCTTTCTCTCTATCCCGCTCAGACTCGATGCGC
AGCACAAGCGAGCCAGACCCATTCGCATCAAGGTTTGATTCTTTCAACTATCAGAGATAC
GATTCCTTCAATGCACAAAGCTATGACCACAACAACAACGCATCCGAGACACCTAAAGCC
TCGTTGACGAGGTTTGACTCGATTGGAAGCACGAGAGACTCTGATTACAGTCAGGGGTTT
GGGTTCGATGACCATGACCCGTTCGGTTCTACGGGACCATTCAAAACAACGACAAATACA
GCTGAGACACCTCGGAGCTCTGATCACTGGAATGCCTTCTAGCCCCCATGCCCACGTTTG
ATGCGAGTATGATCACATATCATATAGTTTGCTATTTTTCTCACAGTCGGAAGAGTTTTA
TGTACCTTGTTTGGTTTTCTCTCTGTTTGCTTATTTTTGTTGTTGATATATAATAGTTAT
TTTGCC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL3896Contig1 714 2 2 U
GGATACGACTCTACTGAGAGACATTTCCGCAAACAGATGGTGCTCGCTCCGAACTAACCA
GCCCTAAAGTGAGAGTCTACCTTGGTTTTTCTCCGATTCAAAGAAGGAAATAAAAAACTA
AAAAGGAGCTCCCATAGCTGAGTGATGCGAGAGCGATAGAAATATGGAAGGAGTTGAGAT
GGAACTAGAGAGAAGAAGCAAGTTCTTGAACAGTTTGATACAACAAAAGAAGAAGGCTAA
AGAGCAGCAGGACCTCAAAGAAGAGTTCAATGTCCGCGTTAGAGCTTCCGATATGCCTCT
GCCCGTGCAGAACAGGGCTTTCAATTTGTCGCGTGAGATATTGAATGCCACGCCTGGTAA
AGCCGACAACAAAAGACTCGCTCTTGCCCTAAAAAAGGACTTCGATTCTGCATATGGTCC
TGCATGGCATTGCATTGTTGGAACCAGCTTTGGTTCGTACGTCACTCATTCCATCGGAGG
GTTCATATATTTCCAGATAGACAAGGTTTATGTTCTTCTATTCAAGACTGCTGTGGAACC
CCTAGATCACCAATGAGAATGTTCATCCAATCTTTTAAAAAAAAAACATCTTCAGTTGTG
TTCTGTATTCACACTATTTGTTTTGAGTTCAATGTGTTAAATTGTTAATCTCCCAAAGAC
AAAACTCTTAGGTTTTGCGAGTCATTGTGAACTATATAACGTATCGTTTTCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ06TF U 1
AF RR2DJ06JQ C 209
BS 1 665 RR2DJ06TF
BS 666 714 RR2DJ06JQ

RD RR2DJ06TF 665 0 0
GGATACGACTCTACTGAGAGACATTTCCGCAAACAGATGGTGCTCGCTCCGAACTAACCA
GCCCTAAAGTGAGAGTCTACCTTGGTTTTTCTCCGATTCAAAGAAGGAAATAAAAAACTA
AAAAGGAGCTCCCATAGCTGAGTGATGCGAGAGCGATAGAAATATGGAAGGAGTTGAGAT
GGAACTAGAGAGAAGAAGCAAGTTCTTGAACAGTTTGATACAACAAAAGAAGAAGGCTAA
AGAGCAGCAGGACCTCAAAGAAGAGTTCAATGTCCGCGTTAGAGCTTCCGATATGCCTCT
GCCCGTGCAGAACAGGGCTTTCAATTTGTCGCGTGAGATATTGAATGCCACGCCTGGTAA
AGCCGACAACAAAAGACTCGCTCTTGCCCTAAAAAAGGACTTCGATTCTGCATATGGTCC
TGCATGGCATTGCATTGTTGGAACCAGCTTTGGTTCGTACGTCACTCATTCCATCGGAGG
GTTCATATATTTCCAGATAGACAAGGTTTATGTTCTTCTATTCAAGACTGCTGTGGAACC
CCTAGATCACCAATGAGAATGTTCATCCAATCTTTTAAAAAAAAAACATCTTCAGTTGTG
TTCTGTATTCACACTATTTGTTTTGAGTTCAATGTGTTAAATTGTTAATCTCCCAAAGAC
AAAAC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2DJ06JQ 506 0 0
AACAGTTTGATACAACAAAAGAAGAAGGCTAAAGAGCAGCAGGACCTCAAAGAAGAGTTC
AATGTCCGCGTTAGAGCTTCCGATATGCCTCTGCCCGTGCAGAACAGGGCTTTCAATTTG
TCGCGTGAGATATTGAATGCCACGCCTGGTAAAGCCGACAACAAAAGACTCGCTCTTGCC
CTAAAAAAGGACTTCGATTCTGCATATGGTCCTGCATGGCATTGCATTGTTGGAACCAGC
TTTGGTTCGTACGTCACTCATTCCATCGGAGGGTTCATATATTTCCAGATAGACAAGGTT
TATGTTTTTCTATTCAAGACTGCTGTGGAACCCCTAGATCACCAATGAGAATGTTCATCC
AATCTTTTAAAAAAAAAACATCTTCAGTTGTGTTCTGTATTCACACTATTTGTTTTGAGT
TCAATGTGTTAAATTGTTAATCTCCCAAAGACAAAACTCTTAGGTTTTGCGAGTCATTGT
GAACTATATAACGTATCGTTTTCGCC

QA 1 506 1 506
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3898Contig1 416 2 1 U
GAGATTCAAAGCTCTTTTCACTCACTAAAGGTCGAAACTTTTACCCTACTGCCTCTCAAG
TCTCAACGACTTCAAGGACCCGTAATGCCAATGGAATTTACTAGTCGACATTTCTGATTC
AGAAGAAGATACAGTAACTACTTTGTAGTAGATCTGACCACTACAGTGTTAAATGCTTTC
ATCAGGAGTATATGAAAAGCCAATGTCAATGATGATACCGGATGTATATACAAGGGCGGA
AGGAGAAGCTACGAATCTCGTTTTTGGCTGCTGTGGTTTGACGGAGGCAAAGGAGGTGGT
GTGGCAGAGTAGGAGACCAGTTTACCTTAATTTACTTGCTTTGGTTTGTATCATAATTGG
TTTTTAATGCCAACTTAATTTGTGTAACCAGTTAACCGATTGGTTCGGGTTGTCAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C372JQ C 1
AF RR2C372TF U 1
BS 1 416 RR2C372TF

RD RR2C372JQ 416 0 0
GAGATTCAAAGCTCTTTTCACTCACTAAAGGTCGAAACTTTTACCCTACTGCCTCTCAAG
TCTCAACGACTTCAAGGACCCGTAATGCCAATGGAATTTACTAGTCGACATTTCTGATTC
AGAAGAAGATACAGTAACTACTTTGTAGTAGATCTGACCACTACAGTGTTAAATGCTTTC
ATCAGGAGTATATGAAAAGCCAATGTCAATGATGATACCGGATGTATATACAAGGGCGGA
AGGAGAAGCTACGAATCTCGTTTTTGGCTGCTGTGGTTTGACGGAGGCAAAGGAGGTGGT
GTGGCAGAGTAGGAGACCAGTTTACCTTAATTTACTTGCTTTGGTTTGTATCATAATTGG
TTTTTAATGCCAACTTAATTTGTGTAACCAGTTAACCGATTGGTTCGGGTTGTCAA

QA 1 416 1 416
DS 

RD RR2C372TF 416 0 0
GAGATTCAAAGCTCTTTTCACTCACTAAAGGTCGAAACTTTTACCCTACTGCCTCTCAAG
TCTCAACGACTTCAAGGACCCGTAATGCCAATGGAATTTACTAGTCGACATTTCTGATTC
AGAAGAAGATACAGTAACTACTTTGTAGTAGATCTGACCACTACAGTGTTAAATGCTTTC
ATCAGGAGTATATGAAAAGCCAATGTCAATGATGATACCGGATGTATATACAAGGGCGGA
AGGAGAAGCTACGAATCTCGTTTTTGGCTGCTGTGGTTTGACGGAGGCAAAGGAGGTGGT
GTGGCAGAGTAGGAGACCAGTTTACCTTAATTTACTTGCTTTGGTTTGTATCATAATTGG
TTTTTAATGCCAACTTAATTTGTGTAACCAGTTAACCGATTGGTTCGGGTTGTCAA

QA 1 416 1 416
DS 



AS 1 2

CO CL3899Contig1 914 2 6 U
GAAGGAAGATTTCTCTGAAACCTACTCTAATGCGAAACTGTTTGTTATCAAATCATACAG
TGAAGATGATATTCACAAAAGCATCAAATACAATGTGTGGTCCAGCACCCTCAATGGCAA
CAAGAAGCTTGATGCTGCATATAATGAGGCTAAAGATAAATCAAACGGGTCCTGTCCTGT
TTTTCTAATGTTCTCTGTAAACACAAGTGGACAATTTGTCGGTTTAGCTGAGATGGTTGG
ACCAGTAGATTTTAACCAGACAGTGGAGTACTGGCAGCAGGACAAGTGGATTGGTTGCTT
CCCTGTCAAGTGGCACATTGTCAAAGACATCCCAAATAGTTCCTTGAGGCATATAACTCT
GGAGAACAATGAGAACAAGCCAGTTACAAATAGCCGAGACACACAGGAGGTAACCCTCGA
GCAAGGCATGAAAGTCATCAAGATTTTCAAAGAACATGCAAGCAAGACATGCATACTGGA
TGATTTTGTATTCTATGAGAGTCGTGAAAAGATAATCAAAGAGGGAAAAAAGAAGCAGCA
GCAATATAAAAAAAAGCAGGCTTTAGCTGCCATTGACAAAAATGCCACTCCCAAAGGCGA
AACCAAAGAGACAAGTACAGCACCACAAGTTGCCAGCGAGATATCACAAAACGGTGTTGG
TGAATTAGCTAGCGCTTGCTGAATGCAGCAGAAAGCTGTACTTACGTTTTGTGGTTTTTT
TTGTCCGTTTTACTACCAAATTTGCTCAATCTTTCTTAGATTAGTAGTTTGGGCTTTTTT
TTTTTTTAAGAGAGACAATATCGGTTTAATGTTGTTTGTTTTGGTGGTAGTAGAGATGCA
AGTTTCTTGCTTTTTTTTTTTTTTTAACTTCTTTATTTATGTATTGCGTAGATGAATCTT
TGGATTATACTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ64TF U 1
AF RR2DJ64JQ C 364
BS 1 721 RR2DJ64TF
BS 722 722 RR2DJ64JQ
BS 723 748 RR2DJ64TF
BS 749 749 RR2DJ64JQ
BS 750 764 RR2DJ64TF
BS 765 914 RR2DJ64JQ

RD RR2DJ64TF 764 0 0
GAAGGAAGATTTCTCTGAAACCTACTCTAATGCGAAACTGTTTGTTATCAAATCATACAG
TGAAGATGATATTCACAAAAGCATCAAATACAATGTGTGGTCCAGCACCCTCAATGGCAA
CAAGAAGCTTGATGCTGCATATAATGAGGCTAAAGATAAATCAAACGGGTCCTGTCCTGT
TTTTCTAATGTTCTCTGTAAACACAAGTGGACAATTTGTCGGTTTAGCTGAGATGGTTGG
ACCAGTAGATTTTAACCAGACAGTGGAGTACTGGCAGCAGGACAAGTGGATTGGTTGCTT
CCCTGTCAAGTGGCACATTGTCAAAGACATCCCAAATAGTTCCTTGAGGCATATAACTCT
GGAGAACAATGAGAACAAGCCAGTTACAAATAGCCGAGACACACAGGAGGTAACCCTCGA
GCAAGGCATGAAAGTCATCAAGATTTTCAAAGAACATGCAAGCAAGACATGCATACTGGA
TGATTTTGTATTCTATGAGAGTCGTGAAAAGATAATCAAAGAGGGAAAAAAGAAGCAGCA
GCAATATAAAAAAAAGCAGGCTTTAGCTGCCATTGACAAAAATGCCACTCCCAAAGGCGA
AACCAAAGAGACAAGTACAGCACCACAAGTTGCCAGCGAGATATCACAAAACGGTGTTGG
TGAATTAGCTAGCGCTTGCTGAATGCAGCAGAAAGCTGTACTTACGTTTTGTGGTTTTTT
T*GTCCGTTTTACTACCAAATTTGCTCA*TCTTTCTTAGATTAG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2DJ64JQ 551 0 0
GAACAATGAGAACAAGCCAGTTACAAATAGCCGAGACACACAGGAGGTAACCCTCGAGCA
AGGCATGAAAGTCATCAAGATTTTCAAAGAACATGCAAGCAAGACATGCATACTGGATGA
TTTTGTATTTTATGAGAGTCGTGAAAAGATAATCAAAGAGGGAAAAAAGAAGCAGCAGCA
ATATAAAAAAAAGCAGGCTTTAGCTGCCATTGACAAAAATGCCACTCCCAAAGGGGAAAC
CAAAGAGACAAGTACAGCACCACAAGTTGCCAGCGAGATATCACAAAACGGTGTTGGTGA
ATTAGCTAGCGCTTGCTGAATGCAGCAGAAAGCTGTACTTACGTTTTGTGGTTTTTTTTG
TCCGTTTTACTACCAAATTTGCTCAATCTTTTTTAGATTAGTAGTTTGGGCTTTTTTTTT
TTTTAAGAGAGACAATATCGGTTTAATGTTGTTTGTTTTGGTGGTAGTAGAGATGCAAGT
TTCTTGCTTTTTTTTTTTTTTTAACTTCTTTATTTATGTATTGCGTAGATGAATCTTTGG
ATTATACTATC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

CO CL3900Contig1 892 2 2 U
GGACTCATCTCTCTGATGAAGACCATGGAGCTTTTCTCTCTCTCTTCCATCCTCCTCCTC
CTTGCGCTCTCCTTCACTAGTCCAATTCTCTCCATCTCTGATCAGCCATTATTAATCTCA
TCTGTTGTTCATGATGAAGAAGAAAGCTGCCCTTACACCGTGATTGTCACCACGAGCTGT
TTCTCTCCTGATTTGTCAAGGGATCAGATCACTCTCGCTTTGGGTGACGCCGACGGTAAC
AAGGTGGTCGCACCGAGACTAGACGAACCGTTAGGTGGTGGAGGAGGTTTCGAGAAATGT
TCATCTGACACATTCCAAGTCAAAGGTCAGTGTCTAGACACTATCTGCTCTCTCTACATC
TACCGTTCCGGTCCCGACGGTTGGATCCCAGAGACCGTGGAGATCTACGAGGAAGGTTCC
AAGTCCGTGAAATTCGATTTCAACAGAAACGTCCCTGAGAACACTTGGTACGGCCACAAC
TATTGCAACAACACCGGTTTGCCACCACCTTCGCCGGATAAACCTCCTCCGTTTAAACCC
ACAGTCCCACCGCCCCACCCACCTCATTCTCCTCCCGACAAACCTTCTATCCCACCACCA
GCACCACCCCATGCACCACCCCATCCACCACCATCTGCTGCCTCTGGACGTGGAGTTGGC
GAGAGTTTGGTTGTTGCGTCTGCTGCGATTGTGATTGCGTTAGCGGCTGTGGTGGTTTGA
GTTTCTAGTTAAGAGTTGCTTTAATGACTAATAAGTATGGTGTAGTGACTTTTGTTTTCT
GTTTGTAGTAGTTGGAGATCCTGGAGACCTTGATTAGTTAATGTATCGAGTCATGAAGTA
CTAGTAATCAATATAAATGAAACATGCACTAGTGTGTTTGCATGTGATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK83TF U 1
AF RR2FK83JQ C 266
BS 1 743 RR2FK83TF
BS 744 892 RR2FK83JQ

RD RR2FK83TF 748 0 0
GGACTCATCTCTCTGATGAAGACCATGGAGCTTTTCTCTCTCTCTTCCATCCTCCTCCTC
CTTGCGCTCTCCTTCACTAGTCCAATTCTCTCCATCTCTGATCAGCCATTATTAATCTCA
TCTGTTGTTCATGATGAAGAAGAAAGCTGCCCTTACACCGTGATTGTCACCACGAGCTGT
TTCTCTCCTGATTTGTCAAGGGATCAGATCACTCTCGCTTTGGGTGACGCCGACGGTAAC
AAGGTGGTCGCACCGAGACTAGACGAACCGTTAGGTGGTGGAGGAGGTTTCGAGAAATGT
TCATCTGACACATTCCAAGTCAAAGGTCAGTGTCTAGACACTATCTGCTCTCTCTACATC
TACCGTTCCGGTCCCGACGGTTGGATCCCAGAGACCGTGGAGATCTACGAGGAAGGTTCC
AAGTCCGTGAAATTCGATTTCAACAGAAACGTCCCTGAGAACACTTGGTACGGCCACAAC
TATTGCAACAACACCGGTTTGCCACCACCTTCGCCGGATAAACCTCCTCCGTTTAAACCC
ACAGTCCCACCGCCCCACCCACCTCATTCTCCTCCCGACAAACCTTCTATCCCACCACCA
GCACCACCCCATGCACCACCCCATCCACCACCATCTGCTGCCTCTGGACGTGGAGTTGGC
GAGAGTTTGGTTGTTGCGTCTGCTGCGATTGTGATTGCGTTAGCGGCTGTGGTGGTTTGA
GTTTCTAGTTAAGAGTTGCTTTA
TGACT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2FK83JQ 627 0 0
AACCGTTAGGTGGTGGAGGAGGTTTCGAGAAATGTTCATCTGACACATTCCAAGTCAAAG
GTCAGTGTCTAGACACTATCTGCTCTCTCTACATCTACCGTTCCGGTCCCGACGGTTGGA
TCCCAGAGACCGTGGAGATCTACGAGGAAGGTTCCAAGTCCGTGAAATTCGATTTCAACA
GAAACGTCCCTGAGAACACTTGGTACGGCCACAACTATTGCAACAACACCGGTTTGCCAC
CACCTTCGCCGGATAAACCTCCTCCGTTTAAACCCACAGTCCCACCGCCCCACCCACCTC
ATTCTCCTCCCGACAAACCTTCTATCCCACCACCAGCACCACCCCATGCACCACCCCATC
CACCACCATCTGCTGCCTCTGGACGTGGAGTTGGCGAGAGTTTGGTTGTTGCGTCTGCTG
CGATTGTGATTGCGTTAGCGGCTGTGGTGGTTTGAGTTTCTAGTTAAGAGTTGCTTTAAT
GACTAATAAGTATGGTGTAGTGACTTTTGTTTTCTGTTTGTAGTAGTTGGAGATCCTGGA
GACCTTGATTAGTTAATGTATCGAGTCATGAAGTACTAGTAATCAATATAAATGAAACAT
GCACTAGTGTGTTTGCATGTGATTTGC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL3901Contig1 1002 2 12 U
GGTCTGTAACAAAACAGTCGCTGGAAGTTCAAGTGCAGAATTGCTTGCAACATTCTGCGA
CAACATCCTCAAGAAGGGGGGTAGTGAGAAGCTGAGTGATGAGCTTGCTTATATAAGCGA
CAAGGATCTTTTCGCCGAGTTCTACAGGAAGAAGCTGGCACGTAGGCTCTTATTTGATCG
CAGTGCTAATGATGATCATGAGAGAAGCATCCTTACAAAGCTCAAGCAACAATGTGGTGG
GCAGTTCACTTCTAAGATGGAGGGCATGGTAACGGACTTGACATTGGCAAGAGAGAACCA
AACCAGTTTCGAGGAGTATCTAGGCAACAACCCCGCTGCAAACCCAGGGATTGATTTGAC
CGTAACTGTTCTTACCACCGGTTTCTGGCCAAGCTACAAATCATTCGACATAAATCTACC
AAGTGAAATGGTCAAGTGTGTTGAAGTTTTCAAAGGGTTTTATGAGACGAAAACGAAACA
TAGGAAACTTACATGGATCTACTCACTAGGAACTTGTCACCTCAACGGAAAGTTTGATCA
CAAGCCCATTGAGTTAGTTGTGTCTACTTACCAGGCTGCTGTGCTTCTGCTGTTCAACAC
AACAGACAAATTGAGCTACAACGATATCCTAACTCAACTGAACCTAAGCCACGAAGATCT
AGTGAGGTTGCTTCATTCCCTGTCATGTGCTAGGTACAAGATCCTTCTCAAGGAGCCAAG
CACAAAGACTGTTACACAGACTGATTCATTTGAATTCAATGCCAAATTCACTGACAGAAT
GCGCAGAATCAAGATCCCTCTCCCTCCTGTTGATGAAAGGAAGAAGGTTGTGGAAGATGT
GGACAAAGACAGACGCTATGCGGTTGATGCTGCCATTGTTAGGATCATGAAGAGCACGAA
AGTATTGGGACATCAACAACTCGTCTCTGAGTGCGTTGAGCTTCTTAGAATCTCCGATGT
TTCTTGGTCGCTAGTATGTCTATAATCCGCACGTTATCGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F439TF U 1
AF RR2A070TF U 198
BS 1 378 RR2F439TF
BS 379 379 RR2A070TF
BS 380 420 RR2F439TF
BS 421 421 RR2A070TF
BS 422 501 RR2F439TF
BS 502 502 RR2A070TF
BS 503 504 RR2F439TF
BS 505 505 RR2A070TF
BS 506 555 RR2F439TF
BS 556 557 RR2A070TF
BS 558 654 RR2F439TF
BS 655 1002 RR2A070TF

RD RR2F439TF 656 0 0
GGTCTGTAACAAAACAGTCGCTGGAAGTTCAAGTGCAGAATTGCTTGCAACATTCTGCGA
CAACATCCTCAAGAAGGGGGGTAGTGAGAAGCTGAGTGATGAGCTTGCTTATATAAGCGA
CAAGGATCTTTTCGCCGAGTTCTACAGGAAGAAGCTGGCACGTAGGCTCTTATTTGATCG
CAGTGCTAATGATGATCATGAGAGAAGCATCCTTACAAAGCTCAAGCAACAATGTGGTGG
GCAGTTCACTTCTAAGATGGAGGGCATGGTAACGGACTTGACATTGGCAAGAGAGAACCA
AACCAGTTTCGAGGAGTATCTAGGCAACAACCCCGCTGCAAACCCAGGGATTGATTTGAC
CGTAACTGTTCTTACCACTGGTTTCTGGCCAAGCTACAAATCATTCGACATAAATCTACC
CAGTGAAATGGTCAAGTGTGTTGAAGTTTTCAAAGGGTTTTATGAGACGAAAACGAAACA
TAGGAAACTTACATGGATCTATTCGCTAGGAACTTGTCACCTCAACGGAAAGTTTGATCA
CAAGCCCATTGAGTT**TTGTGTCTACTTACCAGGCTGCTGTGCTTCTGCTGTTCAACAC
AACAGACAAATTGAGCTACAACGATATCCTAACTCAACTGAACCTAAGCCACGA
GA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2A070TF 805 0 0
ATGAGAGAAGCATCCTTACAAAGCTCAAGCAACAATGTGGTGGGCAGTTCACTTCTAAGA
TGGAGGGCATGGTAACGGACTTGACATTGGCAAGAGAGAACCAAACCAGTTTCGAGGAGT
ATCTAGGCAATAACCCCGCTGCAAACCCAGGGATTGATTTGACCGTCACTGTTCTTACCA
CCGGTTTCTGGCCAAGTTACAAATCATTCGACATAAATCTACCAAGTGAAATGGTCAAGT
GTGTTGAAGTTTTCAAAGGGTTTTATGAGACGAAAACTAAACATAGGAAACTTACATGGA
TCTACTCACTAGGAACTTGTCACCTCAACGGAAAGTTTGATCACAAGCCCATTGAGTTAG
TTGTGTCTACTTACCAGGCTGCTGTGCTTCTGCTGTTCAACACAACAGACAAATTGAGCT
ACAACGATATCCTAACTCAACTGAACCTAAGCCACGAAGATCTAGTGAGGTTGCTTCATT
CCCTGTCATGTGCTAGGTACAAGATCCTTCTCAAGGAGCCAAGCACAAAGACTGTTACAC
AGACTGATTCATTTGAATTCAATGCCAAATTCACTGACAGAATGCGCAGAATCAAGATCC
CTCTCCCTCCTGTTGATGAAAGGAAGAAGGTTGTGGAAGATGTGGACAAAGACAGACGCT
ATGCGGTTGATGCTGCCATTGTTAGGATCATGAAGAGCACGAAAGTATTGGGACATCAAC
AACTCGTCTCTGAGTGCGTTGAGCTTCTTAGAATCTCCGATGTTTCTTGGTCGCTAGTAT
GTCTATAATCCGCACGTTATCGTGT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

CO CL3902Contig1 1449 2 4 U
GGGAAAATTCTTCGCGGAATAGAGAAAGGGATAACCAACTTGACCATTCGCCGCTTCGCT
TTTTTAAATCCATTTCTTACACACCACTTTTCTGCGAAAATCTCTGAATCGGGTTTCGTC
TGAAGTTGAATATACTTTGAGAACTCTCGAGCTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTCTTGTGG
GAATAAGGGTCTGTTGATTCTTGGGTGGGAGAAGATGGAGAAGTACGAGTTGGTTAAAGA
GATAGGTTCTGGGAACTTTGGAGTGGCGAGGCTGATGAGGGTCAAAGATTCCAAGGAACA
TGTTGCCATGAAGTACATCGAGCGTGGCCCCAAGATCGATGAGAACGTGGCAAGGGAGAT
TATTAACCACAGATCACTTTGTCATCCCAATATTATCCGGTTTAAGGAGGTGGTTTTGAC
ACCAACGCATATAGCTATTGTCATGGAATATGCTGCTGGTGGTGAGCTATTTGACCGTAT
ATGCAGCGCTGGTAGATTCAGCGAGGATGAGGCAAGATACTTTTTCCAGCAGCTTATATC
AGGAGCCAGCTACTGCCATGCTATGAATATATGCCACAGAGATCTGAAGCTCGAAAATAT
TCTCTTGGATGGAAGTCCTGCTCCACGCCTGAAAATCTGTGATTTTGGTTATTCCAAGTC
TTCAGTTCTGCACTCTAAGCCCAAATCAACTGTTGGAACTCCAGCATACATTGCACCCGA
GTTCTTTCTCGTAGAGAATATGATGGCAAGATGGCTGATGTATGGTCATGTGGTGTGACT
CTTTATGTCATGCTTGTTGGGGCATACCCATTTGAAGACCCAGAGGATCCCAAAAACTTT
AGAAAAACAATGCAAAGAATAATGGCTGTTCAGTACAAGATCCCTGACTATGTCCATATC
TCACAAGATTGCAAACATATCCTCTCCCGTATATTTGTCGCTAATCCACTCAAGAGGATA
ACAATAGCTGAAATCAAGAAACATCCATGGTTCCTAAAGAACCTTCCACGGGAGCTTACG
GAGATAGCCCAAGCTGCATACTACAGGAAAGAGAATCCGACGTTTTCTCTACAGAGCGTT
GAAGAGATCATGAAGATAGTGGAAGAGGCAAAAACACCTCCTCCTGTTTCTCGATCTGTA
GGAGCATTTGGGTGGGGAGGTGAAGGAGATGCAGAGGAAGAAGTTGAGGAAGTAGTAGAA
GAAGACGAAGAAGATGAGTATGATAAGACGGTGAAGCAAGTCCATGCAAGTGGAGAAATC
CCTATCAGTTAAAGAAAAAGTATTGGTTGTTTTGTTTTTGTAAAAGAAAAAGTTCTCGTT
GGTCTGTTGAATTTATCTTTAGTGGTTTTTTGTTTGGTTCGTAAATTTGAAGATTTCTCT
TGTGGTTTGGCATTTGTAACTCCTGTAAAATCTGCAGTAGAAAAGACAGGTTGATGATGA
GGTTAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT88TF U 1
AF RR2GT88JQB C 719
BS 1 748 RR2GT88TF
BS 749 749 RR2GT88JQB
BS 750 777 RR2GT88TF
BS 778 1449 RR2GT88JQB

RD RR2GT88TF 777 0 0
GGGAAAATTCTTCGCGGAATAGAGAAAGGGATAACCAACTTGACCATTCGCCGCTTCGCT
TTTTTAAATCCATTTCTTACACACCACTTTTCTGCGAAAATCTCTGAATCGGGTTTCGTC
TGAAGTTGAATATACTTTGAGAACTCTCGAGCTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTCTTGTGG
GAATAAGGGTCTGTTGATTCTTGGGTGGGAGAAGATGGAGAAGTACGAGTTGGTTAAAGA
GATAGGTTCTGGGAACTTTGGAGTGGCGAGGCTGATGAGGGTCAAAGATTCCAAGGAACA
TGTTGCCATGAAGTACATCGAGCGTGGCCCCAAGATCGATGAGAACGTGGCAAGGGAGAT
TATTAACCACAGATCACTTTGTCATCCCAATATTATCCGGTTTAAGGAGGTGGTTTTGAC
ACCAACGCATATAGCTATTGTCATGGAATATGCTGCTGGTGGTGAGCTATTTGACCGTAT
ATGCAGCGCTGGTAGATTCAGCGAGGATGAGGCAAGATACTTTTTCCAGCAGCTTATATC
AGGAGCCAGCTACTGCCATGCTATGAATATATGCCACAGAGATCTGAAGCTCGAAAATAT
TCTCTTGGATGGAAGTCCTGCTCCACGCCTGAAAATCTGTGATTTTGGTTATTCCAAGTC
TTCAGTTCTGCACTCTAAGCCCAAATCAACTGTTGGAACTCCAGCATACATTGCACCCGA
GTTCTTTCTCGTAGAGAATATGATGGCA*GATGGCTGATGTATGGTCATGTGGTGTG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2GT88JQB 731 0 0
AG
GTTCTTTCTCGTAGAGAATATGATGGCAAGATGGCTGATGTATGGTCATGTGGTGTGACT
CTTTATGTCATGCTTGTTGGGGCATACCCATTTGAAGACCCAGAGGATCCCAAAAACTTT
AGAAAAACAATGCAAAGAATAATGGCTGTTCAGTACAAGATCCCTGACTATGTCCATATC
TCACAAGATTGCAAACATATCCTCTCCCGTATATTTGTCGCTAATCCACTCAAGAGGATA
ACAATAGCTGAAATCAAGAAACATCCATGGTTCCTAAAGAACCTTCCACGGGAGCTTACG
GAGATAGCCCAAGCTGCATACTACAGGAAAGAGAATCCGACGTTTTCTCTACAGAGCGTT
GAAGAGATCATGAAGATAGTGGAAGAGGCAAAAACACCTCCTCCTGTTTCTCGATCTGTA
GGAGCATTTGGGTGGGGAGGTGAAGGAGATGCAGAGGAAGAAGTTGAGGAAGTAGTAGAA
GAAGACGAAGAAGATGAGTATGATAAGACGGTGAAGCAAGTCCATGCAAGTGGAGAAATC
CCTATCAGTTAAAGAAAAAGTATTGGTTGTTTTGTTTTTGTAAAAGAAAAAGTTCTCGTT
GGTCTGTTGAATTTATCTTTAGTGGTTTTTTGTTTGGTTCGTAAATTTGAAGATTTCTCT
TGTGGTTTGGCATTTGTAACTCCTGTAAAATCTGCAGTAGAAAAGACAGGTTGATGATGA
GGTTAAGTT

QA 3 731 3 731
DS 



AS 1 2

CO CL3903Contig1 1308 2 4 U
GGGTACTAATCCCAAAGAATCTGCCAGACTACTCCGTCGCTTTAAAACCCTAAAATCTCT
CCGCCGTCTATCCAATTCTCCTCACCGTCAGCTCCCATCACAATCTCCCAAACCATGGCG
ACACCGAATCTAGAGTGCCGGATGTACGAAGCCAAGTACCCGGAAGTAGACATGGCGGTG
ATGATCCAGGTCAAAAGCATCGCCGACATGGGAGCCTACGTCTCCCTCCTCGAGTACAAC
AACACGGAAGGGATGATCCTCTTCTCCGAGCTCTCCCGCCGTCGGATCCGGAGCGTCAGC
AGCCTGATCAAGGTCGGGAAGATCGAGCCCGTCATGGTCCTGCGTGTGGACAAGGAGAGG
GGGTACATTGATCTGAGCAAACGCAGGGTCAGCGAGGAGGATATTCAGACTTGTGAAGAG
AGGTATAACAAGAGCAAGCTCGTTCACTCTATCATGCGCCACGTTGCTGAGACCCTTTCT
CTCGATTTGGAGGACTTGTATGTGAACATTGGTTGGCCTTTGTACCGAAAGTATGGTCAT
GCTTTTGAGGCCTTCAAGGTCTTAGTGACTGATCCTGACTCTGTGTTGGGTTCACTCACC
CGTGAGATCAAAGAAGTTGGTTCTGATGGGCAGGAGGTGACAAAAGTTTTACCTGCTGTT
ACGGAAGAAGTGAAAGAAGCACTTGTGAAGAACATTAGGAGGAGAATGACTCCACAACCA
ATGAAAATCCGTGCTGATATCGAGTTGAAATGTTTTCAGTTTGACGGAGTTGTTCACATC
AAGGAGGCCATGAGAAAGGCTGAAGCTGCTGGAAACGATGCTTGTCCTGTTAAGATTAAA
CTGGTTGCTCCACCTCTGTATGTCCTTACTACTCACACACTTGACAAGGACCAAGGGATT
AAAATTCTAGACGAGGCTATAGTAGCTTGCACTGAAACAATTGAGAAACACAAAGGCAAG
CTCGTCGTTAAAGAGGCACCTAGAGCTGTGAGTGAACGTGATGATAAGTTGCTGACAGAA
CACATGGCGAAGCTGAGAATGGACAATGAAGAAATTAGCGGCGATGAAGAAAGTGGAGAA
GAAGAAGAGGACACAGGGATGGGCGACGTTGATATCGACTGTGGCGCCGGAATCATTGAG
TAGGATTTGCCTGTTTTACAACTAATTTTCTTTCTATTTGTTCTACCAACCAGTCTGAGA
GTATATTTTGCTTTTAAAAGAAGAAAACATCCAAATAGTTACCCGTTGAGGGGTAACATG
TCAATCATTACATTCATGACGCTTTTATAAAGATTGATGTATTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ44TF U 1
AF RR2FQ44JQ C 557
BS 1 636 RR2FQ44TF
BS 637 637 RR2FQ44JQ
BS 638 659 RR2FQ44TF
BS 660 1308 RR2FQ44JQ

RD RR2FQ44TF 659 0 0
GGGTACTAATCCCAAAGAATCTGCCAGACTACTCCGTCGCTTTAAAACCCTAAAATCTCT
CCGCCGTCTATCCAATTCTCCTCACCGTCAGCTCCCATCACAATCTCCCAAACCATGGCG
ACACCGAATCTAGAGTGCCGGATGTACGAAGCCAAGTACCCGGAAGTAGACATGGCGGTG
ATGATCCAGGTCAAAAGCATCGCCGACATGGGAGCCTACGTCTCCCTCCTCGAGTACAAC
AACACGGAAGGGATGATCCTCTTCTCCGAGCTCTCCCGCCGTCGGATCCGGAGCGTCAGC
AGCCTGATCAAGGTCGGGAAGATCGAGCCCGTCATGGTCCTGCGTGTGGACAAGGAGAGG
GGGTACATTGATCTGAGCAAACGCAGGGTCAGCGAGGAGGATATTCAGACTTGTGAAGAG
AGGTATAACAAGAGCAAGCTCGTTCACTCTATCATGCGCCACGTTGCTGAGACCCTTTCT
CTCGATTTGGAGGACTTGTATGTGAACATTGGTTGGCCTTTGTACCGAAAGTATGGTCAT
GCTTTTGAGGCCTTCAAGGTCTTAGTGACTGATCCTGACTCTGTGTTGGGTTCACTCACC
CGTGAGATCAAAGAAGTTGGTTCTGATGGGCAGGAG*TGACAAAAGTTTTACCTGCTGT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2FQ44JQ 752 0 0
AGGTCTTAGTGACTGATCCTGACTCTGTGTTGGGTTCACTCACCCGTGAGATCAAAGAAG
TTGGTTCTGATGGGCAGGAGGTGACAAAAGTTTTACCTGCTGTTACGGAAGAAGTGAAAG
AAGCACTTGTGAAGAACATTAGGAGGAGAATGACTCCACAACCAATGAAAATCCGTGCTG
ATATCGAGTTGAAATGTTTTCAGTTTGACGGAGTTGTTCACATCAAGGAGGCCATGAGAA
AGGCTGAAGCTGCTGGAAACGATGCTTGTCCTGTTAAGATTAAACTGGTTGCTCCACCTC
TGTATGTCCTTACTACTCACACACTTGACAAGGACCAAGGGATTAAAATTCTAGACGAGG
CTATAGTAGCTTGCACTGAAACAATTGAGAAACACAAAGGCAAGCTCGTCGTTAAAGAGG
CACCTAGAGCTGTGAGTGAACGTGATGATAAGTTGCTGACAGAACACATGGCGAAGCTGA
GAATGGACAATGAAGAAATTAGCGGCGATGAAGAAAGTGGAGAAGAAGAAGAGGACACAG
GGATGGGCGACGTTGATATCGACTGTGGCGCCGGAATCATTGAGTAGGATTTGCCTGTTT
TACAACTAATTTTCTTTCTATTTGTTCTACCAACCAGTCTGAGAGTATATTTTGCTTTTA
AAAGAAGAAAACATCCAAATAGTTACCCGTTGAGGGGTAACATGTCAATCATTACATTCA
TGACGCTTTTATAAAGATTGATGTATTTTTGC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL3904Contig1 480 2 1 U
GGAGACTGCGTCTCCTCTCTCCTACACAAACACAATCTTCTCACCGTTCGTCTTCGGACC
AGACCAGACCAGACCAGATCAGATCAGATCAGATCAGCCATGGAGGATGAGATTGAGTTG
AAAACTGCTCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAACCAGACAAGGCACTGTTTCACC
CGCTACATTGAGTTCCACAGGTGCACATCTGCAAAGGGCGAGGACTCCAATGAATGCGAG
AGGTTTGCCAAGTACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGAATGGGTTGACAAGTGGAATGAG
CAAAGGGAGACCGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATTTGAGCAAGAAGGCTCTCTTTTA
TCATTTTATGCTTAAGGCCAGAAGAAGGTCTTGTGGATTGATTATTGAAACCCAACTCTT
TCGTTTTTAAACGTTTTCTCTGGATGATCAAAATAAATAAACTGGAAAGACATTCTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CP38TF U 1
AF RR2CP38JQ C 36
BS 1 480 RR2CP38TF

RD RR2CP38TF 480 0 0
GGAGACTGCGTCTCCTCTCTCCTACACAAACACAATCTTCTCACCGTTCGTCTTCGGACC
AGACCAGACCAGACCAGATCAGATCAGATCAGATCAGCCATGGAGGATGAGATTGAGTTG
AAAACTGCTCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAACCAGACAAGGCACTGTTTCACC
CGCTACATTGAGTTCCACAGGTGCACATCTGCAAAGGGCGAGGACTCCAATGAATGCGAG
AGGTTTGCCAAGTACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGAATGGGTTGACAAGTGGAATGAG
CAAAGGGAGACCGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATTTGAGCAAGAAGGCTCTCTTTTA
TCATTTTATGCTTAAGGCCAGAAGAAGGTCTTGTGGATTGATTATTGAAACCCAACTCTT
TCGTTTTTAAACGTTTTCTCTGGATGATCAAAATAAATAAACTGGAAAGACATTCTTTTG

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2CP38JQ 445 0 0
TTTTT
TCACCGTTTGTTTTCGGACCAGACCAGACCAGACCAGATCAGATCAGATCAGATCAGCCA
TGGAGGATGAGATTGAGTTGAAAACTGCTCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAACC
AGACAAGGCACTGTTTCACCCGCTACATTGAGTTCCACAGGTGCACATCTGCAAAGGGCG
AGGACTCCAATGAATGCGAGAGGTTTGCCAAGTACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGAAT
GGGTTGACAAGTGGAATGAGCAAAGGGAGACCGGAACTTTCCCTGGTCCTCTTTGATTTG
AGCAAGAAGGCTCTCTTTTATCATTTTATGCTTAAGGCCAGAAGAAGGTCTTGTGGATTG
ATTATTGAAACCCAACTCTTTCGTTTTTAAACGTTTTCTCTGGATGATCAAAATAAATAA
ACTGGAAAGACATTCTTTTG

QA 6 445 6 445
DS 



AS 1 2

CO CL3905Contig1 917 2 2 U
GGACCAAATCAACATCTCTAATCTATTACTACATGATCGGACAGCTTATGAACCTCAAGG
AGACAGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCCGGGGCCGCTGAAACCCTCGATACTCCAGCCAGAT
CGGCGGTGGGGAACAAGAGAGGCTTTTCCGAGACCGTTGATCTCATGCTCAATCTTTAGT
CCAACAAAGAAGGAGCCATCGATCTTTACAACGCTACAGCTTCTAAACAGAAAACTCTTC
TCAAAAACACTGTTAAGCCTCCTGCTAAATCCCAAGTTGTGGGATGGCCACCAGTGAAGA
ACTCCAGGAAAAACATAATGACTAATCAGAAAACAAGCGGTGCGGAGGATGCCAGCAGCG
AGAAGGCCGGAAATGGTGGTGGAGGAGCCACCGGAGCTGCATTGGTGAAGGTATCCATGG
ACGGGAGCACCCTACCTAAGGAAAGTTGACCTCAAGATATACAAAAGCTATCAGGATCTC
TCTGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGTTCCTTCACTATGGGGAAACTATGGAGCACAAGG
AATGATCGATTTCATGAACGAGACCAAGCTCATGGATCTTCTGAACAGTTCTGATTATGT
TCCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGACTGGATGCTAGTCGGCGATGTCCCATGGGAAAT
GTTTGTCGAGTCATGCAGACGTTTGCGCATTATGAAGGGATCTGAAGCAATTGGACTTGC
TCCGAGAGCAATGGAGAAGTATTCCAAGAACAGATCATAAATTTTTATATTAAGAAAAGA
ATCTTCAGTGTTCAATCATATGACGAGCTCTTGATTTATATGTACTTTCATGATTTCATG
TGGCTATCTCCTATATATGTGTGTCTGTAATTTAAATACTTGATGTGTATATAAAGCAAT
AGTATTATCTTACCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G489TF U 1
AF RR2G489JQ C 512
BS 1 613 RR2G489TF
BS 614 917 RR2G489JQ

RD RR2G489TF 615 0 0
GGACCAAATCAACATCTCTAATCTATTACTACATGATCGGACAGCTTATGAACCTCAAGG
AGACAGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCCGGGGCCGCTGAAACCCTCGATACTCCAGCCAGAT
CGGCGGTGGGGAACAAGAGAGGCTTTTCCGAGACCGTTGATCTCATGCTCAATCTTTAGT
CCAACAAAGAAGGAGCCATCGATCTTTACAACGCTACAGCTTCTAAACAGAAAACTCTTC
TCAAAAACACTGTTAAGCCTCCTGCTAAATCCCAAGTTGTGGGATGGCCACCAGTGAAGA
ACTCCAGGAAAAACATAATGACTAATCAGAAAACAAGCGGTGCGGAGGATGCCAGCAGCG
AGAAGGCCGGAAATGGTGGTGGAGGAGCCACCGGAGCTGCATTGGTGAAGGTATCCATGG
ACGGGAGCACCCTACCTAAGGAAAGTTGACCTCAAGATATACAAAAGCTATCAGGATCTC
TCTGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGTTCCTTCACTATGGGGAAACTATGGAGCACAAGG
AATGATCGATTTCATGAACGAGACCAAGCTCATGGATCTTCTGAACAGTTCTGATTATGT
TCCAAGCTACGAG
AC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2G489JQ 406 0 0
TTCACTAT
GGGAAACTATGGAGCACAAGGAATGATCGATTTCATGAACGAGACCAAGCTCATGGATCT
TCTGAACAGTTCTGATTATGTTCCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGACTGGATGCTAGT
CGGCGATGTCCCATGGGAAATGTTTGTCGAGTCATGCAGACGTTTGCGCATTATGAAGGG
ATCTGAAGCAATTGGACTTGCTCCGAGAGCAATGGAGAAGTATTCCAAGAACAGATCATA
AATTTTTATATTAAGAAAAGAATCTTCAGTGTTCAATCATATGACGAGCTCTTGATTTAT
ATGTACTTTCATGATTTCATGTGGCTATCTCCTATATATGTGTGTCTGTAATTTAAATAC
TTGATGTGTATATAAAGCAATAGTATTATCTTACCAGT

QA 9 406 9 406
DS 



AS 1 2

CO CL3906Contig1 1031 2 2 U
GGAGAGATTTCAATTTGAAGTTTGAAGAATGGAGGGAAAGCAAGCCGGATCGTCTCTAGA
TTCGTTGATATCTTCCTTCAACAAACGAGTCTCCGAGTTGCAGGAACTCGTCATCGCCCG
GAACATGTATCCGGCGAGCAGCGTCCCGGATTTAACGGCGATCGACGCGGCGCTGAGCTC
TATGGAGCTTCAGGTACACTCGATCAAGGATCGGCTGCGTGAAGAGACCGAAGCTATTCC
GAAAGCTAAGAAACTAATTGAGGCATCGCTGAAACAACAAGAGAAGTTGCAGAAGATGTG
TGTTTATGCACCGTCTCACTTTCCTGATAAGACTACGATGTTGAATTCTGATATAAACAG
ATGTTTGCTCCAAGAAAATGTCATGAAGCACGAACAGAGTTCTGCTCTTAGGTCCTTGCA
ATCAGAGGAGGAAGTATCTGTTTTACCCAAGGAGAAGAAAGGTCGTGGGTCTTCTCCTCC
GCTTTGGTACATAACTGTTGAGGAACTCAATTCCCTCTCATCATACATGAGAGGAAGGCT
CACCTTAGAGAAAGTGAATGCGGCTGTCAATGACATGGCTTCATACGCTGAAGCAAATGC
TCATCTTGTTTCAGCTCCAAAACAAAAGCTTGCGGAAAACCTCTGGGAGAAAGCACTGAA
ACTGCGAGACATTGTAACAACGGGTGCAGTGAAGGGAAAACATTTCTTTCTTGAAACTGA
CATGAAGGGGCCAACGTTGAAGCTAGACAACACAGGCAAAGCAATACTTACTGTTTTTAG
ACACCTTGGTCGTGTTAGTGAGACTCGCATCGGTCCAAACCGCGTCATCATTCTTATGAA
GCCTAATTAGAAGAAACCAACTTTTTCTCAAGTTTATATTGCTTATTATCGGAATCCTCT
TGTAGAAGGTCTGCTTATTCGTTGAACGCATTAAGCCTTATAATCTTTTAGACTGTTCTG
CTCACTAGGCCCATCAGAACCAACTAATTTTGTTGTGAAATATGGACAATGTCGGGAAAA
CTGCTATTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN44TF U 1
AF RR2AN44JQ C 267
BS 1 693 RR2AN44TF
BS 694 1031 RR2AN44JQ

RD RR2AN44TF 698 0 0
GGAGAGATTTCAATTTGAAGTTTGAAGAATGGAGGGAAAGCAAGCCGGATCGTCTCTAGA
TTCGTTGATATCTTCCTTCAACAAACGAGTCTCCGAGTTGCAGGAACTCGTCATCGCCCG
GAACATGTATCCGGCGAGCAGCGTCCCGGATTTAACGGCGATCGACGCGGCGCTGAGCTC
TATGGAGCTTCAGGTACACTCGATCAAGGATCGGCTGCGTGAAGAGACCGAAGCTATTCC
GAAAGCTAAGAAACTAATTGAGGCATCGCTGAAACAACAAGAGAAGTTGCAGAAGATGTG
TGTTTATGCACCGTCTCACTTTCCTGATAAGACTACGATGTTGAATTCTGATATAAACAG
ATGTTTGCTCCAAGAAAATGTCATGAAGCACGAACAGAGTTCTGCTCTTAGGTCCTTGCA
ATCAGAGGAGGAAGTATCTGTTTTACCCAAGGAGAAGAAAGGTCGTGGGTCTTCTCCTCC
GCTTTGGTACATAACTGTTGAGGAACTCAATTCCCTCTCATCATACATGAGAGGAAGGCT
CACCTTAGAGAAAGTGAATGCGGCTGTCAATGACATGGCTTCATACGCTGAAGCAAATGC
TCATCTTGTTTCAGCTCCAAAACAAAAGCTTGCGGAAAACCTCTGGGAGAAAGCACTGAA
ACTGCGAGACATTGTAACAACGGGTGCAGTGAA
AGGGA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2AN44JQ 765 0 0
CGCTGAAACAACAAGAGAAGTTGCAGAAGATGTGTGTTTATGCACCGTCTCACTTTCCTG
ATAAGACTACGATGTTGAATTCTGATATAAACAGATGTTTGCTCCAAGAAAATGTCATGA
AGCACGAACAGAGTTCTGCTCTTAGGTCCTTGCAATCAGAGGAGGAAGTATCTGTTTTAC
CCAAGGAGAAGAAAGGTCGTGGGTCTTCTCCTCCGCTTTGGTACATAACTGTTGAGGAAC
TCAATTCCCTCTCATCATACATGAGAGGAAGGCTCACCTTAGAGAAAGTGAATGCGGCTG
TCAATGACATGGCTTCATACGCTGAAGCAAATGCTCATCTTGTTTCAGCTCCAAAACAAA
AGCTTGCGGAAAACCTCTGGGAGAAAGCACTGAAACTGCGAGACATTGTAACAACGGGTG
CAGTGAAGGGAAAACATTTCTTTCTTGAAACTGACATGAAGGGGCCAACGTTGAAGCTAG
ACAACACAGGCAAAGCAATACTTACTGTTTTTAGACACCTTGGTCGTGTTAGTGAGACTC
GCATCGGTCCAAACCGCGTCATCATTCTTATGAAGCCTAATTAGAAGAAACCAACTTTTT
CTCAAGTTTATATTGCTTATTATCGGAATCCTCTTGTAGAAGGTCTGCTTATTCGTTGAA
CGCATTAAGCCTTATAATCTTTTAGACTGTTCTGCTCACTAGGCCCATCAGAACCAACTA
ATTTTGTTGTGAAATATGGACAATGTCGGGAAAACTGCTATTTTA

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL3907Contig1 793 2 6 U
GATGATACCTGGAATAAAAGGAGAGACTGCAATGTTGCCGCAAGAGATTAAGGCTGGTCC
TGGGTGGAGGGAGCTGAAGGAACCTGGTGTGAAGAGAGCTTTGATAGTTGGAGTTGGTCT
TCAGATACTACAACAGTTTGCAGGAATAAATGGAGTAATGTATTATACACCTCAAATACT
AGAAGAGACAGGGGTGTCTAGTCTTTTGACAAACCTTGGAATAAGTGCAGAGTCTGCATC
ACTCCTCATAAGCTCTTTAACTACACTCTTCATGCTTCCTTGCATTCTTGTCTCCATGAG
GTTAATGGATGTATCTGGTAGAAGGTCTCTGATGCTTTCAACAATCCCCATTTTAATATT
GTCACTGCTAACACTGGTGATTGGAAGCTTGGTGAAGCTTGGAGGTACAGCAAACGCATT
GATATCAACAGCTAGCGTTATGGTGTACCTAAGCTGTTTTGTGATGGGGTTTGGAGCCAT
ACCAAACATCCTATGCTCAGAAATTTTCCCTACCTCTGTGCGTGGCCTCTGCATCACCAT
CTGTGCACTCACTTTCTGGATATGTGACATCATTGTCACTTACACTCTTCCTGTCATGCT
CAAATCTCTAGGCCTAGCGGGTGTTTTTGGGATCTATGCATTTGTTTGTGCAGTAGCGTG
GGTTTTCGTGTACCTCAAGGTACCGGAAACAAAAGGAATGCCCCTTGAAGTTATCTCTGA
GTTCTTTTCTGTTGGTGCAAAACAACAAGACGCCACAGCTTCGTTTTTTTCTGATGATGA
CTGACTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE38TF U 1
AF RR2CE38JQ C 293
BS 1 679 RR2CE38TF
BS 680 680 RR2CE38JQ
BS 681 695 RR2CE38TF
BS 696 696 RR2CE38JQ
BS 697 723 RR2CE38TF
BS 724 793 RR2CE38JQ

RD RR2CE38TF 723 0 0
GATGATACCTGGAATAAAAGGAGAGACTGCAATGTTGCCGCAAGAGATTAAGGCTGGTCC
TGGGTGGAGGGAGCTGAAGGAACCTGGTGTGAAGAGAGCTTTGATAGTTGGAGTTGGTCT
TCAGATACTACAACAGTTTGCAGGAATAAATGGAGTAATGTATTATACACCTCAAATACT
AGAAGAGACAGGGGTGTCTAGTCTTTTGACAAACCTTGGAATAAGTGCAGAGTCTGCATC
ACTCCTCATAAGCTCTTTAACTACACTCTTCATGCTTCCTTGCATTCTTGTCTCCATGAG
GTTAATGGATGTATCTGGTAGAAGGTCTCTGATGCTTTCAACAATCCCCATTTTAATATT
GTCACTGCTAACACTGGTGATTGGAAGCTTGGTGAAGCTTGGAGGTACAGCAAACGCATT
GATATCAACAGCTAGCGTTATGGTGTACCTAAGCTGTTTTGTGATGGGGTTTGGAGCCAT
ACCAAACATCCTATGCTCAGAAATTTTCCCTACCTCTGTGCGTGGCCTCTGCATCACCAT
CTGTGCACTCACTTTCTGGATATGTGACATCATTGTCACTTACACTCTTCCTGTCATGCT
CAAATCTCTAGGCCTAGCGGGTGTTTTTGGGATCTATGCATTTGTTTGTGCAGTAGCGTG
GGTTTTCGTGTACCTCAAG*TACCGGAAACAAAAG*AATGCCCCTTGAAGTTATCTCTGA
GTT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2CE38JQ 501 0 0
TCCATGAGGTTAATGGATGTATCTGGTAGAAGGTCTCTGATGCTTTCAACAATCCCCATT
TTAATATTGTCACTGCTAACACTGGTGATTGGAAGCTTGGTGAAGCTTGGAGGTACAGCA
AACGCATTGATATCAACAGCTAGCGTTATGGTGTACCTAAGCTGTTTTGTGATGGGGTTT
GGAGCCATACCAAACATCCTATGCTCAGAAATTTTCCCTACCTCTGTGCGTGGCCTCTGC
ATCACCATCTGTGCACTCACTTTCTGGATATGTGACATCATTGTCACTTACACTCTTCCT
GTCATGCTCAAATCTCTAGGCCTAGCGGGTGTTTTTGGGATCTATGCATTTGTTTGTGCA
GTAGCGTGGGTTTTCGTGTACCTCAAGGTACCGGAAACAAAAGGAATGCCCCTTGAAGTT
ATCTCTGAGTTCTTTTCTGTTGGTGCAAAACAACAAGACGCCACAGCTTCGTTTTTTTCT
GATGATGACTGACTTTTTTTT

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL3908Contig1 663 2 2 U
GGAAATCAGAGGCAGAGACTTAATAGAGAGAAATCAAGAAATCTTACGACGAAGGATGCA
GATATTCGTGAAAACCTTGACCGGAAAAACCATAACCCTAGAAGTTGAGAGCAGCGATAC
CATCGGCAATGTCAAATCCAAAATCCAGGACAAAGAGGGGATACCACCAGATCAGCAGAG
GCTAATCTTTGCTGGGAAACAACTAGAGGATGGCCGAACGCTCGCTGACTACAACATCCA
GAAAGAGTCCACTCTTCACTTGGTCTTGAGGCTTAGGGGTGGCACCATGATCAAGGTCAA
GACTCTCACCGGCAAAGAGATCGAGATTGATATCGAACCTACCGACACTATCGATCGCAT
TAAAGAACGTGTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTCCAACAAAGGCTCATCTACGC
TGGAAAACAGCTAGCTGATGACAAAACGGCAAAAGACTACAACATCGAGGGAGGCTCTGT
TCTTCATCTGGTCCTTGCTCTTAGAGGGGGTGGTTTTGGTCTTCTCTGAGAAGTTAGCTC
TTTGTTTTCTCCTGTGTTTTATCTTTTCTATGACTTGCAATTTGGATTTACAATGGGGAT
CAGTTTACCAATAATCTGATATCGGATCAAAATAATATTTATTTGGAGTTGGTTACTTTT
GAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2GT04TF U 1
AF RR2GT04JQB C 302
BS 1 511 RR2GT04TF
BS 512 663 RR2GT04JQB

RD RR2GT04TF 511 0 0
GGAAATCAGAGGCAGAGACTTAATAGAGAGAAATCAAGAAATCTTACGACGAAGGATGCA
GATATTCGTGAAAACCTTGACCGGAAAAACCATAACCCTAGAAGTTGAGAGCAGCGATAC
CATCGGCAATGTCAAATCCAAAATCCAGGACAAAGAGGGGATACCACCAGATCAGCAGAG
GCTAATCTTTGCTGGGAAACAACTAGAGGATGGCCGAACGCTCGCTGACTACAACATCCA
GAAAGAGTCCACTCTTCACTTGGTCTTGAGGCTTAGGGGTGGCACCATGATCAAGGTCAA
GACTCTCACCGGCAAAGAGATCGAGATTGATATCGAACCTACCGACACTATCGATCGCAT
TAAAGAACGTGTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTCCAACAAAGGCTCATCTACGC
TGGAAAACAGCTAGCTGATGACAAAACGGCAAAAGACTACAACATCGAGGGAGGCTCTGT
TCTTCATCTGGTCCTTGCTCTTAGAGGGGGT

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2GT04JQB 362 0 0
ACTCTCACCGGCAAAGAGATCGAGATTGATATCGAACCTACCGACACTATCGATCGCATT
AAAGAACGTGTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTCCAACAAAGGCTCATCTACGCT
GGAAAACAGCTAGCTGATGACAAAACGGCAAAAGACTACAACATCGAGGGAGGCTCTGTT
CTTCATCTGGTCCTTGCTCTTAGAGGGGGTGGTTTTGGTCTTCTCTGAGAAGTTAGCTCT
TTGTTTTCTCCTGTGTTTTATCTTTTCTATGACTTGCAATTTGGATTTACAATGGGGATC
AGTTTACCAATAATCTGATATCGGATCAAAATAATATTTATTTGGAGTTGGTTACTTTTG
AT

QA 1 362 1 362
DS 



AS 1 2

CO CL3909Contig1 462 2 1 U
GATGAACGATAGAAATTTCTTCTTAGATGCAAGAACTGGAAGCAATCTGCTACTCAAAGC
TGCTGGTGAAAAGACCGGAGGGTATACGGTTGCCAATATGACATGGGATCTTATGCAAGC
TCGGAATATTCCACAGACACTAGCTTCTGTTGAAGCTTACTACAAGGGACTGAAAGAACG
TGAAATACCAGAGGATGATCCGAGACTGATGCTAGTGACGCGTACATTCAATACCCTGAA
GCGTCAGCAAGGGACGTTTCCTAATCGACGTTAAGGCACAGGGACCAAGAGGACGGGTTC
TTCGTTTTTCTGTCCCTGTTTGCTTATTATGACCTCTGTAAACCATCCGGGTTATGCTTT
TCAATCAGTCGTTTAGATGAATAAGGTGATATTTCCCATAAGAAGAAACTTCAATAGGAT
TCTTTGGATGTTACTCTTATTTCAATTTACTCTTGAAGCTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B545JQ C 1
AF RR2B545TF U 1
BS 1 462 RR2B545TF

RD RR2B545JQ 462 0 0
GATGAACGATAGAAATTTCTTCTTAGATGCAAGAACTGGAAGCAATCTGCTACTCAAAGC
TGCTGGTGAAAAGACCGGAGGGTATACGGTTGCCAATATGACATGGGATCTTATGCAAGC
TCGGAATATTCCACAGACACTAGCTTCTGTTGAAGCTTACTACAAGGGACTGAAAGAACG
TGAAATACCAGAGGATGATCCGAGACTGATGCTAGTGACGCGTACATTCAATACCCTGAA
GCGTCAGCAAGGGACGTTTCCTAATCGACGTTAAGGCACAGGGACCAAGAGGACGGGTTC
TTCGTTTTTCTGTCCCTGTTTGCTTATTATGACCTCTGTAAACCATCCGGGTTATGCTTT
TCAATCAGTCGTTTAGATGAATAAGGTGATATTTCCCATAAGAAGAAACTTCAATAGGAT
TCTTTGGATGTTACTCTTATTTCAATTTACTCTTGAAGCTGG

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2B545TF 462 0 0
GATGAACGATAGAAATTTCTTCTTAGATGCAAGAACTGGAAGCAATCTGCTACTCAAAGC
TGCTGGTGAAAAGACCGGAGGGTATACGGTTGCCAATATGACATGGGATCTTATGCAAGC
TCGGAATATTCCACAGACACTAGCTTCTGTTGAAGCTTACTACAAGGGACTGAAAGAACG
TGAAATACCAGAGGATGATCCGAGACTGATGCTAGTGACGCGTACATTCAATACCCTGAA
GCGTCAGCAAGGGACGTTTCCTAATCGACGTTAAGGCACAGGGACCAAGAGGACGGGTTC
TTCGTTTTTCTGTCCCTGTTTGCTTATTATGACCTCTGTAAACCATCCGGGTTATGCTTT
TCAATCAGTCGTTTAGATGAATAAGGTGATATTTCCCATAAGAAGAAACTTCAATAGGAT
TCTTTGGATGTTACTCTTATTTCAATTTACTCTTGAAGCTGG

QA 1 462 1 462
DS 



AS 1 2

CO CL3910Contig1 264 2 1 U
GATACGTGTGTCTCTCAAAATCTCTCCGCACCTCTTAGATCCGTTCCTCTCTCTCAACCA
GCCTCTCTGTTAAACCCTTTTTGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAAATTTCCCAGC
TTAACATTTGCAACTGCTGTTTTACTCTCTGCAATCTCTTGAGAAAAGGCACCTGCTTTA
CACAGACAAGTTCATTAGATCCTGACAATCATTAGTTCCTGAAACCGTCGTCTTGATCCG
GGGCACATTATGCAAATTTAAGGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FN17JQ C 1
AF RR2FN17TF U 1
BS 1 264 RR2FN17TF

RD RR2FN17JQ 264 0 0
GATACGTGTGTCTCTCAAAATCTCTCCGCACCTCTTAGATCCGTTCCTCTCTCTCAACCA
GCCTCTCTGTTAAACCCTTTTTGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAAATTTCCCAGC
TTAACATTTGCAACTGCTGTTTTACTCTTTGCAATCTCTTGAGAAAAGGCACCTGCTTTA
CACAGACAAGTTCATTAGATCCTGACAATCATTAGTTCCTGAAACCGTCGTCTTGATCCG
GGGCACATTATGCAAATTTAAGGG

QA 1 264 1 264
DS 

RD RR2FN17TF 264 0 0
GATACGTGTGTCTCTCAAAATCTCTCCGCACCTCTTAGATCCGTTCCTCTCTCTCAACCA
GCCTCTCTGTTAAACCCTTTTTGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAAATTTCCCAGC
TTAACATTTGCAACTGCTGTTTTACTCTCTGCAATCTCTTGAGAAAAGGCACCTGCTTTA
CACAGACAAGTTCATTAGATCCTGACAATCATTAGTTCCTGAAACCGTCGTCTTGATCCG
GGGCACATTATGCAAATTTAAGGG

QA 1 264 1 264
DS 



AS 1 2

CO CL3911Contig1 474 2 1 U
GGACATAAACTGCTCTTCACTCTTCAGGAGGAGTCTTCTGTTGTTCGTAAAAGTCTTGAG
AGAGATCTTTATTCATCAAGGTTCTTCTATTTTCTATCTTGTCAAAAAGGTTACAACAAT
GGCTGACAGAAAACAAGTTGAGGACGTGAAACCAACCGTGGATACTGCAACTCAGAGCCG
CGTTCTAGGACAGCATGGTAATGAGCCAAGGGATGCCATGGCCCAATTCCGAGCCACCAA
AGATCCTGATGTTAAGAAACTGGACAATGACCAGTTGGCCTTGTTGTTGCAGCGGACAAG
TGAGGCTAGAGCAGCCATCACGGCAGAGCTGAACCGGCGGCTTAACAACTGAGCACGATC
GACGTGTCAATGGATCCACCTTTATTATCTAGCATAAGTTGTTGTTGTTTTTCTAAGCAA
GTGTAACGTGTTGTTCAACTAACTACTCTGGTTTTAATTTAATGAAGTTGTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H132JQ C 1
AF RR2H132TF U 1
BS 1 474 RR2H132TF

RD RR2H132JQ 474 0 0
GGACATAAACTGCTCTTCACTCTTCAGGAGGAGTCTTCTGTTGTTCGTAAAAGTCTTGAG
AGAGATCTTTATTCATCAAGGTTTTTCTATTTTCTATCTTGTCAAAAAGGTTACAACAAT
GGCTGACAGAAAACAAGTTGAGGACGTGAAACCAACCGTGGATACTGCAACTCAGAGCCG
CGTTTTAGGACAGCATGGTAATGAGCCAAGGGATGCCATGGCCCAATTCCGAGCCACCAA
AGATCCTGATGTTAAGAAACTGGACAATGACCAGTTGGCCTTGTTGTTGCAGCGGACAAG
TGAGGCTAGAGCAGCCATCACGGCAGAGCTGAACCGGCGGCTTAACAACTGAGCACGATC
GACGTGTCAATGGATCCACCTTTATTATCTAGCATAAGTTGTTGTTGTTTTTTTAAGCAA
GTGTAACGTGTTGTTCAACTAACTACTCTGGTTTTAATTTAATGAAGTTGTGTT

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2H132TF 474 0 0
GGACATAAACTGCTCTTCACTCTTCAGGAGGAGTCTTCTGTTGTTCGTAAAAGTCTTGAG
AGAGATCTTTATTCATCAAGGTTCTTCTATTTTCTATCTTGTCAAAAAGGTTACAACAAT
GGCTGACAGAAAACAAGTTGAGGACGTGAAACCAACCGTGGATACTGCAACTCAGAGCCG
CGTTCTAGGACAGCATGGTAATGAGCCAAGGGATGCCATGGCCCAATTCCGAGCCACCAA
AGATCCTGATGTTAAGAAACTGGACAATGACCAGTTGGCCTTGTTGTTGCAGCGGACAAG
TGAGGCTAGAGCAGCCATCACGGCAGAGCTGAACCGGCGGCTTAACAACTGAGCACGATC
GACGTGTCAATGGATCCACCTTTATTATCTAGCATAAGTTGTTGTTGTTTTTCTAAGCAA
GTGTAACGTGTTGTTCAACTAACTACTCTGGTTTTAATTTAATGAAGTTGTGTT

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 2

CO CL3912Contig1 930 2 10 U
GCTGGCCTAGCGTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGCCTACC
AAAAGATAATAATACTACTTGAATGCGCTCTTGACTCTTCCCCGTGAAGATAGAAACTAC
CTGCCGACGCTTCAATCTTTGTGTGGCCGTAGGAGGAAGATGGGGTTGATATCAGGGATT
CTGTTCGGGATTGTCTTCGGCGTAGCTATAATGGCTGGCTGGGCTCGTATGATGACTCAC
CGCTCCTCCAAGCGAGTCGCCAAGGCAGTTGATATGAAACTTCTAGGCTCTCTTAGCAGA
GAAGATTTGATCAAAATTTGTGGTGACAACTTTCCTCAGTGGATATCCTTTCCTGCCTTT
GAACAGGTCAAATGGCTCAATAAACTACTAGGCAAGATGTGGCCATTTATTGCAGAGGCA
GCAACTATGGTAATCAGGGATTCTGTTGAACCGCTGCTCGAAGATTACAGACCACCAGGA
ATTACTTCCCTGAAGTTCAGCAAATTGACTCTGGGTAACGTAGCACCAAAAATTGAAGGT
ATTCGTGTTCAAAGCTTCAAGGAAGGTCAAGTCACAATGGACGTTGATCTTCGGTGGGGT
GGTGATCCAAATATCGTTTTAGCTGTTACAGCACTCGTTGCTTCCATACCCATTCAGTTG
AAGGATCTTCAAGTTTTCACAGTTGCACGTGTTATCTTTCAACTTGCGGATGAGATTCCT
TGTATATCCGCTGTTGTTGTAGCTCTACTTGCCGAGTCAAAACCAAGAATCGATTACACT
TTGAAGGCTGTCGGTGGAAGCTTGACGGCAATTCCTGGACTATCTGATATGATCGATGAC
ACGGTTGAAACTATTGTCCAAGACATGCTTCAGTGGCCTCATAGAATAGTTGTTCCCATT
GGTGGTATTCCTGTTGATCTCAGTGATTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB37TF U 1
AF RR2FT38TF U 162
BS 1 458 RR2CB37TF
BS 459 459 RR2FT38TF
BS 460 473 RR2CB37TF
BS 474 474 RR2FT38TF
BS 475 572 RR2CB37TF
BS 573 573 RR2FT38TF
BS 574 644 RR2CB37TF
BS 645 645 RR2FT38TF
BS 646 659 RR2CB37TF
BS 660 930 RR2FT38TF

RD RR2CB37TF 659 0 0
GCTGGCCTAGCGTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGCCTACC
AAAAGATAATAATACTACTTGAATGCGCTCTTGACTCTTCCCCGTGAAGATAGAAACTAC
CTGCCGACGCTTCAATCTTTGTGTGGCCGTAGGAGGAAGATGGGGTTGATATCAGGGATT
CTGTTCGGGATTGTCTTCGGCGTAGCTATAATGGCTGGCTGGGCTCGTATGATGACTCAC
CGCTCCTCCAAGCGAGTCGCCAAGGCAGTTGATATGAAACTTCTAGGCTCTCTTAGCAGA
GAAGATTTGATCAAAATTTGTGGTGACAACTTTCCTCAGTGGATATCCTTTCCTGCCTTT
GAACAGGTCAAATGGCTCAATAAACTACTAGGCAAGATGTGGCCATTTATTGCAGAGGCA
GCAACTATGGTAATCAGGGATTCTGTTGAACCGCTGCTTGAAGATTACAGACCGCCAGGA
ATTACTTCCCTGAAGTTCAGCAAATTGACTCTGGGTAACGTAGCACCAAAAATTGAAGGT
ATTCGTGTTCAAAGCTTCAAGGAAGGTCAAGTGACAATGGACGTTGATCTTCGGTGGGGT
GGTGATCCAAATATCGTTTTAGCTGTTACAGCACTCGTTGCTTCTATACCCATTCAGTT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2FT38TF 769 0 0
GGGGTTGATATCAGGGATTCTGTTCGGGATTGTCTTCGGCGTAGCTATAATGGCTGGCTG
GGCTCGTATGATGACTCACCGCTCCTCCAAGCGAGTCGCCAAGGCAGTTGATATGAAACT
TCTAGGCTCTCTTAGCAGAGAAGATTTGATCAAAATTTGTGGTGACAACTTTCCTCAGTG
GATATCTTTTCCTGCCTTTGAACAGGTCAAATGGCTCAATAAGCTACTAGGCAAGATGTG
GCCATTTATTGCAGAGGCAGCAACTATGGTAATCAGGGATTCTGTTGAACCGCTGCTCGA
AGATTACAGACCACCGGGAATTACTTCCCTGAAGTTCAGCAAATTGACTCTGGGTAACGT
AGCACCAAAAATTGAAGGTATTCGTGTTCAAAGTTTCAAGGAAGGTCAAGTCACAATGGA
CGTTGATCTTCGGTGGGGTGGTGATCCAAATATCGTTTTAGCTGTTACAGCACTTGTTGC
TTCCATACCCATTCAGTTGAAGGATCTTCAAGTTTTCACAGTTGCACGTGTTATCTTTCA
ACTTGCGGATGAGATTCCTTGTATATCCGCTGTTGTTGTAGCTCTACTTGCCGAGTCAAA
ACCAAGAATCGATTACACTTTGAAGGCTGTCGGTGGAAGCTTGACGGCAATTCCTGGACT
ATCTGATATGATCGATGACACGGTTGAAACTATTGTCCAAGACATGCTTCAGTGGCCTCA
TAGAATAGTTGTTCCCATTGGTGGTATTCCTGTTGATCTCAGTGATTTA

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL3913Contig1 812 2 6 U
GGATCATTCGCCGGAGTGATTCGATCATCAATTCCGATGGATGTCTCCTTACCAGTTGAT
AAGCTATCTTTTGGATCACAACCTGAGGACAAAACCTGTGTGGTTCTTGTGGCAACTGGG
AGTTTCAACCCTCCTACGTTCATGCATTTACGCATGTTTGAGCTGGCGAGAGATGCATTA
CACTCAGAGGGATTTCATGTTCTTGGAGGCTACATGTCCCCTGTTAATGATGCATACAAG
AAGAAGGGATTTTTATCTGCAGAGCATCGTTTAGAGATGTGTAATATAGCCTGCAGAACC
TCCGACTTTATTATGGTTGATCCTTGGGAGGCATCCCAAGACAGCTACCAACGAAGTTTG
ATGGTTTTATCAAGGGTCAAGACTTTTCTTACAACAGATAGACTTGTACCCGAGGGATCT
CTCAAAGTCATGCTACTGTGTGGCTCGGATTTACTGCAATCTTTCTGCACTCCTGGTGTT
TGGATCCCTGAACAAGTAAAGGCCATTTGCAAAGACTATGGGATTGTTTGCATCCGTAGA
GAAGGGCAAGATGTTGAAAGTATGATCTATGGTGACAGAATCTTAAACGAAACCCGTGAT
AACATCAGAATAGTCAACAATTTTGTTCCTAATCAGATTAGCTCAGGTAGATTAAGGAAA
TGCATTTCGGGAGGATTATCAGTTAAGTACTTGACTGAAGATGGAGTAATAGAATATATC
AAACAACACCAACTTTACACTCACCTCGAATGACAAAAGCTGAGAAGCATTATTTCTTCA
CCAGATTAATAATATTAATACACAAGATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E605TF U 1
AF RR2E605JQ C 187
BS 1 545 RR2E605TF
BS 546 546 RR2E605JQ
BS 547 646 RR2E605TF
BS 647 647 RR2E605JQ
BS 648 656 RR2E605TF
BS 657 812 RR2E605JQ

RD RR2E605TF 659 0 0
GGATCATTCGCCGGAGTGATTCGATCATCAATTCCGATGGATGTCTCCTTACCAGTTGAT
AAGCTATCTTTTGGATCACAACCTGAGGACAAAACCTGTGTGGTTCTTGTGGCAACTGGG
AGTTTCAACCCTCCTACGTTCATGCATTTACGCATGTTTGAGCTGGCGAGAGATGCATTA
CACTCAGAGGGATTTCATGTTCTTGGAGGCTACATGTCCCCTGTTAATGATGCATACAAG
AAGAAGGGATTTTTATCTGCAGAGCATCGTTTAGAGATGTGTAATATAGCCTGCAGAACC
TCCGACTTTATTATGGTTGATCCTTGGGAGGCATCCCAAGACAGCTACCAACGAAGTTTG
ATGGTTTTATCAAGGGTCAAGACTTTTCTTACAACAGATAGACTTGTACCCGAGGGATCT
CTCAAAGTCATGCTACTGTGTGGCTCGGATTTACTGCAATCTTTCTGCACTCCTGGTGTT
TGGATCCCTGAACAAGTAAAGGCCATTTGCAAAGACTATGGGATTGTTTGCATCCGTAGA
GAAGG*CAAGATGTTGAAAGTATGATCTATGGTGACAGAATCTTAAACGAAACCCGTGAT
AACATCAGAATAGTCAACAATTTTGTTCCTAATCAGATTAGCTCAG*TAGATTAAG
AAA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2E605JQ 626 0 0
GAGGGATTTCATGTTCTTGGAGGCTACATGTCCCCTGTTAATGATGCATACAAGAAGAAG
GGATTTTTATCTGCAGAGCATCGTTTAGAGATGTGTAATATAGCCTGCAGAACCTCCGAC
TTTATTATGGTTGATCCTTGGGAGGCATCCCAAGACAGCTACCAACGAAGTTTGATGGTT
TTATCAAGGGTCAAGACTTTTCTTACAACAGATAGACTTGTACCCGAGGGATCTCTCAAA
GTCATGCTACTGTGTGGCTCGGATTTACTGCAATCTTTCTGCACTCCTGGTGTTTGGATC
CCTGAACAAGTAAAGGCCATTTGCAAAGACTATGGGATTGTTTGCATCCGTAGAGAAGGG
CAAGATGTTGAAAGTATGATCTATGGTGACAGAATCTTAAACGAAACCCGTGATAACATC
AGAATAGTCAACAATTTTGTTCCTAATCAGATTAGCTCAGGTAGATTAAGGAAATGCATT
TCGGGAGGATTATCAGTTAAGTACTTGACTGAAGATGGAGTAATAGAATATATCAAACAA
CACCAACTTTACACTCACCTCGAATGACAAAAGCTGAGAAGCATTATTTCTTCACCAGAT
TAATAATATTAATACACAAGATTTCC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL3914Contig1 1095 2 12 U
GGATGATGATGGTCTGGAACCTAATTGGTCAGACCTTCTAGGTGATCCTAACGTCCTAAA
CCAAGATTCAAAGATACCAACAGTAAGACCCTCTTGTGAGATAGCTATGCAAGAGGTAGT
AGTAGTCAGTACTCATCAGCATCATCAGGTGGATTCATCTAGCGCCAAAAGCCCACAGGC
TAGTTCAATGACATCTAAGCAACGAATGCGTTGGACACCTGAACTTCATGAAGCGTTTGT
CGATGCTATCAATCAGCCAGGCGGTAGTGAACGAGCCACACCTAAGGCTGTACTGAAGCT
CATCAATAGCCCGGGGCTGACCATTTACCATGTCAAAAGCCATTTGCAGAAATACAGAAC
GGCAAGGTATAAACCGGAGCTTTCAGTAGATACAGAAAAGCCTCCACTGAAGACGTTGAA
GACCATTGAAGATATCAAATCTATTGACTTGAAGACGAGCATTGAAATCACTGAAGCTCT
ACTATTACAGATGGAAGTTCAGAAAAAACTCCACGAGCAACTTGAGGTCCAAAGAACACT
GCAGTTACAAATTGAGGAACAAGGTCGGTATCTCCAGATGATGATTGAGAAACAACAACA
GAAGATGCAAGAGAAGAAAATAGGCTCTTCTTCTGGCTCATCATCAATGCCAGAAGCCGA
CAACACTTCAGCTCCATCAACAAACCTTTCGCAGAAACTGCAGAGTGGTTCTAGCACACT
GGATCAGAGCGGATCTTTCTCTGGGGCTACTAAGAAACGAGTTAGAGAAGATTAAAGACA
TATCCTGATCTGCACAAGTTGGAAGTTATGATACTGATTACTGACACAGTGACTTGAGCT
TGAAGTTTCTTTTTGTATAGGAGACATGTTTCTCTTGGAACTAAAGTTAGGGTTTTGTAC
AAAACGTGTTCGTTACTCTTCCTCTTTCTTGCTTTTATGTGAATCTCTCACACCAGAACC
AACTAATCAACTTTTAAAATGGTGATGAGATGACGTGGACAAACCATTGTCGAGTTGGAC
TATTGTCGGCTAATGAGTCAGCTACTGTAATGTTGCTGACGTGGCTTTACGACGTAATAA
TATACTCTTCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF94TF U 1
AF RR2FF94JQ C 355
BS 1 762 RR2FF94TF
BS 763 763 RR2FF94JQ
BS 764 768 RR2FF94TF
BS 769 769 RR2FF94JQ
BS 770 772 RR2FF94TF
BS 773 774 RR2FF94JQ
BS 775 799 RR2FF94TF
BS 800 800 RR2FF94JQ
BS 801 806 RR2FF94TF
BS 807 807 RR2FF94JQ
BS 808 842 RR2FF94TF
BS 843 1095 RR2FF94JQ

RD RR2FF94TF 842 0 0
GGATGATGATGGTCTGGAACCTAATTGGTCAGACCTTCTAGGTGATCCTAACGTCCTAAA
CCAAGATTCAAAGATACCAACAGTAAGACCCTCTTGTGAGATAGCTATGCAAGAGGTAGT
AGTAGTCAGTACTCATCAGCATCATCAGGTGGATTCATCTAGCGCCAAAAGCCCACAGGC
TAGTTCAATGACATCTAAGCAACGAATGCGTTGGACACCTGAACTTCATGAAGCGTTTGT
CGATGCTATCAATCAGCCAGGCGGTAGTGAACGAGCCACACCTAAGGCTGTACTGAAGCT
CATCAATAGCCCGGGGCTGACCATTTACCATGTCAAAAGCCATTTGCAGAAATACAGAAC
GGCAAGGTATAAACCGGAGCTTTCAGTAGATACAGAAAAGCCTCCACTGAAGACGTTGAA
GACCATTGAAGATATCAAATCTATTGACTTGAAGACGAGCATTGAAATCACTGAAGCTCT
ACTATTACAGATGGAAGTTCAGAAAAAACTCCACGAGCAACTTGAGGTCCAAAGAACACT
GCAGTTACAAATTGAGGAACAAGGTCGGTATCTCCAGATGATGATTGAGAAACAACAACA
GAAGATGCAAGAGAAGAAAATAGGCTCTTCTTCTGGCTCATCATCAATGCCAGAAGCCGA
CAACACTTCAGCTCCATCAACAAACCTTTCGCAGAAACTGCAGAGTGGTTCTAGCACACT
GGATCAGAGCGGATCTTTCTCTGGGGCTACTAAGAAACGAGT*AGAGA*GAT**AAGACA
TATCCTGATCTGCACAAGT*GGAAGT*ATGATACTGATTACTGACACAGTGACTTGAGCT
TG

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR2FF94JQ 741 0 0
CAGAACGGCAAGGTATAAACCGGAGCTTTCAGTAGATACAGAAAAGCCTCCACTGAAGAC
GTTGAAGACCATTGAAGATATCAAATCTATTGACTTGAAGACGAGCATTGAAATCACTGA
AGCTCTACTATTACAGATGGAAGTTCAGAAAAAACTCCACGAGCAACTTGAGGTCCAAAG
AACACTGCAGTTACAAATTGAGGAACAAGGTCGGTATCTCCAGATGATGATTGAGAAACA
ACAACAGAAGATGCAAGAGAAGAAAATAGGCTCTTCTTCTGGCTCATCATCAATGCCAGA
AGCCGACAACACTTCAGCTCCATCAACAAACCTTTCGCAGAAACTGCAGAGTGGTTCTAG
CACACTGGATCAGAGCGGATCTTTCTCTGGGGCTACTAAGAAACGAGTTAGAGAAGATTA
AAGACATATCCTGATCTGCACAAGTTGGAAGTTATGATACTGATTACTGACACAGTGACT
TGAGCTTGAAGTTTCTTTTTGTATAGGAGACATGTTTCTCTTGGAACTAAAGTTAGGGTT
TTGTACAAAACGTGTTCGTTACTCTTCCTCTTTCTTGCTTTTATGTGAATCTCTCACACC
AGAACCAACTAATCAACTTTTAAAATGGTGATGAGATGACGTGGACAAACCATTGTCGAG
TTGGACTATTGTCGGCTAATGAGTCAGCTACTGTAATGTTGCTGACGTGGCTTTACGACG
TAATAATATACTCTTCTCTCC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL3915Contig1 997 2 2 U
GAAAAACCTAAGTGTTATCCAATTCTCCATTCCCATAACCATATAAGCCGAGATGAATAC
CCGAGAAGAAGTAGGTGAATTCTCTAAACTCTTCAATGGTTTCATGACTCTAATGAGAAG
ATTCATATTCAAAGTTCTATGCGTCGGTCCAATCCCTAATCACATCTCATTCATCATGGA
TGGAAACCGCAGATTCGCCAAGAAACACAATCTTCAAGGCCTAGACGCGGGACACAGAGC
TGGTTTCGTATCCGTAACATATATTCTTCAGTACTGCCAAGAGATTGGTGTACCGTACGT
CACACTCTACGCCTTTGGTCACGATAATTTCAGGAGAGAACCCGAAGAAGTCAAGTGTGT
GATGGATCTCATGCTGGAGAAAATCGAGCTCACAATCGATCGAGCTATCTCAGGGAGTCT
AAACAATTTGAAAGTGATCTTTGTTGGTGATTTGAATATGTTAAACGAGCGTCTTAAAGC
CGCAGCGCAGAGACTGATGGAAGTTACTGAGGAGAATAGAGGTTTAATGGTTGTGGTTTG
CGTTGCTTACAGCACAAGTCACGAGATTGTTCAGGCTATTAGAGAATCTTGTGTAAGGAA
GTGTGAGGATGGAGATAGTCCTCTAGTTTTGGAGTTGAGTGATGTTGAAGAGTGTATGTA
TACATCAATTCTTCCTGATCCTGCTCTTGTAATAAGAAGAGGAGGACGAGATCGGCTGAG
TAACTTCATGACTTGGCAGACTTCAAGTTCTTTCCTTCGTACCACGGCGGCTCTTTGGCC
GGAGCTAGGTCTTTGGCATTTGGTTTGGGCTATTCTTAATTTCCAGAGGATGCAAAATTA
CTTGCAGAAGAAGCAAAAACTCGACTAAATAGGTTTAACTTAAATATTAGCATGGTTGGA
CATAAAGATTTATGACGACATAAACATATTAAATTAGTTATTAATAACATTTTGTGTTTA
CAAAATAGATGCATAGAACTCATATATAATAGTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ69TF U 1
AF RR2AJ69JQ C 249
BS 1 710 RR2AJ69TF
BS 711 997 RR2AJ69JQ

RD RR2AJ69TF 710 0 0
GAAAAACCTAAGTGTTATCCAATTCTCCATTCCCATAACCATATAAGCCGAGATGAATAC
CCGAGAAGAAGTAGGTGAATTCTCTAAACTCTTCAATGGTTTCATGACTCTAATGAGAAG
ATTCATATTCAAAGTTCTATGCGTCGGTCCAATCCCTAATCACATCTCATTCATCATGGA
TGGAAACCGCAGATTCGCCAAGAAACACAATCTTCAAGGCCTAGACGCGGGACACAGAGC
TGGTTTCGTATCCGTAACATATATTCTTCAGTACTGCCAAGAGATTGGTGTACCGTACGT
CACACTCTACGCCTTTGGTCACGATAATTTCAGGAGAGAACCCGAAGAAGTCAAGTGTGT
GATGGATCTCATGCTGGAGAAAATCGAGCTCACAATCGATCGAGCTATCTCAGGGAGTCT
AAACAATTTGAAAGTGATCTTTGTTGGTGATTTGAATATGTTAAACGAGCGTCTTAAAGC
CGCAGCGCAGAGACTGATGGAAGTTACTGAGGAGAATAGAGGTTTAATGGTTGTGGTTTG
CGTTGCTTACAGCACAAGTCACGAGATTGTTCAGGCTATTAGAGAATCTTGTGTAAGGAA
GTGTGAGGATGGAGATAGTCCTCTAGTTTTGGAGTTGAGTGATGTTGAAGAGTGTATGTA
TACATCAATTCTTCCTGATCCTGCTCTTGTAATAAGAAGAGGAGGACGAG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2AJ69JQ 749 0 0
TATCCGTAACATATATTCTTCAGTACTGCCAAGAGATTGGTGTACCGTACGTCACACTCT
ACGCCTTTGGTCACGATAATTTCAGGAGAGAACCCGAAGAAGTCAAGTGTGTGATGGATC
TCATGCTGGAGAAAATCGAGCTCACAATCGATCGAGCTATCTCAGGGAGTCTAAACAATT
TGAAAGTGATCTTTGTTGGTGATTTGAATATGTTAAACGAGCGTCTTAAAGCCGCAGCGC
AGAGACTGATGGAAGTTACTGAGGAGAATAGAGGTTTAATGGTTGTGGTTTGCGTTGCTT
ACAGCACAAGTCACGAGATTGTTCAGGCTATTAGAGAATCTTGTGTAAGGAAGTGTGAGG
ATGGAGATAGTCCTCTAGTTTTGGAGTTGAGTGATGTTGAAGAGTGTATGTATACATCAA
TTCTTCCTGATCCTGCTCTTGTAATAAGAAGAGGAGGACGAGATCGGCTGAGTAACTTCA
TGACTTGGCAGACTTCAAGTTCTTTCCTTCGTACCACGGCGGCTCTTTGGCCGGAGCTAG
GTCTTTGGCATTTGGTTTGGGCTATTCTTAATTTCCAGAGGATGCAAAATTACTTGCAGA
AGAAGCAAAAACTCGACTAAATAGGTTTAACTTAAATATTAGCATGGTTGGACATAAAGA
TTTATGACGACATAAACATATTAAATTAGTTATTAATAACATTTTGTGTTTACAAAATAG
ATGCATAGAACTCATATATAATAGTTCTT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL3916Contig1 478 2 1 U
GGGAACATCTCCGCGTCATCGTCATCGTTCATCGTCGACACCAGAAGGCGATTCAGTTAG
TTAAACAAGAGAAGAGAAGAGAAGGATGGTGGGAAGTGGAGCTCCACAGAGAGGAAGTGC
AGCCGCAGCTGCTAGCATGCGTAGGAGAAAGCCTAGTGGAAGTGGAGGAGCCTCTGGTGG
TGGTGGTGGTGCTGCAGGATCCATGCTTCAGTTCTACACCGATGACGCACCGGGTCTCAA
GATCTCCCCTAATGTTGTCCTTGTCATGAGCATTGGTTTTATTGCTTTCGTCGCTGTCCT
TCATGTCATGGGCAAGCTCTACTTTGTCAAGTGATAAGACTAGAGAGTGAGAGTGAGCGA
GAGAGAGAGCTTAAGTACACCCAAGTGATTGCTAGTGACCAGAGTTATTAGACAGTGGTT
TCAACTCTATGTTTTCAATTTTGTGAGAGACTATCTATAAAAAAGTTCCAGTTTCTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AU23JQ C 1
AF RR2AU23TF U 1
BS 1 478 RR2AU23TF

RD RR2AU23JQ 478 0 0
GGGAACATCTCCGCGTCATCGTCATCGTTCATCGTCGACACCAGAAGGCGATTCAGTTAG
TTAAACAAGAGAAGAGAAGAGAAGGATGGTGGGAAGTGGAGCTCCACAGAGAGGAAGTGC
AGCCGCAGCTGCTAGCATGCGTAGGAGAAAGCCTAGTGGAAGTGGAGGAGCCTTTGGTGG
TGGTGGTGGTGCTGCAGGATCCATGCTTCAGTTTTACACCGATGACGCACCGGGTCTCAA
GATCTCCCCTAATGTTGTCCTTGTCATGAGCATTGGTTTTATTGCTTTTGTCGCTGTCCT
TCATGTCATGGGCAAGCTTTACTTTGTCAAGTGATAAGACTAGAGAGTGAGAGTGAGCGA
GAGAGAGAGCTTAAGTACACCCAAGTGATTGCTAGTGACCAGAGTTATTAGACAGTGGTT
TCAACTCTATGTTTTCAATTTTGTGAGAGACTATCTATAAAAAAGTTCCAGTTTCTCG

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2AU23TF 478 0 0
GGGAACATCTCCGCGTCATCGTCATCGTTCATCGTCGACACCAGAAGGCGATTCAGTTAG
TTAAACAAGAGAAGAGAAGAGAAGGATGGTGGGAAGTGGAGCTCCACAGAGAGGAAGTGC
AGCCGCAGCTGCTAGCATGCGTAGGAGAAAGCCTAGTGGAAGTGGAGGAGCCTCTGGTGG
TGGTGGTGGTGCTGCAGGATCCATGCTTCAGTTCTACACCGATGACGCACCGGGTCTCAA
GATCTCCCCTAATGTTGTCCTTGTCATGAGCATTGGTTTTATTGCTTTCGTCGCTGTCCT
TCATGTCATGGGCAAGCTCTACTTTGTCAAGTGATAAGACTAGAGAGTGAGAGTGAGCGA
GAGAGAGAGCTTAAGTACACCCAAGTGATTGCTAGTGACCAGAGTTATTAGACAGTGGTT
TCAACTCTATGTTTTCAATTTTGTGAGAGACTATCTATAAAAAAGTTCCAGTTTCTCG

QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 2

CO CL3917Contig1 940 2 2 U
GATAGCTTTTCTTCTCCTTCCTCATTTCTCACTTTTTCAGCGTTGAATCAAATCTCTTCG
TGTTCCCCTCTTTGGCTTCTTCAGGTAATATTTGAACAAATTGCTTACTACTACCATGGG
TGATGCAGCAAACAAGGGTGTTAATGGAACCGCAAGTGCCAAGAAACCCACTGTTATATT
TGTCCTTGGTGGTCCAGGAAGTGGGAAAGGTACACAGTGTGCCTATATCGTTGAACATTA
TGGCTACACACATCTGAGTGCTGGAGACCTTCTTAGGGCCGAAATTAAATCTGGCAATGA
AAATGGAACTATGATCCAGAATATGATTAAAGAAGGGAAGGTTGTACCATCTGAGGTTAC
AATCAAGCTTCTGCAGAAAGCAATTCAAGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGG
TTTCCCTCGCAATGAGGAAAACCGAGCAGCCTTTGAAAAAGTTACTGAGATTGAGCCCAA
GTTTGTCTTGTTCTTTGATTGTCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAA
CCAGGGGAGAGAGGATGACAATATCGAGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGA
ATCTAGCTTACCTGTGATTCAGTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTTAGGAAGATTCATGC
CGCAAAGCCCATTGAAGATGTGTTTCAGGAGGTGAAGGCAGTCTTTACTCCTGAAGCTGA
GAAGGTAAAAAACAATACTTGTGTAATTCTCTAATCCTCTCTTAGTCAAAAAAAAGAAGG
AAATAAAAAGATTCCTCCTAGGAATCACATGTGTTTGTACTTTGTAATGTAGAAGGTTTG
TAACTAACTAATGTTTACTGCTCTGAAGAATCATTAGATTCACCACGGCTGTGTTCTGTA
ACGATGATAAATAGTGCATTTGCATAAACTTTGGTGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU79TF U 1
AF RR2EU79JQ C 227
BS 1 688 RR2EU79TF
BS 689 940 RR2EU79JQ

RD RR2EU79TF 693 0 0
GATAGCTTTTCTTCTCCTTCCTCATTTCTCACTTTTTCAGCGTTGAATCAAATCTCTTCG
TGTTCCCCTCTTTGGCTTCTTCAGGTAATATTTGAACAAATTGCTTACTACTACCATGGG
TGATGCAGCAAACAAGGGTGTTAATGGAACCGCAAGTGCCAAGAAACCCACTGTTATATT
TGTCCTTGGTGGTCCAGGAAGTGGGAAAGGTACACAGTGTGCCTATATCGTTGAACATTA
TGGCTACACACATCTGAGTGCTGGAGACCTTCTTAGGGCCGAAATTAAATCTGGCAATGA
AAATGGAACTATGATCCAGAATATGATTAAAGAAGGGAAGGTTGTACCATCTGAGGTTAC
AATCAAGCTTCTGCAGAAAGCAATTCAAGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGG
TTTCCCTCGCAATGAGGAAAACCGAGCAGCCTTTGAAAAAGTTACTGAGATTGAGCCCAA
GTTTGTCTTGTTCTTTGATTGTCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAA
CCAGGGGAGAGAGGATGACAATATCGAGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGA
ATCTAGCTTACCTGTGATTCAGTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTTAGGAAGATTCATGC
CGCAAAGCCCATTGAAGATGTGTTTCAG
AGTGA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2EU79JQ 714 0 0
ATCGTTGAACATTATGGCTACACACATCTGAGTGCTGGAGACCTTCTTAGGGCCGAAATT
AAATCTGGCAATGAAAATGGAACTATGATCCAGAATATGATTAAAGAAGGGAAGGTTGTA
CCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTGCAGAAAGCAATTCAAGAAAACGGGAATGACAAG
TTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGCAATGAGGAAAACCGAGCAGCCTTTGAAAAAGTTACT
GAGATTGAGCCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTGTCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGC
CTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGACAATATCGAGACTATAAGGAAGCGTTTC
AAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTACCTGTGATTCAGTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTT
AGGAAGATTCATGCCGCAAAGCCCATTGAAGATGTGTTTCAGGAGGTGAAGGCAGTCTTT
ACTCCTGAAGCTGAGAAGGTAAAAAACAATACTTGTGTAATTCTCTAATCCTCTCTTAGT
CAAAAAAAAGAAGGAAATAAAAAGATTCCTCCTAGGAATCACATGTGTTTGTACTTTGTA
ATGTAGAAGGTTTGTAACTAACTAATGTTTACTGCTCTGAAGAATCATTAGATTCACCAC
GGCTGTGTTCTGTAACGATGATAAATAGTGCATTTGCATAAACTTTGGTGATTC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL3918Contig1 794 2 6 U
GGGACAAGACGCAGCTCCATCTCATCTCGTTTTAATCCATCTTCTCCGGCTCGAGCTCTC
TCATCTCCATCTCCGACGCAGACCTGGAGATCTCTCATCTCCAGCTCGAGCTCTCTCTAC
TCCAACCCGAGCTCTCTCTTCTCTGACGCCGACCACAAGCTCTCTCATCTCCGCCTCGAG
CTCTCTCTTCTCCGTCGAAGACCTCGAGCTCTATATCTGACGAAGACCACGAGCTCTCTC
ATCTCCTCTGATTTGGGTTTCAAGCACTGTTGAGGCAACTAAGACAAGAAGAAGCTGTTA
CTCTGAGTCTCAGCCTCTCTCTCATCTTCATCGATCTCAGGCTCTCTCTTGAGTTTTGTG
TTTATTTGTTGATGCTTAGATTCTGCAAGTGTGAGATGACTGGTGGTCCTCCTGCAAATG
TCTACGAGTGTCAATTGTCTCTGTTCTGAGTGAGAAGCAGTTCGAGTCCTGTTGTATCAA
AGGAAGAGTCTGATGAGCTTTATGAAGAAGATAAATGTAATAGAGCTTTAAGGTTGTTGG
CTTTATAAAAAGGCGCAGCTCTGTGATTACATAGAACATGTATACAGACTCATGATAGAG
TTTTATCTGTGTGTAGTACATACATGTATTTACTTCTTTTTTTTGGGGCAATCATACATG
TATTTACATTTCTTAATATCTAGTATATTTACATTTACTAGATACATGTATACAGACTCA
TGATAGAGCTAACATACATACACATGTTATACATTTCTTTGTGCTAGAATGATTTAACTT
ATGATTTATGACAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW71TF U 1
AF RR2BW71JQ C 48
BS 1 643 RR2BW71TF
BS 644 644 RR2BW71JQ
BS 645 731 RR2BW71TF
BS 732 732 RR2BW71JQ
BS 733 774 RR2BW71TF
BS 775 794 RR2BW71JQ

RD RR2BW71TF 774 0 0
GGGACAAGACGCAGCTCCATCTCATCTCGTTTTAATCCATCTTCTCCGGCTCGAGCTCTC
TCATCTCCATCTCCGACGCAGACCTGGAGATCTCTCATCTCCAGCTCGAGCTCTCTCTAC
TCCAACCCGAGCTCTCTCTTCTCTGACGCCGACCACAAGCTCTCTCATCTCCGCCTCGAG
CTCTCTCTTCTCCGTCGAAGACCTCGAGCTCTATATCTGACGAAGACCACGAGCTCTCTC
ATCTCCTCTGATTTGGGTTTCAAGCACTGTTGAGGCAACTAAGACAAGAAGAAGCTGTTA
CTCTGAGTCTCAGCCTCTCTCTCATCTTCATCGATCTCAGGCTCTCTCTTGAGTTTTGTG
TTTATTTGTTGATGCTTAGATTCTGCAAGTGTGAGATGACTGGTGGTCCTCCTGCAAATG
TCTACGAGTGTCAATTGTCTCTGTTCTGAGTGAGAAGCAGTTCGAGTCCTGTTGTATCAA
AGGAAGAGTCTGATGAGCTTTATGAAGAAGATAAATGTAATAGAGCTTTAAGGTTGTTGG
CTTTATAAAAAGGCGCAGCTCTGTGATTACATAGAACATGTATACAGACTCATGATAGAG
TTTTATCTGTGTGTAGTACATACATGTATTTACTTCTTTTTTT*GGGGCAATCATACATG
TATTTACATTTCTTAATATCTAGTATATTTACATTTACTAGATACATGTATACAGACTCA
TGATAGAGCTA*CATACATACACATGTTATACATTTCTTTGTGCTAGAATGATT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2BW71JQ 747 0 0
GGCTCGAGCTCTCTCATCTCCATCTCCGACGCAGACCTGGAGATCTCTCATCTCCAGCTC
GAGCTCTCTCTACTCCAACCCGAGCTCTCTCTTCTCTGACGCCGACCACAAGCTCTCTCA
TCTCCGCCTCGAGCTCTCTCTTCTCCGTCGAAGACCTCGAGCTCTATATCTGACGAAGAC
CACGAGCTCTCTCATCTCCTCTGATTTGGGTTTCAAGCACTGTTGAGGCAACTAAGACAA
GAAGAAGCTGTTACTCTGAGTTTCAGCCTCTCTCTCATCTTCATCGATCTCAGGCTCTCT
CTTGAGTTTTGTGTTTATTTGTTGATGCTTAGATTCTGCAAGTGTGAGATGACTGGTGGT
CCTCCTGCAAATGTCTACGAGTGTCAATTGTCTCTGTTCTGAGTGAGAAGCAGTTCGAGT
CCTGTTGTATCAAAGGAAGAGTCTGATGAGCTTTATGAAGAAGATAAATGTAATAGAGCT
TTAAGGTTGTTGGCTTTATAAAAAGGCGCAGCTCTGTGATTACATAGAACATGTATACAG
ACTCATGATAGAGTTTTATCTGTGTGTAGTACATACATGTATTTACTTCTTTTTTTTGGG
GCAATCATACATGTATTTACATTTCTTAATATCTAGTATATTTACATTTACTAGATACAT
GTATACAGACTCATGATAGAGCTAACATACATACACATGTTATACATTTCTTTGTGCTAG
AATGATTTAACTTATGATTTATGACAA

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL3919Contig1 708 2 2 U
ATTCTCCTTTTGTGAAGTATACACCGCAGTGGAGATGGCTTGATGAAGAGTTCAAAAGAG
TTGACAGGGAGAAAACTCCTTGGCTAATTGTTCTGATGCATGCTCCTATATACAACAGTA
ACGAAGCACACTTCAAGGAAGGTGAAAGCATGCGAGCAGCTTTTGAGGATTGGTTTGTCG
AATACAGAGTCGATGTTATCTTTGCTGGACATGTTCACGCCTACGAGAGATCGTACCGAG
TATCAAATGTGCGGTACAATGTGTCAAGTGGAGATCGTTTCCCGGTTCCAGATACCTCAG
CTCCTGTTTATATCACAGTTGGAGACGGAGGAAATCAAGAAGGTCTTGCGGGAAGGTTTA
GGGAACCACAGCCAGATTACTCTGCATTTAGAGAAGCTAGTTACGGCCACTCCACGCTGG
ACATAAAAAACAGAACACATGCGATATACCACTGGAACCGCAATGATGATGGGAAGAAAG
TAGCAACAGATGAGTTTGTGTTATACAACCAGTACTGGGGAAAGAACATTCGACGGAGAA
AGCTGAAGAAGCATTATATCAAGAATGTTGTGGTTGACTGGATCGCCAGTTGATTTGCTT
ACTAAAGTAGGGGGGAAGATATTCGTCCAACTCTTTACTCTTTTTCTACCAGATCTTGAT
TACTTATAATATTGTTTGTGTTTATTCATCCATGAAATTTAATATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB87TF U 1
AF RR2FB87JQ C 96
BS 1 558 RR2FB87TF
BS 559 708 RR2FB87JQ

RD RR2FB87TF 558 0 0
ATTCTCCTTTTGTGAAGTATACACCGCAGTGGAGATGGCTTGATGAAGAGTTCAAAAGAG
TTGACAGGGAGAAAACTCCTTGGCTAATTGTTCTGATGCATGCTCCTATATACAACAGTA
ACGAAGCACACTTCAAGGAAGGTGAAAGCATGCGAGCAGCTTTTGAGGATTGGTTTGTCG
AATACAGAGTCGATGTTATCTTTGCTGGACATGTTCACGCCTACGAGAGATCGTACCGAG
TATCAAATGTGCGGTACAATGTGTCAAGTGGAGATCGTTTCCCGGTTCCAGATACCTCAG
CTCCTGTTTATATCACAGTTGGAGACGGAGGAAATCAAGAAGGTCTTGCGGGAAGGTTTA
GGGAACCACAGCCAGATTACTCTGCATTTAGAGAAGCTAGTTACGGCCACTCCACGCTGG
ACATAAAAAACAGAACACATGCGATATACCACTGGAACCGCAATGATGATGGGAAGAAAG
TAGCAACAGATGAGTTTGTGTTATACAACCAGTACTGGGGAAAGAACATTCGACGGAGAA
AGCTGAAGAAGCATTATA

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2FB87JQ 613 0 0
ATGCATGCTCCTATATACAACAGTAACGAAGCACACTTCAAGGAAGGTGAAAGCATGCGA
GCAGCTTTTGAGGATTGGTTTGTCGAATACAGAGTCGATGTTATCTTTGCTGGACATGTT
CACGCCTACGAGAGATCGTACCGAGTATCAAATGTGCGGTACAATGTGTCAAGTGGAGAT
CGTTTCCCGGTTCCAGATACCTCAGCTCCTGTTTATATCACAGTTGGAGACGGAGGAAAT
CAAGAAGGTCTTGCGGGAAGGTTTAGGGAACCACAGCCAGATTACTCTGCATTTAGAGAA
GCTAGTTACGGCCACTCCACGCTGGACATAAAAAACAGAACACATGCGATATACCACTGG
AACCGCAATGATGATGGGAAGAAAGTAGCAACAGATGAGTTTGTGTTATACAACCAGTAC
TGGGGAAAGAACATTCGACGGAGAAAGCTGAAGAAGCATTATATCAAGAATGTTGTGGTT
GACTGGATCGCCAGTTGATTTGCTTACTAAAGTAGGGGGGAAGATATTCGTCCAACTCTT
TACTCTTTTTCTACCAGATCTTGATTACTTATAATATTGTTTGTGTTTATTCATCCATGA
AATTTAATATTCG

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

CO CL3920Contig1 1599 2 2 U
GGAGAATTTTCACCAACTAAATAAACATTTTAGACCCGAGCACGCCTCGGGCCTTAGTTG
GTGGGAAGTTAATTAATAATTTTCTAAGCTACTATCCGCTATGGATAAGAGCACAATAAA
CATAAACGGTTATGAGTTCCGTGAATTCCAAGGAGAACTTGAGGATTTAAATCAAACTCA
TTCAGAGCAAATTAGAAGAGAAGCCGAAGTGACATACTTCGACGAATTCGCAAAAGCTGA
ATTCCTTGACCTTTACCCCGAGTACTACAGACAGTACGTCGAAGGATGGTCGAGAAGCTA
CTACATGCGATCAAAACACATGTAGTCAATCTTTAAATTCGCAAACCAAAACCACTCTAT
CACAGAGCTTCACCGAGAATCATGGCAGCACGCCATCGAAGCCACTAGAGATGGGTTATC
TATCCTTCCACGTGTGAGGGCATTATCAGTCAAAACAGAACTTGACCAAGTCAAGTATAT
ACAGTCCTCCGCCGCAGGATACGGTTACATAGGTGCAAAGGGTCCCCCTTATGGTGAAAA
CCATGATAGAGCGATCCGTAGAGCCAAAGCTACCCTATACTCCGCCACAGCGGATGATGG
ACAAGGTATCGATTACGCGATCAGGGAATCAGTTCCTGACGTAGGCTATACACGCACTCA
GTTGGCAGATCTCACTGAGAAAACGAAAGTCAGAGGTGTTTGGGGAAGAGCATTCCACTA
CATCTTACTTGAAAGGCACAGCAGCTAGACCTCTTATAGAGGCAATTCAAGGAGGACAAT
CGTTCATCATGATAGGCAGTGATCCGATCGTCAACGTACCATACGTCTTAACAGCAACTA
AAGCACGGTGCAAATGGTTAATGTCCCTTGATTGGAGCTCATTTGATGCAACAGTCAATC
GATTTGAAATCAACGCAGCATTCGACTTAATGAAAGAGCACTTAGTCTTCCCGGACTTTG
ATACTGAAATGGCATACGAACTATGTCGTCAGATCTTTACACACAAGAAAGTCGCCGCGC
CTGATGGTAAGATATATTGGTCACACAAAGGAATTCCTTCTGGCAGTTACTATACGTCAC
TTGTCGGTTCGATAGTCAATAAACTCGGAGTTGAGTATTTATGGCATCTCAAATTTGGAC
GAGGTCCAATGGTTACGTTCACCCTAGGTGACGACTCCCTTATAGGAGACAATCATTACT
ACCCCCCAGACGAGTTAGCCGATAAAGCTTACGATTTGGGTTGGCTAGTGAATCCAGACA
AAACCGAGTACTCGACGTTACCAGGGAGCATAACCTTCTTAGGAAGATCAGTTCTTGGCT
CCGTTAACCAACGTGAGTTAAAGAAGTGTATACAGCTTCTATTACTACCCGAGTTCCCAG
TTGAATCAGGAGAAATTTCGGCCTTCAGAGCAGCAGCAATCGCAAACGATGCCGGTGGCA
ACAGTGAAATGTTGAACCGAGTCGCTCGAAGACTCAAACGCAAGTACGGAATCGCGGAAG
CGCACCAAGTACCTTTGTATTTTAGACGTTATCAACCATAATAAGTTGCAATATTTAATC
TACTTATAAGCGTTTGAACGAGGGATAAACCCCGTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B767TF U 1
AF RR2B767JQ C 768
BS 1 849 RR2B767TF
BS 850 1599 RR2B767JQ

RD RR2B767TF 849 0 0
GGAGAATTTTCACCAACTAAATAAACATTTTAGACCCGAGCACGCCTCGGGCCTTAGTTG
GTGGGAAGTTAATTAATAATTTTCTAAGCTACTATCCGCTATGGATAAGAGCACAATAAA
CATAAACGGTTATGAGTTCCGTGAATTCCAAGGAGAACTTGAGGATTTAAATCAAACTCA
TTCAGAGCAAATTAGAAGAGAAGCCGAAGTGACATACTTCGACGAATTCGCAAAAGCTGA
ATTCCTTGACCTTTACCCCGAGTACTACAGACAGTACGTCGAAGGATGGTCGAGAAGCTA
CTACATGCGATCAAAACACATGTAGTCAATCTTTAAATTCGCAAACCAAAACCACTCTAT
CACAGAGCTTCACCGAGAATCATGGCAGCACGCCATCGAAGCCACTAGAGATGGGTTATC
TATCCTTCCACGTGTGAGGGCATTATCAGTCAAAACAGAACTTGACCAAGTCAAGTATAT
ACAGTCCTCCGCCGCAGGATACGGTTACATAGGTGCAAAGGGTCCCCCTTATGGTGAAAA
CCATGATAGAGCGATCCGTAGAGCCAAAGCTACCCTATACTCCGCCACAGCGGATGATGG
ACAAGGTATCGATTACGCGATCAGGGAATCAGTTCCTGACGTAGGCTATACACGCACTCA
GTTGGCAGATCTCACTGAGAAAACGAAAGTCAGAGGTGTTTGGGGAAGAGCATTCCACTA
CATCTTACTTGAAAGGCACAGCAGCTAGACCTCTTATAGAGGCAATTCAAGGAGGACAAT
CGTTCATCATGATAGGCAGTGATCCGATCGTCAACGTACCATACGTCTTAACAGCAACTA
AAGCACGGT

QA 1 849 1 849
DS 

RD RR2B767JQ 832 0 0
CAAGGAGGACAATCGTTCATCATGATAGGCAGTGATCCGATCGTCAACGTACCATACGTC
TTAACAGCAACTAAAGCACGGTGCAAATGGTTAATGTCCCTTGATTGGAGCTCATTTGAT
GCAACAGTCAATCGATTTGAAATCAACGCAGCATTCGACTTAATGAAAGAGCACTTAGTC
TTCCCGGACTTTGATACTGAAATGGCATACGAACTATGTCGTCAGATCTTTACACACAAG
AAAGTCGCCGCGCCTGATGGTAAGATATATTGGTCACACAAAGGAATTCCTTCTGGCAGT
TACTATACGTCACTTGTCGGTTCGATAGTCAATAAACTCGGAGTTGAGTATTTATGGCAT
CTCAAATTTGGACGAGGTCCAATGGTTACGTTCACCCTAGGTGACGACTCCCTTATAGGA
GACAATCATTACTACCCCCCAGACGAGTTAGCCGATAAAGCTTACGATTTGGGTTGGCTA
GTGAATCCAGACAAAACCGAGTACTCGACGTTACCAGGGAGCATAACCTTCTTAGGAAGA
TCAGTTCTTGGCTCCGTTAACCAACGTGAGTTAAAGAAGTGTATACAGCTTCTATTACTA
CCCGAGTTCCCAGTTGAATCAGGAGAAATTTCGGCCTTCAGAGCAGCAGCAATCGCAAAC
GATGCCGGTGGCAACAGTGAAATGTTGAACCGAGTCGCTCGAAGACTCAAACGCAAGTAC
GGAATCGCGGAAGCGCACCAAGTACCTTTGTATTTTAGACGTTATCAACCATAATAAGTT
GCAATATTTAATCTACTTATAAGCGTTTGAACGAGGGATAAACCCCGTTCTT

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 2

CO CL3921Contig1 284 2 1 U
GCTAATCATCTCTCTCTACTTTAATTGATGTATCTATTCCTTGTCTATGACGTGTTTGTT
GCTCTCTTTTACTTTCTTCTGTTGTATGTGCTCCAATTGTAAACTTTAAATGATGTATTG
TCTTTGTAAAAAGGAAACAAAAGAAGATGATTACAAGTATAGAACTCAACTCTAAAACAC
ACAAAAAGCATAATTAAAAAATTATAGTTCAACGATGCTTCAAGTGATAAATTTATCTTA
TGAATTATCTTACATAGACCGTTGAAATGAATATCCGCCTTATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BQ81JQ C 1
AF RR2BQ81TF U 1
BS 1 284 RR2BQ81TF

RD RR2BQ81JQ 284 0 0
GCTAATCATCTCTCTCTACTTTAATTGATGTATCTATTCCTTGTCTATGACGTGTTTGTT
GCTCTCTTTTACTTTCTTCTGTTGTATGTGCTCCAATTGTAAACTTTAAATGATGTATTG
TCTTTGTAAAAAGGAAACAAAAGAAGATGATTACAAGTATAGAACTCAACTCTAAAACAC
ACAAAAAGCATAATTAAAAAATTATAGTTCAACGATGCTTCAAGTGATAAATTTATCTTA
TGAATTATCTTACATAGACCGTTGAAATGAATATCCGCCTTATC

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2BQ81TF 284 0 0
GCTAATCATCTCTCTCTACTTTAATTGATGTATCTATTCCTTGTCTATGACGTGTTTGTT
GCTCTCTTTTACTTTCTTCTGTTGTATGTGCTCCAATTGTAAACTTTAAATGATGTATTG
TCTTTGTAAAAAGGAAACAAAAGAAGATGATTACAAGTATAGAACTCAACTCTAAAACAC
ACAAAAAGCATAATTAAAAAATTATAGTTCAACGATGCTTCAAGTGATAAATTTATCTTA
TGAATTATCTTACATAGACCGTTGAAATGAATATCCGCCTTATC

QA 1 284 1 284
DS 



AS 1 2

CO CL3922Contig1 462 2 1 U
GGGGGAATTCACATGATGGCTTCGTTCTCTTCGTTCTCAGTGAGAATTGCGTTACTTTTT
CTGGTTTTCTGCTTGATCGGCTTGCAAGCTGCGTATGATCTCCCTGAACAAACCCGCGGA
GACGTTTGCAGCGGGGTTTCGGATCCGGGTGGGTGCCCAATAAACTGTTTCCGGGCGGAT
CCGGTTTGCGGAGCCGATGGAGTAACGTACTCGTGTGGTTGTCCCGACGCAGCGTGTCAT
GGAGTTCGTGTAGTCAAAAGAGGAGCTTGCGACGGCAGGTAATGCTGGAAGTATCAAGCT
CTGTAGATCACATGTTGAATGGTTTCTTTCCTTTGTGTCTGTGTGTTCTAAGTTGAGTTG
CTTTCTCATCTTAGAACATATGTTGCGTTTGTATGTGTGTTGTTCTTTGTGTTTGTATGT
TCTAAGTTGAGATGCTTTGTCTTAATGGATTTGCCTTTTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BZ31JQ C 1
AF RR2BZ31TF U 1
BS 1 462 RR2BZ31TF

RD RR2BZ31JQ 462 0 0
GGGGGAATTCACATGATGGCTTCGTTCTCTTCGTTCTCAGTGAGAATTGCGTTACTTTTT
CTGGTTTTCTGCTTGATCGGCTTGCAAGCTGCGTATGATCTCCCTGAACAAACCCGCGGA
GACGTTTGCAGCGGGGTTTCGGATCCGGGTGGGTGCCCAATAAACTGTTTCCGGGCGGAT
CCGGTTTGCGGAGCCGATGGAGTAACGTACTCGTGTGGTTGTCCCGACGCAGCGTGTCAT
GGAGTTCGTGTAGTCAAAAGAGGAGCTTGCGACGGCAGGTAATGCTGGAAGTATCAAGCT
CTGTAGATCACATGTTGAATGGTTTCTTTCCTTTGTGTCTGTGTGTTCTAAGTTGAGTTG
CTTTCTCATCTTAGAACATATGTTGCGTTTGTATGTGTGTTGTTCTTTGTGTTTGTATGT
TCTAAGTTGAGATGCTTTGTCTTAATGGATTTGCCTTTTGTT

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2BZ31TF 462 0 0
GGGGGAATTCACATGATGGCTTCGTTCTCTTCGTTCTCAGTGAGAATTGCGTTACTTTTT
CTGGTTTTCTGCTTGATCGGCTTGCAAGCTGCGTATGATCTCCCTGAACAAACCCGCGGA
GACGTTTGCAGCGGGGTTTCGGATCCGGGTGGGTGCCCAATAAACTGTTTCCGGGCGGAT
CCGGTTTGCGGAGCCGATGGAGTAACGTACTCGTGTGGTTGTCCCGACGCAGCGTGTCAT
GGAGTTCGTGTAGTCAAAAGAGGAGCTTGCGACGGCAGGTAATGCTGGAAGTATCAAGCT
CTGTAGATCACATGTTGAATGGTTTCTTTCCTTTGTGTCTGTGTGTTCTAAGTTGAGTTG
CTTTCTCATCTTAGAACATATGTTGCGTTTGTATGTGTGTTGTTCTTTGTGTTTGTATGT
TCTAAGTTGAGATGCTTTGTCTTAATGGATTTGCCTTTTGTT

QA 1 462 1 462
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3924Contig1 843 2 4 U
GGATAACCATCAATACTTTCGTCCGCAAACTCAAAGCTTCAAAAAGTAAAAAACAATGAA
GAATGTCACACTTGTTCTTGCTATGATCCTCTTCTTAAGCTGTGTCATATCCGGAGTCAC
AGCAACAGAACTAGAGTCATCAACTAACCAAGAGCTCTTCCTATCGCGGCACGTCTTACC
TCACTTTCACCCCAAGCCACATTGGCCGTTCCGTGGCCCTAGAAAAGCCTTCCCGCCACA
CCCTGCATGCCACTTCCGACCAACTACGTTCCATCTGCCACAGGAAGTCACCAGATGCTT
GTCCGACAAGAAGGAGGTAGGTACATGTTTCGATGATATCGCTAAGGCTTTCTTCACAAG
AAAAGCCGCTATCGGATCGGAATGTTGCGCGGTGATCAAGAAGATGAACAAAGATTGTGA
GAAAACCGTCTTTGGATCTTTCCATGACCCCTTCTTCACCGGCTATGTCAAGCTACATTG
CTCTACCGTTGTTGGATCTACTTCACTTGTTCCTTCACTTGCTCCTTTACATGCTCCTTT
GCATGCTCCTTCACAGGCTCCCTCACCGCCTCCATCGCAGGCTCCCTCACCGCCTCCATC
GCAGGCTCCCTCACCGCCTCCTCCGCAGGCTCCCTCACCGTCTCTTTCGCAGGCTCACTC
ACCGGCTCTTTCACAGGCTCCCTCACAGGCTCCCTCACCGTCTCTTTCACCGGTTCCTTC
CCCGGCTCAGGGATTTTAGCTATTTGTTACAAAATGTTGTGTCCTAGGGAGTTTTAGTTT
TTCTTCTTGTTTCAAAATTTAGTGATTATTTTGAGACGACCGTCTTTGGATTTTAATTCA
CTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2DA54TF U 1
AF RR2DA54JQ C 177
BS 1 628 RR2DA54TF
BS 629 629 RR2DA54JQ
BS 630 647 RR2DA54TF
BS 648 843 RR2DA54JQ

RD RR2DA54TF 647 0 0
GGATAACCATCAATACTTTCGTCCGCAAACTCAAAGCTTCAAAAAGTAAAAAACAATGAA
GAATGTCACACTTGTTCTTGCTATGATCCTCTTCTTAAGCTGTGTCATATCCGGAGTCAC
AGCAACAGAACTAGAGTCATCAACTAACCAAGAGCTCTTCCTATCGCGGCACGTCTTACC
TCACTTTCACCCCAAGCCACATTGGCCGTTCCGTGGCCCTAGAAAAGCCTTCCCGCCACA
CCCTGCATGCCACTTCCGACCAACTACGTTCCATCTGCCACAGGAAGTCACCAGATGCTT
GTCCGACAAGAAGGAGGTAGGTACATGTTTCGATGATATCGCTAAGGCTTTCTTCACAAG
AAAAGCCGCTATCGGATCGGAATGTTGCGCGGTGATCAAGAAGATGAACAAAGATTGTGA
GAAAACCGTCTTTGGATCTTTCCATGACCCCTTCTTCACCGGCTATGTCAAGCTACATTG
CTCTACCGTTGTTGGATCTACTTCACTTGTTCCTTCACTTGCTCCTTTACATGCTCCTTT
GCATGCTCCTTCACAGGCTCCCTCACCGCCTCCATCGCAGGCTCCCTCACCGCCTCCATC
GCAGGCTCCCTCACCGCCTCCTCCGCAG*CTCCCTCACCGTCTCTTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2DA54JQ 667 0 0
TACCTCACTTTCACCCCAAGCCACATTGGCCGTTCCGTGGCCCTAGAAAAGCCTTCCCGC
CACACCTTGCATGCCACTTCCGACCAACTACGTTCCATCTGCCACAGGAAGTCACCAGAT
GCTTGTCCGACAAGAAGGAGGTAGGTACATGTTTCGATGATATCGCTAAGGCTTTCTTCA
CAAGAAAAGCCGCTATCGGATCGGAATGTTGCGCGGTGATCAAGAAGATGAACAAAGATT
GTGAGAAAACCGTCTTTGGATCTTTCCATGACCCCTTCTTCACCGGCTATGTCAAGCTAC
ATTGCTCTACCGTTGTTGGATCTACTTCACTTGTTCCTTCACTTGCTCCTTTACATGCTC
CTTTGCATGCTCCTTCACAGGCTCCCTCACCGCCTCCATCGCAGGCTCCCTCACCGCCTC
CATCGCAGGCTCCCTCACCGCCTCCTCCGCAGGCTCCCTCACCGTCTCTTTCGCAGGCTC
ACTCACCGGCTCTTTCACAGGCTCCCTCACAGGCTCCCTCACCGTCTCTTTCACCGGTTC
CTTCCCCGGCTCAGGGATTTTAGCTATTTGTTACAAAATGTTGTGTCCTAGGGAGTTTTA
GTTTTTCTTCTTGTTTCAAAATTTAGTGATTATTTTGAGACGACCGTCTTTGGATTTTAA
TTCACTT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL3927Contig1 464 2 1 U
GCTTGATCGATATACTTACAAGAATGAGGAAAATGGAGAAAAAAAAAAAAATACCATTTA
TTTTATTTCGACTATAAAAAATTTCATATCAAAAAAAAATTTTTTTAGTTATGACTTATA
CTCTCTATCACAAGCATATGTATTTTACAAATTATCACAAATTCAAGTTAGTAACTTTTC
TAAATTAAAGTCTTTTTTTGAATATAACATATACATAACATCCTTTTTTGTTAAGAATCA
AATAAAGGATTTTTTTCAAGAACAATGAATCTTTCATTATGAATGGAAAGATAAAACCTT
TTTAAATTCCGAAATAAATCAATGGAAAAACTGGTTACGAAGTCATTCTCAATATAATTT
ACCTCAGATTGCATGGGCTAGATTAGTAACCCAAAAATGGAAAAATAAAATAAACCAAGA
CTCTCTCGTTCTAAATCCAAGTTTAAACAAAGTGGATTCATACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BS45JQ C 1
AF RR2BS45TF U 1
BS 1 464 RR2BS45TF

RD RR2BS45JQ 464 0 0
GCTTGATCGATATACTTACAAGAATGAGGAAAATGGAGAAAAAAAAAAAAATACCATTTA
TTTTATTTCGACTATAAAAAATTTCATATCAAAAAAAAATTTTTTTAGTTATGACTTATA
CTCTCTATCACAAGCATATGTATTTTACAAATTATCACAAATTCAAGTTAGTAACTTTTT
TAAATTAAAGTCTTTTTTTGAATATAACATATACATAACATCCTTTTTTGTTAAGAATCA
AATAAAGGATTTTTTTCAAGAACAATGAATCTTTCATTATGAATGGAAAGATAAAACCTT
TTTAAATTCCGAAATAAATCAATGGAAAAACTGGTTACGAAGTCATTCTCAATATAATTT
ACCTCAGATTGCATGGGCTAGATTAGTAACCCAAAAATGGAAAAATAAAATAAACCAAGA
CTCTCTCGTTCTAAATCCAAGTTTAAACAAAGTGGATTCATACG

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2BS45TF 464 0 0
GCTTGATCGATATACTTACAAGAATGAGGAAAATGGAGAAAAAAAAAAAAATACCATTTA
TTTTATTTCGACTATAAAAAATTTCATATCAAAAAAAAATTTTTTTAGTTATGACTTATA
CTCTCTATCACAAGCATATGTATTTTACAAATTATCACAAATTCAAGTTAGTAACTTTTC
TAAATTAAAGTCTTTTTTTGAATATAACATATACATAACATCCTTTTTTGTTAAGAATCA
AATAAAGGATTTTTTTCAAGAACAATGAATCTTTCATTATGAATGGAAAGATAAAACCTT
TTTAAATTCCGAAATAAATCAATGGAAAAACTGGTTACGAAGTCATTCTCAATATAATTT
ACCTCAGATTGCATGGGCTAGATTAGTAACCCAAAAATGGAAAAATAAAATAAACCAAGA
CTCTCTCGTTCTAAATCCAAGTTTAAACAAAGTGGATTCATACG

QA 1 464 1 464
DS 



AS 1 2

CO CL3928Contig1 917 2 4 U
GCATCGCACGTAGAAGAGGGCGGCCCCCAGGGAGTTTCCGTAAAAAAGTTGGAGTTCAGA
CACAAAAGCATAAAAAGGTCATACCTGCTCGCAAATCAGTTCGGCTAAAGAAGACTAAAA
CGTCAATGGCAGAGAGAATCTCTGTTAGGTCAAAGAATCGTAAAAAGGTTGTTGCAAACA
AACCAGTGCGACGTTCGGGCAGGAAACCGAAGCATGTTGTTCGGCTACAGGATAAAAGTC
AAGTTTCTGGAGGGGGTAAGAAACGCAAACTGGAAACCAAAAGAGGCAGAGGCAGGCCTA
AGAAAGTAAAACAAGAGATTTCCGTAAGAAGTAAGAGAACAGAAAGGATCTTTAGCTATT
GGTTGAATGGACTCCGCTTATCAAGAAAGCCTGATGATGAACGGGTCAGTAAGTTCTCGA
GAGATGGATGTTCTAAACCCTTGGAGAACTCGGATTCTGATCAAGTACAACGTCAGTGTC
ATTTATGCGGCTCGATGGACTCTGAAACCGGATCAACTTTCATCGCTTGCGAAATCTGTG
AAAGTAAATCCATTTCCTAACCTTCTTTTGGTTCACCATGATTAAATCCATTTGTTCTCA
GCTTTATTTTTCTCTTTTTGTCTGTAATGTTTGTAGAATGGTACCATGGAGATGCATGTG
GGATTGGCGAGGAGAACTCAAGTATGGTGATTGGATTCCGGTGCCATCTCTGTCGAGAAA
AGCCTTCTCCCACCTGTCCACATATAAGATCTACTACATCCCCTGTCCCATCCCCATCCT
AAGCTGTGAATATTGATCAAGTTAGAAAATCAGAGTAGAGAAGGAGGAAAGTGTTTGGTG
TCAGTATGAAGTTATATTTGGCTTGTTACTTGGATGAGTAGGTACTTGAGTGAAGTGGTC
GACTTAGAATTAGATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN40TF U 1
AF RR2GN40JQ C 227
BS 1 233 RR2GN40TF
BS 234 234 RR2GN40JQ
BS 235 694 RR2GN40TF
BS 695 917 RR2GN40JQ

RD RR2GN40TF 694 0 0
GCATCGCACGTAGAAGAGGGCGGCCCCCAGGGAGTTTCCGTAAAAAAGTTGGAGTTCAGA
CACAAAAGCATAAAAAGGTCATACCTGCTCGCAAATCAGTTCGGCTAAAGAAGACTAAAA
CGTCAATGGCAGAGAGAATCTCTGTTAGGTCAAAGAATCGTAAAAAGGTTGTTGCAAACA
AACCAGTGCGACGTTCGGGCAGGAAACCGAAGCATGTTGTTCGGCTACAGGATGAAAGTC
AAGTTTCTGGAGGGGGTAAGAAACGCAAACTGGAAACCAAAAGAGGCAGAGGCAGGCCTA
AGAAAGTAAAACAAGAGATTTCCGTAAGAAGTAAGAGAACAGAAAGGATCTTTAGCTATT
GGTTGAATGGACTCCGCTTATCAAGAAAGCCTGATGATGAACGGGTCAGTAAGTTCTCGA
GAGATGGATGTTCTAAACCCTTGGAGAACTCGGATTCTGATCAAGTACAACGTCAGTGTC
ATTTATGCGGCTCGATGGACTCTGAAACCGGATCAACTTTCATCGCTTGCGAAATCTGTG
AAAGTAAATCCATTTCCTAACCTTCTTTTGGTTCACCATGATTAAATCCATTTGTTCTCA
GCTTTATTTTTCTCTTTTTGTCTGTAATGTTTGTAGAATGGTACCATGGAGATGCATGTG
GGATTGGCGAGGAGAACTCAAGTATGGTGATTGG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2GN40JQ 691 0 0
ACAGGATAAAAGTCAAGTTTCTGGAGGGGGTAAGAAACGCAAACTGGAAACCAAAAGAGG
CAGAGGCAGGCCTAAGAAAGTAAAACAAGAGATTTCCGTAAGAAGTAAGAGAACAGAAAG
GATCTTTAGCTATTGGTTGAATGGACTCCGCTTATCAAGAAAGCCTGATGATGAACGGGT
CAGTAAGTTCTCGAGAGATGGATGTTCTAAACCCTTGGAGAACTCGGATTCTGATCAAGT
ACAACGTCAGTGTCATTTATGCGGCTCGATGGACTCTGAAACCGGATCAACTTTCATCGC
TTGCGAAATCTGTGAAAGTAAATCCATTTCCTAACCTTCTTTTGGTTCACCATGATTAAA
TCCATTTGTTTTCAGCTTTATTTTTCTCTTTTTGTCTGTAATGTTTGTAGAATGGTACCA
TGGAGATGCATGTGGGATTGGCGAGGAGAACTCAAGTATGGTGATTGGATTCCGGTGCCA
TCTCTGTCGAGAAAAGCCTTCTCCCACCTGTCCACATATAAGATCTACTACATCCCCTGT
CCCATCCCCATCCTAAGCTGTGAATATTGATCAAGTTAGAAAATCAGAGTAGAGAAGGAG
GAAAGTGTTTGGTGTCAGTATGAAGTTATATTTGGCTTGTTACTTGGATGAGTAGGTACT
TGAGTGAAGTGGTCGACTTAGAATTAGATTG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL3929Contig1 878 2 2 U
ATGATTCCTTTCGTTTTCTTCTTGGATTCTCTTTGGAATCTCCTAGAAATGCGATTAATT
TACCAACAAAGAAACTCAATTCCAGATATCAGCGTGATGCCAATACCTTGGAGGCTTGGA
GCGATGGTGATCTTCCTGCCTAAACCGATCTGTTTTCTCTGCGTTCCCATCCCTGCTTTC
GCCGGTTTTAAGAAGCCAGAAGCGAGCTCTAAGGCGACACTTATGCCAACAACCGTGAAC
CACCCCAGCTGAGAAGTTCCAGTTTTGAAAGTATGAACAACTACAGGCTGTGACTAATGC
TGACTTTGATTTGCCGGATCGATACTCCACTGAATGAGAGGGGATGGAAGAGTTCTACTG
ATGGTTCTACTTCTCCACCACAATGGAGCTGCGAAAATAGGAACAAGCTTACAGTGAATT
AAGGTCTGATTCATGTGTTTGTCACAGATGAGATGCTAAGAAAGCTGAGGAGTTTGCAAG
GTTTGGTGATCAAATTGGACTAAATGAGAAGGCTTTAGGCGACAGAGAAACAAAGAATTA
GCAAAGATCAGTTACAAATGTAAGAGCTCCCCCACATGCATCACATGGTCTGTAAGAAAT
AATATTATTGGCTTAAGACATGCATCACTTTCCCATTTTTAGATTCTATCACCTTATTTT
CAAAATTTTTATTACTTCCTCCACTATTCACTTCAAAATTCTGATTCTATTTTATAAAAT
CATAAAATATGTTCATTAGGCCAATATTTGTTTTTGTTCATGCTTCACCTCATATTTGTT
ATTGGCCATACTCTGCGTTTTTTTCAACAAGTTGAGGGTAAGGTGTATAGATGTTTCCAA
TTTTTAGGACAAAAGTATAAATGTTTCCTTTAAAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB34TF U 1
AF RR2EB34JQ C 64
BS 1 532 RR2EB34TF
BS 533 878 RR2EB34JQ

RD RR2EB34TF 532 0 0
ATGATTCCTTTCGTTTTCTTCTTGGATTCTCTTTGGAATCTCCTAGAAATGCGATTAATT
TACCAACAAAGAAACTCAATTCCAGATATCAGCGTGATGCCAATACCTTGGAGGCTTGGA
GCGATGGTGATCTTCCTGCCTAAACCGATCTGTTTTCTCTGCGTTCCCATCCCTGCTTTC
GCCGGTTTTAAGAAGCCAGAAGCGAGCTCTAAGGCGACACTTATGCCAACAACCGTGAAC
CACCCCAGCTGAGAAGTTCCAGTTTTGAAAGTATGAACAACTACAGGCTGTGACTAATGC
TGACTTTGATTTGCCGGATCGATACTCCACTGAATGAGAGGGGATGGAAGAGTTCTACTG
ATGGTTCTACTTCTCCACCACAATGGAGCTGCGAAAATAGGAACAAGCTTACAGTGAATT
AAGGTCTGATTCATGTGTTTGTCACAGATGAGATGCTAAGAAAGCTGAGGAGTTTGCAAG
GTTTGGTGATCAAATTGGACTAAATGAGAAGGCTTTAGGCGACAGAGAAACA

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2EB34JQ 815 0 0
CAACAAAGAAACTCAATTCCAGATATCAGCGTGATGCCAATAC*TTGGAGGCTTGGAGCG
ATGGTGATCTTCCTGCCTAAACCGATCTGTTTTCTCTGCGTTCCCATCCCTGCTTTCGCC
GGTTT*AAGAAGCCAGAAGCGAGCTCTAAGGCGACACTTATGCCAACAACCGTGAACCAC
CCCAGCTGAGAAGTTCCAGTTTTGAAAGTATGAACAACTACAGGCTGTGACTAATGCTGA
CTTTGATTTGCCGGATCGATACTCCACTGAATGAGAGGGGATGGAAGAGTTCTACTGATG
GTTCTACTTCTCCACCACAATGGAGCTGCGAAAATAGGAACAAGCTTACAGTGAATTAAG
GTCTGATTCATGTGTTTGTCACAGATGAGATGCTAAGAAAGCTGAGGAGTTTGCAAGGTT
TGGTGATCAAATTGGACTAAATGAGAAGGCTTTAGGCGACAGAGAAACAAAGAATTAGCA
AAGATCAGTTACAAATGTAAGAGCTCCCCCACATGCATCACATGGTCTGTAAGAAATAAT
ATTATTGGCTTAAGACATGCATCACTTTCCCATTTTTAGATTCTATCACCTTATTTTCAA
AATTTTTATTACTTCCTCCACTATTCACTTCAAAATTCTGATTCTATTTTATAAAATCAT
AAAATATGTTCATTAGGCCAATATTTGTTTTTGTTCATGCTTCACCTCATATTTGTTATT
GGCCATACTCTGCGTTTTTTTCAACAAGTTGAGGGTAAGGTGTATAGATGTTTCCAATTT
TTAGGACAAAAGTATAAATGTTTCCTTTAAAGATC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL3930Contig1 741 2 1 U
GGACTCTGCAACACACACACAACTATGGAGCTCGTCACAACTCTGGCCAGCTGGTTAACG
CCGACGACTCTCTTCCTCCTCCTCAATTTCACCATCGGCACCATTTTCTTCACCAACAAG
TTCGGTCCCTGTTCCAAGAAACACCAACCGTATCAAGATGGGTTCGGTTCAGGTCATAAC
CATTCTCAGGCGTCGGGTGCATTGGCCGGGAGGAGGAGACGGTTGAGGCAGTGGAGAAGA
GGCGACCGGAGACGACGAGAGTCGAGAGGACGACTTCGATCGATGAAGGAGAAGAAGGTG
TCGACGACAAAGCATCAGATTTCATCAACAAGTTCAAGCAGCAGCTGAAACTACAGAGGC
TAGATTCGTTTCTCAGGTACAGAGAGATGCTCAAGAACAATTGAACTTTGAATTTACGGT
TTTACCCTTTGTCGGAATGGAGTTTCTTGTGGGGTCTACTTGGTTAAAAACGGAATACCC
TTGTCTGAAGGGCTTTTTGGTCATTTCGACACATAATGCTTGTCTTTAGATTTGGTGATG
ACTGATGACAAACTAGTTTTGTCGTGTTCGTAATTTCTAGATCTGGCTTCTGCTGCACTT
TTTTACTTTTACGTTTTAGGTCGGCAAAAGTAGTTTATGCTTATTTTACGTTTAAAAGTA
CTCATAATATTATTAGTCTTCGACTCTTCGTATTGATCAGTTTTTTTTTATAGTTTCCGT
TAAATCGAAAACATTCATTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AY39JQ C 1
AF RR2AY39TFB U 1
BS 1 741 RR2AY39TFB

RD RR2AY39JQ 741 0 0
GGACTCTGCAACACACACACAACTATGGAGCTCGTCACAACTCTGGCCAGCTGGTTAACG
CCGACGACTCTCTTCCTCCTCCTCAATTTCACCATCGGCACCATTTTCTTCACCAACAAG
TTCGGTCCCTGTTCCAAGAAACACCAACCGTATCAAGATGGGTTCGGTTCAGGTCATAAC
CATTCTCAGGCGTCGGGTGCATTGGCCGGGAGGAGGAGACGGTTGAGGCAGTGGAGAAGA
GGCGACCGGAGACGACGAGAGTCGAGAGGACGACTTCGATCGATGAAGGAGAAGAAGGTG
TCGACGACAAAGCATCAGATTTCATCAACAAGTTCAAGCAGCAGCTGAAACTACAGAGGC
TAGATTCGTTTCTCAGGTACAGAGAGATGCTCAAGAACAATTGAACTTTGAATTTACGGT
TTTACCCTTTGTCGGAATGGAGTTTCTTGTGGGGTCTACTTGGTTAAAAACGGAATACCC
TTGTCTGAAGGGCTTTTTGGTCATTTCGACACATAATGCTTGTCTTTAGATTTGGTGATG
ACTGATGACAAACTAGTTTTGTCGTGTTCGTAATTTCTAGATCTGGCTTCTGCTGCACTT
TTTTACTTTTACGTTTTAGGTCGGCAAAAGTAGTTTATGCTTATTTTACGTTTAAAAGTA
CTCATAATATTATTAGTCTTCGACTCTTCGTATTGATCAGTTTTTTTTTATAGTTTCCGT
TAAATCGAAAACATTCATTGG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2AY39TFB 741 0 0
GGACTCTGCAACACACACACAACTATGGAGCTCGTCACAACTCTGGCCAGCTGGTTAACG
CCGACGACTCTCTTCCTCCTCCTCAATTTCACCATCGGCACCATTTTCTTCACCAACAAG
TTCGGTCCCTGTTCCAAGAAACACCAACCGTATCAAGATGGGTTCGGTTCAGGTCATAAC
CATTCTCAGGCGTCGGGTGCATTGGCCGGGAGGAGGAGACGGTTGAGGCAGTGGAGAAGA
GGCGACCGGAGACGACGAGAGTCGAGAGGACGACTTCGATCGATGAAGGAGAAGAAGGTG
TCGACGACAAAGCATCAGATTTCATCAACAAGTTCAAGCAGCAGCTGAAACTACAGAGGC
TAGATTCGTTTCTCAGGTACAGAGAGATGCTCAAGAACAATTGAACTTTGAATTTACGGT
TTTACCCTTTGTCGGAATGGAGTTTCTTGTGGGGTCTACTTGGTTAAAAACGGAATACCC
TTGTCTGAAGGGCTTTTTGGTCATTTCGACACATAATGCTTGTCTTTAGATTTGGTGATG
ACTGATGACAAACTAGTTTTGTCGTGTTCGTAATTTCTAGATCTGGCTTCTGCTGCACTT
TTTTACTTTTACGTTTTAGGTCGGCAAAAGTAGTTTATGCTTATTTTACGTTTAAAAGTA
CTCATAATATTATTAGTCTTCGACTCTTCGTATTGATCAGTTTTTTTTTATAGTTTCCGT
TAAATCGAAAACATTCATTGG

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL3931Contig1 460 2 1 U
GGCTCCGTCGACAGCACAAACCATGGGTATCGATCTTATCGCAGGAGGTAAGAGCAAGAA
GACCAAAAGGACTGCTCCTAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATA
CCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGCAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTT
CATGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTGCAGTTCATGAACGG
CAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGTCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAG
AAGCCTCTCTCTGCTGTTTCGACGGGTGTTATTTTGTGTTATGGTTGCTTTCAGTATAGC
AGTTTTGCTAGTGAACTCGTGTTCCTCTTTGCCTGTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCT
GTCTACTTTTCGTTCTAAACGACAGTTAAATGTTTTGCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FA06JQ C 1
AF RR2FA06TF U 1
BS 1 460 RR2FA06TF

RD RR2FA06JQ 460 0 0
GGCTCCGTCGACAGCACAAACCATGGGTATCGATCTTATCGCAGGAGGTAAGAGCAAGAA
GACCAAAAGGACTGCTCCTAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATA
CCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGCAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTT
CATGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTGCAGTTCATGAACGG
CAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGTCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAG
AAGCCTCTCTCTGCTGTTTCGACGGGTGTTATTTTGTGTTATGGTTGCTTTCAGTATAGC
AGTTTTGCTAGTGAACTCGTGTTCCTCTTTGCCTGTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCT
GTCTACTTTTCGTTCTAAACGACAGTTAAATGTTTTGCTT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2FA06TF 460 0 0
GGCTCCGTCGACAGCACAAACCATGGGTATCGATCTTATCGCAGGAGGTAAGAGCAAGAA
GACCAAAAGGACTGCTCCTAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATA
CCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGCAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTT
CATGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCGCTCTCCAAGCTCGTGCAGTTCATGAACGG
CAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGTCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAG
AAGCCTCTCTCTGCTGTTTCGACGGGTGTTATTTTGTGTTATGGTTGCTTTCAGTATAGC
AGTTTTGCTAGTGAACTCGTGTTCCTCTTTGCCTGTTCCAGACATTGTTTTAAGTTATCT
GTCTACTTTTCGTTCTAAACGACAGTTAAATGTTTTGCTT

QA 1 460 1 460
DS 



AS 1 2

CO CL3932Contig1 694 2 7 U
GGTCACGCGCCGTCGCGAAAACAAAGTAAAGAAAGAAAAAAAAAATCCAAAACGCGGCGA
AGGTTGAGAAAGGAGAGAGAGATGCAATCCCAAGGAATTTGGAGCATACTATGGAGGAAA
TACGCAGATTATAAGTACAACAAGTTCGAGAGGTTCGCTGTCTGGGAGATGATCGAGCCT
TACCGTCGACCCAAAACCTTCACAGCCTTGATTACTATCTACGTCGCCGCCTTTTACACC
GGCGTCATCGGCGCTGCGGTTACGGAGCAGCTTTACAAGGAGAAGTTTTGGGAAGAGCAC
CCAGGCAAAACGGTGCCTCTGATGAAGCCATTATTCTATCGAGGACCGTGGAGGGTTTAT
CGTGGTGAAGCTATTGCTTCTGATGCTAGCAGCAGCCAGTGAAGTTAACGATACGATCCA
GAGACTATGGTCGAAGGATATATCTCCCATCATTAGTTGGTTTATGCTGGTTCGCTAGTA
TATATACAAAACAACTTTGCGTCTAGTAGAATGTGCGTGTGTCGAGTTGTTTAAATGTCT
TCTAGGTTTCTATGGATTAAAGCTGGCTGGTGTATTTTTTCTTGTAGACAATAAGGTTAA
GAATATGATTCTTAAAACTCATGTAATGGCAGTCTCTGTTATTACATTAAGGTTTTGTTA
TGAGAAGTTTAAGGGTTTCCATCCATTTCTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GB64TF U 1
AF RR2GB64JQ C 217
BS 1 595 RR2GB64TF
BS 596 596 RR2GB64JQ
BS 597 651 RR2GB64TF
BS 652 652 RR2GB64JQ
BS 653 677 RR2GB64TF
BS 678 678 RR2GB64JQ
BS 679 694 RR2GB64TF

RD RR2GB64TF 694 0 0
GGTCACGCGCCGTCGCGAAAACAAAGTAAAGAAAGAAAAAAAAAATCCAAAACGCGGCGA
AGGTTGAGAAAGGAGAGAGAGATGCAATCCCAAGGAATTTGGAGCATACTATGGAGGAAA
TACGCAGATTATAAGTACAACAAGTTCGAGAGGTTCGCTGTCTGGGAGATGATCGAGCCT
TACCGTCGACCCAAAACCTTCACAGCCTTGATTACTATCTACGTCGCCGCCTTTTACACC
GGCGTCATCGGCGCTGCGGTTACGGAGCAGCTTTACAAGGAGAAGTTTTGGGAAGAGCAC
CCAGGCAAAACGGTGCCTCTGATGAAGCCATTATTCTATCGAGGACCGTGGAGGGTTTAT
CGTGGTGAAGCTATTGCTTCTGATGCTAGCAGCAGCCAGTGAAGTTAACGATACGATCCA
GAGACTATGGTCGAAGGATATATCTCCCATCATTAGTTGGTTTATGCTGGTTCGCTAGTA
TATATACAAAACAACTTTGCGTCTAGTAGAATGTGCGTGTGTCGAGTTGTTTAAATGTCT
TCTAGGTTTCTATGGATTAAAGCTGGCTGGTGTATTTTTTCTTGTAGACAATAAG*TTAA
GAATATGATTCTTAAAACTCATGTAATGGCAGTCTCTGTTATTACATTAAG*TTTTGTTA
TGAGAAGTTTAAGGGTT*CCATCCATTTCTTTGG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2GB64JQ 478 0 0
ATCTACGTCGCCGCCTTTTACACCGGCGTCATCGGCGCTGCGGTTACGGAGCAGCTTTAC
AAGGAGAAGTTTTGGGAAGAGCACCCAGGCAAAACGGTGCCTCTGATGAAGCCATTATTC
TATCGAGGACCGTGGAGGGTTTATCGTGGTGAAGCTATTGCTTTTGATGCTAGCAGCAGC
CAGTGAAGTTAACGATACGATCCAGAGACTATGGTCGAAGGATATATCTCCCATCATTAG
TTGGTTTATGCTGGTTCGCTAGTATATATACAAAACAACTTTGCGTCTAGTAGAATGTGC
GTGTGTCGAGTTGTTTAAATGTCTTCTAGGTTTCTATGGATTAAAGCTGGCTGGTGTATT
TTTTCTTGTAGACAATAAGGTTAAGAATATGATTCTTAAAACTCATGTAATGGCAGTCTC
TGTTATTACATTAAGGTTTTGTTATGAGAAGTTTAAGGGTTTCCATCCATTTCTTTGG

QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 2

CO CL3933Contig1 768 2 3 U
GATAATAGTCTGCTGCTACACAAATGCTTAAACTCCATACACTGAAGTACAAAGTTGTTT
GCATAACTTAGGAGCTAAAGATAGTCAAAAGGGCAGAGACGAAGCACACATATCTAAAGA
AAGTTAACATGAAATATGGAAAAAAAACGACTTTAATACTTTTATTCTCATACCTCTCCT
CTCATCATTGACTACTAAACTCACTCCATCCTTTGGCGTTTATTTTTCAGCTTTGTGAAC
ATCTGCTCAACATCTTCCGACGTTATCGCCCTTGAAGTACCAACAGACTCCAGCAAACTC
CGTAACCCTTCTTTGAAGTTATTAACGCGGTGACAGAACTCAACTTTAGTAACATGGTCG
AAATTGTTCAAACGATCAAGTGCTCCCCCTTCCTGTTTCTCCAGTTTCTCTGTTCTTTTC
TCCTTTGCCTTATTCTCGTATTCAGCAATCGTGTCCTCTGCATCAAGTAAGTAGCTAACC
TTTCTCTCGCTGTACATCTCAAGGCACGTCTCGCATTTGCACAGCATGTTCCTCCAGTTT
TTGGCTAAAAACAGCGGTTTCTTCTCAAACTCAATACACGAGGTTAGACCTGTTGCAATT
GCACAACCAGCCGCAGGAAAGGGTTCGGGTTCGGCGAGCTTCTCAGTGCATCCTCTCAAA
ACAGGTTTTTCAGCTTCAGTACTGTTCTCAGGCTTGACAGGTTCGGTAGCTGTAGGGGTT
TGGTTTAACTCGGTAGTGTCTGAACAAGCATTAGCAGAATCATTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C684JQ U 99
AF RR2C684TF C 1
BS 1 98 RR2C684TF
BS 99 537 RR2C684JQ
BS 538 768 RR2C684TF

RD RR2C684JQ 439 0 0
ACGAAGCACACATATCTAAAGAAAGTTAACATGAAATATGGAAAAAAAACGACTTTAATA
CTTTTATTCTCATACCTCTCCTCTCATCATTGACTACTAAACTCACTCCATCCTTTGGCG
TTTATTTTTCAGCTTTGTGAACATCTGCTCAACATCTTCCGACGTTATCGCCCTTGAAGT
ACCAACAGACTCCAGCAAACTCCGTAACCCTTCTTTGAAGTTATTAACGCGGTGACAGAA
CTCAACTTTAGTAACATGGTCGAAATTGTTCAAACGATCAAGTGCTCCCCCTTCCTGTTT
CTCCAGTTTCTCTGTTCTTTTCTCCTTTGCCTTATTCTCGTATTCAGCAATCGTGTCCTC
TGCATCAAGTAAGTAGCTAACCTTTCTCTCGCTGTACATCTCAAGGCACGTCTCGCATTT
GCACAGCATGTTCCTCCAG

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2C684TF 768 0 0
GATAATAGTCTGCTGCTACACAAATGCTTAAACTCCATACACTGAAGTACAAAGTTGTTT
GCATAACTTAGGAGCTAAAGATAGTCAAAAGGGCAGAGACGAAGCACACATATCTAAAGA
AAGTTAACATGAGATATGGAAAAGAAACGACTTTAATACTTTTATTCTCATACCTCTCCT
CTCATCATTGACTACTAGACTCACTCCATCCTTTGGCGTTTATTTTTCAGCTTTGTGAAC
ATCTGCTCAACATCTTCCGACGTTATCGCCCTTGAAGTACCAACAGACTCCAGCAAACTC
CGTAACCCTTCTTTGAAGTTATTAACGCGGTGACAGAACTCAACTTTAGTAACATGGTCG
AGATTGTTCAAACGATCAAGTGCTCCGCCTTCCTGTTTCTCCAGTTTCTCTGTTCTTTTC
TCCTTTGCCTTATTCTCGTATTCAGCAATCGTGTCCTCTGCATCAAGTAAGTAGCTAACC
TTTCTCTCGCTGTACATCTCAAGGCACGTCTCGCATTTGCACAGCATGTTCCTCCAGTTT
TTGGCTAAAAACAGCGGTTTCTTCTCAAACTCAATACACGAGGTTAGACCTGTTGCAATT
GCACAACCAGCCGCAGGAAAGGGTTCGGGTTCGGCGAGCTTCTCAGTGCATCCTCTCAAA
ACAGGTTTTTCAGCTTCAGTACTGTTCTCAGGCTTGACAGGTTCGGTAGCTGTAGGGGTT
TGGTTTAACTCGGTAGTGTCTGAACAAGCATTAGCAGAATCATTGGAC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL3934Contig1 856 2 5 U
GCTCCACAAGGTTGCAGAGACGGCTCGGAAGCTGGGGATAATGGTGATCGCTGACGAAGT
GTACGACAAGACTATATTCGGAGACAACCCTTTCGTTCCGATGGCCAAGTTCGCATCGAC
CGTCCCTGTGCTCACCCTGGGAGGCATATCTAAAGGATGGGTTGTTCCTGGATGGAAGAT
TGGCTGGATCGCCTTGAATGATCCCGAGGGCGTTTTCGAATCCACCAAGGTGGCTCAATC
CATCAAGCAGAGTCTTGACATCACTCCTGACCCTTCCACTATCATTCAGGCTGCGCTTCC
TGAGATTTTGGAGAAAGTGGATGAAAACTTCTTTGCAAAGAAGAGCAAGATACTCAAACA
TAATGTCGATTTGGTGTGTGATAGGCTCAAGGATATTCCCTGCGTCGTCTGTCCCAAGAA
ACCTGAGTCTTGCACTTATCTTTTGACCAAGCTGGAGCCGTCATTGTTGGATAACATCAA
GGATGACATTGATTTCTGTGTGAAGCTGGCCAGAGAGGAAAACCTCGTGTTTCTACCAGG
AGAGGCTCTGGGGTTGAAGAACTGGATGAGGATAACTATTGGAGTGGAAGCTCATATGCT
TGAGGATGCACTTGAGAGACTAAAGGGTTTCTGTGCACGTCATACCAAGAGAACAGATAC
AGAAACTGAGTCACCTTCAACCGTTGAAAATGTGTGATAATAATAACACTGTCGGGATAT
TACATGTATTTTACGCGCCCCTAAGCCGTGTGATGTACGTACAATGCGCCAGGGGATGTT
CTGGTGTGATATATCATGCCTTTCCAATTTAATTATCTAAACCAAATTTCAAACCTAATA
AAAATTGTTGTAAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B350JQ C 1
AF RR2B350TF U 1
BS 1 774 RR2B350TF
BS 775 775 RR2B350JQ
BS 776 832 RR2B350TF
BS 833 833 RR2B350JQ
BS 834 856 RR2B350TF

RD RR2B350JQ 856 0 0
GCTCCACAAGGTTGCAGAGACGGCTCGGAAGCTGGGGATAATGGTGATCGCTGACGAAGT
GTACGACAAGACTATATTCGGAGACAACCCTTTCGTTCCGATGGCCAAGTTCGCATCGAC
CGTCCCTGTGCTCACCCTGGGAGGCATATCTAAAGGATGGGTTGTTCCTGGATGGAAGAT
TGGCTGGATCGCCTTGAATGATCCCGAGGGCGTTTTCGAATCCACCAAGGTGGCTCAATC
CATCAAGCAGAGTCTTGACATCACTCCTGACCCTTCCACTATCATTCAGGCTGCGCTTCC
TGAGATTTTGGAGAAAGTGGATGAAAACTTCTTTGCAAAGAAGAGCAAGATACTCAAACA
TAATGTCGATTTGGTGTGTGATAGGCTCAAGGATATTCCCTGCGTCGTCTGTCCCAAGAA
ACCTGAGTCTTGCACTTATCTTTTGACCAAGCTGGAGCCGTCATTGTTGGATAACATCAA
GGATGACATTGATTTCTGTGTGAAGCTGGCCAGAGAGGAAAACCTCGTGTTTCTACCAGG
AGAGGCTCTGGGGTTGAAGAACTGGATGAGGATAACTATTGGAGTGGAAGCTCATATGCT
TGAGGATGCACTTGAGAGACTAAAGGGTTTCTGTGCACGTCATACCAAGAGAACAGATAC
AGAAACTGAGTCACCTTCAACCGTTGAAAATGTGTGATAATAATAACACTGTCGGGATAT
TACATGTATTTTACGCGCCCCTAAGCCGTGTGATGTACGTACAATGCGCCAGGGGATGTT
CTGGTGTGATATATCATGCCTTTCCAATTTAATTATCTAAACCAAATTTCAAACCTAATA
AAAATTGTTGTAAACT

QA 1 856 1 856
DS 

RD RR2B350TF 856 0 0
GCTCCACAAGGTTGCAGAGACGGCTCGGAAGCTGGGGATAATGGTGATCGCTGACGAAGT
GTACGACAAGACTATATTCGGAGACAACCCTTTCGTTCCGATGGCCAAGTTCGCATCGAC
CGTCCCTGTGCTCACCCTGGGAGGCATATCTAAAGGATGGGTTGTTCCTGGATGGAAGAT
TGGCTGGATCGCCTTGAATGATCCCGAGGGCGTTTTCGAATCCACCAAGGTGGCTCAATC
CATCAAGCAGAGTCTTGACATCACTCCTGACCCTTCCACTATCATTCAGGCTGCGCTTCC
TGAGATTTTGGAGAAAGTGGATGAAAACTTCTTTGCAAAGAAGAGCAAGATACTCAAACA
TAATGTCGATTTGGTGTGTGATAGGCTCAAGGATATTCCCTGCGTCGTCTGTCCCAAGAA
ACCTGAGTCTTGCACTTATCTTTTGACCAAGCTGGAGCCGTCATTGTTGGATAACATCAA
GGATGACATTGATTTCTGTGTGAAGCTGGCCAGAGAGGAAAACCTCGTGTTTCTACCAGG
AGAGGCTCTGGGGTTGAAGAACTGGATGAGGATAACTATTGGAGTGGAAGCTCATATGCT
TGAGGATGCACTTGAGAGACTAAAGGGTTTCTGTGCACGTCATACCAAGAGAACAGATAC
AGAAACTGAGTCACCTTCAACCGTTGAAAATGTGTGATAATAATAACACTGTCGGGATAT
TACATGTATTTTACGCGCCCCTAAGCCGTGTGATGTACGTACAATGCGCCAGGG*ATGTT
CTGGTGTGATATATCATGCCTTTCCAATTTAATTATCTAAACCAAATTTCAA*CCTAATA
AAAATTGTTGTAAACT

QA 1 856 1 856
DS 



AS 1 2

CO CL3935Contig1 627 2 2 U
GGTCCAGATATAAACACTATTGATCTATGTGATGATGATTACTTTCTTGTTGTTGCATGT
GATGGAATCTGGGATTGCATGACAAGCCAGCAACTGGTGGATTTTATCCATGAACAGTTA
AAATCTGAAACAAAGCTTGCGACGGTATGTGAAAAGATTGTTGATAGATGTTTGGCTCCA
GACACTGCGAGTGGTGAAGGTTGTGATAATATGACCATCATCTTGGTCCAGTTCAAGAAG
CCTAATCCATCCGAGACCGAGACCGAAGCAGAAGCAGAAGAAATTAAAACAGAACCAAGC
CAGGAGGGGGCCCAGGACGAGGAGCCGAGCTCATCAAGCTAAATGTCCTGAAATGGAGCC
AAGAGGGAGATTTGAATGTCTTTATATATCATTTGTGGTTCAACATTGAAAAATGCTTTT
GAGTGGGTTAGAGAAGCAGAAGCTGGCATTTATTGGGATTTCAGTTTTTTTTTTGTTTTT
TCCTCAGTTTCCACAGCTTCTCTTTACTCACAGACTCTGGTTCTATCGGTTCCTGTAATC
AGAAAAAACGACTTTGTATAGTTTGTCTTGTGATTTGTGGGGAAAAAATGTTGTTTTAGG
ATTATTTTCATATTCTGATTTTGTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY72TF U 1
AF RR2EY72JQ C 128
BS 1 588 RR2EY72TF
BS 589 627 RR2EY72JQ

RD RR2EY72TF 588 0 0
GGTCCAGATATAAACACTATTGATCTATGTGATGATGATTACTTTCTTGTTGTTGCATGT
GATGGAATCTGGGATTGCATGACAAGCCAGCAACTGGTGGATTTTATCCATGAACAGTTA
AAATCTGAAACAAAGCTTGCGACGGTATGTGAAAAGATTGTTGATAGATGTTTGGCTCCA
GACACTGCGAGTGGTGAAGGTTGTGATAATATGACCATCATCTTGGTCCAGTTCAAGAAG
CCTAATCCATCCGAGACCGAGACCGAAGCAGAAGCAGAAGAAATTAAAACAGAACCAAGC
CAGGAGGGGGCCCAGGACGAGGAGCCGAGCTCATCAAGCTAAATGTCCTGAAATGGAGCC
AAGAGGGAGATTTGAATGTCTTTATATATCATTTGTGGTTCAACATTGAAAAATGCTTTT
GAGTGGGTTAGAGAAGCAGAAGCTGGCATTTATTGGGATTTCAGTTTTTTTTTTGTTTTT
TCCTCAGTTTCCACAGCTTCTCTTTACTCACAGACTCTGGTTCTATCGGTTCCTGTAATC
AGAAAAAACGACTTTGTATAGTTTGTCTTGTGATTTGTGGGGAAAAAA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2EY72JQ 500 0 0
AAACAAAGCTTGCGACGGTATGTGAAAAGATTGTTGATAGATGTTTGGCTCCAGACACTG
CGAGTGGTGAAGGTTGTGATAATATGACCATCATCTTGGTCCAGTTCAAGAAGCCTAATC
CATCCGAGACCGAGACCGAAGCAGAAGCAGAAGAAATTAAAACAGAACCAAGCCAGGAGG
GGGCCCAGGACGAGGAGCCGAGCTCATCAAGCTAAATGTCCTGAAATGGAGCCAAGAGGG
AGATTTGAATGTCTTTATATATCATTTGTGGTTCAACATTGAAAAATGCTTTTGAGTGGG
TTAGAGAAGCAGAAGCTGGCATTTATTGGGATTTCAGTTTTTTTTTTGTTTTTTCCTCAG
TTTCCACAGCTTCTCTTTACTCACAGACTCTGGTTCTATCGGTTCCTGTAATCAGAAAAA
ACGACTTTGTATAGTTTGTCTTGTGATTTGTGGGGAAAAAATGTTGTTTTAGGATTATTT
TCATATTCTGATTTTGTGGC

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 2

CO CL3936Contig1 552 2 12 U
GGACATTCAACCATCTCACAAGCGCTAACCGATAGCTAACGATTCAGAAAGAGCGAGGGT
TAAATCAAACGTAGATTCCAAGCAATGGCATCGATGACAATGACAGCAACGTTCCTCCCA
GCCGTCGCTAAGCTTCCGTCACCCACCGGAGGAAGAAGGATGTCCATGGTCAGAGCCTCA
ACGAGCGAGAACACAACCACCTTAGAAGTCAAGGCCAAGGAGGAACAGAGAAGCACCACA
ATGAGGAGGGATCTCATGTTCACGGCTGCAGCTTCTGCCGTTTGTGCCTTGGCGAAGGTA
GCCATGGCGGACGAGGAGGAGCCCAAGCGAGGAACAGAGGCGGCTAAGAAGAAATACGCT
CAAGTTTGTGTCACAATGCCTACGGCAAAGATCTGCCGCTACTGATTCAACCATCCCACC
TTTCATGTCCCTCTCTCTATCTCTCTGTTTCTATTGTTCGGTAAATTTTCTCAAATTTGG
TATGTAATCATATATTTGGATCAAAATATTGAAATTACCAAATGAATCTAATAATATTCG
GGTTAGTTCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX84TF U 1
AF RR2GY43TF U 25
BS 1 125 RR2DX84TF
BS 126 126 RR2GY43TF
BS 127 148 RR2DX84TF
BS 149 149 RR2GY43TF
BS 150 212 RR2DX84TF
BS 213 213 RR2GY43TF
BS 214 411 RR2DX84TF
BS 412 412 RR2GY43TF
BS 413 505 RR2DX84TF
BS 506 506 RR2GY43TF
BS 507 516 RR2DX84TF
BS 517 552 RR2GY43TF

RD RR2DX84TF 516 0 0
GGACATTCAACCATCTCACAAGCGCTAACCGATAGCTAACGATTCAGAAAGAGCGAGGGT
TAAATCAAACGTAGATTCCAAGCAATGGCATCGATGACAATGACAGCAACGTTCCTCCCA
GCCGTTGCTAAGCTTCCGTCACCCACCGTAGGAAGAAGGATGTCCATGGTCAGAGCCTCA
ACGAGCGAGAACACAACCACCTTAGAAGTCAATGCCAAGGAGGAACAGAGAAGCACCACA
ATGAGGAGGGATCTCATGTTCACGGCTGCAGCTTCTGCCGTTTGTGCCTTGGCGAAGGTA
GCCATGGCGGACGAGGAGGAGCCCAAGCGAGGAACAGAGGCGGCTAAGAAGAAATACGCT
CAAGTTTGTGTCACAATGCCTACGGCAAAGATCTGCCGCTACTGATTCAACTATCCCACC
TTTCATGTCCCTCTCTCTATCTCTCTGTTTCTATTGTTCGGTAAATTTTCTCAAATTTGG
TATGTAATCATATATTTGGATCAAA*TATTGAAATT

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2GY43TF 528 0 0
GG
AACCGATAGCTAACGATTCAGAAAGAGCGAGGGTTAAATCAAACGTAGATTCCAAGCAAT
GGCATCTATGACAATGACAGCAACGTTCCTCCCAGCCGTCGCTAAGCTTCCGTCACCCAC
CGGAGGAAGAAGGATGTCCATGGTCAGAGCCTCAACGAGCGAGAACACATCCACCTTAGA
AGTCAAGGCCAAGGAGGAACAGAGAAGCACCACAATGAGGAGGGATCTCATGTTCACGGC
TGCAGCTTCTGCCGTTTGTGCCTTGGCGAAGGTAGCCATGGCGGACGAGGAGGAGCCCAA
GCGAGGAACAGAGGCGGCTAAGAAGAAATACGCTCAAGTTTGTGTCACAATGCCTACGGC
AAAGATCTGCCGCTACTGATTCAACCATCCCACCTTTCATGTCCCTCTCTCTATCTCTCT
GTTTCTATTGTTCGGTAAATTTTCTCAAATTTGGTATGTAATCATATATTTGGATCAAAA
TATTGAAATTACCAAATGAATCTAATAATATTCGGGTTAGTTCCTT

QA 3 528 3 528
DS 



AS 1 2

CO CL3937Contig1 762 2 1 U
GTTACTACCCCGTCATGTGCTTCGGGAGAATCAATCTCTTCGTGCAGACGCTCCTCCTCC
TCTTCTCCCAACGCGAGGTCCCCGATCGCGCGCTCAACTTCGCGGGAATCTTGGTGTTCT
GGACTTGGTTTCCTCTCTTGGTTTCTTGTTTACCGACTTGGCCGGAGAGGTTCTTCTTCG
TGTTCACTAGCTTTACCGTTACGGCGCTGCAGCATATCCAATTCACGCTTAACCATTTCG
CTGCTGATGTCTACGTGGGTCCGCCCACGGGGGCCGACTGGTTCGAGAATCAGGCTGCGG
GGACGCTGGATATCTCGTGTAGTTCGTATATGGATTGGTTCTTTGGTGGGCTGCAGTTTC
AGCTCGAGCACCATTTGTTCCCGAGGTTGCCGCGTTGTCATCTAAGGAAAGTGGCTCCGG
TGGTTCAGGAGCTTTGCAAGAAGCATAATCTTCCGTATAGTAGTCTCTCCTGGTGGGAAG
CGAATGTTTGGACTATTAGGACGTTGAAGAAAGCTGCTTATCAAGCTAGAGACGCGGCTA
ATCCTGTGGTTAAGAACTTGGTTTGGGGAAGCTTTGAATACTCATGGGCTAAGTTGATTT
CAGAATCAGAAAACGAACTCTTTGTTTTGTTTGATCATATAATCATCATCATTATGTTTG
CTTTTGAATCTTTTTACATTTCGTTTTGTTACAACGGAAGAGCCTGTTAGATTGAATTGT
ATCGAGATTTACTGAGACTATTGTTAGCATATTGTTTATTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AK25JQ C 1
AF RR2AK25TF U 1
BS 1 762 RR2AK25TF

RD RR2AK25JQ 762 0 0
GTTACTACCCCGTCATGTGCTTCGGGAGAATCAATCTCTTCGTGCAGACGCTCCTCCTCC
TCTTCTCCCAACGCGAGGTCCCCGATCGCGCGCTCAACTTCGCGGGAATCTTGGTGTTCT
GGACTTGGTTTCCTCTCTTGGTTTCTTGTTTACCGACTTGGCCGGAGAGGTTCTTCTTCG
TGTTCACTAGCTTTACCGTTACGGCGCTGCAGCATATCCAATTCACGCTTAACCATTTCG
CTGCTGATGTCTACGTGGGTCCGCCCACGGGGGCCGACTGGTTCGAGAATCAGGCTGCGG
GGACGCTGGATATCTCGTGTAGTTCGTATATGGATTGGTTCTTTGGTGGGCTGCAGTTTC
AGCTCGAGCACCATTTGTTCCCGAGGTTGCCGCGTTGTCATCTAAGGAAAGTGGCTCCGG
TGGTTCAGGAGCTTTGCAAGAAGCATAATCTTCCGTATAGTAGTCTCTCCTGGTGGGAAG
CGAATGTTTGGACTATTAGGACGTTGAAGAAAGCTGCTTATCAAGCTAGAGACGCGGCTA
ATCCTGTGGTTAAGAACTTGGTTTGGG*AAGCTTTGAATACTCATGG*CTAAGTTGATTT
CAGAATCAGAAAACGAACTCTT*GTTTTGTTTGATCATATAATCATCATCATTATGTTTG
CTTTTGAATCTTTTTACATTTCGTTTTGTTACAACGGAAGAGCCTGTTAGATTGAATTGT
ATCGAGATTTACTGAGACTATTGTTAGCATATTGTTTATTTG

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2AK25TF 762 0 0
GTTACTACCCCGTCATGTGCTTCGGGAGAATCAATCTCTTCGTGCAGACGCTCCTCCTCC
TCTTCTCCCAACGCGAGGTCCCCGATCGCGCGCTCAACTTCGCGGGAATCTTGGTGTTCT
GGACTTGGTTTCCTCTCTTGGTTTCTTGTTTACCGACTTGGCCGGAGAGGTTCTTCTTCG
TGTTCACTAGCTTTACCGTTACGGCGCTGCAGCATATCCAATTCACGCTTAACCATTTCG
CTGCTGATGTCTACGTGGGTCCGCCCACGGGGGCCGACTGGTTCGAGAATCAGGCTGCGG
GGACGCTGGATATCTCGTGTAGTTCGTATATGGATTGGTTCTTTGGTGGGCTGCAGTTTC
AGCTCGAGCACCATTTGTTCCCGAGGTTGCCGCGTTGTCATCTAAGGAAAGTGGCTCCGG
TGGTTCAGGAGCTTTGCAAGAAGCATAATCTTCCGTATAGTAGTCTCTCCTGGTGGGAAG
CGAATGTTTGGACTATTAGGACGTTGAAGAAAGCTGCTTATCAAGCTAGAGACGCGGCTA
ATCCTGTGGTTAAGAACTTGGTTTGGGGAAGCTTTGAATACTCATGGGCTAAGTTGATTT
CAGAATCAGAAAACGAACTCTTTGTTTTGTTTGATCATATAATCATCATCATTATGTTTG
CTTTTGAATCTTTTTACATTTCGTTTTGTTACAACGGAAGAGCCTGTTAGATTGAATTGT
ATCGAGATTTACTGAGACTATTGTTAGCATATTGTTTATTTG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL3938Contig1 708 2 2 U
GGATCCTCACAAGAAAGAGAAAAAGAAACCCTAACCTCTCGTAGCAATGGCGATTGCAAC
ATCGATGAGTTTGAATCTAATTGGAGCATTCAAAGGCTTATCCCTCTCCTCAACCTCATC
GTTCCTCAGAGGCGATTTGATTCTAAACCCTAAAACCTCCTTCACAGACTCGGCGTCAAG
ATTTACGGTGACCAAGTCGCTAAACCAGGGGCCATCATCGTTCGTCAACGTGGCACTAAG
TTCCATGCTGGAAAGAACGTTGGGATTGGTAAAGATCATACCATCTTCTCTTTAATCGAT
GGATTAGTCAAGTTCGAGAAGTTTGGTCCTGACAGGAAGAAGATTAGTGTGTACCCAAGA
GAAGTTGTGCCAGAGAATCCCAACAGTTACAGAGCAAGAAAGAGGGAAGCTTTTAGAGTG
CAAAGGGAGAAGAAGAAGGCCAGACGCGAGAACTACACTTACACACTTCCTACCCCTCAG
CTTGTGCTTGCATCTGCTGCGATCGATGAGGAGGAAACCAATCCCGATTGCTGAGATTCA
TATGTGAAGCTTTCTTTGTCCTCTCGTTATGTTTAGTCTTTGTTTATGATCATTTTCCCT
TTGCTAATTTACAAAGAGGCTTTGTTTCAAAGGTCCAAGAGTTGTTGTATGTGTCCAACT
CAAAACCTCGCTTTTGTCGAATTGAGTTCAAGCCTTCGGATTTTATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC86TF U 1
AF RR2GC86JQ C 81
BS 1 544 RR2GC86TF
BS 545 708 RR2GC86JQ

RD RR2GC86TF 544 0 0
GGATCCTCACAAGAAAGAGAAAAAGAAACCCTAACCTCTCGTAGCAATGGCGATTGCAAC
ATCGATGAGTTTGAATCTAATTGGAGCATTCAAAGGCTTATCCCTCTCCTCAACCTCATC
GTTCCTCAGAGGCGATTTGATTCTAAACCCTAAAACCTCCTTCACAGACTCGGCGTCAAG
ATTTACGGTGACCAAGTCGCTAAACCAGGGGCCATCATCGTTCGTCAACGTGGCACTAAG
TTCCATGCTGGAAAGAACGTTGGGATTGGTAAAGATCATACCATCTTCTCTTTAATCGAT
GGATTAGTCAAGTTCGAGAAGTTTGGTCCTGACAGGAAGAAGATTAGTGTGTACCCAAGA
GAAGTTGTGCCAGAGAATCCCAACAGTTACAGAGCAAGAAAGAGGGAAGCTTTTAGAGTG
CAAAGGGAGAAGAAGAAGGCCAGACGCGAGAACTACACTTACACACTTCCTACCCCTCAG
CTTGTGCTTGCATCTGCTGCGATCGATGAGGAGGAAACCAATCCCGATTGCTGAGATTCA
TATG

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2GC86JQ 628 0 0
TTGGAGCATTCAAAGGCTTATCCCTCTCCTCAACCTCATCGTTCCTCAGAGGCGATTTGA
TTCTAAACCCTAAAACCTCCTTCACAGACTCGGCGTCAAGATTTACGGTGACCAAGTCGC
TAAACCAGGGGCCATCATCGTTCGTCAACGTGGCACTAAGTTCCATGCTGGAAAGAACGT
TGGGATTGGTAAAGATCATACCATCTTCTCTTTAATCGATGGATTAGTCAAGTTCGAGAA
GTTTGGTCCTGACAGGAAGAAGATTAGTGTGTACCCAAGAGAAGTTGTGCCAGAGAATCC
CAACAGTTACAGAGCAAGAAAGAGGGAAGCTTTTAGAGTGCAAAGGGAGAAGAAGAAGGC
CAGACGCGAGAACTACACTTACACACTTCCTACCCCTCAGCTTGTGCTTGCATTTGCTGC
GATCGATGAGGAGGAAACCAATCCCGATTGCTGAGATTCATATGTGAAGCTTTCTTTGTC
CTCTCGTTATGTTTAGTCTTTGTTTATGATCATTTTCCCTTTGCTAATTTACAAAGAGGC
TTTGTTTCAAAGGTCCAAGAGTTGTTGTATGTGTCCAACTCAAAACCTCGCTTTTGTCGA
ATTGAGTTCAAGCCTTCGGATTTTATCG

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL3939Contig1 1011 2 2 U
GGACCTCCTTCTCTTTCACCTCTCCTTCCTTCTTGCTCTATACCGCAAGATCTTCATGGG
TTTGCTTCGTTTCTCGGTAAGCGATCTCCAATAGAAGGGTTAGAAGCTGGGAACATTATG
AACGGAGAAGAGGATTATTCAGATGATGGGTCTCAAACGGGAGAAAAGAAGCGGAGATTG
AACATGGAGCAAGTGAAGACATTAGAGAAGAACTTCGAGATTGGAAACAAGCTTGAACCA
GAGAGGAAAATGCAGTTGGCTCGTGGCTTGGGTTTACAGCCAAGGCAGATAGCGATATGG
TTTCAGAACAGAAGAGCTCGCTGGAAAACAAAGCAGCTTGAGAAAGATTATGATACACTT
AAACGACAGTTTGATTCTCTTAAAGCTGAAAACGATCTTCTTCAAACTCACAACCAGAAA
CTCCAAGCTGAGATAATGAGTTTAAAGAACAGAGAACAAACAGAATCAATAAATCTGAAC
AAAGAAACAGAAGGATCTTGCAGTAACAGAAGCGACAACAGTTCCGATAATCTCAGGCTG
GACATCTCTACAGCTCCGCCATCACTAGACAGCACAATAGCAGGCGGCCATCCACCAGCG
CCGCAGACTATTGGTCGACACTTCTTTCCACCGTCCCCAGCGACCGCAACAACCACCACA
ACGACGATGCAATTCTTTCAAAACCCGTCTTCTGGCCAGAGTATGGTTAAAGAAGAGAAC
AGTATCAGTAACATGTTCTGTGCAATGGATGACCACTCTGGTTTTTGGCCATGGCTTGAT
CAGCAACAGTACAACTGAAACCGGTCGACCTGTTTTTATTTCTTTTAATTTTTAATATAT
TTTTTGTTTTGGTATCAGAAAGAACCCATGCATGTTTCAAAAACTTGGAATCTATCATTA
GCTCACTTTGAGTTTCTTTTTTTCCCCTTTTTGATCAATGAGATGTAAAAAAGATGGGTA
AAAGTTTTAATTATATATACTTCTTTATAATCATAAAACCTTTTTTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ52TF U 1
AF RR2BJ52JQ C 213
BS 1 653 RR2BJ52TF
BS 654 1011 RR2BJ52JQ

RD RR2BJ52TF 653 0 0
GGACCTCCTTCTCTTTCACCTCTCCTTCCTTCTTGCTCTATACCGCAAGATCTTCATGGG
TTTGCTTCGTTTCTCGGTAAGCGATCTCCAATAGAAGGGTTAGAAGCTGGGAACATTATG
AACGGAGAAGAGGATTATTCAGATGATGGGTCTCAAACGGGAGAAAAGAAGCGGAGATTG
AACATGGAGCAAGTGAAGACATTAGAGAAGAACTTCGAGATTGGAAACAAGCTTGAACCA
GAGAGGAAAATGCAGTTGGCTCGTGGCTTGGGTTTACAGCCAAGGCAGATAGCGATATGG
TTTCAGAACAGAAGAGCTCGCTGGAAAACAAAGCAGCTTGAGAAAGATTATGATACACTT
AAACGACAGTTTGATTCTCTTAAAGCTGAAAACGATCTTCTTCAAACTCACAACCAGAAA
CTCCAAGCTGAGATAATGAGTTTAAAGAACAGAGAACAAACAGAATCAATAAATCTGAAC
AAAGAAACAGAAGGATCTTGCAGTAACAGAAGCGACAACAGTTCCGATAATCTCAGGCTG
GACATCTCTACAGCTCCGCCATCACTAGACAGCACAATAGCAGGCGGCCATCCACCAGCG
CCGCAGACTATTGGTCGACACTTCTTTCCACCGTCCCCAGCGACCGCAACAAC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2BJ52JQ 799 0 0
CTTCGAGATTGGAAACAAGCTTGAACCAGAGAGGAAAATGCAGTTGGCTCGTGGCTTGGG
TTTACAGCCAAGGCAGATAGCGATATGGTTTCAGAACAGAAGAGCTCGCTGGAAAACAAA
GCAGCTTGAGAAAGATTATGATACACTTAAACGACAGTTTGATTCTCTTAAAGCTGAAAA
CGATCTTCTTCAAACTCACAACCAGAAACTCCAAGCTGAGATAATGAGTTTAAAGAACAG
AGAACAAACAGAATCAATAAATCTGAACAAAGAAACAGAAGGATCTTGCAGTAACAGAAG
CGACAACAGTTCCGATAATCTCAGGCTGGACATCTCTACAGCTCCGCCATCACTAGACAG
CACAATAGCAGGCGGCCATCCACCAGCGCCGCAGACTATTGGTCGACACTTCTTTCCACC
GTCCCCAGCGACCGCAACAACCACCACAACGACGATGCAATTCTTTCAAAACCCGTCTTC
TGGCCAGAGTATGGTTAAAGAAGAGAACAGTATCAGTAACATGTTCTGTGCAATGGATGA
CCACTCTGGTTTTTGGCCATGGCTTGATCAGCAACAGTACAACTGAAACCGGTCGACCTG
TTTTTATTTCTTTTAATTTTTAATATATTTTTTGTTTTGGTATCAGAAAGAACCCATGCA
TGTTTCAAAAACTTGGAATCTATCATTAGCTCACTTTGAGTTTCTTTTTTTCCCCTTTTT
GATCAATGAGATGTAAAAAAGATGGGTAAAAGTTTTAATTATATATACTTCTTTATAATC
ATAAAACCTTTTTTTTGTT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL3940Contig1 1266 2 2 U
CTAATCATCTCTGTCTGAATCTTGATTCGAAAATGGCTTCTGAAACTGAGTCAGCGACAG
AAAACAACATAAAAGGAGTACTTGTTCATGGAGGAAGATATTTTCAGTACAATGCCTATG
GAAACGTTTGAAGTCTCCAACAAGTATGTTCCTCCTATCCGACCAATCGGTAGAGGAGCT
TACGGCTTTGTCTGTGCTGCAGTAGATTCGGAGACACAAGAAGAGATTGCAATCAAGAAG
ATAGGTAAAGCCTTCGACAACAAAGTAGATGCTAAGCGGACGCTGAGAGAGATTAAGCTA
CTTCGTCATTTAGAACATGAGAACGTTGTCATTATAAAAGACATCATCAGACCACCAAAG
AAGGAGACATTCACAGATGTTTATATAGTCTATGAGTTAATGGATACTGATCTTCATCAG
ATTATTCGTTCAGACCAGCCCTTGAATGATGATCATTGTCAGTACTTCTTGTATCAGATT
CTACGTGGACTCAAGTACATACACTCAGCAAATGTATTACATCGTGACCTTAAGCCGAGT
AACTTGCTTCTGAATGCAAACTGCGACCTTAAGATTGCAGACTTCGGTTTGGCAAGGACG
ACATCTGAGACAGATCTCATGACGGAATATGTTGTCACGAGATGGTACCGAGCACCCGAG
CTGCTTCTTAACAGTTCTGAGTACACATCTGCGATTGATGTCTGGTCTGTTGGTTGCATA
TTTGCTGAGATCATGACAAGGGAACCTCTATTCCCTGGAAAAGACTATGTCCACCAGCTT
AAACTTATAACCGAGTTGATAGGATCACCTGATGGAACGAGCCTAGAGTTTTTCAGAAGC
GAGAATGCCAGAAAGTACGTTAAAGAACTACCAAAGTTCCCGAGGCAGAGCTTTGCATTT
AGGTTTCCTAGTATGAGCTCTATAGCTATCGATTTGCTGGAGAAAATGCTAGTGTTTGAT
CCAGATAAACGCATCACGGTTGAGGAAGCATTGTGTCATCCTTTCTTGTCAGCACTTCAC
GACCTTAACGACGAGCCTGTTTGTTCAAACCATTTCAGTTTCGATTTTGAGAACCCGTCT
TCCACTGAAGAAGAGATTAAGGAGCTCGTGTGGCTAGAATCAGTGAAGTTCAACCCTCAT
CCGACCACTTAAGTCCATTGTTTATTGTAAGGTTGCCTCTTATAAGCTTCTGTTTCATCA
ATGTTGTTTTAGCCTTTTCATCTGTCAAAAAAAAACTATATATCATGCGATACCAGAAAA
TGATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC30TF U 1
AF RR2AC30JQ C 609
BS 1 799 RR2AC30TF
BS 800 1266 RR2AC30JQ

RD RR2AC30TF 799 0 0
CTAATCATCTCTGTCTGAATCTTGATTCGAAAATGGCTTCTGAAACTGAGTCAGCGACAG
AAAACAACATAAAAGGAGTACTTGTTCATGGAGGAAGATATTTTCAGTACAATGCCTATG
GAAACGTTTGAAGTCTCCAACAAGTATGTTCCTCCTATCCGACCAATCGGTAGAGGAGCT
TACGGCTTTGTCTGTGCTGCAGTAGATTCGGAGACACAAGAAGAGATTGCAATCAAGAAG
ATAGGTAAAGCCTTCGACAACAAAGTAGATGCTAAGCGGACGCTGAGAGAGATTAAGCTA
CTTCGTCATTTAGAACATGAGAACGTTGTCATTATAAAAGACATCATCAGACCACCAAAG
AAGGAGACATTCACAGATGTTTATATAGTCTATGAGTTAATGGATACTGATCTTCATCAG
ATTATTCGTTCAGACCAGCCCTTGAATGATGATCATTGTCAGTACTTCTTGTATCAGATT
CTACGTGGACTCAAGTACATACACTCAGCAAATGTATTACATCGTGACCTTAAGCCGAGT
AACTTGCTTCTGAATGCAAACTGCGACCTTAAGATTGCAGACTTCGGTTTGGCAAGGACG
ACATCTGAGACAGATCTCATGACGGAATATGTTGTCACGAGATGGTACCGAGCACCCGAG
CTGCTTCTTAACAGTTCTGAGTACACATCTGCGATTGATGTCTGGTCTGTTGGTTGCATA
TTTGCTGAGATCATGACAAGGGAACCTCTATTCCCTGGAAAAGACTATGTCCACCAGCTT
AAACTTATAACCGAGTTGA

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2AC30JQ 658 0 0
GACAGATCTCATGACGGAATATGTTGTCACGAGATGGTACCGAGCACCCGAGCTGCTTCT
TAACAGTTCTGAGTACACATTTGCGATTGATGTTTGGTCTGTTGGTTGCATATTTGCTGA
GATCATGACAAGGGAACCTCTATTCCCTGGAAAAGACTATGTCCACCAGCTTAAACTTAT
AACCGAGTTGATAGGATCACCTGATGGAACGAGCCTAGAGTTTTTCAGAAGCGAGAATGC
CAGAAAGTACGTTAAAGAACTACCAAAGTTCCCGAGGCAGAGCTTTGCATTTAGGTTTCC
TAGTATGAGCTCTATAGCTATCGATTTGCTGGAGAAAATGCTAGTGTTTGATCCAGATAA
ACGCATCACGGTTGAGGAAGCATTGTGTCATCCTTTCTTGTCAGCACTTCACGACCTTAA
CGACGAGCCTGTTTGTTCAAACCATTTCAGTTTCGATTTTGAGAACCCGTCTTCCACTGA
AGAAGAGATTAAGGAGCTCGTGTGGCTAGAATCAGTGAAGTTCAACCCTCATCCGACCAC
TTAAGTCCATTGTTTATTGTAAGGTTGCCTCTTATAAGCTTCTGTTTCATCAATGTTGTT
TTAGCCTTTTCATCTGTCAAAAAAAAACTATATATCATGCGATACCAGAAAATGATGT

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL3941Contig1 1397 2 2 U
GGATCAACACAACTCTTTCCACTCTTCCAACTTATTATAGATAACATCATCATCCATCAG
CATGACCCAACGAGCCAACCCAAAGACCGGCTGCCTCACGGCGGTTGTCCGCCGTCTTCT
ATGTTCCGGCAGCCAACAAACTCACCCTTCCGACAACATTCTAGACTCCGACGAAACACT
CCAGTTACTAAGCACTTACGAAGAAATCGAAGAGCCAAAGAAAGAGACAAAAACCGAACC
CCAAACACAAGAAGACGACGTCTCTCCTCCTCCTCCAAACGTCGTAGCCAAACTCATGGG
TCTAGATAACCCCGCACCGGGATCAAATCGGTTTAGGTACTTTGAAGATTCCGGTTCGGC
TGTCGCACGGAGCAAATCGGTTAACTTCATGGACTATATCCTAAGAGTTAACGATGAAGA
AGAAGAAGAGGATGACAAAGACGGTCATCTCCAGTGCCGTAGAGTTAGAGCGTCGGTCTC
CTTCCGAGAGATAGTCCCGACCTCGGCGAGATCGAGCTCGAACCAACAGCAGAAGAAGCA
CGATTTCTTGCTGATGTATCTCGACAAGCTGGACGAGAAGAGGGAACTTGTCGGCTCATC
GAGGTCTAGGAGGTTCGAGAAGGTATTAGAAGATTCCAAGGAGCAGGCATTGCCACCTCC
GGAGAAGAAGAAGAAGGAGAACGAGAAAGTGGCCAAGAAGTTTAAAGACGAGCGGAGGAA
AGTAGCCAAGAAGAAGAAGAGTGAGAGTCGCAGTGATCATGTTAACGGAGCTAGAAAGTT
CGATGGTTTCTCTCTCCGTCCAAGAGTAAGTCCTCAGAGAAGATGGCGCTTCTAGGAGGA
GCCGAGTCTAAGAGCATTCCGCCGGATGAGCTTACCGGAAAGGAGACAGAGTCGCAGGAA
AGTAAATCAAATGCGAGTCCTGTTTCGGTTCTTGATCGAGATCTTTATGATTATCTAATC
CTTGATGATGACTACTACTTCTCAGGAGATTCAGAAAGTGCATCGGAGTTTTCAACAAAG
CAAGCAGAGACAACAGCAAAATCTTCATGTTCTTCATCACCAGCAAGAACAAGAACAAAT
ACCAAGAAAGAAAACAATAATAACACCAACAGTGATTCTGAGGAGACAGAGTTTATCACA
AAGCTAATGAATATGCTCTCAGATCTGTCTGAAGAAGACATGAAGTCTTCAACTTGGGTT
TCTACTTCGTCAACCAAACCCGTTGACTATACTCAAGTTGAAGAATTTTGTGTTGAATTT
GGTCAGGAGATTCTTGATCTTGTTATGGACCAGTTAGTTGATGAACTGTTGTATCTAGTT
TGATTTTTTACTTCTCAATCATCAGTGATCAGACTATGTCGTTCTATCATATCTCATAAT
ATATCCAGTCGTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F769TF U 1
AF RR2F769JQ C 553
BS 1 642 RR2F769TF
BS 643 1397 RR2F769JQ

RD RR2F769TF 642 0 0
GGATCAACACAACTCTTTCCACTCTTCCAACTTATTATAGATAACATCATCATCCATCAG
CATGACCCAACGAGCCAACCCAAAGACCGGCTGCCTCACGGCGGTTGTCCGCCGTCTTCT
ATGTTCCGGCAGCCAACAAACTCACCCTTCCGACAACATTCTAGACTCCGACGAAACACT
CCAGTTACTAAGCACTTACGAAGAAATCGAAGAGCCAAAGAAAGAGACAAAAACCGAACC
CCAAACACAAGAAGACGACGTCTCTCCTCCTCCTCCAAACGTCGTAGCCAAACTCATGGG
TCTAGATAACCCCGCACCGGGATCAAATCGGTTTAGGTACTTTGAAGATTCCGGTTCGGC
TGTCGCACGGAGCAAATCGGTTAACTTCATGGACTATATCCTAAGAGTTAACGATGAAGA
AGAAGAAGAGGATGACAAAGACGGTCATCTCCAGTGCCGTAGAGTTAGAGCGTCGGTCTC
CTTCCGAGAGATAGTCCCGACCTCGGCGAGATCGAGCTCGAACCAACAGCAGAAGAAGCA
CGATTTCTTGCTGATGTATCTCGACAAGCTGGACGAGAAGAGGGAACTTGTCGGCTCATC
GAGGTCTAGGAGGTTCGAGAAGGTATTAGAAGATTCCAAGGA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2F769JQ 845 0 0
GATGTATCTCGACAAGCTGGACGAGAAGAGGGAACTTGTCGGCTCATCGAGGTCTAGGAG
GTTCGAGAAGGTATTAGAAGATTCCAAGGAGCAGGCATTGCCACCTCCGGAGAAGAAGAA
GAAGGAGAACGAGAAAGTGGCCAAGAAGTTTAAAGACGAGCGGAGGAAAGTAGCCAAGAA
GAAGAAGAGTGAGAGTCGCAGTGATCATGTTAACGGAGCTAGAAAGTTCGATGGTTTCTC
TCTCCGTCCAAGAGTAAGTCCTCAGAGAAGATGGCGCTTCTAGGAGGAGCCGAGTCTAAG
AGCATTCCGCCGGATGAGCTTACCGGAAAGGAGACAGAGTCGCAGGAAAGTAAATCAAAT
GCGAGTCCTGTTTCGGTTCTTGATCGAGATCTTTATGATTATCTAATCCTTGATGATGAC
TACTACTTCTCAGGAGATTCAGAAAGTGCATCGGAGTTTTCAACAAAGCAAGCAGAGACA
ACAGCAAAATCTTCATGTTCTTCATCACCAGCAAGAACAAGAACAAATACCAAGAAAGAA
AACAATAATAACACCAACAGTGATTCTGAGGAGACAGAGTTTATCACAAAGCTAATGAAT
ATGCTCTCAGATCTGTCTGAAGAAGACATGAAGTCTTCAACTTGGGTTTCTACTTCGTCA
ACCAAACCCGTTGACTATACTCAAGTTGAAGAATTTTGTGTTGAATTTGGTCAGGAGATT
CTTGATCTTGTTATGGACCAGTTAGTTGATGAACTGTTGTATCTAGTTTGATTTTTTACT
TCTCAATCATCAGTGATCAGACTATGTCGTTCTATCATATCTCATAATATATCCAGTCGT
TAACC

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

CO CL3942Contig1 733 2 2 U
GGGCTTCTCCGTCCCTTTCGTCCTTGCTCAGTTTCATCGATCTCCTTTTCTGTTTTTCTT
CCTTTCGCCACTTGAGTACAATTGCATCGGATTTTTGTTTTATACCTTTTTTTTCTGCGG
GAACAAGGAGACATTTGTTCGGTGGGAAAGACAGATTTTGGATAATTCTTTTATTTTAGA
TGTTTCGATTTACTGATTTCCTCCGATAACATCGCATGGAAAATATTTGCGAATTTTTCT
TTTTTTTTGCGTTGACTTATATATTTGGGGGTTTAATTTTGGTTTGGTCAACGGAGTTTT
AGGACTTTGTTTCTAGGTTTGTTAGTGATTGATTCGTTATATGAAATGTAAAGCTTTAAC
ATTTTGACATATGTTCTGTCTTAAGCTTCTATGTAATTTCTTCATTTCTATTGGTCAAGA
CTTTCTAGTTAAGCTTTTGGGTTTTGAATTGTCGGTGTAATGTAAAATTGTGTTTATATT
ATTTTATATATACAAAGTACTATGTAAAAGATGGGTTTTGTTCCTCTGCTAAACATATGC
AGAAGAAGCGTAGTAAAAGGCATTGATTGTTTGAATGGAACAACCGAGTTACGATATCTC
TCAAGAAGAAGCACGTGAGTCTCTCATTGCCATCTCCTACACTTCACCGGAGGAGGTTGA
AGAGTCTCTAACGTCATCAGATGTGAAACCTATCGCCGCCACTACAACAAACGGAGTCGT
CACTAAAAGAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E049TF U 1
AF RR2E049JQ C 596
BS 1 649 RR2E049TF
BS 650 733 RR2E049JQ

RD RR2E049TF 649 0 0
GGGCTTCTCCGTCCCTTTCGTCCTTGCTCAGTTTCATCGATCTCCTTTTCTGTTTTTCTT
CCTTTCGCCACTTGAGTACAATTGCATCGGATTTTTGTTTTATACCTTTTTTTTCTGCGG
GAACAAGGAGACATTTGTTCGGTGGGAAAGACAGATTTTGGATAATTCTTTTATTTTAGA
TGTTTCGATTTACTGATTTCCTCCGATAACATCGCATGGAAAATATTTGCGAATTTTTCT
TTTTTTTTGCGTTGACTTATATATTTGGGGGTTTAATTTTGGTTTGGTCAACGGAGTTTT
AGGACTTTGTTTCTAGGTTTGTTAGTGATTGATTCGTTATATGAAATGTAAAGCTTTAAC
ATTTTGACATATGTTCTGTCTTAAGCTTCTATGTAATTTCTTCATTTCTATTGGTCAAGA
CTTTCTAGTTAAGCTTTTGGGTTTTGAATTGTCGGTGTAATGTAAAATTGTGTTTATATT
ATTTTATATATACAAAGTACTATGTAAAAGATGGGTTTTGTTCCTCTGCTAAACATATGC
AGAAGAAGCGTAGTAAAAGGCATTGATTGTTTGAATGGAACAACCGAGTTACGATATCTC
TCAAGAAGAAGCACGTGAGTCTCTCATTGCCATCTCCTACACTTCACCG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2E049JQ 138 0 0
ATCTCTCAAGAAGAAGCACGTGAGTCTCTCATTGCCATCTCCTACACTTCACCGGAGGAG
GTTGAAGAGTCTCTAACGTCATCAGATGTGAAACCTATCGCCGCCACTACAACAAACGGA
GTCGTCACTAAAAGAAAC

QA 1 138 1 138
DS 



AS 1 2

CO CL3943Contig1 899 2 2 U
GGAAGGACAGGATCAAACTCACACACACAAAAGAAGCAAGAAAACTATTTTTGATATACA
GAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGAAGATGAAGTGTGAGCTATGCGACGGTGTGGCGTGGA
TGTTCTGTGAGTCAGACCAGGCGAGTTTATGCTGGGACTGCGACGGTTACGTTCACGGAG
CTAACTTTCTGGTGGCTAAACACGCGCGCTGCCTTCTTTGTAGCACGTGCCAGTCTCCTA
CGGCTTGGAAAGCTTCGGGTCTTCGACTATGTCCAACAGTTTCCAACTGCGAGCCTTGCC
TTGCTCGTAAGAATAGTAACGGAGAAGACGACGGCGCAGAGTCTTATGATGAGGATGAGG
AGGAAGAAGAAGAAGAAAGTGATGATGAGGTAGAGGAAGAAGAAGGGGAGAATCAGGTGG
TGCCGTGGGATGCGGCTGCGGCTGTGCAAGAACCTCCAGTGATGAGTTCTTGGCGTTCCG
TTAGCAGCGGAGGAGAAGAACGTTTCAGTTTGGTAGAGAAAAGGACGCGACAAGATTTAG
ATCTTAACTCCTCCCATGATGAATCAAACGAGTCACGACCGTTGAAACGGCTAACGAGAG
ATGAAACCTGGCCAAGATCAACGGCTATGATGAAATCAACCTTAAAAATCAAACGACTGT
GATACACCACCAACATAAATAAAATGCCAGCCGTTGATTTCTGCTTATTCAGATTAGATT
AATCATCACTGTTCATTGCAAACAGTTCATCTTTTAGTTAATTGAGTTTAGCTACCTTTA
TGGCTTAGTCTGCTTACTGTTTTTTCTGAAACCAAATGTACTGGTTGAACCCATTTTGCT
TAGCTGCTTACGATTTCGTATTTTTGGTTGTATTATTCACCTATCTATAATTATGTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC20TF U 1
AF RR2EC20JQ C 145
BS 1 610 RR2EC20TF
BS 611 899 RR2EC20JQ

RD RR2EC20TF 610 0 0
GGAAGGACAGGATCAAACTCACACACACAAAAGAAGCAAGAAAACTATTTTTGATATACA
GAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGAAGATGAAGTGTGAGCTATGCGACGGTGTGGCGTGGA
TGTTCTGTGAGTCAGACCAGGCGAGTTTATGCTGGGACTGCGACGGTTACGTTCACGGAG
CTAACTTTCTGGTGGCTAAACACGCGCGCTGCCTTCTTTGTAGCACGTGCCAGTCTCCTA
CGGCTTGGAAAGCTTCGGGTCTTCGACTATGTCCAACAGTTTCCAACTGCGAGCCTTGCC
TTGCTCGTAAGAATAGTAACGGAGAAGACGACGGCGCAGAGTCTTATGATGAGGATGAGG
AGGAAGAAGAAGAAGAAAGTGATGATGAGGTAGAGGAAGAAGAAGGGGAGAATCAGGTGG
TGCCGTGGGATGCGGCTGCGGCTGTGCAAGAACCTCCAGTGATGAGTTCTTGGCGTTCCG
TTAGCAGCGGAGGAGAAGAACGTTTCAGTTTGGTAGAGAAAAGGACGCGACAAGATTTAG
ATCTTAACTCCTCCCATGATGAATCAAACGAGTCACGACCGTTGAAACGGCTAACGAGAG
ATGAAACCTG

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2EC20JQ 755 0 0
GTTTATGCTGGGACTGCGACGGTTACGTTCACGGAGCTAACTTTCTGGTGGCTAAACACG
CGCGCTGCCTTCTTTGTAGCACGTGCCAGTCTCCTACGGCTTGGAAAGCTTCGGGTCTTC
GACTATGTCCAACAGTTTCCAACTGCGAGCCTTGCCTTGCTCGTAAGAATAGTAACGGAG
AAGACGACGGCGCAGAGTCTTATGATGAGGATGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAAGTGATG
ATGAGGTAGAGGAAGAAGAAGGGGAGAATCAGGTGGTGCCGTGGGATGCGGCTGCGGCTG
TGCAAGAACCTCCAGTGATGAGTTCTTGGCGTTCCGTTAGCAGCGGAGGAGAAGAACGTT
TCAGTTTGGTAGAGAAAAGGACGCGACAAGATTTAGATCTTAACTCCTCCCATGATGAAT
CAAACGAGTCACGACCGTTGAAACGGCTAACGAGAGATGAAACCTGGCCAAGATCAACGG
CTATGATGAAATCAACCTTAAAAATCAAACGACTGTGATACACCACCAACATAAATAAAA
TGCCAGCCGTTGATTTCTGCTTATTCAGATTAGATTAATCATCACTGTTCATTGCAAACA
GTTCATCTTTTAGTTAATTGAGTTTAGCTACCTTTATGGCTTAGTCTGCTTACTGTTTTT
TCTGAAACCAAATGTACTGGTTGAACCCATTTTGCTTAGCTGCTTACGATTTCGTATTTT
TGGTTGTATTATTCACCTATCTATAATTATGTTGA

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL3944Contig1 907 2 2 U
GGAAAGAGTGACCAATTCCAAATAAGAATCTGAGCAAAGACTAGCCACCACCCACCAAGA
AAGGAGAGCATTGGAATCGTTTGGGGATCTCGCTATTCATTCGAGTTCACGACCCAAAGT
CGTCATCATGTGGAGAAGAATCGTCTCATCTCATCTCAAAACCCTAGCCGCCGATGTCGC
CGCCGCCGCTTCTCCTCGTCGATCCATAGCCACCACCACCGCCAGACCCGTCCGCTTCTT
CTTCTTCCGTTATCCCTCGCCATTTCAGCACTGAATCAGAGAGCGTTGCGAAGAAGAAGG
TGGAGGATGTGATGCCCATTGCTACTGGTCATGAGAAGGAAGAGCTTGAAGCTGAATTGG
AGGGGAAGAGGCTGCTTGACATTGACTTCCCCGAAGGTCCTTTCGGAACCAAGGAATCTC
CTGCAATTGTAAAGTCTTACTATGACAAGCGAATTGTGGGATGCCCTGGTGGTGAAGGCG
AGGATGAACACGACGTGGTGTGGTTCTGGCTAGAAAAAGGAAAGTCTTTTGAATGCCCCG
TTTGCACTCAGTACTTTGAGCTGGAAGTGGTTGGTCCTGGTGGGCCTCCCGATGGTCGCG
GTGATGCAGACCACCACCATTGATTCGGGCCTCTCCCTTGCCGCGAGTTTTGCTTTTTCT
ATTTTCACGTTCCTAAGATATTTTTTTTTAGATTTTTTTAAATGATTGGAATAAGAAAAG
ATATATGCCGAGCTGGCGAAACAGAGTTGAAAATGTTTTTGATCCTTTTAGAACAACACC
ACTTCGGTACCGGGAAGTTTGTCAAAATGCCAAAACTCTTACGACCGTTGTGTTTTACTT
TTGTAACAATTCTTGAATCAGAATCATTCTTGCCTTTTGGTTATTATATATATTCGACTT
TTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D203TF U 1
AF RR2D203JQ C 199
BS 1 664 RR2D203TF
BS 665 907 RR2D203JQ

RD RR2D203TF 664 0 0
GGAAAGAGTGACCAATTCCAAATAAGAATCTGAGCAAAGACTAGCCACCACCCACCAAGA
AAGGAGAGCATTGGAATCGTTTGGGGATCTCGCTATTCATTCGAGTTCACGACCCAAAGT
CGTCATCATGTGGAGAAGAATCGTCTCATCTCATCTCAAAACCCTAGCCGCCGATGTCGC
CGCCGCCGCTTCTCCTCGTCGATCCATAGCCACCACCACCGCCAGACCCGTCCGCTTCTT
CTTCTTCCGTTATCCCTCGCCATTTCAGCACTGAATCAGAGAGCGTTGCGAAGAAGAAGG
TGGAGGATGTGATGCCCATTGCTACTGGTCATGAGAAGGAAGAGCTTGAAGCTGAATTGG
AGGGGAAGAGGCTGCTTGACATTGACTTCCCCGAAGGTCCTTTCGGAACCAAGGAATCTC
CTGCAATTGTAAAGTCTTACTATGACAAGCGAATTGTGGGATGCCCTGGTGGTGAAGGCG
AGGATGAACACGACGTGGTGTGGTTCTGGCTAGAAAAAGGAAAGTCTTTTGAATGCCCCG
TTTGCACTCAGTACTTTGAGCTGGAAGTGGTTGGTCCTGGTGGGCCTCCCGATGGTCGCG
GTGATGCAGACCACCACCATTGATTCGGGCCTCTCCCTTGCCGCGAGTTTTGCTTTTTCT
ATTT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2D203JQ 709 0 0
TCGATCCATAGCCACCACCACCGCCAGACCCGTCCGCTTCTTCTTCTTCCGTTATCCCTC
GCCATTTCAGCACTGAATCAGAGAGCGTTGCGAAGAAGAAGGTGGAGGATGTGATGCCCA
TTGCTACTGGTCATGAGAAGGAAGAGCTTGAAGCTGAATTGGAGGGGAAGAGGCTGCTTG
ACATTGACTTCCCCGAAGGTCCTTTCGGAACCAAGGAATCTCCTGCAATTGTAAAGTCTT
ACTATGACAAGCGAATTGTGGGATGCCCTGGTGGTGAAGGCGAGGATGAACACGACGTGG
TGTGGTTCTGGCTAGAAAAAGGAAAGTCTTTTGAATGCCCCGTTTGCACTCAGTACTTTG
AGCTGGAAGTGGTTGGTCCTGGTGGGCCTCCCGATGGTCGCGGTGATGCAGACCACCACC
ATTGATTCGGGCCTCTCCCTTGCCGCGAGTTTTGCTTTTTCTATTTTCACGTTCCTAAGA
TATTTTTTTTTAGATTTTTTTAAATGATTGGAATAAGAAAAGATATATGCCGAGCTGGCG
AAACAGAGTTGAAAATGTTTTTGATCCTTTTAGAACAACACCACTTCGGTACCGGGAAGT
TTGTCAAAATGCCAAAACTCTTACGACCGTTGTGTTTTACTTTTGTAACAATTCTTGAAT
CAGAATCATTCTTGCCTTTTGGTTATTATATATATTCGACTTTTGTTTT

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL3945Contig1 984 2 6 U
CTTCTTATCTCTATCCTTTAAAGCGGCCATTGGAGGTCCAGAAAGAACCATTTAAAGCTA
CTTAACTTGAGGTTAGTTAGTAGTACACAAGAAGATGGAAACAGAAGAGGATATGTGCAA
GAACAATTGGGGAAGTGCTTCCATCTTAGATTACAAGATGGCTATGGAGGAGGAGGAGCC
TCCTAATTTTCAAGATTTCAAAGCGTCTTCGGTCCAAGCTTTCCTGCAAGGGATCAAGGC
TCAAGCGTGGGAACCGAGGACCATACTGAGCAACCTGTCCTTTATGGAACATAAGATTCA
CGAACTGCAGGGTCTTGTTCATCTCATCATCCTTGCCCGAAACGGGCAGCAGCTTCAAGA
GGAGCAGCAACAACTCATAACCGCTGATCTTACTTCCATAATCATACAGCTGATTTCAAC
TGCAGGTAGTCTTCTTCCATCTGTTAACCGTAATAGTAATAATATGTCATCTACTACAGC
CCCCGGTTCAGCCTTGTTCCCTTATCCAAGGGAGGCTAATTACCTTGCTTCACAGACCCA
AGACCTCGATTTGCTAAGCCCATGGTTGAAGAAAGCCAAATACATGAAATGAAAAACGAA
GATGATGCCGAGGAAGGAGGAGGAGAGGACCTTCCTCCTGGTTCTTACGAGATAAAGCAG
CTCGAGAAAGAGGAGATCCTTGCACCCCATACCAACTTCTGCACTATCTGTGGCAAGGGT
TTCAAGAGAGACGCTAACCTGAGGATGCACATGAGAGGTCACGGCGACGAGTACAAAACT
CCAGCTGCTCTAGCCAAACCCACCAAAGAAACCCAACCCGGGTTTGAGCCGGTGCTGATC
AAAAGGTACTCTTGCCCATTCCCTGGCTGCAAACGTAACAAGGGTCACAAAAAGTTTCAG
CCTTTGAAGACGATACTATGCGTGAAGAACCATTATAAACGCACCCACTGCGACAAAAGC
TTCACCTGCAGCCGCTGCCATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM36TF U 1
AF RR2BM36JQ C 232
BS 1 616 RR2BM36TF
BS 617 617 RR2BM36JQ
BS 618 687 RR2BM36TF
BS 688 688 RR2BM36JQ
BS 689 709 RR2BM36TF
BS 710 984 RR2BM36JQ

RD RR2BM36TF 709 0 0
CTTCTTATCTCTATCCTTTAAAGCGGCCATTGGAGGTCCAGAAAGAACCATTTAAAGCTA
CTTAACTTGAGGTTAGTTAGTAGTACACAAGAAGATGGAAACAGAAGAGGATATGTGCAA
GAACAATTGGGGAAGTGCTTCCATCTTAGATTACAAGATGGCTATGGAGGAGGAGGAGCC
TCCTAATTTTCAAGATTTCAAAGCGTCTTCGGTCCAAGCTTTCCTGCAAGGGATCAAGGC
TCAAGCGTGGGAACCGAGGACCATACTGAGCAACCTGTCCTTTATGGAACATAAGATTCA
CGAACTGCAGGGTCTTGTTCATCTCATCATCCTTGCCCGAAACGGGCAGCAGCTTCAAGA
GGAGCAGCAACAACTCATAACCGCTGATCTTACTTCCATAATCATACAGCTGATTTCAAC
TGCAGGTAGTCTTCTTCCATCTGTTAACCGTAATAGTAATAATATGTCATCTACTACAGC
CCCCGGTTCAGCCTTGTTCCCTTATCCAAGGGAGGCTAATTACCTTGCTTCACAGACCCA
AGACCTCGATTTGCTAAGCCCATGGTTGAAGAAAGCCAAATACATGAAATGAAAAACGAA
GATGATGCCGAGGAAG*AGGAGGAGAGGACCTTCCTCCTGGTTCTTACGAGATAAAGCAG
CTCGAGAAAGAGGAGATCCTTGCACCC*ATACCAACTTCTGCACTATCT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2BM36JQ 753 0 0
GATCAAGGCTCAAGCGTGGGAACCGAGGACCATACTGAGCAACCTGTCCTTTATGGAACA
TAAGATTCACGAACTGCAGGGTCTTGTTCATCTCATCATCCTTGCCCGAAACGGGCAGCA
GCTTCAAGAGGAGCAGCAACAACTCATAACCGCTGATCTTACTTCCATAATCATACAGCT
GATTTCAACTGCAGGTAGTCTTCTTCCATCTGTTAACCGTAATAGTAATAATATGTCATC
TACTACAGCCCCCGGTTCAGCCTTGTTCCCTTATCCAAGGGAGGCTAATTACCTTGCTTC
ACAGACCCAAGACCTCGATTTGCTAAGCCCATGGTTGAAGAAAGCCAAATACATGAAATG
AAAAACGAAGATGATGCCGAGGAAGGAGGAGGAGAGGACCTTCCTCCTGGTTCTTACGAG
ATAAAGCAGCTCGAGAAAGAGGAGATCCTTGCACCCCATACCAACTTTTGCACTATCTGT
GGCAAGGGTTTCAAGAGAGACGCTAACCTGAGGATGCACATGAGAGGTCACGGCGACGAG
TACAAAACTCCAGCTGCTCTAGCCAAACCCACCAAAGAAACCCAACCCGGGTTTGAGCCG
GTGCTGATCAAAAGGTACTCTTGCCCATTCCCTGGCTGCAAACGTAACAAGGGTCACAAA
AAGTTTCAGCCTTTGAAGACGATACTATGCGTGAAGAACCATTATAAACGCACCCACTGC
GACAAAAGCTTCACCTGCAGCCGCTGCCATACC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL3946Contig1 510 2 7 U
GGAAAGCAAGTGCTTGAAAAACACCAAGCAACAATGTCGAAAATCTCAAAGGTTTCTTCT
TTCTGTTTACTCCTCCTCGTGGTCTTCCTCGTCCTCAGTTCTCAACCTGCACTCTCACTC
CGTGTCCCAAAACCACAATCAGAAACAGCATCACCTCAAACCATGATCGATGATGATTCG
TCTCCAATGGGAATGATCGACCATGCAAAATCCATGATTGCTGGATTCTTCAGCCACAAG
TTTCCATTAATGGGCTGGCCTTTCCCCAAGTACCCACCTTTCACAATGGTCAACCCTAAC
ATCCCAACAAACCCATCTGGAGCTCAAGAGGAATCAGAGAAGCTACCTTCTTCCCCAAGT
AATCTTAACAAAGATGGAGGAAACGCATGAAGACTGAAGTTTCACTTGTGCTCACAAAAA
CACTAATATGGTTTTACATTTCATAAAAAAAATAAAATTTGTATCTTTAACAATTGAATG
GTAAGACAAAGAAGATGTTATCTATCTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH87TF U 1
AF RR2AI41TF U 14
BS 1 87 RR2CH87TF
BS 88 88 RR2AI41TF
BS 89 143 RR2CH87TF
BS 144 144 RR2AI41TF
BS 145 341 RR2CH87TF
BS 342 342 RR2AI41TF
BS 343 510 RR2CH87TF

RD RR2CH87TF 510 0 0
GGAAAGCAAGTGCTTGAAAAACACCAAGCAACAATGTCGAAAATCTCAAAGGTTTCTTCT
TTCTGTTTACTCCTCCTCGTGGTCTTCTTCGTCCTCAGTTCTCAACCTGCACTCTCACTC
CGTGTCCCAAAACCACAATCAGAGACAGCATCACCTCAAACCATGATCGATGATGATTCG
TCTCCAATGGGAATGATCGACCATGCAAAATCCATGATTGCTGGATTCTTCAGCCACAAG
TTTCCATTAATGGGCTGGCCTTTCCCCAAGTACCCACCTTTCACAATGGTCAACCCTAAC
ATCCCAACAAACCCATCTGGAGCTCAAGAGGAATCAGAGAATCTACCTTCTTCCCCAAGT
AATCTTAACAAAGATGGAGGAAACGCATGAAGACTGAAGTTTCACTTGTGCTCACAAAAA
CACTAATATGGTTTTACATTTCATAAAAAAAATAAAATTTGTATCTTTAACAATTGAATG
GTAAGACAAAGAAGATGTTATCTATCTATC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2AI41TF 488 0 0
GG
GAAAAACACCAAGCAACAATGTCGAAAATCTCAAAGGTTTCTTCTTTCTGTTTACTCCTC
CTCGTGGTCTTCCTCGTCCTCAGTTCTCAACCTGCACTCTCACTCCGTGTCCCAAAACCA
CAATCAGAAACAGCATCACCTCAAACCATGATCGATGATGATTCGTCTCCAATGGGAATG
ATCGACCATGCAAAATCCATGATTGCTGGATTCTTCAGCCACAAGTTTCCATTAATGGGC
TGGCCTTTCCCCAAGTACCCACCTTTCACAATGGTCAACCCTAACATCCCAACAAACCCA
TCTGGAGCTCAAGAGGAATCAGAGAAGCTACCTTCTTCCCCAAGTAATCTTAACAAAGAT
GTAGGAAACGCATGAAGACTGAAGTTTCACTTGTGCTCACAAAAACACTAATATGGTTTT
ACATTTCATAAAAAAA*TAAAATTTGTATCTTTAACAATTGAATGGTAAGACAAAGAAGA
TGTTAT

QA 3 488 3 488
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3948Contig1 777 2 2 U
GCGCCACCGGAGATCTCGTCCGCGAGGAGCTTGCTTCTTCCGGTCCTCTCTCCCAACAGC
TAAAAGAGATTGTAAACCAGGGGAAACTGGTTTCGGATGAGATCATAGTGAACCTATTAT
CAAAGAGACTCGAGGCTGGTGAAGCCAAAGGCGAATCTGGTTTCATTCTCGACGGCTTTC
CTCGGACCATGAGACAAGCTGAAATACTAGGAGATGTCACTGACATCGACCTAGTGGTGA
ACTTGAAGCTACCTGAGGAGGTTTTGGTTGACAAGTGTCTAGGCGAGAACATGCGATCAG
TGCGGTAAAGGTTTCAACATAGCTCACATCAACTTAAAAGGTGAGAATGGGAAACCAGGA
ATCAGCATGGATCCGCTTCTACCTCCACCTCAGTGCATGTCAAAGCTCATCACTCGTGCT
GATGATACCGAAGAGGTTGTTAAAGCTAGGCTTCGTATTTACAATGAAACCAGCCAGCCT
CTTGAAGAGTATTACCGTAGCAAGGGAAAGCTGATGGAGTTTGACTTACCTGGAGGCATC
CCTGAGTCATGGCCAAGGCTGTTAGAAGCCTTGAGGCTTGATGATTACGAGGAGAAACAA
TCTGCCGCGGCATAGTTCTCACTTCATTCACTCCGGTATTTATTTATATAATTCTTTGCA
TGTGGAAGACATATGCCTAATCAGTTTTGTGTGTTGGAAATAAAAGAAAAACCTTAGATT
GTTTTTTTTTATTGCCTCAGTTCAGAATAATAATCATCGTACACACTTTTGCAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD79TF U 1
AF RR2CD79JQ C 14
BS 1 666 RR2CD79TF
BS 667 777 RR2CD79JQ

RD RR2CD79TF 673 0 0
GCGCCACCGGAGATCTCGTCCGCGAGGAGCTTGCTTCTTCCGGTCCTCTCTCCCAACAGC
TAAAAGAGATTGTAAACCAGGGGAAACTGGTTTCGGATGAGATCATAGTGAACCTATTAT
CAAAGAGACTCGAGGCTGGTGAAGCCAAAGGCGAATCTGGTTTCATTCTCGACGGCTTTC
CTCGGACCATGAGACAAGCTGAAATACTAGGAGATGTCACTGACATCGACCTAGTGGTGA
ACTTGAAGCTACCTGAGGAGGTTTTGGTTGACAAGTGTCTAGGCGAGAACATGCGATCAG
TGCGGTAAAGGTTTCAACATAGCTCACATCAACTTAAAAGGTGAGAATGGGAAACCAGGA
ATCAGCATGGATCCGCTTCTACCTCCACCTCAGTGCATGTCAAAGCTCATCACTCGTGCT
GATGATACCGAAGAGGTTGTTAAAGCTAGGCTTCGTATTTACAATGAAACCAGCCAGCCT
CTTGAAGAGTATTACCGTAGCAAGGGAAAGCTGATGGAGTTTGACTTACCTGGAGGCATC
CCTGAGTCATGGCCAAGGCTGTTAGAAGCCTTGAGGCTTGATGATTACGAGGAGAAACAA
TCTGCCGCGGCATAGTTCTCACTTCATTCACTCCGGTATTTATTTATATAATTCTTTGCA
TGTGGA
GACATAT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2CD79JQ 764 0 0
TCTCGTCCGCGAGGAGCTTGCTTCTTCCGGTCCTCTCTCCCAACAGCTAAAAGAGATTGT
AAACCAGGGGAAACTGGTTTCGGATGAGATCATAGTGAACCTATTATCAAAGAGACTCGA
GGCTGGTGAAGCCAAAGGCGAATCTGGTTTCATTCTCGACGGCTTTCCTCGGACCATGAG
ACAAGCTGAAATACTAGGAGATGTCACTGACATCGACCTAGTGGTGAACTTGAAGCTACC
TGAGGAGGTTTTGGTTGACAAGTGTCTAGGCGAGAACATGCGATCAGTGCGGTAAAGGTT
TCAACATAGCTCACATCAACTTAAAAGGTGAGAATGGGAAACCAGGAATCAGCATGGATC
CGCTTCTACCTCCACCTCAGTGCATGTCAAAGCTCATCACTCGTGCTGATGATACCGAAG
AGGTTGTTAAAGCTAGGCTTCGTATTTACAATGAAACCAGCCAGCCTCTTGAAGAGTATT
ACCGTAGCAAGGGAAAGCTGATGGAGTTTGACTTACCTGGAGGCATCCCTGAGTCATGGC
CAAGGCTGTTAGAAGCCTTGAGGCTTGATGATTACGAGGAGAAACAATCTGCCGCGGCAT
AGTTCTCACTTCATTCACTCCGGTATTTATTTATATAATTCTTTGCATGTGGAAGACATA
TGCCTAATCAGTTTTGTGTGTTGGAAATAAAAGAAAAACCTTAGATTGTTTTTTTTTATT
GCCTCAGTTCAGAATAATAATCATCGTACACACTTTTGCAAACC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL3949Contig1 406 2 2 U
GGATCCATCTTCTTCTTGCTTTCTCGCATTTCACCTTAACCATGGCTTCGATTGTCTGCT
CTTACGCTCCATTCACGATCCGAGCATCTTCCGGATCCGGGTCTATGAAAAACCCGGATC
AAAACCGCAAGAAAACTGTTTCTTGGTGGGCTCCTCTCTTCGGCATACCCTCCGAGCCAG
ATTACCTCAACATCGAAACCCCCTCCTCAGTGGCTCCGGAACCGAACGGGTCGGGTCAGG
ATCCGGGTCAAAAGCTTTGTCGTCGCGGTTGTTTTACTGAGGAGAAGGCTAGGGAGTTGA
GGAAGAAAATCGCAGAAGCTTCCACGTTCCACGAAGTCATGTATCATTCGGGGATTGCGT
CTCGGCTTGCTTTTGACATCTCTGGTCGGGTTAAGGATTAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E465TF U 1
AF RR2E465JQ C 168
BS 1 257 RR2E465TF
BS 258 406 RR2E465JQ

RD RR2E465TF 262 0 0
GGATCCATCTTCTTCTTGCTTTCTCGCATTTCACCTTAACCATGGCTTCGATTGTCTGCT
CTTACGCTCCATTCACGATCCGAGCATCTTCCGGATCCGGGTCTATGAAAAACCCGGATC
AAAACCGCAAGAAAACTGTTTCTTGGTGGGCTCCTCTCTTCGGCATACCCTCCGAGCCAG
ATTACCTCAACATCGAAACCCCCTCCTCAGTGGCTCCGGAACCGAACGGGTCGGGTCAGG
ATCCGGGTCAAAAGCTT
CTCTC

QA 1 257 1 257
DS 

RD RR2E465JQ 239 0 0
CCCTCCGAGCCAGATTACCTCAACATCGAAACCCCCTCCTCAGTGGCTCCGGAACCGAAC
GGGTCGGGTCAGGATCCGGGTCAAAAGCTTTGTCGTCGCGGTTGTTTTACTGAGGAGAAG
GCTAGGGAGTTGAGGAAGAAAATCGCAGAAGCTTCCACGTTCCACGAAGTCATGTATCAT
TCGGGGATTGCGTCTCGGCTTGCTTTTGACATCTCTGGTCGGGTTAAGGATTAAAAAAA

QA 1 239 1 239
DS 



AS 1 2

CO CL3950Contig1 470 2 1 U
GGGAGGAAAAGCTGGAGAAGGCGATGAACAAGGCCAAAGAGATTGTCTCCTCGTACCCTG
TCGTTGTCTTCAGCAAGACTTACCGTGGTTATTGCCAGAAGGTGAAGCAGTTACTGACAA
AGCTAGGCGCAGATTTTGAAGTACTTGAGCTCGATGAGATGAGTGATGGAGGTGAGATAC
AATCAGCTTTGTCAAAGTGGACTGGACAGAGAACTGTTCCAAGCGTCTTCATCAAAGGGA
AACATATTGGTGGATGCGACAGTGTGATGGAGAGTAACCAGAAAGGTAAGCTTGTGCCTT
TACTGGTTGAAGCTGGTGCTCTTGGCAAAATCTCTTCCAAGCTTTGAACAAGTCTGAAAT
TCAAATCCTGGGACTTCATATTTATATGTTAAGACCAAGAAAAAGTATTGTCTCGTTAAA
CAAAATATACTTTCTCTTTGTTAACTCTGTTTGCAATGAAGTTCTTGCTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GA02JQ C 1
AF RR2GA02TF U 1
BS 1 470 RR2GA02TF

RD RR2GA02JQ 470 0 0
GGGAGGAAAAGCTGGAGAAGGCGATGAACAAGGCCAAAGAGATTGTCTCCTCGTACCCTG
TCGTTGTCTTCAGCAAGACTTACCGTGGTTATTGCCAGAAGGTGAAGCAGTTACTGACAA
AGCTAGGCGCAGATTTTGAAGTACTTGAGCTCGATGAGATGAGTGATGGAGGTGAGATAC
AATCAGCTTTGTCAAAGTGGACTGGACAGAGAACTGTTCCAAGCGTCTTCATCAAAGGGA
AACATATTGGTGGATGCGACAGTGTGATGGAGAGTAACCAGAAAGGTAAGCTTGTGCCTT
TACTGGTTGAAGCTGGTGCTCTTGGCAAAATCTCTTCCAAGCTTTGAACAAGTTTGAAAT
TCAAATCCTGGGACTTCATATTTATATGTTAAGACCAAGAAAAAGTATTGTCTCGTTAAA
CAAAATATACTTTCTCTTTGTTAACTCTGTTTGCAATGAAGTTCTTGCTG

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR2GA02TF 470 0 0
GGGAGGAAAAGCTGGAGAAGGCGATGAACAAGGCCAAAGAGATTGTCTCCTCGTACCCTG
TCGTTGTCTTCAGCAAGACTTACCGTGGTTATTGCCAGAAGGTGAAGCAGTTACTGACAA
AGCTAGGCGCAGATTTTGAAGTACTTGAGCTCGATGAGATGAGTGATGGAGGTGAGATAC
AATCAGCTTTGTCAAAGTGGACTGGACAGAGAACTGTTCCAAGCGTCTTCATCAAAGGGA
AACATATTGGTGGATGCGACAGTGTGATGGAGAGTAACCAGAAAGGTAAGCTTGTGCCTT
TACTGGTTGAAGCTGGTGCTCTTGGCAAAATCTCTTCCAAGCTTTGAACAAGTCTGAAAT
TCAAATCCTGGGACTTCATATTTATATGTTAAGACCAAGAAAAAGTATTGTCTCGTTAAA
CAAAATATACTTTCTCTTTGTTAACTCTGTTTGCAATGAAGTTCTTGCTG

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 2

CO CL3951Contig1 1049 2 2 U
GGGGATGAGAAAGTTTTGAGTTTCCTCTCACGTTACACCAGGTCCAACTCCAAGCATAAG
TAAATCAAGATGTCCGACATGACAAGTCTCGCAGCATCACCTACTTCAAGATCTTCAAAA
CGCGCCATGTACTACGTGCAAAGTCCATCACGTGACTCTTACACGTCAGTTACACAGCCT
AGCCCTATGGACTCTCCCACACACGATTCTTCCTCCGTGGGCCGTCACTCTCGTAACTCA
TCAGCGAGTAGATTCTCCGGGATATCCCGATCATCATCATCAGAAAAGAAGAACATCAAG
AAGTGCAGATCTAACGAGAAAGAATACGAGAGTATACTTGAAGAAGGTTCGTATGAAGAA
ATGGACGACGTGACGTCTATAAAGAGGTGTCAAGCACTACTTGCCGTTTTCATTTTCGTA
GTTCTCTTCGCCGTCTGCTGCTTAATCACGTGGGGAGCTAGTAGACCTTACAAGACTCAA
ATATCGGTTCAGACTTTCGAACTACGCAACTTTTATGTTGGTGAAGCATCAGATTTCCAT
GGCATGCTTACCAAGTTGCTGACTTTGAATGGAACATTAAGAATTGGTATATACAATCCT
GCCCCAACATTTGGTATTCATGTTAGTTCCACACCAGTCAGTCTCTTCTATTATCAACTC
CCTATCGCCACCGGTCAGTTGAAGGAACATTATCAACAGAAGAAGAGTCTATATACGGAA
GCAGTGGTTATAGAGGGAAGAAAGATTCCATTATACGGTGCAGGAGCAAGCCTCGATGCG
ACGGAGAGAGGCGGAAATATTCCGGTGAATTTGAGATTTGAAGTCAAAACAAGAGGATAT
GTGGTCGGAAGATTGGTTACAATAGGGCAAAGAAAGAGAATCTCATGCTCATTTGTCATT
GATGTTGCCATTAATAAGCGCATATCGGTCGATAAGAGTGATTGCAGCTACTCATGATTC
CAAAAACTTTCAATTAAATCAATGCGAGTGATGTGTAATAACAAAATATTGGTATTTAAA
TGTTTAACTGAGGTAAAATTTAAAAAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G532TF U 1
AF RR2G532JQ C 220
BS 1 702 RR2G532TF
BS 703 1049 RR2G532JQ

RD RR2G532TF 702 0 0
GGGGATGAGAAAGTTTTGAGTTTCCTCTCACGTTACACCAGGTCCAACTCCAAGCATAAG
TAAATCAAGATGTCCGACATGACAAGTCTCGCAGCATCACCTACTTCAAGATCTTCAAAA
CGCGCCATGTACTACGTGCAAAGTCCATCACGTGACTCTTACACGTCAGTTACACAGCCT
AGCCCTATGGACTCTCCCACACACGATTCTTCCTCCGTGGGCCGTCACTCTCGTAACTCA
TCAGCGAGTAGATTCTCCGGGATATCCCGATCATCATCATCAGAAAAGAAGAACATCAAG
AAGTGCAGATCTAACGAGAAAGAATACGAGAGTATACTTGAAGAAGGTTCGTATGAAGAA
ATGGACGACGTGACGTCTATAAAGAGGTGTCAAGCACTACTTGCCGTTTTCATTTTCGTA
GTTCTCTTCGCCGTCTGCTGCTTAATCACGTGGGGAGCTAGTAGACCTTACAAGACTCAA
ATATCGGTTCAGACTTTCGAACTACGCAACTTTTATGTTGGTGAAGCATCAGATTTCCAT
GGCATGCTTACCAAGTTGCTGACTTTGAATGGAACATTAAGAATTGGTATATACAATCCT
GCCCCAACATTTGGTATTCATGTTAGTTCCACACCAGTCAGTCTCTTCTATTATCAACTC
CCTATCGCCACCGGTCAGTTGAAGGAACATTATCAACAGAAG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2G532JQ 830 0 0
TGG
CGTCACTCTCGTA*CTCATCAGCGAGTAGAT*CTCCGGGATATCCCGATCATCATCATCA
GAAA*GAAGAACATCAAGAAGTGCAGATCTAACGAGAAAGAATACGAGAGTATACTTGAA
GAAGGTTCGTATGAAGAAATGGACGACGTGACGTCTATAAAGAGGTGTCAAGCACTACTT
GCCGTTTTCATTTTCGTAGTTCTCTTCGCCGTCTGCTGCTTAATCACGTGGGGAGCTAGT
AGACCTTACAAGACTCAAATATCGGTTCAGACTTTCGAACTACGCAACTTTTATGTTGGT
GAAGCATCAGATTTCCATGGCATGCTTACCAAGTTGCTGACTTTGAATGGAACATTAAGA
ATTGGTATATACAATCCTGCCCCAACATTTGGTATTCATGTTAGTTCCACACCAGTCAGT
CTCTTCTATTATCAACTCCCTATCGCCACCGGTCAGTTGAAGGAACATTATCAACAGAAG
AAGAGTCTATATACGGAAGCAGTGGTTATAGAGGGAAGAAAGATTCCATTATACGGTGCA
GGAGCAAGCCTCGATGCGACGGAGAGAGGCGGAAATATTCCGGTGAATTTGAGATTTGAA
GTCAAAACAAGAGGATATGTGGTCGGAAGATTGGTTACAATAGGGCAAAGAAAGAGAATC
TCATGCTCATTTGTCATTGATGTTGCCATTAATAAGCGCATATCGGTCGATAAGAGTGAT
TGCAGCTACTCATGATTCCAAAAACTTTCAATTAAATCAATGCGAGTGATGTGTAATAAC
AAAATATTGGTATTTAAATGTTTAACTGAGGTAAAATTTAAAAAGCG

QA 4 830 4 830
DS 



AS 1 2

CO CL3952Contig1 696 2 1 U
GCCGCCGCGACTGCGAGAGCCTCCGCGAAGGATGCTGCAGCGAGGGCAGGGGATCCGGAT
GAGGAGAAGTATAGGTTGGGTTATGGTGTTGCTGGTAAAGGAGTGAAGCTTCCTTGGTAC
GTTGAGAACAAACGCAAGTATGAAGAAGATGATAGAGTTGGTGGTGAGGAGGAGGATGGT
AGAAGTGAATCTAAGAAGAAGAAGAGTGGGAAGAAGAGCTTGAAGGAGCTGAGGGAAGAG
AGGTTGAAGAGGGAGAGGGTTGAGAAGGAAAGAGAGAGGGCACTTTTCAGGAAACAGAGC
CAGAGAAGCGGTGGCTTTTCACGTAGGTAGGTGAGAAAAGCTTCAAGGTGTACTTATATA
CAAACTTAGTGCTTGTACTTCTTTTGTGTTGATAGTTTGGAGTGTGATAATAATTTACCA
GTTGCTGGACACGAGCATATTTTGAAGTTTAGAGAAGCATGATTGTGTTAGTTTTATTGT
AGCGTTTAGACTTCGAACTTGGAACTACGTGTTTGATATGTACACTTGTGTCAACGTTGG
GTTTGAGAACTGTTTTGGTAGCTGAGAGTCTCATTGGTTCAAATTAGAACGGGAACATCG
GAGTTATAGTCATCTCAGAAGAATAGTTAGGTTGTGAAATTGTGTAGGCGGTGATTGAAT
CGCATGTACGCGAATAAAGAAGACTTGATGTTTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AZ55JQ C 1
AF RR2AZ55TFB U 1
BS 1 696 RR2AZ55TFB

RD RR2AZ55JQ 696 0 0
GCCGCCGCGACTGCGAGAGCCTCCGCGAAGGATGCTGCAGCGAGGGCAGGGGATCCGGAT
GAGGAGAAGTATAGGTTGGGTTATGGTGTTGCTGGTAAAGGAGTGAAGCTTCCTTGGTAC
GTTGAGAACAAACGCAAGTATGAAGAAGATGATAGAGTTGGTGGTGAGGAGGAGGATGGT
AGAAGTGAATCTAAGAAGAAGAAGAGTGGGAAGAAGAGCTTGAAGGAGCTGAGGGAAGAG
AGGTTGAAGAGGGAGAGGGTTGAGAAGGAAAGAGAGAGGGCACTTTTCAGGAAACAGAGC
CAGAGAAGCGGTGGCTTTTCACGTAGGTAGGTGAGAAAAGCTTCAAGGTGTACTTATATA
CAAACTTAGTGCTTGTACTTCTTTTGTGTTGATAGTTTGGAGTGTGATAATAATTTACCA
GTTGCTGGACACGAGCATATTTTGAAGTTTAGAGAAGCATGATTGTGTTAGTTTTATTGT
AGCGTTTAGACTTCGAACTTGGAACTACGTGTTTGATATGTACACTTGTGTCAACGTTGG
GTTTGAGAACTGTTTTGGTAGCTGAGAGTCTCATTGGTTCAAATTAGAACGGGAACATCG
GAGTTATAGTCATCTCAGAAGAATAGTTAGGTTGTGAAATTGTGTAGGCGGTGATTGAAT
CGCATGTACGCGAATAAAGAAGACTTGATGTTTCTC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2AZ55TFB 696 0 0
GCCGCCGCGACTGCGAGAGCCTCCGCGAAGGATGCTGCAGCGAGGGCAGGGGATCCGGAT
GAGGAGAAGTATAGGTTGGGTTATGGTGTTGCTGGTAAAGGAGTGAAGCTTCCTTGGTAC
GTTGAGAACAAACGCAAGTATGAAGAAGATGATAGAGTTGGTGGTGAGGAGGAGGATGGT
AGAAGTGAATCTAAGAAGAAGAAGAGTGGGAAGAAGAGCTTGAAGGAGCTGAGGGAAGAG
AGGTTGAAGAGGGAGAGGGTTGAGAAGGAAAGAGAGAGGGCACTTTTCAGGAAACAGAGC
CAGAGAAGCGGTGGCTTTTCACGTAGGTAGGTGAGAAAAGCTTCAAGGTGTACTTATATA
CAAACTTAGTGCTTGTACTTCTTTTGTGTTGATAGTTTGGAGTGTGATAATAATTTACCA
GTTGCTGGACACGAGCATATTTTGAAGTTTAGAGAAGCATGATTGTGTTAGTTTTATTGT
AGCGTTTAGACTTCGAACTTGGAACTACGTGTTTGATATGTACACTTGTGTCAACGTTGG
GTTTGAGAACTGTTTTGGTAGCTGAGAGTCTCATTGGTTCAAATTAGAACGGGAACATCG
GAGTTATAGTCATCTCAGAAGAATAGTTAGGTTGTGAAATTGTGTAGGCGGTGATTGAAT
CGCATGTACGCGAATAAAGAAGACTTGATGTTTCTC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL3953Contig1 1001 2 2 U
GGGACGACAAAAATAAAATAAACTCAAAAACAATGGGTGTAGACAGTTTATAGTCAACAT
ACTGGATGCAGATTTCCTTTTTTTTGTAGACTATATTAAACCCCTGAGTAAGCTTATCTT
CTCGGCACGAAAATCAATTCACCAGAGCAGGAAAAGATAGCGAGAGTATATAATCAATAG
TAATACCTTTTCTAGGGAGAAGAAAGAAGAAATGGCGCAGTCGGTGATCGTGGATCGAAG
GTTCTGTGTTCCGGACCCCGTGGATCTGGCGATGGTGCGGGATAAGATTGCTTCACAGTA
CGGTAACTTCGTTATAGGTGACGTTGACGGGAACATGCTGTTCCAGGTGAAAAAACCGGG
TTTTGGTCTTCACAAGAAGATGATCTTATTGGATAGTTCTGGATCTCCGGCATTGACTAT
GAAAGAGAAGACGATGACTTTGCATAACAGGTGGCAAGTATTTAAAGGAGGGAGTACGGA
AGAGTGTGATATGCTCTACACGGTGAAAAGATCGTCGATGGTTCAGCGTACAACGAAACT
TGATGTGTTTTTGGGTCACAACAAGAGAAGACATGCGATTTCAAAGTCAAAGGGACGAAT
TGGCTCGAACACTCTTGTGTCGTCTGCGCCGGTGGATCTGACGTCAATGTTGCCCAAATG
CAGCACAAGAAGCACACGCGGCATACCGCTTTATCTGGAAATGACAGTTTCTCGGTGACG
GTTAAACCAAACATCGATTATGCCTTCATTGCCTCTCTCGTAGTCCTTTTTGATGTTGTT
GACCGACAAGAGTCGCCCAAAGGAATCGGCTCTGATAATTTCGAGGCTGTCCATGTTACA
CAGGGTTTATTCCAATGATGGATTTTAAAATAGTTTAAATCCAACGAAAATCTTTTGTTA
TTCAAATAATGATTCTAAATTATGTTATGTTTTAAAATTCAATTGTATTGAATCTTATAT
TTATAAATCATGCACCATATATTTAATTCAGTTTTCAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD72TF U 1
AF RR2BD72JQ C 196
BS 1 521 RR2BD72TF
BS 522 1001 RR2BD72JQ

RD RR2BD72TF 521 0 0
GGGACGACAAAAATAAAATAAACTCAAAAACAATGGGTGTAGACAGTTTATAGTCAACAT
ACTGGATGCAGATTTCCTTTTTTTTGTAGACTATATTAAACCCCTGAGTAAGCTTATCTT
CTCGGCACGAAAATCAATTCACCAGAGCAGGAAAAGATAGCGAGAGTATATAATCAATAG
TAATACCTTTTCTAGGGAGAAGAAAGAAGAAATGGCGCAGTCGGTGATCGTGGATCGAAG
GTTCTGTGTTCCGGACCCCGTGGATCTGGCGATGGTGCGGGATAAGATTGCTTCACAGTA
CGGTAACTTCGTTATAGGTGACGTTGACGGGAACATGCTGTTCCAGGTGAAAAAACCGGG
TTTTGGTCTTCACAAGAAGATGATCTTATTGGATAGTTCTGGATCTCCGGCATTGACTAT
GAAAGAGAAGACGATGACTTTGCATAACAGGTGGCAAGTATTTAAAGGAGGGAGTACGGA
AGAGTGTGATATGCTCTACACGGTGAAAAGATCGTCGATGG

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2BD72JQ 806 0 0
GGAGAAGAAAGAAGAAATGGCGCAGTCGGTGATCGTGGATCGAAGGTTCTGTGTTCCGGA
CCCCGTGGATCTGGCGATGGTGCGGGATAAGATTGCTTCACAGTACGGTAACTTCGTTAT
AGGTGACGTTGACGGGAACATGCTGTTCCAGGTGAAAAAACCGGGTTTTGGTCTTCACAA
GAAGATGATCTTATTGGATAGTTCTGGATCTCCGGCATTGACTATGAAAGAGAAGACGAT
GACTTTGCATAACAGGTGGCAAGTATTTAAAGGAGGGAGTACGGAAGAGTGTGATATGCT
CTACACGGTGAAAAGATCGTCGATGGTTCAGCGTACAACGAAACTTGATGTGTTTTTGGG
TCACAACAAGAGAAGACATGCGATTTCAAAGTCAAAGGGACGAATTGGCTCGAACACTCT
TGTGTCGTCTGCGCCGGTGGATCTGACGTCAATGTTGCCCAAATGCAGCACAAGAAGCAC
ACGCGGCATACCGCTTTATCTGGAAATGACAGTTTCTCGGTGACGGTTAAACCAAACATC
GATTATGCCTTCATTGCCTCTCTCGTAGTCCTTTTTGATGTTGTTGACCGACAAGAGTCG
CCCAAAGGAATCGGCTCTGATAATTTCGAGGCTGTCCATGTTACACAGGGTTTATTCCAA
TGATGGATTTTAAAATAGTTTAAATCCAACGAAAATCTTTTGTTATTCAAATAATGATTC
TAAATTATGTTATGTTTTAAAATTCAATTGTATTGAATCTTATATTTATAAATCATGCAC
CATATATTTAATTCAGTTTTCAAATG

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL3954Contig1 840 2 4 U
GGATTCATTTCATTTCAATTGCATTTTGGTTTTAAAGAGAGCCATGGATACAGAGTTTCT
CAGAACACTAGATCCTCAGATTCTCTTGGGTGCCTTCGTGGCTCTCGTCGCCGTCGGTGC
CGGTGCTGCTTACTATCTGTCCTCCTCCAAGAAACGCAGAGGGTGTTTGGATCCAGAAAT
TTCAAGGAGTTTAAGCTTGTTAAGAAGCACCAACTTAGCCACAATGTGGCTAAGTTCGTT
TTCGAGCTTCCAGCTCCTACCTCCGTCTTGGGTCTTCCCATTGGACAACACATCAGTTTA
GGGCTTTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCAGGGATTACTCCCATGTTCCAAGTTGCTAGAG
CGATACTTGAAAACCCAACAGACAAGACAAAGGTCCACCTCATTTATGCTAATGTCACCT
ACGATGACATTCTCTTAAAGGATGAGTTGGATAGTCTTACCTCCAATTACCCAGATCAAT
TCAAAATTTACTATGTTTTGAACCAGCCTCCGGAAGTATGGGATGGTGGTGTTGGATTTG
TAACCAAGGAAATGATCCAGGCTCATTGCCCTGCACCAGCATCCGATATTCAGATCCTAA
GATGTGGACCACCGCCAATGAACAAGGCCATGGCAGCAAACCTTGAAGCTCTTGGTTACA
CTCCAGAGATGCAGTTCCAGTTCTGATCTTAACCTCTGCTTTATTGGCTTGGAGTCATTT
TTAAAAACTCATTTAATCTGATCAATAACTTTTGTTATCCAATCCTGACTGAGAGTTGTG
TCTTTATTGAGTGATACTTTGTGTTTCTGTTGGAAAAGTTTCATAAAAACCCTTTGTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS57TF U 1
AF RR2CS57JQ C 51
BS 1 726 RR2CS57TF
BS 727 727 RR2CS57JQ
BS 728 756 RR2CS57TF
BS 757 840 RR2CS57JQ

RD RR2CS57TF 756 0 0
GGATTCATTTCATTTCAATTGCATTTTGGTTTTAAAGAGAGCCATGGATACAGAGTTTCT
CAGAACACTAGATCCTCAGATTCTCTTGGGTGCCTTCGTGGCTCTCGTCGCCGTCGGTGC
CGGTGCTGCTTACTATCTGTCCTCCTCCAAGAAACGCAGAGGGTGTTTGGATCCAGAAAT
TTCAAGGAGTTTAAGCTTGTTAAGAAGCACCAACTTAGCCACAATGTGGCTAAGTTCGTT
TTCGAGCTTCCAGCTCCTACCTCCGTCTTGGGTCTTCCCATTGGACAACACATCAGTTTA
GGGCTTTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCAGGGATTACTCCCATGTTCCAAGTTGCTAGAG
CGATACTTGAAAACCCAACAGACAAGACAAAGGTCCACCTCATTTATGCTAATGTCACCT
ACGATGACATTCTCTTAAAGGATGAGTTGGATAGTCTTACCTCCAATTACCCAGATCAAT
TCAAAATTTACTATGTTTTGAACCAGCCTCCGGAAGTATGGGATGGTGGTGTTGGATTTG
TAACCAAGGAAATGATCCAGGCTCATTGCCCTGCACCAGCATCCGATATTCAGATCCTAA
GATGTGGACCACCGCCAATGAACAAGGCCATGGCAGCAAACCTTGAAGCTCTTGGTTACA
CTCCAGAGATGCAGTTCCAGTTCTGATCTTAACCTCTGCTTTATTGGCTTGGAGTCATTT
TTAAAA*CTCATTTAATCTGATCAATAACTTTTGTT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2CS57JQ 790 0 0
CAGAGTTTCTCAGAACACTAGATCCTCAGATTCTCTTGGGTGCCTTCGTGGCTCTCGTCG
CCGTCGGTGCCGGTGCTGCTTACTATCTGTCCTCCTCCAAGAAACGCAGAGGGTGTTTGG
ATCCAGAAATTTCAAGGAGTTTAAGCTTGTTAAGAAGCACCAACTTAGCCACAATGTGGC
TAAGTTCGTTTTCGAGCTTCCAGCTCCTACCTCCGTCTTGGGTCTTCCCATTGGACAACA
CATCAGTTTAGGGCTTTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCAGGGATTACTCCCATGTTCCAA
GTTGCTAGAGCGATACTTGAAAACCCAACAGACAAGACAAAGGTCCACCTCATTTATGCT
AATGTCACCTACGATGACATTCTCTTAAAGGATGAGTTGGATAGTCTTACCTCCAATTAC
CCAGATCAATTCAAAATTTACTATGTTTTGAACCAGCCTCCGGAAGTATGGGATGGTGGT
GTTGGATTTGTAACCAAGGAAATGATCCAGGCTCATTGCCCTGCACCAGCATCCGATATT
CAGATCCTAAGATGTGGACCACCGCCAATGAACAAGGCCATGGCAGCAAACCTTGAAGCT
CTTGGTTACACTCCAGAGATGCAGTTCCAGTTCTGATCTTAACCTCTGCTTTATTGGCTT
GGAGTCATTTTTAAAAACTCATTTAATCTGATCAATAACTTTTGTTATCCAATCCTGACT
GAGAGTTGTGTCTTTATTGAGTGATACTTTGTGTTTCTGTTGGAAAAGTTTCATAAAAAC
CCTTTGTCCG

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL3955Contig1 466 2 1 U
GGACCCAAAGCAAAAATGGTTATATCTAAGAAAACAATTGCTCTATCATTGGCTCTTGTA
GCCATTATCTGTATCGTTATGACCACAACTGAAGCACACACAGGGAGTGAAGCTAAGGAC
AAAGATCACAAGAGTTGTGCCTCGGGAACATGCAAAACAGGAAGTGATGAAGAACCATTT
AACCCGGGTTGTGAACCCGGTAGTGGTAGAAGATGTCGTGCGGGTTGAGATTAAGAGATT
TTTTCGCTCTTGGGAAATGAGTAAAAATTAAATTTTCAATTACTTCTAAAACTACTAAGT
ACATAATAACTGTAACTACATTTATGAGAATAAATTTTGTAAGCAATAGCTAGCAGATAT
TAGCATTGTAAGCTTATATCGGCTAACTTGGTATTAAAATGTTTGAATAACTATACCCCA
TCCATTTGTTATAATATGGCTTTGGATGTAATAAGTTCAAATATAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EF53JQ C 1
AF RR2EF53TF U 1
BS 1 466 RR2EF53TF

RD RR2EF53JQ 466 0 0
GGACCCAAAGCAAAAATGGTTATATCTAAGAAAACAATTGCTCTATCATTGGCTCTTGTA
GCCATTATCTGTATCGTTATGACCACAACTGAAGCACACACAGGGAGTGAAGCTAAGGAC
AAAGATCACAAGAGTTGTGCCTCGGGAACATGCAAAACAGGAAGTGATGAAGAACCATTT
AACCCGGGTTGTGAACCCGGTAGTGGTAGAAGATGTCGTGCGGGTTGAGATTAAGAGATT
TTTTCGCTCTTGGGAAATGAGTAAAAATTAAATTTTCAATTACTTCTAAAACTACTAAGT
ACATAATAACTGTAACTACATTTATGAGAATAAATTTTGTAAGCAATAGCTAGCAGATAT
TAGCATTGTAAGCTTATATCGGCTAACTTGGTATTAAAATGTTTGAATAACTATACCCCA
TCCATTTGTTATAATATGGCTTTGGATGTAATAAGTTCAAATATAT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR2EF53TF 466 0 0
GGACCCAAAGCAAAAATGGTTATATCTAAGAAAACAATTGCTCTATCATTGGCTCTTGTA
GCCATTATCTGTATCGTTATGACCACAACTGAAGCACACACAGGGAGTGAAGCTAAGGAC
AAAGATCACAAGAGTTGTGCCTCGGGAACATGCAAAACAGGAAGTGATGAAGAACCATTT
AACCCGGGTTGTGAACCCGGTAGTGGTAGAAGATGTCGTGCGGGTTGAGATTAAGAGATT
TTTTCGCTCTTGGGAAATGAGTAAAAATTAAATTTTCAATTACTTCTAAAACTACTAAGT
ACATAATAACTGTAACTACATTTATGAGAATAAATTTTGTAAGCAATAGCTAGCAGATAT
TAGCATTGTAAGCTTATATCGGCTAACTTGGTATTAAAATGTTTGAATAACTATACCCCA
TCCATTTGTTATAATATGGCTTTGGATGTAATAAGTTCAAATATAT

QA 1 466 1 466
DS 



AS 1 2

CO CL3956Contig1 715 2 2 U
GGGAAGAAGCTCGTTTTCTCCTGATGATTTGATTAGTGATATTTGTTTCTCTAGTAGGCA
GTGACTGTTCTGGCAGAATTTCCAGGGACGAGTTTGATCTGCATATCAAATTTTCCAAAC
CAATACTCTTTCTTGGATTGGAATCCAGATCCGTAGGCTCTGTCGAGAGAAAGAGTGAGA
AGCTCTCCATTGTTGAGGATCTTCCCACGATCACCACCCCAAGTGATATCAAATTCTCTG
TCGAACGTTCCGGCATAAACCGGAGAGAAGAAGGTCGATGTCAAAGTGTTTCTCGTGATT
TGAATTGAAGAAAAGCCTGGATGAAGATCTTCATTGATCTTTGTTGTTTGATTCTGTTGT
TGGGTGGTATCCCCCCCGTAGTATACCATCATTGAATGTTAGAAGAAGGTGCTCAAGCTA
TACAGATTGAGCAAAGCGTGGTCCTACCAAATCAGACAACGGAAGCTAATCAAGCCGTTG
AAGAACCAAGAGGCAAGAGTTATACACACTAGATCTCGTTAGTCTATCAAGACATTCAGT
TGAGGCCAGTTAAGCCATTCGAAATAAGGATCATCAAGACATTCAGTTAGGCAAAGACCA
TGGTCTATAGGCACAAGCTCAGCAGCTCTAACTCCATTGTAACAACAACTCTCATCTTGG
TTATGTATCTTTTTCACTAAAAGTTATTTCAAAAAAAAAATTTAACTTAAGGACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO21JQ C 1
AF RR2DO21TF U 1
BS 1 699 RR2DO21TF
BS 700 715 RR2DO21JQ

RD RR2DO21JQ 715 0 0
GGGAAGAAGCTCGTTTTCTCCTGATGATTTGATTAGTGATATTTGTTTCTCTAGTAGGCA
GTGACTGTTCTGGCAGAATTTCCAGGGACGAGTTTGATCTGCATATCAAATTTTCCAAAC
CAATACTCTTTCTTGGATTGGAATCCAGATCCGTAGGCTCTGTCGAGAGAAAGAGTGAGA
AGCTCTCCATTGTTGAGGATCTTCCCACGATCACCACCCCAAGTGATATCAAATTTTCTG
TCGAACGTTCCGGCATAAACCGGAGAGAAGAAGGTCGATGTCAAAGTGTTTCTCGTGATT
TGAATTGAAGAAAAGCCTGGATGAAGATCTTCATTGATCTTTGTTGTTTGATTCTGTTGT
TGGGTGGTATCCCCCCCGTAGTATACCATCATTGAATGTTAGAAGAAGGTGCTCAAGCTA
TACAGATTGAGCAAAGCGTGGTCCTACCAAATCAGACAACGGAAGCTAATCAAGCCGTTG
AAGAACCAAGAGGCAAGAGTTATACACACTAGATCTCGTTAGTCTATCAAGACATTCAGT
TGAGGCCAGTTAAGCCATTCGAAATAAGGATCATCAAGACATTCAGTTAGGCAAAGACCA
TGGTCTATAGGCACAAGCTCAGCAGCTCTAACTCCATTGTAACAACAACTCTCATCTTGG
TTATGTATCTTTTTCACTAAAAGTTATTTCAAAAAAAAAATTTAACTTAAGGACC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2DO21TF 699 0 0
GGGAAGAAGCTCGTTTTCTCCTGATGATTTGATTAGTGATATTTGTTTCTCTAGTAGGCA
GTGACTGTTCTGGCAGAATTTCCAGGGACGAGTTTGATCTGCATATCAAATTTTCCAAAC
CAATACTCTTTCTTGGATTGGAATCCAGATCCGTAGGCTCTGTCGAGAGAAAGAGTGAGA
AGCTCTCCATTGTTGAGGATCTTCCCACGATCACCACCCCAAGTGATATCAAATTCTCTG
TCGAACGTTCCGGCATAAACCGGAGAGAAGAAGGTCGATGTCAAAGTGTTTCTCGTGATT
TGAATTGAAGAAAAGCCTGGATGAAGATCTTCATTGATCTTTGTTGTTTGATTCTGTTGT
TGGGTGGTATCCCCCCCGTAGTATACCATCATTGAATGTTAGAAGAAGGTGCTCAAGCTA
TACAGATTGAGCAAAGCGTGGTCCTACCAAATCAGACAACGGAAGCTAATCAAGCCGTTG
AAGAACCAAGAGGCAAGAGTTATACACACTAGATCTCGTTAGTCTATCAAGACATTCAGT
TGAGGCCAGTTAAGCCATTCGAAATAAGGATCATCAAGACATTCAGTTAGGCAAAGACCA
TGGTCTATAGGCACAAGCTCAGCAGCTCTAACTCCATTGTAACAACAACTCTCATCTTGG
TTATGTATCTTTTTCACTAAAAGTTATTTCAAAAAAAAA

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL3957Contig1 793 2 14 U
GAGCGCTTCCCTGTCCTGAGAAAGCGCATGGATGAGGTTATAGGGGATTTCCTGCGAGAA
GGTCTTGAACCCTCAGAAGCAATGATCGGTGATATCATTGATATGGAGATGGATTACATA
AACACTTCTCATCCTAATTTTATTGGCGGAACCAAGGCCGTGGAGGTTGCAATGCAAAAC
GTGAAGTCTTCTAGGGTTCCCCATCCTGTGGCACGACCAAAGCAGGATCCAGTGGACCTC
GAGAAAACTTCTTCTTCTTCAGCAAGTCAGGTGAAATCTCGATCTTTTCTCGGCAGACAA
GCTAATGGAATTGTCCCTGATCAGGGAGTTGTATCCGCAGATGCTGAAAAAGCTGCACCA
GCTGCAAATGCGAATGATTCAAGGTGGGGTATCCCTTCAATTTTCCGAGGTGGTGATAAT
CGGGCAGTTACCAAAGAAAACTTCTTAAACAAACCATTCAATGAAGCTGTTGAGGACATG
TCTCAGAACTTATCGATGATCTATTTAAAGGAGCCCCCAGCTGTCTTGAGGCCATCCGAA
ACCCATTCAGAACAGGAAGATGTCGAGATCCAGATTACAAAACTGTTGCTTAAATCATAC
TATGACATTGTGAGGAAAAATATTGAGGACTCAGTACCAAAAGCAATCATGCATTTCCTG
GTAAACCACACAAAACGTGAGCTGCACAATGTCTTCATCAAGAAGCTATACAGGAGAACT
TGTTTGAAGAATGCTGCAATAGCCGATGAGGTAGCGGTTAAGAAACGCACTCGAGAACAC
TCCACATTCTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG18TF U 1
AF RR2FR39TF U 25
BS 1 619 RR2CG18TF
BS 620 620 RR2FR39TF
BS 621 666 RR2CG18TF
BS 667 667 RR2FR39TF
BS 668 674 RR2CG18TF
BS 675 675 RR2FR39TF
BS 676 700 RR2CG18TF
BS 701 703 RR2FR39TF
BS 704 717 RR2CG18TF
BS 718 718 RR2FR39TF
BS 719 727 RR2CG18TF
BS 728 728 RR2FR39TF
BS 729 738 RR2CG18TF
BS 739 793 RR2FR39TF

RD RR2CG18TF 743 0 0
GAGCGCTTCCCTGTCCTGAGAAAGCGCATGGATGAGGTTATAGGGGATTTCCTGCGAGAA
GGTCTTGAACCCTCAGAAGCAATGATCGGTGATATCATTGATATGGAGATGGATTACATA
AACACTTCTCATCCTAATTTTATTGGCGGAACCAAGGCCGTGGAGGTTGCAATGCAAAAC
GTGAAGTCTTCTAGGGTTCCCCATCCTGTGGCACGACCAAAGCAGGATCCAGTGGACCTC
GAGAAAACTTCTTCTTCTTCAGCAAGTCAGGTGAAATCTCGATCTTTTCTCGGCAGACAA
GCTAATGGAATTGTCCCTGATCAGGGAGTTGTATCCGCAGATGCTGAAAAAGCTGCACCA
GCTGCAAATGCGAATGATTCAAGGTGGGGTATCCCTTCAATTTTCCGAGGTGGTGATAAT
CGGGCAGTTACCAAAGAAAACTTCTTAAACAAACCATTCAATGAAGCTGTTGAGGACATG
TCTCAGAACTTATCGATGATCTATTTAAAGGAGCCCCCAGCTGTCTTGAGGCCATCCGAA
ACCCATTCAGAACAGGAAGATGTCGAGATCCAGATTACAAAACTGTTGCTTAAATCATAC
TATGACATTGTGAGGAAAA*TATTGAGGACTCAGTACCAAAAGCAATCATGCATTTCCTG
GTAAAC*ACACAAA*CGTGAGCTGCACAATGTCTTCATCAG**AGCTATACAGGAGA*CT
TGTTTGA*GAATGCTGCA
GAGCC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2FR39TF 769 0 0
G
GCATGGATGAGGTTATAGGGGATTTCCTGCGAGAAGGTCTTGAACCCTCAGAAGCAATGA
TCGGTGATATCATTGATATGGAGATGGATTACATAAACACTTCTCATCCTAATTTTATTG
GCGGAACCAAGGCCGTGGAGGTTGCAATGCAAAACGTGAAGTCTTCTAGGGTTCCCCATC
CTGTGGCACGACCAAAG***GATCCAGTGGACCTCGAGAAAACTTCTTCTTCTTCAGCAA
GTCAGGTGAAATCTCGATCTTTTCTCGGCAGACAAGCTAATGGAATTGTCCCTGATCAGG
GAGTTGTATCCGCAGATGCTGAAAAAGCTGCACCAGCTGCAAATGCGAATGATTCAAGGT
GGGGTATCCCTTCAATTTTCCGAGGTGGTGATAATCGGGCAGTTACCAAAGAAAACTTCT
TAAACAAACCATTCAATGAAGCTGTTGAGGACATGTCTCAGAACTTATCGATGATCTATT
TAAAGGAGCCCCCAGCTGTCTTGAGGCCATCCGAAACCCATTCAGAACAGGAAGATGTCG
AGATCCAGATTACAAAACTGTTGCTTAAATCATACTATGACATTGTGAGGAAAAATATTG
AGGACTCAGTACCAAAAGCAATCATGCATTTCCTGGTAAACCACACAAAACGTGAGCTGC
ACAATGTCTTCATCAAGAAGCTATACAGGAGAACTTGTTTGAAGAATGCTGCAATAGCCG
ATGAGGTAGCGGTTAAGAAACGCACTCGAGAACACTCCACATTCTTCA

QA 2 769 2 769
DS 



AS 1 2

CO CL3958Contig1 709 2 2 U
GGAATCCGAGCTGATGAGTCTATCAGAGGAGAAAGACTCAACCTTTACGTACAGCATCGT
GAGACCGACGGCGTTCTTTAAGAGCTTAGGTGGACAGGTGGAGATAGTGAAAGACGGGAA
GCCTTACGTGATGTTCGGAGACGGGAAGCTCTGCGCTTGCAAACCCATCAGCGAGGAGGA
TTTAGCTTCGTTCATAGCGGACTGTGTCTTGGAAGAGGGGAAGATCAATAAGGTGTTGCC
TATCGGTGGACCGGGGAAGGCGTTGACGCCGTTGGAGCAAGGGGAGATTCTGTTTAGGAT
ACTAGGGAGAGAGCCTAAGTTCTTGAAGGTGCCTATTGAGATTATGGACTTTGTGATTGG
GGTTCTTGATGGTGTGGCGAAGGTGTTTCCTGGTGTTGCGGAGGCTGCTGAGTTTGGGAA
GATTGGGAGGTACTATGCGGCGGAGAGTATGTTGATTCTTGATCCGGAGGCTGGGGAGTA
TAGTGAGGAGATGACGCCGAGTTATGGGAAGGATACGCTTGAGGACTTTTTTGAGAAAGT
TGTTAGAGAAGGGATGGCTGGTCAAGAACTTGGCGAACAGTTCTTCTAGTTGGGAGAGAA
TGTTTCATGAGATGTGTTAAAGTGTTATAACTGTTGAGGTTAAATTTGAGAGATTTGTTG
ATCCGAACAAGAGTTATGAAACATATGATCACAGGTAATTTTTTCCTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F517TF U 1
AF RR2F517JQ C 1
BS 1 464 RR2F517TF
BS 465 709 RR2F517JQ

RD RR2F517TF 464 0 0
GGAATCCGAGCTGATGAGTCTATCAGAGGAGAAAGACTCAACCTTTACGTACAGCATCGT
GAGACCGACGGCGTTCTTTAAGAGCTTAGGTGGACAGGTGGAGATAGTGAAAGACGGGAA
GCCTTACGTGATGTTCGGAGACGGGAAGCTCTGCGCTTGCAAACCCATCAGCGAGGAGGA
TTTAGCTTCGTTCATAGCGGACTGTGTCTTGGAAGAGGGGAAGATCAATAAGGTGTTGCC
TATCGGTGGACCGGGGAAGGCGTTGACGCCGTTGGAGCAAGGGGAGATTCTGTTTAGGAT
ACTAGGGAGAGAGCCTAAGTTCTTGAAGGTGCCTATTGAGATTATGGACTTTGTGATTGG
GGTTCTTGATGGTGTGGCGAAGGTGTTTCCTGGTGTTGCGGAGGCTGCTGAGTTTGGGAA
GATTGGGAGGTACTATGCGGCGGAGAGTATGTTGATTCTTGATC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2F517JQ 709 0 0
GGAATCCGAGCTGATGAGTCTATCAGAGGAGAAAGACTCAACCTTTACGTACAGCATCGT
GAGACCGACGGCGTTCTTTAAGAGCTTAGGTGGACAGGTGGAGATAGTGAAAGACGGGAA
GCCTTACGTGATGTTCGGAGACGGGAAGCTCTGCGCTTGCAAACCCATCAGCGAGGAGGA
TTTAGCTTCGTTCATAGCGGACTGTGTCTTGGAAGAGGGGAAGATCAATAAGGTGTTGCC
TATCGGTGGACCGGGGAAGGCGTTGACGCCGTTGGAGCAAGGGGAGATTCTGTTTAGGAT
ACTAGGGAGAGAGCCTAAGTTCTTGAAGGTGCCTATTGAGATTATGGACTTTGTGATTGG
GGTTCTTGATGGTGTGGCGAAGGTGTTTCCTGGTGTTGCGGAGGCTGCTGAGTTTGGGAA
GATTGGGAGGTACTATGCGGCGGAGAGTATGTTGATTCTTGATCCGGAGGCTGGGGAGTA
TAGTGAGGAGATGACGCCGAGTTATGGGAAGGATACGCTTGAGGACTTTTTTGAGAAAGT
TGTTAGAGAAGGGATGGCTGGTCAAGAACTTGGCGAACAGTTCTTCTAGTTGGGAGAGAA
TGTTTCATGAGATGTGTTAAAGTGTTATAACTGTTGAGGTTAAATTTGAGAGATTTGTTG
ATCCGAACAAGAGTTATGAAACATATGATCACAGGTAATTTTTTCCTGG

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL3959Contig1 650 2 2 U
GCGCATTGCAGAGGAAGAGAAAGATTTGGTTCAACAGATGCCACCGACGACTTTGCCTTC
AAGCTCTACAACACCACTAGCAACCGAAGCTGATGCTCCTCCTGTTCCAAGTCCTGCAGC
ACCTGTCAAACCTATGTTCAGACACGAGTTCTATCAGAGGCCAGAAGAAGTGGTGTTGAC
TATTTTTGCTAAAGGAATACCAAAGCAGAACGTAAATGTTGAGTTTGGTGACCAGATTCT
GAGTGTTGTGATTGAAGTTGCTGGAGAGGAAGCTTATCATTTCCAGCCAAGATTGTTCGG
GAAGATAATACCAGAGAAGTGCAGATATGAAGTATTGTCAACCAAAGTTGAGATTCGTCT
CGCAAAAGCAGAGATCATCACTTGGGCCTCCCTTGAATATAGCAAAGGGCAAGCTCTTCT
GCCTAAACCCAATGTTGCATCAGCGGTTTCACAGAGGCCAGTGTACCCATCTTCCAAGCC
TGGAAAAGACTGGGACAAGTTGGAAGCTGAAGTGAAGAAGCAGGAGAAGGATGAGAAGCT
AGATGGAGATGCAGCAATGAACAAGTTTTTCAGCGATATATACCAGAGTGCTGATGAGGA
CATGAGGCGAGCCATGAACAAATCATTTGCAGAGTTTAATGGGACAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA65TF U 1
AF RR2HA65JQ C 417
BS 1 519 RR2HA65TF
BS 520 650 RR2HA65JQ

RD RR2HA65TF 519 0 0
GCGCATTGCAGAGGAAGAGAAAGATTTGGTTCAACAGATGCCACCGACGACTTTGCCTTC
AAGCTCTACAACACCACTAGCAACCGAAGCTGATGCTCCTCCTGTTCCAAGTCCTGCAGC
ACCTGTCAAACCTATGTTCAGACACGAGTTCTATCAGAGGCCAGAAGAAGTGGTGTTGAC
TATTTTTGCTAAAGGAATACCAAAGCAGAACGTAAATGTTGAGTTTGGTGACCAGATTCT
GAGTGTTGTGATTGAAGTTGCTGGAGAGGAAGCTTATCATTTCCAGCCAAGATTGTTCGG
GAAGATAATACCAGAGAAGTGCAGATATGAAGTATTGTCAACCAAAGTTGAGATTCGTCT
CGCAAAAGCAGAGATCATCACTTGGGCCTCCCTTGAATATAGCAAAGGGCAAGCTCTTCT
GCCTAAACCCAATGTTGCATCAGCGGTTTCACAGAGGCCAGTGTACCCATCTTCCAAGCC
TGGAAAAGACTGGGACAAGTTGGAAGCTGAAGTGAAGAA

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2HA65JQ 234 0 0
TTT
TGCCTAAACCCAATGTTGCATCAGCGGTTTCACAGAGGCCAGTGTACCCTTTTTCCAAGC
CTGGAAAAGACTGGGACAAGTTGGAAGCTGAAGTGAAGAAGCAGGAGAAGGATGAGAAGC
TAGATGGAGATGCAGCAATGAACAAGTTTTTCAGCGATATATACCAGAGTGCTGATGAGG
ACATGAGGCGAGCCATGAACAAATCATTTGCAGAGTTTAATGGGACAGTGC

QA 4 234 4 234
DS 



AS 1 2

CO CL3960Contig1 1052 2 2 U
GGACACAAAGCAAACAAAGTAAACAAGAAAAGTAAATCATGGCACTTTCGTCCTCTTGTT
CAACGCTCAAAGCCGTTAACTCACGGTGGACGTCTCCACGTCCATCACCAGTACCAAAAG
GGTCTCAGAATCAGCGAGGAACGAACCGAGGTCTTATCTGAGCTGGCTCCTTACATCGTC
TTAGCTGAGAAGCTTGGACGGTTAGCTGTGCAGCTAGCATCTGGAGGTAAGGGAGTACAG
TCCATCAAGGTCGTGTACCGCTCAGCTCGTGACAGAGATGATTTGGACACTAGACTACTC
CGTGCCATGATCACGAAGGGAATCATCGAACCCATCTCAGACGCTTATGTCAACCTGGTG
AATGCTGACTTCATAGCTGTTGACTCCATCCAAGTTCAGATTTCCAACGTGGAGTCAAGT
TTCGCTGGTGCTGTCTCTGATGGTGGTGCTATAAGTATAGAAGGGAAGGTGAAATATGGA
GTGCCGCATTTGACTTGCGTTGGTTCGTTTGGTGTGGACGTGGGCCTCGAAGGGAATCTG
ATACTGTGCAGGCAGGTGGATCAGCCAGGGATGATTGGACAGGTTGGTAACATACTCGGA
GAGCAGAACGTGAATGTGAGTTTCATGAGTGTTGGAAGAACAGTTGTGAGGAAACAAGCT
ATCATGGCGATAGGAGTGGATGAAGAGCCAGAGAAGAAGACACTCGAGAAGATTGGAGGT
GTCTCTGCGATTGAAGAGTTTGTGTTTCTGAAACTATGAGAGTTTGAGATTGGCGTCTGA
GAATGAATAAATTGGTGACCCGGATTTAAAAGGTGTTTGTGTCCAGTGGTCAAGCTGTAG
GAAAAATGTGTGGCATTGCGATTGAATGTGAGTCTTTGTTCTTGTTTTGGTAATGATGCT
TTTGGTTAATGTCATGTTCCTCTTGTTTCTTGATATCCACTAATATGTTACTATGATCTG
TAATGTAACCACTATTTTGATGTATGAACTGGCATTAAGTTTGATAAAACATATATGATG
CAATCCAAGAAGCCTTTTTATTGTTATAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF13TF U 1
AF RR2GF13JQ C 228
BS 1 647 RR2GF13TF
BS 648 1052 RR2GF13JQ

RD RR2GF13TF 647 0 0
GGACACAAAGCAAACAAAGTAAACAAGAAAAGTAAATCATGGCACTTTCGTCCTCTTGTT
CAACGCTCAAAGCCGTTAACTCACGGTGGACGTCTCCACGTCCATCACCAGTACCAAAAG
GGTCTCAGAATCAGCGAGGAACGAACCGAGGTCTTATCTGAGCTGGCTCCTTACATCGTC
TTAGCTGAGAAGCTTGGACGGTTAGCTGTGCAGCTAGCATCTGGAGGTAAGGGAGTACAG
TCCATCAAGGTCGTGTACCGCTCAGCTCGTGACAGAGATGATTTGGACACTAGACTACTC
CGTGCCATGATCACGAAGGGAATCATCGAACCCATCTCAGACGCTTATGTCAACCTGGTG
AATGCTGACTTCATAGCTGTTGACTCCATCCAAGTTCAGATTTCCAACGTGGAGTCAAGT
TTCGCTGGTGCTGTCTCTGATGGTGGTGCTATAAGTATAGAAGGGAAGGTGAAATATGGA
GTGCCGCATTTGACTTGCGTTGGTTCGTTTGGTGTGGACGTGGGCCTCGAAGGGAATCTG
ATACTGTGCAGGCAGGTGGATCAGCCAGGGATGATTGGACAGGTTGGTAACATACTCGGA
GAGCAGAACGTGAATGTGAGTTTCATGAGTGTTGGAAGAACAGTTGT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2GF13JQ 825 0 0
TAAGGGAGTACAGTCCATCAAGGTCGTGTACCGCTCAGCTCGTGACAGAGATGATTTGGA
CACTAGACTACTCCGTGCCATGATCACGAAGGGAATCATCGAACCCATCTCAGACGCTTA
TGTCAACCTGGTGAATGCTGACTTCATAGCTGTTGACTCCATCCAAGTTCAGATTTCCAA
CGTGGAGTCAAGTTTCGCTGGTGCTGTCTCTGATGGTGGTGCTATAAGTATAGAAGGGAA
GGTGAAATATGGAGTGCCGCATTTGACTTGCGTTGGTTCGTTTGGTGTGGACGTGGGCCT
CGAAGGGAATCTGATACTGTGCAGGCAGGTGGATCAGCCAGGGATGATTGGACAGGTTGG
TAACATACTCGGAGAGCAGAACGTGAATGTGAGTTTCATGAGTGTTGGAAGAACAGTTGT
GAGGAAACAAGCTATCATGGCGATAGGAGTGGATGAAGAGCCAGAGAAGAAGACACTCGA
GAAGATTGGAGGTGTCTCTGCGATTGAAGAGTTTGTGTTTCTGAAACTATGAGAGTTTGA
GATTGGCGTCTGAGAATGAATAAATTGGTGACCCGGATTTAAAAGGTGTTTGTGTCCAGT
GGTCAAGCTGTAGGAAAAATGTGTGGCATTGCGATTGAATGTGAGTCTTTGTTCTTGTTT
TGGTAATGATGCTTTTGGTTAATGTCATGTTCCTCTTGTTTCTTGATATCCACTAATATG
TTACTATGATCTGTAATGTAACCACTATTTTGATGTATGAACTGGCATTAAGTTTGATAA
AACATATATGATGCAATCCAAGAAGCCTTTTTATTGTTATAAATC

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

CO CL3961Contig1 1333 2 2 U
GGATCACTCTCTTTCTCTCTATCTATCTCAATTCCTTCTCCTTTTGGTGTATCAAGTTTG
ATTTTTTTTACTTTGATCTTGTAGTTAAAGAAGCAATCTTTTCGTCTTCAAGCTTAAGAA
AGGCAACTTCTTCTTTTTTTTTTTTCCGGAGAATGGGTTTGTGTAAAAACGGAAACTTTA
CTATCTGGGTCTTTCCCATTTCGGTTTCTAAGATAGATTAGTGTTTTTTTTTTGTTCTTC
ACTCTTTGGGAAAAAAATTAGGGTTCCTTCTTTAGTTTTAAGACATGGAGGAGATAGAAG
GAACCAACAGAGCAGCTGTTGAGAGTTGTCATAGAGTTCTTAACCTCTTATCTAGACCAC
CACATCAACAAGATCAAGTGAGTTTAGTGTCTGGTTTCCATGATTTGAGCTTGAGGCCAG
CTGATTCTCTCACTTTAGGGACCCGGTCTTTCAGTTTAAAACCCCCTCCTCTCCTTCAGC
TTAACCACCAGGCAATGCCTTCTTCAACAACTATGTTCCCAGAACATCAACAGCAGCAGT
TGCATGAACGGTTGCAGGCTCACCATCTACATCAACAGCATCAGCAACAAAGACATCATC
AAGCTGAGATTATGCTAAGGAAGTGCAACGGTGGAGGGATAAGTTTGAGCTTCGACAACT
CGAGTTGCACACCAACCATGTCGTCCACTAGGTCCTTTGTTTCATCGCTTAGCATAGATG
GTAGCGTGGCTAATGCAGAAGGGAGAAACTCCTTTCAATTGATAGGGGAGCAGAGTTTAC
CACATTCCAAGAGAAAATGCCTCTTGAAAGGAGACGAGCATGGAAGCCGATGTCACTGCT
CTAAGAAGAGGAAACATAGGGTTAGGAGATCGATCAGAGTGCCTGCTATAAGTAACAAGG
TTGCAGATATCCCTCCTGATGATTATTCGTGGCGAAAATATGGTCAGAAACCCATCAAGG
GCTCTCCTTATCCCAGGGGATATTACAAGTGCAGTAGCATGAGAGGTTGTCCAGCGAGGA
AGTATGTAGAGAGATGTGTGGAGGATCCAGCGATGCTTATTGTTACTTACGAAGCAGAGC
ATAACCATCCGAAACTGCCATCTCAAGCCGTAACAACATAACTTTCATTTGTTATCCTGT
GTTCTCTCTCTCCCATTGAATCTGCTCCAATATTGTGTGATGAAATGATGTGCTTTTTAG
TTTTGGGGTATGGATTTGCTTGTGACTTGTGAGAGAGTTTACTGCGGTTGTTGGGTTTGG
TTTTTAAGGGGTAAACGTAGGATTTGTCAAAAACCTTTTGTTCTTATATCTATAAGTGTA
CTGCTCTCAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY42TFB U 1
AF RR2AY42JQ C 539
BS 1 687 RR2AY42TFB
BS 688 1333 RR2AY42JQ

RD RR2AY42TFB 687 0 0
GGATCACTCTCTTTCTCTCTATCTATCTCAATTCCTTCTCCTTTTGGTGTATCAAGTTTG
ATTTTTTTTACTTTGATCTTGTAGTTAAAGAAGCAATCTTTTCGTCTTCAAGCTTAAGAA
AGGCAACTTCTTCTTTTTTTTTTTTCCGGAGAATGGGTTTGTGTAAAAACGGAAACTTTA
CTATCTGGGTCTTTCCCATTTCGGTTTCTAAGATAGATTAGTGTTTTTTTTTTGTTCTTC
ACTCTTTGGGAAAAAAATTAGGGTTCCTTCTTTAGTTTTAAGACATGGAGGAGATAGAAG
GAACCAACAGAGCAGCTGTTGAGAGTTGTCATAGAGTTCTTAACCTCTTATCTAGACCAC
CACATCAACAAGATCAAGTGAGTTTAGTGTCTGGTTTCCATGATTTGAGCTTGAGGCCAG
CTGATTCTCTCACTTTAGGGACCCGGTCTTTCAGTTTAAAACCCCCTCCTCTCCTTCAGC
TTAACCACCAGGCAATGCCTTCTTCAACAACTATGTTCCCAGAACATCAACAGCAGCAGT
TGCATGAACGGTTGCAGGCTCACCATCTACATCAACAGCATCAGCAACAAAGACATCATC
AAGCTGAGATTATGCTAAGGAAGTGCAACGGTGGAGGGATAAGTTTGAGCTTCGACAACT
CGAGTTGCACACCAACCATGTCGTCCA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2AY42JQ 795 0 0
GTTGCATGAACGGTTGCAGGCTCACCATCTACATCAACAGCATCAGCAACAAAGACATCA
TCAAGCTGAGATTATGCTAAGGAAGTGCAACGGTGGAGGGATAAGTTTGAGCTTCGACAA
CTCGAGTTGCACACCAACCATGTCGTCCACTAGGTCCTTTGTTTCATCGCTTAGCATAGA
TGGTAGCGTGGCTAATGCAGAAGGGAGAAACTCCTTTCAATTGATAGGGGAGCAGAGTTT
ACCACATTCCAAGAGAAAATGCCTCTTGAAAGGAGACGAGCATGGAAGCCGATGTCACTG
CTCTAAGAAGAGGAAACATAGGGTTAGGAGATCGATCAGAGTGCCTGCTATAAGTAACAA
GGTTGCAGATATCCCTCCTGATGATTATTCGTGGCGAAAATATGGTCAGAAACCCATCAA
GGGCTCTCCTTATCCCAGGGGATATTACAAGTGCAGTAGCATGAGAGGTTGTCCAGCGAG
GAAGTATGTAGAGAGATGTGTGGAGGATCCAGCGATGCTTATTGTTACTTACGAAGCAGA
GCATAACCATCCGAAACTGCCATCTCAAGCCGTAACAACATAACTTTCATTTGTTATCCT
GTGTTCTCTCTCTCCCATTGAATCTGCTCCAATATTGTGTGATGAAATGATGTGCTTTTT
AGTTTTGGGGTATGGATTTGCTTGTGACTTGTGAGAGAGTTTACTGCGGTTGTTGGGTTT
GGTTTTTAAGGGGTAAACGTAGGATTTGTCAAAAACCTTTTGTTCTTATATCTATAAGTG
TACTGCTCTCAATGT

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

CO CL3962Contig1 1242 2 2 U
GGACTCCTCTCTCTCCCTCCCTTCACTCGTTTCTTCCTCCTCTCTCCCTCTCAGTTCTGT
AATCCCTAAACCCCCAAATTCAAACAATTCTAGATTCCCTCTCTCTCCTTCTGCTCGTGC
TTTGGGGAATGCGTTCTGTGTAGTCAGCTGTAACGGAAAGTTTGGTGTGAAGCAAATGAA
TAAGGGATCGTGGTTACCAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAGTTAAAGGGTTTATCAGATGA
CTTCTTTGATGATCTCATGAATCACATTGAAGAGGACATGGATGATGATGATGAGGAGGA
GGAGGGAGATTGGGATGCCAAGTTCGAAAACCTCGTCCCTCCACCCTTGGATGTCCTCAC
CAGCTTCTCCTCTCAGTTCACTGGCGCTTCCAAGGTACAACAACGTGGTGGAGTCCAGAG
GAAGAAGCCTGTCCCCACTTTGAAGCAGTCGAGTTCTTCGGAAGTCTCCTCTACCATTGA
TAGCTCCCTTTATGATGTCAAAGTCTCAACGCTATTCCAGTCTTCAAACGCAGTCTCAGT
TCTCAAGAACGCCGCCGCAAATGGTTCTGTCTCGTTCCAAACCCCAATCCAGAGACTGGC
TTTCCCCGTGAAAGGCACCAGAAGCAAGCTGCGCAAACGCCCCACAACCCCCACATTCAG
ATCCCTCAAGTCATTTGCATCAGAGATGATTCAGCAGTTTGCTCCTGATTATGATTCAGG
CTCTGAAACTTACCACCTCCCTTCCGACAATGCCCCCAAGAAGAAACGCCAGAAGAAGAA
CAACAAGTCAGACTCCGACACTCCAGAATCATTCAACGGGGATGGGACAATCCGCATGTG
CACTCATTGCGAGGCAACCAAGACACCACAGTGGAGGGAAGGTCCATGTGGGCCTAAAAC
GCTGTGCAACGCCTGTGGAGTCCGGTTCAGGTCAGGCCGTCTTCTTCCGGAGTACCGTCC
ATCGTCCAGCCCCTCCTTCATCCCAACCTTGCATTCCAATTCTCACAGGAAGATCATAGA
GATGAGAATGAAAGATAAACCGGGATGACTTAGATCCCTGAGGATAGAGATTATATGGAG
AGAGATGTATTCAATTATAGTATTTGAGAAGATTTGAAGTAACTTTTGATTTCAAAAGTG
TTTTTTCTTAGATGATTTTAGGTGAATTAGGAAGTTGTTATGATTTTTAAGTAAAACATT
TTAGAATCTAATCTAAGATGAGTTAGTTTTTTCATAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW68TF U 1
AF RR2BW68JQ C 656
BS 1 719 RR2BW68TF
BS 720 1242 RR2BW68JQ

RD RR2BW68TF 737 0 0
GGACTCCTCTCTCTCCCTCCCTTCACTCGTTTCTTCCTCCTCTCTCCCTCTCAGTTCTGT
AATCCCTAAACCCCCAAATTCAAACAATTCTAGATTCCCTCTCTCTCCTTCTGCTCGTGC
TTTGGGGAATGCGTTCTGTGTAGTCAGCTGTAACGGAAAGTTTGGTGTGAAGCAAATGAA
TAAGGGATCGTGGTTACCAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAGTTAAAGGGTTTATCAGATGA
CTTCTTTGATGATCTCATGAATCACATTGAAGAGGACATGGATGATGATGATGAGGAGGA
GGAGGGAGATTGGGATGCCAAGTTCGAAAACCTCGTCCCTCCACCCTTGGATGTCCTCAC
CAGCTTCTCCTCTCAGTTCACTGGCGCTTCCAAGGTACAACAACGTGGTGGAGTCCAGAG
GAAGAAGCCTGTCCCCACTTTGAAGCAGTCGAGTTCTTCGGAAGTCTCCTCTACCATTGA
TAGCTCCCTTTATGATGTCAAAGTCTCAACGCTATTCCAGTCTTCAAACGCAGTCTCAGT
TCTCAAGAACGCCGCCGCAAATGGTTCTGTCTCGTTCCAAACCCCAATCCAGAGACTGGC
TTTCCCCGTGAAAGGCACCAGAAGCAAGCTGCGCAAACGCCCCACAACCCCCACATTCAG
ATCCCTCAAGTCATTTGCATCAGAGATGATTCAGCAGTTTGCTCCTGATTATGATTCAG
CTCTGAACTTACCCCTCC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2BW68JQ 587 0 0
TTCAGATCCCTCAAGTCATTTGCATCAGAGATGATTCAGCAGTTTGCTCCTGATTATGAT
TCAGGCTCTGAAACTTACCACCTCCCTTCCGACAATGCCCCCAAGAAGAAACGCCAGAAG
AAGAACAACAAGTCAGACTCCGACACTCCAGAATCATTCAACGGGGATGGGACAATCCGC
ATGTGCACTCATTGCGAGGCAACCAAGACACCACAGTGGAGGGAAGGTCCATGTGGGCCT
AAAACGCTGTGCAACGCCTGTGGAGTCCGGTTCAGGTCAGGCCGTCTTCTTCCGGAGTAC
CGTCCATCGTCCAGCCCCTCCTTCATCCCAACCTTGCATTCCAATTCTCACAGGAAGATC
ATAGAGATGAGAATGAAAGATAAACCGGGATGACTTAGATCCCTGAGGATAGAGATTATA
TGGAGAGAGATGTATTCAATTATAGTATTTGAGAAGATTTGAAGTAACTTTTGATTTCAA
AAGTGTTTTTTCTTAGATGATTTTAGGTGAATTAGGAAGTTGTTATGATTTTTAAGTAAA
ACATTTTAGAATCTAATCTAAGATGAGTTAGTTTTTTCATAAAAAAA

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL3963Contig1 700 2 1 U
GGGAACTCATCAAACAAATCTTCTTCTCCCTAGCTCCTCTTTTGATTTTTCTATACATAG
ATAAAAAAATGTCTCTGATTATGGAAAAGACAGACCCATCATCTTCTCCAGCTTTCACCC
TGATGCTGCCCTCCTCGCCAGGAAGTTGCAGAGCATCTACCCTGTGTTCTTCTTGACAAA
CGGAGGAACAGAGATGTACTACGACGTGAGAAGGAATTCGCTGGAGGAAGCAATCAAAGT
ATGTATAGAGGGAGACCTCCAAGGGATTGTCTCGGAGGTGAAGGGTGTTTTCCGAAACCC
AGCCGTGGTCAACAGGATAAAAGAATCCAAACTCTCTCTGATGACGTACGGGAAGCTCAA
CAATGTAGCTGAGGCTGTGTATATGCAGCATTTGATGGGAATAGAAGGAGTCATAGTTGA
TCATGTGGAAGAGATAACAGAGGCTGTGAGAGAGATGACCAATAGAGATGCTCATGATAC
TGAGCCAAAGCCAAACTTTTCTGAGAGAGAGCTCTCCTTTCTTCTCAAGCTCATTCCTGA
GTTGATACAGCACTGAACTCTTAACTCTCTGTTAGTTACATATTATAATAGGATATGTTG
TTTTCCCGAAAACTGGGTATATGAAAAATCTGACAATGTATGTGGGGATGCTGTTATCAT
GAGAGCCCAAATGTTATAGATTGATATCAGTACTACCATC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EM86TF U 1
AF RR2EM86JQ C 6
BS 1 700 RR2EM86TF

RD RR2EM86TF 700 0 0
GGGAACTCATCAAACAAATCTTCTTCTCCCTAGCTCCTCTTTTGATTTTTCTATACATAG
ATAAAAAAATGTCTCTGATTATGGAAAAGACAGACCCATCATCTTCTCCAGCTTTCACCC
TGATGCTGCCCTCCTCGCCAGGAAGTTGCAGAGCATCTACCCTGTGTTCTTCTTGACAAA
CGGAGGAACAGAGATGTACTACGACGTGAGAAGGAATTCGCTGGAGGAAGCAATCAAAGT
ATGTATAGAGGGAGACCTCCAAGGGATTGTCTCGGAGGTGAAGGGTGTTTTCCGAAACCC
AGCCGTGGTCAACAGGATAAAAGAATCCAAACTCTCTCTGATGACGTACGGGAAGCTCAA
CAATGTAGCTGAGGCTGTGTATATGCAGCATTTGATGGGAATAGAAGGAGTCATAGTTGA
TCATGTGGAAGAGATAACAGAGGCTGTGAGAGAGATGACCAATAGAGATGCTCATGATAC
TGAGCCAAAGCCAAACTTTTCTGAGAGAGAGCTCTCCTTTCTTCTCAAGCTCATTCCTGA
GTTGATACAGCACTGAACTCTTAACTCTCTGTTAGTTACATATTATAATAGGATATGTTG
TTTTCCCGAAAACTGGGTATATGAAAAATCTGACAATGTATGTGGGGATGCTGTTATCAT
GAGAGCCCAAATGTTATAGATTGATATCAGTACTACCATC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2EM86JQ 695 0 0
CTCATCAAACAAATCTTCTTCTCCCTAGCTCCTCTTTTGATTTTTCTATACATAGATAAA
AAAATGTCTCTGATTATGGAAAAGACAGACCCATCATCTTCTCCAGCTTTCACCCTGATG
CTGCCCTCCTCGCCAGGAAGTTGCAGAGCATCTACCCTGTGTTCTTCTTGACAAACGGAG
GAACAGAGATGTACTACGACGTGAGAAGGAATTCGCTGGAGGAAGCAATCAAAGTATGTA
TAGAGGGAGACCTCCAAGGGATTGTCTCGGAGGTGAAGGGTGTTTTCCGAAACCCAGCCG
TGGTCAACAGGATAAAAGAATCCAAACTCTCTCTGATGACGTACGGGAAGCTCAACAATG
TAGCTGAGGCTGTGTATATGCAGCATTTGATGGGAATAGAAGGAGTCATAGTTGATCATG
TGGAAGAGATAACAGAGGCTGTGAGAGAGATGACCAATAGAGATGCTCATGATACTGAGC
CAAAGCCAAACTTTTCTGAGAGAGAGCTCTCCTTTCTTCTCAAGCTCATTCCTGAGTTGA
TACAGCACTGAACTCTTAACTCTCTGTTAGTTACATATTATAATAGGATATGTTGTTTTC
CCGAAAACTGGGTATATGAAAAATCTGACAATGTATGTGGGGATGCTGTTATCATGAGAG
CCCAAATGTTATAGATTGATATCAGTACTACCATC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL3964Contig1 1336 2 4 U
GGAACAAAGAACTTAATACTTCAGACCGCATATCTTTGTCTCCCCTCTCTCTCTCCTACT
TTTGTTCGATGGCACCAAAGCACGCGGACAAGATCGAGAACCCTCCTGTTGCCTCTTCAA
GTGAAGAGGAAGAAGAAGAGTCTGGTTCATCTGGAGAAGAATCCAACTCTTCCGATGACG
AAGCTGGAGATGTCCAGTCCAAACTCACTCAGAAACCTGCTCCTCCTGCTTCTGCTGCCA
AGAAGCCTGAATCCGACTCAGAAGAAGGGGAATCCGAATCAGAATCCGACTCCGATTTGG
AGCCTGCCACAAAGACTAAGCCTCTCAACACTGTCGTGACTAAACCGATCCCACCAGAGA
GCTCCACGGCGAAGCGTTCTCTGAAGCAAGCGGATAACAACAACGAGCCTAAGAAGAAGG
CAAAGACATCATCAACCACCACCGAGCAAGTGAAGAAGAAGAAGCCAACAACAACAACAA
CAAAAGATGAAGAAGTCAAGAAGAAGATATCAGGAGAAGAAGCCAAGAAGATGTTGTTTC
AGAGGCTGTTCAGCGAGACAGACGAGATCGCGATGCTTCAAGGCTTTCTCGACTTCACTT
CCACCAAAGGAGACCCTTACGAGAACATGGACGCCTTCTGCGATTACGTCAAGACCTTGA
TCGACTTCAACGCTTCCAAGGCTCAGATCGTTACCAAGCTCCAGAGGTGTAAGAAGAAGT
TTGCGAATATAGTCAAGAACGCCCTCAAGAAAGGAAAGACCGAGGACAAGATCACGTGTG
CTAAGGATCTTGACCAGAAGGCCTTCGAGTTGTCGAGGAAGATTTGGGGGAGTGACGGTG
TGCTTCCTGCTAAACCGAGGAAGAAGAAGTTGTCGAAAGAGGATGAGTTGGTTTCGACGC
CCAAGAAAGAAGTAGTAGAGGTGAAAAAAACAGAGAAGGTGGTGAATGCTGTTGTTGTGG
ACACGCATCATTTCTCGGAGAGTAGAGAGATGGGGTTGTTCTTCAAGGCGGAGAATGTTA
GTGTTATGGGTTTGGACGAGTCTACAGTGAGTGGGGTTTGGGATAGGGTGGAGGATGGAG
GGAAGAAGAGGGAGATGGAGGAGAAGCTGAAGAAGCTAAAGGCTAAGCAGATGGAGCTGT
GTTTGCAGAGAACTGCGCTCGTCGACTACACTGCAAAGATGATATTCAAAAACTATGCAT
CCTCCTCCTCTTCATGATTTGATTAGTTACATTGATGGTTTGTTTTAAGTTTTTTAGTCA
GTAATGTTCTTTATGCCCCCCTTATGTTGGATGCTTGGTTTGGGTGTAAGACCCTTAATA
TGAAATGAGTATTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F416TF U 1
AF RR2F416JQ C 620
BS 1 644 RR2F416TF
BS 645 645 RR2F416JQ
BS 646 706 RR2F416TF
BS 707 1336 RR2F416JQ

RD RR2F416TF 710 0 0
GGAACAAAGAACTTAATACTTCAGACCGCATATCTTTGTCTCCCCTCTCTCTCTCCTACT
TTTGTTCGATGGCACCAAAGCACGCGGACAAGATCGAGAACCCTCCTGTTGCCTCTTCAA
GTGAAGAGGAAGAAGAAGAGTCTGGTTCATCTGGAGAAGAATCCAACTCTTCCGATGACG
AAGCTGGAGATGTCCAGTCCAAACTCACTCAGAAACCTGCTCCTCCTGCTTCTGCTGCCA
AGAAGCCTGAATCCGACTCAGAAGAAGGGGAATCCGAATCAGAATCCGACTCCGATTTGG
AGCCTGCCACAAAGACTAAGCCTCTCAACACTGTCGTGACTAAACCGATCCCACCAGAGA
GCTCCACGGCGAAGCGTTCTCTGAAGCAAGCGGATAACAACAACGAGCCTAAGAAGAAGG
CAAAGACATCATCAACCACCACCGAGCAAGTGAAGAAGAAGAAGCCAACAACAACAACAA
CAAAAGATGAAGAAGTCAAGAAGAAGATATCAGGAGAAGAAGCCAAGAAGATGTTGTTTC
AGAGGCTGTTCAGCGAGACAGACGAGATCGCGATGCTTCAAGGCTTTCTCGACTTCACTT
CCACCAAAGGAGACCCTTACGAGAACATGGACGCCTTCTGCGAT*ACGTCAAGACCTTGA
TCGACTTCAACGCTTCCAAGGCTCAGATCGTTACCAAGCTCCAGAG
TGTA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2F416JQ 717 0 0
CGAGAACATGGACGCCTTCTGCGATTACGTCAAGACCTTGATCGACTTCAACGCTTCCAA
GGCTCAGATCGTTACCAAGCTCCAGAGGTGTAAGAAGAAGTTTGCGAATATAGTCAAGAA
CGCCCTCAAGAAAGGAAAGACCGAGGACAAGATCACGTGTGCTAAGGATCTTGACCAGAA
GGCCTTCGAGTTGTCGAGGAAGATTTGGGGGAGTGACGGTGTGCTTCCTGCTAAACCGAG
GAAGAAGAAGTTGTCGAAAGAGGATGAGTTGGTTTCGACGCCCAAGAAAGAAGTAGTAGA
GGTGAAAAAAACAGAGAAGGTGGTGAATGCTGTTGTTGTGGACACGCATCATTTCTCGGA
GAGTAGAGAGATGGGGTTGTTCTTCAAGGCGGAGAATGTTAGTGTTATGGGTTTGGACGA
GTCTACAGTGAGTGGGGTTTGGGATAGGGTGGAGGATGGAGGGAAGAAGAGGGAGATGGA
GGAGAAGCTGAAGAAGCTAAAGGCTAAGCAGATGGAGCTGTGTTTGCAGAGAACTGCGCT
CGTCGACTACACTGCAAAGATGATATTCAAAAACTATGCATCCTCCTCCTCTTCATGATT
TGATTAGTTACATTGATGGTTTGTTTTAAGTTTTTTAGTCAGTAATGTTCTTTATGCCCC
CCTTATGTTGGATGCTTGGTTTGGGTGTAAGACCCTTAATATGAAATGAGTATTTCT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3966Contig1 1093 2 2 U
TCACTGATCTCGACTATTACATGTTCACAACGAAGAAGAACGACTAAGGAGGCTTCACAA
GATTCCGTCAAAACACAGAAGACTCCTATTGCGACAGACTCTGTCTCGTCCTTCAGATTA
TGTCCCTGCGGAAGAAGGCATTTCATAGGAGCTATGCCGCTTCTTCCCCTGTCTCCCTCC
TACGCTGCTTCTAGCTCAACTGAAGATTTGAAAAGGTTGCGTCCTCCAAAGCCAGACTGG
TACGATGAGCTCTTTGCTTGGTCTATGGATACTAGCATAGAACCGTACTAGAAAGAGATT
TCGAGTTACAAGATGAAACTCTTTGATAATTTGGTGGGAAAAGCAGAAAAGGTTTTGGAG
ATTGGCGTTGGAACAGGTCCTAATTTCAAGTACTACTCGGTTATTCCAAACGTTTCTGTT
CTTGCTGTGGATCCAAACGCTAAGATGGAGAGTTACGCGCGTAAATCCGCGGCAGAAGCA
GGGCTGAAACCTGAAGATTTCAGCTTCATTCATGCGGTCGCAGAAGCTATACCATTAGAG
GATGCATCGGTTGATGCAGTTGTGGGGGCTCTCGTGCTTTGTTCTGTCGCAGATGTTACT
AGAACGCTCAATGAGATAAAACGGGTACTAAGACCGGGTGGGGTTTACCTTTTCATAGAA
CATGTTGCAGGAGAAGATGGATCATTTTTGAGGTTGGTGCAGAATGTTTTGGACCCGTTG
CAACAAGTTGTTGCTGATGGATGTCACTTGACTAGGCGCACCGGAGATTATATTTTAGAA
GCCCGGTTCAATGGCGGTGCAGATATCAACAAGGTCTCTCTGTCTAGCTTGGCTTACTTA
AGCTCTCATGTCTATGGGGTTGCTTACAATTAGAAAAACAGGATGGTGTTTAAGACAAAT
CCATAAGGTATGATGATGATGATGATTGTACACATTCAATGGTAATAAATAAATTTAAAC
GATGGTTTGTGTCCTATTTAATAGAGTAACTGTAAGTCTAATATCCATATGTGTGTCATT
GTTGAATTAAACGACTGTTGTATTATTTTAGAAGCTTTAGTTTTGAAAGTATAACTCTCC
AACGTTCGAGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C886TF U 1
AF RR2C886JQ C 372
BS 1 429 RR2C886TF
BS 430 1093 RR2C886JQ

RD RR2C886TF 429 0 0
TCACTGATCTCGACTATTACATGTTCACAACGAAGAAGAACGACTAAGGAGGCTTCACAA
GATTCCGTCAAAACACAGAAGACTCCTATTGCGACAGACTCTGTCTCGTCCTTCAGATTA
TGTCCCTGCGGAAGAAGGCATTTCATAGGAGCTATGCCGCTTCTTCCCCTGTCTCCCTCC
TACGCTGCTTCTAGCTCAACTGAAGATTTGAAAAGGTTGCGTCCTCCAAAGCCAGACTGG
TACGATGAGCTCTTTGCTTGGTCTATGGATACTAGCATAGAACCGTACTAGAAAGAGATT
TCGAGTTACAAGATGAAACTCTTTGATAATTTGGTGGGAAAAGCAGAAAAGGTTTTGGAG
ATTGGCGTTGGAACAGGTCCTAATTTCAAGTACTACTCGGTTATTCCAAACGTTTCTGTT
CTTGCTGTG

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR2C886JQ 722 0 0
AACAGGTCCTAATTTCAAGTACTACTCGGTTATTCCAAACGTTTCTGTTCTTGCTGTGGA
TCCAAACGCTAAGATGGAGAGTTACGCGCGTAAATCCGCGGCAGAAGCAGGGCTGAAACC
TGAAGATTTCAGCTTCATTCATGCGGTCGCAGAAGCTATACCATTAGAGGATGCATCGGT
TGATGCAGTTGTGGGGGCTCTCGTGCTTTGTTCTGTCGCAGATGTTACTAGAACGCTCAA
TGAGATAAAACGGGTACTAAGACCGGGTGGGGTTTACCTTTTCATAGAACATGTTGCAGG
AGAAGATGGATCATTTTTGAGGTTGGTGCAGAATGTTTTGGACCCGTTGCAACAAGTTGT
TGCTGATGGATGTCACTTGACTAGGCGCACCGGAGATTATATTTTAGAAGCCCGGTTCAA
TGGCGGTGCAGATATCAACAAGGTCTCTCTGTCTAGCTTGGCTTACTTAAGCTCTCATGT
CTATGGGGTTGCTTACAATTAGAAAAACAGGATGGTGTTTAAGACAAATCCATAAGGTAT
GATGATGATGATGATTGTACACATTCAATGGTAATAAATAAATTTAAACGATGGTTTGTG
TCCTATTTAATAGAGTAACTGTAAGTCTAATATCCATATGTGTGTCATTGTTGAATTAAA
CGACTGTTGTATTATTTTAGAAGCTTTAGTTTTGAAAGTATAACTCTCCAACGTTCGAGG
TT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL3967Contig1 977 2 2 U
GGATTCGTTACCTGGCAATGGCAGCGAATCTGATTCGATTCGATTTGCATTGAAGTAACT
TGAGAGAGCCTCCTTCTACTACAGATCTCTTCAAGATCCTCACAACTCTTAACACCGTCA
CCAAGTGAAAAAATGGGTAAGAAGGAGGAGAGAGCTAGACCAGAAATGTTGTCTGTTTAC
CTTTATATACCTAATATTGTTGGATACATGAGAGTTATCTTGAACTGTGTTGCCTTTGCT
GTCTGTTTCTCCAACAAAACACTCTTCTCGGTACTCTATTTCTTTAGCTTTTGTTGTGAT
GCTGTGGATGGCTGGTGCGCTCGTAGATTCAACCAAGTTTCAACATTTGGAGCTGTTCTC
GACATGGTGACAGATAGAGTTAGCACAGCCTGTCTACTCGTGATTCTCTCTCAAGTCTAC
AGGCCTAGCTTGGTCTTCCTTTCGTTGCTTGCTTTAGATATTGCTAGTCATTGGCTTCAG
ATGTACAGTACGTTTCTAGCAGGGAAGAGCAGCCATAAGGATGTCAAAGACAGCACTAGC
TGGCTTTTCAGACTCTACTATGGAAACCGGATCTTTATGTGTTACTGTTGTGTTTCTTGC
GAGGTTCTGTATATCATCCTCCTTCTCATTGCAAAGAACCAAACCGAAAATCTCATCAAT
GTCGTAGCTTCCACTTTAACTCAGATCTCACCACTCTCTTTTCTATTGGCTTTGACATTG
TTCGGTTGGTCGATGAAACAAACAGTTAACATCATTCAGATGAAAACAGCTGCAGATGTC
TGTGTAATGTATGATATAGAGAAGCAGCAGAAGAAACCTTGACCTTTCTTCCTTATTCTG
AACCTGCAACACTTTTTATGTTTCTTAATGTCTGTAGAAACATCTTCCTATGGTTTTTAA
ACAATATTGATTTGCCTTTTGACATAATTTCTGTTTGTAAATATAATCTGATTACAAGTT
TGTATTTCCTCTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC47TF U 1
AF RR2AC47JQ C 118
BS 1 812 RR2AC47TF
BS 813 977 RR2AC47JQ

RD RR2AC47TF 812 0 0
GGATTCGTTACCTGGCAATGGCAGCGAATCTGATTCGATTCGATTTGCATTGAAGTAACT
TGAGAGAGCCTCCTTCTACTACAGATCTCTTCAAGATCCTCACAACTCTTAACACCGTCA
CCAAGTGAAAAAATGGGTAAGAAGGAGGAGAGAGCTAGACCAGAAATGTTGTCTGTTTAC
CTTTATATACCTAATATTGTTGGATACATGAGAGTTATCTTGAACTGTGTTGCCTTTGCT
GTCTGTTTCTCCAACAAAACACTCTTCTCGGTACTCTATTTCTTTAGCTTTTGTTGTGAT
GCTGTGGATGGCTGGTGCGCTCGTAGATTCAACCAAGTTTCAACATTTGGAGCTGTTCTC
GACATGGTGACAGATAGAGTTAGCACAGCCTGTCTACTCGTGATTCTCTCTCAAGTCTAC
AGGCCTAGCTTGGTCTTCCTTTCGTTGCTTGCTTTAGATATTGCTAGTCATTGGCTTCAG
ATGTACAGTACGTTTCTAGCAGGGAAGAGCAGCCATAAGGATGTCAAAGACAGCACTAGC
TGGCTTTTCAGACTCTACTATGGAAACCGGATCTTTATGTGTTACTGTTGTGTTTCTTGC
GAGGTTCTGTATATCATCCTCCTTCTCATTGCAAAGAACCAAACCGAAAATCTCATCAAT
GTCGTAGCTTCCACTTTAACTCAGATCTCACCACTCTCTTTTCTATTGGCTTTGACATTG
TTCGGTTGGTCGATGAAACAAACAGTTAACATCATTCAGATGAAAACAGCTGCAGATGTC
TGTGTAATGTATGATATAGAGAAGCAGCAGAA

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR2AC47JQ 860 0 0
TCACCAAGTGAAAAAATGGGTAAGAAGGAGGAGAGAGCTAGACCAGAAATGTTGTCTGTT
TACCTTTATATACCTAATATTGTTGGATACATGAGAGTTATCTTGAACTGTGTTGCCTTT
GCTGTCTGTTTCTCCAACAAAACACTCTTCTCGGTACTCTATTTCTTTAGCTTTTGTTGT
GATGCTGTGGATGGCTGGTGCGCTCGTAGATTCAACCAAGTTTCAACATTTGGAGCTGTT
CTCGACATGGTGACAGATAGAGTTAGCACAGCCTGTCTACTCGTGATTCTCTCTCAAGTC
TACAGGCCTAGCTTGGTCTTCCTTTCGTTGCTTGCTTTAGATATTGCTAGTCATTGGCTT
CAGATGTACAGTACGTTTCTAGCAGGGAAGAGCAGCCATAAGGATGTCAAAGACAGCACT
AGCTGGCTTTTCAGACTCTACTATGGAAACCGGATCTTTATGTGTTACTGTTGTGTTTCT
TGCGAGGTTCTGTATATCATCCTCCTTCTCATTGCAAAGAACCAAACCGAAAATCTCATC
AATGTCGTAGCTTCCACTTTAACTCAGATCTCACCACTCTCTTTTCTATTGGCTTTGACA
TTGTTCGGTTGGTCGATGAAACAAACAGTTAACATCATTCAGATGAAAACAGCTGCAGAT
GTCTGTGTAATGTATGATATAGAGAAGCAGCAGAAGAAACCTTGACCTTTCTTCCTTATT
CTGAACCTGCAACACTTTTTATGTTTCTTAATGTCTGTAGAAACATCTTCCTATGGTTTT
TAAACAATATTGATTTGCCTTTTGACATAATTTCTGTTTGTAAATATAATCTGATTACAA
GTTTGTATTTCCTCTGTTTC

QA 1 860 1 860
DS 



AS 1 2

CO CL3968Contig1 846 2 2 U
GGGTCGCATCAAATCTCTCCGGTGACAACTCTCTCCATTCCGCCGTCGACAGAGCAACAC
TTCGTTCTGAGAGAGCAGAGGAGAGATGGCATTGGATTACAAACCTTCAGAAGAGTTCTT
AGTCAACAACTTACAGCCCCTCGTTGACTTCGATGTTACGGGAACGCAGGAGCTTTGGCT
CATCCAGTGCCCTATGAGCCATATTCCGGAGATTGAAGGAAAGGAGCTTAAGGTTAATCT
AGGTGAAGATGGTGTCTTGGGACGTTTCGAGGATTCTTCTGGTAAAGAGGTTGAACTAGT
TAGCTTTGCTTCTCAAGAAGGCGATGCAACTGTGATTATACCTTCTGAAACCGAATCAAA
GATCGTTGGGAAGATTTCTAGGCGAGTTTCGTTGGTTCGGTTCCCTGAACCGGAAGAGCT
GCTTCTGACATTTAAAACTCAGCAGAAGAGTGTAAAAGCTGCTCTGAGTTCCTCTCTTAA
AAACTCTAGCCTTGCTATGAGTAGTAGGCGTAAAAGCGGACAGTCTTCTCTTCGACATAG
CAGCAGAGAGGAGAGTTTGTTCACTGGCTTCACCGAGACTCCCAAGTCTTCGAAAAGGAA
GCATTCAGAGCCCTCTTCGAGCAAACGTGCTTCAGGCTCTTCGGATCAGTCGGGTAAGTC
TAAGAAGAAGGTGAAGACTGAGAAGTAATGAGATGTTTGTTTTTTTCTTTTTTCTTTATA
TGATGGTTTTTTTATGTTGAATTTTGATTATGTGAGACGATGAGCAAACTAGTATTGTAT
CCGAATATATAAAGTTACTTCGCCATATGATTATGAAGTTCAAGCTTTTTTAGCTTACTT
TGTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL91TF U 1
AF RR2GL91JQ C 158
BS 1 626 RR2GL91TF
BS 627 846 RR2GL91JQ

RD RR2GL91TF 626 0 0
GGGTCGCATCAAATCTCTCCGGTGACAACTCTCTCCATTCCGCCGTCGACAGAGCAACAC
TTCGTTCTGAGAGAGCAGAGGAGAGATGGCATTGGATTACAAACCTTCAGAAGAGTTCTT
AGTCAACAACTTACAGCCCCTCGTTGACTTCGATGTTACGGGAACGCAGGAGCTTTGGCT
CATCCAGTGCCCTATGAGCCATATTCCGGAGATTGAAGGAAAGGAGCTTAAGGTTAATCT
AGGTGAAGATGGTGTCTTGGGACGTTTCGAGGATTCTTCTGGTAAAGAGGTTGAACTAGT
TAGCTTTGCTTCTCAAGAAGGCGATGCAACTGTGATTATACCTTCTGAAACCGAATCAAA
GATCGTTGGGAAGATTTCTAGGCGAGTTTCGTTGGTTCGGTTCCCTGAACCGGAAGAGCT
GCTTCTGACATTTAAAACTCAGCAGAAGAGTGTAAAAGCTGCTCTGAGTTCCTCTCTTAA
AAACTCTAGCCTTGCTATGAGTAGTAGGCGTAAAAGCGGACAGTCTTCTCTTCGACATAG
CAGCAGAGAGGAGAGTTTGTTCACTGGCTTCACCGAGACTCCCAAGTCTTCGAAAAGGAA
GCATTCAGAGCCCTCTTCGAGCAAAC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2GL91JQ 689 0 0
ACGGGAACGCAGGAGCTTTGGCTCATCCAGTGCCCTATGAGCCATATTCCGGAGATTGAA
GGAAAGGAGCTTAAGGTTAATCTAGGTGAAGATGGTGTCTTGGGACGTTTCGAGGATTCT
TCTGGTAAAGAGGTTGAACTAGTTAGCTTTGCTTCTCAAGAAGGCGATGCAACTGTGATT
ATACCTTCTGAAACCGAATCAAAGATCGTTGGGAAGATTTCTAGGCGAGTTTCGTTGGTT
CGGTTCCCTGAACCGGAAGAGCTGCTTCTGACATTTAAAACTCAGCAGAAGAGTGTAAAA
GCTGCTCTGAGTTCCTCTCTTAAAAACTCTAGCCTTGCTATGAGTAGTAGGCGTAAAAGC
GGACAGTCTTCTTTTCGACATAGCAGCAGAGAGGAGAGTTTGTTCACTGGCTTCACCGAG
ACTCCCAAGTCTTCGAAAAGGAAGCATTCAGAGCCCTCTTCGAGCAAACGTGCTTCAGGC
TCTTCGGATCAGTCGGGTAAGTCTAAGAAGAAGGTGAAGACTGAGAAGTAATGAGATGTT
TGTTTTTTTCTTTTTTCTTTATATGATGGTTTTTTTATGTTGAATTTTGATTATGTGAGA
CGATGAGCAAACTAGTATTGTATCCGAATATATAAAGTTACTTCGCCATATGATTATGAA
GTTCAAGCTTTTTTAGCTTACTTTGTAGT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL3969Contig1 1005 2 8 U
GGGTTCTTGGCAATGATTTACGGCTTCAACTAGCTACGGAGCAAAGAATGGTGAAGCGGC
GGAGATAGAGAGATCTGTGTTGTTCTCTTTACATCTCCATAGCTTCTTCATTCATTCAAT
CTCTCGTTGAACAAATTCGGCTAATCGAGTTTAAAAAAATGGAGACTCTGACAAGTGATG
ATGATCCTGGATTGATTGATTCGGGTGTGTATCTGAGGCTAGGGCTTCTTATTGCAGAGA
AGGGCACTTCTCTCACGTCTCGCTTCATCTCTCGAGAGATCTATGTCGTCTCCCCCAGAG
TCTGCTGCTGCTGTAACCACCGTCTTTGACGGTAGATCTCCCCCCGAGATCACCATTTCA
GACTACTTGACTCGCATTTACAACTACTCTCGCTGCAGCCCTTCTTGCTTCGTCATCGCC
TACATCTACATTCATCAGTTTCTCCACCTCACCCGATCTCACCTCACCCCACTTAATGTC
CACCGCCTTCTCGTTACTAGTGTCATGTTAGCTGCCAAAGTCTTCGATGACAGGTATTAC
AACAATGCGTACTACGCCAGAGTAGGAGGTGTGAGCACGAGAGAGCTGAACAGATTGGAG
ATGAAGCTCTTGTTCGCCCTTGATTTCAAGCTTCAGGTTGATCCTCACACCTTTCACTCC
CACTGTTGTCATTTATAGGAACACAACAGCAGCGACGACGACGGCTTCCACATCGACTGG
CCTATAAAAGAAGCATGCCGACTCAGCAAAGAGTCTTGGCGTAAGACCACACCAGAGTCT
GTCTGCTCTCAAACCACTGCACGCTGATCAGCGAGGATTTCATTCGCGTGGCAACTGTAA
GAATAGGGGTTTTTGGTTTGTGCGTTTTGGTAGTGTGATCAATCATTCTTTTGCACAATT
CGATTCTTGTGAGCAGGCAAAATTCACAATACTTTAAATTTTTGTCTAGTATAAAGTTTC
GAAAATTCTCACTAGCTAGCTAAGTACGTTTTAAGAGGTTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV15TF U 1
AF RR2EV15JQ C 286
BS 1 636 RR2EV15TF
BS 637 637 RR2EV15JQ
BS 638 703 RR2EV15TF
BS 704 704 RR2EV15JQ
BS 705 728 RR2EV15TF
BS 729 729 RR2EV15JQ
BS 730 763 RR2EV15TF
BS 764 1005 RR2EV15JQ

RD RR2EV15TF 764 0 0
GGGTTCTTGGCAATGATTTACGGCTTCAACTAGCTACGGAGCAAAGAATGGTGAAGCGGC
GGAGATAGAGAGATCTGTGTTGTTCTCTTTACATCTCCATAGCTTCTTCATTCATTCAAT
CTCTCGTTGAACAAATTCGGCTAATCGAGTTTAAAAAAATGGAGACTCTGACAAGTGATG
ATGATCCTGGATTGATTGATTCGGGTGTGTATCTGAGGCTAGGGCTTCTTATTGCAGAGA
AGGGCACTTCTCTCACGTCTCGCTTCATCTCTCGAGAGATCTATGTCGTCTCCCCCAGAG
TCTGCTGCTGCTGTAACCACCGTCTTTGACGGTAGATCTCCCCCCGAGATCACCATTTCA
GACTACTTGACTCGCATTTACAACTACTCTCGCTGCAGCCCTTCTTGCTTCGTCATCGCC
TACATCTACATTCATCAGTTTCTCCACCTCACCCGATCTCACCTCACCCCACTTAATGTC
CACCGCCTTCTCGTTACTAGTGTCATGTTAGCTGCCAAAGTCTTCGATGACAGGTATTAC
AACAATGCGTACTACGCCAGAGTAGGAGGTGTGAGCACGAGAGAGCTGAACAGATTGGAG
ATGAAGCTCTTGTTCGCCCTTGATTTCAAGCTTCAG*TTGATCCTCACACCTTTCACTCC
CACTGTTGTCATTTATAGGAACACAACAGCAGCGACGACGACG*CTTCCACATCGACTGG
CCTATAAA*GAAGCATGCCGACTCAGCAAAGAGTCTTGGCGTA
G

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2EV15JQ 720 0 0
TCGTCTCCCCCAGAGTCTGCTGCTGCTGTAACCACCGTCTTTGACGGTAGATCTCCCCCC
GAGATCACCATTTCAGACTACTTGACTCGCATTTACAACTACTCTCGCTGCAGCCCTTCT
TGCTTCGTCATCGCCTACATCTACATTCATCAGTTTCTCCACCTCACCCGATCTCACCTC
ACCCCACTTAATGTCCACCGCCTTCTCGTTACTAGTGTCATGTTAGCTGCCAAAGTCTTC
GATGACAGGTATTACAACAATGCGTACTACGCCAGAGTAGGAGGTGTGAGCACGAGAGAG
CTGAACAGATTGGAGATGAAGCTCTTGTTCGCCCTTGATTTCAAGCTTCAGGTTGATCCT
CACACCTTTCACTCCCACTGTTGTCATTTATAGGAACACAACAGCAGCGACGACGACGGC
TTCCACATCGACTGGCCTATAAAAGAAGCATGCCGACTCAGCAAAGAGTCTTGGCGTAAG
ACCACACCAGAGTCTGTCTGCTCTCAAACCACTGCACGCTGATCAGCGAGGATTTCATTC
GCGTGGCAACTGTAAGAATAGGGGTTTTTGGTTTGTGCGTTTTGGTAGTGTGATCAATCA
TTCTTTTGCACAATTCGATTCTTGTGAGCAGGCAAAATTCACAATACTTTAAATTTTTGT
CTAGTATAAAGTTTCGAAAATTCTCACTAGCTAGCTAAGTACGTTTTAAGAGGTTTGTTT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL3970Contig1 940 2 4 U
TAATATTAACGCACTAATCTCTCCGGCGAGATCTCGAGACGTATCACAGATCCGTCAGGC
TAGTTTGATCTCTCGAGGAATCAATGGCTCCGGTATCGGCACTGGCCAAGTATAAGCTGG
TGTTTCTGGGAGATCAATCGGTGGGGAAGACGAGTATCATCACTCGATTCATGTACGACA
AATTCGACAACACTTACCAGGCCACAATTGGTATTGATTTTTTGTCAAAGACAATGTACC
TCGAAGATCGGACTGTTAGACTGCAGTTGTGGGATACGGCAGGGCAAGAGAGATTCAGGA
GTCTTATTCCGAGCTATATTAGGGATTCTTCTGTTGCTGTTATTGTCTATGATGTTGCAA
GCAGGCAATCCTTCCTAAACACTACTAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACAGAGCGTGGTA
GTGATGTCATAGTTGTGCTTGTTGGAAATAAAACCGACCTTGTCGACAAAAGGCAAGTGT
CAATAGAGGAAGCAGAAGCCAAGGCTCGTGAGCTTAATGTAATGTTTATCGAAACCAGTG
CCAAAGCAGGCTTCAACATAAAGGCGCTTTTCCGCAAGATCGCAGCAGCTTTGCCCGGAA
TGGAAACACTGTCTTCGACAAAGCAAGAAGATATGGTTGATGTCAAGTCTTCCAACGCCA
ATGCATCTTTGGCTCAGCAGCAATCAGGAGGATGTTCTTGTTAAAATTTGCAACAACCAC
AACAAATTGACAGAGAACAAGAGAAAAAAAACACAGATATAAAAGTCCTCGAGCCTTTTT
TTTCATCGGATTGTTTTAGTTTATGGTCTTTGGATTTTCAAATGCTCTCTGCTTCAGTAC
TTTTTGTTAGTTTTTAACAACTTTTCCCAAAACTGTGATTTGTCTATGTATTGGATTTTA
TAACTGTAATCTTTATAAACTAGACAGACGCTTCTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS09TF U 1
AF RR2BS09JQ C 219
BS 1 660 RR2BS09TF
BS 661 661 RR2BS09JQ
BS 662 682 RR2BS09TF
BS 683 940 RR2BS09JQ

RD RR2BS09TF 684 0 0
TAATATTAACGCACTAATCTCTCCGGCGAGATCTCGAGACGTATCACAGATCCGTCAGGC
TAGTTTGATCTCTCGAGGAATCAATGGCTCCGGTATCGGCACTGGCCAAGTATAAGCTGG
TGTTTCTGGGAGATCAATCGGTGGGGAAGACGAGTATCATCACTCGATTCATGTACGACA
AATTCGACAACACTTACCAGGCCACAATTGGTATTGATTTTTTGTCAAAGACAATGTACC
TCGAAGATCGGACTGTTAGACTGCAGTTGTGGGATACGGCAGGGCAAGAGAGATTCAGGA
GTCTTATTCCGAGCTATATTAGGGATTCTTCTGTTGCTGTTATTGTCTATGATGTTGCAA
GCAGGCAATCCTTCCTAAACACTACTAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACAGAGCGTGGTA
GTGATGTCATAGTTGTGCTTGTTGGAAATAAAACCGACCTTGTCGACAAAAGGCAAGTGT
CAATAGAGGAAGCAGAAGCCAAGGCTCGTGAGCTTAATGTAATGTTTATCGAAACCAGTG
CCAAAGCAGGCTTCAACATAAAGGCGCTTTTCCGCAAGATCGCAGCAGCTTTGCCCGGAA
TGGAAACACTGTCTTCGACAAAGCAAGAAGATATGGTTGATGTCAAGTCTTCCAACGCCA
*TGCATCTTTGGCTCAGCAGCA
TC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2BS09JQ 722 0 0
TTTTTGTCAAAGACAATGTACCTCGAAGATCGGACTGTTAGACTGCAGTTGTGGGATACG
GCAGGGCAAGAGAGATTCAGGAGTCTTATTCCGAGCTATATTAGGGATTCTTCTGTTGCT
GTTATTGTCTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCCTTCCTAAACACTACTAAGTGGATCGAT
GAGGTTAGGACAGAGCGTGGTAGTGATGTCATAGTTGTGCTTGTTGGAAATAAAACCGAC
CTTGTCGACAAAAGGCAAGTGTCAATAGAGGAAGCAGAAGCCAAGGCTCGTGAGCTTAAT
GTAATGTTTATCGAAACCAGTGCCAAAGCAGGCTTCAACATAAAGGCGCTTTTCCGCAAG
ATCGCAGCAGCTTTGCCCGGAATGGAAACACTGTTTTCGACAAAGCAAGAAGATATGGTT
GATGTCAAGTCTTCCAACGCCAATGCATCTTTGGCTCAGCAGCAATCAGGAGGATGTTCT
TGTTAAAATTTGCAACAACCACAACAAATTGACAGAGAACAAGAGAAAAAAAACACAGAT
ATAAAAGTCCTCGAGCCTTTTTTTTCATCGGATTGTTTTAGTTTATGGTCTTTGGATTTT
CAAATGCTCTCTGCTTCAGTACTTTTTGTTAGTTTTTAACAACTTTTCCCAAAACTGTGA
TTTGTCTATGTATTGGATTTTATAACTGTAATCTTTATAAACTAGACAGACGCTTCTTGT
TT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL3971Contig1 753 2 2 U
GTGGTATGCTCAAGCCGGGTATGGTTGTGACATTCGCTCCATCTGGGTTGACCACTGAGG
TCAAGTCTGTCGAGATGCACCACGAGTCTCTTGTGGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTG
GATTCAATGTCAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGCGTGGGTATGTTGCATCCAACT
CCAAGGATGACCCTGCCAAGGGAGCTGCTAACTTCACTTCCCAGGTCATCATCATGAACC
ACCCTGGTCAGATTGGTAACGGTTACGCACCAGTGCTTGATTGCCACCCCTCCCACATTG
CAGTCAAGTTCTTTGAGATCCTCACCAAGATTGACAGACGTTCTGGTAAAGAGATCGAGA
AGGAGCCAAAGTTTTTGAAGAATGGAGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCGACCAAGC
CCATGGTTGTTGAGACTTTCTCAGAGTACCCACCACTGGGACGTTTTGCTGTCAGGGACA
TGAGGCAGACTGTTGCTGTTGGAGTTATCAAGAGTGTGGGCAAGAAGGACCCAACCGGTG
CCAAGGTTACCAAGGCTGCTGTCAAGAAGGGTGCCAAATGATGAGACTTTTCTCTCTTGC
GATATTAAAAACTTTGATTGTGTTCGAACCTTTTTTTATATTTTTCTGCAACTTTCTTCT
CTCTGCCTTTTTGGATAGCTCTGAGACATGGTGGTTTCAATTATGCAGTTTGTGGATGAT
TTTGTTTTGCCTAATGCTTTTTAGTGTTTGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B867JQ C 1
AF RR2B867TF U 322
BS 1 321 RR2B867JQ
BS 322 753 RR2B867TF

RD RR2B867JQ 753 0 0
GTGGTATGCTCAAGCCGGGTATGGTTGTGACATTCGCTCCATCTGGGTTGACCACTGAGG
TCAAGTCTGTCGAGATGCACCACGAGTCTCTTGTGGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTG
GATTCAATGTCAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGCGTGGGTATGTTGCATCCAACT
CCAAGGATGACCCTGCCAAGGGAGCTGCTAACTTCACTTCCCAGGTCATCATCATGAACC
ACCCTGGTCAGATTGGTAACGGTTACGCACCAGTGCTTGATTGCCACCCCTCCCACATTG
CAGTCAAGTTCTTTGAGATCCTCACCAAGATTGACAGACGTTTTGGTAAAGAGATCGAGA
AGGAGCCAAAGTTTTTGAAGAATGGAGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCGACCAAGC
CCATGGTTGTTGAGACTTTCTCAGAGTACCCACCACTGGGACGTTTTGCTGTCAGGGACA
TGAGGCAGACTGTTGCTGTTGGAGTTATCAAGAGTGTGGGCAAGAAGGACCCAACCGGTG
CCAAGGTTACCAAGGCTGCTGTCAAGAAGGGTGCCAAATGATGAGACTTT*CTCTCTTGC
GATATTAAAAACTTTGATTGTGTTCGAACCTTTTTT*ATATTTTTCTGCAACTTTCTTCT
CTCTGCCTTTTTGGATAGCTTTGAGACATGGTGGTTTCAATTATGCAGTTTGTGGATGAT
TTTGTTTTGCCTAATGCTTTTTAGTGTTTGCCG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2B867TF 432 0 0
TCACCAAGATTGACAGACGTTCTGGTAAAGAGATCGAGAAGGAGCCAAAGTTTTTGAAGA
ATGGAGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTGTTGAGACTTTCT
CAGAGTACCCACCACTGGGACGTTTTGCTGTCAGGGACATGAGGCAGACTGTTGCTGTTG
GAGTTATCAAGAGTGTGGGCAAGAAGGACCCAACCGGTGCCAAGGTTACCAAGGCTGCTG
TCAAGAAGGGTGCCAAATGATGAGACTTTTCTCTCTTGCGATATTAAAAACTTTGATTGT
GTTCGAACCTTTTTTTATATTTTTCTGCAACTTTCTTCTCTCTGCCTTTTTGGATAGCTC
TGAGACATGGTGGTTTCAATTATGCAGTTTGTGGATGATTTTGTTTTGCCTAATGCTTTT
TAGTGTTTGCCG

QA 1 432 1 432
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3973Contig1 485 2 2 U
CAAGTGAACAGGAGATTGTGATTCAAATCGGAAAATAAATCAAATCCAAATGTCAACTAA
TGGTGTCCTTATGTATAAACCAACTAAACAGGCACTAAACATCAAAATCAACTAAACATT
ATTCATCTCAATGTGATTCACCAAAACATTACACACATAAATCAACTCTCAAATCCAGCC
ATCTCACGCTGAGTCTTCTCTGAAAAAAGCTTGGTAGCAATCATATTATCCATAAAATAC
TCTGTGTAAGGATGATTCTCAGGCACAAGTTCTCTAAACTTATCAAACTGTTCCTCTGCT
TTGTCTTTCTTCTTCAGTAACGTGTATATAACACCTTGACAAAAATACGGCCTGAAATCT
CCTGGTTCTTCTTTGACAAGCTCTCCATAAAGCTTCAACGCTTCACCATGCTTCCCTTCA
ATCACACAAATCTGCGCCAAAAGAAGCTTAAAATCACGAAAATCGTTGTGATTATTCTCC
TTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2BZ87TF C 1
AF RR2BZ87JQ U 16
BS 1 15 RR2BZ87TF
BS 16 485 RR2BZ87JQ

RD RR2BZ87TF 485 0 0
CAAGTGAACAGGAGATTGTGATTCAAATCGGAAAATAAATCAAATCCAAATGTCAACTAA
TGGTGTCCTTATGTATAAACCAACTAAACAGGCACTAAACATCAAAATCAACTAAACATT
ATTCATCTCAATGTGATTCACCAAAACATTACACACATAAATCAACTCTCAGATCCAGCC
ATCTCACGCTGAGTCTTCTCTGAAAAAAGCTTGGTAGCAATCATATTATCCATAAAATAC
TCTGTGTAAGGATGATTCTCAGGCACAAGTTCTCTAAACTTATCAAACTGTTCCTCTGCT
TTGTCTTTCTTCTTCAGTAACGTGTATATAACACCTTGACAAAGATACGGCCTGAAATCT
CCTGGTTCTTCTTTGACAAGCTCTCCATAAAGCTTCAACGCTTCACCATGCTTCCCTTCA
ATCCCACGAATCTGCGCCAAAAGAAGCTTAAAATCACGAAAATCGTTGTGATTATTCTCC
TTCTC

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2BZ87JQ 470 0 0
TTGTGATTCAAATCGGAAAATAAATCAAATCCAAATGTCAACTAATGGTGTCCTTATGTA
TAAACCAACTAAACAGGCACTAAACATCAAAATCAACTAAACATTATTCATCTCAATGTG
ATTCACCAAAACATTACACACATAAATCAACTCTCAAATCCAGCCATCTCACGCTGAGTC
TTCTCTGAAAAAAGCTTGGTAGCAATCATATTATCCATAAAATACTCTGTGTAAGGATGA
TTCTCAGGCACAAGTTCTCTAAACTTATCAAACTGTTCCTCTGCTTTGTCTTTCTTCTTC
AGTAACGTGTATATAACACCTTGACAAAAATACGGCCTGAAATCTCCTGGTTCTTCTTTG
ACAAGCTCTCCATAAAGCTTCAACGCTTCACCATGCTTCCCTTCAATCACACAAATCTGC
GCCAAAAGAAGCTTAAAATCACGAAAATCGTTGTGATTATTCTCCTTCTC

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 2

CO CL3974Contig1 454 2 1 U
GATAGTATGATGGCGGTTGAGCAAGTATGCCCCCATCGTCTAGTGGTTTAGGACATCTCT
CTTTCAAGGAGGCAGCGGGGATTCGACTTCCCCTGGGGGTAGGGTACTACGAAAGGAAGT
TGATCATGGATTATCCATAAAGTTCGAATAGATTCTTCCTGGGTCGATGCCCGAGCGGTT
AATGGGGACGGACTGTAAATTCGTTGGCAATATGTCTACGCTGGTTCAAATCCAGCTCGG
CCCAAAAATTCGCTGTCTACATAACCCTTTTTGTTTTGCATAAATGACAGAGAAGGGTAA
GAAAAAAGTAAAATTTCTGGGTATATTTCGACTTTACTTTTTTCTTTATTTCTTGTGTCT
CGTTACTTTTTGTTTCCATAAAAAATTCCGATCTTGATCTTGCTAAGGGTCCCGAGATGG
ATCCATTAAATATAAACTTTAATGAACAGAGTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GU47JQB C 1
AF RR2GU47TF U 1
BS 1 454 RR2GU47TF

RD RR2GU47JQB 454 0 0
GATAGTATGATGGCGGTTGAGCAAGTATGCCCCCATCGTCTAGTGGTTTAGGACATCTCT
CTTTCAAGGAGGCAGCGGGGATTCGACTTCCCCTGGGGGTAGGGTACTACGAAAGGAAGT
TGATCATGGATTATCCATAAAGTTCGAATAGATTCTTCCTGGGTCGATGCCCGAGCGGTT
AATGGGGACGGACTGTAAATTCGTTGGCAATATGTCTACGCTGGTTCAAATCCAGCTCGG
CCCAAAAATTCGCTGTCTACATAACCCTTTTTGTTTTGCATAAATGACAGAGAAGGGTAA
GAAAAAAGTAAAATTTCTGGGTATATTTCGACTTTACTTTTTTCTTTATTTCTTGTGTCT
CGTTACTTTTTGTTTCCATAAAAAATTCCGATCTTGATCTTGCTAAGGGTCCCGAGATGG
ATCCATTAAATATAAACTTTAATGAACAGAGTCG

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR2GU47TF 454 0 0
GATAGTATGATGGCGGTTGAGCAAGTATGCCCCCATCGTCTAGTGGTTTAGGACATCTCT
CTTTCAAGGAGGCAGCGGGGATTCGACTTCCCCTGGGGGTAGGGTACTACGAAAGGAAGT
TGATCATGGATTATCCATAAAGTTCGAATAGATTCTTCCTGGGTCGATGCCCGAGCGGTT
AATGGGGACGGACTGTAAATTCGTTGGCAATATGTCTACGCTGGTTCAAATCCAGCTCGG
CCCAAAAATTCGCTGTCTACATAACCCTTTTTGTTTTGCATAAATGACAGAGAAGGGTAA
GAAAAAAGTAAAATTTCTGGGTATATTTCGACTTTACTTTTTTCTTTATTTCTTGTGTCT
CGTTACTTTTTGTTTCCATAAAAAATTCCGATCTTGATCTTGCTAAGGGTCCCGAGATGG
ATCCATTAAATATAAACTTTAATGAACAGAGTCG

QA 1 454 1 454
DS 



AS 1 2

CO CL3975Contig1 1070 2 4 U
GGGAAAGACGGAAGGAAGATCGGGGAAGGAGGGAGAGCAAGATGATGACGGGCGGGAGCT
ACACGACTATTGACAGCCAGAAAGTCTCTGGATCTGTACCTTCCGTTCCAGATCCAGGCC
ACACCACTGTCAAATTCACAGAGTCAAATCTTCAAACCTTTCCTCCTTCTGCTACTCAGG
GCAAGATCTCTGGTGGTAGTAATCCTCCTCGAGATGCTGACGATACATTTTCTGGTCATG
GTAGTGGTAGTACCGATGAGCCTCAGTCTGGTGGCTGGCTCCATAAGTTCACTGTTGGTG
CTTATAAGCCTTTCTTTGATGTCGACACTTCCGATGTTGTAGACAGGCTCAAAGAATCTC
TCTTCCCGTTCCGTGGAACCTTTACAGAGAAGACTGCCGATAAGCCTGACTTGTATGGTC
CATTCTGGATATGTACGACTTTGATATTCGTGGCGGCATCTATCGGCACATTTGTCACCT
ATGTAGCACACAAATGGAAGAAACAAGAATGGAACTACGATATCAATCTTGTGACTTGGT
CAGCAGGAGTGTTCTACGGCTATGTCACGCTTGTTCCCCTCGCGTTATATGTCGTTCTCA
AATACTTCTCTGCACCTTCAGGACTAGTCCAACTCTTCTGTCTCTACGGCTACTCCCTCT
TCATCTTTATCCCTGCATTGTGCCTCTCGGTAGTGCCAGTGGAGATCTTCAGATGGGTTA
TCGCGGGCGTAGCAGGGTTCATGTCTGCAACATTTGTGGCTTTGAACCTCAAAGCGCATA
TCAATTCAGCTGGAGAGAGATCGATCCTGATAATCGCAAGCATCTTTCTTTTGCAGCTCG
GGCTTGCGGTTGTTTTGAAGCTCTATCTGTTCACTGTCACCGTATGACTCAGTAATTTTT
AGATCCATCCATAAACGTTTTCTCCTACTCAAATTTTAATCAAAATTTTGAACTGTTTGG
AAACTGAACTCTATGATTCCATTTCATTTAGTTACTTGAACCTTCCATGGTCTACTTGTA
AAAAATAGTGTAATAAAAGTATATCGATTTGTTTGCCGATGTGATGTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F118TF U 1
AF RR2F118JQ C 318
BS 1 749 RR2F118TF
BS 750 750 RR2F118JQ
BS 751 772 RR2F118TF
BS 773 1070 RR2F118JQ

RD RR2F118TF 779 0 0
GGGAAAGACGGAAGGAAGATCGGGGAAGGAGGGAGAGCAAGATGATGACGGGCGGGAGCT
ACACGACTATTGACAGCCAGAAAGTCTCTGGATCTGTACCTTCCGTTCCAGATCCAGGCC
ACACCACTGTCAAATTCACAGAGTCAAATCTTCAAACCTTTCCTCCTTCTGCTACTCAGG
GCAAGATCTCTGGTGGTAGTAATCCTCCTCGAGATGCTGACGATACATTTTCTGGTCATG
GTAGTGGTAGTACCGATGAGCCTCAGTCTGGTGGCTGGCTCCATAAGTTCACTGTTGGTG
CTTATAAGCCTTTCTTTGATGTCGACACTTCCGATGTTGTAGACAGGCTCAAAGAATCTC
TCTTCCCGTTCCGTGGAACCTTTACAGAGAAGACTGCCGATAAGCCTGACTTGTATGGTC
CATTCTGGATATGTACGACTTTGATATTCGTGGCGGCATCTATCGGCACATTTGTCACCT
ATGTAGCACACAAATGGAAGAAACAAGAATGGAACTACGATATCAATCTTGTGACTTGGT
CAGCAGGAGTGTTCTACGGCTATGTCACGCTTGTTCCCCTCGCGTTATATGTCGTTCTCA
AATACTTCTCTGCACCTTCAGGACTAGTCCAACTCTTCTGTCTCTACGGCTACTCCCTCT
TCATCTTTATCCCTGCATTGTGCCTCTCGGTAGTGCCAGTGGAGATCTTCAGATGGGTTA
TCGCGGGCGTAGCAGGGTTCATGTCTGCA*CATTTGTGGCTTTGAACCTCAA
GCGCATA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2F118JQ 753 0 0
GATGTCGACACTTCCGATGTTGTAGACAGGCTCAAAGAATCTCTCTTCCCGTTCCGTGGA
ACCTTTACAGAGAAGACTGCCGATAAGCCTGACTTGTATGGTCCATTCTGGATATGTACG
ACTTTGATATTCGTGGCGGCATCTATCGGCACATTTGTCACCTATGTAGCACACAAATGG
AAGAAACAAGAATGGAACTACGATATCAATCTTGTGACTTGGTCAGCAGGAGTGTTCTAC
GGCTATGTCACGCTTGTTCCCCTCGCGTTATATGTCGTTCTCAAATACTTCTCTGCACCT
TCAGGACTAGTCCAACTCTTCTGTCTCTACGGCTACTCCCTCTTCATCTTTATCCCTGCA
TTGTGCCTCTCGGTAGTGCCAGTGGAGATCTTCAGATGGGTTATCGCGGGCGTAGCAGGG
TTCATGTCTGCAACATTTGTGGCTTTGAACCTCAAAGCGCATATCAATTCAGCTGGAGAG
AGATCGATCCTGATAATCGCAAGCATCTTTCTTTTGCAGCTCGGGCTTGCGGTTGTTTTG
AAGCTCTATCTGTTCACTGTCACCGTATGACTCAGTAATTTTTAGATCCATCCATAAACG
TTTTCTCCTACTCAAATTTTAATCAAAATTTTGAACTGTTTGGAAACTGAACTCTATGAT
TCCATTTCATTTAGTTACTTGAACCTTCCATGGTCTACTTGTAAAAAATAGTGTAATAAA
AGTATATCGATTTGTTTGCCGATGTGATGTTCG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL3976Contig1 910 2 5 U
TTATAAAAATAAATTATCACGGTGTTATTAAATGTAGCTCGAACTTTGTATAAGATAGTA
AAAGATTAAGAAGATTTATAAAAGGATAGAGATGCAACCGCAACCAATATTTCAATGTGA
GATCATCAACCAACAAGTAAAATTGGTATACATTGTAAAACAAATGATAATTCTAGATTT
GATTATTAAAACGCTAAATAAAAATTGAACTACTACATTTATTATTTATGTAAAATTAAA
GAATTGGTGTATTAAAATAATAATAAGAATTATTTGGTCATACAAGTTTACATTTTTTGG
ATCGTATTTGAAAATCTTTTACTTTCGACAAAATGACAAACATTGAGTCTCAAAACGTTA
ATCATTTATCATTTTAACTTTTTATAATGCTCAATATGATAAACCAAACTATATTAGGGT
GATATTTTTGCTGTGAATCATATAGTTCTGCGATTTGAACAAAATCTTCTATCTCTTTCA
AAGTTCTTCTCTTAAGTAAATAATTGTAAACATCAATTAATTGTTTATGGCGCTTTCTTA
TCTCTTCAGACCAATAGAACAAGAAAATGATAAAAATATAGTACAATATTGTATGGATCA
AAATATTAGGAATTAAATGTGTACCCTTACTTCAACCAAAATCATATTCAGTGTTAGACC
ATACTGCACAATATATTGTTTGATTATAATTTTACACATGTTATCCAATATTTTCTCTCC
GGTTCAACTCTTCTAAGCTTTCTAAAGGGTAAAATGCATAAAAAGATACATATTATTACT
CAAAAACATGAATATCCATCAACGAAAATTGATGTATCATCCTTTGCTCATTCAAATTTA
AAAACAATTTTTTAATATCTGTATGGTTTAAAAACAATTTTTTAATATCTGTATGGTTTA
AAAACAATTT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA78TF U 4
AF RR2BA78JQ C 1
BS 1 5 RR2BA78JQ
BS 6 106 RR2BA78TF
BS 107 107 RR2BA78JQ
BS 108 750 RR2BA78TF
BS 751 910 RR2BA78JQ

RD RR2BA78TF 747 0 0
AT
AAAATAAATTATCACGGTGTTATTAAATGTAGCTCGAACTTTGTATAAGATAGTAAAAGA
TTAAGAAGATTTATAAAAGGATAGAGATGCAACCGCAACCATTATTTCAATGTGAGATCA
TCAACCAACAAGTAAAATTGGTATACATTGTAAAACAAATGATAATTCTAGATTTGATTA
TTAAAACGCTAAATAAAAATTGAACTACTACATTTATTATTTATGTAAAATTAAAGAATT
GGTGTATTAAAATAATAATAAGAATTATTTGGTCATACAAGTTTACATTTTTTGGATCGT
ATTTGAAAATCTTTTACTTTCGACAAAATGACAAACATTGAGTCTCAAAACGTTAATCAT
TTATCATTTTAACTTTTTATAATGCTCAATATGATAAACCAAACTATATTAGGGTGATAT
TTTTGCTGTGAATCATATAGTTCTGCGATTTGAACAAAATCTTCTATCTCTTTCAAAGTT
CTTCTCTTAAGTAAATAATTGTAAACATCAATTAATTGTTTATGGCGCTTTCTTATCTCT
TCAGACCAATAGAACAAGAAAATGATAAAAATATAGTACAATATTGTATGGATCAAAATA
TTAGGAATTAAATGTGTACCCTTACTTCAACCAAAATCATATTCAGTGTTAGACCATACT
GCACAATATATTGTTTGATTATAATTTTACACATGTTATCCAATATTTTCTCTCCGGTTC
AACTCTTCTAAGCTTTCTAAAGGGT

QA 3 747 3 747
DS 

RD RR2BA78JQ 910 0 0
TTATAAAAATAAATTATCACGGTGTTATTAAATGTAGCTCGAACTTTGTATAAGATAGTA
AAAGATTAAGAAGATTTATAAAAGGATAGAGATGCAACCGCAACCAATATTTCAATGTGA
GATCATCAACCAACAAGTAAAATTGGTATACATTGTAAAACAAATGATAATTCTAGATTT
GATTATTAAAACGCTAAATAAAAATTGAACTACTACATTTATTATTTATGTAAAATTAAA
GAATTGGTGTATTAAAATAATAATAAGAATTATTTGGTCATACAAGTTTACATTTTTTGG
ATCGTATTTGAAAATCTTTTACTTTCGACAAAATGACAAACATTGAGTCTCAAAACGTTA
ATCATTTATCATTTTAACTTTTTATAATGCTCAATATGATAAACCAAACTATATTAGGGT
GATATTTTTGCTGTGAATCATATAGTTCTGCGATTTGAACAAAATCTTCTATCTCTTTCA
AAGTTCTTCTCTTAAGTAAATAATTGTAAACATCAATTAATTGTTTATGGCGCTTTCTTA
TCTCTTCAGACCAATAGAACAAGAAAATGATAAAAATATAGTACAATATTGTATGGATCA
AAATATTAGGAATTAAATGTGTACCCTTACTTCAACCAAAATCATATTCAGTGTTAGACC
ATACTGCACAATATATTGTTTGATTATAATTTTACACATGTTATCCAATATTTTCTCTCC
GGTTCAACTCTTCTAAGCTTTCTAAAGGGTAAAATGCATAAAAAGATACATATTATTACT
CAAAAACATGAATATCCATCAACGAAAATTGATGTATCATCCTTTGCTCATTCAAATTTA
AAAACAATTTTTTAATATCTGTATGGTTTAAAAACAATTTTTTAATATCTGTATGGTTTA
AAAACAATTT

QA 1 910 1 910
DS 



AS 1 2

CO CL3977Contig1 882 2 2 U
GGAAAACGAGAAAAAACGCTCGTGGAATAATGTCCGGTCTTGCAACATGGTCTAGTCAGC
TATGCATCCTCCTCCACAGACTTATAAAAGAACGCCGCCACGAATCTTTTGATGCACTTC
GTATTTTCCAAGTCCTCGCAGCTTCACTGCTTTGTAGTCTCATGTGGTGGCACTCAGATT
ACCGAGACGTGCACGACCGACTAGGACTACTCTTCTTCGTATCTATTTTCTGGGGAGTAC
TTCCGTCATTTAACGCTGTCTTCACGTTTCCGCAAGAACGAGCGATTTTCACTCGAGAGC
GGGCGTCTGGTATGTACACACTCTCGTCTTACTTCATGGCTCACGTCATCGGATCGCTCA
CCATGGAACTCGTTCTCCCGGCAGCGTTCTTGACGCTAACTTACTGGATGGTCGGTCTAC
GTCCAGGGCTAGTCCCTTTCCTCCTCACCCTTTCCGTTCTATTGCTTTACGTCTTAGCCT
CACAGGGACTCGGACTTGCCTTAGGCGCAGCCATCATGGACGCTAAAAAAGCCTCCACGA
TCGTGACAGTGACGATGCTAGCGTTTGTTTTAACCGGCGGTTACTACGTTAACAAAGTGC
CATCAGGCATGGTGTGGATGAAATACGTTTCCACAACATTTTATTGTTACCGTTTATTAA
TAGCGGTTCAGTACGGGAATGGCGATGAGATATTGGCGATGGTTGGATGCAAGCCAATGG
GAACGCAAGGAGCGGCAAAGACGGCTGGGTGCCGGTTTATGGAGGAGGAAGTGATCGGAG
ACATTGGATCGTGGACGAGCGTTAGTGCTTTGTTTTTCATGTTTGTTGGTTATAGAGTAT
TGGGGTATTTGGCCTTGAGGGGTATTAAACTATAAATGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E352TF U 1
AF RR2E352JQ C 511
BS 1 603 RR2E352TF
BS 604 882 RR2E352JQ

RD RR2E352TF 603 0 0
GGAAAACGAGAAAAAACGCTCGTGGAATAATGTCCGGTCTTGCAACATGGTCTAGTCAGC
TATGCATCCTCCTCCACAGACTTATAAAAGAACGCCGCCACGAATCTTTTGATGCACTTC
GTATTTTCCAAGTCCTCGCAGCTTCACTGCTTTGTAGTCTCATGTGGTGGCACTCAGATT
ACCGAGACGTGCACGACCGACTAGGACTACTCTTCTTCGTATCTATTTTCTGGGGAGTAC
TTCCGTCATTTAACGCTGTCTTCACGTTTCCGCAAGAACGAGCGATTTTCACTCGAGAGC
GGGCGTCTGGTATGTACACACTCTCGTCTTACTTCATGGCTCACGTCATCGGATCGCTCA
CCATGGAACTCGTTCTCCCGGCAGCGTTCTTGACGCTAACTTACTGGATGGTCGGTCTAC
GTCCAGGGCTAGTCCCTTTCCTCCTCACCCTTTCCGTTCTATTGCTTTACGTCTTAGCCT
CACAGGGACTCGGACTTGCCTTAGGCGCAGCCATCATGGACGCTAAAAAAGCCTCCACGA
TCGTGACAGTGACGATGCTAGCGTTTGTTTTAACCGGCGGTTACTACGTTAACAAAGTGC
CAT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2E352JQ 372 0 0
CCATCATGGACGCTAAAAAAGCCTCCACGATCGTGACAGTGACGATGCTAGCGTTTGTTT
TAACCGGCGGTTACTACGTTAACAAAGTGCCATCAGGCATGGTGTGGATGAAATACGTTT
CCACAACATTTTATTGTTACCGTTTATTAATAGCGGTTCAGTACGGGAATGGCGATGAGA
TATTGGCGATGGTTGGATGCAAGCCAATGGGAACGCAAGGAGCGGCAAAGACGGCTGGGT
GCCGGTTTATGGAGGAGGAAGTGATCGGAGACATTGGATCGTGGACGAGCGTTAGTGCTT
TGTTTTTCATGTTTGTTGGTTATAGAGTATTGGGGTATTTGGCCTTGAGGGGTATTAAAC
TATAAATGAGAG

QA 1 372 1 372
DS 



AS 1 2

CO CL3978Contig1 1245 2 2 U
GGACGAATATGCTTTCTTCTTCTCTTTCGTTTATTCCTTTCTTCCTTCACAGATCCTAAA
AGTATCTCTGCTTTACTCTCTTCTTTTTTTACTCTTTGCGTCATTGATCGGATCATGGAG
TTTTTCCTGGAGATGATTCTCACGGCGGTTGTTGCGCTTCTGTTTTCTTTCGTCGTGGCA
AAGCTCGTAACTGTGTCTATGGCCGGGAACAGCGATCGGAGTTCTGATCAGGCGGAGGAA
ACAGAGAACGGTGTTGTTGCGGTGGAGGATGAGGAGCTTTGTTTTGGTTTGAAGATGGAT
GCTCCGGTGGTCCAGAGCGAGAGGAGACTCGGAGTTGTTGTTGACGAGAATGCGGAACTA
GTGGATGGGTTCGGAGTTGTTGATGAATTCGAGGAAGCGGGTAAAGGGGAAGACTTAGTG
GTTACATCCGATGAGTCATCGGCGGCTGTCTCGCCGGAAAATGTGATAGAGGAGGAGATG
AGGGTTTGTGGAAAAGATAAGAAGAGAGACTCGGCGGAAGAGCTTATAGTTTGGACGGCG
GAAGGAGCTGAGTCCACTGCTTCTGTCTCGCTGGAAAACGTGAGAGCAGAGGAGATTATT
ATGATTCGAGGACAAGAGGTGAGAAGTGCACAAGTTGTAGTCGCAGAATCTGAGGAGGTT
AGTGTTGAAGAAAGTAATTCAGTGGAGGAGAGTGAGCATAAGATGGAGTTGGATACTATA
GGAGAGAAAGAGGAGTTGAGCATTGAAGAAGAAGAAGAGGAGGATGATGATGATGATGAT
TGGGAGGGAATAGAGAGGAGCGAACTAGAGAAAGCCTTTGCCACCACTTCAAATCTTTTG
GAAGGATCCGGGAAAGCAGAAGAGATTGGTGACGAGGCTAAGATGGAGTTGTACGGACTG
CACAAGATCGCCACTGAAGGGTCATGCCGAGAGACACAGCCTATGGCCATCATGGTCTCT
GCTCGTGCTAAATGGAATGCCTGGCAAAAACTTGGAAACATGAGTCAAGAGGAGGCAATG
GAGAAGTATCTTGCACTTGTTTCAAAGGAGATTCCTGGTTTGCTGAATACTGTGAAAGGT
GAATCCATTGTTTAAGCAAGGCAAGGCTTGAAGAAGGCTCTTTGGGAATACAAAGGCAAA
TCTATTCTTGTGCATAAAAATCTATGTTTCCCAAAGATAATAAAAAAATGCTGTAAATAA
GACCATTTGATGCAACTTAGTAGTGTTCTACATAACTCGTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX43TF U 1
AF RR2FX43JQ C 553
BS 1 645 RR2FX43TF
BS 646 1245 RR2FX43JQ

RD RR2FX43TF 645 0 0
GGACGAATATGCTTTCTTCTTCTCTTTCGTTTATTCCTTTCTTCCTTCACAGATCCTAAA
AGTATCTCTGCTTTACTCTCTTCTTTTTTTACTCTTTGCGTCATTGATCGGATCATGGAG
TTTTTCCTGGAGATGATTCTCACGGCGGTTGTTGCGCTTCTGTTTTCTTTCGTCGTGGCA
AAGCTCGTAACTGTGTCTATGGCCGGGAACAGCGATCGGAGTTCTGATCAGGCGGAGGAA
ACAGAGAACGGTGTTGTTGCGGTGGAGGATGAGGAGCTTTGTTTTGGTTTGAAGATGGAT
GCTCCGGTGGTCCAGAGCGAGAGGAGACTCGGAGTTGTTGTTGACGAGAATGCGGAACTA
GTGGATGGGTTCGGAGTTGTTGATGAATTCGAGGAAGCGGGTAAAGGGGAAGACTTAGTG
GTTACATCCGATGAGTCATCGGCGGCTGTCTCGCCGGAAAATGTGATAGAGGAGGAGATG
AGGGTTTGTGGAAAAGATAAGAAGAGAGACTCGGCGGAAGAGCTTATAGTTTGGACGGCG
GAAGGAGCTGAGTCCACTGCTTCTGTCTCGCTGGAAAACGTGAGAGCAGAGGAGATTATT
ATGATTCGAGGACAAGAGGTGAGAAGTGCACAAGTTGTAGTCGCA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2FX43JQ 693 0 0
TCCACTGCTTCTGTCTCGCTGGAAAACGTGAGAGCAGAGGAGATTATTATGATTCGAGGA
CAAGAGGTGAGAAGTGCACAAGTTGTAGTCGCAGAATCTGAGGAGGTTAGTGTTGAAGAA
AGTAATTCAGTGGAGGAGAGTGAGCATAAGATGGAGTTGGATACTATAGGAGAGAAAGAG
GAGTTGAGCATTGAAGAAGAAGAAGAGGAGGATGATGATGATGATGATTGGGAGGGAATA
GAGAGGAGCGAACTAGAGAAAGCCTTTGCCACCACTTCAAATCTTTTGGAAGGATCCGGG
AAAGCAGAAGAGATTGGTGACGAGGCTAAGATGGAGTTGTACGGACTGCACAAGATCGCC
ACTGAAGGGTCATGCCGAGAGACACAGCCTATGGCCATCATGGTCTCTGCTCGTGCTAAA
TGGAATGCCTGGCAAAAACTTGGAAACATGAGTCAAGAGGAGGCAATGGAGAAGTATCTT
GCACTTGTTTCAAAGGAGATTCCTGGTTTGCTGAATACTGTGAAAGGTGAATCCATTGTT
TAAGCAAGGCAAGGCTTGAAGAAGGCTCTTTGGGAATACAAAGGCAAATCTATTCTTGTG
CATAAAAATCTATGTTTCCCAAAGATAATAAAAAAATGCTGTAAATAAGACCATTTGATG
CAACTTAGTAGTGTTCTACATAACTCGTTATCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL3979Contig1 1311 2 2 U
GGACAGCACTTAATCGACACGCCTAACCGTAACCTCCTTTTTTCATAGAAAAGCGTTTTC
CTGGGAAAACTTCACGAATCAATCGAAAAACTCACCAAGAGCTCGAGAAACGATGAGCAA
CGAGTACGATTATCTGTTCAAGCTTCTGTTGATCGGTGACTCATCTGTTGGGAAATCATG
CCTGCTTCTTCGATTCACTGATGATGCGTACATTGACAGTTACATAAGCACCATTGGTGT
TGACTTTGTCAGTTCCACTAAATGATCATATACTATATAGTTTTTATATGTGAATTGATT
GTTTTATCACAAAGTTGCTTATAAAGTGGTTCGAATTTGCAGAAAATTAGGACGATTGAG
CAGGATGGGAAGACGATTGAGCTCCAAATCGTGAGTTTAAGGGCATTTTTGTAACTTGTT
CGAATAATTCGGATAATTATTATGTTTAAACTCATTTACTGTTGATGTTGTTATGTTCTC
TTCAGGGAGATCATGGTTTATGATAATAATAATGTGTTAAATGTTTCTGCTATCTTCAGT
GGGATACTGCTGGGCAGGAGCGTTTCAGGACCATCACTAGCAGCTACTACGGAGGAGCTC
ATGGGATCATTGTGAGAGAATTCTTATCCGCTTTTTTATTTACATGCTTTTAAAAAAAAA
CTAAATTAGTGTTTTGTTGGAGTTTCAGTTTCTTTTTTAAAGTGGTTTAGTGTTATCATA
TTTTATCTGCTCTGTTTACTCTGAGACATGTTTGTTGGTGGAAAAACTATTTTTGTCGTG
GGTGTTTAAAAATGATGAGACTTGTATGACCCAACAGATTGTGTATGATTGTACTGAGAT
GGGGAGCTTCAACAACGTGAAGCAGTGGTTGAGCGAGATCGACAGATATGCTAATGACAG
TGTATGCAAGCTTCTTATTGGTAACAAGAATGATATGGTTGAAAGTAAATTTGTTTCCGC
CGAAACTGGAAAGGCCTTAGCAGATGAGCTCGGAATACCCTTTCTCGAGACAAGTGCTAA
GGACTCTATCAACGTCGAACAGGCTTTCTTAACTATTGCTGGCGAGATCAAGAAGAAAAT
GGGAAGCCAGACGAATACAAACAAGACTTCTGGAAGTGGAACTGTCCAAATGAAAGGTCA
GCCAATCCAACAGAACAACGGTGGCGGTTGCTGCGGTCAGTAGTTAAACAAAGTGTTATC
AAAACTATCTGAGACTTCTTCTCTCACTATATGTTGTGAAATCCAATGGCTGTTTAAAAC
AATAACACTGGAAACTTTAGTGAACTTTAATACTCATGTCACTTTGTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F085TF U 1
AF RR2F085JQ C 549
BS 1 636 RR2F085TF
BS 637 1311 RR2F085JQ

RD RR2F085TF 636 0 0
GGACAGCACTTAATCGACACGCCTAACCGTAACCTCCTTTTTTCATAGAAAAGCGTTTTC
CTGGGAAAACTTCACGAATCAATCGAAAAACTCACCAAGAGCTCGAGAAACGATGAGCAA
CGAGTACGATTATCTGTTCAAGCTTCTGTTGATCGGTGACTCATCTGTTGGGAAATCATG
CCTGCTTCTTCGATTCACTGATGATGCGTACATTGACAGTTACATAAGCACCATTGGTGT
TGACTTTGTCAGTTCCACTAAATGATCATATACTATATAGTTTTTATATGTGAATTGATT
GTTTTATCACAAAGTTGCTTATAAAGTGGTTCGAATTTGCAGAAAATTAGGACGATTGAG
CAGGATGGGAAGACGATTGAGCTCCAAATCGTGAGTTTAAGGGCATTTTTGTAACTTGTT
CGAATAATTCGGATAATTATTATGTTTAAACTCATTTACTGTTGATGTTGTTATGTTCTC
TTCAGGGAGATCATGGTTTATGATAATAATAATGTGTTAAATGTTTCTGCTATCTTCAGT
GGGATACTGCTGGGCAGGAGCGTTTCAGGACCATCACTAGCAGCTACTACGGAGGAGCTC
ATGGGATCATTGTGAGAGAATTCTTATCCGCTTTTT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2F085JQ 763 0 0
GCTGGGCAGGAGCGTTTCAGGACCATCACTAGCAGCTACTACGGAGGAGCTCATGGGATC
ATTGTGAGAGAATTCTTATCCGCTTTTTTATTTACATGCTTTTAAAAAAAAACTAAATTA
GTGTTTTGTTGGAGTTTCAGTTTCTTTTTTAAAGTGGTTTAGTGTTATCATATTTTATCT
GCTCTGTTTACTCTGAGACATGTTTGTTGGTGGAAAAACTATTTTTGTCGTGGGTGTTTA
AAAATGATGAGACTTGTATGACCCAACAGATTGTGTATGATTGTACTGAGATGGGGAGCT
TCAACAACGTGAAGCAGTGGTTGAGCGAGATCGACAGATATGCTAATGACAGTGTATGCA
AGCTTCTTATTGGTAACAAGAATGATATGGTTGAAAGTAAATTTGTTTCCGCCGAAACTG
GAAAGGCCTTAGCAGATGAGCTCGGAATACCCTTTCTCGAGACAAGTGCTAAGGACTCTA
TCAACGTCGAACAGGCTTTCTTAACTATTGCTGGCGAGATCAAGAAGAAAATGGGAAGCC
AGACGAATACAAACAAGACTTCTGGAAGTGGAACTGTCCAAATGAAAGGTCAGCCAATCC
AACAGAACAACGGTGGCGGTTGCTGCGGTCAGTAGTTAAACAAAGTGTTATCAAAACTAT
CTGAGACTTCTTCTCTCACTATATGTTGTGAAATCCAATGGCTGTTTAAAACAATAACAC
TGGAAACTTTAGTGAACTTTAATACTCATGTCACTTTGTGTTC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL3980Contig1 1134 2 8 U
GGAGTTAGACCAGATTCGGATATCGTCGGGAAATGGCGTACTCAATTAGTACTAGTACTA
GTAACGCTTTCCGGTGTCACTACTCCGAAACGCTGCGTTTTGCTCCCCGACAACATCAAT
GTGGCCGCATAAACCCTAACCCTTCCTCTCTCCTCTCCTTTAATTCCTCCCCCTTCCTCC
TCGCTCAGAGTCTGGTTCCTTCTCTTTCGCCTGTTTCACGGCGGAATATTGCTAAAATGG
CGGCGTCGGAAGGCTCGATTAACGGAAGCAATAGGATGCTGGTATTCGTGCCACCACATC
CTTTGATCAAACACTGGATCTCTGTCCTGAGAAACGACCAAACTCCTTGTCCTATTTTCA
GGAATGCAATAGGTGAACTAGGGAGACTGTTGATGTATGAAGCATCCCGAGAGTGGCTGC
CAACTGTTGTTGGAGAAATCATGTCTCCGATGGGTGCTGCTTCTGTTGAGTTCATTGATC
CTAGAGAGCCTATAGCGGTTGTTCCCATTTTAAGAGCTGGCCTTGCTCTTGCGGAACATG
CATCAACAGTTTTGCCTGCAAATAAAATATATCATTTAGGAATAAGTCGGGACGAGAAAA
CACTTTTGCCTTCAGTGTATCTTAACAAGCTGCCTGACGAATTTCCCAAGAATTCCAGAG
TGTTCTTGGTGGACCCAATGCTTGCTACAGGCGGTACGATAATTGCAGCGATGGATATGT
TGAAGGAACGTGGTTTGTCCGTTCAGCAAATCAAAGTGATTTGTGCGGTTGCTGCACCTC
CTGCACTATCGAAGCTTAATGAGAAGTACCCCTGGCTTCATGTTTATGCTGGAATCATCG
ATCCTGAAGTCAATGAAAAGGGGTTCATAATCCCTGGGCTTGGAGATGCTGGAGACCGCA
GTTTCGGCACATAAAAACAAGTTTTGATGAAGTGATTCTTGTGTTCGTCTAGAGGTCTAT
GAGAAGAGATCAACATGGCGAACATGCGTTCCTCATTGTAACGAAACAAAGAAGAAACTT
ATGTCTTTATCATTGTTTGTCGCTTGCTAGTGAAACAACTTGTATCTACAAAACAATTTT
TTGAAAAATATTGTTCAAAACTTTAAAATCTGAAATATTAGTGAATTAACTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA23TF U 1
AF RR2DA23JQ C 530
BS 1 599 RR2DA23TF
BS 600 600 RR2DA23JQ
BS 601 701 RR2DA23TF
BS 702 702 RR2DA23JQ
BS 703 725 RR2DA23TF
BS 726 726 RR2DA23JQ
BS 727 738 RR2DA23TF
BS 739 1134 RR2DA23JQ

RD RR2DA23TF 738 0 0
GGAGTTAGACCAGATTCGGATATCGTCGGGAAATGGCGTACTCAATTAGTACTAGTACTA
GTAACGCTTTCCGGTGTCACTACTCCGAAACGCTGCGTTTTGCTCCCCGACAACATCAAT
GTGGCCGCATAAACCCTAACCCTTCCTCTCTCCTCTCCTTTAATTCCTCCCCCTTCCTCC
TCGCTCAGAGTCTGGTTCCTTCTCTTTCGCCTGTTTCACGGCGGAATATTGCTAAAATGG
CGGCGTCGGAAGGCTCGATTAACGGAAGCAATAGGATGCTGGTATTCGTGCCACCACATC
CTTTGATCAAACACTGGATCTCTGTCCTGAGAAACGACCAAACTCCTTGTCCTATTTTCA
GGAATGCAATAGGTGAACTAGGGAGACTGTTGATGTATGAAGCATCCCGAGAGTGGCTGC
CAACTGTTGTTGGAGAAATCATGTCTCCGATGGGTGCTGCTTCTGTTGAGTTCATTGATC
CTAGAGAGCCTATAGCGGTTGTTCCCATTTTAAGAGCTGGCCTTGCTCTTGCGGAACATG
CATCAACAGTTTTGCCTGCAAATAAAATATATCATTTAGGAATAAGTCGGGACGAGAAA*
CACTTTTGCCTTCAGTGTATCTTAACAAGCTGCCTGACGAATTTCCCAAGAATTCCAGAG
TGTTCTTGGTGGACCCAATGCTTGCTACAGGCGGTACGATA*TTGCAGCGATGGATATGT
TGAAG*AACGTGGTTTGT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2DA23JQ 605 0 0
TGCGGAACATGCATCAACAGTTTTGCCTGCAAATAAAATATATCATTTAGGAATAAGTCG
GGACGAGAAAACACTTTTGCCTTCAGTGTATCTTAACAAGCTGCCTGACGAATTTCCCAA
GAATTCCAGAGTGTTCTTGGTGGACCCAATGCTTGCTACAGGCGGTACGATAATTGCAGC
GATGGATATGTTGAAGGAACGTGGTTTGTCCGTTCAGCAAATCAAAGTGATTTGTGCGGT
TGCTGCACCTCCTGCACTATCGAAGCTTAATGAGAAGTACCCCTGGCTTCATGTTTATGC
TGGAATCATCGATCCTGAAGTCAATGAAAAGGGGTTCATAATCCCTGGGCTTGGAGATGC
TGGAGACCGCAGTTTCGGCACATAAAAACAAGTTTTGATGAAGTGATTCTTGTGTTCGTC
TAGAGGTCTATGAGAAGAGATCAACATGGCGAACATGCGTTCCTCATTGTAACGAAACAA
AGAAGAAACTTATGTCTTTATCATTGTTTGTCGCTTGCTAGTGAAACAACTTGTATCTAC
AAAACAATTTTTTGAAAAATATTGTTCAAAACTTTAAAATCTGAAATATTAGTGAATTAA
CTGCG

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL3981Contig1 629 2 2 U
GCAATAAACAATTACTTTGGGGCAGTGATTCTATCTCCAAGCACTGGAATCATTCTAAAC
AACCAAATGGATGATTTCACGGTCCCAGCAAAGTCCAGGGGTGACCTAAATGTGCCGCCT
CCGGCACCGGCTAGCTTCATCAGGCCCGGGAAACGACCATTGTCCTCAATGTCACCCACC
ATTGTACTCAAGGACGGTAAAGTGAAAGCTTCGGTGGGTGCTAGCGGTGGAGCGAACATC
ATCGCCGCAACCACAGAAGTTTTGTTGAATCATTTTTTCCTCAACATGGATCCTCTTTCT
TCTGTTTTGGCTCCAAGAATCTACCACCAGCTGATACCAAACAGTGTTTCGTTTGAGAAT
TTGACGACAGTCTTCGGTGATCATTTCGAGATACCTAAAGAGACAAGAGTTGTGTTGGAA
AAGAAAGGTCATGTTGTAACGCCAATGACCGGAGCGACGATTGTTCAGTTCATAGTTCAA
GAATCCGATGGAAATGCCGGCGGAATGAGTAAGCTTGTGGCAATTAGTGATCCAAGGAAA
GGAGGGTTCCCCTCTGGATATTGAGTTTGTTTATTTAGTTTTCCTGCCATTGTTAATTTA
TTGACGAATAAAATAAAAATAAATTTTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ77TF U 1
AF RR2EJ77JQ C 1
BS 1 455 RR2EJ77TF
BS 456 629 RR2EJ77JQ

RD RR2EJ77TF 455 0 0
GCAATAAACAATTACTTTGGGGCAGTGATTCTATCTCCAAGCACTGGAATCATTCTAAAC
AACCAAATGGATGATTTCACGGTCCCAGCAAAGTCCAGGGGTGACCTAAATGTGCCGCCT
CCGGCACCGGCTAGCTTCATCAGGCCCGGGAAACGACCATTGTCCTCAATGTCACCCACC
ATTGTACTCAAGGACGGTAAAGTGAAAGCTTCGGTGGGTGCTAGCGGTGGAGCGAACATC
ATCGCCGCAACCACAGAAGTTTTGTTGAATCATTTTTTCCTCAACATGGATCCTCTTTCT
TCTGTTTTGGCTCCAAGAATCTACCACCAGCTGATACCAAACAGTGTTTCGTTTGAGAAT
TTGACGACAGTCTTCGGTGATCATTTCGAGATACCTAAAGAGACAAGAGTTGTGTTGGAA
AAGAAAGGTCATGTTGTAACGCCAATGACCGGAGC

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR2EJ77JQ 629 0 0
GCAATAAACAATTACTTTGGGGCAGTGATTCTATCTCCAAGCACTGGAATCATTCTAAAC
AACCAAATGGATGATTTCACGGTCCCAGCAAAGTCCAGGGGTGACCTAAATGTGCCGCCT
CCGGCACCGGCTAGCTTCATCAGGCCCGGGAAACGACCATTGTCCTCAATGTCACCCACC
ATTGTACTCAAGGACGGTAAAGTGAAAGCTTCGGTGGGTGCTAGCGGTGGAGCGAACATC
ATCGCCGCAACCACAGAAGTTTTGTTGAATCATTTTTTCCTCAACATGGATCCTCTTTCT
TCTGTTTTGGCTCCAAGAATCTACCACCAGCTGATACCAAACAGTGTTTCGTTTGAGAAT
TTGACGACAGTCTTCGGTGATCATTTCGAGATACCTAAAGAGACAAGAGTTGTGTTGGAA
AAGAAAGGTCATGTTGTAACGCCAATGACCGGAGCGACGATTGTTCAGTTCATAGTTCAA
GAATCCGATGGAAATGCCGGCGGAATGAGTAAGCTTGTGGCAATTAGTGATCCAAGGAAA
GGAGGGTTCCCCTCTGGATATTGAGTTTGTTTATTTAGTTTTCCTGCCATTGTTAATTTA
TTGACGAATAAAATAAAAATAAATTTTGT

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL3982Contig1 873 2 2 U
GGGATAACAACAGCAAGAGGAGGAAGAAGAAACGTTCGATGATGGTTTATGGAGGCGTAG
GAGGAGATAATTTGGCGGTGGTGAAGGCGGCGGCGCGGGCTTGGTATCAGAGGAAGGAAG
GCAAACCGATTATGAGAGAGTTTGAGATAACAAGAGCACCGAGAACACCTCGACCTTCGC
GGTACAAGATTGAAGCTACAAAGAACATGATCCTCTCTGACAACAAGGTTTTAGCCGAGA
ATAGGGTTTCTAAGTCTTCCCTTTGGTACACAAATTACCATTATCAAGAGGATCAAGAAA
CTCAATACTCTCGTCTACTTGACACTTACGAGATCAAGAACATCTCAAAAAGGCTTCATT
CTGATGATCCTAGTTTATCCGTGAGTTTGAGAAGTGCTTTCATGCTGAGTGACGATAATC
ATAATCATGATTGTGGTTGTGATAATCATGGTATGTTCAAGAGAACTGGATATGATAAGA
ATACTACTAGTAGTGGAAAAACTGATAACAAGATTTCCGTGAAAAAAGTGAGCAAAAGAA
GTTTGTGGAAGGGACTGATTGTTATGGGTCCAGTGTCTACGGTTTGTGGAAGAAGCGATG
ATGTGGATTTACGGGCTTCTAAAGCTAGCCGGAGAACAGTCAAGGTTGCGGCGGCGGCCG
AGGCTCTCCTCAGGTCGGCAGCAAGTGGCAAGACTCAGACCCGTAGTCGCTAACTTTACT
GGTTATTAGGATGGAAAGATTTGAACAATTTCTTAAAAATTCGTACATTTTCATGTTTCT
GTATTTTGATGAACCAGCTGTGTAGTTTCTTCCAGTTTCTGTAACAAAAAAACGTACATC
TATTTTTTCGAATTAATATGTACATCTTCAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL09TF U 1
AF RR2DL09JQ C 181
BS 1 635 RR2DL09TF
BS 636 873 RR2DL09JQ

RD RR2DL09TF 635 0 0
GGGATAACAACAGCAAGAGGAGGAAGAAGAAACGTTCGATGATGGTTTATGGAGGCGTAG
GAGGAGATAATTTGGCGGTGGTGAAGGCGGCGGCGCGGGCTTGGTATCAGAGGAAGGAAG
GCAAACCGATTATGAGAGAGTTTGAGATAACAAGAGCACCGAGAACACCTCGACCTTCGC
GGTACAAGATTGAAGCTACAAAGAACATGATCCTCTCTGACAACAAGGTTTTAGCCGAGA
ATAGGGTTTCTAAGTCTTCCCTTTGGTACACAAATTACCATTATCAAGAGGATCAAGAAA
CTCAATACTCTCGTCTACTTGACACTTACGAGATCAAGAACATCTCAAAAAGGCTTCATT
CTGATGATCCTAGTTTATCCGTGAGTTTGAGAAGTGCTTTCATGCTGAGTGACGATAATC
ATAATCATGATTGTGGTTGTGATAATCATGGTATGTTCAAGAGAACTGGATATGATAAGA
ATACTACTAGTAGTGGAAAAACTGATAACAAGATTTCCGTGAAAAAAGTGAGCAAAAGAA
GTTTGTGGAAGGGACTGATTGTTATGGGTCCAGTGTCTACGGTTTGTGGAAGAAGCGATG
ATGTGGATTTACGGGCTTCTAAAGCTAGCCGGAGA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2DL09JQ 693 0 0
GGTACAAGATTGAAGCTACAAAGAACATGATCCTCTCTGACAACAAGGTTTTAGCCGAGA
ATAGGGTTTCTAAGTCTTCCCTTTGGTACACAAATTACCATTATCAAGAGGATCAAGAAA
CTCAATACTCTCGTCTACTTGACACTTACGAGATCAAGAACATCTCAAAAAGGCTTCATT
CTGATGATCCTAGTTTATCCGTGAGTTTGAGAAGTGCTTTCATGCTGAGTGACGATAATC
ATAATCATGATTGTGGTTGTGATAATCATGGTATGTTCAAGAGAACTGGATATGATAAGA
ATACTACTAGTAGTGGAAAAACTGATAACAAGATTTCCGTGAAAAAAGTGAGCAAAAGAA
GTTTGTGGAAGGGACTGATTGTTATGGGTCCAGTGTCTACGGTTTGTGGAAGAAGCGATG
ATGTGGATTTACGGGCTTCTAAAGCTAGCCGGAGAACAGTCAAGGTTGCGGCGGCGGCCG
AGGCTCTCCTCAGGTCGGCAGCAAGTGGCAAGACTCAGACCCGTAGTCGCTAACTTTACT
GGTTATTAGGATGGAAAGATTTGAACAATTTCTTAAAAATTCGTACATTTTCATGTTTCT
GTATTTTGATGAACCAGCTGTGTAGTTTCTTCCAGTTTCTGTAACAAAAAAACGTACATC
TATTTTTTCGAATTAATATGTACATCTTCAGGG

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL3983Contig1 645 2 9 U
AAACAAAAGAAGTAAATCCCATAAAGAAGCAAAACTCAAAACTTGGATGTTTTAAGCACA
AGCAAAGAAAACACCTCGATGCAACGACGATGTTCTGTGAAAGTGCGCTCATGGAGTCTG
CTTTTTGCAGCTAGAATCTGTATTTCTGTGTGCAAAAAAGCTCCAAAAAACTGAAAAAAA
ATTGTAAAAGAAACAAGAAAGGAGAGCAAAAAGCACCCTTCTCACCTCACTTCAAAAGAT
ACATACATACATACATACATATATAGAAACAGAAGTTTTGAGTAGTTTTACAGTGTGTGT
CTACACTACAACAACATGATGTTGTCTCTCCCTGTACTCTTCTTCCTCAATTGTGTTTCT
TCTCTTACTTTTTGTTCAGAAAGATGCAGCCAAGAGAGCATTTGGACCTTCTCCACACCT
CCGATGAACATCCTTCATCCTATCCGCTGATCTACAAATCCCACTACAACTCCAATCAAA
CGAGGCAACACACATATTGCCCGCCTGTGCCTTCCACTCACAATCTGTTGTACCACAACA
TAGCCTACGATCATCTACATGCTCCACATCCAATCCAAGAAACCATGATCCTAAAGAGAC
ATCCTCATTCACATACTTGTGAAGTACGTTTTGGTTTATCGATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT18JQB U 18
AF RR2AX95JQ U 1
BS 1 88 RR2AX95JQ
BS 89 89 RR2GT18JQB
BS 90 162 RR2AX95JQ
BS 163 163 RR2GT18JQB
BS 164 257 RR2AX95JQ
BS 258 261 RR2GT18JQB
BS 262 495 RR2AX95JQ
BS 496 496 RR2GT18JQB
BS 497 645 RR2AX95JQ

RD RR2GT18JQB 521 0 0
CCCATAAAGAAGCAAAACTCAAAACTTGGATGTTTTAAGCACAAGCAAAGAAAACACCTC
GATGCAACGACGATGTTCTGTGAAAGTGCGCTCATGGAGTCTGCTTTTTGCAGCTAGAAT
CTGTATTTCTGTGTGCAAAAAAGCTCCAGAAAACTGAAAAAAAATTGTAAAAGAAACAAG
AAAGGAGAGCAAAAAGCACCCTTCTCACCTCACTTCAAAAGATACATACATACATACATA
CATATATAGAAACAGAAGTTTTGAGTAGTTTTACAGTGTGT**CTACACTACAACAACAT
GATGTTGTCTCTCCCTGTACTCTTCTTCCTCAATTGTGTTTCTTCTCTTACTTTTTGTTC
AGAAAGATGCAGCCAAGAGAGCATTTGGACCTTCTCCACACCTCCGATGAACATCCTTCA
TCCTATCCGCTGATCTACAAATCCCACTACAGCTCCAATCAAACGAGGCAACACACATAT
TGCCCGCCTGTGCCTTCCACTCACAATCTGTTGTACC
GCAA

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2AX95JQ 645 0 0
AAACAAAAGAAGTAAATCCCATAAAGAAGCAAAACTCAAAACTTGGATGTTTTAAGCACA
AGCAAAGAAAACACCTCGATGCAACGACTATGTTCTGTGAAAGTGCGCTCATGGAGTCTG
CTTTTTGCAGCTAGAATCTGTATTTCTGTGTGCAAAAAAGCTTCAAAAAACTGAAAAAAA
ATTGTAAAAGAAACAAGAAAGGAGAGCAAAAAGCACCCTTCTCACCTCACTTCAAAAGAT
ACATACATACATACATA****TATAGAAACAGAAGTTTTGAGTAGTTTTACAGTGTGTGT
CTACACTACAACAACATGATGTTGTCTCTCCCTGTACTCTTCTTCCTCAATTGTGTTTCT
TCTCTTACTTTTTGTTCAGAAAGATGCAGCCAAGAGAGCATTTGGACCTTCTCCACACCT
CCGATGAACATCCTTCATCCTATCCGCTGATCTACAAATCCCACTACAACTCCAATCAAA
CGAGGCAACACACATGTTGCCCGCCTGTGCCTTCCACTCACAATCTGTTGTACCACAACA
TAGCCTACGATCATCTACATGCTCCACATCCAATCCAAGAAACCATGATCCTAAAGAGAC
ATCCTCATTCACATACTTGTGAAGTACGTTTTGGTTTATCGATAT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL3984Contig1 778 2 2 U
GGAGAAAACCCTAAATCCCCAAAAGAGGAAACGGAGATTTCGATTCGATTCGATCCGATT
GTATGTCTTCGTCTTCTCCGAGTGGTAGCGGTGGCGATTTGAGTGAGAGAAGAGGGATTC
CTGCGGCTAAATTCATCCAAGATATGGAGACTTATCTCTCTCAGTCAGGCTTCGATTCGA
ACTCTGCTCTCGCCTTCCATCAAGAAAGGCTTCAGCAGTATAAAGTTGTTGAAATGAAGC
TTCTAGCCCAGCAAAGAGATCTTCAGGCTAAAATCCCAGATATTGAGAAGTGTTTGGAAG
TTGTTGCCACTTTGGAAGCAAGGAAGGGTACTGGTGAGTCGCTTTTAGCCGACTTTGAAG
TGTCTGAAGGAATATATTCACGGGCATGTATTGAGGACACAGACTCAGTCTGTTTGTGGT
TGGGAGCAAATGTCATGCTAGAATATTCCTGTGAAGAGGCTACATCACTTCTGAAAAACA
ATCTGGAAAATGCTAAAGCCAGCCTGGAGGTTCTTGTAACTGATCTACAGTTCTTGAGGG
ATCAAGTCACAGTTACTCAGGTAACTATAGCGCGTATTTATAACTATGATGTTCATCAAA
GGAGGGTTAAACAAGTTACCCCTACTGCTGTTGCTGCTGCAGACTCATGAATCACAGTTC
CAAATTATAATCGTTAAATGGAGGTATTATATAATATATTTGAAAACGGTTTGTTTATCC
GGTTGTTTGTAATTTTGATTTTTGCTACCGATATGAAGTTTTGTTTTTGCTATGAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H673TF U 1
AF RR2H673JQB C 650
BS 1 704 RR2H673TF
BS 705 778 RR2H673JQB

RD RR2H673TF 704 0 0
GGAGAAAACCCTAAATCCCCAAAAGAGGAAACGGAGATTTCGATTCGATTCGATCCGATT
GTATGTCTTCGTCTTCTCCGAGTGGTAGCGGTGGCGATTTGAGTGAGAGAAGAGGGATTC
CTGCGGCTAAATTCATCCAAGATATGGAGACTTATCTCTCTCAGTCAGGCTTCGATTCGA
ACTCTGCTCTCGCCTTCCATCAAGAAAGGCTTCAGCAGTATAAAGTTGTTGAAATGAAGC
TTCTAGCCCAGCAAAGAGATCTTCAGGCTAAAATCCCAGATATTGAGAAGTGTTTGGAAG
TTGTTGCCACTTTGGAAGCAAGGAAGGGTACTGGTGAGTCGCTTTTAGCCGACTTTGAAG
TGTCTGAAGGAATATATTCACGGGCATGTATTGAGGACACAGACTCAGTCTGTTTGTGGT
TGGGAGCAAATGTCATGCTAGAATATTCCTGTGAAGAGGCTACATCACTTCTGAAAAACA
ATCTGGAAAATGCTAAAGCCAGCCTGGAGGTTCTTGTAACTGATCTACAGTTCTTGAGGG
ATCAAGTCACAGTTACTCAGGTAACTATAGCGCGTATTTATAACTATGATGTTCATCAAA
GGAGGGTTAAACAAGTTACCCCTACTGCTGTTGCTGCTGCAGACTCATGAATCACAGTTC
CAAATTATAATCGTTAAATGGAGGTATTATATAATATATTTGAA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2H673JQB 129 0 0
AATCCCAGTTCCAAATTATAATCGTTAAATGGGGGTATTATATAATATATTTGAAAACGG
TTTGTTTATCCGGTTGTTTGTAATTTTGATTTTTGCTACCGATATGAAGTTTTGTTTTTG
CTATGAACA

QA 1 129 1 129
DS 



AS 1 2

CO CL3985Contig1 671 2 1 U
GGATCTGCGATCAATTGTGTTCTCACACTTTCCCTTGGTTTTCTCGGCGGCTTTCTCTCA
TCTCCTTTTTCCTTCGAATCGTTTCTTTCCATTAATTCTCTGAGATTAAATCTTCCTCCT
TTCTGCGGACCCCTATGTCGGACAAAGGTCGTCCCTTGCCCAAGTTTGGTGAATGGGATG
CGAACGATCCAGCATCAGCTGAAGGTTTCACAGTCATATTCAACAAAGCTAGGGATGAGA
AGAAGACCGGTGGCAAACCCGGTTCACCTGGTAAATCCACTGATGGTCATGCTAAGTCCG
GAGGAGGAGGAGGAGATCCCAGTAAACCCCAGCCCAAAAAATGGCTCTGCTGCATGCAAT
CTCCAGCTGTGGACTCCTGAATGACCACAAAGATGGATTTTGCTTTGCTTCCCCCCCAAA
GAAAAAGTCACATTGCTTAGAGATCTATAGCAATGATATTTTATGTTTTTTATTGTCTTT
CTTGAAAGTACCCACAACAACAAAAAAAGGTTCCTAAGATGAGTTGGAGCAACCCACTTT
AGTATCACGATTATGATTCCATTTTCTTTGAAAGTTGTTTGTTCTTCTTTAAAAAAATGC
TGTAAAATCGTGTTGCCACTGTATCTATTATGTAATGCTTCTCATATGGGTCGGTTTTTT
GGTTTCATTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FI89JQ C 1
AF RR2FI89TF U 1
BS 1 671 RR2FI89TF

RD RR2FI89JQ 671 0 0
GGATCTGCGATCAATTGTGTTCTCACACTTTCCCTTGGTTTTCTCGGCGGCTTTCTCTCA
TCTCCTTTTTCCTTCGAATCGTTTCTTTCCATTAATTCTCTGAGATTAAATCTTCCTCCT
TTCTGCGGACCCCTATGTCGGACAAAGGTCGTCCCTTGCCCAAGTTTGGTGAATGGGATG
CGAACGATCCAGCATCAGCTGAAGGTTTCACAGTCATATTCAACAAAGCTAGGGATGAGA
AGAAGACCGGTGGCAAACCCGGTTCACCTGGTAAATCCACTGATGGTCATGCTAAGTCCG
GAGGAGGAGGAGGAGATCCCAGTAAACCCCAGCCCAAAAAATGGCTTTGCTGCATGCAAT
CTCCAGCTGTGGACTCCTGAATGACCACAAAGATGGATTTTGCTTTGCTTCCCCCCCAAA
GAAAAAGTCACATTGCTTAGAGATCTATAGCAATGATATTTTATGTTTTTTATTGTCTTT
CTTGAAAGTACCCACAACAACAAAAAAAGGTTCCTAAGATGAGTTGGAGCAACCCACTTT
AGTATCACGATTATGATTCCATTTTCTTTGAAAGTTGTTTGTTCTTCTTTAAAAAAATGC
TGTAAAATCGTGTTGCCACTGTATCTATTATGTAATGCTTCTCATATGGGTCGGTTTTTT
GGTTTCATTTT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2FI89TF 671 0 0
GGATCTGCGATCAATTGTGTTCTCACACTTTCCCTTGGTTTTCTCGGCGGCTTTCTCTCA
TCTCCTTTTTCCTTCGAATCGTTTCTTTCCATTAATTCTCTGAGATTAAATCTTCCTCCT
TTCTGCGGACCCCTATGTCGGACAAAGGTCGTCCCTTGCCCAAGTTTGGTGAATGGGATG
CGAACGATCCAGCATCAGCTGAAGGTTTCACAGTCATATTCAACAAAGCTAGGGATGAGA
AGAAGACCGGTGGCAAACCCGGTTCACCTGGTAAATCCACTGATGGTCATGCTAAGTCCG
GAGGAGGAGGAGGAGATCCCAGTAAACCCCAGCCCAAAAAATGGCTCTGCTGCATGCAAT
CTCCAGCTGTGGACTCCTGAATGACCACAAAGATGGATTTTGCTTTGCTTCCCCCCCAAA
GAAAAAGTCACATTGCTTAGAGATCTATAGCAATGATATTTTATGTTTTTTATTGTCTTT
CTTGAAAGTACCCACAACAACAAAAAAAGGTTCCTAAGATGAGTTGGAGCAACCCACTTT
AGTATCACGATTATGATTCCATTTTCTTTGAAAGTTGTTTGTTCTTCTTTAAAAAAATGC
TGTAAAATCGTGTTGCCACTGTATCTATTATGTAATGCTTCTCATATGGGTCGGTTTTTT
GGTTTCATTTT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL3986Contig1 929 2 12 U
GCGTATATTCTTGGGAAGAAGAGAGAGAAAGTTCTCTCGAGTCTCCCTTCTTACCAAACA
CAAATCTTTCAGAAGGGAGCTCGATTTTGTTTTGTCATGTAATATATTCGGTTATCTAGA
TCGACTTTTATCTTCGCTTGGCGATTTACACTTTCGTATGGCGATTTAAACTTTCGTGTG
GCGATTTTTTGGAGTGCATCTCGATCTTTCACGAAGCTGATTTTCAAACTATCTCTTTTG
TCTTCGATAAGGATCGAAATAATCTGCTTTCCACTCGGTCTTTACTTTATATCCCGTTGA
ATATTAGCATCAAAAACCTTTTTCATCGCTCACTCTATCTTTATTTACGGGAGAATCAGT
CTCTGCTTTGTTAATTTCACCACTCGGTGATAATGTAGAGCATCTCTGACGGAAAGGAAG
ATGAGTTTGTAGGATATTTTAAATCGTTTATGAAGTTGATTCAGGAGAGCTGGCGTTTTC
TTAAACGGCCCGGCAAAGAATCTTTACTTCTATTTGATTTAAGTTTCCTCTGGTTTTATT
CCGATGAATCAAAGGCCTCTTTGCTCAAATATTCACGGATTAAGGTGGAAGGCATACAAA
TTGGTATCGGGTTTTTAGATTGGAGGAACCTTGCAAAGGAGAAATGGGATTAAGAAACGG
CGTCCGGAAGCTTGCAGTGGTGATAGACGGCGGCAATGCACGATAGACGGTGGCAATGCA
CGAAGGAAAGTCTGAAATTATCAGTCTCTATTTGAGAGCCACGTGTCTAAGTGACTCATG
AAGCTTATCGCCAAACGAGAAGATCAAGTTTCGGGACGTTTCTCTTTCTTGGGCTAATTA
ATGTTATATTATGGGCTTCTCTAATTTGTAAATCTGATATCAGTTGTACTAATGCCCGTT
GGGCTTTATGAATGGAATCTTCAGTCGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU62TF U 1
AF RR2CU62JQ C 260
BS 1 488 RR2CU62TF
BS 489 489 RR2CU62JQ
BS 490 689 RR2CU62TF
BS 690 690 RR2CU62JQ
BS 691 695 RR2CU62TF
BS 696 696 RR2CU62JQ
BS 697 709 RR2CU62TF
BS 710 710 RR2CU62JQ
BS 711 725 RR2CU62TF
BS 726 726 RR2CU62JQ
BS 727 736 RR2CU62TF
BS 737 929 RR2CU62JQ

RD RR2CU62TF 736 0 0
GCGTATATTCTTGGGAAGAAGAGAGAGAAAGTTCTCTCGAGTCTCCCTTCTTACCAAACA
CAAATCTTTCAGAAGGGAGCTCGATTTTGTTTTGTCATGTAATATATTCGGTTATCTAGA
TCGACTTTTATCTTCGCTTGGCGATTTACACTTTCGTATGGCGATTTAAACTTTCGTGTG
GCGATTTTTTGGAGTGCATCTCGATCTTTCACGAAGCTGATTTTCAAACTATCTCTTTTG
TCTTCGATAAGGATCGAAATAATCTGCTTTCCACTCGGTCTTTACTTTATATCCCGTTGA
ATATTAGCATCAAAAACCTTTTTCATCGCTCACTCTATCTTTATTTACGGGAGAATCAGT
CTCTGCTTTGTTAATTTCACCACTCGGTGATAATGTAGAGCATCTCTGACGGAAAGGAAG
ATGAGTTTGTAGGATATTTTAAATCGTTTATGAAGTTGATTCAGGAGAGCTGGCGTTTTC
TTAAACGGTCCGGCAAAGAATCTTTACTTCTATTTGATTTAAGTTTCCTCTGGTTTTATT
CCGATGAATCAAAGGCCTCTTTGCTCAAATATTCACGGATTAAGGTGGAAGGCATACAAA
TTGGTATCGGGTTTTTAGATTGGAGGAACCTTGCAAAGGAGAAATGGGATTAAGAAACGG
CGTCCGGAAGCTTGCAGTGGTGATAGACG*CGGCA*TGCACGATAGACG*TGGCAATGCA
CGAAG*AAAGTCTGAA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2CU62JQ 670 0 0
TAATCTGCTTTCCACTCGGTCTTTACTTTATATCCCGTTGAATATTAGCATCAAAAACCT
TTTTCATCGCTCACTCTATCTTTATTTACGGGAGAATCAGTCTCTGCTTTGTTAATTTCA
CCACTCGGTGATAATGTAGAGCATCTCTGACGGAAAGGAAGATGAGTTTGTAGGATATTT
TAAATCGTTTATGAAGTTGATTCAGGAGAGCTGGCGTTTTCTTAAACGGCCCGGCAAAGA
ATCTTTACTTCTATTTGATTTAAGTTTCCTCTGGTTTTATTCCGATGAATCAAAGGCCTC
TTTGCTCAAATATTCACGGATTAAGGTGGAAGGCATACAAATTGGTATCGGGTTTTTAGA
TTGGAGGAACCTTGCAAAGGAGAAATGGGATTAAGAAACGGCGTCCGGAAGCTTGCAGTG
GTGATAGACGGCGGCAATGCACGATAGACGGTGGCAATGCACGAAGGAAAGTCTGAAATT
ATCAGTCTCTATTTGAGAGCCACGTGTCTAAGTGACTCATGAAGCTTATCGCCAAACGAG
AAGATCAAGTTTCGGGACGTTTCTCTTTCTTGGGCTAATTAATGTTATATTATGGGCTTC
TCTAATTTGTAAATCTGATATCAGTTGTACTAATGCCCGTTGGGCTTTATGAATGGAATC
TTCAGTCGGC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL3987Contig1 1056 2 4 U
TTTTTGCATACGGCCAAACAGGTTCTGGCAAAACATATACCATGATGGGCAGGCCTGAAG
CGCCGGAGCAGAAAGGACTGATCCCTCGATCACTTGAGCAAATATTCAAAACGAGTCAGT
CTCTTAGTGCACAAGGCTGGAAATACAAGATGCAGGTCTCAATGCTAGAGATCTACAATG
AGTCCCTCAGGGACTTGCTTACTACAAACCGAACAATTGCAATAGAATCTGTGCGAGGAG
ACAGTAACACCACTGGAAGACAATATGCAGTCAAGCATGATGTTAACGGCAACACTCATG
TGAGTGACCTGACTATAATAGATGTATGCAGCATTGGACAAATTTCCTCACTCTTGCAGC
AAGCTGGTCAGAGCAGGTCTGTTGGAAAGACCCATATGAATGAGCAGTCCTCGAGGAGTC
ATTTCGTGTTTACTCTTAGGATTTCTGGTGTGAATGAGAGCACTGAACAGCAGGTACAAG
GTGTTCTTAACCTAATTGATCTTGCTGGAAGTGAGCGACTCTCAAAGAGTGGGGCAACAG
GAGAGCGATTAAAGGAAACACAGGCAATAAACAAAAGCTTGTCTGCTTTGAGTGATGTTA
TATTTGCACTGGCAAAGAAAGAGGATCATGTTCCTTTCAGAAACTCCAAGCTGACATACC
TGCTACAGCCATGTTTAGGAGGTGACTCAAAGACGTTAATGTTTGTTAACATATCACCGG
ATCCAACTTCTACAGGAGAGTCCCTCTGTTCTCTTCGTTTTGCTGCTAGAGTCAACGCAT
GTGAGATTGGGATACCGCGAAGACAAACTTCCTCAAAACTTATTGACAATCGCCTAAGTT
ACGGTTAAAGACTGGTGGTGGTTTTGTCCCTCATATGTGTTTACACAAGCAATTGCTTTG
CTTTTAGAGGTTTGTAATAACTGATTGTGTGGTTTTGACTTAGTGTCCGTCTTGCTGTAT
GAAGCCCTTGAGTTCATATGCAGATTTGTTTCTGGATTTCATTTGATTGTGGAAACTACT
ACTTTCTATCTACTTGTATGAGAAAATTGATTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL43TF U 1
AF RR2CL43JQ C 260
BS 1 681 RR2CL43TF
BS 682 682 RR2CL43JQ
BS 683 719 RR2CL43TF
BS 720 1056 RR2CL43JQ

RD RR2CL43TF 719 0 0
TTTTTGCATACGGCCAAACAGGTTCTGGCAAAACATATACCATGATGGGCAGGCCTGAAG
CGCCGGAGCAGAAAGGACTGATCCCTCGATCACTTGAGCAAATATTCAAAACGAGTCAGT
CTCTTAGTGCACAAGGCTGGAAATACAAGATGCAGGTCTCAATGCTAGAGATCTACAATG
AGTCCCTCAGGGACTTGCTTACTACAAACCGAACAATTGCAATAGAATCTGTGCGAGGAG
ACAGTAACACCACTGGAAGACAATATGCAGTCAAGCATGATGTTAACGGCAACACTCATG
TGAGTGACCTGACTATAATAGATGTATGCAGCATTGGACAAATTTCCTCACTCTTGCAGC
AAGCTGGTCAGAGCAGGTCTGTTGGAAAGACCCATATGAATGAGCAGTCCTCGAGGAGTC
ATTTCGTGTTTACTCTTAGGATTTCTGGTGTGAATGAGAGCACTGAACAGCAGGTACAAG
GTGTTCTTAACCTAATTGATCTTGCTGGAAGTGAGCGACTCTCAAAGAGTGGGGCAACAG
GAGAGCGATTAAAGGAAACACAGGCAATAAACAAAAGCTTGTCTGCTTTGAGTGATGTTA
TATTTGCACTGGCAAAGAAAGAGGATCATGTTCCTTTCAGAAACTCCAAGCTGACATACC
TGCTACAGCCATGTTTAGGAG*TGACTCAAAGACGTTAATGTTTGTTAACATATCACCG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2CL43JQ 797 0 0
ACAATATGCAGTCAAGCATGATGTTAACGGCAACACTCATGTGAGTGACCTGACTATAAT
AGATGTATGCAGCATTGGACAAATTTCCTCACTCTTGCAGCAAGCTGGTCAGAGCAGGTC
TGTTGGAAAGACCCATATGAATGAGCAGTCCTCGAGGAGTCATTTCGTGTTTACTCTTAG
GATTTCTGGTGTGAATGAGAGCACTGAACAGCAGGTACAAGGTGTTCTTAACCTAATTGA
TCTTGCTGGAAGTGAGCGACTCTCAAAGAGTGGGGCAACAGGAGAGCGATTAAAGGAAAC
ACAGGCAATAAACAAAAGCTTGTCTGCTTTGAGTGATGTTATATTTGCACTGGCAAAGAA
AGAGGATCATGTTCCTTTCAGAAACTCCAAGCTGACATACCTGCTACAGCCATGTTTAGG
AGGTGACTCAAAGACGTTAATGTTTGTTAACATATCACCGGATCCAACTTCTACAGGAGA
GTCCCTCTGTTCTCTTCGTTTTGCTGCTAGAGTCAACGCATGTGAGATTGGGATACCGCG
AAGACAAACTTCCTCAAAACTTATTGACAATCGCCTAAGTTACGGTTAAAGACTGGTGGT
GGTTTTGTCCCTCATATGTGTTTACACAAGCAATTGCTTTGCTTTTAGAGGTTTGTAATA
ACTGATTGTGTGGTTTTGACTTAGTGTCCGTCTTGCTGTATGAAGCCCTTGAGTTCATAT
GCAGATTTGTTTCTGGATTTCATTTGATTGTGGAAACTACTACTTTCTATCTACTTGTAT
GAGAAAATTGATTGATC

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL3988Contig1 783 2 2 U
GGAGAACCACCGATGCTAATCCTCATCTTCCTCCTCTTTACCTCCGGCGCCCAAATTGCT
ACCGCTAATGAGCCGGTCCCGGCGCCATGGCCACACCAATTTCACGCGCTACTGTTCATG
AATTACTCGGGAGACCTCTCGATGATTGACCTTTGGTATGACTGGCCCAACGGTCGTAAT
TTCAATATCATACAGGAGCAGCTCGGTGGCATCACCTACGACCTCGAATGGAACAACGGC
ACGTCCTTCGTTTACACCCTCGACGACTCAAAATCGTGCCGTTCTGCTCAACTTGAGGTT
GGAATCTTGCGACCAAACTGGCTAGATGGAGCCAAGTATCAAGGCCAACAACTTGTGAAT
GGGTTTCATTGCAATGTATGGGAGAAAGTAGACTTTATAAGGTACTATGAGGATGTCGAA
ACCAAGAGACCCGTTCAATGGATCTTCTATACAGGGAGGGAGGCTCATGTGGTGACATTC
GAGGTTGGCGCAGTACTTGAGGATGAGAAATGGCAAGCGCCGGTTTATTGTTTCAACAAA
GAGAAGAAGAGTTTATCAACTGAAGGAGCTTTAAGAGAATTTAGAGGATACAAAGGAAAG
GCTGTTTCGTAATGCTAATTACTGAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTGGATCAAAA
TAAGATGCAGCAGCTCAAGAGCAGGAAAAGGGTGAAATAAATTGGCTTATTCTTATTATG
AGCCGTCTAAAATCTTTGTACACAGACTTGAAATGTTTTTATTTGAAATCTCGAGGCTTG
TTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2E064TF U 1
AF RR2E064JQ C 449
BS 1 596 RR2E064TF
BS 597 783 RR2E064JQ

RD RR2E064TF 596 0 0
GGAGAACCACCGATGCTAATCCTCATCTTCCTCCTCTTTACCTCCGGCGCCCAAATTGCT
ACCGCTAATGAGCCGGTCCCGGCGCCATGGCCACACCAATTTCACGCGCTACTGTTCATG
AATTACTCGGGAGACCTCTCGATGATTGACCTTTGGTATGACTGGCCCAACGGTCGTAAT
TTCAATATCATACAGGAGCAGCTCGGTGGCATCACCTACGACCTCGAATGGAACAACGGC
ACGTCCTTCGTTTACACCCTCGACGACTCAAAATCGTGCCGTTCTGCTCAACTTGAGGTT
GGAATCTTGCGACCAAACTGGCTAGATGGAGCCAAGTATCAAGGCCAACAACTTGTGAAT
GGGTTTCATTGCAATGTATGGGAGAAAGTAGACTTTATAAGGTACTATGAGGATGTCGAA
ACCAAGAGACCCGTTCAATGGATCTTCTATACAGGGAGGGAGGCTCATGTGGTGACATTC
GAGGTTGGCGCAGTACTTGAGGATGAGAAATGGCAAGCGCCGGTTTATTGTTTCAACAAA
GAGAAGAAGAGTTTATCAACTGAAGGAGCTTTAAGAGAATTTAGAGGATACAAAGG

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2E064JQ 335 0 0
ATACAGGGAGGGAGGCTCATGTGGTGACATTCGAGGTTGGCGCAGTACTTGAGGATGAGA
AATGGCAAGCGCCGGTTTATTGTTTCAACAAAGAGAAGAAGAGTTTATCAACTGAAGGAG
CTTTAAGAGAATTTAGAGGATACAAAGGAAAGGCTGTTTCGTAATGCTAATTACTGAGAG
CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTGGATCAAAATAAGATGCAGCAGCTCAAGAGCAGGAAA
AGGGTGAAATAAATTGGCTTATTCTTATTATGAGCCGTCTAAAATCTTTGTACACAGACT
TGAAATGTTTTTATTTGAAATCTCGAGGCTTGTTC

QA 1 335 1 335
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3990Contig1 372 2 4 U
GGAAACCCTCAGAGATCCATCGCCGGAGAAGACAACAAGAGAAGCTAAACGAAGAAGAAG
ATGATATACCGAAAGTGGAGTCTGCTTTCCGGTCCACCGGTAATCCTCGGAGCAGCTGTA
GTTGCCGGGATCGCGGTCGGCATCGTCTTACAGAACGTTACGAAAGGAGAGCAGAAGAAG
AATGTTGAAAACAAGTGAAATGGATGCTACGATAGACTGTGGTGTTTGTTAATCGTGTGA
GTTGAGAAAACATTTTAGTTCATGGATTGTGTTGTAAGCTTAATATAATGCTTTTTTTGG
AAGCTTTTGAATACACTTGTATCTTTTTTTTCAGTTTCTTGTTACTAATAATGATAAATT
CATTTCTCACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2E695TF U 1
AF RR2CU81TF U 35
BS 1 141 RR2E695TF
BS 142 142 RR2CU81TF
BS 143 370 RR2E695TF
BS 371 372 RR2CU81TF

RD RR2E695TF 370 0 0
GGAAACCCTCAGAGATCCATCGCCGGAGAAGACAACAAGAGAAGCTAAACGAAGAAGAAG
ATGATATACCGAAAGTGGAGTCTGCTTTCCGGTCCACCGGTAATCCTCGGAGCAGCTGTA
GTTGCCGGGATCGCGGTCGGCGTCGTCTTACAGAACGTTACGAAAGGAGAGCAGAAGAAG
AATGTTGAAAACAAGTGAAATGGATGCTACGATAGACTGTGGTGTTTGTTAATCGTGTGA
GTTGAGAAAACATTTTAGTTCATGGATTGTGTTGTAAGCTTAATATAATGCTTTTTTTGG
AAGCTTTTGAATACACTTGTATCTTTTTTTTCAGTTTCTTGTTACTAATAATGATAAATT
CATTTCTCAC

QA 1 370 1 370
DS 

RD RR2CU81TF 338 0 0
GG
AAGAGAAGCTAAACGAAGAAGAAGATGATATACCGAAAGTGGAGTCTGCTTTCCGGTCCA
CCGGTAATCCTCGGAGCAGCTGTAGTTGCCGGGATCGCGGTCGGCATCGTCTTACAGAAC
GTTACGAAAGGAGAGCAGAAGAAGAATGTTGAAAACAAGTGAAATGGATGCTACGATAGA
CTGTGGTGTTTGTTAATCGTGTGAGTTGAGAAAACATTTTAGTTCATGGATTGTGTTGTA
AGCTTAATATAATGCTTTTTTTGGAAGCTTTTGAATACACTTGTATCTTTTTTTTCAGTT
TCTTGTTACTAATAATGATAAATTCATTTCTCACTC

QA 3 338 3 338
DS 



AS 1 2

CO CL3991Contig1 463 2 1 U
GGGCGCTGCGATCTCTCTCTCTCTCCCTCAGATTCCCTTATCTTGTGGATTACTTTCTCT
GAGAAGATGTTGACGGAAACACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCTTCTGGAGAAGCAGAGG
TTGTTCCAGAGCATCCAGAGGCACACTTACTTGAAAGGACCAATGGACAAGGTCACCTCT
GTTGCCATTCCTCTTGCCTTGGCTACATCTGCTCTCTACATGATTGGAACAGGAATCTAC
AACATGTCCAACGGAATTGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGGCTTCTTCTTTTCGTTTTT
TTAATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCATATCAGACTGTAGTTTG
CACTGGTCTTTGTGATTCCGTTTTGCCAAATAATAAGTTTGCTTAGTCGCAAGACAATGT
CGAAAAGCTGAAAGATGTTTGATGTGAAAAAAGTTTCAACGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BB36JQ C 1
AF RR2BB36TF U 1
BS 1 463 RR2BB36TF

RD RR2BB36JQ 463 0 0
GGGCGCTGCGATCTCTCTCTCTCTCCCTCAGATTCCCTTATCTTGTGGATTACTTTCTCT
GAGAAGATGTTGACGGAAACACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCTTCTGGAGAAGCAGAGG
TTGTTCCAGAGCATCCAGAGGCACACTTACTTGAAAGGACCAATGGACAAGGTCACCTCT
GTTGCCATTCCTCTTGCCTTGGCTACATCTGCTCTCTACATGATTGGAACAGGAATCTAC
AACATGTCCAACGGAATTGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGGCTTCTTCTTTTCGTTTTT
TTAATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCATATCAGACTGTAGTTTG
CACTGGTCTTTGTGATTCCGTTTTGCCAAATAATAAGTTTGCTTAGTCGCAAGACAATGT
CGAAAAGCTGAAAGATGTTTGATGTGAAAAAAGTTTCAACGTC

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2BB36TF 463 0 0
GGGCGCTGCGATCTCTCTCTCTCTCCCTCAGATTCCCTTATCTTGTGGATTACTTTCTCT
GAGAAGATGTTGACGGAAACACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCTTCTGGAGAAGCAGAGG
TTGTTCCAGAGCATCCAGAGGCACACTTACTTGAAAGGACCAATGGACAAGGTCACCTCT
GTTGCCATTCCTCTTGCCTTGGCTACATCTGCTCTCTACATGATTGGAACAGGAATCTAC
AACATGTCCAACGGAATTGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGGCTTCTTCTTTTCGTTTTT
TTAATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTATCCAGTGGCTGCCATATCAGACTGTAGTTTG
CACTGGTCTTTGTGATTCCGTTTTGCCAAATAATAAGTTTGCTTAGTCGCAAGACAATGT
CGAAAAGCTGAAAGATGTTTGATGTGAAAAAAGTTTCAACGTC

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 2

CO CL3992Contig1 621 2 3 U
TTTTTTTAAAGGGCCAAATAAATTCCCTACCAATAATCAATGTTTTTAACAAGTGCCCTT
AACTAATTCCCTTAACACAACATTTATAATAAAATATGTCTAAGGCCCAAATTTTTGGGA
CACCTATAATGATGCTCTAAGGGAATTGTACTCTACATGTGAATTTTTGAAATATGATCT
AAATAAAATAACAAAAATCTTTGGCGCATACGATTCTTTTCTGCTCTATGCGATGGATTC
TCATGATTGCGTCCTCTTCCATAGTCAGAGTCCACCATGGATCGTTAAAAAAACGTTCAA
ACCAACTCCTCCAGCTTTCAAAAACATAAGCAAACGTATTTTCTGTTTGGTTTCATTGAA
ATCATGTAAAACCTTTTCTCTTGCTTTCTGAGCCAGCATTCCATCAAACCTAAAAAACTC
AATTTCTCTTCTTGTGCTAAGTAAACTCAATTCATGTGAAGCTCAGACAGAAGAAGTTGA
GAATTCACTGTGATTGTATAAACGCTTACAAAGAGAAAAAAAATTGAAAGCAAAAAGAGA
CTTCTCCAGAAGCTTGTTTGGGTTTGCAAGAATTTGGTTACAAAGAGAGGGAGGTTGGAC
GGATGAGAAAGCGTTGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW91JQ U 8
AF RR2BW91TF C 1
BS 1 7 RR2BW91TF
BS 8 454 RR2BW91JQ
BS 455 621 RR2BW91TF

RD RR2BW91JQ 447 0 0
AAAGGGCCAAATAAATTCCCTACCAATAATCAATGTTTTTAACAAGTGCCCTTAACTAAT
TCCCTTAACACAACATTTATAATAAAATATGTCTAAGGCCCAAATTTTTGGGACACCTAT
AATGATGCTCTAAGGGAATTGTACTCTACATGTGAATTTTTGAAATATGATCTAAATAAA
ATAACAAAAATCTTTGGCGCATACGATTCTTTTCTGCTCTATGCGATGGATTCTCATGAT
TGCGTCCTCTTCCATAGTCAGAGTCCACCATGGATCGTTAAAAAAACGTTCAAACCAACT
CCTCCAGCTTTCAAAAACATAAGCAAACGTATTTTCTGTTTGGTTTCATTGAAATCATGT
AAAACCTTTTCTCTTGCTTTCTGAGCCAGCATTCCATCAAACCTAAAAAACTCAATTTCT
CTTCTTGTGCTAAGTAAACTCAATTCA

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR2BW91TF 621 0 0
TTTTTTTAAAGGGCCAAATAAATTCCCTACCAATAATCAATGTTTT*AACAAGTGCCCTT
AACTAATTCCCTTAACACAACATTTATAATAAAATATGTCTAAGGCCCAAATTTTTGGGA
CACCTATAATGATGCTCTAAGGGAATTGTACTCTACATGTGAATTTTTGAAATATGATCT
AAATAAAATAACAGAAATCTTTGGCGCATACGATTCTTTTCTGCTCTATGCGATGGATTC
TCATGATTGCGTCCTCTTCCATAGTCAGAGTCCACCATGGATCGTTAAGAAGACGTTCAG
ACCAACTCCTCCAGCTTTCAGAGACATAAGCAGACGTATTTTCTGTTTGGTTTCATTGAA
ATCATGTAAGACCTTTTCTCTTGCTTTCTGAGCCAGCATTCCATCAAACCTAAGAAACTC
AATTTCTCTTCTTGTGCTAAGTAAACTCAATTCATGTGAAGCTCAGACAGAAGAAGTTGA
GAATTCACTGTGATTGTATAAACGCTTACAAAGAGAAAAAAAATTGAAAGCAAAAAGAGA
CTTCTCCAGAAGCTTGTTTGGGTTTGCAAGAATTTGGTTACAAAGAGAGGGAGGTTGGAC
GGATGAGAAAGCGTTGGATCC

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

CO CL3993Contig1 666 2 2 U
GGATTCAGTCTCTAAACATACAGACTGTGTTCTGCCCTTCCGACAGCGCGGTGGGAAAGT
TCGCGCCGAAGTTCAAGGCCTTATCCGCGGCGAACAAGACGGCGCTGGTGTTGTACCACG
GCATGCCGGTTTACCAGTCGTTGCAGATGCTTAGATCGGGTAACGGCGCCGTTAACGCGT
TGGCGACTGAAGGTAACAACAAGTTTGACTTCACGGTTCAGAACGACGGGGAGGAAGTGA
CGCTCGAGACGGACGTCGTGACGGCGAAGTTAACGGGGACGTTGAAGGATCAGGAGCCGT
TGATTGTTTACAAGATTGATAAAGTCTTGTTGCCGAGAGAGATCTATAAGGCCGTTAAGG
CGTCGTCGGCTCCAGCACCTAAGTCGAGTAAGCACAAGCCTAAGAACGCGAAGGCTGACG
GACCAAGCGCCGATGCTCCGTCAAGTGATGACGGTGTGGTCGCTGATGACACAAACGGTG
CCGTGTCGGTTACACGAAGCAGTGTTATTGTGACGGCGATTGTGGGGCTCTGTTTTGGAG
TTTGGCTCATGTGATGTTGTTGTTGGGTTACATGTGGTTGGGAATCTTGATTTTCTTGTT
TTTGATCTTTTATTGATTTTCTTGTCGGACAATGAATTCAATCATTAAATTCACATCACT
TTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK77TF U 1
AF RR2GK77JQ C 83
BS 1 469 RR2GK77TF
BS 470 666 RR2GK77JQ

RD RR2GK77TF 469 0 0
GGATTCAGTCTCTAAACATACAGACTGTGTTCTGCCCTTCCGACAGCGCGGTGGGAAAGT
TCGCGCCGAAGTTCAAGGCCTTATCCGCGGCGAACAAGACGGCGCTGGTGTTGTACCACG
GCATGCCGGTTTACCAGTCGTTGCAGATGCTTAGATCGGGTAACGGCGCCGTTAACGCGT
TGGCGACTGAAGGTAACAACAAGTTTGACTTCACGGTTCAGAACGACGGGGAGGAAGTGA
CGCTCGAGACGGACGTCGTGACGGCGAAGTTAACGGGGACGTTGAAGGATCAGGAGCCGT
TGATTGTTTACAAGATTGATAAAGTCTTGTTGCCGAGAGAGATCTATAAGGCCGTTAAGG
CGTCGTCGGCTCCAGCACCTAAGTCGAGTAAGCACAAGCCTAAGAACGCGAAGGCTGACG
GACCAAGCGCCGATGCTCCGTCAAGTGATGACGGTGTGGTCGCTGATGA

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR2GK77JQ 584 0 0
ATCCGCGGCGAACAAGACGGCGCTGGTGTTGTACCACGGCATGCCGGTTTACCAGTCGTT
GCAGATGCTTAGATCGGGTAACGGCGCCGTTAACGCGTTGGCGACTGAAGGTAACAACAA
GTTTGACTTCACGGTTCAGAACGACGGGGAGGAAGTGACGCTCGAGACGGACGTCGTGAC
GGCGAAGTTAACGGGGACGTTGAAGGATCAGGAGCCGTTGATTGTTTACAAGATTGATAA
AGTCTTGTTGCCGAGAGAGATCTATAAGGCCGTTAAGGCGTCGTCGGCTCCAGCACCTAA
GTCGAGTAAGCACAAGCCTAAGAACGCGAAGGCTGACGGACCAAGCGCCGATGCTCCGTC
AAGTGATGACGGTGTGGTCGCTGATGACACAAACGGTGCCGTGTCGGTTACACGAAGCAG
TGTTATTGTGACGGCGATTGTGGGGCTCTGTTTTGGAGTTTGGCTCATGTGATGTTGTTG
TTGGGTTACATGTGGTTGGGAATCTTGATTTTCTTGTTTTTGATCTTTTATTGATTTTCT
TGTCGGACAATGAATTCAATCATTAAATTCACATCACTTTATTT

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL3994Contig1 695 2 1 U
GGATCAAAGTTTCCTTCGAACCACCAGTCTTCTGAAGGAACCAGCAGAGTCGAGTCGCCT
AGCTCAATAAAAGGGGAAGAATCAGATGACAAGTCAACGGATAATAATGATTGTGTCCCA
GGTGTCTTGTACGATTTGCTGCAGAAAGAGGTGATAACATTAAGAAAAGCTGCTCATGAG
AAAGATCAAAGCCTGAGAGACAAGGATGATGCTATTGAGATGTTGGCGAAGAAGGTTGAA
ACATTAACAAAGGCGATGGAAGTTGAGGCAAAGAAGATGAGAAGAGAAGTAGCTGTAATG
GGAAAAGAAGTTGCTGCCATGCGTGTCGATAAAGGACATCAAGATAGCAAAACCAGACGT
ATCTCTTCCATCTCTAAAGGATCTTCAAACACTGCTCAACTTCTTTCTGGAAGAGTGTCT
GGACGAATTGGGATGACAAAGAGCACATAATAACAAGCTCAATCAATTCGATCAATAACC
GGTTGATCCCTGTTCTTGTACCAAATTGATGAACCATCACTAGGAAGAGGGGTTGGATGT
GAAAGCTGTAAGAGAAAAAACCGGTTTGGTTCGGTGTAAAAAGAAATTGGCTTTATATAT
TTGCCTGATAATTTTCTTATTTTGTTGTGTTGGTGTAAGAGGTAAGGCTTTTGTATTATG
TAACATTTTAAGCTTTCAGTGTGTGATTGTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FT70TF U 1
AF RR2FT70JQ C 36
BS 1 695 RR2FT70TF

RD RR2FT70TF 695 0 0
GGATCAAAGTTTCCTTCGAACCACCAGTCTTCTGAAGGAACCAGCAGAGTCGAGTCGCCT
AGCTCAATAAAAGGGGAAGAATCAGATGACAAGTCAACGGATAATAATGATTGTGTCCCA
GGTGTCTTGTACGATTTGCTGCAGAAAGAGGTGATAACATTAAGAAAAGCTGCTCATGAG
AAAGATCAAAGCCTGAGAGACAAGGATGATGCTATTGAGATGTTGGCGAAGAAGGTTGAA
ACATTAACAAAGGCGATGGAAGTTGAGGCAAAGAAGATGAGAAGAGAAGTAGCTGTAATG
GGAAAAGAAGTTGCTGCCATGCGTGTCGATAAAGGACATCAAGATAGCAAAACCAGACGT
ATCTCTTCCATCTCTAAAGGATCTTCAAACACTGCTCAACTTCTTTCTGGAAGAGTGTCT
GGACGAATTGGGATGACAAAGAGCACATAATAACAAGCTCAATCAATTCGATCAATAACC
GGTTGATCCCTGTTCTTGTACCAAATTGATGAACCATCACTAGGAAGAGGGGTTGGATGT
GAAAGCTGTAAGAGAAAAAACCGGTTTGGTTCGGTGTAAAAAGAAATTGGCTTTATATAT
TTGCCTGATAATTTTCTTATTTTGTTGTGTTGGTGTAAGAGGTAAGGCTTTTGTATTATG
TAACATTTTAAGCTTTCAGTGTGTGATTGTTTGTC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2FT70JQ 660 0 0
AGGAACCAGCAGAGTCGAGTCGCCTAGCTCAATAAAAGGGGAAGAATCAGATGACAAGTC
AACGGATAATAATGATTGTGTCCCAGGTGTCTTGTACGATTTGCTGCAGAAAGAGGTGAT
AACATTAAGAAAAGCTGCTCATGAGAAAGATCAAAGCCTGAGAGACAAGGATGATGCTAT
TGAGATGTTGGCGAAGAAGGTTGAAACATTAACAAAGGCGATGGAAGTTGAGGCAAAGAA
GATGAGAAGAGAAGTAGCTGTAATGGGAAAAGAAGTTGCTGCCATGCGTGTCGATAAAGG
ACATCAAGATAGCAAAACCAGACGTATTTCTTCCATCTCTAAAGGATCTTCAAACACTGC
TCAACTTCTTTCTGGAAGAGTGTCTGGACGAATTGGGATGACAAAGAGCACATAATAACA
AGCTCAATCAATTCGATCAATAACCGGTTGATCCCTGTTCTTGTACCAAATTGATGAACC
ATCACTAGGAAGAGGGGTTGGATGTGAAAGCTGTAAGAGAAAAAACCGGTTTGGTTCGGT
GTAAAAAGAAATTGGCTTTATATATTTGCCTGATAATTTTCTTATTTTGTTGTGTTGGTG
TAAGAGGTAAGGCTTTTGTATTATGTAACATTTTAAGCTTTCAGTGTGTGATTGTTTGTC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL3995Contig1 451 2 1 U
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGATTCTTGCCTCTGCATTACCTCTGCTTCTTTCT
TTCTCCTTTTATCTGTGAACAGAGAAGAAAAGAGAGTCTTCTTTCAACTTCTGGGTAGTT
GAGTCTACAAACAGTTCTAGCTGGAAAAATTAATTGAAGAAAGAGAAAGAGAGAGAGATA
CACAATCTTTAAGAGGCTGTAACGAATTACCCACAATCCAGGAAACCCTGATAAATATTT
CCCGGGAAAGTTTCGGTGTATCATGAGAATCTTGTCTCCATACCTTCTAATAAAGTTGAT
CTCTTAAATTTTTCCCTGTAGAAATCTGTCGAATTTTCGTTTTTTGTTCCATTAATAGAT
CAACAACCAATCTTTACAACCAACAACAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GE26JQ C 1
AF RR2GE26TF U 1
BS 1 451 RR2GE26TF

RD RR2GE26JQ 451 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGATTCTTGCCTCTGCATTACCTCTGCTTCTTTCT
TTCTCCTTTTATCTGTGAACAGAGAAGAAAAGAGAGTCTTCTTTCAACTTCTGGGTAGTT
GAGTCTACAAACAGTTCTAGCTGGAAAAATTAATTGAAGAAAGAGAAAGAGAGAGAGATA
CACAATCTTTAAGAGGCTGTAACGAATTACCCACAATCCAGGAAACCCTGATAAATATTT
CCCGGGAAAGTTTCGGTGTATCATGAGAATCTTGTCTCCATACCTTCTAATAAAGTTGAT
CTCTTAAATTTTTCCCTGTAGAAATCTGTCGAATTTTCGTTTTTTGTTCCATTAATAGAT
CAACAACCAATCTTTACAACCAACAACAACC

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR2GE26TF 451 0 0
GGAGAAACTATTAGTAATAGAAACATGGAAATATTAAGTAATAAGTGTACTGAAAATAAG
ATTACAATCAATAAATCTTAAAAGGGGATTCTTGCCTCTGCATTACCTCTGCTTCTTTCT
TTCTCCTTTTATCTGTGAACAGAGAAGAAAAGAGAGTCTTCTTTCAACTTCTGGGTAGTT
GAGTCTACAAACAGTTCTAGCTGGAAAAATTAATTGAAGAAAGAGAAAGAGAGAGAGATA
CACAATCTTTAAGAGGCTGTAACGAATTACCCACAATCCAGGAAACCCTGATAAATATTT
CCCGGGAAAGTTTCGGTGTATCATGAGAATCTTGTCTCCATACCTTCTAATAAAGTTGAT
CTCTTAAATTTTTCCCTGTAGAAATCTGTCGAATTTTCGTTTTTTGTTCCATTAATAGAT
CAACAACCAATCTTTACAACCAACAACAACC

QA 1 451 1 451
DS 



AS 1 2

CO CL3996Contig1 1119 2 6 U
GTCTGAGGAAACGTCCCAGAGAAGAATCAGCCGCAGTTAACCATTTACCGAGACAGAGAC
ATTGCACCGATTCTCTCATGTTTCTAGGCCAAGACTTGTCTTCTAACGTCCAACATCACA
ACTTCGATATCGACCGCTTGGTCTCTCATCACGTTGAGATAATGAGAATGGAGATTGAAC
AGAAGAGAAAAGCGCAAGGTAGGAAGATAATTGAAGTCATTGAACAAGGGTTGATGAAGA
CATTGAGAGCAAAAGACGAAGAGATCAATCACATCGGAAAACTAAACCTCTTTCTTGAAG
AGAAAGTTAAGTCTCTCTGCGTAGAGAATCAGATATGGCGTGACATGGCTCAGACTAATG
AAGCCACGGTGAACTCCCTACGTTCAAACTTACAACAAGTCCTCGCAGCCGTGGAACGTA
ACAAGTGGGAGGAGCCCACGGCGGCTGATGACGCGCAGTCTTGTTGTGGAAGCAACGACG
AGGGTGATAGTGACGAGCGGTGGAGGTTAGCACGAGAGGCTACAAGCGTGCGTACGATCG
CAAGCACGATGTGTAGAGGGTGCGGAAAAGGAGAAGCAAGAGGGATCATCAGTTTTATGT
AAGGTCTGTGAGATGGCTGTTGTCTGGGTTGAAACACGACTGAAACAGAAAGAAACCAAA
GAGAAAGTGTTTGAAGACCTGAACAAGCTTTGTGAGCGCTTTCCTAGTCCCGCAGGAGAG
TCAATCATCGACTGCAATAACATCCAAAACATGCCAAATGTTACATTCACAATTGGAGGC
AACCCTTTCTCTTTTACCCCTCAACAGTACATTCTCAAAATTGGAGTAGGCTATGCTGAG
ACGTGCATAAGTGGGTTTTCAGCATGCGATTTGCCTCCACCGACCGGTCCTCTTTGGATT
CTTGGGGATGTCTTTATGGGAGCTTACCACACGGTATTCGATTCAGGCAATCTTCAAATT
GGTATTGCAGAAGCCGCATAAGTTTATGTACACCAGTTTATCTATGTAAGTACATTGTGT
TTTATAAATGACTCACGTACTGTCTCTACTAGAACTTTAAACATATTCTAGATCCTAGTG
TATATTTGTTTCATCACTCTTTAGACGTAATATTGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ69TF U 1
AF RR2GJ69JQB C 415
BS 1 570 RR2GJ69TF
BS 571 571 RR2GJ69JQB
BS 572 603 RR2GJ69TF
BS 604 604 RR2GJ69JQB
BS 605 623 RR2GJ69TF
BS 624 1119 RR2GJ69JQB

RD RR2GJ69TF 623 0 0
GTCTGAGGAAACGTCCCAGAGAAGAATCAGCCGCAGTTAACCATTTACCGAGACAGAGAC
ATTGCACCGATTCTCTCATGTTTCTAGGCCAAGACTTGTCTTCTAACGTCCAACATCACA
ACTTCGATATCGACCGCTTGGTCTCTCATCACGTTGAGATAATGAGAATGGAGATTGAAC
AGAAGAGAAAAGCGCAAGGTAGGAAGATAATTGAAGTCATTGAACAAGGGTTGATGAAGA
CATTGAGAGCAAAAGACGAAGAGATCAATCACATCGGAAAACTAAACCTCTTTCTTGAAG
AGAAAGTTAAGTCTCTCTGCGTAGAGAATCAGATATGGCGTGACATGGCTCAGACTAATG
AAGCCACGGTGAACTCCCTACGTTCAAACTTACAACAAGTCCTCGCAGCCGTGGAACGTA
ACAAGTGGGAGGAGCCCACGGCGGCTGATGACGCGCAGTCTTGTTGTGGAAGCAACGACG
AGGGTGATAGTGACGAGCGGTGGAGGTTAGCACGAGAGGCTACAAGCGTGCGTACGATCG
CAAGCACGATGTGTAGAGGGTGCGGAAAAG*AGAAGCAAGAGGGATCATCAGTTTTATGT
AAG*TCTGTGAGATGGCTGTTGT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2GJ69JQB 705 0 0
AACGTAACAAGTGGGAGGAGCCCACGGCGGCTGATGACGCGCAGTCTTGTTGTGGAAGCA
ACGACGAGGGTGATAGTGACGAGCGGTGGAGGTTAGCAGGAGAGGCTACAAGCGTGCGTA
CGATCGCAAGCACGATGTGTAGAGGGTGCGGAAAAGGAGAAGCAAGAGGGATCATCAGTT
TTATGTAAGGTCTGTGAGATGGCTGTTGTCTGGGTTGAAACACGACTGAAACAGAAAGAA
ACCAAAGAGAAAGTGTTTGAAGACCTGAACAAGCTTTGTGAGCGCTTTCCTAGTCCCGCA
GGAGAGTCAATCATCGACTGCAATAACATCCAAAACATGCCAAATGTTACATTCACAATT
GGAGGCAACCCTTTCTCTTTTACCCCTCAACAGTACATTCTCAAAATTGGAGTAGGCTAT
GCTGAGACGTGCATAAGTGGGTTTTCAGCATGCGATTTGCCTCCACCGACCGGTCCTCTT
TGGATTCTTGGGGATGTCTTTATGGGAGCTTACCACACGGTATTCGATTCAGGCAATCTT
CAAATTGGTATTGCAGAAGCCGCATAAGTTTATGTACACCAGTTTATCTATGTAAGTACA
TTGTGTTTTATAAATGACTCACGTACTGTCTCTACTAGAACTTTAAACATATTCTAGATC
CTAGTGTATATTTGTTTCATCACTCTTTAGACGTAATATTGCTAC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL3997Contig1 717 2 2 U
GGGGAGCTTGAGGATCTTGAGGACGACAAGGATCTCGACGACGATCGCTTCCTCGAAGAA
TACAGGAAGAAGAGGTTAACAGAGCTGAGAGAAGCTGCTAAAGTTAGGAGGTATGGAACA
GTGACTCCCATCTCGAGCTCTGACTTCGTGCGGGAGGTTACACAAGCTTCTGCTGAAGTT
TGGGTTGTTCTCTGTCTCTACAAAGATGGTTTTGCGGAGTGTGGGTTGCTACTGGGTTGT
CTAGATGAATTGGCTGGCAGATACCCAGGAACGAAGTTTGTTAAGATTATATCCACTGAT
TGTATTCCAAACTACCCTGATTGCAATCTTCCTACCTTGCTGGCGTACCATCATGGGGCC
GTTAAAGGAACCCATGTTGGCTTGAAGAGTGTTGGCCGTAGGTGCACCCCAGAAAGTGTA
GCCTTAGTTTTGTGTCAGTCGGAGCCAGTACTTAACGATGGCAAAAGTGGAGATGATGAC
TCTTCGAGGGAAGCTGTGATGGCTGGAGTTCGAAGACAGTTCATAGAACGAGTGGTGAAA
GACCATGAAGATAAGGATAATGACGATGATGGTTACAATAGCGATTAGATAACTCTTAAA
GCTTCTCTATTTTTTCTCTGTTTGTTATGCTTGTTGCGGTTTTCTGACTGGTAAACACAA
AAGTGTTTTGACTTCATTGTGTTGTAATGCTTTCTCAAAGGCCTTCTTGTTATTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C232JQ C 1
AF RR2C232TF U 1
BS 1 696 RR2C232TF
BS 697 717 RR2C232JQ

RD RR2C232JQ 717 0 0
GGGGAGCTTGAGGATCTTGAGGACGACAAGGATCTCGACGACGATCGCTTCCTCGAAGAA
TACAGGAAGAAGAGGTTAACAGAGCTGAGAGAAGCTGCTAAAGTTAGGAGGTATGGAACA
GTGACTCCCATCTCGAGCTCTGACTTCGTGCGGGAGGTTACACAAGCTTCTGCTGAAGTT
TGGGTTGTTCTCTGTCTCTACAAAGATGGTTTTGCGGAGTGTGGGTTGCTACTGGGTTGT
CTAGATGAATTGGCTGGCAGATACCCAGGAACGAAGTTTGTTAAGATTATATCCACTGAT
TGTATTCCAAACTACCCTGATTGCAATCTTCCTACCTTGCTGGCGTACCATCATGGGGCC
GTTAAAGGAACCCATGTTGGCTTGAAGAGTGTTGGCCGTAGGTGCACCCCAGAAAGTGTA
GCCTTAGTTTTGTGTCAGTCGGAGCCAGTACTTAACGATGGCAAAAGTGGAGATGATGAC
TCTTCGAGGGAAGCTGTGATGGCTGGAGTTCGAAGACAGTTCATAGAACGAGTGGTGAAA
GACCATGAAGATAAGGATAATGACGATGATGGTTACAATAGCGATTAGATAACTCTTAAA
GCTTCTCTATTTTTTCTCTGTTTGTTATGCTTGTTGCGGTTTTCTGACTGGTAAACACAA
AAGTGTTTTGACTTCATTGTGTTGTAATGCTTTCTCAAAGGCCTTCTTGTTATTTTT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2C232TF 696 0 0
GGGGAGCTTGAGGATCTTGAGGACGACAAGGATCTCGACGACGATCGCTTCCTCGAAGAA
TACAGGAAGAAGAGGTTAACAGAGCTGAGAGAAGCTGCTAAAGTTAGGAGGTATGGAACA
GTGACTCCCATCTCGAGCTCTGACTTCGTGCGGGAGGTTACACAAGCTTCTGCTGAAGTT
TGGGTTGTTCTCTGTCTCTACAAAGATGGTTTTGCGGAGTGTGGGTTGCTACTGGGTTGT
CTAGATGAATTGGCTGGCAGATACCCAGGAACGAAGTTTGTTAAGATTATATCCACTGAT
TGTATTCCAAACTACCCTGATTGCAATCTTCCTACCTTGCTGGCGTACCATCATGGGGCC
GTTAAAGGAACCCATGTTGGCTTGAAGAGTGTTGGCCGTAGGTGCACCCCAGAAAGTGTA
GCCTTAGTTTTGTGTCAGTCGGAGCCAGTACTTAACGATGGCAAAAGTGGAGATGATGAC
TCTTCGAGGGAAGCTGTGATGGCTGGAGTTCGAAGACAGTTCATAGAACGAGTGGTGAAA
GACCATGAAGATAAGGATAATGACGATGATGGTTACAATAGCGATTAGATAACTCTTAAA
GCTTCTCTATTTTTTCTCTGTTTGTTATGCTTGTTGCGGTTTTCTGACTGGTAAACACAA
AAGTGTTTTGACTTCATTGTGTTGTAATGCTTTCTC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3999Contig1 657 2 2 U
GGATCAAACAATTCTTGTCTTGCAAATTTCTTCTAAACCTCTTGCAAAAAAAGTTCGCAT
CTTTGATAGAAGAAGAAGATAATGGCTCGTACGAAGCAAACCGCTAGAAAGTCCACCGGA
GGAAAGGCTCCCAGGAAGCAGCTCGCCACCAAGGCGGCGAGGAAGTCGGCACCGACCACC
GGAGGAGTGAAGAAGCCTCATCGTTACCGTCCCGGAACCGTCGCTCTTCGTGAGATTAGA
AAGTACCAGAAGAGTACTGAGCTGTTGATCCGCAAGCTTCCTTTCCAGCGTCTGGTTCGT
GAGATTGCTCAGGACTTCAAGACGGATCTGAGGTTTCAGAGCCACGCTGTTTTAGCTCTT
CAGGAGGCGGCGGAGGCTTATCTCGTGGGTCTGTTCGAGGATACTAACCTCTGTGCCATT
CACGCTAAGAGGGTTACCATCATGCCCAAGGATATTCAATTGGCCAGAAGGATTCGTGGA
GAACGTGCTTAAGATGAAGTTTTCTCCTCTAATTCAGTTTAGATTATGATTAGTTACTTT
TTTCCCTTTCGTTTATTTCTCTTCAAAGGACATGTTAAATCTTCAACAGCTTTTTTTTTT
AACAATCAAAACAATGATATAAATCTCTCATTATCAATGAAAGCTTCTTTGTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF63TF U 1
AF RR2EF63JQ C 87
BS 1 543 RR2EF63TF
BS 544 657 RR2EF63JQ

RD RR2EF63TF 543 0 0
GGATCAAACAATTCTTGTCTTGCAAATTTCTTCTAAACCTCTTGCAAAAAAAGTTCGCAT
CTTTGATAGAAGAAGAAGATAATGGCTCGTACGAAGCAAACCGCTAGAAAGTCCACCGGA
GGAAAGGCTCCCAGGAAGCAGCTCGCCACCAAGGCGGCGAGGAAGTCGGCACCGACCACC
GGAGGAGTGAAGAAGCCTCATCGTTACCGTCCCGGAACCGTCGCTCTTCGTGAGATTAGA
AAGTACCAGAAGAGTACTGAGCTGTTGATCCGCAAGCTTCCTTTCCAGCGTCTGGTTCGT
GAGATTGCTCAGGACTTCAAGACGGATCTGAGGTTTCAGAGCCACGCTGTTTTAGCTCTT
CAGGAGGCGGCGGAGGCTTATCTCGTGGGTCTGTTCGAGGATACTAACCTCTGTGCCATT
CACGCTAAGAGGGTTACCATCATGCCCAAGGATATTCAATTGGCCAGAAGGATTCGTGGA
GAACGTGCTTAAGATGAAGTTTTCTCCTCTAATTCAGTTTAGATTATGATTAGTTACTTT
TTT

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2EF63JQ 571 0 0
TCGTACGAAGCAAACCGCTAGAAAGTCCACCGGAGGAAAGGCTCCCAGGAAGCAGCTCGC
CACCAAGGCGGCGAGGAAGTCGGCACCGACCACCGGAGGAGTGAAGAAGCCTCATCGTTA
CCGTCCCGGAACCGTCGCTTTTCGTGAGATTAGAAAGTACCAGAAGAGTACTGAGCTGTT
GATCCGCAAGCTTCCTTTCCAGCGTCTGGTTCGTGAGATTGCTCAGGACTTCAAGACGGA
TCTGAGGTTTCAGAGCCACGCTGTTTTAGCTCTTCAGGAGGCGGCGGAGGCTTATCTCGT
GGGTCTGTTCGAGGATACTAACCTCTGTGCCATTCACGCTAAGAGGGTTACCATCATGCC
CAAGGATATTCAATTGGCCAGAAGGATTCGTGGAGAACGTGCTTAAGATGAAGTTTTCTC
CTCTAATTCAGTTTAGATTATGATTAGTTACTTTTTTCCCTTTCGTTTATTTCTCTTCAA
AGGACATGTTAAATCTTCAACAGCTTTTTTTTTTAACAATCAAAACAATGATATAAATCT
CTCATTATCAATGAAAGCTTCTTTGTTTACC

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

CO CL4000Contig1 625 2 3 U
TTTTTTGGACAATGGAAAAGGATAATATATTAGGTAGCTTGCGATACAAGTCAAACATAT
ACATACATATTGAAAAAGAATCAGCCAAAGAAGCTAGGATCATAGCCATTGCTAGAGGTG
GCCAAGACGTAGTAAGCAACGATGTGACCAATAGAACCCCAAGCAAGAACATCCACGATG
TTGAACCCAACTGGATCGTTCGACTTCAAGAGGCTAACGTATTCCTTGGCACGATCATCT
CCGGCTTCAAAGTGGGTTTTACCGTTCTGCTCCGGCACCTGTTTGGCCACGTTCTCACTC
TGGAGGTTGAAGAAGACGAACCGGCCTAGGAAGAGGGAGAGACCGGTGCTGAGGCTTATG
ACCACGGATGGGCTGAGCTCGGCTTTCACGACGGGGGAAGAGGAAGATCTTCTCCCAGAG
GTGGTGGATGGTTTGGGTAAGGCGGAGGAGGAACCACCGAGGCGGAGGGGACGGAGGCCG
TGGAAGGAGATGGAGTTTGGGTTTTGGTGGGAGAATGCGGCGGTGGTTGCGGGTGTGAGG
AAAGCAGATGCGCTTGTCGCCATGTTATCTTCTTCTTGTTCTTCTTCTTTGGAGAGAATG
AGTGGTTTTGGATTTATGATCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E129JQ U 7
AF RR2E129TF C 1
BS 1 6 RR2E129TF
BS 7 437 RR2E129JQ
BS 438 625 RR2E129TF

RD RR2E129JQ 431 0 0
GGACAATGGAAAAGGATAATATATTAGGTAGCTTGCGATACAAGTCAAACATATACATAC
ATATTGAAAAAGAATCAGCCAAAGAAGCTAGGATCATAGCCATTGCTAGAGGTGGCCAAG
ACGTAGTAAGCAACGATGTGACCAATAGAACCCCAAGCAAGAACATCCACGATGTTGAAC
CCAACTGGATCGTTCGACTTCAAGAGGCTAACGTATTCCTTGGCACGATCATCTCCGGCT
TCAAAGTGGGTTTTACCGTTCTGCTCCGGCACCTGTTTGGCCACGTTCTCACTCTGGAGG
TTGAAGAAGACGAACCGGCCTAGGAAGAGGGAGAGACCGGTGCTGAGGCTTATGACCACG
GATGGGCTGAGCTCGGCTTTCACGACGGGGGAAGAGGAAGATCTTCTCCCAGAGGTGGTG
GATGGTTTGGG

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR2E129TF 625 0 0
TTTTTTGGACAATGGAAAAGGATAATATATTAGGTAGCTTGCGATACAAGTCAAACATAT
ACATACATATTGAAAAAGAATCAGCCAAAGAAGCTAGGATCATAGCCATTGCTAGAGGTG
GCCAAGACGTAGTAAGCAACGATGTGACCAATAGAACCCCAAGCAAGAACATCCACGATG
TTGAACCCAACTGGATCGTTCGACTTCAAGAGGCTAACGTATTCCTTGGCACGATCATCT
CCGGCTTCAAAGTGGGTTTTACCGTTCTGCTCCGGCACCTGTTTGGCCACGTTCTCACTC
TGGAGGTTGAAGAAGACGAACCGGCCTAGGAAGAGGGAGAGACCGGTGCTGAGGCTTATG
ACCACGGATGGGCTGAGCTCGGCTTTCACGACGGGGGAAGAGGAAGATCTTCTCCCAGAG
GTGGTGGATGGTTTGGGTAAGGCGGAGGAGGAACCACCGAGGCGGAGGGGACGGAGGCCG
TGGAAGGAGATGGAGTTTGGGTTTTGGTGGGAGAATGCGGCGGTGGTTGCGGGTGTGAGG
AAAGCAGATGCGCTTGTCGCCATGTTATCTTCTTCTTGTTCTTCTTCTTTGGAGAGAATG
AGTGGTTTTGGATTTATGATCTTCC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL4001Contig1 839 2 8 U
GGACACAACCAGATCATGCCTGGTACACTAAGCTGGAGCAGTGTTTAACGCCTTTGCCGG
AAGTAACAGGAACTGAGATCAAAGAAGTAGCGGGTGGGAAGTTGGCGAGATGGCCTGAGA
GATTGAATGCAGTTCCACCGAGGATCAAGAGTGGGAGTTTGCAAGGGATCACTGTGGATG
ACTTTGTCACCAACACAGAGACATGGCAGAGGAGAGTGTCTTACTACAAGAGCTTCGACC
AACAGCTAGCGGAGACAGGAAGGTACAGAAACTTACTTGACATGAATGCTTACCTTGGGG
GTTTCGCTTCAGCCCTGGTCGATGATCCTGTATGGGTCATGAACATTGTCCCCGTGGAGG
CCAGTGTCAACACCCTTGGAGTTATCTATGAACGAGGCTTGATCGGAACGTATCAAAACT
GGTGTGAAGCGATGTCAACTTACCCAAGGACGTACGACTTCATACATGCCGACTCGGTGT
TCAGTCTGTACAAAGACAGATGTGACATGGAAGACATCTTGTTAGAAATGGACAGAATAC
TAAGACCAAAGGGAAGCGTGATCATAAGAGACGACATAGATGTGTTAACAAAAGTGAAGA
AGATAACAGATGGGATGCAATGGGAAGGGAGAATAGGAGATCATGAGAAGGGACCTCTTG
AAAGGTAGAAGGTCTTGTTTCTTGTCAAGGAGTACTGGACGGCGCCTGCACCTGATCAGT
AATCAGAAAGCTATAGATATAATTTAGACCTTTGTACTATCTCCCTTCTGTTTTTTTTTT
TGCTTTTAAAATATTTTGTACACAATCAAAAGACTTTTGGGCGAGAATGAAGAAACAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR45TF U 1
AF RR2FR45JQ C 90
BS 1 671 RR2FR45TF
BS 672 672 RR2FR45JQ
BS 673 701 RR2FR45TF
BS 702 702 RR2FR45JQ
BS 703 749 RR2FR45TF
BS 750 750 RR2FR45JQ
BS 751 774 RR2FR45TF
BS 775 839 RR2FR45JQ

RD RR2FR45TF 774 0 0
GGACACAACCAGATCATGCCTGGTACACTAAGCTGGAGCAGTGTTTAACGCCTTTGCCGG
AAGTAACAGGAACTGAGATCAAAGAAGTAGCGGGTGGGAAGTTGGCGAGATGGCCTGAGA
GATTGAATGCAGTTCCACCGAGGATCAAGAGTGGGAGTTTGCAAGGGATCACTGTGGATG
ACTTTGTCACCAACACAGAGACATGGCAGAGGAGAGTGTCTTACTACAAGAGCTTCGACC
AACAGCTAGCGGAGACAGGAAGGTACAGAAACTTACTTGACATGAATGCTTACCTTGGGG
GTTTCGCTTCAGCCCTGGTCGATGATCCTGTATGGGTCATGAACATTGTCCCCGTGGAGG
CCAGTGTCAACACCCTTGGAGTTATCTATGAACGAGGCTTGATCGGAACGTATCAAAACT
GGTGTGAAGCGATGTCAACTTACCCAAGGACGTACGACTTCATACATGCCGACTCGGTGT
TCAGTCTGTACAAAGACAGATGTGACATGGAAGACATCTTGTTAGAAATGGACAGAATAC
TAAGACCAAAGGGAAGCGTGATCATAAGAGACGACATAGATGTGTTAACAAAAGTGAAGA
AGATAACAGATGGGATGCAATGGGAAGGGAGAATAGGAGATCATGAGAAGGGACCTCTTG
AAAGGTAGAAG*TCTTGTTTCTTGTCAAGGAGTACTGGACG*CGCCTGCACCTGATCAGT
AATCAGAAAGCTATAGATATAATTTAGAC*TTTGTACTATCTCCCTTCTGTTTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2FR45JQ 750 0 0
GCGGGTGGGAAGTTGGCGAGATGGC*TGAGAGATTGAATGCAGTTCCACCGAGGATCAAG
AGTGGGAGTTTGCAAGGGATCACTGTGGATGACTTTGTCACCAACACAGAGACATGGCAG
AGGAGAGTGTCTTACTACAAGAGCTTCGACCAACAGCTAGCGGAGACAGGAAGGTACAGA
AACTTACTTGACATGAATGCTTACCTTGGGGGTTTCGCTTCAGCCCTGGTCGATGATCCT
GTATGGGTCATGAACATTGTCCCCGTGGAGGCCAGTGTCAACACCCTTGGAGTTATCTAT
GAACGAGGCTTGATCGGAACGTATCAAAACTGGTGTGAAGCGATGTCAACTTACCCAAGG
ACGTACGACTTCATACATGCCGACTCGGTGTTCAGTCTGTACAAAGACAGATGTGACATG
GAAGACATCTTGTTAGAAATGGACAGAATACTAAGACCAAAGGGAAGCGTGATCATAAGA
GACGACATAGATGTGTTAACAAAAGTGAAGAAGATAACAGATGGGATGCAATGGGAAGGG
AGAATAGGAGATCATGAGAAGGGACCTCTTGAAAGGTAGAAGGTCTTGTTTCTTGTCAAG
GAGTACTGGACGGCGCCTGCACCTGATCAGTAATCAGAAAGCTATAGATATAATTTAGAC
CTTTGTACTATCTCCCTTCTGTTTTTTTTTTTGCTTTTAAAATATTTTGTACACAATCAA
AAGACTTTTGGGCGAGAATGAAGAAACAAA

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL4002Contig1 452 2 1 U
GGAAGAACCCAACAACTATAATAGTACAAAAAAAAAGAAAAGAAAAATGGAGGCAGGGAA
TACACCACCCTCTTACAACGACGACTGACTATTGCAGATTGTTAGTCCAACTGCACACCT
GACCAGGGGTTTTGTCACTGTTGAAATGTTCAACAGAAAAGGAGAGCTGGTTGTATCGTT
AACGCAAGAGGCTTTGATCTATGCATCATATAGAACCATGGTTTCAAGCAAGTTTCTGTT
CTGGAACTGTGTATTTGGGACTATCCGACACCTAACTTTATTTTCTTTATCTGTTTTCAT
ATGCACTATTATTCAATGGACGCTATTTTTTATGTATTCTATTAGGTTTCATAAAAAGAA
AGACAAGACCAAAATTCTTAATTTAGAGTCATAGTTAGTTTGTATGTTTTAAATATTAAG
TTTTGGTAATGATTTATTTAAAAAGTTTGTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EC27JQ C 1
AF RR2EC27TF U 1
BS 1 452 RR2EC27TF

RD RR2EC27JQ 452 0 0
GGAAGAACCCAACAACTATAATAGTACAAAAAAAAAGAAAAGAAAAATGGAGGCAGGGAA
TACACCACCCTCTTACAACGACGACTGACTATTGCAGATTGTTAGTCCAACTGCACACCT
GACCAGGGGTTTTGTCACTGTTGAAATGTTCAACAGAAAAGGAGAGCTGGTTGTATCGTT
AACGCAAGAGGCTTTGATCTATGCATCATATAGAACCATGGTTTCAAGCAAGTTTCTGTT
CTGGAACTGTGTATTTGGGACTATCCGACACCTAACTTTATTTTCTTTATCTGTTTTCAT
ATGCACTATTATTCAATGGACGCTATTTTTTATGTATTCTATTAGGTTTCATAAAAAGAA
AGACAAGACCAAAATTCTTAATTTAGAGTCATAGTTAGTTTGTATGTTTTAAATATTAAG
TTTTGGTAATGATTTATTTAAAAAGTTTGTTG

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2EC27TF 452 0 0
GGAAGAACCCAACAACTATAATAGTACAAAAAAAAAGAAAAGAAAAATGGAGGCAGGGAA
TACACCACCCTCTTACAACGACGACTGACTATTGCAGATTGTTAGTCCAACTGCACACCT
GACCAGGGGTTTTGTCACTGTTGAAATGTTCAACAGAAAAGGAGAGCTGGTTGTATCGTT
AACGCAAGAGGCTTTGATCTATGCATCATATAGAACCATGGTTTCAAGCAAGTTTCTGTT
CTGGAACTGTGTATTTGGGACTATCCGACACCTAACTTTATTTTCTTTATCTGTTTTCAT
ATGCACTATTATTCAATGGACGCTATTTTTTATGTATTCTATTAGGTTTCATAAAAAGAA
AGACAAGACCAAAATTCTTAATTTAGAGTCATAGTTAGTTTGTATGTTTTAAATATTAAG
TTTTGGTAATGATTTATTTAAAAAGTTTGTTG

QA 1 452 1 452
DS 



AS 1 2

CO CL4003Contig1 516 2 2 U
GGGGAGGAGTCACACTGAGAAACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAT
CAGGAGAATGGCGACGGCGATAATACGTTCAGCTCTATCCCGAGCAGCTACCCGCTCAAC
TCCGAGGACATCCCTTGCTCCAAAGCGGAGATTTTCATCTTCTGCCGGCCTTGACGATGC
TTTCGAAGCTAGAAAGTGGGAGAGCATAACATACGGGGGCATTTTTAGTTGCACTCTTCT
TGCCGCCTATGTTTTGTCCAAGGGTCATCTTCACGGCGACGATCCTCCTGCGTATCCTTA
TATGCACATCCGTAACAAGGAGTTTCCTTGGGGTCCAGACGGTCTGTTTGAGGTGAAGCA
CAACGATGGGCACTGAGATTTTGCGTCTTTACAATGCTTATCGTCTTTGTTTTATAACTT
TGTTAGCTATTTGGTATTCCAATCCTCCTTTCATGTGCTGGGAATTAAGAATGCTACTTT
TTTTTGTCATCATTAAAGACTCTTGTCTTTTCTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV86TF U 1
AF RR2BY69TF U 27
BS 1 488 RR2BV86TF
BS 489 516 RR2BY69TF

RD RR2BV86TF 488 0 0
GGGGAGGAGTCACACTGAGAAACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAT
CAGGAGAATGGCGACGGCGATAATACGTTCAGCTCTATCCCGAGCAGCTACCCGCTCAAC
TCCGAGGACATCCCTTGCTCCAAAGCGGAGATTTTCATCTTCTGCCGGCCTTGACGATGC
TTTCGAAGCTAGAAAGTGGGAGAGCATAACATACGGGGGCATTTTTAGTTGCACTCTTCT
TGCCGCCTATGTTTTGTCCAAGGGTCATCTTCACGGCGACGATCCTCCTGCGTATCCTTA
TATGCACATCCGTAACAAGGAGTTTCCTTGGGGTCCAGACGGTCTGTTTGAGGTGAAGCA
CAACGATGGGCACTGAGATTTTGCGTCTTTACAATGCTTATCGTCTTTGTTTTATAACTT
TGTTAGCTATTTGGTATTCCAATCCTCCTTTCATGTGCTGGGAATTAAGAATGCTACTTT
TTTTTGTC

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2BY69TF 490 0 0
G
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCAGGAGAATGGCGACGGCGATAATACG
TTCGGCTCTATCCCGAGCAGCTATCCGCTCAACTCCGAGGACATCCCTTGCTCCAAAGCG
GAGATTTTCATCTTCTGCCGGCCTTGACGATGCTTTCGAAGCTAGAAAGTGGGAGAGCAT
AACATACGGGGGCATTTTTAGTTGCACTCTTCTTGCCGCCTATGTTTTGTCCAAGGGTCA
TCTTCACGGCGACGATCCTCCTGCGTATCCTTATATGCACATCCGTAACAAGGAGTTTCC
TTGGGGTCCAGACGGTCTGTTTGAGGTGAAGCACAACGATGGGCACTGAGATTTTGCGTC
TTTACAATGCTTATCGTCTTTGTTTTATAACTTTGTTAGCTATTTGGTATTCCAATCCTC
CTTTCATGTGCTGGGAATTAAGAATGCTACTTTTTTTTGTCATCATTAAAGACTCTTGTC
TTTTCTTCG

QA 2 490 2 490
DS 



AS 1 2

CO CL4004Contig1 848 2 2 U
ATGGTGCAACAAAAGATGAGCTTTCCCACATAAATCCACTTGCCAAGTTTCTAACCTTCA
AGTCCATCGTGTTTATGACTTGGTGGCAGGGTGTTGCCATTGCTCTTCTCTCTTCCCTCG
GTTTGTTCAAAAGTTCCATTGCACAGAGCTTGCAGCTCAAGACTAGTGTTCAAGATTTCA
TCATTTGCATTGAGATGGGTATTGCTTCGGTTGTTCACCTGTATGTATTCCCAGCAAAAC
CTTACGGTCTACTGGGAGATCGCTTTACTGGATCTGTATCAGTTCTCGGGGACTATGCAT
CCGTGGACTGCCCTATTGATCCCGATGAGATTAGGGACAGTGAGAGACGAACAAAAGTCC
GTCTTCCACATCCTAACGTTGATATCAGAAGTGGTATGACCATCAAAGAAAGCATGAGAG
ATGTTTTCGTTGGTGGTGGTGAATACATTGTTAAAGACGTGAGGTTCACAGTGACTCAAG
CAGTCGAGCCTATGGAGAAGAGCATCACAAAGTTTAATGAGAAACTGCACAAGATCTCTC
AGAACATAAAGAAACACGACAAGGACAAGAGAAGAGTTAAAGATGACTCTTGCATGTCAT
CATCATCTAGTCGGCGAGTGATTCGCGGGATCGATGATCCGCTTTTAAATGGGAGTTTTA
GTGACAGCGGAGTTACTAGGACCAAAAAGCACCGCCGCAAATCAGGTTACACCAGCGCCG
AAAGCGGGGGAGAGAGCAGTAGTGATCAAGCTTATAGTGGCTTTGAAGTAAGGGGTCGTA
GATGGATCACAAAAGATTAACATTCATTCAAGGAGAGAGACCATTCTACATTAAAGCTCA
GGTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C446TF U 1
AF RR2C446JQ C 153
BS 1 609 RR2C446TF
BS 610 848 RR2C446JQ

RD RR2C446TF 609 0 0
ATGGTGCAACAAAAGATGAGCTTTCCCACATAAATCCACTTGCCAAGTTTCTAACCTTCA
AGTCCATCGTGTTTATGACTTGGTGGCAGGGTGTTGCCATTGCTCTTCTCTCTTCCCTCG
GTTTGTTCAAAAGTTCCATTGCACAGAGCTTGCAGCTCAAGACTAGTGTTCAAGATTTCA
TCATTTGCATTGAGATGGGTATTGCTTCGGTTGTTCACCTGTATGTATTCCCAGCAAAAC
CTTACGGTCTACTGGGAGATCGCTTTACTGGATCTGTATCAGTTCTCGGGGACTATGCAT
CCGTGGACTGCCCTATTGATCCCGATGAGATTAGGGACAGTGAGAGACGAACAAAAGTCC
GTCTTCCACATCCTAACGTTGATATCAGAAGTGGTATGACCATCAAAGAAAGCATGAGAG
ATGTTTTCGTTGGTGGTGGTGAATACATTGTTAAAGACGTGAGGTTCACAGTGACTCAAG
CAGTCGAGCCTATGGAGAAGAGCATCACAAAGTTTAATGAGAAACTGCACAAGATCTCTC
AGAACATAAAGAAACACGACAAGGACAAGAGAAGAGTTAAAGATGACTCTTGCATGTCAT
CATCATCTA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2C446JQ 696 0 0
CAGCTCAAGACTAGTGTTCAAGATTTCATCATTTGCATTGAGATGGGTATTGCTTCGGTT
GTTCACCTGTATGTATTCCCAGCAAAACCTTACGGTCTACTGGGAGATCGCTTTACTGGA
TCTGTATCAGTTCTCGGGGACTATGCATCCGTGGACTGCCCTATTGATCCCGATGAGATT
AGGGACAGTGAGAGACGAACAAAAGTCCGTCTTCCACATCCTAACGTTGATATCAGAAGT
GGTATGACCATCAAAGAAAGCATGAGAGATGTTTTCGTTGGTGGTGGTGAATACATTGTT
AAAGACGTGAGGTTCACAGTGACTCAAGCAGTCGAGCCTATGGAGAAGAGCATCACAAAG
TTTAATGAGAAACTGCACAAGATCTCTCAGAACATAAAGAAACACGACAAGGACAAGAGA
AGAGTTAAGGATGACTCTTGCATGTCATCATCATCTAGTCGGCGAGTGATTCGCGGGATC
GATGATCCGCTTTTAAATGGGAGTTTTAGTGACAGCGGAGTTACTAGGACCAAAAAGCAC
CGCCGCAAATCAGGTTACACCAGCGCCGAAAGCGGGGGAGAGAGCAGTAGTGATCAAGCT
TATAGTGGCTTTGAAGTAAGGGGTCGTAGATGGATCACAAAAGATTAACATTCATTCAAG
GAGAGAGACCATTCTACATTAAAGCTCAGGTGTTTG

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL4005Contig1 824 2 2 U
GCTCTGTGTCTGAGCCCTCTGTCACGCTTGCTTCACCTCCTCCGACGGTTGACCTTTTTG
CGTCCAGTGAACCAGTTGCATCCCCAGAAGCCAAGATTCCTAAACCTGAGTCTATGACCA
CTCCCAACATTGTTGACCCATTTGCTGCAGTTCCTATGCAAAGTTTTGATGGATCTGATC
CTTTTGGTGCCTTCACTTCTGGTCCACAGGCCCCAGTTGTAACAAACACAACAACCCCTG
TATCTTTGGCAGACTCGAAACCACAACAGTTGCAAAAGAAAGATCCTTTCCAGGTGAAAT
CGGGAATATGGGCAGATTCTCTGAGCCGTGGACTAATTGATCTCAATATAACTGCTCCCA
AAAAAAGCTTCCCTTGCTGATGTGGGGGTTGTGGGTGGTCTGAGCAATGACGAAGGGAAC
AAGGCATCTGCTGCTGCGTACTACTCAGGATGGTCCATGGGCGCAGGATCCGGGCTCGGT
AAAACCGGACTATACAGTGCACAGCAGCAGCAACAACCACAACAACAAACACCTGAGATC
TCAGATGATTTCTTCTCCAGCCTCAGTCACCAAAGGTACTAAACTGGAGGCTTTAAGCAG
TGACTTTGTCTGGGGTTATCACGTTTGATTCTACATTCATACCGGAAGTCAGTGTTCTTA
TTCTCAATGGGAGTTTGTTGTTCTTGCTCTTGATTGATGGGACAATTTGATCTGTGGCTT
GCGTTTTAAATAAGATAATTGTTTATGGGAAGAGAGTATTATTTGTTGGTTTGAATTTTC
TATTTGTTCATAGAACAACAAATTATATGTATTTCATTCGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H202TF U 1
AF RR2F945JQ C 245
BS 1 732 RR2H202TF
BS 733 824 RR2F945JQ

RD RR2H202TF 732 0 0
GCTCTGTGTCTGAGCCCTCTGTCACGCTTGCTTCACCTCCTCCGACGGTTGACCTTTTTG
CGTCCAGTGAACCAGTTGCATCCCCAGAAGCCAAGATTCCTAAACCTGAGTCTATGACCA
CTCCCAACATTGTTGACCCATTTGCTGCAGTTCCTATGCAAAGTTTTGATGGATCTGATC
CTTTTGGTGCCTTCACTTCTGGTCCACAGGCCCCAGTTGTAACAAACACAACAACCCCTG
TATCTTTGGCAGACTCGAAACCACAACAGTTGCAAAAGAAAGATCCTTTCCAGGTGAAAT
CGGGAATATGGGCAGATTCTCTGAGCCGTGGACTAATTGATCTCAATATAACTGCTCCCA
AAAAAAGCTTCCCTTGCTGATGTGGGGGTTGTGGGTGGTCTGAGCAATGACGAAGGGAAC
AAGGCATCTGCTGCTGCGTACTACTCAGGATGGTCCATGGGCGCAGGATCCGGGCTCGGT
AAAACCGGACTATACAGTGCACAGCAGCAGCAACAACCACAACAACAAACACCTGAGATC
TCAGATGATTTCTTCTCCAGCCTCAGTCACCAAAGGTACTAAACTGGAGGCTTTAAGCAG
TGACTTTGTCTGGGGTTATCACGTTTGATTCTACATTCATACCGGAAGTCAGTGTTCTTA
TTCTCAATGGGAGTTTGTTGTTCTTGCTCTTGATTGATGGGACAATTTGATCTGTGGCTT
GCGTTTTAAATA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2F945JQ 580 0 0
TTTGGCAGACTCGAAACCACAACAGTTGCAAAAGAAAGATCCTTTCCAGGTGAAATCGGG
AATATGGGCAGATTTTCTGAGCCGTGGACTAATTGATCTCAATATAACTGCTCCCAAAAA
A*GCTTCCCTTGTTGATGTGGGGGTTGTGGGTGGTCTGAGCAATGACGAAGGGAACAAGG
CATCTGCTGCTGCGTACTACTCAGGATGGTCCATGGGCGCAGGATCCGGGCTCGGTAAAA
CCGGACTATACAGTGCACAGCAGCAGCAACAACCACAACAACAAACACCTGAGATTTCAG
ATGATTTTTTCTCCAGCCTCAGTCACCAAAGGTACTAAACTGGAGGCTTTAAGCAGTGAC
TTTGTCTGGGGTTATCACGTTTGATTCTACATTCATACTGGAAGTCAGTGTTTTTATTCT
CAATGGGAGTTTGTTGTTCTTGCTCTTGATTGATGGGACAATTTGATCTGTGGCTTGCGT
TTTAAATAAGATAATTGTTTATGGGAAGAGAGTATTATTTGTTGGTTTGAATTTTCTATT
TGTTCATAGAACAACAAATTATATGTATTTCATTCGACCC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 2

CO CL4006Contig1 868 2 2 U
GGGGAAAAAAGGAAGAAAAAATAAAACGCTCAGTATCTCCGGCTAGTTGAAACCAGACCT
CGAGATCAAATTAGGGCACAAAGCCCTGTCGGAGACAGAAACTATGGGGAGGAAGAAACT
TGAAATCAAGCGAATTGAGAACAAAAGTAGCCGACAAGTTACCTTCTCCAAACGACGCAA
CGGTCTCATCGAGAAAGCTCGCCAGCTTTCCATTCTCTGTGACGCATCCGTCGCTCTCCT
TGTCGTCTCCGCCTCCGGAAAACTCTACAGCTTCTCCTCCGGTGATAACCTGGTCAAGAT
CCTTGATCGCTATGGAAAGCAACATGATGATGATCTTAAAGCCTTGGAGCGTCAGTCAAA
TCCTCTGAACTGTGGTTCACACCATGAGCTACTGGAACTTGTGGAAAGCAAGCTTGAGGA
ATCAAATGTCGATAATGTAAGTGTCGGTTCCCTCGTTCAGCTGGAGGAACAACTTGAGAA
CGCCCTCTCCGTAACAAGAGCTAGGAAGACAGAACTAATGTTGAAGCTTGTCGAGAACCT
TAAAGAAAAGGAGAAATTGCTGGAGGAGGAGAACCATGTTTTGGCTAGCCAGGGAAGATT
ACATCATTCGGGGAACCTAAACCAAGATGAAGCTTTTAGGCTCGTAGAGAAAGCTATTTG
CAGATGGGAGAAGAATAATCTTGTGAGAGCTGAAGCTGATAATATGGAGGTGTCACCTGG
ACAAATCTCCGACATCAATCTTCCGGTAACTCTCCCACTGCTTAATTAGTCCCCTTTATT
AATTGGTGGATAAATAAAATCCAAAACATATAATTTAAAAAAAGAAGATGTGTAGTTATC
CCCTTGTAAAGGGTGTACGTTGTATAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A936TF U 1
AF RR2A936JQ C 242
BS 1 705 RR2A936TF
BS 706 868 RR2A936JQ

RD RR2A936TF 705 0 0
GGGGAAAAAAGGAAGAAAAAATAAAACGCTCAGTATCTCCGGCTAGTTGAAACCAGACCT
CGAGATCAAATTAGGGCACAAAGCCCTGTCGGAGACAGAAACTATGGGGAGGAAGAAACT
TGAAATCAAGCGAATTGAGAACAAAAGTAGCCGACAAGTTACCTTCTCCAAACGACGCAA
CGGTCTCATCGAGAAAGCTCGCCAGCTTTCCATTCTCTGTGACGCATCCGTCGCTCTCCT
TGTCGTCTCCGCCTCCGGAAAACTCTACAGCTTCTCCTCCGGTGATAACCTGGTCAAGAT
CCTTGATCGCTATGGAAAGCAACATGATGATGATCTTAAAGCCTTGGAGCGTCAGTCAAA
TCCTCTGAACTGTGGTTCACACCATGAGCTACTGGAACTTGTGGAAAGCAAGCTTGAGGA
ATCAAATGTCGATAATGTAAGTGTCGGTTCCCTCGTTCAGCTGGAGGAACAACTTGAGAA
CGCCCTCTCCGTAACAAGAGCTAGGAAGACAGAACTAATGTTGAAGCTTGTCGAGAACCT
TAAAGAAAAGGAGAAATTGCTGGAGGAGGAGAACCATGTTTTGGCTAGCCAGGGAAGATT
ACATCATTCGGGGAACCTAAACCAAGATGAAGCTTTTAGGCTCGTAGAGAAAGCTATTTG
CAGATGGGAGAAGAATAATCTTGTGAGAGCTGAAGCTGATAATAT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2A936JQ 627 0 0
GTCGTCTCCGCCTCCGGAAAACTCTACAGCTTCTCCTCCGGTGATAACCTGGTCAAGATC
CTTGATCGCTATGGAAAGCAACATGATGATGATCTTAAAGCCTTGGAGCGTCAGTCAAAT
CCTCTGAACTGTGGTTCACACCATGAGCTACTGGAACTTGTGGAAAGCAAGCTTGAGGAA
TCAAATGTCGATAATGTAAGTGTCGGTTCCCTCGTTCAGCTGGAGGAACAACTTGAGAAC
GCCCTCTCCGTAACAAGAGCTAGGAAGACAGAACTAATGTTGAAGCTTGTCGAGAACCTT
AAAGAAAAGGAGAAATTGCTGGAGGAGGAGAACCATGTTTTGGCTAGCCAGGGAAGATTA
CATCATTCGGGGAACCTAAACCAAGATGAAGCTTTTAGGCTCGTAGAGAAAGCTATTTGC
AGATGG*AGAAGAATAATCTTGTGAGAGCTGAAGCTGATAATATGGAGGTGTCACCTGGA
CAAATCTCCGACATCAATCTTCCGGTAACTCTCCCACTGCTTAATTAGTCCCCTTTATTA
ATTGGTGGATAAATAAAATCCAAAACATATAATTTAAAAAAAGAAGATGTGTAGTTATCC
CCTTGTAAAGGGTGTACGTTGTATAAT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL4007Contig1 1061 2 14 U
GGATCCACATTTCACATTTCATACACAAACACTCAACTCTCATTCTCACAACAATGACAG
GCAGAGAAATTCTCCACAAGATGAAGTTGAAGGCTGGATTCTGCGGATCTGAAACGGGCA
GAGGTAAAAGCAGGACATGGAAAAACATCTCCCACGGTTTTCACTTTGTCAAGGGCAAAG
CTAACCATCCCATGGAGGACTACGTTGTGTCTGAGTTCAAAAAAGTGGACAACCACGATT
TGGGTTTGTTTGCCATCTTTGATGGTCACTTGGGACATGACGTGGCCAAGTACTTGCAGA
CCAACCTCTTTGACAACATACTCAAAGAGAAGGATTTTTGGACTGATATGGAGAAGGCTA
TAAGGGATGCATACATATCAACAGATGCTTCCATATTAGAGCAGTCACTTAAACTTGGCA
AAGGTGGATCAACTGCTGTGACTGGAATTCTGATAGATGGGCAAAAGCTAATAGTTGCTA
ACGTTGGAGACTCACGGGCAGTCATGTCAAAGAATGGTGTTGCATCTCAGCTCTCTGTTG
ATCATGAACCAAGCAAGGAGCAGAAGGAAATAGAGAGCCGTGGCGGCTTTGTATCCAATA
TTCCAGGGGACGTTCCAAGAGTTGATGGACAACTAGCGGTTGCGAGGGCGTTTGGAGATA
AGAGCTTAAAGATACATCTGAGCTCAGAACCAGACATAACACACCAGACCATCCATGATG
AGACCGAGTTCATTGTTTTTGCCAGTGATGGAATTTGGAAGGTGATGTCAAACCAAGAAG
CTGTGGACGCGATCAGAAGCATAAAAGATCCCCATGAGGCAGCCAAGGAGTTGATAGAAG
AAGCAATCTCTAGGAAAAGCAAAGATGACATCTCCTGTATCGTTGTAAGATTCAAGTGAT
GATGTTATGGCTATAAATTAATCAATCAAGTGTCTTAAGAGAGAAACAAAGACATGTAAA
AGCTCAAGCTATATGTGCTATATATGCGACCAATATAAAGTCTGGTCTCTTGTAAAACCA
TTGATGATAAAATCTCGCCAAAATGTAAAAGAATTTCGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E570TF U 1
AF RR2E570JQ C 335
BS 1 566 RR2E570TF
BS 567 567 RR2E570JQ
BS 568 597 RR2E570TF
BS 598 598 RR2E570JQ
BS 599 608 RR2E570TF
BS 609 609 RR2E570JQ
BS 610 652 RR2E570TF
BS 653 653 RR2E570JQ
BS 654 660 RR2E570TF
BS 661 661 RR2E570JQ
BS 662 666 RR2E570TF
BS 667 667 RR2E570JQ
BS 668 685 RR2E570TF
BS 686 1061 RR2E570JQ

RD RR2E570TF 685 0 0
GGATCCACATTTCACATTTCATACACAAACACTCAACTCTCATTCTCACAACAATGACAG
GCAGAGAAATTCTCCACAAGATGAAGTTGAAGGCTGGATTCTGCGGATCTGAAACGGGCA
GAGGTAAAAGCAGGACATGGAAAAACATCTCCCACGGTTTTCACTTTGTCAAGGGCAAAG
CTAACCATCCCATGGAGGACTACGTTGTGTCTGAGTTCAAAAAAGTGGACAACCACGATT
TGGGTTTGTTTGCCATCTTTGATGGTCACTTGGGACATGACGTGGCCAAGTACTTGCAGA
CCAACCTCTTTGACAACATACTCAAAGAGAAGGATTTTTGGACTGATATGGAGAAGGCTA
TAAGGGATGCATACATATCAACAGATGCTTCCATATTAGAGCAGTCACTTAAACTTGGCA
AAGGTGGATCAACTGCTGTGACTGGAATTCTGATAGATGGGCAAAAGCTAATAGTTGCTA
ACGTTGGAGACTCACGGGCAGTCATGTCAAAGAATGGTGTTGCATCTCAGCTCTCTGTTG
ATCATGAACCAAGCAAGGAGCAGAAG*AAATAGAGAGCCGTGGCGGCTTTGTATCCA*TA
TTCCAGGG*ACGTTCCAAGAGTTGATGGACAACTAGCGGTTGCGAGGGCGTT*GGAGATA
*GAGCT*AAAGATACATCTGAGCTC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2E570JQ 727 0 0
TTTTTGGACTGATATGGAGAAGGCTATAAGGGATGCATACATATCAACAGATGCTTCCAT
ATTAGAGCAGTCACTTAAACTTGGCAAAGGTGGATCAACTGCTGTGACTGGAATTCTGAT
AGATGGGCAAAAGCTAATAGTTGCTAACGTTGGAGACTCACGGGCAGTCATGTCAAAGAA
TGGTGTTGCATCTCAGCTCTCTGTTGATCATGAACCAAGCAAGGAGCAGAAGGAAATAGA
GAGCCGTGGCGGCTTTGTATCCAATATTCCAGGGGACGTTCCAAGAGTTGATGGACAACT
AGCGGTTGCGAGGGCGTTTGGAGATAAGAGCTTAAAGATACATCTGAGCTCAGAACCAGA
CATAACACACCAGACCATCCATGATGAGACCGAGTTCATTGTTTTTGCCAGTGATGGAAT
TTGGAAGGTGATGTCAAACCAAGAAGCTGTGGACGCGATCAGAAGCATAAAAGATCCCCA
TGAGGCAGCCAAGGAGTTGATAGAAGAAGCAATCTCTAGGAAAAGCAAAGATGACATCTC
CTGTATCGTTGTAAGATTCAAGTGATGATGTTATGGCTATAAATTAATCAATCAAGTGTC
TTAAGAGAGAAACAAAGACATGTAAAAGCTCAAGCTATATGTGCTATATATGCGACCAAT
ATAAAGTCTGGTCTCTTGTAAAACCATTGATGATAAAATCTCGCCAAAATGTAAAAGAAT
TTCGTGT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL4008Contig1 459 2 1 U
GGGCCGTCTTCAAAAACACTCGTGAGCTTTCCTCCTCCTTCGAGATCTCCATCAAACTTC
TGCTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCCTACTTGCTCGCCGCATTGAGCGGGAAAGCTTCCCC
AACCAGTGCCGATGTCAAGACCATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTCTCA
GATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTGAACGGGAAAGACTTGTGCGAACTGATCGCTGCTGG
TAGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGCGGTGGTGGTGTTGCCAAGAAGGAAGAGAAGAA
AGAAGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTTTTCGAGTAATGCTTTTC
CGCATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTCATTTTGTGTTAAACCCTTTGGAACCTCTGTTGTT
TTTTCTTAGTTCGTACCCGATGATGGCTATCTTTTTGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DQ91JQ C 1
AF RR2DQ91TF U 1
BS 1 459 RR2DQ91TF

RD RR2DQ91JQ 459 0 0
GGGCCGTCTTCAAAAACACTCGTGAGCTTTCCTCCTCCTTCGAGATCTCCATCAAACTTC
TGCTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCCTACTTGCTCGCCGCATTGAGCGGGAAAGCTTCCCC
AACCAGTGCCGATGTCAAGACCATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTCTCA
GATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTGAACGGGAAAGACTTGTGCGAACTGATCGCTGCTGG
TAGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGCGGTGGTGGTGTTGCCAAGAAGGAAGAGAAGAA
AGAAGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTTTTCGAGTAATGCTTTTC
CGCATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTCATTTTGTGTTAAACCCTTTGGAACCTCTGTTGTT
TTTTCTTAGTTCGTACCCGATGATGGCTATCTTTTTGAC

QA 1 459 1 459
DS 

RD RR2DQ91TF 459 0 0
GGGCCGTCTTCAAAAACACTCGTGAGCTTTCCTCCTCCTTCGAGATCTCCATCAAACTTC
TGCTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCCTACTTGCTCGCCGCATTGAGCGGGAAAGCTTCCCC
AACCAGTGCCGATGTCAAGACCATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTCTCA
GATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTGAACGGGAAAGACTTGTGCGAACTGATCGCTGCTGG
TAGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGCGGTGGTGGTGTTGCCAAGAAGGAAGAGAAGAA
AGAAGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTTTTCGAGTAATGCTTTTC
CGCATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTCATTTTGTGTTAAACCCTTTGGAACCTCTGTTGTT
TTTTCTTAGTTCGTACCCGATGATGGCTATCTTTTTGAC

QA 1 459 1 459
DS 



AS 1 2

CO CL4009Contig1 818 2 2 U
GATCTCAACCGGCTTTGGACCGAAACTCGACTGAAATCCACCACAAGATCACACTCCGTT
CCAAAACAAAGAAGTTTCATAGGAGAGTTTACATCAACAGAGGCACTAAGAAATGTTCTA
ATACTAGTGAAGATCCTCCTTGCACAGGATTTGTTGAAGGTATGGCTCCTGTGTTCTCAA
GAGCTGCTTGGTTTTGCACTTGGAACCTCATACAGAATGATTTGGTTCATGGATGGGGAA
TGGATATGAAACTAGGGTATTGTGCACAGGGAGATAGGAAGATGAAGGTAGGGATCGTGG
ATAGAGAGTACATATTTCATCAAGGCATCCAAACTTTAGGAGAAAGTGTACATCCTGAGA
AGAAGACCGCAGCTCGTGATGCTAGGACTAACAGACATGGCCATACAACGTTTGATTCGA
GAACCTCGATAAGGAGGCAGTCGACGTGGGAGCTTCAAAGATTTGAAGAGCGATGGAAAA
AAGCGGTGGAAGAAGACAAGAACTGGATCGATCCATTTTCATCATCGAGCAGGAAGACGA
AGAGCAAGAGCAACAGCGTTGGTAACAGAAGACTAATAAGGCGGGGTGGTAATAGTAATA
CTCAGCGCGTAAAGCATAAGAGAAGTCGAGAGACAGCAACAGCATAACACACCAACACAA
GTAGCAGCATGACGAAGACTTTTTATACACGAACGAGAGATGTGCTTACCTTTATTGTAA
TTAGTTTTATATTATTAACTCAGTTACTTAGGGAGCTTATTATAACCTTTTTAAAATTAA
AACTAAAAAAATGGTTTTATAAATTAATGCGATTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE42TF U 1
AF RR2EE42JQ C 173
BS 1 627 RR2EE42TF
BS 628 818 RR2EE42JQ

RD RR2EE42TF 627 0 0
GATCTCAACCGGCTTTGGACCGAAACTCGACTGAAATCCACCACAAGATCACACTCCGTT
CCAAAACAAAGAAGTTTCATAGGAGAGTTTACATCAACAGAGGCACTAAGAAATGTTCTA
ATACTAGTGAAGATCCTCCTTGCACAGGATTTGTTGAAGGTATGGCTCCTGTGTTCTCAA
GAGCTGCTTGGTTTTGCACTTGGAACCTCATACAGAATGATTTGGTTCATGGATGGGGAA
TGGATATGAAACTAGGGTATTGTGCACAGGGAGATAGGAAGATGAAGGTAGGGATCGTGG
ATAGAGAGTACATATTTCATCAAGGCATCCAAACTTTAGGAGAAAGTGTACATCCTGAGA
AGAAGACCGCAGCTCGTGATGCTAGGACTAACAGACATGGCCATACAACGTTTGATTCGA
GAACCTCGATAAGGAGGCAGTCGACGTGGGAGCTTCAAAGATTTGAAGAGCGATGGAAAA
AAGCGGTGGAAGAAGACAAGAACTGGATCGATCCATTTTCATCATCGAGCAGGAAGACGA
AGAGCAAGAGCAACAGCGTTGGTAACAGAAGACTAATAAGGCGGGGTGGTAATAGTAATA
CTCAGCGCGTAAAGCATAAGAGAAGTC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2EE42JQ 646 0 0
GTTCTCAAGAGCTGCTTGGTTTTGCACTTGGAACCTCATACAGAATGATTTGGTTCATGG
ATGGGGAATGGATATGAAACTAGGGTATTGTGCACAGGGAGATAGGAAGATGAAGGTAGG
GATCGTGGATAGAGAGTACATATTTCATCAAGGCATCCAAACTTTAGGAGAAAGTGTACA
TCCTGAGAAGAAGACCGCAGCTCGTGATGCTAGGACTAACAGACATGGCCATACAACGTT
TGATTCGAGAACCTCGATAAGGAGGCAGTCGACGTGGGAGCTTCAAAGATTTGAAGAGCG
ATGGAAAAAAGCGGTGGAAGAAGACAAGAACTGGATCGATCCATTTTCATCATCGAGCAG
GAAGACGAAGAGCAAGAGCAACAGCGTTGGTAACAGAAGACTAATAAGGCGGGGTGGTAA
TAGTAATACTCAGCGCGTAAAGCATAAGAGAAGTCGAGAGACAGCAACAGCATAACACAC
CAACACAAGTAGCAGCATGACGAAGACTTTTTATACACGAACGAGAGATGTGCTTACCTT
TATTGTAATTAGTTTTATATTATTAACTCAGTTACTTAGGGAGCTTATTATAACCTTTTT
AAAATTAAAACTAAAAAAATGGTTTTATAAATTAATGCGATTGGTC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL4010Contig1 1054 2 4 U
GGGAAGAAAGCAACAGCTTCCGACGTAACCCAGCTGCTCCAAAGGTTTTTGAGAACTCAT
GTGAACAGTGGTAGTGGTGGTGGGTTAGTAATCGAAGTGTTTCTACAGCAGCAATGAAGC
GGAGGGGAGATGATATTAACGCCTCTGTGTCTTCTCCTCTGGCCTCCTCTCGTGGCAAAT
CCAGTAGATCGGGGCTCACGATCCATGATGGCTTGTCCTACATGAAGTATGTTAAGAAGG
TGTTTCAAGATGAAAGAGATACAATTGATACGTTCCTTGTGATTCTGAGAGACTTTAGGA
ATCAAAGGACCGATCTACCTGACGTGGTTGCACGAGTGAAGGTGTTGTTCAAAGGGCATA
ACAATCTCATTTTGGGGTTTAATATCTTTTTGCCTGAGGGATTTAAAATAGCCCTTGATG
ATGATGAAGAAGCTCTACCACCAAATAAGAATATTGAGCAAGGCTTAGCTTTAATAAATA
ACATCAAGAAACGGTTCCAGCACCATGAAGATGTCCTTAAGTCTTTCTTGGAGATCTTGA
AATTGTATCTGTTTGATAAGGACATAGCTGAGGTTTACAATGGGGTATTAAAATTCTTTG
AGAACCACCCGGATTCGCTTGAAGGATTTTTTAGGTGTTTTTCAGTGTCTTTGGCGACTC
ATTCAGCAGCCCTGTTCAACCGGAGTCAGGCCCAACGCTGTGATGAACCAGGATCAGTCC
CTCCTCCTGTTGTTGCAGTAGTCAAGGATCCCCAACCAGATAAGGATGCTGATTCTCGGG
GTGACCCTGATCATAGTGTTCACCTTAATGTCGACGATGCACATAGAGCCGAGGAAAGGA
GTGGAGAAGGAGAGTATAGAGAAAGGAGTTGCCGTGATTTAGACGTTGGTGGAGAAGCAG
AAGAGGAAGGTGTTTTGCACCATTTTCCAAAGAAGAGAAAGTCATTTGAGAGTTTTGAAG
CTTACTCTGGTCCTGCTGCTTCACAACATTATGAGGAAAACAATCTTAAAGAGTCACTTA
GCAAAGAAGAAGATTTATCTAGTCCAAGGAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO58TF U 1
AF RR2BO58JQ C 278
BS 1 689 RR2BO58TF
BS 690 690 RR2BO58JQ
BS 691 740 RR2BO58TF
BS 741 1054 RR2BO58JQ

RD RR2BO58TF 740 0 0
GGGAAGAAAGCAACAGCTTCCGACGTAACCCAGCTGCTCCAAAGGTTTTTGAGAACTCAT
GTGAACAGTGGTAGTGGTGGTGGGTTAGTAATCGAAGTGTTTCTACAGCAGCAATGAAGC
GGAGGGGAGATGATATTAACGCCTCTGTGTCTTCTCCTCTGGCCTCCTCTCGTGGCAAAT
CCAGTAGATCGGGGCTCACGATCCATGATGGCTTGTCCTACATGAAGTATGTTAAGAAGG
TGTTTCAAGATGAAAGAGATACAATTGATACGTTCCTTGTGATTCTGAGAGACTTTAGGA
ATCAAAGGACCGATCTACCTGACGTGGTTGCACGAGTGAAGGTGTTGTTCAAAGGGCATA
ACAATCTCATTTTGGGGTTTAATATCTTTTTGCCTGAGGGATTTAAAATAGCCCTTGATG
ATGATGAAGAAGCTCTACCACCAAATAAGAATATTGAGCAAGGCTTAGCTTTAATAAATA
ACATCAAGAAACGGTTCCAGCACCATGAAGATGTCCTTAAGTCTTTCTTGGAGATCTTGA
AATTGTATCTGTTTGATAAGGACATAGCTGAGGTTTACAATGGGGTATTAAAATTCTTTG
AGAACCACCCGGATTCGCTTGAAGGATTTTTTAGGTGTTTTTCAGTGTCTTTGGCGACTC
ATTCAGCAGCCCTGTTCAACCGGAGTCAG*CCCAACGCTGTGATGAACCAGGATCAGTCC
CTCCTCCTGTTGTTGCAGTA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2BO58JQ 777 0 0
TGTGATTCTGAGAGACTTTAGGAATCAAAGGACCGATCTACCTGACGTGGTTGCACGAGT
GAAGGTGTTGTTCAAAGGGCATAACAATCTCATTTTGGGGTTTAATATCTTTTTGCCTGA
GGGATTTAAAATAGCCCTTGATGATGATGAAGAAGCTCTACCACCAAATAAGAATATTGA
GCAAGGCTTAGCTTTAATAAATAACATCAAGAAACGGTTCCAGCACCATGAAGATGTCCT
TAAGTCTTTCTTGGAGATCTTGAAATTGTATCTGTTTGATAAGGACATAGCTGAGGTTTA
CAATGGGGTATTAAAATTCTTTGAGAACCACCCGGATTCGCTTGAAGGATTTTTTAGGTG
TTTTTCAGTGTCTTTGGCGACTCATTCAGCAGCCCTGTTCAACCGGAGTCAGGCCCAACG
CTGTGATGAACCAGGATCAGTCCCTCCTCCTGTTGTTGCAGTAGTCAAGGATCCCCAACC
AGATAAGGATGCTGATTCTCGGGGTGACCCTGATCATAGTGTTCACCTTAATGTCGACGA
TGCACATAGAGCCGAGGAAAGGAGTGGAGAAGGAGAGTATAGAGAAAGGAGTTGCCGTGA
TTTAGACGTTGGTGGAGAAGCAGAAGAGGAAGGTGTTTTGCACCATTTTCCAAAGAAGAG
AAAGTCATTTGAGAGTTTTGAAGCTTACTCTGGTCCTGCTGCTTCACAACATTATGAGGA
AAACAATCTTAAAGAGTCACTTAGCAAAGAAGAAGATTTATCTAGTCCAAGGAATGG

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL4011Contig1 758 2 3 U
ATAGATAGAAAATGTATGCACAACAAATAAATAACGATAAAAAAAGGTTACAAAGAAAAG
TACTATGATACGATCTAAAAGGGTCTTGGAAACAATCGACTTGACGAAGACGCGAAGATG
ATAATGCAGAAGTGGAAGATGAGCGACATTGAAGAAGAGGAAGTGATGTGGATCATTGTT
GGAGATGTATTGTTCAGGGTTTCCACGAAACGATCCTTATTTGGCTCACTTCTTCTCATC
TTTGACTTTGACCCTTCCTTTATTTCATTTTTAGAAAGAAAACCTGTGTAGATGAAAATG
AAATTTTAGTTTATCGAAATGAATATGGCGCATATTGAAAGTATTTAAGCGTTGGAACTT
ACTTGAATAAAGTGGAAATTTTGTTGAATTTGATGAGCCTAGTAATGGGTAGGAGGTGGG
GGAGAAGCGTAGATGTATACTGGAGGTGGAGGAGATTTTACTGGTGGTGGTGGAGAGTTG
TAATAGTATGGTGGTGGTGGGGACTTCACCGGAGGAGGCGGTGAATGGTAGTAGTAAGGT
GGTGGAGGTGATTTCACTGGTGGGGGAGGTGAGTGGTAGTAGTAAGGTGGTGGAGGTGAT
TTCACCGGTGGAGGTGGTGAGTGGTAGTAGTACGGTGGAGGAGGAGATTTCACAGGTGGA
GGTGGTGAGTGGTAGTAATATGGTGGAGGAGGAGACTTGACGGGAGGAGGTGGTGAATGG
TAATAGTATGGTGGTGGTGGAGATTTCACCGGTGGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC28JQ U 116
AF RR2AC28TF C 1
BS 1 115 RR2AC28TF
BS 116 581 RR2AC28JQ
BS 582 758 RR2AC28TF

RD RR2AC28JQ 466 0 0
AGATGATAATGCAGAAGTGGAAGATGAGCGACATTGAAGAAGAGGAAGTGATGTGGATCA
TTGTTGGAGATGTATTGTTCAGGGTTTCCACGAAACGATCCTTATTTGGCTCACTTCTTC
TCATCTTTGACTTTGACCCTTCCTTTATTTCATTTTTAGAAAGAAAACCTGTGTAGATGA
AAATGAAATTTTAGTTTATCGAAATGAATATGGCGCATATTGAAAGTATTTAAGCGTTGG
AACTTACTTGAATAAAGTGGAAATTTTGTTGAATTTGATGAGCCTAGTAATGGGTAGGAG
GTGGGGGAGAAGCGTAGATGTATACTGGAGGTGGAGGAGATTTTACTGGTGGTGGTGGAG
AGTTGTAATAGTATGGTGGTGGTGGGGACTTCACCGGAGGAGGCGGTGAATGGTAGTAGT
AAGGTGGTGGAGGTGATTTCACTGGTGGGGGAGGTGAGTGGTAGTA

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR2AC28TF 758 0 0
ATAGATAGAAAATGTATGCACAACAAATAAATAACGATAAAAAAAGGTTACAAAGAAAAG
TACTATGATACGATCTAAAAGGGTCTTGGAAACAATCGACTTGACGAAGACGCGAAGATG
ATAATGCAGAAGTGGAAGATGAGCGACATTGAAGAAGAGGAAGTGATGTGGATCATTGTT
GGAGATGTATTGTTCAGGGTTTCCACGAGACGATCCTTATTTGGCTCACTTCTTCTCATC
TTTGACTTTGACCCTTCCTTTATTTCATTTTTAGAAAGAAAACCTGTGTAGATGAAAATG
AGATTTTAGTTTATCGAAATGAATATGGCGCATATTGAAAGTATTTAAGCGTTGGAACTT
ACTTGAATAAAGTGGAAATTTTGTTGAATTTGATGAGCCTAGTAATGGGTAGGAGGTGGG
GGAGAAGCGTAGATGTATACTGGAGGTGGAGGAGATTTTACTGGTGGTGGTGGAGAGTTG
TAATAGTATGGTGGTGGTGGGGACTTCACCGGAGGAGGCGGTGAATGGTAGTAGTAAGGT
GGTGGAGGTGATTTCACTGGTGGGGGAGGTGAGTGGTAGTAGTAAGGTGGTGGAGGTGAT
TTCACCGGTGGAGGTGGTGAGTGGTAGTAGTACGGTGGAGGAGGAGATTTCACAGGTGGA
GGTGGTGAGTGGTAGTAATATGGTGGAGGAGGAGACTTGACGGGAGGAGGTGGTGAATGG
TAATAGTATGGTGGTGGTGGAGATTTCACCGGTGGAGC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL4012Contig1 956 2 6 U
TACTCCGAACCCTAATCTCAGTCTCGCCTCTTCCATCTCGTCAATTCAGCCCGATATGGA
ACTTGCTTCTGCTTTTCTCCGGCGTAGACAAGCCGCTTAGACGACTTCCGACAAGCCGCA
TAGACGAATTCCGTTCTTGTTTCCAGCATACTCCCTCTCTGAATCAGTTCAAGCCATGCG
GGTTGATGCTTCTATCAACGCAGCTTTTGCTTCTCTCATCCACAACAAACACAGCGATTT
GGCGGGAAAGAAGGTGGTTATGTTCTCATATGGAAGTGGTTCAACTGCAACAATGTTTTC
ATTGCGTCTCTGCGAAAACCAGTCTCCTTTCAGCCTCGCAAACATTGCATCTGTAATGGA
TGCTGGCGGTAAACTGAAGGCTACACATGAGTATGCACCTGAGCAGTTTGTGGAGACAAT
GAAGCTGATGGAACATAGGTACGGAGCAAAGGAGTTTGTGACAAGCAAAGAAGGTATCTT
AGAGATTTTGGCTCCGGGTACTTATTACCTGAAAGAGGTTGATTCATTGTACCGGAGATT
CTATGGCAATAAAGGAGACGATGGATCCACAACTCCCTGTAGTGCCCCTCACAACTCTTC
CACACACAACTCCTCCCGTACACAGCTCTTATGTACATACGCCCCTCGTACACAACTCTC
CTAAACACGCTTTACATGTCCACAACTCCCATGTCCACACCTCACCCGTCCACAACACTA
CCGTCCACATCATTCCCGAACACACTAGCCCATCCATGATTCCCCTTCAAACACACCACC
ATTCCTGCGGACTCAGACTACTCCCATGTATGCTATCATTCTGCTCTTCTGGGGATTGAG
AAAGAAAGAGAATCATATGTTATTATTTGTTACTTTTCTCCAGAATGCAAGTGTAAGCTC
AACTTGAATCATGACAATTTGAATTTAAATGATAAAAATGCAAAACATTTGGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS38TF U 1
AF RR2BS38JQ C 253
BS 1 700 RR2BS38TF
BS 701 701 RR2BS38JQ
BS 702 706 RR2BS38TF
BS 707 707 RR2BS38JQ
BS 708 723 RR2BS38TF
BS 724 956 RR2BS38JQ

RD RR2BS38TF 723 0 0
TACTCCGAACCCTAATCTCAGTCTCGCCTCTTCCATCTCGTCAATTCAGCCCGATATGGA
ACTTGCTTCTGCTTTTCTCCGGCGTAGACAAGCCGCTTAGACGACTTCCGACAAGCCGCA
TAGACGAATTCCGTTCTTGTTTCCAGCATACTCCCTCTCTGAATCAGTTCAAGCCATGCG
GGTTGATGCTTCTATCAACGCAGCTTTTGCTTCTCTCATCCACAACAAACACAGCGATTT
GGCGGGAAAGAAGGTGGTTATGTTCTCATATGGAAGTGGTTCAACTGCAACAATGTTTTC
ATTGCGTCTCTGCGAAAACCAGTCTCCTTTCAGCCTCGCAAACATTGCATCTGTAATGGA
TGCTGGCGGTAAACTGAAGGCTACACATGAGTATGCACCTGAGCAGTTTGTGGAGACAAT
GAAGCTGATGGAACATAGGTACGGAGCAAAGGAGTTTGTGACAAGCAAAGAAGGTATCTT
AGAGATTTTGGCTCCGGGTACTTATTACCTGAAAGAGGTTGATTCATTGTACCGGAGATT
CTATGGCAATAAAGGAGACGATGGATCCACAACTCCCTGTAGTGCCCCTCACAACTCTTC
CACACACAACTCCTCCCGTACACAGCTCTTATGTACATACGCCCCTCGTACACAACTCTC
CTAAACACGCTTTACATGTCCACAACTCCCATGTCCACAC*TCACC*GTCCACAACACTA
CCG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2BS38JQ 704 0 0
GGTGGTTATGTTCTCATATGGAAGTGGTTCAACTGCAACAATGTTTTCATTGCGTCTCTG
CGAAAACCAGTCTCCTTTCAGCCTCGCAAACATTGCATCTGTAATGGATGCTGGCGGTAA
ACTGAAGGCTACACATGAGTATGCACCTGAGCAGTTTGTGGAGACAATGAAGCTGATGGA
ACATAGGTACGGAGCAAAGGAGTTTGTGACAAGCAAAGAAGGTATCTTAGAGATTTTGGC
TCCGGGTACTTATTACCTGAAAGAGGTTGATTCATTGTACCGGAGATTTTATGGCAATAA
AGGAGACGATGGATCCACAACTCCCTGTAGTGCCCCTCACAACTCTTCCACACACAACTC
CTCCCGTACACAGCTCTTATGTACATACGCCCCTCGTACACAACTCTCCTAAACACGCTT
TACATGTCCACAACTCCCATGTCCACACCTCACCCGTCCACAACACTACCGTCCACATCA
TTCCCGAACACACTAGCCCATCCATGATTCCCCTTCAAACACACCACCATTCCTGCGGAC
TCAGACTACTCCCATGTATGCTATCATTCTGCTCTTCTGGGGATTGAGAAAGAAAGAGAA
TCATATGTTATTATTTGTTACTTTTCTCCAGAATGCAAGTGTAAGCTCAACTTGAATCAT
GACAATTTGAATTTAAATGATAAAAATGCAAAACATTTGGAGCC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4014Contig1 1260 2 6 U
GGGAATCTAAAGGTTGAAGCAAATCGAAGTGTTCCAACAATGGCGGAATCGACCATCAAG
CTCACAATCAAATTCGGAGGAAGATCGATACCACTTTCGGTATCACCTGACGCTACAACC
AAAGACCTAAAGTCTCTTCTTCAACCCATCACCAACGTTCTTCCTCGTGGCCAGAAACTC
ATCTTCAAAGGGAAGGTTTTGGTAGAGACTTCGACTCTGAAGCAATCTCTGGTGGGAGAT
GGTGCCAAGATCATGTTAATGGCTTCTCAAGGTCTCCATCAAGGGGAAGGACCAGTGCTT
AAGGAAGCTAGTACAAGGCCAATATCTAGAACTATTGTAGATCAGAGAAAACCTAGTGTT
GTTGTAGACAATAACCGTAGTGATCGGTGGAAAGCTACAGGAGTTATTGCCTTAGCTCAA
GCTAATTTGAAGGAAATACCTGAGGAAGTGTGGGACTGTGGATCTGCAGCAAGAGTACTT
GACGTTCGTGAGAACTTCATTCGTGAAGTACCTGCTCGAATCAGCTCTTTTGTCTCTATA
CAAAAACTGTTCCTTCAAGGGAATGGTTTGTGTGATGAATCAATTCAATGGGAAGGGATA
GCATCTCTAAAGCGTCTGATGCTTCTCTCCCTTAGCCATAACAATCTAACTGTTGTGCCA
TCAGAAGTGGGTTCACTGACGTCACTTAGACAGCTTGATGTGGCCAACAACAAGTTGACA
AGCTTACCTAACGAGATAGGACTTCTTACGCAGATAGAGATCTTGAAAGCCAACAATAAC
AGGATAACTAGCCTTCCTGAGAGTATTGGAGACTGTTCCTTCCTCATGGAGGTTGATCTT
TCTGCAAATATGTTATCAGAACTGCCCGAGACAGTCACAAAACTGCGTAAACTAAAGACG
CTGGAGCCCAACAACACGGGGTTAACGACTCTACCGTCTGTGTTATTCAAGATGTGTTTG
CAGCTGACAACATTAGGACTCCACAACACAGAGATAACAGTTGAATCTTTCCGCCAGTTG
GAAGGATGGGGTGAGTTTGATGAAAGACGACGTACTAAGCATCAGAAGCAGATTGATTTT
AGGGTTGTTGGGTCTGGCCAATTCGATGAAGGCGCTGATAAATCTTGGTGAACTGTTTTT
TTGACTCGAGCGTCATGAGTGTTTGAATCATCATCACAAACTCTTGCATCATCCCTGGCC
GTTTTATATAAATACTCTTTTGTGATGACTGAATCAAATTAATAAAAAATTATTTAAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A373TF U 1
AF RR2A373JQ C 380
BS 1 782 RR2A373TF
BS 783 783 RR2A373JQ
BS 784 831 RR2A373TF
BS 832 832 RR2A373JQ
BS 833 857 RR2A373TF
BS 858 1260 RR2A373JQ

RD RR2A373TF 857 0 0
GGGAATCTAAAGGTTGAAGCAAATCGAAGTGTTCCAACAATGGCGGAATCGACCATCAAG
CTCACAATCAAATTCGGAGGAAGATCGATACCACTTTCGGTATCACCTGACGCTACAACC
AAAGACCTAAAGTCTCTTCTTCAACCCATCACCAACGTTCTTCCTCGTGGCCAGAAACTC
ATCTTCAAAGGGAAGGTTTTGGTAGAGACTTCGACTCTGAAGCAATCTCTGGTGGGAGAT
GGTGCCAAGATCATGTTAATGGCTTCTCAAGGTCTCCATCAAGGGGAAGGACCAGTGCTT
AAGGAAGCTAGTACAAGGCCAATATCTAGAACTATTGTAGATCAGAGAAAACCTAGTGTT
GTTGTAGACAATAACCGTAGTGATCGGTGGAAAGCTACAGGAGTTATTGCCTTAGCTCAA
GCTAATTTGAAGGAAATACCTGAGGAAGTGTGGGACTGTGGATCTGCAGCAAGAGTACTT
GACGTTCGTGAGAACTTCATTCGTGAAGTACCTGCTCGAATCAGCTCTTTTGTCTCTATA
CAAAAACTGTTCCTTCAAGGGAATGGTTTGTGTGATGAATCAATTCAATGGGAAGGGATA
GCATCTCTAAAGCGTCTGATGCTTCTCTCCCTTAGCCATAACAATCTAACTGTTGTGCCA
TCAGAAGTGGGTTCACTGACGTCACTTAGACAGCTTGATGTGGCCAACAACAAGTTGACA
AGCTTACCTAACGAGATAGGACTTCTTACGCAGATAGAGATCTTGAAAGCCAACAATAAC
AG*ATAACTAGCCTTCCTGAGAGTATTGGAGACTGTTCCTTCCTCATGGAG*TTGATCTT
TCTGCAAATATGTTATC

QA 1 857 1 857
DS 

RD RR2A373JQ 881 0 0
GTGATCGGTGGAAAGCTACAGGAGTTATTGCCT*AGCTCAAGCTAATTTGAAGGAAATAC
C*GAGGAAGTGTGGGACTGTGGATCTGCAGCAAGAGTACTTGACGTTCGTGAGAACTTCA
TTCGTGAAGTACCTGCTCGAATCAGCTCTTTTGTCTCTATACAAAAACTGTTCCTTCAAG
GGAATGGTTTGTGTGATGAATCAATTCAATGGGAAGGGATAGCATCTCTAAAGCGTCTGA
TGCTTCTCTCCCTTAGCCATAACAATCTAACTGTTGTGCCATCAGAAGTGGGTTCACTGA
CGTCACTTAGACAGCTTGATGTGGCCAACAACAAGTTGACAAGCTTACCTAACGAGATAG
GACTTCTTACGCAGATAGAGATCTTGAAAGCCAACAATAACAGGATAACTAGCCTTCCTG
AGAGTATTGGAGACTGTTCCTTCCTCATGGAGGTTGATCTTTCTGCAAATATGTTATCAG
AACTGCCCGAGACAGTCACAAAACTGCGTAAACTAAAGACGCTGGAGCCCAACAACACGG
GGTTAACGACTCTACCGTCTGTGTTATTCAAGATGTGTTTGCAGCTGACAACATTAGGAC
TCCACAACACAGAGATAACAGTTGAATCTTTCCGCCAGTTGGAAGGATGGGGTGAGTTTG
ATGAAAGACGACGTACTAAGCATCAGAAGCAGATTGATTTTAGGGTTGTTGGGTCTGGCC
AATTCGATGAAGGCGCTGATAAATCTTGGTGAACTGTTTTTTTGACTCGAGCGTCATGAG
TGTTTGAATCATCATCACAAACTCTTGCATCATCCCTGGCCGTTTTATATAAATACTCTT
TTGTGATGACTGAATCAAATTAATAAAAAATTATTTAAAAT

QA 1 881 1 881
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4016Contig1 1327 2 2 U
GGGAAGAGGTTGGCAATTGCAGAGCAAGACACGCGGCTCCTCGATGGCTGTCTTCTGCCA
AGTGGCGGTGCCTGCTTCTGTATATGTAGGTAGAACTCTGTACGTCTTAGAGAAGAGAAG
AGAAGAGAAGAGGGTAGATATAATGGCACATACCACGTTTACGCCGGAAGGGCAGAAGAC
GGAGTCGTTTCGGCTGTTGAGCGGCCACAAAATCCCAGCCGTTGGACTCGGCACCTGGCG
ATCTGGCTCTGAAGCCTCCCACTCCGTTTTCACTGCCCTCGTCGAGGGTGGTTATAGGCA
CATTGATACAGCTTGGGAATATGGTGATCAGAATGAGGTGGGTGTAGGGATGAAGAGGGC
TATCCACGCTGGTACTGAGAGGAGGGACCTCTTCGTGACCTCCAAGCTTTGGTGTACAGA
GTTGTCCCCTGAGAGAGTGCGTCCTGCTCTGCTAAATACCCTTCAACAGCTTCAATCAGA
CTACCTTGATCTTTACCTGATTCACTGGCCTTTCAGGCTAAGAGAAGGAGCAAGTAAGCC
ACCAAAGGCAGGGGACGTCCTTGAGTTTGACATGGAAGGTGTTTGGAGAGAAATGGAGAA
GCTTGTCAAGGACAATCTTGTCAGGAGCATTGGCGTTTGTAACTTCACCCTCACTAAGCT
CAATAAGCTTCTAGCCTTCGCTGATTTGATCCCTTCCGTTTGCCAGATGGAAATGCATCC
TGGTTGGAGAAATGACAAAATGCTCCAACTCTGCAGAATGAATGGTATCCATGTTACAGC
CTATTCGCCGCTGGGATCTCAAGAAGGCGGGAGAGATCTGATACATGATCAGACAGTGGA
GAGGATAGCCAAGAAGCTGAACAAGACACCGGGACAGGTACTAGTAAAATGGGGTCTTCA
GAGAGGAACTAGTGTCATCCCCAAGTCATCGAATCCAGAGAGGATCAAGGAGAACATCAA
AGTTTTTGACTGGGTGATCCCTGACCAAGACTTTGAAGCTCTCAGCAGCATCAGTGACCA
GAAACGAGTGTTGGACGGTGAGGATTTGTTCGTCAACAAGAGCGAAGGTCCATTCCGTAG
CGTGGCAGATCTATGGGACCATGAAGACTAATCCAACCCAAGAAAATCAAATAAGGTGTC
TGTCTGTGGTTAAAGATCAATCAATGTATATGTTTCTATAATAATAAAGTAAAACAAAAC
AAAGGATCTTCCTAAAGAAAACATGATGTGGTGTTCCTGAGAGATTCACTTCTAATGTGT
TTGCTCTCTGTTTCGACTAAATGTTACGACTATTAGTCAACTCACTATCATTTTGTTTTG
TTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM45TF U 1
AF RR2EM45JQ C 646
BS 1 712 RR2EM45TF
BS 713 1327 RR2EM45JQ

RD RR2EM45TF 712 0 0
GGGAAGAGGTTGGCAATTGCAGAGCAAGACACGCGGCTCCTCGATGGCTGTCTTCTGCCA
AGTGGCGGTGCCTGCTTCTGTATATGTAGGTAGAACTCTGTACGTCTTAGAGAAGAGAAG
AGAAGAGAAGAGGGTAGATATAATGGCACATACCACGTTTACGCCGGAAGGGCAGAAGAC
GGAGTCGTTTCGGCTGTTGAGCGGCCACAAAATCCCAGCCGTTGGACTCGGCACCTGGCG
ATCTGGCTCTGAAGCCTCCCACTCCGTTTTCACTGCCCTCGTCGAGGGTGGTTATAGGCA
CATTGATACAGCTTGGGAATATGGTGATCAGAATGAGGTGGGTGTAGGGATGAAGAGGGC
TATCCACGCTGGTACTGAGAGGAGGGACCTCTTCGTGACCTCCAAGCTTTGGTGTACAGA
GTTGTCCCCTGAGAGAGTGCGTCCTGCTCTGCTAAATACCCTTCAACAGCTTCAATCAGA
CTACCTTGATCTTTACCTGATTCACTGGCCTTTCAGGCTAAGAGAAGGAGCAAGTAAGCC
ACCAAAGGCAGGGGACGTCCTTGAGTTTGACATGGAAGGTGTTTGGAGAGAAATGGAGAA
GCTTGTCAAGGACAATCTTGTCAGGAGCATTGGCGTTTGTAACTTCACCCTCACTAAGCT
CAATAAGCTTCTAGCCTTCGCTGATTTGATCCCTTCCGTTTGCCAGATGGAA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2EM45JQ 682 0 0
CACCCTCACTAAGCTCAATAAGCTTCTAGCCTTCGCTGATTTGATCCCTTCCGTTTGCCA
GATGGAAATGCATCCTGGTTGGAGAAATGACAAAATGCTCCAACTCTGCAGAATGAATGG
TATCCATGTTACAGCCTATTCGCCGCTGGGATCTCAAGAAGGCGGGAGAGATCTGATACA
TGATCAGACAGTGGAGAGGATAGCCAAGAAGCTGAACAAGACACCGGGACAGGTACTAGT
AAAATGGGGTCTTCAGAGAGGAACTAGTGTCATCCCCAAGTCATCGAATCCAGAGAGGAT
CAAGGAGAACATCAAAGTTTTTGACTGGGTGATCCCTGACCAAGACTTTGAAGCTCTCAG
CAGCATCAGTGACCAGAAACGAGTGTTGGACGGTGAGGATTTGTTCGTCAACAAGAGCGA
AGGTCCATTCCGTAGCGTGGCAGATCTATGGGACCATGAAGACTAATCCAACCCAAGAAA
ATCAAATAAGGTGTCTGTCTGTGGTTAAAGATCAATCAATGTATATGTTTCTATAATAAT
AAAGTAAAACAAAACAAAGGATCTTCCTAAAGAAAACATGATGTGGTGTTCCTGAGAGAT
TCACTTCTAATGTGTTTGCTCTCTGTTTCGACTAAATGTTACGACTATTAGTCAACTCAC
TATCATTTTGTTTTGTTTTTTC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL4017Contig1 1022 2 4 U
GGTCTCTCTGTTTCTCGATCTGGTTGGGGTTTCTATATAGGGTTTAAGCTACGATGGCTC
TCTGAGCTTCTTCTTCTTCATTTGGAAATCATCATCGCTCTTAGAAGAAGACGACTTTGT
CAACCATTTTTAGATCCTGTATCTTATGATTTTGAAGAATTTTGTGATTTTCCTCTCTGC
CTGTGCTCTGTATCCCTACATGTCGAATGTGCATAGAAAGTGTTTGTGAAAATGCCTCAG
AGATTATTGATTTTGATGTTCCTCCAAAATCCCAAGAAACTGCAAAAAATGTCATCAAGC
CTTTGCGTTGTTGACTTTAGTTTATTTTGTCAGAAGCTGAATTTGTGATCTGAGATGGCG
ACAGAGCAGAAAGGGTTAGAAGATCAGGAGATCCAGCCGAACCAAGTGTCCCCTGGTTTT
GTAGGAGCGATCGAAGAACAACACAAGAAACTCAGAGATCACGCCGAGGCTTATCCATAT
GTTTGGGGTTCTTATACTTGTTGTCTATGGTGGTCTTTTCCTTTGGACCCGCTTATAGGT
GGAGGAAGCTTAGGAGAACCGAGGATCGAGTTCGTGGTCTTCAGACAAAACTTAGGAAAC
TCGTCCACAAGACGAACAAGCAGCAGCCACGAAATCTGGTCAAGCATCAAAAATGGCACC
TGCTTCTATAGCTGCGATGCTCACAGCATCTACCTCATTAGATATGACCATGCAATCTCT
GTTCTATCCTCATTTGCAGCTGAAGAAGCAACAAAGACTTCTAGTCTATCCAAATCGGAG
AGCGCAGTTCCGGTTTCAGACGCTAATGCGTTCTTGTCTACTCATTAGACTCACGCTACA
CTAGTTCAGTTATGCTTTTAGAGTATTTTCTAAATACAACATATATATGTCATTTTTTCT
GGGTAACATAAAACATATGTCATTCTTGTAAGTGAATAATCGATTAATATTTTTTGTCTA
TTAGATTTCACTGTCAAACATTAAAAAAGTGACATATTTGTTGAATGGCTTATGACTATG
AC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2F342TF U 1
AF RR2F342JQ C 305
BS 1 744 RR2F342TF
BS 745 745 RR2F342JQ
BS 746 768 RR2F342TF
BS 769 1022 RR2F342JQ

RD RR2F342TF 768 0 0
GGTCTCTCTGTTTCTCGATCTGGTTGGGGTTTCTATATAGGGTTTAAGCTACGATGGCTC
TCTGAGCTTCTTCTTCTTCATTTGGAAATCATCATCGCTCTTAGAAGAAGACGACTTTGT
CAACCATTTTTAGATCCTGTATCTTATGATTTTGAAGAATTTTGTGATTTTCCTCTCTGC
CTGTGCTCTGTATCCCTACATGTCGAATGTGCATAGAAAGTGTTTGTGAAAATGCCTCAG
AGATTATTGATTTTGATGTTCCTCCAAAATCCCAAGAAACTGCAAAAAATGTCATCAAGC
CTTTGCGTTGTTGACTTTAGTTTATTTTGTCAGAAGCTGAATTTGTGATCTGAGATGGCG
ACAGAGCAGAAAGGGTTAGAAGATCAGGAGATCCAGCCGAACCAAGTGTCCCCTGGTTTT
GTAGGAGCGATCGAAGAACAACACAAGAAACTCAGAGATCACGCCGAGGCTTATCCATAT
GTTTGGGGTTCTTATACTTGTTGTCTATGGTGGTCTTTTCCTTTGGACCCGCTTATAGGT
GGAGGAAGCTTAGGAGAACCGAGGATCGAGTTCGTGGTCTTCAGACAAAACTTAGGAAAC
TCGTCCACAAGACGAACAAGCAGCAGCCACGAAATCTGGTCAAGCATCAAAAATGGCACC
TGCTTCTATAGCTGCGATGCTCACAGCATCTACCTCATTAGATATGACCATGCAATCTCT
GTTCTATCCTCATTTGCAGCTGAA*AAGCAACAAAGACTTCTAGTCTA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2F342JQ 718 0 0
GCGTTGTTGACTTTAGTTTATTTTGTCAGAAGCTGAATTTGTGATCTGAGATGGCGACAG
AGCAGAAAGGGTTAGAAGATCAGGAGATCCAGCCGAACCAAGTGTCCCCTGGTTTTGTAG
GAGCGATCGAAGAACAACACAAGAAACTCAGAGATCACGCCGAGGCTTATCCATATGTTT
GGGGTTCTTATACTTGTTGTCTATGGTGGTCTTTTCCTTTGGACCCGCTTATAGGTGGAG
GAAGCTTAGGAGAACCGAGGATCGAGTTCGTGGTCTTCAGACAAAACTTAGGAAACTCGT
CCACAAGACGAACAAGCAGCAGCCACGAAATCTGGTCAAGCATCAAAAATGGCACCTGCT
TCTATAGCTGCGATGCTCACAGCATCTACCTCATTAGATATGACCATGCAATCTCTGTTC
TATCCTCATTTGCAGCTGAAGAAGCAACAAAGACTTCTAGTCTATCCAAATCGGAGAGCG
CAGTTCCGGTTTCAGACGCTAATGCGTTCTTGTCTACTCATTAGACTCACGCTACACTAG
TTCAGTTATGCTTTTAGAGTATTTTCTAAATACAACATATATATGTCATTTTTTCTGGGT
AACATAAAACATATGTCATTCTTGTAAGTGAATAATCGATTAATATTTTTTGTCTATTAG
ATTTCACTGTCAAACATTAAAAAAGTGACATATTTGTTGAATGGCTTATGACTATGAC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL4018Contig1 665 2 2 U
TTTTTGCTTAACGTAATATTGATTATTGTTTTATGTCAGAACTCATGGAAGTCTAAATGG
CAGAACTAATGAGCTCCAAGAGCTGACCCGTCACCTCTTTGTTACTTATCAAAGTTTCTG
AGCAGTAGCATTGTCTGCTCGTGTAGACAATGACCGAGACCAAGATTTGTCAAAAGGTAA
GCATAATGATTGAAACTGTGATAAACAACACCCTCACGGAATTCAGAGAGTTTTTCAAGA
TATTAACTTAAGTCTTCTCTAGAAGAAGTCAGTATCGCTCCAATCGGTTCGATTTCAGTT
TGGACATTTTCAGGTAAAGACACATGACTCCCATCTGCTTTTCTAAAGGAAGATGCTCTG
AAATAGCTTTAAGCTGAAAAACCGTGATATCCACTTGCCTCATGAGACATGCCAATCTCT
CTGTTGTGCTTTTATTGTACCTATTCCGACCCGACCAAGAGGCAGACTGAAGTGGAAAAG
ATCTCACAGCCAGTAGTGGTGATAGCTCATATTCCATCCTCCATTATACATCTGGAAACC
GTTGAGAAGATCTTTTTTGAATGCTCTTTGAGCAGCTAAAGCCACTGAAGCATCTTCAGT
CACTTGACTGTTATTATTGCAAAAAGGTCCATTTAACTGGCGCTTCTTCATTATAAATTT
AAATC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2F534TF C 1
AF RR2F534JQ U 6
BS 1 5 RR2F534TF
BS 6 665 RR2F534JQ

RD RR2F534TF 665 0 0
TTTTTGCTTAACGTAATATTGATTATTGTTTTATGTCAGAACTCATGGAAGTCTAAATGG
CAGAACTAATGAGCTCCAAGAGCTGACCCGTCACCTCTTTGTTACTTATCAAAGTTTCTG
AGCAGTAGCATTGTCTGCTCGTGTAGACAATGACCGAGACCAAGATTTGTCAAAAGGTAA
GCATAATGATTGAAACTGTGATAAACAACACCCTCACGGAATTCAGAGAGTTTTTCAAGA
TATTAACTTAAGTCTTCTCTAGAAGAAGTCAGTATCGCTCCAATCGGTTCGATTTCAGTT
TGGACATTTTCAGGTAAAGACACATGACTCCCATCTGCTTTTCTAAAGGAAGATGCTCTG
AAATAGCTTTAAGCTGAGAAACCGTGATATCCACTTGCCTCATGAGACATGCCAATCTCT
CTGTTGTGCTTTTATTGTACCTATTCCGACCCGACCAAGAGGCAGACTGAAGTGGAAAAG
ATCTCACAGCCAGTAGTGGTGATAGCTCATATTCCATCCTCCATTATACATCTGGAAACC
GTTGAGAAGATCTTTTTTGAATGCTCTTTGAGCAGCTAAAGCCACTGAAGCATCTTCAGT
CACTTGACTGTTATTATTGCAAAAAGGTCCATTTAACTGGCGCTTCTTCATTATAAATTT
AAATC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2F534JQ 660 0 0
GCTTAACGTAATATTGATTATTGTTTTATGTCAGAACTCATGGAAGTCTAAATGGCAGAA
CTAATGAGCTCCAAGAGCTGACCCGTCACCTCTTTGTTACTTATCAAAGTTTCTGAGCAG
TAGCATTGTCTGCTCGTGTAGACAATGACCGAGACCAAGATTTGTCAAAAGGTAAGCATA
ATGATTGAAACTGTGATAAACAACACCCTCACGGAATTCAGAGAGTTTTTCAAGATATTA
ACTTAAGTCTTCTCTAGAAGAAGTCAGTATCGCTCCAATCGGTTCGATTTCAGTTTGGAC
ATTTTCAGGTAAAGACACATGACTCCCATCTGCTTTTCTAAAGGAAGATGCTCTGAAATA
GCTTTAAGCTGAAAAACCGTGATATCCACTTGCCTCATGAGACATGCCAATCTCTCTGTT
GTGCTTTTATTGTACCTATTCCGACCCGACCAAGAGGCAGACTGAAGTGGAAAAGATCTC
ACAGCCAGTAGTGGTGATAGCTCATATTCCATCCTCCATTATACATCTGGAAACCGTTGA
GAAGATCTTTTTTGAATGCTCTTTGAGCAGCTAAAGCCACTGAAGCATCTTCAGTCACTT
GACTGTTATTATTGCAAAAAGGTCCATTTAACTGGCGCTTCTTCATTATAAATTTAAATC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL4019Contig1 573 2 4 U
TCCAGAGGGTTTGCGATTTAATCTCGGAAGGAATGAAAGGAGTGGGAGGACCATTGCTGT
CAATCGGAGATCTTCTTGCCGATCTCGTTGAAGAAACTGTGGACTCATCAGCTCCACCAA
ATCCTGAGAATTCTTCCAAATTGGAGACTGATGCAATCTCTGGACCGTTGGATCTAACCA
GACTCTTTCAGGACAACTATGATAAACTGAACACTGCTTTTGCTGGTTCTGATCACTCAT
GGACCTCTCTCACTCTGGAGCTTTGCACTTCTTTAGAAACTGCAAACAAGTTGGTCCAAG
ACACCACCAAAATGCTAGATTCTTGTCAGAGAAAGTGGGAGAACTCGAGAGAATAGTGAA
ACAAGGAGATTCAGCAGTCGCAGCTGCCAGAACAGTTCACGCTACGGTTAACCAGAAAGG
TTTACCCTCTTAGGACAACATAATTAATGGTTTTACCAAAGAACAAACCAACCGATTGGG
TTGTATTTAATCATTTTCACAAAATGATATTTGCCTTGTTTCTTGATGTATCCTGAGTGA
TTAAGGATATGAATATTCAAATCTTTTGTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2AX76TFB U 1
AF RR2AX76JQ C 77
BS 1 216 RR2AX76TFB
BS 217 217 RR2AX76JQ
BS 218 568 RR2AX76TFB
BS 569 573 RR2AX76JQ

RD RR2AX76TFB 568 0 0
TCCAGAGGGTTTGCGATTTAATCTCGGAAGGAATGAAAGGAGTGGGAGGACCATTGCTGT
CAATCGGAGATCTTCTTGCCGATCTCGTTGAAGAAACTGTGGACTCATCAGCTCCACCAA
ATCCTGAGAATTCTTCCAAATTGGAGACTGATGCAATCTCTGGACCGTTGGATCTAACCA
GACTCTTTCAGGACAACTATGATAAACTGAACACTGGTTTTGCTGGTTCTGATCACTCAT
GGACCTCTCTCACTCTGGAGCTTTGCACTTCTTTAGAAACTGCAAACAAGTTGGTCCAAG
ACACCACCAAAATGCTAGATTCTTGTCAGAGAAAGTGGGAGAACTCGAGAGAATAGTGAA
ACAAGGAGATTCAGCAGTCGCAGCTGCCAGAACAGTTCACGCTACGGTTAACCAGAAAGG
TTTACCCTCTTAGGACAACATAATTAATGGTTTTACCAAAGAACAAACCAACCGATTGGG
TTGTATTTAATCATTTTCACAAAATGATATTTGCCTTGTTTCTTGATGTATCCTGAGTGA
TTAAGGATATGAATATTCAAATCTTTTG

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2AX76JQ 497 0 0
TGCCGATCTCGTTGAAGAAACTGTGGACTCATCAGCTCCACCAAATCCTGAGAATTTTTC
CAAATTGGAGACTGATGCAATTTTTGGACCGTTGGATTTAACCAGACTCTTTCAGGACAA
CTATGATAAACTGAACACTGCTTTTGCTGGTTCTGATCACTCATGGACCTCTCTCACTTT
GGAGCTTTGCACTTCTTTAGAAACTGCAAACAAGTTGGTCCAAGACACCACCAAAATGCT
AGATTTTTGTCAGAGAAAGTGGGAGAACTCGAGAGAATAGTGAAACAAGGAGATTCAGCA
GTCGCAGCTGCCAGAACAGTTCACGCTACGGTTAACCAGAAAGGTTTACCCTTTTAGGAC
AACATAATTAATGGTTTTACCAAAGAACAAACCAACCGATTGGGTTGTATTTAATCATTT
TCACAAAATGATATTTGCCTTGTTTCTTGATGTATCCTGAGTGATTAAGGATATGAATAT
TCAAATCTTTTGTCATT

QA 1 497 1 497
DS 



AS 1 2

CO CL4020Contig1 944 2 2 U
GGGGAGCGAAAGAGAGAAGACGTGATCGGGCGGTGAAAGAATCATCAATCAATCACACAC
TTCCCCCCAGTGATCTGTTCAGCCGAATACGGTGGATCTTCGCCGGAGTATATCCCGGGG
AAATCGGTTTCATATGGAGAGGGCCGATGAAGGAGCAGGCGAGCCTTCTGGAGCCGCCAT
AAGATCGAGGCTCAGTAACAGAGCGGATCCTTTCCTTGTGGTTTGCAGGTGTTTCAGCTT
CGTTACCTCTCTTATCGCCATCCTCTGCGTCGTCGTTAACGTTCTCGCTGCTATTCGCGC
CTTCCGAGATAGCCACGATCTGTTCGATGGAATATTCCGGTGCTACGCTGTGGTGATTGC
TTGTTTCGTGGTTCTCGCCGAGACTGAATGGGGTTTCATCCTCAAATTTTCCAAGGTTCT
TGAGTACTGGGCTGGGAGAGGAATGCCTCAGATTTTTGTTGCTGTGATGACAAGAGCTTT
CCCTGACTACCTGGCTCAGAAGAAGGATCTCCTGCTTCTACAGAATATCGCTAGCTACAT
GCTCCTTTCTTGTGGTCTTATCTATTTCATCTCTGGAGTTCTGTGCATTGGCTTTCTGAA
GCGTGCTCGACAGCAGAAGGAAATTTCAAGAGAACAAGCCGTCAAGGATCTTGAGGAGAT
AGACCGACGCAGGGAAGAGCTGGAACAATTGCTCCTGAAGCATCGCAGTAGAGACGACGT
GTGAATGACAAGTACCAGCTTCAGCTTCATTCAAAGGACGAGATCTGTTTCTTGTTTCTT
TTTTTTTTTTTCTTTTTGTAGTAAAGGATTGTGTGAGCTCTCTCTCTGTTTCTGCATCCC
TCCCACTTTGATAAAATCTGTTTCTTTTTTTCTGTCTGTTGAAAAACGAACCTTCGATAC
TTAACATGTAAGAGACGAGCAGTATTGAATATGAATTTTGACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A263TF U 1
AF RR2A263JQ C 326
BS 1 790 RR2A263TF
BS 791 944 RR2A263JQ

RD RR2A263TF 800 0 0
GGGGAGCGAAAGAGAGAAGACGTGATCGGGCGGTGAAAGAATCATCAATCAATCACACAC
TTCCCCCCAGTGATCTGTTCAGCCGAATACGGTGGATCTTCGCCGGAGTATATCCCGGGG
AAATCGGTTTCATATGGAGAGGGCCGATGAAGGAGCAGGCGAGCCTTCTGGAGCCGCCAT
AAGATCGAGGCTCAGTAACAGAGCGGATCCTTTCCTTGTGGTTTGCAGGTGTTTCAGCTT
CGTTACCTCTCTTATCGCCATCCTCTGCGTCGTCGTTAACGTTCTCGCTGCTATTCGCGC
CTTCCGAGATAGCCACGATCTGTTCGATGGAATATTCCGGTGCTACGCTGTGGTGATTGC
TTGTTTCGTGGTTCTCGCCGAGACTGAATGGGGTTTCATCCTCAAATTTTCCAAGGTTCT
TGAGTACTGGGCTGGGAGAGGAATGCCTCAGATTTTTGTTGCTGTGATGACAAGAGCTTT
CCCTGACTACCTGGCTCAGAAGAAGGATCTCCTGCTTCTACAGAATATCGCTAGCTACAT
GCTCCTTTCTTGTGGTCTTATCTATTTCATCTCTGGAGTTCTGTGCATTGGCTTTCTGAA
GCGTGCTCGACAGCAGAAGGAAATTTCAAGAGAACAAGCCGTCAAGGATCTTGAGGAGAT
AGACCGACGCAGGGAAGAGCTGGAACAATTGCTCCTGAAGCATCGCAGTAGAGACGACGT
GTGAATGACAAGTACCAGCTTCAGCTTCATTCAAAGGACGAGATCTGTTTCTTGTTTCTT
TTTTTTTTTT
CTTTTGTAGT

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2A263JQ 619 0 0
GATGGAATATTCCGGTGCTACGCTGTGGTGATTGCTTGTTTCGTGGTTCTCGCCGAGACT
GAATGGGGTTTCATCCTCAAATTTTCCAAGGTTCTTGAGTACTGGGCTGGGAGAGGAATG
CCTCAGATTTTTGTTGCTGTGATGACAAGAGCTTTCCCTGACTACCTGGCTCAGAAGAAG
GATCTCCTGCTTTTACAGAATATCGCTAGCTACATGCTCCTTTCTTGTGGTCTTATCTAT
TTCATCTCTGGAGTTCTGTGCATTGGCTTTTTGAAGCGTGCTCGACAGCAGAAGGAAATT
TCAAGAGAACAAGCCGTCAAGGATCTTGAGGAGATAGACCGACGCAGGGAAGAGCTGGAA
CAATTGCTCCTGAAGCATCGCAGTAGAGACGACGTGTGAATGACAAGTACCAGCTTCAGC
TTCATTCAAAGGACGAGATCTGTTTCTTGTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTGTAGTAAA
GGATTGTGTGAGCTCTCTCTCTGTTTCTGCATCCCTCCCACTTTGATAAAATCTGTTTCT
TTTTTTCTGTCTGTTGAAAAACGAACCTTCGATACTTAACATGTAAGAGACGAGCAGTAT
TGAATATGAATTTTGACGG

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL4021Contig1 779 2 5 U
TGATAATGAGGAAGATGGGGTTGATGATGAGGAGGATGAAGAGGAGGAGGAGGAGGATGA
AGTGGATAATGTTGATCGTGGTCTTGGTGGGTCAGGGAGTAGTACTGGACGGTTGATGAA
TGCGGTGGAGATTGATGGGCATGAGCAAGGGGATGATGATGAGGATAATGATGGTGAGAC
TGGTGAAGACGACCAAGGGGTTGAGGATGATGGTGAGTTTGGTGATGATGATGATGATGA
TGATGGTGAAGAGGAGGATGAAGAATCTGGTGAAGGGTACCTTGTTCAGCCAGTCTCTCA
AGTGGAAGATCATGATGCTGTGGGTAGTGACATCGAACCCATTAACGAGGACAACGATCC
AGATGAAGAAGAAGAAGTGGAAGATGATCTCCCAATGCCTGACCAGTCCTTGCCATCATC
ATCTCGTCCAAACAAAAAACGTGATGGTGATGAAGATGATGATGATGTTGATGATGATGA
TGATGATGACGATGACGATGATGGGGTTGATGATGAGGAAGATTAGTTGTGTACACACAA
ACCGTTGCTACTTGTGGAATAGGGCGGCAATGTTCAAAATAGGCAGTTATGGTGAGGCTG
GTGGATTTTCAAATGACGGTTACTCAAGTCGGATTTACCGCCCTTTTAGGAACCCCCAAC
GTTATGGAGGGAAAGAACCAAAAAAAAAACAAAGACAGGATATGATAGTGTTCTCGAGAC
CTTGTTTCTCTGTTAGAGGGTCTTGTAACATGCCTTTATGTAATAAATTTTTTGAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU32TF U 19
AF RR2CU32JQ C 1
BS 1 18 RR2CU32JQ
BS 19 649 RR2CU32TF
BS 650 650 RR2CU32JQ
BS 651 683 RR2CU32TF
BS 684 779 RR2CU32JQ

RD RR2CU32TF 665 0 0
GGTTGATGATGAGGAGGATGAAGAGGAGGAGGAGGAGGATGAAGTGGATAATGTTGATCG
TGGTCTTGGTGGGTCAGGGAGTAGTACTGGACGGTTGATGAATGCGGTGGAGATTGATGG
GCATGAGCAAGGGGATGATGATGAGGATAATGATGGTGAGACTGGTGAAGACGACCAAGG
GGTTGAGGATGATGGTGAGTTTGGTGATGATGATGATGATGATGATGGTGAAGAGGAGGA
TGAAGAATCTGGTGAAGGGTACCTTGTTCAGCCAGTCTCTCAAGTGGAAGATCATGATGC
TGTGGGTAGTGACATCGAACCCATTAACGAGGACAACGATCCAGATGAAGAAGAAGAAGT
GGAAGATGATCTCCCAATGCCTGACCAGTCCTTGCCATCATCATCTCGTCCAAACAAAAA
ACGTGATGGTGATGAAGATGATGATGATGTTGATGATGATGATGATGATGACGATGACGA
TGATGGGGTTGATGATGAGGAAGATTAGTTGTGTACACACAAACCGTTGCTACTTGTGGA
ATAGGGCGGCAATGTTCAAAATAGGCAGTTATGGTGAGGCTGGTGGATTTTCAAATGACG
GTTACTCAAGTCGGATTTACCGCCCTTTTAG*AACCCCCAACGTTATGGAGGGAAAGAAC
CAAAA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2CU32JQ 779 0 0
TGATAATGAGGAAGATGGGGTTGATGATGAGGAGGATGAAGAGGAGGAGGAGGAGGATGA
AGTGGATAATGTTGATCGTGGTCTTGGTGGGTCAGGGAGTAGTACTGGACGGTTGATGAA
TGCGGTGGAGATTGATGGGCATGAGCAAGGGGATGATGATGAGGATAATGATGGTGAGAC
TGGTGAAGACGACCAAGGGGTTGAGGATGATGGTGAGTTTGGTGATGATGATGATGATGA
TGATGGTGAAGAGGAGGATGAAGAATCTGGTGAAGGGTACCTTGTTCAGCCAGTCTCTCA
AGTGGAAGATCATGATGCTGTGGGTAGTGACATCGAACCCATTAACGAGGACAACGATCC
AGATGAAGAAGAAGAAGTGGAAGATGATCTCCCAATGCCTGACCAGTCCTTGCCATCATC
ATTTCGTCCAAACAAAAAACGTGATGGTGATGAAGATGATGATGATGTTGATGATGATGA
TGATGATGACGATGACGATGATGGGGTTGATGATGAGGAAGATTAGTTGTGTACACACAA
ACCGTTGCTACTTGTGGAATAGGGCGGCAATGTTCAAAATAGGCAGTTATGGTGAGGCTG
GTGGATTTTCAAATGACGGTTACTCAAGTCGGATTTACCGCCCTTTTAGGAACCCCCAAC
GTTATGGAGGGAAAGAACCAAAAAAAAAACAAAGACAGGATATGATAGTGTTCTCGAGAC
CTTGTTTCTCTGTTAGAGGGTCTTGTAACATGCCTTTATGTAATAAATTTTTTGAAGTT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL4022Contig1 970 2 10 U
GGCATCACGAAACTCGTCAACGACACTTTGGCTACTGAGCATCTACTACCCAAAGCCACC
GACTCTACTACTTTATCCACAGATGATCTACTCAGAGCCATTGACTGTGGCACATCCGAA
GGTGGTCCTATTGGCCGACACTGGGTCTTGGATCCTATTGATGGCACCAAAGGATTTTTG
AGGGGAGATCAGTACGCGGTAGCACTAGGATTGCTTGAGGAAGGGAAAGTAGTTTTAGGT
GTCCTTGCTTGTCCAAACTTGCCATTAGCTTCCATAGCAGGCAACAACAAGAACAAGAAC
TCTTCTTCTTCTTCTTCAGACGAAACCGGATGCCTCTTCTTTGCTACGATTGGTTCAGGG
ACGTGCGTGCAGCCCTTGGACTCGAACTCCGAACCAGTCAAAGTACATGTGTCGAGCGTT
GAGAATCCGGAAGAGGCATCCTTCTTCGAGTCATTTGAAGGAGCTCACTCTCTTCACGAC
TTATCCAGTTCCATTGCCAATAAACTCGGTGTGAAAGCGCCGCCTGTTAGGATAGATAGC
CAAGCGAAGTATGGAGCTTTGTCTAGAGGAGATGGAGCTATATACTTACGGTTTCCTCAT
AAAGGATACCGTGAAAAGATTTGGGACCATGTCGCTGGTGCTATTGTTGTTACAGAGGCG
GGTGGAATCGTGACGGATGCAGCGGGAAAGCCACTGGATTTCTCGAAAGGGAAGTATCTT
GATTTGGACACAGGCATCATCGTTGCTAATGAGAAGCTTATGCCTTTGCTTTTGAAAGCT
GTTCGTGACTCCATTGCTGAGCAAGAGAATGCTTCTTCTTCATCTTTCTGATTCTTTCTC
TCTTTTGTGTGTCTTTGTATTTGCTATAACTCTTCCTTTCACCACCACTACAACTAAACA
TGTTTCATTACACAGTTAGAGTTTCTTCGATTTTCTATTTAAATAAGAAAAAACATGATG
TTACAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF81TF U 1
AF RR2GF81JQ C 288
BS 1 657 RR2GF81TF
BS 658 658 RR2GF81JQ
BS 659 710 RR2GF81TF
BS 711 711 RR2GF81JQ
BS 712 733 RR2GF81TF
BS 734 734 RR2GF81JQ
BS 735 748 RR2GF81TF
BS 749 749 RR2GF81JQ
BS 750 761 RR2GF81TF
BS 762 970 RR2GF81JQ

RD RR2GF81TF 761 0 0
GGCATCACGAAACTCGTCAACGACACTTTGGCTACTGAGCATCTACTACCCAAAGCCACC
GACTCTACTACTTTATCCACAGATGATCTACTCAGAGCCATTGACTGTGGCACATCCGAA
GGTGGTCCTATTGGCCGACACTGGGTCTTGGATCCTATTGATGGCACCAAAGGATTTTTG
AGGGGAGATCAGTACGCGGTAGCACTAGGATTGCTTGAGGAAGGGAAAGTAGTTTTAGGT
GTCCTTGCTTGTCCAAACTTGCCATTAGCTTCCATAGCAGGCAACAACAAGAACAAGAAC
TCTTCTTCTTCTTCTTCAGACGAAACCGGATGCCTCTTCTTTGCTACGATTGGTTCAGGG
ACGTGCGTGCAGCCCTTGGACTCGAACTCCGAACCAGTCAAAGTACATGTGTCGAGCGTT
GAGAATCCGGAAGAGGCATCCTTCTTCGAGTCATTTGAAGGAGCTCACTCTCTTCACGAC
TTATCCAGTTCCATTGCCAATAAACTCGGTGTGAAAGCGCCGCCTGTTAGGATAGATAGC
CAAGCGAAGTATGGAGCTTTGTCTAGAGGAGATGGAGCTATATACTTACGGTTTCCTCAT
AAAGGATACCGTGAAAAGATTTGGGACCATGTCGCTGGTGCTATTGTTGTTACAGAG*CG
GGTGGAATCGTGACGGATGCAGCGGGAAAGCCACTGGATTTCTCGAAAGG*AAGTATCTT
GATTTGGACACAG*CATCATCGTTGCTA*TGAGAAGCTTAT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2GF81JQ 683 0 0
CAAGAACAAGAACTCTTCTTCTTCTTCTTCAGACGAAACCGGATGCCTCTTCTTTGCTAC
GATTGGTTCAGGGACGTGCGTGCAGCCCTTGGACTCGAACTCCGAACCAGTCAAAGTACA
TGTGTCGAGCGTTGAGAATCCGGAAGAGGCATCCTTCTTCGAGTCATTTGAAGGAGCTCA
CTCTCTTCACGACTTATCCAGTTCCATTGCCAATAAACTCGGTGTGAAAGCGCCGCCTGT
TAGGATAGATAGCCAAGCGAAGTATGGAGCTTTGTCTAGAGGAGATGGAGCTATATACTT
ACGGTTTCCTCATAAAGGATACCGTGAAAAGATTTGGGACCATGTCGCTGGTGCTATTGT
TGTTACAGAGGCGGGTGGAATCGTGACGGATGCAGCGGGAAAGCCACTGGATTTCTCGAA
AGGGAAGTATCTTGATTTGGACACAGGCATCATCGTTGCTAATGAGAAGCTTATGCCTTT
GCTTTTGAAAGCTGTTCGTGACTCCATTGCTGAGCAAGAGAATGCTTCTTCTTCATCTTT
CTGATTCTTTCTCTCTTTTGTGTGTCTTTGTATTTGCTATAACTCTTCCTTTCACCACCA
CTACAACTAAACATGTTTCATTACACAGTTAGAGTTTCTTCGATTTTCTATTTAAATAAG
AAAAAACATGATGTTACAGAGCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4024Contig1 602 2 1 U
GGGAGAGCAATATTTGGAAGATGCGACGGCGAGAAGAAAAGCGACGGAAGTTACACGAAG
CTCTTATTCAAACACTGTATCCTCCTTCATCACCTCCGTCTCCTCCCTCTTCTCCATCTC
CGGTTGCGTTTGATGACGAACCGTTCGATGTAACACTCATAAACCCAGAGGATTACATGA
ACATTGATTCATCAAACCACGACGAGGACGACGTTGATGAAAACGAAGGAGACGAGTCAG
AGACAAAACCTAGTCGAGCGCAGAGGAAAAGGATACGAAAGAAGATGCTCAAAGAGGAAG
CAGCTCGACGGAGGAAAGTGATCGGACCTCTGCTTCCGACAGAAATGATTGATAGGCGTG
AAGACAAAGAAGAAGCAAGTTGCGTACAACCTGCTCGACTAAATGCCCAAGAGGAAAAAG
AAAAAGTGAGCTTTGAGGGCAATGATAAGACGAAAAAGGTCAAGAAGAGAAGAGAGGCAA
AGAAACTGGCGAAAGAGAGTTCTAAACCAACTTATACCTCTAAAATTTCCTAATCAGAGT
GAAAAAAAAAAACTAAACGGATACTTTATGTAATTTCACCAATAACACAAGGGTACTTTA
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2H651TF U 1
AF RR2H651JQB C 140
BS 1 602 RR2H651TF

RD RR2H651TF 602 0 0
GGGAGAGCAATATTTGGAAGATGCGACGGCGAGAAGAAAAGCGACGGAAGTTACACGAAG
CTCTTATTCAAACACTGTATCCTCCTTCATCACCTCCGTCTCCTCCCTCTTCTCCATCTC
CGGTTGCGTTTGATGACGAACCGTTCGATGTAACACTCATAAACCCAGAGGATTACATGA
ACATTGATTCATCAAACCACGACGAGGACGACGTTGATGAAAACGAAGGAGACGAGTCAG
AGACAAAACCTAGTCGAGCGCAGAGGAAAAGGATACGAAAGAAGATGCTCAAAGAGGAAG
CAGCTCGACGGAGGAAAGTGATCGGACCTCTGCTTCCGACAGAAATGATTGATAGGCGTG
AAGACAAAGAAGAAGCAAGTTGCGTACAACCTGCTCGACTAAATGCCCAAGAGGAAAAAG
AAAAAGTGAGCTTTGAGGGCAATGATAAGACGAAAAAGGTCAAGAAGAGAAGAGAGGCAA
AGAAACTGGCGAAAGAGAGTTCTAAACCAACTTATACCTCTAAAATTTCCTAATCAGAGT
GAAAAAAAAAAACTAAACGGATACTTTATGTAATTTCACCAATAACACAAGGGTACTTTA
CT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2H651JQB 463 0 0
ACCGTTCGATGTAACACTCATAAACCCAGAGGATTACATGAACATTGATTCATCAAACCA
CGACGAGGACGACGTTGATGAAAACGAAGGAGACGAGTCAGAGACAAAACCTAGTCGAGC
GCAGAGGAAAAGGATACGAAAGAAGATGCTCAAAGAGGAAGCAGCTCGACGGAGGAAAGT
GATCGGACCTCTGCTTCCGACAGAAATGATTGATAGGCGTGAAGACAAAGAAGAGGCAAG
TTGCGTACAACCTGCTCGACTAAATGCCCAAGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGCTTTGAGGG
CAATGATAAGACGAAAAAGGTCAAGAAGAGAAGAGAGGCAAAGAAACTGGCGAAAGAGAG
TTTTAAACCAACTTATACCTTTAAAATTTCCTAATCAGAGTGAAAAAAAAAAACTAAACG
GATACTTTATGTAATTTCACCAATAACACAAGGGTACTTTACT

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 2

CO CL4025Contig1 874 2 2 U
GTCCTCCGGGTAAAGGAGCTTTGTATATAAGGCCTCTGCTAATAGGGAGTGGCGCTAGCC
TCGGAGTAGCTCCAGCACCTGAGTACACGTTCCTCATCTACGCATCTCCTGTAGGAGACT
ACCATAAGGGAAGCTCAGGTCTGAACCTTAAAGTTGATCATAAGCATCACCGAGCACATT
CTGGTGGGACTGGTGGTGTCAAGAGTTGCACAAACTATTCCCCAATTGTGAAATCGCTGG
TAGAAGCAAAGTCATCAGGTTTCTCTGATGTCTTGTTCCTAGATGCTGCAACTGGCAGGA
ACATCGAAGAGGCGTCTGCATGTAACATCTTCATTCTCAAGGGGAATATTGTGTCTACTC
CGCCAACTTCCGGAACCATTTTACCAGGAATCACTAGGAAAAGCATAAGCGAGCTAGCTC
GTGATATCGGCTACCAGGTTCAAGAACGTGATGTTTCTGTGGATGAGTTATTAGAGGCAG
AAGAAGTGTTCTGCTCGGGAACTGCAATGGTCGTAAAAGCTGTTGAAACCGTGACCTTCC
ATGACAAGAAGGTAAAATACAGGACAGGAGAAGAGGCATTGTCTAAGGAGCTTCACTCGA
TGTTGACGAGTATTCAGACAGGTCTTGTTGAAGACACAAAAGGTTGGATGGTTGATATCG
ATCCTTGTCAAGGTTGAGAAGAAGATTATCTCCGAATAAGCTGTGATGCTAATGATCTTC
ATCTTTACTCAGTGGTGTATCTTTTCTCTTTTTAAGTGTTTTCTTTGTTTGCTTTATGTG
ACCTGTTACAAACTTACAATACACTAGGCAGTGTTGGTAGGCCTGCGCACGGATCGGATA
TCCGGGTTTTTGAAGGTATTTGTGATTTGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN24TF U 1
AF RR2EN24JQ C 193
BS 1 639 RR2EN24TF
BS 640 874 RR2EN24JQ

RD RR2EN24TF 639 0 0
GTCCTCCGGGTAAAGGAGCTTTGTATATAAGGCCTCTGCTAATAGGGAGTGGCGCTAGCC
TCGGAGTAGCTCCAGCACCTGAGTACACGTTCCTCATCTACGCATCTCCTGTAGGAGACT
ACCATAAGGGAAGCTCAGGTCTGAACCTTAAAGTTGATCATAAGCATCACCGAGCACATT
CTGGTGGGACTGGTGGTGTCAAGAGTTGCACAAACTATTCCCCAATTGTGAAATCGCTGG
TAGAAGCAAAGTCATCAGGTTTCTCTGATGTCTTGTTCCTAGATGCTGCAACTGGCAGGA
ACATCGAAGAGGCGTCTGCATGTAACATCTTCATTCTCAAGGGGAATATTGTGTCTACTC
CGCCAACTTCCGGAACCATTTTACCAGGAATCACTAGGAAAAGCATAAGCGAGCTAGCTC
GTGATATCGGCTACCAGGTTCAAGAACGTGATGTTTCTGTGGATGAGTTATTAGAGGCAG
AAGAAGTGTTCTGCTCGGGAACTGCAATGGTCGTAAAAGCTGTTGAAACCGTGACCTTCC
ATGACAAGAAGGTAAAATACAGGACAGGAGAAGAGGCATTGTCTAAGGAGCTTCACTCGA
TGTTGACGAGTATTCAGACAGGTCTTGTTGAAGACACAA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2EN24JQ 682 0 0
GTGGTGTCAAGAGTTGCACAAACTATTCCCCAATTGTGAAATCGCTGGTAGAAGCAAAGT
CATCAGGTTTCTCTGATGTCTTGTTCCTAGATGCTGCAACTGGCAGGAACATCGAAGAGG
CGTCTGCATGTAACATCTTCATTCTCAAGGGGAATATTGTGTCTACTCCGCCAACTTCCG
GAACCATTTTACCAGGAATCACTAGGAAAAGCATAAGCGAGCTAGCTCGTGATATCGGCT
ACCAGGTTCAAGAACGTGATGTTTCTGTGGATGAGTTATTAGAGGCAGAAGAAGTGTTCT
GCTCGGGAACTGCAATGGTCGTAAAAGCTGTTGAAACCGTGACCTTCCATGACAAGAAGG
TAAAATACAGGACAGGAGAAGAGGCATTGTCTAAGGAGCTTCACTCGATGTTGACGAGTA
TTCAGACAGGTCTTGTTGAAGACACAAAAGGTTGGATGGTTGATATCGATCCTTGTCAAG
GTTGAGAAGAAGATTATCTCCGAATAAGCTGTGATGCTAATGATCTTCATCTTTACTCAG
TGGTGTATCTTTTCTCTTTTTAAGTGTTTTCTTTGTTTGCTTTATGTGACCTGTTACAAA
CTTACAATACACTAGGCAGTGTTGGTAGGCCTGCGCACGGATCGGATATCCGGGTTTTTG
AAGGTATTTGTGATTTGCTTCC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL4026Contig1 1057 2 2 U
GATATGTTGATGCGGGACTCACTGAGAAAGCTGAGAAGGCTCTTCAGGAACTTGAGATGA
AAAACACGGAGAGGGATTTTAAGGCGTATCAGTTTCTTATTACATTGTATGGAAGACTTG
GGAAACTGTCTGAAGTTTATAGGATTTGGCGTTCTTTGAGGCTGGCTATGCCCAAAACCT
CGAATGTAGCTTATCTGAACATGATACAAGTGGTGGTGAATTTGAAAGATGTGCCTGGTG
CAGAGACACTGTTCAAGGAATGGCAAGCTAACTTTACTACTTATGACATCAGGGTTGCGA
ATGTGATGATTGGGGCTTATGCAAAAGAAGGTTTCATCGAAAAGGCAAAAGAGCTCAAGG
AGAAAGCTCCAAGAAGAGGTGGAAAGCCCAATGCTAAAACGTGGGAGATCTTCATGGATT
ACTATGTAAAGAGTGGGGATACGGCTCAAGCACTTGAGTGTATATCTAAGGCAGTTTTGA
TCGGCAAAGGAGATGGTGGTAAATGGTTACCGTCACGGGAAGCAGTTAGTACTTTGATGA
GCCAGTTCGGGGGAAAGAAAGATGTTAATGGAGCTGAGAATTTGTTGGAGATTTTGAAGA
AAGGAACTGATGATATAGGCGCAGAGATCTTTGAATCATTGGTAAGAACATATGCAGCAG
CAGGAAAGAGTCATCCTGCTATGCGCCAGCGTTTGAAGATGGACAAGGTTGAGGTTAATA
AAGCGACACAGAAGCTTCTTGATGAATTATGTCACGAAGAGTGAGCAAGTTCTGTTCCAT
CTCTCTTCCCCTTCAGGCAAGACACTAGTTATTCTCACAGCTCTGTTTCTTATTGGGTTA
TAAGAGTAGGCTCATTTTATATGATTGAGAATCCGCAAATCAAATCTTATGGGTCTGTTT
TACATTCACATATGACCGTTTGTTTCATGTGTTTTCTTTCGAGCCTTGCTTTCATTTACA
GTTGAGACAACAAAACTCTCTCACAGTGTAATCTCCTTTTTGGGAATCTAGGAACATCCA
ATGCCCTCATCCAGATAAGCTAATTAAGTTTCTCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT92TF U 1
AF RR2AT92JQ C 157
BS 1 616 RR2AT92TF
BS 617 1057 RR2AT92JQ

RD RR2AT92TF 616 0 0
GATATGTTGATGCGGGACTCACTGAGAAAGCTGAGAAGGCTCTTCAGGAACTTGAGATGA
AAAACACGGAGAGGGATTTTAAGGCGTATCAGTTTCTTATTACATTGTATGGAAGACTTG
GGAAACTGTCTGAAGTTTATAGGATTTGGCGTTCTTTGAGGCTGGCTATGCCCAAAACCT
CGAATGTAGCTTATCTGAACATGATACAAGTGGTGGTGAATTTGAAAGATGTGCCTGGTG
CAGAGACACTGTTCAAGGAATGGCAAGCTAACTTTACTACTTATGACATCAGGGTTGCGA
ATGTGATGATTGGGGCTTATGCAAAAGAAGGTTTCATCGAAAAGGCAAAAGAGCTCAAGG
AGAAAGCTCCAAGAAGAGGTGGAAAGCCCAATGCTAAAACGTGGGAGATCTTCATGGATT
ACTATGTAAAGAGTGGGGATACGGCTCAAGCACTTGAGTGTATATCTAAGGCAGTTTTGA
TCGGCAAAGGAGATGGTGGTAAATGGTTACCGTCACGGGAAGCAGTTAGTACTTTGATGA
GCCAGTTCGGGGGAAAGAAAGATGTTAATGGAGCTGAGAATTTGTTGGAGATTTTGAAGA
AAGGAACTGATGATAT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2AT92JQ 901 0 0
TGAGGCTGGCTATGCCCAAAACCTCGAATGTAGCT*ATCTGAACATGATACAAGTGGTGG
TGAATTTGAAAGATGTGCCTGGTGCAGAGACACTGTTCAAGGAATGGCAAGCTAACTTTA
CTACTTATGACATCAGGGTTGCGAATGTGATGATTGGGGCTTATGCAAAAGAAGGTTTCA
TCGAAAAGGCAAAAGAGCTCAAGGAGAAAGCTCCAAGAAGAGGTGGAAAGCCCAATGCTA
AAACGTGGGAGATCTTCATGGATTACTATGTAAAGAGTGGGGATACGGCTCAAGCACTTG
AGTGTATATCTAAGGCAGTTTTGATCGGCAAAGGAGATGGTGGTAAATGGTTACCGTCAC
GGGAAGCAGTTAGTACTTTGATGAGCCAGTTCGGGGGAAAGAAAGATGTTAATGGAGCTG
AGAATTTGTTGGAGATTTTGAAGAAAGGAACTGATGATATAGGCGCAGAGATCTTTGAAT
CATTGGTAAGAACATATGCAGCAGCAGGAAAGAGTCATCCTGCTATGCGCCAGCGTTTGA
AGATGGACAAGGTTGAGGTTAATAAAGCGACACAGAAGCTTCTTGATGAATTATGTCACG
AAGAGTGAGCAAGTTCTGTTCCATCTCTCTTCCCCTTCAGGCAAGACACTAGTTATTCTC
ACAGCTCTGTTTCTTATTGGGTTATAAGAGTAGGCTCATTTTATATGATTGAGAATCCGC
AAATCAAATCTTATGGGTCTGTTTTACATTCACATATGACCGTTTGTTTCATGTGTTTTC
TTTCGAGCCTTGCTTTCATTTACAGTTGAGACAACAAAACTCTCTCACAGTGTAATCTCC
TTTTTGGGAATCTAGGAACATCCAATGCCCTCATCCAGATAAGCTAATTAAGTTTCTCTC
G

QA 1 901 1 901
DS 



AS 1 2

CO CL4027Contig1 661 2 1 U
CGTTAGATGCCTTCTCATCTCTAGAGCTAGAGGTAGTCTCGACGGCGCGCCTGATCTTCC
GTCTTCCTCTTCGCAGTCCCTGTAACCGATTTCTCATCTTTAAGCCCATTAATCGAACAC
CCACGATCTGGAATCAATGCGAGTTTTAGGTTATGAGAGGCGGTGGGAATCGACTATAAA
AAGACTGGCCGCTCTTCACCCACCGTTGAAGTCCTCTTGATCCGGTTCTGGGCTGTCCCC
CGTGATGGAGAGCTCATGGGAATTGACATACTCTTACTTGATTGAGCAGAATTGTGAACT
CCTCTTCCTCCTCCCTGACTTCAAAGCCACTTTTTTTTATTACCAACGTTTTCAGCCATC
AAATTTTGTTCGCATTCACGATGAAGATTTGGTTGTCTCGGAGGTTTCGATTAAGAAGAA
TCAAAAAAACTCTTAAACAGGTCTGAACTTGATTACATCATGTTGCAATTCTTGGATATT
GATGTCATCAGATCTATCAGCAGTGTTCTTGGCTAGACCAAAGCTCTGGATTACTCTGGT
CGTCAGGCAACCATGTCGGATCCGTATACATATAACGACTTTACAAGATGTGAAAAATGA
AGTTGGCACCAATTATACTAATAACAATGGGTGATCAATTTGTTTATGTTAGGTTGATGG
T


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2HA14TF U 1
AF RR2HA14JQ C 6
BS 1 661 RR2HA14TF

RD RR2HA14TF 661 0 0
CGTTAGATGCCTTCTCATCTCTAGAGCTAGAGGTAGTCTCGACGGCGCGCCTGATCTTCC
GTCTTCCTCTTCGCAGTCCCTGTAACCGATTTCTCATCTTTAAGCCCATTAATCGAACAC
CCACGATCTGGAATCAATGCGAGTTTTAGGTTATGAGAGGCGGTGGGAATCGACTATAAA
AAGACTGGCCGCTCTTCACCCACCGTTGAAGTCCTCTTGATCCGGTTCTGGGCTGTCCCC
CGTGATGGAGAGCTCATGGGAATTGACATACTCTTACTTGATTGAGCAGAATTGTGAACT
CCTCTTCCTCCTCCCTGACTTCAAAGCCACTTTTTTTTATTACCAACGTTTTCAGCCATC
AAATTTTGTTCGCATTCACGATGAAGATTTGGTTGTCTCGGAGGTTTCGATTAAGAAGAA
TCAAAAAAACTCTTAAACAGGTCTGAACTTGATTACATCATGTTGCAATTCTTGGATATT
GATGTCATCAGATCTATCAGCAGTGTTCTTGGCTAGACCAAAGCTCTGGATTACTCTGGT
CGTCAGGCAACCATGTCGGATCCGTATACATATAACGACTTTACAAGATGTGAAAAATGA
AGTTGGCACCAATTATACTAATAACAATGGGTGATCAATTTGTTTATGTTAGGTTGATGG
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2HA14JQ 656 0 0
GATGCCTTCTCATCTCTAGAGCTAGAGGTAGTCTCGACGGCGCGCCTGATCTTCCGTCTT
CCTCTTCGCAGTCCCTGTAACCGATTTCTCATCTTTAAGCCCATTAATCGAACACCCACG
ATCTGGAATCAATGCGAGTTTTAGGTTATGAGAGGCGGTGGGAATCGACTATAAAAAGAC
TGGCCGCTCTTCACCCACCGTTGAAGTCCTCTTGATCCGGTTCTGGGCTGTCCCCCGTGA
TGGAGAGCTCATGGGAATTGACATACTCTTACTTGATTGAGCAGAATTGTGAACTCCTCT
TCCTCCTCCCTGACTTCAAAGCCACTTTTTTTTATTACCAACGTTTTCAGCCATCAAATT
TTGTTCGCATTCACGATGAAGATTTGGTTGTCTCGGAGGTTTCGATTAAGAAGAATCAAA
AAAACTCTTAAACAGGTCTGAACTTGATTACATCATGTTGCAATTCTTGGATATTGATGT
CATCAGATCTATCAGCAGTGTTCTTGGCTAGACCAAAGCTCTGGATTACTCTGGTCGTCA
GGCAACCATGTCGGATCCGTATACATATAACGACTTTACAAGATGTGAAAAATGAAGTTG
GCACCAATTATACTAATAACAATGGGTGATCAATTTGTTTATGTTAGGTTGATGGT

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL4028Contig1 916 2 4 U
GGGCTGATTGTGCAACGTTCGCAAGGGTGACGGAAAATCCCAGGGAATACAGAGAGACAT
GTCAAGGTTTAGATCACTGTTGCAAGCCTCAGTAAATGCAACGAAGAAGGCTTTTACGTG
GAACATTGAAGAATGGGTACCACCTGCAGAGAAGTATATATTTAAGTTCCATTCGAAAGA
AGACTTGAAGAGATGGCATCTCTATTCTGATTCTCAATATGGAGGATTATCTTCGGCTTC
CTTGGAGATCCCAGATGGAGGAAAAGGATCAGATGGAACTGGAATTTTCTCAGGGAACCT
TTCCGTAGACCTCAGTGAGGGATCAAAGTTGAACATCAGTCGCAGTGGCTTCTGTGGAAT
GCGCTCAAAGAAGTTTGATGGCTTCATTGATCTCGACGGGTATGATGCAATAGCCATGAG
GCTTAGAGGAGATGGAAGGTGTTATATCTCTACCATATATACGGAAAACTGGGTGAATTC
ACCGGGACAAACAGAAGATAACTCGTGGCAAGCTTTTGTCTTTGCTCCAAAGGACAGGTG
GTATACTGCTAAGATCCCTCTAGCTAGATACTTGCCAACGTGGAGAGGAAATGTTATAGA
TGTGGAAATGGAGATGAATCCAGGTCGAGTTCTGGGTATGTCACTGTCGGTAAACGCAGA
AGGTGGTGCGGTTGGAGCTAAATCAGGAGCAGGTGATTTCAGAGTTGAGATTGACTGGAT
CAAAGCCTTGAGAATGCCATGAATGGGTGAGAAGCATTATTGGCAATGTATGATGTTTTT
TTTGTTTTAGCTCTGTGAAAACCAGGCCTGAGTTGTGATACTTGGTGGCCAAATAGATTT
GTTGAATTGTAATTGGTCAACACTTTGAGCAATGTTTTAACTATGTTCATCAAATAAAAA
GAACATGATACAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FE21TF U 1
AF RR2FE21JQ C 319
BS 1 649 RR2FE21TF
BS 650 650 RR2FE21JQ
BS 651 661 RR2FE21TF
BS 662 916 RR2FE21JQ

RD RR2FE21TF 661 0 0
GGGCTGATTGTGCAACGTTCGCAAGGGTGACGGAAAATCCCAGGGAATACAGAGAGACAT
GTCAAGGTTTAGATCACTGTTGCAAGCCTCAGTAAATGCAACGAAGAAGGCTTTTACGTG
GAACATTGAAGAATGGGTACCACCTGCAGAGAAGTATATATTTAAGTTCCATTCGAAAGA
AGACTTGAAGAGATGGCATCTCTATTCTGATTCTCAATATGGAGGATTATCTTCGGCTTC
CTTGGAGATCCCAGATGGAGGAAAAGGATCAGATGGAACTGGAATTTTCTCAGGGAACCT
TTCCGTAGACCTCAGTGAGGGATCAAAGTTGAACATCAGTCGCAGTGGCTTCTGTGGAAT
GCGCTCAAAGAAGTTTGATGGCTTCATTGATCTCGACGGGTATGATGCAATAGCCATGAG
GCTTAGAGGAGATGGAAGGTGTTATATCTCTACCATATATACGGAAAACTGGGTGAATTC
ACCGGGACAAACAGAAGATAACTCGTGGCAAGCTTTTGTCTTTGCTCCAAAGGACAGGTG
GTATACTGCTAAGATCCCTCTAGCTAGATACTTGCCAACGTGGAGAGGAAATGTTATAGA
TGTGGAAATGGAGATGAATCCAGGTCGAGTTCTGGGTATGTCACTGTCG*TAAACGCAGA
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2FE21JQ 598 0 0
GGGATCAAAGTTGAACATCAGTCGCAGTGGCTTCTGTGGAATGCGCTCAAAGAAGTTTGA
TGGCTTCATTGATCTCGACGGGTATGATGCAATAGCCATGAGGCTTAGAGGAGATGGAAG
GTGTTATATCTCTACCATATATACGGAAAACTGGGTGAATTCACCGGGACAAACAGAAGA
TAACTCGTGGCAAGCTTTTGTCTTTGCTCCAAAGGACAGGTGGTATACTGCTAAGATCCC
TCTAGCTAGATACTTGCCAACGTGGAGAGGAAATGTTATAGATGTGGAAATGGAGATGAA
TCCAGGTCGAGTTCTGGGTATGTCACTGTCGGTAAACGCAGAAGGTGGTGCGGTTGGAGC
TAAATCAGGAGCAGGTGATTTCAGAGTTGAGATTGACTGGATCAAAGCCTTGAGAATGCC
ATGAATGGGTGAGAAGCATTATTGGCAATGTATGATGTTTTTTTTGTTTTAGCTCTGTGA
AAACCAGGCCTGAGTTGTGATACTTGGTGGCCAAATAGATTTGTTGAATTGTAATTGGTC
AACACTTTGAGCAATGTTTTAACTATGTTCATCAAATAAAAAGAACATGATACAAATC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL4029Contig1 568 2 2 U
GGGACCTTTGATTACGAGGATAGAAGAAAATGGATTCTTCACATTGCCATTATCGAAACT
ACATCCTTCTTCTAATTCTATTTTATTCATCTATGTTTGTTTTAGCTTCAAATATGAACA
TTTCTAGTGATGCAAGAGGCAGCAAAAGTGATAGTAACCCGAAAGAATATACAGACTGTG
GACGATATGAAGTTAAAAGGAGACAAATGACTGTATCTTGTTCTCAATACCCTGGATATA
TTATTACAAAGATCAATTTCGCTGATTATGGTAATCCTACCGGTTGTGAAGAAAATCATA
AAGTTTTTAGACATGGCAATTGTGGCGCAAAAGATACCTTGAGGATCGTCAAAAAGAATT
GTCTTGGAAAATACAAGTGTGGGCTTTTTGTTTCGGACGAGATGTTTGGTCCGAGTCACT
GCAAGAAAGATATTAAGCTCATTGTTCAATTCACATGCACAAAAGTTTAGGCTTTTTATT
TGCTCCTTAATTAAGGCCATAAAAATAATTCTGGTTTGTTTCCTTGTTTTAAGATTTAAT
TTTGTTAATTATTAAAGGATATTTTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2EV29TF U 1
AF RR2EV29JQ C 105
BS 1 566 RR2EV29TF
BS 567 568 RR2EV29JQ

RD RR2EV29TF 568 0 0
GGGACCTTTGATTACGAGGATAGAAGAAAATGGATTCTTCACATTGCCATTATCGAAACT
ACATCCTTCTTCTAATTCTATTTTATTCATCTATGTTTGTTTTAGCTTCAAATATGAACA
TTTCTAGTGATGCAAGAGGCAGCAAAAGTGATAGTAACCCGAAAGAATATACAGACTGTG
GACGATATGAAGTTAAAAGGAGACAAATGACTGTATCTTGTTCTCAATACCCTGGATATA
TTATTACAAAGATCAATTTCGCTGATTATGGTAATCCTACCGGTTGTGAAGAAAATCATA
AAGTTTTTAGACATGGCAATTGTGGCGCAAAAGATACCTTGAGGATCGTCAAAAAGAATT
GTCTTGGAAAATACAAGTGTGGGCTTTTTGTTTCGGACGAGATGTTTGGTCCGAGTCACT
GCAAGAAAGATATTAAGCTCATTGTTCAATTCACATGCACAAAAGTTTAGGCTTTTTATT
TGCTCCTTAATTAAGGCCATAAAAATAATTCTGGTTTGTTTCCTTGTTTTAAGATTTAAT
TTTGTTAATTATTAAAGGATATTTTC
AG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2EV29JQ 464 0 0
GCTTCAAATATGAACATTTCTAGTGATGCAAGAGGCAGCAAAAGTGATAGTAACCCGAAA
GAATATACAGACTGTGGACGATATGAAGTTAAAAGGAGACAAATGACTGTATCTTGTTCT
CAATACCCTGGATATATTATTACAAAGATCAATTTCGCTGATTATGGTAATCCTACCGGT
TGTGAAGAAAATCATAAAGTTTTTAGACATGGCAATTGTGGCGCAAAAGATACCTTGAGG
ATCGTCAAAAAGAATTGTCTTGGAAAATACAAGTGTGGGCTTTTTGTTTCGGACGAGATG
TTTGGTCCGAGTCACTGCAAGAAAGATATTAAGCTCATTGTTCAATTCACATGCACAAAA
GTTTAGGCTTTTTATTTGCTCCTTAATTAAGGCCATAAAAATAATTTTGGTTTGTTTCCT
TGTTTTAAGATTTAATTTTGTTAATTATTAAAGGATATTTTCGG

QA 1 464 1 464
DS 



AS 1 2

CO CL4030Contig1 1004 2 10 U
GCATGCATTCTGCTATGTGGAAGCCGTCCCTTTTGGGCAAGAACTGAGTCAGGAATTTTC
AGAGCAGTTCTGAAAACTGAACCGAGTTTTAGTGAACCTCCTTGGCCTTCATTGTCCTTT
GAAGCTAAAGATTTTGTTAAGCGGTTATTGTACAAAGACCCACGCAAACGAATGACAGCC
TCTCAAGCTTTGATGCATCCATGGATCTCGGGATGTAAGAAGATGAATATCCCATTTGAT
ATACTGATCTTCAGGCAGATCAAAGCATACTTGAAATCTTCTTCGTTGCGCAAAGCCGCT
TTGATGGCTCTGTCAAAGACATTGATTACAGATGAACTTGTTTATCTGAAAGCACAGTTT
GCACTCTTAGCACCTAACAAAAATGGCCTCACCACCTTGGATAACATCAGATCGGCACTT
GCTTCAAATGCGACAGAAGCAATGAAAGAGTCAAGGATACCAGACTTTCTTGCATTGTTA
AATGGACTTGAATACAAAGGGATGGATTTTGGAGAGTTTTGCGCAGCTTCCATCAGTGTT
CATCAGCATGAGTCACTCGATTGTTGGGAGCAGAGCGTTCGCCATGCTTATGAGCTCTTC
GAGATGAATGGAAACCGAGTTATCGTCATCGAAGAACTCGCTTCCGAACTGGGTGTTGGA
TCAACGATACCAGTACATACCATTCTACATGACTGGATTAGACACACTGATGGGAAACTA
AGCTTCTTGGGTTTTGTCAAACTGTTGCACGGTGTCTTTACTCGACAACAGCCTTTAGCT
AAAACACGGTGATGGATGGATGTTATGATGGATTCAAATGAGGAAAAAGCATATACATAG
GGAATGGAGAGATTGTCAAGAACTTTACTGATCTTTTGTTATGGAATTGAAAAAAAACTG
GAATTGTATTAAGACTCTCTCATTCATTCCCATGTTTATAGTGTTATAAAGAAATGCAAA
AGTTTTCAACAGAAGAAAGTAACTTTTAAAATTCAGACTGGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F870TF U 1
AF RR2AN45JQ C 203
BS 1 296 RR2F870TF
BS 297 297 RR2AN45JQ
BS 298 314 RR2F870TF
BS 315 315 RR2AN45JQ
BS 316 530 RR2F870TF
BS 531 531 RR2AN45JQ
BS 532 533 RR2F870TF
BS 534 534 RR2AN45JQ
BS 535 721 RR2F870TF
BS 722 1004 RR2AN45JQ

RD RR2F870TF 721 0 0
GCATGCATTCTGCTATGTGGAAGCCGTCCCTTTTGGGCAAGAACTGAGTCAGGAATTTTC
AGAGCAGTTCTGAAAACTGAACCGAGTTTTAGTGAACCTCCTTGGCCTTCATTGTCCTTT
GAAGCTAAAGATTTTGTTAAGCGGTTATTGTACAAAGACCCACGCAAACGAATGACAGCC
TCTCAAGCTTTGATGCATCCATGGATCTCGGGATGTAAGAAGATGAATATCCCATTTGAT
ATACTGATCTTCAGGCAGATCAAAGCATACTTGAAATCTTCTTCGTTGCGCAAAGCTGCT
TTGATGGCTCTGTCCAAGACATTGATTACAGATGAACTTGTTTATCTGAAAGCACAGTTT
GCACTCTTAGCACCTAACAAAAATGGCCTCACCACCTTGGATAACATCAGATCGGCACTT
GCTTCAAATGCGACAGAAGCAATGAAAGAGTCAAGGATACCAGACTTTCTTGCATTGTTA
AATGGACTTGAATACAAAGGGATGGATTTTGGAGAGTTTTGCGCAGCTTCGATTAGTGTT
CATCAGCATGAGTCACTCGATTGTTGGGAGCAGAGCGTTCGCCATGCTTATGAGCTCTTC
GAGATGAATGGAAACCGAGTTATCGTCATCGAAGAACTCGCTTCCGAACTGGGTGTTGGA
TCAACGATACCAGTACATACCATTCTACATGACTGGATTAGACACACTGATGGGAAACTA
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2AN45JQ 802 0 0
GGATCTCGGGATGTA*GAAGATGAATATCCCATTTGATATACTGATCTTCAGGCAGATCA
AGGCATACTTGAAATCTTCTTCTTTGCGCAAAGCCGCTTTGATGGCTCTGTCAAAGACAT
TGATTACAGATGAACTTGTTTATCTGAAAGCACAGTTTGCACTCTTAGCACCTAACAAAA
ATGGCCTCATCACCTTGGATAACATCAGATCGGCACTTGCTTCAAATGCGACAGAAGCAA
TGAAAGAGTCAAGGATACCAGACTTTCTTGCCTTGTTAAGTGGACTTGAATACAAAGGGA
TGGATTTTGGAGAGTTTTGCGCAGCTTCCATCAGTGTTCATCAGCATGAGTCACTTGATT
GTTGGGAGCAGAGCGTTCGCCATGCTTATGAGCTTTTCGAGATGAATGGAAACCGAGTTA
TCGTCATCGAAGAACTCGCTTCTGAACTGGGTGTTGGATCAACGATCCCAGTACATACCA
TTTTACATGACTGGATTAGACACACTGATGGGAAACTAAGCTTCTTGGGTTTTGTCAAAC
TGTTGCACGGTGTCTTTACTCGACAACAGCCTTTAGCTAAAACACGGTGATGGATGGATG
TTATGATGGATTCAAATGAGGAAAAAGCATATACATAGGGAATGGAGAGATTGTCAAGAA
CTTTACTGATCTTTTGTTATGGAATTGAAAAAAAACTGGAATTGTATTAAGACTCTCTCA
TTCATTCCCATGTTTATAGTGTTATAAAGAAATGCAAAAGTTTTCAACAGAAGAAAGTAA
CTTTTAAAATTCAGACTGGCCT

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL4031Contig1 632 2 2 U
GGATGATACCAACTGGAATTGATAAGATCTCTCCAGTTGGTATCATCAACGTTCCTCGGT
GCAGAAACGTGAAACGCGTAAGGAGGATGATGATCAGCGTCATCTTCCTTCACCACCACC
CTCTTCGGAGTAGTCACACCGGATTCAGATTCCGTCATCTCTTCTTCCACCGACGTACAA
TTCGCCATCAACATTATTGAAAAAATAATACACTTTTTGTTTCTTCTTCTTCTGAGACAA
CTACAGATTCAGATAACTCTCTTCTCAGTGAGAAACGGATTCGAGTGATTCTTATTTCAA
ACGTTTGTGGAAAGCGTATGAAATAAATGATTTGAAACGCCTGGGATTTGCGGATCTATC
AAACGGTCATCTCCTTTTTGTTGTCGGCTTCTACGTAATACCATTTATACCCTCGACGTT
TTTCTCGTGGAAGGTCTTTCCTTAAGGGGTAGAGTAGGTATAACGATAAAATTAGTAGTC
CGCGTTGGAGTGTGGGAGCCTGAAATGCAAGCGCGTATGTCTGCTGCCACGAGTGATTTC
ACCTTTGAGTACTTCTTACGATCCTATTATACCAAGAAAGCTTTTCTTATAATTAAATAT
CAAATTTTGTTTTTTTTTTTGATAAAAGGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED89TF U 1
AF RR2ED89JQ C 162
BS 1 619 RR2ED89TF
BS 620 632 RR2ED89JQ

RD RR2ED89TF 623 0 0
GGATGATACCAACTGGAATTGATAAGATCTCTCCAGTTGGTATCATCAACGTTCCTCGGT
GCAGAAACGTGAAACGCGTAAGGAGGATGATGATCAGCGTCATCTTCCTTCACCACCACC
CTCTTCGGAGTAGTCACACCGGATTCAGATTCCGTCATCTCTTCTTCCACCGACGTACAA
TTCGCCATCAACATTATTGAAAAAATAATACACTTTTTGTTTCTTCTTCTTCTGAGACAA
CTACAGATTCAGATAACTCTCTTCTCAGTGAGAAACGGATTCGAGTGATTCTTATTTCAA
ACGTTTGTGGAAAGCGTATGAAATAAATGATTTGAAACGCCTGGGATTTGCGGATCTATC
AAACGGTCATCTCCTTTTTGTTGTCGGCTTCTACGTAATACCATTTATACCCTCGACGTT
TTTCTCGTGGAAGGTCTTTCCTTAAGGGGTAGAGTAGGTATAACGATAAAATTAGTAGTC
CGCGTTGGAGTGTGGGAGCCTGAAATGCAAGCGCGTATGTCTGCTGCCACGAGTGATTTC
ACCTTTGAGTACTTCTTACGATCCTATTATACCAAGAAAGCTTTTCTTATAATTAAATAT
CAAATTTTGTTTTTTTTTT
GATA

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2ED89JQ 471 0 0
TTCTTCCACCGACGTACAATTCGCCATCAACATTATTGAAAAAATAATACACTTTTTGTT
TCTTCTTCTTCTGAGACAACTACAGATTCAGATAACTCTCTTCTCAGTGAGAAACGGATT
CGAGTGATTCTTATTTCAAACGTTTGTGGAAAGCGTATGAAATAAATGATTTGAAACGCC
TGGGATTTGCGGATCTATCAAACGGTCATCTCCTTTTTGTTGTCGGCTTCTACGTAATAC
CATTTATACCCTCGACGTTTTTCTCGTGGAAGGTCTTTCCTTAAGGGGTAGAGTAGGTAT
AACGATAAAATTAGTAGTCCGCGTTGGAGTGTGGGAGCCTGAAATGCAAGCGCGTATGTC
TGCTGCCACGAGTGATTTCACCTTTGAGTACTTCTTACGATCCTATTATACCAAGAAAGC
TTTTCTTATAATTAAATATCAAATTTTGTTTTTTTTTTTGATAAAAGGCTT

QA 1 471 1 471
DS 



AS 1 2

CO CL4032Contig1 853 2 16 U
TTTTTCTCTCTCCAAAAGCTCTCATTTCTCTCTAGCATCATCTTCATCGTGTTCTTCGTT
TCCGGCCGGCGGAGTTGGCTTCCATAGCCACCGCCGGTCGGGATTTGACTTTTTTCTCTG
TTTGTCCGTGGTTGCATGTCTTTTGCTCGGGTTTTTAGAATTTCAGATAGCTTTCTAGAT
CATCAGATCTCGCTTTTAGAGGTTGCGATTTGTCGATCGAGGTTCAATCGGCGATCTGGT
TGCATGTTCGATGTTACCTCTTGTGGTGGTTCCGCCGAGGTTGGAGGGTGTGCTATTTCT
TGTCTTCGTTTGCGTTGGGATTGAGCCTGGATTATTTATGTTATCTTCTGCTTCATGCAA
GGGTCCTCCTGTTCGTGATCAAGGAATAGGGGCTTTGGCTCTTTCTGCATCATGTCGTGG
GAGATTGAGAGTAAAAAGGTGTGTCCTTCATCTCCTTGGGTTTGCTGTCTGCGTTTCTTC
CTCGTGGCTAGTTGAAGTGATCTTACTAGCAATATAATGAGGTGCATCTGCTTCCCAAAT
AAAGTTCGATTATATGATGTGCGCTTATTCCCTCCTTCCTCCTTCGGTGGTTTCCTCTGG
CTTGGGTTTTTATTTGTTTTGATCTAGATTAGTTTGTTTGTCTGTTCTTAAAACCTCGTT
TGTAAAATTCTATGCCTTTGTTTCCGGAGATTCTCATATGTCTGCCGGCTAATGCTTCTG
GAGGGAGGTTGTTTCCTGCCAGCTATGTTTCTAAGAGTCATTATGACTCGTTAGCTTTGT
ATCTCATCATCATGTGTATTCCTCTGTTTAGTAATGAATGAATCCTCTAGTGTTAAAAAA
AAAGAGGTGGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FE28TF U 1
AF RR2FE28JQ C 71
BS 1 666 RR2FE28TF
BS 667 667 RR2FE28JQ
BS 668 691 RR2FE28TF
BS 692 692 RR2FE28JQ
BS 693 711 RR2FE28TF
BS 712 712 RR2FE28JQ
BS 713 735 RR2FE28TF
BS 736 736 RR2FE28JQ
BS 737 739 RR2FE28TF
BS 740 740 RR2FE28JQ
BS 741 749 RR2FE28TF
BS 750 750 RR2FE28JQ
BS 751 753 RR2FE28TF
BS 754 754 RR2FE28JQ
BS 755 799 RR2FE28TF
BS 800 853 RR2FE28JQ

RD RR2FE28TF 805 0 0
TTTTTCTCTCTCCAAAAGCTCTCATTTCTCTCTAGCATCATCTTCATCGTGTTCTTCGTT
TCCGGCCGGCGGAGTTGGCTTCCATAGCCACCGCCGGTCGGGATTTGACTTTTTTCTCTG
TTTGTCCGTGGTTGCATGTCTTTTGCTCGGGTTTTTAGAATTTCAGATAGCTTTCTAGAT
CATCAGATCTCGCTTTTAGAGGTTGCGATTTGTCGATCGAGGTTCAATCGGCGATCTGGT
TGCATGTTCGATGTTACCTCTTGTGGTGGTTCCGCCGAGGTTGGAGGGTGTGCTATTTCT
TGTCTTCGTTTGCGTTGGGATTGAGCCTGGATTATTTATGTTATCTTCTGCTTCATGCAA
GGGTCCTCCTGTTCGTGATCAAGGAATAGGGGCTTTGGCTCTTTCTGCATCATGTCGTGG
GAGATTGAGAGTAAAAAGGTGTGTCCTTCATCTCCTTGGGTTTGCTGTCTGCGTTTCTTC
CTCGTGGCTAGTTGAAGTGATCTTACTAGCAATATAATGAGGTGCATCTGCTTCCCAAAT
AAAGTTCGATTATATGATGTGCGCTTATTCCCTCCTTCCTCCTTCGGTGGTTTCCTCTGG
CTTGGGTTTTTATTTGTTTTGATCTAGATTAGTTTGTTTGTCTGTTCTTAAAACCTCGTT
TGTAAA*TTCTATGCCTTTGTTTCCGGAGAT*CTCATATGTCTGCCGGCTA*TGCTTCTG
GAGGGAGGTTGTTTC*TGC*AGCTATGTT*CTA*GAGTCATTATGACTCGTTAGCTTTGT
ATCTCATCATCATGTGTAT
CCTCTG

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2FE28JQ 783 0 0
GGAGTTGGCTTCCATAGCCACCGCCGGTCGGGATTTGACTTTTT*CTCTGTTTGTCCGTG
GTTGCATGTCTTTTGCTCGGGTTTTTAGAATTTCAGATAGCTTTCTAGATCATCAGATCT
CGCTTTTAGAGGTTGCGATTTGTCGATCGAGGTTCAATCGGCGATCTGGTTGCATGTTCG
ATGTTACCTCTTGTGGTGGTTCCGCCGAGGTTGGAGGGTGTGCTATTTCTTGTCTTCGTT
TGCGTTGGGATTGAGCCTGGATTATTTATGTTATCTTCTGCTTCATGCAAGGGTCCTCCT
GTTCGTGATCAAGGAATAGGGGCTTTGGCTCTTTCTGCATCATGTCGTGGGAGATTGAGA
GTAAAAAGGTGTGTCCTTCATCTCCTTGGGTTTGCTGTCTGCGTTTCTTCCTCGTGGCTA
GTTGAAGTGATCTTACTAGCAATATAATGAGGTGCATCTGCTTCCCAAATAAAGTTCGAT
TATATGATGTGCGCTTATTCCCTCCTTCCTCCTTCGGTGGTTTCCTCTGGCTTGGGTTTT
TATTTGTTTTGATCTAGATTAGTTTGTTTGTCTGTTCTTAAAACCTCGTTTGTAAAATTC
TATGCCTTTGTTTCCGGAGATTCTCATATGTCTGCCGGCTAATGCTTCTGGAGGGAGGTT
GTTTCCTGCCAGCTATGTTTCTAAGAGTCATTATGACTCGTTAGCTTTGTATCTCATCAT
CATGTGTATTCCTCTGTTTAGTAATGAATGAATCCTCTAGTGTTAAAAAAAAAGAGGTGG
TGT

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL4033Contig1 930 2 2 U
GGGGATCAAAGTTGCAGGAAACCCTAAATTTAGGATCAAATCCGCTGCGATATGGTAGGA
GGTGATGTGTTAGAACCGCGGACGGGAGTGTGGTGGGACCTCAACACGTGTCCGGTTCCC
GCTGGTGTTGAACCTGGTAGTGTCCGTGGGTGTATAGAATCTGCTTTGCACAACCAGATT
GGTCCTCATTCTAAAGTCATCATCTATGCCATGGGCAACCTAGAATTCATCTCTACTGAC
CTCTTGAGAGAGATCTCTTCCTCTGGAATCATTCTTATTCACGCCCCCTACCGTGGGAAC
GACTTAAAGCGTTTTCTGCGCGAATGGACTGAATGGTCTGAGCTTAAACCACCTCCCGTT
AACACAATGCTGATATCCGATGATAATACGATGGCTGATCCTGATCTTTTTCGGCCTTTT
GGATTCACTAATTTTTGTGTATATCCAAAAGGTCGTCGGCCTGTTACGCTTGATGACGAC
CTAAAAGATGAGAAAGTGTTTGTCAAAGAGTTTGTCTGGGAAACTTTATTGGATGATAAT
TATGACAACACAATCGTGAATAAGGAAGATGAACCTTTTTGCATTTGCGACGTATGCGAT
GTTTTTTTGGAAGAATGTGGGGAATTGATCTTTCATTTCAAGAGTGAAAGACACAGACAG
GAGGCTGAGAAAGAGGCTCAAGAAGATGATCGCGAGAGCAGGAAGAGAAATCCCGAAGTG
GCTTTTTTTTACGAGGAAAACAAAAAGCAATTTTTTGAACGAGTCATAATCGAAGATGTT
GACTAAGGAAGAAAAGAAGCTACAGTGCTTGCATGCATCCCCATGTCATTTTAGTATTTA
AATGAAGAATTTATTAATTTTATTTTACAGTTTATTTTTTTTAATAGGGGTAACTAAACG
GATAATGATTTTTATATAGAAAATAATCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF57TF U 1
AF RR2DF57JQ C 460
BS 1 556 RR2DF57TF
BS 557 930 RR2DF57JQ

RD RR2DF57TF 556 0 0
GGGGATCAAAGTTGCAGGAAACCCTAAATTTAGGATCAAATCCGCTGCGATATGGTAGGA
GGTGATGTGTTAGAACCGCGGACGGGAGTGTGGTGGGACCTCAACACGTGTCCGGTTCCC
GCTGGTGTTGAACCTGGTAGTGTCCGTGGGTGTATAGAATCTGCTTTGCACAACCAGATT
GGTCCTCATTCTAAAGTCATCATCTATGCCATGGGCAACCTAGAATTCATCTCTACTGAC
CTCTTGAGAGAGATCTCTTCCTCTGGAATCATTCTTATTCACGCCCCCTACCGTGGGAAC
GACTTAAAGCGTTTTCTGCGCGAATGGACTGAATGGTCTGAGCTTAAACCACCTCCCGTT
AACACAATGCTGATATCCGATGATAATACGATGGCTGATCCTGATCTTTTTCGGCCTTTT
GGATTCACTAATTTTTGTGTATATCCAAAAGGTCGTCGGCCTGTTACGCTTGATGACGAC
CTAAAAGATGAGAAAGTGTTTGTCAAAGAGTTTGTCTGGGAAACTTTATTGGATGATAAT
TATGACAACACAATCG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2DF57JQ 471 0 0
CCTGTTACGCTTGATGACGACCTAAAAGATGAGAAAGTGTTTGTCAAAGAGTTTGTTTGG
GAAACTTTATTGGATGATAATTATGACAACACAATCGTGAATAAGGAAGATGAACCTTTT
TGCATTTGCGACGTATGCGATGTTTTTTTGGAAGAATGTGGGGAATTGATCTTTCATTTC
AAGAGTGAAAGACACAGACAGGAGGCTGAGAAAGAGGCTCAAGAAGATGATCGCGAGAGC
AGGAAGAGAAATCCCGAAGTGGCTTTTTTTTACGAGGAAAACAAAAAGCAATTTTTTGAA
CGAGTCATAATCGAAGATGTTGACTAAGGAAGAAAAGAAGCTACAGTGCTTGCATGCATC
CCCATGTCATTTTAGTATTTAAATGAAGAATTTATTAATTTTATTTTACAGTTTATTTTT
TTTAATAGGGGTAACTAAACGGATAATGATTTTTATATAGAAAATAATCAA

QA 1 471 1 471
DS 



AS 1 2

CO CL4034Contig1 656 2 1 U
CGAGAATCCATCAGTGGTGAATCAGAAAACAATTTTTTTTTTTAAAACAGATTATTCGAT
AATGAAACAATAACAATAGTATATTCCAAAAAGAGCCGAGAAATCAATTATTGTCTTGAG
AATCCATTGAACGTCGATCTTCCATGGATACTTCTGTAACGCAGACGACAAAGACTCTGC
CTCCGGAAGATGAAGAAGACGATGATGAGTGGGACACTGATGGGTATGTGATTCCAAGCT
TGGAGATTAAACAAGAAAATGTTAATGATTCAGAAGCTAACACATCAAAACCTTCTTCTC
CTGAAATTAAATCTGAAGAAAGCATCTACCTAGGACCACATGGGGGAGCTCCTCCCTCGC
AGCTACAAGACGGTAACGCATCGAGCAGGAAGCAGCGGTTTAAGCAGAAGCTCAAGGAAG
CAGACCAGAAAATGAATGTGTCTGGTCGAGAAAACAAATTGGCCAACTTAAGAGAGCTTG
TAGGCGGCGTTGAGAAAGGAACTGATGTGTCAAAAGGTGTTTCAAGAGACTGGCTTGACC
CACATTGCCATGAGTCTCTGTTCGAGAAACGTCAACAACTGTAACGCCTCCTTTTTTCTC
TTTTGTAAACGTTTTGTATCAATACCCAGAGATTTCATCATTATTATCAAACAAAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AP84JQ C 1
AF RR2AP84TF U 1
BS 1 656 RR2AP84TF

RD RR2AP84JQ 656 0 0
CGAGAATCCATCAGTGGTGAATCAGAAAACAATTTTTTTTTTTAAAACAGATTATTCGAT
AATGAAACAATAACAATAGTATATTCCAAAAAGAGCCGAGAAATCAATTATTGTCTTGAG
AATCCATTGAACGTCGATCTTCCATGGATACTTCTGTAACGCAGACGACAAAGACTCTGC
CTCCGGAAGATGAAGAAGACGATGATGAGTGGGACACTGATGGGTATGTGATTCCAAGCT
TGGAGATTAAACAAGAAAATGTTAATGATTCAGAAGCTAACACATCAAAACCTTCTTCTC
CTGAAATTAAATCTGAAGAAAGCATCTACCTAGGACCACATGGGGGAGCTCCTCCCTCGC
AGCTACAAGACGGTAACGCATCGAGCAGGAAGCAGCGGTTTAAGCAGAAGCTCAAGGAAG
CAGACCAGAAAATGAATGTGTCTGGTCGAGAAAACAAATTGGCCAACTTAAGAGAGCTTG
TAGGCGGCGTTGAGAAAGGAACTGATGTGTCAAAAGGTGTTTCAAGAGACTGGCTTGACC
CACATTGCCATGAGTCTCTGTTCGAGAAACGTCAACAACTGTAACGCCTCCTTTTTTCTC
TTTTGTAAACGTTTTGTATCAATACCCAGAGATTTCATCATTATTATCAAACAAAC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2AP84TF 656 0 0
CGAGAATCCATCAGTGGTGAATCAGAAAACAATTTTTTTTTTTAAAACAGATTATTCGAT
AATGAAACAATAACAATAGTATATTCCAAAAAGAGCCGAGAAATCAATTATTGTCTTGAG
AATCCATTGAACGTCGATCTTCCATGGATACTTCTGTAACGCAGACGACAAAGACTCTGC
CTCCGGAAGATGAAGAAGACGATGATGAGTGGGACACTGATGGGTATGTGATTCCAAGCT
TGGAGATTAAACAAGAAAATGTTAATGATTCAGAAGCTAACACATCAAAACCTTCTTCTC
CTGAAATTAAATCTGAAGAAAGCATCTACCTAGGACCACATGGGGGAGCTCCTCCCTCGC
AGCTACAAGACGGTAACGCATCGAGCAGGAAGCAGCGGTTTAAGCAGAAGCTCAAGGAAG
CAGACCAGAAAATGAATGTGTCTGGTCGAGAAAACAAATTGGCCAACTTAAGAGAGCTTG
TAGGCGGCGTTGAGAAAGGAACTGATGTGTCAAAAGGTGTTTCAAGAGACTGGCTTGACC
CACATTGCCATGAGTCTCTGTTCGAGAAACGTCAACAACTGTAACGCCTCCTTTTTTCTC
TTTTGTAAACGTTTTGTATCAATACCCAGAGATTTCATCATTATTATCAAACAAAC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4036Contig1 585 2 17 U
GGGAGTCAGAGAGATCGAAAATGGTGACTAATACTGAAGTGGTATCTCCCGCAAGCAACG
GCGTTGACGGAGGATGTTGCAAGTCAGGTCCTGGTTACGCCACGCCACTCGCCGCCATGT
CTGGTCCATCGGAAAAGCTCATCCACGTCACCGCCGTCTACAGTGGAACGGGACGAGAGA
AGCCTGATTACTTGGCAACAGTAGATGTTGATCCAAACTCACCAACATATTCAACCGTCA
TCCACAGGTTACCAATGCCTTTTCTCGGTGATGAGCTTCATCACTCTGGCTGGAACTCTT
GCAGCTCTTGCCATGGTGATGCTTCCGCCGATCGACGTTTTCTCGTCTTACCATCCCTTA
TATCTGGTCGCATCTATGCGATCGATACAAAGGCAGACCCGAGGGCACCTTCCTTGTACA
AGTACGTGGATCCTAAAGAGATCGCTGATAAGACGGGACTGGCTTATCCACACACAGCTC
ATTGTCTTGCCTCTGGTGAAATCTTGGTCTCCTGTCTTGGAGACGAAGAGGGAAACGCCA
AGGGGAATGGGTTTCTTCTTCTCGACTCTGATTTCAACATCAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F529TF U 4
AF RR2GX36TF U 1
BS 1 196 RR2GX36TF
BS 197 197 RR2F529TF
BS 198 241 RR2GX36TF
BS 242 242 RR2F529TF
BS 243 265 RR2GX36TF
BS 266 266 RR2F529TF
BS 267 325 RR2GX36TF
BS 326 326 RR2F529TF
BS 327 328 RR2GX36TF
BS 329 329 RR2F529TF
BS 330 412 RR2GX36TF
BS 413 413 RR2F529TF
BS 414 442 RR2GX36TF
BS 443 443 RR2F529TF
BS 444 454 RR2GX36TF
BS 455 455 RR2F529TF
BS 456 585 RR2GX36TF

RD RR2F529TF 517 0 0
GGAG
AGAGAGATCGAAAATGGTGACTAATACTGAAGTGGTATCTCCCGCGAGCAACGGCGTTGA
CGGAGGATGTTGCAAGTCAGGTCCTGGTTACGCGACGCCACTCGCCGCCATGTCTGGTCC
ATCGGAAAAGCTCATCTACGTCACCGCCGTCTACAGTGGAACGGGACGAGAGAAGCCTGA
TTACTTGGCAACAGTAGATGTTGATCCAAACTCACCAACATATTCAACCGTCATCCACAG
GTTACCAATGCCTTTTCTCGGTGATGAGCTTCATCACTCTGGCTGGAACTCTTGCAGCTC
TTGCCATGGTGATGCTTCCGCCGATCGACGTTTTCTCGTCTTACCATCCCTTATATCTGG
TCGCATCTATGCGATTGATACAAAGGCAGACCCGAGGGCACCTTCCTTGTACAAGTACGT
GGATCCTAAAGAGATCGCTGATAAGACGGGATTGGCTTATCCACACACAGCTCATTGTCT
TGCCTCTGGTGAAATCTTGGTGTCCTGTCTTGG

QA 5 517 5 517
DS 

RD RR2GX36TF 585 0 0
GGGAGTCAGAGAGATCGAAAATGGTGACTAATACTGAAGTGGTATCTCCCGCAAGCAACG
GCGTTGACGGAGGATGTTGCAAGTCAGGTCCTGGTTACGCCACGCCACTCGCCGCCATGT
CTGGTCCATCGGAAAAGCTCATCCACGTCACCGCCGTCTACAGTGGAACGGGACGAGAGA
AGCCTGATTACTTGGCCACAGTAGATGTTGATCCAAACTCACCAACATATTCAACCGTCA
TTCACAGGTTACCAATGCCTTTTCTGGGTGATGAGCTTCATCACTCTGGCTGGAACTCTT
GCAGCTCTTGCCATGGTGATGCTTCGGCTGATCGACGTTTTCTCGTCTTACCATCCCTTA
TATCTGGTCGCATCTATGCGATCGATACAAAGGCAGACCCGAGGGCACCTTCTTTGTACA
AGTACGTGGATCCTAAAGAGATTGCTGATAAGACTGGACTGGCTTATCCACACACAGCTC
ATTGTCTTGCCTCTGGTGAAATCTTGGTCTCCTGTCTTGGAGACGAAGAGGGAAACGCCA
AGGGGAATGGGTTTCTTCTTCTCGACTCTGATTTCAACATCAAGA

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL4037Contig1 750 2 2 U
GGACTCTCTCTTTTCTACCTCTCTCTCACTGTTGTTTTCTCTCTGTGCTTTGAGATCTCC
ACGAACAAAATGGCTGCAAGATTCTTGTGGGCTTCCAGGGCTGCTTCTCATCTAAGGATC
TCCATCGCCCAACGAGGGTTTTCTTCAGTGGTTTTGAAGGATCTGAAGTATGCTGAATCA
CATGAATGGGTGAAGATTGATGGGAACAAAGCGACCTTTGGTATAACGGATCACGCTCAG
GACCACTTGGGTGATGTGGTCTACGTTGAGTTGCCTGACTTGGGGAGATCGGTGTCACAA
GGTGAGAGTTTTGGAGCGGTTGAGAGTGTGAAAGCTACTAGTGATATCAATTCTCCTGTC
TCCGGTAAGGTGGTGGAAGTTAATGAGGTGCTAGGCGAGTCCCCTGGATTGGTGAACACG
AGCCCGTATGAAGATGGATGGATCATAAAGGTGGAGCTGAGTGATGCAGGCGAGGTAGAG
AAGTTGATGGATTCTGACAAGTACTCCAAGTTCTGCGAAGAAGAAGACGCTAAGCACTGA
GCTTTTTTTTTTTCTTCTTGAAGCTTCCATTGCAACAGAGGTTGTTATTTTCTCAAACGA
AATCTTAATTTATCTACATGAATGAATCAAGAAAATCCTGAAGATTTCGATCTCTGCTTC
TCCTTTTATGTTTTTTGAACTCTCTATTGTTTGAGAATAAATGGTACAAGATAATAAGCT
TTGGCAGTTGCATTGATTTTATCTTTCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B842JQ C 1
AF RR2B842TF U 90
BS 1 89 RR2B842JQ
BS 90 750 RR2B842TF

RD RR2B842JQ 750 0 0
GGACTCTCTCTTTTCTACCTCTCTCTCACTGTTGTTTTCTCTCTGTGCTTTGAGATCTCC
ACGAACAAAATGGCTGCAAGATTCTTGTGGGCTTCCAGGGCTGCTTCTCATCTAAGGATC
TCCATCGCCCAACGAGGGTTTTCTTCAGTGGTTTTGAAGGATCTGAAGTATGCTGAATCA
CATGAATGGGTGAAGATTGATGGGAACAAAGCGACCTTTGGTATAACGGATCACGCTCAG
GACCACTTGGGTGATGTGGTTTACGTTGAGTTGCCTGACTTGGGGAGATCGGTGTCACAA
GGTGAGAGTTTTGGAGCGGTTGAGAGTGTGAAAGCTACTAGTGATATCAATTCTCCTGTC
TCCGGTAAGGTGGTGGAAGTTAATGAGGTGCTAGGCGAGTCCCCTGGATTGGTGAACACG
AGCCCGTATGAAGATGGATGGATCATAAAGGTGGAGCTGAGTGATGCAGGCGAGGTAGAG
AAGTTGATGGATTCTGACAAGTACTCCAAGTTCTGCGAAGAAGAAGACGCTAAGCACTGA
GCTTTTTTTTTTTCTTCTTGAAGCTTCCATTGCAACAGAGGTTGTTATTTTCTCAAACGA
AATCTTAATTTATCTACATGAATGAATCAAGAAAATCCTGAAGATTTCGATCTCTGCTTC
TCCTTTTATGTTTTTTGAACTCTCTATTGTTTGAGAATAAATGGTACAAGATAATAAGCT
TTGGCAGTTGCATTGATTTTATCTTTCATG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2B842TF 661 0 0
GGCTTCCAGGGCTGCTTCTCATCTAAGGATCTCCATCGCCCAACGAGGGTTTTCTTCAGT
GGTTTTGAAGGATCTGAAGTATGCTGAATCACATGAATGGGTGAAGATTGATGGGAACAA
AGCGACCTTTGGTATAACGGATCACGCTCAGGACCACTTGGGTGATGTGGTCTACGTTGA
GTTGCCTGACTTGGGGAGATCGGTGTCACAAGGTGAGAGTTTTGGAGCGGTTGAGAGTGT
GAAAGCTACTAGTGATATCAATTCTCCTGTCTCCGGTAAGGTGGTGGAAGTTAATGAGGT
GCTAGGCGAGTCCCCTGGATTGGTGAACACGAGCCCGTATGAAGATGGATGGATCATAAA
GGTGGAGCTGAGTGATGCAGGCGAGGTAGAGAAGTTGATGGATTCTGACAAGTACTCCAA
GTTCTGCGAAGAAGAAGACGCTAAGCACTGAGCTTTTTTTTTTTCTTCTTGAAGCTTCCA
TTGCAACAGAGGTTGTTATTTTCTCAAACGAAATCTTAATTTATCTACATGAATGAATCA
AGAAAATCCTGAAGATTTCGATCTCTGCTTCTCCTTTTATGTTTTTTGAACTCTCTATTG
TTTGAGAATAAATGGTACAAGATAATAAGCTTTGGCAGTTGCATTGATTTTATCTTTCAT
G

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL4038Contig1 888 2 4 U
GGGAGAGAAGAGAGACCTTAGCCACACACAAACTCTCCAAAAAGCTTTCGGCTTCGATTC
AACCCCAAATCAGTAAAAATAGGGTTACCAGAAGAACCCCACAGGGATTCCACAGAGGAA
CTGCATCACTCGCGTTCCTGCTGCGGCTTGAGGAAGAAGAAGAAGAGTAACGGTAACAGA
GACCAACACAAGGAGGAAGAGAAACCAAAGATGCAGCCAACAGAGCCTCCTGCTCAGCCT
CAGAGTCAGCAGATGGTGAGCTTGAGCTTTAGCAGTCAGATGTCGAGAGAAGACGAGGAG
ATGGCTCGCTCTGCTCTCTCTGCTTTTAGGGCTAAAGAGGATGAGATTGAGAAGAGAAAA
ATGGAGGTTCGTGAACGGGTCAAGGCTCAGCTGGGTCGGGTTGAGGAAGAGACCCGACGT
CTCGCTAACATCCGCGAGGAGCTTGAGACAATGGCAGATCCCATGAGGAAAGAAGTTTCT
TTGGTTCGAAAGAAGATTGATAGCGTCAACAAAGAACTCAAACCATTAGGCGCAACAGTT
CAAAAGAAGGAAAGGGAATACAAAGAAGCATTGGATACATTCAACGAGAAAAACCGTGAG
AAAGTTCAGCTAATCACCAAGCTAATGGAGTTGGTTGGAGAAAGCGAGAAGCTGAGGTTA
AAGAAGCTTGAAGAGCTTAGCAAGAGCATAGAAAACGAGTGAAGACTCTATCTCACAGAC
AAAAGACCAAGAACTAATTGGGCTTAGGATTATGGTTCTGTCTGATGTATTTATTTATTT
ATTTTTCATCAAGTTGGTGTGTTTTTTCGTGGGTGTTTTAGTTTTCATTTTCTTTTCCTA
AGTGGATTGATTTGTAGACTTATGATGGGGTGTTTTATGTTTTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN95TF U 1
AF RR2BN95JQ C 324
BS 1 656 RR2BN95TF
BS 657 657 RR2BN95JQ
BS 658 723 RR2BN95TF
BS 724 888 RR2BN95JQ

RD RR2BN95TF 740 0 0
GGGAGAGAAGAGAGACCTTAGCCACACACAAACTCTCCAAAAAGCTTTCGGCTTCGATTC
AACCCCAAATCAGTAAAAATAGGGTTACCAGAAGAACCCCACAGGGATTCCACAGAGGAA
CTGCATCACTCGCGTTCCTGCTGCGGCTTGAGGAAGAAGAAGAAGAGTAACGGTAACAGA
GACCAACACAAGGAGGAAGAGAAACCAAAGATGCAGCCAACAGAGCCTCCTGCTCAGCCT
CAGAGTCAGCAGATGGTGAGCTTGAGCTTTAGCAGTCAGATGTCGAGAGAAGACGAGGAG
ATGGCTCGCTCTGCTCTCTCTGCTTTTAGGGCTAAAGAGGATGAGATTGAGAAGAGAAAA
ATGGAGGTTCGTGAACGGGTCAAGGCTCAGCTGGGTCGGGTTGAGGAAGAGACCCGACGT
CTCGCTAACATCCGCGAGGAGCTTGAGACAATGGCAGATCCCATGAGGAAAGAAGTTTCT
TTGGTTCGAAAGAAGATTGATAGCGTCAACAAAGAACTCAAACCATTAGGCGCAACAGTT
CAAAAGAAGGAAAGGGAATACAAAGAAGCATTGGATACATTCAACGAGAAAAACCGTGAG
AAAGTTCAGCTAATCACCAAGCTAATGGAGTTGGTTGGAGAAAGCGAGAAGCTGAG*TTA
AAGAAGCTTGAAGAGCTTAGCAAGAGCATAGAAAACGAGTGAAGACTCTATCTCACAGAC
AAA
GACAAGACTAATTGGGC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2BN95JQ 565 0 0
TTTTAGGGCTAAAGAGGATGAGATTGAGAAGAGAAAAATGGAGGTTCGTGAACGGGTCAA
GGCTCAGCTGGGTCGGGTTGAGGAAGAGACCCGACGTCTCGCTAACATCCGCGAGGAGCT
TGAGACAATGGCAGATCCCATGAGGAAAGAAGTTTTTTTGGTTCGAAAGAAGATTGATAG
CGTCAACAAAGAACTCAAACCATTAGGCGCAACAGTTCAAAAGAAGGAAAGGGAATACAA
AGAAGCATTGGATACATTCAACGAGAAAAACCGTGAGAAAGTTCAGCTAATCACCAAGCT
AATGGAGTTGGTTGGAGAAAGCGAGAAGCTGAGGTTAAAGAAGCTTGAAGAGCTTAGCAA
GAGCATAGAAAACGAGTGAAGACTCTATCTCACAGACAAAAGACCAAGAACTAATTGGGC
TTAGGATTATGGTTCTGTCTGATGTATTTATTTATTTATTTTTCATCAAGTTGGTGTGTT
TTTTCGTGGGTGTTTTAGTTTTCATTTTCTTTTCCTAAGTGGATTGATTTGTAGACTTAT
GATGGGGTGTTTTATGTTTTTGATT

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL4039Contig1 422 2 2 U
AAAGCAAATGAGGAATGAAAAAGCTTTGTTGATGAACTCAATCATTCCCAAATGTAAGGC
TTTATTTAAAAGCTTGTTTCAAGAGTTGTGAAAAAAAAATATGAAAAGGAAAAGAAAAAA
AAAAAGTCTCTCTTTTGATGTTATTGGAATAGGTTCGAAAGGCGGAAGCACTGGCGCAAT
GGTTTTCCATAAACACAAGTGATCACCGCCTGTGTTGTTGGACGAACTTTGAGTTCTTGG
CGTCTTCCTCAGTGAATCCAGCGGTGAGCTTGGTGATGAGGACCCCGGTAACGGCAAAAC
CGGTGAAAAACGGCCAGCAACGTTTCCATTCCCTCTTGAAAAACACTGGCCATGGATCGA
ACAACCTCATTTCTCTCTCTCTCTCTCTAACACTTCGGCTCCTGTTGACTGCTTCCCGTT
CC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 
0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2C635TF C 1
AF RR2C635JQ U 2
BS 1 1 RR2C635TF
BS 2 422 RR2C635JQ

RD RR2C635TF 396 0 0
AAAGCAAATGAGGAATGAAAAAGCTTTGTTGATGAACTCAATCATTCGCAAATGTAAGGC
TTTATTTAAAAGCTTGTTTCAAGAGTTGTGAAAAAAAAATATGAAAAGGAAAAGAGAAGA
GAAGAGTCTCTCTTTTGATGTTATTGGAATAGGTTCGAAAGGCGGAAGCACTGGCGCAAT
GGTTTTCCATAAACACAAGTGATCACCGCCTGTGTTGTTGGACGAACTTTGAGTTCTTGG
CGTCTTCCTCAGTGAATCCAGCGGTGAGCTTGGTGATGAGGACGCCGGTAACGGCGAAAC
CGGTGAGAAACGGCCAGCAACGTTTCCATTCCCTCTTGAAGAACACTGGCCATGGATCGA
ACAACCTCATTTCTCTCTCTCTCTCTCTAACACTTC

QA 1 396 1 396
DS 

RD RR2C635JQ 421 0 0
AAGCAAATGAGGAATGAAAAAGCTTTGTTGATGAACTCAATCATTCCCAAATGTAAGGCT
TTATTTAAAAGCTTGTTTCAAGAGTTGTGAAAAAAAAATATGAAAAGGAAAAGAAAAAAA
AAAAGTCTCTCTTTTGATGTTATTGGAATAGGTTCGAAAGGCGGAAGCACTGGCGCAATG
GTTTTCCATAAACACAAGTGATCACCGCCTGTGTTGTTGGACGAACTTTGAGTTCTTGGC
GTCTTCCTCAGTGAATCCAGCGGTGAGCTTGGTGATGAGGACCCCGGTAACGGCAAAACC
GGTGAAAAACGGCCAGCAACGTTTCCATTCCCTCTTGAAAAACACTGGCCATGGATCGAA
CAACCTCATTTCTCTCTCTCTCTCTCTAACACTTCGGCTCCTGTTGACTGCTTCCCGTTC
C

QA 1 421 1 421
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4041Contig1 786 2 2 U
ACACTGACTCCATTTTCATATCTACGGGTGTATCGAGTGATGTTGGATTTATATCGACAT
CTATAGTTCAGATGCTTGCTGGCATTTTAGGTACTGCGCTTGTGGATGTATCCGGAAGAC
GTTCACTCCTACTGGTTTCTCAAGCTGGAATGTTCTTAGGTTGTCTTGCCACAGCCATTT
CGTTCTTCTTGAAGGAGAACCATTGCGGGGAAACAGGAACACCTATATTGGCTCTGATTA
GTGTCACGCTGTACTTTGGATCATATGGATTAGGCATGGGATCAATACCATCGATCATTG
CATCAGAGATTTATCCAGTAGATGTGAAGGGGGCAGCGGGAACAATGTGTGGCTTGGCCA
GCTCTATAAGCGCATGGCTCGTTGCTTACTCTTTCGGTTTCTTGTTTCACTGGAGTGCCA
CAGGAACATTTCTGATGTTTACCACAGTGACTGGCATTGGATTTGTGTTCATAGCTAAGC
TTGTTCCAGAGACTAAAGGAAAATCTTTAGAAGAAATCCAATCTCTTCTTCGTTTTTAGT
GACTCTCCTTGTGAAGATTCTACAATATCAACAGACATTTCCCCCAAAATAGAAAAAGTA
TGGGTCTAGCTTTAAACCTTATAACCTCAACTGTTATATTTAATAGGCAATCCACGGAAT
CAATGTAAAAGCTTCACCATTTTGTATATGATTTTAATATATAATCTGGAACTGTTAGGT
ATCAAATTTGTGTTGTGCCATCGTGATGAAATTCATAACTTGGATAACGAATGGACCATG
TTCAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO77TF U 1
AF RR2AO77JQ C 1
BS 1 643 RR2AO77TF
BS 644 786 RR2AO77JQ

RD RR2AO77TF 643 0 0
ACACTGACTCCATTTTCATATCTACGGGTGTATCGAGTGATGTTGGATTTATATCGACAT
CTATAGTTCAGATGCTTGCTGGCATTTTAGGTACTGCGCTTGTGGATGTATCCGGAAGAC
GTTCACTCCTACTGGTTTCTCAAGCTGGAATGTTCTTAGGTTGTCTTGCCACAGCCATTT
CGTTCTTCTTGAAGGAGAACCATTGCGGGGAAACAGGAACACCTATATTGGCTCTGATTA
GTGTCACGCTGTACTTTGGATCATATGGATTAGGCATGGGATCAATACCATCGATCATTG
CATCAGAGATTTATCCAGTAGATGTGAAGGGGGCAGCGGGAACAATGTGTGGCTTGGCCA
GCTCTATAAGCGCATGGCTCGTTGCTTACTCTTTCGGTTTCTTGTTTCACTGGAGTGCCA
CAGGAACATTTCTGATGTTTACCACAGTGACTGGCATTGGATTTGTGTTCATAGCTAAGC
TTGTTCCAGAGACTAAAGGAAAATCTTTAGAAGAAATCCAATCTCTTCTTCGTTTTTAGT
GACTCTCCTTGTGAAGATTCTACAATATCAACAGACATTTCCCCCAAAATAGAAAAAGTA
TGGGTCTAGCTTTAAACCTTATAACCTCAACTGTTATATTTAA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2AO77JQ 786 0 0
ACACTGACTCCATTTTCATATCTACGGGTGTATCGAGTGATGTTGGATTTATATCGACAT
CTATAGTTCAGATGCTTGCTGGCATTTTAGGTACTGCGCTTGTGGATGTATCCGGAAGAC
GTTCACTCCTACTGGTTTCTCAAGCTGGAATGTTCTTAGGTTGTCTTGCCACAGCCATTT
CGTTCTTCTTGAAGGAGAACCATTGCGGGGAAACAGGAACACCTATATTGGCTCTGATTA
GTGTCACGCTGTACTTTGGATCATATGGATTAGGCATGGGATCAATACCATCGATCATTG
CATCAGAGATTTATCCAGTAGATGTGAAGGGGGCAGCGGGAACAATGTGTGGCTTGGCCA
GCTCTATAAGCGCATGGCTCGTTGCTTACTCTTTCGGTTTCTTGTTTCACTGGAGTGCCA
CAGGAACATTTTTGATGTTTACCACAGTGACTGGCATTGGATTTGTGTTCATAGCTAAGC
TTGTTCCAGAGACTAAAGGAAAATCTTTAGAAGAAATCCAATCTCTTCTTCGTTTTTAGT
GACTCTCCTTGTGAAGATTTTACAATATCAACAGACATTTCCCCCAAAATAGAAAAAGTA
TGGGTCTAGCTTTAAACCTTATAACCTCAACTGTTATATTTAATAGGCAATCCACGGAAT
CAATGTAAAAGCTTCACCATTTTGTATATGATTTTAATATATAATCTGGAACTGTTAGGT
ATCAAATTTGTGTTGTGCCATCGTGATGAAATTCATAACTTGGATAACGAATGGACCATG
TTCAAT

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL4042Contig1 716 2 2 U
GCTCTGAAAACCACCACTACTCTCTCGTAAAGATCTAACCACAGACACATCATCCGCTCA
AGATGGAGAAGTACGAGCGTGTGGTGAAGAAGAAGGATGAGACGCCGATTGACGCCAATG
AGATTCGCATCACTAGTATGGGCAGAGCACGCAACTACATCACCTACGCCATGACTCTTC
TTCAGGAGAAAGGTTCGACTGAAGTTGTGTTCAAGGCAATGGGAAGAGCTATCAACAAGA
CTGTCAACATTGTAGAGCTCATTAAGAGAAGGATCCCTGATCTTCATCAGAACACATGTA
TTGGATCCACCGACATCACAGACACATGGGAACCTAAAGAAGAAGGCCTTCTACCTATTG
AGACCACAAGGCATGTGTCCATGATAACCATTACCCTATCCACCAAAGAGCTTAACACAT
CCTCCATTGGATACCAATGCCCGATTCCTATTGACTTGGTGAAGCCGTCAGGCGACATCG
ACTATGAAGGAGGAGAGGGTTCACCTGGTGGCAGAGGGAGGGGACGAGGAAGAGGAAGAG
GGAGAAGAGGTGGCAGAGGAAATGCATATGTTACACAAAACATAAAAAAAAAAAAAGAAA
AAAAAAGGCCAAGAGTCGTTTGATGTTTTGTTCTATCTCCTTGCTATCTCTCTCCCTCTA
TGTTTTGATTCTGTCCACGAAGAAGACATGTTTGCCATAAAGTGTATCTCCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H370TF U 1
AF RR2H370JQ C 176
BS 1 576 RR2H370TF
BS 577 716 RR2H370JQ

RD RR2H370TF 576 0 0
GCTCTGAAAACCACCACTACTCTCTCGTAAAGATCTAACCACAGACACATCATCCGCTCA
AGATGGAGAAGTACGAGCGTGTGGTGAAGAAGAAGGATGAGACGCCGATTGACGCCAATG
AGATTCGCATCACTAGTATGGGCAGAGCACGCAACTACATCACCTACGCCATGACTCTTC
TTCAGGAGAAAGGTTCGACTGAAGTTGTGTTCAAGGCAATGGGAAGAGCTATCAACAAGA
CTGTCAACATTGTAGAGCTCATTAAGAGAAGGATCCCTGATCTTCATCAGAACACATGTA
TTGGATCCACCGACATCACAGACACATGGGAACCTAAAGAAGAAGGCCTTCTACCTATTG
AGACCACAAGGCATGTGTCCATGATAACCATTACCCTATCCACCAAAGAGCTTAACACAT
CCTCCATTGGATACCAATGCCCGATTCCTATTGACTTGGTGAAGCCGTCAGGCGACATCG
ACTATGAAGGAGGAGAGGGTTCACCTGGTGGCAGAGGGAGGGGACGAGGAAGAGGAAGAG
GGAGAAGAGGTGGCAGAGGAAATGCATATGTTACAC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2H370JQ 541 0 0
TCTTCTTCAGGAGAAAGGTTCGACTGAAGTTGTGTTCAAGGCAATGGGAAGAGCTATCAA
CAAGACTGTCAACATTGTAGAGCTCATTAAGAGAAGGATCCCTGATTTTCATCAGAACAC
ATGTATTGGATCCACCGACATCACAGACACATGGGAACCTAAAGAAGAAGGCCTTCTACC
TATTGAGACCACAAGGCATGTGTCCATGATAACCATTACCCTATCCACCAAAGAGCTTAA
CACATCCTCCATTGGATACCAATGCCCGATTCCTATTGACTTGGTGAAGCCGTCAGGCGA
CATCGACTATGAAGGAGGAGAGGGTTCACCTGGTGGCAGAGGGAGGGGACGAGGAAGAGG
AAGAGGGAGAAGAGGTGGCAGAGGAAATGCATATGTTACACAAAACATAAAAAAAAAAAA
AGAAAAAAAAAGGCCAAGAGTCGTTTGATGTTTTGTTCTATCTCCTTGCTATCTCTCTCC
CTCTATGTTTTGATTCTGTCCACGAAGAAGACATGTTTGCCATAAAGTGTATCTCCTTTT
T

QA 1 541 1 541
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4044Contig1 981 2 4 U
GACCATTTATTCTCTCTCTCTTTTTTTTCTCCAGACTTGTTTCTGCACAAAAATGTTTTA
TTTTGCTTCTTCTTTTTTTTTCGAACACCAAAATGTTTTATTTTGCTAAGGAAGAAAAAG
TTGAATTATTCTTTAACACTATACTAGTTAGAGAGTTTTTCTTTCTCTCTCTAATTTCCT
CTGATCTCTCGCTAAGCCAAATCTCATTCGTAAAACTCGACTCCGGCCGACGGGTGGGCT
TCCACAGCCACCGTCGGTCCGGTTTTAAGCTTTTCTCATTTTTCTTTTTTTCTCTTTTCG
GCTTTTCTTTAGATAGTTTGCATGTTTGTTTTTGATTTTACTGTTCTGGTATCGCACCGT
CTGGTGGACGACCGGCTTTGCCTCTGGGACCGTGCCGTCTCCTTTGACAGTGGTAGCCGA
CTTCTGTTTCCGGGAGTGAAGGCTTACCTAGCTTCGTATCTCCGGCGTTTCTGGTTCTCT
CAAGAATGGGTAGTCACGAGACCGATAATTTGTTAAAGCTCTGACGGTTTGGGGAGAGAT
CTCGACGACATCGATTGGAAGCTCTACGACGGGTGGAGATCGTTTAGCAAAGGCGTGGTG
TGTGATTTAATGTTTTCCGGATGAGATCTCGTTTTGACGATGGAAGCTTTCTGGTAAAAG
CTTTTCGGTGTTAGGGTGAGTGCGGTGATTTGTCGACGGCGTGTTCCGGCAAAATATCAG
TTGTTTTGTTTTTCTCCGGCGAAAATCCCGACTTTTAGATGACAATGTTATGGTTGGCTG
ACGCGTGACTCGTGCGAACGGCGGAGTTTAACGCGTGGACGGTCAGAGAAAAAGATCATG
ACGCGTGGAAGGACGCGTAGTTACTGGTTTGGGCTTGCGGCCCGTTTCGATAGCTCTTCA
TGTTGGGCTTATGTCGTTTTGTAATCGGACCTGAATGGTCTTTTGTTTTTTCGGTTGGAG
ATGAGTCTTTTTTGGGTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F244TF U 1
AF RR2F244JQ C 292
BS 1 658 RR2F244TF
BS 659 659 RR2F244JQ
BS 660 693 RR2F244TF
BS 694 981 RR2F244JQ

RD RR2F244TF 693 0 0
GACCATTTATTCTCTCTCTCTTTTTTTTCTCCAGACTTGTTTCTGCACAAAAATGTTTTA
TTTTGCTTCTTCTTTTTTTTTCGAACACCAAAATGTTTTATTTTGCTAAGGAAGAAAAAG
TTGAATTATTCTTTAACACTATACTAGTTAGAGAGTTTTTCTTTCTCTCTCTAATTTCCT
CTGATCTCTCGCTAAGCCAAATCTCATTCGTAAAACTCGACTCCGGCCGACGGGTGGGCT
TCCACAGCCACCGTCGGTCCGGTTTTAAGCTTTTCTCATTTTTCTTTTTTTCTCTTTTCG
GCTTTTCTTTAGATAGTTTGCATGTTTGTTTTTGATTTTACTGTTCTGGTATCGCACCGT
CTGGTGGACGACCGGCTTTGCCTCTGGGACCGTGCCGTCTCCTTTGACAGTGGTAGCCGA
CTTCTGTTTCCGGGAGTGAAGGCTTACCTAGCTTCGTATCTCCGGCGTTTCTGGTTCTCT
CAAGAATGGGTAGTCACGAGACCGATAATTTGTTAAAGCTCTGACGGTTTGGGGAGAGAT
CTCGACGACATCGATTGGAAGCTCTACGACGGGTGGAGATCGTTTAGCAAAGGCGTGGTG
TGTGATTTAATGTTTTCCGGATGAGATCTCGTTTTGACGATGGAAGCTTTCTGGTAAA*G
CTTTTCGGTGTTAGGGTGAGTGCGGTGATTTGT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2F244JQ 690 0 0
CTCTTTTCGGCTTTTCTTTAGATAGTTTGCATGTTTGTTTTTGATTTTACTGTTCTGGTA
TCGCACCGTCTGGTGGACGACCGGCTTTGCCTCTGGGACCGTGCCGTCTCCTTTGACAGT
GGTAGCCGACTTCTGTTTCCGGGAGTGAAGGCTTACCTAGCTTCGTATCTCCGGCGTTTC
TGGTTCTCTCAAGAATGGGTAGTCACGAGACCGATAATTTGTTAAAGCTCTGACGGTTTG
GGGAGAGATCTCGACGACATCGATTGGAAGCTCTACGACGGGTGGAGATCGTTTAGCAAA
GGCGTGGTGTGTGATTTAATGTTTTCCGGATGAGATCTCGTTTTGACGATGGAAGCTTTC
TGGTAAAAGCTTTTCGGTGTTAGGGTGAGTGCGGTGATTTGTCGACGGCGTGTTCCGGCA
AAATATCAGTTGTTTTGTTTTTCTCCGGCGAAAATCCCGACTTTTAGATGACAATGTTAT
GGTTGGCTGACGCGTGACTCGTGCGAACGGCGGAGTTTAACGCGTGGACGGTCAGAGAAA
AAGATCATGACGCGTGGAAGGACGCGTAGTTACTGGTTTGGGCTTGCGGCCCGTTTCGAT
AGCTCTTCATGTTGGGCTTATGTCGTTTTGTAATCGGACCTGAATGGTCTTTTGTTTTTT
CGGTTGGAGATGAGTCTTTTTTGGGTCTTG

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL4045Contig1 847 2 2 U
TACGTTAATGGAGCCCGTGTTTATCCTCAGGCTGGTGGCGGGTTCACAATCAATGTTAAC
CCTGTTGGCCTACTCCTACCACCACCTCAAGCTGGTGATGTTAAGGAGGAACATGAATCT
GAAAACCCTAAACTCCCTTATCCATCTCTGAAAGCTAACCCTAAGGTTTTCTTTGATATG
ACGGCTTGCGGTAAACCTATTGGTCGGATCGTGATGGAGCTCTTTGCCGACACGACCCCT
CGGACGGCTGAGAATTTCCGCGCCCTCTGTACTGGCGAAAAGGCATGGGGAAGCTTGGTA
AGCCACTCCATTACAAAGGATCAATCATCCACCATATGTGCGCCGATTATATGATTGGCG
GAGGAGATTTCACTCACGAAATTAAAGGATGCGGAGGCGAATCAATCTACGACAGTGGGT
TTTTTCGAGGATGAGAACTTCATCAAAAAGCACACCGGTCCAGGTATCCTCTCCATGAAC
AGCGGTGGTCCTGACACCAACCAATCTCAATTTATGATCTGCTTGACGGAGTGCCCGGAA
CTCGACGATGAACACGTCGTGTTCGGCCAAGTTGTTGAAGGATTGGATGTGGTCAGGATC
ATTTCAAAGATATCTGTTAGGGACAAGCTTTCCAGGCCCGTGGTGATCGCCGACTGCGGT
CAGATTTCATAGATTTGAGATATTTTCAAGTACAATGGTTGGCTTGTGTCCTTTTGATGT
TTGGTCGGGTGCTTTTTTCTTTTTGTTTCTCTGTTTTTCTTTTTCTTGAACTTAGATATT
GGCTACCATTGAAAAATGATAACCATCATCAGTTTTAGCTATAATTTCTATTGCAGAAAC
ATTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C066TF U 1
AF RR2C066JQ C 141
BS 1 546 RR2C066TF
BS 547 847 RR2C066JQ

RD RR2C066TF 546 0 0
TACGTTAATGGAGCCCGTGTTTATCCTCAGGCTGGTGGCGGGTTCACAATCAATGTTAAC
CCTGTTGGCCTACTCCTACCACCACCTCAAGCTGGTGATGTTAAGGAGGAACATGAATCT
GAAAACCCTAAACTCCCTTATCCATCTCTGAAAGCTAACCCTAAGGTTTTCTTTGATATG
ACGGCTTGCGGTAAACCTATTGGTCGGATCGTGATGGAGCTCTTTGCCGACACGACCCCT
CGGACGGCTGAGAATTTCCGCGCCCTCTGTACTGGCGAAAAGGCATGGGGAAGCTTGGTA
AGCCACTCCATTACAAAGGATCAATCATCCACCATATGTGCGCCGATTATATGATTGGCG
GAGGAGATTTCACTCACGAAATTAAAGGATGCGGAGGCGAATCAATCTACGACAGTGGGT
TTTTTCGAGGATGAGAACTTCATCAAAAAGCACACCGGTCCAGGTATCCTCTCCATGAAC
AGCGGTGGTCCTGACACCAACCAATCTCAATTTATGATCTGCTTGACGGAGTGCCCGGAA
CTCGAC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2C066JQ 707 0 0
TCCATCTCTGAAAGCTAACCCTAAGGTTTTCTTTGATATGACGGCTTGCGGTAAACCTAT
TGGTCGGATCGTGATGGAGCTCTTTGCCGACACGACCCCTCGGACGGCTGAGAATTTCCG
CGCCCTCTGTACTGGCGAAAAGGCATGGGGAAGCTTGGTAAGCCACTCCATTACAAAGGA
TCAATCATCCACCATATGTGCGCCGATTATATGATTGGCGGAGGAGATTTCACTCACGAA
ATTAAAGGATGCGGAGGCGAATCAATTTACGACAGTGGGTTTTT*CGAGGATGAGAACTT
CATCAAAAAGCACACCGGTCCAGGTATCCTCTCCATGAACAGCGGTGGTCCTGACACCAA
CCAATCTCAATTTATGATCTGCTTGACGGAGTGCCCGGAACTCGACGATGAACACGTCGT
GTTCGGCCAAGTTGTTGAAGGATTGGATGTGGTCAGGATCATTTCAAAGATATCTGTTAG
GGACAAGCTTTCCAGGCCCGTGGTGATCGCCGACTGCGGTCAGATTTCATAGATTTGAGA
TATTTTCAAGTACAATGGTTGGCTTGTGTCCTTTTGATGTTTGGTCGGGTGCTTTTTTCT
TTTTGTTTCTCTGTTTTTCTTTTTCTTGAACTTAGATATTGGCTACCATTGAAAAATGAT
AACCATCATCAGTTTTAGCTATAATTTCTATTGCAGAAACATTTCAG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL4046Contig1 663 2 2 U
GGGCTCGCCGGCATAAAAGACGCAAAGAGGTAGCAGAAGACACAGTATCAAGACTGAAAA
TGAAGGGACGCCAAGGAGAGAGAGTTAGATTGTACGTTCGAGGAACAGTCCTAGGTTACA
AGAGGTCGAAGTCGAACCAATACCCAAACACATCTCTGATCCAGATTGAAGGAGTGAACA
CAACAGAGGAGGTTACTTGGTACAAGGGAAAGCGCATGGCTTACATCTACAAGGCGAAGA
CAAAGAAGAACGGTTCTCACTACCGTTGCATCTGGGGCAAAGTCGCTAGGCCACATGGTA
ACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAGTTCACTTCAAACCTACCACCAAAGTCAATGGGGCTAG
AGTTAGAGTGTTCATGTACCCAAGCAACATATGAGAGGAGGATAGATTCAAGACATGGAA
TTAATTTTCACAGTTATCAGAAGGGAGGCTCCAATTTTGATTTCCTCAGAAGCTAATATA
GTTTATCCTATATTCAACTTTTTTTTTCATAGACTGTCGATGTTAAAACATTAATTTTGA
TGGAATTGCAAAAACAAAAGAGTTCCCAATTTATTTTCTCTACATTTTTTTCCATTGATA
TTCTTTCTATGAATATCAAAAAGTGTTAAAGAAATTGAAGTAGTCAACCCTTTTTATGAT
GTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2G138TF U 1
AF RR2G138JQ C 1
BS 1 622 RR2G138TF
BS 623 663 RR2G138JQ

RD RR2G138TF 622 0 0
GGGCTCGCCGGCATAAAAGACGCAAAGAGGTAGCAGAAGACACAGTATCAAGACTGAAAA
TGAAGGGACGCCAAGGAGAGAGAGTTAGATTGTACGTTCGAGGAACAGTCCTAGGTTACA
AGAGGTCGAAGTCGAACCAATACCCAAACACATCTCTGATCCAGATTGAAGGAGTGAACA
CAACAGAGGAGGTTACTTGGTACAAGGGAAAGCGCATGGCTTACATCTACAAGGCGAAGA
CAAAGAAGAACGGTTCTCACTACCGTTGCATCTGGGGCAAAGTCGCTAGGCCACATGGTA
ACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAGTTCACTTCAAACCTACCACCAAAGTCAATGGGGCTAG
AGTTAGAGTGTTCATGTACCCAAGCAACATATGAGAGGAGGATAGATTCAAGACATGGAA
TTAATTTTCACAGTTATCAGAAGGGAGGCTCCAATTTTGATTTCCTCAGAAGCTAATATA
GTTTATCCTATATTCAACTTTTTTTTTCATAGACTGTCGATGTTAAAACATTAATTTTGA
TGGAATTGCAAAAACAAAAGAGTTCCCAATTTATTTTCTCTACATTTTTTTCCATTGATA
TTCTTTCTATGAATATCAAAAA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2G138JQ 663 0 0
GGGCTCGCCGGCATAAAAGACGCAAAGAGGTAGCAGAAGACACAGTATCAAGACTGAAAA
TGAAGGGACGCCAAGGAGAGAGAGTTAGATTGTACGTTCGAGGAACAGTCCTAGGTTACA
AGAGGTCGAAGTCGAACCAATACCCAAACACATCTCTGATCCAGATTGAAGGAGTGAACA
CAACAGAGGAGGTTACTTGGTACAAGGGAAAGCGCATGGCTTACATCTACAAGGCGAAGA
CAAAGAAGAACGGTTCTCACTACCGTTGCATCTGGGGCAAAGTCGCTAGGCCACATGGTA
ACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAGTTCACTTCAAACCTACCACCAAAGTCAATGGGGCTAG
AGTTAGAGTGTTCATGTACCCAAGCAACATATGAGAGGAGGATAGATTCAAGACATGGAA
TTAATTTTCACAGTTATCAGAAGGGAGGCTCCAATTTTGATTTCCTCAGAAGCTAATATA
GTTTATCCTATATTCAACTTTTTTTTTCATAGACTGTCGATGTTAAAACATTAATTTTGA
TGGAATTGCAAAAACAAAAGAGTTCCCAATTTATTTTCTCTACATTTTTTTCCATTGATA
TTCTTTCTATGAATATCAAAAAGTGTTAAAGAAATTGAAGTAGTCAACCCTTTTTATGAT
GTT

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL4047Contig1 1157 2 2 U
GGGTTGTTAAATTCTTGTAGGACTGTGTCAGAGATAGTCGGCGCAGAGAGATAGAGATGG
AGGAAGCTCTGAAGATACAGTCTTTGTTCATTTATCCGATCAAATCTTGCCGTGGAATCT
CCGTCCCTCAGGCAACCGTAACTCACACTGGATTTCAATGGGACCGGTATTGGTTAGTGG
TGAACTACAAAGGAAGAGCATACACTCAAAGAGTTGAGCCAAAGCTTGCTCTTGTCGAAA
CTGAGCTCCCCAAGGAAGCCTTCTTGGAAGATTGGGAGCCAACAAAAGACTCATTTTTGG
TGGTAAAAGCTCCAGGTATGAGTCCGTTAAAGATTCCATTGACTAAGCCGAGCTCGATCG
CAGAAGGTGTGTCTATGTGGGAGTGGTCTGGCTCTGCGTTTGATGAGGGAGAAGAAGCTG
CAAAATGGTTTTCAGATTATCTTGGCAAACAAAGCCGTTTGGTTCGGTTTAACAAAGAAA
CTGAAACCAGGCCTTCACCTCCTGAGTTTGCAGCAGGCTACTCTACAACGTTTACAGATA
TGTTTCCCTTCTTGTTTGCATCTCAGGCTTCTTTAGACCAGCTGAATACACTACTCCCCA
GAACCGGTGCCTATTAACCGTTTTCGACCAAATTTTCTTGTGGATAACTGTGATCCTTTT
GGTGAAGATCTTTGGGATGAAATCAAGATTAACGAATTAGTCTTCCAAGGAGTTAGGCTG
TGTAGCCGCTGCAAGGTACCACTTGTGAATCAAGAAACCGGAGTTCCAGATGTAGCAGAA
CCAACTGAAACTTTGATGAAATTCAGATCAGACAAAGTCTTAGTGCCAGAAACGAAGCCA
CGTGGAAAGGTTTTCTTTGGTAAGGAGATGGTTTGGAACTGGAACATAAGCAACAGTGAA
GGCAAAGGCAATAAGACAATCAAAGTTGGTGATACCATCTCTGTTGCAAGGAAAATACCT
TCCAGAGCTGAAGCAGCTGTTTAACTCTCAACATATTTGCTTTCTTTTCTTTTCTTTTCT
TCTTCTGTGTGTTATCTCTAAACTAAAGTTTAAGATAAATGATTGCTTGCATGCTTGCTC
ATTTAAATCAAACAAACATCACTTGTTTTGAGAGATACATCTTGTTGAATGTGTGATCAT
GTTTTTCTGTTTGACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ83TF U 1
AF RR2AQ83JQ C 370
BS 1 773 RR2AQ83TF
BS 774 1157 RR2AQ83JQ

RD RR2AQ83TF 773 0 0
GGGTTGTTAAATTCTTGTAGGACTGTGTCAGAGATAGTCGGCGCAGAGAGATAGAGATGG
AGGAAGCTCTGAAGATACAGTCTTTGTTCATTTATCCGATCAAATCTTGCCGTGGAATCT
CCGTCCCTCAGGCAACCGTAACTCACACTGGATTTCAATGGGACCGGTATTGGTTAGTGG
TGAACTACAAAGGAAGAGCATACACTCAAAGAGTTGAGCCAAAGCTTGCTCTTGTCGAAA
CTGAGCTCCCCAAGGAAGCCTTCTTGGAAGATTGGGAGCCAACAAAAGACTCATTTTTGG
TGGTAAAAGCTCCAGGTATGAGTCCGTTAAAGATTCCATTGACTAAGCCGAGCTCGATCG
CAGAAGGTGTGTCTATGTGGGAGTGGTCTGGCTCTGCGTTTGATGAGGGAGAAGAAGCTG
CAAAATGGTTTTCAGATTATCTTGGCAAACAAAGCCGTTTGGTTCGGTTTAACAAAGAAA
CTGAAACCAGGCCTTCACCTCCTGAGTTTGCAGCAGGCTACTCTACAACGTTTACAGATA
TGTTTCCCTTCTTGTTTGCATCTCAGGCTTCTTTAGACCAGCTGAATACACTACTCCCCA
GAACCGGTGCCTATTAACCGTTTTCGACCAAATTTTCTTGTGGATAACTGTGATCCTTTT
GGTGAAGATCTTTGGGATGAAATCAAGATTAACGAATTAGTCTTCCAAGGAGTTAGGCTG
TGTAGCCGCTGCAAGGTACCACTTGTGAATCAAGAAACCGGAGTTCCAGATGT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2AQ83JQ 788 0 0
TGTCTATGTGGGAGTGGTCTGGCTCTGCGTTTGATGAGGGAGAAGAAGCTGCAAAATGGT
TTTCAGATTATCTTGGCAAACAAAGCCGTTTGGTTCGGTTTAACAAAGAAACTGAAACCA
GGCCTTCACCTCCTGAGTTTGCAGCAGGCTACTCTACAACGTTTACAGATATGTTTCCCT
TCTTGTTTGCATCTCAGGCTTCTTTAGACCAGCTGAATACACTACTCCC*AGAACCGGTG
CCTATTAACCGTTTTCGACCAAATTTTCTTGTGGATAACTGTGATCCTTTTGGTGAAGAT
CTTTGGGATGAAATCAAGATTAACGAATTAGTCTTCCAAGGAGTTAGGCTGTGTAGCCGC
TGCAAGGTACCACTTGTGAATCAAGAAACCGGAGTTCCAGATGTAGCAGAACCAACTGAA
ACTTTGATGAAATTCAGATCAGACAAAGTCTTAGTGCCAGAAACGAAGCCACGTGGAAAG
GTTTTCTTTGGTAAGGAGATGGTTTGGAACTGGAACATAAGCAACAGTGAAGGCAAAGGC
AATAAGACAATCAAAGTTGGTGATACCATCTCTGTTGCAAGGAAAATACCTTCCAGAGCT
GAAGCAGCTGTTTAACTCTCAACATATTTGCTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTCTTCTGTG
TGTTATCTCTAAACTAAAGTTTAAGATAAATGATTGCTTGCATGCTTGCTCATTTAAATC
AAACAAACATCACTTGTTTTGAGAGATACATCTTGTTGAATGTGTGATCATGTTTTTCTG
TTTGACCG

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL4048Contig1 391 2 1 U
GTACTCTTGACATTAAGAAGTCTTCCCATAAAAAGCTATCAAAGTGGCTGCAATCTAAAG
CTTCTGCAGGAATGGTAGTCTCTTTCCCGATGTTATCAAACAGGAGTGTGTATAGTTTAA
CTTCAAAATACCAACTGGTTTATCAGTATAGGAAACTATAATCATAAAGTGTTGTAAGCT
GTATACTATAAAGAGTTGTTAACTCTCATTTGACCTTTTAAATTAACCCTGATATACTGA
TAACTGCAAGCAAATTTGATTGGTTTATTATACACTTGTTCTGATTGTTTTAACCATTTG
CACAGATCACTGTGAAAGAAGACAAGCACAAGAAGGAGATTGTACTGATTTCAGTGAACC
GCAGGCACCCTGATTACTCATCCTTCAAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H527JQB C 1
AF RR2H527TF U 1
BS 1 391 RR2H527TF

RD RR2H527JQB 391 0 0
GTACTCTTGACATTAAGAAGTCTTCCCATAAAAAGCTATCAAAGTGGCTGCAATCTAAAG
CTTCTGCAGGAATGGTAGTCTCTTTCCCGATGTTATCAAACAGGAGTGTGTATAGTTTAA
CTTCAAAATACCAACTGGTTTATCAGTATAGGAAACTATAATCATAAAGTGTTGTAAGCT
GTATACTATAAAGAGTTGTTAACTCTCATTTGACCTTTTAAATTAACCCTGATATACTGA
TAACTGCAAGCAAATTTGATTGGTTTATTATACACTTGTTCTGATTGTTTTAACCATTTG
CACAGATCACTGTGAAAGAAGACAAGCACAAGAAGGAGATTGTACTGATTTCAGTGAACC
GCAGGCACCCTGATTACTCATCCTTCAAGCC

QA 1 391 1 391
DS 

RD RR2H527TF 391 0 0
GTACTCTTGACATTAAGAAGTCTTCCCATAAAAAGCTATCAAAGTGGCTGCAATCTAAAG
CTTCTGCAGGAATGGTAGTCTCTTTCCCGATGTTATCAAACAGGAGTGTGTATAGTTTAA
CTTCAAAATACCAACTGGTTTATCAGTATAGGAAACTATAATCATAAAGTGTTGTAAGCT
GTATACTATAAAGAGTTGTTAACTCTCATTTGACCTTTTAAATTAACCCTGATATACTGA
TAACTGCAAGCAAATTTGATTGGTTTATTATACACTTGTTCTGATTGTTTTAACCATTTG
CACAGATCACTGTGAAAGAAGACAAGCACAAGAAGGAGATTGTACTGATTTCAGTGAACC
GCAGGCACCCTGATTACTCATCCTTCAAGCC

QA 1 391 1 391
DS 



AS 1 2

CO CL4049Contig1 1088 2 2 U
GGACCATTCGTCTGTCACAACTACCACCACCCCCTTCCTTTCTCCATTTGCTTTGTCTCC
GAGACACGATTTCGATCTTCCTTCCTCAAAAAAAGTAGCAAACCCACAACGAAAGTTTCG
AGCTTTCTTATTAGATCCAACATCATTCTTCGATTCATTTCCCCACCTTAGGGTTTATTG
AATGGGTTCTGGGCTCTCTCTCTTCACCAATGGCTCATCATCGTCTTCTCCGTCGCCCCG
TGAACGAGATCTGTTAAAGCCCGGTCTCGGTGATCTCCCCGAAAGCTGCGTGGCCTTGAT
CCTCGAGAAGTTGGATCCGGTCGAGATCTGCAGATTCTCGAAGCTAAACGGAGCCTTTCG
CAGCGCCTCCTGGGCCGATTTCGTCTGGGAATCGAAGCTTCCTCATGATTACAGGTCGAT
TCTCGAGAAAATCCTCGGCGGGTTCCCGGAAAAGCCGCGTAAAAGAGACATCTACAACTT
TCTCTCTTGTGTTAATTCCTTCGACGACGGCACAAAGAAAGCTTGGGTTGATAAACGAAC
CAGTGATCTCTGTTTGTGCATATCGGTTAAGGGTTTGTCGGTAACCGGGATTGATGATCG
TAGATACTGGAATCACATTCCTTCTGATGAATCTCGATTTGCTTCAGTAGCGTATCTTCA
GCAAGTCTGGTGGTTTCAAGTTGATGGAGAAATCGAGTTTCCGTTCCCAGCAGGAACCTA
CAGCGTCTTCTTCAGGCTTCATCTAGGCAAACCGGGAAAACGGTTTGGTTGGAGGGTTTG
CAATAACGAGCAGATTCATGGTTGGGACATTAAACCGGTTCAGTTTCAGATTTGGACTGA
AGATGGTCAGCACTCTTCGTCTCAATGCATGTTAACTGAACCAGGAACATGGAGTCATTA
CCATGCTGGAGACTTTGTGGTTGGGAAGTCGAAAAGCTCGTCTACGAAGCTTAGGTTCTC
CATGACTCAGATTGATTGTACACATACCAAAGGAGGGTTGTGTGTAGACTCTGTAATTGT
GTATCCGAGCTCGTGTAAGGATCGGTTGAGACGGTTTTAAAAGTCTTTAAACCGAAGTTT
GGTGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H022TF U 1
AF RR2H022JQ C 420
BS 1 644 RR2H022TF
BS 645 1088 RR2H022JQ

RD RR2H022TF 644 0 0
GGACCATTCGTCTGTCACAACTACCACCACCCCCTTCCTTTCTCCATTTGCTTTGTCTCC
GAGACACGATTTCGATCTTCCTTCCTCAAAAAAAGTAGCAAACCCACAACGAAAGTTTCG
AGCTTTCTTATTAGATCCAACATCATTCTTCGATTCATTTCCCCACCTTAGGGTTTATTG
AATGGGTTCTGGGCTCTCTCTCTTCACCAATGGCTCATCATCGTCTTCTCCGTCGCCCCG
TGAACGAGATCTGTTAAAGCCCGGTCTCGGTGATCTCCCCGAAAGCTGCGTGGCCTTGAT
CCTCGAGAAGTTGGATCCGGTCGAGATCTGCAGATTCTCGAAGCTAAACGGAGCCTTTCG
CAGCGCCTCCTGGGCCGATTTCGTCTGGGAATCGAAGCTTCCTCATGATTACAGGTCGAT
TCTCGAGAAAATCCTCGGCGGGTTCCCGGAAAAGCCGCGTAAAAGAGACATCTACAACTT
TCTCTCTTGTGTTAATTCCTTCGACGACGGCACAAAGAAAGCTTGGGTTGATAAACGAAC
CAGTGATCTCTGTTTGTGCATATCGGTTAAGGGTTTGTCGGTAACCGGGATTGATGATCG
TAGATACTGGAATCACATTCCTTCTGATGAATCTCGATTTGCTT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2H022JQ 669 0 0
TTCTCGAGAAAATCCTCGGCGGGTTCCCGGAAAAGCCGCGTAAAAGAGACATCTACAACT
TTCTCTCTTGTGTTAATTCCTTCGACGACGGCACAAAGAAAGCTTGGGTTGATAAACGAA
CCAGTGATCTCTGTTTGTGCATATCGGTTAAGGGTTTGTCGGTAACCGGGATTGATGATC
GTAGATACTGGAATCACATTCCTTCTGATGAATCTCGATTTGCTTCAGTAGCGTATCTTC
AGCAAGTCTGGTGGTTTCAAGTTGATGGAGAAATCGAGTTTCCGTTCCCAGCAGGAACCT
ACAGCGTCTTCTTCAGGCTTCATCTAGGCAAACCGGGAAAACGGTTTGGTTGGAGGGTTT
GCAATAACGAGCAGATTCATGGTTGGGACATTAAACCGGTTCAGTTTCAGATTTGGACTG
AAGATGGTCAGCACTCTTCGTCTCAATGCATGTTAACTGAACCAGGAACATGGAGTCATT
ACCATGCTGGAGACTTTGTGGTTGGGAAGTCGAAAAGCTCGTCTACGAAGCTTAGGTTCT
CCATGACTCAGATTGATTGTACACATACCAAAGGAGGGTTGTGTGTAGACTCTGTAATTG
TGTATCCGAGCTCGTGTAAGGATCGGTTGAGACGGTTTTAAAAGTCTTTAAACCGAAGTT
TGGTGTTGT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL4050Contig1 1188 2 2 U
GGGATACACTGTCATCGTTGGCTTATTTCCACTCTTCTGCGGATTGCAACTTGTGGTAAA
AAATACTTGCGTAGCTCGAAGATCCTCCTGAATGGGTTCTCTCAACTTGCCTCACGCTTC
ATCGTTCAAGGGAGGAAGTGAAACGTTTCTCCGGAATGTTCTTGAAAGTATACTGAAAAC
GTATTTGATGAAGAATCCGACAGTGAAGACGATATGGGAACTAGTTCAGTCGATGGACAA
TGAAAAGATATGCTACGATCACTTCACTTTCAGGACATTTAAGGTAGATGGTTATGGAAT
AGATTCTTTGTCGAGTTTTTTCATGGATTACGGATACAAAATTGGAGGCGAACTTGATTT
TCCAAAGAACAAATCAAAAGTTAAATGGTTTTCTCCTCCGGATGTTCACGTCCCTCACGA
CGGTCATGGTCTAACCAACGGCCCTTTGCCACGAATCGCTATAGCTGAGGTTCTTCTTGA
CCAACTTAGCCTTGAATCACAGGGGATAATAAGAAAGTACTTGAAACCAGAAGGTGGTAA
GCAAGCGGTTCTGTCAAGCACTTTGGGGTCCTTAATATGGGAGAAGCCTACATGGACCGA
CTTCAAGCAACTCGCAAAAGAAAATGAATTTGCGGCATGGACGCTTATCCACGGCTACAC
GATGAACCATCTTGCATTTTCGGTTCATCGATTCAAACACCAGTTCAGTGACATTAAGTT
CATCAAACAGTATCTTGAAGAAAAGGAATTCGAACTTAACACTGACGGGGGAGTTATCAA
AGTGAGTCAAGATTGTCTACTGTTACAAGTATCGTCCATCGCGGACAAACTTACGGTTGA
ATTTGCTGAGGGAGTAACTGAAACAATCCCGGCTTCTTACATTGAGTTTACTCAACGTCT
AGTTCTTCCACAGTTCAAAGATGTGCCGTTTGATGAGATTAAAGAGTTCCACAGACGTGA
AGGCTTTGAGCTTGATAACGCCAGCAACATAATGGAAAGTACCCGTTTCACAGCACAAGT
GTGAAACAAGACTTGTCTTGTTCGGCTCAGTATGCCAAATGTGTGCATGTATTTGTGTGT
TTATGTATGAGTGAGCTTGTGACCTTGATTCCGATCGGTAACAATGTATAATCGTGGAAT
GGCAGAAAATATAATTAAGTTATGAAATAATTTAAAATCTACATAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX24TF U 1
AF RR2BX24JQ C 471
BS 1 705 RR2BX24TF
BS 706 1188 RR2BX24JQ

RD RR2BX24TF 705 0 0
GGGATACACTGTCATCGTTGGCTTATTTCCACTCTTCTGCGGATTGCAACTTGTGGTAAA
AAATACTTGCGTAGCTCGAAGATCCTCCTGAATGGGTTCTCTCAACTTGCCTCACGCTTC
ATCGTTCAAGGGAGGAAGTGAAACGTTTCTCCGGAATGTTCTTGAAAGTATACTGAAAAC
GTATTTGATGAAGAATCCGACAGTGAAGACGATATGGGAACTAGTTCAGTCGATGGACAA
TGAAAAGATATGCTACGATCACTTCACTTTCAGGACATTTAAGGTAGATGGTTATGGAAT
AGATTCTTTGTCGAGTTTTTTCATGGATTACGGATACAAAATTGGAGGCGAACTTGATTT
TCCAAAGAACAAATCAAAAGTTAAATGGTTTTCTCCTCCGGATGTTCACGTCCCTCACGA
CGGTCATGGTCTAACCAACGGCCCTTTGCCACGAATCGCTATAGCTGAGGTTCTTCTTGA
CCAACTTAGCCTTGAATCACAGGGGATAATAAGAAAGTACTTGAAACCAGAAGGTGGTAA
GCAAGCGGTTCTGTCAAGCACTTTGGGGTCCTTAATATGGGAGAAGCCTACATGGACCGA
CTTCAAGCAACTCGCAAAAGAAAATGAATTTGCGGCATGGACGCTTATCCACGGCTACAC
GATGAACCATCTTGCATTTTCGGTTCATCGATTCAAACACCAGTT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2BX24JQ 718 0 0
TTCTTCTTGACCAACTTAGCCTTGAATCACAGGGGATAATAAGAAAGTACTTGAAACCAG
AAGGTGGTAAGCAAGCGGTTCTGTCAAGCACTTTGGGGTCCTTAATATGGGAGAAGCCTA
CATGGACCGACTTCAAGCAACTCGCAAAAGAAAATGAATTTGCGGCATGGACGCTTATCC
ACGGCTACACGATGAACCATCTTGCATTTTCGGTTCATCGATTCAAACACCAGTTCAGTG
ACATTAAGTTCATCAAACAGTATCTTGAAGAAAAGGAATTCGAACTTAACACTGACGGGG
GAGTTATCAAAGTGAGTCAAGATTGTCTACTGTTACAAGTATCGTCCATCGCGGACAAAC
TTACGGTTGAATTTGCTGAGGGAGTAACTGAAACAATCCCGGCTTCTTACATTGAGTTTA
CTCAACGTCTAGTTCTTCCACAGTTCAAAGATGTGCCGTTTGATGAGATTAAAGAGTTCC
ACAGACGTGAAGGCTTTGAGCTTGATAACGCCAGCAACATAATGGAAAGTACCCGTTTCA
CAGCACAAGTGTGAAACAAGACTTGTCTTGTTCGGCTCAGTATGCCAAATGTGTGCATGT
ATTTGTGTGTTTATGTATGAGTGAGCTTGTGACCTTGATTCCGATCGGTAACAATGTATA
ATCGTGGAATGGCAGAAAATATAATTAAGTTATGAAATAATTTAAAATCTACATAATT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL4051Contig1 406 2 1 U
GCACTCTCACCAACACGATGTCTCTTGTGGCACTTAGCTCATGCGGACATGTGTTCTGCA
AGAAGTGCGGCGAGAAGTTTATGCCCGTGGACAAAGTCTGTCTTGTGTGTGACAAACCTT
GCAAGGACAGGAACTTGGTTGGGTTGAAGAAAGGAGGCACTGGTTTTGCCGAGCATGACG
ATCATCTTGAGGCTAAAGAGTACAAGCATTTGGGTAGTGGCTCTGGTTTAGGGATGGTGA
GAATGGGTAAGACATGATGGTTTTGGAAAGCGCATCAAATGTTTGAGTTTAAGTTGTATA
CAACTAAGAGACTGTTTTCCCTATTTGGCCTTTCGTTCTTGTTCTTTTCATCGGATCTGT
ATTTGCACTTCTACTCCCTCAATACGCATGCGTCTTTTCAAGGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D082JQ C 1
AF RR2D082TF U 1
BS 1 406 RR2D082TF

RD RR2D082JQ 406 0 0
GCACTCTCACCAACACGATGTTTCTTGTGGCACTTAGCTCATGCGGACATGTGTTCTGCA
AGAAGTGCGGCGAGAAGTTTATGCCCGTGGACAAAGTCTGTTTTGTGTGTGACAAACCTT
GCAAGGACAGGAACTTGGTTGGGTTGAAGAAAGGAGGCACTGGTTTTGCCGAGCATGACG
ATCATCTTGAGGCTAAAGAGTACAAGCATTTGGGTAGTGGCTCTGGTTTAGGGATGGTGA
GAATGGGTAAGACATGATGGTTTTGGAAAGCGCATCAAATGTTTGAGTTTAAGTTGTATA
CAACTAAGAGACTGTTTTCCCTATTTGGCCTTTCGTTCTTGTTCTTTTCATCGGATCTGT
ATTTGCACTTCTACTCCCTCAATACGCATGCGTCTTTTCAAGGATT

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR2D082TF 406 0 0
GCACTCTCACCAACACGATGTCTCTTGTGGCACTTAGCTCATGCGGACATGTGTTCTGCA
AGAAGTGCGGCGAGAAGTTTATGCCCGTGGACAAAGTCTGTCTTGTGTGTGACAAACCTT
GCAAGGACAGGAACTTGGTTGGGTTGAAGAAAGGAGGCACTGGTTTTGCCGAGCATGACG
ATCATCTTGAGGCTAAAGAGTACAAGCATTTGGGTAGTGGCTCTGGTTTAGGGATGGTGA
GAATGGGTAAGACATGATGGTTTTGGAAAGCGCATCAAATGTTTGAGTTTAAGTTGTATA
CAACTAAGAGACTGTTTTCCCTATTTGGCCTTTCGTTCTTGTTCTTTTCATCGGATCTGT
ATTTGCACTTCTACTCCCTCAATACGCATGCGTCTTTTCAAGGATT

QA 1 406 1 406
DS 



AS 1 2

CO CL4052Contig1 749 2 6 U
GGATTTTCACACAAACCAACTTCAGCGACAAGATAACAACCTTGTGAAGATCGATCGGAT
AAAAAATGGCGGAGAAGAGCTTCAAGTACATCATCCTCGGCGGCGGCGTTTCAGCCGGAT
ACGCAGCTAAGGAGTTTGCTAGTCAAGGGGTTAAACCAGGAGAATTGGCGGTTATCTCCA
AAGAGGCGGTGGCTCCTTATGAACGTCCTGCTCTTAGCAAGGGTTATTTGTTTCCTGAAG
GGGCGGCTAGACTCCCAGGTTTCCATTGCTGTGTTGGTAGTGGTGGAGAAAAACTGCTTC
CTGAATCATACAAACAGAAAGGGATTGAGTTGATACTAAGCACAGAAATAGTGAAAGCAG
ATCTTGCTGCCAAGAGCCTTGTCAGCGCAGCTGGAGATGTCTTCAAATATGAAACTCTCA
TCATTGCAACTGGTTCTACTGTTCTCAAATTGACTGACTTTGGTGTGAAGGGTGCTGACT
CAAAGAACATCCTCTATCTGAGGGAGATTGATGATGCTGACAAAGTGGTTGAAGCAATTA
AAGCAAAGAAAGGTGGAAAGGCTGTAGTTGTTGGTGGAGGTTACATTGGTCTTGAGCTTA
GTGCAGCTTTGAGGATCAACAATTTTGATGTCACTATGGTTTTCCCTGAACCTTGGTGCA
TGCCTAGGCTTTTCACCGCAGACATTGCTGCTTTCTATGAGACTTACTATACAAACAAGG
GAGTGAAGATCATTAAATGAACAGTTGCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL23TF U 1
AF RR2EL24TF U 1
BS 1 328 RR2DL23TF
BS 329 329 RR2EL24TF
BS 330 596 RR2DL23TF
BS 597 597 RR2EL24TF
BS 598 710 RR2DL23TF
BS 711 749 RR2EL24TF

RD RR2DL23TF 710 0 0
GGATTTTCACACAAACCAACTTCAGCGACAAGATAACAACCTTGTGAAGATCGATCGGAT
AAAAAATGGCGGAGAAGAGCTTCAAGTACATCATCCTCGGCGGCGGCGTTTCAGCCGGAT
ACGCAGCTAAGGAGTTTGCTAGTCAAGGGGTTAAACCAGGAGAATTGGCGGTTATCTCCA
AAGAGGCGGTGGCTCCTTATGAACGTCCTGCTCTTAGCAAGGGTTATTTGTTTCCTGAAG
GGGCGGCTAGACTCCCAGGTTTCCATTGCTGTGTTGGTAGTGGTGGAGAAAAACTGCTTC
CTGAATCATACAAACAGAAAGGGATTGATTTGATACTAAGCACAGAAATAGTGAAAGCAG
ATCTTGCTGCCAAGAGCCTTGTCAGCGCAGCTGGAGATGTCTTCAAATATGAAACTCTCA
TCATTGCAACTGGTTCTACTGTTCTCAAATTGACTGACTTTGGTGTGAAGGGTGCTGACT
CAAAGAACATCCTCTATCTGAGGGAGATTGATGATGCTGACAAAGTGGTTGAAGCAATTA
AAGCAAAGAAAGGTGGAAAGGCTGTAGTTGTTGGTGGAGGTTACATTGGTCTTGAGTTTA
GTGCAGCTTTGAGGATCAACAATTTTGATGTCACTATGGTTTTCCCTGAACCTTGGTGCA
TGCCTAGGCTTTTCACCGCAGACATTGCTGCTTTCTATGAGACTTACTAT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2EL24TF 749 0 0
GGATTTTCACACAAACCAACTTCAGCGACAAGATAACAACCTTGTGAAGATCGATCGGAT
AAAAAATGGCGGAGAAGAGCTTCAAGTACATCATCCTCGGCGGCGGCGTTTCAGCCGGAT
ACGCAGCTAAGGAGTTTGCTAGTCAAGGGGTTAAACCAGGAGAATTGGCGGTTATCTCCA
AAGAGGCGGTGGCTCCTTATGAACGTCCTGCTCTTAGCAAGGGTTATTTGTTTCCTGAAG
GGGCGGCTAGACTCCCAGGTTTCCATTGCTGTGTTGGTAGTGGTGGAGAAAAACTGCTTC
CTGAATCATACAAACAGAAAGGGATTGAGTTGATACTAAGCACAGAAATAGTGAAAGCAG
ATCTTGCTGCCAAGAGCCTTGTCAGCGCAGCTGGAGATGTCTTCAAATATGAAACTCTCA
TCATTGCAACTGGTTCTACTGTTCTCAGATTGACTGACTTTGGTGTGAAGGGTGCTGACT
CAAAGAACATCCTCTATCTGAGGGAGATTGATGATGCTGACAAAGTGGTTGAAGCAATTA
AAGCAAAGAAAGGTGGAAAGGCTGTAGTTGTTGGTGGAGGTTACATTGGTCTTGAGCTTA
GTGCAGCTTTGAGGATCAACAATTTTGATGTCACTATGGTTTTCCCTGAACCTTGGTGCA
TGCCTAGGCTTTTCACCGCAGACATTGCTGCTTTCTATGAGACTTACTATACAAACAAGG
GAGTGAAGATCATTAAATGAACAGTTGCA

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL4053Contig1 1083 2 4 U
GGAAAACAAAATCCTTGGCTCCTCTCTCTCGCCCCGAATCTCGCTCTCTCTTGCTTGCGA
TGGCGAATAATAATCAAGCAAGCCTTCTTCTCCAGAAGCAGCTCAAAGATCTGTGCAAGA
ACCCGGTCGATGGTTTCTCTGCTGGTCTCCTTGACGAGAGTAACGTTTTTCAATGGAGCG
TCTCCATCATGGGTCCTCCTGATACCTTGTAGTGAGTTTTAGTTTGATTGTCTGTGTTTC
TGTTTGATTCTATACAGAATTGCATATTGTGTGAGGTTGGTTTGGTTGAATTTGCTTAGC
TGATTGATTCCATTGTAACATGAATGTTTGTTACATTGTGGTACTTTAATTGGTTCTGTT
GCTATGTTTGATAGAGGTTGGTTTTGGATGAATTGTTATGGTATTGAAAACTTGATTCTC
TGATTGCAGTGAAGGGGGATTCTTTAATGCAATTATGACGTTTCCAGATAATTACCCTAA
TCAACCACCAACTTTGCAGTTCACTTCGGAGATGTGGCATCCTAATGTTTATTCTGATGG
TAAAGTTTGCATATCGATTCTTCATCCTCCTGGTGATGATCCTAATGGATACGAGCTTGC
CTCTGAACGTTGGACCGCTGTCCAAACGGTAGAAAGCATTGTGTTGAGTATCATATCTAT
GCTCTCGGGTCCCAACGATGAGTCACCGGCTAACGTGGACGCTGCAAAAGAGTGGAGAGA
CAACAGGGCTGAGTTTAGGAAGAAAGTGAGTCGCTGTGTTAGAAAATCGCAAGAGATGCT
ATGAGCGTCTCTTGCTCCCCTGCGTTTTTATCTTTTGTAGAAATTTCTCTCCTAAGCTAA
AAGAGAGAGAGAGCGAGCGTAAGAAGCATCATTCAATCATCAAGAAGCAGCAGCCAGATG
AATCTGTGTGCTCAAAATGCTTGTTTTCTTTTTTTCTTTTGGTTTTGGAGTTGGCTTTAA
GGTTTGGAATATTGTGGTGGAATCAAATCCAATCCACCTTTTAGGATTATAATCTTACTC
TCGTTAATGGATTCGTTTTCACATTCCTTTTTTTTATTTTATTTGATATCATAGCTTTCG
ACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2G192TF U 1
AF RR2G192JQ C 318
BS 1 708 RR2G192TF
BS 709 709 RR2G192JQ
BS 710 720 RR2G192TF
BS 721 1083 RR2G192JQ

RD RR2G192TF 720 0 0
GGAAAACAAAATCCTTGGCTCCTCTCTCTCGCCCCGAATCTCGCTCTCTCTTGCTTGCGA
TGGCGAATAATAATCAAGCAAGCCTTCTTCTCCAGAAGCAGCTCAAAGATCTGTGCAAGA
ACCCGGTCGATGGTTTCTCTGCTGGTCTCCTTGACGAGAGTAACGTTTTTCAATGGAGCG
TCTCCATCATGGGTCCTCCTGATACCTTGTAGTGAGTTTTAGTTTGATTGTCTGTGTTTC
TGTTTGATTCTATACAGAATTGCATATTGTGTGAGGTTGGTTTGGTTGAATTTGCTTAGC
TGATTGATTCCATTGTAACATGAATGTTTGTTACATTGTGGTACTTTAATTGGTTCTGTT
GCTATGTTTGATAGAGGTTGGTTTTGGATGAATTGTTATGGTATTGAAAACTTGATTCTC
TGATTGCAGTGAAGGGGGATTCTTTAATGCAATTATGACGTTTCCAGATAATTACCCTAA
TCAACCACCAACTTTGCAGTTCACTTCGGAGATGTGGCATCCTAATGTTTATTCTGATGG
TAAAGTTTGCATATCGATTCTTCATCCTCCTGGTGATGATCCTAATGGATACGAGCTTGC
CTCTGAACGTTGGACCGCTGTCCAAACGGTAGAAAGCATTGTGTTGAGTATCATATCTAT
GCTCTCGGGTCCCAACGATGAGTCACCGGCTAACGTGGACGCTGCAAA*GAGTGGAGAGA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2G192JQ 766 0 0
ACATGAATGTTTGTTACATTGTGGTACTTTAATTGGTTCTGTTGCTATGTTTGATAGAGG
TTGGTTTTGGATGAATTGTTATGGTATTGAAAACTTGATTCTCTGATTGCAGTGAAGGGG
GATTCTTTAATGCAATTATGACGTTTCCAGATAATTACCCTAATCAACCACCAACTTTGC
AGTTCACTTCGGAGATGTGGCATCCTAATGTTTATTCTGATGGTAAAGTTTGCATATCGA
TTCTTCATCCTCCTGGTGATGATCCTAATGGATACGAGCTTGCCTCTGAACGTTGGACCG
CTGTCCAAACGGTAGAAAGCATTGTGTTGAGTATCATATCTATGCTCTCGGGTCCCAACG
ATGAGTCACCGGCTAACGTGGACGCTGCAAAAGAGTGGAGAGACAACAGGGCTGAGTTTA
GGAAGAAAGTGAGTCGCTGTGTTAGAAAATCGCAAGAGATGCTATGAGCGTCTCTTGCTC
CCCTGCGTTTTTATCTTTTGTAGAAATTTCTCTCCTAAGCTAAAAGAGAGAGAGAGCGAG
CGTAAGAAGCATCATTCAATCATCAAGAAGCAGCAGCCAGATGAATCTGTGTGCTCAAAA
TGCTTGTTTTCTTTTTTTCTTTTGGTTTTGGAGTTGGCTTTAAGGTTTGGAATATTGTGG
TGGAATCAAATCCAATCCACCTTTTAGGATTATAATCTTACTCTCGTTAATGGATTCGTT
TTCACATTCCTTTTTTTTATTTTATTTGATATCATAGCTTTCGACC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL4054Contig1 965 2 8 U
GGGGCGTTTAGTGGAAACGTTCACCGATCATCACTCTCTCCGTCGTAGCTCTCTGTTTTT
TTCCAGGCAAGTAGCGCAATCGGAGGAATGGATCAGTTCTCGGGAGGCAATTGGTCAATG
ATCCCCAACGTTCAGGCGCAGGGTAGTTTCGGTACACCCACCAATCAAGACCATCTATTC
CTCCAGCAACAGCAACAACAACAGCCACAACAATTTCATCATCAACAACAACAACAACAA
ACCCAGCAGCAGCAGTTCCAGCCACAGCAACAGCAACAACAACAACAAGAGATGCAGTTC
CAGCAATTCCAGCAACAACAACAGTTCATTCAACAACAGCAGTTCCATCACCAGCAGCAC
CGTCTCTTACATTCTCCTAATCAGCAGCAGCCGCAATCCTCTTTGCAATCCCCTCCTCCG
CCGCAACAGACGATGGTTCATACTCCGCAATCTATGATGCATACACCGCAGCAGCAGCAA
CAGTTGGTGCATACTCCGCAGCAATCGGTTCAGACCCCGCAGCAGCACCAGTCTTTAGCT
TCTCATTTCCATCTCTATCCTTTGGTGGAGAGACTATCAGATGCTGTTGAAACAGGAACA
CGAGATCAGAACTCTGATGCTCTGGTGAGTGAATTGAACGGCCATTTTGATAAGTGCCAG
CAGCTGTTGAATTCGATTTCAGGATCCCTTGGATCCAAAACTACTATGACTGTTGATGGG
CAAAAGAGGAATCTAGAAGAAAGTGAGCATTTACTTCAACAAAGAAGGGACTTGATTATG
GAATATAGAAAATCTATTGAAGACCTTGCCAAGATTGAGCCTTAGTTTCATACCCCTCGC
TTAGATGTGGTGTATCTTTATTTACGTCTACTCTACACTTGTAGCTTTCTAATAAAAGAC
CAAGATTTGTAATCAGTGAACCACTTCTTAATTCAAAGAATAATAATGAAAATGTTCTTT
TCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2CG89TF U 1
AF RR2DJ14TF U 316
BS 1 616 RR2CG89TF
BS 617 617 RR2DJ14TF
BS 618 682 RR2CG89TF
BS 683 683 RR2DJ14TF
BS 684 699 RR2CG89TF
BS 700 700 RR2DJ14TF
BS 701 721 RR2CG89TF
BS 722 965 RR2DJ14TF

RD RR2CG89TF 721 0 0
GGGGCGTTTAGTGGAAACGTTCACCGATCATCACTCTCTCCGTCGTAGCTCTCTGTTTTT
TTCCAGGCAAGTAGCGCAATCGGAGGAATGGATCAGTTCTCGGGAGGCAATTGGTCAATG
ATCCCCAACGTTCAGGCGCAGGGTAGTTTCGGTACACCCACCAATCAAGACCATCTATTC
CTCCAGCAACAGCAACAACAACAGCCACAACAATTTCATCATCAACAACAACAACAACAA
ACCCAGCAGCAGCAGTTCCAGCCACAGCAACAGCAACAACAACAACAAGAGATGCAGTTC
CAGCAATTCCAGCAACAACAACAGTTCATTCAACAACAGCAGTTCCATCACCAGCAGCAC
CGTCTCTTACATTCTCCTAATCAGCAGCAGCCGCAATCCTCTTTGCAATCCCCTCCTCCG
CCGCAACAGACGATGGTTCATACTCCGCAATCTATGATGCATACACCGCAGCAGCAGCAA
CAGTTGGTGCATACTCCGCAGCAATCGGTTCAGACCCCGCAGCAGCACCAGTCTTTAGCT
TCTCATTTCCATCTCTATCCTTTGGTGGAGAGACTATCAGATGCTGTTGAAACAGGAACA
CGAGATCAGAACTCTGCTGCTCTGGTGAGTGAATTGAACGGCCATTTTGATAAGTGCCAG
CAGCTGTTGAATTCGATTTCAG*ATCCCTTGGATCCAAA*CTACTATGACTGTTGATGGG
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2DJ14TF 650 0 0
G
AACAACAGTTCATTCAACAACAGCAGTTCCATCACCAGCAGCACCGTCTCTTACATTCTC
CTAATCAGCAGCAGCCGCAATCCTCTTTGCAATCCCCTCCTCCGCCGCAACAGACGATGG
TTCATACTCCGCAATCTATGATGCATACACCGCAGCAGCAGCAACAGTTGGTGCATACTC
CGCAGCAATCGGTTCAGACCCCGCAGCAGCACCAGTCTTTAGCTTCTCATTTCCATCTCT
ATCCTTTGGTGGAGAGACTATCAGATGCTGTTGAAACAGGAACACGAGATCAGAACTCTG
ATGCTCTGGTGAGTGAATTGAACGGCCATTTTGATAAGTGCCAGCAGCTGTTGAATTCGA
TTTCAGGATCCCTTGGATCCAAAACTACTATGACTGTTGATGGGCAAAAGAGGAATCTAG
AAGAAAGTGAGCATTTACTTCAACAAAGAAGGGACTTGATTATGGAATATAGAAAATCTA
TTGAAGACCTTGCCAAGATTGAGCCTTAGTTTCATACCCCTCGCTTAGATGTGGTGTATC
TTTATTTACGTCTACTCTACACTTGTAGCTTTCTAATAAAAGACCAAGATTTGTAATCAG
TGAACCACTTCTTAATTCAAAGAATAATAATGAAAATGTTCTTTTCTTC

QA 2 650 2 650
DS 



AS 1 2

CO CL4055Contig1 1033 2 2 U
GGAAAACTTCAAACAGCTTCTGAACAACTCTTGAAACCAAAGACTTCTCTAATGTCGGAA
GAGATACGCGAGCACGGTAGTGACACCAACCCTAAACCTTCTCCACCGCCGCCAAAACGT
GGTCTCATCAGTCGCAAGAGACAGCTCGTGTTTCTCTCCCTCATGATATTACTAGCCGCA
AAAGGACTCGTGGGGATAGGCGAAGTAGCGTTTGTGATACTATCTTACATCTACTTGTAT
GAGTTCATCTCCAGGTTTGCCTTCCCACGCAGGCAAAACGAGCAGAAGAGGAGGCTCTCA
AACCCTAAAAACAAACTCTTCCAAACTTACTTCCTCGCCACTGCTATTATCGGTTATCAC
TCTCTCTCTCTCTCCTTATCTCATTTCTGTTATTAACGTTTTATTTTATTTATTTTATTT
TTTATTTTATAAACGTTTTCTCTCTCAGGTCTACTCTTCCCGATTTGCTACATCGGAGAT
GGACTATACCGGGGAGACATTCACGGTGTTAGAGCTGCAGCTCCACATCTCTTCCTCCTC
TCCGGTCAAGCCTTCACAGAACCAATTGGTTTCTCTGACCGCTTTGCGACTCCCATTGGT
ATTCTTGGACCGGTTTTCTACAACGCTCGTCGTATCTTCGCGCTGTTGGATTGGGTTAAA
GCCGAGTTCTCAGATACACAGCGTCCTGGTGGTCCAGTGAGATTGTACGGAGGAAGAGCC
ATTGCTTCTGTTAACACTGTCATGTGGTTTTACAATCTGTTTGGTCTCTTGTTGCCTGTG
TTTCTTCCTCGGTCTTGTGAGATTTACTTCTCAGCCGACAACAAAGGAGATTAGTTTCTG
ATCTCTTTTGTATACTGTCTACTTTAGAACTTTTATGTTGTGTTTGTGTTCTTGTTTCCA
TCAGGTAAAAGATTATTGCTAATAAAAGCGACAGTTTATGATTGCATGATTAATATGTCT
AATGACAAGCGATGTAGCTAATGATAAATACATAAGATATATGATCATTCACATCAGACA
GTAGAAGGGTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E921TF U 1
AF RR2E921JQ C 309
BS 1 686 RR2E921TF
BS 687 1033 RR2E921JQ

RD RR2E921TF 686 0 0
GGAAAACTTCAAACAGCTTCTGAACAACTCTTGAAACCAAAGACTTCTCTAATGTCGGAA
GAGATACGCGAGCACGGTAGTGACACCAACCCTAAACCTTCTCCACCGCCGCCAAAACGT
GGTCTCATCAGTCGCAAGAGACAGCTCGTGTTTCTCTCCCTCATGATATTACTAGCCGCA
AAAGGACTCGTGGGGATAGGCGAAGTAGCGTTTGTGATACTATCTTACATCTACTTGTAT
GAGTTCATCTCCAGGTTTGCCTTCCCACGCAGGCAAAACGAGCAGAAGAGGAGGCTCTCA
AACCCTAAAAACAAACTCTTCCAAACTTACTTCCTCGCCACTGCTATTATCGGTTATCAC
TCTCTCTCTCTCTCCTTATCTCATTTCTGTTATTAACGTTTTATTTTATTTATTTTATTT
TTTATTTTATAAACGTTTTCTCTCTCAGGTCTACTCTTCCCGATTTGCTACATCGGAGAT
GGACTATACCGGGGAGACATTCACGGTGTTAGAGCTGCAGCTCCACATCTCTTCCTCCTC
TCCGGTCAAGCCTTCACAGAACCAATTGGTTTCTCTGACCGCTTTGCGACTCCCATTGGT
ATTCTTGGACCGGTTTTCTACAACGCTCGTCGTATCTTCGCGCTGTTGGATTGGGTTAAA
GCCGAGTTCTCAGATACACAGCGTCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2E921JQ 725 0 0
AAACAAACTCTTCCAAACTTACTTCCTCGCCACTGCTATTATCGGTTATCACTCTCTCTC
TCTCTCCTTATCTCATTTCTGTTATTAACGTTTTATTTTATTTATTTTATTTTTTATTTT
ATAAACGTTTTCTCTCTCAGGTCTACTCTTCCCGATTTGCTACATCGGAGATGGACTATA
CCGGGGAGACATTCACGGTGTTAGAGCTGCAGCTCCACATCTCTTCCTCCTCTCCGGTCA
AGCCTTCACAGAACCAATTGGTTTCTCTGACCGCTTTGCGACTCCCATTGGTATTCTTGG
ACCGGTTTTCTACAACGCTCGTCGTATCTTCGCGCTGTTGGATTGGGTTAAAGCCGAGTT
CTCAGATACACAGCGTCCTGGTGGTCCAGTGAGATTGTACGGAGGAAGAGCCATTGCTTC
TGTTAACACTGTCATGTGGTTTTACAATCTGTTTGGTCTCTTGTTGCCTGTGTTTCTTCC
TCGGTCTTGTGAGATTTACTTCTCAGCCGACAACAAAGGAGATTAGTTTCTGATCTCTTT
TGTATACTGTCTACTTTAGAACTTTTATGTTGTGTTTGTGTTCTTGTTTCCATCAGGTAA
AAGATTATTGCTAATAAAAGCGACAGTTTATGATTGCATGATTAATATGTCTAATGACAA
GCGATGTAGCTAATGATAAATACATAAGATATATGATCATTCACATCAGACAGTAGAAGG
GTCAC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL4056Contig1 400 2 1 U
GGGTGTTCTCGCGGCTTTAGCTTAAACAACAGATCCCACAATGCCTAAGCAAATCCACGA
TATTAAGGACTTCCTTTTGACAGCGAGGAGGAAAGATGCTCGATCTGTGAAGATCAAGAA
AAGCAAAGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCGAAGTACCTCTACACTTTCTGCGT
CTTTGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCCCTTCCTCCAGGTTTGAGTGTGCA
AGACCTTTGAAGATGAAGATGCCTTGGTGATCAATCTTCTGTGCCATTTTTATTTTTTCC
CCTAGAAGAAGTTGCTTTGTGTCCTCGTAGTGAAATTAAACCTAGAGTTTTCAGTATGCT
CCAGTGTGACTGGTTATGAATTGATTCAGTTTTTAATATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B783JQ C 1
AF RR2B783TF U 1
BS 1 400 RR2B783TF

RD RR2B783JQ 400 0 0
GGGTGTTCTCGCGGCTTTAGCTTAAACAACAGATCCCACAATGCCTAAGCAAATCCACGA
TATTAAGGACTTCCTTTTGACAGCGAGGAGGAAAGATGCTCGATCTGTGAAGATCAAGAA
AAGCAAAGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCGAAGTACCTTTACACTTTTTGCGT
CTTTGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCCCTTCCTCCAGGTTTGAGTGTGCA
AGACCTTTGAAGATGAAGATGCCTTGGTGATCAATCTTCTGTGCCATTTTTATTTTTTCC
CCTAGAAGAAGTTGCTTTGTGTCCTCGTAGTGAAATTAAACCTAGAGTTTTCAGTATGCT
CCAGTGTGACTGGTTATGAATTGATTCAGTTTTTAATATC

QA 1 400 1 400
DS 

RD RR2B783TF 400 0 0
GGGTGTTCTCGCGGCTTTAGCTTAAACAACAGATCCCACAATGCCTAAGCAAATCCACGA
TATTAAGGACTTCCTTTTGACAGCGAGGAGGAAAGATGCTCGATCTGTGAAGATCAAGAA
AAGCAAAGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCGAAGTACCTCTACACTTTCTGCGT
CTTTGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCCCTTCCTCCAGGTTTGAGTGTGCA
AGACCTTTGAAGATGAAGATGCCTTGGTGATCAATCTTCTGTGCCATTTTTATTTTTTCC
CCTAGAAGAAGTTGCTTTGTGTCCTCGTAGTGAAATTAAACCTAGAGTTTTCAGTATGCT
CCAGTGTGACTGGTTATGAATTGATTCAGTTTTTAATATC

QA 1 400 1 400
DS 



AS 1 2

CO CL4057Contig1 710 2 23 U
GCTACAAATTCTTAATTATTTAAGAGGTGTGAGATGATTCCTCAACAGTCACAGACAAAA
CAAGAATATCACCCCATTGTCACTGACAAAACACTTGGGTTTAACTTAAGTGCGATATGG
TTGAAACATTTAAATAGTACTACAAAACAAAGAAACAGTTCTTGTTTGCTGCTTCCCATT
AATCTCAGGAGCTCTGTTTCGACCTCTTCATAAGCTCTATGAACTCTCTAAACGCGTTGT
CAGAATCGTGAGGTCCAGGGGAGGCTTCAGGGTGGTACTGTAAAGACATGACATTCATAG
CCGGGAAAGACAGACCCGCACAGCTTCCATCATTGAGATTGACATGTGTCACTTCTACCC
CTCCAGGAAGTGAAGCCGGGTCAACCGCATAGTTGTGGTTCTGAACACTGATCTCCACCT
GACCAGTTCTGTTATTACGAACTGGGTGGTTCCCTCCATGATGACCAAACTTCATCTTGA
AGGTCTTACCACCCAAAGCTTGTCCGAACAACTGATGCCCCATACAGATCCCGTAAACAG
GAGCTTTACCAAGAAGCTCCTTGACCGTCTCAACAGCATACGGAACAGCAGAAGGGTCTC
CAGGTCCGTTGCTGAACAAGATCCCGTCTGGATTCATTTTAAGAGCCTCGGAAGCTGGAA
ATGTCGACGGGACAACGGTGATTTGGCATCCGTAAGAGGACAGGCGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA64JQ U 41
AF RR2B375JQ U 1
BS 1 59 RR2B375JQ
BS 60 60 RR2CA64JQ
BS 61 75 RR2B375JQ
BS 76 76 RR2CA64JQ
BS 77 130 RR2B375JQ
BS 131 131 RR2CA64JQ
BS 132 244 RR2B375JQ
BS 245 245 RR2CA64JQ
BS 246 282 RR2B375JQ
BS 283 283 RR2CA64JQ
BS 284 298 RR2B375JQ
BS 299 299 RR2CA64JQ
BS 300 404 RR2B375JQ
BS 405 405 RR2CA64JQ
BS 406 421 RR2B375JQ
BS 422 422 RR2CA64JQ
BS 423 484 RR2B375JQ
BS 485 485 RR2CA64JQ
BS 486 507 RR2B375JQ
BS 508 508 RR2CA64JQ
BS 509 517 RR2B375JQ
BS 518 518 RR2CA64JQ
BS 519 710 RR2B375JQ

RD RR2CA64JQ 484 0 0
CAACAT
AGTCACAGACAAAACAAGAATATCAGTCCATTGTCATTGACAAAACACTTGGTTTTAACT
TA**TGCGATATGGTTGAAACATTTAAATAGTACTACAAAACAAAGAAACAGTTCTTGTT
TGCTGCTTCCCATTAATCTCAGGAGCTCTGTTTCGACCTCTTCATAAGCTCTATGAACTC
TCTAAACGCGTTGTCAGAATCGTGAGGTCCAGGGGAGGTTTCAGGGTGGTACTGTAAAGA
CATGACATTCATAGCCGGGAAAGACAGACCCGCACAGCTTCCATCATTGAGATTGACATG
TGTCACTTCTACCCCTTCTGGAAGTGAAGCCGGGTCAACCGCATAGTTGTGGTTCTGAAC
ACTGATTTCCACCTGACCAGTTCTGTTATTACGAACTGGGTGGTTCCCTCCATGATGACC
AAACTTCATCTTGAAGGTCTTACCACCCAAAGCTTGTCCGAACAACTGATGCCCCATA

QA 7 484 7 484
DS 

RD RR2B375JQ 710 0 0
GCTACAAATTCTTAATTATTTAAGAGGTGTGAGATGATTCCTCAACAGTCACAGACAAA*
CAAGAATATCACCCCTTTGTCACTGACAAAACACTTGGGTTTAACTTAAGTGCGATATGG
TTGAAACATT*AAATAGTACTACAAAACAAAGAAACAGTTCTTGTTTGCTGCTTCCCATT
AATCTCAGGAGCTCTGTTTCGACCTCTTCATAAGCTCTATGAACTCTCTAAACGCGTTGT
CAGAGTCGTGAGGTCCAGGGGAGGCTTCAGGGTGGTACTGTAGAGACATGACATTCATCG
CCGGGAAAGACAGACCCGCACAGCTTCCATCATTGAGATTGACATGTGTCACTTCTACCC
CTCCAGGAAGTGAAGCCGGGTCAACCGCATAGTTGTGGTTCTGAGCACTGATCTCCACCT
GGCCAGTTCTGTTATTACGAACTGGGTGGTTCCCTCCATGATGACCAAACTTCATCTTGA
AGGTTTTACCACCCAAAGCTTGTCCGAGCAACTGATGGCCCATACAGATCCCGTAAACAG
GAGCTTTACCAAGAAGCTCCTTGACCGTCTCAACAGCATACGGAACAGCAGAAGGGTCTC
CAGGTCCGTTGCTGAACAAGATCCCGTCTGGATTCATTTTAAGAGCCTCGGAAGCTGGAA
ATGTCGACGGGACAACGGTGATTTGGCATCCGTAAGAGGACAGGCGTCTT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL4058Contig1 1121 2 2 U
GGAAGATTTTCACTAATATTCAACTACAAAGCAACAATGGTGGTGTCACTCTTCTCTGCA
AGGAATGCTTTCTTTATAAGCTTATGCTTATTTGCAGCATTGTACCGGCCGGTTTTGAGT
AGACCAGCTAAGTTTGCGGATGACTTTAGGATCATGTGGTCCGATACTCATATCACTCAA
ATCGATGGAGGAAGAGCCATTCAGCTCAAGTTGGACCCTAGCTCAGGATGTGGGTTCGCT
TCGAAGAAGCAATATTTGTTTGGCCGCGTTAGCATGAAAATTAAACTCATCCCGGGTGAT
TCCGCAGGAACAGTAGCTGCGTTCTATATGAATTCGGATACAGATTCTGTAAGAGATGAA
CTAGATTTTGAATTCTTGGGAAACCGAAGTGGACAACCTTACACTGTGCAAACTAACGTA
TTTGCTCGTGGTAAAGGCGATAGAGAGCAAAGAGTGAACCTTTGGTTTGATCCTTCTCGT
GAATTCCACGAATACGCCATTTCATGGAACCATCTCCGTATTGTGTTCTACGTAGACAAT
GTCCCCATTAGGGTTTATAAGAACAACGAGGCTAGGAAAGTACCATACCCGAGATTCCAA
CCAATGGGTGTATATTCCACATTATGGGAAGCCGATGATTGGGCAACACGCGGAGGAATA
GAGAAAATCAATTGGTCGGGAGCTCCATTTTATGCGTACTACAAAGATTTTGATATAGAA
GGATGTTCGGTTCCAGGACCAGCAGATTGTCCAACTAATCCAAAGAATTGGTGGGAAGGC
AGTGCGTACCACCAATTGAGTCCAGTTGAGGCTCGAAGTTATAGATGGGTCCGAGTGAAC
CATATGATCTATGATTACTGTACCGACAGGTCTCGTTTTCCTGTTCCTCCCCCGGAATGC
TCTGCCGGAATATGATCAAACAAACGTATAATGTCTTCAAAACAAGATTAAATGCTAAGT
GGTTCCACCAGCAACTTTGTAGTGTGATTAACCAGTCTTGTTGTACTTGTATGTGAACTA
CTCATAATCAATCTGGTTGTGATCAAATTTTCATATATATCTCTCAAATTGTACTTTGTT
TTCATTGTGTATTATATATTGATTTATATTATCGCATGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF48TF U 1
AF RR2AF48JQ C 326
BS 1 716 RR2AF48TF
BS 717 1121 RR2AF48JQ

RD RR2AF48TF 716 0 0
GGAAGATTTTCACTAATATTCAACTACAAAGCAACAATGGTGGTGTCACTCTTCTCTGCA
AGGAATGCTTTCTTTATAAGCTTATGCTTATTTGCAGCATTGTACCGGCCGGTTTTGAGT
AGACCAGCTAAGTTTGCGGATGACTTTAGGATCATGTGGTCCGATACTCATATCACTCAA
ATCGATGGAGGAAGAGCCATTCAGCTCAAGTTGGACCCTAGCTCAGGATGTGGGTTCGCT
TCGAAGAAGCAATATTTGTTTGGCCGCGTTAGCATGAAAATTAAACTCATCCCGGGTGAT
TCCGCAGGAACAGTAGCTGCGTTCTATATGAATTCGGATACAGATTCTGTAAGAGATGAA
CTAGATTTTGAATTCTTGGGAAACCGAAGTGGACAACCTTACACTGTGCAAACTAACGTA
TTTGCTCGTGGTAAAGGCGATAGAGAGCAAAGAGTGAACCTTTGGTTTGATCCTTCTCGT
GAATTCCACGAATACGCCATTTCATGGAACCATCTCCGTATTGTGTTCTACGTAGACAAT
GTCCCCATTAGGGTTTATAAGAACAACGAGGCTAGGAAAGTACCATACCCGAGATTCCAA
CCAATGGGTGTATATTCCACATTATGGGAAGCCGATGATTGGGCAACACGCGGAGGAATA
GAGAAAATCAATTGGTCGGGAGCTCCATTTTATGCGTACTACAAAGATTTTGATAT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2AF48JQ 796 0 0
ATATGAATTCGGATACAGATTCTGTAAGAGATGAACTAGATTTTGAATTCTTGGGAAACC
GAAGTGGACAACCTTACACTGTGCAAACTAACGTATTTGCTCGTGGTAAAGGCGATAGAG
AGCAAAGAGTGAACCTTTGGTTTGATCCTTCTCGTGAATTCCACGAATACGCCATTTCAT
GGAACCATCTCCGTATTGTGTTCTACGTAGACAATGTCCCCATTAGGGTTTATAAGAACA
ACGAGGCTAGGAAAGTACCATACCCGAGATTCCAACCAATGGGTGTATATTCCACATTAT
GGGAAGCCGATGATTGGGCAACACGCGGAGGAATAGAGAAAATCAATTGGTCGGGAGCTC
CATTTTATGCGTACTACAAAGATTTTGATATAGAAGGATGTTCGGTTCCAGGACCAGCAG
ATTGTCCAACTAATCCAAAGAATTGGTGGGAAGGCAGTGCGTACCACCAATTGAGTCCAG
TTGAGGCTCGAAGTTATAGATGGGTCCGAGTGAACCATATGATCTATGATTACTGTACCG
ACAGGTCTCGTTTTCCTGTTCCTCCCCCGGAATGCTCTGCCGGAATATGATCAAACAAAC
GTATAATGTCTTCAAAACAAGATTAAATGCTAAGTGGTTCCACCAGCAACTTTGTAGTGT
GATTAACCAGTCTTGTTGTACTTGTATGTGAACTACTCATAATCAATCTGGTTGTGATCA
AATTTTCATATATATCTCTCAAATTGTACTTTGTTTTCATTGTGTATTATATATTGATTT
ATATTATCGCATGAAG

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL4059Contig1 1007 2 2 U
GGATTGATTGATTGCTTCCTTCCATGGAGACTCCTAAAATCTCGAAGCTTGACAAGCGAC
TCACCGAACCGAGAATGAAAAAGAAGAGAATGAAGCATGAGTTTCTCACATCTCTTAACA
ATCTCGATGATGGTTGCCTCATGCACATCCTCAGCTTCCTCTCTCCAATTCCTGATAGGT
ATAACACAGCACTCGTTTGCCACAGATGGAGATATCTGGCTTGTCACCCTCGCTTGTGGT
TACGAGTCGACCCTTTTGTGAAGGATTTATCACTCCCTGGAGTTTTCCATGACATTGAGT
CTGCTGTATCTGCTGCAAGACCTGGTGATACCATTTTAATAGGAGCTGGTGGAAGTCATC
GCGTTTCTAATATTCAGATTAAAAAGCCTATTTGCCTGATTGGTGGTGGCGAGATTCCTG
ATGAAACCACCCTTGTATGTTCTAGAGGATCAGACAGTGCCCTGGAGTTGCTATCAACCT
GCAAGCTAGCGAATCTAACAGTAAAAGCCGAGCTTGGGTGCTGCTTGCTTCACAGGAGTG
GAAGGCTAACGATCGATGGATGTGTGCTTCAATGTGAAACGAACCCTTTGGATCATCTCT
CATGCCCAATCGTGAGCACTGCTGGAGAGGAAGATAACTTGAGCAGGCATGTGGAAGTGA
AGGAAACCGTTGTTGAAAAGATCAAGGGAAACAGTGTGACTGTTTTGCAGACAAGGATAG
AAGGAGGTGCAAAGGCTGTTGCTACAAGCGGAGACTTGGTACTGCAGCGTGTTCGAGTCA
TGTACTCGAAGGCTTACCTCTACTTCTGGTTTGATGTGGATCATGAGTGAAAGGTGATCT
ATCTGTTGTATGTTAGATTAATTACTGCCTTCTTTTTCTTTCTTCAACCTGTAACATTCG
TAATATTATGTGGGATGGTGGTCATCTATCATCATCATCATTATCTCCCTTTGTACTTCA
TTTTTTTTACATTTTCTTTTTAAGATATAACAGGTTCGTTTCTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP20TF U 1
AF RR2FP20JQ C 258
BS 1 646 RR2FP20TF
BS 647 1007 RR2FP20JQ

RD RR2FP20TF 652 0 0
GGATTGATTGATTGCTTCCTTCCATGGAGACTCCTAAAATCTCGAAGCTTGACAAGCGAC
TCACCGAACCGAGAATGAAAAAGAAGAGAATGAAGCATGAGTTTCTCACATCTCTTAACA
ATCTCGATGATGGTTGCCTCATGCACATCCTCAGCTTCCTCTCTCCAATTCCTGATAGGT
ATAACACAGCACTCGTTTGCCACAGATGGAGATATCTGGCTTGTCACCCTCGCTTGTGGT
TACGAGTCGACCCTTTTGTGAAGGATTTATCACTCCCTGGAGTTTTCCATGACATTGAGT
CTGCTGTATCTGCTGCAAGACCTGGTGATACCATTTTAATAGGAGCTGGTGGAAGTCATC
GCGTTTCTAATATTCAGATTAAAAAGCCTATTTGCCTGATTGGTGGTGGCGAGATTCCTG
ATGAAACCACCCTTGTATGTTCTAGAGGATCAGACAGTGCCCTGGAGTTGCTATCAACCT
GCAAGCTAGCGAATCTAACAGTAAAAGCCGAGCTTGGGTGCTGCTTGCTTCACAGGAGTG
GAAGGCTAACGATCGATGGATGTGTGCTTCAATGTGAAACGAACCCTTTGGATCATCTCT
CATGCCCAATCGTGAGCACTGCTGGAGAGGAAGATAACTTGAGCAG
CATGTG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2FP20JQ 750 0 0
GTGAAGGATTTATCACTCCCTGGAGTTTTCCATGACATTGAGTCTGCTGTATCTGCTGCA
AGACCTGGTGATACCATTTTAATAGGAGCTGGTGGAAGTCATCGCGTTTCTAATATTCAG
ATTAAAAAGCCTATTTGCCTGATTGGTGGTGGCGAGATTCCTGATGAAACCACCCTTGTA
TGTTCTAGAGGATCAGACAGTGCCCTGGAGTTGCTATCAACCTGCAAGCTAGCGAATCTA
ACAGTAAAAGCCGAGCTTGGGTGCTGCTTGCTTCACAGGAGTGGAAGGCTAACGATCGAT
GGATGTGTGCTTCAATGTGAAACGAACCCTTTGGATCATCTCTCATGCCCAATCGTGAGC
ACTGCTGGAGAGGAAGATAACTTGAGCAGGCATGTGGAAGTGAAGGAAACCGTTGTTGAA
AAGATCAAGGGAAACAGTGTGACTGTTTTGCAGACAAGGATAGAAGGAGGTGCAAAGGCT
GTTGCTACAAGCGGAGACTTGGTACTGCAGCGTGTTCGAGTCATGTACTCGAAGGCTTAC
CTCTACTTCTGGTTTGATGTGGATCATGAGTGAAAGGTGATCTATCTGTTGTATGTTAGA
TTAATTACTGCCTTCTTTTTCTTTCTTCAACCTGTAACATTCGTAATATTATGTGGGATG
GTGGTCATCTATCATCATCATCATTATCTCCCTTTGTACTTCATTTTTTTTACATTTTCT
TTTTAAGATATAACAGGTTCGTTTCTCTTT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL4060Contig1 391 2 1 U
GGGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAA
GGACAGCTCCATTGGGACAAAACACGGTTCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGG
CAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCTTATGTTA
GGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGTTTCAAGG
TCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTTCGAGGTTGTTGTTTCCTTATGGTTGTTGCTGCTT
TCAGAATCGAAGTTTTGTAGACCCCGCTTTTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGACATTGGT
TTGAGTTTTCTATCTTTCTGTTCTGATCGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BX45JQ C 1
AF RR2BX45TF U 1
BS 1 391 RR2BX45TF

RD RR2BX45JQ 391 0 0
GGGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAA
GGACAGCTCCATTGGGACAAAACACGGTTCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGG
CAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCTTATGTTA
GGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGTTTCAAGG
TCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTTCGAGGTTGTTGTTTCCTTATGGTTGTTGCTGCTT
TCAGAATCGAAGTTTTGTAGACCCCGCTTTTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGACATTGGT
TTGAGTTTTCTATCTTTCTGTTCTGATCGAC

QA 1 391 1 391
DS 

RD RR2BX45TF 391 0 0
GGGTAACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAA
GGACAGCTCCATTGGGACAAAACACGGTTCTGCTAAGAGGACCCAAGAACTCTCGTGAGG
CAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCACACAGTCACTCCAAGCCTTATGTTA
GGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAGGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGTTTCAAGG
TCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTTCGAGGTTGTTGTTTCCTTATGGTTGTTGCTGCTT
TCAGAATCGAAGTTTTGTAGACCCCGCTTTTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGACATTGGT
TTGAGTTTTCTATCTTTCTGTTCTGATCGAC

QA 1 391 1 391
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4062Contig1 1092 2 2 U
GGGCACATTCTCTGTCTCTCTAAATATTTTCTTCTTCCTTCTGAAACTTCTGTGCGGTAA
AGAAAGCATAAATTTTTAAATTTTGATATAAAGAAGAAAGGAAAAAAGATTTACTTGGTG
TCTTTTAATTTACTGTTCTTGCAATGGTTTTGTTTTGTGAAATATTTCTTGGTGAAGAAG
GTAACCTAGAAGACGGAGAGTGGGTTAACGAAAGCTCATAGTTGTAATCCTTTCTCATCA
GGAAAACCAAAAAAAAGATTTTCTTTTCAAGTCTTTCCTCTGTTTCAGAAGATCATAAGA
GAGTTTGCGTTACCTTTTCATCGTTTTCTACTGGGTTTAAAAAAATCAAGAAACCATGAG
CACAAGTCTACTAAGTGATCCAACGATGCTGATTTCAACAACAGAGGGCATGATCGCCTC
TCAACAGCCGTCTCCATCGCCTACAACACAAATCTCGGGCGACGAGCCTGAGCCCGTGAC
GTGTGACTGCTGCGGATTAACCGAGGAGTGTACACAATCGTACATAGAGATGATCAGAGA
GCGTTACATGGGTAAATGGATCTGTGGTCTTTGTTCTGAAGCTGTGAAGTACGAGGTTAT
AAGAACTAAACGATTGCTGACTCCAGAGGAAGCTATGGCAAGGCACATGAACACGTGTTA
CAAGTTCAAATGCTCAAGCCCACCTCCTAATCCCACTGGACATTTGATCTCTGCGATGAG
ACAGATCTTGAGAAGAAGCTTGGATTCTCCAAGAGTGCTTAGATCGATGCCTAGTAGTCC
TTCTAAAGATGAAGATGATTGTGTTCCAAATGTTTTGTCTAGGTCTGATAGCTGTTTCGC
CAGTTTGACCTAAAAAAAAGCTCATAGTTGGGAAAATAAGTGTTTAAACTGGGTGATAAC
CGCGGTTTAAGGACCACCACCTGGTAAGGATCCGGTTTTCAGATTGCAAGTTTTCGTCAT
TAACCAAAACTGGTCTCTTGTATGTGTTTTTTGCCGGATTTGTCTACCTGTGGAAAGTTT
TTGGCCAAATGCTTAAAATGTACAAGTCTTGCGTTGTTTCTTGATTCCTCCCAATTGCTA
ATAACTTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW77TF U 1
AF RR2DW77JQ C 511
BS 1 565 RR2DW77TF
BS 566 1092 RR2DW77JQ

RD RR2DW77TF 565 0 0
GGGCACATTCTCTGTCTCTCTAAATATTTTCTTCTTCCTTCTGAAACTTCTGTGCGGTAA
AGAAAGCATAAATTTTTAAATTTTGATATAAAGAAGAAAGGAAAAAAGATTTACTTGGTG
TCTTTTAATTTACTGTTCTTGCAATGGTTTTGTTTTGTGAAATATTTCTTGGTGAAGAAG
GTAACCTAGAAGACGGAGAGTGGGTTAACGAAAGCTCATAGTTGTAATCCTTTCTCATCA
GGAAAACCAAAAAAAAGATTTTCTTTTCAAGTCTTTCCTCTGTTTCAGAAGATCATAAGA
GAGTTTGCGTTACCTTTTCATCGTTTTCTACTGGGTTTAAAAAAATCAAGAAACCATGAG
CACAAGTCTACTAAGTGATCCAACGATGCTGATTTCAACAACAGAGGGCATGATCGCCTC
TCAACAGCCGTCTCCATCGCCTACAACACAAATCTCGGGCGACGAGCCTGAGCCCGTGAC
GTGTGACTGCTGCGGATTAACCGAGGAGTGTACACAATCGTACATAGAGATGATCAGAGA
GCGTTACATGGGTAAATGGATCTGT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2DW77JQ 582 0 0
TACACAATCGTACATAGAGATGATCAGAGAGCGTTACATGGGTAAATGGATCTGTGGTCT
TTGTTCTGAAGCTGTGAAGTACGAGGTTATAAGAACTAAACGATTGCTGACTCCAGAGGA
AGCTATGGCAAGGCACATGAACACGTGTTACAAGTTCAAATGCTCAAGCCCACCTCCTAA
TCCCACTGGACATTTGATCTCTGCGATGAGACAGATCTTGAGAAGAAGCTTGGATTCTCC
AAGAGTGCTTAGATCGATGCCTAGTAGTCCTTCTAAAGATGAAGATGATTGTGTTCCAAA
TGTTTTGTCTAGGTCTGATAGCTGTTTCGCCAGTTTGACCTAAAAAAAAGCTCATAGTTG
GGAAAATAAGTGTTTAAACTGGGTGATAACCGCGGTTTAAGGACCACCACCTGGTAAGGA
TCCGGTTTTCAGATTGCAAGTTTTCGTCATTAACCAAAACTGGTCTCTTGTATGTGTTTT
TTGCCGGATTTGTCTACCTGTGGAAAGTTTTTGGCCAAATGCTTAAAATGTACAAGTCTT
GCGTTGTTTCTTGATTCCTCCCAATTGCTAATAACTTTTGGC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

CO CL4063Contig1 769 2 2 U
GAATAAGTTGCTTCATCAACTACCCTTGTTACAACTTACATGCATGACGTACTAAACTGT
ATTAAACGAACATATATAGGAGTTTTCTCATCTTTATCTTCATTACAGAAACCATAAGGC
TCATGTCTATCAATTTTTGGTATTATATATAACATAATTATCAATATTAGCGCACACAAC
TCATCGCAACACTTTCAGATTTTCTCTGACGCCAATTTTCGGTACATCTCCTCGACGTGT
ACCTGATAATACTTGAGCAGGTTGTTCCTCCGGTTCTTGAGCGTTGCAGTCACTAAGTCT
CTCGCTACATCGAAAGGTTTTGTCTCCACCGTCACTGCTTTGATGTACTCAAACTTTCTT
AGCTTGTTCTTCTCTGCCGTGGACTTCAGTTCTGAAATGATGTGCTCTTGTAACTCAGAG
AGAGAACATAGTTCTTCGAATGGTTTAGTAAAACCAAGTTCTTTAGCCCAACGTTTAACG
GTTTCTTGGTTTGGAACAATCACCGCGACAAGCATCGATTTGAAGCTGTCTCCATAAACC
CATATATCTTGGACAAGAGAGTTTTGACCGTAGATATTTTCCAAGTTCTCAAGAGCAACG
TATTCTCCTTGAGAGAGTTTGATAAGATTCTTTTTACGATCAATTATCTTAAGTACTCCA
TTTGATTGAATCTCACCAATATCTCCTGTATGGAACCATCCGTCTTTCATGACTTCTTGA
GTAAGTTCAGGGTTCTTGTAATAACCAGAAAACAGACATTTTCCTCTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE48JQ U 1
AF RR2FB13TF C 77
BS 1 711 RR2GE48JQ
BS 712 769 RR2FB13TF

RD RR2GE48JQ 711 0 0
GAATAAGTTGCTTCATCAACTACCCTTGTTACAACTTACATGCATGACGTACTAAACTGT
ATTAAACGAACATATATAGGAGTTTTCTCATCTTTATCTTCATTACAGAAACCATAAGGC
TCATGTCTATCAATTTTTGGTATTATATATAACATAATTATCAATATTAGCGCACACAAC
TCATCGCAACACTTTCAGATTTTCTCTGACGCCAATTTTCGGTACATCTCCTCGACGTGT
ACCTGATAATACTTGAGCAGGTTGTTCCTCCGGTTCTTGAGCGTTGCAGTCACTAAGTCT
CTCGCTACATCGAAAGGTTTTGTCTCCACCGTCACTGCTTTGATGTACTCAAACTTTCTT
AGCTTGTTCTTCTCTGCCGTGGACTTCAGTTCTGAAATGATGTGCTCTTGTAACTCAGAG
AGAGAACATAGTTCTTCGAATGGTTTAGTAAAACCAAGTTCTTTAGCCCAACGTTTAACG
GTTTCTTGGTTTGGAACAATCACCGCGACAAGCATCGATTTGAAGCTGTCTCCATAAACC
CATATATCTTGGACAAGAGAGTTTTGACCGTAGATATTTTCCAAGTTCTCAAGAGCAACG
TATTCTCCTTGAGAGAGTTTGATAAGATTCTTTTTACGATCAATTATCTTAAGTACTCCA
TTTGATTGAATCTCACCAATATCTCCTGTATGGAACCATCCGTCTTTCATG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2FB13TF 693 0 0
TAGGAGTTTTCTCATCTTTATCTTCATTACAGAAACCATAAGGCTCATGTCTATCAATTT
TTGGTATTATATATAACATAATTATCAATATTAGCGCACACAACTCATCGCAACACTTTC
AGATTTTCTCTGACGCCAATTTTCGGTACATCTCCTCGACGTGTACCTGATAATACTTGA
GCAGGTTGTTCCTCCGGTTCTTGAGCGTTGCAGTCACTAAGTCTCTCGCTACATCGAAAG
GTTTTGTCTCCACCGTCACTGCTTTGATGTACTCAAACTTTCTTAGCTTGTTCTTCTCTG
CCGTGGACTTCAGTTCTGAAATGATGTGCTCTTGTAACTCAGAGAGAGAACATAGTTCTT
CGAATGGTTTAGTAAAACCAAGTTCTTTAGCCCAACGTTTAACGGTTTCTTGGTTTGGAA
CAATCACCGCGACAAGCATCGATTTGAAGCTGTCTCCATAAACCCATATATCTTGGACAA
GAGAGTTTTGACCGTAGATATTTTCCAAGTTCTCAAGAGCAACGTATTCTCCTTGAGAGA
GTTTGATAAGATTCTTTTTACGATCAATTATCTTAAGTACTCCATTTGATTGAATCTCAC
CAATATCTCCTGTATGGAACCATCCGTCTTTCATGACTTCTTGAGTAAGTTCAGGGTTCT
TGTAATAACCAGAAAACAGACATTTTCCTCTTA

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL4064Contig1 956 2 2 U
GTGGAAATACAACTGAAGGAAGATGGTGTGATGTACATACATGTGGGAACTTTTCAGGCT
TGTCTGCATTCAGTAGTGTTTAAGTAGAACGTGACTGTTCTAATAGATATGAGGCGATGA
ATGACTAGGCATTAGAAGAGACATACAGGACAGGCTTTTAGCCCCATACAGCTTATAGGC
AGAAAAAAAGTTGCAGGTTTTGATGAATGAGTCTCTTTGCCAAAGCACCAGTGTGCAATA
CTCGAAGTTGTGCCTGCTAAGACGAAAACAACCGCCACGATGTGGTAGAGCCATGACTGT
TTTTGGCTTAAAAATTCACTCTCATCTGTCAGATTATGAATTCTTCTAAGATGACCTCAT
CAGTTTAGCTTTAGGTACATCAAAGAGGATTAATCAAGTACACATATTTGTGGAACTTGA
AGTATAAGCTAAACCAAGCTTGCTTGAAATGTTGAAACAACCGCTGATTATATTGGCCAT
TGGGAAAGAACACTGGAAACTGCTAAAGAGGTACACCAGCCATTTGGATATATTAGTTTG
GTTAATGGCTCCTCTTTTATTCTCATTTAAGAAAGTTCTAACTTCGAGTGTACATCTCAC
TCAAGGAAAAGAATATATCTGATTGATGTTGTTGCTTCTCCAGTACTGCGTCTCTTCATG
TGAATGGTTCATGCATGGAAGTTTGGTATGGTATAAACAGTAGTATATGCTGTTAATAGA
ACAAGGGCATAAAGTGTTGGAACTAGGAGAGTTTCCAGCATTCTGATTCGGAAATGTGTC
TGAGTTTGTATTTAGTTCTTGTTTCTGAGACAAGAGATTGAAGTTTGTTTATAGGATGAT
GTTATAAGAGTGATGAGAGAAAGTTCTTGTTTCTGAGACGAGATTGAAGTTTGTTTATAG
GACGATGTTATAAGAGTGATGAGAGACCAAATCTTAATCTTGATCATGGTTTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG96TF U 1
AF RR2DG96JQ C 325
BS 1 721 RR2DG96TF
BS 722 956 RR2DG96JQ

RD RR2DG96TF 721 0 0
GTGGAAATACAACTGAAGGAAGATGGTGTGATGTACATACATGTGGGAACTTTTCAGGCT
TGTCTGCATTCAGTAGTGTTTAAGTAGAACGTGACTGTTCTAATAGATATGAGGCGATGA
ATGACTAGGCATTAGAAGAGACATACAGGACAGGCTTTTAGCCCCATACAGCTTATAGGC
AGAAAAAAAGTTGCAGGTTTTGATGAATGAGTCTCTTTGCCAAAGCACCAGTGTGCAATA
CTCGAAGTTGTGCCTGCTAAGACGAAAACAACCGCCACGATGTGGTAGAGCCATGACTGT
TTTTGGCTTAAAAATTCACTCTCATCTGTCAGATTATGAATTCTTCTAAGATGACCTCAT
CAGTTTAGCTTTAGGTACATCAAAGAGGATTAATCAAGTACACATATTTGTGGAACTTGA
AGTATAAGCTAAACCAAGCTTGCTTGAAATGTTGAAACAACCGCTGATTATATTGGCCAT
TGGGAAAGAACACTGGAAACTGCTAAAGAGGTACACCAGCCATTTGGATATATTAGTTTG
GTTAATGGCTCCTCTTTTATTCTCATTTAAGAAAGTTCTAACTTCGAGTGTACATCTCAC
TCAAGGAAAAGAATATATCTGATTGATGTTGTTGCTTCTCCAGTACTGCGTCTCTTCATG
TGAATGGTTCATGCATGGAAGTTTGGTATGGTATAAACAGTAGTATATGCTGTTAATAGA
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2DG96JQ 632 0 0
TCTGTCAGATTATGAATTCTTCTAAGATGACCTCATCAGTTTAGCTTTAGGTACATCAAA
GAGGATTAATCAAGTACACATATTTGTGGAACTTGAAGTATAAGCTAAACCAAGCTTGCT
TGAAATGTTGAAACAACCGCTGATTATATTGGCCATTGGGAAAGAACACTGGAAACTGCT
AAAGAGGTACACCAGCCATTTGGATATATTAGTTTGGTTAATGGCTCCTCTTTTATTCTC
ATTTAAGAAAGTTCTAACTTCGAGTGTACATCTCACTCAAGGAAAAGAATATATCTGATT
GATGTTGTTGCTTCTCCAGTACTGCGTCTCTTCATGTGAATGGTTCATGCATGGAAGTTT
GGTATGGTATAAACAGTAGTATATGCTGTTAATAGAACAAGGGCATAAAGTGTTGGAACT
AGGAGAGTTTCCAGCATTCTGATTCGGAAATGTGTCTGAGTTTGTATTTAGTTCTTGTTT
CTGAGACAAGAGATTGAAGTTTGTTTATAGGATGATGTTATAAGAGTGATGAGAGAAAGT
TCTTGTTTCTGAGACGAGATTGAAGTTTGTTTATAGGACGATGTTATAAGAGTGATGAGA
GACCAAATCTTAATCTTGATCATGGTTTTAGC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL4065Contig1 1229 2 2 U
GGAAAACGATGGAGTTGGATCTTACACCGAAGCTGCCAAAGCAAGTGTACGGAGGAGATG
GTGGATCGTACTACGCGTGGTGCCCCGAAGAGTTGCCGATGCTGAAAGAGGGTAACATCG
GAGCAGCGAAGCTTGCTCTTGAACAGCACGGTTTCGCTGTTCCTCGTTACTCTGACTCTC
CTAAAGTCGCCTATGTTCTTCAAGGATCTGGAACGGCGGGGATTGTTCTCCCTGAGCAGG
AGGAGAAGGTGATCGGTATCAAAGAAGGCGACTCTATTGCTCTTCCTTTCGGTGTTGTCA
CATGGTGGTTCAACAGTGGGGAGAGCGAGCTTGTTATCCTCCTCCTTGGTGAAACCCACA
AGGCTCACAAGAGGGGAGAGTTTACCGACTTCTACCTCACCGGCTCCAACGGGATCTTCA
CCGGTTTTACCCCTGAGTTTGTTGGCAGAGCATGGGATCTCGACGAGGGGACCGTGAAGA
AACTCGTCGGTTCTCAGACCGGTAAAGGCATTGTGAAGCTGGACGCTGGTGTCAAGATGC
CGCATCCTAAGGAGGGTGACCGTGAAGGGTTTGTGTTGAACTGTTTGGAAGCTCCTCTTG
ATGTTGACATCAAGGACGGTGGGAGAGTTGTGGTGTTGAACACTAAGAACCTTCCTCTGG
TTGGGGAGGTTGGGTTTGGTGCTGATCTCGTTAGGATCGATGCTCATTCCATGTGTTCGC
CAGGTTTCTCTTGTGACTCGGCTCTTCAGGTGACTTACATTGTTGCCGGTAGTGGGAGAG
TTCAGGTTGTTGGTGCTGATGGGAAGAGGGTTCTTGAGACTCATATCAAGGCTGGTTCTC
TCTTTATTGTTCCCAGGTTCTTTGTGGTTTCGAAGATTGCTGATCCTGAGGGCATGTCTT
GGTTCTCCATTGTGACTACTCCCGATCCAATCTTCACGCATTTGGCTGGGAGGACATCGG
TTTGGAAGGCATTGTCTCCGGAGGTTTTGCAGGCGGCGTTTAAGGTTGATCCTGAGGTGG
AGCAGTCCTTCCGTTCAAAGCGAACTTCCGACGCCATTTTCTTCCCTCCTTCCAACTGAA
TAAAGCGAAGAGATGAGAACAAGAACCAGCTTTGTCTTTAGTCGTTGTTTTTCCCCCTGT
TTTCTCTTTGCTTGTGACTCACGGAAGCACTTATGGTCTGCTTCTGTTTGTGTTTTATCC
TGGACCGGTTCTTGTTCTCTTTGTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ72TF U 1
AF RR2DQ47TF U 568
BS 1 670 RR2BJ72TF
BS 671 1229 RR2DQ47TF

RD RR2BJ72TF 670 0 0
GGAAAACGATGGAGTTGGATCTTACACCGAAGCTGCCAAAGCAAGTGTACGGAGGAGATG
GTGGATCGTACTACGCGTGGTGCCCCGAAGAGTTGCCGATGCTGAAAGAGGGTAACATCG
GAGCAGCGAAGCTTGCTCTTGAACAGCACGGTTTCGCTGTTCCTCGTTACTCTGACTCTC
CTAAAGTCGCCTATGTTCTTCAAGGATCTGGAACGGCGGGGATTGTTCTCCCTGAGCAGG
AGGAGAAGGTGATCGGTATCAAAGAAGGCGACTCTATTGCTCTTCCTTTCGGTGTTGTCA
CATGGTGGTTCAACAGTGGGGAGAGCGAGCTTGTTATCCTCCTCCTTGGTGAAACCCACA
AGGCTCACAAGAGGGGAGAGTTTACCGACTTCTACCTCACCGGCTCCAACGGGATCTTCA
CCGGTTTTACCCCTGAGTTTGTTGGCAGAGCATGGGATCTCGACGAGGGGACCGTGAAGA
AACTCGTCGGTTCTCAGACCGGTAAAGGCATTGTGAAGCTGGACGCTGGTGTCAAGATGC
CGCATCCTAAGGAGGGTGACCGTGAAGGGTTTGTGTTGAACTGTTTGGAAGCTCCTCTTG
ATGTTGACATCAAGGACGGTGGGAGAGTTGTGGTGTTGAACACTAAGAACCTTCCTCTGG
TTGGGGAGGT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2DQ47TF 662 0 0
GGTTTGTGTTGAACTGTTTGGAAGCTCCTCTTGATGTTGACATCAAGGACGGTGGGAGAG
TTGTGGTGTTGAACACTAAGAACCTTCCTCTGGTTGGGGAGGTTGGGTTTGGTGCTGATC
TCGTTAGGATCGATGCTCATTCCATGTGTTCGCCAGGTTTCTCTTGTGACTCGGCTCTTC
AGGTGACTTACATTGTTGCCGGTAGTGGGAGAGTTCAGGTTGTTGGTGCTGATGGGAAGA
GGGTTCTTGAGACTCATATCAAGGCTGGTTCTCTCTTTATTGTTCCCAGGTTCTTTGTGG
TTTCGAAGATTGCTGATCCTGAGGGCATGTCTTGGTTCTCCATTGTGACTACTCCCGATC
CAATCTTCACGCATTTGGCTGGGAGGACATCGGTTTGGAAGGCATTGTCTCCGGAGGTTT
TGCAGGCGGCGTTTAAGGTTGATCCTGAGGTGGAGCAGTCCTTCCGTTCAAAGCGAACTT
CCGACGCCATTTTCTTCCCTCCTTCCAACTGAATAAAGCGAAGAGATGAGAACAAGAACC
AGCTTTGTCTTTAGTCGTTGTTTTTCCCCCTGTTTTCTCTTTGCTTGTGACTCACGGAAG
CACTTATGGTCTGCTTCTGTTTGTGTTTTATCCTGGACCGGTTCTTGTTCTCTTTGTTGA
TC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL4066Contig1 1110 2 2 U
AGGGGAAATCGGCAAAACATCAATTGCGGTCGCCGAGGGGTCTTCTGATTGTACCGACAC
CGGTACACGCCACGAGGAGCCATAAGGTTCCGAGTTTCTCCTCCGTGCAACGATGTCGGA
GACTCGCCGGAGTCAATCTAACAATGAACGAAACGACAACTCCGAGAATCAACACGGAAG
AGTTGTAATAGAGAACAGTCATGGTGAGAAACTCGTTGGAGTTTTGCAAGATACCGGCTC
AACCGAGACTGTTGTCATCTGCCATGGATTCCAATCATCGAAGGATCGGATCCCTATGAG
GACAATAGCTAATGTCTTTGAAAGAGCAAAGATCACTACTTTCCGGTTTGATTTCGCTGG
CAACGGGGAAAGCCAAGGATCATTTCAGTATGGTAACTACCGACGTGAAGCTGAAGATCT
CCGCTCTGTTCTTCAACACTTGCGTGGAGAAAACCGCGAAATTTTTGCAATTATCGGACA
TAGTAAAGGTGGGAATGTGGTGCTTTTGTATGCAGCAAAGTACAAGGATGTGGAGACTGT
TGTGAACATCTCAGGACGGTTTTTTCTAGAGAGGGGGATAGAAGGTAGGCTTGGTAAGGA
CTACTTCAAGAGAATCAAAGAGAACGGGTTCATCGATGTTAGGAACAGAAAGGGAAAGTT
TGAATATAGAGTAACAGAAGGGAGTCTAAAGGACCGTCTCACAACCAATACTCATGAAGC
ATGTCTCTCTATTCATGAAAACTGCAGGGTGTTGACAGTTCATGGGTCAGACGATAAAAT
CGTGTCTGTAACAGAAGCATATGAATTCGCCAAGTACATAAAGAACCATAAACTGTGTCT
TATTGAAGGAGCTGATCACGAGTTCACTTCTCACCAGCTTCAGCTTGCTTCTACTGTTTT
ATCATTCTTCAAGAAAGACGATGATGGTGACCCAGGTGATATCAGTACAAGTAGCCGAGA
CCCCATGAGACCCGTTGTTCCGATTACTTCACGAATTTAGATATATATTTATTCAGTTAC
AGGCTTGTGCTTAGTCGATTTAGTTGTTTATGATTAATAAAATCTTTATGTTAGTTACTA
ATTATGCATCTGGTAATATGTTTATACACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ41TF U 1
AF RR2AJ41JQ C 284
BS 1 676 RR2AJ41TF
BS 677 1110 RR2AJ41JQ

RD RR2AJ41TF 676 0 0
AGGGGAAATCGGCAAAACATCAATTGCGGTCGCCGAGGGGTCTTCTGATTGTACCGACAC
CGGTACACGCCACGAGGAGCCATAAGGTTCCGAGTTTCTCCTCCGTGCAACGATGTCGGA
GACTCGCCGGAGTCAATCTAACAATGAACGAAACGACAACTCCGAGAATCAACACGGAAG
AGTTGTAATAGAGAACAGTCATGGTGAGAAACTCGTTGGAGTTTTGCAAGATACCGGCTC
AACCGAGACTGTTGTCATCTGCCATGGATTCCAATCATCGAAGGATCGGATCCCTATGAG
GACAATAGCTAATGTCTTTGAAAGAGCAAAGATCACTACTTTCCGGTTTGATTTCGCTGG
CAACGGGGAAAGCCAAGGATCATTTCAGTATGGTAACTACCGACGTGAAGCTGAAGATCT
CCGCTCTGTTCTTCAACACTTGCGTGGAGAAAACCGCGAAATTTTTGCAATTATCGGACA
TAGTAAAGGTGGGAATGTGGTGCTTTTGTATGCAGCAAAGTACAAGGATGTGGAGACTGT
TGTGAACATCTCAGGACGGTTTTTTCTAGAGAGGGGGATAGAAGGTAGGCTTGGTAAGGA
CTACTTCAAGAGAATCAAAGAGAACGGGTTCATCGATGTTAGGAACAGAAAGGGAAAGTT
TGAATATAGAGTAACA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2AJ41JQ 827 0 0
GATCGGATCCCTATGAGGACAATAGCTAATGTCTTTGAAAGAGCAAAGATCACTACTTTC
CGGTTTGATTTCGCTGGCAACGGGGAAAGCCAAGGATCATTTCAGTATGGTAACTACCGA
CGTGAAGCTGAAGATCTCCGCTCTGTTCTTCAACACTTGCGTGGAGAAAACCGCGAAATT
TTTGCAATTATCGGACATAGTAAAGGTGGGAATGTGGTGCTTTTGTATGCAGCAAAGTAC
AAGGATGTGGAGACTGTTGTGAACATCTCAGGACGGTTTTTTCTAGAGAGGGGGATAGAA
GGTAGGCTTGGTAAGGACTACTTCAAGAGAATCAAAGAGAACGGGTTCATCGATGTTAGG
AACAGAAAGGGAAAGTTTGAATATAGAGTAACAGAAGGGAGTCTAAAGGACCGTCTCACA
ACCAATACTCATGAAGCATGTCTCTCTATTCATGAAAACTGCAGGGTGTTGACAGTTCAT
GGGTCAGACGATAAAATCGTGTCTGTAACAGAAGCATATGAATTCGCCAAGTACATAAAG
AACCATAAACTGTGTCTTATTGAAGGAGCTGATCACGAGTTCACTTCTCACCAGCTTCAG
CTTGCTTCTACTGTTTTATCATTCTTCAAGAAAGACGATGATGGTGACCCAGGTGATATC
AGTACAAGTAGCCGAGACCCCATGAGACCCGTTGTTCCGATTACTTCACGAATTTAGATA
TATATTTATTCAGTTACAGGCTTGTGCTTAGTCGATTTAGTTGTTTATGATTAATAAAAT
CTTTATGTTAGTTACTAATTATGCATCTGGTAATATGTTTATACACG

QA 1 827 1 827
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4068Contig1 1038 2 2 U
GGCCTCCTCTCTTTTCCCACCAAATTATCTTCTACTTGTGTGTTCACATAGAGAAAAAAA
GAAAAAATGGATGGTCACAACACTGGTAAAGACATTGGTATGAAGAGAAGTGCTTCCGAG
TTGGCTCTGCAAGAGTTGCTAAGTTTTTGTCCAGACAAGAATCTATTCTTGACACAAGCC
CTCTAGACCCTTCTTTTGATCTCATGAACTGGGATTACACATGTGAGTTAAGAGATAATC
GTTTGAAGTCTGAGAGCTTGAATCCAGCTGGACTTTTTCTTGATGCACAGTCCTCCATTT
GCGAGAATCTGTCAGCTGATAGTCCAGTGTCAGCCAATAAACCTGAGGCAAAGAGAGCGG
CTCGCGGAACCGTGAGTGTATATACTGATGATCACTCTGATGAAGAAGATGCGGAGATAG
AAGCTGGCCAGTCTGAAATGACTAATGATCCCAATGATGTAAAACGTATTAGAAGGATGT
ACTCAAACAGGATATCAGCAAGGCGTTCAAGGCAAAGGAAGCAAGAACAGCTGGCAGATC
TTGAATCTCAGGTTGACTCATTGAAAGGAGTGAACTCAACACTCTACAAGCAGCTCATAG
ATGCAACACAACAGTTTCGTACTGCTGGAACAAATAACAGAGTTCTTAGATCAGATGTTG
AAACCTTGAGAGTCAAGGTGAAACTAGCTGAAGATTTGATAGCTAGAGGGTCCTTCACTA
GCAGCTTGAATCAGCTTCTTCAAACTCATCTAAGTCCACCAGTACCACATTCCATCAACA
GTCTGCACTACACAGGAAATAATACCTCACCGGCCATTACGGACCACAGTGACCATTCTC
TGTTCCCTGGAATCACCATCTCTGGACAGAACTCAAGCCCTGGACTTGGTAATGTATCCA
GCGAAGCTGTTAGCTGCGTCTCAGATATCTGGCCATAAGTGTCTCTTTATTCACAATATG
TAGTGATCACTCTTTAAATTTCATGTATGTGTTTCACTATAGAACTAGAAACATATAAAT
GAAATCTACGTTTGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS08TF U 1
AF RR2BS08JQ C 280
BS 1 673 RR2BS08TF
BS 674 1038 RR2BS08JQ

RD RR2BS08TF 673 0 0
GGCCTCCTCTCTTTTCCCACCAAATTATCTTCTACTTGTGTGTTCACATAGAGAAAAAAA
GAAAAAATGGATGGTCACAACACTGGTAAAGACATTGGTATGAAGAGAAGTGCTTCCGAG
TTGGCTCTGCAAGAGTTGCTAAGTTTTTGTCCAGACAAGAATCTATTCTTGACACAAGCC
CTCTAGACCCTTCTTTTGATCTCATGAACTGGGATTACACATGTGAGTTAAGAGATAATC
GTTTGAAGTCTGAGAGCTTGAATCCAGCTGGACTTTTTCTTGATGCACAGTCCTCCATTT
GCGAGAATCTGTCAGCTGATAGTCCAGTGTCAGCCAATAAACCTGAGGCAAAGAGAGCGG
CTCGCGGAACCGTGAGTGTATATACTGATGATCACTCTGATGAAGAAGATGCGGAGATAG
AAGCTGGCCAGTCTGAAATGACTAATGATCCCAATGATGTAAAACGTATTAGAAGGATGT
ACTCAAACAGGATATCAGCAAGGCGTTCAAGGCAAAGGAAGCAAGAACAGCTGGCAGATC
TTGAATCTCAGGTTGACTCATTGAAAGGAGTGAACTCAACACTCTACAAGCAGCTCATAG
ATGCAACACAACAGTTTCGTACTGCTGGAACAAATAACAGAGTTCTTAGATCAGATGTTG
AAACCTTGAGAGT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2BS08JQ 759 0 0
TTGATGCACAGTCCTCCATTTGCGAGAATCTGTCAGCTGATAGTCCAGTGTCAGCCAATA
AACCTGAGGCAAAGAGAGCGGCTCGCGGAACCGTGAGTGTATATACTGATGATCACTCTG
ATGAAGAAGATGCGGAGATAGAAGCTGGCCAGTCTGAAATGACTAATGATCCCAATGATG
TAAAACGTATTAGAAGGATGTACTCAAACAGGATATCAGCAAGGCGTTCAAGGCAAAGGA
AGCAAGAACAGCTGGCAGATCTTGAATCTCAGGTTGACTCATTGAAAGGAGTGAACTCAA
CACTCTACAAGCAGCTCATAGATGCAACACAACAGTTTCGTACTGCTGGAACAAATAACA
GAGTTCTTAGATCAGATGTTGAAACCTTGAGAGTCAAGGTGAAACTAGCTGAAGATTTGA
TAGCTAGAGGGTCCTTCACTAGCAGCTTGAATCAGCTTCTTCAAACTCATCTAAGTCCAC
CAGTACCACATTCCATCAACAGTCTGCACTACACAGGAAATAATACCTCACCGGCCATTA
CGGACCACAGTGACCATTCTCTGTTCCCTGGAATCACCATCTCTGGACAGAACTCAAGCC
CTGGACTTGGTAATGTATCCAGCGAAGCTGTTAGCTGCGTCTCAGATATCTGGCCATAAG
TGTCTCTTTATTCACAATATGTAGTGATCACTCTTTAAATTTCATGTATGTGTTTCACTA
TAGAACTAGAAACATATAAATGAAATCTACGTTTGGTTT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL4069Contig1 954 2 2 U
GAACAAAGAAGCGGTGGTGGTGGGTTTCTTCATCCTCACCATCATCTACAAGGACGTGCA
ACGACGTCGTCTCTCTTTCCTGGTATCGATAACTTCACCCCGACAACATCGTTTTTGAAC
TTCCATAATCCGACAAAGCAAGAAGGAGATCAAGATTCGGAAGAGTTAAGTTCAGACAAG
AAACGGAGACTCCAAACGGCGTCGGATATACATCATCAACATGAACAAATCGGTGGCTAT
ACTCTTCAGTCTAGCAACAGTGGTTCCACGGCTACAACCGCGCAAATACCAGGAAACTTC
TGGATGGTTGCGGCTGCGGCGGCGGCCGTAGGTGGTGGTAATAATAACCAAACAGGAGGA
GTTTCTGGAGGCAGTGGTGGTGGTGGAGAGCCTGTGTGGACGTTTCCTTCGATTAACACT
GCCGCTGCTGCCTTATACAGAAGTAGCGTTTCGGGCGTTTCGGGCGGTGCGGTTTCGAGC
GGTTTACATTTTATGAATTTTGCAGCGCCAATGGCATTTCTTACTGGACAACAGCTAGCA
ACCAGTAGTAATCATGAGATCAATGAAGATAATAATAATAATGAAGGAGGTAGAAGAAGT
GACGGTGGGGATCATCATAGTACACATGAGAGACATCATCATCATCAACAACAACAGCAT
CATAATATTCTCTCCGGTTTAAATCAGTACGGACGGCAAGTTTCCGGCGAATCTCAGGCT
AGTGATTCACTTGGAGGCGGTGAGGAAGATCCACAAGATTAAAAATACACAAAGAAAACA
AAACAACTAATCGTGGATAACCCGGCGGCGCCGGTGGTGGAGACTGTGTTCGGCGGCTGT
GTAATACTTTTGTTTTGCCGTTATTTTTTGTTTTTCACTGTCTGTATTAATTTTTTTTTT
GCTAAGTTAAAAACAAAAATACGCGAGAACGTGAGATTTTTTTAGTTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E348TF U 1
AF RR2E348JQ C 295
BS 1 687 RR2E348TF
BS 688 954 RR2E348JQ

RD RR2E348TF 687 0 0
GAACAAAGAAGCGGTGGTGGTGGGTTTCTTCATCCTCACCATCATCTACAAGGACGTGCA
ACGACGTCGTCTCTCTTTCCTGGTATCGATAACTTCACCCCGACAACATCGTTTTTGAAC
TTCCATAATCCGACAAAGCAAGAAGGAGATCAAGATTCGGAAGAGTTAAGTTCAGACAAG
AAACGGAGACTCCAAACGGCGTCGGATATACATCATCAACATGAACAAATCGGTGGCTAT
ACTCTTCAGTCTAGCAACAGTGGTTCCACGGCTACAACCGCGCAAATACCAGGAAACTTC
TGGATGGTTGCGGCTGCGGCGGCGGCCGTAGGTGGTGGTAATAATAACCAAACAGGAGGA
GTTTCTGGAGGCAGTGGTGGTGGTGGAGAGCCTGTGTGGACGTTTCCTTCGATTAACACT
GCCGCTGCTGCCTTATACAGAAGTAGCGTTTCGGGCGTTTCGGGCGGTGCGGTTTCGAGC
GGTTTACATTTTATGAATTTTGCAGCGCCAATGGCATTTCTTACTGGACAACAGCTAGCA
ACCAGTAGTAATCATGAGATCAATGAAGATAATAATAATAATGAAGGAGGTAGAAGAAGT
GACGGTGGGGATCATCATAGTACACATGAGAGACATCATCATCATCAACAACAACAGCAT
CATAATATTCTCTCCGGTTTAAATCAG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2E348JQ 660 0 0
AACTTCTGGATGGTTGCGGCTGCGGCGGCGGCCGTAGGTGGTGGTAATAATAACCAAACA
GGAGGAGTTTCTGGAGGCAGTGGTGGTGGTGGAGAGCCTGTGTGGACGTTTCCTTCGATT
AACACTGCCGCTGCTGCCTTATACAGAAGTAGCGTTTCGGGCGTTTCGGGCGGTGCGGTT
TCGAGCGGTTTACATTTTATGAATTTTGCAGCGCCAATGGCATTTCTTACTGGACAACAG
CTAGCAACCAGTAGTAATCATGAGATCAATGAAGATAATAATAATAATGAAGGAGGTAGA
AGAAGTGACGGTGGGGATCATCATAGTACACATGAGAGACATCATCATCATCAACAACAA
CAGCATCATAATATTCTCTCCGGTTTAAATCAGTACGGACGGCAAGTTTCCGGCGAATCT
CAGGCTAGTGATTCACTTGGAGGCGGTGAGGAAGATCCACAAGATTAAAAATACACAAAG
AAAACAAAACAACTAATCGTGGATAACCCGGCGGCGCCGGTGGTGGAGACTGTGTTCGGC
GGCTGTGTAATACTTTTGTTTTGCCGTTATTTTTTGTTTTTCACTGTCTGTATTAATTTT
TTTTTTGCTAAGTTAAAAACAAAAATACGCGAGAACGTGAGATTTTTTTAGTTTTTTTTT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL4070Contig1 945 2 2 U
GGGAGGGAGAAGACGACAGACAAGTTTTCAGTTTCAGTTTAAAGCAATGGCGGATAAGGC
TGAGAAGATGAAGCTCCGGCAAGATTACCGGAACTTATGGCACTCCGATCTCATGGGAAC
CGTCACCGCCGACACTCCCTATTGTTGCTTGTCGTGTGTGTGCGGACCGTGTGTTTCTTA
CTTGCTTCGGAGAAGAGCACTTTACAATGACATGTCCAGGTATACTTGCTGTGCTGGATA
CATGCCTTGTAGTGGGAGGTGTGGAGAAAGCAAATGCCCTGAACTCTGCCTTGCTACTGA
GGTTTTCCTCTGTTTCGGAAACTCTGTGGCCTCTACTCGCTTTCTTCTCCAGGATGAATT
CAACATCCAGACTACAAAATGCGACAATTGCATTATTGGATTTATGTTCTGCCTAAGCCA
AGTCGCTTGCATATTCTCTATTGTCGCTTGCCTCGTTGGTAGCGAGGAACTTTCTGAAGC
TTCTCAGATACTCTCTTGCTGTGCCGATATGGTCTACTGCACGGTTTGCGCGTGTATGCA
GACTCAACACAAGCTTGAAATGGACAAAAGAGATGGAGTGTTTGGTCCTCAGCCAATGGG
CGTTCCACCGGCACAGCAGATGTCCCGTTTTGACCAACCTGCCCCTCCAGTCGGCTACCC
TCCTGCATCTTACCCACCGGCTCAAGGCTACCCTCCTGCACCTTACCCACCGGCTCAAGG
CTACCCTCCTGCATCTTATCCGCCTCCTGGTTATCCCCAACATTGAGGAACTTTAAACCA
ATATCTTCATATTGTGTGTCAAAGTGTTGTTGTTATTACTGTTCAGCTATTTTTCTCAGT
TATGTGGCTGCTTTGCAAGTATTAGTACTCTGGTTTATGCACTAAAACATTTGGTATCAT
CTGGTGTGTTGACTTTGTTGGTATTTTTCTCCCATTTATCTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC63TF U 1
AF RR2GC63JQ C 309
BS 1 707 RR2GC63TF
BS 708 945 RR2GC63JQ

RD RR2GC63TF 713 0 0
GGGAGGGAGAAGACGACAGACAAGTTTTCAGTTTCAGTTTAAAGCAATGGCGGATAAGGC
TGAGAAGATGAAGCTCCGGCAAGATTACCGGAACTTATGGCACTCCGATCTCATGGGAAC
CGTCACCGCCGACACTCCCTATTGTTGCTTGTCGTGTGTGTGCGGACCGTGTGTTTCTTA
CTTGCTTCGGAGAAGAGCACTTTACAATGACATGTCCAGGTATACTTGCTGTGCTGGATA
CATGCCTTGTAGTGGGAGGTGTGGAGAAAGCAAATGCCCTGAACTCTGCCTTGCTACTGA
GGTTTTCCTCTGTTTCGGAAACTCTGTGGCCTCTACTCGCTTTCTTCTCCAGGATGAATT
CAACATCCAGACTACAAAATGCGACAATTGCATTATTGGATTTATGTTCTGCCTAAGCCA
AGTCGCTTGCATATTCTCTATTGTCGCTTGCCTCGTTGGTAGCGAGGAACTTTCTGAAGC
TTCTCAGATACTCTCTTGCTGTGCCGATATGGTCTACTGCACGGTTTGCGCGTGTATGCA
GACTCAACACAAGCTTGAAATGGACAAAAGAGATGGAGTGTTTGGTCCTCAGCCAATGGG
CGTTCCACCGGCACAGCAGATGTCCCGTTTTGACCAACCTGCCCCTCCAGTCGGCTACCC
TCCTGCATCTTACCCACCGGCTCAAGGCTACCCTCCTGCACCTTACC
ACCGGC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2GC63JQ 637 0 0
TCTGTTTCGGAAACTCTGTGGCCTCTACTCGCTTTCTTCTCCAGGATGAATTCAACATCC
AGACTACAAAATGCGACAATTGCATTATTGGATTTATGTTCTGCCTAAGCCAAGTCGCTT
GCATATTCTCTATTGTCGCTTGCCTCGTTGGTAGCGAGGAACTTTCTGAAGCTTCTCAGA
TACTCTCTTGCTGTGCCGATATGGTCTACTGCACGGTTTGCGCGTGTATGCAGACTCAAC
ACAAGCTTGAAATGGACAAAAGAGATGGAGTGTTTGGTCCTCAGCCAATGGGCGTTCCAC
CGGCACAGCAGATGTCCCGTTTTGACCAACCTGCCCCTCCAGTCGGCTACCCTCCTGCAT
CTTACCCACCGGCTCAAGGCTACCCTCCTGCACCTTACCCACCGGCTCAAGGCTACCCTC
CTGCATCTTATCCGCCTCCTGGTTATCCCCAACATTGAGGAACTTTAAACCAATATCTTC
ATATTGTGTGTCAAAGTGTTGTTGTTATTACTGTTCAGCTATTTTTCTCAGTTATGTGGC
TGCTTTGCAAGTATTAGTACTCTGGTTTATGCACTAAAACATTTGGTATCATCTGGTGTG
TTGACTTTGTTGGTATTTTTCTCCCATTTATCTGATG

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL4071Contig1 766 2 2 U
GGGCCAAGAACAAGAAAAACAATACACAGAAACAGAGAGAGTTTTGTTGATATTTAGAAA
AAAAAGAACACAGCGTTGGAAAATGGATATGCAGTCACAGATGACACGTCCTTATGGTCA
TGATCAAGCTGAGGATCCAATCAGAGTTCACCATCCAGAGGAAGAAGAGCATCAAGAGAA
GGGAGCAACTAAAGTGTTGAAGAAAGTGAAAGGAAAAGCCAAGAAGATCAAGAACAGTCT
TATCAAACATGGTCACGGCCATGACCACGATCATGATGTCGAAATAGAAGACGACGAAAA
CAATGAGCAAGACCCACAATTGCACGGCGCGCCAGCACACACAGTGTATAATACTCAAGG
CGGTGTAACGGGTGAACCCGACTCACTGCGTCATCCCGGAGAAGCTAATGTTCCGGCACC
TGAGGAGATCGTTCCACCAGGGACACAAGTTTTCCCGGTCGTGTCTTCCGATGATGTGAA
GAAACAGCCACCTAAAGGTGTCTCCTTTAGCCTTCCTGTTGCAACACACACTCACCAAGA
CTCCAACTCACTCGCTTGTAATGAAGAAACAGAGTTTATGAAAAAACAGAGTTCAAGAAC
AGAGTAATGAAAAAACAGAGTGAAGAAGAAAGAACAGAGCAAGACTCAGCGATTGTTAAC
CCAGTTACACCCGTTAACGAGGGTGTTAGTCTGGGCCGGGAACTGTCTCCCGGAATCCAC
TAGATCAGAGTTTACAAGTGTATTTGAATCTCAAGGTCTTTGCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP45TF U 1
AF RR2FP45JQ C 49
BS 1 677 RR2FP45TF
BS 678 766 RR2FP45JQ

RD RR2FP45TF 677 0 0
GGGCCAAGAACAAGAAAAACAATACACAGAAACAGAGAGAGTTTTGTTGATATTTAGAAA
AAAAAGAACACAGCGTTGGAAAATGGATATGCAGTCACAGATGACACGTCCTTATGGTCA
TGATCAAGCTGAGGATCCAATCAGAGTTCACCATCCAGAGGAAGAAGAGCATCAAGAGAA
GGGAGCAACTAAAGTGTTGAAGAAAGTGAAAGGAAAAGCCAAGAAGATCAAGAACAGTCT
TATCAAACATGGTCACGGCCATGACCACGATCATGATGTCGAAATAGAAGACGACGAAAA
CAATGAGCAAGACCCACAATTGCACGGCGCGCCAGCACACACAGTGTATAATACTCAAGG
CGGTGTAACGGGTGAACCCGACTCACTGCGTCATCCCGGAGAAGCTAATGTTCCGGCACC
TGAGGAGATCGTTCCACCAGGGACACAAGTTTTCCCGGTCGTGTCTTCCGATGATGTGAA
GAAACAGCCACCTAAAGGTGTCTCCTTTAGCCTTCCTGTTGCAACACACACTCACCAAGA
CTCCAACTCACTCGCTTGTAATGAAGAAACAGAGTTTATGAAAAAACAGAGTTCAAGAAC
AGAGTAATGAAAAAACAGAGTGAAGAAGAAAGAACAGAGCAAGACTCAGCGATTGTTAAC
CCAGTTACACCCGTTAA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2FP45JQ 718 0 0
GATATTTAGAAAAAAAAGAACACAGCGTTGGAAAATGGATATGCAGTCACAGATGACACG
TCCTTATGGTCATGATCAAGCTGAGGATCCAATCAGAGTTCACCATCCAGAGGAAGAAGA
GCATCAAGAGAAGGGAGCAACTAAAGTGTTGAAGAAAGTGAAAGGAAAAGCCAAGAAGAT
CAAGAACAGTCTTATCAAACATGGTCACGGCCATGACCACGATCATGATGTCGAAATAGA
AGACGACGAAAACAATGAGCAAGACCCACAATTGCACGGCGCGCCAGCACACACAGTGTA
TAATACTCAAGGCGGTGTAACGGGTGAACCCGACTCACTGCGTCATCCCGGAGAAGCTAA
TGTTCCGGCACCTGAGGAGATCGTTCCACCAGGGACACAAGTTTTCCCGGTCGTGTCTTC
CGATGATGTGAAGAAACAGCCACCTAAAGGTGTCTCCTTTAGCCTTCCTGTTGCAACACA
CACTCACCAAGACTCCAACTCACTCGCTTGTAATGAAGAAACAGAGTTTATGAAAAAACA
GAGTTCAAGAACAGAGTAATGAAAAAACAGAGTGAAGAAGAAAGAACAGAGCAAGACTCA
GCGATTGTTAACCCAGTTACACCCGTTAACGAGGGTGTTAGTCTGGGCCGGGAACTGTCT
CCCGGAATCCACTAGATCAGAGTTTACAAGTGTATTTGAATCTCAAGGTCTTTGCAGT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL4072Contig1 718 2 4 U
GGAAAAGACCCAAAGTCATCACTTGTTTCCACTTCCTTCCTCCTTGGTACTACCAAACAC
ACCAAAGAAGAAGAAGAAGAAGTGACTTATCATGTCTCCTCCTTCTTCTCTCCAATGCCT
TACAGTCTACTTTGCCTTAATTCTCTTCCTGAGCTCCTCCACTGTTCTCTCCCATTCCGA
TCTGGTCACCCGTTTACCCGGTCAACCCCTGGTCGGATTCCGCCAATACTCAGGTTATGT
CACCGTCGACGAAAAGAAACAGAGGGCTCTGTTTTACTACTTCGCCGAAGCTGAAACCGA
ACCTACCTCCAAGCCTGCCATTCGTCGTCTTGCTCGCAGGGGGTGGAGTCAAGCGTATTA
GCGGCCTCATCTACGAAGAGACCAGAGGAGTCCTCAAGATCTTTCTCGAGAATGTCATCC
GTGACGCCGTCACCTACACTGAGCACGCTAGGAGGAAGACGGTTACTGCTATGGATGTTG
TCTATGCTTTGAAGAGACAAGGACGCACTCTGTACGGTTTCGGCGGTTAATCAACGGATT
GAGATTTTAGGAGGAGACGGAATTAGAGTGTTGTTTCTGTTATCATCCACTTGTTTAGTA
GTAAAAAGTAGTTTGTGTTTTGAGCTGTGTCTTGTTAAAGCCAATTTGATGTTCTATGTA
GCTACGATTCAGCAATCTCTGCTTGGATTCTTAAAAAATTTCTGTTTGCAAAACGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY38TF U 1
AF RR2EY38JQ C 75
BS 1 697 RR2EY38TF
BS 698 698 RR2EY38JQ
BS 699 712 RR2EY38TF
BS 713 718 RR2EY38JQ

RD RR2EY38TF 717 0 0
GGAAAAGACCCAAAGTCATCACTTGTTTCCACTTCCTTCCTCCTTGGTACTACCAAACAC
ACCAAAGAAGAAGAAGAAGAAGTGACTTATCATGTCTCCTCCTTCTTCTCTCCAATGCCT
TACAGTCTACTTTGCCTTAATTCTCTTCCTGAGCTCCTCCACTGTTCTCTCCCATTCCGA
TCTGGTCACCCGTTTACCCGGTCAACCCCTGGTCGGATTCCGCCAATACTCAGGTTATGT
CACCGTCGACGAAAAGAAACAGAGGGCTCTGTTTTACTACTTCGCCGAAGCTGAAACCGA
ACCTACCTCCAAGCCTGCCATTCGTCGTCTTGCTCGCAGGGGGTGGAGTCAAGCGTATTA
GCGGCCTCATCTACGAAGAGACCAGAGGAGTCCTCAAGATCTTTCTCGAGAATGTCATCC
GTGACGCCGTCACCTACACTGAGCACGCTAGGAGGAAGACGGTTACTGCTATGGATGTTG
TCTATGCTTTGAAGAGACAAGGACGCACTCTGTACGGTTTCGGCGGTTAATCAACGGATT
GAGATTTTAGGAGGAGACGGAATTAGAGTGTTGTTTCTGTTATCATCCACTTGTTTAGTA
GTAAAAAGTAGTTTGTGTTTTGAGCTGTGTCTTGTTAAAGCCAATTTGATGTTCTATGTA
GCTACGATTCAGCAATCTCTGCTTGGATTCTTAAAAA*TTTCTGTTTGCAAA
CGATG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2EY38JQ 644 0 0
AGAAGAAGTGACTTATCATGTCTCCTCCTTCTTCTCTCCAATGCCTTACAGTCTACTTTG
CCTTAATTCTCTTCCTGAGCTCCTCCACTGTTCTCTCCCATTCCGATCTGGTCACCCGTT
TACCCGGTCAACCCCTGGTCGGATTCCGCCAATACTCAGGTTATGTCACCGTCGACGAAA
AGAAACAGAGGGCTCTGTTTTACTACTTCGCCGAAGCTGAAACCGAACCTACCTCCAAGC
CTGCCATTCGTCGTCTTGCTCGCAGGGGGTGGAGTCAAGCGTATTAGCGGCCTCATCTAC
GAAGAGACCAGAGGAGTCCTCAAGATCTTTCTCGAGAATGTCATCCGTGACGCCGTCACC
TACACTGAGCACGCTAGGAGGAAGACGGTTACTGCTATGGATGTTGTCTATGCTTTGAAG
AGACAAGGACGCACTCTGTACGGTTTCGGCGGTTAATCAACGGATTGAGATTTTAGGAGG
AGACGGAATTAGAGTGTTGTTTCTGTTATCATCCACTTGTTTAGTAGTAAAAAGTAGTTT
GTGTTTTGAGCTGTGTCTTGTTAAAGCCAATTTGATGTTCTATGTAGCTACGATTCAGCA
ATCTCTGCTTGGATTCTTAAAAAATTTCTGTTTGCAAAACGATG

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL4073Contig1 821 2 9 U
AAGGCATAGATGGACAGGGAGATACGAAGCGCATTTGTGGGATAAGAACAGCTGGAACGA
GACGCAGACCAAGAAAGGACGTCAAGTTTATCTAGGAGCATATGACGAAGAAGAAGCAGC
AGCACGTGCCTATGACTTAGCGGCATTGAAGTATTGGGGAAGAGACACACTCTTGAACTT
CCCTCTATCTACTTATGAAGAAGACATCAAAGAAATGGAAGGCAACTCCAAGGAAGAGTA
CATAGGATCTTTGAGAAGGAAAAGTAGTGGATTTTCACGCGGTGTTTCAAAATACAGAGG
CGTTGCAAGGCACCACCATAATGGGAGATGGGAAGCTCGGATTGGAAGGGTGTTTGGTAA
TAAATATCTATACCTGGGGACATACGCAACGCAAGAAGAAGCAGCCAGAGCATACGACAT
CGCGGCAATAGAGTACCGTGGACTTAACGCCGTTACCAACTTCGACGTCAGCCGTTATCT
AGACTTACCGGCATCGAAAAAAACCAACGCCGCCGCAAGTCCAGAATCGCCAAATGATCA
AACATCGTCGGATGATACAAAAACAGAGGAGATAACCGAGCCGTTTACGCCGCCTGAAGC
TATTCAATCACGCCGGAGCTTTCCCGATGACATCAGACGTATTTCGAGTGTCAGGATTCC
GGCAAGTTAGCGACGGAGGAGGACGTTATCTTCGGTGGTTTTAATTCTTTCATAAGCCCT
GGTTTATGTAACGAGTTTGATTATTGGTCTTGATCGTAATGTTTACTATGTTATGCTTCA
AAAAAATGATAACTTGGCGGTAAAGTTATGCTGTTTCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE85TF U 86
AF RR2GZ44JQ C 1
BS 1 85 RR2GZ44JQ
BS 86 276 RR2CE85TF
BS 277 277 RR2GZ44JQ
BS 278 306 RR2CE85TF
BS 307 307 RR2GZ44JQ
BS 308 375 RR2CE85TF
BS 376 376 RR2GZ44JQ
BS 377 502 RR2CE85TF
BS 503 821 RR2GZ44JQ

RD RR2CE85TF 417 0 0
GTTTATCTAGGAGCATATGACGAAGAAGAAGCAGCAGCACGTGCCTATGACTTAGCGGCA
TTGAAGTATTGGGGAAGAGACACACTCTTGAACTTCCCTCTATCTACTTATGAAGAAGAC
ATCAAAGAAATGGAAGGCAACTCCAAGGAAGAGTACATAGGATCTTTGAGAAGGAAAAGT
AGTGGATTTTCTCGCGGTGTTTCAAAATACAGAGGCGTTGCCAGGCACCACCATAATGGG
AGATGGGAAGCTCGGATTGGAAGGGTGTTTGGTAATAAATATCTATACCTTGGGACATAC
GCAACGCAAGAAGAAGCAGCCAGAGCATACGACATCGCGGCAATAGAGTACCGTGGACTT
AACGCCGTTACCAACTTCGACGTCAGCCGTTATCTAGACTTACCGGCATCGAAAAAA

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR2GZ44JQ 821 0 0
AAGGCATAGATGGACAGGGAGATACGAAGCGCATTTGTGGGATAAGAACAGCTGGAACGA
GACGCAGACCAAGAAAGGACGTCAAGTTTATCTAGGAGCATATGACGAAGAAGAAGCAGC
AGCACGTGCCTATGACTTAGCGGCATTGAAGTATTGGGGAAGAGACACACTCTTGAACTT
CCCTCTATCTACTTATGAAGAAGACATCAAAGAAATGGAAGGCAACTCCAAGGAAGAGTA
TATAGGATCTTTGAGAAGGAAAAGTAGTGGATTTTCACGCGGTGTTTCAAAATACAGAGG
CGTTGCAAGGCACCACCATAATGGGAGATGGGAAGCTCGGATTGGAAGGGTGTTTGGTAA
TAAATATCTATACCTGGGGACATACGCAACGCAAGAAGAAGCAGCCAGAGCATACGACAT
CGCGGCAATAGAGTACCGTGGACTTAACGCCGTTACCAACTTCGACGTCAGCCGTTATCT
AGACTTACCGGCATCGAAAAAAACCAACGCCGCCGCAAGTCCAGAATCGCCAAATGATCA
AACATCGTCGGATGATACAAAAACAGAGGAGATAACCGAGCCGTTTACGCCGCCTGAAGC
TATTCAATCACGCCGGAGCTTTCCCGATGACATCAGACGTATTTCGAGTGTCAGGATTCC
GGCAAGTTAGCGACGGAGGAGGACGTTATCTTCGGTGGTTTTAATTCTTTCATAAGCCCT
GGTTTATGTAACGAGTTTGATTATTGGTCTTGATCGTAATGTTTACTATGTTATGCTTCA
AAAAAATGATAACTTGGCGGTAAAGTTATGCTGTTTCAATC

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 2

CO CL4074Contig1 996 2 4 U
GCAGCTAGTCCCATAAAAACATCTGTATCAGGCATATCTTTTAGTCTCAAGGAAAGATGT
GCTGCAGTGGACACTGTTTCTATTGTGGCTCGAATACTGCATAAATCAAAAGCTCATCTC
CAGTCTATGCTTATGTCAAGAAATGGCTCTCTGGTTGAAGACTTCTTTGGTCAACTGGTT
GGTTCCGTACCTGAACTGACAGAGCACTTGCATAGGACAACTGCAAGGATACTGCTGCAT
GTTAATGGATATGTTGACCGGATTGCTAATTCTAAATGGGAAGTCAAGGAGCTTGGAGTG
GAGCATAATGGGTATGTTGATTTGATGCTGGGGGAATTCAAACACTACAAAACAAGGCTT
GCTCATGGAGGCATCCAACAGGAGGTCCAGAATATCCTACTGCAATATGGAGTTGAAATA
TTTGCGGAGATGCTGGTCGAAGGGTTCTCTCGAATAAAAAGATGTACTGATGAAGGACGG
GCTCTCATGTCACTAGATATTCAGGTCCTAATAAACGGGCTACAGCACTTTGTGCCAACA
AAGGTGAAGCCAAAGTTACAGATAGTCGAAACATTTATCAAGGCATACTATCTGCCAGAG
ACGGAATATGTCCACTGGGCAAGGGCTCATCCGAAATATTCGAAAGCACAGGTCATTGGA
CTGGTGAATTTAGTAGCCACCATGAAAAGCTGGAAGAGGAAAACGCGACTAGAAGTTGTG
GAGAAGATCGAATCAGCTGCTGCGTAGATCAAATCTAAAAGCAACAACAAAGTAATATCT
ACTTCTTTTCTCTGGTCTTGTTTTGTCTTTTGCTTTTGTCTCTTTCTTTTGCATTTAGAA
TCGAGTGGTGTAAATTTGAGGATAAGCCCTTCTTAGTTGCTGTCGTGCTTAATGGGGTTG
TGTAAAAGATTCTCCTCAAGTTGTACAGTCCTGAAGAGATTGTACCACACATTTTCCTAC
ACTTAAATACTTCATTAATGTCTCAGTGTTTGTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD76TF U 1
AF RR2GD76JQ C 194
BS 1 651 RR2GD76TF
BS 652 652 RR2GD76JQ
BS 653 687 RR2GD76TF
BS 688 996 RR2GD76JQ

RD RR2GD76TF 693 0 0
GCAGCTAGTCCCATAAAAACATCTGTATCAGGCATATCTTTTAGTCTCAAGGAAAGATGT
GCTGCAGTGGACACTGTTTCTATTGTGGCTCGAATACTGCATAAATCAAAAGCTCATCTC
CAGTCTATGCTTATGTCAAGAAATGGCTCTCTGGTTGAAGACTTCTTTGGTCAACTGGTT
GGTTCCGTACCTGAACTGACAGAGCACTTGCATAGGACAACTGCAAGGATACTGCTGCAT
GTTAATGGATATGTTGACCGGATTGCTAATTCTAAATGGGAAGTCAAGGAGCTTGGAGTG
GAGCATAATGGGTATGTTGATTTGATGCTGGGGGAATTCAAACACTACAAAACAAGGCTT
GCTCATGGAGGCATCCAACAGGAGGTCCAGAATATCCTACTGCAATATGGAGTTGAAATA
TTTGCGGAGATGCTGGTCGAAGGGTTCTCTCGAATAAAAAGATGTACTGATGAAGGACGG
GCTCTCATGTCACTAGATATTCAGGTCCTAATAAACGGGCTACAGCACTTTGTGCCAACA
AAGGTGAAGCCAAAGTTACAGATAGTCGAAACATTTATCAAGGCATACTATCTGCCAGAG
ACGGAATATGTCCACTGGGCAAGGGCTCATCCGAAATATTCGAAAGCACAG*TCATTGGA
CTGGTGAATTTAGTAGCCACCATGAAA
GCTGGA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2GD76JQ 803 0 0
AACTGACAGAGCACTTGCATAGGACAACTGCAAGGATACTGCTGCATGTTAATGGATATG
TTGAC*GGATTGCTAATTCTAAATGGGAAGTCAAGGAGCTTGGAGTGGAGCATAATGGGT
ATGTTGATTTGATGCTGGGGGAATTCAAACACTACAAAACAAGGCTTGCTCATGGAGGCA
TCCAACAGGAGGTCCAGAATATCCTACTGCAATATGGAGTTGAAATATTTGCGGAGATGC
TGGTCGAAGGGTTCTCTCGAATAAAAAGATGTACTGATGAAGGACGGGCTCTCATGTCAC
TAGATATTCAGGTCCTAATAAACGGGCTACAGCACTTTGTGCCAACAAAGGTGAAGCCAA
AGTTACAGATAGTCGAAACATTTATCAAGGCATACTATCTGCCAGAGACGGAATATGTCC
ACTGGGCAAGGGCTCATCCGAAATATTCGAAAGCACAGGTCATTGGACTGGTGAATTTAG
TAGCCACCATGAAAAGCTGGAAGAGGAAAACGCGACTAGAAGTTGTGGAGAAGATCGAAT
CAGCTGCTGCGTAGATCAAATCTAAAAGCAACAACAAAGTAATATCTACTTCTTTTCTCT
GGTCTTGTTTTGTCTTTTGCTTTTGTCTCTTTCTTTTGCATTTAGAATCGAGTGGTGTAA
ATTTGAGGATAAGCCCTTCTTAGTTGCTGTCGTGCTTAATGGGGTTGTGTAAAAGATTCT
CCTCAAGTTGTACAGTCCTGAAGAGATTGTACCACACATTTTCCTACACTTAAATACTTC
ATTAATGTCTCAGTGTTTGTATT

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL4075Contig1 1171 2 2 U
GGGTTGAGAGGGTGACAAACAACAAGCAAAACTAAGCAGGGACATTATAGAAGAAGAAGA
AAAAGAATCAGGGAGAGATGACGGTCATAAATATTATCTTCAGAGTCGATGAGATATGCA
AGAAGTACGACAAGTACGACGTCGACAAGCAGCGTGAGCTCGGCGCGTCCGGAGACGATG
CCTTCTCCCGTCTCTTCAACTCCATTGATACCGATATTGAATCGGTTGTACATAAAGCGG
AGTTGGCATCAACAGAGAGCAACAGAGCTGCAGCTGTGGCCTTGAATGCTGAGGTTCGAA
GGACAAAAGCTCGTTTAGCTGAAGATGTTGTTAAACTGCAGAAACTCGCCGTTAAAAAGG
TGAAAGGGCTCACAAAAGAGGAACGAGAGTCCCGATGTGATCTAGTTATCGCGCTAGCCG
ATAGGATTCAAGTGATACCTGACGGACATGAAAGACAATCTAATAATGAATGGGGAGGTG
CTTCTGCACCCAACAAGAACATCAAGTTTGATATATCTGAGGAAGACATGGATGACGGGT
TTTTCCAGCAAACTGAAGAATCCAGCCAGTTTCGACAAGAATATGAAATGAGAAAAAAGA
AGCAGGACGAGGGCCTTGATGTTATATCAGAAGGTTTGGACGCACTGAAGAACTTAGCAC
GTGACATGAACGAGGAACTAGACAAGCAAGTCCCATTGATGGATGAAATGGAAACAAAGG
TTGATGGAGCAACTTCGGATTTGAAGAACACCAATGTTAGGCTCAAGCAACAGCTTGTAA
AGATGAGATCGAGCCGCAATTTCTGCATCGACATCATTTTTCTCTGTGTGGTCCTTGGAA
TCATTTCTTACATCTATAATGCCCTGAGCTAAAGTTGGGGAGGCAGATACCGGATATTCT
CATTGCCATTGTCAAGCCTATGGTAAAACTTCTTACCAAAGTAATAATAGTCATTTCCTG
GAGAGCAAGCAAACAAGTTATTTTCACAAGCTTTTACCATTTGTATAACAGTTTTAAGGA
ATTATTCTTGGCAAGAAATAATACATATGCACAAGGTTCGCTGTTGTAGTTGTGTTTGTT
TTGTTGGGCGATTTATTTTGTTGAATCAGAATGTTTTAGCGTTTCCAAGTATCATAAATT
TGTAAGAAAATGAAAGTAAACGTTTGTGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG29TF U 1
AF RR2AG29JQ C 315
BS 1 715 RR2AG29TF
BS 716 1171 RR2AG29JQ

RD RR2AG29TF 715 0 0
GGGTTGAGAGGGTGACAAACAACAAGCAAAACTAAGCAGGGACATTATAGAAGAAGAAGA
AAAAGAATCAGGGAGAGATGACGGTCATAAATATTATCTTCAGAGTCGATGAGATATGCA
AGAAGTACGACAAGTACGACGTCGACAAGCAGCGTGAGCTCGGCGCGTCCGGAGACGATG
CCTTCTCCCGTCTCTTCAACTCCATTGATACCGATATTGAATCGGTTGTACATAAAGCGG
AGTTGGCATCAACAGAGAGCAACAGAGCTGCAGCTGTGGCCTTGAATGCTGAGGTTCGAA
GGACAAAAGCTCGTTTAGCTGAAGATGTTGTTAAACTGCAGAAACTCGCCGTTAAAAAGG
TGAAAGGGCTCACAAAAGAGGAACGAGAGTCCCGATGTGATCTAGTTATCGCGCTAGCCG
ATAGGATTCAAGTGATACCTGACGGACATGAAAGACAATCTAATAATGAATGGGGAGGTG
CTTCTGCACCCAACAAGAACATCAAGTTTGATATATCTGAGGAAGACATGGATGACGGGT
TTTTCCAGCAAACTGAAGAATCCAGCCAGTTTCGACAAGAATATGAAATGAGAAAAAAGA
AGCAGGACGAGGGCCTTGATGTTATATCAGAAGGTTTGGACGCACTGAAGAACTTAGCAC
GTGACATGAACGAGGAACTAGACAAGCAAGTCCCATTGATGGATGAAATGGAAAC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2AG29JQ 857 0 0
TTAGCTGAAGATGTTGTTAAACTGCAGAAACTCGCCGTTAAAAAGGTGAAAGGGCTCACA
AAAGAGGAACGAGAGTCCCGATGTGATCTAGTTATCGCGCTAGCCGATAGGATTCAAGTG
ATACCTGACGGACATGAAAGACAATCTAATAATGAATGGGGAGGTGCTTCTGCACCCAAC
AAGAACATCAAGTTTGATATATCTGAGGAAGACATGGATGACGGGTTTTTCCAGCAAACT
GAAGAATCCAGCCAGTTTCGACAAGAATATGAAATGAGAAAAAAGAAGCAGGACGAGGGC
CTTGATGTTATATCAGAAGGTTTGGACGCACTGAAGAACTTAGCACGTGACATGAACGAG
GAACTAGACAAGCAAGTCCCATTGATGGATGAAATGGAAACAAAGGTTGATGGAGCAACT
TCGGATTTGAAGAACACCAATGTTAGGCTCAAGCAACAGCTTGTAAAGATGAGATCGAGC
CGCAATTTCTGCATCGACATCATTTTTCTCTGTGTGGTCCTTGGAATCATTTCTTACATC
TATAATGCCCTGAGCTAAAGTTGGGGAGGCAGATACCGGATATTCTCATTGCCATTGTCA
AGCCTATGGTAAAACTTCTTACCAAAGTAATAATAGTCATTTCCTGGAGAGCAAGCAAAC
AAGTTATTTTCACAAGCTTTTACCATTTGTATAACAGTTTTAAGGAATTATTCTTGGCAA
GAAATAATACATATGCACAAGGTTCGCTGTTGTAGTTGTGTTTGTTTTGTTGGGCGATTT
ATTTTGTTGAATCAGAATGTTTTAGCGTTTCCAAGTATCATAAATTTGTAAGAAAATGAA
AGTAAACGTTTGTGGGC

QA 1 857 1 857
DS 



AS 1 2

CO CL4076Contig1 1009 2 2 U
GAACCCTTGGCAGCCCACAACTCCTTATGCTAAGCGGCGTCGGTCCATCAGCTCAATTAC
AAGCCCAAAACATTACTGTGATGATGGACCAGCCCCATGTGGGTCAAGGGATGCACGACA
ACCCTATGAACGCCGTGTTTATCCCTTCTCCGGTCCCTGTCGAAGTCTCACTCATTGAGG
TAGTTGGAATTACCGGCGAAGGAACATACGTTGAGGCTGCCGGTGGTGAGAATTTTGGTG
GTGGAGGTGGTAGTGGTTCCTCCGCTAGAGACTACTATGCGATGTTTTCTCCAAAGGCAA
CGTTATTAGAGTCAAATTCAATGAGGTTATCATCAGCCCAACCTTTTCAAGGAGGCTTCA
TTTTGGAGAAAGTAATGGGCCCACTATCCACGGGTCATTTGGAGATCCGGACCCGAAATC
CGAATGATAACCCGGTTGTCACGTTCAACTATTTCCAACACCCAGACGACCTAAAACGAT
GCGTTCGAGGGATCCAAACCATAGAGAGAGTTGTGCAATCTAAGGCGTTTGCACGGTACA
AGTATGCGGATATGTCTTTTGAATATCTGCTTAACCTTACGGCAAGTACTCCAGTCAATC
TAAGGCCGCCTCGCAGCGGTCCTGGAGCCTCGCTGCCTCCATCAGCTGAGGAATTTTGCC
AACATACGGTTACAACAATTTGGCATTACCATGGAGGATGTGTTGTGGGCGGAGTCGTCG
ATGGGGATTATAAGGTTATCGGTATTGACCGGCTTAGGGTCATTGATATGTCGACCGTTG
GTTATTGTCCTGGTACAAACCCTCAAGCCACGGTTATGATGCTTGGCAGGTATATGGGTG
TGAAGATCATGAGAGAGAGACTCGCCAATAAGTAGGATAGGATCAGGTTTTTGTGAAAAC
GTTACTACCTACAAATGAAATAAATCAAGATCTTATTAGTCAATGTATCTAGTAGCTGCG
TACATGTTTTGGTGGTACTTTTATATAATACACGATCTTATTTTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ93TF U 1
AF RR2FQ93JQ C 264
BS 1 664 RR2FQ93TF
BS 665 1009 RR2FQ93JQ

RD RR2FQ93TF 664 0 0
GAACCCTTGGCAGCCCACAACTCCTTATGCTAAGCGGCGTCGGTCCATCAGCTCAATTAC
AAGCCCAAAACATTACTGTGATGATGGACCAGCCCCATGTGGGTCAAGGGATGCACGACA
ACCCTATGAACGCCGTGTTTATCCCTTCTCCGGTCCCTGTCGAAGTCTCACTCATTGAGG
TAGTTGGAATTACCGGCGAAGGAACATACGTTGAGGCTGCCGGTGGTGAGAATTTTGGTG
GTGGAGGTGGTAGTGGTTCCTCCGCTAGAGACTACTATGCGATGTTTTCTCCAAAGGCAA
CGTTATTAGAGTCAAATTCAATGAGGTTATCATCAGCCCAACCTTTTCAAGGAGGCTTCA
TTTTGGAGAAAGTAATGGGCCCACTATCCACGGGTCATTTGGAGATCCGGACCCGAAATC
CGAATGATAACCCGGTTGTCACGTTCAACTATTTCCAACACCCAGACGACCTAAAACGAT
GCGTTCGAGGGATCCAAACCATAGAGAGAGTTGTGCAATCTAAGGCGTTTGCACGGTACA
AGTATGCGGATATGTCTTTTGAATATCTGCTTAACCTTACGGCAAGTACTCCAGTCAATC
TAAGGCCGCCTCGCAGCGGTCCTGGAGCCTCGCTGCCTCCATCAGCTGAGGAATTTTGCC
AACA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2FQ93JQ 746 0 0
GCTAGAGACTACTATGCGATGTTTTCTCCAAAGGCAACGTTATTAGAGTCAAATTCAATG
AGGTTATCATCAGCCCAACCTTTTCAAGGAGGCTTCATTTTGGAGAAAGTAATGGGCCCA
CTATCCACGGGTCATTTGGAGATCCGGACCCGAAATCCGAATGATAACCCGGTTGTCACG
TTCAACTATTTCCAACACCCAGACGACCTAAAACGATGCGTTCGAGGGATCCAAACCATA
GAGAGAGTTGTGCAATCTAAGGCGTTTGCACGGTACAAGTATGCGGATATGTCTTTTGAA
TATCTGCTTAACCTTACGGCAAGTACTCCAGTCAATCTAAGGCCGCCTCGCAGCGGTCCT
GGAGCCTCGCTGCCTCCATCAGCTGAGGAATTTTGCCAACATACGGTTACAACAATTTGG
CATTACCATGGAGGATGTGTTGTGGGCGGAGTCGTCGATGGGGATTATAAGGTTATCGGT
ATTGACCGGCTTAGGGTCATTGATATGTCGACCGTTGGTTATTGTCCTGGTACAAACCCT
CAAGCCACGGTTATGATGCTTGGCAGGTATATGGGTGTGAAGATCATGAGAGAGAGACTC
GCCAATAAGTAGGATAGGATCAGGTTTTTGTGAAAACGTTACTACCTACAAATGAAATAA
ATCAAGATCTTATTAGTCAATGTATCTAGTAGCTGCGTACATGTTTTGGTGGTACTTTTA
TATAATACACGATCTTATTTTCCTCC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL4077Contig1 731 2 3 U
GGGAGTGACGACGGTCAAACCCGTCTGAACCGGAAACTTTCGCAGTCAAACATCACCGGA
GAGACTCACGACAAATCGCTACGGGTCTATAACAAAAAGCACGAATCAAACACCATGAAC
CCTGAGATTCATCACTCCAAAGTGATCTCACATGTCTTTTTCACCGGCTCTGCCAAGCAA
GGCACTCCTGGGCCACCCATTGGTCTTATCGACATTGGTGAGAGCGAAATTGCCTACCTC
TTCAGAGTCTCTCTCCCTGGCATTCATAAAAACCCAAATAAGATCAGATGTGAGATTCAG
AGGGAGGGAAGAGTATGCATTCAAGGAGTAGTACCTGAGATTGCGATCCCAAGTGACTCC
GCCGGATGCTTGTACAGAATGCAAGTGCAGCAGCTCTGCCCGCCAGGTCCATTCTCGATC
ACGTTTAACCTTCCGGGGCAAGTGGATCCTCGCTTGTTTTCTCCAAAGTTCAGACCTGAT
GGGATCTTTGAAGTTGTTGTCGTCAAGCTCGGTGTACGCGTCCCTGCATCGTAGTTCGAT
TTGGGTGTACTTCATTAACTAGGATATGTTCGAAAGTGCTTTTTTCAAAACATGACTGTT
CACATTGATCCCAATTTCTTAGGATGTTCTTAGACTGAACAAAAGTGGTTAGATGTGAAT
ATGGTACTAGTTTTGAGCAAATTGAATGTTAACATTTCTACAAAAAGTTGGTTTCTGTTT
CAGTTCAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CD10TF U 1
AF RR2CD10JQ C 30
BS 1 705 RR2CD10TF
BS 706 706 RR2CD10JQ
BS 707 731 RR2CD10TF

RD RR2CD10TF 731 0 0
GGGAGTGACGACGGTCAAACCCGTCTGAACCGGAAACTTTCGCAGTCAAACATCACCGGA
GAGACTCACGACAAATCGCTACGGGTCTATAACAAAAAGCACGAATCAAACACCATGAAC
CCTGAGATTCATCACTCCAAAGTGATCTCACATGTCTTTTTCACCGGCTCTGCCAAGCAA
GGCACTCCTGGGCCACCCATTGGTCTTATCGACATTGGTGAGAGCGAAATTGCCTACCTC
TTCAGAGTCTCTCTCCCTGGCATTCATAAAAACCCAAATAAGATCAGATGTGAGATTCAG
AGGGAGGGAAGAGTATGCATTCAAGGAGTAGTACCTGAGATTGCGATCCCAAGTGACTCC
GCCGGATGCTTGTACAGAATGCAAGTGCAGCAGCTCTGCCCGCCAGGTCCATTCTCGATC
ACGTTTAACCTTCCGGGGCAAGTGGATCCTCGCTTGTTTTCTCCAAAGTTCAGACCTGAT
GGGATCTTTGAAGTTGTTGTCGTCAAGCTCGGTGTACGCGTCCCTGCATCGTAGTTCGAT
TTGGGTGTACTTCATTAACTAGGATATGTTCGAAAGTGCTTTTTTCAAAACATGACTGTT
CACATTGATCCCAATTTCTTAGGATGTTCTTAGACTGAACAAAAGTGGTTAGATGTGAAT
ATGGTACTAGTTTTGAGCAAATTGAATGTTAACATTTCTACAAAA*GTTGGTTTCTGTTT
CAGTTCAGACC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2CD10JQ 702 0 0
CCGGAAACTTTCGCAGTCAAACATCACCGGAGAGACTCACGACAAATCGCTACGGGTCTA
TAACAAAAAGCACGAATCAAACACCATGAACCCTGAGATTCATCACTCCAAAGTGATCTC
ACATGTCTTTTTCACCGGCTCTGCCAAGCAAGGCACTCCTGGGCCACCCATTGGTCTTAT
CGACATTGGTGAGAGCGAAATTGCCTACCTCTTCAGAGTCTCTCTCCCTGGCATTCATAA
AAACCCAAATAAGATCAGATGTGAGATTCAGAGGGAGGGAAGAGTATGCATTCAAGGAGT
AGTACCTGAGATTGCGATCCCAAGTGACTCCGCCGGATGCTTGTACAGAATGCAAGTGCA
GCAGCTCTGCCCGCCAGGTCCATTCTCGATCACGTTTAACCTTCCGGGGCAAGTGGATCC
TCGCTTGTTTTCTCCAAAGTTCAGACCTGATGGGATCTTTGAAGTTGTTGTCGTCAAGCT
CGGTGTACGCGTCCCTGCATCGTAGTTCGATTTGGGTGTACTTCATTAACTAGGATATGT
TCGAAAGTGCTTTTTTCAAAACATGACTGTTCACATTGATCCCAATTTCTTAGGATGTTC
TTAGACTGAACAAAAGTGGTTAGATGTGAATATGGTACTAGTTTTGAGCAAATTGAATGT
TAACATTTCTACAAAAAGTTGGTTTCTGTTTCAGTTCAGACC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL4078Contig1 620 2 3 U
TGTCGGGCACAAGGGAAAATTTGGACACGAGTTCCTGGAGTTCGAGTTTAGACCGGACGG
TAAGCTCCGTTACGCCAATAACTCAAACTACAAAAACGATACGATGATCCGGAAGGAGGT
GTTTCTCACCCCCGCCCTTCTCTCCGAATGCAAGCGTATCGTTTCCGACAGCGAGATAAT
GAAAGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCGTGTTGGAAGACAAGAGCTTGAGAT
CGTTATGGGAAATGAGCATATTTCCTTCGCTACCTCTAAGATTGGTTCTCTTGTTGATGT
CCAAAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTTCTACTATCTTGTTCAGGACTTGAA
ATGTCTTGTTTTTTCGCTCATCTCGCTTCACTTCAAGATCAAGCCTATTTAGAGAATGAA
GAAATCACTCTACTTGCTGCTGATGGGAGTATATGGCTGAAGTTTTTTTTTTTTGTATGT
TTCTGGCTCATTACTATTACTGAGAGTAATGCTAGTTTCTTGTTCTGTTAACTTGAAAAC
CTTGAGTTCCACTCATATCCTGTTTTTGCAATGAATCTTAAATGAGCGTTGGTATCGTAA
TGGACAATGGATTGGCACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM03TF U 230
AF RR2CM03JQ C 1
BS 1 229 RR2CM03JQ
BS 230 582 RR2CM03TF
BS 583 620 RR2CM03JQ

RD RR2CM03TF 353 0 0
GAGCTTGAGATCGTTATGGGAAATGAGCATATTTCCTTCGCTACCTCTAAGATTGGTTCT
CTTGTTGATGTCCAAAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTTCTACTATCTTGTT
CAGGACTTGAAATGTCTTGTTTTTTCGCTCATCTCGCTTCACTTCAAGATCAAGCCTATT
TAGAGAATGAAGAAATCACTCTACTTGCTGCTGATGGGAGTATATGGCTGAAGTTTTTTT
TTTTTGTATGTTTCTGGCTCATTACTATTACTGAGAGTAATGCTAGTTTCTTGTTCTGTT
AACTTGAAAACCTTGAGTTCCACTCATATCCTGTTTTTGCAATGAATCTTAAA

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR2CM03JQ 620 0 0
TGTCGGGCACAAGGGAAAATTTGGACACGAGTTCCTGGAGTTCGAGTTTAGACCGGACGG
TAAGCTCCGTTACGCCAATAACTCAAACTACAAAAACGATACGATGATCCGGAAGGAGGT
GTTTCTCACCCCCGCCCTTCTCTCCGAATGCAAGCGTATCGTTTCCGACAGCGAGATAAT
GAAAGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCGTGTTGGAAGACAAGAGCTTGAGAT
CGTTATGGGAAATGAGCATATTTCCTTCGCTACCTTTAAGATTGGTTCTCTTGTTGATGT
CCAGAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTTCTACTATCTTGTTCAGGACTTGAA
ATGTCTTGTTTTTTCGCTCATCTCGCTTCACTTCAAGATCAAGCCTATTTAGAGAATGAA
GAAATCAGTCTACTTGCTGCTGATGGGAGTATATGGCTGAAGTTTTTTTTTTTTGTATGT
TTCTGGCTCATTACTATTACTGAGAGTAATGCTAGTTTCTTGTTCTGTTAACTTGAAAAC
CTTGAGTTCCACTCATATCCTGTTTTTGCAATGAATCTTAAATGAGCGTTGGTATCGTAA
TGGACAATGGATTGGCACTT

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL4079Contig1 1239 2 2 U
GCAAAAGACGTGTTTCTGGAACTTCAATATACTTTGAGTCCATGCCTTACCGACTTGATG
AATCAACAGGCATTGTGGACTATGACATGCTCGAGAAGACTGCTCTACTGTTCCGACCAA
AGCTTATAATTGCAGGAGCTAGTGCGTACAGCCGAGATTTTGACTATCCTCGCATGAGAA
AGATTGCAGACTCAGTTGGTGCTTTTCTGATGATGGATATGGCTCACATCAGTGGACTTG
TGGCTGCTTCTGTGGTAGCTGATCCTTTTGAGTATTGCGATATTGTTACAACAACCACTC
ACAAGTCTTTGAGGGGTCCGAGAGGTGGCATGATCTTCTTTAAGAAGGATCCAGTTAATG
GGGTTGAACTTGAATCTGCCATTAACAATGCTGTCTTCCCTGGTTTGCAGGGCGGCCCTC
ATAACCACACAATAGGAGGATTAGCAGTCTGCTTGAAACATGCACAGTCGCCAGAGTTCA
AGGCTTACCAGAAAAGAGTTGTGGCTAATTGTAGGTCTCTTGCTAACCGATTGGTTGAAC
TCGGGTTTAAGCTGGTTTCTGGTGGCAGCGATAACCACTTGGTTCTCGTTGATCTTAGAC
CATTGGGCATGGATGGTGCTAGGGTTGAGAAAATCTTAGACATGGCATCTATTACACTCA
ACAAGAACTCTGTCCCTGGGGACAAAAGTGCATTGGTTCCAGGGGGATAAAGATAGGAAC
ACCTGCAATGACGACAAGAGGATTGTCAGAGAAGGACTTTGTGGTGGTTGCTGACTTGAT
CAAGGAAGGAGTGGAGATAACGATGGAAGCAAAGAAGCTAGTTTTGGGAACAAAGCTTGG
AGAGTTCACCAAGTTGGTAACATCTCCTGAGTTCCCACTGAGAGAGAGAGTGGAGAGCCT
CAAGGAGAGAGTCGAATCCTTCACCTCTCGTTTCCCCATTCCTGGAGTTTGAAATCATTG
GAAACAAAAAACAGATGGCGTCTTGTTGTACCTTTTATTATCTATCATTGACCTTTATCT
TCTAGGGTTTAATTAGCTCCTTTAGCTTGCCTCTGTCCCAAGTTTTTTTTTTCTTCAAAA
ATTTAAACTTATCAGAGTAAATTTTGTGTTTGAATCTTGTGGATATTCTCCTTTGGTTAC
ACTATGCGAGGTCTGTACTCTCTCTCTCACTAAATGAGATTTCATTTGTCAAGCAGATTT
GATATCTTTCTATCAAAGGTCTCAAGGATTTTAATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI02TF U 1
AF RR2BI02JQ C 451
BS 1 733 RR2BI02TF
BS 734 1239 RR2BI02JQ

RD RR2BI02TF 733 0 0
GCAAAAGACGTGTTTCTGGAACTTCAATATACTTTGAGTCCATGCCTTACCGACTTGATG
AATCAACAGGCATTGTGGACTATGACATGCTCGAGAAGACTGCTCTACTGTTCCGACCAA
AGCTTATAATTGCAGGAGCTAGTGCGTACAGCCGAGATTTTGACTATCCTCGCATGAGAA
AGATTGCAGACTCAGTTGGTGCTTTTCTGATGATGGATATGGCTCACATCAGTGGACTTG
TGGCTGCTTCTGTGGTAGCTGATCCTTTTGAGTATTGCGATATTGTTACAACAACCACTC
ACAAGTCTTTGAGGGGTCCGAGAGGTGGCATGATCTTCTTTAAGAAGGATCCAGTTAATG
GGGTTGAACTTGAATCTGCCATTAACAATGCTGTCTTCCCTGGTTTGCAGGGCGGCCCTC
ATAACCACACAATAGGAGGATTAGCAGTCTGCTTGAAACATGCACAGTCGCCAGAGTTCA
AGGCTTACCAGAAAAGAGTTGTGGCTAATTGTAGGTCTCTTGCTAACCGATTGGTTGAAC
TCGGGTTTAAGCTGGTTTCTGGTGGCAGCGATAACCACTTGGTTCTCGTTGATCTTAGAC
CATTGGGCATGGATGGTGCTAGGGTTGAGAAAATCTTAGACATGGCATCTATTACACTCA
ACAAGAACTCTGTCCCTGGGGACAAAAGTGCATTGGTTCCAGGGGGATAAAGATAGGAAC
ACCTGCAATGACG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2BI02JQ 789 0 0
GCTTGAAACATGCACAGTCGCCAGAGTTCAAGGCTTACCAGAAAAGAGTTGTGGCTAATT
GTAGGTCTCTTGCTAACCGATTGGTTGAACTCGGGTTTAAGCTGGTTTCTGGTGGCAGCG
ATAACCACTTGGTTCTCGTTGATCTTAGACCATTGGGCATGGATGGTGCTAGGGTTGAGA
AAATCTTAGACATGGCATCTATTACACTCAACAAGAACTCTGTCCCTGGGGACAAAAGTG
CATTGGTTCCAGGGGGATAAGGATAGGAACACCTGCAATGACGACAAGAGGATTGTCAGA
GAAGGACTTTGTGGTGGTTGCTGACTTGATCAAGGAAGGAGTGGAGATAACGATGGAAGC
AAAGAAGCTAGTTTTGGGAACAAAGCTTGGAGAGTTCACCAAGTTGGTAACATCTCCTGA
GTTCCCACTGAGAGAGAGAGTGGAGAGCCTCAAGGAGAGAGTCGAATCCTTCACCTCTCG
TTTCCCCATTCCTGGAGTTTGAAATCATTGGAAACAAAAAACAGATGGCGTCTTGTTGTA
CCTTTTATTATCTATCATTGACCTTTATCTTCTAGGGTTTAATTAGCTCCTTTAGCTTGC
CTCTGTCCCAAGTTTTTTTTTTCTTCAAAAATTTAAACTTATCAGAGTAAATTTTGTGTT
TGAATCTTGTGGATATTCTCCTTTGGTTACACTATGCGAGGTCTGTACTCTCTCTCTCAC
TAAATGAGATTTCATTTGTCAAGCAGATTTGATATCTTTCTATCAAAGGTCTCAAGGATT
TTAATTTGC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL4080Contig1 716 2 6 U
GGGCCTCACTCATTAGCATTTCCTCTCCCATTAGCTCCCTACCACGGTATCACGCCCACC
TGATCCGATTATCAGAAGCACCAAAGCTTGGTATATATATTTCTCCGATCTGAGCAATGG
CTTTGGTGATGCACTCGTACAAGGGAAACAAAAACTCTGACAAGGCATTCATTGCCGCAG
AGTTCACTGGTGTCAAGATCGATATGCCTTCTGACTTTGAGATGGGTGTCACCAACAAAA
CCCCCGAGTTCCTCAAGATGAACCCTTTGGGAAAGATTCCTGTACTAGAGACTCCTGAGG
GTCCTATCTTTGAGAGCAATGCCATTGCCCGTTACGTAAGCAGATTGAACGGTGACAACT
CCTTGAACGGCTCCTCCCTCATCGAATCTGCACATGTTGATCAATGGATCGATTTCTCCA
CAAATGAAATTTATGGAAACATCTTCAACTGGTTCGTCCCTAGAATGGGCTTTATGCCAT
ACAGTGTTCCTAGTGAGGAAGCTGCTATCTCTGCGTTGAAAAGAGGACTTGAGGCTTTGA
ACACCCATCTCACTTCCAACACTTACCTTGTTGGACACTCTGTTACCCTCGCTGATATCA
TCACCGTCTGCAACTTGAACCTCGGGTTTTCAACTGTCATGACCAAGAGCTTCACTTCTG
CATACCCTCACGTTGAGAGATACTTCTGGACCTTGATCAACCAACCAAACTTCAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2C785TF U 1
AF RR2F468TF U 60
BS 1 293 RR2C785TF
BS 294 294 RR2F468TF
BS 295 501 RR2C785TF
BS 502 502 RR2F468TF
BS 503 715 RR2C785TF
BS 716 716 RR2F468TF

RD RR2C785TF 715 0 0
GGGCCTCACTCATTAGCATTTCCTCTCCCATTAGCTCCCTACCACGGTATCACGCCCACC
TGATCCGATTATCAGAAGCACCAAAGCTTGGTATATATATTTCTCCGATCTGAGCAATGG
CTTTGGTGATGCACTCGTACAAGGGAAACAAAAACTCTGACAAGGCATTCATTGCCGCAG
AGTTCACTGGTGTCAAGATCGATATGCCTTCTGACTTTGAGATGGGTGTCACCAACAAAA
CCCCCGAGTTCCTCAAGATGAACCCTTTGGGAAAGATTCCTGTACTAGAGACTGCTGAGG
GTCCTATCTTTGAGAGCAATGCCATTGCCCGTTACGTAAGCAGATTGAACGGTGACAACT
CCTTGAACGGCTCCTCCCTCATCGAATCTGCACATGTTGATCAATGGATCGATTTCTCCA
CAAATGAAATTTATGGAAACATCTTCAACTGGTTCGTCCCTAGAATGGGCTTTATGCCAT
ACAGTGTTCCTAGTGAGGAAGTTGCTATCTCTGCGTTGAAAAGAGGACTTGAGGCTTTGA
ACACCCATCTCACTTCCAACACTTACCTTGTTGGACACTCTGTTACCCTCGCTGATATCA
TCACCGTCTGCAACTTGAACCTCGGGTTTTCAACTGTCATGACCAAGAGCTTCACTTCTG
CATACCCTCACGTTGAGAGATACTTCTGGACCTTGATCAACCAACCAAACTTCAA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2F468TF 657 0 0
CTGATCCGATTATCAGAAGCACCAAAGCTTGGTATATATATTTCTCCGATCTGAGCAATG
GCTTTGGTGATGCACTCGTACAAGGGAAACAAAAACTCTGACAAGGCATTCATTGCCGCA
GAGTTCACTGGTGTCAAGATCGATATGCCTTCTGACTTTGAGATGGGTGTCACCAACAAA
ACCCCCGAGTTCCTCAAGATGAACCCTTTGGGAAAGATTCCTGTACTAGAGACTCCTGAG
GGTCCTATCTTTGAGAGCAATGCCATTGCCCGTTACGTAAGCAGATTGAACGGTGACAAC
TCCTTGAACGGCTCCTCCCTCATCGAATCTGCACATGTTGATCAATGGATCGATTTCTCC
ACAAATGAAATTTATGGAAACATCTTCAACTGGTTCGTCCCTAGAATGGGCTTTATGCCA
TACAGTGTTCCTAGTGAGGAAGCTGCTATCTCTGCGTTGAAAAGAGGACTTGAGGCTTTG
AACACCCATCTCACTTCCAACACTTACCTTGTTGGACACTCTGTTACCCTCGCTGATATC
ATCACCGTCTGCAACTTGAACCTCGGGTTTTCAACTGTCATGACCAAGAGCTTCACTTCT
GCATACCCTCACGTTGAGAGATACTTCTGGAC*TTGATCACCCA*CCAAACTTCAAG

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL4081Contig1 911 2 2 U
GGGAGTTACGGATGATGCAAAGGACCCTAGCGTTGACACATTCCGTAACGCTTCGTTACA
CATCTTAAAGCGTTTTGGAGTCCCTTCGGAAGGTTTAGATCTTAAAATCGAAGCCCGTGG
AGTAGCTCCAGAGGGAGGTGGAGAAGTTCTTTTAACTGTTCCGAATGTTCGGACTCTAAC
CGCGGTCCAGTGGGTAGAGTAAGGAATGGTGAAGAGGATACGTGGTTGGACTTTCTCTGC
AAGAGTTTCTAGTGACTTTGAACATTCCATGAGATTCGCAGCTCGTGGAATCTTTAACAA
CCTCTTGCCTGATGTTCACATCTTCAACGATCACAAATCTGGCCCTCACGCTTGAAAATC
ACCTGGATACGGAATAACACTGGTAGCAGAAACAACTGCAGGGCGTCACATCTCCGCAGA
TACAACAGTGTCTTGTGGAAGGACAGATGAGACGGGAGAGGTCGATGAAGAGAAGCAAGA
GAGGAAACCAGCAGAAGACACTGGAGTTGAAATAGCTTCATGGCTTCTCCAGGAGATTGA
GAAAGGCGGAGTTGTTGATTCAACACACCAGGGATTGTTGTTTATACTATGTGCGTTATG
CCAACAAGACGTGTCAAAGGTTCGAGTGGGAACGTTATCTCCTTATGGAGTTGAGACGTT
GTGGAGCTTGAAGGAGTTTTTGGGAGTTACTTTTAGCCTCAGACCTGATCCTGATACAGC
AACTGTCATACTCACTTGCGTTGGAAGTGGTTTGGTTAACCTCTCCAGAAAGCTGTCTTG
ATTTTTCATTTTTTCCGTGTTTGTTTACTCGATCAATCAGCTTTATACAGTTTTGTCTGA
AGGAAAACGCTTTTCTATTTGTTTAAATGGATGTGTGTTATAATTTATGACATACTTTTG
GTTCACTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR48TF U 1
AF RR2BR48JQ C 163
BS 1 416 RR2BR48TF
BS 417 911 RR2BR48JQ

RD RR2BR48TF 416 0 0
GGGAGTTACGGATGATGCAAAGGACCCTAGCGTTGACACATTCCGTAACGCTTCGTTACA
CATCTTAAAGCGTTTTGGAGTCCCTTCGGAAGGTTTAGATCTTAAAATCGAAGCCCGTGG
AGTAGCTCCAGAGGGAGGTGGAGAAGTTCTTTTAACTGTTCCGAATGTTCGGACTCTAAC
CGCGGTCCAGTGGGTAGAGTAAGGAATGGTGAAGAGGATACGTGGTTGGACTTTCTCTGC
AAGAGTTTCTAGTGACTTTGAACATTCCATGAGATTCGCAGCTCGTGGAATCTTTAACAA
CCTCTTGCCTGATGTTCACATCTTCAACGATCACAAATCTGGCCCTCACGCTTGAAAATC
ACCTGGATACGGAATAACACTGGTAGCAGAAACAACTGCAGGGCGTCACATCTCCG

QA 1 416 1 416
DS 

RD RR2BR48JQ 749 0 0
GAATGTTCGGACTCTAACCGCGGTCCAGTGGGTAGAGTAAGGAATGGTGAAGAGGATACG
TGGTTGGACTTTCTCTGCAAGAGTTTCTAGTGACTTTGAACATTCCATGAGATTCGCAGC
TCGTGGAATCTTTAACAACCTCTTGCCTGATGTTCACATCTTCAACGATCACAAATCTGG
CCCTCACGCTTGAAAATCACCTGGATACGGAATAACACTGGTAGCAGAAACAACTGCAGG
GCGTCACATCTCCGCAGATACAACAGTGTCTTGTGGAAGGACAGATGAGACGGGAGAGGT
CGATGAAGAGAAGCAAGAGAGGAAACCAGCAGAAGACACTGGAGTTGAAATAGCTTCATG
GCTTCTCCAGGAGATTGAGAAAGGCGGAGTTGTTGATTCAACACACCAGGGATTGTTGTT
TATACTATGTGCGTTATGCCAACAAGACGTGTCAAAGGTTCGAGTGGGAACGTTATCTCC
TTATGGAGTTGAGACGTTGTGGAGCTTGAAGGAGTTTTTGGGAGTTACTTTTAGCCTCAG
ACCTGATCCTGATACAGCAACTGTCATACTCACTTGCGTTGGAAGTGGTTTGGTTAACCT
CTCCAGAAAGCTGTCTTGATTTTTCATTTTTTCCGTGTTTGTTTACTCGATCAATCAGCT
TTATACAGTTTTGTCTGAAGGAAAACGCTTTTCTATTTGTTTAAATGGATGTGTGTTATA
ATTTATGACATACTTTTGGTTCACTCATT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL4082Contig1 1009 2 2 U
ACGGGTAATGAATCAGCTGAAATACTCCAGTTCTGTTGCAGAATCAACACTCTGCATTAC
ATCAGGACGGAGATGGAATCCTCCGGGAGAAAAACATTAAACCGTCTCCCGGAATCCGAC
GTAGCTGCCTTTGATGGTAAACCTAAAATCTTTGAACAGTCGATCGGTTACTGCTCGAAA
GGAATACAGCAACTCTCTGAAGCAACTGCTTACAAGATCGTCTTCCACGATCTAAGCAAC
GTTCTCTGGGACGGTCTTTACGTGGGAGAAGTATCTTCCTCGAGGGTCGAGTCCTTTCTT
CAAGAGCTTGAACGTTGCCTCGAGATTATATCATCATCCGTTCACGATAGAGTCAGAACC
AGAGTCATTTCAGACATCATGAGAGCTTCTTTCGACGGGTTCTTACTAGTCCTCCTCGCA
GGTGGACCATCGCGTAGCTTCACGGTTCAAGATTCCGATGCGGTAGACGAGGACTTCAAG
TTTCTATGCGATCTCTTCTGGTCGAACGGAGACGGGTTGCCTTTGGATTTGATCGAGAAG
GTTTCGACGACGGTCAAGAGTATACTTCCGCTGCTGCGTACGGATACGGACTCTCTTATA
CAACGGTTTAAAGCTGTGTGTCTTGAAAATCACGGTTCGGACAGAGGGAAGCTTCCGTTG
CCGCCGACTTCTGGTCCGTGGAGTCCGACAGAAGCGAACACGCTGTTGAGGGTTTTGTGT
TACCGTTATGATGAGTCTGCGACGAAGTTTCTGAAGAGAACGTATAACATGCCGAGGAAG
CTAACTTGAGAATATGATGTGGAAATGGGAGGTGCACCGGTCTAGTGTGAGATGTGGTAT
ATTTCTTTGGCGTGATGAAAACCAATTTGGTATTGATAACTGATAAGTTACCTGTACAAG
AAAGTAGAAAGAGATTTTGTGAAACGTTCTTCAGTTGTACTTGTACTATTCTTTTTTTTT
TCTTTGTAACACATTGTACTTGTACTATTCAAAAGCGTGTAGTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI90TF U 1
AF RR2EI90JQ C 229
BS 1 630 RR2EI90TF
BS 631 1009 RR2EI90JQ

RD RR2EI90TF 630 0 0
ACGGGTAATGAATCAGCTGAAATACTCCAGTTCTGTTGCAGAATCAACACTCTGCATTAC
ATCAGGACGGAGATGGAATCCTCCGGGAGAAAAACATTAAACCGTCTCCCGGAATCCGAC
GTAGCTGCCTTTGATGGTAAACCTAAAATCTTTGAACAGTCGATCGGTTACTGCTCGAAA
GGAATACAGCAACTCTCTGAAGCAACTGCTTACAAGATCGTCTTCCACGATCTAAGCAAC
GTTCTCTGGGACGGTCTTTACGTGGGAGAAGTATCTTCCTCGAGGGTCGAGTCCTTTCTT
CAAGAGCTTGAACGTTGCCTCGAGATTATATCATCATCCGTTCACGATAGAGTCAGAACC
AGAGTCATTTCAGACATCATGAGAGCTTCTTTCGACGGGTTCTTACTAGTCCTCCTCGCA
GGTGGACCATCGCGTAGCTTCACGGTTCAAGATTCCGATGCGGTAGACGAGGACTTCAAG
TTTCTATGCGATCTCTTCTGGTCGAACGGAGACGGGTTGCCTTTGGATTTGATCGAGAAG
GTTTCGACGACGGTCAAGAGTATACTTCCGCTGCTGCGTACGGATACGGACTCTCTTATA
CAACGGTTTAAAGCTGTGTGTCTTGAAAAT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2EI90JQ 781 0 0
GATCTAAGCAACGTTCTCTGGGACGGTCTTTACGTGGGAGAAGTATCTTCCTCGAGGGTC
GAGTCCTTTCTTCAAGAGCTTGAACGTTGCCTCGAGATTATATCATCATCCGTTCACGAT
AGAGTCAGAACCAGAGTCATTTCAGACATCATGAGAGCTTCTTTCGACGGGTTCTTACTA
GTCCTCCTCGCAGGTGGACCATCGCGTAGCTTCACGGTTCAAGATTCCGATGCGGTAGAC
GAGGACTTCAAGTTTCTATGCGATCTCTTCTGGTCGAACGGAGACGGGTTGCCTTTGGAT
TTGATCGAGAAGGTTTCGACGACGGTCAAGAGTATACTTCCGCTGCTGCGTACGGATACG
GACTCTCTTATACAACGGTTTAAAGCTGTGTGTCTTGAAAATCACGGTTCGGACAGAGGG
AAGCTTCCGTTGCCGCCGACTTCTGGTCCGTGGAGTCCGACAGAAGCGAACACGCTGTTG
AGGGTTTTGTGTTACCGTTATGATGAGTCTGCGACGAAGTTTCTGAAGAGAACGTATAAC
ATGCCGAGGAAGCTAACTTGAGAATATGATGTGGAAATGGGAGGTGCACCGGTCTAGTGT
GAGATGTGGTATATTTCTTTGGCGTGATGAAAACCAATTTGGTATTGATAACTGATAAGT
TACCTGTACAAGAAAGTAGAAAGAGATTTTGTGAAACGTTCTTCAGTTGTACTTGTACTA
TTCTTTTTTTTTTCTTTGTAACACATTGTACTTGTACTATTCAAAAGCGTGTAGTTTTTT
T

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL4083Contig1 820 2 2 U
GGGAAAGAAAGATGAGATTACTGGACTTCAAGAAAAGGATTTTGACTCTTTCAGCTCTGA
TGATGAAGAAGAAGAATCTGGTGAACAGCTTTTGCGTATACGCGATGCTCTCGAATCTCT
TGAGTCTCAGCTTGCTGCTTTACAGAATCTACGGCATAGACAACAGTATGAGAAGCAAGT
AGCTCTCTCTGAGATTGATTACAGCAGGAAGATGTTGCTTGAGAAGCTCAAGGAGTACAA
AGGGAAAGAACTTGAAGTGCTAAGCGAGGCTTCAACTTTTGCTGGCGAAAGAGTTGACTA
TGAGAACGATCTTCTCCTTCCTCCTTACCCCCCACCCTCCTCTTCCTCTCTCCCTCGGTT
TGGATAGTAACAATGCCTACTTACCTCATTTACCGTCAAAGCAGAAGAAATCTGCAGATG
CAAATGGGTTTGGCTCAGCAGAGGTCAAGGGTCCTAATGGAGTTGTTCGCTTCTTAGGCT
CTGTTGCAAAGATCATGCTACCAATCATCGGCGTCATTTCAGTCTTGTCTGCTTCCGGTT
ATGGTCCAGAGATCAAGAAAAGAGGTGTGTCATTCAAACTTCTGGGGCTTCTCCCTCAAC
GAGTAGTCAGAGCACCTAATCAGTGCCCGCCTGGGAAAGTTCTGATGATTGAAGACGGTG
AAGCAAGGTGTCTTGTGAAGGAAAGAGTCGAAATACCTTTTGACTCGGTGGTTGCAAAAC
GAGATGTAACATACGGATACGGTTGAACTAAATGAAAAAAAAACGCCTTTCTCTGTAATC
TTTACTGCCTCCACTGTGTAACGTTTCAACCTTTTATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ70TF U 1
AF RR2CJ70JQ C 343
BS 1 654 RR2CJ70TF
BS 655 820 RR2CJ70JQ

RD RR2CJ70TF 654 0 0
GGGAAAGAAAGATGAGATTACTGGACTTCAAGAAAAGGATTTTGACTCTTTCAGCTCTGA
TGATGAAGAAGAAGAATCTGGTGAACAGCTTTTGCGTATACGCGATGCTCTCGAATCTCT
TGAGTCTCAGCTTGCTGCTTTACAGAATCTACGGCATAGACAACAGTATGAGAAGCAAGT
AGCTCTCTCTGAGATTGATTACAGCAGGAAGATGTTGCTTGAGAAGCTCAAGGAGTACAA
AGGGAAAGAACTTGAAGTGCTAAGCGAGGCTTCAACTTTTGCTGGCGAAAGAGTTGACTA
TGAGAACGATCTTCTCCTTCCTCCTTACCCCCCACCCTCCTCTTCCTCTCTCCCTCGGTT
TGGATAGTAACAATGCCTACTTACCTCATTTACCGTCAAAGCAGAAGAAATCTGCAGATG
CAAATGGGTTTGGCTCAGCAGAGGTCAAGGGTCCTAATGGAGTTGTTCGCTTCTTAGGCT
CTGTTGCAAAGATCATGCTACCAATCATCGGCGTCATTTCAGTCTTGTCTGCTTCCGGTT
ATGGTCCAGAGATCAAGAAAAGAGGTGTGTCATTCAAACTTCTGGGGCTTCTCCCTCAAC
GAGTAGTCAGAGCACCTAATCAGTGCCCGCCTGGGAAAGTTCTGATGATTGAAG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2CJ70JQ 478 0 0
TTCCTTTCTCCCTCGGTTTGGATAGTAACAATGCCTACTTACCTCATTTACCGTCAAAGC
AGAAGAAATCTGCAGATGCAAATGGGTTTGGCTCAGCAGAGGTCAAGGGTCCTAATGGAG
TTGTTCGCTTCTTAGGCTCTGTTGCAAAGATCATGCTACCAATCATCGGCGTCATTTCAG
TCTTGTCTGCTTCCGGTTATGGTCCAGAGATCAAGAAAAGAGGTGTGTCATTCAAACTTC
TGGGGCTTCTCCCTCAACGAGTAGTCAGAGCACCTAATCAGTGCCCGCCTGGGAAAGTTC
TGATGATTGAAGACGGTGAAGCAAGGTGTCTTGTGAAGGAAAGAGTCGAAATACCTTTTG
ACTCGGTGGTTGCAAAACGAGATGTAACATACGGATACGGTTGAACTAAATGAAAAAAAA
ACGCCTTTCTCTGTAATCTTTACTGCCTCCACTGTGTAACGTTTCAACCTTTTATCCC

QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 2

CO CL4084Contig1 806 2 4 U
TAAAACCCAAATGGGCAAGTTTACAAGCTTAATACAACGGTCCAATCCCCATTTGTTACT
AACCCAATATTACATTAAGTTTTGGAAGCCCAAACGTAATTAAATTATTCCACCGCTTCG
TAGCCGCTTCAGCTTAACACGCGTCAGTCGATCTGAAGAAGCAAGAGACGCGTTGATCAA
CTCATCTGCATGCCTTTGACTTGGTTCACGCGCTTTGGACGCGCCGCCAAAGAGGATGAG
GAATTGTTGACGCAGCGTCGCCACCAGCAGATTCGATTAAATGTAACTACCCCACCGGAC
TCGTTGAACTTCGCTTGATGGTGCTTTCCATCTAAACCATGGCTAACTGACCAGAAATAC
CATGCTTCACCGGAATTTAATCGGAGGATTACTTGAACCAAAATGAGCAGAGACCATTTG
CCGGACCGTATAGAACGCCGACTCTCCTTGATCCACCCCATATATGGCTAAAGAAATCCA
TCAAACCTCATTAACACTCCATCCAAGATGCTTTCTTCACGCCAAACTGGCAATATATCA
GTCGCCTACGGGATTAGAATAAGACCAAGTGGAAAGCACATAACACTAATCTCCATCGAA
GAATAGCTTAATCCTTGAAGAACTACTTCGACTGAGATCAACTAGAAACACTAAAAAGAA
AAACAACAAAATCGCCAAGCGAGAAGAGATATCGCCTACGCGAAAGGGTACTCGCCAAAG
CGAAGAAACACATATTACATCAAAAAAAGAGGAACATGTCTCATCCTCCCTCTGAAGGAT
AGAAGTTTGATAAGAGGGATAGGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ96JQ U 1
AF RR2C869TF C 221
BS 1 269 RR2EZ96JQ
BS 270 270 RR2C869TF
BS 271 336 RR2EZ96JQ
BS 337 806 RR2C869TF

RD RR2EZ96JQ 336 0 0
TAAAACCCAAATGGGCAAGTTTACAAGCTTAATACAACGGTCCAATCCCCATTTGTTACT
AACCCAATATTACATTAAGTTTTGGAAGCCCAAACGTAATTAAATTATTCCACCGCTTCG
TAGCCGCTTCAGCTTAACACGCGTCAGTCGATCTGAAGAAGCAAGAGACGCGTTGATCAA
CTCATCTGCATGCCTTTGACTTGGTTCACGCGCTTTGGACGCGCCGCCAAAGAGGATGAG
GAATTGTTGACGCAGCGTCGCCACCAGCA*ATTCGATTAAATGTAACTACCCCACCGGAC
TCGTTGAACTTCGCTTGATGGTGCTTTCCATCTAAA

QA 1 336 1 336
DS 

RD RR2C869TF 586 0 0
GCGCCGCCGAAGAGGATGAGGAATTGTTGACGCAGCGTCGCCACCAGCAGATTCGATTAA
ATGTAACTACGCCACCGGACTCGTTGAACTTCGCTTGATGGTGCTTTCCATCTAAACCAT
GGCTAACTGACCAGAAATACCATGCTTCACCGGAATTTAATCGGAGGATTACTTGAACCA
AAATGAGCAGAGACCATTTGCCGGACCGTATAGAACGCCGACTCTCCTTGATCCACCCCA
TATATGGCTAAAGAAATCCATCAAACCTCATTAACACTCCATCCAAGATGCTTTCTTCAC
GCCAAACTGGCAATATATCAGTCGCCTACGGGATTAGAATAAGACCAAGTGGAAAGCACA
TAACACTAATCTCCATCGAAGAATAGCTTAATCCTTGAAGAACTACTTCGACTGAGATCA
ACTAGAAACACTAAAAAGAAAAACAACAAAATCGCCAAGCGAGAAGAGATATCGCCTACG
CGAAAGGGTACTCGCCAAAGCGAAGAAACACATATTACATCAAAAAAAGAGGAACATGTC
TCATCCTCCCTCTGAAGGATAGAAGTTTGATAAGAGGGATAGGAGA

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL4085Contig1 1179 2 2 U
GGGACGTCTCTCTCTCTCTCTCTATCGCTTGGTGAAGAAGAGGGTCTATTGATTGATTTA
TTTCTTTGTTCTCTACGGTAGCTAGTCTAATCGAATCAAAAAGTTTTTACCTTTCGCGGT
CTCTGTTTGCAACCCTAAACTCTCTCCGACACGTTTGTTTTGGATCTCTTCCCAAAACTG
TTTTTTTTTGTTTTGGTAATAATGCGACCGTTTATGTCTGGCTCGAGAGCTTTGTTCAAC
TTAATCTCATGTCGAAACGCAATCAGGAGCCCGATCAATCGCTCCGGGATCATTCAGAGG
AGTTTTATATGGAATGGAGTTCGCCGATTTGGTTCTCTTCCGGGGGTAGAGAGATGCTCT
TCATACGGGTTGATGTCAAATGATGATGATGGTAGAAGAGCCGCTTTCGGTACTGGGAGC
TTAATTCAAAGACGGCATTTTCTGGGGTGCGGAGATGGGGAAGAAGGTGGTGGTGAATTG
TCAAAGATCTACGAAGAGCGACGTGTCTTGGGGTATTCTCAGGAGCAATTGTTTAATGTA
GTTCTAGCTGTAGACTTGTACCACGGCTTTGTTCCTTGGTGTCAGCGCTCCGAGGTTCTT
AAAGAATATCCTGATGGCTCTTTCGATGCTGAGCTCGAGATTGGTTTCAAGTTCCTTGTC
GAGAGTTACATCTCCCATGTTGAGTTCGAAAGACCCAAATGGATTAAGACGACAGCGAGA
GACACAGGCCTGTTTGACCATTTGATCAACCTCTGGCAGTTCAAGCCAGGTCCCATTCCA
GGAACCTGCGAGCTTTCTACTCTTGTCGATTTCAAATTCAACTCACCTCTCTATCGCCAG
GTGGCTTCGATGTTCTTAAAGGAGGTAGCAACAAGGCTCATTGGGGCGTTTAGTGACCGA
TGCCGACTTGTGTATGGTCCTGGAGTTCCTGTCGATGCAAACTCATATGAACAAAAAGCT
TGATACATATAATCCTATAATCTATTTAATGAAACTAACAATTATCAGGTTAGTTTGCAT
GTTGTTTGCTAGAGAGAGCGATTACCCCATAGCTTTTTGTTGCATTTTTTTTCATATATG
AATTGCTTTTGCATTATCAACACATTAGATGTTTGTTTAAATGTAAAAGCTGAATTTAAT
TACATCCGTTTCTCCTATTCTTTTGGGAGTTTTATTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK41TF U 1
AF RR2FK41JQ C 589
BS 1 691 RR2FK41TF
BS 692 1179 RR2FK41JQ

RD RR2FK41TF 691 0 0
GGGACGTCTCTCTCTCTCTCTCTATCGCTTGGTGAAGAAGAGGGTCTATTGATTGATTTA
TTTCTTTGTTCTCTACGGTAGCTAGTCTAATCGAATCAAAAAGTTTTTACCTTTCGCGGT
CTCTGTTTGCAACCCTAAACTCTCTCCGACACGTTTGTTTTGGATCTCTTCCCAAAACTG
TTTTTTTTTGTTTTGGTAATAATGCGACCGTTTATGTCTGGCTCGAGAGCTTTGTTCAAC
TTAATCTCATGTCGAAACGCAATCAGGAGCCCGATCAATCGCTCCGGGATCATTCAGAGG
AGTTTTATATGGAATGGAGTTCGCCGATTTGGTTCTCTTCCGGGGGTAGAGAGATGCTCT
TCATACGGGTTGATGTCAAATGATGATGATGGTAGAAGAGCCGCTTTCGGTACTGGGAGC
TTAATTCAAAGACGGCATTTTCTGGGGTGCGGAGATGGGGAAGAAGGTGGTGGTGAATTG
TCAAAGATCTACGAAGAGCGACGTGTCTTGGGGTATTCTCAGGAGCAATTGTTTAATGTA
GTTCTAGCTGTAGACTTGTACCACGGCTTTGTTCCTTGGTGTCAGCGCTCCGAGGTTCTT
AAAGAATATCCTGATGGCTCTTTCGATGCTGAGCTCGAGATTGGTTTCAAGTTCCTTGTC
GAGAGTTACATCTCCCATGTTGAGTTCGAAA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2FK41JQ 591 0 0
TCCGAGGTTCTTAAAGAATATCCTGATGGCTCTTTCGATGCTGAGCTCGAGATTGGTTTC
AAGTTCCTTGTCGAGAGTTACATCTCCCATGTTGAGTTCGAAAGACCCAAATGGATTAAG
ACGACAGCGAGAGACACAGGCCTGTTTGACCATTTGATCAACCTCTGGCAGTTCAAGCCA
GGTCCCATTCCAGGAACCTGCGAGCTTTCTACTCTTGTCGATTTCAAATTCAACTCACCT
CTCTATCGCCAGGTGGCTTCGATGTTCTTAAAGGAGGTAGCAACAAGGCTCATTGGGGCG
TTTAGTGACCGATGCCGACTTGTGTATGGTCCTGGAGTTCCTGTCGATGCAAACTCATAT
GAACAAAAAGCTTGATACATATAATCCTATAATCTATTTAATGAAACTAACAATTATCAG
GTTAGTTTGCATGTTGTTTGCTAGAGAGAGCGATTACCCCATAGCTTTTTGTTGCATTTT
TTTTCATATATGAATTGCTTTTGCATTATCAACACATTAGATGTTTGTTTAAATGTAAAA
GCTGAATTTAATTACATCCGTTTCTCCTATTCTTTTGGGAGTTTTATTCAC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL4086Contig1 947 2 4 U
GGGTATTTACGAGAAGGGTTTTGAGAGACCTTCTCCTATTCAGGAAGAGAGTACCCCTAT
TGCCTTAACCGGCAGAGATATCCATGCCCGCGCCAAGAACGGCACTGGCAAGACTGCCGC
CTTTTGTATTCCTGTCTTGGAAAAAATTGACCAAGATAACAACGTTATTCAAGCTGTGAT
AATTGTCCCTACTAGAGAGTTAGCCCTTCAGACATCACAGGTGTGCAAGGAGCTGGGGAA
GCATTTGAAGATTCAGGTCATGGTCACCACTGGAGGCACCAGTCTCAAAGATGATATCAT
GCGTTTGTATCAGCCTGTCCATTTACTCGTTGGAACTCCTGGCAGAATTTTGGACCTCAC
CAAGAAAGGTGTTTGTGTTTTGAAGGATTGTTCTGTGCTCGCTATGGACGAGGCTGATAA
GCTTTTATCTCAAGAGTTCCAACCTTCAGTGGAACATTTGATCAGCTTTCTTCCCGAAAA
TCGCCAGATTTTGATGTTCTCAGCCACGTTTCCTGTCACTGTCAAGTATTTCAAGGATCG
ATTTTTGACAAATCCTTACATCATTAATCTCATGGATGAACTTACGCTCAAGGGTATTAC
CCAATTCTATGCTTTTGTTGAAGAACGTCAGAAAATTCATTGCTTGAATACACTCTTCTC
CAAGCTGCAAATTAACCAATCGATCATATTCTGCAATTCCGTGAACCGTGTGGAGCTCTT
AGCTAAGAAAATTACAGAACTTGGGTATTCTTGTTTTTACATTCATGCAAAGATGCTGCA
GGACCATCGTAACAGAGTGTTCCATGACTTCCGCAATGGTGCATGCCGGAATCTTGTGTG
TACTGACCTGTTCACACGTGGGATTGACATTCAAGCAGTCAATTTGGTGATAAACTTTGA
TTTCCCAAAGATGCAGAACATATCTTCACAGGTTGTCGATCAGAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF33TF U 1
AF RR2BS43TF U 210
BS 1 549 RR2DF33TF
BS 550 550 RR2BS43TF
BS 551 630 RR2DF33TF
BS 631 947 RR2BS43TF

RD RR2DF33TF 630 0 0
GGGTATTTACGAGAAGGGTTTTGAGAGACCTTCTCCTATTCAGGAAGAGAGTACCCCTAT
TGCCTTAACCGGCAGAGATATCCATGCCCGCGCCAAGAACGGCACTGGCAAGACTGCCGC
CTTTTGTATTCCTGTCTTGGAAAAAATTGACCAAGATAACAACGTTATTCAAGCTGTGAT
AATTGTCCCTACTAGAGAGTTAGCCCTTCAGACATCACAGGTGTGCAAGGAGCTGGGGAA
GCATTTGAAGATTCAGGTCATGGTCACCACTGGAGGCACCAGTCTCAAAGATGATATCAT
GCGTTTGTATCAGCCTGTCCATTTACTCGTTGGAACTCCTGGCAGAATTTTGGACCTCAC
CAAGAAAGGTGTTTGTGTTTTGAAGGATTGTTCTGTGCTCGCTATGGACGAGGCTGATAA
GCTTTTATCTCAAGAGTTCCAACCTTCAGTGGAACATTTGATCAGCTTTCTTCCCGAAAA
TCGCCAGATTTTGATGTTCTCAGCCACGTTTCCTGTCACTGTCAAGTATTTCAAGGATCG
ATTTTTGACGAATCCTTACATCATTAATCTCATGGATGAACTTACGCTCAAGGGTATTAC
CCAATTCTATGCTTTTGTTGAAGAACGTCA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2BS43TF 738 0 0
G
GACATCACAGGTGTGTAAGGAGCTGGGGAAGCATTTGAAGATTCAGGTCATGGTTACTAC
TGGAGGCACCAGTCTCAAAGATGATATCATGCGTTTGTATCAGCCTGTCCATTTACTCGT
TGGAACTCCTGGCAGAATTTTGGATCTCACCAAGAAAGGTGTTTGTGTTTTGAAGGATTG
TTCTGTGCTCGCTATGGACGAGGCTGATAAGCTTTTATCTCAAGAGTTCCAACCTTCAGT
GGAACATTTGATCAGCTTTCTTCCCGAAAATCGCCAGATTTTGATGTTCTCAGCCACGTT
TCCTGTCACTGTCAAGTATTTCAAGGATCGATTTTTGACAAATCCTTACATCATTAATCT
CATGGATGAACTTACGCTCAAGGGTATTACCCAATTCTATGCTTTTGTTGAAGAACGTCA
GAAAATTCATTGCTTGAATACACTCTTCTCCAAGCTGCAAATTAACCAATCGATCATATT
CTGCAATTCCGTGAACCGTGTGGAGCTCTTAGCTAAGAAAATTACAGAACTTGGGTATTC
TTGTTTTTACATTCATGCAAAGATGCTGCAGGACCATCGTAACAGAGTGTTCCATGACTT
CCGCAATGGTGCATGCCGGAATCTTGTGTGTACTGACCTGTTCACACGTGGGATTGACAT
TCAAGCAGTCAATTTGGTGATAAACTTTGATTTCCCAAAGATGCAGAACATATCTTCACA
GGTTGTCGATCAGAAGT

QA 2 738 2 738
DS 



AS 1 2

CO CL4087Contig1 400 2 1 U
GGGACTTTTCCAATCGTAAGGCTTAATCTTCTCCTCGGCTTTCTTTGCTGGATCCACGAC
TAAAAGAAGAAGAGCGAAGAAGAAGCAGCGATGGCGAAATCAAGCGCCGACGATGAGGAG
CTCCGGCGTGCTTGCGAGGCCGCCATCGAAGGAACCAAGCAATCGATCGTCATGTCGATC
CGCGTCGCCAAGAGCCGCGGTGTCTGGGGAAAGTCTGGAAAATTAGGTCGCCAAATGGCC
AAACCTAGGGTTCTCGCTCTTTCCGGTGACATATCCTTCTCCTTTCCCTCTCTCGATTTG
ATTTAGCATTTCTGGATCCGAGCCTTTGTTTTTGTTCACCTTCCTTAGATTAAGCATTAA
CTGCTGGTGTCTATTGCAATTAGATCCTAAATTTTCAATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FO79JQ C 1
AF RR2FO79TF U 1
BS 1 400 RR2FO79TF

RD RR2FO79JQ 400 0 0
GGGACTTTTCCAATCGTAAGGCTTAATCTTCTCCTCGGCTTTCTTTGCTGGATCCACGAC
TAAAAGAAGAAGAGCGAAGAAGAAGCAGCGATGGCGAAATCAAGCGCCGACGATGAGGAG
CTCCGGCGTGCTTGCGAGGCCGCCATCGAAGGAACCAAGCAATCGATCGTCATGTCGATC
CGCGTCGCCAAGAGCCGCGGTGTCTGGGGAAAGTCTGGAAAATTAGGTCGCCAAATGGCC
AAACCTAGGGTTCTCGCTCTTTCCGGTGACATATCCTTCTCCTTTCCCTCTCTCGATTTG
ATTTAGCATTTCTGGATCCGAGCCTTTGTTTTTGTTCACCTTCCTTAGATTAAGCATTAA
CTGCTGGTGTCTATTGCAATTAGATCCTAAATTTTCAATT

QA 1 400 1 400
DS 

RD RR2FO79TF 400 0 0
GGGACTTTTCCAATCGTAAGGCTTAATCTTCTCCTCGGCTTTCTTTGCTGGATCCACGAC
TAAAAGAAGAAGAGCGAAGAAGAAGCAGCGATGGCGAAATCAAGCGCCGACGATGAGGAG
CTCCGGCGTGCTTGCGAGGCCGCCATCGAAGGAACCAAGCAATCGATCGTCATGTCGATC
CGCGTCGCCAAGAGCCGCGGTGTCTGGGGAAAGTCTGGAAAATTAGGTCGCCAAATGGCC
AAACCTAGGGTTCTCGCTCTTTCCGGTGACATATCCTTCTCCTTTCCCTCTCTCGATTTG
ATTTAGCATTTCTGGATCCGAGCCTTTGTTTTTGTTCACCTTCCTTAGATTAAGCATTAA
CTGCTGGTGTCTATTGCAATTAGATCCTAAATTTTCAATT

QA 1 400 1 400
DS 



AS 1 2

CO CL4088Contig1 958 2 12 U
GATCACACACATACCCAAAATTTTCTTCTCCTCTTTTCTCTCTCTGTCTCAAAGTTAGTA
GTATCTTTTCGCTTTGTGTCTTCTACCTTTTCCTTTGGTTGATTCTCTGTGTGTTTCGTC
AGTGCTGAGTCTGGAACCGGAGATGGTGACGGCAGATGACTGGACCAAGTCAGCGATGAG
AGATGGAGAAGTGGTGGCTGAGCTTCTGGTCAGGCTAAAGAAAGCCAAAGTGAGACCTGT
TCTGTTCTCGTGTCCGACGTTCCAGTGGGGAAACCGGCAGCCACGGTCGAGAAAAGAAGC
TGATTCAGCTAGATGTAGCCCGAGTACACCGCTCTCTTGGAGCGCTTCTTCTTCTCCATC
TGCTCACCTCGACGGTTACGAGGCCACCAATGGCACGGGCTCATTATTTCCCGTCGGATC
TAGATCCAAGGTTCTTGTAACCGCAGACTTGGATTTTGGTGTCAAAAGATTGCAGAGCAA
AAAGGACACTGCATCGATCAGATCAGCATTCAGGGAACGAGGAGACATGAAGAACAAGAA
CTTTAAGAGAATGAAGTTGAACACACAAATTTGTACTTCTCTCTCAGGTTGTAATGTGGC
ACAAAATGAAGATGGCAGTTTCCTGCTACCTGACTTGAATTTAGTGCCATGTGAGGAAGC
AACACTACATGATATAAGGACTATAAAGTGAAGGAACTCACTTAAAGTGATCAGAGTGGA
CTGATTTGATCATCTTTGGCTCAGCTTCTGAACTTCTGAAAAGAGTCTGCACTGCAGGAA
CTCATGAAAAAAAAAAATTGCGTATAAATTCCTCAAGGAATTTTCGTCCATATATAAGAT
AAATATCATAAGCAGATGTGTAGGATAAAGAAAACAAATATTTGTTGGTTTCTTTGTAGT
GTCATTTTGTAATGTTTGTCTACATTAGCATAAGGAGTCATTTTGTAATGTTATTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR17TF U 1
AF RR2FR17JQ C 352
BS 1 678 RR2FR17TF
BS 679 679 RR2FR17JQ
BS 680 695 RR2FR17TF
BS 696 696 RR2FR17JQ
BS 697 751 RR2FR17TF
BS 752 752 RR2FR17JQ
BS 753 761 RR2FR17TF
BS 762 762 RR2FR17JQ
BS 763 779 RR2FR17TF
BS 780 780 RR2FR17JQ
BS 781 790 RR2FR17TF
BS 791 958 RR2FR17JQ

RD RR2FR17TF 790 0 0
GATCACACACATACCCAAAATTTTCTTCTCCTCTTTTCTCTCTCTGTCTCAAAGTTAGTA
GTATCTTTTCGCTTTGTGTCTTCTACCTTTTCCTTTGGTTGATTCTCTGTGTGTTTCGTC
AGTGCTGAGTCTGGAACCGGAGATGGTGACGGCAGATGACTGGACCAAGTCAGCGATGAG
AGATGGAGAAGTGGTGGCTGAGCTTCTGGTCAGGCTAAAGAAAGCCAAAGTGAGACCTGT
TCTGTTCTCGTGTCCGACGTTCCAGTGGGGAAACCGGCAGCCACGGTCGAGAAAAGAAGC
TGATTCAGCTAGATGTAGCCCGAGTACACCGCTCTCTTGGAGCGCTTCTTCTTCTCCATC
TGCTCACCTCGACGGTTACGAGGCCACCAATGGCACGGGCTCATTATTTCCCGTCGGATC
TAGATCCAAGGTTCTTGTAACCGCAGACTTGGATTTTGGTGTCAAAAGATTGCAGAGCAA
AAAGGACACTGCATCGATCAGATCAGCATTCAGGGAACGAGGAGACATGAAGAACAAGAA
CTTTAAGAGAATGAAGTTGAACACACAAATTTGTACTTCTCTCTCAGGTTGTAATGTGGC
ACAAAATGAAGATGGCAGTTTCCTGCTACCTGACTTGAATTTAGTGCCATGTGAGGAAGC
AACACTACATGATATAAG*ACTATAAAGTGAAGGA*CTCACTTAAAGTGATCAGAGTGGA
CTGATTTGATCATCTTTGGCTCAGCTTCTGA*CTTCTGAAA*GAGTCTGCACTGCAGGA*
CTCATGAAAA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2FR17JQ 607 0 0
TTCTCCATCTGCTCACCTCGACGGTTACGAGGCCACCAATGGCACGGGCTCATTATTTCC
CGTCGGATCTAGATCCAAGGTTTTTGTAACCGCAGACTTGGATTTTGGTGTCAAAAGATT
GCAGAGCAAAAAGGACACTGCATCGATCAGATCAGCATTCAGGGAACGAGGAGACATGAA
GAACAAGAACTTTAAGAGAATGAAGTTGAACACACAAATTTGTACTTCTCTCTCAGGTTG
TAATGTGGCACAAAATGAAGATGGCAGTTTCCTGCTACCTGACTTGAATTTAGTGCCATG
TGAGGAAGCAACACTACATGATATAAGGACTATAAAGTGAAGGAACTCACTTAAAGTGAT
CAGAGTGGACTGATTTGATCATCTTTGGCTCAGCTTTTGAACTTTTGAAAAGAGTTTGCA
CTGCAGGAACTCATGAAAAAAAAAAATTGCGTATAAATTCCTCAAGGAATTTTCGTCCAT
ATATAAGATAAATATCATAAGCAGATGTGTAGGATAAAGAAAACAAATATTTGTTGGTTT
CTTTGTAGTGTCATTTTGTAATGTTTGTCTACATTAGCATAAGGAGTCATTTTGTAATGT
TATTCGG

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL4089Contig1 1130 2 12 U
GGTCTCTCTCTCGCGGTTGCTCAGACCCATTCATGGCTACCATTCTCAGCTTTGCTCCTC
CCTCTGTTCCATCTACAACATACCCAAAACCCTCTCTAAGAATCCCTCTTTTTACGTCTC
TGCCACTCTCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTGGCCTTACTTCTTCATTCCTGG
TTAGAAATGAATCATTTTTGTCTCCATCATCCTCTCCAATTCAAGCTCTTGCAGAAGAAG
CCGTTGATTCTTCTACTCTAGCCTCTTCATCAAAGCTTGTCCTTGTTGTTGGCGGCACTG
GTGGTGTCGGGCAACTAGTGGTAGCTTCATTGCTTAAGAGGAACATTAAGTCAAGGCTAT
TACTGCGTGATCTTGAGAAAGCTACCAAGTTGTTCGGTAAACAAGATGAAGATTCATTAC
AGGTAATCAAAGGGGATACTAGGAATGCTAAGGATCTTGATCCAGCCTTGTTTGAGGGTG
TGACACATGTGATTTGCTGCACGGGGACTACAGCTTTCCCTTCTCAGCGGTGGAGTGGAG
AGAACACACCTGATAAAGTAGATTGGGAAGGTGTGAGGAATCTCATATCAGCACTGCCCT
CATCGGTGGAGAGAGTTGTTCTGGTTTCATCAGTAGGTGTCACCAAGCCTGATGAGCTTC
CTTGGAGCATCATGAACTTGTTTGGGGTTCTTAAGTACAAGAAGATGGGTGAAGATTTTC
TTAGGGAGTCTGGTCTTCCATACACCATTATCAGACCGGGTAGATTGACTGATGGACCGT
ACACATCCTATGACCTCAATACTCTGCTCAAAGCTACAGCTGGCGAACGGCGTGCTGTTG
TCATTGGTCAAGGTGATAAACTTGTTGGAGAGGTAAGCAGACTTGTGGTGGCTGAAGCTT
GCATGCAGGCACTTGATATTGAGTTCGCACAAGGGAAAGCTTATGAGATCAATTCAGTTA
AGGGAGATGGTCCAGGAAGTGATCCGCAGAAATGGCGAGAGTTGTTTAAAGTTGCAGAAT
CCAAATGATAGGAGATGATACTGATAAATGTGTACAGAGATATGGTCCAGTTGTGTGTAC
ACATATACTTATGTGATAACTTTCATCAATACATGAACATGATCAACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FI51TF U 1
AF RR2FI51JQ C 317
BS 1 636 RR2FI51TF
BS 637 637 RR2FI51JQ
BS 638 688 RR2FI51TF
BS 689 689 RR2FI51JQ
BS 690 699 RR2FI51TF
BS 700 702 RR2FI51JQ
BS 703 718 RR2FI51TF
BS 719 719 RR2FI51JQ
BS 720 725 RR2FI51TF
BS 726 726 RR2FI51JQ
BS 727 738 RR2FI51TF
BS 739 1130 RR2FI51JQ

RD RR2FI51TF 750 0 0
GGTCTCTCTCTCGCGGTTGCTCAGACCCATTCATGGCTACCATTCTCAGCTTTGCTCCTC
CCTCTGTTCCATCTACAACATACCCAAAACCCTCTCTAAGAATCCCTCTTTTTACGTCTC
TGCCACTCTCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTGGCCTTACTTCTTCATTCCTGG
TTAGAAATGAATCATTTTTGTCTCCATCATCCTCTCCAATTCAAGCTCTTGCAGAAGAAG
CCGTTGATTCTTCTACTCTAGCCTCTTCATCAAAGCTTGTCCTTGTTGTTGGCGGCACTG
GTGGTGTCGGGCAACTAGTGGTAGCTTCATTGCTTAAGAGGAACATTAAGTCAAGGCTAT
TACTGCGTGATCTTGAGAAAGCTACCAAGTTGTTCGGTAAACAAGATGAAGATTCATTAC
AGGTAATCAAAGGGGATACTAGGAATGCTAAGGATCTTGATCCAGCCTTGTTTGAGGGTG
TGACACATGTGATTTGCTGCACGGGGACTACAGCTTTCCCTTCTCAGCGGTGGAGTGGAG
AGAACACACCTGATAAAGTAGATTGGGAAGGTGTGAGGAATCTCATATCAGCACTGCCCT
CATCGGTGGAGAGAGTTGTTCTGGTTTCATCAGTAG*TGTCACCAAGCCTGATGAGCTTC
CTTGGAGCATCATGAACTTGTTTGGGGT*CTTAAGTACAG**AGATGGGTGAAGATTT*C
TTAGG*AGTCTGGTCTTC
ATACACATTATC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2FI51JQ 814 0 0
AGTGGTAGCTTCATTGCTTAAGAGGAACATTAAGTCAAGGCTATTACTGCGTGATCTTGA
GAAAGCTACCAAGTTGTTCGGTAAACAAGATGAAGATTCATTACAGGTAATCAAAGGGGA
TACTAGGAATGCTAAGGATCTTGATCCAGCCTTGTTTGAGGGTGTGACACATGTGATTTG
CTGCACGGGGACTACAGCTTTCCCTTCTCAGCGGTGGAGTGGAGAGAACACACCTGATAA
AGTAGATTGGGAAGGTGTGAGGAATCTCATATCAGCACTGCCCTCATCGGTGGAGAGAGT
TGTTCTGGTTTCATCAGTAGGTGTCACCAAGCCTGATGAGCTTCCTTGGAGCATCATGAA
CTTGTTTGGGGTTCTTAAGTACAAGAAGATGGGTGAAGATTTTCTTAGGGAGTCTGGTCT
TCCATACACCATTATCAGACCGGGTAGATTGACTGATGGACCGTACACATCCTATGACCT
CAATACTCTGCTCAAAGCTACAGCTGGCGAACGGCGTGCTGTTGTCATTGGTCAAGGTGA
TAAACTTGTTGGAGAGGTAAGCAGACTTGTGGTGGCTGAAGCTTGCATGCAGGCACTTGA
TATTGAGTTCGCACAAGGGAAAGCTTATGAGATCAATTCAGTTAAGGGAGATGGTCCAGG
AAGTGATCCGCAGAAATGGCGAGAGTTGTTTAAAGTTGCAGAATCCAAATGATAGGAGAT
GATACTGATAAATGTGTACAGAGATATGGTCCAGTTGTGTGTACACATATACTTATGTGA
TAACTTTCATCAATACATGAACATGATCAACTCC

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL4090Contig1 1039 2 2 U
GGAACTGGCTCGTCGTCCGTCTCTCTAGATCCACCGTTCGAAGCAGTAACAATGGCGGCT
CCGTCGCGCGAGGATCTTGTGTACATGGCTAAGCTAGCGGAGCAGGCGGAGAGGTACGAG
GAGATGGTCGAGTTCATGGAGAAAGTCTCCGCCGCAACAGATGGCACAGAGCTCACAATC
GAGGAGCGAAACCTCCTCTCAGTCGCTTACAAGAACGTGATCGGCGCTCGCCGCGCCTCG
TGGAGAATCATCTCATCGATCGAGCAGAAAGAAGAGAGCCGCGGGAACGCCGAACGCGTC
AACACGATCCGCGACTACAAGGCCAAGATCGAGACGGAGCTCTCGGGGATCTGCGGCGGA
ATCCTAAAGCTGCTCGAGTCTACGCTCATCCCTTCCGCTGCTTCCGAGGAGTCCAAGGTT
TTCTACCTCAAGATGAAAGGTGATTACTACAGGTACTTGGCCGAGTTCAAAACCGGTAAA
GAGAGAGACGCCGCCGCCGATAACACACTCGCCGCTTACGAATCTGCTCAGGAGCATGGT
AAGGGGCTTGCTTCAACTCACCCAATCCGTCTTGGTTTGGCATTGAACTTCTCTGTGTTC
TATTACGAGATCCTCGAGTCTCCTGACCGTGCCTGCGACCTAGCTAAAACGGCTTTTGAT
GCGGCCATTGCTGAGCTAGACACACTAGGGGAAGAGTCATACAAGGATAGCACTTTGATC
ATGCAGCTTCTCCGTGATAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATGCAGGATGAAGTTGCA
GACGAGATCAAGGAAGCAGCTGTGAAGCCAGCAGAAGAGCAGAAATGAAGAATCTTTGTG
TGAAATGGTACTGCTAGTGTTAGGAATTGAAACCATCTTTTTCGTCAATAAATCGTATTG
TGTCTAATCAAAGAGATGAGTCTCTCTCTCTTTTCTTCCATGTTGAAGTACATTATTACT
CTAATATCTCCCCTTTTGCGTTACCCTTTTGAAACGATGTTTGACGTTTTTTTTCTGTGT
TAAAAAGGGAAAATAATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX60TF U 1
AF RR2BX60JQ C 241
BS 1 640 RR2BX60TF
BS 641 1039 RR2BX60JQ

RD RR2BX60TF 640 0 0
GGAACTGGCTCGTCGTCCGTCTCTCTAGATCCACCGTTCGAAGCAGTAACAATGGCGGCT
CCGTCGCGCGAGGATCTTGTGTACATGGCTAAGCTAGCGGAGCAGGCGGAGAGGTACGAG
GAGATGGTCGAGTTCATGGAGAAAGTCTCCGCCGCAACAGATGGCACAGAGCTCACAATC
GAGGAGCGAAACCTCCTCTCAGTCGCTTACAAGAACGTGATCGGCGCTCGCCGCGCCTCG
TGGAGAATCATCTCATCGATCGAGCAGAAAGAAGAGAGCCGCGGGAACGCCGAACGCGTC
AACACGATCCGCGACTACAAGGCCAAGATCGAGACGGAGCTCTCGGGGATCTGCGGCGGA
ATCCTAAAGCTGCTCGAGTCTACGCTCATCCCTTCCGCTGCTTCCGAGGAGTCCAAGGTT
TTCTACCTCAAGATGAAAGGTGATTACTACAGGTACTTGGCCGAGTTCAAAACCGGTAAA
GAGAGAGACGCCGCCGCCGATAACACACTCGCCGCTTACGAATCTGCTCAGGAGCATGGT
AAGGGGCTTGCTTCAACTCACCCAATCCGTCTTGGTTTGGCATTGAACTTCTCTGTGTTC
TATTACGAGATCCTCGAGTCTCCTGACCGTGCCTGCGACC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2BX60JQ 799 0 0
TGGAGAATCATCTCATCGATCGAGCAGAAAGAAGAGAGCCGCGGGAACGCCGAACGCGTC
AACACGATCCGCGACTACAAGGCCAAGATCGAGACGGAGCTCTCGGGGATCTGCGGCGGA
ATCCTAAAGCTGCTCGAGTCTACGCTCATCCCTTCCGCTGCTTCCGAGGAGTCCAAGGTT
TTCTACCTCAAGATGAAAGGTGATTACTACAGGTACTTGGCCGAGTTCAAAACCGGTAAA
GAGAGAGACGCCGCCGCCGATAACACACTCGCCGCTTACGAATCTGCTCAGGAGCATGGT
AAGGGGCTTGCTTCAACTCACCCAATCCGTCTTGGTTTGGCATTGAACTTCTCTGTGTTC
TATTACGAGATCCTCGAGTCTCCTGACCGTGCCTGCGACCTAGCTAAAACGGCTTTTGAT
GCGGCCATTGCTGAGCTAGACACACTAGGGGAAGAGTCATACAAGGATAGCACTTTGATC
ATGCAGCTTCTCCGTGATAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATGCAGGATGAAGTTGCA
GACGAGATCAAGGAAGCAGCTGTGAAGCCAGCAGAAGAGCAGAAATGAAGAATCTTTGTG
TGAAATGGTACTGCTAGTGTTAGGAATTGAAACCATCTTTTTCGTCAATAAATCGTATTG
TGTCTAATCAAAGAGATGAGTCTCTCTCTCTTTTCTTCCATGTTGAAGTACATTATTACT
CTAATATCTCCCCTTTTGCGTTACCCTTTTGAAACGATGTTTGACGTTTTTTTTCTGTGT
TAAAAAGGGAAAATAATCT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL4091Contig1 983 2 2 U
GCTTCAACTCCTCGTGTAAAGGAAGGAGACGTTTTCTCAAATGCATCAGAGGCTGTTAAT
ACTGAAACATGTGAAGCTGATGGAGAAGACATACCTGAGGAGGAAGCAGTTTGTAGGATT
TGTTTGGTGGATCTCTGTGAAGGAGGAGAAACTTTAAAAATGGAGTGTAGTTGCAAAGGA
GAGCTTGCTCTTGCGCACAAAGACTGTGCTCTCAAATGGTTCACCATAAAGGGTAACAGG
ACCTGTGAAGTTTGTAAACAAGAAGTTAAGAACTTGCCTGTGACACTCTTACGGATCCAA
AGCATTCGAAACTCTGGTGTTCCTCAGATAGATGTCACTGGGTACAGGGTTTGGCAGGAG
GTTCCAGTTCTAGTAATCATCAGTATGCTTGCTTACTTTTGTTTCCTGGAGCAGCTCCTG
GTTGAGAAAATGGGGACGGGTGCAATTGCTATATCACTGCCGTTTTCTTGTATTCTTGGT
CTTCTTGCATCCATGACTGCATCAACCATGGTAATGAGAAGATTTGTGTGGATTTACGCA
TCTGTACAGTTTGCTTTGGTGGTTCTCTTCGCCCATGTATTTTATTCAGTGGTGGAGTTG
CAACCGGTTCTGTCAGTTCTTCTGTCAACATTTGCTGGATTTGGTGTATGCATATGCGGA
AGTTCAGTGATGGTTGAGTTTGTGAGATGGAGACGTAGATGGCTAGCCAGAAGGCTGGAG
CAGCAGCTGAACAATGCTCAGACGCTGCCCCAAACGCTGGATGCAACAACCTCTCAGCAT
CATCCAAATGCAGCGTAGATCCAGGAAAAGTGGAGAGATGATTTTACATTTATACAGTAG
TTGTTGGTTAATGTTATGTGTGATGAAGTGGAATGCTTAAAATGATTGTTATTTTGTTTG
TCTTTGCTTTGTTTACATACACCATTGTATTGTTTGTAAGTTTGTAACTTTGACTGCTCA
ATCTCTGCAAATAAATTGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG24TF U 1
AF RR2DG24JQ C 310
BS 1 709 RR2DG24TF
BS 710 983 RR2DG24JQ

RD RR2DG24TF 709 0 0
GCTTCAACTCCTCGTGTAAAGGAAGGAGACGTTTTCTCAAATGCATCAGAGGCTGTTAAT
ACTGAAACATGTGAAGCTGATGGAGAAGACATACCTGAGGAGGAAGCAGTTTGTAGGATT
TGTTTGGTGGATCTCTGTGAAGGAGGAGAAACTTTAAAAATGGAGTGTAGTTGCAAAGGA
GAGCTTGCTCTTGCGCACAAAGACTGTGCTCTCAAATGGTTCACCATAAAGGGTAACAGG
ACCTGTGAAGTTTGTAAACAAGAAGTTAAGAACTTGCCTGTGACACTCTTACGGATCCAA
AGCATTCGAAACTCTGGTGTTCCTCAGATAGATGTCACTGGGTACAGGGTTTGGCAGGAG
GTTCCAGTTCTAGTAATCATCAGTATGCTTGCTTACTTTTGTTTCCTGGAGCAGCTCCTG
GTTGAGAAAATGGGGACGGGTGCAATTGCTATATCACTGCCGTTTTCTTGTATTCTTGGT
CTTCTTGCATCCATGACTGCATCAACCATGGTAATGAGAAGATTTGTGTGGATTTACGCA
TCTGTACAGTTTGCTTTGGTGGTTCTCTTCGCCCATGTATTTTATTCAGTGGTGGAGTTG
CAACCGGTTCTGTCAGTTCTTCTGTCAACATTTGCTGGATTTGGTGTATGCATATGCGGA
AGTTCAGTGATGGTTGAGTTTGTGAGATGGAGACGTAGATGGCTAGCCA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2DG24JQ 674 0 0
AACTCTGGTGTTCCTCAGATAGATGTCACTGGGTACAGGGTTTGGCAGGAGGTTCCAGTT
CTAGTAATCATCAGTATGCTTGCTTACTTTTGTTTCCTGGAGCAGCTCCTGGTTGAGAAA
ATGGGGACGGGTGCAATTGCTATATCACTGCCGTTTTCTTGTATTCTTGGTCTTCTTGCA
TCCATGACTGCATCAACCATGGTAATGAGAAGATTTGTGTGGATTTACGCATCTGTACAG
TTTGCTTTGGTGGTTCTCTTCGCCCATGTATTTTATTCAGTGGTGGAGTTGCAACCGGTT
CTGTCAGTTCTTCTGTCAACATTTGCTGGATTTGGTGTATGCATATGCGGAAGTTCAGTG
ATGGTTGAGTTTGTGAGATGGAGACGTAGATGGCTAGCCAGAAGGCTGGAGCAGCAGCTG
AACAATGCTCAGACGCTGCCCCAAACGCTGGATGCAACAACCTCTCAGCATCATCCAAAT
GCAGCGTAGATCCAGGAAAAGTGGAGAGATGATTTTACATTTATACAGTAGTTGTTGGTT
AATGTTATGTGTGATGAAGTGGAATGCTTAAAATGATTGTTATTTTGTTTGTCTTTGCTT
TGTTTACATACACCATTGTATTGTTTGTAAGTTTGTAACTTTGACTGCTCAATCTCTGCA
AATAAATTGTTTGC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL4092Contig1 846 2 6 U
TTTTTCTTCCTGTCTCTCTCCTCTGTTTGTATCCATGGATAAGATTAATCTTGTGAAGAA
TGGTGTTTTGAGACTGCCACCTGGTTTCAGGTTTCATCCCACTGATGAAGAACTTGTGGT
TCAGTATCTCAAGAGAAAAGGTTTTTCTTCCCCATTACCAGTTTCCATCATTCCTGATGT
CGATGTTTGCAGAGCTGATCCTTGGGACTTACCTGGCAACTTAGAAAAGGAGAGGTACTT
CTTCAGCACAAGGGAAGCCAAGTACCCAAATGGGAACCGGTCCAATAGGGCAACTGAGTC
CGGTTATTGGAAAGCTACTGTATTGATAAACGGGTTGTGACCTCTAGAGGAAACCAAATC
GTTGGTTCAAAGAAAACTCTCGTCTTTTACAAAGGCAAACCACCTCATGGCTCAAGAACC
GATTGGATCATGCACGAATATCAGCTCTCTTCCTCTCCTCCGAGTTCTATAGGCCCCACT
CAGAATTGGGTTCTTTGTCGCATCTTCCTTAAGAAGAGAGCCGGTGACAAGAACGAAGAC
GAGGGAGATAACCGGAATCTTAGATGTAATAATGACCAACTTGAAATAATTACACCAAAC
CAAACCGAGGATAAAACCGAACCAATCTTCTTCGACTTCATGAGAAAAGAAAGGACTACG
GATTTGAACCTTTTGCCGAGCTCTCCTTCTTCCGGTCACGCTTCAAGTGGTGTCACGACG
GAGATGTTCTCTTCTGATGAAGAGACCAGTAGTTGCAATAGTTTAAGAAGAAATCCTTAA
TTAAATTTTAATGTTGACTGTCTTATATAGTAATTTTATATTAATACGACTCTCCTTCCT
TTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY40TF U 1
AF RR2GY40JQ C 71
BS 1 660 RR2GY40TF
BS 661 661 RR2GY40JQ
BS 662 705 RR2GY40TF
BS 706 706 RR2GY40JQ
BS 707 718 RR2GY40TF
BS 719 846 RR2GY40JQ

RD RR2GY40TF 718 0 0
TTTTTCTTCCTGTCTCTCTCCTCTGTTTGTATCCATGGATAAGATTAATCTTGTGAAGAA
TGGTGTTTTGAGACTGCCACCTGGTTTCAGGTTTCATCCCACTGATGAAGAACTTGTGGT
TCAGTATCTCAAGAGAAAAGGTTTTTCTTCCCCATTACCAGTTTCCATCATTCCTGATGT
CGATGTTTGCAGAGCTGATCCTTGGGACTTACCTGGCAACTTAGAAAAGGAGAGGTACTT
CTTCAGCACAAGGGAAGCCAAGTACCCAAATGGGAACCGGTCCAATAGGGCAACTGAGTC
CGGTTATTGGAAAGCTACTGTATTGATAAACGGGTTGTGACCTCTAGAGGAAACCAAATC
GTTGGTTCAAAGAAAACTCTCGTCTTTTACAAAGGCAAACCACCTCATGGCTCAAGAACC
GATTGGATCATGCACGAATATCAGCTCTCTTCCTCTCCTCCGAGTTCTATAGGCCCCACT
CAGAATTGGGTTCTTTGTCGCATCTTCCTTAAGAAGAGAGCCGGTGACAAGAACGAAGAC
GAGGGAGATAACCGGAATCTTAGATGTAATAATGACCAACTTGAAATAATTACACCAAAC
CAAACCGAGGATAAAACCGAACCAATCTTCTTCGACTTCATGAGAAAAGAAAGGACTACG
*ATTTGAACCTTTTGCCGAGCTCTCCTTCTTCCGGTCACGCTTCA*GTGGTGTCACGA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2GY40JQ 776 0 0
AGACTGCCACCTGGTTTCAGGTTTCATCCCACTGATGAAGAACTTGTGGTTCAGTATCTC
AAGAGAAAAGGTTTTTCTTCCCCATTACCAGTTTCCATCATTCCTGATGTCGATGTTTGC
AGAGCTGATCCTTGGGACTTACCTGGCAACTTAGAAAAGGAGAGGTACTTCTTCAGCACA
AGGGAAGCCAAGTACCCAAATGGGAACCGGTCCAATAGGGCAACTGAGTCCGGTTATTGG
AAAGCTACTGTATTGATAAACGGGTTGTGACCTCTAGAGGAAACCAAATCGTTGGTTCAA
AGAAAACTCTCGTCTTTTACAAAGGCAAACCACCTCATGGCTCAAGAACCGATTGGATCA
TGCACGAATATCAGCTTTCTTCCTCTCCTCCGAGTTCTATAGGCCCCACTCAGAATTGGG
TTCTTTGTCGCATCTTCCTTAAGAAGAGAGCCGGTGACAAGAACGAAGACGAGGGAGATA
ACCGGAATCTTAGATGTAATAATGACCAACTTGAAATAATTACACCAAACCAAACCGAGG
ATAAAACCGAACCAATCTTCTTCGACTTCATGAGAAAAGAAAGGACTACGGATTTGAACC
TTTTGCCGAGCTCTCCTTCTTCCGGTCACGCTTCAAGTGGTGTCACGACGGAGATGTTCT
CTTCTGATGAAGAGACCAGTAGTTGCAATAGTTTAAGAAGAAATCCTTAATTAAATTTTA
ATGTTGACTGTCTTATATAGTAATTTTATATTAATACGACTCTCCTTCCTTTTTCC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL4093Contig1 380 2 1 U
GGAGGGTTTTCAAGAATCTGTGAGTGTTTATAACGCCGCTCGTCCTCATCTTTTAGCTCC
TCACGCCAGAGCAATCGAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
TAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCTGCAACGCCAAGGAAATCGGATTCAT
CAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTCTATGCAAGAGCAGTCGTTTGGTTTTTGAGCTTTT
GAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGACAA
TTGAGTTGTTGAGCATTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EJ35JQ C 1
AF RR2EJ35TF U 1
BS 1 380 RR2EJ35TF

RD RR2EJ35JQ 380 0 0
GGAGGGTTTTCAAGAATCTGTGAGTGTTTATAACGCCGCTCGTCCTCATCTTTTAGCTCC
TCACGCCAGAGCAATCGAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
TAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCTGCAACGCCAAGGAAATCGGATTCAT
CAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTCTATGCAAGAGCAGTCGTTTGGTTTTTGAGCTTTT
GAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGACAA
TTGAGTTGTTGAGCATTTTT

QA 1 380 1 380
DS 

RD RR2EJ35TF 380 0 0
GGAGGGTTTTCAAGAATCTGTGAGTGTTTATAACGCCGCTCGTCCTCATCTTTTAGCTCC
TCACGCCAGAGCAATCGAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
TAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCTGCAACGCCAAGGAAATCGGATTCAT
CAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTCTATGCAAGAGCAGTCGTTTGGTTTTTGAGCTTTT
GAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGACAA
TTGAGTTGTTGAGCATTTTT

QA 1 380 1 380
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4095Contig1 472 2 2 U
GGGTAAAAAATAAAATACTTCATCTATTTTCTAAATTTTGAACTCACTATCAATCCATTT
CTATTATCCACGATGATGAAATCCCTTCAACTTTTGTTCACCTTCTTAACTATATTCATC
ATTCTTTCACTAGGAATGATGACAGATGCGAAGAATGCAAAAATGTGTCCTCATAGACTT
GCAATTAGCAGAGTATGGCCTTGCACTGCGTTACGATGTCGAATTGACTGTAAAAAGAAT
TACCCACCTACTGGTACTGGTATTTGTTCGGTTGAGGAAGGATTTTGCGACTGCCAGGGT
CCTTGTTAGAGTTCTCGCTAATTGTTGTGAATATAATACACAACTCAAATTCTATATTAC
CTTTTTAAAATAAATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTATATTATTT
GTATCAGATCTGTGAATTTATTTAGTATAAATAATAATATGAATGTTAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H788TF U 1
AF RR2H788JQB C 27
BS 1 462 RR2H788TF
BS 463 472 RR2H788JQB

RD RR2H788TF 462 0 0
GGGTAAAAAATAAAATACTTCATCTATTTTCTAAATTTTGAACTCACTATCAATCCATTT
CTATTATCCACGATGATGAAATCCCTTCAACTTTTGTTCACCTTCTTAACTATATTCATC
ATTCTTTCACTAGGAATGATGACAGATGCGAAGAATGCAAAAATGTGTCCTCATAGACTT
GCAATTAGCAGAGTATGGCCTTGCACTGCGTTACGATGTCGAATTGACTGTAAAAAGAAT
TACCCACCTACTGGTACTGGTATTTGTTCGGTTGAGGAAGGATTTTGCGACTGCCAGGGT
CCTTGTTAGAGTTCTCGCTAATTGTTGTGAATATAATACACAACTCAAATTCTATATTAC
CTTTTTAAAATAAATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTATATTATTT
GTATCAGATCTGTGAATTTATTTAGTATAAATAATAATATGA

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2H788JQB 446 0 0
TTTTTTAAATTTTGAACTCACTATCAATCCATTTTTATTATCCACGATGATGAAATCCCT
TCAACTTTTGTTCCCCTTTTTAACTATATTCATCATTTTTTCACTAGGAATGATGACAGA
TGCGAAGAATGCAAAAATGTGTCCTCATAGACTTGCAATTAGCAGAGTATGGCCTTGCAC
TGCGTTACGATGTCGAATTGACTGTAAAAAGAATTACCCCCCTACTGGTACTGGTATTTG
TTCGGTTGAGGAAGGATTTTGGGACTGCCAGGGTCCTTGTTAGAGTTCTCGCTAATTGTT
GTGAATATAATACACAACTCAAATTTTATATTACCTTTTTAAAATAAATGTTTAAATAAT
TTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTATATTATTTGTATCAGATCTGTGAATTTATTTAGT
ATAAATAATAATATGAATGTTAAATC

QA 1 446 1 446
DS 



AS 1 2

CO CL4096Contig1 332 2 3 U
GCAGTTGCAGAGACTAAACCTAAGGTACTCACTGATTCTAAGAAGCTTCAAGAAAAATGT
GTTGGAGAAATGGAGCAACCAAGAGAAGCAATTATAGAGCCTCAAGAGAAGTCTCAAAAT
GCTCAAGAGAATAGCAAGTGTTTTGAGAAGCATGTTGCTATGGTTAATCAATCTGAGGCA
CTCGTTGATTCTAGGAAGCTTGAAGAGAAAGTTGTCCGAGAAAGCGTTCAACCTATGGAA
ACAATTGCAGAGCATCAGCCCCAGTCCCAAAACACTCAAGACACCAACAAGTTCTTCGAG
AAGCCCAACGTAGAGTTCACAGAGGTATATGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F449JQ C 1
AF RR2F449TF U 1
BS 1 8 RR2F449TF
BS 9 9 RR2F449JQ
BS 10 332 RR2F449TF

RD RR2F449JQ 332 0 0
GCAGTTGCAGAGACTAAACCTAAGGTACTCACTGATTTTAAGAAGCTTCAAGAAAAATGT
GTTGGAGAAATGGAGCAACCAAGAGAAGCAATTATAGAGCCTCAAGAGAAGTCTCAAAAT
GCTCAAGAGAATAGCAAGTGTTTTGAGAAGCATGTTGCTATGGTTAATCAATTTGAGGCA
CTCGTTGATTTTAGGAAGCTTGAAGAGAAAGTTGTCCGAGAAAGCGTTCAACCTATGGAA
ACAATTGCAGAGCATCAGCCCCAGTCCCAAAACACTCAAGACACCAACAAGTTTTTCGAG
AAGCCCAACGTAGAGTTCACAGAGGTATATGT

QA 1 332 1 332
DS 

RD RR2F449TF 332 0 0
GCAGTTGCTGAGACTAAACCTAAGGTACTCACTGATTCTAAGAAGCTTCAAGAAAAATGT
GTTGGAGAAATGGAGCAACCAAGAGAAGCAATTATAGAGCCTCAAGAGAAGTCTCAAAAT
GCTCAAGAGAATAGCAAGTGTTTTGAGAAGCATGTTGCTATGGTTAATCAATCTGAGGCA
CTCGTTGATTCTAGGAAGCTTGAAGAGAAAGTTGTCCGAGAAAGCGTTCAACCTATGGAA
ACAATTGCAGAGCATCAGCCCCAGTCCCAAAACACTCAAGACACCAACAAGTTCTTCGAG
AAGCCCAACGTAGAGTTCACAGAGGTATATGT

QA 1 332 1 332
DS 



AS 1 2

CO CL4097Contig1 560 2 2 U
GCAATGAAACTAACCTCAACTGAAACAAAACTCCAGAGTGAAAACTGAGTACAGACCAGA
CAGTTCAACTGTTCAACTACAAGCAAGTTTACTCAAAGGACCAAACACAAAACATATAGA
GACTTGAAAAAAAAAAAACAAAGCTACTAAATCACTGCTTCTCAGCTTTGTAACTAGACC
CACGGACATTATCACAAACCATAGTAATCTACACCAATTTCAAGAGCAGACAGATCAAAT
GAGGAGCGGAAAGGAAAAGGGTTTCATGTCTGTGTCCCGTTTTAAAGCTGCACTTCTCTG
TCATGTATCCAGCTGAAAGGAATCTTGGGTCCTTTCTTGGCTCTTGCTTGAGCTCTCTCA
TCCAACCTCCTGATTCTCGGAGTCAACCCACATAAGTAGTCTTGAGCTTTGTTTCCTTCA
CCTGAAAGCCCGTTTAAGTTCTCGATCTTCCACCTCTTTGTCACTTTCAGCCTCAGCTTT
TTCCTCTTCCTCGTCTTTCTCTTCTTCCTCCTCTTTATCACTTTCAGCCTCAGCTTTTTT
CTCTTCTTCCTTCTCTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E193JQ U 1
AF RR2B372TF C 39
BS 1 456 RR2E193JQ
BS 457 560 RR2B372TF

RD RR2E193JQ 467 0 0
GCAATGAAACTAACCTCAACTGAAACAAAACTCCAGAGTGAAAACTGAGTACAGACCAGA
CAGTTCAACTGTTCAACTACAAGCAAGTTTACTCAAAGGACCAAACACAAAACATATAGA
GACTTGAAAAAAAAAAAACAAAGCTACTAAATCACTGCTTCTCAGCTTTGTAACTAGACC
CACGGACATTATCACAAACCATAGTAATCTACACCAATTTCAAGAGCAGACAGATCAAAT
GAGGAGCGGAAAGGAAAAGGGTTTCATGTCTGTGTCCCGTTTTAAAGCTGCACTTCTCTG
TCATGTATCCAGCTGAAAGGAATCTTGGGTCCTTTCTTGGCTCTTGCTTGAGCTCTCTCA
TCCAACCTCCTGATTCTCGGAGTCAACCCACATAAGTAGTCTTGAGCTTTGTTTCCTTCA
CCTGAAAGCCCGTTTAAGTTCTCGATCTTCCACCTC
CCAACCAAAAA

QA 1 456 1 456
DS 

RD RR2B372TF 522 0 0
TGAAAACTGAGTACAGACCAGACAGTTCAACTGTTCAACTACAAGCAAGTTTACTCAAAG
GACCAAACACAAAACATATAGAGACTTGAAAAAAAAAA**CAAAGCTACTAAATCACTGC
TTCTCAGCTTTGTAACTAGACCCACGGACATTATCACAAACCATAGTAATCTACACCAAT
TTCAAGAGCAGACAGATCAAATGAGGAGCGGAGAGGAAAAGGGTTTCATGTCTGTGTCCC
GTTTTAGAGCTGCACTTCTCTGTCATGTATCCAGCTGAAAGGAATCTTGGGTCCTTTCTT
GGCTCTTGCTTGAGCTCTCTCATCCAACCTCCTGATTCTCGGAGTCAACCCACATAAGTA
GTCTTGAGCTTTGTTTCCTTCACCTGAAAGCCCGTTTAAGTTCTCGATCTTCCACCTCTT
TGTCACTTTCAGCCTCAGCTTTTTCCTCTTCCTCGTCTTTCTCTTCTTCCTCCTCTTTAT
CACTTTCAGCCTCAGCTTTTTTCTCTTCTTCCTTCTCTCACC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 2

CO CL4098Contig1 988 2 6 U
GATTCGCCAGTTCTTCACCTTCTTCTCACCCTCAAGCTGATCCCACTCGCACGTTGGCTT
CAACGGCAGCTAAACGAGGATCTGTTCCCATTTTCAAGGCCAAAAAGCATAAACCAGTTT
TCCCTGGTTCGTCTTCCATAAAACCCATCCCTTACCATCCTCCGGATCAACAAACTCCAC
GAGGGCAAGTCATGAACAGATTACCATCTGGTCCTTCCAGTTCAAGTGAACCCACAAAAG
GAACTGGACCTGAGTCTTTTGTAGGAAGAAGAGTTAGAACAAGGTGGCCAGAAGACAATA
CATTTTACGAAGCTGCCATCTCCAAGTATGATCCAGTTGAGGGCCGTTATGCTTTGGTTT
ATGACATTGGAACACTTAATGAGGCATGGGAATGGGTTAAACTCGCAGAGATATCTCCTG
GGGATATTGAGTGGGTAGGAGAGGATCCTGGGATTTGTAATCGATATGGTTACAACGGAC
AAGGCCATGGTCTGAACAGAAGTACAGGACCCGACAATGTTCCACAACGAGGACCAGTTT
GGCAAAGACCACTATCAAAAACGATCTCAGAACATCACAGAATGGAAGTGGGAAAAGGAA
ACATGTCGATATACGTCTCCGTCCGACCAATGTCCTAATCAGAGAGGTGGAGAGAGTTCT
TGGTTCACACAATCCAGATCCTCAAGAAGTTGAAATGGCTAAGAGAGTTTTGGAGGAGCA
AGAACGTGCGCTTGTGGGTGCAATAACAAAGCTTGGAGATATATCCAATGGAGAGAACGT
TTTGCCAAGGCACGGTGCAATGCAGACCATAAGGAGCAGCTGATGAAGAAGAAGTAAACA
TTGGTTGAGATGGAAAGTCGAGAGTCTCTAACTTCTTTGATGTTGCCTTTTCTTTGGTAT
CTGACTGTAATTTTTGTTGCTAACTTTAGAGATTAGCTTTACCCAAATGCTGGAGGATAT
AATGTTCAGTGGAACGGTTTCAATCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA54TF U 1
AF RR2FA54JQ C 624
BS 1 723 RR2FA54TF
BS 724 724 RR2FA54JQ
BS 725 749 RR2FA54TF
BS 750 750 RR2FA54JQ
BS 751 767 RR2FA54TF
BS 768 988 RR2FA54JQ

RD RR2FA54TF 784 0 0
GATTCGCCAGTTCTTCACCTTCTTCTCACCCTCAAGCTGATCCCACTCGCACGTTGGCTT
CAACGGCAGCTAAACGAGGATCTGTTCCCATTTTCAAGGCCAAAAAGCATAAACCAGTTT
TCCCTGGTTCGTCTTCCATAAAACCCATCCCTTACCATCCTCCGGATCAACAAACTCCAC
GAGGGCAAGTCATGAACAGATTACCATCTGGTCCTTCCAGTTCAAGTGAACCCACAAAAG
GAACTGGACCTGAGTCTTTTGTAGGAAGAAGAGTTAGAACAAGGTGGCCAGAAGACAATA
CATTTTACGAAGCTGCCATCTCCAAGTATGATCCAGTTGAGGGCCGTTATGCTTTGGTTT
ATGACATTGGAACACTTAATGAGGCATGGGAATGGGTTAAACTCGCAGAGATATCTCCTG
GGGATATTGAGTGGGTAGGAGAGGATCCTGGGATTTGTAATCGATATGGTTACAACGGAC
AAGGCCATGGTCTGAACAGAAGTACAGGACCCGACAATGTTCCACAACGAGGACCAGTTT
GGCAAAGACCACTATCAAAAACGATCTCAGAACATCACAGAATGGAAGTGGGAAAAGGAA
ACATGTCGATATACGTCTCCGTCCGACCAATGTCCTAATCAGAGAGGTGGAGAGAGTTCT
TGGTTCACACAATCCAGATCCTCAAGAAGTTGAAATGGCTAAGAGAGTTTTGGAGGAGCA
AGA*CGTGCGCTTGTGGGTGCAATAACAA*GCTTGGAGATATATCCA
TGGAGAGACGTTTGCCA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2FA54JQ 365 0 0
CGACCAATGTCCTAATCAGAGAGGTGGAGAGAGTTCTTGGTTCACACAATCCAGATCCTC
AAGAAGTTGAAATGGCTAAGAGAGTTTTGGAGGAGCAAGAACGTGCGCTTGTGGGTGCAA
TAACAAAGCTTGGAGATATATCCAATGGAGAGAACGTTTTGCCAAGGCACGGTGCAATGC
AGACCATAAGGAGCAGCTGATGAAGAAGAAGTAAACATTGGTTGAGATGGAAAGTCGAGA
GTCTCTAACTTCTTTGATGTTGCCTTTTCTTTGGTATCTGACTGTAATTTTTGTTGCTAA
CTTTAGAGATTAGCTTTACCCAAATGCTGGAGGATATAATGTTCAGTGGAACGGTTTCAA
TCATC

QA 1 365 1 365
DS 



AS 1 2

CO CL4099Contig1 1049 2 4 U
GAGATATTTATTTATGCCAAACGGCATATTGACGCTGGTGAAGAAATATGTTACAACTAC
AAATTCCCGCTTGAGGACAACAAAATCCCCTGCAACTGTAGAGCGCCAAAGTGCCGTGGA
TCGCTGAACTAGGAGAGATGAGGTTGGTAGAAGAAACTGAATCAGAAGGTTTTTTTTGGG
TTCAAGTGAAGAAGCTGGACGAATCCCTTTTGCAGTATAAATCTCCAACAGGCAGCAGCA
GATGAGTCTCCTCTCTTTGAACACAAACTGTAACCATTTCATCCCACATACTAACACTTA
TAAATAACTGCAATTTTTTCTGTTATTTTCTTTTTGATACTTTTCTAGTTTTCTTTTGTT
GTTGTGGTCATCTACAACGAAAAAAATTTAATGCCAAGTTGATAATAGATTTATTTTATT
ATTATAATAAACTTAATTCCTTATGAATTTAAAGAAACAAGACTAATCTTTATTGTTTTT
CGTGCAACAAAACAGAAGATTATTATTGTTAAGCATTTTTAGCTGTCCATTGTGAAAAAC
GGGCCAACTTATAGAAATTAGATCTTTGTTGATTGGTTTCATTTGAGCAGAAAAGGAGAA
AAGAGACTACTACTGTTATGGCTTAATGAAAGCTAAGAGGAATTGTAAGAAAAAAAAAAG
ATTAGCAATGTGATAATTCCATTTCCACAACCCCATTGTGCTTGATATGGTATGTATAAT
GTTATATATGTATCCTTCCCTTTTTTTTAATTTCTTACTATTGCAATTTATTGGACACTG
ACATTTGGTGAATTTTAATTTTAACTAAATTGAGAAAAGCAAAATTGCTTCATCAGACGC
GAAATGGACAGGCTTACTTTTGCTCTATCTAGTTAAAAGGCAAAATATTGGAGTAGTGTT
CCCTTTCTTTCCCCTCACTGTTTGGGTTTTGCCAAAGAATAATTTGTTCATCGACTTCGT
TTCTGGTCGTTGGGGTACCAGATTTTCTCTGTCTGTAGTTTGAAACTATGTATTATATAA
ATTAAAATATTTGTATCATTAAAACACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H852TF U 1
AF RR2H852JQ C 476
BS 1 658 RR2H852TF
BS 659 659 RR2H852JQ
BS 660 746 RR2H852TF
BS 747 1049 RR2H852JQ

RD RR2H852TF 746 0 0
GAGATATTTATTTATGCCAAACGGCATATTGACGCTGGTGAAGAAATATGTTACAACTAC
AAATTCCCGCTTGAGGACAACAAAATCCCCTGCAACTGTAGAGCGCCAAAGTGCCGTGGA
TCGCTGAACTAGGAGAGATGAGGTTGGTAGAAGAAACTGAATCAGAAGGTTTTTTTTGGG
TTCAAGTGAAGAAGCTGGACGAATCCCTTTTGCAGTATAAATCTCCAACAGGCAGCAGCA
GATGAGTCTCCTCTCTTTGAACACAAACTGTAACCATTTCATCCCACATACTAACACTTA
TAAATAACTGCAATTTTTTCTGTTATTTTCTTTTTGATACTTTTCTAGTTTTCTTTTGTT
GTTGTGGTCATCTACAACGAAAAAAATTTAATGCCAAGTTGATAATAGATTTATTTTATT
ATTATAATAAACTTAATTCCTTATGAATTTAAAGAAACAAGACTAATCTTTATTGTTTTT
CGTGCAACAAAACAGAAGATTATTATTGTTAAGCATTTTTAGCTGTCCATTGTGAAAAAC
GGGCCAACTTATAGAAATTAGATCTTTGTTGATTGGTTTCATTTGAGCAGAAAAGGAGAA
AAGAGACTACTACTGTTATGGCTTAATGAAAGCTAAGAGGAATTGTAAGAAAAAAAAA*G
ATTAGCAATGTGATAATTCCATTTCCACAACCCCATTGTGCTTGATATGGTATGTATAAT
GTTATATATGTATCCTTCCCTTTTTT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2H852JQ 574 0 0
TTTTTCGTGCAACAAAACAGAAGATTATTATTGTTAAGCATTTTTAGCTGTCCATTGTGA
AAAACGGGCCAACTTATAGAAATTAGATCTTTGTTGATTGGTTTCATTTGAGCAGAAAAG
GAGAAAAGAGACTACTACTGTTATGGCTTAATGAAAGCTAAGAGGAATTGTAAGAAAAAA
AAAAGATTAGCAATGTGATAATTCCATTTCCACAACCCCATTGTGCTTGATATGGTATGT
ATAATGTTATATATGTATCCTTCCCTTTTTTTTAATTTCTTACTATTGCAATTTATTGGA
CACTGACATTTGGTGAATTTTAATTTTAACTAAATTGAGAAAAGCAAAATTGCTTCATCA
GACGCGAAATGGACAGGCTTACTTTTGCTCTATCTAGTTAAAAGGCAAAATATTGGAGTA
GTGTTCCCTTTCTTTCCCCTCACTGTTTGGGTTTTGCCAAAGAATAATTTGTTCATCGAC
TTCGTTTCTGGTCGTTGGGGTACCAGATTTTCTCTGTCTGTAGTTTGAAACTATGTATTA
TATAAATTAAAATATTTGTATCATTAAAACACGC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL4100Contig1 456 2 4 U
GGTCATGATAAAATAGTTTTATATCGTACATAAAAGTTAATATAAACATACATGGCACAT
ACCATAAGGGTCGCTCAAAGGGTGACAGAATAACTGAATGTAAGTAAAAACCAAAAATAT
AAATAATAACTCAAACCTAATAAAATTTGATAGATTAACATGGGAAGTGGCAAACACATT
GGGCCCATGGAAATTTAAAATCGCAAGTACCAAATATTGCTTTCTCTTTTTCGACGCAAT
TCTTCTGGCATTTAGCATTACTGTTACAAAATGCTCTCCCTGCCTTAGGTTCCTTCCTGC
ATGACTTCTGCCCTTCCACCATAGTTGGTTCCTCAAAAGCAGAAAAGATAATAAGAACAA
TGAACAGGAGGGTGATGATGGAAGCAAACTTAGCCATGCTATATTTTACTTTTTACTTCT
TCTTTATTTTAATTAAGGGAAGTATGTGTATAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H866TF C 1
AF RR2BE06JQ U 27
BS 1 26 RR2H866TF
BS 27 201 RR2BE06JQ
BS 202 202 RR2H866TF
BS 203 456 RR2BE06JQ

RD RR2H866TF 446 0 0
GGTCATGATAAAATAGTTTTATATCGTACATAAAAGTTAATATAAACATACATGGCACAT
ACCATAAGGGTCGCTCAAAGGGTGACAGAATAACTGAATGTAAGTAAAAACCAAAAATAT
AAATAATAACTCAAACCTAATAAAATTTGATAGATTAACATGGGAAGTGGCAGACACATT
GGGCCCATGGAAATTTAAAATCGCAAGTACCAAATATTGCTTTCTCTTTTTCGACGCAAT
TCTTCTGGCATTTAGCATTACTGTTACAAATTGCTCTCCCTGCCTTAGGTTCCTTCCTGC
ATGACTTCTGCCCTTCCACCATAGTTGGTTCTTCAAAAGCAGAAAAGATAATAAGAACAA
TGAAGAGGAGGGTGATGATGGAAGCAAACTTAGCCATGCTATATTTTACTTTTTACTTCT
TCTTTATTTTAATTAAGGGAAGTATG

QA 1 446 1 446
DS 

RD RR2BE06JQ 430 0 0
TACATAAAAGTTAATATAAACATACATGGCACATACCATAAGGGTCGCTCAAAGGGTGAC
AGAATAACTGAATGTAAGTAAAAACCAAAAATATAAATAATAACTCAAACCTAATAAAAT
TTGATAGATTAACATGGGAAGTGGCAAACACATTGGGCCCATGGAAATTTAAAATTGCAA
GTACCAAATATTGCTTTCTCTTTTTCGACGCAATTCTTCTGGCATTTAGCATTACTGTTA
CAAAATGCTCTCCCTGCCTTAGGTTCCTTCCTGCATGACTTCTGCCCTTCCACCATAGTT
GGTTCCTCAAAAGCAGAAAAGATAATAAGAACAATGAACAGGAGGGTGATGATGGAAGCA
AACTTAGCCATGCTATATTTTACTTTTTACTTCTTCTTTATTTTAATTAAGGGAAGTATG
TGTATAATCC

QA 1 430 1 430
DS 



AS 1 2

CO CL4101Contig1 1126 2 6 U
GGGATTCTCAATTCTTCCTTACACAAACAAAACAAACATAAAAGCCCACAGCTTTCTTCT
GTAGTAAATTGATTTCAACCGTCCGATCATTCATCTTTGCCATCAACCCTTCACCAATCC
CTACACAGATCATCTGCCTGCCTCTCTCTATTTTGCTGTTTCTCTCTCTCTCGATCTCTC
CGGCGAGCCGTTCTCATAGGTTGTTCTGGTGTAACAGTAGGAATCAAGCTTTAGCATCCT
CAGAATCCTGTCTGTTGGCATCTCTGTAAATGGGCTGCTTCCACTCGAAGGTAGCAAGAG
AATCCCGTGGACACGAAGACCCTGTCAAGCTTTCCTCCGAGACTGCCTTTAGTGTGAGTG
AGGTTGAAGCATTGTTTGAGCTGTTCAAGAGCATAAGCAGTTCCGTTGTTGATGATGGTT
TGATAAACAAGGAAGAGTTTCAACTTGCCTTGTTCAAGAACCCGAAGAAGGAGAATCTAT
TTGCTAACAGGATATTTGATATGTTTGATGTGAAACGAAAAGGAGTGATTGATTTCGGCG
ACTTTGTCATATCACTCAATGTTTTCCATCCCAATGCTTCTTTAGAAGACAAAATCGATT
TTACGTTTAGGCTTTATGACATGGACTGTACGGGTTTCATTGAACGACAAGAGGTGAAGC
AAATGTTGATCGCCCTTCTGTGCGAATCTGAAATGAAATTGGCTGATGAAACCATAGAGA
TAATACTAGATAAGACATTTGAAGATGCAGACGTGAATCAGGATGGAAAGATTGATAAAC
TAGAGTGGAGCGATTTCGTGAACAAGAACCCATCACTACTTAAAATCATGACACTCCCAT
ATCTCAGGGATATAACGACAACGTTTCCAAGCTTTGTCTTTAACTCGGAGGTGGATGAGA
TTGCCACATGACGAAACAAAACCGTTTTACAAAAGGTTGGACCGGTCCGCACAAGAAAGA
ACAAGACCAAGTAGTTGACAACTGTTTGCAAACACAGTAGTAGATCCCATTTTTTTCTTT
AAATTGTATTTTCATATTCTGGGTTCCTATTTTCTCCTCAGAACATTTTTGAAATCCTTT
GGTTTTTAGCTTTAAAAAAGAGCGAAAATCACCAACTCTCTACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR85TF U 1
AF RR2FR85JQ C 351
BS 1 697 RR2FR85TF
BS 698 698 RR2FR85JQ
BS 699 710 RR2FR85TF
BS 711 711 RR2FR85JQ
BS 712 759 RR2FR85TF
BS 760 1126 RR2FR85JQ

RD RR2FR85TF 759 0 0
GGGATTCTCAATTCTTCCTTACACAAACAAAACAAACATAAAAGCCCACAGCTTTCTTCT
GTAGTAAATTGATTTCAACCGTCCGATCATTCATCTTTGCCATCAACCCTTCACCAATCC
CTACACAGATCATCTGCCTGCCTCTCTCTATTTTGCTGTTTCTCTCTCTCTCGATCTCTC
CGGCGAGCCGTTCTCATAGGTTGTTCTGGTGTAACAGTAGGAATCAAGCTTTAGCATCCT
CAGAATCCTGTCTGTTGGCATCTCTGTAAATGGGCTGCTTCCACTCGAAGGTAGCAAGAG
AATCCCGTGGACACGAAGACCCTGTCAAGCTTTCCTCCGAGACTGCCTTTAGTGTGAGTG
AGGTTGAAGCATTGTTTGAGCTGTTCAAGAGCATAAGCAGTTCCGTTGTTGATGATGGTT
TGATAAACAAGGAAGAGTTTCAACTTGCCTTGTTCAAGAACCCGAAGAAGGAGAATCTAT
TTGCTAACAGGATATTTGATATGTTTGATGTGAAACGAAAAGGAGTGATTGATTTCGGCG
ACTTTGTCATATCACTCAATGTTTTCCATCCCAATGCTTCTTTAGAAGACAAAATCGATT
TTACGTTTAGGCTTTATGACATGGACTGTACGGGTTTCATTGAACGACAAGAGGTGAAGC
AAATGTTGATCGCCCTTCTGTGCGAATCTGAAATGAA*TTGGCTGATGAA*CCATAGAGA
TAATACTAGATAAGACATTTGAAGATGCAGACGTGAATC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2FR85JQ 776 0 0
AGTGTGAGTGAGGTTGAAGCATTGTTTGAGCTGTTCAAGAGCATAAGCAGTTCCGTTGTT
GATGATGGTTTGATAAACAAGGAAGAGTTTCAACTTGCCTTGTTCAAGAACCCGAAGAAG
GAGAATCTATTTGCTAACAGGATATTTGATATGTTTGATGTGAAACGAAAAGGAGTGATT
GATTTCGGCGACTTTGTCATATCACTCAATGTTTTCCATCCCAATGCTTCTTTAGAAGAC
AAAATCGATTTTACGTTTAGGCTTTATGACATGGACTGTACGGGTTTCATTGAACGACAA
GAGGTGAAGCAAATGTTGATCGCCCTTCTGTGCGAATCTGAAATGAAATTGGCTGATGAA
ACCATAGAGATAATACTAGATAAGACATTTGAAGATGCAGACGTGAATCAGGATGGAAAG
ATTGATAAACTAGAGTGGAGCGATTTCGTGAACAAGAACCCATCACTACTTAAAATCATG
ACACTCCCATATCTCAGGGATATAACGACAACGTTTCCAAGCTTTGTCTTTAACTCGGAG
GTGGATGAGATTGCCACATGACGAAACAAAACCGTTTTACAAAAGGTTGGACCGGTCCGC
ACAAGAAAGAACAAGACCAAGTAGTTGACAACTGTTTGCAAACACAGTAGTAGATCCCAT
TTTTTTCTTTAAATTGTATTTTCATATTCTGGGTTCCTATTTTCTCCTCAGAACATTTTT
GAAATCCTTTGGTTTTTAGCTTTAAAAAAGAGCGAAAATCACCAACTCTCTACATC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL4102Contig1 466 2 6 U
CCTGTGGTAATCACTGCGTCTAAAGACAGAGTTCCAAACATAAAATTCAATGTCGCTAAG
GTGCTTCAGTCCCTTATTCCAATAGTGGATCAATCGGTGGTAGAGAAGACGATTCGTCCA
GGGCTTGTGGAGCTAAGCGAGGATCCAGATGTTGATGTGAGGTATTTTGCCAACGAAGCT
CTTCAATCTATTGATAATGTGATGATGTCTTAGCTAAAAAAAAGGAAAACTTTTAGATCT
TGTCTGTCTCTGTGTTGTTTTCTGTTTGATGCAAAAGTTATGAAATCTCGAGACTTTGTA
ACGTAAGTAGTGGAGGGAAATAACTCTTGTGTTCTGTTTTTTTTTTCTTCTTATTACACT
TGCACACTTAAGTGACTCCGTATGAAGTATGTCCATTGTCTTTCAACTAGTTTGTTCACA
TTTGATTTTGTTTTGAAAACTTCTCCAGCTAATGAACATTTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT37JQB C 1
AF RR2AV90TF U 28
BS 1 28 RR2GT37JQB
BS 29 346 RR2AV90TF
BS 347 348 RR2GT37JQB
BS 349 448 RR2AV90TF
BS 449 449 RR2GT37JQB
BS 450 466 RR2AV90TF

RD RR2GT37JQB 458 0 0
CCTGTGGTAATCACTGCGTCTAAAGACAGAGTTCCAAACATCAAATTCAATGTCGCTAAG
GTGCTTCAGTCCCTTATTCCAATAGTGGATCAATCGGTGGTAGAGAAGACGATTCGTCCA
GGGCTTGTGGAGCTAAGCGAGGATCCAGATGTTGATGTGAGGTATTTTGCCAACGAAGCT
CTTCAATCTATTGATAATGTGATGGTGTTTTAGCTAAAAAAA*GGAAAACTTTTAGATCT
TGTCTGTCTCTG*GTTGTTTTCTGTTTGATGCAAAAGTTATGAAATCTCGAGACTTTGTA
ACGTAAGTAGTGGAGGGAAATAACTCTTGTGTTCTGTTTTTTTTTTCTTCTTATTACACT
TGCACACTTAAGTGACTCCGTATGAAGTATGTCCATTGTCTTTCAACTAGTTTGTTCACT
TTTGATTTTGTTTTGAAAACTTCTCCAGCTAATGAAC
G

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR2AV90TF 439 0 0
G
GAGTTCCAAACATAAAATTCAATGTCGCTAAGGTGCTTCAGTCCCTTATTCCAATAGTGG
ATCAATCGGTGGTAGAGAAGACGATTCGTCCAGGGCTTGTGGAGCTAAGCGAGGATCCAG
ATGTTGATGTGAGGTATTTTGCCAACGAAGCTCTTCAATCTATTGATAATGTGATGATGT
CTTAGCTAAAAAAAAGGAAAACTTTTAGATCTTGTCTGTCTCTGTGTTGTTTTCTGTTTG
ATGCAAAAGTTATGAAATCTCGAGACTTTGTAACGTAAGTAGTGGAGGGAAATAACTCTT
GTGTTCTGTTTTTTTTTT**TCTTATTACACTTGCACACTTAAGTGACTCCGTATGAAGT
ATGTCCATTGTCTTTCAACTAGTTTGTTCACATTTGATTTTGTTTTGAAAACTTCTCCAG
TTAATGAACATTTTTGGC

QA 2 439 2 439
DS 



AS 1 2

CO CL4103Contig1 387 2 1 U
GGATCGTCTGAGCTTACCAAAACTCCGGTCAAATGGCGATGACGACTGCTACACTCTTCC
ATGCACTTGTTCCTTCCAACAGTTACAAATCCGGAGCTGTTTCCTCTTCGTTCGTCTCAG
TTCCGTCTTCTTCGTCGTCTCTCCAATTCCGCTCGCTCGTCACCGGTGCCGGTGGCAGAA
CAGGGCAAATCGTGTACAAGAAGTTGAGGAGGCAAAGTTTAAAGCACTTGATCTGGCCTC
AAAGCCTGAGGGAACAGGCACCCCAACAAAGGATTTCAAGGCACTTTTCGCTCAAGTTAC
CGCTCGGTTCTAATCTTCTGTTACTCTGTCTTTGTAGCAGAGTCATAGGATTAGAGACTT
CGAGGAATAATAAATACATTTTGTGAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AC64JQ C 1
AF RR2AC64TF U 1
BS 1 387 RR2AC64TF

RD RR2AC64JQ 387 0 0
GGATCGTCTGAGCTTACCAAAACTCCGGTCAAATGGCGATGACGACTGCTACACTCTTCC
ATGCACTTGTTCCTTCCAACAGTTACAAATCCGGAGCTGTTTCCTCTTCGTTCGTCTCAG
TTCCGTCTTTTTCGTCGTCTCTCCAATTCCGCTCGCTCGTCACCGGTGCCGGTGGCAGAA
CAGGGCAAATCGTGTACAAGAAGTTGAGGAGGCAAAGTTTAAAGCACTTGATCTGGCCTC
AAAGCCTGAGGGAACAGGCACCCCAACAAAGGATTTCAAGGCACTTTTCGCTCAAGTTAC
CGCTCGGTTCTAATCTTCTGTTACTCTGTCTTTGTAGCAGAGTCATAGGATTAGAGACTT
CGAGGAATAATAAATACATTTTGTGAG

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR2AC64TF 387 0 0
GGATCGTCTGAGCTTACCAAAACTCCGGTCAAATGGCGATGACGACTGCTACACTCTTCC
ATGCACTTGTTCCTTCCAACAGTTACAAATCCGGAGCTGTTTCCTCTTCGTTCGTCTCAG
TTCCGTCTTCTTCGTCGTCTCTCCAATTCCGCTCGCTCGTCACCGGTGCCGGTGGCAGAA
CAGGGCAAATCGTGTACAAGAAGTTGAGGAGGCAAAGTTTAAAGCACTTGATCTGGCCTC
AAAGCCTGAGGGAACAGGCACCCCAACAAAGGATTTCAAGGCACTTTTCGCTCAAGTTAC
CGCTCGGTTCTAATCTTCTGTTACTCTGTCTTTGTAGCAGAGTCATAGGATTAGAGACTT
CGAGGAATAATAAATACATTTTGTGAG

QA 1 387 1 387
DS 



AS 1 2

CO CL4104Contig1 776 2 3 U
CACACAACTAAGTAGAAGAATAATACAACAAGGATTAGAGATAAACGAAGCAAAGTCCCA
ATGCTTTAAGTAGTAGTAGGAAACAGCAAGGATTAGAGATAAACAAAGCAACGTCCAAAT
GCTTTTAAGTAGTAGTAGAAAACAACACGGATTATAGATACACAAACCAAAGTCTCTCAC
CCTAGGCTTCAGCGTTGACAACAGCACTCGACATTTGCCGAGAAAATGCTGCTTCACTCT
CAAGAAGCCATTCCCTGGCGCAAATCAAAACCTCCACAGTCTCAGGCCTCAAAAACGTCT
TGTACTCATCCATCTCCCTCGGTTCCATGTCAAACACGTAGTCAAAGGCTGTAGCTGAAA
CCGGGATGGAGAGGATGTCTCTAGCCATCTTGCACAACGTCGGGTACTTGAGCTTGTTCT
GTTTCCACCAGTCGAGAACATCAAACTCCTGAACACGAGGAAGCAGCGTTTCGTCAAGGT
ACTGGTCCAGCTCTGACTTGAGGTTCTGCCCTGTTGTCTCCAGTATGTAGTTGTCGAAAT
CAGACAGCCCGTCTGCTTCGGATGCTGGCTTTAGAGGCGCAGGGAGTGCCATGTACTCGT
TGAAGAGCTCGTGGATCCCATCGTCCACGGTCTTGATGTTCTTCCCAGCGTCTTCTCCGA
ATATCTTGGAGAAGCTGAACTCCACTAGCTTCATCTTGAACCGAGGATCCATCACAACCG
CCATCGCCAAGACCAAGCTACACTCCCTCCAGTACTTGTCAACCTTCTCCTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS43JQ U 140
AF RR2FS43TF C 1
BS 1 139 RR2FS43TF
BS 140 432 RR2FS43JQ
BS 433 776 RR2FS43TF

RD RR2FS43JQ 293 0 0
AAACAACACGGATTATAGATACACAAACCAAAGTCTCTCACCCTAGGCTTCAGCGTTGAC
AACAGCACTCGACATTTGCCGAGAAAATGCTGCTTCACTCTCAAGAAGCCATTCCCTGGC
GCAAATCAAAACCTCCACAGTCTCAGGCCTCAAAAACGTCTTGTACTCATCCATCTCCCT
CGGTTCCATGTCAAACACGTAGTCAAAGGCTGTAGCTGAAACCGGGATGGAGAGGATGTC
TCTAGCCATCTTGCACAACGTCGGGTACTTGAGCTTGTTCTGTTTCCACCAGT

QA 1 293 1 293
DS 

RD RR2FS43TF 776 0 0
CACACAACTAAGTAGAAGAATAATACAACAAGGATTAGAGATAAACGAAGCAAAGTCCCA
ATGCTTTAAGTAGTAGTAGGAAACAGCAAGGATTAGAGATAAACAAAGCAACGTCCAAAT
GCTTTTAAGTAGTAGTAGAAAACAACACGGATTATAGATACACAAACCAAAGTCTCTCAC
CCTAGGCTTCAGCGTTGACAACAGCACTCGACATTTGCCGAGAAGATGCTGCTTCACTCT
CAAGAAGCCATTCCCTGGCGCAAATCAGAGCCTCCACAGTCTCAGGCCTCAGAGACGTCT
TGTACTCATCCATCTCCCTCGGTTCCATGTCAAACACGTAGTCAAAGGCTGTAGCTGAGA
CCGGGATGGAGAGGATGTCTCTAGCCATCTTGCACAACGTCGGGTACTTGAGCTTGTTCT
GTTTCCACCAGTCGAGAACATCAAACTCCTGAACACGAGGAAGCAGCGTTTCGTCAAGGT
ACTGGTCCAGCTCTGACTTGAGGTTCTGCCCTGTTGTCTCCAGTATGTAGTTGTCGAAAT
CAGACAGCCCGTCTGCTTCGGATGCTGGCTTTAGAGGCGCAGGGAGTGCCATGTACTCGT
TGAAGAGCTCGTGGATCCCATCGTCCACGGTCTTGATGTTCTTCCCAGCGTCTTCTCCGA
ATATCTTGGAGAAGCTGAACTCCACTAGCTTCATCTTGAACCGAGGATCCATCACAACCG
CCATCGCCAAGACCAAGCTACACTCCCTCCAGTACTTGTCAACCTTCTCCTTCATC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL4105Contig1 744 2 2 U
ATAAATTAGTGACGCTTGTTGTTATAAATAAGATTAAGAATTTGGCACAATATGGTTTCA
AGATGCCATCATAGATCAACGGCTTCCCTTTTTTCTACGTTGAACAGAAAAAAAAAAAAA
AGGAAAGATTAGAGTTTGTTAAGTTAAATACCATCACTAATTCTTAATGACATAAGGTCT
TTGCGGTGTCGCTTTCAGAAGCTTCATCCCGTACATCTTCGGTATAGTCATCTTCCCGGG
ATCCTCGACAAATTTGACAATAGAACCTTTGATATCCTTGATATAACCCTGTAAAAGTCT
CGATTCTCATATCGGGAGAAAGATCTTCAATGCTTTTATTGACAAAGGGGGAAACGCACA
TGAATTGGAGGCTAAAAGGCCTAATGATTTAAGTGAAGCCAAGGCCAGCAGGATCTGCAA
AAGATCGATGGAACCAGCGGCAACCCGATCTTCAATCACGGACCAGAGCTACCATCATCA
ACGAATCTTCAGTGACCATCCCGAACCAGATCTGCGAAAGAGTACGAACGAAAGGCCCAA
CTCCACACCGGACATAACTATACATAAAAATGGGTTTGAATGATGATGGGTTAAAAGCAA
TCTCTACGATTGTTCATGCTCCGATTCAGTTTCTCTCTCCTAATCGTGAATGAAGATAGG
TTAAAACAAGAAACGAAAACCCAACAAATTATCAAAGGTGATTTGTAAAACAAGATAGGA
GTTTTACATTGCTTTATGAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A879TF C 1
AF RR2A879JQ U 24
BS 1 23 RR2A879TF
BS 24 744 RR2A879JQ

RD RR2A879TF 744 0 0
ATAAATTAGTGACGCTTGTTGTTATAAATAAGATTAAGAATTTGGCACAATATGGTTTCA
AGATGCCATCATAGATCAACGGCTTCCCTTTTTTCTACGTTGAACAGAAAAAAAAAAAAA
AGGAAAGATTAGAGTTTGTTAAGTTAAATACCATCACTAATTCTTAATGACATAAGGTCT
TTGCGGTGTCGCTTTCAGAAGCTTCATCCCGTACATCTTCGGTATAGTCATCTTCCCGGG
ATCCTCGACAAATTTGACAATAGAACCTTTGATATCCTTGATATAACCCTGTAAAAGTCT
CGATTCTCATATCGGGAGAAAGATCTTCAATGCTTTTATTGACAAAGGGGGAAACGCACA
TGAATTGGAGGCTAAAAGGCCTAATGATTTAAGTGAAGCCAAGGCCAGCAGGATCTGCAA
AAGATCGATGGAACCAGCGGCAACCCGATCTTCAATCACGGACCAGAGCTACCATCATCA
ACGAATCTTCAGTGACCATCCCGAACCAGATCTGCGAAAGAGTACGAACGAGAGGCCCAA
CTCCACACCGGACATAACTATACATAAAAATGGGTTTGAATGATGATGGGTTAAAAGCAA
TCTCTACGATTGTTCATGCTCCGATTCAGTTTCTCTCTCCTAATCGTGAATGAAGATAGG
TTAAAACAAGAAACGAAAACCCAACAAATTATCAAAGGTGATTTGTAAAACAAGATAGGA
GTTTTACATTGCTTTATGAATCCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2A879JQ 721 0 0
ATAAATAAGATTAAGAATTTGGCACAATATGGTTTCAAGATGCCATCATAGATCAACGGC
TTCCCTTTTTTCTACGTTGAACAGAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGATTAGAGTTTGTTAAG
TTAAATACCATCACTAATTCTTAATGACATAAGGTCTTTGCGGTGTCGCTTTCAGAAGCT
TCATCCCGTACATCTTCGGTATAGTCATCTTCCCGGGATCCTCGACAAATTTGACAATAG
AACCTTTGATATCCTTGATATAACCCTGTAAAAGTCTCGATTCTCATATCGGGAGAAAGA
TCTTCAATGCTTTTATTGACAAAGGGGGAAACGCACATGAATTGGAGGCTAAAAGGCCTA
ATGATTTAAGTGAAGCCAAGGCCAGCAGGATCTGCAAAAGATCGATGGAACCAGCGGCAA
CCCGATCTTCAATCACGGACCAGAGCTACCATCATCAACGAATCTTCAGTGACCATCCCG
AACCAGATCTGCGAAAGAGTACGAACGAAAGGCCCAACTCCACACCGGACATAACTATAC
ATAAAAATGGGTTTGAATGATGATGGGTTAAAAGCAATCTCTACGATTGTTCATGCTCCG
ATTCAGTTTCTCTCTCCTAATCGTGAATGAAGATAGGTTAAAACAAGAAACGAAAACCCA
ACAAATTATCAAAGGTGATTTGTAAAACAAGATAGGAGTTTTACATTGCTTTATGAATCC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL4106Contig1 1126 2 8 U
GGATGTCAACAAGAATCAGCTGATGCATCCTTCCTACAATCCTGCTACTGCTATCTCTGT
AAACATGGTAACAGATGCTGCCTCTGCACGACCTTCAACAATGACGCCACAGGAAAAGCT
AGAAAAACTTAGGCGCAGGCAGCAAATGCAGGCAATGCTTGCTATTCAGAGACAACAGCA
GCAATTTCGTCATCAGGTTCCTGTAGCAGATCAGTCCATTACTCAGAACTGTTGTCAAGA
TAATCCACTCCAGCTTGTTGACAAAACTAATCTTCAAGGGCTAACTGCAATACCTTCCTT
TGATCCTAGTTCATCTCTGGAACTAGATGATCCTGCCAAATTTGCTGCTGCTGTTGATAA
TCCATCAGAATTCTCGGTTCTTTATCGGCTTCAAGATGTTGTAGCAAAGTTAGATATGGG
AACAAGGACTTGTATAAGGGATAGCTTATTCCGGTTGGCTGATAGCGCAGGTCAGAGGCA
TCACGCTGGTGATACATCCCACAGTAATAAGAGTAGCCAGGATGACAGTGAGGTTGTTCC
TAAAGAAAAATCCAGATATAGATATGCAGGGATGCTAGACACAGAAACAGTGACCAATCC
CACAGACAGAACTGTGGCTCATTTGCTCTTTCATAGGCCTTTTGATATGTCTGCGTCAAA
GCATACGGAAGGACTAGAATCACCACCTTCTTCGAAGATGGGAGCTGAAGTAAAAGGGAG
TTTCCCTAGCACAAGAGATAGTCGCATGGATAAGCAGAAAGCAAAAGAGGAAGACATACC
TGCAGGTTCAGTTGCTTTAGGGTATGGATCTAACTCGGGATCCAGTAGCACTGTTGGTGA
GAAGGTTGCTAAAGCATCCCATGGAAACAAAAGAAAGTTGTGAAGTATAGAAGGCTTAGG
TTGCGGTGTTAGAGAGGAGCTTGAGGAAATCTGCAGAGTTGACAACATCTCTCTGCATTG
CTAGAAACAATCTCCTCTTTACTCCTTTCATGTGAAGCTCTTATTCTTGTAATTAGTTGT
TTTGTTTTGTGACTTGCTGAACACCCCCCCCCCTTCTTATTACACTACCTCCATGAGAAC
TACATTTTGGAATACTCGTGTTGTTTGCTTCTATATTTCTCTCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH78TF U 1
AF RR2EH78JQ C 377
BS 1 671 RR2EH78TF
BS 672 672 RR2EH78JQ
BS 673 717 RR2EH78TF
BS 718 718 RR2EH78JQ
BS 719 724 RR2EH78TF
BS 725 725 RR2EH78JQ
BS 726 771 RR2EH78TF
BS 772 1126 RR2EH78JQ

RD RR2EH78TF 776 0 0
GGATGTCAACAAGAATCAGCTGATGCATCCTTCCTACAATCCTGCTACTGCTATCTCTGT
AAACATGGTAACAGATGCTGCCTCTGCACGACCTTCAACAATGACGCCACAGGAAAAGCT
AGAAAAACTTAGGCGCAGGCAGCAAATGCAGGCAATGCTTGCTATTCAGAGACAACAGCA
GCAATTTCGTCATCAGGTTCCTGTAGCAGATCAGTCCATTACTCAGAACTGTTGTCAAGA
TAATCCACTCCAGCTTGTTGACAAAACTAATCTTCAAGGGCTAACTGCAATACCTTCCTT
TGATCCTAGTTCATCTCTGGAACTAGATGATCCTGCCAAATTTGCTGCTGCTGTTGATAA
TCCATCAGAATTCTCGGTTCTTTATCGGCTTCAAGATGTTGTAGCAAAGTTAGATATGGG
AACAAGGACTTGTATAAGGGATAGCTTATTCCGGTTGGCTGATAGCGCAGGTCAGAGGCA
TCACGCTGGTGATACATCCCACAGTAATAAGAGTAGCCAGGATGACAGTGAGGTTGTTCC
TAAAGAAAAATCCAGATATAGATATGCAGGGATGCTAGACACAGAAACAGTGACCAATCC
CACAGACAGAACTGTGGCTCATTTGCTCTTTCATAGGCCTTTTGATATGTCTGCGTCAAA
GCATACGGAAG*ACTAGAATCACCACCTTCTTCGAAGATGGGAGCTGAAGTAAAAGG*AG
TTTCTCTAGCACAAGAGATAGTCGCATGGATAAGCAGAAAGCAAAAGAGGA
GACAT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2EH78JQ 750 0 0
GTTCTTTATCGGCTTCAAGATGTTGTAGCAAAGTTAGATATGGGAACAAGGACTTGTATA
AGGGATAGCTTATTCCGGTTGGCTGATAGCGCAGGTCAGAGGCATCACGCTGGTGATACA
TCCCACAGTAATAAGAGTAGCCAGGATGACAGTGAGGTTGTTCCTAAAGAAAAATCCAGA
TATAGATATGCAGGGATGCTAGACACAGAAACAGTGACCAATCCCACAGACAGAACTGTG
GCTCATTTGCTCTTTCATAGGCCTTTTGATATGTCTGCGTCAAAGCATACGGAAGGACTA
GAATCACCACCTTCTTCGAAGATGGGAGCTGAAGTAAAAGGGAGTTTCCCTAGCACAAGA
GATAGTCGCATGGATAAGCAGAAAGCAAAAGAGGAAGACATACCTGCAGGTTCAGTTGCT
TTAGGGTATGGATCTAACTCGGGATCCAGTAGCACTGTTGGTGAGAAGGTTGCTAAAGCA
TCCCATGGAAACAAAAGAAAGTTGTGAAGTATAGAAGGCTTAGGTTGCGGTGTTAGAGAG
GAGCTTGAGGAAATCTGCAGAGTTGACAACATCTCTCTGCATTGCTAGAAACAATCTCCT
CTTTACTCCTTTCATGTGAAGCTCTTATTCTTGTAATTAGTTGTTTTGTTTTGTGACTTG
CTGAACACCCCCCCCCCTTCTTATTACACTACCTCCATGAGAACTACATTTTGGAATACT
CGTGTTGTTTGCTTCTATATTTCTCTCCTT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL4107Contig1 1066 2 6 U
GGAAGCTCTAATGGCGAAACAGAGTTACTTCTTCTTGTTTCTTTCTCTCGTCTCACTCTG
TTCCTCAACAACTACAACTCATGATGTCTTTGACCCACCAACGGTCTTCCCAACAAACCC
TACAACTACACCACCGGTTACTACATTTCCTCCTGTGACCATAACACCAACAAACCCTAC
CACAACTCTTACCCCTCCGCTCACAACAGTCCCTGCTACACTCACACCACCTGTGACCAA
CCCAGTGACTCAGTATCCTCCAACACAACCCTCAGGGACGGTTCCGGTTCCCGTCATTCC
GCCGCCTTTTACCTCAAACTCTCCTTCGGTTTCAGGTCAAAACTGGTGCGTGGCGAAGCC
CGGAGCCTCTCAAACCTCACTCCAACTAGCTCTTGACTATGCGTGCGGGTTAGGTGGAGC
TGATTGCTCTCAGATACAGCAAGGAGGCAACTGTTATTCGCCTATCAGTCTCCAGAACCA
TGCCTCATTTGCCTTCAACAGCTATTACCAGAAGAACCCTTCTCCACAAAGCTGTGATTT
TGGCGGTGCAGCCTCCGTTGTAAACACCAACCCAAGCACTGGTTCTTGCGTTTACCAGAC
AGGCTCATCAACGCCAACTCCATCAACACAAACAGTGAACCAGCCTCCTGTCACATCAAC
ACCAATAATACCAACAGAAGGCGGGATAATCGGGGTTGGAACTCCACCAGCAGTTTTTAA
CCCGGCGAATCCTTTACCAAACACTATGAACAATCCATTATCAGGAGGTCCTCCGGCGGT
TTACGGGTTTGATGGTTCGCCTAGTGGGAGCAATCCAACATTATCAGACTCTACCTACTT
GCAGCTTCACTTTGGTCACACTGTGGTGGTGACAATGATTCTCCACGCAGTGCTATTTCA
TTAGAAAGTAGAATTATATAGGAGTTGAATTAGTTTTATGAGATAGTGTTCAACAAGCTT
AAGCTCTTAGAGTATCTTACGAAGAAGCTAGGGATGTAAGACATTATAAATTTGTTTGAT
TCAACGCTCATGTTTCGGTTTTGTACAGAAAACTTCCTGTTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA54TF U 1
AF RR2EA54JQ C 314
BS 1 678 RR2EA54TF
BS 679 680 RR2EA54JQ
BS 681 700 RR2EA54TF
BS 701 701 RR2EA54JQ
BS 702 717 RR2EA54TF
BS 718 1066 RR2EA54JQ

RD RR2EA54TF 725 0 0
GGAAGCTCTAATGGCGAAACAGAGTTACTTCTTCTTGTTTCTTTCTCTCGTCTCACTCTG
TTCCTCAACAACTACAACTCATGATGTCTTTGACCCACCAACGGTCTTCCCAACAAACCC
TACAACTACACCACCGGTTACTACATTTCCTCCTGTGACCATAACACCAACAAACCCTAC
CACAACTCTTACCCCTCCGCTCACAACAGTCCCTGCTACACTCACACCACCTGTGACCAA
CCCAGTGACTCAGTATCCTCCAACACAACCCTCAGGGACGGTTCCGGTTCCCGTCATTCC
GCCGCCTTTTACCTCAAACTCTCCTTCGGTTTCAGGTCAAAACTGGTGCGTGGCGAAGCC
CGGAGCCTCTCAAACCTCACTCCAACTAGCTCTTGACTATGCGTGCGGGTTAGGTGGAGC
TGATTGCTCTCAGATACAGCAAGGAGGCAACTGTTATTCGCCTATCAGTCTCCAGAACCA
TGCCTCATTTGCCTTCAACAGCTATTACCAGAAGAACCCTTCTCCACAAAGCTGTGATTT
TGGCGGTGCAGCCTCCGTTGTAAACACCAACCCAAGCACTGGTTCTTGCGTTTACCAGAC
AGGCTCATCAACGCCAACTCCATCAACACAAACAGTGAACCAGCCTCCTGTCACATCAAC
ACCAATAATACCAACAGA**GCGGGATAATCGGGGTTGGA*CTCCACCAGCAGTTTT
AACCCGGC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2EA54JQ 753 0 0
ACTCAAACTCTCTTCGG
TTCAGGTCAAAACTGGTGCGTGGCGAAGCCCGGAGC*TCTCAAACCTCACTCCAACTAGC
TCTTGACTATGCGTGCGGGTTAGGTGGAGCTGATTGCTCTCAGATACAGCAAGGAGGCAA
CTGTTATTCGCCTATCAGTCTCCAGAACCATGCCTCATTTGCCTTCAACAGCTATTACCA
GAAGAACCCTTCTCCACAAAGCTGTGATTTTGGCGGTGCAGCCTCCGTTGTAAACACCAA
CCCAAGCACTGGTTCTTGCGTTTACCAGACAGGCTCATCAACGCCAACTCCATCAACACA
AACAGTGAACCAGCCTCCTGTCACATCAACACCAATAATACCAACAGGAGGCGGGATAAT
CGGGGTTGGAACTCCACCAGCAGTTTTTAACCCGGCGAATCCTTTACCAAACACTATGAA
CAATCCATTATCAGGAGGTCCTCCGGCGGTTTACGGGTTTGATGGTTCGCCTAGTGGGAG
CAATCCAACATTATCAGACTCTACCTACTTGCAGCTTCACTTTGGTCACACTGTGGTGGT
GACAATGATTCTCCACGCAGTGCTATTTCATTAGAAAGTAGAATTATATAGGAGTTGAAT
TAGTTTTATGAGATAGTGTTCAACAAGCTTAAGCTCTTAGAGTATCTTACGAAGAAGCTA
GGGATGTAAGACATTATAAATTTGTTTGATTCAACGCTCATGTTTCGGTTTTGTACAGAA
AACTTCCTGTTGTTTC

QA 18 753 18 753
DS 



AS 1 2

CO CL4108Contig1 1137 2 2 U
GGATTATCATCGATCATTGATCAAAAGAGAAGCTAATTAGTAACAGAATTGCTGATTTGA
AAATGAATGTTTCTTGTTTCTTCTTCATTCAAGTACTATTGTTGTTGTTTCTCTCTTCTT
TTGCTCCAACCAATGCTCAAGGGTTGAAAGTTGGGTTCTATGACAAGACATGTTCCAAAG
CTGAGGCTATTGTTAAGAAGTCTGTCTCCGATGCCATGAAGAATGACCCGACAATTGGAG
CTCCTTTGCTCAGAATGTTCTTCCACGACTGTTTCGTTCGGGGTTGTGAAGGGTCGGTCT
TGCTAGAGCTAAATAACAAAAAGGACGAGAAGAATGCAGCTCCTAACCTCAGCCTTCGAG
GGTTTGAGGTCATAGATAATGTAAAGGCAGCTGTAGAAAAGGAGTGTCCAGGCGTTGTTT
CTTGCTCTGATGTCTTGGCCCTTGTCGCCAGAGATGCAGTTGTAGCGCTTGATGGACCGT
CTTGGGGAGTTGAAACGGGAAGAAGAGACGGTCGAGTTACAAACATCAATGAGGCCAGAG
CGAACTTACCATCACCACTTAATAACATCACTAGCCTTATCAGTCAATTTGATTCTAAAG
GCCTCGACAAGAAAGACCTCGCCGTGCTCTCGGGTGGACACACGGTCGGGCAGGGACACT
GTCCTTTAATCCTTAACCGGTTGTACAATTTCACCGGGAAAGGAGACAGTGACCCGGACT
TAGACACGGAATACGCAGCCACCCTCAGAAAAAGATGCAAGCCCACCGATACAACGACGG
CTCTAGAAATGGATCCAGGAAGCTTCAAAACATTCGATGAGAGCTACTTCAAGCTTGTTT
CACAAAGAAGAGGGTTCTTTCAATTTGATGCAGCTCTTTTAAACAACCAAGAAAATAAGT
CTTACGTTTTCAAGCAAACAAAAAGTTATGGGTCTAGTTTCTCTAAGGATTTTGGTGTCT
CTATGGTGAAGATGGGTCGGATTGGAGTTTTAACTGGTAAGGCCGGGGAAGTTCGGAAGA
AGTGCAGAATGGTTAACTAAGTACAGATCTTCTTGTGAGATTGTGATTATTTGTATTGCA
GTTGTTTGTGTATTTTTTCTTGAAAAATTATGTGTGAAATAAACGTATCAACTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI06TF U 1
AF RR2CI06JQ C 429
BS 1 669 RR2CI06TF
BS 670 1137 RR2CI06JQ

RD RR2CI06TF 669 0 0
GGATTATCATCGATCATTGATCAAAAGAGAAGCTAATTAGTAACAGAATTGCTGATTTGA
AAATGAATGTTTCTTGTTTCTTCTTCATTCAAGTACTATTGTTGTTGTTTCTCTCTTCTT
TTGCTCCAACCAATGCTCAAGGGTTGAAAGTTGGGTTCTATGACAAGACATGTTCCAAAG
CTGAGGCTATTGTTAAGAAGTCTGTCTCCGATGCCATGAAGAATGACCCGACAATTGGAG
CTCCTTTGCTCAGAATGTTCTTCCACGACTGTTTCGTTCGGGGTTGTGAAGGGTCGGTCT
TGCTAGAGCTAAATAACAAAAAGGACGAGAAGAATGCAGCTCCTAACCTCAGCCTTCGAG
GGTTTGAGGTCATAGATAATGTAAAGGCAGCTGTAGAAAAGGAGTGTCCAGGCGTTGTTT
CTTGCTCTGATGTCTTGGCCCTTGTCGCCAGAGATGCAGTTGTAGCGCTTGATGGACCGT
CTTGGGGAGTTGAAACGGGAAGAAGAGACGGTCGAGTTACAAACATCAATGAGGCCAGAG
CGAACTTACCATCACCACTTAATAACATCACTAGCCTTATCAGTCAATTTGATTCTAAAG
GCCTCGACAAGAAAGACCTCGCCGTGCTCTCGGGTGGACACACGGTCGGGCAGGGACACT
GTCCTTTAA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2CI06JQ 709 0 0
GATGTCTTGGCCCTTGTCGCCAGAGATGCAGTTGTAGCGCTTGATGGACCGTCTTGGGGA
GTTGAAACGGGAAGAAGAGACGGTCGAGTTACAAACATCAATGAGGCCAGAGCGAACTTA
CCATCACCACTTAATAACATCACTAGCCTTATCAGTCAATTTGATTTTAAAGGCCTCGAC
AAGAAAGACCTCGCCGTGCTTTCGGGTGGACACACGGTCGGGCAGGGACACTGTCCTTTA
ATCCTTAACCGGTTGTACAATTTCACCGGGAAAGGAGACAGTGACCCGGACTTAGACACG
GAATACGCAGCCACCCTCAGAAAAAGATGCAAGCCCACCGATACAACGACGGCTCTAGAA
ATGGATCCAGGAAGCTTCAAAACATTCGATGAGAGCTACTTCAAGCTTGTTTCACAAAGA
AGAGGGTTCTTTCAATTTGATGCAGCTCTTTTAAACAACCAAGAAAATAAGTCTTACGTT
TTCAAGCAAACAAAAAGTTATGGGTCTAGTTTCTCTAAGGATTTTGGTGTCTCTATGGTG
AAGATGGGTCGGATTGGAGTTTTAACTGGTAAGGCCGGGGAAGTTCGGAAGAAGTGCAGA
ATGGTTAACTAAGTACAGATCTTCTTGTGAGATTGTGATTATTTGTATTGCAGTTGTTTG
TGTATTTTTTCTTGAAAAATTATGTGTGAAATAAACGTATCAACTTGTG

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL4109Contig1 686 2 2 U
GCAGCGATCTCGAAGTTTGTCTCCTTGGAAGTGTGGCTCCTTGTGTGTTGTATGGAAGCA
ATGCAGAGAGGCTTGGGTCTGCTCCTGGAACCTTTTCCAATCACTGCTTGACGTATTTGG
GATTGTACTTTGTCGGCAACTCTTTGTTTGGTTGGAACTGTCTTGCTCCTTGGTTCTCTT
ATTCCAGCCGCTCTGCCATTCGCCGAAGGTTTAACCTTGAGGGAAGCTTTGAGGCGATGA
ACAGGTCATGTGGTTGCTGCGGTAGCTGCATAGAAGACGAGATGCAAAGGGAGCATATGG
AGACGACTTGTGACTTTGTGACGCATGTCCTTTGCCATACATGTGCACTTTGCCAAGAAG
GCCGTGAGATCCGCAGGAAGGTTCTTCACCCTGGTTTCAATGCTCAGTCCACTGTGGTCG
TGCTTCCACCAAGTGAACAAACCATGGGACGTAAGTGAAAAGCTTGCGTTGAGTCATGTG
TCCTAAATAACACTTGTTACATTTGTATACGCACAGTGAGGTGTGAACTATGATGTTTGT
CTTTTGCTTGCTTTTGTCGCATGTTCTTTTCTTTTATTTTCTTTCTTCAACGGATGCAAC
ACATATGTATATCTTTATTGTTACGCACTTCGTTTTGATATGGTAATGTAATATTCAATA
AAGTTTTAAAACTAATCTCCAAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B834JQ C 1
AF RR2B834TF U 51
BS 1 50 RR2B834JQ
BS 51 686 RR2B834TF

RD RR2B834JQ 686 0 0
GCAGCGATCTCGAAGTTTGTCTCCTTGGAAGTGTGGCTCCTTGTGTGTTGTATGGAAGCA
ATGCAGAGAGGCTTGGGTCTGCTCCTGGAACCTTTTCCAATCACTGCTTGACGTATTTGG
GATTGTACTTTGTCGGCAACTCTTTGTTTGGTTGGAACTGTCTTGCTCCTTGGTTCTCTT
ATTCCAGCCGCTCTGCCATTCGCCGAAGGTTTAACCTTGAGGGAAGCTTTGAGGCGATGA
ACAGGTCATGTGGTTGCTGCGGTAGCTGCATAGAAGACGAGATGCAAAGGGAGCATATGG
AGACGACTTGTGACTTTGTGACGCATGTCCTTTGCCATACATGTGCACTTTGCCAAGAAG
GCCGTGAGATCCGCAGGAAGGTTCTTCACCCTGGTTTCAATGCTCAGTCCACTGTGGTCG
TGCTTCCACCAAGTGAACAAACCATGGGACGTAAGTGAAAAGCTTGCGTTGAGTCATGTG
TCCTAAATAACACTTGTTACATTTGTATACGCACAGTGAGGTGTGAACTATGATGTTTGT
CTTTTGCTTGCTTTTGTCGCATGTTCTTTTCTTTTATTTTCTTTCTTCAACGGATGCAAC
ACATATGTATATCTTTATTGTTACGCACTTCGTTTTGATATGGTAATGTAATATTCAATA
AAGTTTTAAAACTAATCTCCAAGTTC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2B834TF 636 0 0
TATGGAAGCAATGCAGAGAGGCTTGGGTCTGCTCCTGGAACCTTTTCCAATCACTGCTTG
ACGTATTTGGGATTGTACTTTGTCGGCAACTCTTTGTTTGGTTGGAACTGTCTTGCTCCT
TGGTTCTCTTATTCCAGCCGCTCTGCCATTCGCCGAAGGTTTAACCTTGAGGGAAGCTTT
GAGGCGATGAACAGGTCATGTGGTTGCTGCGGTAGCTGCATAGAAGACGAGATGCAAAGG
GAGCATATGGAGACGACTTGTGACTTTGTGACGCATGTCCTTTGCCATACATGTGCACTT
TGCCAAGAAGGCCGTGAGATCCGCAGGAAGGTTCTTCACCCTGGTTTCAATGCTCAGTCC
ACTGTGGTCGTGCTTCCACCAAGTGAACAAACCATGGGACGTAAGTGAAAAGCTTGCGTT
GAGTCATGTGTCCTAAATAACACTTGTTACATTTGTATACGCACAGTGAGGTGTGAACTA
TGATGTTTGTCTTTTGCTTGCTTTTGTCGCATGTTCTTTTCTTTTATTTTCTTTCTTCAA
CGGATGCAACACATATGTATATCTTTATTGTTACGCACTTCGTTTTGATATGGTAATGTA
ATATTCAATAAAGTTTTAAAACTAATCTCCAAGTTC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL4110Contig1 631 2 14 U
GGGACGTATAAGAAGTAGCGATGAAAACCGTATCCGTGGACGAAACCAAAAACACGGTGG
TGCTACGAGCCGAGCACCGGGACGAGGAAGGCCGGAAAGCTGTCGATAAATTCGAGCTGA
AGACTCGAAACCCCGACACGATCAAGCAAGTAGAGAAGAAGCTGATGGAGAAAGGCGTCC
AGCGGATGGAGAGACACCCTTCCGACGGGACTCAGATCAAACGTCCGCCGCCGAAGTCCG
GTCACGGCGGGAAGTACACGTGGGAGGGGTCTGATCGGATGGAGGATTACGAGATGCAGC
CAGATCCGCCGGCGATGGACGAAGGTGATCCTAATTACGACGAGGAGAAGATCGGTGGTC
GTGGTGATGACGTGGCGGTGGAGGTTGTGAAAGGTGAGGTTGAGGTGGCGAAGGAAGCGC
CGGGAGGTGTGGCTAGGGTGGAGGTTGATCATGGCTTGATCAGTTCTACTTGAGTTGCTA
GGGGCATGGAAGAAAGTGTTGGGGTAAATGTGAGAAGGAATGGAAACTTTGGGAGTGGTT
TTTAATTTTTTTAGTTTGTGATGTTTTAATGTATTGTTGACGTGGTGGAACGTTATTTGT
GTAAAGAAATAATATTACTGCATTGAAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H835TF U 1
AF RR2FB39TF U 2
BS 1 25 RR2H835TF
BS 26 26 RR2FB39TF
BS 27 37 RR2H835TF
BS 38 38 RR2FB39TF
BS 39 43 RR2H835TF
BS 44 44 RR2FB39TF
BS 45 64 RR2H835TF
BS 65 65 RR2FB39TF
BS 66 103 RR2H835TF
BS 104 104 RR2FB39TF
BS 105 136 RR2H835TF
BS 137 137 RR2FB39TF
BS 138 442 RR2H835TF
BS 443 631 RR2FB39TF

RD RR2H835TF 442 0 0
GGGACGTATAAGAAGTAGCGATGAAGACCGTATCCGTTGACGAGACCAAAAACACGGTGG
TGCTGCGAGCCGAGCACCGGGACGAGGAAGGCCGGAAAGCTGTGGATAAATTCGAGCTGA
AGACTCGAAACCCCGAGACGATCAAGCAAGTAGAGAAGAAGCTGATGGAGAAAGGCGTCC
AGCGGATGGAGAGACACCCTTCCGACGGGACTCAGATCAAACGTCCGCCGCCGAAGTCCG
GTCACGGCGGGAAGTACACGTGGGAGGGGTCTGATCGGATGGAGGATTACGAGATGCAGC
CAGATCCGCCGGCGATGGACGAAGGTGATCCTAATTACGACGAGGAGAAGATCGGTGGTC
GTGGTGATGACGTGGCGGTGGAGGTTGTGAAAGGTGAGGTTGAGGTGGCGAAGGAAGCGC
CGGGAGGTGTGGCTAGGGTGGA

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR2FB39TF 630 0 0
GGGAAACGCATAAGA
AGCGATGAAAACTGTATCGGTGGACGAAACCAAAAACACGGTGGTGCTACGAGCCGAGCG
CCGGGACGAGGAAGGCCGGAAAGCTGTCGATAAATTCGAGCTGAAGACTCGAAACCCCGA
CACGATCAAGCAAGTCGAGAAGAAGCTGATGGAGAAAGGCGTCCAGCGGATGGAGAGGCA
CCCTTCCGACGGGACTCAGATCAAACGTCCGCCGCCGAAGTCCGGTCACGGCGGGAAGTA
CACGTGGGAGGGGTCTGATCGGATGGAGGATTACGAGATGCAGCCAGATCCGCCGGCGAT
GGACGAAGGTGATCCTAATTACGACGAGGAGAAGATCGGTGGTCGTGGTGATGACGTGGC
GGTGGAGGTTGTGAAAGGTGAGGTTGAGGTGGCGAAGGAAGCGCCGGGAGGTGTGGCTAG
GGTGGAGGTTGATCATGGCTTGATCAGTTCTACTTGAGTTGCTAGGGGCATGGAAGAAAG
TGTTGGGGTAAATGTGAGAAGGAATGGAAACTTTGGGAGTGGTTTTTAATTTTTTTAGTT
TGTGATGTTTTAATGTATTGTTGACGTGGTGGAACGTTATTTGTGTAAAGAAATAATATT
ACTGCATTGAAATGT

QA 16 630 16 630
DS 



AS 1 2

CO CL4111Contig1 722 2 21 U
CATGTACACCACATGTTTTTATTTAACGACAATTTTACAAAACATAATCTCATTTGTACA
AAATATTGATATTTTCAATAAAACAAAAACAAAACATAGTTTACGGCATAATTTCCCCCT
AGTACAAGAATAGAATCAAATGACTTGAAAATGGTAAAAGCGCATAAAAAAAGAAAATGA
ATGTACATTGGGTTTGGTCTTAAGATAAAAACATAAACCTTTTACCATAAGCTGGAAGCA
ACAGAGGTGAGCTTCTTCTTTGTCTCCTCTGCCATGTTCTTCAACGAAGACATATCTTGC
TGAGCCTGGAGAGAGAGGCGGTTGATAAGATCACCAGCGGAGAGATCCAGAGGAAAATCT
CCATCATCATCTCCAAACAGAACAGCACTAGAGATTGCTGATGAACCATGGAACTTCTTT
AATGAACTTTTGGCCTCAAGGTCCATGGAGTTGTTCTCGTTACCAAAGTACTGAGCAGAG
GAGATTGATTTTGCGTTAGAGAACTTCTTCCGGGCTTCATCTGTCTCTTGAATTCTTGAG
GAACTTGTGATTGGTTTCTTCTGAAACACGCCTCCTCCGTTCATCTCAAACTCCTCGAAG
AAGCCCGTTGATTTCGGTGGAGCTACATGACCAAACACTTGAGGGCCGTTGCTCATGTAT
TGCTCTCTTGTTTGAACACCGTCCGCGTAATCAAAGCGAGAGGAAAACGATGACCTAGCT
GA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 

AF RR2C378JQ U 6
AF RR2F443JQ U 1
BS 1 158 RR2F443JQ
BS 159 159 RR2C378JQ
BS 160 162 RR2F443JQ
BS 163 163 RR2C378JQ
BS 164 167 RR2F443JQ
BS 168 168 RR2C378JQ
BS 169 215 RR2F443JQ
BS 216 217 RR2C378JQ
BS 218 218 RR2F443JQ
BS 219 219 RR2C378JQ
BS 220 287 RR2F443JQ
BS 288 288 RR2C378JQ
BS 289 293 RR2F443JQ
BS 294 294 RR2C378JQ
BS 295 421 RR2F443JQ
BS 422 422 RR2C378JQ
BS 423 605 RR2F443JQ
BS 606 606 RR2C378JQ
BS 607 614 RR2F443JQ
BS 615 615 RR2C378JQ
BS 616 722 RR2F443JQ

RD RR2C378JQ 714 0 0
ACACCACATGTTTTTATTTAATGACAATTTTACAAAACATAATCTCATTTGTACAAAATA
TTGATATTTTCAATAAAACAAAAACAAAACATAGTTTACGGCATAATTTCCCCCTAGTAC
AAGAATAGAATCAAATGACTTGAAAATGGTAAAAGCGCATAAAAAAAGAAAATGAATGTA
CATTGGGTTTGGTCTTAAGATAAAAACATAAACCTTTTACCATAAGCTGGAAGCAACAGA
GGTGAGCTTCTTCTTTGTCTCCTCTGCCATGTTCTTCAACGAAGACATATCTTGCTGAGC
CTGGAGAGAG**GCGGTTGATAAGATCACCAGCTGAGAGATCCAGAGGAAAATCTCCATC
ATCATCTCCAAACAGATCAGCACTAGAGATTGCTGATGAACCATGGAACTTCTTTAATGT
ACTTTTGGCCTCAAGGTCCATGGAGTTGTTCTCGTTACCAAAGTACTGAGCAGAGGAGAT
TGATTTTGCGTTAGTGAACTTCTTCCGGGCTTCATCTGTCTCTTGAATTCTTGAGGAACT
TGTGATTGGTTTCTTCTGATACACGCCTCCTCCGTTCATCTCAAACTCCTCGAAGAAGCC
CGTTGATTTCGGTGGAGCTACATGACCAAACACTTGAGGGCCGTTGCTCATGTATTGCTC
TCTTGTTTGAACACCGTCCGCGTAATCAAAGCGAGAGGAAAACGATGACCTAGC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2F443JQ 722 0 0
CATGTACACCACATGTTTTTATTTAACGACAATTTTACAAAACATAATCTCATTTGTACA
AAATATTGATATTTTCAATAAAACAAAAACAAAACATAGTTTACGGCATAATTTCCCCCT
AGTACAAGAATAGAATCAAATGACTTGAAAATGGTAAA*GCGTATAAGAAAAGAAAATGA
ATGTACATTGGGTTTGGTCTTAAGATAAAAACATAC*CTTTTTACCATAAGCTGGAAGCA
ACAGAGGTGAGCTTCTTCTTTGTCTCCTCTGCCATGTTCTTCAACGACGACATGTCTTGC
TGAGCCTGGAGAGAGAGGCGGTTGATAAGATCACCAGCGGAGAGATCCAGAGGAAAATCT
CCATCATCATCTCCAAACAGAACAGCACTAGAGATTGCTGATGAACCATGGAACTTCTTT
AGTGAACTTTTGGCCTCAAGGTCCATGGAGTTGTTCTCGTTACCAAAGTACTGAGCAGAG
GAGATTGATTTTGCGTTAGAGAACTTCTTCCGGGCTTCATCTGTCTCTTGAATTCTTGAG
GAACTTGTGATTGGTTTCTTCTGAAACACGCCTCCTCCGTTCATCTCAAACTCCTCGAAG
AAGCCTGTTGATTTTGGTGGAGCTACATGACCAAACACTTGAGGGCCGTTGCTCATGTAT
TGCTCTCTTGTTTGAACACCGTCCGCGTAATCAAAGCGAGAGGAAAACGATGACCTAGCT
GA

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL4112Contig1 1326 2 4 U
GGGAACAACGACCATCTCTCATAGCATACAGATCAAAAACACATCTCCTCCAATCTTCTT
CCTCTGTCTCCAATGGCAACAGAAACCTACACTACCGTGCCAAACCATGACGAGACCGAG
TCAACAGAGTTCGAGAAGCAACTGAAACGGTACCAAGACCTGATCTCCACGTTGCCTCAC
GTGAAAGGCTGGAGGCCCAAAGATCCCCTGATTGGGTACGGTGGTCATTGGTTGATACAG
CCTATCGTCGAAGGTTCCCTTTACGCGCAAGGGTTCTTCCAAGCAGGACCCAGTGACTTC
CTCATCTGTAGCTACCCAAAGACAGGTACCACTTGGCTCAAATCTCTAGCCTTCGTAATA
GCCAACAGATCTCGCTTTGATGATTCCACGAACCCTCTCCTAAAACGTAACCCTCATGAG
CTTATTCCTTTCATTGAGATCGAGTTCCCTTTGTTCCATCAAGTTGAGGGTCTCGAAGAT
GAAGGGAACACTCTGTTCTCAACTCATATGCCATACAAGTTACTACCCGATTCGGTTGTG
AAAACGGGTTGTAAGATGGTTTATATCTGGAGAGACCCAAAGAACACTTTCATCTCCTTG
TGGCATTTCTTCCAAAAGAAAAGGTCAGATAGTGGCCCGCTCATTAGTTTTGAGGAGTCT
TTTGATATGTTCTGTCAAGGTTTTTCTGCCTACGGCCCTTATCTTGATCATGTCCTGGCA
TATTGGAAAGCTCACCAAGAGAATCCAGATCAGATTTTGTTCCTTAAGTATGAGACTCTG
AGTGCTGATCCTTTGCCTCACGTGAAGAAATTGGCTGAGTTCATGGGTTATGGATTTACA
ACTGAGGAAGAGAAAAACGGGGTTGTTGAGAAAGTTGTGAATCTTTGCAGTTTCGAGACG
TTGAAGAATCTTGAAGCTAACAAAGGAGATAAAGAGAGAGAAGATCATTCTTCTCCTTTT
ACAAATAGCGCGTATTTCAGGAAAGGAAAGATCGGAGATTGGGAAAATTATCTGACTCCA
GACATGGCAGCTCGTATGGATAGGATAATGGAAGAGAAAGTAAAGGGTACTGATTTGCTT
GAAAATGGTAAATGAGCTGTTTCTTGTTCGGGGAATGACTGTCCTTGCATGCTTGTTTAA
AATATGTTTGTTCCTCTTTTCACGCTTATTCTATTTGATGAATAAAATTTGTTTCTGTCT
CATGTCAATGTACTATCAATAAAAAAAAGAATTGGCTTTGCATTATATGGTGCATGAATG
TACTGGCTATATTAAAAAGGAATGGAATTTTTATGGGGTGAACGGCCACATCATGCATAA
GATAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI42TF U 1
AF RR2BI42JQ C 453
BS 1 805 RR2BI42TF
BS 806 806 RR2BI42JQ
BS 807 840 RR2BI42TF
BS 841 1326 RR2BI42JQ

RD RR2BI42TF 852 0 0
GGGAACAACGACCATCTCTCATAGCATACAGATCAAAAACACATCTCCTCCAATCTTCTT
CCTCTGTCTCCAATGGCAACAGAAACCTACACTACCGTGCCAAACCATGACGAGACCGAG
TCAACAGAGTTCGAGAAGCAACTGAAACGGTACCAAGACCTGATCTCCACGTTGCCTCAC
GTGAAAGGCTGGAGGCCCAAAGATCCCCTGATTGGGTACGGTGGTCATTGGTTGATACAG
CCTATCGTCGAAGGTTCCCTTTACGCGCAAGGGTTCTTCCAAGCAGGACCCAGTGACTTC
CTCATCTGTAGCTACCCAAAGACAGGTACCACTTGGCTCAAATCTCTAGCCTTCGTAATA
GCCAACAGATCTCGCTTTGATGATTCCACGAACCCTCTCCTAAAACGTAACCCTCATGAG
CTTATTCCTTTCATTGAGATCGAGTTCCCTTTGTTCCATCAAGTTGAGGGTCTCGAAGAT
GAAGGGAACACTCTGTTCTCAACTCATATGCCATACAAGTTACTACCCGATTCGGTTGTG
AAAACGGGTTGTAAGATGGTTTATATCTGGAGAGACCCAAAGAACACTTTCATCTCCTTG
TGGCATTTCTTCCAAAAGAAAAGGTCAGATAGTGGCCCGCTCATTAGTTTTGAGGAGTCT
TTTGATATGTTCTGTCAAGGTTTTTCTGCCTACGGCCCTTATCTTGATCATGTCCTGGCA
TATTGGAAAGCTCACCAAGAGAATCCAGATCAGATTTTGTTCCTTAAGTATGAGACTCTG
AGTGCTGATCCTTTGCCTCACGTGA*GAAATTGGCTGAGTTCATGGGTTATGGATTTACA
CTGAGAGAGAAA

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2BI42JQ 874 0 0
GTTCCATCAAGTTGAGGGTCTCGAAGATGAAGGGAACACTCTGTTCTCAACTCATATGCC
ATACAAGTTACTACCCGATTCGGTTGTGAAAACGGGTTGTAAGATGGTTTATATCTGGAG
AGACCCAAAGAACACTTTCATCTCCTTGTGGCATTTCTTCCAAAAGAAAAGGTCAGATAG
TGGCCCGCTCATTAGTTTTGAGGAGTCTTTTGATATGTTCTGTCAAGGTTTTTCTGCCTA
CGGCCCTTATCTTGATCATGTCCTGGCATATTGGAAAGCTCACCAAGAGAATCCAGATCA
GATTTTGTTCCTTAAGTATGAGACTCTGAGTGCTGATCCTTTGCCTCACGTGAAGAAATT
GGCTGAGTTCATGGGTTATGGATTTACAACTGAGGAAGAGAAAAACGGGGTTGTTGAGAA
AGTTGTGAATCTTTGCAGTTTCGAGACGTTGAAGAATCTTGAAGCTAACAAAGGAGATAA
AGAGAGAGAAGATCATTCTTCTCCTTTTACAAATAGCGCGTATTTCAGGAAAGGAAAGAT
CGGAGATTGGGAAAATTATCTGACTCCAGACATGGCAGCTCGTATGGATAGGATAATGGA
AGAGAAAGTAAAGGGTACTGATTTGCTTGAAAATGGTAAATGAGCTGTTTCTTGTTCGGG
GAATGACTGTCCTTGCATGCTTGTTTAAAATATGTTTGTTCCTCTTTTCACGCTTATTCT
ATTTGATGAATAAAATTTGTTTCTGTCTCATGTCAATGTACTATCAATAAAAAAAAGAAT
TGGCTTTGCATTATATGGTGCATGAATGTACTGGCTATATTAAAAAGGAATGGAATTTTT
ATGGGGTGAACGGCCACATCATGCATAAGATAAT

QA 1 874 1 874
DS 



AS 1 2

CO CL4113Contig1 1368 2 8 U
GCTGAACCCGCCACCAAAATCTCTTGTGGATTTGAAAGCTCATGATCACCAACTCACCCT
TCTTCCACGACTCGATTCTTTCACATGTAATGCTTGCGGCCTCAAGGGAGATCGAAGCCC
TTACGCATGCTTTATTTGTGGTTTCATGATCCATAAACAATGCCTTATCCTTCCACGTGT
CATTAACATCAATCGCCATGATCACCGTGTTTCTCGTACTTCGGTTCTTGGTGACGGTGC
TATGAATTCTGTGTGTGGAGTTTGTCGGAAGAAGGTGGATTGGACTTGTGGTGGGTTTTC
TTGTCAGAGGTGTCCTGCCTATGTCGTTCATTCTCGCTGTGCTACAAGATATGATGTGTG
GAACGAAAAAGAACTAGAAGGAGTACCTGAAGAAGAAGAAGATGTAGAACCATATGTGGT
GATAGATGAATTCACAATACAACATTTCAGCCACAAAGAACATCATCTAAGACTTAGTGG
GAATGGTATGCTGTATGAGGATAACAAACGATGCAATGCATGCACCCATCACATCGGTCT
CCAATCCTTTTATGGATGTATGGATTGTGATTTTTCTCTCCATCAGAAGTGTGCTAAATG
CCCTAAAAAGAAATGGCATGTGCTACACAACGAACGGCTCACTTTAGTTACAGACAAGGA
GCCAGATGCCTTCAGATGTCATGCTTGCAGTCGAAGGTCCAATGGTTTCATGTACAAGCA
AGGGGATAAGGAGTTAGATGTGTTGTGCGGTTCGATTTATGAGCCATTTGTCCAGACAAG
TCATCCCCACCATCCATTATACTACCTTCCAACAGAAGAACTTACAAAAAGATGCAATGG
TTGCAACCGATGCGATCCACGTTTGTTAAGGTGCATTGAAGGTGATTGTGGATTTGTATT
GTGCTTCACCTGGGCCACTTTACCACAAGTGATAAAACACAGAGTAGACGATTATCCTTT
CTCACTATGCTATGGAGATGAAGAGGCAAGTGGTAAATACTGGAGTGACATTTGTGAGAG
AGAAACCAATCCAAAGGAATGGTTTTACACTTGTAAAGACCATCGGGGTAGTTTGCATAC
GGAATGTGTGCTGGGTGAATTTACGGGGCTCATGCCAAGAAGGGTAGTAAAATATTTGGA
GACATTGTATGAGGTGGTGCTGAATAATAGGGTAACTCGCCCATTTTGCAAACCGTGTAA
GTCTCGTTGCATGTACCCTATCATCCTCAAGTTGCTTGGAACCTCAGGGACATACCTTTG
CTTTATTGCTTGGGTATATGCACATTGTTTCGATTATGAATCGTTAAAAGTATAAAAAGT
GTAATTAAATATGTTCATGGAGGCAAGATATTTATCCGTTTTTAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F213TF U 1
AF RR2F213JQ C 665
BS 1 696 RR2F213TF
BS 697 697 RR2F213JQ
BS 698 730 RR2F213TF
BS 731 731 RR2F213JQ
BS 732 772 RR2F213TF
BS 773 773 RR2F213JQ
BS 774 783 RR2F213TF
BS 784 1368 RR2F213JQ

RD RR2F213TF 783 0 0
GCTGAACCCGCCACCAAAATCTCTTGTGGATTTGAAAGCTCATGATCACCAACTCACCCT
TCTTCCACGACTCGATTCTTTCACATGTAATGCTTGCGGCCTCAAGGGAGATCGAAGCCC
TTACGCATGCTTTATTTGTGGTTTCATGATCCATAAACAATGCCTTATCCTTCCACGTGT
CATTAACATCAATCGCCATGATCACCGTGTTTCTCGTACTTCGGTTCTTGGTGACGGTGC
TATGAATTCTGTGTGTGGAGTTTGTCGGAAGAAGGTGGATTGGACTTGTGGTGGGTTTTC
TTGTCAGAGGTGTCCTGCCTATGTCGTTCATTCTCGCTGTGCTACAAGATATGATGTGTG
GAACGAAAAAGAACTAGAAGGAGTACCTGAAGAAGAAGAAGATGTAGAACCATATGTGGT
GATAGATGAATTCACAATACAACATTTCAGCCACAAAGAACATCATCTAAGACTTAGTGG
GAATGGTATGCTGTATGAGGATAACAAACGATGCAATGCATGCACCCATCACATCGGTCT
CCAATCCTTTTATGGATGTATGGATTGTGATTTTTCTCTCCATCAGAAGTGTGCTAAATG
CCCTAAAAAGAAATGGCATGTGCTACACAACGAACGGCTCACTTTAGTTACAGACAAGGA
GCCAGATGCCTTCAGATGTCATGCTTGCAGTCGAAG*TCCAATGGTTTCATGTACAAGCA
AGGGGATAAG*AGTTAGATGTGTTGTGCGGTTCGATTTATGAGCCATTTGTC*AGACAAG
TCA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2F213JQ 704 0 0
GATGCCTTCAGATGTCATGCTTGCAGTCGAAGGTCCAATGGTTTCATGTACAAGCAAGGG
GATAAGGAGTTAGATGTGTTGTGCGGTTCGATTTATGAGCCATTTGTCCAGACAAGTCAT
CCCCACCATCCATTATACTACCTTCCAACAGAAGAACTTACAAAAAGATGCAATGGTTGC
AACCGATGCGATCCACGTTTGTTAAGGTGCATTGAAGGTGATTGTGGATTTGTATTGTGC
TTCACCTGGGCCACTTTACCACAAGTGATAAAACACAGAGTAGACGATTATCCTTTCTCA
CTATGCTATGGAGATGAAGAGGCAAGTGGTAAATACTGGAGTGACATTTGTGAGAGAGAA
ACCAATCCAAAGGAATGGTTTTACACTTGTAAAGACCATCGGGGTAGTTTGCATACGGAA
TGTGTGCTGGGTGAATTTACGGGGCTCATGCCAAGAAGGGTAGTAAAATATTTGGAGACA
TTGTATGAGGTGGTGCTGAATAATAGGGTAACTCGCCCATTTTGCAAACCGTGTAAGTCT
CGTTGCATGTACCCTATCATCCTCAAGTTGCTTGGAACCTCAGGGACATACCTTTGCTTT
ATTGCTTGGGTATATGCACATTGTTTCGATTATGAATCGTTAAAAGTATAAAAAGTGTAA
TTAAATATGTTCATGGAGGCAAGATATTTATCCGTTTTTAGTTT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4115Contig1 804 2 3 U
CTTTTCATTATTTTCCATTATTTAATCAAATAACTTTAGTTATGCGATTATGAAATGCAT
GCACAAAATATTTTTTAATTAAACATACACTTAAAATAAGATTTTTAGTGTAAATCCAAT
CAAATAATCCAAACCACACAAATACACATCTTCAAATAAAGAAATTGGGTGCGTATATAT
AAATTTTACAAAACAAATAAATAAAAAGAAAAGAAATCCGTTTTATTTCTTTAGTTCCGA
ACTCCATATATAGCAGCGATATAGAGAAGTTGTGTCGCTGAAAGTATTATCAGAAATGCC
TCCATTGTCCTCAGGCGGGCATTTCTCATCCCAAGTTCAATTTCCTTGCATCCAAATCCC
ATGGCTAGAACTGTAAGAGACCAAGCAATCATGGCAGCAGAGACAGCTGCCGGAAGACTA
GCTGTAGTCCAGGACTGGAGATGACTGACACCGGAGATAACAGAGGCTGCTCCAGCAACT
CCGGCAATTAAAGCAAACATCACAAAGAATCCAGTGGCCGCATTGCCCATCGGAAAATAT
ATGGGCGAAAAATGAGCGGGAAGACTGAAATCCGCACCAATAGGGAAGCCATGGCTGATA
GCTTTGTTCATGGACCATGCTCCAATTCCGAGAACAATGGCGTACATGCAGAAATTCAGG
AGTAGAAGCAAAGAGGCCACTGGTTTCATCTGCTGTTCCGCCATTTTTTCTTGTCACCCT
AGACAAGAACAATCTAGAGCTATGTATTTTTTTGTCTGAAAAGTCATATTTGAAGTTAAG
ATCTTCACAATGTTGGATGTGTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH93JQ U 2
AF RR2BH93TF C 1
BS 1 1 RR2BH93TF
BS 2 770 RR2BH93JQ
BS 771 804 RR2BH93TF

RD RR2BH93JQ 769 0 0
TTTTCATTATTTTCCATTATTTAATCAAATAACTTTAGTTATGCGATTATGAAATGCATG
CACAAAATATTTTTTAATTAAACATACACTTAAAATAAGATTTTTAGTGTAAATCCAATC
AAATAATCCAAACCACACAAATACACATCTTCAAATAAAGAAATTGGGTGCGTATATATA
AATTTTACAAAACAAATAAATAAAAAGAAAAGAAATCCGTTTTATTTCTTTAGTTCCGAA
CTCCATATATAGCAGCGATATAGAGAAGTTGTGTCGCTGAAAGTATTATCAGAAATGCCT
CCATTGTCCTCAGGCGGGCATTTCTCATCCCAAGTTCAATTTCCTTGCATCCAAATCCCA
TGGCTAGAACTGTAAGAGACCAAGCAATCATGGCAGCAGAGACAGCTGCCGGAAGACTAG
CTGTAGTCCAGGACTGGAGATGACTGACACCGGAGATAACAGAGGCTGCTCCAGCAACTC
CGGCAATTAAAGCAAACATCACAAAGAATCCAGTGGCCGCATTGCCCATCGGAAAATATA
TGGGCGAAAAATGAGCGGGAAGACTGAAATCCGCACCAATAGGGAAGCCATGGCTGATAG
CTTTGTTCATGGACCATGCTCCAATTCCGAGAACAATGGCGTACATGCAGAAATTCAGGA
GTAGAAGCAAAGAGGCCACTGGTTTCATCTGCTGTTCCGCCATTTTTTCTTGTCACCCTA
GACAAGAACAATCTAGAGCTATGTATTTTTTTGTCTGAAAAGTCATATT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2BH93TF 804 0 0
CTTTTCATTATTTTCCATTATTTAATCAAATAACTTTAGTTATGCGATTATGAAATGCAT
GCACAAAATATTTTTTAATTAAACATACACTTAAAATAAGATTTTTAGTGTAAATCCAAT
CAAATAATCCAAACCACACAAATACACATCTTCAAATAAAGAAATTGGGTGCGTATATAT
AAATTTTACAAAACAAATAAATAAAAAGAAAAGAAATCCGTTTTATTTCTTTAGTTCCGA
ACTCCATATATAGCAGCGATATAGAGAAGTTGTGTCGCTGAAAGTATTATCAGAAATGCC
TCCATTGTCCTCAGGCGGGCATTTCTCATCCCAAGTTCAATTTCCTTGCATCCAAATCCC
ATGGCTAGAACTGTAAGAGACCAAGCAATCATGGCAGCAGAGACAGCTGCCGGAAGACTA
GCTGTAGTCCAGGACTGGAGATGACTGACACCGGAGATAACAGAGGCTGCTCCAGCAACT
CCGGCAATTAAAGCAAACATCACAAAGAATCCAGTGGCCGCATTGCCCATCGGAAAATAT
ATGGGCGAAAAATGAGCGGGAAGACTGAAATCCGCACCAATAGGGAAGCCATGGCTGATA
GCTTTGTTCATGGACCATGCTCCAATTCCGAGAACAATGGCGTACATGCAGAAATTCAGG
AGTAGAAGCAAAGAGGCCACTGGTTTCATCTGCTGTTCCGCCATTTTTTCTTGTCACCCT
AGACAAGAACAATCTAGAGCTATGTATTTTTTTGTCTGAAAAGTCATATTTGAAGTTAAG
ATCTTCACAATGTTGGATGTGTCC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4117Contig1 1107 2 2 U
GGAACAAGGGAGGAAAAGGGAGATCGGGTTTACTTTCTCCTTCCCCGTGCATCAAACCTC
CATTGACTCAGGAACGCTTATCAAGTGGACTAAAGGCTTTAACGTGTCTGGAATGGAAGG
TAAAAACGTGGTTGCCTGTTTAAATGAAGCTATGGAAGAACATGGACTTGATATGCGAGT
TTCTGCTCTCGTAAATGATGGAGTGGGAACATTAGCTGGAGCAAGGTATTGGGACAAGGA
TGTGATGGCCGGTGTGATTCTTGGCACTGGGACAAACGCTTGTTATGTTGAGCAGAAGAA
TGCAATTCCTAAACTCCAAAACAAATCTTCTTCTGGCACAACGATCATCAACACAGAGTG
GGGAGGTTTCTCTAAGTGTCTTCCACGGGCCATTTTTGACCAAGAGATGGATAAGGAAAG
CTTAAATCCTGGTGAACATTTATATGAGAAGATGATCTCAGGGATGTACCTTGGTGAAAT
TGTAAGGAGGGTTTTGCTTCATATGTTTAAAGCTGGTGAATTGTTCGGACAATCAGTTCC
TGTCAAACTATGCACTCCTTTTGCAATCAAGAGCCAGGATCTATGCAAATTGCAGGAGGA
CAATACCGATGATCTTTCAAGTGTTGGATCAATCCTATACAACATTTTTGAGGTAGAGGC
GGATCTGAAGGCGAGGAGGATAGTGGTGGACGTGTGTGACACAGTAGTGAAACGCGGAGG
ACGTCTAGCAGGAGCTGGTATAGTGGCAATTCTGGAGAGGATTGAGAGAGAGACAAAAAG
ACTGGCTTCGGGTCAAAGAACCGTTGTGGCTATGGACGGTGCACTTTACGAGAAGTACCC
GCAGTATCGACAGTATATGCAAGATGCACTAGTTGAGCTTCTTGGTGATGACCTTGCAAG
GCACGTTCATATTAAACATACCAAAGATGTTTCTGGGCTTGGTGCTGCTCTTGGCCGCTA
CTAACTCCATTTATTTGTAGTTGCACGTCTACTTCGTGAGTAAAAGTCTTGGTCCGATAC
TGCTGCTCTTCTTTTTCTTTTTTCTAATCTCTTTTTACTTCATGAGTTAAACACGCATTA
TGTTATCTCTAATATATAAGAATTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D334TF U 1
AF RR2D334JQ C 328
BS 1 711 RR2D334TF
BS 712 1107 RR2D334JQ

RD RR2D334TF 714 0 0
GGAACAAGGGAGGAAAAGGGAGATCGGGTTTACTTTCTCCTTCCCCGTGCATCAAACCTC
CATTGACTCAGGAACGCTTATCAAGTGGACTAAAGGCTTTAACGTGTCTGGAATGGAAGG
TAAAAACGTGGTTGCCTGTTTAAATGAAGCTATGGAAGAACATGGACTTGATATGCGAGT
TTCTGCTCTCGTAAATGATGGAGTGGGAACATTAGCTGGAGCAAGGTATTGGGACAAGGA
TGTGATGGCCGGTGTGATTCTTGGCACTGGGACAAACGCTTGTTATGTTGAGCAGAAGAA
TGCAATTCCTAAACTCCAAAACAAATCTTCTTCTGGCACAACGATCATCAACACAGAGTG
GGGAGGTTTCTCTAAGTGTCTTCCACGGGCCATTTTTGACCAAGAGATGGATAAGGAAAG
CTTAAATCCTGGTGAACATTTATATGAGAAGATGATCTCAGGGATGTACCTTGGTGAAAT
TGTAAGGAGGGTTTTGCTTCATATGTTTAAAGCTGGTGAATTGTTCGGACAATCAGTTCC
TGTCAAACTATGCACTCCTTTTGCAATCAAGAGCCAGGATCTATGCAAATTGCAGGAGGA
CAATACCGATGATCTTTCAAGTGTTGGATCAATCCTATACAACATTTTTGAGGTAGAGGC
GGATCTGAAGGCGAGGAGGATAGTGGTGGACGTGTGTGACACAGTAGTGAA
CGC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2D334JQ 780 0 0
TTCTTCTGGCACAACGATCATCAACACAGAGTGGGGAGGTTTCTCTAAGTGTCTTCCACG
GGCCATTTTTGACCAAGAGATGGATAAGGAAAGCTTAAATCCTGGTGAACATTTATATGA
GAAGATGATCTCAGGGATGTACCTTGGTGAAATTGTAAGGAGGGTTTTGCTTCATATGTT
TAAAGCTGGTGAATTGTTCGGACAATCAGTTCCTGTCAAACTATGCACTCCTTTTGCAAT
CAAGAGCCAGGATCTATGCAAATTGCAGGAGGACAATACCGATGATCTTTCAAGTGTTGG
ATCAATCCTATACAACATTTTTGAGGTAGAGGCGGATCTGAAGGCGAGGAGGATAGTGGT
GGACGTGTGTGACACAGTAGTGAAACGCGGAGGACGTCTAGCAGGAGCTGGTATAGTGGC
AATTCTGGAGAGGATTGAGAGAGAGACAAAAAGACTGGCTTCGGGTCAAAGAACCGTTGT
GGCTATGGACGGTGCACTTTACGAGAAGTACCCGCAGTATCGACAGTATATGCAAGATGC
ACTAGTTGAGCTTCTTGGTGATGACCTTGCAAGGCACGTTCATATTAAACATACCAAAGA
TGTTTCTGGGCTTGGTGCTGCTCTTGGCCGCTACTAACTCCATTTATTTGTAGTTGCACG
TCTACTTCGTGAGTAAAAGTCTTGGTCCGATACTGCTGCTCTTCTTTTTCTTTTTTCTAA
TCTCTTTTTACTTCATGAGTTAAACACGCATTATGTTATCTCTAATATATAAGAATTGTT

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL4118Contig1 1135 2 2 U
GGATTCACGTGTCAAAAAAACCAAAAAAAAACTCAACCCCTCACTCACTCACTTCCGGCG
ATGTATCGAACGGCGGCGAAACGTCTTCTCGGAGCTGGTTTCGCAACCAGCCGCCTCCTC
CGATTGCCCAAGCCCAGGCCCACCACCTTCATCATCCCTTACTCCTACACTTCCTCCTCG
ATGGGCCACACCGAATCTCCTCCGATTGGTAATCAATCCGTAAACCCTAATCAACCGGAT
CCCACTTCTTCCACGGATACACGAGAAGGGCCTCGTCGAGACGAGAGCAGCAGGAAGCCG
AGAGCTGAGTTTCAGGAAGAGCAGGCCCGTGTCCTCGCCGCCTCCCTTCGCCACGTGCCG
AGGTTAGGTTGGACGGAGGAAGCGATGATTGCAGGCTCGAGAGAAGCCGGTGTGTCTCCT
TCCATTGTTGGCTCTTTCTCCAGGAAAGAAGCTGCTCTTGTTGAGTACTTCATGGATGAA
TGCTTGCAACTGCTTATCGACAGAGTAGACTCTGGTTTGGATCTTCAAAACTTGATTCCG
AGTGAACGTGTTTCTAAGCTCGTTAGGATTCGATTGGAGATGCAGATCCCTTACATGTCC
AAATGGCCTCAAGCTCTTAGTATTCAAGCGCATCCGGCGAATGTTCCGACGAGTTTTAGG
CAACGGGCGATGTTGGTTGATGAGATATGGCACACTGTTGGAGATGGAGCTTCTGATTTG
GATTGGTATGTCAAGCGTACTGTTCTTGGAGGTGTTTACTCAACCACCGAGATTTACATG
CTTACTGATGACTCCCCAGAGTATCGCGATACATGGGCGTTCTTGGATGATAGAGTCAAA
GATGCTTTTGATTTGAAGAAGAGCATACAAGAGGCAAAGTATTTTGCACAAGACATTGGA
GCTGGAGTTGGAAAATCGTTTCAAGGACTGATGAATGGAGTTATGCAGACCATGTCCAGA
AGAGGTGGTAGCTCTGCTTTTTGAAGAAAGATCATCACACCTTTACACAATAAAAGATGC
TTCATCCTTTTAAGATGATTATCTAGTACTTTGAGTTTGAGATACGCTCTAATAATATTA
TGATATTAGTATGTATGACCTGAAGTTATAAACTATTTACTCAACACGAGTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ18TF U 1
AF RR2AJ18JQ C 271
BS 1 657 RR2AJ18TF
BS 658 1135 RR2AJ18JQ

RD RR2AJ18TF 657 0 0
GGATTCACGTGTCAAAAAAACCAAAAAAAAACTCAACCCCTCACTCACTCACTTCCGGCG
ATGTATCGAACGGCGGCGAAACGTCTTCTCGGAGCTGGTTTCGCAACCAGCCGCCTCCTC
CGATTGCCCAAGCCCAGGCCCACCACCTTCATCATCCCTTACTCCTACACTTCCTCCTCG
ATGGGCCACACCGAATCTCCTCCGATTGGTAATCAATCCGTAAACCCTAATCAACCGGAT
CCCACTTCTTCCACGGATACACGAGAAGGGCCTCGTCGAGACGAGAGCAGCAGGAAGCCG
AGAGCTGAGTTTCAGGAAGAGCAGGCCCGTGTCCTCGCCGCCTCCCTTCGCCACGTGCCG
AGGTTAGGTTGGACGGAGGAAGCGATGATTGCAGGCTCGAGAGAAGCCGGTGTGTCTCCT
TCCATTGTTGGCTCTTTCTCCAGGAAAGAAGCTGCTCTTGTTGAGTACTTCATGGATGAA
TGCTTGCAACTGCTTATCGACAGAGTAGACTCTGGTTTGGATCTTCAAAACTTGATTCCG
AGTGAACGTGTTTCTAAGCTCGTTAGGATTCGATTGGAGATGCAGATCCCTTACATGTCC
AAATGGCCTCAAGCTCTTAGTATTCAAGCGCATCCGGCGAATGTTCCGACGAGTTTT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2AJ18JQ 865 0 0
CCTCGTCGAGACGAGAGCAGCAGGAAGCCGAGAGCTGAGTTTCAGGAAGAGCAGGCCCGT
GTCCTCGCCGCCTCCTTTCGCCACGTGCCGAGGTTAGGTTGGACGGAGGAAGCGATGATT
GCAGGCTCGAGAGAAGCCGGTGTGTCTCCTTCCATTGTTGGCTCTTTCTCCAGGAAAGAA
GCTGCTCTTGTTGAGTACTTCATGGATGAATGCTTGCAACTGCTTATCGACAGAGTAGAC
TCTGGTTTGGATCTTCAAAACTTGATTCCGAGTGAACGTGTTTCTAAGCTCGTTAGGATT
CGATTGGAGATGCAGATCCCTTACATGTCCAAATGGCCTCAAGCTCTTAGTATTCAAGCG
CATCCGGCGAATGTTCCGACGAGTTTTAGGCAACGGGCGATGTTGGTTGATGAGATATGG
CACACTGTTGGAGATGGAGCTTCTGATTTGGATTGGTATGTCAAGCGTACTGTTCTTGGA
GGTGTTTACTCAACCACCGAGATTTACATGCTTACTGATGACTCCCCAGAGTATCGCGAT
ACATGGGCGTTCTTGGATGATAGAGTCAAAGATGCTTTTGATTTGAAGAAGAGCATACAA
GAGGCAAAGTATTTTGCACAAGACATTGGAGCTGGAGTTGGAAAATCGTTTCAAGGACTG
ATGAATGGAGTTATGCAGACCATGTCCAGAAGAGGTGGTAGCTCTGCTTTTTGAAGAAAG
ATCATCACACCTTTACACAATAAAAGATGCTTCATCCTTTTAAGATGATTATCTAGTACT
TTGAGTTTGAGATACGCTCTAATAATATTATGATATTAGTATGTATGACCTGAAGTTATA
AACTATTTACTCAACACGAGTCACG

QA 1 865 1 865
DS 



AS 1 2

CO CL4119Contig1 1208 2 2 U
GCCTGATCCTCGACGTGGCCAACAACACCCTCCAAGGACCTTACCGTGCTTTCTTGGCCG
ACCTAGCCGCAGGAGACGCTAAAAGAACGCGAGTCGCAAACGCGTTTTTCTCTTTCTTAT
GGCGGTTGGAAACGTTTTGGGATACGCGGCTGGTTCTTTCACTAACCTACATAAAATGTT
CCCTTTCGCTATGACCAATGCATGCGATATTTACTGCGCTAATCTCAAGAGCTGCTTCTT
CTTGTCCATCACACTCCTCCTCCTCGTCACCATCACGTCTCTTTGGTACGTACAAGACAA
ACAATGGTCTCCCCCGCCGGTAGCCGCCGGAGAGGAGACTAAGAGTGTTCCTTTCTTTGG
AGAAATCTTTGGTGCTTTTAGAGTCATGGAACGTCCCATGTGGATGCTTCTTATCGTCAC
GGCGCTAAACTGGATCGCATGGTTCCCGTTTCTTTTGTTCGATACTGATTGGATGGGTCG
TGAAGTGTACGGTGGAGACTCGGAAGGAAACGATAGGCTGAAGCAGATATACAACAAGGG
AGTGCAGTCTGGTGCATTGGGGCTTATGTTTAACTCTATCGTTCTTGGTTTCATGTCACT
TGGTGTTGAGTGGATTGGTAAGAAAGTGGGTGGAGCTAAAAAGCTTTGGGGTATTGTTAA
TTTCATTCTTGCCGTTGGTTTGGCCATGACGGTTCTCGTCACGAAATTGGCGGCGGATTA
CCGGAAAGTTGCGGGTCCTTATGCCGGACCGTCGCCTGGTATTAGAGCTGGAGCTTTAAG
TCTCTTCGCTGTTCTTGGTATTCCATTAGCTATTACTTTCAGTATTCCGTCTGCATTAGC
CTCCATATTTTCAAGCAGCTCCGGTGTCGGCCAAGGACTTTCGTTAGGAGTTTTGAATTT
GGCAATTGTGATACCCCAAATGATAGTATCACTAGGGGGAGGACCTTTCGACGCCCTTTT
TGGCGGTGGAAACTTACCGGCGTTTATAGTCGGAGCAATCGCAGCGGCGGTCAGTGGAGT
ATTAGCTATAACTGTTTTACCTTCACCACCACCGGACGCACCTAGCTTGAAGACAGGAGC
CATGGGATTCCATTAGTTTATATTATGTTTTATTTTCTTTATGAAACTCGTGATCAAATA
CAGTACTATTGCGCAAAACTGCAAGACCCAAAAGCAAAAAATAGAAAAGAACAGAAGATG
ATAAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP64TF U 1
AF RR2AP64JQ C 355
BS 1 739 RR2AP64TF
BS 740 1208 RR2AP64JQ

RD RR2AP64TF 739 0 0
GCCTGATCCTCGACGTGGCCAACAACACCCTCCAAGGACCTTACCGTGCTTTCTTGGCCG
ACCTAGCCGCAGGAGACGCTAAAAGAACGCGAGTCGCAAACGCGTTTTTCTCTTTCTTAT
GGCGGTTGGAAACGTTTTGGGATACGCGGCTGGTTCTTTCACTAACCTACATAAAATGTT
CCCTTTCGCTATGACCAATGCATGCGATATTTACTGCGCTAATCTCAAGAGCTGCTTCTT
CTTGTCCATCACACTCCTCCTCCTCGTCACCATCACGTCTCTTTGGTACGTACAAGACAA
ACAATGGTCTCCCCCGCCGGTAGCCGCCGGAGAGGAGACTAAGAGTGTTCCTTTCTTTGG
AGAAATCTTTGGTGCTTTTAGAGTCATGGAACGTCCCATGTGGATGCTTCTTATCGTCAC
GGCGCTAAACTGGATCGCATGGTTCCCGTTTCTTTTGTTCGATACTGATTGGATGGGTCG
TGAAGTGTACGGTGGAGACTCGGAAGGAAACGATAGGCTGAAGCAGATATACAACAAGGG
AGTGCAGTCTGGTGCATTGGGGCTTATGTTTAACTCTATCGTTCTTGGTTTCATGTCACT
TGGTGTTGAGTGGATTGGTAAGAAAGTGGGTGGAGCTAAAAAGCTTTGGGGTATTGTTAA
TTTCATTCTTGCCGTTGGTTTGGCCATGACGGTTCTCGTCACGAAATTGGCGGCGGATTA
CCGGAAAGTTGCGGGTCCT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2AP64JQ 854 0 0
CTTTGGAGAAATCTTTGGTGCTTTTAGAGTCATGGAACGTCCCATGTGGATGCTTCTTAT
CGTCACGGCGCTAAACTGGATCGCATGGTTCCCGTTTCTTTTGTTCGATACTGATTGGAT
GGGTCGTGAAGTGTACGGTGGAGACTCGGAAGGAAACGATAGGCTGAAGCAGATATACAA
CAAGGGAGTGCAGTCTGGTGCATTGGGGCTTATGTTTAACTCTATCGTTCTTGGTTTCAT
GTCACTTGGTGTTGAGTGGATTGGTAAGAAAGTGGGTGGAGCTAAAAGGCTTTGGGGTAT
TGTTAATTTCATTCTTGCCGTTGGTTTGGCCATGACGGTTCTCGTCACGAAATTGGCGGC
GGATTACCGGAAAGTTGCGGGTCCTTATGCCGGACCGTCGCCTGGTATTAGAGCTGGAGC
TTTAAGTCTCTTCGCTGTTCTTGGTATTCCATTAGCTATTACTTTCAGTATTCCGTCTGC
ATTAGCCTCCATATTTTCAAGCAGCTCCGGTGTCGGCCAAGGACTTTCGTTAGGAGTTTT
GAATTTGGCAATTGTGATACCCCAAATGATAGTATCACTAGGGGGAGGACCTTTCGACGC
CCTTTTTGGCGGTGGAAACTTACCGGCGTTTATAGTCGGAGCAATCGCAGCGGCGGTCAG
TGGAGTATTAGCTATAACTGTTTTACCTTCACCACCACCGGACGCACCTAGCTTGAAGAC
AGGAGCCATGGGATTCCATTAGTTTATATTATGTTTTATTTTCTTTATGAAACTCGTGAT
CAAATACAGTACTATTGCGCAAAACTGCAAGACCCAAAAGCAAAAAATAGAAAAGAACAG
AAGATGATAAAGTC

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 2

CO CL4120Contig1 922 2 2 U
GATCACTTTCTCCTTCTCAATCATTGTAATCCAGACAAATTCAGACATCGTAATTGCACC
AGATTGTCAAGAGACGTTCATCTAAAGAAAACACCTTCTGCAAGAAAAGTGCTTCTGGGA
GACAGGTAAGAAACTGCATTTGCCCGAGATCAACCACAGCACTCGAGAGATACTACAAAA
GTAAACGGTAAATCAGAAAACAATCATAGTTTCAAATGAGCAAGTGTATAACTAAAGGGG
AAAACATAACTGTTGTTTTATTCACCAACCATGTATAGCTTCGATAAACGATTGCAGATT
TGAAGCGTCAGTGATTCATGTTATTTATTGAAGAAAGAGATTACAAATTAGTGCTGCACA
AAAAAAAAAAACTCACTGAGCTGCTTATTGGGTTATGCTCTGATTCTTTACCGGCGGAGA
GATTGTATCAAGAAAAAACGAGGTGATTTGGGCAAGCATCAGCAATGACTAAAGCTCTGA
AAATGATTGCTGGTGAAGTTTACGGCTGGGCACGGTGCTCTCTGCATCAGTGGAAATTCA
TCTAATCAAAGGCCACTTGCTTAGATGTTGATGCCATAATCTTCCACGTGTTATATTATT
TTTTCTTGGGTAAAAATGTTAAGACGTTGTTTTACAAAAAAAAAAAATGTTAAGACGTTT
TATATTATTGTTATAATGGTTATGACTTATGAGTATGGATATGGGCTTTGGATTATGGCA
TTTAGTTTGTCACTAACATGCTTAATATCTTTTTCTTTTTGTAAAAGTACATGCATGCTC
AACATCATTACTTTAGAATTTAGATAAAACTGTTATGTAGAAGTTCTAAGAATAAGATAA
GTGCATATATGATCATGTGTTCTCCAGAAATTGTACAAGGGAATCATTTATCAAATCTAA
TATATCAACTAATAATTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G447TF U 1
AF RR2G447JQ C 519
BS 1 610 RR2G447TF
BS 611 922 RR2G447JQ

RD RR2G447TF 610 0 0
GATCACTTTCTCCTTCTCAATCATTGTAATCCAGACAAATTCAGACATCGTAATTGCACC
AGATTGTCAAGAGACGTTCATCTAAAGAAAACACCTTCTGCAAGAAAAGTGCTTCTGGGA
GACAGGTAAGAAACTGCATTTGCCCGAGATCAACCACAGCACTCGAGAGATACTACAAAA
GTAAACGGTAAATCAGAAAACAATCATAGTTTCAAATGAGCAAGTGTATAACTAAAGGGG
AAAACATAACTGTTGTTTTATTCACCAACCATGTATAGCTTCGATAAACGATTGCAGATT
TGAAGCGTCAGTGATTCATGTTATTTATTGAAGAAAGAGATTACAAATTAGTGCTGCACA
AAAAAAAAAAACTCACTGAGCTGCTTATTGGGTTATGCTCTGATTCTTTACCGGCGGAGA
GATTGTATCAAGAAAAAACGAGGTGATTTGGGCAAGCATCAGCAATGACTAAAGCTCTGA
AAATGATTGCTGGTGAAGTTTACGGCTGGGCACGGTGCTCTCTGCATCAGTGGAAATTCA
TCTAATCAAAGGCCACTTGCTTAGATGTTGATGCCATAATCTTCCACGTGTTATATTATT
TTTTCTTGGG

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2G447JQ 404 0 0
TTTT
TGCATCAGTGGAAATTCATTTAATCAAAGGCCACTTGCTTAGATGTTGATGCCATAATTT
TCCACGTGTTATATTATTTTTTTTTGGGTAAAAATGTTAAGACGTTGTTTTACAAAAAAA
AAAAATGTTAAGACGTTTTATATTATTGTTATAATGGTTATGACTTATGAGTATGGATAT
GGGCTTTGGATTATGGCATTTAGTTTGTCACTAACATGCTTAATATCTTTTTCTTTTTGT
AAAAGTACATGCATGCTCAACATCATTACTTTAGAATTTAGATAAAACTGTTATGTAGAA
GTTCTAAGAATAAGATAAGTGCATATATGATCATGTGTTCTCCAGAAATTGTACAAGGGA
ATCATTTATCAAATCTAATATATCAACTAATAATTTTCTC

QA 5 404 5 404
DS 



AS 1 2

CO CL4121Contig1 1244 2 4 U
GGGATTAGACCATATTTCAGAACACTGCTTAAAGTTAAAACTGACTCTGTCTCCCTCCCT
CTCTCTTTTTATGTAATAACGAAACAGATTTGATGGTAAACTAATGCTAGAGAAGCTCCG
GGACAAGAGGCTGGTCTTTGTTGGGGACTCAATAGGAAGAAACCAATGGGAGTCTCTTCT
CTGCTTACTATCTTCTGCAGTCAAGAACGAGAGCTCGGTTTATGAAGTGAATGGAAGTCC
CATCACAAAGCACACAGGTTACTTAGTGTTCAGATTCAAGGACTACAATTGCACAGTGGA
GTACTACAGATCACCATTCTTGGTTCCTCAAACCAGACCACCGGCAAGATCAGCCAATAA
AGTTAAGACAACTTTGAAACTGGACACTATGGATTGGACTTCTAGCAAATGGAGAGATGC
AGATGTTTTAGTGCTCAATACTGGACATTTGTGGAACTATGGGAAGACTATTAGAATGTA
AGTTTGTTACAATGTCTCTCATCTTTGATCATTTTAATCTGATCATGAAATGATGTTGTG
ACTAACAGGGGATGCTATTTTCAAGAAGGAGAAGAAGTGAAGCTTAAGATGAGTGTAGAT
GATGCTTATAAGCGAGCTATGGAGACTGTTATGAAATGGATTCAAACGGAGGTTGATTCA
GACAAAACGCAAGTCTTCTTCCGCTCATACGCTCCTGTGCATTTCAGGGGAGGAGATTGG
AGAACAGGATGAACATGTCTCATGGAGACATTGCCTGAGATGGGAACCACCTCATTGGTT
TCGTCAGAGACGTGGAACCAGTTAAAGATCCTGGGAGATGCGTTATCACGTTACTCCAAC
AGATCAGAGACCGTTGAAGTGAAAGTGTTGAACATAACAGCAATGTCTGTTCAAAGAAAA
GATGGTCACCCGTCTCTTTACTATCTTGGCTCGCGTGGTCCTGCGCCGCTTCATCGCCAA
GACTGTAGCCACTGGTGCCTTCCTGGTGTTCCTGATACTTGGAACGAACTCATGTATACG
TTGTTTATGAAACAAGGAAGAGCCAAAGAAGCAAATGGTACAGGAAATGTCACAATGTCA
TGAACCCTGCCGTTTTCCTGAAGATGCTGAGCTCAAAGATCAAAAAGGGTTTTGGATTTT
TTTTTATTATTAGATTAATTGGGTGGGGTTATGTAATTAGGTTGATAATCTTAATCTCTG
GTTGTAAAGATAGAAAAATCTCAGATATATTCAAAGTTTCATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO86TF U 1
AF RR2EO86JQ C 378
BS 1 765 RR2EO86TF
BS 766 766 RR2EO86JQ
BS 767 775 RR2EO86TF
BS 776 1244 RR2EO86JQ

RD RR2EO86TF 776 0 0
GGGATTAGACCATATTTCAGAACACTGCTTAAAGTTAAAACTGACTCTGTCTCCCTCCCT
CTCTCTTTTTATGTAATAACGAAACAGATTTGATGGTAAACTAATGCTAGAGAAGCTCCG
GGACAAGAGGCTGGTCTTTGTTGGGGACTCAATAGGAAGAAACCAATGGGAGTCTCTTCT
CTGCTTACTATCTTCTGCAGTCAAGAACGAGAGCTCGGTTTATGAAGTGAATGGAAGTCC
CATCACAAAGCACACAGGTTACTTAGTGTTCAGATTCAAGGACTACAATTGCACAGTGGA
GTACTACAGATCACCATTCTTGGTTCCTCAAACCAGACCACCGGCAAGATCAGCCAATAA
AGTTAAGACAACTTTGAAACTGGACACTATGGATTGGACTTCTAGCAAATGGAGAGATGC
AGATGTTTTAGTGCTCAATACTGGACATTTGTGGAACTATGGGAAGACTATTAGAATGTA
AGTTTGTTACAATGTCTCTCATCTTTGATCATTTTAATCTGATCATGAAATGATGTTGTG
ACTAACAGGGGATGCTATTTTCAAGAAGGAGAAGAAGTGAAGCTTAAGATGAGTGTAGAT
GATGCTTATAAGCGAGCTATGGAGACTGTTATGAAATGGATTCAAACGGAGGTTGATTCA
GACAAAACGCAAGTCTTCTTCCGCTCATACGCTCCTGTGCATTTCAGGGGAGGAGATTGG
AGAACAGGATGAACATGTCTCATGGAGACATTGCCTGAGATGGGA*CCACCTCAT
G

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2EO86JQ 867 0 0
AAACT
GACACTATGGATTGGACTTCTAGCAAATG*AGAGATGCAGATGTTTTAGTGCTCAATACT
GGACATTTGTGGAACTATGGGAAGACTATTAGAATGTAAGTTTGTTACAATGTCTCTCAT
CTTTGATCATTTTAATCTGATCATGAAATGATGTTGTGACTAACAGGGGATGCTATTTTC
AAGAAGGAGAAGAAGTGAAGCTTAAGATGAGTGTAGATGATGCTTATAAGCGAGCTATGG
AGACTGTTATGAAATGGATTCAAACGGAGGTTGATTCAGACAAAACGCAAGTCTTCTTCC
GCTCATACGCTCCTGTGCATTTCAGGGGAGGAGATTGGAGAACAGGATGAACATGTCTCA
TGGAGACATTGCCTGAGATTGGAACCACCTCATTGGTTTCGTCAGAGACGTGGAACCAGT
TAAAGATCCTGGGAGATGCGTTATCACGTTACTCCAACAGATCAGAGACCGTTGAAGTGA
AAGTGTTGAACATAACAGCAATGTCTGTTCAAAGAAAAGATGGTCACCCGTCTCTTTACT
ATCTTGGCTCGCGTGGTCCTGCGCCGCTTCATCGCCAAGACTGTAGCCACTGGTGCCTTC
CTGGTGTTCCTGATACTTGGAACGAACTCATGTATACGTTGTTTATGAAACAAGGAAGAG
CCAAAGAAGCAAATGGTACAGGAAATGTCACAATGTCATGAACCCTGCCGTTTTCCTGAA
GATGCTGAGCTCAAAGATCAAAAAGGGTTTTGGATTTTTTTTTATTATTAGATTAATTGG
GTGGGGTTATGTAATTAGGTTGATAATCTTAATCTCTGGTTGTAAAGATAGAAAAATCTC
AGATATATTCAAAGTTTCATAG

QA 6 867 6 867
DS 



AS 1 2

CO CL4122Contig1 1188 2 2 U
AGTTGGAGTAGAGAGAAGAGCGGAACCAGTGTTAGCAATCTGCAAACCTGAGCCGTCTGC
TATCATCACATCTTCACCTCCCGTGTATGGTTGATGAAGTGCGAGATTATTGAGATCGGT
GGTGATGTGGTGTGTAGCACCAGAGTCAAGGATCCAGCTATGTGGGTCATACATCGGAGC
AGCAACCATATTTGCACGAGGTTGCCATGGAGCAAGCTGCTGCTGTTGCGAGTAGGCGCC
AGTCATCTGCTGTTGGAGTTGAGAACACGTACGGGCACTGTGTCCATGAACTCCGCAAAT
TTGACAACGGCCTAGATAAGGACGTGGTGTGTGCTTCGGACGAGCGGAGAAGGAAGGTTG
CTGCTGGTACTGAGGCTGTGATTGATGTCCTCTGTAGTTACTCCTCTGTTGATGACCTCT
GTTGTTGTTGCGTCCACGATAAGCAACAGAGTTTGCAGTGACGGGTGGTGTCGTGGTGAC
CGCAGCAGCCGACGATTGCAGCTTAGCTTCATAGTTTATCAACTTCTCATGAACCTCAGT
GAGAGAGGGAGGCGTGTCGCGGCCTTCCAACTGATCAGCAACCGTTTTGTACTCTGCAGG
GAGCCCATCGAGGATTGCTTCCAGCTGATCCTCTTGGTCAAGTGTTTTGCCAAGAAGCGC
CAACTGATCGAAACGAGTGGTCAGGCCTTGGATGTATTCATCGATTGGCTTTGTACCTTT
CGACCAGTTCTTGATCTGTTGTCGGATCTGTTGAATATGGCCCCGGCTTGGTTTAGCGTA
GGTGGACTCGAGCGTACTCCAGATTTCTGCAGCCGTAGTGGCCTTCGAGAGTAAGGGCTG
GATGGTGTTTGAAATCGCACCAATGAGACCACTGTAGAGAAGCTTATCCTGACGTTTACA
GAGTGTGTATGATGCGTTAGCAGTGACGACGTCATTGACAGTCTCTGTTGGTGGTGGGAC
GATGACCGATCCATCAAGGTAGCCTGAGAGATCGTATCCGTCGAGTAGGGAGTGCACCTG
ACGACTCCACATGATATAGTTGGAGGTGGTAAGCTTGGTGATATTTGCCATGTTCACATT
GAGAAGAACAGGATCCCCGGAGACATTGATAGTCTCTGCAGATGTAGCCGGCGAGAGCGA
CATATGTGTCGAAGAAGAAGAAGTTTTGATGAAAAACTTGTGGCGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC76TF U 1
AF RR2BC76JQ C 325
BS 1 705 RR2BC76TF
BS 706 1188 RR2BC76JQ

RD RR2BC76TF 705 0 0
AGTTGGAGTAGAGAGAAGAGCGGAACCAGTGTTAGCAATCTGCAAACCTGAGCCGTCTGC
TATCATCACATCTTCACCTCCCGTGTATGGTTGATGAAGTGCGAGATTATTGAGATCGGT
GGTGATGTGGTGTGTAGCACCAGAGTCAAGGATCCAGCTATGTGGGTCATACATCGGAGC
AGCAACCATATTTGCACGAGGTTGCCATGGAGCAAGCTGCTGCTGTTGCGAGTAGGCGCC
AGTCATCTGCTGTTGGAGTTGAGAACACGTACGGGCACTGTGTCCATGAACTCCGCAAAT
TTGACAACGGCCTAGATAAGGACGTGGTGTGTGCTTCGGACGAGCGGAGAAGGAAGGTTG
CTGCTGGTACTGAGGCTGTGATTGATGTCCTCTGTAGTTACTCCTCTGTTGATGACCTCT
GTTGTTGTTGCGTCCACGATAAGCAACAGAGTTTGCAGTGACGGGTGGTGTCGTGGTGAC
CGCAGCAGCCGACGATTGCAGCTTAGCTTCATAGTTTATCAACTTCTCATGAACCTCAGT
GAGAGAGGGAGGCGTGTCGCGGCCTTCCAACTGATCAGCAACCGTTTTGTACTCTGCAGG
GAGCCCATCGAGGATTGCTTCCAGCTGATCCTCTTGGTCAAGTGTTTTGCCAAGAAGCGC
CAACTGATCGAAACGAGTGGTCAGGCCTTGGATGTATTCATCGAT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2BC76JQ 864 0 0
TGGTGTGTGCTTCGGACGAGCGGAGAAGGAAGGTTGCTGCTGGTACTGAGGCTGTGATTG
ATGTCCTCTGTAGTTACTCCTCTGTTGATGACCTCTGTTGTTGTTGCGTCCACGATAAGC
AACAGAGTTTGCAGTGACGGGTGGTGTCGTGGTGACCGCAGCAGCCGACGATTGCAGCTT
AGCTTCATAGTTTATCAACTTCTCATGAACCTCAGTGAGAGAGGGAGGCGTGTCGCGGCC
TTCCAACTGATCAGCAACCGTTTTGTACTCTGCAGGGAGCCCATCGAGGATTGCTTCCAG
CTGATCCTCTTGGTCAAGTGTTTTGCCAAGAAGCGCCAACTGATCGAAACGAGTGGTCAG
GCCTTGGATGTATTCATCGATTGGCTTTGTACCTTTCGACCAGTTCTTGATCTGTTGTCG
GATCTGTTGAATATGGCCCCGGCTTGGTTTAGCGTAGGTGGACTCGAGCGTACTCCAGAT
TTCTGCAGCCGTAGTGGCCTTCGAGAGTAAGGGCTGGATGGTGTTTGAAATCGCACCAAT
GAGACCACTGTAGAGAAGCTTATCCTGACGTTTACAGAGTGTGTATGATGCGTTAGCAGT
GACGACGTCATTGACAGTCTCTGTTGGTGGTGGGACGATGACCGATCCATCAAGGTAGCC
TGAGAGATCGTATCCGTCGAGTAGGGAGTGCACCTGACGACTCCACATGATATAGTTGGA
GGTGGTAAGCTTGGTGATATTTGCCATGTTCACATTGAGAAGAACAGGATCCCCGGAGAC
ATTGATAGTCTCTGCAGATGTAGCCGGCGAGAGCGACATATGTGTCGAAGAAGAAGAAGT
TTTGATGAAAAACTTGTGGCGGCT

QA 1 864 1 864
DS 



AS 1 2

CO CL4123Contig1 442 2 1 U
GGAAGATCCTGTTCTTGACAAGATTGATGAGGAGCTTCTTAACCGAGGTTTTGGGATGCC
TACACCTGGTGGGTGGTGTATCGGGAGCCACGAAAACGGGAGTGACCCTTGTGCTGTTAT
TGGTGATACTGATGTTATCAGGCCTGGTCCAGGTGCTAGACGGCTGGAGAGTCTTGTTAC
TTCGCTGTTATCGGCTGAGAATTTTCGACCAAAACAATGCAAGTAAATCACATTGCAGAA
CATCACAGAGATTGATGTAGCAGCTTTTTGGGAGTAGATGTGATTTAGGATCTGATTGAA
TCTCTCTTTTAGTCAAAGAGTATAAGTGAGGACACTGAACAGTTTAGGCTTTGGCTCTTG
GGAAGCATATTATAACAGATTAATGTATTGTTGTAGTTATCACATTTTCACCCATTTTTC
ATATTGCAATTTTGAGATTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AY44JQ C 1
AF RR2AY44TFB U 1
BS 1 442 RR2AY44TFB

RD RR2AY44JQ 442 0 0
GGAAGATCCTGTTCTTGACAAGATTGATGAGGAGCTTTTTAACCGAGGTTTTGGGATGCC
TACACCTGGTGGGTGGTGTATCGGGAGCCACGAAAACGGGAGTGACCCTTGTGCTGTTAT
TGGTGATACTGATGTTATCAGGCCTGGTCCAGGTGCTAGACGGCTGGAGAGTCTTGTTAC
TTCGCTGTTATCGGCTGAGAATTTTCGACCAAAACAATGCAAGTAAATCACATTGCAGAA
CATCACAGAGATTGATGTAGCAGCTTTTTGGGAGTAGATGTGATTTAGGATCTGATTGAA
TCTCTCTTTTAGTCAAAGAGTATAAGTGAGGACACTGAACAGTTTAGGCTTTGGCTCTTG
GGAAGCATATTATAACAGATTAATGTATTGTTGTAGTTATCACATTTTCACCCATTTTTC
ATATTGCAATTTTGAGATTTTC

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR2AY44TFB 442 0 0
GGAAGATCCTGTTCTTGACAAGATTGATGAGGAGCTTCTTAACCGAGGTTTTGGGATGCC
TACACCTGGTGGGTGGTGTATCGGGAGCCACGAAAACGGGAGTGACCCTTGTGCTGTTAT
TGGTGATACTGATGTTATCAGGCCTGGTCCAGGTGCTAGACGGCTGGAGAGTCTTGTTAC
TTCGCTGTTATCGGCTGAGAATTTTCGACCAAAACAATGCAAGTAAATCACATTGCAGAA
CATCACAGAGATTGATGTAGCAGCTTTTTGGGAGTAGATGTGATTTAGGATCTGATTGAA
TCTCTCTTTTAGTCAAAGAGTATAAGTGAGGACACTGAACAGTTTAGGCTTTGGCTCTTG
GGAAGCATATTATAACAGATTAATGTATTGTTGTAGTTATCACATTTTCACCCATTTTTC
ATATTGCAATTTTGAGATTTTC

QA 1 442 1 442
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4125Contig1 1325 2 4 U
GGGAGATTCCTTTAACATTATCACATTCAGTGATGATACTTCTCTGTTTTCAACCTCAAT
GGAGTTGGTTACTCCAGATGCTGTTGAAAGAGGCGTAGAGTGGATGAAGAAGAACTTTCT
TGTCAAAGATGGTACCAACATGCTCCCTCCCCTAGAGAAGGCTGTGGAAATGCTTTCGAA
TACACGTGGCTCCGTTCCTATGATCTTCTTCGTAACAGATGGGTCTGTTGAAGACGAGAG
ACACATTTGTAATGTAATGAAGAAACGTCTTGCTAGTGGTGGATCAGTGTCTCCACGGAT
ACAAACTTTTGGGTTAGGTGTATTCTGTAATCACTACTTCTTACAAACGCTTGCAAATCT
ATCTAGGGGCCAGCATGAATCAGTTTATAATACAGATCACATAGAGGAACGGTTAGAAAA
ATTGTTTACAAGGGCTTTATCTACTGTTCTTTTGAATATAACAATAGAGCCCCTGCAGAA
TCTTGATGAAGTTGAGGTATACCCTTCGAATATTCCTGATCTAACGTCCTCAAGACCATT
GATGATATATGGGAGGTACAGAGGAAAGTTCCCTGAGAATGTGAAAGCCAATGGTCTGCT
AGGAGATTTTAGCAGCTTCTCTGTAGAGCTGACTGTACAAAGTGCAAAAGACATGCCTCT
TGATAAAGTGTTTGCAAAGAATGTCATTGACTTGCTTACTGCTGAGGCATGGTTCTTGGA
AGACAAACAGCTCAAAGAAAAGATTAGTAAACTAAGCATCCAAACCGGCGTACCATCTGA
GTATACTAGAATGATCCAACTAGACAACACGGAAGAAGCATCAAAGCCAATGACACTGGC
GTAAAGAAAAATACAGCGAGCAACGGCGAGAAACAGAAGATGATATCAAGAACAATCCCG
CTGCAAAACTTTGGGATAGGCTTTGGTGATATTACGGCTACCAGAGAGAATGTTCCACCA
GGATATGGAGAGCAGAGAGAGCCTGATGCCGCTGAGAAGTTCGTGAAGGCTGCTTCGAGC
TGTTGCGTCTCCTTGTGCAACAAATGTTGCTGCATGTGCTGTGTCCAATGCTGCACTAAG
CTCAATGATCAATGTGTCCTTGTCTTCACGCAGCTCTTCACAGCGCTTGCTTGCATCGCT
TGCTATGAGTGTTGCACAAATGTTTGCTGTGCATGTGGTGGAGAGGACTAGTCATATAAA
AAAAAATGGTTTTGAATTCGAGTGTAAAGTTTTAAAAAGCTTCAAAGTAAGTTTGTATAG
TTACGTTTACACACACTACATGTAATTTCTGTACGGCCTGGTCATATATAAAAAAGCTTT
ACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2CE60TF U 1
AF RR2CE60JQ C 577
BS 1 706 RR2CE60TF
BS 707 707 RR2CE60JQ
BS 708 744 RR2CE60TF
BS 745 1325 RR2CE60JQ

RD RR2CE60TF 746 0 0
GGGAGATTCCTTTAACATTATCACATTCAGTGATGATACTTCTCTGTTTTCAACCTCAAT
GGAGTTGGTTACTCCAGATGCTGTTGAAAGAGGCGTAGAGTGGATGAAGAAGAACTTTCT
TGTCAAAGATGGTACCAACATGCTCCCTCCCCTAGAGAAGGCTGTGGAAATGCTTTCGAA
TACACGTGGCTCCGTTCCTATGATCTTCTTCGTAACAGATGGGTCTGTTGAAGACGAGAG
ACACATTTGTAATGTAATGAAGAAACGTCTTGCTAGTGGTGGATCAGTGTCTCCACGGAT
ACAAACTTTTGGGTTAGGTGTATTCTGTAATCACTACTTCTTACAAACGCTTGCAAATCT
ATCTAGGGGCCAGCATGAATCAGTTTATAATACAGATCACATAGAGGAACGGTTAGAAAA
ATTGTTTACAAGGGCTTTATCTACTGTTCTTTTGAATATAACAATAGAGCCCCTGCAGAA
TCTTGATGAAGTTGAGGTATACCCTTCGAATATTCCTGATCTAACGTCCTCAAGACCATT
GATGATATATGGGAGGTACAGAGGAAAGTTCCCTGAGAATGTGAAAGCCAATGGTCTGCT
AGGAGATTTTAGCAGCTTCTCTGTAGAGCTGACTGTACAAAGTGCAAAAGACATGCCTCT
TGATAAAGTGTTTGCAAAGAATGTCATTGACTTGCTTACTGCTGAG*CATGGTTCTTGGA
AGACAAACAGCTCAAAGAAAAGAT
AG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2CE60JQ 749 0 0
GAATGTGAAAGCCAATGGTCTGCTAGGAGATTTTAGCAGCTTCTCTGTAGAGCTGACTGT
ACAAAGTGCAAAAGACATGCCTCTTGATAAAGTGTTTGCAAAGAATGTCATTGACTTGCT
TACTGCTGAGGCATGGTTCTTGGAAGACAAACAGCTCAAAGAAAAGATTAGTAAACTAAG
CATCCAAACCGGCGTACCATCTGAGTATACTAGAATGATCCAACTAGACAACACGGAAGA
AGCATCAAAGCCAATGACACTGGCGTAAAGAAAAATACAGCGAGCAACGGCGAGAAACAG
AAGATGATATCAAGAACAATCCCGCTGCAAAACTTTGGGATAGGCTTTGGTGATATTACG
GCTACCAGAGAGAATGTTCCACCAGGATATGGAGAGCAGAGAGAGCCTGATGCCGCTGAG
AAGTTCGTGAAGGCTGCTTCGAGCTGTTGCGTCTCCTTGTGCAACAAATGTTGCTGCATG
TGCTGTGTCCAATGCTGCACTAAGCTCAATGATCAATGTGTCCTTGTCTTCACGCAGCTC
TTCACAGCGCTTGCTTGCATCGCTTGCTATGAGTGTTGCACAAATGTTTGCTGTGCATGT
GGTGGAGAGGACTAGTCATATAAAAAAAAATGGTTTTGAATTCGAGTGTAAAGTTTTAAA
AAGCTTCAAAGTAAGTTTGTATAGTTACGTTTACACACACTACATGTAATTTCTGTACGG
CCTGGTCATATATAAAAAAGCTTTACTCC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL4126Contig1 692 2 8 U
GGGATGAGATCAGATGCTACCAGAACTTTGGTCATGCTGAATGAGCAAGGCGAGAGATCA
CGAGGACTCATCAAAAGGCTGTTGACATCGATCGTGATCTCAGTTGGGGTGAGAAGCTTC
TTGGTAGCCTCGGAGGCATTTTCTCAAGGACTTGGAAGCCTAAAAAGACTCGCTCCATTA
CCGGTCCTGTCGTAACTAGAGGTGAATCCCCTAAGAGAAGAGTTAACAACTTGGAGACTA
GAGAAAAGCTGGGACTGAACCATCTACCCAAACCACATTCAAGAAGAACCCGTGAGCCTC
TCCCTGAATCCGCTGATGCTTATCAGAAAATAGAGATGGAGAAAGTAAAGCACGACGATG
GACTTGCAGATTTGAGTAATCTACTCGGTGAACTAAAGAACATGGCTGTTGATATGGGAA
CTGAAATCGAAAGGCAAAACAATGGACTTGATCATCTTCAAGACGATGTCGACGAGCTTA
ACTTCAGAGTGAAACAAGCTAACCAACGAGCTCGCCGTTTACTCCGCAAGTAACACCAGC
CCCTCCCACAAGTGTACCTGTTCAGCTTCTCTTTTCTCTGTTGATTGAATCTTATCAGAA
CACAGAGATTTTAATAAAGATTGAGACATTTGATTCCAGAAAACTGCATCAAGTTTATTT
AGATATATGGAATTACAACTCTTATCACCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP06TF U 1
AF RR2AP06JQ C 57
BS 1 86 RR2AP06TF
BS 87 87 RR2AP06JQ
BS 88 419 RR2AP06TF
BS 420 420 RR2AP06JQ
BS 421 438 RR2AP06TF
BS 439 439 RR2AP06JQ
BS 440 457 RR2AP06TF
BS 458 692 RR2AP06JQ

RD RR2AP06TF 465 0 0
GGGATGAGATCAGATGCTACCAGAACTTTGGTCATGCTGAATGAGCAAGGCGAGAGATCA
CGAGGACTCATCAAAAGGCTGTTGACGTCGATCGTGATCTCAGTTGGGGTGAGAAGCTTC
TTGGTAGCCTCGGAGGCATTTTCTCAAGGACTTGGAAGCCTAAAAAGACTCGCTCCATTA
CCGGTCCTGTCGTAACTAGAGGTGAATCCCCTAAGAGAAGAGTTAACAACTTGGAGACTA
GAGAAAAGCTGGGACTGAACCATCTACCCAAACCACATTCAAGAAGAACCCGTGAGCCTC
TCCCTGAATCCGCTGATGCTTATCAGAAAATAGAGATGGAGAAAGTAAAGCACGACGATG
GACTTGCAGATTTGAGTAATCTACTCGGTGAACTAAAGAACATGGCTGTTGATATGGGA*
CTGAAATCGAAAGGCAAA*CAATGGACTTGATCATCT
CAGACGAT

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR2AP06JQ 636 0 0
ATCACGAGGACTCATCAAAAGGCTGTTGACATCGATCGTGATCTCAGTTGGGGTGAGAAG
CTTCTTGGTAGCCTCGGAGGCATTTTCTCAAGGACTTGGAAGCCTAAAAAGACTCGCTCC
ATTACCGGTCCTGTCGTAACTAGAGGTGAATCCCCTAAGAGAAGAGTTAACAACTTGGAG
ACTAGAGAAAAGCTGGGACTGAACCATCTACCCAAACCACATTCAAGAAGAACCCGTGAG
CCTCTCCCTGAATCCGGTGATGCTTATCAGAAAATAGAGATGGAGAAAGTAAAGCAGGAC
GATGGACTTGCAGATTTGAGTAATCTACTCGGTGAACTAAAGAACATGGCTGTTGATATG
GGAACTGAAATCGAAAGGCAAAACAATGGACTTGATCATCTTCAAGACGATGTCGACGAG
CTTAACTTCAGAGTGAAACAAGCTAACCAACGAGCTCGCCGTTTACTCCGCAAGTAACAC
CAGCCCCTCCCACAAGTGTACCTGTTCAGCTTCTCTTTTCTCTGTTGATTGAATCTTATC
AGAACACAGAGATTTTAATAAAGATTGAGACATTTGATTCCAGAAAACTGCATCAAGTTT
ATTTAGATATATGGAATTACAACTCTTATCACCAGC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4128Contig1 901 2 2 U
CCATACTTTCCGGTTACCTTCGTCGTTAGTCAAGTCTGATTACCAGATACTCTACGAGTT
CTTCCTCGAATATTCGGGAGAGATTCTAGTCGAGGCTGAGAAACTGGGTATCTCGCGAGA
GGAAGCTGCTCACAACCTCCTCTTCGCCACGTGCTTCAACACGTGGGGAGGGATGAAGAT
CCTCTTCTCGAACCTGGTTAAACGGGTCGGGCGGGCGGGTACCAAACTCCAGATCCGGTT
AGCGGAGGAGATAAGATCGGTTATCGAATCCAACGGCGGGGAGCTCACGATGGGAGGGAT
TGAGCAGATGGAGCTCACGAAATCAGTCGCCTTCGAATGTCTCCGGTTCGAACCGCCGGT
TCCGGCGCAATACGCTCTTGCGAAGAAGGACTTTGTTGTCGAGAGCCACGACGCGGCGTT
TAGAGTCAAGGCTGGAGAAATGCTTTATGGGTATCAACCGCTTGCGACTAGGGATCCGAA
GATATTCGAAAGAGCAGAGGAGTTTCTGCCGGAGAGATTCCTCGGGGAGGAAGGAGGGAG
GTTGTTGCAGCATGTCGTGTGGTCGAATGGTCCGCAGACGGAGAATCCGACCGTGGGGAA
TAAACAGTGCGCCGGTAAGGACTTTGTTGTTTTGGTCGCGAGGTCGTTTTTGATTGAGAT
TTTCAGGAGGTATGATTCGTTTGATATTGAGGTCGGTTCATCGCCGTTGGGAAGCTCCGT
TAAATTCACGTCTCTGAGGAAGGCTAGCTTTTAGAGAGTCAAGGGTAAATCTGTACTGTT
TGTTCGCACGCGTTACTTATTATTATTATTTATTTTCTTCTGTGCTTCTCTTTTCTTCTA
ATTATAAATATAATATCAAATGCTTGTTATGAAATATATAAAATAAAAGTGTTGCCTTTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2C129TF U 1
AF RR2C129JQ C 146
BS 1 527 RR2C129TF
BS 528 901 RR2C129JQ

RD RR2C129TF 527 0 0
CCATACTTTCCGGTTACCTTCGTCGTTAGTCAAGTCTGATTACCAGATACTCTACGAGTT
CTTCCTCGAATATTCGGGAGAGATTCTAGTCGAGGCTGAGAAACTGGGTATCTCGCGAGA
GGAAGCTGCTCACAACCTCCTCTTCGCCACGTGCTTCAACACGTGGGGAGGGATGAAGAT
CCTCTTCTCGAACCTGGTTAAACGGGTCGGGCGGGCGGGTACCAAACTCCAGATCCGGTT
AGCGGAGGAGATAAGATCGGTTATCGAATCCAACGGCGGGGAGCTCACGATGGGAGGGAT
TGAGCAGATGGAGCTCACGAAATCAGTCGCCTTCGAATGTCTCCGGTTCGAACCGCCGGT
TCCGGCGCAATACGCTCTTGCGAAGAAGGACTTTGTTGTCGAGAGCCACGACGCGGCGTT
TAGAGTCAAGGCTGGAGAAATGCTTTATGGGTATCAACCGCTTGCGACTAGGGATCCGAA
GATATTCGAAAGAGCAGAGGAGTTTCTGCCGGAGAGATTCCTCGGGG

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2C129JQ 756 0 0
GCCACGTGCTTCAACACGTGGGGAGGGATGAAGATCCTCTTCTCGAACCTGGTTAAACGG
GTCGGGCGGGCGGGTACCAAACTCCAGATCCGGTTAGCGGAGGAGATAAGATCGGTTATC
GAATCCAACGGCGGGGAGCTCACGATGGGAGGGATTGAGCAGATGGAGCTCACGAAATCA
GTCGCCTTCGAATGTCTCCGGTTCGAACCGCCGGTTCCGGCGCAATACGCTCTTGCGAAG
AAGGACTTTGTTGTCGAGAGCCACGACGCGGCGTTTAGAGTCAAGGCTGGAGAAATGCTT
TATGGGTATCAACCGCTTGCGACTAGGGATCCGAAGATATTCGAAAGAGCAGAGGAGTTT
CTGCCGGAGAGATTCCTCGGGGAGGAAGGAGGGAGGTTGTTGCAGCATGTCGTGTGGTCG
AATGGTCCGCAGACGGAGAATCCGACCGTGGGGAATAAACAGTGCGCCGGTAAGGACTTT
GTTGTTTTGGTCGCGAGGTCGTTTTTGATTGAGATTTTCAGGAGGTATGATTCGTTTGAT
ATTGAGGTCGGTTCATCGCCGTTGGGAAGCTCCGTTAAATTCACGTCTCTGAGGAAGGCT
AGCTTTTAGAGAGTCAAGGGTAAATCTGTACTGTTTGTTCGCACGCGTTACTTATTATTA
TTATTTATTTTCTTCTGTGCTTCTCTTTTCTTCTAATTATAAATATAATATCAAATGCTT
GTTATGAAATATATAAAATAAAAGTGTTGCCTTTCC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL4129Contig1 765 2 2 U
GGAAGGATGGCGAAGCTGGTGTTCTTCACCGTAGTTGTTATCACCATTTGCTCCTTTGGA
ATCTCCGTTGATGACAAATGTGCTGCTTGCAACGCCGTCGCGGAGGAACTGGAGTCACAG
CTTTTGAAGGAAAAGCCACGAAACCATCTTGATTTGAGAAACCGACTCAATTCTAAAGGC
CAGCGTGAAGGAAAGGTTATTGATTATAGAATGAGCGACCTGAGGGTGGTTGATTTGTTG
GACGGGCTGTGTGATAGAATGCAGGACTATACTCTACAAAAGGTGAAATCTAAAAATAGT
GAATGGGTCAAAGTGGAAAGTTTTGACAATCTAACAAATAAACAAGAAGCTAAAGCGCAT
GCCAATGACATTTCAACTTATTGCGGAAGATTGCTGGAGGAAACGGAAGATGAGCTTGCT
GAGGTAATAAAGAATGGATCGTTAAAAGTAGGAGATGCGCGCAAGGTTCTGTGTCAAACT
TTAAGCAATCACTGCAGCAAATCAAGTGAAACAGATTCAGAAGATGAAGACGCCGATGAC
GATGCAGATGAATTATAGCTCATTCCGGGGGAAAGTCTCATCACTTATTTTACCAACAAG
GTCCCACTACAAAGACATTTTTTTACGACTCATTTGTAGCTTAGACACCTTTTTCAGCTT
TTATGTTCCATCGATAATCCGTTCTAGAAAACTTATTCAGACTGTGACAGCGTTCTGTTT
TAGAGATTTTTTTTCTCAAAGGCATTTAAATTAGCTTGACAGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA70TF U 1
AF RR2AA70JQ C 14
BS 1 716 RR2AA70TF
BS 717 765 RR2AA70JQ

RD RR2AA70TF 716 0 0
GGAAGGATGGCGAAGCTGGTGTTCTTCACCGTAGTTGTTATCACCATTTGCTCCTTTGGA
ATCTCCGTTGATGACAAATGTGCTGCTTGCAACGCCGTCGCGGAGGAACTGGAGTCACAG
CTTTTGAAGGAAAAGCCACGAAACCATCTTGATTTGAGAAACCGACTCAATTCTAAAGGC
CAGCGTGAAGGAAAGGTTATTGATTATAGAATGAGCGACCTGAGGGTGGTTGATTTGTTG
GACGGGCTGTGTGATAGAATGCAGGACTATACTCTACAAAAGGTGAAATCTAAAAATAGT
GAATGGGTCAAAGTGGAAAGTTTTGACAATCTAACAAATAAACAAGAAGCTAAAGCGCAT
GCCAATGACATTTCAACTTATTGCGGAAGATTGCTGGAGGAAACGGAAGATGAGCTTGCT
GAGGTAATAAAGAATGGATCGTTAAAAGTAGGAGATGCGCGCAAGGTTCTGTGTCAAACT
TTAAGCAATCACTGCAGCAAATCAAGTGAAACAGATTCAGAAGATGAAGACGCCGATGAC
GATGCAGATGAATTATAGCTCATTCCGGGGGAAAGTCTCATCACTTATTTTACCAACAAG
GTCCCACTACAAAGACATTTTTTTACGACTCATTTGTAGCTTAGACACCTTTTTCAGCTT
TTATGTTCCATCGATAATCCGTTCTAGAAAACTTATTCAGACTGTGACAGCGTTCT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2AA70JQ 752 0 0
AGCTGGTGTTCTTCACCGTAGTTGTTATCACCATTTGCTCCTTTGGAATCTCCGTTGATG
ACAAATGTGCTGCTTGCAACGCCGTCGCGGAGGAACTGGAGTCACAGCTTTTGAAGGAAA
AGCCACGAAACCATCTTGATTTGAGAAACCGACTCAATTCTAAAGGCCAGCGTGAAGGAA
AGGTTATTGATTATAGAATGAGCGACCTGAGGGTGGTTGATTTGTTGGACGGGCTGTGTG
ATAGAATGCAGGACTATACTCTACAAAAGGTGAAATCTAAAAATAGTGAATGGGTCAAAG
TGGAAAGTTTTGACAATCTAACAAATAAACAAGAAGCTAAAGCGCATGCCAATGACATTT
CAACTTATTGCGGAAGATTGCTGGAGGAAACGGAAGATGAGCTTGCTGAGGTAATAAAGA
ATGGATCGTTAAAAGTAGGAGATGCGCGCAAGGTTCTGTGTCAAACTTTAAGCAATCACT
GCAGCAAATCAAGTGAAACAGATTCAGAAGATGAAGACGCCGATGACGATGCAGATGAAT
TATAGCTCATTCCGGGG*AAAGTCTCATCACTTATTTTACCAACAAGGTCCCACTACAAA
GACATTTTTTTACGACTCATTTGTAGCTTAGACACCTTTTTCAGCTTTTATGTTCCATCG
ATAATCCGTTCTAGAAAACTTATTCAGACTGTGACAGCGTTCTGTTTTAGAGATTTTTTT
TCTCAAAGGCATTTAAATTAGCTTGACAGAAC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL4130Contig1 755 2 2 U
GGGATTTTATAATAATAATGTTGTTTCAGTGTTACAAAAAAAAAAATGTTGTTTCAAAAC
CTACGCTGGAAAGTATTCTTATTCCAATAAGCTCCAACTTTATTTCAACAGTGAACGATC
GGTAACTCTTGAAGCTAAAAATCTTCCATTCTCCTCTAAGACCATGGAAGCTCTCTCGAC
TTCATCATACATCTCCAATTTGCCCCAGACAAAGCCACTCTTTAAAACTTCTCTACCGTT
TTCCCAGTCTTCCTGTTGGTCATGTAATCCGCGAATCCCCAATCTGAGAATCAGCGACGG
ATCAAGCCACGGGAGGCTTCGGTTACAGGCTCTCTTACACGACGACGACACGCCAAGTGA
AGGTGACGCCGAAAGCAGCGGGCATGGCCTTTTCCCTGGAGAAGATGTCTTCTCTCTATC
ACAGACATCTCTTGCACTTCCTCCTCAGGGTTCTGGTGGAAACCGAGGTGGGCTTTTTAG
GACTCCCATCTCTGGTGGAGTTCAGAATGCTACATCCGCTCATGCGTTACCTCCACCTGC
TTTAGCTGTTCGTAACTTGCTTGAACAGGCTAGGTTTGCTCATCTATGCACAGTCATGTC
TAAGATGCACCATCGCAGGGAAGGTTACCCTTTTGGCTCTTTGGTCGATTTTGCTCCTGA
TCGTATGGGCCATCCAATATTTTATTTTCACCGTTGGCCATCCACACAAGAAACCTCTTG
GCTGAACCTAGATGCAGTCTCGTTGTTCAGATGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ60TF U 1
AF RR2GR14TF U 1
BS 1 382 RR2GJ60TF
BS 383 755 RR2GR14TF

RD RR2GJ60TF 382 0 0
GGGATTTTATAATAATAATGTTGTTTCAGTGTTACAAAAAAAAAAATGTTGTTTCAAAAC
CTACGCTGGAAAGTATTCTTATTCCAATAAGCTCCAACTTTATTTCAACAGTGAACGATC
GGTAACTCTTGAAGCTAAAAATCTTCCATTCTCCTCTAAGACCATGGAAGCTCTCTCGAC
TTCATCATACATCTCCAATTTGCCCCAGACAAAGCCACTCTTTAAAACTTCTCTACCGTT
TTCCCAGTCTTCCTGTTGGTCATGTAATCCGCGAATCCCCAATCTGAGAATCAGCGACGG
ATCAAGCCACGGGAGGCTTCGGTTACAGGCTCTCTTACACGACGACGACACGCCAAGTGA
AGGTGACGCCGAAAGCAGCGGG

QA 1 382 1 382
DS 

RD RR2GR14TF 755 0 0
GGGATTTTATAATAATAATGTTGTTTCAGTGTTACAAAAAAAAAAATGTTGTTTCAAAAC
CTACGCTGGAAAGTATTCTTATTCCAATAAGCTCCAACTTTATTTCAACAGTGAACGATC
GGTAACTCTTGAAGCTAAAAATCTTCCATTCTCCTCTAAGACCATGGAAGCTCTCTCGAC
TTCATCATACATCTCCAATTTGCCCCAGACAAAGCCACTCTTTAAAACTTCTCTACCGTT
TTCCCAGTCTTCCTGTTGGTCATGTAATCCGCGAATCCCCAATCTGAGAATCAGCGACGG
ATCAAGCCACGGGAGGCTTCGGTTACAGGCTCTCTTACACGACGACGACACGCCAAGTGA
AGGTGACGCCGAAAGCAGCGGGCATGGCCTTTTCCCTGGAGAAGATGTCTTCTCTCTATC
ACAGACATCTCTTGCACTTCCTCCTCAGGGTTCTGGTGGAAACCGAGGTGGGCTTTTTAG
GACTCCCATCTCTGGTGGAGTTCAGAATGCTACATCCGCTCATGCGTTACCTCCACCTGC
TTTAGCTGTTCGTAACTTGCTTGAACAGGCTAGGTTTGCTCATCTATGCACAGTCATGTC
TAAGATGCACCATCGCAGGGAAGGTTACCCTTTTGGCTCTTTGGTCGATTTTGCTCCTGA
TCGTATGGGCCATCCAATATTTTATTTTCACCGTTGGCCATCCACACAAGAAACCTCTTG
GCTGAACCTAGATGCAGTCTCGTTGTTCAGATGCC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL4131Contig1 738 2 3 U
GGAGCTTAAAGAGAATAACTCTTTTTAACGATGCTTAGATGTTTCATAGTAAGTATATTT
CACAAAGCAAAGCAACGTAAAATGTGCAATTTGAAAAACGAAGAGTTGTTATCAGCAGTA
AACGAGGTATCATGAAGTTTCTTCTTAGCTCATCTCATCTCTTGATTACTTATTACCTTC
ACGAAAATTATCAAACTTCAACAAGTCCAGGAGTTGGATCTTCTCATTACGGGTTTCATT
TGCTTGTCTTCCTCAAGAGCAACCATACCGACATGCGACGGATCTTCCAACATCATCTTG
GCTACTAAGTATCCGGCGATTGACCAGGTCTGGCATTTACGTGACTGCTTCCCCACGTAT
CTCCCTAGCTTTCCATCATAGTATTCAGGCCAATTGTCTTTATGAAGCCTAGCCTCAGCC
ACTTCAATTGCTCGTCTTGCTATTTGAGGTCGACCAGTTTTGATACAAGCAGCCGTCAGT
AGCCATAGCAGTACTGGCCAGGATCCTCCGTTGTGGTAACTCCATCGGGTGTTTTTGGGG
TCACAACCAGTTACTATTCTCCATTCATGGCTTTCTATTGCAGGGTAGCAAACTTTCAGT
GGCATTTCTCCAACCAACTATTCCCAGCGAGATTCTATGAGATCCATAATTGCGGTTGAC
TGTTCAGGAGTAGCCATGGAAGACAATATGGCTATCCAATTTCCCAAGGCAAACCAACGG
AAATCCATTTTTGCGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A333JQ U 288
AF RR2FP28JQ U 1
BS 1 619 RR2FP28JQ
BS 620 620 RR2A333JQ
BS 621 738 RR2FP28JQ

RD RR2A333JQ 388 0 0
CAG
CATCATCTTGGCTACTAAGTATCCGGCGATTGACCAGGTCTGGCATTTACGTGACTGCTT
CCCCACGTATCTCCCTAGCTTTCCATCATAGTATTCAGGCCAATTGTCTTTATGAAGCCT
AGCCTCAGCCACTTCAATTGCTCGTCTTGCTATTTGAGGTCGACCAGTTTTGATACAAGC
AGCCGTCAGTAGCCATAGCAGTACTGGCCAGGATCCTCCGTTGTGGTAACTCCATCGGGT
GTTTTTGGGGTCACAACCAGTTACTATTCTCCATTCATGGCTTTCTATTGCAGGGTAGCA
AACTTTCAGTGGCATTTCTCCAACCAACTATTCCCAGCGAGATTCTATGAGATCCATAAT
TGCGGTTGACTGTTCAGGAGTAGCC

QA 4 388 4 388
DS 

RD RR2FP28JQ 738 0 0
GGAGCTTAAAGAGAATAACTCTTTTTAACGATGCTTAGATGTTTCATAGTAAGTATATTT
CACAAAGCAAAGCAACGTAAAATGTGCAATTTGAAAAACGAAGAGTTGTTATCAGCAGTA
AACGAGGTATCATGAAGTTTCTTCTTAGCTCATCTCATCTCTTGATTACTTATTACCTTC
ACGAAAATTATCAAACTTCAACAAGTCCAGGAGTTGGATCTTCTCATTACGGGTTTCATT
TGCTTGTCTTCCTCAAGAGCAACCATACCGACATGCGACGGATCTTCCAACATCATCTTG
GCTACTAAGTATCCGGCGATTGACCAGGTCTGGCATTTACGTGACTGCTTCCCCACGTAT
CTCCCTAGCTTTCCATCATAGTATTCAGGCCAATTGTCTTTATGAAGCCTAGCCTCAGCC
ACTTCAATTGCTCGTCTTGCTATTTGAGGTCGACCAGTTTTGATACAAGCAGCCGTCAGT
AGCCATAGCAGTACTGGCCAGGATCCTCCGTTGTGGTAACTCCATCGGGTGTTTTTGGGG
TCACAACCAGTTACTATTCTCCATTCATGGCTTTCTATTGCAGGGTAGCAAACTTTCAGT
GGCATTTCTCCAACCAACTCTTCCCAGCGAGATTCTATGAGATCCATAATTGCGGTTGAC
TGTTCAGGAGTAGCCATGGAAGACAATATGGCTATCCAATTTCCCAAGGCAAACCAACGG
AAATCCATTTTTGCGGGG

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL4132Contig1 1101 2 2 U
GGGCCGTCGAAAGAAGGGTAAACAAAAAAAAACCTAGCACCCGATTCTCAATCAGTAGAA
CAAAGTCTGAGAGTTTCGCTCTCAAATCGCCTCTCTGATTTTAGGTGCGCTTCAAGGTGG
TTAGTGATTGTATACCGTTGCCTGAGAGCGAATTCAAGAAAGCAATCAAGGAGAACTACA
ACAACAGAAACAAGTTCAAAACAGAACTAACTCGTAAACAGGTATTCAAGCTTACAAAGC
TTTTCCGACCAGCTGCTCTCCCTGCACAATTGACTCACACTCTGCCAGTCCCTGTTCCTC
GTCCTGCTGAAAGGAAAAGATCTGATAATGACCGTTATGCTCCTGGCAGCAGCAGCAGAA
CTCATGGAAGGAGCTCACGCAATGCTGCTGCACCTCCTCCACGACGCAGAGAAGAGCCAC
CCCGAAGAGAAGAACCGCCCCGTGATCTATACCTCACCGAAAGCGAGTACAGAACGTACG
GCTTGAGAAGAGCAGAACCAGCTCAGCATTATCCAGTTCCGCCACCTGAGTCTTCTTACC
GTCTGGTGGACTCGTACCGTCCATCTGTGGTGGACCACGAGCGGCTTTTGAGACAAGCAG
AGATCGAGAGGCATCATGAGCGTAGTAGAGAAGTTCTTTTGCCTGAGAGAAGCAGCCACC
ACCCGTCGTATGATCACCTAAGCTCTAGGCGCCTGGCGCCAGAGCCACCTTTGGAGTCTT
ACAGGAGAGACCCGTATCACAGGGTCGAGTACCGTAGCCCCGAAAGACTACATAGGACAT
ACCTGCCTTTTTCAGGAAGAGAAGACGATGACTTGTATTCCCGATATGTTACGCCGGACT
CATTGGCTGAGTACTACCGATCATCATCATCATCTCGCAGATACCCTCCAAGCTTAGCTG
AATCTGAGTTTCCGCCTTCATCATTAACGTCCCGGTATGCTTACTCAGGGTCTTTACCTT
ATTCTCACCGCTGATTTCTACTTTTAGCTCTTTCCTTTGAAATGTATTTTCTGTTTAATG
TATGTTTGGATTTGGACATGCTTTCGTTGGTTCCACCCGAACTTGGATTGTACTGTGGTT
TTATTTACTCGTCGTTGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS25TF U 1
AF RR2AS25JQ C 409
BS 1 789 RR2AS25TF
BS 790 1101 RR2AS25JQ

RD RR2AS25TF 791 0 0
GGGCCGTCGAAAGAAGGGTAAACAAAAAAAAACCTAGCACCCGATTCTCAATCAGTAGAA
CAAAGTCTGAGAGTTTCGCTCTCAAATCGCCTCTCTGATTTTAGGTGCGCTTCAAGGTGG
TTAGTGATTGTATACCGTTGCCTGAGAGCGAATTCAAGAAAGCAATCAAGGAGAACTACA
ACAACAGAAACAAGTTCAAAACAGAACTAACTCGTAAACAGGTATTCAAGCTTACAAAGC
TTTTCCGACCAGCTGCTCTCCCTGCACAATTGACTCACACTCTGCCAGTCCCTGTTCCTC
GTCCTGCTGAAAGGAAAAGATCTGATAATGACCGTTATGCTCCTGGCAGCAGCAGCAGAA
CTCATGGAAGGAGCTCACGCAATGCTGCTGCACCTCCTCCACGACGCAGAGAAGAGCCAC
CCCGAAGAGAAGAACCGCCCCGTGATCTATACCTCACCGAAAGCGAGTACAGAACGTACG
GCTTGAGAAGAGCAGAACCAGCTCAGCATTATCCAGTTCCGCCACCTGAGTCTTCTTACC
GTCTGGTGGACTCGTACCGTCCATCTGTGGTGGACCACGAGCGGCTTTTGAGACAAGCAG
AGATCGAGAGGCATCATGAGCGTAGTAGAGAAGTTCTTTTGCCTGAGAGAAGCAGCCACC
ACCCGTCGTATGATCACCTAAGCTCTAGGCGCCTGGCGCCAGAGCCACCTTTGGAGTCTT
ACAGGAGAGACCCGTATCACAGGGTCGAGTACCGTAGCCCCGAAAGACTACATAGGACAT
ACCTGCCTT
CT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2AS25JQ 693 0 0
GAGAAGAGCCACCCCGAAGAGAAGAACCGCCCCGTGATCTATACCTCACCGAAAGCGAGT
ACAGAACGTACGGCTTGAGAAGAGCAGAACCAGCTCAGCATTATCCAGTTCCGCCACCTG
AGTCTTCTTACCGTCTGGTGGACTCGTACCGTCCATCTGTGGTGGACCACGAGCGGCTTT
TGAGACAAGCAGAGATCGAGAGGCATCATGAGCGTAGTAGAGAAGTTCTTTTGCCTGAGA
GAAGCAGCCACCACCCGTCGTATGATCACCTAAGCTCTAGGCGCCTGGCGCCAGAGCCAC
CTTTGGAGTCTTACAGGAGAGACCCGTATCACAGGGTCGAGTACCGTAGCCCCGAAAGAC
TACATAGGACATACCTGCCTTTTTCAGGAAGAGAAGACGATGACTTGTATTCCCGATATG
TTACGCCGGACTCATTGGCTGAGTACTACCGATCATCATCATCATCTCGCAGATACCCTC
CAAGCTTAGCTGAATCTGAGTTTCCGCCTTCATCATTAACGTCCCGGTATGCTTACTCAG
GGTCTTTACCTTATTCTCACCGCTGATTTCTACTTTTAGCTCTTTCCTTTGAAATGTATT
TTCTGTTTAATGTATGTTTGGATTTGGACATGCTTTCGTTGGTTCCACCCGAACTTGGAT
TGTACTGTGGTTTTATTTACTCGTCGTTGTACC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL4133Contig1 790 2 3 U
ATTTGGCGGTAGAGGTGGAGACGGTGGTGCTGGAGGTGACGGTACCGGAGGTGGGAGCGT
TGATGGTTACTACCAAGAGATGATACAACGTTATCCTGGAGACGCTCTTCTCCTCGCTAA
CTACGCTCGTTTCCTCAAAGAGGTGAAGGGTGATGAGAGAAAAGCAGAGGAGTACTGTGA
GAGAGCGATGTTGTCTGAAGACGGGAGAGATGGTGAGATGTTGTCTATGTATGGAGATTT
GATATGGAAAAATCACGGAGATGGTGTTCGTGCTCAGTCTTACTTTGATCAAGCTGTTCA
ATCTTCTCCTGATGACTGTCATGTTCTTGCCTCATATGCTCGGTTTCTGTGGGATACCGA
AGAGGAAGAGGAGGAGGAAGAAAGTAAATATGAGAATGGTTTCTCTACTTATAACTCATC
TGTGTCAGTTATGTCCTGACCCTTGGTGTGCTGATCTTAAACCGGTGTAATATAATAACA
ATTTGAAGTCCGGTTTAATCATAAAAAATATCTATTGCACATTGAGGTAGATTGATGCTT
ATGTGTTGGAAGAGAGGAACCAAGTATCAAAACTCCAAAGATGCATTATTGTGATATCCG
AAAGAAGATAAAAAGGTGTGAATTGGGATTGGTCCATGGGCTCTGGATAGAATCAATTAT
TAGTTGTCAAAAAATAAAAATCAATTATTGATCAGTGGTGGCTAGAGACGTCATGCTCAA
GCTTTGTGTTTTTTTTTTTTTTGGTGTCAATGCATGCATGAAATAAAACTTTGCTAGTTG
CAATTTGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F972TF U 64
AF RR2AY85JQ C 1
BS 1 64 RR2AY85JQ
BS 65 360 RR2F972TF
BS 361 790 RR2AY85JQ

RD RR2F972TF 297 0 0
G
GGTTACTACCAAGAGATGATACAACGTTATCCTGGAGACGCTCTTCTCCTCGCTAACTAC
GCTCGTTTCCTCAAAGAGGTGAAGGGTGATGAGAGAAAAGCAGAGGAGTACTGTGAGAGA
GCGATGTTGTCTGAAGACGGGAGAGATGGTGAGATGTTGTCTATGTATGGAGATTTGATA
TGGAAAAATCACGGAGATGGTGTTCGTGCTCAGTCTTACTTTGATCAAGCTGTTCAATCT
TCTCCTGATGACTGTCATGTTCTTGCCTCATATGCTCGGTTTCTGTGGGATACCGA

QA 2 297 2 297
DS 

RD RR2AY85JQ 790 0 0
ATTTGGCGGTAGAGGTGGAGACGGTGGTGCTGGAGGTGACGGTACCGGAGGTGGGAGCGT
TGATGGTTACTACGAGGAGATGATACAACGTTATCCTGGAGACGCTCTTCTCCTCGCTAA
CTACGCTCGTTTCCTCAAAGAGGTGAAGGGTGATGAGAGAAAAGCGGAGGAGTACTGTGA
GAGAGCGATGTTGTCTGAGGATGGGAGAGATGGTGAGATGTTGTCTATGTATGGAGATTT
GATATGGAAGAATCACGGAGATGGTGTTCGTGCTCAGTCTTACTTTGATCAAGCTGTTCA
ATCTTCTCCTGATGACTGTCATGTTCTTGCCTCATATGCTCGGTTTCTGTGGGATACCGA
AGAGGAAGAGGAGGAGGAAGAAAGTAAATATGAGAATGGTTTCTCTACTTATAACTCATC
TGTGTCAGTTATGTCCTGACCCTTGGTGTGCTGATCTTAAACCGGTGTAATATAATAACA
ATTTGAAGTCCGGTTTAATCATAAAAAATATCTATTGCACATTGAGGTAGATTGATGCTT
ATGTGTTGGAAGAGAGGAACCAAGTATCAAAACTCCAAAGATGCATTATTGTGATATCCG
AAAGAAGATAAAAAGGTGTGAATTGGGATTGGTCCATGGGCTCTGGATAGAATCAATTAT
TAGTTGTCAAAAAATAAAAATCAATTATTGATCAGTGGTGGCTAGAGACGTCATGCTCAA
GCTTTGTGTTTTTTTTTTTTTTGGTGTCAATGCATGCATGAAATAAAACTTTGCTAGTTG
CAATTTGCAG

QA 1 790 1 790
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4135Contig1 1119 2 6 U
TTTTTATTTCATCTCTACGACATTAAAACCAGACCAAACCAAAAACATTAATAGTTTTAC
CACCCTTTCCAAAAATTCTCTCTTTTACTCCTATCTTCTGCTTTAGAACTTTGAGGGAGG
TGAGCAAAAATGGGAAGAACACCTTGCTGTGACAAGAAAGGTTTGAAGAAAGGTCCATGG
ACTCCGGAAGAAGATGAGATTCTCGTTGAGTATATCAAGAAAAACAGTCATGGAAGCTGG
AGAACTCTTCCCAAGAACGCTGGGTTACTTCGCTGTGGAAAGAGCTGTAGACTGAGATGG
ACTAACTATCTAAGACCAGACATAAAGAGAGGTCCTTTCACTCCTGATGAAGAGAAACTC
GTTGTCCAACTTCACGCCATTCTCGGCAACAGGTGGGCTGCTATAGCAGCACAGCTTCCA
GGGAGAACAGACAATGAGATCAAGAACCTATGGAACACTCACTTGAAGAAACGTCTGCTA
AGTATGGGTCTAGACCCCAAAACCCATGAGCCATTACCATCATATGGGTTAGTCATACAA
GCTCCAGCTTCACCAACAACTCGCCACATGGCTCAATGGGAAAGTGCTAGGCTTGAAGCT
GAGGCAAGGCTTTCTAGAGAGTCAATGCTTTTCAATCCTTCTTCTCTAGGAGGTGGCAAA
ACCGATTGTGATCACTTCTTACGCATATGGAACTCAGAGATTGGTGATTCCTTCAGAAAC
CTTGCACCATTTGATGAAACAACAGCTACTACTTGTCAAAGCCCTTGCTCTAGGACAACC
ACATCTTCCTCATCAGCTGCACTTCCAAAGAGCTCAACAAACTCTTGTGTTGGGAAAGAG
ATTGTTATGAAGACTACTCCTGGCTCTGATTCTTCTCCATGTTCCAACAATCTTGAAGAT
GTTTCATCAGATTCTGCTCTTCAACTCCTGCTTGACTTCCCAATAAGTGATGATGATATG
AGCTTCTTGGAAGAGAACATTGGTAGCTACTCTAAATTTTAATCCTTTTTAAAAACATAT
CAAGTGGAGATATGTTATCTATGTAAATCAGCACTAGTTAGTTATTACTTAGTATCAATC
CTCTTTATGACTCAATGATGCTCCAGAAAACTGCAAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW94TF U 1
AF RR2EW94JQ C 399
BS 1 727 RR2EW94TF
BS 728 728 RR2EW94JQ
BS 729 739 RR2EW94TF
BS 740 740 RR2EW94JQ
BS 741 796 RR2EW94TF
BS 797 1119 RR2EW94JQ

RD RR2EW94TF 796 0 0
TTTTTATTTCATCTCTACGACATTAAAACCAGACCAAACCAAAAACATTAATAGTTTTAC
CACCCTTTCCAAAAATTCTCTCTTTTACTCCTATCTTCTGCTTTAGAACTTTGAGGGAGG
TGAGCAAAAATGGGAAGAACACCTTGCTGTGACAAGAAAGGTTTGAAGAAAGGTCCATGG
ACTCCGGAAGAAGATGAGATTCTCGTTGAGTATATCAAGAAAAACAGTCATGGAAGCTGG
AGAACTCTTCCCAAGAACGCTGGGTTACTTCGCTGTGGAAAGAGCTGTAGACTGAGATGG
ACTAACTATCTAAGACCAGACATAAAGAGAGGTCCTTTCACTCCTGATGAAGAGAAACTC
GTTGTCCAACTTCACGCCATTCTCGGCAACAGGTGGGCTGCTATAGCAGCACAGCTTCCA
GGGAGAACAGACAATGAGATCAAGAACCTATGGAACACTCACTTGAAGAAACGTCTGCTA
AGTATGGGTCTAGACCCCAAAACCCATGAGCCATTACCATCATATGGGTTAGTCATACAA
GCTCCAGCTTCACCAACAACTCGCCACATGGCTCAATGGGAAAGTGCTAGGCTTGAAGCT
GAGGCAAGGCTTTCTAGAGAGTCAATGCTTTTCAATCCTTCTTCTCTAGGAGGTGGCAAA
ACCGATTGTGATCACTTCTTACGCATATGGAACTCAGAGATTGGTGATTCCTTCAGAAAC
CTTGCAC*ATTTGATGAAA*AACAGCTACTACTTGTCAAAGCCCTTGCTCTAGGACAACC
ACATCTTCCTCATCAG

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2EW94JQ 721 0 0
TGCTATAGCAGCACAGCTTCCAGGGAGAACAGACAATGAGATCAAGAACCTATGGAACAC
TCACTTGAAGAAACGTCTGCTAAGTATGGGTCTAGACCCCAAAACCCATGAGCCATTACC
ATCATATGGGTTAGTCATACAAGCTCCAGCTTCACCAACAACTCGCCACATGGCTCAATG
GGAAAGTGCTAGGCTTGAAGCTGAGGCAAGGCTTTCTAGAGAGTCAATGCTTTTCAATCC
TTCTTCTCTAGGAGGTGGCAAAACCGATTGTGATCACTTCTTACGCATATGGAACTCAGA
GATTGGTGATTCCTTCAGAAACCTTGCACCATTTGATGAAACAACAGCTACTACTTGTCA
AAGCCCTTGCTCTAGGACAACCACATCTTCCTCATCAGCTGCACTTCCAAAGAGCTCAAC
AAACTCTTGTGTTGGGAAAGAGATTGTTATGAAGACTACTCCTGGCTCTGATTCTTCTCC
ATGTTCCAACAATCTTGAAGATGTTTCATCAGATTCTGCTCTTCAACTCCTGCTTGACTT
CCCAATAAGTGATGATGATATGAGCTTCTTGGAAGAGAACATTGGTAGCTACTCTAAATT
TTAATCCTTTTTAAAAACATATCAAGTGGAGATATGTTATCTATGTAAATCAGCACTAGT
TAGTTATTACTTAGTATCAATCCTCTTTATGACTCAATGATGCTCCAGAAAACTGCAAGA
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL4136Contig1 873 2 2 U
GGGAAACCCGGTAACCAATATTGGATTTGATTATAACCATCGAATTCCTTTTGCTCATGG
AATGGCACTCATCTCTGATGAACTTTACAAGTCGATGAAGAGAATCTGCAAAGGATAGTA
TGAAAGTGTTGATCCAAGTAACACTGAATGCTTGAAACTCGTTGAAGAATATCATAAGTG
CACTGATAGAATAAACTACTCACTTGTCACAACGCCATTGTGCGACGATGAAGACCCTTC
TCCCGATTGCTATGATTATCGGTACGTGTTAACTACGTACTGGGCCAATGATGAGAGTGT
GCGCAGGGCTCTTCACATCAATAAGGAGAGTAAAGGGAAGTGGGTACGTTGTGACTGGGA
TATGCCTTATACAAATGACATCAAAAGCAGTGTACCATACCATATGAATAACAGTATCAA
TGGCTACCCTTCTCTCATCTTCAGTGGTGATCATGACATTTATGTGCCTTCCCTTGGAAC
TCAAGCTTGGATTAGATCACTTAACTATTCTGTCACTGATGACTGGAGACCTTGGATAAT
AGGCGACCAAATCGCTGGATACACTAGGACTTATGCCAATAAGATGACATTTGCGACTAT
CAAAGGAGGAGGACACACTCCTGAATATAAACCAGAGAGTTATATCATGTTTCAAAGGTG
GATCAGTGGCAAACCTATTTAGCAACAAGTCCAAGTTCAGGACCGGTCCTCGGCATATAA
CTTGGCTATGGGCTACGATGAAACATTGGTCAAGAACACCTAATTACCAAATTATTATAG
CAAAATCTTATCAATATTTAGTTAGATTGTTTGTCAAAGCATATCTGTATATAACTATCA
CGCCTTCTCCATAAGAAACCTTAATTTACTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DB96TF U 1
AF RR2DB96JQ C 62
BS 1 696 RR2DB96TF
BS 697 873 RR2DB96JQ

RD RR2DB96TF 696 0 0
GGGAAACCCGGTAACCAATATTGGATTTGATTATAACCATCGAATTCCTTTTGCTCATGG
AATGGCACTCATCTCTGATGAACTTTACAAGTCGATGAAGAGAATCTGCAAAGGATAGTA
TGAAAGTGTTGATCCAAGTAACACTGAATGCTTGAAACTCGTTGAAGAATATCATAAGTG
CACTGATAGAATAAACTACTCACTTGTCACAACGCCATTGTGCGACGATGAAGACCCTTC
TCCCGATTGCTATGATTATCGGTACGTGTTAACTACGTACTGGGCCAATGATGAGAGTGT
GCGCAGGGCTCTTCACATCAATAAGGAGAGTAAAGGGAAGTGGGTACGTTGTGACTGGGA
TATGCCTTATACAAATGACATCAAAAGCAGTGTACCATACCATATGAATAACAGTATCAA
TGGCTACCCTTCTCTCATCTTCAGTGGTGATCATGACATTTATGTGCCTTCCCTTGGAAC
TCAAGCTTGGATTAGATCACTTAACTATTCTGTCACTGATGACTGGAGACCTTGGATAAT
AGGCGACCAAATCGCTGGATACACTAGGACTTATGCCAATAAGATGACATTTGCGACTAT
CAAAGGAGGAGGACACACTCCTGAATATAAACCAGAGAGTTATATCATGTTTCAAAGGTG
GATCAGTGGCAAACCTATTTAGCAACAAGTCCAAGT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2DB96JQ 812 0 0
ATGGCACTCATCTCTGATGAACTTTACAAGTCGATGAAGAGAATCTGCAAAGGATAGTAT
GAAAGTGTTGATCCAAGTAACACTGAATGCTTGAAACTCGTTGAAGAATATCATAAGTGC
ACTGATAGAATAAACTACTCACTTGTCACAACGCCATTGTGCGACGATGAAGACCCTTCT
CCCGATTGCTATGATTATCGGTACGTGTTAACTACGTACTGGGCCAATGATGAGAGTGTG
CGCAGGGCTCTTCACATCAATAAGGAGAGTAAAGGGAAGTGGGTACGTTGTGACTGGGAT
ATGCCTTATACAAATGACATCAAAAGCAGTGTACCATACCATATGAATAACAGTATCAAT
GGCTACCCTTCTCTCATCTTCAGTGGTGATCATGACATTTATGTGCCTTCCCTTGGAACT
CAAGCTTGGATTAGATCACTTAACTATTCTGTCACTGATGACTGGAGACCTTGGATAATA
GGCGACCAAATCGCTGGATACACTAGGACTTATGCCAATAAGATGACATTTGCGACTATC
AAAGGAGGAGGACACACTCCTGAATATAAACCAGAGAGTTATATCATGTTTCAAAGGTGG
ATCAGTGGCAAACCTATTTAGCAACAAGTCCAAGTTCAGGACCGGTCCTCGGCATATAAC
TTGGCTATGGGCTACGATGAAACATTGGTCAAGAACACCTAATTACCAAATTATTATAGC
AAAATCTTATCAATATTTAGTTAGATTGTTTGTCAAAGCATATCTGTATATAACTATCAC
GCCTTCTCCATAAGAAACCTTAATTTACTCTT

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

CO CL4137Contig1 1100 2 2 U
GGGTGTTCTCATTCAAAATTCAGTTCGGTTCTCAGATCTCTGAGCTCAAGAATAGTTTAA
GTGTTGTGAACTCCGCAGCAGAACAGATAAAGAATTCTGAGAAATTCAAAAGAATAATGC
AGACAGTTTTGTCCCTTGGAAACGCCCTAAACCAGGGGACGGCTAGAGGTGCTGCGGTGG
GGTTTAAGCTTGACAGTCTACCAAAACTCAGTGAAACCCGGGCGCGTAATAACCGTATGA
CACTGATGCATTATCTGTGCAAGATTCTTGCTGAGAAAATGCCAGAAGTTTTGGGTTTCA
CAAAAGATTTATCCTCACTGGAGCCTTCAACAAAGGTTCAACTGAAGTTTTTGGCTGAGG
AGATGCAAGCTATAAACAAGGGACTGGAGAAAGTCGTACAAGAACTCTCCTTGTCCGAAA
ATGATGGCCCAATCTCACACACCTTTAACAAGATATTGAAGGAGTTCCTTCTTTATGCGG
AAGCAGAAGTAAGGTCCTTGGCTTCACTCTATTCAGGAGTGGGACGAAACGTGGATGGCT
TAATTCTCTACTTCGGTGAAGACCCAGCTAAGTGCCCATTTGAACAAGTGGTGTCTACTC
TTCTAAACTTTGTAAGACTCTTCAACCGTGCGCATGAAGAAAACGGAAAACAACTTGAGG
CAGAAGCTAAAAAGAAAGCTGAAGAGCAGAAATCAAAAACAAGTGAAGTAGATAAAGAAA
GCAGGAAGCCCTTGTCCTTGGAGGAACATGTTAAGAAGGAGAAAACAAAAATAAGTGGAT
TTGATAAAGAAACGAAGGAGGAAGGAACCGCTGCTTGAAAAATTGCTTCTTCTTATTTTT
TTTAGATGGACTGGAATGGACCGGCGATGGTGAGGAGGCTGTGCGGCTCAATCCCGTGGT
GTTTGCAGACAACGTGAAAAGTGGGATATTAATGGCAGCATTGTCACCTAACGACAAAGC
TAACTTGTAAAATAGGGAAGGGGGTATAAAATAATGTAACTAGAAAGCAATAAACACAAA
TACATCATATACATTGTATGGTCAAAACTTTTCTTGTGGGTTTAGCTCGCTGCAATAAGC
AATGTCATTTGATTTACCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D236TF U 1
AF RR2D236JQ C 596
BS 1 699 RR2D236TF
BS 700 1100 RR2D236JQ

RD RR2D236TF 699 0 0
GGGTGTTCTCATTCAAAATTCAGTTCGGTTCTCAGATCTCTGAGCTCAAGAATAGTTTAA
GTGTTGTGAACTCCGCAGCAGAACAGATAAAGAATTCTGAGAAATTCAAAAGAATAATGC
AGACAGTTTTGTCCCTTGGAAACGCCCTAAACCAGGGGACGGCTAGAGGTGCTGCGGTGG
GGTTTAAGCTTGACAGTCTACCAAAACTCAGTGAAACCCGGGCGCGTAATAACCGTATGA
CACTGATGCATTATCTGTGCAAGATTCTTGCTGAGAAAATGCCAGAAGTTTTGGGTTTCA
CAAAAGATTTATCCTCACTGGAGCCTTCAACAAAGGTTCAACTGAAGTTTTTGGCTGAGG
AGATGCAAGCTATAAACAAGGGACTGGAGAAAGTCGTACAAGAACTCTCCTTGTCCGAAA
ATGATGGCCCAATCTCACACACCTTTAACAAGATATTGAAGGAGTTCCTTCTTTATGCGG
AAGCAGAAGTAAGGTCCTTGGCTTCACTCTATTCAGGAGTGGGACGAAACGTGGATGGCT
TAATTCTCTACTTCGGTGAAGACCCAGCTAAGTGCCCATTTGAACAAGTGGTGTCTACTC
TTCTAAACTTTGTAAGACTCTTCAACCGTGCGCATGAAGAAAACGGAAAACAACTTGAGG
CAGAAGCTAAAAAGAAAGCTGAAGAGCAGAAATCAAAAA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2D236JQ 505 0 0
TACTCTTCTAAACTTTGTAAGACTCTTCAACCGTGCGCATGAAGAAAACGGAAAACAACT
TGAGGCAGAAGCTAAAAAGAAAGCTGAAGAGCAGAAATCAAAAACAAGTGAAGTAGATAA
AGAAAGCAGGAAGCCCTTGTCCTTGGAGGAACATGTTAAGAAGGAGAAAACAAAAATAAG
TGGATTTGATAAAGAAACGAAGGAGGAAGGAACCGCTGCTTGAAAAATTGCTTCTTCTTA
TTTTTTTTAGATGGACTGGAATGGACCGGCGATGGTGAGGAGGCTGTGCGGCTCAATCCC
GTGGTGTTTGCAGACAACGTGAAAAGTGGGATATTAATGGCAGCATTGTCACCTAACGAC
AAAGCTAACTTGTAAAATAGGGAAGGGGGTATAAAATAATGTAACTAGAAAGCAATAAAC
ACAAATACATCATATACATTGTATGGTCAAAACTTTTCTTGTGGGTTTAGCTCGCTGCAA
TAAGCAATGTCATTTGATTTACCGC

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 2

CO CL4138Contig1 1149 2 2 U
TTTTTGTTTGTCTCCTCCGCCGATTTTCAGACACTAGTTTAGTTTCTGTCCGAAAGAGTT
TCAGTTGTAAAAATTTAAATTACTTTTTTTCCCCGTACAAAATCGAAAAAAATGTCATCG
TTTCTCAGTTTTCCGGCCATTTCACCTCTTCCATCTGCTTTTCCCGGCGCTTCATTTCGT
CCTCGCTTTTCATCTCCACGATTGTTCAAGTCTTGTGTTAAGTGCAGTTATGCTGAAGCT
ACTATTGACATTGTGGCAGATGTCAGATCTGAAAGGGTTGTAGTTCTTGGAGGCAATGGT
TTCGTTGGCTCAGCTATCTGCAAGGAAGCAATCTCCAACGGAATCGAGGTTGTAAGTGTC
AGCAGGTCTGGTCGTCCTAGCTTGCAAGATTCATGGTTGGATCAGGTTACATGGGTTACT
GGTGATGTTTTCTATTTGAACTGGGATGAAGTACTTCTCGGTGCCACTGCTGTAGTTTCG
ACCATTGGTGGTTTTGGTAATGAAGAACAGATGAAAAGAATCAACGGTGAAGCTAACGTT
ATCGCTGTGAATGCTGCTAAGGATTTCGGAGTTCCTAAGTTTGTCTTGATCACTGTTCAC
GACTACAATCTTCCACCATTTGTTCTATCCAGCGGTTACTTCACCGGAAAACGCAGCGCA
GAGGCAGAACTCCTCTCCAAATATCCCAACTCCGGAGTTGTGCTGAGACCAGGTTTCATA
TACGGGAAACGAAAAGTGAACGGATTCGAGGTCCCGCTTGATCTGGTCGGGGAGCCACTA
GACAAGATATACGATGCTGCAGAGAGGTTCATTAGACCGTTGAGGTCTCTCCCTGCGTCT
GATCTCATCTTGGCTCCCCCGGTTAAAGTCGATGATCTAGCACTTGCTGTGATTAACGCC
GTTAAAGATGACGACATCTTTGGCATTTTCACTATTGAGCAGATCAAAGAAGCAGCTGCA
AGATGAGAGCCTTTAGCTACTAAAACAGCTTCTTCCTGTTCCTCTCCCTTTACATACTTT
GTAACCGTAAAATACCGTATATATTTTTGCTTGTTTCGCGACGAGCGAGCAATCGTATTA
TTTCGGGACCGGAGATTTATGTGTTTAACTAGGTGTTGTCCGCGTAAATGATATCATAAA
AAGATTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F305TF U 1
AF RR2F305JQ C 612
BS 1 715 RR2F305TF
BS 716 1149 RR2F305JQ

RD RR2F305TF 715 0 0
TTTTTGTTTGTCTCCTCCGCCGATTTTCAGACACTAGTTTAGTTTCTGTCCGAAAGAGTT
TCAGTTGTAAAAATTTAAATTACTTTTTTTCCCCGTACAAAATCGAAAAAAATGTCATCG
TTTCTCAGTTTTCCGGCCATTTCACCTCTTCCATCTGCTTTTCCCGGCGCTTCATTTCGT
CCTCGCTTTTCATCTCCACGATTGTTCAAGTCTTGTGTTAAGTGCAGTTATGCTGAAGCT
ACTATTGACATTGTGGCAGATGTCAGATCTGAAAGGGTTGTAGTTCTTGGAGGCAATGGT
TTCGTTGGCTCAGCTATCTGCAAGGAAGCAATCTCCAACGGAATCGAGGTTGTAAGTGTC
AGCAGGTCTGGTCGTCCTAGCTTGCAAGATTCATGGTTGGATCAGGTTACATGGGTTACT
GGTGATGTTTTCTATTTGAACTGGGATGAAGTACTTCTCGGTGCCACTGCTGTAGTTTCG
ACCATTGGTGGTTTTGGTAATGAAGAACAGATGAAAAGAATCAACGGTGAAGCTAACGTT
ATCGCTGTGAATGCTGCTAAGGATTTCGGAGTTCCTAAGTTTGTCTTGATCACTGTTCAC
GACTACAATCTTCCACCATTTGTTCTATCCAGCGGTTACTTCACCGGAAAACGCAGCGCA
GAGGCAGAACTCCTCTCCAAATATCCCAACTCCGGAGTTGTGCTGAGACCAGGTT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2F305JQ 538 0 0
TCCACCATTTGTTCTATCCAGCGGTTACTTCACCGGAAAACGCAGCGCAGAGGCAGAACT
CCTCTCCAAATATCCCAACTCCGGAGTTGTGCTGAGACCAGGTTTCATATACGGGAAACG
AAAAGTGAACGGATTCGAGGTCCCGCTTGATCTGGTCGGGGAGCCACTAGACAAGATATA
CGATGCTGCAGAGAGGTTCATTAGACCGTTGAGGTCTCTCCCTGCGTCTGATCTCATCTT
GGCTCCCCCGGTTAAAGTCGATGATCTAGCACTTGCTGTGATTAACGCCGTTAAAGATGA
CGACATCTTTGGCATTTTCACTATTGAGCAGATCAAAGAAGCAGCTGCAAGATGAGAGCC
TTTAGCTACTAAAACAGCTTCTTCCTGTTCCTCTCCCTTTACATACTTTGTAACCGTAAA
ATACCGTATATATTTTTGCTTGTTTCGCGACGAGCGAGCAATCGTATTATTTCGGGACCG
GAGATTTATGTGTTTAACTAGGTGTTGTCCGCGTAAATGATATCATAAAAAGATTCGT

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

CO CL4139Contig1 1272 2 4 U
GGATCACTAACACAATCAACTCTCTCCTTCTCTACTCAAAAACCAAAAGGACACAAACAT
GGAGATCTCAAAAACCCTTTTGCTAGTGGTTTCTCTTGCGGCTGCAACTTGTTTCTTGCA
AGCCAAGGCAGCTGGAGTTTACTGTAGCAACCCTTACACTCGATGTTACCACAAGTACAT
TCAGTGTCCAGAGGAATGCCCAAGCACGACTGCTATGAACTCCAAGAACAAAGTTTGCTA
CGCAGATTGCGATAGACCCACTTGCAAATCTCAATGCCGCATGAGGAAACCGAACTGCAA
TAGACCTGGATCAGCTTGTTATGATCCGAGGTTCATTGGAGGAGACGGTATTGTGTTTTA
CTTCCATGGAAAGAGCAATCAAGAGTTCAGCCTCGTCTCTGACTCTGACCTTCAGATCAA
TGGTAGGTTCATTGGCCACAGACCCGCTGGTCGTGCCAGAGACTTCACATGGATCCAAGC
TCTCGGGTTCCTATTCAACTCCCACAAGTTCTCTCTTGAAGCCGCGAAAACCGCCACATG
GGACAACGAAGTTGACCATCTCAAGTTCACTTTCGATGGCCAAGATGTATCTGTCCCTGA
AGAAACACTCTCCACCTGGTACTCACCAAACAAGGACATCAAGATCGAGAGAGTGACAAT
TAGAAACAGTGTGATCGTGACAATCAAAGACAAAGCTGAGATCATGGTCAACGTGGTTCC
AGTAACTAAAGAAGACGACAGGATCCATAGCTACAAAGTACCATCGGATGACTGCTTTGC
ACATCTCGAGGTTCAGTTCAAGTTCTTCAACCTTTCACCAAAGGTAGACGGAATCTTGGG
ACGGACCTACAAACCTGATTTCCAGAACCCGGCTAAGCCTGGGGTTGCAATGCCAGTGGT
TGGTGGTGAAGAGAGCTTCAAGACCTCGTCTTTCCTCTCTAACGACTGTAAAACTTGCAT
TTTTTTTGAATCACAGGCAGAGATTGAGTCCGTTAAGTCAGAGATTGAATATGCTGCTTT
GGATTGCACCCGTGGTGCGTTTTCTGGATATGGAATCGTGTGCAGGAAGTGAAGAAATCG
TATTTGAAAAAATTGGCTTACAAAGAAGAATAAGGGCAGAGAGCAGTAGCTTTTGCTTGA
AATTTTACAAAGTAAAATAATTGCCATGAAAAGATGTTGTATGTACTTGCTATTTACTAC
TTTGAAATGTATTTCTATTGTATCATCCACCATGTATTAACTTACTCATTGTTAATGATA
TATATTACTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D656TF U 1
AF RR2D656JQ C 623
BS 1 710 RR2D656TF
BS 711 711 RR2D656JQ
BS 712 732 RR2D656TF
BS 733 1272 RR2D656JQ

RD RR2D656TF 732 0 0
GGATCACTAACACAATCAACTCTCTCCTTCTCTACTCAAAAACCAAAAGGACACAAACAT
GGAGATCTCAAAAACCCTTTTGCTAGTGGTTTCTCTTGCGGCTGCAACTTGTTTCTTGCA
AGCCAAGGCAGCTGGAGTTTACTGTAGCAACCCTTACACTCGATGTTACCACAAGTACAT
TCAGTGTCCAGAGGAATGCCCAAGCACGACTGCTATGAACTCCAAGAACAAAGTTTGCTA
CGCAGATTGCGATAGACCCACTTGCAAATCTCAATGCCGCATGAGGAAACCGAACTGCAA
TAGACCTGGATCAGCTTGTTATGATCCGAGGTTCATTGGAGGAGACGGTATTGTGTTTTA
CTTCCATGGAAAGAGCAATCAAGAGTTCAGCCTCGTCTCTGACTCTGACCTTCAGATCAA
TGGTAGGTTCATTGGCCACAGACCCGCTGGTCGTGCCAGAGACTTCACATGGATCCAAGC
TCTCGGGTTCCTATTCAACTCCCACAAGTTCTCTCTTGAAGCCGCGAAAACCGCCACATG
GGACAACGAAGTTGACCATCTCAAGTTCACTTTCGATGGCCAAGATGTATCTGTCCCTGA
AGAAACACTCTCCACCTGGTACTCACCAAACAAGGACATCAAGATCGAGAGAGTGACAAT
TAGAAACAGTGTGATCGTGACAATCAAAGACAAAGCTGAGATCATGGTCA*CGTGGTTCC
AGTAACTAAAGA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2D656JQ 650 0 0
TCACCAAACAAGGACATCAAGATCGAGAGAGTGACAATTAGAAACAGTGTGATCGTGACA
ATCAAAGACAAAGCTGAGATCATGGTCAACGTGGTTCCAGTAACTAAAGAAGACGACAGG
ATCCATAGCTACAAAGTACCATCGGATGACTGCTTTGCACATCTCGAGGTTCAGTTCAAG
TTCTTCAACCTTTCACCAAAGGTAGACGGAATCTTGGGACGGACCTACAAACCTGATTTC
CAGAACCCGGCTAAGCCTGGGGTTGCAATGCCAGTGGTTGGTGGTGAAGAGAGCTTCAAG
ACCTCGTCTTTCCTCTCTAACGACTGTAAAACTTGCATTTTTTTTGAATCACAGGCAGAG
ATTGAGTCCGTTAAGTCAGAGATTGAATATGCTGCTTTGGATTGCACCCGTGGTGCGTTT
TCTGGATATGGAATCGTGTGCAGGAAGTGAAGAAATCGTATTTGAAAAAATTGGCTTACA
AAGAAGAATAAGGGCAGAGAGCAGTAGCTTTTGCTTGAAATTTTACAAAGTAAAATAATT
GCCATGAAAAGATGTTGTATGTACTTGCTATTTACTACTTTGAAATGTATTTCTATTGTA
TCATCCACCATGTATTAACTTACTCATTGTTAATGATATATATTACTAGT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL4140Contig1 1022 2 12 U
TTTTTGTTCGTTTTGGTGCCAACCTCCACCGCAACAATCGTCAGCTTCAACCTCCGGAGT
CGCCGCAAGGAATCGTCCGTGGCATATTTTTTTGAGGTCTACAAAGTGTTTTTGCCTTTC
TTAACGAACTAGGAAGTGGTTAAAAGTCATGGAGGGTTTTGATTTGCTAGAGATATCATG
ACGCAGTGCATAGACGGATTCAAGCATGTATGCAACTCTCTGTTTCGGTGTTTTGATATC
GAGATATATAAACAGTCTGGAGGCCTTGGAGATCCTGAACTACTTGCCAGAGAGACATTT
TTTAGCGTGAGTGAAATAGAGGCTCTCTATGAGCTGTTTAAGAAAATCAGCAGTGCTGTC
ATTGATGATGGGCTAATAAACAAGGAAGAGTTTCAACTAGCCTTGTTCAAGACAAATAAA
AAAGAGAGCTTGTTTGCAGACCGGGTGTTTGATTTGTTCGACACAAAGCATAATGGAATA
CTGGGGTTTGAGGAGTTTGCTCGTGCTCTCTCCGTCTTTCATCCAAATGCTCCTATAGAC
GACAAGATTGATTTTTCGTTTCAGTTATATGATCTTAAACAGCAAGGTTTCATCGAGAGG
CAGGAGGTGAAGCAAATGGTGGGGGCTACTCTTGCTGAGTCGGGCATGAACCTGTCAGAC
GAAGTCATAGAGAGTATAATCGACAAGACATTTGAAGAAGCTGACACAAAGCATGACGGG
AGGATCGATAAGGAAGAGGGGAGGATCCTTGTTCTTAGGCATCCTTCGCTTTTGAAATAT
GACACTTCAGTATCTCAAGGATATCACGACTACGTTTCCGAGCTTTGTGTTTCATTTTCA
GGTGGAAGATACCTGAGAAGAGCATAGCAGATCAAACAGTTTGGCAAGTGTGTTTGTTTT
CAGTCATGTATCATGTTTAATTTGTTTTTTTTTAAAACCTCTTTGAACTCCAGTTTCCAA
GATTTTGTTGTTTTTTCTGTGAAAATGGAAAAGAAAAAAACGAAAACAAAGTTGTATTTT
AA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2F363TF U 1
AF RR2F363JQ C 512
BS 1 622 RR2F363TF
BS 623 623 RR2F363JQ
BS 624 685 RR2F363TF
BS 686 686 RR2F363JQ
BS 687 719 RR2F363TF
BS 720 720 RR2F363JQ
BS 721 732 RR2F363TF
BS 733 734 RR2F363JQ
BS 735 738 RR2F363TF
BS 739 739 RR2F363JQ
BS 740 758 RR2F363TF
BS 759 1022 RR2F363JQ

RD RR2F363TF 761 0 0
TTTTTGTTCGTTTTGGTGCCAACCTCCACCGCAACAATCGTCAGCTTCAACCTCCGGAGT
CGCCGCAAGGAATCGTCCGTGGCATATTTTTTTGAGGTCTACAAAGTGTTTTTGCCTTTC
TTAACGAACTAGGAAGTGGTTAAAAGTCATGGAGGGTTTTGATTTGCTAGAGATATCATG
ACGCAGTGCATAGACGGATTCAAGCATGTATGCAACTCTCTGTTTCGGTGTTTTGATATC
GAGATATATAAACAGTCTGGAGGCCTTGGAGATCCTGAACTACTTGCCAGAGAGACATTT
TTTAGCGTGAGTGAAATAGAGGCTCTCTATGAGCTGTTTAAGAAAATCAGCAGTGCTGTC
ATTGATGATGGGCTAATAAACAAGGAAGAGTTTCAACTAGCCTTGTTCAAGACAAATAAA
AAAGAGAGCTTGTTTGCAGACCGGGTGTTTGATTTGTTCGACACAAAGCATAATGGAATA
CTGGGGTTTGAGGAGTTTGCTCGTGCTCTCTCCGTCTTTCATCCAAATGCTCCTATAGAC
GACAAGATTGATTTTTCGTTTCAGTTATATGATCTTAAACAGCAAGGTTTCATCGAGAGG
CAGGAGGTGAAGCAAATGGTGGTGGCTACTCTTGCTGAGTCGGGCATGAACCTGTCAGAC
GAAGTCATAGAGAGTATAATCGACA*GACATTTGAAGAAGCTGACACAAAGCATGACGG*
AGGATCGATAAG**AGAGTGGAGGATCCTTGTTCTTAG
CAT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2F363JQ 511 0 0
CCGTCTTTCATCCAAATGCTCCTATAGACGACAAGATTGATTTTTCGTTTCAGTTATATG
ATTTTAAACAGCAAGGTTTCATCGAGAGGCAGGAGGTGAAGCAAATGGTGGGGGCTACTC
TTGCTGAGTCGGGCATGAACCTGTCAGACGAAGTCATAGAGAGTATAATCGACAAGACAT
TTGAAGAAGCTGACACAAAGCATGACGGGAGGATCGATAAGGAAGAGGGGAGGATCCTTG
TTTTTAGGCATCCTTCGCTTTTGAAATATGACACTTCAGTATCTCAAGGATATCACGACT
ACGTTTCCGAGCTTTGTGTTTCATTTTCAGGTGGAAGATACCTGAGAAGAGCATAGCAGA
TCAAACAGTTTGGCAAGTGTGTTTGTTTTCAGTCATGTATCATGTTTAATTTGTTTTTTT
TTAAAACCTCTTTGAACTCCAGTTTCCAAGATTTTGTTGTTTTTTCTGTGAAAATGGAAA
AGAAAAAAACGAAAACAAAGTTGTATTTTAA

QA 1 511 1 511
DS 



AS 1 2

CO CL4141Contig1 656 2 1 U
GCAATTACATCACCTGAAACTTCACCGGAAAGACATGTAGATGACACATGGATGCAGGAG
CTAAATGCAAATCGACCACCAACACCAACCAGAGGGCGCCCACAAACCCCAGACGACCGT
GGCTCTCTTGCTTGGATATAAACCTATCCAGAGAGACAGAGACGCACTTGTGAGATTGCA
TACTTCTCCTGATAAGCTGCCTCTTTGATGATGATCCTCATGTTGTGTACAGATCCAACC
AAAACCATTCTTGATCCACAATGATCGATTGCGAGATGGATCACACTTGGAATCAATGCA
AGCTCTTAAGATACTGGGGGGATTTCACAGATGATGAAAGAGTAAGAAGTCAAGTTGGGT
GGTTTTGGAGGCGGTGACTATTTGTGAGCGAGGCAGAGTATTTTTATTGGGTAAAAGGGA
ATTTGTTCATTTTGTTTGGCTTCTATATATTTTCTAAGTTTTGTTTATTTGTCTGTGGTA
TTGGGACACAACACAAGTGACTAGCAAAGGGGTTATGGTTGGGATATTAGAGGTGTATTA
GTTTCGAGGAAGAAGGGTGTTTGTATCATAGAGAGGTGTGTGGGCATTGTGTAATTTCTT
TATTCCTATAATCACTATGTAATTTGTAACACCGTTGTGTGTTTATTATGATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GW13TF U 1
AF RR2GW13JQ C 18
BS 1 656 RR2GW13TF

RD RR2GW13TF 656 0 0
GCAATTACATCACCTGAAACTTCACCGGAAAGACATGTAGATGACACATGGATGCAGGAG
CTAAATGCAAATCGACCACCAACACCAACCAGAGGGCGCCCACAAACCCCAGACGACCGT
GGCTCTCTTGCTTGGATATAAACCTATCCAGAGAGACAGAGACGCACTTGTGAGATTGCA
TACTTCTCCTGATAAGCTGCCTCTTTGATGATGATCCTCATGTTGTGTACAGATCCAACC
AAAACCATTCTTGATCCACAATGATCGATTGCGAGATGGATCACACTTGGAATCAATGCA
AGCTCTTAAGATACTGGGGGGATTTCACAGATGATGAAAGAGTAAGAAGTCAAGTTGGGT
GGTTTTGGAGGCGGTGACTATTTGTGAGCGAGGCAGAGTATTTTTATTGGGTAAAAGGGA
ATTTGTTCATTTTGTTTGGCTTCTATATATTTTCTAAGTTTTGTTTATTTGTCTGTGGTA
TTGGGACACAACACAAGTGACTAGCAAAGGGGTTATGGTTGGGATATTAGAGGTGTATTA
GTTTCGAGGAAGAAGGGTGTTTGTATCATAGAGAGGTGTGTGGGCATTGTGTAATTTCTT
TATTCCTATAATCACTATGTAATTTGTAACACCGTTGTGTGTTTATTATGATTTGC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2GW13JQ 639 0 0
AACTTCACCGGAAAGACATGTAGATGACACATGGATGCAGGAGCTAAATGCAAATCGACC
ACCAACACCAACCAGAGGGCGCCCACAAACCCCAGACGACCGTGGCTCTCTTGCTTGGAT
ATAAACCTATCCAGAGAGACAGAGACGCACTTGTGAGATTGCATACTTCTCCTGATAAGC
TGCCTCTTTGATGATGATCCTCATGTTGTGTACAGATCCAACCAAAACCATTCTTGATCC
ACAATGATCGATTGCGAGATGGATCACACTTGGAATCAATGCAAGCTCTTAAGATACTGG
GGGGATTTCACAGATGATGAAAGAGTAAGAAGTCAAGTTGGGTGGTTTTGGAGGCGGTGA
CTATTTGTGAGCGAGGCAGAGTATTTTTATTGGGTAAAAGGGAATTTGTTCATTTTGTTT
GGCTTCTATATATTTTTTAAGTTTTGTTTATTTGTCTGTGGTATTGGGACACAACACAAG
TGACTAGCAAAGGGGTTATGGTTGGGATATTAGAGGTGTATTAGTTTCGAGGAAGAAGGG
TGTTTGTATCATAGAGAGGTGTGTGGGCATTGTGTAATTTCTTTATTCCTATAATCACTA
TGTAATTTGTAACACCGTTGTGTGTTTATTATGATTTGC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL4142Contig1 967 2 2 U
GGGGGAACTCAAGAACACAGCATACAAAACTGGGTCTCAGATTTGTTCTGGAAACAGCTC
GATCTAAATTACCCTGATATGCCAGATGCAATGGTTCACCATGGCTTCTACAGTGCTTAT
CACAATACAACGGTACGGCCTGCAGTTTTGGATGCAGTGAAACGAGCGAAGAAGTTCTAT
GGGGAGAACATCAAGATCATGGTGACGGGTCATTCAATGGGAGGAGCCATGGCTGCTTTT
TGTGGACTAGACCTAGTTAATGAAGGATATGAAAACGTACAGGTCATGACGTTTGGGCAA
CCTCGTATTGGGAATGCGGCTTTTGCATCTTATTACAACTTGCTTGTGCCTAATACCTTC
CGGATCACGCATGACCGAGATATTGTTCCTCATCTGCCTCCTTTCTTTTATCTTTTCCCT
CAGAAAACATACCATCACTTCCCAACAGAGGTGTGGGTGAGAGATCTAAGTGTTTTGAAA
ATTGTTCGTTTTAGTATTGAGAAAGTTTGTGACAACACCGGTGAAGATCCTACTTGCTGC
AGATCGGTAATGGGAAGTAGCATATCTGACCATTTAACGTACTTTGGAGTGGAGTTGATG
TGCGAGACTTGGAGACAATGCAGTATAGTGATGGGCCACGAGTTGGAGAGTTACAGCAGA
AGAGATTCCAAGGGTAACATATTCCTGTCCCAGATAGATCCTTCCCCGGTGGTAACTGAA
ACGAAAACTCTATCCACAACCACAACCGGAGTCTCCAGTATTTAGGAGCTGGTTGATGAG
AGAGTGTTGAGCAAGAGTGGAGTGCTTGCTTGGAAGGGAGAGTTTGGGAGACTCAGAGGT
GGAGGACGAAGGGGGGTTCTTGATTATTTATGGTCGTGTAAGATAGTCTACAGATAATAA
ACTAAGACGTTGTAAATAGGTCGTACTCGTCGGTTGATATATAAATAAGAAAGCATGTTA
AACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF80TF U 1
AF RR2FF80JQ C 280
BS 1 668 RR2FF80TF
BS 669 967 RR2FF80JQ

RD RR2FF80TF 668 0 0
GGGGGAACTCAAGAACACAGCATACAAAACTGGGTCTCAGATTTGTTCTGGAAACAGCTC
GATCTAAATTACCCTGATATGCCAGATGCAATGGTTCACCATGGCTTCTACAGTGCTTAT
CACAATACAACGGTACGGCCTGCAGTTTTGGATGCAGTGAAACGAGCGAAGAAGTTCTAT
GGGGAGAACATCAAGATCATGGTGACGGGTCATTCAATGGGAGGAGCCATGGCTGCTTTT
TGTGGACTAGACCTAGTTAATGAAGGATATGAAAACGTACAGGTCATGACGTTTGGGCAA
CCTCGTATTGGGAATGCGGCTTTTGCATCTTATTACAACTTGCTTGTGCCTAATACCTTC
CGGATCACGCATGACCGAGATATTGTTCCTCATCTGCCTCCTTTCTTTTATCTTTTCCCT
CAGAAAACATACCATCACTTCCCAACAGAGGTGTGGGTGAGAGATCTAAGTGTTTTGAAA
ATTGTTCGTTTTAGTATTGAGAAAGTTTGTGACAACACCGGTGAAGATCCTACTTGCTGC
AGATCGGTAATGGGAAGTAGCATATCTGACCATTTAACGTACTTTGGAGTGGAGTTGATG
TGCGAGACTTGGAGACAATGCAGTATAGTGATGGGCCACGAGTTGGAGAGTTACAGCAGA
AGAGATTC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2FF80JQ 688 0 0
CAGGTCATGACGTTTGGGCAACCTCGTATTGGGAATGCGGCTTTTGCATCTTATTACAAC
TTGCTTGTGCCTAATACCTTCCGGATCACGCATGACCGAGATATTGTTCCTCATCTGCCT
CCTTTCTTTTATCTTTTCCCTCAGAAAACATACCATCACTTCCCAACAGAGGTGTGGGTG
AGAGATCTAAGTGTTTTGAAAATTGTTCGTTTTAGTATTGAGAAAGTTTGTGACAACACC
GGTGAAGATCCTACTTGCTGCAGATCGGTAATGGGAAGTAGCATATCTGACCATTTAACG
TACTTTGGAGTGGAGTTGATGTGCGAGACTTGGAGACAATGCAGTATAGTGATGGGCCAC
GAGTTGGAGAGTTACAGCAGAAGAGATTCCAAGGGTAACATATTCCTGTCCCAGATAGAT
CCTTCCCCGGTGGTAACTGAAACGAAAACTCTATCCACAACCACAACCGGAGTCTCCAGT
ATTTAGGAGCTGGTTGATGAGAGAGTGTTGAGCAAGAGTGGAGTGCTTGCTTGGAAGGGA
GAGTTTGGGAGACTCAGAGGTGGAGGACGAAGGGGGGTTCTTGATTATTTATGGTCGTGT
AAGATAGTCTACAGATAATAAACTAAGACGTTGTAAATAGGTCGTACTCGTCGGTTGATA
TATAAATAAGAAAGCATGTTAAACTTTT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL4143Contig1 802 2 4 U
TTTTTCCTTGACGTTGGAATGACTGCAGAGCTCTCTAAGAACGATAGGGAGAATTTGCTT
GATTTTTTCAAGGCGGTTGCGCTTAGGGATGGCCGGACTGCTGCTGAGAGAACACTTAAG
TTGTCAAGAAAGCAAAACTGTCCCAATCCAGAGGCTTTCATTGAGGAAGTAGAAGAAGCA
TTCAAATTCTGGGGAACCCCTGAGGGAGATTTAGTGCATCCTGCAGATTGCATGCACGAG
TTACTTGAGAAAGTGAGACGTCACAGAGTTAATATTGACGGGAATGTGTGCACCGTGATG
GTCACAACATTAGTTCTCGAGGGTTGGCAACGGAAACTTGATCCAGGGTACGATGTGATG
CACACGCTGCAAACAATGGTGCTGAAAACCGACTGGGCTAAGTCTCTTTCTTACACGGTG
GATGGTCTGATGGCACCGTAGGAGAAGAAAGGTTTCCATCATCTTTTTCTTTTTTTTCAA
ATTTTGTTTGTCATCATAATAGGAGTCGAGTCGACAAATTTTTACAAATCTTAGATGAGG
GAACATAGAATCAAAGTACATGTTCTTGATGTTCATCTTTGTTTATTTCTCTATTCTTTT
TTTTCTTTTTTGCTTTTTGTTGTTATGGATTTTGGTTCATTCTAACTACATAGATTGTAT
TCACGCGGTTAGTTACCTGTATTAACCAACCGCCCGTTTGTTCTCTGAACTGAACCGAAG
AACAGTGAACATAAAACAATGAAAAAGACTGCCTGAGAATGATGGTGCAGAGAATTTGAA
TAAATTGTTCTCCTTGTATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR03TF U 1
AF RR2GR03JQ C 287
BS 1 620 RR2GR03TF
BS 621 621 RR2GR03JQ
BS 622 681 RR2GR03TF
BS 682 802 RR2GR03JQ

RD RR2GR03TF 681 0 0
TTTTTCCTTGACGTTGGAATGACTGCAGAGCTCTCTAAGAACGATAGGGAGAATTTGCTT
GATTTTTTCAAGGCGGTTGCGCTTAGGGATGGCCGGACTGCTGCTGAGAGAACACTTAAG
TTGTCAAGAAAGCAAAACTGTCCCAATCCAGAGGCTTTCATTGAGGAAGTAGAAGAAGCA
TTCAAATTCTGGGGAACCCCTGAGGGAGATTTAGTGCATCCTGCAGATTGCATGCACGAG
TTACTTGAGAAAGTGAGACGTCACAGAGTTAATATTGACGGGAATGTGTGCACCGTGATG
GTCACAACATTAGTTCTCGAGGGTTGGCAACGGAAACTTGATCCAGGGTACGATGTGATG
CACACGCTGCAAACAATGGTGCTGAAAACCGACTGGGCTAAGTCTCTTTCTTACACGGTG
GATGGTCTGATGGCACCGTAGGAGAAGAAAGGTTTCCATCATCTTTTTCTTTTTTTTCAA
ATTTTGTTTGTCATCATAATAGGAGTCGAGTCGACAAATTTTTACAAATCTTAGATGAGG
GAACATAGAATCAAAGTACATGTTCTTGATGTTCATCTTTGTTTATTTCTCTATTCTTTT
TTTTCTTTTTTGCTTTTTGT*GTTATGGATTTTGGTTCATTCTAACTACATAGATTGTAT
TCACGCGGTTAGTTACCTGTA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2GR03JQ 516 0 0
TGTGCACCGTGATGGTCACAACATTAGTTCTCGAGGGTTGGCAACGGAAACTTGATCCAG
GGTACGATGTGATGCACACGCTGCAAACAATGGTGCTGAAAACCGACTGGGCTAAGTCTC
TTTCTTACACGGTGGATGGTCTGATGGCACCGTAGGAGAAGAAAGGTTTCCATCATCTTT
TTCTTTTTTTTCAAATTTTGTTTGTCATCATAATAGGAGTCGAGTCGACAAATTTTTACA
AATCTTAGATGAGGGAACATAGAATCAAAGTACATGTTCTTGATGTTCATCTTTGTTTAT
TTCTCTATTCTTTTTTTTCTTTTTTGCTTTTTGTTGTTATGGATTTTGGTTCATTCTAAC
TACATAGATTGTATTCACGCGGTTAGTTACCTGTATTAACCAACCGCCCGTTTGTTCTCT
GAACTGAACCGAAGAACAGTGAACATAAAACAATGAAAAAGACTGCCTGAGAATGATGGT
GCAGAGAATTTGAATAAATTGTTCTCCTTGTATGTC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL4144Contig1 1137 2 2 U
GGCCTCAGGACAAAATTGTACGGATGGATTATTATCGGAGCTTTCTCGCATTTTCTCTAT
TCTGTCTTATCCTGATCCTACCTCGAGTCTCATCCGCCTCTATACGTTTCCTCCCTCGAT
GGAGTAGTAACAGAGATGGGTCTGTGATAAAGCAGAAGACGAGTGCTGCTTCATCTCTTG
TTTTTGATCCGACTCGTGTCACTCAGCTCTCTTGGACTCCTAGAGTGTTTTTATACAAAG
GGTTTCTCTCAGATGAGGAATGTGATCATTTCATCAAATTGGCGAAAGGGAAGCTGGAGA
AGTCTATGGTGGCGGATAATGATTCAGGCGAGAGCGTAGAGAGTGAAATACGTACAAGCT
CTGGAATGTTCCTTTCCAAAAAACAGGATGAAATAGTAGCTAATGTGGAGTCAAGACTTG
CCGCATGGACCTTTCTTCCTGAAGAAAATGGAGAATCAATGCAAATACTGCACTATGAGA
ATGGTCAAAAGTATGAACCACATTTTGATTACTTCCATGACGAGGCAAACGTACAGCTCG
GTGGTCATAGGATCGCCACTGTATTGATGTACTTGTCCAACGTCAAAAAAGGTGGAGAGA
CAGTCTTTCCCATGTGGAAGGGCGCAACAGATCAACCAAAAGACGATAGCTGGACCGAAT
GTGCCAAAGAAAGTTATGCGGTGAAACCGGTGAAAGGGGACGCACTGCTCTTCTTCAATC
TTCATCTCAATGCAACCACAGACCCGAGCAGCTTACATGGAAGCTGTCCAGTGGTTGAGG
GAGAGAAATGGTCAGCAACCAGATGGATTCATGTCGAGTCCTTTGACAGATGGTTTAACA
AGACGTCTGGGTGTGTGGACGAGAATGAGAACTGCCCTAAATGGGCAAAGGCAGGGGAAT
GCGAGAAGAATCCAAGCTACATGGTGGGTTCAGAGACTGACCATGGATATTGCAGAAAGA
GCTGCAAAGTTTGCTCTTCTTAAAGAAATAAAGTATAATCAAAGCTCTTTACTAAAAGGA
TCAATGATTTTTGTAGATGTTTTTCGCCATTCAAGATATAGCAAAAACCTTTCGTTAGTA
GAATGAAAAAGTTGAGAACTACACTTAAAAGATAATCCTCATGCTATGTTACTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV34TF U 1
AF RR2AV34JQ C 300
BS 1 693 RR2AV34TF
BS 694 1137 RR2AV34JQ

RD RR2AV34TF 693 0 0
GGCCTCAGGACAAAATTGTACGGATGGATTATTATCGGAGCTTTCTCGCATTTTCTCTAT
TCTGTCTTATCCTGATCCTACCTCGAGTCTCATCCGCCTCTATACGTTTCCTCCCTCGAT
GGAGTAGTAACAGAGATGGGTCTGTGATAAAGCAGAAGACGAGTGCTGCTTCATCTCTTG
TTTTTGATCCGACTCGTGTCACTCAGCTCTCTTGGACTCCTAGAGTGTTTTTATACAAAG
GGTTTCTCTCAGATGAGGAATGTGATCATTTCATCAAATTGGCGAAAGGGAAGCTGGAGA
AGTCTATGGTGGCGGATAATGATTCAGGCGAGAGCGTAGAGAGTGAAATACGTACAAGCT
CTGGAATGTTCCTTTCCAAAAAACAGGATGAAATAGTAGCTAATGTGGAGTCAAGACTTG
CCGCATGGACCTTTCTTCCTGAAGAAAATGGAGAATCAATGCAAATACTGCACTATGAGA
ATGGTCAAAAGTATGAACCACATTTTGATTACTTCCATGACGAGGCAAACGTACAGCTCG
GTGGTCATAGGATCGCCACTGTATTGATGTACTTGTCCAACGTCAAAAAAGGTGGAGAGA
CAGTCTTTCCCATGTGGAAGGGCGCAACAGATCAACCAAAAGACGATAGCTGGACCGAAT
GTGCCAAAGAAAGTTATGCGGTGAAACCGGTGA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2AV34JQ 838 0 0
AAGTCTATGGTGGCGGATAATGATTCAGGCGAGAGCGTAGAGAGTGAAATACGTACAAGC
TCTGGAATGTTCCTTTCCAAAAAACAGGATGAAATAGTAGCTAATGTGGAGTCAAGACTT
GCCGCATGGACCTTTCTTCCTGAAGAAAATGGAGAATCAATGCAAATACTGCACTATGAG
AATGGTCAAAAGTATGAACCACATTTTGATTACTTCCATGACGAGGCAAACGTACAGCTC
GGTGGTCATAGGATCGCCACTGTATTGATGTACTTGTCCAACGTCAAAAAAGGTGGAGAG
ACAGTCTTTCCCATGTGGAAGGGCGCAACAGATCAACCAAAAGACGATAGCTGGACCGAA
TGTGCCAAAGAAGGTTATGCGGTGAAACCGGTGAAAGGGGACGCACTGCTCTTCTTCAAT
CTTCATCTCAATGCAACCACAGACCCGAGCAGCTTACATGGAAGCTGTCCAGTGGTTGAG
GGAGAGAAATGGTCAGCAACCAGATGGATTCATGTCGAGTCCTTTGACAGATGGTTTAAC
AAGACGTCTGGGTGTGTGGACGAGAATGAGAACTGCCCTAAATGGGCAAAGGCAGGGGAA
TGCGAGAAGAATCCAAGCTACATGGTGGGTTCAGAGACTGACCATGGATATTGCAGAAAG
AGCTGCAAAGTTTGCTCTTCTTAAAGAAATAAAGTATAATCAAAGCTCTTTACTAAAAGG
ATCAATGATTTTTGTAGATGTTTTTCGCCATTCAAGATATAGCAAAAACCTTTCGTTAGT
AGAATGAAAAAGTTGAGAACTACACTTAAAAGATAATCCTCATGCTATGTTACTTATC

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 2

CO CL4145Contig1 1320 2 2 U
GGACCTCACGACAACAGATCTAGGCTGAGCTTCCTTTAGCTTCGATTCTCTCGCATTTGC
TTATAGGTTTTATGCACGAATGAGATCGTTGTAGATCGTGACTGAAGCGAGAGAGAGAGA
TAAAAAAAAATTAGGAGAGCGAAGATGAGCGAGGGCCAGAAGTTCCAGCTAGGAACAATC
GGCGCTTTGAGTCTATCCGTTGTGTCGTCTGTGTCGATCGTGATCTGTAACAAGGCGCTT
ATTAGCACCCTTGGCTTCACCTTCGCGACTACATTGACAAGTTGGCATCTATTGGTCACG
TTTTGTTCCCTTCATGTGGCACTATGGATGAAGATGTTTGAACACAAACCTTTTGATCCA
CGAGCTGTGATGGGATTTGGCATTCTGAATGGGATATCTATTGGACTATTGAACCTCAGC
CTGGGCTTTAATTCCGTTGGTTTTTACCAGATGACAAAACTAGCAATCATCCCCTGTACT
GTTCTCTTGGAGACCCTCTTCTTCAGGAAAAAGTTCAGTCGAAAAATTCAGTTTTCATTA
ACCATCCTTCTCCTTGGTGTTGGAATTGCAACCGTCACAGATCTTCAGCTTAATATGCTG
GGTTCTGTCTTGTCGCTGCTGGCTGTTATCACAACTTGTGTTGCTCAAATTATGACAAAT
ACCATCCAGAAGAAGTTCAAAGTTTCATCCACGCAGCTTCTTTATCAGTCTTGCCCTTAT
CAAGCAATTACACTTTTCGTCACTGGCCCATTTTTAGATGGGCTCCTAACCAACCAGAAC
GTGTTTGCTTTCAAGTACACTTCTCAAGTTGTGTTCTTCATCGTCCTGTCTTGCATGATA
TCAGTCTCTGTAAACTTCAGCACTTTTCTGGTCATTGGGAAAACGTCTCCGGTCACGTAT
CAGGTACTCGGACATCTGAAAACATGCCTGGTTCTAGCATTTGGCTATGTGTTGCTGAAG
GACCCATTCAACTGGCGCAACATTCTTGGTATTATGGTGGCTGTGATTGGAATGGTTGTT
TATTCCTATTTCTGCTCGGTTGAAACTCAGCAGAAGGCAAGTGAAACATCAACCCAGTTG
CCTCAGATGAAAGAGAGTGAGAAGGATCCGCTAATAGCAGCTGAAAATGGAAGCGGAGTG
TTATCAGATGGTGGTGGTGTTGGTGTGGGTGTGCAAAAGACGACAGCCCCTGTATGGAAC
TCGAATAGAGATTTTCAAGCCTAAAAAACTGAACATTGCTATTTTTTTTCTTATATATAT
AAATATCAAACTCTCTTTTGTATCAGATTTGTCAGAAAAGAAAAACTTTTTTTATTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB89TF U 1
AF RR2AB89JQ C 556
BS 1 749 RR2AB89TF
BS 750 1320 RR2AB89JQ

RD RR2AB89TF 749 0 0
GGACCTCACGACAACAGATCTAGGCTGAGCTTCCTTTAGCTTCGATTCTCTCGCATTTGC
TTATAGGTTTTATGCACGAATGAGATCGTTGTAGATCGTGACTGAAGCGAGAGAGAGAGA
TAAAAAAAAATTAGGAGAGCGAAGATGAGCGAGGGCCAGAAGTTCCAGCTAGGAACAATC
GGCGCTTTGAGTCTATCCGTTGTGTCGTCTGTGTCGATCGTGATCTGTAACAAGGCGCTT
ATTAGCACCCTTGGCTTCACCTTCGCGACTACATTGACAAGTTGGCATCTATTGGTCACG
TTTTGTTCCCTTCATGTGGCACTATGGATGAAGATGTTTGAACACAAACCTTTTGATCCA
CGAGCTGTGATGGGATTTGGCATTCTGAATGGGATATCTATTGGACTATTGAACCTCAGC
CTGGGCTTTAATTCCGTTGGTTTTTACCAGATGACAAAACTAGCAATCATCCCCTGTACT
GTTCTCTTGGAGACCCTCTTCTTCAGGAAAAAGTTCAGTCGAAAAATTCAGTTTTCATTA
ACCATCCTTCTCCTTGGTGTTGGAATTGCAACCGTCACAGATCTTCAGCTTAATATGCTG
GGTTCTGTCTTGTCGCTGCTGGCTGTTATCACAACTTGTGTTGCTCAAATTATGACAAAT
ACCATCCAGAAGAAGTTCAAAGTTTCATCCACGCAGCTTCTTTATCAGTCTTGCCCTTAT
CAAGCAATTACACTTTTCGTCACTGGCCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2AB89JQ 765 0 0
GGTGTTGGAATTGCAACCGTCACAGATCTTCAGCTTAATATGCTGGGTTCTGTCTTGTCG
CTGCTGGCTGTTATCACAACTTGTGTTGCTCAAATTATGACAAATACCATCCAGAAGAAG
TTCAAAGTTTCATCCACGCAGCTTCTTTATCAGTCTTGCCCTTATCAAGCAATTACACTT
TTCGTCACTGGCCCATTTTTAGATGGGCTCCTAACCAACCAGAACGTGTTTGCTTTCAAG
TACACTTCTCAAGTTGTGTTCTTCATCGTCCTGTCTTGCATGATATCAGTCTCTGTAAAC
TTCAGCACTTTTCTGGTCATTGGGAAAACGTCTCCGGTCACGTATCAGGTACTCGGACAT
CTGAAAACATGCCTGGTTCTAGCATTTGGCTATGTGTTGCTGAAGGACCCATTCAACTGG
CGCAACATTCTTGGTATTATGGTGGCTGTGATTGGAATGGTTGTTTATTCCTATTTCTGC
TCGGTTGAAACTCAGCAGAAGGCAAGTGAAACATCAACCCAGTTGCCTCAGATGAAAGAG
AGTGAGAAGGATCCGCTAATAGCAGCTGAAAATGGAAGCGGAGTGTTATCAGATGGTGGT
GGTGTTGGTGTGGGTGTGCAAAAGACGACAGCCCCTGTATGGAACTCGAATAGAGATTTT
CAAGCCTAAAAAACTGAACATTGCTATTTTTTTTCTTATATATATAAATATCAAACTCTC
TTTTGTATCAGATTTGTCAGAAAAGAAAAACTTTTTTTATTCCTC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL4146Contig1 797 2 2 U
GTTTTACCTATGTTACAAAAAAAAAAAAAAAATTTCTTTTACCTTATTGAGATTTTATAT
CCTTTCTACAGTAATGCCTTATTTTCTCATTTACCTTTTGTCGGTAAAATAAGTATTATG
ATTGTAAAAATAAATTATAAACAATATTATCACATAGATACGAAGAGAACGTTGACTAAT
CAAGGCAGCAAGTGCAAATGTTGCAGTGACACGTGACATGTTCTGTAGCCGTGGGGTTTA
GTTACCCTGCACCAAATCACGGCTTCTGATTTGGTGAGTAGTCACACAATGTCTCGAGGT
TTAAATTTGAGTTTTGAGGTGGTTGTGATACGTGAAAGAGGGCCCCTTATGCTGAATAGA
AAGTTTTGAAACAATAAACTACGCTATGTTTTTCCTTCTATTTTTGTCAACTACTACCGC
TCAATGGGGACCGAAACCACATTACAAACTAAACTATCTCCCCTTCACAAGCGATAATCC
CAAAACTAAAAAAAGATCCTCATAACAAAACCTTAATAAATCGTAAAATTGTTGAGTTTA
TGTATTTATGTCAACAAAATATATGGGTCTGAACACCTATGGTGAAAACAATGCGAATCA
ATAAACTACATATTTGTTATATGCATTTTTAACTCTTTCGTTCAAAAAGAATGCTGAGAG
ACAAAGAGAGCACATAAGGTCACATGATGTGATTATGGGCCCTGCAGTTTGTACTGCACA
CACATGTATTTTTTACCATCCACGACAGTCCTTAGGTTTGCTATTGCAGCGAAACGTAAC
GTGAAGCTTTTTTGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC48TF U 1
AF RR2EC48JQ C 180
BS 1 569 RR2EC48TF
BS 570 797 RR2EC48JQ

RD RR2EC48TF 569 0 0
GTTTTACCTATGTTACAAAAAAAAAAAAAAAATTTCTTTTACCTTATTGAGATTTTATAT
CCTTTCTACAGTAATGCCTTATTTTCTCATTTACCTTTTGTCGGTAAAATAAGTATTATG
ATTGTAAAAATAAATTATAAACAATATTATCACATAGATACGAAGAGAACGTTGACTAAT
CAAGGCAGCAAGTGCAAATGTTGCAGTGACACGTGACATGTTCTGTAGCCGTGGGGTTTA
GTTACCCTGCACCAAATCACGGCTTCTGATTTGGTGAGTAGTCACACAATGTCTCGAGGT
TTAAATTTGAGTTTTGAGGTGGTTGTGATACGTGAAAGAGGGCCCCTTATGCTGAATAGA
AAGTTTTGAAACAATAAACTACGCTATGTTTTTCCTTCTATTTTTGTCAACTACTACCGC
TCAATGGGGACCGAAACCACATTACAAACTAAACTATCTCCCCTTCACAAGCGATAATCC
CAAAACTAAAAAAAGATCCTCATAACAAAACCTTAATAAATCGTAAAATTGTTGAGTTTA
TGTATTTATGTCAACAAAATATATGGGTC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2EC48JQ 618 0 0
TCAAGGCAGCAAGTGCAAATGTTGCAGTGACACGTGACATGTTCTGTAGCCGTGGGGTTT
AGTTACCCTGCACCAAATCACGGCTTCTGATTTGGTGAGTAGTCACACAATGTCTCGAGG
TTTAAATTTGAGTTTTGAGGTGGTTGTGATACGTGAAAGAGGGCCCCTTATGCTGAATAG
AAAGTTTTGAAACAATAAACTACGCTATGTTTTTCCTTCTATTTTTGTCAACTACTACCG
CTCAATGGGGACCGAAACCACATTACAAACTAAACTATCTCCCCTTCACAAGCGATAATC
CCAAAACTAAAAAAAGATCCTCATAACAAAACCTTAATAAATCGTAAAATTGTTGAGTTT
ATGTATTTATGTCAACAAAATATATGGGTCTGAACACCTATGGTGAAAACAATGCGAATC
AATAAACTACATATTTGTTATATGCATTTTTAACTCTTTCGTTCAAAAAGAATGCTGAGA
GACAAAGAGAGCACATAAGGTCACATGATGTGATTATGGGCCCTGCAGTTTGTACTGCAC
ACACATGTATTTTTTACCATCCACGACAGTCCTTAGGTTTGCTATTGCAGCGAAACGTAA
CGTGAAGCTTTTTTGTCT

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL4147Contig1 1269 2 2 U
GAGTTTCAGCAAAGTGATTCAGGACGTGACGGGGTTCTATGTGATACTTGAAGGGTTCTT
TATGGTTGAGAATGTGAGGAAAGCTATAAGGATCGATGAGCATGTACCAGACAGTCTTAC
CACTTCGATGGTGGACGATGTGTTCTACGTGTTGCAGAGCTGTCTGAGGAGAGCGATTTC
GACTTCCAACATCAGCTCTGTGATTGCTGTGTTGAGCAATGCTGGTAGCTTGTTGGCTAA
TGATTACCATGAAGCTTTGCAGCAGAAGATTAGAGAGCCGAACCTTGGTGCTAGGTTGTT
CTTGGGTGGTATTGGTGTGGAAAACACTGGAACTGAGATTGCAACTGCTTTGAACAATAT
GGATGTGAGCTGCGAGTATATTCTCAAACTAAAACATGAAATCGAGGAGCAATGTACTGA
GGTGTTTCCTGCACCAGCAGATCGAGAGAGGATAAAGTCATGTCTATCCGAGCTAGGCGA
GCTAAGCAACACGTTCAAGCAGCTACTGAACTCAGGCATGGAACAGCTAGTAGCAACCGT
AACGCCAAGAATCCGTCCGGTTCTAGACACTGTAGCTACCATAAGCTACGAGCTGACAGA
AACAGAGTACGCAGAGAACGAGGTGAACGACCCGTGGGTCCAACGACTTCTCCACTCGGT
GGAAACGAACGCTGCGTGGCTCCAACCACTGATGACATCAAACAACTATGACTCGTTTCT
GCATCTCATAATAGATTTCATAGTGAAGAGACTTGAAGTGATAATGATGCAGAAACGGTT
TAGCCAGCTTGGTGGTCTTCAGCTAGACCGGGACACGAGGGCTTTGGTTAGCCATTTCTC
GGGTATGACTCAGAGAACGGTGGGAGATAAGTTCGCTCGGTTAACTCAAATGGCGGCGAT
ACTTAACTTGGAGAAGGTCTCAGAGATTTTGGACTTCTGGGGAGAGAACCCAGGGCCTAT
GACTTGGAGACTCACACCGGCTGAGGTTAGACGGGTCTTGGGTCTTCGGGTCGAGTTTAA
ACCCGAATCTATTGCTGCTCTCAAGTTGTGATGTTAATTTGATTATGTTGTCAACCCACG
AATTACTCAGTTTTGGTGTTGATAAATTCTTGTTTTGGTGTATAACCGTGTATTGCATAG
TGCATGATCAACGGTTTATCTTCTTTTTTTTTCTTTTCCTTTTTCTATATATCGAAACTA
CACGTATGACATAATATTTGTTGCATGGTCTCACGTCGGGGGTGGGAAAAAACCTGAGAT
CCAGACCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI62TF U 1
AF RR2BI62JQ C 447
BS 1 813 RR2BI62TF
BS 814 1269 RR2BI62JQ

RD RR2BI62TF 813 0 0
GAGTTTCAGCAAAGTGATTCAGGACGTGACGGGGTTCTATGTGATACTTGAAGGGTTCTT
TATGGTTGAGAATGTGAGGAAAGCTATAAGGATCGATGAGCATGTACCAGACAGTCTTAC
CACTTCGATGGTGGACGATGTGTTCTACGTGTTGCAGAGCTGTCTGAGGAGAGCGATTTC
GACTTCCAACATCAGCTCTGTGATTGCTGTGTTGAGCAATGCTGGTAGCTTGTTGGCTAA
TGATTACCATGAAGCTTTGCAGCAGAAGATTAGAGAGCCGAACCTTGGTGCTAGGTTGTT
CTTGGGTGGTATTGGTGTGGAAAACACTGGAACTGAGATTGCAACTGCTTTGAACAATAT
GGATGTGAGCTGCGAGTATATTCTCAAACTAAAACATGAAATCGAGGAGCAATGTACTGA
GGTGTTTCCTGCACCAGCAGATCGAGAGAGGATAAAGTCATGTCTATCCGAGCTAGGCGA
GCTAAGCAACACGTTCAAGCAGCTACTGAACTCAGGCATGGAACAGCTAGTAGCAACCGT
AACGCCAAGAATCCGTCCGGTTCTAGACACTGTAGCTACCATAAGCTACGAGCTGACAGA
AACAGAGTACGCAGAGAACGAGGTGAACGACCCGTGGGTCCAACGACTTCTCCACTCGGT
GGAAACGAACGCTGCGTGGCTCCAACCACTGATGACATCAAACAACTATGACTCGTTTCT
GCATCTCATAATAGATTTCATAGTGAAGAGACTTGAAGTGATAATGATGCAGAAACGGTT
TAGCCAGCTTGGTGGTCTTCAGCTAGACCGGGA

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2BI62JQ 823 0 0
AGAGGATAAAGTCATGTCTATCCGAGCTAGGCGAGCTAAGCAACACGTTCAAGCAGCTAC
TGAACTCAGGCATGGAACAGCTAGTAGCAACCGTAACGCCAAGAATCCGTCCGGTTCTAG
ACACTGTAGCTACCATAAGCTACGAGCTGACAGAAACAGAGTACGCAGAGAACGAGGTGA
ACGACCCGTGGGTCCAACGACTTCTCCACTCGGTGGAAACGAACGCTGCGTGGCTCCAAC
CACTGATGACATCAAACAACTATGACTCGTTTCTGCATCTCATAATAGATTTCATAGTGA
AGAGACTTGAAGTGATAATGATGCAGAAACGGTTTAGCCAGCTTGGTGGTCTTCAGCTAG
ACCGGGACACGAGGGCTTTGGTTAGCCATTTCTCGGGTATGACTCAGAGAACGGTGGGAG
ATAAGTTCGCTCGGTTAACTCAAATGGCGGCGATACTTAACTTGGAGAAGGTCTCAGAGA
TTTTGGACTTCTGGGGAGAGAACCCAGGGCCTATGACTTGGAGACTCACACCGGCTGAGG
TTAGACGGGTCTTGGGTCTTCGGGTCGAGTTTAAACCCGAATCTATTGCTGCTCTCAAGT
TGTGATGTTAATTTGATTATGTTGTCAACCCACGAATTACTCAGTTTTGGTGTTGATAAA
TTCTTGTTTTGGTGTATAACCGTGTATTGCATAGTGCATGATCAACGGTTTATCTTCTTT
TTTTTTCTTTTCCTTTTTCTATATATCGAAACTACACGTATGACATAATATTTGTTGCAT
GGTCTCACGTCGGGGGTGGGAAAAAACCTGAGATCCAGACCGT

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL4148Contig1 711 2 2 U
GTCGCAGTTCGCTTCTCCATCGTCGCCGGAGGAAGACATGAAAGTCAAGGTCTTGCGTAT
CCTTCTACTTCATCTTCTCTGCAGACATAGGTTCTTTGATGCTTAAAACATGATTTTTTA
AGATGCAGCTTAGGTTTGTTTCCTAAGATCTAGAGTTGTTCTCTTTTCAGTAATTTCAGT
TTTGATTACTGACGTAGATGACTTTCTAATAGTTTTTTTTTCGCTGAGGACTCTTGTCGT
TACCTCTCAACTAGTTCACATAGCTCAAAGTTTCTTAATTTAGGATTTTGTTTCCAAAGA
AATGTTTCTTCCTTGACTCTCAGTGCTACTATGTCTTTACTGACTTTAAAAAAACAGAGT
GGCACGCGGTTGCGTCATGGACATGGGATGCTCAAGATGAGACATGTGGGATATGTCGTA
TGCCATTTGACGGTTGTTGTCCAGACTGCAAACTCCCTGGAGATGATTGCCCCCTAATTT
GGGGAGCTTGCAACCATTCGTTCCATCTCCATTGTATATTGAAATGGGTCAATTCACAGA
CGAGTCAAGCTCATTGCCCCATGTGCCGTAGAGAATGGCGATTCAAAGAGTAACAAGGAG
TGGAGAGAGACCCACCCTTTGTGTTGTGCTTTGAGTAGATGCCTAGCATTGGTTTTCATT
TGCAGAGATGTGTTGTATCGTTGTTCCGAATTTAGTACGACCCTTGATGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2F315TF U 1
AF RR2F315JQ C 37
BS 1 706 RR2F315TF
BS 707 711 RR2F315JQ

RD RR2F315TF 706 0 0
GTCGCAGTTCGCTTCTCCATCGTCGCCGGAGGAAGACATGAAAGTCAAGGTCTTGCGTAT
CCTTCTACTTCATCTTCTCTGCAGACATAGGTTCTTTGATGCTTAAAACATGATTTTTTA
AGATGCAGCTTAGGTTTGTTTCCTAAGATCTAGAGTTGTTCTCTTTTCAGTAATTTCAGT
TTTGATTACTGACGTAGATGACTTTCTAATAGTTTTTTTTTCGCTGAGGACTCTTGTCGT
TACCTCTCAACTAGTTCACATAGCTCAAAGTTTCTTAATTTAGGATTTTGTTTCCAAAGA
AATGTTTCTTCCTTGACTCTCAGTGCTACTATGTCTTTACTGACTTTAAAAAAACAGAGT
GGCACGCGGTTGCGTCATGGACATGGGATGCTCAAGATGAGACATGTGGGATATGTCGTA
TGCCATTTGACGGTTGTTGTCCAGACTGCAAACTCCCTGGAGATGATTGCCCCCTAATTT
GGGGAGCTTGCAACCATTCGTTCCATCTCCATTGTATATTGAAATGGGTCAATTCACAGA
CGAGTCAAGCTCATTGCCCCATGTGCCGTAGAGAATGGCGATTCAAAGAGTAACAAGGAG
TGGAGAGAGACCCACCCTTTGTGTTGTGCTTTGAGTAGATGCCTAGCATTGGTTTTCATT
TGCAGAGATGTGTTGTATCGTTGTTCCGAATTTAGTACGACCCTTG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2F315JQ 675 0 0
CATGAAAGTCAAGGTCTTGCGTATCTTTCTACTTCATCTTCTCTGCAGACATAGGTTCTT
TGATGCTTAAAACATGATTTTTTAAGATGCAGCTTAGGTTTGTTTCCTAAGATCTAGAGT
TGTTCTCTTTTCAGTAATTTCAGTTTTGATTACTGACGTAGATGACTTTCTAATAGTTTT
TTTTTCGCTGAGGACTCTTGTCGTTACCTCTCAACTAGTTCACATAGCTCAAAGTTTCTT
AATTTAGGATTTTGTTTCCAAAGAAATGTTTCTTCCTTGACTCTCAGTGCTACTATGTCT
TTACTGACTTTAAAAAAACAGAGTGGCACGCGGTTGCGTCATGGACATGGGATGCTCAAG
ATGAGACATGTGGGATATGTCGTATGCCATTTGACGGTTGTTGTCCAGACTGCAAACTCC
CTGGAGATGATTGCCCCCTAATTTGGGGAGCTTGCAACCATTCGTTCCATCTCCATTGTA
TATTGAAATGGGTCAATTCACAGACGAGTCAAGCTCATTGCCCCATGTGCCGTAGAGAAT
GGCGATTCAAAGAGTAACAAGGAGTGGAGAGAGACCCACCCTTTGTGTTGTGCTTTGAGT
AGATGCCTAGCATTGGTTTTCATTTGCAGAGATGTGTTGTATCGTTGTTCCGAATTTAGT
ACGACCCTTGATGGA

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL4149Contig1 600 2 1 U
GTTTCTTGGAAGAGTTCTCTTCGCTTCTCTCTTCATCCTCTCCGCATGGCAAATGTTCAA
TGACTTTGGAGTTGATGGTGGTCCTGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCAAAGCTTCATCTAGC
CAAGTCACATCTATCTTCTAGATTAGGTGTAACTTTGCCTAGCGTAGAGGCAAAACAAGT
CGTCGTTGCTATAGTTGCGTTGAAAGGAGTTGGAGGCGTACTCTTTGTTATTGGAAACAT
CTTCGGTGCTTATCTTCTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTCAGTCCTATTCTGTATGATTT
CTACAACTACGGACCTGAGGAGCGTCATTTCTCTCCATTGTTGACTGAGTTCTTGCAGAG
CGTTGCACTCTTTGGAGCATTACTCTTCTTTATTGGAATGAAGAACTCAACACCAACTAA
GAGGAATCTGAAGAGGACTCCTAAGCCGAAAGCTGCTTAGTATCTTCTGGATTGCCACAC
TCAATACCTTCAGAACTTTTTTTTTTGTTCGGAAAAATTCGTTTCTTAGCACTTTTGGTT
TTATTTTTGTTGTACGATTCTTAAATTGGCTCATGATATCATATCGCTATCTTTTACTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B279JQ C 1
AF RR2B279TF U 1
BS 1 600 RR2B279TF

RD RR2B279JQ 600 0 0
GTTTCTTGGAAGAGTTCTCTTCGCTTCTCTCTTCATCCTCTCCGCATGGCAAATGTTCAA
TGACTTTGGAGTTGATGGTGGTCCTGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCAAAGCTTCATCTAGC
CAAGTCACATCTATCTTCTAGATTAGGTGTAACTTTGCCTAGCGTAGAGGCAAAACAAGT
CGTCGTTGCTATAGTTGCGTTGAAAGGAGTTGGAGGCGTACTCTTTGTTATTGGAAACAT
CTTCGGTGCTTATCTTCTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTCAGTCCTATTCTGTATGATTT
CTACAACTACGGACCTGAGGAGCGTCATTTCTCTCCATTGTTGACTGAGTTCTTGCAGAG
CGTTGCACTCTTTGGAGCATTACTCTTCTTTATTGGAATGAAGAACTCAACACCAACTAA
GAGGAATCTGAAGAGGACTCCTAAGCCGAAAGCTGCTTAGTATCTTCTGGATTGCCACAC
TCAATACCTTCAGAACTTTTTTTTTTGTTCGGAAAAATTCGTTTCTTAGCACTTTTGGTT
TTATTTTTGTTGTACGATTCTTAAATTGGCTCATGATATCATATCGCTATCTTTTACTTC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2B279TF 600 0 0
GTTTCTTGGAAGAGTTCTCTTCGCTTCTCTCTTCATCCTCTCCGCATGGCAAATGTTCAA
TGACTTTGGAGTTGATGGTGGTCCTGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCAAAGCTTCATCTAGC
CAAGTCACATCTATCTTCTAGATTAGGTGTAACTTTGCCTAGCGTAGAGGCAAAACAAGT
CGTCGTTGCTATAGTTGCGTTGAAAGGAGTTGGAGGCGTACTCTTTGTTATTGGAAACAT
CTTCGGTGCTTATCTTCTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTCAGTCCTATTCTGTATGATTT
CTACAACTACGGACCTGAGGAGCGTCATTTCTCTCCATTGTTGACTGAGTTCTTGCAGAG
CGTTGCACTCTTTGGAGCATTACTCTTCTTTATTGGAATGAAGAACTCAACACCAACTAA
GAGGAATCTGAAGAGGACTCCTAAGCCGAAAGCTGCTTAGTATCTTCTGGATTGCCACAC
TCAATACCTTCAGAACTTTTTTTTTTGTTCGGAAAAATTCGTTTCTTAGCACTTTTGGTT
TTATTTTTGTTGTACGATTCTTAAATTGGCTCATGATATCATATCGCTATCTTTTACTTC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4151Contig1 1012 2 2 U
GGATACACGAGGTTACATTATCAACAGAGAGCTAAGAAAAAAAACATAACACGCAGAGTC
ACATAAATATAGCTTAATGGAGGTGCACAAGGTGGTTGCTCCGCCGCATAGGAGCACGGC
GGCGAAGCTGAAGACAAGACTGAAGGAGACTTTCTTCCCTGATGATCCTCTAAGACAGTT
CAGAGGACAACCGAACCGTACCAAACTCGTCATATATGGAGGATTGATAAGTTTGATTTC
TTGGTGATGTTATGCGCCTTCTTTGGTGTTGTTTTCTTGTCGGTCCAGAACGGTCTAGCT
ATAGCGGTGGGACTATCGTTGTTCAAGTTATTAATGCAAGTAACGAGGCCGAAGACCGTT
ATTATGGGCAATATTCCGGGGACAGATGTGTACCGTAATCTTCATCATTACAAAGATGCA
CGAAGGATCCCAGGGTTCATTGTCCTAAGCATTGAATCTCCTGTCAATTTTGCCAATTCT
AATTACCTCACCGAAAGAACATCTCGTTGGATAGAAGAATGCGAAGAAGAGGAAGCACAG
GAGAAGCATTCTAGCCTTCGGTTCTTGATTCTTGAAATGTCAGCTGTGAGTGGGGTGGAC
ACAAACGGTGTCTCATTCTTTAAAGAATTGAAGAAAACCACAGCGAAGAAGAACATCGAG
CTTGTGTTTGTGAACCCATTAAGTGAAGTGATGGAGAAGCTACAAAGAGCTGACGAAGAA
GAAGAGTTCATGAGGCCTGAGTTTCTCTTCTTGACTGTTTCTGAGGCCGTTGCGTCGCTC
TCTCTTAAAGGAGGCCCATCTCTCAATAACGTTTGACACTAAAGATTTTGTTTTATCTGT
CCAAATATGATATTTGGCAGATGGTTAAAGGTCCCCTTCTTTTTCTATTTTCAGTACAGC
TAAGTTGTATGCTATGTTCATTTCTCTTTCTCTATCATTGAATTGATCAAGAATCTCAAG
ATGTATGTTTTGGTATGAGCTTTTGCTAATATGGAGTTTAGCCGATTGAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW84TF U 1
AF RR2GW84JQ C 266
BS 1 651 RR2GW84TF
BS 652 1012 RR2GW84JQ

RD RR2GW84TF 651 0 0
GGATACACGAGGTTACATTATCAACAGAGAGCTAAGAAAAAAAACATAACACGCAGAGTC
ACATAAATATAGCTTAATGGAGGTGCACAAGGTGGTTGCTCCGCCGCATAGGAGCACGGC
GGCGAAGCTGAAGACAAGACTGAAGGAGACTTTCTTCCCTGATGATCCTCTAAGACAGTT
CAGAGGACAACCGAACCGTACCAAACTCGTCATATATGGAGGATTGATAAGTTTGATTTC
TTGGTGATGTTATGCGCCTTCTTTGGTGTTGTTTTCTTGTCGGTCCAGAACGGTCTAGCT
ATAGCGGTGGGACTATCGTTGTTCAAGTTATTAATGCAAGTAACGAGGCCGAAGACCGTT
ATTATGGGCAATATTCCGGGGACAGATGTGTACCGTAATCTTCATCATTACAAAGATGCA
CGAAGGATCCCAGGGTTCATTGTCCTAAGCATTGAATCTCCTGTCAATTTTGCCAATTCT
AATTACCTCACCGAAAGAACATCTCGTTGGATAGAAGAATGCGAAGAAGAGGAAGCACAG
GAGAAGCATTCTAGCCTTCGGTTCTTGATTCTTGAAATGTCAGCTGTGAGTGGGGTGGAC
ACAAACGGTGTCTCATTCTTTAAAGAATTGAAGAAAACCACAGCGAAGAAG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2GW84JQ 747 0 0
GTGTTGTTTTCTTGTCGGTCCAGAACGGTCTAGCTATAGCGGTGGGACTATCGTTGTTCA
AGTTATTAATGCAAGTAACGAGGCCGAAGACCGTTATTATGGGCAATATTCCGGGGACAG
ATGTGTACCGTAATCTTCATCATTACAAAGATGCACGAAGGATCCCAGGGTTCATTGTCC
TAAGCATTGAATCTCCTGTCAATTTTGCCAATTCTAATTACCTCACCGAAAGAACATCTC
GTTGGATAGAAGAATGCGAAGAAGAGGAAGCACAGGAGAAGCATTCTAGCCTTCGGTTCT
TGATTCTTGAAATGTCAGCTGTGAGTGGGGTGGACACAAACGGTGTCTCATTCTTTAAAG
AATTGAAGAAAACCACAGCGAAGAAGAACATCGAGCTTGTGTTTGTGAACCCATTAAGTG
AAGTGATGGAGAAGCTACAAAGAGCTGACGAAGAAGAAGAGTTCATGAGGCCTGAGTTTC
TCTTCTTGACTGTTTCTGAGGCCGTTGCGTCGCTCTCTCTTAAAGGAGGCCCATCTCTCA
ATAACGTTTGACACTAAAGATTTTGTTTTATCTGTCCAAATATGATATTTGGCAGATGGT
TAAAGGTCCCCTTCTTTTTCTATTTTCAGTACAGCTAAGTTGTATGCTATGTTCATTTCT
CTTTCTCTATCATTGAATTGATCAAGAATCTCAAGATGTATGTTTTGGTATGAGCTTTTG
CTAATATGGAGTTTAGCCGATTGAGTC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4153Contig1 698 2 1 U
GCCATCTCTGATCAGCCATTATTAATCTCATCTGTTGTTCATGATGAAGAAGAAAGCTGC
CCTTACACCGTGATTGTCACCACGAGCTGTTTCTCTCCTGATTTGTCAAGGGATCAGATC
ACTCTCGCTTTGGGTGACGCCGACGGTAACAAGGTGGTCGCACCGAGACTAGACGAACCG
TTAGGTGGTGGAGGAGGTTTCGAGAAATGTTCATCTGACACATTCCAAGTCCGTGAAATT
CGATTTCAACAAAAACGTCCCTGAGAACACTTGGTACGGCCACAACTATTGCAACAACAC
CGGTTTGCCACTACCTTCGCCGGATAAACCTCCTCCGTTTAAACCCACAGTCCCACCGCC
CCACCCACCTCATTCTCCTCCCGACAAACCTTCTATCCCACCACCAGCACCACCCCATGC
ACCACCCCATCCACCACCATCTGCTGCCTCTGGACGTGGAGTTGGTGAGAGTTTGGTTGT
TGCGTCTGCTGCGATTGTGATTGCGTTAGCGGCTGTGGTGGTTTGAGTTTCTAGTTAAGA
GTTGCTTTAATGACTAATAAGTATGGTGTAGTGACTTTTGTTTTCTGTTTGTAGTAGTTG
GAGATCCTGGAGACCTTGATTAGTTAATGTATCGAGTCATGAAGTACTAGTAATCAATAT
AAATGAAACATGCACTAGTGTGTTTGCATGTGATTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AE13JQ C 1
AF RR2AE13TF U 1
BS 1 698 RR2AE13TF

RD RR2AE13JQ 698 0 0
GCCATCTCTGATCAGCCATTATTAATCTCATCTGTTGTTCATGATGAAGAAGAAAGCTGC
CCTTACACCGTGATTGTCACCACGAGCTGTTTCTCTCCTGATTTGTCAAGGGATCAGATC
ACTCTCGCTTTGGGTGACGCCGACGGTAACAAGGTGGTCGCACCGAGACTAGACGAACCG
TTAGGTGGTGGAGGAGGTTTCGAGAAATGTTCATCTGACACATTCCAAGTCCGTGAAATT
CGATTTCAACAAAAACGTCCCTGAGAACACTTGGTACGGCCACAACTATTGCAACAACAC
CGGTTTGCCACTACCTTCGCCGGATAAACCTCCTCCGTTTAAACCCACAGTCCCACCGCC
CCACCCACCTCATTCTCCTCCCGACAAACCTTCTATCCCACCACCAGCACCACCCCATGC
ACCACCCCATCCACCACCATCTGCTGCCTCTGGACGTGGAGTTGGTGAGAGTTTGGTTGT
TGCGTCTGCTGCGATTGTGATTGCGTTAGCGGCTGTGGTGGTTTGAGTTTCTAGTTAAGA
GTTGCTTTAATGACTAATAAGTATGGTGTAGTGACTTTTGTTTTCTGTTTGTAGTAGTTG
GAGATCCTGGAGACCTTGATTAGTTAATGTATCGAGTCATGAAGTACTAGTAATCAATAT
AAATGAAACATGCACTAGTGTGTTTGCATGTGATTTAC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2AE13TF 698 0 0
GCCATCTCTGATCAGCCATTATTAATCTCATCTGTTGTTCATGATGAAGAAGAAAGCTGC
CCTTACACCGTGATTGTCACCACGAGCTGTTTCTCTCCTGATTTGTCAAGGGATCAGATC
ACTCTCGCTTTGGGTGACGCCGACGGTAACAAGGTGGTCGCACCGAGACTAGACGAACCG
TTAGGTGGTGGAGGAGGTTTCGAGAAATGTTCATCTGACACATTCCAAGTCCGTGAAATT
CGATTTCAACAAAAACGTCCCTGAGAACACTTGGTACGGCCACAACTATTGCAACAACAC
CGGTTTGCCACTACCTTCGCCGGATAAACCTCCTCCGTTTAAACCCACAGTCCCACCGCC
CCACCCACCTCATTCTCCTCCCGACAAACCTTCTATCCCACCACCAGCACCACCCCATGC
ACCACCCCATCCACCACCATCTGCTGCCTCTGGACGTGGAGTTGGTGAGAGTTTGGTTGT
TGCGTCTGCTGCGATTGTGATTGCGTTAGCGGCTGTGGTGGTTTGAGTTTCTAGTTAAGA
GTTGCTTTAATGACTAATAAGTATGGTGTAGTGACTTTTGTTTTCTGTTTGTAGTAGTTG
GAGATCCTGGAGACCTTGATTAGTTAATGTATCGAGTCATGAAGTACTAGTAATCAATAT
AAATGAAACATGCACTAGTGTGTTTGCATGTGATTTAC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL4154Contig1 1026 2 2 U
GGAAACTAGGAATTAAACACAGATGGGGAGCGTAAGAATACAACCACCGTCTTCTTCATC
GACACATCTTATCCACAACCTTCTCCGACATCCCGAACCACCGTCTTCCTTCTGTCTCTT
CATCAGACCCTTTCGCTTCTCCGCTGTAACATGTCAATCCAGCCGCTGTAACAAGCCTCG
GTTTCAATCAATCTCTTCAAAGCCTCCGCTTCCTTTTCACTCTACTTCTTCTTCTTCTTC
ACTCGTAGCGAAATCCTTTTCTGCCATCGATGAGCCGGACCTCGGAGAAGAAGATGAGAG
CGAGGAATACGATTACAAAGAAGAAGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGAGTGGAATGGT
ATCCGCGAGAGGAAGTGAGGACGACTACGAGGAGGATAAGATAGAGAAGATGAAGAAGAA
GGCTCGGGGCTCGGGTTTGAAGTTGACGATAAAGGAGAAGAAGGAACTTGCTTCATACGC
CCATAGTCTTGGTGACAAATTGAAATGTCAACTCGTCGGAAAATCTGGCGTTACTGATTC
GGTGGTTTTCTCATTCCTCGAGACTCTCGAGAAGAACGAGCTCTTAAAGGTGAAGATACG
GAAGACATCTCCAGAGGAGATGGAGGACGCTGTTATGCATTTGGAGGAAGCCACTGGTTC
TGTTGCTGTTGGCCAAATCGGGAGGACCGTGATATTGTACCGCCCTAGTCCCACCAAAAT
GAAAGCTGAGGAGAAGAAGAAGGAAGTTGAGAGATTGTTGATTAGAAGGAGACAGAAGTT
CTCAAACTCCCGACCCACTAGACCTTTTAGGAGAGAGTATTCAGAGAGACCTGATGGACG
TGGACGCAGAGGAGGAAGTAGAGTTGCAACGCCTTGATTTTTTTGTTATTGTTAATTTGC
TCGGTTTGTTTTTTTATTATCACCTAAGTAGACCAGTTCTTTGCTTTTGTATGCCTTCTT
CAAAAAAATACAATCTCGATCTGTAAACCCTCCATTGCTGGGAAGCTGTAACCATTTGTG
GCCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO40TF U 1
AF RR2BO40JQ C 257
BS 1 643 RR2BO40TF
BS 644 1026 RR2BO40JQ

RD RR2BO40TF 643 0 0
GGAAACTAGGAATTAAACACAGATGGGGAGCGTAAGAATACAACCACCGTCTTCTTCATC
GACACATCTTATCCACAACCTTCTCCGACATCCCGAACCACCGTCTTCCTTCTGTCTCTT
CATCAGACCCTTTCGCTTCTCCGCTGTAACATGTCAATCCAGCCGCTGTAACAAGCCTCG
GTTTCAATCAATCTCTTCAAAGCCTCCGCTTCCTTTTCACTCTACTTCTTCTTCTTCTTC
ACTCGTAGCGAAATCCTTTTCTGCCATCGATGAGCCGGACCTCGGAGAAGAAGATGAGAG
CGAGGAATACGATTACAAAGAAGAAGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGAGTGGAATGGT
ATCCGCGAGAGGAAGTGAGGACGACTACGAGGAGGATAAGATAGAGAAGATGAAGAAGAA
GGCTCGGGGCTCGGGTTTGAAGTTGACGATAAAGGAGAAGAAGGAACTTGCTTCATACGC
CCATAGTCTTGGTGACAAATTGAAATGTCAACTCGTCGGAAAATCTGGCGTTACTGATTC
GGTGGTTTTCTCATTCCTCGAGACTCTCGAGAAGAACGAGCTCTTAAAGGTGAAGATACG
GAAGACATCTCCAGAGGAGATGGAGGACGCTGTTATGCATTTG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2BO40JQ 770 0 0
TTTTCTGCCATCGATGAGCCGGACCTCGGAGAAGAAGATGAGAGCGAGGAATACGATTAC
AAAGAAGAAGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGAGTGGAATGGTATCCGCGAGAGGAAGT
GAGGACGACTACGAGGAGGATAAGATAGAGAAGATGAAGAAGAAGGCTCGGGGCTCGGGT
TTGAAGTTGACGATAAAGGAGAAGAAGGAACTTGCTTCATACGCCCATAGTCTTGGTGAC
AAATTGAAATGTCAACTCGTCGGAAAATCTGGCGTTACTGATTCGGTGGTTTTCTCATTC
CTCGAGACTCTCGAGAAGAACGAGCTCTTAAAGGTGAAGATACGGAAGACATCTCCAGAG
GAGATGGAGGACGCTGTTATGCATTTGGAGGAAGCCACTGGTTCTGTTGCTGTTGGCCAA
ATCGGGAGGACCGTGATATTGTACCGCCCTAGTCCCACCAAAATGAAAGCTGAGGAGAAG
AAGAAGGAAGTTGAGAGATTGTTGATTAGAAGGAGACAGAAGTTCTCAAACTCCCGACCC
ACTAGACCTTTTAGGAGAGAGTATTCAGAGAGACCTGATGGACGTGGACGCAGAGGAGGA
AGTAGAGTTGCAACGCCTTGATTTTTTTGTTATTGTTAATTTGCTCGGTTTGTTTTTTTA
TTATCACCTAAGTAGACCAGTTCTTTGCTTTTGTATGCCTTCTTCAAAAAAATACAATCT
CGATCTGTAAACCCTCCATTGCTGGGAAGCTGTAACCATTTGTGGCCATG

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL4155Contig1 927 2 2 U
GGATATCAGCCCCACTTTGCTCCCATTCTTCTTCTCCTTCTTCATCTCATACCTCACTCC
CCCTCACTTCTCATCTCTCTGTCTCGGCACTAACGAACTCTCAAAAACCAAACAACACTA
AAAAGCTTATCTTCGGTCTTAATATCAGAAATGAGAGAGCTTGAGCGGTTGAAGACGAGC
ATGAACCACCATCAATGGCCACCCATTGGAGCTCCGATGAATATCCGGCGAGAAGAGCCG
TGGAAATCTCGATTCGACGACTCAGTCAACGCCGTCTCGTTCGGGTTCGTCGCAACAGCC
ATTCTCATCTCAATGTTCCTCGTCATGGCTATCTTCGAGAGACTGATCCGGACCACCACC
ACCACGACTACTACTACTAACCAAGATTCCTCTTCTGGTCGGGCCCTTTCGGGTATGGAT
TCTCGGGTCGGGTACAACGGTGCAGCATCTAAGCTCGGTTATCAATCTCCAAAGATGACT
GTTTACACGAACGGGGTATTGGTATTGATGCCAGGAGATGATATCCCTACTTTCATCGCA
CATCGAGCGCCCGTGCCATGTCCTCAACGCATCATCTCACCGTCTCAGCATCAACATAGC
TCATCGAGTGATTCTTCCAACTCAAACTCTATTCAAGAATGTTGAAAGACTTGTTTATTT
TATCTCGTACCATCACCACCACCATTGGCTTATTAAAACATTTCAAGCCACCAACCACAT
TGAGCTGAGTTGAGTTTGGCATCTGATGTTTTTTTTTTTCTCCTGATGATACCGCTACAT
ATATTGGGTTCGGGAGATTATTTATGCGTATTTTGTGTACATAGGCATTATTAGGAAACT
GGTTTATGCCCTTAGCATAATTAATCATATATATAATCAAGATTTGACTCTCTCTTTTGT
TAGAGCTTCTCTGTCATTTGCTAGTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP40TF U 1
AF RR2FP40JQ C 355
BS 1 739 RR2FP40TF
BS 740 927 RR2FP40JQ

RD RR2FP40TF 739 0 0
GGATATCAGCCCCACTTTGCTCCCATTCTTCTTCTCCTTCTTCATCTCATACCTCACTCC
CCCTCACTTCTCATCTCTCTGTCTCGGCACTAACGAACTCTCAAAAACCAAACAACACTA
AAAAGCTTATCTTCGGTCTTAATATCAGAAATGAGAGAGCTTGAGCGGTTGAAGACGAGC
ATGAACCACCATCAATGGCCACCCATTGGAGCTCCGATGAATATCCGGCGAGAAGAGCCG
TGGAAATCTCGATTCGACGACTCAGTCAACGCCGTCTCGTTCGGGTTCGTCGCAACAGCC
ATTCTCATCTCAATGTTCCTCGTCATGGCTATCTTCGAGAGACTGATCCGGACCACCACC
ACCACGACTACTACTACTAACCAAGATTCCTCTTCTGGTCGGGCCCTTTCGGGTATGGAT
TCTCGGGTCGGGTACAACGGTGCAGCATCTAAGCTCGGTTATCAATCTCCAAAGATGACT
GTTTACACGAACGGGGTATTGGTATTGATGCCAGGAGATGATATCCCTACTTTCATCGCA
CATCGAGCGCCCGTGCCATGTCCTCAACGCATCATCTCACCGTCTCAGCATCAACATAGC
TCATCGAGTGATTCTTCCAACTCAAACTCTATTCAAGAATGTTGAAAGACTTGTTTATTT
TATCTCGTACCATCACCACCACCATTGGCTTATTAAAACATTTCAAGCCACCAACCACAT
TGAGCTGAGTTGAGTTTGG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2FP40JQ 573 0 0
ACCACCACCACGACTACTACTACTAACCAAGATTCCTCTTCTGGTCGGGCCCTTTCGGGT
ATGGATTCTCGGGTCGGGTACAACGGTGCAGCATCTAAGCTCGGTTATCAATCTCCAAAG
ATGACTGTTTACACGAACGGGGTATTGGTATTGATGCCAGGAGATGATATCCCTACTTTC
ATCGCACATCGAGCGCCCGTGCCATGTCCTCAACGCATCATCTCACCGTCTCAGCATCAA
CATAGCTCATCGAGTGATTCTTCCAACTCAAACTCTATTCAAGAATGTTGAAAGACTTGT
TTATTTTATCTCGTACCATCACCACCACCATTGGCTTATTAAAACATTTCAAGCCACCAA
CCACATTGAGCTGAGTTGAGTTTGGCATCTGATGTTTTTTTTTTTCTCCTGATGATACCG
CTACATATATTGGGTTCGGGAGATTATTTATGCGTATTTTGTGTACATAGGCATTATTAG
GAAACTGGTTTATGCCCTTAGCATAATTAATCATATATATAATCAAGATTTGACTCTCTC
TTTTGTTAGAGCTTCTCTGTCATTTGCTAGTTA

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL4156Contig1 836 2 12 U
GGACCCATCGCTCATAGTTACTTCCTCTCTCTCCCTTCTTTTGCCATGGCTGAGCCAAGA
ACAAAATACAGTGAATACAGCTAACAAGAGATATCAAAACAACATTGCTCAAAAAAAAAA
ACAACGAGAAGAACAAACGGCATGAGAGAGCTACAGAGCTTCAAAATGACGTCACTATAT
CAGAACCATCAATGGCCACCTGTGGGAGCTCCAACGAATATCCGACAAGAGGGGAAATGG
GGATCTCAGTTCAACGATCCAGTCAACGCTGTGTCTTTTGGTTTTATCGCCACAGCCATT
CTCATCTCAATGTTCATTGTCATGGCCATGTTCGAAATGCTTATTCGAACCACCACCACT
AACTCACATTCTTCTCCGGGACAGGTCCTTTCGGGTCTAGAGTCACGGGTGGGACTCAAT
GGACTTGCATTTTCGAAGTTTGGTTGCGAATCTCCCAAGATAGGGGTGTACTCAAAAGGG
GTCTCGGTGTTAATGCCAGGAGACAATGTACCTACATTCATTGCTCACCATGCACCCGTA
CCCGCACCTGCAGACAAAAAGTCCAACACTCAAAGTTCCAGCGCAAACTCCATTCAAGAA
TGTTAACAACTCTAGATTTGCATTATTAAGTGTTTTGTTCCTCTGTAGCTTCATCGCTTA
GATTACTGGAGGTTGAGTATCTCGTCGTAGATATAACTAAAGGAACCAAGCTGCAAAAGC
CTGGCTTAAGTATATATGTATTTATATGATTTGCCAGATTTTAAAATTTGTTGAATTTCA
TATGCTTATTACAAGAAAATAAGTTGAAGGGGAGAGAATGAATGTGTTTTCACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX29TF U 1
AF RR2EX29JQ C 378
BS 1 704 RR2EX29TF
BS 705 705 RR2EX29JQ
BS 706 717 RR2EX29TF
BS 718 718 RR2EX29JQ
BS 719 754 RR2EX29TF
BS 755 755 RR2EX29JQ
BS 756 761 RR2EX29TF
BS 762 763 RR2EX29JQ
BS 764 774 RR2EX29TF
BS 775 775 RR2EX29JQ
BS 776 789 RR2EX29TF
BS 790 836 RR2EX29JQ

RD RR2EX29TF 799 0 0
GGACCCATCGCTCATAGTTACTTCCTCTCTCTCCCTTCTTTTGCCATGGCTGAGCCAAGA
ACAAAATACAGTGAATACAGCTAACAAGAGATATCAAAACAACATTGCTCAAAAAAAAAA
ACAACGAGAAGAACAAACGGCATGAGAGAGCTACAGAGCTTCAAAATGACGTCACTATAT
CAGAACCATCAATGGCCACCTGTGGGAGCTCCAACGAATATCCGACAAGAGGGGAAATGG
GGATCTCAGTTCAACGATCCAGTCAACGCTGTGTCTTTTGGTTTTATCGCCACAGCCATT
CTCATCTCAATGTTCATTGTCATGGCCATGTTCGAAATGCTTATTCGAACCACCACCACT
AACTCACATTCTTCTCCGGGACAGGTCCTTTCGGGTCTAGAGTCACGGGTGGGACTCAAT
GGACTTGCATTTTCGAAGTTTGGTTGCGAATCTCCCAAGATAGGGGTGTACTCAAAAGGG
GTCTCGGTGTTAATGCCAGGAGACAATGTACCTACATTCATTGCTCACCATGCACCCGTA
CCCGCACCTGCAGACAAAAAGTCCAACACTCAAAGTTCCAGCGCAAACTCCATTCAAGAA
TGTTAACAACTCTAGATTTGCATTATTAAGTGTTTTGTTCCTCTGTAGCTTCATCGCTTA
GATTACTGGAGGTTGAGTATCTCGTCGTAGATATAACTAAAGGA*CCAAGCTGCAAA*GC
CTGGCTTAAGTATATATGTATTTATATGATTTGC*AGATTT**AAATTTGTTGA*TTTCA
TATGCTTAT
ACAGAAATAG

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2EX29JQ 459 0 0
GGGACAGGTCCTTTCGGGTCTAGAGTCACGGGTGGGACTCAATGGACTTGCATTTTCGAA
GTTTGGTTGCGAATCTCCCAAGATAGGGGTGTACTCAAAAGGGGTCTCGGTGTTAATGCC
AGGAGACAATGTACCTACATTCATTGCTCACCATGCACCCGTACCCGCACCTGCAGACAA
AAAGTCCAACACTCAAAGTTCCAGCGCAAACTCCATTCAAGAATGTTAACAACTCTAGAT
TTGCATTATTAAGTGTTTTGTTCCTCTGTAGCTTCATCGCTTAGATTACTGGAGGTTGAG
TATCTCGTCGTAGATATAACTAAAGGAACCAAGCTGCAAAAGCCTGGCTTAAGTATATAT
GTATTTATATGATTTGCCAGATTTTAAAATTTGTTGAATTTCATATGCTTATTACAAGAA
AATAAGTTGAAGGGGAGAGAATGAATGTGTTTTCACTAC

QA 1 459 1 459
DS 



AS 1 2

CO CL4157Contig1 1097 2 2 U
GGAGATCTGTGAGATCTAGAGGAAGAAGACGAGCAGAATGGCATCCATGGCGGCAGGACC
GGATCACCTCTTTAATCTGAGAAACAGTTTCTACCTAGGTGCGTATCAAGCGGCGATCAA
CAACAGCGAGATCCCTAATCTTTCGCAGGAAGATATCATCGAGCGCGATTGCCTCGTCCA
CCGCGCTTACATCGCTCTTGGTAGCTACCAGCTTGTCATTAATGAGATCGACGAAGCGTC
GGCTACTCCTCTTCAGGCAGTCAAGCTCCTCGCTATGTATCTATCTAGTCCTGAAAATAA
GGAATCAACGATTGCTAGCTTGAGGGAGTGGTTGGCAGATCCAACTGCTGGAAACAATGC
TACTGTTAGGTTGATTGCTGGTACGATCTTCATGCATGAGGAAGACTATAGCGAGGCTCT
TAAGCACACTCATTCTGGAGGAACCATGGACCTGCATGCTTTGAATGTCCAGATATTCAT
AAAGATGCACAGGTCAGATTATGCTGAGAAACAGCTGAGAGTGATGCAACAGTTTGATGA
GGACCACACTCTCACTCAACTCGCGAGTGCATGGTTGAACCTGGCAGTAGGGGGTTCCAA
GATACAAGAAGCTTATCTAATCTTCCAGGATTTCTCTGAGAAGTACCCAATGACAAGCTT
GATCTTGAACAGCAAGGCGGTTTGTTGCATGCATATGGGTAACTTTGAAGAAGCTGAGAC
TTTTCTGCTTGAAGCACTCAACAAGGATGCGAAAGACCCAGAAACTCTTGCAAACTTAGT
TGTGTGCAGTATTCATGTGGGGAAACAATCATCATCACGTTACCTAAGCCAGCTGAAACT
GTCGCAACCAGAACATGTACTTGTGAAGCGAGCAGCATTTGCTGAAGATAACTTCGAGAG
AGCGCTTCAATCTTTCGCCTGAAAGAACTCAAAAATCCATGGGTTCACTGCTAAAACAAT
GCATAAGGACTCTTTTGTCTCACCTAGAGTCAGTTGCTTTTATCTATCAGAATGAACATC
TTTTATTCTTACAACCCTATCGTGAAACGAGTATATGAATTGTTTTTTTTCTCATTGGAC
ATGTAGCATTTTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT12TF U 1
AF RR2FT12JQ C 631
BS 1 696 RR2FT12TF
BS 697 1097 RR2FT12JQ

RD RR2FT12TF 696 0 0
GGAGATCTGTGAGATCTAGAGGAAGAAGACGAGCAGAATGGCATCCATGGCGGCAGGACC
GGATCACCTCTTTAATCTGAGAAACAGTTTCTACCTAGGTGCGTATCAAGCGGCGATCAA
CAACAGCGAGATCCCTAATCTTTCGCAGGAAGATATCATCGAGCGCGATTGCCTCGTCCA
CCGCGCTTACATCGCTCTTGGTAGCTACCAGCTTGTCATTAATGAGATCGACGAAGCGTC
GGCTACTCCTCTTCAGGCAGTCAAGCTCCTCGCTATGTATCTATCTAGTCCTGAAAATAA
GGAATCAACGATTGCTAGCTTGAGGGAGTGGTTGGCAGATCCAACTGCTGGAAACAATGC
TACTGTTAGGTTGATTGCTGGTACGATCTTCATGCATGAGGAAGACTATAGCGAGGCTCT
TAAGCACACTCATTCTGGAGGAACCATGGACCTGCATGCTTTGAATGTCCAGATATTCAT
AAAGATGCACAGGTCAGATTATGCTGAGAAACAGCTGAGAGTGATGCAACAGTTTGATGA
GGACCACACTCTCACTCAACTCGCGAGTGCATGGTTGAACCTGGCAGTAGGGGGTTCCAA
GATACAAGAAGCTTATCTAATCTTCCAGGATTTCTCTGAGAAGTACCCAATGACAAGCTT
GATCTTGAACAGCAAGGCGGTTTGTTGCATGCATAT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2FT12JQ 467 0 0
TTTT
TCTGAGAAGTACCCAATGACAAGCTTGATCTTGAACAGCAAGGCGGTTTGTTGCATGCAT
ATGGGTAACTTTGAAGAAGCTGAGACTTTTCTGCTTGAAGCACTCAACAAGGATGCGAAA
GACCCAGAAACTCTTGCAAACTTAGTTGTGTGCAGTATTCATGTGGGGAAACAATCATCA
TCACGTTACCTAAGCCAGCTGAAACTGTCGCAACCAGAACATGTACTTGTGAAGCGAGCA
GCATTTGCTGAAGATAACTTCGAGAGAGCGCTTCAATCTTTCGCCTGAAAGAACTCAAAA
ATCCATGGGTTCACTGCTAAAACAATGCATAAGGACTCTTTTGTCTCACCTAGAGTCAGT
TGCTTTTATCTATCAGAATGAACATCTTTTATTCTTACAACCCTATCGTGAAACGAGTAT
ATGAATTGTTTTTTTTCTCATTGGACATGTAGCATTTTATTTT

QA 5 467 5 467
DS 



AS 1 2

CO CL4158Contig1 735 2 2 U
GCGAGAAAGCCTCTGCACCCGTATTACATCGTGGGGATGACTGCTACGCGGTTAGCTATA
CCGTTATATGTTTTTGGATGCCCACACAACTTCATGCGTGTAGAGCCTAGCAAGGCCTGG
TGCGTGTGCTTGTGCACCTTCATGGGGTTGCAAGCTGTCGTTCTTCTTCTTCAGCATTAT
TTTGGTTCACGTTGCTTTGTTCCCCGCCAGATGCTACCAGAGAAGTACAACTACCACAGA
AGATTCAATCAGGACGTCAGCCGCAACACTGATTGCGTCATCTGCATGACAGCTATCAAT
CTCAGACAGCGTACCAGTGATTTCATGGTAACTCCATGTGAACATTTATTCCACACGGGA
TGCTTACAGAGATGGATGGATATAAAAATGGAATGCCCGACTTGTCGGCGTTCCCTGCCT
CCAGCTTAGAGGATGTTTTTCGGGTTTGTTAGGATGTACAGACTTCACTCAAGTTTAATT
TGCGGGTCTGTCTGGAATAGTTGTGGGGGGTGTGTTTCACAAAATACGAAGTTAACTGCT
GCAAAAGTTTCCGAAAACAGGTGGGGCTGGGCTATTTGGTTTTATGTACTTGGAGAGGTG
TAGAAGGGTTTTTTAGATGAAAGCAGAAGAGCAAACACGGAATCTGTAACCGCAGCTAGA
AATTTGCGAATAGACATTGTGTTCTGTATAAACTGTCTAAATGTTACAATCTTAGTGCAT
ATTCTTTCACCCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G112TF U 1
AF RR2G112JQ C 168
BS 1 552 RR2G112TF
BS 553 735 RR2G112JQ

RD RR2G112TF 552 0 0
GCGAGAAAGCCTCTGCACCCGTATTACATCGTGGGGATGACTGCTACGCGGTTAGCTATA
CCGTTATATGTTTTTGGATGCCCACACAACTTCATGCGTGTAGAGCCTAGCAAGGCCTGG
TGCGTGTGCTTGTGCACCTTCATGGGGTTGCAAGCTGTCGTTCTTCTTCTTCAGCATTAT
TTTGGTTCACGTTGCTTTGTTCCCCGCCAGATGCTACCAGAGAAGTACAACTACCACAGA
AGATTCAATCAGGACGTCAGCCGCAACACTGATTGCGTCATCTGCATGACAGCTATCAAT
CTCAGACAGCGTACCAGTGATTTCATGGTAACTCCATGTGAACATTTATTCCACACGGGA
TGCTTACAGAGATGGATGGATATAAAAATGGAATGCCCGACTTGTCGGCGTTCCCTGCCT
CCAGCTTAGAGGATGTTTTTCGGGTTTGTTAGGATGTACAGACTTCACTCAAGTTTAATT
TGCGGGTCTGTCTGGAATAGTTGTGGGGGGTGTGTTTCACAAAATACGAAGTTAACTGCT
GCAAAAGTTTCC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2G112JQ 568 0 0
TCTTCAGCATTATTTTGGTTCACGTTGCTTTGTTCCCCGCCAGATGCTACCAGAGAAGTA
CAACTACCACAGAAGATTCAATCAGGACGTCAGCCGCAACACTGATTGCGTCATCTGCAT
GACAGCTATCAATCTCAGACAGCGTACCAGTGATTTCATGGTAACTCCATGTGAACATTT
ATTCCACACGGGATGCTTACAGAGATGGATGGATATAAAAATGGAATGCCCGACTTGTCG
GCGTTCCCTGCCTCCAGCTTAGAGGATGTTTTTCGGGTTTGTTAGGATGTACAGACTTCA
CTCAAGTTTAATTTGCGGGTCTGTCTGGAATAGTTGTGGGGGGTGTGTTTCACAAAATAC
GAAGTTAACTGCTGCAAAAGTTTCCGAAAACAGGTGGGGCTGGGCTATTTGGTTTTATGT
ACTTGGAGAGGTGTAGAAGGGTTTTTTAGATGAAAGCAGAAGAGCAAACACGGAATCTGT
AACCGCAGCTAGAAATTTGCGAATAGACATTGTGTTCTGTATAAACTGTCTAAATGTTAC
AATCTTAGTGCATATTCTTTCACCCCAC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

CO CL4159Contig1 345 2 1 U
GGGATTTACAGACTGAGAAGCTGACTTGGGTTTCGTCTCTGGTTGCTATTGCTCTTGGGT
TGGGGATTGTCATCAGCCCTTTCTTTGGTTTTAGCCTTTACTGAGAACAAAGTTTCAAGC
TTCAAGTATTTGTAGCTACTCTACTACAAGTAAAGAGAGTTTTTTTGGTCTATTCAATTT
ACTACTAAGTGCTTGTATGATCTAAATCTCGTAATCTTGCTTTTGAACTCTGCTCGGAGA
AGACATTTTCTTGATTATTTTTATTTAAGACAAGTTTGGTTTTTGGTTTGCATTGTTAAA
CAAGTTGATGCAAGTGTAACCATTTTTCTTTTTCTTCTATTATCA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FU72JQ C 1
AF RR2FU72TF U 1
BS 1 345 RR2FU72TF

RD RR2FU72JQ 345 0 0
GGGATTTACAGACTGAGAAGCTGACTTGGGTTTCGTCTCTGGTTGCTATTGCTCTTGGGT
TGGGGATTGTCATCAGCCCTTTCTTTGGTTTTAGCCTTTACTGAGAACAAAGTTTCAAGC
TTCAAGTATTTGTAGCTACTCTACTACAAGTAAAGAGAGTTTTTTTGGTCTATTCAATTT
ACTACTAAGTGCTTGTATGATCTAAATCTCGTAATCTTGCTTTTGAACTCTGCTCGGAGA
AGACATTTTCTTGATTATTTTTATTTAAGACAAGTTTGGTTTTTGGTTTGCATTGTTAAA
CAAGTTGATGCAAGTGTAACCATTTTTCTTTTTCTTCTATTATCA

QA 1 345 1 345
DS 

RD RR2FU72TF 345 0 0
GGGATTTACAGACTGAGAAGCTGACTTGGGTTTCGTCTCTGGTTGCTATTGCTCTTGGGT
TGGGGATTGTCATCAGCCCTTTCTTTGGTTTTAGCCTTTACTGAGAACAAAGTTTCAAGC
TTCAAGTATTTGTAGCTACTCTACTACAAGTAAAGAGAGTTTTTTTGGTCTATTCAATTT
ACTACTAAGTGCTTGTATGATCTAAATCTCGTAATCTTGCTTTTGAACTCTGCTCGGAGA
AGACATTTTCTTGATTATTTTTATTTAAGACAAGTTTGGTTTTTGGTTTGCATTGTTAAA
CAAGTTGATGCAAGTGTAACCATTTTTCTTTTTCTTCTATTATCA

QA 1 345 1 345
DS 



AS 1 2

CO CL4160Contig1 965 2 2 U
CAAAAGACAACTCCAAATTAAGAAAAACGAAATCGTTATGAAAAAAATGTGCTTAAAGAT
ACCCATCAAATGGGAGAGAAGGCTGGCTATCTTGACCAACACGTCAGGTTATTAACTCAG
CGGCTCAAGCTCATGAACTTATCGAGCCAGTCCATGTTTACACTCTTCGGTCTCTCAAGT
GGAAGTCCAAGAGCTCGGTCCCATATCAGCTGTGAGCATATTCCAAGACTCCTTGAGACG
CCAAAAAGAACCGTGTAGTATTTTGCTTCGGTTAGCCCATAATAGTTGAAAAGCACTCCG
CTGTGAGCATCAACGTTAGGCCAAGGGTTCTTGACCTTTCCTAGCTCGGTTAGAATAGGA
GGCACAACTTCATAAAGCTTAAAAACCAGCTGAAAAAGAGGGTCATCAGGTAGATGCTTC
AAGGCGAATTCTCTTTGGCATACATATCTTGGATCTGTCTTACGCAAAACACCATGGCCA
TATCCTGGAACTACCTTGCCACTGTTTAACGTTTTCCAGACATAATCTTTCAGGTGTTCC
TTTGATATATTTTCCCCGCATTCCGCCACAACTGATTTGATCCATAGCAAAACTTCCTGA
TTAGCCAAACCATGGAGTGGTCCAGCTAAACCATTTAGCGCAGCTGCAAATGAAAGATAT
GGATCTGAGAGGGCACTCCCAACCAAGTGGCCAGCGTGAGCACTAACATTTCCACCTTCA
TGATCACTGTGAATGGTGATATAAAGCCTCATGAGCTCTTTCATCTGAGGACTATCAAAT
CCCAGCATGTGTGAAAAATTAGCACCATAATCCAAAGAATCGTCTAGTGGAATGATGCTA
CCGTCTTTAAACATCCTCCGGTAAACATATGAAGCTACAACAGGAACACGAGCAATCAAG
TTGAGGGCATCCTCAAAGGTTGGCTCCCAATACTTTGACTTATGAACAACACCCTCCTCA
TATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2GG07JQB U 1
AF RR2FE14TF C 247
BS 1 646 RR2GG07JQB
BS 647 965 RR2FE14TF

RD RR2GG07JQB 646 0 0
CAAAAGACAACTCCAAATTAAGAAAAACGAAATCGTTATGAAAAAAATGTGCTTAAAGAT
ACCCATCAAATGGGAGAGAAGGCTGGCTATCTTGACCAACACGTCAGGTTATTAACTCAG
CGGCTCAAGCTCATGAACTTATCGAGCCAGTCCATGTTTACACTCTTCGGTCTCTCAAGT
GGAAGTCCAAGAGCTCGGTCCCATATCAGCTGTGAGCATATTCCAAGACTCCTTGAGACG
CCAAAAAGAACCGTGTAGTATTTTGCTTCGGTTAGCCCATAATAGTTGAAAAGCACTCCG
CTGTGAGCATCAACGTTAGGCCAAGGGTTCTTGACCTTTCCTAGCTCGGTTAGAATAGGA
GGCACAACTTCATAAAGCTTAAAAACCAGCTGAAAAAGAGGGTCATCAGGTAGATGCTTC
AAGGCGAATTCTCTTTGGCATACATATCTTGGATCTGTCTTACGCAAAACACCATGGCCA
TATCCTGGAACTACCTTGCCACTGTTTAACGTTTTCCAGACATAATCTTTCAGGTGTTCC
TTTGATATATTTTCCCCGCATTCCGCCACAACTGATTTGATCCATAGCAAAACTTCCTGA
TTAGCCAAACCATGGAGTGGTCCAGCTAAACCATTTAGCGCAGCTG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2FE14TF 719 0 0
AGAACCGTGTAGTATTT*GCTTCGGTTAGCCCATAATAGTTGAGAAGCACTCCGCTGTGA
GCATCAACGTTAGGCCAAGGGTTCTTGACCTTTCCTAGCTCGGTTAGAATAGGAGGCACA
ACTTCATAAAGCTTAGAAACCAGCTGAAAAAGAGGGTCATCAGGTAGATGCTTCAAGGCG
AATTCTCTTTGGCATACATATCTTGGATCTGTCTTACGCAAAACACCATGGCCATATCCT
GGAACTACCTTGCCACTGTTTAACGTTTTCCAGACATAATCTTTCAGGTGTTCCTTTGAT
ATATTTTCCCCGCATTCCGCCACAACTGATTTGATCCATAGCAAAACTTCCTGATTAGCC
AAACCATGGAGTGGTCCAGCTAAACCATTTAGCGCAGCTGCAAATGAAAGATATGGATCT
GAGAGGGCACTCCCAACCAAGTGGCCAGCGTGAGCACTAACATTTCCACCTTCATGATCA
CTGTGAATGGTGATATAAAGCCTCATGAGCTCTTTCATCTGAGGACTATCAAATCCCAGC
ATGTGTGAAAAATTAGCACCATAATCCAAAGAATCGTCTAGTGGAATGATGCTACCGTCT
TTAAACATCCTCCGGTAAACATATGAAGCTACAACAGGAACACGAGCAATCAAGTTGAGG
GCATCCTCAAAGGTTGGCTCCCAATACTTTGACTTATGAACAACACCCTCCTCATATGC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL4161Contig1 636 2 1 U
GGATATTTGCTTGGTTGCTCTGTCTTCCTCAAAATCGAAACAGAAGAGAAACTGTCAAAT
CTCGCACTGGAACTCTAGGTCCAGCAAAGGGGATCAAGAACATCATGCCTGGAATCTTAC
TGGGCTCCAATCTGCTAAAGAAGGGAGTATCATGGAGAGGTCTTAAGGGTTCAGTAATTT
TTTCTCTTGGATTCTATGCACATGGTGTTCTGTTCCCTAATCCAGAAAGGGTACTTGAAG
AAGCCAAAGAGTCATGTGCAAAAGCCAAGTCTTTATCAGAGGAGTATTACGCTCAACTGG
ATGAGTTAATTGAAAATAAAAAGGTGTTGGACAATGCAATGCAGTTGTATCTGGCTGGAA
ATGCTCAGTTGAAAGAACTTAAAGAGTCCAATGGACTTTGAAAACGTTTTGTCAATCGCA
GGAAGAATCTAGTTGGAGTCTCTTGTGATGAAATTGAACAGAAGAAATGATCTAATTTGG
TGCGAAGAATGAAAGCAGTATATGGAATCTTTAGTGTAAGTAGCTGAAGGTTTTGATGGT
GTGGCCTTCTTTAAAACTTTTGAGCTCTGTTAGTAATTAGTATATATATCAACTTTGGAG
CAACATTCTTGAGTTTGTTTTGTTGTTAGTTAAATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C161JQ C 1
AF RR2C161TF U 1
BS 1 636 RR2C161TF

RD RR2C161JQ 636 0 0
GGATATTTGCTTGGTTGCTCTGTCTTCCTCAAAATCGAAACAGAAGAGAAACTGTCAAAT
CTCGCACTGGAACTCTAGGTCCAGCAAAGGGGATCAAGAACATCATGCCTGGAATCTTAC
TGGGCTCCAATCTGCTAAAGAAGGGAGTATCATGGAGAGGTCTTAAGGGTTCAGTAATTT
TTTCTCTTGGATTCTATGCACATGGTGTTCTGTTCCCTAATCCAGAAAGGGTACTTGAAG
AAGCCAAAGAGTCATGTGCAAAAGCCAAGTCTTTATCAGAGGAGTATTACGCTCAACTGG
ATGAGTTAATTGAAAATAAAAAGGTGTTGGACAATGCAATGCAGTTGTATCTGGCTGGAA
ATGCTCAGTTGAAAGAACTTAAAGAGTCCAATGGACTTTGAAAACGTTTTGTCAATCGCA
GGAAGAATCTAGTTGGAGTCTCTTGTGATGAAATTGAACAGAAGAAATGATCTAATTTGG
TGCGAAGAATGAAAGCAGTATATGGAATCTTTAGTGTAAGTAGCTGAAGGTTTTGATGGT
GTGGCCTTCTTTAAAACTTTTGAGCTCTGTTAGTAATTAGTATATATATCAACTTTGGAG
CAACATTCTTGAGTTTGTTTTGTTGTTAGTTAAATC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2C161TF 636 0 0
GGATATTTGCTTGGTTGCTCTGTCTTCCTCAAAATCGAAACAGAAGAGAAACTGTCAAAT
CTCGCACTGGAACTCTAGGTCCAGCAAAGGGGATCAAGAACATCATGCCTGGAATCTTAC
TGGGCTCCAATCTGCTAAAGAAGGGAGTATCATGGAGAGGTCTTAAGGGTTCAGTAATTT
TTTCTCTTGGATTCTATGCACATGGTGTTCTGTTCCCTAATCCAGAAAGGGTACTTGAAG
AAGCCAAAGAGTCATGTGCAAAAGCCAAGTCTTTATCAGAGGAGTATTACGCTCAACTGG
ATGAGTTAATTGAAAATAAAAAGGTGTTGGACAATGCAATGCAGTTGTATCTGGCTGGAA
ATGCTCAGTTGAAAGAACTTAAAGAGTCCAATGGACTTTGAAAACGTTTTGTCAATCGCA
GGAAGAATCTAGTTGGAGTCTCTTGTGATGAAATTGAACAGAAGAAATGATCTAATTTGG
TGCGAAGAATGAAAGCAGTATATGGAATCTTTAGTGTAAGTAGCTGAAGGTTTTGATGGT
GTGGCCTTCTTTAAAACTTTTGAGCTCTGTTAGTAATTAGTATATATATCAACTTTGGAG
CAACATTCTTGAGTTTGTTTTGTTGTTAGTTAAATC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL4162Contig1 971 2 2 U
GGACCCGTAAGATTCTCTTTGCGCCGCCCAAAGAAAAAAAACAAAGAAGAAAGCAATGCC
ACTGTCACTAGTCCAAGCCGCTTCAGTGTCCTACTTGAGATCCCAATCAACTCTTCCTAA
GCCCTCCTCCTCCTCCTCTGGTATACTTCTCCAAAAGTCAATCTTTCCTGATTCGACCAA
GTTAACACCTTTCCACCGGATCTTTCGCTCCACGAAGAAATCCTCAAACGGGTCTCCTCG
CGCTTCCTTGCTCGAGACGCCTGTCTTGTGGGCTGGTCGAATCTGCGTCTTTTACGCCCT
CGTCAGAGCTGGTTTAGCTGGATCCAAGTCTAACCCCATCGTCTCTGGTTTGGAGAGTGG
CGGTGTTGATGTTGAAGATGATGGTACTGCTGCTGTGGATCTTGGTTTCTCCAAGTGGAT
TCAGTACATTAAGGGCAAACCAGATAAGGATGCAGCTGATAAGAGGAAGCTAGTGAGCAA
ATGGCACCCAACGACAAAGGGAACACTTAGAAGGAACTACAGGGTACCTTCCAAAGGTGA
AGGAAACCGTCTCCTCAAAGCCATTGCCTCTCTTCTCTCAGATGATGACCACTTTAGAGA
TGCAACATCTTACAAGGGCTGTCAAATACGGCGAGAGAGTGCCCACGGTCAGAGCGTCTG
TTGCAACAACGTGAGAGCTCTGTTTGATGAGTTACCGACGCCACATTTGGTGGTTGAGAT
CACACCTTTTCCTGCTGGTCCGCTTACAGAGATTGACTACCTTAAGGCTGAGAAGCTGGA
AAAGGTTCTTAGGTCAGGGCCCAACATCTGAAACACTCTGCTACTAAGAGAGAGTGTTGT
AGCCATGTGTCTAGTTCCAAAACCTGCACATACTATTACTCTTTACCATCTTTTGACGCT
GTGAAACTGTTTTACTTTCTCGTCAAGCATGTATCGTTACCATTGTCATGATTAAAAGAT
CGTTTTAAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS89TF U 1
AF RR2FS89JQ C 251
BS 1 760 RR2FS89TF
BS 761 971 RR2FS89JQ

RD RR2FS89TF 760 0 0
GGACCCGTAAGATTCTCTTTGCGCCGCCCAAAGAAAAAAAACAAAGAAGAAAGCAATGCC
ACTGTCACTAGTCCAAGCCGCTTCAGTGTCCTACTTGAGATCCCAATCAACTCTTCCTAA
GCCCTCCTCCTCCTCCTCTGGTATACTTCTCCAAAAGTCAATCTTTCCTGATTCGACCAA
GTTAACACCTTTCCACCGGATCTTTCGCTCCACGAAGAAATCCTCAAACGGGTCTCCTCG
CGCTTCCTTGCTCGAGACGCCTGTCTTGTGGGCTGGTCGAATCTGCGTCTTTTACGCCCT
CGTCAGAGCTGGTTTAGCTGGATCCAAGTCTAACCCCATCGTCTCTGGTTTGGAGAGTGG
CGGTGTTGATGTTGAAGATGATGGTACTGCTGCTGTGGATCTTGGTTTCTCCAAGTGGAT
TCAGTACATTAAGGGCAAACCAGATAAGGATGCAGCTGATAAGAGGAAGCTAGTGAGCAA
ATGGCACCCAACGACAAAGGGAACACTTAGAAGGAACTACAGGGTACCTTCCAAAGGTGA
AGGAAACCGTCTCCTCAAAGCCATTGCCTCTCTTCTCTCAGATGATGACCACTTTAGAGA
TGCAACATCTTACAAGGGCTGTCAAATACGGCGAGAGAGTGCCCACGGTCAGAGCGTCTG
TTGCAACAACGTGAGAGCTCTGTTTGATGAGTTACCGACGCCACATTTGGTGGTTGAGAT
CACACCTTTTCCTGCTGGTCCGCTTACAGAGATTGACTAC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2FS89JQ 721 0 0
CTCGAGACGCCTGTCTTGTGGGCTGGTCGAATCTGCGTCTTTTACGCCCTCGTCAGAGCT
GGTTTAGCTGGATCCAAGTCTAACCCCATCGTCTCTGGTTTGGAGAGTGGCGGTGTTGAT
GTTGAAGATGATGGTACTGCTGCTGTGGATCTTGGTTTCTCCAAGTGGATTCAGTACATT
AAGGGCAAACCAGATAAGGATGCAGCTGATAAGAGGAAGCTAGTGAGCAAATGGCACCCA
ACGACAAAGGGAACACTTAGAAGGAACTACAGGGTACCTTCCAAAGGTGAAGGAAACCGT
CTCCTCAAAGCCATTGCCTCTCTTCTCTCAGATGATGACCACTTTAGAGATGCAACATCT
TACAAGGGCTGTCAAATACGGCGAGAGAGTGCCCACGGTCAGAGCGTCTGTTGCAACAAC
GTGAGAGCTCTGTTTGATGAGTTACCGACGCCACATTTGGTGGTTGAGATCACACCTTTT
CCTGCTGGTCCGCTTACAGAGATTGACTACCTTAAGGCTGAGAAGCTGGAAAAGGTTCTT
AGGTCAGGGCCCAACATCTGAAACACTCTGCTACTAAGAGAGAGTGTTGTAGCCATGTGT
CTAGTTCCAAAACCTGCACATACTATTACTCTTTACCATCTTTTGACGCTGTGAAACTGT
TTTACTTTCTCGTCAAGCATGTATCGTTACCATTGTCATGATTAAAAGATCGTTTTAAGG
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4164Contig1 568 2 6 U
GGAGGTAATCCAGTCTGGTTCGTTTTCAAATAGAGAGACCAGTTTACCTTTGTGCAGATG
ATACATATTCCTCCAACGCTGAAAATTGTCCCTCTGAGTAAAAACCCTAGAAAATCCTAA
TCTCCGTCGATCAGAGCAAGAAGAAGATGACTGGTCCCAACACTGTTTCTGGGGATGACA
TCGATGAGAGCAAAGTCAAAGCACCAAACATGTTCGTACGAGCCAAAGAGGAGATCGATG
CTGTTATTGGTGCTATTCATCAACGCAAGAGTTCCAGGGATGAATCTGACAAGATGGAAT
TCAAATCCGAGAAACAAGAAGATGAAAAGAAGAAACCAAATGCGATGAGAAAAGCAAGGG
AAGAAATCAAATCTTTGTTCCATTCCAAGGAGAAACCTCATCGCCATCATCATCACCACA
AAGAAACTCATGGAAGGAGTGATGATATCGACGAGAACACACCGGTGAATGAAGTGAAGG
CTCCTAATGTTTTCGAGAGAGCACAGGAGGAAATCGAGACCGTCATTGAAACCACACATC
CCAAGAAGAATGTGGCTGACGGTTCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI39TF U 1
AF RR2C954TF U 137
BS 1 369 RR2EI39TF
BS 370 370 RR2C954TF
BS 371 534 RR2EI39TF
BS 535 535 RR2C954TF
BS 536 539 RR2EI39TF
BS 540 568 RR2C954TF

RD RR2EI39TF 539 0 0
GGAGGTAATCCAGTCTGGTTCGTTTTCAAATAGAGAGACCAGTTTACCTTTGTGCAGATG
ATACATATTCCTCCAACGCTGAAAATTGTCCCTCTGAGTAAAAACCCTAGAAAATCCTAA
TCTCCGTCGATCAGAGCAAGAAGAAGATGACTGGTCCCAACACTGTTTCTGGGGATGACA
TCGATGAGAGCAAAGTCAAAGCACCAAACATGTTCGTACGAGCCAAAGAGGAGATCGATG
CTGTTATTGGTGCTATTCATCAACGCAAGAGTTCCAGGGATGAATCTGACAAGATGGAAT
TCAAATCCGAGAAACAAGAAGATGAAAAGAAGAAACCAAATGCGATGAGAAAAGCAAGGG
AAGAAATCAGATCTTTGTTCCATTCCAAGGAGAAACCTCATCGCCATCATCATCACCACA
AAGAAACTCATGGAAGGAGTGATGATATCGACGAGAACACACCGGTGAATGAAGTGAAGG
CTCCTAATGTTTTCGAGAGAGCACAGGAGGAAATCGAGACCGTCATTGAAACCATACAT

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2C954TF 432 0 0
CAAGAAGAAGATGACTGGTCCCAACACTGTTTCTGGGGATGACATCGATGAGAGCAAAGT
CAAAGCACCAAACATGTTCGTACGAGCCAAAGAGGAGATCGATGCTGTTATTGGTGCTAT
TCATCAACGCAAGAGTTCCAGGGATGAATCTGACAAGATGGAATTCAAATCCGAGAAACA
AGAAGATGAAAAGAAGAAACCAAATGTGATGAGAAAAGCAAGGGAAGAAATCAAATCTTT
GTTCCATTCCAAGGAGAAACCTCATCGCCATCATCATCACCACAAAGAAACTCATGGAAG
GAGTGATGATATCGACGAGAACACACCGGTGAATGAAGTGAAGGCTCCTAATGTTTTCGA
GAGAGCACAGGAGGAAATCGAGGCCGTCATTGAAACCACACATCCCAAGAAGAATGTGGC
TGACGGTTCTGA

QA 1 432 1 432
DS 



AS 1 2

CO CL4165Contig1 519 2 2 U
GGAGCGTCGGCCTTTTATCAGGCGACGTCACACGGCAAAGACAAGCTGTTTGAGTCATCA
TCTCAAGCCCATTCTCTTCCTTGGACTTCTTATCTTCTTGCCTCATTGCTCTTACCCAAT
CCAACATATCATTCTCCGCCATAAACGGTTGCCTTGAAGCCGGTTTACCCGTCAACAGCT
CCAAGAGGAATACTCCGAACGAGTAGACATCACATTTGGACGTAGGACTGTTTGTTGATT
TCCTGATCTCTGGTGCTGTGTAGGAAGCGATGTCAGGATCACTAGGTGGACAGATGAGTC
TATTAAGACACTTAGGCAGTAATCCGTGAGACAAGCTTCGAAGTCGTGACCTAGGAGGAT
GTTTTTGGACTTGAGGTTTCCGTGGAATTTTGCAGATGATTGGTGAATGTAATGTAGTGC
TTGAGCTACATCTTCTGCTATCTTTAAACATGATGTCCAATGTAATGGCTTTGTCTTTGA
TGTTCTTGAACCTAGATTTTCATGGGATAAAATTTAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C724TF U 1
AF RR2C724JQ C 98
BS 1 508 RR2C724TF
BS 509 519 RR2C724JQ

RD RR2C724TF 508 0 0
GGAGCGTCGGCCTTTTATCAGGCGACGTCACACGGCAAAGACAAGCTGTTTGAGTCATCA
TCTCAAGCCCATTCTCTTCCTTGGACTTCTTATCTTCTTGCCTCATTGCTCTTACCCAAT
CCAACATATCATTCTCCGCCATAAACGGTTGCCTTGAAGCCGGTTTACCCGTCAACAGCT
CCAAGAGGAATACTCCGAACGAGTAGACATCACATTTGGACGTAGGACTGTTTGTTGATT
TCCTGATCTCTGGTGCTGTGTAGGAAGCGATGTCAGGATCACTAGGTGGACAGATGAGTC
TATTAAGACACTTAGGCAGTAATCCGTGAGACAAGCTTCGAAGTCGTGACCTAGGAGGAT
GTTTTTGGACTTGAGGTTTCCGTGGAATTTTGCAGATGATTGGTGAATGTAATGTAGTGC
TTGAGCTACATCTTCTGCTATCTTTAAACATGATGTCCAATGTAATGGCTTTGTCTTTGA
TGTTCTTGAACCTAGATTTTCATGGGAT

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2C724JQ 422 0 0
TTGCCTCATTGCTCTTACCCAATCCAACATATCATTTTCCGCCATAAACGGTTGCCTTGA
AGCCGGTTTACCCGTCAACAGCTCCAAGAGGAATACTCCGAACGAGTAGACATCACATTT
GGACGTAGGACTGTTTGTTGATTTCCTGATTTCTGGTGCTGTGTAGGAAGCGATGTCAGG
ATCACTAGGTGGACAGATGAGTTTATTAAGACACTTAGGCAGTAATCCGTGAGACAAGCT
TCGAAGTCGTGACCTAGGAGGATGTTTTTGGACTTGAGGTTTCCGTGGAATTTTGCAGAT
GATTGGTGAATGTAATGTAGTGCTTGAGCTACATTTTTTGCTATCTTTAAACATGATGTC
CAATGTAATGGCTTTGTTTTTGATGTTCTTGAACCTAGATTTTCATGGGATAAAATTTAA
AA

QA 1 422 1 422
DS 



AS 1 2

CO CL4166Contig1 1295 2 2 U
CATTTGTTTGATCTCCTCTCATACATATACGGAAACTAAAAAATGGGCTTTTGTTTCTGT
TTATCCTCATCAGAAGGATCAACAGATCGAAACCAGATTTATGAGATAAAAGATTATGGA
CAAGAAAATGCAGTTTTACACTCTGAACAGCAAGATGTCAGCAAGGCTTTGGCTCTGTCT
CTTCTTTAGCTGGAGGCAAGGGATACAATCAAGATGCTGCCATTCTCCACCTGGGCTATG
GAACAGAAGAAGGAGCGTTGTGTGGAGTGTTTGATGGTCATGGTGAGAAAGGTGAATTGG
TGAGCAAGATAGTAAGAAACCAATTGCCATCTTTATTGTTAGGTCATATGAATAACCATT
CAGTGACACGAGACTGGAAACTCATTTGTGAAACTACGTTTTTGTTGATGGACAAAAGAA
TTCTTAAACTCAAAAACACCCTTGATTGCTCTTCCTCCGGAACTACTGCTGTTCTCGCCG
TTACACACGGAAATCAAGTGATGGTGGCAAATCTAGGAGATTCAAGGGCTGTGATGATTG
GAACAAGTGAGGATGGAGAAATCAAGGTGGTTCAATTAACCACTGACCTGAAGCCAAGTG
TTCCAAGCGAAGCCGACAGAATAAGAAAACGCAACGGAAGGGTCTTGGCATTAGAGTCAG
AGCCACATATTCTAAGAGTATGGCTTCCACATCAAAACCGGCCCAGTCTAGCCATGTCTA
GGTCTTTGGGTGATTTCGTTCTTAAAAGCTATGGTGTCATTGCGACTCCTCAAGTATCTG
CGCATCAAATCACTCCTGGCGACCAGTTTCTGCTCCTTGCTTCCGATGGGGTCTGGGATG
TTCTTAGTAACGAAGAAGTCGCTATGGTGGTAATGAATTCAGAGAATGAGGCAGCAGCGG
CCAACGCAGTGACAGAGGCGGCGGCTAATGCATGGAAACAGAAATATCCGACGGTCAAGG
TTGATGATATTTCTGTCGTGTGCCTCTTTCTCAACAAGAGGCTTCATCCTCAGCTACGTA
TGTAATCAAACAAACAAACTTGCGAAGAAAACAAATAACGACTAATCAAAGATGGATGCC
ACGTACGATTGTTTACTCAGACTTCTGTGTGTTGCCTTTGAGTGTGAATGTATGTGTGTG
TATATATTACATTTGTATGTTAAGTCGTGTGATTATTAATAGAAAATAAATAGTAGAAGA
TGTTGGGAGTGGTGCGTGTCGTGGGATCAAAGTAACGAGGACTTTGACATTTTGAACAGA
CGTCATAAGAATCTATGTATTGGAGTGCTTTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL37TF U 1
AF RR2CL37JQ C 592
BS 1 696 RR2CL37TF
BS 697 1295 RR2CL37JQ

RD RR2CL37TF 696 0 0
CATTTGTTTGATCTCCTCTCATACATATACGGAAACTAAAAAATGGGCTTTTGTTTCTGT
TTATCCTCATCAGAAGGATCAACAGATCGAAACCAGATTTATGAGATAAAAGATTATGGA
CAAGAAAATGCAGTTTTACACTCTGAACAGCAAGATGTCAGCAAGGCTTTGGCTCTGTCT
CTTCTTTAGCTGGAGGCAAGGGATACAATCAAGATGCTGCCATTCTCCACCTGGGCTATG
GAACAGAAGAAGGAGCGTTGTGTGGAGTGTTTGATGGTCATGGTGAGAAAGGTGAATTGG
TGAGCAAGATAGTAAGAAACCAATTGCCATCTTTATTGTTAGGTCATATGAATAACCATT
CAGTGACACGAGACTGGAAACTCATTTGTGAAACTACGTTTTTGTTGATGGACAAAAGAA
TTCTTAAACTCAAAAACACCCTTGATTGCTCTTCCTCCGGAACTACTGCTGTTCTCGCCG
TTACACACGGAAATCAAGTGATGGTGGCAAATCTAGGAGATTCAAGGGCTGTGATGATTG
GAACAAGTGAGGATGGAGAAATCAAGGTGGTTCAATTAACCACTGACCTGAAGCCAAGTG
TTCCAAGCGAAGCCGACAGAATAAGAAAACGCAACGGAAGGGTCTTGGCATTAGAGTCAG
AGCCACATATTCTAAGAGTATGGCTTCCACATCAAA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2CL37JQ 704 0 0
AGCCAAGTGTTCCAAGCGAAGCCGACAGAATAAGAAAACGCAACGGAAGGGTCTTGGCAT
TAGAGTCAGAGCCACATATTCTAAGAGTATGGCTTCCACATCAAAACCGGCCCAGTCTAG
CCATGTCTAGGTCTTTGGGTGATTTCGTTCTTAAAAGCTATGGTGTCATTGCGACTCCTC
AAGTATCTGCGCATCAAATCACTCCTGGCGACCAGTTTCTGCTCCTTGCTTCCGATGGGG
TCTGGGATGTTCTTAGTAACGAAGAAGTCGCTATGGTGGTAATGAATTCAGAGAATGAGG
CAGCAGCGGCCAACGCAGTGACAGAGGCGGCGGCTAATGCATGGAAACAGAAATATCCGA
CGGTCAAGGTTGATGATATTTCTGTCGTGTGCCTCTTTCTCAACAAGAGGCTTCATCCTC
AGCTACGTATGTAATCAAACAAACAAACTTGCGAAGAAAACAAATAACGACTAATCAAAG
ATGGATGCCACGTACGATTGTTTACTCAGACTTCTGTGTGTTGCCTTTGAGTGTGAATGT
ATGTGTGTGTATATATTACATTTGTATGTTAAGTCGTGTGATTATTAATAGAAAATAAAT
AGTAGAAGATGTTGGGAGTGGTGCGTGTCGTGGGATCAAAGTAACGAGGACTTTGACATT
TTGAACAGACGTCATAAGAATCTATGTATTGGAGTGCTTTCTAC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL4167Contig1 797 2 2 U
GGGAGAGAAGGAAGATACTCTAATTCATGGCTATTCTCTTCACACCTCCACAGTGCAGAG
CCTTCTCTCCTCCCGTATTCAACAACCACGCTACCGGAGAAACCACTCCCTCTCCTAACT
CCGTAAAGCTAAAAACCTCTCGGTTTATCTCTATCCGGCGTTGGGGTTGCAGAAGCGGCG
AAAGTGGGAGTAAACAAACCAGAACTGCTCCCAAAAGAGTTCACTTCTGTCATAGATGTT
GCTGGCTTCCTCTCTGATGGCCAGGAGAAGAGGATTGCTGAAGAAATCGATGATATTGAG
AAAGATACAGGGTTTAAGCTAAGAGTCTTGGCTCAAAACTATCCTGTTACACCTGGACTA
GCTTTCAAGGATTACTGGCAAGTTGATGATAACACTATTGTGTTTGTCGCTGATCCCACT
TTTGGGAACATATTGAACTTTAATGTTGGGGCTACTGTTGATTTGGACATACCTCGTAGT
TTCTGGAGTCGTTTAGCTGGGAAGTACGGCAATATGTTTTACTGGAAAGAAAAGGGTGAA
GATGCATCCATCGAAGCTGCAGTAATGGCTATATCAAGCTGCTTAAGGGAACCCGTTGGT
GCAAATAACTGTGCAGAGATTTACTGAAGTTTTATGACCTGATAAAATGTATGTTACAAA
ACACATATAAACATCGATACCACATGTGATAGTAAGAGTATAGATGTTGATTGTTGAATC
TGACATCAACCCTATATAGTTTTTGTACTTGTGTTATATCGTACTGTATTAGTACGTTTG
TCGAGATTGTTCAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB66TF U 1
AF RR2HB66JQ C 37
BS 1 694 RR2HB66TF
BS 695 797 RR2HB66JQ

RD RR2HB66TF 701 0 0
GGGAGAGAAGGAAGATACTCTAATTCATGGCTATTCTCTTCACACCTCCACAGTGCAGAG
CCTTCTCTCCTCCCGTATTCAACAACCACGCTACCGGAGAAACCACTCCCTCTCCTAACT
CCGTAAAGCTAAAAACCTCTCGGTTTATCTCTATCCGGCGTTGGGGTTGCAGAAGCGGCG
AAAGTGGGAGTAAACAAACCAGAACTGCTCCCAAAAGAGTTCACTTCTGTCATAGATGTT
GCTGGCTTCCTCTCTGATGGCCAGGAGAAGAGGATTGCTGAAGAAATCGATGATATTGAG
AAAGATACAGGGTTTAAGCTAAGAGTCTTGGCTCAAAACTATCCTGTTACACCTGGACTA
GCTTTCAAGGATTACTGGCAAGTTGATGATAACACTATTGTGTTTGTCGCTGATCCCACT
TTTGGGAACATATTGAACTTTAATGTTGGGGCTACTGTTGATTTGGACATACCTCGTAGT
TTCTGGAGTCGTTTAGCTGGGAAGTACGGCAATATGTTTTACTGGAAAGAAAAGGGTGAA
GATGCATCCATCGAAGCTGCAGTAATGGCTATATCAAGCTGCTTAAGGGAACCCGTTGGT
GCAAATAACTGTGCAGAGATTTACTGAAGTTTTATGACCTGATAAAATGTATGTTACAAA
ACACATATAAACATCGATACCACATGTGATAGTA
GAGTATA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2HB66JQ 761 0 0
TCTTCACACCTCCACAGTGCAGAGC*TTCTCTCCTCCCGTATTCAACAACCACGCTACCG
GAGAAACCACTCCCTCTCCTAACTCCGTAAAGCTAAAAACCTCTCGGTTTATCTCTATCC
GGCGTTGGGGTTGCAGAAGCGGCGAAAGTGGGAGTAAACAAACCAGAACTGCTCCCAAAA
GAGTTCACTTCTGTCATAGATGTTGCTGGCTTCCTCTCTGATGGCCAGGAGAAGAGGATT
GCTGAAGAAATCGATGATATTGAGAAAGATACAGGGTTTAAGCTAAGAGTCTTGGCTCAA
AACTATCCTGTTACACCTGGACTAGCTTTCAAGGATTACTGGCAAGTTGATGATAACACT
ATTGTGTTTGTCGCTGATCCCACTTTTGGGAACATATTGAACTTTAATGTTGGGGCTACT
GTTGATTTGGACATACCTCGTAGTTTCTGGAGTCGTTTAGCTGGGAAGTACGGCAATATG
TTTTACTGGAAAGAAAAGGGTGAAGATGCATCCATCGAAGCTGCAGTAATGGCTATATCA
AGCTGCTTAAGGGAACCCGTTGGTGCAAATAACTGTGCAGAGATTTACTGAAGTTTTATG
ACCTGATAAAATGTATGTTACAAAACACATATAAACATCGATACCACATGTGATAGTAAG
AGTATAGATGTTGATTGTTGAATCTGACATCAACCCTATATAGTTTTTGTACTTGTGTTA
TATCGTACTGTATTAGTACGTTTGTCGAGATTGTTCAAAGC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL4168Contig1 514 2 1 U
GAGGCAAACATGGAAGTGGAGACAAACACGGAAGTGGAGGTTCGTCAATGGGTGAAGGTA
AACACGGGGGTGGAGGCTCTTCTAAAAAGGAGAAAAAAGAATTCCATTATGCAGGTTCAT
CTATGGATGCAAGTAGTTCAAGTGAAAGTTCAGATGGAAGTTCAGATGGAAGTTCAGATG
GTGAAAGTTCACATGGGAGTGGTGGTAAACACATGTGAGTAAACGTGAATTCATGGAAGA
ATAAAAGACATTGGTGGACCTATTCCAATGTTTAGCATATGACGTGTCATGAATTGTACG
GCATTGTAAGGGAAAAAAAACTTTTTACAATTTTTATGTTAATATATGTAATGGTTAAAA
CTGATTAATATGATAAGACAGAAAGACTATTATGATACAATGTATAGTGAAAATATAAAA
ATAATGTAATGTGGTAACAATTATTTCCATTCCTTCTTGAAAGGATCTGGTTTAGCTAGC
TTCCGATATTTAATTATAGAAATTTAATACTTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FU73JQ C 1
AF RR2FU73TF U 1
BS 1 514 RR2FU73TF

RD RR2FU73JQ 514 0 0
GAGGCAAACATGGAAGTGGAGACAAACACGGAAGTGGAGGTTCGTCAATGGGTGAAGGTA
AACACGGGGGTGGAGGCTCTTCTAAAAAGGAGAAAAAAGAATTCCATTATGCAGGTTCAT
CTATGGATGCAAGTAGTTCAAGTGAAAGTTCAGATGGAAGTTCAGATGGAAGTTCAGATG
GTGAAAGTTCACATGGGAGTGGTGGTAAACACATGTGAGTAAACGTGAATTCATGGAAGA
ATAAAAGACATTGGTGGACCTATTCCAATGTTTAGCATATGACGTGTCATGAATTGTACG
GCATTGTAAGGGAAAAAAAACTTTTTACAATTTTTATGTTAATATATGTAATGGTTAAAA
CTGATTAATATGATAAGACAGAAAGACTATTATGATACAATGTATAGTGAAAATATAAAA
ATAATGTAATGTGGTAACAATTATTTCCATTCCTTCTTGAAAGGATCTGGTTTAGCTAGC
TTCCGATATTTAATTATAGAAATTTAATACTTAG

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2FU73TF 514 0 0
GAGGCAAACATGGAAGTGGAGACAAACACGGAAGTGGAGGTTCGTCAATGGGTGAAGGTA
AACACGGGGGTGGAGGCTCTTCTAAAAAGGAGAAAAAAGAATTCCATTATGCAGGTTCAT
CTATGGATGCAAGTAGTTCAAGTGAAAGTTCAGATGGAAGTTCAGATGGAAGTTCAGATG
GTGAAAGTTCACATGGGAGTGGTGGTAAACACATGTGAGTAAACGTGAATTCATGGAAGA
ATAAAAGACATTGGTGGACCTATTCCAATGTTTAGCATATGACGTGTCATGAATTGTACG
GCATTGTAAGGGAAAAAAAACTTTTTACAATTTTTATGTTAATATATGTAATGGTTAAAA
CTGATTAATATGATAAGACAGAAAGACTATTATGATACAATGTATAGTGAAAATATAAAA
ATAATGTAATGTGGTAACAATTATTTCCATTCCTTCTTGAAAGGATCTGGTTTAGCTAGC
TTCCGATATTTAATTATAGAAATTTAATACTTAG

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL4169Contig1 756 2 2 U
GGAAAACATTAAAACACAAGTTAAAGAAACTGCCTTACAAGAACTACATACGTTGTTTCA
AAGCTCTTTGTTTTTTTCAAAATGGAAAATATTGTTAGATTCGCGGTTACCATCATTTTT
GTACTTTACTCTCTATCATCATCTAACGCCGCAACTACACCACCGAGCGGTGGAGGCGGC
GGAGGAGGAGATGCTCAAGCAATGCCGTGTATACAAAAACTTATGCCGTGCCAGCCGTTT
CTTCACTCGGTCACTCCACCACCGCCTCCATCGTGCTGCCTGCCGATGAGGGAGATCGTC
GCCAACGACGCGACGTGTCTTTGCTCCGTCTTCAACAACGTGGATATGCTCAAATCGCTT
AACCTCACTAAAGACAATGCTCTTGATCTCCCTAAAGCCTGTGGCGCCAACCCTGACATC
TCACTCTGCAAAGCCAGTTCCGCGGGTGGTACTACTATGCCTTCGACATCGTCGGCAACT
CCAAAAAGTCCTCCGGTGTCTTCCACTGGAAGCGGTTCCACCGGAGCTTCATCAGCTTCT
TCAACATCCACACCAACAAGCTCTGTTCCGGCTATCAACTTTGCTGGACTAAGCTTCGCA
TCGACTATTGTGGCATTCGCAACAACTGTCTTCTGATCGACTACTATATATATATTATCA
CATCACGTTTTTATTAATTTTTAGATAGGTTTAATCTGTTTGAAATTATGTTTGGAAACT
TAATATTCATATGTAATGAAAAAATTCTAATAATAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY66TFB U 1
AF RR2AY66JQ C 1
BS 1 667 RR2AY66TFB
BS 668 756 RR2AY66JQ

RD RR2AY66TFB 667 0 0
GGAAAACATTAAAACACAAGTTAAAGAAACTGCCTTACAAGAACTACATACGTTGTTTCA
AAGCTCTTTGTTTTTTTCAAAATGGAAAATATTGTTAGATTCGCGGTTACCATCATTTTT
GTACTTTACTCTCTATCATCATCTAACGCCGCAACTACACCACCGAGCGGTGGAGGCGGC
GGAGGAGGAGATGCTCAAGCAATGCCGTGTATACAAAAACTTATGCCGTGCCAGCCGTTT
CTTCACTCGGTCACTCCACCACCGCCTCCATCGTGCTGCCTGCCGATGAGGGAGATCGTC
GCCAACGACGCGACGTGTCTTTGCTCCGTCTTCAACAACGTGGATATGCTCAAATCGCTT
AACCTCACTAAAGACAATGCTCTTGATCTCCCTAAAGCCTGTGGCGCCAACCCTGACATC
TCACTCTGCAAAGCCAGTTCCGCGGGTGGTACTACTATGCCTTCGACATCGTCGGCAACT
CCAAAAAGTCCTCCGGTGTCTTCCACTGGAAGCGGTTCCACCGGAGCTTCATCAGCTTCT
TCAACATCCACACCAACAAGCTCTGTTCCGGCTATCAACTTTGCTGGACTAAGCTTCGCA
TCGACTATTGTGGCATTCGCAACAACTGTCTTCTGATCGACTACTATATATATATTATCA
CATCACG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2AY66JQ 756 0 0
GGAAAACATTAAAACACAAGTTAAAGAAACTGCCTTACAAGAACTACATACGTTGTTTCA
AAGCTCTTTGTTTTTTTCAAAATGGAAAATATTGTTAGATTCGCGGTTACCATCATTTTT
GTACTTTACTCTCTATCATCATCTAACGCCGCAACTACACCACCGAGCGGTGGAGGCGGC
GGAGGAGGAGATGCTCAAGCAATGCCGTGTATACAAAAACTTATGCCGTGCCAGCCGTTT
CTTCACTCGGTCACTCCACCACCGCCTCCATCGTGCTGCCTGCCGATGAGGGAGATCGTC
GCCAACGACGCGACGTGTCTTTGCTCCGTCTTCAACAACGTGGATATGCTCAAATCGCTT
AACCTCACTAAAGACAATGCTCTTGATCTCCCTAAAGCCTGTGGCGCCAACCCTGACATC
TCACTCTGCAAAGCCAGTTCCGCGGGTGGTACTACTATGCCTTCGACATCGTCGGCAACT
CCAAAAAGTCCTCCGGTGTCTTCCACTGGAAGCGGTTCCACCGGAGCTTCATCAGCTTCT
TCAACATCCACACCAACAAGCTCTGTTCCGGCTATCAACTTTGCTGGACTAAGCTTCGCA
TCGACTATTGTGGCATTCGCAACAACTGTCTTCTGATCGACTACTATATATATATTATCA
CATCACGTTTTTATTAATTTTTAGATAGGTTTAATCTGTTTGAAATTATGTTTGGAAACT
TAATATTCATATGTAATGAAAAAATTCTAATAATAT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL4170Contig1 940 2 10 U
GGAAAAACAAAGCGTCTTTCTCTCACGGCAACAAGCAACAGCGACGAGATTGATCGACGG
CGACGAGATTGATCGACGGCGACGAGATCGAGCAACGGTGACGAGATCGAGTGTATTCTC
TCTCACAAAACAGACGAGATTGAGACTCGCAACCTCAAAATGTCGAATCCTCAGTAAGAA
CTACAAGTTTACAAGTTAACTTCAAACCAATGAAGAATGTGAGCACCTGATCAGCCTCGC
TAAACCCAACATGCTTAAGTGAACTGTTGTTGATGAGAAAACCGGTGGTAGCAAAGATCC
CTCTGGCTCTTGACTTGCCTAATGTAGGGGACTTTGTGTATGATAACCCGAGGAACGGTA
TCTCCATTGTTCCTCCTGTTCCTATGGAGAACTCGCTGATTCAAGTGGTGAGTATTACTG
AGGAAGGTGCTTTTCTTGAGGCTGCTTCCACTGTTATCCTGTTTGCGTCGCCTCTACGTT
CTGTTTTCATCAGAGCTCCAGCGTCTCCTTTGTACGTACCTGTCACAACCATAATGGAGA
AGATCTTAGGTCCAGTCTCTGTTGGTTCGCTGAGGTTGGTTCAACGGATGTGAGGATCAA
CCCAGTTGTTAGGTTCAACTACTTCAGTGACCCACAGGATCTTGAGAGGTGTGTCAATGG
GACTAGGAAGATTGGAGAGATACTCAGGAGCCGAGCTATGCAGGACTTTATGTTCAGGGA
ATGGTTTGGGAGCTATAGGTTCAGGTTCGTCGGGGTGCTATTCCGTTTTAGTTTTTATTT
ATTTTAAATAGTATATTTGTAATATTTGGTCTTTTTATATTGACTAAGCTTGGGGTGGGT
ATTTGAATATCCACTCGAATTCGGTTAAAATCTATTCGGGTTTAAATTTTTTGAGTTTAA
AAATTTTAACTCTATTCGGGTATTTATAAATTTTGGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB88TF U 1
AF RR2HB88JQ C 278
BS 1 612 RR2HB88TF
BS 613 613 RR2HB88JQ
BS 614 637 RR2HB88TF
BS 638 638 RR2HB88JQ
BS 639 648 RR2HB88TF
BS 649 649 RR2HB88JQ
BS 650 687 RR2HB88TF
BS 688 688 RR2HB88JQ
BS 689 713 RR2HB88TF
BS 714 940 RR2HB88JQ

RD RR2HB88TF 713 0 0
GGAAAAACAAAGCGTCTTTCTCTCACGGCAACAAGCAACAGCGACGAGATTGATCGACGG
CGACGAGATTGATCGACGGCGACGAGATCGAGCAACGGTGACGAGATCGAGTGTATTCTC
TCTCACAAAACAGACGAGATTGAGACTCGCAACCTCAAAATGTCGAATCCTCAGTAAGAA
CTACAAGTTTACAAGTTAACTTCAAACCAATGAAGAATGTGAGCACCTGATCAGCCTCGC
TAAACCCAACATGCTTAAGTGAACTGTTGTTGATGAGAAAACCGGTGGTAGCAAAGATCC
CTCTGGCTCTTGACTTGCCTAATGTAGGGGACTTTGTGTATGATAACCCGAGGAACGGTA
TCTCCATTGTTCCTCCTGTTCCTATGGAGAACTCGCTGATTCAAGTGGTGAGTATTACTG
AGGAAGGTGCTTTTCTTGAGGCTGCTTCCACTGTTATCCTGTTTGCGTCGCCTCTACGTT
CTGTTTTCATCAGAGCTCCAGCGTCTCCTTTGTACGTACCTGTCACAACCATAATGGAGA
AGATCTTAGGTCCAGTCTCTGTTGGTTCGCTGAGGTTGGTTCAACGGATGTGAGGATCAA
CCCAGTTGTTAG*TTCAACTACTTCAGTGACCCACAG*ATCTTGAGAG*TGTGTCAATGG
GACTAGGAAGATTGGAGAGATACTCAG*AGCCGAGCTATGCAGGACTTTATGT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2HB88JQ 663 0 0
AAAACCGGTGGTAGCAAAGATCCCTCTGGCTCTTGACTTGCCTAATGTAGGGGACTTTGT
GTATGATAACCCGAGGAACGGTATCTCCATTGTTCCTCCTGTTCCTATGGAGAACTCGCT
GATTCAAGTGGTGAGTATTACTGAGGAAGGTGCTTTTCTTGAGGCTGCTTCCACTGTTAT
CCTGTTTGCGTCGCCTCTACGTTCTGTTTTCATCAGAGCTCCAGCGTCTCCTTTGTACGT
ACCTGTCACAACCATAATGGAGAAGATCTTAGGTCCAGTCTCTGTTGGTTCGCTGAGGTT
GGTTCAACGGATGTGAGGATCAACCCAGTTGTTAGGTTCAACTACTTCAGTGACCCACAG
GATCTTGAGAGGTGTGTCAATGGGACTAGGAAGATTGGAGAGATACTCAGGAGCCGAGCT
ATGCAGGACTTTATGTTCAGGGAATGGTTTGGGAGCTATAGGTTCAGGTTCGTCGGGGTG
CTATTCCGTTTTAGTTTTTATTTATTTTAAATAGTATATTTGTAATATTTGGTCTTTTTA
TATTGACTAAGCTTGGGGTGGGTATTTGAATATCCACTCGAATTCGGTTAAAATCTATTC
GGGTTTAAATTTTTTGAGTTTAAAAATTTTAACTCTATTCGGGTATTTATAAATTTTGGT
TTC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL4171Contig1 938 2 4 U
GTGCAGAGTTATGCGCTGAGAAGTTTGAGATAACCAGGGAGCAGCAAGATGATTACGCTG
TTCAGAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCTCAAGAAGCTGGCGCCTTCACATGGGAGATCG
TCCCGGTTGAAGTTTCTGGAGGAAGGGGTAGGCCATCAACCATTGTTGACAAGGATGAAG
GTCTTGGGAAGTTTGATGCTGCAAAACTGAGGAAACTCCGTCCGAGTTTCAAGGAGAATG
GAGGCACAGTTACAGCTGGAAATGCCTCTAGCATAAGTGATGGTGCAGCTGCTATTGTCC
TAGTGAGTGGAGAGAAGGCGCTTCAGCTAGGACTTCAAGTACTTGCAAAAGTTAAAGGTT
ATGGTGACGCAGCTCAGGAGCCAGAGTTTTTCACTACTGCTCCTGCTCTGGCAATACCAA
AAGCTATTGCACATGCTGGTTTGGAATCTTCTCAAGTTGATTACTATGAGATCAATGAAG
CATTTGCAGTTGTAGCACTTGCAAATCAAAAGCTACTTGGGATTAGTCCGGAGAAGGTGA
ATGTAAATGGAGGAGCCGTCTCCTTAGGGCATCCTCTAGGCTGCAGTGGAGCCCGTATTC
TAATCACATTGCTTGGGATACTGAAGAGGAGAAACGGCAAGTACGGTGTGGGAGGAGTGT
GCAACGGAGGAGGAGGTGCTTCTGCTCTTGTTCTTGAACTCGTTTGATGCATTTATATGA
ATCCCAGGTTGTTGAACTATATAGAGCGTATCTATCATTCTACCAACTTGCACTTCAAGT
TTGATATTGGTTGGTCTCTCTCAATAAACGAGTGATGATGATCTTTGATGTTGTTAAGTT
TATTTAGTTATTTTATGAACTATGTTTCTGTTTCCGTACTTTGTGACCTCAGTTCTCAGT
TATGAACCTACCGATTTATTTTTAGTTTAATGAATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI06TF U 1
AF RR2EI06JQ C 197
BS 1 579 RR2EI06TF
BS 580 580 RR2EI06JQ
BS 581 618 RR2EI06TF
BS 619 938 RR2EI06JQ

RD RR2EI06TF 618 0 0
GTGCAGAGTTATGCGCTGAGAAGTTTGAGATAACCAGGGAGCAGCAAGATGATTACGCTG
TTCAGAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCTCAAGAAGCTGGCGCCTTCACATGGGAGATCG
TCCCGGTTGAAGTTTCTGGAGGAAGGGGTAGGCCATCAACCATTGTTGACAAGGATGAAG
GTCTTGGGAAGTTTGATGCTGCAAAACTGAGGAAACTCCGTCCGAGTTTCAAGGAGAATG
GAGGCACAGTTACAGCTGGAAATGCCTCTAGCATAAGTGATGGTGCAGCTGCTATTGTCC
TAGTGAGTGGAGAGAAGGCGCTTCAGCTAGGACTTCAAGTACTTGCAAAAGTTAAAGGTT
ATGGTGACGCAGCTCAGGAGCCAGAGTTTTTCACTACTGCTCCTGCTCTGGCAATACCAA
AAGCTATTGCACATGCTGGTTTGGAATCTTCTCAAGTTGATTACTATGAGATCAATGAAG
CATTTGCAGTTGTAGCACTTGCAAATCAAAAGCTACTTGGGATTAGTCCGGAGAAGGTGA
ATGTAAATGGAGGAGCCGTCTCCTTAGGGCATCCTCTAG*CTGCAGTGGAGCCCGTATTC
TAATCACATTGCTTGGGA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2EI06JQ 742 0 0
TGCTGCAAAACTGAGGAAACTCCGTCCGAGTTTCAAGGAGAATGGAGGCACAGTTACAGC
TGGAAATGCCTCTAGCATAAGTGATGGTGCAGCTGCTATTGTCCTAGTGAGTGGAGAGAA
GGCGCTTCAGCTAGGACTTCAAGTACTTGCAAAAGTTAAAGGTTATGGTGACGCAGCTCA
GGAGCCAGAGTTTTTCACTACTGCTCCTGCTCTGGCAATACCAAAAGCTATTGCACATGC
TGGTTTGGAATCTTCTCAAGTTGATTACTATGAGATCAATGAAGCATTTGCAGTTGTAGC
ACTTGCAAATCAAAAGCTACTTGGGATTAGTCCGGAGAAGGTGAATGTAAATGGAGGAGC
CGTCTCCTTAGGGCATCCTCTAGGCTGCAGTGGAGCCCGTATTCTAATCACATTGCTTGG
GATACTGAAGAGGAGAAACGGCAAGTACGGTGTGGGAGGAGTGTGCAACGGAGGAGGAGG
TGCTTCTGCTCTTGTTCTTGAACTCGTTTGATGCATTTATATGAATCCCAGGTTGTTGAA
CTATATAGAGCGTATCTATCATTCTACCAACTTGCACTTCAAGTTTGATATTGGTTGGTC
TCTCTCAATAAACGAGTGATGATGATCTTTGATGTTGTTAAGTTTATTTAGTTATTTTAT
GAACTATGTTTCTGTTTCCGTACTTTGTGACCTCAGTTCTCAGTTATGAACCTACCGATT
TATTTTTAGTTTAATGAATTTG

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL4172Contig1 1055 2 4 U
GGAAGCCATGGCTAATCGCTATGATCCGAATCCTTTCGCCGAGGAAGAAGAAGTCAATCC
CTTCGCTAACCCAGGGAGTATCCCTCCAGCATCGAACTCAAGACTCTCTCCTTTGCCTCC
AGAGCCTGTTGGTTTCGGTTATGGTCGAACCGTAGACATTCCTCTTGACAATAATGACAG
ATCCGGTACACAGAATTTGAAGAAGAAAGAAGAGGAACTTCAAGCCAAAGAAGCTGAGCT
AAGACGACGAGAGCAGGACGTCAAAAGGAGAGAAGATGCTGCTGCACGAGCTGGAATAAC
TATTGAAGTGAAAAACTGGCCGCCTTTCTTCCCACTTATCCACCATGACATTGCCAACGA
AATCCCCGTTCATCTCCAAAGGCTACAGTATGTTACCTTTGCTACCTATTTGGGGTTGGT
TCTTTGTCTGTTCTGGAACATTATTGCCGTTACTACAGCTTGGATCAAAGGAGAAGGAGT
GACGATATGGCTTCTTGCCGTTATTTACTTCATAGCGGGTGTCCCAGGAGGCTATGTGTT
ATGGTATCGCCCCCTCTACCGTGCCTTCAGAACTGATAGTGCTTTGAGCTTCGGATGGTT
TTTCTTGTTCTACATGCTCCACATTCTTTTCACTGTATTTGCTGCTGTTGCTCCACCTGT
TGTCTTCAAAGGAAAATCTCTTGCTGGGACCTTACCTGCAATAGATGTCATAAGCGGTAA
CACATTGGTTGGGATATTTTACTTCATTGGGTTTGGATTTTTCTGCCTTGAATCAGTGGT
CAGCATTTGGGTTATTCAGCAAGTGTATATGTACTTTCGAGGCAGCGGGAAACAAGATGA
GTTGAGACGAGAAGCGGCCAGAGGAGCCCTGAGAGCCGCCGTGTGAGAGAGAGCTCACTG
TAACACTTGGTTTGATGTATGTAATTTTCCCTGTTTCTTTCGTTTTTAGATTCTGTCTTC
ACGGCTCTCTGCTTTGTTTGCAAAAAACATATTAAATTTTTCTTTAATACCTTTTATGTG
ATGTAAATTTGTTTGTTCAAAAGTTTAGAGTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU38TF U 1
AF RR2DU38JQ C 371
BS 1 771 RR2DU38TF
BS 772 772 RR2DU38JQ
BS 773 792 RR2DU38TF
BS 793 1055 RR2DU38JQ

RD RR2DU38TF 792 0 0
GGAAGCCATGGCTAATCGCTATGATCCGAATCCTTTCGCCGAGGAAGAAGAAGTCAATCC
CTTCGCTAACCCAGGGAGTATCCCTCCAGCATCGAACTCAAGACTCTCTCCTTTGCCTCC
AGAGCCTGTTGGTTTCGGTTATGGTCGAACCGTAGACATTCCTCTTGACAATAATGACAG
ATCCGGTACACAGAATTTGAAGAAGAAAGAAGAGGAACTTCAAGCCAAAGAAGCTGAGCT
AAGACGACGAGAGCAGGACGTCAAAAGGAGAGAAGATGCTGCTGCACGAGCTGGAATAAC
TATTGAAGTGAAAAACTGGCCGCCTTTCTTCCCACTTATCCACCATGACATTGCCAACGA
AATCCCCGTTCATCTCCAAAGGCTACAGTATGTTACCTTTGCTACCTATTTGGGGTTGGT
TCTTTGTCTGTTCTGGAACATTATTGCCGTTACTACAGCTTGGATCAAAGGAGAAGGAGT
GACGATATGGCTTCTTGCCGTTATTTACTTCATAGCGGGTGTCCCAGGAGGCTATGTGTT
ATGGTATCGCCCCCTCTACCGTGCCTTCAGAACTGATAGTGCTTTGAGCTTCGGATGGTT
TTTCTTGTTCTACATGCTCCACATTCTTTTCACTGTATTTGCTGCTGTTGCTCCACCTGT
TGTCTTCAAAGGAAAATCTCTTGCTGGGACCTTACCTGCAATAGATGTCATAAGCGGTAA
CACATTGGTTGGGATATTTTACTTCATTGGGTTTGGATTTTTCTGCCTTGA*TCAGTGGT
CAGCATTTGGGT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2DU38JQ 685 0 0
CATCTCCAAAGGCTACAGTATGTTACCTTTGCTACCTATTTGGGGTTGGTTCTTTGTCTG
TTCTGGAACATTATTGCCGTTACTACAGCTTGGATCAAAGGAGAAGGAGTGACGATATGG
CTTCTTGCCGTTATTTACTTCATAGCGGGTGTCCCAGGAGGCTATGTGTTATGGTATCGC
CCCCTCTACCGTGCCTTCAGAACTGATAGTGCTTTGAGCTTCGGATGGTTTTTCTTGTTC
TACATGCTCCACATTCTTTTCACTGTATTTGCTGCTGTTGCTCCACCTGTTGTCTTCAAA
GGAAAATCTCTTGCTGGGACCTTACCTGCAATAGATGTCATAAGCGGTAACACATTGGTT
GGGATATTTTACTTCATTGGGTTTGGATTTTTCTGCCTTGAATCAGTGGTCAGCATTTGG
GTTATTCAGCAAGTGTATATGTACTTTCGAGGCAGCGGGAAACAAGATGAGTTGAGACGA
GAAGCGGCCAGAGGAGCCCTGAGAGCCGCCGTGTGAGAGAGAGCTCACTGTAACACTTGG
TTTGATGTATGTAATTTTCCCTGTTTCTTTCGTTTTTAGATTCTGTCTTCACGGCTCTCT
GCTTTGTTTGCAAAAAACATATTAAATTTTTCTTTAATACCTTTTATGTGATGTAAATTT
GTTTGTTCAAAAGTTTAGAGTTCAC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL4173Contig1 928 2 6 U
GGATACAAGTCGTCTCTTGATGGACTGGACTAAGAAGGTGTCCAGGCTTATGATAAATTG
GAAGCGTGAGGCAGAACTAAGAAATCTCGGTTACAAGGTCTATGGCAATCCTTTCTCCAC
CAGCACGAGGCGTGTTCTTGCTGTTCTCCTTGAGAAAGGGCTCTCTTACGAATCCATTAC
CGTGGATTTAAAATCCGGTGAACACAAGACGGAGTCTTTCCTCTCTCTCAATCCTTTTGG
TCAAATCCCAGTTTTTGTAGATGGAAACATTAAGCTGCATGAGTCTCGAGCCATAACACA
ATACATCGCATATGTTCATAGCGCAAGAGGCACACAACTTCTGTACCTTCAAAGCCACGA
GACAATGGCAATACTAACAGTGTGGATGGAAATCGAAGCTCACCAGTTCGATCCATTTGC
GTCGAAACTCACTTGGGAGCAAGCCATTAAGCCTATTTACGGTCTAGAGACTGACCAAGA
GGTCGTCAAAGAAAACGAGGCTAATCTAGAGAAGGTTTTAGATGTCTACGAGAAACGACT
CGGGAAATATAAATTCTTGGCTTGCAATACCTTTACTTTGGCTGATCTTCATCACTTGCC
CAATATACAATACCTTTTAGGAACACCGACAAAGAGATTGTTCGAAGATCGACCTAAAGT
GCGTAAGTGGGTGGGTGAGATTACGGGTAGAGAGGCTTGGAAAATGGCTTGTGATCATGA
AAAGTATTGGTTTGGTAAGCAAATGAAATAACTGAAAGCAAAAGAAAACTGTGTGGGAAT
GTGATTGTGTGTTGTATTTTGGCCTTTGTTTGTAAGCTTGTGTTGTTTGTTGTGTGGTGA
ATCTTATAAGATTCATTTGTGTTTGGTTTATGTATGTCTGGTGTATATGTGAATAAAGGG
AATAATAATAGCCAGTAATTTTTAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK10TF U 1
AF RR2DK10JQ C 252
BS 1 620 RR2DK10TF
BS 621 621 RR2DK10JQ
BS 622 657 RR2DK10TF
BS 658 658 RR2DK10JQ
BS 659 678 RR2DK10TF
BS 679 928 RR2DK10JQ

RD RR2DK10TF 678 0 0
GGATACAAGTCGTCTCTTGATGGACTGGACTAAGAAGGTGTCCAGGCTTATGATAAATTG
GAAGCGTGAGGCAGAACTAAGAAATCTCGGTTACAAGGTCTATGGCAATCCTTTCTCCAC
CAGCACGAGGCGTGTTCTTGCTGTTCTCCTTGAGAAAGGGCTCTCTTACGAATCCATTAC
CGTGGATTTAAAATCCGGTGAACACAAGACGGAGTCTTTCCTCTCTCTCAATCCTTTTGG
TCAAATCCCAGTTTTTGTAGATGGAAACATTAAGCTGCATGAGTCTCGAGCCATAACACA
ATACATCGCATATGTTCATAGCGCAAGAGGCACACAACTTCTGTACCTTCAAAGCCACGA
GACAATGGCAATACTAACAGTGTGGATGGAAATCGAAGCTCACCAGTTCGATCCATTTGC
GTCGAAACTCACTTGGGAGCAAGCCATTAAGCCTATTTACGGTCTAGAGACTGACCAAGA
GGTCGTCAAAGAAAACGAGGCTAATCTAGAGAAGGTTTTAGATGTCTACGAGAAACGACT
CGGGAAATATAAATTCTTGGCTTGCAATACCTTTACTTTGGCTGATCTTCATCACTTGCC
CAATATACAATACCTTTTAG*AACACCGACAAAGAGATTGTTCGAAGATCGACCTAA*GT
GCGTAAGTGGGTGGGTGA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2DK10JQ 677 0 0
TTTTTGTAGATGGAAACATTAAGCTGCATGAGTCTCGAGCCATAACACAATACATCGCAT
ATGTTCATAGCGCAAGAGGCACACAACTTCTGTACCTTCAAAGCCACGAGACAATGGCAA
TACTAACAGTGTGGATGGAAATCGAAGCTCACCAGTTCGATCCATTTGCGTCGAAACTCA
CTTGGGAGCAAGCCATTAAGCCTATTTACGGTCTAGAGACTGACCAAGAGGTCGTCAAAG
AAAACGAGGCTAATCTAGAGAAGGTTTTAGATGTCTACGAGAAACGACTCGGGAAATATA
AATTCTTGGCTTGCAATACCTTTACTTTGGCTGATCTTCATCACTTGCCCAATATACAAT
ACCTTTTAGGAACACCGACAAAGAGATTGTTCGAAGATCGACCTAAAGTGCGTAAGTGGG
TGGGTGAGATTACGGGTAGAGAGGCTTGGAAAATGGCTTGTGATCATGAAAAGTATTGGT
TTGGTAAGCAAATGAAATAACTGAAAGCAAAAGAAAACTGTGTGGGAATGTGATTGTGTG
TTGTATTTTGGCCTTTGTTTGTAAGCTTGTGTTGTTTGTTGTGTGGTGAATCTTATAAGA
TTCATTTGTGTTTGGTTTATGTATGTCTGGTGTATATGTGAATAAAGGGAATAATAATAG
CCAGTAATTTTTAAACT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL4174Contig1 885 2 2 U
GGACCAAATGCTAATAATGGCTACTAGGGAAGAGAGAGATAAGTATAGATCTGTTCTTAA
CGATGTAGGAGGTGTTCAATGGAGGTATGGTCACCCTCCAGCTTTTGACCTTGTGAACCA
GCTCTTTGAAGAAGGCCAGACCAAGGTATGGCCAGAAGGATCCTTGGAAGAGACGGTTCA
AAACGCAATCAAGTCATGGGAGATGGAGCTCTCACACAAGATCCGTTTACAAGACTTCAA
GACTATAAACCCTGATAAGTTTAAGCTCTTTGTCAATGGGAGAGAAGGATTATCGGCTGA
AGAAACGCTTAGGCTTGGGAGTTACAATGCTTTGCTCAAGACCTCTCTACCTGGAGAGTT
TCAGTACTATAAACCAGAAGAAGAGAGCTTCGAGTCATCACATGATGCCTTTAGATCTGC
TTTACCACGTGGGTTTGCTTTTGAGATACTTTCTGTGTACTCAGGGCCGCCTAATATAGC
CTTCAAGTTTAGACACTGGGGATACTTTGAAGGAAACTTCAAAGGCCATGCTCCTACTGG
AGAAATGGTTCAGTTCCTCGGCCTGGGAGTTCTAAAGGTTGATGAACTGCTTAGAGCAGA
GGAGATTGAGATTTACTATGATCCAGGAGAGCTGTTCGGGGGACTGCTCAAGGGACCACC
TATATCAGAGACCAAAACCACAGACAGTGGAGACAACACTGCAGAGAAACAGAGTTGTCC
CTTCACACATTAAGAAAACTTAAGGAACTACGACTGTTGATTTACTGTATCATTGGGCCA
TACTGGAAAAATAAGGAAAGCAGAAGTGTGTAGACTCTTTATAAAATATATTGTAATAGT
CACTTGGATGCATGGAATAAGTTATATATTATGTTTTCAAGCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF71TF U 1
AF RR2FF71JQ C 304
BS 1 657 RR2FF71TF
BS 658 885 RR2FF71JQ

RD RR2FF71TF 657 0 0
GGACCAAATGCTAATAATGGCTACTAGGGAAGAGAGAGATAAGTATAGATCTGTTCTTAA
CGATGTAGGAGGTGTTCAATGGAGGTATGGTCACCCTCCAGCTTTTGACCTTGTGAACCA
GCTCTTTGAAGAAGGCCAGACCAAGGTATGGCCAGAAGGATCCTTGGAAGAGACGGTTCA
AAACGCAATCAAGTCATGGGAGATGGAGCTCTCACACAAGATCCGTTTACAAGACTTCAA
GACTATAAACCCTGATAAGTTTAAGCTCTTTGTCAATGGGAGAGAAGGATTATCGGCTGA
AGAAACGCTTAGGCTTGGGAGTTACAATGCTTTGCTCAAGACCTCTCTACCTGGAGAGTT
TCAGTACTATAAACCAGAAGAAGAGAGCTTCGAGTCATCACATGATGCCTTTAGATCTGC
TTTACCACGTGGGTTTGCTTTTGAGATACTTTCTGTGTACTCAGGGCCGCCTAATATAGC
CTTCAAGTTTAGACACTGGGGATACTTTGAAGGAAACTTCAAAGGCCATGCTCCTACTGG
AGAAATGGTTCAGTTCCTCGGCCTGGGAGTTCTAAAGGTTGATGAACTGCTTAGAGCAGA
GGAGATTGAGATTTACTATGATCCAGGAGAGCTGTTCGGGGGACTGCTCAAGGGACC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2FF71JQ 582 0 0
AACGCTTAGGCTTGGGAGTTACAATGCTTTGCTCAAGACCTCTCTACCTGGAGAGTTTCA
GTACTATAAACCAGAAGAAGAGAGCTTCGAGTCATCACATGATGCCTTTAGATCTGCTTT
ACCACGTGGGTTTGCTTTTGAGATACTTTCTGTGTACTCAGGGCCGCCTAATATAGCCTT
CAAGTTTAGACACTGGGGATACTTTGAAGGAAACTTCAAAGGCCATGCTCCTACTGGAGA
AATGGTTCAGTTCCTCGGCCTGGGAGTTCTAAAGGTTGATGAACTGCTTAGAGCAGAGGA
GATTGAGATTTACTATGATCCAGGAGAGCTGTTCGGGGGACTGCTCAAGGGACCACCTAT
ATCAGAGACCAAAACCACAGACAGTGGAGACAACACTGCAGAGAAACAGAGTTGTCCCTT
CACACATTAAGAAAACTTAAGGAACTACGACTGTTGATTTACTGTATCATTGGGCCATAC
TGGAAAAATAAGGAAAGCAGAAGTGTGTAGACTCTTTATAAAATATATTGTAATAGTCAC
TTGGATGCATGGAATAAGTTATATATTATGTTTTCAAGCGCC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

CO CL4175Contig1 422 2 1 U
GAGAGTATACTCGATCTGCAGAAGCAGCTGACATTGCTTGGTAGCGAAACACGGAGGGAT
ATGAATGGTAATCGATCTGATGAACCCGTAACTAGCACAACTACTGCAGACGAGCTTCGA
TCAGAGTTAGATGGTGCTATCGCCAGTGAATGCCCATTCTGTGGAGAACTAATGATCAAT
GAGACCACTCTGCCTTTTATTAAACCTGAGGAAACACAACATTCTGCTTCATGGGACCTC
CGACCACAGACCAACTTAGCTAACCAGAGGACTATTTCTTTACCTGTTTGATCTGTGTAA
CACCGTGATTTCCTTTTTGTGTAATATCTTCTTCAGCTGCCTTGGAGTGTTGATCTGATT
TTGAGTGTGAACGTAATATTATTATTTAAGCTTCTTGAGATATCATACACTACATTTTGC
TC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2GD05JQ C 1
AF RR2GD05TF U 1
BS 1 422 RR2GD05TF

RD RR2GD05JQ 422 0 0
GAGAGTATACTCGATCTGCAGAAGCAGCTGACATTGCTTGGTAGCGAAACACGGAGGGAT
ATGAATGGTAATCGATCTGATGAACCCGTAACTAGCACAACTACTGCAGACGAGCTTCGA
TCAGAGTTAGATGGTGCTATCGCCAGTGAATGCCCATTCTGTGGAGAACTAATGATCAAT
GAGACCACTCTGCCTTTTATTAAACCTGAGGAAACACAACATTTTGCTTCATGGGACCTC
CGACCACAGACCAACTTAGCTAACCAGAGGACTATTTCTTTACCTGTTTGATCTGTGTAA
CACCGTGATTTCCTTTTTGTGTAATATCTTCTTCAGCTGCCTTGGAGTGTTGATCTGATT
TTGAGTGTGAACGTAATATTATTATTTAAGCTTCTTGAGATATCATACACTACATTTTGC
TC

QA 1 422 1 422
DS 

RD RR2GD05TF 422 0 0
GAGAGTATACTCGATCTGCAGAAGCAGCTGACATTGCTTGGTAGCGAAACACGGAGGGAT
ATGAATGGTAATCGATCTGATGAACCCGTAACTAGCACAACTACTGCAGACGAGCTTCGA
TCAGAGTTAGATGGTGCTATCGCCAGTGAATGCCCATTCTGTGGAGAACTAATGATCAAT
GAGACCACTCTGCCTTTTATTAAACCTGAGGAAACACAACATTCTGCTTCATGGGACCTC
CGACCACAGACCAACTTAGCTAACCAGAGGACTATTTCTTTACCTGTTTGATCTGTGTAA
CACCGTGATTTCCTTTTTGTGTAATATCTTCTTCAGCTGCCTTGGAGTGTTGATCTGATT
TTGAGTGTGAACGTAATATTATTATTTAAGCTTCTTGAGATATCATACACTACATTTTGC
TC

QA 1 422 1 422
DS 



AS 1 2

CO CL4176Contig1 825 2 2 U
GGGAATGGATAAGGAACAACGCCAGAGCCAATGAGAGAAACAGGCGCAACGACCGTCCCA
AAAACTTTGATAGAAGCAGAAACTTTGAGAGGAGAAGAGAGAACATGGCAGGAGGCCCTC
CTCCCCAACGTCCTCCCATGGGAGGCCCTCCTCCCCCTGGCCAGAATTATGGCGGACCAC
CACCACAGAACAACATGGGAGGGCAGAGGCCTCCACCAAACTATGGAGGACCACCACCAC
AGCAGAACAACATGGGAGGACAGAGACCTCCAGCAAACTACGGAGGAGCACCACCACCGA
ACTATGGAGGGCCACCACCACCGAACTACGGGGGAGCGCCACCACAAAACAACATGGGAG
GAGCACCACCACCAAACTATGGAGGAGCGCCACCACCGAACTATGGAGGAGCACCACCGC
AGAACAACATGGGAGGAGGTCCACCAAATGCAGGATGGTCAGGTAACAACAACAACTACC
AGCAGCAGAATGGTGGAATGCAGCAGCCACAGTACCAGAACAACTATCCACCTAACCGGG
ATGGCAGCGGGAACCCGTACCAGGGTTAAGAGTAGTTGAAGCAGTTGTGGGTTTTTTTAT
TGTCATGCATTTTTGGACTATGTATAGATAATTTGAGGAAGGGAGTGAGAGTGCAATAGG
TAGGGTTAAAAAATCCTTTTGTTTTCAGTGTTTTATCAGTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCAACTGTTTTATCAGTCTGGTATTGTGTCAAGATAACCTC
TCAGCGACTGTGGCACGGTTAAATTGAGTTTGTTTTTTTTTAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO53TF U 1
AF RR2DO53JQ C 397
BS 1 469 RR2DO53TF
BS 470 825 RR2DO53JQ

RD RR2DO53TF 469 0 0
GGGAATGGATAAGGAACAACGCCAGAGCCAATGAGAGAAACAGGCGCAACGACCGTCCCA
AAAACTTTGATAGAAGCAGAAACTTTGAGAGGAGAAGAGAGAACATGGCAGGAGGCCCTC
CTCCCCAACGTCCTCCCATGGGAGGCCCTCCTCCCCCTGGCCAGAATTATGGCGGACCAC
CACCACAGAACAACATGGGAGGGCAGAGGCCTCCACCAAACTATGGAGGACCACCACCAC
AGCAGAACAACATGGGAGGACAGAGACCTCCAGCAAACTACGGAGGAGCACCACCACCGA
ACTATGGAGGGCCACCACCACCGAACTACGGGGGAGCGCCACCACAAAACAACATGGGAG
GAGCACCACCACCAAACTATGGAGGAGCGCCACCACCGAACTATGGAGGAGCACCACCGC
AGAACAACATGGGAGGAGGTCCACCAAATGCAGGATGGTCAGGTAACAA

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR2DO53JQ 429 0 0
CGAACTATGGAGGAGCACCCCCGCAGAACAACATGGGAGGAGGTCCACCAAATGCAGGAT
GGTCAGGTAACAACAACAACTACCAGCAGCAGAATGGTGGAATGCAGCAGCCACAGTACC
AGAACAACTATCCACCTAACCGGGATGGCAGCGGGAACCCGTACCAGGGTTAAGAGTAGT
TGAAGCAGTTGTGGGTTTTTTTATTGTCATGCATTTTTGGACTATGTATAGATAATTTGA
GGAAGGGAGTGAGAGTGCAATAGGTAGGGTTAAAAAATCCTTTTGTTTTCAGTGTTTTAT
CAGTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCAACTGTTTTATCAGT
CTGGTATTGTGTCAAGATAACCTCTCAGCGACTGTGGCACGGTTAAATTGAGTTTGTTTT
TTTTTAGTC

QA 1 429 1 429
DS 



AS 1 2

CO CL4177Contig1 1136 2 12 U
GGATCGCCCAAATAAAATCCACCGTCGTCGCCGGAGCTCCGATCTTCACTACCCAGAAAA
TGTCCCTCTCTGATGATGAAGACGAGTGCTTCGCTCGGTTCCTCGAATCAGAAGTCTCAT
CGGTAGAGGATGAAGAAAAAACGAAAGAACCTGAACCAAAACGACAACGTATTGAGAAGA
AAGACAAAACAAAGGTTGTAGACAAGGATGGTGCAAAGAGAATAGAGAGTGGAGTTCTCA
CCAAAGTTCCTACAGAGGTGTTTCGTCATATCTTCAAGTTCTTATCATCCGAGGATCTTC
TATCATGCTCTTTAGTGTGTAAATTTCTCAATTTTGCTGCCTCTGATGAATCTTTATGGC
GTCGCTTGTACTGTATCCGGTGGGGGCTAATGCCTTCAACTAGAATGTTACGTGAATATG
CTTGGAAGAAGCTTTATATCGATCGTGACGAGAAGGACATGATTGAACTCGTCAGAAGCT
GTCCAACGGATTTTAAAGTGTATTACGTTCAAATGCAAGCAGCAAAGCGAAGCCAAGCAC
CTCTTCCCTCCGAGATGGTGGATGACCAGGTAGTTCTTGACAAAACGGTACTTGACAAAG
TATCTCTGTGGAAGAAAAGCAAGGGACTTACTGATAAAGCTGTGATTGGCCATGTTTGTT
TGGGAACAAAATGTGGTTACCATCAGATTGACGATGTGTTCATATGCGAAGAGACTGGAA
ATGTTCATGTATGCGATGAGAACTGCAAGGAATTGATATTTTGTCCAGACAGTGGGTGTA
TGGTGTGTACTATCTCAGGTCTTTGTTCTGATAGTTTGGTCCTAGAAACTGATTCAGGCA
CAGATCAGGAAGAAGCTGAAGTATTAACAGAAAGGGGCCGTTTTGATAGAGCTTTGAATT
TGGATACAACTGCAAGAGTGAGCAGGAATTAGAACGTACCTTTGGGTTTTGCTGATCCAA
CCAAAAGCTTCAGCCTTTAGTGTAGTACTAGTAGCACATGTAAGGGAGAAGTGCAATGAA
TCAAAAGTAGTACATCTTGTTTTGAGTAGTCTTTTATGCTTTGTAAGTTGTGTGCAGAGC
TTTGTCTGTAACTTTACTCAGATTGTCCTTGAAAAGTGTTTTACATGTTGGTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP02TF U 1
AF RR2EP02JQ C 345
BS 1 709 RR2EP02TF
BS 710 710 RR2EP02JQ
BS 711 741 RR2EP02TF
BS 742 742 RR2EP02JQ
BS 743 749 RR2EP02TF
BS 750 750 RR2EP02JQ
BS 751 761 RR2EP02TF
BS 762 762 RR2EP02JQ
BS 763 765 RR2EP02TF
BS 766 766 RR2EP02JQ
BS 767 786 RR2EP02TF
BS 787 1136 RR2EP02JQ

RD RR2EP02TF 786 0 0
GGATCGCCCAAATAAAATCCACCGTCGTCGCCGGAGCTCCGATCTTCACTACCCAGAAAA
TGTCCCTCTCTGATGATGAAGACGAGTGCTTCGCTCGGTTCCTCGAATCAGAAGTCTCAT
CGGTAGAGGATGAAGAAAAAACGAAAGAACCTGAACCAAAACGACAACGTATTGAGAAGA
AAGACAAAACAAAGGTTGTAGACAAGGATGGTGCAAAGAGAATAGAGAGTGGAGTTCTCA
CCAAAGTTCCTACAGAGGTGTTTCGTCATATCTTCAAGTTCTTATCATCCGAGGATCTTC
TATCATGCTCTTTAGTGTGTAAATTTCTCAATTTTGCTGCCTCTGATGAATCTTTATGGC
GTCGCTTGTACTGTATCCGGTGGGGGCTAATGCCTTCAACTAGAATGTTACGTGAATATG
CTTGGAAGAAGCTTTATATCGATCGTGACGAGAAGGACATGATTGAACTCGTCAGAAGCT
GTCCAACGGATTTTAAAGTGTATTACGTTCAAATGCAAGCAGCAAAGCGAAGCCAAGCAC
CTCTTCCCTCCGAGATGGTGGATGACCAGGTAGTTCTTGACAAAACGGTACTTGACAAAG
TATCTCTGTGGAAGAAAAGCAAGGGACTTACTGATAAAGCTGTGATTGGCCATGTTTGTT
TGGGAACAAAATGTGGTTACCATCAGATTGACGATGTGTTCATATGCGA*GAGACTGGAA
ATGTTCATGTATGCGATGAGA*CTGCAAG*AATTGATATTT*GTC*AGACAGTGGGTGTA
TGGTGT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2EP02JQ 792 0 0
GATGAATCTTTATGGCGTCGCTTGTACTGTATCCGGTGGGGGCTAATGCCTTCAACTAGA
ATGTTACGTGAATATGCTTGGAAGAAGCTTTATATCGATCGTGACGAGAAGGACATGATT
GAACTCGTCAGAAGCTGTCCAACGGATTTTAAAGTGTATTACGTTCAAATGCAAGCAGCA
AAGCGAAGCCAAGCACCTCTTCCCTCCGAGATGGTGGATGACCAGGTAGTTCTTGACAAA
ACGGTACTTGACAAAGTATCTCTGTGGAAGAAAAGCAAGGGACTTACTGATAAAGCTGTG
ATTGGCCATGTTTGTTTGGGAACAAAATGTGGTTACCATCAGATTGACGATGTGTTCATA
TGCGAAGAGACTGGAAATGTTCATGTATGCGATGAGAACTGCAAGGAATTGATATTTTGT
CCAGACAGTGGGTGTATGGTGTGTACTATCTCAGGTCTTTGTTCTGATAGTTTGGTCCTA
GAAACTGATTCAGGCACAGATCAGGAAGAAGCTGAAGTATTAACAGAAAGGGGCCGTTTT
GATAGAGCTTTGAATTTGGATACAACTGCAAGAGTGAGCAGGAATTAGAACGTACCTTTG
GGTTTTGCTGATCCAACCAAAAGCTTCAGCCTTTAGTGTAGTACTAGTAGCACATGTAAG
GGAGAAGTGCAATGAATCAAAAGTAGTACATCTTGTTTTGAGTAGTCTTTTATGCTTTGT
AAGTTGTGTGCAGAGCTTTGTCTGTAACTTTACTCAGATTGTCCTTGAAAAGTGTTTTAC
ATGTTGGTAATT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL4178Contig1 667 2 1 U
GGGTCTTCTACATTGCGATTTACCGTGGAAGTGAGGAAGTGACAAGAGGGGCGAAGATCC
GATCTGCTACAGTGTTTCAAGGAGAATCAATGGCGGGAGTTGGAACATCAATGATTGGAT
CTGTTCTTATGTTTACAGTGGTGCTCTCGCTCCAAGAAGTGTACAGAGGGAAATTAGCTT
CTTCTGAGTTGTTGACGATCCTTGGAGGCTTCACTAGCTCCCTCCTCTTTCTCTCTCTCA
CCTTCATTGGAAATCTCCAGGAATCTTCTGGCATGAAGAGTGGCTGGGGTGCAGTGATAG
TTGCGGAAATCATAGCTCTTGTTGCTGCTGGCACGGTGCACCGAGTTTGCATTACAACCT
GTTTCTTGTTCTCCGCTGGGCTGTTATACGAGATGAGCAAGATCTCAGGATACATGCTCT
CCAGAGCTGAATCAAAATCTAAAAGGCACTGAATCAAGAGGACGGGATTACTAAGTTACA
TGATGTTCTCGCTTTTGATGATCTTGTTTACATAGTCTCTAAGGATACTTTACAACTATG
AAATTTAGAATTTTACGCGTATCTTACGTTTGACTTGGTCGATATCCTCGCAATTCCATA
GTTGTGGACTTTGTGGTTATGACTTTGTGTTGTGCGTTCTTATAGAAACCAAGACAAATG
GTGAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B024JQ C 1
AF RR2B024TF U 1
BS 1 667 RR2B024TF

RD RR2B024JQ 667 0 0
GGGTCTTCTACATTGCGATTTACCGTGGAAGTGAGGAAGTGACAAGAGGGGCGAAGATCC
GATCTGCTACAGTGTTTCAAGGAGAATCAATGGCGGGAGTTGGAACATCAATGATTGGAT
CTGTTCTTATGTTTACAGTGGTGCTCTCGCTCCAAGAAGTGTACAGAGGGAAATTAGCTT
CTTCTGAGTTGTTGACGATCCTTGGAGGCTTCACTAGCTCCCTCCTCTTTCTCTCTCTCA
CCTTCATTGGAAATCTCCAGGAATCTTCTGGCATGAAGAGTGGCTGGGGTGCAGTGATAG
TTGCGGAAATCATAGCTCTTGTTGCTGCTGGCACGGTGCACCGAGTTTGCATTACAACCT
GTTTCTTGTTCTCCGCTGGGCTGTTATACGAGATGAGCAAGATCTCAGGATACATGCTCT
CCAGAGCTGAATCAAAATCTAAAAGGCACTGAATCAAGAGGACGGGATTACTAAGTTACA
TGATGTTCTCGCTTTTGATGATCTTGTTTACATAGTCTCTAAGGATACTTTACAACTATG
AAATTTAGAATTTTACGCGTATCTTACGTTTGACTTGGTCGATATCCTCGCAATTCCATA
GTTGTGGACTTTGTGGTTATGACTTTGTGTTGTGCGTTCTTATAGAAACCAAGACAAATG
GTGAGAC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2B024TF 667 0 0
GGGTCTTCTACATTGCGATTTACCGTGGAAGTGAGGAAGTGACAAGAGGGGCGAAGATCC
GATCTGCTACAGTGTTTCAAGGAGAATCAATGGCGGGAGTTGGAACATCAATGATTGGAT
CTGTTCTTATGTTTACAGTGGTGCTCTCGCTCCAAGAAGTGTACAGAGGGAAATTAGCTT
CTTCTGAGTTGTTGACGATCCTTGGAGGCTTCACTAGCTCCCTCCTCTTTCTCTCTCTCA
CCTTCATTGGAAATCTCCAGGAATCTTCTGGCATGAAGAGTGGCTGGGGTGCAGTGATAG
TTGCGGAAATCATAGCTCTTGTTGCTGCTGGCACGGTGCACCGAGTTTGCATTACAACCT
GTTTCTTGTTCTCCGCTGGGCTGTTATACGAGATGAGCAAGATCTCAGGATACATGCTCT
CCAGAGCTGAATCAAAATCTAAAAGGCACTGAATCAAGAGGACGGGATTACTAAGTTACA
TGATGTTCTCGCTTTTGATGATCTTGTTTACATAGTCTCTAAGGATACTTTACAACTATG
AAATTTAGAATTTTACGCGTATCTTACGTTTGACTTGGTCGATATCCTCGCAATTCCATA
GTTGTGGACTTTGTGGTTATGACTTTGTGTTGTGCGTTCTTATAGAAACCAAGACAAATG
GTGAGAC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL4179Contig1 1050 2 2 U
CTGTGTCTTCAGTTTGCCCACCAACTGTTCGTTGAAATTCCGCAGAGAGAGTGGGATTTG
AAGTTTTTATAGAGAGATGAAGGATTTTCCTTCTTGCTTCGGTGAAAACGGAGTCCAAGT
TGCGGATTCCTCGTCTTCGAACTCCGGGAAGAACGCTCAGAATCTGGTCACTTCTATCTA
CCAGTGCCGTATCCGAGGAAGGACTTGTTTGATCACTGTGACGTGGGCCAAGACTCTGAT
GGGTCAGAGTGTGACCGTTGGTGTTGATGATTCTCGTAACCAGAGCCTCTGTAAAGTCGA
GATCAAGCCCTGGCTGTTCACTAAACGAAAAGGATCCAAGAGTTTGGAGGTTTATTCGTG
TAGCGTCTATGTTTTCTGGGATCTGTCGTCTGCGAAGTTCGGATCAGGACCTGAAGCTTT
GGGAGGATTCTATTTGGGTGTTGTTGTTGACAGGGAGATGGTTCTGCTTCTCGGTGATAT
GAAGAAGGAAGCTTTCAAGAAGACGAACGCTTCTTCGCCTTCGTCTCTGGGCGGCGCTGT
GTTCATCGCCAAGAAAGAGCATGTTTTTGGTAAGAGGGAGTTTATAACGAAGGCTCAGCT
CTGTTCAGATGGGGTTAGGATACATGATGTTGTGATTGAATGTGACACGAGCGTCACTGA
TCCTTGTCTCGTCGTTCGTGTGGATGGGAAGACGTTGTTGCAGGTGAAGCGGCTTAAGTG
GAAGTTTCGTGGGAACGATACGATAGTTGTTAATAGAGTGGCTGTGGAAGTTTTGTGGGA
TGTTCATAGTTGGCTCTTTGGGATCCCTTCTTCTACAGCGGGAAACGCAGTGTTTATGTT
CAGGACTAGTCAATCTTCTTCGGATAAGAGCTTGTCTTCTTTCTCACAGGACATCATGGC
AGCAACAACAACAGCAAACTCCAAGTCTCAAAGTTCTGGTTTTTCGCTGATTCTGTACGC
TTGGAAGAACGAGTAGATTGCCTGTAAAAGCGTTTGTTGATTCCTTGTCGACATTTGTTA
TTTATAGAGTGATGATTAATGAATTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB02TF U 1
AF RR2AB02JQ C 378
BS 1 681 RR2AB02TF
BS 682 1050 RR2AB02JQ

RD RR2AB02TF 681 0 0
CTGTGTCTTCAGTTTGCCCACCAACTGTTCGTTGAAATTCCGCAGAGAGAGTGGGATTTG
AAGTTTTTATAGAGAGATGAAGGATTTTCCTTCTTGCTTCGGTGAAAACGGAGTCCAAGT
TGCGGATTCCTCGTCTTCGAACTCCGGGAAGAACGCTCAGAATCTGGTCACTTCTATCTA
CCAGTGCCGTATCCGAGGAAGGACTTGTTTGATCACTGTGACGTGGGCCAAGACTCTGAT
GGGTCAGAGTGTGACCGTTGGTGTTGATGATTCTCGTAACCAGAGCCTCTGTAAAGTCGA
GATCAAGCCCTGGCTGTTCACTAAACGAAAAGGATCCAAGAGTTTGGAGGTTTATTCGTG
TAGCGTCTATGTTTTCTGGGATCTGTCGTCTGCGAAGTTCGGATCAGGACCTGAAGCTTT
GGGAGGATTCTATTTGGGTGTTGTTGTTGACAGGGAGATGGTTCTGCTTCTCGGTGATAT
GAAGAAGGAAGCTTTCAAGAAGACGAACGCTTCTTCGCCTTCGTCTCTGGGCGGCGCTGT
GTTCATCGCCAAGAAAGAGCATGTTTTTGGTAAGAGGGAGTTTATAACGAAGGCTCAGCT
CTGTTCAGATGGGGTTAGGATACATGATGTTGTGATTGAATGTGACACGAGCGTCACTGA
TCCTTGTCTCGTCGTTCGTGT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2AB02JQ 673 0 0
GGGATCTGTCGTCTGCGAAGTTCGGATCAGGACCTGAAGCTTTGGGAGGATTCTATTTGG
GTGTTGTTGTTGACAGGGAGATGGTTCTGCTTCTCGGTGATATGAAGAAGGAAGCTTTCA
AGAAGACGAACGCTTCTTCGCCTTCGTCTCTGGGCGGCGCTGTGTTCATCGCCAAGAAAG
AGCATGTTTTTGGTAAGAGGGAGTTTATAACGAAGGCTCAGCTCTGTTCAGATGGGGTTA
GGATACATGATGTTGTGATTGAATGTGACACGAGCGTCACTGATCCTTGTCTCGTCGTTC
GTGTGGATGGGAAGACGTTGTTGCAGGTGAAGCGGCTTAAGTGGAAGTTTCGTGGGAACG
ATACGATAGTTGTTAATAGAGTGGCTGTGGAAGTTTTGTGGGATGTTCATAGTTGGCTCT
TTGGGATCCCTTCTTCTACAGCGGGAAACGCAGTGTTTATGTTCAGGACTAGTCAATCTT
CTTCGGATAAGAGCTTGTCTTCTTTCTCACAGGACATCATGGCAGCAACAACAACAGCAA
ACTCCAAGTCTCAAAGTTCTGGTTTTTCGCTGATTCTGTACGCTTGGAAGAACGAGTAGA
TTGCCTGTAAAAGCGTTTGTTGATTCCTTGTCGACATTTGTTATTTATAGAGTGATGATT
AATGAATTGATCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL4180Contig1 912 2 2 U
GGATTCAGTGTCACCTTGATTCTTTTGTTTTGCTTTCTTGAGCATCTAGCTAGCCATGGA
TACATCTTCTCTCGTAATTAATCATCACCAGTCTCTGTCTCGCATCATCAAACCTCCCTC
TGTACCCAAATGTCGTCCTTTCTCCTCCCTTCAATCCTTTCCGACCAGACAACTCCTAAA
CAATCAGCTCGGAGCGGATGCGGAGGTGGAAGACGAAAGAGGGTTGACGCCGTTGGAGCT
TGCGAGGGAGATTCTGAAGACGACGCCTAAAGGGAACCCGATGCAGTTTGGTCGGAGAAT
AGGGTTAGAGAAGGTGATCAGTATACTTGAGGATCAAGTGTTCAAGTACGCTGAGGTGGA
GGAGATTTTGGAGAAGCGAGGGAGAGGGAAAGACGTGGAGTATCTGGTGAAGTGGAAGGA
CGGTGGAGATTGCGACTGGGTGAAAGGTGTACACGTGGCGGAAGATGTGGTGAAGGACTA
CGAAGCTGGGCTTGAGTACGCTGTAGCGGAGAGGGTGATGGGAAAGAGGATGGGGGACGA
TGGGAAGACGGAGTATCTTGTCAAATGGACTGATATGGCTGATGCCACGTGGGAGCCTGA
GGAGAACGTTGACACTAGCCTTGTGCAACTCTTTGAACAAGAAGAGGAGGCTCAACTTGT
TAATGGCCCGACCATTGTGTGAGCTTGATGAGCTTGGGAGCCATGATTTTTGTTTTGTTT
CTTTCTATTGAAATTTTCTTTTTAACTAAATATTTCACAAAAAGGCATTTGTCAGTGATG
TGATAGAAAATTTGCCGAGATTGGAACACTTGGTGAATTCTAATTTCTCTGCTGAGATTA
GAACAAAACTAGCTCAATCCAAGCTCTGTTTGTACATTAAATGCCATCAATTGATATTTG
TTCTTCTATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED22TF U 1
AF RR2ED22JQ C 228
BS 1 645 RR2ED22TF
BS 646 912 RR2ED22JQ

RD RR2ED22TF 645 0 0
GGATTCAGTGTCACCTTGATTCTTTTGTTTTGCTTTCTTGAGCATCTAGCTAGCCATGGA
TACATCTTCTCTCGTAATTAATCATCACCAGTCTCTGTCTCGCATCATCAAACCTCCCTC
TGTACCCAAATGTCGTCCTTTCTCCTCCCTTCAATCCTTTCCGACCAGACAACTCCTAAA
CAATCAGCTCGGAGCGGATGCGGAGGTGGAAGACGAAAGAGGGTTGACGCCGTTGGAGCT
TGCGAGGGAGATTCTGAAGACGACGCCTAAAGGGAACCCGATGCAGTTTGGTCGGAGAAT
AGGGTTAGAGAAGGTGATCAGTATACTTGAGGATCAAGTGTTCAAGTACGCTGAGGTGGA
GGAGATTTTGGAGAAGCGAGGGAGAGGGAAAGACGTGGAGTATCTGGTGAAGTGGAAGGA
CGGTGGAGATTGCGACTGGGTGAAAGGTGTACACGTGGCGGAAGATGTGGTGAAGGACTA
CGAAGCTGGGCTTGAGTACGCTGTAGCGGAGAGGGTGATGGGAAAGAGGATGGGGGACGA
TGGGAAGACGGAGTATCTTGTCAAATGGACTGATATGGCTGATGCCACGTGGGAGCCTGA
GGAGAACGTTGACACTAGCCTTGTGCAACTCTTTGAACAAGAAGA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2ED22JQ 685 0 0
CGCCGTTGGAGCTTGCGAGGGAGATTCTGAAGACGACGCCTAAAGGGAACCCGATGCAGT
TTGGTCGGAGAATAGGGTTAGAGAAGGTGATCAGTATACTTGAGGATCAAGTGTTCAAGT
ACGCTGAGGTGGAGGAGATTTTGGAGAAGCGAGGGAGAGGGAAAGACGTGGAGTATCTGG
TGAAGTGGAAGGACGGTGGAGATTGCGACTGGGTGAAAGGTGTACACGTGGCGGAAGATG
TGGTGAAGGACTACGAAGCTGGGCTTGAGTACGCTGTAGCGGAGAGGGTGATGGGAAAGA
GGATGGGGGACGATGGGAAGACGGAGTATCTTGTCAAATGGACTGATATGGCTGATGCCA
CGTGGGAGCCTGAGGAGAACGTTGACACTAGCCTTGTGCAACTCTTTGAACAAGAAGAGG
AGGCTCAACTTGTTAATGGCCCGACCATTGTGTGAGCTTGATGAGCTTGGGAGCCATGAT
TTTTGTTTTGTTTCTTTCTATTGAAATTTTCTTTTTAACTAAATATTTCACAAAAAGGCA
TTTGTCAGTGATGTGATAGAAAATTTGCCGAGATTGGAACACTTGGTGAATTCTAATTTC
TCTGCTGAGATTAGAACAAAACTAGCTCAATCCAAGCTCTGTTTGTACATTAAATGCCAT
CAATTGATATTTGTTCTTCTATGCC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL4181Contig1 761 2 3 U
GAGAAGAAGATGATCTCTCTCACCGTTAGCCCGACTGATGATGACTCCAACCCAACCACT
GGTTCTCGCCTCAACCAGAGTCCACCAAAGTCTAAACCAGCCCCCTCTGTCTCTGACAAG
AAAACAGATCCTCCTGAAGTGGTTGTTGATCCTCTTCTTTCTGAAGACAGTGACACTGTT
AAAGTTGGACCAATGCCCATCAAAGTTACAGGGTCTCCTCCAATTGTAACAGTCGGTACT
ATTCCTCTGGACCCCAGCTCACTTCAGAAGAAGTAAGCCCCTGTTTTGGTTTATTATCGC
ATGTCTTCTTTATATTTGATCACCCTCTGCATTATACTCCTGCTTCATCATATATGCCAC
ATGTGGTATGATGAGAGGCTTCTGTTTATATAGCTGAGAGTCTTGACTGGTGACTTGAGA
ATTCGCAATTATGTCAAACGCCGTAAAGATTATCGTTGGTTTGCGGTTAGTGGTTGCGTT
TTGGTTATTTTGGATTTGACCGGTGAATTATTGCGTTTTGAGTTCTCTTCTGTTTTTTTT
TTCCAGTTGTGAAATTCCCAGTTTTACATTTCCTTGTATGTTGGCGTTCTGTTTGGTCAT
TTTGTTTCAACTCAAAGGAGTTTTCAAAATTGGATATTAAATTCTTCTTTTTCTGGTCAA
ATATTGTCCTTCTTTCCAATGGCATTTACATATTTTAGGCAACTTTCGAACTATAAGGAA
CCTTTTTCACTTGCTATCATATTAACTGCTAGATTATAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C269TF U 153
AF RR2C269JQ C 1
BS 1 152 RR2C269JQ
BS 153 534 RR2C269TF
BS 535 761 RR2C269JQ

RD RR2C269TF 382 0 0
TCTTCTTTCTGAAGACAGTGACACTGTTAAAGTTGGACCAATGCCCATCAAAGTTACAGG
GTCTCCTCCAATTGTAACAGTCGGTACTATTCCTCTGGACCCCAGCTCACTTCAGAAGAA
GTAAGCCCCTGTTTTGGTTTATTATCGCATGTCTTCTTTATATTTGATCACCCTCTGCAT
TATACTCCTGCTTCATCATATATGCCACATGTGGTATGATGAGAGGCTTCTGTTTATATA
GCTGAGAGTCTTGACTGGTGACTTGAGAATTCGCAATTATGTCAAACGCCGTAAAGATTA
TCGTTGGTTTGCGGTTAGTGGTTGCGTTTTGGTTATTTTGGATTTGACCGGTGAATTATT
GCGTTTTGAGTTCTCTTCTGTT

QA 1 382 1 382
DS 

RD RR2C269JQ 761 0 0
GAGAAGAAGATGATCTCTCTCACCGTTAGCCCGACTGATGATGACTCCAACCCAACCACT
GGTTCTCGCCTCAACCAGAGTCCACCAAAGTCTAAACCAGCCCCCTCTGTCTCTGACAAG
AAAACAGATCCTCCTGAAGTGGTTGTTGATCCTCTTCTTTCTGAAGACAGTGACACTGTT
AAAGTTGGATCAATGCCCATCAAAGTTACAGGGTCTCCTCCAATTGTAACAGTCGGTACT
ATTCCTCTGGACCCCAGCTCACTTCAGAAGAAGTAAGCCCCTGTTTTGGTTTATTATCGC
ATGTCTTCTTTATATTTGATCACCCTCTGCATTATACTCCTGCTTCATCATATATGCCAC
ATGTGGTATGATGAGAGGCTTCTGTTTATATAGCTGAGAGTCTTGACTGGTGACTTGAGA
ATTCGCAATTATGTCAAACGCCGTAAAGATTATCGTTGGTTTGCGGTTAGTGGTTGCGTT
TTGGTTATTTTGGATTTGACCGGTGAATTATTGCGTTTTGAGTTCTCTTCTGTTTTTTTT
TTCCAGTTGTGAAATTCCCAGTTTTACATTTCCTTGTATGTTGGCGTTCTGTTTGGTCAT
TTTGTTTCAACTCAAAGGAGTTTTCAAAATTGGATATTAAATTCTTCTTTTTCTGGTCAA
ATATTGTCCTTCTTTCCAATGGCATTTACATATTTTAGGCAACTTTCGAACTATAAGGAA
CCTTTTTCACTTGCTATCATATTAACTGCTAGATTATAATC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL4182Contig1 1017 2 2 U
GGGGAGCCTCTTTACAATCTATCTTCCACCATCTTCTTTTCACAGCAGCGAAGTCCTTGT
TTGATGATTCACTCCACATCCTCCCTGAAACCTCGACCTTGGAAAAGACTCAATCTTTCG
AAACCCTCTACGCTCACATTTGCTCTTGCCGAATCAGATTCTCCTCAGCCTTTAGAAACA
AGCTCGAAATCTCTTCTCCTACAACTCTCTAAGTGTTTCGATCTTCCATCAGATTACTTC
CAGCAGCTACCAAGTGATCTTCGTCTCGATTTAAATGATGCTGCCTTTGATCTCTCCAAT
GGACCCATCATCGATGAGTGTGGTCAAGAGCTTGGGGAGACCTTACTGAATCTGTCCCGT
GCTTGGGAACAAGCAGACACATCAACCTCTCGTACTTTAGTGAAGAAACTTCCCGAACTG
GAAACTTTTTTAACAGATGGTGCCAAGTCAGCCTTTGGGAGGCGTCTGATATCTGCGGGA
AAAAGGTTCAGGGGAATGGGACAGTACGGTCAAAGTGAATTACAGAAGATTGCTAAAGCA
ATGATTACAACTGGAGAGGTCTTATCTGCAAATACACCATCTGCTTCAGTCGGTAATGAA
TCTAAGTCGACAACCAGGATGTTTAAGTTTGGGGAGCTTCAGGTTGCTGTGAGTCCAGAG
AAAGCATACGCTGGAGCTGCCATTGCATTCGTCTTTGGGATACTGTCATGGCAAATCAGT
CAGGGAATCCAAAGCATACCAGAGAGCTCATTGCAGTATGCTAATGACAATGCATTGCAA
CTCGCAAAGTCTCTAAGAGGGTCTCTTTTAGCTACGTTTTATGCGTCAGCCGTCTTGTCA
GGATTCACAACAGCTGGGCTCCTCCTTCTCGCTAAGCAGCTTTCATCAGAGAAAGACTCA
TCATAATCCTTCCGGGATGATCTCTATATCAATCATGTTTATTATTGTATCTACTACAAC
CTTTGATTCTGTCTATTAAAACTGTGGAATGGGTTGAGTTGTATTTTGTTTTCAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT94TF U 1
AF RR2GC25TF U 492
BS 1 600 RR2GT94TF
BS 601 1017 RR2GC25TF

RD RR2GT94TF 600 0 0
GGGGAGCCTCTTTACAATCTATCTTCCACCATCTTCTTTTCACAGCAGCGAAGTCCTTGT
TTGATGATTCACTCCACATCCTCCCTGAAACCTCGACCTTGGAAAAGACTCAATCTTTCG
AAACCCTCTACGCTCACATTTGCTCTTGCCGAATCAGATTCTCCTCAGCCTTTAGAAACA
AGCTCGAAATCTCTTCTCCTACAACTCTCTAAGTGTTTCGATCTTCCATCAGATTACTTC
CAGCAGCTACCAAGTGATCTTCGTCTCGATTTAAATGATGCTGCCTTTGATCTCTCCAAT
GGACCCATCATCGATGAGTGTGGTCAAGAGCTTGGGGAGACCTTACTGAATCTGTCCCGT
GCTTGGGAACAAGCAGACACATCAACCTCTCGTACTTTAGTGAAGAAACTTCCCGAACTG
GAAACTTTTTTAACAGATGGTGCCAAGTCAGCCTTTGGGAGGCGTCTGATATCTGCGGGA
AAAAGGTTCAGGGGAATGGGACAGTACGGTCAAAGTGAATTACAGAAGATTGCTAAAGCA
ATGATTACAACTGGAGAGGTCTTATCTGCAAATACACCATCTGCTTCAGTCGGTAATGAA

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2GC25TF 526 0 0
GGGAATGGGACAGTACGGTCAAGGTGAATTACAGAAGATTGCTAAAGCAATGATTACAAC
TGGAGAGGTCTTATCTGCAAATACGCCATCTGCTTCAGTCGGTAATGAATCTAAGTCGAC
AACCAGGATGTTTAAGTTTGGGGAGCTTCAGGTTGCTGTGAGTCCAGAGAAAGCATACGC
TGGAGCTGCCATTGCATTCGTCTTTGGGATACTGTCATGGCAAATCAGTCAGGGAATCCA
AAGCATACCAGAGAGCTCATTGCAGTATGCTAATGACAATGCATTGCAACTCGCAAAGTC
TCTAAGAGGGTCTCTTTTAGCTACGTTTTATGCGTCAGCCGTCTTGTCAGGATTCACAAC
AGCTGGGCTCCTCCTTCTCGCTAAGCAGCTTTCATCAGAGAAAGACTCATCATAATCCTT
CCGGGATGATCTCTATATCAATCATGTTTATTATTGTATCTACTACAACCTTTGATTCTG
TCTATTAAAACTGTGGAATGGGTTGAGTTGTATTTTGTTTTCAGAG

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 2

CO CL4183Contig1 598 2 2 U
GGGGCTGAAGAGCAGATGGATTCTGAATCTGCTGCATTGGTCTCTCGCTGTTGTGACGAT
GTATTCTAGGGTTTACTTGGGGTACCACACGGTTGTGCAGGTTTTCGCGGGGGCTGCGTT
GGGGGTGGTTGTTGGCGGGAGTTGGTTCTGGGTGGTGAATAGTGTGTTGTTTCGTTATTT
TCCGGTGATCGAGGAGAGTGCGTTGGGGAGGATGCTGTGTGTGAAGGATACTTCTCATAT
CCCTGATGTGTTGAAGTTTGAGTATGACAATGCTAGGGCTGCTAGGAAGAATATGGTGGA
CTCTAAGTCCGATTGATTTGTGTTTTCCTGGTCGGGAAAGCATTGTTTAGCCACTGTTGT
AAGACACTATGACATTGGTGAGAGTACCTGCTCATATAAACATGAAAGGAGCCTTCTTCC
CACTTATATTCATCAAGTTATCTTTGACTTTACTTCCATTTTCTTTGATCTTCTATATAT
ATTGAAAAAGACATTGCTTCATAAACGTAAAGAGAAAAGTTAATGACTTATTGATCTCTG
CTTTCGAGGATTCAAGCACTCTAGTGTATTTCTTTAGTTATCAAGACACATTATTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC73TF U 1
AF RR2EC73JQ C 1
BS 1 536 RR2EC73TF
BS 537 598 RR2EC73JQ

RD RR2EC73TF 536 0 0
GGGGCTGAAGAGCAGATGGATTCTGAATCTGCTGCATTGGTCTCTCGCTGTTGTGACGAT
GTATTCTAGGGTTTACTTGGGGTACCACACGGTTGTGCAGGTTTTCGCGGGGGCTGCGTT
GGGGGTGGTTGTTGGCGGGAGTTGGTTCTGGGTGGTGAATAGTGTGTTGTTTCGTTATTT
TCCGGTGATCGAGGAGAGTGCGTTGGGGAGGATGCTGTGTGTGAAGGATACTTCTCATAT
CCCTGATGTGTTGAAGTTTGAGTATGACAATGCTAGGGCTGCTAGGAAGAATATGGTGGA
CTCTAAGTCCGATTGATTTGTGTTTTCCTGGTCGGGAAAGCATTGTTTAGCCACTGTTGT
AAGACACTATGACATTGGTGAGAGTACCTGCTCATATAAACATGAAAGGAGCCTTCTTCC
CACTTATATTCATCAAGTTATCTTTGACTTTACTTCCATTTTCTTTGATCTTCTATATAT
ATTGAAAAAGACATTGCTTCATAAACGTAAAGAGAAAAGTTAATGACTTATTGATC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2EC73JQ 598 0 0
GGGGCTGAAGAGCAGATGGATTCTGAATCTGCTGCATTGGTCTCTCGCTGTTGTGACGAT
GTATTCTAGGGTTTACTTGGGGTACCACACGGTTGTGCAGGTTTTCGCGGGGGCTGCGTT
GGGGGTGGTTGTTGGCGGGAGTTGGTTCTGGGTGGTGAATAGTGTGTTGTTTCGTTATTT
TCCGGTGATCGAGGAGAGTGCGTTGGGGAGGATGCTGTGTGTGAAGGATACTTCTCATAT
CCCTGATGTGTTGAAGTTTGAGTATGACAATGCTAGGGCTGCTAGGAAGAATATGGTGGA
CTCTAAGTCCGATTGATTTGTGTTTTCCTGGTCGGGAAAGCATTGTTTAGCCACTGTTGT
AAGACACTATGACATTGGTGAGAGTACCTGCTCATATAAACATGAAAGGAGCCTTCTTCC
CACTTATATTCATCAAGTTATCTTTGACTTTACTTCCATTTTCTTTGATCTTCTATATAT
ATTGAAAAAGACATTGCTTCATAAACGTAAAGAGAAAAGTTAATGACTTATTGATCTCTG
CTTTCGAGGATTCAAGCACTCTAGTGTATTTCTTTAGTTATCAAGACACATTATTTGC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL4184Contig1 1256 2 2 U
GGTATTCATTTTGTTTTCTCTAGAGTAGAAACCAAGAGAGAGGGCGAAAATAAACTTGAC
TTTTCTTAGTCTTTTTTCTTTCTTTCTTTTGACGGCAATTTTTCTAAGTCTTTGGTAACG
AGTTTCTTGTTCTTGGTGTATCTCTGCAACCAATTCTTGAGGAAATGGGACTTTCTCTTT
CACTTCTCGTGTCTGCTTGTAAAGAAGTCTGGTCAAACCAACTCTCCAGTTTCAAGAACC
CTGTCGAGAGTTTTCTTGGAACCAGATCCTTCAGCAGAGGCTTGACTTCAAGAACCAACA
GTTTCAAGAGCGAGGCGCCTGAGCAAAACTCTCCCAAGGCCGCCGGTATGGAGAGGTCAT
TGAGCTTCAATAACTGGGAGATTCCAACAGAAGAAGTCAACACTGAGCCGACGACGAATC
AGGCAGAAGATGATCAGATTGTGGACGTGGAGAAGAAGCCTAAACGCAACAGTTTGAACG
GACGAACCTGCGAGAGAATCCAAATAATGAAACCCACCACGATTATTACTCCCCCTAAGC
CTTTTGTGTTCTTCTCCCCAAGACCGCTCGCCGAGCTTGACGCGGCTGCAACCACGTTAC
AGAAGGTGTACAAGAGTTACCGGACAGAAGGAACCTAGCGGATTGCGCGGTTGTGGTTGA
AGAGCTCTGGTGGAAGACTCTGGATTCTGCAGCTCTGAAACAGAGAATGAACCTGTAGAA
ACCAACATTACAGAGGACAAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGACACAAAGACCGGTGTTG
GAGCTGTCCAAGAGGCTATCTTGCAAATGGACAAGTGGAGTTGGTCCAAGAATTGGGTGT
GTTAGAGATTATCCCATGGAGCTGCAGTCACAAGCATTCGAACAAGTCAGCATGTCTCCT
CGGATTTTGCCTTTTTCTGCACGCTTCCCGTCACCGTACGGTCCTATTCCTTCACCAAGG
CCTAGTCCTAGAGTAAGAGTCTCTCCACGCTTAGCATACATGGGGATACCAAGTCCTAGA
GTTCAGGTAAACTGTTAGTCTTTTTGATTCACCCAATAAGAGAGTCTTGTGACTTTTAAG
ATGTGAGAAAAGGCTTTATTAATTCTCCCATCCTTTGTTCTTTAATTCATGTCAAACAAA
GTTTATTTCTTTTTAGCTCCCATTTTGTATTTGTAGTGGGTTCTTGGTTTGATAAATCCG
ACAGGCTGTAAATTGAAGTTCTTATTAATAGACCTTCTTGTGTGATCTTTGATCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP66TF U 1
AF RR2AP66JQ C 386
BS 1 764 RR2AP66TF
BS 765 1256 RR2AP66JQ

RD RR2AP66TF 764 0 0
GGTATTCATTTTGTTTTCTCTAGAGTAGAAACCAAGAGAGAGGGCGAAAATAAACTTGAC
TTTTCTTAGTCTTTTTTCTTTCTTTCTTTTGACGGCAATTTTTCTAAGTCTTTGGTAACG
AGTTTCTTGTTCTTGGTGTATCTCTGCAACCAATTCTTGAGGAAATGGGACTTTCTCTTT
CACTTCTCGTGTCTGCTTGTAAAGAAGTCTGGTCAAACCAACTCTCCAGTTTCAAGAACC
CTGTCGAGAGTTTTCTTGGAACCAGATCCTTCAGCAGAGGCTTGACTTCAAGAACCAACA
GTTTCAAGAGCGAGGCGCCTGAGCAAAACTCTCCCAAGGCCGCCGGTATGGAGAGGTCAT
TGAGCTTCAATAACTGGGAGATTCCAACAGAAGAAGTCAACACTGAGCCGACGACGAATC
AGGCAGAAGATGATCAGATTGTGGACGTGGAGAAGAAGCCTAAACGCAACAGTTTGAACG
GACGAACCTGCGAGAGAATCCAAATAATGAAACCCACCACGATTATTACTCCCCCTAAGC
CTTTTGTGTTCTTCTCCCCAAGACCGCTCGCCGAGCTTGACGCGGCTGCAACCACGTTAC
AGAAGGTGTACAAGAGTTACCGGACAGAAGGAACCTAGCGGATTGCGCGGTTGTGGTTGA
AGAGCTCTGGTGGAAGACTCTGGATTCTGCAGCTCTGAAACAGAGAATGAACCTGTAGAA
ACCAACATTACAGAGGACAAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGAC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2AP66JQ 871 0 0
AACAGAAGAAGTCAACACTGAGCCGACGACGAATCAGGCAGAAGATGATCAGATTGTGGA
CGTGGAGAAGAAGCCTAAACGCAACAGTTTGAACGGACGAACCTGCGAGAGAATCCAAAT
AATGAAACCCACCACGATTATTACTCCCCCTAAGCCTTTTGTGTTCTTCTCCCCAAGACC
GCTCGCCGAGCTTGACGCGGCTGCAACCACGTTACAGAAGGTGTACAAGAGTTACCGGAC
AGAAGGAACCTAGCGGATTGCGCGGTTGTGGTTGAAGAGCTCTGGTGGAAGACTCTGGAT
TCTGCAGCTCTGAAACAGAGAATGAACCTGTAGAAACCAACATTACAGAGGACAAAGAAG
AAGAAGAAGAGGAAGAGACACAAAGACCGGTGTTGGAGCTGTCCAAGAGGCTATCTTGCA
AATGGACAAGTGGAGTTGGTCCAAGAATTGGGTGTGTTAGAGATTATCCCATGGAGCTGC
AGTCACAAGCATTCGAACAAGTCAGCATGTCTCCTCGGATTTTGCCTTTTTCTGCACGCT
TCCCGTCACCGTACGGTCCTATTCCTTCACCAAGGCCTAGTCCTAGAGTAAGAGTCTCTC
CACGCTTAGCATACATGGGGATACCAAGTCCTAGAGTTCAGGTAAACTGTTAGTCTTTTT
GATTCACCCAATAAGAGAGTCTTGTGACTTTTAAGATGTGAGAAAAGGCTTTATTAATTC
TCCCATCCTTTGTTCTTTAATTCATGTCAAACAAAGTTTATTTCTTTTTAGCTCCCATTT
TGTATTTGTAGTGGGTTCTTGGTTTGATAAATCCGACAGGCTGTAAATTGAAGTTCTTAT
TAATAGACCTTCTTGTGTGATCTTTGATCTG

QA 1 871 1 871
DS 



AS 1 2

CO CL4185Contig1 1117 2 2 U
GGAACATCTCTTAGTGATGTCTGAAGATATTGGCTACAACAAAGAAACTCCTTGTGATTT
TCCAAGAAACCCTCTTTGCATCTTCCTAAGTGATTTCAAATCAGTTTTAAAATTTGATGA
GCTCGGTTTGGAGATAGCACGAATAGCTTTACCTGCTGCACTTGCTTTAACAGCTGATCC
CAATACCTTATGTGTGGAATACTCTTATGGAAACTGATGGGTCAAGTCGATATCTTTAAC
CTAAGTACCAAACATCTTCAGTTCTCTAGATTCATGAAAAATGGGTTTCTTTTACTGATG
AGAGTTATAGCCGTGACATTCTGTGTAACGCTTTCCGCATCACTAGCTGCACGAGAAGGA
TCCATTTCCATGGCAGCTTTCCAAGTTTGCTTGCAGGTTTGGTTAGCAACTTCACTTCTT
GCAGATGGGTATGCTGTAGCTGGCCAGGCAATACTAGCGAGTGCGTTTGCTAAAAAGGAC
TACAAAAGAGCTGCAGCTACCGCCTCCCGTGTCCTGCAGTTGGGACTGGTTCTCGGATTT
CTACTTGCGGTTATACTTGGCGCAGGATTGCATTTTGGAGCAAGACTATTCACAAAAGAT
GATAAAGTCTTGCACCTCATTAGCATAGGACTTCCGTTTGTGGCAGGGACACAACCAATC
AATGCCTTAGCATTTGTATTCGATGGAGTTAACTTTGGAGCATCTGATTTTGGTTATGCC
GCAGCTTCATTAGTTATGGTGGCTATAGTTAGCATCTTGTGTTTGATACTACTCTCGTCG
ACTCATGGGTTTATTGGACTTTGGTTTGGTCTCACCATTTACATGAGTCTTAGAGCAGCC
GTTGGATTCTGGCGGATTGGGACAGCAACAGGACCTTGGTCTTTTCTCAGGAGGTAGAAG
AAGGACAATTAAAGGGGAGGGCATGTTTTAAGTTGTTCTTTAAATTAATGAGCTTGTGAT
TGAATAAAACACAAAAGAATATGTATTTAGAGATGCAAATAATTATATGTGGTTTAGTAA
TATTCTTGAGAATATTAAGGGGGTGGGGGTAGGTGGTATACTAAATTTGGGATCTAGATT
GATGAAACTTTTATGTATTCAGGCATGAAATTTTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B313TF U 1
AF RR2B313JQ C 424
BS 1 838 RR2B313TF
BS 839 1117 RR2B313JQ

RD RR2B313TF 838 0 0
GGAACATCTCTTAGTGATGTCTGAAGATATTGGCTACAACAAAGAAACTCCTTGTGATTT
TCCAAGAAACCCTCTTTGCATCTTCCTAAGTGATTTCAAATCAGTTTTAAAATTTGATGA
GCTCGGTTTGGAGATAGCACGAATAGCTTTACCTGCTGCACTTGCTTTAACAGCTGATCC
CAATACCTTATGTGTGGAATACTCTTATGGAAACTGATGGGTCAAGTCGATATCTTTAAC
CTAAGTACCAAACATCTTCAGTTCTCTAGATTCATGAAAAATGGGTTTCTTTTACTGATG
AGAGTTATAGCCGTGACATTCTGTGTAACGCTTTCCGCATCACTAGCTGCACGAGAAGGA
TCCATTTCCATGGCAGCTTTCCAAGTTTGCTTGCAGGTTTGGTTAGCAACTTCACTTCTT
GCAGATGGGTATGCTGTAGCTGGCCAGGCAATACTAGCGAGTGCGTTTGCTAAAAAGGAC
TACAAAAGAGCTGCAGCTACCGCCTCCCGTGTCCTGCAGTTGGGACTGGTTCTCGGATTT
CTACTTGCGGTTATACTTGGCGCAGGATTGCATTTTGGAGCAAGACTATTCACAAAAGAT
GATAAAGTCTTGCACCTCATTAGCATAGGACTTCCGTTTGTGGCAGGGACACAACCAATC
AATGCCTTAGCATTTGTATTCGATGGAGTTAACTTTGGAGCATCTGATTTTGGTTATGCC
GCAGCTTCATTAGTTATGGTGGCTATAGTTAGCATCTTGTGTTTGATACTACTCTCGTCG
ACTCATGGGTTTATTGGACTTTGGTTTGGTCTCACCATTTACATGAGTCTTAGAGCAG

QA 1 838 1 838
DS 

RD RR2B313JQ 694 0 0
GATGGGTATGCTGTAGCTGGCCAGGCAATACTAGCGAGTGCGTTTGCTAAAAAGGACTAC
AAAAGAGCTGCAGCTACCGCCTCCCGTGTCCTGCAGTTGGGACTGGTTCTCGGATTTCTA
CTTGCGGTTATACTTGGCGCAGGATTGCATTTTGGAGCAAGACTATTCACAAAAGATGAT
AAAGTCTTGCACCTCATTAGCATAGGACTTCCGTTTGTGGCAGGGACACAACCAATCAAT
GCCTTAGCATTTGTATTCGATGGAGTTAACTTTGGAGCATCTGATTTTGGTTATGCCGCA
GCTTCATTAGTTATGGTGGCTATAGTTAGCATCTTGTGTTTGATACTACTCTCGTCGACT
CATGGGTTTATTGGACTTTGGTTTGGTCTCACCATTTACATGAGTCTTAGAGCAGCCGTT
GGATTCTGGCGGATTGGGACAGCAACAGGACCTTGGTCTTTTCTCAGGAGGTAGAAGAAG
GACAATTAAAGGGGAGGGCATGTTTTAAGTTGTTCTTTAAATTAATGAGCTTGTGATTGA
ATAAAACACAAAAGAATATGTATTTAGAGATGCAAATAATTATATGTGGTTTAGTAATAT
TCTTGAGAATATTAAGGGGGTGGGGGTAGGTGGTATACTAAATTTGGGATCTAGATTGAT
GAAACTTTTATGTATTCAGGCATGAAATTTTTAA

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL4186Contig1 735 2 19 U
GGCTGATTGAAAAACATTCGAAGAGCCGACAACAGAGAGAGAGAGACCAAAGCCATGGGT
CTAGAGGAAGCTGGAGATTTGGTTCTCCACATCATCCTATCCAAAATCGGACCTGAGAAC
ACAGCGAGAGTGGCTTGCGTCAGCAAACGCCTCAAGGTCTCCGCCTCCGAGGACTCCCTC
TGGTCCATCTTCTGTTCCCATGATCTCAACATCTCTACTCCTCTCGGTCCCCATGCAGAT
CCTTCTCCTTCCTTCAAGGCGGCATATCAGTCATGGAGGGAGTCCTTTAGAATGTATCCA
TGGCATCTCGTCAAGCGCGTTGGACGTTGCTGGGACAACCTCAAACGATGGTTGAGGTTA
AACTTCCCTGAAGCAGAGGCAACACTGAGGAAAGGAGCCACAGAGGAGGATCTCGAAGAG
TTCGAGTCTGCTCTCAAGCTCAAACTTCCTCTCCCCACAAGGCTTCTCTACCGTTTCGTC
GATGGCCAAGAGCCTTCTTCATCCTCCAATGGCCTTATTGGTGGCTATTCTCTGTACTCT
CATGAAGTCAATGTCTACTTGTTACCTCTCAAGGAAGTGATAACGGAGACCAACGAAACC
ATGAGCGATCTGTTCGGTGTCTCTAACGGATCCAACTATATCGTTGTGGCTGCGTCCATG
ATGGCGACTTTGAAAATGTTTTTCCTAGACTGCTCCAACGGACAGCTTTACACCGGGACG
AGTACACGCCAGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW27TFB U 143
AF RR2CG09TF U 1
BS 1 235 RR2CG09TF
BS 236 236 RR2AW27TFB
BS 237 346 RR2CG09TF
BS 347 347 RR2AW27TFB
BS 348 380 RR2CG09TF
BS 381 381 RR2AW27TFB
BS 382 395 RR2CG09TF
BS 396 396 RR2AW27TFB
BS 397 413 RR2CG09TF
BS 414 414 RR2AW27TFB
BS 415 422 RR2CG09TF
BS 423 423 RR2AW27TFB
BS 424 531 RR2CG09TF
BS 532 532 RR2AW27TFB
BS 533 578 RR2CG09TF
BS 579 579 RR2AW27TFB
BS 580 583 RR2CG09TF
BS 584 584 RR2AW27TFB
BS 585 735 RR2CG09TF

RD RR2AW27TFB 471 0 0
GCAAACGCCTCAAGGTCTCTGCCTCCGAGGACTCCCTCTGGTCCATCTTCTGTTCCCTTG
ATCTCAACATCTCTACTCCTCTCGGTCCCCATGCAGATCCTTCTCCTTCCTTCAAGGCGG
CATATCAGTCATGGAGGGAGTCCTTTAGAATGTATCCATGGCATCTCGTCAAGCGCGTTG
GATGTTGCTGGGACAACCTCAAACGATGGTTGAGGTTAAACTTCCCTGAAGCAGAGGCAA
CACTGAGGAAAGGAGCCACAGTGGAGGATCTCGAAGAGTTCGAGTCTGCTCTCAAGGTCA
AACTTCCTCTCCCCACAAGGCTTCTCTACCGTTTCGTCGATGGCCAAGAGCCTTCTTCAT
CCTCCAATGGCCTTATTGGTGGCTATTCTCTGTACTCTCATGAAGTCAATGTCTACTTGT
TACCTCTCAAGGAAGTGATAACGGAGACCAACGAAACCATGAGCGATCTGT

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR2CG09TF 735 0 0
GGCTGATTGAAAAACATTCGAAGAGCCGACAACAGAGAGAGAGAGACCAAAGCCATGGGT
CTAGAGGAAGCTGGAGATTTGGTTCTCCACATCATCCTATCCAAAATCGGACCTGAGAAC
ACAGCGAGAGTGGCTTGCGTCAGCAAACGCCTCAAGGTCTCCGCCTCCGAGGACTCCCTC
TGGTCCATCTTCTGTTCCCATGATCTCAACATCTCTACTCCTCTCGGTCCCCATGGAGAT
CCTTCTCCTTCCTTCAAGGCGGCATATCAGTCATGGAGGGAGTCCTTTAGAATGTATCCA
TGGCATCTCGTCAAGCGCGTTGGACGTTGCTGGGACAACCTCAAACTATGGTTGAGGTTA
AACTTCCCTGAAGCAGAGGCGACACTGAGGAAAGGTGCCACAGAGGAGGATCTTGAAGAG
TTTGAGTCTGCTCTCAAGCTCAAACTTCCTCTCCCCACAAGGCTTCTCTACCGTTTCGTC
GATGGCCAAGAGCCTTCTTCATCCTCCAATGGCCTTATTGGTGGCTATTCTGTGTACTCT
CATGAAGTCAATGTCTACTTGTTACCTCTCAAGGAAGTTATAAGGGAGACCAACGAAACC
ATGAGCGATCTGTTCGGTGTCTCTAACGGATCCAACTATATCGTTGTGGCTGCGTCCATG
ATGGCGACTTTGAAAATGTTTTTCCTAGACTGCTCCAACGGACAGCTTTACACCGGGACG
AGTACACGCCAGATG

QA 1 735 1 735
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4189Contig1 850 2 2 U
GTTTGCATTGTTTTGGTAGGAGGAACCAATATGGTTCTAGAAGATGAAAAGAAGAAAGGA
GAAGCTTCAGGAGAAACATCAGATAGAGGAAATACGCTAAGCAGAATGAACAGTGAAAGC
TCCTTGTCTCCGACAGAAGATGATGAAGAAGACGAAGAGAGGAAGCCCGAACTCGGCCCC
ATGATCGCTCTCAAAGAACAGCTCGAGAAAGATAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGG
AAGGAGCAGCTTATCGGTGTCGTGGATTTTGAAGATGTCGGAGAGACACCGGATCCTGTA
GTAAAGATCCTACACTTGACAGTTAGGTCCCCAGACAGAGAGGAGATGGTGTTGACGATA
CCTGATGATGGAGTGCCAAACCCGAAAGGTCCTTGGTTCACAATAAAGGAAGGATCCAAG
TACACACTTGTCTTCAACTTCCGTGTCACCAACAATATCGTTTCGGGCCTTCGTTATAAC
AATACCGTTTGGAAAACCGGTGTCAAGGTGGATAGTACGAAAGCAATGCTTGGGACGTTT
AGTCCTCAAGCTGAGCCTTACCAACATATAATGCCTGAAGAAACGACCCCGTCAGGTATT
TTCGCTAGAGGATCCTATTCCGCAAGGACGAAGTTTGTTGATGACGATAATAAGTGCTAT
TTGGAGATCAATTACACCTTCGACATCCGCAAGAATTGGCAATGATCCACCTAATTCAAC
ACCTTCTTAATTCCAAAACCCATACAGACCAAAGCTCTTTTGATAATATTCCTTTTTCTA
TCTTACATTATTTGACTTCAGACTAGAAAACTTTTTTTTGATAACGACTAGAAAACTTGT
TTAGCTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC48TF U 1
AF RR2BC48JQ C 175
BS 1 591 RR2BC48TF
BS 592 850 RR2BC48JQ

RD RR2BC48TF 591 0 0
GTTTGCATTGTTTTGGTAGGAGGAACCAATATGGTTCTAGAAGATGAAAAGAAGAAAGGA
GAAGCTTCAGGAGAAACATCAGATAGAGGAAATACGCTAAGCAGAATGAACAGTGAAAGC
TCCTTGTCTCCGACAGAAGATGATGAAGAAGACGAAGAGAGGAAGCCCGAACTCGGCCCC
ATGATCGCTCTCAAAGAACAGCTCGAGAAAGATAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAGATGG
AAGGAGCAGCTTATCGGTGTCGTGGATTTTGAAGATGTCGGAGAGACACCGGATCCTGTA
GTAAAGATCCTACACTTGACAGTTAGGTCCCCAGACAGAGAGGAGATGGTGTTGACGATA
CCTGATGATGGAGTGCCAAACCCGAAAGGTCCTTGGTTCACAATAAAGGAAGGATCCAAG
TACACACTTGTCTTCAACTTCCGTGTCACCAACAATATCGTTTCGGGCCTTCGTTATAAC
AATACCGTTTGGAAAACCGGTGTCAAGGTGGATAGTACGAAAGCAATGCTTGGGACGTTT
AGTCCTCAAGCTGAGCCTTACCAACATATAATGCCTGAAGAAACGACCCCG

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2BC48JQ 676 0 0
GC
CCCCATGATCGCTCTCAAAGAACAGCTCGAGAAAGATAAGGATGATGAAAGCTTGAGGAG
ATGGAAGGAGCAGCTTATCGGTGTCGTGGATTTTGAAGATGTCGGAGAGACACCGGATCC
TGTAGTAAAGATCCTACACTTGACAGTTAGGTCCCCAGACAGAGAGGAGATGGTGTTGAC
GATACCTGATGATGGAGTGCCAAACCCGAAAGGTCCTTGGTTCACAATAAAGGAAGGATC
CAAGTACACACTTGTCTTCAACTTCCGTGTCACCAACAATATCGTTTCGGGCCTTCGTTA
TAACAATACCGTTTGGAAAACCGGTGTCAAGGTGGATAGTACGAAAGCAATGCTTGGGAC
GTTTAGTCCTCAAGCTGAGCCTTACCAACATATAATGCCTGAAGAAACGACCCCGTCAGG
TATTTTCGCTAGAGGATCCTATTCCGCAAGGACGAAGTTTGTTGATGACGATAATAAGTG
CTATTTGGAGATCAATTACACCTTCGACATCCGCAAGAATTGGCAATGATCCACCTAATT
CAACACCTTCTTAATTCCAAAACCCATACAGACCAAAGCTCTTTTGATAATATTCCTTTT
TCTATCTTACATTATTTGACTTCAGACTAGAAAACTTTTTTTTGATAACGACTAGAAAAC
TTGTTTAGCTTTGC

QA 3 676 3 676
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4191Contig1 838 2 8 U
GGAAAGCTAAAATCAAAATCTGATTCCCATCACTTAGAGGTCGAGAGAAAAATTAAACTC
GGCGATAGAAATGGCTTCTTCCTCAAGTTATTCCTTCGTCCTTACAATGACAATCTTGTC
ACAATTTCTCTTAGCCCCAACATCAGCTTTGACCAACGGAGAATATATCGATGCCAACTG
CCAACGGGTCAAAAACATAACATTTTGTGTCGACACATTAACCACCTATCCTCCCACGGT
TTCGGCCACCAGCCTGTTACAATTGGCGGAAGCCGTAATCAACCTAGCAATAGCCCATGC
TGAGAAGACAGCTGGTTTTGCTGCCGAGACAGCCAAGAACGAGGCAGCACTGAAGACCCA
GTTCAGCGAGTGCCATGATGCCTATGTATCTATTGTTGCGTCTCTAAAAAGCGCATCATT
GGAGCTTAAGGAAACACCAGACACTGCAAACTACGACGTCATGGTCTCTAGTGATGACAC
TAGTCGCGTGAAGGATTTGGTTGGGAAAAACTTGGACAAATCATCCAAGACGCTCATGGA
GATGACATTGCAGATGGAAAAACTTCTTGATATCGCTGCTGGTGCCACCGATGCTGTTGA
TGACGATGACGAGAACATACGTCGTCGTACTTAATGATGTTTGAACTAAGTCGGGGGTTT
TCAGTTTATGGTTTGCTTTTGGTGAAAACATGAATAGATTCAAAAGACATAGAAACATTA
TGTCGCTGATAATTGAATCTTAGGAAACTTCTAAAATATAATATGTTGCAATTGTTGCGG
TCAAAATCTGTTCGAGTGATGTCAACGGCTAAGATCACATAAAAATCGTATCGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP73TF U 1
AF RR2FP73JQ C 105
BS 1 704 RR2FP73TF
BS 705 705 RR2FP73JQ
BS 706 743 RR2FP73TF
BS 744 744 RR2FP73JQ
BS 745 758 RR2FP73TF
BS 759 759 RR2FP73JQ
BS 760 782 RR2FP73TF
BS 783 838 RR2FP73JQ

RD RR2FP73TF 782 0 0
GGAAAGCTAAAATCAAAATCTGATTCCCATCACTTAGAGGTCGAGAGAAAAATTAAACTC
GGCGATAGAAATGGCTTCTTCCTCAAGTTATTCCTTCGTCCTTACAATGACAATCTTGTC
ACAATTTCTCTTAGCCCCAACATCAGCTTTGACCAACGGAGAATATATCGATGCCAACTG
CCAACGGGTCAAAAACATAACATTTTGTGTCGACACATTAACCACCTATCCTCCCACGGT
TTCGGCCACCAGCCTGTTACAATTGGCGGAAGCCGTAATCAACCTAGCAATAGCCCATGC
TGAGAAGACAGCTGGTTTTGCTGCCGAGACAGCCAAGAACGAGGCAGCACTGAAGACCCA
GTTCAGCGAGTGCCATGATGCCTATGTATCTATTGTTGCGTCTCTAAAAAGCGCATCATT
GGAGCTTAAGGAAACACCAGACACTGCAAACTACGACGTCATGGTCTCTAGTGATGACAC
TAGTCGCGTGAAGGATTTGGTTGGGAAAAACTTGGACAAATCATCCAAGACGCTCATGGA
GATGACATTGCAGATGGAAAAACTTCTTGATATCGCTGCTGGTGCCACCGATGCTGTTGA
TGACGATGACGAGAACATACGTCGTCGTACTTAATGATGTTTGAACTAAGTCGGGGGTTT
TCAGTTTATGGTTTGCTTTTGGTGAAAACATGAATAGATTCAAA*GACATAGAAACATTA
TGTCGCTGATAATTGAATCTTAG*AAACTTCTAAAATA*AATATGTTGCAATTGTTGCGG
TC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2FP73JQ 734 0 0
CAATGACAATCTTGTCACAATTTCTCTTAGCCCCAACATCAGCTTTGACCAACGGAGAAT
ATATCGATGCCAACTGCCAACGGGTCAAAAACATAACATTTTGTGTCGACACATTAACCA
CCTATCCTCCCACGGTTTCGGCCACCAGCCTGTTACAATTGGCGGAAGCCGTAATCAACC
TAGCAATAGCCCATGCTGAGAAGACAGCTGGTTTTGCTGCCGAGACAGCCAAGAACGAGG
CAGCACTGAAGACCCAGTTCAGCGAGTGCCATGATGCCTATGTATCTATTGTTGCGTCTC
TAAAAAGCGCATCATTGGAGCTTAAGGAAACACCAGACACTGCAAATTACGACGTCATGG
TCTCTAGTGATGACACTAGTCGCGTGAAGGATTTGGTTGGGAAAAACTTGGACAAATCAT
CCAAGACGCTCATGGAGATGACATTGCAGATGGAAAAACTTCTTGATATCGCTGCTGGTG
CCACCGATGCTGTTGATGACGATGACGAGAACATACGTCGTCGTACTTAATGATGTTTGA
ACTAAGTCGGGGGTTTTCAGTTTATGGTTTGCTTTTGGTGAAAACATGAATAGATTCAAA
AGACATAGAAACATTATGTCGCTGATAATTGAATCTTAGGAAACTTCTAAAATATAATAT
GTTGCAATTGTTGCGGTCAAAATCTGTTCGAGTGATGTCAACGGCTAAGATCACATAAAA
ATCGTATCGTTTAC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL4192Contig1 1259 2 2 U
GGACCCATTGTCTTAACTAACAGACACCCAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAAAAC
CAAAACCATTACTACACACATTTTGTTGTTTGAGAAAGAGATGGAGAGAGCAATAGCGAT
TTCCCCGAGCCTGAGTCAAAACTACCTACTTTGTCCTTCACGCGCCTTAACCACGCGCCT
CCACTCGTTCTCCACTACTCGGAACTTATCGTCTCCATCTTCCTCCTCCTCCATCAAACT
TCAGCATTCTTCGTCTTCCTCTTCCTCCATCAATGGCGGAATCTCCCTTACTCGTTGCAA
CGCCGTCCTCTCCAATTCGTCTTCCGGTACGGAGGTAGCAGACATAGATTGGGACAACAT
CGGGTTCGGTCTGAAACCCACTGATTACATGTACGTCATGAAATGCAACGCGTATGAGAA
ATGGTGCCGAGAGGATGTGTATGCCTGCTCCTACCGTCGATCAGTTTGTCCAAGCTGTCG
AAGCAACCGTGTTAGCAAACAAACGTTGGGTTCCACCTGCAGGTAAAGGTTCTTTGTATA
TTAGACCGTTGCTAATGGGAACTGGAGCTGTTCTTGGTCTTGCCCCTGCCCCAGAATATA
CTTTCCTTGTCTATGTTTCTCCTGTTGGAAACTACTTCAAGGAAGGTGTGGCACCAATCA
ATTTGATTGTGGAAAGTGAATTTCACCGTGCAACACCTGGTGGTACTGGAGGTGTTAAGA
CCATTGGCAATTACGCTGCAGTACTAAAAGCACAGTCGATTGCGAAATCTAAAGGATATT
CTGATGTTTTGTACCTTGATTGCGTTTACAAACGATATCTTGAAGAGGTCTCCTCTTGCA
ATATCTTCATTGTTAAGGACAATGTGATATCTACTCCTGAAATAAAAGGAACCATTTTAC
CTGGGATTACGCGGAAAAGCATAATCGATGTGGCTCGTACCCAAGGCTTTAAGGTGGAGG
AACGGGATGTGACAGTGGACGAGTTACTAGAAGCAGATGAAGTTTTCTGCACAGGAACCG
CCGTGGTTGTTTCTCCAGTTGGAAGCATTACACACAAAGGCAAAAGAGTATCTTATGGAG
AAGGTAGCTTTGGACCTGTCTCGGAGAAACTCTACACCGTTCTGACAAGCTTACAGATGG
GTCTGATCGAGGACAACATGAACTGGACTGTGAATCTGAGTTAGATAAAACCTCTACACC
GGTGTTTCCGGTTTTATTTTTTTGTTCTCATATAAGTCTGTGATTCTTATTCGTGAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX35TF U 1
AF RR2CX35JQ C 531
BS 1 692 RR2CX35TF
BS 693 1259 RR2CX35JQ

RD RR2CX35TF 697 0 0
GGACCCATTGTCTTAACTAACAGACACCCAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAAAAC
CAAAACCATTACTACACACATTTTGTTGTTTGAGAAAGAGATGGAGAGAGCAATAGCGAT
TTCCCCGAGCCTGAGTCAAAACTACCTACTTTGTCCTTCACGCGCCTTAACCACGCGCCT
CCACTCGTTCTCCACTACTCGGAACTTATCGTCTCCATCTTCCTCCTCCTCCATCAAACT
TCAGCATTCTTCGTCTTCCTCTTCCTCCATCAATGGCGGAATCTCCCTTACTCGTTGCAA
CGCCGTCCTCTCCAATTCGTCTTCCGGTACGGAGGTAGCAGACATAGATTGGGACAACAT
CGGGTTCGGTCTGAAACCCACTGATTACATGTACGTCATGAAATGCAACGCGTATGAGAA
ATGGTGCCGAGAGGATGTGTATGCCTGCTCCTACCGTCGATCAGTTTGTCCAAGCTGTCG
AAGCAACCGTGTTAGCAAACAAACGTTGGGTTCCACCTGCAGGTAAAGGTTCTTTGTATA
TTAGACCGTTGCTAATGGGAACTGGAGCTGTTCTTGGTCTTGCCCCTGCCCCAGAATATA
CTTTCCTTGTCTATGTTTCTCCTGTTGGAAACTACTTCAAGGAAGGTGTGGCACCAATCA
ATTTGATTGTGGAAAGTGAATTTCACCGTGCA
CACCT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2CX35JQ 729 0 0
TCTTTGTATATTAGACCGTTGCTAATGGGAACTGGAGCTGTTCTTGGTCTTGCCC*TGCC
CCAGAATATACTTTCCTTGTCTATGTTTCTCCTGTTGGAAACTACTTCAAGGAAGGTGTG
GCACCAATCAATTTGATTGTGGAAAGTGAATTTCACCGTGCAACACCTGGTGGTACTGGA
GGTGTTAAGACCATTGGCAATTACGCTGCAGTACTAAAAGCACAGTCGATTGCGAAATCT
AAAGGATATTCTGATGTTTTGTACCTTGATTGCGTTTACAAACGATATCTTGAAGAGGTC
TCCTCTTGCAATATCTTCATTGTTAAGGACAATGTGATATCTACTCCTGAAATAAAAGGA
ACCATTTTACCTGGGATTACGCGGAAAAGCATAATCGATGTGGCTCGTACCCAAGGCTTT
AAGGTGGAGGAACGGGATGTGACAGTGGACGAGTTACTAGAAGCAGATGAAGTTTTCTGC
ACAGGAACCGCCGTGGTTGTTTCTCCAGTTGGAAGCATTACACACAAAGGCAAAAGAGTA
TCTTATGGAGAAGGTAGCTTTGGACCTGTCTCGGAGAAACTCTACACCGTTCTGACAAGC
TTACAGATGGGTCTGATCGAGGACAACATGAACTGGACTGTGAATCTGAGTTAGATAAAA
CCTCTACACCGGTGTTTCCGGTTTTATTTTTTTGTTCTCATATAAGTCTGTGATTCTTAT
TCGTGAAAC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL4193Contig1 517 2 1 U
GGCCCCCAAGTCCTGATATCGTTTGCGCTTCTTCCCATCAGTTGAAACGGTCTGAGTAAA
GACTTCTTGATTAATCTCATCGATTCACTCCCCCACTGCGTCTTCAATGCTTATCCGATC
TGAAAGGCGGTGAACTCTTAGTATAAATATGTGGCTATTTTCTCCAATCTGAAGTCAGGC
CAGTGTTCATCCGTCCTTGAAACTAGACTCCTGCGGTTCTGTGAGGCTAGCAAGCGATGG
AGCAAGCGGCGGAGGAGTGATGGACCAGGTGACGGGCTCTCGGACATGTGATTCTGTTGC
TGTGGACATCAAAACGCCAGCTGTTAGCTCGGGTGGTGGGATATCATCTGCACAGTAAAC
TGCATTGTTTGAGACGTAAACAGTTATATAGTTATAAATACTATAGTGATCAGCGTTTCG
GCTGACTTGACAAGCACGCAAATCACAGTCACTAGACGATTACACAATATGCTTTTATTA
GGAGATCCATAAAGTAAAATATATAAACCTTGAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EW67TF U 1
AF RR2EW67JQ C 101
BS 1 517 RR2EW67TF

RD RR2EW67TF 517 0 0
GGCCCCCAAGTCCTGATATCGTTTGCGCTTCTTCCCATCAGTTGAAACGGTCTGAGTAAA
GACTTCTTGATTAATCTCATCGATTCACTCCCCCACTGCGTCTTCAATGCTTATCCGATC
TGAAAGGCGGTGAACTCTTAGTATAAATATGTGGCTATTTTCTCCAATCTGAAGTCAGGC
CAGTGTTCATCCGTCCTTGAAACTAGACTCCTGCGGTTCTGTGAGGCTAGCAAGCGATGG
AGCAAGCGGCGGAGGAGTGATGGACCAGGTGACGGGCTCTCGGACATGTGATTCTGTTGC
TGTGGACATCAAAACGCCAGCTGTTAGCTCGGGTGGTGGGATATCATCTGCACAGTAAAC
TGCATTGTTTGAGACGTAAACAGTTATATAGTTATAAATACTATAGTGATCAGCGTTTCG
GCTGACTTGACAAGCACGCAAATCACAGTCACTAGACGATTACACAATATGCTTTTATTA
GGAGATCCATAAAGTAAAATATATAAACCTTGAATGG

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2EW67JQ 417 0 0
TCTTCAATGCTTATCCGATCTGAAAGGCGGTGAACTCTTAGTATAAATATGTGGCTATTT
TCTCCAATCTGAAGTCAGGCCAGTGTTCATCCGTCCTTGAAACTAGACTCCTGCGGTTCT
GTGAGGCTAGCAAGCGATGGAGCAAGCGGCGGAGGAGTGATGGACCAGGTGACGGGCTCT
CGGACATGTGATTCTGTTGCTGTGGACATCAAAACGCCAGCTGTTAGCTCGGGTGGTGGG
ATATCATCTGCACAGTAAACTGCATTGTTTGAGACGTAAACAGTTATATAGTTATAAATA
CTATAGTGATCAGCGTTTCGGCTGACTTGACAAGCACGCAAATCACAGTCACTAGACGAT
TACACAATATGCTTTTATTAGGAGATCCATAAAGTAAAATATATAAACCTTGAATGG

QA 1 417 1 417
DS 



AS 1 2

CO CL4194Contig1 417 2 1 U
GGATATTTTGCGGACGGGTGTTTAAACATTTTGGTTCTTGCTCTCTACGTGGACGGCGGC
TAGGTTCAAACAACAGATCCGACAATGCCTAAGCAAATCCACGAGATCAAGGACTTTCTT
CTGACAGCAAGAAGGAAGGATGCTCGGTCTGTGAAGATCAAGAGAAGCAAAGACATTGTC
AAGTTCAAGGTCAGATGCTCAAAGTACCTCTACACGCTCTGCGTCTTTTACCAAGAGAAA
GCCGACAAGCTTAAGCAGTCTCTTCCTCCAGGTTTGAGTGTGCAAGACCTTTGAAGATGA
TGAATCCATATGAGAATATGTTTTTGTTTACTTCAGCTATGTTCAAACTTTTTCGAGTAT
GACTATGTTTTCTGAATTTTTCTTTTGTTTTAAAAGAATCAAATACCGTCTCTCTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BT45JQ C 1
AF RR2BT45TF U 1
BS 1 417 RR2BT45TF

RD RR2BT45JQ 417 0 0
GGATATTTTGCGGACGGGTGTTTAAACATTTTGGTTCTTGCTCTCTACGTGGACGGCGGC
TAGGTTCAAACAACAGATCCGACAATGCCTAAGCAAATCCACGAGATCAAGGACTTTCTT
CTGACAGCAAGAAGGAAGGATGCTCGGTCTGTGAAGATCAAGAGAAGCAAAGACATTGTC
AAGTTCAAGGTCAGATGCTCAAAGTACCTCTACACGCTCTGCGTCTTTTACCAAGAGAAA
GCCGACAAGCTTAAGCAGTCTCTTCCTCCAGGTTTGAGTGTGCAAGACCTTTGAAGATGA
TGAATCCATATGAGAATATGTTTTTGTTTACTTCAGCTATGTTCAAACTTTTTCGAGTAT
GACTATGTTTTCTGAATTTTTCTTTTGTTTTAAAAGAATCAAATACCGTCTCTCTTG

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR2BT45TF 417 0 0
GGATATTTTGCGGACGGGTGTTTAAACATTTTGGTTCTTGCTCTCTACGTGGACGGCGGC
TAGGTTCAAACAACAGATCCGACAATGCCTAAGCAAATCCACGAGATCAAGGACTTTCTT
CTGACAGCAAGAAGGAAGGATGCTCGGTCTGTGAAGATCAAGAGAAGCAAAGACATTGTC
AAGTTCAAGGTCAGATGCTCAAAGTACCTCTACACGCTCTGCGTCTTTTACCAAGAGAAA
GCCGACAAGCTTAAGCAGTCTCTTCCTCCAGGTTTGAGTGTGCAAGACCTTTGAAGATGA
TGAATCCATATGAGAATATGTTTTTGTTTACTTCAGCTATGTTCAAACTTTTTCGAGTAT
GACTATGTTTTCTGAATTTTTCTTTTGTTTTAAAAGAATCAAATACCGTCTCTCTTG

QA 1 417 1 417
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4196Contig1 859 2 2 U
GGATTGTCTTTATCAACCTACCCCTGAAACGTCCCTCTGCCTTCTGCTTCTCTCTCATTT
TGTCAGCCCATAAATCTTTTTTAGTCGTTGTCGTCGCTTCAAATCTCTCTTTTCATAAAG
ATTTGCATCTTCAAGTAACTTGTTTTGCAGAAATGAAGTCCGTTGGAAACTGCTCAGGTA
CTCATGTATATGGAGTTGGTGAAGAAGAAGAAGCAGAACTTTGGAGGGAGATGGCTTTTT
GATCAAGAAATATCATCTCAGGTGACGGTGGAGAACTCACAAGATAATGAGTTCAAACAA
AAGGAAGACTGCAAGCACTCCTTCATCTACAGGGATGATACTGGAGAAGTGTGTTGTGTT
TGTGGACTCATCAAGGGACACATCGCAAGTATGATCGAGTTTGTGTTCAACAAGAGCGGA
GATTCCTCAGAATCTGACGTAAGTCCTCGAGGTTATAATGGGAATGGAACTCGTATGTAC
GGAGTTAGTGAAGAAGAAGAAGCACAACTTTGGAGGGAGATGGCTTTCGCCCAAGAATCT
TTTCAGATCGATGACTGTGTTCACTCCTTCATCTTCAAGGATGATATTGGAGAGGTGTGT
TGTGTTTGTGGACTCATCAAGAGACACATCGCAAGAATGATCGAGTTTGAGTTCAACAAG
GACGACATGTTATTGCTTTAGACAAGCCGAAGTGGAGTGGCTAGGGTTATTTGGTAATCT
AGCATCATATGTGTTAATCTCTAGTATCTTCTGCGTAGGATTAGACATGATAATGGTTTC
TTCTTTTCTTCCTCCTCTCTTAAAGATCATGAAACGCTTTGTTCTGCCACACAAGAATAA
TATCATTTCCTCGCGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL67TF U 1
AF RR2GL67JQ C 160
BS 1 574 RR2GL67TF
BS 575 859 RR2GL67JQ

RD RR2GL67TF 574 0 0
GGATTGTCTTTATCAACCTACCCCTGAAACGTCCCTCTGCCTTCTGCTTCTCTCTCATTT
TGTCAGCCCATAAATCTTTTTTAGTCGTTGTCGTCGCTTCAAATCTCTCTTTTCATAAAG
ATTTGCATCTTCAAGTAACTTGTTTTGCAGAAATGAAGTCCGTTGGAAACTGCTCAGGTA
CTCATGTATATGGAGTTGGTGAAGAAGAAGAAGCAGAACTTTGGAGGGAGATGGCTTTTT
GATCAAGAAATATCATCTCAGGTGACGGTGGAGAACTCACAAGATAATGAGTTCAAACAA
AAGGAAGACTGCAAGCACTCCTTCATCTACAGGGATGATACTGGAGAAGTGTGTTGTGTT
TGTGGACTCATCAAGGGACACATCGCAAGTATGATCGAGTTTGTGTTCAACAAGAGCGGA
GATTCCTCAGAATCTGACGTAAGTCCTCGAGGTTATAATGGGAATGGAACTCGTATGTAC
GGAGTTAGTGAAGAAGAAGAAGCACAACTTTGGAGGGAGATGGCTTTCGCCCAAGAATCT
TTTCAGATCGATGACTGTGTTCACTCCTTCATCT

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2GL67JQ 700 0 0
CCGTTGGAAACTGCTCAGGTACTCATGTATATGGAGTTGGTGAAGAAGAAGAAGCAGAAC
TTTGGAGGGAGATGGCTTTTTGATCAAGAAATATCATCTCAGGTGACGGTGGAGAACTCA
CAAGATAATGAGTTCAAACAAAAGGAAGACTGCAAGCACTCCTTCATCTACAGGGATGAT
ACTGGAGAAGTGTGTTGTGTTTGTGGACTCATCAAGGGACACATCGCAAGTATGATCGAG
TTTGTGTTCAACAAGAGCGGAGATTCCTCAGAATCTGACGTAAGTCCTCGAGGTTATAAT
GGGAATGGAACTCGTATGTACGGAGTTAGTGAAGAAGAAGAAGCACAACTTTGGAGGGAG
ATGGCTTTCGCCCAAGAATCTTTTCAGATCGATGACTGTGTTCACTCCTTCATCTTCAAG
GATGATATTGGAGAGGTGTGTTGTGTTTGTGGACTCATCAAGAGACACATCGCAAGAATG
ATCGAGTTTGAGTTCAACAAGGACGACATGTTATTGCTTTAGACAAGCCGAAGTGGAGTG
GCTAGGGTTATTTGGTAATCTAGCATCATATGTGTTAATCTCTAGTATCTTCTGCGTAGG
ATTAGACATGATAATGGTTTCTTCTTTTCTTCCTCCTCTCTTAAAGATCATGAAACGCTT
TGTTCTGCCACACAAGAATAATATCATTTCCTCGCGTTAC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL4197Contig1 1175 2 2 U
TTTTTTAGTTTTCCCCTCTCTGCGAAACCATATTTTTAAAACCCTTCACAACCTCCCATT
ACTTGTTCCACCACCATCTTTCACGTTTCTAAAGGCTCCCTTCTGAATCGCCCATTTAAT
AGAGGTTTGAACTAGTTTCGATGGCAGTTGAAGCACACCATCTTAACCCTTTATTTTCTT
CTAACAGAGAAATGATGCAACCCGTTGAAGCAAACAGTTTATTCTATAACAACAACCAGA
TCAGATACAACACTCTTCCAGCGACTGCGATGCCATTTAACCCTACCATGGAATGTCAAA
CTTCTACGTTTAATCCCATTTACAACATCTCACCTGTTGACGGTTTGGTTCATCAGTCCA
TGAAGCCAACGATCCATTCCGTTGATAGCTCCGTTACATTCAACAGTGACAATAATAATG
GCAACAACGTTAATTATCATCCTCCTGTGTCGTCTTTGAGAAAACGCCCCAGAGAAGAAT
CGGTTGTTGAAAACCCTATGCCAAGCCAGAAACGTTGCACTGATCCTCTCATGTTCCTAG
GACAAGACTTGTCTTCTAACATCCAACATCACAACTTAGATATCGACCGCTTGATCTCTA
ATCATGTTGAGATAATGAGAACGGGGATCGAAGAGAAGAGAAAACAACAAGGTAGGAAGA
TAATGGAAGTTATTGAACAAGGGTTGATGAAGACACTCAGAGCCAAAGACGAAGAGATCA
ATCACATAGGCAAACTAAACCTCTTTCTTGAGGAGAAGGTTAAGTTTTTTAGTGTAGAGA
ATCAGTTATGGCGTGACATGGCACAGTTTAATGAAGCCACTGTAAACTCCCTAAGGTCAA
ATTTCCAACAAGTCCTCGCTGCCGTGGAACGTAACCGGTGGGAGGAGCCTACGACTGCTG
ATGACGCGCAGTCTTGTTGCGGAAGCAACGACGAGGATGATAGTACCACGATGATGCGCA
CGGTTACAAGTACGATGTGTAGAAGCTGTGGGAAAGGAGAAGCAAGTGTGTTACTGTTAC
CATGCAGACACATGTGCTTATGCAGTGTGTGTGGTTTTTCGATCAACACATGTCCAATCT
GTAAATCTCCAAAGAACGCTAGTCTCCATGTTAATCTTTCCTAACAATACTCGGTAAATT
GTAAATGTCCTAAAATAGTAAATAGTGAAAACAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT41TF U 1
AF RR2CT41JQ C 524
BS 1 625 RR2CT41TF
BS 626 1175 RR2CT41JQ

RD RR2CT41TF 625 0 0
TTTTTTAGTTTTCCCCTCTCTGCGAAACCATATTTTTAAAACCCTTCACAACCTCCCATT
ACTTGTTCCACCACCATCTTTCACGTTTCTAAAGGCTCCCTTCTGAATCGCCCATTTAAT
AGAGGTTTGAACTAGTTTCGATGGCAGTTGAAGCACACCATCTTAACCCTTTATTTTCTT
CTAACAGAGAAATGATGCAACCCGTTGAAGCAAACAGTTTATTCTATAACAACAACCAGA
TCAGATACAACACTCTTCCAGCGACTGCGATGCCATTTAACCCTACCATGGAATGTCAAA
CTTCTACGTTTAATCCCATTTACAACATCTCACCTGTTGACGGTTTGGTTCATCAGTCCA
TGAAGCCAACGATCCATTCCGTTGATAGCTCCGTTACATTCAACAGTGACAATAATAATG
GCAACAACGTTAATTATCATCCTCCTGTGTCGTCTTTGAGAAAACGCCCCAGAGAAGAAT
CGGTTGTTGAAAACCCTATGCCAAGCCAGAAACGTTGCACTGATCCTCTCATGTTCCTAG
GACAAGACTTGTCTTCTAACATCCAACATCACAACTTAGATATCGACCGCTTGATCTCTA
ATCATGTTGAGATAATGAGAACGGG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2CT41JQ 652 0 0
TCCTCTCATGTTCCTAGGACAAGACTTGTCTTCTAACATCCAACATCACAACTTAGATAT
CGACCGCTTGATCTCTAATCATGTTGAGATAATGAGAACGGGGATCGAAGAGAAGAGAAA
ACAACAAGGTAGGAAGATAATGGAAGTTATTGAACAAGGGTTGATGAAGACACTCAGAGC
CAAAGACGAAGAGATCAATCACATAGGCAAACTAAACCTCTTTCTTGAGGAGAAGGTTAA
GTTTTTTAGTGTAGAGAATCAGTTATGGCGTGACATGGCACAGTTTAATGAAGCCACTGT
AAACTCCCTAAGGTCAAATTTCCAACAAGTCCTCGCTGCCGTGGAACGTAACCGGTGGGA
GGAGCCTACGACTGCTGATGACGCGCAGTCTTGTTGCGGAAGCAACGACGAGGATGATAG
TACCACGATGATGCGCACGGTTACAAGTACGATGTGTAGAAGCTGTGGGAAAGGAGAAGC
AAGTGTGTTACTGTTACCATGCAGACACATGTGCTTATGCAGTGTGTGTGGTTTTTCGAT
CAACACATGTCCAATCTGTAAATCTCCAAAGAACGCTAGTCTCCATGTTAATCTTTCCTA
ACAATACTCGGTAAATTGTAAATGTCCTAAAATAGTAAATAGTGAAAACAGT

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL4198Contig1 952 2 18 U
GGAAGAAGGAACTCGATAAGAGGTTTAAGGAAGCTGTGAGCCGCCCTGAGGTGATGGAGA
AAGTTGAAGCGGTTAAAGCTGAGGTTGTTAGTTCAGGAGCATCGTCTTTCGAAGAGCTGA
GCGATGAGCTGAAAGAGAAGATTCTGATGACGAGAAGGGAGGTGGAAGCAGAGATGGTTG
TTGTGTTGAAGTCGATTGGTCTGGAGCTGGAGGCTGTGAAACCGAATCTGAAGGAGGTAG
TAGCTGAGCAGAGCAGCCTTGTTCCGAACGAGAACATTCAAGAAAAGCTTGAGAAGCTGA
ACCAGGAGATCACGGAGAAGATTGAGGAGGTGGTGAGGACACCAGAGATCAAGAGCATGG
TTGAGTTGCTGAAAGTGGAGGCCGCAAAGGCGAGCCAGACGCAGGATGGGAGTCAGAAGA
TCCAGGCGCTTGAGCAGCAGATCAAGCAGAAGATAGCTGATGCTCTGAGCATGTCAGGAC
TGCAGGAAAAACAAGAGGAGCTCGAGAAGGAGCTCGCAGCTGCGCGTGAGCTAGCTGAAG
AGGAATCAGACGAGAGTGTGAAGGAAGATGATGATGATGACGATGAAGATGGTTCAGGAT
CCGGGAGATCAGAGATAATCAACCCCAGCTTCGCATGAAAACACGAAACAAGACATTGAT
TTGATCTTGAAGCAGCTCTTTTCGATTTACATTGGTAAAGACAGGCTTTTCTTAGAACTT
TCTGTCTATGATCTGAGCAATAGCTAAGAGGAACAACAGCTTAGAAGCCTGCTTTCTTTA
GTTTTAGCTTTTCTGGATTGGATTAAAACTTGTATTTGGATTCATTTCTGTATTTTTGTT
ATGTCTTGTTTCGTTAGAACAACTAGTTTTGTTTTCTTGATTCTCACATGACAATAAGCA
ACACTTTTCACTCTTCTGTTCAACCCTTTTGATATATTCATAGATTTTGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F542TF U 1
AF RR2AX77JQ C 89
BS 1 121 RR2F542TF
BS 122 122 RR2AX77JQ
BS 123 163 RR2F542TF
BS 164 164 RR2AX77JQ
BS 165 238 RR2F542TF
BS 239 239 RR2AX77JQ
BS 240 340 RR2F542TF
BS 341 341 RR2AX77JQ
BS 342 343 RR2F542TF
BS 344 344 RR2AX77JQ
BS 345 422 RR2F542TF
BS 423 423 RR2AX77JQ
BS 424 502 RR2F542TF
BS 503 503 RR2AX77JQ
BS 504 537 RR2F542TF
BS 538 538 RR2AX77JQ
BS 539 556 RR2F542TF
BS 557 952 RR2AX77JQ

RD RR2F542TF 559 0 0
GGAAGAAGGAACTCGATAAGAGGTTTAAGGAAGCTGTGAGCCGCCCTGAGGTGATGGAGA
AAGTTGAAGCGGTTAAAGCTGAGGTTGTTAGTTCAGGAGCATCGTCTTTCGAAGAGCTGA
GTGATGAGCTGAAAGAGAAGATTCTGATGACGAGAAGGGAGGTTGAAGCAGAGATGGTTG
TTGTGTTGAAGTCGATTGGTCTGGAGCTGGAGGCTGTGAAACCGAATCTGAAGGAGGTGG
TAGCTGAGCAGAGCAGCCTTGTTCCGAACGAGAACATTCAAGAAAAGCTTGAGAAGCTGA
ACCAGGAGATCACGGAGAAGATTGAGGAGGTGGTGAGGACGCCGGAGATCAAGAGCATGG
TTGAGTTGCTGAAAGTGGAGGCCGCAAAGGCGAGCCAGACGCAGGATGGGAGTCAGAAGA
TCGAGGCGCTTGAGCAGCAGATCAAGCAGAAGATAGCTGATGCTCTGAGCATGTCAGGAC
TGCAGGAAAAACAAGAGGAGCTGGAGAAGGAGCTCGCAGCTGCGCGTGAGCTAGCTGGAG
AGGAATCAGACGAGAG
GGT

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2AX77JQ 864 0 0
TAGC
TCAGGAGCATCGTCTTTTGAAGAGCTGAGCGATGAGCTGAAAGAGAAGATTCTGATGACG
AGGAGGGAGGTGGAAGCAGAGATGGTTGTTGTGTTGAAGTCGATTGGTCTGGAGCTGGAG
GCTGTGAAACCGAATCTGAAGGAGGTAGTAGCTGAGCAGGGTAGCCTTGTTCCGAACGAG
AACATTCAAGAAAAGCTTGAGAAGCTGAACCAGGAGATCACGGAGAAGATTGAGGAGGTG
GTGAGGACACCAGAGATCAAGAGCATGGTTGAGTTGCTGAAAGTGGAGGCCGCAAAGGCG
AGCCAGACGCAGGATGGGAGTCAGAAGATCCAGGCGCTTGAGCAGCAGATCAAGCAGAAG
ATAGCTGATGCTCTGAGCATGTCAGGACTGCAGGAAAAACAAGAGGAGCTCGAGAAGGAG
CTCGCAGCTGCGCGTGAGCTAGCTGAAGAGGAATCAGACGAGAGTGTGAAGGAAGATGAT
GATGATGACGATGAAGATGGTTCAGGATCCGGGAGATCAGAGATAATCAACCCCAGCTTC
GCATGAAAACACGAAACAAGACATTGATTTGATCTTGAAGCAGCTCTTTTCGATTTACAT
TGGTAAAGACAGGCTTTTCTTAGAACTTTCTGTCTATGATCTGAGCAATAGCTAAGAGGA
ACAACAGCTTAGAAGCCTGCTTTCTTTAGTTTTAGCTTTTCTGGATTGGATTAAAACTTG
TATTTGGATTCATTTCTGTATTTTTGTTATGTCTTGTTTCGTTAGAACAACTAGTTTTGT
TTTCTTGATTCTCACATGACAATAAGCAACACTTTTCACTCTTCTGTTCAACCCTTTTGA
TATATTCATAGATTTTGTCT

QA 5 864 5 864
DS 



AS 1 2

CO CL4199Contig1 680 2 1 U
CGAAAGAAGGTCTTTGCATTCCTTTAATAACGAAAGAAGGACAAGTCTCAAATGACATTA
ATATAATACAAGAAAAAAAGGGTTAAAATCAGCAAGTCCACGAAGCAAATCTCTTGATAA
CAGGATTCATCTGTTTGTCTTCTTCAAGAGAGATCATTCCAATATGTGAAGGATCTTCAA
GCATCATCTTAGCAACCAAGTAACCTGCGATTGACCAAGTCTGGTATTTTCTTGCTTGTT
TTCCAACGTACCTTCCTAGCTTACCGTCGTAGTACTCTGGCCAGCAATCTCTGTGAAGCC
GTGATTCAATTAGGTCGATGGCCCGTCTGGCTATTTGAGGCCGACCGGTCTTGATGCAAG
CCGCGGTCAGCATCCACAGCAAAACAGGCCAAGATCCGCCATTGTGGTAGCTCCAACGAG
TGTTCTTAGGATCACAACCGGTGACGATCCGCCACTCATGGCTCTCGATGCAAGGGTAGC
ATATCTTGAGCGGCATCTCACCAACTAGCTCCTCCCAACGGTGCTCAAGAAGGTCCATAA
TGGCCATTGACTGATCCGGAGTGGCCAGAGAAGAGAGGATGGCCACACAGTTTCCTAATG
AAAACCACCTGAAGTCCATACGGGCCGGGCTTACATTCCCGACAAAGTACCCTCCACGGA
GAGGCATGAAGTCGAAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL26JQ U 149
AF RR2CX83JQ U 1
BS 1 680 RR2CX83JQ

RD RR2BL26JQ 421 0 0
AGAGATCATTCCAATATGTGAAGGATCTTCAAGCATCATCTTAGCAACCAAGTAACCTGC
GATTGACCAAGTCTGGTATTTTCTTGCTTGTTTTCCAACGTACCTTCCTAGCTTACCGTC
GTAGTACTCTGGCCAGCAATCTCTGTGAAGCCGTGATTCAATTAGGTCGATGGCCCGTCT
GGCTATTTGAGGCCGACCGGTCTTGATGCAAGCCGCGGTCAGCATCCACAGCAAAACAGG
CCAAGATCCGCCATTGTGGTAGCTCCAACGAGTGTTCTTAGGATCACAACCGGTGACGAT
CCGCCACTCATGGCTCTCGATGCAAGGGTAGCATATCTTGAGCGGCATCTCACCAACTAG
CTCCTCCCAACGGTGCTCAAGAAGGTCCATAATGGCCATTGACTGATCCGGAGTGGCCAG
A

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR2CX83JQ 680 0 0
CGAAAGAAGGTCTTTGCATTCCTTTAATAACGAAAGAAGGACAAGTCTCAAATGACATTA
ATATAATACAAGAAAAAAAGGGTTAAAATCAGCAAGTCCACGAAGCAAATCTCTTGATAA
CAGGATTCATCTGTTTGTCTTCTTCAAGAGAGATCATTCCAATATGTGAAGGATCTTCAA
GCATCATCTTAGCAACCAAGTAACCTGCGATTGACCAAGTCTGGTATTTTCTTGCTTGTT
TTCCAACGTACCTTCCTAGCTTACCGTCGTAGTACTCTGGCCAGCAATCTCTGTGAAGCC
GTGATTCAATTAGGTCGATGGCCCGTCTGGCTATTTGAGGCCGACCGGTCTTGATGCAAG
CCGCGGTCAGCATCCACAGCAAAACAGGCCAAGATCCGCCATTGTGGTAGCTCCAACGAG
TGTTCTTAGGATCACAACCGGTGACGATCCGCCACTCATGGCTCTCGATGCAAGGGTAGC
ATATCTTGAGCGGCATCTCACCAACTAGCTCCTCCCAACGGTGCTCAAGAAGGTCCATAA
TGGCCATTGACTGATCCGGAGTGGCCAGAGAAGAGAGGATGGCCACACAGTTTCCTAATG
AAAACCACCTGAAGTCCATACGGGCCGGGCTTACATTCCCGACAAAGTACCCTCCACGGA
GAGGCATGAAGTCGAAAACC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL4200Contig1 598 2 2 U
GGGTAGGGGACTAGAGGAGCAATGATGATTCGTGTTGTTTCTCTTTTTTGTTTCGTTTTC
ACCATCCCTGCCCTAGTATTCTCAGACGATGGGACTATCTATGAGATCCTCCAGGAGAAC
GGGTTACCGTTGGGGATATTTCCAAAAGGCGTTAAAGATTTCAGCTTCAACGGCGAAACG
GGACGGTTCTCGGTTTATTTGAACCAGTCTTGTGATGCTAAATACGAGACGGAGCTGCAT
TACGACGTGAATATTACAGGGAAGATAAGTTATGGTGAGATTAAGGACTTGTCTGGAATC
TTGGCGCAAGATCTGTTCCTTTGGTTTCCGGTTAAAGGAATACGAATCGACGTGCCGAGC
TCTGGTCTCATAGTTTTTGACGTTGGCGTCGTTCGCAAGCAATACTCGTTGTCTTTGTTT
GAGACGCCGAGGGATTGTGTAGCTGTTCATGGTGAAAACAAGGTTATATCTTCTGTGTTG
CCATTGTATCAAGTAGATCAAACTCTCGGGAAAGATGTTGTTTAGCCAAAGTTTGAAAGG
CTGATGTTATAATATACAAGAAAGATAGACAGATGCTCTCATCAATTCTTAAAGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G385TF U 1
AF RR2G385JQ C 166
BS 1 523 RR2G385TF
BS 524 598 RR2G385JQ

RD RR2G385TF 523 0 0
GGGTAGGGGACTAGAGGAGCAATGATGATTCGTGTTGTTTCTCTTTTTTGTTTCGTTTTC
ACCATCCCTGCCCTAGTATTCTCAGACGATGGGACTATCTATGAGATCCTCCAGGAGAAC
GGGTTACCGTTGGGGATATTTCCAAAAGGCGTTAAAGATTTCAGCTTCAACGGCGAAACG
GGACGGTTCTCGGTTTATTTGAACCAGTCTTGTGATGCTAAATACGAGACGGAGCTGCAT
TACGACGTGAATATTACAGGGAAGATAAGTTATGGTGAGATTAAGGACTTGTCTGGAATC
TTGGCGCAAGATCTGTTCCTTTGGTTTCCGGTTAAAGGAATACGAATCGACGTGCCGAGC
TCTGGTCTCATAGTTTTTGACGTTGGCGTCGTTCGCAAGCAATACTCGTTGTCTTTGTTT
GAGACGCCGAGGGATTGTGTAGCTGTTCATGGTGAAAACAAGGTTATATCTTCTGTGTTG
CCATTGTATCAAGTAGATCAAACTCTCGGGAAAGATGTTGTTT

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2G385JQ 433 0 0
TTCAACGGCGAAACGGGACGGTTCTCGGTTTATTTGAACCAGTCTTGTGATGCTAAATAC
GAGACGGAGCTGCATTACGACGTGAATATTACAGGGAAGATAAGTTATGGTGAGATTAAG
GACTTGTCTGGAATCTTGGCGCAAGATCTGTTCCTTTGGTTTCCGGTTAAAGGAATACGA
ATCGACGTGCCGAGCTCTGGTCTCATAGTTTTTGACGTTGGCGTCGTTCGCAAGCAATAC
TCGTTGTCTTTGTTTGAGACGCCGAGGGATTGTGTAGCTGTTCATGGTGAAAACAAGGTT
ATATCTTCTGTGTTGCCATTGTATCAAGTAGATCAAACTCTCGGGAAAGATGTTGTTTAG
CCAAAGTTTGAAAGGCTGATGTTATAATATACAAGAAAGATAGACAGATGCTCTCATCAA
TTCTTAAAGATTT

QA 1 433 1 433
DS 



AS 1 2

CO CL4201Contig1 852 2 3 U
GGTTTATTGTGACAGCACAGAGCAAGAGTGCATTGTGCACACATTTGGTGACCACAGTCT
TTGACTTCAATCGTGCATGCTTGCTCAAAGCAAATGCAACACATCTCCGAATCACTCATC
TCAGACATGTTATCATCTGAGGCTGTGTCGGAGTAAGATGGTGACGGTAAAGAGAAAGCA
GTTCCCTTGAGGATGGTTTTCTCTCTCTCCCTGTTAGCATCCATCAGAGCTGCTCCAAGA
GAAGTTTCGCCTCCTCGTTAAGCTCGCTGATGAACTTTAAAGGGGATGGCCAGACAAGAG
GCTCAGCAGAAGAGGGGTTAAGCAACGCCCCACATGCTCCGTGCTTGTGTTTCATCGCAA
CCACATATGGTATCCTCCCAGAAGCGTCTCTCTGGGAGACGATCAGCACCCCAAGCAAGT
AACTTTCTGACGCAATCGATAGATCCGCTTCTTGCAGCCAAATGAAGAGGTGTGCTCCCT
GGAGAGCCGTAAAGGTTAGTGGAAGCACAAACAAGAGAGCCACTGTCCAAGAGAACATTG
ACACATTCAGGACGTCTCTGCCTAGCAGCTAGATGCAAGGCTGTTGCTCCTTTGTCATCC
CTTGTATTCACAAATCTCGCATATCCCCAATGGACAGCAACGGGGCTAGACTGAGCAGCA
GAGAGAATGAGTTGAAGACAATCAGCATGTCCATAGTAAGCTGCGTAGTGCAAACATGTT
CTTCGATTGGCGGAATCAAACATCAAAACATTAGCTCCGACTTGAGCAAGCTTCTTGACG
CAGGAGACCCTCCCGTACATCGCAGCCAGCATCAACGGAGTCTGCTTGTGACGGTTCAAC
AAATCTGGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM57JQ U 332
AF RR2AM57TF C 1
BS 1 331 RR2AM57TF
BS 332 440 RR2AM57JQ
BS 441 852 RR2AM57TF

RD RR2AM57JQ 109 0 0
ACATGCTCCGTGCTTGTGTTTCATCGCAACCACATATGGTATCCTCCCAGAAGCGTCTCT
CTGGGAGACGATCAGCACCCCAAGCAAGTAACTTTCTGACGCAATCGAT

QA 1 109 1 109
DS 

RD RR2AM57TF 852 0 0
GGTTTATTGTGACAGCACAGAGCAAGAGTGCATTGTGCACACATTTGGTGACCACAGTCT
TTGACTTCAATCGTGCATGCTTGCTCAAAGCAAATGCAACACATCTCCGAATCACTCATC
TCAGACATGTTATCATCTGAGGCTGTGTCGGAGTAAGATGGTGACGGTAAAGAGAAAGCA
GTTCCCTTGAGGATGGTTTTCTCTCTCTCCCTGTTAGCATCCATCAGAGCTGCTCCAAGA
GAAGTTTCGCCTCCTCGTTAAGCTCGCTGATGAACTTTAAAGGGGATGGCCAGACAAGAG
GCTCAGCAGAAGAGGGGTTAAGCAACGCCCCACATGCTCCGTGCTTGTGTTTCATCGCAA
CCACATATGGTATCCTCCCAGAAGCGTCTCTCTGG*AGACGATCAGCACCCCAAGCAAGT
AACTTTCTGACGCAATCGATAGATCCGCTTCTTGCAGCCAAATGAAGAGGTGTGCTCCCT
GGAGAGCCGTAAAGGTTAGTGGAAGCACAAACAAGAGAGCCACTGTCCAAGAGAACATTG
ACACATTCAGGACGTCTCTGCCTAGCAGCTAGATGCAAGGCTGTTGCTCCTTTGTCATCC
CTTGTATTCACAAATCTCGCATATCCCCAATGGACAGCAACGGGGCTAGACTGAGCAGCA
GAGAGAATGAGTTGAAGACAATCAGCATGTCCATAGTAAGCTGCGTAGTGCAAACATGTT
CTTCGATTGGCGGAATCAAACATCAAAACATTAGCTCCGACTTGAGCAAGCTTCTTGACG
CAGGAGACCCTCCCGTACATCGCAGCCAGCATCAACGGAGTCTGCTTGTGACGGTTCAAC
AAATCTGGATTC

QA 1 852 1 852
DS 



AS 1 2

CO CL4202Contig1 927 2 2 U
GGAAAGAAAAAGAAGAAGAGAGTAAAGCTTCAATGGTGATTATATCGGGGAGCTTCTCCG
TGAGAGCTGCCTTGGATACACAGCCTAGACTTCCGTACAACCCTAACGCGCCTCGTAAAG
CGAAGAAAACCCCTAACAGCAAATCTTTCTTACCGCCGCCTTTACCTCCTCCTCCACCGT
CTCCTCGAATCAGCATCTCCGTCGACGATTTGCTCAAGCGACCCGCAAGTAAAGAGTTGA
GTGAAGAAGTTGATGATAGTTATATGGGATATGAGACGTGGTCTCCAAGTCCACCAAAGC
TTGAGAAGCCGAGATCAGTTTTCAATGCTGCTTCTTTAGCTTTTATAGGTGATTCCATTT
ATGAGCTATATGCTCGTAGGCATTTCCTTTTCCCTCCACTTAGTATCGAAGATTATAACG
ATCGTGTTAGAGCTGTGGTGCGTTGTGAAGCTCAGTATGCTTTGCTGAAGAAACTTGTTG
ATGATGATTTCCTAACAAAGGAAGAGAGGGATGTACTCAGGTGGGGAAAGAATCTAGGCT
CTGCTAGAACTCGTTCAAGGAGGCGTGCAGGTGTTTCAGTTTATAACAAAGCATCATCAT
TGGAGACACTGATTGGTTATCTGTATCTGACGAACGGGAAAAGATTAGAGAAGATAATGG
AGAATCTAGGATTCTCAAGCGACTCTTCGACTGAGATCATGATTGAAATGGCCAAGCCAA
AGCCATCAGAATCAAACCTGCCTTCCTTTATACTCAATGAGCAAGTGTCACAGTAGTATA
GTAAAGGTCGTTTACTCTCTCAGATCATGCAAAAGCTGAAGGATCATCAGAGTTACGCCG
GCTTAGCTTTTCATTGCTCACTTAACCGGAGAGTATGTGTATTGTGTGCGTACACATCGT
GATATATACGAATGTGTAGAACTCCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H924TF U 1
AF RR2H924JQ C 549
BS 1 746 RR2H924TF
BS 747 927 RR2H924JQ

RD RR2H924TF 746 0 0
GGAAAGAAAAAGAAGAAGAGAGTAAAGCTTCAATGGTGATTATATCGGGGAGCTTCTCCG
TGAGAGCTGCCTTGGATACACAGCCTAGACTTCCGTACAACCCTAACGCGCCTCGTAAAG
CGAAGAAAACCCCTAACAGCAAATCTTTCTTACCGCCGCCTTTACCTCCTCCTCCACCGT
CTCCTCGAATCAGCATCTCCGTCGACGATTTGCTCAAGCGACCCGCAAGTAAAGAGTTGA
GTGAAGAAGTTGATGATAGTTATATGGGATATGAGACGTGGTCTCCAAGTCCACCAAAGC
TTGAGAAGCCGAGATCAGTTTTCAATGCTGCTTCTTTAGCTTTTATAGGTGATTCCATTT
ATGAGCTATATGCTCGTAGGCATTTCCTTTTCCCTCCACTTAGTATCGAAGATTATAACG
ATCGTGTTAGAGCTGTGGTGCGTTGTGAAGCTCAGTATGCTTTGCTGAAGAAACTTGTTG
ATGATGATTTCCTAACAAAGGAAGAGAGGGATGTACTCAGGTGGGGAAAGAATCTAGGCT
CTGCTAGAACTCGTTCAAGGAGGCGTGCAGGTGTTTCAGTTTATAACAAAGCATCATCAT
TGGAGACACTGATTGGTTATCTGTATCTGACGAACGGGAAAAGATTAGAGAAGATAATGG
AGAATCTAGGATTCTCAAGCGACTCTTCGACTGAGATCATGATTGAAATGGCCAAGCCAA
AGCCATCAGAATCAAACCTGCCTTCC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2H924JQ 379 0 0
ACTCGTTCAAGGAGGCGTGCAGGTGTTTCAGTTTATAACAAAGCATCATCATTGGAGACA
CTGATTGGTTATCTGTATCTGACGAACGGGAAAAGATTAGAGAAGATAATGGAGAATCTA
GGATTCTCAAGCGACTCTTCGACTGAGATCATGATTGAAATGGCCAAGCCAAAGCCATCA
GAATCAAACCTGCCTTCCTTTATACTCAATGAGCAAGTGTCACAGTAGTATAGTAAAGGT
CGTTTACTCTCTCAGATCATGCAAAAGCTGAAGGATCATCAGAGTTACGCCGGCTTAGCT
TTTCATTGCTCACTTAACCGGAGAGTATGTGTATTGTGTGCGTACACATCGTGATATATA
CGAATGTGTAGAACTCCTA

QA 1 379 1 379
DS 



AS 1 2

CO CL4203Contig1 513 2 2 U
AACACAAAAGTATAGTTTATTATTAATAAAACAGCATACAACATGATTTTATATATTATA
AATTTAGAAGGTGATCAACATCTTCAATTTAAAGCAAACAGCTTAAACATACATACCTTT
ATTAAATCGAACATACCACACTTACATTATAGATATATAAGGTCTTATTGTTTTTATTTT
ATACGATAGACTTATCTTTGTAATTTTCAGTATTTTCCGTAGCAGTGGCAATGCTCTTCG
TAGCCATGCTTCTCACACTCTCCTTTACACGAGTGGTAGTAATGTTCCTTACACACATCC
TTACAAGCTTTTTCCTTGCATGGATATACTGGGGCTTCGCCTAAATACTTCTTACAAGTC
GCCTCGCTCTTCGGGATTTCGGTGGAAATTAACAAGACAACGAGCAAAAGAGTGGTGAAG
CAAATGGAATTGAGGGTCTTTGCCATTTCTGCAGCTTTTGCTTTCTTTCCTTTTTCTTAC
ACTTGTTTGTTTCTTTAAACTTGGATGATACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FH93TF C 1
AF RR2FH93JQ U 38
BS 1 37 RR2FH93TF
BS 38 513 RR2FH93JQ

RD RR2FH93TF 513 0 0
AACACAAAAGTATAGTTTATTATTAATAAAACAGCATACAACATGATTTTATATATTATA
AATTTAGAAGGTGATCAACATCTTCAATTTAAAGCAAACAGCTTAAACATACATACCTTT
ATTAAATCGAACATACCACACTTACATTATAGATATATAAGGTCTTATTGTTTTTATTTT
ATACGATAGACTTATCTTTGTAATTTTCAGTATTTTCCGTAGCAGTGGCAATGCTCTTCG
TAGCCATGCTTCTCACACTCTCCTTTACACGAGTGGTAGTAATGTTCCTTACACACATCC
TTACAAGCTTTTTCCTTGCATGGATATACTGGGGCTTCGCCTAAATACTTCTTACAAGTC
GCCTCGCTCTTCGGGATTTCGGTGGAAATTAACAAGACAACGAGCAAAAGAGTGGTGAAG
CAGATGGAATTGAGGGTCTTTGCCATTTCTGCAGCTTTTGCTTTCTTTCCTTTTTCTTAC
ACTTGTTTGTTTCTTTAAACTTGGATGATACCC

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2FH93JQ 476 0 0
ACAACATGATTTTATATATTATAAATTTAGAAGGTGATCAACATCTTCAATTTAAAGCAA
ACAGCTTAAACATACATACCTTTATTAAATCGAACATACCACACTTACATTATAGATATA
TAAGGTCTTATTGTTTTTATTTTATACGATAGACTTATCTTTGTAATTTTCAGTATTTTC
CGTAGCAGTGGCAATGCTCTTCGTAGCCATGCTTCTCACACTCTCCTTTACACGAGTGGT
AGTAATGTTCCTTACACACATCCTTACAAGCTTTTTCCTTGCATGGATATACTGGGGCTT
CGCCTAAATACTTCTTACAAGTCGCCTCGCTCTTCGGGATTTCGGTGGAAATTAACAAGA
CAACGAGCAAAAGAGTGGTGAAGCAAATGGAATTGAGGGTCTTTGCCATTTCTGCAGCTT
TTGCTTTCTTTCCTTTTTCTTACACTTGTTTGTTTCTTTAAACTTGGATGATACCC

QA 1 476 1 476
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4205Contig1 614 2 1 U
GGGAACGAGATATAACAAAAAGAATTTAGAATACCTGGCTAGCTAAAGGATAGCAATATG
GGGAATTGTGGACTAAAGCCAAAAGTTTTGTCGGAAACTGGAGCTCCGGCGCCAGAGGAG
CTTGAGATTTCACTTCTTGAAGATCAGAAGATAGACGCTGCAAAATCTCTTATCAACCTG
TTCCTTCAAGACAAGGCAGATAAGACTATGAAAGAGGAGGAGAAGATAACACCGGAAAAG
ATACCGGTTACTGAAGTTCTGAAAACAGCTCTGGCTGAGGCAGAGTCTCCAGTTACAGAA
AAGACAAAAATTCCAGTGACGGGCCCAAAATCTCCTGCTGATGATCTGAAGGTTGTGAAG
GAAGAGGCCGTTCATGGCCAGAAAGTGATCCACGATGCGACTGTGAAAGAAAGAGAAACA
GAGGCGAAGCCAGAGGAAGTCAGAGGAGAAGCACAAGTGCAGTGAAATAAGCCCAAAACT
TTTACAAGCTAGTTTCTACGTTTGCGGTCTTGATCTCAATACGCTTTTCTTTTTGTTTAG
CTTATTTTTTTTTTGTGTGTTTAGCTTATGTTTGTTCTTGATTCTCAAATGCAAACGCTT
GGTTTCATTACATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EK04JQ C 1
AF RR2EK04TF U 1
BS 1 614 RR2EK04TF

RD RR2EK04JQ 614 0 0
GGGAACGAGATATAACAAAAAGAATTTAGAATACCTGGCTAGCTAAAGGATAGCAATATG
GGGAATTGTGGACTAAAGCCAAAAGTTTTGTCGGAAACTGGAGCTCCGGCGCCAGAGGAG
CTTGAGATTTCACTTCTTGAAGATCAGAAGATAGACGCTGCAAAATCTCTTATCAACCTG
TTCCTTCAAGACAAGGCAGATAAGACTATGAAAGAGGAGGAGAAGATAACACCGGAAAAG
ATACCGGTTACTGAAGTTCTGAAAACAGCTCTGGCTGAGGCAGAGTCTCCAGTTACAGAA
AAGACAAAAATTCCAGTGACGGGCCCAAAATCTCCTGCTGATGATTTGAAGGTTGTGAAG
GAAGAGGCCGTTCATGGCCAGAAAGTGATCCACGATGCGACTGTGAAAGAAAGAGAAACA
GAGGCGAAGCCAGAGGAAGTCAGAGGAGAAGCACAAGTGCAGTGAAATAAGCCCAAAACT
TTTACAAGCTAGTTTCTACGTTTGCGGTCTTGATCTCAATACGCTTTTCTTTTTGTTTAG
CTTATTTTTTTTTTGTGTGTTTAGCTTATGTTTGTTCTTGATTCTCAAATGCAAACGCTT
GGTTTCATTACATG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2EK04TF 614 0 0
GGGAACGAGATATAACAAAAAGAATTTAGAATACCTGGCTAGCTAAAGGATAGCAATATG
GGGAATTGTGGACTAAAGCCAAAAGTTTTGTCGGAAACTGGAGCTCCGGCGCCAGAGGAG
CTTGAGATTTCACTTCTTGAAGATCAGAAGATAGACGCTGCAAAATCTCTTATCAACCTG
TTCCTTCAAGACAAGGCAGATAAGACTATGAAAGAGGAGGAGAAGATAACACCGGAAAAG
ATACCGGTTACTGAAGTTCTGAAAACAGCTCTGGCTGAGGCAGAGTCTCCAGTTACAGAA
AAGACAAAAATTCCAGTGACGGGCCCAAAATCTCCTGCTGATGATCTGAAGGTTGTGAAG
GAAGAGGCCGTTCATGGCCAGAAAGTGATCCACGATGCGACTGTGAAAGAAAGAGAAACA
GAGGCGAAGCCAGAGGAAGTCAGAGGAGAAGCACAAGTGCAGTGAAATAAGCCCAAAACT
TTTACAAGCTAGTTTCTACGTTTGCGGTCTTGATCTCAATACGCTTTTCTTTTTGTTTAG
CTTATTTTTTTTTTGTGTGTTTAGCTTATGTTTGTTCTTGATTCTCAAATGCAAACGCTT
GGTTTCATTACATG

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL4206Contig1 714 2 4 U
GGAGCTTGGGTGGGGCACTAGCTACACTCTTGGCCATTGAACTTGCGTCAAGCCAATTAG
CTAAACGTGGAGCAATCACTGTTACTATGTACAATTTTGGATCTCCAAGAGTAGGCAACA
AAAAATTTGCTGATGTTTATAACCAGAAAGTAAAAGGCAGCTGGAGAGTTGTAAACCACA
GAGACATAATTCCCACAGTTCCTCGCTTGATGGGCTATTGTCATGTTGCGCATCCTGTTT
ATCTCGCTGCTGGAGAAGTGGAGAACACGGATTTTCAAAAAGATGGTTATCATGGTGAGG
TGATAGGGGAAGCGACACCTGATATTCTTGTTAGTAGATTTATGAAAGGTGAGAAGGAAC
TCGTTGAGCAGATACTTCAAACTGAAATCAAACTATTCAACGCAATTCGTGATGGGAGTG
CCCTTATGCAGCATATGGAGGATTTCTACTACATCACACTGTTAGAGAGTGTGAAATTAT
ATTACAAAAATGTTGAGGATTTGGAAGGCGTTGAAAAGACTACCATATGATCGAAGGGAG
AGAACTAATGGCTCGCTCCAGCTTCATCGGATTCACACTGTATACCAATTTACAAGAGAA
GCATCCACTGGTTTGCATTGTTTTCTCATTGGATTACAAAGTAAAGAATACTGTGTACCA
AAATGTAATTATTTACACGATGTCAAAAGGGAACAAGAATGGTTGGAAGTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ58TF U 1
AF RR2EJ58JQ C 249
BS 1 662 RR2EJ58TF
BS 663 663 RR2EJ58JQ
BS 664 682 RR2EJ58TF
BS 683 714 RR2EJ58JQ

RD RR2EJ58TF 682 0 0
GGAGCTTGGGTGGGGCACTAGCTACACTCTTGGCCATTGAACTTGCGTCAAGCCAATTAG
CTAAACGTGGAGCAATCACTGTTACTATGTACAATTTTGGATCTCCAAGAGTAGGCAACA
AAAAATTTGCTGATGTTTATAACCAGAAAGTAAAAGGCAGCTGGAGAGTTGTAAACCACA
GAGACATAATTCCCACAGTTCCTCGCTTGATGGGCTATTGTCATGTTGCGCATCCTGTTT
ATCTCGCTGCTGGAGAAGTGGAGAACACGGATTTTCAAAAAGATGGTTATCATGGTGAGG
TGATAGGGGAAGCGACACCTGATATTCTTGTTAGTAGATTTATGAAAGGTGAGAAGGAAC
TCGTTGAGCAGATACTTCAAACTGAAATCAAACTATTCAACGCAATTCGTGATGGGAGTG
CCCTTATGCAGCATATGGAGGATTTCTACTACATCACACTGTTAGAGAGTGTGAAATTAT
ATTACAAAAATGTTGAGGATTTGGAAGGCGTTGAAAAGACTACCATATGATCGAAGGGAG
AGAACTAATGGCTCGCTCCAGCTTCATCGGATTCACACTGTATACCAATTTACAAGAGAA
GCATCCACTGGTTTGCATTGTTTTCTCATTGGATTACAAAGTAAAGAATACTGTGTACCA
AA*TGTAATTATTTACACGATG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2EJ58JQ 466 0 0
GCTGGAGAAGTGGAGAACACGGATTTTCAAAAAGATGGTTATCATGGTGAGGTGATAGGG
GAAGCGACCCCTGATATTCTTGTTAGTAGATTTATGAAAGGTGAGAAGGAACTCGTTGAG
CAGATACTTCAAACTGAAATCAAACTATTCAACGCAATTCGTGATGGGAGTGCCCTTATG
CAGCATATGGAGGATTTTTACTACATCACACTGTTAGAGAGTGTGAAATTATATTACAAA
AATGTTGAGGATTTGGAAGGCGTTGAAAAGACTACCATATGATCGAAGGGAGAGAACTAA
TGGCTCGCTCCAGCTTCATCGGATTCACACTGTATACCAATTTACAAGAGAAGCATCCAC
TGGTTTGCATTGTTTTCTCATTGGATTACAAAGTAAAGAATACTGTGTACCAAAATGTAA
TTATTTACACGATGTCAAAAGGGAACAAGAATGGTTGGAAGTTATC

QA 1 466 1 466
DS 



AS 1 2

CO CL4207Contig1 987 2 2 U
GGAGGAACTCTCTTCCTTCAACAAAAAAAAACACACCAATAGAGATCCAAGAAAGGAGAG
GCCATTAAAGAAAGAGAGAGAGAAATGGGAAGGTCACCTTGTTGCGAGAAAGCTCACATG
AACAAAGGAGCTTGGACTAAAGAAGAAGATCATCTTCTCGTTGATTACATCCGCAAACAC
GGCGAAGGTTGCTGGCGATCTCTCCCTCGAGCCGCCGGATTACAAAGATGTGGTAAGAGT
TGTAGGTTGAGATGGATGAATTATCTAAGACCAGATCTCAAGAGAGGTAATTTCACTGAG
GAAGAAGACGAACTCATCATCAAACTCCATAGCTTACTCGGTAACAAATGGTCGTTGATT
GCTGGGAGATTAGCAGGAAGAACAGACAACGAGATCAAAAACTATTGGAACACTCACATC
AAGAGGAAGCTTGTCAGCCGTGGGATTGATCCAAACACCCATCGTCCGATCAACGCAATC
CCTCCTTCAAAAACAACAACATCACTTCTAAACGACGAGCCTGTACAATTCGATTTAGCC
GGACCGGATCAACATCAGACGGTTAAACCGGAACCGATGGCGCTAGACCGGGAAGAGGTT
AATAATGATATCAACAATAATAACTCCACGAGCAGTGGAACGACGTCGGACGACGATTGT
GAACTCAATTTGGAACTCTCTGTTGGTCTGGCTACTACGAGGTACCAGTCAACCCGGAAG
GCAAGTCTTGACTCGGTCGAGTCCACTGAACGGTGGGGATCCGAGTTGTTCGGGGCTCAG
GCTGAAGTGTGTTTGTGTTGTCGGATAGGGTTTCATAATGAGTCCTGTCGTAATTGTCGT
GTTTCGGATGCTCGAACCATCTGGGAATCGAAAATTCTTTAGGAATATTTTATATATTAG
TTAATTTGTATTTTTGTTTTGTTTTGTTATGTTTCTTCTTGTAATGAATGCATCAAGTAA
CAAAAAGTAGGATAAATTTTCTGCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E748TF U 1
AF RR2E748JQ C 288
BS 1 644 RR2E748TF
BS 645 987 RR2E748JQ

RD RR2E748TF 644 0 0
GGAGGAACTCTCTTCCTTCAACAAAAAAAAACACACCAATAGAGATCCAAGAAAGGAGAG
GCCATTAAAGAAAGAGAGAGAGAAATGGGAAGGTCACCTTGTTGCGAGAAAGCTCACATG
AACAAAGGAGCTTGGACTAAAGAAGAAGATCATCTTCTCGTTGATTACATCCGCAAACAC
GGCGAAGGTTGCTGGCGATCTCTCCCTCGAGCCGCCGGATTACAAAGATGTGGTAAGAGT
TGTAGGTTGAGATGGATGAATTATCTAAGACCAGATCTCAAGAGAGGTAATTTCACTGAG
GAAGAAGACGAACTCATCATCAAACTCCATAGCTTACTCGGTAACAAATGGTCGTTGATT
GCTGGGAGATTAGCAGGAAGAACAGACAACGAGATCAAAAACTATTGGAACACTCACATC
AAGAGGAAGCTTGTCAGCCGTGGGATTGATCCAAACACCCATCGTCCGATCAACGCAATC
CCTCCTTCAAAAACAACAACATCACTTCTAAACGACGAGCCTGTACAATTCGATTTAGCC
GGACCGGATCAACATCAGACGGTTAAACCGGAACCGATGGCGCTAGACCGGGAAGAGGTT
AATAATGATATCAACAATAATAACTCCACGAGCAGTGGAACGAC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2E748JQ 700 0 0
TAATTTCACTGAGGAAGAAGACGAACTCATCATCAAACTCCATAGCTTACTCGGTAACAA
ATGGTCGTTGATTGCTGGGAGATTAGCAGGAAGAACAGACAACGAGATCAAAAACTATTG
GAACACTCACATCAAGAGGAAGCTTGTCAGCCGTGGGATTGATCCAAACACCCATCGTCC
GATCAACGCAATCCCTCCTTCAAAAACAACAACATCACTTCTAAACGACGAGCCTGTACA
ATTCGATTTAGCCGGACCGGATCAACATCAGACGGTTAAACCGGAACCGATGGCGCTAGA
CCGGGAAGAGGTTAATAATGATATCAACAATAATAACTCCACGAGCAGTGGAACGACGTC
GGACGACGATTGTGAACTCAATTTGGAACTCTCTGTTGGTCTGGCTACTACGAGGTACCA
GTCAACCCGGAAGGCAAGTCTTGACTCGGTCGAGTCCACTGAACGGTGGGGATCCGAGTT
GTTCGGGGCTCAGGCTGAAGTGTGTTTGTGTTGTCGGATAGGGTTTCATAATGAGTCCTG
TCGTAATTGTCGTGTTTCGGATGCTCGAACCATCTGGGAATCGAAAATTCTTTAGGAATA
TTTTATATATTAGTTAATTTGTATTTTTGTTTTGTTTTGTTATGTTTCTTCTTGTAATGA
ATGCATCAAGTAACAAAAAGTAGGATAAATTTTCTGCTGG

QA 1 700 1 700
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4209Contig1 885 2 2 U
GGTCTGCTCTTCGTTTTCATCGATTACGGCGGGTTTTTTCCATTCCTGATGGGTTTATAT
ACTCGAGGGCGAGTCTGGACAGTTGTCACAAGCCGATGATGCTTAGGAAACGAGCAGAAG
AAGGTGGAGTGTCGCTGAAGTATCTACAGGATATGCACGAGAAGAATGAGAGCTTTGAGA
GTGGAAACCACGGGGTGCTCTCTGTTAGTAAACCGTCTTTGGAGATGGATAACTCTCTCC
ATCCTGATATCAAGGACCGTGTCCTTTACTTGGAAGGGAATCATATGCGTTCTAGCATCC
AGAAGGTTCCTGCTTTGGTTTTGGACTATGAACCAAATATTGACTCCAGCAGAGATATTG
AAGCAAAGAGACAGCAAGTTCTTTCTAATGTTAATGCCATCATAACTTGCGTTACTGATA
TGTTTATGATTGGTATTGTTGAAGGTACGCATGACAAGTTGCTGAGTTTTTTTTACTTTG
TGAAGAAGAATCAAGAAACGTCGCAAGAGCAGCCGACATTGCTGATGCCTCCTCATAATG
GAGGTCTCTGGATTGGACCAGAAGGGAAGCATGTCCCATGATTAGAACTCCCGTCTCAAG
ATTTCAGGAAGGGCATGTCGCTCTTAACCAGACCGTCTGCGCGAAACTCTCCCCCACTGT
TTTGTTTGCTCTGAAGCAGCATTGTCAGGGTTATATCGAGTGTCAATAGGGTATGGTTGG
CTTTATGTTTCGTTTGTTTTAGGGAACTTCTTCTTTACGACTTTTACACCCTCTCTTAGT
TTAGTTATTAACCCTTTTGTGTAGAGAAAGATTTGATGATGTCTCAGTTTTATCTTCTTT
CTTTAAAGCTTTCCTCTCTAAAGGTATGAAACCTATTTGTCTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ60TF U 1
AF RR2GQ60JQ C 312
BS 1 738 RR2GQ60TF
BS 739 885 RR2GQ60JQ

RD RR2GQ60TF 738 0 0
GGTCTGCTCTTCGTTTTCATCGATTACGGCGGGTTTTTTCCATTCCTGATGGGTTTATAT
ACTCGAGGGCGAGTCTGGACAGTTGTCACAAGCCGATGATGCTTAGGAAACGAGCAGAAG
AAGGTGGAGTGTCGCTGAAGTATCTACAGGATATGCACGAGAAGAATGAGAGCTTTGAGA
GTGGAAACCACGGGGTGCTCTCTGTTAGTAAACCGTCTTTGGAGATGGATAACTCTCTCC
ATCCTGATATCAAGGACCGTGTCCTTTACTTGGAAGGGAATCATATGCGTTCTAGCATCC
AGAAGGTTCCTGCTTTGGTTTTGGACTATGAACCAAATATTGACTCCAGCAGAGATATTG
AAGCAAAGAGACAGCAAGTTCTTTCTAATGTTAATGCCATCATAACTTGCGTTACTGATA
TGTTTATGATTGGTATTGTTGAAGGTACGCATGACAAGTTGCTGAGTTTTTTTTACTTTG
TGAAGAAGAATCAAGAAACGTCGCAAGAGCAGCCGACATTGCTGATGCCTCCTCATAATG
GAGGTCTCTGGATTGGACCAGAAGGGAAGCATGTCCCATGATTAGAACTCCCGTCTCAAG
ATTTCAGGAAGGGCATGTCGCTCTTAACCAGACCGTCTGCGCGAAACTCTCCCCCACTGT
TTTGTTTGCTCTGAAGCAGCATTGTCAGGGTTATATCGAGTGTCAATAGGGTATGGTTGG
CTTTATGTTTCGTTTGTT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2GQ60JQ 574 0 0
GCTTTGGTTTTGGACTATGAACCAAATATTGACTCCAGCAGAGATATTGAAGCAAAGAGA
CAGCAAGTTCTTTCTAATGTTAATGCCATCATAACTTGCGTTACTGATATGTTTATGATT
GGTATTGTTGAAGGTACGCATGACAAGTTGCTGAGTTTTTTTTACTTTGTGAAGAAGAAT
CAAGAAACGTCGCAAGAGCAGCCGACATTGCTGATGCCTCCTCATAATGGAGGTCTCTGG
ATTGGACCAGAAGGGAAGCATGTCCCATGATTAGAACTCCCGTCTCAAGATTTCAGGAAG
GGCATGTCGCTCTTAACCAGACCGTCTGCGCGAAACTCTCCCCCACTGTTTTGTTTGCTC
TGAAGCAGCATTGTCAGGGTTATATCGAGTGTCAATAGG*TATGGTTGGCTTTATGTTTC
GTTTGTTTTAGGGAACTTCTTCTTTACGACTTTTACACCCTCTCTTAGTTTAGTTATTAA
CCCTTTTGTGTAGAGAAAGATTTGATGATGTCTCAGTTTTATCTTCTTTCTTTAAAGCTT
TCCTCTCTAAAGGTATGAAACCTATTTGTCTCTT

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL4210Contig1 462 2 1 U
AAGGATCTTTGTGGGGGACAAAGTCGATCCGATAGCGAAAACTAGAGACCGAGAGAGATC
GAAGCAGTTAGTTATGCCAGGAGGAGGAGGTGCGCTCAAGTCCTTGAAACCAAAGATCCA
ATCCGTTGATATCCAAGCCGCCGCGGGATGGGGTATCGCCGCCGCAGCCGGCGCCATCTG
GATCGTCCAACCTTTTGATTGGATAAAGAAGACATTCATTGATAAACCGGCGGAAGAGAA
CTGAGTGAGAGAGATCATCAAAGACTCACTAACAAAGTGAGGTCTTTTTTTCTTCCAATT
TCTAAGTTTGTCATCGCATCTCTGTGATGAAGCTGAATAAATTTTTGTTCTTTTCTGGGG
CTTTGTGATTTCATGTAGACTTTTTGTTTCTCAAATGATATAACACAAGAGAAAAGCATA
CACTCCAAAATTATCAGAAAAGAGGACCCCTTTTGCTTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A449JQ C 1
AF RR2A449TF U 1
BS 1 462 RR2A449TF

RD RR2A449JQ 462 0 0
AAGGATCTTTGTGGGGGACAAAGTCGATCCGATAGCGAAAACTAGAGACCGAGAGAGATC
GAAGCAGTTAGTTATGCCAGGAGGAGGAGGTGCGCTCAAGTCCTTGAAACCAAAGATCCA
ATCCGTTGATATCCAAGCCGCCGCGGGATGGGGTATCGCCGCCGCAGCCGGCGCCATTTG
GATCGTCCAACCTTTTGATTGGATAAAGAAGACATTCATTGATAAACCGGGGGAAGAGAA
CTGAGTGAGAGAGATCATCAAAGACTCACTAACAAAGTGAGGTTTTTTTTTTTTCCAATT
TTTAAGTTTGTCATCGCATTTTTGTGATGAAGCTGAATAAATTTTTGTTTTTTTTTGGGG
CTTTGTGATTTCATGTAGACTTTTTGTTTTTCAAATGATATAACACAAGAGAAAAGCATA
CACTCCAAAATTATCAGAAAAGAGGACCCCTTTTGCTTTTTT

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2A449TF 462 0 0
AAGGATCTTTGTGGGGGACAAAGTCGATCCGATAGCGAAAACTAGAGACCGAGAGAGATC
GAAGCAGTTAGTTATGCCAGGAGGAGGAGGTGCGCTCAAGTCCTTGAAACCAAAGATCCA
ATCCGTTGATATCCAAGCCGCCGCGGGATGGGGTATCGCCGCCGCAGCCGGCGCCATCTG
GATCGTCCAACCTTTTGATTGGATAAAGAAGACATTCATTGATAAACCGGCGGAAGAGAA
CTGAGTGAGAGAGATCATCAAAGACTCACTAACAAAGTGAGGTCTTTTTTTCTTCCAATT
TCTAAGTTTGTCATCGCATCTCTGTGATGAAGCTGAATAAATTTTTGTTCTTTTCTGGGG
CTTTGTGATTTCATGTAGACTTTTTGTTTCTCAAATGATATAACACAAGAGAAAAGCATA
CACTCCAAAATTATCAGAAAAGAGGACCCCTTTTGCTTTTTT

QA 1 462 1 462
DS 



AS 1 2

CO CL4211Contig1 902 2 2 U
GAGAGCCATTGGATAAGATCGAATCTCTTCTCGAAATTGGAATCTGAGGATGGTTGAGGT
AGAATCGCATTTGTATTCATCGAGAGCAGGAGGAAGTTTCAGCATTCTCTTGACCTTGTT
GTAGCACACTTTTGTTTTGAACTCGAAATTTTGTTCTCGGATCCTTAGAACCGAAAAAAT
TGTTCTCGGATCTTAGGAGGAGGATGTGTGATTTGATCGCTCGTACGGGTCGGCTCCAGC
AACGCTACGAGAATGGCTGCCGTCTCGTTGCCGGGTACTGTAATTGATTTGATCCGATCC
GATCCCCTCCTTCCTTACCTGTGCAACTTGCGTTCACTATTTAGATCTTTTGAATTGGCC
TGTGTTTCCTTGATCTTTGGTTCGTTAATGGTTCAGGTGCATTCCATTTAGATATAGAAA
CTCCGAAGAAGTGGGTGATTCTTCTGACTGTGGGAAAGTGGTTGAAGTGTTGATGATCAC
TTCTTCTGGTGGACCTGGACTTCTCTTTCCAAAGGGAGGGTGGGAGAATGATGAGACAGT
TAGGGAGGCTGCAGCTAGAGAAGCTGTCGAAGAAGCTGGAGTTCGCGGGATTTTACTGGA
TTTGTTGGGAGAATACGATTCCTGAAGCTGTTGAGAATTGTCGTCATGCATGGATGAAAT
GTGCCTTGGAGGAAGGCTTCTGTAAATGGCACCAGGACAAAGGACTTCAGCTTATCCAAT
AAGCCACGCTTCTCTTTTCGTGCCTATCATTCATTTTTTTTTATCAACATAGGAGTTTTT
GTCATCATTTGTTTCCTGCGTTTCCAAGGCATTTTATATCACATGAACAGTGTTGCGAAA
GCGATTTGCAGCAAAAACTGAACTTCAGAAAAAAAATAACAAATAGAATATTTACCATCC
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2FZ17TF U 1
AF RR2FZ17JQ C 247
BS 1 667 RR2FZ17TF
BS 668 902 RR2FZ17JQ

RD RR2FZ17TF 667 0 0
GAGAGCCATTGGATAAGATCGAATCTCTTCTCGAAATTGGAATCTGAGGATGGTTGAGGT
AGAATCGCATTTGTATTCATCGAGAGCAGGAGGAAGTTTCAGCATTCTCTTGACCTTGTT
GTAGCACACTTTTGTTTTGAACTCGAAATTTTGTTCTCGGATCCTTAGAACCGAAAAAAT
TGTTCTCGGATCTTAGGAGGAGGATGTGTGATTTGATCGCTCGTACGGGTCGGCTCCAGC
AACGCTACGAGAATGGCTGCCGTCTCGTTGCCGGGTACTGTAATTGATTTGATCCGATCC
GATCCCCTCCTTCCTTACCTGTGCAACTTGCGTTCACTATTTAGATCTTTTGAATTGGCC
TGTGTTTCCTTGATCTTTGGTTCGTTAATGGTTCAGGTGCATTCCATTTAGATATAGAAA
CTCCGAAGAAGTGGGTGATTCTTCTGACTGTGGGAAAGTGGTTGAAGTGTTGATGATCAC
TTCTTCTGGTGGACCTGGACTTCTCTTTCCAAAGGGAGGGTGGGAGAATGATGAGACAGT
TAGGGAGGCTGCAGCTAGAGAAGCTGTCGAAGAAGCTGGAGTTCGCGGGATTTTACTGGA
TTTGTTGGGAGAATACGATTCCTGAAGCTGTTGAGAATTGTCGTCATGCATGGATGAAAT
GTGCCTT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2FZ17JQ 656 0 0
ACGAGAATGGCTGCCGTCTCGTTGCCGGGTACTGTAATTGATTTGATCCGATCCGATCCC
CTCCTTCCTTACCTGTGCAACTTGCGTTCACTATTTAGATCTTTTGAATTGGCCTGTGTT
TCCTTGATCTTTGGTTCGTTAATGGTTCAGGTGCATTCCATTTAGATATAGAAACTCCGA
AGAAGTGGGTGATTCTTCTGACTGTGGGAAAGTGGTTGAAGTGTTGATGATCACTTCTTC
TGGTGGACCTGGACTTCTCTTTCCAAAGGGAGGGTGGGAGAATGATGAGACAGTTAGGGA
GGCTGCAGCTAGAGAAGCTGTCGAAGAAGCTGGAGTTCGCGGGATTTTACTGGATTTGTT
GGGAGAATACGATTCCTGAAGCTGTTGAGAATTGTCGTCATGCATGGATGAAATGTGCCT
TGGAGGAAGGCTTCTGTAAATGGCACCAGGACAAAGGACTTCAGCTTATCCAATAAGCCA
CGCTTCTCTTTTCGTGCCTATCATTCATTTTTTTTTATCAACATAGGAGTTTTTGTCATC
ATTTGTTTCCTGCGTTTCCAAGGCATTTTATATCACATGAACAGTGTTGCGAAAGCGATT
TGCAGCAAAAACTGAACTTCAGAAAAAAAATAACAAATAGAATATTTACCATCCTC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4213Contig1 734 2 2 U
GGGCAGAATCAAATTGGTCGTTAGGGTTTTAGCTCTCAAAGTTAAAACCTTTTGATTCTC
TTAAACCGGAGAAGAGATCAGTACGCCGATCGGTCAATTTTGAATCAATGGCGATGGCTA
TGAGACTCCCCGCGATAGCGAGAGCGGCGACGGAAGCTCCTTCGGTTGGATTGAGGCGCC
TGTTCTGTTCGAATGCTTCAAAGTTTTCATTCCTTTCTCCTCAGGCTGCTAATTCCGAAA
CTCCGTCTCGTCCCCAGGCCGAACCCAGCACCAATCTCTTCGTCTCCGGGCTTAGTAAGC
GCACCACTTCTGAAGGGCTTAGGACAGCTTTCGCTCAGTTTGGAGAAGTTGCTGGTGCCA
AGGTTGTCACAGACAGAGTCTCGGGATATTCAAAAGGGTTTGGATTTGTTCGTTATACCA
CCTTAGAAGATTCTGCCAAAGGCATTGCTGGAATGGATGGCAAGTTTCTTGACGGTTGGG
TCATCTTCGCAGAGTATGCAAGGCCAAGAGAGCAACCGTGTCCGTATCAACCTCTGAACA
ACATGAATACTCCTCCTTATGGTAACCGCTATTGAAACAAGCCTCTTCATGGAAACCTTT
GGGCATTTGTTCTTGACGAATCATTATATTTGTGTTATGTTTCACTCTGTTATCTACCGT
GATTGAACTGTCTCTTCTCCCTCCGTAGTGTGGAGTTACAAAAACTTCAATTTATATACT
TCGAGTAATAACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV90TF U 1
AF RR2GV90JQB C 279
BS 1 699 RR2GV90TF
BS 700 734 RR2GV90JQB

RD RR2GV90TF 699 0 0
GGGCAGAATCAAATTGGTCGTTAGGGTTTTAGCTCTCAAAGTTAAAACCTTTTGATTCTC
TTAAACCGGAGAAGAGATCAGTACGCCGATCGGTCAATTTTGAATCAATGGCGATGGCTA
TGAGACTCCCCGCGATAGCGAGAGCGGCGACGGAAGCTCCTTCGGTTGGATTGAGGCGCC
TGTTCTGTTCGAATGCTTCAAAGTTTTCATTCCTTTCTCCTCAGGCTGCTAATTCCGAAA
CTCCGTCTCGTCCCCAGGCCGAACCCAGCACCAATCTCTTCGTCTCCGGGCTTAGTAAGC
GCACCACTTCTGAAGGGCTTAGGACAGCTTTCGCTCAGTTTGGAGAAGTTGCTGGTGCCA
AGGTTGTCACAGACAGAGTCTCGGGATATTCAAAAGGGTTTGGATTTGTTCGTTATACCA
CCTTAGAAGATTCTGCCAAAGGCATTGCTGGAATGGATGGCAAGTTTCTTGACGGTTGGG
TCATCTTCGCAGAGTATGCAAGGCCAAGAGAGCAACCGTGTCCGTATCAACCTCTGAACA
ACATGAATACTCCTCCTTATGGTAACCGCTATTGAAACAAGCCTCTTCATGGAAACCTTT
GGGCATTTGTTCTTGACGAATCATTATATTTGTGTTATGTTTCACTCTGTTATCTACCGT
GATTGAACTGTCTCTTCTCCCTCCGTAGTGTGGAGTTAC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2GV90JQB 456 0 0
TTCGTCTCCGGGCTTAGTAAGCGCACCACTTCTGAAGGGCTTAGGACAGCTTTCGCTCAG
TTTGGAGAAGTTGCTGGTGCCAAGGTTGTCACAGACAGAGTCTCGGGATATTCAAAAGGG
TTTGGATTTGTTCGTTATACCACCTTAGAAGATTCTGCCAAAGGCATTGCTGGAATGGAT
GGCAAGTTTCTTGACGGTTGGGTCATCTTCGCAGAGTATGCAAGGCCAAGAGAGCAACCG
TGTCCGTATCAACCTCTGAACAACATGAATACTCCTCCTTATGGTAACCGCTATTGAAAC
AAGCCTCTTCATGGAAACCTTTGGGCATTTGTTCTTGACGAATCATTATATTTGTGTTAT
GTTTCACTCTGTTATCTACCGTGATTGAACTGTCTCTTCTCCCTCCGTAGTGTGGAGTTA
CAAAAACTTCAATTTATATACTTCGAGTAATAACCG

QA 1 456 1 456
DS 



AS 1 2

CO CL4214Contig1 988 2 2 U
GGAGTTTCGTAACTTTATCATCGTTGAAACACACAGAGAAGAAACCACCCCAAGAGAGCG
AGAGAGATATTTTCTTCACATCTCTGGAGCTTCGAATTCTAGGTCATCATCCATTATTCG
TTGATCTGATTATTATATTCAATAAAGTAGTGTGATAGAGAGAGTTTAGAAGGGCCAATA
CCCCGCCCATTGAATCGATTCTGATCGAGCTAGCTCAAAGGAAGTTTTGGGATAGAAGGG
CAGATCGTGTCTGATGGAGTTTCTCAGATGAATGAATATTGGGTTCTCAAAACCTCTTAT
TGTTGAGTTGCCTCGATAAATGATGATATTTGGTTGAAGAAGTCAATTCTAGAGAAACCG
AAGAAAAGAAGATATGAAAAAGCATCGGTTTAGAGAGACATTGAAGTCCTTCTTTGAGCC
TCATTTTGATCATGAGAAAGGCGAAATGCTCAAAGGAACAAAATCTGAAATGGATGAAAA
GGTGAAGAAAATCTTGGGAATGGTTGAGAGTGGAGACATCGACGAAGGTAAATCTAAAAG
ACAAGTGGTTTCAGATTTAGTGAATGAATTCTACAATGCGTACCAGTCTCTATATCGCAA
GTACGATGATCTAACAGGAGATATTAAGAAAAAGGTGCACGGGAAAGGAGAAAGCTCTTC
ATCATCGAGCTCAGACTCGGATTCTGACCATTCTTCGAAGAGGAAGAACAAGCGAAATGG
GAAAGTAGAGAAAGATGTGGAGTCTGTAACAGATGGACAAACCGAAGCTGCTGATCTGAA
AGAAAAGTTGACAATGAGTGTTGAAGAAAAAGAAGCAGCTTTGGTGAAGTTAAAAGAATC
GGAAGAGATCATCAGGAATTTGAAACTCGAAACTGAGAAGTTAGAGGGCGAGAAGACAAC
AGCTCTGAGTGATAGCAGAGAACTACATCAGAAACTGGAAGTTGCGGGAAAAACGGAAAC
TGATCTGAGCAAGAGGTTAGAAGATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H268TF U 1
AF RR2H268JQ C 206
BS 1 630 RR2H268TF
BS 631 988 RR2H268JQ

RD RR2H268TF 630 0 0
GGAGTTTCGTAACTTTATCATCGTTGAAACACACAGAGAAGAAACCACCCCAAGAGAGCG
AGAGAGATATTTTCTTCACATCTCTGGAGCTTCGAATTCTAGGTCATCATCCATTATTCG
TTGATCTGATTATTATATTCAATAAAGTAGTGTGATAGAGAGAGTTTAGAAGGGCCAATA
CCCCGCCCATTGAATCGATTCTGATCGAGCTAGCTCAAAGGAAGTTTTGGGATAGAAGGG
CAGATCGTGTCTGATGGAGTTTCTCAGATGAATGAATATTGGGTTCTCAAAACCTCTTAT
TGTTGAGTTGCCTCGATAAATGATGATATTTGGTTGAAGAAGTCAATTCTAGAGAAACCG
AAGAAAAGAAGATATGAAAAAGCATCGGTTTAGAGAGACATTGAAGTCCTTCTTTGAGCC
TCATTTTGATCATGAGAAAGGCGAAATGCTCAAAGGAACAAAATCTGAAATGGATGAAAA
GGTGAAGAAAATCTTGGGAATGGTTGAGAGTGGAGACATCGACGAAGGTAAATCTAAAAG
ACAAGTGGTTTCAGATTTAGTGAATGAATTCTACAATGCGTACCAGTCTCTATATCGCAA
GTACGATGATCTAACAGGAGATATTAAGAA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2H268JQ 783 0 0
CGAGCTAGCTCAAAGGAAGTTTTGGGATAGAAGGGCAGATCGTGTCTGATGGAGTTTCTC
AGATGAATGAATATTGGGTTCTCAAAACCTCTTATTGTTGAGTTGCCTCGATAAATGATG
ATATTTGGTTGAAGAAGTCAATTCTAGAGAAACCGAAGAAAAGAAGATATGAAAAAGCAT
CGGTTTAGAGAGACATTGAAGTCCTTCTTTGAGCCTCATTTTGATCATGAGAAAGGCGAA
ATGCTCAAAGGAACAAAATTTGAAATGGATGAAAAGGTGAAGAAAATCTTGGGAATGGTT
GAGAGTGGAGACATCGACGAAGGTAAATCTAAAAGACAAGTGGTTTCAGATTTAGTGAAT
GAATTCTACAATGCGTACCAGTCTCTATATCGCAAGTACGATGATCTAACAGGAGATATT
AAGAAAAAGGTGCACGGGAAAGGAGAAAGCTCTTCATCATCGAGCTCAGACTCGGATTCT
GACCATTCTTCGAAGAGGAAGAACAAGCGAAATGGGAAAGTAGAGAAAGATGTGGAGTCT
GTAACAGATGGACAAACCGAAGCTGCTGATCTGAAAGAAAAGTTGACAATGAGTGTTGAA
GAAAAAGAAGCAGCTTTGGTGAAGTTAAAAGAATCGGAAGAGATCATCAGGAATTTGAAA
CTCGAAACTGAGAAGTTAGAGGGCGAGAAGACAACAGCTCTGAGTGATAGCAGAGAACTA
CATCAGAAACTGGAAGTTGCGGGAAAAACGGAAACTGATCTGAGCAAGAGGTTAGAAGAT
ATG

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL4215Contig1 976 2 2 U
GGCTCTTGGTTCTGTTTCTTCCTCGTTTTCCACTTTGCGTTTCCATGGCGGCGGTTATCG
GAAACGTGGCGCTGTTACTCGACGTCAACTCTCACCGTACGGTGGTCGCTGATCGGAGAA
TTCGCTTGGCGGTCGTCGACGTCGTTCTGAATCTACCGAAGAGAGACTCATCGCACGGTT
ACGTTTCTTCTCATTACGCGTCTCTCTCGTCCAACAAGCCTCTTGAATCTGACGGAGAGG
CTCGGAGTCGCCGGTTTCTGACTCGCGGAAAGGCGAAATCAAGGGCTAACGCCGTGGATT
ACGACGAGGCCGGATCCAGCGACAAGGGTGAGGGGAAGGAGAGTGATGACGATGAAGATG
AAGAAGCGTACGATGTTGAGAAGGAGATGAAGAGGAGAGCCAAGGAGCTGCAGGATATGA
AGGAGCTTGAGAGGAAAGCAGAGAGGAGAGCAACTGCAGAACTGATGTTTGAGTTGGGAC
AAAAGGCTTATGGTAAAGGCATGTATGGACGAGCAATTGAGTTTCTTGAAGGAGCTCTTA
CTATTATCCCAAGGCCAACGCTTTTTGGCGGTGAGATTCAAATTTGGTTAGCTATGGCAT
ATGAGGCCAATAATCGCCACGCTGATTGCATTGATCTTTATCAGCAACTAGAGAAGAGAC
ACCCGAGTCCTGGTATCCGTCGTCAAGCTTCTGAGCTTAGGTATATCTTGCAAGCTCCTA
AGCTCAAGATCTCTCAGGAGGAGATGGTTACCATACCCATGATCGGTTCAAGCTACGACA
GCTATGCAGTGACATGGAGTGACAAGGAGAGGGACAGAGACAGGAGGATGAATGAATCGA
CTACGAATCAGGTCGACTCGAGTGAAGACTTTCTAGGAAAGCTCTTGGTTTGGCGACCAC
CTGTCGGGATGGAGAAGAACAAAGTCTTTTGGCTTTCTTTGACGCTGTGGTTTGGTTTAG
TTGGAGCAGCACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A960TF U 1
AF RR2A960JQ C 322
BS 1 741 RR2A960TF
BS 742 976 RR2A960JQ

RD RR2A960TF 745 0 0
GGCTCTTGGTTCTGTTTCTTCCTCGTTTTCCACTTTGCGTTTCCATGGCGGCGGTTATCG
GAAACGTGGCGCTGTTACTCGACGTCAACTCTCACCGTACGGTGGTCGCTGATCGGAGAA
TTCGCTTGGCGGTCGTCGACGTCGTTCTGAATCTACCGAAGAGAGACTCATCGCACGGTT
ACGTTTCTTCTCATTACGCGTCTCTCTCGTCCAACAAGCCTCTTGAATCTGACGGAGAGG
CTCGGAGTCGCCGGTTTCTGACTCGCGGAAAGGCGAAATCAAGGGCTAACGCCGTGGATT
ACGACGAGGCCGGATCCAGCGACAAGGGTGAGGGGAAGGAGAGTGATGACGATGAAGATG
AAGAAGCGTACGATGTTGAGAAGGAGATGAAGAGGAGAGCCAAGGAGCTGCAGGATATGA
AGGAGCTTGAGAGGAAAGCAGAGAGGAGAGCAACTGCAGAACTGATGTTTGAGTTGGGAC
AAAAGGCTTATGGTAAAGGCATGTATGGACGAGCAATTGAGTTTCTTGAAGGAGCTCTTA
CTATTATCCCAAGGCCAACGCTTTTTGGCGGTGAGATTCAAATTTGGTTAGCTATGGCAT
ATGAGGCCAATAATCGCCACGCTGATTGCATTGATCTTTATCAGCAACTAGAGAAGAGAC
ACCCGAGTCCTGGTATCCGTCGTCAAGCTTCTGAGCTTAGGTATATCTTGCAAGCTCCTA
AGCTCAAGATCTCTCAGGAGG
GAGA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2A960JQ 655 0 0
ACAAGGGTGAGGGGAAGGAGAGTGATGACGATGAAGATGAAGAAGCGTACGATGTTGAGA
AGGAGATGAAGAGGAGAGCCAAGGAGCTGCAGGATATGAAGGAGCTTGAGAGGAAAGCAG
AGAGGAGAGCAACTGCAGAACTGATGTTTGAGTTGGGACAAAAGGCTTATGGTAAAGGCA
TGTATGGACGAGCAATTGAGTTTCTTGAAGGAGCTCTTACTATTATCCCAAGGCCAACGC
TTTTTGGCGGTGAGATTCAAATTTGGTTAGCTATGGCATATGAGGCCAATAATCGCCACG
CTGATTGCATTGATCTTTATCAGCAACTAGAGAAGAGACACCCGAGTCCTGGTATCCGTC
GTCAAGCTTCTGAGCTTAGGTATATCTTGCAAGCTCCTAAGCTCAAGATCTCTCAGGAGG
AGATGGTTACCATACCCATGATCGGTTCAAGCTACGACAGCTATGCAGTGACATGGAGTG
ACAAGGAGAGGGACAGAGACAGGAGGATGAATGAATCGACTACGAATCAGGTCGACTCGA
GTGAAGACTTTCTAGGAAAGCTCTTGGTTTGGCGACCACCTGTCGGGATGGAGAAGAACA
AAGTCTTTTGGCTTTCTTTGACGCTGTGGTTTGGTTTAGTTGGAGCAGCACTTTT

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL4216Contig1 875 2 4 U
GGATCCTCTGTCTCAATGGGGACTCCGGAGTTTCCAGATCTGGGGAATCACTGCTCCGTT
GATTATTGCAAGCAGATCGATTTCTTGCCTTTCACATGCGATCGATGCATCCAGGTGTTC
TGTTTGGATCATCGTAGCTACATGAAACACTCCTGTCCGAAAGGAAACAGAGGAGATGTA
ACGGTCGTAATCTGTCCGTTGTGTGCTAAAGGAGTTAGGTTAAACCCTGACGAAGATCCA
AACATCACTTGGGAGAAACACGTGAACACAGATTGTGATCCATCAAACTACGAGAAAACT
GTCAAGAAGAAGAAATGTCCTGTTCCAAGATGCAGGGAGTTGCTTACCTTCTCCAACACT
ATAAAATGTCGAGATTGCAGTATCGAGCATTGCTTGAAACATCGGTTTGGGCCTGACCAT
AGTTGCTCTGGACCTAAGAAGCTTGAATCCAGTTTCTCATTCATGGGTTTCTTGAGTACT
ACAACTAACACAAAAGAAGCTCCCGCTTCATCATCTTCGAGATGGTCTAGTCTTTTAGCT
TCCGCGGAAGCTAGTATCAGAGAACTCGGTAACGATATTAGCCAGAAGTTGCAGTTCTCG
AGTGGCGGCGATGGTAGTTCGGAGAAAACGCAGGAGAGGAATGGTAAAGTTACGGTTGAT
GTTTGTCCGAAATGCAGCAAAGGGTTTCGTGAACCTGGGGAGCCATTGAAGCATATTGAT
AAGGATCATCGTGGTACTTCTATAGCTTAGAAGCATGATGGAAATGATGATGAATTGGTT
AAATATTTGTGTGATTGTAACATTTTTGTTCTTGTGTTGTTGTAACATTCTTTGCGATCG
GTTTTGGTTTTATGGTTTATGAATTATAGAAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP39TF U 1
AF RR2CP39JQ C 246
BS 1 633 RR2CP39TF
BS 634 634 RR2CP39JQ
BS 635 671 RR2CP39TF
BS 672 875 RR2CP39JQ

RD RR2CP39TF 677 0 0
GGATCCTCTGTCTCAATGGGGACTCCGGAGTTTCCAGATCTGGGGAATCACTGCTCCGTT
GATTATTGCAAGCAGATCGATTTCTTGCCTTTCACATGCGATCGATGCATCCAGGTGTTC
TGTTTGGATCATCGTAGCTACATGAAACACTCCTGTCCGAAAGGAAACAGAGGAGATGTA
ACGGTCGTAATCTGTCCGTTGTGTGCTAAAGGAGTTAGGTTAAACCCTGACGAAGATCCA
AACATCACTTGGGAGAAACACGTGAACACAGATTGTGATCCATCAAACTACGAGAAAACT
GTCAAGAAGAAGAAATGTCCTGTTCCAAGATGCAGGGAGTTGCTTACCTTCTCCAACACT
ATAAAATGTCGAGATTGCAGTATCGAGCATTGCTTGAAACATCGGTTTGGGCCTGACCAT
AGTTGCTCTGGACCTAAGAAGCTTGAATCCAGTTTCTCATTCATGGGTTTCTTGAGTACT
ACAACTAACACAAAAGAAGCTCCCGCTTCATCATCTTCGAGATGGTCTAGTCTTTTAGCT
TCCGCGGAAGCTAGTATCAGAGAACTCGGTAACGATATTAGCCAGAAGTTGCAGTTCTCG
AGTGGCGGCGATGGTAGTTCGGAGAAAACGCAG*AGAGGAATGGTAAAGTTACGGTTGAT
GTTTGTCCGAA
TGCAGC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2CP39JQ 630 0 0
CACTTGGGAGAAACACGTGAACACAGATTGTGATCCATCAAACTACGAGAAAACTGTCAA
GAAGAAGAAATGTCCTGTTCCAAGATGCAGGGAGTTGCTTACCTTCTCCAACACTATAAA
ATGTCGAGATTGCAGTATCGAGCATTGCTTGAAACATCGGTTTGGGCCTGACCATAGTTG
CTCTGGACCTAAGAAGCTTGAATCCAGTTTCTCATTCATGGGTTTCTTGAGTACTACAAC
TAACACAAAAGAAGCTCCCGCTTCATCATTTTCGAGATGGTCTAGTCTTTTAGCTTCCGC
GGAAGCTAGTATCAGAGAACTCGGTAACGATATTAGCCAGAAGTTGCAGTTCTCGAGTGG
CGGCGATGGTAGTTCGGAGAAAACGCAGGAGAGGAATGGTAAAGTTACGGTTGATGTTTG
TCCGAAATGCAGCAAAGGGTTTCGTGAACCTGGGGAGCCATTGAAGCATATTGATAAGGA
TCATCGTGGTACTTCTATAGCTTAGAAGCATGATGGAAATGATGATGAATTGGTTAAATA
TTTGTGTGATTGTAACATTTTTGTTCTTGTGTTGTTGTAACATTCTTTGCGATCGGTTTT
GGTTTTATGGTTTATGAATTATAGAAAACC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL4217Contig1 915 2 4 U
GGAATAGAGAAGATTTACGAGTAAAACCCTAATTTTTGTACGATGAGCAATGTCGGTGAG
AAATTGGTTGGGGAGAAGAAAGAGGCAGCAGCGCAGCAGCCGCGACAGTTTCTGACGATG
AATGCGAAGCTCTACTCTCTGGAGAGGTTCCAAGAAGATTTTGCTGATGTCTCGGTAAAG
GAGGTAGATTTGCTCAACGAGTTGGAGGTATCCAAAGTATATCACTGCGACGGGTTGGTG
TTATGAATCTGGCTTTTTTGAGATTTGGGTTACACTTACTGTCGACCCCAACGGTGCGTC
CTGGAGCAAGTTTTTGCGAATGTAACCGGGGCCCTTCTGTAGCTACGGTTTTCAGCTCTA
TCCATCTTCTGGTGGGAGCTTCCTTGTTGATGAGGACAACAAACTTGCTGTCTTGTTTGA
ACTAGACGAAACCCAGACCACTCACAAGGCCTTTGTGTTTGGACAAGACGGCTCCTTCAA
ATCCTCCGTCAGCCTCGGACAAGCTCTCTTACTCGAAAACCGTTCTTATAACAAACTCTA
CAAAGCTGCTCGTCCCCCACTTGTTTGCTCTTCCCCTTATCGTCCAAGCTCAGTCCAACT
CAACCAACCGAATGTTTGAGATTTGAGGAAACGCATGTGCTCAGAGATCAAGTGTTAAAT
TGAGCATGTTAATCTGACCAAGTTTGAGATGTGGAAACTCTTTGCTTTTGTTTTATCTTA
GGTTGTGATCTCAGTCCGTCTATGTAATCTCTTTTTATCTTTTTTGTCCCAAGACCTTTT
TATCCATCTCTTCGTTTGTCAGACTTGTTTCTATGACCACTATTATTTTATATTCTTATG
TTTAAGCTCTTGTGTTTTTGACATTGCCTCCTATTGTTTTCGTTGTCTATCTTGCGTTTA
TGCTCGTGTTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CN56TF U 1
AF RR2CN56JQ C 433
BS 1 658 RR2CN56TF
BS 659 659 RR2CN56JQ
BS 660 713 RR2CN56TF
BS 714 915 RR2CN56JQ

RD RR2CN56TF 715 0 0
GGAATAGAGAAGATTTACGAGTAAAACCCTAATTTTTGTACGATGAGCAATGTCGGTGAG
AAATTGGTTGGGGAGAAGAAAGAGGCAGCAGCGCAGCAGCCGCGACAGTTTCTGACGATG
AATGCGAAGCTCTACTCTCTGGAGAGGTTCCAAGAAGATTTTGCTGATGTCTCGGTAAAG
GAGGTAGATTTGCTCAACGAGTTGGAGGTATCCAAAGTATATCACTGCGACGGGTTGGTG
TTATGAATCTGGCTTTTTTGAGATTTGGGTTACACTTACTGTCGACCCCAACGGTGCGTC
CTGGAGCAAGTTTTTGCGAATGTAACCGGGGCCCTTCTGTAGCTACGGTTTTCAGCTCTA
TCCATCTTCTGGTGGGAGCTTCCTTGTTGATGAGGACAACAAACTTGCTGTCTTGTTTGA
ACTAGACGAAACCCAGACCACTCACAAGGCCTTTGTGTTTGGACAAGACGGCTCCTTCAA
ATCCTCCGTCAGCCTCGGACAAGCTCTCTTACTCGAAAACCGTTCTTATAACAAACTCTA
CAAAGCTGCTCGTCCCCCACTTGTTTGCTCTTCCCCTTATCGTCCAAGCTCAGTCCAACT
CAACCAACCGAATGTTTGAGATTTGAGGAAACGCATGTGCTCAGAGATCAAGTGTTAA*T
TGAGCATGTTAATCTGACCAAGTTTGAGATGTGGAAACTCTTTGCTTTTGTTT
AT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2CN56JQ 483 0 0
CCAGACCACTCACAAGGCCTTTGTGTTTGGACAAGACGGCTCCTTCAAATCCTCCGTCAG
CCTCGGACAAGCTTTCTTACTCGAAAACCGTTCTTATAACAAACTCTACAAAGCTGCTCG
TCCCCCACTTGTTTGCTCTTCCCCTTATCGTCCAAGCTCAGTCCAACTCAACCAACCGAA
TGTTTGAGATTTGAGGAAACGCATGTGCTCAGAGATCAAGTGTTAAATTGAGCATGTTAA
TCTGACCAAGTTTGAGATGTGGAAACTCTTTGCTTTTGTTTTATCTTAGGTTGTGATCTC
AGTCCGTCTATGTAATCTCTTTTTATCTTTTTTGTCCCAAGACCTTTTTATCCATCTCTT
CGTTTGTCAGACTTGTTTCTATGACCACTATTATTTTATATTCTTATGTTTAAGCTCTTG
TGTTTTTGACATTGCCTCCTATTGTTTTCGTTGTCTATCTTGCGTTTATGCTCGTGTTTA
ACC

QA 1 483 1 483
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4219Contig1 560 2 1 U
GGATAGATTCCCATTTCGGCACTTCCGCTTCACATCATCAGATCGGAGCCCCCCCCCACC
CCACACACACACACACAACAAGCGATGCCGCCGCCGACGCAGACCTTGACCGTCGCAGCG
AAGTCCCTACGAAACCGGATCTTCTCCAGATCCGGATCAACATCCGCCGGCGCGAGCCGA
TGGGCGACTCCTGGCCACGAGGAGCGTCCCAAGGGCTTCTTCATGAACCGAACTCCTCCC
CCGCCGGGGCAGTCGCGGAAATGGGAGGATTGGGAGCTTCCTTGCTACGTCACGAGCTTC
CTCACGATCGTCATCCTCGGCGTGGGGCTCAACGCGAAGCCTGATCTTTCCATCGAGACT
TGGGCGCATCAGAAAGCCCTGGAATGCCTCGAGACGGAGAGGCTCGCGTCGTCTTCTGCT
GGAGATTCTTCCGATTGAGAGAGCATTCGGATGTTTGAGAGAGCCTTCCTTTTGAAAGTT
TGAATCAGTGTGTCTTTTGTTTTTGTTGATAATGATGAAATAAAGTGTTCTTTTAAAAAC
TGTTTTTGACGAACTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D294TF U 1
AF RR2D294JQ C 142
BS 1 560 RR2D294TF

RD RR2D294TF 560 0 0
GGATAGATTCCCATTTCGGCACTTCCGCTTCACATCATCAGATCGGAGCCCCCCCCCACC
CCACACACACACACACAACAAGCGATGCCGCCGCCGACGCAGACCTTGACCGTCGCAGCG
AAGTCCCTACGAAACCGGATCTTCTCCAGATCCGGATCAACATCCGCCGGCGCGAGCCGA
TGGGCGACTCCTGGCCACGAGGAGCGTCCCAAGGGCTTCTTCATGAACCGAACTCCTCCC
CCGCCGGGGCAGTCGCGGAAATGGGAGGATTGGGAGCTTCCTTGCTACGTCACGAGCTTC
CTCACGATCGTCATCCTCGGCGTGGGGCTCAACGCGAAGCCTGATCTTTCCATCGAGACT
TGGGCGCATCAGAAAGCCCTGGAATGCCTCGAGACGGAGAGGCTCGCGTCGTCTTCTGCT
GGAGATTCTTCCGATTGAGAGAGCATTCGGATGTTTGAGAGAGCCTTCCTTTTGAAAGTT
TGAATCAGTGTGTCTTTTGTTTTTGTTGATAATGATGAAATAAAGTGTTCTTTTAAAAAC
TGTTTTTGACGAACTTTACC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2D294JQ 419 0 0
TTCTCCAGATCCGGATCAACATCCGCCGGCGCGAGCCGATGGGCGACTCCTGGCCACGAG
GAGCGTCCCAAGGGCTTCTTCATGAACCGAACTCCTCCCCCGCCGGGGCAGTCGCGGAAA
TGGGAGGATTGGGAGCTTCCTTGCTACGTCACGAGCTTCCTCACGATCGTCATCCTCGGC
GTGGGGCTCAACGCGAAGCCTGATCTTTCCATCGAGACTTGGGCGCATCAGAAAGCCCTG
GAATGCCTCGAGACGGAGAGGCTCGCGTCGTCTTCTGCTGGAGATTCTTCCGATTGAGAG
AGCATTCGGATGTTTGAGAGAGCCTTCCTTTTGAAAGTTTGAATCAGTGTGTCTTTTGTT
TTTGTTGATAATGATGAAATAAAGTGTTCTTTTAAAAACTGTTTTTGACGAACTTTACC

QA 1 419 1 419
DS 



AS 1 2

CO CL4220Contig1 1368 2 4 U
CTGGAGCGAATGTCCGAACCCCTGATGCATTTCAACATTGACCTTAAGCTGCAACGCTTT
GATAGTGCTCTCAAGAACATCGTGTCATCAGGGGATGACTACTTTCCTGATTGCATGAAC
TTGATGAAGAAAAACCCTCAGCTTTTCCCGCTAGGTCTTCAGCCAATTACCGATACTGAA
AAGAAACAAGCAGTGCTGGAGGCTTGGGCAGATCATCTCACTGATGAAAAACGTTTTGAG
GATGCTGCTACTACCTACCTATGTTGCTATAACTTGGAAAAGGCTTCAAAGGCGTATCGT
GAGTGGTGATTGGAGTGGGGTACTCAGAGTGGGGGCTCTAATGAAGTTAGGTAAAGATGA
GATCTTGAAACTGGCATACGAACTCTGTGAATAAGTCAATGCTCTTGGGAAACCAGGGGA
AGCAGCGAAGATAGCTCTAGAGTATTGTGGAGATATAAGCGGTTGAGTTAATTTGCTTAT
CAATGCAAGGGAGTGGGAAGAAGCTTTAAGGGTTGCCTTTCTGCATACAGAAGATGGTTT
AGTCTCAGTGGTGAAGAGTTCTGCTCTTGAGTGTGCTAGTGGTCTAGTAAGCTAATTCAA
AGAATCGATAGAGAAAGTATGAAAATATTTGACTAGGTATCTAGCTGTTCGTCAGAGACG
ATTGCTGCTTGCAGCAAAGCTCAAGTCTGAGGAACGGTCAGTCATTGATCTTGACGATGA
CACAGCTTCAGAAGCAAGTAGCAACCTGAGTGGAATGAGCGCCTATACTTTGGGGACAAG
GAGAGGTTCTGCTGCTTCAGTCACCTCAAGCACGGCTACCAAGGCAAGAGACTTGAGGCG
CCAGAGAAAGAGCGGGAAGATCCGTGCTGGCAGTGCGGGTGAGGAGATGGCGCTTGTTGA
TCATTTGAAGGGTATGCGTATGACAGAAGGAGGAAAGAGAGAGCTGAAGTCTTTATTGAT
ATGTCTGGTAACACTTGGTGAGAAGGAGTCTGCACAGAAGTTGCAACAGACTGCAGAGAA
TTTCCTGGTCGCTCAAGTAGCAGCAGTAGAGCTAGCAGACGATACAGTGTCCAGCGAGAG
CGTTGATGAAGAAGTGTATTCCTTTGAACGTTACGTTCAGAAGACGAGATCCACGGCACG
AGGCTTTGATGCCTTTAGCTGGATGCTAAAGGTGTTCGTTAGCCCATGAAAAATCTTTTA
GATCTTGTTCTTGACTGAATAAGCAGTAGCATATCAACAAGCTTGTGCGTTTTAAACATC
AAAACTTTCCTGCTACATTTTGTCCTCTTTGTTTTGGATCTTCGTTGTTGTTATTGCCGT
TTTACACTAGAGAGATTTAAGTTGCATCTACCACATTTTCTTTTGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H895TF U 1
AF RR2H895JQ C 624
BS 1 693 RR2H895TF
BS 694 694 RR2H895JQ
BS 695 728 RR2H895TF
BS 729 1368 RR2H895JQ

RD RR2H895TF 728 0 0
CTGGAGCGAATGTCCGAACCCCTGATGCATTTCAACATTGACCTTAAGCTGCAACGCTTT
GATAGTGCTCTCAAGAACATCGTGTCATCAGGGGATGACTACTTTCCTGATTGCATGAAC
TTGATGAAGAAAAACCCTCAGCTTTTCCCGCTAGGTCTTCAGCCAATTACCGATACTGAA
AAGAAACAAGCAGTGCTGGAGGCTTGGGCAGATCATCTCACTGATGAAAAACGTTTTGAG
GATGCTGCTACTACCTACCTATGTTGCTATAACTTGGAAAAGGCTTCAAAGGCGTATCGT
GAGTGGTGATTGGAGTGGGGTACTCAGAGTGGGGGCTCTAATGAAGTTAGGTAAAGATGA
GATCTTGAAACTGGCATACGAACTCTGTGAATAAGTCAATGCTCTTGGGAAACCAGGGGA
AGCAGCGAAGATAGCTCTAGAGTATTGTGGAGATATAAGCGGTTGAGTTAATTTGCTTAT
CAATGCAAGGGAGTGGGAAGAAGCTTTAAGGGTTGCCTTTCTGCATACAGAAGATGGTTT
AGTCTCAGTGGTGAAGAGTTCTGCTCTTGAGTGTGCTAGTGGTCTAGTAAGCTAATTCAA
AGAATCGATAGAGAAAGTATGAAAATATTTGACTAGGTATCTAGCTGTTCGTCAGAGACG
ATTGCTGCTTGCAGCAAAGCTCAAGTCTGAGGA*CGGTCAGTCATTGATCTTGACGATGA
CACAGCTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2H895JQ 745 0 0
AATATTTGACTAGGTATCTAGCTGTTCGTCAGAGACGATTGCTGCTTGCAGCAAAGCTCA
AGTCTGAGGAACGGTCAGTCATTGATCTTGACGATGACACAGCTTCAGAAGCAAGTAGCA
ACCTGAGTGGAATGAGCGCCTATACTTTGGGGACAAGGAGAGGTTCTGCTGCTTCAGTCA
CCTCAAGCACGGCTACCAAGGCAAGAGACTTGAGGCGCCAGAGAAAGAGCGGGAAGATCC
GTGCTGGCAGTGCGGGTGAGGAGATGGCGCTTGTTGATCATTTGAAGGGTATGCGTATGA
CAGAAGGAGGAAAGAGAGAGCTGAAGTCTTTATTGATATGTCTGGTAACACTTGGTGAGA
AGGAGTCTGCACAGAAGTTGCAACAGACTGCAGAGAATTTCCTGGTCGCTCAAGTAGCAG
CAGTAGAGCTAGCAGACGATACAGTGTCCAGCGAGAGCGTTGATGAAGAAGTGTATTCCT
TTGAACGTTACGTTCAGAAGACGAGATCCACGGCACGAGGCTTTGATGCCTTTAGCTGGA
TGCTAAAGGTGTTCGTTAGCCCATGAAAAATCTTTTAGATCTTGTTCTTGACTGAATAAG
CAGTAGCATATCAACAAGCTTGTGCGTTTTAAACATCAAAACTTTCCTGCTACATTTTGT
CCTCTTTGTTTTGGATCTTCGTTGTTGTTATTGCCGTTTTACACTAGAGAGATTTAAGTT
GCATCTACCACATTTTCTTTTGTGG

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL4221Contig1 517 2 1 U
TTTTTTCTAACCAATTACCTTTTTCCAAACGAGCTAGTTAACTTCTAACCAATTATATAA
CTTAGTTATAGTGTATTGGCTTTGAACAAAAAAAAAAGTTATAGGGTATTGGCGGGAATT
AACCTCATCCACACATCTTTATCCTACATCAATGGCCCAGATTAATTATGCATTTGTGAC
AAGACATATATCTGTTTCTTTTTTTCAACCATTGGATTTTCTGCTGTACTTTATTCTCAG
ATTTTTTTTGTTTGATTAAGCACATCTCTATTATTTCTTTTTGTTTTTTTTAAAGTTCTT
CTGGAAAAAATCATATTTTTAGATTACTACTACTAAAAAAAAAATTTGTTCACTTATACC
TAATTAACCTAATCGTTTTACCATAATTTAACGTGCTCTCTTATCACCCACATATTCCCA
TGGTCGACCATTGCATGATTATCCCCGGAGAATGGACCACCATCAGCTCTCTATGGGAGT
TTGTAAGCGACTATTTTATGTACGTTATTTCAGGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GU68TF U 1
AF RR2GU68JQB C 164
BS 1 517 RR2GU68TF

RD RR2GU68TF 517 0 0
TTTTTTCTAACCAATTACCTTTTTCCAAACGAGCTAGTTAACTTCTAACCAATTATATAA
CTTAGTTATAGTGTATTGGCTTTGAACAAAAAAAAAAGTTATAGGGTATTGGCGGGAATT
AACCTCATCCACACATCTTTATCCTACATCAATGGCCCAGATTAATTATGCATTTGTGAC
AAGACATATATCTGTTTCTTTTTTTCAACCATTGGATTTTCTGCTGTACTTTATTCTCAG
ATTTTTTTTGTTTGATTAAGCACATCTCTATTATTTCTTTTTGTTTTTTTTAAAGTTCTT
CTGGAAAAAATCATATTTTTAGATTACTACTACTAAAAAAAAAATTTGTTCACTTATACC
TAATTAACCTAATCGTTTTACCATAATTTAACGTGCTCTCTTATCACCCACATATTCCCA
TGGTCGACCATTGCATGATTATCCCCGGAGAATGGACCACCATCAGCTCTCTATGGGAGT
TTGTAAGCGACTATTTTATGTACGTTATTTCAGGTAC

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2GU68JQB 354 0 0
AATTATGCATTTGTGACAAGACATATATCTGTTTCTTTTTTTCAACCATTGGATTTTCTG
CTGTACTTTATTCTCAGATTTTTTTTGTTTGATTAAGCACATCTCTATTATTTCTTTTTG
TTTTTTTTAAAGTTCTTCTGGAAAAAATCATATTTTTAGATTACTACTACTAAAAAAAAA
ATTTGTTCACTTATACCTAATTAACCTAATCGTTTTACCATAATTTAACGTGCTCTCTTA
TCACCCACATATTCCCATGGTCGACCATTGCATGATTATCCCCGGAGAATGGACCACCAT
CAGCTCTCTATGGGAGTTTGTAAGCGACTATTTTATGTACGTTATTTCAGGTAC

QA 1 354 1 354
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4223Contig1 1041 2 6 U
TTTTTCCTTTTAATTTTATCACAGCCATGGTGATCGTCCCCAACATCTCCCCTTCTTCCC
ACCAAATCTCCCCTTCCTTCTTCCATCTCCGCCTCCGCATTCCCACCACGTCCCCTGCTT
CCTCTCGCCTAAACAACGGAGACGGAGGGGGAGGAGGAGGAATCACCTTGTCGTCGACGA
TCCGAGCTTACATAGAGAAACCAAACTCCATCTCAAGCTTCGCCAACACTGTCATCGGCT
CTCTACCCGTCATCGGACTCCTCGCCAGGATCCTCAGCGATGAAGGCGGCGTCGGGAGAG
ATCTCGTCGACTTTCGAGTTTAGGAAACGAGTCGGGAATAAATGCGCACCTAGTGATTCT
AGAGCTTTCTACGAGTTCCAACAGCGAAGAGGCAAGGCAGGAGAACCTTTGTATGTGCTT
CTTTGCTGTTGGGTTGCTGCAGTAGGCGCAGGGCTTCTCAAATCTGAAGAGATCCTCGAA
GGTGTTACTAGGGTTAGCATTTCAAATGATCTCGAGTTCGAAGAACAGAACTTCATTGCT
TTAATGACTGAAGCTAGACAGAGGAGGTCAAAGTTGAACGTTTCAGCGCCAACGATCCCG
ATGGAGCTAAGAGTCGAAAAGGCTCTTGAAGGTATATATGCCTGTTGCTTCAGGGGAGGA
GTTATAGAGGAGGAAGATGAGAAGCTTCTTCTGGTGATGCTGACCGCTGTTTTCCCATCG
GTGGAGAAGTCTGAGATAGAGAGGATCATCAAAGAGAAGGCGGTTAGAGTAGCTGAAGGT
GGAGAAGAACAGAGTCTCATGGCTGAGCCGAAAAGGCTGCCTAAAGAAGCTATTCAGATG
CAAATGAAAGATCTTGAGTTCCTTCAACAACAAAACATAGAATCTTAACAATGGCCATGT
TTCAAGTATATCAATGTTTTGTTACTTTACTAAAAGTTAAGCAGTTCATAGTCTCTAGGA
GGGGAACTTGTTTGTGTAGTAGTTTTGTAGAGAAAGAAAAAAAGAGAGTAACCTTTACAG
TTAAGAACATGTTTCCATCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ92TF U 1
AF RR2GZ92JQ C 294
BS 1 621 RR2GZ92TF
BS 622 622 RR2GZ92JQ
BS 623 631 RR2GZ92TF
BS 632 632 RR2GZ92JQ
BS 633 649 RR2GZ92TF
BS 650 1041 RR2GZ92JQ

RD RR2GZ92TF 649 0 0
TTTTTCCTTTTAATTTTATCACAGCCATGGTGATCGTCCCCAACATCTCCCCTTCTTCCC
ACCAAATCTCCCCTTCCTTCTTCCATCTCCGCCTCCGCATTCCCACCACGTCCCCTGCTT
CCTCTCGCCTAAACAACGGAGACGGAGGGGGAGGAGGAGGAATCACCTTGTCGTCGACGA
TCCGAGCTTACATAGAGAAACCAAACTCCATCTCAAGCTTCGCCAACACTGTCATCGGCT
CTCTACCCGTCATCGGACTCCTCGCCAGGATCCTCAGCGATGAAGGCGGCGTCGGGAGAG
ATCTCGTCGACTTTCGAGTTTAGGAAACGAGTCGGGAATAAATGCGCACCTAGTGATTCT
AGAGCTTTCTACGAGTTCCAACAGCGAAGAGGCAAGGCAGGAGAACCTTTGTATGTGCTT
CTTTGCTGTTGGGTTGCTGCAGTAGGCGCAGGGCTTCTCAAATCTGAAGAGATCCTCGAA
GGTGTTACTAGGGTTAGCATTTCAAATGATCTCGAGTTCGAAGAACAGAACTTCATTGCT
TTAATGACTGAAGCTAGACAGAGGAGGTCAAAGTTGAACGTTTCAGCGCCAACGATCCCG
ATGGAGCTAAGAGTCGAAAAG*CTCTTGAAG*TATATATGCCTGTTGCT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2GZ92JQ 748 0 0
GGGAGAGATCTCGTCGACTTTCGAGTTTAGGAAACGAGTCGGGAATAAATGCGCACCTAG
TGATTCTAGAGCTTTCTACGAGTTCCAACAGCGAAGAGGCAAGGCAGGAGAACCTTTGTA
TGTGCTTCTTTGCTGTTGGGTTGCTGCAGTAGGCGCAGGGCTTCTCAAATCTGAAGAGAT
CCTCGAAGGTGTTACTAGGGTTAGCATTTCAAATGATCTCGAGTTCGAAGAACAGAACTT
CATTGCTTTAATGACTGAAGCTAGACAGAGGAGGTCAAAGTTGAACGTTTCAGCGCCAAC
GATCCCGATGGAGCTAAGAGTCGAAAAGGCTCTTGAAGGTATATATGCCTGTTGCTTCAG
GGGAGGAGTTATAGAGGAGGAAGATGAGAAGCTTCTTCTGGTGATGCTGACCGCTGTTTT
CCCATCGGTGGAGAAGTCTGAGATAGAGAGGATCATCAAAGAGAAGGCGGTTAGAGTAGC
TGAAGGTGGAGAAGAACAGAGTCTCATGGCTGAGCCGAAAAGGCTGCCTAAAGAAGCTAT
TCAGATGCAAATGAAAGATCTTGAGTTCCTTCAACAACAAAACATAGAATCTTAACAATG
GCCATGTTTCAAGTATATCAATGTTTTGTTACTTTACTAAAAGTTAAGCAGTTCATAGTC
TCTAGGAGGGGAACTTGTTTGTGTAGTAGTTTTGTAGAGAAAGAAAAAAAGAGAGTAACC
TTTACAGTTAAGAACATGTTTCCATCAG

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL4224Contig1 1036 2 2 U
GGAAGCTTTTCTCTCACAAAGAGGACGAACAAAAAATGTATGCAGATTCAGGGTTAATGC
CCCGCTACATGCAAACTTGTTCTCCAGATATTCACCAATTTGAAGACCTCTTCAAATCAT
ACAAGCTCTCAGAGGATGAAATGATAAATGGTTTTGCTCAGCGATCAAACCTACCTGAGT
ATGATATTGGAGAAGAAGGGGATCTATTCAACGCTCCTGATTCAATTCTTGAAGAGCCAA
TCTTAACCGTTGATCCGCTCTCAGCTGCCTTAACGATGATCTCTTGCGGGGAAGACTCTT
CCCAAGGGCTTTGTGATCTTCCTGACCTCGATCTCGGGTCGTTTCAGAGTGATCAGCAGC
TTCTTGACAATGCCTTTTATGAATGCGAGCAAGATCTCATGATGAAATCAGCTACGATGG
AGTCTCCACTATCTGAAGTTTTGGACGTCAAGAACACCTCTGTCGTGACAACGGGGATCA
ACGAGAGCCAGGATATGCAGAAGAGCGTAAGCTCGGGGAACCTGAGCTCTGTGGATTGGT
CACATGCACAGCAAGAGGCTGTTGTGGTTCAGAACTTCCCTGATTTTTCTCAGTTGGATT
TTGGTTCTGATTATGGGATGCGACGAGCCTTTAGTGAAAGCGACATACAGAAACTAGGGA
CTGGTCATTTTCAGTCTCCGTTGGATATGATTATTGTGAGCTGTACTTCAGAGGATCGAC
GTGAGAAGCTTTCTCGATACAGGAACAAGAAGAGCAGGCGAAATTTCGGGCGTAAAATCA
AGTATGCTTGTAGGAAAGCTCTAGCAGATAACCAACCGAGGATCCGAGGAAGGTTTGCGA
AAACAGAGGAACGGAAATAGAATGGTTTCAAATGAATGGGGCTGAGTAAAATGAAGAACT
TGAAAACATAAGGAGATAAAGCCTATCGCATCGAAACTAGTTTTGTTTAATATATGTATA
GAATTAAAATGTTATAAGCCTTTAGTTAGTGCTTTTTTGTGTATAAAAATGGTTTATCTG
AATAAGCTTTTTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU56TF U 1
AF RR2CU56JQ C 331
BS 1 738 RR2CU56TF
BS 739 1036 RR2CU56JQ

RD RR2CU56TF 738 0 0
GGAAGCTTTTCTCTCACAAAGAGGACGAACAAAAAATGTATGCAGATTCAGGGTTAATGC
CCCGCTACATGCAAACTTGTTCTCCAGATATTCACCAATTTGAAGACCTCTTCAAATCAT
ACAAGCTCTCAGAGGATGAAATGATAAATGGTTTTGCTCAGCGATCAAACCTACCTGAGT
ATGATATTGGAGAAGAAGGGGATCTATTCAACGCTCCTGATTCAATTCTTGAAGAGCCAA
TCTTAACCGTTGATCCGCTCTCAGCTGCCTTAACGATGATCTCTTGCGGGGAAGACTCTT
CCCAAGGGCTTTGTGATCTTCCTGACCTCGATCTCGGGTCGTTTCAGAGTGATCAGCAGC
TTCTTGACAATGCCTTTTATGAATGCGAGCAAGATCTCATGATGAAATCAGCTACGATGG
AGTCTCCACTATCTGAAGTTTTGGACGTCAAGAACACCTCTGTCGTGACAACGGGGATCA
ACGAGAGCCAGGATATGCAGAAGAGCGTAAGCTCGGGGAACCTGAGCTCTGTGGATTGGT
CACATGCACAGCAAGAGGCTGTTGTGGTTCAGAACTTCCCTGATTTTTCTCAGTTGGATT
TTGGTTCTGATTATGGGATGCGACGAGCCTTTAGTGAAAGCGACATACAGAAACTAGGGA
CTGGTCATTTTCAGTCTCCGTTGGATATGATTATTGTGAGCTGTACTTCAGAGGATCGAC
GTGAGAAGCTTTCTCGAT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2CU56JQ 706 0 0
ATCTCGGGTCGTTTCAGAGTGATCAGCAGCTTCTTGACAATGCCTTTTATGAATGCGAGC
AAGATCTCATGATGAAATCAGCTACGATGGAGTCTCCACTATCTGAAGTTTTGGACGTCA
AGAACACCTCTGTCGTGACAACGGGGATCAACGAGAGCCAGGATATGCAGAAGAGCGTAA
GCTCGGGGAACCTGAGCTCTGTGGATTGGTCACATGCACAGCAAGAGGCTGTTGTGGTTC
AGAACTTCCCTGATTTTTCTCAGTTGGATTTTGGTTCTGATTATGGGATGCGACGAGCCT
TTAGTGAAAGCGACATACAGAAACTAGGGACTGGTCATTTTCAGTCTCCGTTGGATATGA
TTATTGTGAGCTGTACTTCAGAGGATCGACGTGAGAAGCTTTCTCGATACAGGAACAAGA
AGAGCAGGCGAAATTTCGGGCGTAAAATCAAGTATGCTTGTAGGAAAGCTCTAGCAGATA
ACCAACCGAGGATCCGAGGAAGGTTTGCGAAAACAGAGGAACGGAAATAGAATGGTTTCA
AATGAATGGGGCTGAGTAAAATGAAGAACTTGAAAACATAAGGAGATAAAGCCTATCGCA
TCGAAACTAGTTTTGTTTAATATATGTATAGAATTAAAATGTTATAAGCCTTTAGTTAGT
GCTTTTTTGTGTATAAAAATGGTTTATCTGAATAAGCTTTTTATTG

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL4225Contig1 1133 2 2 U
GACCGAAGAGCTTGTTGCAAAGAAGGTGAAAAGCTTCTGCCAGGAACATCTACCGAGATT
CTCGAAAAGGGTTGACCTGAACACCTTCGATGTCTCTGCTTCTAGCTCACAAGGGGTTCC
TAAAGTTATGCTTTTGTCGACAAAGAAAGACACTCCTGTCATCTGGCGTGTTCTTAGTGG
CTTGTACAATGGACGCTTTGTCTTCTATAACACAGAGGTTCATGATACTTCTGATACGAA
GGTTAGGAGCCTAGGTGTTGACGCATTTCCAGCGATAGTTGGCCGGTTATCGAATGGGGA
GAAGCAGGTCTTGAAGACAGGGATCACTGTGAAAAATCTGAAATCAGCGGTCCAGGAGAT
TGGTAAATTGCTAGAAGCATTTGAGAAGAAGAACAAAAAGGCGTCTTCCAATAGTCAGTC
AGGCAAAGCACAGATCGAGCCCGTAGAAAAGATACATCTTCTCTCGAGAACAAATTTTGA
TTCCATTTGTGGAGAGAACATTCCTGTTTGCATCATTGGTGCTTTCAGATCTTCACAGGG
TAAAGAGAAGCTGCACTCAGTATTGTCTAGGGTGTCACAGAAGTCTTTGTCTAGACGACA
AGCTTCAGGAACTGGCTCTCAGGACACAGTATCCTATTCTCTCGTGGACGCGGCAAAGCA
GTCATCGTTCTTGAGCTCGTTTGACAAATCAGAGTTCAAAACATCTGATCAGCTCCTAAT
AGCATACAAGCCCAAACGAGGCAAGTTTGCTACTTTTAAAGGGGACATGACAATGGAAGA
AGCTGAGAAATTCGTAGCGGCTGTTCTGAACGGAGACATACAGTTCACAAAGACAAGACA
GAAACCTCAGGTCAAATGATAGTTTTGTTTCGTCAGGGATTAGTTTCACTTCCTTCTTAA
CTTTTTCATGAAGTCCTGTGTTGCAAGCTACTTGTGGTGGTTCTTTGTAATTGGAGAGGG
GAAGTATGTGTATTGTCTTGTGTCAGAGAGACGGTGAAATAGTCTTATAGGAATAGATTT
TACATAAACATGGAACTAAAAAAGGTTAATTTGTAATTATTATGACTGTAATCACTCTGG
AGCATTGTGCTTTAAAAGAGTAAAATGATGGTTGTTGGTTGAGGCCATTGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO46TF U 1
AF RR2AO46JQ C 263
BS 1 618 RR2AO46TF
BS 619 1133 RR2AO46JQ

RD RR2AO46TF 618 0 0
GACCGAAGAGCTTGTTGCAAAGAAGGTGAAAAGCTTCTGCCAGGAACATCTACCGAGATT
CTCGAAAAGGGTTGACCTGAACACCTTCGATGTCTCTGCTTCTAGCTCACAAGGGGTTCC
TAAAGTTATGCTTTTGTCGACAAAGAAAGACACTCCTGTCATCTGGCGTGTTCTTAGTGG
CTTGTACAATGGACGCTTTGTCTTCTATAACACAGAGGTTCATGATACTTCTGATACGAA
GGTTAGGAGCCTAGGTGTTGACGCATTTCCAGCGATAGTTGGCCGGTTATCGAATGGGGA
GAAGCAGGTCTTGAAGACAGGGATCACTGTGAAAAATCTGAAATCAGCGGTCCAGGAGAT
TGGTAAATTGCTAGAAGCATTTGAGAAGAAGAACAAAAAGGCGTCTTCCAATAGTCAGTC
AGGCAAAGCACAGATCGAGCCCGTAGAAAAGATACATCTTCTCTCGAGAACAAATTTTGA
TTCCATTTGTGGAGAGAACATTCCTGTTTGCATCATTGGTGCTTTCAGATCTTCACAGGG
TAAAGAGAAGCTGCACTCAGTATTGTCTAGGGTGTCACAGAAGTCTTTGTCTAGACGACA
AGCTTCAGGAACTGGCTC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2AO46JQ 871 0 0
GCATTTCCAGCGATAGTTGGCCGGTTATCGAATGGGGAGAAGCAGGTCTTGAAGACAGGG
ATCACTGTGAAAAATCTGAAATCAGCGGTCCAGGAGATTGGTAAATTGCTAGAAGCATTT
GAGAAGAAGAACAAAAAGGCGTCTTCCAATAGTCAGTCAGGCAAAGCACAGATCGAGCCC
GTAGAAAAGATACATCTTCTCTCGAGAACAAATTTTGATTCCATTTGTGGAGAGAACATT
CCTGTTTGCATCATTGGTGCTTTCAGATCTTCACAGGGTAAAGAGAAGCTGCACTCAGTA
TTGTCTAGGGTGTCACAGAAGTCTTTGTCTAGACGACAAGCTTCAGGAACTGGCTCTCAG
GACACAGTATCCTATTCTCTCGTGGACGCGGCAAAGCAGTCATCGTTCTTGAGCTCGTTT
GACAAATCAGAGTTCAAAACATCTGATCAGCTCCTAATAGCATACAAGCCCAAACGAGGC
AAGTTTGCTACTTTTAAAGGGGACATGACAATGGAAGAAGCTGAGAAATTCGTAGCGGCT
GTTCTGAACGGAGACATACAGTTCACAAAGACAAGACAGAAACCTCAGGTCAAATGATAG
TTTTGTTTCGTCAGGGATTAGTTTCACTTCCTTCTTAACTTTTTCATGAAGTCCTGTGTT
GCAAGCTACTTGTGGTGGTTCTTTGTAATTGGAGAGGGGAAGTATGTGTATTGTCTTGTG
TCAGAGAGACGGTGAAATAGTCTTATAGGAATAGATTTTACATAAACATGGAACTAAAAA
AGGTTAATTTGTAATTATTATGACTGTAATCACTCTGGAGCATTGTGCTTTAAAAGAGTA
AAATGATGGTTGTTGGTTGAGGCCATTGGCG

QA 1 871 1 871
DS 



AS 1 2

CO CL4226Contig1 865 2 2 U
CAGCGTCTGTGCCGGTCCAAATCTTTCGTGCTCTTTCTTATTTGCCTAGTTGTAATTCGG
TTTGTGACTGTGATTCATTTTTCTAAGGAGATATGCCTTTTCCTAATCTTCTGAAAATTC
CAGATCTGATGTAGATTCTTTTCATAAAAGTTCCGGATCTATTGATTTGCGGTGTGGATT
TTCGTCCAAAGCTTTTATCTTTGATTCTCTTTTTAGATCTGTTGAGTTTTATCTTTTATG
CATATCTCCTAGGCTACTTGTGTGGTTCTCTCAGATTCAGAGGTTGTCTAAATGCGAAGA
GTTCGCTGTGGGTTCCGTCTAAGCCGTATCTTTGCCATGCCGTTTGTGGCCTATGTTCAT
TGTTCTCTGGTTTGGGTGGGCTTCGCTCCTAGTAGATTGAGCAGATTTCGTGGAGATCTG
TGTGTGTGGTGGCTTCATATCTTAGCATTTAAGCAGTCGTTTTCGACTCAGCCGTATCCG
AAGTGTGACAGAATCTTTGAGTGATTCTTCCTTGCCGGTCTGTGAAGCTTTGGTTACTTG
TTTACTGAGGTGTATCCTCGTTGTTCTAGGAGGAAGTGGTTGTACGGTGGTTTGGCCGCG
GGCATTCACGTCAAGCAGCTTTCATAGGCTCTCTATCCTTTAGGTTTCTCTGCTCTCTTG
AGATGTGGCTTCTAGTGGTTTGGGATCTAGTTACTTAGTTTAAAGTTTGATTGTAAAAGT
TTGCCTTTTATTCTGTTTTGGCTTTTGCCTCCCCTTTGTGGGCTTAAGGTTCCGGAAACA
TCATGTCGTTTGCCGGTTTAGCTAACCCCGAACATACCTTCGTTCATTGGTCTTGTGTCA
ATCCCCTATCTATAATATAATCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C817TF U 1
AF RR2C817JQ C 140
BS 1 564 RR2C817TF
BS 565 865 RR2C817JQ

RD RR2C817TF 564 0 0
CAGCGTCTGTGCCGGTCCAAATCTTTCGTGCTCTTTCTTATTTGCCTAGTTGTAATTCGG
TTTGTGACTGTGATTCATTTTTCTAAGGAGATATGCCTTTTCCTAATCTTCTGAAAATTC
CAGATCTGATGTAGATTCTTTTCATAAAAGTTCCGGATCTATTGATTTGCGGTGTGGATT
TTCGTCCAAAGCTTTTATCTTTGATTCTCTTTTTAGATCTGTTGAGTTTTATCTTTTATG
CATATCTCCTAGGCTACTTGTGTGGTTCTCTCAGATTCAGAGGTTGTCTAAATGCGAAGA
GTTCGCTGTGGGTTCCGTCTAAGCCGTATCTTTGCCATGCCGTTTGTGGCCTATGTTCAT
TGTTCTCTGGTTTGGGTGGGCTTCGCTCCTAGTAGATTGAGCAGATTTCGTGGAGATCTG
TGTGTGTGGTGGCTTCATATCTTAGCATTTAAGCAGTCGTTTTCGACTCAGCCGTATCCG
AAGTGTGACAGAATCTTTGAGTGATTCTTCCTTGCCGGTCTGTGAAGCTTTGGTTACTTG
TTTACTGAGGTGTATCCTCGTTGT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2C817JQ 726 0 0
TTTCATAAAAGTTCCGGATCTATTGATTTGCGGTGTGGATTTTCGTCCAAAGCTTTTATC
TTTGATTCTCTTTTTAGATCTGTTGAGTTTTATCTTTTATGCATATCTCCTAGGCTACTT
GTGTGGTTCTCTCAGATTCAGAGGTTGTCTAAATGCGAAGAGTTCGCTGTGGGTTCCGTT
TAAGCCGTATCTTTGCCATGCCGTTTGTGGCCTATGTTCATTGTTCTCTGGTTTGGGTGG
GCTTCGCTCCTAGTAGATTGAGCAGATTTCGTGGAGATCTGTGTGTGTGGTGGCTTCATA
TCTTAGCATTTAAGCAGTCGTTTTCGACTCAGCCGTATCCGAAGTGTGACAGAATCTTTG
AGTGATTCTTCCTTGCCGGTCTGTGAAGCTTTGGTTACTTGTTTACTGAGGTGTATCCTC
GTTGTTCTAGGAGGAAGTGGTTGTACGGTGGTTTGGCCGCGGGCATTCACGTCAAGCAGC
TTTCATAGGCTCTCTATCCTTTAGGTTTCTCTGCTCTCTTGAGATGTGGCTTCTAGTGGT
TTGGGATCTAGTTACTTAGTTTAAAGTTTGATTGTAAAAGTTTGCCTTTTATTCTGTTTT
GGCTTTTGCCTCCCCTTTGTGGGCTTAAGGTTCCGGAAACATCATGTCGTTTGCCGGTTT
AGCTAACCCCGAACATACCTTCGTTCATTGGTCTTGTGTCAATCCCCTATCTATAATATA
ATCAGT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4228Contig1 742 2 2 U
GGGAGAAGACTGTAGTGTTGCTTAGTCGTCGGAGCAACGCACAAGACATAGTACCGACGT
GTGCTTCAGATTTACAATGACCCCTCTTCCTCCTTCATCGGTTCCCTCTCCTACTCCATT
TCAACAAATCCTTAATCTCTGATATTACACCCACACACACACACACACAAGAAGAGACAG
TCAGCGACTCTGATCGCGTAAAGGCAGAGCCTTTTTTATATACCCAAGTTAGCAACTTTC
CTCAACCTGCGATCTCTGAATCTCTCTCTCTCCTTTTTCTGAGAGTTCACAGTTCTGTCT
TATATTACATTGATGGGTTGCTCCTGGTTCTCTTGCCACAAGAGTGGAGGAGAACCTTCA
GAAGTTCATAGAGAACTTTCAGTGTCAGGCAAGGTAAAGATTTACAAATACAAAGAGCTT
CGTCAGGCGACCAATGATTTCGATGCCCTGAATAAAATTGGAGAAGGAGGGTTTGGTTCT
GTGTACAAGGGCCGTCTTAAAGATGGAAAGATTGCAGCTATCAAAGTCCTTTCCGCTGAG
TCAAGACAAGGCGTGAAAGAGTTCTTGACCGAGATCAACGTCATATCAGAAATACAGCAT
GAGAATTTGGTTAAGTTATATGGATGCTGCGTTGAAGGGAGTCACAGGATTCTCGTTTAC
AACTATATGGAGAACATGAGCCTCGACATGACGCTTCTTGCTGGGGGATACATTAAGAGT
GGGATACAGTTTGACTGGAGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2GB09TF U 1
AF RR2GE20TF U 1
BS 1 740 RR2GB09TF
BS 741 742 RR2GE20TF

RD RR2GB09TF 740 0 0
GGGAGAAGACTGTAGTGTTGCTTAGTCGTCGGAGCAACGCACAAGACATAGTACCGACGT
GTGCTTCAGATTTACAATGACCCCTCTTCCTCCTTCATCGGTTCCCTCTCCTACTCCATT
TCAACAAATCCTTAATCTCTGATATTACACCCACACACACACACACACAAGAAGAGACAG
TCAGCGACTCTGATCGCGTAAAGGCAGAGCCTTTTTTATATACCCAAGTTAGCAACTTTC
CTCAACCTGCGATCTCTGAATCTCTCTCTCTCCTTTTTCTGAGAGTTCACAGTTCTGTCT
TATATTACATTGATGGGTTGCTCCTGGTTCTCTTGCCACAAGAGTGGAGGAGAACCTTCA
GAAGTTCATAGAGAACTTTCAGTGTCAGGCAAGGTAAAGATTTACAAATACAAAGAGCTT
CGTCAGGCGACCAATGATTTCGATGCCCTGAATAAAATTGGAGAAGGAGGGTTTGGTTCT
GTGTACAAGGGCCGTCTTAAAGATGGAAAGATTGCAGCTATCAAAGTCCTTTCCGCTGAG
TCAAGACAAGGCGTGAAAGAGTTCTTGACCGAGATCAACGTCATATCAGAAATACAGCAT
GAGAATTTGGTTAAGTTATATGGATGCTGCGTTGAAGGGAGTCACAGGATTCTCGTTTAC
AACTATATGGAGAACATGAGCCTCGACATGACGCTTCTTGCTGGGGGATACATTAAGAGT
GGGATACAGTTTGACTGGAG

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2GE20TF 742 0 0
GGGAGAAGACTGTAGTGTTGCTTAGTCGTCGGAGCAACGCACAAGACATAGTACCGACGT
GTGCTTCAGATTTACAATGACCCCTCTTCCTCCTTCATCGGTTCCCTCTCCTACTCCATT
TCAACAAATCCTTAATCTCTGATATTACACCCACACACACACACACACAAGAAGAGACAG
TCAGCGACTCTGATCGCGTAAAGGCAGAGCCTTTTTTATATACCCAAGTTAGCAACTTTC
CTCAACCTGCGATCTCTGAATCTCTCTCTCTCCTTTTTCTGAGAGTTCACAGTTCTGTCT
TATATTACATTGATGGGTTGCTCCTGGTTCTCTTGCCACAAGAGTGGAGGAGAACCTTCA
GAAGTTCATAGAGAACTTTCAGTGTCAGGCAAGGTAAAGATTTACAAATACAAAGAGCTT
CGTCAGGCGACCAATGATTTCGATGCCCTGAATAAAATTGGAGAAGGAGGGTTTGGTTCT
GTGTACAAGGGCCGTCTTAAAGATGGAAAGATTGCAGCTATCAAAGTCCTTTCCGCTGAG
TCAAGACAAGGCGTGAAAGAGTTCTTGACCGAGATCAACGTCATATCAGAAATACAGCAT
GAGAATTTGGTTAAGTTATATGGATGCTGCGTTGAAGGGAGTCACAGGATTCTCGTTTAC
AACTATATGGAGAACATGAGCCTCGACATGACGCTTCTTGCTGGGGGATACATTAAGAGT
GGGATACAGTTTGACTGGAGAA

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL4229Contig1 763 2 2 U
GGAACACACTCGTTATACCCAACCCAAACCTAAAAGAGGCTTATACCGACGTTCCTAGCT
TCTTTCATCCTCCTCCTGAGCCGCCATCTCTCCTCCTCCGACCTCCATCGTCTCTTTCGC
TAAGCTTCTCCAAAGGGACAATGCCGAAGATTAAGACTAACAGAGTAAAGTACCCAGAAG
GTTGGGAGTTGATTGAGCCTACTCTTCTTGAGATAGAGGCCAAGATGAGAGAAGCTGAGA
TAGATACACATGATGGAAAGAGAAAGTGTGAAGCCTTGTGGCCAATCTTCAAGCTCTCTC
ATCAGAGGAGACGCTATGTCTATGACCTCTATTACCGTAGGGAGGAGATCTCTAAAGAGC
TTTATGAGTTCTGCTTGGATCAGAACTATGCTGATCGTAACCTCATAGCCAAGTGGAAAA
AGTCAGGATATGAGCGTTTATGCTGCTTGCGCTGCATACAGCCAAGAGACCACAACTACG
GAACAACATGCGTGTGCCGTGTTCCCAAACACTTGCGTGAAGAGAAAGTCGTTGAATGCG
TTCACTGCGGTTGTCAAGGATGCGCCAGTGGCGATTAATCTCCACTTTTTAGGTTTTTCT
TTCACTATTCCTCACTGTTGCTGTATTCTATATCTTGTCAAAATCTGAATCATGTACCCT
AAAAACACCCTGAAGAGACTACCTTTCAAAACCTCTACTCGTTAACTCTGTTGCTGAAAC
TATAAAGACGTTCCCGGTTTTGGTATATAAATGAATTTAGAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD76JQ C 1
AF RR2AD76TF U 1
BS 1 756 RR2AD76TF
BS 757 763 RR2AD76JQ

RD RR2AD76JQ 763 0 0
GGAACACACTCGTTATACCCAACCCAAACCTAAAAGAGGCTTATACCGACGTTCCTAGCT
TCTTTCATCCTCCTCCTGAGCCGCCATCTCTCCTCCTCCGACCTCCATCGTCTCTTTCGC
TAAGCTTCTCCAAAGGGACAATGCCGAAGATTAAGACTAACAGAGTAAAGTACCCAGAAG
GTTGGGAGTTGATTGAGCCTACTCTTCTTGAGATAGAGGCCAAGATGAGAGAAGCTGAGA
TAGATACACATGATGGAAAGAGAAAGTGTGAAGCCTTGTGGCCAATCTTCAAGCTCTCTC
ATCAGAGGAGACGCTATGTCTATGACCTCTATTACCGTAGGGAGGAGATCTCTAAAGAGC
TTTATGAGTTTTGCTTGGATCAGAACTATGCTGATCGTAACCTCATAGCCAAGTGGAAAA
AGTCAGGATATGAGCGTTTATGCTGCTTGCGCTGCATACAGCCAAGAGACCACAACTACG
GAACAACATGCGTGTGCCGTGTTCCCAAACACTTGCGTGAAGAGAAAGTCGTTGAATGCG
TTCACTGCGGTTGTCAAGGATGCGCCAGTGGCGATTAATCTCCACTTTT*AGGTTTTTCT
TTCACTATTCCTCACTGTTGCTGTATTCTATATCTTGTCAAAATTTGAATCATGTACCCT
AAAAACACCCTGAAGAGACTACCTTTCAAAACCTCTACTCGTTAACTCTGTTGCTGAAAC
TATAAAGACGTTCCCGGTTTTGGTATATAAATGAATTTAGAGG

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2AD76TF 756 0 0
GGAACACACTCGTTATACCCAACCCAAACCTAAAAGAGGCTTATACCGACGTTCCTAGCT
TCTTTCATCCTCCTCCTGAGCCGCCATCTCTCCTCCTCCGACCTCCATCGTCTCTTTCGC
TAAGCTTCTCCAAAGGGACAATGCCGAAGATTAAGACTAACAGAGTAAAGTACCCAGAAG
GTTGGGAGTTGATTGAGCCTACTCTTCTTGAGATAGAGGCCAAGATGAGAGAAGCTGAGA
TAGATACACATGATGGAAAGAGAAAGTGTGAAGCCTTGTGGCCAATCTTCAAGCTCTCTC
ATCAGAGGAGACGCTATGTCTATGACCTCTATTACCGTAGGGAGGAGATCTCTAAAGAGC
TTTATGAGTTCTGCTTGGATCAGAACTATGCTGATCGTAACCTCATAGCCAAGTGGAAAA
AGTCAGGATATGAGCGTTTATGCTGCTTGCGCTGCATACAGCCAAGAGACCACAACTACG
GAACAACATGCGTGTGCCGTGTTCCCAAACACTTGCGTGAAGAGAAAGTCGTTGAATGCG
TTCACTGCGGTTGTCAAGGATGCGCCAGTGGCGATTAATCTCCACTTTTTAGGTTTTTCT
TTCACTATTCCTCACTGTTGCTGTATTCTATATCTTGTCAAAATCTGAATCATGTACCCT
AAAAACACCCTGAAGAGACTACCTTTCAAAACCTCTACTCGTTAACTCTGTTGCTGAAAC
TATAAAGACGTTCCCGGTTTTGGTATATAAATGAAT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL4230Contig1 780 2 2 U
GGATCTCAGACCCAGAGGCTAAGGGCTATTTTGATTTACTGATTAAGGTATATCCAGATG
GAAAAATGAGTCAGCATTTTGCCAGCTTAAAGCCGGGGGATGTGTTGGAAGTGAAAGGAC
CTATTGAAAAATTCAAATATTCGCCTAACATGAAGAAACATATTGGCATGATTGCTGGTG
GAAGTGGGATTACTCCAATGCTTCAGGTGATTGATACCATTGTGAAGAATCCTGAGGACA
ACACGAAGGTAACATTACTTTATGCCAATGTTTCTCCGGATGATATACTTCTCAAGCAAA
AGCTGGATGCTCTTCAGGCAAACCACCCAAATCTGAAGGTATTCTATACGGTTGACAATC
CTACTAAAAATTGGAAAGGAGGAGTAGGTTACGTTTCAAAGGACATGGCTCTGAAAGGCT
TACCTCTTCCTGCTGACGATACACTTATCCTCGTATGTGGTCCTCCTGGGATGATGGAAC
ATGTATCCGGAGGCAAAGCTCCAGACTGGTCACAAGGAGAGGTAAAGGGGATACTCAAGG
AACTCGGATTCACAGAGCAAATGGTTTTCAAATTCTGAGAGGCTTATGAATCAAAGTTCC
TTAGTTCTACTCTTGACGAGGTTTCATTTCATGTAATAAAGTGGCCCTAAGGCAAACATT
AATTGATGCAGGATGAGCTTGAACACAGGACCTATCAAGCTTTGAAAATAAACAAAGCAA
AAAGTTCAGTTAGTCTTTTGTCTCTGGAGGGTTTTAGCTACCGGGACCTATGCTATACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H611TF U 1
AF RR2H611JQB C 229
BS 1 648 RR2H611TF
BS 649 780 RR2H611JQB

RD RR2H611TF 648 0 0
GGATCTCAGACCCAGAGGCTAAGGGCTATTTTGATTTACTGATTAAGGTATATCCAGATG
GAAAAATGAGTCAGCATTTTGCCAGCTTAAAGCCGGGGGATGTGTTGGAAGTGAAAGGAC
CTATTGAAAAATTCAAATATTCGCCTAACATGAAGAAACATATTGGCATGATTGCTGGTG
GAAGTGGGATTACTCCAATGCTTCAGGTGATTGATACCATTGTGAAGAATCCTGAGGACA
ACACGAAGGTAACATTACTTTATGCCAATGTTTCTCCGGATGATATACTTCTCAAGCAAA
AGCTGGATGCTCTTCAGGCAAACCACCCAAATCTGAAGGTATTCTATACGGTTGACAATC
CTACTAAAAATTGGAAAGGAGGAGTAGGTTACGTTTCAAAGGACATGGCTCTGAAAGGCT
TACCTCTTCCTGCTGACGATACACTTATCCTCGTATGTGGTCCTCCTGGGATGATGGAAC
ATGTATCCGGAGGCAAAGCTCCAGACTGGTCACAAGGAGAGGTAAAGGGGATACTCAAGG
AACTCGGATTCACAGAGCAAATGGTTTTCAAATTCTGAGAGGCTTATGAATCAAAGTTCC
TTAGTTCTACTCTTGACGAGGTTTCATTTCATGTAATAAAGTGGCCCT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2H611JQB 552 0 0
ATCCTGAGGACAACACGAAGGTAACATTACTTTATGCCAATGTTTCTCCGGATGATATAC
TTCTCAAGCAAAAGCTGGATGCTCTTCAGGCAAACCACCCAAATCTGAAGGTATTCTATA
CGGTTGACAATCCTACTAAAAATTGGAAAGGAGGAGTAGGTTACGTTTCAAAGGACATGG
CTCTGAAAGGCTTACCTCTTCCTGCTGACGATACACTTATCCTCGTATGTGGTCCTCCTG
GGATGATGGAACATGTATCCGGAGGCAAAGCTCCAGACTGGTCACAAGGAGAGGTAAAGG
GGATACTCAAGGAACTCGGATTCACAGAGCAAATGGTTTTCAAATTCTGAGAGGCTTATG
AATCAAAGTTCCTTAGTTCTACTCTTGACGAGGTTTCATTTCATGTAATAAAGTGGCCCT
AAGGCAAACATTAATTGATGCAGGATGAGCTTGAACACAGGACCTATCAAGCTTTGAAAA
TAAACAAAGCAAAAAGTTCAGTTAGTCTTTTGTCTCTGGAGGGTTTTAGCTACCGGGACC
TATGCTATACTT

QA 1 552 1 552
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4232Contig1 730 2 3 U
TTTTTGTGCATTTTGTAGCCGGTGGTTTGGCTGGTATCACTGCTGCTTCTGCTACTTACC
CACTTGATCTTGTTAGGACTCGTCTTGCTGCTCAGACAAAGGTAATCTACTACACGGGTA
TCTGGCATACTCTGCGCACTATCAGCACCGATGAAGGTATCTTGGGACTCTACAAGGGAC
TCGGAACAACGCTTGTGGGTGTTGGGCCTAGTATTGCCATTAGCTTTTTCTGCGTATGAA
TCTTTGAGATCTTATTGGATGTCAAACAGGCCTCATGATTCTCCTGTTGTGGTCAGTCTA
GCTTGTGGAAGTCTTTCAGGCATAGCATCTTCAACTGCTACGTTTCCATTGGGATCTGGT
GAGAAGAAGGAAGCAGCTAGAAGGAGTTGGTGGACGAGCGGTCGTGTACAAGACGGGTTT
GTTAGGGACATTGAAGCGTATTGTTAAGACGGAAGGAGTGAGAGGTTTGTACAGAGGGAT
TCTTCCCGAGTACTACAAAGTGGTTCCTGGTGTTGGGATTTGCTTCATGACCTACGAGAC
ACTCAAGCTTTACTTCATGGATCTTTCCTCAAAGCTATAGACTCTGTTTTTATATGTTGT
AGAATTCTTAGGTTATTTTTGGTGAAAAGACAAAACTGTAAAAGCAGTGGGTGGAGGATA
ATATAAGAAACTACAGTAGAAAATTTATATGTATTTTGGATTATATCCAGTGAGATTAGA
TGATAGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO64TF U 26
AF RR2GO64JQ C 1
BS 1 25 RR2GO64JQ
BS 26 441 RR2GO64TF
BS 442 730 RR2GO64JQ

RD RR2GO64TF 416 0 0
TTTGGCTGGTATCACTGCTGCTTCTGCTACTTACCCACTTGATCTTGTTAGGACTCGTCT
TGCTGCTCAGACAAAGGTAATCTACTACACGGGTATCTGGCATACTCTGCGCACTATCAG
CACCGATGAAGGTATCTTGGGACTCTACAAGGGACTCGGAACAACGCTTGTGGGTGTTGG
GCCTAGTATTGCCATTAGCTTTTTCTGCGTATGAATCTTTGAGATCTTATTGGATGTCAA
ACAGGCCTCATGATTCTCCTGTTGTGGTCAGTCTAGCTTGTGGAAGTCTTTCAGGCATAG
CATCTTCAACTGCTACGTTTCCATTGGGATCTGGTGAGAAGAAGGAAGCAGCTAGAAGGA
GTTGGTGGACGAGCGGTCGTGTACAAGACGGGTTTGTTAGGGACATTGAAGCGTAT

QA 1 416 1 416
DS 

RD RR2GO64JQ 730 0 0
TTTTTGTGCATTTTGTAGCCGGTGGTTTGGCTGGTATCACTGCTGCTTCTGCTACTTACC
CACTTGATCTTGTTAGGACTCGTCTTGCTGCTCAGACAAAGGTAATCTACTACACGGGTA
TCTGGCATACTCTGCGCACTATCAGCACCGATGAAGGTATCTTGGGACTCTACAAGGGAC
TCGGAACAACGCTTGTGGGTGTTGGGCCTAGTATTGCCATTAGCTTTT*CTGCGTATGAA
TCTTTGAGATCTTATTGGATGTCAAACAGGCCTCATGATTCTCCTGTTGTGGTCAGTCTA
GCTTGTGGAAGTCTTTCAGGCATAGCATCTTCAACTGCTACGTTTCCATTGG*ATCTGGT
GAGAAGAAGGAAGCAGCTAGAAGGAGTTGGTGGACGAGCGGTCGTGTACAAGACGGGTTT
GTTAGGGACATTGAAGCGTATTGTTAAGACGGAAGGAGTGAGAGGTTTGTACAGAGGGAT
TCTTCCCGAGTACTACAAAGTGGTTCCTGGTGTTGGGATTTGCTTCATGACCTACGAGAC
ACTCAAGCTTTACTTCATGGATCTTTCCTCAAAGCTATAGACTCTGTTTTTATATGTTGT
AGAATTCTTAGGTTATTTTTGGTGAAAAGACAAAACTGTAAAAGCAGTGGGTGGAGGATA
ATATAAGAAACTACAGTAGAAAATTTATATGTATTTTGGATTATATCCAGTGAGATTAGA
TGATAGTTAC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL4233Contig1 1422 2 2 U
ATAACCGGTGACGAGATGCACATTCTCGACACCGGAGCTCGTTTCTCCGCCGTTAGATTC
TCACCGGTATTCAATCCTACTCCCCGCAGAAGATACGTCATCGTAAGGGCTAATCTCCCG
TTTCCGAAGCATCAAGCTAAGTACCACAAAGAGCTCGAAGCTGCCATCGATGCTGTTGAA
AGAGGTTGTCGCCTCTGTGTCGATGTAAAGAGACCGCTTTTCTCTTCCAAAGAAGACAAG
ATCCTCGAGAAGAATGACCAAACACCAGTTACCATCGCAGACTTCGGAGTACAAGCTTTA
GTCAGCTTACAGCTTTCGAAATTGTTTCCTTCGATACCTTTGGTCGCTGAAGAAGACTCT
CTCTTCTTGCGTGAGAACAATCTCGTGAACTCTGTGGTGAGTGAAGTCATCGCAAATGCT
GCTGATGATGATCACTTGTCTGATGCTGATGTGCTTGAAGCTATTGACAGAGGTGGCAAA
GATGCTCATACGTTTTGCAACAAACCTGCTACTTATTGGGTTTTGGATCCAATAGATGGC
ACAAAAGGGTTTCTTAGAGGAGATGTTGGTTTATATGTGGTAGGATTGGTACTTGTTGTA
GATAATGAAATAGTGCTAGGGGTCATGGGCTGTCCAAACTGGCCTGGAGACTCTTCAGAT
GAAACCACCGGGACCTTAATGCTCTCCCATACTGGCTGTGGAACGTGGACCAAGAGTTTA
CTACAAGTATCATCAGCTGATTGGACGAGGCGTTTTGTTGATGCATGTGGTTTATTGAAC
AAGGCTCGGTTTGTTATTCAAGAGAGCCAACCCTGGGAATCACTTCCATTGTCTAGTGGT
TCGACGCAAAGATAGATTCAGGTGACTTGCTTGGTAATGAGATTCGGCTTTTGCCCACGT
GTCATGGAAGTTTGTGCAAGTACATGATGGTAGCTTCTGGTAGAGCATCGGTTTTCTTTC
TCCGAGCCAGAACTGAGCGAAAAAGTACAAAGTCTTGGGATCATGCTGTTGGGATCATTT
TTCCTGCGGGTGGTATTCTGGTTAGCAACGGAAGTTTACATGATCAGCTTCTTGAGATGA
TCTCTTCTGCTTCCCCAGCTCTTTGATTTATATGACTACTCCCTACAGTTTATACGATTT
TTTCGACCACGCTGCAAATGTGATTATAACTTCGTGTGGCACAGAAGTCTTAAGCTCTTT
GGAAAGTTTCTCCTACCCCAATCGATTCTTGTGTTTTCTATTCATATCCTTTATTGGGGA
TTCTTGTGTTTTCTACACTCTTTCATATCTTTTATTTATTTACTATTGTTTGTGGTGAGG
TACCTACGGAGAAACCCTCACTGCTCTTGCTCTAACAATAAGCAGGTTCAGTATTAAGAC
TATTAACACAGCAACCGAACTGTTGAAGGCTCAGTTTTGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO24TF U 1
AF RR2BO24JQ C 586
BS 1 687 RR2BO24TF
BS 688 1422 RR2BO24JQ

RD RR2BO24TF 692 0 0
ATAACCGGTGACGAGATGCACATTCTCGACACCGGAGCTCGTTTCTCCGCCGTTAGATTC
TCACCGGTATTCAATCCTACTCCCCGCAGAAGATACGTCATCGTAAGGGCTAATCTCCCG
TTTCCGAAGCATCAAGCTAAGTACCACAAAGAGCTCGAAGCTGCCATCGATGCTGTTGAA
AGAGGTTGTCGCCTCTGTGTCGATGTAAAGAGACCGCTTTTCTCTTCCAAAGAAGACAAG
ATCCTCGAGAAGAATGACCAAACACCAGTTACCATCGCAGACTTCGGAGTACAAGCTTTA
GTCAGCTTACAGCTTTCGAAATTGTTTCCTTCGATACCTTTGGTCGCTGAAGAAGACTCT
CTCTTCTTGCGTGAGAACAATCTCGTGAACTCTGTGGTGAGTGAAGTCATCGCAAATGCT
GCTGATGATGATCACTTGTCTGATGCTGATGTGCTTGAAGCTATTGACAGAGGTGGCAAA
GATGCTCATACGTTTTGCAACAAACCTGCTACTTATTGGGTTTTGGATCCAATAGATGGC
ACAAAAGGGTTTCTTAGAGGAGATGTTGGTTTATATGTGGTAGGATTGGTACTTGTTGTA
GATAATGAAATAGTGCTAGGGGTCATGGGCTGTCCAAACTGGCCTGGAGACTCTTCAGAT
GAAACCACCGGGACCTTAATGCTCTCC
ATACT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2BO24JQ 837 0 0
TTGGTACTTGTTGTAGATAATGAAATAGTGCTAGGGGTCATGGGCTGTCCAAACTGGCCT
GGAGACTCTTCAGATGAAACCACCGGGACCTTAATGCTCTCCCATACTGGCTGTGGAACG
TGGACCAAGAGTTTACTACAAGTATCATCAGCTGATTGGACGAGGCGTTTTGTTGATGCA
TGTGGTTTATTGAACAAGGCTCGGTTTGTTATTCAAGAGAGCCAACCCTGGGAATCACTT
CCATTGTCTAGTGGTTCGACGCAAAGATAGATTCAGGTGACTTGCTTGGTAATGAGATTC
GGCTTTTGCCCACGTGTCATGGAAGTTTGTGCAAGTACATGATGGTAGCTTCTGGTAGAG
CATCGGTTTTCTTTCTCCGAGCCAGAACTGAGCGAAAAAGTACAAAGTCTTGGGATCATG
CTGTTGGGATCATTTTTCCTGCGGGTGGTATTCTGGTTAGCAACGGAAGTTTACATGATC
AGCTTCTTGAGATGATCTCTTCTGCTTCCCCAGCTCTTTGATTTATATGACTACTCCCTA
CAGTTTATACGATTTTTTCGACCACGCTGCAAATGTGATTATAACTTCGTGTGGCACAGA
AGTCTTAAGCTCTTTGGAAAGTTTCTCCTACCCCAATCGATTCTTGTGTTTTCTATTCAT
ATCCTTTATTGGGGATTCTTGTGTTTTCTACACTCTTTCATATCTTTTATTTATTTACTA
TTGTTTGTGGTGAGGTACCTACGGAGAAACCCTCACTGCTCTTGCTCTAACAATAAGCAG
GTTCAGTATTAAGACTATTAACACAGCAACCGAACTGTTGAAGGCTCAGTTTTGGAG

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 2

CO CL4234Contig1 734 2 3 U
AAAAACTAAATCATCCAAACAAAACAAAAGAACTAAGTTTGTTTTCTTAGATACTCCCCC
AGTTACTTCTCTAGATTCTATTTTCTCGCTACTTTCCAAATCATCAAACTTTAAACTCAA
ACACCAAATGCACAAAAACGCATGACCGAAACTTGCCTTCGGGTGTTATGGTGAGGTTGC
AATGGTATAGAACAGCTCAAGGTCTTTCCATCATTATATTCCTGGCTTCTCTACAGTGTC
TAACCCTGTCGTTTTGCATATCGGACATAGATTCTTTTGCTTCAGCCATTCTTTAATGCA
TTGGCTATGGAAGCCATGCCCACATTCCAGCTTTCCCAGTTCTTCTCCCTCATTGTATTC
CTCCTGACAGACGCAGCATGGCTCTATCTCTTGTGGACATCTGGTGTCACTACTGTATTT
CTGCTGCTTCAATCGGTTTGATATGGTTTCCTCATTCAGACCGGTACAAACATCTCCAAT
CCCGCTCTCCCTAGAGACAACAACTCCTCATACGACATGTTGTCAACATCGAGTCGCATG
TCTCTGTAACGGTCATGAATACCAGCTGCACCTAGCATCGACTGATTGAGAAGCATAACA
TCCCTCTAAACGTAAAGGTCCCTGTCCTACGCATCTGTTCCAAGACATTGCGGAGCTCCG
CGAGTCTGCCTCTTCCTCGACTTGTCGATGCTAAGCCTCGCAAAGATTGAGGAACGCCAT
TAGTAGTTTGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL56JQ U 454
AF RR2AL56TF C 1
BS 1 453 RR2AL56TF
BS 454 707 RR2AL56JQ
BS 708 734 RR2AL56TF

RD RR2AL56JQ 254 0 0
ATTCAGACCGGTACAAACATCTCCAATCCCGCTCTCCCTAGAGACAACAACTCCTCATAC
GACATGTTGTCAACATCGAGTCGCATGTCTCTGTAACGGTCATGAATACCAGCTGCACCT
AGCATCGACTGATTGAGAAGCATAACATCCCTCTAAACGTAAAGGTCCCTGTCCTACGCA
TCTGTTCCAAGACATTGCGGAGCTCCGCGAGTCTGCCTCTTCCTCGACTTGTCGATGCTA
AGCCTCGCAAAGAT

QA 1 254 1 254
DS 

RD RR2AL56TF 734 0 0
AAAAACTAAATCATCCAAACAAAACAAAAGAACTAAGTTTGTTTTCTTAGATACTCCCCC
AGTTACTTCTCTAGATTCTATTTTCTCGCTACTTTCCAAATCATCAAACTTTAAACTCAA
ACACCAAATGCACAAAAACGCATGACCGAAACTTGCCTTCGGGTGTTATGGTGAGGTTGC
AATGGTATAGAACAGCTCAAGGTCTTTCCATCATTATATTCCTGGCTTCTCTACAGTGTC
TAACCCTGTCGTTTTGCATATCGGACATAGATTCTTTTGCTTCAGCCATTCTTTAATGCA
TTGGCTATGGAAGCCATGCCCACATTCCAGCTTTCCCAGTTCTTCTCCCTCATTGTATTC
CTCCTGACAGACGCAGCATGGCTCTATCTCTTGTGGACATCTGGTGTCACTACTGTATTT
CTGCTGCTTCAATCGGTTTGATATGGTTTCCTCATTCAGACCGGTACAAACATCTCCAAT
CC*GCTCTCC*TAGAGACAACAACTCCTCATACGACATGTTGTCAACATCGAGTCGCATG
TCTCTGTAACGGTCATGAATACCAGCTGCACCTAGCATCGACTGATTGAGAAGCATAACA
TCC*TCTAAACGTAA*GGTCCCTGTCCTACGCATCTGTTCCAAGACATTGCGGAGCTCCG
CGAGTCTGCCTCTTCCTCGACTTGTCGATGCTAAGCCTCGCAAAGATTGAGGAACGCCAT
TAGTAGTTTGTCCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL4235Contig1 766 2 2 U
GGGCTATCTGAGAATACAAAATGGCGGCGGCTAAAGCAGCGGTGGTATTGCCACGTCCGG
TGACGTTTGTGACGGGAAATGCGAAGAAGCTAGAAGAGGTCAAGGCTATCATCGGAAACT
CCATTCCTTTCAAATCTCTCAAACTCGACCTGCCTGAGCTTCAAGGTGAGCCTGAGGATA
TCTCCAAAGAGAAAGCTCGTTTGGCTGCTCTTCAGGTTAATGGGCCGGTCCTAGTGGAGG
ATACATGTCTCTGTTTCAATGCTCTGAAGGGTCTTCCTGGGCCTTACATAAGTGGTTTCT
TGAGAAGCTTGGCCATGAAGGTTTGAACAACTTACTGATGGCCTATGAAGATAAATCAGC
TTACGCATTGTGTGCATTCTCTTTCTCGCATGGTCCCGGTGCTGAACCTCTTACATTTTT
GGGGAAAACTCCGGGTAAGATAGTTCCAGCCAGAGGACCGACTGATTTCGGGTGGGATCC
AGTGTTTCAACCTGATGGGTATGACCAAACTTATGCAGAAATGGCAAAGGAAGAAAAGAA
CAAGATATCTCATAGGTACAAGTCTTTAGCAATGGTGAAATCTCACTTTAAGGAGGCTGG
CTACGTGTTCCAGACAACTGATGATGATACCAACTAAAGTGAACCCAGTTACCATTTTCC
CTTCAGCTTTTGAATATTTGAGCACTGGGTCTCCTTTTCTACAAGTAGAAACACTTCTGT
TCACAAGTTTCTAACCAAAACATATAATGGCAAACATATTCATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DE79TF U 1
AF RR2DE79JQ C 117
BS 1 524 RR2DE79TF
BS 525 766 RR2DE79JQ

RD RR2DE79TF 524 0 0
GGGCTATCTGAGAATACAAAATGGCGGCGGCTAAAGCAGCGGTGGTATTGCCACGTCCGG
TGACGTTTGTGACGGGAAATGCGAAGAAGCTAGAAGAGGTCAAGGCTATCATCGGAAACT
CCATTCCTTTCAAATCTCTCAAACTCGACCTGCCTGAGCTTCAAGGTGAGCCTGAGGATA
TCTCCAAAGAGAAAGCTCGTTTGGCTGCTCTTCAGGTTAATGGGCCGGTCCTAGTGGAGG
ATACATGTCTCTGTTTCAATGCTCTGAAGGGTCTTCCTGGGCCTTACATAAGTGGTTTCT
TGAGAAGCTTGGCCATGAAGGTTTGAACAACTTACTGATGGCCTATGAAGATAAATCAGC
TTACGCATTGTGTGCATTCTCTTTCTCGCATGGTCCCGGTGCTGAACCTCTTACATTTTT
GGGGAAAACTCCGGGTAAGATAGTTCCAGCCAGAGGACCGACTGATTTCGGGTGGGATCC
AGTGTTTCAACCTGATGGGTATGACCAAACTTATGCAGAAATGG

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2DE79JQ 650 0 0
AACTCCATTCCTTTCAAATCTCTCAAACTCGACCTGCCTGAGCTTCAAGGTGAGCCTGAG
GATATCTCCAAAGAGAAAGCTCGTTTGGCTGCTCTTCAGGTTAATGGGCCGGTCCTAGTG
GAGGATACATGTCTCTGTTTCAATGCTCTGAAGGGTCTTCCTGGGCCTTACATAAGTGGT
TTCTTGAGAAGCTTGGCCATGAAGGTTTGAACAACTTACTGATGGCCTATGAAGATAAAT
CAGCTTACGCATTGTGTGCATTCTCTTTCTCGCATGGTCCCGGTGCTGAACCTCTTACAT
TTTTGGGGAAAACTCCGGGTAAGATAGTTCCAGCCAGAGGACCGACTGATTTCGGGTGGG
ATCCAGTGTTTCAACCTGATGGGTATGACCAAACTTATGCAGAAATGGCAAAGGAAGAAA
AGAACAAGATATCTCATAGGTACAAGTCTTTAGCAATGGTGAAATCTCACTTTAAGGAGG
CTGGCTACGTGTTCCAGACAACTGATGATGATACCAACTAAAGTGAACCCAGTTACCATT
TTCCCTTCAGCTTTTGAATATTTGAGCACTGGGTCTCCTTTTCTACAAGTAGAAACACTT
CTGTTCACAAGTTTCTAACCAAAACATATAATGGCAAACATATTCATTGG

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL4236Contig1 986 2 6 U
GTCGAGGAAGCGAATCAGAAACGTGTCAAGCTCGAGAAGAATCTTAAGCTGAGGTGAATG
TCTAGCGAATCTAGTAGTAGTGTGGAGTTTCCTCCTGACTTGACCGTTGAGCTCTTTATC
TCTACCTACGAAGCTACTTCTAAAGCCGTTCACGATTTCTCCAAGCCGTTGATCAACATG
ATGAAAGCTGCGGGATGGGATCTCGACTCCGCGGCTAGCTCCATCGAGCCTGAGGTTGAT
TACGCCAAGAGGCCTCACAAGAAGTATGCGTTCGAGTCGTACATATGCCAGAGGATGTTC
GGTGGGTTTCAGCGCAAAGATTTCTCATTAGTAGACTCAGCAGAGAGTGATGATGATGAC
ACTGAGACGTTCTTCCGTCAGTTTCTTTCACTGAAAGACATGGATCCACTAGATGCTCTG
TGTGCAAACCCGGACTCAAACTTTGGCAAGTTCTGCAGGAGCAAGTATCTCATCTTGATC
CACCCGAAGATGGAAGCTTCTTTCTTCGGGAACGTGGACCAGCGTGACTACGTGGCGGGA
GGTGGGCACCCGAGGACAGGGTTTTACCAGGCTTTCTTGAAGCTAGCGAAGTCGGTGTGG
ATATTGCATAGGCTGGCTTACTCTTTTGATCCGGCTGCGAAGATCTTCCAAGTGAAGAAG
GGGAGTGAGTACTCTGACTCGTACATGGAAAGTGTGTTGAAGAACATAGTTGTGGATGAC
AAGGGAGAGAGCCCGAGAGTTGGTCTTATGGTGATGCCTGGGTTTTGGATTGGTGGAAGT
GTGGTTCAGAGCAGAGTTTATGTCTCAGGTGTAAAGGTTGTTGAATGAAAGAGGTTCTCT
GGTGGTCTTACATGAACCTCAAGAAGAATCTCAACAGCTGTTTTAAAGCTTCCCAAGTTT
TATTGTCTACTTGTTATAAATTATGTAATTGTTCAGAACTCATAAGCAAAACAAGTACTT
CCTCAACAAAATGTATGTTTTGAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E683TF U 1
AF RR2E683JQ C 202
BS 1 594 RR2E683TF
BS 595 595 RR2E683JQ
BS 596 611 RR2E683TF
BS 612 612 RR2E683JQ
BS 613 622 RR2E683TF
BS 623 986 RR2E683JQ

RD RR2E683TF 622 0 0
GTCGAGGAAGCGAATCAGAAACGTGTCAAGCTCGAGAAGAATCTTAAGCTGAGGTGAATG
TCTAGCGAATCTAGTAGTAGTGTGGAGTTTCCTCCTGACTTGACCGTTGAGCTCTTTATC
TCTACCTACGAAGCTACTTCTAAAGCCGTTCACGATTTCTCCAAGCCGTTGATCAACATG
ATGAAAGCTGCGGGATGGGATCTCGACTCCGCGGCTAGCTCCATCGAGCCTGAGGTTGAT
TACGCCAAGAGGCCTCACAAGAAGTATGCGTTCGAGTCGTACATATGCCAGAGGATGTTC
GGTGGGTTTCAGCGCAAAGATTTCTCATTAGTAGACTCAGCAGAGAGTGATGATGATGAC
ACTGAGACGTTCTTCCGTCAGTTTCTTTCACTGAAAGACATGGATCCACTAGATGCTCTG
TGTGCAAACCCGGACTCAAACTTTGGCAAGTTCTGCAGGAGCAAGTATCTCATCTTGATC
CACCCGAAGATGGAAGCTTCTTTCTTCGGGAACGTGGACCAGCGTGACTACGTGGCGGGA
GGTGGGCACCCGAGGACAGGGTTTTACCAGGCTTTCTTGAAGCTAGCGAAGTCG*TGTGG
ATATTGCATAG*CTGGCTTACT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2E683JQ 785 0 0
CTCGACTCCGCGGCTAGCTCCATCGAGC*TGAGGTTGATTACGCCAAGAGGCCTCACAAG
AAGTATGCGTTCGAGTCGTACATATGCCAGAGGATGTTCGGTGGGTTTCAGCGCAAAGAT
TTCTCATTAGTAGACTCAGCAGAGAGTGATGATGATGACACTGAGACGTTCTTCCGTCAG
TTTCTTTCACTGAAAGACATGGATCCACTAGATGCTCTGTGTGCAAACCCGGACTCAAAC
TTTGGCAAGTTCTGCAGGAGCAAGTATCTCATCTTGATCCACCCGAAGATGGAAGCTTCT
TTCTTCGGGAACGTGGACCAGCGTGACTACGTGGCGGGAGGTGGGCACCCGAGGACAGGG
TTTTACCAGGCTTTCTTGAAGCTAGCGAAGTCGGTGTGGATATTGCATAGGCTGGCTTAC
TCTTTTGATCCGGCTGCGAAGATCTTCCAAGTGAAGAAGGGGAGTGAGTACTCTGACTCG
TACATGGAAAGTGTGTTGAAGAACATAGTTGTGGATGACAAGGGAGAGAGCCCGAGAGTT
GGTCTTATGGTGATGCCTGGGTTTTGGATTGGTGGAAGTGTGGTTCAGAGCAGAGTTTAT
GTCTCAGGTGTAAAGGTTGTTGAATGAAAGAGGTTCTCTGGTGGTCTTACATGAACCTCA
AGAAGAATCTCAACAGCTGTTTTAAAGCTTCCCAAGTTTTATTGTCTACTTGTTATAAAT
TATGTAATTGTTCAGAACTCATAAGCAAAACAAGTACTTCCTCAACAAAATGTATGTTTT
GAATT

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL4237Contig1 451 2 1 U
GGATAGAGAAGAAAACACACAACACAACACATACCATATTGAAGCTTTTCACAGAAACTT
CAGAAGAGCTTAAAACAGAATGGGAACAGCTACTTTTATAGATATTCTTCTTGCTATCCT
CTTGCCTCCTCTTGGCGTCTTTCTCAGATATGGTTGCGGGGTTGAGTTTTGGATATGTTT
GGTTTTGACGCTGCTTGGGTATCTTCCTGGGATCCTCTACGCCCTTTATGTCCTCACCAA
ATGATCATTCACCTCCATCTACCCTCTCTTCTTGTATCTTCATCTCCTTGAACTGCTGGT
TCGTCGTGTTTTCATCTCGTTGTGTGACTGATTCATCTTTTCTTTCATCAGGGGTTTATC
GCTGTTGTGTTTGCATTGTTATATAATTTCTTTTAATCCTTCTTTTGCGTGAAGAGCTTG
TTTATTCGATTCTTTAATTAGTATTTACTAG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E053TF U 3
AF RR2ES66TF U 1
BS 1 451 RR2ES66TF

RD RR2E053TF 409 0 0
GG
AGAGAAGAAAACACACAACACAACACATACCATATTGAAGCTTTTCACAGAAACTTCAGA
AGAGCTTAAAACAGAATGGGAACAGCTACTTTTATAGATATTCTTCTTGCTATCCTCTTG
CCTCCTCTTGGCGTCTTTCTCAGATATGGTTGCGGGGTTGAGTTTTGGATATGTTTGGTT
TTGACGCTGCTTGGGTATCTTCCTGGGATCCTCTACGCCCTTTATGTCCTCACCAAATGA
TCATTCACCTCCATCTACCCTCTCTTCTTGTATCTTCATCTCCTTGAACTGCTGGTTCGT
CGTGTTTTCATCTCGTTGTGTGACTGATTCATCTTTTCTTTCATCAGGGGTTTATCGCTG
TTGTGTTTGCATTGTTATATAATTTCTTTTAATCCTTCTTTTGCGTG

QA 3 409 3 409
DS 

RD RR2ES66TF 451 0 0
GGATAGAGAAGAAAACACACAACACAACACATACCATATTGAAGCTTTTCACAGAAACTT
CAGAAGAGCTTAAAACAGAATGGGAACAGCTACTTTTATAGATATTCTTCTTGCTATCCT
CTTGCCTCCTCTTGGCGTCTTTCTCAGATATGGTTGCGGGGTTGAGTTTTGGATATGTTT
GGTTTTGACGCTGCTTGGGTATCTTCCTGGGATCCTCTACGCCCTTTATGTCCTCACCAA
ATGATCATTCACCTCCATCTACCCTCTCTTCTTGTATCTTCATCTCCTTGAACTGCTGGT
TCGTCGTGTTTTCATCTCGTTGTGTGACTGATTCATCTTTTCTTTCATCAGGGGTTTATC
GCTGTTGTGTTTGCATTGTTATATAATTTCTTTTAATCCTTCTTTTGCGTGAAGAGCTTG
TTTATTCGATTCTTTAATTAGTATTTACTAG

QA 1 451 1 451
DS 



AS 1 2

CO CL4238Contig1 407 2 1 U
GACGGCGGCTTTCTAAAAGAGACACACTTGCTCCTCCTTCACTGCCTTCTCTTTCCAAAC
CACCAGGTTCTGTGAGATCATTAACCGGAAGCCGGTTAAGCTCAAAATCACTATCATTTG
AGTCAAGCATTGCTCCGTTTACTCTCTCTGCCAAGACGTTCACCGCAAGGGAGATAGCGA
AAGCTACTAACGGCTTTGCGGAGTCGAGGGTTCTTGGTGAAGGCGGGTTTGGAAGAGTCT
ATGAAGGTCTTTTCGATGATGGGACTAAAGTAGCGGTTAAAGTACTGAAGAGGGATGACC
ATATAGGATATATTGATCTCAAAGAACACAAACACAATTAGCTCAAACTCGTTTGTATCA
CACAAAAATAAGAACTCTTCTTATTAACTCTTTGAGGAAACTCTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EV18JQ C 1
AF RR2EV18TF U 1
BS 1 407 RR2EV18TF

RD RR2EV18JQ 407 0 0
GACGGCGGCTTTCTAAAAGAGACACACTTGCTCCTCCTTCACTGCCTTCTCTTTCCAAAC
CACCAGGTTCTGTGAGATCATTAACCGGAAGCCGGTTAAGCTCAAAATCACTATCATTTG
AGTCAAGCATTGCTCCGTTTACTCTCTCTGCCAAGACGTTCACCGCAAGGGAGATAGCGA
AAGCTACTAACGGCTTTGCGGAGTCGAGGGTTCTTGGTGAAGGCGGGTTTGGAAGAGTCT
ATGAAGGTCTTTTCGATGATGGGACTAAAGTAGCGGTTAAAGTACTGAAGAGGGATGACC
ATATAGGATATATTGATCTCAAAGAACACAAACACAATTAGCTCAAACTCGTTTGTATCA
CACAAAAATAAGAACTCTTCTTATTAACTCTTTGAGGAAACTCTCTC

QA 1 407 1 407
DS 

RD RR2EV18TF 407 0 0
GACGGCGGCTTTCTAAAAGAGACACACTTGCTCCTCCTTCACTGCCTTCTCTTTCCAAAC
CACCAGGTTCTGTGAGATCATTAACCGGAAGCCGGTTAAGCTCAAAATCACTATCATTTG
AGTCAAGCATTGCTCCGTTTACTCTCTCTGCCAAGACGTTCACCGCAAGGGAGATAGCGA
AAGCTACTAACGGCTTTGCGGAGTCGAGGGTTCTTGGTGAAGGCGGGTTTGGAAGAGTCT
ATGAAGGTCTTTTCGATGATGGGACTAAAGTAGCGGTTAAAGTACTGAAGAGGGATGACC
ATATAGGATATATTGATCTCAAAGAACACAAACACAATTAGCTCAAACTCGTTTGTATCA
CACAAAAATAAGAACTCTTCTTATTAACTCTTTGAGGAAACTCTCTC

QA 1 407 1 407
DS 



AS 1 2

CO CL4239Contig1 1156 2 8 U
GATGATTGCGTTCGGTGTGATCCAAATCGTATTCTCTCCGATTCCTGATTTTGATCAGTT
ATGGTGGCTGTCCATTGTGGCTGCAGTCATGTCTTTTGGTTACTCCACCGTTGGGCTTGG
TCTTGGCATCTCCAAAGTGGTAGAGAACAAAGAAATTAAAGGCACTCTCACTGGAGTCAC
CATTGGGACTGTGACATCGAGTGGGACCGTGACACCTACACAGAAAGTCTGGAGAACTTT
TCAGTCTCTTGGGAACATTGCATTTGCCTATGCTTACTCCATGATTCTCATCGAGATCCA
GGACACGTTGAAATCACCACCTGCAGAGGAAAACACAATGAGGAAAGCGACTCTCATAAG
TGTAGCAGTGACGACGCTCTTCTACATGCTCTGTGGCTGCGTAGGGTATGCAGCTTTTGG
TGATTCCTCACCTGGAAACCTCCTTGCCGCTGGAGGATTCAGAAACCCCTATTGGTTCTT
GACATAGCCAACCTCGCCATAGTGATCCACCTAGTTGGAGCTTACCAAGTCTACTGCCAG
CCGCTCTTTGCCTTTGTGGAGAAAGAAGCCGCCAAGAGGTATCCAGAGAGTAAGTTCATC
ACAAACGAGACCAAGATCCACCTCTTTCCAGGATCAAAGCCTTTCAACTTGAATCTCTTT
AGGCTCGTGTGGAGGACCATCTTTGTGATCACGACAACGTTGATCTCTATGCTGATGCCT
TTCTTCAATGACGTGCTTGGTCTCTTGGGGGCCATCGGTTTTTGGCCTCTAACGGTCTAT
TTCCCTGTGGAGATGTACATTGTGCAGAAGAATGTGCGGAGATGGAGCACGATGTGGGTT
TGTCTTCAAGTCTTGAGTCTGGCTTGTCTTGTTGTGTCTGTAGCCGCGGCCGCAGGATCT
GTGGTTGGGATTGTTACTGATCTCAAGAGTTACAGACCTTTCAAGACGGATTTCTGAAGA
GCCCTTTCGGAACAAATAAACTCCCCGCAATAGGGATGCAGTTATATATAAATTGGATGT
TGTGACTTGATCTTTTAAGTTAGTTAAACTTTTTCAAAGTGTTCTATATGAGATATTCGA
CGCAGAACTTGGGCTGAGTTCGTATTCTTGTTGATAGCACATTAGTGAATTCAATATTGG
ACTGACATGATTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D643TF U 1
AF RR2D643JQ C 348
BS 1 662 RR2D643TF
BS 663 663 RR2D643JQ
BS 664 718 RR2D643TF
BS 719 719 RR2D643JQ
BS 720 727 RR2D643TF
BS 728 728 RR2D643JQ
BS 729 762 RR2D643TF
BS 763 1156 RR2D643JQ

RD RR2D643TF 775 0 0
GATGATTGCGTTCGGTGTGATCCAAATCGTATTCTCTCCGATTCCTGATTTTGATCAGTT
ATGGTGGCTGTCCATTGTGGCTGCAGTCATGTCTTTTGGTTACTCCACCGTTGGGCTTGG
TCTTGGCATCTCCAAAGTGGTAGAGAACAAAGAAATTAAAGGCACTCTCACTGGAGTCAC
CATTGGGACTGTGACATCGAGTGGGACCGTGACACCTACACAGAAAGTCTGGAGAACTTT
TCAGTCTCTTGGGAACATTGCATTTGCCTATGCTTACTCCATGATTCTCATCGAGATCCA
GGACACGTTGAAATCACCACCTGCAGAGGAAAACACAATGAGGAAAGCGACTCTCATAAG
TGTAGCAGTGACGACGCTCTTCTACATGCTCTGTGGCTGCGTAGGGTATGCAGCTTTTGG
TGATTCCTCACCTGGAAACCTCCTTGCCGCTGGAGGATTCAGAAACCCCTATTGGTTCTT
GACATAGCCAACCTCGCCATAGTGATCCACCTAGTTGGAGCTTACCAAGTCTACTGCCAG
CCGCTCTTTGCCTTTGTGGAGAAAGAAGCCGCCAAGAGGTATCCAGAGAGTAAGTTCATC
ACAAACGAGACCAAGATCCACCTCTTTCCAGGATCAAAGCCTTTCAACTTGAATCTCTTT
AG*CTCGTGTGGAGGACCATCTTTGTGATCACGACAACGTTGATCTCTATGCTGATGC*T
TTCTTCA*TGACGTGCTTGGTCTCTTGGGGGCCATCGGTTTT
GGCCTCTACGGTC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2D643JQ 809 0 0
CGACTCTCATAAGTGTAGCAGTGACGACGCTCTTCTACATGCTCTGTGGCTGCGTAGGGT
ATGCAGCTTTTGGTGATTCCTCACCTGGAAACCTCCTTGCCGCTGGAGGATTCAGAAACC
CCTATTGGTTCTTGACATAGCCAACCTCGCCATAGTGATCCACCTAGTTGGAGCTTACCA
AGTCTACTGCCAGCCGCTCTTTGCCTTTGTGGAGAAAGAAGCCGCCAAGAGGTATCCAGA
GAGTAAGTTCATCACAAACGAGACCAAGATCCACCTCTTTCCAGGATCAAAGCCTTTCAA
CTTGAATCTCTTTAGGCTCGTGTGGAGGACCATCTTTGTGATCACGACAACGTTGATCTC
TATGCTGATGCCTTTCTTCAATGACGTGCTTGGTCTCTTGGGGGCCATCGGTTTTTGGCC
TCTAACGGTCTATTTCCCTGTGGAGATGTACATTGTGCAGAAGAATGTGCGGAGATGGAG
CACGATGTGGGTTTGTCTTCAAGTCTTGAGTCTGGCTTGTCTTGTTGTGTCTGTAGCCGC
GGCCGCAGGATCTGTGGTTGGGATTGTTACTGATCTCAAGAGTTACAGACCTTTCAAGAC
GGATTTCTGAAGAGCCCTTTCGGAACAAATAAACTCCCCGCAATAGGGATGCAGTTATAT
ATAAATTGGATGTTGTGACTTGATCTTTTAAGTTAGTTAAACTTTTTCAAAGTGTTCTAT
ATGAGATATTCGACGCAGAACTTGGGCTGAGTTCGTATTCTTGTTGATAGCACATTAGTG
AATTCAATATTGGACTGACATGATTAAGG

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

CO CL4240Contig1 964 2 2 U
GGTGGTGGAAGCGGATGGGTTAATAGGCTTCTGAGTATGTGTTCTGAGGACGCTAAAGCC
GCTTTCACGGCCGTCACGGTGTCTCTTCTCTTCCGATCTGCTCTCGCCGAGCCAAAGTCG
ATTCCTTCCGCGTCTATGTACCCTACCCTTGACGTGGGTGATCGTGTTATGGCCGAGAAG
GTCTCGTACATTTTCAGGAAGCCGGAGGTTTCGGAGATAGTGATCTTCAAGACTCCTCCA
ATCTTGGTGGAACATGGTTACAGTTCCAATGATGTTTACATTAAGAGGATAGTGGCAAGT
GAAGGTGACTGGGTTGAAGTTCGTGATGGGAAGCTCCTTGTGAATGAGAATGTGCAAGAA
GAAGATTTTGTCTTGGAGCCAATGTCCTATAAAATGGAACCAATGTTTGTCCCCAAAGGC
AATGTCTTTGTCCTCGGAGACAACCGCAACAAAAGCTTTGATTCTCACAACTGGGGTCCA
CTCCCGATAGAGAACATTCTTGGAAGATCTGTGTTCCGGTACTGGCCACCGAGCAAAGTG
TCGGACACCATATACCACGACCAAGCTGTGGCAAAGGGATCTGTTAGTGTTTCGTGACGA
AATAAAAGCTGGATGCTTTCTTAAGATTTAAGCACGTGATTGTGCAAAACCAGTTTGGTC
AGGAATTGAAAACTCAACATTATGTTGCCGCAGCTACATGATGTTGGTTATGGATCGTAT
CATTTGGTTGCCGCTGAAAGGTGGGAAGCCGGATAAATTATGTGTAGAGAAAGGAATGGA
AGGTGCAAACTGTAAAAGGTTTTTTTTGCTAATAATTGTTGTGTGTGTGTTTTAAAGCTT
TAATGTTGAGGCGATTATTGTCACAAGTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTATTTCTGTGTTTA
TGTATAACAATCCTGTAAACCTTTGTTGTTGTTAAGTAATAAAACCCAATATGGGATAAT
TGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2FZ14TF U 1
AF RR2FZ14JQ C 428
BS 1 643 RR2FZ14TF
BS 644 964 RR2FZ14JQ

RD RR2FZ14TF 643 0 0
GGTGGTGGAAGCGGATGGGTTAATAGGCTTCTGAGTATGTGTTCTGAGGACGCTAAAGCC
GCTTTCACGGCCGTCACGGTGTCTCTTCTCTTCCGATCTGCTCTCGCCGAGCCAAAGTCG
ATTCCTTCCGCGTCTATGTACCCTACCCTTGACGTGGGTGATCGTGTTATGGCCGAGAAG
GTCTCGTACATTTTCAGGAAGCCGGAGGTTTCGGAGATAGTGATCTTCAAGACTCCTCCA
ATCTTGGTGGAACATGGTTACAGTTCCAATGATGTTTACATTAAGAGGATAGTGGCAAGT
GAAGGTGACTGGGTTGAAGTTCGTGATGGGAAGCTCCTTGTGAATGAGAATGTGCAAGAA
GAAGATTTTGTCTTGGAGCCAATGTCCTATAAAATGGAACCAATGTTTGTCCCCAAAGGC
AATGTCTTTGTCCTCGGAGACAACCGCAACAAAAGCTTTGATTCTCACAACTGGGGTCCA
CTCCCGATAGAGAACATTCTTGGAAGATCTGTGTTCCGGTACTGGCCACCGAGCAAAGTG
TCGGACACCATATACCACGACCAAGCTGTGGCAAAGGGATCTGTTAGTGTTTCGTGACGA
AATAAAAGCTGGATGCTTTCTTAAGATTTAAGCACGTGATTGT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2FZ14JQ 537 0 0
TTGTCCTCGGAGACAACCGCAACAAAAGCTTTGATTTTCACAACTGGGGTCCACTCCCGA
TAGAGAACATTCTTGGAAGATCTGTGTTCCGGTACTGGCCACCGAGCAAAGTGTCGGACA
CCATATACCACGACCAAGCTGTGGCAAAGGGATTTGTTAGTGTTTCGTGACGAAATAAAA
GCTGGATGCTTTTTTAAGATTTAAGCACGTGATTGTGCAAAACCAGTTTGGTCAGGAATT
GAAAACTCAACATTATGTTGCCGCAGCTACATGATGTTGGTTATGGATCGTATCATTTGG
TTGCCGCTGAAAGGTGGGAAGCCGGATAAATTATGTGTAGAGAAAGGAATGGAAGGTGCA
AACTGTAAAAGGTTTTTTTTGCTAATAATTGTTGTGTGTGTGTTTTAAAGCTTTAATGTT
GAGGCGATTATTGTCACAAGTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTATTTCTGTGTTTATGTATAA
CAATCCTGTAAACCTTTGTTGTTGTTAAGTAATAAAACCCAATATGGGATAATTGTT

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

CO CL4241Contig1 903 2 2 U
CTTTGATAAGAGAACAAAAGAAAAAATATATATTTATACATATTCTTTTATCAAATATGA
ACAAAATCACTGGAATAGAAATATTTTAAATCATAATGCTGTTAACAGATCACCTTCCCT
CTTATTCTGAGTTTCAACCTTGGTTTCTCCGTCCATCGGCTCCGGTGGCTTTCTCAGCAC
CGGAGCTGGTTTTCTTTTTCGGCTTTTATTATTTCTGTGGTTCTAGGTTGTTACAAACGG
TGTTTGTGGTAGATCGTGGTTCGAAGACTCAAAGATTTCATTTTGGGGCTCTTTGATGCT
TCAACCTTCCTTCTACTATGACTGGTTGGCTCTAGATCCTGCATGCAAGACGCGATTTAT
GGTTTTAATGGTAATATTGGTCTTCGAGCTTACTCTCTGCCTTGTTTGTTCCTCTTGATC
CGATCTGGTATCGATCCTTTCTAGTCTCATTATTGTGACTAGTTTTGTCCGGATTGGTTT
GTTGCTCTCTTCTTGTCTTTTCCCCTGAGATTTGATCGAAATCTCGCCTTATCAATTTAC
TTCTTCTTGGCGTATCCTTCGTCGTCTATGGTTCGACATCGCCTTCAGCCGTGATTGCCG
AATATTGAAGCTCCGTGCTCTGAATTTGTCTGTGCTATTCTCCATAGGAGGAGACAGTCA
TCAACAAAGGTTTTGGTGGCTTTTAATCAAGGTTCAGAAGGTGTTTGTTTGCTCTGAAGT
TCAGTTGGTTATCTTTGTCGAAGTGCATGTATTGGCTCTAGTCTAGAATTGTAAACTCCG
TTTGTTTATGTTTAGTTTGTGTCTCTGTTTCCCTTGGTTTAGGGCTTCTTTCTAGGAAAA
CCTTTGTTTTCACTAGCAACTTTACCAGAGTCATCTCTTTGTACTGCGGGTCTTTCAGTG
TGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2BF80TF U 1
AF RR2BF80JQ C 569
BS 1 644 RR2BF80TF
BS 645 903 RR2BF80JQ

RD RR2BF80TF 644 0 0
CTTTGATAAGAGAACAAAAGAAAAAATATATATTTATACATATTCTTTTATCAAATATGA
ACAAAATCACTGGAATAGAAATATTTTAAATCATAATGCTGTTAACAGATCACCTTCCCT
CTTATTCTGAGTTTCAACCTTGGTTTCTCCGTCCATCGGCTCCGGTGGCTTTCTCAGCAC
CGGAGCTGGTTTTCTTTTTCGGCTTTTATTATTTCTGTGGTTCTAGGTTGTTACAAACGG
TGTTTGTGGTAGATCGTGGTTCGAAGACTCAAAGATTTCATTTTGGGGCTCTTTGATGCT
TCAACCTTCCTTCTACTATGACTGGTTGGCTCTAGATCCTGCATGCAAGACGCGATTTAT
GGTTTTAATGGTAATATTGGTCTTCGAGCTTACTCTCTGCCTTGTTTGTTCCTCTTGATC
CGATCTGGTATCGATCCTTTCTAGTCTCATTATTGTGACTAGTTTTGTCCGGATTGGTTT
GTTGCTCTCTTCTTGTCTTTTCCCCTGAGATTTGATCGAAATCTCGCCTTATCAATTTAC
TTCTTCTTGGCGTATCCTTCGTCGTCTATGGTTCGACATCGCCTTCAGCCGTGATTGCCG
AATATTGAAGCTCCGTGCTCTGAATTTGTCTGTGCTATTCTCCA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2BF80JQ 335 0 0
TGGTTCGACATCGCCTTCAGCCGTGATTGCCGAATATTGAAGCTCCGTGCTCTGAATTTG
TCTGTGCTATTCTCCATAGGAGGAGACAGTCATCAACAAAGGTTTTGGTGGCTTTTAATC
AAGGTTCAGAAGGTGTTTGTTTGCTCTGAAGTTCAGTTGGTTATCTTTGTCGAAGTGCAT
GTATTGGCTCTAGTCTAGAATTGTAAACTCCGTTTGTTTATGTTTAGTTTGTGTCTCTGT
TTCCCTTGGTTTAGGGCTTCTTTCTAGGAAAACCTTTGTTTTCACTAGCAACTTTACCAG
AGTCATCTCTTTGTACTGCGGGTCTTTCAGTGTGT

QA 1 335 1 335
DS 



AS 1 2

CO CL4242Contig1 588 2 5 U
AATGTAAAAAAAATTATCGATAACAAAAAAAATATTGTTTAAAATATTTAAATGCATTAT
AGTTGAAAAAACTAACTTGCGCGGATCATCTATTACTCTCTATTTATCAAACATGAACTT
AATTAAAGGGATCAAAGTATATTAGGAAATAACCTATGATTGCCTAAAAATAAATATCCC
CAATTTGGTTTGACGATCCTTGGCGCTTGGGTTGATTGACTATGTTCGGCTCGTATCATT
TACAAGTTTGTTGGGGAAAATCACCTACATTGCCTAATCCACAGGCTTTGAAAAGTTTGA
CAAGATCAACATATTTCTTAAAATCTTTCCCTATTATACATGCACATTGTTTTGTCCCCG
CTTGATCTCCCTTTGCACGAACGTTACAACAGTCCTTTTCCCAGTACTTTTTATCTCTAG
TAATAAGGCGCATGCAGTAATCAAAACTTTCAAAGCAAGTATCTGCTAAACTCTTACTCT
TGATTGTAGCCGGTAATGATGACAAGAGTATGACGAAGACGATGCATATTAATTGAATGG
TCTTCATTTTTTTGATCGATTAGTAGCTCTTTATGATAATCGATTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B058JQ U 23
AF RR2B058TF C 1
BS 1 22 RR2B058TF
BS 23 343 RR2B058JQ
BS 344 344 RR2B058TF
BS 345 485 RR2B058JQ
BS 486 588 RR2B058TF

RD RR2B058JQ 463 0 0
ACAAAAAAAATATTGTTTAAAATATTTAAATGCATTATAGTTGAAAAAACTAACTTGCGC
GGATCATCTATTACTCTCTATTTATCAAACATGAACTTAATTAAAGGGATCAAAGTATAT
TAGGAAATAACCTATGATTGCCTAAAAATAAATATCCCCAATTTGGTTTGACGATCCTTG
GCGCTTGGGTTGATTGACTATGTTCGGCTCGTATCATTTACAAGTTTGTTGGGGAAAATC
ACCTACATTGCCTAATCCACAGGCTTTGAAAAGTTTGACAAGATCAACATATTTCTTAAA
ATCTTTCCCTATTATACATGCCCATTGTTTTGTCCCCGCTTGATCTCCCTTTGCACGAAC
GTTACAACAGTCCTTTTCCCAGTACTTTTTATCTCTAGTAATAAGGCGCATGCAGTAATC
AAAACTTTCAAAGCAAGTATCTGCTAAACTCTTACTCTTGATT

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2B058TF 588 0 0
AATGTAAAAAAAATTATCGATAACAAAATAAATATTGTTTATAATATTTAAATGCATTAT
AGTTGAAAAAACTAACTTGCGCGGATCATCTATTACTCTCTATTTATCAAACATGAACTT
AATTAAAGTGATCAAAGTATATTAGGAAATAACCTATGATTGCCTATAAATAAATATCTC
CAATTTGGTTTGACGATCCTTGGCGCTTGGGTTGATTGACTATGTTCGGCTCGTATCATT
TACAAGTTTGTTGGTGATAATCACCTACATTGCCTAATCCACAGGCTTTGAAAAGTTTGA
CGAGATCAACATATTTCTTATAATCTTTCGCTATTATACATGCACATTGTTTTGTCGCCG
CTTGATCTCGCTTTGCACGAACGTTACAACAGTCCTTTTCCCAGTACTTTTTATCTCTAG
TAATAAGGCGCATGCAGTAATCAAGACTTTCAAAGCAAGTATCTGCTAAACTCTTACTCT
TGATTGTAGCCGGTAATGATGACAAGAGTATGACGAAGACGATGCATATTAATTGAATGG
TCTTCATTTTTTTGATCGATTAGTAGCTCTTTATGATAATCGATTGGC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4245Contig1 661 2 4 U
GGAATTCGTTGTTCGTCAGAAGCTGAAGAACCTCCCTCCTACGACGGCGAAAGAGACGGA
AGCAAAAATCTTGGATCAGCCATGAATGCACCGGACCGATACGAGCGATTCGTTGTTCCC
GAAGGCACTAAAAAGGTTTCTTATGAGAGGGACACAAAGATCATCAACGCTGCTTCCTTC
ACGATTGAGAGAGAAGATCATACCATTGGAAACATCGTCCGCATGCAACTTCACAGCGAC
GAGAATGTTTTGTTTGCTGGGTACCAACTTCCTCATCCTCTCAAGTACAAAATCATAGTC
AGGATTCACACCACAAGCCAGTCTTCCCCGATGCAAGCATACAATCAGGCTATCAATGAC
TTTGACAAGGAGCTTGACTTTCTCAAGAGCCAATTTGAGGCAGAGGTGGCGAGGTTTTCG
AGTCCCTACTAAGGAGCTTAGAGTTCTCCATCGGCACTTTGGAATCACATTTTCCTTTCT
CTCAGCACCAACCAGAAGACTTATAATGAGCTTGTTGCTACTTGCTTTTATAAATTTAGG
AACAAATTTTTTCATGTTATTTGTTTTAACTCTATGTTTTGGACACCATTCCGGCTGCTA
AGAAGCACTATTTGGAATACCTTGTCTTATATCCATCTTATCTACGAAAACGTTTTATTG
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2DV96TF U 1
AF RR2DV96JQ C 188
BS 1 590 RR2DV96TF
BS 591 591 RR2DV96JQ
BS 592 599 RR2DV96TF
BS 600 661 RR2DV96JQ

RD RR2DV96TF 599 0 0
GGAATTCGTTGTTCGTCAGAAGCTGAAGAACCTCCCTCCTACGACGGCGAAAGAGACGGA
AGCAAAAATCTTGGATCAGCCATGAATGCACCGGACCGATACGAGCGATTCGTTGTTCCC
GAAGGCACTAAAAAGGTTTCTTATGAGAGGGACACAAAGATCATCAACGCTGCTTCCTTC
ACGATTGAGAGAGAAGATCATACCATTGGAAACATCGTCCGCATGCAACTTCACAGCGAC
GAGAATGTTTTGTTTGCTGGGTACCAACTTCCTCATCCTCTCAAGTACAAAATCATAGTC
AGGATTCACACCACAAGCCAGTCTTCCCCGATGCAAGCATACAATCAGGCTATCAATGAC
TTTGACAAGGAGCTTGACTTTCTCAAGAGCCAATTTGAGGCAGAGGTGGCGAGGTTTTCG
AGTCCCTACTAAGGAGCTTAGAGTTCTCCATCGGCACTTTGGAATCACATTTTCCTTTCT
CTCAGCACCAACCAGAAGACTTATAATGAGCTTGTTGCTACTTGCTTTTATAAATTTAGG
AACAAATTTTTTCATGTTATTTGTTTTAACTCTATGTTTTGGACACCATTGCGGCTGCT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2DV96JQ 474 0 0
AGAGAGAAGATCATACCATTGGAAACATCGTCCGCATGCAACTTCACAGCGACGAGAATG
TTTTGTTTGCTGGGTACCAACTTCCTCATCCTCTCAAGTACAAAATCATAGTCAGGATTC
ACACCACAAGCCAGTCTTCCCCGATGCAAGCATACAATCAGGCTATCAATGACTTTGACA
AGGAGCTTGACTTTCTCAAGAGCCAATTTGAGGCAGAGGTGGCGAGGTTTTCGAGTCCCT
ACTAAGGAGCTTAGAGTTCTCCATCGGCACTTTGGAATCACATTTTCCTTTCTCTCAGCA
CCAACCAGAAGACTTATAATGAGCTTGTTGCTACTTGCTTTTATAAATTTAGGAACAAAT
TTTTTCATGTTATTTGTTTTAACTCTATGTTTTGGACACCATTCCGGCTGCTAAGAAGCA
CTATTTGGAATACCTTGTCTTATATCCATCTTATCTACGAAAACGTTTTATTGG

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 2

CO CL4246Contig1 798 2 10 U
GGAAAAGAGAACAAAGTTTGACTGCAACAACCAAAATGTAACATCGAAATGAGCTTAGTA
GGAACAATCCATACCGTTTACTTTAAGCTTCTCCGAGTCCAAACGATATCTAAAAACCAG
AAAAAAAGGGAACAAAGAAGGGATAGAATGCGATTCAGACGACTCATGCACTTCAGGACA
TGATTTTGGCAGACCGAACATAAAGGCTGTCAACAACCTTCCCCATGTTTGCAATGGTGT
CAAGAGTAGCCGAGTAGATAGCATCCGCCTTCGGATCCTCGAATATGATGAGACACCCAG
CCCCTTGATCCAACGTACCTGAGAATTTCTTGTCAAGAATCATCTGAAACAGCTTCTTCT
CCACATGGTCCAACGGCAACCCAATCAGCTCAGCGATGTGACCTATCTCAACTCGCGAGA
AAGGCTCGATCAAACGACACAAGTTCTGCTCCAGAAGCGTGTCGTAAAGAGAAGAAAGAT
GCCTGTGAACAATCGGGTCATCCTCCAGCTGCGCCTTGTAGTCACGCAGCGCGTTCTCAA
ACAGCTCCAACGACCTCTTGGAGTGAGCATCAGCCACCGCCTTCATGGCGTCTAGATCAG
CGCCAACGTACTGAAGTCCAGCCTTGGAGGAGATTATCCCCGCGACATCATCAGCTTGGC
TAACCATGATCTTGCACAGCAACATGTACTTCAAGCTGAACACCGCTCTCGGATCACCGA
GAGCGTTGAACGACTCAAAGGCTTCGAAGAAGTAGCTGTAACCAGTCTTGTAGTCCTTCT
CTTCGGCGTGGAGGATCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT69JQ U 1
AF RR2EA37TF C 3
BS 1 87 RR2FT69JQ
BS 88 88 RR2EA37TF
BS 89 321 RR2FT69JQ
BS 322 322 RR2EA37TF
BS 323 432 RR2FT69JQ
BS 433 433 RR2EA37TF
BS 434 546 RR2FT69JQ
BS 547 547 RR2EA37TF
BS 548 713 RR2FT69JQ
BS 714 798 RR2EA37TF

RD RR2FT69JQ 713 0 0
GGAAAAGAGAACAAAGTTTGACTGCAACAACCAAAATGTAACATCGAAATGAGCTTAGTA
GGAACAATCCATACCGTTTACTTTAAGTTTCTCCGAGTCCAAACGATATCTAAAAACCAG
AAAAAAAGGGAACAAAGAAGGGATAGAATGCGATTCAGACGACTCATGCACTTCAGGACA
TGATTTTGGCAGACCGAACATAAAGGCTGTCAACAACCTTCCCCATGTTTGCAATGGTGT
CAAGAGTAGCCGAGTAGATAGCATCCGCCTTCGGATCCTCGAATATGATGAGACACCCAG
CCCCTTGATCCAACGTACCTGCGAATTTCTTGTCAAGAATCATCTGAAACAGCTTCTTCT
CCACATGGTCCAACGGCAACCCAATCAGCTCAGCGATGTGACCTATCTCAACTCGCGAGA
AAGGCTCGATCAGACGACACAAGTTCTGCTCCAGAAGCGTGTCGTAAAGAGAAGAAAGAT
GCCTGTGAACAATCGGGTCATCCTCCAGCTGCGCCTTGTAGTCACGCAGCGCGTTCTCAA
ACAGCTTCAACGACCTCTTGGAGTGAGCATCAGCCACCGCCTTCATGGCGTCTAGATCAG
CGCCAACGTACTGAAGTCCAGCCTTGGAGGAGATTATCCCCGCGACATCATCAGCTTGGC
TAACCATGATCTTGCACAGCAACATGTACTTCAAGCTGAACACCGCTCTCGGA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2EA37TF 796 0 0
AAAAGAGAACAAAGTTTGACTGCAACAACCAAAATGTAACATCGAAATGAGCTTAGTAGG
AACAATCCATACCGTT*ACTTTAAGCTTCTCCGAGTCCAAACGATATCTAAAA*CCAGAA
AAAAAGGGAACAAAGAAGGGATAGAATGCGATTCAGACGACTCATGCACTTCAGGACATG
ATTTTGGCAGACCGAACATAAAGGCTGTCAACAACCTTCCCCATGTTTGCAATGGTGTCA
AGAGTAGCCGAGTAGATAGCATCCGCCTTCGGATCCTCGAATATGATGAGACACCCAGCT
CCTTGATCCAACGTACCTGAGAATTTCTTGTCAAGAATCATCTGAGACAGCTTCTTCTCC
ACATGGTCCAACGGCAACCCAATCAGCTCAGCGATGTGACCTATCTCAACTCGCGAGAAA
GGCTCGATCAAACGACACAAGTTCTGCTCCAGAAGCGTGTCGTAGAGAGAAGAGAGATGC
CTGTGAACAATCGGGTCATCCTCCAGCTGCGCCTTGTAGTCACGCAGCGCGTTCTCAAAC
AGCTCCAACGACCTCTTGGAGTGAGCATCAGCCACCGCCTTCATGGCGTCTAGATCAGCG
CCAACGTACTGAAGTCCAGCCTTGGAGGAGATTATCCCCGCGACATCGTCAGCTTGGCTA
ACCATGATCTTGCACAGCAACATGTACTTCAAGCTGAACACCGCTCTCGGATCACCGAGA
GCGTTGAACGACTCAAAGGCTTCGAAGAAGTAGCTGTAACCAGTCTTGTAGTCCTTCTCT
TCGGCGTGGAGGATCC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL4247Contig1 1083 2 2 U
GGAGCATAGAGAATCTCCCCTTATCCTCTCATCTCTCCCTTCCTCCTTCAACCAAAAGTC
TCAGTTGCAACTCCGGTGACCGGCGCGTGGCGGCTCCCTTAGCGCCACCGCCGGTACCGT
TAGCTTCGATTTCGTTGTGTTTGATAGATCTCGTGATTAGGTGGTGTTAGGGCTTATTGA
TAGTGTTGGTCATCCCGGTTGGCGTTTGTCGTGTCTTTAGCAACGGGTGTGTATATGGCG
GGGCCAGATACTCCGGCTTCAGTTTCTACAACAGATTGCCTGTTGGTTTTGACCTAGTCT
TGTTCCTGTTCTCGGCTTTTCTTCCTATCAGTTCCAAGGTTGCTCTTCTGAGTGTTGATT
CAAGTCTGGTTTGGGGTTCGTCTTTCGGATGTGGTCTTGTTGCGGGAGCATCTACTTTCT
CTTCCTAGAAGCTGTGTGTTTCTGGTTGGGTTATTAGCGTCGCAGTGGTTCTGTCCTTCA
GGTCTTCTCTTGCGTGGAGGTGGCCATTCTTCAGTCGGTAGATGGCTGAGTTTGGGATGC
GAGTGTCCGTGTGTTAGAGTTGGAGGTCTTAGAAGGCGTTTTCCCCGGTCAGAGTTCAAG
GTTTTCATCTTGTGCTTGATATTAGCTTCAGTTTGGCTCCTCTTGGTATTGGTTGAGGTG
AAGTTTCTGCCGCTGTACCTCTTCTTTCTTGCAACTATCTCAGCTTTTTGGAGTCTGGTG
GAGTTCGTCAGGTTCACTCTTCGCTTTGTAGCAGTGTGTTTAGACTTGAGCTCTTGGTCT
TCAGCTCCTTTCTCGTGCTTCCCTGTTATTGTTCCTTTGGAGTGGTTGCTGTGGAGAAGT
TGTGCATTTGGTATGTTTGAGTCTCTTGGAATTGGACTCTCTTGAGATTAGCCTCCTATG
TTTAATGTATCAGTGTTGTTTTATGCGTTCCTCTAGATGCCTGATGTCTGGGCTTGGATC
CCCATTAATCTCTTGGGTGCTGGTTCCCGTAAATCATTCGGGTTTTGTTTGCTAAATATG
AATGTTGTGATCTGCTTGTAAGATTTGGTTCAGGATTCTTTTTAATCAAATTTCAATTTG
GGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2BA09TF U 1
AF RR2BA09JQ C 320
BS 1 727 RR2BA09TF
BS 728 1083 RR2BA09JQ

RD RR2BA09TF 727 0 0
GGAGCATAGAGAATCTCCCCTTATCCTCTCATCTCTCCCTTCCTCCTTCAACCAAAAGTC
TCAGTTGCAACTCCGGTGACCGGCGCGTGGCGGCTCCCTTAGCGCCACCGCCGGTACCGT
TAGCTTCGATTTCGTTGTGTTTGATAGATCTCGTGATTAGGTGGTGTTAGGGCTTATTGA
TAGTGTTGGTCATCCCGGTTGGCGTTTGTCGTGTCTTTAGCAACGGGTGTGTATATGGCG
GGGCCAGATACTCCGGCTTCAGTTTCTACAACAGATTGCCTGTTGGTTTTGACCTAGTCT
TGTTCCTGTTCTCGGCTTTTCTTCCTATCAGTTCCAAGGTTGCTCTTCTGAGTGTTGATT
CAAGTCTGGTTTGGGGTTCGTCTTTCGGATGTGGTCTTGTTGCGGGAGCATCTACTTTCT
CTTCCTAGAAGCTGTGTGTTTCTGGTTGGGTTATTAGCGTCGCAGTGGTTCTGTCCTTCA
GGTCTTCTCTTGCGTGGAGGTGGCCATTCTTCAGTCGGTAGATGGCTGAGTTTGGGATGC
GAGTGTCCGTGTGTTAGAGTTGGAGGTCTTAGAAGGCGTTTTCCCCGGTCAGAGTTCAAG
GTTTTCATCTTGTGCTTGATATTAGCTTCAGTTTGGCTCCTCTTGGTATTGGTTGAGGTG
AAGTTTCTGCCGCTGTACCTCTTCTTTCTTGCAACTATCTCAGCTTTTTGGAGTCTGGTG
GAGTTCG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2BA09JQ 764 0 0
TCTTCCTATCAGTTCCAAGGTTGCTCTTCTGAGTGTTGATTCAAGTCTGGTTTGGGGTTC
GTCTTTCGGATGTGGTCTTGTTGCGGGAGCATCTACTTTCTCTTCCTAGAAGCTGTGTGT
TTCTGGTTGGGTTATTAGCGTCGCAGTGGTTCTGTCCTTCAGGTCTTCTCTTGCGTGGAG
GTGGCCATTCTTCAGTCGGTAGATGGCTGAGTTTGGGATGCGAGTGTCCGTGTGTTAGAG
TTGGAGGTCTTAGAAGGCGTTTTCCCCGGTCAGAGTTCAAGGTTTTCATCTTGTGCTTGA
TATTAGCTTCAGTTTGGCTCCTCTTGGTATTGGTTGAGGTGAAGTTTCTGCCGCTGTACC
TCTTCTTTCTTGCAACTATCTCAGCTTTTTGGAGTCTGGTGGAGTTCGTCAGGTTCACTC
TTCGCTTTGTAGCAGTGTGTTTAGACTTGAGCTCTTGGTCTTCAGCTCCTTTCTCGTGCT
TCCCTGTTATTGTTCCTTTGGAGTGGTTGCTGTGGAGAAGTTGTGCATTTGGTATGTTTG
AGTCTCTTGGAATTGGACTCTCTTGAGATTAGCCTCCTATGTTTAATGTATCAGTGTTGT
TTTATGCGTTCCTCTAGATGCCTGATGTCTGGGCTTGGATCCCCATTAATCTCTTGGGTG
CTGGTTCCCGTAAATCATTCGGGTTTTGTTTGCTAAATATGAATGTTGTGATCTGCTTGT
AAGATTTGGTTCAGGATTCTTTTTAATCAAATTTCAATTTGGGC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL4248Contig1 638 2 2 U
GGAAATGGAGGTGGAGAAAAACAGACTGTTTCCGGAATGGCTGGATTTCACTTCGGACGA
TGCCAAGACTGTGTTCTTGGCTATTACTGTGTCTTTGGCGTTTCGATATTTTATTGCAGA
ACCAAGATACATTCCTTCCTTGTCCATGTATCCTACCTTCGATGTCGGAGACAGATTAGT
TGCAGAGAAGGTGAGTTATTATTTCAGGAAGCCATGTGCAAACGATATTGTAATCTTCAA
GAGTCCACCGGTTCTTCAGGAAGTTGGCTACACTGATGCTGATGTTTTCATTAAACGGAT
TGTTGCCAAAGAAGGCGACCTTGTGGAGGTTCATAATGGGAAACTGATGGTTAACGGTGT
TCCTCGGAATGAAAGTTTCATCTTGGAGCCTCCTGGTTATGAAATGACACCCGTTCGGGT
ACCTGAGAACTCAGTCTTTGTGATGGGTGACAACCGGAACAACAGTTATGATTCTCACGT
GTGGGGACCTCTGCCTTTGAAGAATATTATAGGACGGTCAGTTTTCCGGTATTGGCCACC
AAACAGAGTAAGCGGAACAGTGCTAGAAGGTGGCTGTGCTGTAGACATACAGCAATAGAG
CATATTTGGAACGTTTTTATATTTTATTTTGCATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD60TF U 1
AF RR2GD60JQ C 120
BS 1 527 RR2GD60TF
BS 528 638 RR2GD60JQ

RD RR2GD60TF 527 0 0
GGAAATGGAGGTGGAGAAAAACAGACTGTTTCCGGAATGGCTGGATTTCACTTCGGACGA
TGCCAAGACTGTGTTCTTGGCTATTACTGTGTCTTTGGCGTTTCGATATTTTATTGCAGA
ACCAAGATACATTCCTTCCTTGTCCATGTATCCTACCTTCGATGTCGGAGACAGATTAGT
TGCAGAGAAGGTGAGTTATTATTTCAGGAAGCCATGTGCAAACGATATTGTAATCTTCAA
GAGTCCACCGGTTCTTCAGGAAGTTGGCTACACTGATGCTGATGTTTTCATTAAACGGAT
TGTTGCCAAAGAAGGCGACCTTGTGGAGGTTCATAATGGGAAACTGATGGTTAACGGTGT
TCCTCGGAATGAAAGTTTCATCTTGGAGCCTCCTGGTTATGAAATGACACCCGTTCGGGT
ACCTGAGAACTCAGTCTTTGTGATGGGTGACAACCGGAACAACAGTTATGATTCTCACGT
GTGGGGACCTCTGCCTTTGAAGAATATTATAGGACGGTCAGTTTTCC

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2GD60JQ 519 0 0
AACCAAGATACATTCCTTCCTTGTCCATGTATCCTACCTTCGATGTCGGAGACAGATTAG
TTGCAGAGAAGGTGAGTTATTATTTCAGGAAGCCATGTGCAAACGATATTGTAATCTTCA
AGAGTCCACCGGTTCTTCAGGAAGTTGGCTACACTGATGCTGATGTTTTCATTAAACGGA
TTGTTGCCAAAGAAGGCGACCTTGTGGAGGTTCATAATGGGAAACTGATGGTTAACGGTG
TTCCTCGGAATGAAAGTTTCATCTTGGAGCCTCCTGGTTATGAAATGACACCCGTTCGGG
TACCTGAGAACTCAGTTTTTGTGATGGGTGACAACCGGAACAACAGTTATGATTCTCACG
TGTGGGGACCTCTGCCTTTGAAGAATATTATAGGACGGTCAGTTTTCCGGTATTGGCCAC
CAAACAGAGTAAGCGGAACAGTGCTAGAAGGTGGCTGTGCTGTAGACATACAGCAATAGA
GCATATTTGGAACGTTTTTATATTTTATTTTGCATTTTT

QA 1 519 1 519
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4250Contig1 702 2 2 U
GGGAAGTCACAGTCTAAGATTCAAGATTTGGAGAAGAGGCACAAGGTCAAAGAGGATGAC
TCAGCAAAACTTGTGGCTGACCTGCAGAGGTCAGTCCAAGACTTAGAGGATTCAATCAAG
GTGAAAGATGATGAATCATCAAAACTGGTGGAGGAGTTAGAAGGGGAGAAAGCATTGCTT
GAGTCACAACTAGAGAGTTCAAAAGCCAAGATCCATGATCTGGAGGAATCTCAAAAGGTT
GCATATGAATGGGTGGTAGAGATGCAGAGAGAGAAAGGATTGCTTGAGTCACAACTCAAG
GTGTCACAAGCAAGGAACCAAGACTTTGAGAAGTCGCAGAAGGCAGTGATGGATGTATTT
CAAGAAGAAAGATGCCGCAGAGATGTGGCTGAGGATGCATTGAGGAAGAAACTACGAGGA
GCTTATGATGTCATCGACACGCTCAAAATGAAAGTGAATAGCCTCGAAGCGGACCAAGCA
TTTTGCAAGAAGGTGCACATCCATATACATTAAGTACAGCTTCTAAAACTCTTTTACAAG
ACTGTACCATTCATTAGAGTCAGGAAGAAGACAATTTAGATTTTTACCAGACTCATGTAT
TTTATTTCTGTCACAGTGTTCATGCTTAAATTCATTTATACAGATCCAGTTACACTGTTT
TTAAAATCTTTGTTGGCAAAATCAATGTTTGATACAAATGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2FW50JQ C 1
AF RR2FW50TF U 1
BS 1 697 RR2FW50TF
BS 698 702 RR2FW50JQ

RD RR2FW50JQ 702 0 0
GGGAAGTCACAGTCTAAGATTCAAGATTTGGAGAAGAGGCACAAGGTCAAAGAGGATGAC
TCAGCAAAACTTGTGGCTGACCTGCAGAGGTCAGTCCAAGACTTAGAGGATTCAATCAAG
GTGAAAGATGATGAATCATCAAAACTGGTGGAGGAGTTAGAAGGGGAGAAAGCATTGCTT
GAGTCACAACTAGAGAGTTCAAAAGCCAAGATCCATGATCTGGAGGAATCTCAAAAGGTT
GCATATGAATGGGTGGTAGAGATGCAGAGAGAGAAAGGATTGCTTGAGTCACAACTCAAG
GTGTCACAAGCAAGGAACCAAGACTTTGAGAAGTCGCAGAAGGCAGTGATGGATGTATTT
CAAGAAGAAAGATGCCGCAGAGATGTGGCTGAGGATGCATTGAGGAAGAAACTACGAGGA
GCTTATGATGTCATCGACACGCTCAAAATGAAAGTGAATAGCCTCGAAGCGGACCAAGCA
TTTTGCAAGAAGGTGCACATCCATATACATTAAGTACAGCTTCTAAAACTCTTTTACAAG
ACTGTACCATTCATTAGAGTCAGGAAGAAGACAATTTAGATTTTTACCAGACTCATGTAT
TTTATTTCTGTCACAGTGTTCATGCTTAAATTCATTTATACAGATCCAGTTACACTGTTT
TTAAAATCTTTGTTGGCAAAATCAATGTTTGATACAAATGAT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2FW50TF 701 0 0
GGGAAGTCACAGTCTAAGATTCAAGATTTGGAGAAGAGGCACAAGGTCAAAGAGGATGAC
TCAGCAAAACTTGTGGCTGACCTGCAGAGGTCAGTCCAAGACTTAGAGGATTCAATCAAG
GTGAAAGATGATGAATCATCAAAACTGGTGGAGGAGTTAGAAGGGGAGAAAGCATTGCTT
GAGTCACAACTAGAGAGTTCAAAAGCCAAGATCCATGATCTGGAGGAATCTCAAAAGGTT
GCATATGAATGGGTGGTAGAGATGCAGAGAGAGAAAGGATTGCTTGAGTCACAACTCAAG
GTGTCACAAGCAAGGAACCAAGACTTTGAGAAGTCGCAGAAGGCAGTGATGGATGTATTT
CAAGAAGAAAGATGCCGCAGAGATGTGGCTGAGGATGCATTGAGGAAGAAACTACGAGGA
GCTTATGATGTCATCGACACGCTCAAAATGAAAGTGAATAGCCTCGAAGCGGACCAAGCA
TTTTGCAAGAAGGTGCACATCCATATACATTAAGTACAGCTTCTAAAACTCTTTTACAAG
ACTGTACCATTCATTAGAGTCAGGAAGAAGACAATTTAGATTTTTACCAGACTCATGTAT
TTTATTTCTGTCACAGTGTTCATGCTTAAATTCATTTATACAGATCCAGTTACACTGTTT
TTAAAATCTTTGTTGGCAAAATCAATGTTTGATACAA
TGAT

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL4251Contig1 773 2 2 U
GGCAGATTTCGTCGCATGCTGGTTCTAGACGTCAAGAGGCTCAGCGTTTGGGTCGTATTC
TTAGGGCCAAGGGTAAAATTGAAGATAGAATGACTGGTGGAAAAGAAGAGTACAATGCAT
TCTTCTACTCACTCGTTTCTACAGATACGCAGGAAATGTATTATTCAACGAAAAGACAGC
AGTTCTTGATCGACCAAGGTTACAGCTTCAAAGTTATAACAAGTCTTCCACCACCTGATG
CTGGTTCAAGCTTAAGCTACCACACTCAAGAAGAACAGTTTTCCCTTCTGGCAAAGGTGT
TGAACGCTGGAGACGATTTGGTTGGTTTAGAGCAACTGGAAGAAGACATAGACGGAAAGG
CCCTGCAAGCGGCGAGACGAAACAAGGGAGTGATGAGTGTAATGTCAGGTGCGAAAGGAT
TAGTGTACCAGGAATTCAACTCTGGCCGTCGCAAATCATCTGGTCAACAATTCAAGAAAC
CTAAAGACCCTACAAAACGACACCACCTCTTCAAGACACGTTAACGGTTACGTTTCGTGT
AGCGCGCGCACACACAAGATTAGAAAAAAAAACAAGGTTTCAGAGCTCTCTTATAACTTT
GTGCAGTATTTTTTTTTTTCAATAGAAACTGTAGTGGACTTTTTTTTGCACTCAGTTTCT
TTCTTTTTTTTTTCTTTTTGAAACACTCAGTTTCTTTCGTCTTTTTAACTTTGTAAAGGA
AAGTGTCAACGGTGAAAGAAAAAGAAAAATAAATTATCTTTTTAGTGAATAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU36TF U 1
AF RR2FU36JQ C 161
BS 1 572 RR2FU36TF
BS 573 773 RR2FU36JQ

RD RR2FU36TF 572 0 0
GGCAGATTTCGTCGCATGCTGGTTCTAGACGTCAAGAGGCTCAGCGTTTGGGTCGTATTC
TTAGGGCCAAGGGTAAAATTGAAGATAGAATGACTGGTGGAAAAGAAGAGTACAATGCAT
TCTTCTACTCACTCGTTTCTACAGATACGCAGGAAATGTATTATTCAACGAAAAGACAGC
AGTTCTTGATCGACCAAGGTTACAGCTTCAAAGTTATAACAAGTCTTCCACCACCTGATG
CTGGTTCAAGCTTAAGCTACCACACTCAAGAAGAACAGTTTTCCCTTCTGGCAAAGGTGT
TGAACGCTGGAGACGATTTGGTTGGTTTAGAGCAACTGGAAGAAGACATAGACGGAAAGG
CCCTGCAAGCGGCGAGACGAAACAAGGGAGTGATGAGTGTAATGTCAGGTGCGAAAGGAT
TAGTGTACCAGGAATTCAACTCTGGCCGTCGCAAATCATCTGGTCAACAATTCAAGAAAC
CTAAAGACCCTACAAAACGACACCACCTCTTCAAGACACGTTAACGGTTACGTTTCGTGT
AGCGCGCGCACACACAAGATTAGAAAAAAAAA

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2FU36JQ 613 0 0
TTATTCAACGAAAAGACAGCAGTTCTTGATCGACCAAGGTTACAGCTTCAAAGTTATAAC
AAGTCTTCCACCACCTGATGCTGGTTCAAGCTTAAGCTACCACACTCAAGAAGAACAGTT
TTCCCTTCTGGCAAAGGTGTTGAACGCTGGAGACGATTTGGTTGGTTTAGAGCAACTGGA
AGAAGACATAGACGGAAAGGCCCTGCAAGCGGCGAGACGAAACAAGGGAGTGATGAGTGT
AATGTCAGGTGCGAAAGGATTAGTGTACCAGGAATTCAACTCTGGCCGTCGCAAATCATT
TGGTCAACAATTCAAGAAACCTAAAGACCCTACAAAACGACACCACCTTTTCAAGACACG
TTAACGGTTACGTTTCGTGTAGCGCGCGCACACACAAGATTAGAAAAAAAAACAAGGTTT
CAGAGCTCTCTTATAACTTTGTGCAGTATTTTTTTTTTTCAATAGAAACTGTAGTGGACT
TTTTTTTGCACTCAGTTTCTTTCTTTTTTTTTTCTTTTTGAAACACTCAGTTTCTTTCGT
CTTTTTAACTTTGTAAAGGAAAGTGTCAACGGTGAAAGAAAAAGAAAAATAAATTATCTT
TTTAGTGAATAGG

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

CO CL4252Contig1 657 2 1 U
TTTTTCCTTGCTTTTGAGAAAAAAATAATTTTTATGTAGGAAAGGGTTAATTAATCAATA
AAAATATATAAAAAAGAAGTAGAAAAGAGATAAATGCAGGGTGGTAAGCTTTTGACGGTG
TTTGTGTGCCTTGTCTCTACGGTGGCGCTGGTGAACGCCGGCGATCCTTACTTCTACTAC
ACGTGGAACGTGACGTACGGAACCGCCGCGCCTCTCGGAATCCCTCAACAGGTGATTCTC
ATCAACGGAGAGTTCCCTGGTCCTAACCTTAACTCTACATCTAACAACAATGTCGTCATC
AATGTCTTTAACAACCTTGACGAGCCTTTCCTCTTGACCTGGAGTGGTCTCCAGCACAGG
AAGAACTCATGGCAAGATGGTGTGACTGGGACCTCATGCCCAATCCCAGCAGGCACCAAC
TTCACTTACCACTTCCAGCCAAAGGACCAGATCGGTAGTTACTTCTACTACCCATCCACC
GCTCTCCACCGTTTCTCCGGTGGTTTCGGTGGCCTCCGTGTCAACAGCCGTCTCCTCATC
CCCGTCCCTTACGCTGACCCCGAAGACGACTACACCGTCCTTATCAACGACTGGTACACC
AAGAGCCACACCGCTCTCAAGACCTTCCTCGACAGTGGTCGCACTCTTGGATCCCCT


BQ
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2CU05TF U 1
AF RR2G407TF U 1
BS 1 657 RR2CU05TF

RD RR2CU05TF 657 0 0
TTTTTCCTTGCTTTTGAGAAAAAAATAATTTTTATGTAGGAAAGGGTTAATTAATCAATA
AAAATATATAAAAAAGAAGTAGAAAAGAGATAAATGCAGGGTGGTAAGCTTTTGACGGTG
TTTGTGTGCCTTGTCTCTACGGTGGCGCTGGTGAACGCCGGCGATCCTTACTTCTACTAC
ACGTGGAACGTGACGTACGGAACCGCCGCGCCTCTCGGAATCCCTCAACAGGTGATTCTC
ATCAACGGAGAGTTCCCTGGTCCTAACCTTAACTCTACATCTAACAACAATGTCGTCATC
AATGTCTTTAACAACCTTGACGAGCCTTTCCTCTTGACCTGGAGTGGTCTCCAGCACAGG
AAGAACTCATGGCAAGATGGTGTGACTGGGACCTCATGCCCAATCCCAGCAGGCACCAAC
TTCACTTACCACTTCCAGCCAAAGGACCAGATCGGTAGTTACTTCTACTACCCATCCACC
GCTCTCCACCGTTTCTCCGGTGGTTTCGGTGGCCTCCGTGTCAACAGCCGTCTCCTCATC
CCCGTCCCTTACGCTGACCCCGAAGACGACTACACCGTCCTTATCAACGACTGGTACACC
AAGAGCCACACCGCTCTCAAGACCTTCCTCGACAGTGGTCGCACTCTTGGATCCCCT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2G407TF 656 0 0
TTTTTTCTTGCTTTTGAGAAAAAAATAATTTTTATGTAGGAAAGGGTTAATTAATCAATA
AAAATATATAAAAAAGAAGTAGAAAAGAGATAAATGCAGGGTGGTAAGCTTTTGACGGTG
TTTGTGTGCCTTGTCTCTACGGTGGCGCTGGTGAACGCCGGCGATCCTTACTTCTACTAC
ACGTGGAACGTGACGTACGGAACCGCCGCGCCTCTCGGAATCCCTCAACAGGTGATTCTC
ATCAACGGAGAGTTCCCTGGTCCTAACCTTAACTCTACATCTAACAACAATGTCGTCATC
AATGTCTTTAACAACCTTGACGAGCCTTTCCTCTTGACCTGGAGTGGTCTCCAGCACAGG
AAGAACTCATGGCAAGATGGTGTGACTGGGACCTCATGCCCAATCCCAGCAGGCACCAAC
TTCACTTACCACTTCCAGCCAAAGGACCAGATCGGTAGTTACTTCTACTACCCATCCACC
GCTCTCCACCGTTTCTCCGGTGGTTTCGGTGGCCTCCGTGTCAACAGCCGTCTCCTCATC
CCCGTCCCTTACGCTGACCCCGAAGACGACTACACCGTCCTTATCAACGACTGGTACACC
AAGAGCCACACCGCTCTCAAGAC*TTCCTCGACAGTGGTCGCACTCTTGGATCCCC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL4253Contig1 873 2 4 U
GGATTCCTCCGTTTGTCAATTTTCTCCGATAGATCTTAATCGAATTCCAGAGGAGGTGTA
GAAGCAAATCGATCAAGCATGGGTAACACAGATAAGCTAATGAACCAGATATTCGACCTC
AAATTCACCTCCAAATCTCTCCAACGGCAGTCGAGGAAGTGCGAGAAGGAAGAGAAGGCA
GAGAAACTCAAGGTCAAGAAGGCCATCGAGAAAGGGAACATTGATGGTGCTCGGATCTAC
GCCGAGAACGCCATTCGTAAACGCAGCGAGCAGATGAACTACCTCCGTCTCGCTTCTCGC
CTCGACGCTGTTGTCGCTCGCTTAGACACTCAGGCTAAGATGGCCACCATCACCAAATCC
ATGACCAACATCGTCAAATCCCTCGAGTCTTCCCTCGCCACAGGCAATCTACAGAAGATG
TCAGAGACTATGGATTCATTTGAGAAGCAGTTTGTGAACATGGAGGTCCAGGCTGAGTTC
ATGGAGAACGCTATGGCTGGTTCGACATCATTGTCCACTCCGGAAGGCGAGGTCAACAGC
CTGATGCAGCAGGTAGCAGATGACTATGGTCTTGAAGTCTCTGTTGGGTTACCTCAGCCT
GCTGGGCATGCTATCCCTACTGCGACAGAGGAGAAAGTCGATGAGGATGATTTGTCCAGT
AGGCTTGCAGAGCTCAAGGCCAGAGGATGAGTCAGGGGAACCAACAACCATATGCTTTGG
ACTATTTGCCATTTAGGACGAGGTCCTTACCAGAATGTTACAGCTTATTATCTACAAACA
TTGGCATATTTGTGTATATTCCTCACTTTGAGATATGCTTTGTTTTTAACTTTATATAAA
TTTTACGAATTGCAATTATATGATTTCCTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA27TF U 1
AF RR2HA27JQ C 251
BS 1 662 RR2HA27TF
BS 663 663 RR2HA27JQ
BS 664 674 RR2HA27TF
BS 675 873 RR2HA27JQ

RD RR2HA27TF 674 0 0
GGATTCCTCCGTTTGTCAATTTTCTCCGATAGATCTTAATCGAATTCCAGAGGAGGTGTA
GAAGCAAATCGATCAAGCATGGGTAACACAGATAAGCTAATGAACCAGATATTCGACCTC
AAATTCACCTCCAAATCTCTCCAACGGCAGTCGAGGAAGTGCGAGAAGGAAGAGAAGGCA
GAGAAACTCAAGGTCAAGAAGGCCATCGAGAAAGGGAACATTGATGGTGCTCGGATCTAC
GCCGAGAACGCCATTCGTAAACGCAGCGAGCAGATGAACTACCTCCGTCTCGCTTCTCGC
CTCGACGCTGTTGTCGCTCGCTTAGACACTCAGGCTAAGATGGCCACCATCACCAAATCC
ATGACCAACATCGTCAAATCCCTCGAGTCTTCCCTCGCCACAGGCAATCTACAGAAGATG
TCAGAGACTATGGATTCATTTGAGAAGCAGTTTGTGAACATGGAGGTCCAGGCTGAGTTC
ATGGAGAACGCTATGGCTGGTTCGACATCATTGTCCACTCCGGAAGGCGAGGTCAACAGC
CTGATGCAGCAGGTAGCAGATGACTATGGTCTTGAAGTCTCTGTTGGGTTACCTCAGCCT
GCTGGGCATGCTATCCCTACTGCGACAGAGGAGAAAGTCGATGAGGATGATTTGTCCAGT
AG*CTTGCAGAGCT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2HA27JQ 623 0 0
CCATTCGTAAACGCAGCGAGCAGATGAACTACCTCCGTCTCGCTTCTCGCCTCGACGCTG
TTGTCGCTCGCTTAGACACTCAGGCTAAGATGGCCACCATCACCAAATCCATGACCAACA
TCGTCAAATCCCTCGAGTTTTCCCTCGCCACAGGCAATTTACAGAAGATGTCAGAGACTA
TGGATTCATTTGAGAAGCAGTTTGTGAACATGGAGGTCCAGGCTGAGTTCATGGAGAACG
CTATGGCTGGTTCGACATCATTGTCCACTCCGGAAGGGGAGGTCAACAGCCTGATGCAGC
AGGTAGCAGATGACTATGGTCTTGAAGTTTCTGTTGGGTTACCTCAGCCTGCTGGGCATG
CTATCCCTACTGCGACAGAGGAGAAAGTCGATGAGGATGATTTGTCCAGTAGGCTTGCAG
AGCTCAAGGCCAGAGGATGAGTCAGGGGAACCAACAACCATATGCTTTGGACTATTTGCC
ATTTAGGACGAGGTCCTTACCAGAATGTTACAGCTTATTATCTACAAACATTGGCATATT
TGTGTATATTCCTCACTTTGAGATATGCTTTGTTTTTAACTTTATATAAATTTTACGAAT
TGCAATTATATGATTTCCTTTTG

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL4254Contig1 570 2 1 U
GGGGAGACATCTCTGAGGTATTCGAAGTCGTTGAGAATCCACGCGAAGGAAAAGCTCCCC
TTCAACTCCAAAACCCATTTGCAGCTTCATGGAGAGCTAGATACTGGAACTGGGGACCCT
AATTACTTCTCTGCGATTATTGGACACCTTTTCCCCGAGGCTTTAACAGGGCTGGGAGTA
GGATTCCATTATGATAAGCGCCACAAGCTTCGGTCTCATGTCCGCGTGAAAAAAGAGTTT
CCTTTAAGAGCGAATAAGCTTGTGACCTTCAATATTAAAGGGCGGTGTGATTTTGATCAA
AACTTCAATCAGAAGAACCCTGTAGGAGCTGCAGAATTTGCCTGGAACATAATGAACTTT
AAGGAAGATCAAGATGTACGGTTGAAAGTTGGCTACGAAATCTTTAATAAGGTTCCTTAT
ATGCAGATTAGAGAAAACAATTGGACTCGTAACGCTAACACGAAGGGAAAATGGAACTTG
AGGTTTGACCTGTGACTGCACTCTGATTCTTCTGAGAAATGTATTAGTAATACTTTGATT
CTTCCAATTAATCAAATTCACAGATTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ED26TF U 1
AF RR2ED26JQ C 168
BS 1 570 RR2ED26TF

RD RR2ED26TF 570 0 0
GGGGAGACATCTCTGAGGTATTCGAAGTCGTTGAGAATCCACGCGAAGGAAAAGCTCCCC
TTCAACTCCAAAACCCATTTGCAGCTTCATGGAGAGCTAGATACTGGAACTGGGGACCCT
AATTACTTCTCTGCGATTATTGGACACCTTTTCCCCGAGGCTTTAACAGGGCTGGGAGTA
GGATTCCATTATGATAAGCGCCACAAGCTTCGGTCTCATGTCCGCGTGAAAAAAGAGTTT
CCTTTAAGAGCGAATAAGCTTGTGACCTTCAATATTAAAGGGCGGTGTGATTTTGATCAA
AACTTCAATCAGAAGAACCCTGTAGGAGCTGCAGAATTTGCCTGGAACATAATGAACTTT
AAGGAAGATCAAGATGTACGGTTGAAAGTTGGCTACGAAATCTTTAATAAGGTTCCTTAT
ATGCAGATTAGAGAAAACAATTGGACTCGTAACGCTAACACGAAGGGAAAATGGAACTTG
AGGTTTGACCTGTGACTGCACTCTGATTCTTCTGAGAAATGTATTAGTAATACTTTGATT
CTTCCAATTAATCAAATTCACAGATTTTAC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2ED26JQ 403 0 0
AGGGCTGGGAGTAGGATTCCATTATGATAAGCGCCACAAGCTTCGGTCTCATGTCCGCGT
GAAAAAAGAGTTTCCTTTAAGAGCGAATAAGCTTGTGACCTTCAATATTAAAGGGCGGTG
TGATTTTGATCAAAACTTCAATCAGAAGAACCCTGTAGGAGCTGCAGAATTTGCCTGGAA
CATAATGAACTTTAAGGAAGATCAAGATGTACGGTTGAAAGTTGGCTACGAAATCTTTAA
TAAGGTTCCTTATATGCAGATTAGAGAAAACAATTGGACTCGTAACGCTAACACGAAGGG
AAAATGGAACTTGAGGTTTGACCTGTGACTGCACTCTGATTCTTCTGAGAAATGTATTAG
TAATACTTTGATTCTTCCAATTAATCAAATTCACAGATTTTAC

QA 1 403 1 403
DS 



AS 1 2

CO CL4255Contig1 947 2 14 U
GGGCTAAGGTCGTCTCTTGTCTGTCAAACAAATCCTCCACATCCAAAAAAAAAACAAATC
CCTTGAAACTCTCCTAATCTCACAAGAACAACACAAGATTAAAGAAACTAAAAGATCATC
GACCCAACAAAAAATGGTGAGCCCATTTAGAACTCCATGTACTTCGCCAAGAAAATCAAG
AAAAGCGAGCAAGAACCCTTATTCAAACCGTGGACTCGACAAATTCTCTGAGCTTCTCTC
AGAACTCGACGAGAAGAGACAGAGCATCTACTCCAAGAAGCTCGATTCCGGTGGCCCGCC
TCTTGTCCGATTCGTGTTCACAAGCTCGGGCGAGTGTGTCCCCGCCGTTATCAAATCGTC
TTATCTTCATAAGCAGAAGAAGACCAAAGATGTTGCCGCTTCTGCTGCTGCTAAAGTCAA
GACAGTAGTCAACGAGTTGAAAGCAGAGGAAACAAAGAAGACAGAACCTGAAACAGAGGA
GAAACAGAGCTGTGTTTTGAATGAGAATCTGAAGAAGATCACGAAACCGAACCGTTTCTT
GCCTGTGACTGTGATCTTGGTTCTTGTTTTCTTGGTTTTCTTTGGAAGATCTGTTTCGAT
CATGTGCACTTGTATTGCTTGGTACTTGGTACCAGCGATCAAAGAACAGAGAGGAAACAG
AGGATCTTCATCATATGCGACGAAGAAGAAAGATTTCGCTAGGAAGTTGAGTATTGAAGA
CAGAGCATCGTTTAATCCAAGAACTGTTCGTAATCTTTCTCCTCGCAAGTAGAATTTTCG
TTTTCTGGCTGCTCGTGTAAATACCGCGTGACCGAGCAAAAACTTTTTTTTTCATTTTGT
GAAGTTCTTTGATTTATTTTTTTGTTATCTTTGGTTTCTTCACTGTTTCTTTCATAATTT
TTAACTGTGATAAATTAGCAGATAAATTGTATATTCTTCTTCTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E341TF U 1
AF RR2E341JQ C 362
BS 1 717 RR2E341TF
BS 718 718 RR2E341JQ
BS 719 742 RR2E341TF
BS 743 743 RR2E341JQ
BS 744 752 RR2E341TF
BS 753 753 RR2E341JQ
BS 754 761 RR2E341TF
BS 762 762 RR2E341JQ
BS 763 767 RR2E341TF
BS 768 768 RR2E341JQ
BS 769 773 RR2E341TF
BS 774 775 RR2E341JQ
BS 776 800 RR2E341TF
BS 801 947 RR2E341JQ

RD RR2E341TF 807 0 0
GGGCTAAGGTCGTCTCTTGTCTGTCAAACAAATCCTCCACATCCAAAAAAAAAACAAATC
CCTTGAAACTCTCCTAATCTCACAAGAACAACACAAGATTAAAGAAACTAAAAGATCATC
GACCCAACAAAAAATGGTGAGCCCATTTAGAACTCCATGTACTTCGCCAAGAAAATCAAG
AAAAGCGAGCAAGAACCCTTATTCAAACCGTGGACTCGACAAATTCTCTGAGCTTCTCTC
AGAACTCGACGAGAAGAGACAGAGCATCTACTCCAAGAAGCTCGATTCCGGTGGCCCGCC
TCTTGTCCGATTCGTGTTCACAAGCTCGGGCGAGTGTGTCCCCGCCGTTATCAAATCGTC
TTATCTTCATAAGCAGAAGAAGACCAAAGATGTTGCCGCTTCTGCTGCTGCTAAAGTCAA
GACAGTAGTCAACGAGTTGAAAGCAGAGGAAACAAAGAAGACAGAACCTGAAACAGAGGA
GAAACAGAGCTGTGTTTTGAATGAGAATCTGAAGAAGATCACGAAACCGAACCGTTTCTT
GCCTGTGACTGTGATCTTGGTTCTTGTTTTCTTGGTTTTCTTTGGAAGATCTGTTTCGAT
CATGTGCACTTGTATTGCTTGGTACTTGGTACCAGCGATCAAAGAACAGAGAGGAAACAG
AGGATCTTCATCATATGCGACGAAGAAGAAAGATTTCGCTAGGAAGTTGAGTATTGA*GA
CAGAGCATCGTTTAATCCAAGA*CTGTTCGTA*TCTTTCTC*TCGCA*GTAGA**TTTCG
TTTTCTGGCTGCTCGTGTAA
TACGCGT

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2E341JQ 586 0 0
TATCTTCATAAGCAGAAGAAGACCAAAGATGTTGCCGCTTCTGCTGCTGCTAAAGTCAAG
ACAGTAGTCAACGAGTTGAAAGCAGAGGAAACAAAGAAGACAGAACCTGAAACAGAGGAG
AAACAGAGCTGTGTTTTGAATGAGAATCTGAAGAAGATCACGAAACCGAACCGTTTCTTG
CCTGTGACTGTGATCTTGGTTCTTGTTTTCTTGGTTTTCTTTGGAAGATCTGTTTCGATC
ATGTGCACTTGTATTGCTTGGTACTTGGTACCAGCGATCAAGGAACAGAGAGGAAACAGA
GGATCTTCATCATATGCGACGAAGAAGAAAGATTTCGCTAGGAAGTTGAGTATTGAAGAC
AGAGCATCGTTTAATCCAAGAACTGTTCGTAATCTTTCTCCTCGCAAGTAGAATTTTCGT
TTTCTGGCTGCTCGTGTAAATACCGCGTGACCGAGCAAAAACTTTTTTTTTCATTTTGTG
AAGTTCTTTGATTTATTTTTTTGTTATCTTTGGTTTCTTCACTGTTTCTTTCATAATTTT
TAACTGTGATAAATTAGCAGATAAATTGTATATTCTTCTTCTGTTT

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL4256Contig1 718 2 4 U
GGATAGTGTTTTCCGCGGTCGTTTCCTTTCCTCTCTCTCTCTCTCGCTTTACGGAAAATT
CGCATCTGAACTCAGCACCCTCGCAATTCGTTCGTAGCTCTTTATTCATTTCCGTCTGAG
CAATGGCTTTGGTTCTACACACTTACAAGGGAAACAAAGGTGCTTACAAGGCACTCATCG
CTGCAGAGTATGCAGGTGTCAAGATCGAGGAATCTTCCAACTTTCAGATGGACGTCACCA
ACAAATCTCCCGAGTTTCTCAAGATGAACCCCATTGGAAAGGTTCCCGTGCTTGAGACTC
CACAAGGTCCCATCTTTGAGAGCAATGCCATTACCCGTTACGTGAGCCGTGTGAATGGTG
ACAGCCCTTTGAATGGATCATCCCTCATTGATTACGCTCACATTGAGCAATGGATTGATT
TTGCCTCGTTGGAGATTGATGCTAACATGCTGAGGTGGTTCGCTCCAAGGATGGGCTATG
CTCCTTTCTCTGCTCCTGCTGAGGAAGCTGCTATCGCTGGATTGAAGAGAGGACTTGACG
CTCTTAACACCCATCTCGCCTCCAACACTTACCTCGTTGGACACTCTGTTACACTCGCAG
ATATTGTGACCATCTGCAACTTGAACTTGGGATTTGCCACCGTCATGACCAAGAGCTTCA
CCTCTGAGTTCCCTCATGTTGAGAGATACTTCTGGACGATGGTCAACCAACCCAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D291TF U 1
AF RR2EC39TF U 13
BS 1 42 RR2D291TF
BS 43 44 RR2EC39TF
BS 45 697 RR2D291TF
BS 698 718 RR2EC39TF

RD RR2D291TF 697 0 0
GGATAGTGTTTTCCGCGGTCGTTTCCTTTCCTCTCTCTCTCT**CGCTTTACGGAAAATT
CGCATCTGAACTCAGCACCCTCGCAATTCGTTCGTAGCTCTTTATTCATTTCCGTCTGAG
CAATGGCTTTGGTTCTACACACTTACAAGGGAAACAAAGGTGCTTACAAGGCACTCATCG
CTGCAGAGTATGCAGGTGTCAAGATCGAGGAATCTTCCAACTTTCAGATGGACGTCACCA
ACAAATCTCCCGAGTTTCTCAAGATGAACCCCATTGGAAAGGTTCCCGTGCTTGAGACTC
CACAAGGTCCCATCTTTGAGAGCAATGCCATTACCCGTTACGTGAGCCGTGTGAATGGTG
ACAGCCCTTTGAATGGATCATCCCTCATTGATTACGCTCACATTGAGCAATGGATTGATT
TTGCCTCGTTGGAGATTGATGCTAACATGCTGAGGTGGTTCGCTCCAAGGATGGGCTATG
CTCCTTTCTCTGCTCCTGCTGAGGAAGCTGCTATCGCTGGATTGAAGAGAGGACTTGACG
CTCTTAACACCCATCTCGCCTCCAACACTTACCTCGTTGGACACTCTGTTACACTCGCAG
ATATTGTGACCATCTGCAACTTGAACTTGGGATTTGCCACCGTCATGACCAAGAGCTTCA
CCTCTGAGTTCCCTCATGTTGAGAGATACTTCTGGAC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2EC39TF 706 0 0
GG
GCGGTCGTTTCCTTTCCTCTCTCTCTCTCTCGCTTTACGGAAAATTCGCATCTGAACTCA
GCACCCTCGCAATTCGTTCGTAGCTCTTTATTCATTTCCGTCTGAGCAATGGCTTTGGTT
CTACACACTTACAAGGGAAGCAAAGGTGCTTACAAGGCACTCATCGCTGCAGAGTATGCA
GGTGTCAAGATCGAGGAATCTTCCAACTTTCAGATGGGCGTCACCAACAAATCTCCCGAG
TTTCTCAAGATGAACCCCATTGGAAAGGTTCCCGTGCTTGAGACTCCACAAGGTCCCATC
TTTGAGAGCAATGCCATTACCCGTTACGTGAGCCGTGTGAATGGTGACAGCCCTTTGAAT
GGATCATCCCTCATTGATTACGCTCACATTGAGCAATGGATTGATTTTGCCTCGTTGGAG
ATTGATGCTAACATGCTGAGGTGGTTCGCTCCAAGGATGGGCTATGCTCCTTTCTCTGCT
CCTGCTGAGGAAGCTGCTATCGCTGGATTGAAGATAGGACTTGATGCTCTTAACACCCAT
CTCGCCTCCAACACTTACCTCGTTGGACACTCTGTTACACTCGCAGATATTGTGACCATC
TGCAACTTGAACTTGGGATTTGCCACCGTCATGACCAAGAGCTTCACCTCTGAGTTCCCT
CATGTTGAGAGATACTTCTGGACGATGGTCAACCAACCCAACTT

QA 3 706 3 706
DS 



AS 1 2

CO CL4257Contig1 1014 2 8 U
GGCCTTACAAAAAAAAAAAAAAAACTCAGTTTCTCTCTCCAATGACGGCGACACTAGGTA
GAGACCAGTATGTGTACATGGCGAAGCTCGCCGAGCAGGCGGAGCGTTACGAGGAGATGG
TCCAGTTCATGGAGCAGCTCGTCACATCCGCCGCTCCATCATCCTCAGAACTCACCGTGG
AGGAGCGCAACCTCCTCTCGGTCGCGTACAAGAACGTGATCGGATCTCTGCGCGCCGCGT
GGAGGATCGTCTCGTCGATCGAGCGGAAGGAAGAGAGCAGGAAGAACGAGGAGCACGCGG
CGCTCGTCAAGGACTACAGATCCAAGGTGGAGGCGGAGCTCTCCTCGGTCTGCTCGGGGA
TCCTCAGGCTCCTGGACTCGCATCTGATCCCGTCGGCGGCGGGGAGCAGCGAGTCGAAGG
TGTTTTACATGAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACATGGCGGAGTTTAAGGCCGGTG
AGGAGAGGAAAGCTGCTGCTGAAGATACCATGCTCGCTTACAAAGCTGCTCAGGATATTG
CAGCGGCTGAGATGGCGCCTACTCATCCGATAAGGCTTGGTCTTGCGTTGAATTTCTCTG
TGTTTTACTATGAGATCCTCAATTCTTCCGACAAAGCTTGTAACATGGCCAAACAGGCAT
TTGAAGAAGCCATAGCTGAGCTTGACACACTGGGAGAAATCCTACAAAGACAGCACTCTC
ATTATGCAGTTGCTCAGGGATAATCTTACCCTCTGGACCTCTGATATGCAGGAGCAGATG
GACGAGGCCTGATGATCTTTGATGGAAAAAGGGAGAGAGTTATGCTGCCATGTTTCTGGT
CTCAAGATCCTTATAACATCGGCTTGAAAAATATTATTCTTTTTAAGTGTTTTATGATGC
GTATGTGCACAGCTTGATGATTTGTCTACTCTTATCTTAAAAGTCTAAAACTATGTGCTC
TAAAACTTGTAATCTCTCAAGACTTTGATGAAGCCTTGAAAACCTCTTTATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D856TF U 1
AF RR2D856JQ C 388
BS 1 738 RR2D856TF
BS 739 739 RR2D856JQ
BS 740 758 RR2D856TF
BS 759 759 RR2D856JQ
BS 760 771 RR2D856TF
BS 772 772 RR2D856JQ
BS 773 806 RR2D856TF
BS 807 1014 RR2D856JQ

RD RR2D856TF 806 0 0
GGCCTTACAAAAAAAAAAAAAAAACTCAGTTTCTCTCTCCAATGACGGCGACACTAGGTA
GAGACCAGTATGTGTACATGGCGAAGCTCGCCGAGCAGGCGGAGCGTTACGAGGAGATGG
TCCAGTTCATGGAGCAGCTCGTCACATCCGCCGCTCCATCATCCTCAGAACTCACCGTGG
AGGAGCGCAACCTCCTCTCGGTCGCGTACAAGAACGTGATCGGATCTCTGCGCGCCGCGT
GGAGGATCGTCTCGTCGATCGAGCGGAAGGAAGAGAGCAGGAAGAACGAGGAGCACGCGG
CGCTCGTCAAGGACTACAGATCCAAGGTGGAGGCGGAGCTCTCCTCGGTCTGCTCGGGGA
TCCTCAGGCTCCTGGACTCGCATCTGATCCCGTCGGCGGCGGGGAGCAGCGAGTCGAAGG
TGTTTTACATGAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACATGGCGGAGTTTAAGGCCGGTG
AGGAGAGGAAAGCTGCTGCTGAAGATACCATGCTCGCTTACAAAGCTGCTCAGGATATTG
CAGCGGCTGAGATGGCGCCTACTCATCCGATAAGGCTTGGTCTTGCGTTGAATTTCTCTG
TGTTTTACTATGAGATCCTCAATTCTTCCGACAAAGCTTGTAACATGGCCAAACAGGCAT
TTGAAGAAGCCATAGCTGAGCTTGACACACTGGGAGAAATCCTACAAAGACAGCACTCTC
ATTATGCAGTTGCTCAGG*ATAATCTTACCCTCTGGAC*TCTGATATGCAG*AGCAGATG
GACGAGGCCTGATGATCTTTGATGGA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2D856JQ 627 0 0
TCCCGTCGGCGGCGGGGAGCAGCGAGTCGAAGGTGTTTTACATGAAGATGAAGGGGGATT
ACCATAGGTACATGGCGGAGTTTAAGGCCGGTGAGGAGAGGAAAGCTGCTGCTGAAGATA
CCATGCTCGCTTACAAAGCTGCTCAGGATATTGCAGCGGCTGAGATGGCGCCTACTCATC
CGATAAGGCTTGGTCTTGCGTTGAATTTCTCTGTGTTTTACTATGAGATCCTCAATTCTT
CCGACAAAGCTTGTAACATGGCCAAACAGGCATTTGAAGAAGCCATAGCTGAGCTTGACA
CACTGGGAGAAATCCTACAAAGACAGCACTCTCATTATGCAGTTGCTCAGGGATAATCTT
ACCCTCTGGACCTCTGATATGCAGGAGCAGATGGACGAGGCCTGATGATCTTTGATGGAA
AAAGGGAGAGAGTTATGCTGCCATGTTTCTGGTCTCAAGATCCTTATAACATCGGCTTGA
AAAATATTATTCTTTTTAAGTGTTTTATGATGCGTATGTGCACAGCTTGATGATTTGTCT
ACTCTTATCTTAAAAGTCTAAAACTATGTGCTCTAAAACTTGTAATCTCTCAAGACTTTG
ATGAAGCCTTGAAAACCTCTTTATCCC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL4258Contig1 1112 2 2 U
GGAGCTCCAACAATGGCGAATTCCTTCACTTCGCTTGCTGATTTGAAGGCCGATGGCTGT
TGAAGACCGGTCGCTGTTCGACCACAGCAGAGTTTTGTCTTTTGCGGTTTTGGGAGTCTA
GGATTGTGTCTCAAGATGTGGATGCTGTCGCTCTCCAATCCTACAGCGACAAGGAAAAAT
CTCTAGGCTCCAAGTATGTACATATACCTCTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTATATTTTAACACCAGATTGGGGTTTTGTGTGTATGTAAGATCCTG
CTTCCCGAGATATATAATCGAGACGATGTTGATTTGTTTTGGAATCGATGATGCCGCAAC
GGAATTAGCTGAGATTCATAATTCTTTGTAAATAGATCTAAATCTTATTTGGATTTCAAA
ACTAGAAAATTGGGTGGTTGTTGCAGGAAAAAGGTTTGAGAGAGGGTTTTGGCATCTCAA
GTATCTGCAACAGTTCCCACAAGGTATATAATACATCATATTTCCCAGATTCTGTAATGC
TGATTTTTGTTTTCAGTTGATCGTGTATGCGATTATGTGAGTCACTAACAAGAGTCTTAG
GGAAAATATTCATCAGGTACCACTTCACATCCCTTACTTATTCACACGGAAATGCTTTGG
ATAGCGGTCAGATTGACGAGCTCTGCATCGAATCTTAGTATTCACCTCTGTGTCAATTAT
ATAGCCTTAGTTCCGACCCCTTCCTTCTTTTTTTCTTTGAAAAAAGCTCTTCTGGAGTTT
TATCAACAATTTTATTGTGTAGGTGGTTTCTTTGATGATACTGAAAATATTGATTATAAC
TTCACAGATCTGATTTTAAATGATATGTTTTAGCTCCTAAAGTTCTTTCTGAGAAATTCC
AGATTTTGTAAATACTTTGATGTCTATATCTTTATGTAAGTGGATTTGAAGCTTCTAGAT
GTAATAATTTTGTGCTCTTAGTGTGGATAAGCCGATACTCTTATCACTCAAATATGCTAA
CGTTTTTTTACCAAGAGTCGCTCATCTTTGTTGCTGTTATTTATGTATTATCACTCTTCG
ATGACCACACACTGGAAATAAACAACTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A883TF U 1
AF RR2A883JQ C 354
BS 1 760 RR2A883TF
BS 761 1112 RR2A883JQ

RD RR2A883TF 760 0 0
GGAGCTCCAACAATGGCGAATTCCTTCACTTCGCTTGCTGATTTGAAGGCCGATGGCTGT
TGAAGACCGGTCGCTGTTCGACCACAGCAGAGTTTTGTCTTTTGCGGTTTTGGGAGTCTA
GGATTGTGTCTCAAGATGTGGATGCTGTCGCTCTCCAATCCTACAGCGACAAGGAAAAAT
CTCTAGGCTCCAAGTATGTACATATACCTCTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTATATTTTAACACCAGATTGGGGTTTTGTGTGTATGTAAGATCCTG
CTTCCCGAGATATATAATCGAGACGATGTTGATTTGTTTTGGAATCGATGATGCCGCAAC
GGAATTAGCTGAGATTCATAATTCTTTGTAAATAGATCTAAATCTTATTTGGATTTCAAA
ACTAGAAAATTGGGTGGTTGTTGCAGGAAAAAGGTTTGAGAGAGGGTTTTGGCATCTCAA
GTATCTGCAACAGTTCCCACAAGGTATATAATACATCATATTTCCCAGATTCTGTAATGC
TGATTTTTGTTTTCAGTTGATCGTGTATGCGATTATGTGAGTCACTAACAAGAGTCTTAG
GGAAAATATTCATCAGGTACCACTTCACATCCCTTACTTATTCACACGGAAATGCTTTGG
ATAGCGGTCAGATTGACGAGCTCTGCATCGAATCTTAGTATTCACCTCTGTGTCAATTAT
ATAGCCTTAGTTCCGACCCCTTCCTTCTTTTTTTCTTTGA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2A883JQ 759 0 0
CCGCAACGGAATTAGCTGAGATTCATAATTCTTTGTAAATAGATCTAAATCTTATTTGGA
TTTCAAAACTAGAAAATTGGGTGGTTGTTGCAGGAAAAAGGTTTGAGAGAGGGTTTTGGC
ATCTCAAGTATCTGCAACAGTTCCCACAAGGTATATAATACATCATATTTCCCAGATTCT
GTAATGCTGATTTTTGTTTTCAGTTGATCGTGTATGCGATTATGTGAGTCACTAACAAGA
GTCTTAGGGAAAATATTCATCAGGTACCACTTCACATCCCTTACTTATTCACACGGAAAT
GCTTTGGATAGCGGTCAGATTGACGAGCTCTGCATCGAATCTTAGTATTCACCTCTGTGT
CAATTATATAGCCTTAGTTCCGACCCCTTCCTTCTTTTTTTCTTTGAAAAAAGCTCTTCT
GGAGTTTTATCAACAATTTTATTGTGTAGGTGGTTTCTTTGATGATACTGAAAATATTGA
TTATAACTTCACAGATCTGATTTTAAATGATATGTTTTAGCTCCTAAAGTTCTTTCTGAG
AAATTCCAGATTTTGTAAATACTTTGATGTCTATATCTTTATGTAAGTGGATTTGAAGCT
TCTAGATGTAATAATTTTGTGCTCTTAGTGTGGATAAGCCGATACTCTTATCACTCAAAT
ATGCTAACGTTTTTTTACCAAGAGTCGCTCATCTTTGTTGCTGTTATTTATGTATTATCA
CTCTTCGATGACCACACACTGGAAATAAACAACTTCTCC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL4259Contig1 697 2 1 U
GGACTCGAGTATTGATCGACTCCGGTCTTCTATTCTTCTCTTTCTTCTTCCTGTGAGATA
TTTGGAAAACCGAAACCGCGATTTAGCTGGTTTCAACCCCTTTTCTTCGGACGAGCAAAG
TTCGCTTCAAGCCAACATGAGTAGGCCAATGGAAGAGGACACCAACCAGGGAAAGACCGA
AGAGGAGGAGTTCAACACCGGACCCCTTTCTGTTCTGATGATGAGTGTTAAGAACAACAC
TCAAGTCTTGATCAACTGCCGCAACAACCGGAAACTCCTTGGCCGTGTTAGGGCTTTCGA
CAGGCACTGCAACATGGTTCTCGAAAATGTCAGAGAAATGTGGACTGAGGTACCTAAAAC
TGGGAAAGGAAAGAAGAAGGCTCTTCCCGTCAACAGAGATCGCTTTATTAGCAAGATGTT
TCTCCGTGGTGACTCTGTCATTATCGTCCTCAGGAATCCCAAGTAAGACAGAAAGAGTTT
GAGATGTCTGTTCGGAGTTGTTTTTTCTTCACTCTTCTCGTGACAGTCCTAATTGTTTGC
ATCAATGGAGATACATTTTTCATAATGAGTCTTAAAATCTAGTGTTCCCCTTGTATTTTT
CACTTGTGTTCTCTCTTATCTCTTATGACTAAGACGCAGCGTTGATCACTTGTGTTCTGT
CTTATCTCTCGTGGGTGCTCCTTATATGATAATTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CG33JQ C 1
AF RR2CG33TF U 1
BS 1 697 RR2CG33TF

RD RR2CG33JQ 697 0 0
GGACTCGAGTATTGATCGACTCCGGTCTTCTATTCTTCTCTTTCTTCTTCCTGTGAGATA
TTTGGAAAACCGAAACCGCGATTTAGCTGGTTTCAACCCCTTTTCTTCGGACGAGCAAAG
TTCGCTTCAAGCCAACATGAGTAGGCCAATGGAAGAGGACACCAACCAGGGAAAGACCGA
AGAGGAGGAGTTCAACACCGGACCCCTTTCTGTTCTGATGATGAGTGTTAAGAACAACAC
TCAAGTCTTGATCAACTGCCGCAACAACCGGAAACTCCTTGGCCGTGTTAGGGCTTTCGA
CAGGCACTGCAACATGGTTCTCGAAAATGTCAGAGAAATGTGGACTGAGGTACCTAAAAC
TGGGAAAGGAAAGAAGAAGGCTCTTCCCGTCAACAGAGATCGCTTTATTAGCAAGATGTT
TCTCCGTGGTGACTCTGTCATTATCGTCCTCAGGAATCCCAAGTAAGACAGAAAGAGTTT
GAGATGTCTGTTCGGAGTTGTTTTTTCTTCACTCTTCTCGTGACAGTCCTAATTGTTTGC
ATCAATGGAGATACATTTTTCATAATGAGTCTTAAAATCTAGTGTTCCCCTTGTATTTTT
CACTTGTGTTCTCTCTTATCTCTTATGACTAAGACGCAGCGTTGATCACTTGTGTTCTGT
CTTATCTCTCGTGGGTGCTCCTTATATGATAATTTTC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2CG33TF 697 0 0
GGACTCGAGTATTGATCGACTCCGGTCTTCTATTCTTCTCTTTCTTCTTCCTGTGAGATA
TTTGGAAAACCGAAACCGCGATTTAGCTGGTTTCAACCCCTTTTCTTCGGACGAGCAAAG
TTCGCTTCAAGCCAACATGAGTAGGCCAATGGAAGAGGACACCAACCAGGGAAAGACCGA
AGAGGAGGAGTTCAACACCGGACCCCTTTCTGTTCTGATGATGAGTGTTAAGAACAACAC
TCAAGTCTTGATCAACTGCCGCAACAACCGGAAACTCCTTGGCCGTGTTAGGGCTTTCGA
CAGGCACTGCAACATGGTTCTCGAAAATGTCAGAGAAATGTGGACTGAGGTACCTAAAAC
TGGGAAAGGAAAGAAGAAGGCTCTTCCCGTCAACAGAGATCGCTTTATTAGCAAGATGTT
TCTCCGTGGTGACTCTGTCATTATCGTCCTCAGGAATCCCAAGTAAGACAGAAAGAGTTT
GAGATGTCTGTTCGGAGTTGTTTTTTCTTCACTCTTCTCGTGACAGTCCTAATTGTTTGC
ATCAATGGAGATACATTTTTCATAATGAGTCTTAAAATCTAGTGTTCCCCTTGTATTTTT
CACTTGTGTTCTCTCTTATCTCTTATGACTAAGACGCAGCGTTGATCACTTGTGTTCTGT
CTTATCTCTCGTGGGTGCTCCTTATATGATAATTTTC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL4260Contig1 602 2 1 U
GATGACTTAACTGATATGCCAGCCGGAACAAAGACTTTCTTGCGACAAAAGGTTACTCTG
GGATCATCTAATCCAACCAGTGAAGCAACGCAAGAGAACACTAGAAAAGCTAAAAGCTGT
TCAAAAGAGAACAAAACAGAATGCGAAGGAGATGAGAAACTTGATGGGTTACAAGAAAGT
GAGAAAAGATGTTTGAAATCTTCCAAAGAATGTAACGTTGGTTCTGGTGCTCTACGGTAC
GCACTTCATCTGAGGTTTATTTGCCCATTACCCAAGAAAGCTTCAAAGAAACCTGATAAT
GACGACACCACGGGGCAAAAGAAAAACTTGGATTCAGATGGGAAGAGGAGATTCTATCTG
TACAACGACTTGAGAGTCGTGTTTCCACAACGCCACACAGATTCAGATGAAGGAAAGTTG
AATGTGGAGTACCATTACCCAGAAAACCCAAGATACTTCAACATCACAGACTAGGTTTTA
CACTGGTTGTATTTCGTTTTCTTGTTTAAGAAGAAATCAATGGACTTATTTGTACATAAC
CATGGCTTTGACACGACGTTGTACAGATTTAGGCCTTACGTTAAACTCTTACTCTTGTCC
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2E367TF U 1
AF RR2E367JQ C 199
BS 1 602 RR2E367TF

RD RR2E367TF 602 0 0
GATGACTTAACTGATATGCCAGCCGGAACAAAGACTTTCTTGCGACAAAAGGTTACTCTG
GGATCATCTAATCCAACCAGTGAAGCAACGCAAGAGAACACTAGAAAAGCTAAAAGCTGT
TCAAAAGAGAACAAAACAGAATGCGAAGGAGATGAGAAACTTGATGGGTTACAAGAAAGT
GAGAAAAGATGTTTGAAATCTTCCAAAGAATGTAACGTTGGTTCTGGTGCTCTACGGTAC
GCACTTCATCTGAGGTTTATTTGCCCATTACCCAAGAAAGCTTCAAAGAAACCTGATAAT
GACGACACCACGGGGCAAAAGAAAAACTTGGATTCAGATGGGAAGAGGAGATTCTATCTG
TACAACGACTTGAGAGTCGTGTTTCCACAACGCCACACAGATTCAGATGAAGGAAAGTTG
AATGTGGAGTACCATTACCCAGAAAACCCAAGATACTTCAACATCACAGACTAGGTTTTA
CACTGGTTGTATTTCGTTTTCTTGTTTAAGAAGAAATCAATGGACTTATTTGTACATAAC
CATGGCTTTGACACGACGTTGTACAGATTTAGGCCTTACGTTAAACTCTTACTCTTGTCC
TT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2E367JQ 404 0 0
TCTTCCAAAGAATGTAACGTTGGTTCTGGTGCTCTACGGTACGCACTTCATCTGAGGTTT
ATTTGCCCATTACCCAAGAAAGCTTCAAAGAAACCTGATAATGACGACACCACGGGGCAA
AAGAAAAACTTGGATTCAGATGGGAAGAGGAGATTCTATCTGTACAACGACTTGAGAGTC
GTGTTTCCACAACGCCACACAGATTCAGATGAAGGAAAGTTGAATGTGGAGTACCATTAC
CCAGAAAACCCAAGATACTTCAACATCACAGACTAGGTTTTACACTGGTTGTATTTCGTT
TTCTTGTTTAAGAAGAAATCAATGGACTTATTTGTACATAACCATGGCTTTGACACGACG
TTGTACAGATTTAGGCCTTACGTTAAACTCTTACTCTTGTCCTT

QA 1 404 1 404
DS 



AS 1 2

CO CL4261Contig1 457 2 4 U
AGGCTTGGGGTGGACTGATGGGCCCTGACTACAACTACTTCGAGAGAAGCAACCTCGACA
TTTTCAGCGGAAGAGCGCCGTGTTTACCTAGTCCGATCTGCTCTCTGAACCTAACCTCCG
ACGGCTCCGGCGATCACCACGGATGGTACGTCAACTACGTCGAGGTCTCGACCGCTGGAG
TTCACGCTCAGTGCTCCGCTCAGAATTTCGAGATCGAGCAGTGGCTTGCGACCGATACGT
CTCCGTATGAGCTTACTGCCGTGAGGAACAATTGTCCCGTGTCGCTTACGGATAGCGTCA
GTCGGGTCGGGTCGGAGATCCGGAAACAGCTCTCTTGGGTCATCTGAGTGATGATGAGAG
TGTGTGATTCGTATTGTATGTTTATCATCGTCTTATGAGTGTAATCTGGCCTTTGATTAA
TATGATTTCGATAAATAAAACATTTTAGTTACTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD22TF U 1
AF RR2BD22JQ C 27
BS 1 324 RR2BD22TF
BS 325 325 RR2BD22JQ
BS 326 442 RR2BD22TF
BS 443 457 RR2BD22JQ

RD RR2BD22TF 442 0 0
AGGCTTGGGGTGGACTGATGGGCCCTGACTACAACTACTTCGAGAGAAGCAACCTCGACA
TTTTCAGCGGAAGAGCGCCGTGTTTACCTAGTCCGATCTGCTCTCTGAACCTAACCTCCG
ACGGCTCCGGCGATCACCACGGATGGTACGTCAACTACGTCGAGGTCTCGACCGCTGGAG
TTCACGCTCAGTGCTCCGCTCAGAATTTCGAGATCGAGCAGTGGCTTGCGACCGATACGT
CTCCGTATGAGCTTACTGCCGTGAGGAACAATTGTCCCGTGTCGCTTACGGATAGCGTCA
GTCGGGTCGGGTCGGAGATCCGGATACAGCTCTCTTGGGTCATCTGAGTGATGATGAGAG
TGTGTGATTCGTATTGTATGTTTATCATCGTCTTATGAGTGTAATCTGGCCTTTGATTAA
TATGATTTCGATAAATAAAACA

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR2BD22JQ 431 0 0
GACTACAACTACTTCGAGAGAAGCAACCTCGACATTTTCAGCGGAAGAGCGCCGTGTTTA
CCTAGTCCGATCTGCTCTCTGAACCTAACCTCCGACGGCTCCGGCGATCACCACGGATGG
TACGTCAACTACGTCGAGGTCTCGACCGCTGGAGTTCACGCTCAGTGCTCCGCTCAGAAT
TTCGAGATCGAGCAGTGGCTTGCGACCGATACGTCTCCGTATGAGCTTACTGCCGTGAGG
AACAATTGTCCCGTGTCGCTTAGGGATAGCGTCAGTCGGGTCGGGTCGGAGATCCGGAAA
CAGCTTTCTTGGGTCATCTGAGTGATGATGAGAGTGTGTGATTCGTATTGTATGTTTATC
ATCGTCTTATGAGTGTAATCTGGCCTTTGATTAATATGATTTCGATAAATAAAACATTTT
AGTTACTTTGC

QA 1 431 1 431
DS 



AS 1 2

CO CL4262Contig1 1249 2 14 U
GGAAGTTGGTTGTTAGCTATGTGTTTACTCCCTCTCTTCTCTCGACGAATCCATCTTCTT
CGACCTTCTTAGCTTCGTCACTATTCTAAACCTGGAACTGAATCAGTGAGCTCCTAAAGA
AGAAGACAACAATGATGCAGACTTGTCGTATCCATCAGTCTTTTACTTTCCCTCATAGAA
CTCTTCCAAGGCGTGATGCTTCTTCCATCTCTATTAAACCCCCAAAAGTTTGTTTTACTC
TTAAAAAACAGCCTTTGGGGGTTTCGAACTTTATACGGGGAAGACGATTATATGTGAACT
TGAATGCTAATGACGCACACCCATCCATGTCTATGCTCGAAGAAGCAACCTCCCCTGAAA
ACACCGAAGAAGCTGAGCTTCCATTTAGTAAATGGTCACCTTCTAAATACATTTGGAGAG
GCTTGTCGGTCCCCATTATAGCGGGACAAGTCGTTCTCCGGATACTGAAAGGCAAGATCC
ACTGGAGAAACACTCTCCAGCAGCTGGAGAGAACCGGACCCAAGTCTCTAGGAGTCTGTC
TTCTCACTTCCACGTTTGTCGGCATGGCTTTCACTATCCAGTTCGTTAGAGAGTTTACTA
GACTAGGCCTCAACAGATCCATCGGTGGCGTCTTGGCTTTGGCCTTCTCTAGAGAGCTGA
GTCCGGTCATCACATCGATTGTTGTGGCCGGACGTATGGGAAGCGCTTTCGCAGCTGAGC
TAGGGACAATGCAAGTCTCTGAGCAGACGGATACGCTCCGTGTCTTGGGAGCGGATCCGA
TCGATTATCTGATCACGCCGAGAGTCATCGCTTCGTGTTTGGCTCTGCCGTTTCTGACGC
TCATGTGTTTCACCGTCGGGATGGCTTCGAGTGCTCTGCTCTCTGATGCGGTTTATGGGA
TTAGCATTAACATAATCATGGACTCGGCCCATCGAGCGCTTAGGCCGTGGGACATTGTGA
GCGCTATGATTAAGGCTCAGGTGTTTGGGGCTATTATATCGGTGATTAGCTGTTCTTGGG
GAGTGACTACGACGGGAGGTGCTAAAGGTGTTGGAGAATCTACAACTTCTGCTGTTGTTA
TGTCTCTTGTCGGAATCTTTATTGCGGATTTTGTGCTTTCTTCCTTCTTCTTTCAAGGTG
CTGGAGATTCTTTAAAGAACTGTGTGTGACGTACTCTTTTTTTTTTCTGGCTTCTTGATC
CAATTTGGATATTTGTGGTTTAGATCGGTTCAGTAAATCAGTTCAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D740TF U 1
AF RR2D740JQ C 416
BS 1 665 RR2D740TF
BS 666 666 RR2D740JQ
BS 667 708 RR2D740TF
BS 709 709 RR2D740JQ
BS 710 728 RR2D740TF
BS 729 729 RR2D740JQ
BS 730 749 RR2D740TF
BS 750 750 RR2D740JQ
BS 751 758 RR2D740TF
BS 759 759 RR2D740JQ
BS 760 768 RR2D740TF
BS 769 769 RR2D740JQ
BS 770 786 RR2D740TF
BS 787 1249 RR2D740JQ

RD RR2D740TF 792 0 0
GGAAGTTGGTTGTTAGCTATGTGTTTACTCCCTCTCTTCTCTCGACGAATCCATCTTCTT
CGACCTTCTTAGCTTCGTCACTATTCTAAACCTGGAACTGAATCAGTGAGCTCCTAAAGA
AGAAGACAACAATGATGCAGACTTGTCGTATCCATCAGTCTTTTACTTTCCCTCATAGAA
CTCTTCCAAGGCGTGATGCTTCTTCCATCTCTATTAAACCCCCAAAAGTTTGTTTTACTC
TTAAAAAACAGCCTTTGGGGGTTTCGAACTTTATACGGGGAAGACGATTATATGTGAACT
TGAATGCTAATGACGCACACCCATCCATGTCTATGCTCGAAGAAGCAACCTCCCCTGAAA
ACACCGAAGAAGCTGAGCTTCCATTTAGTAAATGGTCACCTTCTAAATACATTTGGAGAG
GCTTGTCGGTCCCCATTATAGCGGGACAAGTCGTTCTCCGGATACTGAAAGGCAAGATCC
ACTGGAGAAACACTCTCCAGCAGCTGGAGAGAACCGGACCCAAGTCTCTAGGAGTCTGTC
TTCTCACTTCCACGTTTGTCGGCATGGCTTTCACTATCCAGTTCGTTAGAGAGTTTACTA
GACTAGGCCTCAACAGATCCATCGGTGGCGTCTTGGCTTTGGCCTTCTCTAGAGAGCTGA
GTCCG*TCATCACATCGATTGTTGTGGCCGGACGTATGGGAAGCGCTT*CGCAGCTGAGC
TAGGGACA*TGCAAGTCTCTGAGCAGACG*ATACGCTC*GTGTCTTGG*AGCGGATCCGA
TCGATT
TCTGAT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2D740JQ 834 0 0
GGAGAGGC
TGTCGGTCCCCATTATAGCGGGACAAGTCGTTCTCCGGATACTGAAAGGCAAGATCCACT
GGAGAAACACTCTCCAGCAGCTGGAGAGAACCGGACCCAAGTCTCTAGGAGTCTGTCTTC
TCACTTCCACGTTTGTCGGCATGGCTTTCACTATCCAGTTCGTTAGAGAGTTTACTAGAC
TAGGCCTCAACAGATCCATCGGTGGCGTCTTGGCTTTGGCCTTCTCTAGAGAGCTGAGTC
CGGTCATCACATCGATTGTTGTGGCCGGACGTATGGGAAGCGCTTTCGCAGCTGAGCTAG
GGACAATGCAAGTCTCTGAGCAGACGGATACGCTCCGTGTCTTGGGAGCGGATCCGATCG
ATTATCTGATCACGCCGAGAGTCATCGCTTCGTGTTTGGCTCTGCCGTTTCTGACGCTCA
TGTGTTTCACCGTCGGGATGGCTTCGAGTGCTCTGCTCTCTGATGCGGTTTATGGGATTA
GCATTAACATAATCATGGACTCGGCCCATCGAGCGCTTAGGCCGTGGGACATTGTGAGCG
CTATGATTAAGGCTCAGGTGTTTGGGGCTATTATATCGGTGATTAGCTGTTCTTGGGGAG
TGACTACGACGGGAGGTGCTAAAGGTGTTGGAGAATCTACAACTTCTGCTGTTGTTATGT
CTCTTGTCGGAATCTTTATTGCGGATTTTGTGCTTTCTTCCTTCTTCTTTCAAGGTGCTG
GAGATTCTTTAAAGAACTGTGTGTGACGTACTCTTTTTTTTTTCTGGCTTCTTGATCCAA
TTTGGATATTTGTGGTTTAGATCGGTTCAGTAAATCAGTTCAATCC

QA 9 834 9 834
DS 



AS 1 2

CO CL4263Contig1 998 2 4 U
GGGACTTGGGATTTGGATACTGACCAAGAAGATGATTCGGTGGTTGGTAATAACTCGTAT
TACAAGGTGAAATGGGAGAAGAAGGTTGGTGGTAACGAGAGTTGGGTGTTTCATCATTTG
TTGAAGACTTCTTCTAAGTACCCATGGTTGATGCTTTATCTACGAGCTGACGCTTCTCGT
GGCTTCTCTGGTGGGTATCATTACGATACTAGAGGAATGATGAAAATGACGCTGAAATCT
CCGGACTTCAAGGTTAGATTCAAGCTAGAGATTCTAAAAGGTGGCGGTTCAGGGAGCCAG
TTTTATCTAATGGACATGGGAAGTTCTGGAAAAACGACGGTAGCGAATGCGACGGTGACG
TCACCAGCGACGTGACTAGGTACAGCGAGATGATAATCAACCCCCAGTCAACCGCAGTTT
GCGGCCCCAACCGCTTAAACGCTTGTCCACCGGAACACGCGTTTCTAAACGGGACTAAAG
TTCACAGGACGGACAAGGAGAGGTTCCCTTACGAAGCGTATCACTATTACTGCGTTCCTG
GGAACGCGCGTTTCGCGGAAGCTCCGTACGATGTCTGCGATCCGTACAGTAATCCCCAGC
CGCAGGAGATTCTGCAGATCTTGCCTCATCCAGTGTGGGGAGAATTTGGGTATCCGACAA
AGAAAGGACAAGGTTGGATTGGAGATCCAAGAACTTGGGAACTTGATGTCGGAAAACTCT
TTCAGTCACTTCACTTTTACCAGGATCCAGGGACGGAGCCGGTGAAAAGACACTGGTCGT
CAATAGATTTAGGAACTGAAATATATATGAGCAAGAATCAAATTGCAGAATGGACTGTAT
CTGATTTCGACATTGTTATACCAAAGACCAATGTTTGAGTGGAAAAAATGTATATATATC
TTCTTAAAAATGCTGATATAAGACATGTCAATTAACTCTTCAAGAATCTTGATTGTTGTT
GATATTATCATCGAATTGAGAAAAGGAGATGTTTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F765TF U 1
AF RR2F765JQ C 250
BS 1 605 RR2F765TF
BS 606 606 RR2F765JQ
BS 607 662 RR2F765TF
BS 663 998 RR2F765JQ

RD RR2F765TF 662 0 0
GGGACTTGGGATTTGGATACTGACCAAGAAGATGATTCGGTGGTTGGTAATAACTCGTAT
TACAAGGTGAAATGGGAGAAGAAGGTTGGTGGTAACGAGAGTTGGGTGTTTCATCATTTG
TTGAAGACTTCTTCTAAGTACCCATGGTTGATGCTTTATCTACGAGCTGACGCTTCTCGT
GGCTTCTCTGGTGGGTATCATTACGATACTAGAGGAATGATGAAAATGACGCTGAAATCT
CCGGACTTCAAGGTTAGATTCAAGCTAGAGATTCTAAAAGGTGGCGGTTCAGGGAGCCAG
TTTTATCTAATGGACATGGGAAGTTCTGGAAAAACGACGGTAGCGAATGCGACGGTGACG
TCACCAGCGACGTGACTAGGTACAGCGAGATGATAATCAACCCCCAGTCAACCGCAGTTT
GCGGCCCCAACCGCTTAAACGCTTGTCCACCGGAACACGCGTTTCTAAACGGGACTAAAG
TTCACAGGACGGACAAGGAGAGGTTCCCTTACGAAGCGTATCACTATTACTGCGTTCCTG
GGAACGCGCGTTTCGCGGAAGCTCCGTACGATGTCTGCGATCCGTACAGTAATCCCCAGC
CGCAG*AGATTCTGCAGATCTTGCCTCATCCAGTGTGGGGAGAATTTGGGTATCCGACAA
AG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2F765JQ 749 0 0
AAGGTTAGATTCAAGCTAGAGATTCTAAAAGGTGGCGGTTCAGGGAGCCAGTTTTATCTA
ATGGACATGGGAAGTTCTGGAAAAACGACGGTAGCGAATGCGACGGTGACGTCACCAGCG
ACGTGACTAGGTACAGCGAGATGATAATCAACCCCCAGTCAACCGCAGTTTGCGGCCCCA
ACCGCTTAAACGCTTGTCCACCGGAACACGCGTTTCTAAACGGGACTAAAGTTCACAGGA
CGGACAAGGAGAGGTTCCCTTACGAAGCGTATCACTATTACTGCGTTCCTGGGAACGCGC
GTTTCGCGGAAGCTCCGTACGATGTTTGCGATCCGTACAGTAATCCCCAGCCGCAGGAGA
TTCTGCAGATCTTGCCTCATCCAGTGTGGGGAGAATTTGGGTATCCGACAAAGAAAGGAC
AAGGTTGGATTGGAGATCCAAGAACTTGGGAACTTGATGTCGGAAAACTCTTTCAGTCAC
TTCACTTTTACCAGGATCCAGGGACGGAGCCGGTGAAAAGACACTGGTCGTCAATAGATT
TAGGAACTGAAATATATATGAGCAAGAATCAAATTGCAGAATGGACTGTATCTGATTTCG
ACATTGTTATACCAAAGACCAATGTTTGAGTGGAAAAAATGTATATATATCTTCTTAAAA
ATGCTGATATAAGACATGTCAATTAACTCTTCAAGAATCTTGATTGTTGTTGATATTATC
ATCGAATTGAGAAAAGGAGATGTTTAAGG

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL4264Contig1 871 2 2 U
GGGAGACGATAATAAACACACAGAGAATGGAGAAGTACTTTGGAAATGCGTACAGGGGAG
ATCCAGGAGTGCCGCACGCGGATGCTGATAGGTTCGTGAACATATGGATTGGCTCGGCTG
CCCTCTCTGCTCTCACCTGGGTCAATCCTTACATGTGGCAGCTCTCCAGCCAGTTCAAGT
ATTAACTAACTCTTTTATTCTCTCTCTCTCTTGACCAATCTGGATTCGAAGGTTTGTGGC
TTTTTTGTTTTCTGTGTGTTTGGTTTTTCTCTGAGTGCTAGTGTTTTGGTGCGTCTGAAT
TGGCTTCTCTGACTTACTCTACCGAGACTTTGTTTGTGCATCTAGCTCTTGCTTCTGTTG
GGTTACAGGAAAGTTTGAGACTTTGGTTCCTTTTAGACGAAACTGAATGGAGTTTTGTTG
TTAAGGCATAGCTAAAACGTCAGCGTTTTTTGGTCTTATGGAGGCTTGTAACTTCGTAGT
AGTCTCCTCTCTTTGTATGATAACACGATTCAGTTCACGATAGCTAGCTAGCTAGCTAGT
AGTATGTTTCCTCTCTTCATAAAGCTTTTTATCATGATAAGTGGATGCTCTTTGAGCAGT
ACCACTGGAAAAAAGCAAGGGCGAAGAAGCAGCCTTACGAATTCAAGTGGAATAAGATAC
CGAAAGAAGTCAGGGACTCGTATTATTACAACTGGCCTGTCTACTTCCCTTAGAAGAAAC
CTCTGCCTTGGAATCTTTTCAGCTTGCCTTGTCGAACTTATTAAGAATGTAACTCTGTTT
GCTTCTCGTTCTGTTCCTTTTCTGTTGGATTTTAAGTTTGGTCTGTACTGATCACTCAAC
TATCCTCTTCTAGATGAAACTCTTATGGCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA89TF U 1
AF RR2GA89JQ C 173
BS 1 589 RR2GA89TF
BS 590 871 RR2GA89JQ

RD RR2GA89TF 589 0 0
GGGAGACGATAATAAACACACAGAGAATGGAGAAGTACTTTGGAAATGCGTACAGGGGAG
ATCCAGGAGTGCCGCACGCGGATGCTGATAGGTTCGTGAACATATGGATTGGCTCGGCTG
CCCTCTCTGCTCTCACCTGGGTCAATCCTTACATGTGGCAGCTCTCCAGCCAGTTCAAGT
ATTAACTAACTCTTTTATTCTCTCTCTCTCTTGACCAATCTGGATTCGAAGGTTTGTGGC
TTTTTTGTTTTCTGTGTGTTTGGTTTTTCTCTGAGTGCTAGTGTTTTGGTGCGTCTGAAT
TGGCTTCTCTGACTTACTCTACCGAGACTTTGTTTGTGCATCTAGCTCTTGCTTCTGTTG
GGTTACAGGAAAGTTTGAGACTTTGGTTCCTTTTAGACGAAACTGAATGGAGTTTTGTTG
TTAAGGCATAGCTAAAACGTCAGCGTTTTTTGGTCTTATGGAGGCTTGTAACTTCGTAGT
AGTCTCCTCTCTTTGTATGATAACACGATTCAGTTCACGATAGCTAGCTAGCTAGCTAGT
AGTATGTTTCCTCTCTTCATAAAGCTTTTTATCATGATAAGTGGATGCT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2GA89JQ 699 0 0
GTTCAAGTATTAACTAACTCTTTTATTCTCTCTCTCTCTTGACCAATCTGGATTCGAAGG
TTTGTGGCTTTTTTGTTTTCTGTGTGTTTGGTTTTTCTCTGAGTGCTAGTGTTTTGGTGC
GTCTGAATTGGCTTCTCTGACTTACTCTACCGAGACTTTGTTTGTGCATCTAGCTCTTGC
TTCTGTTGGGTTACAGGAAAGTTTGAGACTTTGGTTCCTTTTAGACGAAACTGAATGGAG
TTTTGTTGTTAAGGCATAGCTAAAACGTCAGCGTTTTTTGGTCTTATGGAGGCTTGTAAC
TTCGTAGTAGTCTCCTCTCTTTGTATGATAACACGATTCAGTTCACGATAGCTAGCTAGC
TAGCTAGTAGTATGTTTCCTCTCTTCATAAGGCTTTTTATCATGATAAGTGGATGCTCTT
TGAGCAGTACCACTGGAAAAAAGCAAGGGCGAAGAAGCAGCCTTACGAATTCAAGTGGAA
TAAGATACCGAAAGAAGTCAGGGACTCGTATTATTACAACTGGCCTGTCTACTTCCCTTA
GAAGAAACCTCTGCCTTGGAATCTTTTCAGCTTGCCTTGTCGAACTTATTAAGAATGTAA
CTCTGTTTGCTTCTCGTTCTGTTCCTTTTCTGTTGGATTTTAAGTTTGGTCTGTACTGAT
CACTCAACTATCCTCTTCTAGATGAAACTCTTATGGCGG

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL4265Contig1 1016 2 2 U
GGACCTCACATCTTTCTTTCTCCTTCGGTCGGATTGCAAAAAACTAGAGATAGAGAGAGA
GAAGCTGCAAGGAAACAACAGTCTTCTTCAATGTCGGTTTTTAACTCTAACAACAACGAA
TCAACGATGAAAGATGACGAAAAAGATGAATCCACGGTGGCTGGTAACTGCCCCCACACC
CACCGCCTCTCTTTCCCCCCCCCAGATTTTTTTCTTACATATCTCACTAACAGTTTGTCG
GTTACATCCTTCCCCTAAACCTTTATAAACCCTAAACCCCCTCATCATCTTCCCCTTAAT
TTATCTCCTTAAGTAAACTCCTTGATTAACCACACACCACTCCCATAAATTTACTTCGCC
TGCCTAAAAACCAATATAACTTCTTATATATTTATTTCAAAATGAGCCCAGAGAAAGATG
GTGTTTCCAAACCCACTCCACTCTCCATACCCATTTCGACCCGACCCGAATCCGACGTGG
CTTCTCCGCTCCCGATGCCGCTAGACATCCTGCACGGGAACCCAATCCCGCCGTTTCTCT
CCAAAACATTCGATTTGGTGGATGACCCGAGTCTCGACCCGGTCATATCTTGGGGACTTA
CCGGAGCGAGCTTCGTCGTCTGGGACCCCGTGGAGTTCGCCAGAATCATACTCCCGCGGA
ATTTCAAACACAACAATTTCTCCAGCTTCGTCAGACAGCTTAACACTTATGTCGGTATCT
CTGTTATGTCTCCCTTAGTGTAAAATTATTATAATATGTTCCTCTGCTTTTGTTTTGTAG
ATTTGGATAAGATGCTGATGATTCATGGATGTTTTTTTTTCTTTAACATTTGTTAACTCC
TTTCCCTGTTTCTTCTTTCAAATTTTTTGTATTTTTTGTAATTTCCAACATGTTGTATAG
ATTGTTGAAACTGTTTTTTTTTTAACTGCTGTAATTATGTTTTAATGGGATTTGCAATCT
CTATAATAATGTAAAGGTTTCTGAGTAATGTATCTATGAACTTGGGTTTGTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H678TF U 1
AF RR2H678JQB C 311
BS 1 733 RR2H678TF
BS 734 1016 RR2H678JQB

RD RR2H678TF 739 0 0
GGACCTCACATCTTTCTTTCTCCTTCGGTCGGATTGCAAAAAACTAGAGATAGAGAGAGA
GAAGCTGCAAGGAAACAACAGTCTTCTTCAATGTCGGTTTTTAACTCTAACAACAACGAA
TCAACGATGAAAGATGACGAAAAAGATGAATCCACGGTGGCTGGTAACTGCCCCCACACC
CACCGCCTCTCTTTCCCCCCCCCAGATTTTTTTCTTACATATCTCACTAACAGTTTGTCG
GTTACATCCTTCCCCTAAACCTTTATAAACCCTAAACCCCCTCATCATCTTCCCCTTAAT
TTATCTCCTTAAGTAAACTCCTTGATTAACCACACACCACTCCCATAAATTTACTTCGCC
TGCCTAAAAACCAATATAACTTCTTATATATTTATTTCAAAATGAGCCCAGAGAAAGATG
GTGTTTCCAAACCCACTCCACTCTCCATACCCATTTCGACCCGACCCGAATCCGACGTGG
CTTCTCCGCTCCCGATGCCGCTAGACATCCTGCACGGGAACCCAATCCCGCCGTTTCTCT
CCAAAACATTCGATTTGGTGGATGACCCGAGTCTCGACCCGGTCATATCTTGGGGACTTA
CCGGAGCGAGCTTCGTCGTCTGGGACCCCGTGGAGTTCGCCAGAATCATACTCCCGCGGA
ATTTCAAACACAACAATTTCTCCAGCTTCGTCAGACAGCTTAACACTTATGTCGGTATCT
CTGTTATGTCTCC
TTAGTG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2H678JQB 706 0 0
AAGTAAACTCCTTGATTAACCACACACCACTCCCATAAATTTACTTCGCCTGCCTAAAAA
CCAATATAACTTCTTATATATTTATTTCAAAATGAGCCCAGAGAAAGATGGTGTTTCCAA
ACCCACTCCACTCTCCATACCCATTTCGACCCGACCCGAATCCGACGTGGCTTTTCCGCT
CCCGATGCCGCTAGACATCCTGCACGGGAACCCAATCCCGCCGTTTCTCTCCAAAACATT
CGATTTGGTGGATGACCCGAGTCTCGACCCGGTCATATTTTGGGGACTTACCGGAGCGAG
CTTCGTCGTTTGGGACCCCGTGGAGTTCGCCAGAATCATACTCCCGCGGAATTTCAAACA
CAACAATTTCTCCAGCTTCGTCAGACAGCTTAACACTTATGTCGGTATCTCTGTTATGTC
TCCCTTAGTGTAAAATTATTATAATATGTTCCTCTGCTTTTGTTTTGTAGATTTGGATAA
GATGCTGATGATTCATGGATGTTTTTTTTTCTTTAACATTTGTTAACTCCTTTCCCTGTT
TCTTCTTTCAAATTTTTTGTATTTTTTGTAATTTCCAACATGTTGTATAGATTGTTGAAA
CTGTTTTTTTTTTAACTGCTGTAATTATGTTTTAATGGGATTTGCAATCTCTATAATAAT
GTAAAGGTTTCTGAGTAATGTATCTATGAACTTGGGTTTGTGTTTT

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL4266Contig1 1002 2 6 U
TTTTTTTGATGAAGTGAAGGATAAGGAGAAGGTAGAGGAGAGTGTTAGTGAGAAGAAAGT
TGAACAATTTTTCAAGGGTTTGAAGTCAAATAATGAGAGAGGTGTGGCTAGTGGTGGTGG
TGATGGAGAGCCTTTCCTTGTGACGAGAAACGGTGAGCTTCCTCCTAGATGGGATGGTCC
TAATGGTACTGTTCTTTTGGTGAACAAACCCAAAGGATGGACTTCCTTTACCGTGTGTGG
TAAGCTACGACGAATAGTCAAAGTGAAAAAGGTTGGTCACGCTGGAACACTTGATCCCAT
GGCTACTGGTCTCTTAATCGTCTGCGTTGGTAAAGCCACCAAGGTGGTTGACAGATACCA
AGGGATGATCAAAGGTTACAGTGGAGTTTTTCGCCTTGGTGAAGCTACTTCAACTTTAGA
CGCGGACTCTCCTGTGATTCAACGAGAGCCTTGGGAGCACATTAAAGACGATGACATTAA
GAAAGCTTTGACATCTTTTCTTGGCGAGATATGGCAAGTCCCTCCAATGTTCTCAGCTAT
TAAAGTTGGAGGTGAGAAGATGTATGACAAGGCAAGACGAGGAGAAACCGTAGAGCTTTC
TCCCAGACGAATCTCCATTTTCCAGTTTGACATCGAACGTAGTTTAGATGACAGACAGAA
TCTGATTTTTCGAGTTGTGTGCTCAAAGGGTACATACATAAGATCTCTATGTGCAGACCT
TGCTAAAGCTCTTGGAAGTTGTGCTCACCTCGCTGCTCTCCGGCGAGATTCAATCGGTGA
ATACTCTGCTAACGATGCTTGGGAATTCAATGAGCTGGAAGCAGCAATTACCAAAAACTA
CTTCTAGAAGAACACGAAGGCTTTGATAGATGCTTCCATAAATGAGTAGAATATCCATCA
AACGGTGGATTCTTGGTGACAAACAAAGGCTTACATAGATCACTGTTTGTTCTTTTAAAC
GCTTACATTATTGCCCAAGAGTATATCTAAGACCCTTATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP56TF U 1
AF RR2D188TF U 291
BS 1 393 RR2CP56TF
BS 394 394 RR2D188TF
BS 395 690 RR2CP56TF
BS 691 691 RR2D188TF
BS 692 718 RR2CP56TF
BS 719 1002 RR2D188TF

RD RR2CP56TF 720 0 0
TTTTTTTGATGAAGTGAAGGATAAGGAGAAGGTAGAGGAGAGTGTTAGTGAGAAGAAAGT
TGAACAATTTTTCAAGGGTTTGAAGTCAAATAATGAGAGAGGTGTGGCTAGTGGTGGTGG
TGATGGAGAGCCTTTCCTTGTGACGAGAAACGGTGAGCTTCCTCCTAGATGGGATGGTCC
TAATGGTACTGTTCTTTTGGTGAACAAACCCAAAGGATGGACTTCCTTTACCGTGTGTGG
TAAGCTACGACGAATAGTCAAAGTGAAAAAGGTTGGTCACGCTGGAACACTTGATCCCAT
GGCTACTGGTCTCTTAATCGTCTGCGTTGGTAAAGCCACCAAGGTGGTTGACAGATACCA
AGGGATGATCAAAGGTTACAGTGGAGTTTTTCGTCTTGGTGAAGCTACTTCAACTTTAGA
CGCGGACTCTCCTGTGATTCAACGAGAGCCTTGGGAGCACATTAAAGACGATGACATTAA
GAAAGCTTTGACATCTTTTCTTGGCGAGATATGGCAAGTCCCTCCAATGTTCTCAGCTAT
TAAAGTTGGAGGTGAGAAGATGTATGACAAGGCAAGACGAGGAGAAACCGTAGAGCTTTC
TCCCAGACGAATCTCCATTTTCCAGTTTGACATCGAACGTAGTTTAGATGACAGACAGAA
TCTGATTTTTCGAGTTGTGTGCTCAAAGGG*ACATACATAAGATCTCTATGTGCAGAC
TT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2D188TF 712 0 0
GG
GATCCCATGGCTACTGGTCTCTTAATCGTCTGCGTTGGTAAAGCCACCAAGGTGGTTGAC
AGATACCAAGGGATGATCAAAGGTTACAGTGGAGTTTTTCGCCTTGGTGAAGCTACTTCA
ACTTTAGACGCGGACTCTCCTGTGATTCAACGAGAGCCTTGGGAGCATATTAAAGACGAT
GACATTAAGAAAGCTTTGACATCTTTTCTTGGCGAGATATGGCAAGTCCCTCCAATGTTC
TCAGCTATTAAAGTTGGAGGTGAGAAGATGTATGACAAGGCAAGACGAGGAGAAACCGTA
GAGCTTTCTCCCAGACGAATCTCCATTTTCCAGTTTGACATCGAACGTAGTTTAGATGAC
AGACAGAATCTGATTTTTCGAGTTGTGTGCTCAAAGGGTACATACATAAGATCTCTATGT
GCAGACCTTGCTAAAGCTCTTGGAAGTTGTGCTCACCTCGCTGCTCTCCGGCGAGATTCA
ATCGGTGAATACTCTGCTAACGATGCTTGGGAATTCAATGAGCTGGAAGCAGCAATTACC
AAAAACTACTTCTAGAAGAACACGAAGGCTTTGATAGATGCTTCCATAAATGAGTAGAAT
ATCCATCAAACGGTGGATTCTTGGTGACAAACAAAGGCTTACATAGATCACTGTTTGTTC
TTTTAAACGCTTACATTATTGCCCAAGAGTATATCTAAGACCCTTATCTT

QA 3 712 3 712
DS 



AS 1 2

CO CL4267Contig1 1223 2 8 U
GGATCTCTGTTCTTAATCATCTCATGCACACACACACGATTTCTCTCACACAGACATCTC
TCTCCGTTTCACTCTCCTAATCTCTCTCTCACACGCGACAAATCGATCTCAAACCTAGAA
TCGGGAACCCTAATCCGTCGTCGCAGACTGTTCCAACTTCGACGGTGGCTCCTAACCCTG
ACTTGTTTACTCCGTCTTTCACTCAGCGGCTCCTCCTTCTCCGACGAATTCTACAGTCTC
ATCTTCATCTTGTTCGAGCACTGGTATGTTGCAGAAAGTCCGACGATTTCGACGGATCTA
ACCACTCTCGCACCGGATTCGTGAGCGGTCTCGAAGTTCCCAAAAGCATTGATTCGTGCT
GTTTTGAGATGATTCGAGTATAATGTTTCCAGATTCGTAGTGCGTAAGTGAGATTTTGTG
CAGATTTGCTCGTTCTTCTAGTGACTACTGTGTTGAGATTGTTAATTAGTGGATGAGTGA
GTTATTGTTGTTGATTTTGAGTGAGTTTTAATGGTTGTAGCTTTAATGGTGTTTGTTGTG
CAGGAGAATGATTTTACGCCTTTTGGAGGTGATTTGATTGGAGAGTTGAAGAATGGACTT
TTGAAGCAGAGAACAAACAGAGCATCACGCTCTCGATTGGAAAAAATGCAGTATAATCAG
AAAAAAGAGTCTTATCCAACGCCGCTTATCCAAATAAGAGACATCTAAAATCAGTATGGT
GTCGTTGGGAGATTTTGTTCATCATAGCTTCTCTGCATTTGCTCTACTTGGTGTTTCCCA
TTTTATCAGGGAATAAAAGTTATAGATGAATCTCATGAGCAACATACCACAGATCTTGAT
AATTCCTTTGGTTATTTGTTTTCTGTTTTCTGCAGTGTCAGTGGAGAAAACAAGCATTAC
AAGTCTCTCCCACAGATCTTTGGAGGATCTTCTAGGAAATGCAGTAGCTTCTGAATAATG
CAAGGGTTGATCTTTGCTGATTTCTTCTTGACTTGATCTTATGATTGTTTTGTAGGTTGA
AGATGAAGTCACTAGACTTAGGAATTGTTTTGGTTTTTGTGTATTTGGATTGAACACTCA
AATATATATATGCAGGGTGTTGCATTAACATAAGAAAACTCGTTGATGGATAGATTTGAT
GGTGTTCTCCTATGGAGTTCATGTGTTTCATGTATTGATTTGTATGTTTTGAATTTTTAA
TGGAAAAGTATATGGTATTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET77TF U 1
AF RR2ET77JQ C 331
BS 1 645 RR2ET77TF
BS 646 646 RR2ET77JQ
BS 647 709 RR2ET77TF
BS 710 710 RR2ET77JQ
BS 711 735 RR2ET77TF
BS 736 736 RR2ET77JQ
BS 737 785 RR2ET77TF
BS 786 1223 RR2ET77JQ

RD RR2ET77TF 785 0 0
GGATCTCTGTTCTTAATCATCTCATGCACACACACACGATTTCTCTCACACAGACATCTC
TCTCCGTTTCACTCTCCTAATCTCTCTCTCACACGCGACAAATCGATCTCAAACCTAGAA
TCGGGAACCCTAATCCGTCGTCGCAGACTGTTCCAACTTCGACGGTGGCTCCTAACCCTG
ACTTGTTTACTCCGTCTTTCACTCAGCGGCTCCTCCTTCTCCGACGAATTCTACAGTCTC
ATCTTCATCTTGTTCGAGCACTGGTATGTTGCAGAAAGTCCGACGATTTCGACGGATCTA
ACCACTCTCGCACCGGATTCGTGAGCGGTCTCGAAGTTCCCAAAAGCATTGATTCGTGCT
GTTTTGAGATGATTCGAGTATAATGTTTCCAGATTCGTAGTGCGTAAGTGAGATTTTGTG
CAGATTTGCTCGTTCTTCTAGTGACTACTGTGTTGAGATTGTTAATTAGTGGATGAGTGA
GTTATTGTTGTTGATTTTGAGTGAGTTTTAATGGTTGTAGCTTTAATGGTGTTTGTTGTG
CAGGAGAATGATTTTACGCCTTTTGGAGGTGATTTGATTGGAGAGTTGAAGAATGGACTT
TTGAAGCAGAGAACAAACAGAGCATCACGCTCTCGATTGGAAAAA*TGCAGTATAATCAG
AAAAAAGAGTCTTATCCAACGCCGCTTATCCAAATAAGAGACATCTAAA*TCAGTATGGT
GTCGTTGGGAGATTT*GTTCATCATAGCTTCTCTGCATTTGCTCTACTTGGTGTTTCCCA
TTTTA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2ET77JQ 893 0 0
GTCTCGAAGTCCCAAAGCA
TGATTCGTGCTGTTT*GAGATGATTCGAGTATAATGTTTCCAGATTCGTAGTGCGTAAGT
GAGATTTTGTGCAGATT*GCTCGT*CTTCTAGTGACTACTGTGTTGAGATTGTTAATTAG
TGGATGAGTGAGTTATTGTTGTTGATTTTGAGTGAGTTTTAATGGTTGTAGCTTTAATGG
TGTTTGTTGTGCAGGAGAATGATTTTACGCCTTTTGGAGGTGATTTGATTGGAGAGTTGA
AGAATGGACTTTTGAAGCAGAGAACAAACAGAGCATCAGGCTCTCGATTGGAAAAAATGC
AGTATAATCAGAAAAAAGAGTCTTATCCAACGCCGCTTATCCAAATAAGAGACATCTAAA
ATCAGTATGGTGTCGTTGGGAGATTTTGTTCATCATAGCTTCTCTGCATTTGCTCTACTT
GGTGTTTCCCATTTTATCAGGGAATAAAAGTTATAGATGAATCTCATGAGCAACATACCA
CAGATCTTGATAATTCCTTTGGTTATTTGTTTTCTGTTTTCTGCAGTGTCAGTGGAGAAA
ACAAGCATTACAAGTCTCTCCCACAGATCTTTGGAGGATCTTCTAGGAAATGCAGTAGCT
TCTGAATAATGCAAGGGTTGATCTTTGCTGATTTCTTCTTGACTTGATCTTATGATTGTT
TTGTAGGTTGAAGATGAAGTCACTAGACTTAGGAATTGTTTTGGTTTTTGTGTATTTGGA
TTGAACACTCAAATATATATATGCAGGGTGTTGCATTAACATAAGAAAACTCGTTGATGG
ATAGATTTGATGGTGTTCTCCTATGGAGTTCATGTGTTTCATGTATTGATTTGTATGTTT
TGAATTTTTAATGGAAAAGTATATGGTATTTATG

QA 20 893 20 893
DS 



AS 1 2

CO CL4268Contig1 797 2 2 U
GGAATCAAAAACGTTCGAACCGGTGAAGAGAGGTTTGACCTGAGATCACAACCTAATCAG
TCTCTACTCCGATTCACCATCACGATGTGGAGAAGAATCGTCTCTTCCGGTCTCAAAACG
CTAGCCGCCGATGTCGCCGTCGCTTCGCCTTCTCGTCGATCGATAGCCGGCTCCGCCAGA
CCCGTCGGCTTCTACCTCACTGCCGGTCGATCTCCCACCTCCTTCATCACTCGTCATTTC
AGCTCGGAACCAGGGATCACCCCTGCAAAGAAGAAGGTGGAGGATGTAATGCCCATAGCT
ACTGGTCATGAGAAGGAAGAGCTTGAAGCTGAACTTGAGGGGAGGAGGCTGCTTGACATT
GACTTCCCCGAAGGTCCTTTTGGAACTAAGGAAGCTCCTGCTATTGTGAAGTCCTACTAT
GACAAGCGGATTGTGGGATGCCCTGGTGGTGAAGGCGAGGAGGAGCACGATGTTGTGTGG
TTCTGGCTGGAGAAAGGAAAGTCTTTTGAATGTCCGGTTTGCACTCAGTACTTCGAGCTG
GAAGTGGTTGGTCCTGGTGGACCTCCCGATGGTCACGGTGATGAAGACGATGAGCACCAT
CACTGAGAGACAAACATTTTGTTTTCAGTCTTTTTTTTTCCAAATGTTCCACATTTCTTT
GTTGGAATAAACAGATGTTTTTCGATCCGTTTGAAACAACACTCAAGCATCGGAGTTTAT
AAAATGCCAAAACTCTTATGACCGTGGTTTCCCCTTTTGTAAACAACTCTTGAATCTGAA
TCGGTCTTTTGCCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA63TF U 1
AF RR2DA63JQ C 191
BS 1 603 RR2DA63TF
BS 604 797 RR2DA63JQ

RD RR2DA63TF 603 0 0
GGAATCAAAAACGTTCGAACCGGTGAAGAGAGGTTTGACCTGAGATCACAACCTAATCAG
TCTCTACTCCGATTCACCATCACGATGTGGAGAAGAATCGTCTCTTCCGGTCTCAAAACG
CTAGCCGCCGATGTCGCCGTCGCTTCGCCTTCTCGTCGATCGATAGCCGGCTCCGCCAGA
CCCGTCGGCTTCTACCTCACTGCCGGTCGATCTCCCACCTCCTTCATCACTCGTCATTTC
AGCTCGGAACCAGGGATCACCCCTGCAAAGAAGAAGGTGGAGGATGTAATGCCCATAGCT
ACTGGTCATGAGAAGGAAGAGCTTGAAGCTGAACTTGAGGGGAGGAGGCTGCTTGACATT
GACTTCCCCGAAGGTCCTTTTGGAACTAAGGAAGCTCCTGCTATTGTGAAGTCCTACTAT
GACAAGCGGATTGTGGGATGCCCTGGTGGTGAAGGCGAGGAGGAGCACGATGTTGTGTGG
TTCTGGCTGGAGAAAGGAAAGTCTTTTGAATGTCCGGTTTGCACTCAGTACTTCGAGCTG
GAAGTGGTTGGTCCTGGTGGACCTCCCGATGGTCACGGTGATGAAGACGATGAGCACCAT
CAC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2DA63JQ 607 0 0
TCTACCTCACTGCCGGTCGATCTCCCACCTCCTTCATCACTCGTCATTTCAGCTCGGAAC
CAGGGATCACCCCTGCAAAGAAGAAGGTGGAGGATGTAATGCCCATAGCTACTGGTCATG
AGAAGGAAGAGCTTGAAGCTGAACTTGAGGGGAGGAGGCTGCTTGACATTGACTTCCCCG
AAGGTCCTTTTGGAACTAAGGAAGCTCCTGCTATTGTGAAGTCCTACTATGACAAGCGGA
TTGTGGGATGCCCTGGTGGTGAAGGCGAGGAGGAGCACGATGTTGTGTGGTTCTGGCTGG
AGAAAGGAAAGTCTTTTGAATGTCCGGTTTGCACTCAGTACTTCGAGCTGGAAGTGGTTG
GTCCTGGTGGACCTCCCGATGGTCACGGTGATGAAGACGATGAGCACCATCACTGAGAGA
CAAACATTTTGTTTTCAGTCTTTTTTTTTCCAAATGTTCCACATTTCTTTGTTGGAATAA
ACAGATGTTTTTCGATCCGTTTGAAACAACACTCAAGCATCGGAGTTTATAAAATGCCAA
AACTCTTATGACCGTGGTTTCCCCTTTTGTAAACAACTCTTGAATCTGAATCGGTCTTTT
GCCTTTC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL4269Contig1 1067 2 10 U
GGAGACCAATCACTACACAAATAAACCCACAACTCTCCTTCTCAAAAACATTTTAACCTC
AAACCAATTAAATCTCTCCGATCATGCCGATAAGAAACATCGCCATCGGCGGAGTCCAAG
AAGAAGTGACTCATCCCAGCGCACTTAGGGCGGCGCTGGCTGAGTTTATCTCGACTTTGA
TCTTTGTCTTCGCCGGCTCAGGCTCCGGTATCGCTTTCAACAAGCTCACTGACAATGGTG
CCACCACTCCTTCAGGACTCGTAGCCGCTGCATTAGCTCATGCTTTCGGTCTCTTCGTCG
CTGTTTCCGTCGGTGCTAACATCTCTGGTAGTCATGTTAACCCTGCCGTTACCTTCGGTG
CTTTCGTCGGTGGTAACATCACTCTCCTCCGTGGTATCCTCTATTGGATTGCTCAGCTTC
TTGGCTCAGTCGTCGCTTGTCTCCTCCTTAAATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAG
CTTTTGGTCTCTCTGCTGGAGTTGAATCCTTAAACGGTTTTGTCTTCGAGATCGTGATGA
CCTTCGGGCTCGTCTACACCGTTTACGCCACAGCCGTCGACCCCAAGAACGGTAGTCTCG
GAACAATCGCACCAATTGCCATAGGTTTCATCGTTGGAGCTAACATCCTTGCCGGTGGAG
CTTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTTTGGACCAGCCGTCGTGAGCTGGA
CGTGAACCAACTACTGGATCTACTGGGCTGGTCCTCTTGTCGGTGGTGGACTCGCTGGAC
TCATCTACGAGTTTGTCTTCATCAACCAAAACGGTCACGAGCAATTGCCCACCACTGATT
ACTGAAGACTGCCAAAATTCAATGTGATTTGATTTGTTTTTATTTTGCATCGTAATGGGG
TTTCTATGTGGTCGTTGGATCTTTTTAGATGAATTGTTGTATGTTGATTGCATGGTTTAT
TTGGGTTTGTTGTTGGAGTTTTAAATTCCCTGGAAGACTTTTGTGCAATTTTATTGTACT
AATGACTATAAATGATAAAACCAGTGAATGTGAATTATCATGCTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO78TF U 1
AF RR2DO78JQ C 312
BS 1 624 RR2DO78TF
BS 625 625 RR2DO78JQ
BS 626 654 RR2DO78TF
BS 655 655 RR2DO78JQ
BS 656 697 RR2DO78TF
BS 698 698 RR2DO78JQ
BS 699 725 RR2DO78TF
BS 726 727 RR2DO78JQ
BS 728 750 RR2DO78TF
BS 751 1067 RR2DO78JQ

RD RR2DO78TF 752 0 0
GGAGACCAATCACTACACAAATAAACCCACAACTCTCCTTCTCAAAAACATTTTAACCTC
AAACCAATTAAATCTCTCCGATCATGCCGATAAGAAACATCGCCATCGGCGGAGTCCAAG
AAGAAGTGACTCATCCCAGCGCACTTAGGGCGGCGCTGGCTGAGTTTATCTCGACTTTGA
TCTTTGTCTTCGCCGGCTCAGGCTCCGGTATCGCTTTCAACAAGCTCACTGACAATGGTG
CCACCACTCCTTCAGGACTCGTAGCCGCTGCATTAGCTCATGCTTTCGGTCTCTTCGTCG
CTGTTTCCGTCGGTGCTAACATCTCTGGTAGTCATGTTAACCCTGCCGTTACCTTCGGTG
CTTTCGTCGGTGGTAACATCACTCTCCTCCGTGGTATCCTCTATTGGATTGCTCAGCTTC
TTGGCTCAGTCGTCGCTTGTCTCCTCCTTAAATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAG
CTTTTGGTCTCTCTGCTGGAGTTGAATCCTTAAACGGTTTTGTCTTCGAGATCGTGATGA
CCTTCGGGCTCGTCTACACCGTTTACGCCACAGCCGTCGACCCCAAGAACGGTAGTCTCG
GAACAATCGCACCAATTGCCATAG*TTTCATCGTTGGAGCTAACATCCTTGCCG*TGGAG
CTTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTT*GGACCAGCCGTCGTGAGCTGGA
CGTGA**CAACTACTGGATCTACTGGGCTG
TC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2DO78JQ 756 0 0
GGTGCTAACATCTCTGGTAGTCATGTTAACCCTGCCGTTACTTTCGGTGCTTTCGTCGGT
GGTAACATCACTCTCCTCCGTGGTATCCTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTGGCTCAGTC
GTCGCTTGTCTCCTCCTTAAATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCTTTTGGTCTC
TCTGCTGGAGTTGAATCCTTAAACGGTTTTGTCTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTC
GTCTACACCGTTTACGCCACAGCCGTCGACCCCAAGAACGGTAGTCTCGGAACAATCGCA
CCAATTGCCATAGGTTTCATCGTTGGAGCTAACATCCTTGCCGGTGGAGCTTTCAGCGGA
GCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTTTGGACCAGCCGTCGTGAGCTGGACGTGGACCAAC
TACTGGATCTACTGGGCTGGTCCTCTTGTCGGTGGTGGACTCGCTGGACTCATCTACGAG
TTTGTCTTCATCAACCAAAACGGTCACGAGCAATTGCCCACCACTGATTACTGAAGACTG
CCAAAATTCAATGTGATTTGATTTGTTTTTATTTTGCATCGTAATGGGGTTTCTATGTGG
TCGTTGGATCTTTTTAGATGAATTGTTGTATGTTGATTGCATGGTTTATTTGGGTTTGTT
GTTGGAGTTTTAAATTCCCTGGAAGACTTTTGTGCAATTTTATTGTACTAATGACTATAA
ATGATAAAACCAGTGAATGTGAATTATCATGCTCCG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL4270Contig1 814 2 2 U
GTCGGGATTAGGCCTCCAAGCAATTTCAGAAGGTTGTAGAAAACTAGAGTCTATCCTCTA
CTTTTGCCAGCGGATGACTAATGTAGCTGTGACAGCCATGTCTGAGAACTGTCCCCAGCT
TACGGTCTTTAGGCTCTGCATAATGGGTCGCCATAGGCCCGACCACGTGACAGGGAAGCC
AATGGACGATGGATCTGGCGCCATTGTCAAAAACTGCAAGAAGCTAACCAGGCTTGCAGT
GTCTGGGTTACTAACAGACTAAGCTTTTAGCCTTATAGGAGAGTATGGGAAGTTGATCCG
TACTCTGTCTGTAGCTTTTGCAGGGGACAGTGACATGGGTCTGAGATATATACTCGAGGG
GTGTCCTAAGCTAGAGAAGCTTGAAATCAGGGACAGTCCTTTCGGGGATGCTGGACTGCG
CTCTGGTATGCATAGGTATAATGATATGAGGTTTGTTTGGATGTCGTCATGTATGTTGTC
CCGGGGAAGCTGCAGTGATATTGCTCGCGCTCTGCCTAGTGTGGTGGTGGAAGTATTTGG
GTCAGATGATGATGATGTCGATGTCGATGAGGACAATGCAGATTATGTGGAGATACTGTA
CATGTATCGGTCCCTTGATGGCCCAAGGAAGGATGCTCCAAAGTTTGTAACAATTTTATG
AAGACAAACTTAGAGAATGTTGTGTTTGTACCAAGAAAGAGTGACGAGTCAAGGAAGAAA
ATGTTGTTGTGATAATTAAAGAATGAAACGTTTATTATTTGTCTTGTGTAGTCAAAGGCA
AAAGAGTGTGTAATGAAGAATTTGATTTTACAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E587TF U 1
AF RR2E587JQ C 105
BS 1 517 RR2E587TF
BS 518 814 RR2E587JQ

RD RR2E587TF 517 0 0
GTCGGGATTAGGCCTCCAAGCAATTTCAGAAGGTTGTAGAAAACTAGAGTCTATCCTCTA
CTTTTGCCAGCGGATGACTAATGTAGCTGTGACAGCCATGTCTGAGAACTGTCCCCAGCT
TACGGTCTTTAGGCTCTGCATAATGGGTCGCCATAGGCCCGACCACGTGACAGGGAAGCC
AATGGACGATGGATCTGGCGCCATTGTCAAAAACTGCAAGAAGCTAACCAGGCTTGCAGT
GTCTGGGTTACTAACAGACTAAGCTTTTAGCCTTATAGGAGAGTATGGGAAGTTGATCCG
TACTCTGTCTGTAGCTTTTGCAGGGGACAGTGACATGGGTCTGAGATATATACTCGAGGG
GTGTCCTAAGCTAGAGAAGCTTGAAATCAGGGACAGTCCTTTCGGGGATGCTGGACTGCG
CTCTGGTATGCATAGGTATAATGATATGAGGTTTGTTTGGATGTCGTCATGTATGTTGTC
CCGGGGAAGCTGCAGTGATATTGCTCGCGCTCTGCCT

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2E587JQ 710 0 0
AGAACTGTCCCCAGCTTACGGTCTTTAGGCTCTGCATAATGGGTCGCCATAGGCCCGACC
ACGTGACAGGGAAGCCAATGGACGATGGATCTGGCGCCATTGTCAAAAACTGCAAGAAGC
TAACCAGGCTTGCAGTGTCTGGGTTACTAACAGACTAAGCTTTTAGCCTTATAGGAGAGT
ATGGGAAGTTGATCCGTACTCTGTCTGTAGCTTTTGCAGGGGACAGTGACATGGGTCTGA
GATATATACTCGAGGGGTGTCCTAAGCTAGAGAAGCTTGAAATCAGGGACAGTCCTTTCG
GGGATGCTGGACTGCGCTCTGGTATGCATAGGTATAATGATATGAGGTTTGTTTGGATGT
CGTCATGTATGTTGTCCCGGGGAAGCTGCAGTGATATTGCTCGCGCTCTGCCTAGTGTGG
TGGTGGAAGTATTTGGGTCAGATGATGATGATGTCGATGTCGATGAGGACAATGCAGATT
ATGTGGAGATACTGTACATGTATCGGTCCCTTGATGGCCCAAGGAAGGATGCTCCAAAGT
TTGTAACAATTTTATGAAGACAAACTTAGAGAATGTTGTGTTTGTACCAAGAAAGAGTGA
CGAGTCAAGGAAGAAAATGTTGTTGTGATAATTAAAGAATGAAACGTTTATTATTTGTCT
TGTGTAGTCAAAGGCAAAAGAGTGTGTAATGAAGAATTTGATTTTACAGC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL4271Contig1 417 2 1 U
GGGTGAGTCGAGCTGAGTCAATGGCTACTGAAAAATTAGGGATCTTTATCGAGAAGAATC
CTCCCGAGTCCAAACTCACCCAACTAGGCGTTCGTAATTGGCCCAAGTGGGGTTGTCCTC
CAAGCAAGTTTCCATGGACTTACGATGCAAAGGAGACTTGTTTTCTGCTAGAGGGGAAAG
TGAAAGTTTACCCTGATGGTTCCGATGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGCGACTTTGTTG
TTTTCCCTAAAGGAATGAGTTGCACTTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAAGCACTACC
AATTCGAGTGAATGGCTATTTACTTCTACGTACTCCGCATGTTGGTAATATGTATCCTCC
GGTTATTTGAAATCCATCTTGTATGTTTTTAAGTTGTATCAATCAAATTCTGACGGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DN89JQ C 1
AF RR2DN89TF U 1
BS 1 417 RR2DN89TF

RD RR2DN89JQ 417 0 0
GGGTGAGTCGAGCTGAGTCAATGGCTACTGAAAAATTAGGGATCTTTATCGAGAAGAATC
CTCCCGAGTCCAAACTCACCCAACTAGGCGTTCGTAATTGGCCCAAGTGGGGTTGTCCTC
CAAGCAAGTTTCCATGGACTTACGATGCAAAGGAGACTTGTTTTTTGCTAGAGGGGAAAG
TGAAAGTTTACCCTGATGGTTCCGATGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGCGACTTTGTTG
TTTTCCCTAAAGGAATGAGTTGCACTTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAAGCACTACC
AATTCGAGTGAATGGCTATTTACTTCTACGTACTCCGCATGTTGGTAATATGTATCCTCC
GGTTATTTGAAATCCATCTTGTATGTTTTTAAGTTGTATCAATCAAATTCTGACGGG

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR2DN89TF 417 0 0
GGGTGAGTCGAGCTGAGTCAATGGCTACTGAAAAATTAGGGATCTTTATCGAGAAGAATC
CTCCCGAGTCCAAACTCACCCAACTAGGCGTTCGTAATTGGCCCAAGTGGGGTTGTCCTC
CAAGCAAGTTTCCATGGACTTACGATGCAAAGGAGACTTGTTTTCTGCTAGAGGGGAAAG
TGAAAGTTTACCCTGATGGTTCCGATGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGCGACTTTGTTG
TTTTCCCTAAAGGAATGAGTTGCACTTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAAGCACTACC
AATTCGAGTGAATGGCTATTTACTTCTACGTACTCCGCATGTTGGTAATATGTATCCTCC
GGTTATTTGAAATCCATCTTGTATGTTTTTAAGTTGTATCAATCAAATTCTGACGGG

QA 1 417 1 417
DS 



AS 1 2

CO CL4272Contig1 414 2 1 U
GGGAGAATAAAACATAAAAATAATAAATTTTAGGTTAAATCTCAAATTATCATATAATTT
GGAAGAAAAAATATTTTCTAGAATTCTATATATTCAAAAGGATGAAGTATTAATACAAAA
AGAATCCAAACACCTTTGAATATTAACAGTTTTAAAAGTTCTCCTGAATTTTCTCAAAGT
TATTATTTTGAATTATCATAATATATTTTGTAAAAGAATTTGTGGCTTTAGGATATTTTA
AAACTGCACTCAGTATTATAAACCAATAGTTTTTACTGCAACTTCTTTTTCTTTTGGTTA
TAAAAGCGCACAGCTAGATCATAAGAAAAAAATATTGGAATGTAAAGATTCAATTAAGCA
CAATACAGTGAGAACCTTGGATTATAGTGTAAAAACTACCTATATATTAGAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DJ96JQ C 1
AF RR2DJ96TF U 1
BS 1 414 RR2DJ96TF

RD RR2DJ96JQ 414 0 0
GGGAGAATAAAACATAAAAATAATAAATTTTAGGTTAAATCTCAAATTATCATATAATTT
GGAAGAAAAAATATTTTCTAGAATTCTATATATTCAAAAGGATGAAGTATTAATACAAAA
AGAATCCAAACACCTTTGAATATTAACAGTTTTAAAAGTTCTCCTGAATTTTCTCAAAGT
TATTATTTTGAATTATCATAATATATTTTGTAAAAGAATTTGTGGCTTTAGGATATTTTA
AAACTGCACTCAGTATTATAAACCAATAGTTTTTACTGCAACTTCTTTTTCTTTTGGTTA
TAAAAGCGCACAGCTAGATCATAAGAAAAAAATATTGGAATGTAAAGATTCAATTAAGCA
CAATACAGTGAGAACCTTGGATTATAGTGTAAAAACTACCTATATATTAGAGAC

QA 1 414 1 414
DS 

RD RR2DJ96TF 414 0 0
GGGAGAATAAAACATAAAAATAATAAATTTTAGGTTAAATCTCAAATTATCATATAATTT
GGAAGAAAAAATATTTTCTAGAATTCTATATATTCAAAAGGATGAAGTATTAATACAAAA
AGAATCCAAACACCTTTGAATATTAACAGTTTTAAAAGTTCTCCTGAATTTTCTCAAAGT
TATTATTTTGAATTATCATAATATATTTTGTAAAAGAATTTGTGGCTTTAGGATATTTTA
AAACTGCACTCAGTATTATAAACCAATAGTTTTTACTGCAACTTCTTTTTCTTTTGGTTA
TAAAAGCGCACAGCTAGATCATAAGAAAAAAATATTGGAATGTAAAGATTCAATTAAGCA
CAATACAGTGAGAACCTTGGATTATAGTGTAAAAACTACCTATATATTAGAGAC

QA 1 414 1 414
DS 



AS 1 2

CO CL4273Contig1 600 2 1 U
GGCGACAGATCTGTCTTTCATTTTCAACACAGACCTGGGTTGCTTCCACCATGCCACGGC
TGCTTCCCTTCAAGAGGATATGCCGCTAATCCGTGTATATCGCCGAGATTCCCACTGCGA
AGCATCAACGAGCTACTACCTTTGAGAAGAAATAGAGACATGGTGAAGATTGTTGTTTCT
CCAATATTCATCATGATGAGGTTGACATCCAAAGCTCCTGATCCCTCCATTTATGGGATA
ATCTTTTTACTTGTCCAGCCATACAAAAGTTGATTGTTTGGACTTGGAATAGCACAACTT
CCTTGTCATCTGTCGCCGTATGCATTTTAGCTACGGATTGTCTCTTCTAGCAACGAAAAT
ATCGGTGGCTAATTCACTAGTTTCTTGTAGTGAGAACATTTAAACTATGGGTAATTAATA
GGTTAAGAAAGGATCAAAGTCAGTAGACATAAGTTTCAACCAAGATTCAACCTTGTGTTT
TAGATACAACGACTATGAATTGTTGGATCTAGAAACTAATAAAATTCACCTATTGTGACA
TTTCACGTACGAGGATGTATTAAACCAATGTTTTTGTCTTCTAATTACATGACATTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B253TF U 1
AF RR2B253JQ C 175
BS 1 600 RR2B253TF

RD RR2B253TF 600 0 0
GGCGACAGATCTGTCTTTCATTTTCAACACAGACCTGGGTTGCTTCCACCATGCCACGGC
TGCTTCCCTTCAAGAGGATATGCCGCTAATCCGTGTATATCGCCGAGATTCCCACTGCGA
AGCATCAACGAGCTACTACCTTTGAGAAGAAATAGAGACATGGTGAAGATTGTTGTTTCT
CCAATATTCATCATGATGAGGTTGACATCCAAAGCTCCTGATCCCTCCATTTATGGGATA
ATCTTTTTACTTGTCCAGCCATACAAAAGTTGATTGTTTGGACTTGGAATAGCACAACTT
CCTTGTCATCTGTCGCCGTATGCATTTTAGCTACGGATTGTCTCTTCTAGCAACGAAAAT
ATCGGTGGCTAATTCACTAGTTTCTTGTAGTGAGAACATTTAAACTATGGGTAATTAATA
GGTTAAGAAAGGATCAAAGTCAGTAGACATAAGTTTCAACCAAGATTCAACCTTGTGTTT
TAGATACAACGACTATGAATTGTTGGATCTAGAAACTAATAAAATTCACCTATTGTGACA
TTTCACGTACGAGGATGTATTAAACCAATGTTTTTGTCTTCTAATTACATGACATTTCAT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2B253JQ 426 0 0
GTTTCTCCAATATTCATCATGATGAGGTTGACATCCAAAGCTCCTGATCCCTCCATTTAT
GGGATAATCTTTTTACTTGTCCAGCCATACAAAAGTTGATTGTTTGGACTTGGAATAGCA
CAACTTCCTTGTCATCTGTCGCCGTATGCATTTTAGCTACGGATTGTTTTTTCTAGCAAC
GAAAATATCGGTGGCTAATTCACTAGTTTCTTGTAGTGAGAACATTTAAACTATGGGTAA
TTAATAGGTTAAGAAAGGATCAAAGTCAGTAGACATAAGTTTCAACCAAGATTCAACCTT
GTGTTTTAGATACAACGACTATGAATTGTTGGATCTAGAAACTAATAAAATTCACCTATT
GTGACATTTCACGTACGAGGATGTATTAAACCAATGTTTTTGTTTTCTAATTACATGACA
TTTCAT

QA 1 426 1 426
DS 



AS 1 2

CO CL4274Contig1 920 2 2 U
GGAACATCTTCTTTAATAATGTCTGGTCTCTGTTTCTCTCTCTCTTACATACCGAAGCGA
TGAAGAAGCTCTACCGCAAAGGAACCGTACACCCTTCGCCGCAGATAAAATCCGACGACC
ACCTTCTCTCTCTTCTTCCCGTTGCCATCTTCTCACTAGCGGCGGTTCTTTCACCGAAAG
ACCGTGAAGTCTTGGCTTACCTCTTATCAACCGCCTCTTACTCCGGCGACCGAAACTATG
CATCTCGCCTGAATAAGACCAAACTCCACGAGAAGTCCCGTTCAGACAATCACTCCCCAC
TTTTTCATTGTGACTGTTTCAGCTGCTACACGTGTTACTGGGTCAGATGGGACTCTTCAC
CAAGCCGCAAGCTGATTCACGAAATCATCGACGCTTACGAAGAAAGCTTGGAGAATAAGA
AACAAACCAAGAAGAAGAAAGATCGGAGAAAGCGTTCAGGGAAAGCTCCAGCTCACGCTA
GTCCTAGCTTTGGTACGAATGATTCAGAGAGTCCAAGTCAGCTTACTGATTCGATTTCGA
GTTCTTGTGCATGTTCGAGTTCGAGTCATGAGTTGGTTGATGGTACTGGTGGTTGCAACG
GCGGTTTGAAATCCACGGAGGATTTCCTTGCCGGAGACGTTGGCAAAGAGACGGCTGAAG
AGCAGGAGAAGGGATCCGTTAGAAGATTTGTGAGTTTCATTGGTGAGAAAGTTTTTGGTG
TTTGGGGATAAGAAAATTTACAAGAAATAAAAAGCTAGAGATGTTTTTTTTGGTAAAAAG
CTAAAAATGTTTTTTCAAAGGTTTAATTCTTTGGATCTTTGTAGGCCAAAATGTTTGAGT
ACCCAAAGTTTTCATGTATAAGAATTAACTGTATTGCGGCAAAAAAACATCACTGTATTA
TAACATCTTGATTATATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM69TF U 1
AF RR2BM69JQ C 237
BS 1 650 RR2BM69TF
BS 651 920 RR2BM69JQ

RD RR2BM69TF 650 0 0
GGAACATCTTCTTTAATAATGTCTGGTCTCTGTTTCTCTCTCTCTTACATACCGAAGCGA
TGAAGAAGCTCTACCGCAAAGGAACCGTACACCCTTCGCCGCAGATAAAATCCGACGACC
ACCTTCTCTCTCTTCTTCCCGTTGCCATCTTCTCACTAGCGGCGGTTCTTTCACCGAAAG
ACCGTGAAGTCTTGGCTTACCTCTTATCAACCGCCTCTTACTCCGGCGACCGAAACTATG
CATCTCGCCTGAATAAGACCAAACTCCACGAGAAGTCCCGTTCAGACAATCACTCCCCAC
TTTTTCATTGTGACTGTTTCAGCTGCTACACGTGTTACTGGGTCAGATGGGACTCTTCAC
CAAGCCGCAAGCTGATTCACGAAATCATCGACGCTTACGAAGAAAGCTTGGAGAATAAGA
AACAAACCAAGAAGAAGAAAGATCGGAGAAAGCGTTCAGGGAAAGCTCCAGCTCACGCTA
GTCCTAGCTTTGGTACGAATGATTCAGAGAGTCCAAGTCAGCTTACTGATTCGATTTCGA
GTTCTTGTGCATGTTCGAGTTCGAGTCATGAGTTGGTTGATGGTACTGGTGGTTGCAACG
GCGGTTTGAAATCCACGGAGGATTTCCTTGCCGGAGACGTTGGCAAAGAG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2BM69JQ 684 0 0
TATGCATCTCGCCTGAATAAGACCAAACTCCACGAGAAGTCCCGTTCAGACAATCACTCC
CCACTTTTTCATTGTGACTGTTTCAGCTGCTACACGTGTTACTGGGTCAGATGGGACTCT
TCACCAAGCCGCAAGCTGATTCACGAAATCATCGACGCTTACGAAGAAAGCTTGGAGAAT
AAGAAACAAACCAAGAAGAAGAAAGATCGGAGAAAGCGTTCAGGGAAAGCTCCAGCTCAC
GCTAGTCCTAGCTTTGGTACGAATGATTCAGAGAGTCCAAGTCAGCTTACTGATTCGATT
TCGAGTTCTTGTGCATGTTCGAGTTCGAGTCATGAGTTGGTTGATGGTACTGGTGGTTGC
AACGGCGGTTTGAAATCCACGGAGGATTTCCTTGCCGGAGACGTTGGCAAAGAGACGGCT
GAAGAGCAGGAGAAGGGATCCGTTAGAAGATTTGTGAGTTTCATTGGTGAGAAAGTTTTT
GGTGTTTGGGGATAAGAAAATTTACAAGAAATAAAAAGCTAGAGATGTTTTTTTTGGTAA
AAAGCTAAAAATGTTTTTTCAAAGGTTTAATTCTTTGGATCTTTGTAGGCCAAAATGTTT
GAGTACCCAAAGTTTTCATGTATAAGAATTAACTGTATTGCGGCAAAAAAACATCACTGT
ATTATAACATCTTGATTATATCAC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4276Contig1 544 2 2 U
GGATAGCCGTCTATGGCGTATTACGAAGCATCTCTAATGGAAGAATGAAGAGTTTTATAG
GATGTATTGAATCCTGTATGAAGTAACTCAGCAGCGCTGGCGTTTTCCAAATGGTCCGGC
AAAGAGTATTCTTTCATCTGGATTTAAGTCTCCTCCGATATAACTACGGTGAATCAGGTC
CTCTTTACTCAAGTACCCGCGGTTTAAAGTGGAAGGCGTTTCATATTTGGTATTGGAGTC
CCCAGATCCGAAAAACTTTATTTTCATGGTGGAGCTATACGGCGGAGAGGAGAGTTGAAG
AGGCGTCTTCGAGAAGCTGGTGGTTGAGATGTTTGGCGGTGGAGCTAAGATTGCCGTTCA
ACACTCACGAGACACGTGTGCCAGAGATGTGATTCGTGTTGGTCAATTCGTCAACGCGTG
GCAAAGCTTTCAGATGTTTCTTCATTTGGGTTTTAATATTTAGTGGGCTTCTCTGTTACT
GTATATTGTAATCTGATATCAAATGTATTGCCCAATGGACTTAATCAATGAAACTTCAGC
GGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 

AF RR2F907TF U 1
AF RR2F907JQ C 309
BS 1 540 RR2F907TF
BS 541 544 RR2F907JQ

RD RR2F907TF 544 0 0
GGATAGCCGTCTATGGCGTATTACGAAGCATCTCTAATGGAAGAATGAAGAGTTTTATAG
GATGTATTGAATCCTGTATGAAGTAACTCAGCAGCGCTGGCGTTTTCCAAATGGTCCGGC
AAAGAGTATTCTTTCATCTGGATTTAAGTCTCCTCCGATATAACTACGGTGAATCAGGTC
CTCTTTACTCAAGTACCCGCGGTTTAAAGTGGAAGGCGTTTCATATTTGGTATTGGAGTC
CCCAGATCCGAAAAACTTTATTTTCATGGTGGAGCTATACGGCGGAGAGGAGAGTTGAAG
AGGCGTCTTCGAGAAGCTGGTGGTTGAGATGTTTGGCGGTGGAGCTAAGATTGCCGTTCA
ACACTCACGAGACACGTGTGCCAGAGATGTGATTCGTGTTGGTCAATTCGTCAACGCGTG
GCAAAGCTTTCAGATGTTTCTTCATTTGGGTTTTAATATTTAGTGGGCTTCTCTGTTACT
GTATATTGTAATCTGATATCAAATGTATTGCCCAATGGACTTAATCAATGAAACTTCAGC
TGAC

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2F907JQ 236 0 0
TCGAGAAGCTGGTGGTTGAGATGTTTGGCGGTGGAGCTAAGATTGCCGTTCAACACTCAC
GAGACACGTGTGCCAGAGATGTGATTCGTGTTGGTCAATTCGTCAACGCGTGGCAAAGCT
TTCAGATGTTTCTTCATTTGGGTTTTAATATTTAGTGGGCTTCTTTGTTACTGTATATTG
TAATCTGATATCAAATGTATTGCCCAATGGACTTAATCAATGAAACTTCAGCGGAC

QA 1 236 1 236
DS 



AS 1 2

CO CL4277Contig1 495 2 3 U
GGATAAGAAATACTAAACTCTCAACTAAAAGCTGTGTCACCTTTTAAAACAGTGATTGGA
TATAAAACAACTCACAAAAGCTAAAAATAATCACAGGTGGATACATAATTTATTTTTTAA
GTGTAGTTTCTGAAACCCAAAAAGAGGTAAAACGAAAAAACATACAAAGTAGTTACAGAA
AAAGAGAAAAAAAAAGCGGTGGTAACTTGATCTACAAGTTAGAGTGGCCTAGACGTAGCA
GGACACGGTGCCACGAAGTGTTGAGCACCCCTCTTAGGTTCCACACCGACTCCACATTTT
CCGGCTGAACATTGGCCGCCGAATCCACCGCTTTGGCGACGACCTTAGTATTCTGGGAGA
CATCAACGGTGGCTTCAAACAGCACCCACGCCCATTTGTCGCTGGAATTGTGTTCAGAGA
TGTAATGCTCTCCTGGTTTCTGTGTTCTAGAAGCTTCTTCTTCTAGAGAATGTGATTTGC
GAGGTTTGTTAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D301JQ U 47
AF RR2D301TF C 1
BS 1 46 RR2D301TF
BS 47 160 RR2D301JQ
BS 161 495 RR2D301TF

RD RR2D301JQ 114 0 0
AAACAGTGATTGGATATAAAACAACTCACAAAAGCTAAAAATAATCACAGGTGGATACAT
AATTTATTTTTTAAGTGTAGTTTCTGAAACCCAAAAAGAGGTAAAACGAAAAAA

QA 1 114 1 114
DS 

RD RR2D301TF 495 0 0
GGATAAGAAATACTAAACTCTCAACTAAAAGCTGTGTCACCTTTTAAAACAGTGATTGGA
TATAAAACAACTCACAAAAGCTAAGAGTAATCACAGGTGGATACATAATTTATTTTTTAA
GTGTAGTTTCTGAAACCCAAAAAGAGGTAAAACGAGAAAACATACAAAGTAGTTACAGAA
AAAGAGAAAAAAAAAGCGGTGGTAACTTGATCTACAAGTTAGAGTGGCCTAGACGTAGCA
GGACACGGTGCCACGAAGTGTTGAGCACCCCTCTTAGGTTCCACACCGACTCCACATTTT
CCGGCTGAACATTGGCCGCCGAATCCACCGCTTTGGCGACGACCTTAGTATTCTGGGAGA
CATCAACGGTGGCTTCAAACAGCACCCACGCCCATTTGTCGCTGGAATTGTGTTCAGAGA
TGTAATGCTCTCCTGGTTTCTGTGTTCTAGAAGCTTCTTCTTCTAGAGAATGTGATTTGC
GAGGTTTGTTAGTCC

QA 1 495 1 495
DS 



AS 1 2

CO CL4278Contig1 521 2 2 U
GGGACAAACTCGATCTCTTTACTGAATCATTTTCATTCAATGGATAAGCAAACTAACATA
TCCTTAAAGGCTGTCTAATCCACTCTAAACAAACTACGTTTACCATTAAAAAAAGGGAGA
ACAAAATTAACAAATCAACTTACAACATTATTATCTCTCTTTGGAGAAAAGCGACTTATA
TCTCTGTCTATATAACCTATGATTTTGGAAAAAAAGTTCAGAAATAATTTGAAGTCAGTG
CCAAGGCCTTCCGGGAAAATGAAGAACGAAAAAGGATCTCATCTTTATTCACCAGAAACT
CCGAGGTATCAATGACAACCATCTTGACCCTCTCCCTGTCTCAGAAACAGACCCAGAGTA
CCTTCTCGACTTGTGAATCCTCATTTTAACACCAGGAACTTTGCGTGCAATCGCTTGCCA
TATCATCTGGACCGCATCATCCACCCTCGACGGAAAATGGAACTCGTAAAGCTTCTCCAC
TTCCTTCAACCTATTCCACATCCTCGTCCACTCCTCCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB29TF C 1
AF RR2CB29JQ U 76
BS 1 75 RR2CB29TF
BS 76 521 RR2CB29JQ

RD RR2CB29TF 496 0 0
GGGACAAACTCGATCTCTTTACTGAATCATTTTCATTCAATGGATAAGCAAACTAACATA
TCCTTAAAGGCTGTCTAATCCACTCTAAACAAACTACGTTTACCATTAAAAAAAGGGAGA
TCAAAATTAACAAATCAACTTACAACATTATTATCTCTCTTTGGAGAAAAGCGACTTATA
TCTCTGTCTATATAACCTATGATTTTGGAAAAAAAGTTCAGAAATAATTTGAAGTCAGTG
CCAAGGCCTTCCGGGAAAATGAAGAACGAAAAAGGATCTCATCTTTATTCACCAGAAACT
CCGAGGTATCAATGACAACCATCTTGACCCTCTCCCTGTCTCAGAAACAGACCCAGAGTA
CCTTCTCGACTTGTGAATCCTCATTTTAACACCAGGAACTTTGCGTGCAATCGCTTGCCA
TATCATCTGGACCGCATCATCCACCCTCGACGGAAAATGGAACTCGTAGAGCTTCTCCAC
TTCCTTCAACCTATTC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2CB29JQ 446 0 0
TAATCCACTCTAAACAAACTACGTTTACCATTAAAAAAAGGGAGAACAAAATTAACAAAT
CAACTTACAACATTATTATCTCTCTTTGGAGAAAAGCGACTTATATCTCTGTCTATATAA
CCTATGATTTTGGAAAAAAAGTTCAGAAATAATTTGAAGTCAGTGCCAAGGCCTTCCGGG
AAAATGAAGAACGAAAAAGGATCTCATCTTTATTCACCAGAAACTCCGAGGTATCAATGA
CAACCATCTTGACCCTCTCCCTGTCTCAGAAACAGACCCAGAGTACCTTCTCGACTTGTG
AATCCTCATTTTAACACCAGGAACTTTGCGTGCAATCGCTTGCCATATCATCTGGACCGC
ATCATCCACCCTCGACGGAAAATGGAACTCGTAAAGCTTCTCCACTTCCTTCAACCTATT
CCACATCCTCGTCCACTCCTCCTTGC

QA 1 446 1 446
DS 



AS 1 2

CO CL4279Contig1 421 2 1 U
GCTAAAGAGCCGAAGAAACCGTTTCAGAGAGTGAACGTTGAAGAGGTTGTCTTCACTGAC
GAGAGGCTTAAAGATAACTCTTACTGGGCTAAGGATGGTGCTGATTCTGGCTATGGTGCT
AAAGCTCAAGAGGTTCTAGGTCAAGTCAGAGGAAGGGGTTTCCGACATGAGAAGACGAAG
AAGAAACGTGGTAGCTACAGAGGAGGAGAGATCGATCTTCAGTCACATTCGGTTAAGTTT
GAGTACTCAGACGATGAATGATGATCAATTGATAAGCAATACACTTGTCTTTATCTTTAT
CTTTGTATCTCCTTTTAAATTATTATCACCCATCTCTTTTGCTTTGCTTATCTCAAAAAT
GTAAGACTATTCGGATCTAATTAACCCGGCACTGGGTTCAAGTTTTGCCTGTGTTGATTT
T


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2CP76JQ C 1
AF RR2CP76TF U 1
BS 1 421 RR2CP76TF

RD RR2CP76JQ 421 0 0
GCTAAAGAGCCGAAGAAACCGTTTCAGAGAGTGAACGTTGAAGAGGTTGTTTTCACTGAC
GAGAGGCTTAAAGATAACTCTTACTGGGCTAAGGATGGTGCTGATTCTGGCTATGGTGCT
AAAGCTCAAGAGGTTTTAGGTCAAGTCAGAGGAAGGGGTTTCCGACATGAGAAGACGAAG
AAGAAACGTGGTAGCTACAGAGGAGGAGAGATCGATCTTCAGTCACATTCGGTTAAGTTT
GAGTACTCAGACGATGAATGATGATCAATTGATAAGCAATACACTTGTCTTTATCTTTAT
CTTTGTATCTCCTTTTAAATTATTATCACCCATCTCTTTTGCTTTGCTTATCTCAAAAAT
GTAAGACTATTCGGATCTAATTAACCCGGCACTGGGTTCAAGTTTTGCCTGTGTTGATTT
T

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR2CP76TF 421 0 0
GCTAAAGAGCCGAAGAAACCGTTTCAGAGAGTGAACGTTGAAGAGGTTGTCTTCACTGAC
GAGAGGCTTAAAGATAACTCTTACTGGGCTAAGGATGGTGCTGATTCTGGCTATGGTGCT
AAAGCTCAAGAGGTTCTAGGTCAAGTCAGAGGAAGGGGTTTCCGACATGAGAAGACGAAG
AAGAAACGTGGTAGCTACAGAGGAGGAGAGATCGATCTTCAGTCACATTCGGTTAAGTTT
GAGTACTCAGACGATGAATGATGATCAATTGATAAGCAATACACTTGTCTTTATCTTTAT
CTTTGTATCTCCTTTTAAATTATTATCACCCATCTCTTTTGCTTTGCTTATCTCAAAAAT
GTAAGACTATTCGGATCTAATTAACCCGGCACTGGGTTCAAGTTTTGCCTGTGTTGATTT
T

QA 1 421 1 421
DS 



AS 1 2

CO CL4280Contig1 654 2 5 U
GTCACAGATAAAACTTAGAGAGAGAGGTTTGACCAGACTCATACAAATGGAAAAAAGGTC
TAATTATTTTCGGGAAAAAAACTTGTTCGAGTCGTGAAATACAAATACTGGAAAGGCTTA
TGTGAAACTCGAAAAGGAGTTCAAAAGTAGTTGCTGGTGTAAAAATTTTTGAAAAAATCA
AACTTTCCTTGATCCTTGCTTCCGGTATTCTGGACGAGCCCTTCACCAACTACGTATTGA
CCGATGATATGGTGACGCTGCTTTGCGTGATCCACTATGTCAGTCAGCTCTTCCATTCCC
TTGAATAAAGGAAAATCAATCACCTTAGGGTCAGTGACGTGAGCGTTTTTACGAATCTGA
GTAAAGATTGCGAAACGGAGCTGAAAAGGCGCGACAACGTCTTGGAAATTGTAAATGTCC
GTGATTGTAGGGATGGATCTACAGGCAGCTCTGAAGTAATCGAATACACGGCGGCGAGCT
TCCGTTAGGTTCGCTGAGTTCGGAGGTACGCCGATCTTCCTTAACGTGAAAGGTGCCGCC
ATCTGATCGCTGAAGCGAGGATCTTTCTCTCTCTCTTCCTGAGATGATAACCAAGGATCA
AATGCTGAGAGAGAAGAGAAGAGAAGCAGTCAACGACGTCGTTTTCACCATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM07JQ U 43
AF RR2CM07TF C 1
BS 1 42 RR2CM07TF
BS 43 224 RR2CM07JQ
BS 225 225 RR2CM07TF
BS 226 496 RR2CM07JQ
BS 497 654 RR2CM07TF

RD RR2CM07JQ 454 0 0
ACAAATGGAAAAAAGGTCTAATTATTTTCGGGAAAAAAACTTGTTCGAGTCGTGAAATAC
AAATACTGGAAAGGCTTATGTGAAACTCGAAAAGGAGTTCAAAAGTAGTTGCTGGTGTAA
AAATTTTTGAAAAAATCAAACTTTCCTTGATCCTTGCTTCCGGTATTCTGGACGAGCCCT
TCCCCAACTACGTATTGACCGATGATATGGTGACGCTGCTTTGCGTGATCCACTATGTCA
GTCAGCTCTTCCATTCCCTTGAATAAAGGAAAATCAATCACCTTAGGGTCAGTGACGTGA
GCGTTTTTACGAATCTGAGTAAAGATTGCGAAACGGAGCTGAAAAGGCGCGACAACGTCT
TGGAAATTGTAAATGTCCGTGATTGTAGGGATGGATCTACAGGCAGCTCTGAAGTAATCG
AATACACGGCGGCGAGCTTCCGTTAGGTTCGCTG

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR2CM07TF 654 0 0
GTCACAGATAAAACTTAGAGAGAGAGGTTTGACCAGACTCATACAAATGGAAAAAAGGTC
TAATTATTTTCGGGAAGAAGACTTGTTCGAGTCGTGAAATACAAATACTGGAAAGGCTTA
TGTGAAACTCGAAAAGGAGTTCAAAAGTAGTTGCTGGTGTAGAAATTTTTGAGAAAATCA
GACTTTCCTTGATCCTTGCTTCCGGTATTCTGGACGAGCCCTTCACCAACTACGTATTGA
CCGATGATATGGTGACGCTGCTTTGCGTGATCCACTATGTCAGTCAGCTCTTCCATTCCC
TTGAATAGAGGAAGATCAATCACCTTAGGGTCAGTGACGTGAGCGTTTTTACGAATCTGA
GTAGAGATTGCGAAACGGAGCTGAGAAGGCGCGACAACGTCTTGGAGATTGTAAATGTCC
GTGATTGTAGGGATGGATCTACAGGCAGCTCTGAAGTAATCGAATACACGGCGGCGAGCT
TCCGTTAGGTTCGCTGAGTTCGGAGGTACGCCGATCTTCCTTAACGTGAAAGGTGCCGCC
ATCTGATCGCTGAAGCGAGGATCTTTCTCTCTCTCTTCCTGAGATGATAACCAAGGATCA
AATGCTGAGAGAGAAGAGAAGAGAAGCAGTCAACGACGTCGTTTTCACCATTCC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL4281Contig1 534 2 4 U
GGCCTTGGAACGGCGGCGACGGTGCTGAACACGTCTCTATACACCGTTGACGGCGGAGAG
AGAGCTGTGATCTTCGATCGATTCAGAGGAGTCATGGATCAAACCGTCGGCGAAGGGACT
CACTTCCTGATCCCGATTCTACAGAAGCCCCACATCTTCGAGGGAGGTTGCTGCTACGCT
TGCTAGATCTCCCAATGTGGCTTACTTGCCCGGTGGTCAGAGCATGCTCTTTTCTCTTAA
CCGTTGATCAGAACTATATGGTTATGGGGAATCTGTTAAGAAATGGTGAAATGCTCTTTG
GTTTTCTGATAAACTGTGAAGAAAAAAGAAGAAACTAGTTGCTGGGCCAAAATGCTCTTT
GAATTCTATAACACTTGCGTTGTTTGAGATCTATCTTATTTTCAATAAATAAACACAAGA
GTGTCTCAATTCACAAATACTAAGTTGATGTAAGAGTTAGTTTTGAGGATACGTAGTGGA
GGGAAGCCACATGTTTGATCATGAGACCATGTGAAACATACAACTTTTATCATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A845TF U 1
AF RR2A845JQ C 1
BS 1 404 RR2A845TF
BS 405 405 RR2A845JQ
BS 406 415 RR2A845TF
BS 416 534 RR2A845JQ

RD RR2A845TF 415 0 0
GGCCTTGGAACGGCGGCGACGGTGCTGAACACGTCTCTATACACCGTTGACGGCGGAGAG
AGAGCTGTGATCTTCGATCGATTCAGAGGAGTCATGGATCAAACCGTCGGCGAAGGGACT
CACTTCCTGATCCCGATTCTACAGAAGCCCCACATCTTCGAGGGAGGTTGCTGCTACGCT
TGCTAGATCTCCCAATGTGGCTTACTTGCCCGGTGGTCAGAGCATGCTCTTTTCTCTTAA
CCGTTGATCAGAACTATATGGTTATGGGGAATCTGTTAAGAAATGGTGAAATGCTCTTTG
GTTTTCTGATAAACTGTGAAGAAAAAAGAAGAAACTAGTTGCTGGGCCAAAATGCTCTTT
GAATTCTATAACACTTGCGTTGTTTGAGATCTATCTTATTTTCA*TAAATAAACA

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR2A845JQ 534 0 0
GGCCTTGGAACGGCGGCGACGGTGCTGAACACGTCTCTATACACCGTTGACGGCGGAGAG
AGAGCTGTGATCTTCGATCGATTCAGAGGAGTCATGGATCAAACCGTCGGCGAAGGGACT
CACTTCCTGATCCCGATTCTACAGAAGCCCCACATCTTCGAGGGAGGTTGCTGCTACGCT
TGCTAGATCTCCCAATGTGGCTTACTTGCCCGGTGGTCAGAGCATGCTCTTTTCTCTTAA
CCGTTGATCAGAACTATATGGTTATGGGGAATCTGTTAAGAAATGGTGAAATGCTCTTTG
GTTTTCTGATAAACTGTGAAGAAAAAAGAAGAAACTAGTTGCTGGGCCAAAATGCTCTTT
GAATTCTATAACACTTGCGTTGTTTGAGATCTATCTTATTTTCAATAAATAAACACAAGA
GTGTCTCAATTCACAAATACTAAGTTGATGTAAGAGTTAGTTTTGAGGATACGTAGTGGA
GGGAAGCCACATGTTTGATCATGAGACCATGTGAAACATACAACTTTTATCATC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 2

CO CL4282Contig1 481 2 1 U
GGTGATCGTAAGAGTGAACAAAGCTGCATCCTCCGTTTAGGGTTTTCACCAAGTCGTCTT
CCTCGCATTTCCGCAAGCAATCATGGTTCTCCAAAATGACATCGACCTCCTCAACCCTCC
AGCTGAGCTGGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTGCAATCTCCCAACTCTTT
CTTCATGGACGTCAAATGCCAGGGATGCTTCAACATAACAACTGTGTTCAGCCACTCTCA
AACGGTTGTAGTATGTGGAAACTGTCAGACTGTTCTGTGCCAGCCCACCGGTGGTAAAGC
CAGGCTCACTGAGGGTTGCTCTTTCAGGAAAAAGTGAAATCGTCATCTTTTCACAAAATG
TTTGCTGTTATATTCAGTTTGGTTTTTCTTTCTTTACTAGTTATTGTTATTGTCATGTGA
CGTTTCTTTATGTTTCTTATGAAAAGATTTTGAAGACATGAAAACTACTAGTTGAGTTAT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2FG53TF U 1
AF RR2FG53JQ C 60
BS 1 481 RR2FG53TF

RD RR2FG53TF 481 0 0
GGTGATCGTAAGAGTGAACAAAGCTGCATCCTCCGTTTAGGGTTTTCACCAAGTCGTCTT
CCTCGCATTTCCGCAAGCAATCATGGTTCTCCAAAATGACATCGACCTCCTCAACCCTCC
AGCTGAGCTGGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTGCAATCTCCCAACTCTTT
CTTCATGGACGTCAAATGCCAGGGATGCTTCAACATAACAACTGTGTTCAGCCACTCTCA
AACGGTTGTAGTATGTGGAAACTGTCAGACTGTTCTGTGCCAGCCCACCGGTGGTAAAGC
CAGGCTCACTGAGGGTTGCTCTTTCAGGAAAAAGTGAAATCGTCATCTTTTCACAAAATG
TTTGCTGTTATATTCAGTTTGGTTTTTCTTTCTTTACTAGTTATTGTTATTGTCATGTGA
CGTTTCTTTATGTTTCTTATGAAAAGATTTTGAAGACATGAAAACTACTAGTTGAGTTAT
T

QA 1 481 1 481
DS 

RD RR2FG53JQ 422 0 0
TCCTCGCATTTCCGCAAGCAATCATGGTTTTCCAAAATGACATCGACCTCCTCAACCCTC
CAGCTGAGCTGGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTTGTGCAATCTCCCAACTCTT
TTTTCATGGACGTCAAATGCCAGGGATGCTTCAACATAACAACTGTGTTCAGCCACTCTC
AAACGGTTGTAGTATGTGGAAACTGTCAGACTGTTCTGTGCCAGCCCACCGGTGGTAAAG
CCAGGCTCACTGAGGGTTGCTCTTTCAGGAAAAAGTGAAATCGTCATCTTTTCACAAAAT
GTTTGCTGTTATATTCAGTTTGGTTTTTCTTTCTTTACTAGTTATTGTTATTGTCATGTG
ACGTTTCTTTATGTTTTTTATGAAAAGATTTTGAAGACATGAAAACTACTAGTTGAGTTA
TT

QA 1 422 1 422
DS 



AS 1 2

CO CL4283Contig1 738 2 3 U
GTTTTGAGAGAAAAACATGTAAATTATCGTAATAGAGATGTATGCGTTTTTCTTTATATT
AGGCCAATAAATATTTCTCTGCTGCAACTAAAACTCTTGTAAAGAGAACAATAATAAAGA
GTACTACTAGAACTTCTGTTTGCATGCCCAAACCAACTACGATTATTGCTTGTCATTACT
CTTGGAATGTTGGCTAGAATCTTTTCTGTGAGTACCCGGAAAGCTTCTACTCCCATGGCT
TCATCGAGTTCCTGCAGAGGGTTGGAAGAACTATCGATAATGGAGATGAGTTTCTGAAGG
GCTTCATCCTTTAGAGCTTCTCTGATTTCACTAGAAGAAGCGATAGCCTCGAGACGGGTC
TTCTCTACGACATACTTTTCTTCCTCCACAGTTATCGGTGGTCTCGCCACGGGAACTTCC
TTTGCAGCAGATGAAGAAGCACTAGCCTTGTGCTCTGTCTTTACTACCACATCTTTTGTC
TCCACCGAGACTTCCTTTGCTGGAGAGCCTGCTGGCTTCTCCTCGGGTGCAGAAGGTTTA
GCACATGGAGTCTCTTTGTGCTTCTTGAAACAACCCAAGGAACAGTAAGGAACAATACAA
GTGGGACGCTTGTACTTGGATACAACTTTCTCGCAGATTTCGCATGTCGGAGCTACTCGA
GGACACATAGCTCCTCCCTTCTACCTATTCTCAGTAAGCGATGCGAGTCAATTTCAATTT
CAATTTCAGGGTAGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F975JQ U 5
AF RR2F975TF C 1
BS 1 10 RR2F975TF
BS 11 423 RR2F975JQ
BS 424 738 RR2F975TF

RD RR2F975JQ 419 0 0
GAGAGA
AAAAACATGTAAATTATCGTAATAGAGATGTATGCGTTTTTCTTTATATTAGGCCAATAA
ATATTTCTCTGCTGCAACTAAAACTCTTGTAAAGAGAACAATAATAAAGAGTACTACTAG
AACTTCTGTTTGCATGCCCAAACCAACTACGATTATTGCTTGTCATTACTCTTGGAATGT
TGGCTAGAATCTTTTCTGTGAGTACCCGGAAAGCTTCTACTCCCATGGCTTCATCGAGTT
CCTGCAGAGGGTTGGAAGAACTATCGATAATGGAGATGAGTTTCTGAAGGGCTTCATCCT
TTAGAGCTTCTCTGATTTCACTAGAAGAAGCGATAGCCTCGAGACGGGTCTTCTCTACGA
CATACTTTTCTTCCTCCACAGTTATCGGTGGTCTCGCCACGGGAACTTCCTTT

QA 7 419 7 419
DS 

RD RR2F975TF 738 0 0
GTTTTGAGAGAAAAACATGTAAATTATCGTAATAGAGATGTATGCGTTTT*CTTTATATT
AGGCCAATAAATATTTCTCTGCTGCAACTAAAACTCTTGTAAAGAGAACAATAATAAAGA
GTACTACTAGAACTTCTGTTTGCATGCCCAAACCAACTACGATTATTGCTTGTCATTACT
CTTGGAATGTTGGCTAGAATCTTTTCTGTGAGTACCCGGAAAGCTTCTACTCCCATGGCT
TCATCGAGTTCCTGCAGAGGGTTGGAAGAACTATCGATAATGGAGATGAGTTTCTGAAGG
GCTTCATCCTTTAGAGCTTCTCTGATTTCACTAGAAGAAGCGATAGCCTCGAGACGGGTC
TTCTCTACGACATACTTTTCTTCCTCCACAGTTATCGGTGGTCTCGCCACGGGAACTTCC
TTTGCAGCAGATGAAGAAGCACTAGCCTTGTGCTCTGTCTTTACTACCACATCTTTTGTC
TCCACCGAGACTTCCTTTGCTGGAGAGCCTGCTGGCTTCTCCTCGGGTGCAGAAGGTTTA
GCACATGGAGTCTCTTTGTGCTTCTTGAAACAACCCAAGGAACAGTAAGGAACAATACAA
GTGGGACGCTTGTACTTGGATACAACTTTCTCGCAGATTTCGCATGTCGGAGCTACTCGA
GGACACATAGCTCCTCCCTTCTACCTATTCTCAGTAAGCGATGCGAGTCAATTTCAATTT
CAATTTCAGGGTAGGCCC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL4284Contig1 417 2 1 U
GGGCCGTTGCCGCACTTGCTTTGCTTCTCCTCAGTGTTTCTACACCTTCAAGCTAATCAA
TCAAGATGCAGAACGAAGAGGGTCAGATCACAGAACTATACGTTCCTAGGAAATGCTCTG
CTACTAACAGGATGATCACATCAAAGGATCATGCCTCTGTCCAGCTCAACATTGGTCATT
TAGATGCTGATGGCATCTATACTGGACAGTTCACTACCTTTGCTCTCTGCGGTTTCGTTC
GTGCCCAGGGGGATGCAGACAGTGGCGTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAG
CCAAACAATTCTAAGATGCTTATTTAAGTTGTCGTTCTCTCTCTTTTGTTATTTAATTAA
AAAGAAAGACATCGGATATTTTACTGAAGTAATGAATTTTGCTAGACCCTTGGTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H940JQ C 1
AF RR2H940TF U 1
BS 1 417 RR2H940TF

RD RR2H940JQ 417 0 0
GGGCCGTTGCCGCACTTGCTTTGCTTCTCCTCAGTGTTTTTACACCTTCAAGCTAATCAA
TCAAGATGCAGAACGAAGAGGGTCAGATCACAGAACTATACGTTCCTAGGAAATGCTCTG
CTACTAACAGGATGATCACATCAAAGGATCATGCCTCTGTCCAGCTCAACATTGGTCATT
TAGATGCTGATGGCATCTATACTGGACAGTTCACTACCTTTGCTCTCTGCGGTTTCGTTC
GTGCCCAGGGGGATGCAGACAGTGGCGTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAG
CCAAACAATTTTAAGATGCTTATTTAAGTTGTCGTTCTCTCTCTTTTGTTATTTAATTAA
AAAGAAAGACATCGGATATTTTACTGAAGTAATGAATTTTGCTAGACCCTTGGTTTT

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR2H940TF 417 0 0
GGGCCGTTGCCGCACTTGCTTTGCTTCTCCTCAGTGTTTCTACACCTTCAAGCTAATCAA
TCAAGATGCAGAACGAAGAGGGTCAGATCACAGAACTATACGTTCCTAGGAAATGCTCTG
CTACTAACAGGATGATCACATCAAAGGATCATGCCTCTGTCCAGCTCAACATTGGTCATT
TAGATGCTGATGGCATCTATACTGGACAGTTCACTACCTTTGCTCTCTGCGGTTTCGTTC
GTGCCCAGGGGGATGCAGACAGTGGCGTGGACAGGTTGTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAG
CCAAACAATTCTAAGATGCTTATTTAAGTTGTCGTTCTCTCTCTTTTGTTATTTAATTAA
AAAGAAAGACATCGGATATTTTACTGAAGTAATGAATTTTGCTAGACCCTTGGTTTT

QA 1 417 1 417
DS 



AS 1 2

CO CL4285Contig1 656 2 2 U
GAAACAACATAAACACTTCTAATTAAAATCATGTAAATTCTTGTGGTCTCATGTTATTAT
TCTACTTCAAAGTTTGAATTTTAACCTACCTGGTTACAGTAAAATCCAGCGAACCAATCA
ACTAGTCTGGGAAGACTTCGTCGCGCTCATTGTCTACTGAAGACAAATGTCCATGTCCAG
AGCTGGAGCTGGTGTTGTTGTGCACCTCTTCTGGTATGTCTTCATCATCATCATCCGTTG
AGGCTTTGTCGTAAAAAAAGGGTCTCTGACAAATGCAAGCTTGCGGATACTCGTGGAACT
CACCGCGTCCTGGTTTGAACTCATCAGGATCACCCATGAACCCTCTCTGACAAGATTTCA
CTTTCTTGGCGAAGGTTTGCCACTCCATCTTTTCCCGGTCCATGAACAAAGCACTAAGCT
TCTTCGCATTTGGCCTTATGGTCCTCTTATGCCCCATGTACCTCCTTCGGCCTGCAAGAA
TCTTGGCCATATTTCCATTATTATTAGTAATAAAGACATCACTTTCGTCGCTGACTATGT
AGTCAATGGCAGCAAGGCGTGAAGAATAGGGAAGCAAAGGCTTGAGCTCATCATTGGCAA
GCATTTCCTTAGTGTAAAAGTTTGGAAACAGCTCTCTGAGTGGTCTCAGTGTCCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G228JQ U 1
AF RR2GT47JQB U 1
BS 1 349 RR2G228JQ
BS 350 656 RR2GT47JQB

RD RR2G228JQ 349 0 0
GAAACAACATAAACACTTCTAATTAAAATCATGTAAATTCTTGTGGTCTCATGTTATTAT
TCTACTTCAAAGTTTGAATTTTAACCTACCTGGTTACAGTAAAATCCAGCGAACCAATCA
ACTAGTCTGGGAAGACTTCGTCGCGCTCATTGTCTACTGAAGACAAATGTCCATGTCCAG
AGCTGGAGCTGGTGTTGTTGTGCACCTCTTCTGGTATGTCTTCATCATCATCATCCGTTG
AGGCTTTGTCGTAAAAAAAGGGTCTCTGACAAATGCAAGCTTGCGGATACTCGTGGAACT
CACCGCGTCCTGGTTTGAACTCATCAGGATCACCCATGAACCCTCTCTG

QA 1 349 1 349
DS 

RD RR2GT47JQB 656 0 0
GAAACAACATAAACACTTCTAATTAAAATCATGTAGATTCTTGTGGTCTCATGTTATTAT
TCTACTTCAAAGTTTGAATTTTAACCTACCTGGTTACAGTAAAATCCAGCGAACCAATCA
ACTAGTCTGGGAAGACTTCGTCGCGCTCATTGTCTACTGAAGACAAATGTCCATGTCCAG
AGCTGGAGCTGGTGTTGTTGTGCACCTCTTCTGGTATGTCTTCATCATCATCATCCGTTG
AGGCTTTGTCGTAAGAGAAGGGTCTCTGACAAATGCAAGCTTGCGGATACTCGTGGAACT
CACCGCGTCCTGGTTTGAACTCATCAGGATCACCCATGAACCCTCTCTGACAAGATTTCA
CTTTCTTGGCGAAGGTTTGCCACTCCATCTTTTCCCGGTCCATGAACAAAGCACTAAGCT
TCTTCGCATTTGGCCTTATGGTCCTCTTATGCCCCATGTACCTCCTTCGGCCTGCAAGAA
TCTTGGCCATATTTCCATTATTATTAGTAATAAAGACATCACTTTCGTCGCTGACTATGT
AGTCAATGGCAGCAAGGCGTGAAGAATAGGGAAGCAAAGGCTTGAGCTCATCATTGGCAA
GCATTTCCTTAGTGTAAAAGTTTGGAAACAGCTCTCTGAGTGGTCTCAGTGTCCTT

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL4286Contig1 1008 2 2 U
GGTGCTTTATCAAACGGGAGAGAGCCGCTGGGATATTCCGTCTTTATCTTGGTTTAAGCC
CTGCTCTTACTGGGGATAAGAGTAAGCTCTTGCTATCGGCTAAGAGGGTAAGGAGGGCGA
CTGGTGTTGAGTTTATTGTATCTTTGTCTGGACATGACTTGTCAAGAAGTAGTAATAATT
ACATAGGAAAACTAAGATCGAATTTTCTTGGTACTAAGTTCACGGTTTACGAAAACCAAC
CTCCTCCGGTTGATTCAAGAAGATCATCCAAATCCAACAAGAGATTATCACAAACGATGC
GCGTGTCTCCATGGGTAACTTCATCTACTCATAGTTACAGCATTGCTTCGATCTTGTATG
AACTGAATGTCCTCAGAACCAGAGGTCCAAGAAGAATGCAATGTATCATGAACAGTATCC
CAGTGTCTTCTATTCAAGAAGGGGGACAGGTTCATACTCCGACAGAGTTGTCAAACCTAG
GAAGTAAGAAGAAGAAGAGAGGGCTAATGGATTTCTGCTCAGGGAACTTGGGAGGAGACT
CCGTTGTACAGGAACCATTAGTCCTGAAAAACAAGTTACCGAGATGGCACGAGCAGCTTC
AGTGTTGGTGTCTTAACTTCAAAGGACGAGTCACGGTTGCGTCAGTGAAAAACTTCCAGC
TAATGGCAGCTGCTGCAGAAGCACGGAAGGACATGAACGTACCAGAAGAGGAGCAAGAGA
GAGTGATGTTGCAGTTTGGGAAGATAGGGAAAGATACATTCACCATGGACTATCGTTACC
CGATCTCTGCATTCCAAGCTTTTGCCATTTGTTTAAGCAGCTTCGACACAAAGCCTGTTC
GATGAATGAACAAAAGGTACATATCAATGTTATGTTCTCTATTTGCAGTTGTTGTGTGTT
AAATGAATGTACATACTTTCCTTCTCGGAGCAAACAATCAGATCTTTTCCCATTCAACTT
CATCCACTTAATTATGTAACTAAAATGCAATCAACGTTTGGTTTAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ13TF U 1
AF RR2AJ13JQ C 248
BS 1 647 RR2AJ13TF
BS 648 1008 RR2AJ13JQ

RD RR2AJ13TF 647 0 0
GGTGCTTTATCAAACGGGAGAGAGCCGCTGGGATATTCCGTCTTTATCTTGGTTTAAGCC
CTGCTCTTACTGGGGATAAGAGTAAGCTCTTGCTATCGGCTAAGAGGGTAAGGAGGGCGA
CTGGTGTTGAGTTTATTGTATCTTTGTCTGGACATGACTTGTCAAGAAGTAGTAATAATT
ACATAGGAAAACTAAGATCGAATTTTCTTGGTACTAAGTTCACGGTTTACGAAAACCAAC
CTCCTCCGGTTGATTCAAGAAGATCATCCAAATCCAACAAGAGATTATCACAAACGATGC
GCGTGTCTCCATGGGTAACTTCATCTACTCATAGTTACAGCATTGCTTCGATCTTGTATG
AACTGAATGTCCTCAGAACCAGAGGTCCAAGAAGAATGCAATGTATCATGAACAGTATCC
CAGTGTCTTCTATTCAAGAAGGGGGACAGGTTCATACTCCGACAGAGTTGTCAAACCTAG
GAAGTAAGAAGAAGAAGAGAGGGCTAATGGATTTCTGCTCAGGGAACTTGGGAGGAGACT
CCGTTGTACAGGAACCATTAGTCCTGAAAAACAAGTTACCGAGATGGCACGAGCAGCTTC
AGTGTTGGTGTCTTAACTTCAAAGGACGAGTCACGGTTGCGTCAGTG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2AJ13JQ 761 0 0
GGTTGATTCAAGAAGATCATCCAAATCCAACAAGAGATTATCACAAACGATGCGCGTGTC
TCCATGGGTAACTTCATCTACTCATAGTTACAGCATTGCTTCGATCTTGTATGAACTGAA
TGTCCTCAGAACCAGAGGTCCAAGAAGAATGCAATGTATCATGAACAGTATCCCAGTGTC
TTCTATTCAAGAAGGGGGACAGGTTCATATTCCGACAGAGTTGTCAAACCTAGGAAGTAA
GAAGAAGAAGAGAGGGCTAATGGATTTCTGCTCAGGGAACTTGGGAGGAGACTCCGTTGT
ACAGGAACCATTAGTCCTGAAAAACAAGTTACCGAGATGGCACGAGCAGCTTCAGTGTTG
GTGTCTTAACTTCAAAGGACGAGTCACGGTTGCGTCAGTGAAAAACTTCCAGCTAATGGC
AGCTGCTGCAGAAGCACGGAAGGACATGAACGTACCAGAAGAGGAGCAAGAGAGAGTGAT
GTTGCAGTTTGGGAAGATAGGGAAAGATACATTCACCATGGACTATCGTTACCCGATCTC
TGCATTCCAAGCTTTTGCCATTTGTTTAAGCAGCTTCGACACAAAGCCTGTTCGATGAAT
GAACAAAAGGTACATATCAATGTTATGTTCTCTATTTGCAGTTGTTGTGTGTTAAATGAA
TGTACATACTTTCCTTCTCGGAGCAAACAATCAGATCTTTTCCCATTCAACTTCATCCAC
TTAATTATGTAACTAAAATGCAATCAACGTTTGGTTTAGAC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4288Contig1 470 2 2 U
GGAATCTAGCAAAATTCTATCTAAAAAAATCGTAATCAATAGTAGTCTTTTAAATAATAA
TTAGAAAAAAGAATCGTGCAAACTAAAATGGAAAAGGTAAATTTCTTTGCAATAATCTTT
ATGGTGTTAATGGTCGTGACAAGGGTTTCTGCGGAAGAGCCACCGATGAAAGTGACGGCC
AATGAGGTGACTCTTGCGGCGGAGGCGGCAGCCTCGAGTTTCAAAAGCAGCGCTGGAGAG
GCTGCTCAAGGGGCCAGGACATGGGCCGATTGGGCTACGAGCAAATTCAGGATTGGTGGA
AATTTCGAAAAAACTCCCGATTCAGAGTGAAACGTATGGAGGTCATAAGAAAAATTTATC
TTAAGAACATGCATAACTGTTTACCAAGTAAAAATATGTGAATTGAGGAAGCAACAATAT
AGTTGCATTCTCTTGTATCTTATTGTATAAGAAAATTTTCCATTAACCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2EO43TF U 1
AF RR2EO43JQ C 25
BS 1 467 RR2EO43TF
BS 468 470 RR2EO43JQ

RD RR2EO43TF 470 0 0
GGAATCTAGCAAAATTCTATCTAAAAAAATCGTAATCAATAGTAGTCTTTTAAATAATAA
TTAGAAAAAAGAATCGTGCAAACTAAAATGGAAAAGGTAAATTTCTTTGCAATAATCTTT
ATGGTGTTAATGGTCGTGACAAGGGTTTCTGCGGAAGAGCCACCGATGAAAGTGACGGCC
AATGAGGTGACTCTTGCGGCGGAGGCGGCAGCCTCGAGTTTCAAAAGCAGCGCTGGAGAG
GCTGCTCAAGGGGCCAGGACATGGGCCGATTGGGCTACGAGCAAATTCAGGATTGGTGGA
AATTTCGAAAAAACTCCCGATTCAGAGTGAAACGTATGGAGGTCATAAGAAAAATTTATC
TTAAGAACATGCATAACTGTTTACCAAGTAAAAATATGTGAATTGAGGAAGCAACAATAT
AGTTGCATTCTCTTGTATCTTATTGTATAAGAAAATTTTCCATTAAC
ACT

QA 1 467 1 467
DS 

RD RR2EO43JQ 446 0 0
AAAAATCGTAATCAATAGTAGTCTTTTAAATAATAATTAGAAAAAAGAATCGTGCAAACT
AAAATGGAAAAGGTAAATTTCTTTGCAATAATCTTTATGGTGTTAATGGTCGTGACAAGG
GTTTTTGCGGAAGAGCCCCCGATGAAAGTGACGGCCAATGAGGTGACTCTTGCGGGGGAG
GGGGCAGCCTCGAGTTTCAAAAGCAGCGCTGGAGAGGCTGCTCAAGGGGCCAGGACATGG
GCCGATTGGGCTACGAGCAAATTCAGGATTGGTGGAAATTTCGAAAAAACTCCCGATTCA
GAGTGAAACGTATGGAGGTCATAAGAAAAATTTTTTTTAAGAACATGCATAACTGTTTAC
CAAGTAAAAATATGTGAATTGAGGAAGCAACAATATAGTTGCATTTTCTTGTATTTTATT
GTATAAGAAAATTTTCCATTAACCCT

QA 1 446 1 446
DS 



AS 1 2

CO CL4289Contig1 865 2 2 U
GGCTGAGAATCGTTCATCTTCATCATCTTCCTAATCCAAATCCCTAATTCTCGAGTTAGT
TTTCAATCCAAGAAACTCGCCAAGAACTGGATACTCTGGCGGATTCAGAGACCAAGAACC
GAGACGTGGTTCTGAAGCTGTATGACGCCCTGAGATCTCGAGACGTCGAATCGGTTCACC
GGATCCTCACCCCGGATCTCGACTACTGGTTCCACGGCCCTCCGCCGCACCAGTTTTTGA
TGCGCACGCTCACCGGCGCCTCTCCTCCCTTCGAGTTCGCGCCTCTCTCCGTCGTCTCCC
TCGGATCAACCGTCATCGCCGAGGGCTGCGACGCCGCTAGCTCCATCTCCTGGATCCACG
CCTGGACCGTGTCGCATGGGATAATCGCTCAGGTGAGGGAGTACTCGAACACTTCTCTCA
CCGTCACCCGGATCGGTGGCGTCGTCGCCGGAAGGTCTGCCGAGATCGCGCGCTCGCACT
GCCCCTCCGTGTGGGAAGGCAAGTTCTCGGGTCGGGCGGGAAAATCCGTGCCGGGTCTGG
TTCTGGCGATTTGAGGATTTGGTCAGTATTTCGGTAAGGAAACAGTCACGTGGACTAATA
ACTAAATAAAGGCTGCTTACGTGTCGGTATCTGGTTGGCTTGTCGTATATGTGAGGATTT
TGTGCGGTTGAAGACGCGGTGTGGGCTGCGTTTTGGCTGTCGCTAGTTCTTCATTTGTTT
TTTTCTTTTTAATTTGCTTTATAATCGTGCTTTTGTATTTTAGTGGCTACAGCAAACATG
GGGATACCCAAATTGGCTTGTGCCGTTGTGTCTGATGTAATGTTTGGTTATGTTATAATT
GAAATAAAAATGTGCGTTTGGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV54TF U 1
AF RR2DV54JQ C 196
BS 1 606 RR2DV54TF
BS 607 865 RR2DV54JQ

RD RR2DV54TF 606 0 0
GGCTGAGAATCGTTCATCTTCATCATCTTCCTAATCCAAATCCCTAATTCTCGAGTTAGT
TTTCAATCCAAGAAACTCGCCAAGAACTGGATACTCTGGCGGATTCAGAGACCAAGAACC
GAGACGTGGTTCTGAAGCTGTATGACGCCCTGAGATCTCGAGACGTCGAATCGGTTCACC
GGATCCTCACCCCGGATCTCGACTACTGGTTCCACGGCCCTCCGCCGCACCAGTTTTTGA
TGCGCACGCTCACCGGCGCCTCTCCTCCCTTCGAGTTCGCGCCTCTCTCCGTCGTCTCCC
TCGGATCAACCGTCATCGCCGAGGGCTGCGACGCCGCTAGCTCCATCTCCTGGATCCACG
CCTGGACCGTGTCGCATGGGATAATCGCTCAGGTGAGGGAGTACTCGAACACTTCTCTCA
CCGTCACCCGGATCGGTGGCGTCGTCGCCGGAAGGTCTGCCGAGATCGCGCGCTCGCACT
GCCCCTCCGTGTGGGAAGGCAAGTTCTCGGGTCGGGCGGGAAAATCCGTGCCGGGTCTGG
TTCTGGCGATTTGAGGATTTGGTCAGTATTTCGGTAAGGAAACAGTCACGTGGACTAATA
ACTAAA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2DV54JQ 670 0 0
ATCTCGACTACTGGTTCCACGGCCCTCCGCCGCACCAGTTTTTGATGCGCACGCTCACCG
GCGCCTCTCCTCCCTTCGAGTTCGCGCCTCTCTCCGTCGTCTCCCTCGGATCAACCGTCA
TCGCCGAGGGCTGCGACGCCGCTAGCTCCATCTCCTGGATCCACGCCTGGACCGTGTCGC
ATGGGATAATCGCTCAGGTGAGGGAGTACTCGAACACTTCTCTCACCGTCACCCGGATCG
GTGGCGTCGTCGCCGGAAGGTCTGCCGAGATCGCGCGCTCGCACTGCCCCTCCGTGTGGG
AAGGCAAGTTCTCGGGTCGGGCGGGAAAATCCGTGCCGGGTCTGGTTCTGGCGATTTGAG
GATTTGGTCAGTATTTCGGTAAGGAAACAGTCACGTGGACTAATAACTAAATAAAGGCTG
CTTACGTGTCGGTATCTGGTTGGCTTGTCGTATATGTGAGGATTTTGTGCGGTTGAAGAC
GCGGTGTGGGCTGCGTTTTGGCTGTCGCTAGTTCTTCATTTGTTTTTTTCTTTTTAATTT
GCTTTATAATCGTGCTTTTGTATTTTAGTGGCTACAGCAAACATGGGGATACCCAAATTG
GCTTGTGCCGTTGTGTCTGATGTAATGTTTGGTTATGTTATAATTGAAATAAAAATGTGC
GTTTGGGACC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL4290Contig1 686 2 2 U
GAAGAGACAACTTCAGTACTTCTTGTCTGGACAATGGTTCTGCTAAGCCAATACCAAGAT
TGGCAGGCACGTGCAAGAGAAGAAGTGAAGCAAGTTTTTGGCGATAAAGTACCTGATACA
GATGGTCTTAACCAGCTCAAAGTTATGACGATGATATTGTATGAGGTCCTTAGGCTATAT
CCTCCAGTGACACAGGTGAGCAGAGCCATTCACAAAGAGATGAAGCTAGGAGATCTGACT
TTACCAGGTGGTGTTCAGATCAGTCTACCTATCCTGCTAGTTCAACGCGACACCGAGCTG
TGGGGCGACGATGCAGCGGAGTTCAAGCCTGAAAGATTCAAAGAAGGTCTCTCAAAGGCA
ACGAAGAGTCAAGTCTCCTTCTTTCCCTTTGCGTGGGGACCAAGGATCTGCATTGGGCAG
AACTTTGCCCTATTGGAAGCAAAGATGGCAATGGCATTGATTCTGCAGAGATTCTCCTTC
GAGTTATCTCCTTCTTATGTGCATGCTCCTTACACTGTCATCACAATTCACCCACAGTTT
GGTGCTCACCTTATCCTGAAGAAGCTCTAGTCTCATAAATGGTTAAACCCCCTTTTGTTT
TCTTCTTGTCAAAGAAACTTGTAATACACAGATGAAACGAGTCGGCCGGATCATATATAA
TACGAAACTCAAATGAATTTTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2E074TF U 1
AF RR2E074JQ C 411
BS 1 684 RR2E074TF
BS 685 686 RR2E074JQ

RD RR2E074TF 684 0 0
GAAGAGACAACTTCAGTACTTCTTGTCTGGACAATGGTTCTGCTAAGCCAATACCAAGAT
TGGCAGGCACGTGCAAGAGAAGAAGTGAAGCAAGTTTTTGGCGATAAAGTACCTGATACA
GATGGTCTTAACCAGCTCAAAGTTATGACGATGATATTGTATGAGGTCCTTAGGCTATAT
CCTCCAGTGACACAGGTGAGCAGAGCCATTCACAAAGAGATGAAGCTAGGAGATCTGACT
TTACCAGGTGGTGTTCAGATCAGTCTACCTATCCTGCTAGTTCAACGCGACACCGAGCTG
TGGGGCGACGATGCAGCGGAGTTCAAGCCTGAAAGATTCAAAGAAGGTCTCTCAAAGGCA
ACGAAGAGTCAAGTCTCCTTCTTTCCCTTTGCGTGGGGACCAAGGATCTGCATTGGGCAG
AACTTTGCCCTATTGGAAGCAAAGATGGCAATGGCATTGATTCTGCAGAGATTCTCCTTC
GAGTTATCTCCTTCTTATGTGCATGCTCCTTACACTGTCATCACAATTCACCCACAGTTT
GGTGCTCACCTTATCCTGAAGAAGCTCTAGTCTCATAAATGGTTAAACCCCCTTTTGTTT
TCTTCTTGTCAAAGAAACTTGTAATACACAGATGAAACGAGTCGGCCGGATCATATATAA
TACGAAACTCAAATGAATTTTTAA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2E074JQ 276 0 0
CATTGGGCAGAACTTTGCCCTATTGGAAGCAAAGATGGCAATGGCATTGATTCTGCAGAG
ATTCTCCTTCGAGTTATCTCCTTTTTATGTGCATGCTCCTTACACTGTCATCACAATTCA
CCCACAGTTTGGTGCTCCCCTTATCCTGAAGAAGCTCTAGTTTCATAAATGGTTAAACCC
CCTTTTGTTTTCTTCTTGTCAAAGAAACTTGTAATACACAGATGAAACGAGTCGGCCGGA
TCATATATAATACGAAACTCAAATGAATTTTTAACC

QA 1 276 1 276
DS 



AS 1 2

CO CL4291Contig1 992 2 4 U
GGGTCTAAAAGCGACTCAAAAGTCAACAGCGAGAAGTAAAGGAGTGAGCGGAGGAAGAAG
AAAAGCCTATTAATCAGGTAAGAAGTAAAGGACTTATTATGGCAAGAGTCGTCGTGGAGT
CTGACACGGTATCTGGAGGTTCCGATGTACTACAGCTAAGTCTTGACTCGATCAGGGAAT
CGTTGATCAGGCAAGAAGACACCATCGTCTTCAGCTTGATCGAGAGAGCTAAGTTTCCTC
TCAATTCACCTGCTTTCGAGGACTCCTCCTCCTCTCTGACTGAGTTCTTTGTCAGAGAAA
TCGAAACCATCCAAGCTAAGGTAGGAAGATACGATAACCCAGAAGAGAATCCTTTCTTCC
TTGACAACATTCCTCACTCTGTTTTTCCTACCCACAAACATCCACAGGTTCTGCACCCTA
AGGCTTCATCTGTTAACATAAAAACGGCTTTGGGATGTTTACTTTAAAGAACTGCTTCCT
TTGTTTGTTAAACCTGGTGATGATGGTAACTACGCATCAACTGCTGCTTCTGATCTCGCT
TGTTTACAAGCTCTTTCGAGAAGGATTCACTATGGTAAGTTTGTTGCTGAGGTCAAATTC
AGAGATGCTCCTCATGACTATGAGCCTGCTATCCGCTCTAAGGATACAGAGGCATTGATG
AAGCTTTTGACGTTCGAGAAAGTAGAGGAAATGGTTAAGAAGAGAGTTGAGAAGAAAGCA
GAAACGTTTGGACAGGAGGTTAAGTGCGTCTCTGGTGGTGATGAGAGTGAGAAGAAGAAG
TATAAAGTGGAACCGTCTCTAGTCTCTCGCATCTACGGAGAATGGCTTATCCCTCTTACT
AAAGACGTCGAGGTTGAGTATCTTCTACGTCGTCTCGATTGAATCTCGAGTATTAAACAA
GATGATGAGTCCATTGTCTTTCCCACACTTGCAAGATTTGTTTTTCATTACAGACAGTTT
GTCCAATATGAATAAACCAAACCGATTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E952TF U 1
AF RR2E952JQ C 264
BS 1 642 RR2E952TF
BS 643 643 RR2E952JQ
BS 644 680 RR2E952TF
BS 681 992 RR2E952JQ

RD RR2E952TF 682 0 0
GGGTCTAAAAGCGACTCAAAAGTCAACAGCGAGAAGTAAAGGAGTGAGCGGAGGAAGAAG
AAAAGCCTATTAATCAGGTAAGAAGTAAAGGACTTATTATGGCAAGAGTCGTCGTGGAGT
CTGACACGGTATCTGGAGGTTCCGATGTACTACAGCTAAGTCTTGACTCGATCAGGGAAT
CGTTGATCAGGCAAGAAGACACCATCGTCTTCAGCTTGATCGAGAGAGCTAAGTTTCCTC
TCAATTCACCTGCTTTCGAGGACTCCTCCTCCTCTCTGACTGAGTTCTTTGTCAGAGAAA
TCGAAACCATCCAAGCTAAGGTAGGAAGATACGATAACCCAGAAGAGAATCCTTTCTTCC
TTGACAACATTCCTCACTCTGTTTTTCCTACCCACAAACATCCACAGGTTCTGCACCCTA
AGGCTTCATCTGTTAACATAAAAACGGCTTTGGGATGTTTACTTTAAAGAACTGCTTCCT
TTGTTTGTTAAACCTGGTGATGATGGTAACTACGCATCAACTGCTGCTTCTGATCTCGCT
TGTTTACAAGCTCTTTCGAGAAGGATTCACTATGGTAAGTTTGTTGCTGAGGTCAAATTC
AGAGATGCTCCTCATGACTATGAGCCTGCTATCCGCTCTAAG*ATACAGAGGCATTGATG
AAGCTTTTGACGTTCGAGAA
GT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2E952JQ 729 0 0
TCCTCCTCCTCTCTGACTGAGTTCTTTGTCAGAGAAATCGAAACCATCCAAGCTAAGGTA
GGAAGATACGATAACCCAGAAGAGAATCCTTTCTTCCTTGACAACATTCCTCACTCTGTT
TTTCCTACCCACAAACATCCACAGGTTCTGCACCCTAAGGCTTCATCTGTTAACATAAAA
ACGGCTTTGGGATGTTTACTTTAAAGAACTGCTTCCTTTGTTTGTTAAACCTGGTGATGA
TGGTAACTACGCATCAACTGCTGCTTCTGATCTCGCTTGTTTACAAGCTCTTTCGAGAAG
GATTCACTATGGTAAGTTTGTTGCTGAGGTCAAATTCAGAGATGCTCCTCATGACTATGA
GCCTGCTATCCGCTCTAAGGATACAGAGGCATTGATGAAGCTTTTGACGTTCGAGAAAGT
AGAGGAAATGGTTAAGAAGAGAGTTGAGAAGAAAGCAGAAACGTTTGGACAGGAGGTTAA
GTGCGTCTCTGGTGGTGATGAGAGTGAGAAGAAGAAGTATAAAGTGGAACCGTCTCTAGT
CTCTCGCATCTACGGAGAATGGCTTATCCCTCTTACTAAAGACGTCGAGGTTGAGTATCT
TCTACGTCGTCTCGATTGAATCTCGAGTATTAAACAAGATGATGAGTCCATTGTCTTTCC
CACACTTGCAAGATTTGTTTTTCATTACAGACAGTTTGTCCAATATGAATAAACCAAACC
GATTTGATC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL4292Contig1 1468 2 2 U
GTAACCCATTTTCCCAATCAATCACTCTTCACTTCCCCCACTCCTACTCCTTTTCTCCTT
TCTAAGCAATCTCTCTCTCTCCTTATATTCTCAAATTTGATTCTCTTTCATACCTGCACA
CCACTACCAACAGAGCTAAATTGCTAAAACTGTAAAAAAGAAGATGTTTGGACAAAGCTT
CCCGGAGGATCTTGATTGTGGCAACTTCTTTGACAACATGGACGACATTCTTGACTTTCC
CGGTTGTGATATGGATGTCGGTTTCAACATCGGTGACTCCGACTCTTTCCCTAACATCTG
GACCACTCATCAAGACACATGGCCCGCCGCTGCTGACCCTCTCTTCTCTTCCAACGCAAA
CTCTGACTCATCACCTGAGCTCTATGTTCCGTTTGAGGATATTGTTAAGGTGGAAAAGCC
AGCAAGCTTTGTAGAGGAGTCTTTGGTTGAGAAGAAGGAAGATACGTTTTCCACAAACAC
GGATTCATCGTCTTCTCATAGCCACTTCAGGAGCTCAAGTCCAGTGTCGGTACTCGAGAG
CAGCTCCTCCTCGTCTCAGACGACCAACACAACCTCGCTTGTCCTCTCTGGAAAGCACGG
TCGTCCACGCACAAAACGCCCTCGTCCACCGGTCCAGGAGATGGATAGAGCCAATGTTTG
CGGGGCGGACTCGCGTCTCATCGTTAGAATACCAAAGCAGTTTCTCTCTGACCACAGCAA
GATGATCACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGGCCAAGGTTATTTCTTCCTCTTCTTCGTCGGG
GATTGATCTTGAAACCAACGGAAGCAACAACGTTGACTCGTATGATTCAGAGCAGCATCC
GGTTAGGAAATGTATGCACTGTGAGGTTACCAAGACTCCACAGTGGAGGCTTGGGCCTAT
GGGCCCAAAGACGCTTTGCAACGCGTGTGGCGTGCGTTACAAGTCTGGAAGGCTTTTCCC
GGAGTACCGTCCAGCTAATAGTCCAACATTCACTCCAGCTCTCCACTCAAACTCACACAA
AAAGGTGGCTGAAATGAGAAGCAAGAGGTGCAGCTACGCAAATGAAGAGAATGATCTGCA
AGATTTGATTCCGAACAATGCCTACATTGGCGTGGACTAAAACAGAGAAAGATGTTCAGT
TTTCAAGCGTTGAAGTGATTAGAGTTGCGAGGAGTAGGAAAGAGTCAGTGAGCACAAATG
TTTTAGCTTTAGAAGAGATGAATGAAGAGGAGGATCAAGAGTTAGATGAAAAGTGATTGT
GATTGTATTTTGTATTTGTAGTATGTATGGGCAAAACTCTTGAACACAAAAGAAGAGCAG
AAGATTTTGAAGACTCTAGACAGTTAGGTTTTACGTTAAATCTTCCTCTCCTTTTTCTCC
TTTCAATTCTTTGTATTTTTATTGTGAGGATTCTTTTGTAGTTGGTTTGTTTATTTTTTG
TTTTTGTTAAAATCCCATTTTATTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B317TF U 1
AF RR2B317JQ C 676
BS 1 740 RR2B317TF
BS 741 1468 RR2B317JQ

RD RR2B317TF 740 0 0
GTAACCCATTTTCCCAATCAATCACTCTTCACTTCCCCCACTCCTACTCCTTTTCTCCTT
TCTAAGCAATCTCTCTCTCTCCTTATATTCTCAAATTTGATTCTCTTTCATACCTGCACA
CCACTACCAACAGAGCTAAATTGCTAAAACTGTAAAAAAGAAGATGTTTGGACAAAGCTT
CCCGGAGGATCTTGATTGTGGCAACTTCTTTGACAACATGGACGACATTCTTGACTTTCC
CGGTTGTGATATGGATGTCGGTTTCAACATCGGTGACTCCGACTCTTTCCCTAACATCTG
GACCACTCATCAAGACACATGGCCCGCCGCTGCTGACCCTCTCTTCTCTTCCAACGCAAA
CTCTGACTCATCACCTGAGCTCTATGTTCCGTTTGAGGATATTGTTAAGGTGGAAAAGCC
AGCAAGCTTTGTAGAGGAGTCTTTGGTTGAGAAGAAGGAAGATACGTTTTCCACAAACAC
GGATTCATCGTCTTCTCATAGCCACTTCAGGAGCTCAAGTCCAGTGTCGGTACTCGAGAG
CAGCTCCTCCTCGTCTCAGACGACCAACACAACCTCGCTTGTCCTCTCTGGAAAGCACGG
TCGTCCACGCACAAAACGCCCTCGTCCACCGGTCCAGGAGATGGATAGAGCCAATGTTTG
CGGGGCGGACTCGCGTCTCATCGTTAGAATACCAAAGCAGTTTCTCTCTGACCACAGCAA
GATGATCACCAAGAAGAAGA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2B317JQ 793 0 0
TCTCATCGTTAGAATACCAAAGCAGTTTCTCTCTGACCACAGCAAGATGATCACCAAGAA
GAAGAAGAAGAAGGCCAAGGTTATTTCTTCCTCTTCTTCGTCGGGGATTGATCTTGAAAC
CAACGGAAGCAACAACGTTGACTCGTATGATTCAGAGCAGCATCCGGTTAGGAAATGTAT
GCACTGTGAGGTTACCAAGACTCCACAGTGGAGGCTTGGGCCTATGGGCCCAAAGACGCT
TTGCAACGCGTGTGGCGTGCGTTACAAGTCTGGAAGGCTTTTCCCGGAGTACCGTCCAGC
TAATAGTCCAACATTCACTCCAGCTCTCCACTCAAACTCACACAAAAAGGTGGCTGAAAT
GAGAAGCAAGAGGTGCAGCTACGCAAATGAAGAGAATGATCTGCAAGATTTGATTCCGAA
CAATGCCTACATTGGCGTGGACTAAAACAGAGAAAGATGTTCAGTTTTCAAGCGTTGAAG
TGATTAGAGTTGCGAGGAGTAGGAAAGAGTCAGTGAGCACAAATGTTTTAGCTTTAGAAG
AGATGAATGAAGAGGAGGATCAAGAGTTAGATGAAAAGTGATTGTGATTGTATTTTGTAT
TTGTAGTATGTATGGGCAAAACTCTTGAACACAAAAGAAGAGCAGAAGATTTTGAAGACT
CTAGACAGTTAGGTTTTACGTTAAATCTTCCTCTCCTTTTTCTCCTTTCAATTCTTTGTA
TTTTTATTGTGAGGATTCTTTTGTAGTTGGTTTGTTTATTTTTTGTTTTTGTTAAAATCC
CATTTTATTCCCT

QA 1 793 1 793
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4294Contig1 895 2 8 U
GATGTTTAAACGGGACAAAGAAGCAGCTCGAGACATCGCAAAGTCGGCTAAAAGAAACAG
AGAGAAAGTTAACAGAGCTTCAAACTCTTCTGCGTCTGACAAAGGATGCAAGAGAAGCTG
CTGAGGTTGGTGTGAAAGCTGCAAACGCGAAAGCAGACGCTGTGGAGTCAAGACTCAGAG
ACGTGGAAGCAGAATCAGAATCTTTGATCTTGAAGATCGAATCTTTGGAAGAGAGGATAG
AAAAGGAACGTGTCTTATCAGCAAAACACATTTCAAAGTGCGAGGAACTGCAAGATGAGA
TCTCAAAACTTAAACATGAACTTGAGCATTATGAAGAAGCAGAGCATAAGCCTAAACATG
TTAGAGCTTTTGATGATGATTATAAGCTGAAGCAAGAGAAGGAACTAGCAGTGGCTGCCT
CCAAATTTGCATAGTGCCAGAGAACTATTGCTTCACTGGGTCAGAGATTCAGTCACTTGC
TACATTTGATGATTTCTTGATTGAACCTTGAGGAGAAGCTCTCTGGTCAGATTATTGATC
ATTCCCAAGAATGGTAATAAGAGTCAATAGACATTGAAATCAGAATGATGAGCAGCTGAA
TCTGTCAGCTAAAGAAACTTGGAATCATATTCATGAATACAAGTGTAGAGGACACATGAA
CAACGGGGAAGGCTAAGCCAAAAGAGGGTTGAGATACATATGTCAATAGAACACTAAGGG
AAAGAAAATGGATATAGTTTTTTTTCTTTCATTTTATTTTTATAAATTATTATCCATTCA
ATCTCTATTGTTTAAGATCATATCAAATATCAGCAGAACTAAGTACAAATTACAATCTAA
AACGTAAAAGTAAATATATAATAAACTGTGAAAAGTATTTTCATTTTGCTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG80TF U 1
AF RR2BG80JQ C 14
BS 1 817 RR2BG80TF
BS 818 818 RR2BG80JQ
BS 819 848 RR2BG80TF
BS 849 849 RR2BG80JQ
BS 850 860 RR2BG80TF
BS 861 861 RR2BG80JQ
BS 862 873 RR2BG80TF
BS 874 895 RR2BG80JQ

RD RR2BG80TF 878 0 0
GATGTTTAAACGGGACAAAGAAGCAGCTCGAGACATCGCAAAGTCGGCTAAAAGAAACAG
AGAGAAAGTTAACAGAGCTTCAAACTCTTCTGCGTCTGACAAAGGATGCAAGAGAAGCTG
CTGAGGTTGGTGTGAAAGCTGCAAACGCGAAAGCAGACGCTGTGGAGTCAAGACTCAGAG
ACGTGGAAGCAGAATCAGAATCTTTGATCTTGAAGATCGAATCTTTGGAAGAGAGGATAG
AAAAGGAACGTGTCTTATCAGCAAAACACATTTCAAAGTGCGAGGAACTGCAAGATGAGA
TCTCAAAACTTAAACATGAACTTGAGCATTATGAAGAAGCAGAGCATAAGCCTAAACATG
TTAGAGCTTTTGATGATGATTATAAGCTGAAGCAAGAGAAGGAACTAGCAGTGGCTGCCT
CCAAATTTGCATAGTGCCAGAGAACTATTGCTTCACTGGGTCAGAGATTCAGTCACTTGC
TACATTTGATGATTTCTTGATTGAACCTTGAGGAGAAGCTCTCTGGTCAGATTATTGATC
ATTCCCAAGAATGGTAATAAGAGTCAATAGACATTGAAATCAGAATGATGAGCAGCTGAA
TCTGTCAGCTAAAGAAACTTGGAATCATATTCATGAATACAAGTGTAGAGGACACATGAA
CAACGGGGAAGGCTAAGCCAAAAGAGGGTTGAGATACATATGTCAATAGAACACTAAGGG
AAAGAAAATGGATATAGTTTTTTTTCTTTCATTTTATTTTTATAAATTATTATCCATTCA
ATCTCTATTGTTTAAGATCATATCAAATATCAGCAGA*CTAAGTACAAATTACAATCTAA
AACGTAAA*GTAAATATATA*TAAACTGTGAAA
GTATT

QA 1 873 1 873
DS 

RD RR2BG80JQ 882 0 0
GACAAAGAAGCAGCTCGAGACATCGCAAAGTCGGCTAAAAGAAACAGAGAGAAAGTTAAC
AGAGCTTCAAACTCTTCTGCGTCTGACAAAGGATGCAAGAGAAGCTGCTGAGGTTGGTGT
GAAAGCTGCAAACGCGAAAGCAGACGCTGTGGAGTCAAGACTCAGAGACGTGGAAGCAGA
ATCAGAATCTTTGATCTTGAAGATCGAATCTTTGGAAGAGAGGATAGAAAAGGAACGTGT
CTTATCAGCAAAACACATTTCAAAGTGCGAGGAACTGCAAGATGAGATCTCAAAACTTAA
ACATGAACTTGAGCATTATGAAGAAGCAGAGCATAAGCCTAAACATGTTAGAGCTTTTGA
TGATGATTATAAGCTGAAGCAAGAGAAGGAACTAGCAGTGGCTGCCTCCAAATTTGCATA
GTGCCAGAGAACTATTGCTTCACTGGGTCAGAGATTCAGTCACTTGCTACATTTGATGAT
TTCTTGATTGAACCTTGAGGAGAAGCTCTCTGGTCAGATTATTGATCATTCCCAAGAATG
GTAATAAGAGTCAATAGACATTGAAATCAGAATGATGAGCAGCTGAATCTGTCAGCTAAA
GAAACTTGGAATCATATTCATGAATACAAGTGTAGAGGACACATGAACAACGGGGAAGGC
TAAGCCAAAAGAGGGTTGAGATACATATGTCAATAGAACACTAAGGGAAAGAAAATGGAT
ATAGTTTTTTTTCTTTCATTTTATTTTTATAAATTATTATCCATTCAATCTCTATTGTTT
AAGATCATATCAAATATCAGCAGAACTAAGTACAAATTACAATCTAAAACGTAAAAGTAA
ATATATAATAAACTGTGAAAAGTATTTTCATTTTGCTTTTGC

QA 1 882 1 882
DS 



AS 1 2

CO CL4295Contig1 910 2 4 U
TCGACTTCGCTGAGATGTTTAACTCCGAGCTTCAGACATGGACGACTCTTCCGAGGATGA
ACAAGCCGAGGAAGATGTGTTCAGGTGTTTTCATGGACGGCAAGTTTTATGTAACCGGTG
GGATCGGTGGGGATGAGTCCAAGCTCTTGACTTGCGGTGAAGAGTATGACTTGGAGACCA
AGAAATGGACTCACATCCCTGACTTGTCCCCTCCGAGGAGCCGCGCTGATATGTCGTCGG
CGAACGACGCGCCGCCTCTTGTTGCTGTTGTGAATAACCAACTGTATGCAGCTGATCACG
CGGATATGGAAGTGAGGAAGTATGATAAGGAGAAGAAGAGATGGTTGACCGTTGGGAGGT
TGCCTGAGAGAGCTGGCTCGGTTAATGGATGGGGGCTTGCTTTTAGAGCTTGTGGGGAGA
GGTTGATTGTTATAGGTGGGCCGAGGAACTCGGGAGGTGGTTTATAGAGCTGAACTCTTG
GACACCTAGCGACCGGTGGTGGTCCACCACAGTGGACGTTGCTTGATAGGAAACATTCTC
CTAACTTTGTGTACAATTGCGCAGTGATGGGTTGCTGAAAGCAGCACACATTCTATAATA
CTACTCTCCATTTGAAAAGACTATCCACTGAAGGTTCCAAGCTCCAACCTTTTAAGCTGC
TGCTTATTCTTGTTCCATATTTTTGTTTTTTCTTACAATTTTTTTTTTTTTCAAATTGGA
TACAACTATCTCTGTGTTGTTAGAACAAGTCTCAAAGAAGGAAAGAAAAGAAAAAAACTG
AAACAGGTTACAATAAGTTGGTTGAAAAGGTTGAAGTTTTTTTAGAAGGTTGCCAGATGT
GGTTAACATTGTTGTATGTGTTTTAATTATTTGTTCTTTTTTTTATAATAATCTACTTTT
GAATCTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO16TF U 1
AF RR2BO16JQ C 203
BS 1 528 RR2BO16TF
BS 529 529 RR2BO16JQ
BS 530 617 RR2BO16TF
BS 618 910 RR2BO16JQ

RD RR2BO16TF 624 0 0
TCGACTTCGCTGAGATGTTTAACTCCGAGCTTCAGACATGGACGACTCTTCCGAGGATGA
ACAAGCCGAGGAAGATGTGTTCAGGTGTTTTCATGGACGGCAAGTTTTATGTAACCGGTG
GGATCGGTGGGGATGAGTCCAAGCTCTTGACTTGCGGTGAAGAGTATGACTTGGAGACCA
AGAAATGGACTCACATCCCTGACTTGTCCCCTCCGAGGAGCCGCGCTGATATGTCGTCGG
CGAACGACGCGCCGCCTCTTGTTGCTGTTGTGAATAACCAACTGTATGCAGCTGATCACG
CGGATATGGAAGTGAGGAAGTATGATAAGGAGAAGAAGAGATGGTTGACCGTTGGGAGGT
TGCCTGAGAGAGCTGGCTCGGTTAATGGATGGGGGCTTGCTTTTAGAGCTTGTGGGGAGA
GGTTGATTGTTATAGGTGGGCCGAGGAACTCGGGAGGTGGTTTATAGAGCTGAACTCTTG
GACACCTAGCGACCGGTGGTGGTCCACCACAGTGGACGTTGCTTGATATGAAACATTCTC
CTAACTTTGTGTACAATTGCGCAGTGATGGGTTGCTGAAAGCAGCACACATTCTATAATA
CTACTCTCCATTTGAAA
GACTATC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2BO16JQ 708 0 0
CTTGTCCCCTCCGAGGAGCCGCGCTGATATGTCGTCGGCGAACGACGCGCCGCCTCTTGT
TGCTGTTGTGAATAACCAACTGTATGCAGCTGATCACGCGGATATGGAAGTGAGGAAGTA
TGATAAGGAGAAGAAGAGATGGTTGACCGTTGGGAGGTTGCCTGAGAGAGCTGGCTCGGT
TAATGGATGGGGGCTTGCTTTTAGAGCTTGTGGGGAGAGGTTGATTGTTATAGGTGGGCC
GAGGAACTCGGGAGGTGGTTTATAGAGCTGAACTCTTGGACACCTAGCGAC*GGTGGTGG
TCCACCACAGTGGACGTTGCTTGATAGGAAACATTCTCCTAACTTTGTGTACAATTGCGC
AGTGATGGGTTGCTGAAAGCAGCACACATTCTATAATACTACTCTCCATTTGAAAAGACT
ATCCACTGAAGGTTCCAAGCTCCAACCTTTTAAGCTGCTGCTTATTCTTGTTCCATATTT
TTGTTTTTTCTTACAATTTTTTTTTTTTTCAAATTGGATACAACTATCTCTGTGTTGTTA
GAACAAGTCTCAAAGAAGGAAAGAAAAGAAAAAAACTGAAACAGGTTACAATAAGTTGGT
TGAAAAGGTTGAAGTTTTTTTAGAAGGTTGCCAGATGTGGTTAACATTGTTGTATGTGTT
TTAATTATTTGTTCTTTTTTTTATAATAATCTACTTTTGAATCTTCTT

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL4296Contig1 489 2 2 U
GGGAACATGACCAAATGTTCACACTCACAGAGTATTCTAATCTTCTAAAGGTGGATGTTC
CCGGAAGAGATACTCCTCCAGATGCTCAACACCGCCTTTCAGAAATTCTCTCTCACTGAT
ATCAAACTCCTCAGAGCAGCCATCCGCGGGTTACCCCATGAATAAAAAGAGCTTCTCCAG
CATCTAATATCTTGTTTCATTAGTTTCATAAGCTGCAGAAAAATCACCAAGGGTGAGGAA
TCCCAAAGGAGAGGCAAAAGAATAACAATGTACATCATCTTGGTGCTTCTGCTGCAATAA
TAGCCTGGTTCCATTATTTTTTCGTTTGTTTGTTTATTTTTCTTCTCTCTCACTTGTCTA
AGGTTTTTTGATGTCCAAAACAGAAGCAAGAGCTTCGTTAGAGATTTCGTTTGTATAAAA
CTTTCCAAGGTGACTTCATTTTCCAATCGAAAACAAAAAAAAATGGAGAGAAAGCCACAG
ATATCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D664JQ C 1
AF RR2D664TF U 23
BS 1 22 RR2D664JQ
BS 23 489 RR2D664TF

RD RR2D664JQ 489 0 0
GGGAACATGACCAAATGTTCACACTCACAGAGTATTCTAATCTTCTAAAGGTGGATGTTC
CCGGAAGAGATACTCCTCCAGATGCTCAACACCGCCTTTCAGAAATTCTCTCTCACTGAT
ATCAAACTCCTCAGAGCAGCCATCCGCGGGTTACCCCATGAATAAAAAGAGCTTCTCCAG
CATCTAATATCTTGTTTCATTAGTTTCATAAGCTGCAGAAAAATCACCAAGGGTGAGGAA
TCCCAAAGGAGAGGCAAAAGAATAACAATGTACATCATCTTGGTGCTTCTGCTGCAATAA
TAGCCTGGTTCCATTATTTTTTCGTTTGTTTGTTTATTTTTCTTCTCTCTCACTTGTCTA
AGGTTTTTTGATGTCCAAAACAGAAGCAAGAGCTTCGTTAGAGATTTCGTTTGTATAAAA
CTTTCCAAGGTGACTTCATTTTCCAATCGAAAACAAAAAAAAATGGAGAGAAAGCCACAG
ATATCTACC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2D664TF 467 0 0
ACTCACAGAGTATTCTAATCTTCTAAAGGTGGATGTTCCCGGAAGAGATACTCCTCCAGA
TGCTCAACACCGCCTTTCAGAAATTCTCTCTCACTGATATCAAACTCCTCAGAGCAGCCA
TCCGCGGGTTACCCCATGAATAAAAAGAGCTTCTCCAGCATCTAATATCTTGTTTCATTA
GTTTCATAAGCTGCAGAAAAATCACCAAGGGTGAGGAATCCCAAAGGAGAGGCAAAAGAA
TAACAATGTACATCATCTTGGTGCTTCTGCTGCAATAATAGCCTGGTTCCATTATTTTTT
CGTTTGTTTGTTTATTTTTCTTCTCTCTCACTTGTCTAAGGTTTTTTGATGTCCAAAACA
GAAGCAAGAGCTTCGTTAGAGATTTCGTTTGTATAAAACTTTCCAAGGTGACTTCATTTT
CCAATCGAAAACAAAAAAAAATGGAGAGAAAGCCACAGATATCTACC

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 2

CO CL4297Contig1 994 2 2 U
GGATTACAAGACAGTCAGACAGATCAGGAACAGCTTAGACTCGCAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGAAAAACACCGTCGTTCTTCTTCCACCCACAGAACATAACCAGAGATCGTAGAATCT
GTCTATCTCTCTCTTTTAGGTCCGATTCGATGCCGTCCCGTAGGCGTACCCTCCTCAAAG
TCATCATCCTCGGCGATAGCGGGGTGGGGAAGACCTCTCTGATGAATCAATATGTTAATA
AAAAGTTCAGCAACCAGTACAAAGCCACCATTGGAGCTGACTTCTTGACTAAGGAAGTCC
AGTTTGAAGATCGTCTTTTCACTTTACAGATCTGGGATACGGCTGGGCAAGAAAGGTTTC
AGAGCCTTGGTGTAGCTTTTTACCGGGGTGCTGATTGCTGTGTTCTTGTATATGATGTCA
ACTCCATGAAATCTTTTGAAAATCTCAACAACTGGAGAGAAGAGTTTCTGATCCAGGCGA
GTCCATCGGATCCAGAGAACTTTCCGTTTGTTCTTATCGGAAACAAGGTTGACGTGGATG
GTGGAAACAGCAGAGTGGTTTCAGAGAAGAAGGCTAAAGCTTGGTGCGCTCCAAAGGGAA
ACATTCCCTACTTTGAAACCTCTGCTAAGGAAGGCACCAATGTTGAGGAGGCTTTCCAAT
GCATCGCCAAGAACGCTCTGAAGAGCGGCGAAGAGGAAGAGCTATACTTGCCGGACACAA
TCGATGTCGGGACAAGCAATCAGCAGAGGTCTACAGGGTGTGAATGCTAAGGAGAGTATC
TCTCCCAGAAGAATGCTTTTGAGTTCAAACAATGGGGGGAACGTGTCTCTCCTCCCATCA
CCTCTCTTCTTCGCCAGTTATCTCTAAACTTTTATTATATTACTACATGCTGTAAATTTG
TTCTTTTGTGGGCTAAAGAGAACCCTTCAAAATGATTTGACTTGTCTAGCAAGCAAGTAT
TTGTGTTATATTTGAAAGAAACATATTTCCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D927TF U 1
AF RR2D927JQ C 212
BS 1 711 RR2D927TF
BS 712 994 RR2D927JQ

RD RR2D927TF 711 0 0
GGATTACAAGACAGTCAGACAGATCAGGAACAGCTTAGACTCGCAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGAAAAACACCGTCGTTCTTCTTCCACCCACAGAACATAACCAGAGATCGTAGAATCT
GTCTATCTCTCTCTTTTAGGTCCGATTCGATGCCGTCCCGTAGGCGTACCCTCCTCAAAG
TCATCATCCTCGGCGATAGCGGGGTGGGGAAGACCTCTCTGATGAATCAATATGTTAATA
AAAAGTTCAGCAACCAGTACAAAGCCACCATTGGAGCTGACTTCTTGACTAAGGAAGTCC
AGTTTGAAGATCGTCTTTTCACTTTACAGATCTGGGATACGGCTGGGCAAGAAAGGTTTC
AGAGCCTTGGTGTAGCTTTTTACCGGGGTGCTGATTGCTGTGTTCTTGTATATGATGTCA
ACTCCATGAAATCTTTTGAAAATCTCAACAACTGGAGAGAAGAGTTTCTGATCCAGGCGA
GTCCATCGGATCCAGAGAACTTTCCGTTTGTTCTTATCGGAAACAAGGTTGACGTGGATG
GTGGAAACAGCAGAGTGGTTTCAGAGAAGAAGGCTAAAGCTTGGTGCGCTCCAAAGGGAA
ACATTCCCTACTTTGAAACCTCTGCTAAGGAAGGCACCAATGTTGAGGAGGCTTTCCAAT
GCATCGCCAAGAACGCTCTGAAGAGCGGCGAAGAGGAAGAGCTATACTTGC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2D927JQ 783 0 0
AGA
CTCTCTGATGAATCAATATGTTAATAAAAAGTTCAGCAACCAGTACAAAGCCACCATTGG
AGCTGACTTCTTGACTAAGGAAGTCCAGTTTGAAGATCGTCTTTTCACTTTACAGATCTG
GGATACGGCTGGGCAAGAAAGGTTTCAGAGCCTTGGTGTAGCTTTTTACCGGGGTGCTGA
TTGCTGTGTTCTTGTATATGATGTCAACTCCATGAAATCTTTTGAAAATCTCAACAACTG
GAGAGAAGAGTTTCTGATCCAGGCGAGTCCATCGGATCCAGAGAACTTTCCGTTTGTTCT
TATCGGAAACAAGGTTGACGTGGATGGTGGAAACAGCAGAGTGGTTTCAGAGAAGAAGGC
TAAAGCTTGGTGCGCTCCAAAGGGAAACATTCCCTACTTTGAAACCTCTGCTAAGGAAGG
CACCAATGTTGAGGAGGCTTTCCAATGCATCGCCAAGAACGCTCTGAAGAGCGGCGAAGA
GGAAGAGCTATACTTGCCGGACACAATCGATGTCGGGACAAGCAATCAGCAGAGGTCTAC
AGGGTGTGAATGCTAAGGAGAGTATCTCTCCCAGAAGAATGCTTTTGAGTTCAAACAATG
GGGGGAACGTGTCTCTCCTCCCATCACCTCTCTTCTTCGCCAGTTATCTCTAAACTTTTA
TTATATTACTACATGCTGTAAATTTGTTCTTTTGTGGGCTAAAGAGAACCCTTCAAAATG
ATTTGACTTGTCTAGCAAGCAAGTATTTGTGTTATATTTGAAAGAAACATATTTCCTCCC

QA 4 783 4 783
DS 



AS 1 2

CO CL4298Contig1 861 2 5 U
GGACGTTCTGTTTACATAAACATCCAGAAGTTCGTTCAGTTTCAGCTCACGGTTAATGTT
GTTGCACTGATTGTTAACTTCTCTTCAGCTTGTTTAACCGGGAGTGCTCCTTTAACTGCT
GTTCAGTTGCTATGGGTGAACATGATCATGTACACACTTGGAGCTCTTGCTTTAGCTACA
GAGCCACCAAACAACGAGCTGATGAGACGCTTACCCGTTGGAAGGAGAGGAAACTTCATC
ACCAACGCCATGTGGAGGAACATTCTAGGACAGTCTGTGTATCAGTTCATTGTCATTTGG
TTTCTCCAAGCCAAAGGGAAGTCTGTGTTTGGTCTTGATGGTCCTGACTCAACTCTCATG
TTAAACACTCTTATCTTCAACTGTTTCGTCTTCTGTCAGGTGTTTAATGAGATAAGCTCT
AGAGAGATGGAAGAGATTGATGTTTTCAAGGGAATACTAGACAACTACGTCTTTGTGGTT
GTGATCGGTGCAACGGTCTTCTTTTAGATCATAATCATTGAGTTCTTGGGAACATTTGCA
AGCACCACACCACTCACAATAGTCCAATGGATCTTCAGTATCCTCATAGGTTTCTTGGGT
ATGCCAATATCTGCAGGACTGAAGATGATTCCCGTCTGATCCATCCATCAAATTTAGCTC
GAAAACCGCTCTTTAAAGAGAGCTCTCTTCTCATCTCTTAGAACAATTTCTTTCAAATTT
TAGAATAGAAAGTCTTTTTACTAAGTTTTTGCCTTTTGCAATAACTCTTTTTTTTCATTA
TTAAGGACAAGCAACTGATCTATGTTTTCTCTATTTTTGTAAAACCCACTGTTTCTTTGA
AATGACTATCTTTGTTTCTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ03TFB U 85
AF RR2AZ03JQ C 1
BS 1 84 RR2AZ03JQ
BS 85 106 RR2AZ03TFB
BS 107 107 RR2AZ03JQ
BS 108 585 RR2AZ03TFB
BS 586 861 RR2AZ03JQ

RD RR2AZ03TFB 501 0 0
TCAGCTTGTTTAACCGGGAGTGGTCCTTTAACTGCTGTTCAGTTGCTATGGGTGAACATG
ATCATGTACACACTTGGAGCTCTTGCTTTAGCTACAGAGCCACCAAACAACGAGCTGATG
AGACGCTTACCCGTTGGAAGGAGAGGAAACTTCATCACCAACGCCATGTGGAGGAACATT
CTAGGACAGTCTGTGTATCAGTTCATTGTCATTTGGTTTCTCCAAGCCAAAGGGAAGTCT
GTGTTTGGTCTTGATGGTCCTGACTCAACTCTCATGTTAAACACTCTTATCTTCAACTGT
TTCGTCTTCTGTCAGGTGTTTAATGAGATAAGCTCTAGAGAGATGGAAGAGATTGATGTT
TTCAAGGGAATACTAGACAACTACGTCTTTGTGGTTGTGATCGGTGCAACGGTCTTCTTT
TAGATCATAATCATTGAGTTCTTGGGAACATTTGCAAGCACCACACCACTCACAATAGTC
CAATGGATCTTCAGTATCCTC

QA 1 501 1 501
DS 

RD RR2AZ03JQ 861 0 0
GGACGTTCTGTTTACATAAACATCCAGAAGTTCGTTCAGTTTCAGCTCACGGTTAATGTT
GTTGCACTGATTGTTAACTTCTCTTCAGCTTGTTTAACCGGGAGTGCTCCTTTAACTGCT
GTTCAGTTGCTATGGGTGAACATGATCATGTACACACTTGGAGCTCTTGCTTTAGCTACA
GAGCCACCAAACAACGAGCTGATGAGACGCTTACCCGTTGGAAGGAGAGGAAACTTCATC
ACCAACGCCATGTGGAGGAACATTCTAGGACAGTCTGTGTATCAGTTCATTGTCATTTGG
TTTCTCCAAGCCAAAGGGAAGTCTGTGTTTGGTCTTGATGGTCCTGACTCAACTCTCATG
TTAAACACTCTTATCTTCAACTGTTTCGTCTTCTGTCAGGTGTTTAATGAGATAAGCTCT
AGAGAGATGGAAGAGATTGATGTTTTCAAGGGAATACTAGACAACTACGTCTTTGTGGTT
GTGATCGGTGCAACGGTCTTCTTTTAGATCATAATCATTGAGTTCTTGGGAACATTTGCA
AGCACCACACCACTCACAATAGTCCAATGGATCTTCAGTATCCTCATAGGTTTCTTGGGT
ATGCCAATATCTGCAGGACTGAAGATGATTCCCGTCTGATCCATCCATCAAATTTAGCTC
GAAAACCGCTCTTTAAAGAGAGCTCTCTTCTCATCTCTTAGAACAATTTCTTTCAAATTT
TAGAATAGAAAGTCTTTTTACTAAGTTTTTGCCTTTTGCAATAACTCTTTTTTTTCATTA
TTAAGGACAAGCAACTGATCTATGTTTTCTCTATTTTTGTAAAACCCACTGTTTCTTTGA
AATGACTATCTTTGTTTCTTA

QA 1 861 1 861
DS 



AS 1 2

CO CL4299Contig1 1128 2 4 U
GGATAAAACTTCGAAAAAAGAAAAAGACAAAACCTTTGAGTCACTCCTAAAAATATCATA
AACTGACGGACACACTCACAGATGGGTATTCTCAGATTATCTATGTCTCAATAACATCTT
GGAAGAAGCTCGTGTTGTGCTTCACTTGCGTTGATGATGCTTACGCGACAGGGTATATTC
ATTGCCTAGATTGCTAAAGCTTTTAGGGAAAAAGAGAGAAGCTTTGTGCCTTTGTCTTAA
AAAAATGGCTTTTTGGTCAACATCAGCTGGGATAGGATCTTGTTGTCTTCTTAACAATGA
CATCACTGAAACATGGAGGTTTCCTTCCACCTGTTTTTCAACGTGTAAGAACAAGATTAA
ACGCGGATCTGAGACCCTGAGAGTTACAAGAAAACATATCTCTAGTGATCTGGTCACAAG
TGCGCTGCAAAGTTATCATCATCGGTTGAGTAAGATTCGTGCTTTAAAAACTTCTACCGA
GCTGAAAGAAGAGGTATCTACAAGAAGTTCTCAGGTAGAGGACCCAAAGAAGGTAACAAG
ATCATCTTATTCCTTCAGGACGAAGTCTGGTGCTCTTGTTAAAGTTAAAGTCGAAAAGAA
GAGGGAGGAAAAGTACAGTATCATGGTTTATGTCAGTGGTGATGACAACAAGAGTAGTAG
TCTGGTGATGGTTTGGGGTGTCTACAGGTCTGACTCTTCTTCCAAATTCTTGGCGTTGGA
GATCAAAGCTGAGACAGAGGAAGAAACAACCGCGTTGTCACCTGTTGAGCCAACCGAGCC
AAAGAACAATGACCTCTTCATTGGATTCAATGCAAGTGATCAACCTGAGAATGTTATATT
GCCTTCACTTCCTGATGGAAGGGAATGGAGGCGGTTGGTGGACACAGCTCTTCCTTTCCC
AGGGTTTTTCTCTGTTGAAGGAGAGACTGTTGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAAGAGATGAA
TCAACCAGTGATGTATGAGATGAAGCCGTACAGTTGCACCCTTTTTGAAACAACCATCAA
TGCTACTACTACTGGTTAGAAACTCAAATTATGATCTTTGTATATGTTAAAAAGATTGTG
TTGTAATGTTTGAGATAAGAATATTTAATCAAATCAATTACTTTCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI27TF U 1
AF RR2EI27JQ C 352
BS 1 558 RR2EI27TF
BS 559 559 RR2EI27JQ
BS 560 599 RR2EI27TF
BS 600 1128 RR2EI27JQ

RD RR2EI27TF 599 0 0
GGATAAAACTTCGAAAAAAGAAAAAGACAAAACCTTTGAGTCACTCCTAAAAATATCATA
AACTGACGGACACACTCACAGATGGGTATTCTCAGATTATCTATGTCTCAATAACATCTT
GGAAGAAGCTCGTGTTGTGCTTCACTTGCGTTGATGATGCTTACGCGACAGGGTATATTC
ATTGCCTAGATTGCTAAAGCTTTTAGGGAAAAAGAGAGAAGCTTTGTGCCTTTGTCTTAA
AAAAATGGCTTTTTGGTCAACATCAGCTGGGATAGGATCTTGTTGTCTTCTTAACAATGA
CATCACTGAAACATGGAGGTTTCCTTCCACCTGTTTTTCAACGTGTAAGAACAAGATTAA
ACGCGGATCTGAGACCCTGAGAGTTACAAGAAAACATATCTCTAGTGATCTGGTCACAAG
TGCGCTGCAAAGTTATCATCATCGGTTGAGTAAGATTCGTGCTTTAAAAACTTCTACCGA
GCTGAAAGAAGAGGTATCTACAAGAAGTTCTCAGGTAGAGGACCCAAAGAAGGTAACAAG
ATCATCTTATTCCTTCAG*ACGAAGTCTGGTGCTCTTGTTAAAGTTAAAGTCGAAAAGA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2EI27JQ 777 0 0
CAAGATTAAACGCGGATCTGAGACCCTGAGAGTTACAAGAAAACATATCTCTAGTGATCT
GGTCACAAGTGCGCTGCAAAGTTATCATCATCGGTTGAGTAAGATTCGTGCTTTAAAAAC
TTCTACCGAGCTGAAAGAAGAGGTATCTACAAGAAGTTCTCAGGTAGAGGACCCAAAGAA
GGTAACAAGATCATCTTATTCCTTCAGGACGAAGTCTGGTGCTCTTGTTAAAGTTAAAGT
CGAAAAGAAGAGGGAGGAAAAGTACAGTATCATGGTTTATGTCAGTGGTGATGACAACAA
GAGTAGTAGTCTGGTGATGGTTTGGGGTGTCTACAGGTCTGACTCTTCTTCCAAATTCTT
GGCGTTGGAGATCAAAGCTGAGACAGAGGAAGAAACAACCGCGTTGTCACCTGTTGAGCC
AACCGAGCCAAAGAACAATGACCTCTTCATTGGATTCAATGCAAGTGATCAACCTGAGAA
TGTTATATTGCCTTCACTTCCTGATGGAAGGGAATGGAGGCGGTTGGTGGACACAGCTCT
TCCTTTCCCAGGGTTTTTCTCTGTTGAAGGAGAGACTGTTGTAGCAGAAGAAGAAGAAGA
AGAGATGAATCAACCAGTGATGTATGAGATGAAGCCGTACAGTTGCACCCTTTTTGAAAC
AACCATCAATGCTACTACTACTGGTTAGAAACTCAAATTATGATCTTTGTATATGTTAAA
AAGATTGTGTTGTAATGTTTGAGATAAGAATATTTAATCAAATCAATTACTTTCCAC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL4300Contig1 521 2 1 U
GGGAGTCGAGACAATTTAACAATGGCGACGAACAAAATCGTCCGTCTGATCACACCGAGC
CGATCCGCCTCCTCTAGATTCCTGGAGCCTGTATCCCGATTTCTAAGCTCCGTTACTCCT
CCTCCTCCTTCGCCGCAGTCACCATCCCCGTCTCCGAATCAGGATCAGGTTGTGAAGCCA
GATGCGAAACTTCAAGAGATGCCCAAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGGAGGAGGTGGA
GAGTTTGTTAACGAAGATACGGGTGAGATAGGAGGCCCTAGAGGTCCTGAGCCCACTCGG
TACGGCGATTGGGAACAACGTGGTCGATGCTCCGACTTTTAAGACGTGATCCAAGTAAAC
CTGGCTTACCTTATTAGAGTCTCCTTGTTCATCATTTTGATTCCATTTGTTTTATGTATT
CGCAAATAATGGAGATAGTTGGAATTGTGATATGTCTTGGATTCGTTGTGTTGTTTATGA
ATGTTTTAGCTATTTGATTACGTAAAGTTTTATTTTGTAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B870JQ C 1
AF RR2B870TF U 1
BS 1 521 RR2B870TF

RD RR2B870JQ 521 0 0
GGGAGTCGAGACAATTTAACAATGGCGACGAACAAAATCGTCCGTTTGATCACACCGAGC
CGATCCGCCTCCTTTAGATTCCTGGAGCCTGTATCCCGATTTTTAAGCTCCGTTACTCCT
CCTCCTCCTTCGCCGCAGTCACCATCCCCGTTTCCGAATCAGGATCAGGTTGTGAAGCCA
GATGCGAAACTTCAAGAGATGCCCAAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGGAGGAGGTGGA
GAGTTTGTTAACGAAGATACGGGTGAGATAGGAGGCCCTAGAGGTCCTGAGCCCCCTCGG
TACGGCGATTGGGAACAACGTGGTCGATGCTCCGACTTTTAAGACGTGATCCAAGTAAAC
CTGGCTTACCTTATTAGAGTCTCCTTGTTCATCATTTTGATTCCATTTGTTTTATGTATT
CGCAAATAATGGAGATAGTTGGAATTGTGATATGTTTTGGATTCGTTGTGTTGTTTATGA
ATGTTTTAGCTATTTGATTACGTAAAGTTTTATTTTGTAAG

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2B870TF 521 0 0
GGGAGTCGAGACAATTTAACAATGGCGACGAACAAAATCGTCCGTCTGATCACACCGAGC
CGATCCGCCTCCTCTAGATTCCTGGAGCCTGTATCCCGATTTCTAAGCTCCGTTACTCCT
CCTCCTCCTTCGCCGCAGTCACCATCCCCGTCTCCGAATCAGGATCAGGTTGTGAAGCCA
GATGCGAAACTTCAAGAGATGCCCAAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGGAGGAGGTGGA
GAGTTTGTTAACGAAGATACGGGTGAGATAGGAGGCCCTAGAGGTCCTGAGCCCACTCGG
TACGGCGATTGGGAACAACGTGGTCGATGCTCCGACTTTTAAGACGTGATCCAAGTAAAC
CTGGCTTACCTTATTAGAGTCTCCTTGTTCATCATTTTGATTCCATTTGTTTTATGTATT
CGCAAATAATGGAGATAGTTGGAATTGTGATATGTCTTGGATTCGTTGTGTTGTTTATGA
ATGTTTTAGCTATTTGATTACGTAAAGTTTTATTTTGTAAG

QA 1 521 1 521
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4302Contig1 578 2 2 U
TTTTTTTTTGTAAAGAAAACTTTTCTTTTTCATTCTATGTTTACTACCAAATAATTGTCG
ATATTACAAAGAAAGTAGAGGCTGGATAGCAATCAAAGATGAACTGACATCAACAAAGAC
AAAACAATTGCGATATAGGTACCAAGGAAATTTGAGGTGGAAGACGGAATCTGGGTCTTC
TCTAGAGGTACTTTCTTGCGAGTGCACGTACCTTGGTGTCAAAATGCGTGGATGTGATGC
GAGAACCAGGCAGATACAAGGGATTCAGAAGAATCTTAATATAAAGCTCATGGACCTCCT
GAAAGAAGCTCTTGATGCCGCCCTCATTGCGTGAATCATGAAGGAGCATGAGACGAGTAT
GGCCTGCAGTAACATACACTGAGACAACCAGATCGTTGAATCTGTCGACAGACTTCAAGA
ACATGGCACTTGTAGTCCATGCCAAGTCTTGGACGACATCTAACGCAGCATGTAATATAA
ACTGGTGCAGTTGAGCAGCATCTTCTCTTTTAGCAACAGACCCAACTTCAGCTTCATAGA
TTGGAATATCATTCCGAGCCACAATCATAAAGCAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS23TF C 1
AF RR2CS23JQ U 26
BS 1 25 RR2CS23TF
BS 26 578 RR2CS23JQ

RD RR2CS23TF 521 0 0
TTTTTTTTTGTAAAGAAAACTTTTCTTTTTCATTCTATGTTTACTACCAAATAATTGTCG
ATATTACAAAGAAAGTAGAGGCTGGATAGCAATCAAAGATGAACTGACATCAACAAAGAC
AAAACAATTGCGATATAGGTACCAAGGAAATTTGAGGTGGAAGACGGAATCTGGGTCTTC
TCTAGAGGTACTTTCTTGCGAGTGCACGTACCTTGGTGTCAAAATGCGTGGATGTGATGC
GAGAACCAGGCAGATACAAGGGATTCAGAAGAATCTTAATATAAAGCTCATGGACCTCCT
GAAAGAAGCTCTTGATGCCGCCCTCATTGCGTGAATCATGAAGGAGCATGAGACGAGTAT
GGCCTGCAGTAACATACACTGAGACAACCAGATCGTTGAATCTGTCGACAGACTTCAAGA
ACATGGCACTTGTAGTCCATGCCAAGTCTTGGACGACATCTAACGCAGCATGTAATATAA
ACTGGTGCAGTTGAGCAGCATCTTCTCTTTTAGCAACAGAC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2CS23JQ 553 0 0
TTTTTCATTCTATGTTTACTACCAAATAATTGTCGATATTACAAAGAAAGTAGAGGCTGG
ATAGCAATCAAAGATGAACTGACATCAACAAAGACAAAACAATTGCGATATAGGTACCAA
GGAAATTTGAGGTGGAAGACGGAATCTGGGTCTTCTCTAGAGGTACTTTCTTGCGAGTGC
ACGTACCTTGGTGTCAAAATGCGTGGATGTGATGCGAGAACCAGGCAGATACAAGGGATT
CAGAAGAATCTTAATATAAAGCTCATGGACCTCCTGAAAGAAGCTCTTGATGCCGCCCTC
ATTGCGTGAATCATGAAGGAGCATGAGACGAGTATGGCCTGCAGTAACATACACTGAGAC
AACCAGATCGTTGAATCTGTCGACAGACTTCAAGAACATGGCACTTGTAGTCCATGCCAA
GTCTTGGACGACATCTAACGCAGCATGTAATATAAACTGGTGCAGTTGAGCAGCATCTTC
TCTTTTAGCAACAGACCCAACTTCAGCTTCATAGATTGGAATATCATTCCGAGCCACAAT
CATAAAGCAAGCC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL4303Contig1 1055 2 2 U
GGGTACTGGACGGAGCCGGAACAAGGGAAGCTTAACTACCAAGACGCGGACGATATGCTC
AACTTGTGCAGTAGCAACAACATAGAAACCAGAGGACATTGTATCTTTTGGGAAGTCCAA
GCAACTGTTCAGCAGTGGATACAAAAGATGAACCAAAACGACATAAACACCGCGGTCCAA
AACCGCTTAACAGGTCTTTTAAACCGGTACAAAGGAAAATTCAAACATTACGATGTGAAC
AACGAGATGTTACACGGATCATTTTACCAAGACAAGCTAGGCAAAGACATAAGAGTCAAC
ATGTTCAAGACCACACCAGCTAGACCCATCCGCGACATTGTTCGTGAATGATTATCACAT
AGAAGATGGATGTGATCCAAAATCCTGCCCGGAGAAGTACATTGAGCATATTCTTGATCT
GCAAGAAAAGGGTGCGCCGGTAGGAGGAATCGGGATTCAAGGCCATATCGATTGTCCGAT
AGGTCCAATTGTTTGTTCAGCTCTGGACAGACTAGGAATCCTCGGTTTACCGATATGGTT
CACAGAGTTAGATGTCTCGTCGATAAATGAGCACATCAGGGGAGATGATTTGGAGGTAAT
GATGTGGGAAGCTTTTGGCCATCCTGCGGTTGAAGGCATAATGTTATGGGGATTTTGGGA
GCTGTTCATGAGTAGAGACAACTCTCATTTGGTAAATGCAGAAAGTGAAGTTAACGAAGC
TGGTAAAAGGCTTTTAGCTGTGAAGAAAGATTGGCTTTTTCATGCAAATGGGCATATTGA
TCAAAACGGTGCGTTTGCGTTTAGAGGGTATCATGGAAATTATGCTGTTGAAGTGATTAC
AAGTTTTTTTCAGAAGGTTTTAAAAACGTTTGTTGTTGAAAAAGGAGATTCGGCTCAGGT
TATTACTGTGGATTTTCAAGGTTTGTGATTCCTTTGTGTGATGCATGTGTGTTTTTTGTG
TTTCTATCTAACTTCAAATATTCTCAAGCTTTGGTGTTTGTATATTGTTGGTGTTTGTTG
GTGTTTGTATATTGTGGGAATAAAAAGTTTACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC58TF U 1
AF RR2FC58JQ C 577
BS 1 724 RR2FC58TF
BS 725 1055 RR2FC58JQ

RD RR2FC58TF 724 0 0
GGGTACTGGACGGAGCCGGAACAAGGGAAGCTTAACTACCAAGACGCGGACGATATGCTC
AACTTGTGCAGTAGCAACAACATAGAAACCAGAGGACATTGTATCTTTTGGGAAGTCCAA
GCAACTGTTCAGCAGTGGATACAAAAGATGAACCAAAACGACATAAACACCGCGGTCCAA
AACCGCTTAACAGGTCTTTTAAACCGGTACAAAGGAAAATTCAAACATTACGATGTGAAC
AACGAGATGTTACACGGATCATTTTACCAAGACAAGCTAGGCAAAGACATAAGAGTCAAC
ATGTTCAAGACCACACCAGCTAGACCCATCCGCGACATTGTTCGTGAATGATTATCACAT
AGAAGATGGATGTGATCCAAAATCCTGCCCGGAGAAGTACATTGAGCATATTCTTGATCT
GCAAGAAAAGGGTGCGCCGGTAGGAGGAATCGGGATTCAAGGCCATATCGATTGTCCGAT
AGGTCCAATTGTTTGTTCAGCTCTGGACAGACTAGGAATCCTCGGTTTACCGATATGGTT
CACAGAGTTAGATGTCTCGTCGATAAATGAGCACATCAGGGGAGATGATTTGGAGGTAAT
GATGTGGGAAGCTTTTGGCCATCCTGCGGTTGAAGGCATAATGTTATGGGGATTTTGGGA
GCTGTTCATGAGTAGAGACAACTCTCATTTGGTAAATGCAGAAAGTGAAGTTAACGAAGC
TGGT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2FC58JQ 479 0 0
CAGGGGAGATGATTTGGAGGTAATGATGTGGGAAGCTTTTGGCCATCCTGCGGTTGAAGG
CATAATGTTATGGGGATTTTGGGAGCTGTTCATGAGTAGAGACAACTTTCATTTGGTAAA
TGCAGAAGGTGAAGTTAACGAAGCTGGTAAAAGGCTTTTAGCTGTGAAGAAAGATTGGCT
TTTTCATGCAAATGGGCATATTGATCAAAACGGTGCGTTTGCGTTTAGAGGGTATCATGG
AAATTATGCTGTTGAAGTGATTACAAGTTTTTTTCAGAAGGTTTTAAAAACGTTTGTTGT
TGAAAAAGGAGATTCGGCTCAGGTTATTACTGTGGATTTTCAAGGTTTGTGATTCCTTTG
TGTGATGCATGTGTGTTTTTTGTGTTTCTATCTAACTTCAAATATTCTCAAGCTTTGGTG
TTTGTATATTGTTGGTGTTTGTTGGTGTTTGTATATTGTGGGAATAAAAAGTTTACATC

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 2

CO CL4304Contig1 705 2 3 U
TACCAAAAAAAAATTAGAATTTTCGTCTTCGATACAATTCATCAATGCCATCGATTAAAC
AAACAAGTTTGGTCATGAATAAAAAGATTAATATCATTGTTTTGATTAAACGAGTAGGTT
GAAAGTTTAAGACAATGTACTTGAAAAGCAAAAAAACATAAGGGAAGAATCCGAAAAACA
CTAGTAATAACAATACACCATCATAACCTAAATCGAACAGAGAGAAACATCTTCTTAAGC
ACGTTCACCACGGATCCTCCTCGCCAACTGAATGTCCTTAGGCATGATCGTAACCCTCTT
GGCGTGAATCGCGCACAGATTGGTATCCTCGAACAAACCGACAAGGTACGCCTCAGCCGC
CTCTTGAAGAGCCAACACGGCGTGGCTCTGGAACCTCAGATCCGTCTTAAAGTCCTGCGC
GATCTCACGGACCAGACGCTGGAAAGGAAGCTTACGGATCAACAGCTCCGTGCTCTTCTG
GTACTTTCTAATCTCACGAAGCGCGACGGTTCCGGGACGGTAACGGTGAGGCTTCTTGAC
TCCTCCGGTGGTCGGAGCAGATTTTCTCGCCGCCTTGGTGGCGAGCTGCTTCCTGGGAGC
TTTGCCTCCGGTGGACTTCCTAGCGGTTTGCTTTGTACGAGCCATTCTTCTTCTCTAAAA
GTTGCGGCTTTTGTTGATGAATGAAATTGCAGAGAAGCGAGATTT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A149TF C 1
AF RR2A149JQ U 2
BS 1 1 RR2A149TF
BS 2 688 RR2A149JQ
BS 689 705 RR2A149TF

RD RR2A149TF 705 0 0
TACCAAAAAAAAATTAGAATTTTCGTCTTCGATACAATTCATCAATGCCATCGATTAGAC
AAACAAGTTTGGTCATGAATAAAAAGATTAATATCATTGTTTTGATTAAACGAGTAGGTT
GAAAGTTTAAGACAATGTACTTGAAAAGCAAAAAAACATAAGGGAAGAATCCGAAGAACA
CTAGTAATAACAATACACCATCATAACCTAAATCGAACAGAGAGAAACATCTTCTTAAGC
ACGTTCACCACGGATCCTCCTCGCCAACTGAATGTCCTTAGGCATGATCGTAACCCTCTT
GGCGTGAATCGCGCACAGATTGGTATCCTCGAACAAACCGACAAGGTACGCCTCAGCCGC
CTCTTGAAGAGCCAACACGGCGTGGCTCTGGAACCTCAGATCCGTCTTAAAGTCCTGCGC
GATCTCACGGACCAGACGCTGGAAAGGAAGCTTACGGATCAACAGCTCCGTGCTCTTCTG
GTACTTTCTAATCTCACGAAGCGCGACGGTTCCGGGACGGTAACGGTGAGGCTTCTTGAC
TCCTCCGGTGGTCGGAGCAGATTTTCTCGCCGCCTTGGTGGCGAGCTGCTTCCTGGGAGC
TTTGCCTCCGGTGGACTTCCTAGCGGTTTGCTTTGTACGAGCCATTCTTCTTCTCTAAAA
GTTGCGGCTTTTGTTGATGAATGAAATTGCAGAGAAGCGAGATTT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2A149JQ 687 0 0
ACCAAAAAAAAATTAGAATTTTCGTCTTCGATACAATTCATCAATGCCATCGATTAAACA
AACAAGTTTGGTCATGAATAAAAAGATTAATATCATTGTTTTGATTAAACGAGTAGGTTG
AAAGTTTAAGACAATGTACTTGAAAAGCAAAAAAACATAAGGGAAGAATCCGAAAAACAC
TAGTAATAACAATACACCATCATAACCTAAATCGAACAGAGAGAAACATCTTCTTAAGCA
CGTTCACCACGGATCCTCCTCGCCAACTGAATGTCCTTAGGCATGATCGTAACCCTCTTG
GCGTGAATCGCGCACAGATTGGTATCCTCGAACAAACCGACAAGGTACGCCTCAGCCGCC
TCTTGAAGAGCCAACACGGCGTGGCTCTGGAACCTCAGATCCGTCTTAAAGTCCTGCGCG
ATCTCACGGACCAGACGCTGGAAAGGAAGCTTACGGATCAACAGCTCCGTGCTCTTCTGG
TACTTTCTAATCTCACGAAGCGCGACGGTTCCGGGACGGTAACGGTGAGGCTTCTTGACT
CCTCCGGTGGTCGGAGCAGATTTTCTCGCCGCCTTGGTGGCGAGCTGCTTCCTGGGAGCT
TTGCCTCCGGTGGACTTCCTAGCGGTTTGCTTTGTACGAGCCATTCTTCTTCTCTAAAAG
TTGCGGCTTTTGTTGATGAATGAAATT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL4305Contig1 883 2 6 U
GGGTTGAGAAGAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGATCGGTTCTTGGTTTGAGAATTTC
GAATGGCGGTTTCTACTGTAACTTCATTCATATTGCCCTCTTTCCCAAATCCAACCAGAC
AGAAAGTCTCTCCGCTTTCATTGTTTCCATCCTCTTCTTCTACTCATGGCAGCATTGGCT
CCTCCCTACTTAACAAACCTTCCCCCTTGTTCACGAATAAGGTTTTCGCTGCTCCAGAAA
CCCTAACTCTAGAAACCATCGATGAACAGTCCTCTGAGGAATTCCCCGAGGTTCCGAGCT
CTTCCTCCATCAATGTAGACGCAGATAAGATGGCGCCAAAGCAGAAGATTAGGATCAAGC
TTAGATCATACTGGGTGCCTCTTATTGAGGACTCATGCAAGCAGATACTTGACGCTGCGA
GGAATACTAATGCCAAGACTATGGGTCCTGTTCCGTTGCCCACCAAGAAGCGTATCTACT
GTGTTCTCAAGTCTCCCCACGTTCACAAGGACGCAAGGTTTCACTTTGAGATCCGGACTC
ACCAGCGGATGATTGATATTCTCTACCCTACTGCTCAGACCATCGACTCCTTGATGCAGC
TGGATCTCCCTGCTGGTGTTGATGTGGAGGTCAAGCTCTGAATGCAAACAATGGGTGATG
GGCGCTTGCATTTCATGAACAGACTGTTTCAGATCAACTACACTGCTTAGAACTTGTAAG
CCATGTATCATCCTTTTGAGAGCCTATGTAATGAATGTTATCTGGTCCTTGTTGTTAATT
GATGAACAAATCAGCAAGTAAGCAAGTTTAAAAGGACCTTTTTTTTTGTATTGTGTGTTT
ACTAATTGTTTTGCTGTCAACTGTTACAAATAAGTTCAATGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR50TF U 1
AF RR2FR50JQ C 273
BS 1 743 RR2FR50TF
BS 744 744 RR2FR50JQ
BS 745 750 RR2FR50TF
BS 751 751 RR2FR50JQ
BS 752 777 RR2FR50TF
BS 778 883 RR2FR50JQ

RD RR2FR50TF 782 0 0
GGGTTGAGAAGAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGATCGGTTCTTGGTTTGAGAATTTC
GAATGGCGGTTTCTACTGTAACTTCATTCATATTGCCCTCTTTCCCAAATCCAACCAGAC
AGAAAGTCTCTCCGCTTTCATTGTTTCCATCCTCTTCTTCTACTCATGGCAGCATTGGCT
CCTCCCTACTTAACAAACCTTCCCCCTTGTTCACGAATAAGGTTTTCGCTGCTCCAGAAA
CCCTAACTCTAGAAACCATCGATGAACAGTCCTCTGAGGAATTCCCCGAGGTTCCGAGCT
CTTCCTCCATCAATGTAGACGCAGATAAGATGGCGCCAAAGCAGAAGATTAGGATCAAGC
TTAGATCATACTGGGTGCCTCTTATTGAGGACTCATGCAAGCAGATACTTGACGCTGCGA
GGAATACTAATGCCAAGACTATGGGTCCTGTTCCGTTGCCCACCAAGAAGCGTATCTACT
GTGTTCTCAAGTCTCCCCACGTTCACAAGGACGCAAGGTTTCACTTTGAGATCCGGACTC
ACCAGCGGATGATTGATATTCTCTACCCTACTGCTCAGACCATCGACTCCTTGATGCAGC
TGGATCTCCCTGCTGGTGTTGATGTGGAGGTCAAGCTCTGAATGCAAACAATGGGTGATG
GGCGCTTGCATTTCATGAACAGACTGTTTCAGATCAACTACACTGCTTAGAACTTGTAAG
CCATGTATCATCCTTTTGAGAGC*TATGTA*TGAATGTTATCTGGTCCTTGTTGTTA
TTGAT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2FR50JQ 611 0 0
TCTGAGGAATTCCCCGAGGTTCCGAGCTCTTCCTCCATCAATGTAGACGCAGATAAGATG
GCGCCAAAGCAGAAGATTAGGATCAAGCTTAGATCATACTGGGTGCCTCTTATTGAGGAC
TCATGCAAGCAGATACTTGACGCTGCGAGGAATACTAATGCCAAGACTATGGGTCCTGTT
CCGTTGCCCACCAAGAAGCGTATCTACTGTGTTCTCAAGTCTCCCCACGTTCACAAGGAC
GCAAGGTTTCACTTTGAGATCCGGACTCACCAGCGGATGATTGATATTCTCTACCCTACT
GCTCAGACCATCGACTCCTTGATGCAGCTGGATCTCCCTGCTGGTGTTGATGTGGAGGTC
AAGCTCTGAATGCAAACAATGGGTGATGGGCGCTTGCATTTCATGAACAGACTGTTTCAG
ATCAACTACACTGCTTAGAACTTGTAAGCCATGTATCATCCTTTTGAGAGCCTATGTAAT
GAATGTTATCTGGTCCTTGTTGTTAATTGATGAACAAATCAGCAAGTAAGCAAGTTTAAA
AGGACCTTTTTTTTTGTATTGTGTGTTTACTAATTGTTTTGCTGTCAACTGTTACAAATA
AGTTCAATGTA

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL4306Contig1 1020 2 8 U
GGACCGCAATGGTCTCAGCTCGTGACTGGAACATCCTAAACCAGCTCAAAGGAGGCAAGC
CAACCACAACCACCAGCCAAAACGGCGTAGGATCCTTGAAAGTATCAAACCTAAACGGAT
ACTGCGAGAGCTGGAGAGTCAACGTGGAGCTTCACAACATCAGAGACTTCACGGTGGTGC
CACAAGAGTGCGTCTGGTTCGTCCAAAAGTACATGACGTCATCTCAATACGAGGATGACG
TGGAGAGAGCCGTTGATGAAGCCATCCTATACCTCGGAAAAACTTGTTGCGAGAAGAAGA
AATGTGATGGCATGGATGCTTGGATCTTTGACATTGATGACACTCTTCTCTCCACCATTC
CTTACCACAAGAGCAACGGATGCTTCGGTGGTGAGCAACTAAACACGACCAAGTTCGAGG
AATGGCAAAATTTGGGAAAGGCACCAGCGGTTCCAAGCATGGTGAAGCTGTTCCACGAGA
TCAGAGAGAGAGGCTTCAAAATCTTTTTGGTCTCTTCTCGTAAAGAGTATCTAAGATCCG
CCACCGTCGAAAACCTTATTGAAGTCGGTTACCACGGCTGGTCTAACCTTCTTCTCAGGG
GAGAAGAGGAAGAGAAGAAGAGTGTGAGCCAATACAAAGCAGATGTGAGGACCTGGCTTA
CAAGTCTTGGATACAGAGTTTGGGGAGTGATGGGTGCACAATGGAACAGCTTCGCAGGTT
GTCCAGTTCCCAAGAGAACCTTCAAGCTCCCTAATTCCATCTACTACATTGCTTGATCAA
ATCATATTTACTACTCTAACCAAAGACAAATAAGATCAGAGATTCAATCTGATTCTCGAG
TCTGCTTATCATCTCCCTTCTTTTCTTTTTGTCATTTTTGGTTTATATAAAAGTCAAATG
CTTATGAGTGATATTATGAACCACGATCATCTTTGTTTCCGTTGAATTCAGCTGTTTCTC
TTTCCTTGTATTACAATTTTGGGCCTTTGTGAAATTGATTATGGGCTCTTTTTAATAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C002TF U 1
AF RR2C002JQ C 278
BS 1 717 RR2C002TF
BS 718 718 RR2C002JQ
BS 719 737 RR2C002TF
BS 738 738 RR2C002JQ
BS 739 757 RR2C002TF
BS 758 758 RR2C002JQ
BS 759 798 RR2C002TF
BS 799 1020 RR2C002JQ

RD RR2C002TF 811 0 0
GGACCGCAATGGTCTCAGCTCGTGACTGGAACATCCTAAACCAGCTCAAAGGAGGCAAGC
CAACCACAACCACCAGCCAAAACGGCGTAGGATCCTTGAAAGTATCAAACCTAAACGGAT
ACTGCGAGAGCTGGAGAGTCAACGTGGAGCTTCACAACATCAGAGACTTCACGGTGGTGC
CACAAGAGTGCGTCTGGTTCGTCCAAAAGTACATGACGTCATCTCAATACGAGGATGACG
TGGAGAGAGCCGTTGATGAAGCCATCCTATACCTCGGAAAAACTTGTTGCGAGAAGAAGA
AATGTGATGGCATGGATGCTTGGATCTTTGACATTGATGACACTCTTCTCTCCACCATTC
CTTACCACAAGAGCAACGGATGCTTCGGTGGTGAGCAACTAAACACGACCAAGTTCGAGG
AATGGCAAAATTTGGGAAAGGCACCAGCGGTTCCAAGCATGGTGAAGCTGTTCCACGAGA
TCAGAGAGAGAGGCTTCAAAATCTTTTTGGTCTCTTCTCGTAAAGAGTATCTAAGATCCG
CCACCGTCGAAAACCTTATTGAAGTCGGTTACCACGGCTGGTCTAACCTTCTTCTCAGGG
GAGAAGAGGAAGAGAAGAAGAGTGTGAGCCAATACAAAGCAGATGTGAGGACCTGGCTTA
CAAGTCTTGGATACAGAGTTTGGGGAGTGATGGGTGCACAATGGAACAGCTTCGCAG*TT
GTCCAGTTCCCAAGAGA*CCTTCAAGCTCCCTAATTC*ATCTACTACATTGCTTGATCAA
ATCATATTTACTACTCTA
CCAAGACAAATAA

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2C002JQ 743 0 0
AAAAACTTGTTGCGAGAAGAAGAAATGTGATGGCATGGATGCTTGGATCTTTGACATTGA
TGACACTCTTCTCTCCACCATTCCTTACCACAAGAGCAACGGATGCTTCGGTGGTGAGCA
ACTAAACACGACCAAGTTCGAGGAATGGCAAAATTTGGGAAAGGCACCAGCGGTTCCAAG
CATGGTGAAGCTGTTCCACGAGATCAGAGAGAGAGGCTTCAAAATCTTTTTGGTCTCTTT
TCGTAAAGAGTATCTAAGATCCGCCACCGTCGAAAACCTTATTGAAGTCGGTTACCACGG
CTGGTCTAACCTTTTTTTCAGGGGAGAAGAGGAAGAGAAGAAGAGTGTGAGCCAATACAA
AGCAGATGTGAGGACCTGGCTTACAAGTCTTGGATACAGAGTTTGGGGAGTGATGGGTGC
ACAATGGAACAGCTTCGCAGGTTGTCCAGTTCCCAAGAGAACCTTCAAGCTCCCTAATTC
CATTTACTACATTGCTTGATCAAATCATATTTACTACTCTAACCAAAGACAAATAAGATC
AGAGATTCAATCTGATTCTCGAGTCTGCTTATCATCTCCCTTCTTTTCTTTTTGTCATTT
TTGGTTTATATAAAAGTCAAATGCTTATGAGTGATATTATGAACCACGATCATCTTTGTT
TCCGTTGAATTCAGCTGTTTCTCTTTCCTTGTATTACAATTTTGGGCCTTTGTGAAATTG
ATTATGGGCTCTTTTTAATAAGC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL4307Contig1 653 2 1 U
GGGGGTTGCATCTTTCCACATGACCCAATCTCTCAAATATATTTCAAAATGATATTAAGA
TTTCCATTGAATTCCAGGGGCCTTCTTGTTTTCGCTTTAAACAAACCCCTTACAGTCGTT
TCTATAGCCTTCTGTTTCTGTCAACTACTATTCCACTCTTTTGACCATATGCAACATGCG
TGGATGAGAATTTATCTTTCTTTTAAAGAATAATAATTTTATAAATTCAACCCAAATGGG
AATGTGATTTCGATTACAAAACGACTCGATCAAAAATCCTCAAATTTTATATTTCCTAAA
TATAAATAACTTTGCTAAATCCATCACCCGGCATGTTTTCCGTTCTCAACCTTCGACGAG
AACCACATGGAGATGAGATTCACTTTGTTTGCTCAAATGCTAATATCTCACATATCTCTT
TTGGAATAGCTAGTTCGAGTGCCAGGTTCGGACATTCGTGGCTCCTAAAGGACATTGCCA
ATATGCTACCCATAACTATAACTTTTTCCTAAATAATGTAAAATATTATTAAGTTTAATT
TGTTCTCGAAAAAAAAAGTAAAAAAAAAGTAGTACACTATTCACTAAAGATAACTTTTCT
TTTTTTTTCCTGCAAGATAAATAAGTGAAATATATTTTAATACAATCTCTTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EA04JQ C 1
AF RR2EA04TF U 1
BS 1 653 RR2EA04TF

RD RR2EA04JQ 653 0 0
GGGGGTTGCATCTTTCCACATGACCCAATCTCTCAAATATATTTCAAAATGATATTAAGA
TTTCCATTGAATTCCAGGGGCCTTCTTGTTTTCGCTTTAAACAAACCCCTTACAGTCGTT
TCTATAGCCTTCTGTTTCTGTCAACTACTATTCCACTCTTTTGACCATATGCAACATGCG
TGGATGAGAATTTATCTTTCTTTTAAAGAATAATAATTTTATAAATTCAACCCAAATGGG
AATGTGATTTCGATTACAAAACGACTCGATCAAAAATCCTCAAATTTTATATTTCCTAAA
TATAAATAACTTTGCTAAATCCATCACCCGGCATGTTTTCCGTTCTCAACCTTCGACGAG
AACCACATGGAGATGAGATTCACTTTGTTTGCTCAAATGCTAATATCTCACATATCTCTT
TTGGAATAGCTAGTTCGAGTGCCAGGTTCGGACATTCGTGGCTCCTAAAGGACATTGCCA
ATATGCTACCCATAACTATAACTTTTTCCTAAATAATGTAAAATATTATTAAGTTTAATT
TGTTCTCGAAAAAAAAAGTAAAAAAAAAGTAGTACACTATTCACTAAAGATAACTTTTCT
TTTTTTTTCCTGCAAGATAAATAAGTGAAATATATTTTAATACAATCTCTTGG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2EA04TF 653 0 0
GGGGGTTGCATCTTTCCACATGACCCAATCTCTCAAATATATTTCAAAATGATATTAAGA
TTTCCATTGAATTCCAGGGGCCTTCTTGTTTTCGCTTTAAACAAACCCCTTACAGTCGTT
TCTATAGCCTTCTGTTTCTGTCAACTACTATTCCACTCTTTTGACCATATGCAACATGCG
TGGATGAGAATTTATCTTTCTTTTAAAGAATAATAATTTTATAAATTCAACCCAAATGGG
AATGTGATTTCGATTACAAAACGACTCGATCAAAAATCCTCAAATTTTATATTTCCTAAA
TATAAATAACTTTGCTAAATCCATCACCCGGCATGTTTTCCGTTCTCAACCTTCGACGAG
AACCACATGGAGATGAGATTCACTTTGTTTGCTCAAATGCTAATATCTCACATATCTCTT
TTGGAATAGCTAGTTCGAGTGCCAGGTTCGGACATTCGTGGCTCCTAAAGGACATTGCCA
ATATGCTACCCATAACTATAACTTTTTCCTAAATAATGTAAAATATTATTAAGTTTAATT
TGTTCTCGAAAAAAAAAGTAAAAAAAAAGTAGTACACTATTCACTAAAGATAACTTTTCT
TTTTTTTTCCTGCAAGATAAATAAGTGAAATATATTTTAATACAATCTCTTGG

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL4308Contig1 584 2 3 U
TTTTTTTTGTACAAAACATGGGGTTTTACATCTTTATTCACTGTCTGTCACAAAACGTTT
GAAAGTGACTGAATCTTGCACCAGTTTCGATAACCACAAAGCATGCCGGATTCAAAAACA
AAACATTACTGCCAATAAACATCCATTACAATAGCTCCTCTAACAAGTGATCATTCATTA
CTGAGGTTTGGTTGTGACCGTGTCATTTGGCTTTGGTACTGGTTGGATTCTTTGGTACGG
CTTCCTGGTAAGAGTCTCTCCCCTTAGAGCAGCCACGTATCTGTCGTTTGTATCCTGCTT
CTGTTTCAACTCGCCGAGGTATTCAGCTAGCCTCTCTTGGTTTACTTTACCCATCATGAC
GGTTTCGGGTCGGGCGGATTGTCGGAACCGGGCCTCAAGCTCCGGATTAGTGGAATTGGT
GGCCTGCATAACTCCATAGCCGATTATCCCCGGAATGACACCGCATACGGTAGCGAACGT
GAAGAAGAAGGATCTCGAATCTCTCGTCTTCCTCACTAGCCATCTCCATGTATCGCTCTT
CTCATACAAAAACGACATCGTTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL60TF C 1
AF RR2FL60JQ U 52
BS 1 51 RR2FL60TF
BS 52 552 RR2FL60JQ
BS 553 584 RR2FL60TF

RD RR2FL60TF 584 0 0
TTTTTTTTGTACAAAACATGGGGTTTTACATCTTTATTCACTGTCTGTCACAAAACGTTT
GAAAGTGACTGAATCTTGCACCAGTTTCGATAACCACAAAGCATGCCGGATTCAAAAACA
AAACATTACTGCCAATAAACATCCATTACAATAGCTCCTCTAACAAGTGATCATTCATTA
CTGAGGTTTGGTTGTGACCGTGTCATTTGGCTTTGGTACTGGTTGGATTCTTTGGTACGG
CTTCCTGGTAAGAGTCTCTCCCCTTAGAGCAGCCACGTATCTGTCGTTTGTATCCTGCTT
CTGTTTCAACTCGCCGAGGTATTCAGCTAGCCTCTCTTGGTTTACTTTACCCATCATGAC
GGTTTCGGGTCGGGCGGATTGTCGGAGCCGGGCCTCAAGCTCCGGATTAGTGGAATTGGT
GGCCTGCATAACTCCATAGCCGATTATCCCCGGAATGACACCGCATACGGTAGCGAACGT
GAAGAAGAAGGATCTCGAATCTCTCGTCTTCCTCACTAGCCATCTCCATGTATCGCTCTT
CTCATACAAAAACGACATCGTTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2FL60JQ 501 0 0
AAAACGTTTGAAAGTGACTGAATCTTGCACCAGTTTCGATAACCACAAAGCATGCCGGAT
TCAAAAACAAAACATTACTGCCAATAAACATCCATTACAATAGCTCCTCTAACAAGTGAT
CATTCATTACTGAGGTTTGGTTGTGACCGTGTCATTTGGCTTTGGTACTGGTTGGATTCT
TTGGTACGGCTTCCTGGTAAGAGTCTCTCCCCTTAGAGCAGCCACGTATCTGTCGTTTGT
ATCCTGCTTCTGTTTCAACTCGCCGAGGTATTCAGCTAGCCTCTCTTGGTTTACTTTACC
CATCATGACGGTTTCGGGTCGGGCGGATTGTCGGAACCGGGCCTCAAGCTCCGGATTAGT
GGAATTGGTGGCCTGCATAACTCCATAGCCGATTATCCCCGGAATGACACCGCATACGGT
AGCGAACGTGAAGAAGAAGGATCTCGAATCTCTCGTCTTCCTCACTAGCCATCTCCATGT
ATCGCTCTTCTCATACAAAAA

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL4309Contig1 194 2 1 U
GCAGGCTAGGTTAGTGCAAGGTACATCGTTTGTTCATGAGACGATGAGTCCTTACAAGAC
ACTTGAAGAGCTTTGGGATGGCGAGATATGATGTCTTTTGTTAGAATTTCAATGCTTAAC
CATTTCCCTCTGAATATGGAGAAAACTATTTTCCCACCACTTTTTATCATTTAATAAAAA
GAACATCATTTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D079JQ C 1
AF RR2D079TF U 1
BS 1 194 RR2D079TF

RD RR2D079JQ 194 0 0
GCAGGCTAGGTTAGTGCAAGGTACATCGTTTGTTCATGAGACGATGAGTCCTTACAAGAC
ACTTGAAGAGCTTTGGGATGGCGAGATATGATGTCTTTTGTTAGAATTTCAATGCTTAAC
CATTTCCCTCTGAATATGGAGAAAACTATTTTCCCACCACTTTTTATCATTTAATAAAAA
GAACATCATTTTCT

QA 1 194 1 194
DS 

RD RR2D079TF 194 0 0
GCAGGCTAGGTTAGTGCAAGGTACATCGTTTGTTCATGAGACGATGAGTCCTTACAAGAC
ACTTGAAGAGCTTTGGGATGGCGAGATATGATGTCTTTTGTTAGAATTTCAATGCTTAAC
CATTTCCCTCTGAATATGGAGAAAACTATTTTCCCACCACTTTTTATCATTTAATAAAAA
GAACATCATTTTCT

QA 1 194 1 194
DS 



AS 1 2

CO CL4310Contig1 1153 2 2 U
GGAATCTAACATCGTCTCCTCTCCTCCATTGCGACATGCTTCCCAATTCGCAGACAAAGA
TGACGATCACGCAGATCATACTATCTCTCGTTATAGCTTCCATTTCCTCAACCTCCAATG
TCTTAGCCGATCGGATCTTTCCAACTCATCTAGTGGGAACGTTCAGCCGAAACAACCGCG
AACCAAAGTACACGATCCAGTTTCTCCCCGAAGATTCACCGTTTCACCCGGGTGATAATC
TGGAGTCTATGGTGATGCTTGATAAGCAAGGGAGAAGATTCTTATGTTTCTTACCAAAGG
AGGAGGAAGAATCTACTAGCGGATGGGCCTCTACTCAGCAGCAGAACGTTAGCACTGTGC
TGATGGAAACGGATAAGCAGATGAAGCTTAAGACTCCTGATGAGTTGCTTCAGCCACTGG
ATGAGAAATGTCTTGTCAGGCAAGAGGGTTGGTGGTCGTATGAGTTTTGTCATCTAGGGT
CGGTAAGACAGCTACACATTGAGGATTGCACCAAGATTGTGCAAGAGTTTTCCTTGGGTA
AGTATGACGCAGAGGCAACTGCTGCATTTAATCAAAATGTGTCTGATGTTTCTACAATGA
AAGAGAGGTATCACTCTCATATATACACCAATGGGACCACCTGTGATCTTACAGGAACTC
CTCGTGAAGTCGTGGTGAGGTTTGTATGCGCTGAAACGAGGGCAATGGTCACATCGATCA
CGGAGCTATCTACTTGCAAGTACGCATTGGCTGTTCAGTGCCCGACCTTGTGCAAGCATC
CGCTGTTTCAGCTAGAGAAACCAGTGTCACACACTAACCACTGCAATTTGATCCCAGGCG
CAACAAGCGACGAGGAAGGAGTAGTAGGCGAATCACCTAAGGTTGCTGATTCTTGAAAAA
CACTTGGCTGAATCACGGGATTGTATATATAAGAGCAAGTACATCTCCATGTCGGTATGC
TCGTTGAAGTGTTCTTGGTTAAGAACCGGCTTAGCTTACCGGTAGAATGATGATACTCTC
TTTGTAGCCTTTAGTCTAATATTCATTTTGAAGTTTGGAACCGGTTAAAATTTCCTTTTG
TGAAACTTGGAATCGTTGTCCAAAAAAAAAGAGTGAAACTTGGAATCATATATATACACA
TCGATTGATATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD39TF U 1
AF RR2AD39JQ C 246
BS 1 630 RR2AD39TF
BS 631 1153 RR2AD39JQ

RD RR2AD39TF 630 0 0
GGAATCTAACATCGTCTCCTCTCCTCCATTGCGACATGCTTCCCAATTCGCAGACAAAGA
TGACGATCACGCAGATCATACTATCTCTCGTTATAGCTTCCATTTCCTCAACCTCCAATG
TCTTAGCCGATCGGATCTTTCCAACTCATCTAGTGGGAACGTTCAGCCGAAACAACCGCG
AACCAAAGTACACGATCCAGTTTCTCCCCGAAGATTCACCGTTTCACCCGGGTGATAATC
TGGAGTCTATGGTGATGCTTGATAAGCAAGGGAGAAGATTCTTATGTTTCTTACCAAAGG
AGGAGGAAGAATCTACTAGCGGATGGGCCTCTACTCAGCAGCAGAACGTTAGCACTGTGC
TGATGGAAACGGATAAGCAGATGAAGCTTAAGACTCCTGATGAGTTGCTTCAGCCACTGG
ATGAGAAATGTCTTGTCAGGCAAGAGGGTTGGTGGTCGTATGAGTTTTGTCATCTAGGGT
CGGTAAGACAGCTACACATTGAGGATTGCACCAAGATTGTGCAAGAGTTTTCCTTGGGTA
AGTATGACGCAGAGGCAACTGCTGCATTTAATCAAAATGTGTCTGATGTTTCTACAATGA
AAGAGAGGTATCACTCTCATATATACACCA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2AD39JQ 908 0 0
TCTATGGTGATGCTTGATAAGCAAGGGAGAAGATTCTTATGTTTCTTACCAAAGGAGGAG
GAAGAATCTACTAGCGGATGGGCCTCTACTCAGCAGCAGAACGTTAGCACTGTGCTGATG
GAAACGGATAAGCAGATGAAGCTTAAGACTCCTGATGAGTTGCTTCAGCCACTGGATGAG
AAATGTCTTGTCAGGCAAGAGGGTTGGTGGTCGTATGAGTTTTGTCATCTAGGGTCGGTA
AGACAGCTACACATTGAGGATTGCACCAAGATTGTGCAAGAGTTTTCCTTGGGTAAGTAT
GACGCAGAGGCAACTGCTGCATTTAATCAAAATGTGTCTGATGTTTCTACAATGAAAGAG
AGGTATCACTCTCATATATACACCAATGGGACCACCTGTGATCTTACAGGAACTCCTCGT
GAAGTCGTGGTGAGGTTTGTATGCGCTGAAACGAGGGCAATGGTCACATCGATCACGGAG
CTATCTACTTGCAAGTACGCATTGGCTGTTCAGTGCCCGACCTTGTGCAAGCATCCGCTG
TTTCAGCTAGAGAAACCAGTGTCACACACTAACCACTGCAATTTGATCCCAGGCGCAACA
AGCGACGAGGAAGGAGTAGTAGGCGAATCACCTAAGGTTGCTGATTCTTGAAAAACACTT
GGCTGAATCACGGGATTGTATATATAAGAGCAAGTACATCTCCATGTCGGTATGCTCGTT
GAAGTGTTCTTGGTTAAGAACCGGCTTAGCTTACCGGTAGAATGATGATACTCTCTTTGT
AGCCTTTAGTCTAATATTCATTTTGAAGTTTGGAACCGGTTAAAATTTCCTTTTGTGAAA
CTTGGAATCGTTGTCCAAAAAAAAAGAGTGAAACTTGGAATCATATATATACACATCGAT
TGATATCG

QA 1 908 1 908
DS 



AS 1 2

CO CL4311Contig1 567 2 2 U
AGGGCAGATAGAACACTGGAGCTCAATTCTCACTTATCTCTTCCTTCTCACTGGGAACAG
TGTCTTGATCTCAAGACCGGTGAGATTTACTACATAAACTGGAAAAATGGAATGAGAGTG
AAAGAGGATCCAAGGAAAGTGATGATGAAGGCAGATAATGACAGTGAAGAATCATATGGA
ACCTTGTGCTCAGAAGAAGATAGCTCGTATTACGATAGTGAGGAGTCTTCATCAGCATCA
TCTCCATCATCAAGAGAGAATCAAAAAGAGGACGAGGATGAAGATGATGAAGACGAAGAA
GAGGAAGATGAAGAAGAAGATGTGCTTGTGGTTGCTGGATGCAAAGCTTGTTTCATGTAC
TTCATGGTCCCTAAGCTTGTCGAGGACTGTCCCAAATGTGCTGCACAGCTTCTTCACTTT
GATCGACCTCGTTATGCTTCTTCTTAAAACATCTCTCTTTGTTTCCACGTTTTTCTTTCG
TTTTTTTTCCTTATGAGAATTTATTTTGGTTTTCTGTTTTTTTTTTCTTTAATCTTCTAT
TTGTCATAATTTAGTGATTTCTCTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ83TF U 1
AF RR2EJ83JQ C 1
BS 1 497 RR2EJ83TF
BS 498 567 RR2EJ83JQ

RD RR2EJ83TF 497 0 0
AGGGCAGATAGAACACTGGAGCTCAATTCTCACTTATCTCTTCCTTCTCACTGGGAACAG
TGTCTTGATCTCAAGACCGGTGAGATTTACTACATAAACTGGAAAAATGGAATGAGAGTG
AAAGAGGATCCAAGGAAAGTGATGATGAAGGCAGATAATGACAGTGAAGAATCATATGGA
ACCTTGTGCTCAGAAGAAGATAGCTCGTATTACGATAGTGAGGAGTCTTCATCAGCATCA
TCTCCATCATCAAGAGAGAATCAAAAAGAGGACGAGGATGAAGATGATGAAGACGAAGAA
GAGGAAGATGAAGAAGAAGATGTGCTTGTGGTTGCTGGATGCAAAGCTTGTTTCATGTAC
TTCATGGTCCCTAAGCTTGTCGAGGACTGTCCCAAATGTGCTGCACAGCTTCTTCACTTT
GATCGACCTCGTTATGCTTCTTCTTAAAACATCTCTCTTTGTTTCCACGTTTTTCTTTCG
TTTTTTTTCCTTATGAG

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2EJ83JQ 567 0 0
AGGGCAGATAGAACACTGGAGCTCAATTCTCACTTATCTCTTCCTTCTCACTGGGAACAG
TGTCTTGATCTCAAGACCGGTGAGATTTACTACATAAACTGGAAAAATGGAATGAGAGTG
AAAGAGGATCCAAGGAAAGTGATGATGAAGGCAGATAATGACAGTGAAGAATCATATGGA
ACCTTGTGCTCAGAAGAAGATAGCTCGTATTACGATAGTGAGGAGTCTTCATCAGCATCA
TCTCCATCATCAAGAGAGAATCAAAAAGAGGACGAGGATGAAGATGATGAAGACGAAGAA
GAGGAAGATGAAGAAGAAGATGTGCTTGTGGTTGCTGGATGCAAAGCTTGTTTCATGTAC
TTCATGGTCCCTAAGCTTGTCGAGGACTGTCCCAAATGTGCTGCACAGCTTCTTCACTTT
GATCGACCTCGTTATGCTTCTTCTTAAAACATCTCTCTTTGTTTCCACGTTTTTCTTTCG
TTTTTTTTCCTTATGAGAATTTATTTTGGTTTTCTGTTTTTTTTTTCTTTAATCTTCTAT
TTGTCATAATTTAGTGATTTCTCTTCC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4313Contig1 710 2 3 U
TTTTTTTTTGGCAAAATTATTGAAGATTTATAAAGTGCTGTTCTTCTACAGTTCAAAAGC
ATTACAAAAGCTGTGAGCTGCAAAATGTAAAGAAACCTCTAAACAGGGATTGAAATGTGT
TAATACTTTAGGACATGTCAGGATGATATTAAGAAGCAAGCAAATTTCTCAAAATCTTGA
CCACAACTCTTCTAAATCAGGGGGAAGGTCCATTGTCTTCCTTCTCTGATTCATCTTTGC
TCTGCAGATTCTCAGAGTTTGGAGAGTTTTCAGCTGTCACAGTCTCATCATCCTCGTTCT
TAAGAAGCGAAGAGAATGATAGAGGATTGCAGGTCGAGCTGGCCTTTTGCAACCCTCGTA
TGGCTCTCATTGCAGCTAGTGTACTCCTGTATATATCGAGATTTTCATCTCCGAGAGTTG
AGAAGTCTGAGCAGAGATCCTCGGTGAGTTGTTTTGATGTGAGGATGAGACTGCGTTAGA
AGACTCCACAACTTCGGCTTCGCATGGGAAGAGAAGCTCAAGATTGGCCTCACATTCACG
GACTAACCTGGTAAGTGGCTCAGTAGTAAAGAAGGGTTGATGGAGAACAAGCTGTGTGAA
AGGCAAACGAAGAAGTCCTCCTGTTCTTTTGTCATACTTCTTCAAAATTTTGACAAGTCC
TGCAAAGTTTAGGGAGCTGTAGTTTTTAAGGAGAACCATCTCGCCATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E244JQ U 10
AF RR2E244TF C 1
BS 1 9 RR2E244TF
BS 10 500 RR2E244JQ
BS 501 710 RR2E244TF

RD RR2E244JQ 491 0 0
GGCAAAATTATTGAAGATTTATAAAGTGCTGTTCTTCTACAGTTCAAAAGCATTACAAAA
GCTGTGAGCTGCAAAATGTAAAGAAACCTCTAAACAGGGATTGAAATGTGTTAATACTTT
AGGACATGTCAGGATGATATTAAGAAGCAAGCAAATTTCTCAAAATCTTGACCACAACTC
TTCTAAATCAGGGGGAAGGTCCATTGTCTTCCTTCTCTGATTCATCTTTGCTCTGCAGAT
TCTCAGAGTTTGGAGAGTTTTCAGCTGTCACAGTCTCATCATCCTCGTTCTTAAGAAGCG
AAGAGAATGATAGAGGATTGCAGGTCGAGCTGGCCTTTTGCAACCCTCGTATGGCTCTCA
TTGCAGCTAGTGTACTCCTGTATATATCGAGATTTTCATCTCCGAGAGTTGAGAAGTCTG
AGCAGAGATCCTCGGTGAGTTGTTTTGATGTGAGGATGAGACTGCGTTAGAAGACTCCAC
AACTTCGGCTT

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2E244TF 710 0 0
TTTTTTTTTGGCAAAATTATTGAAGATTTATAAAGTGCTGTTCTTCTACAGTTCAAAAGC
ATTACAAAAGCTGTGAGCTGCAAAATGTAAAGAAACCTCTAAACAGGGATTGAAATGTGT
TAATACTTTAGGACATGTCAGGATGATATTAAGAAGCAAGCAAATTTCTCAAAATCTTGA
CCACAACTCTTCTAAATCAGGGGGAAGGTCCATTGTCTTCCTTCTCTGATTCATCTTTGC
TCTGCAGATTCTCAGAGTTTGGAGAGTTTTCAGCTGTCACAGTCTCATCATCCTCGTTCT
TAAGAAGCGAAGAGAATGATAGAGGATTGCAGGTCGAGCTGGCCTTTTGCAACCCTCGTA
TGGCTCTCATTGCAGCTAGTGTACTCCTGTATATATCGAGATTTTCATCTCCGAGAGTTG
AGAAGTCTGAGCAGAGATCCTCGGTGAGTTGTTTTGATGTGAGGATGAGACTGCGTTAGA
AGACTCCACAACTTCGGCTTCGCATGGGAAGAGAAGCTCAAGATTGGCCTCACATTCACG
GACTAACCTGGTAAGTGGCTCAGTAGTAAAGAAGGGTTGATGGAGAACAAGCTGTGTGAA
AGGCAAACGAAGAAGTCCTCCTGTTCTTTTGTCATACTTCTTCAAAATTTTGACAAGTCC
TGCAAAGTTTAGGGAGCTGTAGTTTTTAAGGAGAACCATCTCGCCATGAC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL4314Contig1 650 2 2 U
GGCTCCTCCTCCCTCCTCCTCAGCCGCGATCTCCTCCTCCTCCTTAAACTCCATCGTCTC
TTGTCGATTAGTTTCTCCAAAGAGAAGGATGCCAAAGGTTAAGACAAACCGAGTCAAGTA
CCCAGAAGGGTGGGAGTTGATCGAGCCTACTCTTCGTGAGCTTGATGCCAAGATGATAGA
AGCGGAGATGGATACACATGATGGCAAGAGAAAGTGTGAAGCTTTATGGCCAATCTTCAA
ACTCTCTCATCAGAGGAGTCGCTATGTGTACGACCTTTATTACCGGAGGAAGGAGATATC
TAAAGAGCTCTATGAGTTCTGCTTGGACCAGGGATATGCTGATCGTAACCTCATTGCCAA
ATGGAAGAAGTCAGGGTATGAGCGTCTATGCTGCTTGCGGTGCATACAGCCGAGAGACCA
CAACTATGGAACCACATGTGTATGTCGTGTTCCCAAACACTTGCGTGAAGAGAAAGCCAT
TGAGTGTGTTCACTGCGGGTGTCAAGGATGCGCCAGTGGCGATTAATCTCTCAGACTGTT
TTCTTCACCATTGTCACTCTCTCTATGTATTTCTATATATTTGTCAAATCTGGATTATGT
ACCCTGACTAATTTCCGTTTGCAGAACTTCTAATGTCAAGTCTTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G750TF U 1
AF RR2G750JQ C 57
BS 1 120 RR2G750TF
BS 121 650 RR2G750JQ

RD RR2G750TF 120 0 0
GGCTCCTCCTCCCTCCTCCTCAGCCGCGATCTCCTCCTCCTCCTTAAACTCCATCGTCTC
TTGTCGATTAGTTTCTCCAAAGAGAAGGATGCCAAAGGTTAAGACAAACCGAGTCAAGTA

QA 1 120 1 120
DS 

RD RR2G750JQ 594 0 0
TCTCTTGTCGATTAGTTTCTCCAAAGAGAAGGATGCCAAAGGTTAAGACAAACCGAGTCA
AGTACCCAGAAGGGTGGGAGTTGATCGAGCCTACTCTTCGTGAGCTTGATGCCAAGATGA
TAGAAGCGGAGATGGATACACATGATGGCAAGAGAAAGTGTGAAGCTTTATGGCCAATCT
TCAAACTCTCTCATCAGAGGAGTCGCTATGTGTACGACCTTTATTACCGGAGGAAGGAGA
TATCTAAAGAGCTCTATGAGTTCTGCTTGGACCAGGGATATGCTGATCGTAACCTCATTG
CCAAATGGAAGAAGTCAGGGTATGAGCGTCTATGCTGCTTGCGGTGCATACAGCCGAGAG
ACCACAACTATGGAACCACATGTGTATGTCGTGTTCCCAAACACTTGCGTGAAGAGAAAG
CCATTGAGTGTGTTCACTGCGGGTGTCAAGGATGCGCCAGTGGCGATTAATCTCTCAGAC
TGTTTTCTTCACCATTGTCACTCTCTCTATGTATTTCTATATATTTGTCAAATCTGGATT
ATGTACCCTGACTAATTTCCGTTTGCAGAACTTCTAATGTCAAGTCTTGTTTCC

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

CO CL4315Contig1 501 2 3 U
GATACTTGTGGTTCAAACTTTCATACCTCAACGTGGAAAACATAACGTACAACCATTTCT
GTAAACTATCTTCACCAGAATGGGATGTTATAATGACTTAGACAAGAGGACACACGTGTT
TCTTACAACACAAATGCACATTTGGGGGATGACCATATCATGGAGGTACAACAGGTCGGG
TTGGGTTCCGGCCAAGACCAAGTCCCAAACCTAAAGGAACACTGTAACTCTTTGGCTTGC
TGCTATGGTTATGGCTGCAGTTTGAAAAATGAACATGTGCTGACTGCGAATTATGTACGG
GGTTAACATCAATAGCAACGTGGCCATTGCCATTCTGAAGATTAGAACTCCGCTGCATCC
GCATCATGCTATACCCTCTTGTCTTGGTGTTGCGTCTTCTTCATGACACTCAATATCTTC
ATTATAACCTTTGATCAAGAAATCCGAGCAGTTTCTTCTGCAACCGAGATCGTATGGATT
CCTGAACCGACCTCCTGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD94JQ U 202
AF RR2CD94TF C 1
BS 1 201 RR2CD94TF
BS 202 339 RR2CD94JQ
BS 340 501 RR2CD94TF

RD RR2CD94JQ 138 0 0
GTCCCAAACCTAAAGGAACACTGTAACTCTTTGGCTTGCTGCTATGGTTATGGCTGCAGT
TTGAAAAATGAACATGTGCTGACTGCGAATTATGTACGGGGTTAACATCAATAGCAACGT
GGCCATTGCCATTCTGAA

QA 1 138 1 138
DS 

RD RR2CD94TF 501 0 0
GATACTTGTGGTTCAAACTTTCATACCTCAACGTGGAAAACATAACGTACAACCATTTCT
GTAAACTATCTTCACCAGAATGGGATGTTATAATGACTTAGACAAGAGGACACACGTGTT
TCTTACAACACAAATGCACATTTGGGGGATGACCATATCATGGAGGTACAACAGGTCGGG
TTGGGTTCCGGCCAAGACCAAGTCCCAGACCTAAAGGAACACTGTAACTCTTTGGCTTGC
TGCTATGGTTATGGCTGCAGTTTGAAGAATGAACATGTGCTGACTGCGAATTATGTACGG
GGTTAACATCAATAGCAACGTGGCCATTGCCATTCTGAAGATTAGAACTCCGCTGCATCC
GCATCATGCTATACCCTCTTGTCTTGGTGTTGCGTCTTCTTCATGACACTCAATATCTTC
ATTATAACCTTTGATCAAGAAATCCGAGCAGTTTCTTCTGCAACCGAGATCGTATGGATT
CCTGAACCGACCTCCTGGGCC

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL4316Contig1 581 2 3 U
GGTGAAAATACATCTTTGTAAGATTAATCAAAGGCTTTTATAATCTCTTGTAAGAATCAG
ACAGTTCTCAGTATGTGTTATATGCAATGCTGAAACTTATAACTTGTAGATTCTTTGATT
CCATAAGAAACTAGAAAAAGAAGTTTGTAAAAGCAGATTGAACAAAGAAGACAGAATAAC
AAAAATCAGAGAGGAAGATCAAGCCCTTTTCCAACATCAACACCAATGATTTGAAGTATT
CCTTTGTTCAAAATCAGCTCAACAATGAAGGTGCCGATGAAACCAATCATACAAGCTCTG
GAGTTCCATATCTCAGCTGTAAATGTGAATCCCAGAAACGCTGGTTCAAACTTGGGCTCC
ACTTTTGGCACTATCACCCCTTGAGGACTTTAGCTGCGCGAACACACAGAGACGATTGTT
TCCGACCGAACCAGAGAGTTCTTTGGCTCAGACAATGGCCATGATGAACCGACAGCTTCC
GAGGAACAGGTAAGAAAGATGAAGACAGTGGCGTCGAAGTGAGAAGCGAGCTCGCCATTT
TTCTTTTTGTTTTTAGACGAAGGAGGAAGATGAGTCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN78TF C 1
AF RR2FN78JQ U 52
BS 1 51 RR2FN78TF
BS 52 554 RR2FN78JQ
BS 555 581 RR2FN78TF

RD RR2FN78TF 581 0 0
GGTGAAAATACATCTTTGTAAGATTAATCAAAGGCTTTTATAATCTCTTGTAAGAATCAG
ACAGTTCTCAGTATGTGTTATATGCAATGCTGAAACTTATAACTTGTAGATTCTTTGATT
CCATAAGAAACTAGAAAAAGAAGTTTGTAAAAGCAGATTGAACAAAGAAGACAGAATAAC
AAAAATCAGAGAGGAAGATCAAGCCCTTTTCCAACATCAACACCAATGATTTGAAGTATT
CCTTTGTTCAAAATCAGCTCAACAATGAAGGTGCCGATGAGACCAATCATACAAGCTCTG
GAGTTCCATATCTCAGCTGTAAATGTGAATCCCAGAAACGCTGGTTCAAACTTGGGCTCC
ACTTTTGGCACTATCACCCCTTGAGGACTTTAGCTGCGCGAACACACAGAGACGATTGTT
TCCGACCGAACCAGAGAGTTCTTTGGCTCAGACAATGGCCATGATGAACCGACAGCTTCC
GAGGAACAGGTAAGAAAGATGAGGACAGTGGCGTCGAAGTGAGAAGCGAGCTCGCCATTT
TTCTTTTTGTTTTTAGACGAAGGAGGAAGATGAGTCTGTCC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2FN78JQ 503 0 0
AAGAATCAGACAGTTCTCAGTATGTGTTATATGCAATGCTGAAACTTATAACTTGTAGAT
TCTTTGATTCCATAAGAAACTAGAAAAAGAAGTTTGTAAAAGCAGATTGAACAAAGAAGA
CAGAATAACAAAAATCAGAGAGGAAGATCAAGCCCTTTTCCAACATCAACACCAATGATT
TGAAGTATTCCTTTGTTCAAAATCAGCTCAACAATGAAGGTGCCGATGAAACCAATCATA
CAAGCTCTGGAGTTCCATATCTCAGCTGTAAATGTGAATCCCAGAAACGCTGGTTCAAAC
TTGGGCTCCACTTTTGGCACTATCACCCCTTGAGGACTTTAGCTGCGCGAACACACAGAG
ACGATTGTTTCCGACCGAACCAGAGAGTTCTTTGGCTCAGACAATGGCCATGATGAACCG
ACAGCTTCCGAGGAACAGGTAAGAAAGATGAAGACAGTGGCGTCGAAGTGAGAAGCGAGC
TCGCCATTTTTCTTTTTGTTTTT

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL4317Contig1 729 2 1 U
GAAGTCGACGTTAGGGACAAGAGGACGGGTAAAAGTGTAAAGCACGACGGAGTTTCAGTA
GGAGAGATTGTGTTAAAAGGAGGATCAGTTATGCTCGGTTACTACAAAGACCCTGAAGGA
ACCGCGGCGTGTATGAGAGAGGACAGATGGTTCTATACAGGAGATGTTGGGGTTATACAT
GAAGACGGTTACTTGGAGGTTAAGGACAGGTCAAAGGATGTGATCATATGCGGAGGAGAG
AACATAAGCAGCGCGGAGGTTGAGACTGTTCTGTACACTAACCCGGTGGTGAAGGAAGCT
GCTGTGGTGGCTAAACCGGATAAGATGTGGAGAGAGACACCGTGTGCTTTTGTGAGCTTG
AAGTATGGTAATAATGGTGGTGATGGGTCGGTGACTGAGAGGGAGATAAGGGAGTTCTGT
AAGACGAAGTTGCCTAAGTATATGGTTCCGAGGAAAGTGATTTTTCAGGAGGAGCTTCCA
AAGACATCTACTGGAAAAATTCAGAAGTTTCTTCTCAGACAAATGGCTAAGTCCTTGCCT
TGATTGATGATCTGGTTTGTGTTATTGAGACTATGAGGAAACTATGAGAAGAAAAAAAAT
AAAGAGTATCTATCGTTTGTGATGTATTAATATTATATCCTTGAGAGGGGATTAGTTTCT
AAGTTTGATGTAACATATGCTTGAATTTATTGTAATGAGATTTGCTAAGAAAGAGTGACT
TTACAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BD36TF U 1
AF RR2BD36JQ C 51
BS 1 729 RR2BD36TF

RD RR2BD36TF 729 0 0
GAAGTCGACGTTAGGGACAAGAGGACGGGTAAAAGTGTAAAGCACGACGGAGTTTCAGTA
GGAGAGATTGTGTTAAAAGGAGGATCAGTTATGCTCGGTTACTACAAAGACCCTGAAGGA
ACCGCGGCGTGTATGAGAGAGGACAGATGGTTCTATACAGGAGATGTTGGGGTTATACAT
GAAGACGGTTACTTGGAGGTTAAGGACAGGTCAAAGGATGTGATCATATGCGGAGGAGAG
AACATAAGCAGCGCGGAGGTTGAGACTGTTCTGTACACTAACCCGGTGGTGAAGGAAGCT
GCTGTGGTGGCTAAACCGGATAAGATGTGGAGAGAGACACCGTGTGCTTTTGTGAGCTTG
AAGTATGGTAATAATGGTGGTGATGGGTCGGTGACTGAGAGGGAGATAAGGGAGTTCTGT
AAGACGAAGTTGCCTAAGTATATGGTTCCGAGGAAAGTGATTTTTCAGGAGGAGCTTCCA
AAGACATCTACTGGAAAAATTCAGAAGTTTCTTCTCAGACAAATGGCTAAGTCCTTGCCT
TGATTGATGATCTGGTTTGTGTTATTGAGACTATGAGGAAACTATGAGAAGAAAAAAAAT
AAAGAGTATCTATCGTTTGTGATGTATTAATATTATATCCTTGAGAGGGGATTAGTTTCT
AAGTTTGATGTAACATATGCTTGAATTTATTGTAATGAGATTTGCTAAGAAAGAGTGACT
TTACAAGTT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2BD36JQ 679 0 0
AGTTTCAGTAGGAGAGATTGTGTTAAAAGGAGGATCAGTTATGCTCGGTTACTACAAAGA
CCCTGAAGGAACCGCGGCGTGTATGAGAGAGGACAGATGGTTCTATACAGGAGATGTTGG
GGTTATACATGAAGACGGTTACTTGGAGGTTAAGGACAGGTCAAAGGATGTGATCATATG
CGGAGGAGAGAACATAAGCAGCGCGGAGGTTGAGACTGTTCTGTACACTAACCCGGTGGT
GAAGGAAGCTGCTGTGGTGGCTAAACCGGATAAGATGTGGAGAGAGACACCGTGTGCTTT
TGTGAGCTTGAAGTATGGTAATAATGGTGGTGATGGGTCGGTGACTGAGAGGGAGATAAG
GGAGTTCTGTAAGACGAAGTTGCCTAAGTATATGGTTCCGAGGAAAGTGATTTTTCAGGA
GGAGCTTCCAAAGACATCTACTGGAAAAATTCAGAAGTTTCTTCTCAGACAAATGGCTAA
GTCCTTGCCTTGATTGATGATCTGGTTTGTGTTATTGAGACTATGAGGAAACTATGAGAA
GAAAAAAAATAAAGAGTATCTATCGTTTGTGATGTATTAATATTATATCCTTGAGAGGGG
ATTAGTTTCTAAGTTTGATGTAACATATGCTTGAATTTATTGTAATGAGATTTGCTAAGA
AAGAGTGACTTTACAAGTT

QA 1 679 1 679
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4319Contig1 1100 2 4 U
GGATTCATTTCACAAATATAAACCTCTAAGTCGACACACAAAAAACACATTTCTTGATTA
ATGGCGTCTTCGAGTTCTCTAGCTATTTCTCCGAGGAAGCTCCGGTCAGACCTTTACTCA
TACTCTTACCAAGACGGTTCCAACACACCACTCGTTATCTCTGTTCTCTCATCTCTTATA
GAACGAACGGTAGCTCGGAACGAGAGAATTAGCTGGAGCTACGGTGGTTTTGGTAAGACA
TGTGTCTTCGATTGCATGGAAGTTCCTGACATGACGATCCAATCGTACTTAGAGAGGATT
TTCCGGTATACCAAAGCCGGTCCATCGGTTTACGTTGTGGCTTATGTATACATTGACCGG
TTCTGTCAGAATAATCAAGGTTTTAGAATCAGCATCACTAATGTACATCGTCTACTTATG
ACAACCATCATGGTCGCTTCCAAATACGTCGAAGACATGTAAGTTGAAAAAAATGTTTAA
AATTTGGACGCCTTTTGTTAAAAATACAAATGCTTAAAATGTTACTAAATTCATTTATTT
ATAAATTCATGAAAATAAAGTTGTGGTGTTGAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGTTGTGG
TGTTGACTCATTTTTCATTCTCTTTGACCACTACAAGAACTACAGAAACTCCTACTTTGC
CAAGGTAGGAGGATTAGAGACAGAAGACTTGAACAACTTGGAGTTGGAGTTCTTGTTCTT
GATGAGGTTTAAGTTGCGTGTGAATGTGAGTGTGTTCGAGAGTTACTGTTGTCACCTTGA
GAGAGAAGTAAGTATCGGGGGAGGTTATCAGATCGAGAAGGCATTACGTTGCGCTGAGGA
AATCAAATCAAGACAAATTGTTTAAGATCCTAAAGATCATCATCACCATCAATTTTCACG
AATCTTGTTGTAGTCAAGAAGAACTCTGTTTTTTGTTTGTTTTGTCGCTTTGCTTTTGAG
AGTCTTTGACTTTCTGATTACCTTGTCGTATGGGCTTTTCTTGAAAAATAAATGTAAATA
GACAAATCTCACTAGAATCTCTATAAATTAATATTCGATAAGTTAATAATTTTTATAAAT
TAATATATTTTGTCGATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH74TF U 1
AF RR2FH74JQ C 519
BS 1 692 RR2FH74TF
BS 693 693 RR2FH74JQ
BS 694 726 RR2FH74TF
BS 727 1100 RR2FH74JQ

RD RR2FH74TF 730 0 0
GGATTCATTTCACAAATATAAACCTCTAAGTCGACACACAAAAAACACATTTCTTGATTA
ATGGCGTCTTCGAGTTCTCTAGCTATTTCTCCGAGGAAGCTCCGGTCAGACCTTTACTCA
TACTCTTACCAAGACGGTTCCAACACACCACTCGTTATCTCTGTTCTCTCATCTCTTATA
GAACGAACGGTAGCTCGGAACGAGAGAATTAGCTGGAGCTACGGTGGTTTTGGTAAGACA
TGTGTCTTCGATTGCATGGAAGTTCCTGACATGACGATCCAATCGTACTTAGAGAGGATT
TTCCGGTATACCAAAGCCGGTCCATCGGTTTACGTTGTGGCTTATGTATACATTGACCGG
TTCTGTCAGAATAATCAAGGTTTTAGAATCAGCATCACTAATGTACATCGTCTACTTATG
ACAACCATCATGGTCGCTTCCAAATACGTCGAAGACATGTAAGTTGAAAAAAATGTTTAA
AATTTGGACGCCTTTTGTTAAAAATACAAATGCTTAAAATGTTACTAAATTCATTTATTT
ATAAATTCATGAAAATAAAGTTGTGGTGTTGAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGTTGTGG
TGTTGACTCATTTTTCATTCTCTTTGACCACTACAAGAACTACAGAAACTCCTACTTTGC
CAAGGTAGGAGGATTAGAGACAGAAGACTTGA*CAACTTGGAGTTGGAGTTCTTGTTCTT
GATGAG
TTTA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2FH74JQ 582 0 0
ATGTTACTAAATTCATTTATTTATAAATTCATGAAAATAAAGTTGTGGTGTTGAAAAAAA
AAAAGAAAAAAAAAAGTTGTGGTGTTGACTCATTTTTCATTCTCTTTGACCACTACAAGA
ACTACAGAAACTCCTACTTTGCCAAGGTAGGAGGATTAGAGACAGAAGACTTGAACAACT
TGGAGTTGGAGTTCTTGTTCTTGATGAGGTTTAAGTTGCGTGTGAATGTGAGTGTGTTCG
AGAGTTACTGTTGTCACCTTGAGAGAGAAGTAAGTATCGGGGGAGGTTATCAGATCGAGA
AGGCATTACGTTGCGCTGAGGAAATCAAATCAAGACAAATTGTTTAAGATCCTAAAGATC
ATCATCACCATCAATTTTCACGAATCTTGTTGTAGTCAAGAAGAACTCTGTTTTTTGTTT
GTTTTGTCGCTTTGCTTTTGAGAGTCTTTGACTTTCTGATTACCTTGTCGTATGGGCTTT
TCTTGAAAAATAAATGTAAATAGACAAATCTCACTAGAATCTCTATAAATTAATATTCGA
TAAGTTAATAATTTTTATAAATTAATATATTTTGTCGATCCT

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

CO CL4320Contig1 828 2 6 U
AAATACTTTTTTTCTCACTTGTTCGAAAAGTAAAAACCGGTAAACAGAACATCGCTTAAA
TATACCTAACTTAAAAAGGTTAAAACCATGATTGATATAAGATAGAAAACGAAAAACAAA
CAAAGAAACAGCCTCTCAAAACCAATAACAACAACCCCTTATTCATTACCAATATTTGGT
CAACCTCATAAGAAGACCAATATCTCATAATTTCCACGACCAGACCAACCAAACCCGAAC
CACACATACGAAGAACCACCAAAGCTTGGTCCTTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGTAAA
CAGGCTTGTAGGGACCTTCAACGGGTATGCTGACGTAGTCAGACTGGTCCTTGGTGAGCT
TGGTGAGTCTAGCACCGAGCTTGCCCAAGTGAAGTGCAGCTACCTTCTCATCCAAGTGCT
TAGGCAGAACATACACCTTCTTCTCATACTTCCCACTCGACTTCTCGTTCCATAGCTCAA
GCTGTGCAATCACCTGGTTGGTGAACGAGCACGACATCACAAAACTTGGGTGTCCAGTAG
CACATCCCAAGTTCATAAGACGACCCTCGGCTAGCACAATGATGCCTGACTTGGTGTCCG
GAAACACCCACCTATCAGTCTGCGGCTTGATGGTGATACGTTTCACACCAGGGAAAGTCT
CGAGTCCGAGCATGTCGATCTCGTTGTCAAAGTGACCAATGTTGCACACAATGGCGTTGT
TCTTCATCTTCCTCATGTGGTCGACCATGATGATGTCTTTGTTTCCAGTGGTGGTGCAGA
AGATGTCAGCTTCAGAGACAACGTCCTCAAGGGTTAGAACTTGAAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2E190JQ U 1
AF RR2DK42TF C 154
BS 1 520 RR2E190JQ
BS 521 521 RR2DK42TF
BS 522 814 RR2E190JQ
BS 815 815 RR2DK42TF
BS 816 824 RR2E190JQ
BS 825 828 RR2DK42TF

RD RR2E190JQ 824 0 0
AAATACTTTTTTTCTCACTTGTTCGAAAAGTAAAAACCGGTAAACAGAACATCGCTTAAA
TATACCTAACTTAAAAAGGTTAAAACCATGATTGATATAAGATAGAAAACGAAAAACAAA
CAAAGAAACAGCCTCTCAAAACCAATAACAACAACCCCTTATTCATTACCAATATTTGGT
CAACCTCATAAGAAGACCAATATCTCATAATTTCCACGACCAGACCAACCAAACCCGAAC
CACACATACGAAGAACCACCAAAGCTTGGTCCTTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGTAAA
CAGGCTTGTAGGGACCTTCAACGGGTATGCTGACGTAGTCAGACTGGTCCTTGGTGAGCT
TGGTGAGTCTAGCACCGAGCTTGCCCAAGTGAAGTGCAGCTACCTTCTCATCCAAGTGCT
TAGGCAGAACATACACCTTCTTCTCATACTTCCCACTCGACTTCTCGTTCCATAGCTCAA
GCTGTGCAATCACCTGGTTGGTGAACGAGCACGACATCACGAAACTTGGGTGTCCAGTAG
CACATCCCAAGTTCATAAGACGACCCTCGGCTAGCACAATGATGCCTGACTTGGTGTCCG
GAAACACCCACCTATCAGTCTGCGGCTTGATGGTGATACGTTTCACACCAGGGAAAGTCT
CGAGTCCGAGCATGTCGATCTCGTTGTCAAAGTGACCAATGTTGCACACAATGGCGTTGT
TCTTCATCTTCCTCATGTGGTCGACCATGATGATGTCTTTGTTTCCAGTGGTGGTGCAGA
AGATGTCAGCTTCAGAGACAACGTCCTCAAGGGT*AGAACTTGA

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2DK42TF 675 0 0
ACCCCTTATTCATTACCAATATTTGGTCAAC*TCATAAGAAGACCAATATCTCATAATTT
CCACGACCAGACCAACCAAACCCGAACCACACATACGAAGAACCACCAAAGCTTGGTCCT
TTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGTGAACAGGCTTGTAGGGACCTTCAACGGGTATGCTGA
CGTAGTCAGACTGGTCCTTGGTGAGCTTGGTGAGTCTAGCACCGAGCTTGCCCAAGTGAA
GTGCAGCTACCTTCTCATCCAAGTGCTTAGGCAGAACATACACCTTCTTCTCATACTTCC
CACTCGACTTCTCGTTCCATAGCTCAAGCTGTGCAATCACCTGGTTGGTGAACGAGCACG
ACATCACAAAACTTGGGTGTCCAGTAGCACATCCCAAGTTCATAAGACGACCCTCGGCTA
GCACAATGATGCCTGACTTGGTGTCCGGAAACACCCACCTATCAGTCTGCGGCTTGATGG
TGATACGTTTCACACCAGGGAAAGTCTCGAGTCCGAGCATGTCGATCTCGTTGTCAAAGT
GACCAATGTTGCACACAATGGCGTTGTTCTTCATCTTCCTCATGTGGTCGACCATGATGA
TGTCTTTGTTTCCAGTGGTGGTGCAGAAGATGTCAGCTTCAGAGACAACGTCCTCAAGGG
TTAGAACTTGAAGGC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL4321Contig1 712 2 2 U
GGACTTTGAAACTGTGTTTGCATGCAACTCTCTTGATGTGAATATTATCTCTCAATTTTG
TGTGGTATACAAATTGCTTTCCTAAAAATCCTTTTTTGCATTTCCAACCTCTCTCTGCGT
TTCACATGGCTTCTTCTTCTTCTTCTCCAGTGATCATCAATTGTGCACACGATGTATTCC
TCAGTTTCAGAGGACACGACGTCCGCCGTAAGTTCCGTTCCCACTTTCTCAAGGAGCTCG
ACCGCAAGGTAATCACCTTCAAGGACGATGAGATGGAAAGAGGCCAATCTATTGCGGATG
AGCTTATCAAGGCCATACAAGGATCCAGGATCTCAGTTGTAGCGTTTTCCGAAAACTTTG
CAAATTCGAGCTGGTGTTTGGATGAGTTAGCCGAGATCATGAGGTGCAGAGAGGAACGAG
GCCAAATCGTGATACCCATTTTCTACGAAGTGGATCCTTGTCATGTCAGGTATCAAACCC
ACGTCTTCGGAGAGATCTTTGAAAAGACTTGCGAAGACATAGAGGAGGAAAAGAAACATA
TGTGGCGACAGGCTTTGACCCCCGCAGCCAACATAGCTGGAGAGGATTCTCGAAACTGGT
AGGGTTGTTCGTTTGTCAACTCCATCAAGATTCTCCATTTACATAAATGATCTCTCCAGA
TATTATTGGGACTATTCATTTGTGCATCTAGATGAATATTTTAATTGGACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED65TF U 1
AF RR2ED65JQ C 183
BS 1 698 RR2ED65TF
BS 699 712 RR2ED65JQ

RD RR2ED65TF 698 0 0
GGACTTTGAAACTGTGTTTGCATGCAACTCTCTTGATGTGAATATTATCTCTCAATTTTG
TGTGGTATACAAATTGCTTTCCTAAAAATCCTTTTTTGCATTTCCAACCTCTCTCTGCGT
TTCACATGGCTTCTTCTTCTTCTTCTCCAGTGATCATCAATTGTGCACACGATGTATTCC
TCAGTTTCAGAGGACACGACGTCCGCCGTAAGTTCCGTTCCCACTTTCTCAAGGAGCTCG
ACCGCAAGGTAATCACCTTCAAGGACGATGAGATGGAAAGAGGCCAATCTATTGCGGATG
AGCTTATCAAGGCCATACAAGGATCCAGGATCTCAGTTGTAGCGTTTTCCGAAAACTTTG
CAAATTCGAGCTGGTGTTTGGATGAGTTAGCCGAGATCATGAGGTGCAGAGAGGAACGAG
GCCAAATCGTGATACCCATTTTCTACGAAGTGGATCCTTGTCATGTCAGGTATCAAACCC
ACGTCTTCGGAGAGATCTTTGAAAAGACTTGCGAAGACATAGAGGAGGAAAAGAAACATA
TGTGGCGACAGGCTTTGACCCCCGCAGCCAACATAGCTGGAGAGGATTCTCGAAACTGGT
AGGGTTGTTCGTTTGTCAACTCCATCAAGATTCTCCATTTACATAAATGATCTCTCCAGA
TATTATTGGGACTATTCATTTGTGCATCTAGATGAATA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2ED65JQ 530 0 0
AGTTTCAGAGGACACGACGTCCGCCGTAAGTTCCGTTCCCACTTTCTCAAGGAGCTCGAC
CGCAAGGTAATCACCTTCAAGGACGATGAGATGGAAAGAGGCCAATTTATTGCGGATGAG
CTTATCAAGGCCATACAAGGATCCAGGATTTCAGTTGTAGCGTTTTCCGAAAACTTTGCA
AATTCGAGCTGGTGTTTGGATGAGTTAGCCGAGATCATGAGGTGCAGAGAGGAACGAGGC
CAAATCGTGATACCCATTTTTTACGAAGTGGATCCTTGTCATGTCAGGTATCAAACCCAC
GTTTTCGGAGAGATCTTTGAAAAGACTTGGGAAGACATAGAGGAGGAAAAGAAACATATG
TGGCGACAGGCTTTGACCCCCGCAGCCAACATAGCTGGAGAGGATTCTCGAAACTGGTAG
GGTTGTTCGTTTGTCAACTCCATCAAGATTCTCCATTTACATAAATGATCTCTCCAGATA
TTATTGGGACTATTCATTTGTGCATCTAGATGAATATTTTAATTGGACTT

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 2

CO CL4322Contig1 496 2 1 U
GGAGAGGCGATTGTCTCACAAAACAGCTCGTCGTGACAAATTCGAAGTCAAAGGCGACGA
TTTAGTGTACACTGAGCTGCGCAAACCAGAGACGGAGACAAAGCCTTTGGAGCTTAGCGA
GGATTTGCCTGGAATGGGCCAGTTCTACTGCCTACACTGCGATCGGTACTTCTCTAATGC
GTCTGTGCGTGATGATCATTTTAAGACCAAGAAGCACAAGAAGCGTGTGAAGTTAATGAA
TGGACCTGCGCCACACTCACAACTCGATGCTGATTTGGCTGCTGGGATGGGAATGCCCGA
CAATGGTCCAAAGCTCATGGCTTCTTGAGTTCACTTTCAGTTTTTTTTTGTTTCTAAATA
GTTCACAGTTAACTGAACCTGTGGATTGTTGTTGTAAGATGCCCCTTAGTATTAAAACTA
TAAGTTCAATGCTATAAGTGTTGTAAGATGTCCCTTAGTATTAAAACTATAAGTTCAATG
CTATAAGTTTTTTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BD21JQ C 1
AF RR2BD21TF U 1
BS 1 496 RR2BD21TF

RD RR2BD21JQ 496 0 0
GGAGAGGCGATTGTCTCACAAAACAGCTCGTCGTGACAAATTCGAAGTCAAAGGCGACGA
TTTAGTGTACACTGAGCTGCGCAAACCAGAGACGGAGACAAAGCCTTTGGAGCTTAGCGA
GGATTTGCCTGGAATGGGCCAGTTCTACTGCCTACACTGCGATCGGTACTTCTCTAATGC
GTCTGTGCGTGATGATCATTTTAAGACCAAGAAGCACAAGAAGCGTGTGAAGTTAATGAA
TGGACCTGCGCCACACTCACAACTCGATGCTGATTTGGCTGCTGGGATGGGAATGCCCGA
CAATGGTCCAAAGCTCATGGCTTCTTGAGTTCACTTTCAGTTTTTTTTTGTTTCTAAATA
GTTCACAGTTAACTGAACCTGTGGATTGTTGTTGTAAGATGCCCCTTAGTATTAAAACTA
TAAGTTCAATGCTATAAGTGTTGTAAGATGTCCCTTAGTATTAAAACTATAAGTTCAATG
CTATAAGTTTTTTCCC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2BD21TF 496 0 0
GGAGAGGCGATTGTCTCACAAAACAGCTCGTCGTGACAAATTCGAAGTCAAAGGCGACGA
TTTAGTGTACACTGAGCTGCGCAAACCAGAGACGGAGACAAAGCCTTTGGAGCTTAGCGA
GGATTTGCCTGGAATGGGCCAGTTCTACTGCCTACACTGCGATCGGTACTTCTCTAATGC
GTCTGTGCGTGATGATCATTTTAAGACCAAGAAGCACAAGAAGCGTGTGAAGTTAATGAA
TGGACCTGCGCCACACTCACAACTCGATGCTGATTTGGCTGCTGGGATGGGAATGCCCGA
CAATGGTCCAAAGCTCATGGCTTCTTGAGTTCACTTTCAGTTTTTTTTTGTTTCTAAATA
GTTCACAGTTAACTGAACCTGTGGATTGTTGTTGTAAGATGCCCCTTAGTATTAAAACTA
TAAGTTCAATGCTATAAGTGTTGTAAGATGTCCCTTAGTATTAAAACTATAAGTTCAATG
CTATAAGTTTTTTCCC

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 2

CO CL4323Contig1 1162 2 2 U
GGGACATCATTTATCTTAGTTCAGACGAGGAGGATAATAAACTAGTCGATCACACTTCTT
TCTTTTACGATGACAAACCTAAGCGTACTTGTCAATGGAAACCAGTTTCCGAGGATTTAA
CGGTGGAGGACGACGATGATTGTGTGGTATTGGATGGTGATCCTTACAAGACAAAGGAAA
AGGAGACTACACTTCACACTTGTGAAGCCGATGACGACATCCTTGTGCTAGGGCAAAAGG
GTGAGATAGCCTGTATAGACTTCCCACATCCGCGACATGCCTGCGCTAAGTACCCTTTCA
ATTCCACGTCACACGACAAGTATTGTGACATGTGTCACTGTTATGTTTGTGACATACGTG
CCCCGTGTCCTCACTGGTGCATTGGTATCTCAACCTATAATCACTGTCATGCCAATGACA
AAGATCAGATATGGAAGAATCAACGTGAATGCATCAGAACTGGAACATTACTTCCGCCTC
AAACTATGCTACAAAACACTTGGTATTCCCCTGTAAACCAGTTTGGGCCATCTACTATGG
TTGCGCCTCGCCCAAACACGTACATCAGACCTGGTTACAGATCCGAGCAACCAAGAACCT
CTCCGCAAAATCGACAACCTCGTGCTCCTCATCAGTTATACCGAAACCAAAACGATAGGT
TTAATAATGGTAACCCAATCCCCCAAGTGTTCTCTTCCAAACCTCACTCATGGACTCCAC
AGAGACCAAGTTTACGCGCTACTCCTTTGGACGTTGCTCAAGGCTTGCCGTATAACCCTT
ACGTCACTCCTCCCACGGCTTTACAAAGCAATTCACAGCAGACGTTTCGTGATTATTCAC
AGCAATTTAGCCGGACAAGTGCAGTTTGGTCTGGACCACCTAATCCTCCAGTGAAGCAGC
AGCAGCAACAACAACAAAGAAGTGTCAATAGAACACTTTCGGAGATTGAAGACTGGCTCA
TGGACATTGGACAGCACTACCCGGATTGATCCGGCTTGTTCCTTTATCTGGTCCAATTCG
GTCTCGAAGCCTTCTTTGGATGATTCGAACATTAGGATTGTATTTTCATATTAGTTAAAT
TTAGAATCAGTATGTACATAGTAGTATTAGCCAAGAGCTTTTTGGTTAGGACGTTTAGTT
TACGAAAACATATTGTTATCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU08TF U 1
AF RR2EU08JQ C 645
BS 1 708 RR2EU08TF
BS 709 1162 RR2EU08JQ

RD RR2EU08TF 708 0 0
GGGACATCATTTATCTTAGTTCAGACGAGGAGGATAATAAACTAGTCGATCACACTTCTT
TCTTTTACGATGACAAACCTAAGCGTACTTGTCAATGGAAACCAGTTTCCGAGGATTTAA
CGGTGGAGGACGACGATGATTGTGTGGTATTGGATGGTGATCCTTACAAGACAAAGGAAA
AGGAGACTACACTTCACACTTGTGAAGCCGATGACGACATCCTTGTGCTAGGGCAAAAGG
GTGAGATAGCCTGTATAGACTTCCCACATCCGCGACATGCCTGCGCTAAGTACCCTTTCA
ATTCCACGTCACACGACAAGTATTGTGACATGTGTCACTGTTATGTTTGTGACATACGTG
CCCCGTGTCCTCACTGGTGCATTGGTATCTCAACCTATAATCACTGTCATGCCAATGACA
AAGATCAGATATGGAAGAATCAACGTGAATGCATCAGAACTGGAACATTACTTCCGCCTC
AAACTATGCTACAAAACACTTGGTATTCCCCTGTAAACCAGTTTGGGCCATCTACTATGG
TTGCGCCTCGCCCAAACACGTACATCAGACCTGGTTACAGATCCGAGCAACCAAGAACCT
CTCCGCAAAATCGACAACCTCGTGCTCCTCATCAGTTATACCGAAACCAAAACGATAGGT
TTAATAATGGTAACCCAATCCCCCAAGTGTTCTCTTCCAAACCTCACT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2EU08JQ 518 0 0
AACCAAAACGATAGGTTTAATAATGGTAACCCAATCCCCCAAGTGTTCTCTTCCAAACCT
CACTCATGGACTCCACAGAGACCAAGTTTACGCGCTACTCCTTTGGACGTTGCTCAAGGC
TTGCCGTATAACCCTTACGTCACTCCTCCCACGGCTTTACAAAGCAATTCACAGCAGACG
TTTCGTGATTATTCACAGCAATTTAGCCGGACAAGTGCAGTTTGGTCTGGACCACCTAAT
CCTCCAGTGAAGCAGCAGCAGCAACAACAACAAAGAAGTGTCAATAGAACACTTTCGGAG
ATTGAAGACTGGCTCATGGACATTGGACAGCACTACCCGGATTGATCCGGCTTGTTCCTT
TATCTGGTCCAATTCGGTCTCGAAGCCTTCTTTGGATGATTCGAACATTAGGATTGTATT
TTCATATTAGTTAAATTTAGAATCAGTATGTACATAGTAGTATTAGCCAAGAGCTTTTTG
GTTAGGACGTTTAGTTTACGAAAACATATTGTTATCAG

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

CO CL4324Contig1 496 2 1 U
GGAGAAAGTCCGTGAATTGAATCGCAGAAGCGAAGAGCAAAAGGGATCTCTCCAATGTCG
TCGTCGTCAAGCGATCCGTCGAGAACAACAGGGATGGAGAGGAAGAAGAAAGGAGCTCCG
ATCAAATTCTTGGTGCCTCTCATATACGCGCCTGCTCTTCCTCTGATTCGTTTGACCTTG
AGGCATCAGCCTGTTCTCAGAGACCGTCTCTTCGGTCTTGTCCTCGCCGGTGCTTTCGCT
CATGGCTTCTACCTCGTAACGGACATATATGATGCAGAGAGCAAATGAGAAAAAGGGGAG
TTGCAGCCTTTCATCTAGAGCTCGGCATTTCTCAGATGTCTTTCTGATTTAATAAATAAA
ACTGCTTTTGTTTTCTTTTAATTACTTTTGTTACAAGATTACATTTTGCTCGTGAATCTG
AAATTGGATTTGGTTTGTGAATACATTTGTCATTTTGTTTCCTAAGGAGAAGTGTATTTC
ACACAGCTTTTACATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GL63JQ C 1
AF RR2GL63TF U 1
BS 1 496 RR2GL63TF

RD RR2GL63JQ 496 0 0
GGAGAAAGTCCGTGAATTGAATCGCAGAAGCGAAGAGCAAAAGGGATCTCTCCAATGTCG
TCGTCGTCAAGCGATCCGTCGAGAACAACAGGGATGGAGAGGAAGAAGAAAGGAGCTCCG
ATCAAATTCTTGGTGCCTCTCATATACGCGCCTGCTCTTCCTCTGATTCGTTTGACCTTG
AGGCATCAGCCTGTTCTCAGAGACCGTCTCTTCGGTCTTGTCCTCGCCGGTGCTTTCGCT
CATGGCTTCTACCTCGTAACGGACATATATGATGCAGAGAGCAAATGAGAAAAAGGGGAG
TTGCAGCCTTTCATCTAGAGCTCGGCATTTCTCAGATGTCTTTCTGATTTAATAAATAAA
ACTGCTTTTGTTTTCTTTTAATTACTTTTGTTACAAGATTACATTTTGCTCGTGAATCTG
AAATTGGATTTGGTTTGTGAATACATTTGTCATTTTGTTTCCTAAGGAGAAGTGTATTTC
ACACAGCTTTTACATC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2GL63TF 496 0 0
GGAGAAAGTCCGTGAATTGAATCGCAGAAGCGAAGAGCAAAAGGGATCTCTCCAATGTCG
TCGTCGTCAAGCGATCCGTCGAGAACAACAGGGATGGAGAGGAAGAAGAAAGGAGCTCCG
ATCAAATTCTTGGTGCCTCTCATATACGCGCCTGCTCTTCCTCTGATTCGTTTGACCTTG
AGGCATCAGCCTGTTCTCAGAGACCGTCTCTTCGGTCTTGTCCTCGCCGGTGCTTTCGCT
CATGGCTTCTACCTCGTAACGGACATATATGATGCAGAGAGCAAATGAGAAAAAGGGGAG
TTGCAGCCTTTCATCTAGAGCTCGGCATTTCTCAGATGTCTTTCTGATTTAATAAATAAA
ACTGCTTTTGTTTTCTTTTAATTACTTTTGTTACAAGATTACATTTTGCTCGTGAATCTG
AAATTGGATTTGGTTTGTGAATACATTTGTCATTTTGTTTCCTAAGGAGAAGTGTATTTC
ACACAGCTTTTACATC

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 2

CO CL4325Contig1 867 2 2 U
GGACACCGCACTCTCTCATCTTCCTCGTTCTTGAATCTTTTTATCTCCTCTGTTTAGATC
CATGGATAATGTTAAGTTCGTGAAGAATGGTGTTATGAGATTACCACCTGGATTCAGGTT
TCATCCCACTGATGAGGAGCTTGTGGTTCAGTATCTCAAGAGAAAAGTCCTTTCTTCTCC
ATTACCAGCTTCCATCATTCCTGATTTTGATGTTTGCAGAGCTGATCCTTGGGACTTACC
TGGCAATTTGGAGAAAGAGAGGTACTTCTTTAGCACAAGGGAAGCCAAGTACCCAAATGG
GAACCGGTCTAATAGGGCAACCGGTTCCGGTTATTGGAAAGCTACAGGTATTGATAAACG
GATTGTGACCTCTAGAGGAAATCAAATCGTTGGTTTGAAGAAAACACTTGTGTTCTACAA
AGGCAAACCACCTCATGGTTCAAGAACCGATTGGATCATGCATGAATATCGTCTCTCTTC
CTCTCCTCCGAGTTCTTTGGGCCCTACTCAGAACTGGGTTCTTTGTCGTATCTTCCTTAA
GAAGAGAGCTGGTAGCAACGATGACGGAGATAACCGGAATCTTGGTTATGGTAATGAACG
TATTGAAATTACCACAGCAAACCAAACCGAAGATAAGACCAAACCAATCTTCTTTGATTT
CATGAGAAAAGAAAGGACTACGGACTTGAACCTTCTGCCGGGCTCTCCTACTTCCGACCA
CGCTTCAAGTGGACTCACGACGGAGATTTTCTCTTCAGATGAAGAGAGCAGTAGTAGTTG
CAATAGTTTCAGACGAAATCTTTAATTTAATTTTACATGTTTTTGACTATCTTAATAATT
TTATACCAATACGACTCTCCTTCCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED86TF U 1
AF RR2ED86JQ C 174
BS 1 668 RR2ED86TF
BS 669 867 RR2ED86JQ

RD RR2ED86TF 668 0 0
GGACACCGCACTCTCTCATCTTCCTCGTTCTTGAATCTTTTTATCTCCTCTGTTTAGATC
CATGGATAATGTTAAGTTCGTGAAGAATGGTGTTATGAGATTACCACCTGGATTCAGGTT
TCATCCCACTGATGAGGAGCTTGTGGTTCAGTATCTCAAGAGAAAAGTCCTTTCTTCTCC
ATTACCAGCTTCCATCATTCCTGATTTTGATGTTTGCAGAGCTGATCCTTGGGACTTACC
TGGCAATTTGGAGAAAGAGAGGTACTTCTTTAGCACAAGGGAAGCCAAGTACCCAAATGG
GAACCGGTCTAATAGGGCAACCGGTTCCGGTTATTGGAAAGCTACAGGTATTGATAAACG
GATTGTGACCTCTAGAGGAAATCAAATCGTTGGTTTGAAGAAAACACTTGTGTTCTACAA
AGGCAAACCACCTCATGGTTCAAGAACCGATTGGATCATGCATGAATATCGTCTCTCTTC
CTCTCCTCCGAGTTCTTTGGGCCCTACTCAGAACTGGGTTCTTTGTCGTATCTTCCTTAA
GAAGAGAGCTGGTAGCAACGATGACGGAGATAACCGGAATCTTGGTTATGGTAATGAACG
TATTGAAATTACCACAGCAAACCAAACCGAAGATAAGACCAAACCAATCTTCTTTGATTT
CATGAGAA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2ED86JQ 694 0 0
CTTCTCCATTACCAGCTTCCATCATTCCTGATTTTGATGTTTGCAGAGCTGATCCTTGGG
ACTTACCTGGCAATTTGGAGAAAGAGAGGTACTTCTTTAGCACAAGGGAAGCCAAGTACC
CAAATGGGAACCGGTCTAATAGGGCAACCGGTTCCGGTTATTGGAAAGCTACAGGTATTG
ATAAACGGATTGTGACCTCTAGAGGAAATCAAATCGTTGGTTTGAAGAAAACACTTGTGT
TCTACAAAGGCAAACCACCTCATGGTTCAAGAACCGATTGGATCATGCATGAATATCGTC
TCTCTTCCTCTCCTCCGAGTTCTTTGGGCCCTACTCAGAACTGGGTTCTTTGTCGTATCT
TCCTTAAGAAGAGAGCTGGTAGCAACGATGACGGAGATAACCGGAATCTTGGTTATGGTA
ATGAACGTATTGAAATTACCACAGCAAACCAAACCGAAGATAAGACCAAACCAATCTTCT
TTGATTTCATGAGAAAAGAAAGGACTACGGACTTGAACCTTCTGCCGGGCTCTCCTACTT
CCGACCACGCTTCAAGTGGACTCACGACGGAGATTTTCTCTTCAGATGAAGAGAGCAGTA
GTAGTTGCAATAGTTTCAGACGAAATCTTTAATTTAATTTTACATGTTTTTGACTATCTT
AATAATTTTATACCAATACGACTCTCCTTCCTTT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL4326Contig1 887 2 4 U
GTGTTCCGTTTCATTTCTCTTATTCTTTCTTGGTAACGAAAGGTTCGTTTCCCAATTCTT
TTATCAAGCACAAATCATAATACGTCTTATTCCGATTTAAGATTTACTTTTGTTTCGATA
GATCAGACTCATTTCCTGAATCTGTATATAAAAGTTCTTTGACAAGAGGAAGAAATCTCC
GGTTTCAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAGCTTCACACAATCATC
AGAGCCGAAGCTGTGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCGCCATCGAACATGGATCT
GTGTTCGAAATGCTACAGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAACAGCTGTTGCAAAAGC
TGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCATAGCCGAGCCGGATGTGGC
AGAGAAGGCAGTTGCTACCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATCTTCTTCTTCTGC
TGCAGTTCCTGAACAGAACGAACCGTCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGTGTCTGTG
CTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTCAAGTGCAAATGCGGGAGCACTTTCTGTGG
CGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAGCTTTGATTTCAAAGAAGCTGGGCGTGG
TGAGATTGCAAAAGCCAATCCGGTTATTAAAGCTGATAAGCTTCAAAGGTTCTGAAGATT
TGTATTGTTGGAAAAGGCCTCTATGGTGTTTGGTCTCTTTTCTTTCTTTTAACTCAAATT
GTACTTGAACGGAATTGGGTTTCTAGTGGAATGTTTCCAAAGGGGGTAAGATGATGAATT
TGGTTTTATAATAAAAGTGGATCTATCAAGTTTGGTTTCTCTATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB18TF U 1
AF RR2EB18JQ C 140
BS 1 553 RR2EB18TF
BS 554 554 RR2EB18JQ
BS 555 639 RR2EB18TF
BS 640 887 RR2EB18JQ

RD RR2EB18TF 639 0 0
GTGTTCCGTTTCATTTCTCTTATTCTTTCTTGGTAACGAAAGGTTCGTTTCCCAATTCTT
TTATCAAGCACAAATCATAATACGTCTTATTCCGATTTAAGATTTACTTTTGTTTCGATA
GATCAGACTCATTTCCTGAATCTGTATATAAAAGTTCTTTGACAAGAGGAAGAAATCTCC
GGTTTCAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAGCTTCACACAATCATC
AGAGCCGAAGCTGTGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCGCCATCGAACATGGATCT
GTGTTCGAAATGCTACAGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAACAGCTGTTGCAAAAGC
TGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCATAGCCGAGCCGGATGTGGC
AGAGAAGGCAGTTGCTACCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATCTTCTTCTTCTGC
TGCAGTTCCTGAACAGAACGAACCGTCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGTGTCTGTG
CTGCAACAAGAAG*TTGGGATACTTGGTTTCAAGTGCAAATGCGGGAGCACTTTCTGTGG
CGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAGCTTTGA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2EB18JQ 748 0 0
ATCTGTATATAAAAGTTCTTTGACAAGAGGAAGAAATCTCCGGTTTCAACAGGAAGAATG
GGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAGCTTCACACAATCATCAGAGCCGAAGCTGTGTGCA
AACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCGCCATCGAACATGGATCTGTGTTCGAAATGCTACAGA
GACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAACAGCTGTTGCAAAAGCTGCTGTTGAGAAATCTTTC
AAGCCTCCTCCTACCCTCTTCATAGCCGAGCCGGATGTGGCAGAGAAGGCAGTTGCTACC
GCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATCTTCTTCTTCTGCTGCAGTTCCTGAACAGAAC
GAACCGTCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGTGTCTGTGCTGCAACAAGAAGGTTGGG
ATACTTGGTTTCAAGTGCAAATGCGGGAGCACTTTCTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAG
AGACATGATTGCAGCTTTGATTTCAAAGAAGCTGGGCGTGGTGAGATTGCAAAAGCCAAT
CCGGTTATTAAAGCTGATAAGCTTCAAAGGTTCTGAAGATTTGTATTGTTGGAAAAGGCC
TCTATGGTGTTTGGTCTCTTTTCTTTCTTTTAACTCAAATTGTACTTGAACGGAATTGGG
TTTCTAGTGGAATGTTTCCAAAGGGGGTAAGATGATGAATTTGGTTTTATAATAAAAGTG
GATCTATCAAGTTTGGTTTCTCTATGCC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL4327Contig1 726 2 2 U
GGATTTCCCCCACTTTCCTTTGCAAAAAAACAAAGCAGAATGGCACTGAGAATCTGGGCT
TCCTCTACAGCAAACGCTCTCAAGCTCTCTTCTTCTGCCTCCAAATCTCATCTCCTTCCG
GCTTTCTCCGTCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGATTTAAATATGCAAATTCA
CATGAGTGGGTGAAACATGATGGCTCAGTGGCTACCATAGGCATCACTGACCATGCCCAG
GTAACAAAAACATAGCTCATCAGAAGTAGTTTAGGTTAGTTTTACCAGTACTTGCTTGAA
AAAAAAGAGAAACTACATATGGTGATGTTGGGCAGAATCATTTAGGAGGAGTTGTGTTTG
TGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGCTCAGTGAGCAAAGAAAAGAACTTTGGAGCTGTGGAGA
GTGTCAAGGCCACAAGTGAGATTCTATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCGTTGAGGTTAACA
CAAAGCTCACCGATTCGCCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGA
TAAAGGTGAAACCAAGTAACCCTGCAGAGTTGGAAACCTTGATGGGCTCAAAGGAATACA
CCAAGTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGAGGGACTTCACTTGTCAGTGTTCCT
TACCCTATATCTCTCTCGGCTTTGTATCTCTGTAATACTAATTTGGTTGAAAGATGATAT
CATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV69TF U 1
AF RR2CV69JQ C 243
BS 1 633 RR2CV69TF
BS 634 726 RR2CV69JQ

RD RR2CV69TF 633 0 0
GGATTTCCCCCACTTTCCTTTGCAAAAAAACAAAGCAGAATGGCACTGAGAATCTGGGCT
TCCTCTACAGCAAACGCTCTCAAGCTCTCTTCTTCTGCCTCCAAATCTCATCTCCTTCCG
GCTTTCTCCGTCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGATTTAAATATGCAAATTCA
CATGAGTGGGTGAAACATGATGGCTCAGTGGCTACCATAGGCATCACTGACCATGCCCAG
GTAACAAAAACATAGCTCATCAGAAGTAGTTTAGGTTAGTTTTACCAGTACTTGCTTGAA
AAAAAAGAGAAACTACATATGGTGATGTTGGGCAGAATCATTTAGGAGGAGTTGTGTTTG
TGGAGCTGCCAGAAGAGAAAAGCTCAGTGAGCAAAGAAAAGAACTTTGGAGCTGTGGAGA
GTGTCAAGGCCACAAGTGAGATTCTATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCGTTGAGGTTAACA
CAAAGCTCACCGATTCGCCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGA
TAAAGGTGAAACCAAGTAACCCTGCAGAGTTGGAAACCTTGATGGGCTCAAAGGAATACA
CCAAGTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2CV69JQ 484 0 0
AACAAAAACATAGCTCATCAGAAGTAGTTTAGGTTAGTTTTACCAGTACTTGCTTGAAAA
AAAAGAGAAACTACATATGGTGATGTTGGGCAGAATCATTTAGGAGGAGTTGTGTTTGTG
GAGCTGCCAGAAGAGAAAAGCTCAGTGAGCAAAGAAAAGAACTTTGGAGCTGTGGAGAGT
GTCAAGGCCACAAGTGAGATTCTATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCGTTGAGGTTAACACA
AAGCTCACCGATTCGCCTGGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGATGGTTGGATGATA
AAGGTGAAACCAAGTAACCCTGCAGAGTTGGAAACCTTGATGGGCTCAAAGGAATACACC
AAGTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGAGGGACTTCACTTGTCAGTGTTCCTTA
CCCTATATCTCTCTCGGCTTTGTATCTCTGTAATACTAATTTGGTTGAAAGATGATATCA
TTCG

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 2

CO CL4328Contig1 846 2 4 U
GAAAGATGAGGTGGACTTTATGTGCCACCCAATTTTTTTGTAGAGCATTTTAGTTTAAAA
TACTATGAAAATAAAAAGAGATGGAGAAAAGAAGAGTCACGAGCCGTCTATATTACAATG
GGACAGATGCGTAGTGAGAACATTGAGGAGGGTAATGCACTTGGCGCTTTGGCTGCTAAG
AACATTGTTTATATGAAACTTTTACGTGTTTGTTTTTATTTTGTTGGGAGTTTTCGGGAG
CCGACATTACATTTATAACTTGGCTCGTGAGATTAATTTGTTTCAGTACTTGCATTACTG
AATCCGTGATAGGCAGCCGACATTACATTTACAATTGTAATTACTTTTTTAAGTTAAAAA
GTATAGTTATTTTAAATTTAATCATTTTCAAAATAGTATTTAGTTGATTTTGACAATAAT
TTTTAAAACGGTATCAAACTAGCTCTCGTCGATTTTGACTGCAAAGAATAAAAAGTTTTG
TTTGGTTCTAAAACGTTTTTCATAGGCTCTCGTCGGTGCTAAAAAGGCACCGCGATAACA
TGTAACTAATTGAAAAAACATGTAACTAATGATGACAAAAAAAACATGTAACTAATTATT
TTGTCGAGTTTAGATCATGACCTTTAGAAGGGTTTCTTTCATAGCTTAAAGTGTTATTAA
AGAGGGTTTTTATTCAATCGTATGTGGCGACCGGTTTTCTTTTTTGGCTCGATGAACTCT
TTGTTAATGAAAGGTGTGGCTTCTGATGGTACAGATTGTTGGGAGAATTTTGGTTGGACC
ATTCTCTTGTAATGGTTAATGACATTAAGTGTAATGGTTAATGACATATAAATGCATCTT
CCGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE51TF U 1
AF RR2EE51JQ C 122
BS 1 583 RR2EE51TF
BS 584 584 RR2EE51JQ
BS 585 625 RR2EE51TF
BS 626 846 RR2EE51JQ

RD RR2EE51TF 625 0 0
GAAAGATGAGGTGGACTTTATGTGCCACCCAATTTTTTTGTAGAGCATTTTAGTTTAAAA
TACTATGAAAATAAAAAGAGATGGAGAAAAGAAGAGTCACGAGCCGTCTATATTACAATG
GGACAGATGCGTAGTGAGAACATTGAGGAGGGTAATGCACTTGGCGCTTTGGCTGCTAAG
AACATTGTTTATATGAAACTTTTACGTGTTTGTTTTTATTTTGTTGGGAGTTTTCGGGAG
CCGACATTACATTTATAACTTGGCTCGTGAGATTAATTTGTTTCAGTACTTGCATTACTG
AATCCGTGATAGGCAGCCGACATTACATTTACAATTGTAATTACTTTTTTAAGTTAAAAA
GTATAGTTATTTTAAATTTAATCATTTTCAAAATAGTATTTAGTTGATTTTGACAATAAT
TTTTAAAACGGTATCAAACTAGCTCTCGTCGATTTTGACTGCAAAGAATAAAAAGTTTTG
TTTGGTTCTAAAACGTTTTTCATAGGCTCTCGTCGGTGCTAAAAAGGCACCGCGATAACA
TGTAACTAATTGAAAAAACATGTAACTAATGATGACAAAAAAA*CATGTAACTAATTATT
TTGTCGAGTTTAGATCATGACCTTT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2EE51JQ 725 0 0
GACAGATGCGTAGTGAGAACATTGAGGAGGGTAATGCACTTGGCGCTTTGGCTGCTAAGA
ACATTGTTTATATGAAACTTTTACGTGTTTGTTTTTATTTTGTTGGGAGTTTTCGGGAGC
CGACATTACATTTATAACTTGGCTCGTGAGATTAATTTGTTTCAGTACTTGCATTACTGA
ATCCGTGATAGGCAGCCGACATTACATTTACAATTGTAATTACTTTTTTAAGTTAAAAAG
TATAGTTATTTTAAATTTAATCATTTTCAAAATAGTATTTAGTTGATTTTGACAATAATT
TTTAAAACGGTATCAAACTAGCTCTCGTCGATTTTGACTGCAAAGAATAAAAAGTTTTGT
TTGGTTTTAAAACGTTTTTCATAGGCTCTCGTCGGTGCTAAAAAGGCACCGCGATAACAT
GTAACTAATTGAAAAAACATGTAACTAATGATGACAAAAAAAACATGTAACTAATTATTT
TGTCGAGTTTAGATCATGACCTTTAGAAGGGTTTCTTTCATAGCTTAAAGTGTTATTAAA
GAGGGTTTTTATTCAATCGTATGTGGCGACCGGTTTTCTTTTTTGGCTCGATGAACTCTT
TGTTAATGAAAGGTGTGGCTTCTGATGGTACAGATTGTTGGGAGAATTTTGGTTGGACCA
TTCTCTTGTAATGGTTAATGACATTAAGTGTAATGGTTAATGACATATAAATGCATCTTC
CGATG

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL4329Contig1 828 2 6 U
GAAGATTATTATTTCTCTGTTGAGTGCCACTTCCTCTGCTGTTATCTATGAATGTGCTGG
GACGCTTGTTTCTCTCTCATCTGCCCCTACTGCTATTAGGGCTGCTGCCAACACCTACTG
TCAACTTCTTCTTTCTCAGAGTGACAACAATGTGAAGCTTATTTTGCTCGATCGGTTGAG
TGAGCTTAAGTCATCGCACAGAGATATCATGGTTGAGCTAATAATAGATGTGCTCAGAGT
ACTCTCAAGCCCAAACCTTGATATTCGCAGGAAGACACTTGACATTGCTCTTGATTTGAT
TACTCATCATAACATTAATGAGGTCGTTCAAATGTTGAAGAAAGAAGTTGTGTAGACACA
GAGTGGAGAGCTTGAGAAGAATGGAGAGTACAGACAAATGCTCATTCAAGCAATACATGC
CTGTGCAGTTAAGTTCCCCGAAGTTGCAAGCACAGTGGTCCATCTTCTTATGGATTTCTT
GGGAGATAGCAATGTGGCTTCAGCACTTGACGTGATTTCATTTGTTAGAGAGATAATAGA
AACAAATCCCAAGTTGAGAGTTTCAATCATAACCAGGTTGCTGGACACGTTCTATCAGAT
CCGTGCTGGGAAGGTCTGCCCTTGTGCACTGTGGATTAATGGGGAGTATTGCCTTTCACT
TTCGGAAGTTGAGAGTGGCATTTCAACCATTAAGCAATGCCTTGGTGATTTACCATTCTA
CTCTGTTTCTGCGGAATTTGAGCCAACTGAGACTTCGAAGAAGATTATTTTAACATTGCT
CTTTTTAAAATCTATTTTAAATAATTTAATTAATTTTATGTTCTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO31TF U 1
AF RR2CO31JQ C 161
BS 1 613 RR2CO31TF
BS 614 614 RR2CO31JQ
BS 615 636 RR2CO31TF
BS 637 637 RR2CO31JQ
BS 638 660 RR2CO31TF
BS 661 828 RR2CO31JQ

RD RR2CO31TF 660 0 0
GAAGATTATTATTTCTCTGTTGAGTGCCACTTCCTCTGCTGTTATCTATGAATGTGCTGG
GACGCTTGTTTCTCTCTCATCTGCCCCTACTGCTATTAGGGCTGCTGCCAACACCTACTG
TCAACTTCTTCTTTCTCAGAGTGACAACAATGTGAAGCTTATTTTGCTCGATCGGTTGAG
TGAGCTTAAGTCATCGCACAGAGATATCATGGTTGAGCTAATAATAGATGTGCTCAGAGT
ACTCTCAAGCCCAAACCTTGATATTCGCAGGAAGACACTTGACATTGCTCTTGATTTGAT
TACTCATCATAACATTAATGAGGTCGTTCAAATGTTGAAGAAAGAAGTTGTGTAGACACA
GAGTGGAGAGCTTGAGAAGAATGGAGAGTACAGACAAATGCTCATTCAAGCAATACATGC
CTGTGCAGTTAAGTTCCCCGAAGTTGCAAGCACAGTGGTCCATCTTCTTATGGATTTCTT
GGGAGATAGCAATGTGGCTTCAGCACTTGACGTGATTTCATTTGTTAGAGAGATAATAGA
AACAAATCCCAAGTTGAGAGTTTCAATCATAACCAGGTTGCTGGACACGTTCTATCAGAT
CCGTGCTGGGAAG*TCTGCCCTTGTGCACTGTGGAT*AATGGGGAGTATTGCCTTTCACT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2CO31JQ 668 0 0
T
TTTTGCTCGATCG**TGAGTGAGCTTAAGTCATCGCACAGAGATATCATGGTTGAGCTAA
TAATAGATGTGCTCAGAGTACTCTCAAGCCCAAACCTTGATATTCGCAGGAAGACACTTG
ACATTGCTCTTGATTTGATTACTCATCATAACATTAATGAGGTCGTTCAAATGTTGAAGA
AAGAAGTTGTGTAGACACAGAGTGGAGAGCTTGAGAAGAATGGAGAGTACAGACAAATGC
TCATTCAAGCAATACATGCCTGTGCAGTTAAGTTCCCCGAAGTTGCAAGCACAGTGGTCC
ATCTTTTTATGGATTTCTTGGGAGATAGCAATGTGGCTTCAGCACTTGACGTGATTTCAT
TTGTTAGAGAGATAATAGAAACAAATCCCAAGTTGAGAGTTTCAATCATAACCAGGTTGC
TGGACACGTTCTATCAGATCCGTGCTGGGAAGGTCTGCCCTTGTGCACTGTGGATTATTG
GGGAGTATTGCCTTTCACTTTCGGAAGTTGAGAGTGGCATTTCAACCATTAAGCAATGCC
TTGGTGATTTACCATTCTACTCTGTTTCTGCGGAATTTGAGCCAACTGAGACTTCGAAGA
AGATTATTTTAACATTGCTCTTTTTAAAATCTATTTTAAATAATTTAATTAATTTTATGT
TCTCACG

QA 2 668 2 668
DS 



AS 1 2

CO CL4330Contig1 1306 2 2 U
GGAAAACACGAAACCCTAATGTCGGAGCTTTCATTGAGTTCGAAGATTTGAACCAAGCGA
TACAGATGATCTCGTTCTACGCGTCGTCGTCAGAGCCTGCTCAGGTTCGAGGCAAAACTG
TGTACCTCCAGTACTCCAACAGGCAGGAGATTGTGAACAACAAGACGGCGGCGGATGTTG
TGGGGAATGTTCTTCTTGTGACGGTGGAAGGGGAGGATGCTCGCATGGTCAGCATTGATG
TTTTGCATCTGGTATTCTCAGCCTTTGGTTTCGTCCACAAGATTACTACTTTCGAGAAGA
CAGCTGGATATCAGGCACTTGTTCAATTTACTGACGCAGAAACTGCAACCTCTGCAAGAA
CTTCCCTCGATGGAAGAAACATCCCTAGTTATCTACTCCCTGAGGAAGTCAGCCCATGCT
CTCTTAAAATCACATATTCAGCTCATACAGATTTGACTGTCAAATTCCAGAGCCATCGGA
GCAGGGACTATACTAATCCTTACCTTCCTGTTGTCCCTTCAGCCATTGATAGTACTGGTC
AGGTGGTTGTGGGGTGTAGACGGGAGGAAAATGGAGCCTGAAAGTAATGTTCTTCTTGCA
TCCATCGAGAACATGCAGTATGCAGTAACCTTGGATGTTTTACACACGGTTTTTGTGGCA
TTTGGAGCTGTTCAAAAGATTGCAATGTTTGACAAGAATGGTGGGGTTCAGGCATTGATT
CAATACCCAGATGTTCAGACAGCTGTGGTGGCGAAAGGAGCATTGGAAGGACACTGTATT
TATGAGGGTGGGTTCTGTAAGCTACACATCACATACTCACGCCACACCGACCTCAGCATT
AAGGTGAACAACGATAGAAGCAGAGACTACACAATGCCTGACCCGGCTGTTGCGATGGCT
CCACAGCCCGGGCATAATCCATACCCAAGTAATTCACCGCAATACCAGGGAGCAGATGCG
AGCCATTACCAGCAGCAGCAGCCACAAGGGGGATGGGGGCAGCAATCAGGAGGGCAAGGT
CACAATCCCTACATGGGAGGACCACCGTCGATGCATCAAGGTGGTCCTGGTGGTTATATG
CCGCCACACCATTATGGTAGTGGCCCTTTTGGTCCAATGCATTAGAATGAAAAAAAAAAG
AAAAAGAGTCCTTTTTATAAGTCGAAAGACAGAAGGTGTTTAATCCCTCTCTTTTTACGC
ATTCCTCTGTTTTCTTAGTTTTGTTGTTGTTCTGTTTATGGAACATGACTTGTACTTGTG
TCCAAAAAGATCATTATCATAAGATTCATAACCATTTGGTTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG43TF U 1
AF RR2CG43JQ C 581
BS 1 644 RR2CG43TF
BS 645 1306 RR2CG43JQ

RD RR2CG43TF 644 0 0
GGAAAACACGAAACCCTAATGTCGGAGCTTTCATTGAGTTCGAAGATTTGAACCAAGCGA
TACAGATGATCTCGTTCTACGCGTCGTCGTCAGAGCCTGCTCAGGTTCGAGGCAAAACTG
TGTACCTCCAGTACTCCAACAGGCAGGAGATTGTGAACAACAAGACGGCGGCGGATGTTG
TGGGGAATGTTCTTCTTGTGACGGTGGAAGGGGAGGATGCTCGCATGGTCAGCATTGATG
TTTTGCATCTGGTATTCTCAGCCTTTGGTTTCGTCCACAAGATTACTACTTTCGAGAAGA
CAGCTGGATATCAGGCACTTGTTCAATTTACTGACGCAGAAACTGCAACCTCTGCAAGAA
CTTCCCTCGATGGAAGAAACATCCCTAGTTATCTACTCCCTGAGGAAGTCAGCCCATGCT
CTCTTAAAATCACATATTCAGCTCATACAGATTTGACTGTCAAATTCCAGAGCCATCGGA
GCAGGGACTATACTAATCCTTACCTTCCTGTTGTCCCTTCAGCCATTGATAGTACTGGTC
AGGTGGTTGTGGGGTGTAGACGGGAGGAAAATGGAGCCTGAAAGTAATGTTCTTCTTGCA
TCCATCGAGAACATGCAGTATGCAGTAACCTTGGATGTTTTACA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2CG43JQ 726 0 0
AAAGTAATGTTCTTCTTGCATCCATCGAGAACATGCAGTATGCAGTAACCTTGGATGTTT
TACACACGGTTTTTGTGGCATTTGGAGCTGTTCAAAAGATTGCAATGTTTGACAAGAATG
GTGGGGTTCAGGCATTGATTCAATACCCAGATGTTCAGACAGCTGTGGTGGCGAAAGGAG
CATTGGAAGGACACTGTATTTATGAGGGTGGGTTCTGTAAGCTACACATCACATACTCAC
GCCACACCGACCTCAGCATTAAGGTGAACAACGATAGAAGCAGAGACTACACAATGCCTG
ACCCGGCTGTTGCGATGGCTCCACAGCCCGGGCATAATCCATACCCAAGTAATTCACCGC
AATACCAGGGAGCAGATGCGAGCCATTACCAGCAGCAGCAGCCACAAGGGGGATGGGGGC
AGCAATCAGGAGGGCAAGGTCACAATCCCTACATGGGAGGACCACCGTCGATGCATCAAG
GTGGTCCTGGTGGTTATATGCCGCCACACCATTATGGTAGTGGCCCTTTTGGTCCAATGC
ATTAGAATGAAAAAAAAAAGAAAAAGAGTCCTTTTTATAAGTCGAAAGACAGAAGGTGTT
TAATCCCTCTCTTTTTACGCATTCCTCTGTTTTCTTAGTTTTGTTGTTGTTCTGTTTATG
GAACATGACTTGTACTTGTGTCCAAAAAGATCATTATCATAAGATTCATAACCATTTGGT
TTTATC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL4331Contig1 1130 2 4 U
GGGACTTCTTCTATTCACACAATTCACGAACACTGCAGGAAGAAGGAGAAGACGAACCTT
CTACGTCTATTCCTCGCATTACGTGAATCGATCAATTGGATCCATTTGGTTTTCGGATCC
GAAGATCCGAATACTCTAAGACGGATCATCTGATGAACCCCGAGATAGCGAGCTTCGATT
ACTGGTTTAATTGGAGAGTGCTTCTCTGCGCGGTATGGGTGCTGGCTCCGATGGTTGTTG
CTCTCTTCGTTATATACAAGTACGAAGATAGTTCTGTTTAAACTCAGCGACGAAACGGTG
ATGATAGTGAAGAACACAGTGATGTTCTTCTGTGCGTTGATGATGCTTGGAGACCTTGTT
TTGAGCGAATCCACCCGGGTTGGTTGCTGGGTTTCCGGATCCTCGCCTTGTGCTTTCTTC
TGGCGACCAACATTGCCCGGCTCGCTCTTCGCGGGTGGCGTATCTACTACTATTACACTC
AGTGGACTTACACGTTGATAGCAATCTACTTTGGGATGGGATCAGTGCTTTCTGTTTACG
GGTGTTTTCAACACAAGAAGCAACTTAGCGCTAGACTAGCGGACGATGCAGAGAGTGGAT
TACGTTTGCCTCTTAATGGGGAGAAAATGGTTTTGCTCGAGAAGAGTAAAGCTTCTGATT
CGAAGGCACTACAGTCCTCTGTCCATCTCTTCCAGATTATATTTCAGATGAGTGCTGGAG
CAGCAGTGCTTACAGACAGTATTTACTGGACCGTGATTTTCCCGTTTCTGTCTTTACAAG
ACTATGAGATGGGTTTCATGACTGTGAATTTGCATACGAGCAACCTCTTTTTGCTGCTCT
GTGACACAACTCTTAACCGTCTGAGGTTTCCCATGTTCAGGTTCGCTTACTTCATCTTGT
GGACAGGATGTTTCGTTATTTTCCAATGGATTCTCCATCTTCCTTCTTATGGACTCTATG
CATTATTCGTCAGAATCAAATACAAACTGAAGAGTTTCGCGTCGTAAGAATCAATCTTCG
TTTCATTTTAAGGGGTTTTCCAACAATGAATGTGAACATAAGTTTATTAGCATATACCCA
TGTCTAAAATTTTCAGAACAGATGAATATAATCACCACAGTTTTCAGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF73TF U 1
AF RR2BF73JQ C 359
BS 1 778 RR2BF73TF
BS 779 779 RR2BF73JQ
BS 780 862 RR2BF73TF
BS 863 1130 RR2BF73JQ

RD RR2BF73TF 862 0 0
GGGACTTCTTCTATTCACACAATTCACGAACACTGCAGGAAGAAGGAGAAGACGAACCTT
CTACGTCTATTCCTCGCATTACGTGAATCGATCAATTGGATCCATTTGGTTTTCGGATCC
GAAGATCCGAATACTCTAAGACGGATCATCTGATGAACCCCGAGATAGCGAGCTTCGATT
ACTGGTTTAATTGGAGAGTGCTTCTCTGCGCGGTATGGGTGCTGGCTCCGATGGTTGTTG
CTCTCTTCGTTATATACAAGTACGAAGATAGTTCTGTTTAAACTCAGCGACGAAACGGTG
ATGATAGTGAAGAACACAGTGATGTTCTTCTGTGCGTTGATGATGCTTGGAGACCTTGTT
TTGAGCGAATCCACCCGGGTTGGTTGCTGGGTTTCCGGATCCTCGCCTTGTGCTTTCTTC
TGGCGACCAACATTGCCCGGCTCGCTCTTCGCGGGTGGCGTATCTACTACTATTACACTC
AGTGGACTTACACGTTGATAGCAATCTACTTTGGGATGGGATCAGTGCTTTCTGTTTACG
GGTGTTTTCAACACAAGAAGCAACTTAGCGCTAGACTAGCGGACGATGCAGAGAGTGGAT
TACGTTTGCCTCTTAATGGGGAGAAAATGGTTTTGCTCGAGAAGAGTAAAGCTTCTGATT
CGAAGGCACTACAGTCCTCTGTCCATCTCTTCCAGATTATATTTCAGATGAGTGCTGGAG
CAGCAGTGCTTACAGACAGTATTTACTGGACCGTGATTTTCCCGTTTCTGTCTTTACA*G
ACTATGAGATGGGTTTCATGACTGTGAATTTGCATACGAGCAACCTCTTTTTGCTGCTCT
GTGACACAACTCTTAACCGTCT

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR2BF73JQ 772 0 0
TTTTGAGCGAATCCACCCGGGTTGGTTGCTGGGTTTCCGGATCCTCGCCTTGTGCTTTCT
TCTGGCGACCAACATTGCCCGGCTCGCTCTTCGCGGGTGGCGTATCTACTACTATTACAC
TCAGTGGACTTACACGTTGATAGCAATCTACTTTGGGATGGGATCAGTGCTTTCTGTTTA
CGGGTGTTTTCAACACAAGAAGCAACTTAGCGCTAGACTAGCGGACGATGCAGAGAGTGG
ATTACGTTTGCCTCTTAATGGGGAGAAAATGGTTTTGCTCGAGAAGAGTAAAGCTTCTGA
TTCGAAGGCACTACAGTCCTCTGTCCATCTCTTCCAGATTATATTTCAGATGAGTGCTGG
AGCAGCAGTGCTTACAGACAGTATTTACTGGACCGTGATTTTCCCGTTTCTGTCTTTACA
AGACTATGAGATGGGTTTCATGACTGTGAATTTGCATACGAGCAACCTCTTTTTGCTGCT
CTGTGACACAACTCTTAACCGTCTGAGGTTTCCCATGTTCAGGTTCGCTTACTTCATCTT
GTGGACAGGATGTTTCGTTATTTTCCAATGGATTCTCCATCTTCCTTCTTATGGACTCTA
TGCATTATTCGTCAGAATCAAATACAAACTGAAGAGTTTCGCGTCGTAAGAATCAATCTT
CGTTTCATTTTAAGGGGTTTTCCAACAATGAATGTGAACATAAGTTTATTAGCATATACC
CATGTCTAAAATTTTCAGAACAGATGAATATAATCACCACAGTTTTCAGGTC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL4332Contig1 656 2 2 U
GAGCTTAGGGATACAGTTCGACCCGTTATACTAGCGGGAAAGAAAGAGACAGTGACAGTC
GCAATGCAAAAGGCAGATAGGTTCAGAACAGAGCTCCTGAGAAGAGGTGTTCTCTTAGTT
CCTGTCGTATGGGGTGAACGTAAAACACAGGAAGTGGAGAAGAAAAGAGGGTTTGGAGCT
TCTTCAAAGGCTGCTGCTGCTGCATCTCTTCCTTCCATTGGGGAAGATTTTGATACAAGG
GCTCAATCGGTAGTTGCTCAGTCAAAGCTGAAAAGTGAAATAAGGTTCAAGCCCGAGATT
GTCTCGCCTGGTGAATGGGAAAGGTGGATAAGAGATCAACAAATAGCTGAAGGTGTTGTC
CCTGGGGAGGATGTGTACATCATACTCCGGTTAGATGGTCGTGTCCGCAGATCGGGTAAA
GGGATGCCTGATTGGGCTGAGATCTCAAATGAGTTGCCGCCCATGGATGACGTGCTCAGC
AAGTTAGAAAGATGAAGCTTTCTTCGCATGTTGTTGACAAGAGACCAGAGAGAGTTACTC
ATAGGAGAAGAAAATCTCTGCGTTGTTTGTATTGTGTACACAAATTCCATGCGATTGTAC
TATATGTGAAGACAAGAAGATTATTGTATTTTCTCAAAAGAAAGTTTTTTTTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2ET75JQ C 1
AF RR2ET75TF U 1
BS 1 653 RR2ET75TF
BS 654 656 RR2ET75JQ

RD RR2ET75JQ 656 0 0
GAGCTTAGGGATACAGTTCGACCCGTTATACTAGCGGGAAAGAAAGAGACAGTGACAGTC
GCAATGCAAAAGGCAGATAGGTTCAGAACAGAGCTCCTGAGAAGAGGTGTTCTCTTAGTT
CCTGTCGTATGGGGTGAACGTAAAACACAGGAAGTGGAGAAGAAAAGAGGGTTTGGAGCT
TCTTCAAAGGCTGCTGCTGCTGCATCTCTTCCTTCCATTGGGGAAGATTTTGATACAAGG
GCTCAATCGGTAGTTGCTCAGTCAAAGCTGAAAAGTGAAATAAGGTTCAAGCCCGAGATT
GTCTCGCCTGGTGAATGGGAAAGGTGGATAAGAGATCAACAAATAGCTGAAGGTGTTGTC
CCTGGGGAGGATGTGTACATCATACTCCGGTTAGATGGTCGTGTCCGCAGATCGGGTAAA
GGGATGCCTGATTGGGCTGAGATCTCAAATGAGTTGCCGCCCATGGATGACGTGCTCAGC
AAGTTAGAAAGATGAAGCTTTCTTCGCATGTTGTTGACAAGAGACCAGAGAGAGTTACTC
ATAGGAGAAGAAAATCTCTGCGTTGTTTGTATTGTGTACACAAATTCCATGCGATTGTAC
TATATGTGAAGACAAGAAGATTATTGTATTTTCTCAAAAGAAAGTTTTTTTTTTCC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2ET75TF 655 0 0
GAGCTTAGGGATACAGTTCGACCCGTTATACTAGCGGGAAAGAAAGAGACAGTGACAGTC
GCAATGCAAAAGGCAGATAGGTTCAGAACAGAGCTCCTGAGAAGAGGTGTTCTCTTAGTT
CCTGTCGTATGGGGTGAACGTAAAACACAGGAAGTGGAGAAGAAAAGAGGGTTTGGAGCT
TCTTCAAAGGCTGCTGCTGCTGCATCTCTTCCTTCCATTGGGGAAGATTTTGATACAAGG
GCTCAATCGGTAGTTGCTCAGTCAAAGCTGAAAAGTGAAATAAGGTTCAAGCCCGAGATT
GTCTCGCCTGGTGAATGGGAAAGGTGGATAAGAGATCAACAAATAGCTGAAGGTGTTGTC
CCTGGGGAGGATGTGTACATCATACTCCGGTTAGATGGTCGTGTCCGCAGATCGGGTAAA
GGGATGCCTGATTGGGCTGAGATCTCAAATGAGTTGCCGCCCATGGATGACGTGCTCAGC
AAGTTAGAAAGATGAAGCTTTCTTCGCATGTTGTTGACAAGAGACCAGAGAGAGTTACTC
ATAGGAGAAGAAAATCTCTGCGTTGTTTGTATTGTGTACACAAATTCCATGCGATTGTAC
TATATGTGAAGACAAGAAGATTATTGTATTTTCTCAAAAGAAAGTTTTTTTTT
CC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL4333Contig1 798 2 10 U
CCAAATTTCAAATTCAATATACCTCCTTAATGGCTTCCCATGAATAACGCCAACAAAGCA
ACAATGGTATTTTATTTTTTAATTATACACTGATTCAGCGGTTAATAATTCAAAAATAGA
CAAACTATATACATAATAAAACTAATCATGGAAGATAAATCACTACCATAATTATTATTT
TTTTATCAACTAATTAATTCACTTCATGAAACCTTGAGCCATCTTAGCATAGTCACCTAA
CCCATGGCTACCACCTCCCGACTTCTCATCCTCTTTCTTAGCCGCATGTTCTCCAGCTCC
TCCCCCGTGGCTTCCGCTGACACCACCGTGGCTTCCTCCGGCGCCACCAAAGGAGTGAGC
GTGTGAAGTTTCGTACTTGTGGAGATAATTTTCAGCCTTCTCGAGGTACTGACCAATACC
GCTCTTTTCATCGAACTTACCGTATCTTTGAGCTGCGTCTAGTATGTCAGCAGTGGCTCC
AGCGACTTTAGCTTTGTCGAGCTTGTCTGACTCGTTACGAGAAGCGGCTTGAGCAGCCTC
GGCTACGATCTTGGCACTAGCCATGAGCTCGGCGTTCGTAGCTGGCTTATGTGCCGTTGG
GTCGGAGCTGGAAGCCGGTTTATGTGTGGGATCGGTGTGGCCTGGTTTGTTATGTTGTGG
TTTGGATCCGGGTCTGAAGTTTCCGGTTTCTTGTCGGAGAACTTATTCTTTACTTGATCG
GTGAGGAAATCCATGGTTCTTGTCTTGTCTCGAACGATTTTTTTGTGCTTTAGTTAAGCT
TGAATTTGGAAAATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD27JQ U 1
AF RR2AS69TF C 77
BS 1 119 RR2BD27JQ
BS 120 120 RR2AS69TF
BS 121 186 RR2BD27JQ
BS 187 187 RR2AS69TF
BS 188 234 RR2BD27JQ
BS 235 235 RR2AS69TF
BS 236 347 RR2BD27JQ
BS 348 348 RR2AS69TF
BS 349 545 RR2BD27JQ
BS 546 798 RR2AS69TF

RD RR2BD27JQ 545 0 0
CCAAATTTCAAATTCAATATACCTCCTTAATGGCTTCCCATGAATAACGCCAACAAAGCA
ACAATGGTATTTTATTTTTTAATTATACACTGATTCAGCGGTTAATAATTCAAAAATAG*
CAAACTATATACATAATAAAACTAATCATGGAAGATAAATCACTACCATAATTATTATTT
TTTTATTAACTAATTAATTCACTTCATGAAACCTTGAGCCATCTTAGCATAGTCTCCTAA
CCCATGGCTACCACCTCCCGACTTCTCATCCTCTTTCTTAGCCGCATGTTCTCCAGCTCC
TCCCCCGTGGCTTCCGCTGACACCACCGTGGCTTCCTCCGGCGCCACTAAAGGAGTGAGC
GTGTGAAGTTTCGTACTTGTGGAGATAATTTTCAGCCTTCTCGAGGTACTGACCAATACC
GCTCTTTTCATCGAACTTACCGTATCTTTGAGCTGCGTCTAGTATGTCAGCAGTGGCTCC
AGCGACTTTAGCTTTGTCGAGCTTGTCTGACTCGTTACGAGAAGCGGCTTGAGCAGCCTC
GGCTA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2AS69TF 722 0 0
TTATAG
TTATACACTGATTCAGCGGTTAATAATTCAGAAATAGACAAACTATATACATAATAAAAC
TAATCATGGAAGATAAATCACTACCATAATTATTATTTTTTTATCAACTAATTAATTCAC
TTCATGAAACCTTGAGCCATCTTAGCATAGTCACCTAACCCATGGCTACCACCTCCCGAC
TTCTCATCCTCTTTCTTAGCCGCATGTTCTCCAGCTCCTCCTCCGTGGCTTCCGCTGACA
CCACCGTGGCTTCCTCCGGCGCCGCCAGTGGAGTGAGTGTGTGAAGTTTCGTACTTGTGG
AGATAATTTTCAGCCTTCTCGAGGTACTGACCAATACCGCTCTTTTCATCGAACTTACCG
TATCTTTGAGCTGCGTCTAGTATGTCAGCAGTGGCTCCGGCGACTTTAGCTTTGTCGAGC
TTGTCTGTCTCGTTACGTGAAG*GGCTTGAGCAGCCTCGGCTACGATCTTGGCACTAGCC
ATGAGCTCGGCGTTCGTAGCTGGCTTATGTGCCGTTGGGTCGGAGCTGGAAGCCGGTTTA
TGTGTGGGATCGGTGTGGCCTGGTTTGTTATGTTGTGGTTTGGATCCGGGTCTGAAGTTT
CCGGTTTCTTGTCGGAGAACTTATTCTTTACTTGATCGGTGAGGAAATCCATGGTTCTTG
TCTTGTCTCGAACGATTTTTTTGTGCTTTAGTTAAGCTTGAATTTGGAAAATGTCC

QA 7 722 7 722
DS 



AS 1 2

CO CL4334Contig1 544 2 2 U
GGGCCCTGCTTCTCCGTCGAGGTTATTGTGTCGTCTCCCGGAGATTTGCATTGAATTCGA
TCGCTCCTAAGTCAAGTCAGCTGAATCTCGAGATGGTTTACATAGTTTCATGGGACGAAT
TCGTAGATCGATCTGTTCAGCTTTTCAAAGCTGACCCCGAATCTACTAGGTATGTTGTCA
AGTATAGACATTGTGATGGCAAGCTAGTTTTGAAGGTTACTGATAACAAAGAGTGTCTCA
AGTTCAAGACAGACCAAGCACAAGAAGCAAAGAAGATGGAGAAACTGAATAACATATTCT
TCACCCTCATGGCCAGAGGACCTGATGTTGATCTTTCTGAAGTGAACGGGAAAGAACAGA
TGGAGACACAACCTGTGAAGAAAGGCAGAGGAAGGAAGCAATAAGTCCCATGATTCTGTT
TTTCTTTCTTTTTTTTCTTTTTTGGTATCAAGATTTTGATCCATTTTTGGGGGATATTTT
GAGATGGGGATTGTGATGATAGGATAATTAAATATTTGTTCTAATTTAAGCTGACTTTGG
CTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2D981JQ C 1
AF RR2D981TF U 42
BS 1 41 RR2D981JQ
BS 42 544 RR2D981TF

RD RR2D981JQ 544 0 0
GGGCCCTGCTTCTCCGTCGAGGTTATTGTGTCGTCTCCCGGAGATTTGCATTGAATTCGA
TCGCTCCTAAGTCAAGTCAGCTGAATCTCGAGATGGTTTACATAGTTTCATGGGACGAAT
TCGTAGATCGATCTGTTCAGCTTTTCAAAGCTGACCCCGAATCTACTAGGTATGTTGTCA
AGTATAGACATTGTGATGGCAAGCTAGTTTTGAAGGTTACTGATAACAAAGAGTGTCTCA
AGTTCAAGACAGACCAAGCCCAAGAAGCAAAGAAGATGGAGAAACTGAATAACATATTCT
TCACCCTCATGGCCAGAGGACCTGATGTTGATCTTTCTGAAGTGAACGGGAAAGAACAGA
TGGAGACACAACCTGTGAAGAAAGGCAGAGGAAGGAAGCAATAAGTCCCATGATTCTGTT
TTTCTTTCTTTTTTTTCTTTTTTGGTATCAAGATTTTGATCCATTTTTGGGGGATATTTT
GAGATGGGGATTGTGATGATAGGATAATTAAATATTTGTTCTAATTTAAGCTGACTTTGG
CTCG

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2D981TF 503 0 0
AGATTTGCATTGAATTCGATCGCTCCTAAGTCAAGTCAGCTGAATCTCGAGATGGTTTAC
ATAGTTTCATGGGACGAATTCGTAGATCGATCTGTTCAGCTTTTCAAAGCTGACCCCGAA
TCTACTAGGTATGTTGTCAAGTATAGACATTGTGATGGCAAGCTAGTTTTGAAGGTTACT
GATAACAAAGAGTGTCTCAAGTTCAAGACAGACCAAGCACAAGAAGCAAAGAAGATGGAG
AAACTGAATAACATATTCTTCACCCTCATGGCCAGAGGACCTGATGTTGATCTTTCTGAA
GTGAACGGGAAAGAACAGATGGAGACACAACCTGTGAAGAAAGGCAGAGGAAGGAAGCAA
TAAGTCCCATGATTCTGTTTTTCTTTCTTTTTTTTCTTTTTTGGTATCAAGATTTTGATC
CATTTTTGGGGGATATTTTGAGATGGGGATTGTGATGATAGGATAATTAAATATTTGTTC
TAATTTAAGCTGACTTTGGCTCG

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL4335Contig1 843 2 10 U
GGGAGAGACCATCAACGATCGTGATAGGTGTCCACAGTGCAAAGGAGAGAAGGTTGTCTC
CGAGAAGAAGGTGCTTGAAGTAGCTGTGGAGAAGGGAATGCAGCACAGTCAAAAGATCAC
TTTCAGAGGACAAGCAGATGAAGCGCCTGATACGGTTACTGGAGATATAGTGTTCGTCAT
TCAGCAGAAGGAGCACCCAACCTTCAAGAGAAAGGGAGATGATCTCTTCGTGGAGCACAC
CCTCTCCCTAACCGAAGCCCTCTGTGGGTTCCAGTTTGTCTTGACTCACTTGGACACAAG
ACAGCTTCTCATCAAATCGCATCCTGGAGAGTGTGTGAAGCCAGATTCATACAGGGCGAT
AAGCGACGAGGGAATACCGATACACCAAAGGCCCTTCATGAAGGGCAAGCTGTACATCCA
CTTCACTGTGGAGTTCCCAGACTCGCTGGGCCCGAACCAGACAAAGGCCATTGAAGCGGT
TTTGCCGAAGCCAGCGAAGGCGACTCTGAGCGACATGGAGATAGACGAGTGCGAAGAAAC
GACGCTGCACGATGTGGACATGGAGGATGAGATGAGAAAGAAGGCTCGTGCTCAGAGAGA
GGCTTATGATGATGACGACGATGATGAAGAAAGTCCAGGAGGTGCTCAGCGTGTGCAATG
TGCCCAGCAGTGATATCCAAAATGCTGGTTACGATTTTTTTTTAATAGACTTTTGCCGGT
TCTGTGGCAAGAAACTCGTGTTCTTATTCAAAATGCTGGTCAAGATCTTTTGTTTTTTGT
TTTTGGTTTTTTTTTTTCAGAATAAACTTTTACTACTAGTTGTCGAGATCTTGTCATTAC
CGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2AU18TF U 1
AF RR2CY71TF U 195
BS 1 375 RR2AU18TF
BS 376 376 RR2CY71TF
BS 377 537 RR2AU18TF
BS 538 538 RR2CY71TF
BS 539 641 RR2AU18TF
BS 642 642 RR2CY71TF
BS 643 702 RR2AU18TF
BS 703 703 RR2CY71TF
BS 704 715 RR2AU18TF
BS 716 843 RR2CY71TF

RD RR2AU18TF 715 0 0
GGGAGAGACCATCAACGATCGTGATAGGTGTCCACAGTGCAAAGGAGAGAAGGTTGTCTC
CGAGAAGAAGGTGCTTGAAGTAGCTGTGGAGAAGGGAATGCAGCACAGTCAAAAGATCAC
TTTCAGAGGACAAGCAGATGAAGCGCCTGATACGGTTACTGGAGATATAGTGTTCGTCAT
TCAGCAGAAGGAGCACCCAACCTTCAAGAGAAAGGGAGATGATCTCTTCGTGGAGCACAC
CCTCTCCCTAACCGAAGCCCTCTGTGGGTTCCAGTTTGTCTTGACTCACTTGGACACAAG
ACAGCTTCTCATCAAATCGCATCCTGGAGAGTGTGTGAAGCCAGATTCATACAGGGCGAT
AAGCGACGAGGGAATGCCGATACACCAAAGGCCCTTCATGAAGGGCAAGCTGTACATCCA
CTTCACTGTGGAGTTCCCAGACTCGCTGGGCCCGAACCAGACAAAGGCCATTGAAGCGGT
TTTGCCGAAGCCAGCGAAGGCGACTCTGAGCGACATGGAGATAGACGAGTGCGAAGAGAC
GACGCTGCACGATGTGGACATGGAGGATGAGATGAGAAAGAAGGCTCGTGCTCAGAGAGA
GGCTTATGATGATGACGACGATGATGAAGAAAGTCCAGGAG*TGCTCAGCGTGTGCAATG
TGCCCAGCAGTGATATCCAAAATGCTGGTTACGATTTTTTTT*AATAGACTTTTG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2CY71TF 649 0 0
G
CCCAACCTTCAAGAGAAAGGGAGATGATCTCTTCGTGGAGCACACCCTCTCCCTAACCGA
AGCCCTCTGTGGGTTCCAGTTTGTCTTGACTCACTTGGACACAAGACAGCTTCTCATCAA
ATCGCATCCTGGAGAGTGTGTGAAGCCAGATTCATACAGGGCGATAAGCGACGAGGGAAT
ACCGATACACCAAAGGCCCTTCATGAAGGGCAAGCTGTACATCCACTTCACTGTGGAGTT
CCCAGACTCGCTGGGCCCGAACCAGACAAAGGCCATTGAAGCGGTTTTGCCGAAGCCAGC
GAAGGCGACTCTGAGCGACATGGAGATAGACGAGTGCGAAGAAACGACGCTGCACGATGT
GGACATGGAGGATGAGATGAGAAAGAAGGCTCGTGCTCAGAGAGAGGCTTATGATGATGA
CGACGATGATGAAGAAGGTCCAGGAGGTGCTCAGCGTGTGCAATGTGCCCAGCAGTGATA
TCCAAAATGCTGGTTACGATTTTTTTTTAATAGACTTTTGCCGGTTCTGTGGCAAGAAAC
TCGTGTTCTTATTCAAAATGCTGGTCAAGATCTTTTGTTTTTTGTTTTTGGTTTTTTTTT
TTCAGAATAAACTTTTACTACTAGTTGTCGAGATCTTGTCATTACCGC

QA 2 649 2 649
DS 



AS 1 2

CO CL4336Contig1 667 2 2 U
GGCCCCGTCCCCGGTCCTCTTTCCAAACTCAAACAAGCTCTCTTCTCTCTGTCTCTCTTC
TCTCTGATTATCTCTCTAACGCATGAGAGAACAAACTCATCTCACAATCTCAGCCTCTCC
GGAATATTCTCTTGCTGTTACCATTGGGACAAACATCGCTCTCTCCGCCGTTCTCTGGCC
AATGCCTCCGCTGACATTGAGTCCTCTCTGTTCAAACCTAGACCTCCTTTTCCAGATTTG
AAGAAGCCCCAGGATCTAAGCATAACGGTGTTGATGCCTGGAGATAATACGCCTAAATTT
ATAGCATTGCCGTGTCCATGCGCCCCGCCTCGGCCGGAGAAGCTTACCGTTGATGTTCAA
AGTCCACCACACTCACCGCCTGTTAAGCCCCCGCGTTTTCCAGTTCCTCTTTGCTAGGTT
TAATCAGCTAAAAGATAACACAAAGGAGAAAAAAGTCAAAATATCTCGTTTTGATGTACA
TATGAATCATAATTTTTTTTTCTTTTGAAACTATCATAAATTTAATTTTGTTCACTGATT
TATTACTATGTATTCAGTTGGCAACATTATGAAGTGGTTTGAATGTGTGATTTTTTTAAT
AGAGAATGACACTTATATTAATCAAATAATGATGTAGTTAGATGTTAATTTTGAAAACAT
GATTGGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR48TF U 1
AF RR2FR48JQ C 1
BS 1 653 RR2FR48TF
BS 654 667 RR2FR48JQ

RD RR2FR48TF 653 0 0
GGCCCCGTCCCCGGTCCTCTTTCCAAACTCAAACAAGCTCTCTTCTCTCTGTCTCTCTTC
TCTCTGATTATCTCTCTAACGCATGAGAGAACAAACTCATCTCACAATCTCAGCCTCTCC
GGAATATTCTCTTGCTGTTACCATTGGGACAAACATCGCTCTCTCCGCCGTTCTCTGGCC
AATGCCTCCGCTGACATTGAGTCCTCTCTGTTCAAACCTAGACCTCCTTTTCCAGATTTG
AAGAAGCCCCAGGATCTAAGCATAACGGTGTTGATGCCTGGAGATAATACGCCTAAATTT
ATAGCATTGCCGTGTCCATGCGCCCCGCCTCGGCCGGAGAAGCTTACCGTTGATGTTCAA
AGTCCACCACACTCACCGCCTGTTAAGCCCCCGCGTTTTCCAGTTCCTCTTTGCTAGGTT
TAATCAGCTAAAAGATAACACAAAGGAGAAAAAAGTCAAAATATCTCGTTTTGATGTACA
TATGAATCATAATTTTTTTTTCTTTTGAAACTATCATAAATTTAATTTTGTTCACTGATT
TATTACTATGTATTCAGTTGGCAACATTATGAAGTGGTTTGAATGTGTGATTTTTTTAAT
AGAGAATGACACTTATATTAATCAAATAATGATGTAGTTAGATGTTAATTTTG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2FR48JQ 667 0 0
GGCCCCGTCCCCGGTCCTCTTTCCAAACTCAAACAAGCTCTCTTCTCTCTGTCTCTCTTC
TCTCTGATTATCTCTCTAACGCATGAGAGAACAAACTCATCTCACAATCTCAGCCTCTCC
GGAATATTCTCTTGCTGTTACCATTGGGACAAACATCGCTCTCTCCGCCGTTCTCTGGCC
AATGCCTCCGCTGACATTGAGTCCTCTCTGTTCAAACCTAGACCTCCTTTTCCAGATTTG
AAGAAGCCCCAGGATCTAAGCATAACGGTGTTGATGCCTGGAGATAATACGCCTAAATTT
ATAGCATTGCCGTGTCCATGCGCCCCGCCTCGGCCGGAGAAGCTTACCGTTGATGTTCAA
AGTCCACCACACTCACCGCCTGTTAAGCCCCCGCGTTTTCCAGTTCCTCTTTGCTAGGTT
TAATCAGCTAAAAGATAACACAAAGGAGAAAAAAGTCAAAATATCTCGTTTTGATGTACA
TATGAATCATAATTTTTTTTTCTTTTGAAACTATCATAAATTTAATTTTGTTCACTGATT
TATTACTATGTATTCAGTTGGCAACATTATGAAGTGGTTTGAATGTGTGATTTTTTTAAT
AGAGAATGACACTTATATTAATCAAATAATGATGTAGTTAGATGTTAATTTTGAAAACAT
GATTGGT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL4337Contig1 1179 2 4 U
GAACAACAAGACAGTCCCCCTTAAGCGGCTTTCACCAAATAGGGTTTAAGCTCGATGGCG
ACGACGACGACCTTGAACCGACTCCTGAAGCAGAAATGTAGATCAGTCTCTTCTGCTCTC
TCGCATCAAGTCCTTTTCAATTTCACTCGCCACGACGCTCTCCCTTGTCAGCAAATACCA
GCTCTTCGATCAACCACCCGCTCGTTCCTCGACTTCTATCAGTTTTGGAACAAGAAAGCA
ATCGAGGACGAACGTGCTAGACTTAATGATGAGATGAATCGGGGATACTTTGCTGATATG
AAAGAGTTCAAGGAACATGGCGGTAAGATAGCTGCTGCTAGTGAGACTTTGATTCCTGCT
GCGTCTGCCATGAAGTTTCCGGTGTTAGCAGTGACTTTCTCTAATGGAAAAAGCATGAAG
CTGCCTATTAATTCCAACAGTAACGAGGTTGATAAAGAGAGTTTGGCTGTTCCTAAGGTG
ACGTTGGTGTGTCTGTCTTTCCGAGCTAGCTCTCAGGAAATGATCAGCTCGTGGAGCAAA
CCATTTATTAAATCGTTTGGCGACAGGAAAGATCTTCAGTTGTTCGAGGTTTCGTTTATA
GACAAATGGCTGCTGGGGTTAGCTCCCATAAAGAAACTACTTCTCCGAGTCTTGCAAAAA
CCGAACAACAGCGAGAACAGTATCCTCCAGAGGCAGGTTGTTTACTCATTTGGGGACCAT
TATCACTTCAGAAAGCAAATGAAAGTTCTGAACCTTCTCACCGGGTACATTCTCCTACTC
GACAAATCCGGGAGAATAAGATGTCAAGGTTTTGGAACAGCAACTCCAGAGGAAGTATCT
CAACTTCTCTCTTGCACCTCACTTCTCTTGAAAGATCAATGAGAGATCGCTGCTTAAACC
AGAGGATGTCTCAAAAAAGACAATTGCTCCTTTACAGAAGGGCTTCCAGAAGAAAATAAA
CTCTCTCTTATTCCTTGTTCTGATTGGATTAGTGTTATCGCCATATTCAAAGGCAACAGA
GAATCCTATCTTCCAATCTATATTGGTGTTCAAAGACTAAAAGAGGGCACTCTTCAGTTC
TTTTTTCTTTCAGATACTTTTGTTGTATTCATTATGAGAACACCACCTAATGGCCAAAAA
CTTTGTCTTATACAATTAGAGTAAAAAAGATTAAAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU02TF U 1
AF RR2CU02JQ C 436
BS 1 659 RR2CU02TF
BS 660 660 RR2CU02JQ
BS 661 688 RR2CU02TF
BS 689 1179 RR2CU02JQ

RD RR2CU02TF 688 0 0
GAACAACAAGACAGTCCCCCTTAAGCGGCTTTCACCAAATAGGGTTTAAGCTCGATGGCG
ACGACGACGACCTTGAACCGACTCCTGAAGCAGAAATGTAGATCAGTCTCTTCTGCTCTC
TCGCATCAAGTCCTTTTCAATTTCACTCGCCACGACGCTCTCCCTTGTCAGCAAATACCA
GCTCTTCGATCAACCACCCGCTCGTTCCTCGACTTCTATCAGTTTTGGAACAAGAAAGCA
ATCGAGGACGAACGTGCTAGACTTAATGATGAGATGAATCGGGGATACTTTGCTGATATG
AAAGAGTTCAAGGAACATGGCGGTAAGATAGCTGCTGCTAGTGAGACTTTGATTCCTGCT
GCGTCTGCCATGAAGTTTCCGGTGTTAGCAGTGACTTTCTCTAATGGAAAAAGCATGAAG
CTGCCTATTAATTCCAACAGTAACGAGGTTGATAAAGAGAGTTTGGCTGTTCCTAAGGTG
ACGTTGGTGTGTCTGTCTTTCCGAGCTAGCTCTCAGGAAATGATCAGCTCGTGGAGCAAA
CCATTTATTAAATCGTTTGGCGACAGGAAAGATCTTCAGTTGTTCGAGGTTTCGTTTATA
GACAAATGGCTGCTGGGGTTAGCTCCCATAAAGAAACTACTTCTCCGAGTCTTGCAAAA*
CCGAACAACAGCGAGAACAGTATCCTCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2CU02JQ 744 0 0
AACAGTAACGAGGT*GATAAAGAGAGTTTGGCTGTTCCTAAGGTGACGTTGGTGTGTCTG
TCTTTCCGAGCTAGCTCTCAGGAAATGATCAGCTCGTGGAGCAAACCATTTATTAAATCG
TTTGGCGACAGGAAAGATCTTCAGTTGTTCGAGGTTTCGTTTATAGACAAATGGCTGCTG
GGGTTAGCTCCCATAAAGAAACTACTTCTCCGAGTCTTGCAAAAACCGAACAACAGCGAG
AACAGTATCCTCCAGAGGCAGGTTGTTTACTCATTTGGGGACCATTATCACTTCAGAAAG
CAAATGAAAGTTCTGAACCTTCTCACCGGGTACATTCTCCTACTCGACAAATCCGGGAGA
ATAAGATGTCAAGGTTTTGGAACAGCAACTCCAGAGGAAGTATCTCAACTTCTCTCTTGC
ACCTCACTTCTCTTGAAAGATCAATGAGAGATCGCTGCTTAAACCAGAGGATGTCTCAAA
AAAGACAATTGCTCCTTTACAGAAGGGCTTCCAGAAGAAAATAAACTCTCTCTTATTCCT
TGTTCTGATTGGATTAGTGTTATCGCCATATTCAAAGGCAACAGAGAATCCTATCTTCCA
ATCTATATTGGTGTTCAAAGACTAAAAGAGGGCACTCTTCAGTTCTTTTTTCTTTCAGAT
ACTTTTGTTGTATTCATTATGAGAACACCACCTAATGGCCAAAAACTTTGTCTTATACAA
TTAGAGTAAAAAAGATTAAAGACC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL4338Contig1 715 2 2 U
GAGAAGAGTAGCGAGTACAGAGGAATCAGGAGACGTCCATGGGGAAGATGGGCGGCTGAT
ATTCGCGATCCGATAAAAGGAGTTCGAGTTTGGCTGGGGACGTTCAACACTGCAGAAGAT
GCTGCGAGAGCTTATGACCTTGAAGCTAAGAGGATCCGTGGAGCTAAAGCTAAGCTCAAC
TTCCCTAACGAATCACCTTCAAGAAAACGTAAATCTTCTTCTTCTTCTTCAAAACAGCCT
CCTCAGGTTAAGGTAGAGGAGAAGCGTGAGGAGGTTGGAATGGCGTGTAGTAGCCTGTGG
GAGGGGGACACGATTCAGGTCGATACACAGTGGCTTGAAGAAGCCATCAAGGGCGGTGAG
AAGAGACAGAAGGGTTGTGATGGTGATGGTGAAGGTGACGACGTGAATGCTCAGCTTTCG
GAAGAGCTTCTTGCTTTTGAGAAAGAGACGGAGTGTTTCTTCCAGATGCCGTTTATGGAG
GGGGGAAACTGTGGTTCGTCTTCGACAACATCTATGACCAGTGTCTTTGAGGGAGATGAT
GTCTTGGATCTTTGGTATTGAATGGTTCTTTTGTACTTTTAGTGAAATGATCATATGAGT
CTTTTGGTGTTGTATTTGTACAAGTCAGATTCTCGTTCGGCTTGTGTGTGTGTGTATTTG
ACTATTGTAACTGTGATTCTTCTACCTTGTCAATGTAAAATAGCTCAAGTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2FT86TF U 1
AF RR2FT86JQ C 216
BS 1 714 RR2FT86TF
BS 715 715 RR2FT86JQ

RD RR2FT86TF 714 0 0
GAGAAGAGTAGCGAGTACAGAGGAATCAGGAGACGTCCATGGGGAAGATGGGCGGCTGAT
ATTCGCGATCCGATAAAAGGAGTTCGAGTTTGGCTGGGGACGTTCAACACTGCAGAAGAT
GCTGCGAGAGCTTATGACCTTGAAGCTAAGAGGATCCGTGGAGCTAAAGCTAAGCTCAAC
TTCCCTAACGAATCACCTTCAAGAAAACGTAAATCTTCTTCTTCTTCTTCAAAACAGCCT
CCTCAGGTTAAGGTAGAGGAGAAGCGTGAGGAGGTTGGAATGGCGTGTAGTAGCCTGTGG
GAGGGGGACACGATTCAGGTCGATACACAGTGGCTTGAAGAAGCCATCAAGGGCGGTGAG
AAGAGACAGAAGGGTTGTGATGGTGATGGTGAAGGTGACGACGTGAATGCTCAGCTTTCG
GAAGAGCTTCTTGCTTTTGAGAAAGAGACGGAGTGTTTCTTCCAGATGCCGTTTATGGAG
GGGGGAAACTGTGGTTCGTCTTCGACAACATCTATGACCAGTGTCTTTGAGGGAGATGAT
GTCTTGGATCTTTGGTATTGAATGGTTCTTTTGTACTTTTAGTGAAATGATCATATGAGT
CTTTTGGTGTTGTATTTGTACAAGTCAGATTCTCGTTCGGCTTGTGTGTGTGTGTATTTG
ACTATTGTAACTGTGATTCTTCTACCTTGTCAATGTAAAATAGCTCAAGTTTTG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2FT86JQ 500 0 0
TTCTTCTTCTTCTTCAAAACAGCCTCCTCAGGTTAAGGTAGAGGAGAAGCGTGAGGAGGT
TGGAATGGCGTGTAGTAGCCTGTGGGAGGGGGACACGATTCAGGTCGATACACAGTGGCT
TGAAGAAGCCATCAAGGGCGGTGAGAAGAGACAGAAGGGTTGTGATGGTGATGGTGAAGG
TGACGACGTGAATGCTCAGCTTTCGGAAGAGCTTCTTGCTTTTGAGAAAGAGACGGAGTG
TTTCTTCCAGATGCCGTTTATGGAGGGGGGAAACTGTGGTTCGTCTTCGACAACATCTAT
GACCAGTGTCTTTGAGGGAGATGATGTCTTGGATCTTTGGTATTGAATGGTTCTTTTGTA
CTTTTAGTGAAATGATCATATGAGTCTTTTGGTGTTGTATTTGTACAAGTCAGATTCTCG
TTCGGCTTGTGTGTGTGTGTATTTGACTATTGTAACTGTGATTCTTCTACCTTGTCAATG
TAAAATAGCTCAAGTTTTGT

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 2

CO CL4339Contig1 679 2 2 U
GGGGGTTGGAAGCATGGAGCCACCACCGAGTTCGCGACCGGAGGAACCTCCGTCATGGGA
CGAACTTTACAAAATCAATCTAATGCCATCGGAGCTGTTTCTCAAGTTCCGAAAGGAGCT
CCAAGGCCTTCGCGTTGGCGTCAACCTCGAGTTGTATAACGAACCCACGAATGATTACCA
CGCAAAGCTTGTTTTGAAGCCACTATCACCAGAAAGGAATTGGAAGTTTATTTATGAGCC
TTTACACCAAGAAGTTCGTGTTCTTTCAAAGAAGATTCCTATCACCAGATTTCTCAACCT
CCAGGTTGGTGTGGGGCATAACTTTCAGATGAATGCAATGGGTTGGAAATGGAAGCTTAC
CTCTTGTTTGGGTGGAGATGGTGTGTCTCGGATCCGAAACAAAACCACTCTTGGTTTGAC
TCCTGGTGTCGATTTACGGTTTGGTTGGAGAGCTGATTTTGTACTCCCTGAAGTTACTGG
AGCTCTTGGTACTGAAGAACCGTTATTCAACATGAGCTCAGGGCGTTTAGAGGCATCACT
GGATAGAGTAGAAGCCATTTTAACACATTCCGAATATCTATAACCAATTACTTGTGTGGT
TTCTTTCAAACTAGTCACTATCATCTGATAAACTGTTTGTTCTTGGTTTTATATTGAGAT
AGTCTTTGTTTTAGGGGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF63JQ C 1
AF RR2AF63TF U 1
BS 1 669 RR2AF63TF
BS 670 679 RR2AF63JQ

RD RR2AF63JQ 679 0 0
GGGGGTTGGAAGCATGGAGCCACCACCGAGTTCGCGACCGGAGGAACCTCCGTCATGGGA
CGAACTTTACAAAATCAATCTAATGCCATCGGAGCTGTTTCTCAAGTTCCGAAAGGAGCT
CCAAGGCCTTCGCGTTGGCGTCAACCTCGAGTTGTATAACGAACCCACGAATGATTACCA
CGCAAAGCTTGTTTTGAAGCCACTATCACCAGAAAGGAATTGGAAGTTTATTTATGAGCC
TTTACACCAAGAAGTTCGTGTTCTTTCAAAGAAGATTCCTATCACCAGATTTCTCAACCT
CCAGGTTGGTGTGGGGCATAACTTTCAGATGAATGCAATGGGTTGGAAATGGAAGCTTAC
CTCTTGTTTGGGTGGAGATGGTGTGTCTCGGATCCGAAACAAAACCACTCTTGGTTTGAC
TCCTGGTGTCGATTTACGGTTTGGTTGGAGAGCTGATTTTGTACTCCCTGAAGTTACTGG
AGCTCTTGGTACTGAAGAACCGTTATTCAACATGAGCTCAGGGCGTTTAGAGGCATCACT
GGATAGAGTAGAAGCCATTTTAACACATTCCGAATATCTATAACCAATTACTTGTGTGGT
TTCTTTCAAACTAGTCACTATCATCTGATAAACTGTTTGTTCTTGGTTTTATATTGAGAT
AGTCTTTGTTTTAGGGGTT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2AF63TF 669 0 0
GGGGGTTGGAAGCATGGAGCCACCACCGAGTTCGCGACCGGAGGAACCTCCGTCATGGGA
CGAACTTTACAAAATCAATCTAATGCCATCGGAGCTGTTTCTCAAGTTCCGAAAGGAGCT
CCAAGGCCTTCGCGTTGGCGTCAACCTCGAGTTGTATAACGAACCCACGAATGATTACCA
CGCAAAGCTTGTTTTGAAGCCACTATCACCAGAAAGGAATTGGAAGTTTATTTATGAGCC
TTTACACCAAGAAGTTCGTGTTCTTTCAAAGAAGATTCCTATCACCAGATTTCTCAACCT
CCAGGTTGGTGTGGGGCATAACTTTCAGATGAATGCAATGGGTTGGAAATGGAAGCTTAC
CTCTTGTTTGGGTGGAGATGGTGTGTCTCGGATCCGAAACAAAACCACTCTTGGTTTGAC
TCCTGGTGTCGATTTACGGTTTGGTTGGAGAGCTGATTTTGTACTCCCTGAAGTTACTGG
AGCTCTTGGTACTGAAGAACCGTTATTCAACATGAGCTCAGGGCGTTTAGAGGCATCACT
GGATAGAGTAGAAGCCATTTTAACACATTCCGAATATCTATAACCAATTACTTGTGTGGT
TTCTTTCAAACTAGTCACTATCATCTGATAAACTGTTTGTTCTTGGTTTTATATTGAGAT
AGTCTTTGT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4341Contig1 807 2 4 U
GGGATCTGGTGGATGCTCTACGAGAGGTTGACTGGTCGTCGCCGCCGCATCCGCTATCGG
AGTTCTTCTCAAGGTTCACCGTTCCTAAATCTTTCGCTAAATGGGATAGCCGCCTCAAGT
GCAATCTCTACTACTACCGAACGAACTACTTCATCATGATCGTCTTTATTCTTGGATTGG
GATTTCTTACAAGGCCTCTCGCCATTCTCTCTGCCCTTTTGACAGCACTAACTGTTGCAT
TCCTAAATGACAGCTTTGCAGGTTCCTTTAGTGAGAAGGCCACCCGAACCATCAGAAGAT
TCTCCCCACCTTTAGCTGCTAAAATGAGACCTCCATTGGCGCCTGTCATCCGTGGACGCC
CATCAGCTAAGAGAGCAATCTATATCTGTGGCCAACCCCGTTGGGTCTTTGTCTTGATAT
CCTCACTTGTGAGTTTTGCACTTTGGTATATTTCATGTGGTTTGTTCACCGTCTCTTTGG
CACTACTCATTGGGCTTCTTGCCGCGATTCTTCATGCAACCTTGAGAACACCCAACTTGA
AGGCACGTCTTAACACCTTCAGGGAGGAATTTCGAGCAGTGTGGCGTAACTACAGTGAGA
TCTAGAGTAATATAAGCTCGAGCAGAGTATTGCTGTTGCTCTGTGATCTTTAATTTGTTT
TTTAGCTCCATGACTCGGGATTCTGTTTCTTGATTTGGTTTCTGCTTTCTGTCGTAGCAG
TCTTTTGTTTAAGCACTTGTAAAGCCAGCTTGTTTGCTGTTGTTTCCCCCCCCCCCAAAA
CCCTTTTAATATACAATCCTAGAGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU41TF U 1
AF RR2DU41JQ C 214
BS 1 662 RR2DU41TF
BS 663 663 RR2DU41JQ
BS 664 725 RR2DU41TF
BS 726 807 RR2DU41JQ

RD RR2DU41TF 726 0 0
GGGATCTGGTGGATGCTCTACGAGAGGTTGACTGGTCGTCGCCGCCGCATCCGCTATCGG
AGTTCTTCTCAAGGTTCACCGTTCCTAAATCTTTCGCTAAATGGGATAGCCGCCTCAAGT
GCAATCTCTACTACTACCGAACGAACTACTTCATCATGATCGTCTTTATTCTTGGATTGG
GATTTCTTACAAGGCCTCTCGCCATTCTCTCTGCCCTTTTGACAGCACTAACTGTTGCAT
TCCTAAATGACAGCTTTGCAGGTTCCTTTAGTGAGAAGGCCACCCGAACCATCAGAAGAT
TCTCCCCACCTTTAGCTGCTAAAATGAGACCTCCATTGGCGCCTGTCATCCGTGGACGCC
CATCAGCTAAGAGAGCAATCTATATCTGTGGCCAACCCCGTTGGGTCTTTGTCTTGATAT
CCTCACTTGTGAGTTTTGCACTTTGGTATATTTCATGTGGTTTGTTCACCGTCTCTTTGG
CACTACTCATTGGGCTTCTTGCCGCGATTCTTCATGCAACCTTGAGAACACCCAACTTGA
AGGCACGTCTTAACACCTTCAGGGAGGAATTTCGAGCAGTGTGGCGTAACTACAGTGAGA
TCTAGAGTAATATAAGCTCGAGCAGAGTATTGCTGTTGCTCTGTGATCTTTAATTTGTTT
TT*AGCTCCATGACTCGGGATTCTGTTTCTTGATTTGGTTTCTGCTTTCTGTCGTAGCAG
TCTTT
G

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2DU41JQ 594 0 0
CCCTTTTGACAGCACTAACTGTTGCATTCCTAAATGACAGCTTTGCAGGTTCCTTTAGTG
AGAAGGCCACCCGAACCATCAGAAGATTCTCCCCACCTTTAGCTGCTAAAATGAGACCTC
CATTGGCGCCTGTCATCCGTGGACGCCCATCAGCTAAGAGAGCAATCTATATCTGTGGCC
AACCCCGTTGGGTCTTTGTCTTGATATCCTCACTTGTGAGTTTTGCACTTTGGTATATTT
CATGTGGTTTGTTCACCGTCTCTTTGGCACTACTCATTGGGCTTCTTGCCGCGATTCTTC
ATGCAACCTTGAGAACACCCAACTTGAAGGCACGTCTTAACACCTTCAGGGAGGAATTTC
GAGCAGTGTGGGGTAACTACAGTGAGATCTAGAGTAATATAAGCTCGAGCAGAGTATTGC
TGTTGCTCTGTGATCTTTAATTTGTTTTTTAGCTCCATGACTCGGGATTCTGTTTCTTGA
TTTGGTTTTTGCTTTCTGTCGTAGCAGTCTTTTGTTTAAGCACTTGTAAAGCCAGCTTGT
TTGCTGTTGTTTCCCCCCCCCCCAAAACCCTTTTAATATACAATCCTAGAGTCG

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

CO CL4342Contig1 848 2 2 U
GGGTAGTATCTTATTTCTCAAGTACTCTTATCTCATATATTTCGCTCTTTTAGTTTCTCG
TTACAAAATTTCCTTAAAGAAATACATTTGAAAAGCTGTAATCATATATGGCACCACCAC
CTCCGTCACCACCACCTGTTTCATTGAGGGTATTAAACCTTCTACTAAGGGTTTTGACTG
CAATTTTTCTAGTTATATCTGTCATCGTCCTCACCACCAATAGCGTCACCATCGGATCTA
TCAAATTTCATTTCAATGATGTTTATGCTTATAGATACATGCTAGCCGCTGCCGTCATCG
GTCTAATTTACGCTGCCATGCAACTTTTCTTCACAATCTGCCAATTCTCCACCGGAACGA
CAAACTCATTTAATTATCAACTTGATTTTTACGGTGACAAGGTAATATCATATCTAGTGG
CGACGGGTTCGGCAGCTGGATTTGGAGCAACCAAAGATTTGAAAGATGCATTTATAGCGT
TGGTCTCATTAGATTCGACTGATCCTGTGGATGAGTTCTTCAGCAAAGGATATGCATCGG
CCAGTCTTCTTCTCTTTGCTTTCCTCTGTCTCGCTGTTTTATCTGTTTTCTCATCTCTAG
CCATTGCCAAAAGATCATTTTAAGCTCATCATGACAAAGACAAGTCGATTTGTGACTTAC
AATGCTTTAAAATATGATTTGATTATATAGATTTGTCCCAATGTTATGCGTTGCTATTCG
TTCTGTAAACAATTTACGATTGGTTTTGTTACCAAAGTTAATAAGTGTTGTTTTAATGCA
TGTAAAGTAATTCAGCTGCTGTGTGTTATATGGACGCCATGTTGTGATATAAGTAATAAG
TTCTAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK17TF U 1
AF RR2BK17JQ C 558
BS 1 696 RR2BK17TF
BS 697 848 RR2BK17JQ

RD RR2BK17TF 696 0 0
GGGTAGTATCTTATTTCTCAAGTACTCTTATCTCATATATTTCGCTCTTTTAGTTTCTCG
TTACAAAATTTCCTTAAAGAAATACATTTGAAAAGCTGTAATCATATATGGCACCACCAC
CTCCGTCACCACCACCTGTTTCATTGAGGGTATTAAACCTTCTACTAAGGGTTTTGACTG
CAATTTTTCTAGTTATATCTGTCATCGTCCTCACCACCAATAGCGTCACCATCGGATCTA
TCAAATTTCATTTCAATGATGTTTATGCTTATAGATACATGCTAGCCGCTGCCGTCATCG
GTCTAATTTACGCTGCCATGCAACTTTTCTTCACAATCTGCCAATTCTCCACCGGAACGA
CAAACTCATTTAATTATCAACTTGATTTTTACGGTGACAAGGTAATATCATATCTAGTGG
CGACGGGTTCGGCAGCTGGATTTGGAGCAACCAAAGATTTGAAAGATGCATTTATAGCGT
TGGTCTCATTAGATTCGACTGATCCTGTGGATGAGTTCTTCAGCAAAGGATATGCATCGG
CCAGTCTTCTTCTCTTTGCTTTCCTCTGTCTCGCTGTTTTATCTGTTTTCTCATCTCTAG
CCATTGCCAAAAGATCATTTTAAGCTCATCATGACAAAGACAAGTCGATTTGTGACTTAC
AATGCTTTAAAATATGATTTGATTATATAGATTTGT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2BK17JQ 291 0 0
GCTTTCTTCTGTCTCGCTGTTTTATCTGTTTTTTCATCTCTAGCCATTGCCAAAAGATCA
TTTTAAGCTCATCATGACAAAGACAAGTCGATTTGTGACTTACAATGCTTTAAAATATGA
TTTGATTATATAGATTTGTCCCAATGTTATGCGTTGCTATTCGTTCTGTAAACAATTTAC
GATTGGTTTTGTTACCAAAGTTAATAAGTGTTGTTTTAATGCATGTAAAGTAATTCAGCT
GCTGTGTGTTATATGGACGCCATGTTGTGATATAAGTAATAAGTTCTAGAC

QA 1 291 1 291
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4344Contig1 603 2 3 U
GGAAATTTACCAAAACCTTGACAAATCAGATTTTCGAAAAACCCTAAAAATCATCAAAAA
AAGCTCGAGCGTTCGTTCGTCAATTAACCGGAGAAGAAGATGAAGGGAAGCTTCTCGATC
GCCCGTCAGGTTCTCCAACGCCGTTTCTCAACACTCCGTTCGTCGCGATACTCCGCGTTA
TCCAGCTCCGCCCGATCGCTTATCGTGGCTCCAAACTCGATGCCGTCGCAGATCCCTAGA
AACTCGTTGTTACCTGCCTCCACCTTCCTCTGTTCCATCGAATCTAACTTCTCCACAACG
CTTTTCCCCAGCCGGAGAAGCCTCTGCTCATCAGCTGCAGGTGGAAATGGTGTTGTTATA
GTGAAATCAGAGGAAGAGTTCAACAGTGCAATGAGCAAAGCTGAAGGTGGATCTTCACCG
TCCATCTTCTACTTCACTGCCGCCTGGTGTGGACCATGCAAGTTCATTGCCCCTGTGATC
GTGGAGCTTAGTAAACAGTACCCTGATGTAACAACGTATAAGATCGACATTGATGAGGCT
GGACTTTCAAACACTCTCAGCAAGCTGAGTATCACGGCTGTGCCAACACTGCAGTTGTTT
AAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2BU20TF U 50
AF RR2H353TF U 1
BS 1 105 RR2H353TF
BS 106 106 RR2BU20TF
BS 107 603 RR2H353TF

RD RR2BU20TF 125 0 0
GG
CATCAAAAAAAGCTCGAGCGTTCGTTCGTCAATTAACCGGAGAAGAAGATGAAGGGAAGC
TTCTCGATCGCCCGTCAGGTTCTCCAACGCCGTTTCTCAACACTCCGTTCGTCGCGATAC
TCC

QA 3 125 3 125
DS 

RD RR2H353TF 603 0 0
GGAAATTTACCAAAACCTTGACAAATCAGATTTTCGAAAAACCCTAAAAATCATCAAAAA
AAGCTCGAGCGTTCGTTCGTCAATTAACCGGAGAAGAAGATGAAGTGAAGCTTCTCGATC
GCCCGTCAGGTTCTCCAACGCCGTTTCTCAACACTCCGTTCGTCGCGATACTCCGCGTTA
TCCAGCTCCGCCCGATCGCTTATCGTGGCTCCAAACTCGATGCCGTCGCAGATCCCTAGA
AACTCGTTGTTACCTGCCTCCACCTTCCTCTGTTCCATCGAATCTAACTTCTCCACAACG
CTTTTCCCCAGCCGGAGAAGCCTCTGCTCATCAGCTGCAGGTGGAAATGGTGTTGTTATA
GTGAAATCAGAGGAAGAGTTCAACAGTGCAATGAGCAAAGCTGAAGGTGGATCTTCACCG
TCCATCTTCTACTTCACTGCCGCCTGGTGTGGACCATGCAAGTTCATTGCCCCTGTGATC
GTGGAGCTTAGTAAACAGTACCCTGATGTAACAACGTATAAGATCGACATTGATGAGGCT
GGACTTTCAAACACTCTCAGCAAGCTGAGTATCACGGCTGTGCCAACACTGCAGTTGTTT
AAA

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL4345Contig1 634 2 2 U
GGATCCTTCTTTCAAATGGGAAGTCTCTCCATCTCCACCCTTCCTCTGTCGCCGTTTCGG
ATTCAGACTCAAACCCGATTTACGATAATCAGTACCCAAACGAATACCGGATCATTCAAT
CTCAAGCAGACAAGGATTTGCACGAAAGTTGGAGGTTTGGGAGGAAATCGAAGAGAGCAG
AATGATTCGAGATTCGTCGATGAAAATGACGACATGGAAGGTTACTTGGATCATCTCTCT
CTCGAATACGATTCCGTATGGGATACAAAGCCCTCCTGGTGTCAGCCATGGACGATAGTG
GTGACGGGTTTGTCAATAGTGGCTTGTAGCTGGGCAATACTACATTCGGTTTTAGTTTCA
TCGCTTGCCGTTGGTTTAATTGGCGCGTGGTGGTACATTTTCCTTTACAGCTACCCAAAG
TCTTACTCAGAAATGATTGCTGAAAGAAGGAAAAGAGTAGCTGATGGTTATCATTCGTCA
TACCTTGTATCTATCTATCTATCTATATATTAGTTTATCTCAGTTTCATTCATCAGATGT
TTTTATAACAAACAGATCGATTACATAAGTAGAAAGTCATGTGATTACTAGAAACATAAC
TAAAATCCATAATGACCATGTCCCTTTCTTCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GO59JQ C 1
AF RR2GO59TF U 21
BS 1 20 RR2GO59JQ
BS 21 634 RR2GO59TF

RD RR2GO59JQ 634 0 0
GGATCCTTCTTTCAAATGGGAAGTCTCTCCATCTCCACCCTTCCTCTGTCGCCGTTTCGG
ATTCAGACTCAAACCCGATTTACGATAATCAGTACCCAAACGAATACCGGATCATTCAAT
CTCAAGCAGACAAGGATTTGCACGAAAGTTGGAGGTTTGGGAGGAAATCGAAGAGAGCAG
AATGATTCGAGATTCGTCGATGAAAATGACGACATGGAAGGTTACTTGGATCATCTCTCT
CTCGAATACGATTCCGTATGGGATACAAAGCCCTCCTGGTGTCAGCCATGGACGATAGTG
GTGACGGGTTTGTCAATAGTGGCTTGTAGCTGGGCAATACTACATTCGGTTTTAGTTTCA
TCGCTTGCCGTTGGTTTAATTGGCGCGTGGTGGTACATTTTCCTTTACAGCTACCCAAAG
TCTTACTCAGAAATGATTGCTGAAAGAAGGAAAAGAGTAGCTGATGGTTATCATTCGTCA
TACCTTGTATCTATCTATCTATCTATATATTAGTTTATCTCAGTTTCATTCATCAGATGT
TTTTATAACAAACAGATCGATTACATAAGTAGAAAGTCATGTGATTACTAGAAACATAAC
TAAAATCCATAATGACCATGTCCCTTTCTTCTCG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2GO59TF 614 0 0
AAGTCTCTCCATCTCCACCCTTCCTCTGTCGCCGTTTCGGATTCAGACTCAAACCCGATT
TACGATAATCAGTACCCAAACGAATACCGGATCATTCAATCTCAAGCAGACAAGGATTTG
CACGAAAGTTGGAGGTTTGGGAGGAAATCGAAGAGAGCAGAATGATTCGAGATTCGTCGA
TGAAAATGACGACATGGAAGGTTACTTGGATCATCTCTCTCTCGAATACGATTCCGTATG
GGATACAAAGCCCTCCTGGTGTCAGCCATGGACGATAGTGGTGACGGGTTTGTCAATAGT
GGCTTGTAGCTGGGCAATACTACATTCGGTTTTAGTTTCATCGCTTGCCGTTGGTTTAAT
TGGCGCGTGGTGGTACATTTTCCTTTACAGCTACCCAAAGTCTTACTCAGAAATGATTGC
TGAAAGAAGGAAAAGAGTAGCTGATGGTTATCATTCGTCATACCTTGTATCTATCTATCT
ATCTATATATTAGTTTATCTCAGTTTCATTCATCAGATGTTTTTATAACAAACAGATCGA
TTACATAAGTAGAAAGTCATGTGATTACTAGAAACATAACTAAAATCCATAATGACCATG
TCCCTTTCTTCTCG

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL4346Contig1 689 2 3 U
TTTTGACTTGATAAGTGATCGCCACAACATTTATTGAATTTTCTTTACATTGTCAAAAAT
ACATTTGAAGCACAAAGACAGAAAAAACGGGTACAGAATATGCAAAGAGTTTCTGGATGG
GGACTGAGGGTATGATCAGTCTAAAAAAAGCTTGGCCAGTGGGAGGGAAAGTACCTTAAC
TCCATTAGCCATGTCTTCAGGAAATGAATATTCTTCAGGTTTATGGCTATATCCTTTGTA
GCACGGGATGAATATCATACCCATTGGAGATATCCTGGAAACAGAAAACACACAACAAAG
TTCAGTAGCAATCTAAGAAAGAAAAGTGAAAGTAGACGAAAGTAAACATGAAACTTGGAA
AATTTTTGGTAGTACCTGGCCATGAAAAGAGAATCATGATAAGCTCGGCTTATCATCATC
TTGTGTGATAAGTTTAGCTCTGTGCTTGCCTCTGCCATTTTCTTGATTACTAGTTTGTCT
GAAAGTGCCGGTAGATCTTGATTTACAATCTTGAACTCTGTTAGCTTCACTTTTCGTTTT
TGAGCAATCGTGTTGGCAGATTCCTCTATTTTCTTGATCACTGTGTTTCTTCTCCCTTCA
TCAATATCCCTTGTATCGATTTCAAGATGAGATTTGCTTGGAATGCTGTTGATCGCTCCA
GGGTGTAGCTCAAGAATACCTTAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB86JQ U 26
AF RR2CB86TF C 1
BS 1 25 RR2CB86TF
BS 26 564 RR2CB86JQ
BS 565 689 RR2CB86TF

RD RR2CB86JQ 539 0 0
AACATTTATTGAATTTTCTTTACATTGTCAAAAATACATTTGAAGCACAAAGACAGAAAA
AACGGGTACAGAATATGCAAAGAGTTTCTGGATGGGGACTGAGGGTATGATCAGTCTAAA
AAAAGCTTGGCCAGTGGGAGGGAAAGTACCTTAACTCCATTAGCCATGTCTTCAGGAAAT
GAATATTCTTCAGGTTTATGGCTATATCCTTTGTAGCACGGGATGAATATCATACCCATT
GGAGATATCCTGGAAACAGAAAACACACAACAAAGTTCAGTAGCAATCTAAGAAAGAAAA
GTGAAAGTAGACGAAAGTAAACATGAAACTTGGAAAATTTTTGGTAGTACCTGGCCATGA
AAAGAGAATCATGATAAGCTCGGCTTATCATCATCTTGTGTGATAAGTTTAGCTCTGTGC
TTGCCTCTGCCATTTTCTTGATTACTAGTTTGTCTGAAAGTGCCGGTAGATCTTGATTTA
CAATCTTGAACTCTGTTAGCTTCACTTTTCGTTTTTGAGCAATCGTGTTGGCAGATTCC

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2CB86TF 689 0 0
TTTTGACTTGATAAGTGATCGCCACAACATTTATTGAATTT*CTTTACATTGTCAAAGAT
ACATTTGAAGCACAAAGACAGAAGAAACGGGTACAGAATATGCAAAGAGTTTCTGGATGG
GGACTGAGGGTATGATCAGTCTAAAGAGAGCTTGGCCAGTGTGAGGGAAAGTACCTTAAC
TCCATTAGCCATGTCTTCAGGAGATGAATATTCTTCAGGTTTATGGCTATATCCTTTGTA
GCACGGGATGAATATCATACCCATTGGAGATATCCTGGAAACAGAAAACACACAACAAAG
TTCAGTAGCAATCTAAGAAAGAAGAGTGAAAGTAGACGAAAGTAAACATGAAACTTGGAG
AATTTTTGGTAGTACCTGGCCATGAAAAGAGAATCATGATAAGCTCGGCTTATCATCATC
TTGTGTGATAAGTTTAGCTCTGTGCTTGCCTCTGCCATTTTCTTGATTACTAGTTTGTCT
GAGAGTGCCGGTAGATCTTGATTTACAATCTTGAACTCTGTTAGCTTCACTTTTCGTTTT
TGAGCAATCGTGTTGGCAGATTCCTCTATTTTCTTGATCACTGTGTTTCTTCTCCCTTCA
TCAATATCCCTTGTATCGATTTCAAGATGAGATTTGCTTGGAATGCTGTTGATCGCTCCA
GGGTGTAGCTCAAGAATACCTTAAAAAAA

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL4347Contig1 1345 2 4 U
GGAGGCCAAGTTACTTCATCTCCACGACATATATAAACTCCGTCAGAACAGAGCCAGAGA
AAGAAACCCTAATTGAAGCTTTGAACAATGAAGAAGACTATTTTCGATCTTCCAGAGGAT
TTGGTAGAAGATGAGATATTTTCTAGGGTGACGATGTCATCTCTGAGATCAGTTCGGTCT
ACATGCAGAAAGTGGAACGTTTGTTGTAAAAATAGGATCCTTTTTGGTAAAGCAGTAGCA
GACTCAAAGAAGCAGTTCCTGATGATGGACTCGAGGAGGATTTGTTTGATGAACTTCGAT
CAAAGCAAAGACAATGGCGACCCATCTATAAGACAAGTTAGCGTACTTGATCGAATACAG
ATCTTTTATGTGTTTCACTGTGATGATGGCTTGTTGCTATGCCTCCTTAAGGATTGCTCA
AGGCTCTTGGTATGTAATCCTTATTTAGGGCAAACGAGGTGGATTGAACCCAGACACAGG
TTCCAACGTGGAGACAGGTTTGCTCTCGGATACGACCACAACAACCTTAACCACAAGATC
CTGAGGATCTCCAAAGAGATCCATCCAGTTACAAGCAAGCACGTTTTAGGGTTCCAACTC
TATGACTTTAGCTCGAGTTCTTGGAAGGTTCTTGATGTCAAGCCCCCCCCGGAGATAAGG
GATCATTCACTCGGCATCTCTTTGAAAGGAAACACTTATTTTCGTTCGAGTGTTGTAGGT
TCCTTCCTCTGTTTTGATTTCACAGCAGAAAGCTTTGCACCGCTTCTGCCTCTGCCGCCG
TCTCATTCTTACCGCGGATTGCATTTTCTGTCTTTCTCTTGCGTTAGAAGAAGAGAAGAG
CAGCATCTCGCTGTCTTGTATCAGCACTCGGATACACGTGAGACGATCGAGATTAGCGTT
ACGGATAAGATCGGTCCTGATGTTGTGTCTTGGACAAAGTTTTTGAAAGTGGTCACTGGC
TGTTCGGTTAAAACTTATACTGGGAGTTTTCTCGTTGACGAGGAGAAGAAAATCGCTGTG
GTTTTCGTTCTTGAAATGGTCAGTGGATGTGTCTACCAAACTGCTCACGTCTTCGGACAA
GATGGATACTTCAAATCTGTGAGAATACGAGAAGCTATGGAGCTCGAAGACAGTTTGAAT
AAGATATATTATCCGCCACTGTTGTGTTCTTCGTATCTTCCAAGCTTACTGCAACTCAAC
TAACCAGGCTAATGGAAAGAATGTGCAATCATCTTCTTTCGGATAAATCTTTAATTTTGT
GTTTTGGCTTTTGAATGTTTTAGCCTCTCTTTTCAGACTTTTTTCATGTCTCTCGTGATG
TAATCTATGATACAAGGTTCATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B035TF U 1
AF RR2B035JQ C 549
BS 1 718 RR2B035TF
BS 719 719 RR2B035JQ
BS 720 828 RR2B035TF
BS 829 1345 RR2B035JQ

RD RR2B035TF 828 0 0
GGAGGCCAAGTTACTTCATCTCCACGACATATATAAACTCCGTCAGAACAGAGCCAGAGA
AAGAAACCCTAATTGAAGCTTTGAACAATGAAGAAGACTATTTTCGATCTTCCAGAGGAT
TTGGTAGAAGATGAGATATTTTCTAGGGTGACGATGTCATCTCTGAGATCAGTTCGGTCT
ACATGCAGAAAGTGGAACGTTTGTTGTAAAAATAGGATCCTTTTTGGTAAAGCAGTAGCA
GACTCAAAGAAGCAGTTCCTGATGATGGACTCGAGGAGGATTTGTTTGATGAACTTCGAT
CAAAGCAAAGACAATGGCGACCCATCTATAAGACAAGTTAGCGTACTTGATCGAATACAG
ATCTTTTATGTGTTTCACTGTGATGATGGCTTGTTGCTATGCCTCCTTAAGGATTGCTCA
AGGCTCTTGGTATGTAATCCTTATTTAGGGCAAACGAGGTGGATTGAACCCAGACACAGG
TTCCAACGTGGAGACAGGTTTGCTCTCGGATACGACCACAACAACCTTAACCACAAGATC
CTGAGGATCTCCAAAGAGATCCATCCAGTTACAAGCAAGCACGTTTTAGGGTTCCAACTC
TATGACTTTAGCTCGAGTTCTTGGAAGGTTCTTGATGTCAAGCCCCCCCCGGAGATAAGG
GATCATTCACTCGGCATCTCTTTGAAAGGAAACACTTATTTTCGTTCGAGTGTTGTAG*T
TCCTTCCTCTGTTTTGATTTCACAGCAGAAAGCTTTGCACCGCTTCTGCCTCTGCCGCCG
TCTCATTCTTACCGCGGATTGCATTTTCTGTCTTTCTCTTGCGTTAGA

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2B035JQ 797 0 0
CTCCAAAGAGATCCATCCAGTTACAAGCAAGCACGTTTTAGGGTTCCAACTCTATGACTT
TAGCTCGAGTTCTTGGAAGGTTCTTGATGTCAAGCCCCCCCCGGAGATAAGGGATCATTC
ACTCGGCATCTCTTTGAAAGGAAACACTTATTTTCGTTCGAGTGTTGTAGGTTCCTTCCT
CTGTTTTGATTTCACAGCAGAAAGCTTTGCACCGCTTCTGCCTCTGCCGCCGTCTCATTC
TTACCGCGGATTGCATTTTCTGTCTTTCTCTTGCGTTAGAAGAAGAGAAGAGCAGCATCT
CGCTGTCTTGTATCAGCACTCGGATACACGTGAGACGATCGAGATTAGCGTTACGGATAA
GATCGGTCCTGATGTTGTGTCTTGGACAAAGTTTTTGAAAGTGGTCACTGGCTGTTCGGT
TAAAACTTATACTGGGAGTTTTCTCGTTGACGAGGAGAAGAAAATCGCTGTGGTTTTCGT
TCTTGAAATGGTCAGTGGATGTGTCTACCAAACTGCTCACGTCTTCGGACAAGATGGATA
CTTCAAATCTGTGAGAATACGAGAAGCTATGGAGCTCGAAGACAGTTTGAATAAGATATA
TTATCCGCCACTGTTGTGTTCTTCGTATCTTCCAAGCTTACTGCAACTCAACTAACCAGG
CTAATGGAAAGAATGTGCAATCATCTTCTTTCGGATAAATCTTTAATTTTGTGTTTTGGC
TTTTGAATGTTTTAGCCTCTCTTTTCAGACTTTTTTCATGTCTCTCGTGATGTAATCTAT
GATACAAGGTTCATCCT

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL4348Contig1 719 2 2 U
GCCGGAAGCTCCAATCTATGGATACCATCTAGTAACTGCTACTTCTCGGTGGCTTGTTAT
CTTCATTCAAAGTACAAGGCTAGCGAGTCATCAACGTACAAAAGAAACGGAAAACCTGCG
TCAATCCGCTATGGGACAGGGGCTATTTCTGGTTACTTTAGCAACGATGATGTTAAAGTT
GGTGGTCTTGTTATCAAGGATCAGGAGTTCATAGAGGCTACTAGTGAGCCTGGTATTACA
TTCTTAGTAGCCAAGTTTGATGGTATCTTAGGGTTGGGATTCAAAGAGATTTCTGTAGGG
AACTCAACTCCAGTTTGGTATAACATGGTAGATAAAGGTGATCAAGGAAGTGAGGTCGGT
TACGGATTTGGGGTTGAAGGAAGCGAAGGACTTGGTGGAGAAAGCTCCGACCTTGTTGAA
GAAAGGAGTTAGTAAGGAGGAAGCTGAGAAGATCATTGAGAAGTTGAAGGCTGTTGGTGC
TAAAGTTGATATGGAGTGATGACCTTTTAGGTGCTAAAATTGATAAGGAACAGTATGTTT
GATTTCTGGGTTTGCTTAAAGTTGTCTGCTTTTTTATATTATGGAACGTTAGCTCTTGTG
AGCAGTGTTGTGTATTGAGTTTTTAGTAGCTAAAAAGTCTTGGAGTTTATAAGGAACAGC
ATAAAGTTGTTTGCTTTTTCTTCTATTGAGCGTTAGCTCTGACTGTGAGCTTGTTGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL43TF U 1
AF RR2DL43JQ C 10
BS 1 601 RR2DL43TF
BS 602 719 RR2DL43JQ

RD RR2DL43TF 601 0 0
GCCGGAAGCTCCAATCTATGGATACCATCTAGTAACTGCTACTTCTCGGTGGCTTGTTAT
CTTCATTCAAAGTACAAGGCTAGCGAGTCATCAACGTACAAAAGAAACGGAAAACCTGCG
TCAATCCGCTATGGGACAGGGGCTATTTCTGGTTACTTTAGCAACGATGATGTTAAAGTT
GGTGGTCTTGTTATCAAGGATCAGGAGTTCATAGAGGCTACTAGTGAGCCTGGTATTACA
TTCTTAGTAGCCAAGTTTGATGGTATCTTAGGGTTGGGATTCAAAGAGATTTCTGTAGGG
AACTCAACTCCAGTTTGGTATAACATGGTAGATAAAGGTGATCAAGGAAGTGAGGTCGGT
TACGGATTTGGGGTTGAAGGAAGCGAAGGACTTGGTGGAGAAAGCTCCGACCTTGTTGAA
GAAAGGAGTTAGTAAGGAGGAAGCTGAGAAGATCATTGAGAAGTTGAAGGCTGTTGGTGC
TAAAGTTGATATGGAGTGATGACCTTTTAGGTGCTAAAATTGATAAGGAACAGTATGTTT
GATTTCTGGGTTTGCTTAAAGTTGTCTGCTTTTTTATATTATGGAACGTTAGCTCTTGTG
A

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2DL43JQ 710 0 0
TCCAATCTATGGATACCATCTAGTAACTGCTACTTCTCGGTGGCTTGTTATCTTCATTCA
AAGTACAAGGCTAGCGAGTCATCAACGTACAAAAGAAACGGAAAACCTGCGTCAATCCGC
TATGGGACAGGGGCTATTTCTGGTTACTTTAGCAACGATGATGTTAAAGTTGGTGGTCTT
GTTATCAAGGATCAGGAGTTCATAGAGGCTACTAGTGAGCCTGGTATTACATTCTTAGTA
GCCAAGTTTGATGGTATCTTAGGGTTGGGATTCAAAGAGATTTCTGTAGGGAACTCAACT
CCAGTTTGGTATAACATGGTAGATAAAGGTGATCAAGGAAGTGAGGTCGGTTACGGATTT
GGGGTTGAAGGAAGCGAAGGACTTGGTGGAGAAAGCTCCGACCTTGTTGAAGAAAGGAGT
TAGTAAGGAGGAAGCTGAGAAGATCATTGAGAAGTTGAAGGCTGTTGGTGCTAAAGTTGA
TATGGAGTGATGACCTTTTAGGTGCTAAAATTGATAAGGAACAGTATGTTTGATTTCTGG
GTTTGCTTAAAGTTGTCTGCTTTTTTATATTATGGAACGTTAGCTCTTGTGAGCAGTGTT
GTGTATTGAGTTTTTAGTAGCTAAAAAGTCTTGGAGTTTATAAGGAACAGCATAAAGTTG
TTTGCTTTTTCTTCTATTGAGCGTTAGCTCTGACTGTGAGCTTGTTGCAG

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL4349Contig1 736 2 2 U
GGGATTTGAGGTTCGGTTAAAGTTGTTGTTTTCTTCCAATTGCAATTGCTCTTTCTCAAA
CTTTTCTGAGCTGATTATTGCTTCTCGCCGATTTGATTCTCGCTGCTGTGCCTTATTTTC
GGAATCATTGAAGCAATCTTCAATTTCTCTTTCGATTTTGTAGGAGGAAGAGCTCGGCAA
AGCAATCATCTTGTTTTTTTCCTATATTTCAACAACACTTTCAACCAACACTTTTTGGGG
TGTTTGGATCCAGAGAATTTTAAGGAGTTCAAACTTGTTAAGAAGCAGCAACTTAGTGTG
TTTGACCATTGGAGAACATATCAGTTACAGCTATGTGCAGGAATTAAAAAAAACAATATT
TTGTTTTGGCTTTTCCATTAGTTTGCTCATTTTCGTTGAAGCTGTATTATCAAATAGATG
ATGGTGGGCATCGTGACAATGGTTGGCATAAAGCATCTCAGGGCAAGTGGATGATGCAGC
AACAGCAACAACAACACCAACCATCGATGAAACAAGTGATGTCGATCATAATAGCACAAC
TGTCGTTATATGCTACTTGGTTTGTCTTGCAATTAATAAGAGTGAACCAACTTTTAGGAG
AGTTTATTTCAGATGAACTTGTTCTCATCATCCGTGTTAGATACAGAAAAATCCTTGAAT
TGAGTTGTTGCTTGTTGGTAACTGATATTACTACGTGTTTTTACTTGAGCTATTACGGTA
GTTAATTCTTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B938JQ C 1
AF RR2B938TF U 84
BS 1 83 RR2B938JQ
BS 84 736 RR2B938TF

RD RR2B938JQ 736 0 0
GGGATTTGAGGTTCGGTTAAAGTTGTTGTTTTCTTCCAATTGCAATTGCTCTTTCTCAAA
CTTTTCTGAGCTGATTATTGCTTCTCGCCGATTTGATTCTCGCTGCTGTGCCTTATTTTC
GGAATCATTGAAGCAATCTTCAATTTCTCTTTCGATTTTGTAGGAGGAAGAGCTCGGCAA
AGCAATCATCTTGTTTTTTTCCTATATTTCAACAACACTTTCAACCAACACTTTTTGGGG
TGTTTGGATCCAGAGAATTTTAAGGAGTTCAAACTTGTTAAGAAGCAGCAACTTAGTGTG
TTTGACCATTGGAGAACATATCAGTTACAGCTATGTGCAGGAATTAAAAAAAACAATATT
TTGTTTTGGCTTTTCCATTAGTTTGCTCATTTTCGTTGAAGCTGTATTATCAAATAGATG
ATGGTGGGCATCGTGACAATGGTTGGCATAAAGCATCTCAGGGCAAGTGGATGATGCAGC
AACAGCAACAACAACACCAACCATCGATGAAACAAGTGATGTCGATCATAATAGCACAAC
TGTCGTTATATGCTACTTGGTTTGTCTTGCAATTAATAAGAGTGAACCAACTTTTAGGAG
AGTTTATTTCAGATGAACTTGTTCTCATCATCCGTGTTAGATACAGAAAAATCCTTGAAT
TGAGTTGTTGCTTGTTGGTAACTGATATTACTACGTGTTTTTACTTGAGCTATTACGGTA
GTTAATTCTTCTTTCC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2B938TF 653 0 0
CTCGCCGATTTGATTCTCGCTGCTGTGCCTTATTTTCGGAATCATTGAAGCAATCTTCAA
TTTCTCTTTCGATTTTGTAGGAGGAAGAGCTCGGCAAAGCAATCATCTTGTTTTTTTCCT
ATATTTCAACAACACTTTCAACCAACACTTTTTGGGGTGTTTGGATCCAGAGAATTTTAA
GGAGTTCAAACTTGTTAAGAAGCAGCAACTTAGTGTGTTTGACCATTGGAGAACATATCA
GTTACAGCTATGTGCAGGAATTAAAAAAAACAATATTTTGTTTTGGCTTTTCCATTAGTT
TGCTCATTTTCGTTGAAGCTGTATTATCAAATAGATGATGGTGGGCATCGTGACAATGGT
TGGCATAAAGCATCTCAGGGCAAGTGGATGATGCAGCAACAGCAACAACAACACCAACCA
TCGATGAAACAAGTGATGTCGATCATAATAGCACAACTGTCGTTATATGCTACTTGGTTT
GTCTTGCAATTAATAAGAGTGAACCAACTTTTAGGAGAGTTTATTTCAGATGAACTTGTT
CTCATCATCCGTGTTAGATACAGAAAAATCCTTGAATTGAGTTGTTGCTTGTTGGTAACT
GATATTACTACGTGTTTTTACTTGAGCTATTACGGTAGTTAATTCTTCTTTCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL4350Contig1 959 2 2 U
GCAGAGTGATCAGCAAGAATTTCCGTCGCCTGCTTGAGATTAGCGAGAGGCAAGCGTTCA
ATGCACCACCCGAAAATGTACGTGATCACGTCATGGCAGCCACCAGAGCCCTAACCAAAG
GTGATTTCCAGACCGCGTTTGATGTTCTGAACTCTCTTGATGTCTGGAGAATGCTCAAGA
ACCGGGACAGTATCCTCGACATGGTGAAAGCTAGGATCAAAGAAGAGGCTCTAAGGACTT
ACCTGTTCACATACTCCAGCTCCTATGAGTCCCTCAGCCTTGAACAGCTGGCTAAGATGT
TTGACGTCACCGAAGCACAGGTTCACAGCATTGTGAGTAAGATGATGATCAATGAAGAGC
TTCACGCAAGCTGGGACCAGCCAACACGATGCATTGTCTTCCATGAAGTGCAACACAGCA
GATTACAGTCATTGGCTTTCCAGCTAACCGAGAAACTATCGGTTTTGGCAGAGAGTAACG
AAAGGGCTATGGAAGCAAGGACCGGTGGAGGTGGTCTTGATTTGAGTTCAAGGAGAAGGG
ACAACAATCAGGACTATGCAGGAGCAGCATCGGGTGGTGGGAGATGGCAGGACAACAACA
TGGGTTATGGACAAGGAAGACAAGGTAACAACAGATCTGGATATGGAGGAAGACCAGGAC
AGCCTAGAGACTGGTCCGGCCAGAACCGAGGAGGAGGATATGCAGCAAGAGCTGGGTCAG
GAAACAGAGGTGGTGGTATGCAAATGGATGGCTCAACCCGTATGGTGAGTCTTAACCGTG
GTGTTCGCGCTTAGCCAAGCTGCGGACAGTGTTGATTTTGGTTTCTTTTAAGACCTTTTG
TTATGTTTTTCTTTTTGTTGTTTTGTCGTCGGTTAAAGTTTGGATCTGTCTTTAATAAGT
TTTGCTTCAGAACTTTAAATTACTTTGTTTGAGAGTTGTTGAACATTATTGTTTCTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET54TF U 1
AF RR2ET54JQ C 314
BS 1 687 RR2ET54TF
BS 688 959 RR2ET54JQ

RD RR2ET54TF 687 0 0
GCAGAGTGATCAGCAAGAATTTCCGTCGCCTGCTTGAGATTAGCGAGAGGCAAGCGTTCA
ATGCACCACCCGAAAATGTACGTGATCACGTCATGGCAGCCACCAGAGCCCTAACCAAAG
GTGATTTCCAGACCGCGTTTGATGTTCTGAACTCTCTTGATGTCTGGAGAATGCTCAAGA
ACCGGGACAGTATCCTCGACATGGTGAAAGCTAGGATCAAAGAAGAGGCTCTAAGGACTT
ACCTGTTCACATACTCCAGCTCCTATGAGTCCCTCAGCCTTGAACAGCTGGCTAAGATGT
TTGACGTCACCGAAGCACAGGTTCACAGCATTGTGAGTAAGATGATGATCAATGAAGAGC
TTCACGCAAGCTGGGACCAGCCAACACGATGCATTGTCTTCCATGAAGTGCAACACAGCA
GATTACAGTCATTGGCTTTCCAGCTAACCGAGAAACTATCGGTTTTGGCAGAGAGTAACG
AAAGGGCTATGGAAGCAAGGACCGGTGGAGGTGGTCTTGATTTGAGTTCAAGGAGAAGGG
ACAACAATCAGGACTATGCAGGAGCAGCATCGGGTGGTGGGAGATGGCAGGACAACAACA
TGGGTTATGGACAAGGAAGACAAGGTAACAACAGATCTGGATATGGAGGAAGACCAGGAC
AGCCTAGAGACTGGTCCGGCCAGAACC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2ET54JQ 646 0 0
AGCACAGGTTCACAGCATTGTGAGTAAGATGATGATCAATGAAGAGCTTCACGCAAGCTG
GGACCAGCCAACACGATGCATTGTCTTCCATGAAGTGCAACACAGCAGATTACAGTCATT
GGCTTTCCAGCTAACCGAGAAACTATCGGTTTTGGCAGAGAGTAACGAAAGGGCTATGGA
AGCAAGGACCGGTGGAGGTGGTCTTGATTTGAGTTCAAGGAGAAGGGACAACAATCAGGA
CTATGCAGGAGCAGCATCGGGTGGTGGGAGATGGCAGGACAACAACATGGGTTATGGACA
AGGAAGACAAGGTAACAACAGATCTGGATATGGAGGAAGACCAGGACAGCCTAGAGACTG
GTCCGGCCAGAACCGAGGAGGAGGATATGCAGCAAGAGCTGGGTCAGGAAACAGAGGTGG
TGGTATGCAAATGGATGGCTCAACCCGTATGGTGAGTCTTAACCGTGGTGTTCGCGCTTA
GCCAAGCTGCGGACAGTGTTGATTTTGGTTTCTTTTAAGACCTTTTGTTATGTTTTTCTT
TTTGTTGTTTTGTCGTCGGTTAAAGTTTGGATCTGTCTTTAATAAGTTTTGCTTCAGAAC
TTTAAATTACTTTGTTTGAGAGTTGTTGAACATTATTGTTTCTATT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL4351Contig1 818 2 10 U
GAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTC
GAAGACGATCAGATACCGTCCTAGTCTCAACCATAAACTCCTCAACAGTACAGCGCCTTG
AGCGTTCCCGAGCTGACCCAGCAGATGTGGGACGCCAAGAACATGATGTGCGCAGCTGAC
CCTCGCCACGGCCGTTACTTGACAGCTTCTGCTGTGTTCCGTGGGAAGATGAGTACCAAG
GAGGTCGACGAACAGATGATGAATGTGCAGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTCGAGTGG
ATTCCGAACAACGTGAAATCGAGCGTCTGCGATATAGCTCCCACGGGTTTGAAAATGGCG
TCGACTTTCATAGGGAACTCGACTTCGATACAGGAAATGTTCAGGCGTGTGAGTGAACAG
TTCACTGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCACTGGTACACGGGAGAAGGAATGGAT
GAGATGGAGTTCACGGAAGCTGAGAGTAACATGAACGATCTTGTTGCTGAGTACCAGCAA
TATCAGGATGCTACAGTCGGTGAAGAAGAGTATGAGGAGGACGAAGAAGAGTATGCGGAG
GAAGAAGCTTAAGAAAAACATGATTGATTACTACTTTTGTAAGGCTTCACACAAGCAACA
AGTCGTTCTTTTATCTCTATTTAATGTTCGAATTTTCTTTATTTTGTGCTTTGCGAGTCT
TGTTATAGAATCTATCTAAAAAAATGAAAAAGTAAGATTTGTTCTAGTGTCTAATCCCTT
GTTTTGTCTATGATAGTATTTCATTATCAAGCCTGTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM33JQ C 1
AF RR2BM33TF U 1
BS 1 704 RR2BM33TF
BS 705 705 RR2BM33JQ
BS 706 743 RR2BM33TF
BS 744 744 RR2BM33JQ
BS 745 750 RR2BM33TF
BS 751 751 RR2BM33JQ
BS 752 773 RR2BM33TF
BS 774 774 RR2BM33JQ
BS 775 784 RR2BM33TF
BS 785 818 RR2BM33JQ

RD RR2BM33JQ 818 0 0
GAACTGCGAAAGCATT*GCCAAGGATGTTTTCATTA*TCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTC
GAAGACGATCAGATACCGTCCTAGTCTCAACCATAAACTCCTCAACAGTACAGCGCCTTG
AGCGTTCCCGAGCTGACCCAGCAGATGTGGGACGCCAAGAACATGATGTGCGCAGCTGAC
CCTCGCCACGGCCGTTACTTGACAGCTTCTGCTGTGTTCCGTGGGAAGATGAGTACCAAG
GAGGTCGACGAACAGATGATGAATGTGCAGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTCGAGTGG
ATTCCGAACAACGTGAAATCGAGCGTTTGCGATATAGCTCCCACGGGTTTGAAAATGGCG
TCGACTTTCATAGGGAACTCGACTTCGATACAGGAAATGTTCAGGCGTGTGAGTGAACAG
TTCACTGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCACTGGTACACGGGAGAAGGAATGGAT
GAGATGGAGTTCACGGAAGCTGAGAGTAACATGAACGATCTTGTTGCTGAGTACCAGCAA
TATCAGGATGCTACAGTCGGTGAAGAAGAGTATGAGGAGGACGAAGAAGAGTATGCGGAG
GAAGAAGCTTAAGAAAAACATGATTGATTACTACTTTTGTAAGGCTTCACACAAGCAACA
AGTCGTTCTTTTATCTCTATTTAATGTTCGAATTTTCTTTATTTTGTGCTTTGCGAGTCT
TGTTATAGAATCTATCTAAAAAAATGAAAAAGTAAGATTTGTTCTAGTGTCTAATCCCTT
GTTTTGTCTATGATAGTATTTCATTATCAAGCCTGTAG

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2BM33TF 784 0 0
GAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTC
GAAGACGATCAGATACCGTCCTAGTCTCAACCATAAACTCCTCAACAGTACAGCGCCTTG
AGCGTTCCCGAGCTGACCCAGCAGATGTGGGACGCCAAGAACATGATGTGCGCAGCTGAC
CCTCGCCACGGCCGTTACTTGACAGCTTCTGCTGTGTTCCGTGGGAAGATGAGTACCAAG
GAGGTCGACGAACAGATGATGAATGTGCAGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTCGAGTGG
ATTCCGAACAACGTGAAATCGAGCGTCTGCGATATAGCTCCCACGGGTTTGAAAATGGCG
TCGACTTTCATAGGGAACTCGACTTCGATACAGGAAATGTTCAGGCGTGTGAGTGAACAG
TTCACTGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCACTGGTACACGGGAGAAGGAATGGAT
GAGATGGAGTTCACGGAAGCTGAGAGTAACATGAACGATCTTGTTGCTGAGTACCAGCAA
TATCAGGATGCTACAGTCGGTGAAGAAGAGTATGAGGAGGACGAAGAAGAGTATGCGGAG
GAAGAAGCTTAAGAAAAACATGATTGATTACTACTTTTGTAAGGCTTCACACAAGCAACA
AGTCGTTCTTTTATCTCTATTTAATGTTCGAATTTTCTTTATTT*GTGCTTTGCGAGTCT
TGTTATAGAATCTATCTAAAAAA*TGAAAA*GTAAGATTTGTTCTAGTGTCTA*TCCCTT
GTTT

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL4352Contig1 994 2 6 U
GAAGACAGCTTTCGAGCAAACACTTCCACGCGTTCTTCCCTTACTTCATGCTCATAGCCT
TCGAAGGAGGGTCGATCATCAGAGCGATCTTTCTCTTGCTCTCTTGTTCTTTCCTCTGGG
CTCTGCCACAAGAGACCAAACTCAAAGTCCTCTCTTTCGTAACATTCTCTGGTCTTAAAG
TAAAAGACATGGACAGCGTTTCCAGGTCGGTTCTACCCAAGTTCTTCCTCGACAACTTGA
GCCTCCAGGTTTACGACGTGTGGGCTCGAACTACGTATTCCAAAGTCGTGTTCACGAGCT
TGCCTCAAGTGATGGTGGAGAGGTTTTTAAGAGAGCATCTCAGCGCTGATGACAACAACA
AGAACAACAAGAAGCCTTCACTTGGTATTGGAAGCTCTTCAAGCCTTCAAGATCACAGCT
TCATCTCCATTTGCAAAGAAGCTTATCTTTGTAACGAAGAAGAGGTCATGAACAAGAACA
ACACTCTTCCTAGAGAAAGATACCCAAAGCCATTGATATTCCATGACGGGAGATTAGCTT
TCTTGCCAACACCATTAGCTACACTCACTATGTTCATGTGGCTCCCTATTGGATTCTTCC
TCGCTGTCTTCAGGATCTCGATAGGAGTCTTGCTTCCTTACCACGTAGCCAACATCTTGG
CTGCTATGTCCGGTGTTAGAATCACTTTCAAGACTCATAACTTGTACAACGGTCGTCCGG
GGAGAGCTTGCTAGAGTTTTGGGATTCGAATGCACTAATCTCACAAGGAAAGATAAGTAC
TTGGTTCTTGCTGGAAATGAAGGCATTGTCACATAAAAAAATAATAATCAGTTCTTTTTT
TCTTTTTTGCTTGTTTAATAGTTAAATGTCTCTATTTCAGGACTTAGATGTTTAAAATGC
TATTGTCATCATTTCAGTTTCTCATCATCTTTTTCCTTTCTCAGGACTACTGGTATGTAA
TGGGACTGTTTGGTTATACATAGTCTTTGTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A019TF U 1
AF RR2A019JQ C 119
BS 1 767 RR2A019TF
BS 768 768 RR2A019JQ
BS 769 802 RR2A019TF
BS 803 803 RR2A019JQ
BS 804 814 RR2A019TF
BS 815 994 RR2A019JQ

RD RR2A019TF 814 0 0
GAAGACAGCTTTCGAGCAAACACTTCCACGCGTTCTTCCCTTACTTCATGCTCATAGCCT
TCGAAGGAGGGTCGATCATCAGAGCGATCTTTCTCTTGCTCTCTTGTTCTTTCCTCTGGG
CTCTGCCACAAGAGACCAAACTCAAAGTCCTCTCTTTCGTAACATTCTCTGGTCTTAAAG
TAAAAGACATGGACAGCGTTTCCAGGTCGGTTCTACCCAAGTTCTTCCTCGACAACTTGA
GCCTCCAGGTTTACGACGTGTGGGCTCGAACTACGTATTCCAAAGTCGTGTTCACGAGCT
TGCCTCAAGTGATGGTGGAGAGGTTTTTAAGAGAGCATCTCAGCGCTGATGACAACAACA
AGAACAACAAGAAGCCTTCACTTGGTATTGGAAGCTCTTCAAGCCTTCAAGATCACAGCT
TCATCTCCATTTGCAAAGAAGCTTATCTTTGTAACGAAGAAGAGGTCATGAACAAGAACA
ACACTCTTCCTAGAGAAAGATACCCAAAGCCATTGATATTCCATGACGGGAGATTAGCTT
TCTTGCCAACACCATTAGCTACACTCACTATGTTCATGTGGCTCCCTATTGGATTCTTCC
TCGCTGTCTTCAGGATCTCGATAGGAGTCTTGCTTCCTTACCACGTAGCCAACATCTTGG
CTGCTATGTCCGGTGTTAGAATCACTTTCAAGACTCATAACTTGTACAACGGTCGTCCGG
GGAGAGCTTGCTAGAGTTTTGGGATTCGAATGCACTAATCTCACAAG*AAAGATAAGTAC
TTGGTTCTTGCTGGAAATGAAG*CATTGTCACAT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR2A019JQ 876 0 0
GGCTCTGCCACAAGAGACCAAACTCAAAGTCCTCTCTTTCGTAACATTCTCTGGTCTTAA
AGTAAAAGACATGGACAGCGTTTCCAGGTCGGTTCTACCCAAGTTCTTCCTCGACAACTT
GAGCCTCCAGGTTTACGACGTGTGGGCTCGAACTACGTATTCCAAAGTCGTGTTCACGAG
CTTGCCTCAAGTGATGGTGGAGAGGTTTTTAAGAGAGCATCTCAGCGCTGATGACAACAA
CAAGAACAACAAGAAGCCTTCACTTGGTATTGGAAGCTCTTCAAGCCTTCAAGATCACAG
CTTCATCTCCATTTGCAAAGAAGCTTATCTTTGTAACGAAGAAGAGGTCATGAACAAGAA
CAACACTCTTCCTAGAGAAAGATACCCAAAGCCATTGATATTCCATGACGGGAGATTAGC
TTTCTTGCCAACACCATTAGCTACACTCACTATGTTCATGTGGCTCCCTATTGGATTTTT
CCTCGCTGTCTTCAGGATCTCGATAGGAGTCTTGCTTCCTTACCACGTAGCCAACATCTT
GGCTGCTATGTCCGGTGTTAGAATCACTTTCAAGACTCATAACTTGTACAACGGTCGTCC
GGGGAGAGCTTGCTAGAGTTTTGGGATTCGAATGCACTAATCTCACAAGGAAGGATAAGT
ACTTGGTTCTTGCTGGAAATGAAGGCATTGTCACATAAAAAAATAATAATCAGTTCTTTT
TTTCTTTTTTGCTTGTTTAATAGTTAAATGTCTCTATTTCAGGACTTAGATGTTTAAAAT
GCTATTGTCATCATTTCAGTTTCTCATCATCTTTTTCCTTTCTCAGGACTACTGGTATGT
AATGGGACTGTTTGGTTATACATAGTCTTTGTTTCT

QA 1 876 1 876
DS 



AS 1 2

CO CL4353Contig1 627 2 6 U
CCGGAGTACAGTGGATCTGGATCTGATTTTGGCCGGAAACCTGATTCCGGACACGGCGGA
AGGACGGAGGTTGAGTATGGCCGGAAACCTGAATCGGAGCATGGATCTGGCTATGACCGT
CGCAAGGATGAAAATGATGATAAGAAAGAGAGCCATGGCCACAAAAAATATAGTGGCAAG
GACTCTGATGCTGATGAGATGACAAAGATGAAGGAGAAGGAGAAGAAGAAGGATAAGGAT
AAGAAGAAAGATGGGTATAACTCCGGCGATGATGAGAAGAAGAAGAACAAGAACAAGGAC
CATCATGATGATTATGACGAGAAGAAGAAGAACAAAAACAAGGACCATGATTATGATGAG
AAGAAGAAGAAGAAGGACTATCATCATGGTAGTGATGATGACAAGAAGAAGAATAAGAAG
GATCATTATGGTAGTGATGAGGATAAGAAGAAGAATAAGAAGGATCATTATGGTAGTGAT
GAGGATAAGAAGAAGAATAAGAAGGATAAGCATCACAAGGGACACCGTGAATACGATGAC
TAGAAAAACCCCTTCTTCCTACATAAGGCATTGTGCATCGCAACTGCCAAGCTTTTAGTC
ACTAATTCAGTAACCCACCGCTCACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM39TF U 1
AF RR2BM39JQ C 93
BS 1 124 RR2BM39TF
BS 125 125 RR2BM39JQ
BS 126 162 RR2BM39TF
BS 163 163 RR2BM39JQ
BS 164 167 RR2BM39TF
BS 168 627 RR2BM39JQ

RD RR2BM39TF 167 0 0
CCGGAGTACAGTGGATCTGGATCTGATTTTGGCCGGAAACCTGATTCCGGACACGGCGGA
AGGACGGAGGTTGAGTATGGCCGGAAACCTGAATCGGAGCATGGATCTGGCTATGACCGT
CGCACGGATGAAAATGATGATAAGAAAGAGAGCCATGGCCACGAAAA

QA 1 167 1 167
DS 

RD RR2BM39JQ 535 0 0
ATT
GGAGCATGGATCTGGCTATGACCGTCGCAAGGATGAAAATGATGATAAGAAAGAGAGCCA
TGGCCACAAAAAATATAGTGGCAAGGACTCTGATGCTGATGAGATGACAAAGATGAAGGA
GAAGGAGAAGAAGAAGGATAAGGATAAGAAGAAAGATGGGTATAACTCCGGCGATGATGA
GAAGAAGAAGAACAAGAACAAGGACCATCATGATGATTATGACGAGAAGAAGAAGAACAA
AAACAAGGACCATGATTATGATGAGAAGAAGAAGAAGAAGGACTATCATCATGGTAGTGA
TGATGACAAGAAGAAGAATAAGAAGGATCATTATGGTAGTGATGAGGATAAGAAGAAGAA
TAAGAAGGATCATTATGGTAGTGATGAGGATAAGAAGAAGAATAAGAAGGATAAGCATCA
CAAGGGACACCGTGAATACGATGACTAGAAAAACCCCTTCTTCCTACATAAGGCATTGTG
CATCGCAACTGCCAAGCTTTTAGTCACTAATTCAGTAACCCACCGCTCACTT

QA 4 535 4 535
DS 



AS 1 2

CO CL4354Contig1 1181 2 8 U
GGATTCTCGTCTTCTTCTTTATTTCTTATAGGTCTGAGATATCAAATGGATTCAAATCAT
AATATTATTCTCTTTGTGGCCTTTCTTATTCTTTGCTTAACTGTGAATGGAGTTACCGGA
TATGCCACGGTCACTGGCACGGTGTTTTGTGACCAATGCAAGGATGGAGAGAAATCTTTG
TTCGATTTTCCCGTCTCCGGAATCAAGATTAGTGTCACATGTGTGGATGAAAATGGACAA
GTCTATATGTCAAGAGAAGAGACCACTAACTGGCTTGGAGGATATGTGATGAGATTCGAC
GGGACGCCGGATCTAAGCAACTGTTATGCTCAGGTTTCAGACAATGGAGCTCAACAAGGC
TCAAGTAGTAGTTGCAGCATCGCTTCAGGTCCTACGCAGAAACTTAAACTACTGTTTAAT
TTCTTTGGGATTGAAACTTTCGTTGTGGATGCCCTTCTTGCTCAGCCGGTTCAGCCAATG
TCTTCTTGTCCTAAACCACCACCAGCTTCGGTTATGCTTCCTCCTCAGGTCCCGGTCATG
CCTCCTCCTCAGGTTAAACTTCCACCTTTGCCTCCAATTGCTCAAGTCGGTCTTACCTTC
TCCTAAGGCCCCGGCCATGAGTCCTCCAGCTACATCGCCACCTCAATTTAAGCCTCCACC
TTTGCCTCCAATCCCTCCAGTTCCATTTCTAGAGCCCTCAGCTTGTTCTCACCAGTTATG
GATAAGACCTGAATACAGATGCTACTGGAAGGTGATAGGTCCAGACACGAAGGTTGCGGT
CGTGTTTGGACTAGTAGCCGGGAGGAGATATGGTAATTATATGACAGTACGAGAAGCGCT
TAACGGGAGAGGAGAAGCCTACAAGACTCTCCTAAGGGAAGCAACAACTGCATTACTCAA
TTCATACAACTCTCTTGGCTTTCCTTATAACTCCGTTGCTGTGATCACATATACAAATAT
GGCTCTCCTTGGGAGCTCGCAGCACGATGTTCTCATGACAGCTATCCGTTTCATCAAGGC
TAACTCGGGGACTTGCAAATTCACTGTCTGCAAGTGATTTCAGTGTGTTTTTAATTATTA
TTTAAATACTCTACACTTTCTTCTTTTCCCAATGTTCTTGGGTACCTTTTGTAACACCTA
CTATGAAAATCTATACTTGGATCCATTAGAGTTTACATACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ81TF U 1
AF RR2BZ81JQ C 458
BS 1 712 RR2BZ81TF
BS 713 713 RR2BZ81JQ
BS 714 724 RR2BZ81TF
BS 725 725 RR2BZ81JQ
BS 726 732 RR2BZ81TF
BS 733 733 RR2BZ81JQ
BS 734 751 RR2BZ81TF
BS 752 1181 RR2BZ81JQ

RD RR2BZ81TF 758 0 0
GGATTCTCGTCTTCTTCTTTATTTCTTATAGGTCTGAGATATCAAATGGATTCAAATCAT
AATATTATTCTCTTTGTGGCCTTTCTTATTCTTTGCTTAACTGTGAATGGAGTTACCGGA
TATGCCACGGTCACTGGCACGGTGTTTTGTGACCAATGCAAGGATGGAGAGAAATCTTTG
TTCGATTTTCCCGTCTCCGGAATCAAGATTAGTGTCACATGTGTGGATGAAAATGGACAA
GTCTATATGTCAAGAGAAGAGACCACTAACTGGCTTGGAGGATATGTGATGAGATTCGAC
GGGACGCCGGATCTAAGCAACTGTTATGCTCAGGTTTCAGACAATGGAGCTCAACAAGGC
TCAAGTAGTAGTTGCAGCATCGCTTCAGGTCCTACGCAGAAACTTAAACTACTGTTTAAT
TTCTTTGGGATTGAAACTTTCGTTGTGGATGCCCTTCTTGCTCAGCCGGTTCAGCCAATG
TCTTCTTGTCCTAAACCACCACCAGCTTCGGTTATGCTTCCTCCTCAGGTCCCGGTCATG
CCTCCTCCTCAGGTTAAACTTCCACCTTTGCCTCCAATTGCTCAAGTCGGTCTTACCTTC
TCCTAAGGCCCCGGCCATGAGTCCTCCAGCTACATCGCCACCTCAATTTAAGCCTCCACC
TTTGCCTCCAATCCCTCCAGTTCCATTTCTAGAGCCCTCAGCTTGTTCTCAC*AGTTATG
GATA*GACCTGA*TACAGATGCTACTGGAAG
TGATAGT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2BZ81JQ 724 0 0
TTGCTCAGCCGGTTCAGCCAATGTCTTCTTGTCCTAAACCACCACCAGCTTCGGTTATGC
TTCCTCCTCAGGTCCCGGTCATGCCTCCTCCTCAGGTTAAACTTCCACCTTTGCCTCCAA
TTGCTCAAGTCGGTCTTACCTTCTCCTAAGGCCCCGGCCATGAGTCCTCCAGCTACATCG
CCACCTCAATTTAAGCCTCCACCTTTGCCTCCAATCCCTCCAGTTCCATTTCTAGAGCCC
TCAGCTTGTTCTCACCAGTTATGGATAAGACCTGAATACAGATGCTACTGGAAGGTGATA
GGTCCAGACACGAAGGTTGCGGTCGTGTTTGGACTAGTAGCCGGGAGGAGATATGGTAAT
TATATGACAGTACGAGAAGCGCTTAACGGGAGAGGAGAAGCCTACAAGACTCTCCTAAGG
GAAGCAACAACTGCATTACTCAATTCATACAACTCTCTTGGCTTTCCTTATAACTCCGTT
GCTGTGATCACATATACAAATATGGCTCTCCTTGGGAGCTCGCAGCACGATGTTCTCATG
ACAGCTATCCGTTTCATCAAGGCTAACTCGGGGACTTGCAAATTCACTGTCTGCAAGTGA
TTTCAGTGTGTTTTTAATTATTATTTAAATACTCTACACTTTCTTCTTTTCCCAATGTTC
TTGGGTACCTTTTGTAACACCTACTATGAAAATCTATACTTGGATCCATTAGAGTTTACA
TACT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL4355Contig1 676 2 2 U
GAGCCACAAAATAGTTGTGTATTATTATTGATAATGTTTCTTTTGTTATTAAATTCTATA
TAGTCACACAACACTAGACAATTTTTTAAATTATTGTTTCTCCCATACTAAAATTATATA
AAGGCGATTTACAATCCATCTTCTTTGTGCCTCTAGTCTTCACTTAACTCTCCACCCAAA
GCAAACTGTCAGATCCTTTGCACCTCCAAGAATGTAATTTACATAGAATAAAAGGTGTGT
GTTTGAACTTTCTTCGTAAAGATTCTTTACTCAGCTCACATTGAAAGTGCTGCGTAAAGA
AGTTGGTTCCAAGTATCAGGCAGCCCGGGGAGGCACCAATGGCTGCAATCGTTCCCTCCA
TCGCCACCGTATGTAGAAGGGTGAGCATCTTTTCTCAGCTGAAACAAAGTGGTGATATCT
AGTAAGAACACACGATTTTTCATTGAACTCAACACTTTGGACACAATTCCTGCAGATGGA
GGCTGACCACTTGGGTAATTTGATCCATCCAACGGCTGCATTTGCCCATTACAACTTTTC
CTTGGCTCGTTCCATTCCCTTCCCTCGTAGTGAGTGGGAGAAATGCCTTGGAAGAAAACT
TTGGTCCTGGTGGTATCGACGTTTTGATCAACCCATCGACTCCAAGTGGTAAGTCCTTTG
TAGAAAGCGTCAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI51JQB U 1
AF RR2CI61TF C 6
BS 1 525 RR2GI51JQB
BS 526 676 RR2CI61TF

RD RR2GI51JQB 525 0 0
GAGCCACAAAATAGTTGTGTATTATTATTGATAATGTTTCTTTTGTTATTAAATTCTATA
TAGTCACACAACACTAGACAATTTTTTAAATTATTGTTTCTCCCATACTAAAATTATATA
AAGGCGATTTACAATCCATCTTCTTTGTGCCTCTAGTCTTCACTTAACTCTCCACCCAAA
GCAAACTGTCAGATCCTTTGCACCTCCAAGAATGTAATTTACATAGAATAAAAGGTGTGT
GTTTGAACTTTCTTCGTAAAGATTCTTTACTCAGCTCACATTGAAAGTGCTGCGTAAAGA
AGTTGGTTCCAAGTATCAGGCAGCCCGGGGAGGCACCAATGGCTGCAATCGTTCCCTCCA
TCGCCACCGTATGTAGAAGGGTGAGCATCTTTTCTCAGCTGAAACAAAGTGGTGATATCT
AGTAAGAACACACGATTTTTCATTGAACTCAACACTTTGGACACAATTCCTGCAGATGGA
GGCTGACCACTTGGGTAATTTGATCCATCCAACGGCTGCATTTGC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2CI61TF 671 0 0
ACAAAATAGTTGTGTATTATTATTGATAATGTTTCTTTTGTTATTAAATTCTATATAGTC
ACACAACACTAGACAATTTTT*AGATTATTGTTTCTCCCATACTAAAATTATATAAAGGC
GATTTACAATCCATCTTCTTTGTGCCTCTAGTCTTCACTTAACTCTCCACCCAAAGCAAA
CTGTCAGATCCTTTGCACCTCCAAGAATGTAATTTACATAGAATAAAAGGTGTGTGTTTG
AACTTTCTTCGTAGAGATTCTTTACTCAGCTCACATTGAAAGTGCTGCGTAGAGAAGTTG
GTTCCAAGTATCAGGCAGCCCGGGGAGGCACCAATGGCTGCAATCGTTCCCTCCATCGCC
ACCGTATGTAGAAGGGTGAGCATCTTTTCTCAGCTGAGACAAAGTGGTGATATCTAGTAA
GAACACACGATTTTTCATTGAACTCAACACTTTGGACACAATTCCTGCAGATGGAGGCTG
ACCACTTGGGTAATTTGATCCATCCAACGGCTGCATTTGCCCATTACAACTTTTCCTTGG
CTCGTTCCATTCCCTTCCCTCGTAGTGAGTGGGAGAAATGCCTTGGAAGAAAACTTTGGT
CCTGGTGGTATCGACGTTTTGATCAACCCATCGACTCCAAGTGGTAAGTCCTTTGTAGAA
AGCGTCAAGCC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL4356Contig1 878 2 2 U
TTTTTGGCAGTAACGAGATGGAACCTCCCATACGAATAGGACTAGTTATCTTTCCTCTTA
TCCTACTTACTATAGCTCCAATCCTTTATCTTCTTATTGGTTATCCTCTCTATTATTCAT
CATCATCATCATCTATATACAAACGTTTAACAACTTCATCGTCGGAGAAACCTTTGCCAT
TGCTTTCTTCTACCTCTAACTATTCATCTGGCTCATCACCAATACTATCATCATCATCAT
CGGATTATTCGGATCATGGTGAGACATTATTTTTACAACAATCGGTGGATGATAACGATT
ATGACGACACATTTCATGGTCTCAAGCCACCTTCATCTTTGCATAACGAAATTTCCATCT
CATCATCAAATGTTGATCATCAAGAAAAGAAGCATCGCCGGAAAAAGAGAAAAGCGAAGT
AATGCGATCTATTCACCGGTGAGTGGGTCCCGAACTCTGAAGCTCCGTACTACACAAACA
CGACATGCTGGGCGATACACGAACACCAAAACTGCATGAAATATGGAAGACCCGATTTAG
GTTTCTTGAAATGGAGATGGAAACCGAAAGAGTGTGATCTCCCTTTGTTTGATCCTTTCG
AGTTTCTTGAGATCGTTAGAGGAAAAAGCATGGCGTTTGTTGGTGACTCGGTTAACAGAA
ACCACGTACAGTCTTTGATATGCCTACTCTCGAGGGTACCCATTCTCATGCTTAAGTATT
CAATATATTTATTAATTAATTCATGTATTTTAGTATTATTTTATGATTTTTAAAATGATA
CTAACTTCATTTGGTACCCATTATCATGTTTATATTTGTTAACTATTCCATGTATTTTGG
TATTATTGTATGATTTTAAAAATAATACTAACTTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL54TF U 1
AF RR2BL54JQ C 106
BS 1 575 RR2BL54TF
BS 576 878 RR2BL54JQ

RD RR2BL54TF 575 0 0
TTTTTGGCAGTAACGAGATGGAACCTCCCATACGAATAGGACTAGTTATCTTTCCTCTTA
TCCTACTTACTATAGCTCCAATCCTTTATCTTCTTATTGGTTATCCTCTCTATTATTCAT
CATCATCATCATCTATATACAAACGTTTAACAACTTCATCGTCGGAGAAACCTTTGCCAT
TGCTTTCTTCTACCTCTAACTATTCATCTGGCTCATCACCAATACTATCATCATCATCAT
CGGATTATTCGGATCATGGTGAGACATTATTTTTACAACAATCGGTGGATGATAACGATT
ATGACGACACATTTCATGGTCTCAAGCCACCTTCATCTTTGCATAACGAAATTTCCATCT
CATCATCAAATGTTGATCATCAAGAAAAGAAGCATCGCCGGAAAAAGAGAAAAGCGAAGT
AATGCGATCTATTCACCGGTGAGTGGGTCCCGAACTCTGAAGCTCCGTACTACACAAACA
CGACATGCTGGGCGATACACGAACACCAAAACTGCATGAAATATGGAAGACCCGATTTAG
GTTTCTTGAAATGGAGATGGAAACCGAAAGAGTGT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2BL54JQ 773 0 0
CTCTCTATTATTCATCATCATCATCATCTATATACAAACGTTTAACAACTTCATCGTCGG
AGAAACCTTTGCCATTGCTTTCTTCTACCTCTAACTATTCATCTGGCTCATCACCAATAC
TATCATCATCATCATCGGATTATTCGGATCATGGTGAGACATTATTTTTACAACAATCGG
TGGATGATAACGATTATGACGACACATTTCATGGTCTCAAGCCACCTTCATCTTTGCATA
ACGAAATTTCCATCTCATCATCAAATGTTGATCATCAAGAAAAGAAGCATCGCCGGAAAA
AGAGAAAAGCGAAGTAATGCGATCTATTCACCGGTGAGTGGGTCCCGAACTCTGAAGCTC
CGTACTACACAAACACGACATGCTGGGCGATACACGAACACCAAAACTGCATGAAATATG
GAAGACCCGATTTAGGTTTCTTGAAATGGAGATGGAAACCGAAAGAGTGTGATCTCCCTT
TGTTTGATCCTTTCGAGTTTCTTGAGATCGTTAGAGGAAAAAGCATGGCGTTTGTTGGTG
ACTCGGTTAACAGAAACCACGTACAGTCTTTGATATGCCTACTCTCGAGGGTACCCATTC
TCATGCTTAAGTATTCAATATATTTATTAATTAATTCATGTATTTTAGTATTATTTTATG
ATTTTTAAAATGATACTAACTTCATTTGGTACCCATTATCATGTTTATATTTGTTAACTA
TTCCATGTATTTTGGTATTATTGTATGATTTTAAAAATAATACTAACTTCACT

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL4357Contig1 799 2 8 U
GATCACTTAAACCGGCAAAAGAAATTCAAGCTGGATATGAGTGGCTCATCCCAAACTCTG
TGAAAGAGTTGGCAGCTACTGATATACGTATGAGGTTCTTTCGGGAAACTGTTACGGACG
TGACGGTTGCACTAGTTTCAGGATGCGACATGACAAACGATTTCACGGAGTATACAAACT
GGTCACAGCAAAGGATACAAGATCATGCAGGCTTCAATCTGCTTCTCTTTGGTATAGAGA
TGTTCCAAGTGAAGCATAAATGGAGATATAAACCATTTCCAATGTCTGAACTGGAACTAA
AGGATGTGTTGAGCTGTTACCTCACTGGCCAAGCAAGACACATGGTGGTATCATTGCATG
TTGAAGTTAGAAGAACTATTAAAATGTCTCGGGTTTTACTACTTGTCACAGACTGTTATG
GTGATTTAACAAGTTATGGAGAAGTTCTCTACATCAATTTTCAGTGTTACAAGCCTGTAC
AAGTGATGGTTCAAGAAGATAGAAATTCGCTGAAGGTGGTTCAAGCTCACAAGAAAGCTG
TCACCAGATGTCTTGTCCAGTGGAAGGAGCATCCTCCAGACCAAGTACTCAAGCTATCAT
CCTTGAGGACAAAGATGTTCTGAAAAAGGGAGTATTGTGACAGCTTAAAACTATACCACT
TGGTTTAGTTATTATGATTTACTTCTGGTTATGCTGGTTTGTTTCATTAACCGGTTTGTT
GGTTCAATCAAACTATATGTACTGGTCATAGGACCATTTTAGATAGTCAATCAAACAATC
AAATAATTATCTTTATCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D563TF U 1
AF RR2D563JQ C 1
BS 1 726 RR2D563TF
BS 727 727 RR2D563JQ
BS 728 731 RR2D563TF
BS 732 732 RR2D563JQ
BS 733 751 RR2D563TF
BS 752 752 RR2D563JQ
BS 753 769 RR2D563TF
BS 770 799 RR2D563JQ

RD RR2D563TF 779 0 0
GATCACTTAAACCGGCAAAAGAAATTCAAGCTGGATATGAGTGGCTCATCCCAAACTCTG
TGAAAGAGTTGGCAGCTACTGATATACGTATGAGGTTCTTTCGGGAAACTGTTACGGACG
TGACGGTTGCACTAGTTTCAGGATGCGACATGACAAACGATTTCACGGAGTATACAAACT
GGTCACAGCAAAGGATACAAGATCATGCAGGCTTCAATCTGCTTCTCTTTGGTATAGAGA
TGTTCCAAGTGAAGCATAAATGGAGATATAAACCATTTCCAATGTCTGAACTGGAACTAA
AGGATGTGTTGAGCTGTTACCTCACTGGCCAAGCAAGACACATGGTGGTATCATTGCATG
TTGAAGTTAGAAGAACTATTAAAATGTCTCGGGTTTTACTACTTGTCACAGACTGTTATG
GTGATTTAACAAGTTATGGAGAAGTTCTCTACATCAATTTTCAGTGTTACAAGCCTGTAC
AAGTGATGGTTCAAGAAGATAGAAATTCGCTGAAGGTGGTTCAAGCTCACAAGAAAGCTG
TCACCAGATGTCTTGTCCAGTGGAAGGAGCATCCTCCAGACCAAGTACTCAAGCTATCAT
CCTTGAGGACAAAGATGTTCTGAAAAAGGGAGTATTGTGACAGCTTAAAACTATACCACT
TGGTTTAGTTATTATGATTTACTTCTGGTTATGCTGGTTTGTTTCATTAACCGGTTTGTT
GGTTCA*TCAA*CTATATGTACTGGTCATAG*ACCATTTTAGATAGTCA
TCAACATCAA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2D563JQ 799 0 0
GATCACTTAAAC*GGCAAAAGAAAT*CAAGCTGGATATGAGTGGCTCATCCCAAACTCTG
TGAAAGAGTTGGCAGCTACTGATATACGTATGAGGT*CTTTCGGGAAACTGTTACGGACG
TGACGGTTGCACTAGTTTCAGGATGCGACATGACAAACGATTTCACGGAGTATACAAACT
GGTCACAGCAAAGGATACAAGATCATGCAGGCTTCAATCTGCTTCTCTTTGGTATAGAGA
TGTTCCAAGTGAAGCATAAATGGAGATATAAACCATTTCCAATGTCTGAACTGGAACTAA
AGGATGTGTTGAGCTGTTACCTCACTGGCCAAGCAAGACACATGGTGGTATCATTGCATG
TTGAAGTTAGAAGAACTATTAAAATGTCTCGGGTTTTACTACTTGTCACAGACTGTTATG
GTGATTTAACAAGTTATGGAGAAGTTCTCTACATCAATTTTCAGTGTTACAAGCCTGTAC
AAGTGATGGTTCAAGAAGATAGAAATTCGCTGAAGGTGGTTCAAGCTCACAAGAAAGCTG
TCACCAGATGTCTTGTCCAGTGGAAGGAGCATCCTCCAGACCAAGTACTCAAGCTATCAT
CCTTGAGGACAAAGATGTTCTGAAAAAGGGAGTATTGTGACAGCTTAAAACTATACCACT
TGGTTTAGTTATTATGATTTACTTCTGGTTATGCTGGTTTGTTTCATTAACCGGTTTGTT
GGTTCAATCAAACTATATGTACTGGTCATAGGACCATTTTAGATAGTCAATCAAACAATC
AAATAATTATCTTTATCCC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL4358Contig1 659 2 1 U
GGAGACTAGTCCCCTTTGCTTGGCTTAGGATTGTTCTTGCATCATCTTAAAAAATGTCTT
CGCTTTCTTTACTCAGCGGCGGTGCTCTCCAGGCTCGTTGCGCAAGACATGCACATGTTA
GCCCACGCGCGGCGCATCCTACCAAACCCGCGCCTCCGTCCTTCTTGCCAACCGGCGCCT
CTCGCAGGAACTTGCTGTTTTCCCTGACGGCAGCCACGGTGGTGACGGGACTGCTGCCTG
CATCAATGGCGGAGACTATTCCGTTATTCGGGATCAGAAAGAAGCTGAAAAAGGCGGAAG
AAGAAGCGGTGGAGATCGTGAAGGAAGGCTTCGAGACGGCGGAGAAAGGCGTAGAAGCGG
CTGAGAAGGGATTAGAGGCGGCGGAGAAGGGAGTAGAGACGGCGGAGAAAGAAATCGAGA
CGGCCGTTAGTTATAACGGATTGACGCAGGCGGGAGCAGTCGTGGCTGCTGAGTTCGTGG
GAGTTCTTGTCGCAACTTCGGTCGTCAACGGGATTTTAGGACCTGAAGCCCAGAAATCGT
GACTTTTATCATTTCAAGATTGAAAAACATTTAAGTTCAAAAAAAAAAGATTGAAAAACA
TTTGATCTTCGAGTGTAATATTGTGTCTAAAAGTTGTGTTTAATTATAATATATATCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E292TF U 1
AF RR2E292JQ C 162
BS 1 659 RR2E292TF

RD RR2E292TF 659 0 0
GGAGACTAGTCCCCTTTGCTTGGCTTAGGATTGTTCTTGCATCATCTTAAAAAATGTCTT
CGCTTTCTTTACTCAGCGGCGGTGCTCTCCAGGCTCGTTGCGCAAGACATGCACATGTTA
GCCCACGCGCGGCGCATCCTACCAAACCCGCGCCTCCGTCCTTCTTGCCAACCGGCGCCT
CTCGCAGGAACTTGCTGTTTTCCCTGACGGCAGCCACGGTGGTGACGGGACTGCTGCCTG
CATCAATGGCGGAGACTATTCCGTTATTCGGGATCAGAAAGAAGCTGAAAAAGGCGGAAG
AAGAAGCGGTGGAGATCGTGAAGGAAGGCTTCGAGACGGCGGAGAAAGGCGTAGAAGCGG
CTGAGAAGGGATTAGAGGCGGCGGAGAAGGGAGTAGAGACGGCGGAGAAAGAAATCGAGA
CGGCCGTTAGTTATAACGGATTGACGCAGGCGGGAGCAGTCGTGGCTGCTGAGTTCGTGG
GAGTTCTTGTCGCAACTTCGGTCGTCAACGGGATTTTAGGACCTGAAGCCCAGAAATCGT
GACTTTTATCATTTCAAGATTGAAAAACATTTAAGTTCAAAAAAAAAAGATTGAAAAACA
TTTGATCTTCGAGTGTAATATTGTGTCTAAAAGTTGTGTTTAATTATAATATATATCGT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2E292JQ 498 0 0
TTCTTGCCAACCGGCGCCTCTCGCAGGAACTTGCTGTTTTCCCTGACGGCAGCCACGGTG
GTGACGGGACTGCTGCCTGCATCAATGGCGGAGACTATTCCGTTATTCGGGATCAGAAAG
AAGCTGAAAAAGGCGGAAGAAGAAGCGGTGGAGATCGTGAAGGAAGGCTTCGAGACGGCG
GAGAAAGGCGTAGAAGCGGCTGAGAAGGGATTAGAGGCGGCGGAGAAGGGAGTAGAGACG
GCGGAGAAAGAAATCGAGACGGCCGTTAGTTATAACGGATTGACGCAGGCGGGAGCAGTC
GTGGCTGCTGAGTTCGTGGGAGTTCTTGTCGCAACTTCGGTCGTCAACGGGATTTTAGGA
CCTGAAGCCCAGAAATCGTGACTTTTATCATTTCAAGATTGAAAAACATTTAAGTTCAAA
AAAAAAAGATTGAAAAACATTTGATCTTCGAGTGTAATATTGTGTCTAAAAGTTGTGTTT
AATTATAATATATATCGT

QA 1 498 1 498
DS 



AS 1 2

CO CL4359Contig1 868 2 13 U
GGCTGCAGCAGCATGTCGTCTAGCTCAGCTTCTAACCTGGTCTTCTTATCCACATGGTTA
TAATTGTTATCCCCCATCGAAACTGAACTACTGCGTCCTGCTTGTTCTACTACGGAGACA
AGTGATGCACTGAAGCAGAGACCCACCAAGAACGAATGTTAATGTAAAGGTCGAGACTTG
AAACCTAATAACAACAGAAACTTAGCCAATCACAAAACCAAATGGGGTCCCTAAGCACAC
TTCTATCAGTAATCACCGATCAAGAAACTGTTAGGCCTATAAACTTCGAAGCAAATTGTT
CCTCGAATGCAACAAAGAAGGCAGAAAGACATGAAACTTCGAAGCAAAGGAGCAAACTTG
AAGTAAGCTTCGTCAGCATCAACGAGCGTCTCGAACGGTTGGTGATGAACTTACCGAAAA
GGAACAAACTTTCAGATGGAATCGGCAACTCTAATCAAAACCCAGAAGCTTTTCGATCAA
GTAGACTCCGATTGACTCGACTCGACTCAGAGTCGCACCAATCCCAAAATCAAGAAACTC
CAAGTTCGCACCTTTTTTTTAAACTTAAAAAGATATTTGATTAATAGTTGAACCGGAGAT
AACCAATTTGCATTACCGACCTCGTGGGTCAAAGGATACTTACACGTGTTGGTCGACTAT
TTGTTATAAAAGATCTTCCGCTACGAATGGGCCCCTTGACACGAAGTATTGTATAAACTT
TTGATCCTACGTGGCGCAATGAGATCTAAGCTTGCTATTTTCTAGTTTAATTACAGACCG
TAGATTTTAGAAAGACAACTTATATACTCCTAAAACCACAATTAGAATTTAAGCTCTTCT
GTTTATTTACATTGAACCAAACATGAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AH54JQ C 1
AF RR2AH54TF U 1
BS 1 797 RR2AH54TF
BS 798 798 RR2AH54JQ
BS 799 814 RR2AH54TF
BS 815 816 RR2AH54JQ
BS 817 820 RR2AH54TF
BS 821 821 RR2AH54JQ
BS 822 826 RR2AH54TF
BS 827 827 RR2AH54JQ
BS 828 829 RR2AH54TF
BS 830 831 RR2AH54JQ
BS 832 855 RR2AH54TF
BS 856 856 RR2AH54JQ
BS 857 868 RR2AH54TF

RD RR2AH54JQ 868 0 0
GGCTGCAGCAGCATGTCGTCTAGCTCAGCTTCTAACCTGGTCTTCTTATCCACATGGTTA
TAATTGTTATCCCCCATCGAAACTGAACTACTGCGTCCTGCTTGTTCTACTACGGAGACA
AGTGATGCACTGAAGCAGAGACCCACCAAGAACGAATGTTAATGTAAAGGTCGAGACTTG
AAACCTAATAACAACAGAAACTTAGCCAATCACAAAACCAAATGGGGTCCCTAAGCACAC
TTCTATCAGTAATCACCGATCAAGAAACTGTTAGGCCTATAAACTTCGAAGCAAATTGTT
CCTCGAATGCAACAAAGAAGGCAGAAAGACATGAAACTTCGAAGCAAAGGAGCAAACTTG
AAGTAAGCTTCGTCAGCATCAACGAGCGTCTCGAACGGTTGGTGATGAACTTACCGAAAA
GGAACAAACTTTCAGATGGAATCGGCAACTCTAATCAAAACCCAGAAGCTTTTCGATCAA
GTAGACTCCGATTGACTCGACTCGACTCAGAGTCGCACCAATCCCAAAATCAAGAAACTC
CAAGTTCGCACCTTTTTTTTAAACTTAAAAAGATATTTGATTAATAGTTGAACCGGAGAT
AACCAATTTGCATTACCGACCTCGTGGGTCAAAGGATACTTACACGTGTTGGTCGACTAT
TTGTTATAAAAGATCTTCCGCTACGAATGGGCCCCTTGACACGAAGTATTGTATAAACTT
TTGATCCTACGTGGCGCAATGAGATCTAAGCTTGCTATTTTCTAGTTTAATTACAGACCG
TAGATTTTAGAAAGACAACTTATATACTCCTAAAACCACAATTAGAATTTAAGCTCTTCT
GTTTATTTACATTGAACCAAACATGAGT

QA 1 868 1 868
DS 

RD RR2AH54TF 868 0 0
GGCTGCAGCAGCATGTCGTCTAGCTCAGCTTCTAACCTGGTCTTCTTATCCACATGGTTA
TAATTGTTATCCCCCATCGAAACTGAACTACTGCGTCCTGCTTGTTCTACTACGGAGACA
AGTGATGCACTGAAGCAGAGACCCACCAAGAACGAATGTTAATGTAAAGGTCGAGACTTG
AAACCTAATAACAACAGAAACTTAGCCAATCACAAAACCAAATGGGGTCCCTAAGCACAC
TTCTATCAGTAATCACCGATCAAGAAACTGTTAGGCCTATAAACTTCGAAGCAAATTGTT
CCTCGAATGCAACAAAGAAGGCAGAAAGACATGAAACTTCGAAGCAAAGGAGCAAACTTG
AAGTAAGCTTCGTCAGCATCAACGAGCGTCTCGAACGGTTGGTGATGAACTTACCGAAAA
GGAACAAACTTTCAGATGGAATCGGCAACTCTAATCAAAACCCAGAAGCTTTTCGATCAA
GTAGACTCCGATTGACTCGACTCGACTCAGAGTCGCACCAATCCCAAAATCAAGAAACTC
CAAGTTCGCACCTTTTTTTTAAACTTAAAAAGATATTTGATTAATAGTTGAACCGGAGAT
AACCAATTTGCATTACCGACCTCGTGGGTCAAAGGATACTTACACGTGTTGGTCGACTAT
TTGTTATAAAAGATCTTCCGCTACGAATGGGCCCCTTGACACGAAGTATTGTATAAACTT
TTGATCCTACGTGGCGCAATGAGATCTAAGCTTGCTATTTTCTAGTTTAATTACAGACCG
TAGATTTTAGAAAGACA*CTTATATACTCCTAAA**CACA*TTAGATTT**AGCTCTTCT
GTTTATTTACATTGA*CCAAACATGAGT

QA 1 868 1 868
DS 



AS 1 2

CO CL4360Contig1 729 2 3 U
TTTTTTCATAGACAAACGGAACTTAATATATGAACGAAACGAAAAAGGACAACAACGAAA
GAAAATAGCCGATATATCGAAGAATCAAAAGCTTATATATGCATCATCATGATGTATGAT
TATATAAAGAAAGTAAATACAACAAAAAAAATTGTAAAGTTAGAATCATAGGGTACGTTA
CGGAAGAAAAATCATTAACGATCAAGACTGAAGATTGAACGGTGTTGAATCCAATCCTCT
TCTCTATCATTTTGTTATCACTTAGCGTATCTATAGCAATGCGTGATCGCACTGCATCCA
CGCCTATAAGGATTATTCCTTCTCCCCTTCTTGCAATCGTAGTAAGACCGGCCACGTCTA
TTGCAAGGCACATTATTCTTTTTAAGAGCATCGTAGCCAATGTAACGACGTCCTCTAGCG
AGTTGACGTCGGTTTGTCTCTGAATCCATTAGAGATTCTAGTTCACCATCATCTCCGATA
CAACCTTGCCCGTTGAAGCAAGATTTAGTCAAAGGGTACGTCGCATTGACGGTTGTAGCT
ACCATAGCTAAGATCAAGAGACCAAAGATGATTAACAACTTGACACCACCCATTTTGTAT
ATATATTTGTTTTTATACAGATGAGTTATATTAAAACCCCTTTTCTTTAGTTTTTGGTTT
CTTCTACGACCCTTCCTTATGTAAGGAGAGGGAGAAATATAAAGTGATAGAGATTGTGCA
GAAGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB21JQ U 81
AF RR2HB21TF C 1
BS 1 80 RR2HB21TF
BS 81 191 RR2HB21JQ
BS 192 729 RR2HB21TF

RD RR2HB21JQ 111 0 0
AGAATCAAAAGCTTATATATGCATCATCATGATGTATGATTATATAAAGAAAGTAAATAC
AACAAAAAAAATTGTAAAGTTAGAATCATAGGGTACGTTACGGAAGAAAAA

QA 1 111 1 111
DS 

RD RR2HB21TF 729 0 0
TTTTTTCATAGACAAACGGAACTTAATATATGAACGAAACGAAAAAGGACAACAACGAAA
GAAAATAGCCGATATATCGAAGAATCAAAAGCTTATATATGCATCATCATGATGTATGAT
TATATAAAGAAAGTAAATACAACAAAAAAAATTGTAAAGTTAGAATCATAGGGTACGTTA
CGGAAGAAAAATCATTAACGATCAAGACTGAAGATTGAACGGTGTTGAATCCAATCCTCT
TCTCTATCATTTTGTTATCACTTAGCGTATCTATAGCAATGCGTGATCGCACTGCATCCA
CGCCTATAAGGATTATTCCTTCTCCCCTTCTTGCAATCGTAGTAAGACCGGCCACGTCTA
TTGCAAGGCACATTATTCTTTTTAAGAGCATCGTAGCCAATGTAACGACGTCCTCTAGCG
AGTTGACGTCGGTTTGTCTCTGAATCCATTAGAGATTCTAGTTCACCATCATCTCCGATA
CAACCTTGCCCGTTGAAGCAAGATTTAGTCAAAGGGTACGTCGCATTGACGGTTGTAGCT
ACCATAGCTAAGATCAAGAGACCAAAGATGATTAACAACTTGACACCACCCATTTTGTAT
ATATATTTGTTTTTATACAGATGAGTTATATTAAAACCCCTTTTCTTTAGTTTTTGGTTT
CTTCTACGACCCTTCCTTATGTAAGGAGAGGGAGAAATATAAAGTGATAGAGATTGTGCA
GAAGAACCC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL4361Contig1 633 2 2 U
GGGCATAAAGATATAGTTTTATATAACTAGATAGATATATCTCGTAACACTTTCATATCA
CATCTCTTTAGATCTAGAGAGTACATTATTGAAATAAAACACCCAAATACATAAAGATAG
ATACGTGTATAGATATTCAATGAGTATCTACTCATTAGACAAAAGCACTTCGTCGATTTC
TTTGGTCGTTTTGACAGCCACTTGGAGCAGAAACTCCGGGGGAGCCGCGTTTTCGTCAAT
CCTCTCGTATTCCATGCGCCATTTCACCACACCTCCAGATCCTCCTTGCTTCGGGGTCAC
CTGGAGAGTGCATAGGAAGCTCTTTAACTCTTTCATCATATCTCCCTCTAGTACTCTAAA
CTTTATCATATTGTTCTTCGGTTCCACTGCCTCGATCCTCTGATAGGCCACCAATGGCTT
GCCATCCTGGACATAGTTCCAGGTGAGGAGAGTGCCAACTTTGCCCATCTCTCCCTTTTC
CACACGACATCCCTTGAGGTTTTCAGGACTGGCTTTAGACAAGTCTTGTGGTCTCACTGC
GAACATGTGATAGAACTTCGTGGCTGGAGCTTTGATCTCAACGTCTGCCTCAATCTCTCC
TTGTAGAGAAGGCTTCAACATCGCTTGTGCCAC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G424JQ U 1
AF RR2AB16TF C 5
BS 1 503 RR2G424JQ
BS 504 633 RR2AB16TF

RD RR2G424JQ 503 0 0
GGGCATAAAGATATAGTTTTATATAACTAGATAGATATATCTCGTAACACTTTCATATCA
CATCTCTTTAGATCTAGAGAGTACATTATTGAAATAAAACACCCAAATACATAAAGATAG
ATACGTGTATAGATATTCAATGAGTATCTACTCATTAGACAAAAGCACTTCGTCGATTTC
TTTGGTCGTTTTGACAGCCACTTGGAGCAGAAACTCCGGGGGAGCCGCGTTTTCGTCAAT
CCTCTCGTATTCCATGCGCCATTTCACCACACCTCCAGATCCTCCTTGCTTCGGGGTCAC
CTGGAGAGTGCATAGGAAGCTCTTTAACTCTTTCATCATATCTCCCTCTAGTACTCTAAA
CTTTATCATATTGTTCTTCGGTTCCACTGCCTCGATCCTCTGATAGGCCACCAATGGCTT
GCCATCCTGGACATAGTTCCAGGTGAGGAGAGTGCCAACTTTGCCCATCTCTCCCTTTTC
CACACGACATCCCTTGAGGTTTT

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2AB16TF 629 0 0
ATAAAGATATAGTTTTATATAACTAGATAGATATATCTCGTAACACTTTCATATCACATC
TCTTTAGATCTAGAGAGTACATTATTGAAATAAAACACCCAAATACATAAAGATAGATAC
GTGTATAGATATTCAATGAGTATCTACTCATTAGACAAAAGCACTTCGTCGATTTCTTTG
GTCGTTTTGACAGCCACTTGGAGCAGAGACTCCGGGGGAGCCGCGTTTTCGTCAATCCTC
TCGTATTCCATGCGCCATTTCACCACACCTCCAGATCCTCCTTGCTTCGGGGTCACCTGG
AGAGTGCATAGGAAGCTCTTTAACTCTTTCATCATATCTCCCTCTAGTACTCTAAACTTT
ATCATATTGTTCTTCGGTTCCACTGCCTCGATCCTCTGATAGGCCACCAATGGCTTGCCA
TCCTGGACATAGTTCCAGGTGAGGAGAGTGCCAACTTTGCCCATCTCTCCCTTTTCCACA
CGACATCCCTTGAGGTTTTCAGGACTGGCTTTAGACAAGTCTTGTGGTCTCACTGCGAAC
ATGTGATAGAACTTCGTGGCTGGAGCTTTGATCTCAACGTCTGCCTCAATCTCTCCTTGT
AGAGAAGGCTTCAACATCGCTTGTGCCAC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL4362Contig1 781 2 2 U
GGACTTGCAAGACTTTTCTTCTTCTGTCTTGTCTGCATATAAGAAAATAAAATATGGCAA
CCATCGAGGAAAGCTCTGATTTGGATGATATACAGAAGCATCTATTTGAGGACCTGATGA
TCCCTGATGGTTTCATGGAAGATTTTGTCTTTGATGATGCTGATTTTTTCTCAGGACTCT
GGTCTCTAGAACCCTTGAACCAAGTTCCTAAACAGGAACCTGGTTCACCGGTTCTTGATC
CAGATTCCTATGTCCAAGAGTTTCTGCAAATGGAAGCAGAATCATCATCAACAACAACTA
CAACCACAGCATCAACAGAGGTTGAAACTGTCTCAAACCGGAAAAGATCAAAGAGAGCTG
AAGAGACAAGGCATTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCGTGGGGAAAATTCGCAGCAGAGA
TTCGAGATCCGGCTAAGAAAGGATCAAGGATTTGGCTAGGCACTTTTGAGAGTGACATTG
ATGCTGCAAGAGCTTATGACTATGAAGCTTTTAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCA
ACTTTCCTTTGGATGCAGGAAAGTATGATGCTCCGGTCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAA
GAACCGATGTACCGGAGCCTCAAGGAACAACTTCCAGTAATTCATCATCGAACTAATGGG
ATTGGTGATGCTTAAGTTTTAATTAGTATAGGTAAATATGTGAAGTATCATGTATAGAGA
GCCAAGAAAATGTTGGATTAGTGTAGTTAATGTGTAATAAAGAGTTCCTGTGACAATGGA
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2DE84TF U 1
AF RR2DE84JQ C 130
BS 1 620 RR2DE84TF
BS 621 781 RR2DE84JQ

RD RR2DE84TF 620 0 0
GGACTTGCAAGACTTTTCTTCTTCTGTCTTGTCTGCATATAAGAAAATAAAATATGGCAA
CCATCGAGGAAAGCTCTGATTTGGATGATATACAGAAGCATCTATTTGAGGACCTGATGA
TCCCTGATGGTTTCATGGAAGATTTTGTCTTTGATGATGCTGATTTTTTCTCAGGACTCT
GGTCTCTAGAACCCTTGAACCAAGTTCCTAAACAGGAACCTGGTTCACCGGTTCTTGATC
CAGATTCCTATGTCCAAGAGTTTCTGCAAATGGAAGCAGAATCATCATCAACAACAACTA
CAACCACAGCATCAACAGAGGTTGAAACTGTCTCAAACCGGAAAAGATCAAAGAGAGCTG
AAGAGACAAGGCATTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCGTGGGGAAAATTCGCAGCAGAGA
TTCGAGATCCGGCTAAGAAAGGATCAAGGATTTGGCTAGGCACTTTTGAGAGTGACATTG
ATGCTGCAAGAGCTTATGACTATGAAGCTTTTAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCA
ACTTTCCTTTGGATGCAGGAAAGTATGATGCTCCGGTCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAA
GAACCGATGTACCGGAGCCT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2DE84JQ 652 0 0
GTTTCATGGAAGATTTTGTCTTTGATGATGCTGATTTTTTCTCAGGACTCTGGTCTCTAG
AACCCTTGAACCAAGTTCCTAAACAGGAACCTGGTTCACCGGTTCTTGATCCAGATTCCT
ATGTCCAAGAGTTTCTGCAAATGGAAGCAGAATCATCATCAACAACAACTACAACCACAG
CATCAACAGAGGTTGAAACTGTCTCAAACCGGAAAAGATCAAAGAGAGCTGAAGAGACAA
GGCATTACAGAGGCGTGAGAAGGAGGCCGTGGGGAAAATTCGCAGCAGAGATTCGAGATC
CGGCTAAGAAAGGATCAAGGATTTGGCTAGGCACTTTTGAGAGTGACATTGATGCTGCAA
GAGCTTATGACTATGAAGCTTTTAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTTCCTT
TGGATGCAGGAAAGTATGATGCTCCGGTCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAACCGATG
TACCGGAGCCTCAAGGAACAACTTCCAGTAATTCATCATCGAACTAATGGGATTGGTGAT
GCTTAAGTTTTAATTAGTATAGGTAAATATGTGAAGTATCATGTATAGAGAGCCAAGAAA
ATGTTGGATTAGTGTAGTTAATGTGTAATAAAGAGTTCCTGTGACAATGGAG

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL4363Contig1 812 2 4 U
CCTAAATTACGAAGAATCTAAAGCTAAGCTGAACCAAAAAAACGTGAAAGAAAGGTGATC
ATCGGAGATGGCATCGAAACGGATTTTGAAGGAATTGAAGGACCTGCAGAAGGATCCTCC
TACTTCATGCAGCGCAGGACCGGTGGCGGAAGACATGTTCCATTGGCAAGCGACGATAAT
GGGTCCATCCGACAGCCCTTACTCTGGCGGTGTTTTTCTTGTTACCATTCATTTCCCTCC
TGATTATCCTTTTAAACCTCCCAAGGTTACTTCCCTTCCTTTCACTACTACTCTCTATCG
ATGGCATTGCATGTTGTGCTTTCTTTAGTTTCTCATATGTGTGTGTGGTGGTGGGGTGTG
ACCCCAAAAACAAATTGTAGGTGGCTTTTAGGACAAAGGTGTTCCATCCAAACATCAACA
GCAATGGGAGCATCTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAGTGGAGTCCTGCCCTCACCATTT
CCAAGGTGCTGCTGTCGATCTGCTCGTTGTTGACGGATCCAAACCCGGATGATCCTTTGG
TTCCGGAGATTGCTCACATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTACGAGTCTACTGCCCGTA
CCTGGACTCAAAAGTACGGAATGGGCTGACCACTCTCCCCCGCAAGGACTTCCCTTTTTA
ATAACCTAAAAGAACTCTTCTCATTTCTATGTAATCATATTTATAAAACTTTTCTGTCTT
ATTAAAAAAAATTGTGAAGACCGAGATCAGTAAGAAATCGCATGATCTCCCATTTTCATT
TAAATCTCATGGAATTTGTAAACTTTAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX87TF U 1
AF RR2CX87JQ C 118
BS 1 353 RR2CX87TF
BS 354 354 RR2CX87JQ
BS 355 612 RR2CX87TF
BS 613 812 RR2CX87JQ

RD RR2CX87TF 613 0 0
CCTAAATTACGAAGAATCTAAAGCTAAGCTGAACCAAAAAAACGTGAAAGAAAGGTGATC
ATCGGAGATGGCATCGAAACGGATTTTGAAGGAATTGAAGGACCTGCAGAAGGATCCTCC
TACTTCATGCAGCGCAGGACCGGTGGCGGAAGACATGTTCCATTGGCAAGCGACGATAAT
GGGTCCATCCGACAGCCCTTACTCTGGCGGTGTTTTTCTTGTTACCATTCATTTCCCTCC
TGATTATCCTTTTAAACCTCCCAAGGTTACTTCCCTTCCTTTCACTACTACTCTCTATCG
ATGGCATTGCATGTTGTGCTTTCTTTAGTTTCTCATATGTGTGTGTGGTGGTGTGGTGTG
ACCCCAAAAACAAATTGTAGGTGGCTTTTAGGACAAAGGTGTTCCATCCAAACATCAACA
GCAATGGGAGCATCTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAGTGGAGTCCTGCCCTCACCATTT
CCAAGGTGCTGCTGTCGATCTGCTCGTTGTTGACGGATCCAAACCCGGATGATCCTTTGG
TTCCGGAGATTGCTCACATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTACGAGTCTACTGCCCGTA
CCTGGACTCAAA
G

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2CX87JQ 695 0 0
TCCTACTTCATGCAGCGCAGGACCGGTGGCGGAAGACATGTTCCATTGGCAAGCGACGAT
AATGGGTCCATCCGACAGCCCTTACTCTGGCGGTGTTTTTCTTGTTACCATTCATTTCCC
TCCTGATTATCCTTTTAAACCTCCCAAGGTTACTTCCCTTCCTTTCACTACTACTCTCTA
TCGATGGCATTGCATGTTGTGCTTTCTTTAGTTTCTCATATGTGTGTGTGGTGGTGGGGT
GTGACCCCAAAAACAAATTGTAGGTGGCTTTTAGGACAAAGGTGTTCCATCCAAACATCA
ACAGCAATGGGAGCATCTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAGTGGAGTCCTGCCCTCACCA
TTTCCAAGGTGCTGCTGTCGATCTGCTCGTTGTTGACGGATCCAAACCCGGATGATCCTT
TGGTTCCGGAGATTGCTCACATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTACGAGTCTACTGCCC
GTACCTGGACTCAAAAGTACGGAATGGGCTGACCACTCTCCCCCGCAAGGACTTCCCTTT
TTAATAACCTAAAAGAACTCTTCTCATTTCTATGTAATCATATTTATAAAACTTTTCTGT
CTTATTAAAAAAAATTGTGAAGACCGAGATCAGTAAGAAATCGCATGATCTCCCATTTTC
ATTTAAATCTCATGGAATTTGTAAACTTTAAGTCC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL4364Contig1 922 2 2 U
TATACACCCCAAAGGTGTTGGCCTTATACATGCCGCCTTCGGTCGAATACATAATCTCTC
TGCTTTCTGTTTTGAGGATCGGAGAAGCCTTTTTGCCTTTAGATCCTTCTTGGCCGAGAG
AAAGAGTCTTGTCTATTGTTTCCTCTTCGAATGTTTCTCTTGTTATTGCCTGCGGCTCTT
CTTTCGATCAGTTCGGGTGTGCGCCGCTTCACAGATCGCATTGGCTTGTTCAAAACATCC
CTGTGTTGTTCTTTTCCATGAGTGAGAGGTTGAGTGCTGTAACTGCTCGGCGATCGAGCC
TTGTTTGGCCTTGCGAGAGAGAGAAGTAAAGGAAGTTTTGTTATCTCATGTACACTTCTG
GATCTACTGGAAAGCCTAAAGGAATATGTGGCACTGAGCAAGGACTTTTAAACCGTTTCA
AGTGGATGCAAGAGCACTATCCTGTTGTTGGAGAGCAGCAATTCGCTTTCAAGACTTCAG
TTGGTTTTATTGATCATTTGCAGGAGTTTCTTGGTGCTACTCTCAATTCCACCCCATTAG
TCATTCCTCCATTTACTCTCCTAAAACAGAATATGATATCCTTCCTTGATTTTCTGGAGG
CGTATTCTATCAGTAGGCTCGTAGCTGTCCCATCGATGATCAGAGCTATTCTACCTACTT
TACAACATCGTGGACATAATAAGCTCAAAAGTTGCCTGAAGCTGGTAGTTTTAAGCGGAG
AACCCTTTCCTTTGAGCCTGTGGGATTCACTTCACAAGTTACTTCCGGATACATGTTTTC
TGAACCTATATGGGAGTACAGAGGTGAGAAAATATGCTTATTATGATTTAATCTCAAGGA
TCTTCTTAAGCTTGTATACTTAAAAAAACTCCTAGCAGTGCCGGATAGTTGTTACCGTGT
TAATGGTTTGAAAGATGTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH31TF U 1
AF RR2CH31JQ C 174
BS 1 245 RR2CH31TF
BS 246 922 RR2CH31JQ

RD RR2CH31TF 245 0 0
TATACACCCCAAAGGTGTTGGCCTTATACATGCCGCCTTCGGTCGAATACATAATCTCTC
TGCTTTCTGTTTTGAGGATCGGAGAAGCCTTTTTGCCTTTAGATCCTTCTTGGCCGAGAG
AAAGAGTCTTGTCTATTGTTTCCTCTTCGAATGTTTCTCTTGTTATTGCCTGCGGCTCTT
CTTTCGATCAGTTCGGGTGTGCGCCGCTTCACAGATCGCATTGGCTTGTTCAAAACATCC
CTGTG

QA 1 245 1 245
DS 

RD RR2CH31JQ 749 0 0
GGCTCTTCTTTCGATCAGTTCGGGTGTGCGCCGCTTCACAGATCGCATTGGCTTGTTCAA
AACATCCCTGTGTTGTTCTTTTCCATGAGTGAGAGGTTGAGTGCTGTAACTGCTCGGCGA
TCGAGCCTTGTTTGGCCTTGCGAGAGAGAGAAGTAAAGGAAGTTTTGTTATCTCATGTAC
ACTTCTGGATCTACTGGAAAGCCTAAAGGAATATGTGGCACTGAGCAAGGACTTTTAAAC
CGTTTCAAGTGGATGCAAGAGCACTATCCTGTTGTTGGAGAGCAGCAATTCGCTTTCAAG
ACTTCAGTTGGTTTTATTGATCATTTGCAGGAGTTTCTTGGTGCTACTCTCAATTCCACC
CCATTAGTCATTCCTCCATTTACTCTCCTAAAACAGAATATGATATCCTTCCTTGATTTT
CTGGAGGCGTATTCTATCAGTAGGCTCGTAGCTGTCCCATCGATGATCAGAGCTATTCTA
CCTACTTTACAACATCGTGGACATAATAAGCTCAAAAGTTGCCTGAAGCTGGTAGTTTTA
AGCGGAGAACCCTTTCCTTTGAGCCTGTGGGATTCACTTCACAAGTTACTTCCGGATACA
TGTTTTCTGAACCTATATGGGAGTACAGAGGTGAGAAAATATGCTTATTATGATTTAATC
TCAAGGATCTTCTTAAGCTTGTATACTTAAAAAAACTCCTAGCAGTGCCGGATAGTTGTT
ACCGTGTTAATGGTTTGAAAGATGTTGAT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL4365Contig1 709 2 5 U
GGGTCGGCCAAAAGATCTTCACATTCAGTTGTCGTCGTCTACCGAGAGACTTTGCAAAGA
TGGCGAGAAGAGATAAAAGTGAGATGTCAATACTCATGATCATGATGATCTCATCAATGC
TGATGACCATGGTTGACTCTTCTAGATCAGTCCAAAGATCCCGTGACAGTGAAGAATCTG
AGATCGTACGAAGACACTTGCTCGCTAATGGCCTAGGCGTCACTCCTCCAATGGGGTGGA
ATAGCTGGAACCATTTTAGCTGTAACATAAATGAGAAAGTCATCAAAGAAACTGCTGATG
CTTTGGTTAGCACTGGCCTCTCTAAGCTCGGTTACAACTATGTTAATATCGATGATTGTT
GGGCTGAACTTGCTCGTGACCAAAAGGGCAATCTGGTGCCAAAGAAGTCAACGTTCCCTT
CTGGTATCAAAGCCCTTGCAGATTACGTTCACAGCAAGGGCCTTAAGCTTGGGATTTACT
CTGATGCAGGGTACTTGACATGCAGCAAAACAATGCCGGGCTCTCTAGGCCATGAGGAGC
AAGATGCCAAGACATTTGCAGAATGGGGAATAGATTACTTGAAGTATGACAACTGCAACA
CTGATGGCTCTAGACCAACCGTCAGGTATCCAGTTATGACCCGAGCTCTGATGAAATCTG
GCCGTCCAATCTTTCACTCCTTGTGTGAATGGGGGGACATGCATCCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE19TF U 1
AF RR2CU50TF U 161
BS 1 175 RR2AE19TF
BS 176 176 RR2CU50TF
BS 177 493 RR2AE19TF
BS 494 494 RR2CU50TF
BS 495 709 RR2AE19TF

RD RR2AE19TF 709 0 0
GGGTCGGCCAAAAGATCTTCACATTCAGTTGTCGTCGTCTACCGAGAGACTTTGCAAAGA
TGGCGAGAAGAGATAAAAGTGAGATGTCAATACTCATGATCATGATGATCTCATCAATGC
TGATGACCATGGTTGACTCTTCTAGATCAGTCCAAAGATCCCGTGACAGTGAAGAGTCTG
AGATCGTACGAAGACACTTGCTCGCTAATGGCCTAGGCGTCACTCCTCCAATGGGGTGGA
ATAGCTGGAACCATTTTAGCTGTAACATAAATGAGAAAGTCATCAAAGAAACTGCTGATG
CTTTGGTTAGCACTGGCCTCTCTAAGCTCGGTTACAACTATGTTAATATCGATGATTGTT
GGGCTGAACTTGCTCGTGACCAAAAGGGCAATCTGGTGCCAAAGAAGTCAACGTTCCCTT
CTGGTATCAAAGCCCTTGCAGATTACGTTCACAGCAAGGGCCTTAAGCTTGGGATTTACT
CTGATGCAGGGTATTTGACATGCAGCAAAACAATGCCGGGCTCTCTAGGCCATGAGGAGC
AAGATGCCAAGACATTTGCAGAATGGGGAATAGATTACTTGAAGTATGACAACTGCAACA
CTGATGGCTCTAGACCAACCGTCAGGTATCCAGTTATGACCCGAGCTCTGATGAAATCTG
GCCGTCCAATCTTTCACTCCTTGTGTGAATGGGGGGACATGCATCCAGC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2CU50TF 509 0 0
CCGTGACAGTGAAGAATCTGAGATCGTACGAAGACACTTGCTCGCTAATGGCCTAGGCGT
CACTCCTCCAATGGGGTGGAATAGCTGGAACCATTTTAGCTGTAACATAAATGAGAAAGT
CATCAAAGAAACTGCTGATGCTTTGGTTAGCACTGGCCTCTCTAAGCTCGGTTACAACTA
TGTTAATATCGATGATTGTTGGGCTGAACTTGCTCGTGACCAAAAGGGCAATCTGGTGCC
AAAGAAGTCAACGTTCCCTTCTGGTATCAAAGCCCTTGCAGATTACGTTCACAGCAAGGG
CCTTAAGCTTGGGATTTACTCTGATGCAGGGTACTTGACATGCAGCAAAACAATGCCTGG
CTCTCTAGGGCATGAGGAGCAAGATGCCAAGACATTTGCAGAATGGGGAATAGATTACTT
GAAGTATGACAACTGCAACACTGATGGCTCTAGACCAACCGTCAGGTATCCAGTTATGAC
CCGAGCTCTGATGAAATCTGGCCGTCC
CA

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 2

CO CL4366Contig1 460 2 1 U
GGGAATCACCAAACATATCACTCTTCTCTAATCGAAGTTTGAAATCTTAATTTTTCCAGA
GGAAAAAAAAGATGTCAGGGAGAGGAAAGGGAGGAAAAGGATTGGGAAAGGGAGGAGCCA
AGAGGCATCGCAAAGTTCTCCGAGACAACATCCAAGGAATCACCAAACCAGCGATCCGTC
GTCTGGCCAGAAGAGGAGGTGTGAAGCGTATCAGCGGATTGATCTACGAAGAGACTCGCG
GCGTCCTCAAGATCTTTCTGGAGAACGTGATCCGCGACGCCGTTACATACACGGAGCACG
CTCGCCGGAAAACAGTTACGGCTATGGACGTTGTGTACGCTCTCAAGAGGCAGGGAAGAA
CTCTCTACGGATTCGGCGGCTGATTCGATTGTTTCTGTTTCAGATTTTGTAAAATGTTTT
TATGAGAATCAATGGGAATAATAATATGGCATCTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FT26TF U 1
AF RR2FT26JQ C 255
BS 1 460 RR2FT26TF

RD RR2FT26TF 460 0 0
GGGAATCACCAAACATATCACTCTTCTCTAATCGAAGTTTGAAATCTTAATTTTTCCAGA
GGAAAAAAAAGATGTCAGGGAGAGGAAAGGGAGGAAAAGGATTGGGAAAGGGAGGAGCCA
AGAGGCATCGCAAAGTTCTCCGAGACAACATCCAAGGAATCACCAAACCAGCGATCCGTC
GTCTGGCCAGAAGAGGAGGTGTGAAGCGTATCAGCGGATTGATCTACGAAGAGACTCGCG
GCGTCCTCAAGATCTTTCTGGAGAACGTGATCCGCGACGCCGTTACATACACGGAGCACG
CTCGCCGGAAAACAGTTACGGCTATGGACGTTGTGTACGCTCTCAAGAGGCAGGGAAGAA
CTCTCTACGGATTCGGCGGCTGATTCGATTGTTTCTGTTTCAGATTTTGTAAAATGTTTT
TATGAGAATCAATGGGAATAATAATATGGCATCTTTTTCC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2FT26JQ 206 0 0
TTTT
TGGAGAACGTGATCCGGGACGCCGTTACATACACGGAGCACGCTCGCCGGAAAACAGTTA
CGGCTATGGACGTTGTGTACGCTCTCAAGAGGCAGGGAAGAACTCTTTACGGATTCGGCG
GCTGATTCGATTGTTTTTGTTTCAGATTTTGTAAAATGTTTTTATGAGAATCAATGGGAA
TAATAATATGGCATTTTTTTCC

QA 5 206 5 206
DS 



AS 1 2

CO CL4367Contig1 935 2 2 U
GCACATACCTTGCAGTCATGACTGTTGTTTTCTTCTGGGCTGCAGAGAGCACAGACTTCT
TCTCTGCAAAGTTTGGGGTGAGATCTATCAGTGGGAATCCGCACGAGCCTACATCAGCTA
TATACCTCCAAGTTAGTATAATTAGCCAGGCACTTATCTTTGTCACAAGGTCACGTAGCT
GGTCTTATGCTGAACGTCCTGGCTTATGGTTGATCGCTGCCTCTTTCTTAGCTCAGCTGA
TTGCTACTCTCATTGCTGTGTATGCAAACTTGGATTTTGCAAGAATCAGAGGTACAGGGT
GGGGATGGGCAGGAGTTATCTGGCTCTACAGTATAGTTACTTACGTCCCATTGGATATAC
TCAAGTTCATCATCAGATATTCACTAAGTGGTAGAGCCTGGGATAATGTCATTGAGAACA
AGACCGCTTTCACGTCAAAGAAAGACTATGGAAAAGGAGAGAGGGAAGCACAATGGGCAC
AAGCTCAACGTACCCTTCACGGATTGCAACCTGCTCAGCCCTCAGAAATGTTCAACGATA
AGAGTACTTATAGAGAACTTTCAGAGATAGCTGACCAGGCCAAGAGACGGGCTGAAGTCG
CAAGGTTAAGAGAGCATCATACATTGAAAGGTCACGTGGAATCAGTAGTGAAGCAGAAGG
GATTTGACATAGAGGCTATCCAGCAACACTACACCCTGTGATTGATTTTCAGAAACAAAG
TGTGTGTTCTCAGTTTAGTTTAGAACTAAAACCCCACAAGAGTATTGAATAATAAACCAC
CACCACCATAAGAAAATACTGCAAGAAAAGAAAAGAGAAAAAAATGTTAATTTCTTTTAT
CAGCAGTGGCTGTTGGCTGCTTTATTTGTTTTGAGATATTCTTGTTTTTTGCTATGACAA
GCTTACAAAGCTAATAAGATATTACAGTTACTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ03TF U 1
AF RR2FQ03JQ C 166
BS 1 655 RR2FQ03TF
BS 656 935 RR2FQ03JQ

RD RR2FQ03TF 655 0 0
GCACATACCTTGCAGTCATGACTGTTGTTTTCTTCTGGGCTGCAGAGAGCACAGACTTCT
TCTCTGCAAAGTTTGGGGTGAGATCTATCAGTGGGAATCCGCACGAGCCTACATCAGCTA
TATACCTCCAAGTTAGTATAATTAGCCAGGCACTTATCTTTGTCACAAGGTCACGTAGCT
GGTCTTATGCTGAACGTCCTGGCTTATGGTTGATCGCTGCCTCTTTCTTAGCTCAGCTGA
TTGCTACTCTCATTGCTGTGTATGCAAACTTGGATTTTGCAAGAATCAGAGGTACAGGGT
GGGGATGGGCAGGAGTTATCTGGCTCTACAGTATAGTTACTTACGTCCCATTGGATATAC
TCAAGTTCATCATCAGATATTCACTAAGTGGTAGAGCCTGGGATAATGTCATTGAGAACA
AGACCGCTTTCACGTCAAAGAAAGACTATGGAAAAGGAGAGAGGGAAGCACAATGGGCAC
AAGCTCAACGTACCCTTCACGGATTGCAACCTGCTCAGCCCTCAGAAATGTTCAACGATA
AGAGTACTTATAGAGAACTTTCAGAGATAGCTGACCAGGCCAAGAGACGGGCTGAAGTCG
CAAGGTTAAGAGAGCATCATACATTGAAAGGTCACGTGGAATCAGTAGTGAAGCA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2FQ03JQ 770 0 0
CAAGGTCACGTAGCTGGTCTTATGCTGAACGTCCTGGCTTATGGTTGATCGCTGCCTCTT
TCTTAGCTCAGCTGATTGCTACTCTCATTGCTGTGTATGCAAACTTGGATTTTGCAAGAA
TCAGAGGTACAGGGTGGGGATGGGCAGGAGTTATCTGGCTCTACAGTATAGTTACTTACG
TCCCATTGGATATACTCAAGTTCATCATCAGATATTCACTAAGTGGTAGAGCCTGGGATA
ATGTCATTGAGAACAAGACCGCTTTCACGTCAAAGAAAGACTATGGAAAAGGAGAGAGGG
AAGCACAATGGGCACAAGCTCAACGTACCCTTCACGGATTGCAACCTGCTCAGCCCTCAG
AAATGTTCAACGATAAGAGTACTTATAGAGAACTTTCAGAGATAGCTGACCAGGCCAAGA
GACGGGCTGAAGTCGCAAGGTTAAGAGAGCATCATACATTGAAAGGTCACGTGGAATCAG
TAGTGAAGCAGAAGGGATTTGACATAGAGGCTATCCAGCAACACTACACCCTGTGATTGA
TTTTCAGAAACAAAGTGTGTGTTCTCAGTTTAGTTTAGAACTAAAACCCCACAAGAGTAT
TGAATAATAAACCACCACCACCATAAGAAAATACTGCAAGAAAAGAAAAGAGAAAAAAAT
GTTAATTTCTTTTATCAGCAGTGGCTGTTGGCTGCTTTATTTGTTTTGAGATATTCTTGT
TTTTTGCTATGACAAGCTTACAAAGCTAATAAGATATTACAGTTACTTAG

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL4368Contig1 747 2 3 U
TAACTATAAATCGAACAAATAACATTCATAATCTCACGTTTTTTACCAACAACATGCACT
TCTACTATTAATCTTGTGGGTTAGGCCGTGTTTGGCTCCACAACTCCACAAGAATATCAA
ACAACTAAAATAAATCAAAATTAAAAAGGAACAAAAGCTGAAATATTAAAAGCAAAGACA
ATATCTTTTTGTACCGCTAGTGCTTGCTAGTATCATCTTTATATTCATGCTCATATTATA
CCATCACATCATTAAGCTCTAAAACATCCAACAAGATGGTTATGGCTATTATGATGATGA
TTACCATGATAATTAACCGATATCTCTCCATGGATCTTGTCTTTAACATGCCGGAAAACC
TCCACGTGGCAAGGGATCGTGATGTTACCTTTCTGCTCGAATCCATACTCTTCTTCTGCT
TCCTTTAGGGGTTGCATGAACAATGGATGGTTAAAATAGAAAACAGGAACAACAAATCTT
TGTTTCTCCTCTTCACTTGATCCCACTTTGATTGCTAAACAGCCCTTTGGAACATCTCTG
ATCCCTTGTTTTCTGTTGTTCTTAAAACCATTTGAATGGAAGCTCTTGAGGTTTTTCACT
CGGGAACCCATAATTTTTAAAACGATGAAGAGAAAAGAAAACTGAGGAAAAAAAATTGGC
TTGGAAAACGGTTCGAGAGAGGCCAAGGGTTCTCAAGTGGAAGGGAGAGAGTTTATGACA
CTTAATAAAGTGGCCCATTTTTATTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG89JQ U 2
AF RR2EG89TF C 1
BS 1 1 RR2EG89TF
BS 2 699 RR2EG89JQ
BS 700 747 RR2EG89TF

RD RR2EG89JQ 698 0 0
AACTATAAATCGAACAAATAACATTCATAATCTCACGTTTTTTACCAACAACATGCACTT
CTACTATTAATCTTGTGGGTTAGGCCGTGTTTGGCTCCACAACTCCACAAGAATATCAAA
CAACTAAAATAAATCAAAATTAAAAAGGAACAAAAGCTGAAATATTAAAAGCAAAGACAA
TATCTTTTTGTACCGCTAGTGCTTGCTAGTATCATCTTTATATTCATGCTCATATTATAC
CATCACATCATTAAGCTCTAAAACATCCAACAAGATGGTTATGGCTATTATGATGATGAT
TACCATGATAATTAACCGATATCTCTCCATGGATCTTGTCTTTAACATGCCGGAAAACCT
CCACGTGGCAAGGGATCGTGATGTTACCTTTCTGCTCGAATCCATACTCTTCTTCTGCTT
CCTTTAGGGGTTGCATGAACAATGGATGGTTAAAATAGAAAACAGGAACAACAAATCTTT
GTTTCTCCTCTTCACTTGATCCCACTTTGATTGCTAAACAGCCCTTTGGAACATCTCTGA
TCCCTTGTTTTCTGTTGTTCTTAAAACCATTTGAATGGAAGCTCTTGAGGTTTTTCACTC
GGGAACCCATAATTTTTAAAACGATGAAGAGAAAAGAAAACTGAGGAAAAAAAATTGGCT
TGGAAAACGGTTCGAGAGAGGCCAAGGGTTCTCAAGTG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2EG89TF 747 0 0
TAACTATAAATCGAACAAATAACATTCATAATCTCACGTTTTT*ACCAACAACATGCACT
TCTACTATTAATCTTGTGGGTTAGGCCGTGTTTGGCTCCACAACTCCACAAGAATATCAA
ACAACTAAAATAAATCAAAATTAAAAAGGAACAAAAGCTGAAATATTAAAAGCAAAGACA
ATATCTTTTTGTACCGCTAGTGCTTGCTAGTATCATCTTTATATTCATGCTCATATTATA
CCATCACATCATTAAGCTCTAAAACATCCAACAAGATGGTTATGGCTATTATGATGATGA
TTACCATGATAATTAACCGATATCTCTCCATGGATCTTGTCTTTAACATGCCGGAAAACC
TCCACGTGGCAAGGGATCGTGATGTTACCTTTCTGCTCGAATCCATACTCTTCTTCTGCT
TCCTTTAGGGGTTGCATGAACAATGGATGGTTAAAATAGAAAACAGGAACAACAAATCTT
TGTTTCTCCTCTTCACTTGATCCCACTTTGATTGCTAAACAGCCCTTTGGAACATCTCTG
ATCCCTTGTTTTCTGTTGTTCTTAAAACCATTTGAATGGAAGCTCTTGAGGTTTTTCACT
CGGGAACCCATAATTTTTAAAACGATGAAGAGAAAAGAAAACTGAGGAAAAAAAATTGGC
TTGGAAAACGGTTCGAGAGAGGCCAAGGGTTCTCAAGTGGAAGGGAGAGAGTTTATGACA
CTTAATAAAGTGGCCCATTTTTATTCC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL4369Contig1 641 2 1 U
GGAAAGAAACATAAACCAAAGCTAAAGATACATAATTTCTCGATCTTTGGAGGGAGCCGT
CAGATCAGAATCTGATCATGGACAAGGTGATGAGAATGTCATCAGAGAAAGGAGTTGTGA
TCTTCACCAAAGACTCTTGTTGTCTTTGCTACGCCGTGCAGATCCTTTTCCGTGACCTTA
GGGTTCAACCAACCATCCACGAGATCGACAATGATCCTGACTGCCGCGAGATAGAGAAGG
CCTTAGTCCGTCTTGGCTGCACCAACGCTGTTCCTGCTGTTTTCGTCAGTGGTAAGCTGG
TGGGTTCGACCAACGAAGTCATGTCGCTTCACCTAAGTGGCTCTCTTGTTCCATTGATCA
AGCCGTATCAGTCATTTCATAACTAGAAAATGAATGGATCCTTAAACAAATGATAATTGC
TATGTTGATTAGAAAGTAAATAATGATGGAAATATTACACGTAAATGTGTATGACGTTCT
TATATATATATAAGTTACTTTTTATATTTTTTTTTTGTAGCTGATCATGTCTAAGAAGTT
TATAACTAGCTAGATTCGTATTTCCCTGCTTAATCAATCAGTGGATGAACTGATGTGCTA
TCTAATGTAATGGAGAAAATTATATATCATATGTTTGTATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B240JQ C 1
AF RR2B240TF U 1
BS 1 641 RR2B240TF

RD RR2B240JQ 641 0 0
GGAAAGAAACATAAACCAAAGCTAAAGATACATAATTTCTCGATCTTTGGAGGGAGCCGT
CAGATCAGAATCTGATCATGGACAAGGTGATGAGAATGTCATCAGAGAAAGGAGTTGTGA
TCTTCACCAAAGACTCTTGTTGTCTTTGCTACGCCGTGCAGATCCTTTTCCGTGACCTTA
GGGTTCAACCAACCATCCACGAGATCGACAATGATCCTGACTGCCGCGAGATAGAGAAGG
CCTTAGTCCGTCTTGGCTGCACCAACGCTGTTCCTGCTGTTTTCGTCAGTGGTAAGCTGG
TGGGTTCGACCAACGAAGTCATGTCGCTTCACCTAAGTGGCTCTCTTGTTCCATTGATCA
AGCCGTATCAGTCATTTCATAACTAGAAAATGAATGGATCCTTAAACAAATGATAATTGC
TATGTTGATTAGAAAGTAAATAATGATGGAAATATTACACGTAAATGTGTATGACGTTCT
TATATATATATAAGTTACTTTTTATATTTTTTTTTTGTAGCTGATCATGTCTAAGAAGTT
TATAACTAGCTAGATTCGTATTTCCCTGCTTAATCAATCAGTGGATGAACTGATGTGCTA
TCTAATGTAATGGAGAAAATTATATATCATATGTTTGTATT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2B240TF 641 0 0
GGAAAGAAACATAAACCAAAGCTAAAGATACATAATTTCTCGATCTTTGGAGGGAGCCGT
CAGATCAGAATCTGATCATGGACAAGGTGATGAGAATGTCATCAGAGAAAGGAGTTGTGA
TCTTCACCAAAGACTCTTGTTGTCTTTGCTACGCCGTGCAGATCCTTTTCCGTGACCTTA
GGGTTCAACCAACCATCCACGAGATCGACAATGATCCTGACTGCCGCGAGATAGAGAAGG
CCTTAGTCCGTCTTGGCTGCACCAACGCTGTTCCTGCTGTTTTCGTCAGTGGTAAGCTGG
TGGGTTCGACCAACGAAGTCATGTCGCTTCACCTAAGTGGCTCTCTTGTTCCATTGATCA
AGCCGTATCAGTCATTTCATAACTAGAAAATGAATGGATCCTTAAACAAATGATAATTGC
TATGTTGATTAGAAAGTAAATAATGATGGAAATATTACACGTAAATGTGTATGACGTTCT
TATATATATATAAGTTACTTTTTATATTTTTTTTTTGTAGCTGATCATGTCTAAGAAGTT
TATAACTAGCTAGATTCGTATTTCCCTGCTTAATCAATCAGTGGATGAACTGATGTGCTA
TCTAATGTAATGGAGAAAATTATATATCATATGTTTGTATT

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL4370Contig1 508 2 1 U
GGACTCGGGTCGGGTGTTTTAGTTCTGCGCCGCGCCGCTTCCTCCCGTCATGCTTTCGTC
TCTGCGCTAAACGTTTTAAACGTGGCAAATGGAGCTAGCGGATCGAGCAGTCGGGCTTCT
ATTATCTTCAATCAGCTTATCCGTATTCACCTACTATACTTTCTGGGTCATCATCCTGCC
ATTTGTAGATAGTGATCACTTCATCCACAAGTACTTCTTGCCTCAAGACTATGCGATTCT
CGTACCTGTCTTCGCTGGCGTAACTCTCCTCTCTCTTCTTTGCGTATTCATTGGGATGGT
CATGCTCAAATCCAAAAAGAAGAAGGCTTGATTTGGTTTTTCATTTCTTCAGCTGTTGTG
CACACTTTGTTTTGGACTTTTTGGTCTTTTGAGAGGTTTAGGCCTCTGCCTGAACTTTAG
TTGGTGTAGTTGAACCGTACGAGACTATTGTCTTAATGTTGAATACGCAAGGACATATTA
TTAACTAAATAAAGTGTTTTGTTTGGGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BO02JQ C 1
AF RR2BO02TF U 1
BS 1 508 RR2BO02TF

RD RR2BO02JQ 508 0 0
GGACTCGGGTCGGGTGTTTTAGTTTTGCGCCGCGCCGCTTCCTCCCGTCGTGCTTTCGTC
TCTGCTCTAAACGTTTTAAACGTGGCAAATGGAGCTAGCGGATCGAGCAGTCGGGCTTTT
ATTATCTTCAATCAGCTTATCCGTATTCACCTACTATACTTTCTGGGTCATCATCCTGCC
ATTTGTAGATAGTGATCACTTCATCCACAAGTACTTCTTGCCTCAAGACTATGCGATTCT
CGTACCTGTCTTCGCTGGCGTAACTCTCCTCTCTCTTCTTTGCGTATTCATTGGGATGGT
CATGCTCAAATCCAAAAAGAAGAAGGCTTGATTTGGTTTTTCATTTCTTCAGCTGTTGTG
CACACTTTGTTTTGGACTTTTTGGTCTTTTGAGAGGTTTAGGCCTCTGCCTGAACTTTAG
TTGGTGTAGTTGAACCGTACGAGACTATTGTCTTAATGTTGAATACGCAAGGACATATTA
TTAACTAAATAAAGTGTTTTGTTTGGGG

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2BO02TF 508 0 0
GGACTCGGGTCGGGTGTTTTAGTTCTGCGCCGCGCCGCTTCCTCCCGTCATGCTTTCGTC
TCTGCGCTAAACGTTTTAAACGTGGCAAATGGAGCTAGCGGATCGAGCAGTCGGGCTTCT
ATTATCTTCAATCAGCTTATCCGTATTCACCTACTATACTTTCTGGGTCATCATCCTGCC
ATTTGTAGATAGTGATCACTTCATCCACAAGTACTTCTTGCCTCAAGACTATGCGATTCT
CGTACCTGTCTTCGCTGGCGTAACTCTCCTCTCTCTTCTTTGCGTATTCATTGGGATGGT
CATGCTCAAATCCAAAAAGAAGAAGGCTTGATTTGGTTTTTCATTTCTTCAGCTGTTGTG
CACACTTTGTTTTGGACTTTTTGGTCTTTTGAGAGGTTTAGGCCTCTGCCTGAACTTTAG
TTGGTGTAGTTGAACCGTACGAGACTATTGTCTTAATGTTGAATACGCAAGGACATATTA
TTAACTAAATAAAGTGTTTTGTTTGGGG

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 2

CO CL4371Contig1 745 2 3 U
TCTGGACAGATGTGCTTTGGTTATTCTTCTCGGAGAAGGCGCAGAAGAGAAGGCCTTGCA
ACTTAATGGAACTGACATTGGTGGATGGAAGGCTCTTGTTAAAGTTGAACCAGAGGAGGA
AAGAGACGAGGAGGCAGACCTTTATAGATCCTCTCTGGCTGACGAAATATATAATGACCG
CAGATTTTGGTTTGGCGTTGCCGTTAGGGGATATGACACTTCCCTTCCTGCAGATGAAAT
CGAGAGCGCTTTGATGAAACACTTCTCTTCCTGTGGAGAGATCACCCATGTTTTTGTCTC
TACTCTCGATAAGAAGACTAATATCTATTTTCTCCAAAAAGAAGGAGAAGCTAGGGCGCT
GGATCTTTGTGGAACTGAAGTGGGGAGGTTCTAAAATAGCTGTTTGTCGCTTAGCTACAA
TCTTTACTAACCGTCCCCCTCCCGGCGGTGGAATTTGTTACGGCTACTCTGTCCCAGCTC
ATATGATTGAGTTTACCCGCGAGATCCAAGACAAGGTCGCTGCTTTTAAGAAGCAGAGGG
CTGCTTTTAAGAAGCAGAGGGTTTCTGTCTAGAAAATCTCTCTCAAACATCTATCTTTGG
TGTTTAATAATTAAATAAATCGTGTGAGCTTGTACAATGCAACCTTGGGGATTTCTTACT
TATGCGTACTGTCAGAGCTCATTATTATGTATGATGAGCCGTTTGTGTGTGTGTCTGGAT
GATAAACGTACTCTTAATAATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ89TFB U 130
AF RR2AZ89JQ C 1
BS 1 129 RR2AZ89JQ
BS 130 499 RR2AZ89TFB
BS 500 745 RR2AZ89JQ

RD RR2AZ89TFB 370 0 0
GGAGGCAGACCTTTATAGATCCTCTCTGGCTGACGAAATATATAATGACCGCAGATTTTG
GTTTGGCGTTGCCGTTAGGGGATATGACACTTCCCTTCCTGCAGATGAAATCGAGAGCGC
TTTGATGAAACACTTCTCTTCCTGTGGAGAGATCACCCATGTTTTTGTCTCTACTCTCGA
TAAGAAGACTAATATCTATTTTCTCCAAAAAGAAGGAGAAGCTAGGGCGCTGGATCTTTG
TGGAACTGAAGTGGGGAGGTTCTAAAATAGCTGTTTGTCGCTTAGCTACAATCTTTACTA
ACCGTCCCCCTCCCGGCGGTGGAATTTGTTACGGCTACTCTGTCCCAGCTCATATGATTG
AGTTTACCCG

QA 1 370 1 370
DS 

RD RR2AZ89JQ 745 0 0
TCTGGACAGATGTGCTTTGGTTATTCTTCTCGGAGAAGGCGCAGAAGAGAAGGCCTTGCA
ACTTAATGGAACTGACATTGGTGGATGGAAGGCTCTTGTTAAAGTTGAACCAGAGGAGGA
AAGAGACGAGGAGGCAGACCTTTATAGATCCTCTCTGGCTGACGAAATATATAATGACCG
CAGATTTTGGTTTGGCGTTGCCGTTAGGGGATATGACACTTCCCTTCCTGCAGATGAAAT
CGAGAGCGCTTTGATGAAACACTTCTCTTCCTGTGGAGAGATCACCCATGTTTTTGTCTC
TACTCTCGATAAGAAGACTAATATCTATTTTCTCCAAAAAGAAGGAGAAGCTAGGGCGCT
GGATCTTTGTGGAACTGAAGTGGG*AGGTTCTAAAATAGCTGTTTGTCGCTTAGCTACAA
TCTTTACTAACCGTCCCCCTCCCGGCGGTGGAATTTGTTACGGCTACTCTGTCCCAGCTC
ATATGATTGAGTTTACCCGCGAGATCCAAGACAAGGTCGCTGCTTTTAAGAAGCAGAGGG
CTGCTTTTAAGAAGCAGAGGGTTTCTGTCTAGAAAATCTCTCTCAAACATCTATCTTTGG
TGTTTAATAATTAAATAAATCGTGTGAGCTTGTACAATGCAACCTTGGGGATTTCTTACT
TATGCGTACTGTCAGAGCTCATTATTATGTATGATGAGCCGTTTGTGTGTGTGTCTGGAT
GATAAACGTACTCTTAATAATTATT

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL4372Contig1 811 2 2 U
GAAGAGTCGGAGAACGAGAGAAAGAGATCGAGTCATTGTTAAAGTTAACCAACGAACAGA
GGGCGTTGGAGAAGCTGTTGGATGAAGAGCGCAAGGCTCATATAGCCGCAAACCGAAGAG
CTGAAGCTCTTTCTCTTGAGCTGCAAGATGCACAGGAACCGTTGATAATCTTCACAAGAG
TTATCTCAAGCTAGGTTAAAAGAAACTGCACTAGACAACAAGATCAGAGCTGCGAGTTCT
TCGCATGGGAAACAGGCCAGAATGGATGATGTTGTTGATATGGACATTGGAGAAATAAGC
TTAGAATCTTGAGTACTAATAAACAATCTCGAAGCGCAAGAGGAGATGACAATGGTGCTT
ATGAGGATGGTGTTTCGTTTTCCAGAGGAGATGAGGACACCCAAAACCAGCAAGGCGAAG
AAGAGGAGGAAGCAGAAGATTAGAGGAAGCTGACAGTGCAGAATCTTAAGCATGAGCTGA
CGAAGTATGATTGCAGACATTTGTTACTGAACAAAGGCCATCAGAGCAAAAAAGAGATTC
TTGCTTTGTATGAAGCTCGTGTTCTTCCCAAGAAAGCGTTAGAGAAAGAAGAGAGAAAGA
GACAGTGACAAGCCTACTTCGTGGGACACAAAACTCTTTATAGAGTGAGGGAAGAAACAT
GTTTTAAACTCGAAGTTTCTATCTTTTGTGATTAGTATAGAGTTTGCTTTAACAAGGCTC
TGACTTGAGCATTGTTGTATTAAAACTGAGGTGTAGGTTTAAAGAGTTTTTTTTTTGACA
TTGTTTAATGAGTGTTCTTATGTTGGTATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT01TF U 1
AF RR2FT01JQ C 1
BS 1 748 RR2FT01TF
BS 749 811 RR2FT01JQ

RD RR2FT01TF 748 0 0
GAAGAGTCGGAGAACGAGAGAAAGAGATCGAGTCATTGTTAAAGTTAACCAACGAACAGA
GGGCGTTGGAGAAGCTGTTGGATGAAGAGCGCAAGGCTCATATAGCCGCAAACCGAAGAG
CTGAAGCTCTTTCTCTTGAGCTGCAAGATGCACAGGAACCGTTGATAATCTTCACAAGAG
TTATCTCAAGCTAGGTTAAAAGAAACTGCACTAGACAACAAGATCAGAGCTGCGAGTTCT
TCGCATGGGAAACAGGCCAGAATGGATGATGTTGTTGATATGGACATTGGAGAAATAAGC
TTAGAATCTTGAGTACTAATAAACAATCTCGAAGCGCAAGAGGAGATGACAATGGTGCTT
ATGAGGATGGTGTTTCGTTTTCCAGAGGAGATGAGGACACCCAAAACCAGCAAGGCGAAG
AAGAGGAGGAAGCAGAAGATTAGAGGAAGCTGACAGTGCAGAATCTTAAGCATGAGCTGA
CGAAGTATGATTGCAGACATTTGTTACTGAACAAAGGCCATCAGAGCAAAAAAGAGATTC
TTGCTTTGTATGAAGCTCGTGTTCTTCCCAAGAAAGCGTTAGAGAAAGAAGAGAGAAAGA
GACAGTGACAAGCCTACTTCGTGGGACACAAAACTCTTTATAGAGTGAGGGAAGAAACAT
GTTTTAAACTCGAAGTTTCTATCTTTTGTGATTAGTATAGAGTTTGCTTTAACAAGGCTC
TGACTTGAGCATTGTTGTATTAAAACTG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2FT01JQ 811 0 0
GAAGAGTCGGAGAACGAGAGAAAGAGATCGAGTCATTGTTAAAGTTAACCAACGAACAGA
GGGCGTTGGAGAAGCTGTTGGATGAAGAGCGCAAGGCTCATATAGCCGCAAACCGAAGAG
CTGAAGCTCTTTCTCTTGAGCTGCAAGATGCACAGGAACCGTTGATAATCTTCACAAGAG
TTATCTCAAGCTAGGTTAAAAGAAACTGCACTAGACAACAAGATCAGAGCTGCGAGTTCT
TCGCATGGGAAACAGGCCAGAATGGATGATGTTGTTGATATGGACATTGGAGAAATAAGC
TTAGAATCTTGAGTACTAATAAACAATCTCGAAGCGCAAGAGGAGATGACAATGGTGCTT
ATGAGGATGGTGTTTCGTTTTCCAGAGGAGATGAGGACACCCAAAACCAGCAAGGCGAAG
AAGAGGAGGAAGCAGAAGATTAGAGGAAGCTGACAGTGCAGAATCTTAAGCATGAGCTGA
CGAAGTATGATTGCAGACATTTGTTACTGAACAAAGGCCATCAGAGCAAAAAAGAGATTC
TTGCTTTGTATGAAGCTCGTGTTCTTCCCAAGAAAGCGTTAGAGAAAGAAGAGAGAAAGA
GACAGTGACAAGCCTACTTCGTGGGACACAAAACTCTTTATAGAGTGAGGGAAGAAACAT
GTTTTAAACTCGAAGTTTCTATCTTTTGTGATTAGTATAGAGTTTGCTTTAACAAGGCTC
TGACTTGAGCATTGTTGTATTAAAACTGAGGTGTAGGTTTAAAGAGTTTTTTTTTTGACA
TTGTTTAATGAGTGTTCTTATGTTGGTATTT

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL4373Contig1 621 2 4 U
AAACGCAAAATTTGTTTTATTCATAACTCATAACCATGTTATGTACATATAGAATGATAG
AAATATACTAATCAAAAGTAATATACAAACAAAGGATAAACAAACTCTCCAAGAAAAAGG
TCGTTTTAAACATATTCATTTACATATATATAGACTATAAAATAACATAAGCTAGAACAT
GTTTTAGTTATGATGAACAAGGGGCGCTACACTTGGTCGTACAGTCAAATGAACATCCTC
CGCTCTTGCTAGTGCTTTTGTAACCTTCCTTGTTAACGTTGGTTGATTTGTAGCACGTCT
CAGGACACTTCAACTTCTTACCTTTACAAGGTCCTTGCATGCTGCATGTATGTTCCCCAC
TTATAAAACTTCCAGTTCCGGGAAACTTAGGAATCCCATGAGTCCCATGATGAAACCCAT
GAAACCCATGAATCCCGTGAACCTTATTAATCCCATGGAACCCGGATTTGGAGAAAAAGT
CGTGGAATTCACTATCCCAGGGTTGCCGACTTGCTTGAGATGAAGAGACAAATATGATTA
GGAGAAGAAAAGGTAGAAGGATATATTTTTTAGACATTTTGTTGTTGTTGTCCTGTGTGA
ACTTTGATTGTTGTTGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AK53TF C 1
AF RR2AK53JQ U 114
BS 1 113 RR2AK53TF
BS 114 316 RR2AK53JQ
BS 317 317 RR2AK53TF
BS 318 621 RR2AK53JQ

RD RR2AK53TF 621 0 0
AAACGCAAAATTTGTTTTATTCATAACTCATAACCATGTTATGTACATATAGAATGATAG
AAATATACTAATCAAAAGTAATATACAAACAAAGGATAAACAAACTCTCCAAGAAAAATG
TCGTTTTAAACATATTCATTTACATATATATAGACTATAAGATAACATAAGCTAGAACAT
GTTTTAGTTATGATGAACAAGTGGCGCTACACTTGGTCGTACAGTCAAATGAACATCCTC
CGCTCTTGCTAGTGCTTTTGTAACCTTCCTTGTTAACGTTGGTTGATTTGTAGCACGTCT
CAGGACACTTCAACTTCTTACCTTTACAAGGTCCTTGCATGCTGCATGTATGTTCCCCAC
TTATAAAACTTCCAGTTCCGGGAAACTTAGGAATCCCATGAGTCCCATGATGAAACCCAT
GAAACCCATGAATCCCGTGAACCTTATTAATCCCATGGAACCCGGATTTGGAGAAAAAGT
CGTGGAATTCACTATCCCAGGGTTGCCGACTTGCTTGAGATGAAGAGACAAATATGATTA
GGAGAAGAAAAGGTAGAAGGATATATTTTTTAGACATTTTGTTGTTGTTGTCCTGTGTGA
ACTTTGATTGTTGTTGTTCCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2AK53JQ 508 0 0
AAAAAGGTCGTTTTAAACATATTCATTTACATATATATAGACTATAAAATAACATAAGCT
AGAACATGTTTTAGTTATGATGAACAAGGGGCGCTACACTTGGTCGTACAGTCAAATGAA
CATCCTCCGCTCTTGCTAGTGCTTTTGTAACCTTCCTTGTTAACGTTGGTTGATTTGTAG
CACGTCTCAGGACACTTCAACTTTTTACCTTTACAAGGTCCTTGCATGCTGCATGTATGT
TCCCCACTTATAAAACTTCCAGTTCCGGGAAACTTAGGAATCCCATGAGTCCCATGATGA
AACCCATGAAACCCATGAATCCCGTGAACCTTATTAATCCCATGGAACCCGGATTTGGAG
AAAAAGTCGTGGAATTCACTATCCCAGGGTTGCCGACTTGCTTGAGATGAAGAGACAAAT
ATGATTAGGAGAAGAAAAGGTAGAAGGATATATTTTTTAGACATTTTGTTGTTGTTGTCC
TGTGTGAACTTTGATTGTTGTTGTTCCC

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 2

CO CL4374Contig1 694 2 4 U
GGAAGCAAAAAAAAAAAAACATCCCCACATCTCTCACCGACTCATCTCTTTCTATCTTTC
TGCTCACTATCTCTTCTGCCGTCGATCCTTGGCCCTTTTCTATCTCCGTCTTCTAACATC
AACCTCTGCTTTATCTCCGTTGCGCGTTTCATTCAATCTATAAGAGACATTCAATCTTTT
TAATGGGTTTTGAAGATCAAGAAGAACAGAAACAGAGTCCAAAACAGAGTCAGGCCCAGA
TGGTGTTCAAGTTTCACTTTCATGTTCCCCACCTCCACATACACCATCATCATAACCATC
ATTATGTTCCGAAAGGCTGTGTCGCGATTATGGTGGGACACGAAGGAGAAGAAGAAGGTC
TACACAGATTCGTGATTCCTTTGATGTTCTTGAGCCATCCTCTGTTTTTGAGTCTCTTGA
AAGAAGCTGAAGAAGAGTACGGATTCAAACACGCGGGCCCGATTACGATTCCTTGCCGCG
TCGATGAGTTTAAGCATGTTCAGGAGATTATCGACGAGGAGACTCATCGCCGTCACAGTC
ATCACGGTAACGGACACAACTACCATCATCACCACCACCACAACCATCTGCCATGTTTCT
AAAGATCAGTACTTAGGATTTGTTGGTTTAGTTTGGTATTGGTTTGGTTTGACATATAAT
TGGGTATTGGTTTGGTTTGACTTCTCTTTTGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET63TF U 1
AF RR2ET63JQ C 553
BS 1 616 RR2ET63TF
BS 617 617 RR2ET63JQ
BS 618 629 RR2ET63TF
BS 630 694 RR2ET63JQ

RD RR2ET63TF 629 0 0
GGAAGCAAAAAAAAAAAAACATCCCCACATCTCTCACCGACTCATCTCTTTCTATCTTTC
TGCTCACTATCTCTTCTGCCGTCGATCCTTGGCCCTTTTCTATCTCCGTCTTCTAACATC
AACCTCTGCTTTATCTCCGTTGCGCGTTTCATTCAATCTATAAGAGACATTCAATCTTTT
TAATGGGTTTTGAAGATCAAGAAGAACAGAAACAGAGTCCAAAACAGAGTCAGGCCCAGA
TGGTGTTCAAGTTTCACTTTCATGTTCCCCACCTCCACATACACCATCATCATAACCATC
ATTATGTTCCGAAAGGCTGTGTCGCGATTATGGTGGGACACGAAGGAGAAGAAGAAGGTC
TACACAGATTCGTGATTCCTTTGATGTTCTTGAGCCATCCTCTGTTTTTGAGTCTCTTGA
AAGAAGCTGAAGAAGAGTACGGATTCAAACACGCGGGCCCGATTACGATTCCTTGCCGCG
TCGATGAGTTTAAGCATGTTCAGGAGATTATCGACGAGGAGACTCATCGCCGTCACAGTC
ATCACGGTAACGGACACAACTACCATCATCACCACCACCACAACCATCTGCCATGTTTCT
AAAGATCAGTACTTAG*ATTTGTTGGTTT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2ET63JQ 142 0 0
GACACAACTACCATCATCACCACCACCACAACCATCTGCCATGTTTCTAAAGATCAGTAC
TTAGGATTTGTTGGTTTAGTTTGGTATTGGTTTGGTTTGACATATAATTGGGTATTGGTT
TGGTTTGACTTCTCTTTTGAGA

QA 1 142 1 142
DS 



AS 1 2

CO CL4375Contig1 582 2 5 U
GCAAAATTGAGAGCAGAGGAGCTTCTAACATTCTGCTTCGAATGCAAATATTATTTTGTA
GCCACAAATGAATGAAGTTGTGTAGCTACTTGGTACTCCAATAAATATACCTCACTTCAT
TTCAAACCCTAAAAAGCCCTATTCAATATCATCGATTTTTAAAAAATGTGTTTTTTTGTT
TTGAAAAAAACAATACATATATCTGAAATGAGGGATCCAACAATGCTCTCAAACCTCTGC
ATTTTCTTCTTTCCTTATAGCTTTCAGTCGTTCTTGAAGTTTCTTGCTTTGTTCGAAATT
TACCTTCCTCTTCACAGCTTTCTCTTGGCGGAAACAATGAAAAAGCTTTACTTTCAGCTC
CGTACAGTCTCCAAAGAATTTTCCAATAGGATGATCTAAATGACACTTTTGGAATTCCTC
AATTATCTCGAGACACATTGGGTGTCTGTGTGGTGTAAGTGGAGGATGCATCTTCCTTTT
CTTTTTTCCTTTTTTTTTAAGTTCTTGATTTGGTTGGCAATCGATGACCTGAGACTTTGG
GAGAGAGAGAGAGGATTTGTGCTATACAACTCGGAATCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX16TF C 1
AF RR2BX16JQ U 23
BS 1 22 RR2BX16TF
BS 23 63 RR2BX16JQ
BS 64 64 RR2BX16TF
BS 65 541 RR2BX16JQ
BS 542 582 RR2BX16TF

RD RR2BX16TF 582 0 0
GCAAAATTGAGAGCAGAGGAGCTTCTAACATTCTGCTTCGAATGCAAATATTATTTTGTA
GCCACAAATGAATGAAGTTGTGTAGCTACTTGGTACTCCAATAAATATACCTCACTTCAT
TTCAAACCCTAAGAAGCCCTATTCAATATCATCGATTTTTAAGAGATGTGTTTTTTTGTT
TTGAAAAAGACAATACATATATCTGAGATGAGGGATCCAACAATGCTCTCAAACCTCTGC
ATTTTCTTCTTTCCTTATAGCTTTCAGTCGTTCTTGAAGTTTCTTGCTTTGTTCGAAATT
TACCTTCCTCTTCACAGCTTTCTCTTGGCGGAAACAATGAAGAAGCTTTACTTTCAGCTC
CGTACAGTCTCCAAAGAATTTTCCAATAGGATGATCTAAATGACACTTTTGGAATTCCTC
AATTATCTCGAGACACATTGGGTGTCTGTGTGGTGTAAGTGGAGGATGCATCTTCCTTTT
CTTTTTTCCTTTTTTTTTAAGTTCTTGATTTGGTTGGCAATCGATGACCTGAGACTTTGG
GAGAGAGAGAGAGGATTTGTGCTATACAACTCGGAATCCTCC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2BX16JQ 519 0 0
TTCTAACATTCTGCTTCGAATGCAAATATTATTTTGTAGCCCCAAATGAATGAAGTTGTG
TAGCTACTTGGTACTCCAATAAATATACCTCACTTCATTTCAAACCCTAAAAAGCCCTAT
TCAATATCATCGATTTTTAAAAAATGTGTTTTTTTGTTTTGAAAAAAACAATACATATAT
CTGAAATGAGGGATCCAACAATGCTCTCAAACCTCTGCATTTTCTTCTTTCCTTATAGCT
TTCAGTCGTTCTTGAAGTTTCTTGCTTTGTTCGAAATTTACCTTCCTCTTCACAGCTTTC
TCTTGGCGGAAACAATGAAAAAGCTTTACTTTCAGCTCCGTACAGTCTCCAAAGAATTTT
CCAATAGGATGATCTAAATGACACTTTTGGAATTCCTCAATTATCTCGAGACACATTGGG
TGTCTGTGTGGTGTAAGTGGAGGATGCATCTTCCTTTTCTTTTTTCCTTTTTTTTTAAGT
TCTTGATTTGGTTGGCAATCGATGACCTGAGACTTTGGG

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 2

CO CL4376Contig1 698 2 3 U
GCGATTCAAGCTGCTTCGCTTCTCGTTGTTGGTCCTTTTGTTGATTATCTCCTCAGTGGC
AAGTTCATCTTGAGCTACAACATGTCTTCTGGTTGCTTTGTATTCATCCTTCTCTCTTGT
GCCTTGGCGGTGTTCTGCAACATAAGCCAGTACCTTTGCATCGGGCGATTTTCAGCGGTA
TCGTTCCAGGTTATAGGCCACATGAAGACCGTGTGTATCTTGACACTGGGATGGCTCCTC
TTTGATTCTGCGATGACTTTCAAAAACGTGTCCGGCATGTTTGTTGCCATTGTTGGGATG
GTGATTTATAGCTGGGCCATGGAATTGGAGAAACAGGCTAATCTTGCGGCAAAGGCTTTG
AACAGTGTGAAACACAGCTTGACTGAAGAGGAGTTTCAACTTTTAAAGGAAGGTGTGGAA
ACTACACAGTCCAAAGATGTTGAGCTAGGCGGCGGCTACACAAAAGCTTAGTAAGAGATG
ATGGATAGTAAACATAGTTTTCTGGTACAAGTTCTTCTGTGTTAAAGTTGTTATGTTTTT
GTGTTATTTAAACCAAAAGGGTGGTGGTCGAAATAAAGCAAAGATCAAATCCTCCCCCAT
AAAGGATTCTAGGAGATTAGTCTACGCTTCGAACTATGTCCCTTTGTTATAAAAAAGATG
TTTTGTGTTATTTATATATTTACTAGCTAATTCCATGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G927JQ C 1
AF RR2G927TF U 1
BS 1 655 RR2G927TF
BS 656 656 RR2G927JQ
BS 657 698 RR2G927TF

RD RR2G927JQ 698 0 0
GCGATTCAAGCTGCTTCGCTTCTCGTTGTTGGTCCTTTTGTTGATTATCTCCTCAGTGGC
AAGTTCATCTTGAGCTACAACATGTCTTCTGGTTGCTTTGTATTCATCCTTCTCTCTTGT
GCCTTGGCGGTGTTCTGCAACATAAGCCAGTACCTTTGCATCGGGCGATTTTCAGCGGTA
TCGTTCCAGGTTATAGGCCACATGAAGACCGTGTGTATCTTGACACTGGGATGGCTCCTC
TTTGATTCTGCGATGACTTTCAAAAACGTGTCCGGCATGTTTGTTGCCATTGTTGGGATG
GTGATTTATAGCTGGGCCATGGAATTGGAGAAACAGGCTAATCTTGCGGCAAAGGCTTTG
AACAGTGTGAAACACAGCTTGACTGAAGAGGAGTTTCAACTTTTAAAGGAAGGTGTGGAA
ACTACACAGTCCAAAGATGTTGAGCTAGGCGGCGGCTACACAAAAGCTTAGTAAGAGATG
ATGGATAGTAAACATAGTTTTCTGGTACAAGTTCTTCTGTGTTAAAGTTGTTATGTTTTT
GTGTTATTTAAACCAAAAGGGTGGTGGTCGAAATAAAGCAAAGATCAAATCCTCCCCCAT
AAAGGATTCTAGGAGATTAGTCTACGCTTCGAACTATGTCCCTTTGTTATAAAAAAGATG
TTTTGTGTTATTTATATATTTACTAGCTAATTCCATGG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2G927TF 698 0 0
GCGATTCAAGCTGCTTCGCTTCTCGTTGTTGGTCCTTTTGTTGATTATCTCCTCAGTGGC
AAGTTCATCTTGAGCTACAACATGTCTTCTGGTTGCTTTGTATTCATCCTTCTCTCTTGT
GCCTTGGCGGTGTTCTGCAACATAAGCCAGTACCTTTGCATCGGGCGATTTTCAGCGGTA
TCGTTCCAGGTTATAGGCCACATGAAGACCGTGTGTATCTTGACACTGGGATGGCTCCTC
TTTGATTCTGCGATGACTTTCAAAAACGTGTCCGGCATGTTTGTTGCCATTGTTGGGATG
GTGATTTATAGCTGGGCCATGGAATTGGAGAAACAGGCTAATCTTGCGGCAAAGGCTTTG
AACAGTGTGAAACACAGCTTGACTGAAGAGGAGTTTCAACTTTTAAAGGAAGGTGTGGAA
ACTACACAGTCCAAAGATGTTGAGCTAGGCGGCGGCTACACAAAAGCTTAGTAAGAGATG
ATGGATAGTAAACATAGTTTTCTGGTACAAGTTCTTCTGTGTTAAAGTTGTTATGTTTTT
GTGTTATTTAAACCAAAAGGGTGGTGGTCGAAATAAAGCAAAGATCAAATCCTCCCCCAT
AAAGGATTCTAGGAGATTAGTCTACGCTTCGAACTATGTCCCTTTGTTATAAAAA*GATG
TTTTGTGTTATTTATATATTTACTAGCTAATTCCATGG

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL4377Contig1 491 2 1 U
GTGAGGATTATGAGGGAGGAACATTCACTGTCTCCAACTTGGGAGGACCTTTTGGCATCA
AACAGTTCTGTGCAGTCATCAATCCACCTCAAGCCGCTATTCTAGCAATCGGATCAGCTG
AAAAGAGAGTTGTTGCTGGTAGTGGACCTGACCAATTCAACGTGGCTTCGTACATGTCTG
TAACACTTAGCTGTGACCACCGCGTAATAGACGGTGCGATTGGAGCTGAATGGTTGAAAG
CATTCAAGGGCTACATCGAGACCCCAGAATCTATGTTGCTTTAAAATCCACACACAGAGA
GAGATACACGCATCAAAAGTTAAGCTCATATGAGTGGAGACATTTAAATTTTATCTGGTT
TCAACAGTTTCTACCGGATTTGATCACTTTAGCCCTGGCGCCCCCCTGGGCATGCTTTTC
AAAGTTGCTTGTTTTTTTCTTCTTTTGCCATTCATTAAACTTGAGTTGACAGGTTTTTGT
CCCAAAAATAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F618JQ C 1
AF RR2F618TF U 1
BS 1 491 RR2F618TF

RD RR2F618JQ 491 0 0
GTGAGGATTATGAGGGAGGAACATTCACTGTCTCCAACTTGGGAGGACCTTTTGGCATCA
AACAGTTCTGTGCAGTCATCAATCCACCTCAAGCCGCTATTCTAGCAATCGGATCAGCTG
AAAAGAGAGTTGTTGCTGGTAGTGGACCTGACCAATTCAACGTGGCTTCGTACATGTCTG
TAACACTTAGCTGTGACCACCGCGTAATAGACGGTGCGATTGGAGCTGAATGGTTGAAAG
CATTCAAGGGCTACATCGAGACCCCAGAATCTATGTTGCTTTAAAATCCACACACAGAGA
GAGATACACGCATCAAAAGTTAAGCTCATATGAGTGGAGACATTTAAATTTTATCTGGTT
TCAACAGTTTCTACCGGATTTGATCACTTTAGCCCTGGCGCCCCCCTGGGCATGCTTTTC
AAAGTTGCTTGTTTTTTTCTTCTTTTGCCATTCATTAAACTTGAGTTGACAGGTTTTTGT
CCCAAAAATAA

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2F618TF 491 0 0
GTGAGGATTATGAGGGAGGAACATTCACTGTCTCCAACTTGGGAGGACCTTTTGGCATCA
AACAGTTCTGTGCAGTCATCAATCCACCTCAAGCCGCTATTCTAGCAATCGGATCAGCTG
AAAAGAGAGTTGTTGCTGGTAGTGGACCTGACCAATTCAACGTGGCTTCGTACATGTCTG
TAACACTTAGCTGTGACCACCGCGTAATAGACGGTGCGATTGGAGCTGAATGGTTGAAAG
CATTCAAGGGCTACATCGAGACCCCAGAATCTATGTTGCTTTAAAATCCACACACAGAGA
GAGATACACGCATCAAAAGTTAAGCTCATATGAGTGGAGACATTTAAATTTTATCTGGTT
TCAACAGTTTCTACCGGATTTGATCACTTTAGCCCTGGCGCCCCCCTGGGCATGCTTTTC
AAAGTTGCTTGTTTTTTTCTTCTTTTGCCATTCATTAAACTTGAGTTGACAGGTTTTTGT
CCCAAAAATAA

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 2

CO CL4378Contig1 436 2 2 U
GAGCTTGACACTGCTCTTAAGCACATCCGCTCTAGGAAAAACCAACTTATGTACGACTCC
ATCAATGAGCTCCAAAGAAAGGAGAAGACCATACAGGAACAAAACATGCTTTCCAAACAG
ATCAAGGAGAGGGAAAAGATTCTTAGGGCACAACAAGAGCAATGGGACCAGCAAAACCAT
GGCCACAATATGCCCCCTCCTCCTCCCCCGCAGCAGCATCAAATCCAGCAGCCATACATG
CTCTCTCATCAGCCATCTCCTTTTCTCAACATGGGTGGCCTGTATCAAGAAGAAGATCCA
ATGACAATGAGGAGGAACGAGCTCGATCTGTCTCTTGAACCTGTTTACAACTGCAATCTT
GGCTGCTTTGCCGCATGAAACAATTCCATATATTTCTATAATCAACAATAATAACAATTA
AATTTCTTTGTTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DH65JQ C 1
AF RR2DH65TF U 90
BS 1 89 RR2DH65JQ
BS 90 436 RR2DH65TF

RD RR2DH65JQ 436 0 0
GAGCTTGACACTGCTCTTAAGCACATCCGCTCTAGGAAAAACCAACTTATGTACGACTCC
ATCAATGAGCTCCAAAGAAAGGAGAAGACCATACAGGAACAAAACATGCTTTCCAAACAG
ATCAAGGAGAGGGAAAAGATTCTTAGGGCACAACAAGAGCAATGGGACCAGCAAAACCAT
GGCCACAATATGCCCCCTCCTCCTCCCCCGCAGCAGCATCAAATCCAGCAGCCATACATG
CTCTCTCATCAGCCATCTCCTTTTCTCAACATGGGTGGCCTGTATCAAGAAGAAGATCCA
ATGACAATGAGGAGGAACGAGCTCGATCTGTCTCTTGAACCTGTTTACAACTGCAATCTT
GGCTGCTTTGCCGCATGAAACAATTCCATATATTTCTATAATCAACAATAATAACAATTA
AATTTCTTTGTTTCAG

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR2DH65TF 347 0 0
CATACAGGAACAAAACATGCTTTCCAAACAGATCAAGGAGAGGGAAAAGATTCTTAGGGC
ACAACAAGAGCAATGGGACCAGCAAAACCATGGCCACAATATGCCCCCTCCTCCTCCCCC
GCAGCAGCATCAAATCCAGCAGCCATACATGCTCTCTCATCAGCCATCTCCTTTTCTCAA
CATGGGTGGCCTGTATCAAGAAGAAGATCCAATGACAATGAGGAGGAACGAGCTCGATCT
GTCTCTTGAACCTGTTTACAACTGCAATCTTGGCTGCTTTGCCGCATGAAACAATTCCAT
ATATTTCTATAATCAACAATAATAACAATTAAATTTCTTTGTTTCAG

QA 1 347 1 347
DS 



AS 1 2

CO CL4379Contig1 923 2 2 U
GGGCGACACTTATTTTGTCTTCCTCTTTCTCTTTGCTCCTTGGAATATGAACAGTTTTTT
GAGTTCTCTTGCGTTTCTCAATTCTCAGCAACAAACATGAACTCATATGTTTCTGGAACT
GAATCAAAGATCAAGAACCCCTTCCCCATGCTCTGATCTTTCTGTTATGGTGAGTCCTCG
AATCGAAGACAGATCAAATGATGAAACATGGATTATGGAAGGTTTGATCTAGCAGGGCTT
GGTATGTGTCTTATGCAAAGTGGGATGGTTGCTAGGTCTCCAGAAGATATCAAAGCAGTT
GTAGTAAAAACTGATAAGATGATCAAAGGATCGGTTTACCTAGGCGTAATGAAATCTAAA
TCAGTCGTAGTACCAATTTCAGTTTTAAATTTCTGCTATAATATGCACTTACCTAACAAG
AGCAACAAAAACGGTTGTTTTGTCAGGAAGTTACTTGGCAAGTCTTTCTCTTTGCCCTGG
GAGATCAGAGCTACCATTTCTACATTCAAATACACAGCCGTTTGTGATTAAGGAATCACG
TTATTGGTAGAAACACGATTAGATGCTTCAAGTCTTCAGACCAGGTTATGAATTTTTTTA
ACTTCTTTATATTTTTTGTAGCTTACAAAACTAATAGGACAAATAAAAGAGTTGGCTTGC
TCATTATGTCTAGGCTTAAATCTAGATGCAAAACTGGGGAAGTGTTTTATTGGTTCAGCT
TTTATTTCCTAAGAAACAGATCGCAGTAAGTAACCAGGTCCGTAAAGCGGGGAAAATTCT
GCACAAGCATCTATCAGTTCAAAGAACTTATCAATGCATGATCATGTGGAAATGTAAAAG
TAGCTTCAAGAAGTCATCAACTAAACACTTATACCTAAGCGTAGAGTACATATTTTTCGA
TATAAGCCAGTAATTTTCTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ71TF U 1
AF RR2BQ71JQ C 150
BS 1 638 RR2BQ71TF
BS 639 923 RR2BQ71JQ

RD RR2BQ71TF 638 0 0
GGGCGACACTTATTTTGTCTTCCTCTTTCTCTTTGCTCCTTGGAATATGAACAGTTTTTT
GAGTTCTCTTGCGTTTCTCAATTCTCAGCAACAAACATGAACTCATATGTTTCTGGAACT
GAATCAAAGATCAAGAACCCCTTCCCCATGCTCTGATCTTTCTGTTATGGTGAGTCCTCG
AATCGAAGACAGATCAAATGATGAAACATGGATTATGGAAGGTTTGATCTAGCAGGGCTT
GGTATGTGTCTTATGCAAAGTGGGATGGTTGCTAGGTCTCCAGAAGATATCAAAGCAGTT
GTAGTAAAAACTGATAAGATGATCAAAGGATCGGTTTACCTAGGCGTAATGAAATCTAAA
TCAGTCGTAGTACCAATTTCAGTTTTAAATTTCTGCTATAATATGCACTTACCTAACAAG
AGCAACAAAAACGGTTGTTTTGTCAGGAAGTTACTTGGCAAGTCTTTCTCTTTGCCCTGG
GAGATCAGAGCTACCATTTCTACATTCAAATACACAGCCGTTTGTGATTAAGGAATCACG
TTATTGGTAGAAACACGATTAGATGCTTCAAGTCTTCAGACCAGGTTATGAATTTTTTTA
ACTTCTTTATATTTTTTGTAGCTTACAAAACTAATAGG

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2BQ71JQ 774 0 0
GCTCTGATCTTTCTGTTATGGTGAGTCCTCGAATCGAAGACAGATCAAATGATGAAACAT
GGATTATGGAAGGTTTGATCTAGCAGGGCTTGGTATGTGTCTTATGCAAAGTGGGATGGT
TGCTAGGTCTCCAGAAGATATCAAAGCAGTTGTAGTAAAAACTGATAAGATGATCAAAGG
ATCGGTTTACCTAGGCGTAATGAAATCTAAATCAGTCGTAGTACCAATTTCAGTTTTAAA
TTTCTGCTATAATATGCACTTACCTAACAAGAGCAACAAAAACGGTTGTTTTGTCAGGAA
GTTACTTGGCAAGTCTTTCTCTTTGCCCTGGGAGATCAGAGCTACCATTTCTACATTCAA
ATACACAGCCGTTTGTGATTAAGGAATCACGTTATTGGTAGAAACACGATTAGATGCTTC
AAGTCTTCAGACCAGGTTATGAATTTTTTTAACTTCTTTATATTTTTTGTAGCTTACAAA
ACTAATAGGACAAATAAAAGAGTTGGCTTGCTCATTATGTCTAGGCTTAAATCTAGATGC
AAAACTGGGGAAGTGTTTTATTGGTTCAGCTTTTATTTCCTAAGAAACAGATCGCAGTAA
GTAACCAGGTCCGTAAAGCGGGGAAAATTCTGCACAAGCATCTATCAGTTCAAAGAACTT
ATCAATGCATGATCATGTGGAAATGTAAAAGTAGCTTCAAGAAGTCATCAACTAAACACT
TATACCTAAGCGTAGAGTACATATTTTTCGATATAAGCCAGTAATTTTCTTCGC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL4380Contig1 1295 2 2 U
GCTAACATTCTTATGTGTCACAACAAGCTTATTTATATAATTCAAGTTGGAATCAGAAAC
AAGTGCATCCTTCTTCATTTACACAGGTAGATTGAGATAAAGATGGTGATGCAAACAGTG
GATCTACGATCAGACACCGTGACTAGACCTACCGACGCGATGCGTGAAGCAATGGGAAGC
GCAGAGGTTGACGATGACGTCCTCGGCTACGACCCAACGGCTCGACGTCTTGAAGAGGAG
ATGGCCGAAATGATGGGGAAAGAAGCGGCTCTGTTCGTGCCATCTGGTACAATGGGGAAC
CTCATATCCGTTATGGTTCACTGCGACGTGAGAGGCAGCGAGGTGATTCCCGGCGACAAC
TGTCACATCCATGTTTACGAGAATGGAGGTATATCAACAATAGGAGGCGTGCATCCCAAG
ACAATCAAGAATGAAGAAGACGGTACAATGGACTTGGGGGGCTATAGAAGCAGCCATTAG
AGACCCTAAAGGAAGCACGTTTTATCCATCAACGAGGTTGATTTGCTTGGAGAACACACA
CGCCAACTCTGGTGGGAGATGCTTGAGCGCGGAATACACAGATACAGTTGGAGAGATTGC
CAAGAGACATGGATTAAAGCTTCATATCGATGGAGCTCGCCTGTTTAATGCTTCCATTGC
CCTTGGAGTTCCAGTCCATAGGCTTGTACAGGCTGCTGACTCTGTTTCGGTGTGTCTCTC
TAAAGGTCTTGGAGCTCCTATAGGATCTGTAGTCGTTGGTCCGCAGAGTTTCATAGAAAA
GGCAAAAACGTTAAGAAAAACATTAGGTGGAGGAATGAGACAAATAGGTGTTCTGTGTGC
AGCTGCTTTGGTCGCACTTCAAGAGAACCTCCCAAAGTTACAGTTTGACCACAAGAAGAC
AAAGTTGTTAGCTGAAGGGTTGAATCAGATGAAAGGGATTAGAGTGAACGTTACAGCCGT
GGAGACCAACATGATTTTCATGGATATGGAGGATGGATCAAAACTTACTGCTGAGAAACT
GCGCAAGAGTCTAACTGAGTATGGCATTCTCGTCATCCCAGAAAACTCGTCCCGGATCAG
AATGGTTATACACCACCAGATAACAACAAGTGATGTGCATTACACATTATCTTGTTTTCA
ACAGGCAGTGCAAATGATTCAGGAACCAAGCAGAAACTAAACTTGCAGAACCGAAAAATG
TTTTTATTTAAATGTTGTTTGTCTAAGTCACTTCTATATAAAAACTTCAGAGATTGATCG
ATCTCTCAATGAAATTTGAATTGAACTTGTCACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F553TF U 1
AF RR2F553JQ C 554
BS 1 626 RR2F553TF
BS 627 1295 RR2F553JQ

RD RR2F553TF 626 0 0
GCTAACATTCTTATGTGTCACAACAAGCTTATTTATATAATTCAAGTTGGAATCAGAAAC
AAGTGCATCCTTCTTCATTTACACAGGTAGATTGAGATAAAGATGGTGATGCAAACAGTG
GATCTACGATCAGACACCGTGACTAGACCTACCGACGCGATGCGTGAAGCAATGGGAAGC
GCAGAGGTTGACGATGACGTCCTCGGCTACGACCCAACGGCTCGACGTCTTGAAGAGGAG
ATGGCCGAAATGATGGGGAAAGAAGCGGCTCTGTTCGTGCCATCTGGTACAATGGGGAAC
CTCATATCCGTTATGGTTCACTGCGACGTGAGAGGCAGCGAGGTGATTCCCGGCGACAAC
TGTCACATCCATGTTTACGAGAATGGAGGTATATCAACAATAGGAGGCGTGCATCCCAAG
ACAATCAAGAATGAAGAAGACGGTACAATGGACTTGGGGGGCTATAGAAGCAGCCATTAG
AGACCCTAAAGGAAGCACGTTTTATCCATCAACGAGGTTGATTTGCTTGGAGAACACACA
CGCCAACTCTGGTGGGAGATGCTTGAGCGCGGAATACACAGATACAGTTGGAGAGATTGC
CAAGAGACATGGATTAAAGCTTCATA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2F553JQ 742 0 0
GGGAGATGCTTGAGCGCGGAATACACAGATACAGTTGGAGAGATTGCCAAGAGACATGGA
TTAAAGCTTCATATCGATGGAGCTCGCCTGTTTAATGCTTCCATTGCCCTTGGAGTTCCA
GTCCATAGGCTTGTACAGGCTGCTGACTCTGTTTCGGTGTGTCTCTCTAAAGGTCTTGGA
GCTCCTATAGGATCTGTAGTCGTTGGTCCGCAGAGTTTCATAGAAAAGGCAAAAACGTTA
AGAAAAACATTAGGTGGAGGAATGAGACAAATAGGTGTTCTGTGTGCAGCTGCTTTGGTC
GCACTTCAAGAGAACCTCCCAAAGTTACAGTTTGACCACAAGAAGACAAAGTTGTTAGCT
GAAGGGTTGAATCAGATGAAAGGGATTAGAGTGAACGTTACAGCCGTGGAGACCAACATG
ATTTTCATGGATATGGAGGATGGATCAAAACTTACTGCTGAGAAACTGCGCAAGAGTCTA
ACTGAGTATGGCATTCTCGTCATCCCAGAAAACTCGTCCCGGATCAGAATGGTTATACAC
CACCAGATAACAACAAGTGATGTGCATTACACATTATCTTGTTTTCAACAGGCAGTGCAA
ATGATTCAGGAACCAAGCAGAAACTAAACTTGCAGAACCGAAAAATGTTTTTATTTAAAT
GTTGTTTGTCTAAGTCACTTCTATATAAAAACTTCAGAGATTGATCGATCTCTCAATGAA
ATTTGAATTGAACTTGTCACTC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL4381Contig1 492 2 1 U
GGAGTGTTGCGGCAATATCTGTGAGTTCAAAGGCAATGAAGCACGTGGTGAAGATCTTGA
GCCTGGTGGTGGCAGTCTCTGCCTTATGGATTACTCTTTTGCAGGCTGCAATTGTTCCAC
AAAGTCATACATGTTTGCTACCGATATACTTTGTTGTGTCACTTGGATGCTATGGTTTAT
TAATGGTTGGAGTCGGAATAATGCAGTTCCCTACCTGTCCTCAAGAATCAGTTCTCTTGA
ACCATCTGCATTGCAGGATATTGCAGAGGCAAAAGACTTCTTAAGCACAAACGGAATAGA
TATTGGAACGTATTGACACATTCTGTGATATTCTTCTTGTTGACTTCCCTAAAGCATTAA
CCTGTATCCCATCTTCGTTTTAAACCTCAAGTTTGAGTTAACTATGTCTTTTGGCTAGAA
CATTGATAGTATTATGTCAAAGAAAAGAAGGTAGTTTATGTTTGAACTTTTAAATACAGA
GTCGTTCAGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FV50JQ C 1
AF RR2FV50TF U 1
BS 1 492 RR2FV50TF

RD RR2FV50JQ 492 0 0
GGAGTGTTGCGGCAATATCTGTGAGTTCAAAGGCAATGAAGCACGTGGTGAAGATCTTGA
GCCTGGTGGTGGCAGTTTCTGCCTTATGGATTACTCTTTTGCAGGCTGCAATTGTTCCAC
AAAGTCATACATGTTTGCTACCGATATACTTTGTTGTGTCACTTGGATGCTATGGTTTAT
TAATGGTTGGAGTCGGAATAATGCAGTTCCCTACCTGTCCTCAAGAATCAGTTCTCTTGA
ACCATCTGCATTGCAGGATATTGCAGAGGCAAAAGACTTCTTAAGCACAAACGGAATAGA
TATTGGAACGTATTGACACATTCTGTGATATTCTTCTTGTTGACTTCCCTAAAGCATTAA
CCTGTATCCCATCTTCGTTTTAAACCTCAAGTTTGAGTTAACTATGTCTTTTGGCTAGAA
CATTGATAGTATTATGTCAAAGAAAAGAAGGTAGTTTATGTTTGAACTTTTAAATACAGA
GTCGTTCAGATT

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR2FV50TF 492 0 0
GGAGTGTTGCGGCAATATCTGTGAGTTCAAAGGCAATGAAGCACGTGGTGAAGATCTTGA
GCCTGGTGGTGGCAGTCTCTGCCTTATGGATTACTCTTTTGCAGGCTGCAATTGTTCCAC
AAAGTCATACATGTTTGCTACCGATATACTTTGTTGTGTCACTTGGATGCTATGGTTTAT
TAATGGTTGGAGTCGGAATAATGCAGTTCCCTACCTGTCCTCAAGAATCAGTTCTCTTGA
ACCATCTGCATTGCAGGATATTGCAGAGGCAAAAGACTTCTTAAGCACAAACGGAATAGA
TATTGGAACGTATTGACACATTCTGTGATATTCTTCTTGTTGACTTCCCTAAAGCATTAA
CCTGTATCCCATCTTCGTTTTAAACCTCAAGTTTGAGTTAACTATGTCTTTTGGCTAGAA
CATTGATAGTATTATGTCAAAGAAAAGAAGGTAGTTTATGTTTGAACTTTTAAATACAGA
GTCGTTCAGATT

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 2

CO CL4382Contig1 597 2 1 U
GGACAAAAATCGTCCCTTCGATTTGCTTCGCCCTACGTTTCTGTTTCGGTTTCTCTTTCT
CTTCCGACCGTTCAGATCTTCGTCTCCCGATTTGTGGAATTTCTGTCAAAGGGTCTGCTC
TAACATGTCAGGAAGAAAGGAAACAGTGTTAGATTTGGCTAAGTTTGTGGATAAAGGTGT
GCAAGTTAAGCTCACCGGTGGTAGACAGGTCACTGGAACTCTCAAGGGCTATGATCAGTT
GCTCAACCTTGTTCTGGACGGGGCAGTTGAATCTGTGCGAGATCATGATGATCCTTTGAA
GACTACCGACCAAACAAGACCTCTTGGTTTAATTGTTTGTCGTGGAACTGCGGTGATGCT
CGTCTCACCAACGGATGGCACTGAGGAAATCGCTAACCCGTTTGTTCAACCAGAAGCTGT
CTAAAGAGTCTCATTTATGTTTTTTAGGTTGGGGGTTTTTTGAGAGTATTATGTATCAGT
ATCTGCCATGGACGTTGGAAACAATTATTTCTATGTTCTCAGGTCCGACTCTGCCTAACA
ATTAGAGTGTGATTTGAACTGTTTTTGACTTTATCATTGATCAAAATTTAAGTTGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E334JQ C 1
AF RR2E334TF U 1
BS 1 597 RR2E334TF

RD RR2E334JQ 597 0 0
GGACAAAAATCGTCCCTTCGATTTGCTTCGCCCTACGTTTCTGTTTCGGTTTCTCTTTCT
CTTCCGACCGTTCAGATCTTCGTCTCCCGATTTGTGGAATTTCTGTCAAAGGGTCTGCTC
TAACATGTCAGGAAGAAAGGAAACAGTGTTAGATTTGGCTAAGTTTGTGGATAAAGGTGT
GCAAGTTAAGCTCACCGGTGGTAGACAGGTCACTGGAACTCTCAAGGGCTATGATCAGTT
GCTCAACCTTGTTCTGGACGGGGCAGTTGAATCTGTGCGAGATCATGATGATCCTTTGAA
GACTACCGACCAAACAAGACCTCTTGGTTTAATTGTTTGTCGTGGAACTGCGGTGATGCT
CGTCTCACCAACGGATGGCACTGAGGAAATCGCTAACCCGTTTGTTCAACCAGAAGCTGT
CTAAAGAGTCTCATTTATGTTTTTTAGGTTGGGGGTTTTTTGAGAGTATTATGTATCAGT
ATCTGCCATGGACGTTGGAAACAATTATTTCTATGTTCTCAGGTCCGACTCTGCCTAACA
ATTAGAGTGTGATTTGAACTGTTTTTGACTTTATCATTGATCAAAATTTAAGTTGCT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2E334TF 597 0 0
GGACAAAAATCGTCCCTTCGATTTGCTTCGCCCTACGTTTCTGTTTCGGTTTCTCTTTCT
CTTCCGACCGTTCAGATCTTCGTCTCCCGATTTGTGGAATTTCTGTCAAAGGGTCTGCTC
TAACATGTCAGGAAGAAAGGAAACAGTGTTAGATTTGGCTAAGTTTGTGGATAAAGGTGT
GCAAGTTAAGCTCACCGGTGGTAGACAGGTCACTGGAACTCTCAAGGGCTATGATCAGTT
GCTCAACCTTGTTCTGGACGGGGCAGTTGAATCTGTGCGAGATCATGATGATCCTTTGAA
GACTACCGACCAAACAAGACCTCTTGGTTTAATTGTTTGTCGTGGAACTGCGGTGATGCT
CGTCTCACCAACGGATGGCACTGAGGAAATCGCTAACCCGTTTGTTCAACCAGAAGCTGT
CTAAAGAGTCTCATTTATGTTTTTTAGGTTGGGGGTTTTTTGAGAGTATTATGTATCAGT
ATCTGCCATGGACGTTGGAAACAATTATTTCTATGTTCTCAGGTCCGACTCTGCCTAACA
ATTAGAGTGTGATTTGAACTGTTTTTGACTTTATCATTGATCAAAATTTAAGTTGCT

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL4383Contig1 816 2 10 U
GACACCAAACCTCTCCTCTCTCTCCCTCTCTTCGCATCTCAAAGAACAAACAACAGAAAG
AAAAACAAAAGAATAACAAGAAAATGGAGGTCTCGACTAGAAAGCCTTATTTCATAGAAG
AAGAAGACGATGGATTGGTTTCTCTAGCAGAGATGGAAGCTGGAGTTTCTTCTCCTTCTT
CTTGCTACAAAAACACGAACCAGTACCATCTTCAGAGTTATTATTATAATTACCATCAGT
ACTCTGTTTCATCACCCAGATCTGTTGTTGTCTCTGGAAAATTCCATGATTTTAGATTCG
ACAATAGCTGTTTCGGACAACAATCATCAGTTCCTCATTTCTTGGACTCCTGTTTCCTCT
GTAAGAAGCGTCTTGGTCATAACAAAGACATCTTCATGTACAGAGGAGACACACCGTTCT
GTAGCGAGGTGTGTAGAGAAGAACAGATAAAGAGAGACGAGTCGAAAGAGAAGAAAAAGA
ATCTGTCTTCATCTGTGAAAGCTATGAGAAGAAATGAAAAGAGAAGCTCTTCTTCTTCTC
CAACTAGATCTCGTGACTATGCTTTCCATTCTGGAACTGTCGCTGCTGCTTAGTTTATAA
TATCTCTTTTAGTTAATATTCCATGGCAAAACAAAAACCAAGAGAATCCATTCAAGCCAA
TTGCTGTAAAAGTTGGTTAATGGTTTGAATTTAAAAACTCCTTTTCAAGGGTTTGTCCTT
TTTCGTTTTTATTAGATTTTATTTTGCATAAAGAAAAAAAAATCATGCAATTTTGGGAGT
ACAAGAAAACTGTGGCTAAACGTTTGCCTGTGTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK94TF U 1
AF RR2GK94JQ C 42
BS 1 654 RR2GK94TF
BS 655 655 RR2GK94JQ
BS 656 659 RR2GK94TF
BS 660 660 RR2GK94JQ
BS 661 670 RR2GK94TF
BS 671 671 RR2GK94JQ
BS 672 696 RR2GK94TF
BS 697 697 RR2GK94JQ
BS 698 707 RR2GK94TF
BS 708 816 RR2GK94JQ

RD RR2GK94TF 723 0 0
GACACCAAACCTCTCCTCTCTCTCCCTCTCTTCGCATCTCAAAGAACAAACAACAGAAAG
AAAAACAAAAGAATAACAAGAAAATGGAGGTCTCGACTAGAAAGCCTTATTTCATAGAAG
AAGAAGACGATGGATTGGTTTCTCTAGCAGAGATGGAAGCTGGAGTTTCTTCTCCTTCTT
CTTGCTACAAAAACACGAACCAGTACCATCTTCAGAGTTATTATTATAATTACCATCAGT
ACTCTGTTTCATCACCCAGATCTGTTGTTGTCTCTGGAAAATTCCATGATTTTAGATTCG
ACAATAGCTGTTTCGGACAACAATCATCAGTTCCTCATTTCTTGGACTCCTGTTTCCTCT
GTAAGAAGCGTCTTGGTCATAACAAAGACATCTTCATGTACAGAGGAGACACACCGTTCT
GTAGCGAGGTGTGTAGAGAAGAACAGATAAAGAGAGACGAGTCGAAAGAGAAGAAAAAGA
ATCTGTCTTCATCTGTGAAAGCTATGAGAAGAAATGAAAAGAGAAGCTCTTCTTCTTCTC
CAACTAGATCTCGTGACTATGCTTTCCATTCTGGAACTGTCGCTGCTGCTTAGTTTATAA
TATCTCTTTTAGTTAATATTCCATGGCAAAACAAAAACCAAGAGAATCCATTCA*GCCA*
TTGCTGTAAA*GTTGGTTAATGGTTTGAATTTAAAA*CTCCTTTTCA
GGGTTGTCCTTTTCGT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2GK94JQ 775 0 0
AAGAACAAACAACAGAAAGAAAAACAAAAGAATAACAAGAAAATGGAGGTCTCGACTAGA
AAGCCTTATTTCATAGAAGAAGAAGACGATGGATTGGTTTCTCTAGCAGAGATGGAAGCT
GGAGTTTCTTCTCCTTCTTCTTGCTACAAAAACACGAACCAGTACCATCTTCAGAGTTAT
TATTATAATTACCATCAGTACTCTGTTTCATCACCCAGATCTGTTGTTGTCTCTGGAAAA
TTCCATGATTTTAGATTCGACAATAGCTGTTTCGGACAACAATCATCAGTTCCTCATTTC
TTGGACTCCTGTTTCCTCTGTAAGAAGCGTCTTGGTCATAACAAAGACATCTTCATGTAC
AGAGGAGACACACCGTTCTGTAGCGAGGTGTGTAGAGAAGAACAGATAAAGAGAGACGAG
TCGAAAGAGAAGAAAAAGAATCTGTCTTCATCTGTGAAAGCTATGAGAAGAAATGAAAAG
AGAAGCTCTTCTTCTTCTCCAACTAGATCTCGTGACTATGCTTTCCATTCTGGAACTGTC
GCTGCTGCTTAGTTTATAATATCTCTTTTAGTTAATATTCCATGGCAAAACAAAAACCAA
GAGAATCCATTCAAGCCAATTGCTGTAAAAGTTGGTTAATGGTTTGAATTTAAAAACTCC
TTTTCAAGGGTTTGTCCTTTTTCGTTTTTATTAGATTTTATTTTGCATAAAGAAAAAAAA
ATCATGCAATTTTGGGAGTACAAGAAAACTGTGGCTAAACGTTTGCCTGTGTGCG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL4384Contig1 1414 2 2 U
GGAGAGCCTATTATGTGTGCGATCCTAATCTGAAAATCTCAGATCAGATTAATAATTTTT
GTTCGTTCGTTTATTTGTTTTTTTTTTTTTGAAAAATGCATATAATGAGTCCACCAATGT
GCGACCATTGCAACATGGGAAAAGCCATTGTTTATTGTAAGACACATTTGGCTAGTGTTT
GTTCTCAATGTGACCGGAAGTTTCACCACTATGTGACTATGGATAGTCCCGATCACTCCC
GGCTTCTGTTGTGTGAAAAATGCGTTTTGCATGCCGCAGATGTCCAGTGCCTTGAACAAG
GATTGTGCCTATGCCAAACATGCGTTCCAAACGCAAACGTCACCTCAGGCATTCATTTTT
GTAACGTTCCTAATAATCATTCTGGTTATAGTTTTCCACGAGATCTCGATCTTGATTCTT
TTTCCTCCTCTTTGTCATCTTCTTTAACTGATCTCAGTTGGGGATATCCCTTTGTTCCAT
TACCTCCAAAAAATGGGGACTCATCATCCTCTTCTTCTATTATTTTTCAAAATTTTGATA
ATCATACAAAGAATATTAGTGATCAACGAGGGCGAATGCTTCAGCCCGATGATATGGACA
ATTCTAAGGATTTTTCATATTCAGGCTTTGAACCTTACAAAACTAAAGATATAGAGAACG
TTTGGCTGAACAATTTTGATGACGACAAGTCAGTATTAGATCAAAAAGAATATTTATCCA
GGGAAGAATTGATCTTAACCGATCAACTCATCGATGAAATAATGAAACACAATGAAGTAA
CAACAACCGAGGTTATACATCAAGATTACAACATCGAAGCTTTGGCTAATGCAAGTTGTG
AAGATTACATCACGAATCAAATGATTCAATCAAAGGCAAAGGAGGAGACCAATAACAACG
TTGGAAAATTATTCACTAACGCTCATATTCATGATGAGTGTCGACCATCGCAGTTGATTC
TGACCGAGGTCGATGAGATGTTAACATGGGAGGAACAATTACTTGAATCTCCTATATACA
CACCGCAGAATCGATTAGAGGCAAAGAAGAGATATCTTGAAAAGAAAAAGAAACGCAAGT
TTGGGAAGAAAATTAGATATGAATCTCGAAAGTCTTCAGCCGATACGAAGAAACGACTGA
AAGGAAGATTTACAATTTGATGCAGAATATGATTATGACCCACGAGCTAATAATACAAAC
AAATAGGCTAATAAAACCATGACCCAATAAAAAATGGTTGCAACCATTTGATAATCTTCC
TTATGTTTACCGTTTTCAAAATTTCATAAACCAGTCAAAATGCGGGCGCATGAAGACGTA
CGGGGGCACATGACCCCATCTGATTTTTGTTTTCCTTAGTAATTTCTAATAGCTTATGTA
ATGGTTTCCTAAACAAACAATTATACATATTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ92TF U 1
AF RR2CJ92JQ C 640
BS 1 706 RR2CJ92TF
BS 707 1414 RR2CJ92JQ

RD RR2CJ92TF 706 0 0
GGAGAGCCTATTATGTGTGCGATCCTAATCTGAAAATCTCAGATCAGATTAATAATTTTT
GTTCGTTCGTTTATTTGTTTTTTTTTTTTTGAAAAATGCATATAATGAGTCCACCAATGT
GCGACCATTGCAACATGGGAAAAGCCATTGTTTATTGTAAGACACATTTGGCTAGTGTTT
GTTCTCAATGTGACCGGAAGTTTCACCACTATGTGACTATGGATAGTCCCGATCACTCCC
GGCTTCTGTTGTGTGAAAAATGCGTTTTGCATGCCGCAGATGTCCAGTGCCTTGAACAAG
GATTGTGCCTATGCCAAACATGCGTTCCAAACGCAAACGTCACCTCAGGCATTCATTTTT
GTAACGTTCCTAATAATCATTCTGGTTATAGTTTTCCACGAGATCTCGATCTTGATTCTT
TTTCCTCCTCTTTGTCATCTTCTTTAACTGATCTCAGTTGGGGATATCCCTTTGTTCCAT
TACCTCCAAAAAATGGGGACTCATCATCCTCTTCTTCTATTATTTTTCAAAATTTTGATA
ATCATACAAAGAATATTAGTGATCAACGAGGGCGAATGCTTCAGCCCGATGATATGGACA
ATTCTAAGGATTTTTCATATTCAGGCTTTGAACCTTACAAAACTAAAGATATAGAGAACG
TTTGGCTGAACAATTTTGATGACGACAAGTCAGTATTAGATCAAAA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2CJ92JQ 775 0 0
AAACTAAAGATATAGAGAACGTTTGGCTGAACAATTTTGATGACGACAAGTCAGTATTAG
ATCAAAAAGAATATTTATCCAGGGAAGAATTGATCTTAACCGATCAACTCATCGATGAAA
TAATGAAACACAATGAAGTAACAACAACCGAGGTTATACATCAAGATTACAACATCGAAG
CTTTGGCTAATGCAAGTTGTGAAGATTACATCACGAATCAAATGATTCAATCAAAGGCAA
AGGAGGAGACCAATAACAACGTTGGAAAATTATTCACTAACGCTCATATTCATGATGAGT
GTCGACCATCGCAGTTGATTCTGACCGAGGTCGATGAGATGTTAACATGGGAGGAACAAT
TACTTGAATCTCCTATATACACACCGCAGAATCGATTAGAGGCAAAGAAGAGATATCTTG
AAAAGAAAAAGAAACGCAAGTTTGGGAAGAAAATTAGATATGAATCTCGAAAGTCTTCAG
CCGATACGAAGAAACGACTGAAAGGAAGATTTACAATTTGATGCAGAATATGATTATGAC
CCACGAGCTAATAATACAAACAAATAGGCTAATAAAACCATGACCCAATAAAAAATGGTT
GCAACCATTTGATAATCTTCCTTATGTTTACCGTTTTCAAAATTTCATAAACCAGTCAAA
ATGCGGGCGCATGAAGACGTACGGGGGCACATGACCCCATCTGATTTTTGTTTTCCTTAG
TAATTTCTAATAGCTTATGTAATGGTTTCCTAAACAAACAATTATACATATTGAG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL4385Contig1 805 2 6 U
ATAGTAAAAGTTCTCATCAGCTTATTGTGCTAATTAAACTGCTAAAAGCTCAAAATTACA
ACATCATAAATCACAATAACCAATTCCTTTAACCAAAAATCTCTGCTTGTATACCACTAC
TACGGCTTAAAAAGCAGAGTTAACCCTGTCCCATCAAATCAAATAGAGAATTAAATCCCG
AAAGCAAGCATTTTCAGATTCTACAGAAAAAATTTACAGTAAATATACGACTCCAGTCTC
AAGACAATCTTCAAGAAATTTGTGTCTGTCTCTCTCTCAAACAACTGTGGTAGTGTAGTT
TGGGAAGAGTGTGACAAGTTTGTTAACAGAATCTGAGTGGAACTTCCTTGCGAACAGGTA
ACATGGACGTCTTATTCCGTTCCATGTACAAGGCCAATGCAGCTCATCTCCACGCTTGCC
AACGCTTGTTACGTGTACACTCATGTCGTCGGACGTGATATTTTTCAAGAACTTGAGTGA
GACATCGCGGGATCTGTATGTCTTGGGATGCCATTTACGCTCAGACCAATCAACATACGT
GACTGACCAGTTCGATATTCCTCCAGGATCAAGCATATGGAAGAATGTAGGCAGGTAATG
TTCATCTGCAATACAGTTCTTATTTGCTTCTACCCCAGGTCTGCAATATCGCCGGAATTT
TGAGTAGTAGAGATTATCAGCCATCACTATCAAAGCGTGGTGACGTTTCATTGTGAACCA
CTGAGCACCCTTTCTGAAATCTTGCCTAGGGATTTCAGGTAACATGTTATCCATGTGTCT
ACCCGTCCATGCGGACAGGATCCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G437JQ U 1
AF RR2G574JQ U 1
BS 1 125 RR2G437JQ
BS 126 126 RR2G574JQ
BS 127 350 RR2G437JQ
BS 351 351 RR2G574JQ
BS 352 389 RR2G437JQ
BS 390 805 RR2G574JQ

RD RR2G437JQ 389 0 0
ATAGTAAAAGTTCTCATCAGCTTATTGTGCTAATTAAACTGCTAAAAGCTCAAAATTACA
ACATCATAAATCACAATAACCAATTCCTTTAACCAAAAATCTCTGCTTGTATACCACTAC
TACGGGTTAAAAAGCAGAGTTAACCCTGTCCCATCAAATCAAATAGAGAATTAAATCCCG
AAAGCAAGCATTTTCAGATTCTACAGAAAAAATTTACAGTAAATATACGACTCCAGTCTC
AAGACAATCTTCAAGAAATTTGTGTCTGTCTCTCTCTCAAACAACTGTGGTAGTGTAGTT
TGGGAAGAGTGTGACAAGTTTGTTAACAGAATCTGAGTGGAACTTCCTTGGGAACAGGTA
ACATGGACGTCTTATTCCGTTCCATGTAC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2G574JQ 805 0 0
ATAGTAAAAGTTCTCATCAGCTTATTGTGCTAATTAAACTGCTAAAAGCTCAAAATTACA
ACATCATAAATCACAATAACCAATTCCTTTAACCAAAAATCTCTGCTTGTATACCACTAC
TACGGCTTAAAAAGCAGAGTTAACCCTGTCCCATCAAATCAAATAGAGAATTAAATCCCG
AAAGCAAGCATTTTCAGATTCTACAGAAAAAATTTACAGTAAATATACGACTCCAGTCTC
AAGACAATCTTCAAGAAATTTGTGTCTGTCTCTCTCTCAAACAACTGTGGTAGTGTAGTT
TGGGAAGAGTGTGACAAGTTTGTTAACAGAATCTGAGTGGAACTTCCTTGCGAACAGGTA
ACATGGACGTCTTATTCCGTTCCATGTACAAGGCCAATGCAGCTCATCTCCACGCTTGCC
AACGCTTGTTACGTGTACACTCATGTCGTCGGACGTGATATTTTTCAAGAACTTGAGTGA
GACATCGCGGGATCTGTATGTCTTGGGATGCCATTTACGCTCAGACCAATCAACATACGT
GACTGACCAGTTCGATATTCCTCCAGGATCAAGCATATGGAAGAATGTAGGCAGGTAATG
TTCATCTGCAATACAGTTCTTATTTGCTTCTACCCCAGGTCTGCAATATCGCCGGAATTT
TGAGTAGTAGAGATTATCAGCCATCACTATCAAAGCGTGGTGACGTTTCATTGTGAACCA
CTGAGCACCCTTTCTGAAATCTTGCCTAGGGATTTCAGGTAACATGTTATCCATGTGTCT
ACCCGTCCATGCGGACAGGATCCTC

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

CO CL4386Contig1 585 2 1 U
GGAGCCGCAGGAGGAAAATGACGACGAGACTCAGGAAGAACAGGAAGAAGCGCGGCCACG
TCAGCGCCGGACATGGACGTATCGGAAAGCACCGAAAGCATCCCGGAGGTCGCGGTAACG
CCGGAGGTATGCACCACCACAGGATCCTCTTCGACAAGTACCATCCCGGTTACTTCGGCA
AAGTCGGTATGAGGTACTTCCACAAGCTCCGCAACAAGTTCTTCTGCCCGATCGTCAACC
TCGACAGGCTCTGGTCGCTCGTCCCCGAGGACGTGATGGCCAAGTCGACCAAGGACAAGG
TTCCGTTGATCGATGTGACTCAGCACGGGTTCTTTAAGGTGTTGGGGAAAGGTCATTTGC
CTGAGAACAAGCCTTTTGTGGTGAAGGCGAAGCTTATCTCGAAGACTGCTGAGAAGAAGA
TTAAGGAAGCTGGTGGTGCTGTTGTTCTTACAGCTTAGACTTTTGTCAGTTGTTTTGGTT
ATAACCTTGTCTTGTTTTTGGATTTTTGAGTTTTGAAAACTTATGTTTTGCTTTTATAAA
TGGTTTGTTATGACATTTTCGGGTTTTATGATTGTTATTACAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FL56TF U 1
AF RR2FL56JQ C 96
BS 1 585 RR2FL56TF

RD RR2FL56TF 585 0 0
GGAGCCGCAGGAGGAAAATGACGACGAGACTCAGGAAGAACAGGAAGAAGCGCGGCCACG
TCAGCGCCGGACATGGACGTATCGGAAAGCACCGAAAGCATCCCGGAGGTCGCGGTAACG
CCGGAGGTATGCACCACCACAGGATCCTCTTCGACAAGTACCATCCCGGTTACTTCGGCA
AAGTCGGTATGAGGTACTTCCACAAGCTCCGCAACAAGTTCTTCTGCCCGATCGTCAACC
TCGACAGGCTCTGGTCGCTCGTCCCCGAGGACGTGATGGCCAAGTCGACCAAGGACAAGG
TTCCGTTGATCGATGTGACTCAGCACGGGTTCTTTAAGGTGTTGGGGAAAGGTCATTTGC
CTGAGAACAAGCCTTTTGTGGTGAAGGCGAAGCTTATCTCGAAGACTGCTGAGAAGAAGA
TTAAGGAAGCTGGTGGTGCTGTTGTTCTTACAGCTTAGACTTTTGTCAGTTGTTTTGGTT
ATAACCTTGTCTTGTTTTTGGATTTTTGAGTTTTGAAAACTTATGTTTTGCTTTTATAAA
TGGTTTGTTATGACATTTTCGGGTTTTATGATTGTTATTACAGTT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2FL56JQ 490 0 0
AAGCATCCCGGAGGTCGCGGTAACGCCGGAGGTATGCACCACCACAGGATCCTCTTCGAC
AAGTACCATCCCGGTTACTTCGGCAAAGTCGGTATGAGGTACTTCCACAAGCTCCGCAAC
AAGTTCTTCTGCCCGATCGTCAACCTCGACAGGCTCTGGTCGCTCGTCCCCGAGGACGTG
ATGGCCAAGTCGACCAAGGACAAGGTTCCGTTGATCGATGTGACTCAGCACGGGTTCTTT
AAGGTGTTGGGGAAAGGTCATTTGCCTGAGAACAAGCCTTTTGTGGTGAAGGCGAAGCTT
ATCTCGAAGACTGCTGAGAAGAAGATTAAGGAAGCTGGTGGTGCTGTTGTTCTTACAGCT
TAGACTTTTGTCAGTTGTTTTGGTTATAACCTTGTCTTGTTTTTGGATTTTTGAGTTTTG
AAAACTTATGTTTTGCTTTTATAAATGGTTTGTTATGACATTTTCGGGTTTTATGATTGT
TATTACAGTT

QA 1 490 1 490
DS 



AS 1 2

CO CL4387Contig1 758 2 2 U
TTTTGCTCTCAAAAATTAAATTTCATTAAGCTAATGAACACAATAGATAAGTGGCAACCA
AACAAATTACATATCAGTAGTACATACTATATAGTTAAACTAATTAAACAACTTTAACCG
TCACCCAAAAAGAAACGAAGAAGAAGCTTTTATCGTTCTTCATCGTTTTAAGCAAAAAAT
AGAGCCGCAAGAGAGAGCCATGAGAAGCACGGCGGCTCTCTCTTCCTCGCCGAGTTTACT
CCACAGCCTCTTCTTCTCAACAGGTGATCTCTTCATCACCGGAACTTTAAACCCTAAATC
CAAAAATCTACCCATTCTTTGCTGCTGCTACTACTACCACTGCACTTGCTGCTGTGATCA
TCATCTTTGCTGGTCTTGTTTCCATCGTCGAGGCTTAGATCACTAGTATCACTGCTGATG
CTTCTTTTTCTGTTTTTCTTCTCTGGTTTGATTCCGAGAGCCGCTTGCCTCTTCTTCCTG
CTCTTGATCCCACAGGCATTGCACAATGACTTAGGTCCAGCAGGGCCACCACGCCAAAGA
GGAGTACGGAATGTGCCGCAATCAACGCAAGTCCTCTTCGTCTCACCACTACTACTTCCA
TTGCTACTGCAGTTCTCGTTATCAACATCAGATAACTCTCCGGAAGAATCAACCTTTGTT
TTCGTTTCTTCTGATCGCTCAGACATTCTTTGATAGCAGCTACTACTTTGATGATGATAA
GGTATAAAAGAGAGGGAGAGAGACGGCGAATGGGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AN78TF C 1
AF RR2AN78JQ U 269
BS 1 268 RR2AN78TF
BS 269 758 RR2AN78JQ

RD RR2AN78TF 758 0 0
TTTTGCTCTCAAAAATTAAATTTCATTAAGCTAATGAACACAATAGATAAGTGGCAACCA
AACAAATTACATATCAGTAGTACATACTATATAGTTAAACTAATTAAACAACTTTAACCG
TCACCCAAAAAGAAACGAAGAAGAAGCTTTTATCGTTCTTCATCGTTTTAAGCAAAAAAT
AGAGCCGCAAGAGAGAGCCATGAGAAGCACGGCGGCTCTCTCTTCCTCGCCGAGTTTACT
CCACAGCCTCTTCTTCTCAACAGGTGATCTCTTCATCACCGGAACTTTAAACCCTAAATC
CAAAAATCTACCCATTCTTTGCTGCTGCTACTACTACCACTGCACTTGCTGCTGTGATCA
TCATCTTTGCTGGTCTTGTTTCCATCGTCGAGGCTTAGATCACTAGTATCACTGCTGATG
CTTCTTTTTCTGTTTTTCTTCTCTGGTTTGATTCCGAGAGCCGCTTGCCTCTTCTTCCTG
CTCTTGATCCCACAGGCATTGCACAATGACTTAGGTCCAGCAGGGCCACCACGCCAAAGA
GGAGTACGGAATGTGCCGCAATCAACGCAAGTCCTCTTCGTCTCACCACTACTACTTCCA
TTGCTACTGCAGTTCTCGTTATCAACATCAGATAACTCTCCGGAAGAATCAACCTTTGTT
TTCGTTTCTTCTGATCGCTCAGACATTCTTTGATAGCAGCTACTACTTTGATGATGATAA
GGTATAAAAGAGAGGGAGAGAGACGGCGAATGGGGTCC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2AN78JQ 490 0 0
CTCTTCATCACCGGAACTTTAAACCCTAAATCCAAAAATCTACCCATTCTTTGCTGCTGC
TACTACTACCACTGCACTTGCTGCTGTGATCATCATCTTTGCTGGTCTTGTTTCCATCGT
CGAGGCTTAGATCACTAGTATCACTGCTGATGCTTCTTTTTCTGTTTTTCTTCTCTGGTT
TGATTCCGAGAGCCGCTTGCCTCTTCTTCCTGCTCTTGATCCCACAGGCATTGCACAATG
ACTTAGGTCCAGCAGGGCCACCACGCCAAAGAGGAGTACGGAATGTGCCGCAATCAACGC
AAGTCCTCTTCGTCTCACCACTACTACTTCCATTGCTACTGCAGTTCTCGTTATCAACAT
CAGATAACTCTCCGGAAGAATCAACCTTTGTTTTCGTTTCTTCTGATCGCTCAGACATTC
TTTGATAGCAGCTACTACTTTGATGATGATAAGGTATAAAAGAGAGGGAGAGAGACGGCG
AATGGGGTCC

QA 1 490 1 490
DS 



AS 1 2

CO CL4388Contig1 730 2 2 U
GGCACTACATACTCCCTACTTACAAAGTACACACAATAAAGTTAAGCTACAAAAAGATTA
ACAAGAGATGGCAATAAGGTGTTTAACCGTGTTCCTCGTTGTTCTCACTGTGGCTCAATC
CGTCACTGCCACAAGACCGGCCCCGGCCAAGAATGTCGGAGCTGGCCTTGACGACCAAAA
GAACTTTGTTGCGTTTGCTGGAATCGGTGGAGCTGCTGGAGTTGGTGGTGTTGGTGGTGT
CGGAGCAGGTCTTGGTGGTGTAGCTGGTGGAGTAGGTGGTGTCGCAGGAGTTTTGCCTGT
AGGAGGAGGAATTGGTGGTTTAGGAGGTGTAGGTGGTCTCGGCGGTGGTTCAGGTCTCGG
CGGTGGTTCAGGTCTCGGTGGTGGAATAGGTGGAATTGGTGGTGGTTCAGGTCTTGGTGG
TGGTGTAGGTGGGCTCGGCGGTGTAGGCGGTCTAGGCGGAGTAGGTGGTTTAGGAGGAAT
TGGCGGTGGAAGCGACTGCGGTGGTCTCACGCACCCTTGATGACAAAAGCGTTTTTTTCA
TCTCTCTATAAACAAAAGATCGATCGAAGGGTTCATAAGTATTAATATTTGTATCCGTCA
TATCATGTTGTAAGTTTTTCCCCGATGTTATGTACTTATGTTTTTGTTTATTTTCCATAT
ACGTTTCATTTTTCATGCTGTTTGTTATTATTTAGTACTTGTGAGAAACCTTGTGCTATC
AATAAATGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D587TF U 1
AF RR2D587JQ C 232
BS 1 721 RR2D587TF
BS 722 730 RR2D587JQ

RD RR2D587TF 725 0 0
GGCACTACATACTCCCTACTTACAAAGTACACACAATAAAGTTAAGCTACAAAAAGATTA
ACAAGAGATGGCAATAAGGTGTTTAACCGTGTTCCTCGTTGTTCTCACTGTGGCTCAATC
CGTCACTGCCACAAGACCGGCCCCGGCCAAGAATGTCGGAGCTGGCCTTGACGACCAAAA
GAACTTTGTTGCGTTTGCTGGAATCGGTGGAGCTGCTGGAGTTGGTGGTGTTGGTGGTGT
CGGAGCAGGTCTTGGTGGTGTAGCTGGTGGAGTAGGTGGTGTCGCAGGAGTTTTGCCTGT
AGGAGGAGGAATTGGTGGTTTAGGAGGTGTAGGTGGTCTCGGCGGTGGTTCAGGTCTCGG
CGGTGGTTCAGGTCTCGGTGGTGGAATAGGTGGAATTGGTGGTGGTTCAGGTCTTGGTGG
TGGTGTAGGTGGGCTCGGCGGTGTAGGCGGTCTAGGCGGAGTAGGTGGTTTAGGAGGAAT
TGGCGGTGGAAGCGACTGCGGTGGTCTCACGCACCCTTGATGACAAAAGCGTTTTTTTCA
TCTCTCTATAAACAAAAGATCGATCGAAGGGTTCATAAGTATTAATATTTGTATCCGTCA
TATCATGTTGTAAGTTTTTCCCCGATGTTATGTACTTATGTTTTTGTTTATTTTCCATAT
ACGTTTCATTTTTCATGCTGTTTGTTATTATTTAGTACTTGTGAGAAACCTTGTGCTATC
A
TAAA

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2D587JQ 499 0 0
TGGTGGTGTCGGAGCAGGTCTTGGTGGTGTAGCTGGTGGAGTAGGTGGTGTCGCAGGAGT
TTTGCCTGTAGGAGGAGGAATTGGTGGTTTAGGAGGTGTAGGTGGTCTCGGCGGTGGTTC
AGGTCTCGGCGGTGGTTCAGGTCTCGGTGGTGGAATAGGTGGAATTGGTGGTGGTTCAGG
TCTTGGTGGTGGTGTAGGTGGGCTCGGCGGTGTAGGCGGTCTAGGCGGAGTAGGTGGTTT
AGGAGGAATTGGCGGTGGAAGCGACTGCGGTGGTCTCACGCACCCTTGATGACAAAAGCG
TTTTTTTCATCTCTCTATAAACAAAAGATCGATCGAAGGGTTCATAAGTATTAATATTTG
TATCCGTCATATCATGTTGTAAGTTTTTCCCCGATGTTATGTACTTATGTTTTTGTTTAT
TTTCCATATACGTTTCATTTTTCATGCTGTTTGTTATTATTTAGTACTTGTGAGAAACCT
TGTGCTATCAATAAATGGA

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

CO CL4389Contig1 1072 2 2 U
GATGGTAAGTGGATTAGGGTGGAGTCTTAAGGACCAAACGGGTTCGGAAATCTTCGGATT
ACGGGCATGCTACAGAAGCCTATCAGCACTACATGCGGAAATGGAAGGTCTGCTTTGGGC
AACCTCATGCTTGAGAGATATGAGGATTCCCTCGATACAAATCGAGACAGATTGCTCGGA
CCTTGTGGACATGACCACAAATCCGACGGAGTGGCCTATTTTCTCGGCAGAGATAGAGAT
CTACCGGAAACTCCAAGAGGACTTCATGGATGTGAGACTTACTCATATTCCTCGAATCCG
GAACGCTCGAGCCGACGCACTGGCGAAGGAAGCAAGGAGTAGAGGCCATATCTTTTCCCA
TATAGATCAGACCCGATCAGACGGAGACACTCTACGAAGGGTCACCCGACTGACCACCAC
TTGATCTAAACAGATGGGCGGACGACAAAAAAAAATGTATTGTAAACTGTGTATTATGTA
TGATCTAGAACGTTTAGTAGAGTGTCTTGACTTGGTCAGGATTTTGGTTTTACTTAGTCA
TATTATGACCGCGAAGTGCACCGTTTGAAGTTTGAACATGTATAGTAGAATAATATGGAA
CTTTTCCTTGGAAGGTTTGTTTTTGTATATGAAACTGTCCTTCTGACCTTTGTCTTTGAA
TGTATAATGTCTATGATGTTAAGATTTTTCAAAATTATAATGTAATTTTTTTTTCTGAGG
AACATATGTTGTGAATTCAATTACTAAATTGGTCCACCGACTTGGCCATGACAATGACGA
TTAAGTAATTAACAAAGCATAACTATAATATTACATATACTTTAACTACTTAAAAGGTGA
TAAATAGGTTACCTGTGAATGTTTTGTTCTTAATCACTAAAATTTTTTTTTGACTAATAA
GTACTAGAAGTTTATGGATCAAAGTTTCTAATTCCTCCAAGTCCGAAGCTACATTATGCA
TTATTATTTTCACCTCAAACGTCTTTCAATCTAGATATTGTTTTTGTTATACTCAAAATA
AAATTCAATATTTCTGTTATCAAAATTTGAAACTGAAATAAGTAGTAAGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E377TF U 1
AF RR2E377JQ C 641
BS 1 713 RR2E377TF
BS 714 1072 RR2E377JQ

RD RR2E377TF 715 0 0
GATGGTAAGTGGATTAGGGTGGAGTCTTAAGGACCAAACGGGTTCGGAAATCTTCGGATT
ACGGGCATGCTACAGAAGCCTATCAGCACTACATGCGGAAATGGAAGGTCTGCTTTGGGC
AACCTCATGCTTGAGAGATATGAGGATTCCCTCGATACAAATCGAGACAGATTGCTCGGA
CCTTGTGGACATGACCACAAATCCGACGGAGTGGCCTATTTTCTCGGCAGAGATAGAGAT
CTACCGGAAACTCCAAGAGGACTTCATGGATGTGAGACTTACTCATATTCCTCGAATCCG
GAACGCTCGAGCCGACGCACTGGCGAAGGAAGCAAGGAGTAGAGGCCATATCTTTTCCCA
TATAGATCAGACCCGATCAGACGGAGACACTCTACGAAGGGTCACCCGACTGACCACCAC
TTGATCTAAACAGATGGGCGGACGACAAAAAAAAATGTATTGTAAACTGTGTATTATGTA
TGATCTAGAACGTTTAGTAGAGTGTCTTGACTTGGTCAGGATTTTGGTTTTACTTAGTCA
TATTATGACCGCGAAGTGCACCGTTTGAAGTTTGAACATGTATAGTAGAATAATATGGAA
CTTTTCCTTGGAAGGTTTGTTTTTGTATATGAAACTGTCCTTCTGACCTTTGTCTTTGAA
TGTATAATGTCTATGATGTTAAGATTTTTCAAAATTATAATGTAATTTTTTTT
CT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2E377JQ 432 0 0
TTCTGACCTTTGTCTTTGAATGTATAATGTCTATGATGTTAAGATTTTTCAAAATTATAA
TGTAATTTTTTTTTCTGAGGAACATATGTTGTGAATTCAATTACTAAATTGGTCCACCGA
CTTGGCCATGACAATGACGATTAAGTAATTAACAAAGCATAACTATAATATTACATATAC
TTTAACTACTTAAAAGGTGATAAATAGGTTACCTGTGAATGTTTTGTTCTTAATCACTAA
AATTTTTTTTTGACTAATAAGTACTAGAAGTTTATGGATCAAAGTTTCTAATTCCTCCAA
GTCCGAAGCTACATTATGCATTATTATTTTCACCTCAAACGTCTTTCAATCTAGATATTG
TTTTTGTTATACTCAAAATAAAATTCAATATTTCTGTTATCAAAATTTGAAACTGAAATA
AGTAGTAAGCAC

QA 1 432 1 432
DS 



AS 1 2

CO CL4390Contig1 576 2 1 U
GGGAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAGATAATAATCTCATCTTCATTTCTCTTCTTC
AAAAATAAAAATGGCAAAAAATTCATTAGCCATATATCTAATGTTACTAATTGCATTGAG
CACTGTTTATGAAACACAGGGGACATTCTCATTACCTCTTTACTTGAAGAACTTTCCCAA
AGTAGGCCAAGATTTTGAGTCTTTCGCTTACAAAGGTGGGAGAATTGCCAAGTGTGACTC
AAAACTTGGAGTCAAACCCAAAAGGATACCCCAACTTGGGTCAAAGGCAAAAGTAACGTA
AAAGGCTATTGAAATTACAACTATCTCCTTGTGAACAAACAAAAGAACGGATTTTTGTTT
ACGTTCCTACCCCTCGCAAGTCGCCTGTTTAGACAGACGGCTTGAAAATAAGTCGTCTAG
ACGACTTAACTTAAAGTCGAGTTAAGTCGTCTGGACAGTTTTTCTTAAACATAATTTAAA
AATTTTGTAAAAAATATTTTGATAAGTGAAAAATTGGAATTATGTAATTAACATATGTCT
TAAGAGATATAAATTAATATATAACAAATTCCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BO51TF U 1
AF RR2BO51JQ C 55
BS 1 576 RR2BO51TF

RD RR2BO51TF 576 0 0
GGGAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAGATAATAATCTCATCTTCATTTCTCTTCTTC
AAAAATAAAAATGGCAAAAAATTCATTAGCCATATATCTAATGTTACTAATTGCATTGAG
CACTGTTTATGAAACACAGGGGACATTCTCATTACCTCTTTACTTGAAGAACTTTCCCAA
AGTAGGCCAAGATTTTGAGTCTTTCGCTTACAAAGGTGGGAGAATTGCCAAGTGTGACTC
AAAACTTGGAGTCAAACCCAAAAGGATACCCCAACTTGGGTCAAAGGCAAAAGTAACGTA
AAAGGCTATTGAAATTACAACTATCTCCTTGTGAACAAACAAAAGAACGGATTTTTGTTT
ACGTTCCTACCCCTCGCAAGTCGCCTGTTTAGACAGACGGCTTGAAAATAAGTCGTCTAG
ACGACTTAACTTAAAGTCGAGTTAAGTCGTCTGGACAGTTTTTCTTAAACATAATTTAAA
AATTTTGTAAAAAATATTTTGATAAGTGAAAAATTGGAATTATGTAATTAACATATGTCT
TAAGAGATATAAATTAATATATAACAAATTCCAATT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2BO51JQ 522 0 0
TTCTTCAAAAATAAAAATGGCAAAAAATTCATTAGCCATATATTTAATGTTACTAATTGC
ATTGAGCACTGTTTATGAAACACAGGGGACATTTTCATTACCTCTTTACTTGAAGAACTT
TCCCAAAGTAGGCCAAGATTTTGAGTCTTTCGCTTACAAAGGTGGGAGAATTGCCAAGTG
TGACTCAAAACTTGGAGTCAAACCCAAAAGGATACCCCAACTTGGGTCAAAGGCAAAAGT
AACGTAAAAGGCTATTGAAATTACAACTATTTCCTTGTGAACAAACAAAAGAACGGATTT
TTGTTTACGTTCCTACCCCTCGCAAGTCGCCTGTTTAGACAGACGGCTTGAAAATAAGTT
GTTTAGACGACTTAACTTAAAGTCGAGTTAAGTTGTCTGGACAGTTTTTTTTAAACATAA
TTTAAAAATTTTGTAAAAAATATTTTGATAAGTGAAAAATTGGAATTATGTAATTAACAT
ATGTTTTAAGAGATATAAATTAATATATAACAAATTCCAATT

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 2

CO CL4391Contig1 1696 2 2 U
GGAAACACACTCATTTCTTCATTCCGTCTTGTCTCTCTCTATTTCAAATCTCAAAAAAAA
AAGCGAATCATGTCTCTGAGGCCAAGCGCGAAGACGGAGGTGAGACGGAACCGGTACAAA
GTGGCGGTGGATGCGGAGGAGGGACGGCGGAGGCTAGAGGATCACATGGTGGAGATCAGG
AAGAACAAGAGGGAAGAGAATCTCCAGAAGAAGAGACGCGAAGCCATCTCCTCCTCCTCC
TCCTCCGCCGCGCCTCAGGAGGGTCTTTCTTCTGCCAAGAAGATGATAGAGAATCTACCG
GAGATGGTGATTGGGATATGGTCAGAGGATACCAACTCACAACTCGAGACCACCACTCTC
CTCAGGAAACTGCTTTCTCTTGAGCAAAACCCTCCTATCAATGATGTTATAGCATCTGGT
GTTGTTCCTCGCCTTGTGACCTTTCTTTCAAGGGATGATTTTCCCAAACTTCAGTTTGAG
GCAGCTTGGGCGCCCACCAACATTGCTTCAGGGACATCAGAGAACACTAATGTTATCGTT
CAAAGTGGTGCTATCCCAAGTTTTATTCATCTTCTCACCTCCCCTAATGAGGAAGTCCGC
GAACAGGCTGTTTGGGCACTGGGGAACGTTGCTGGTGACTCACCAAAATGCCGTGATCTC
GTCTTGAGCCTAGGTGCCATGTTGCCTCTTCTCTCTCAGTTCCATGACCATACAAAGCTC
TCCATGCTTAGGAACGCTACATGGACTTTGTCAAACTTCTGCAGAGGGAAGCCTCAGCCT
TCTTTTGAGCAGACAAGCCCAGCTTTGCCGGTTCTTAAGAGGCTTGTGGAATCAACAGAT
GAAGAAGTTCTCACAGATGCATGCTGGGCTCTGTCGTACCTCTCGGACAGCTCAAATGAA
AAGATACAGACTGTTATCGATACTGGCGTTATCCCTCGCCTCATCGATCTCTTAGCTCAA
TAACGCAGAGTTCGAAGTGAAGAAAGAAGCTGCTTGGGGGATCTCAAATGCTACTTCTGG
TGGCACTCATGATCAGATCAAGTGCTTCCTCGTCTTCTCCACCTTCTTACAAACCCTTAC
AAGAAGAGTATCAAGAAGGAAGCTTGCTGGACCATCTCCAACATTACAGCTGGGAGTTCT
AAACAGATACAAGGAGTGATTGAAGCAGGTATCATTCAGTCTCTTATTGGAGAACATTCT
GGTGGTTGGAGAAGCAGTGAAGAGCTTAGGTCATACAGGAGATGATAACCCTTACGCTGC
AATGATAGATGAAGCAGAAGGGCTTGAGAAGATTGAGAATCTTCAGAGCCACGACAACAA
CGATATATACCAAAAGGCTGTGAAAATCCTCGAAACGTTTTGGACTGAAGACGATGATGA
TGATGAAGGAGCCAACGATGAAAACCACGCTCCGCAAGCCGGTTTCCAGTTCGGAAGCGC
TAACGTTGCTGCCCCTCCTAGTCAGTTCAACTTCATGTGAAGAAGGTGTCGAACGGTGAT
AACGTGAAGTGAAAGAAGTTTTTTCTTGTCTTTTCTACTGCATCATCATGCACAAGTCAC
AACTCGTGGATATGAAGAAACACTGTGTACGAGTAGTATCTTTTGTCTTGTTGTGAAACA
GTTAATGTTTGGTGTTTTTTTCAATAACGAATCTCTATTATATCAGAGTTGAAATTAAAG
TTCATTTGTTTGCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BB16TF U 1
AF RR2BB16JQ C 813
BS 1 890 RR2BB16TF
BS 891 1696 RR2BB16JQ

RD RR2BB16TF 890 0 0
GGAAACACACTCATTTCTTCATTCCGTCTTGTCTCTCTCTATTTCAAATCTCAAAAAAAA
AAGCGAATCATGTCTCTGAGGCCAAGCGCGAAGACGGAGGTGAGACGGAACCGGTACAAA
GTGGCGGTGGATGCGGAGGAGGGACGGCGGAGGCTAGAGGATCACATGGTGGAGATCAGG
AAGAACAAGAGGGAAGAGAATCTCCAGAAGAAGAGACGCGAAGCCATCTCCTCCTCCTCC
TCCTCCGCCGCGCCTCAGGAGGGTCTTTCTTCTGCCAAGAAGATGATAGAGAATCTACCG
GAGATGGTGATTGGGATATGGTCAGAGGATACCAACTCACAACTCGAGACCACCACTCTC
CTCAGGAAACTGCTTTCTCTTGAGCAAAACCCTCCTATCAATGATGTTATAGCATCTGGT
GTTGTTCCTCGCCTTGTGACCTTTCTTTCAAGGGATGATTTTCCCAAACTTCAGTTTGAG
GCAGCTTGGGCGCCCACCAACATTGCTTCAGGGACATCAGAGAACACTAATGTTATCGTT
CAAAGTGGTGCTATCCCAAGTTTTATTCATCTTCTCACCTCCCCTAATGAGGAAGTCCGC
GAACAGGCTGTTTGGGCACTGGGGAACGTTGCTGGTGACTCACCAAAATGCCGTGATCTC
GTCTTGAGCCTAGGTGCCATGTTGCCTCTTCTCTCTCAGTTCCATGACCATACAAAGCTC
TCCATGCTTAGGAACGCTACATGGACTTTGTCAAACTTCTGCAGAGGGAAGCCTCAGCCT
TCTTTTGAGCAGACAAGCCCAGCTTTGCCGGTTCTTAAGAGGCTTGTGGAATCAACAGAT
GAAGAAGTTCTCACAGATGCATGCTGGGCTCTGTCGTACCTCTCGGACAG

QA 1 890 1 890
DS 

RD RR2BB16JQ 884 0 0
TCTTAAGAGGCTTGTGGAATCAACAGATGAAGAAGTT*TCACAGATGCATGCTGGGCTCT
GTCGTACCTCTCGGACAGCTCAAATGAAAAGATACAGACTGTTATCGATACTGGCGTTAT
CCCTCGCCTCATCGATCTCTTAGCTCAATAACGCAGAGTTCGAAGTGAAGAAAGAAGCTG
CTTGGGGGATCTCAAATGCTACTTCTGGTGGCACTCATGATCAGATCAAGTGCTTCCTCG
TCTTCTCCACCTTCTTACAAACCCTTACAAGAAGAGTATCAAGAAGGAAGCTTGCTGGAC
CATCTCCAACATTACAGCTGGGAGTTCTAAACAGATACAAGGAGTGATTGAAGCAGGTAT
CATTCAGTCTCTTATTGGAGAACATTCTGGTGGTTGGAGAAGCAGTGAAGAGCTTAGGTC
ATACAGGAGATGATAACCCTTACGCTGCAATGATAGATGAAGCAGAAGGGCTTGAGAAGA
TTGAGAATCTTCAGAGCCACGACAACAACGATATATACCAAAAGGCTGTGAAAATCCTCG
AAACGTTTTGGACTGAAGACGATGATGATGATGAAGGAGCCAACGATGAAAACCACGCTC
CGCAAGCCGGTTTCCAGTTCGGAAGCGCTAACGTTGCTGCCCCTCCTAGTCAGTTCAACT
TCATGTGAAGAAGGTGTCGAACGGTGATAACGTGAAGTGAAAGAAGTTTTTTCTTGTCTT
TTCTACTGCATCATCATGCACAAGTCACAACTCGTGGATATGAAGAAACACTGTGTACGA
GTAGTATCTTTTGTCTTGTTGTGAAACAGTTAATGTTTGGTGTTTTTTTCAATAACGAAT
CTCTATTATATCAGAGTTGAAATTAAAGTTCATTTGTTTGCTCT

QA 1 884 1 884
DS 



AS 1 2

CO CL4392Contig1 564 2 2 U
GATAAAAGAAGATGAATTACCTCATATTTATGCTAATTATTGCTATGTGTTCTGGTTTGA
ATGAAGGATGTTTTTGGTGTAATATGAACACTTTAGAAGTTCAAAATCAACTCAATCAAG
GTATTACTCTCAAAGTTAATTGCTCATCCAACAGAAACCAAGTTGAGGATCTCCACGAGC
TAAAATTCAATGAGAAATATAATATCTCAGTTAAAGAATTAGGAATGGGAATGAGAATTG
TATGGCGTTGCACCTTACGATTTGGGGATAAAGTGAAAAGTTCTCAAACTATATGGCGTG
CATATAGAGGAGCCAGTCAAACGCGAGGTGGTGAAAAACGTTCATGGATTGCTAGAACTG
ATGGAATTTATTTAGAGAAAAATAATAAAGCAAAAGGACTCCAACATCATTGGATCGTTG
CTAAACAATGAGTTTTGTCTTCTTAAAATCTATTACATATGATGCTATGATTATTTTTCT
GTCATATGAGATAAATAGTCATTTTGATTTGGGATAATAATAATATACATATATTTTGAT
GTTTATGTGAAAAATTGTTTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C182JQ C 1
AF RR2C182TF U 71
BS 1 70 RR2C182JQ
BS 71 564 RR2C182TF

RD RR2C182JQ 564 0 0
GATAAAAGAAGATGAATTACCTCATATTTATGCTAATTATTGCTATGTGTTCTGGTTTGA
ATGAAGGATGTTTTTGGTGTAATATGAACACTTTAGAAGTTCAAAATCAACTCAATCAAG
GTATTACTCTCAAAGTTAATTGCTCATCCAACAGAAACCAAGTTGAGGATCTCCACGAGC
TAAAATTCAATGAGAAATATAATATCTCAGTTAAAGAATTAGGAATGGGAATGAGAATTG
TATGGCGTTGCCCCTTACGATTTGGGGATAAAGTGAAAAGTTCTCAAACTATATGGCGTG
CATATAGAGGAGCCAGTCAAACGCGAGGTGGTGAAAAACGTTCATGGATTGCTAGAACTG
ATGGAATTTATTTAGAGAAAAATAATAAAGCAAAAGGACTCCAACATCATTGGATCGTTG
CTAAACAATGAGTTTTGTCTTCTTAAAATCTATTACATATGATGCTATGATTATTTTTCT
GTCATATGAGATAAATAGTCATTTTGATTTGGGATAATAATAATATACATATATTTTGAT
GTTTATGTGAAAAATTGTTTATGT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2C182TF 494 0 0
TTTTTGGTGTAATATGAACACTTTAGAAGTTCAAAATCAACTCAATCAAGGTATTACTCT
CAAAGTTAATTGCTCATCCAACAGAAACCAAGTTGAGGATCTCCACGAGCTAAAATTCAA
TGAGAAATATAATATCTCAGTTAAAGAATTAGGAATGGGAATGAGAATTGTATGGCGTTG
CACCTTACGATTTGGGGATAAAGTGAAAAGTTCTCAAACTATATGGCGTGCATATAGAGG
AGCCAGTCAAACGCGAGGTGGTGAAAAACGTTCATGGATTGCTAGAACTGATGGAATTTA
TTTAGAGAAAAATAATAAAGCAAAAGGACTCCAACATCATTGGATCGTTGCTAAACAATG
AGTTTTGTCTTCTTAAAATCTATTACATATGATGCTATGATTATTTTTCTGTCATATGAG
ATAAATAGTCATTTTGATTTGGGATAATAATAATATACATATATTTTGATGTTTATGTGA
AAAATTGTTTATGT

QA 1 494 1 494
DS 



AS 1 2

CO CL4393Contig1 623 2 3 U
GGGCGCAGCCGCATTTTAGAGGTTCTCTTGCATCCTTCTTCGTCTAGGGTTTCACCAAGT
CGTCGTCTTTCGTCGCATTTCCTCAACGCAACAATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTG
CTAAACCCTCCAGCTGAGCTCGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTGCAATCT
CCTAACTCTTTCTTCATGGACGTCAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACAGTGTTT
AGCCACTCTCAAACAGTTGTAGTGTGTGGTAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCCACT
GGCGGTAAAGCCAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGATTTGATAT
TTCTCACATTAAATCTCACCTTTTCACAAATGTTGCTGTGAGAGAGAAGTCAGATCTTTA
TTTAAGTTTGCTTTAGTACTTCTTATTGTGTTTATGACAGTCTTTCTTTTTTTTTTGATT
ATGAGAGATTTTGAAACCATCATCACAAACTACTAGTTGGGTTCCTCTACTTTCGTTTAG
TCATAAATCGAATCGCATCAACTGTCTGGTTTCTTGTTTATTGTCTACATATCTGTATTT
TGTCAATCGTTGAATAAAACACT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D939TF U 3
AF RR2EW12JQ C 1
BS 1 4 RR2EW12JQ
BS 5 511 RR2D939TF
BS 512 623 RR2EW12JQ

RD RR2D939TF 509 0 0
GG
GCAGCCGCATTTTAGAGGTTCTCTTGCATCCTTCTTCGTCTAGGGTTTCACCAAGTCGTC
GTCTTTCGTCGCATTTCCTCAACGCAACAATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTGCTAA
ACCCTCCAGCTGAGCTCGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTGCAATCTCCTA
ACTCTTTCTTCATGGACGTCAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACAGTGTTTAGCC
ACTCTCAAACAGTTGTAGTGTGTGGTAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCCACTGGCG
GTAAAGCCAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGATTTGATATTTCT
CACATTAAATCTCACCTTTTCACAAATGTTGCTGTGAGAGAGAAGTCAGATCTTTATTTA
AGTTTGCTTTAGTACTTCTTATTGTGTTTATGACAGTCTTTCTTTTTTTTTTGATTATGA
GAGATTTTGAAACCATCATCACAAACT

QA 3 509 3 509
DS 

RD RR2EW12JQ 623 0 0
GGGCGCAGCCGCATTTTAGAGGTTCTCTTGCATCCTTCTTCGTCTAGGGTTTCACCAAGT
CGTCGTCTTTCGTCGCATTTCCTCAACGCAACAATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTG
CTAAACCCTCCAGCTGAGCTCGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTGCAATCT
CCTAACTCTTTCTTCATGGACGTCAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACAGTGTTT
AGCCACTCTCAAACAGTTGTAGTGTGTGGTAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCCACT
GGTGGTAAAGCCAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGATTTGATAT
TTCTCACATTAAATCTCATCTTTTCACAAATGTTGCTGTGAGAGAGAAGTCAGATCTTTA
TTTAAGTTTGCTTTAGTACTTCTTATTGTGTTTATGACAGTCTTTCTTTTTTT**TGATT
ATGAGAGATTTTGAAACCATCATCACAAACTACTAGTTGGGTTCCTCTACTTTCGTTTAG
TCATAAATCGAATCGCATCAACTGTCTGGTTTCTTGTTTATTGTCTACATATCTGTATTT
TGTCAATCGTTGAATAAAACACT

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL4394Contig1 493 2 1 U
GGAATTCCTAAATAAACCCTAGAAGAAAGAGAAACAGAGGGAAGTTGATCGAGATCGAGA
TGGGGAATGAGACAAAGAGCAATGGAGCTTCAAGCTTGGGTGGAGGAGGGTTTAGGGCAA
AGATGGACCACTATGTGTACAGTGGAGAAAAGAAGCACGTTTTGGCAGGGATCGGGATAT
TCACCGTCATCTTCGGCATCCCTTGGTATCTTATGAATCGAGGATCAAACAAGCATCGGT
CTCACCAAGATTACATGGAAAAGGCAGATAAAGCTAGAAAAGCTCGTCTCTCTTCATCTC
CATCTCCATCCTCTGACAAGTAGTCCTGTTTCAGACTCTTAGTCAGATACATGCCGTGAC
TCAGCGTTTTCCATGTCCATACAAAACATAACTCAGCAATGTCTGAGCCAGTGTGGTTTT
ATTTAGTTCAGTTTTACGTATCATGTCACTGTACTCCAGTTTCTATATTGAATAAAATAA
AAAGTTTTTTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FH85JQ C 1
AF RR2FH85TF U 1
BS 1 493 RR2FH85TF

RD RR2FH85JQ 493 0 0
GGAATTCCTAAATAAACCCTAGAAGAAAGAGAAACAGAGGGAAGTTGATCGAGATCGAGA
TGGGGAATGAGACAAAGAGCAATGGAGCTTCAAGCTTGGGTGGAGGAGGGTTTAGGGCAA
AGATGGACCACTATGTGTACAGTGGAGAAAAGAAGCACGTTTTGGCAGGGATCGGGATAT
TCACCGTCATCTTCGGCATCCCTTGGTATCTTATGAATCGAGGATCAAACAAGCATCGGT
CTCACCAAGATTACATGGAAAAGGCAGATAAAGCTAGAAAAGCTCGTCTCTCTTCATCTC
CATCTCCATCCTCTGACAAGTAGTCCTGTTTCAGACTCTTAGTCAGATACATGCCGTGAC
TCAGCGTTTTCCATGTCCATACAAAACATAACTCAGCAATGTCTGAGCCAGTGTGGTTTT
ATTTAGTTCAGTTTTACGTATCATGTCACTGTACTCCAGTTTCTATATTGAATAAAATAA
AAAGTTTTTTCTC

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR2FH85TF 493 0 0
GGAATTCCTAAATAAACCCTAGAAGAAAGAGAAACAGAGGGAAGTTGATCGAGATCGAGA
TGGGGAATGAGACAAAGAGCAATGGAGCTTCAAGCTTGGGTGGAGGAGGGTTTAGGGCAA
AGATGGACCACTATGTGTACAGTGGAGAAAAGAAGCACGTTTTGGCAGGGATCGGGATAT
TCACCGTCATCTTCGGCATCCCTTGGTATCTTATGAATCGAGGATCAAACAAGCATCGGT
CTCACCAAGATTACATGGAAAAGGCAGATAAAGCTAGAAAAGCTCGTCTCTCTTCATCTC
CATCTCCATCCTCTGACAAGTAGTCCTGTTTCAGACTCTTAGTCAGATACATGCCGTGAC
TCAGCGTTTTCCATGTCCATACAAAACATAACTCAGCAATGTCTGAGCCAGTGTGGTTTT
ATTTAGTTCAGTTTTACGTATCATGTCACTGTACTCCAGTTTCTATATTGAATAAAATAA
AAAGTTTTTTCTC

QA 1 493 1 493
DS 



AS 1 2

CO CL4395Contig1 873 2 4 U
GGGAGAGAAGAGAAGAGAATCAGATCGGAGAAAATGACGACGTCGATGATACAGAGGCTG
TTCACGCAAGGCACCAAGATCGTCTGCGTCGGCCGTAACTACGCCGCTCACGCCAAAGAA
CTAGGCAACGCCGTCCCCAAGGAACCGGTAATATTCTTAAAGCCGACTTCATCATACTTA
GGGAATGGAGGAACGATTGAGATTCCACATCCTCTTGAATCACTTCATCATGAGGTGGAG
CTCGCTGTAGTGATGGGAGAGAAGGCTAGAGATGTACCCGAGTCTACCGCCATGGACTAC
ATTGGAGGATATGCGGTTGCTCTTGATATGACTGCTAGGGAACTCCAAGCTTCTGCCAAG
GCGTCTGGTCTCCCTTGGACACTTGCTAAAGGACAGGATACTTTCACTCCGATAAGCTCT
GTTCTGCCAAAGGCGATGGTGCATGATCCCGATAACCTAGAACTTTGGCTAAAGGTTGAT
GGTGAAACAAGACAGAAGGGTTTGACAAAAGATATGATCTTCAAGGTCCCGTACCTCATC
AGCTACATAAGCTCTATAATGACTCTCTACGAAGGAGATGTCATCTTGACTGGTACACCA
GAAAGTGTTGGACCTGTAAAGATAGGACAGAAGATAACCGCACGGATCACTGGTCTATCT
GAAGTTCAGTTCGATGTTGACAGGCGTGTAAAGCCTTTGAGTTAAGTGATTTGTTTGTGT
TTCAAATAATAATTAATAAAAAATTTAATCTTTTGATTTAAGTAATAAACCATGTGTAAT
TTCTTCATTTATTGTATTTCCTTGCACTTGAGAGAGGAGCAGAGAAACTAAAACTATCAA
ATAATGCAACGTCAAAATTAAACGGTTTATGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN64TF U 1
AF RR2BN64JQ C 191
BS 1 665 RR2BN64TF
BS 666 666 RR2BN64JQ
BS 667 679 RR2BN64TF
BS 680 873 RR2BN64JQ

RD RR2BN64TF 679 0 0
GGGAGAGAAGAGAAGAGAATCAGATCGGAGAAAATGACGACGTCGATGATACAGAGGCTG
TTCACGCAAGGCACCAAGATCGTCTGCGTCGGCCGTAACTACGCCGCTCACGCCAAAGAA
CTAGGCAACGCCGTCCCCAAGGAACCGGTAATATTCTTAAAGCCGACTTCATCATACTTA
GGGAATGGAGGAACGATTGAGATTCCACATCCTCTTGAATCACTTCATCATGAGGTGGAG
CTCGCTGTAGTGATGGGAGAGAAGGCTAGAGATGTACCCGAGTCTACCGCCATGGACTAC
ATTGGAGGATATGCGGTTGCTCTTGATATGACTGCTAGGGAACTCCAAGCTTCTGCCAAG
GCGTCTGGTCTCCCTTGGACACTTGCTAAAGGACAGGATACTTTCACTCCGATAAGCTCT
GTTCTGCCAAAGGCGATGGTGCATGATCCCGATAACCTAGAACTTTGGCTAAAGGTTGAT
GGTGAAACAAGACAGAAGGGTTTGACAAAAGATATGATCTTCAAGGTCCCGTACCTCATC
AGCTACATAAGCTCTATAATGACTCTCTACGAAGGAGATGTCATCTTGACTGGTACACCA
GAAAGTGTTGGACCTGTAAAGATAGGACAGAAGATAACCGCACGGATCACTGGTCTATCT
GAAGT*CAGTTCGATGTTG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2BN64JQ 683 0 0
GAACGATTGAGATTCCACATCCTCTTGAATCACTTCATCATGAGGTGGAGCTCGCTGTAG
TGATGGGAGAGAAGGCTAGAGATGTACCCGAGTCTACCGCCATGGACTACATTGGAGGAT
ATGCGGTTGCTCTTGATATGACTGCTAGGGAACTCCAAGCTTCTGCCAAGGCGTCTGGTC
TCCCTTGGACACTTGCTAAAGGACAGGATACTTTCACTCCGATAAGCTCTGTTCTGCCAA
AGGCGATGGTGCATGATCCCGATAACCTAGAACTTTGGCTAAAGGTTGATGGTGAAACAA
GACAGAAGGGTTTGACAAAAGATATGATCTTCAAGGTCCCGTACCTCATCAGCTACATAA
GCTCTATAATGACTCTCTACGAAGGAGATGTCATCTTGACTGGTACACCAGAAGGTGTTG
GACCTGTAAAGATAGGACAGAAGATAACCGCAGGGATCACTGGTCTATCTGAAGTTCAGT
TCGATGTTGACAGGCGTGTAAAGCCTTTGAGTTAAGTGATTTGTTTGTGTTTCAAATAAT
AATTAATAAAAAATTTAATCTTTTGATTTAAGTAATAAACCATGTGTAATTTCTTCATTT
ATTGTATTTCCTTGCACTTGAGAGAGGAGCAGAGAAACTAAAACTATCAAATAATGCAAC
GTCAAAATTAAACGGTTTATGGC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL4396Contig1 1111 2 2 U
ATTTCTCTCTCTCAAGAACTCATTTTCTCGCTCTAACACAATGGATAACAGCTGTATAGA
TGACAGTACCAGCAACAACACTTCAGGCTCTCTCTCCATCTCTACTCCCTCGGCTAAAAA
CAAACTCTCTCCCCCTCCTCCTCAGGCGACGATGCGTCTCTACAGAATGGGAAGCGGCGG
GAGCAGCGTCGTGCTTGATTCCGAGAACGGCGTCGAGACGGAGTCGCGGAAGCTCCCGTC
GTCGAAGTTCAAAGGCGTCGTCCCTCAGCCCAACGGAAGATGGGGCGCTCAGATTTACGA
GAAGCACCAGCGCGTCTGGCTCGGCACTTTCAACGAGGAGGAAGAGGCCGCCGCTTCCTA
CGACATCGCCGCTCGGAGATTCCGGGGACGCGACGCCGTAACGAACTTCAAGTCGTCGCC
GGCGACGGCGACGGCGGTCGACGGAGCCGCCGACGCTGAGTCTGCTTTCCTCGAGGCTCA
CTCCAAGGCCGAGATCGTTGATATGCTGAGGAAACACACTTACGCCGACGAGCTTCAGCA
GAGCAGACGGAAGTTCCTTGACGGTAACGGTAACGGAAAGTCAGGGACGGCGACGATGAG
TAGCTCTAACGGAAACGACGGCGTTTCGAGAGCGCGTGAGGTTCTTTCCGAGAAAGCCGT
TACGCCTAGCGACGTCGGGAAGCTTAACCGGTTGGTGATACCGAAACAGCACGCGGAGAA
GCATTTTCCGTTACCAGCGATGACGACGGCGGCGGCGGCGACGGTGACGGCGATCGCTAC
TTCTTCTCCGACGAAAGGCGTTTTGATTAATCTGGAAGACAGGACGGGGAAGGTGTGGCG
GTTCCGTTACTCGTACTGGAACAGCAGTCAAAGTTACGTGTTGACCAAGGGATGGAGCCG
GTTCGTTAAAGAGAAGAATCTCCGAGCCGGGGATGTGGTTTGCTTCGAGAGGTCGACCGG
TCCTGACCGGCAATTGTATATTGACTGGAGAGTTCGGTCCGGTACGGAGGAAATTACGCC
GGTTCGGAATGTGGTTAGGCTATTCGGGGTCAACATTTCTAATGCGACGACTAACGCTAA
ATCAAAAGACGTCGCAGCAGAGTACGGTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A153TF U 1
AF RR2A153JQ C 684
BS 1 748 RR2A153TF
BS 749 1111 RR2A153JQ

RD RR2A153TF 751 0 0
ATTTCTCTCTCTCAAGAACTCATTTTCTCGCTCTAACACAATGGATAACAGCTGTATAGA
TGACAGTACCAGCAACAACACTTCAGGCTCTCTCTCCATCTCTACTCCCTCGGCTAAAAA
CAAACTCTCTCCCCCTCCTCCTCAGGCGACGATGCGTCTCTACAGAATGGGAAGCGGCGG
GAGCAGCGTCGTGCTTGATTCCGAGAACGGCGTCGAGACGGAGTCGCGGAAGCTCCCGTC
GTCGAAGTTCAAAGGCGTCGTCCCTCAGCCCAACGGAAGATGGGGCGCTCAGATTTACGA
GAAGCACCAGCGCGTCTGGCTCGGCACTTTCAACGAGGAGGAAGAGGCCGCCGCTTCCTA
CGACATCGCCGCTCGGAGATTCCGGGGACGCGACGCCGTAACGAACTTCAAGTCGTCGCC
GGCGACGGCGACGGCGGTCGACGGAGCCGCCGACGCTGAGTCTGCTTTCCTCGAGGCTCA
CTCCAAGGCCGAGATCGTTGATATGCTGAGGAAACACACTTACGCCGACGAGCTTCAGCA
GAGCAGACGGAAGTTCCTTGACGGTAACGGTAACGGAAAGTCAGGGACGGCGACGATGAG
TAGCTCTAACGGAAACGACGGCGTTTCGAGAGCGCGTGAGGTTCTTTCCGAGAAAGCCGT
TACGCCTAGCGACGTCGGGAAGCTTAACCGGTTGGTGATACCGAAACAGCACGCGGAGAA
GCATTTTCCGTTACCAGCGATGACGACG
CGC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2A153JQ 428 0 0
TTAACCGGTTGGTGATACCGAAACAGCACGCGGAGAAGCATTTTCCGTTACCAGCGATGA
CGACGGCGGCGGCGGCGACGGTGACGGCGATCGCTACTTCTTCTCCGACGAAAGGCGTTT
TGATTAATCTGGAAGACAGGACGGGGAAGGTGTGGCGGTTCCGTTACTCGTACTGGAACA
GCAGTCAAAGTTACGTGTTGACCAAGGGATGGAGCCGGTTCGTTAAAGAGAAGAATCTCC
GAGCCGGGGATGTGGTTTGCTTCGAGAGGTCGACCGGTCCTGACCGGCAATTGTATATTG
ACTGGAGAGTTCGGTCCGGTACGGAGGAAATTACGCCGGTTCGGAATGTGGTTAGGCTAT
TCGGGGTCAACATTTCTAATGCGACGACTAACGCTAAATCAAAAGACGTCGCAGCAGAGT
ACGGTGGT

QA 1 428 1 428
DS 



AS 1 2

CO CL4397Contig1 517 2 1 U
GGGAGACGATAACAAACACATAGAGAGAGCGACGGAGAGAAGAAATGGAGAAGTATTTTG
GAAATGCGTACAGGGGAGATCCAGGAGTGCCGCACGCAGATGCTGATAGGTTCGTGAACA
TATGGATTGGTTCGGCTGCCTTCTCTGCTCTCACCTGGATCAATCCTTACATGTGGCAGC
TCTCCAACCAGTTCAACTATCATGATAAATGGATGCTCTTTGAGCAGTATCACTGGAAAA
AAGCAAGGGCGAAGAAGCAGCCTTACGAATTCAAGTGGAATAAGATACCAAAAGAAGTCA
GGGACTCGTATTACTACAATTGGCCTGTCTACTTCCCTTAGATGAAAGCCTCTCCCTTGC
AATCTTTTCGGCTGCTTTTTGTCGAACTTTTTTAAGCATATAACTCTATTTGCTTCTCGT
TCTGTTCCTTTTCTGTTGGATTTTTAAGTTTGGTCTGTACTGATCACTCAAACTATTCTC
TGTTTAATTATCCTCTTCTAGATGAAACTCTTATGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C683JQ C 1
AF RR2C683TF U 1
BS 1 517 RR2C683TF

RD RR2C683JQ 517 0 0
GGGAGACGATAACAAACACATAGAGAGAGCGACGGAGAGAAGAAATGGAGAAGTATTTTG
GAAATGCGTACAGGGGAGATCCAGGAGTGCCGCACGCAGATGCTGATAGGTTCGTGAACA
TATGGATTGGTTCGGCTGCCTTTTTTGCTCTCACCTGGATCAATCCTTACATGTGGCAGC
TCTCCAACCAGTTCAACTATCATGATAAATGGATGCTCTTTGAGCAGTATCACTGGAAAA
AAGCAAGGGGGAAGAAGCAGCCTTACGAATTCAAGTGGAATAAGATACCAAAAGAAGTCA
GGGACTCGTATTACTACAATTGGCCTGTTTACTTCCCTTAGATGAAAGCCTCTCCCTTGC
AATCTTTTCGGCTGCTTTTTGTCGAACTTTTTTAAGCATATAACTCTATTTGCTTCTCGT
TCTGTTCCTTTTTTGTTGGATTTTTAAGTTTGGTCTGTACTGATCACTCAAACTATTCTC
TGTTTAATTATCCTTTTCTAGATGAAACTCTTATGGC

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2C683TF 517 0 0
GGGAGACGATAACAAACACATAGAGAGAGCGACGGAGAGAAGAAATGGAGAAGTATTTTG
GAAATGCGTACAGGGGAGATCCAGGAGTGCCGCACGCAGATGCTGATAGGTTCGTGAACA
TATGGATTGGTTCGGCTGCCTTCTCTGCTCTCACCTGGATCAATCCTTACATGTGGCAGC
TCTCCAACCAGTTCAACTATCATGATAAATGGATGCTCTTTGAGCAGTATCACTGGAAAA
AAGCAAGGGCGAAGAAGCAGCCTTACGAATTCAAGTGGAATAAGATACCAAAAGAAGTCA
GGGACTCGTATTACTACAATTGGCCTGTCTACTTCCCTTAGATGAAAGCCTCTCCCTTGC
AATCTTTTCGGCTGCTTTTTGTCGAACTTTTTTAAGCATATAACTCTATTTGCTTCTCGT
TCTGTTCCTTTTCTGTTGGATTTTTAAGTTTGGTCTGTACTGATCACTCAAACTATTCTC
TGTTTAATTATCCTCTTCTAGATGAAACTCTTATGGC

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 2

CO CL4398Contig1 990 2 2 U
GATATTTACAATCCTGCCATCAAGAAAACTTCCGCAACCGTGGATCACCATCTCGATCCG
TCGTTGACCCTAAGCCTCTCCGGCGAGAGCTACATGACCAAGACGGTTGAGATGACCGTT
GCCGGCGCTGGGAGCCAAGTTTGTCGGCAGACTTCGTCTCATAGCGGAATCTCCTCTTTC
TCGAGCGGAAGGGTAAAGAGAGAAAGAGATATCTGCGGCGAAGAAGAGGCGGGGGAGACG
ACGGAGAGAGTGGTGTGTTCGAGAGTGATTGATGATCATGAAGACGAAGAAGGTGTTAGT
GCTCGTAAAAAGCTTAGACTCACTAAACAACAATCCGCTCTTCTTGAAGAGAGCTTCAAA
CAACACAGCACTCTTAATCCCAAGCAAAAACAAGCTCTTGCGAGACAGCTGAATCTAAGG
CCTAGGCAAGTTGAAGTGTGGTTCCAAAACAGGAGAGCTAGGACAAAACTAAAGCAAACA
GAAGTGGATTGTGAGATTTTGAAGAAATGTTGTGATACTTTAACGGATGAGAATAGAAGG
CTTCAAAAAGAGCTTCAGGATCTGAAGGCTTTAAAGATGTCTCAACCTTTCTACATGCAT
ATGCCGGCGGCGACTTTGACGATGTGCCCTTCTTGTGAGAGACTCGGCGGTGGTGGTGCT
GGTGCTGGAGGAGGCGGAGGTACGGTTGAGGTTGATGAAGGAACGGCGAAGGGAGCTTTC
TCCATCGTCACAAAGCCTCGTTTCTACAACCCTTTCACTAGTCCTTCTGCAGCTTGTTAA
TTACCTATTAATTAATTTGTTTTTCCATATCCAATTAGGAATTAGTTAGAAGTTAAATCC
GGAAAAAGTCCTGAGTTAAAATTTGGGGAATATTGGGGAATAGTCTTTATAGACAAGGCT
CTTCAACGATCCCACTTTATTTTTCGGTGGGATTGTTGGTTGATGAAGAAATTTATAGTT
TGTAATTATACTAGTACTTACTAATAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G516TF U 1
AF RR2G516JQ C 132
BS 1 642 RR2G516TF
BS 643 990 RR2G516JQ

RD RR2G516TF 642 0 0
GATATTTACAATCCTGCCATCAAGAAAACTTCCGCAACCGTGGATCACCATCTCGATCCG
TCGTTGACCCTAAGCCTCTCCGGCGAGAGCTACATGACCAAGACGGTTGAGATGACCGTT
GCCGGCGCTGGGAGCCAAGTTTGTCGGCAGACTTCGTCTCATAGCGGAATCTCCTCTTTC
TCGAGCGGAAGGGTAAAGAGAGAAAGAGATATCTGCGGCGAAGAAGAGGCGGGGGAGACG
ACGGAGAGAGTGGTGTGTTCGAGAGTGATTGATGATCATGAAGACGAAGAAGGTGTTAGT
GCTCGTAAAAAGCTTAGACTCACTAAACAACAATCCGCTCTTCTTGAAGAGAGCTTCAAA
CAACACAGCACTCTTAATCCCAAGCAAAAACAAGCTCTTGCGAGACAGCTGAATCTAAGG
CCTAGGCAAGTTGAAGTGTGGTTCCAAAACAGGAGAGCTAGGACAAAACTAAAGCAAACA
GAAGTGGATTGTGAGATTTTGAAGAAATGTTGTGATACTTTAACGGATGAGAATAGAAGG
CTTCAAAAAGAGCTTCAGGATCTGAAGGCTTTAAAGATGTCTCAACCTTTCTACATGCAT
ATGCCGGCGGCGACTTTGACGATGTGCCCTTCTTGTGAGAGA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2G516JQ 859 0 0
GAGCCAAGTTTGTCGGCAGACTTCGTCTCATAGCGGA*TCTC*TCTT*CTCGAGCGGAAG
G*TAAAGAGAGAAAGAGATATCTGCGGCGAAGAAGAGGCGGGGGAGACGACGGAGAGAGT
GGTGTGTTCGAGAGTGATTGATGATCATGAAGACGAAGAAGGTGTTAGTGCTCGTAAAAA
GCTTAGACTCACTAAACAACAATCCGCTCTTCTTGAAGAGAGCTTCAAACAACACAGCAC
TCTTAATCCCAAGCAAAAACAAGCTCTTGCGAGACAGCTGAATCTAAGGCCTAGGCAAGT
TGAAGTGTGGTTCCAAAACAGGAGAGCTAGGACAAAACTAAAGCAAACAGAAGTGGATTG
TGAGATTTTGAAGAAATGTTGTGATACTTTAACGGATGAGAATAGAAGGCTTCAAAAAGA
GCTTCAGGATCTGAAGGCTTTAAAGATGTCTCAACCTTTCTACATGCATATGCCGGCGGC
GACTTTGACGATGTGCCCTTCTTGTGAGAGACTCGGCGGTGGTGGTGCTGGTGCTGGAGG
AGGCGGAGGTACGGTTGAGGTTGATGAAGGAACGGCGAAGGGAGCTTTCTCCATCGTCAC
AAAGCCTCGTTTCTACAACCCTTTCACTAGTCCTTCTGCAGCTTGTTAATTACCTATTAA
TTAATTTGTTTTTCCATATCCAATTAGGAATTAGTTAGAAGTTAAATCCGGAAAAAGTCC
TGAGTTAAAATTTGGGGAATATTGGGGAATAGTCTTTATAGACAAGGCTCTTCAACGATC
CCACTTTATTTTTCGGTGGGATTGTTGGTTGATGAAGAAATTTATAGTTTGTAATTATAC
TAGTACTTACTAATAATCC

QA 1 859 1 859
DS 



AS 1 2

CO CL4399Contig1 1200 2 2 U
GGATTGCAAAACATGTTGAAGCTTTCGTGTAACGCGACTGATAAGTTACAGAGCTTTTCC
TCGCATTATAATCAACCGGATCCGGTTCGTCGGAGAATCGTGTCTTCCGTCTCTTGTTCT
GAGAATAGGAAAACGGGTTTGAATCCTCTGCGGGCGGCTGTATCTGCTGAACAAGAAAGT
GTGATTCGAGCAGAACAAGGTTTGGGCACACTCAGGTCGGCTCCGGTTGGGTAGCTTGAC
GGAGGATGGCTTGTCGTATAAGGAGAAGTTCATAGTCAGATCCCACGAAGTGCAGAGTAA
CAAAACCGCTACGGTCCAAACCATTGCCAATCTTTTGCAGGAGGTGGGATGTAATCAGTT
TCAGAGCGTTGGATTTTCTACCGATGGATTTGCGACAACACCAACCATGAGGAAACTGAA
TCTCATTTGGGTCACTTCCAGAATGCACATTGAGATCTACAAATATCCAGCTTGGGGTGA
TGTGGTTGAGATAGAGACATGGTGTCAGAGTGAAGGAAGGATAGGGACAAGGCGTGATTG
GATTCTTAAGGACGTTGCTACTGGTGAAATCACTGGCCGTGCTACAAGCAAGTGGGTGAT
GATGAACCGAGTCACAAGAAGGCTTCAGAAAATTTCAGATGATGTTCGGGACGAGCACTT
GATGTTCTGTCCTAAAGAACCCAGATTAGCATTTCCGGAAGAGGAAAATAACCGAAGCTT
GAAGAAAATCCCCAAACTCGAAGATCAGGCCCAATACTCAATCATTGGACTTAAGCCAAG
ACGAGCTGATCTCGACATGAACCATCATGTCAATAATGTCACATATATTGGATGGCTTCT
TGAGAGCATGCCTCAAGAGATTGTAGACACGCACGAACTTCAGGTCATAATTTTGGATTA
CAGACGAGAATGTCAGCAAGACGATGTGGTGGATTCACTCACCACCTCAAAGAGTGGCCC
TGCAACATCAGGCACACAAAGCTACAACGATAGCCAGTTCTTACATCTCCTAAGGTTGTC
TGGAGATGGTCAGGAGATCAACCGTGGGACAACCATGTGGAGAAAGAAGCCCTTCAGATA
GATAATCTCTATGCCCATTTAATAACACCATACGAGCCAAGGGACCAACCATTTCACGTA
AACCTCTTTGGTTATTTGATTAAACAAGTTACATGATTGATAACAGATTATGCCGATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FI73TF U 1
AF RR2FI73JQ C 560
BS 1 693 RR2FI73TF
BS 694 1200 RR2FI73JQ

RD RR2FI73TF 693 0 0
GGATTGCAAAACATGTTGAAGCTTTCGTGTAACGCGACTGATAAGTTACAGAGCTTTTCC
TCGCATTATAATCAACCGGATCCGGTTCGTCGGAGAATCGTGTCTTCCGTCTCTTGTTCT
GAGAATAGGAAAACGGGTTTGAATCCTCTGCGGGCGGCTGTATCTGCTGAACAAGAAAGT
GTGATTCGAGCAGAACAAGGTTTGGGCACACTCAGGTCGGCTCCGGTTGGGTAGCTTGAC
GGAGGATGGCTTGTCGTATAAGGAGAAGTTCATAGTCAGATCCCACGAAGTGCAGAGTAA
CAAAACCGCTACGGTCCAAACCATTGCCAATCTTTTGCAGGAGGTGGGATGTAATCAGTT
TCAGAGCGTTGGATTTTCTACCGATGGATTTGCGACAACACCAACCATGAGGAAACTGAA
TCTCATTTGGGTCACTTCCAGAATGCACATTGAGATCTACAAATATCCAGCTTGGGGTGA
TGTGGTTGAGATAGAGACATGGTGTCAGAGTGAAGGAAGGATAGGGACAAGGCGTGATTG
GATTCTTAAGGACGTTGCTACTGGTGAAATCACTGGCCGTGCTACAAGCAAGTGGGTGAT
GATGAACCGAGTCACAAGAAGGCTTCAGAAAATTTCAGATGATGTTCGGGACGAGCACTT
GATGTTCTGTCCTAAAGAACCCAGATTAGCATT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2FI73JQ 641 0 0
ACTGGTGAAATCACTGGCCGTGCTACAAGCAAGTGGGTGATGATGAACCGAGTCACAAGA
AGGCTTCAGAAAATTTCAGATGATGTTCGGGACGAGCACTTGATGTTCTGTCCTAAAGAA
CCCAGATTAGCATTTCCGGAAGAGGAAAATAACCGAAGCTTGAAGAAAATCCCCAAACTC
GAAGATCAGGCCCAATACTCAATCATTGGACTTAAGCCAAGACGAGCTGATCTCGACATG
AACCATCATGTCAATAATGTCACATATATTGGATGGCTTCTTGAGAGCATGCCTCAAGAG
ATTGTAGACACGCACGAACTTCAGGTCATAATTTTGGATTACAGACGAGAATGTCAGCAA
GACGATGTGGTGGATTCACTCACCACCTCAAAGAGTGGCCCTGCAACATCAGGCACACAA
AGCTACAACGATAGCCAGTTCTTACATCTCCTAAGGTTGTCTGGAGATGGTCAGGAGATC
AACCGTGGGACAACCATGTGGAGAAAGAAGCCCTTCAGATAGATAATCTCTATGCCCATT
TAATAACACCATACGAGCCAAGGGACCAACCATTTCACGTAAACCTCTTTGGTTATTTGA
TTAAACAAGTTACATGATTGATAACAGATTATGCCGATTAC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL4400Contig1 1056 2 2 U
CACTAGCCCTGAAAGCGACCGAGTTTCCTGGGAGTTACCTTTTATACATGGATGGTTGAT
GGGTCAAGGTCATGGTGTCTCTTCTGCTCCCAACAGAGGCTCCTCCTCCGCATCTCGGTC
ATCCAGACCTAGTCTTGAGGCTGGAGTAGCTTTGACAGAACTACCTTGTACTGTCAAACT
CAGAGTGTGGCGACATGACATGGGAGACCCATTTGCACAGATGAAATCTGACAGGTGTCT
TCTAACATTACCGCATGTCGTCCTTTGCAGTGAAGATGGGAGCTCATTTTTCGCCGTGCG
GTAGATATTTAGCAGCATGTGTTGCAATGTGTTGTTCCTCATGCTGAGATAGATCCAGGA
CTGCAGACGCTAGCACAACAAGATTCAGGGCTTGCAACTTCCCCGACTCAACACCCTGTC
ACAGCACACCAAGTCATTTACGAGCTTCGTGTCTATTCTCTCCAAAAGGAAAGCTTTGGT
TCAGTAATTGTGTCACGGGAAATTAGAGCTGCGCATTGCTTGACCTCTATTCAGTTCTCG
CCCACCTCCGAGCACATACTGCTTGCATATGGACGGCATCATGGTTCTCTTTTGAATAGC
ATCGTTAGTGATGGTGAAGCTACATTACATTATTTCACAGTGTTGGAGATGTACAGAGTT
TCGGATATGGAGCTGGTGAGAGTACTCCCAAGTTCAGAGGATGAAGTGAATGTTGCTTGT
TTTCATCCCTCTCCTGGTGGTGGCCTTGTTTATGGGACCAAGGAGGGTTCACTGAGGATC
TTCCAGTACAATACAGATGCAACCTCTAACTTCACCGGACCAAACACCTTTCCTGAGGAG
AACTTGTCCGAGGTAGCCTAGAATTATACAGCAATAATCTTTTTCGGAACAACCCAAATC
AAACAAAAGGGCCATTTTTGGGTTTCCATAAATCTTTTTTACAGACATTTTCTTTTAGGT
AAAGAGACTGCAGATAAAGAAAATGTAAAAAATATTGTTTTTGTTGTTGCTGTTTGTAAC
AGAGTACCCTTCCCTTTATGTATTGTTATTATTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B378TF U 1
AF RR2B378JQ C 292
BS 1 466 RR2B378TF
BS 467 1056 RR2B378JQ

RD RR2B378TF 467 0 0
CACTAGCCCTGAAAGCGACCGAGTTTCCTGGGAGTTACCTTTTATACATGGATGGTTGAT
GGGTCAAGGTCATGGTGTCTCTTCTGCTCCCAACAGAGGCTCCTCCTCCGCATCTCGGTC
ATCCAGACCTAGTCTTGAGGCTGGAGTAGCTTTGACAGAACTACCTTGTACTGTCAAACT
CAGAGTGTGGCGACATGACATGGGAGACCCATTTGCACAGATGAAATCTGACAGGTGTCT
TCTAACATTACCGCATGTCGTCCTTTGCAGTGAAGATGGGAGCTCATTTTTCGCCGTGCG
GTAGATATTTAGCAGCATGTGTTGCAATGTGTTGTTCCTCATGCTGAGATAGATCCAGGA
CTGCAGACGCTAGCACAACAAGATTCAGGGCTTGCAACTTCCCCGACTCAACACCCTGTC
ACAGCACACCAAGTCATTTACGAGCTTCGTGTCTATTCTCTCCAAA
G

QA 1 466 1 466
DS 

RD RR2B378JQ 765 0 0
CGCCGTGCGGTAGATATTTAGCAGCATGTGTTGCA*TGTGTTGTTCCTCATGCTGAGATA
GATCCAGGACTGCAGACGCTAGCACAACAAGATTCAGGGCTTGCAACTTCCCCGACTCAA
CACCCTGTCACAGCACACCAAGTCATTTACGAGCTTCGTGTCTATTCTCTCCAAAAGGAA
AGCTTTGGTTCAGTAATTGTGTCACGGGAAATTAGAGCTGCGCATTGCTTGACCTCTATT
CAGTTCTCGCCCACCTCCGAGCACATACTGCTTGCATATGGACGGCATCATGGTTCTCTT
TTGAATAGCATCGTTAGTGATGGTGAAGCTACATTACATTATTTCACAGTGTTGGAGATG
TACAGAGTTTCGGATATGGAGCTGGTGAGAGTACTCCCAAGTTCAGAGGATGAAGTGAAT
GTTGCTTGTTTTCATCCCTCTCCTGGTGGTGGCCTTGTTTATGGGACCAAGGAGGGTTCA
CTGAGGATCTTCCAGTACAATACAGATGCAACCTCTAACTTCACCGGACCAAACACCTTT
CCTGAGGAGAACTTGTCCGAGGTAGCCTAGAATTATACAGCAATAATCTTTTTCGGAACA
ACCCAAATCAAACAAAAGGGCCATTTTTGGGTTTCCATAAATCTTTTTTACAGACATTTT
CTTTTAGGTAAAGAGACTGCAGATAAAGAAAATGTAAAAAATATTGTTTTTGTTGTTGCT
GTTTGTAACAGAGTACCCTTCCCTTTATGTATTGTTATTATTAGC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL4401Contig1 650 2 1 U
GGGTTTCTCTTCCGCATCGTCGTCTCCAGCTTCTCCTCGTGTGGTTTATACTCTAAATCG
AGTATATAAAGGATGGGAAGATGCCCGACAAGAAAGGTGAAGAAGAGGCGTTTGTCTCAC
AAAACAGCTCGTCGTGACAAATTCGAAGTCAAAGGCGACGATCTAGTGTACACTGAGCTG
CGCAAACCAGAGACGGAGACAAAGCCTTTGGAGCTTAGCGAGGATTTGCCTGGAATGGGC
CAGTTCTACTGCCTACACTGCGATCGGTACTTCTCTAATGCGTCTGTGCGAGATGATCAT
TTTAAGACCAAGAAACACAAGAAGCGTGTGAAGTTAATGAATGGACTGCGCCACACTCGC
AACTCGATGCAGATTTGGCTGCTGGGATGGGAATGCCCGACAATGGTCCAAAGCTCATGG
CTTCTTGAGTTCTCACTTTCAGTTTTTTTTTCTTCTGTTTCTTAATAGTTCACAGTTAAC
TGAACTTGTGGATTGTTGTTGTAAGATGTCCCTTAGTATTAAAACTATAAGTTCAATGCT
ATATGTGTTTTCCTGATTGCCTGACACTGATATAAGTTGGAAGTTAGCAACGTTAAAGAG
CTATATATATATATATATATATGGCGAGATTATTTGCATCTCCGCTTCGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AY57JQ C 1
AF RR2AY57TFB U 1
BS 1 650 RR2AY57TFB

RD RR2AY57JQ 650 0 0
GGGTTTCTCTTCCGCATCGTCGTCTCCAGCTTCTCCTCGTGTGGTTTATACTCTAAATCG
AGTATATAAAGGATGGGAAGATGCCCGACAAGAAAGGTGAAGAAGAGGCGTTTGTCTCAC
AAAACAGCTCGTCGTGACAAATTCGAAGTCAAAGGCGACGATCTAGTGTACACTGAGCTG
CGCAAACCAGAGACGGAGACAAAGCCTTTGGAGCTTAGCGAGGATTTGCCTGGAATGGGC
CAGTTCTACTGCCTACACTGCGATCGGTACTTCTTTAATGCGTCTGTGCGAGATGATCAT
TTTAAGACCAAGAAACACAAGAAGCGTGTGAAGTTAATGAATGGACTGCGCCACACTCGC
AACTCGATGCAGATTTGGCTGCTGGGATGGGAATGCCCGACAATGGTCCAAAGCTCATGG
CTTCTTGAGTTCTCACTTTCAGTTTTTTTTTCTTCTGTTTCTTAATAGTTCACAGTTAAC
TGAACTTGTGGATTGTTGTTGTAAGATGTCCCTTAGTATTAAAACTATAAGTTCAATGCT
ATATGTGTTTTCCTGATTGCCTGACACTGATATAAGTTGGAAGTTAGCAACGTTAAAGAG
CTATATATATATATATATATATGGCGAGATTATTTGCATCTCCGCTTCGC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2AY57TFB 650 0 0
GGGTTTCTCTTCCGCATCGTCGTCTCCAGCTTCTCCTCGTGTGGTTTATACTCTAAATCG
AGTATATAAAGGATGGGAAGATGCCCGACAAGAAAGGTGAAGAAGAGGCGTTTGTCTCAC
AAAACAGCTCGTCGTGACAAATTCGAAGTCAAAGGCGACGATCTAGTGTACACTGAGCTG
CGCAAACCAGAGACGGAGACAAAGCCTTTGGAGCTTAGCGAGGATTTGCCTGGAATGGGC
CAGTTCTACTGCCTACACTGCGATCGGTACTTCTCTAATGCGTCTGTGCGAGATGATCAT
TTTAAGACCAAGAAACACAAGAAGCGTGTGAAGTTAATGAATGGACTGCGCCACACTCGC
AACTCGATGCAGATTTGGCTGCTGGGATGGGAATGCCCGACAATGGTCCAAAGCTCATGG
CTTCTTGAGTTCTCACTTTCAGTTTTTTTTTCTTCTGTTTCTTAATAGTTCACAGTTAAC
TGAACTTGTGGATTGTTGTTGTAAGATGTCCCTTAGTATTAAAACTATAAGTTCAATGCT
ATATGTGTTTTCCTGATTGCCTGACACTGATATAAGTTGGAAGTTAGCAACGTTAAAGAG
CTATATATATATATATATATATGGCGAGATTATTTGCATCTCCGCTTCGC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL4402Contig1 1047 2 2 U
TGAAAGGAAAAAAAAAAAAACTTTTATGGACGATTGGGGAGGATTGGCTCCAGAGATACT
CACAAACATCATCTCAAGGCTCACGATTCAGGAGCGATGGACGGGACCGATGTTCGTCAG
AAAATCGTGGCTAGCCGCTTGCAGAGATCCGTATCTCTGGTCTACCTTCGATCTGGAGAA
ATGTTTCGAGTCGTACCCCGAGTCGACTCAGTGGTGGTCCTCTGAGTTCGAGCGGACGAT
AGATTCCATGGTCCGATCAGTCGTCGATTGGAGCGAAGGAGGTCTCACAGAGATCCGTGT
ACGCCATTGCAGCGACCACGCTCTCTCTTACGCCGCCGATAGATGTCCGAATCTCGGTTC
TCTCGCGGTTTGTAGCAGTCCTCGCGTGACGGACGCATCTATGGCGAAGATTGCGTTTCG
TTGCAGGAGTCTAAAGGAGCTAGATATCAGTTACTGCCACGAGATATCTCACGACACGCT
TGTGATGATCGGTAGAAACTGTCCTAACCTCACGACGCTGAAACGCAACCTTATGGATTG
GTCTGATTCGTCGTCTCGGCACATCGGCTCTGTTGTTCCTACAGGGTATTTAGACGCTTG
TCCTCAAGACGGAGACACGGAAGCTGGGGCGATCGGGAAACACATGATCAATCTTGAGCG
TTTGGAGATTCGGTTCTCTAGATTGTCTGCGAAAGGACTCGCTTCGGTATGTGAGGGTTG
TCCGAAGCTGGAGTATTTGGACTTGTTTGGGTGTGTGCATTTGTCGGGGCGTGACATTGC
GAACAATGTGTCGAGGCTGAAGGGGGTTAAGGAGGTGAAGAAGCCAGATGTTTACGTGCC
GAGGTCGGGGGATGTGGTGGCTCAGACGGAGAGGTACGGACATTGGAGACTTTATGACGA
GAGGTTTGATATACAATCCATGAGGATCTGAGTTGTTCATACACTACGTAATGTTAGGTA
ATAAAGCAACCGATATGTTTGTTGTTATTGTGCGTTTTATTTATGTAACTTGTACATGAA
GGAAATTAAATCAAGCATTTTCCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DB81TF U 1
AF RR2DB81JQ C 546
BS 1 661 RR2DB81TF
BS 662 1047 RR2DB81JQ

RD RR2DB81TF 661 0 0
TGAAAGGAAAAAAAAAAAAACTTTTATGGACGATTGGGGAGGATTGGCTCCAGAGATACT
CACAAACATCATCTCAAGGCTCACGATTCAGGAGCGATGGACGGGACCGATGTTCGTCAG
AAAATCGTGGCTAGCCGCTTGCAGAGATCCGTATCTCTGGTCTACCTTCGATCTGGAGAA
ATGTTTCGAGTCGTACCCCGAGTCGACTCAGTGGTGGTCCTCTGAGTTCGAGCGGACGAT
AGATTCCATGGTCCGATCAGTCGTCGATTGGAGCGAAGGAGGTCTCACAGAGATCCGTGT
ACGCCATTGCAGCGACCACGCTCTCTCTTACGCCGCCGATAGATGTCCGAATCTCGGTTC
TCTCGCGGTTTGTAGCAGTCCTCGCGTGACGGACGCATCTATGGCGAAGATTGCGTTTCG
TTGCAGGAGTCTAAAGGAGCTAGATATCAGTTACTGCCACGAGATATCTCACGACACGCT
TGTGATGATCGGTAGAAACTGTCCTAACCTCACGACGCTGAAACGCAACCTTATGGATTG
GTCTGATTCGTCGTCTCGGCACATCGGCTCTGTTGTTCCTACAGGGTATTTAGACGCTTG
TCCTCAAGACGGAGACACGGAAGCTGGGGCGATCGGGAAACACATGATCAATCTTGAGCG
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2DB81JQ 502 0 0
ATTCGTCGTCTCGGCACATCGGCTCTGTTGTTCCTACAGGGTATTTAGACGCTTGTCCTC
AAGACGGAGACACGGAAGCTGGGGCGATCGGGAAACACATGATCAATCTTGAGCGTTTGG
AGATTCGGTTCTCTAGATTGTCTGCGAAAGGACTCGCTTCGGTATGTGAGGGTTGTCCGA
AGCTGGAGTATTTGGACTTGTTTGGGTGTGTGCATTTGTCGGGGCGTGACATTGCGAACA
ATGTGTCGAGGCTGAAGGGGGTTAAGGAGGTGAAGAAGCCAGATGTTTACGTGCCGAGGT
CGGGGGATGTGGTGGCTCAGACGGAGAGGTACGGACATTGGAGACTTTATGACGAGAGGT
TTGATATACAATCCATGAGGATCTGAGTTGTTCATACACTACGTAATGTTAGGTAATAAA
GCAACCGATATGTTTGTTGTTATTGTGCGTTTTATTTATGTAACTTGTACATGAAGGAAA
TTAAATCAAGCATTTTCCTTGC

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 2

CO CL4403Contig1 1385 2 2 U
GGAGAAAAAGAGGCGAGAAACTCCCCCTAAATAAAAAATAAAAATAAAAAAAATGTCCGA
AAGATTATTGGTGTAGCTTTTGATTTCTGTCTCTTCGTTATCGATTTCGGACATCCACAT
TGGTCTCGTAGATCTGCAAAATCTGCGTGTTTCGTTCTGTAATTTTGAAATCGAGATTCA
ATTGTTTTGTTTGAGAGGTCACGACATTAGATTTGGGACCTTCTGCTGATTCGCATTTCC
CGATCTAACCTGAGCGACTCGATTCGTGGTCGACATTGTTTGGTGGGTTGGATCTGAAGA
AAAGGTGACAAGAGATGGATCCAATCTCTGCGGTTAGCGAAGAGCTGGCTGAGATCGGAG
GACAAATCAATGACCTTTTCCGCGCTTTGTCAAATGGATTCCAGAAGCTGGAGAAGATCA
AAGATGCTAATAGACAGAGCAGGCAGCTGGAAGAACTCACTGACAAAATGCGCGACTGCA
AAAGCCTTATTAAAGATTTCGATAGGGAAGTCAAAAGCTTGGAAGGTGGAAACGACGCCA
CCACTAACCGGATGTTGAATGATCGACGTCAATCTATGGTTAAGGAACTAAACTCATATG
TTGCTCTTAAGAAGAAATACTCATCAAATCTAGCAAGCAATAATAAGAGAGTAGATCTTT
TCGATGGTCCTGCTGAAGACAACATGGAAGAGAATGTCTTACTTGCTTCAAATATGACCA
ATCAAGAACTTGTGAATAAAGGCAACTCTATGATGGATGACACTGATCAAGCCATTGAAA
GAGGGAAAAAGATTGTTCAAGAGACTATAAATGTGGGAACAGATACTTCAGCAGCTCTCA
AGGCTCAGACCGACCAAATGAGTAGGGTTGTCAATGAACTGGATTCTATTCATTTCTCAC
TCAAGAAGGCCTCCAAGCTGGTCAAGGAAATCGGTAGGCAGGTTGCAACGGACAAATGTA
TTATGGCATTTCTTTTCCTTATTGTCATTGGTGTCATAGCAATCATCATCGTCAAGACTG
TGAACCCAAACAACAAAGACATCCGGGACATACCGGGCCTAGCTCCACCAGCCATGATGA
ACAGACGTTTACTCTGGAACCATTACTGAACTAAAAGATTCTCATTTCATGCATTCAAAA
TACTCGTACGTAGTGCACGCTTCTTGGTCCTTCACCTAAGTCCATGTTGCTGTTGATGAA
ACCGCTTCACTTAACCAGTTTTTCTTCACATGGCTCTTGGCTGCTGCGCATTTGAGAAGT
CGCCCTTTCCCTTATAGTCCATGTGACTGGTTCTGTGATATGTCATTATGTAATGCGTTT
TTTTTAAACCAAACCTCGTCTCTGTTTTATTAATTTATTTAATGGTTCCTCTGTTTTCAT
TGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2AO25TF U 1
AF RR2AO25JQ C 491
BS 1 738 RR2AO25TF
BS 739 1385 RR2AO25JQ

RD RR2AO25TF 738 0 0
GGAGAAAAAGAGGCGAGAAACTCCCCCTAAATAAAAAATAAAAATAAAAAAAATGTCCGA
AAGATTATTGGTGTAGCTTTTGATTTCTGTCTCTTCGTTATCGATTTCGGACATCCACAT
TGGTCTCGTAGATCTGCAAAATCTGCGTGTTTCGTTCTGTAATTTTGAAATCGAGATTCA
ATTGTTTTGTTTGAGAGGTCACGACATTAGATTTGGGACCTTCTGCTGATTCGCATTTCC
CGATCTAACCTGAGCGACTCGATTCGTGGTCGACATTGTTTGGTGGGTTGGATCTGAAGA
AAAGGTGACAAGAGATGGATCCAATCTCTGCGGTTAGCGAAGAGCTGGCTGAGATCGGAG
GACAAATCAATGACCTTTTCCGCGCTTTGTCAAATGGATTCCAGAAGCTGGAGAAGATCA
AAGATGCTAATAGACAGAGCAGGCAGCTGGAAGAACTCACTGACAAAATGCGCGACTGCA
AAAGCCTTATTAAAGATTTCGATAGGGAAGTCAAAAGCTTGGAAGGTGGAAACGACGCCA
CCACTAACCGGATGTTGAATGATCGACGTCAATCTATGGTTAAGGAACTAAACTCATATG
TTGCTCTTAAGAAGAAATACTCATCAAATCTAGCAAGCAATAATAAGAGAGTAGATCTTT
TCGATGGTCCTGCTGAAGACAACATGGAAGAGAATGTCTTACTTGCTTCAAATATGACCA
ATCAAGAACTTGTGAATA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2AO25JQ 895 0 0
TAAAGATTTCGATAGGGAAGTCAAAAGCTTGGAAGGTGGAAACGACGCCACCACTAACCG
GATGTTGAATGATCGACGTCAATCTATGGTTAAGGAACTAAACTCATATGTTGCTCTTAA
GAAGAAATACTCATCAAATCTAGCAAGCAATAATAAGAGAGTAGATCTTTTCGATGGTCC
TGCTGAAGACAACATGGAAGAGAATGTCTTACTTGCTTCAAATATGACCAATCAAGAACT
TGTGAATAAAGGCAACTCTATGATGGATGACACTGATCAAGCCATTGAAAGAGGGAAAAA
GATTGTTCAAGAGACTATAAATGTGGGAACAGATACTTCAGCAGCTCTCAAGGCTCAGAC
CGACCAAATGAGTAGGGTTGTCAATGAACTGGATTCTATTCATTTCTCACTCAAGAAGGC
CTCCAAGCTGGTCAAGGAAATCGGTAGGCAGGTTGCAACGGACAAATGTATTATGGCATT
TCTTTTCCTTATTGTCATTGGTGTCATAGCAATCATCATCGTCAAGACTGTGAACCCAAA
CAACAAAGACATCCGGGACATACCGGGCCTAGCTCCACCAGCCATGATGAACAGACGTTT
ACTCTGGAACCATTACTGAACTAAAAGATTCTCATTTCATGCATTCAAAATACTCGTACG
TAGTGCACGCTTCTTGGTCCTTCACCTAAGTCCATGTTGCTGTTGATGAAACCGCTTCAC
TTAACCAGTTTTTCTTCACATGGCTCTTGGCTGCTGCGCATTTGAGAAGTCGCCCTTTCC
CTTATAGTCCATGTGACTGGTTCTGTGATATGTCATTATGTAATGCGTTTTTTTTAAACC
AAACCTCGTCTCTGTTTTATTAATTTATTTAATGGTTCCTCTGTTTTCATTGGTT

QA 1 895 1 895
DS 



AS 1 2

CO CL4404Contig1 1103 2 8 U
GGGAAGCCAACCAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCCGACAAAAAAAGTTTCAATGGCCAAT
AACAGTGACGACAAGGTTTCAGAAACAACTTCAGATCGGCCTGTTAGAGTCTATGCTGAT
GGCATCTTCGATTTATTCCACTTCGGCCATGCTCGCGCCATCGAACAAGCAAAAAAATCG
TTTCCGAACACATATCTGCTGGTAGGATGTTGCAACGACAAGATTACCAACAAGTTTAAA
GGCAAGACCGTCATGACAGAGTCCGAGCGTTATGAATCTCTCCGACATTGCAAGTGGGTC
GATGAAGTGATTCCAGATGCACCATGGGTTCTCACCACAGAGTTTCTCGATAAGCATAAG
GTCGACTATGTTGCCCACGATGCTCTTCCGTATGCGGATGCTAGTGGAGCTGGAAACGAT
GTTTATGAGTTTGTGAAGTCGATTGGAAAGTTTAAAGAAACTAAAAGAACAGAAGGGATA
TCGACATCAGACATAATCATGAGAATAGTGAAAGATTACAACCAGTATGTGTTGCGTAAT
TTGGACCGAGGATATTCAAGAGGAGAACTCGGTGTCAGCTTCGTCAAGGAGAAGAGGCTT
AGAGTGAACGTTAAACTGAAGAAATTACAAGAGAAAGTGAAAGAACAGCAAGAGGAGATA
CAAACCGTAGCAAAAACTGCTGGGACGCATCATGACGAATGGGTTGAAAACGCTGATCGT
TGGGTTGTTGGATTTCTAGAAATGTTTGAGGAAGGTTGTCATAAAATGGGAACAGCCATC
AGAGATGGGATCCAGCAAAAGCTATTGAGGCAAGAGTCGGAAGAGAACCGGCGCTTGATT
CAAAACGGACTGACAAGTGCCAAGGAGGAACAGATTTCTGATAAAGATGGGCTTGCAAAA
GGAGATGAAAACTATCATCATGATCAAGAAGGTTCCTTAAATGAGAGGAAAAAAATAATA
AGATAGTAAAGACATGAGAGGTTCTTGGCTAATGATTCAAGAGTTTCCACAGCTCTGGCA
TTAGTATTTCTTGTTTTATTATGTTCCAACTTGTTATTACTTTCTAAGAATCAAATGCAG
CAGAAGTTAAAGCTGTCACTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK05TF U 1
AF RR2BK05JQ C 330
BS 1 644 RR2BK05TF
BS 645 645 RR2BK05JQ
BS 646 654 RR2BK05TF
BS 655 655 RR2BK05JQ
BS 656 675 RR2BK05TF
BS 676 676 RR2BK05JQ
BS 677 709 RR2BK05TF
BS 710 1103 RR2BK05JQ

RD RR2BK05TF 711 0 0
GGGAAGCCAACCAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCCGACAAAAAAAGTTTCAATGGCCAAT
AACAGTGACGACAAGGTTTCAGAAACAACTTCAGATCGGCCTGTTAGAGTCTATGCTGAT
GGCATCTTCGATTTATTCCACTTCGGCCATGCTCGCGCCATCGAACAAGCAAAAAAATCG
TTTCCGAACACATATCTGCTGGTAGGATGTTGCAACGACAAGATTACCAACAAGTTTAAA
GGCAAGACCGTCATGACAGAGTCCGAGCGTTATGAATCTCTCCGACATTGCAAGTGGGTC
GATGAAGTGATTCCAGATGCACCATGGGTTCTCACCACAGAGTTTCTCGATAAGCATAAG
GTCGACTATGTTGCCCACGATGCTCTTCCGTATGCGGATGCTAGTGGAGCTGGAAACGAT
GTTTATGAGTTTGTGAAGTCGATTGGAAAGTTTAAAGAAACTAAAAGAACAGAAGGGATA
TCGACATCAGACATAATCATGAGAATAGTGAAAGATTACAACCAGTATGTGTTGCGTAAT
TTGGACCGAGGATATTCAAGAGGAGAACTCGGTGTCAGCTTCGTCAAGGAGAAGAGGCTT
AGAGTGAACGTTAAACTGAAGAAATTACAAGAGAAAGTGAAAGA*CAGCAAGAG*AGATA
CAAACCGTAGCAAAA*CTGCTGGGACGCATCATGACGAATGGGTTGAAA
CG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2BK05JQ 774 0 0
TCTCACCACAGAGTTTCTCGATAAGCATAAGGTCGACTATGTTGCCCACGATGCTCTTCC
GTATGCGGATGCTAGTGGAGCTGGAAACGATGTTTATGAGTTTGTGAAGTCGATTGGAAA
GTTTAAAGAAACTAAAAGAACAGAAGGGATATCGACATCAGACATAATCATGAGAATAGT
GAAAGATTACAACCAGTATGTGTTGCGTAATTTGGACCGAGGATATTCAAGAGGAGAACT
CGGTGTCAGCTTCGTCAAGGAGAAGAGGCTTAGAGTGAACGTTAAACTGAAGAAATTACA
AGAGAAAGTGAAAGAACAGCAAGAGGAGATACAAACCGTAGCAAAAACTGCTGGGACGCA
TCATGACGAATGGGTTGAAAACGCTGATCGTTGGGTTGTTGGATTTCTAGAAATGTTTGA
GGAAGGTTGTCATAAAATGGGAACAGCCATCAGAGATGGGATCCAGCAAAAGCTATTGAG
GCAAGAGTCGGAAGAGAACCGGCGCTTGATTCAAAACGGACTGACAAGTGCCAAGGAGGA
ACAGATTTCTGATAAAGATGGGCTTGCAAAAGGAGATGAAAACTATCATCATGATCAAGA
AGGTTCCTTAAATGAGAGGAAAAAAATAATAAGATAGTAAAGACATGAGAGGTTCTTGGC
TAATGATTCAAGAGTTTCCACAGCTCTGGCATTAGTATTTCTTGTTTTATTATGTTCCAA
CTTGTTATTACTTTCTAAGAATCAAATGCAGCAGAAGTTAAAGCTGTCACTGAC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4406Contig1 935 2 4 U
GAGATCTGAAATCATTTTCCTCTCTCTACAATGGCGGTGACTGAACACGTCGTTCGATCG
ATACTCGGTATTATCGGATCTATGTTGACTGTAGCGATGTTCGGGTACTCAATTCCGCGA
TTTAACAGAATCAGAAAGGATGGTTCCGTAGGGGCACTAAAGCCTGATTGGAATTTCGTG
AAGTTATTCCACTGTACTATATGGTGTCTGTATGGAACCCCATTTGTTCAAGTTCATGGA
GTAATTTTGTCATATCTTCACGGGTTTGCGTTTTTTATCGAGCTTGGGTATGTTGCAGTA
TATATGATTTACTATGAAGAAACTGAACCCCGCACGTCAATCTTGTGGACAATTGTGGTC
TATGGGCCGATTCTCTTCGCCTTACTCGTCTTGTGTTTATTCTTTATTCCTGCACATATC
AAACGAGAATTACTTGGAATCATATGTGTAATTGTCAGCATTTTTGTGCAGTCTAATGTC
CACTTGGCGGCGCTGAGACAGATAGCGGTTACACAGAACTTTAAGCTCATGCCGGCTTGG
TTAATTGGCTGTGGTCTCTTAAACGCAATTTTATGGATTTTATATTCAATACTGGTCGAA
ATAGATCTTTACGTACTAATAAGCAGTATTGTTGGGGGCGTATTAGTTTTCATCCATCTC
ATAGTTCGTGTCACCGGTGAACCATTTCCTCTCCTAACGTTACCGGTTTGACATTTGGGT
ACTATTATGAATAATAAGACATCTGTGTCATTATGTGTAACCCGCCGTTGTTTCCTTTTT
TGCCTTTTTTGTTTGTTTGAAATATCTGGATCTTGATTCATTTCCCTGTTTTTTTTTTTC
TTTTGTGTGTGTGTAATTTGTAAAACCTCTTGGATAGTTATACAAAATTTCGAGAGAGGA
GAAACGGGTTTACATCCGTAGTCATTGCTTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC43TF U 1
AF RR2FC43JQ C 278
BS 1 759 RR2FC43TF
BS 760 760 RR2FC43JQ
BS 761 774 RR2FC43TF
BS 775 935 RR2FC43JQ

RD RR2FC43TF 778 0 0
GAGATCTGAAATCATTTTCCTCTCTCTACAATGGCGGTGACTGAACACGTCGTTCGATCG
ATACTCGGTATTATCGGATCTATGTTGACTGTAGCGATGTTCGGGTACTCAATTCCGCGA
TTTAACAGAATCAGAAAGGATGGTTCCGTAGGGGCACTAAAGCCTGATTGGAATTTCGTG
AAGTTATTCCACTGTACTATATGGTGTCTGTATGGAACCCCATTTGTTCAAGTTCATGGA
GTAATTTTGTCATATCTTCACGGGTTTGCGTTTTTTATCGAGCTTGGGTATGTTGCAGTA
TATATGATTTACTATGAAGAAACTGAACCCCGCACGTCAATCTTGTGGACAATTGTGGTC
TATGGGCCGATTCTCTTCGCCTTACTCGTCTTGTGTTTATTCTTTATTCCTGCACATATC
AAACGAGAATTACTTGGAATCATATGTGTAATTGTCAGCATTTTTGTGCAGTCTAATGTC
CACTTGGCGGCGCTGAGACAGATAGCGGTTACACAGAACTTTAAGCTCATGCCGGCTTGG
TTAATTGGCTGTGGTCTCTTAAACGCAATTTTATGGATTTTATATTCAATACTGGTCGAA
ATAGATCTTTACGTACTAATAAGCAGTATTGTTGGGGGCGTATTAGTTTTCATCCATCTC
ATAGTTCGTGTCACCGGTGAACCATTTCCTCTCCTAACGTTACCGGTTTGACATTTGGGT
ACTATTATGAATAATAAGACATCTGTGTCATTATGTGTA*CCCGCCGTTGTTTC
TTTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2FC43JQ 658 0 0
TCGAGCTTGGGTATGTTGCAGTATATATGATTTACTATGAAGAAACTGAACCCCGCACGT
CAATCTTGTGGACAATTGTGGTCTATGGGCCGATTCTCTTCGCCTTACTCGTCTTGTGTT
TATTCTTTATTCCTGCACATATCAAACGAGAATTACTTGGAATCATATGTGTAATTGTCA
GCATTTTTGTGCAGTCTAATGTCCACTTGGCGGCGCTGAGACAGATAGCGGTTACACAGA
ACTTTAAGCTCATGCCGGCTTGGTTAATTGGCTGTGGTCTCTTAAACGCAATTTTATGGA
TTTTATATTCAATACTGGTCGAAATAGATCTTTACGTACTAATAAGCAGTATTGTTGGGG
GCGTATTAGTTTTCATCCATCTCATAGTTCGTGTCACCGGTGAACCATTTCCTCTCCTAA
CGTTACCGGTTTGACATTTGGGTACTATTATGAATAATAAGACATCTGTGTCATTATGTG
TAACCCGCCGTTGTTTCCTTTTTTGCCTTTTTTGTTTGTTTGAAATATCTGGATCTTGAT
TCATTTCCCTGTTTTTTTTTTTCTTTTGTGTGTGTGTAATTTGTAAAACCTCTTGGATAG
TTATACAAAATTTCGAGAGAGGAGAAACGGGTTTACATCCGTAGTCATTGCTTTTTCT

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL4407Contig1 821 2 2 U
GATTCATCATTTGGAGTATGGTGGTAGAGTTCTGAAACCATTGGATTTATATGAGATTCT
CACGGGCTGTTCTGAAAACGTTGTTATTGAAGCTTCCGTTAGTGGCTGGGTTCACAAGCG
TCTGATGAAGCTATACATGGACTTTTGCCAGAATTTGTCAGAGAACCCCAGTATAAAATT
GCTTAAGAAATTATACATTTCGGAGGTAGAGGATGATATCAATGTGTCAGAATGTGAACT
GCAAGATGTATCAGCTGCTCCTTTATTACGTGCCCTCCATGTGCACAATACAGTTGCGAT
GTTGGATCTCTCCCACAATATGTTAGGGAATGGAACAATGGAGAAACTGAAACAACTGTT
TGCCTCATCAAACCAGATGTATGGTGCTTTAACTTTGGATTTGCACTCCAACCGATTTGG
TCCAACTTCTTTGTTCCAGATCTGTGAATGCCCTGTTCTGTTCACTCGGCTGGAAGTCCT
CAATGTGTCGAGGAATCGACTTACTGATGCTTGTGGATCATACCTCTCAACCATCTTGAA
AAACTACCGGGCACTTTACAGCTTGAATGTGGAACATTGTTCACTCACATCTAGAACAAT
TCAAAAGATTGCTGATGCTTTGGATCCTGAGTCGGGACTTTCACAACTCTATATAGGTTA
TAACAATCCTATTTCAGGGAGTGCTATTCAAAACCTCTTGGCCAAATTAGTTACTCTAAG
CAGGTTGGAAAAACAAAACACTAAAGATGTATTTAAAAAAAAAACTTCTCCACATGTAAA
TCGATCTGACATTATTATATGTTAAACCACTACAGCTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ10TF U 1
AF RR2FJ10JQ C 181
BS 1 673 RR2FJ10TF
BS 674 821 RR2FJ10JQ

RD RR2FJ10TF 673 0 0
GATTCATCATTTGGAGTATGGTGGTAGAGTTCTGAAACCATTGGATTTATATGAGATTCT
CACGGGCTGTTCTGAAAACGTTGTTATTGAAGCTTCCGTTAGTGGCTGGGTTCACAAGCG
TCTGATGAAGCTATACATGGACTTTTGCCAGAATTTGTCAGAGAACCCCAGTATAAAATT
GCTTAAGAAATTATACATTTCGGAGGTAGAGGATGATATCAATGTGTCAGAATGTGAACT
GCAAGATGTATCAGCTGCTCCTTTATTACGTGCCCTCCATGTGCACAATACAGTTGCGAT
GTTGGATCTCTCCCACAATATGTTAGGGAATGGAACAATGGAGAAACTGAAACAACTGTT
TGCCTCATCAAACCAGATGTATGGTGCTTTAACTTTGGATTTGCACTCCAACCGATTTGG
TCCAACTTCTTTGTTCCAGATCTGTGAATGCCCTGTTCTGTTCACTCGGCTGGAAGTCCT
CAATGTGTCGAGGAATCGACTTACTGATGCTTGTGGATCATACCTCTCAACCATCTTGAA
AAACTACCGGGCACTTTACAGCTTGAATGTGGAACATTGTTCACTCACATCTAGAACAAT
TCAAAAGATTGCTGATGCTTTGGATCCTGAGTCGGGACTTTCACAACTCTATATAGGTTA
TAACAATCCTATT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2FJ10JQ 641 0 0
GCTTAAGAAATTATACATTTCGGAGGTAGAGGATGATATCAATGTGTCAGAATGTGAACT
GCAAGATGTATCAGCTGCTCCTTTATTACGTGCCCTCCATGTGCACAATACAGTTGCGAT
GTTGGATCTCTCCCACAATATGTTAGGGAATGGAACAATGGAGAAACTGAAACAACTGTT
TGCCTCATCAAACCAGATGTATGGTGCTTTAACTTTGGATTTGCACTCCAACCGATTTGG
TCCAACTTCTTTGTTCCAGATCTGTGAATGCCCTGTTCTGTTCACTCGGCTGGAAGTCCT
CAATGTGTCGAGGAATCGACTTACTGATGCTTGTGGATCATACCTCTCAACCATCTTGAA
AAACTACCGGGCACTTTACAGCTTGAATGTGGAACATTGTTCACTCACATCTAGAACAAT
TCAAAAGATTGCTGATGCTTTGGATCCTGAGTCGGGACTTTCACAACTCTATATAGGTTA
TAACAATCCTATTTCAGGGAGTGCTATTCAAAACCTCTTGGCCAAATTAGTTACTCTAAG
CAGGTTGGAAAAACAAAACACTAAAGATGTATTTAAAAAAAAAACTTCTCCACATGTAAA
TCGATCTGACATTATTATATGTTAAACCACTACAGCTTTAC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL4408Contig1 738 2 1 U
GGTTCCGAGACCTCTCCATTCCTACCAAGAAAAATGGAGATCACAAACGTTACTGAGTAT
GAAGCAATCGCAAAGGAGAAGTTGCCTAAGATGGTATATGACTACTATGCGTCTGGAGTC
AGAAAAGTGTTTCAAATGTTACGCGATGAGTTCGAGCTAACCATGGCACTAAGTGGGTGC
AGGTCTCTCAGTGAGATTACTAGGAACCACATTATCACAGAGTGGGAGACTCCACGCCAT
TTGCCCAAGTTATAAAGAGAGGCAAACCAAAAAAGAAAAAGCAATAAACCTGAGAACAGC
AACAACACACAGAGCTACGCAATGGATTAAAACCTATTGATATTCTTCTGATTGATCTCT
TTGGCTATTTATTTCGAAAGAATGGTTTCTCTGTTGTATCCAAAACTCACAAGACAACGA
CTAGAGATTCCCTTGTAATGCTATTTGCCTACTTCTACCTTCAGTCCCATTCTTCTTCCT
TTTACAATAGAGACAACTACCATTCAGTTCACATCAGAGTATAACCATCATCAAAAGTCG
AACACAACAGCTGAATAGTAAAGACTAAAGAGAGCCAGAGAGGTTAATGGGCTCTACCTA
CCGTAGAAATGTCCAAACAAGATTGGGCTTGAACGTTATCATTAGGCTCATTGCTTTGTA
TCATTCCACTTTCATCATCTCTTAGATTTGTGTCCTTCAAAAAAAATTGGCTTATGAAAT
ACTATTTACTTATTTAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BI61JQ C 1
AF RR2BI61TF U 1
BS 1 738 RR2BI61TF

RD RR2BI61JQ 738 0 0
GGTTCCGAGACCTCTCCATTCCTACCAAGAAAAATGGAGATCACAAACGTTACTGAGTAT
GAAGCAATCGCAAAGGAGAAGTTGCCTAAGATGGTATATGACTACTATGCGTCTGGAGTC
AGAAAAGTGTTTCAAATGTTACGCGATGAGTTCGAGCTAACCATGGCACTAAGTGGGTGC
AGGTCTCTCAGTGAGATTACTAGGAACCACATTATCACAGAGTGGGAGACTCCACGCCAT
TTGCCCAAGTTATAAAGAGAGGCAAACCAAAAAAGAAAAAGCAATAAACCTGAGAACAGC
AACAACACACAGAGCTACGCAATGGATTAAAACCTATTGATATTCTTCTGATTGATCTCT
TTGGCTATTTATTTCGAAAGAATGGTTTCTCTGTTGTATCCAAAACTCACAAGACAACGA
CTAGAGATTCCCTTGTAATGCTATTTGCCTACTTCTACCTTCAGTCCCATTCTTCTTCCT
TTTACAATAGAGACAACTACCATTCAGTTCACATCAGAGTATAACCATCATCAAAAGTCG
AACACAACAGCTGAATAGTAAAGACTAAAGAGAGCCAGAGAGGTTAATGGGCTCTACCTA
CCGTAGAAATGTCCAAACAAGATTGGGCTTGAACGTTATCATTAGGCTCATTGCTTTGTA
TCATTCCACTTTCATCATCTCTTAGATTTGTGTCCTTCAAAAAAAATTGGCTTATGAAAT
ACTATTTACTTATTTAAG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2BI61TF 738 0 0
GGTTCCGAGACCTCTCCATTCCTACCAAGAAAAATGGAGATCACAAACGTTACTGAGTAT
GAAGCAATCGCAAAGGAGAAGTTGCCTAAGATGGTATATGACTACTATGCGTCTGGAGTC
AGAAAAGTGTTTCAAATGTTACGCGATGAGTTCGAGCTAACCATGGCACTAAGTGGGTGC
AGGTCTCTCAGTGAGATTACTAGGAACCACATTATCACAGAGTGGGAGACTCCACGCCAT
TTGCCCAAGTTATAAAGAGAGGCAAACCAAAAAAGAAAAAGCAATAAACCTGAGAACAGC
AACAACACACAGAGCTACGCAATGGATTAAAACCTATTGATATTCTTCTGATTGATCTCT
TTGGCTATTTATTTCGAAAGAATGGTTTCTCTGTTGTATCCAAAACTCACAAGACAACGA
CTAGAGATTCCCTTGTAATGCTATTTGCCTACTTCTACCTTCAGTCCCATTCTTCTTCCT
TTTACAATAGAGACAACTACCATTCAGTTCACATCAGAGTATAACCATCATCAAAAGTCG
AACACAACAGCTGAATAGTAAAGACTAAAGAGAGCCAGAGAGGTTAATGGGCTCTACCTA
CCGTAGAAATGTCCAAACAAGATTGGGCTTGAACGTTATCATTAGGCTCATTGCTTTGTA
TCATTCCACTTTCATCATCTCTTAGATTTGTGTCCTTCAAAAAAAATTGGCTTATGAAAT
ACTATTTACTTATTTAAG

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL4409Contig1 801 2 4 U
GTGATGGAGAGTGTTTGTTTGATATAGAGGAGTCTCTTGAGGAGCTGGAACAGCTTGCTG
ATACTGCTGGTCTTATGGTCGTTGGTTCTACCTATCAAAAGCTAGCTTCCCCAAATCCTA
GAACATATATTGGATCCGGAAAGGTCTCAGAGATTAAAAGTGCAATTAATGCACTAGACG
TTGAGACTGTGATCTTTGACGATGAACTTTCACCAGGGCAATTGCGTAACCTGGAAAAGG
CCTTTGGTGGGGATGTTCGAGTTTGTGACCGTACCGCCCTTATCTTGGATATTTTCAACC
AAAGAGCCGCAACTCACGAAGCAGCCTTGCAGGTTGCTCTAGCGCAGATGGAGTACCAAT
TACCACGATTAACTAGAATGTGGACTCATCTTGAGCGTCAATCAGGTGGCCAAGTTAAGG
GTATGGGAGAAAAACAAATTGAAGTTGATAAGCGAATCTTGCGTACTCAAATTGGAGTTC
TCAAAAAAGAGTTGGAATCTGTTAGAAAGCATAGGAAGCAGTATAGAAGCCGGCGTGTTG
CTATACCTGTTCCTGTTGTATCTTTGGTTGGTTACACAAATGCTGGAAAGAGTACACTTT
TGAACCAATTGACTGGTGCTAATGTTCTCGCTGAAAATCGTTTGTTTGCGACCCTTGATC
CAACAACGAGAAAGGTTCAGATGCACAACGGGAAGGAGTTTCTTCTCACAGATACTGTTG
GCTTTATTCAAAGTTACAACCACCTTGTGTTTCTTGCAGTTGCTGCTTTCAGAGCACACT
CGAGAGATATCAGAGTCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ47TF U 1
AF RR2H122TF U 28
BS 1 514 RR2GJ47TF
BS 515 515 RR2H122TF
BS 516 526 RR2GJ47TF
BS 527 801 RR2H122TF

RD RR2GJ47TF 526 0 0
GTGATGGAGAGTGTTTGTTTGATATAGAGGAGTCTCTTGAGGAGCTGGAACAGCTTGCTG
ATACTGCTGGTCTTATGGTCGTTGGTTCTACCTATCAAAAGCTAGCTTCCCCAAATCCTA
GAACATATATTGGATCCGGAAAGGTCTCAGAGATTAAAAGTGCAATTAATGCACTAGACG
TTGAGACTGTGATCTTTGACGATGAACTTTCACCAGGGCAATTGCGTAACCTGGAAAAGG
CCTTTGGTGGGGATGTTCGAGTTTGTGACCGTACCGCCCTTATCTTGGATATTTTCAACC
AAAGAGCCGCAACTCACGAAGCAGCCTTGCAGGTTGCTCTAGCGCAGATGGAGTACCAAT
TACCACGATTAACTAGAATGTGGACTCATCTTGAGCGTCAATCAGGTGGCCAAGTTAAGG
GTATGGGAGAAAAACAAATTGAAGTTGATAAGCGAATCTTGCGTACTCAAATTGGAGTTC
TCAAAAAAGAGTTGGAATCTGTTAGAAAGCATAG*AAGCAGTATAG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2H122TF 774 0 0
G
GGAGTCTCTTGAGGAGCTGGAACAGCTTGCTGATACTGCTGGTCTTATGGTCGTTGGTTC
TACCTATCAAAAGCTAGCTTCCCCAAATCCTAGAACATATATTGGATCCGGAAAGGTCTC
AGAGATTAAAAGTGCAATTAATGCACTAGACGTTGAGACTGTGATCTTTGACGATGAACT
TTCACCAGGGCAATTGCGTAACCTGGAAAAGGCCTTTGGTGGGGATGTTCGAGTTTGTGA
CCGTACCGCCCTTATCTTGGATATTTTCAACCAAAGAGCCGCAACTCACGAAGCAGCCTT
GCAGGTTGCTCTAGCGCAGATGGAGTACCAATTACCACGATTAACTAGAATGTGGACTCA
TCTTGAGCGTCAATCAGGTGGCCAAGTTAAGGGTATGGGAGAAAAACAAATTGAAGTTGA
TAAGCGAATCTTGCGTACTCAAATTGGAGTTCTCAAAAAAGAGTTGGAATCTGTTAGAAA
GCATAGGAAGCAGTATAGAAGCCGGCGTGTTGCTATACCTGTTCCTGTTGTATCTTTGGT
TGGTTACACAAATGCTGGAAAGAGTACACTTTTGAACCAATTGACTGGTGCTAATGTTCT
CGCTGAAAATCGTTTGTTTGCGACCCTTGATCCAACAACGAGAAAGGTTCAGATGCACAA
CGGGAAGGAGTTTCTTCTCACAGATACTGTTGGCTTTATTCAAAGTTACAACCACCTTGT
GTTTCTTGCAGTTGCTGCTTTCAGAGCACACTCGAGAGATATCAGAGTCATCC

QA 2 774 2 774
DS 



AS 1 2

CO CL4410Contig1 571 2 2 U
GGTCTTTCGAGATCAGAAGACGCCGCACTTCCATCTTTTGAGCTGCAGAGAGAAGAGAGT
TGGTGAAAATGAGTCGTGGAAGTGGAGCAGCTCCAAAGGGGAGAAGAAGGGAGGAGTCTC
CTTCACCATTGATTGTTCTAAACCTGTTGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCTTAGA
GAAGTTTCTCCAGGAGAGGATTAAGGTTGGTGGTGGTAAAGCTGGTGCTCTTGGTGATTC
CGTCTCAATCACTCGTGACAAGAACAAGATCACCGTCACCTCTGATGGCCAATTCTCCAA
GAGATACCTCAAGTACTTGACAAAGAAGTATCTGAAGAAGCACAATGTGAGAGATTGGCT
CAGAGTGATTGCTGCCAACAAGGACCGTAACCTCTATGAGTTGAGGTACTTCAACATCGC
CGAGAACGAAGCAGAGGAAGAAGACTAAAAAAAAACCACCATCTCTTCGTCTATTCTATT
ACAACTCTCTGTTCTGTTTAAGATGTTATATAGTTTGGTTGAAGGGATACACTTTCGTTT
GTTTGTTGCTGCGCATTTGAGCTTTCTATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G028JQ C 1
AF RR2G028TF U 80
BS 1 79 RR2G028JQ
BS 80 571 RR2G028TF

RD RR2G028JQ 571 0 0
GGTCTTTCGAGATCAGAAGACGCCGCACTTCCATCTTTTGAGCTGCAGAGAGAAGAGAGT
TGGTGAAAATGAGTCGTGGAAGTGGAGCAGCTCCAAAGGGGAGAAGAAGGGAGGAGTCTC
CTTCACCATTGATTGTTCTAAACCTGTTGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCTTAGA
GAAGTTTCTCCAGGAGAGGATTAAGGTTGGTGGTGGTAAAGCTGGTGCTCTTGGTGATTC
CGTCTCAATCACTCGTGACAAGAACAAGATCACCGTCACCTCTGATGGCCAATTCTCCAA
GAGATACCTCAAGTACTTGACAAAGAAGTATCTGAAGAAGCACAATGTGAGAGATTGGCT
CAGAGTGATTGCTGCCAACAAGGACCGTAACCTCTATGAGTTGAGGTACTTCAACATCGC
CGAGAACGAAGCAGAGGAAGAAGACTAAAAAAAAACCACCATCTCTTCGTCTATTCTATT
ACAACTCTCTGTTCTGTTTAAGATGTTATATAGTTTGGTTGAAGGGATACACTTTCGTTT
GTTTGTTGCTGCGCATTTGAGCTTTCTATGG

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2G028TF 492 0 0
AAGTGGAGCAGCTCCAAAGGGGAGAAGAAGGGAGGAGTCTCCTTCACCATTGATTGTTCT
AAACCTGTTGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCTTAGAGAAGTTTCTCCAGGAGAGG
ATTAAGGTTGGTGGTGGTAAAGCTGGTGCTCTTGGTGATTCCGTCTCAATCACTCGTGAC
AAGAACAAGATCACCGTCACCTCTGATGGCCAATTCTCCAAGAGATACCTCAAGTACTTG
ACAAAGAAGTATCTGAAGAAGCACAATGTGAGAGATTGGCTCAGAGTGATTGCTGCCAAC
AAGGACCGTAACCTCTATGAGTTGAGGTACTTCAACATCGCCGAGAACGAAGCAGAGGAA
GAAGACTAAAAAAAAACCACCATCTCTTCGTCTATTCTATTACAACTCTCTGTTCTGTTT
AAGATGTTATATAGTTTGGTTGAAGGGATACACTTTCGTTTGTTTGTTGCTGCGCATTTG
AGCTTTCTATGG

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 2

CO CL4411Contig1 608 2 4 U
GGAACACGTGTCAACATTCACCGTTCTTTCTCTCTCTCGACGAAATCGTCCGCCTCTCTC
TTTTCTCGATCACATGGTGGGTGATGGAAAAAGAACACAGAGCCTCTTCCCTCCATTGAG
ATGCCTCCGTTCACCGCCGTGGCTGTTGATGCGACAAACAGTTTCTTCGTCGGAGGATCT
CAGCAAGAAGATTAGGAAGCCTTATACCATCACCAAGTCGAGGGAGAGCTGGACGGAGCC
TGAGCACGACAAGTTCCTCGAAGCTCTTCAGCTAGACTGGAAGAAGATTAAAGCTTTTAT
TGGGTCAAAAATTGTGATTCAGGTACAGTAAATTGGAAGAAGATTGAAGCTTTTAAAACG
ACTTTACTCGCGTAGCTTTGTTTTATTTTCAACTTTATGTTGTGTAATGTGTAGTGTTGA
TTGGCTTCACCAGGAATCAAATAGAAAGCTTGTTTTTTTATATGAAACCGCAAGCTTTCT
CTTTGATTCTTGTTCTCACTTCGCACTTGGTGAGCTTCTCTCGGTCTTACTCTGTTTTTA
CTTATCTTGCTCTCTGTTTTTGTCTCACTCACTCTGCTTGTTTCTTACTTGTGTTACAAC
TTACAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX55TF U 1
AF RR2DX55JQ C 236
BS 1 270 RR2DX55TF
BS 271 271 RR2DX55JQ
BS 272 311 RR2DX55TF
BS 312 608 RR2DX55JQ

RD RR2DX55TF 311 0 0
GGAACACGTGTCAACATTCACCGTTCTTTCTCTCTCTCGACGAAATCGTCCGCCTCTCTC
TTTTCTCGATCACATGGTGGGTGATGGAAAAAGAACACAGAGCCTCTTCCCTCCATTGAG
ATGCCTCCGTTCACCGCCGTGGCTGTTGATGCGACAAACAGTTTCTTCGTCGGAGGATCT
CAGCAAGAAGATTAGGAAGCCTTATACCATCACCAAGTCGAGGGAGAGCTGGACGGAGCC
TGAGCACGACAAGTTCCTCGAAGCTCTTCA*CTAGACTGGAAGAAGATTAAAGCTTTTAT
TGGGTCAAAAA

QA 1 311 1 311
DS 

RD RR2DX55JQ 373 0 0
GAGCCTGAGCACGACAAGTTCCTCGAAGCTCTTCAGCTAGACTGGAAGAAGATTAAAGCT
TTTATTGGGTCAAAAATTGTGATTCAGGTACAGTAAATTGGAAGAAGATTGAAGCTTTTA
AAACGACTTTACTCGCGTAGCTTTGTTTTATTTTCAACTTTATGTTGTGTAATGTGTAGT
GTTGATTGGCTTCACCAGGAATCAAATAGAAAGCTTGTTTTTTTATATGAAACCGCAAGC
TTTCTCTTTGATTCTTGTTCTCACTTCGCACTTGGTGAGCTTCTCTCGGTCTTACTCTGT
TTTTACTTATCTTGCTCTCTGTTTTTGTCTCACTCACTCTGCTTGTTTCTTACTTGTGTT
ACAACTTACAACC

QA 1 373 1 373
DS 



AS 1 2

CO CL4412Contig1 900 2 2 U
GCAATTAGGGGAGTTGGCGACGTCATCTGGGAAGCTGCAATTAGCAGAGGAGTGCATGAA
GTATGCGATGGATCTGAGTGGTTTGTTACTGCTTTATTCTTCTCTGGGAGATGCTGAAGG
TGTGTCAAAACTTGCAACACTTGCTAAAGAGCAAGGGAAGAACAATGTCGCCTTTCTTTG
CCTATTCATGCTGGGCAAATTGGAAGATTGTCTGGACTTGTTGGTGGAGAGTAACCGGAT
ACCAGAAGCTGCTCTAATGGCAAGATCATACCTTCCAAGCAAAGTATCTGAGATAGTAGC
TCTTTGGAGGAAAGATCTCAGCAAGATAAATTCAAAAGCAGCAGAATCTTTGGCTGATCC
TGAGGAGTACTCAAACCTGTTTGATGATTGGCAAGTTGCTCTTTCCGTCGAAGCAAAAGC
TGCAGAGACAAGGGGAGTTTATACAGCAGCAGAAAATTATCCTAGTCATGCTGATAGATC
TTCAATGACCCTCGTGGAAGCCTTTAGAAACTTGCAAGTTGAGGAAGAGGAGGAATCACT
TGAAAATGGAGATACGGATCACGAGGAGGTGGTAGCAGAAGAAAACGGAGATGAAGAAAA
GAATGATGATGAGGATGTAGAGGAACATCATCAAGAAGAAAGAGTTGTTGTTGATGGTGA
CTCAACCGATGGAGCAGTGCTTGTAAACGGGAGTGAAGCTGAATAAGAGTGGGGTACGAA
TAATGAAGGAAACCCATCAGCCTAATGGCAAGTTCGGACAAGGCTGAATTGTTTTTTTGT
CGTTTTGGTGATTAATTTGATTCCCCCAAAAGATAATGCCGCCTTTTAGAACATGTTTTG
TTTGTTTCCGTGATTTTGTGAATTCATTTGCCTTTAGGAAACATAATACCATGGTTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT73TF U 1
AF RR2FT73JQ C 427
BS 1 678 RR2FT73TF
BS 679 900 RR2FT73JQ

RD RR2FT73TF 678 0 0
GCAATTAGGGGAGTTGGCGACGTCATCTGGGAAGCTGCAATTAGCAGAGGAGTGCATGAA
GTATGCGATGGATCTGAGTGGTTTGTTACTGCTTTATTCTTCTCTGGGAGATGCTGAAGG
TGTGTCAAAACTTGCAACACTTGCTAAAGAGCAAGGGAAGAACAATGTCGCCTTTCTTTG
CCTATTCATGCTGGGCAAATTGGAAGATTGTCTGGACTTGTTGGTGGAGAGTAACCGGAT
ACCAGAAGCTGCTCTAATGGCAAGATCATACCTTCCAAGCAAAGTATCTGAGATAGTAGC
TCTTTGGAGGAAAGATCTCAGCAAGATAAATTCAAAAGCAGCAGAATCTTTGGCTGATCC
TGAGGAGTACTCAAACCTGTTTGATGATTGGCAAGTTGCTCTTTCCGTCGAAGCAAAAGC
TGCAGAGACAAGGGGAGTTTATACAGCAGCAGAAAATTATCCTAGTCATGCTGATAGATC
TTCAATGACCCTCGTGGAAGCCTTTAGAAACTTGCAAGTTGAGGAAGAGGAGGAATCACT
TGAAAATGGAGATACGGATCACGAGGAGGTGGTAGCAGAAGAAAACGGAGATGAAGAAAA
GAATGATGATGAGGATGTAGAGGAACATCATCAAGAAGAAAGAGTTGTTGTTGATGGTGA
CTCAACCGATGGAGCAGT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2FT73JQ 474 0 0
GACAAGGGGAGTTTATACAGCAGCAGAAAATTATCCTAGTCATGGTGATAGATTTTCAAT
GACCCTCGTGGAAGCCTTTAGAAACTTGCAAGTTGAGGAAGAGGAGGAATCACTTGAAAA
TGGAGATACGGATCACGAGGAGGTGGTAGCAGAAGAAAACGGAGATGAAGAAAAGAATGA
TGATGAGGATGTAGAGGAACATCATCAAGAAGAAGGAGTTGTTGTTGATGGTGACTCAAC
CGATGGAGCAGTGCTTGTAAACGGGAGTGAAGCTGAATAAGAGTGGGGTACGAATAATGA
AGGAAACCCATCAGCCTAATGGCAAGTTCGGACAAGGCTGAATTGTTTTTTTGTCGTTTT
GGTGATTAATTTGATTCCCCCAAAAGATAATGCCGCCTTTTAGAACATGTTTTGTTTGTT
TCCGTGATTTTGTGAATTCATTTGCCTTTAGGAAACATAATACCATGGTTTTCG

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 2

CO CL4413Contig1 506 2 1 U
GGGAATTGTGCTCGAAGCATTAATTCTCTTACGGAAAGAAAAAAGAATCAAAACATAAAA
AAAAAGTGAAGTGTGAAAATGGCAACGGATGGGACCACTTTTCCAGAAGGCGACGCAGAA
GCAGAACTCAATCCTGGACTGAACAAGAGTTTTGAAGTTGATCCTGTTTCTTCAGAGATC
GCTTTAGACAAGATGGCGGAAAAGATACAACAAAACTTGGAAAGGAAGGAAAACGCAAAG
GCCAGGAGAGACGCAACACAAGCGCTGAAGAAGACGATTATCATATCAGCCGTGATCGTC
GCCGTAACTGGAGCCGCCTTCGCCATCACCAAAAAACTCAAAGAGAAATGATTTTGATTA
CATAACTTAATTACTTCAGTTTTCCTCTTTAATATGTAACTACTATTACTTCTTCAAAAA
ACTAAGAAAATACATCTATTATTTTATACCTATTTTTTTTTGTCAAATGTAATTTTTTAA
AATAATAATGCAATGGACTATTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EW27TF U 1
AF RR2EW27JQ C 15
BS 1 506 RR2EW27TF

RD RR2EW27TF 506 0 0
GGGAATTGTGCTCGAAGCATTAATTCTCTTACGGAAAGAAAAAAGAATCAAAACATAAAA
AAAAAGTGAAGTGTGAAAATGGCAACGGATGGGACCACTTTTCCAGAAGGCGACGCAGAA
GCAGAACTCAATCCTGGACTGAACAAGAGTTTTGAAGTTGATCCTGTTTCTTCAGAGATC
GCTTTAGACAAGATGGCGGAAAAGATACAACAAAACTTGGAAAGGAAGGAAAACGCAAAG
GCCAGGAGAGACGCAACACAAGCGCTGAAGAAGACGATTATCATATCAGCCGTGATCGTC
GCCGTAACTGGAGCCGCCTTCGCCATCACCAAAAAACTCAAAGAGAAATGATTTTGATTA
CATAACTTAATTACTTCAGTTTTCCTCTTTAATATGTAACTACTATTACTTCTTCAAAAA
ACTAAGAAAATACATCTATTATTTTATACCTATTTTTTTTTGTCAAATGTAATTTTTTAA
AATAATAATGCAATGGACTATTAATT

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2EW27JQ 492 0 0
AAGCATTAATTCTCTTACGGAAAGAAAAAAGAATCAAAACATAAAAAAAAAGTGAAGTGT
GAAAATGGCAACGGATGGGACCACTTTTCCAGAAGGCGACGCAGAAGCAGAACTCAATCC
TGGACTGAACAAGAGTTTTGAAGTTGATCCTGTTTCTTCAGAGATCGCTTTAGACAAGAT
GGCGGAAAAGATACAACAAAACTTGGAAAGGAAGGAAAACGCAAAGGCCAGGAGAGACGC
AACACAAGCGCTGAAGAAGACGATTATCATATCAGCCGTGATCGTCGCCGTAACTGGAGC
CGCCTTCGCCATCACCAAAAAACTCAAAGAGAAATGATTTTGATTACATAACTTAATTAC
TTCAGTTTTCCTCTTTAATATGTAACTACTATTACTTCTTCAAAAAACTAAGAAAATACA
TCTATTATTTTATACCTATTTTTTTTTGTCAAATGTAATTTTTTAAAATAATAATGCAAT
GGACTATTAATT

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 2

CO CL4414Contig1 865 2 2 U
GAGAGGAGAGAGAAGGATGATTCTGTTCTCTCTTTCTCTCGAAACCTTTCCATCTTCTTC
GCCTCCGAAAAGATGATTCTGTATCTCTCTGTGGTTCTTCACGAAATGCCGATAACCCCT
CTTTTCGTGGCTCTTCGATGAAGCGGAATTCTTCTCTCTCTCGATGACTGTCGTCGAGGA
AGGAAATCACTGATTATCTCCATCACCATCTGGTCGATCACGAGACGCTTCTTCTCGACT
TCAACTGTTCGATTGGCAAATAAGAGTAAGCGAGAGGAGAAGAAGAGGAAGAAGAAGAAG
AGGAAGGAGAAGGGTTGACTGAGGAGATTGGAGGAGCGACGGAGGAGTTGAAAACGGCGT
CGCATAGGGAGCAGCGGTATGCTAGATTCACTCGTTCTGTATCCATTGGTGAATTTTGTA
GGATTTGTTCAATCTTGAGCAGCAGATCGTCCAAGCTGATTTGGACAACAGTTCTTCAAA
AGTTACAGAAGCTCTATGTTTCCAGATAGTGAAGGTGTTGGAGTTCGTTGCAAAGAAAGA
AAGTCTGCAACTGCCCCACGGTTTTACAGCATTACAAGTACTCTTAGAAAGTGAAAATGA
GGAGACAGGGAAACTTTGCAAATTCACCTGCAAGTGGAATATGTCAAGGCTTATGTCAAC
TGCTGTTTACAATGACAGTAAGTCTCTTTAATTACTGTCTATTTCATGGTCAGGTCTTTT
GGCACATATACCTTATCTTTGTATGGAAGAACAAGTATCATGCATTTAGGTTGCTTCTAA
AGTCGTACGGACAATGATATTATTGTTTGGAACTTTGTAATTTTTTTTTATAACCTTTAA
ATAAGAGATTTGCAATGGACCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX85TF U 1
AF RR2GX85JQ C 155
BS 1 646 RR2GX85TF
BS 647 865 RR2GX85JQ

RD RR2GX85TF 646 0 0
GAGAGGAGAGAGAAGGATGATTCTGTTCTCTCTTTCTCTCGAAACCTTTCCATCTTCTTC
GCCTCCGAAAAGATGATTCTGTATCTCTCTGTGGTTCTTCACGAAATGCCGATAACCCCT
CTTTTCGTGGCTCTTCGATGAAGCGGAATTCTTCTCTCTCTCGATGACTGTCGTCGAGGA
AGGAAATCACTGATTATCTCCATCACCATCTGGTCGATCACGAGACGCTTCTTCTCGACT
TCAACTGTTCGATTGGCAAATAAGAGTAAGCGAGAGGAGAAGAAGAGGAAGAAGAAGAAG
AGGAAGGAGAAGGGTTGACTGAGGAGATTGGAGGAGCGACGGAGGAGTTGAAAACGGCGT
CGCATAGGGAGCAGCGGTATGCTAGATTCACTCGTTCTGTATCCATTGGTGAATTTTGTA
GGATTTGTTCAATCTTGAGCAGCAGATCGTCCAAGCTGATTTGGACAACAGTTCTTCAAA
AGTTACAGAAGCTCTATGTTTCCAGATAGTGAAGGTGTTGGAGTTCGTTGCAAAGAAAGA
AAGTCTGCAACTGCCCCACGGTTTTACAGCATTACAAGTACTCTTAGAAAGTGAAAATGA
GGAGACAGGGAAACTTTGCAAATTCACCTGCAAGTGGAATATGTCA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2GX85JQ 711 0 0
TCTCTCTCGATGACTGTCGTCGAGGAAGGAAATCACTGATTATCTCCATCACCATCTGGT
CGATCACGAGACGCTTCTTCTCGACTTCAACTGTTCGATTGGCAAATAAGAGTAAGCGAG
AGGAGAAGAAGAGGAAGAAGAAGAAGAGGAAGGAGAAGGGTTGACTGAGGAGATTGGAGG
AGCGACGGAGGAGTTGAAAACGGCGTCGCATAGGGAGCAGCGGTATGCTAGATTCACTCG
TTCTGTATCCATTGGTGAATTTTGTAGGATTTGTTCAATCTTGAGCAGCAGATCGTCCAA
GCTGATTTGGACAACAGTTCTTCAAAAGTTACAGAAGCTCTATGTTTCCAGATAGTGAAG
GTGTTGGAGTTCGTTGCAAAGAAAGAAAGTCTGCAACTGCCCCACGGTTTTACAGCATTA
CAAGTACTCTTAGAAAGTGAAAATGAGGAGACAGGGAAACTTTGCAAATTCACCTGCAAG
TGGAATATGTCAAGGCTTATGTCAACTGCTGTTTACAATGACAGTAAGTCTCTTTAATTA
CTGTCTATTTCATGGTCAGGTCTTTTGGCACATATACCTTATCTTTGTATGGAAGAACAA
GTATCATGCATTTAGGTTGCTTCTAAAGTCGTACGGACAATGATATTATTGTTTGGAACT
TTGTAATTTTTTTTTATAACCTTTAAATAAGAGATTTGCAATGGACCATGC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4416Contig1 676 2 2 U
GGGAAATGAAGATGGCTCTGCCCCCACCGAGACTCAATCTCTCACCGTCCAGTTCCCTCG
GCGAACCAAGATCCTTACCGTCCATGTCTGACATCCTGACGTCATCAAAAGCTCGAAATC
TTGACTTAAAGATCCAGACTTTAGGACCGTTTTACAGAGTGACAGGGAAGAACACAGACA
CTGGAGCTGAGGTAGGACGAGCAGAGGGAGTGGTTAGGCCATGGTTCGGACGAGGCTTGG
TTCTGCATCTTGATACGATAAGGTTGACGAAAGAGACGATGGCTATGGATAAGTCTCTCC
TTGGAGTTGGTTTATACGTAGGAGCTGTAGCTATCCGACATGGCTACGACTGTGGTTGCC
GCACTGCTCAGCTTCTAGCCATCTACGACTCTGATCTCTACCATTCTAAGCTGGTTAGGT
TTTACAAAAGAATTGGGTTCAAAGAAGTGAAAGAAGTGAGTGGTGGGACGATAGGAGACA
TGGCTGACATGTTGGTGTGGGGTGGAATTGGCACTCGTATGGATGCTAATATCCATCATC
TCCTTGTTAAATGGTCCAAAGTTTTCCTCAAATCAGTTTCTTAATGACTTGTGTTATATC
ATGTTCATTCTTAAAAGGAATCAGACCATACTATTTTTTTACTAAGATCATATGTATACA
GTATACTTCATCACTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT30TF U 1
AF RR2CT30JQ C 1
BS 1 492 RR2CT30TF
BS 493 676 RR2CT30JQ

RD RR2CT30TF 492 0 0
GGGAAATGAAGATGGCTCTGCCCCCACCGAGACTCAATCTCTCACCGTCCAGTTCCCTCG
GCGAACCAAGATCCTTACCGTCCATGTCTGACATCCTGACGTCATCAAAAGCTCGAAATC
TTGACTTAAAGATCCAGACTTTAGGACCGTTTTACAGAGTGACAGGGAAGAACACAGACA
CTGGAGCTGAGGTAGGACGAGCAGAGGGAGTGGTTAGGCCATGGTTCGGACGAGGCTTGG
TTCTGCATCTTGATACGATAAGGTTGACGAAAGAGACGATGGCTATGGATAAGTCTCTCC
TTGGAGTTGGTTTATACGTAGGAGCTGTAGCTATCCGACATGGCTACGACTGTGGTTGCC
GCACTGCTCAGCTTCTAGCCATCTACGACTCTGATCTCTACCATTCTAAGCTGGTTAGGT
TTTACAAAAGAATTGGGTTCAAAGAAGTGAAAGAAGTGAGTGGTGGGACGATAGGAGACA
TGGCTGACATGT

QA 1 492 1 492
DS 

RD RR2CT30JQ 676 0 0
GGGAAATGAAGATGGCTCTGCCCCCACCGAGACTCAATCTCTCACCGTCCAGTTCCCTCG
GCGAACCAAGATCCTTACCGTCCATGTCTGACATCCTGACGTCATCAAAAGCTCGAAATC
TTGACTTAAAGATCCAGACTTTAGGACCGTTTTACAGAGTGACAGGGAAGAACACAGACA
CTGGAGCTGAGGTAGGACGAGCAGAGGGAGTGGTTAGGCCATGGTTCGGACGAGGCTTGG
TTCTGCATCTTGATACGATAAGGTTGACGAAAGAGACGATGGCTATGGATAAGTCTCTCC
TTGGAGTTGGTTTATACGTAGGAGCTGTAGCTATCCGACATGGCTACGACTGTGGTTGCC
GCACTGCTCAGCTTCTAGCCATCTACGACTCTGATCTCTACCATTCTAAGCTGGTTAGGT
TTTACAAAAGAATTGGGTTCAAAGAAGTGAAAGAAGTGAGTGGTGGGACGATAGGAGACA
TGGCTGACATGTTGGTGTGGGGTGGAATTGGCACTCGTATGGATGCTAATATCCATCATC
TCCTTGTTAAATGGTCCAAAGTTTTCCTCAAATCAGTTTCTTAATGACTTGTGTTATATC
ATGTTCATTCTTAAAAGGAATCAGACCATACTATTTTTTTACTAAGATCATATGTATACA
GTATACTTCATCACTC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL4417Contig1 653 2 1 U
GATCGTCGACGTGCCTGTCTTCGGGAGGCTGACGTTACCCTTGGAGAAGCGCGGGGAGAT
TCCTATACCTAAGAAGCCTGATGTAGACATTGAGAAGATCAAGTTCCAGAAGTTTTCTCT
GGAAGAGACTGTTGCGATACTCCACGTGAGGCTTGAGAACATGAATGATTTTGACTTGGG
GCTTAACGACTTGGACTGTGAGGTTTGGTTGAGTGATGTGAGCATTGGGAAAGCTGAGAT
AGCGGATTCTATTAAGCTTGATAAGAACGGGAGCGGGTTGGTTAACGTGCCGATCACGTT
TAGGCCCAAGGATTTTGGGTCTGCGCTTTGGGATATGATTCGTGGTAAAGGGACGGGGTA
TACTATTAAATGGAATGTGGATGTTGATACGCCGTTTGGTGCTATAAAGCTTCCTATTGT
TAAGGAAGGTGGTGAGACTCGTTTGAAGAAGGAAGATAATGATGATGATGATGATGACGA
ATGAGGAGTAAGGGAAAGAGCTCAAGAGAATGAGTGTGGTTTTAAGTAATGAATCTTCCA
TCTTTAAAAAATAATGTTTTTTTTAAGTTAAACTGGGGACTTGTGTTTGGTGTGTGTTGT
TGATGACTGATGGATCAGACTTTTCAGTAGTGCTGTCTTTTGTTTGGACTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FT30JQ C 1
AF RR2FT30TF U 1
BS 1 653 RR2FT30TF

RD RR2FT30JQ 653 0 0
GATCGTCGACGTGCCTGTCTTCGGGAGGCTGACGTTACCCTTGGAGAAGCGCGGGGAGAT
TCCTATACCTAAGAAGCCTGATGTAGACATTGAGAAGATCAAGTTCCAGAAGTTTTCTCT
GGAAGAGACTGTTGCGATACTCCACGTGAGGCTTGAGAACATGAATGATTTTGACTTGGG
GCTTAACGACTTGGACTGTGAGGTTTGGTTGAGTGATGTGAGCATTGGGAAAGCTGAGAT
AGCGGATTCTATTAAGCTTGATAAGAACGGGAGCGGGTTGGTTAACGTGCCGATCACGTT
TAGGCCCAAGGATTTTGGGTCTGCGCTTTGGGATATGATTCGTGGTAAAGGGACGGGGTA
TACTATTAAATGGAATGTGGATGTTGATACGCCGTTTGGTGCTATAAAGCTTCCTATTGT
TAAGGAAGGTGGTGAGACTCGTTTGAAGAAGGAAGATAATGATGATGATGATGATGACGA
ATGAGGAGTAAGGGAAAGAGCTCAAGAGAATGAGTGTGGTTTTAAGTAATGAATCTTCCA
TCTTTAAAAAATAATGTTTTTTTTAAGTTAAACTGGGGACTTGTGTTTGGTGTGTGTTGT
TGATGACTGATGGATCAGACTTTTCAGTAGTGCTGTCTTTTGTTTGGACTTCC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2FT30TF 653 0 0
GATCGTCGACGTGCCTGTCTTCGGGAGGCTGACGTTACCCTTGGAGAAGCGCGGGGAGAT
TCCTATACCTAAGAAGCCTGATGTAGACATTGAGAAGATCAAGTTCCAGAAGTTTTCTCT
GGAAGAGACTGTTGCGATACTCCACGTGAGGCTTGAGAACATGAATGATTTTGACTTGGG
GCTTAACGACTTGGACTGTGAGGTTTGGTTGAGTGATGTGAGCATTGGGAAAGCTGAGAT
AGCGGATTCTATTAAGCTTGATAAGAACGGGAGCGGGTTGGTTAACGTGCCGATCACGTT
TAGGCCCAAGGATTTTGGGTCTGCGCTTTGGGATATGATTCGTGGTAAAGGGACGGGGTA
TACTATTAAATGGAATGTGGATGTTGATACGCCGTTTGGTGCTATAAAGCTTCCTATTGT
TAAGGAAGGTGGTGAGACTCGTTTGAAGAAGGAAGATAATGATGATGATGATGATGACGA
ATGAGGAGTAAGGGAAAGAGCTCAAGAGAATGAGTGTGGTTTTAAGTAATGAATCTTCCA
TCTTTAAAAAATAATGTTTTTTTTAAGTTAAACTGGGGACTTGTGTTTGGTGTGTGTTGT
TGATGACTGATGGATCAGACTTTTCAGTAGTGCTGTCTTTTGTTTGGACTTCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL4418Contig1 753 2 4 U
GGAAGTCCCTCTTCTTTTACCGACTTAAAATCCTCCAAACTCCTATAAAATCTCCAAAGT
CCCAAAGTTTATTTCTTTATCGATCAACACAAAGCAATCTGAGATCTTTTACATCATCAA
TGGCATCATCCGGCCTTACAAGATCAGGAAGTGCACCACAATTCTACCTAGACGAGAAGT
GGAAGCTGTCAAAGAAAGACGGATTCAGCGGTGGCATGTTGAAGATCACGCGCTCCCCGT
CCATGTCGTCTTGCCGCGGCAAGAAGTCACAGAAACACGGGAGACGCGCTTTCACGAGGA
AGTGCGCGAAATTGGTCAAAGAACAGAGAGCTCGCTTCTACATCATGCGTCGCTGCGTGA
TCATGCTTATTTGCTGGAGAGATAACTACTCTGATTCTTAAAAAAAAAACAAACACAAAT
CTCTCTTTGCTCTGTTCTGAAACAGAGGTCGATAGATATACATGTACATAAAGTGTTCTG
TTTTCTAGTGGTTTCTGCTTCTTTAGATTAGTTTAGGTTATGTAATTTGTATGTCTGAGC
CTTTGATTCTGGAAAGAGGTCATGTGCTTCAAGATCAGTTTCAGTGTGCTGAAGTTTAAC
AAGAAAACCAAAAGAAAAAAAAACAGAAAAGTTGTATAATAATTCAATATAAAATAGTGA
AATAGATTCTCGTTTTTTTGTTTGTTGCTTTTCATTAATGATTTTTACTGTGGTGAAGAC
ATGAATGTGGCGTTTCTCTATCTATCTTTCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY27TF U 1
AF RR2DY27JQ C 120
BS 1 598 RR2DY27TF
BS 599 599 RR2DY27JQ
BS 600 612 RR2DY27TF
BS 613 753 RR2DY27JQ

RD RR2DY27TF 620 0 0
GGAAGTCCCTCTTCTTTTACCGACTTAAAATCCTCCAAACTCCTATAAAATCTCCAAAGT
CCCAAAGTTTATTTCTTTATCGATCAACACAAAGCAATCTGAGATCTTTTACATCATCAA
TGGCATCATCCGGCCTTACAAGATCAGGAAGTGCACCACAATTCTACCTAGACGAGAAGT
GGAAGCTGTCAAAGAAAGACGGATTCAGCGGTGGCATGTTGAAGATCACGCGCTCCCCGT
CCATGTCGTCTTGCCGCGGCAAGAAGTCACAGAAACACGGGAGACGCGCTTTCACGAGGA
AGTGCGCGAAATTGGTCAAAGAACAGAGAGCTCGCTTCTACATCATGCGTCGCTGCGTGA
TCATGCTTATTTGCTGGAGAGATAACTACTCTGATTCTTAAAAAAAAAACAAACACAAAT
CTCTCTTTGCTCTGTTCTGAAACAGAGGTCGATAGATATACATGTACATAAAGTGTTCTG
TTTTCTAGTGGTTTCTGCTTCTTTAGATTAGTTTAGGTTATGTAATTTGTATGTCTGAGC
CTTTGATTCTGGAAAGAGGTCATGTGCTTCAAGATCAGTTTCAGTGTGCTGAAGTTTA*C
AAGAAAACCAAA
GAAAAAAA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2DY27JQ 634 0 0
ATGGCATCATCCGGCCTTACAAGATCAGGAAGTGCACCACAATTCTACCTAGACGAGAAG
TGGAAGCTGTCAAAGAAAGACGGATTCAGCGGTGGCATGTTGAAGATCACGCGCTCCCCG
TCCATGTCGTCTTGCCGCGGCAAGAAGTCACAGAAACACGGGAGACGCGCTTTCACGAGG
AAGTGCGCGAAATTGGTCAAAGAACAGAGAGCTCGCTTCTACATCATGCGTCGCTGCGTG
ATCATGCTTATTTGCTGGAGAGATAACTACTCTGATTCTTAAAAAAAAAACAAACACAAA
TCTCTCTTTGCTCTGTTCTGAAACAGAGGTCGATAGATATACATGTACATAAAGTGTTCT
GTTTTCTAGTGGTTTCTGCTTCTTTAGATTAGTTTAGGTTATGTAATTTGTATGTCTGAG
CCTTTGATTCTGGAAAGAGGTCATGTGCTTCAAGATCAGTTTCAGTGTGCTGAAGTTTAA
CAAGAAAACCAAAAGAAAAAAAAACAGAAAAGTTGTATAATAATTCAATATAAAATAGTG
AAATAGATTCTCGTTTTTTTGTTTGTTGCTTTTCATTAATGATTTTTACTGTGGTGAAGA
CATGAATGTGGCGTTTCTCTATCTATCTTTCTCG

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL4419Contig1 700 2 3 U
GCACACTAACCAACTTGTGTTTTCTTTTGCAGGTTTAATTTCGTGAATTAACGTAAAGCT
TTTTCACCCTTACCTCGCGATGGATACTTCACAAGCCGACGCTGACAAAGCTGCTGGAAA
ACGTCATGCAACCGCGCCGCCCGAAGGTGAGCCCGCTGCAAAGACTCTTAAGTTTTCCGA
CGCTCTTGTCCCAGTTGATCAAAGCAAGGATGCCTCTACTGTTGCAACCGCTGCTTTGCC
CAAGGATCTACTACAGTGGCCGATTGAACGGCTAGCTACACAGGTCAACCAAGTCTTTCT
CGACACCATCATCCAGAATGGAGAAGGTGGATATGAAGTTCCCGACGATCAAATCGTCCC
TACTCTTCGTGTTTACGAGATCAACGTGACCAATCTGCGGAACGCTTTTCGCTCCGTACT
GTATACCGTCTTACGCGCCAAGTTCATTGAACGTGGTGATCGTACTGTTACCGCCGCCAC
TACTTTGGCGACGAACGTCTCAAACTTGACTGCTGATGCCTGCATGGCTGCGCTCTACGC
TAAGCTTCGCACTCTGCATCGACAGATCTACACTCATAAAGGAAGGTTCACTGACCAACC
GACTTACACCAACGATGTCGAACTCCCTCTCCCTTTTGCTGTTGCAATTGATGGAATCGG
AATGTTTCGCACCTCTGCGATGAGTACCCGTTTTAACGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB72TF U 1
AF RR2FJ34TF U 29
BS 1 612 RR2HB72TF
BS 613 613 RR2FJ34TF
BS 614 700 RR2HB72TF

RD RR2HB72TF 700 0 0
GCACACTAACCAACTTGTGTTTTCTTTTGCAGGTTTAATTTCGTGAATTAACGTAAAGCT
TTTTCACCCTTACCTCGCGATGGATACTTCACAAGCCGACGCTGACAAAGCTGCTGGAAA
ACGTCATGCAACCGCGCCGCCCGAAGGTGAGCCCGCTGCAAAGACTCTTAAGTTTTCCGA
CGCTCTTGTCCCAGTTGATCAAAGCAAGGATGCCTCTACTGTTGCAACCGCTGCTTTGCC
CAAGGATCTACTACAGTGGCCGATTGAACGGCTAGCTACACAGGTCAACCAAGTCTTTCT
CGACACCATCATCCAGAATGGAGAAGGTGGATATGAAGTTCCCGACGATCAAATCGTCCC
TACTCTTCGTGTTTACGAGATCAACGTGACCAATCTGCGGAACGCTTTTCGCTCCGTACT
GTATACCGTCTTACGCGCCAAGTTCATTGAACGTGGTGATCGTACTGTTACCGCCGCCAC
TACTTTGGCGACGAACGTCTCAAACTTGACTGCTGATGCCTGCATGGCTGCGCTCTACGC
TAAGCTTCGCACTCTGCATCGACAGATCTACACTCATAAAGGAAGGTTCACTGACCAACC
GACTTACACCAAGGATGTCGAACTCCCTCTCCCTTTTGCTGTTGCAATTGATGGAATCGG
AATGTTTCGCACCTCTGCGATGAGTACCCGTTTTAACGTG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2FJ34TF 658 0 0
AA
AGGTTTAATTTCGTGAATTAACGTAAAGCTTTTTCACCCTTACCTCGCGATGGATACTTC
ACAAGCCGACGCTGACAAAGCTGCTGGAAAGCGTCATGCAACCGCGCCGCCCGAAGGTGA
GCCCGCTGCAAAGACTCTTAAGTTTTCCGACGCTCTTGTCCCAGTTGATCAAAGCAAGGA
TGCCTCTACTGTTGCAACCGCTGCTTTGCCCAAGGATCTACTACA*TGGCCGATTGAACG
GCTAGCTACACAGGTCAACCAAGTCTTTCTCGACACCATCATCCAGAATGGAGAAGGTGG
ATATGAATTTCCCGACGATCAAATCGTCCCTACTCTTCGTGTTTACGAGATCAACGTGAC
CAATCTGCGGAACGCTTTTCGCTCCGTACTGTATACCGTCTTACGCGCCAAGTTCATTGA
ACGTGGTGATCGTACTGTTACCGCCGCCACTACTTTGGCGACGAACGTCTCAAACTTGAC
TGCTGATGCCTGCATGGCTGCGCTCTACGCTAAGCTTCGCACTCTGCATCGACAGATCTA
CACTCATAAAGGAAGGTTCACTGACCAACCGACTTACACCAACGATGTCGA*CTCCCTCT
CCCTTTTGCTGTTGCAATTGATGGAATCGGA*TGTTTCGCACCTCTGCGATGAGTA

QA 3 658 3 658
DS 



AS 1 2

CO CL4420Contig1 1018 2 10 U
GAGTCTAGGTGATTCTCCCTGGCAGGCAATGGCCAGTTATGCTAGTGTTGTTATGGCCAA
ATCTGCAGGCGAGCAAGTGAGTGTATTCAGTCCTAATGTTTTCGAAACCGTTTCCGATGC
CCTTCAGAAGGCTGGTGACCAAGGTCTGAGCATTGAAGAGGTCCAGCGTCTTATTGATAT
TCCAGGCCAGGAAACTTTTGATTGTATTGTAAATGTCCTTGAAACATTTCGGATAGCTTT
GAAGGTAAATGGGTATGATAATTCCCGTGTTGTCCATTCCTTCTACCGATCAAAGTACTT
CTTGACATTTGAGGAAGGTAATACCTCAGACAATAATCTTCAGCGGCCTCTACCAGTGAA
TTACCTAGAGAAAGTTGTTGGGGAACATAGGTCAAACGATTCTAAGATCAGCATTTCTTC
ACAGGACGAGCGTGAGCACGTTGCTGGCAACAGAGTTCACAAGGTTACAATTCTTAACCT
TCCTGAAACGGATCAGACAAGCGGTTTACACGAAGCATCTATGAAAAGTCCATCTGCTAC
ATTTGGAATGAGGTTTGGAGGTGAAACAAAGGAATCGACTTGTGAGAAATCACCACCTGT
GCCAATATATCCATGGGTAAACGCAGATGGGTCCATAAATAAAGTCGTCTTTGATGGACT
CGTTCGCCGTGTTCTAGGTACCGTGATGCAGAATCCCGGTATACCTGAGGACGAGATCAT
AAACCTAATGGATGTACTAAATCCTCAGAGCTGTAGGAAGCTTCTGGAGTTGATGACACT
CGATGGGTATGTGAAAGTGAGGGAAATAATGCAAACCAAGTTCACCGGTCCTCCGTCTCT
GCTAACCAGTCTTCTCATAACCGCCCCCAAAAACCCGGAGCTTATCAGCCGCAAACACTT
GTTTGCTAACTCCAAGGGACTCTTTGCCTTGTGAATGTAATAAGATATGCAATAATTCAC
TTTTGTTTCTAGATTCATATCTTCAAGAATATTGTATGCTTCTTTCAAGTTTCACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H357TF U 1
AF RR2H357JQ C 243
BS 1 677 RR2H357TF
BS 678 678 RR2H357JQ
BS 679 704 RR2H357TF
BS 705 705 RR2H357JQ
BS 706 709 RR2H357TF
BS 710 710 RR2H357JQ
BS 711 722 RR2H357TF
BS 723 723 RR2H357JQ
BS 724 756 RR2H357TF
BS 757 1018 RR2H357JQ

RD RR2H357TF 771 0 0
GAGTCTAGGTGATTCTCCCTGGCAGGCAATGGCCAGTTATGCTAGTGTTGTTATGGCCAA
ATCTGCAGGCGAGCAAGTGAGTGTATTCAGTCCTAATGTTTTCGAAACCGTTTCCGATGC
CCTTCAGAAGGCTGGTGACCAAGGTCTGAGCATTGAAGAGGTCCAGCGTCTTATTGATAT
TCCAGGCCAGGAAACTTTTGATTGTATTGTAAATGTCCTTGAAACATTTCGGATAGCTTT
GAAGGTAAATGGGTATGATAATTCCCGTGTTGTCCATTCCTTCTACCGATCAAAGTACTT
CTTGACATTTGAGGAAGGTAATACCTCAGACAATAATCTTCAGCGGCCTCTACCAGTGAA
TTACCTAGAGAAAGTTGTTGGGGAACATAGGTCAAACGATTCTAAGATCAGCATTTCTTC
ACAGGACGAGCGTGAGCACGTTGCTGGCAACAGAGTTCACAAGGTTACAATTCTTAACCT
TCCTGAAACGGATCAGACAAGCGGTTTACACGAAGCATCTATGAAAAGTCCATCTGCTAC
ATTTGGAATGAGGTTTGGAGGTGAAACAAAGGAATCGACTTGTGAGAAATCACCACCTGT
GCCAATATATCCATGGGTAAACGCAGATGGGTCCATAAATAAAGTCGTCTTTGATGGACT
CGTTCGCCGTGTTCTAG*TACCGTGATGCAGAATCCCGGTATAC*TGAG*ACGAGATCAT
AA*CCTAATGGATGTACTAAATCCTCAGAGCTGTAG
AGCTCTGGAGTGATG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2H357JQ 776 0 0
AGGTAAATGGGTATGATAATTCCCGTGTTGTCCATTCTTTCTACCGATCAAAGTACTTCT
TGACATTTGAGGAAGGTAATACCTCAGACAATAATCTTCAGCGGCCTCTACCAGTGAATT
ACCTAGAGAAAGTTGTTGGGGAACATAGGTCAAACGATTCTAAGATCAGCATTTCTTCAC
AGGACGAGCGTGAGCACGTTGCTGGCAACAGAGTTCACAAGGTTACAATTCTTAACCTTC
CTGAAACGGATCAGACAAGCGGTTTACACGAAGCATCTATGAAAAGTCCATCTGCTACAT
TTGGAATGAGGTTTGGAGGTGAAACAAAGGAATCGACTTGTGAGAAATCACCACCTGTGC
CAATATATCCATGGGTAAACGCAGATGGGTCCATAAATAAAGTCGTCTTTGATGGACTCG
TTCGCCGTGTTCTAGGTACCGTGATGCAGAATCCCGGTATACCTGAGGACGAGATCATAA
ACCTAATGGATGTACTAAATCCTCAGAGCTGTAGGAAGCTTCTGGAGTTGATGACACTCG
ATGGGTATGTGAAAGTGAGGGAAATAATGCAAACCAAGTTCACCGGTCCTCCGTCTCTGC
TAACCAGTCTTCTCATAACCGCCCCCAAAAACCCGGAGCTTATCAGCCGCAAACACTTGT
TTGCTAACTCCAAGGGACTCTTTGCCTTGTGAATGTAATAAGATATGCAATAATTCACTT
TTGTTTCTAGATTCATATCTTCAAGAATATTGTATGCTTCTTTCAAGTTTCACTAC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL4421Contig1 939 2 2 U
GGGAGAGACGATGGAGCTGAACGGAGAGGGAGGAAAAGCGACGACGTATTGCGTGACGGG
TGCAAGTGGATACATCGGTTCTTGGTTGGTTAACTCTCTTCTAGAAAGAGGCTACGCGGT
TCATGCCACTCTCAGAGATCTTGCAAAATCTCAATATTTTCAATTCAAGTGGAAACGAAA
CGAACGGCTTAGATTATTCCGAGCGGATCTTGAAGGTGAAGGCAGCTTCGATGAAGCCGT
TAAGGGCTGTCATGGGGTGTTCCATGTCGCGGCTTCCATGGAGTTTGATATCTCACCGGG
TCATGTTAATCTAGAGAGTTATGTCCAGAGCAAAGTCATTGACCCGGCAATAAAAGGCGT
ACGGAACGTACTTGGTTCTTGTCTAAAGTCAAACTCAGTCAAGAGAGTAGTCTTCACGTC
ATCCATCAGTACCCTGACAGCCAAAGATGAGAATGAACGGTGGAGATCAGTCGTAGACGA
GACTTGCAAGACTCCCATTGATCATGTACTTAAAACAAAAGCAAGTGGATGGGTTTATGT
ACTATCGAAACTAGTATCAGAGGAAGAAGCATTTAGATATGCAAAAGAGAAAGGAACGGA
TCTTGTTTCAGTTATTACAACTACTGTCTCGGGTCCGCCTCTTCTCCTTCTCTCCCATCA
AGCCTTCAAGTTCTCTTGTCTCCAATAACAGGTGACTCCAAGTTGTTTGCGATACTATCA
GCAGTGAACAAAAGAATGGGATCGATTGGTTTGGTGCACATTGAAGATATTTGCATGGCG
CACTTGTTTTTTATGGAAGAACCAAAAGCTGAAGGTCAATACATATGTTGTGTTGATAAT
ATTGATATGCATGTGTTGATGTTTAAGCACTTTTTTAAGGAGCATCTTTGTAAAGTTCAT
AAGTAAGTTCTTGAAACTTTACGATCTTCAGTTGCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA34TF U 1
AF RR2CA34JQ C 234
BS 1 687 RR2CA34TF
BS 688 939 RR2CA34JQ

RD RR2CA34TF 687 0 0
GGGAGAGACGATGGAGCTGAACGGAGAGGGAGGAAAAGCGACGACGTATTGCGTGACGGG
TGCAAGTGGATACATCGGTTCTTGGTTGGTTAACTCTCTTCTAGAAAGAGGCTACGCGGT
TCATGCCACTCTCAGAGATCTTGCAAAATCTCAATATTTTCAATTCAAGTGGAAACGAAA
CGAACGGCTTAGATTATTCCGAGCGGATCTTGAAGGTGAAGGCAGCTTCGATGAAGCCGT
TAAGGGCTGTCATGGGGTGTTCCATGTCGCGGCTTCCATGGAGTTTGATATCTCACCGGG
TCATGTTAATCTAGAGAGTTATGTCCAGAGCAAAGTCATTGACCCGGCAATAAAAGGCGT
ACGGAACGTACTTGGTTCTTGTCTAAAGTCAAACTCAGTCAAGAGAGTAGTCTTCACGTC
ATCCATCAGTACCCTGACAGCCAAAGATGAGAATGAACGGTGGAGATCAGTCGTAGACGA
GACTTGCAAGACTCCCATTGATCATGTACTTAAAACAAAAGCAAGTGGATGGGTTTATGT
ACTATCGAAACTAGTATCAGAGGAAGAAGCATTTAGATATGCAAAAGAGAAAGGAACGGA
TCTTGTTTCAGTTATTACAACTACTGTCTCGGGTCCGCCTCTTCTCCTTCTCTCCCATCA
AGCCTTCAAGTTCTCTTGTCTCCAATA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2CA34JQ 706 0 0
AAGCCGTTAAGGGCTGTCATGGGGTGTTCCATGTCGCGGCTTCCATGGAGTTTGATATCT
CACCGGGTCATGTTAATCTAGAGAGTTATGTCCAGAGCAAAGTCATTGACCCGGCAATAA
AAGGCGTACGGAACGTACTTGGTTCTTGTCTAAAGTCAAACTCAGTCAAGAGAGTAGTCT
TCACGTCATCCATCAGTACCCTGACAGCCAAAGATGAGAATGAACGGTGGAGATCAGTCG
TAGACGAGACTTGCAAGACTCCCATTGATCATGTACTTAAAACAAAAGCAAGTGGATGGG
TTTATGTACTATCGAAACTAGTATCAGAGGAAGAAGCATTTAGATATGCAAAAGAGAAAG
GAACGGATCTTGTTTCAGTTATTACAACTACTGTTTCGGGTCCGCCTTTTCTCCTTCTCT
CCCATCAAGCCTTCAAGTTCTCTTGTCTCCAATAACAGGTGACTCCAAGTTGTTTGCGAT
ACTATCAGCAGTGAACAAAAGAATGGGATCGATTGGTTTGGTGCACATTGAAGATATTTG
CATGGCGCACTTGTTTTTTATGGAAGAACCAAAAGCTGAAGGTCAATACATATGTTGTGT
TGATAATATTGATATGCATGTGTTGATGTTTAAGCACTTTTTTAAGGAGCATCTTTGTAA
AGTTCATAAGTAAGTTCTTGAAACTTTACGATCTTCAGTTGCGACT

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL4422Contig1 959 2 2 U
GCCGGTCACAAGACCAACGGTGTGTTGGATGCCGTCTACTTCTGCGTTGTAACGATGACA
ACCGTTGGATACGGTGACCTTGTCCCTAGTAGCTCCGCATCTAGACTACTCGCTTGTGCC
TTTGTCTTCTCCGGAATGGTCCTAGTGGGTCACCTTTTAAGCAGAGCAGCAGATTATCTA
GTGGAGAAGCAAGAGACTTTGCTGGTCAGGGCTTTCCATCTGCGTCAAAGCTCCGGTCCA
CTAGACATCCTCAAGGAGTTGCAAACTAACAGGCTCAGATACAAATGCTACGTCACGTTC
ATTGTCTTTGTAGTCCTCGTCATTGCCGGTACTGTTTTCCTTGTAACGTTTGAGAAAATG
CCGGTTATTGAGGCTTTCTACTGTGTTTGCTCCACGGTTACTACATTGGGTTATGGAGAC
AAAAGCTTTAACTCTGGAACCGGACGGCTCTTCGCTGTGTTTTGGATCTTGACGAGTACT
ATATGTTTGGCTCAGTTTTTACTCTATGTAGCTGAGTTAAATGCAGAAACCAAACAGAGG
GAGTTGGTGAAATGGGTTTTGACAAGGAGGATCACAAACAATGATCTTGAAGCTGCTGAT
CTTGATGAAGATAGAGTTGTCGAAGCTGCAGAGTTTATTGTATATAAGCTGAAAGAAATG
GGGAAGATTGATGAGAAAGATATATCTGGGATCATGGAAGAGTTTGAGCAACTTGATTAT
GATGAATCTGGAAACCTGACCAATTCTGACATCGTTCTAGCTCAGATCCAAAGGTAAGCA
TTCATTTAAGTTATTATACCTGCACACAACTACACGAAGTAAAGAGAGTGAACAGTTCTT
TTTTTGAAAATGTTATTTGTTTCTGTATGTGTGTGTTTGTACTGTAATGTCTCTATGACT
GTTTTGTGATGTCTTGAGTGTATAATACGCATGGATTTACACGTATACGTTGTCTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F038TF U 1
AF RR2F038JQ C 275
BS 1 766 RR2F038TF
BS 767 959 RR2F038JQ

RD RR2F038TF 766 0 0
GCCGGTCACAAGACCAACGGTGTGTTGGATGCCGTCTACTTCTGCGTTGTAACGATGACA
ACCGTTGGATACGGTGACCTTGTCCCTAGTAGCTCCGCATCTAGACTACTCGCTTGTGCC
TTTGTCTTCTCCGGAATGGTCCTAGTGGGTCACCTTTTAAGCAGAGCAGCAGATTATCTA
GTGGAGAAGCAAGAGACTTTGCTGGTCAGGGCTTTCCATCTGCGTCAAAGCTCCGGTCCA
CTAGACATCCTCAAGGAGTTGCAAACTAACAGGCTCAGATACAAATGCTACGTCACGTTC
ATTGTCTTTGTAGTCCTCGTCATTGCCGGTACTGTTTTCCTTGTAACGTTTGAGAAAATG
CCGGTTATTGAGGCTTTCTACTGTGTTTGCTCCACGGTTACTACATTGGGTTATGGAGAC
AAAAGCTTTAACTCTGGAACCGGACGGCTCTTCGCTGTGTTTTGGATCTTGACGAGTACT
ATATGTTTGGCTCAGTTTTTACTCTATGTAGCTGAGTTAAATGCAGAAACCAAACAGAGG
GAGTTGGTGAAATGGGTTTTGACAAGGAGGATCACAAACAATGATCTTGAAGCTGCTGAT
CTTGATGAAGATAGAGTTGTCGAAGCTGCAGAGTTTATTGTATATAAGCTGAAAGAAATG
GGGAAGATTGATGAGAAAGATATATCTGGGATCATGGAAGAGTTTGAGCAACTTGATTAT
GATGAATCTGGAAACCTGACCAATTCTGACATCGTTCTAGCTCAGA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2F038JQ 685 0 0
TCAGATACAAATGCTACGTCACGTTCATTGTCTTTGTAGTCCTCGTCATTGCCGGTACTG
TTTTCCTTGTAACGTTTGAGAAAATGCCGGTTATTGAGGCTTTCTACTGTGTTTGCTCCA
CGGTTACTACATTGGGTTATGGAGACAAAAGCTTTAACTCTGGAACCGGACGGCTCTTCG
CTGTGTTTTGGATCTTGACGAGTACTATATGTTTGGCTCAGTTTTTACTCTATGTAGCTG
AGTTAAATGCAGAAACCAAACAGAGGGAGTTGGTGAAATGGGTTTTGACAAGGAGGATCA
CAAACAATGATCTTGAAGCTGCTGATCTTGATGAAGATAGAGTTGTCGAAGCTGCAGAGT
TTATTGTATATAAGCTGAAAGAAATGGGGAAGATTGATGAGAAAGATATATCTGGGATCA
TGGAAGAGTTTGAGCAACTTGATTATGATGAATCTGGAAACCTGACCAATTCTGACATCG
TTCTAGCTCAGATCCAAAGGTAAGCATTCATTTAAGTTATTATACCTGCACACAACTACA
CGAAGTAAAGAGAGTGAACAGTTCTTTTTTTGAAAATGTTATTTGTTTCTGTATGTGTGT
GTTTGTACTGTAATGTCTCTATGACTGTTTTGTGATGTCTTGAGTGTATAATACGCATGG
ATTTACACGTATACGTTGTCTAAGC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL4423Contig1 1281 2 2 U
GGGCCCTTGCCCCTCGAGAGAATGAGCGGATTGTGGATGTAGCTGCTGCTCCTGGGGGTA
AAACTACGTACGTCGCTGCTCTAATGAAAAACACCGGCTTGATATTCGCGAATGAGATGA
AAGTACCTAGGCTCAAGTCGCTAAATGCCAATCTGCACCGCATGGGGGTCACAAATACCA
TAGTTTGTAACTATGATGGAAGAGATCTACCAAAGGTGTTAGGTGAGAAATCGGTTGATA
GAGTATTGTTGGATGCACCTTGCAGTGGGACTGGGGTCATTTCGAAAGATGAATCGGTTA
AAGTTTCGAAATCCCTGGAGGATATAAAGAAATTTGCTCACTTGCAAAAGCAACTTTTAC
TCGCTGCTATTGATATGGTGGATGCCACTTCCAAAACCGGTGGATATATTGTTTACTCAA
CATGTTCACTTATGGTTGCTGAGAACGAAGCTGTCATAGACTATGCGCTCAAAAAGAGGA
GTGTTCAACTCGTTAAAACTGGACTCGACTTCGGCCAAGACGGATTTGTAAAATTTAGAG
AACATCGATTTCATCCGTCTTTAAACAAGACCAAACGTTTTTATCCTCATGTACACAACA
TGGATGGATTCTTTGTGGCAAAGCTAAAGAAGATGAGTAACATGAAACAAACTTCAGAAG
GTGATGGTGATGATGAGGCGTTAGGAACTGTAGATGAAGCTGATGTGTCCAGTGATGATG
ATGATGAGGAAGCTGAGGCCATGGAAGAGATGGAGAAACCTTCCGTTCCCAAGAAGCAAC
TCAAGAAAACTAAAGATGAAGCTGAGGCGTTAGGAACTGCAGATGAAGCTGATGTGTCCA
GTGATGATGATGAAGCTGAGGCCATGGAAGAGATGGAGAAACCTTCCGTTCCCAAGAAGC
AACTCAAGAAAACTAAAGAAAGCAAGGAGAGACTTGCAAAATCAAAGGAGAACAAAAGTG
GCAAGAAAGATAAGAAATCAAAATCTAAAAATGCACCTATAATAAAGAAGCAAAGGAAGA
GCAAAACTGAAGTGAGGATGGAGATTTCTCAAGCTAGGGAAGAGAAAAGAAGAGCAATGA
GAGAGAAGTCGAAGGAGAAGCAATGATTCAGTGATTTTGCATCAAACACTATCCCATGGG
GAAGTTTAAGGTGCCATGTATTGGCTTGTTTTTATTTATGAATTCACGAACTATTTTTGT
AACATTAAAAGCTAGAAACAAGAGAATTACACTCTCTTAAGACTCCATGGACAGATCTTA
TGTGTCCAAAAGTTTTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS87TF U 1
AF RR2CS87JQ C 592
BS 1 656 RR2CS87TF
BS 657 1281 RR2CS87JQ

RD RR2CS87TF 656 0 0
GGGCCCTTGCCCCTCGAGAGAATGAGCGGATTGTGGATGTAGCTGCTGCTCCTGGGGGTA
AAACTACGTACGTCGCTGCTCTAATGAAAAACACCGGCTTGATATTCGCGAATGAGATGA
AAGTACCTAGGCTCAAGTCGCTAAATGCCAATCTGCACCGCATGGGGGTCACAAATACCA
TAGTTTGTAACTATGATGGAAGAGATCTACCAAAGGTGTTAGGTGAGAAATCGGTTGATA
GAGTATTGTTGGATGCACCTTGCAGTGGGACTGGGGTCATTTCGAAAGATGAATCGGTTA
AAGTTTCGAAATCCCTGGAGGATATAAAGAAATTTGCTCACTTGCAAAAGCAACTTTTAC
TCGCTGCTATTGATATGGTGGATGCCACTTCCAAAACCGGTGGATATATTGTTTACTCAA
CATGTTCACTTATGGTTGCTGAGAACGAAGCTGTCATAGACTATGCGCTCAAAAAGAGGA
GTGTTCAACTCGTTAAAACTGGACTCGACTTCGGCCAAGACGGATTTGTAAAATTTAGAG
AACATCGATTTCATCCGTCTTTAAACAAGACCAAACGTTTTTATCCTCATGTACACAACA
TGGATGGATTCTTTGTGGCAAAGCTAAAGAAGATGAGTAACATGAAACAAACTTCA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2CS87JQ 690 0 0
TACACAACATGGATGGATTCTTTGTGGCAAAGCTAAAGAAGATGAGTAACATGAAACAAA
CTTCAGAAGGTGATGGTGATGATGAGGCGTTAGGAACTGTAGATGAAGCTGATGTGTCCA
GTGATGATGATGATGAGGAAGCTGAGGCCATGGAAGAGATGGAGAAACCTTCCGTTCCCA
AGAAGCAACTCAAGAAAACTAAAGATGAAGCTGAGGCGTTAGGAACTGCAGATGAAGCTG
ATGTGTCCAGTGATGATGATGAAGCTGAGGCCATGGAAGAGATGGAGAAACCTTCCGTTC
CCAAGAAGCAACTCAAGAAAACTAAAGAAAGCAAGGAGAGACTTGCAAAATCAAAGGAGA
ACAAAAGTGGCAAGAAAGATAAGAAATCAAAATCTAAAAATGCACCTATAATAAAGAAGC
AAAGGAAGAGCAAAACTGAAGTGAGGATGGAGATTTCTCAAGCTAGGGAAGAGAAAAGAA
GAGCAATGAGAGAGAAGTCGAAGGAGAAGCAATGATTCAGTGATTTTGCATCAAACACTA
TCCCATGGGGAAGTTTAAGGTGCCATGTATTGGCTTGTTTTTATTTATGAATTCACGAAC
TATTTTTGTAACATTAAAAGCTAGAAACAAGAGAATTACACTCTCTTAAGACTCCATGGA
CAGATCTTATGTGTCCAAAAGTTTTGTTTC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL4424Contig1 1091 2 2 U
GGACTTCCTCTGCGGCGGAGGAGTATTCATGTGAAAAGAGGAATGGTTGGATGCAATACT
TGTCCCCGCGGGTCTAGCCGTGATGGCCGCATACCATGTCTGGCTCGGCTACGCTATAAT
CCACCGTCCCAAGCTCACTGTCATCTCCCTCAACGCTGAGTCTCGACGCCAATGGGTCTT
CTCTATGATGACCGTACGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCCCTTTTCCTCTTTTGGTC
CAGATTAGGGTTTCTAGGACTTTGTAATTGAGATTCAATTTTTATCATTGTTATTTGTGT
GCAGGAGCCGCTTAAAAACGGTACTTTAGCAGTACAGACAATAAGGAACAACATAATGGC
ATCAACTCTTTTAGCCACGACAGCAATCACCCTCTGTTCCATCATCGGAGTCTTCGTAAG
CAACAACAACACCTCTGCTTCCAAATCCACAGCCTCGGCTATCATATACGGAAACAAAAG
CCCTCTCCTTTCGACAATCAAGAACTTCGCGATCCCCGTCTGTTTCCTCATGGCCTTTCT
CTGCAACGTCCAGTCCATCAGGTACTACGCTCATGTGAGTTTCCTCATCACGGTTCCCGT
CTCTAGAGGGAAGAGAGAGCATTGTGAGTACGTGTCTAGAAACTTGAACAGAGCTAGCTA
CTTTTGGTCTCTCGGACTTCGAGCTTTCTACTTCTCCTTCCCGCTTTTCTTGTGGAACTT
CGGTCCCATCCCTATGTTTGTGTGTTGCTGTTTGATGTCGTCGATTCTTTATTTCTTGGA
TACCACCACTAGCTTCACTAGGCATCTCCATAGCGAGTCTTTCAGAGAGATAGCTGAGTC
TATGGACGGTGAAATCGAATCAGCCGTTCATTCTCTGTAGAATCTTCTCTGTTTTTTTCT
TGTGTGGATGTTCGTTAGTTTCAAGAGTTGTTGTAGTATTAGCGGAGTTTGTTTGTAATG
TGATGAAACAACCTGTCCAAACAAACTGTCCAAATAACATGTTACATAGAATGTAGACTA
TGTAATCGCTTGCACATTGTTGTCACTATTGGTTAACTCATTGCCTTTGATATATTACAG
TGTTCTGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG61TF U 1
AF RR2BG61JQ C 284
BS 1 776 RR2BG61TF
BS 777 1091 RR2BG61JQ

RD RR2BG61TF 776 0 0
GGACTTCCTCTGCGGCGGAGGAGTATTCATGTGAAAAGAGGAATGGTTGGATGCAATACT
TGTCCCCGCGGGTCTAGCCGTGATGGCCGCATACCATGTCTGGCTCGGCTACGCTATAAT
CCACCGTCCCAAGCTCACTGTCATCTCCCTCAACGCTGAGTCTCGACGCCAATGGGTCTT
CTCTATGATGACCGTACGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCCCTTTTCCTCTTTTGGTC
CAGATTAGGGTTTCTAGGACTTTGTAATTGAGATTCAATTTTTATCATTGTTATTTGTGT
GCAGGAGCCGCTTAAAAACGGTACTTTAGCAGTACAGACAATAAGGAACAACATAATGGC
ATCAACTCTTTTAGCCACGACAGCAATCACCCTCTGTTCCATCATCGGAGTCTTCGTAAG
CAACAACAACACCTCTGCTTCCAAATCCACAGCCTCGGCTATCATATACGGAAACAAAAG
CCCTCTCCTTTCGACAATCAAGAACTTCGCGATCCCCGTCTGTTTCCTCATGGCCTTTCT
CTGCAACGTCCAGTCCATCAGGTACTACGCTCATGTGAGTTTCCTCATCACGGTTCCCGT
CTCTAGAGGGAAGAGAGAGCATTGTGAGTACGTGTCTAGAAACTTGAACAGAGCTAGCTA
CTTTTGGTCTCTCGGACTTCGAGCTTTCTACTTCTCCTTCCCGCTTTTCTTGTGGAACTT
CGGTCCCATCCCTATGTTTGTGTGTTGCTGTTTGATGTCGTCGATTCTTTATTTCT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2BG61JQ 808 0 0
ATCATTGTTATTTGTGTGCAGGAGCCGCTTAAAAACGGTACTTTAGCAGTACAGACAATA
AGGAACAACATAATGGCATCAACTCTTTTAGCCACGACAGCAATCACCCTCTGTTCCATC
ATCGGAGTCTTCGTAAGCAACAACAACACCTCTGCTTCCAAATCCACAGCCTCGGCTATC
ATATACGGAAACAAAAGCCCTCTCCTTTCGACAATCAAGAACTTCGCGATCCCCGTCTGT
TTCCTCATGGCCTTTCTCTGCAACGTCCAGTCCATCAGGTACTACGCTCATGTGAGTTTC
CTCATCACGGTTCCCGTCTCTAGAGGGAAGAGAGAGCATTGTGAGTACGTGTCTAGAAAC
TTGAACAGAGCTAGCTACTTTTGGTCTCTCGGACTTCGAGCTTTCTACTTCTCCTTCCCG
CTTTTCTTGTGGAACTTCGGTCCCATCCCTATGTTTGTGTGTTGCTGTTTGATGTCGTCG
ATTCTTTATTTCTTGGATACCACCACTAGCTTCACTAGGCATCTCCATAGCGAGTCTTTC
AGAGAGATAGCTGAGTCTATGGACGGTGAAATCGAATCAGCCGTTCATTCTCTGTAGAAT
CTTCTCTGTTTTTTTCTTGTGTGGATGTTCGTTAGTTTCAAGAGTTGTTGTAGTATTAGC
GGAGTTTGTTTGTAATGTGATGAAACAACCTGTCCAAACAAACTGTCCAAATAACATGTT
ACATAGAATGTAGACTATGTAATCGCTTGCACATTGTTGTCACTATTGGTTAACTCATTG
CCTTTGATATATTACAGTGTTCTGAACC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL4425Contig1 944 2 2 U
GGGACAGCCTTCTCTCTCTGACTCTCTGCTTCTCCATCAATGGCTACCATTAGTAGCTTA
CACATATGCGCATCTGATCATCACTCTCGTCTTCCTCGAATCTCCGACGCAGCAGATCAA
TCTCGTCACACAAACCAAATCGTCACTTTTTCTTCGTCTCCTATTTCCAGAAGAGACGCG
AATCTCATTCTCCTCGGCTCGCTTCCGTTGACGAGCTTCTTCGTTCTACCGCCGAGTTCT
TCGGAGGCGAGAGAGAGACGGAGCAGGAAAGTCATCCCTCTCGACGAGTATTCCACTAGC
CCTGAAGGGTTAAAGTACTATGACATTGAGGAAGGTAAAGGTCCAGTAGCCACAGTAGGA
TCAACTGCTCAGGTGCATTTTGATTGCCGTTACAGAAGCATCACTGCAATCTCCACGAGA
GAGTCCAAGCTTTTGGCTGGGAATCGTAGTATTGCTCAGCCATACGAGTTCAAGGTCGGA
TCAACTCCAGGAAAGGAGAGGAAACGAGAGTTTGTGGACAATCCAAACGGGTTGTTCTCT
GCACAGGCTGCACCAAAGCCTCCTCCAGCTATGTATTACATTACTGAGGGAATGAAAGTC
GGTGGCAAGAGAACTGTGATTGTTCCGCCTGAAGCTGGTTATGGTCAGAAAGGAATGAAC
GAGATACCGCCTGGAGCTACGTTTGAGTTAAACATAGAGCTGCTTCAGGTGACTCCCCCA
GCAGAGAAAGAGAAGTGAACAAAGATTCTTCCCAACACTGATAAAGAGAAAGCTTGAAGC
TTTTTCACAAGCCCAACATTTGTCTAAAAGATCATTAGAGAGGAGAAACTATAGAGAGAG
AGAAAAAAAGAATGTAAATTTTCGACTCCGGTACACTAAATAACCGGGTATTATTTGTTG
TGATAGAATCTTTCAAAAGTAGCTGGTTCTTACGTGGCGGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B585TF U 1
AF RR2B585JQ C 243
BS 1 781 RR2B585TF
BS 782 944 RR2B585JQ

RD RR2B585TF 781 0 0
GGGACAGCCTTCTCTCTCTGACTCTCTGCTTCTCCATCAATGGCTACCATTAGTAGCTTA
CACATATGCGCATCTGATCATCACTCTCGTCTTCCTCGAATCTCCGACGCAGCAGATCAA
TCTCGTCACACAAACCAAATCGTCACTTTTTCTTCGTCTCCTATTTCCAGAAGAGACGCG
AATCTCATTCTCCTCGGCTCGCTTCCGTTGACGAGCTTCTTCGTTCTACCGCCGAGTTCT
TCGGAGGCGAGAGAGAGACGGAGCAGGAAAGTCATCCCTCTCGACGAGTATTCCACTAGC
CCTGAAGGGTTAAAGTACTATGACATTGAGGAAGGTAAAGGTCCAGTAGCCACAGTAGGA
TCAACTGCTCAGGTGCATTTTGATTGCCGTTACAGAAGCATCACTGCAATCTCCACGAGA
GAGTCCAAGCTTTTGGCTGGGAATCGTAGTATTGCTCAGCCATACGAGTTCAAGGTCGGA
TCAACTCCAGGAAAGGAGAGGAAACGAGAGTTTGTGGACAATCCAAACGGGTTGTTCTCT
GCACAGGCTGCACCAAAGCCTCCTCCAGCTATGTATTACATTACTGAGGGAATGAAAGTC
GGTGGCAAGAGAACTGTGATTGTTCCGCCTGAAGCTGGTTATGGTCAGAAAGGAATGAAC
GAGATACCGCCTGGAGCTACGTTTGAGTTAAACATAGAGCTGCTTCAGGTGACTCCCCCA
GCAGAGAAAGAGAAGTGAACAAAGATTCTTCCCAACACTGATAAAGAGAAAGCTTGAAGC
T

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2B585JQ 702 0 0
GGAGGCGAGAGAGAGACGGAGCAGGAAAGTCATCCCTCTCGACGAGTATTCCACTAGCCC
TGAAGGGTTAAAGTACTATGACATTGAGGAAGGTAAAGGTCCAGTAGCCACAGTAGGATC
AACTGCTCAGGTGCATTTTGATTGCCGTTACAGAAGCATCACTGCAATCTCCACGAGAGA
GTCCAAGCTTTTGGCTGGGAATCGTAGTATTGCTCAGCCATACGAGTTCAAGGTCGGATC
AACTCCAGGAAAGGAGAGGAAACGAGAGTTTGTGGACAATCCAAACGGGTTGTTCTCTGC
ACAGGCTGCACCAAAGCCTCCTCCAGCTATGTATTACATTACTGAGGGAATGAAAGTCGG
TGGCAAGAGAACTGTGATTGTTCCGCCTGAAGCTGGTTATGGTCAGAAAGGAATGAACGA
GATACCGCCTGGAGCTACGTTTGAGTTAAACATAGAGCTGCTTCAGGTGACTCCCCCAGC
AGAGAAAGAGAAGTGAACAAAGATTCTTCCCAACACTGATAAAGAGAAAGCTTGAAGCTT
TTTCACAAGCCCAACATTTGTCTAAAAGATCATTAGAGAGGAGAAACTATAGAGAGAGAG
AAAAAAAGAATGTAAATTTTCGACTCCGGTACACTAAATAACCGGGTATTATTTGTTGTG
ATAGAATCTTTCAAAAGTAGCTGGTTCTTACGTGGCGGCTTC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL4426Contig1 622 2 2 U
GGAACCCACTTAACCAAAAACAAAAATGTTTACAACGAAACCGATCCTTTTAGCTTCCCT
TCTCCTCATCATCTTCGTCTCTGCAACTCACTCAGCTCGTCAGAAGAGCGGTAACAACGG
TTTAGGATTTGCCGGTGTGCCCGGATCCGGATACGCCGGGATACCCGGGTTTGGAAACGG
GTTTCCGGGTACCGGAGTCGGCGGTGGATACGGCGGAGGCTACGGTGGTCCGAGCGGCGG
GTACGGGAAAGGAGGCGTGGTGAGGCCGACGGTGACTTGCAAAGAGAAAGGACCTTGTAA
CGGCAAGAAGCTGAGGTGTCCTGCAAGGTGTTTCAGCTCTTTTAGCCGCTCCGGGAAAGG
ATACGGCGGTGGAGGCGGAGGTGGTGGATGCACCATGGATTGTAAGAAGAAGTGTGTCGC
TTATTGCTAAAGAAAAAAATAATTAAAGTCCTATCTTTATAATATATAGTCATTACAATG
ATTATATATTTGCTATGTTATTGTAGTTGATGATCATGAAGATCCTTTTGTCTTGATTTG
ATTGTAGTAGTTTTTTATATGCATTATATATGGTTGTGAACTTTTGTGATTGAATAAATG
AGAAAACCTTACAGTTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2AT63TF U 1
AF RR2AT63JQ C 100
BS 1 619 RR2AT63TF
BS 620 622 RR2AT63JQ

RD RR2AT63TF 622 0 0
GGAACCCACTTAACCAAAAACAAAAATGTTTACAACGAAACCGATCCTTTTAGCTTCCCT
TCTCCTCATCATCTTCGTCTCTGCAACTCACTCAGCTCGTCAGAAGAGCGGTAACAACGG
TTTAGGATTTGCCGGTGTGCCCGGATCCGGATACGCCGGGATACCCGGGTTTGGAAACGG
GTTTCCGGGTACCGGAGTCGGCGGTGGATACGGCGGAGGCTACGGTGGTCCGAGCGGCGG
GTACGGGAAAGGAGGCGTGGTGAGGCCGACGGTGACTTGCAAAGAGAAAGGACCTTGTAA
CGGCAAGAAGCTGAGGTGTCCTGCAAGGTGTTTCAGCTCTTTTAGCCGCTCCGGGAAAGG
ATACGGCGGTGGAGGCGGAGGTGGTGGATGCACCATGGATTGTAAGAAGAAGTGTGTCGC
TTATTGCTAAAGAAAAAAATAATTAAAGTCCTATCTTTATAATATATAGTCATTACAATG
ATTATATATTTGCTATGTTATTGTAGTTGATGATCATGAAGATCCTTTTGTCTTGATTTG
ATTGTAGTAGTTTTTTATATGCATTATATATGGTTGTGAACTTTTGTGATTGAATAAATG
AGAAAACCTTACAGTTTTT
CTC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2AT63JQ 523 0 0
TCAGAAGAGCGGTAACAACGGTTTAGGATTTGCCGGTGTGCCCGGATCCGGATACGCCGG
GATACCCGGGTTTGGAAACGGGTTTCCGGGTACCGGAGTCGGCGGTGGATACGGCGGAGG
TTACGGTGGTCCGAGCGGCGGGTACGGGAAAGGAGGCGTGGTGAGGCCGACGGTGACTTG
CAAAGAGAAAGGACCTTGTAACGGCAAGAAGCTGAGGTGTCCTGCAAGGTGTTTCAGCTT
TTTTAGCCGCTCCGGGAAAGGATACGGCGGTGGAGGCGGAGGTGGTGGATGCCCCATGGA
TTGTAAGAAGAAGTGTGTCGCTTATTGCTAAAGAAAAAAATAATTAAAGTCCTATCTTTA
TAATATATAGTCATTACAATGATTATATATTTGCTATGTTATTGTAGTTGATGATCATGA
AGATCCTTTTGTCTTGATTTGATTGTAGTAGTTTTTTATATGCATTATATATGGTTGTGA
ACTTTTGTGATTGAATAAATGAGAAAACCTTACAGTTTTTTTC

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 2

CO CL4427Contig1 926 2 2 U
GGGGATATCAAAAAACGCCCAATCAATTTCTAAAATTATCAATTTAGGTCACCTCTCTCT
CTCTCTCTCTGGCCAAGGATCATTTCTGATCGTCAAATCCAGTAAGCAAAAAGCTCTCAA
CTTTCATCAATTCCCGTCTCTGGGTTCCAATTTCATCTTCACAGTGACGATCTCTCTGAT
TCTGATGGCAGTGGAAGATGATGATTCGACCATAGAGGAGCCTCGCGAAGGCACTGAATT
CGAATCCGAGGAAGCGGCCAAGACGTTCTACGACGATTACTCCAGAAGTTTAGGCTTCGT
GATGCGTGTAATGTCTTGTCGGAGATCCGAGAGAGATGGAAGAATCCTTTCCCGGAGATT
CGGTTGTAATAAAGAAGGTCGCTGTGTTAGTGTCCGTGGCAAGTCTGGTTCTGTCAGGAA
ACCGAGACAGAGCACGAGAGAAGGTTGTAAGGCTATGATTCATGTCAAGTACGATCGGTC
TGGTAAATGGGTCGTAACCAAATTCGTCAAAGAACATAACCATCCGCTTGTCGTGGAGCC
TCGACAGGCTCGTCAGAGTCTGGATGAGAAGGACAAGAGGATTCATGAGTTGACGGTTGA
GCTGCGGAACGAGAAGCGGTTATGTGCTGCGTATAAAGAGCAGTTAGATGCGTTTGCGAA
GATTGTTGAAGAGTATAGTAATCGGATGTCGAAGAAAGTTGAGAGTGTGGTTGAGAATTT
GAAGGAGTTTGAACGTATAGAGGTCGAGCTGTTGCATAGTAATGAAGATGATATATTTTA
AGCCAACTTTAAATGTGTGCTGCTTTTTTGGAATTTTTTTTTTTTGAATCTGTTGAGCTT
TCTTTACCGGCTTTCCCAGATCTCAGTGTAATCTGTTTGTTGTTGAATCTTAGTTTATGG
AATGTAATCTGAGAAACTTTGTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE78TF U 1
AF RR2BE78JQ C 210
BS 1 721 RR2BE78TF
BS 722 926 RR2BE78JQ

RD RR2BE78TF 721 0 0
GGGGATATCAAAAAACGCCCAATCAATTTCTAAAATTATCAATTTAGGTCACCTCTCTCT
CTCTCTCTCTGGCCAAGGATCATTTCTGATCGTCAAATCCAGTAAGCAAAAAGCTCTCAA
CTTTCATCAATTCCCGTCTCTGGGTTCCAATTTCATCTTCACAGTGACGATCTCTCTGAT
TCTGATGGCAGTGGAAGATGATGATTCGACCATAGAGGAGCCTCGCGAAGGCACTGAATT
CGAATCCGAGGAAGCGGCCAAGACGTTCTACGACGATTACTCCAGAAGTTTAGGCTTCGT
GATGCGTGTAATGTCTTGTCGGAGATCCGAGAGAGATGGAAGAATCCTTTCCCGGAGATT
CGGTTGTAATAAAGAAGGTCGCTGTGTTAGTGTCCGTGGCAAGTCTGGTTCTGTCAGGAA
ACCGAGACAGAGCACGAGAGAAGGTTGTAAGGCTATGATTCATGTCAAGTACGATCGGTC
TGGTAAATGGGTCGTAACCAAATTCGTCAAAGAACATAACCATCCGCTTGTCGTGGAGCC
TCGACAGGCTCGTCAGAGTCTGGATGAGAAGGACAAGAGGATTCATGAGTTGACGGTTGA
GCTGCGGAACGAGAAGCGGTTATGTGCTGCGTATAAAGAGCAGTTAGATGCGTTTGCGAA
GATTGTTGAAGAGTATAGTAATCGGATGTCGAAGAAAGTTGAGAGTGTGGTTGAGAATTT
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2BE78JQ 717 0 0
CCATAGAGGAGCCTCGCGAAGGCACTGAATTCGAATCCGAGGAAGCGGCCAAGACGTTCT
ACGACGATTACTCCAGAAGTTTAGGCTTCGTGATGCGTGTAATGTCTTGTCGGAGATCCG
AGAGAGATGGAAGAATCCTTTCCCGGAGATTCGGTTGTAATAAAGAAGGTCGCTGTGTTA
GTGTCCGTGGCAAGTCTGGTTCTGTCAGGAAACCGAGACAGAGCACGAGAGAAGGTTGTA
AGGCTATGATTCATGTCAAGTACGATCGGTCTGGTAAATGGGTCGTAACCAAATTCGTCA
AAGAACATAACCATCCGCTTGTCGTGGAGCCTCGACAGGCTCGTCAGAGTCTGGATGAGA
AGGACAAGAGGATTCATGAGTTGACGGTTGAGCTGCGGAACGAGAAGCGGTTATGTGCTG
CGTATAAGGAGCAGTTAGATGCGTTTGCGAAGATTGTTGAAGAGTATAGTAATCGGATGT
CGAAGAAAGTTGAGAGTGTGGTTGAGAATTTGAAGGAGTTTGAACGTATAGAGGTCGAGC
TGTTGCATAGTAATGAAGATGATATATTTTAAGCCAACTTTAAATGTGTGCTGCTTTTTT
GGAATTTTTTTTTTTTGAATCTGTTGAGCTTTCTTTACCGGCTTTCCCAGATCTCAGTGT
AATCTGTTTGTTGTTGAATCTTAGTTTATGGAATGTAATCTGAGAAACTTTGTAACC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL4428Contig1 1358 2 2 U
CCTTGACGGAGATTGGGGTTCTTCTTCTTCGATCACAAGTTAGAGCGTCTTTTAGATTCT
GAGATCGAGCTCTTAGTAGAAGGATCGTGGATTTAACAGCATACTAAATCTTTGAGTTCC
ACGTGATTCCCCGATGATGTCGCCGAAGCAAATCTCCGACGATCGAGGATCCTCACATTT
CCGGCATACCCCTTTCCAGATAACCCATGTCATTGGGAACTTCTTTAGGATATGGTCAGT
GTATTCCATGTACCGCTACTTGAATCAGACTGGAGCGCCTGTTGTTCTCTTCCTCTTCTG
CTGTCTGGTGCCCTCATCCTTGGTCTTCTTGATCCTTCAGAAACCATGGAAAGGAAGAGC
CCTTTCTAATCAGCAGATTGTACCTTCTCTTATCAATGGAGTCATCACTGCTCTGTACTT
CATCTTGTGGGGGAAGGGTCTTAAGTCTTGTGGACCTCTTAGAGCGATCTTGTCAGAGTA
CTCTGGTGCTGTTCTTGGAGTGCTTTCTGGAGTACTATATGGACGGAGAGGCCACGTGTG
GAAAAAGGTAGGTGGCCTTGTTGCTATGCTGGTAGCTCTTTTTTTCTTATCTCAAGGATG
GGCAACATCATCTCTCTCCCCATTTTCGTCGAAAGATAGTACTGACACCAAAGGGAAGAA
TTAGTAACAGAACAAGCACTAGGACTGATGGGAATGATGATACCCGTTGTTGCTGGAATC
TTATCAGCATTAAGGCGAGTTATTGCAAGGCGTGTTTCTCTTAAGAACCAGCAAAAGAAA
CGACTTCATGCGATAACCATTACTTTTGCAACCTGTTTTCTGTTTCCTTTGGCCATGTGG
GACCTTGTCACAGGGTCGTTTTCCGGGAAAGCTGTGGAGTTGCCATTTTTTGCGTGGGCT
TTCCTTGGCACCATTGTTTTCGGGATCATTTTAATATTCTATGTTGACAATATCGCAGAA
GAGAGATTGCATATGGTGTTTTCTTCCCCGAGGCATTTAATGGTAGTTGGAGCATGCATA
ATCGTCATGGAGATTGCTTACGAGATGGATTTTTCTCTTCCTGGTTTCATTGTCTGTTGC
TTAGTGTTAGGGTTTGGAATATACGAAGCAACATCTCTAGAACGCAGCAAAAAGGACTCT
TCGATTAAATCAGAAGATGGACCAGATGGAATCCTTGGTAACGACTTTGATACTTCTCCA
GTTCTTCCCATATAGGTTAGTGACGATGTCAATCTTTACCAGTTCTCACCATATTAACGA
GGTTACTTTTGAAATGTTCTTGTCCTTGACGATGTAAATCTTTGTCTGTTTTAATACTCT
CAATTCTTGTACCTTTTTGATTTTATCTTTGTTTAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY29TF U 1
AF RR2GY29JQ C 595
BS 1 649 RR2GY29TF
BS 650 1358 RR2GY29JQ

RD RR2GY29TF 649 0 0
CCTTGACGGAGATTGGGGTTCTTCTTCTTCGATCACAAGTTAGAGCGTCTTTTAGATTCT
GAGATCGAGCTCTTAGTAGAAGGATCGTGGATTTAACAGCATACTAAATCTTTGAGTTCC
ACGTGATTCCCCGATGATGTCGCCGAAGCAAATCTCCGACGATCGAGGATCCTCACATTT
CCGGCATACCCCTTTCCAGATAACCCATGTCATTGGGAACTTCTTTAGGATATGGTCAGT
GTATTCCATGTACCGCTACTTGAATCAGACTGGAGCGCCTGTTGTTCTCTTCCTCTTCTG
CTGTCTGGTGCCCTCATCCTTGGTCTTCTTGATCCTTCAGAAACCATGGAAAGGAAGAGC
CCTTTCTAATCAGCAGATTGTACCTTCTCTTATCAATGGAGTCATCACTGCTCTGTACTT
CATCTTGTGGGGGAAGGGTCTTAAGTCTTGTGGACCTCTTAGAGCGATCTTGTCAGAGTA
CTCTGGTGCTGTTCTTGGAGTGCTTTCTGGAGTACTATATGGACGGAGAGGCCACGTGTG
GAAAAAGGTAGGTGGCCTTGTTGCTATGCTGGTAGCTCTTTTTTTCTTATCTCAAGGATG
GGCAACATCATCTCTCTCCCCATTTTCGTCGAAAGATAGTACTGACACC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2GY29JQ 764 0 0
AGGATGGGCAACATCATCTCTCTCCCCATTTTCGTCGAAAGATAGTACTGACACCAAAGG
GAAGAATTAGTAACAGAACAAGCACTAGGACTGATGGGAATGATGATACCCGTTGTTGCT
GGAATCTTATCAGCATTAAGGCGAGTTATTGCAAGGCGTGTTTCTCTTAAGAACCAGCAA
AAGAAACGACTTCATGCGATAACCATTACTTTTGCAACCTGTTTTCTGTTTCCTTTGGCC
ATGTGGGACCTTGTCACAGGGTCGTTTTCCGGGAAAGCTGTGGAGTTGCCATTTTTTGCG
TGGGCTTTCCTTGGCACCATTGTTTTCGGGATCATTTTAATATTCTATGTTGACAATATC
GCAGAAGAGAGATTGCATATGGTGTTTTCTTCCCCGAGGCATTTAATGGTAGTTGGAGCA
TGCATAATCGTCATGGAGATTGCTTACGAGATGGATTTTTCTCTTCCTGGTTTCATTGTC
TGTTGCTTAGTGTTAGGGTTTGGAATATACGAAGCAACATCTCTAGAACGCAGCAAAAAG
GACTCTTCGATTAAATCAGAAGATGGACCAGATGGAATCCTTGGTAACGACTTTGATACT
TCTCCAGTTCTTCCCATATAGGTTAGTGACGATGTCAATCTTTACCAGTTCTCACCATAT
TAACGAGGTTACTTTTGAAATGTTCTTGTCCTTGACGATGTAAATCTTTGTCTGTTTTAA
TACTCTCAATTCTTGTACCTTTTTGATTTTATCTTTGTTTAGAG

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL4429Contig1 907 2 8 U
GGGGGTAGACTTGCAGTCTTGTAGAAACAAGGAAGGTACCTAGAAAAGAGAGAGTTAAAA
GAAATGGCTAAGTTCTTCATAAATCAAGCCAAGCAATACGCTGCAGCCCGACCTAATTAC
CCGATCCAGCTCTTTGAGTTCATCGCATCGAAAACACTATGCCACGACCTTGCATGGGAC
GTTGGTGCCGGAAGCGGCCAGGCCTCACGATCGCTAGCCGGGATGTACAAGAATGTGATT
GCTACGGACACAAGTTCCAAGCAACTTGAGTTTGCTGCAAAGATTCCCAACGTACGTTAC
GAGCTCACACCACCGGTGATGTCTTTGTCGGAGATCGAACAGCTAGTAGCGCCTGAATCA
TCCGTGGACTTGGTCACCGTCGCTCAAGCCCTTCACTGGTTCGACCTACCGACCTTTTAC
AGCAACGTGAAATACGTGCTCAAGAAACCAGACGGAGTATTCGCCGCCTGGTGTTACACC
AACCCTGAGGTCAACGCCACCGTGGACGAGGTTTTCCGGAGGTTCTACGAGGAAAAACTT
GGCCCGTATTGGGATAAAGCTAGGCGGCTTGTGGAGGATGGGTACAAGGGAATAGAGTTT
CCGTTTGAGAAGATCGTGGATGAGTCAACGGAAAGTCAAACTTTTCCTGTTAGGTTTGTG
ACGGAGAGAGATGGGGATTGAAGAGTTTCTGACGTATCTGAGGTCATCTTCTGCGTATCA
GACGGCTAAAGATAAGGGGGTTGAGCTTTTGACGGCGGAGATGGAAGGGGAGTTTGTTGG
TTCGTGGAAAGAAGATGGTGAAGAGAAGAAAGTTGTTAGGTTTCCTATCTATTTGTTGAT
TGGTAGAGTTGGAGGAGATCGTGTCTGAATATCTGTCTTCTTGATTTGAATTGTCAAAAA
GAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F428TF U 1
AF RR2F428JQ C 208
BS 1 639 RR2F428TF
BS 640 640 RR2F428JQ
BS 641 653 RR2F428TF
BS 654 654 RR2F428JQ
BS 655 702 RR2F428TF
BS 703 703 RR2F428JQ
BS 704 724 RR2F428TF
BS 725 907 RR2F428JQ

RD RR2F428TF 743 0 0
GGGGGTAGACTTGCAGTCTTGTAGAAACAAGGAAGGTACCTAGAAAAGAGAGAGTTAAAA
GAAATGGCTAAGTTCTTCATAAATCAAGCCAAGCAATACGCTGCAGCCCGACCTAATTAC
CCGATCCAGCTCTTTGAGTTCATCGCATCGAAAACACTATGCCACGACCTTGCATGGGAC
GTTGGTGCCGGAAGCGGCCAGGCCTCACGATCGCTAGCCGGGATGTACAAGAATGTGATT
GCTACGGACACAAGTTCCAAGCAACTTGAGTTTGCTGCAAAGATTCCCAACGTACGTTAC
GAGCTCACACCACCGGTGATGTCTTTGTCGGAGATCGAACAGCTAGTAGCGCCTGAATCA
TCCGTGGACTTGGTCACCGTCGCTCAAGCCCTTCACTGGTTCGACCTACCGACCTTTTAC
AGCAACGTGAAATACGTGCTCAAGAAACCAGACGGAGTATTCGCCGCCTGGTGTTACACC
AACCCTGAGGTCAACGCCACCGTGGACGAGGTTTTCCGGAGGTTCTACGAGGAAAAACTT
GGCCCGTATTGGGATAAAGCTAGGCGGCTTGTGGAGGATGGGTACAAGGGAATAGAGTTT
CCGTTTGAGAAGATCGTGGATGAGTCAACGGAAAGTCAA*CTTTTCCTGTTAG*TTTGTG
ACGGAGAGAGATGGGGATTGAAGAGTTTCTGACGTATCTGAG*TCATCTTCTGCGTATCA
GACG
CTAAGATAGGGGTTGAGCT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2F428JQ 700 0 0
CGATCGCTAGCCGGGATGTACAAGAATGTGATTGCTACGGACACAAGTTCCAAGCAACTT
GAGTTTGCTGCAAAGATTCCCAACGTACGTTACGAGCTCACACCACCGGTGATGTCTTTG
TCGGAGATCGAACAGCTAGTAGCGCCTGAATCATCCGTGGACTTGGTCACCGTCGCTCAA
GCCCTTCACTGGTTCGACCTACCGACCTTTTACAGCAACGTGAAATACGTGCTCAAGAAA
CCAGACGGAGTATTCGCCGCCTGGTGTTACACCAACCCTGAGGTCAACGCCACCGTGGAC
GAGGTTTTCCGGAGGTTCTACGAGGAAAAACTTGGCCCGTATTGGGATAAAGCTAGGCGG
CTTGTGGAGGATGGGTACAAGGGAATAGAGTTTCCGTTTGAGAAGATCGTGGATGAGTCA
ACGGAAAGTCAAACTTTTCCTGTTAGGTTTGTGACGGAGAGAGATGGGGATTGAAGAGTT
TCTGACGTATCTGAGGTCATCTTCTGCGTATCAGACGGCTAAAGATAAGGGGGTTGAGCT
TTTGACGGCGGAGATGGAAGGGGAGTTTGTTGGTTCGTGGAAAGAAGATGGTGAAGAGAA
GAAAGTTGTTAGGTTTCCTATCTATTTGTTGATTGGTAGAGTTGGAGGAGATCGTGTCTG
AATATCTGTCTTCTTGATTTGAATTGTCAAAAAGAGTTCC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL4430Contig1 567 2 1 U
GGACTAAACTAAAGAGGAAGAGGAACAAAGAGAAACAATGGAGTCTCCGAAGAAGATAGC
TCATGAGATCGGTGGTGTCAAGAGAGACGCTCTTCGATTTGGTCTCAACGGCGTTAAGAG
CGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCATCTTACGAATCTGGAAAGAGATCGCACTA
GGTGATGAAGAGGACGATCATTGGACATACCTACGGGACTGCACTTCCTTTGAAGATGGA
TATGGACAGGCAAATTCTCTCTAGGTTTCAGAGACCTCCTGGACCAATTCCTTCGTCAAT
GCTCGGTTTAGAAGTCTACACTGGAGCCATTGATGACTTTGGTTTTGAGGATTACTTGAA
TGACCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCCGTAGACTTCCACCACGGGATGGAAGTTCG
TCTTGGCATGTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGTTTCATGTAAGGACCCCTATCATGGGT
GGTTTTTTATTGCATGTTATGTCTTTTTAGCTTTTGAATGATGAATCAAGTTGGATCGTT
TTATAAACTTCTTTCTACTTGTACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EE94TF U 1
AF RR2EE94JQ C 94
BS 1 567 RR2EE94TF

RD RR2EE94TF 567 0 0
GGACTAAACTAAAGAGGAAGAGGAACAAAGAGAAACAATGGAGTCTCCGAAGAAGATAGC
TCATGAGATCGGTGGTGTCAAGAGAGACGCTCTTCGATTTGGTCTCAACGGCGTTAAGAG
CGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCATCTTACGAATCTGGAAAGAGATCGCACTA
GGTGATGAAGAGGACGATCATTGGACATACCTACGGGACTGCACTTCCTTTGAAGATGGA
TATGGACAGGCAAATTCTCTCTAGGTTTCAGAGACCTCCTGGACCAATTCCTTCGTCAAT
GCTCGGTTTAGAAGTCTACACTGGAGCCATTGATGACTTTGGTTTTGAGGATTACTTGAA
TGACCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCCGTAGACTTCCACCACGGGATGGAAGTTCG
TCTTGGCATGTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGTTTCATGTAAGGACCCCTATCATGGGT
GGTTTTTTATTGCATGTTATGTCTTTTTAGCTTTTGAATGATGAATCAAGTTGGATCGTT
TTATAAACTTCTTTCTACTTGTACTCC

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2EE94JQ 474 0 0
TCGATTTGGTCTCAACGGCGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCATC
TTACGAATCTGGAAAGAGATCGCACTAGGTGATGAAGAGGACGATCATTGGACATACCTA
CGGGACTGCACTTCCTTTGAAGATGGATATGGACAGGCAAATTCTCTCTAGGTTTCAGAG
ACCTCCTGGACCAATTCCTTCGTCAATGCTCGGTTTAGAAGTCTACACTGGAGCCATTGA
TGACTTTGGTTTTGAGGATTACTTGAATGACCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCCGT
AGACTTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATGTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAG
TTTCATGTAAGGACCCCTATCATGGGTGGTTTTTTATTGCATGTTATGTCTTTTTAGCTT
TTGAATGATGAATCAAGTTGGATCGTTTTATAAACTTCTTTCTACTTGTACTCC

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 2

CO CL4431Contig1 871 2 4 U
GCAAGAATCTGCCAAAGTCAAGTGCCATCAAGCTCATTGATTTTGGAAGTACGACCTTTG
AACATCAAGATCATAACTATATTGTATCCACTAGGCATTACCGCGCACCAGAAGTTATCC
TAGGGGTTGGATGGAACTATCCATGTGACCTGTGGAGTATTGGTTGCATACTTGTTGAAC
TTTGTTCGGGAGAGGCACTTTTCCAAACGCATGAAAACTTGGAGCATTTGGCCATGATGG
AAAGGGTCCTAGGACCATTGCCATCTCATATGGTGCTCAGAGCCGACCGGCGCTCTGAGA
GATACTTCAGGAGAGGTGCAAAGTTAGATTGGCCTGAAGGTGCAACGTCGAGAGACAGCT
TGAAAGCAGTATGGAAACTTCCCCGGTTGCCGAACCTGATCATGCAGCATGTGGATCATT
CGGCGGGTGATCTGATAGATCTGTTACAAGGGCTGCTTCGGTATGAACCAACGGAGAGGC
TCAAGGCAAGGGAAGCACTGAGCCATCCCTTCTTCACAAGAAGCCGGGAACAGAGTATTC
CCTTTAACCCAACCCCTCATCCATTTTTATATAACCGCAAGAACTAATAAGAAGAAAAGC
AGATGAATGTTTGGGGGGATTAAAAGATCTGGATCTTCTGGTTTCTTCATTTCTCTTGGT
GTTTTTTGTAGCCATGTATGTTATACATAATTTCATGTATAGAAATGAAAAGAAAGAAGG
AAAATGCCTTTGTACCTTATTTCGTGTGTCTGTTGTTTTTTTTGTTTCTTTGGGTTCGGT
TTCTGACCACGACCGACCTAGATTGTTCCGTGGTTGTTCAAAAGTGTTACTACAGTTTTT
TACACTCATTAATGTTGAATGTGTGTTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU59TF U 1
AF RR2BU59JQ C 642
BS 1 666 RR2BU59TF
BS 667 667 RR2BU59JQ
BS 668 706 RR2BU59TF
BS 707 871 RR2BU59JQ

RD RR2BU59TF 706 0 0
GCAAGAATCTGCCAAAGTCAAGTGCCATCAAGCTCATTGATTTTGGAAGTACGACCTTTG
AACATCAAGATCATAACTATATTGTATCCACTAGGCATTACCGCGCACCAGAAGTTATCC
TAGGGGTTGGATGGAACTATCCATGTGACCTGTGGAGTATTGGTTGCATACTTGTTGAAC
TTTGTTCGGGAGAGGCACTTTTCCAAACGCATGAAAACTTGGAGCATTTGGCCATGATGG
AAAGGGTCCTAGGACCATTGCCATCTCATATGGTGCTCAGAGCCGACCGGCGCTCTGAGA
GATACTTCAGGAGAGGTGCAAAGTTAGATTGGCCTGAAGGTGCAACGTCGAGAGACAGCT
TGAAAGCAGTATGGAAACTTCCCCGGTTGCCGAACCTGATCATGCAGCATGTGGATCATT
CGGCGGGTGATCTGATAGATCTGTTACAAGGGCTGCTTCGGTATGAACCAACGGAGAGGC
TCAAGGCAAGGGAAGCACTGAGCCATCCCTTCTTCACAAGAAGCCGGGAACAGAGTATTC
CCTTTAACCCAACCCCTCATCCATTTTTATATAACCGCAAGAACTAATAAGAAGAAAAGC
AGATGAATGTTTGGGGGGATTAAAAGATCTGGATCTTCTGGTTTCTTCATTTCTCTTGGT
GTTTTT*GTAGCCATGTATGTTATACATAATTTCATGTATAGAAAT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2BU59JQ 230 0 0
TTTT
TTCATTTCTCTTGGTGTTTTTTGTAGCCATGTATGTTATACATAATTTCATGTATAGAAA
TGAAAAGAAAGAAGGAAAATGCCTTTGTACCTTATTTCGTGTGTCTGTTGTTTTTTTTGT
TTCTTTGGGTTCGGTTTCTGACCACGACCGACCTAGATTGTTCCGTGGTTGTTCAAAAGT
GTTACTACAGTTTTTTACACTCATTAATGTTGAATGTGTGTTTCAC

QA 5 230 5 230
DS 



AS 1 2

CO CL4432Contig1 590 2 4 U
TTTGATCATCTCTTTCTACTACGCACCATGGGATTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACA
AACACTTCCACTTCAAATCCTAATCTCTCTTCTGCCAGTACCCATAATAGTTCATACGTC
TACCACGGTCCACAAGTCCATACCGTTAGAGAGTCCATAACATCTTCTACAAACGCAACA
TTTTGTGTCTATCAATATCCAAATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCA
ACTATAGAGTCAGCTCAACGTTTCCGTTGCTAGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAA
TAAAATCACTGTTCCAGCCTTTCAGGTTTCGTTGTTAAGGAATGAAGTTAGAATTATGGG
AAAAATTGTCGGAGTTGTCTTGCAATCTTTGTTTATTTAGATATGGTGTGAGTGAGTGAG
TGCGGACCGGCTCAAACTTTACTCTCTTAAGAGTTAGGTTGTAATATAATATTACAACTT
GAATTTGTGTGCGTGTCTGTTTGTAGCATGTTAAAAGTACATATATGTAACCTGGCCGCT
TTTTTTTTTAATGTAACCTGGTCTTTATGTATGTAGTTTCTATTTTCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA53TF U 1
AF RR2DO26TF U 100
BS 1 179 RR2CA53TF
BS 180 180 RR2DO26TF
BS 181 214 RR2CA53TF
BS 215 590 RR2DO26TF

RD RR2CA53TF 214 0 0
TTTGATCATCTCTTTCTACTACGCACCATGGGATTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACA
AACACTTCCACTTCAAATCCTAATCTCTCTTCTGCCAGTACCCATAATAGTTCATACGTC
TACCACGGTCCACAAGTCCATACCGTTAGAGAGTCCATAACATCTTCTACAAACGCAACT
TTTTGTGTCTATCAATATCCAAATAATTCAGTCC

QA 1 214 1 214
DS 

RD RR2DO26TF 491 0 0
G
CCCATAATAGTTCATACGTCTACCACGGTCCACAAGTCCATACCGTTAGAGAGTCCATAA
CATCTTCTACAAACGCAACATTTTGTGTCTATCAATATCCAAATAATTCAGTCCTTGTAA
AACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGCTCAACGTTTCCGTTGCTAGTCTCTTG
CTTAAACCAAAGGCGATAAATAAAATCACTGTTCCAGCCTTTCAGGTTTCGTTGTTAAGG
AATGAAGTTAGAATTATGGGAAAAATTGTCGGAGTTGTCTTGCAATCTTTGTTTATTTAG
ATATGGTGTGAGTGAGTGAGTGCGGACCGGCTCAAACTTTACTCTCTTAAGAGTTAGGTT
GTAATATAATATTACAACTTGAATTTGTGTGCGTGTCTGTTTGTAGCATGTTAAAAGTAC
ATATATGTAACCTGGCCGCTTTTTTTTTTAATGTAACCTGGTCTTTATGTATGTAGTTTC
TATTTTCTGT

QA 2 491 2 491
DS 



AS 1 2

CO CL4433Contig1 511 2 1 U
GGAAAAGAAGAGCTGGGAAGCTACCAGGAGACACAACCTCTGTTCTCAAAGCATGGTGGC
AATCTCATTCCAAATGGCCTTACCCTACTGAGGAAGATAAGGCGAGGTTGGTGCAGGAGA
CAGGTTTGCAGCTAAAGCAGATAAACAATTGGTTCATCAATCAGAGAAAAAGGAACTGGC
ACAGCAATCCATCTTCTTCCACTGTCTTGAAGAACAAACGCAAAAGCAATGCAGGTGACA
ATAGCGGAAGGGAGCGTTTCACGTAGTAAACAACATATATATATTATCAAGTGAATTGTA
GCTGGATTGGTTGGGATTTGAAGCAAAGGGTTTTTAGGGGTTAAAATGAAGGAGAAGAAG
TTGGGGCTTATATAGATGAAGAGAGGGGACAGTATTAGAAAGTAACTTTTTGTGCAATTA
CAACATAGTTCGCAGTTTGGTTATGTTATCCCAATATGTTTATTAGTAGTAAGTACACAA
ATCCCAAAAGTAAAAAAAAGGTTGTCATTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H944JQ C 1
AF RR2H944TF U 1
BS 1 511 RR2H944TF

RD RR2H944JQ 511 0 0
GGAAAAGAAGAGCTGGGAAGCTACCAGGAGACACAACCTCTGTTCTCAAAGCATGGTGGC
AATCTCATTCCAAATGGCCTTACCCTACTGAGGAAGATAAGGCGAGGTTGGTGCAGGAGA
CAGGTTTGCAGCTAAAGCAGATAAACAATTGGTTCATCAATCAGAGAAAAAGGAACTGGC
ACAGCAATCCATCTTTTTCCACTGTCTTGAAGAACAAACGCAAAAGCAATGCAGGTGACA
ATAGCGGAAGGGAGCGTTTCACGTAGTAAACAACATATATATATTATCAAGTGAATTGTA
GCTGGATTGGTTGGGATTTGAAGCAAAGGGTTTTTAGGGGTTAAAATGAAGGAGAAGAAG
TTGGGGCTTATATAGATGAAGAGAGGGGACAGTATTAGAAAGTAACTTTTTGTGCAATTA
CAACATAGTTCGCAGTTTGGTTATGTTATCCCAATATGTTTATTAGTAGTAAGTACACAA
ATCCCAAAAGTAAAAAAAAGGTTGTCATTGT

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2H944TF 511 0 0
GGAAAAGAAGAGCTGGGAAGCTACCAGGAGACACAACCTCTGTTCTCAAAGCATGGTGGC
AATCTCATTCCAAATGGCCTTACCCTACTGAGGAAGATAAGGCGAGGTTGGTGCAGGAGA
CAGGTTTGCAGCTAAAGCAGATAAACAATTGGTTCATCAATCAGAGAAAAAGGAACTGGC
ACAGCAATCCATCTTCTTCCACTGTCTTGAAGAACAAACGCAAAAGCAATGCAGGTGACA
ATAGCGGAAGGGAGCGTTTCACGTAGTAAACAACATATATATATTATCAAGTGAATTGTA
GCTGGATTGGTTGGGATTTGAAGCAAAGGGTTTTTAGGGGTTAAAATGAAGGAGAAGAAG
TTGGGGCTTATATAGATGAAGAGAGGGGACAGTATTAGAAAGTAACTTTTTGTGCAATTA
CAACATAGTTCGCAGTTTGGTTATGTTATCCCAATATGTTTATTAGTAGTAAGTACACAA
ATCCCAAAAGTAAAAAAAAGGTTGTCATTGT

QA 1 511 1 511
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4435Contig1 884 2 4 U
GAACTCAATGACATTTACAGGTTCAAGACTGAGGAATACTCACACACGGCGGTGAACAAG
TTCAATGTGATGCCAGACTCAATACCAGAGTGGGTTTTCGACTTCATGCCTCTTAGGGGA
GGCTACTTTGTGGGTAATGTAGGACCTGCCCATATGGACTTCCGGTGGTTTGCACTCGGC
AACTGCGTCTCCATACTCTCGTCCTTGGCCACTCCAGATCAGTCCATGGCCATTATGGAC
CTTCTTGAGCACAGGTGGGCTGAGCTTGTAGGCGAGATGCCCCTCAAGATTTGTTATCCT
TGCCTCGAGGGCCACGAGTGGCGCATCATCACTGGCTGTGACCCCAAGAACACTCGGTGG
AGCTACCACAACGGAGGTTCTTGGCCAGTTTTGCTGTGGCAGCTAACGGCGGCGTGCATC
AAAACAGGAAGACCGCAGATCGCAAGACGTGCGGTTGACCTCATAGAATCGCGTCTTCAC
AGAGACTGTTGGCCAGAGTATTACGACGGTAAGCTTGGACGGTACGTGGGGAAACAGGCT
AGGAAATATCAGACATGGTCGATAGCAGGGTACTTAGTGGCTAAAATGTTGCTAGAAGAT
CCTTCACACATCGGTATGATCTCTCTCGATGAAGACAAACTTATGAAACCAGTTATCGAT
CTGCGTCTTGGCCGCAACTTTGAAAAACAGATCTCTGTTTCTGGTCTGTTCAGTACTTGT
CACTTTACAATTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTGTTTGGCTGTTTGTATGATAATGATAT
TAATAACTTCTGCGGAAGATGGGGTCATAGACTTTATTGATTGCTTCTTTCTTGCCTTGC
AAGTAAGAAGAAAAGAAATGGGAAAAGATCGTTTGCCGTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW34TF U 1
AF RR2GW34JQ C 210
BS 1 686 RR2GW34TF
BS 687 687 RR2GW34JQ
BS 688 722 RR2GW34TF
BS 723 884 RR2GW34JQ

RD RR2GW34TF 722 0 0
GAACTCAATGACATTTACAGGTTCAAGACTGAGGAATACTCACACACGGCGGTGAACAAG
TTCAATGTGATGCCAGACTCAATACCAGAGTGGGTTTTCGACTTCATGCCTCTTAGGGGA
GGCTACTTTGTGGGTAATGTAGGACCTGCCCATATGGACTTCCGGTGGTTTGCACTCGGC
AACTGCGTCTCCATACTCTCGTCCTTGGCCACTCCAGATCAGTCCATGGCCATTATGGAC
CTTCTTGAGCACAGGTGGGCTGAGCTTGTAGGCGAGATGCCCCTCAAGATTTGTTATCCT
TGCCTCGAGGGCCACGAGTGGCGCATCATCACTGGCTGTGACCCCAAGAACACTCGGTGG
AGCTACCACAACGGAGGTTCTTGGCCAGTTTTGCTGTGGCAGCTAACGGCGGCGTGCATC
AAAACAGGAAGACCGCAGATCGCAAGACGTGCGGTTGACCTCATAGAATCGCGTCTTCAC
AGAGACTGTTGGCCAGAGTATTACGACGGTAAGCTTGGACGGTACGTGGGGAAACAGGCT
AGGAAATATCAGACATGGTCGATAGCAGGGTACTTAGTGGCTAAAATGTTGCTAGAAGAT
CCTTCACACATCGGTATGATCTCTCTCGATGAAGACAAACTTATGAAACCAGTTATCGAT
CTGCGTCTTGGCCGCAACTTTGAAAA*CAGATCTCTGTTTCTGGTCTGTTCAGTACTTGT
CA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2GW34JQ 675 0 0
CACTCCAGATCAGTCCATGGCCATTATGGACCTTCTTGAGCACAGGTGGGCTGAGCTTGT
AGGCGAGATGCCCCTCAAGATTTGTTATCCTTGCCTCGAGGGCCACGAGTGGCGCATCAT
CACTGGCTGTGACCCCAAGAACACTCGGTGGAGCTACCACAACGGAGGTTCTTGGCCAGT
TTTGCTGTGGCAGCTAACGGCGGCGTGCATCAAAACAGGAAGACCGCAGATCGCAAGACG
TGCGGTTGACCTCATAGAATCGCGTCTTCACAGAGACTGTTGGCCAGAGTATTACGACGG
TAAGCTTGGACGGTACGTGGGGAAACAGGCTAGGAAATATCAGACATGGTCGATAGCAGG
GTACTTAGTGGCTAAAATGTTGCTAGAAGATCCTTCACACATCGGTATGATCTCTCTCGA
TGAAGACAAACTTATGAAACCAGTTATCGATCTGCGTCTTGGCCGCAACTTTGAAAAACA
GATCTCTGTTTCTGGTCTGTTCAGTACTTGTCACTTTACAATTTTTTGTTTTTGTTTTTG
TTTTGTTTGGCTGTTTGTATGATAATGATATTAATAACTTCTGCGGAAGATGGGGTCATA
GACTTTATTGATTGCTTCTTTCTTGCCTTGCAAGTAAGAAGAAAAGAAATGGGAAAAGAT
CGTTTGCCGTTTATC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL4436Contig1 1281 2 2 U
GGGAATCCAACAAAAAAACACACCAAGATTCTGCCGCAAATCGACGCAACTAATATTATT
TCCTCAGGACACCGTTACTACTTACTAGGTAGAGAGGAGGGAAGTGAGACTGAAGTTAGG
TTTGAGAATGGCGACGAGTAGAGTGGTGATGGTTGCGCAGGATGGTACCGGAGATTACCG
CTCCGTTCAAGACGCAATTGACTCGGTTCCTCTCGGAAACACGTGTCGGACTGTCATCCG
TATCTCACCGGGGATCTACAGGCAGCCGGTGTACGTGCCAAAGAGGAAAAACTTCATCAC
TTTCGCCGGAATCTCCCCGGAAATCACCGTTTTGACATGGAACAATACAGCTTCCAAGAT
TGAGCATCACCAGGTTTTCTTTCTTAAAGACCTTGCTAATTCTTAGCAGCATGTACAATC
ACTCTGTTTGTTTGTTGGTTTGACAGGCGTCTAGAGTGATAGGGACGGGAACGTTTGGGT
GCGGGAGTGTTATTGTTGAAGGTGAAGACTTTATTGCTGAGAACCTTACTTTTGAGAACT
CTTCTCCTGGGGGATCAGGGCAAGCTGTGGCGATAAGAGTCACTGCAGACCGTTGTGCCT
TTTATAACTGTCGCTTTCTCGGCTGGCAGGATACATTGTATCTGCATCATGGGAAACAGT
ATTTGAAAGATTGCTACGTAGAAGGAAGCGTGGATTTCATATTTGGAAACAGCACTGCGC
TCTTGGAACACTGCCATATCCACTGCAAATCTCAGGGTTTCATTACAGCACAAAGCCGCA
AAACGTCTCAAGAATCTACTGGTTACGTATTCCTAAGATGTGTGATCACGGGGAATGGTC
AGAGTGGGTATATGTATCTAGGAAGGCCATGGGGACCGTTTGGGAGAGTGGTTCTTGCAT
ACACTTACATGGATGCATGTGTTAGAAACGTTGGTTGGCATAACTGGGGAAACGCAGAGA
ATGAGAGAAGTGCTTGCTTTTATGAGTACAGGTGCTTTGGTCCGGGTAGCTGCTCGTCAG
GACGTGTTACATGGTCGAGAGAACTGATGGATGAAGAAGCTGGACACTTCCTGCATCATA
GTTTTGTGGATCCAAATCAGGACCGGCCTTGGTTGTGTCTGAGAATGGGAGTGAAGACAC
CGTATTCTGCGTAGAGTACTTGAAAAAGTGGTTGTATTTGTCACCGAGGCGTTGAATAAC
AAAGGAATATGGAGAACCCCACCTGGCTGTAAACCAATTACTTTAACTTGGAATTATATT
TGTCCTAGTGAATAAGATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF30TF U 1
AF RR2CF30JQ C 555
BS 1 720 RR2CF30TF
BS 721 1281 RR2CF30JQ

RD RR2CF30TF 720 0 0
GGGAATCCAACAAAAAAACACACCAAGATTCTGCCGCAAATCGACGCAACTAATATTATT
TCCTCAGGACACCGTTACTACTTACTAGGTAGAGAGGAGGGAAGTGAGACTGAAGTTAGG
TTTGAGAATGGCGACGAGTAGAGTGGTGATGGTTGCGCAGGATGGTACCGGAGATTACCG
CTCCGTTCAAGACGCAATTGACTCGGTTCCTCTCGGAAACACGTGTCGGACTGTCATCCG
TATCTCACCGGGGATCTACAGGCAGCCGGTGTACGTGCCAAAGAGGAAAAACTTCATCAC
TTTCGCCGGAATCTCCCCGGAAATCACCGTTTTGACATGGAACAATACAGCTTCCAAGAT
TGAGCATCACCAGGTTTTCTTTCTTAAAGACCTTGCTAATTCTTAGCAGCATGTACAATC
ACTCTGTTTGTTTGTTGGTTTGACAGGCGTCTAGAGTGATAGGGACGGGAACGTTTGGGT
GCGGGAGTGTTATTGTTGAAGGTGAAGACTTTATTGCTGAGAACCTTACTTTTGAGAACT
CTTCTCCTGGGGGATCAGGGCAAGCTGTGGCGATAAGAGTCACTGCAGACCGTTGTGCCT
TTTATAACTGTCGCTTTCTCGGCTGGCAGGATACATTGTATCTGCATCATGGGAAACAGT
ATTTGAAAGATTGCTACGTAGAAGGAAGCGTGGATTTCATATTTGGAAACAGCACTGCGC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2CF30JQ 727 0 0
TCAGGGCAAGCTGTGGCGATAAGAGTCACTGCAGACCGTTGTGCCTTTTATAACTGTCGC
TTTCTCGGCTGGCAGGATACATTGTATCTGCATCATGGGAAACAGTATTTGAAAGATTGC
TACGTAGAGGGAAGCGTGGATTTCATATTTGGAAACAGCACTGCGCTCTTGGAACACTGC
CATATCCACTGCAAATCTCAGGGTTTCATTACAGCACAAAGCCGCAAAACGTCTCAAGAA
TCTACTGGTTACGTATTCCTAAGATGTGTGATCACGGGGAATGGTCAGAGTGGGTATATG
TATCTAGGAAGGCCATGGGGACCGTTTGGGAGAGTGGTTCTTGCATACACTTACATGGAT
GCATGTGTTAGAAACGTTGGTTGGCATAACTGGGGAAACGCAGAGAATGAGAGAAGTGCT
TGCTTTTATGAGTACAGGTGCTTTGGTCCGGGTAGCTGCTCGTCAGGACGTGTTACATGG
TCGAGAGAACTGATGGATGAAGAAGCTGGACACTTCCTGCATCATAGTTTTGTGGATCCA
AATCAGGACCGGCCTTGGTTGTGTCTGAGAATGGGAGTGAAGACACCGTATTCTGCGTAG
AGTACTTGAAAAAGTGGTTGTATTTGTCACCGAGGCGTTGAATAACAAAGGAATATGGAG
AACCCCACCTGGCTGTAAACCAATTACTTTAACTTGGAATTATATTTGTCCTAGTGAATA
AGATACC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL4437Contig1 524 2 1 U
GGAGTTTCGTCATTTGTACTACTGTAGAAGGGGAGGAAGAAGAGGTATGGCGTGGAGAGG
AAACATATCGAAGTCTCTCAAAGAGCTGAGGATTCTCCTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAG
CGCTTCCACCAGGACGTTCGTGGAGAAGAATTACAAAGATTTGAAGTCCCTGAACCCTAA
ATTCCCTTTCCTGATCCGCGAATGCAGTGGGATCCAGCCTCAGATGTGGGCCAGATATGA
TATGGGTGCGGAGAGGTGTGTGAACTTGGATGGTATGAACGAGTCACAGATTCTCAAGTC
TCTTCAAGACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAAATGGTTGTTTTAAAAT
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTTAGATGATCCCGAATAAGATACAAACTTGAAACACA
TTCATCTGATCTCACTGTTCCTGTTATTCTATTACTTTGCAATTGCAACTAGTTGGTGTA
ATATCGCCTTTCATTTTTGTTTGTAATCCTTGGAACTTGTTATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H017JQ C 1
AF RR2H017TF U 1
BS 1 524 RR2H017TF

RD RR2H017JQ 524 0 0
GGAGTTTCGTCATTTGTACTACTGTAGAAGGGGAGGAAGAAGAGGTATGGCGTGGAGAGG
AAACATATCGAAGTTTTTCAAAGAGCTGAGGATTTTCCTCTGTCAATTTTCCCCAGCTAG
CGCTTCCACCAGGACGTTCGTGGAGAAGAATTACAAAGATTTGAAGTCCCTGAACCCTAA
ATTCCCTTTCCTGATCCGGGAATGCAGTGGGATCCAGCCTCAGATGTGGGCCAGATATGA
TATGGGTGCGGAGAGGTGTGTGAACTTGGATGGTATGAACGAGTCACAGATTTTCAAGTT
TTTTCAAGACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAAATGGTTGTTTTAAAAT
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTTAGATGATCCCGAATAAGATACAAACTTGAAACACA
TTCATCTGATCTCACTGTTCCTGTTATTCTATTACTTTGCAATTGCAACTAGTTGGTGTA
ATATCGCCTTTCATTTTTGTTTGTAATCCTTGGAACTTGTTATT

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2H017TF 524 0 0
GGAGTTTCGTCATTTGTACTACTGTAGAAGGGGAGGAAGAAGAGGTATGGCGTGGAGAGG
AAACATATCGAAGTCTCTCAAAGAGCTGAGGATTCTCCTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAG
CGCTTCCACCAGGACGTTCGTGGAGAAGAATTACAAAGATTTGAAGTCCCTGAACCCTAA
ATTCCCTTTCCTGATCCGCGAATGCAGTGGGATCCAGCCTCAGATGTGGGCCAGATATGA
TATGGGTGCGGAGAGGTGTGTGAACTTGGATGGTATGAACGAGTCACAGATTCTCAAGTC
TCTTCAAGACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAAATGGTTGTTTTAAAAT
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTTAGATGATCCCGAATAAGATACAAACTTGAAACACA
TTCATCTGATCTCACTGTTCCTGTTATTCTATTACTTTGCAATTGCAACTAGTTGGTGTA
ATATCGCCTTTCATTTTTGTTTGTAATCCTTGGAACTTGTTATT

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

CO CL4438Contig1 537 2 1 U
GACTCTACATCTCCCGCAAACGTCGCGGTTTCAAGCTACACGTTGGCTTGACCAGACAAC
AACTACTTCAAAAGGAATCACAGTGTGTATAGGTCGTGAGAGAAAGTGTTGGTTTTTCCC
TCTGTTTCGTCAAGAAGGTTTGAAGGTTTGGTCTTTTTTTATTTTCATTTGCTTTTTTCG
GGTGAATATAGAAGGGTTGAAGAAGGGTGAAAGAAAGGTGTGAAGAGAGTGAATGACTCT
TCAGAAGATTTAGAAGAAGAGTGAAAGTGCTCATCCTCTTTCTACTCCAAGTTCAATGCT
TTTTAAAATTTATATATACAAAGTGAGAGAGGAAGATAGACAGAAGGATAGTGTTTTGTG
GGATCTTCCTTTCTCTTAGAAAAAGGGTCGTGTGAGATTTTGCAAGGATTGTTTTTCATA
CCTTGTACCTCAAAAAAAAACATGTGTATGCCTTTGTCCTTTTGTGTTTTTATCTTTCTA
GGTGATCAAGTTGTAAAACTCAACAACAGTCCTTAATGAAATGTGATTTGGTTATCG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CF79TF U 1
AF RR2CF79JQ C 6
BS 1 537 RR2CF79TF

RD RR2CF79TF 537 0 0
GACTCTACATCTCCCGCAAACGTCGCGGTTTCAAGCTACACGTTGGCTTGACCAGACAAC
AACTACTTCAAAAGGAATCACAGTGTGTATAGGTCGTGAGAGAAAGTGTTGGTTTTTCCC
TCTGTTTCGTCAAGAAGGTTTGAAGGTTTGGTCTTTTTTTATTTTCATTTGCTTTTTTCG
GGTGAATATAGAAGGGTTGAAGAAGGGTGAAAGAAAGGTGTGAAGAGAGTGAATGACTCT
TCAGAAGATTTAGAAGAAGAGTGAAAGTGCTCATCCTCTTTCTACTCCAAGTTCAATGCT
TTTTAAAATTTATATATACAAAGTGAGAGAGGAAGATAGACAGAAGGATAGTGTTTTGTG
GGATCTTCCTTTCTCTTAGAAAAAGGGTCGTGTGAGATTTTGCAAGGATTGTTTTTCATA
CCTTGTACCTCAAAAAAAAACATGTGTATGCCTTTGTCCTTTTGTGTTTTTATCTTTCTA
GGTGATCAAGTTGTAAAACTCAACAACAGTCCTTAATGAAATGTGATTTGGTTATCG

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2CF79JQ 532 0 0
TACATTTCCCGCAAACGTCGCGGTTTCAAGCTACACGTTGGCTTGACCAGACAACAACTA
CTTCAAAAGGAATCACAGTGTGTATAGGTCGTGAGAGAAAGTGTTGGTTTTTCCCTTTGT
TTTGTCAAGAAGGTTTGAAGGTTTGGTCTTTTTTTATTTTCATTTGCTTTTTTCGGGTGA
ATATAGAAGGGTTGAAGAAGGGTGAAAGAAAGGTGTGAAGAGAGTGAATGACTTTTCAGA
AGATTTAGAAGAAGAGTGAAAGTGCTCATCCTCTTTTTACTCCAAGTTCAATGCTTTTTA
AAATTTATATATACAAAGTGAGAGAGGAAGATAGACAGAAGGATAGTGTTTTGTGGGATC
TTCCTTTTTCTTAGAAAAAGGGTCGTGTGAGATTTTGCAAGGATTGTTTTTCATACCTTG
TACCTCAAAAAAAAACATGTGTATGCCTTTGTCCTTTTGTGTTTTTATCTTTCTAGGTGA
TCAAGTTGTAAAACTCAACAACAGTCCTTAATGAAATGTGATTTGGTTATCG

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL4439Contig1 629 2 2 U
CATGAAACAAAGGTTATACGAGAAAACTATAAATCTAATACAAAGGTTATACACAAACCC
CAACTATGATGATTCATCCCTATTGACAAATAATTTAAAGAAGAGAAAAAAAAACAAAAA
TCAAAACCTAGAATAATATCACAATAATACCTTAAGCAAATTTATAACTGGAAAAATATT
CAAATCTCTCATACTACTAATACTCACCACACACATTCCAGAAGGTTAAACTTATAATCA
AATATCAACCTAACTGGTTATTGTCTTATTCCTCTTCTTCTTGTTTCATCATCATCATCA
TACACCACTCGGCATCGTCTTTAACTCATGCAATGTAGCTCTAATCTGCTCTTGAACCAG
CTCTAATCTCCTCGAATACACTTCCAGCTCCAGAATCTGTTGCTTCCTCCACCGCTCATC
ATTCACCGCCTTGTTCCCACCTCCTCCTTCCACACCATAACCTAACGGCCGTGTAAACAT
GGGGCTTAACGAGCCAAAGCCATGTTGATCAGATGTCATGTTTCGGAGAAGGGAAAGGAA
AAACAGATCTGGCTTCAGCTCTTGCGATCAGGTTAAGACCAAAGGGAACCAGATGCGGTT
GGGAGAGAGAGAGAAGTGTTGGGTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EQ13TF C 1
AF RR2EQ13JQ U 7
BS 1 6 RR2EQ13TF
BS 7 629 RR2EQ13JQ

RD RR2EQ13TF 629 0 0
CATGAAACAAAGGTTATACGAGAAAACTATAAATCTAATACAAAGGTTATACACAAACCC
CAACTATGATGATTCATCCCTATTGACAAATAATTTAAAGAAGAGAAAAAAAAACAAAAA
TCAAAACCTAGAATAATATCACAATAATACCTTAAGCAAATTTATAACTGGAAAAATATT
CAAATCTCTCATACTACTAATACTCACCACACACATTCCAGAAGGTTAAACTTATAATCA
AATATCAACCTAACTGGTTATTGTCTTATTCCTCTTCTTCTTGTTTCATCATCATCATCA
TACACCACTCGGCATCGTCTTTAACTCATGCAATGTAGCTCTAATCTGCTCTTGAACCAG
CTCTAATCTCCTCGAATACACTTCCAGCTCCAGAATCTGTTGCTTCCTCCACCGCTCATC
ATTCACCGCCTTGTTCCCACCTCCTCCTTCCACACCATAACCTAACGGCCGTGTAAACAT
GGGGCTTAACGAGCCAAAGCCATGTTGATCAGATGTCATGTTTCGGAGAAGGGAAAGGAA
AAACAGATCTGGCTTCAGCTCTTGCGATCAGGTTAAGACCAAAGGGAACCAGATGCGGTT
GGGAGAGAGAGAGAAGTGTTGGGTTCCCC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2EQ13JQ 623 0 0
ACAAAGGTTATACGAGAAAACTATAAATCTAATACAAAGGTTATACACAAACCCCAACTA
TGATGATTCATCCCTATTGACAAATAATTTAAAGAAGAGAAAAAAAAACAAAAATCAAAA
CCTAGAATAATATCACAATAATACCTTAAGCAAATTTATAACTGGAAAAATATTCAAATC
TCTCATACTACTAATACTCACCACACACATTCCAGAAGGTTAAACTTATAATCAAATATC
AACCTAACTGGTTATTGTCTTATTCCTCTTCTTCTTGTTTCATCATCATCATCATACACC
ACTCGGCATCGTCTTTAACTCATGCAATGTAGCTCTAATCTGCTCTTGAACCAGCTCTAA
TCTCCTCGAATACACTTCCAGCTCCAGAATCTGTTGCTTCCTCCACCGCTCATCATTCAC
CGCCTTGTTCCCACCTCCTCCTTCCACACCATAACCTAACGGCCGTGTAAACATGGGGCT
TAACGAGCCAAAGCCATGTTGATCAGATGTCATGTTTCGGAGAAGGGAAAGGAAAAACAG
ATCTGGCTTCAGCTCTTGCGATCAGGTTAAGACCAAAGGGAACCAGATGCGGTTGGGAGA
GAGAGAGAAGTGTTGGGTTCCCC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL4440Contig1 1048 2 6 U
GCGGGATCCCGATCACGAAGATCCTCAAGCTCTCGAAGCTCAAGACGGATTACAAGGCCT
TCGAGGCGAAGAGGAAGCTCTGCGACTCTTACGAGATGTTCTTCGCGGATCGGAGAGTGA
TTCCTCTGCTCCCGAGGCTGATCGGGAAGAAGCTTTTTGCGAGCAAGAAGATCCCCGCGG
CGGTTGATTTGAGGCATAAGAACTGGGAGGAGCAGATTGGGAAGGCTTGTGGCTCTGCTA
TGTTTTTCGTTAGGACGGGGACGTGTAGTGTGGTTAAAGTTGGGAAGCTGTCGATGGAGA
GCGATGAGGTTGTTGAGAATGTGATGGCGACGCTGAACGGTGTCGTTGAGGTGTTGCCTG
GTCAGTGGAAGTATGTTAGGTCTTTGCATTTGAAGCTGTCTGAGAGCTTGGCTTTGCCTG
TTTATCAGAGTGTTCCTGATTTGAAGCTGAAGATCGATGCTTTTGGAAGTGAGAGCGGTG
TTGTTGTTGAGGAAGAGAACAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGGTGAAAGTGTTG
TTGTTGATGGTGGTGAGAAGAGTGATGCAGTGAAGGGGAAGAAGAAGAAAGGAAGGATTC
ATGAGGTTAGGTATATGGATAGTAATGTATCTGAGGTGCTTGATGAAGACGAGATTGGTG
ATGTTGAGGTTAGTAATGAGATTGTTGAGTCTGGTGGTGATATGGAGAAGAAGATGAAGA
AGAGGAAGAAGGAGGCTGAGAAACCCAAGAAGAAAGTGGCCAAGGGGAAGCTGAAGGAGA
AGAGTAAGGATGAGTTAAAGCCGAAGAAGAAGACAAAGATTACTAAACAAGAGTCTGGCG
GTGGTTTGAAACCGAAGAGTGTGCTTAGAAAGTAATGCAATAGAAGATCAGGGAGTTAAC
TCTTTTTTGCTTCTCTTACATGATTTATGTTTTTATCTTAGTGCTGGTTACATTTTGGTG
TCTTTCTATCGTGTACTGCTGCTTCTCTTGAACATCTTAACCGGTGTGAATGTACCCTTC
TACTTTATAAACGAGTGTTTTTATCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C326TF U 1
AF RR2C326JQ C 256
BS 1 271 RR2C326TF
BS 272 272 RR2C326JQ
BS 273 670 RR2C326TF
BS 671 671 RR2C326JQ
BS 672 708 RR2C326TF
BS 709 1048 RR2C326JQ

RD RR2C326TF 717 0 0
GCGGGATCCCGATCACGAAGATCCTCAAGCTCTCGAAGCTCAAGACGGATTACAAGGCCT
TCGAGGCGAAGAGGAAGCTCTGCGACTCTTACGAGATGTTCTTCGCGGATCGGAGAGTGA
TTCCTCTGCTCCCGAGGCTGATCGGGAAGAAGCTTTTTGCGAGCAAGAAGATCCCCGCGG
CGGTTGATTTGAGGCATAAGAACTGGGAGGAGCAGATTGGGAAGGCTTGTGGCTCTGCTA
TGTTTTTCGTTAGGACGGGGACGTGTAGTGTTGTTAAAGTTGGGAAGCTGTCGATGGAGA
GCGATGAGGTTGTTGAGAATGTGATGGCGACGCTGAACGGTGTCGTTGAGGTGTTGCCTG
GTCAGTGGAAGTATGTTAGGTCTTTGCATTTGAAGCTGTCTGAGAGCTTGGCTTTGCCTG
TTTATCAGAGTGTTCCTGATTTGAAGCTGAAGATCGATGCTTTTGGAAGTGAGAGCGGTG
TTGTTGTTGAGGAAGAGAACAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGGTGAAAGTGTTG
TTGTTGATGGTGGTGAGAAGAGTGATGCAGTGAAGGGGAAGAAGAAGAAAGGAAGGATTC
ATGAGGTTAGGTATATGGATAGTAATGTATCTGAGGTGCTTGATGAAGACGAGATTGGTG
ATGTTGAGGT*AGTAATGAGATTGTTGAGTCTGGTGGTGATATGGAGA
GAGATGAGA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2C326JQ 793 0 0
CGGGGACGTGTAGTGTG**TAAAGTTGGGAAGCTGTCGATGGAGAGCGATGAGGTTGTTG
AGAATGTGATGGCGACGCTGAACGGTGTCGTTGAGGTGTTGCCTGGTCAGTGGAAGTATG
TTAGGTCTTTGCATTTGAAGCTGTCTGAGAGCTTGGCTTTGCCTGTTTATCAGAGTGTTC
CTGATTTGAAGCTGAAGATCGATGCTTTTGGAAGTGAGAGCGGTGTTGTTGTTGAGGAAG
AGAACAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGGTGAAAGTGTTGTTGTTGATGGTGGTG
AGAAGAGTGATGCAGTGAAGGGGAAGAAGAAGAAAGGAAGGATTCATGAGGTTAGGTATA
TGGATAGTAATGTATCTGAGGTGCTTGATGAAGACGAGATTGGTGATGTTGAGGTTAGTA
ATGAGATTGTTGAGTCTGGTGGTGATATGGAGAAGAAGATGAAGAAGAGGAAGAAGGAGG
CTGAGAAACCCAAGAAGAAAGTGGCCAAGGGGAAGCTGAAGGAGAAGAGTAAGGATGAGT
TAAAGCCGAAGAAGAAGACAAAGATTACTAAACAAGAGTCTGGCGGTGGTTTGAAACCGA
AGAGTGTGCTTAGAAAGTAATGCAATAGAAGATCAGGGAGTTAACTCTTTTTTGCTTCTC
TTACATGATTTATGTTTTTATCTTAGTGCTGGTTACATTTTGGTGTCTTTCTATCGTGTA
CTGCTGCTTCTCTTGAACATCTTAACCGGTGTGAATGTACCCTTCTACTTTATAAACGAG
TGTTTTTATCTTG

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL4441Contig1 661 2 4 U
GGGTGAGAGAGAAGAAACAAAAAAAAAATGGACAAGAGTGGAGGAAGAAAGGTGATGGAT
GAGATAAGGAGCTTTGAGAAGGCAAATTTGTTCGATCTTGGCCATCCTCTTCTCAACCGC
ATCGCTGACTCTTTCGTCAAAGCCGCCGGTGTCGGAGCTTTACAAGCTGTGTCTAGGGAA
GCTTACTTTACGGTGGTTGATGGGGCAGGGTTTGACGCGAGCAACATGGGTCCACCTTCT
GAGAATGCCGGCAGCAAGAAACATAGGTTTCCTAATCTCAGAGGGGAAAGAAGCAAATCG
TTGGATGCATTTGTGAAGAACACAGGAAAAGAATCTCTCCAGTGGGGGCTTGCAGCTGGA
TTATACTCGGGTATAACGTATAGTATGAAGGAGACTCGTGGAGGAGCTCATGACTGGAGG
AATAGCGCCGTGGCTGGAGCATTAACGGGAGCAGCGATGGCTATGACGACCTCAGAGAGG
ACAAGCCATGAGCAAGTGTTTCAGTCTGCTCTTACAGGAGCAGCCATTTCCACTGCTGCT
AATCTCCTTTCTAGCGTTTTCTAGATGGACCCATTAAAAGTCTTGTTATTTGCATTAAGT
TTTAGCATAAACATGTGTCTTTTTATAAAACTTTTCTACGGATCTGTCAAGACTAGGCTC
T


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 

AF RR2ES06TF U 1
AF RR2ES06JQ C 1
BS 1 640 RR2ES06TF
BS 641 641 RR2ES06JQ
BS 642 656 RR2ES06TF
BS 657 661 RR2ES06JQ

RD RR2ES06TF 661 0 0
GGGTGAGAGAGAAGAAACAAAAAAAAAATGGACAAGAGTGGAGGAAGAAAGGTGATGGAT
GAGATAAGGAGCTTTGAGAAGGCAAATTTGTTCGATCTTGGCCATCCTCTTCTCAACCGC
ATCGCTGACTCTTTCGTCAAAGCCGCCGGTGTCGGAGCTTTACAAGCTGTGTCTAGGGAA
GCTTACTTTACGGTGGTTGATGGGGCAGGGTTTGACGCGAGCAACATGGGTCCACCTTCT
GAGAATGCCGGCAGCAAGAAACATAGGTTTCCTAATCTCAGAGGGGAAAGAAGCAAATCG
TTGGATGCATTTGTGAAGAACACAGGAAAAGAATCTCTCCAGTGGGGGCTTGCAGCTGGA
TTATACTCGGGTATAACGTATAGTATGAAGGAGACTCGTGGAGGAGCTCATGACTGGAGG
AATAGCGCCGTGGCTGGAGCATTAACGGGAGCAGCGATGGCTATGACGACCTCAGAGAGG
ACAAGCCATGAGCAAGTGTTTCAGTCTGCTCTTACAGGAGCAGCCATTTCCACTGCTGCT
AATCTCCTTTCTAGCGTTTTCTAGATGGACCCATTAAAAGTCTTGTTATTTGCATTAAGT
TTTAGCATAAACATGTGTCTTTTTATAAAACTTTTCTACG*ATCTGTCAAGACTAG
CTCTC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2ES06JQ 661 0 0
GGGTGAGAGAGAAGAAACAAAAAAAAAATGGACAAGAGTGGAGGAAGAAAGGTGATGGAT
GAGATAAGGAGCTTTGAGAAGGCAAATTTGTTCGATCTTGGCCATCCTCTTCTCAACCGC
ATCGCTGACTCTTTCGTCAAAGCCGCCGGTGTCGGAGCTTTACAAGCTGTGTCTAGGGAA
GCTTACTTTACGGTGGTTGATGGGGCAGGGTTTGACGCGAGCAACATGGGTCCACCTTCT
GAGAATGCCGGCAGCAAGAAACATAGGTTTCCTAATCTCAGAGGGGAAAGAAGCAAATCG
TTGGATGCATTTGTGAAGAACACAGGAAAAGAATCTCTCCAGTGGGGGCTTGCAGCTGGA
TTATACTCGGGTATAACGTATAGTATGAAGGAGACTCGTGGAGGAGCTCATGACTGGAGG
AATAGCGCCGTGGCTGGAGCATTAACGGGAGCAGCGATGGCTATGACGACCTCAGAGAGG
ACAAGCCATGAGCAAGTGTTTCAGTCTGCTCTTACAGGAGCAGCCATTTCCACTGCTGCT
AATCTCCTTTCTAGCGTTTTCTAGATGGACCCATTAAAAGTCTTGTTATTTGCATTAAGT
TTTAGCATAAACATGTGTCTTTTTATAAAACTTTTCTACGGATCTGTCAAGACTAGGCTC
T

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL4442Contig1 514 2 1 U
GGTTCTTGCCTCCGCTGCTCTCCCTTGCTTCTTGATCATTACCGAAAGAGTTTCTCCTCC
CGCTTCTCTGTTCTTTCCCTTCTTCTTGTTCCCCAGTATTCTCTAAGGCCACGTCAACTT
GAGATGATTCTTTCACATTGTTGGTTCCTTCCAACTGTCTCTCTTCCGTTGCCACATCTG
ATATTGAAGTCTTGTCAGGGTTTGAAACAGACATCCACCTCTCCAACCAGCTCCAAGCAG
AACTAGGCTTTGTGGGATCACATTTAATGCTAATAGGCTTCGTCTTGGGAGTTGACTCCA
ATAGCTATAATCAAAATGTGCAACAAAATGGATATACAAAAAAAAAAAATTGACTCTAAT
GTAGTGAAAAGAAACATACATGTTTAGCAAACTTGTTTTCAATAAGTTTTTGTGTTGCTG
CATTTGTCTCCGCCTTATCCTGAAACAAGAAACAGTATTAAAATTTCGCAGTTTTTTAAT
AGCAATTAAATGATATACTGAAAACAGGCATCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CH18JQ C 1
AF RR2CH18TF U 1
BS 1 514 RR2CH18TF

RD RR2CH18JQ 514 0 0
GGTTCTTGCCTCCGCTGCTCTCCCTTGCTTCTTGATCATTACCGAAAGAGTTTCTCCTCC
CGCTTTTCTGTTCTTTCCCTTCTTCTTGTTCCCCAGTATTCTCTAAGGCCACGTCAACTT
GAGATGATTCTTTCACATTGTTGGTTCCTTCCAACTGTCTTTCTTCCGTTGCCACATCTG
ATATTGAAGTCTTGTCAGGGTTTGAAACAGACATCCACCTCTCCAACCAGCTCCAAGCAG
AACTAGGCTTTGTGGGATCACATTTAATGCTAATAGGCTTCGTCTTGGGAGTTGACTCCA
ATAGCTATAATCAAAATGTGCAACAAAATGGATATACAAAAAAAAAAAATTGACTCTAAT
GTAGTGAAAAGAAACATACATGTTTAGCAAACTTGTTTTCAATAAGTTTTTGTGTTGCTG
CATTTGTCTCCGCCTTATCCTGAAACAAGAAACAGTATTAAAATTTCGCAGTTTTTTAAT
AGCAATTAAATGATATACTGAAAACAGGCATCTC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2CH18TF 514 0 0
GGTTCTTGCCTCCGCTGCTCTCCCTTGCTTCTTGATCATTACCGAAAGAGTTTCTCCTCC
CGCTTCTCTGTTCTTTCCCTTCTTCTTGTTCCCCAGTATTCTCTAAGGCCACGTCAACTT
GAGATGATTCTTTCACATTGTTGGTTCCTTCCAACTGTCTCTCTTCCGTTGCCACATCTG
ATATTGAAGTCTTGTCAGGGTTTGAAACAGACATCCACCTCTCCAACCAGCTCCAAGCAG
AACTAGGCTTTGTGGGATCACATTTAATGCTAATAGGCTTCGTCTTGGGAGTTGACTCCA
ATAGCTATAATCAAAATGTGCAACAAAATGGATATACAAAAAAAAAAAATTGACTCTAAT
GTAGTGAAAAGAAACATACATGTTTAGCAAACTTGTTTTCAATAAGTTTTTGTGTTGCTG
CATTTGTCTCCGCCTTATCCTGAAACAAGAAACAGTATTAAAATTTCGCAGTTTTTTAAT
AGCAATTAAATGATATACTGAAAACAGGCATCTC

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL4443Contig1 535 2 1 U
GGGATCTCTCCTCTGCCGCACGACAGGACAGTTGTTTCTCAATCTCTCTCTGCGAAAATG
GTGACTGCCAAGAAGACGAAGAGGTCTCACGAGGGAATCAACAGTAGGTTGGCTCTTGTG
ATGAAGAGTGGTAAATACACTCTTGGTTACAAGTCCGTCCTCAAGTCTCTCCGTGGCTCC
AAAGGGAAGCTTATTCTCATCTCTTCCAACTGCCCACCGTTGAGGAGATCGGAGATTGAG
TACTACGCAATGCTTGCCAAAGTTGGTGTTCACCACTACAATGGAAACAACGTTGATTTG
GGTACAGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTTTCTTGTCTGAGCATCGTTGATCCTGGTGAT
TCTGACATTATCAAGAGCATTCCTGGTGATCAGTGATATACCATTATCAATTTTGTTTTT
CCCCTACTTCTATGGATATTCTCAAAATTTATTAGCAAACAATCTTGTGTTTGGTGTTTT
GTTATTTTACATTATGAAAAGGATAGGAAAAAATATAAATGTTTTTTTTTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BV20TF U 1
AF RR2BV20JQ C 14
BS 1 535 RR2BV20TF

RD RR2BV20TF 535 0 0
GGGATCTCTCCTCTGCCGCACGACAGGACAGTTGTTTCTCAATCTCTCTCTGCGAAAATG
GTGACTGCCAAGAAGACGAAGAGGTCTCACGAGGGAATCAACAGTAGGTTGGCTCTTGTG
ATGAAGAGTGGTAAATACACTCTTGGTTACAAGTCCGTCCTCAAGTCTCTCCGTGGCTCC
AAAGGGAAGCTTATTCTCATCTCTTCCAACTGCCCACCGTTGAGGAGATCGGAGATTGAG
TACTACGCAATGCTTGCCAAAGTTGGTGTTCACCACTACAATGGAAACAACGTTGATTTG
GGTACAGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTTTCTTGTCTGAGCATCGTTGATCCTGGTGAT
TCTGACATTATCAAGAGCATTCCTGGTGATCAGTGATATACCATTATCAATTTTGTTTTT
CCCCTACTTCTATGGATATTCTCAAAATTTATTAGCAAACAATCTTGTGTTTGGTGTTTT
GTTATTTTACATTATGAAAAGGATAGGAAAAAATATAAATGTTTTTTTTTTTGAC

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2BV20JQ 522 0 0
TGCCGCACGACAGGACAGTTGTTTCTCAATCTCTTTTTGCGAAAATGGTGACTGCCAAGA
AGACGAAGAGGTCTCACGAGGGAATCAACAGTAGGTTGGCTCTTGTGATGAAGAGTGGTA
AATACACTCTTGGTTACAAGTCCGTCCTCAAGTCTCTCCGTGGCTCCAAAGGGAAGCTTA
TTTTCATTTCTTCCAACTGCCCACCGTTGAGGAGATCGGAGATTGAGTACTACGCAATGC
TTGCCAAAGTTGGTGTTCACCACTACAATGGAAACAACGTTGATTTGGGTACAGCTTGTG
GAAAGTACTTCCGTGTTTCTTGTCTGAGCATCGTTGATCCTGGTGATTCTGACATTATCA
AGAGCATTCCTGGTGATCAGTGATATACCATTATCAATTTTGTTTTTCCCCTACTTCTAT
GGATATTCTCAAAATTTATTAGCAAACAATCTTGTGTTTGGTGTTTTGTTATTTTACATT
ATGAAAAGGATAGGAAAAAATATAAATGTTTTTTTTTTTGAC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 2

CO CL4444Contig1 810 2 2 U
TTTTTGAGGCTTTGAATATCTCTGCTCTTTGGGATTTGCCTTCCATTCTCGTCTGCGAGA
ACAATCACTATGGGATGGGAACTGCTGAGTGGAGAGCTGCCAAGAGCCCATCTTACTACA
AGCGTGGTGATTACGTTCCTGGTTTGAAGGTAGATGGTATGGATGCATTTGCTGTCAAAC
AAGCGTGCAAATTTGCTAAGGAACATGCTTTGAAGAATGGACCAATAATTCTGGAGATGG
ACACATACAGGTACCACGGTCACTCCATGTCTGACCCTGGGAGCACATACCGTACAAGAG
ATGAGATATCTGGTGTGAGACAGGAACGAGACCCAATTGAGAGAATAAAGAAGCTGGTGC
TATCTCATGACCTAGCAACCGAGAAGGAGCTTAAGGATATGGAGAAGGAAATTAGAAAAG
AAGTAGATGACGCCATTGCCAAAGCTAAGGATTGCCCAATGCCAGAGCCTTCTGAGCTTT
TCACCAATGTGTACGTGAAGGGATTTGGCACTGAGTCATTTGGAGCTGACAGAAAAGAAG
TCAAAGCCGCGCTTCCATGAAGCTCTTGTTCGTTGAACTGCCACGTGGCATGACCAAGTT
CTTTGATAGGCAACCATGAAATAATAAAGAGGCTTTTTGGGCAGAGTGTTGTGTGCTCTG
TTCAAGGCCGTTGCGTGTTTTATTGTCCAAGTATCCTTTTCTTAGAGAGAAACATATGAC
TTTTGTGTTTTGTATCTAAGTTTGCTTCTGATTGTTTTCAATACAGATGAACAGCTTCCG
ATTGTTCTATCTCAGGATTCATATTCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR61TF U 1
AF RR2CR61JQ C 96
BS 1 605 RR2CR61TF
BS 606 810 RR2CR61JQ

RD RR2CR61TF 605 0 0
TTTTTGAGGCTTTGAATATCTCTGCTCTTTGGGATTTGCCTTCCATTCTCGTCTGCGAGA
ACAATCACTATGGGATGGGAACTGCTGAGTGGAGAGCTGCCAAGAGCCCATCTTACTACA
AGCGTGGTGATTACGTTCCTGGTTTGAAGGTAGATGGTATGGATGCATTTGCTGTCAAAC
AAGCGTGCAAATTTGCTAAGGAACATGCTTTGAAGAATGGACCAATAATTCTGGAGATGG
ACACATACAGGTACCACGGTCACTCCATGTCTGACCCTGGGAGCACATACCGTACAAGAG
ATGAGATATCTGGTGTGAGACAGGAACGAGACCCAATTGAGAGAATAAAGAAGCTGGTGC
TATCTCATGACCTAGCAACCGAGAAGGAGCTTAAGGATATGGAGAAGGAAATTAGAAAAG
AAGTAGATGACGCCATTGCCAAAGCTAAGGATTGCCCAATGCCAGAGCCTTCTGAGCTTT
TCACCAATGTGTACGTGAAGGGATTTGGCACTGAGTCATTTGGAGCTGACAGAAAAGAAG
TCAAAGCCGCGCTTCCATGAAGCTCTTGTTCGTTGAACTGCCACGTGGCATGACCAAGTT
CTTTG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2CR61JQ 715 0 0
GCTGCCAAGAGCCCATCTTACTACAAGCGTGGTGATTACGTTCCTGGTTTGAAGGTAGAT
GGTATGGATGCATTTGCTGTCAAACAAGCGTGCAAATTTGCTAAGGAACATGCTTTGAAG
AATGGACCAATAATTCTGGAGATGGACACATACAGGTACCACGGTCACTCCATGTCTGAC
CCTGGGAGCACATACCGTACAAGAGATGAGATATCTGGTGTGAGACAGGAACGAGACCCA
ATTGAGAGAATAAAGAAGCTGGTGCTATCTCATGACCTAGCAACCGAGAAGGAGCTTAAG
GATATGGAGAAGGAAATTAGAAAAGAAGTAGATGACGCCATTGCCAAAGCTAAGGATTGC
CCAATGCCAGAGCCTTTTGAGCTTTTCACCAATGTGTACGTGAAGGGATTTGGCACTGAG
TCATTTGGAGCTGACAGAAAAGAAGTCAAAGCCGCGCTTCCATGAAGCTCTTGTTCGTTG
AACTGCCACGTGGCATGACCAAGTTCTTTGATAGGCAACCATGAAATAATAAAGAGGCTT
TTTGGGCAGAGTGTTGTGTGCTCTGTTCAAGGCCGTTGCGTGTTTTATTGTCCAAGTATC
CTTTTCTTAGAGAGAAACATATGACTTTTGTGTTTTGTATCTAAGTTTGCTTCTGATTGT
TTTCAATACAGATGAACAGCTTCCGATTGTTCTATCTCAGGATTCATATTCAAGC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4446Contig1 920 2 14 U
GGGGATTAACAGCCAGGCCACATATAAATGATTTGGAACAAAGACAGCTTCTCAATCCTT
ACACGCTTGAAAATCAGGTAGAGATGCTTCTTGCTTTCTGTCATGAGATGGGATTCTCTT
CGGTAGCATTTGTTGGTCATGATGATGGAGGTCTGCTTGCTCTGAAAGCTGCACAGAGAT
TGATGACAACAAACGATCCCATCAAAGTTGTGGTCAGAGGAGTGGTTTTGCTAAATGTAA
GCTTGACAAGGGAAGTCGTTCCAGCTTTTGCAAGAATACTTCTGCACACATCACTACGGA
AGAAACACCTCGTTCGCCCTCTTTTACGCACTGAGATAGCTCAAGTAGTGAATCGTCGCG
CTTGGTATGATCCTGCAAAGATGACAACAGACGTCCTCAGACTATACAAGGCCCCGCTAC
ACGTAGAAGGCTGGGACGAGGCACTTCATGAGATAGGCAGACTCTCATCTGAAACGGTGC
TTGCACCTCAAAATGCAGCTTCGCTTCTTAAGGATGTGGAAAACCTGCCAGTATTAGTCA
TTGCTGGAGCCGAAGACGCTCTTGTCCCATTGAAGTCATCCCAAGCAATGGCGTCTAAAC
TCCTAAACTCTAGACTAGTTGCAGTCTCAGGATGTGGGCATCTACCACACGAGGAGTGTC
CCAAGGCGCTTCTTGCAGCCATGTCCCCTTTCATCACTAGACTTATACTCAGGCCAGATC
TCCAGAGTCAATAGCCAAACCACTTCCTCGTTTTGGTCGTCCTCTTAGCTTAACAATCAG
ACCCAAATTTTGAGGTCCTGTTAGGGTGAATTCATCATAGGATTTGTTGTAACCTTTCGT
TTCTTTGAGCGTGTTTCTTTTATTATTATTCACTTAAACATGAGTGTGGCACAAGTCTCT
GTAAATTATTTGGTTTGGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ48TF U 1
AF RR2DR62JQ C 197
BS 1 346 RR2FQ48TF
BS 347 347 RR2DR62JQ
BS 348 565 RR2FQ48TF
BS 566 566 RR2DR62JQ
BS 567 630 RR2FQ48TF
BS 631 631 RR2DR62JQ
BS 632 686 RR2FQ48TF
BS 687 687 RR2DR62JQ
BS 688 707 RR2FQ48TF
BS 708 708 RR2DR62JQ
BS 709 712 RR2FQ48TF
BS 713 713 RR2DR62JQ
BS 714 747 RR2FQ48TF
BS 748 920 RR2DR62JQ

RD RR2FQ48TF 747 0 0
GGGGATTAACAGCCAGGCCACATATAAATGATTTGGAACAAAGACAGCTTCTCAATCCTT
ACACGCTTGAAAATCAGGTAGAGATGCTTCTTGCTTTCTGTCATGAGATGGGATTCTCTT
CGGTAGCATTTGTTGGTCATGATGATGGAGGTCTGCTTGCTCTGAAAGCTGCACAGAGAT
TGATGACAACAAACGATCCCATCAAAGTTGTGGTCAGAGGAGTGGTTTTGCTAAATGTAA
GCTTGACAAGGGAAGTCGTTCCAGCTTTTGCAAGAATACTTCTGCACACATCACTACGGA
AGAAACACCTCGTTCGCCCTCTTTTACGCACTGAGATAGCTCAAGTGGTGAATCGTCGCG
CTTGGTATGATCCTGCAAAGATGACAACAGACGTCCTCAGACTATACAAGGCCCCGCTAC
ACGTAGAAGGCTGGGACGAGGCACTTCATGAGATAGGCAGACTCTCATCTGAAACGGTGC
TTGCACCTCAAAATGCAGCTTCGCTTCTTAAGGATGTGGAAAACCTGCCAGTATTAGTCA
TTGCTGGAGCCGAAGACGCTCTTGTTCCATTGAAGTCATCCCAAGCAATGGCGTCTAAAC
TCCTAAACTCTAGACTAGTTGCAGTCTCAG*ATGTGGGCATCTACCACACGAGGAGTGTC
CCAAGGCGCTTCTTGCAGCCATGTCCTCTTTCATCACTAGACTTATATTCAG*CCAGATC
TCCAGAGTCAATAGCCAAACCACTTCC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2DR62JQ 724 0 0
TCCCATCAAAGTTGTGGTCAGAGGAGTGGTTTTGCTTAATGTAAGCTTGTCAAGGGAAGT
CGTTCCAGCTTTTGCAAGAATACTTCTGCACACATCACTACGGAAGAAACACCTCGTTCG
CCCTCTTTTACGCACTGAGATAGCTCAAGTAGTGAATCGTCGCGCTTGGTATGATCCTGC
AAAGATGACAACAGACGTCCTCAGACTATACAAGGCCCCGCTACACGTAGAAGGCTGGGA
CGAGGCACTTCATGAGATAGGCAGACTCTCATCTGAAACGGTGCTTGCACCTCAAAATGC
AGCTTCGCTTCTTAAGGATGTGGAAGACCTGCCGGTATTAGTCATTGCTGGAGCCGAAGA
CGCTCTTGTCCCATTGAAGTCATCCCAAGCAATGGCGTCTAAACTCCTAAACTCTAGACT
AGTTGCAGTGTCAGGATGTGGGCATCTACCACACGAGGAGTGTCCCAAGGCGCTTCTTGC
AGCCATGTCCCCTTTCATCACTAGACTTATACTCAGGCCAGATCTCCAGAGTCAATAGCC
AAACCACTTCCTCGTTTTGGTCGTCCTCTTAGCTTAACAATCAGACCCAAATTTTGAGGT
CCTGTTAGGGTGAATTCATCATAGGATTTGTTGTAACCTTTCGTTTCTTTGAGCGTGTTT
CTTTTATTATTATTCACTTAAACATGAGTGTGGCACAAGTCTCTGTAAATTATTTGGTTT
GGAA

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL4447Contig1 588 2 1 U
GGAATATATACACACGTAACTTGCATAGTACACAACCTCAAACATCGACCAGACTCTTGA
AAACATGGTGATGGGTGCACCGTCGACGTCCTTGGATGAGATCAGAAAGGCACAAAGAGC
AGATGGTCCCGCAGGTATCTTGGCTATAGGCACGGCAAACCCTGCGAACCATGTGATCCA
AGCGGAGTACCCAGACTACTACTTCCGCATCACCAACAGTGAACACATGACTGACCTCAA
GGAGAAGTTCAAGCGCATGTGTGACAAGTCGATGATAAGGAAACGACACATGCCTGGTGC
TGACTACCAGCTCACCAAGCTCCTTGGTCTCCGTCCTTCCGTTAAGCGCCTCATGATGTA
CCAGCAAGGTTGCTTCGCCGGCGGCACTGTCCTCCGTCTCGCCAAGGACCTCGCTGAGAA
CAACCGTGGCGCACGTGTCCTTGTGGTCTGCTCCGAGATCACAGCTGTCACCTTCCGTGG
CCCTACCAACCACCTACACATACTTTTCCCAGCATCGTGTCTTTTAATGTTTTTCAGTTT
GATATGGAATATGTAATGCAATAACTAATGAAGTATGCATTTAGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DO58TF U 1
AF RR2DO58JQ C 44
BS 1 588 RR2DO58TF

RD RR2DO58TF 588 0 0
GGAATATATACACACGTAACTTGCATAGTACACAACCTCAAACATCGACCAGACTCTTGA
AAACATGGTGATGGGTGCACCGTCGACGTCCTTGGATGAGATCAGAAAGGCACAAAGAGC
AGATGGTCCCGCAGGTATCTTGGCTATAGGCACGGCAAACCCTGCGAACCATGTGATCCA
AGCGGAGTACCCAGACTACTACTTCCGCATCACCAACAGTGAACACATGACTGACCTCAA
GGAGAAGTTCAAGCGCATGTGTGACAAGTCGATGATAAGGAAACGACACATGCCTGGTGC
TGACTACCAGCTCACCAAGCTCCTTGGTCTCCGTCCTTCCGTTAAGCGCCTCATGATGTA
CCAGCAAGGTTGCTTCGCCGGCGGCACTGTCCTCCGTCTCGCCAAGGACCTCGCTGAGAA
CAACCGTGGCGCACGTGTCCTTGTGGTCTGCTCCGAGATCACAGCTGTCACCTTCCGTGG
CCCTACCAACCACCTACACATACTTTTCCCAGCATCGTGTCTTTTAATGTTTTTCAGTTT
GATATGGAATATGTAATGCAATAACTAATGAAGTATGCATTTAGTGTG

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2DO58JQ 545 0 0
ATT
GACCAGACTTTTGAAAACATGGTGATGGGTGCACCGTCGACGTCCTTGGATGAGATCAGA
AAGGCACAAAGAGCAGATGGTCCCGCAGGTATTTTGGCTATAGGCACGGCAAACCCTGCG
AACCATGTGATCCAAGCGGAGTACCCAGACTACTACTTCCGCATCACCAACAGTGAACAC
ATGACTGACCTCAAGGAGAAGTTCAAGGGCATGTGTGACAAGTCGATGATAAGGAAACGA
CACATGCCTGGTGCTGACTACCAGCTCACCAAGCTCCTTGGTTTCCGTCCTTCCGTTAAG
CGCCTCATGATGTACCAGCAAGGTTGCTTTGCCGGGGGCACTGTCCTCCGTTTCGCCAAG
GACCTCGCTGAGAACAACCGTGGCGCACGTGTCCTTGTGGTTTGCTCCGAGATCACAGCT
GTCACCTTCCGTGGCCCTACCAACCACCTACACATACTTTTCCCAGCATCGTGTTTTTTA
ATGTTTTTCAGTTTGATATGGAATATGTAATGCAATAACTAATGAAGTATGCATTTAGTG
TG

QA 4 545 4 545
DS 



AS 1 2

CO CL4448Contig1 1126 2 4 U
GATTGTTGATTTTATATTACAGAACTCTGGGCAGAAAGACTTCAATTTTAATCCCTCTTT
TCGTGATCCCTTCACGGGCGCAAATGCTTATGTTCCTGGGCAAGCTTCTCATTCAGCTGC
AACACCGGCAAAGCCTTTATACAAGCACATTCCTAAAAGAGGAGTGCTAGTTTTTGATGT
TGCTCAATATGACGGAATCCTGAAAAAGATGACAGAGTTTAACAACACTCTACGATCTGA
CCCAGTAAATACTGACAAGTCCATGACAGAAACCGAAGTATCCAGAGTGGGCTCAATCGT
TAAGATACTCAAGGACACATCACATTACCACGCTACCAGTTTTTCTGACATCGATATCGC
TTTGCTTTTGAAAGTGATACAAGCATGGCCACCTGCGATGATGTTTCCGGCTACTGATTT
AGTCAGGATGCTCGTTTTGCATCCTCATGGAGCAAGCCTACTTATTAAGCATGTGGAAAA
CAACAATGATCTGCTTCTGGATGTTATAAAGAAAGTCACAGAAGATTCGGCTCTTCCTGC
AAATCTTCTTACAACTGTTCGTGTCCTTGTTAATCTATTCAAGAATCCTTCATTTCATTA
CTGGCTACAGAAGCATCATAGTCTAATTCTTGATGCCTTCTCAAACTGTTATTCATCACC
AAATAAGAATCTGCAGTTGGCGTATTCGACGTTGCTTCTCAATTATGCAGTGCTACTAAT
AGAGAAGAAAGATGAAGAAGGCCAAGCTCAAGTCCTTTCTGCAGCATTGCAGATTGCAGA
AGAGGAAGCTGCAGGTGTTGATTCCAAGTTCCGGAGTTTGGTAGCAATCGGCTCGCTGAT
GCTTGAAGGGCTCGTGAAGAAGACAGCGATAGATTTTGAGGTGGAGAGCATTGCCAAATC
AGCAAAGGCATCTAAGGAAGCTAAGATTGTGGAAGTTGGTGCTGATATCGATCTTCTAAT
TCGCCAGCCTTAAAACGGAGTCTTCTGAGATTAGGATCTCTTACTTGAAACGTTTCTAGC
AGAGTTTCAGATTTCTGAATACATATTTGAATATTAGTCAGATATGAAAGTGACTTTGCT
CTTGTGAACAGAATTTGAATATTTTTTTTATAAGAACTTAAATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES34TF U 1
AF RR2ES34JQ C 234
BS 1 738 RR2ES34TF
BS 739 739 RR2ES34JQ
BS 740 771 RR2ES34TF
BS 772 1126 RR2ES34JQ

RD RR2ES34TF 771 0 0
GATTGTTGATTTTATATTACAGAACTCTGGGCAGAAAGACTTCAATTTTAATCCCTCTTT
TCGTGATCCCTTCACGGGCGCAAATGCTTATGTTCCTGGGCAAGCTTCTCATTCAGCTGC
AACACCGGCAAAGCCTTTATACAAGCACATTCCTAAAAGAGGAGTGCTAGTTTTTGATGT
TGCTCAATATGACGGAATCCTGAAAAAGATGACAGAGTTTAACAACACTCTACGATCTGA
CCCAGTAAATACTGACAAGTCCATGACAGAAACCGAAGTATCCAGAGTGGGCTCAATCGT
TAAGATACTCAAGGACACATCACATTACCACGCTACCAGTTTTTCTGACATCGATATCGC
TTTGCTTTTGAAAGTGATACAAGCATGGCCACCTGCGATGATGTTTCCGGCTACTGATTT
AGTCAGGATGCTCGTTTTGCATCCTCATGGAGCAAGCCTACTTATTAAGCATGTGGAAAA
CAACAATGATCTGCTTCTGGATGTTATAAAGAAAGTCACAGAAGATTCGGCTCTTCCTGC
AAATCTTCTTACAACTGTTCGTGTCCTTGTTAATCTATTCAAGAATCCTTCATTTCATTA
CTGGCTACAGAAGCATCATAGTCTAATTCTTGATGCCTTCTCAAACTGTTATTCATCACC
AAATAAGAATCTGCAGTTGGCGTATTCGACGTTGCTTCTCAATTATGCAGTGCTACTAAT
AGAGAAGAAAGATGAAGA*GGCCAAGCTCAAGTCCTTTCTGCAGCATTGCA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2ES34JQ 893 0 0
GATCTGACCCAGTAA*TACTGACAAGTCCATGACAGAA*CCGAAGTATCCAGAG*GGGCT
CAATCGTTAAGATACTCAAGGACACATCACAT*ACCACGCTACCAGTTTT*CTGACATCG
ATATCGCTTTGCTTTTGAAAGTGATACAAGCATGGCCAC*TGCGATGATGTTTCCGGCTA
CTGATTTAGTCAGGATGCTCGTTTTGCATCCTCATGGAGCAAGCCTACTTATTAAGCATG
TGGAAAACAACAATGATCTGCTTCTGGATGTTATAAAGAAAGTCACAGAAGATTCGGCTC
TTCCTGCAAATCTTCTTACAACTGTTCGTGTCCTTGTTAATCTATTCAAGAATCCTTCAT
TTCATTACTGGCTACAGAAGCATCATAGTCTAATTCTTGATGCCTTCTCAAACTGTTATT
CATCACCAAATAAGAATCTGCAGTTGGCGTATTCGACGTTGCTTCTCAATTATGCAGTGC
TACTAATAGAGAAGAAAGATGAAGAAGGCCAAGCTCAAGTCCTTTCTGCAGCATTGCAGA
TTGCAGAAGAGGAAGCTGCAGGTGTTGATTCCAAGTTCCGGAGTTTGGTAGCAATCGGCT
CGCTGATGCTTGAAGGGCTCGTGAAGAAGACAGCGATAGATTTTGAGGTGGAGAGCATTG
CCAAATCAGCAAAGGCATCTAAGGAAGCTAAGATTGTGGAAGTTGGTGCTGATATCGATC
TTCTAATTCGCCAGCCTTAAAACGGAGTCTTCTGAGATTAGGATCTCTTACTTGAAACGT
TTCTAGCAGAGTTTCAGATTTCTGAATACATATTTGAATATTAGTCAGATATGAAAGTGA
CTTTGCTCTTGTGAACAGAATTTGAATATTTTTTTTATAAGAACTTAAATTAT

QA 1 893 1 893
DS 



AS 1 2

CO CL4449Contig1 756 2 2 U
GATCTACGAGCTTTACAACGAGGACAAAAGGTCCGGACCAGAGTCGGAGAAGGACTGGGG
GATGTTTCATCCCAACGGGACTTCTGTTTACCCTCTTGGCTTAAGCGGTGGTGGTGGTGG
CGCTGGATCAGCTGATTTGAACGGGACGACGTTGTTGTTCTGCGTGGCGAAAGCTGATGC
TGATGATGATAAGTTGGAGGACGGTTTGAACTGGGCTTGTGGACAGGGACGAGCTAACTG
CGCTGCGCTTCAGCCGGGACAGCCTTGTTATCTACCGAACGATATCAAGAGCCATGCTTC
TTTTGCTTATAATGATTATTACCAGAAGATGAAGAGTGCTGGTGGGACTTGTGACTTTGA
TGGTACTGCCATCACTACCCCTAGAGATCCTAGCTATAGAACATGTGCTTATACGGGAAG
CTTAAACGCAAACGGAACGGGAGGAAACTTTCCTCCTGCGTTAGGACCCGCGAGTCAAGT
GGGAGGGAACGCAAACGCACTTATCGTTTCTATCTGCCATCTTCCCTTCTTGGCAACGTT
AGCTCTCACGCTACTACTACTAGTACTGTAACTTCGGTGTTGTAGTAACCGGAGAAGTGT
ATGTACCGGCGTGTCTGGTTATATCCGGTTATCGGTATTATTTGTTTTAGTACTTTGGTT
GTAGAAGTGTTTTAAGTGTAGCTAGAGAGAGGAGATTACATGTTCTCATTCTTTTTGTCT
TCATCATTTGAACTGAAAATCTTTTGAATTAGAGTG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F447TF U 1
AF RR2F447JQ C 6
BS 1 511 RR2F447TF
BS 512 756 RR2F447JQ

RD RR2F447TF 511 0 0
GATCTACGAGCTTTACAACGAGGACAAAAGGTCCGGACCAGAGTCGGAGAAGGACTGGGG
GATGTTTCATCCCAACGGGACTTCTGTTTACCCTCTTGGCTTAAGCGGTGGTGGTGGTGG
CGCTGGATCAGCTGATTTGAACGGGACGACGTTGTTGTTCTGCGTGGCGAAAGCTGATGC
TGATGATGATAAGTTGGAGGACGGTTTGAACTGGGCTTGTGGACAGGGACGAGCTAACTG
CGCTGCGCTTCAGCCGGGACAGCCTTGTTATCTACCGAACGATATCAAGAGCCATGCTTC
TTTTGCTTATAATGATTATTACCAGAAGATGAAGAGTGCTGGTGGGACTTGTGACTTTGA
TGGTACTGCCATCACTACCCCTAGAGATCCTAGCTATAGAACATGTGCTTATACGGGAAG
CTTAAACGCAAACGGAACGGGAGGAAACTTTCCTCCTGCGTTAGGACCCGCGAGTCAAGT
GGGAGGGAACGCAAACGCACTTATCGTTTCT

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2F447JQ 751 0 0
ACGAGCTTTACAACGAGGACAAAAGGTCCGGACCAGAGTCGGAGAAGGACTGGGGGATGT
TTCATCCCAACGGGACTTCTGTTTACCCTCTTGGCTTAAGCGGTGGTGGTGGTGGCGCTG
GATCAGCTGATTTGAACGGGACGACGTTGTTGTTCTGCGTGGCGAAAGCTGATGCTGATG
ATGATAAGTTGGAGGACGGTTTGAACTGGGCTTGTGGACAGGGACGAGCTAACTGCGCTG
CGCTTCAGCCGGGACAGCCTTGTTATCTACCGAACGATATCAAGAGCCATGCTTCTTTTG
CTTATAATGATTATTACCAGAAGATGAAGAGTGCTGGTGGGACTTGTGACTTTGATGGTA
CTGCCATCACTACCCCTAGAGATCCTAGCTATAGAACATGTGCTTATACGGGAAGCTTAA
ACGCAAACGGAACGGGAGGAAACTTTCCTCCTGCGTTAGGACCCGCGAGTCAAGTGGGAG
GGAACGCAAACGCACTTATCGTTTCTATCTGCCATCTTCCCTTCTTGGCAACGTTAGCTC
TCACGCTACTACTACTAGTACTGTAACTTCGGTGTTGTAGTAACCGGAGAAGTGTATGTA
CCGGCGTGTCTGGTTATATCCGGTTATCGGTATTATTTGTTTTAGTACTTTGGTTGTAGA
AGTGTTTTAAGTGTAGCTAGAGAGAGGAGATTACATGTTCTCATTCTTTTTGTCTTCATC
ATTTGAACTGAAAATCTTTTGAATTAGAGTG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL4450Contig1 880 2 2 U
GCTATGAGTTTATTCCTAACGGAGACTTAAGACAACATCTATCGGGAAAAGGAGGCAGAT
CTGTCGTCAATTGGGGTATTCGTCTAAGAATAGCTGTGGAAGCAGCACTAGGTTTGGAGT
ATTTACACATTGGATGCACACCACCAATGGTACACAGAGACGTCAAAACTACAAACATAT
TGTTGGACGAGCACTACAAGGCCAAACTGGCTGATTTTGGGCCCTCCAGGTCTTTTCCGG
TTGGAAGTGAATCTCATGTTTCGACGGTGGTTGCTGGTACTCCTGGTTACCTCGATCCTG
AGTATTACCATACAGGCCGGTTGGGTGAGAAAAGTGACGTTTACAGTTTCGGCATTGTGT
TACTGGAAATAATCACCAACCAACCAGTGATTGATCGAAACCGCAGAAATTCTCACATAA
CACAATGGGTTGGGTCTGAGCTCAACGGAGGGAATATTGCAAAGATCATGGATCCAAATC
TTCACGGAGATTATGATTCTCTCTCTGCCTGGAGAGCTCTTGAGCTGGCAATGTCGTGCG
CGGATCCAACTTCAGCAAAACGACCAACCATGTCTCATGTTGTTATCGAACTAAAAGAGT
GTCTTGTATCTGAAAACTCGAGGAGAAATATGAGTCGGAGAATGGATTCACTGAGCTCAA
ATGAAGTGAGCATGACCTTTGATAGTGGTATGATTTCCAGAGCAAGATAGTGTGTGCCAC
ACGTATCACAAGGACAATAACCTGTGTGTTTTGTGTGCGTATTGTTTTTTTTTTAAATAT
GTAAAAAAATAAAATAATTACTAAACTGATTGAATTGAAGGATGTTCTTTGTAACAAATT
GATCTAAATAAAGGAAATAAAAATGTTTGAATCTCGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD38TF U 1
AF RR2FD38JQ C 85
BS 1 736 RR2FD38TF
BS 737 880 RR2FD38JQ

RD RR2FD38TF 736 0 0
GCTATGAGTTTATTCCTAACGGAGACTTAAGACAACATCTATCGGGAAAAGGAGGCAGAT
CTGTCGTCAATTGGGGTATTCGTCTAAGAATAGCTGTGGAAGCAGCACTAGGTTTGGAGT
ATTTACACATTGGATGCACACCACCAATGGTACACAGAGACGTCAAAACTACAAACATAT
TGTTGGACGAGCACTACAAGGCCAAACTGGCTGATTTTGGGCCCTCCAGGTCTTTTCCGG
TTGGAAGTGAATCTCATGTTTCGACGGTGGTTGCTGGTACTCCTGGTTACCTCGATCCTG
AGTATTACCATACAGGCCGGTTGGGTGAGAAAAGTGACGTTTACAGTTTCGGCATTGTGT
TACTGGAAATAATCACCAACCAACCAGTGATTGATCGAAACCGCAGAAATTCTCACATAA
CACAATGGGTTGGGTCTGAGCTCAACGGAGGGAATATTGCAAAGATCATGGATCCAAATC
TTCACGGAGATTATGATTCTCTCTCTGCCTGGAGAGCTCTTGAGCTGGCAATGTCGTGCG
CGGATCCAACTTCAGCAAAACGACCAACCATGTCTCATGTTGTTATCGAACTAAAAGAGT
GTCTTGTATCTGAAAACTCGAGGAGAAATATGAGTCGGAGAATGGATTCACTGAGCTCAA
ATGAAGTGAGCATGACCTTTGATAGTGGTATGATTTCCAGAGCAAGATAGTGTGTGCCAC
ACGTATCACAAGGACA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2FD38JQ 796 0 0
TAAGAATAGCTGTGGAAGCAGCACTAGGTTTGGAGTATTTACACATTGGATGCACACCAC
CAATGGTACACAGAGACGTCAAAACTACAAACATATTGTTGGACGAGCACTACAAGGCCA
AACTGGCTGATTTTGGGCCCTCCAGGTCTTTTCCGGTTGGAAGTGAATCTCATGTTTCGA
CGGTGGTTGCTGGTACTCCTGGTTACCTCGATCCTGAGTATTACCATACAGGCCGGTTGG
GTGAGAAAAGTGACGTTTACAGTTTCGGCATTGTGTTACTGGAAATAATCACCAACCAAC
CAGTGATTGATCGAAACCGCAGAAATTCTCACATAACACAATGGGTTGGGTCTGAGCTCA
ACGGAGGGAATATTGCAAAGATCATGGATCCAAATCTTCACGGAGATTATGATTCTCTCT
CTGCCTGGAGAGCTCTTGAGCTGGCAATGTCGTGCGCGGATCCAACTTCAGCAAAACGAC
CAACCATGTCTCATGTTGTTATCGAACTAAAAGAGTGTCTTGTATCTGAAAACTCGAGGA
GAAATATGAGTCGGAGAATGGATTCACTGAGCTCAAATGAAGTGAGCATGACCTTTGATA
GTGGTATGATTTCCAGAGCAAGATAGTGTGTGCCACACGTATCACAAGGACAATAACCTG
TGTGTTTTGTGTGCGTATTGTTTTTTTTTTAAATATGTAAAAAAATAAAATAATTACTAA
ACTGATTGAATTGAAGGATGTTCTTTGTAACAAATTGATCTAAATAAAGGAAATAAAAAT
GTTTGAATCTCGTTAC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL4451Contig1 652 2 1 U
GGACTAAACTAAAGAGGAAGAGGAAAGAGGAAGCAGAGCGAAACAAAGAGAAACAATGGA
GTCACCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGCGTGAAGAGAGACGCTCTTCGATTTGG
TCTCAACGGTGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCATCTTACGAATC
TGGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGGACGATCATTGGGCATACCTACGGGACTGC
ACTTCCTTTGAAGATGGATATGGACACGCAAATTCTCTCTAGGTTTCAGAGACCTCCTGG
ACCAATTCCTTCGTCAATGCTCGGTTTAGAAGTCTACACAGGAGCCGTTGATGACTTTGG
TTTTGAGGATTACTTGAATGACCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCCGTAGACTTCCA
CCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATGTCAAAGTGATGTAGATAGATATTTAGAAATAT
TCTAAATATCTTATCATTTATTTTATTAGTTATTATTGGTTTTATTAATTATTTTAGATA
ATTATCTTAATGTTTTAGGGTTATATGGCTTTCTTATATATAGCCGTCTAGGCTTAACAT
TGTATTCAGTTTGTGAGTTGATTGATTATTAATAAAATTGAGAGTTTTCTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G431JQ C 1
AF RR2G431TF U 1
BS 1 652 RR2G431TF

RD RR2G431JQ 652 0 0
GGACTAAACTAAAGAGGAAGAGGAAAGAGGAAGCAGAGCGAAACAAAGAGAAACAATGGA
GTCACCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGCGTGAAGAGAGACGCTCTTCGATTTGG
TCTCAACGGTGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCATCTTACGAATC
TGGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGGACGATCATTGGGCATACCTACGGGACTGC
ACTTCCTTTGAAGATGGATATGGACACGCAAATTCTCTCTAGGTTTCAGAGACCTCCTGG
ACCAATTCCTTCGTCAATGCTCGGTTTAGAAGTCTACACAGGAGCCGTTGATGACTTTGG
TTTTGAGGATTACTTGAATGACCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCCGTAGACTTCCA
CCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATGTCAAAGTGATGTAGATAGATATTTAGAAATAT
TCTAAATATCTTATCATTTATTTTATTAGTTATTATTGGTTTTATTAATTATTTTAGATA
ATTATCTTAATGTTTTAGGGTTATATGGCTTTCTTATATATAGCCGTCTAGGCTTAACAT
TGTATTCAGTTTGTGAGTTGATTGATTATTAATAAAATTGAGAGTTTTCTCT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2G431TF 652 0 0
GGACTAAACTAAAGAGGAAGAGGAAAGAGGAAGCAGAGCGAAACAAAGAGAAACAATGGA
GTCACCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGCGTGAAGAGAGACGCTCTTCGATTTGG
TCTCAACGGTGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCATCTTACGAATC
TGGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGGACGATCATTGGGCATACCTACGGGACTGC
ACTTCCTTTGAAGATGGATATGGACACGCAAATTCTCTCTAGGTTTCAGAGACCTCCTGG
ACCAATTCCTTCGTCAATGCTCGGTTTAGAAGTCTACACAGGAGCCGTTGATGACTTTGG
TTTTGAGGATTACTTGAATGACCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCCGTAGACTTCCA
CCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATGTCAAAGTGATGTAGATAGATATTTAGAAATAT
TCTAAATATCTTATCATTTATTTTATTAGTTATTATTGGTTTTATTAATTATTTTAGATA
ATTATCTTAATGTTTTAGGGTTATATGGCTTTCTTATATATAGCCGTCTAGGCTTAACAT
TGTATTCAGTTTGTGAGTTGATTGATTATTAATAAAATTGAGAGTTTTCTCT

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL4452Contig1 1075 2 2 U
GGCCAATGCCAAACCAAGCTAATCAGGCTCTAGGACAAGGCTATCCACCCCAACAACAAC
AGCAGCAGCAGATGATGATGGCTCAGTTCTATGCCCAACAGCAACAACTACAGCAACAGC
AGCAGCAACAGCAACAAGCATATGGAAACCAGATGGGAGGAGGATATGGATACGGTTATA
ATCAACAGCAACAAGGAAGCAGCCCATATTTGGAGCAGCAAATGCATGGCATGTCCATCA
GAGACCAGGTGTCGCATCAGGCACCATCATCATCATCTTCTTATCTGCCTCCTAGGAGAC
CTAAGAATAGACCAGAGGATAAGCTATTTGGGGATCTAGTTGACATCTCCAAATTCAAGC
CTAGTACAAAACCGACTTCCGGAAGAGCTGGTACCATGTGAAAGATCTACTCATGATTTA
TGATTATTCGTCTCTCTGTATCTTTACTCAGCTTCTTTTTTTTCAAGATTTGATCAAATT
GATTAGACCCTCTTGTGAGATGCATACATACATATATGTTATCGTGTTCCTTGCTTATAA
ATTTGCTGGTGATTATGACGGGGAATGGATTTGTATATTTATTGTAGAGAGCTGTTTGTC
CGGAGATTCTATTTTCTAGGACATTGTTAAAACATTATTTGTTTGTTTGTTTCCCTTGGC
ACTAAAGCTCGATATGATTTAAGAGAGTTTCGTATACGAAGAATTGAGCATATTGTTCAA
AAGAACAGAAAGTCAATATGTCCGAGTGGTTAAGGAGACAGACTCGAAATCTGTTGGGCT
TTGCCTGCGCAGGTTCGAATCCTGCTGTTGACGGTTTTTTTCTTTTTTTTTACAAGAAGC
CCGTCAACAAGCGAGTACAACAGATCTTTCTCATTTTGTCAAGCCCATTGGGCCATAAGA
GTTAGGTAGCCATGTGATTTGTTAGCTTCTGTGGCGTTTGTCTGTGCCACATAAGCACTT
ATTACAACGTGTCCTCTGTCTGTCTGCATGATCCTCTTCATTACATTTGGCCACCGAACC
AAAACATAACTCCCCTTCTTTCAGATTCTTCGCATTTCTTCTTCTTCCGTTGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD12TF U 1
AF RR2CD12JQ C 305
BS 1 637 RR2CD12TF
BS 638 1075 RR2CD12JQ

RD RR2CD12TF 637 0 0
GGCCAATGCCAAACCAAGCTAATCAGGCTCTAGGACAAGGCTATCCACCCCAACAACAAC
AGCAGCAGCAGATGATGATGGCTCAGTTCTATGCCCAACAGCAACAACTACAGCAACAGC
AGCAGCAACAGCAACAAGCATATGGAAACCAGATGGGAGGAGGATATGGATACGGTTATA
ATCAACAGCAACAAGGAAGCAGCCCATATTTGGAGCAGCAAATGCATGGCATGTCCATCA
GAGACCAGGTGTCGCATCAGGCACCATCATCATCATCTTCTTATCTGCCTCCTAGGAGAC
CTAAGAATAGACCAGAGGATAAGCTATTTGGGGATCTAGTTGACATCTCCAAATTCAAGC
CTAGTACAAAACCGACTTCCGGAAGAGCTGGTACCATGTGAAAGATCTACTCATGATTTA
TGATTATTCGTCTCTCTGTATCTTTACTCAGCTTCTTTTTTTTCAAGATTTGATCAAATT
GATTAGACCCTCTTGTGAGATGCATACATACATATATGTTATCGTGTTCCTTGCTTATAA
ATTTGCTGGTGATTATGACGGGGAATGGATTTGTATATTTATTGTAGAGAGCTGTTTGTC
CGGAGATTCTATTTTCTAGGACATTGTTAAAACATTA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2CD12JQ 771 0 0
GAATAGACCAGAGGATAAGCTATTTGGGGATCTAGTTGACATCTCCAAATTCAAGCCTAG
TACAAAACCGACTTCCGGAAGAGCTGGTACCATGTGAAAGATCTACTCATGATTTATGAT
TATTCGTCTCTCTGTATCTTTACTCAGCTTCTTTTTTTTCAAGATTTGATCAAATTGATT
AGACCCTCTTGTGAGATGCATACATACATATATGTTATCGTGTTCCTTGCTTATAAATTT
GCTGGTGATTATGACGGGGAATGGATTTGTATATTTATTGTAGAGAGCTGTTTGTCCGGA
GATTCTATTTTCTAGGACATTGTTAAAACATTATTTGTTTGTTTGTTTCCCTTGGCACTA
AAGCTCGATATGATTTAAGAGAGTTTCGTATACGAAGAATTGAGCATATTGTTCAAAAGA
ACAGAAAGTCAATATGTCCGAGTGGTTAAGGAGACAGACTCGAAATCTGTTGGGCTTTGC
CTGCGCAGGTTCGAATCCTGCTGTTGACGGTTTTTTTCTTTTTTTTTACAAGAAGCCCGT
CAACAAGCGAGTACAACAGATCTTTCTCATTTTGTCAAGCCCATTGGGCCATAAGAGTTA
GGTAGCCATGTGATTTGTTAGCTTCTGTGGCGTTTGTCTGTGCCACATAAGCACTTATTA
CAACGTGTCCTCTGTCTGTCTGCATGATCCTCTTCATTACATTTGGCCACCGAACCAAAA
CATAACTCCCCTTCTTTCAGATTCTTCGCATTTCTTCTTCTTCCGTTGTCG

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL4453Contig1 1349 2 2 U
GGACAGCTTCAGCTTTTCTTCGCACAACTGAACTCTCTCATAACTCTTCTTATCATATTT
TTTTTACCATTCACTTTTTAGATTTCATATCTCGCTGGTGGAAAAGCTCATTAAACTAGC
TACTGCTCTACCTATCAGTCGGTAACTACCGAACTTTGATTATTATTTTTCATGTTTAAG
TTTGTGTTATATCAGCAGATAGCATAACTAACGGTATTGTATTCAGTTCATATGATTTGG
ATAAGATAATGGACATATAATTTGCTCATTTGTTTGTATATCAGACAATGGTATTGTTTT
AAATTTTAACAAGCAATTCCATTTTGTTTCCAGTTTATTTGGTTCTCTTCCAATAAAAGT
AAAAACAAAAAACAAAAAAAAACGAAAAAGCTCGAGAAATGGCTCCCAAGAACAACCGTG
GAAAGACAAAAGGAGACAAGAAGAAGAAGGAAGAGAAAGGTATCACCAACAGTGAAAACC
TTATCTATATTTTTTTGTCAGCCAAAAAAAAAACCTTATCTATATGAATTTTAATTAAAA
AATAAGCTGTTGATTTACTTCCTTTAATAATTAAGTTATAGTTTACATATGAACCATGGT
TTACGGTTTATATGCAGTTCTTCCGGTTATGGTGGATGTCATTGTGAACCTTCCGGACGA
GACGGAGGCTATTTTGAAGGTTTGTGTGACTATTTTCCTCGCATCATTTTCGAATTGTGT
TCTATTTCTCATATTTCTTGCGTGTTAACAACTGTTTTTCTGGTAGCGGTTTCTTTGTGA
AATTTGTTATCTTTATAACTTACAACCCTTTTTCTATTTCTCTGTCTTAATACTTTTACA
CACCCAGCTGATTTCTATTGCATTAGTTTCTTGACTGTATAATTGTTAATCCTGAAACTT
TTTGTGGTGTAAATGTTAAAAAAAAATCTGAAGCTTTATCTTAATATGTTACATGTTTTG
TTTTTGATATATAAACTCCCAATGTGCATGGTCGATTTTCTTTTCTTTGATTTTGTTGTT
TGGGATAAGGTGCGCGAAGGAATACACGTTACCATAAAAATTGATAATTATACATGCTGT
ATTATTTTGGTTTTTTTCTTTCTAAAAAATCATTTTCAATTGACTTATAATTTTATCATT
ACTTGAGCGTGTATATAATTACAAAACTGTGTGTAACACAAAAATTCGATTATCAACTAA
TTCAATTATTTCCACATTTTGGTCAACAAATTACGTAGACGTTATATAGACAGTGAAATA
TGTATAACGGAATCATATGTATATGTATATAAAATTATCGTCAAAAACACGTGTATCTCT
TATTCATATTTCTTTTTTTTATCTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E627TF U 1
AF RR2E627JQ C 544
BS 1 601 RR2E627TF
BS 602 1349 RR2E627JQ

RD RR2E627TF 601 0 0
GGACAGCTTCAGCTTTTCTTCGCACAACTGAACTCTCTCATAACTCTTCTTATCATATTT
TTTTTACCATTCACTTTTTAGATTTCATATCTCGCTGGTGGAAAAGCTCATTAAACTAGC
TACTGCTCTACCTATCAGTCGGTAACTACCGAACTTTGATTATTATTTTTCATGTTTAAG
TTTGTGTTATATCAGCAGATAGCATAACTAACGGTATTGTATTCAGTTCATATGATTTGG
ATAAGATAATGGACATATAATTTGCTCATTTGTTTGTATATCAGACAATGGTATTGTTTT
AAATTTTAACAAGCAATTCCATTTTGTTTCCAGTTTATTTGGTTCTCTTCCAATAAAAGT
AAAAACAAAAAACAAAAAAAAACGAAAAAGCTCGAGAAATGGCTCCCAAGAACAACCGTG
GAAAGACAAAAGGAGACAAGAAGAAGAAGGAAGAGAAAGGTATCACCAACAGTGAAAACC
TTATCTATATTTTTTTGTCAGCCAAAAAAAAAACCTTATCTATATGAATTTTAATTAAAA
AATAAGCTGTTGATTTACTTCCTTTAATAATTAAGTTATAGTTTACATATGAACCATGGT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2E627JQ 806 0 0
AAGCTGTTGATTTACTTCCTTTAATAATTAAGTTATAGTTTACATATGAACCATGGTTTA
CGGTTTATATGCAGTTCTTCCGGTTATGGTGGATGTCATTGTGAACCTTCCGGACGAGAC
GGAGGCTATTTTGAAGGTTTGTGTGACTATTTTCCTCGCATCATTTTCGAATTGTGTTCT
ATTTCTCATATTTCTTGCGTGTTAACAACTGTTTTTCTGGTAGCGGTTTCTTTGTGAAAT
TTGTTATCTTTATAACTTACAACCCTTTTTCTATTTCTCTGTCTTAATACTTTTACACAC
CCAGCTGATTTCTATTGCATTAGTTTCTTGACTGTATAATTGTTAATCCTGAAACTTTTT
GTGGTGTAAATGTTAAAAAAAAATCTGAAGCTTTATCTTAATATGTTACATGTTTTGTTT
TTGATATATAAACTCCCAATGTGCATGGTCGATTTTCTTTTCTTTGATTTTGTTGTTTGG
GATAAGGTGCGCGAAGGAATACACGTTACCATAAAAATTGATAATTATACATGCTGTATT
ATTTTGGTTTTTTTCTTTCTAAAAAATCATTTTCAATTGACTTATAATTTTATCATTACT
TGAGCGTGTATATAATTACAAAACTGTGTGTAACACAAAAATTCGATTATCAACTAATTC
AATTATTTCCACATTTTGGTCAACAAATTACGTAGACGTTATATAGACAGTGAAATATGT
ATAACGGAATCATATGTATATGTATATAAAATTATCGTCAAAAACACGTGTATCTCTTAT
TCATATTTCTTTTTTTTATCTTTTTC

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL4454Contig1 786 2 3 U
GGGCACAAGTCGAAAAGATCTAGAGAACAAAATCCTGGCGTAAATCTCGTTAGGGTTTTT
CAGCTTTTTAAATAAAAGCGCAAAAAAACATTTTGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAA
TGGCGGGTTACAAAGCAGACGATGAATACGATTACCTTTTCAAGGTTGTTCTCATCGGTG
ACTCTGGTGTTGGGAAGTCCAATCTGCTTTCACGATTCACCAAGAACGAGTTCAGCCTCG
AGTCCAAATCAACCATCGGAGTCGAGTTCGCGACTAGGAGCTTGAATGTTGACGATAAAG
TCATCAAAGCTCAGAAACCACACCGATCCAAACATCGTAGTGATGCTCGTGGGGAACAAA
TCTGATCTCCGCCACCTCGTGGCTGTTCAGACAGACGATGCCAAGTCATTCGCTGAGAAA
GAGTCTCTTTACTTCATGGAAACTTCGGCTCTCGACTCTACCAATGTTGAGAACGCTTTC
GCGGAAGTCCTCACTCAGATTCACTGCGTTGTGAGCAGAAAGGCAATGGAAGCTGCGAGC
GAATCCGCTAATGTTCCGTCCAAAGGAGACAAGATCGATCTTGGTAAAGATGTTTCTGCT
GTGAAGAAAGGTGGATGCTGCTCAAACTAATAATAACAGAGTGGAACCACTTGGTTTAGT
GGTAAACAACCGGGTTATGTGTTCAAAAGTGGTTCGAATATGAGAGATTGCTTTAGGTTG
ATTGGTTAAATGCTCTTGTGATGTATTTCTGTTGGTTCTATAAATTAATCGATGTTCTTG
CCTGAG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ25TFB U 1
AF RR2AZ25JQ C 1
BS 1 4 RR2AZ25JQ
BS 5 630 RR2AZ25TFB
BS 631 786 RR2AZ25JQ

RD RR2AZ25TFB 630 0 0
GGGG
ACAAGTCGAAAAGATCTAGAGAACAAAATCCTGGCGTAAATCTCGTTAGGGTTTTTCAGC
TTTTTAAATAAAAGCGCAAAAAAACATTTTGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATGGC
GGGTTACAAAGCAGACGATGAATACGATTACCTTTTCAAGGTTGTTCTCATCGGTGACTC
TGGTGTTGGGAAGTCCAATCTGCTTTCACGATTCACCAAGAACGAGTTCAGCCTCGAGTC
CAAATCAACCATCGGAGTCGAGTTCGCGACTAGGAGCTTGAATGTTGACGATAAAGTCAT
CAAAGCTCAGAAACCACACCGATCCAAACATCGTAGTGATGCTCGTGGGGAACAAATCTG
ATCTCCGCCACCTCGTGGCTGTTCAGACAGACGATGCCAAGTCATTCGCTGAGAAAGAGT
CTCTTTACTTCATGGAAACTTCGGCTCTCGACTCTACCAATGTTGAGAACGCTTTCGCGG
AAGTCCTCACTCAGATTCACTGCGTTGTGAGCAGAAAGGCAATGGAAGCTGCGAGCGAAT
CCGCTAATGTTCCGTCCAAAGGAGACAAGATCGATCTTGGTAAAGATGTTTCTGCTGTGA
AGAAAGGTGGATGCTGCTCAAACTAA

QA 5 630 5 630
DS 

RD RR2AZ25JQ 786 0 0
GGGCACAAGTCGAAAAGATCTAGAGAACAAAATCCTGGCGTAAATCTCGTTAGGGTTTTT
CAGCTTTTTAAATAAAAGCGCAAAAAAACATTTTGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAA
TGGCGGGTTACAAAGCAGACGATGAATACGATTACCTTTTCAAGGTTGTTCTCATCGGTG
ACTCTGGTGTTGGGAAGTCCAATCTGCTTTCACGATTCACCAAGAACGAGTTCAGCCTCG
AGTCCAAATCAACCATCGGAGTCGAGTTCGCGACTAGGAGCTTGAATGTTGACGATAAAG
TCATCAAAGCTCAGAAACCACACCGATCCAAACATCGTAGTGATGCTCGTGGGGAACAAA
TCTGATCTCCGCCACCTCGTGGCTGTTCAGACAGACGATGCCAAGTCATTCGCTGAGAAA
GAGTCTCTTTACTTCATGGAAACTTCGGCTCTCGACTCTACCAATGTTGAGAACGCTTTC
GCGGAAGTCCTCACTCAGATTCACTGCGTTGTGAGCAGAAAGGCAATGGAAGCTGCGAGC
GAATCCGCTAATGTTCCGTCCAAAGGAGACAAGATCGATCTTGGTAAAGATGTTTCTGCT
GTGAAGAAAGGTGGATGCTGCTCAAACTAATAATAACAGAGTGGAACCACTTGGTTTAGT
GGTAAACAACCGGGTTATGTGTTCAAAAGTGGTTCGAATATGAGAGATTGCTTTAGGTTG
ATTGGTTAAATGCTCTTGTGATGTATTTCTGTTGGTTCTATAAATTAATCGATGTTCTTG
CCTGAG

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL4455Contig1 506 2 1 U
ATGAGGGATGGTCATAATAAGGTTTACAAGTCATTTTCAGATGTAATTGAAGGAAAAGAG
GGAAGATTTCGCGAGACTCTGCTTGGCAAACGGGTCGATTATTCGGGGCGTTCGGTGATT
GTCGTTGGACCCTCACTTTCATTACATCGCTGTGGATTGCCTCGCGAAATAGCAATAGAG
CTCTTCCAGACATTTGTAATTCGTGGTCTAATTAGACAACATCTGGCATGAACAAGTAGT
GGACTCAAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATTAATTGTTATGGTTTT
AAATAAAATTGAGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGTTGTTGTTTGTTATTGT
TGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTGTTTAGTGTTTAAAATACTTGAATTGA
TGTTTCTCCCCTTAGGTTTGTACGTTTGGATGTTTGTGTATTTAATTTTCCCAGTAATAA
AAACAAATGTATAATTTTAAGTTCCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FS46JQ C 1
AF RR2FS46TF U 1
BS 1 506 RR2FS46TF

RD RR2FS46JQ 506 0 0
ATGAGGGATGGTCATAATAAGGTTTACAAGTCATTTTCAGATGTAATTGAAGGAAAAGAG
GGAAGATTTCGCGAGACTCTGCTTGGCAAACGGGTCGATTATTCGGGGCGTTCGGTGATT
GTCGTTGGACCCTCACTTTCATTACATCGCTGTGGATTGCCTCGCGAAATAGCAATAGAG
CTCTTCCAGACATTTGTAATTCGTGGTCTAATTAGACAACATCTGGCATGAACAAGTAGT
GGACTCAAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATTAATTGTTATGGTTTT
AAATAAAATTGAGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGTTGTTGTTTGTTATTGT
TGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTGTTTAGTGTTTAAAATACTTGAATTGA
TGTTTCTCCCCTTAGGTTTGTACGTTTGGATGTTTGTGTATTTAATTTTCCCAGTAATAA
AAACAAATGTATAATTTTAAGTTCCG

QA 1 506 1 506
DS 

RD RR2FS46TF 506 0 0
ATGAGGGATGGTCATAATAAGGTTTACAAGTCATTTTCAGATGTAATTGAAGGAAAAGAG
GGAAGATTTCGCGAGACTCTGCTTGGCAAACGGGTCGATTATTCGGGGCGTTCGGTGATT
GTCGTTGGACCCTCACTTTCATTACATCGCTGTGGATTGCCTCGCGAAATAGCAATAGAG
CTCTTCCAGACATTTGTAATTCGTGGTCTAATTAGACAACATCTGGCATGAACAAGTAGT
GGACTCAAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATTAATTGTTATGGTTTT
AAATAAAATTGAGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGTTGTTGTTTGTTATTGT
TGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTGTTTAGTGTTTAAAATACTTGAATTGA
TGTTTCTCCCCTTAGGTTTGTACGTTTGGATGTTTGTGTATTTAATTTTCCCAGTAATAA
AAACAAATGTATAATTTTAAGTTCCG

QA 1 506 1 506
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4457Contig1 507 2 1 U
GGACCATTACTAGCAGTAAACCAATTGCGTGATCCCAAATCTTATCTCCCCCCTCGATTC
GATTCGATTCGATGTCGACGGAGGCGGAGGTTGTTAACTCTGGCGAGGACTTCGTTCACA
TCGAAGAACACTCAAGCAGACCTACCGGCGACATCTCGTTGAGCGACAGCATAGTCAATG
TGGAGAAGGAGGACGCCGTCGAGGAAGAAGATTTGATGGAGATACCGAGCGACGAGTCAG
TATTTACAGTGAAGAGGATAATATCATCAGTGGCGATTGCAGTTACAGGGACAGCTATAG
TTACTGGTATACTTCTCGCAAGAAGAAGGTGAAAACAATTGTGATGTGGGGCAGAGTTTT
TCTCTCCTCATTCTCCTGAGAGCCATACAAAAGAAAACTACACAAACTCAACAACATTTT
ACAGTCTTTCTGCTTTCTTTTTCTTTTATTTTACTTTTGTGTTGTTGGTTGATGAAATTT
TTCCTTATAATAATAAAGCTTTTTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A788JQ C 1
AF RR2A788TF U 1
BS 1 507 RR2A788TF

RD RR2A788JQ 507 0 0
GGACCATTACTAGCAGTAAACCAATTGCGTGATCCCAAATCTTATCTCCCCCCTCGATTC
GATTCGATTCGATGTCGACGGAGGCGGAGGTTGTTAACTCTGGCGAGGACTTCGTTCACA
TCGAAGAACACTCAAGCAGACCTACCGGCGACATCTCGTTGAGCGACAGCATAGTCAATG
TGGAGAAGGAGGACGCCGTCGAGGAAGAAGATTTGATGGAGATACCGAGCGACGAGTCAG
TATTTACAGTGAAGAGGATAATATCATCAGTGGCGATTGCAGTTACAGGGACAGCTATAG
TTACTGGTATACTTCTCGCAAGAAGAAGGTGAAAACAATTGTGATGTGGGGCAGAGTTTT
TCTCTCCTCATTCTCCTGAGAGCCATACAAAAGAAAACTACACAAACTCAACAACATTTT
ACAGTCTTTCTGCTTTCTTTTTCTTTTATTTTACTTTTGTGTTGTTGGTTGATGAAATTT
TTCCTTATAATAATAAAGCTTTTTGTT

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2A788TF 507 0 0
GGACCATTACTAGCAGTAAACCAATTGCGTGATCCCAAATCTTATCTCCCCCCTCGATTC
GATTCGATTCGATGTCGACGGAGGCGGAGGTTGTTAACTCTGGCGAGGACTTCGTTCACA
TCGAAGAACACTCAAGCAGACCTACCGGCGACATCTCGTTGAGCGACAGCATAGTCAATG
TGGAGAAGGAGGACGCCGTCGAGGAAGAAGATTTGATGGAGATACCGAGCGACGAGTCAG
TATTTACAGTGAAGAGGATAATATCATCAGTGGCGATTGCAGTTACAGGGACAGCTATAG
TTACTGGTATACTTCTCGCAAGAAGAAGGTGAAAACAATTGTGATGTGGGGCAGAGTTTT
TCTCTCCTCATTCTCCTGAGAGCCATACAAAAGAAAACTACACAAACTCAACAACATTTT
ACAGTCTTTCTGCTTTCTTTTTCTTTTATTTTACTTTTGTGTTGTTGGTTGATGAAATTT
TTCCTTATAATAATAAAGCTTTTTGTT

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 2

CO CL4458Contig1 807 2 5 U
GTCCAAATGTGGGTTTCCGATGAGCGCTGGTCTCAAGTCTTTGGGGTTTTCGCTTGGCAA
AAATGCACGTGATCTAGCTTGTCAGAGTGCTGAGAGATGGAGCAGCTTGGGAGAAGATGC
TGGTCTGCAGAACCTCGAGTTGCATTCTTTTCGTGCTGCTTTCCAAGTGGTTCTTTCCAA
GCATTATCCAGAGGTTTTGGCGACAGGTCCCTCTATTGGACGCCAAGGGAAGGCCTTCCG
TCGTCGTCAAAAGCAAAGAAAAACTCTTGAAACTCCAGCAAAAGTAGATACAAGTTGTAG
GAAAGACACCGATGACAAGAAATCCATGAGGCATACAGGTTCAGATTCCAACAGTTATTC
TTCTTTTGAGAAGTTTTGCCTGTCGGCATTTTCCCGCCTGAATCTAGAACATCCTCAAGA
TCTGGACCTGAGTGCCACATGGAAGGAAGCTGATGCATTCACGGAACTGATAGGACCTTA
CTGGTCTATACGAGCTGCACTAGGACCTGTGCTTGAGACACTGATCTTGCTTGATAGGCT
TATGTTTCTCCAAGAACAAGGAGACTCTATTGAAGTTACAATGCTTCCCATTTTCGACCC
AACCATCTCACCTAGGAACGTCGCCATCATTGCTAAAAGACTTTGACCGTAAAGCTTATT
GGAGCAGTTAAGAGAATCCACCTGAAGAATTCTACTTTTTTTTTCCGTCGTGTGAACACA
GACCCATTTCTTCCTTGTTGTTCGTGTTGTACAAGAAACGAATTAGGAAATGTATTAAGG
TTTCTTTTGACATTTCCGAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR91TF U 144
AF RR2CR91JQ C 1
BS 1 143 RR2CR91JQ
BS 144 637 RR2CR91TF
BS 638 638 RR2CR91JQ
BS 639 658 RR2CR91TF
BS 659 807 RR2CR91JQ

RD RR2CR91TF 515 0 0
ATTCTTTTCGTGCTGCTTTCCAAGTGGTTCTTTCCAAGCATTATCCAGAGGTTTTGGCGA
CAGGTCCCTCTATTGGACGCCAAGGGAAGGCCTTCCGTCGTCGTCAAAAGCAAAGAAAAA
CTCTTGAAACTCCAGCAAAAGTAGATACAAGTTGTAGGAAAGACACCGATGACAAGAAAT
CCATGAGGCATACAGGTTCAGATTCCAACAGTTATTCTTCTTTTGAGAAGTTTTGCCTGT
CGGCATTTTCCCGCCTGAATCTAGAACATCCTCAAGATCTGGACCTGAGTGCCACATGGA
AGGAAGCTGATGCATTCACGGAACTGATAGGACCTTACTGGTCTATACGAGCTGCACTAG
GACCTGTGCTTGAGACACTGATCTTGCTTGATAGGCTTATGTTTCTCCAAGAACAAGGAG
ACTCTATTGAAGTTACAATGCTTCCCATTTTCGACCCAACCATCTCACCTAGGAACGTCG
CCATCATTGCTAAA*GACTTTGACCGTAAAGCTTA

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2CR91JQ 807 0 0
GTCCAAATGTGGGTTTCCGATGAGCGCTGGTCTCAAGTCTTTGGGGTTTTCGCTTGGCAA
AAATGCACGTGATCTAGCTTGTCAGAGTGCTGAGAGATGGAGCAGCTTGGGAGAAGATGC
TGGTCTGCAGAACCTCGAGTTGCATTCTTTTCGTGCTGCTTTCCAAGTGGTTCTTTCCAA
GCATTATCCAGAGGTTTTGGCGACAGGTCCCTCTATTGGACGCCAAGGGAAGGCCTTCCG
TCGTCGTCAAAAGCAAAGAAAAACTCTTGAAACTCCAGCAAAAGTAGATACAAGTTGTAG
GAAAGACACCGATGACAAGAAATCCATGAGGCATACAGGTTCAGATTCCAACAGTTATTC
TTCTTTTGAGAAGTTTTGCCTGTCGGCATTTTCCCGCCTGAATCTAGAACATCCTCAAGA
TCTGGACCTGAGTGCCACATGGAAGGAAGCTGATGCATTCACGGAACTGATAGGACCTTA
CTGGTCTATACGAGCTGCACTAGGACCTGTGCTTGAGACACTGATCTTGCTTGATAGGCT
TATGTTTCTCCAAGAACAAGGAGACTCTATTGAAGTTACAATGCTTCCCATTTTCGACCC
AACCATCTCACCTAGGAACGTCGCCATCATTGCTAAAAGACTTTGACCGTAAAGCTTATT
GGAGCAGTTAAGAGAATCCACCTGAAGAATTCTACTTTTTTTTTCCGTCGTGTGAACACA
GACCCATTTCTTCCTTGTTGTTCGTGTTGTACAAGAAACGAATTAGGAAATGTATTAAGG
TTTCTTTTGACATTTCCGAAAAAAAAA

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

CO CL4459Contig1 846 2 6 U
GATGCTTTCCTCAGTTTGGAACTCGAGGATCACTTGAGCAACACGGTTTTGCGAGAAACA
AGATGTGGCTTGTGGAAAATGATCCTCCTGCTTTACCTTCATTCGACTCAACCGGCAAAG
CCTATGTGGATTTGGTACTTAAGTCCTCTGATGAAGACACAACAAGGATCTGGCCTTACA
GCTTTGAGTTTCACTTGAGAGTTTCATTGGGATTAGACGGGAACCTAACGCTGATATCAC
GAGTCAGAAACATCAACTCAAAGCCTTTTAGCTTCTCCATTGCTTACCACACTTACTTCT
CCATCTCCGATATCAGTGAAGTAAGACTTGAAGGGCTTGAAACTCTTGACTATCTTGATA
ACTTGCTTGATAAAGAGCGGTTTACTGAGCAAGGCGATGCATTAACCTTTGAATCCGAGA
TTGATAGAGTGTACTTGAACTCTAAAGACGTGGTTGCTGTTTTTGACCATGAGAGAAAAC
GTACATTCCTCATCGAGAAAGAAGGTCTGCCTGATGTTGTGGTGTGGAATCCATGGGACA
AGAAAGCTAAAGCATTGCCAGATTTGGGAGATGAAGAGTACAAACAGATGCTTTGTGTTG
ATGGAGCAGCCATTGAGAAACCAATCACCTTGAAACCGGGTGAAGAATGGACCGGGAAAT
TAAATCTCTCCCTTGTCCTTTCCACCTGAAAAAAACCGGTACCGGTTATCTTCAAACCTA
TTGATTCTTCTTTGTCTCTCTTATTATTATATTTTTCGGTATAGTTTACAGAAGATCATC
ACAGTGTGTGTGTGTGTGATTTTTTGGCATCAAAATCCTGAATATTAAAAGGAAACCTGA
GATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR14TF U 1
AF RR2CR14JQ C 294
BS 1 694 RR2CR14TF
BS 695 695 RR2CR14JQ
BS 696 715 RR2CR14TF
BS 716 716 RR2CR14JQ
BS 717 744 RR2CR14TF
BS 745 846 RR2CR14JQ

RD RR2CR14TF 749 0 0
GATGCTTTCCTCAGTTTGGAACTCGAGGATCACTTGAGCAACACGGTTTTGCGAGAAACA
AGATGTGGCTTGTGGAAAATGATCCTCCTGCTTTACCTTCATTCGACTCAACCGGCAAAG
CCTATGTGGATTTGGTACTTAAGTCCTCTGATGAAGACACAACAAGGATCTGGCCTTACA
GCTTTGAGTTTCACTTGAGAGTTTCATTGGGATTAGACGGGAACCTAACGCTGATATCAC
GAGTCAGAAACATCAACTCAAAGCCTTTTAGCTTCTCCATTGCTTACCACACTTACTTCT
CCATCTCCGATATCAGTGAAGTAAGACTTGAAGGGCTTGAAACTCTTGACTATCTTGATA
ACTTGCTTGATAAAGAGCGGTTTACTGAGCAAGGCGATGCATTAACCTTTGAATCCGAGA
TTGATAGAGTGTACTTGAACTCTAAAGACGTGGTTGCTGTTTTTGACCATGAGAGAAAAC
GTACATTCCTCATCGAGAAAGAAGGTCTGCCTGATGTTGTGGTGTGGAATCCATGGGACA
AGAAAGCTAAAGCATTGCCAGATTTGGGAGATGAAGAGTACAAACAGATGCTTTGTGTTG
ATGGAGCAGCCATTGAGAAACCAATCACCTTGAAACCGGGTGAAGAATGGACCGGGAAAT
TAAATCTCTCCCTTGTCCTTTCCACCTGAAAAAA*CCGGTACCGGTTATCTTCAA*CCTA
TTGATTCTTCTTTGTCTCTCTTAT
ATTAT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2CR14JQ 553 0 0
TACTTTTCCATTTCCGATATCAGTGAAGTAAGACTTGAAGGGCTTGAAACTTTTGACTAT
CTTGATAACTTGCTTGATAAAGAGCGGTTTACTGAGCAAGGGGATGCATTAACCTTTGAA
TCCGAGATTGATAGAGTGTACTTGAACTCTAAAGACGTGGTTGCTGTTTTTGACCATGAG
AGAAAACGTACATTCCTCATCGAGAAAGAAGGTTTGCCTGATGTTGTGGTGTGGAATCCA
TGGGACAAGAAAGCTAAAGCATTGCCAGATTTGGGAGATGAAGAGTACAAACAGATGCTT
TGTGTTGATGGAGCAGCCATTGAGAAACCAATCACCTTGAAACCGGGTGAAGAATGGACC
GGGAAATTAAATCTTTCCCTTGTCCTTTCCACCTGAAAAAAACCGGTACCGGTTATTTTC
AAACCTATTGATTTTTCTTTGTCTCTCTTATTATTATATTTTTCGGTATAGTTTACAGAA
GATCATCACAGTGTGTGTGTGTGTGATTTTTTGGCATCAAAATCCTGAATATTAAAAGGA
AACCTGAGATTTG

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL4460Contig1 958 2 2 U
GGGTTGAACTTGGTCTCTGAGCTGCTTCTTCGCCCCCTTTATAATTTTCCAGCAAATAAC
AAAAAAAAACTTCCCTAAGAAAAAACAAAGAGAATCCTTTATAAATTATCTGAGTCTCTT
CAACAGTTTTCTCAAACATCCATCAAAATCTCAGGTTCTTGTGATTTTCTTTCTTCAAAC
TACTAACAAAAGCTTTTGGATATGGCGTCGAGTCAGTGGACGAGGTCGGAGGACAAGATG
TTCTAGCAAGCGCTGGTGCTATTCCCAGAGGGATCTCCCAATCGGTGGGAGAGAATCGCC
GATCAGCTCCAGAAATCGGCTGGTGAAGTTAGGGAGCATTACGAAGCGTTGGTGCACGAC
GTTTTGGAGATCGATTCCGGACGAGTCGATGTCCCTGATTACATGGATGACTCGGCTGCG
GGTTGGGACTCAGCTGGTCAGATCTCGTTTGGGTCTAAACACGGGGAGACCGAGCGGAAA
CGAGGAACTCCTTGGTCCGAAAACGAACACAAATTGTTTCTGATTGGATTAAAGAGATAT
GGGAAAGGAGACTGGAGGAGCATATCGAGGAACGTGGTGGTCACTAGGACACCAACGCAA
GTCGCCAGCCATGCTCAGAAATATTTCCTTAGACAGAACTCTGTGAAGAAAGAGAGGAAG
AGGTCGAGCATCCACGACATAACTACTGTCGATACTAACTTAGCCATGCCTGGTTCGAAC
ATGGACTGGACTGGACAGCAGGAGAGCTCTGTTCAGACTCAGCATCAGCAGCAACGGAGC
ATGTCGGAGTTTGGTCAGGAACTGATGACTCCGGGTGGTCATTATGAGGAGTTCGGTTAT
CGGATGTGAAAGAAGAGGGAGGGGAGTTTGTAATGGCTTTAGTTTGTTTAGTAGGTGTTT
TTTTTTACACATTTTATGTGAATAGGAAAGCATTAGCATTGGGTTTATTTTCTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H928TF U 1
AF RR2H928JQ C 229
BS 1 738 RR2H928TF
BS 739 958 RR2H928JQ

RD RR2H928TF 738 0 0
GGGTTGAACTTGGTCTCTGAGCTGCTTCTTCGCCCCCTTTATAATTTTCCAGCAAATAAC
AAAAAAAAACTTCCCTAAGAAAAAACAAAGAGAATCCTTTATAAATTATCTGAGTCTCTT
CAACAGTTTTCTCAAACATCCATCAAAATCTCAGGTTCTTGTGATTTTCTTTCTTCAAAC
TACTAACAAAAGCTTTTGGATATGGCGTCGAGTCAGTGGACGAGGTCGGAGGACAAGATG
TTCTAGCAAGCGCTGGTGCTATTCCCAGAGGGATCTCCCAATCGGTGGGAGAGAATCGCC
GATCAGCTCCAGAAATCGGCTGGTGAAGTTAGGGAGCATTACGAAGCGTTGGTGCACGAC
GTTTTGGAGATCGATTCCGGACGAGTCGATGTCCCTGATTACATGGATGACTCGGCTGCG
GGTTGGGACTCAGCTGGTCAGATCTCGTTTGGGTCTAAACACGGGGAGACCGAGCGGAAA
CGAGGAACTCCTTGGTCCGAAAACGAACACAAATTGTTTCTGATTGGATTAAAGAGATAT
GGGAAAGGAGACTGGAGGAGCATATCGAGGAACGTGGTGGTCACTAGGACACCAACGCAA
GTCGCCAGCCATGCTCAGAAATATTTCCTTAGACAGAACTCTGTGAAGAAAGAGAGGAAG
AGGTCGAGCATCCACGACATAACTACTGTCGATACTAACTTAGCCATGCCTGGTTCGAAC
ATGGACTGGACTGGACAG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2H928JQ 730 0 0
GAGGACAAGATGTTCTAGCAAGCGCTGGTGCTATTCCCAGAGGGATCTCCCAATCGGTGG
GAGAGAATCGCCGATCAGCTCCAGAAATCGGCTGGTGAAGTTAGGGAGCATTACGAAGCG
TTGGTGCACGACGTTTTGGAGATCGATTCCGGACGAGTCGATGTCCCTGATTACATGGAT
GACTCGGCTGCGGGTTGGGACTCAGCTGGTCAGATCTCGTTTGGGTCTAAACACGGGGAG
ACCGAGCGGAAACGAGGAACTCCTTGGTCCGAAAACGAACACAAATTGTTTCTGATTGGA
TTAAAGAGATATGGGAAAGGAGACTGGAGGAGCATATCGAGGAACGTGGTGGTCACTAGG
ACACCAACGCAAGTCGCCAGCCATGCTCAGAAATATTTCCTTAGACAGAACTCTGTGAAG
AAAGAGAGGAAGAGGTCGAGCATCCACGACATAACTACTGTCGATACTAACTTAGCCATG
CCTGGTTCGAACATGGACTGGACTGGACAGCAGGAGAGCTCTGTTCAGACTCAGCATCAG
CAGCAACGGAGCATGTCGGAGTTTGGTCAGGAACTGATGACTCCGGGTGGTCATTATGAG
GAGTTCGGTTATCGGATGTGAAAGAAGAGGGAGGGGAGTTTGTAATGGCTTTAGTTTGTT
TAGTAGGTGTTTTTTTTTACACATTTTATGTGAATAGGAAAGCATTAGCATTGGGTTTAT
TTTCTTATAC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL4461Contig1 955 2 2 U
GCGGCATTCTCTACGACGCCGCCGCCGTCCCTTCCAATTTAACCGGGATCAAACTCTCCG
CCGTGAGACTCAGAAGCGGAAGCTTGAGAAAACACGGAGTACATTCTCTCAACGAGTTCT
CAATTCCGACAGGTTTGGTCGTGAAGCCGTACGTGACGAGACTCGTCCTTGTGTATCAGA
ACCTAGCTAACTACTCTCGCTTGTATTACCCTTTGACTGGTTACGACTACGTCGCTCCCG
TGCTGGGTCTCCTCGCTTACGACGCTAAGAATCTCTCCGCCGTTAACTTGCCGGAGCTCG
AGTTAACGGCGTCGAACGATCCCATTAGGATTGGTTTCACTGATCTCGAACGTATCCCGC
AAGGGTCTAGCGCTAAGTGCGTTAGTTTTGATTCGCGAGGGAAAGCGAGTTTTAAGGACT
CGGTTCAGCCTGGGAACACGTGTGAGACTGATCGTCAGGGACATTTCTCAGTGGTGGTGA
AGTCTGTGGCGTCTGCTCCGTCACCGATTGAGGGAAGGAAGAAGAAGAAGGATAAGAGCT
CTGAGGACAGTTCAAGGACTTGGATCATTGTTGGATCAGTGGTTGGTGGGCTGATACTTT
TGGGGCTGTTGGTGTTTATTGTTTTGAGGTGTCGGAGTTACAAGAAGGAGGAGAAGATTA
GGGAGATGGAGAGAGCTGGAGAGACAGGGGAAGCTCTTAGGATGACTCAGGTTGGAGAGA
CAAGAGCACCGACAGCTACTACGACTCGTACACAACCAATGCTTGAAACTGAATACGCAG
CTTAGATTTGATTGTGTGTTTTGTGTACATCATCATTAGCTTCAGCTTTGATCCATCTGT
TACTGTCTTCTGGTAAAGTGTTTTTCTGATTTTTTTTTAGTTGTGGTTAGCAAGTTGATA
CGTACATTCATCTTGTTTCTCTACGAGTGATTTAAGGAAATAAGCATTATTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B476TF U 1
AF RR2B476JQ C 40
BS 1 698 RR2B476TF
BS 699 955 RR2B476JQ

RD RR2B476TF 698 0 0
GCGGCATTCTCTACGACGCCGCCGCCGTCCCTTCCAATTTAACCGGGATCAAACTCTCCG
CCGTGAGACTCAGAAGCGGAAGCTTGAGAAAACACGGAGTACATTCTCTCAACGAGTTCT
CAATTCCGACAGGTTTGGTCGTGAAGCCGTACGTGACGAGACTCGTCCTTGTGTATCAGA
ACCTAGCTAACTACTCTCGCTTGTATTACCCTTTGACTGGTTACGACTACGTCGCTCCCG
TGCTGGGTCTCCTCGCTTACGACGCTAAGAATCTCTCCGCCGTTAACTTGCCGGAGCTCG
AGTTAACGGCGTCGAACGATCCCATTAGGATTGGTTTCACTGATCTCGAACGTATCCCGC
AAGGGTCTAGCGCTAAGTGCGTTAGTTTTGATTCGCGAGGGAAAGCGAGTTTTAAGGACT
CGGTTCAGCCTGGGAACACGTGTGAGACTGATCGTCAGGGACATTTCTCAGTGGTGGTGA
AGTCTGTGGCGTCTGCTCCGTCACCGATTGAGGGAAGGAAGAAGAAGAAGGATAAGAGCT
CTGAGGACAGTTCAAGGACTTGGATCATTGTTGGATCAGTGGTTGGTGGGCTGATACTTT
TGGGGCTGTTGGTGTTTATTGTTTTGAGGTGTCGGAGTTACAAGAAGGAGGAGAAGATTA
GGGAGATGGAGAGAGCTGGAGAGACAGGGGAAGCTCTT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2B476JQ 916 0 0
TT
ACCGGGATCAAACTCTCCGCCGTGAGACTCAGAAGCGGAAGCTTGAGAAAACACGGAGTA
CAT*CTCTCAACGAGTTCTCAATTCCGACAGGTTTGGTCGTGAAGCCGTACGTGACGAGA
CTCGTCCTTGTGTATCAGAACCTAGCTAACTACTCTCGCTTGTATTACCCTTTGACTGGT
TACGACTACGTCGCTCCCGTGCTGGGTCTCCTCGCTTACGACGCTAAGAATCTCTCCGCC
GTTAACTTGCCGGAGCTCGAGTTAACGGCGTCGAACGATCCCATTAGGATTGGTTTCACT
GATCTCGAACGTATCCCGCAAGGGTCTAGCGCTAAGTGCGTTAGTTTTGATTCGCGAGGG
AAAGCGAGTTTTAAGGACTCGGTTCAGCCTGGGAACACGTGTGAGACTGATCGTCAGGGA
CATTTCTCAGTGGTGGTGAAGTCTGTGGCGTCTGCTCCGTCACCGATTGAGGGAAGGAAG
AAGAAGAAGGATAAGAGCTCTGAGGACAGTTCAAGGACTTGGATCATTGTTGGATCAGTG
GTTGGTGGGCTGATACTTTTGGGGCTGTTGGTGTTTATTGTTTTGAGGTGTCGGAGTTAC
AAGAAGGAGGAGAAGATTAGGGAGATGGAGAGAGCTGGAGAGACAGGGGAAGCTCTTAGG
ATGACTCAGGTTGGAGAGACAAGAGCACCGACAGCTACTACGACTCGTACACAACCAATG
CTTGAAACTGAATACGCAGCTTAGATTTGATTGTGTGTTTTGTGTACATCATCATTAGCT
TCAGCTTTGATCCATCTGTTACTGTCTTCTGGTAAAGTGTTTTTCTGATTTTTTTTTAGT
TGTGGTTAGCAAGTTGATACGTACATTCATCTTGTTTCTCTACGAGTGATTTAAGGAAAT
AAGCATTATTGTTT

QA 3 916 3 916
DS 



AS 1 2

CO CL4462Contig1 878 2 2 U
GTCTTAAATAGAACTATAAGCATCTGACTAGAAATATCCTTGATTCAGCAATGATCAAAT
AGTATGTACTTACACTTAAAATGCCTGACAAATTGGATGCATTGGTAAGGTGGTTGAGTA
CGTGAGTGAGGCCCAGCACCGCTTGATAAGGTGGTTGGCATACAGCAAAATATACTTAGC
CCTGTAAATAGGTATGATGACATAGTTAAGTTTTAGAGTCCTCATATCTGTACTGAGCAT
TGGTTAAGATAGATCAACTGAAGAATAAGAGTATCAAGAGAAAAAGACTATAGGGCACTA
ACTATTCCAGTTGCTTTTTCTTGCCCGTCACTCTTAAACAGAATTAATTGAACAATATGG
TTAAGGAACCCATCAAGATTTAAACAAGACATCAATGTGGATACAAAATCACAAAGGAAA
TGAGGTTTAGCTCTTTAGTCAACTAGTATCATCACAAGACAGAGAAAGAACACACAGTGG
ATATTCATCAGCTACATCAACATAAAAACAAAGAAATTATACATACATATAGAGACTGAT
AGAATCACCTGATGTTATAAATATTCCACCTGTGCTGAACGTTGAAAGAGAGTATTTGTC
GGCAAGACATCCAAGAGTTGGGTTTGCAAATCAGTAACAAGAGCTGTAAGACAATTAACC
AACATTGCACAAACATTTAATTAAAACATCAACAAGCAAATTAAAATAAATCTTCTTAAG
AATGCTTAAGCAGAGAGAGAGTGCATTTACCTAGAGGCAAGAAATTATCTGAAGCAAAAT
TCAGCAACTCTTTCCCAAAATGATATCTTTTAGCAGAAGCTGAGAAGCCTCCATTACGAC
CTACCTATGGAGCAAAACAAAAGGCATTCAACGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G879TF U 1
AF RR2G879JQ C 350
BS 1 589 RR2G879TF
BS 590 878 RR2G879JQ

RD RR2G879TF 589 0 0
GTCTTAAATAGAACTATAAGCATCTGACTAGAAATATCCTTGATTCAGCAATGATCAAAT
AGTATGTACTTACACTTAAAATGCCTGACAAATTGGATGCATTGGTAAGGTGGTTGAGTA
CGTGAGTGAGGCCCAGCACCGCTTGATAAGGTGGTTGGCATACAGCAAAATATACTTAGC
CCTGTAAATAGGTATGATGACATAGTTAAGTTTTAGAGTCCTCATATCTGTACTGAGCAT
TGGTTAAGATAGATCAACTGAAGAATAAGAGTATCAAGAGAAAAAGACTATAGGGCACTA
ACTATTCCAGTTGCTTTTTCTTGCCCGTCACTCTTAAACAGAATTAATTGAACAATATGG
TTAAGGAACCCATCAAGATTTAAACAAGACATCAATGTGGATACAAAATCACAAAGGAAA
TGAGGTTTAGCTCTTTAGTCAACTAGTATCATCACAAGACAGAGAAAGAACACACAGTGG
ATATTCATCAGCTACATCAACATAAAAACAAAGAAATTATACATACATATAGAGACTGAT
AGAATCACCTGATGTTATAAATATTCCACCTGTGCTGAACGTTGAAAGA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2G879JQ 529 0 0
GAACAATATGGTTAAGGAACCCATCAAGATTTAAACAAGACATCAATGTGGATACAAAAT
CACAAAGGAAATGAGGTTTAGCTCTTTAGTCAACTAGTATCATCACAAGACAGAGAAAGA
ACACACAGTGGATATTCATCAGCTACATCAACATAAAAACAAAGAAATTATACATACATA
TAGAGACTGATAGAATCACCTGATGTTATAAATATTCCACCTGTGCTGAACGTTGAAAGA
GAGTATTTGTCGGCAAGACATCCAAGAGTTGGGTTTGCAAATCAGTAACAAGAGCTGTAA
GACAATTAACCAACATTGCACAAACATTTAATTAAAACATCAACAAGCAAATTAAAATAA
ATCTTCTTAAGAATGCTTAAGCAGAGAGAGAGTGCATTTACCTAGAGGCAAGAAATTATC
TGAAGCAAAATTCAGCAACTCTTTCCCAAAATGATATCTTTTAGCAGAAGCTGAGAAGCC
TCCATTACGACCTACCTATGGAGCAAAACAAAAGGCATTCAACGAGTCC

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL4463Contig1 510 2 1 U
GGGATGAAATTTTGATCTATCTGCGATTATCTTTTGTTGAAATTCCCAATTCCTGAGAGT
CAAGAACCCTAACTTTAATATGGTTTGCATAATGTGTTTGGTGCCGCTGTTCCTCGTCCC
GCTCGTCAATTTACTGCCTCGGATCATTGATTTCTTAATGGCCAAACTGTATGGATGGCT
CGGATGGGAATACAGGAAGCCAGCTAGAGTTCCTCCAGCTTGTCCTTTCAAGCCAACTGT
CACCAAAGTAGCTGCAGAAACAATAAGTGAAGGTACAGAAACAATAGCTAAACCCGCGGA
GGATACCACTGGTGGTGGGGTGAAGCAGGATTGAAGCTGACTCCTCCTCCCTCCTTTAAT
AAAGCTTTTTAACATTCTGTGGACATGTTTTGGATAAGAGAACAGTCTTGTGTGTGTGTG
TGTGTCATAATAATGTACGTTCAAAGTTTATGGTCATCGTTGTAACAGATAATTTTCTTT
TAGTGTTTACATGGGCTAGACTTGGAATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CX36JQ C 1
AF RR2CX36TF U 1
BS 1 510 RR2CX36TF

RD RR2CX36JQ 510 0 0
GGGATGAAATTTTGATCTATCTGCGATTATCTTTTGTTGAAATTCCCAATTCCTGAGAGT
CAAGAACCCTAACTTTAATATGGTTTGCATAATGTGTTTGGTGCCGCTGTTCCTCGTCCC
GCTCGTCAATTTACTGCCTCGGATCATTGATTTCTTAATGGCCAAACTGTATGGATGGCT
CGGATGGGAATACAGGAAGCCAGCTAGAGTTCCTCCAGCTTGTCCTTTCAAGCCAACTGT
CACCAAAGTAGCTGCAGAAACAATAAGTGAAGGTACAGAAACAATAGCTAAACCCGCGGA
GGATACCACTGGTGGTGGGGTGAAGCAGGATTGAAGCTGACTCCTCCTCCCTCCTTTAAT
AAAGCTTTTTAACATTCTGTGGACATGTTTTGGATAAGAGAACAGTCTTGTGTGTGTGTG
TGTGTCATAATAATGTACGTTCAAAGTTTATGGTCATCGTTGTAACAGATAATTTTCTTT
TAGTGTTTACATGGGCTAGACTTGGAATTC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2CX36TF 510 0 0
GGGATGAAATTTTGATCTATCTGCGATTATCTTTTGTTGAAATTCCCAATTCCTGAGAGT
CAAGAACCCTAACTTTAATATGGTTTGCATAATGTGTTTGGTGCCGCTGTTCCTCGTCCC
GCTCGTCAATTTACTGCCTCGGATCATTGATTTCTTAATGGCCAAACTGTATGGATGGCT
CGGATGGGAATACAGGAAGCCAGCTAGAGTTCCTCCAGCTTGTCCTTTCAAGCCAACTGT
CACCAAAGTAGCTGCAGAAACAATAAGTGAAGGTACAGAAACAATAGCTAAACCCGCGGA
GGATACCACTGGTGGTGGGGTGAAGCAGGATTGAAGCTGACTCCTCCTCCCTCCTTTAAT
AAAGCTTTTTAACATTCTGTGGACATGTTTTGGATAAGAGAACAGTCTTGTGTGTGTGTG
TGTGTCATAATAATGTACGTTCAAAGTTTATGGTCATCGTTGTAACAGATAATTTTCTTT
TAGTGTTTACATGGGCTAGACTTGGAATTC

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL4464Contig1 696 2 2 U
TGATCTTATAAAAATACAAATGCAAAGTTAGATAGTGTTTCATTTGAAAAGGGTCAACAG
CACTTAGCACAAGCTTATTTAGTACAAGAAGAAGCATCTTTGTTTGCCTCTATCAGCACC
AACGTATTGATAACCATCATATAAGCTTACAACATTAGCACAATCAAGGCGATCTTGAAC
CCGGTGTAATCCTATCTTTACCAAATCTAGACACACTCTTAGGAGTCACAGCACCAGGAC
TCGCTCCACGATAACTCGCGCGAAGGCTCTCATCAACAGCAGAAGAAGACTTCCTTATCG
CCCGTCTGAAAAACTTCTTAGCGGCGGGCGAAAGCATAGTCCTAACGTTCGGACTCGCGC
TTCCGCTTCCAAGACGAGGAGACGGCGGAAACGGAGGCTTCTTAAACATACTGTTCGACC
TCTCTCTCAGCTTCCTCGACACATCCCTCGACAAAGAATGCGCCCTCACGTCCCTCGCAG
GCGCGGGCGGAATGTTGTAGTGAGGACCATCAGCTCTACCGCCGATATCGATAGGCGTAT
CCTCGGGGTCTAACCGCATAGGTGTCCCTTCGATCTCACCCCATGTAACAAAAGGCGATT
CATCTAAACCAGGTGCAGGAGACGGAGTTTTAACAAAACTATACCCGTTATCTGCTCTCT
TATCCGACTCCACGTAGAAACGATTCGGAGTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CX81TF C 1
AF RR2CX81JQ U 41
BS 1 40 RR2CX81TF
BS 41 696 RR2CX81JQ

RD RR2CX81TF 696 0 0
TGATCTTATAAAAATACAAATGCAAAGTTAGATAGTGTTTCATTTGAAAAGGTTCAACAG
CACTTAGCACAAGCTTATTTAGTACAAGAAGAAGCATCTTTGTTTGCCTCTATCAGCACC
AACGTATTGATAACCATCATATAAGCTTACAACATTAGCACAATCAAGGCGATCTTGAAC
CCGGTGTAATCCTATCTTTACCAAATCTAGACACACTCTTAGGAGTCACAGCACCAGGAC
TCGCTCCACGATAACTCGCGCGAAGGCTCTCATCAACAGCAGAAGAAGACTTCCTTATCG
CCCGTCTGAAAAACTTCTTAGCGGCGGGCGAAAGCATAGTCCTAACGTTCGGACTCGCGC
TTCCGCTTCCAAGACGAGGAGACGGCGGAAACGGAGGCTTCTTAAACATACTGTTCGACC
TCTCTCTCAGCTTCCTCGACACATCCCTCGACAAAGAATGCGCCCTCACGTCCCTCGCAG
GCGCGGGCGGAATGTTGTAGTGAGGACCATCAGCTCTACCGCCGATATCGATAGGCGTAT
CCTCGGGGTCTAACCGCATAGGTGTCCCTTCGATCTCACCCCATGTAACAAAAGGCGATT
CATCTAAACCAGGTGCAGGAGACGGAGTTTTAACAAAACTATACCCGTTATCTGCTCTCT
TATCCGACTCCACGTAGAAACGATTCGGAGTCTTCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2CX81JQ 656 0 0
CATTTGAAAAGGGTCAACAGCACTTAGCACAAGCTTATTTAGTACAAGAAGAAGCATCTT
TGTTTGCCTCTATCAGCACCAACGTATTGATAACCATCATATAAGCTTACAACATTAGCA
CAATCAAGGCGATCTTGAACCCGGTGTAATCCTATCTTTACCAAATCTAGACACACTCTT
AGGAGTCACAGCACCAGGACTCGCTCCACGATAACTCGCGCGAAGGCTCTCATCAACAGC
AGAAGAAGACTTCCTTATCGCCCGTCTGAAAAACTTCTTAGCGGCGGGCGAAAGCATAGT
CCTAACGTTCGGACTCGCGCTTCCGCTTCCAAGACGAGGAGACGGCGGAAACGGAGGCTT
CTTAAACATACTGTTCGACCTCTCTCTCAGCTTCCTCGACACATCCCTCGACAAAGAATG
CGCCCTCACGTCCCTCGCAGGCGCGGGCGGAATGTTGTAGTGAGGACCATCAGCTCTACC
GCCGATATCGATAGGCGTATCCTCGGGGTCTAACCGCATAGGTGTCCCTTCGATCTCACC
CCATGTAACAAAAGGCGATTCATCTAAACCAGGTGCAGGAGACGGAGTTTTAACAAAACT
ATACCCGTTATCTGCTCTCTTATCCGACTCCACGTAGAAACGATTCGGAGTCTTCC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL4465Contig1 1421 2 2 U
GGGCGTTTACGGTAGAGAAATGATCTGTCCTAGCTCGACAAAAGCTAAGAAGCGGCAAGA
TCTCTGAGCTCTGTTGCGATAGGTACAAATAATCAAAATCGCAATGGGGGAAGGCAACTT
GTCGTTTCGCCGTCTCACCAGCATACGCCACCGGAAGAAGCGCACTGCGGCGAAGGATGA
TGCTGAAGCTAGCCTCATCTCGTCTTCACCGCCTCCTACGCCGATAACACCAGCTGCGGT
TGTCGGGAAGGCGAAGAAGAAAGCTATAGGAGCGAGGTTGTGGATGAGGTTTGATCGGAC
TGGAGCTATGGAAGTGGTGGAATGCGACAAGAGCACCATCATCAAACGTGCTTCTGTCCC
CGCTAGAGATCTCAGGATTCTTGGCCCTGTCTTCTCCCACTCTTCTAACATTCTTGCGAG
GGAGAAAGCTATTGTTGTGAACTTAGAAGTCTTAAAGTTAATAGTCACCGCTGAAGAAGT
GCTTCTCTTGGATCCTCTCCGTCCTGATGTTCTACCATTCGTTGAACGACTCAAGCAACA
GTTTCCTCAGAGTACTGATGCTTCTGAAAACGTTGTGCAATCATCTGTTCTTGATCATGA
AGCTGGAGAGGGCTTGCAGAGTGAGCTTCCTTTTGAGTTCCAGGTTCTCGAGATTGCGCT
AGAGACTGTCTGCTCGTTTCTTGATACTAGTGTCTATGCACTTGAGACAGAAGCTTGGCC
TGTCCTAGATGAACTAACCAAGAATGTCAGCACCGAGAATCTTGAATACGTTAGAAGCTT
GAAAAGTAATCTCACCCGCTTGCTAGCCCGTGTACAGAAGGTGAGAGACGAAATCGAACA
TTTGTTAGATGACAACGAAGACATGGCAGACTTGTACTTAACAAGGAAATGGATCCAGCA
GAACCAGCAATCTGAAGCAGAACTTGGAGAGACGGCATCAAACCTTCTTAGCCGGGCCAC
ATCAAACAGAAGCTCCACTATGGTGACGAGTAGTACGAAGGAGGACGACGTGGAGGATCT
AGAGATGTTGCTGGAGGCATACTTCATGCAACTAGTGGGGATGCGGAACAGGATACTTAC
GGTGAGAGAGTACATTGACGACACAGAAGACTACGTGAACATACAACTTGATAACCAACG
AAACGAAATGATTCAGCTGCAGCTGACGCTGACCATAGCCTCGTTTGCGATCACTGCAAA
CACGCTGTTGGTAAGTTTGTTCGGAATGAACATACCGTGTCCGTTGTATAAGATGGATGA
TGTCTTTGGTTACTTTTTGTCGAGTGTTATTGCGGTATGCGTTGTGATTTTCATGCTCAC
CCTTGGTTACGCCTGGTGGAAAAAGCTGCTTGGCTCGTAATCACTCTTTTTCCACTTGTG
TAATCAAAACAAAACCCATTGCTACATGTTTAGTACAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A820TF U 1
AF RR2A820JQ C 637
BS 1 709 RR2A820TF
BS 710 1421 RR2A820JQ

RD RR2A820TF 709 0 0
GGGCGTTTACGGTAGAGAAATGATCTGTCCTAGCTCGACAAAAGCTAAGAAGCGGCAAGA
TCTCTGAGCTCTGTTGCGATAGGTACAAATAATCAAAATCGCAATGGGGGAAGGCAACTT
GTCGTTTCGCCGTCTCACCAGCATACGCCACCGGAAGAAGCGCACTGCGGCGAAGGATGA
TGCTGAAGCTAGCCTCATCTCGTCTTCACCGCCTCCTACGCCGATAACACCAGCTGCGGT
TGTCGGGAAGGCGAAGAAGAAAGCTATAGGAGCGAGGTTGTGGATGAGGTTTGATCGGAC
TGGAGCTATGGAAGTGGTGGAATGCGACAAGAGCACCATCATCAAACGTGCTTCTGTCCC
CGCTAGAGATCTCAGGATTCTTGGCCCTGTCTTCTCCCACTCTTCTAACATTCTTGCGAG
GGAGAAAGCTATTGTTGTGAACTTAGAAGTCTTAAAGTTAATAGTCACCGCTGAAGAAGT
GCTTCTCTTGGATCCTCTCCGTCCTGATGTTCTACCATTCGTTGAACGACTCAAGCAACA
GTTTCCTCAGAGTACTGATGCTTCTGAAAACGTTGTGCAATCATCTGTTCTTGATCATGA
AGCTGGAGAGGGCTTGCAGAGTGAGCTTCCTTTTGAGTTCCAGGTTCTCGAGATTGCGCT
AGAGACTGTCTGCTCGTTTCTTGATACTAGTGTCTATGCACTTGAGACA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2A820JQ 785 0 0
GTTCCAGGTTCTCGAGATTGCGCTAGAGACTGTCTGCTCGTTTCTTGATACTAGTGTCTA
TGCACTTGAGACAGAAGCTTGGCCTGTCCTAGATGAACTAACCAAGAATGTCAGCACCGA
GAATCTTGAATACGTTAGAAGCTTGAAAAGTAATCTCACCCGCTTGCTAGCCCGTGTACA
GAAGGTGAGAGACGAAATCGAACATTTGTTAGATGACAACGAAGACATGGCAGACTTGTA
CTTAACAAGGAAATGGATCCAGCAGAACCAGCAATCTGAAGCAGAACTTGGAGAGACGGC
ATCAAACCTTCTTAGCCGGGCCACATCAAACAGAAGCTCCACTATGGTGACGAGTAGTAC
GAAGGAGGACGACGTGGAGGATCTAGAGATGTTGCTGGAGGCATACTTCATGCAACTAGT
GGGGATGCGGAACAGGATACTTACGGTGAGAGAGTACATTGACGACACAGAAGACTACGT
GAACATACAACTTGATAACCAACGAAACGAAATGATTCAGCTGCAGCTGACGCTGACCAT
AGCCTCGTTTGCGATCACTGCAAACACGCTGTTGGTAAGTTTGTTCGGAATGAACATACC
GTGTCCGTTGTATAAGATGGATGATGTCTTTGGTTACTTTTTGTCGAGTGTTATTGCGGT
ATGCGTTGTGATTTTCATGCTCACCCTTGGTTACGCCTGGTGGAAAAAGCTGCTTGGCTC
GTAATCACTCTTTTTCCACTTGTGTAATCAAAACAAAACCCATTGCTACATGTTTAGTAC
AAATT

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL4466Contig1 1085 2 2 U
GCTGTTCGACTCGGAGGATCCTAGAGAACGTGAGTCTCTCAAGACCATCCTCCACCGTGT
CTACGGGAAGTTCATGGTTCACAGACCGTTCATCCGCAAAGCCATGAGCAACATCTTCTA
CACCTTCGTGTTCGAGTCCGAGAAGCGAAACGGTATCGCCGAGCTTCTCGAGGTCTTCGG
GAGTATAGTGAGCGGTTTCGCTCTCCCTCTGAAAGAGGAGCATAAGATCTTTTTGTGGAG
AGTGCTTGTTCCGTTGCATAAAGCTAAATCGGTTGGGGGCTATTTTCGCCAGCTGTCTTA
TTGCGTGACGCAGTTTATTGATAAGGAGCCGAAGCTTGGGAGCGTTGTGGTGAAAGGGTT
GTTGAAGTTTTGGCCTGTGACGAGTAGTCAGAAGGAAGTTATGTTTCTTGGGGAGGTTGA
GGAGATTGTTGAGGGGATGAGTTTGTTGGAGTTTCAGAAGGTTATGGTTCCTCTGTTCTT
GAGGATTGCTTCCTGTGTCAACAGTTGCCACTTTCAGGTTTCAGAAAGAGCGTTGTTCTT
GTGGAACAACGATCAGATTGTGAATTTGATTGCGCACAACAGGCAAGCTATCTTACCGAT
CATGTTCACTGCCTTGAGAAGAACGCTGAGAATCACTGGAACCAATCTGTGCTGAACTTA
ACTCTAAACGTGAGGAAAATGTTCTGTGAGATGGACGAGGATTTGTTCATGTCTTGCCAC
GCACGGTTTCAGGAGGAGGAAGCAGAGCAATGCTCTGCAGAGGAGAAGAGGAAAGAAGTA
TGGGCGAGGCTGGAGAAGGCAGCGAGTATGAAGCCTGTAACTGGAAAGACAGCTGTTCTT
GTAACTCCTTTAGCAACCTCCATTGCTTGCTAAATGAAGATATGATGGAATGGCTGTTGC
TTAAGCTATGGTCTGTCTTGATTGATCTTTGTAATGTTATATAGTTTTTGATGTTGTTAG
CTATATATATGTGGGGTTTTATGCTAAATCTCTTGCTTTAAAAGTGAGGAAGCCGTTAAA
CCATGCCGCAGATTTCTATATGAAACTCTTTGTATTCAGTTAAGTTATATAAGAAATCCC
TTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2EE78TF U 1
AF RR2EE78JQ C 374
BS 1 560 RR2EE78TF
BS 561 1085 RR2EE78JQ

RD RR2EE78TF 560 0 0
GCTGTTCGACTCGGAGGATCCTAGAGAACGTGAGTCTCTCAAGACCATCCTCCACCGTGT
CTACGGGAAGTTCATGGTTCACAGACCGTTCATCCGCAAAGCCATGAGCAACATCTTCTA
CACCTTCGTGTTCGAGTCCGAGAAGCGAAACGGTATCGCCGAGCTTCTCGAGGTCTTCGG
GAGTATAGTGAGCGGTTTCGCTCTCCCTCTGAAAGAGGAGCATAAGATCTTTTTGTGGAG
AGTGCTTGTTCCGTTGCATAAAGCTAAATCGGTTGGGGGCTATTTTCGCCAGCTGTCTTA
TTGCGTGACGCAGTTTATTGATAAGGAGCCGAAGCTTGGGAGCGTTGTGGTGAAAGGGTT
GTTGAAGTTTTGGCCTGTGACGAGTAGTCAGAAGGAAGTTATGTTTCTTGGGGAGGTTGA
GGAGATTGTTGAGGGGATGAGTTTGTTGGAGTTTCAGAAGGTTATGGTTCCTCTGTTCTT
GAGGATTGCTTCCTGTGTCAACAGTTGCCACTTTCAGGTTTCAGAAAGAGCGTTGTTCTT
GTGGAACAACGATCAGATTG

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2EE78JQ 712 0 0
CCTGTGACGAGTAGTCAGAAGGAAGTTATGTTTCTTGGGGAGGTTGAGGAGATTGTTGAG
GGGATGAGTTTGTTGGAGTTTCAGAAGGTTATGGTTCCTCTGTTCTTGAGGATTGCTTCC
TGTGTCAACAGTTGCCACTTTCAGGTTTCAGAAAGAGCGTTGTTCTTGTGGAACAACGAT
CAGATTGTGAATTTGATTGCGCACAACAGGCAAGCTATCTTACCGATCATGTTCACTGCC
TTGAGAAGAACGCTGAGAATCACTGGAACCAATCTGTGCTGAACTTAACTCTAAACGTGA
GGAAAATGTTCTGTGAGATGGACGAGGATTTGTTCATGTCTTGCCACGCACGGTTTCAGG
AGGAGGAAGCAGAGCAATGCTCTGCAGAGGAGAAGAGGAAAGAAGTATGGGCGAGGCTGG
AGAAGGCAGCGAGTATGAAGCCTGTAACTGGAAAGACAGCTGTTCTTGTAACTCCTTTAG
CAACCTCCATTGCTTGCTAAATGAAGATATGATGGAATGGCTGTTGCTTAAGCTATGGTC
TGTCTTGATTGATCTTTGTAATGTTATATAGTTTTTGATGTTGTTAGCTATATATATGTG
GGGTTTTATGCTAAATCTCTTGCTTTAAAAGTGAGGAAGCCGTTAAACCATGCCGCAGAT
TTCTATATGAAACTCTTTGTATTCAGTTAAGTTATATAAGAAATCCCTTTTC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL4467Contig1 841 2 2 U
GGGAACAACAACACAACAACAACTAGAGAAAACGTTAGAGAGAGAACTAAAGAAACTACT
TCTCGCATATGATCTCTCCTGTGTGAGTGAGAGATGTTTAATGGCTTTTCCTTGATCTCG
TTCTGTATGGGGATTTCATTCTCCTTCTACTTTGGTTCGTCGAGTCCGGTTTGCCTCTCG
GTGGAGTTTCAGAACTTGTTTTGGTTCCGGTCTTGTTGTGTGAACGTGGTTTTCTTCTAG
ATTCGTGGGGTTGGCTTCCTATGCAAACCAGGGGATTTCATTTTCAGGTTGCCAATATTG
GATCACTGATAAAATTGGGTTCTATCGAATTCGTTTCCCACAAGTCATTGACGTCGTCAC
TCATCACTGTCAGGGTCGCCGTTTGTTTTCTACATCCGAAACTGATTTGCACGAGCTTGA
CAGTCTGAACGAGGAATCCTACAAAGATACCATATTAATTATGCAACTCCTTAGGGACAA
TCTGACTTTGTGGACCTCTGACATTCCAGAAGAAGGAGTGAACTGATATGTGTGCACCCG
CTGCAGCGGCACTAGACAAACATGTTTCAAGAACTGAATGTACGGTCAATAAATAGCAAA
ATGCAGAGTTCCCCTGTTTTAGTGTCATTATTATTGTGGATGTTGTTGTATAATCTCTCT
TTTGTTTGACCGTGTGAGTGTATTGCATCATCCTGATGCCCTGAGTTCAGTTCACTACTG
TTTTGCTTCACCCACCCATTTCTCTTTACCATATTTGTCTTGTGGATCTAATCTTGTATC
CCTTTTGTGTCTCTGGTTGAATCAGCCACACAAAACAGAATAACTCAATGCAGTTTCTTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2FR40TF U 1
AF RR2FR40JQ C 146
BS 1 656 RR2FR40TF
BS 657 841 RR2FR40JQ

RD RR2FR40TF 656 0 0
GGGAACAACAACACAACAACAACTAGAGAAAACGTTAGAGAGAGAACTAAAGAAACTACT
TCTCGCATATGATCTCTCCTGTGTGAGTGAGAGATGTTTAATGGCTTTTCCTTGATCTCG
TTCTGTATGGGGATTTCATTCTCCTTCTACTTTGGTTCGTCGAGTCCGGTTTGCCTCTCG
GTGGAGTTTCAGAACTTGTTTTGGTTCCGGTCTTGTTGTGTGAACGTGGTTTTCTTCTAG
ATTCGTGGGGTTGGCTTCCTATGCAAACCAGGGGATTTCATTTTCAGGTTGCCAATATTG
GATCACTGATAAAATTGGGTTCTATCGAATTCGTTTCCCACAAGTCATTGACGTCGTCAC
TCATCACTGTCAGGGTCGCCGTTTGTTTTCTACATCCGAAACTGATTTGCACGAGCTTGA
CAGTCTGAACGAGGAATCCTACAAAGATACCATATTAATTATGCAACTCCTTAGGGACAA
TCTGACTTTGTGGACCTCTGACATTCCAGAAGAAGGAGTGAACTGATATGTGTGCACCCG
CTGCAGCGGCACTAGACAAACATGTTTCAAGAACTGAATGTACGGTCAATAAATAGCAAA
ATGCAGAGTTCCCCTGTTTTAGTGTCATTATTATTGTGGATGTTGTTGTATAATCT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2FR40JQ 696 0 0
TCTACTTTGGTTCGTCGAGTCCGGTTTGCCTCTCGGTGGAGTTTCAGAACTTGTTTTGGT
TCCGGTCTTGTTGTGTGAACGTGGTTTTCTTCTAGATTCGTGGGGTTGGCTTCCTATGCA
AACCAGGGGATTTCATTTTCAGGTTGCCAATATTGGATCACTGATAAAATTGGGTTCTAT
CGAATTCGTTTCCCACAAGTCATTGACGTCGTCACTCATCACTGTCAGGGTCGCCGTTTG
TTTTCTACATCCGAAACTGATTTGCACGAGCTTGACAGTCTGAACGAGGAATCCTACAAA
GATACCATATTAATTATGCAACTCCTTAGGGACAATCTGACTTTGTGGACCTCTGACATT
CCAGAAGAAGGAGTGAACTGATATGTGTGCACCCGCTGCAGCGGCACTAGACAAACATGT
TTCAAGAACTGAATGTACGGTCAATAAATAGCAAAATGCAGAGTTCCCCTGTTTTAGTGT
CATTATTATTGTGGATGTTGTTGTATAATCTCTCTTTTGTTTGACCGTGTGAGTGTATTG
CATCATCCTGATGCCCTGAGTTCAGTTCACTACTGTTTTGCTTCACCCACCCATTTCTCT
TTACCATATTTGTCTTGTGGATCTAATCTTGTATCCCTTTTGTGTCTCTGGTTGAATCAG
CCACACAAAACAGAATAACTCAATGCAGTTTCTTCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL4468Contig1 642 2 3 U
GAAAGACAACACCCTGATTAGTGATCTTACATGGACTCATATGATCACCATGCCAGAGAT
CATAGATGTGTGTGAATTTAAAAAAAAACATTATTCTGCGTACTTTAATGTTAAGTAGCT
AGTACTTAGTGTCAAATAACTATAGATAAATATATTAAGTCAAACCCACAATGCACCAGC
CCTCTTAAGCATAGGGATCAATGAGCCGTTAAGATGAAGACTCATGACCTCGTTGGCTCC
ACCAACTAACTCTCCTCCGATAAAAACCACTGGAACCGCTGGGCTACATCCAAGCCGCAA
CAAGGCCTGCTCAATCTCCCTCCCTCTTGATACCTCATCTAGCTCGTAAACGGCTGGATT
TGCTCCCAAATCGCAAAGCAATGTCTTGACCGTGTGGGACATGCAACATAAGCTTTTGCT
GTATATCACCACTGGTCTCTCCAGAACCATCTCTGTTATCATATCCATTGCTAGTTTTTG
TTTCTTTGTTTTACTTTTGAAATAGGTTTATGATTATGAATCAGTATCTATGTATTTTAC
GGTTGAAGAGAAAATATCAAACTGATTTTTAAAAGGTTTAAGGGAAAATAATGAAACTCT
TGATTCGACTCGAAGAATAATGTTTTGTGAGAATGTTGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F915JQ U 67
AF RR2F915TF C 1
BS 1 66 RR2F915TF
BS 67 586 RR2F915JQ
BS 587 642 RR2F915TF

RD RR2F915JQ 520 0 0
TGTGTGTGAATTTAAAAAAAAACATTATTCTGCGTACTTTAATGTTAAGTAGCTAGTACT
TAGTGTCAAATAACTATAGATAAATATATTAAGTCAAACCCACAATGCACCAGCCCTCTT
AAGCATAGGGATCAATGAGCCGTTAAGATGAAGACTCATGACCTCGTTGGCTCCACCAAC
TAACTCTCCTCCGATAAAAACCACTGGAACCGCTGGGCTACATCCAAGCCGCAACAAGGC
CTGCTCAATCTCCCTCCCTCTTGATACCTCATCTAGCTCGTAAACGGCTGGATTTGCTCC
CAAATCGCAAAGCAATGTCTTGACCGTGTGGGACATGCAACATAAGCTTTTGCTGTATAT
CACCACTGGTCTCTCCAGAACCATCTCTGTTATCATATCCATTGCTAGTTTTTGTTTCTT
TGTTTTACTTTTGAAATAGGTTTATGATTATGAATCAGTATCTATGTATTTTACGGTTGA
AGAGAAAATATCAAACTGATTTTTAAAAGGTTTAAGGGAA

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2F915TF 642 0 0
GAAAGACAACACCCTGATTAGTGATCTTACATGGACTCATATGATCACCATGCCAGAGAT
CATAGATGTGTGTGAATTTAAAAAAAAACATTATTCTGCGTACTTTAATGTTAAGTAGCT
AGTACTTAGTGTCAAATAACTATAGATAAATATATTAAGTCAAACCCACAATGCACCAGC
CCTCTTAAGCATAGGGATCAATGAGCCGTTAAGATGAAGACTCATGACCTCGTTGGCTCC
ACCAACTAACTCTCCTCCGATAAAAACCACTGGAACCGCTGGGCTACATCCAAGCCGCAA
CAAGGCCTGCTCAATCTCCCTCCCTCTTGATACCTCATCTAGCTCGTAAACGGCTGGATT
TGCTCCGAAATCGCAGAGCAATGTCTTGACCGTGTGGGACATGCAACATAAGCTTTTGCT
GTATATCACCACTGGTCTCTCCAGAACCATCTCTGTTATCATATCCATTGCTAGTTTTTG
TTTCTTTGTTTTACTTTTGAAATAGGTTTATGATTATGAATCAGTATCTATGTATTTTAC
GGTTGAAGAGAAAATATCAAACTGATTTTTAAAAGGTTTAAGGGAAAATAATGAAACTCT
TGATTCGACTCGAAGAATAATGTTTTGTGAGAATGTTGTATC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL4469Contig1 572 2 10 U
GGATTGTCCATCTATCTTCTTCTTCTACTCATTCCACATCTGACATCTCCTAGTTTATTT
CTTTTTAGACATGGCTAACTCACTTTTCTTTTTCTTCTTAGCCGTCTCTCTTATGTTTCT
TCTTGCAGCGGCTTCGACAACTGCAGCTGCAGGGAACGCCACAAGTGGGTTGAGATATGG
CGGATGTGCTCCCGGAGACACTGTTAGAGAATGCATAACGGCGGAGATTGAGGAGGATGG
AGTTGAGGCTGTGGTGCGGCGGATTCTGCAGCAACAGAAGGGGTATTTAGGCTACCGAGT
TCTACAGAAGCAGAGGCGAGCTTCGAACTGTAAGATCATTGCTAATTGCATCGGAATAGT
TAATCAGAAAAACGCACCTTGCACTTCCTACGAAAGATGCAAACGTGCCACTGGCTAATA
TTTCGTTTATTTTTTTTGAACTTATATTTCGTTTATTTTCTCTCTTGATTATGTGTGTGT
TTGAGATCCCTTCTTTTGTTTATCTTTTAAAGAATCAAAATGTAACAATAAGAACGTCTG
TCGGTTGGAATAAATGTTGATCGAATTTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FI91JQ C 1
AF RR2BV69TF U 29
BS 1 30 RR2FI91JQ
BS 31 240 RR2BV69TF
BS 241 241 RR2FI91JQ
BS 242 344 RR2BV69TF
BS 345 345 RR2FI91JQ
BS 346 417 RR2BV69TF
BS 418 418 RR2FI91JQ
BS 419 516 RR2BV69TF
BS 517 517 RR2FI91JQ
BS 518 572 RR2BV69TF

RD RR2FI91JQ 564 0 0
GGATTGTCCATCTATCTTCTTCTTCTACTCATTCCACATCTGACATCTCCTAGTTTATTT
CTTTTTAGACATTGCTAACTCACTTTTCTTTTTCTTCTTAGCCGTCTCTCTTATGTTTCT
TCTTGCAGCGGCTTCGACAACTGCAGCTGCAGGGAACGCCACAAGTGGGTTGAGATATGG
CGGATGTGCTCCCGGAGACACTGTTAGAGAATGCATAACGGCGGAGATTGAGGAGGATGG
AGTTGAGGCTGTGGTGCGGCGGATTCTGCAGCAACAGAAGGGGTATTTAGGCTACCGAGT
TCTACAGAAGCAGAGGCGAGCTTCGAACTGTAAGATCATTGCTAATTGCATCGGAATAGT
TAATCAGAAA**CGCACCTTGCACTTCCTACGAAAGATGCAAACGTGCCACTGGCTAATA
TTTCGTTTATTTTTTTTGAACTTATATTTCGTTTATTTTCTCTCTTGATTATGTGTGTGT
TTGAGATCCCTTCTTTTGTTTATCTTTTAAAGAATCAAAATGTAACAATAAGAACGTCTG
TCGGTTGGAATAAATGTTGATCGA

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2BV69TF 544 0 0
GG
ATTCCACATCTGACATCTCCTAGTTTATTTCTTTTTAGACATGGCTAACTCACTTTTCTT
TTTCTTCTTAGCCGTCTCTCTTATGTTTCTTCTTGCAGCGGCTTCGACAACTGCAGCTGC
AGGGAACGCCACAAGTGGGTTGAGATATGGCGGATGTGCTCCCGGAGACACTGTTAGAGA
ATGCATAACGGCGGAGATTGAGGAGGATGG*GTTGAGGCTGTGGTGCGGCGGATTCTGCA
GCAACAGAAGGGGTATTTAGGCTACCGAGTTCTACAGAAGCAGAGGCGAGCTTCGAACTG
TAAGATCATTGCTAGTTGCATCGGAATAGTTAATCAGAAAAACGCACCTTGCACTTCCTA
CGAAAGATGCAAACGTGCCACTGGCTAGTATTTCGTTTATTTTTTTTGAACTTATATTTC
GTTTATTTTCTCTCTTGATTATGTGTGTGTTTGAGATCCCTTCTTTTGTTTATCTTTTAA
AGAATCGAAATGTAACAATAAGAACGTCTGTCGGTTGGAATAAATGTTGATCGAATTTAA
TG

QA 3 544 3 544
DS 



AS 1 2

CO CL4470Contig1 614 2 1 U
GGAAAAGAGGGAGGGAGAACATACCTTATCTGCCTATCGGTGGGTCAGAAACAGAATGGC
GAATTCACTATGCTTCTTAGCTTCTCCTCCTACCAGTTGCATCCAGTCTCCCATCAAAAG
CCATATACCAACTCACTTCTTCTTTCTAATAAGTGATCAGAACTCGTTGTTGACTCAGAA
GAGACAAGTGTTTCAGACTTGTAAATCCAAAAGCTTCCAAATTCAGGCCACAGACGGTAC
TGAGACCACTAAATCTAACAGCATACTTTGTCCAAACTGTGAAGGCAAGGGTGCTGTGGC
ATGTTCTCAATGCAAAGGAGGAGGTGTGAATTTGATTGACCATTTTAATGGGCAGTTTAA
AGCTGGTGACTCCTGTTGGCTTTGTGGTGAGAAAAAGTTTGTTTTATGTGGGGACTGCAA
TGGAGCGGGTTTCCTTGGTGGTTTCTTGAGCACCCAGGATCAGTAATACATAAAAAAGCC
TCTTCAAAAGTTGGATCCTGCCATTTCTGTATAAACCTTAGATGTAAAAGTCTTTCTCTC
TATCAATGCTCTTCTAAAACCAAAATGTATATTACTACTTGTTACTGAACACCATCTTTT
ATTGTATTCTTGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EH24JQ C 1
AF RR2EH24TF U 1
BS 1 614 RR2EH24TF

RD RR2EH24JQ 614 0 0
GGAAAAGAGGGAGGGAGAACATACCTTATCTGCCTATCGGTGGGTCAGAAACAGAATGGC
GAATTCACTATGCTTCTTAGCTTCTCCTCCTACCAGTTGCATCCAGTCTCCCATCAAAAG
CCATATACCAACTCACTTCTTCTTTCTAATAAGTGATCAGAACTCGTTGTTGACTCAGAA
GAGACAAGTGTTTCAGACTTGTAAATCCAAAAGCTTCCAAATTCAGGCCACAGACGGTAC
TGAGACCACTAAATCTAACAGCATACTTTGTCCAAACTGTGAAGGCAAGGGTGCTGTGGC
ATGTTCTCAATGCAAAGGAGGAGGTGTGAATTTGATTGACCATTTTAATGGGCAGTTTAA
AGCTGGTGACTCCTGTTGGCTTTGTGGTGAGAAAAAGTTTGTTTTATGTGGGGACTGCAA
TGGAGCGGGTTTCCTTGGTGGTTTCTTGAGCACCCAGGATCAGTAATACATAAAAAAGCC
TCTTCAAAAGTTGGATCCTGCCATTTCTGTATAAACCTTAGATGTAAAAGTCTTTCTCTC
TATCAATGCTCTTCTAAAACCAAAATGTATATTACTACTTGTTACTGAACACCATCTTTT
ATTGTATTCTTGGC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2EH24TF 614 0 0
GGAAAAGAGGGAGGGAGAACATACCTTATCTGCCTATCGGTGGGTCAGAAACAGAATGGC
GAATTCACTATGCTTCTTAGCTTCTCCTCCTACCAGTTGCATCCAGTCTCCCATCAAAAG
CCATATACCAACTCACTTCTTCTTTCTAATAAGTGATCAGAACTCGTTGTTGACTCAGAA
GAGACAAGTGTTTCAGACTTGTAAATCCAAAAGCTTCCAAATTCAGGCCACAGACGGTAC
TGAGACCACTAAATCTAACAGCATACTTTGTCCAAACTGTGAAGGCAAGGGTGCTGTGGC
ATGTTCTCAATGCAAAGGAGGAGGTGTGAATTTGATTGACCATTTTAATGGGCAGTTTAA
AGCTGGTGACTCCTGTTGGCTTTGTGGTGAGAAAAAGTTTGTTTTATGTGGGGACTGCAA
TGGAGCGGGTTTCCTTGGTGGTTTCTTGAGCACCCAGGATCAGTAATACATAAAAAAGCC
TCTTCAAAAGTTGGATCCTGCCATTTCTGTATAAACCTTAGATGTAAAAGTCTTTCTCTC
TATCAATGCTCTTCTAAAACCAAAATGTATATTACTACTTGTTACTGAACACCATCTTTT
ATTGTATTCTTGGC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL4471Contig1 451 2 6 U
AGGGAATTCAAACACTCGTAGAAATTAATTGCTTTTACATAAACCTTTGTTACTCTTGTT
TGGTGACAAAATTGTTGTAAGAAACACAAAAGTTGGAACACTTTGAAAGAAAAAAAGAAC
AGAATTTTTGTCTACTTGGCGGATTTCTTCTTGGAAGGCTCAGCTTGGGATTCAGCTTTG
AGGATATTGAGTTGACCACCTTCTTTGCAAGCAGCATTAGCAGCTTTCACTTCATTGCAA
TGGTTAATGAATTTCGTAAGCTCCCGGTCGGTGTCTGACTCTTTCGTTGTCTTTGATGGT
TTCATATATCTCCTTCCTTTGCGAGTTTGAATGGCTTTTCCATGGCGATTTGGGGCAACA
GTCCTCTTCTTCTGTTGTCCCTTGAACTGATTGCTCTTCTGCGTCATCTTCTTCTTTGAT
CTAAACTTCTCGTTGTCTCTAGGGTTTTCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AH04TF C 1
AF RR2AH04JQ U 3
BS 1 2 RR2AH04TF
BS 3 162 RR2AH04JQ
BS 163 163 RR2AH04TF
BS 164 321 RR2AH04JQ
BS 322 322 RR2AH04TF
BS 323 451 RR2AH04JQ

RD RR2AH04TF 451 0 0
AGGGAATTCAAACACTCGTAGAAATTAATTGCTTTTACATAAACCTTTGTTACTCTTGTT
TGGTGACAAAATTGTTGTAAGAAACACAAAAGTTGGAACACTTTGAAAGAAAAAAAGAAC
AGAATTTTTGTCTACTTGGCGGATTTCTTCTTGGAAGGCTCAGCTTGGGATTCAGCTTTG
AGGATATTGAGTTGACCACCTTCTTTGCAAGCAGCATTAGCAGCTTTCACTTCATTGCAA
TGGTTAATGAATTTCGTAAGCTCCCGGTCGGTGTCTGACTCTTTCGTTGTCTTTGATGGT
TTCATATATCTCCTTCCTTTGCGAGTTTGAATGGCTTTTCCATGGCGATTTGGGGCAACA
GTCCTCTTCTTCTGTTGTCCCTTGAACTGATTGCTCTTCTGCGTCATCTTCTTCTTTGAT
CTAAACTTCTCGTTGTCTCTAGGGTTTTCCC

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR2AH04JQ 449 0 0
GGAATTCAAACACTCGTAGAAATTAATTGCTTTTACATAAACCTTTGTTACTCTTGTTTG
GTGACAAAATTGTTGTAAGAAACACAAAAGTTGGAACACTTTGAAAGAAAAAAAGAACAG
AATTTTTGTCTACTTGGCGGATTTCTTCTTGGAAGGCTCATCTTGGGATTCAGCTTTGAG
GATATTGAGTTGACCACCTTCTTTGCAAGCAGCATTAGCAGCTTTCACTTCATTGCAATG
GTTAATGAATTTCGTAAGCTCCCGGTCGGTGTCTGACTCTTTCGTTGTCTTTGATGGTTT
CATATATCTCCTTCCTTTGGGAGTTTGAATGGCTTTTCCATGGCGATTTGGGGCAACAGT
CCTCTTCTTCTGTTGTCCCTTGAACTGATTGCTCTTCTGCGTCATCTTCTTCTTTGATCT
AAACTTCTCGTTGTCTCTAGGGTTTTCCC

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 2

CO CL4472Contig1 911 2 4 U
GGGTAGCAAAAAAAAAAAAGAATGCGGTTCGTGCTTGTCCATGGGGTTTGTCATGGCGCA
TGGACTTGGTACAAAGTAAAACCACTCCTCGAGGCAGCTGGTCACAGCGTGACTGCAGTG
GATCTGGCAGCATCGGGTATAAGCACAGTCAAAGCCCAAGAGATTCAGAGTTTAAAAGAT
TACGCCAAACCGTTGCTTGATCTTTTGAGCTCGTTTGGGGGCAGAGAAAAAGTGACTATT
GTTGCTCATAGCATGGGAGGCGTATCGGCTGCTCTCGCTGCCGACATCTTCCCTAACAAG
ATCGCTGCTATTGTCTTCTTGACGGCTACCATGCCCGATACCAAGAACCCGCCTACTTAC
CCGTTCCAGAAGTTGGTCCCGAGTCGTTCGACACCAGTAGAGTTATCAGACACCACGTTT
CGCAGCTACGCAACACATGATCGTCCTCCTCCACATACTATTCTTTTCGGACCAAAGTTC
ATGGCCAAGAAACTATATCAACTGTCTCCGGTCGAAGATCTAGAACTGGTGAAACTGTTG
GTGAGGGAGAACCCGGCTTTGGCAATAGACAATCTTGCAGGAACAAGAGCTTTTAGTGAG
GAAGGGTATGGATCGGTTACACGTGTGTATATCATATGTGGAGAGGATGACTTGATACGT
GAGGAGCATCAGCGATTGATGATCAACAACTATCCGCCAAAAGAAGTGATAGAGATTAAA
GACGCGGATCATATGCCAATGTTCTCCAAACCTAAAGAACTATGTGCTTGTCTACTGGAA
ATCGCAGAAAAATATACTTGAATATTTGTAGTGATATGTTTGTATTGTCGTGGCGTGGAG
TCTCTATGGATGTTTCCTTCTTTATGTAAAGACAACAACATGTTTGTAAAACAGAGTCAG
TGTTTTACTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS90TF U 1
AF RR2DS90JQ C 93
BS 1 701 RR2DS90TF
BS 702 702 RR2DS90JQ
BS 703 774 RR2DS90TF
BS 775 911 RR2DS90JQ

RD RR2DS90TF 774 0 0
GGGTAGCAAAAAAAAAAAAGAATGCGGTTCGTGCTTGTCCATGGGGTTTGTCATGGCGCA
TGGACTTGGTACAAAGTAAAACCACTCCTCGAGGCAGCTGGTCACAGCGTGACTGCAGTG
GATCTGGCAGCATCGGGTATAAGCACAGTCAAAGCCCAAGAGATTCAGAGTTTAAAAGAT
TACGCCAAACCGTTGCTTGATCTTTTGAGCTCGTTTGGGGGCAGAGAAAAAGTGACTATT
GTTGCTCATAGCATGGGAGGCGTATCGGCTGCTCTCGCTGCCGACATCTTCCCTAACAAG
ATCGCTGCTATTGTCTTCTTGACGGCTACCATGCCCGATACCAAGAACCCGCCTACTTAC
CCGTTCCAGAAGTTGGTCCCGAGTCGTTCGACACCAGTAGAGTTATCAGACACCACGTTT
CGCAGCTACGCAACACATGATCGTCCTCCTCCACATACTATTCTTTTCGGACCAAAGTTC
ATGGCCAAGAAACTATATCAACTGTCTCCGGTCGAAGATCTAGAACTGGTGAAACTGTTG
GTGAGGGAGAACCCGGCTTTGGCAATAGACAATCTTGCAGGAACAAGAGCTTTTAGTGAG
GAAGGGTATGGATCGGTTACACGTGTGTATATCATATGTGGAGAGGATGACTTGATACGT
GAGGAGCATCAGCGATTGATGATCAACAACTATCCGCCAAA*GAAGTGATAGAGATTAAA
GACGCGGATCATATGCCAATGTTCTCCAAACCTAAAGAACTATGTGCTTGTCTA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2DS90JQ 819 0 0
AGGCAGCT
GTCACAGCGTGACTGCAGTGGATCTGGCAGCATCGGGTATAAGCACAGTCAAAGCCCAAG
AGAT*CAGAGTTTAAAAGATTACGCCAAACCGTTGCTTGATCTTTTGAGCTCGTTTGGGG
GCAGAGAAAAAGTGACTATTGTTGCTCATAGCATGGGAGGCGTATCGGCTGCTCTCGCTG
CCGACATCTTCCCTAACAAGATCGCTGCTATTGTCTTCTTGACGGCTACCATGCCCGATA
CCAAGAACCCGCCTACTTACCCGTTCCAGAAGTTGGTCCCGAGTCGTTCGACACCAGTAG
AGTTATCAGACACCACGTTTCGCAGCTACGCAACACATGATCGTCCTCCTCCACATACTA
TTCTTTTCGGACCAAAGTTCATGGCCAAGAAACTATATCAACTGTCTCCGGTCGAAGATC
TAGAACTGGTGAAACTGTTGGTGAGGGAGAACCCGGCTTTGGCAATAGACAATCTTGCAG
GAACAAGAGCTTTTAGTGAGGAAGGGTATGGATCGGTTACACGTGTGTATATCATATGTG
GAGAGGATGACTTGATACGTGAGGAGCATCAGCGATTGATGATCAACAACTATCCGCCAA
AAGAAGTGATAGAGATTAAAGACGCGGATCATATGCCAATGTTCTCCAAACCTAAAGAAC
TATGTGCTTGTCTACTGGAAATCGCAGAAAAATATACTTGAATATTTGTAGTGATATGTT
TGTATTGTCGTGGCGTGGAGTCTCTATGGATGTTTCCTTCTTTATGTAAAGACAACAACA
TGTTTGTAAAACAGAGTCAGTGTTTTACTTG

QA 9 819 9 819
DS 



AS 1 2

CO CL4473Contig1 790 2 2 U
GTCACTCGTTCAAGAGGCTGGTCGTTTCTTGAACGACCTGGTTGGCTCTTGCTTATTGCC
TTCTGGATTGCACAAGCGATTGCAACTGCTGTTGCTGTTTTGGCAGACTGGGAGTTTGCA
AGAATCAAAGGAATAGGGCTTGGATGGGCTGGGGTTATTTGGCTTTACAGTATTGTCTTT
TATATTCCATTAGACATGCTCAAGTTCGCAATCCGTTACATACTATCTGTAACTGCATGG
AATAATCTCATTGACAACAAGACTGCGTTTACTACGAAGCAAAACTATGGGATAGAGGAG
AGAGAGGCACAATGGGCTCTCGCACAGAGGACTTTACATGGTCTTCAGAACCAAGAAACG
GCTAATGTTTTCCCTGAGAAAGGTGGCTACAGAGAACTGTCTGAGATCGCTGAGCAAGCC
AAGAGACGAGCTGAGATCGCTAGGCTTAGGGAACTTCATACGCTTAAAGGACATGTGGAG
TCAGTGGTGAAGCTCAAGGGACTTGACATTGAGACAGCTGGTCACTACACCGTTTAATAA
CAAGATGGACTCAGAGAGGATGATTAAGGAAGAAGATCGTTTGTTTAAGGGATGATAATG
ATGATAATATCATAAGATGAGAGGGAATAAAATGATGTTTTAGTTTATGTTTTGTGTTTA
ATTCCTCTAAAACTCCTGGGGTTTTATTTTCTTCTTATTCTTCCTTGATTTTAGACTTAA
TTATAATTGTGTTTTCAGTTTGCTCTGTGTTGGAGACAAAAAGAAGATAGTATAATATTT
TCTTAGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI43TF U 1
AF RR2DI43JQ C 106
BS 1 616 RR2DI43TF
BS 617 790 RR2DI43JQ

RD RR2DI43TF 616 0 0
GTCACTCGTTCAAGAGGCTGGTCGTTTCTTGAACGACCTGGTTGGCTCTTGCTTATTGCC
TTCTGGATTGCACAAGCGATTGCAACTGCTGTTGCTGTTTTGGCAGACTGGGAGTTTGCA
AGAATCAAAGGAATAGGGCTTGGATGGGCTGGGGTTATTTGGCTTTACAGTATTGTCTTT
TATATTCCATTAGACATGCTCAAGTTCGCAATCCGTTACATACTATCTGTAACTGCATGG
AATAATCTCATTGACAACAAGACTGCGTTTACTACGAAGCAAAACTATGGGATAGAGGAG
AGAGAGGCACAATGGGCTCTCGCACAGAGGACTTTACATGGTCTTCAGAACCAAGAAACG
GCTAATGTTTTCCCTGAGAAAGGTGGCTACAGAGAACTGTCTGAGATCGCTGAGCAAGCC
AAGAGACGAGCTGAGATCGCTAGGCTTAGGGAACTTCATACGCTTAAAGGACATGTGGAG
TCAGTGGTGAAGCTCAAGGGACTTGACATTGAGACAGCTGGTCACTACACCGTTTAATAA
CAAGATGGACTCAGAGAGGATGATTAAGGAAGAAGATCGTTTGTTTAAGGGATGATAATG
ATGATAATATCATAAG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2DI43JQ 685 0 0
GACTGGGAGTTTGCAAGAATCAAAGGAATAGGGCTTGGATGGGCTGGGGTTATTTGGCTT
TACAGTATTGTCTTTTATATTCCATTAGACATGCTCAAGTTCGCAATCCGTTACATACTA
TCTGTAACTGCATGGAATAATCTCATTGACAACAAGACTGCGTTTACTACGAAGCAAAAC
TATGGGATAGAGGAGAGAGAGGCACAATGGGCTCTCGCACAGAGGACTTTACATGGTCTT
CAGAACCAAGAAACGGCTAATGTTTTCCCTGAGAAAGGTGGCTACAGAGAACTGTCTGAG
ATCGCTGAGCAAGCCAAGAGACGAGCTGAGATCGCTAGGCTTAGGGAACTTCATACGCTT
AAAGGACATGTGGAGTCAGTGGTGAAGCTCAAGGGACTTGACATTGAGACAGCTGGTCAC
TACACCGTTTAATAACAAGATGGACTCAGAGAGGATGATTAAGGAAGAAGATCGTTTGTT
TAAGGGATGATAATGATGATAATATCATAAGATGAGAGGGAATAAAATGATGTTTTAGTT
TATGTTTTGTGTTTAATTCCTCTAAAACTCCTGGGGTTTTATTTTCTTCTTATTCTTCCT
TGATTTTAGACTTAATTATAATTGTGTTTTCAGTTTGCTCTGTGTTGGAGACAAAAAGAA
GATAGTATAATATTTTCTTAGGTTC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL4474Contig1 865 2 2 U
GCACTACCACGAGGAGAAAGGCACAGATGGTGAAGAAAACAACAAGTTCTCGGAAAATGC
CAGTTCCTTGTCTAGCGAGGACGCAGCGAGTTTGAACCGCGATAGTGTTCTCACTGTCAA
AGCGGCTACAGTCGCGTCTCAGTGGTTGGAACTGCTTCATCAAGACATCAAATGCCGTGT
TTCCGCTCTTCGCCGTAGCAAGAAGAGGGTTCGAGCAGTTGTGACGACAGAGCTACCTTT
CTTAATAAGTAAAGAGTTCCCAGCTGATCAGGAGAATGATCCAAGTGTACTCTTCACTGG
AGCCTCGAGGGCTTCAACGGTGGATAACCACAAGAACAGATGGATGGCGCTTTTTAAACA
ACTCGAGCAAACTCTATCTGAAGAAGAGAAACAATTGGAGAGCTGGTTAAGCAAAGTGAG
AGAGCTGCAATCACATTGCGACCAAGGTCTGCAACACTTGAGCTTGAGTTCTGGTCAGAA
CTTCTTACAGTTAGGAATGCCATTGTACTCTAGAGCTGCGGATGCACTGATATCAGACAA
AGATTTAGCCGTTAGAGCAGCCGTAGCCTCCATATATTCCACCTGCAATTTTCTTGCATC
AGAGGAGAACATAGCCTGTACCTGAACTCCTCTAAAACTTCTGACCAGTTTCTGATTCAA
TTTTTTTAGTTGACAAACCTTTTCTCAGTTACTTTAGTGTGTAAGCTTTTCATAGCAAAG
TTTCTTTGTATGTGCATCTGTAACACTGGGAGCATTGCTCACCATCCTTGTCTTTTCTTC
TTTTATATATTTATTTTCTCTGCAATAAGAACCCTTGTACGCTGAGTTCGTTAACACCTG
AAAGTTATAGACTTGCCTTGTGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F114TF U 1
AF RR2F114JQ C 99
BS 1 775 RR2F114TF
BS 776 865 RR2F114JQ

RD RR2F114TF 786 0 0
GCACTACCACGAGGAGAAAGGCACAGATGGTGAAGAAAACAACAAGTTCTCGGAAAATGC
CAGTTCCTTGTCTAGCGAGGACGCAGCGAGTTTGAACCGCGATAGTGTTCTCACTGTCAA
AGCGGCTACAGTCGCGTCTCAGTGGTTGGAACTGCTTCATCAAGACATCAAATGCCGTGT
TTCCGCTCTTCGCCGTAGCAAGAAGAGGGTTCGAGCAGTTGTGACGACAGAGCTACCTTT
CTTAATAAGTAAAGAGTTCCCAGCTGATCAGGAGAATGATCCAAGTGTACTCTTCACTGG
AGCCTCGAGGGCTTCAACGGTGGATAACCACAAGAACAGATGGATGGCGCTTTTTAAACA
ACTCGAGCAAACTCTATCTGAAGAAGAGAAACAATTGGAGAGCTGGTTAAGCAAAGTGAG
AGAGCTGCAATCACATTGCGACCAAGGTCTGCAACACTTGAGCTTGAGTTCTGGTCAGAA
CTTCTTACAGTTAGGAATGCCATTGTACTCTAGAGCTGCGGATGCACTGATATCAGACAA
AGATTTAGCCGTTAGAGCAGCCGTAGCCTCCATATATTCCACCTGCAATTTTCTTGCATC
AGAGGAGAACATAGCCTGTACCTGAACTCCTCTAAAACTTCTGACCAGTTTCTGATTCAA
TTTTTTTAGTTGACAAACCTTTTCTCAGTTACTTTAGTGTGTAAGCTTTTCATAGCAAAG
TTTCTTTGTATGTGCATCTGTAACACTGGGAGCATTGCTCACCATCCTTGTCTTT
CTTCTTTATAT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2F114JQ 767 0 0
GCGATAGTGTTCTCACTGTCAAAGCGGCTACAGTCGCGTCTCAGTGGTTGGAACTGCTTC
ATCAAGACATCAAATGCCGTGTTTCCGCTCTTCGCCGTAGCAAGAAGAGGGTTCGAGCAG
TTGTGACGACAGAGCTACCTTTCTTAATAAGTAAAGAGTTCCCAGCTGATCAGGAGAATG
ATCCAAGTGTACTCTTCACTGGAGCCTCGAGGGCTTCAACGGTGGATAACCACAAGAACA
GATGGATGGCGCTTTTTAAACAACTCGAGCAAACTCTATCTGAAGAAGAGAAACAATTGG
AGAGCTGGTTAAGCAAAGTGAGAGAGCTGCAATCACATTGCGACCAAGGTTTGCAACACT
TGAGCTTGAGTTCTGGTCAGAACTTCTTACAGTTAGGAATGCCATTGTACTCTAGAGCTG
CGGATGCACTGATATCAGACAAAGATTTAGCCGTTAGAGCAGCCGTAGCCTCCATATATT
CCACCTGCAATTTTCTTGCATCAGAGGAGAACATAGCCTGTACCTGAACTCCTCTAAAAC
TTCTGACCAGTTTTTGATTCAATTTTTTTAGTTGACAAACCTTTTTTCAGTTACTTTAGT
GTGTAAGCTTTTCATAGCAAAGTTTCTTTGTATGTGCATCTGTAACACTGGGAGCATTGC
TCACCATCCTTGTCTTTTCTTCTTTTATATATTTATTTTCTCTGCAATAAGAACCCTTGT
ACGCTGAGTTCGTTAACACCTGAAAGTTATAGACTTGCCTTGTGTCG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL4475Contig1 1224 2 8 U
GGACAACCATTGAGAGTTTAATACTTTGTAAGTGACTTGTAAAACAAAATGGCGAGATTC
GGATTAGTTGTAGTGAAGATTCTTGTGATTCTAGGGCTTGTGAGCTTTTCAGAAGCTCAA
CTGAAGATAGGGTTCTACGATAAAACTTGCCCTAACGCAGAGAAGATCATACAAGCTGTT
GTCAACCAACATATTCGCAAAGTACCATCTTTGGCTGCTGGCCTTATTAGGATGCATTTC
CATGATTGCTTTGTTCGGGGCTGTGATGGTTCGATCTTGATCAACGCGACATCGAGCAAC
CAACAAGTGGAGAAGGTTGCTCCTCCAAATCTAACTGTTAGAGGTTTTGACTTTATCGAT
TTAGTGAAGACTGTTCTGGAGAAGAAGTGTCCAGGAGTAGTCTCATGCGCCGATATCATC
ACTCTCGCTACTAGAGACTCGGTTGCTGCCATTGGTGGACCGACATGGAATGTTCCAACA
GGACGCAGAGACGGACGGATCTCTAATGCTACCGAGGCTTTGAACAACATTCCTCCTCCT
TTCGGAAACTTCACTACTCTGATTACCCTATTTGGAAACCAAGGACTTGATGTGAAAGAC
CTTGTCTTGTTATCCGGCGCGCACACAATCGGAGTGTCTCATTGTTCCTCCTTCTCAAAC
CGTCTCTTCAACTTTACCGGCGTAGGAGACCAAGATCCATCGCTTGACAGCGAATATGCC
GACAATCTCAAGTCACGGAAATGTTTATCTATTGCCGACAATACCACACAGGTTGAAATG
GATCCTGGTAGTAGAAACACCTTTGATCTTAGCTACTTCAAGCTCGTCTTGAAACGCCGT
GGGCTTTTTGAGTCTGATGCGGCATTGACTAAGGATCCCACGGCTTTGGGTCAGGTCAGA
GGCTTCGCCGGATGATCTCTGCAAGATTTCTTTGTCGAATTTGGCAAGTCAATGGAGAAA
ATGGGAAGGATTGGGGTGAAAACCGGGTCGGATGGAGAGATCCGAAGAACCTGTTCAGTG
GTTAATTGAAAAACTTTCTTTTGTTTTATTTTTATTTGGTGATTTTGGGTGTTTTTGTTA
TTCGACTACTTTGGGTGTTTACTATTTCGAAATGTTTATTTGTGTATGTGGTCAAAATGT
TATTTTCGAATAAGTTTCACGTTTGTGAAAATCGTTGTAATAAATTTTCAATCTATTTGT
TTTCAATAAAAATGTTCTCTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC41TF U 1
AF RR2BC41JQ C 344
BS 1 684 RR2BC41TF
BS 685 685 RR2BC41JQ
BS 686 760 RR2BC41TF
BS 761 761 RR2BC41JQ
BS 762 771 RR2BC41TF
BS 772 772 RR2BC41JQ
BS 773 867 RR2BC41TF
BS 868 1224 RR2BC41JQ

RD RR2BC41TF 867 0 0
GGACAACCATTGAGAGTTTAATACTTTGTAAGTGACTTGTAAAACAAAATGGCGAGATTC
GGATTAGTTGTAGTGAAGATTCTTGTGATTCTAGGGCTTGTGAGCTTTTCAGAAGCTCAA
CTGAAGATAGGGTTCTACGATAAAACTTGCCCTAACGCAGAGAAGATCATACAAGCTGTT
GTCAACCAACATATTCGCAAAGTACCATCTTTGGCTGCTGGCCTTATTAGGATGCATTTC
CATGATTGCTTTGTTCGGGGCTGTGATGGTTCGATCTTGATCAACGCGACATCGAGCAAC
CAACAAGTGGAGAAGGTTGCTCCTCCAAATCTAACTGTTAGAGGTTTTGACTTTATCGAT
TTAGTGAAGACTGTTCTGGAGAAGAAGTGTCCAGGAGTAGTCTCATGCGCCGATATCATC
ACTCTCGCTACTAGAGACTCGGTTGCTGCCATTGGTGGACCGACATGGAATGTTCCAACA
GGACGCAGAGACGGACGGATCTCTAATGCTACCGAGGCTTTGAACAACATTCCTCCTCCT
TTCGGAAACTTCACTACTCTGATTACCCTATTTGGAAACCAAGGACTTGATGTGAAAGAC
CTTGTCTTGTTATCCGGCGCGCACACAATCGGAGTGTCTCATTGTTCCTCCTTCTCAAAC
CGTCTCTTCAACTTTACCGGCGTATGAGACCAAGATCCATCGCTTGACAGCGAATATGCC
GACAATCTCAAGTCACGGAAATGTTTATCTATTGCCGACA*TACCACACAG*TTGAAATG
GATCCTGGTAGTAGAAACACCTTTGATCTTAGCTACTTCAAGCTCGTCTTGAAACGCCGT
GGGCTTTTTGAGTCTGATGCGGCATTG

QA 1 867 1 867
DS 

RD RR2BC41JQ 881 0 0
GG
TTTGACTTTATCGATTTAGTGAAGACTGTTCTGGAGAAGAAGTGTCCAGGAGTAGTCTCA
TGCGCCGATATCATCACTCTCGCTACTAGAGACTCGGTTGCTGCCATTGGTGGACCGACA
TGGAATGTTCCAACAGGACGCAGAGACGGACGGATCTCTAATGCTACCGAGGCTTTGAAC
AACATTCCTCCTCCTTTCGGAAACTTCACTACTCTGATTACCCTATTTGGAAACCAAGGA
CTTGATGTGAAAGACCTTGTCTTGTTATCCGGCGCGCACACAATCGGAGTGTCTCATTGT
TCCTCCTTCTCAAACCGTCTCTTCAACTTTACCGGCGTAGGAGACCAAGATCCATCGCTT
GACAGCGAATATGCCGACAATCTCAAGTCACGGAAATGTTTATCTATTGCCGACAATACC
ACACAGGTTGAAATGGATCCTGGTAGTAGAAACACCTTTGATCTTAGCTACTTCAAGCTC
GTCTTGAAACGCCGTGGGCTTTTTGAGTCTGATGCGGCATTGACTAAGGATCCCACGGCT
TTGGGTCAGGTCAGAGGCTTCGCCGGATGATCTCTGCAAGATTTCTTTGTCGAATTTGGC
AAGTCAATGGAGAAAATGGGAAGGATTGGGGTGAAAACCGGGTCGGATGGAGAGATCCGA
AGAACCTGTTCAGTGGTTAATTGAAAAACTTTCTTTTGTTTTATTTTTATTTGGTGATTT
TGGGTGTTTTTGTTATTCGACTACTTTGGGTGTTTACTATTTCGAAATGTTTATTTGTGT
ATGTGGTCAAAATGTTATTTTCGAATAAGTTTCACGTTTGTGAAAATCGTTGTAATAAAT
TTTCAATCTATTTGTTTTCAATAAAAATGTTCTCTGCTC

QA 3 881 3 881
DS 



AS 1 2

CO CL4476Contig1 928 2 2 U
GGGAACTGAACTTCTCTCTATCTCTCTCTCTCCCTCACCTCTCTCTGTCTCTTCTCTCCA
CTTCACGATGGCTTCTCTCAGACTCCCCGCTCAGCTCGTTACACGCGGCACTCTCAACCA
CCATAACTCCTCTTCCTCCGCCGCTTCCTCCTCAAGCCTCTCCTGGCGGCGATCACTCTC
ACCGGACAACTCAATCCCGACCCTCCCATCTTCCTCATCCCTTAACCGGAAACCATCATC
GGTTATGCGGTTTCATGCAAGGTCTCATCGGTCAATATGCAGTCCCCATTCTGGAGGAAA
AATCGGTGTGAGGAACAGATGCGCCGACGCGTGTGGCTTACATGGACACACAGGATATTG
CTAGGCTGACACTTATTGCTTTACGCAACGAGAAAGTCAACGGAAAGCTTCTAACGTTCG
CTGGCCCTCGTGCATGGACTACTCAAGAAGTAATAACATTATGTGAGAGACTTGCTGGGC
AAGATGCGAATGTCACAACGGTTCCAGTTTCTGTATTGAGAGTCACACGTCAGTTAACTA
GGTTTTTTCAGTGGACAAACGATGTTGCAGATAGATTGGCCTTCACAGAGGTTCTCTCGA
GTGACACGGTCTTCTCTGTTCCGATGACTGAGACTAATAGTCTACTAGGTGTGGATCAAA
AGGATTTGGTGACTCTAGAGAAGTACTTGCAAGATTACTTCAGCAACATACTGAAGAAAC
TAAAGGATCTTAAGGCACAATCCAAGCAATCAGACATCTACTTCTAAGTTCTGACCTTGT
AGTGTCTTAATAAGATTCAACGCTATTAAAAACTGCATTTGCGTCCATAATGTGTCACTG
AGCTTTATCCGTTTGTTTCTTATTCAACAATGGGTTATTGTACTTTTTGTAATTAAAGAG
AATTATTGTAATATAAATGTAGCTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G565TF U 1
AF RR2G565JQ C 231
BS 1 644 RR2G565TF
BS 645 928 RR2G565JQ

RD RR2G565TF 644 0 0
GGGAACTGAACTTCTCTCTATCTCTCTCTCTCCCTCACCTCTCTCTGTCTCTTCTCTCCA
CTTCACGATGGCTTCTCTCAGACTCCCCGCTCAGCTCGTTACACGCGGCACTCTCAACCA
CCATAACTCCTCTTCCTCCGCCGCTTCCTCCTCAAGCCTCTCCTGGCGGCGATCACTCTC
ACCGGACAACTCAATCCCGACCCTCCCATCTTCCTCATCCCTTAACCGGAAACCATCATC
GGTTATGCGGTTTCATGCAAGGTCTCATCGGTCAATATGCAGTCCCCATTCTGGAGGAAA
AATCGGTGTGAGGAACAGATGCGCCGACGCGTGTGGCTTACATGGACACACAGGATATTG
CTAGGCTGACACTTATTGCTTTACGCAACGAGAAAGTCAACGGAAAGCTTCTAACGTTCG
CTGGCCCTCGTGCATGGACTACTCAAGAAGTAATAACATTATGTGAGAGACTTGCTGGGC
AAGATGCGAATGTCACAACGGTTCCAGTTTCTGTATTGAGAGTCACACGTCAGTTAACTA
GGTTTTTTCAGTGGACAAACGATGTTGCAGATAGATTGGCCTTCACAGAGGTTCTCTCGA
GTGACACGGTCTTCTCTGTTCCGATGACTGAGACTAATAGTCTA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2G565JQ 698 0 0
AACCATCATCGGTTATGCGGTTTCATGCAAGGTCTCATCGGTCAATATGCAGTCCCCATT
CTGGAGGAAAAATCGGTGTGAGGAACAGATGCGCCGACGCGTGTGGCTTACATGGACACA
CAGGATATTGCTAGGCTGACACTTATTGCTTTACGCAACGAGAAAGTCAACGGAAAGCTT
CTAACGTTCGCTGGCCCTCGTGCATGGACTACTCAAGAAGTAATAACATTATGTGAGAGA
CTTGCTGGGCAAGATGCGAATGTCACAACGGTTCCAGTTTCTGTATTGAGAGTCACACGT
CAGTTAACTAGGTTTTTTCAGTGGACAAACGATGTTGCAGATAGATTGGCCTTCACAGAG
GTTCTCTCGAGTGACACGGTCTTCTCTGTTCCGATGACTGAGACTAATAGTCTACTAGGT
GTGGATCAAAAGGATTTGGTGACTCTAGAGAAGTACTTGCAAGATTACTTCAGCAACATA
CTGAAGAAACTAAAGGATCTTAAGGCACAATCCAAGCAATCAGACATCTACTTCTAAGTT
CTGACCTTGTAGTGTCTTAATAAGATTCAACGCTATTAAAAACTGCATTTGCGTCCATAA
TGTGTCACTGAGCTTTATCCGTTTGTTTCTTATTCAACAATGGGTTATTGTACTTTTTGT
AATTAAAGAGAATTATTGTAATATAAATGTAGCTTACC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4478Contig1 669 2 2 U
GGAACAACACATTTCTAAGAGACGGATAAAAAAAAAAGTAATGGCGGAGAAAGAAGTGAA
GCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAACTCAA
AGGCATAGCGTACGATTACGTTGAAGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTTCTTGC
ACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATTCTCGA
GTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCTATTCTCCCTGA
AGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAGATTAT
CACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTGGCCGA
GCAGACAAGAGAACTGATGAAGAACATGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCC
TCCAAGAGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTA
GACGGAAGTCATATTTGGTTCTGTGTTTCAATGTTTTTTAAGTTACTGTCATGTTTGGAC
TTGAACCTTGTTATCTGTTATGTTTCTCAAAAAGCTTATCTTTTTTCTTCTAATAAACAA
ATTCATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2FH77TF U 1
AF RR2FH77JQ C 103
BS 1 666 RR2FH77TF
BS 667 669 RR2FH77JQ

RD RR2FH77TF 669 0 0
GGAACAACACATTTCTAAGAGACGGATAAAAAAAAAAGTAATGGCGGAGAAAGAAGTGAA
GCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAACTCAA
AGGCATAGCGTACGATTACGTTGAAGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTTCTTGC
ACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATTCTCGA
GTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCTATTCTCCCTGA
AGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAGATTAT
CACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTGGCCGA
GCAGACAAGAGAACTGATGAAGAACATGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCC
TCCAAGAGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTA
GACGGAAGTCATATTTGGTTCTGTGTTTCAATGTTTTTTAAGTTACTGTCATGTTTGGAC
TTGAACCTTGTTATCTGTTATGTTTCTCAAAAAGCTTATCTTTTTTCTTCTAATAAACAA
ATTCAT
CTT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2FH77JQ 567 0 0
GATGGCTTTCAAACTCAAAGGCATAGCGTACGATTACGTTGAAGAAATACTAGAGCACAA
AAGCCCTTTGCTTCTTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTTTTGTCCACAA
TGGCAAAACCATTTTCGAGTTTCAAGTGATTTTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACA
GAATCCTATTTTCCCTGAAGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTTTTAGCTAAACT
TGTCGATGAACAGATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGG
AAGAGAGGCTTTGGCCGAGCAGACAAGAGAACTGATGAAGAACATGGAGAAGGTTGAGGC
TGTGAAAGATTGTATTCCTCCAAGAGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGA
AAGAATCAGATCCGCTTAGACGGAAGTCATATTTGGTTTTGTGTTTCAATGTTTTTTAAG
TTACTGTCATGTTTGGACTTGAACCTTGTTATTTGTTATGTTTTTCAAAAAGCTTATTTT
TTTTTTTTTAATAAACAAATTCATTTT

QA 1 567 1 567
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4480Contig1 990 2 4 U
GGAAAGATCCGAACATCTCCGCGTCATCGTCATCGTTCATCGTCGACACCAGAAGGCGAT
TCAGGTGAGGTTTTTTTTATTTATATTTTGTTGCTGCGACTGTGTGATTGAGGAATCCCT
AGATCTCTTGGTTGAGATCCGATAATGAGATCTCTCGGTGTTGAAAACCAGAATCGCGTT
AAATCTAACGATTTGCGATCTGATAAGAGTAGTGTAGAATCTCCGCATGGTTTATAGCTA
TATATTGGTTTCAATGTTGAATTCGAATTTTGCAGCGATCATCTGAAATTTTGCCTTTGA
ATCATTCTAGCTTAATTCCATCGATTCTCTGGGGATGTTTGAGAATGTTGTTTCACCATT
GGATTTGTTGAACGGTCGCTCGTATTTTGAAATTAGAATCATTTGATTGCAATTAGATGA
ACAATTCGTAGCGTTTAGATTTATCATTTTCTTTTAAACATTTTTCTTGGTTTTGAATTT
CTAATTAGTAAAGTGATTAACTGTAACTTCTTACACACGTGTCTTCAGTTAGTTAAACAA
GAGAAGAGAAGAGAAGGATGGTGGGAAGTGGAGCTCCACAGAGAGGAAGTGCAGCTGCAG
CTGCTAGCATGCGTAGGAGAAAGCCTAGTGGAAGTGGAGGAGCCTCTGGTGGTGGTGGTG
GTGCTGCAGGATCCATGCTTCAGTTCTACACCGATGACGCACCGGGTCTCAAGATCTCCC
CTAATGTTGTCCTTGTCATGAGCATTGGTTTTATTGCTTTCGTCGCTGTCCTTCATGTCA
TGGGCAAGCTCTACTTTGTCAAGTGATAAGACTAGAGAGTGAGAGTGAGCGAGAGAGAGA
GCTTAAGTACACCCAAGTGATTGCTAGTGACCAGAGTTATTAGACAGTGGTTTCAACTCT
ATGTTTTCAATTTTGTGAGAGACTATCTATAAAAAAGTTCCAGTTTCTTGATATTCTTCT
TACAGTTTTTAATGGGATGAACATTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF24TF U 1
AF RR2AF24JQ C 168
BS 1 669 RR2AF24TF
BS 670 670 RR2AF24JQ
BS 671 681 RR2AF24TF
BS 682 990 RR2AF24JQ

RD RR2AF24TF 681 0 0
GGAAAGATCCGAACATCTCCGCGTCATCGTCATCGTTCATCGTCGACACCAGAAGGCGAT
TCAGGTGAGGTTTTTTTTATTTATATTTTGTTGCTGCGACTGTGTGATTGAGGAATCCCT
AGATCTCTTGGTTGAGATCCGATAATGAGATCTCTCGGTGTTGAAAACCAGAATCGCGTT
AAATCTAACGATTTGCGATCTGATAAGAGTAGTGTAGAATCTCCGCATGGTTTATAGCTA
TATATTGGTTTCAATGTTGAATTCGAATTTTGCAGCGATCATCTGAAATTTTGCCTTTGA
ATCATTCTAGCTTAATTCCATCGATTCTCTGGGGATGTTTGAGAATGTTGTTTCACCATT
GGATTTGTTGAACGGTCGCTCGTATTTTGAAATTAGAATCATTTGATTGCAATTAGATGA
ACAATTCGTAGCGTTTAGATTTATCATTTTCTTTTAAACATTTTTCTTGGTTTTGAATTT
CTAATTAGTAAAGTGATTAACTGTAACTTCTTACACACGTGTCTTCAGTTAGTTAAACAA
GAGAAGAGAAGAGAAGGATGGTGGGAAGTGGAGCTCCACAGAGAGGAAGTGCAGCTGCAG
CTGCTAGCATGCGTAGGAGAAAGCCTAGTGGAAGTGGAGGAGCCTCTGGTGGTGGTGGTG
GTGCTGCAG*ATCCATGCTTC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2AF24JQ 823 0 0
CCAGAATCGCGTTAAATCTAACGATTTGCGATCTGATAAGAGTAGTGTAGAATCTCCGCA
TGGTTTATAGCTATATATTGGTTTCAATGTTGAATTCGAATTTTGCAGCGATCATCTGAA
ATTTTGCCTTTGAATCATTCTAGCTTAATTCCATCGATTCTCTGGGGATGTTTGAGAATG
TTGTTTCACCATTGGATTTGTTGAACGGTCGCTCGTATTTTGAAATTAGAATCATTTGAT
TGCAATTAGATGAACAATTCGTAGCGTTTAGATTTATCATTTTCTTTTAAACATTTTTCT
TGGTTTTGAATTTCTAATTAGTAAAGTGATTAACTGTAACTTCTTACACACGTGTCTTCA
GTTAGTTAAACAAGAGAAGAGAAGAGAAGGATGGTGGGAAGTGGAGCTCCACAGAGAGGA
AGTGCAGCTGCAGCTGCTAGCATGCGTAGGAGAAAGCCTAGTGGAAGTGGAGGAGCCTCT
GGTGGTGGTGGTGGTGCTGCAGGATCCATGCTTCAGTTCTACACCGATGACGCACCGGGT
CTCAAGATCTCCCCTAATGTTGTCCTTGTCATGAGCATTGGTTTTATTGCTTTCGTCGCT
GTCCTTCATGTCATGGGCAAGCTCTACTTTGTCAAGTGATAAGACTAGAGAGTGAGAGTG
AGCGAGAGAGAGAGCTTAAGTACACCCAAGTGATTGCTAGTGACCAGAGTTATTAGACAG
TGGTTTCAACTCTATGTTTTCAATTTTGTGAGAGACTATCTATAAAAAAGTTCCAGTTTC
TTGATATTCTTCTTACAGTTTTTAATGGGATGAACATTTATAT

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL4481Contig1 688 2 2 U
GGGCGCGCTTACGCGCCTTAACAACCAGCAAAGGCGACAATGCGAGCATCAGTTTCATCT
CCGCCTCGTCTTCACTCTTCATTCATTCACCGTCCCGTCAGTTTCACACCGTCTTCTTCC
CGCTTCCTGTCGCCAGCAGCAGCATCATCTTATCCACGAATCAAAGCAGAAGTCGACACG
AACACGGTAGTCGCAATCTCTGTAGGCGTAGCCAGCGTCGCATTAGGAATCGGAATCCCT
GTCTTCTACGAGACACAAATCGACAATGCCGCTAAGCGAGAGAACACTCAACCTTGTTTT
CCCTACAACGGAACCGGAGCTCAGAAATGTAGATTGTGTGTGGGAAGTGGTAACGTGACG
GTAGAGCTTGGTGGGGGAGAGAAGGAAGTCTCCAGCTGTATCAACTGTGATGGTGCTGGT
TCCTTGACTTGCACTACTTGTCAAGGCTCTGGTCTCCAACCTCGTTACCTTGATCGAAGG
GAGTTCAAGGACGATGACTAAATATATTTCACTACAGAACCATATCAAAAGAATGTCACT
TTCTCCCTTCTGTGTAATTTATTACATTTGCACAATACGGTTTTGTTTTGTCTTTACCAA
AACATGTGAGAATTCATGACTTGGATACTGAAACAGTTGAAAGATATAATGAGCAAACAT
GATAAACTAGCTGATACTATTTTCACTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A412JQ C 1
AF RR2A412TF U 1
BS 1 678 RR2A412TF
BS 679 688 RR2A412JQ

RD RR2A412JQ 688 0 0
GGGCGCGCTTACGCGCCTTAACAACCAGCAAAGGCGACAATGCGAGCATCAGTTTCATCT
CCGCCTCGTCTTCACTCTTCATTCATTCACCGTCCCGTCAGTTTCACACCGTCTTCTTCC
CGCTTCCTGTCGCCAGCAGCAGCATCATCTTATCCACGAATCAAAGCAGAAGTCGACACG
AACACGGTAGTCGCAATCTCTGTAGGCGTAGCCAGCGTCGCATTAGGAATCGGAATCCCT
GTCTTCTACGAGACACAAATCGACAATGCCGCTAAGCGAGAGAACACTCAACCTTGTTTT
CCCTACAACGGAACCGGAGCTCAGAAATGTAGATTGTGTGTGGGAAGTGGTAACGTGACG
GTAGAGCTTGGTGGGGGAGAGAAGGAAGTCTCCAGCTGTATCAACTGTGATGGTGCTGGT
TCCTTGACTTGCACTACTTGTCAAGGCTCTGGTCTCCAACCTCGTTACCTTGATCGAAGG
GAGTTCAAGGACGATGACTAAATATATTTCACTACAGAACCATATCAAAAGAATGTCACT
TTCTCCCTTCTGTGTAATTTATTACATTTGCACAATACGGTTTTGTTTTGTCTTTACCAA
AACATGTGAGAATTCATGACTTGGATACTGAAACAGTTGAAAGATATAATGAGCAAACAT
GATAAACTAGCTGATACTATTTTCACTC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2A412TF 678 0 0
GGGCGCGCTTACGCGCCTTAACAACCAGCAAAGGCGACAATGCGAGCATCAGTTTCATCT
CCGCCTCGTCTTCACTCTTCATTCATTCACCGTCCCGTCAGTTTCACACCGTCTTCTTCC
CGCTTCCTGTCGCCAGCAGCAGCATCATCTTATCCACGAATCAAAGCAGAAGTCGACACG
AACACGGTAGTCGCAATCTCTGTAGGCGTAGCCAGCGTCGCATTAGGAATCGGAATCCCT
GTCTTCTACGAGACACAAATCGACAATGCCGCTAAGCGAGAGAACACTCAACCTTGTTTT
CCCTACAACGGAACCGGAGCTCAGAAATGTAGATTGTGTGTGGGAAGTGGTAACGTGACG
GTAGAGCTTGGTGGGGGAGAGAAGGAAGTCTCCAGCTGTATCAACTGTGATGGTGCTGGT
TCCTTGACTTGCACTACTTGTCAAGGCTCTGGTCTCCAACCTCGTTACCTTGATCGAAGG
GAGTTCAAGGACGATGACTAAATATATTTCACTACAGAACCATATCAAAAGAATGTCACT
TTCTCCCTTCTGTGTAATTTATTACATTTGCACAATACGGTTTTGTTTTGTCTTTACCAA
AACATGTGAGAATTCATGACTTGGATACTGAAACAGTTGAAAGATATAATGAGCAAACAT
GATAAACTAGCTGATACT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL4482Contig1 510 2 1 U
CGCGATTCTTCATCTGCCAACCCTAGCACTGATTTCTTCCTTTTTTTTTTCTTCTGTCAA
GTCCCAAATTCAGTTGTTCCTCGTCACTCCTCTCCTATCCACATTTCCATGTCAAATCTG
GGTTTTCTTTGAGTTTTATTAGATCTGCGTTTTGTTTCTAGTTGACTGTTATCAAGATCT
ATGATGTGGGCATGAAGAAGAAAGGGTTTTCACTGAACTTAACAGAGCAGACTTTACGAA
GGCGAGGCAAGAGAAGCGTATTGTTCCTGCGTCTCTCTCTCTATGGCTCCATGTCTCTCC
ATCTCCCTACTGGCTTTGTCAATGGTAGAGAACTGAACGAGTGATGAAGCCCATAGGAGG
TTTAGATTAAGGTTAATTATGTTTTGGCTAGTTAGATTTTGGTTTAATGTTTTTTATTAG
TTTTTGGTTTATTGTTATCGATTAGTTTCGGTTTAATGTGCTCTTTAATTATTTGTATAC
TGATTTGATTAATAAATAAAATTTAATTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B642JQ C 1
AF RR2B642TF U 1
BS 1 510 RR2B642TF

RD RR2B642JQ 510 0 0
CGCGATTCTTCATCTGCCAACCCTAGCACTGATTTCTTCCTTTTTTTTTTCTTCTGTCAA
GTCCCAAATTCAGTTGTTCCTCGTCACTCCTCTCCTATCCACATTTCCATGTCAAATCTG
GGTTTTCTTTGAGTTTTATTAGATCTGCGTTTTGTTTCTAGTTGACTGTTATCAAGATCT
ATGATGTGGGCATGAAGAAGAAAGGGTTTTCACTGAACTTAACAGAGCAGACTTTACGAA
GGCGAGGCAAGAGAAGCGTATTGTTCCTGCGTCTCTCTCTCTATGGCTCCATGTCTCTCC
ATCTCCCTACTGGCTTTGTCAATGGTAGAGAACTGAACGAGTGATGAAGCCCATAGGAGG
TTTAGATTAAGGTTAATTATGTTTTGGCTAGTTAGATTTTGGTTTAATGTTTTTTATTAG
TTTTTGGTTTATTGTTATCGATTAGTTTCGGTTTAATGTGCTCTTTAATTATTTGTATAC
TGATTTGATTAATAAATAAAATTTAATTTT

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2B642TF 510 0 0
CGCGATTCTTCATCTGCCAACCCTAGCACTGATTTCTTCCTTTTTTTTTTCTTCTGTCAA
GTCCCAAATTCAGTTGTTCCTCGTCACTCCTCTCCTATCCACATTTCCATGTCAAATCTG
GGTTTTCTTTGAGTTTTATTAGATCTGCGTTTTGTTTCTAGTTGACTGTTATCAAGATCT
ATGATGTGGGCATGAAGAAGAAAGGGTTTTCACTGAACTTAACAGAGCAGACTTTACGAA
GGCGAGGCAAGAGAAGCGTATTGTTCCTGCGTCTCTCTCTCTATGGCTCCATGTCTCTCC
ATCTCCCTACTGGCTTTGTCAATGGTAGAGAACTGAACGAGTGATGAAGCCCATAGGAGG
TTTAGATTAAGGTTAATTATGTTTTGGCTAGTTAGATTTTGGTTTAATGTTTTTTATTAG
TTTTTGGTTTATTGTTATCGATTAGTTTCGGTTTAATGTGCTCTTTAATTATTTGTATAC
TGATTTGATTAATAAATAAAATTTAATTTT

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL4483Contig1 510 2 1 U
GTGGACAAAGAAGAATACATTACTTAACAAAAATGATGATCAAAGATGTTCAAAACATGA
GAGTCGAGAAGATTAATACCAAGGACGAATTATCTTTTCAGTCACCAGGAGATTACGTAA
GATTCATAAGCCCAGAGGTTTACAAATCCAACAGACAGAAATATCTCAGAAGCTACACGT
TCAAAAGCTACGAGGAGGAAGCAGACCTGTCCTCTAAGAAAGAGAGGAAGTGGTTCAAGA
ACAAGAAGATGATGATCAAGTTTAAGAAGACGAGTGACTCAATTGGCAAATCCCTCAAAT
CTTGCCTCATCCTCTTGTTCTCTTGCTTTCATGTCTGATTCTTCTAATATGTACGATCAC
CCATTCCTCTTTTTTCTTTTGTCTACCGTAATCTCAGTCATCTTCACTTTGCTTTTGGAA
TAATTTCGAACTCCTTGTGTAATATCACACTATTGTCTCGTATACATTGAATATCGATTG
TTCTCTATTTTTTAATTGAATAGACTTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EC07JQ C 1
AF RR2EC07TF U 1
BS 1 510 RR2EC07TF

RD RR2EC07JQ 510 0 0
GTGGACAAAGAAGAATACATTACTTAACAAAAATGATGATCAAAGATGTTCAAAACATGA
GAGTCGAGAAGATTAATACCAAGGACGAATTATCTTTTCAGTCACCAGGAGATTACGTAA
GATTCATAAGCCCAGAGGTTTACAAATCCAACAGACAGAAATATCTCAGAAGCTACACGT
TCAAAAGCTACGAGGAGGAAGCAGACCTGTCCTCTAAGAAAGAGAGGAAGTGGTTCAAGA
ACAAGAAGATGATGATCAAGTTTAAGAAGACGAGTGACTCAATTGGCAAATCCCTCAAAT
CTTGCCTCATCCTCTTGTTCTCTTGCTTTCATGTCTGATTCTTCTAATATGTACGATCAC
CCATTCCTCTTTTTTCTTTTGTCTACCGTAATCTCAGTCATCTTCACTTTGCTTTTGGAA
TAATTTCGAACTCCTTGTGTAATATCACACTATTGTCTCGTATACATTGAATATCGATTG
TTCTCTATTTTTTAATTGAATAGACTTTTG

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2EC07TF 510 0 0
GTGGACAAAGAAGAATACATTACTTAACAAAAATGATGATCAAAGATGTTCAAAACATGA
GAGTCGAGAAGATTAATACCAAGGACGAATTATCTTTTCAGTCACCAGGAGATTACGTAA
GATTCATAAGCCCAGAGGTTTACAAATCCAACAGACAGAAATATCTCAGAAGCTACACGT
TCAAAAGCTACGAGGAGGAAGCAGACCTGTCCTCTAAGAAAGAGAGGAAGTGGTTCAAGA
ACAAGAAGATGATGATCAAGTTTAAGAAGACGAGTGACTCAATTGGCAAATCCCTCAAAT
CTTGCCTCATCCTCTTGTTCTCTTGCTTTCATGTCTGATTCTTCTAATATGTACGATCAC
CCATTCCTCTTTTTTCTTTTGTCTACCGTAATCTCAGTCATCTTCACTTTGCTTTTGGAA
TAATTTCGAACTCCTTGTGTAATATCACACTATTGTCTCGTATACATTGAATATCGATTG
TTCTCTATTTTTTAATTGAATAGACTTTTG

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL4484Contig1 532 2 3 U
GGGGGCTAGAGCTGGTCAGAACGGGTACCACCACCGTACTGAGATGAACAAGAAGATTTA
CAGACTTGGTAAAGTTGGCCAAGAGACTCACACAGCCATGACTGAGTTCGACAGAACCGA
GAAGGAGATCACACCGTTGGGAGGTTTCCCGCACTATGGTATAGTGAAGGATGATTATTT
GTTGATCAAGGGGTGTTGCTTGGGGCCGAAGAAACGTGTGGTGACTTTGAGACAGACGTT
GTTGAAGCAGACTTCTAGGGTTGCGTTGGAGGAGATAAATATTAAGTTCATCGACACTTC
TTCCAATGGTGGACACGGTCGTTTTCAGACTGCTGAAGAGAAGGCCAAGTTCTATGGTAG
ACTCAAGGCTTAGATTTTTTATTTTTGTTCCAAATCCCGTTAAAACATTTTCTTTATTGT
ATTTGTTATTTTCAGAGTTTCTTTCTTTGTTGGTCCTTGGTTCTTTTGGTATTGGTCCTT
GTTCTTTTGACATTTGAGCAATCTGTTTGGGATTTGATTTAACTTTGGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DO16TF U 1
AF RR2DO16JQ C 105
BS 1 280 RR2DO16TF
BS 281 281 RR2DO16JQ
BS 282 532 RR2DO16TF

RD RR2DO16TF 532 0 0
GGGGGCTAGAGCTGGTCAGAACGGGTACCACCACCGTACTGAGATGAACAAGAAGATTTA
CAGACTTGGTAAAGTTGGCCAAGAGACTCACACAGCCATGACTGAGTTCGACAGAACCGA
GAAGGAGATCACACCGTTGGGAGGTTTCCCGCACTATGGTATAGTGAAGGATGATTATTT
GTTGATCAAGGGGTGTTGCTTGGGGCCGAAGAAACGTGTGGTGACTTTGAGACAGACGTT
GTTGAAGCAGACTTCTAGGGTTGCGTTGGAGGAGATAAATCTTAAGTTCATCGACACTTC
TTCCAATGGTGGACACGGTCGTTTTCAGACTGCTGAAGAGAAGGCCAAGTTCTATGGTAG
ACTCAAGGCTTAGATTTTTTATTTTTGTTCCAAATCCCGTTAAAACATTTTCTTTATTGT
ATTTGTTATTTTCAGAGTTTCTTTCTTTGTTGGTCCTTGGTTCTTTTGGTATTGGTCCTT
GTTCTTTTGACATTTGAGCAATCTGTTTGGGATTTGATTTAACTTTGGTTTT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2DO16JQ 428 0 0
AGTTCGACAGAACCGAGAAGGAGATCACACCGTTGGGAGGTTTCCCGCACTATGGTATAG
TGAAGGATGATTATTTGTTGATCAAGGGGTGTTGCTTGGGGCCGAAGAAACGTGTGGTGA
CTTTGAGACAGACGTTGTTGAAGCAGACTTCTAGGGTTGCGTTGGAGGAGATAAATATTA
AGTTCATCGACACTTCTTCCAATGGTGGACACGGTCGTTTTCAGACTGCTGAAGAGAAGG
CCAAGTTTTATGGTAGACTCAAGGCTTAGATTTTTTATTTTTGTTCCAAATCCCGTTAAA
ACATTTTCTTTATTGTATTTGTTATTTTCAGAGTTTCTTTCTTTGTTGGTCCTTGGTTTT
TTTGGTATTGGTCCTTGTTCTTTTGACATTTGAGCAATCTGTTTGGGATTTGATTTAACT
TTGGTTTT

QA 1 428 1 428
DS 



AS 1 2

CO CL4485Contig1 1053 2 6 U
GCATCGACAAACGTCAATTTCAACCACACCGACGACAACCCCTGGAAACTCAACAACGGA
GATTTCAACAAGGGCATCTACTCCTCGCAGCCCAAGAGCTATGGCTTCAATTTCAAGAAC
AACAAGGGGATGATCATCGATCAAGATCATCATCAGATCCCCCAGAAAGGAGTAGGGAAA
AAGAACAGGAAGAATCAGAAGAATAACAACAACAATAAGGAAGATGACAAGAACACGAAC
GAGAAGAGGTTTAAGACTCTTCCTCCCGCGGAGGCACTTCCGAGGAACGAGACCATCGGT
GGTTACATCTTCGTGTGCAACAACGACACCATGGAGGAGAATCTGAAGCGCCAGCTTTTC
GGTTTGCCTCCGAGATACAGGGACTCCGTCAGAGCCATCACTCCCGGTCTTCCTCTCTTC
CTCTACAACTACTCCACTCACCAGCTTCACGGTGTTTACCAGGCAGCTAGCTTCGGTGGG
ACTAACATTGAGCCCAACGCTTTCGAAGACAAGAAATGTCCTGGCGAATCTCGGTTCCCT
GCTCAGGTCAGGGCCATCACCAGGAAAGTTTGTTTGCCTTTGGAAGAAGATTCTTTCCGT
CCTATTCTCCATCACTACGACGGCCCTAAGTTCCGCCTCGAACTCACCGTCCCTGAGGTT
CTTTCTCTTTTGGACATTTTTGATGAGCAAAACCCTTGAATTGGGATTTAAAAGAAAACA
ACAACAACATGAAGACAGACTAAAAAGTTCCCTTTTAACATATCCATAAAGAGAGAGATC
TTTACATATCATTCTACGTATATTAGTAATTGTCTCAAGAAAATGGTACTAGTTTATACA
CTTTTCGGGTTTAATTTCTTTTGTATTTTTACAAGAGAGGATGTGTTAAATATATTATAT
GAGATGGGGGCTACATTTGCGTGGGTGAGATGAACAAAAAACAAATCATGTCTTTCACTT
GTGTTTGTGTAAAGTAAATAAAGTTTCATGTGTTACAACCAAAACTGGCATAAATGAGGA
TGAACTTGATTCATTTATGTATTTTTTTTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP59TF U 1
AF RR2EP59JQ C 271
BS 1 657 RR2EP59TF
BS 658 658 RR2EP59JQ
BS 659 717 RR2EP59TF
BS 718 718 RR2EP59JQ
BS 719 793 RR2EP59TF
BS 794 1053 RR2EP59JQ

RD RR2EP59TF 793 0 0
GCATCGACAAACGTCAATTTCAACCACACCGACGACAACCCCTGGAAACTCAACAACGGA
GATTTCAACAAGGGCATCTACTCCTCGCAGCCCAAGAGCTATGGCTTCAATTTCAAGAAC
AACAAGGGGATGATCATCGATCAAGATCATCATCAGATCCCCCAGAAAGGAGTAGGGAAA
AAGAACAGGAAGAATCAGAAGAATAACAACAACAATAAGGAAGATGACAAGAACACGAAC
GAGAAGAGGTTTAAGACTCTTCCTCCCGCGGAGGCACTTCCGAGGAACGAGACCATCGGT
GGTTACATCTTCGTGTGCAACAACGACACCATGGAGGAGAATCTGAAGCGCCAGCTTTTC
GGTTTGCCTCCGAGATACAGGGACTCCGTCAGAGCCATCACTCCCGGTCTTCCTCTCTTC
CTCTACAACTACTCCACTCACCAGCTTCACGGTGTTTACCAGGCAGCTAGCTTCGGTGGG
ACTAACATTGAGCCCAACGCTTTCGAAGACAAGAAATGTCCTGGCGAATCTCGGTTCCCT
GCTCAGGTCAGGGCCATCACCAGGAAAGTTTGTTTGCCTTTGGAAGAAGATTCTTTCCGT
CCTATTCTCCATCACTACGACGGCCCTAAGTTCCGCCTCGAACTCACCGTCCCTGAG*TT
CTTTCTCTTTTGGACATTTTTGATGAGCAAAACCCTTGAATTGGGATTTAAAAGAAA*CA
ACAACAACATGAAGACAGACTAAAAAGTTCCCTTTTAACATATCCATAAAGAGAGAGATC
TTTACATATCATT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2EP59JQ 783 0 0
GAGGCACTTCCGAGGAACGAGACCATCGGTGGTTACATCTTCGTGTGCAACAACGACACC
ATGGAGGAGAATCTGAAGCGCCAGCTTTTCGGTTTGCCTCCGAGATACAGGGACTCCGTC
AGAGCCATCACTCCCGGTCTTCCTCTCTTCCTCTACAACTACTCCACTCACCAGCTTCAC
GGTGTTTACCAGGCAGCTAGCTTCGGTGGGACTAACATTGAGCCCAACGCTTTCGAAGAC
AAGAAATGTCCTGGCGAATCTCGGTTCCCTGCTCAGGTCAGGGCCATCACCAGGAAAGTT
TGTTTGCCTTTGGAAGAAGATTCTTTCCGTCCTATTCTCCATCACTACGACGGCCCTAAG
TTCCGCCTCGAACTCACCGTCCCTGAGGTTCTTTTTCTTTTGGACATTTTTGATGAGCAA
AACCCTTGAATTGGGATTTAAAAGAAAACAACAACAACATGAAGACAGACTAAAAAGTTC
CCTTTTAACATATCCATAAAGAGAGAGATCTTTACATATCATTCTACGTATATTAGTAAT
TGTCTCAAGAAAATGGTACTAGTTTATACACTTTTCGGGTTTAATTTCTTTTGTATTTTT
ACAAGAGAGGATGTGTTAAATATATTATATGAGATGGGGGCTACATTTGCGTGGGTGAGA
TGAACAAAAAACAAATCATGTCTTTCACTTGTGTTTGTGTAAAGTAAATAAAGTTTCATG
TGTTACAACCAAAACTGGCATAAATGAGGATGAACTTGATTCATTTATGTATTTTTTTTT
ACT

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL4486Contig1 709 2 1 U
GGAAGCAAAACCAACCTGCCTTTCATTCCTCCTAAAAAGCTCCAACCTTTTTTACAATCA
ATCACTGTACTTCTTCACTCCGAGAATCAATGGCGGCGGCGGCTGCAGCGACGGCGATCG
GTTTCCCGCAGGCGTATCTGGAGGGTAAAGAGGTGAAGGAGACGAGTTCGCTGGTGACTG
AGCCCTGCCGTCATTTCTACACTCAAGGTTGGGTGTCCGGAACAGGAGGTAGCATCACCA
TGAAGGTTCACGATGCTTCTATCCCTAAACCCGATCAACTCATCATCATGTCCCCTTCAG
GTGTTCAGAAGGAGAGGATGCAACCTGAGGATATGTACATTTTATCTCCTAATGGATCCA
TCATATCTGCACCTTCTCCAAAGCCTTACCCTAATAAGCCTCCCGAGTGTACTGATTGTG
CTCCTCTTTTCATGAAGGCATATGAGATGCGAAATGCTGGAGCTGTTATTCATAGCCATG
GCATGGAATCTTGTCTTGTGACAATGCTTAATCCACAAGCCAAAGAATTTCGTATAACTC
ACATGGAGATGATAAAAGGGATTCAAGGTCACGGATACTATGACGAACTTGTTGTCCCAA
TCATAGAGAACACAGCTTATGAGAACGAACTAACAGATTCACTCACCAAAGCTATAGAAG
CCTATCCAAAAGCAACCGCAGTGTTGGTACGCAATCACGGAGTTTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AU16TF U 1
AF RR2AY65TFB U 287
BS 1 709 RR2AU16TF

RD RR2AU16TF 709 0 0
GGAAGCAAAACCAACCTGCCTTTCATTCCTCCTAAAAAGCTCCAACCTTTTTTACAATCA
ATCACTGTACTTCTTCACTCCGAGAATCAATGGCGGCGGCGGCTGCAGCGACGGCGATCG
GTTTCCCGCAGGCGTATCTGGAGGGTAAAGAGGTGAAGGAGACGAGTTCGCTGGTGACTG
AGCCCTGCCGTCATTTCTACACTCAAGGTTGGGTGTCCGGAACAGGAGGTAGCATCACCA
TGAAGGTTCACGATGCTTCTATCCCTAAACCCGATCAACTCATCATCATGTCCCCTTCAG
GTGTTCAGAAGGAGAGGATGCAACCTGAGGATATGTACATTTTATCTCCTAATGGATCCA
TCATATCTGCACCTTCTCCAAAGCCTTACCCTAATAAGCCTCCCGAGTGTACTGATTGTG
CTCCTCTTTTCATGAAGGCATATGAGATGCGAAATGCTGGAGCTGTTATTCATAGCCATG
GCATGGAATCTTGTCTTGTGACAATGCTTAATCCACAAGCCAAAGAATTTCGTATAACTC
ACATGGAGATGATAAAAGGGATTCAAGGTCACGGATACTATGACGAACTTGTTGTCCCAA
TCATAGAGAACACAGCTTATGAGAACGAACTAACAGATTCACTCACCAAAGCTATAGAAG
CCTATCCAAAAGCAACCGCAGTGTTGGTACGCAATCACGGAGTTTACAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2AY65TFB 409 0 0
CATGTCCCCTTCAGGTGTTCAGAAGGAGAGGATGCAACCTGAGGATATGTACATTTTATC
TCCTAATGGATCCATCATATCTGCACCTTCTCCAAAGCCTTACCCTAATAAGCCTCCCGA
GTGTACTGATTGTGCTCCTCTTTTCATGAAGGCATATGAGATGCGAAATGCTGGAGCTGT
TATTCATAGCCATGGCATGGAATCTTGTCTTGTGACAATGCTTAATCCACAAGCCAAAGA
ATTTCGTATAACTCACATGGAGATGATAAAAGGGATTCAAGGTCACGGATACTATGACGA
ACTTGTTGTCTCAATCATAGAGAACACAGCTTATGAGAACGAACTAACAGATTCACTCAC
CAAAGCTATAGAAGCCTATCCAAAAGCAACCGCAGTGTTGGTACGCAAT

QA 1 409 1 409
DS 



AS 1 2

CO CL4487Contig1 757 2 2 U
GAGAGCAGGTACCGCTGCCTCGAAATCAGCTGAAATACAAGCAAGTAAAATGAAAGAAGG
CTCTTTAACAAAACCAGACGGTCCTGGATCAAAAACTGACTCTAAACGTATCAAACACCA
AAATGCTCACCGGGCACGTTTAAGGAGGCTTGAGTACATATCAGATTTGGAAAGAACCAT
CCAAGTGCTACAAGCTCAAGGATGTGAAATGTCATCTGCCATTCACTACTTGGATCAACA
GCTGGTCATGCTTGGTATGGAAAATAGAGCCTTGAAACAACGTCTGGATAGTTTAGCAGA
AATCCAAAAACTTAAACATGTTGAGCAACAATTCCTTGAAAGAGAGATAGGAAATCTGAA
ATTTCGAAAGCACCAACAACAACCACAACAGAATCAGAAACAAACGCAGCAAAACAGATA
CAACAACTACCGCCCACCCACCACGCAGGAACCCGAGTCCCAGTTTGCAGCCTTGGCGAT
ATGATTTTAGGAAAATATGGATCCACTTCCAGTTAAATTTCTCAGTATGCTCTATAAGGT
CTTATAAACATTTTTCTCAGTGTTCATATACGATAGGTAAGCCCAGTAATGCTTGCAGTC
TGGAATGAATGCCTGAGCAAAGTATAGTCACATATATTATAATGTGGATGTTCAAATTCT
TATTTTTATATAATTATTTTTATTAAAGTTGTGTAAGAGTCTATGAAACAACTCTATCAT
GTTAATTATCTTGTAATATATATACTATTAATTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI65TF U 1
AF RR2GI65JQB C 88
BS 1 612 RR2GI65TF
BS 613 757 RR2GI65JQB

RD RR2GI65TF 612 0 0
GAGAGCAGGTACCGCTGCCTCGAAATCAGCTGAAATACAAGCAAGTAAAATGAAAGAAGG
CTCTTTAACAAAACCAGACGGTCCTGGATCAAAAACTGACTCTAAACGTATCAAACACCA
AAATGCTCACCGGGCACGTTTAAGGAGGCTTGAGTACATATCAGATTTGGAAAGAACCAT
CCAAGTGCTACAAGCTCAAGGATGTGAAATGTCATCTGCCATTCACTACTTGGATCAACA
GCTGGTCATGCTTGGTATGGAAAATAGAGCCTTGAAACAACGTCTGGATAGTTTAGCAGA
AATCCAAAAACTTAAACATGTTGAGCAACAATTCCTTGAAAGAGAGATAGGAAATCTGAA
ATTTCGAAAGCACCAACAACAACCACAACAGAATCAGAAACAAACGCAGCAAAACAGATA
CAACAACTACCGCCCACCCACCACGCAGGAACCCGAGTCCCAGTTTGCAGCCTTGGCGAT
ATGATTTTAGGAAAATATGGATCCACTTCCAGTTAAATTTCTCAGTATGCTCTATAAGGT
CTTATAAACATTTTTCTCAGTGTTCATATACGATAGGTAAGCCCAGTAATGCTTGCAGTC
TGGAATGAATGC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2GI65JQB 670 0 0
ATCAAAAACTGACTCTAAACGTATCAAACACCAAAATGCTCACCGGGCACGTTTAAGGAG
GCTTGAGTACATATCAGATTTGGAAAGAACCATCCAAGTGCTACAAGCTCAAGGATGTGA
AATGTCATCTGCCATTCACTACTTGGATCAACAGCTGGTCATGCTTGGTATGGAAAATAG
AGCCTTGAAACAACGTCTGGATAGTTTAGCAGAAATCCAAAAACTTAAACATGTTGAGCA
ACAATTCCTTGAAAGAGAGATAGGAAATTTGAAATTTCGAAAGCACCAACAACAACCACA
ACAGAATCAGAAACAAACGCAGCAAAACAGATACAACAACTACCGCCCACCCACCACGCA
GGAACCCGAGTCCCAGTTTGCAGCCTTGGCGATATGATTTTAGGAAAATATGGATCCACT
TCCAGTTAAATTTCTCAGTATGCTCTATAAGGTTTTATAAACATTTTTTTCAGTGTTCAT
ATACGATAGGTAAGCCCAGTAATGCTTGCAGTTTGGAATGAATGCCTGAGCAAAGTATAG
TCACATATATTATAATGTGGATGTTCAAATTCTTATTTTTATATAATTATTTTTATTAAA
GTTGTGTAAGAGTCTATGAAACAACTCTATCATGTTAATTATCTTGTAATATATATACTA
TTAATTTTCT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL4488Contig1 718 2 4 U
GGGTCGTTCATCATCCTCACAAAACCCTAAAAGTTTCAACCTTTTTGCTAACAAACCATG
GCTTTGTTCTCCGCACCTTACGACACTGCTGCGACAGGAGTCTTCTTGGACATAGACGAA
TGTAAGATCCCCGAGGAACTCACTGCAGCTGACATCGTACCGAGGATTAGACAGAAACTG
TTGGATGTTGGTCTACGTGGTCCTCCTGCTTCGATCCGGATTTATGGTGATTTGACTGGT
CTTGACTTCCAATCCCCGGATCTAAAGCTCAATCAATTTCACGCAGGAGAGAAACGTTCT
AAGATGACGAAAATATTGGAGGACATTGTTTCGTGGTCAGGTGAGAATCCAGAACCATCG
GTAGGAGTACTAGTCTTGGGAGACTTAGAAGTCGCAGATGATGCTGACATCGCCGAGGTT
ATTCAACTTCTCCAGACTCGGAAAAATTATCAGTTTATCCTTGTCTCTCCAGAATCTCCA
CCCCCACCTCCTCCTCCAACTGTGGTGATGATTCTGAGCTCTGTTCCTCCTCGTGATGGA
CTCTAGTTGTTGTTTTTATCTAGCAAGTATTAATGAACTCTTTTTTAATGAACTTTTTTG
AAGAGAAATAAGTAGAGTATTTGTTGTTAGTAAATGTTTGGATAATCAAATCCTCTTTTG
GAAACTTATGTTACGTCTCGGAAAGCAAAAGATAATTAATTATTAGATTTTTAATGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR54TF U 1
AF RR2AR54JQ C 94
BS 1 165 RR2AR54TF
BS 166 166 RR2AR54JQ
BS 167 683 RR2AR54TF
BS 684 718 RR2AR54JQ

RD RR2AR54TF 683 0 0
GGGTCGTTCATCATCCTCACAAAACCCTAAAAGTTTCAACCTTTTTGCTAACAAACCATG
GCTTTGTTCTCCGCACCTTACGACACTGCTGCGACAGGAGTCTTCTTGGACATAGACGAA
TGTAAGATCCCCGAGGAACTCACTGCAGCTGACATCGTACCGAGGGTTAGACAGAAACTG
TTGGATGTTGGTCTACGTGGTCCTCCTGCTTCGATCCGGATTTATGGTGATTTGACTGGT
CTTGACTTCCAATCCCCGGATCTAAAGCTCAATCAATTTCACGCAGGAGAGAAACGTTCT
AAGATGACGAAAATATTGGAGGACATTGTTTCGTGGTCAGGTGAGAATCCAGAACCATCG
GTAGGAGTACTAGTCTTGGGAGACTTAGAAGTCGCAGATGATGCTGACATCGCCGAGGTT
ATTCAACTTCTCCAGACTCGGAAAAATTATCAGTTTATCCTTGTCTCTCCAGAATCTCCA
CCCCCACCTCCTCCTCCAACTGTGGTGATGATTCTGAGCTCTGTTCCTCCTCGTGATGGA
CTCTAGTTGTTGTTTTTATCTAGCAAGTATTAATGAACTCTTTTTTAATGAACTTTTTTG
AAGAGAAATAAGTAGAGTATTTGTTGTTAGTAAATGTTTGGATAATCAAATCCTCTTTTG
GAAACTTATGTTACGTCTCGGAA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2AR54JQ 625 0 0
ACAGGAGTCTTCTTGGACATAGACGAATGTAAGATCCCCGAGGAACTCACTGCAGCTGAC
ATCGTACCGAGGATTAGACAGAAACTGTTGGATGTTGGTCTACGTGGTCCTCCTGCTTCG
ATCCGGATTTATGGTGATTTGACTGGTCTTGACTTCCAATCCCCGGATCTAAAGCTCAAT
CAATTTCACGCAGGAGAGAAACGTTCTAAGATGACGAAAATATTGGAGGACATTGTTTCG
TGGTCAGGTGAGAATCCAGAACCATCGGTAGGAGTACTAGTCTTGGGAGACTTAGAAGTC
GCAGATGATGCTGACATCGCCGAGGTTATTCAACTTCTCCAGACTCGGAAAAATTATCAG
TTTATCCTTGTCTCTCCAGAATCTCCACCCCCACCTCCTCCTCCAACTGTGGTGATGATT
CTGAGCTCTGTTCCTCCTCGTGATGGACTCTAGTTGTTGTTTTTATCTAGCAAGTATTAA
TGAACTCTTTTTTAATGAACTTTTT*GAAGAGAAATAAGTAGAGTATTTGTTGTTAGTAA
ATGTTTGGATAATCAAATCCTCTTTTGGAAACTTATGTTACGTCTCGGAAAGCAAAAGAT
AATTAATTATTAGATTTTTAATGGG

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL4489Contig1 1052 2 2 U
GGATTCAAGAATCGTCCTTTACTTTCAGTGCCTCTCTCACTTTGCCTATCTCCTACTCAT
CTGTTTCTTCGCCTTCTCTCAGCCTTTCTTTCTTGTTCTATCAGAAATAGTGAATGGAGC
TGTGGACAGAAGCTAGAGCCTTAAAGGCAAGTCTAAGAGGAGAAGCAATAAAGCATCAGG
TGATTGTGTCTGAGGAACTAAGCCGAACTTCTTCTGCTGAAGATTTCCCCGTTGAGTGTT
TCCTCGATTTCTCAGAAGAAGGTCAAGAACAAGAAGAAGAAGAAGGACTTGTATCTGTTT
GTTCTTCACAAGAAGAACAAGATTGTCGTATCTTTAGTTCACAACCTCGCATCTTTGATC
AACTTCCTTCCTTGCCGGATGAAGATGTGGAAGAGCTTGAATGGGTATCTCGTGTTGTGG
ATGATTGTTCTTCACCAGAAGTCTCACTTCTCTTCACACAAACCCACAAAACCAAACCAA
GCTTCTCATCTTCAATACCGGTTAAACCAAGAACCAAACGGTCTCGGAACAGCTTAAGCG
GTAACCGGGTGTGGCCACTAGTTTCAATCAACCAACATGCAGCAGGAGAGCAGTGTAAGA
AGAAGAAACTAGAAACGGCGCTTGTGTTTCAAAGAAGATGCAGCCATTGTGGCACAAACA
CCACACCTCAGTGGAGAACCGGTCCGGCCGGTCCAAAAACCTTATGCAATGCATGTGGAG
TCCGGTTTAAGTCCGGTAGGCTCTGCCCGGAGTACAGACCGGCGGATAGTCCGACGTTCT
CAAATGAGATCCACTCAAATCTTCATAGGAAGGTTATGGAACTGAGAAAGAGTAAAGAGT
TCGGTGAAGAAAGAGGAGAAGCTACTACTAAATCAGACCAAGTCAAATTTGGCAGCTAAG
TGGTAGAGAAGACTTAGGTAAAATGAAAATCTACTTGTTTTAACATTATCTCTAGTTTTG
TAAAATTTAACAACCTGGTCCAAAACATATTAAGTTGTTCTGGAATTAGTGTCTGAAAAG
TGTTGTTCTCTCTATAAACAAGATTATGTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B793TF U 1
AF RR2B793JQ C 487
BS 1 731 RR2B793TF
BS 732 1052 RR2B793JQ

RD RR2B793TF 731 0 0
GGATTCAAGAATCGTCCTTTACTTTCAGTGCCTCTCTCACTTTGCCTATCTCCTACTCAT
CTGTTTCTTCGCCTTCTCTCAGCCTTTCTTTCTTGTTCTATCAGAAATAGTGAATGGAGC
TGTGGACAGAAGCTAGAGCCTTAAAGGCAAGTCTAAGAGGAGAAGCAATAAAGCATCAGG
TGATTGTGTCTGAGGAACTAAGCCGAACTTCTTCTGCTGAAGATTTCCCCGTTGAGTGTT
TCCTCGATTTCTCAGAAGAAGGTCAAGAACAAGAAGAAGAAGAAGGACTTGTATCTGTTT
GTTCTTCACAAGAAGAACAAGATTGTCGTATCTTTAGTTCACAACCTCGCATCTTTGATC
AACTTCCTTCCTTGCCGGATGAAGATGTGGAAGAGCTTGAATGGGTATCTCGTGTTGTGG
ATGATTGTTCTTCACCAGAAGTCTCACTTCTCTTCACACAAACCCACAAAACCAAACCAA
GCTTCTCATCTTCAATACCGGTTAAACCAAGAACCAAACGGTCTCGGAACAGCTTAAGCG
GTAACCGGGTGTGGCCACTAGTTTCAATCAACCAACATGCAGCAGGAGAGCAGTGTAAGA
AGAAGAAACTAGAAACGGCGCTTGTGTTTCAAAGAAGATGCAGCCATTGTGGCACAAACA
CCACACCTCAGTGGAGAACCGGTCCGGCCGGTCCAAAAACCTTATGCAATGCATGTGGAG
TCCGGTTTAAG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2B793JQ 566 0 0
CATT
TTCAATACCGGTTAAACCAAGAACCAAACGGTCTCGGAACAGCTTAAGCGGTAACCGGGT
GTGGCCACTAGTTTCAATCAACCAACATGCAGCAGGAGAGCAGTGTAAGAAGAAGAAACT
AGAAACGGCGCTTGTGTTTCAAAGAAGATGCAGCCATTGTGGCACAAACACCACACCTCA
GTGGAGAACCGGTCCGGCCGGTCCAAAAACCTTATGCAATGCATGTGGAGTCCGGTTTAA
GTCCGGTAGGCTCTGCCCGGAGTACAGACCGGCGGATAGTCCGACGTTCTCAAATGAGAT
CCACTCAAATCTTCATAGGAAGGTTATGGAACTGAGAAAGAGTAAAGAGTTCGGTGAAGA
AAGAGGAGAAGCTACTACTAAATCAGACCAAGTCAAATTTGGCAGCTAAGTGGTAGAGAA
GACTTAGGTAAAATGAAAATCTACTTGTTTTAACATTATCTCTAGTTTTGTAAAATTTAA
CAACCTGGTCCAAAACATATTAAGTTGTTCTGGAATTAGTGTCTGAAAAGTGTTGTTCTC
TCTATAAACAAGATTATGTATT

QA 5 566 5 566
DS 



AS 1 2

CO CL4490Contig1 1065 2 2 U
GGTAGTAACTAAAGGCGACCAATATGATGTGAGAGAGCAATCTAACGAAAACGAGGTTCG
TAATCTTGGAAAACCTGTAGATTTAGCTGGTCAGTATTACAAAGATGGTGCAGATGAGAT
TAGCTTTTTAAACATAACTGGATTCCGTGATTTTCCTCTAGGGGATTTGCCGATGATACA
GGTTTTGAGGTACACATCAGAAAATGTCTTCGTACCACTAACCGTTGGAGGTGGTATTAG
AGATTTCACAGATGCTACCGGCAGATACTATTCGAGTCTGGAAGTTGCTGCTGAGTATTT
CAGATCCGGTGCTGATAAGATCTCCATAGGAAGCGACGCTGTTTATGCTGCGGAAGAGTT
TATTAGATCAGGGGTGAAGACAGGAAAGAGTAGTTTAGAACAAATATCCAGAGTTTATGG
AAATCAGGCTGTGGTTGTAAGTATCGATCCTCGTAGAGTTTATGTGAACCATCCTGAGGA
TGTGCCATACAAAGTCATCAGAGTAACTAACCCAGGTCCGAATGGGGAAGAATATGCATG
GTACCAGTGCACGGTAAGTGGAGGACGAGAAGGTCGGCCTATTGGAGCATATGAGCTTGC
AAAAGCGGTGGAAGAGTTAGGTGCTGGTGAAATTCTACTGAACTGCATAGACTGTGATGG
TCAAGGGAAAGGATTTGATACAGACTTGGTAAAGCTCATCTCTGATTCAGTGGGCATACC
GGTTATCGCAAGCAGTGGAGCAGGCACTCCTGAGCACTTTTCTGAGGTGTTTGAGACGAC
AAATGCTTCTGCTGCGCTTGCTGCCGGAATTTTCCACCGGAAAGAGGTACCCATCCAATC
TGTGAAAGAGCGCTTGCTAGAGAAGAGCATAGAAGTCAGGATGTAAGAAATACCTGATTT
TCCGTTTCTGTTCACGTGTTACCATTATTCGTGTCACACTTCCAACAAGATCGATTCTTA
TTTCAATAAGTTATTATTATAACAGATTAATCGATCACTGACCATTTCGTTGTATGAGAG
TAGATGAACTTATGTTTTAATCTTTTTCATTGCATATACATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ96TF U 1
AF RR2BZ96JQ C 381
BS 1 609 RR2BZ96TF
BS 610 1065 RR2BZ96JQ

RD RR2BZ96TF 609 0 0
GGTAGTAACTAAAGGCGACCAATATGATGTGAGAGAGCAATCTAACGAAAACGAGGTTCG
TAATCTTGGAAAACCTGTAGATTTAGCTGGTCAGTATTACAAAGATGGTGCAGATGAGAT
TAGCTTTTTAAACATAACTGGATTCCGTGATTTTCCTCTAGGGGATTTGCCGATGATACA
GGTTTTGAGGTACACATCAGAAAATGTCTTCGTACCACTAACCGTTGGAGGTGGTATTAG
AGATTTCACAGATGCTACCGGCAGATACTATTCGAGTCTGGAAGTTGCTGCTGAGTATTT
CAGATCCGGTGCTGATAAGATCTCCATAGGAAGCGACGCTGTTTATGCTGCGGAAGAGTT
TATTAGATCAGGGGTGAAGACAGGAAAGAGTAGTTTAGAACAAATATCCAGAGTTTATGG
AAATCAGGCTGTGGTTGTAAGTATCGATCCTCGTAGAGTTTATGTGAACCATCCTGAGGA
TGTGCCATACAAAGTCATCAGAGTAACTAACCCAGGTCCGAATGGGGAAGAATATGCATG
GTACCAGTGCACGGTAAGTGGAGGACGAGAAGGTCGGCCTATTGGAGCATATGAGCTTGC
AAAAGCGGT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2BZ96JQ 685 0 0
CAGGAAAGAGTAGTTTAGAACAAATATCCAGAGTTTATGGAAATCAGGCTGTGGTTGTAA
GTATCGATCCTCGTAGAGTTTATGTGAACCATCCTGAGGATGTGCCATACAAAGTCATCA
GAGTAACTAACCCAGGTCCGAATGGGGAAGAATATGCATGGTACCAGTGCACGGTAAGTG
GAGGACGAGAAGGTCGGCCTATTGGAGCATATGAGCTTGCAAAAGCGGTGGAAGAGTTAG
GTGCTGGTGAAATTCTACTGAACTGCATAGACTGTGATGGTCAAGGGAAAGGATTTGATA
CAGACTTGGTAAAGCTCATCTCTGATTCAGTGGGCATACCGGTTATCGCAAGCAGTGGAG
CAGGCACTCCTGAGCACTTTTCTGAGGTGTTTGAGACGACAAATGCTTCTGCTGCGCTTG
CTGCCGGAATTTTCCACCGGAAAGAGGTACCCATCCAATCTGTGAAAGAGCGCTTGCTAG
AGAAGAGCATAGAAGTCAGGATGTAAGAAATACCTGATTTTCCGTTTCTGTTCACGTGTT
ACCATTATTCGTGTCACACTTCCAACAAGATCGATTCTTATTTCAATAAGTTATTATTAT
AACAGATTAATCGATCACTGACCATTTCGTTGTATGAGAGTAGATGAACTTATGTTTTAA
TCTTTTTCATTGCATATACATTTTC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4492Contig1 1311 2 2 U
GGGTCTTCTTCTTCTTCTTATAAATTCGATTCGATCTCCGACGAAGAAAACCCTAGCGCA
AACTCTTATAGATTCCTCAGCGAGAAGAGAATCTATAAACTCCGAGCTTGAGTTCCCCAT
CTCTCCTTCGTCTCTCTCTCTCTCCTCGCTGGGTAAGATCTTTGGTGTTTTTGATTCAAC
AGTTTTTATCTACTTGCTTGAGATTTTTGGGGTAAAGTCTACACAGTTCAGTATCGATGT
GCTCCACTAGGATGATGATCCCTAATCATTAGACTTTTCAAAAGTTGATGCTCATGTTCT
CACCTCTGTCTATGGCTTTTACTGTCATCCTTCAAAAGCTTAGTGTCTTTGGTCCTGGTT
TGAATCCCTCTTTCCCTTACTGCATCGCCAATCACTCCCGTTAGTTACCATAACTCTGCC
TCCTTCAGTGGTACCTGCCTTTTGATATTGTTTGCAAGCCTCAAGTGGTGTTCCTGCTTT
AGACATTCTTGAGTGTGAGATTTACACCAACCCAGATCATGTAAATCTGTGCTCTCATAG
CATAAAGTGTATTCCTTCTGACTGAGTTCTTGAGGAAGTCTTCTTTGATCTACACCAAAC
ACCCGCATCTTAATTATCAAAGCTAGCTCTACTTTTCTTGAAGCTAGAATGCTCCAAGAA
GAGGCGGTTGGATTCTCTCTCCGGCGCAACTCCTTCAGGCGCCGATCCCCAAGATCAAAC
GTTGACGACAGGGATGGACTCCGCTCCACATCAAATCACGGAAAGGCGATCTGAAATCCG
TCAAACAGCTGCACGCCCAAGGGTTCGACGCGAACGCTCTGGCTTGGGGACCTAAATCGA
AAGGAGCGACTCCGCTTCACCTCGCTGCCGAGGGGGGAAACATCGAAGTCATGGATCTGC
TCCTCGAGCGCGGGGCCAACATCGATGCCAGGACGTGGGGCTCTTGCGGGTGGACACCTC
TCCACGCTGCGGCTAAAGAGAGGAAGAGAGAGGCGGTGAAGTTTCTGGTGGAGAACGGCG
CGTTTCTGCCTGATGACATAAGTGATACGAGATTCAATCCGCCGGTGCATTACTGTCACG
GGCTGGAGTGGGCGTACGAGGAGATGAAGAGGCTTAACAGTGAGTCTTCTTCTTCTTCGT
CTGGTGGCGACACGTCTTGCAGTTCGGAGAACTGATCTTTGTTGCTGTCTTTTTGCTCTA
CTTTTCTGAAAGTCTTGCCGTTGAGAACTCTGAAGAATGTTATGGTTTTGTATCTTCTAT
ATGTCAAAACTGGTGCTTGTATGCCTTGCATAATAAATCTTTGTGTATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI37TF U 1
AF RR2EI37JQ C 593
BS 1 654 RR2EI37TF
BS 655 1311 RR2EI37JQ

RD RR2EI37TF 654 0 0
GGGTCTTCTTCTTCTTCTTATAAATTCGATTCGATCTCCGACGAAGAAAACCCTAGCGCA
AACTCTTATAGATTCCTCAGCGAGAAGAGAATCTATAAACTCCGAGCTTGAGTTCCCCAT
CTCTCCTTCGTCTCTCTCTCTCTCCTCGCTGGGTAAGATCTTTGGTGTTTTTGATTCAAC
AGTTTTTATCTACTTGCTTGAGATTTTTGGGGTAAAGTCTACACAGTTCAGTATCGATGT
GCTCCACTAGGATGATGATCCCTAATCATTAGACTTTTCAAAAGTTGATGCTCATGTTCT
CACCTCTGTCTATGGCTTTTACTGTCATCCTTCAAAAGCTTAGTGTCTTTGGTCCTGGTT
TGAATCCCTCTTTCCCTTACTGCATCGCCAATCACTCCCGTTAGTTACCATAACTCTGCC
TCCTTCAGTGGTACCTGCCTTTTGATATTGTTTGCAAGCCTCAAGTGGTGTTCCTGCTTT
AGACATTCTTGAGTGTGAGATTTACACCAACCCAGATCATGTAAATCTGTGCTCTCATAG
CATAAAGTGTATTCCTTCTGACTGAGTTCTTGAGGAAGTCTTCTTTGATCTACACCAAAC
ACCCGCATCTTAATTATCAAAGCTAGCTCTACTTTTCTTGAAGCTAGAATGCTC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2EI37JQ 719 0 0
CACCAAACACCCGCATCTTAATTATCAAAGCTAGCTCTACTTTTCTTGAAGCTAGAATGC
TCCAAGAAGAGGCGGTTGGATTCTCTCTCCGGCGCAACTCCTTCAGGCGCCGATCCCCAA
GATCAAACGTTGACGACAGGGATGGACTCCGCTCCACATCAAATCACGGAAAGGCGATCT
GAAATCCGTCAAACAGCTGCACGCCCAAGGGTTCGACGCGAACGCTCTGGCTTGGGGACC
TAAATCGAAAGGAGCGACTCCGCTTCACCTCGCTGCCGAGGGGGGAAACATCGAAGTCAT
GGATCTGCTCCTCGAGCGCGGGGCCAACATCGATGCCAGGACGTGGGGCTCTTGCGGGTG
GACACCTCTCCACGCTGCGGCTAAAGAGAGGAAGAGAGAGGCGGTGAAGTTTCTGGTGGA
GAACGGCGCGTTTCTGCCTGATGACATAAGTGATACGAGATTCAATCCGCCGGTGCATTA
CTGTCACGGGCTGGAGTGGGCGTACGAGGAGATGAAGAGGCTTAACAGTGAGTCTTCTTC
TTCTTCGTCTGGTGGCGACACGTCTTGCAGTTCGGAGAACTGATCTTTGTTGCTGTCTTT
TTGCTCTACTTTTCTGAAAGTCTTGCCGTTGAGAACTCTGAAGAATGTTATGGTTTTGTA
TCTTCTATATGTCAAAACTGGTGCTTGTATGCCTTGCATAATAAATCTTTGTGTATGTC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL4493Contig1 943 2 2 U
GGAGAGGATGATTGTTGCCCGATCTGTTTCAGCTCCTTCACGGTGCCCTGTCGTGGCAAC
TGTGGCCATTGGTATTGCGGAAGCTGCATCTTGCAGTATTGGAACTATGCTGCAGTCTCT
AAGCCTTGTAAGCGTCCTATGTGTGTTCGACACATCACTAAGTTGTTACCAGAAGCATCC
TTGCAACAGCGGCAAGAGGAAGGTGAAGGAGGTTCTTGCTAAGATCCGTAGGTATAACCG
TCTCTTTGTTGGAGGTTTAACTGGCTTTCTTCAGAAGTTGCAGGAGCTGCCTTTGCTGAT
TAAGAGATTGGTGTGGCACATGATGGATCCAGATACAAACACTCTCTATTTTCACGAAGT
TCACATCTTTGCAGTTAAGAACATCTTACCTTTATTAAAGTTTCAATCTTGTTTTGTAGT
GCACTATCTGACGCCTTACTCTTCATAGTTTAGTGTTTAGTTACTATCATTACCCACTAA
GTTTTGTTGTCATTCGTTGTATGTACTAATGACCAAAAACAAGGCTACACAGATCTATCA
TTGAAGGACGAGAAACTAAGTTTCTTCCGGTGTTGCAGATGTTGATGAGTACCCTTTACA
CTGCGGCAGAGTTTAGCTTCATCCCAACGGGAGGGTTCAGAATAGTGACGGTGTTCGACT
ACACTGCTATTGCAATGATCTTGATTCTGCGCGTGGTGGGGTTATATCGGAGGAGACGTC
TTGCTCAGCGTGTTAGGCATATTGCAGCTGCAGAACTTGAACCAGAATAGAGTTCGAAAG
GAAAGCTTTAACATACAAAATGAATGTATATTATTATGTGAAGGAGCAAGCGTTTGTTTG
TTGTAGGTTTGTTTGGTAGATCATAGAGAAGCCAAGAGTCTTCGACCACTGTAAAGAAAG
TGAAATACAATCTTTTATAAATAAAAAATGTAATTACGTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT43TF U 1
AF RR2FT43JQ C 277
BS 1 736 RR2FT43TF
BS 737 943 RR2FT43JQ

RD RR2FT43TF 739 0 0
GGAGAGGATGATTGTTGCCCGATCTGTTTCAGCTCCTTCACGGTGCCCTGTCGTGGCAAC
TGTGGCCATTGGTATTGCGGAAGCTGCATCTTGCAGTATTGGAACTATGCTGCAGTCTCT
AAGCCTTGTAAGCGTCCTATGTGTGTTCGACACATCACTAAGTTGTTACCAGAAGCATCC
TTGCAACAGCGGCAAGAGGAAGGTGAAGGAGGTTCTTGCTAAGATCCGTAGGTATAACCG
TCTCTTTGTTGGAGGTTTAACTGGCTTTCTTCAGAAGTTGCAGGAGCTGCCTTTGCTGAT
TAAGAGATTGGTGTGGCACATGATGGATCCAGATACAAACACTCTCTATTTTCACGAAGT
TCACATCTTTGCAGTTAAGAACATCTTACCTTTATTAAAGTTTCAATCTTGTTTTGTAGT
GCACTATCTGACGCCTTACTCTTCATAGTTTAGTGTTTAGTTACTATCATTACCCACTAA
GTTTTGTTGTCATTCGTTGTATGTACTAATGACCAAAAACAAGGCTACACAGATCTATCA
TTGAAGGACGAGAAACTAAGTTTCTTCCGGTGTTGCAGATGTTGATGAGTACCCTTTACA
CTGCGGCAGAGTTTAGCTTCATCCCAACGGGAGGGTTCAGAATAGTGACGGTGTTCGACT
ACACTGCTATTGCAATGATCTTGATTCTGCGCGTGGTGGGGTTATATCGGAGGAGACGTC
TTGCTCAGCGTGTTAG
CAT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2FT43JQ 667 0 0
GTTGCAGGAGCTGCCTTTGCTGATTAAGAGATTGGTGTGGCACATGATGGATCCAGATAC
AAACACTCTCTATTTTCACGAAGTTCACATCTTTGCAGTTAAGAACATCTTACCTTTATT
AAAGTTTCAATCTTGTTTTGTAGTGCACTATCTGACGCCTTACTCTTCATAGTTTAGTGT
TTAGTTACTATCATTACCCACTAAGTTTTGTTGTCATTCGTTGTATGTACTAATGACCAA
AAACAAGGCTACACAGATCTATCATTGAAGGACGAGAAACTAAGTTTCTTCCGGTGTTGC
AGATGTTGATGAGTACCCTTTACACTGCGGCAGAGTTTAGCTTCATCCCAACGGGAGGGT
TCAGAATAGTGACGGTGTTCGACTACACTGCTATTGCAATGATCTTGATTCTGCGCGTGG
TGGGGTTATATCGGAGGAGACGTCTTGCTCAGCGTGTTAGGCATATTGCAGCTGCAGAAC
TTGAACCAGAATAGAGTTCGAAAGGAAAGCTTTAACATACAAAATGAATGTATATTATTA
TGTGAAGGAGCAAGCGTTTGTTTGTTGTAGGTTTGTTTGGTAGATCATAGAGAAGCCAAG
AGTCTTCGACCACTGTAAAGAAAGTGAAATACAATCTTTTATAAATAAAAAATGTAATTA
CGTGGAC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL4494Contig1 871 2 2 U
GGAAGTCTCTCTTGTGTAACAGAACACCAAAGCTCCCTTTTCTTGAGTCTCCGTTCTTAA
ACGTCAAGAGTTATGGTGAGAGTCTTTCTTCTCTACAATCTCTTAAACTCATTTCTTCTC
TGTTTGGTTCCCAAGAAGCTTAGAGTTCTCTTCCCTCCTTCTTGGTACACCGACGACAAG
ATCCCACCACCGTCTGAATCGGAACGTTCTTTGAGAACCGACCCGGTGGATCTTAAACGA
GTGTTTCAGATGTTTGACAAGAACGGAGACGGCCGCATCACAAAGGAAGAGCTAAATGAT
TCTTTAGAGAATCTAGGAATCTTCATGCCAGACAAAGATCTGATCCAGATGATCCAAAAG
ATGGACGCAAATGGAGATGGCTGTGTAGACATCAACGAGTTTGAGTCTCTTTACGGTTCG
ATCGTCGAAGAGAAAGAGGAAGAGGATATGAGAGATGCGTTCAATGTGTTTGATCAAGAC
GGTGATGGATTTATTAGCGTTGAAGAGTTAAAGTCTGTGATGGCTTCCTTGGGACTCAAG
CAAGGTAAAACTCTAAAGTGTTGTAAAGAGATGATTACTCAAGTTGATGAAGATGGTGAT
GGTAGAGTCAATTACAGTGAGTTTCTTCAGATGATGAAGTCTGGTGGGTTTAGCAATAGA
TCATAATCAGATTAAGCTGATTTGATCCCTTTTTACTCTGTAAATAGTTTCTTTTTATGC
TTTGTTTAATCTTGAGCTGAATTGTTTAAACAACACTCTTTGTTTTTTTCCTACAACTCT
GAATGGTGCATGCCACGTGACTTTGCCAGCTTGAAACAATCATGTGTTGTAAACAGAACC
ACACATGTAATGATAGATTAATTATTGGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF38TF U 1
AF RR2CF38JQ C 60
BS 1 726 RR2CF38TF
BS 727 871 RR2CF38JQ

RD RR2CF38TF 729 0 0
GGAAGTCTCTCTTGTGTAACAGAACACCAAAGCTCCCTTTTCTTGAGTCTCCGTTCTTAA
ACGTCAAGAGTTATGGTGAGAGTCTTTCTTCTCTACAATCTCTTAAACTCATTTCTTCTC
TGTTTGGTTCCCAAGAAGCTTAGAGTTCTCTTCCCTCCTTCTTGGTACACCGACGACAAG
ATCCCACCACCGTCTGAATCGGAACGTTCTTTGAGAACCGACCCGGTGGATCTTAAACGA
GTGTTTCAGATGTTTGACAAGAACGGAGACGGCCGCATCACAAAGGAAGAGCTAAATGAT
TCTTTAGAGAATCTAGGAATCTTCATGCCAGACAAAGATCTGATCCAGATGATCCAAAAG
ATGGACGCAAATGGAGATGGCTGTGTAGACATCAACGAGTTTGAGTCTCTTTACGGTTCG
ATCGTCGAAGAGAAAGAGGAAGAGGATATGAGAGATGCGTTCAATGTGTTTGATCAAGAC
GGTGATGGATTTATTAGCGTTGAAGAGTTAAAGTCTGTGATGGCTTCCTTGGGACTCAAG
CAAGGTAAAACTCTAAAGTGTTGTAAAGAGATGATTACTCAAGTTGATGAAGATGGTGAT
GGTAGAGTCAATTACAGTGAGTTTCTTCAGATGATGAAGTCTGGTGGGTTTAGCAATAGA
TCATAATCAGATTAAGCTGATTTGATCCCTTTTTACTCTGTAAATAGTTTCTTTTTATGC
TTTGTT
AAT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2CF38JQ 812 0 0
AACGTCAAGAGTTATGGTGAGAGTCTTTCTTCTCTACAATCTCTTAAACTCATTTCTTCT
CTGTTTGGTTCCCAAGAAGCTTAGAGTTCTCTTCCCTCCTTCTTGGTACACCGACGACAA
GATCCCACCACCGTCTGAATCGGAACGTTCTTTGAGAACCGACCCGGTGGATCTTAAACG
AGTGTTTCAGATGTTTGACAAGAACGGAGACGGCCGCATCACAAAGGAAGAGCTAAATGA
TTCTTTAGAGAATCTAGGAATCTTCATGCCAGACAAAGATCTGATCCAGATGATCCAAAA
GATGGACGCAAATGGAGATGGCTGTGTAGACATCAACGAGTTTGAGTCTCTTTACGGTTC
GATCGTCGAAGAGAAAGAGGAAGAGGATATGAGAGATGCGTTCAATGTGTTTGATCAAGA
CGGTGATGGATTTATTAGCGTTGAAGAGTTAAAGTCTGTGATGGCTTCCTTGGGACTCAA
GCAAGGTAAAACTCTAAAGTGTTGTAAAGAGATGATTACTCAAGTTGATGAAGATGGTGA
TGGTAGAGTCAATTACAGTGAGTTTCTTCAGATGATGAAGTCTGGTGGGTTTAGCAATAG
ATCATAATCAGATTAAGCTGATTTGATCCCTTTTTACTCTGTAAATAGTTTCTTTTTATG
CTTTGTTTAATCTTGAGCTGAATTGTTTAAACAACACTCTTTGTTTTTTTCCTACAACTC
TGAATGGTGCATGCCACGTGACTTTGCCAGCTTGAAACAATCATGTGTTGTAAACAGAAC
CACACATGTAATGATAGATTAATTATTGGACG

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

CO CL4495Contig1 780 2 1 U
GGGATTGTTGAGGAATCAGCCATGGAAGAACAAGAAGAGAAGAAGACGAGAGAGATCCAG
AGATGATGATAGATCACAACCAAACCATATTCCTCTTGATCTAACCTTGGAGATACTCTA
AAGACTTCCTGCAAAATCAATCGTGAGATACTTCCCAGTTTTATCAACTCATTCACGTCG
GTCCTCTGCACGGCCACCACGTCTTCTGCGCCCAGGGCCTGATTTTATTATATGGATCCC
GGATCTGGAACCCAAGCTTGCGTCGGGTTTCAACCTTAACCACATCCCAAAGAGCACATT
CCCACCTCGCTTGATAGTCGTAAGTCTTTTTTAGGTTACGATCCATTTGAGGGTAAACAC
AAAGTACTGTCCTTATATTATGGAAGTAATTCTGTAAAGCCTCTTATCCTTACATTGGGA
GGAAGCTGCCCTATGCGTCAATGGGATTCTGTATATATTATGAGGCGCTTGATACTGATG
GTCATCGTATAATAATGAGATTCGATGTCAAATCTGAAAGCTTCAGTCTTATAAAATATC
CAGACTGCTCTCGTAACTTATGAGGGAAGGCTAGCCTTGGTTACTCGTGACTTTCCATGT
GGTGATGGTGAATTATATATTTTGAAAGATACACATGTACACGAATGGACGCGTCAGTGC
TTGTCTCATGTACGTTTTAAGAGCAAATGGAGGATCATATGCAATTCAAAGTATTACTGA
TGCTGGTGAGCTTGTTTTGCACCAAAAGTTTGTTGATCGTTTATTCTATATTCGATCCAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H742TF U 1
AF RR2GU53TF U 1
BS 1 780 RR2GU53TF

RD RR2H742TF 678 0 0
GGGATTGTTGAGGAATCAGCCATGGAAGAACAAGAAGAGAAGAAGACGAGAGAGATCCAG
AGATGATGATAGATCACAACCAAACCATATTCCTCTTGATCTAACCTTGGAGATACTCTA
AAGACTTCCTGCAAAATCAATCGTGAGATACTTCCCAGTTTTATCAACTCATTCACGTCG
GTCCTCTGCACGGCCACCACGTCTTCTGCGCCCAGGGCCTGATTTTATTATATGGATCCC
GGATCTGGAACCCAAGCTTGCGTCGGGTTTCAACCTTAACCACATCCCAAAGAGCACATT
CCCACCTCGCTTGATAGTCGTAAGTCTTTTTTAGGTTACGATCCATTTGAGGGTAAACAC
AAAGTACTGTCCTTATATTATGGAAGTAATTCTGTAAAGCCTCTTATCCTTACATTGGGA
GGAAGCTGCCCTATGCGTCAATGGGATTCTGTATATATTATGAGGCGCTTGATACTGATG
GTCATCGTATAATAATGAGATTCGATGTCAAATCTGAAAGCTTCAGTCTTATAAAATATC
CAGACTGCTCTCGTAACTTATGAGGGAAGGCTAGCCTTGGTTACTCGTGACTTTCCATGT
GGTGATGGTGAATTATATATTTTGAAAGATACACATGTACACGAATGGACGCGTCAGTGC
TTGTCTCATGTACGTTTT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2GU53TF 780 0 0
GGGATTGTTGAGGAATCAGCCATGGAAGAACAAGAAGAGAAGAAGACGAGAGAGATCCAG
AGATGATGATAGATCACAACCAAACCATATTCCTCTTGATCTAACCTTGGAGATACTCTA
AAGACTTCCTGCAAAATCAATCGTGAGATACTTCCCAGTTTTATCAACTCATTCACGTCG
GTCCTCTGCACGGCCACCACGTCTTCTGCGCCCAGGGCCTGATTTTATTATATGGATCCC
GGATCTGGAACCCAAGCTTGCGTCGGGTTTCAACCTTAACCACATCCCAAAGAGCACATT
CCCACCTCGCTTGATAGTCGTAAGTCTTTTTTAGGTTACGATCCATTTGAGGGTAAACAC
AAAGTACTGTCCTTATATTATGGAAGTAATTCTGTAAAGCCTCTTATCCTTACATTGGGA
GGAAGCTGCCCTATGCGTCAATGGGATTCTGTATATATTATGAGGCGCTTGATACTGATG
GTCATCGTATAATAATGAGATTCGATGTCAAATCTGAAAGCTTCAGTCTTATAAAATATC
CAGACTGCTCTCGTAACTTATGAGGGAAGGCTAGCCTTGGTTACTCGTGACTTTCCATGT
GGTGATGGTGAATTATATATTTTGAAAGATACACATGTACACGAATGGACGCGTCAGTGC
TTGTCTCATGTACGTTTTAAGAGCAAATGGAGGATCATATGCAATTCAAAGTATTACTGA
TGCTGGTGAGCTTGTTTTGCACCAAAAGTTTGTTGATCGTTTATTCTATATTCGATCCAA

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL4496Contig1 1244 2 2 U
GGACTCCACCTTAATTAGCATCTTTTCAGACAGAGAGAGATTCGGACCAAAAATGCAGTA
CAAGAATCTGGGGAAATCGGGATTGAAAGTGAGCACGCTCTCGTTCGGAGCGTGGGTAAC
TTTCGGGAACCAGCTGGACGTGAAAGAAGCCAAATCGATTCTCCAGTGCTGCCGTGATCA
CGGGGTCAACTTCTTCGACAACGCCGAGGTCTACGCCAATGGACGAGCCGAGGAGATTAT
GGGCCAGGCGATTCGTGAGCTGGGATGGCGCAGATCCGACGTCGTCGTCTCCACCAAGAT
CTTCTGGGGTGGTCCTGGTCCTAACGACAAAGGTTTGTCGAGGAAACATATCGTCGAAGG
AACCAAAGCTTCTCTCAAAAGACTCGATATGGACTACGTCGATGTCCTCTATTGCCACAG
GCCTGATGCTTCAACACCTATTGAGGAGACGGTGAGGGCGATGAACTATGTGATTGATAA
GGGCTGGGCGTTCTACTGGGGAACAAGTGAATGGTCGGCTCAACAAATTACAGAGGCATG
GGGAGCTGCTGAGAGGTTGGATTTGGTCGGTCCAATCGTGGAACAGCCTGAGTACAACAT
GTTTGCTAGGCACAAAGTTGAGTCAGAGTTTCTTCCTCTGTACACCAACCATGGCATAGG
TCTCACTACTTGGAGCCCACTTGCATCTGGTGTGCTCACTGGTAAATACAACAAGGGATC
TATTCCCTCTGACAGCCGATTTGCTTTGGAGAATTACAAAAACCTTGCCGATAGATCACT
TGTGGATGACGTGCTGAGGAAAGTCAGCGGTCTCAAACCGATTGCAGATGAGCTAGGTGT
AACTTTGGCTCAGCTTGCGATCGCGTGGTGTGCTTCAAATCCTAACGTGTCATCCGTTAT
CACCGGTGCCACAAGAGAGTCACAGATTCAAGAAAACATGAAGGCTGTTGATGTGATCCC
GTTGTTGACGCCACATGTTCTGGACAAGATCGAGCAAGTTATACAGAGCAAACCTAAACG
TCCTGAATCATACCGGTAAAAACCAAAATCCTGAGATCATTTGGAGGCTTGTGTGATGGT
TGTTCTTGGAAGTTGCCACCTGTTGTCTTTGTTTGTTTTCATATGCATTCTAAGACTCGG
AGACAGAGAGAGTACTAATGTGTTGTTTTTCTAGTTTTGTTGGTTCCACATTTTAAAACG
GTTCTATTGTTAGTGAAAACTTAAAAGTTGGTTCTTGTAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF77TF U 1
AF RR2DF77JQ C 553
BS 1 605 RR2DF77TF
BS 606 1244 RR2DF77JQ

RD RR2DF77TF 605 0 0
GGACTCCACCTTAATTAGCATCTTTTCAGACAGAGAGAGATTCGGACCAAAAATGCAGTA
CAAGAATCTGGGGAAATCGGGATTGAAAGTGAGCACGCTCTCGTTCGGAGCGTGGGTAAC
TTTCGGGAACCAGCTGGACGTGAAAGAAGCCAAATCGATTCTCCAGTGCTGCCGTGATCA
CGGGGTCAACTTCTTCGACAACGCCGAGGTCTACGCCAATGGACGAGCCGAGGAGATTAT
GGGCCAGGCGATTCGTGAGCTGGGATGGCGCAGATCCGACGTCGTCGTCTCCACCAAGAT
CTTCTGGGGTGGTCCTGGTCCTAACGACAAAGGTTTGTCGAGGAAACATATCGTCGAAGG
AACCAAAGCTTCTCTCAAAAGACTCGATATGGACTACGTCGATGTCCTCTATTGCCACAG
GCCTGATGCTTCAACACCTATTGAGGAGACGGTGAGGGCGATGAACTATGTGATTGATAA
GGGCTGGGCGTTCTACTGGGGAACAAGTGAATGGTCGGCTCAACAAATTACAGAGGCATG
GGGAGCTGCTGAGAGGTTGGATTTGGTCGGTCCAATCGTGGAACAGCCTGAGTACAACAT
GTTTG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2DF77JQ 692 0 0
GAGGTTGGATTTGGTCGGTCCAATCGTGGAACAGCCTGAGTACAACATGTTTGCTAGGCA
CAAAGTTGAGTCAGAGTTTCTTCCTCTGTACACCAACCATGGCATAGGTCTCACTACTTG
GAGCCCACTTGCATCTGGTGTGCTCACTGGTAAATACAACAAGGGATCTATTCCCTCTGA
CAGCCGATTTGCTTTGGAGAATTACAAAAACCTTGCCGATAGATCACTTGTGGATGACGT
GCTGAGGAAAGTCAGCGGTCTCAAACCGATTGCAGATGAGCTAGGTGTAACTTTGGCTCA
GCTTGCGATCGCGTGGTGTGCTTCAAATCCTAACGTGTCATCCGTTATCACCGGTGCCAC
AAGAGAGTCACAGATTCAAGAAAACATGAAGGCTGTTGATGTGATCCCGTTGTTGACGCC
ACATGTTCTGGACAAGATCGAGCAAGTTATACAGAGCAAACCTAAACGTCCTGAATCATA
CCGGTAAAAACCAAAATCCTGAGATCATTTGGAGGCTTGTGTGATGGTTGTTCTTGGAAG
TTGCCACCTGTTGTCTTTGTTTGTTTTCATATGCATTCTAAGACTCGGAGACAGAGAGAG
TACTAATGTGTTGTTTTTCTAGTTTTGTTGGTTCCACATTTTAAAACGGTTCTATTGTTA
GTGAAAACTTAAAAGTTGGTTCTTGTAGTTCC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4498Contig1 934 2 2 U
GGATCTTCTATTGAAAAACAATAAAATTTAAACAATGAAATTTTCATATTCTCTATCCAA
ACGATTTGTTTTTCTTAATTTGGCCATCCAATTCCTCATTACACATAGTGTTTCCTCACT
GAACATTACTAATGAGTATCTCAACCACAAATGCCTCCTTAATCAAGGGATATATAATGT
TGGAAGTGAATACGAGAACAACCTCAACATTCTCTTTCGTAAAGTTCGTACTGATGGTTA
TGCTCAGACGGGTTCCATGCACCTAAGTAAGGACCCGAATTTTGATTCTCTCACCGTCAT
GTTCCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGATCTAAATGCCGTACATGCGCTGACACTGCAGT
CGCTGGGTTTCGTAAAAGATGTCTGAGGAACAAAGGAGGTATAATATGGTACGACCAATG
TTTTCTTTGGGTTAGTGCGTTTGGTGAATCAATGTCAATCAAAACTAATTACAAGAATAT
TTTTTCTATGTACAACCCAAATAATGTGAGAGGGGATGCGAAATTGTTTGCCAAGAGGGC
GATGAATTTTTTGTCTGAGCTAACACTTAAAGTCAAGAAAAACACGGGGGCTAGTCTTGT
CATCATATATTACGCGGCAGGAGAAAAGAAGTTCGGGAAAATTACATTATATGCAATGGT
GCAGTGTGTAAGCGAAACAATAGATTGTAAAAGTTGTTTGACATGGAGTATAACAAAGCT
TTTCAAGAACGGCGACATTAAACAAGGAGCGAGAATTTTGGGTGTGAACTGTGACGTAAG
ATATGAGCTATACCCTTTTCTTAGGAGTTAAGCATTTTTTTATAGTGGTGATGAATACAT
CCTCTTCATAATTTCCAATTATATTTTAGTGTTGTTTACCTTTATTCTTTTTTTTCTGAA
ATGTAAGATTCGTATTTTAATAACTAGTGTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW87TF U 1
AF RR2GW87JQ C 268
BS 1 620 RR2GW87TF
BS 621 934 RR2GW87JQ

RD RR2GW87TF 622 0 0
GGATCTTCTATTGAAAAACAATAAAATTTAAACAATGAAATTTTCATATTCTCTATCCAA
ACGATTTGTTTTTCTTAATTTGGCCATCCAATTCCTCATTACACATAGTGTTTCCTCACT
GAACATTACTAATGAGTATCTCAACCACAAATGCCTCCTTAATCAAGGGATATATAATGT
TGGAAGTGAATACGAGAACAACCTCAACATTCTCTTTCGTAAAGTTCGTACTGATGGTTA
TGCTCAGACGGGTTCCATGCACCTAAGTAAGGACCCGAATTTTGATTCTCTCACCGTCAT
GTTCCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGATCTAAATGCCGTACATGCGCTGACACTGCAGT
CGCTGGGTTTCGTAAAAGATGTCTGAGGAACAAAGGAGGTATAATATGGTACGACCAATG
TTTTCTTTGGGTTAGTGCGTTTGGTGAATCAATGTCAATCAAAACTAATTACAAGAATAT
TTTTTCTATGTACAACCCAAATAATGTGAGAGGGGATGCGAAATTGTTTGCCAAGAGGGC
GATGAATTTTTTGTCTGAGCTAACACTTAAAGTCAAGAAAAACACGGGGGCTAGTCTTGT
CATCATATATTACGCGGCAG
AG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2GW87JQ 667 0 0
TAAGGACCCGAATTTTGATTCTCTCACCGTCATGTTCCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGG
ATCTAAATGCCGTACATGCGCTGACACTGCAGTCGCTGGGTTTCGTAAAAGATGTCTGAG
GAACAAAGGAGGTATAATATGGTACGACCAATGTTTTCTTTGGGTTAGTGCGTTTGGTGA
ATCAATGTCAATCAAAACTAATTACAAGAATATTTTTTCTATGTACAACCCAAATAATGT
GAGAGGGGATGCGAAATTGTTTGCCAAGAGGGCGATGAATTTTTTGTCTGAGCTAACACT
TAAAGTCAAGAAAAACACGGGGGCTAGTCTTGTCATCATATATTACGCGGCAGGAGAAAA
GAAGTTCGGGAAAATTACATTATATGCAATGGTGCAGTGTGTAAGCGAAACAATAGATTG
TAAAAGTTGTTTGACATGGAGTATAACAAAGCTTTTCAAGAACGGCGACATTAAACAAGG
AGCGAGAATTTTGGGTGTGAACTGTGACGTAAGATATGAGCTATACCCTTTTCTTAGGAG
TTAAGCATTTTTTTATAGTGGTGATGAATACATCCTCTTCATAATTTCCAATTATATTTT
AGTGTTGTTTACCTTTATTCTTTTTTTTCTGAAATGTAAGATTCGTATTTTAATAACTAG
TGTTTAT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL4499Contig1 1107 2 2 U
GGGCCTTACTCTCCTCCCAAGCGATTGATTTTGCTTTTCTGTTACCTTCTCCTATCATAT
CATATTTCAGTGTTCGGATCGATGGCGTCGGGTCGGGTCAACTCGGGATTCGATTTCGGA
TCCGATGATATCATCCGCACTTACGACGACTTCACCAACCAGGACTCCTCTAACGGTTCC
AACTCCGATCCTGCGATCTCCGCTACCAACTTCAATAAGGAGTTTAACAAGACTAGGATG
GCGAGGTCTTCGGTTTTTCCTACGAGCTCTTACAGTCCACCAGAGGACTCTTTGAGCCAA
GATCTTACTGCCACTGTGGAAGAACCATGAAGAAGTATACAGACAACGTGATGCGTTTTC
TCGAAGGCATCAGCTCACGCTTGTCCCAGCTTGAGCTCTACTGCTACAACCTTGATAAGA
CTATTGGTGAGATGAGATCGGATTTGACTCGTGATAACGAGGAGGCTGATGTTAAGCTTA
GATCTATGGAGAAACATCTTCAAGAGGTGCGTAGATCGGTACAGATTCTCAGAGACAAAC
AAGAGTTGGCAGATACTCAGAAAGACCTAGCGAGGCTTCAGGTTGTGCATAAAGATTCAT
CTTCCCCGTCTCACTCCCAACAAAGCGAGGAGGCTTCTGTTCCTGAGCCTAAGAAGAGTG
AGAACACCTTTGATGCACACAACCAGCAGCTTGCGCTTGCTTTGCCTCATCAAGTACCAC
CACAGCCACCAGCCAGCCACAGCCACAGATTGAGTGTTCAGTCCTCAGGAGGGCCTCCCA
GAGGAGGGTGGTGAGAGAAGCCACAGTGGCTCCTCTTCTAGGCCCTAGTTTTATTGGGCC
CAATAGATTGGGCCTGTTGTGTATTTCTTCCTATTGAACTCAATTTATGTTTCCTCCCAA
TAATATCGTGTGTTTTACTCTTCAATCTGCCACTTGAACAAACCCACAAATCTCTTGTCT
TTGAGTTTATTTTCTTTTGCACAAACTTCTATAAATATTGTTCTGTTGTTCATATTAGTC
GGTCCTATTAAGATATTAATCTCCTTATTGTATAATTTCCTTTTCTTTGTTCAAAAAAAA
AGAATAATAATAATTTCCTTTTGTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D311TF U 1
AF RR2D311JQ C 455
BS 1 577 RR2D311TF
BS 578 1107 RR2D311JQ

RD RR2D311TF 577 0 0
GGGCCTTACTCTCCTCCCAAGCGATTGATTTTGCTTTTCTGTTACCTTCTCCTATCATAT
CATATTTCAGTGTTCGGATCGATGGCGTCGGGTCGGGTCAACTCGGGATTCGATTTCGGA
TCCGATGATATCATCCGCACTTACGACGACTTCACCAACCAGGACTCCTCTAACGGTTCC
AACTCCGATCCTGCGATCTCCGCTACCAACTTCAATAAGGAGTTTAACAAGACTAGGATG
GCGAGGTCTTCGGTTTTTCCTACGAGCTCTTACAGTCCACCAGAGGACTCTTTGAGCCAA
GATCTTACTGCCACTGTGGAAGAACCATGAAGAAGTATACAGACAACGTGATGCGTTTTC
TCGAAGGCATCAGCTCACGCTTGTCCCAGCTTGAGCTCTACTGCTACAACCTTGATAAGA
CTATTGGTGAGATGAGATCGGATTTGACTCGTGATAACGAGGAGGCTGATGTTAAGCTTA
GATCTATGGAGAAACATCTTCAAGAGGTGCGTAGATCGGTACAGATTCTCAGAGACAAAC
AAGAGTTGGCAGATACTCAGAAAGACCTAGCGAGGCT

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2D311JQ 653 0 0
TAACGAGGAGGCTGATGTTAAGCTTAGATCTATGGAGAAACATCTTCAAGAGGTGCGTAG
ATCGGTACAGATTCTCAGAGACAAACAAGAGTTGGCAGATACTCAGAAAGACCTAGCGAG
GCTTCAGGTTGTGCATAAAGATTCATCTTCCCCGTCTCACTCCCAACAAAGCGAGGAGGC
TTCTGTTCCTGAGCCTAAGAAGAGTGAGAACACCTTTGATGCACACAACCAGCAGCTTGC
GCTTGCTTTGCCTCATCAAGTACCACCACAGCCACCAGCCAGCCACAGCCACAGATTGAG
TGTTCAGTCCTCAGGAGGGCCTCCCAGAGGAGGGTGGTGAGAGAAGCCACAGTGGCTCCT
CTTCTAGGCCCTAGTTTTATTGGGCCCAATAGATTGGGCCTGTTGTGTATTTCTTCCTAT
TGAACTCAATTTATGTTTCCTCCCAATAATATCGTGTGTTTTACTCTTCAATCTGCCACT
TGAACAAACCCACAAATCTCTTGTCTTTGAGTTTATTTTCTTTTGCACAAACTTCTATAA
ATATTGTTCTGTTGTTCATATTAGTCGGTCCTATTAAGATATTAATCTCCTTATTGTATA
ATTTCCTTTTCTTTGTTCAAAAAAAAAGAATAATAATAATTTCCTTTTGTAGG

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL4500Contig1 863 2 4 U
GGACAGCCCAACCCTTGACCCTTATACTTCCGAACTCTATACTTCCCCTAAGTTATTTCT
CAATCTGAATCCCATCCAAACAAAACCAAAAAGAAGAAGAAAACATAGAACAAAATGGAA
GTCCCGTTTCTAAACAAGAATTTTTCATCTTCATCTTCTTCAAACTTAAATTCATCATCA
TGGGCTTGGCCTTCTTGTCACCAAAACCCTAGAACCATATCTTTTAGAGCGACTAGTATC
GCAAACAACCCTTATGACGTTGACGAGGAAGAGGAAGAAGATGATAAGCCACTTTCTACC
ATCATACTCTCGTCCGAATCATTCATGGCTGACGGCATAGAAGAGCTTCCGGAGACCGAG
TCCATAGAGAATGTGATCAAAGGTATAAAACCATCAGAAAGACTCATCTTTGAACGAAAA
GGAAAATCCAAATCTATACTCGAAGAGATGAGGAACCAGGATTCATGCTCTTATCCTTGG
AATCAATCCACCTTTTCTACAATTTCAAACGATTCGTGGTGGAGATGGGTTGAGGTACAC
ACCCTTCATCACGGCTAGAGAAGCCTCAAAATGTATCATGAAGATGACCAAATAACGTTT
GATACGTCGTGACAGACGGGAGGGGAGGTAAACATGCAATGCACAATTAACGTTTGTGTG
AGAATCTATAAGAGTTGCGTCTAGAGAGATTTATACGGACCTTTTTCGGAGGTTTCATTT
CATGCCATATAAACAGTTAGTATATTCGTGAGCCCTTCTTTATTTGCTTCCAGTGCGTGT
GACTCATACTGGTACTATATTTTTTAATTTAATCTATTTTGTATTTGTCCCTTTGTCAAT
ACTAAAACTGAATTTTCTTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR03TF U 1
AF RR2BR03JQ C 310
BS 1 663 RR2BR03TF
BS 664 664 RR2BR03JQ
BS 665 697 RR2BR03TF
BS 698 863 RR2BR03JQ

RD RR2BR03TF 701 0 0
GGACAGCCCAACCCTTGACCCTTATACTTCCGAACTCTATACTTCCCCTAAGTTATTTCT
CAATCTGAATCCCATCCAAACAAAACCAAAAAGAAGAAGAAAACATAGAACAAAATGGAA
GTCCCGTTTCTAAACAAGAATTTTTCATCTTCATCTTCTTCAAACTTAAATTCATCATCA
TGGGCTTGGCCTTCTTGTCACCAAAACCCTAGAACCATATCTTTTAGAGCGACTAGTATC
GCAAACAACCCTTATGACGTTGACGAGGAAGAGGAAGAAGATGATAAGCCACTTTCTACC
ATCATACTCTCGTCCGAATCATTCATGGCTGACGGCATAGAAGAGCTTCCGGAGACCGAG
TCCATAGAGAATGTGATCAAAGGTATAAAACCATCAGAAAGACTCATCTTTGAACGAAAA
GGAAAATCCAAATCTATACTCGAAGAGATGAGGAACCAGGATTCATGCTCTTATCCTTGG
AATCAATCCACCTTTTCTACAATTTCAAACGATTCGTGGTGGAGATGGGTTGAGGTACAC
ACCCTTCATCACGGCTAGAGAAGCCTCAAAATGTATCATGAAGATGACCAAATAACGTTT
GATACGTCGTGACAGACGGGAGGGGAGGTAAACATGCAATGCACAATTAACGTTTGTGTG
AGA*TCTATAAGAGTTGCGTCTAGAGAGATTTATACG
ACTT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2BR03JQ 554 0 0
TCGTCCGAATCATTCATGGCTGACGGCATAGAAGAGCTTCCGGAGACCGAGTCCATAGAG
AATGTGATCAAAGGTATAAAACCATCAGAAAGATTCATCTTTGAACGAAAAGGAAAATCC
AAATCTATACTCGAAGAGATGAGGAACCAGGATTCATGCTTTTATCCTTGGAATCAATCC
ACCTTTTCTACAATTTCAAACGATTCGTGGTGGAGATGG*TTGAGGTACACACCCTTCAT
CACGGCTAGAGAAGCCTCAAAATGTATCATGAAGATGACCAAATAACGTTTGATACGTCG
TGACAGACGGGAGGGGAGGTAAACATGCAATGCACAATTAACGTTTGTGTGAGAATCTAT
AAGAGTTGCGTCTAGAGAGATTTATACGGACCTTTTTCGGAGGTTTCATTTCATGCCATA
TAAACAGTTAGTATATTCGTGAGCCCTTCTTTATTTGCTTCCAGTGCGTGTGACTCATAC
TGGTACTATATTTTTTAATTTAATCTATTTTGTATTTGTCCCTTTGTCAATACTAAAACT
GAATTTTCTTTCCG

QA 1 554 1 554
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4502Contig1 819 2 6 U
ACAACAATTTCATTCATATTCATGTCTTTCGCCAAATCCAATAGAAAAAAATCTCTAAAT
GAAAACCTCAAAACTGAAAACTCCATGTTAAAAGAAAAAAAAAAAGAATCTCCTATCTGA
GTGAGATGAAAACACGACTTATCGAGGAGCAGAAATAGGTGCACTAGCTTTGGCGTAACC
AACCCAAGCAACAAGGCCAACGGCTAGTATCACCCATCCCATCACGTCATACCTCAACTC
ACTGCTTTTCACTACCTTTGGTCTTGAAGCTCCTGATGGACCGGCGCCACCCAGTGGCTG
TGTGCCAAAGCCTTGCCTGTGAATCTCTGCGTGCAGTAGCGGAGCCTTGGCCGTCATTAC
AAGTGATTTCTGGTAGGTTTCATTATCCGGATGCTCATCCACAGCAGTTTGAAATAAGTG
AGCAGCTAAGTCAAAGATGTGTTTAGCTTCAGTCTCTTCCGGAGTCCAAAACGCAAGCGT
AGTATATGCATTACCCAGGCACCAAATCGCAGCGTGTTTCTTTGGATCAATCAACAACGC
CTCTTCAAGCTTAGTAATTGCCTCTTGAACAAATTGCTTCGGATCTTCGTTTTGAAACTG
AGCTAGTTCCATTAGAGCTCCTGCCCATCTAACCAAGTTATCGGCATCTAAGGGGTTTTT
CAAGTAGGTGGCTTCGGATACTTTGCGAATTTGCTCGGACATTATTATCGCATCGAACTC
AGCGTCGTTTTTATCCATGGCTTCTCGAAGCTTTCGTACAACACTTCTTCTTCTTCTTCT
CTCGTACATAACGGCTCTACTCTCCTCGGCTGTGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL45JQ U 1
AF RR2BQ64TF C 117
BS 1 339 RR2EL45JQ
BS 340 340 RR2BQ64TF
BS 341 579 RR2EL45JQ
BS 580 580 RR2BQ64TF
BS 581 648 RR2EL45JQ
BS 649 819 RR2BQ64TF

RD RR2EL45JQ 648 0 0
ACAACAATTTCATTCATATTCATGTCTTTCGCCAAATCCAATAGAAAAAAATCTCTAAAT
GAAAACCTCAAAACTGAAAACTCCATGTTAAAAGAAAAAAAAAAAGAATCTCCTATCTGA
GTGAGATGAAAACACGACTTATCGAGGAGCAGAAATAGGTGCACTAGCTTTGGCGTAACC
AACCCAAGCAACAAGGCCAACGGCTAGTATCACCCATCCCATCACGTCATACCTCAACTC
ACTGCTTTTCACTACCTTTGGTCTTGAAGCTCCTGATGGACCGGCGCCACCCAGTGGCTG
TGTGCCAAAGCCTTGCCTGTGAATCTCTGCGTGCAGTAGTGGAGCCTTGGCCGTCATTAC
AAGTGATTTCTGGTAGGTTTCATTATCCGGATGCTCATCCACAGCAGTTTGAAATAAGTG
AGCAGCTAAGTCAAAGATGTGTTTAGCTTCAGTCTCTTCCGGAGTCCAAAACGCAAGCGT
AGTATATGCATTACCCAGGCACCAAATCGCAGCGTGTTTCTTTGGATCAATCAACAACGC
CTCTTCAAGCTTAGTAATTGCCTCTTGAACAAATTGCTTTGGATCTTCGTTTTGAAACTG
AGCTAGTTCCATTAGAGCTCCTGCCCATCTAACCAAGTTATCGGCATC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2BQ64TF 703 0 0
CTGAGTGAGATGAAA*CACGACTTATCGAG*AGCAGAGATAGGTGCACTAGCTTTGGCGT
AACCAACCCAAGCAACAAGGCCAACGGCTAGTATCACCCATCCCATCACGTCATACCTCA
ACTCACTGCTTT*CACTACCTTTGGTCTTGAAGCTCCTGATGGACCGGCGCCACCCAGTG
GCTGTGTGCCAAAGCCTTGCCTGTGAATCTCTGCGTGCAGTAGCGGAGCCTTGGCCGTCA
TTACAAGTGATTTCTGGTAGGTTTCATTATCCGGATGCTCATCGACAGCAGTTTGAAATA
AGTGAGCAGCTAAGTCAAAGATGTGTTTAGCTTCAGTCTCTTCCGGAGTCCAAAACGCAA
GCGTAGTATATGCATTACCCAGGCACCAAATCGCAGCGTGTTTCTTTGGATCAATCAACA
ACGCCTCTTCAAGCTTAGTAATTGCCTCTTGAACAAATTGCTTCGGATCTTCGTTTTGAA
ACTGAGCTAGTTCCATTAGAGCTCCTGCCCATCTAACCAAGTTATCGGCATCTAAGGGGT
TTTTCAAGTAGGTGGCTTCGGATACTTTGCGAATTTGCTCGGACATTATTATCGCATCGA
ACTCAGCGTCGTTTTTATCCATGGCTTCTCGAAGCTTTCGTACAACACTTCTTCTTCTTC
TTCTCTCGTACATAACGGCTCTACTCTCCTCGGCTGTGTCTCC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL4503Contig1 463 2 11 U
GAGCTAGGAAGAAAGAACTAACACTTTGATTGCACTCAAAAATAAACTTGTCTTTCAAGC
TAACATCAATAATAAATAATATCCAAGAAAACAAAATAATGGAACTACTACAAATCTTTT
ACTGGTATGATCTTTCTGTTCGCATTGTTGCATGCTATATATTACCTTATGTAACCTTAA
AAGTCTTCTTCTTCTTCTCTCCGTCTCCATTACGGAATCCAAAATGTGCGTAATATATTA
GGTAATTTCATCAAATGTTGAGAGGATCATCTTCTGTGTTTCTTTCATTAAAAGGTGTCC
AATCATTTGTCTTTGGCTTGTCAGTAATCATCATGAGCCTTCTTTGCAGGAAACTTGCAA
TAAAGAGGAAAACGGAGCACATTCCAAACATGACAGTCATAGGGAACGCATTCACATTGT
ACAAGACAACACAGACAAAGATGTTCAGAGGAATCCGGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H293JQ U 13
AF RR2E329JQ U 1
BS 1 34 RR2E329JQ
BS 35 35 RR2H293JQ
BS 36 221 RR2E329JQ
BS 222 222 RR2H293JQ
BS 223 291 RR2E329JQ
BS 292 292 RR2H293JQ
BS 293 351 RR2E329JQ
BS 352 352 RR2H293JQ
BS 353 370 RR2E329JQ
BS 371 371 RR2H293JQ
BS 372 463 RR2E329JQ

RD RR2H293JQ 363 0 0
AAA
AACTAACACTTTGATTGCACTCAAAAATAAACTTGTCTTTCAGGCTAACATCAATAATAA
ATAATATCCAAGAAAACAAAATAATGGAACTACTACAAATCTTTTACTGGTATGATCTTT
CTGTTCGCATTGTTGCATGCTATATATTACCTTATGTAACCTTAAAAGTCTTCTTCTTCT
TCTCTCCGTCTCCATTACGGAATCCAAAATGTGCGTAATATATTAGGTAATTTCATCAAA
TGTTGAGAGGATCATCTTCTGTGTTTCTTTCATTAAAAGGTGTCCAATCATTTGTCTTTG
GCTTGTCAGTAATCATCATGAGCCTTCTTTGCAGGAAACTTGCAATAAAGAGGAAAACGG

QA 4 363 4 363
DS 

RD RR2E329JQ 463 0 0
GAGCTAGGAAGAAAGAACTAACACTTTGATTGCATTCAAAAATAAACTTGTCTTTCAAGC
TAACATCAATAATAAATAATATCCAAGAAAACAAAATAATGGAACTACTACAAATCTTTT
ACTGGTATGATCTTTCTGTTCGCATTGTTGCATGCTATATATTACCTTATGTAACCTTAA
AAGTCTTCTTCTTCTTCTCTCCGTCTCCATTACGGAATCCAGAATGTGCGTAATATATTA
GGTAATTTCATCAAATGTTGAGAGGATCATCTTCTGTGTTTCTTTCATTAAGAGGTGTCC
AATCATTTGTCTTTGGCTTGTCAGTAATCATCATGAGCCTTCTTTGCAGGAGACTTGCAA
TAAAGAGGAAGACGGAGCACATTCCAAACATGACAGTCATAGGGAACGCATTCACATTGT
ACAAGACAACACAGACAAAGATGTTCAGAGGAATCCGGAAAAA

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 2

CO CL4504Contig1 822 2 8 U
GAAGCATTGTCTGATTCTTGGTTTGTTAAACTCCGAGAAAGAAAACAATGGTTGCATTAG
CTGTTTCTTCCTCGGGTATTGCTTCGTCTCGCCGTCATTACAGCTTCCAGTTACGTCGTC
CACGAAACCCTCCGACTCAGACAGCGGTTTCTTCTTCTTCGGCGGCGGCTTCCCCTGGGT
TTGATTTGAGTACCCTCGAGTCCGCCATCAACAAGAAAGATAGTAGTGGTGTTAAGGAAG
CTTTGGATCGATTGAGTGAAGAAGGTTGGGCTAAGAAATGGAGTTCTCAGCCTTACATGT
CACGTCGTACGACGTCGCTTCGGGAGCTGACGAATCTCGGAATCAAGAATGCAGAGAATC
TTGCCATCCCTAGTGTCAGGAACGATGCTGCTTTTCTTGTAACTGTTGTCGGAACAACGA
GCGTCTTAGCTGTAATTGCCGGCCAACTTCCCGGGGACTGGGGATTCTTTGTGCCTTACT
TAGTTGGGAGCATATCATTGGTAGTTTTGGGCGTGGGAAGCGTTTCACCGGGGCTTCTTC
AAGCTGCGATTTCCGGGTTTTCGACGTTCTTCCCTGATTATCAAGAACGTCTTGCCGCAC
ATGAAGCGGCCCACTTCTTAGTGGCTTACTTAATTGGACTTCCGATCCTCGGCTACTCGT
TAGATATTGGTAAAGAACACGTTAATCTCATCGACGAGAGGCTTGCTAAACTAATATACA
GCGGTCAGCTTGACTCTAAGGAGCTTGATAGGTTGGCTGCTGTTGCAATGGCTGGACTGC
CGCCGAGGGTCTGAAGTATGACAAAGTGATCGGCCAATCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A143TF U 1
AF RR2A143JQ C 296
BS 1 740 RR2A143TF
BS 741 741 RR2A143JQ
BS 742 751 RR2A143TF
BS 752 752 RR2A143JQ
BS 753 804 RR2A143TF
BS 805 805 RR2A143JQ
BS 806 814 RR2A143TF
BS 815 822 RR2A143JQ

RD RR2A143TF 817 0 0
GAAGCATTGTCTGATTCTTGGTTTGTTAAACTCCGAGAAAGAAAACAATGGTTGCATTAG
CTGTTTCTTCCTCGGGTATTGCTTCGTCTCGCCGTCATTACAGCTTCCAGTTACGTCGTC
CACGAAACCCTCCGACTCAGACAGCGGTTTCTTCTTCTTCGGCGGCGGCTTCCCCTGGGT
TTGATTTGAGTACCCTCGAGTCCGCCATCAACAAGAAAGATAGTAGTGGTGTTAAGGAAG
CTTTGGATCGATTGAGTGAAGAAGGTTGGGCTAAGAAATGGAGTTCTCAGCCTTACATGT
CACGTCGTACGACGTCGCTTCGGGAGCTGACGAATCTCGGAATCAAGAATGCAGAGAATC
TTGCCATCCCTAGTGTCAGGAACGATGCTGCTTTTCTTGTAACTGTTGTCGGAACAACGA
GCGTCTTAGCTGTAATTGCCGGCCAACTTCCCGGGGACTGGGGATTCTTTGTGCCTTACT
TAGTTGGGAGCATATCATTGGTAGTTTTGGGCGTGGGAAGCGTTTCACCGGGGCTTCTTC
AAGCTGCGATTTCCGGGTTTTCGACGTTCTTCCCTGATTATCAAGAACGTCTTGCCGCAC
ATGAAGCGGCCCACTTCTTAGTGGCTTACTTAATTGGACTTCCGATCCTCGGCTACTCGT
TAGATATTGGTAAAGAACACGTTAATCTCATCGACGAGAGGCTTGCTAAACTAATATACA
GCGGTCAGCTTGACTCTAAG*AGCTTGATAG*TTGGCTGCTGTTGCAATGGCTGGACTGC
CGCCGAGGGTCTGAAGTATGACAA*GTGATCGGC
AAT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR2A143JQ 527 0 0
CATGTCACGTCGTACGACGTCGCTTCGGGAGCTGACGAATCTCGGAATCAAGAATGCAGA
GAATCTTGCCATCCCTAGTGTCAGGAACGATGCTGCTTTTCTTGTAACTGTTGTCGGAAC
AACGAGCGTCTTAGCTGTAATTGCCGGCCAACTTCCCGGGGACTGGGGATTCTTTGTGCC
TTACTTAGTTGGGAGCATATCATTGGTAGTTTTGGGCGTGGGAAGCGTTTCACCGGGGCT
TCTTCAAGCTGCGATTTCCGGGTTTTCGACGTTCTTCCCTGATTATCAAGAACGTCTTGC
CGCACATGAAGCGGCCCACTTCTTAGTGGCTTACTTAATTGGACTTCCGATCCTCGGCTA
CTCGTTAGATATTGGTAAAGAACACGTTAATTTCATCGACGAGAGGCTTGCTAAACTAAT
ATACAGCGGTCAGCTTGACTCTAAGGAGCTTGATAGGTTGGCTGCTGTTGCAATGGCTGG
ACTGCCGCCGAGGGTCTGAAGTATGACAAAGTGATCGGCCAATCTGC

QA 1 527 1 527
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4507Contig1 983 2 2 U
GTCCAATCTACCAGCCAAGAAGATTCTCTGCTTGATTTTGCAGTATGGGAGCCTCCACAT
GGACCTTACAGGACTTTTCATCATCCATGGGCAAACTATGTCAAACTTAGTGGTGCCGTT
AGGCATTGCGCTTCATGGTCATGGCTATGCACGGCTGCATTCTTTCAGAAATTCAGGCAG
CGCCAGAGAAAAGACAGGCTTTCCGTCAGGAACTTCAGAGAGTTGGAAACGAAGGAGCCA
AAGTGTTGAGGTTGTTTGGTGAAAAAGTGGAGAAAATGGAGAAGCTAAACCAAGGAAACA
TTCTGAAAGAAGTTCAACGAGCAGCGAGGAACTTCAGCTGAAGATAGACAGCAACTCTTT
CCTTCTCGTCAACTCTGAAAGCTGGGCTGCTATGAAAGAGAAAGCTGATGCCGAACAAGC
GCAACAAAACTATCACGAAGAAGCCAAAGAGGACGAAGAGACCAAAGTGATTCAATCTCT
CAGCCAGATTTGGGACACTAACAACAACAACAACCTCAACCATCATCATCAGAGTCCACA
TACTACTGGTAATGATTCTCGGCTTTGGAGGTCAACGGAGAGTATGATGTTTAGGAACCG
AGAACACTGGCCGAGCGTCTCATTCATAGGCGGATCTACGATCAATGAGATAGAATCCAA
AGTATATGAGAGCGCAAGTTCCTTGTCGTTGGCCACATTTGCGTCTCTTCTTATCGAGTT
CGTTGCAAGGCTACAGAACGTGGTTAACGCGTTTGAGGAGCTTAGCACCAAAGCCGATTT
CAAAGAGCCAGATAGTGAGACAGAGAAGAAGAACATAGTTAAAGCTGGATTTTGGACAAG
ACTAAGGACCTGCTTTAGCTCCAGGGATTAGTAGAGGCAGTTTGCAGTTTAACCATGAGG
TGCATAGTTTTGATTTGTATAGACAATTTGATGTAGTTCTTTTGTTGTTGTCTTGACATG
ATATATGCTAATTCCATTTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F314TF U 1
AF RR2F314JQ C 221
BS 1 724 RR2F314TF
BS 725 983 RR2F314JQ

RD RR2F314TF 724 0 0
GTCCAATCTACCAGCCAAGAAGATTCTCTGCTTGATTTTGCAGTATGGGAGCCTCCACAT
GGACCTTACAGGACTTTTCATCATCCATGGGCAAACTATGTCAAACTTAGTGGTGCCGTT
AGGCATTGCGCTTCATGGTCATGGCTATGCACGGCTGCATTCTTTCAGAAATTCAGGCAG
CGCCAGAGAAAAGACAGGCTTTCCGTCAGGAACTTCAGAGAGTTGGAAACGAAGGAGCCA
AAGTGTTGAGGTTGTTTGGTGAAAAAGTGGAGAAAATGGAGAAGCTAAACCAAGGAAACA
TTCTGAAAGAAGTTCAACGAGCAGCGAGGAACTTCAGCTGAAGATAGACAGCAACTCTTT
CCTTCTCGTCAACTCTGAAAGCTGGGCTGCTATGAAAGAGAAAGCTGATGCCGAACAAGC
GCAACAAAACTATCACGAAGAAGCCAAAGAGGACGAAGAGACCAAAGTGATTCAATCTCT
CAGCCAGATTTGGGACACTAACAACAACAACAACCTCAACCATCATCATCAGAGTCCACA
TACTACTGGTAATGATTCTCGGCTTTGGAGGTCAACGGAGAGTATGATGTTTAGGAACCG
AGAACACTGGCCGAGCGTCTCATTCATAGGCGGATCTACGATCAATGAGATAGAATCCAA
AGTATATGAGAGCGCAAGTTCCTTGTCGTTGGCCACATTTGCGTCTCTTCTTATCGAGTT
CGTT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2F314JQ 763 0 0
AGTTGGAAACGAAGGAGCCAAAGTGTTGAGGTTGTTTGGTGAAAAAGTGGAGAAAATGGA
GAAGCTAAACCAAGGAAACATTCTGAAAGAAGTTCAACGAGCAGCGAGGAACTTCAGCTG
AAGATAGACAGCAACTCTTTCCTTCTCGTCAACTCTGAAAGCTGGGCTGCTATGAAAGAG
AAAGCTGATGCCGAACAAGCGCAACAAAACTATCACGAAGAAGCCAAAGAGGACGAAGAG
ACCAAAGTGATTCAATCTTTCAGCCAGATTTGGGACACTAACAACAACAACAACCTCAAC
CATCATCATCAGAGTCCACATACTACTGGTAATGATTCTCGGCTTTGGAGGTCAACGGAG
AGTATGATGTTTAGGAACCGAGAACACTGGCCGAGCGTCTCATTCATAGGCGGATCTACG
ATCAATGAGATAGAATCCAAAGTATATGAGAGCGCAAGTTCCTTGTCGTTGGCCACATTT
GCGTCTCTTCTTATCGAGTTCGTTGCAAGGCTACAGAACGTGGTTAACGCGTTTGAGGAG
CTTAGCACCAAAGCCGATTTCAAAGAGCCAGATAGTGAGACAGAGAAGAAGAACATAGTT
AAAGCTGGATTTTGGACAAGACTAAGGACCTGCTTTAGCTCCAGGGATTAGTAGAGGCAG
TTTGCAGTTTAACCATGAGGTGCATAGTTTTGATTTGTATAGACAATTTGATGTAGTTCT
TTTGTTGTTGTCTTGACATGATATATGCTAATTCCATTTTTGG

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL4508Contig1 610 2 1 U
GGACATCAAATCTCATTCTCTCTAAAAACAAGAGTAAAACTTTCGTTATTTTCACAACCT
CAAATGGCTCGTACCAAGCAAACAGCAAGAAAATCAACCGGAGGAAAGGCTCCGAGGAAG
CAGCTGGCGACGAAAGCGGCGAGGAAGTCTGCTCCGGCCACCGGAGGAGTGAAGAAGCCG
CACAGATTCCGTCCCGGAACGGTGGCGCTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACC
GAGCTCCTGATCCGAAAGCTCCCTTTCCAGCGCCTCGTCCGAGAGATCGCTCAGGATTTT
AAGACGGATCTGAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAGGCGGCGGAGGCT
TACCTCGTCGGTCTGTTCGAGGACACGAACCTGTGTGCGATTCACGCGAAGAGGGTCACC
ATTATGCCTAAAGATATCCAGCTCGCGAGGAGGATCAGGGGTGAGAGGGCTTGAAGCGGT
GGTGATGAACAAGAAGAACAATGGTTTCGAAGAACAATGGTTTCTTAGTTATGGTTTTAA
ATTACTTTGGTTGTTTAAATCAGTTCGTGTAAATCTTTTTTATTAAAAATGTTCGTGTGT
TTTTCAAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BW94JQ C 1
AF RR2BW94TF U 1
BS 1 610 RR2BW94TF

RD RR2BW94JQ 610 0 0
GGACATCAAATCTCATTCTCTCTAAAAACAAGAGTAAAACTTTCGTTATTTTCACAACCT
CAAATGGCTCGTACCAAGCAAACAGCAAGAAAATCAACCGGAGGAAAGGCTCCGAGGAAG
CAGCTGGCGACGAAAGCGGCGAGGAAGTCTGCTCCGGCCACCGGAGGAGTGAAGAAGCCG
CACAGATTCCGTCCCGGAACGGTGGCGCTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACC
GAGCTCCTGATCCGAAAGCTCCCTTTCCAGCGCCTCGTCCGAGAGATCGCTCAGGATTTT
AAGACGGATCTGAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAGGCGGCGGAGGCT
TACCTCGTCGGTCTGTTCGAGGACACGAACCTGTGTGCGATTCACGCGAAGAGGGTCACC
ATTATGCCTAAAGATATCCAGCTCGCGAGGAGGATCAGGGGTGAGAGGGCTTGAAGCGGT
GGTGATGAACAAGAAGAACAATGGTTTCGAAGAACAATGGTTTCTTAGTTATGGTTTTAA
ATTACTTTGGTTGTTTAAATCAGTTCGTGTAAATCTTTTTTATTAAAAATGTTCGTGTGT
TTTTCAAGCC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2BW94TF 610 0 0
GGACATCAAATCTCATTCTCTCTAAAAACAAGAGTAAAACTTTCGTTATTTTCACAACCT
CAAATGGCTCGTACCAAGCAAACAGCAAGAAAATCAACCGGAGGAAAGGCTCCGAGGAAG
CAGCTGGCGACGAAAGCGGCGAGGAAGTCTGCTCCGGCCACCGGAGGAGTGAAGAAGCCG
CACAGATTCCGTCCCGGAACGGTGGCGCTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACC
GAGCTCCTGATCCGAAAGCTCCCTTTCCAGCGCCTCGTCCGAGAGATCGCTCAGGATTTT
AAGACGGATCTGAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAGGCGGCGGAGGCT
TACCTCGTCGGTCTGTTCGAGGACACGAACCTGTGTGCGATTCACGCGAAGAGGGTCACC
ATTATGCCTAAAGATATCCAGCTCGCGAGGAGGATCAGGGGTGAGAGGGCTTGAAGCGGT
GGTGATGAACAAGAAGAACAATGGTTTCGAAGAACAATGGTTTCTTAGTTATGGTTTTAA
ATTACTTTGGTTGTTTAAATCAGTTCGTGTAAATCTTTTTTATTAAAAATGTTCGTGTGT
TTTTCAAGCC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL4509Contig1 805 2 3 U
GCAGAACATGTAATCAACCTTGTTCATAAACTGAGCAGACAATCATAAGTAGTAAATATT
TTAAAGATAGCAGAGACAAAAGTAGTAAACATCATAAGACAAAACAGAGATACCAGAGAC
AAAACGTTGCTTGCCAATCGAAAACGAGTTTTAAACATATTTTAGTAAATAGACGAGACT
TGCATTTCCCTAATCCCACCTTGAAATGCGCCAAGTCAGGGTGAGGATTTCTCCGGTTTC
AACATCGTTTTGTGCCAGTGACTTGTCCCCCTTCAATACCCCTTCTTTTCCTCGTAACTT
CAGATCCTTTGCTGGCATTTGAATCACATTGGCAATTTTCTCCTTCAAACTCCACACCTT
TTCCGACAACGACTCCACTGCTATTTCAATGACTTTCCTTCCATCCACGGTTGGAACCGA
CACCTTGATCGTTGAGGAATCCTCTATAACACAAGCTGACTCGTCAACCTTTCGTCTCTT
TGGCTCTGATTCTGATGAAGAGGAATCCTCATCATGCTGATTATAAGGACTATCCAACAG
ATGGTTCCCCATGACCTCACGAAAGTATTCATCTTCCATCTGAGCAAAGCAGTCAACACC
CTCCACAAAACCATACAAATCATCAACAAAAGTCATTGACCCTTTCTTTTCCTCCTCCCA
TTGAAGACACTCGCAATATCTCTCAATAACTGTCTCTGTATCAACATGATCGGAATCCTT
TACTACTTTGGAATACGCATCAACAGCTTTCTCATAACAATCGAACATTGCATCACCTGG
TTCCATAAAGTTCAAACGTGGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D552JQ U 1
AF RR2CD21TF C 145
BS 1 554 RR2D552JQ
BS 555 555 RR2CD21TF
BS 556 805 RR2D552JQ

RD RR2D552JQ 805 0 0
GCAGAACATGTAATCAACCTTGTTCATAAACTGAGCAGACAATCATAAGTAGTAAATATT
TTAAAGATAGCAGAGACAAAAGTAGTAAACATCATAAGACAAAACAGAGATACCAGAGAC
AAAACGTTGCTTGCCAATCGAAAACGAGTTTTAAACATATTTTAGTAAATAGACGAGACT
TGCATTTCCCTAATCCCACCTTGAAATGCGCCAAGTCAGGGTGAGGATTTCTCCGGTTTC
AACATCGTTTTGTGCCAGTGACTTGTCCCCCTTCAATACCCCTTCTTTTCCTCGTAACTT
CAGATCCTTTGCTGGCATTTGAATCACATTGGCAATTTTCTCCTTCAAACTCCACACCTT
TTCCGACAACGACTCCACTGCTATTTCAATGACTTTCCTTCCATCCACGGTTGGAACCGA
CACCTTGATCGTTGAGGAATCCTCTATAACACAAGCTGACTCGTCAACCTTTCGTCTCTT
TGGCTCTGATTCTGATGAAGAGGAATCCTCATCATGCTGATTATAAGGACTATCCAACAG
ATGGTTCCCCATGATCTCACGAAAGTATTCATCTTCCATCTGAGCAAAGCAGTCAACACC
CTCCACAAAACCATACAAATCATCAACAAAAGTCATTGACCCTTTCTTTTCCTCCTCCCA
TTGAAGACACTCGCAATATCTCTCAATAACTGTCTCTGTATCAACATGATCGGAATCCTT
TACTACTTTGGAATACGCATCAACAGCTTTCTCATAACAATCGAACATTGCATCACCTGG
TTCCATAAAGTTCAAACGTGGTATC

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2CD21TF 661 0 0
CGAGTTTTAAACATATTTTAGTAAATAGACGAGACTTGCATTTCCCTAATCCCACCTTGA
AATGCGCCAAGTCAGGGTGAGGATTTCTCCGGTTTCAACATCGTTTTGTGCCAGTGACTT
GTCCCCCTTCAATACCCCTTCTTTTCCTCGTAACTTCAGATCCTTTGCTGGCATTTGAAT
CACATTGGCAATTTTCTCCTTCAAACTCCACACCTTTTCCGACAACGACTCCACTGCTAT
TTCAATGACTTTCCTTCCATCCACGGTTGGAACCGACACCTTGATCGTTGAGGAATCCTC
TATAACACAAGCTGACTCGTCAACCTTTCGTCTCTTTGGCTCTGATTCTGATGAAGAGGA
ATCCTCATCATGCTGATTATAAGGACTATCCAACAGATGGTTCCCCATGACCTCACGAAA
GTATTCATCTTCCATCTGAGCAAAGCAGTCAACACCCTCCACAAAACCATACAAATCATC
AACAAAAGTCATTGACCCTTTCTTTTCCTCCTCCCATTGAAGACACTCGCAATATCTCTC
AATAACTGTCTCTGTATCAACATGATCGGAATCCTTTACTACTTTGGAATACGCATCGAC
AGCTTTCTCATAACAATCGAACATTGCATCACCTGGTTCCATAAAGTTCAAACGTGGTAT
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL4510Contig1 1120 2 2 U
GGAGGACAGATGATGGGCCATGTCGTGGCCCGGTCTCACCTGTTTCTGTGTCGAAGTAAC
TTCGCCGATAGTATACGGTGTCAGGGCTTGAGGGTTTCAAAAACCCTAAGAATGGAGTCG
CAGCAGTCAAAGAGACCCACTTGCCCTGCTTGCGCTAAACCCACGAAGCTCTGCCTCTGC
AACAGGATCCGATCTCCGCCGCTGGATAACCAGGTGAGTGTTACTATCCTTCAGCACAGC
CTGGAGAGGAAACACGCGCTTAACTCGACTCGAATCGCTAGGTTAGGGCTTAAGAATGTT
ACCGTCACCACCGTTTTCGATGTCCATGACGAGGCAGAGTTCTTGATAAGAGTTAAAGGT
GCCTCTTTGGAGCTTGTGGATGACTTGGAATCTGACGAGAAACCATTACTGGTTGATAAT
GAAAGCTCGAAAACTGGTGAAAGTTTGAAGATTTCTCAACATTCAGATGATAAGATAGGT
CCTTGTGAAGAGAGTTTGATCAGAATCTCTATGAAGAAACGAGGTGTTATGATTGGTATC
AGCAATGTCTCCACCTCTTTGATGGAAGATCCTAGTTTTGGTGGGATATTGGCTTCTCCT
GCAGCAATGGATGTGTTGGCAAAAGGGTTTGTGGTAACAAAGCTCCCTGAAGGGAAGCAA
GAGTTCGAGCTCGAGGTTCCTCCTGGAACAGCACTGTTGTTCCCAAGCGAAGGATCGGTG
ATGATCAATGAACTTAAAGAGAGAGGTTTGAAGGTAAGGAATCTGATAGTTCTTGATGGA
ACGTGGTCAAAGGCGAGGAGAATGTACCTTGAGAACCCGTGGCTGAAGCTTTTGTGTAGC
CATGTGAAGCTGGAAATCGAAGGTGCAAGTTTGTACAGAGAAGTTAGAAGACAGCCGAGA
GAGGGGTGTTTGTCGACGATAGAGAGTATTGTACACGCGATGAAGGAGATGGGTGAAGAT
CCTGAGGGTTTGGATAACATGTTGGATGTTTTTGAATCCATGGTTGGAGATCAAAGAAGA
TGTAAAGATGAGAACTTTGTTAAAGTTTTCTGAAAGGCAGTGACTTTGCTCTTGTAACAT
GTAAGCTGGCATTGTTAATTGTTAAAGTGTTCCATTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV49TF U 1
AF RR2CV49JQ C 382
BS 1 649 RR2CV49TF
BS 650 1120 RR2CV49JQ

RD RR2CV49TF 649 0 0
GGAGGACAGATGATGGGCCATGTCGTGGCCCGGTCTCACCTGTTTCTGTGTCGAAGTAAC
TTCGCCGATAGTATACGGTGTCAGGGCTTGAGGGTTTCAAAAACCCTAAGAATGGAGTCG
CAGCAGTCAAAGAGACCCACTTGCCCTGCTTGCGCTAAACCCACGAAGCTCTGCCTCTGC
AACAGGATCCGATCTCCGCCGCTGGATAACCAGGTGAGTGTTACTATCCTTCAGCACAGC
CTGGAGAGGAAACACGCGCTTAACTCGACTCGAATCGCTAGGTTAGGGCTTAAGAATGTT
ACCGTCACCACCGTTTTCGATGTCCATGACGAGGCAGAGTTCTTGATAAGAGTTAAAGGT
GCCTCTTTGGAGCTTGTGGATGACTTGGAATCTGACGAGAAACCATTACTGGTTGATAAT
GAAAGCTCGAAAACTGGTGAAAGTTTGAAGATTTCTCAACATTCAGATGATAAGATAGGT
CCTTGTGAAGAGAGTTTGATCAGAATCTCTATGAAGAAACGAGGTGTTATGATTGGTATC
AGCAATGTCTCCACCTCTTTGATGGAAGATCCTAGTTTTGGTGGGATATTGGCTTCTCCT
GCAGCAATGGATGTGTTGGCAAAAGGGTTTGTGGTAACAAAGCTCCCTG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2CV49JQ 739 0 0
GACTTGGAATCTGACGAGAAACCATTACTGGTTGATAATGAAAGCTCGAAAACTGGTGAA
AGTTTGAAGATTTCTCAACATTCAGATGATAAGATAGGTCCTTGTGAAGAGAGTTTGATC
AGAATCTCTATGAAGAAACGAGGTGTTATGATTGGTATCAGCAATGTCTCCACCTCTTTG
ATGGAAGATCCTAGTTTTGGTGGGATATTGGCTTCTCCTGCAGCAATGGATGTGTTGGCA
AAAGGGTTTGTGGTAACAAAGCTCCCTGAAGGGAAGCAAGAGTTCGAGCTCGAGGTTCCT
CCTGGAACAGCACTGTTGTTCCCAAGCGAAGGATCGGTGATGATCAATGAACTTAAAGAG
AGAGGTTTGAAGGTAAGGAATCTGATAGTTCTTGATGGAACGTGGTCAAAGGCGAGGAGA
ATGTACCTTGAGAACCCGTGGCTGAAGCTTTTGTGTAGCCATGTGAAGCTGGAAATCGAA
GGTGCAAGTTTGTACAGAGAAGTTAGAAGACAGCCGAGAGAGGGGTGTTTGTCGACGATA
GAGAGTATTGTACACGCGATGAAGGAGATGGGTGAAGATCCTGAGGGTTTGGATAACATG
TTGGATGTTTTTGAATCCATGGTTGGAGATCAAAGAAGATGTAAAGATGAGAACTTTGTT
AAAGTTTTCTGAAAGGCAGTGACTTTGCTCTTGTAACATGTAAGCTGGCATTGTTAATTG
TTAAAGTGTTCCATTTGTC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL4511Contig1 525 2 4 U
GCAATAATTTTCACGTCTGGTTTTGATGCTTTCAAGGTAAAAAAAATCATGTGGATAGAC
AACTTGATTCATGTGGAAGCAAAACACAAAGGTAAAGACACTGTTACATGGAAGCATTGG
GAATGATAAAATTCTGTTTCGTGCTTACTCGCAAAGGAACCAAAGATGACTGAGATTCAA
TGATCTAAGCTTCAGAGCTGGGTACTCAACTTCTGTGGCGGTTCTTGTAATAACTCTTCT
TCGAAGTCATCGTTCTGTATCTGTATGTCCTGAGTATTTAGCTGCGGTTGTGGTGGTAAT
GGTGGTTCTTGTGCAACAGGGTATGCTTGTGGCTGAAACATTCTATAATAAGGTTCTTTC
AGATCGAATTTGCATGTCGATATTGGAGGATTCCGCCTTGACTTGCTCCCGGACCCCACA
TTTTAGCTGATAGAGTTAGATCTATTGTGTAACTCTGAGCACTGTGGGCTATCAAATGAA
GTCTACCAGTGATCTCTTGACCTGCCATCACATAAATGGGTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AN02TF C 1
AF RR2AN02JQ U 17
BS 1 16 RR2AN02TF
BS 17 154 RR2AN02JQ
BS 155 155 RR2AN02TF
BS 156 525 RR2AN02JQ

RD RR2AN02TF 525 0 0
GCAATAATTTTCACGTCTGGTTTTGATGCTTTCAAGGTAAAAAAAATCATGTGGATAGAC
AACTTGATTCATGTGGAAGCAAAACACAAAGGTAAAGACACTGTTACATGGAAGCATTGG
GAATGATAAAATTCTGTTTCGTGCTTACTCGCAAAGGAACCAAAGATGACTGAGATTCAA
TGATCTAAGCTTCAGAGCTGGGTACTCAACTTCTGTGGCGGTTCTTGTAATAACTCTTCT
TCGAAGTCATCGTTCTGTATCTGTATGTCCTGAGTATTTAGCTGCGGTTGTGGTGGTAAT
GGTGGTTCTTGTGCAACAGGGTATGCTTGTGGCTGAGACATTCTATAATAAGGTTCTTTC
AGATCGAATTTGCATGTCGATATTGGAGGATTCCGCCTTGACTTGCTCCCGGACCCCACA
TTTTAGCTGATAGAGTTAGATCTATTGTGTAACTCTGAGCACTGTGGGCTATCAAATGAA
GTCTACCAGTGATCTCTTGACCTGCCATCACATAAATGGGTTGCC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2AN02JQ 509 0 0
CTGGTTTTGATGCTTTCAAGGTAAAAAAAATCATGTGGATAGACAACTTGATTCATGTGG
AAGCAAAACACAAAGGTAAAGACACTGTTACATGGAAGCATTGGGAATGATAAAATTCTG
TTTCGTGCTTACTCGCAA*GGAACCAAAGATGACTGAGATTCAATGATCTAAGCTTCAGA
GCTGGGTACTCAACTTCTGTGGCGGTTCTTGTAATAACTCTTCTTCGAAGTCATCGTTCT
GTATCTGTATGTCCTGAGTATTTAGCTGCGGTTGTGGTGGTAATGGTGGTTCTTGTGCAA
CAGGGTATGCTTGTGGCTGAAACATTCTATAATAAGGTTCTTTCAGATCGAATTTGCATG
TCGATATTGGAGGATTCCGCCTTGACTTGCTCCCGGACCCCACATTTTAGCTGATAGAGT
TAGATCTATTGTGTAACTCTGAGCACTGTGGGCTATCAAATGAAGTCTACCAGTGATCTC
TTGACCTGCCATCACATAAATGGGTTGCC

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 2

CO CL4512Contig1 995 2 2 U
GGAAGGTCACTTATGTCTCTGGCTCTCTTATAAGACCATAACACAGAACAAGGCTTTTGT
CGTGTGTAACGATGGCGTCAAGTGATAAAGTTCCGGTGGCGTGTCCTGCAAGCAGCGGAG
AAGGTAAGGATCCAATGGGAGATCCGACGAAGACAACTACAGCGATGTTAGACAAAGGAA
CGGCGATGTTGCAGTCTATGAAACCGATCAGACAAATGAGTCTCAATATGTGTTCATTTG
CTTGCTATAGCCACGATCCTGGCCGTCAGATCGAAGTTCATATGTACGGTCACCGTGTAA
ACCAAGACTTTCTCCAATGTGCCGTCTACGATTCCAATTCCTCTAAGGCTCATCTCATCG
GGATCGAATATATAGTGTCCGAGAAGTTGTTCGAGAGCCTCTCACCGGATGAACAAAAGC
TTTGGCACTCGCATGACTACGAGATCCAAATGGCTCTTCTAGTAACTCCAAGGGTCCCAG
AGCTTGTTGCGATGCCGGAGCTTAAGAATCTTGCTAAATCTTACGGCAAATTTTGGTGCA
CATGGCAGATCGATCGCGGAGATAGATTACCATTAGGTGTACCATCATTTAATGGTTTCT
CCACAAGACGTGGATCTCGGTAGGATCAAACCGGAGCTGGTGAAAAAGAGAGATGAAGAA
CATGGAATCTCGACGGAATCGTTGAAACCGTCACGAGAAGGGATTTGCGGACCGGAGAAA
AAGAATCTGATCGCTGATTATTGGGTTCGGTTTAGGAAAGGCTTTGCGCTTGATGTTGTT
GAGACAGATATGAAGAGAACAGCTCCCTTCCCGTACTTCCTTTCTTTTACTTAAGACATT
ATAACTTCGTAAGCTTATAGTATAATATGTTCGGGTTTATAGTAAGAAACTGGTCCAAGT
TTATTTTGTGTGAGTCAGGTGTTTTAAATAATGTCTTAAAGCATTATGTCTTTAAAATGA
TGTAACTTTTTGACGTGTAAAGTTGATATTTACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN73TF U 1
AF RR2EN73JQ C 328
BS 1 647 RR2EN73TF
BS 648 995 RR2EN73JQ

RD RR2EN73TF 647 0 0
GGAAGGTCACTTATGTCTCTGGCTCTCTTATAAGACCATAACACAGAACAAGGCTTTTGT
CGTGTGTAACGATGGCGTCAAGTGATAAAGTTCCGGTGGCGTGTCCTGCAAGCAGCGGAG
AAGGTAAGGATCCAATGGGAGATCCGACGAAGACAACTACAGCGATGTTAGACAAAGGAA
CGGCGATGTTGCAGTCTATGAAACCGATCAGACAAATGAGTCTCAATATGTGTTCATTTG
CTTGCTATAGCCACGATCCTGGCCGTCAGATCGAAGTTCATATGTACGGTCACCGTGTAA
ACCAAGACTTTCTCCAATGTGCCGTCTACGATTCCAATTCCTCTAAGGCTCATCTCATCG
GGATCGAATATATAGTGTCCGAGAAGTTGTTCGAGAGCCTCTCACCGGATGAACAAAAGC
TTTGGCACTCGCATGACTACGAGATCCAAATGGCTCTTCTAGTAACTCCAAGGGTCCCAG
AGCTTGTTGCGATGCCGGAGCTTAAGAATCTTGCTAAATCTTACGGCAAATTTTGGTGCA
CATGGCAGATCGATCGCGGAGATAGATTACCATTAGGTGTACCATCATTTAATGGTTTCT
CCACAAGACGTGGATCTCGGTAGGATCAAACCGGAGCTGGTGAAAAA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2EN73JQ 668 0 0
ACGATTCCAATTCCTCTAAGGCTCATCTCATCGGGATCGAATATATAGTGTCCGAGAAGT
TGTTCGAGAGCCTCTCACCGGATGAACAAAAGCTTTGGCACTCGCATGACTACGAGATCC
AAATGGCTCTTCTAGTAACTCCAAGGGTCCCAGAGCTTGTTGCGATGCCGGAGCTTAAGA
ATCTTGCTAAATCTTACGGCAAATTTTGGTGCACATGGCAGATCGATCGCGGAGATAGAT
TACCATTAGGTGTACCATCATT*AATGGTTTCTCCACAAGACGTGGATCTCGGTAGGATC
AAACCGGAGCTGGTGAAAAAGAGAGATGAAGAACATGGAATCTCGACGGAATCGTTGAAA
CCGTCACGAGAAGGGATTTGCGGACCGGAGAAAAAGAATCTGATCGCTGATTATTGGGTT
CGGTTTAGGAAAGGCTTTGCGCTTGATGTTGTTGAGACAGATATGAAGAGAACAGCTCCC
TTCCCGTACTTCCTTTCTTTTACTTAAGACATTATAACTTCGTAAGCTTATAGTATAATA
TGTTCGGGTTTATAGTAAGAAACTGGTCCAAGTTTATTTTGTGTGAGTCAGGTGTTTTAA
ATAATGTCTTAAAGCATTATGTCTTTAAAATGATGTAACTTTTTGACGTGTAAAGTTGAT
ATTTACCG

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL4513Contig1 653 2 1 U
GAGATGTATGTATCACAATATGTATAAGCTAAATATTTTAACAGTAGAATCATTCATGTG
TTCTTGATGGTTCTTATTTGGCAAAGTCATCACATTTTCTCATTAAATTGTTTTACCCTT
CCATTGTTTATTTATTATTATTATTTTTTGTGCACCACCCTTTCATTGTTTATTAATAAG
CTATATTCTTTACCATATAAAGGATCCACGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAA
GCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGACGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAA
TACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCACCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTG
AAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCGGCCATGAGATTGAAGATACACACGTCATCAAG
GACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGATCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTC
TAAAACTCTAGAAGCTCCTATTATATATAAGGGGGTTCGATCATCTCTATCAGTTTATTG
TTGTCTAATTAAGAAGTTAAATAAAGTGGAATCTCCTTATGAATAATCATGTTTATGATT
CCGAAGTCTGAGTATTGGAGATACACTACGTGTCTTTGAATATACGTATATGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ET40JQ C 1
AF RR2ET40TF U 1
BS 1 653 RR2ET40TF

RD RR2ET40JQ 653 0 0
GAGATGTATGTATCACAATATGTATAAGCTAAATATTTTAACAGTAGAATCATTCATGTG
TTCTTGATGGTTCTTATTTGGCAAAGTCATCACATTTTCTCATTAAATTGTTTTACCCTT
CCATTGTTTATTTATTATTATTATTTTTTGTGCACCACCCTTTCATTGTTTATTAATAAG
CTATATTCTTTACCATATAAAGGATCCACGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAA
GCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGACGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAA
TACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCACCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTG
AAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCGGCCATGAGATTGAAGATACACACGTCATCAAG
GACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGATCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTC
TAAAACTCTAGAAGCTCCTATTATATATAAGGGGGTTCGATCATCTCTATCAGTTTATTG
TTGTCTAATTAAGAAGTTAAATAAAGTGGAATCTCCTTATGAATAATCATGTTTATGATT
CCGAAGTCTGAGTATTGGAGATACACTACGTGTCTTTGAATATACGTATATGC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2ET40TF 653 0 0
GAGATGTATGTATCACAATATGTATAAGCTAAATATTTTAACAGTAGAATCATTCATGTG
TTCTTGATGGTTCTTATTTGGCAAAGTCATCACATTTTCTCATTAAATTGTTTTACCCTT
CCATTGTTTATTTATTATTATTATTTTTTGTGCACCACCCTTTCATTGTTTATTAATAAG
CTATATTCTTTACCATATAAAGGATCCACGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAA
GCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGACGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAA
TACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCACCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTG
AAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCGGCCATGAGATTGAAGATACACACGTCATCAAG
GACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGATCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTC
TAAAACTCTAGAAGCTCCTATTATATATAAGGGGGTTCGATCATCTCTATCAGTTTATTG
TTGTCTAATTAAGAAGTTAAATAAAGTGGAATCTCCTTATGAATAATCATGTTTATGATT
CCGAAGTCTGAGTATTGGAGATACACTACGTGTCTTTGAATATACGTATATGC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL4514Contig1 1018 2 8 U
TTTTTTGGAAAGAAAAAAAACTCCAAAGAAAGTAGATATGGCGAAGGACGTGGAAGCCGT
TTCTGGAGAAGGGTTTCAGACAAGAGACTATCAAGATCCACCACCGGCGCCTCTGTTTGA
TCCGGAGGAGCTGACCAAGTGGTCTTTTTACAGAGCAGTCATTACCGAGTTCGTTGCTAC
TCTCCTCTTCTTGTACATCACCGTTTTGACAGTCATCGGTTACAAGATTCAGACCGATAG
TACTGCCGGCGGCGTTGACTGCGGTGGAGTTGGTATCCTAGGTATCGCTTGGGCTTTCGG
TGGCATGATCTTCATCCTTGTTTACTGCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATTAACCC
GGCAGTGACATTTGGGCTACTCTTGGCACGTAAAGTGTCGTTGGTTAGAGCCATATTGTA
CGGCGGTGGAGCCAACTCTCTAGCCGACGGCTACAGCACAGGAACAGGCCTAGCTGCAGA
GATCATTGGTACTTTCGTTCTTGTCTACACCGTCTTCTCCGCCACTGACCCTAAACGCAG
TGCCAGAGACTCCCACGTTCCAGTGTTGGCGCCACTTCCAATTGGATTTGCGGTGTTCAT
GGTGCACTTGGCTACCATTCCCATCACCGGAACTGGTATTAACCCGGCAAGGAGTTTTGG
AGCAGCCGTCATCTTCAACGAGAGCAAGCCCTGGGATGACCACTGGATATTTTGGGTGGG
ACCATTTATTGGAGCTGCGATAGCTGCATTCTACCATCAGTTCGTTCTGAGGGCTTCAGG
TTCCAAGTCTCTCGGATCTTTCAGAAGTGCTGCAAACGTCTAAATAATCTCTCATCTCCA
CCGTAGCAGATTCTGAAATAATAAAGATGATAAATCTTTTTTCTCTATGTACAAAATTAT
CCAAATCAGTTCCAGTTTGTTATCTTCTTGTTTGTGTTTTCTACTTGCTCTTTTGTGGAT
TTTCGTTGAGTGTAATTGTTCTTATATTAGGCCAATGCCAAGTTTATCAAGTGACTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H020TF U 1
AF RR2H020JQ C 194
BS 1 639 RR2H020TF
BS 640 640 RR2H020JQ
BS 641 677 RR2H020TF
BS 678 678 RR2H020JQ
BS 679 686 RR2H020TF
BS 687 687 RR2H020JQ
BS 688 700 RR2H020TF
BS 701 1018 RR2H020JQ

RD RR2H020TF 705 0 0
TTTTTTGGAAAGAAAAAAAACTCCAAAGAAAGTAGATATGGCGAAGGACGTGGAAGCCGT
TTCTGGAGAAGGGTTTCAGACAAGAGACTATCAAGATCCACCACCGGCGCCTCTGTTTGA
TCCGGAGGAGCTGACCAAGTGGTCTTTTTACAGAGCAGTCATTACCGAGTTCGTTGCTAC
TCTCCTCTTCTTGTACATCACCGTTTTGACAGTCATCGGTTACAAGATTCAGACCGATAG
TACTGCCGGCGGCGTTGACTGCGGTGGAGTTGGTATCCTAGGTATCGCTTGGGCTTTCGG
TGGCATGATCTTCATCCTTGTTTACTGCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATTAACCC
GGCAGTGACATTTGGGCTACTCTTGGCACGTAAAGTGTCGTTGGTTAGAGCCATATTGTA
CGGCGGTGGAGCCAACTCTCTAGCCGACGGCTACAGCACAGGAACAGGCCTAGCTGCAGA
GATCATTGGTACTTTCGTTCTTGTCTACACCGTCTTCTCCGCCACTGACCCTAAACGCAG
TGCCAGAGACTCCCACGTTCCAGTGTTGGCGCCACTTCCAATTGGATTTGCGGTGTTCAT
GGTGCACTTGGCTACCATTCCCATCACCGGAACTGGTAT*AACCCGGCAAGGAGTTTTGG
AGCAGCCGTCATCTTCA*CGAGAGCA*GCCCTGGGATGAC
ACTGG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2H020JQ 825 0 0
TACATCACCGTTTTGACAGTCATCGGTTACAAGATTCAGACCGATAGTACTGCCGGCGGC
GTTGACTGCGGTGGAGTTGGTATCCTAGGTATCGCTTGGGCTTTCGGTGGCATGATCTTC
ATCCTTGTTTACTGCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATTAACCCGGCAGTGACATTT
GGGCTACTCTTGGCACGTAAAGTGTCGTTGGTTAGAGCCATATTGTACGGCGGTGGAGCC
AACTCTCTAGCCGACGGCTACAGCACAGGAACAGGCCTAGCTGCAGAGATCATTGGTACT
TTCGTTCTTGTCTACACCGTCTTCTCCGCCACTGACCCTAAACGCAGTGCCAGAGACTCC
CACGTTCCAGTGTTGGCGCCACTTCCAATTGGATTTGCGGTGTTCATGGTGCACTTGGCT
ACCATTCCCATCACCGGAACTGGTATTAACCCGGCAAGGAGTTTTGGAGCAGCCGTCATC
TTCAACGAGAGCAAGCCCTGGGATGACCACTGGATATTTTGGGTGGGACCATTTATTGGA
GCTGCGATAGCTGCATTCTACCATCAGTTCGTTCTGAGGGCTTCAGGTTCCAAGTCTCTC
GGATCTTTCAGAAGTGCTGCAAACGTCTAAATAATCTCTCATCTCCACCGTAGCAGATTC
TGAAATAATAAAGATGATAAATCTTTTTTCTCTATGTACAAAATTATCCAAATCAGTTCC
AGTTTGTTATCTTCTTGTTTGTGTTTTCTACTTGCTCTTTTGTGGATTTTCGTTGAGTGT
AATTGTTCTTATATTAGGCCAATGCCAAGTTTATCAAGTGACTGG

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

CO CL4515Contig1 625 2 9 U
AACTCAACGACAACTTTCATTAGCCAATTCATGGTAACCGGATTACAACCCCACAAGATT
TTAACCCACCATACAAACGATGCAATCTAGTAACACATAGGAACACTAAGTTGGCTCCTA
CGCTACCCGAAGTGAGACATCGCTGTATTTTCCACCACATTACACCAAATCCAACTCACA
ACTCGAGCTGAACAGGAACTTAAACCTAACCCTACTACAGAATCAGTTCAACAACAAACC
AAAAAATCCCAGTCCCTAACCGGATTCACTTTCAACACACCAACTAATGATTACCAAAAA
TAGACGTGAAAACCTTGAACCATCAGTATCAACACCAAGGCGCTTCCGGTAGCATACAAA
GACTTCCAGCAGTTATTGACTCGATTCCTGCCCACTGTGAAACAATCAATACTCCACAAC
TCGAAATATTGTGCCTCTTAACCACCTAAAATTCGACCACAATGATACGATAACGCCTAC
TAGCACAAGAACATAACCAAATCATGACGGCAAGATAAGAGCAAGCTAAAGGTTCCTGAT
GATAGACCGTGATGTTCGTGTCCAAAAGCATCTTCACCACCGGCGCATTATCGTGACTGG
CTTTGCTCATTGACGTTCAGTCGTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR69JQ U 1
AF RR2FL12JQ U 1
BS 1 52 RR2FL12JQ
BS 53 53 RR2FR69JQ
BS 54 134 RR2FL12JQ
BS 135 135 RR2FR69JQ
BS 136 310 RR2FL12JQ
BS 311 311 RR2FR69JQ
BS 312 400 RR2FL12JQ
BS 401 401 RR2FR69JQ
BS 402 625 RR2FL12JQ

RD RR2FR69JQ 520 0 0
AACTCAACGACAACTTTCATTAGCCAATTCATGGTAACCGGATTACAACCCCACAAGATT
TTAACCCACCATACAAACGATGCAATCTAGTAACACATAGGAACACTAAGTTGGCTCCTA
CGCTACCCGAAGTGAGACATCGCTGTATTTTCCACCACATTACACCAAGTCCAACTCACA
ACTCGAGCTGAACAGGAACTTAAACCTAACCCTACTACAGAATCAGTTCAACAACAAACC
AAAAAATCCCAGTCCCTAACCGGATTCACTTTCAACACACCAACTAATGATTACCAAAAA
TAGACGTGAAAACCTTGAACCATCAGTATCAACACCAAGGCGCTTCCGGTAGCATACAAA
GACTTCCAGCAGTTATTGACTCGATTCCTGCCCACTGTGAAACAATCAATACTCCACAAC
TCGAAATATTGTGCCTCTTAACCACCTAAAATTCGACCACAATGATACGATAACGCCTAC
TAGCACAAGAACATAACCAAATCATGACGGCAAGATAAGA

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2FL12JQ 625 0 0
AACTCAACGACAACTTTCATTAGCCAATTCATGGTAACCGGATTACAACCCCCCAAGATT
TTAACCCACCATACAAACGATGCAATCTAGTAACACATAGGAACACTAAGTTGGCTCCTA
CGCTACCCGAAGTGGGACATCGCTGTATTTTCCACCACATTACACCAAATCCAACTCACA
ACTCGAGCTGAACAGGAACTTAAACCTAACCCTACTACAGAATCAGTTCAACAACAAACC
AAAAAATCCCAGTCCCTAACCGGATTCACTTTCAACACACCAACTAATGATTACCAAAAA
TAGACGTGAAGACCTTGAACCATCAGTATCAACACCAAGGCGCTTCCGGTAGCATACAAA
GACTTCCAGCAGTTATTGACTCGATTCCTGCCCACTGTGAGACAATCAATACTCCACAAC
TCGAAATATTGTGCCTCTTAACCACCTAAAATTCGACCACAATGATACGATAACGCCTAC
TAGCACAAGAACATAACCAAATCATGACGGCAAGATAAGAGCAAGCTAAAGGTTCCTGAT
GATAGACCGTGATGTTCGTGTCCAAAAGCATCTTCACCACCGGCGCATTATCGTGACTGG
CTTTGCTCATTGACGTTCAGTCGTT

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL4516Contig1 777 2 10 U
AGAAATGATGCCACTTCCGCCTCAAGCTCAACCACCTCCTTTGCCCCACGCACATCCACC
TATGGTTCCTCCGCCTCCTTGTAATCCACAGTCTCCTCCCCCCTTACCTCCAAAGGTCAC
ACAATTGTCTGAACCGGATGCTTATGATCATAACGTAGAGCACCATTGGCAGGGTGTTCT
GTCCAAAAGTGGAGTTCATTACTCCACGATCGTTGCTCAGAGATTGGAATCCGACATTTG
CAAATATACAAATGGGTTTTCAGAGGCTGTGCAATGGCCAGTTAAATTGGATATGACCAA
GCGCACGGATATGAAGAAAGTAAAATCGACTTTCACAAACACTCAGCCACACCAAAGAGA
GGTTTGTCAGTTAATTCCAGCAACTTTCAACGATCGTAAAGGGCTCCAAGATTTCACATC
ATACTTGAAGCAGAGAGATTGTGCAGGAGTGATAAAGATACCTGTAACAAGCCTTATGTG
GGCGAGGCATCTCTTTATTCTTCCCTACTCGGAAGAGACATGTTCCATGCTTTCAGTCAC
CCCGAGCTCCTCTGAATGTTTGATCGGTTTGGTTTTGCCCAAGGAACCAAATGCTGAGTG
CTCGTGACATATAGAGATCCTACTCATGTATCACAGGACAAAAGTAGAGTCATTGCTCAA
GATAGTTCGAAATGAGTTTGTAAATGATGGAACGTACTAGTGGTGTAATCTCACTCTTTG
TTTCAAACCAATTGTACATTGGTGTGAACTATATTTAGCTGTTGAAGTATTGTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW46TF U 1
AF RR2FW46JQ C 396
BS 1 683 RR2FW46TF
BS 684 684 RR2FW46JQ
BS 685 707 RR2FW46TF
BS 708 708 RR2FW46JQ
BS 709 728 RR2FW46TF
BS 729 729 RR2FW46JQ
BS 730 747 RR2FW46TF
BS 748 748 RR2FW46JQ
BS 749 766 RR2FW46TF
BS 767 777 RR2FW46JQ

RD RR2FW46TF 766 0 0
AGAAATGATGCCACTTCCGCCTCAAGCTCAACCACCTCCTTTGCCCCACGCACATCCACC
TATGGTTCCTCCGCCTCCTTGTAATCCACAGTCTCCTCCCCCCTTACCTCCAAAGGTCAC
ACAATTGTCTGAACCGGATGCTTATGATCATAACGTAGAGCACCATTGGCAGGGTGTTCT
GTCCAAAAGTGGAGTTCATTACTCCACGATCGTTGCTCAGAGATTGGAATCCGACATTTG
CAAATATACAAATGGGTTTTCAGAGGCTGTGCAATGGCCAGTTAAATTGGATATGACCAA
GCGCACGGATATGAAGAAAGTAAAATCGACTTTCACAAACACTCAGCCACACCAAAGAGA
GGTTTGTCAGTTAATTCCAGCAACTTTCAACGATCGTAAAGGGCTCCAAGATTTCACATC
ATACTTGAAGCAGAGAGATTGTGCAGGAGTGATAAAGATACCTGTAACAAGCCTTATGTG
GGCGAGGCATCTCTTTATTCTTCCCTACTCGGAAGAGACATGTTCCATGCTTTCAGTCAC
CCCGAGCTCCTCTGAATGTTTGATCGGTTTGGTTTTGCCCAAGGAACCAAATGCTGAGTG
CTCGTGACATATAGAGATCCTACTCATGTATCACAGGACAAAAGTAGAGTCATTGCTCAA
GATAGTTCGAAATGAGTTTGTAA*TGATGGAACGTACTAGTGGTGTA*TCTCACTCTTTG
TTTCAAAC*AATTGTACATTGGTGTGA*CTATATTTAGCTGTTGAA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2FW46JQ 382 0 0
GTAAAGGGCTCCAAGATTTCACATCATACTTGAAGCAGAGAGATTGTGCAGGAGTGATAA
AGATACCTGTAACAAGCCTTATGTGGGCGAGGCATCTCTTTATTCTTCCCTACTCGGAAG
AGACATGTTCCATGCTTTCAGTCACCCCGAGCTCCTCTGAATGTTTGATCGGTTTGGTTT
TGCCCAAGGAACCAAATGCTGAGTGCTCGTGACATATAGAGATCCTACTCATGTATCACA
GGACAAAAGTAGAGTCATTGCTCAAGATAGTTCGAAATGAGTTTGTAAATGATGGAACGT
ACTAGTGGTGTAATCTCACTCTTTGTTTCAAACCAATTGTACATTGGTGTGAACTATATT
TAGCTGTTGAAGTATTGTTATC

QA 1 382 1 382
DS 



AS 1 2

CO CL4517Contig1 1158 2 2 U
GGGAAAAAAAATCATATCTTTAATGACATTTCTCTCCTCAAATGTCAAAACTGTCTGACG
AAACTGACGCCGGAATCTGAAGGAAACTCCGGTGAAAAAAGCGGTGCGTATAATGCTCAA
AGCCGTACAGATCTTGGGTTGGTCAACATCAGGGTTAACCATCATCTCACAGAGACTGAC
CAAGACCCGCAACTCCACCACCGTCTCTTTCCTCTCCACATCTACAAACCCTCTAAAGCT
CTCAACTTTCTCCTCCTCTCCACGGAAAACACTCCGTTTCAACCCGACCCGAATGTCTTC
CTCACTTCCCGGATCCGACCCAGTTCCCAAGTCTCCAACTTTCGTCTCTGTTCAATCAGC
TGGAGATGTTCGTAAGATAAAGTTCTGTCAATGGTGCGGAGGCCCTACCAAGCACGAGAT
ACCTGACGGAGAAGAGAAGCTGAGAGCTATTTGCACACACTGCGACAAAATCGCTTACCA
GAATCCTAAGATGGTTGTAGGTTGTCTTATTGAGCATGAAGGAAAGGTATTGCTTTGCAA
ACGTAATATTCAACCTTCACACGGTCTATGGACTCTTCCTGCGGGTTATCTAGAGGTTGG
AGAGTCAGCTGCTGAAGGAGCAATGAGGGAGACTTGGGAAGAAGCAGGAGCCACTGTGGA
AGTTGTTTCTCCTTTTGCGCAGCTCGATATTCCTCTTATTGGCCAAACGTATGTTATATT
CTTGGCAAAGCTGAAGAATCTTGATTTTGCGCCTGGTCCTGAGTCATTGGAGTGCCGTCT
TTTTTCACTAGACGAGATACCCTTTGATTCCTTGGCGTTTTCATCTATATATGTTACCTT
AAATCTGTATTTGGAAGATCTTAAAAAGGGGAAAGTAAAGTTTCACTATGGTACTATAAA
CAAAAGGCCTGGAAGTAGTCCTTCAGATATTCGAGCCTTTAGTCTTGATTACCGTTTGCA
GCCATGAATCGAGCTTGCAGGAGCAGCTTCTGGATTCGCTGTCATTCTTCCATGTCGTGT
GTGTTTCACTTCGCACCTCATTGTTGACTAGAGAGGAAAGGAATGTTAAGGCTGTACAAA
GAGTTTCTATTTCTGTTTTCAGTTGTTGCCCGAACTGTAAAAGGAAAACTTCAGATGTGA
ATGCAAAACATTTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ45TF U 1
AF RR2EJ45JQ C 580
BS 1 642 RR2EJ45TF
BS 643 1158 RR2EJ45JQ

RD RR2EJ45TF 642 0 0
GGGAAAAAAAATCATATCTTTAATGACATTTCTCTCCTCAAATGTCAAAACTGTCTGACG
AAACTGACGCCGGAATCTGAAGGAAACTCCGGTGAAAAAAGCGGTGCGTATAATGCTCAA
AGCCGTACAGATCTTGGGTTGGTCAACATCAGGGTTAACCATCATCTCACAGAGACTGAC
CAAGACCCGCAACTCCACCACCGTCTCTTTCCTCTCCACATCTACAAACCCTCTAAAGCT
CTCAACTTTCTCCTCCTCTCCACGGAAAACACTCCGTTTCAACCCGACCCGAATGTCTTC
CTCACTTCCCGGATCCGACCCAGTTCCCAAGTCTCCAACTTTCGTCTCTGTTCAATCAGC
TGGAGATGTTCGTAAGATAAAGTTCTGTCAATGGTGCGGAGGCCCTACCAAGCACGAGAT
ACCTGACGGAGAAGAGAAGCTGAGAGCTATTTGCACACACTGCGACAAAATCGCTTACCA
GAATCCTAAGATGGTTGTAGGTTGTCTTATTGAGCATGAAGGAAAGGTATTGCTTTGCAA
ACGTAATATTCAACCTTCACACGGTCTATGGACTCTTCCTGCGGGTTATCTAGAGGTTGG
AGAGTCAGCTGCTGAAGGAGCAATGAGGGAGACTTGGGAAGA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2EJ45JQ 579 0 0
TGCGGGTTATCTAGAGGTTGGAGAGTCAGCTGCTGAAGGAGCAATGAGGGAGACTTGGGA
AGAAGCAGGAGCCACTGTGGAAGTTGTTTCTCCTTTTGCGCAGCTCGATATTCCTCTTAT
TGGCCAAACGTATGTTATATTCTTGGCAAAGCTGAAGAATCTTGATTTTGCGCCTGGTCC
TGAGTCATTGGAGTGCCGTCTTTTTTCACTAGACGAGATACCCTTTGATTCCTTGGCGTT
TTCATCTATATATGTTACCTTAAATCTGTATTTGGAAGATCTTAAAAAGGGGAAAGTAAA
GTTTCACTATGGTACTATAAACAAAAGGCCTGGAAGTAGTCCTTCAGATATTCGAGCCTT
TAGTCTTGATTACCGTTTGCAGCCATGAATCGAGCTTGCAGGAGCAGCTTCTGGATTCGC
TGTCATTCTTCCATGTCGTGTGTGTTTCACTTCGCACCTCATTGTTGACTAGAGAGGAAA
GGAATGTTAAGGCTGTACAAAGAGTTTCTATTTCTGTTTTCAGTTGTTGCCCGAACTGTA
AAAGGAAAACTTCAGATGTGAATGCAAAACATTTTGATC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL4518Contig1 932 2 2 U
GCAATCAAAGAGACTTTTGGGAAGTTCGACAATGTTCTCCAGCCAGGTTGTCACTGTATG
CCATGGTGCTTAGGTAGTCAAGTCGCTGGTCACCTTTCATTGCGTGTTCAGCAGCTCGAT
GTTCGCTGCGAGACCAAAACTAAGGATAATGTGTTTGTAACCGTTGTTGCATCCATACAA
TACCGTGCCTTAGCTGAAAGTGCTCAAGATTTTTTTACAAGCTCAGCAACACCAGGAACC
AGATTCAGGCTTATGTCTTTGATGTGATCCGAGCAAGTGTTCCTAAGCTGGACCTAGACT
CAACCTTTGAGCAGAAGAACGACATTGCCAAAACTGTTGAGAGTGAGCTTGAAAAGGCTA
TGTCCCATTACGGGTATGAGATAGTCCAGACGCTTATTGTGGACATTGAGCCAGATGTGC
ATGTCAAGAAGGCAATGAATGAGATCAATGCTGCTTCGAGAATGAGAGAGGCGGCGAGTG
AGAAAGCTGAAGCAGAGAAGATACTGCAGATCAAGAGAGCCGAGGGAGAAGCTGAATCGA
AATACCTTTCAGGTCTTGGTATAGCTCGTCAGAGACAAGCCATTGTGGATGGTTTGAGAA
ACAGCGTGCTTGCATTTTCTGAGTCTGTTCCAGGGACTTCTTCCAAAGACGTCATGGACA
TGGTTCTGATCACTCAGTACTTTGACACACTTAAGGATATTGGGGCGTCTTCCAAGTCAA
ACTCCGTGTTCATACCGCACGGTCCAGGCGCTGTTAAGGACATTGCTTCACAGATCAGGG
ATGGTTTACTTCAGGGGAAAGCTGCTGAGTAAGAAGATGTCAAAGTACAAAACTTTCTTC
AGGGTTTTAGCTGTTTGTGTTTTTACTTTGTTTTTATCTTCAGGGTTTTTGTCTTTGTCT
TTCTGTTTTACTTGAATCTCACTCAATAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C194TF U 1
AF RR2C194JQ C 214
BS 1 547 RR2C194TF
BS 548 932 RR2C194JQ

RD RR2C194TF 547 0 0
GCAATCAAAGAGACTTTTGGGAAGTTCGACAATGTTCTCCAGCCAGGTTGTCACTGTATG
CCATGGTGCTTAGGTAGTCAAGTCGCTGGTCACCTTTCATTGCGTGTTCAGCAGCTCGAT
GTTCGCTGCGAGACCAAAACTAAGGATAATGTGTTTGTAACCGTTGTTGCATCCATACAA
TACCGTGCCTTAGCTGAAAGTGCTCAAGATTTTTTTACAAGCTCAGCAACACCAGGAACC
AGATTCAGGCTTATGTCTTTGATGTGATCCGAGCAAGTGTTCCTAAGCTGGACCTAGACT
CAACCTTTGAGCAGAAGAACGACATTGCCAAAACTGTTGAGAGTGAGCTTGAAAAGGCTA
TGTCCCATTACGGGTATGAGATAGTCCAGACGCTTATTGTGGACATTGAGCCAGATGTGC
ATGTCAAGAAGGCAATGAATGAGATCAATGCTGCTTCGAGAATGAGAGAGGCGGCGAGTG
AGAAAGCTGAAGCAGAGAAGATACTGCAGATCAAGAGAGCCGAGGGAGAAGCTGAATCGA
AATACCT

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2C194JQ 719 0 0
TTTACAAGCTCAGCAACACCAGGAACCAGATTCAGGCTTATGTCTTTGATGTGATCCGAG
CAAGTGTTCCTAAGCTGGACCTAGACTCAACCTTTGAGCAGAAGAACGACATTGCCAAAA
CTGTTGAGAGTGAGCTTGAAAAGGCTATGTCCCATTACGGGTATGAGATAGTCCAGACGC
TTATTGTGGACATTGAGCCAGATGTGCATGTCAAGAAGGCAATGAATGAGATCAATGCTG
CTTCGAGAATGAGAGAGGCGGCGAGTGAGAAAGCTGAAGCAGAGAAGATACTGCAGATCA
AGAGAGCCGAGGGAGAAGCTGAATCGAAATACCTTTCAGGTCTTGGTATAGCTCGTCAGA
GACAAGCCATTGTGGATGGTTTGAGAAACAGCGTGCTTGCATTTTCTGAGTCTGTTCCAG
GGACTTCTTCCAAAGACGTCATGGACATGGTTCTGATCACTCAGTACTTTGACACACTTA
AGGATATTGGGGCGTCTTCCAAGTCAAACTCCGTGTTCATACCGCACGGTCCAGGCGCTG
TTAAGGACATTGCTTCACAGATCAGGGATGGTTTACTTCAGGGGAAAGCTGCTGAGTAAG
AAGATGTCAAAGTACAAAACTTTCTTCAGGGTTTTAGCTGTTTGTGTTTTTACTTTGTTT
TTATCTTCAGGGTTTTTGTCTTTGTCTTTCTGTTTTACTTGAATCTCACTCAATAAAGC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL4519Contig1 759 2 10 U
GGGAGAAACACTGAAAAGGTTCCTAATTTGAAAACATTACAGATCTTATTACATCTGTTC
TTCTTGTATAACACATTTACACAAGAACCACCTAGAACCAGAATAACTATGCTCTTTTTT
TATACATAACACTCTAATCCAGCATTTGACTCCAAGATAGTGGCAAGTGATAAGACCTAA
CCTTGCGAAGGCACAAACTTTAGCTCATTGATTCTTTTCTTTCATCTTCCATGGTATACA
CCGGTATCTCCCAGTTCTTGTTCTTCTTGGGATCATCAGTTAAGATGAGAACCGTTTCAT
ACTCTTTAAATGTCTTAAAGAATGTTTTTGCTCCCATCATTACCAATCTCTCCACCATGA
ATAACTGGTAGTTATTCTTGATTATAGGATCCAGAATCTCACTAAAGTTCGATGAGTAAG
CCAGTTTGTACCTGACGGCGAGAGGAGAGAAGAATCCAGGAGTTCTCTCATTAAAACCAA
TGAAAAGAGTCCTCCCTGGTGGGACACGCTTCTCTATCCTGTGAAGGATAAACTCTGGTC
GTGTATCTCTGTCTAGATGAGGAAACTGAATCCTCTCAACTCCGAACCTGTCTTTTCTGG
TTTTCAGTTTGTCCCCTCGGCGAACGTGGATAGCATCATAATCACCAAGTTGTGCTTTTA
TCTTTTCTGCTGCGTTTCTCAAACTTGCAGCTGCCATATTAGGGAGAAAGGAGTAAGGAA
GCATGACGTCGCTACGGTTGCCTCTATCTTTGCACTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2DQ62JQ U 1
AF RR2CB28JQ U 287
BS 1 290 RR2DQ62JQ
BS 291 291 RR2CB28JQ
BS 292 440 RR2DQ62JQ
BS 441 441 RR2CB28JQ
BS 442 473 RR2DQ62JQ
BS 474 474 RR2CB28JQ
BS 475 729 RR2DQ62JQ
BS 730 730 RR2CB28JQ
BS 731 757 RR2DQ62JQ
BS 758 759 RR2CB28JQ

RD RR2DQ62JQ 757 0 0
GGGAGAAACACTGAAAAGGTTCCTAATTTGAAAACATTACAGATCTTATTACATCTGTTC
TTCTTGTATAACACATTTACACAAGAACCACCTAGAACCAGAATAACTATGCTCTTTTTT
TATACATAACACTCTAATCCAGCATTTGACTCCAAGATAGTGGCAAGTGATAAGACCTAA
CCTTGCGAAGGCACAAACTTTAGCTCATTGATTCTTTTCTTTCATCTTCCATGGTATACA
CCGGTATCTCCCAGTTCTTGTTCTTCTTGGGATCATCAGTTAAGATGAGATCCGTTTCAT
ACTCTTTAAATGTCTTAAAGAATGTTTTTGCTCCCATCATTACCAATCTCTCCACCATGA
ATAACTGGTAGTTATTCTTGATTATAGGATCCAGAATCTCACTAAAGTTCGATGAGTAAG
CCAGTTTGTACCTGACGGCGGGAGGAGAGAAGAATCCAGGAGTTCTCTCATTAGAACCAA
TGAAAAGAGTCCTCCCTGGTGGGACACGCTTCTCTATCCTGTGAAGGATAAACTCTGGTC
GTGTATCTCTGTCTAGATGAGGAAACTGAATCCTCTCAACTCCGAACCTGTCTTTTCTGG
TTTTCAGTTTGTCCCCTCGGCGAACGTGGATAGCATCATAATCACCAAGTTGTGCTTTTA
TCTTTTCTGCTGCGTTTCTCAAACTTGCAGCTGCCATATTAGGGAGAAAGGAGTAAGGAA
GCATGACGTTGCTACGGTTGCCTCTATCTTTGCACTC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2CB28JQ 473 0 0
GAGAACCGTTTCATACTCTTTAAATGTCTTAAAGAATGTTTTTGCTCCCATCATTACCAA
TCTCTCCACCATGAATAACTGGTAGTTATTCTTGATTATAGGATCCAGAATCTCACTAAA
GTTCGATGAGTAAGCCAGTTTGTACCTGACGGCGAGAGGAGAGAAGAATCCAGGAGTTCT
CTCATTAAAACCAATGAAAAGAGTCCTCCCTGGTGGGACACGCTTCTCTATCCTGTGAAG
GATAAACTCTGGTCGTGTATCTCTGTCTAGATGAGGAAACTGAATCCTCTCAACTCCGAA
CCTGTCTTTTCTGGTTTTCAGTTTGTCCCCTCGGCGAACGTGGATAGCATCATAATCACC
AAGTTGTGCTTTTGTCTTTTCTGCTGCGTTTCTCAAAGTTGCAGCTGCCATATTAGGGAG
AAAGGAGTAAGGAAGCATGACGTCGCTACGGTTGCCTCTATCTTTGCACTCAA

QA 1 473 1 473
DS 



AS 1 2

CO CL4520Contig1 738 2 5 U
ATTAACCAGAGCTCACTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTAGCTCCAATGGGCTTCCCC
GTAGGTTACACAGAGGTCTTCATCCCGAAGCTCTTCGAACAAACACTCTCCCTACTCAGT
TTCATCAGAACCGTCCTCTTCTCTCTCTTCCGCTTCTTGGGTCTCTCCGACTTCCTCGAA
ATGGACCAACCCTGGCCCGACTACACATCTCACCCGACCCGAACACCCACCGAACTCCGC
TCCCCCTTCTCCGCCCTCCTAATCCGCGAGATCTTGCCCGTCGTCAAGTTCGAAGACGTC
TCAGGCGAGGATCTGCCGGAAAGCTGCGCCGTCTGTCTCTACGAGTTCGAAGGAGAGCAA
GAGATCCGGTGGCTGAGAAACTGCAGGCACATATTCCACCGGAGCTGTCTCGACCGTTGG
ATGGATCACGATCAGAAGACGTGTCCTCTCTGTAGGACGCCGTTTGTTCCCGATGAGATG
CAAGAAGAGTTTAATCAACGGCTGTGGGCTGCTTCGGGTGTTCATGACTTCCACAGCGAG
TACTGTCCCGTGGCGGAACTATAGAGAGAGACGGGAGACGGCTTCTTTTCCCTCTCCTTG
TGTCTTTTTTTTTTGACTTTTCACCCCTGTACTTTTAAATTTGCTCTTTTTCACCCTTGC
TAACATTAGATTTGCCACGCTTTCATGTGTTTGTTAGATATACATATGAATGATATGAGC
AATAAACATTACGAAATC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP47TF U 3
AF RR2BP47JQ C 1
BS 1 2 RR2BP47JQ
BS 3 613 RR2BP47TF
BS 614 614 RR2BP47JQ
BS 615 672 RR2BP47TF
BS 673 738 RR2BP47JQ

RD RR2BP47TF 677 0 0
TAACCAGAGCTCACTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTAGCTCCAATGGGCTTCCCCGT
AGGTTACACAGAGGTCTTCATCCCGAAGCTCTTCGAACAAACACTCTCCCTACTCAGTTT
CATCAGAACCGTCCTCTTCTCTCTCTTCCGCTTCTTGGGTCTCTCCGACTTCCTCGAAAT
GGACCAACCCTGGCCCGACTACACATCTCACCCGACCCGAACACCCACCGAACTCCGCTC
CCCCTTCTCCGCCCTCCTAATCCGCGAGATCTTGCCCGTCGTCAAGTTCGAAGACGTCTC
AGGCGAGGATCTGCCGGAAAGCTGCGCCGTCTGTCTCTACGAGTTCGAAGGAGAGCAAGA
GATCCGGTGGCTGAGAAACTGCAGGCACATATTCCACCGGAGCTGTCTCGACCGTTGGAT
GGATCACGATCAGAAGACGTGTCCTCTCTGTAGGACGCCGTTTGTTCCCGATGAGATGCA
AGAAGAGTTTAATCAACGGCTGTGGGCTGCTTCGGGTGTTCATGACTTCCACAGCGAGTA
CTGTCCCGTGGCGGAACTATAGAGAGAGACGGGAGACGGCTTCTTTTCCCTCTCCTTGTG
TCTTTTTTTTT*GACTTTTCACCCCTGTACTTTTAAATTTGCTCTTTTTCACCCTTGCTA
ACATTAGATT
GCCACGC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2BP47JQ 738 0 0
ATTAACCAGAGCTCACTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTAGCTCCAATGGGCTTCCCC
GTAGGTTACACAGAGGTCTTCATCCCGAAGCTCTTCGAACAAACACTCTCCCTACTCAGT
TTCATCAGAACCGTCCTCTTCTCTCTCTTCCGCTTCTTGGGTCTCTCCGACTTCCTCGAA
ATGGACCAACCCTGGCCCGACTACACATCTCACCCGACCCGAACACCCACCGAACTCCGC
TCCCCCTTCTCCGCCCTCCTAATCCGCGAGATCTTGCCCGTCGTCAAGTTCGAAGACGTC
TCAGGCGAGGATCTGCCGGAAAGCTGCGCCGTCTGTCTCTACGAGTTCGAAGGAGAGCAA
GAGATCCGGTGGCTGAGAAACTGCAGGCACATATTCCACCGGAGCTGTCTCGACCGTTGG
ATGGATCACGATCAGAAGACGTGTCCTCTCTGTAGGACGCCGTTTGTTCCCGATGAGATG
CAAGAAGAGTTTAATCAACGGCTGTGGGCTGCTTCGGGTGTTCATGACTTCCACAGCGAG
TACTGTCCCGTGGCGGAACTATAGAGAGAGACGGGAGACGGCTTCTTTTCCCTCTCCTTG
TGTCTTTTTTTTTTGACTTTTCACCCCTGTACTTTTAAATTTGCTCTTTTTCACCCTTGC
TAACATTAGATTTGCCACGCTTTCATGTGTTTGTTAGATATACATATGAATGATATGAGC
AATAAACATTACGAAATC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL4521Contig1 1513 2 2 U
GTCACCAAAATGGTTGATCTCTGCGACAAGACCGGAGACACGGACCACGCCACTCGTCTT
TTCGACAACGTCTCCAACCCTAACGTCTTCTCGTACAACTCCATCATCCGAGCTTACACA
CACAACTCCTTGCACCACCACGCGGTCCGAATCTACAAGCAGATGCTCACTAACAGCCTC
GAGTTACCAGATCGGTTCACTTTCCCTTTCGTGTTCAAATCATGCGCGAGCCTCGGGTCG
TGTTACTTGGGCAAGCAGGTTCATGCTCACTTCTGTAAATTCGGGCCTAAGTGCCACGTC
GTGACGGAGAACGCTCTCGTGGATATGTACATGAAGTTCGATGGTTTCGACGAGGACGCG
CGTAAGGTGTTCGATGAAATGTCTGAGAGAGATGTTATATCGTGGAACAGTCTGATTTCC
GGACACGCGCGGCTCGGGCAGATGAAGAAGGCGAGGGGATTGTTTGATTCCATACCGGAG
GAGAAGACGATCGTGTCTTGGACTGCGATGATCTCCGGGTACACGGGGGCTGGATGTTAT
GCGGAGGCTATGGAGCTCTTCCGCGGCATGCAGTTAGCTGGTGTTGAACCTGACGAGATC
AGTCTCGTCTCTGTTCTGCCTTCTTGTGCTCATCTCGGGTCGCTAGAGGTCGGGAAGTGG
ATCCATATCTACGCGGAGCGGAAGGGGTTTCTGAGACAGACTGGTGTTTGCAACGCTCTT
ATTGAGATGTACTCGAAGTGCGGTAGGATTAGCGAAGCTGTTCAGTTGTTTGATCAGATG
AAGGGGAAAGATGTTATATCGTGGAGTACGATGATCTCAGGGTATGCACATCACGGGAAC
GCTGAGGGAGCAATGGAAACATTCGATGAAATGCGGAGAGCGATGGTGAGGCCTAACGGG
ATCACGTTTCTTGGTCTGTTATCAGCTTGTTCACATGTTGGGTTGTGGCGACAAGGTTTG
AAGTATTTTGATATGATGAAGGAAGATTATCAGATCGAGCCAAAGATTGAACACTATGGT
TGTCTGATCGATGTTTTGGCAAGAGCAGGGGAACTGGAACGAGCTGTTGAAGTAACAAAG
ACGGTGCCGATGAAACCTGGCTCGAAGATTTGGGGTTCGTTGTTGAGCTCTTGCAGAACA
CGAAGCAATCTCGATGTTGCTCTGCTCGCAATGGACCATCTTGTTGAGCTAGAGCCTGAG
GATATGGGGAACTATGTTCTGCTTTCCAATATTTATGCAGATTTGGGGATGTGGGAGGAG
GTTTCGAGATTGAGGAAGGTGATAAGGAATGGGAATATGAAGAGAACGCCAGGCTGTAGC
TTGATAGAAGTGGATAATGCTGTTCAGGAGTTTGTTGCGGGAGATGATCGCAAACCTTAC
TGGACTGAGATCTGTTCAGTGTTGCAACTGTTCTGTGTACATCAGGATGTGATTAAAAAC
AATAGTACTCTTGCTTCTATAGGAATGGTGATTTAGATTACAACAAACAAATTTTATTAC
GAGTATTTTATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH07TF U 1
AF RR2BH07JQ C 712
BS 1 779 RR2BH07TF
BS 780 1513 RR2BH07JQ

RD RR2BH07TF 779 0 0
GTCACCAAAATGGTTGATCTCTGCGACAAGACCGGAGACACGGACCACGCCACTCGTCTT
TTCGACAACGTCTCCAACCCTAACGTCTTCTCGTACAACTCCATCATCCGAGCTTACACA
CACAACTCCTTGCACCACCACGCGGTCCGAATCTACAAGCAGATGCTCACTAACAGCCTC
GAGTTACCAGATCGGTTCACTTTCCCTTTCGTGTTCAAATCATGCGCGAGCCTCGGGTCG
TGTTACTTGGGCAAGCAGGTTCATGCTCACTTCTGTAAATTCGGGCCTAAGTGCCACGTC
GTGACGGAGAACGCTCTCGTGGATATGTACATGAAGTTCGATGGTTTCGACGAGGACGCG
CGTAAGGTGTTCGATGAAATGTCTGAGAGAGATGTTATATCGTGGAACAGTCTGATTTCC
GGACACGCGCGGCTCGGGCAGATGAAGAAGGCGAGGGGATTGTTTGATTCCATACCGGAG
GAGAAGACGATCGTGTCTTGGACTGCGATGATCTCCGGGTACACGGGGGCTGGATGTTAT
GCGGAGGCTATGGAGCTCTTCCGCGGCATGCAGTTAGCTGGTGTTGAACCTGACGAGATC
AGTCTCGTCTCTGTTCTGCCTTCTTGTGCTCATCTCGGGTCGCTAGAGGTCGGGAAGTGG
ATCCATATCTACGCGGAGCGGAAGGGGTTTCTGAGACAGACTGGTGTTTGCAACGCTCTT
ATTGAGATGTACTCGAAGTGCGGTAGGATTAGCGAAGCTGTTCAGTTGTTTGATCAGAT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2BH07JQ 802 0 0
AACGCTCTTATTGAGATGTACTCGAAGTGCGGTAGGATTAGCGAAGCTGTTCAGTTGTTT
GATCAGATGAAGGGGAAAGATGTTATATCGTGGAGTACGATGATCTCAGGGTATGCACAT
CACGGGAACGCTGAGGGAGCAATGGAAACATTCGATGAAATGCGGAGAGCGATGGTGAGG
CCTAACGGGATCACGTTTCTTGGTCTGTTATCAGCTTGTTCACATGTTGGGTTGTGGCGA
CAAGGTTTGAAGTATTTTGATATGATGAAGGAAGATTATCAGATCGAGCCAAAGATTGAA
CACTATGGTTGTCTGATCGATGTTTTGGCAAGAGCAGGGGAACTGGAACGAGCTGTTGAA
GTAACAAAGACGGTGCCGATGAAACCTGGCTCGAAGATTTGGGGTTCGTTGTTGAGCTCT
TGCAGAACACGAAGCAATCTCGATGTTGCTCTGCTCGCAATGGACCATCTTGTTGAGCTA
GAGCCTGAGGATATGGGGAACTATGTTCTGCTTTCCAATATTTATGCAGATTTGGGGATG
TGGGAGGAGGTTTCGAGATTGAGGAAGGTGATAAGGAATGGGAATATGAAGAGAACGCCA
GGCTGTAGCTTGATAGAAGTGGATAATGCTGTTCAGGAGTTTGTTGCGGGAGATGATCGC
AAACCTTACTGGACTGAGATCTGTTCAGTGTTGCAACTGTTCTGTGTACATCAGGATGTG
ATTAAAAACAATAGTACTCTTGCTTCTATAGGAATGGTGATTTAGATTACAACAAACAAA
TTTTATTACGAGTATTTTATTC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL4522Contig1 923 2 4 U
GTTCCTCGCCGAACACACATCCATCCATCACCTTCCACTAGTTCCGTAAGTGTTTCCGAA
AAGCCATGGAAACTGGGAAACGAGACAGAGAAGACATGGAAGTGCAACCCTCCTCTCCGA
GAAAGCCACGTGTACTCCTCGCTGCAAGCGGAAGCGTCGCCGCCATCAAATTCGGCAATC
TCTGCCATTGTTTCACAGAGTGGGCTGAAGTGAGAGCCGTCGTCACGAAATCGTCTCTGC
ATTTCGTCGACAGACTCTCTCTCCCAGGGGAAGTGACTCTGTACGCTGATGAAGACGAGT
GGTCGAGCTGGAACAAGATCGGCGATCCCGTGCTTCACATCGAGCTCAGACGTTGGGCTG
ATGTTTTGGTCATTGCTCCTTTGTCTGCTAACACATTAGGGAAGATTGCTGGCGGGCTGT
GTGATAATCTTCTGACTTGTATCATTCGAGCTTGGGATTATAGCAAACCGCTTTTCGTTG
CACCTGCGATGAATACTTTGATGTGGAACAATCCTTTTACAGAGAGGCATTTGTTGTCGC
TTGATGAACTTGGAGTCACGCTTATTCCTCCCATAAAGAAGAGATTTGGCGTGTGGGGAC
TATGGTAACGGCGCTATGGCTGAGCCTTCTCTTATCTATTCCACTGTCAGGCTCTTCTGG
GAGTCGCAGGCTCATCAGCAAAGTGGTGGTACAAGTTAAAAGACCATGGTGGTGTCCACT
TTGCATTGGTTGGTTCTGTTTTCAGTGTCATAGATAATAGATGATTGTTCAGTTTGTAAT
GCTTGTTTATTGTACATCTTTAAAACAGCTGTCTGGAATCTGGGTTGATGTCTCCACTCA
TGTTGCTTTAGAACACTATTTAAGTTTATCTAAGCTTAGTATTAAACTATCTGAGCTCTC
TGAAACTAGTGAATTTTACCGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP78TF U 1
AF RR2GP78JQ C 157
BS 1 650 RR2GP78TF
BS 651 651 RR2GP78JQ
BS 652 665 RR2GP78TF
BS 666 923 RR2GP78JQ

RD RR2GP78TF 665 0 0
GTTCCTCGCCGAACACACATCCATCCATCACCTTCCACTAGTTCCGTAAGTGTTTCCGAA
AAGCCATGGAAACTGGGAAACGAGACAGAGAAGACATGGAAGTGCAACCCTCCTCTCCGA
GAAAGCCACGTGTACTCCTCGCTGCAAGCGGAAGCGTCGCCGCCATCAAATTCGGCAATC
TCTGCCATTGTTTCACAGAGTGGGCTGAAGTGAGAGCCGTCGTCACGAAATCGTCTCTGC
ATTTCGTCGACAGACTCTCTCTCCCAGGGGAAGTGACTCTGTACGCTGATGAAGACGAGT
GGTCGAGCTGGAACAAGATCGGCGATCCCGTGCTTCACATCGAGCTCAGACGTTGGGCTG
ATGTTTTGGTCATTGCTCCTTTGTCTGCTAACACATTAGGGAAGATTGCTGGCGGGCTGT
GTGATAATCTTCTGACTTGTATCATTCGAGCTTGGGATTATAGCAAACCGCTTTTCGTTG
CACCTGCGATGAATACTTTGATGTGGAACAATCCTTTTACAGAGAGGCATTTGTTGTCGC
TTGATGAACTTGGAGTCACGCTTATTCCTCCCATAAAGAAGAGATTTGGCGTGTGGGGAC
TATGGTAACGGCGCTATGGCTGAGCCTTCTCTTATCTATTCCACTGTCAG*CTCTTCTGG
GAGTC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2GP78JQ 767 0 0
TCGCCGCCATCAAATTCGGCAATCTCTGCCATTGTTTCACAGAGTGGGCTGAAGTGAGAG
CCGTCGTCACGAAATCGTCTCTGCATTTCGTCGACAGACTCTCTCTCCCAGGGGAAGTGA
CTCTGTACGCTGATGAAGACGAGTGGTCGAGCTGGAACAAGATCGGCGATCCCGTGCTTC
ACATCGAGCTCAGACGTTGGGCTGATGTTTTGGTCATTGCTCCTTTGTCTGCTAACACAT
TAGGGAAGATTGCTGGCGGGCTGTGTGATAATCTTCTGACTTGTATCATTCGAGCTTGGG
ATTATAGCAAACCGCTTTTCGTTGCACCTGCGATGAATACTTTGATGTGGAACAATCCTT
TTACAGAGAGGCATTTGTTGTCGCTTGATGAACTTGGAGTCACGCTTATTCCTCCCATAA
AGAAGAGATT*GGCGTGTGGGGACTATGGTAACGGCGCTATGGCTGAGCCTTCTCTTATC
TATTCCACTGTCAGGCTCTTCTGGGAGTCGCAGGCTCATCAGCAAAGTGGTGGTACAAGT
TAAAAGACCATGGTGGTGTCCACTTTGCATTGGTTGGTTCTGTTTTCAGTGTCATAGATA
ATAGATGATTGTTCAGTTTGTAATGCTTGTTTATTGTACATCTTTAAAACAGCTGTCTGG
AATCTGGGTTGATGTCTCCACTCATGTTGCTTTAGAACACTATTTAAGTTTATCTAAGCT
TAGTATTAAACTATCTGAGCTCTCTGAAACTAGTGAATTTTACCGGC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL4523Contig1 504 2 1 U
GGAAAAACAAAAAAACAAGAACTATCTGAGAGACACTTTGTGCGGCCATGGCAGCCTCTC
TCCAATCCTCCGCCACATTCCTCCAGTCTGCCAAACTCTCCACCGCTCCTTCTCGCGGCA
GTGCTCTCCTCCGGTCGACTCAGACGATCGGCAAATCATTTGGGCTAGAGACTTCTTCTG
CACGCCTCACTTGTTCCTACCAATCTGACATCAAGGACTTCGCCGGAAAAACAAAAAAAC
AAGAACGTGAAAAACACGGCAGCTTCGGTGGGAGAGATCACTCTGAAAGTGACCAAGAGC
ATACCTGAGACAGGTGAAGTGATCGGAGTGTTCGAGAGTCTTCAGCCGTCGGACACTGAC
TTGGGTGCCAAGGTGCCAAAGGATGTGAAGATCCAAGGTGTGTGGTATGGTCAACTTGAG
TGATCATATATATGTTATTATCAAAAACTATTCTTCTGTTAATTGTATTTGATGATAATG
AGAACATACATCTTTTCATGCGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FL57JQ C 1
AF RR2FL57TF U 1
BS 1 504 RR2FL57TF

RD RR2FL57JQ 504 0 0
GGAAAAACAAAAAAACAAGAACTATCTGAGAGACACTTTGTGCGGCCATGGCAGCCTCTC
TCCAATCCTCCGCCACATTCCTCCAGTCTGCCAAACTCTCCACCGCTCCTTCTCGCGGCA
GTGCTCTCCTCCGGTCGACTCAGACGATCGGCAAATCATTTGGGCTAGAGACTTCTTCTG
CACGCCTCACTTGTTCCTACCAATCTGACATCAAGGACTTCGCCGGAAAAACAAAAAAAC
AAGAACGTGAAAAACACGGCAGCTTCGGTGGGAGAGATCACTCTGAAAGTGACCAAGAGC
ATACCTGAGACAGGTGAAGTGATCGGAGTGTTCGAGAGTCTTCAGCCGTCGGACACTGAC
TTGGGTGCCAAGGTGCCAAAGGATGTGAAGATCCAAGGTGTGTGGTATGGTCAACTTGAG
TGATCATATATATGTTATTATCAAAAACTATTCTTCTGTTAATTGTATTTGATGATAATG
AGAACATACATCTTTTCATGCGCC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2FL57TF 504 0 0
GGAAAAACAAAAAAACAAGAACTATCTGAGAGACACTTTGTGCGGCCATGGCAGCCTCTC
TCCAATCCTCCGCCACATTCCTCCAGTCTGCCAAACTCTCCACCGCTCCTTCTCGCGGCA
GTGCTCTCCTCCGGTCGACTCAGACGATCGGCAAATCATTTGGGCTAGAGACTTCTTCTG
CACGCCTCACTTGTTCCTACCAATCTGACATCAAGGACTTCGCCGGAAAAACAAAAAAAC
AAGAACGTGAAAAACACGGCAGCTTCGGTGGGAGAGATCACTCTGAAAGTGACCAAGAGC
ATACCTGAGACAGGTGAAGTGATCGGAGTGTTCGAGAGTCTTCAGCCGTCGGACACTGAC
TTGGGTGCCAAGGTGCCAAAGGATGTGAAGATCCAAGGTGTGTGGTATGGTCAACTTGAG
TGATCATATATATGTTATTATCAAAAACTATTCTTCTGTTAATTGTATTTGATGATAATG
AGAACATACATCTTTTCATGCGCC

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL4524Contig1 928 2 4 U
GGACTCTCAATCCTATCTCTTCCTCCATGACTGCCTCAGCTTCGTCTCTCGCTCTCTCCA
CCTTCGACCCTAAATCCCTTCCTTTCTCCATCTCCAGACCCACATCTGTGTATTGTTACA
GAATTCATGCCGGGTGGAAGTGTATATGACTATCTACACAAGCAAAAGGGCGTCTTCAAG
CTTCCAGCTCTGTTAAAAGTAGCTATAGATATCTGCAAAGGGATGAACTACTTACACCAA
AATAATATAATTCACAGAGATTTAAAGGCTGCCAACCTTTTAATGGACGAGCATGAGGTA
GTTAAGGTTGCTGACTTTGGAGTGGCTATAGTAAAAGCACAAACAGGAGTTATGACAGCT
GAAACAGGAACATATCGCTGGATGGCTCCGGAGGTGATAGAACACAAGCCATATGATCAC
AAGGCAGACGTTTTCAGCTACGGGATTGTGCTATGGGAGTTGTTGACTGGCAAGATTCCA
TATGAATACATGACGCCATTGCAGGCAGCAGTAGGGGTGGTTCAGAAGGGACTACGGCCT
ACAATCCCTAAGAAGACGCATCCGAAAATGAGAGAGCTGATGGAGAGATTGTGGGAGAAA
GATCCAACGCTGAGACCAGACTTCTCAGAGATAATAGAGCAGCTACAAGAGATAGCCAAG
GAAGTAGATGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAAGATCACCAACGGGAGGAGGAGGTATCTTT
GCGGCTCTCAGGAGAACTGCAACACATCATTGAATACATTGCATTGATCCCACCCACCCA
CCAAGTACTTGCTTCCAGAAAAGATTGATTTGGCAGAGTTTTTGTGTTGCTTACCTGCTG
TTTATTCAATTGATTTTGTTTCCTTTCTGTAAGTTATAATACCCCACCCACACACACACA
CACACCCATATTGTCCATTTCATCCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E850TF U 1
AF RR2E850JQ C 160
BS 1 660 RR2E850TF
BS 661 661 RR2E850JQ
BS 662 672 RR2E850TF
BS 673 928 RR2E850JQ

RD RR2E850TF 672 0 0
GGACTCTCAATCCTATCTCTTCCTCCATGACTGCCTCAGCTTCGTCTCTCGCTCTCTCCA
CCTTCGACCCTAAATCCCTTCCTTTCTCCATCTCCAGACCCACATCTGTGTATTGTTACA
GAATTCATGCCGGGTGGAAGTGTATATGACTATCTACACAAGCAAAAGGGCGTCTTCAAG
CTTCCAGCTCTGTTAAAAGTAGCTATAGATATCTGCAAAGGGATGAACTACTTACACCAA
AATAATATAATTCACAGAGATTTAAAGGCTGCCAACCTTTTAATGGACGAGCATGAGGTA
GTTAAGGTTGCTGACTTTGGAGTGGCTATAGTAAAAGCACAAACAGGAGTTATGACAGCT
GAAACAGGAACATATCGCTGGATGGCTCCGGAGGTGATAGAACACAAGCCATATGATCAC
AAGGCAGACGTTTTCAGCTACGGGATTGTGCTATGGGAGTTGTTGACTGGCAAGATTCCA
TATGAATACATGACGCCATTGCAGGCAGCAGTAGGGGTGGTTCAGAAGGGACTACGGCCT
ACAATCCCTAAGAAGACGCATCCGAAAATGAGAGAGCTGATGGAGAGATTGTGGGAGAAA
GATCCAACGCTGAGACCAGACTTCTCAGAGATAATAGAGCAGCTACAAGAGATAGCCAAG
*AAGTAGATGAA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2E850JQ 769 0 0
AAGCAAAAGGGCGTCTTCAAGCTTCCAGCTCTGTTAAAAGTAGCTATAGATATCTGCAAA
GGGATGAACTACTTACACCAAAATAATATAATTCACAGAGATTTAAAGGCTGCCAACCTT
TTAATGGACGAGCATGAGGTAGTTAAGGTTGCTGACTTTGGAGTGGCTATAGTAAAAGCA
CAAACAGGAGTTATGACAGCTGAAACAGGAACATATCGCTGGATGGCTCCGGAGGTGATA
GAACACAAGCCATATGATCACAAGGCAGACGTTTTCAGCTACGGGATTGTGCTATGGGAG
TTGTTGACTGGCAAGATTCCATATGAATACATGACGCCATTGCAGGCAGCAGTAGGGGTG
GTTCAGAAGGGACTACGGCCTACAATCCCTAAGAAGACGCATCCGAAAATGAGAGAGCTG
ATGGAGAGATTGTGGGAGAAAGATCCAACGCTGAGACCAGACTTTTCAGAGATAATAGAG
CAGCTACAAGAGATAGCCAAGGAAGTAGATGAAGAGGAGGAGGAGAAGAAAAGATCACCA
ACGGGAGGAGGAGGTATCTTTGCGGCTCTCAGGAGAACTGCAACACATCATTGAATACAT
TGCATTGATCCCACCCACCCACCAAGTACTTGCTTCCAGAAAAGATTGATTTGGCAGAGT
TTTTGTGTTGCTTACCTGCTGTTTATTCAATTGATTTTGTTTCCTTTCTGTAAGTTATAA
TACCCCACCCACACACACACACACACCCATATTGTCCATTTCATCCAGC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL4525Contig1 672 2 2 U
GACGATTCCCCAAAAAATGGCTCTTGTTCAATCCACAGCTCTTGCTAACTTCAACGTCCG
GTTATCGCCGGTTCTATCCACACTCCACGCTCCGTCGTCTCTCTTCCTCCGGAGGGAAAC
TCGTCCGGTAACCTCTCCGTTGTCATCCTCCTCCTCCACCACCGCCGGGAGCTTGTCCTT
CTCGCCGCTGACGCATCAGCGGAAGCCTCCTCTCTGCCCTCCTCCTCGCGGCAAGTTTGT
TAGAGAAGATTATCTTGTGAGGAAACTGTCAGCTGAAGAACTTCAGGAGCTGGTGAAAGG
AGAGAGGAAGGTGCCGCTCATTGTTGATTTTTATGCAACTTGGTGTGGACCTTGTATCTT
GATGGCTCAGGAACTCGAAATGCTTGCAGTAGAGTATGAGAGCAATGCAATGATTGTGAA
AGTTGATACAGATGATGAGTACGAGTTTGCACGCGACATGCAGGTTCGGGGCTTACCTAC
ATTGTTATTCATAAGTCCTGACCCAAGCAAAGATGCAATCAGAACAGAAGGGCTAATTCC
ATTACAGATGATGCGCGATATCATCGATAACGACATGTGAAAGTCTTGTCGTGAAGAAAA
CACTTTCTTGCTTTAGGATTTGAATAGTTGCTATTTGGCTTTTTGAGGATGCGGTGAGAA
GAATGTCATCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU21TF U 1
AF RR2EU21JQ C 140
BS 1 643 RR2EU21TF
BS 644 672 RR2EU21JQ

RD RR2EU21TF 644 0 0
GACGATTCCCCAAAAAATGGCTCTTGTTCAATCCACAGCTCTTGCTAACTTCAACGTCCG
GTTATCGCCGGTTCTATCCACACTCCACGCTCCGTCGTCTCTCTTCCTCCGGAGGGAAAC
TCGTCCGGTAACCTCTCCGTTGTCATCCTCCTCCTCCACCACCGCCGGGAGCTTGTCCTT
CTCGCCGCTGACGCATCAGCGGAAGCCTCCTCTCTGCCCTCCTCCTCGCGGCAAGTTTGT
TAGAGAAGATTATCTTGTGAGGAAACTGTCAGCTGAAGAACTTCAGGAGCTGGTGAAAGG
AGAGAGGAAGGTGCCGCTCATTGTTGATTTTTATGCAACTTGGTGTGGACCTTGTATCTT
GATGGCTCAGGAACTCGAAATGCTTGCAGTAGAGTATGAGAGCAATGCAATGATTGTGAA
AGTTGATACAGATGATGAGTACGAGTTTGCACGCGACATGCAGGTTCGGGGCTTACCTAC
ATTGTTATTCATAAGTCCTGACCCAAGCAAAGATGCAATCAGAACAGAAGGGCTAATTCC
ATTACAGATGATGCGCGATATCATCGATAACGACATGTGAAAGTCTTGTCGTGAAGAAAA
CACTTTCTTGCTTTAGGATTTGAATAGTTGCTATTTGGCTTTT
G

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2EU21JQ 533 0 0
TTGTCATCCTCCTCCTCCACCACCGCCGGGAGCTTGTCCTTCTCGCCGCTGACGCATCAG
CGGAAGCCTCCTCTCTGCCCTCCTCCTCGCGGCAAGTTTGTTAGAGAAGATTATCTTGTG
AGGAAACTGTCAGCTGAAGAACTTCAGGAGCTGGTGAAAGGAGAGAGGAAGGTGCCGCTC
ATTGTTGATTTTTATGCAACTTGGTGTGGACCTTGTATCTTGATGGCTCAGGAACTCGAA
ATGCTTGCAGTAGAGTATGAGAGCAATGCAATGATTGTGAAAGTTGATACAGATGATGAG
TACGAGTTTGCACGCGACATGCAGGTTCGGGGCTTACCTACATTGTTATTCATAAGTCCT
GACCCAAGCAAAGATGCAATCAGAACAGAAGGGCTAATTCCATTACAGATGATGCGCGAT
ATCATCGATAACGACATGTGAAAGTCTTGTCGTGAAGAAAACACTTTCTTGCTTTAGGAT
TTGAATAGTTGCTATTTGGCTTTTTGAGGATGCGGTGAGAAGAATGTCATCTA

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 2

CO CL4526Contig1 667 2 2 U
TAATCTCTTTTCTTCTTCTACCAATCATATAGTCATGGCAAAGTCTCTAGCTGGATTGGC
GCTTTTAGCCACTCTTTTCATGTCAGTTGATGCGTTTAGACCTTCTGGTTTAATCAACGG
TCACGCCACGTTCTATGGAGGGAGTGACGCTTCAGGAACAATGGGGGGAGCTTGTGGGTA
CGGAGATCTTTACTCGGCGGGATTGTTCCCGTCGTTTTCCAAAGAGTAAGCTGTTACAAG
AAAGGAGGAGTGAGATTCAGAATAAACGGAAGGGACTACTTCGAGCTAGTGAACATACAG
AACGTAGGAGGAGCTGGTTCGATTAAATCTGTCTCGATTAAAGGATCGAAGACTGGTTGG
TTAGCCATGTCTCGCAACTGGGGAGCTAACTGGCAATCAAACGCTTATCTCGATGGACAA
TCTATCTCTTTCTCCATTACCACTACTGATGGTGCTACGAGAGTCTTCCTCAATGTTGTT
CCTTCTTCTTGGTCTTTTGGACAGACTTATTCTTCCAGGGTTCAGTTTTAATTATTTCTT
GTTTCTTTGTATGTCTGAAATATATTATTGGCAGTGGTCGCGCTTTGAGTCTGTTATTTT
CTCCCGGAGCGACCCGCCCCGCTTTGTTATTACTACTTTATATATAATCTGATTTGATGG
TTTCACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AU36TF U 1
AF RR2AU36JQ C 1
BS 1 658 RR2AU36TF
BS 659 667 RR2AU36JQ

RD RR2AU36TF 658 0 0
TAATCTCTTTTCTTCTTCTACCAATCATATAGTCATGGCAAAGTCTCTAGCTGGATTGGC
GCTTTTAGCCACTCTTTTCATGTCAGTTGATGCGTTTAGACCTTCTGGTTTAATCAACGG
TCACGCCACGTTCTATGGAGGGAGTGACGCTTCAGGAACAATGGGGGGAGCTTGTGGGTA
CGGAGATCTTTACTCGGCGGGATTGTTCCCGTCGTTTTCCAAAGAGTAAGCTGTTACAAG
AAAGGAGGAGTGAGATTCAGAATAAACGGAAGGGACTACTTCGAGCTAGTGAACATACAG
AACGTAGGAGGAGCTGGTTCGATTAAATCTGTCTCGATTAAAGGATCGAAGACTGGTTGG
TTAGCCATGTCTCGCAACTGGGGAGCTAACTGGCAATCAAACGCTTATCTCGATGGACAA
TCTATCTCTTTCTCCATTACCACTACTGATGGTGCTACGAGAGTCTTCCTCAATGTTGTT
CCTTCTTCTTGGTCTTTTGGACAGACTTATTCTTCCAGGGTTCAGTTTTAATTATTTCTT
GTTTCTTTGTATGTCTGAAATATATTATTGGCAGTGGTCGCGCTTTGAGTCTGTTATTTT
CTCCCGGAGCGACCCGCCCCGCTTTGTTATTACTACTTTATATATAATCTGATTTGAT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2AU36JQ 667 0 0
TAATCTCTTTTCTTCTTCTACCAATCATATAGTCATGGCAAAGTCTCTAGCTGGATTGGC
GCTTTTAGCCACTCTTTTCATGTCAGTTGATGCGTTTAGACCTTCTGGTTTAATCAACGG
TCACGCCACGTTCTATGGAGGGAGTGACGCTTCAGGAACAATGGGGGGAGCTTGTGGGTA
CGGAGATCTTTACTCGGCGGGATTGTTCCCGTCGTTTTCCAAAGAGTAAGCTGTTACAAG
AAAGGAGGAGTGAGATTCAGAATAAACGGAAGGGACTACTTCGAGCTAGTGAACATACAG
AACGTAGGAGGAGCTGGTTCGATTAAATCTGTCTCGATTAAAGGATCGAAGACTGGTTGG
TTAGCCATGTCTCGCAACTGGGGAGCTAACTGGCAATCAAACGCTTATCTCGATGGACAA
TCTATCTCTTTCTCCATTACCACTACTGATGGTGCTACGAGAGTCTTCCTCAATGTTGTT
CCTTCTTCTTGGTCTTTTGGACAGACTTATTCTTCCAGGGTTCAGTTTTAATTATTTCTT
GTTTCTTTGTATGTCTGAAATATATTATTGGCAGTGGTCGCGCTTTGAGTCTGTTATTTT
CTCCCGGAGCGACCCGCCC*GCTTTGTTATTACTACTTTATATATAATCTGATTTGATGG
TTTCACT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL4527Contig1 504 2 1 U
GGGATCCTATAGAGAAGATTGCCACTCCTCAACCTCCGAGTCAAGAAACGGAGGAGCTTG
AAGACAGTTTTGATTTTGGAAACCAAGTGATTGAGCAGATTTCAAATAAGGATACAATCT
CGGCGGCTAGTGCAACGATACCTCCATTGGAAGCCACTACTTCAAATGGCTCACCATTCT
CCAATGGAGAAGTGGAAGAACTCGAGGTTGTACCAATGCGACAGCCCGAGGTGACGCATA
GAGCTTCAGTTCAACAGCGCAAACCGATAATCAAATTTAGCTTCACGTCTCTAGGCAAAA
CCAACAGCAAGTAATAATGGTGTTTCCCTACATTGCCAAGAATCTCAGAGCTTTAAGCTG
AAGGCTTCTTTCCTACTTTATGTAAAAGAAGAATTTTATATTTATATGCTTTTCTTAGAT
GTTAAAAACAATTTCTAAATACTTGGTTCAATGTAACACTCGTTTCATAAGAATCAGAAG
ATTTCTATGCATACTATTATTAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GD73JQ C 1
AF RR2GD73TF U 1
BS 1 504 RR2GD73TF

RD RR2GD73JQ 504 0 0
GGGATCCTATAGAGAAGATTGCCACTCCTCAACCTCCGAGTCAAGAAACGGAGGAGCTTG
AAGACAGTTTTGATTTTGGAAACCAAGTGATTGAGCAGATTTCAAATAAGGATACAATCT
CGGCGGCTAGTGCAACGATACCTCCATTGGAAGCCACTACTTCAAATGGCTCACCATTCT
CCAATGGAGAAGTGGAAGAACTCGAGGTTGTACCAATGCGACAGCCCGAGGTGACGCATA
GAGCTTCAGTTCAACAGCGCAAACCGATAATCAAATTTAGCTTCACGTCTCTAGGCAAAA
CCAACAGCAAGTAATAATGGTGTTTCCCTACATTGCCAAGAATCTCAGAGCTTTAAGCTG
AAGGCTTCTTTCCTACTTTATGTAAAAGAAGAATTTTATATTTATATGCTTTTCTTAGAT
GTTAAAAACAATTTCTAAATACTTGGTTCAATGTAACACTCGTTTCATAAGAATCAGAAG
ATTTCTATGCATACTATTATTAGC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2GD73TF 504 0 0
GGGATCCTATAGAGAAGATTGCCACTCCTCAACCTCCGAGTCAAGAAACGGAGGAGCTTG
AAGACAGTTTTGATTTTGGAAACCAAGTGATTGAGCAGATTTCAAATAAGGATACAATCT
CGGCGGCTAGTGCAACGATACCTCCATTGGAAGCCACTACTTCAAATGGCTCACCATTCT
CCAATGGAGAAGTGGAAGAACTCGAGGTTGTACCAATGCGACAGCCCGAGGTGACGCATA
GAGCTTCAGTTCAACAGCGCAAACCGATAATCAAATTTAGCTTCACGTCTCTAGGCAAAA
CCAACAGCAAGTAATAATGGTGTTTCCCTACATTGCCAAGAATCTCAGAGCTTTAAGCTG
AAGGCTTCTTTCCTACTTTATGTAAAAGAAGAATTTTATATTTATATGCTTTTCTTAGAT
GTTAAAAACAATTTCTAAATACTTGGTTCAATGTAACACTCGTTTCATAAGAATCAGAAG
ATTTCTATGCATACTATTATTAGC

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL4528Contig1 800 2 2 U
GGAGTCGATCAAAGGTTACCTTCTCGTGATCAACGAGGACAAAGTCTTCGCGTTCAACGT
ATCGACTCAGCATTACGTGAGAACGGCCGGTCCGCGTCTCTTGTTCTCTGCTGGTTTGGA
AGAGATCAGGTCCTCTTTCTTGAGCCATCGTCAGTCGTCTTCGAGGAATGTGGCTGTGAA
GGCGAGGCCTTTGGTGGCTAGCGACAGAGAGAATCTTCTCGTGGTGGGGTTAGGAGACGG
GTACTTCGGTGTTTACAAGTCGAAGCTTCCGAGTCTCAAAGGAGAGTTCAGCACGATGCT
TTGGAGCAGTCCTGTGTTTTTCTTCATACTGTTTCTGTTCGGAGCTTGGCATTTTTTTGC
GAAGAAGAAAGAATCACTCACGGCCTGGGGACCGGATGATCCTTTTACGGCGGCCGCGGG
ACAGAACAGCTCTGCGAAAGAGCCGAGTTTTACTGGGCCTGCTAGAAGAAACGATGACCT
GATGGATCTTAGGAGGAGGTACGTTGGTGCGTCCCCGTACCGTAATGAGCAGAGTTCGAG
AGCTCCGGTGGATGGAGGAGGGTATAGAACAACCGCGCAGGATCATAATAATTATCGAGG
TGGGTCGGGTCTTGATTCGAGCGGGTTTGGTAATAGAAGAGATAGTTTGTATGGTAACAA
CAAAGTTATGGACGACGAAAGTTAAAAAAAAAAAGGAGGAATCTCTCTGGACTTTTGCAA
CATTTGAATTTTGACATGTAAGAAAGTTTTACTCTTTTGTAATTTCTAAAGCTTTTTAAA
AGTTTCCTCCTTTGTTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES21TF U 1
AF RR2ES21JQ C 252
BS 1 576 RR2ES21TF
BS 577 800 RR2ES21JQ

RD RR2ES21TF 576 0 0
GGAGTCGATCAAAGGTTACCTTCTCGTGATCAACGAGGACAAAGTCTTCGCGTTCAACGT
ATCGACTCAGCATTACGTGAGAACGGCCGGTCCGCGTCTCTTGTTCTCTGCTGGTTTGGA
AGAGATCAGGTCCTCTTTCTTGAGCCATCGTCAGTCGTCTTCGAGGAATGTGGCTGTGAA
GGCGAGGCCTTTGGTGGCTAGCGACAGAGAGAATCTTCTCGTGGTGGGGTTAGGAGACGG
GTACTTCGGTGTTTACAAGTCGAAGCTTCCGAGTCTCAAAGGAGAGTTCAGCACGATGCT
TTGGAGCAGTCCTGTGTTTTTCTTCATACTGTTTCTGTTCGGAGCTTGGCATTTTTTTGC
GAAGAAGAAAGAATCACTCACGGCCTGGGGACCGGATGATCCTTTTACGGCGGCCGCGGG
ACAGAACAGCTCTGCGAAAGAGCCGAGTTTTACTGGGCCTGCTAGAAGAAACGATGACCT
GATGGATCTTAGGAGGAGGTACGTTGGTGCGTCCCCGTACCGTAATGAGCAGAGTTCGAG
AGCTCCGGTGGATGGAGGAGGGTATAGAACAACCGC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2ES21JQ 549 0 0
TTTACAAGTCGAAGCTTCCGAGTCTCAAAGGAGAGTTCAGCACGATGCTTTGGAGCAGTC
CTGTGTTTTTCTTCATACTGTTTCTGTTCGGAGCTTGGCATTTTTTTGCGAAGAAGAAAG
AATCACTCACGGCCTGGGGACCGGATGATCCTTTTACGGCGGCCGCGGGACAGAACAGCT
CTGCGAAAGAGCCGAGTTTTACTGGGCCTGCTAGAAGAAACGATGCCCTGATGGATCTTA
GGAGGAGGTACGTTGGTGCGTCCCCGTACCGTAATGAGCAGAGTTCGAGAGCTCCGGTGG
ATGGAGGAGGGTATAGAACAACCGCGCAGGATCATAATAATTATCGAGGTGGGTCGGGTC
TTGATTCGAGCGGGTTTGGTAATAGAAGAGATAGTTTGTATGGTAACAACAAAGTTATGG
ACGACGAAAGTTAAAAAAAAAAAGGAGGAATCTCTCTGGACTTTTGCAACATTTGAATTT
TGACATGTAAGAAAGTTTTACTCTTTTGTAATTTCTAAAGCTTTTTAAAAGTTTCCTCCT
TTGTTAATT

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

CO CL4529Contig1 910 2 4 U
GAAATCTCTTCGTCTCTCTTTTGCAAATTCCCCAGTCTCTGTTCCTCTTTGTTAACAAAA
GACTCCTTTTTTCCCGGAAGACAGTTAACGCTCCATGACGAAGCAGCACGCGAACCGGTC
TCCTTACGATAACAATGGAGGAACATGTGTGGCCATCGCTGGATCGGATTACTGCGTCAT
CGCCGCCGATACTCGAATGTCTACCGGTTACAGCATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAAT
CCATAAACTAGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGGTTCCAAGCTGATGTAAAAGC
ACTTCAGAAAGTACTTACATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCACAACAAGCAGAT
GAGCTGTCCTGCTATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCC
TTACTACGCCTTTAATGCCCTCGGAGGGCTCGACGAGAATGGTAAAGGGTGTGTGTTCAC
CTATGACGCTGTTGGTTCGTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCGAC
TCTTATTATGCCGTTTCTTGATAATCAGCTCAAGAGTCCCAGCCCTCTTTTGCTTCCTGC
CCAGGATGCTATCACGCCCCTTTCGGAACCTGAAGCAGTTGACTTGGTGAAGACTGTTTT
CGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAA
GGCCGATGGCATCAAGACCGAAGTTATGGATTTGAGGAAAGACTAAGCGAATTTAACGCG
CATATGAGTGTTGAGAACACACATCTTTGTTACTTTGTCGTTGGTCATCATATCAACTGT
GTTTGACGTTTAAAACTGTTTTGTTGTCTTGTTAACAGTAACAAATTCTCATTGTCTCAT
TTATGAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ77TF U 1
AF RR2FJ77JQ C 208
BS 1 627 RR2FJ77TF
BS 628 628 RR2FJ77JQ
BS 629 716 RR2FJ77TF
BS 717 910 RR2FJ77JQ

RD RR2FJ77TF 716 0 0
GAAATCTCTTCGTCTCTCTTTTGCAAATTCCCCAGTCTCTGTTCCTCTTTGTTAACAAAA
GACTCCTTTTTTCCCGGAAGACAGTTAACGCTCCATGACGAAGCAGCACGCGAACCGGTC
TCCTTACGATAACAATGGAGGAACATGTGTGGCCATCGCTGGATCGGATTACTGCGTCAT
CGCCGCCGATACTCGAATGTCTACCGGTTACAGCATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAAT
CCATAAACTAGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGGTTCCAAGCTGATGTAAAAGC
ACTTCAGAAAGTACTTACATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCACAACAAGCAGAT
GAGCTGTCCTGCTATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCC
TTACTACGCCTTTAATGCCCTCGGAGGGCTCGACGAGAATGGTAAAGGGTGTGTGTTCAC
CTATGACGCTGTTGGTTCGTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCGAC
TCTTATTATGCCGTTTCTTGATAATCAGCTCAAGAGTCCCAGCCCTCTTTTGCTTCCTGC
CCAGGATGCTATCACGCCCCTTTCGGA*CCTGAAGCAGTTGACTTGGTGAAGACTGTTTT
CGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2FJ77JQ 703 0 0
TTACAGCATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAGCAGACAAAGCTGTGCT
CTCTTCCTCTGGGTTCCAAGCTGATGTAAAAGCACTTCAGAAAGTACTTACATCAAGGCA
CTTGGTTTATCAGCATCAGCACAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCTATGGCTCAGCTTCT
CTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCCTTACTACGCCTTTAATGCCCTCGGAGG
GCTCGACGAGAATGGTAAAGGGTGTGTGTTCACCTATGACGCTGTTGGTTCGTATGAGAA
GGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCGACTCTTATTATGCCGTTTCTTGATAATCA
GCTCAAGAGTCCCAGCCCTCTTTTGCTTCCTGCCCAGGATGCTATCACGCCCCTTTCGGA
ACCTGAAGCAGTTGACTTGGTGAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTA
CACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCGATGGCATCAAGACCGAAGTTAT
GGATTTGAGGAAAGACTAAGCGAATTTAACGCGCATATGAGTGTTGAGAACACACATCTT
TGTTACTTTGTCGTTGGTCATCATATCAACTGTGTTTGACGTTTAAAACTGTTTTGTTGT
CTTGTTAACAGTAACAAATTCTCATTGTCTCATTTATGAACAC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4531Contig1 1086 2 2 U
GGAAGGAGAACACAAAGACCCAGCTCTCAAAAAAAAAATACAGCCGCCATGTCTTTTCTT
CTTTCTAATCTATCTCCTTCGATACTTCTCCAAACCGGAAAATCCACAAACCTTAGTAGA
CCCATCTTCACTCCATCTCTATCGCCATCGTCTTCAACAACAGGCTACGCGTTTGATGAG
GATGCTCTCTCTACACTCTCTCTTTCTTCCGTCCAGTCTCCTCCTCTTCAAGACGCGCAG
GTTAAGACAAAACCCACTCCGCAAGACAAGCATAACAACAACGACAGAGATGAGTTCTAC
ATCAACCTCGGTCTCGCTGTCCGTACGCTTCGTGAAGATATGCCTTTGATCTTCGCTAGA
GATCTAAACTACGACATCTACAGGGATGATGTAACGTTTGTGGATCCGATGAACACATTC
AGTGGGATTGAGAACTACAAGTTGATCTTCTGGGCACTCAGGTTTTACGGGAAGATATTG
TTCAGAGACATCTCTCTTGAGATCTTCAGGGTATGGCAACCATCAGAGAACATGATTCAG
ATCAGGTGGACTCTCAAAGGTGTGCCTAGAGTTCCATGGGAAGCTAAAGGAGAGTTTCAA
GGCACTTCTCGGTATAAGCTCGACCGTAATGGCAAAATCTATTAGCATAAAGTCGATAAC
TTGGCTTTCAATTTCCCTCATCAGCTCAAACCCGCAGTGTCGGTTTTGGATTTGGTGACT
GCTTCTGCGAGTAGTCCGAATCCGACGTTCTTTTCCGGTCCTGTCGACTCGTGTTCGTGT
TCATGGATCGAGTTCTATCAAGCGGTGAGGCGGACATTGGACAAGACAGAGGATATGCTT
GTGACAGACAGTTTAATCACATGCTCATAGTGGAAGTAGAGTTGCTATACACATACTCAG
GGACACACCGTTCTCAGGTGTATATAGGTGTTACATTTAAAGGTTATATATATATGTGTG
AGTAGATCTGGTTGGCTTTAAGCTTTTGCGGAACATAAAAGTGTAATGTGGTTCGAAAAG
CTTTTATACAACTTTGTCATTGGAGTTTTGTCTTTGTTATCATTTGAAATATTAGAAGCA
CAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2A441TF U 1
AF RR2A441JQ C 247
BS 1 751 RR2A441TF
BS 752 1086 RR2A441JQ

RD RR2A441TF 751 0 0
GGAAGGAGAACACAAAGACCCAGCTCTCAAAAAAAAAATACAGCCGCCATGTCTTTTCTT
CTTTCTAATCTATCTCCTTCGATACTTCTCCAAACCGGAAAATCCACAAACCTTAGTAGA
CCCATCTTCACTCCATCTCTATCGCCATCGTCTTCAACAACAGGCTACGCGTTTGATGAG
GATGCTCTCTCTACACTCTCTCTTTCTTCCGTCCAGTCTCCTCCTCTTCAAGACGCGCAG
GTTAAGACAAAACCCACTCCGCAAGACAAGCATAACAACAACGACAGAGATGAGTTCTAC
ATCAACCTCGGTCTCGCTGTCCGTACGCTTCGTGAAGATATGCCTTTGATCTTCGCTAGA
GATCTAAACTACGACATCTACAGGGATGATGTAACGTTTGTGGATCCGATGAACACATTC
AGTGGGATTGAGAACTACAAGTTGATCTTCTGGGCACTCAGGTTTTACGGGAAGATATTG
TTCAGAGACATCTCTCTTGAGATCTTCAGGGTATGGCAACCATCAGAGAACATGATTCAG
ATCAGGTGGACTCTCAAAGGTGTGCCTAGAGTTCCATGGGAAGCTAAAGGAGAGTTTCAA
GGCACTTCTCGGTATAAGCTCGACCGTAATGGCAAAATCTATTAGCATAAAGTCGATAAC
TTGGCTTTCAATTTCCCTCATCAGCTCAAACCCGCAGTGTCGGTTTTGGATTTGGTGACT
GCTTCTGCGAGTAGTCCGAATCCGACGTTCT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2A441JQ 840 0 0
ACAAAACCCACTCCGCAAGACAAGCATAACAACAACGACAGAGATGAGTTCTACATCAAC
CTCGGTCTCGCTGTCCGTACGCTTCGTGAAGATATGCCTTTGATCTTCGCTAGAGATCTA
AACTACGACATCTACAGGGATGATGTAACGTTTGTGGATCCGATGAACACATTCAGTGGG
ATTGAGAACTACAAGTTGATCTTCTGGGCACTCAGGTTTTACGGGAAGATATTGTTCAGA
GACATCTCTCTTGAGATCTTCAGGGTATGGCAACCATCAGAGAACATGATTCAGATCAGG
TGGACTCTCAAAGGTGTGCCTAGAGTTCCATGGGAAGCTAAAGGAGAGTTTCAAGGCACT
TCTCGGTATAAGCTCGACCGTAATGGCAAAATCTATTAGCATAAAGTCGATAACTTGGCT
TTCAATTTCCCTCATCAGCTCAAACCCGCAGTGTCGGTTTTGGATTTGGTGACTGCTTCT
GCGAGTAGTCCGAATCCGACGTTCTTTTCCGGTCCTGTCGACTCGTGTTCGTGTTCATGG
ATCGAGTTCTATCAAGCGGTGAGGCGGACATTGGACAAGACAGAGGATATGCTTGTGACA
GACAGTTTAATCACATGCTCATAGTGGAAGTAGAGTTGCTATACACATACTCAGGGACAC
ACCGTTCTCAGGTGTATATAGGTGTTACATTTAAAGGTTATATATATATGTGTGAGTAGA
TCTGGTTGGCTTTAAGCTTTTGCGGAACATAAAAGTGTAATGTGGTTCGAAAAGCTTTTA
TACAACTTTGTCATTGGAGTTTTGTCTTTGTTATCATTTGAAATATTAGAAGCACAATGC

QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 2

CO CL4532Contig1 653 2 1 U
CTGAGAAATATAAAATCGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGAAACTGTTAATCTCGAGTTTA
ATTATCAATGGAAGGGATCACGGAAGGAGTTAACAACATGAGCTTGGCCGTTGATTCGCA
GAAGAAGAACCGGATTCAAGTTTCCAACACTAAGAAACCGTTGTTCTTCTACGTCAATCT
CGCCAAGAGGTACATGCAGCAGTACGCAGATGTGGAGTTGTCTGCACTTGGAATGGCCAT
TGCTACGGTTGTTACCGTTGCTGAGATATTAAAGAACAGTGGGTTTGCTGTTGAAAAGAA
GATCATGACTTCGACTGTGGATATCAAGGACGGTGCAAGGGGTCGTCCTGTGCAGAAACC
CAAGATTGAGATAACGCTCGCCAAGTCTGAGAAGTTTGATGAATTAATGGCTGCGGCCAA
CGAAGACGAGGAGGCTGCAGAAGCTCAAGAGCAGAACTGAAATCTCTTTTTTTTTTAGTT
TTGAGTTTCTTTCGACCATCTGATTTCTCTGTTTCTTATCTCTCTGCTGCTAAAACACTT
TGATTTATTTTTGTTTTGGCTCACTTTGAAATGTTATCTTGGATTGTGTTCGCTGTACTT
GTGAACGTGTTTATTTACAGATCGTAGTAGGTGTAGAGACAAGATTTTGTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AR32JQ C 1
AF RR2AR32TF U 1
BS 1 653 RR2AR32TF

RD RR2AR32JQ 653 0 0
CTGAGAAATATAAAATCGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGAAACTGTTAATCTCGAGTTTA
ATTATCAATGGAAGGGATCACGGAAGGAGTTAACAACATGAGCTTGGCCGTTGATTCGCA
GAAGAAGAACCGGATTCAAGTTTCCAACACTAAGAAACCGTTGTTCTTCTACGTCAATCT
CGCCAAGAGGTACATGCAGCAGTACGCAGATGTGGAGTTGTCTGCACTTGGAATGGCCAT
TGCTACGGTTGTTACCGTTGCTGAGATATTAAAGAACAGTGGGTTTGCTGTTGAAAAGAA
GATCATGACTTCGACTGTGGATATCAAGGACGGTGCAAGGGGTCGTCCTGTGCAGAAACC
CAAGATTGAGATAACGCTCGCCAAGTCTGAGAAGTTTGATGAATTAATGGCTGCGGCCAA
CGAAGACGAGGAGGCTGCAGAAGCTCAAGAGCAGAACTGAAATCTCTTTTTTTTTTAGTT
TTGAGTTTCTTTCGACCATCTGATTTCTCTGTTTCTTATCTCTCTGCTGCTAAAACACTT
TGATTTATTTTTGTTTTGGCTCACTTTGAAATGTTATCTTGGATTGTGTTCGCTGTACTT
GTGAACGTGTTTATTTACAGATCGTAGTAGGTGTAGAGACAAGATTTTGTTGC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2AR32TF 653 0 0
CTGAGAAATATAAAATCGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAGAAACTGTTAATCTCGAGTTTA
ATTATCAATGGAAGGGATCACGGAAGGAGTTAACAACATGAGCTTGGCCGTTGATTCGCA
GAAGAAGAACCGGATTCAAGTTTCCAACACTAAGAAACCGTTGTTCTTCTACGTCAATCT
CGCCAAGAGGTACATGCAGCAGTACGCAGATGTGGAGTTGTCTGCACTTGGAATGGCCAT
TGCTACGGTTGTTACCGTTGCTGAGATATTAAAGAACAGTGGGTTTGCTGTTGAAAAGAA
GATCATGACTTCGACTGTGGATATCAAGGACGGTGCAAGGGGTCGTCCTGTGCAGAAACC
CAAGATTGAGATAACGCTCGCCAAGTCTGAGAAGTTTGATGAATTAATGGCTGCGGCCAA
CGAAGACGAGGAGGCTGCAGAAGCTCAAGAGCAGAACTGAAATCTCTTTTTTTTTTAGTT
TTGAGTTTCTTTCGACCATCTGATTTCTCTGTTTCTTATCTCTCTGCTGCTAAAACACTT
TGATTTATTTTTGTTTTGGCTCACTTTGAAATGTTATCTTGGATTGTGTTCGCTGTACTT
GTGAACGTGTTTATTTACAGATCGTAGTAGGTGTAGAGACAAGATTTTGTTGC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL4533Contig1 801 2 2 U
GGATCATCATTCATCAACCAAACTCACCAACAAGAACAATAACAATAGCAAGAACAAGAG
AAGGATTCTGCCTTGGATATTACACAAAAGCATATAGAGAAAGAAATCTTGATTTCGAAA
AACAATGGCGTACGAGAAAGTCAATGAGATTAACCTTAAGGACACAGAGCTTCGTCTTGG
ATTACCTGGAACAGAGCAAGTTAAGGAAGAACAAGAGGTTTCTTGTGTTAGAAGCATCAA
GCGTCAATATCAAAGCGATAACGAGGAAGAATCTACACCTCCTACGAAAACTCAAATCGT
TGGTTGGCCTCCGGTGAGATCTTACCGTAAGAACAACAACAGTGTGAGCTATGTGAAAGT
GAGTATGGACGGAGCTCCATACCTACGTAAAATCGATATCAAAACATATAAAAACTATCC
AGAGCTTCTCAGGGAGTTAGAGAACATGTTCAAGTTCACAATAGGTGAATACAACGAAAG
AGAAGGGTACGAAGGATCTGAAGTTGTACCAACGTACGAGGATAAAGATGGAGACTGGAT
GTTGGTTGGTGATGTTCCATGGGATATGTTCTCTTCCTCTTGTAAGAGACTCAGAATCAT
GAAAGGACCTGATGCTCTTGCTTTAGACTCTGGCTTATGATGAATTCCACACCAAACACA
AAACTATTCAGGGTTTTGTTCAATGAGTTAGATCCATTTCCACGTGATTTTATCTTTTCA
TTTTTATTTGTTTTTTTGTTTTTAGATTTGGAATTTGATGTAAAGATACATGAAATTTAT
GTATAATACGGATACATACAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT27TF U 1
AF RR2AT27JQ C 1
BS 1 738 RR2AT27TF
BS 739 801 RR2AT27JQ

RD RR2AT27TF 738 0 0
GGATCATCATTCATCAACCAAACTCACCAACAAGAACAATAACAATAGCAAGAACAAGAG
AAGGATTCTGCCTTGGATATTACACAAAAGCATATAGAGAAAGAAATCTTGATTTCGAAA
AACAATGGCGTACGAGAAAGTCAATGAGATTAACCTTAAGGACACAGAGCTTCGTCTTGG
ATTACCTGGAACAGAGCAAGTTAAGGAAGAACAAGAGGTTTCTTGTGTTAGAAGCATCAA
GCGTCAATATCAAAGCGATAACGAGGAAGAATCTACACCTCCTACGAAAACTCAAATCGT
TGGTTGGCCTCCGGTGAGATCTTACCGTAAGAACAACAACAGTGTGAGCTATGTGAAAGT
GAGTATGGACGGAGCTCCATACCTACGTAAAATCGATATCAAAACATATAAAAACTATCC
AGAGCTTCTCAGGGAGTTAGAGAACATGTTCAAGTTCACAATAGGTGAATACAACGAAAG
AGAAGGGTACGAAGGATCTGAAGTTGTACCAACGTACGAGGATAAAGATGGAGACTGGAT
GTTGGTTGGTGATGTTCCATGGGATATGTTCTCTTCCTCTTGTAAGAGACTCAGAATCAT
GAAAGGACCTGATGCTCTTGCTTTAGACTCTGGCTTATGATGAATTCCACACCAAACACA
AAACTATTCAGGGTTTTGTTCAATGAGTTAGATCCATTTCCACGTGATTTTATCTTTTCA
TTTTTATTTGTTTTTTTG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2AT27JQ 801 0 0
GGATCATCATTCATCAACCAAACTCACCAACAAGAACAATAACAATAGCAAGAACAAGAG
AAGGATTCTGCCTTGGATATTACACAAAAGCATATAGAGAAAGAAATCTTGATTTCGAAA
AACAATGGCGTACGAGAAAGTCAATGAGATTAACCTTAAGGACACAGAGCTTCGTCTTGG
ATTACCTGGAACAGAGCAAGTTAAGGAAGAACAAGAGGTTTCTTGTGTTAGAAGCATCAA
GCGTCAATATCAAAGCGATAACGAGGAAGAATCTACACCTCCTACGAAAACTCAAATCGT
TGGTTGGCCTCCGGTGAGATCTTACCGTAAGAACAACAACAGTGTGAGCTATGTGAAAGT
GAGTATGGACGGAGCTCCATACCTACGTAAAATCGATATCAAAACATATAAAAACTATCC
AGAGCTTCTCAGGGAGTTAGAGAACATGTTCAAGTTCACAATAGGTGAATACAACGAAAG
AGAAGGGTACGAAGGATCTGAAGTTGTACCAACGTACGAGGATAAAGATGGAGACTGGAT
GTTGGTTGGTGATGTTCCATGGGATATGTTCTCTTCCTCTTGTAAGAGACTCAGAATCAT
GAAAGGACCTGATGCTCTTGCTTTAGACTCTGGCTTATGATGAATTCCACACCAAACACA
AAACTATTCAGGGTTTTGTTCAATGAGTTAGATCCATTTCCACGTGATTTTATCTTTTCA
TTTTTATTTGTTTTTTTGTTTTTAGATTTGGAATTTGATGTAAAGATACATGAAATTTAT
GTATAATACGGATACATACAC

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL4534Contig1 888 2 2 U
GGAATTCGTTCTGAAACAATCTTCGAAGTTCGTATCGGTTTGCTGAAAGTTAGTAAAAAC
AATGGGAGGTGGTAAAGACAAGCATCATGATGAGCAAGACAAAGGGTTTCATGGTTTCCC
AGGAGGTGGACATCATTACCCTCCTGGTGCACCTGGAGGTTACCCACCCGCTGGATACCC
GCCACAACAAGGATATCCTCCAGCTGGAGGCTACCCACCTGCAGGTTACCCACCCGGTGC
ATACCCTCCTGGTGCACCCGGAGGTTATCCTCCTGCAGGCTATCCTGCTCCTCACCATGC
AGGACATTCTAGTGGTGGACTAGGAGGTATGATCGCCGGTGCAGCTGGTGCTGCCGCAGC
AGCCTATGGAGCTCACCACATTGCTCATGGAGCACACAACCCTTACGGTCATGCAGGGCC
CGCAGGGTTTGGCCACGTTGGTCACGGTGGATATGGTCATGGTAAGTTCAAGCACGGAAA
GCATGGAGGCAAATTCAAGCACGGAGGCAAGTTCAAGCATGGAAAGCATGGCAAACACGG
TATGTTTGGAGGAGGCAAATTCAAGAAGTGGAAGTAATCACAAACAAAAAATAATAACGA
TTCTCTCCTCCAGTAGTCTCATTACCTGACCGATGTTTCTAATAATCAACCCCCTCTCAA
AATAATTTCAATTTAACTATATATATCGGTTTAGAGATTGCTGGTTTAGAGAAAATAAAA
TGGAGAGTGATAGTAGTAATGTAAAAACCTTATGGTATCTGTAGAAGAGGTTTCTTCGGT
CTCTCAATAGCAGATGCTTTGAAACTTATCTATGATTTTGGTTTTGTAATTGACAGTTTG
TGTTTGTTCTGGTTCTTCTTTTCTTTAATTTTAAATCTCTTATGTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A588TF U 1
AF RR2A588JQ C 108
BS 1 742 RR2A588TF
BS 743 888 RR2A588JQ

RD RR2A588TF 742 0 0
GGAATTCGTTCTGAAACAATCTTCGAAGTTCGTATCGGTTTGCTGAAAGTTAGTAAAAAC
AATGGGAGGTGGTAAAGACAAGCATCATGATGAGCAAGACAAAGGGTTTCATGGTTTCCC
AGGAGGTGGACATCATTACCCTCCTGGTGCACCTGGAGGTTACCCACCCGCTGGATACCC
GCCACAACAAGGATATCCTCCAGCTGGAGGCTACCCACCTGCAGGTTACCCACCCGGTGC
ATACCCTCCTGGTGCACCCGGAGGTTATCCTCCTGCAGGCTATCCTGCTCCTCACCATGC
AGGACATTCTAGTGGTGGACTAGGAGGTATGATCGCCGGTGCAGCTGGTGCTGCCGCAGC
AGCCTATGGAGCTCACCACATTGCTCATGGAGCACACAACCCTTACGGTCATGCAGGGCC
CGCAGGGTTTGGCCACGTTGGTCACGGTGGATATGGTCATGGTAAGTTCAAGCACGGAAA
GCATGGAGGCAAATTCAAGCACGGAGGCAAGTTCAAGCATGGAAAGCATGGCAAACACGG
TATGTTTGGAGGAGGCAAATTCAAGAAGTGGAAGTAATCACAAACAAAAAATAATAACGA
TTCTCTCCTCCAGTAGTCTCATTACCTGACCGATGTTTCTAATAATCAACCCCCTCTCAA
AATAATTTCAATTTAACTATATATATCGGTTTAGAGATTGCTGGTTTAGAGAAAATAAAA
TGGAGAGTGATAGTAGTAATGT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2A588JQ 781 0 0
TTCATGGTTTCCCAGGAGGTGGACATCATTACCCTCCTGGTGCACCTGGAGGTTACCCAC
CCGCTGGATACCCGCCACAACAAGGATATCCTCCAGCTGGAGGCTACCCACCTGCAGGTT
ACCCACCCGGTGCATACCCTCCTGGTGCACCCGGAGGTTATCCTCCTGCAGGCTATCCTG
CTCCTCACCATGCAGGACATTCTAGTGGTGGACTAGGAGGTATGATCGCCGGTGCAGCTG
GTGCTGCCGCAGCAGCCTATGGAGCTCACCACATTGCTCATGGAGCACACAACCCTTACG
GTCATGCAGGGCCCGCAGGGTTTGGCCACGTTGGTCACGGTGGATATGGTCATGGTAAGT
TCAAGCACGGAAAGCATGGAGGCAAATTCAAGCACGGAGGCAAGTTCAAGCATGGAAAGC
ATGGCAAACACGGTATGTTTGGAGGAGGCAAATTCAAGAAGTGGAAGTAATCACAAACAA
AAAATAATAACGATTCTCTCCTCCAGTAGTCTCATTACCTGACCGATGTTTCTAATAATC
AACCCCCTCTCAAAATAATTTCAATTTAACTATATATATCGGTTTAGAGATTGCTGGTTT
AGAGAAAATAAAATGGAGAGTGATAGTAGTAATGTAAAAACCTTATGGTATCTGTAGAAG
AGGTTTCTTCGGTCTCTCAATAGCAGATGCTTTGAAACTTATCTATGATTTTGGTTTTGT
AATTGACAGTTTGTGTTTGTTCTGGTTCTTCTTTTCTTTAATTTTAAATCTCTTATGTTG
G

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL4535Contig1 1069 2 6 U
GGCTTTGGACATGGAAGGAATGGGAAAAGGTCAGATATGGGTGAACGGTGAGAGCATCGG
TAGGTACTGGACAGCGTTTGCCACTAGTGACTGTGGTCATTGCAGCTACACCGGGACATA
CAAACCGAACAAGTGCCTATCCGGCTGTGGTCAGCCTACACAGAGATACTACCACGTCCC
TAGATCATGGCTAAAACCGAGCCAGAACCTGTTGGTGATATTCGAGGAGCTTGGAGGAAA
CCCATCAGCTGTTTCTTTGGTCAAAAGATCGGTCTCTGGAGTCTGTGCTGAAGTCTCTGA
ATACCATCCCAATATCAAGAACTGGCAGATCGAAAGCTACGGGAAAGGACAAACGTTTCG
AAGACCGAAAGTTCATTTGAAATGTAGTCCTGGTCAAGCTATTTCAGCTATCAAGTTTGC
TAGCTTTGGGACTCCTTTAGGAAAATGGGAGTTACCAGCAAGGAGAGTGTCACGCAGCTA
CCTCATACGCTATCTTAGAGAGGAAGTGTGTAGGGAAAGCGAGATGTGCAGTGACGATAT
CCAACAGTAACTTCGGGAAAGATCCGTGTCCGAATGTGTTGAAACGGCTGACTGTTGAAG
CGGTATGTTCCCCTGAGACATCTGTAACCAGTTGGAAGCCTTAAAAGATGATCATTGTGC
TCTTTTGACTACAAAAAAATGTATAACCAAACAATACAGAGAGGGAGAGAGAGATGTAAG
CTGTTGTGTGCATGTGTGTGTTTAGTTTGAACAGAAGACTTTGTTGGCTTAGAGTAGTTT
TCAGTTAGGTAAGAGAGAAAGTCTGTAGAGAGTTGTGATGGGTCTCGGGCAATTCCGGGT
CTTATCAAAAAAAAAAACGTTCTGCCCACTGGTCATCACCGACCATTTTAACCGGTTGTG
GAGACCGGATTTGTTGGGGCTGAATGAAGTTGGTTTAATGTTTGGTTCTGAGTTTGTCTT
TGTAATCAACAAGTGAAGGTTCATGTTGGGAGAAAGATCTTATTGTGTGACTCATTTGTT
TCAAACGCTGTCGTTTCACTTTCTAATCTAGATATGTTTGCTTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG45TF U 1
AF RR2DG45JQ C 309
BS 1 678 RR2DG45TF
BS 679 679 RR2DG45JQ
BS 680 788 RR2DG45TF
BS 789 789 RR2DG45JQ
BS 790 822 RR2DG45TF
BS 823 1069 RR2DG45JQ

RD RR2DG45TF 822 0 0
GGCTTTGGACATGGAAGGAATGGGAAAAGGTCAGATATGGGTGAACGGTGAGAGCATCGG
TAGGTACTGGACAGCGTTTGCCACTAGTGACTGTGGTCATTGCAGCTACACCGGGACATA
CAAACCGAACAAGTGCCTATCCGGCTGTGGTCAGCCTACACAGAGATACTACCACGTCCC
TAGATCATGGCTAAAACCGAGCCAGAACCTGTTGGTGATATTCGAGGAGCTTGGAGGAAA
CCCATCAGCTGTTTCTTTGGTCAAAAGATCGGTCTCTGGAGTCTGTGCTGAAGTCTCTGA
ATACCATCCCAATATCAAGAACTGGCAGATCGAAAGCTACGGGAAAGGACAAACGTTTCG
AAGACCGAAAGTTCATTTGAAATGTAGTCCTGGTCAAGCTATTTCAGCTATCAAGTTTGC
TAGCTTTGGGACTCCTTTAGGAAAATGGGAGTTACCAGCAAGGAGAGTGTCACGCAGCTA
CCTCATACGCTATCTTAGAGAGGAAGTGTGTAGGGAAAGCGAGATGTGCAGTGACGATAT
CCAACAGTAACTTCGGGAAAGATCCGTGTCCGAATGTGTTGAAACGGCTGACTGTTGAAG
CGGTATGTTCCCCTGAGACATCTGTAACCAGTTGGAAGCCTTAAAAGATGATCATTGTGC
TCTTTTGACTACAAAAAA*TGTATAACCAAACAATACAGAGAGGGAGAGAGAGATGTAAG
CTGTTGTGTGCATGTGTGTGTTTAGTTTGAACAGAAGACTTTGTTGGCTTAGAGTAGTTT
TCAGTTAG*TAAGAGAGAAAGTCTGTAGAGAGTTGTGATGGG

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR2DG45JQ 761 0 0
CCAATATCAAGAACTGGCAGATCGAAAGCTACGGGAAAGGACAAACGTTTCGAAGACCGA
AAGTTCATTTGAAATGTAGTCCTGGTCAAGCTATTTCAGCTATCAAGTTTGCTAGCTTTG
GGACTCCTTTAGGAAAATGGGAGTTACCAGCAAGGAGAGTGTCACGCAGCTACCTCATAC
GCTATCTTAGAGAGGAAGTGTGTAGGGAAAGCGAGATGTGCAGTGACGATATCCAACAGT
AACTTCGGGAAAGATCCGTGTCCGAATGTGTTGAAACGGCTGACTGTTGAAGCGGTATGT
TCCCCTGAGACATCTGTAACCAGTTGGAAGCCTTAAAAGATGATCATTGTGCTCTTTTGA
CTACAAAAAAATGTATAACCAAACAATACAGAGAGGGAGAGAGAGATGTAAGCTGTTGTG
TGCATGTGTGTGTTTAGTTTGAACAGAAGACTTTGTTGGCTTAGAGTAGTTTTCAGTTAG
GTAAGAGAGAAAGTCTGTAGAGAGTTGTGATGGGTCTCGGGCAATTCCGGGTCTTATCAA
AAAAAAAAACGTTCTGCCCACTGGTCATCACCGACCATTTTAACCGGTTGTGGAGACCGG
ATTTGTTGGGGCTGAATGAAGTTGGTTTAATGTTTGGTTCTGAGTTTGTCTTTGTAATCA
ACAAGTGAAGGTTCATGTTGGGAGAAAGATCTTATTGTGTGACTCATTTGTTTCAAACGC
TGTCGTTTCACTTTCTAATCTAGATATGTTTGCTTTTTTCC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL4536Contig1 805 2 2 U
GGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTCTGCTCAAGCCTGGTATGGTTGTCACC
TTCGCTCCTTCAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCCGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTT
GTGGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGTCAAGAATGTTGCTGTGAAGGAT
CTTAAGCTTGGGTATGTTGCATCCAACTCCAAGGATGACCCTGCCAAGGGTGCTGCCAAC
TTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATCGGTAATGGTTACGCTCCG
GTTCTTGATTGCCACACGTCCCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCCTCACCAAGATT
GACAGGCGATCTGGTAAAGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGTTCTTGAAGAATGGTGATGCC
GGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGTCGAGACTTTCTCCGAGTACCCA
CCTTTGGGTCGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGACGGTGGCTGTTGGTGTTATCAAG
AGCGTCGACAAGAAGGACCCAACCGGTGCTAAGGTCACCAAGGCCGCAGTCAAGAAGGGA
GCTAAATGATGAGACTTCTCTCGTCTTTGGATTTTTATTTGCGTTACGAAAAACTTTGAT
GGCGTTTCTTTTTCTTAATTTTCTTCTACCTTGTTTTTGAATCTTTGAGACTATTTTGGT
TTTCAATTATGCAGCTTTTGGATAATTTTGCCTCATGTTTTTGTTTATGCTCTCGAGTGT
TCATTAAGCTGCTTTTCTATTGGGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK01TF U 1
AF RR2AK01JQ C 1
BS 1 760 RR2AK01TF
BS 761 805 RR2AK01JQ

RD RR2AK01TF 760 0 0
GGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTCTGCTCAAGCCTGGTATGGTTGTCACC
TTCGCTCCTTCAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCCGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTT
GTGGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGTCAAGAATGTTGCTGTGAAGGAT
CTTAAGCTTGGGTATGTTGCATCCAACTCCAAGGATGACCCTGCCAAGGGTGCTGCCAAC
TTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATCGGTAATGGTTACGCTCCG
GTTCTTGATTGCCACACGTCCCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCCTCACCAAGATT
GACAGGCGATCTGGTAAAGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGTTCTTGAAGAATGGTGATGCC
GGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGTCGAGACTTTCTCCGAGTACCCA
CCTTTGGGTCGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGACGGTGGCTGTTGGTGTTATCAAG
AGCGTCGACAAGAAGGACCCAACCGGTGCTAAGGTCACCAAGGCCGCAGTCAAGAAGGGA
GCTAAATGATGAGACTTCTCTCGTCTTTGGATTTTTATTTGCGTTACGAAAAACTTTGAT
GGCGTTTCTTTTTCTTAATTTTCTTCTACCTTGTTTTTGAATCTTTGAGACTATTTTGGT
TTTCAATTATGCAGCTTTTGGATAATTTTGCCTCATGTTT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2AK01JQ 805 0 0
GGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTCTGCTCAAGCCTGGTATGGTTGTCACT
TTCGCTCCTTCAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCCGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTT
GTGGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGTCAAGAATGTTGCTGTGAAGGAT
CTTAAGCTTGGGTATGTTGCATCCAACTCCAAGGATGACCCTGCCAAGGGTGCTGCCAAC
TTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATCGGTAATGGTTACGCTCCG
GTTCTTGATTGCCACACGTCCCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCCTCACCAAGATT
GACAGGCGATCTGGTAAAGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGTTCTTGAAGAATGGTGATGCC
GGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGTCGAGACTTTCTCCGAGTACCCA
CCTTTGGGTCGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGACGGTGGCTGTTGGTGTTATCAAG
AGCGTCGACAAGAAGGACCCAACCGGTGCTAAGGTCACCAAGGCCGCAGTCAAGAAGGGA
GCTAAATGATGAGACTTCTCTCGTCTTTGGATTTTTATTTGCGTTACGAAAAACTTTGAT
GGCGTTTCTTTTTCTTAATTTTCTTCTACCTTGTTTTTGAATCTTTGAGACTATTTTGGT
TTTCAATTATGCAGCTTTTGGATAATTTTGCCTCATGTTTTTGTTTATGCTCTCGAGTGT
TCATTAAGCTGCTTTTCTATTGGGT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

CO CL4537Contig1 1034 2 2 U
GGGGACTAATCTTCTGTGTTGCATCGGGCCGTTTCCCCCCCACCACACAGCGAAGATGCT
ACGAGTAGCCGGGAGAAGGCTTTTATCAGTTTCGCAGAGATCTTCCACTGCGACATCCTC
CTTCGCTCTCTCCCGGGACCATAGCAGCGGCTCCTCTTCCTCCACCAGATCTGTCCCCTC
TGCAGATCTTTCACGTTTCGATTCTTACCACCGTAGTAGCCTTATAAGAGGTTTCTCTTC
TCAAGTCCTTACCCAAGGGAATGAGGTAGGTTTTGGTTCGGAACCAGCCACCGTAGAGGC
TGTCAAAACACCTAACTCAAAGATTGTCTATGACGACCACAACCATGAGCGTTACCCGCC
TGGTGACCCTAGCAAGCGTGCCTTTGCTTATTTCGTCCTTTCCGGTGGGAGGTTTGTCTA
CGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTCGTTCTCAAGCTTATTGTCAGCATGTCCGCAAGTAAAGA
TGTCCTTGCCCTTGCATCCCTCGAGGTTGACCTCGGTAGCATCGAACCGGGAACCACTGT
CACGGTTAAGTGGCGTGGAAAGCCCGTGTTCATCAGGAGAAGGACGGAAGATGACATCAA
GCTGGCCAATAGCGTGGATCTTGGATCTCTGAGGGACCCGCAAGAAGATGCGGTGAGGGT
GAAGAATCCCGGAATGGCTAGTGGTGGTTGGAGTCTGCACTCACCTGGGATGCATCCCCT
TGCCTAATGCTGGTGATTACAGAGGTTGGTTTTGTCCGTGTCATGGTTCGCATTATGATA
TCTCTGGAAGGATTAGGAAAGGACCTGCACCGTATAACCTGGAAGTACCAACATACAGCT
TCTTGGAAGAGAACAAGTTACTCATTGGTTGATGAATAAAAAAAAGCACAACAGTAAGCT
TCTTCTTGCTTTCTTTTGCTGAATAATAAAAAAACATGTAACTCGAGCAGCTCTGTTTTT
TCGATGATGATGATGGTGAAAGACTCTATTCATAGTTTGTGTTTATTAATTTATCACTCA
CTCCTATTTTACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ65TF U 1
AF RR2AQ65JQ C 225
BS 1 790 RR2AQ65TF
BS 791 1034 RR2AQ65JQ

RD RR2AQ65TF 791 0 0
GGGGACTAATCTTCTGTGTTGCATCGGGCCGTTTCCCCCCCACCACACAGCGAAGATGCT
ACGAGTAGCCGGGAGAAGGCTTTTATCAGTTTCGCAGAGATCTTCCACTGCGACATCCTC
CTTCGCTCTCTCCCGGGACCATAGCAGCGGCTCCTCTTCCTCCACCAGATCTGTCCCCTC
TGCAGATCTTTCACGTTTCGATTCTTACCACCGTAGTAGCCTTATAAGAGGTTTCTCTTC
TCAAGTCCTTACCCAAGGGAATGAGGTAGGTTTTGGTTCGGAACCAGCCACCGTAGAGGC
TGTCAAAACACCTAACTCAAAGATTGTCTATGACGACCACAACCATGAGCGTTACCCGCC
TGGTGACCCTAGCAAGCGTGCCTTTGCTTATTTCGTCCTTTCCGGTGGGAGGTTTGTCTA
CGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTCGTTCTCAAGCTTATTGTCAGCATGTCCGCAAGTAAAGA
TGTCCTTGCCCTTGCATCCCTCGAGGTTGACCTCGGTAGCATCGAACCGGGAACCACTGT
CACGGTTAAGTGGCGTGGAAAGCCCGTGTTCATCAGGAGAAGGACGGAAGATGACATCAA
GCTGGCCAATAGCGTGGATCTTGGATCTCTGAGGGACCCGCAAGAAGATGCGGTGAGGGT
GAAGAATCCCGGAATGGCTAGTGGTGGTTGGAGTCTGCACTCACCTGGGATGCATCCCCT
TGCCTAATGCTGGTGATTACAGAGGTTGGTTTTGTCCGTGTCATGGTTCGCATTATGATA
TCTCTGGAAG
A

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2AQ65JQ 810 0 0
TAAGAGGTTTCTCTTCTCAAGTCCTTACCCAAGGGAATGAGGTAGGTTTTGGTTCGGAAC
CAGCCACCGTAGAGGCTGTCAAAACACCTAACTCAAAGATTGTCTATGACGACCACAACC
ATGAGCGTTACCCGCCTGGTGACCCTAGCAAGCGTGCCTTTGCTTATTTCGTCCTTTCCG
GTGGGAGGTTTGTCTACGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTCGTTCTCAAGCTTATTGTCAGCA
TGTCCGCAAGTAAAGATGTCCTTGCCCTTGCATCCCTCGAGGTTGACCTCGGTAGCATCG
AACCGGGAACCACTGTCACGGTTAAGTGGCGTGGAAAGCCCGTGTTCATCAGGAGAAGGA
CGGAAGATGACATCAAGCTGGCCAATAGCGTGGATCTTGGATCTCTGAGGGACCCGCAAG
AAGATGCGGTGAGGGTGAAGAATCC*GGAATGGCTAGTGGTGGTTGGAGTCTGCACTCAC
CTGGGATGCATCCCCTTGCCTAATGCTGGTGATTACAGAGGTTGGTTTTGTCCGTGTCAT
GGTTCGCATTATGATATCTCTGGAAGGATTAGGAAAGGACCTGCACCGTATAACCTGGAA
GTACCAACATACAGCTTCTTGGAAGAGAACAAGTTACTCATTGGTTGATGAATAAAAAAA
AGCACAACAGTAAGCTTCTTCTTGCTTTCTTTTGCTGAATAATAAAAAAACATGTAACTC
GAGCAGCTCTGTTTTTTCGATGATGATGATGGTGAAAGACTCTATTCATAGTTTGTGTTT
ATTAATTTATCACTCACTCCTATTTTACTT

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

CO CL4538Contig1 508 2 2 U
GACCGTGGCTCCAGGCTACACCAAAGGATCCGGACTCGGAGCTGAGATCATCGGAACCTT
CGTCCTTGTTTACACAGTCTTCTCCGCCACCGACGCTAAGAGAAGCGCGCGTGACTCCCA
CGTTCCGATTTTGGCTCCGCTCCCAATAGGATTCGCTGTGTTTTTGGTTCACTTGGCGAC
GATTCCGATCACCGGGACCGGGATTAACCCGGCTCGGAGTCTAGGAGCTGCAATCATCTA
CAACAAGGACCACGCTTGGGATGACCACTGGATATTCTGGGGGGGACCATTTATTGGAGC
AGCTCTTGCGGCTCTCTACCACCAGCTTGTCATCAGAGCTCTTCCTTTCAAGACCAGAAC
CTGATTTCCTTTTGTCTCTTGTTTTATTTATTGATGTTCGTCTCTGTTCTTTGTTTGTAT
CGGAGCTTCAAAATATTTGACATGTTCTGATGTTTGTTTGTCTAATGAATTTATTTGTTT
AATGAATTTGTTTGAGGTTCCTCTGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2EB60JQ C 1
AF RR2EB60TF U 1
BS 1 505 RR2EB60TF
BS 506 508 RR2EB60JQ

RD RR2EB60JQ 508 0 0
GACCGTGGCTCCAGGCTACACCAAAGGATCCGGACTCGGAGCTGAGATCATCGGAACCTT
CGTCCTTGTTTACACAGTCTTCTCCGCCACCGACGCTAAGAGAAGCGCGCGTGACTCCCA
CGTTCCGATTTTGGCTCCGCTCCCAATAGGATTCGCTGTGTTTTTGGTTCACTTGGCGAC
GATTCCGATCACCGGGACCGGGATTAACCCGGCTCGGAGTCTAGGAGCTGCAATCATCTA
CAACAAGGACCACGCTTGGGATGACCACTGGATATTCTGGGGGGGACCATTTATTGGAGC
AGCTCTTGCGGCTCTCTACCACCAGCTTGTCATCAGAGCTCTTCCTTTCAAGACCAGAAC
CTGATTTCCTTTTGTCTCTTGTTTTATTTATTGATGTTCGTCTCTGTTCTTTGTTTGTAT
CGGAGCTTCAAAATATTTGACATGTTCTGATGTTTGTTTGTCTAATGAATTTATTTGTTT
AATGAATTTGTTTGAGGTTCCTCTGTTT

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2EB60TF 505 0 0
GACCGTGGCTCCAGGCTACACCAAAGGATCCGGACTCGGAGCTGAGATCATCGGAACCTT
CGTCCTTGTTTACACAGTCTTCTCCGCCACCGACGCTAAGAGAAGCGCGCGTGACTCCCA
CGTTCCGATTTTGGCTCCGCTCCCAATAGGATTCGCTGTGTTTTTGGTTCACTTGGCGAC
GATTCCGATCACCGGGACCGGGATTAACCCGGCTCGGAGTCTAGGAGCTGCAATCATCTA
CAACAAGGACCACGCTTGGGATGACCACTGGATATTCTGGGGGGGACCATTTATTGGAGC
AGCTCTTGCGGCTCTCTACCACCAGCTTGTCATCAGAGCTCTTCCTTTCAAGACCAGAAC
CTGATTTCCTTTTGTCTCTTGTTTTATTTATTGATGTTCGTCTCTGTTCTTTGTTTGTAT
CGGAGCTTCAAAATATTTGACATGTTCTGATGTTTGTTTGTCTAATGAATTTATTTGTTT
AATGAATTTGTTTGAGGTTCCTCTG

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 2

CO CL4539Contig1 922 2 2 U
GGGATTTTGCGAGTCGGTGTTGAACCCTTCTGAGATTTTGCGAGTCGGAGTAGATAGATG
GCGATCTTATATGCGTTGGTGGCGCGTGGATCGGTGGTGTTATCGGAGTTTAGCGCAACA
TCCACCAACGCGAGCTCAATCGCGAAGCAGATTTTGGAGAAGCTGCCGGGTGAAGAAGAT
GTGGATAGCCACGTGTCCTACTCTCAGGATCGGTACGTCTTCCACGTCAAGCGTACCGAT
GGTCTTACCGCCCTCTGTATGGCCGATGAAACCGCCGGAAGGAGTATACCGTTTGGGTTT
CTGGAAGAGATTCATCAGAGATTTGTGAGAAGTTACGGCCGTGCCATTCACTCTGCTCAA
GCTTACTCCATGAACGATGAGTTTTCACGGGTTTTGAGTCAGCAGATGGAATACTATTCT
AACGATCCCAATGCTGACAGGGTTAGCAGAATCAAATGTGAAATGTCTCAGGTTAGAAAC
GTGATGATTGAGAATATAGATAAAGTCTTGGATAGAGGGGAGCGTTTGGAGTTGCTTGTG
GATAAAACCGCAAATATGCAAGGGAACACTTTTCGTTTCAGGAAGCAAGCTCGCCGTTTT
AGAAGCGTCATGTGGTGGAGAAATGCCAAGCTTACGATTGCACTGATACTTGTACTCGCA
GTGGTTGTATACGTCGCGATGGCCTTTGTTTGCCACGGGCCAAGTCTTCCTTCTTGTTTC
AAGTAAGAATTTACATTCTCTGTCTCACCTTTCCCTTCTTGGGAAATTCATCAGTCTCTG
CTCTGCTTTGGTTTTTGTAATCACTGTGATAATGCATTGTGTAAAATGTGTGTGTGTTTT
TGTGCTTTTTTGAAGTATGCTATGTGCTTTGAATGATGTAGAGAATCGATCGTTATTATA
AAATGTGATTTTTCACTGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG48TF U 1
AF RR2CG48JQ C 225
BS 1 727 RR2CG48TF
BS 728 922 RR2CG48JQ

RD RR2CG48TF 727 0 0
GGGATTTTGCGAGTCGGTGTTGAACCCTTCTGAGATTTTGCGAGTCGGAGTAGATAGATG
GCGATCTTATATGCGTTGGTGGCGCGTGGATCGGTGGTGTTATCGGAGTTTAGCGCAACA
TCCACCAACGCGAGCTCAATCGCGAAGCAGATTTTGGAGAAGCTGCCGGGTGAAGAAGAT
GTGGATAGCCACGTGTCCTACTCTCAGGATCGGTACGTCTTCCACGTCAAGCGTACCGAT
GGTCTTACCGCCCTCTGTATGGCCGATGAAACCGCCGGAAGGAGTATACCGTTTGGGTTT
CTGGAAGAGATTCATCAGAGATTTGTGAGAAGTTACGGCCGTGCCATTCACTCTGCTCAA
GCTTACTCCATGAACGATGAGTTTTCACGGGTTTTGAGTCAGCAGATGGAATACTATTCT
AACGATCCCAATGCTGACAGGGTTAGCAGAATCAAATGTGAAATGTCTCAGGTTAGAAAC
GTGATGATTGAGAATATAGATAAAGTCTTGGATAGAGGGGAGCGTTTGGAGTTGCTTGTG
GATAAAACCGCAAATATGCAAGGGAACACTTTTCGTTTCAGGAAGCAAGCTCGCCGTTTT
AGAAGCGTCATGTGGTGGAGAAATGCCAAGCTTACGATTGCACTGATACTTGTACTCGCA
GTGGTTGTATACGTCGCGATGGCCTTTGTTTGCCACGGGCCAAGTCTTCCTTCTTGTTTC
AAGTAAG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2CG48JQ 698 0 0
CGTCAAGCGTACCGATGGTCTTACCGCCCTCTGTATGGCCGATGAAACCGCCGGAAGGAG
TATACCGTTTGGGTTTCTGGAAGAGATTCATCAGAGATTTGTGAGAAGTTACGGCCGTGC
CATTCACTCTGCTCAAGCTTACTCCATGAACGATGAGTTTTCACGGGTTTTGAGTCAGCA
GATGGAATACTATTCTAACGATCCCAATGCTGACAGGGTTAGCAGAATCAAATGTGAAAT
GTCTCAGGTTAGAAACGTGATGATTGAGAATATAGATAAAGTCTTGGATAGAGGGGAGCG
TTTGGAGTTGCTTGTGGATAAAACCGCAAATATGCAAGGGAACACTTTTCGTTTCAGGAA
GCAAGCTCGCCGTTTTAGAAGCGTCATGTGGTGGAGAAATGCCAAGCTTACGATTGCACT
GATACTTGTACTCGCAGTGGTTGTATACGTCGCGATGGCCTTTGTTTGCCACGGGCCAAG
TCTTCCTTCTTGTTTCAAGTAAGAATTTACATTCTCTGTCTCACCTTTCCCTTCTTGGGA
AATTCATCAGTCTCTGCTCTGCTTTGGTTTTTGTAATCACTGTGATAATGCATTGTGTAA
AATGTGTGTGTGTTTTTGTGCTTTTTTGAAGTATGCTATGTGCTTTGAATGATGTAGAGA
ATCGATCGTTATTATAAAATGTGATTTTTCACTGTGAC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL4540Contig1 754 2 4 U
GACGAACCCTAGCTTCTTCGTTTCCCCTCTCCCCCTCCCAAATCTGATCTGTCCTTGCAA
TCGGATTTGAATTCAGCTAATCCATTGATCATGGCGTCGAAGAAGAAGCACTCTGAAGGA
ATCGCGTTACTCTCCGTTTACAGTGACGAGGATGACGAAGAGATGGAAGACGCCGAGTAG
GAAGAGCAGAGAAACAAGGAAGAAGTCGAACGAACTGGAGAGGGTGGCCGTCAGCCAGAA
GAAGAAGCTAACTTCATGGACGAGGAGAAAGAAAGAGAAGATTCCAGAACGCCTGGTGGA
CCTTCAAGCGCTCACGCCACCCCTCGTTCACTCGACAACAACGACGAATCATCATCGAGA
CCCGATCGGAGGAGTAGCAGTCCAATGAATTTCGAGTCTAGGGTTGCGAATGGTGAGGAT
ACGTCAGGGGAAAGTACTGATACGTTATTGGATCAGTTCCTTCCTCCGCGCCCTAAGGAG
AAGTGCTCCTGTATCTGGTGCAAGTGCTGGTTCTGGATACTCAGCTTTCGCGCAACAACG
GAGACGAGACTCGGAAGGAAGAAGATCCTCAGAGTGGAAACTGGAGAGAAGAAGTTAAGA
CCATAGTACAAGATTCTCAAGAGGTTCTAGCCCAACATCTTTCAATCTTTCATAGTGATT
ACAAGCCTAGAATCAATGATATACAATGTCTTTATTCTGTTTTGTTTACTAACGAGACAT
CAAAATTTTCAGAACAGTAATGTTTTTACGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL73TF U 1
AF RR2BL73JQ C 65
BS 1 702 RR2BL73TF
BS 703 703 RR2BL73JQ
BS 704 722 RR2BL73TF
BS 723 754 RR2BL73JQ

RD RR2BL73TF 722 0 0
GACGAACCCTAGCTTCTTCGTTTCCCCTCTCCCCCTCCCAAATCTGATCTGTCCTTGCAA
TCGGATTTGAATTCAGCTAATCCATTGATCATGGCGTCGAAGAAGAAGCACTCTGAAGGA
ATCGCGTTACTCTCCGTTTACAGTGACGAGGATGACGAAGAGATGGAAGACGCCGAGTAG
GAAGAGCAGAGAAACAAGGAAGAAGTCGAACGAACTGGAGAGGGTGGCCGTCAGCCAGAA
GAAGAAGCTAACTTCATGGACGAGGAGAAAGAAAGAGAAGATTCCAGAACGCCTGGTGGA
CCTTCAAGCGCTCACGCCACCCCTCGTTCACTCGACAACAACGACGAATCATCATCGAGA
CCCGATCGGAGGAGTAGCAGTCCAATGAATTTCGAGTCTAGGGTTGCGAATGGTGAGGAT
ACGTCAGGGGAAAGTACTGATACGTTATTGGATCAGTTCCTTCCTCCGCGCCCTAAGGAG
AAGTGCTCCTGTATCTGGTGCAAGTGCTGGTTCTGGATACTCAGCTTTCGCGCAACAACG
GAGACGAGACTCGGAAGGAAGAAGATCCTCAGAGTGGAAACTGGAGAGAAGAAGTTAAGA
CCATAGTACAAGATTCTCAAGAGGTTCTAGCCCAACATCTTTCAATCTTTCATAGTGATT
ACAAGCCTAGAATCAATGATATACAATGTCTTTATTCTGTTT*GTTTACTAACGAGACAT
CA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2BL73JQ 690 0 0
ATTTGAATTCAGCTAATCCATTGATCATGGCGTCGAAGAAGAAGCACTCTGAAGGAATCG
CGTTACTCTCCGTTTACAGTGACGAGGATGACGAAGAGATGGAAGACGCCGAGTAGGAAG
AGCAGAGAAACAAGGAAGAAGTCGAACGAACTGGAGAGGGTGGCCGTCAGCCAGAAGAAG
AAGCTAACTTCATGGACGAGGAGAAAGAAAGAGAAGATTCCAGAACGCCTGGTGGACCTT
CAAGCGCTCACGCCACCCCTCGTTCACTCGACAACAACGACGAATCATCATCGAGACCCG
ATCGGAGGAGTAGCAGTCCAATGAATTTCGAGTCTAGGGTTGCGAATGGTGAGGATACGT
CAGGGGAAAGTACTGATACGTTATTGGATCAGTTCCTTCCTCCGCGCCCTAAGGAGAAGT
GCTCCTGTATCTGGTGCAAGTGCTGGTTCTGGATACTCAGCTTTCGCGCAACAACGGAGA
CGAGACTCGGAAGGAAGAAGATCCTCAGAGTGGAAACTGGAGAGAAGAAGTTAAGACCAT
AGTACAAGATTCTCAAGAGGTTCTAGCCCAACATCTTTCAATCTTTCATAGTGATTACAA
GCCTAGAATCAATGATATACAATGTCTTTATTCTGTTTTGTTTACTAACGAGACATCAAA
ATTTTCAGAACAGTAATGTTTTTACGTTCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL4541Contig1 1040 2 6 U
CGAACGACTGAATTGTAATCGATCCAATTCTACACCATTAATACTCCACTTAACTTCGAT
CAATCAGTTTCCTTTTTATTGTTTCGTTCAGCTCTGTCTTTCTTCTTCATTGATTATTTT
GTGTCACAGTTGTTCTCCTGGACGAGGCTTCCATGGTTCAGATCGTCAGAGATGAATAAA
GGGGAAGTTCTTAGCCTCTATTTTCCATGAACCTCGCTGGTCAATCTGTTTCTCTCACTC
TGATTTGGTTTGTTTTTTGGTACGTGAAGCATTGTGTGAGCAGAGTTGGTGGTCGTGAGC
TTTAACACGGAGGAGGCACGGCGCGATGGTGATGGTGCTAGCTGATGATGATGACGATGT
TTGGATTTAGATCTAGTTGACTATGTGGAGAACACAATCTGTGCTTGCAATGGTTACCAT
GTTCCTCGATGCTGTGAAATTAGAGTCCCACTGGCCAATGATTTAGGGAAGTTGACGTTT
CATGTACATATGAATAGGGGTTTAAGGTAACAAAACAAAGCGTGTCGAGGAAGAGTCTGG
CAAGCTGTTTCTGCTAACCGTCACCCTGGTGCCGTGAATTTCATGTCGAACCAGCAAAGC
CTAGGAGCTCAACTTGCCCAGCTTGGTAGAGATGCTTCAGCTGCTGGAGCTGCTCGCCGT
TTTACCACACAGAAGAAGAGTATTGTAGAGATTGAATCGGTTGGTGTTGCTGGTAAAACT
GAGAGCCGTGTTAAGAAACACTTCCGCCTAGAGTTTGTAAATGCTCCATGTATAAATAAA
TAGTGAAAGTCGGACTTGAAGGACGTTTTGGCGACTTCTCATACAACCACGGCAGATGGA
GTTGATGAGGAAGAAAAATGTCCTTTGACGTTGATGAGAAAGAAAAATGTTTGCGATTTA
CCAATGATCTTGACGTTGATGAGGAAGAAAAAAATTTCCGTTACAGATAGCAGCTCTGTT
TTCAAATGAAGGTATGTAAGAGTTCTACTACTTTGAACTGTGTTTCCCGTGTCTAATTAA
ATAAAAGTAGACCTTCACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA26TF U 1
AF RR2HA26JQ C 258
BS 1 717 RR2HA26TF
BS 718 718 RR2HA26JQ
BS 719 737 RR2HA26TF
BS 738 738 RR2HA26JQ
BS 739 765 RR2HA26TF
BS 766 1040 RR2HA26JQ

RD RR2HA26TF 765 0 0
CGAACGACTGAATTGTAATCGATCCAATTCTACACCATTAATACTCCACTTAACTTCGAT
CAATCAGTTTCCTTTTTATTGTTTCGTTCAGCTCTGTCTTTCTTCTTCATTGATTATTTT
GTGTCACAGTTGTTCTCCTGGACGAGGCTTCCATGGTTCAGATCGTCAGAGATGAATAAA
GGGGAAGTTCTTAGCCTCTATTTTCCATGAACCTCGCTGGTCAATCTGTTTCTCTCACTC
TGATTTGGTTTGTTTTTTGGTACGTGAAGCATTGTGTGAGCAGAGTTGGTGGTCGTGAGC
TTTAACACGGAGGAGGCACGGCGCGATGGTGATGGTGCTAGCTGATGATGATGACGATGT
TTGGATTTAGATCTAGTTGACTATGTGGAGAACACAATCTGTGCTTGCAATGGTTACCAT
GTTCCTCGATGCTGTGAAATTAGAGTCCCACTGGCCAATGATTTAGGGAAGTTGACGTTT
CATGTACATATGAATAGGGGTTTAAGGTAACAAAACAAAGCGTGTCGAGGAAGAGTCTGG
CAAGCTGTTTCTGCTAACCGTCACCCTGGTGCCGTGAATTTCATGTCGAACCAGCAAAGC
CTAGGAGCTCAACTTGCCCAGCTTGGTAGAGATGCTTCAGCTGCTGGAGCTGCTCGCCGT
TTTACCACACAGAAGAAGAGTATTGTAGAGATTGAATCGGTTGGTGTTGCTGGTAAA*CT
GAGAGCCGTGTTAAGAA*CACTTCCGCCTAGAGTTTGTAAATGCT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2HA26JQ 783 0 0
TGGTACGTGAAGCATTGTGTGAGCAGAGTTGGTGGTCGTGAGCTTTAACACGGAGGAGGC
ACGGCGCGATGGTGATGGTGCTAGCTGATGATGATGACGATGTTTGGATTTAGATCTAGT
TGACTATGTGGAGAACACAATCTGTGCTTGCAATGGTTACCATGTTCCTCGATGCTGTGA
AATTAGAGTCCCACTGGCCAATGATTTAGGGAAGTTGACGTTTCATGTACATATGAATAG
GGGTTTAAGGTAACAAAACAAAGCGTGTCGAGGAAGAGTCTGGCAAGCTGTTTTTGCTAA
CCGTCACCCTGGTGCCGTGAATTTCATGTCGAACCAGCAAAGCCTAGGAGCTCAACTTGC
CCAGCTTGGTAGAGATGCTTCAGCTGCTGGAGCTGCTCGCCGTTTTACCACACAGAAGAA
GAGTATTGTAGAGATTGAATCGGTTGGTGTTGCTGGTAAAACTGAGAGCCGTGTTAAGAA
ACACTTCCGCCTAGAGTTTGTAAATGCTCCATGTATAAATAAATAGTGAAAGTCGGACTT
GAAGGACGTTTTGGCGACTTCTCATACAACCACGGCAGATGGAGTTGATGAGGAAGAAAA
ATGTCCTTTGACGTTGATGAGAAAGAAAAATGTTTGCGATTTACCAATGATCTTGACGTT
GATGAGGAAGAAAAAAATTTCCGTTACAGATAGCAGCTCTGTTTTCAAATGAAGGTATGT
AAGAGTTCTACTACTTTGAACTGTGTTTCCCGTGTCTAATTAAATAAAAGTAGACCTTCA
CGG

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL4542Contig1 635 2 1 U
GAAAGTAAAATTGAGTGCTATAGACATCAAAAGAAATGTTGTACAGGGAATATCTCCTAG
CATCTATATATAGGTAATAGTCGATCTAGATATTATGAATGATTTATAGCATATGTGATA
ATCACTCTGCATAGCCAAATAAAGAAAATGATCTCAATACTGTTTTCAGCCTCTGCTTTT
GCTATATTATTCTTCTTTTTGAAAATCAGCATAGATCAGTAACCAACGACTCTTGATCCC
AAATCGAAGCTTAAAATATAATTTAAACCAAACAAAGTATATCTATATAGTAAATCATGT
CTAATTTTTAATCATAATATATTTGTGACTAGTCATATTTTTCCATTTTTTTATTCTGTG
AAAATTTTGTGATTTTTATAAAATTAGTCACAAACGCATCGTGACTATTTCGTAGTTATA
CGATAAATTTCTACAAGTGAAACTAAAGAAACAAAAACTCCAAAAAGAAGGAGCATAGGT
TATGTGTCCAGCCGATGTGTAAACACAACATGTTCATGTTCGAGAGATAAGTATCGACAA
TGCTATAAATATTACAATACATAATGGTAAAACCGTAGACTTGTTGTAAGAATCTCTTGT
GTTTTAATAAAGGAACAAGTTAAGAGATTTCTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FQ75JQ C 1
AF RR2FQ75TF U 1
BS 1 635 RR2FQ75TF

RD RR2FQ75JQ 635 0 0
GAAAGTAAAATTGAGTGCTATAGACATCAAAAGAAATGTTGTACAGGGAATATCTCCTAG
CATCTATATATAGGTAATAGTCGATCTAGATATTATGAATGATTTATAGCATATGTGATA
ATCACTCTGCATAGCCAAATAAAGAAAATGATCTCAATACTGTTTTCAGCCTCTGCTTTT
GCTATATTATTCTTCTTTTTGAAAATCAGCATAGATCAGTAACCAACGACTCTTGATCCC
AAATCGAAGCTTAAAATATAATTTAAACCAAACAAAGTATATCTATATAGTAAATCATGT
CTAATTTTTAATCATAATATATTTGTGACTAGTCATATTTTTCCATTTTTTTATTCTGTG
AAAATTTTGTGATTTTTATAAAATTAGTCACAAACGCATCGTGACTATTTCGTAGTTATA
CGATAAATTTCTACAAGTGAAACTAAAGAAACAAAAACTCCAAAAAGAAGGAGCATAGGT
TATGTGTCCAGCCGATGTGTAAACACAACATGTTCATGTTCGAGAGATAAGTATCGACAA
TGCTATAAATATTACAATACATAATGGTAAAACCGTAGACTTGTTGTAAGAATCTCTTGT
GTTTTAATAAAGGAACAAGTTAAGAGATTTCTTCC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2FQ75TF 635 0 0
GAAAGTAAAATTGAGTGCTATAGACATCAAAAGAAATGTTGTACAGGGAATATCTCCTAG
CATCTATATATAGGTAATAGTCGATCTAGATATTATGAATGATTTATAGCATATGTGATA
ATCACTCTGCATAGCCAAATAAAGAAAATGATCTCAATACTGTTTTCAGCCTCTGCTTTT
GCTATATTATTCTTCTTTTTGAAAATCAGCATAGATCAGTAACCAACGACTCTTGATCCC
AAATCGAAGCTTAAAATATAATTTAAACCAAACAAAGTATATCTATATAGTAAATCATGT
CTAATTTTTAATCATAATATATTTGTGACTAGTCATATTTTTCCATTTTTTTATTCTGTG
AAAATTTTGTGATTTTTATAAAATTAGTCACAAACGCATCGTGACTATTTCGTAGTTATA
CGATAAATTTCTACAAGTGAAACTAAAGAAACAAAAACTCCAAAAAGAAGGAGCATAGGT
TATGTGTCCAGCCGATGTGTAAACACAACATGTTCATGTTCGAGAGATAAGTATCGACAA
TGCTATAAATATTACAATACATAATGGTAAAACCGTAGACTTGTTGTAAGAATCTCTTGT
GTTTTAATAAAGGAACAAGTTAAGAGATTTCTTCC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL4543Contig1 625 2 2 U
GGAGAAAAAATAAGCACAAATGGCAGTTTCTCTCCCGAACTCATTTCTCCAGATCAATCC
ATGTGCTCCTTCTCTCGTAGTCAAAAAGCCGGTTAAGGCGGCATCGATTGGCGCGAACCG
AGGAAATAAACCGGCGGGAAGCAATAATCCTTCGGTGGTTCGAGTGACGTGCAGGAAGAA
GGATTTGCACCCGGAGTTTCACGAGGACGCCAAGGTTTACTGCAACGGAGAGCTCGTGAT
GACGACCGGAGGGACCAAGAAAGAGTACGTCGTTGATGTTTGGTCCGGTAACCATCCCTT
TTACCTCGGGAACCGGTCGGCTTTGATGGTCGACGCTGACCAAGTTGAGAAGTTCCGGAA
GAGGTTCGCGGGGTTGTCGGAGATTATGGAGATTCCGGTTCTGAAAGGAGAGATCGTCTT
GCCCACGAAGAAAAGCAAAGGTGCTGGCAAAGGGAAGAAGAAATGATTGAGAGAGACTTT
GTGATGTTTGAAATTGGAGTTTTCTGGTAAAAGTTTTTAAGTTTGTCTTTGCTTTTGCTT
GGGCTGTTTGAATAGTTATGTTATGTTTCTTCTTGAATGCAAATGATTATGATTTTATTC
TAAGAATTTATTTGGTTTCCAGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2DL78TF U 1
AF RR2DL78JQ C 78
BS 1 623 RR2DL78TF
BS 624 625 RR2DL78JQ

RD RR2DL78TF 625 0 0
GGAGAAAAAATAAGCACAAATGGCAGTTTCTCTCCCGAACTCATTTCTCCAGATCAATCC
ATGTGCTCCTTCTCTCGTAGTCAAAAAGCCGGTTAAGGCGGCATCGATTGGCGCGAACCG
AGGAAATAAACCGGCGGGAAGCAATAATCCTTCGGTGGTTCGAGTGACGTGCAGGAAGAA
GGATTTGCACCCGGAGTTTCACGAGGACGCCAAGGTTTACTGCAACGGAGAGCTCGTGAT
GACGACCGGAGGGACCAAGAAAGAGTACGTCGTTGATGTTTGGTCCGGTAACCATCCCTT
TTACCTCGGGAACCGGTCGGCTTTGATGGTCGACGCTGACCAAGTTGAGAAGTTCCGGAA
GAGGTTCGCGGGGTTGTCGGAGATTATGGAGATTCCGGTTCTGAAAGGAGAGATCGTCTT
GCCCACGAAGAAAAGCAAAGGTGCTGGCAAAGGGAAGAAGAAATGATTGAGAGAGACTTT
GTGATGTTTGAAATTGGAGTTTTCTGGTAAAAGTTTTTAAGTTTGTCTTTGCTTTTGCTT
GGGCTGTTTGAATAGTTATGTTATGTTTCTTCTTGAATGCAAATGATTATGATTTTATTC
TAAGAATTTATTTGGTTTCCAGG
AG

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2DL78JQ 548 0 0
TAGTCAAAAAGCCGGTTAAGGCGGCATCGATTGGCGCGAACCGAGGAAATAAACCGGCGG
GAAGCAATAATCCTTCGGTGGTTCGAGTGACGTGCAGGAAGAAGGATTTGCACCCGGAGT
TTCACGAGGACGCCAAGGTTTACTGCAACGGAGAGCTCGTGATGACGACCGGAGGGACCA
AGAAAGAGTACGTCGTTGATGTTTGGTCCGGTAACCATCCCTTTTACCTCGGGAACCGGT
TGGCTTTGATGGTTGACGCTGACCAAGTTGAGAAGTTCCGGAAGAGGTTCGGGGGGTTGT
CGGAGATTATGGAGATTCCGGTTTTGAAAGGAGAGATTGTTTTGCCCACGAAGAAAAGCA
AAGGTGCTGGCAAAGGGAAGAAGAAATGATTGAGAGAGACTTTGTGATGTTTGAAATTGG
AGTTTTTTGGTAAAAGTTTTTAAGTTTGTTTTTGCTTTTGCTTGGGCTGTTTGAATAGTT
ATGTTATGTTTTTTTTTGAATGCAAATGATTATGATTTTATTTTAAGAATTTATTTGGTT
TCCAGGGG

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 2

CO CL4544Contig1 979 2 4 U
GGAGTATGGGGCTAACTAGGTTTATAACGGAGAGAGGAGGGAGACATTGTTTGTACAGAG
TAGGGTATAGAAACGTGATTGACAAGGGAGTTGAGCTGAACAAAGATGGCATCGAGACTC
ATCTCATGATGGAAACTTCAGGACATGGTGCTGTTAAGGAGAATCACTTCTTAGATGACG
GTGCATACATGGTGGTGAAAATTATAATTGAAATGGTGAGAATGAGACTGGCGGGATCAA
AGGAAGGTATTGGTAGCCTGATAAAAGATCTCGAGGAGCCATTAGAATCGGCTGAGCTGC
GGATGAATATTTTGTCGGAGCCAAGAGATGCCAAAGCAAAAGGCATTGAAGCCATTGAGA
CATTCAGGCAATACATTGAGGAAGGAAAACTAGAAGGATGGGAATTGGATTCTTGTGGAG
AATGTTGGGTTAGTGAAGGTTGTTTGGTAGACTCAAATGATCATCCATCTGCCATTGATG
CTCACATGTACAGGGCAAAAGTGATGGACAAAAAGAGTGGGGAAGAGTATGGATGGGTAC
ACATGAGGCAGAGCATTCACAATCCTAACATTGCTCTTAATATGCAATCAGTGCTTCTTG
GTGGATGTCTCTCCATGACAACTCTTTTCAGAGACCGGTTTCTTGAAGCTAGTGGGATAG
CTAGATTCCTCGACATAAGTGATATCGACAATTATATCGGAAGTCAATCCTGAAGGCTCT
TCAATCAAATTGCAAATGATAGCATTAAACGACAGTGTGAAGGCTACTTTTTTTTTTGAA
AGAAGGAAAAAATTCATGTGCTATGTTTTTGTATTCTTTTTGAGGATACACTTAGACATT
AACCAAAAACGTCCGCCATTTCATTATATGATCGTCAGTAACGTATAGTAATGGGTAGAT
GTGATTATAAAATGAATGTGTAATATACATGGATATAATTGGTGAACGATAATAATGTCA
ATGGAAAGTAATTGGGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH94TF U 1
AF RR2FH94JQ C 257
BS 1 715 RR2FH94TF
BS 716 716 RR2FH94JQ
BS 717 762 RR2FH94TF
BS 763 979 RR2FH94JQ

RD RR2FH94TF 766 0 0
GGAGTATGGGGCTAACTAGGTTTATAACGGAGAGAGGAGGGAGACATTGTTTGTACAGAG
TAGGGTATAGAAACGTGATTGACAAGGGAGTTGAGCTGAACAAAGATGGCATCGAGACTC
ATCTCATGATGGAAACTTCAGGACATGGTGCTGTTAAGGAGAATCACTTCTTAGATGACG
GTGCATACATGGTGGTGAAAATTATAATTGAAATGGTGAGAATGAGACTGGCGGGATCAA
AGGAAGGTATTGGTAGCCTGATAAAAGATCTCGAGGAGCCATTAGAATCGGCTGAGCTGC
GGATGAATATTTTGTCGGAGCCAAGAGATGCCAAAGCAAAAGGCATTGAAGCCATTGAGA
CATTCAGGCAATACATTGAGGAAGGAAAACTAGAAGGATGGGAATTGGATTCTTGTGGAG
AATGTTGGGTTAGTGAAGGTTGTTTGGTAGACTCAAATGATCATCCATCTGCCATTGATG
CTCACATGTACAGGGCAAAAGTGATGGACAAAAAGAGTGGGGAAGAGTATGGATGGGTAC
ACATGAGGCAGAGCATTCACAATCCTAACATTGCTCTTAATATGCAATCAGTGCTTCTTG
GTGGATGTCTCTCCATGACAACTCTTTTCAGAGACCGGTTTCTTGAAGCTAGTGGGATAG
CTAGATTCCTCGACATAAGTGATATCGACAATTATATCGGAAGTCAATCCTGAAG*CTCT
TCAATCAAATTGCAAATGATAGCATTAAACGACAGTGTGAAG
CTAC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2FH94JQ 723 0 0
CCTGATAAAAGATCTCGAGGAGCCATTAGAATCGGCTGAGCTGCGGATGAATATTTTGTC
GGAGCCAAGAGATGCCAAAGCAAAAGGCATTGAAGCCATTGAGACATTCAGGCAATACAT
TGAGGAAGGAAAACTAGAAGGATGGGAATTGGATTCTTGTGGAGAATGTTGGGTTAGTGA
AGGTTGTTTGGTAGACTCAAATGATCATCCATCTGCCATTGATGCTCACATGTACAGGGC
AAAAGTGATGGACAAAAAGAGTGGGGAAGAGTATGGATGGGTACACATGAGGCAGAGCAT
TCACAATCCTAACATTGCTCTTAATATGCAATCAGTGCTTCTTGGTGGATGTCTCTCCAT
GACAACTCTTTTCAGAGACCGGTTTCTTGAAGCTAGTGGGATAGCTAGATTCCTCGACAT
AAGTGATATCGACAATTATATCGGAAGTCAATCCTGAAGGCTCTTCAATCAAATTGCAAA
TGATAGCATTAAACGACAGTGTGAAGGCTACTTTTTTTTTTGAAAGAAGGAAAAAATTCA
TGTGCTATGTTTTTGTATTCTTTTTGAGGATACACTTAGACATTAACCAAAAACGTCCGC
CATTTCATTATATGATCGTCAGTAACGTATAGTAATGGGTAGATGTGATTATAAAATGAA
TGTGTAATATACATGGATATAATTGGTGAACGATAATAATGTCAATGGAAAGTAATTGGG
ACG

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL4545Contig1 845 2 20 U
GCAAACATAGTTTAACCTATTAGTCCTTGAGTTTGAAACAGTTCTTTCTATATATACTTG
TTACACAATATGGGGGAAGAGTATCTCAAAGATATACACAGAGATATTCAACGTCTCTTT
TACTCACTCACTCAGACAGAAGCTGGTGTTGGTGTTGATGTTGAGGTTGAAGAGGCAACA
CGGTTTTCAGGTGGGATTTCTGTAAACTCAGACAAGATTGCTCTGAACTCATCCCCTGAC
ATCGTCTCTTTCTCCAAAAGCACTTCAACAATCTTGTCCATGGCTTCACGGTTGTTCCTT
ATGTGCCCCAAAGCTATCTCGTACGCACTGTCTGATAGCGTCTTCACCGCTGAATCAATA
TAGTTTGCAAGCTTCTCAGACATTGAGTTTCTTGCCATCATCCTCATGATCACATCGCTC
TGAGCTGATGAGTCCATCAACGACCATGGTCCAATTTCAGACATCCCAAATGTTGTCACC
ATCTGCTTAGCCAAACCGGTGATCTGTTGCAAGTCACCAACTGCACCAGTAGTCACCTCC
GGCTCACCAAAGATGACTTCTTCAGCAGCTCGACCACCGAGCCCACCAACGATCCTCGCA
AACAGTTGCTGTTTGGAGATTAGAGTTGGATCATCTGAGGGAATGAACCAAGTCAGACCT
CTCGCTTGTCCTCTTGGAATCAATGTCACCTTTTGGACAGCATCATGTCCTGGAGTCAAC
GTTCCACAGACGGCATGTCCAACTTCATGGTAAGCAACCAAGCTCTTACTCTTCCCATCT
GTCATGACAGTTCCTTCCATCCCAGCTACGATCCTATCAATAGAATCATCAATCTCTTTA
GACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2H630JQB U 1
AF RR2D347TF C 210
BS 1 242 RR2H630JQB
BS 243 243 RR2D347TF
BS 244 344 RR2H630JQB
BS 345 345 RR2D347TF
BS 346 546 RR2H630JQB
BS 547 548 RR2D347TF
BS 549 571 RR2H630JQB
BS 572 572 RR2D347TF
BS 573 593 RR2H630JQB
BS 594 594 RR2D347TF
BS 595 602 RR2H630JQB
BS 603 603 RR2D347TF
BS 604 686 RR2H630JQB
BS 687 687 RR2D347TF
BS 688 695 RR2H630JQB
BS 696 696 RR2D347TF
BS 697 767 RR2H630JQB
BS 768 768 RR2D347TF
BS 769 831 RR2H630JQB
BS 832 845 RR2D347TF

RD RR2H630JQB 831 0 0
GCAAACATAGTTTAACCTATTAGTCCTTGAGTTTGAAACAGTTCTTTCTATATATACTTG
TTACACAATATGGGGGAAGAGTATCTCAAAGATATACACAGAGATATTCAACGTCTCTTT
TACTCACTCACTCAGACAGAAGCTGGTGTTGGTGTTGATGTTGAGGTTGAAGAGGCAACA
CGGTTTTCAGGTGGGATTTCTGTAAACTCAGACAAGATTGCTCTGAACTCATCCCCTGAC
ATTGTCTCTTTCTCCAAAAGCACTTCAACAATCTTGTCCATGGCTTCACGGTTGTTCCTT
ATGTGCCCCAAAGCTATCTCGTACGCACTGTCTGATAGCGTCTTGACCGCTGAATCAATA
TAGTTTGCAAGCTTCTCAGACATTGAGTTTCTTGCCATCATCCTCATGATCACATCGCTC
TGAGCTGATGAGTCCATCAACGACCATGGTCCAATTTCAGACATCCCAAATGTTGTCACC
ATCTGCTTAGCCAAACCGGTGATCTGTTGCAAGTCACCAACTGCACCAGTAGTCACCTCC
GGCTCA**AAAGATGACTTCTTCAGCAGCTCTACCACCGAGCCCACCAACGATTCTCGCA
AATAGTTGCTGTTTGGAGATTAGAGTTGGATCATCTGAGGGAATGAACCAAGTCAGACCT
CTCGCTTGTCCTCTTGGAATCAATGTGACCTTTTGTACAGCATCATGTCCTGGAGTCAAC
GTTCCACAGACGGCATGTCCAACTTCATGGTAAGCAACCAAGCTCTTGCTCTTCCCATCT
GTCATGACAGTTCCTTCCATCCCAGCTACGATCCTATCAATAGAATCATCA

QA 1 831 1 831
DS 

RD RR2D347TF 636 0 0
AGACAAGATTGCTCTGAACTCATCTCCTGACATCGTCTCTTTCTCCAAAAGCACTTCAAC
AATCTTGTCCATGGCTTCTCGGTTGTTCCTTATGTGCCCCAAAGCTATCTCGTACGCACT
GTCTGATAGCGTCTTCACCGCTGAATCGATGTCGTTTGCAAGCTTCTCAGACATTGAGTT
TCTTGCCATCATCCTCATGATCACATCGCTCTGAGCTGATGAGTCCATCAACGACCATGG
TCCAATTTCAGACATCCCAAATGTTGTCACCATCTGTTTAGCCAAACCGGTGATCT**TG
CAAGTCACCAACTGCACCAGTAGTCACCTCCGGCTCACCAAAGATGACTTCTTCAGCAGC
TCGACCACCGAGCCCACCAACGATCCTCGCAAACAGTTGCTGTTTGGAGATTAGAGTTGG
ATCATCTGAGGGAATGAACCAAGTCAGACCTCTCGCTTGTCCTCTTGGAATCAATGTCAC
TTTTTGGACAGCATCATGTCCTGGAGTCAACGTTCCACAGACGGCATGTCCAACTTCATG
GTAAGCAACCAAGCTTTTACTCTTCCCATCTGTCATGACAGTTCCTTCCATTCCAGCTAC
TATCCTATCAATCGAATCATCAATCTCTTTAGACGC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL4546Contig1 554 2 1 U
GGGCGATCTGCAAAACTTCATTTTCAATAGACTGCGTATTCACCTTCTCCTTCTCGGCTT
CTCCTACCCAACCAAACCTTCTCATCGTTCGTCTTCGAATCAGCCATGGAGGATGAGATT
GAACTGAAAACTGCTCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAACCAGACAAGGCATTGC
TTCACCCGTTACATTGAGTTCCACAGGTGCACAACTGCAAAGGGTGAGGACTCCAGTGAC
TGCGAGAGGTTCGCCAAGTACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGAATGGGTTGACAAGTGG
AACGAGCAGAGGGAGACCGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATCTGAGCAAGAAGCTCTC
TTTTTATCATGTTTTGTTTGAGGCCAAAAGGTCGTCTGGATGATCATTTCAATCCAACTC
TTATCTTTTTGTTTAATCGTTTTTCTTTGGTTGATCAAATAAAATAAACCGCAAGACATT
CGTTTGGATTATAATGATTTGAGCGTGGACCTAAATCTCCCAATTTAAAATTTCGAGGCA
GTTTTGTTATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BM51TF U 1
AF RR2BM51JQ C 49
BS 1 554 RR2BM51TF

RD RR2BM51TF 554 0 0
GGGCGATCTGCAAAACTTCATTTTCAATAGACTGCGTATTCACCTTCTCCTTCTCGGCTT
CTCCTACCCAACCAAACCTTCTCATCGTTCGTCTTCGAATCAGCCATGGAGGATGAGATT
GAACTGAAAACTGCTCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAACCAGACAAGGCATTGC
TTCACCCGTTACATTGAGTTCCACAGGTGCACAACTGCAAAGGGTGAGGACTCCAGTGAC
TGCGAGAGGTTCGCCAAGTACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGAATGGGTTGACAAGTGG
AACGAGCAGAGGGAGACCGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATCTGAGCAAGAAGCTCTC
TTTTTATCATGTTTTGTTTGAGGCCAAAAGGTCGTCTGGATGATCATTTCAATCCAACTC
TTATCTTTTTGTTTAATCGTTTTTCTTTGGTTGATCAAATAAAATAAACCGCAAGACATT
CGTTTGGATTATAATGATTTGAGCGTGGACCTAAATCTCCCAATTTAAAATTTCGAGGCA
GTTTTGTTATTTCC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2BM51JQ 506 0 0
CCTTTTCGGCTTCTCCTACCCAACCAAACCTTCTCATCGTTCGTCTTCGAATCAGCCATG
GAGGATGAGATTGAACTGAAAACTGCTCCTGCTGATTTCCGGTTCCCTACAACGAACCAG
ACAAGGCATTGCTTCACCCGTTACATTGAGTTCCACAGGTGCACAACTGCAAAGGGTGAG
GACTCCAGTGACTGCGAGAGGTTCGCCAAGTACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGAATGG
GTTGACAAGTGGAACGAGCAGAGGGAGACCGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATCTGAG
CAAGAAGCTCTCTTTTTATCATGTTTTGTTTGAGGCCAAAAGGTCGTCTGGATGATCATT
TCAATCCAACTCTTATCTTTTTGTTTAATCGTTTTTCTTTGGTTGATCAAATAAAATAAA
CCGCAAGACATTCGTTTGGATTATAATGATTTGAGCGTGGACCTAAATCTCCCAATTTAA
AATTTCGAGGCAGTTTTGTTATTTCC

QA 1 506 1 506
DS 



AS 1 2

CO CL4547Contig1 674 2 2 U
GAAGGATACTGGCCTTTTCGGCGTGTACGCAGTTGCTAAGGCTGATTGCTTAGATGATTT
ATCATATGCTATCATGCGTGAGGTAACCGGGTTGGCCGGCCGAGTTTCAGACGATGATGT
GACACGTGCACGGAATCAGCTGAAATCGTCGCTATTGCTTCACATGGATGGAACCAGTCC
AATTGCTGAAGATATTGGTCGTCAGCTGCTGACATATGGGAGAAGAATCCCAACCGCTGA
ACTCTTTGCGAGGATCGATGCTGTTGATGCCAACGCGGTTAGACGTGTCGCCAACAAGTA
TATCTATGACAAGGACCTTGCAATCTCAGCCATTGGTCCGATCCAAGATTTGCCGGACTA
CAACAAGTTCAGACGTAGAACTTACATGAACCGTTACTAAGCCTCTGAAAATAACCGTCA
CAGCACCGCAATGTTCGCCCACGGGAGAGTCCATAGGCGGAGAGAGAAAGAACAAGGGTG
GCTGATCGATTCATTATTTTGAGTTTTCCTTTACTGTAATCTTATAAATTTCCCATCGGT
GGTAAAATAATAAATCTACCATTTGGAAGATGCTAGAGATCCTTTGGTTTTTGCTTCTCT
TCATAATTTTGCTATACATACTAATAAGTTGTGGAATGTTGGTTTAAAACCTTAATTTGA
ATCATTATTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2EF79TF U 1
AF RR2EF79JQ C 169
BS 1 671 RR2EF79TF
BS 672 674 RR2EF79JQ

RD RR2EF79TF 674 0 0
GAAGGATACTGGCCTTTTCGGCGTGTACGCAGTTGCTAAGGCTGATTGCTTAGATGATTT
ATCATATGCTATCATGCGTGAGGTAACCGGGTTGGCCGGCCGAGTTTCAGACGATGATGT
GACACGTGCACGGAATCAGCTGAAATCGTCGCTATTGCTTCACATGGATGGAACCAGTCC
AATTGCTGAAGATATTGGTCGTCAGCTGCTGACATATGGGAGAAGAATCCCAACCGCTGA
ACTCTTTGCGAGGATCGATGCTGTTGATGCCAACGCGGTTAGACGTGTCGCCAACAAGTA
TATCTATGACAAGGACCTTGCAATCTCAGCCATTGGTCCGATCCAAGATTTGCCGGACTA
CAACAAGTTCAGACGTAGAACTTACATGAACCGTTACTAAGCCTCTGAAAATAACCGTCA
CAGCACCGCAATGTTCGCCCACGGGAGAGTCCATAGGCGGAGAGAGAAAGAACAAGGGTG
GCTGATCGATTCATTATTTTGAGTTTTCCTTTACTGTAATCTTATAAATTTCCCATCGGT
GGTAAAATAATAAATCTACCATTTGGAAGATGCTAGAGATCCTTTGGTTTTTGCTTCTCT
TCATAATTTTGCTATACATACTAATAAGTTGTGGAATGTTGGTTTAAAACCTTAATTTGA
ATCATTATTTT
CTT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2EF79JQ 506 0 0
TGGAACCAGTCCAATTGCTGAAGATATTGGTCGTCAGCTGCTGACATATGGGAGAAGAAT
CCCAACCGCTGAACTCTTTGCGAGGATCGATGCTGTTGATGCCAACGCGGTTAGACGTGT
CGCCAACAAGTATATCTATGACAAGGACCTTGCAATCTCAGCCATTGGTCCGATCCAAGA
TTTGCCGGACTACAACAAGTTCAGACGTAGAACTTACATGAACCGTTACTAAGCCTCTGA
AAATAACCGTCACAGCACCGCAATGTTCGCCCACGGGAGAGTCCATAGGCGGAGAGAGAA
AGAACAAGGGTGGCTGATCGATTCATTATTTTGAGTTTTCCTTTACTGTAATCTTATAAA
TTTCCCATCGGTGGTAAAATAATAAATCTACCATTTGGAAGATGCTAGAGATCCTTTGGT
TTTTGCTTCTCTTCATAATTTTGCTATACATACTAATAAGTTGTGGAATGTTGGTTTAAA
ACCTTAATTTGAATCATTATTTTTTT

QA 1 506 1 506
DS 



AS 1 2

CO CL4548Contig1 686 2 2 U
TTTTTTTTCAAGCAAATATGATTAAACATCATCAATTACACAATTCCATAAATCCAATTG
TTCAGCTTTAGAGATCCAAAACAGCTTTGCTTTTATTCAAAAGAGACTGAAACAAAACAA
TAAATCACTCACTCAAAGAGCATTAACCAAAAGCTCTCACATTCTTACTTGGTCTTGGTG
GGTACCCATGGTTGGTACCGAGTCCAGTTCTTTTGCCCCGGGTTCAAGGTATGTCCTTTA
AAATGGTAAATGTATGCATCACCTTCTCCAGAGAAGTTCTCTTTATGCTCAATCCCATAC
CTTTTTGGTTTCTGACTCAACAGCTCATCTCCAGTGTGATCAGTGATGAAATGAAGCCAT
CCGTGCCATTCGGCTGGTACTTGAGATGCGTTGTAACGATCCTTGGATGCGTACTCTACC
CACCTGTGTCTACCGCACTGAGTATCGCCCAGCTTCTGGTAGTATTTGTTACCGAACTTG
TCCACACCAATAAGCGTTGCTCCTATGTTGTGTATTTTGGTTTGCAAGAGGTTTCCATCT
GGCAGGCATCTCAGGAAGCCTTATTCTCGGATCATCCTGAGGAAGCCTCCGAGACCTTTC
TCTCTAATCGCCTCCAACGCACTCTTCGCCACCGTCAATGCCATCGCTCTCCTCTCTGTC
TCTCTCGATCGATGTCGGAAACTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DI76TF C 1
AF RR2DI76JQ U 9
BS 1 8 RR2DI76TF
BS 9 686 RR2DI76JQ

RD RR2DI76TF 686 0 0
TTTTTTTTCAAGCAAATATGATTAAACATCATCAATTACACAATTCCATAAATCCAATTG
TTCAGCTTTAGAGATCCAAAACAGCTTTGCTTTTATTCAAAAGAGACTGAAACAAAACAA
TAAATCACTCACTCAGAGAGCATTAACCAAAAGCTCTCACATTCTTACTTGGTCTTGGTG
GGTACCCATGGTTGGTACCGAGTCCAGTTCTTTTGCCCCGGGTTCAAGGTATGTCCTTTA
GAATGGTAAATGTATGCATCACCTTCTCCAGAGAAGTTCTCTTTATGCTCAATCCCATAC
CTTTTTGGTTTCTGACTCAACAGCTCATCTCCAGTGTGATCAGTGATGAAATGAAGCCAT
CCGTGCCATTCGGCTGGTACTTGAGATGCGTTGTAACGATCCTTGGATGCGTACTCTACC
CACCTGTGTCTACCGCACTGAGTATCGCCCAGCTTCTGGTAGTATTTGTTACCGAACTTG
TCCACACCAATAAGCGTTGCTCCTATGTTGTGTATTTTGGTTTGCAAGAGGTTTCCATCT
GGCAGGCATCTCAGGAAGCCTTATTCTCGGATCATCCTGAGGAAGCCTCCGAGACCTTTC
TCTCTAATCGCCTCCAACGCACTCTTCGCCACCGTCAATGCCATCGCTCTCCTCTCTGTC
TCTCTCGATCGATGTCGGAAACTCCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2DI76JQ 678 0 0
CAAGCAAATATGATTAAACATCATCAATTACACAATTCCATAAATCCAATTGTTCAGCTT
TAGAGATCCAAAACAGCTTTGCTTTTATTCAAAAGAGACTGAAACAAAACAATAAATCAC
TCACTCAAAGAGCATTAACCAAAAGCTCTCACATTCTTACTTGGTCTTGGTGGGTACCCA
TGGTTGGTACCGAGTCCAGTTCTTTTGCCCCGGGTTCAAGGTATGTCCTTTAAAATGGTA
AATGTATGCATCACCTTCTCCAGAGAAGTTCTCTTTATGCTCAATCCCATACCTTTTTGG
TTTCTGACTCAACAGCTCATCTCCAGTGTGATCAGTGATGAAATGAAGCCATCCGTGCCA
TTCGGCTGGTACTTGAGATGCGTTGTAACGATCCTTGGATGCGTACTCTACCCACCTGTG
TCTACCGCACTGAGTATCGCCCAGCTTCTGGTAGTATTTGTTACCGAACTTGTCCACACC
AATAAGCGTTGCTCCTATGTTGTGTATTTTGGTTTGCAAGAGGTTTCCATCTGGCAGGCA
TCTCAGGAAGCCTTATTCTCGGATCATCCTGAGGAAGCCTCCGAGACCTTTCTCTCTAAT
CGCCTCCAACGCACTCTTCGCCACCGTCAATGCCATCGCTCTCCTCTCTGTCTCTCTCGA
TCGATGTCGGAAACTCCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL4549Contig1 1440 2 2 U
GGATCAGATCCGACAGCTCAAAAGGTTTGACGTCGGTGAAGACTGTCCTGTCTTTGATGG
TCTTTACTCCTTTTGCCAGACGTATGCTGGTGGCTCTGTGGGTGGATCTGTTAAGCTTAA
CCACGGGCTTTGTGATATTGCTATTAACTGGGCTGGTGGTCTCCATCATGCTAAGAAGTG
TGAGGCTTCTGGCTTCTGCTATGTCAATGATATCGTCCTAGCTATCCTTGAGTTGCTTAA
GCAGCATGAGCGTGTTCTGTATGTTGATATCGACATTCACCACGGAGATGGAGTGGAAGA
GGCCTTTTACGCTACTGACAGGGTCATGACCGTCTCATTCCACAAATTTGGAGATTACTT
TCCCGGCACAGGTCACATACAGGACATTGGCTACGGAAGTGGGAAGTACTATTCTCTCAA
CGTACCGCTTGACGATGGGATCGACGACGAGAGCTATCATCTCTTGTTCAAGCCCATCAT
GGGGAAAGTGATGGAGATTTTCCGACCAGGTGCGGTTGTACTGCAGTGCGGTGCTGATTC
TTTGTCTGGTGATAGGCTCGGATGCTTTAACCTCTCCATCAAAGGTCATGCCGAGTGTGT
CAAGTTTATGAGGTCGTTTAATGTTCCTTTGCTTCTCTTGGGTGGTGGTGGTTACACTAT
CCGTAATGTAGCTCGGTGCTGGTGCTACGAGACTGGAGTTGCGCTTGGAATCGAAGTTGA
GGACAAGATGCCGGAGCATGAGTACTATGAGTACTTTGGTCCAGACTATACGCTTCACGT
TGCTCCGAGTAACATGGAGAACAAGAACTCTCGGCAGATGCTTGAAGTGATTCGTAATGA
CTTGCTTCACAACCTCTCGAAGCTTCAGCATGCTCCTAGTGTGCCGTTTCAGGAAAGGCC
ACCAGATACAGAGACTCCTGAGGTAGATGAAGACCAAGAGGATGGAGATAAAAGATGGGA
TGCTGATTCTGACATGGATGTAGATGATGATCGAGTGAAAAGAGAAGCTGTTGAATCTGA
TGCAAAGGACAAGGATGGAGGACTGAAAGGAGTAATGGAGCGTATGAAAGGTTTTGAGAT
GAGGGGTATGGAGGAGAGTGGAAGCACCACCAAGGTAACAGGAGGAAACTCAGTGGGAGT
TGAGGAAGCAGGCGTGAAAATGGAAGAGGATGGCACAAACAAGTCAGGTGCAGCAGATCA
AGTGTTTCCTAAAACATAAAAAAGGACTTTGGAAGCTTCTCATTACTTGTTTTGTCTTCC
TAGTCTTTCAAATCTTTTTTAGTTTGTTATTGATAATTGAATACGCACGTTTATGTATTT
ATTTGTTGCAATGTGGCATGTGATGTCTGAATGATCGCAAGACGGGGATAATTCTATTTG
CTATGTATGAAGTATATGGGGCTTCTTCTATCAAAACACTACCCCTGACATCTCATAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D531TF U 1
AF RR2D531JQ C 652
BS 1 712 RR2D531TF
BS 713 1440 RR2D531JQ

RD RR2D531TF 712 0 0
GGATCAGATCCGACAGCTCAAAAGGTTTGACGTCGGTGAAGACTGTCCTGTCTTTGATGG
TCTTTACTCCTTTTGCCAGACGTATGCTGGTGGCTCTGTGGGTGGATCTGTTAAGCTTAA
CCACGGGCTTTGTGATATTGCTATTAACTGGGCTGGTGGTCTCCATCATGCTAAGAAGTG
TGAGGCTTCTGGCTTCTGCTATGTCAATGATATCGTCCTAGCTATCCTTGAGTTGCTTAA
GCAGCATGAGCGTGTTCTGTATGTTGATATCGACATTCACCACGGAGATGGAGTGGAAGA
GGCCTTTTACGCTACTGACAGGGTCATGACCGTCTCATTCCACAAATTTGGAGATTACTT
TCCCGGCACAGGTCACATACAGGACATTGGCTACGGAAGTGGGAAGTACTATTCTCTCAA
CGTACCGCTTGACGATGGGATCGACGACGAGAGCTATCATCTCTTGTTCAAGCCCATCAT
GGGGAAAGTGATGGAGATTTTCCGACCAGGTGCGGTTGTACTGCAGTGCGGTGCTGATTC
TTTGTCTGGTGATAGGCTCGGATGCTTTAACCTCTCCATCAAAGGTCATGCCGAGTGTGT
CAAGTTTATGAGGTCGTTTAATGTTCCTTTGCTTCTCTTGGGTGGTGGTGGTTACACTAT
CCGTAATGTAGCTCGGTGCTGGTGCTACGAGACTGGAGTTGCGCTTGGAATC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2D531JQ 789 0 0
G
TACACTATCCGTAATGTAGCTCGGTGCTGGTGCTACGAGACTGGAGTTGCGCTTGGAATC
GAAGTTGAGGACAAGATGCCGGAGCATGAGTACTATGAGTACTTTGGTCCAGACTATACG
CTTCACGTTGCTCCGAGTAACATGGAGAACAAGAACTCTCGGCAGATGCTTGAAGTGATT
CGTAATGACTTGCTTCACAACCTCTCGAAGCTTCAGCATGCTCCTAGTGTGCCGTTTCAG
GAAAGGCCACCAGATACAGAGACTCCTGAGGTAGATGAAGACCAAGAGGATGGAGATAAA
AGATGGGATGCTGATTCTGACATGGATGTAGATGATGATCGAGTGAAAAGAGAAGCTGTT
GAATCTGATGCAAAGGACAAGGATGGAGGACTGAAAGGAGTAATGGAGCGTATGAAAGGT
TTTGAGATGAGGGGTATGGAGGAGAGTGGAAGCACCACCAAGGTAACAGGAGGAAACTCA
GTGGGAGTTGAGGAAGCAGGCGTGAAAATGGAAGAGGATGGCACAAACAAGTCAGGTGCA
GCAGATCAAGTGTTTCCTAAAACATAAAAAAGGACTTTGGAAGCTTCTCATTACTTGTTT
TGTCTTCCTAGTCTTTCAAATCTTTTTTAGTTTGTTATTGATAATTGAATACGCACGTTT
ATGTATTTATTTGTTGCAATGTGGCATGTGATGTCTGAATGATCGCAAGACGGGGATAAT
TCTATTTGCTATGTATGAAGTATATGGGGCTTCTTCTATCAAAACACTACCCCTGACATC
TCATAACT

QA 2 789 2 789
DS 



AS 1 2

CO CL4550Contig1 889 2 8 U
GCATCACCAATGCCTGGTTTCCACCACCACCCACCAGGAGGTGCAATGGCAGGTCCACAC
CATCCAATGTACGTAGGACAGAACGGTCAAGGTCTGGTGCCGTCTCAGCCTATGGGGTAT
GGTTACCAACTTCAGTTCATGCCTGGTGTGCGTCCAGGCTCTGGTCCAGCCAACTTCATG
ATGCCTTACCCTCTTCAAAGGCAGAACCAGCCTGGTCCACGTGTTGGGTTCAGGCGTGGT
GCTACTAACATGCAGCAGCACTTCCAGCAACAACAGCAGATGATGCAGCAAAATGCAACT
CCGGGAATGAGATACATGGGTGGTCCAGGCAACAGGAGGAATGGAATGGAAGGAGCTGCT
CCACAAGGGATCATCCCTTTGCCATTGGATGCATCTGCAATCTCTCACAATGGTTCTCAA
AACCCACAGAAGCCACCACTCCTCCCCATTTCTAAGCTCATGTCTGCCTTGGCTCTTGCT
AACCCTGCTAATCACCCACAGATGCTTGGGGAGCATCTTTACCCACTTGTGGAGAAGCAG
GAGCCAGTTCATACGGCCAAAGTCACCGGGATGTTGCTGGAGATGGACCAAGCCGAGATC
CTGCACCTTCTGGAGTCACCAGAAGCTCTTAAGGCCAAAGTCTCCGAGGCGCTGGATGTG
CTCAGGCTCTCTGCTAATCCACCAGCCGTCTCTTCCGTTGATGACCAGTTCGCCCCCTCG
TCAACAGAGTGAACTGACTCCTTAACTCTCAAGACATTATCTCCTCTGTCTTTTTAGTAA
ACAATCTCTTTTTCAAAAAAACTTTGTAGGAATTGCTTTCTCTCTTTTGCAACTTTAGTT
TGTTTTCAAGTTCTACTCTTTTTATCATTTCTTTGTTTTGGGTCTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW03TF U 1
AF RR2FW03JQ C 246
BS 1 665 RR2FW03TF
BS 666 666 RR2FW03JQ
BS 667 723 RR2FW03TF
BS 724 724 RR2FW03JQ
BS 725 751 RR2FW03TF
BS 752 752 RR2FW03JQ
BS 753 774 RR2FW03TF
BS 775 889 RR2FW03JQ

RD RR2FW03TF 775 0 0
GCATCACCAATGCCTGGTTTCCACCACCACCCACCAGGAGGTGCAATGGCAGGTCCACAC
CATCCAATGTACGTAGGACAGAACGGTCAAGGTCTGGTGCCGTCTCAGCCTATGGGGTAT
GGTTACCAACTTCAGTTCATGCCTGGTGTGCGTCCAGGCTCTGGTCCAGCCAACTTCATG
ATGCCTTACCCTCTTCAAAGGCAGAACCAGCCTGGTCCACGTGTTGGGTTCAGGCGTGGT
GCTACTAACATGCAGCAGCACTTCCAGCAACAACAGCAGATGATGCAGCAAAATGCAACT
CCGGGAATGAGATACATGGGTGGTCCAGGCAACAGGAGGAATGGAATGGAAGGAGCTGCT
CCACAAGGGATCATCCCTTTGCCATTGGATGCATCTGCAATCTCTCACAATGGTTCTCAA
AACCCACAGAAGCCACCACTCCTCCCCATTTCTAAGCTCATGTCTGCCTTGGCTCTTGCT
AACCCTGCTAATCACCCACAGATGCTTGGGGAGCATCTTTACCCACTTGTGGAGAAGCAG
GAGCCAGTTCATACGGCCAAAGTCACCGGGATGTTGCTGGAGATGGACCAAGCCGAGATC
CTGCACCTTCTGGAGTCACCAGAAGCTCTTAAGGCCAAAGTCTCCGAGGCGCTGGATGTG
CTCAG*CTCTCTGCTAATCCACCAGCCGTCTCTTCCGTTGATGACCAGTTCGCCCCCTCG
TCA*CAGAGTGAACTGACTCCTTAACTCTCA*GACATTATCTCCTCTGTCTTTT
A

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2FW03JQ 644 0 0
TAACATGCAGCAGCACTTCCAGCAACAACAGCAGATGATGCAGCAAAATGCAACTCCGGG
AATGAGATACATGGGTGGTCCAGGCAACAGGAGGAATGGAATGGAAGGAGCTGCTCCACA
AGGGATCATCCCTTTGCCATTGGATGCATCTGCAATCTCTCACAATGGTTCTCAAAACCC
ACAGAAGCCACCACTCCTCCCCATTTTTAAGCTCATGTCTGCCTTGGCTCTTGCTAACCC
TGCTAATCACCCACAGATGCTTGGGGAGCATCTTTACCCACTTGTGGAGAAGCAGGAGCC
AGTTCATACGGCCAAAGTCACCGGGATGTTGCTGGAGATGGACCAAGCCGAGATCCTGCA
CCTTCTGGAGTCACCAGAAGCTCTTAAGGCCAAAGTTTCCGAGGCGCTGGATGTGCTCAG
GCTTTCTGCTAATCCACCAGCCGTCTCTTCCGTTGATGACCAGTTCGCCCCCTCGTCAAC
AGAGTGAACTGACTCCTTAACTCTCAAGACATTATCTCCTCTGTCTTTTTAGTAAACAAT
CTCTTTTTCAAAAAAACTTTGTAGGAATTGCTTTCTCTCTTTTGCAACTTTAGTTTGTTT
TCAAGTTCTACTCTTTTTATCATTTCTTTGTTTTGGGTCTTATC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL4551Contig1 740 2 5 U
GAAAAAATATTTGCCTGCTTCATTTTTATTTTAAACGGATTTTATTATTTAACAATCTTC
TTAAAACAAATCCATTATTTTACACCCTACGAGATCACCACAACGACATGAATGACTCTT
TGTATCCGTTCTCTCCATGTCACTGCAACTTAAGTCTGCAGTATATGCTTTCTCTTCCTA
TGTTCATGACCTTTCACGACATTTAACTTGAGAATCTATGGCCCTTAGCTTACTTCCGCC
GTAAGTAAGCTGGATAAACTCTGGCAAAACTCCATGTATAGTCTTAACTCGCCCGGGGAT
TTTGATATTTCTATTACACAATTGGTTGGAGTCACCTCAATCACCTCTGCTGATAATAAG
TCAAAAGAAGATCTTGATCTTATCTCTTTTGGCTGAATCTTAACCTTGAAATGCTTTATT
CTTTCGACTGATAAACTAACATAAGTTGCTGCAGCTTCAATCTTCTTGATTGTTTCTTGT
ACTGTGTTCTCGGACCCAATTTTGGTTTTATAAATCTTATCATCCTGTTCTTCTAAGAGA
CCTGACAAATCTAGATCACTAGACATTGCTATTATCTGAAAAGCGTTTATGAAATTTGAA
GACGCGGTTGCTGCATTTATCCCAGCAACACTTTCCTTGATTGAGTCTGGAACTCGATGA
TAAGCTGGTATATAACCTAACTTGAACCAAGAATCTTGGATGATTATCTCAGCTAGTTTC
ATACGCCTTTGAGGATTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK16JQ U 33
AF RR2FQ13JQ U 1
BS 1 56 RR2FQ13JQ
BS 57 57 RR2DK16JQ
BS 58 490 RR2FQ13JQ
BS 491 491 RR2DK16JQ
BS 492 740 RR2FQ13JQ

RD RR2DK16JQ 677 0 0
AAACGGATTTTATTATTTAACAATCTTCTTAGAACAAATCCATTATTTTACACCCTACGA
GATCACCACAACGACATGAATGACTCTTTGTATCCGTTCTCTCCATGTCACTGCAACTTA
AGTCTGCAGTATATGCTTTCTCTTCCTATGTTCATGACCTTTCACGACATTTAACTTGAG
AATCTATGGCCCTTAGCTTACTTCCGCCGTAAGTAAGCTGGATAAACTCTGGCAAAACTC
CATGTATAGTCTTAACTCGCCCGGGGATTTTGATATTTCTATTACA*AATTGGTTGGAGT
CACCTCAATCACCTCTGCTGATAATAAGTCAAAAGAAGATCTTGATCTTATCTCTTTTGG
CTGAATCTTAACCTTGAAATGCTTTATTCTTTCGACTGATAAACTAACATAAGTTGCTGC
AGCTTCAATCTTCTTGATTGTTTCTTGTGCTGTGTTCTCGGACCCAATTTTGGTTTTATA
AATCTTATCATCCTGTTCTTCTAAGAGACCTGACAAATCTAGATCACTAGACATTGCTAT
TATCTGAAAAGCGTTTATGAAATTTGAAGACGCGGTTGCTGCATTTATCTCAGCAACACT
TTCCTTGATTGAGTCTGGAACTCGATGATAAGCTGGTATATAACCTAACTTGAACCAAGA
ATCTTGGATGATTATCT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2FQ13JQ 740 0 0
GAAAAAATATTTGCCTGCTTCATTTTTATTTTAAACGGATTTTATTATTTAACAATTTTC
TTAAAACAAATCCATTATTTTACACCCTACGAGATCACCACAACGACATGAATGACTCTT
TGTATCCGTTCTCTCCATGTCACTGCAACTTAAGTCTGCAGTATATGCTTTCTCTTCCTA
TGTTCATGACCTTTCACGACATTTAACTTGAGAATCTATGGCCCTTAGCTTACTTCCGCC
GTAAGTAAGCTGGATAAACTCTGGCAAAACTCCATGTATAGTCTTAACTCGCCCGGGGAT
TTTGATATTTCTATTACACAATTGGTTGGAGTCACCTCAATCACCTCTGCTGATAATAAG
TCAAAAGAAGATCTTGATCTTATCTCTTTTGGCTGAATCTTAACCTTGAAATGCTTTATT
CTTTCGACTGATAAACTAACATAAGTTGCTGCAGCTTCAATCTTCTTGATTGTTTCTTGT
ACTGTGTTCTTGGACCCAATTTTGGTTTTATAAATCTTATCATCCTGTTCTTCTAAGAGA
CCTGACAAATCTAGATCACTAGACATTGCTATTATCTGAAAAGCGTTTATGAAATTTGAA
GACGCGGTTGCTGCATTTATCCCAGCAACACTTTCCTTGATTGAGTCTGGAACTCGATGA
TAAGCTGGTATATAACCTAACTTGAACCAAGAATCTTGGATGATTATCTCAGCTAGTTTC
ATACGCCTTTGAGGATTTGG

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL4552Contig1 716 2 2 U
GGATCTCTTGCTTTATCTATTCTCTCTCTCTCTCTCCGATGGGTCTCCCCACGGATATAA
AGGAGCTTGAGATTCCGGATTACATACTTAAGATACTTTACGTCATTAGTTTCTTCAGAG
ACATGATCGACGCTCTCTGTCCTTACATCGGTTTACCCCATTTCTTAGACGATGGCATTC
CTCGACCCGGCCCGATCGTACCCGACAACACGGCGACGACTCTCGCTTACGAGGTTTCCC
CGGTTGTTCGTTTCTCGGATCTTCAGACCGATCTCGACGACTGCTGTACGGTTTGTCTCT
CCAACTTCGCATACGATGATAAAGTTAGACAGCTTCCGAACTGCCGACACGTGTTCCACG
ATAGCTGCATGGACCGTTGGATCGTTGACTGCCGCAAGATCACATGTCCGAATTGTCGAG
ACCGGTTCTTACCGGCCGAATATTACGCGCGGATAAATTCCGGTTTTGGTTCGGTTTGGT
ACATTGATGAATCGGAAAGTACTACTATTGCCAACTAATCGTGGCCTTCCATTTTTCCTA
GTATTTGGTTTTGTTGTAATATTCTCTATAAGACCTTTGCATCTGTTCTTTAGATATTGC
TACTGATCAGTACTCTGCGTTTTTTTCAGTATTCTGTGTCAAGTTTTAACTATGTAACAA
AAAGTGAAAAGACATCAAACTATATTAGTCTCATTTTAGACTAAAATTTTTAAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ70JQ C 1
AF RR2BQ70TF U 1
BS 1 663 RR2BQ70TF
BS 664 716 RR2BQ70JQ

RD RR2BQ70JQ 716 0 0
GGATCTCTTGCTTTATCTATTCTCTCTCTCTCTCTCCGATGGGTCTCCCCACGGATATAA
AGGAGCTTGAGATTCCGGATTACATACTTAAGATACTTTACGTCATTAGTTTCTTCAGAG
ACATGATCGACGCTCTCTGTCCTTACATCGGTTTACCCCATTTCTTAGACGATGGCATTC
CTCGACCCGGCCCGATCGTACCCGACAACACGGCGACGACTCTCGCTTACGAGGTTTCCC
CGGTTGTTCGTTTCTCGGATCTTCAGACCGATCTCGACGACTGCTGTACGGTTTGTCTCT
CCAACTTCGCATACGATGATAAAGTTAGACAGCTTCCGAACTGCCGACACGTGTTCCACG
ATAGCTGCATGGACCGTTGGATCGTTGACTGCCGCAAGATCACATGTCCGAATTGTCGAG
ACCGGTTCTTACCGGCCGAATATTACGCGCGGATAAATTCCGGTTTTGGTTCGGTTTGGT
ACATTGATGAATCGGAAAGTACTACTATTGCCAACTAATCGTGGCCTTCCATTTTTCCTA
GTATTTGGTTTTGTTGTAATATTCTCTATAAGACCTTTGCATCTGTTCTTTAGATATTGC
TACTGATCAGTACTCTGCGTTTTTTTCAGTATTCTGTGTCAAGTTTTAACTATGTAACAA
AAAGTGAAAAGACATCAAACTATATTAGTCTCATTTTAGACTAAAATTTTTAAACC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2BQ70TF 663 0 0
GGATCTCTTGCTTTATCTATTCTCTCTCTCTCTCTCCGATGGGTCTCCCCACGGATATAA
AGGAGCTTGAGATTCCGGATTACATACTTAAGATACTTTACGTCATTAGTTTCTTCAGAG
ACATGATCGACGCTCTCTGTCCTTACATCGGTTTACCCCATTTCTTAGACGATGGCATTC
CTCGACCCGGCCCGATCGTACCCGACAACACGGCGACGACTCTCGCTTACGAGGTTTCCC
CGGTTGTTCGTTTCTCGGATCTTCAGACCGATCTCGACGACTGCTGTACGGTTTGTCTCT
CCAACTTCGCATACGATGATAAAGTTAGACAGCTTCCGAACTGCCGACACGTGTTCCACG
ATAGCTGCATGGACCGTTGGATCGTTGACTGCCGCAAGATCACATGTCCGAATTGTCGAG
ACCGGTTCTTACCGGCCGAATATTACGCGCGGATAAATTCCGGTTTTGGTTCGGTTTGGT
ACATTGATGAATCGGAAAGTACTACTATTGCCAACTAATCGTGGCCTTCCATTTTTCCTA
GTATTTGGTTTTGTTGTAATATTCTCTATAAGACCTTTGCATCTGTTCTTTAGATATTGC
TACTGATCAGTACTCTGCGTTTTTTTCAGTATTCTGTGTCAAGTTTTAACTATGTAACAA
AAA

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL4553Contig1 748 2 3 U
GGAAAGAATCAAAACAGATCAACCAAAACGCTACCCAATCCTTCAGATGATCAACGGAGA
GACCCAAAGGCAAAATCAATGTCTCTGCAGAAATTCAAGCTTCTCGCCACTCACTGCAGC
ACCGTCGCCGAGAGTCCAACGCGCAGCCCCGTCGTCCACCTCCGCCGCCGTAAAACGCTG
CGTTTGCTACTCACGCGTTCATCAGATCGTTGGCGATCACCGGAGATCCAAAACAACGGC
GAGGAACTGACGGGATCGGATGGTGCCAGGGGATTATCCGGGAAGAGAGATAAGATCCGA
TCTCGGCGGAAGCTGAGAGAGCTTTTCGTCTCTTCGCCTCCGGTGGAGGAAGGCCAACGT
CGTGGCGGCGGCGGCGGCGATGCGAGGAATGGAACGGAGAGGGCGTTAGTACCGGTTAAC
GGCGTTGATACTAACGGAGGTGTTGGAGAAGAGTCAACGGGTCGACGTATGGGCCTTAAC
GGCGCAACGAGGCCCATGTTATCTGGGACACTTCGATGTAGGTTACTCCGAAGAGCTTGG
CGTCCCGTTCTTGTAACTATTCCTGAACAATAAAGCAAATAAAAGATTTGACATTTTTTT
TTTTGATTGATTAAAATTCCCTTTAATAAGTAACTTATGAATTTTAGTGAATCCATATGT
CGTTTTTGGTTCTGGTTAGTTTTTAGGTGCTTTTTTTTTGTGTGTGAAAAGTGTATTTCT
TTGTTCTAGATATGTCTCGTTGCAAGTT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES38TF U 1
AF RR2ES38JQ C 1
BS 1 3 RR2ES38JQ
BS 4 201 RR2ES38TF
BS 202 748 RR2ES38JQ

RD RR2ES38TF 201 0 0
GGG
AAGAATCAAAACAGATCAACCAAAACGCTACCCAATCCTTCAGATGATCAACGGAGAGAC
CCAAAGGCAAAATCAATGTCTCTGCAGAAATTCAAGCTTCTCGCCACTCACTGCAGCACC
GTCGCCGAGAGTCCAACGCGCAGCCCCGTCGTCCACCTCCGCCGCCGTAAAACGCTGCGT
TTGCTACTCACGCGTTCA

QA 4 201 4 201
DS 

RD RR2ES38JQ 748 0 0
GGAAAGAATCAGAACAGATCAACCAAAACGCTACCCAATCCTTCAGATGATCAACGGAGA
GACCCAAAGGCAAAATCAATGTCTCTGCAGAAATTCAAGCTTCTCGCCACTCACTGCAGC
ACCGTCGCCGAGAGTCCAACGCGCAGCCCCGTCGTCCACCTCCGCCGCCGTAAAACGCTG
CGTTTGCTACTCACGCGTTCATCAGATCGTTGGCGATCACCGGAGATCCAAAACAACGGC
GAGGAACTGACGGGATCGGATGGTGCCAGGGGATTATCCGGGAAGAGAGATAAGATCCGA
TCTCGGCGGAAGCTGAGAGAGCTTTTCGTCTCTTCGCCTCCGGTGGAGGAAGGCCAACGT
CGTGGCGGCGGCGGCGGCGATGCGAGGAATGGAACGGAGAGGGCGTTAGTACCGGTTAAC
GGCGTTGATACTAACGGAGGTGTTGGAGAAGAGTCAACGGGTCGACGTATGGGCCTTAAC
GGCGCAACGAGGCCCATGTTATCTGGGACACTTCGATGTAGGTTACTCCGAAGAGCTTGG
CGTCCCGTTCTTGTAACTATTCCTGAACAATAAAGCAAATAAAAGATTTGACATTTTTTT
TTTTGATTGATTAAAATTCCCTTTAATAAGTAACTTATGAATTTTAGTGAATCCATATGT
CGTTTTTGGTTCTGGTTAGTTTTTAGGTGCTTTTTTTTTGTGTGTGAAAAGTGTATTTCT
TTGTTCTAGATATGTCTCGTTGCAAGTT

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL4554Contig1 519 2 1 U
GGGACTATCTCTCTCTAAAGATTTGTATATACGTAACAAGAGAAAGAGGAGATCAATAAC
ATGTCTGATTGGGGACCAGTTTTTGTCGCGGTGACGCTTTTCGTGCTGCTAACTCCGGGG
CTGCTGATTCAGATTCCAGGGAGAAATCGAGTAGTTGAGTTTGGAACATTTCAGACAAGT
GGTGTTTCGGTTATTGTTCATACCCTAGTCTACTTCACTCTTGTTTGTATTCTCTTGATC
GCTATCCAAGTTCACATGTATATCGCCTAATCGAATAAAATAAAAAACCTCTCCATTTTT
GTGCTAGCTTTACTTTAGAATTTTATTTCAGTTGAATTGTGTGTCGTAGTCGTTAACATT
TTTATTTGGTACAAGTAACAAAGTGGTCTCAAAGTACTGCAATATTATTTCACTTGACTC
GCGTGTAATTTTTTTTTCTTTTTCAAATGGGATTGTATGTAATTCATATTAACATATGTA
TGTAGAAATGTTAAAGTGATATGATATATGCATCGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2HB48TF U 1
AF RR2HB48JQ C 17
BS 1 519 RR2HB48TF

RD RR2HB48TF 519 0 0
GGGACTATCTCTCTCTAAAGATTTGTATATACGTAACAAGAGAAAGAGGAGATCAATAAC
ATGTCTGATTGGGGACCAGTTTTTGTCGCGGTGACGCTTTTCGTGCTGCTAACTCCGGGG
CTGCTGATTCAGATTCCAGGGAGAAATCGAGTAGTTGAGTTTGGAACATTTCAGACAAGT
GGTGTTTCGGTTATTGTTCATACCCTAGTCTACTTCACTCTTGTTTGTATTCTCTTGATC
GCTATCCAAGTTCACATGTATATCGCCTAATCGAATAAAATAAAAAACCTCTCCATTTTT
GTGCTAGCTTTACTTTAGAATTTTATTTCAGTTGAATTGTGTGTCGTAGTCGTTAACATT
TTTATTTGGTACAAGTAACAAAGTGGTCTCAAAGTACTGCAATATTATTTCACTTGACTC
GCGTGTAATTTTTTTTTCTTTTTCAAATGGGATTGTATGTAATTCATATTAACATATGTA
TGTAGAAATGTTAAAGTGATATGATATATGCATCGTTCT

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2HB48JQ 503 0 0
AAAGATTTGTATATACGTAACAAGAGAAAGAGGAGATCAATAACATGTCTGATTGGGGAC
CAGTTTTTGTCGCGGTGACGCTTTTCGTGCTGCTAACTCCGGGGCTGCTGATTCAGATTC
CAGGGAGAAATCGAGTAGTTGAGTTTGGAACATTTCAGACAAGTGGTGTTTCGGTTATTG
TTCATACCCTAGTCTACTTCACTCTTGTTTGTATTCTCTTGATCGCTATCCAAGTTCACA
TGTATATCGCCTAATCGAATAAAATAAAAAACCTCTCCATTTTTGTGCTAGCTTTACTTT
AGAATTTTATTTCAGTTGAATTGTGTGTCGTAGTCGTTAACATTTTTATTTGGTACAAGT
AACAAAGTGGTCTCAAAGTACTGCAATATTATTTCACTTGACTCGCGTGTAATTTTTTTT
TCTTTTTCAAATGGGATTGTATGTAATTCATATTAACATATGTATGTAGAAATGTTAAAG
TGATATGATATATGCATCGTTCT

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL4555Contig1 708 2 4 U
GATTGCTGATTTGAATAACAAGTGGGCTTCATATGCTGGACCTGGTGGTTGGAATGATCC
GGATATGTTGGAAGTTGGGAACGGAGGGATGACTTACGAGGAGTATCGTGGTCACTTTAG
CATTTGGGCTTTGATGAAGGCACCACTTTTGATCGGTTGTGATGTGAGAAACATGACTGC
TGAGACTTTTGAGATTTTGAGCAATAAGGAGGTTATCGCTGTTAACCAAGACCCACTTGG
TGTTCAAGGAAGGAAAATTCAAGCCTATGGAGAAGATGATTGTCAACAGGTGTGGTCAGG
GCCTTTAACTGGTGACCGTATGGTAGCTGCTCTCTGGAACCGTTGTTCAAACCCTGCAAC
CATTACAGCAACGTGGGATATGATCGGTCTTGAATCTACCGTTAGCGTCTCGGTTAGAGA
CTTGTGGCTGCACAAAGATGTAACAGACAATGCGTCTGTCTCTTTTGAAGCTCAAGTAGA
GGCACACGACTGTCACATGTACATCCTCACTCCCCAGGCGGTGGTATCACTCTCTGATGT
ATAGTCCAAAGGCTGCCACTGTGTTTGTGTACAACTTTTGTTGTGTACTATCTTGTAACA
CATGAAAGCTGTTGTTATTCAGACAACTTTCATAGTGTTCTTTTGTACAAAAAACCTATA
GAACATATGTGTTCATGAAGTTACTAAATAAAGAAATACTTTTGAGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU07JQ C 1
AF RR2CU07TF U 1
BS 1 653 RR2CU07TF
BS 654 654 RR2CU07JQ
BS 655 689 RR2CU07TF
BS 690 708 RR2CU07JQ

RD RR2CU07JQ 708 0 0
GATTGCTGATTTGAATAACAAGTGGGCTTCATATGCTGGACCTGGTGGTTGGAATGATCC
GGATATGTTGGAAGTTGGGAACGGAGGGATGACTTACGAGGAGTATCGTGGTCACTTTAG
CATTTGGGCTTTGATGAAGGCACCACTTTTGATCGGTTGTGATGTGAGAAACATGACTGC
TGAGACTTTTGAGATTTTGAGCAATAAGGAGGTTATCGCTGTTAACCAAGACCCACTTGG
TGTTCAAGGAAGGAAAATTCAAGCCTATGGAGAAGATGATTGTCAACAGGTGTGGTCAGG
GCCTTTAACTGGTGACCGTATGGTAGCTGCTTTCTGGAACCGTTGTTCAAACCCTGCAAC
CATTACAGCAACGTGGGATATGATCGGTCTTGAATCTACCGTTAGCGTCTCGGTTAGAGA
CTTGTGGCTGCACAAAGATGTAACAGACAATGCGTCTGTTTCTTTTGAAGCTCAAGTAGA
GGCACACGACTGTCACATGTACATCCTCACTCCCCAGGCGGTGGTATCACTTTTTGATGT
ATAGTCCAAAGGCTGCCACTGTGTTTGTGTACAACTTTTGTTGTGTACTATCTTGTAACA
CATGAAAGCTGTTGTTATTCAGACAACTTTCATAGTGTTCTTTTGTACAAAAAACCTATA
GAACATATGTGTTCATGAAGTTACTAAATAAAGAAATACTTTTGAGGC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2CU07TF 689 0 0
GATTGCTGATTTGAATAACAAGTGGGCTTCATATGCTGGACCTGGTGGTTGGAATGATCC
GGATATGTTGGAAGTTGGGAACGGAGGGATGACTTACGAGGAGTATCGTGGTCACTTTAG
CATTTGGGCTTTGATGAAGGCACCACTTTTGATCGGTTGTGATGTGAGAAACATGACTGC
TGAGACTTTTGAGATTTTGAGCAATAAGGAGGTTATCGCTGTTAACCAAGACCCACTTGG
TGTTCAAGGAAGGAAAATTCAAGCCTATGGAGAAGATGATTGTCAACAGGTGTGGTCAGG
GCCTTTAACTGGTGACCGTATGGTAGCTGCTCTCTGGAACCGTTGTTCAAACCCTGCAAC
CATTACAGCAACGTGGGATATGATCGGTCTTGAATCTACCGTTAGCGTCTCGGTTAGAGA
CTTGTGGCTGCACAAAGATGTAACAGACAATGCGTCTGTCTCTTTTGAAGCTCAAGTAGA
GGCACACGACTGTCACATGTACATCCTCACTCCCCAGGCGGTGGTATCACTCTCTGATGT
ATAGTCCAAAGGCTGCCACTGTGTTTGTGTACAACTTTTGTTGTGTACTATCTTGTAACA
CATGAAAGCTGTTGTTATTCAGACAACTTTCATAGTGTTCTTTTGTACAAAAA*CCTATA
GAACATATGTGTTCATGAAGTTACTAAAT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL4556Contig1 1252 2 4 U
GGGTGTTACGCGATGACATTCAAGAATTGAAACCAACTTATCTAGCTGGAGTTCCAAGAG
TGTTTGAGAGAATCCATGAGGGTATTCAAAAGGCTCTTCAGGAACTTAACCCTAGAAGGA
GATTTATCTTAAATGCTCTCTACAAACACAAGCTTTCATGGTTGAATCGTGGATACTCGC
ATAGCAAAGCTTCACCCATGGCTGATTTAATTGCTTTCAGAAAGATTAGAGACAAATTGG
GAGGTCGAATCCGGTTGCTAATATCTGGAGGAGCACCTTTGAGCCCTGAGATTGAAGAGT
TCTTGAGAGTTACTTGTTGTTGCTTTGTCCTCCAAGGCTACGGTCTGACGGAGACGCTTG
GAGGAACGGCTTTGTGTATCCCAGATGAGATGTGTATGCTAGGGACAGTCGGTATACCGG
CGGTTTACAATGAGATACGGCTTGAGGAGGTGGCTGAAATGGGCTACGACCCACTCGGTG
AAAATCCCGCAGGCGAGATCTGTATAAGAGGAAAATGTTTGTTTTCTGGTTATTACAAGA
ACCCTGAGCTTACTGATGAAGTCTTGAAAGACGGATGGTTCCATACAGGAGATATAGGTG
AGATTCAGCCAAATGGAGTACTCAAGATCATTGATCGTAAAAAGAATTTGATTAAACTTT
CTCAAGGAGAGTACGTTGCTCTTGAGAATTTGGAAAACATCTACGGGCAAAACTCTGTAG
TACAAGATATATGGGTCTATGGAGACAGCTTCAAATCAATGCTTGTCGCGGTGATTGTTC
CAAACCCTGAAGTCGTGAACCGGTGGGCTAAAGATCTCGGTTTTAATAAACCATTCGAAG
AACTCTGTTCTCTCTCTGAGTTACAAGAACACATCATTTTAGAACTGAAGTCCACGGCAG
AGAAGAACAAGCTAAAAAGGTTCGAGTACATCAAAGCAGTGACGGTGGAGATAAAACCTT
TCGACTTAGAGAGAGACTTGGTGACTGCGACGCTCAAGAATAAGAGGAACAATCTTCTCA
AGTATTATCAGGTACAAGTCGACGAGATGTACAGAAAATTGGCGTCCAAAAATCTGAAAG
TACTGAGATGATGTGTGTGTCCTAATATTGATAATTATGTTATATATATGTATCAATAAT
TGATCAAAATGAGCCTTATGCTCTCTGTAATGTTGTGTTTCTGTTCTATGTTGAATGACG
ATCACTTGCATCATAATTATTAGTATTTAATACTATTTATTTTTTCTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT80TF U 1
AF RR2AT80JQ C 341
BS 1 802 RR2AT80TF
BS 803 803 RR2AT80JQ
BS 804 823 RR2AT80TF
BS 824 1252 RR2AT80JQ

RD RR2AT80TF 826 0 0
GGGTGTTACGCGATGACATTCAAGAATTGAAACCAACTTATCTAGCTGGAGTTCCAAGAG
TGTTTGAGAGAATCCATGAGGGTATTCAAAAGGCTCTTCAGGAACTTAACCCTAGAAGGA
GATTTATCTTAAATGCTCTCTACAAACACAAGCTTTCATGGTTGAATCGTGGATACTCGC
ATAGCAAAGCTTCACCCATGGCTGATTTAATTGCTTTCAGAAAGATTAGAGACAAATTGG
GAGGTCGAATCCGGTTGCTAATATCTGGAGGAGCACCTTTGAGCCCTGAGATTGAAGAGT
TCTTGAGAGTTACTTGTTGTTGCTTTGTCCTCCAAGGCTACGGTCTGACGGAGACGCTTG
GAGGAACGGCTTTGTGTATCCCAGATGAGATGTGTATGCTAGGGACAGTCGGTATACCGG
CGGTTTACAATGAGATACGGCTTGAGGAGGTGGCTGAAATGGGCTACGACCCACTCGGTG
AAAATCCCGCAGGCGAGATCTGTATAAGAGGAAAATGTTTGTTTTCTGGTTATTACAAGA
ACCCTGAGCTTACTGATGAAGTCTTGAAAGACGGATGGTTCCATACAGGAGATATAGGTG
AGATTCAGCCAAATGGAGTACTCAAGATCATTGATCGTAAAAAGAATTTGATTAAACTTT
CTCAAGGAGAGTACGTTGCTCTTGAGAATTTGGAAAACATCTACGGGCAAAACTCTGTAG
TACAAGATATATGGGTCTATGGAGACAGCTTCAAATCAATGCTTGTCGCGGTGATTGTTC
CAAACCCTGAAGTCGTGAACCG*TGGGCTAAAGATCTCGGTTT
AAT

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR2AT80JQ 912 0 0
CGGTCTGACGGAGACGCTTGGAGGAACGGCTTTGTGT*TCCCAGATGAGATGTGTATGCT
AGGGACAGTCGGTATACCGGCGGTTTACAATGAGATACGGCTTGAGGAGGTGGCTGAAAT
GGGCTACGACCCACTCGGTGAAAATCCCGCAGGCGAGATCTGTATAAGAGGAAAATGTTT
GTTTTCTGGTTATTACAAGAACCCTGAGCTTACTGATGAAGTCTTGAAAGACGGATGGTT
CCATACAGGAGATATAGGTGAGATTCAGCCAAATGGAGTACTCAAGATCATTGATCGTAA
AAAGAATTTGATTAAACTTTCTCAAGGAGAGTACGTTGCTCTTGAGAATTTGGAAAACAT
CTACGGGCAAAACTCTGTAGTACAAGATATATGGGTCTATGGAGACAGCTTCAAATCAAT
GCTTGTCGCGGTGATTGTTCCAAACCCTGAAGTCGTGAACCGGTGGGCTAAAGATCTCGG
TTTTAATAAACCATTCGAAGAACTCTGTTCTCTCTCTGAGTTACAAGAACACATCATTTT
AGAACTGAAGTCCACGGCAGAGAAGAACAAGCTAAAAAGGTTCGAGTACATCAAAGCAGT
GACGGTGGAGATAAAACCTTTCGACTTAGAGAGAGACTTGGTGACTGCGACGCTCAAGAA
TAAGAGGAACAATCTTCTCAAGTATTATCAGGTACAAGTCGACGAGATGTACAGAAAATT
GGCGTCCAAAAATCTGAAAGTACTGAGATGATGTGTGTGTCCTAATATTGATAATTATGT
TATATATATGTATCAATAATTGATCAAAATGAGCCTTATGCTCTCTGTAATGTTGTGTTT
CTGTTCTATGTTGAATGACGATCACTTGCATCATAATTATTAGTATTTAATACTATTTAT
TTTTTCTTTTCC

QA 1 912 1 912
DS 



AS 1 2

CO CL4557Contig1 989 2 10 U
GTCAGTACTCTTCTCTCTACTCAATTCTTCTTCCTGGTAAAAGCCCATACCTGCCCTTTG
TGATATCATGGGTCATGAATGTCTCGATGCATCAAAGGAGTTCAAGTGGGGTGAGGACGT
CAACGTTAAAAGTGAAGTGACTGAAATTGTTCTTGTTCGTCATGGAGAAACCACATGGAA
TGCTGCTGGAAGAATCCAGGGACAAATTGAATCGGATCTTAACGAAATTGGACAAAAGCA
GGCTGTTGCAATCGCTGAGAGACTGGGAAAAGAGGAGAGACCCATAGCTATATATTCATC
AGACCTCAAGCGAGCCAAAGACACTGCTCTCAAGATCGCGGAAACATGTTTTTGTTCCAA
GGTGACTGAAGTACCTGAATTAAAAGAGAGGCATGTGGGTAGTCTTCAAGGGCTATATTG
GAAAGAAGGAGCAGAGAAAGAACCTGAAGCTTACTCTGCTTTCTTTTCTTCCCAAAATGA
CCTCGAGATTCCTGGAGGAGGAGAGAGCTTTGACCAACTTTGTGAGAGATCCATGAATGC
CCTTGAGCAAATTGCAAAGAAGCACAAAGGAGAGAGAGTGATAGTAGTGACTCATGGGGG
AGTTTTGAGGGCAATTTACATGAGCATCACACAAGCTTCCTCTGCTGGGAAACTCCTTAA
TGCTTCTGTGAATGTTGTTCGCTTCAATGACGAGAAATGGATCATCGATTCATGGAGCGA
TGTTTCGCATCTCTCATCCGTTGGATTCCTCCAACGTGGCTTTGATGGAGATGCCAAGCC
CTAGAGAACCATTACCCATTCTGTGGATCTCCTTCATAAATAATATTATGTGTACTTATT
TGATGTTTCATTCTGTGTATGTGTTTTAAGATAAGAAGTGTTTCCATTTGCGAGATCGAT
GTTCTCGTGAAAGGTTTTCTATCTTGTATTTTGCATTAAGCGATTAATAAGCTCTTTATT
TAAGACTCTTCTAAAGATCAAATTACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG33TF U 1
AF RR2FG33JQ C 226
BS 1 746 RR2FG33TF
BS 747 747 RR2FG33JQ
BS 748 753 RR2FG33TF
BS 754 754 RR2FG33JQ
BS 755 776 RR2FG33TF
BS 777 777 RR2FG33JQ
BS 778 787 RR2FG33TF
BS 788 788 RR2FG33JQ
BS 789 808 RR2FG33TF
BS 809 989 RR2FG33JQ

RD RR2FG33TF 808 0 0
GTCAGTACTCTTCTCTCTACTCAATTCTTCTTCCTGGTAAAAGCCCATACCTGCCCTTTG
TGATATCATGGGTCATGAATGTCTCGATGCATCAAAGGAGTTCAAGTGGGGTGAGGACGT
CAACGTTAAAAGTGAAGTGACTGAAATTGTTCTTGTTCGTCATGGAGAAACCACATGGAA
TGCTGCTGGAAGAATCCAGGGACAAATTGAATCGGATCTTAACGAAATTGGACAAAAGCA
GGCTGTTGCAATCGCTGAGAGACTGGGAAAAGAGGAGAGACCCATAGCTATATATTCATC
AGACCTCAAGCGAGCCAAAGACACTGCTCTCAAGATCGCGGAAACATGTTTTTGTTCCAA
GGTGACTGAAGTACCTGAATTAAAAGAGAGGCATGTGGGTAGTCTTCAAGGGCTATATTG
GAAAGAAGGAGCAGAGAAAGAACCTGAAGCTTACTCTGCTTTCTTTTCTTCCCAAAATGA
CCTCGAGATTCCTGGAGGAGGAGAGAGCTTTGACCAACTTTGTGAGAGATCCATGAATGC
CCTTGAGCAAATTGCAAAGAAGCACAAAGGAGAGAGAGTGATAGTAGTGACTCATGGGGG
AGTTTTGAGGGCAATTTACATGAGCATCACACAAGCTTCCTCTGCTGGGAAACTCCTTAA
TGCTTCTGTGAATGTTGTTCGCTTCAATGACGAGAAATGGATCATCGATTCATGGAGCGA
TGTTTCGCATCTCTCATCCGTTGGAT*CCTCCA*CGTGGCTTTGATGGAGATGCCA*GCC
CTAGAGA*CCATTACCCATTCTGTGGAT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2FG33JQ 764 0 0
AATTGGACAAAAGCAGGCTGTTGCAATCGCTGAGAGACTGGGAAAAGAGGAGAGACCCAT
AGCTATATATTCATCAGACCTCAAGCGAGCCAAAGACACTGCTCTCAAGATCGCGGAAAC
ATGTTTTTGTTCCAAGGTGACTGAAGTACCTGAATTAAAAGAGAGGCATGTGGGTAGTCT
TCAAGGGCTATATTGGAAAGAAGGAGCAGAGAAAGAACCTGAAGCTTATTCTGCTTTCTT
TTCTTCCCAAAATGACCTCGAGATTCCTGGAGGAGGAGAGAGCTTTGACCAACTTTGTGA
GAGATCCATGAATGCCCTTGAGCAAATTGCAAAGAAGCACAAAGGAGAGAGAGTGATAGT
AGTGACTCATGGGGGAGTTTTGAGGGCAATTTACATGAGCATCACACAAGCTTCCTCTGC
TGGGAAACTCCTTAATGCTTCTGTGAATGTTGTTCGCTTCAATGACGAGAAATGGATCAT
CGATTCATGGAGCGATGTTTCGCATCTCTCATCCGTTGGATTCCTCCAACGTGGCTTTGA
TGGAGATGCCAAGCCCTAGAGAACCATTACCCATTCTGTGGATCTCCTTCATAAATAATA
TTATGTGTACTTATTTGATGTTTCATTCTGTGTATGTGTTTTAAGATAAGAAGTGTTTCC
ATTTGCGAGATCGATGTTCTCGTGAAAGGTTTTCTATCTTGTATTTTGCATTAAGCGATT
AATAAGCTCTTTATTTAAGACTCTTCTAAAGATCAAATTACTAC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL4558Contig1 1194 2 2 U
GGCCTTTCCTCTTTTCTTCGTCTCCCACCATTTCTGAGACGACGACCCCCCAGAAGATAA
AAAAAGAGCTTCCTTGTTGGAGATCTAGACGAGGAAGATCACTTATTTTCCCTCTGGATC
TCCAGAGAGTAGGAGAAACGAGAGACATCAGGTTCAGGTGAAGAAGGAGGAGGGAAGAGG
CAATGGCGGGTAGGTATTGGTGTGTGTGTTCACAAGCTGTGGATCCTATCATTGACGCAG
CGGAGATCAAATGTCCCTATTGCCAAAGCGGGTTCGTTGAGGAAATGAGCGAAGAGATTA
ATGGTGGTGGCAGCAGCTTACGAGAGGTTCAAAACCAAGAGATTGACTTCGGCACGGACC
GTGCCCTGTCTTTATGGGGTCCAATCTTGGTTGGAATGATGAGTAATCCTAGGAGACGTA
GAAGGTTTCGGAGGACAGAGTTTGGTCTTGATACTGATGAGGTCAATGGTGGAAATGACA
TCAGCACTGTCGACAATCCTCATCACAATCGTCGTCATCGCCACAGGGAACATGATGGAG
AGATTGATTTAGGCAGGGAGGTTGATTCCATCATCAGGAGGAGAAGGAGAAGCTCGGCTG
CGATATTGCAGTTGCTTCAAGGCATTCGTGAAGGGATTAACTCAGATCACGAGAGCTCAG
ACGGGAACACTGCTTCTCGCTCTGCCATTGGAGATTACTTGGCTCGGCCGGAGTTTGACA
GCTTGCTTCGAAATCTAGCTGACAACGATCTGATAAGGCGACAAGGGACACTTCCAGCGC
GGAAGGAAGCGGTGGAGAATCTCCCAACGGTTAAAGTATGCGAGCCGTTGCAGTGTTCGG
TTTGTTTGGAGGACTTTGAGAAAGGAAGTGAAGCTAAAGAGATGCCGTGTAAGCACAAGT
TTCATAGCCAGTGTATAGTACCGTGGCTTGAGCTTCACAGTTCGTGTCCCGTGTGCCGAT
ATGAACTACCTCCTGATGATGAGGTAAAGACTGATCTGGTGAGACCGACGACAAGAAGTG
TAGGGGTCAACTTGAGTAATGAGAATGTGGAAGAGAATGCAAGGAACATTAGTGGGAGCG
AGAGAAGGTTTTCGTTGCCGTGGCCGTTGAGTGGATTGTTCTCTTCCTCCTCTTCGTCAT
CAGGATCAACATCAGGGTCGTCTCAGCTCAATGAGAACTCAAGTTAAGGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B823TF U 1
AF RR2B823JQ C 308
BS 1 781 RR2B823TF
BS 782 1194 RR2B823JQ

RD RR2B823TF 781 0 0
GGCCTTTCCTCTTTTCTTCGTCTCCCACCATTTCTGAGACGACGACCCCCCAGAAGATAA
AAAAAGAGCTTCCTTGTTGGAGATCTAGACGAGGAAGATCACTTATTTTCCCTCTGGATC
TCCAGAGAGTAGGAGAAACGAGAGACATCAGGTTCAGGTGAAGAAGGAGGAGGGAAGAGG
CAATGGCGGGTAGGTATTGGTGTGTGTGTTCACAAGCTGTGGATCCTATCATTGACGCAG
CGGAGATCAAATGTCCCTATTGCCAAAGCGGGTTCGTTGAGGAAATGAGCGAAGAGATTA
ATGGTGGTGGCAGCAGCTTACGAGAGGTTCAAAACCAAGAGATTGACTTCGGCACGGACC
GTGCCCTGTCTTTATGGGGTCCAATCTTGGTTGGAATGATGAGTAATCCTAGGAGACGTA
GAAGGTTTCGGAGGACAGAGTTTGGTCTTGATACTGATGAGGTCAATGGTGGAAATGACA
TCAGCACTGTCGACAATCCTCATCACAATCGTCGTCATCGCCACAGGGAACATGATGGAG
AGATTGATTTAGGCAGGGAGGTTGATTCCATCATCAGGAGGAGAAGGAGAAGCTCGGCTG
CGATATTGCAGTTGCTTCAAGGCATTCGTGAAGGGATTAACTCAGATCACGAGAGCTCAG
ACGGGAACACTGCTTCTCGCTCTGCCATTGGAGATTACTTGGCTCGGCCGGAGTTTGACA
GCTTGCTTCGAAATCTAGCTGACAACGATCTGATAAGGCGACAAGGGACACTTCCAGCGC
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2B823JQ 887 0 0
TGGCAGCAGCTTACGAGAGGTTCAAAACCAAGAGATTGACTTCGGCACGGACCGTGCCCT
GTCTTTATGGGGTCCAATCTTGGTTGGAATGATGAGTAATCCTAGGAGACGTAGAAGGTT
TCGGAGGACAGAGTTTGGTCTTGATACTGATGAGGTCAATGGTGGAAATGACATCAGCAC
TGTCGACAATCCTCATCACAATCGTCGTCATCGCCACAGGGAACATGATGGAGAGATTGA
TTTAGGCAGGGAGGTTGATTCCATCATCAGGAGGAGAAGGAGAAGCTCGGCTGCGATATT
GCAGTTGCTTCAAGGCATTCGTGAAGGGATTAACTCAGATCACGAGAGCTCAGACGGGAA
CACTGCTTCTCGCTCTGCCATTGGAGATTACTTGGCTCGGCCGGAGTTTGACAGCTTGCT
TCGAAATCTAGCTGACAACGATCTGATAAGGCGACAAGGGACACTTCCAGCGCGGAAGGA
AGCGGTGGAGAATCTCCCAACGGTTAAAGTATGCGAGCCGTTGCAGTGTTCGGTTTGTTT
GGAGGACTTTGAGAAAGGAAGTGAAGCTAAAGAGATGCCGTGTAAGCACAAGTTTCATAG
CCAGTGTATAGTACCGTGGCTTGAGCTTCACAGTTCGTGTCCCGTGTGCCGATATGAACT
ACCTCCTGATGATGAGGTAAAGACTGATCTGGTGAGACCGACGACAAGAAGTGTAGGGGT
CAACTTGAGTAATGAGAATGTGGAAGAGAATGCAAGGAACATTAGTGGGAGCGAGAGAAG
GTTTTCGTTGCCGTGGCCGTTGAGTGGATTGTTCTCTTCCTCCTCTTCGTCATCAGGATC
AACATCAGGGTCGTCTCAGCTCAATGAGAACTCAAGTTAAGGATTCC

QA 1 887 1 887
DS 



AS 1 2

CO CL4559Contig1 741 2 1 U
CGTGTGCATTTTCATTGCACAGATGGAATATTGATTGAACTTAATATAAAATTATTACAA
AGGAGATAAACAAAAGTTTTAAAAAAAAAAAAGCTTTCATTTGTATTCTCTGTCTCCTTT
ACCCAAGGATTAAAGTTTTCGTTTTTTTTTCTGCAAAAATCAAACGTCTATGAGCTGATG
GTACACCTTTTTGGTTACTTAGTGTTGTGTGTTGGGACACTAAGATAGAACTTAGTGTTC
TTGAAGTCATCTAGTAACGGGTTGTATCCGTCCTTTGTCCTCGTCTTTGAAGGTAAACCA
AACTCATCCATGAACGCTGATGTATCCAGAGTGAGAGTTCGCCTTTTCCTTCCTTTTTTC
GACGGTGTCCCGTCTTTTTCCGTCTTCCTCCACCCAGAACAATAATGATCCATTCGTTCC
AAAAGCCAGAAATCGGTTGGGAAAAATATATCAGCATCACCCTTTGCGTCTAGATAACTA
CTGTAATCTGAGCTACTTCCATCTTTCTTTGTTGAAACCAATAGGGCTCTTTCACCAGGA
ACTTTCACATCGGGCAAGAAGCTAAAGTCCGAAGCGATTAGGGACATCTTTGGCAGCTTT
TCATGTAAAACCTCCAGCAGTTTCAAACAACCTGTTGGAAGCCAACAACGTCTAGGTTTA
GGAAACAGTTTAGACCAGATTTCTTTAGGTTTTGAAACCGGAGGAGCTTCTTGTTCAACA
ATGTCAATGCAGCGCTTGATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW69JQ U 1
AF RR2G742JQ U 1
BS 1 741 RR2G742JQ

RD RR2GW69JQ 699 0 0
CGTGTGCATTTTCATTGCACAGATGGAATATTGATTGAACTTAATATAAAATTATTACAA
AGGAGATAAACAAAAGTTTTAAAAAAAAAAAAGCTTTCATTTGTATTCTCTGTCTCCTTT
ACCCAAGGATTAAAGTTTTCGTTTTTTTTTCTGCAAAAATCAAACGTCTATGAGCTGATG
GTACACCTTTTTGGTTACTTAGTGTTGTGTGTTGGGACACTAAGATAGAACTTAGTGTTC
TTGAAGTCATCTAGTAACGGGTTGTATCCGTCCTTTGTCCTCGTCTTTGAAGGTAAACCA
AACTCATCCATGAACGCTGATGTATCCAGAGTGAGAGTTCGCCTTTTCCTTCCTTTTTTC
GACGGTGTCCCGTCTTTTTCCGTCTTCCTCCACCCAGAACAATAATGATCCATTCGTTCC
AAAAGCCAGAAATCGGTTGGGAAAAATATATCAGCATCACCCTTTGCGTCTAGATAACTA
CTGTAATCTGAGCTACTTCCATCTTTCTTTGTTGAAACCAATAGGGCTCTTTCACCAGGA
ACTTTCACATCGGGCAAGAAGCTAAAGTCCGAAGCGATTAGGGACATCTTTGGCAGCTTT
TCATGTAAAACCTCCAGCAGTTTCAAACAACCTGTTGGAAGCCAACAACGTCTAGGTTTA
GGAAACAGTTTAGACCAGATTTCTTTAG*TTTTGAAACC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2G742JQ 741 0 0
CGTGTGCATTTTCATTGCACAGATGGAATATTGATTGAACTTAATATAAAATTATTACAA
AGGAGATAAACAAAAGTTTTAAAAAAAAAAAAGCTTTCATTTGTATTCTCTGTCTCCTTT
ACCCAAGGATTAAAGTTTTCGTTTTTTTTTCTGCAAAAATCAAACGTCTATGAGCTGATG
GTACACCTTTTTGGTTACTTAGTGTTGTGTGTTGGGACACTAAGATAGAACTTAGTGTTC
TTGAAGTCATCTAGTAACGGGTTGTATCCGTCCTTTGTCCTCGTCTTTGAAGGTAAACCA
AACTCATCCATGAACGCTGATGTATCCAGAGTGAGAGTTCGCCTTTTCCTTCCTTTTTTC
GACGGTGTCCCGTCTTTTTCCGTCTTCCTCCACCCAGAACAATAATGATCCATTCGTTCC
AAAAGCCAGAAATCGGTTGGGAAAAATATATCAGCATCACCCTTTGCGTCTAGATAACTA
CTGTAATCTGAGCTACTTCCATCTTTCTTTGTTGAAACCAATAGGGCTCTTTCACCAGGA
ACTTTCACATCGGGCAAGAAGCTAAAGTCCGAAGCGATTAGGGACATCTTTGGCAGCTTT
TCATGTAAAACCTCCAGCAGTTTCAAACAACCTGTTGGAAGCCAACAACGTCTAGGTTTA
GGAAACAGTTTAGACCAGATTTCTTTAGGTTTTGAAACCGGAGGAGCTTCTTGTTCAACA
ATGTCAATGCAGCGCTTGATC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL4560Contig1 1303 2 2 U
GTCGACTCGACTCGTTGGGTCTCTATATGGGGAGCCCGATTTAGGGTTTCATCCATTAAT
CCATCGATTCACCATCTCATCTCCCCCTCAAAGCTCCAACACTTTCTCCGTTTGGGTTTT
AAAGTTAAGACCATGCCTAAAGAGAGGAAACAACGCTCTGTATCTCATGAAAGGCTTAGA
GGATCGCCTATGTATTGTGAATCAAGCCGTGCTCTGAAGCCTAGTGAGAAGCAAGTTAAG
GAATGGGAAGAAGCTAGATGTCCTGTCTGTATGGAACATCCTCACAACGGAATCCTTCTC
GTTTGTTCTTCCTATGATAACGGCTGCAGGCCTTACATGTGTGACACTAGCCACCGGCAT
TCCAACTGTTTCGATCAGTACCGCAAAGCTTCTAAACAGACTGAAGGTGCAGCAGTAGCT
TCAGCTTCTGAGGTGAATCCGAGAGAGGCTGAAGGCGTTGTGGCAACAGAGGCGGATCAA
GAGAAAGGCAAACCGAAGCTTACTTGCCCGTTATGCCGTGGAGATATTAAAGAATGGGTA
GTTGTTGAGCCTGCTCGATGTTTCATGAACGCAAAACATAGAAGCTGTTCTTCCGAGACT
TGTGAGTTCAGCGGAACCTCTGACCTGAGAAAGCACGCGAGGTTGCTGCATCCAGGAGTG
AGGCCATCAGAGGCAGATCCGGAGAGGCAGAGAAGCTGGAGGAGGCTAGAAAGGCAGAGA
GACTTGGGTGATTTGCTTAGCACACTGCAGTCTTCTTTTGGAGTAGGAGGAGAAGAAAGA
AGCAGCAGCAGCAACGAAGATGGGATCATGTCGTTTGATGATGGTGGTTGGCTTACAGTG
TTCTTCCTCATCCGCGTGTTTAGGCCAGAGTCAAGTGGTGGGGCAAGGAGTAGTAGTAGC
AGCTGGTCAGGTACGTCTAGAGCTAGGTCACATATAGGTGTGAGGAGAAGATCTTCAAGG
CTTTGGGGAGAGAGCTATGAAGGTGGTGATACAGGAACACCAGCAGCTAGAGATGGAGAG
AACAATAATCAGTCTTCTGATGGACAAGAGTCTGGAACTCAAAGACGCCGTGTCAGAAGA
AGATATTACATTGAGGATGATGATGATGATGAAGAGGCGTGATGGCTCTCTCTCTCAAAA
CGTACAATTTGGGTTTTTAACTTTATGAAACAAAATATTGGGGGAAACTTTGTATTAATA
ACCCCCAACTCGTTAAAACCTATTCTGCAAAATTTCTTTGCAGATTGAAAAATGTTTCTA
TTGAGAAACAAAATGCTACAAAATAATTTAATACCCTTTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX63TF U 1
AF RR2GX63JQ C 522
BS 1 709 RR2GX63TF
BS 710 1303 RR2GX63JQ

RD RR2GX63TF 709 0 0
GTCGACTCGACTCGTTGGGTCTCTATATGGGGAGCCCGATTTAGGGTTTCATCCATTAAT
CCATCGATTCACCATCTCATCTCCCCCTCAAAGCTCCAACACTTTCTCCGTTTGGGTTTT
AAAGTTAAGACCATGCCTAAAGAGAGGAAACAACGCTCTGTATCTCATGAAAGGCTTAGA
GGATCGCCTATGTATTGTGAATCAAGCCGTGCTCTGAAGCCTAGTGAGAAGCAAGTTAAG
GAATGGGAAGAAGCTAGATGTCCTGTCTGTATGGAACATCCTCACAACGGAATCCTTCTC
GTTTGTTCTTCCTATGATAACGGCTGCAGGCCTTACATGTGTGACACTAGCCACCGGCAT
TCCAACTGTTTCGATCAGTACCGCAAAGCTTCTAAACAGACTGAAGGTGCAGCAGTAGCT
TCAGCTTCTGAGGTGAATCCGAGAGAGGCTGAAGGCGTTGTGGCAACAGAGGCGGATCAA
GAGAAAGGCAAACCGAAGCTTACTTGCCCGTTATGCCGTGGAGATATTAAAGAATGGGTA
GTTGTTGAGCCTGCTCGATGTTTCATGAACGCAAAACATAGAAGCTGTTCTTCCGAGACT
TGTGAGTTCAGCGGAACCTCTGACCTGAGAAAGCACGCGAGGTTGCTGCATCCAGGAGTG
AGGCCATCAGAGGCAGATCCGGAGAGGCAGAGAAGCTGGAGGAGGCTAG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2GX63JQ 782 0 0
AGATATTAAAGAATGGGTAGTTGTTGAGCCTGCTCGATGTTTCATGAACGCAAAACATAG
AAGCTGTTCTTCCGAGACTTGTGAGTTCAGCGGAACCTCTGACCTGAGAAAGCACGCGAG
GTTGCTGCATCCAGGAGTGAGGCCATCAGAGGCAGATCCGGAGAGGCAGAGAAGCTGGAG
GAGGCTAGAAAGGCAGAGAGACTTGGGTGATTTGCTTAGCACACTGCAGTCTTCTTTTGG
AGTAGGAGGAGAAGAAAGAAGCAGCAGCAGCAACGAAGATGGGATCATGTCGTTTGATGA
TGGTGGTTGGCTTACAGTGTTCTTCCTCATCCGCGTGTTTAGGCCAGAGTCAAGTGGTGG
GGCAAGGAGTAGTAGTAGCAGCTGGTCAGGTACGTCTAGAGCTAGGTCACATATAGGTGT
GAGGAGAAGATCTTCAAGGCTTTGGGGAGAGAGCTATGAAGGTGGTGATACAGGAACACC
AGCAGCTAGAGATGGAGAGAACAATAATCAGTCTTCTGATGGACAAGAGTCTGGAACTCA
AAGACGCCGTGTCAGAAGAAGATATTACATTGAGGATGATGATGATGATGAAGAGGCGTG
ATGGCTCTCTCTCTCAAAACGTACAATTTGGGTTTTTAACTTTATGAAACAAAATATTGG
GGGAAACTTTGTATTAATAACCCCCAACTCGTTAAAACCTATTCTGCAAAATTTCTTTGC
AGATTGAAAAATGTTTCTATTGAGAAACAAAATGCTACAAAATAATTTAATACCCTTTTA
CT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL4561Contig1 980 2 4 U
GGAACACATTCGAAAACAAAATTCAATCGGGAGAAGATGTCTATAATCAAGAAGCTTACC
AATCGGGATTGGGTAAAAAGGGCTGAACCGAAGTTATCAGATACTCCAAGAAACTATGAG
GCCAGTCCCAAAGACGCCAAGGTTCCAATCTCTCCCTCCACTGCACAGCTACGTTCTGAT
GTCCCGAAGCCCACGAATCTGAACAATGGACACATCGAGTCTCGGGTGGACGAGAAAAAC
AGCAACTTCATGCTCTATCCAAGGAACCTCTCGATCACTTGGTCGGATGACCCCAACTAT
TGGACTTGGTTTCTCAACAAGGAGTCACCAAATGAGGCAGGTGTAGAAGCTGTGGCGTTG
AAAAACGTGTGTTGGCTCGACATCACGGGAAAATTCGACACGAAGAATCTCACTCCAGGT
ATTACGTACGAGGTAGTCTTTAAGGTGAAACTAGAGGATCCGGCCTATGGATGGGACACT
CCGGTGAACATTAAACTAGTGTTGCCTAACGGTAACCACAAACTGCAGGAGCAAAAGGTG
AGTTTAAGGGAAATACCAAGGTATCAATGGGTCGATATTATAGTCGGAGAATTCAAGCCC
GAGAAAAATTCCGCCGGTGAAATCACTTTCTCAATGTATGAGCATGAGAGTGGCCTTTGG
AAGAAAGGGCTCTTCCTCAAAGGTGTTGACATTTGTCCCAAATATATAAATTAATATGGG
AATATAAATTTCCAAATGCACCACCACTGAAACTTTATATATATATTACATCATGACATA
TCTGTATGGAACGAGTGTGTGCATATATACGATAAGGTTGATCTATGGTATTATTACTTT
AGACACCTATTTTGATGTTGGTACTGAATAAAACCAAAACCGAGAGTTAGTGTACTAATG
TTTTAAGTTTGAATTCGAGTTTTATGATTTGAGTGTATGTATGTAATAAATAATCCCATT
AATGAAAATTTGTTTGTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP92TF U 1
AF RR2EP92JQ C 275
BS 1 682 RR2EP92TF
BS 683 683 RR2EP92JQ
BS 684 753 RR2EP92TF
BS 754 980 RR2EP92JQ

RD RR2EP92TF 753 0 0
GGAACACATTCGAAAACAAAATTCAATCGGGAGAAGATGTCTATAATCAAGAAGCTTACC
AATCGGGATTGGGTAAAAAGGGCTGAACCGAAGTTATCAGATACTCCAAGAAACTATGAG
GCCAGTCCCAAAGACGCCAAGGTTCCAATCTCTCCCTCCACTGCACAGCTACGTTCTGAT
GTCCCGAAGCCCACGAATCTGAACAATGGACACATCGAGTCTCGGGTGGACGAGAAAAAC
AGCAACTTCATGCTCTATCCAAGGAACCTCTCGATCACTTGGTCGGATGACCCCAACTAT
TGGACTTGGTTTCTCAACAAGGAGTCACCAAATGAGGCAGGTGTAGAAGCTGTGGCGTTG
AAAAACGTGTGTTGGCTCGACATCACGGGAAAATTCGACACGAAGAATCTCACTCCAGGT
ATTACGTACGAGGTAGTCTTTAAGGTGAAACTAGAGGATCCGGCCTATGGATGGGACACT
CCGGTGAACATTAAACTAGTGTTGCCTAACGGTAACCACAAACTGCAGGAGCAAAAGGTG
AGTTTAAGGGAAATACCAAGGTATCAATGGGTCGATATTATAGTCGGAGAATTCAAGCCC
GAGAAAAATTCCGCCGGTGAAATCACTTTCTCAATGTATGAGCATGAGAGTGGCCTTTGG
AAGAAAGGGCTCTTCCTCAAAG*TGTTGACATTTGTCCCAAATATATAAATTAATATGGG
AATATAAATTTCCAAATGCACCACCACTGAAAC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2EP92JQ 706 0 0
TCACTTGGTCGGATGACCCCAACTATTGGACTTGGTTTCTCAACAAGGAGTCACCAAATG
AGGCAGGTGTAGAAGCTGTGGCGTTGAAAAACGTGTGTTGGCTCGACATCACGGGAAAAT
TCGACACGAAGAATCTCACTCCAGGTATTACGTACGAGGTAGTCTTTAAGGTGAAACTAG
AGGATCCGGCCTATGGATGGGACACTCCGGTGAACATTAAACTAGTGTTGCCTAACGGTA
ACCACAAACTGCAGGAGCAAAAGGTGAGTTTAAGGGAAATACCAAGGTATCAATGGGTCG
ATATTATAGTCGGAGAATTCAAGCCCGAGAAAAATTCCGCCGGTGAAATCACTTTCTCAA
TGTATGAGCATGAGAGTGGCCTTTGGAAGAAAGGGCTCTTCCTCAAAGGTGTTGACATTT
GTCCCAAATATATAAATTAATATGGGAATATAAATTTCCAAATGCACCACCACTGAAACT
TTATATATATATTACATCATGACATATCTGTATGGAACGAGTGTGTGCATATATACGATA
AGGTTGATCTATGGTATTATTACTTTAGACACCTATTTTGATGTTGGTACTGAATAAAAC
CAAAACCGAGAGTTAGTGTACTAATGTTTTAAGTTTGAATTCGAGTTTTATGATTTGAGT
GTATGTATGTAATAAATAATCCCATTAATGAAAATTTGTTTGTATG

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL4562Contig1 474 2 1 U
GGCAGCGGTGGAGCAGTTTCAGCAGCGATCAAGGCTAGATGCGAAATGGAAATAGACCGC
ATTGAGAAACAATTTGAAGACTGCATAGCTTTCCTCCTTAGAGTACTGTCTTCGAAGCTG
AATGTGGGACACTTTCCTCATTTGGCTGATTTAGTAACCAGGATCAATTACAATTATCAC
TACATGTCCGACACTGGAAGCTTGATGACTGTTTCTGGAGCTGAGACCAGCTCATCCAGC
ACCTGAACTGCCCAAATATGAGACCGGGGGGATGGTCTCAGGCTTTTCTTGAGTTCTTTC
ATAGTAGTAGCTTTCAAAGTTTTTAAAATAGATATGATTCTAAGATGTAGGTGGATGCAG
TATTAGCTCAAGACATTTCCAGTTTGTATATGTTTTATGTGCTTGTGATGTTTGAAACTC
AAAAAAGTATGTAAAAGGTGCTGAGGCAAAAGAAAAGAAGAAAAGTTATAATGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AS18JQ C 1
AF RR2AS18TF U 1
BS 1 474 RR2AS18TF

RD RR2AS18JQ 474 0 0
GGCAGCGGTGGAGCAGTTTCAGCAGCGATCAAGGCTAGATGCGAAATGGAAATAGACCGC
ATTGAGAAACAATTTGAAGACTGCATAGCTTTCCTCCTTAGAGTACTGTCTTCGAAGCTG
AATGTGGGACACTTTCCTCATTTGGCTGATTTAGTAACCAGGATCAATTACAATTATCAC
TACATGTCCGACACTGGAAGCTTGATGACTGTTTCTGGAGCTGAGACCAGCTCATCCAGC
ACCTGAACTGCCCAAATATGAGACCGGGGGGATGGTCTCAGGCTTTTCTTGAGTTCTTTC
ATAGTAGTAGCTTTCAAAGTTTTTAAAATAGATATGATTCTAAGATGTAGGTGGATGCAG
TATTAGCTCAAGACATTTCCAGTTTGTATATGTTTTATGTGCTTGTGATGTTTGAAACTC
AAAAAAGTATGTAAAAGGTGCTGAGGCAAAAGAAAAGAAGAAAAGTTATAATGG

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2AS18TF 474 0 0
GGCAGCGGTGGAGCAGTTTCAGCAGCGATCAAGGCTAGATGCGAAATGGAAATAGACCGC
ATTGAGAAACAATTTGAAGACTGCATAGCTTTCCTCCTTAGAGTACTGTCTTCGAAGCTG
AATGTGGGACACTTTCCTCATTTGGCTGATTTAGTAACCAGGATCAATTACAATTATCAC
TACATGTCCGACACTGGAAGCTTGATGACTGTTTCTGGAGCTGAGACCAGCTCATCCAGC
ACCTGAACTGCCCAAATATGAGACCGGGGGGATGGTCTCAGGCTTTTCTTGAGTTCTTTC
ATAGTAGTAGCTTTCAAAGTTTTTAAAATAGATATGATTCTAAGATGTAGGTGGATGCAG
TATTAGCTCAAGACATTTCCAGTTTGTATATGTTTTATGTGCTTGTGATGTTTGAAACTC
AAAAAAGTATGTAAAAGGTGCTGAGGCAAAAGAAAAGAAGAAAAGTTATAATGG

QA 1 474 1 474
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4564Contig1 820 2 2 U
GGACCCTAATTCGAAAATGCCGCCGCCGTTACCGTCTCTGCAACTCCGGCGACTCCTCCT
CCGCACCTTCACCTCATCCTCCTCCGCCACTCCTCTCCAATCTCACTCCCGTTTCATTTC
CCCTCACCAGCCACCTCCCAGATTCCCTCTATTCCCTTCTTCCAGACTCTTCTCATCCGA
AACCAATGCGGATCCACAAACCCCGACCCGACTCAGATCGCTCTCTCCTTCTCCAAGGAA
CTCACCGGGGTACGGTAAGGCGTTGGATAAGAAAGAGTATTACGGGTTTTTGAAGATATT
GTGTGGGATTGAGAGGCTTGAGCATGTGATGATTGTGTTTAAGAGCATGAAAGCTGATGG
ATGTAAGCCTGGGATCAAGACTTATGATTTGTTGATGGGGAAGATGTGTGCGAATAACCA
GGTGACTAGAGCTAATGGTTTGTACAAAGAGGCGGCGAGGAGAGGTGTTGAGGTTAGTCC
TAAGGAGTACAGAGTTGATCCGAGGTTTTTGAAGAAGAAGAGTAAGGAGGTGGATAGCAA
TGTGAAGAAGAGGGAGACTTTGCCTGAGAAGACCGCGAGGAAGAGGAGAAGGCTCAAGCA
GATCAACATGAGTTTTGTTAAGAAGCCGCATAATAAGATGAGGAGGAGAATGTGATCGGT
AGCATTCTCTTTAATGTTTTTATGGTTCAAAACAGTCTTTTTGTTATTTCCTTGTTATTG
TTTTGTGAGAAGGTACTGTGATCTTTTGATCAGGAGCAGAATAATCTTTCAGTTCGATGT
AACGTTTAGACACTTTTTAATGGGATGGCTCAAGAATCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER09TF U 1
AF RR2ER09JQ C 51
BS 1 749 RR2ER09TF
BS 750 820 RR2ER09JQ

RD RR2ER09TF 749 0 0
GGACCCTAATTCGAAAATGCCGCCGCCGTTACCGTCTCTGCAACTCCGGCGACTCCTCCT
CCGCACCTTCACCTCATCCTCCTCCGCCACTCCTCTCCAATCTCACTCCCGTTTCATTTC
CCCTCACCAGCCACCTCCCAGATTCCCTCTATTCCCTTCTTCCAGACTCTTCTCATCCGA
AACCAATGCGGATCCACAAACCCCGACCCGACTCAGATCGCTCTCTCCTTCTCCAAGGAA
CTCACCGGGGTACGGTAAGGCGTTGGATAAGAAAGAGTATTACGGGTTTTTGAAGATATT
GTGTGGGATTGAGAGGCTTGAGCATGTGATGATTGTGTTTAAGAGCATGAAAGCTGATGG
ATGTAAGCCTGGGATCAAGACTTATGATTTGTTGATGGGGAAGATGTGTGCGAATAACCA
GGTGACTAGAGCTAATGGTTTGTACAAAGAGGCGGCGAGGAGAGGTGTTGAGGTTAGTCC
TAAGGAGTACAGAGTTGATCCGAGGTTTTTGAAGAAGAAGAGTAAGGAGGTGGATAGCAA
TGTGAAGAAGAGGGAGACTTTGCCTGAGAAGACCGCGAGGAAGAGGAGAAGGCTCAAGCA
GATCAACATGAGTTTTGTTAAGAAGCCGCATAATAAGATGAGGAGGAGAATGTGATCGGT
AGCATTCTCTTTAATGTTTTTATGGTTCAAAACAGTCTTTTTGTTATTTCCTTGTTATTG
TTTTGTGAGAAGGTACTGTGATCTTTTGA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2ER09JQ 770 0 0
GACTCCTCCTCCGCAC*TTCACCTCATCCTCCTCCGCCACTCCTCTCCAATCTCACTCCC
GTTTCATTTCCCCTCACCAGCCACCTCCCAGATTCCCTCTATTCCCTTCTTCCAGACTCT
TCTCATCCGAAACCAATGCGGATCCACAAACCCCGACCCGACTCAGATCGCTCTCTCCTT
CTCCAAGGAACTCACCGGGGTACGGTAAGGCGTTGGATAAGAAAGAGTATTACGGGTTTT
TGAAGATATTGTGTGGGATTGAGAGGCTTGAGCATGTGATGATTGTGTTTAAGAGCATGA
AAGCTGATGGATGTAAGCCTGGGATCAAGACTTATGATTTGTTGATGGGGAAGATGTGTG
CGAATAACCAGGTGACTAGAGCTAATGGTTTGTACAAAGAGGCGGCGAGGAGAGGTGTTG
AGGTTAGTCCTAAGGAGTACAGAGTTGATCCGAGGTTTTTGAAGAAGAAGAGTAAGGAGG
TGGATAGCAATGTGAAGAAGAGGGAGACTTTGCCTGAGAAGACCGCGAGGAAGAGGAGAA
GGCTCAAGCAGATCAACATGAGTTTTGTTAAGAAGCCGCATAATAAGATGAGGAGGAGAA
TGTGATCGGTAGCATTCTCTTTAATGTTTTTATGGTTCAAAACAGTCTTTTTGTTATTTC
CTTGTTATTGTTTTGTGAGAAGGTACTGTGATCTTTTGATCAGGAGCAGAATAATCTTTC
AGTTCGATGTAACGTTTAGACACTTTTTAATGGGATGGCTCAAGAATCGG

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL4565Contig1 475 2 1 U
GGGCTCAGTGAAGCTGCAAGTGTTTGATTATGATACATTCTCTGCTGATGACATAATGGG
AGAAGCTGAGATTGACATCCAACCATTGATCACATCTGCTATGGCTTTTGGAGACCCTGA
AATGTTTGGAGATATGCAGATTGGGAAATGGCTGAAATCCAACGACAATGCTCTTATAGA
GGATAGCATTATCAACATTGCAGATGGGAAAGTGAAACAAGAGGTTCAAATCAAGCTTCA
GAATGTCGAATCTGGTGAGTTGGAACTAGACCTTGAGTGGCTGCCTCTTGACCAATGATA
AAATAACAGTTTTATTATAGGCTCGTTAAAATTTATGTATGGAAGAGAAAGAAAATCTTG
ATATTGTATTCATTTTAATTCTGGAAACTTCAATCTTGAAAACCCTCTTTGGTGTTTTGT
TTATGAGAGCCATTTGTATAACTCAAATAGATTATATGTTCTAGTTTAAATTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FO41JQ C 1
AF RR2FO41TF U 1
BS 1 475 RR2FO41TF

RD RR2FO41JQ 475 0 0
GGGCTCAGTGAAGCTGCAAGTGTTTGATTATGATACATTCTCTGCTGATGACATAATGGG
AGAAGCTGAGATTGACATCCAACCATTGATCACATCTGCTATGGCTTTTGGAGACCCTGA
AATGTTTGGAGATATGCAGATTGGGAAATGGCTGAAATCCAACGACAATGCTCTTATAGA
GGATAGCATTATCAACATTGCAGATGGGAAAGTGAAACAAGAGGTTCAAATCAAGCTTCA
GAATGTCGAATCTGGTGAGTTGGAACTAGACCTTGAGTGGCTGCCTCTTGACCAATGATA
AAATAACAGTTTTATTATAGGCTCGTTAAAATTTATGTATGGAAGAGAAAGAAAATCTTG
ATATTGTATTCATTTTAATTCTGGAAACTTCAATCTTGAAAACCCTCTTTGGTGTTTTGT
TTATGAGAGCCATTTGTATAACTCAAATAGATTATATGTTCTAGTTTAAATTTTT

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2FO41TF 475 0 0
GGGCTCAGTGAAGCTGCAAGTGTTTGATTATGATACATTCTCTGCTGATGACATAATGGG
AGAAGCTGAGATTGACATCCAACCATTGATCACATCTGCTATGGCTTTTGGAGACCCTGA
AATGTTTGGAGATATGCAGATTGGGAAATGGCTGAAATCCAACGACAATGCTCTTATAGA
GGATAGCATTATCAACATTGCAGATGGGAAAGTGAAACAAGAGGTTCAAATCAAGCTTCA
GAATGTCGAATCTGGTGAGTTGGAACTAGACCTTGAGTGGCTGCCTCTTGACCAATGATA
AAATAACAGTTTTATTATAGGCTCGTTAAAATTTATGTATGGAAGAGAAAGAAAATCTTG
ATATTGTATTCATTTTAATTCTGGAAACTTCAATCTTGAAAACCCTCTTTGGTGTTTTGT
TTATGAGAGCCATTTGTATAACTCAAATAGATTATATGTTCTAGTTTAAATTTTT

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 2

CO CL4566Contig1 890 2 4 U
GCAATATGTGCTAGTTCACGGAAGTTGCCACGGCGCGTGGTGCTGGTACAAGGTCAAACC
GGTGCTAGAAGCCTCAGGACACCGTGTGACCGTTGTGGATCTGACGGCTTCTGGTGTCAA
CATGAGCAGAGTGGAAGAGATCCAGTCGCTTGAGGATTACACCAAACCATTGCTCAACGT
TCTTGAGTCGTTTGGCTCAGATGAGAAGGCGATCCTCGTGGCGCATAGCCTAGGAGGGCC
ATCGGTTGGTCTTGCAGCCGACATGTTTCCTAGTAAGATCTCTGTTGCTGTTTTTGTAAC
GTCGTTCATGCCAGACACAAAGAATCCACCTTCTTACACTTTTGAAAAGTATCTGGAGAG
TGTTACGGAAGAAGTAAGATCAAACATGGAGTTTGGGACATACGGAACACATAAACATCC
TCTAACGTCTGTACTTTTTGGAACCAAGTTCTTGGCCAAGTACTTGTACCAACTTTCACC
AGTTCAAGATTTTGAACTGGCCAAAATGTTGGTAAGAGTTGGACCGGCGGTTACCAGTAA
TTTGACGGGAACAAAAAACTTAACCGAAGAAGGGTATGGTTCTGTAACTCGTGTGTATGT
CATATGTGGGGAGGACAAGGGTATAACCAAAGAATTTCAGCGATGGATTATTGAGAATTA
TCCCGGTTAAAGAAGTGATGGAGATCAGAGATGCAGATCATATGCCAATGTTCTCCAAGC
CACATGAGCTCTGTAAATGTCTACTTAAAATTGCTAATAAATATGCATAAGCAAACCTGA
CAATGATATCATTATTGTCATTATATTAGTAAAAATAAAATTTAAAGTTTCCACCACCAT
GATAGCTAAATGTTTCATGGGATGGATGATTGTATGAATAAGATTACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ61TF U 1
AF RR2BA89TF U 8
BS 1 272 RR2AJ61TF
BS 273 273 RR2BA89TF
BS 274 716 RR2AJ61TF
BS 717 890 RR2BA89TF

RD RR2AJ61TF 716 0 0
GCAATATGTGCTAGTTCACGGAAGTTGCCACGGCGCGTGGTGCTGGTACAAGGTCAAACC
GGTGCTAGAAGCCTCAGGACACCGTGTGACCGTTGTGGATCTGACGGCTTCTGGTGTCAA
CATGAGCAGAGTGGAAGAGATCCAGTCGCTTGAGGATTACACCAAACCATTGCTCAACGT
TCTTGAGTCGTTTGGCTCAGATGAGAAGGCGATCCTCGTGGCGCATAGCCTAGGAGGGCC
ATCGGTTGGTCTTGCAGCCGACATGTTTCCTATTAAGATCTCTGTTGCTGTTTTTGTAAC
GTCGTTCATGCCAGACACAAAGAATCCACCTTCTTACACTTTTGAAAAGTATCTGGAGAG
TGTTACGGAAGAAGTAAGATCAAACATGGAGTTTGGGACATACGGAACACATAAACATCC
TCTAACGTCTGTACTTTTTGGAACCAAGTTCTTGGCCAAGTACTTGTACCAACTTTCACC
AGTTCAAGATTTTGAACTGGCCAAAATGTTGGTAAGAGTTGGACCGGCGGTTACCAGTAA
TTTGACGGGAACAAAAAACTTAACCGAAGAAGGGTATGGTTCTGTAACTCGTGTGTATGT
CATATGTGGGGAGGACAAGGGTATAACCAAAGAATTTCAGCGATGGATTATTGAGAATTA
TCCCGGTTAAAGAAGTGATGGAGATCAGAGATGCAGATCATATGCCAATGTTCTCC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2BA89TF 883 0 0
GG
GCTAGTTCACGGAAGTTGCCACGGCGCGTGGTGCTGGTACAAGGTCAAACCGGTGCTAGA
AGCTTCAGGACACCGTGTGACCGTTGTGGATCTGACGGCTTCTGGTGTCAACATGAGCAG
AGTGGAAGAGATCCAGTCGCTTGAGGATTACACCAAACCATTGCTCAACGTTCTTGAGTC
GTTTGGCTCAGATGAGAAGGCGATCCTCGTGGCGCATAGCCTAGGAGGGCCATCGGTTGG
TCTTGCAGCCGACATGTTTCCTAGTAAGATCTCTGTTGCTGTTTTTGTAACGTCGTTCAT
GCCAGACACAAAGAATCCACCTTCTTACACTTTTGAAAAGTATCTGGAGAGTGTTACGGA
AGAAGTAAGATCAAACATGGAGTTTGGGACATACGGAACACATAAACATCCTCTAACGTC
TGTACTTTTTGGAACCAAGTTCTTGGCCAAGTACTTGTACCAACTTTCACCAGTTCAAGA
TTTTGAACTGGCCAAAATGTTGGTAAGAGTTGGACCGGCGGTTACCAGTAATTTGACGGG
AACAAAAAACTTAACCGAAGAAGGGTATGGTTCTGTAACTCGTGTGTATGTCATATGTGG
GGAGGACAAGGGTATAACCAAAGAATTTCAGCGATGGATTATTGAGAATTATCC*GGTTA
AAGAAGTGATGGAGATCAGAGATGCAGATCATATGCCAATGTTCTCCAAGCCACATGAGC
TCTGTAAATGTCTACTTAAAATTGCTAATAAATATGCATAAGCAAACCTGACAATGATAT
CATTATTGTCATTATATTAGTAAAAATAAAATTTAAAGTTTCCACCACCATGATAGCTAA
ATGTTTCATGGGATGGATGATTGTATGAATAAGATTACTAC

QA 3 883 3 883
DS 



AS 1 2

CO CL4567Contig1 429 2 1 U
GGGAAGCGAAGCGAAACGGAGAAATCTCTCTTAGCTAGCTCTCAAAAATGGCGGCGACAC
CGATTGCGAGTCCGATTGCGGTGGCGATGTACCCGACTTTATCGGTGTTCACTCTGGCGA
TTGGCCTCGTCATTACCGCTTTCTTCTTCATCTATGAAGCTACATCATCCAGGAAAAACC
GTAGTCTCGGGATGGAGCTTGCGACCGCGGCAGTAGCATCTGTTTTCCTGGGATTTGGAT
CGTTGTTTTTGCTACTTGCTAGTGGTGTTTATGTCTGATCCTTCTTCCTCAATACTATTC
CCAGCTAGTTTCAATGAACAAAAAAAAATAACAGACTTTTATTTTCTGTCCAATTTAAAT
CAGAGTTATGAATGTTAAGACTTTTGATTGTCTTTCTTTGTGGATTTTTAACGCGCTAAA
CGTAGTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AE92JQ C 1
AF RR2AE92TF U 1
BS 1 429 RR2AE92TF

RD RR2AE92JQ 429 0 0
GGGAAGCGAAGCGAAACGGAGAAATCTCTTTTAGCTAGCTCTCAAAAATGGCGGCGACAC
CGATTGCGAGTCCGATTGCGGTGGCGATGTACCCGACTTTATCGGTGTTCACTCTGGCGA
TTGGCCTCGTCATTACCGCTTTTTTCTTCATCTATGAAGCTACATCATCCAGGAAAAACC
GTAGTCTCGGGATGGAGCTTGCGACCGCGGCAGTAGCATCTGTTTTCCTGGGATTTGGAT
CGTTGTTTTTGCTACTTGCTAGTGGTGTTTATGTCTGATCCTTCTTCCTCAATACTATTC
CCAGCTAGTTTCAATGAACAAAAAAAAATAACAGACTTTTATTTTCTGTCCAATTTAAAT
CAGAGTTATGAATGTTAAGACTTTTGATTGTCTTTCTTTGTGGATTTTTAACGCGCTAAA
CGTAGTTTG

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR2AE92TF 429 0 0
GGGAAGCGAAGCGAAACGGAGAAATCTCTCTTAGCTAGCTCTCAAAAATGGCGGCGACAC
CGATTGCGAGTCCGATTGCGGTGGCGATGTACCCGACTTTATCGGTGTTCACTCTGGCGA
TTGGCCTCGTCATTACCGCTTTCTTCTTCATCTATGAAGCTACATCATCCAGGAAAAACC
GTAGTCTCGGGATGGAGCTTGCGACCGCGGCAGTAGCATCTGTTTTCCTGGGATTTGGAT
CGTTGTTTTTGCTACTTGCTAGTGGTGTTTATGTCTGATCCTTCTTCCTCAATACTATTC
CCAGCTAGTTTCAATGAACAAAAAAAAATAACAGACTTTTATTTTCTGTCCAATTTAAAT
CAGAGTTATGAATGTTAAGACTTTTGATTGTCTTTCTTTGTGGATTTTTAACGCGCTAAA
CGTAGTTTG

QA 1 429 1 429
DS 



AS 1 2

CO CL4568Contig1 705 2 2 U
GCTAGTGGGAACAAGAGAAATCGTTGGAAAGCAACAGCCCTCTTACTTGGAGTATTTTGT
ATGATTGGTTTGGATTTTTCACCTTTGATAACGGTTCTAGAAAGCGATTTCAACATGGAC
AGTGCTTCTACAACAGAAACTGATACTTTAGATGACACTAACCAAATGAGTAAAGGAAAA
CCTCCCAGGCACCTATCTTCTCTGCAACATATCACTACTACTACTAGTAGGCTTCAGGTT
GCAGTCACTGCGGATTTGGATGTTTGTAAGTCACCTGATGAAAATTCAGTTTTTTTTCCT
GTCTACCGATCAGGAAGCTGTGCTGAACAAGGTGCGAAACAGTTCATGGAAGATGAACAC
ATTTGCATCGATGATCTTGGTGCATCTCTTGATTCCTCATCTCTTTCCGCCTTCTATGGG
GTGTTTGACGGCCATGGTGGCACAGATGCATCACTGTTTGTTAGAAAGAACATACTGAGA
TTCATAGTAGACGACTCTTACTTCCCACTATGTGTAAAGAAGGCAGTTAAGAATGCTTTC
TTGAAAGCTGATTACCAATTTGCAGACGAATCTTCTCTTGACATCTCTTCTGGGACCACT
GCGCTTACAGCTTTGATTTTTGGAAGGAGGTTGATAGTTGCAAACGCTGGTGATTGCCGA
GCAGTGCTCGGCAGAAGAGGCAGAGCAATAGAGTTATCCAAAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX40TFB U 1
AF RR2AX40JQ C 196
BS 1 673 RR2AX40TFB
BS 674 705 RR2AX40JQ

RD RR2AX40TFB 673 0 0
GCTAGTGGGAACAAGAGAAATCGTTGGAAAGCAACAGCCCTCTTACTTGGAGTATTTTGT
ATGATTGGTTTGGATTTTTCACCTTTGATAACGGTTCTAGAAAGCGATTTCAACATGGAC
AGTGCTTCTACAACAGAAACTGATACTTTAGATGACACTAACCAAATGAGTAAAGGAAAA
CCTCCCAGGCACCTATCTTCTCTGCAACATATCACTACTACTACTAGTAGGCTTCAGGTT
GCAGTCACTGCGGATTTGGATGTTTGTAAGTCACCTGATGAAAATTCAGTTTTTTTTCCT
GTCTACCGATCAGGAAGCTGTGCTGAACAAGGTGCGAAACAGTTCATGGAAGATGAACAC
ATTTGCATCGATGATCTTGGTGCATCTCTTGATTCCTCATCTCTTTCCGCCTTCTATGGG
GTGTTTGACGGCCATGGTGGCACAGATGCATCACTGTTTGTTAGAAAGAACATACTGAGA
TTCATAGTAGACGACTCTTACTTCCCACTATGTGTAAAGAAGGCAGTTAAGAATGCTTTC
TTGAAAGCTGATTACCAATTTGCAGACGAATCTTCTCTTGACATCTCTTCTGGGACCACT
GCGCTTACAGCTTTGATTTTTGGAAGGAGGTTGATAGTTGCAAACGCTGGTGATTGCCGA
GCAGTGCTCGGCA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2AX40JQ 510 0 0
TCTTTTCTGCAACATATCACTACTACTACTAGTAGGCTTCAGGTTGCAGTCACTGCGGAT
TTGGATGTTTGTAAGTCACCTGATGAAAATTCAGTTTTTTTTCCTGTCTACCGATCAGGA
AGCTGTGCTGAACAAGGTGCGAAACAGTTCATGGAAGATGAACACATTTGCATCGATGAT
CTTGGTGCATCTCTTGATTCCTCATCTCTTTCCGCCTTCTATGGGGTGTTTGACGGCCAT
GGTGGCACAGATGCATCACTGTTTGTTAGAAAGAACATACTGAGATTCATAGTAGACGAC
TCTTACTTCCCACTATGTGTAAAGAAGGCAGTTAAGAATGCTTTCTTGAAAGCTGATTAC
CAATTTGCAGACGAATCTTCTCTTGACATCTCTTCTGGGACCACTGCGCTTACAGCTTTG
ATTTTTGGAAGGAGGTTGATAGTTGCAAACGCTGGTGATTGCCGAGCAGTGCTCGGCAGA
AGAGGCAGAGCAATAGAGTTATCCAAAGAC

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL4569Contig1 1011 2 6 U
GGGGAACTTTAAGCTGCCGAAACACTGCGATAACAACGAAGTTCTCAAAGCTCTTTGCAA
CGAAGCTGGTTGGACCGTAGAGGAAGACGGAACTACTTACCGTAAGGGATGCAAACCAAT
GGATCGAATGGAACTCATGAATGGTTCCACTTCAGCGAGTCCATGCTCATCGTACCAGCC
CAGCCCTCGTGGTTCCTACAATCCAAGCCCTTCATCTTCCTCATTCCCTAGTCCTACAAA
CATATTCGGTGATGCTAACTCACTAATCCCATGGCTCAAGAACCTCTCTTCAAACTCACC
TTCCAAGCTTCCCTTCTTCCACGGGAACTCCATAAGCGCTCCCGTGACTCCACCACTGGC
TCGAAGCCCTACTCGTGACCAAGTGACCATCCCTGAATCTGGATGGCTCTCTGGAATGCA
AACCCCACAGAGCGGACCGTCTTCTCCTACTTTCAGCTTAGTCTCGAGAAACCCGTTTTT
CGACAAAGAGGCTTTTAAAATGGGAGATTGTAATTCGCCAATGTGGACTCCTGGACAAAG
TGGAAACTGCTCTCCAGCTATTCCTGCTGGTGTTGATCAAACCTCTGACGTGCCGATGGC
TGATGGAATGTCGGCAGAGTTTGCGTTTGGAATGGTGAAGCCTTGGGAAGGAGAAAGGAT
ACATGGAGAATGCGTTTCAGATGATTTAGAACTCACACTTGGAAATTCAAGAACCAGATG
ATGATGATTTTTAGAGAAGAATCAAAACATCGTTTGCTATCAATCATCTCTCTTATCAAA
TTAGTTTATCTCTTGCTTTTTCATTTCATCTTTGTTTGTCTGTTTTTTTTACCAGTGTGA
TGATTAAAGGTGATTGAGAGAAAAAAGGGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAACATTTTCGAAC
TCAGTTTTTTTTTCTCTTGTTGGCTTTTGACTAAAGTTGTAGTTGTAGAATTTTGTCTCT
CCAAGTTTGTTTTTCATATATTAATCTATAATTATAGTGGGTTAATCATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER25TF U 1
AF RR2ER25JQ C 321
BS 1 740 RR2ER25TF
BS 741 741 RR2ER25JQ
BS 742 779 RR2ER25TF
BS 780 780 RR2ER25JQ
BS 781 800 RR2ER25TF
BS 801 1011 RR2ER25JQ

RD RR2ER25TF 808 0 0
GGGGAACTTTAAGCTGCCGAAACACTGCGATAACAACGAAGTTCTCAAAGCTCTTTGCAA
CGAAGCTGGTTGGACCGTAGAGGAAGACGGAACTACTTACCGTAAGGGATGCAAACCAAT
GGATCGAATGGAACTCATGAATGGTTCCACTTCAGCGAGTCCATGCTCATCGTACCAGCC
CAGCCCTCGTGGTTCCTACAATCCAAGCCCTTCATCTTCCTCATTCCCTAGTCCTACAAA
CATATTCGGTGATGCTAACTCACTAATCCCATGGCTCAAGAACCTCTCTTCAAACTCACC
TTCCAAGCTTCCCTTCTTCCACGGGAACTCCATAAGCGCTCCCGTGACTCCACCACTGGC
TCGAAGCCCTACTCGTGACCAAGTGACCATCCCTGAATCTGGATGGCTCTCTGGAATGCA
AACCCCACAGAGCGGACCGTCTTCTCCTACTTTCAGCTTAGTCTCGAGAAACCCGTTTTT
CGACAAAGAGGCTTTTAAAATGGGAGATTGTAATTCGCCAATGTGGACTCCTGGACAAAG
TGGAAACTGCTCTCCAGCTATTCCTGCTGGTGTTGATCAAACCTCTGACGTGCCGATGGC
TGATGGAATGTCGGCAGAGTTTGCGTTTGGAATGGTGAAGCCTTGGGAAGGAGAAAGGAT
ACATGGAGAATGCGTTTCAGATGATTTAGAACTCACACTTGGAAATTCAAGAACCAGATG
ATGATGATTTTTAGAGAAGA*TCAAAACATCGTTTGCTATCAATCATCTCTCTTATCAA*
TTAGTTTATCTCTTGCTTTT
CATTTCAT

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2ER25JQ 691 0 0
ACGGGAACTCCATAAGCGCTCCCGTGACTCCACCACTGGCTCGAAGCCCTACTCGTGACC
AAGTGACCATCCCTGAATCTGGATGGCTCTCTGGAATGCAAACCCCACAGAGCGGACCGT
CTTCTCCTACTTTCAGCTTAGTCTCGAGAAACCCGTTTTTCGACAAAGAGGCTTTTAAAA
TGGGAGATTGTAATTCGCCAATGTGGACTCCTGGACAAAGTGGAAACTGCTCTCCAGCTA
TTCCTGCTGGTGTTGATCAAACCTCTGACGTGCCGATGGCTGATGGAATGTCGGCAGAGT
TTGCGTTTGGAATGGTGAAGCCTTGGGAAGGAGAAAGGATACATGGAGAATGCGTTTCAG
ATGATTTAGAACTCACACTTGGAAATTCAAGAACCAGATGATGATGATTTTTAGAGAAGA
ATCAAAACATCGTTTGCTATCAATCATCTCTCTTATCAAATTAGTTTATCTCTTGCTTTT
TCATTTCATCTTTGTTTGTCTGTTTTTTTTACCAGTGTGATGATTAAAGGTGATTGAGAG
AAAAAAGGGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAACATTTTCGAACTCAGTTTTTTTTTCTCTTGT
TGGCTTTTGACTAAAGTTGTAGTTGTAGAATTTTGTCTCTCCAAGTTTGTTTTTCATATA
TTAATCTATAATTATAGTGGGTTAATCATAT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL4570Contig1 484 2 2 U
GGACCACAACTCATTATCGCATCAAAAACAAAACCTCATCAGAAACAAATCTATTGACTA
AGTTTCTTCGAAGTGTAAAAGAGGAGAGATGGAGTCAATGAAGATGAGGCTTATGGTGGT
GTTGATGGTGGCTATTGTGGCTTTCTCAGCCGTAGGAAAGGCGGCGGCTCAGACGGCAGA
GGCTCCAGCTCCAAGTCCGACTTCTGATGCCGCTATGTTCGTCCCGGCATTGTTTGCATC
TGTTGTTGCTTTGGCATCTGGGTTTCTCTTCTAAACCAATCTCTACATATCATATAGTGT
TAGGGTTTGTTACTTTATTTTCCCTTCACTTCCTGTCTATTTTCATCATATGAGCTTTTT
TTTTTGTTATTGTTTCTAATATTTGCACTACTATATATTATTTCTTATTGATTGATATAA
CCTTCGGGTTTTGATGTAATTGCATGAGATTGTTTATGTTTATATGTTATATAATTGTTA
CCAC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2CN32JQ C 1
AF RR2CN32TF U 2
BS 1 1 RR2CN32JQ
BS 2 484 RR2CN32TF

RD RR2CN32JQ 484 0 0
GGACCACAACTCATTATCGCATCAAAAACAAAACCTCATCAGAAACAAATCTATTGACTA
AGTTTCTTCGAAGTGTAAAAGAGGAGAGATGGAGTCAATGAAGATGAGGCTTATGGTGGT
GTTGATGGTGGCTATTGTGGCTTTTTCAGCCGTAGGAAAGGCGGCGGCTCAGACGGCAGA
GGCTCCAGCTCCAAGTCCGACTTCTGATGCCGCTATGTTCGTCCCGGCATTGTTTGCATC
TGTTGTTGCTTTGGCATCTGGGTTTTTCTTCTAAACCAATCTCTACATATCATATAGTGT
TAGGGTTTGTTACTTTATTTTCCCTTCACTTCCTGTCTATTTTCATCATATGAGCTTTTT
TTTTTGTTATTGTTTCTAATATTTGCACTACTATATATTATTTCTTATTGATTGATATAA
CCTTCGGGTTTTGATGTAATTGCATGAGATTGTTTATGTTTATATGTTATATAATTGTTA
CCAC

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2CN32TF 483 0 0
GACCACAACTCATTATCGCATCAAAAACAAAACCTCATCAGAAACAAATCTATTGACTAA
GTTTCTTCGAAGTGTAAAAGAGGAGAGATGGAGTCAATGAAGATGAGGCTTATGGTGGTG
TTGATGGTGGCTATTGTGGCTTTCTCAGCCGTAGGAAAGGCGGCGGCTCAGACGGCAGAG
GCTCCAGCTCCAAGTCCGACTTCTGATGCCGCTATGTTCGTCCCGGCATTGTTTGCATCT
GTTGTTGCTTTGGCATCTGGGTTTCTCTTCTAAACCAATCTCTACATATCATATAGTGTT
AGGGTTTGTTACTTTATTTTCCCTTCACTTCCTGTCTATTTTCATCATATGAGCTTTTTT
TTTTGTTATTGTTTCTAATATTTGCACTACTATATATTATTTCTTATTGATTGATATAAC
CTTCGGGTTTTGATGTAATTGCATGAGATTGTTTATGTTTATATGTTATATAATTGTTAC
CAC

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL4571Contig1 731 2 2 U
GGAAAACAATAAGTTCCAAGAATCTATCTGGCTTTCCAAGAATCCAAGGGGTCAGAAAAT
AGCCATGGCAGTCACAGCATTGAACACATTGAAACTTGCATCGTCGCCTCTAGATTCGTT
TCCTTCAGTCTCTTCTTCGTCTTCTTACTCGGTGTCTCTGATAAGCGTCGGCATCAGAAA
CTCCGTGGGGTCTCCTTTCAAGAGATGTCTAAAGCAGACATGTTCTGTTCGAGCCATGTC
TTCGGCTGATTCATCTTCTTCCTTCGGATCGAGAATGGAGGAGAGCGTGAAGAAAACTGT
GAATAATAACACTGTCGTTGTTTACTCCAAAACTTGGTGCCCATACTGTTCTGAAGTGAA
GACATTGTTCAAGAGAATTGGTGTTCAGCCACTGGTGATTGAATTGGATCAACTTGGTCC
ACAAGGGCCACAACTGCAGAAGGTACTGGAAAGACTTACTGGGCAACGCACTGTTCCTAA
TGTGTTCGTAGGAGGCAAGCACATTGGTGGCTGCACAGATACAGTGAAGCTGAACAGGAA
AGGAGAACTGGAGCTGATGTTAGCTGAAGCCAACGGTAAAACCGAACAGACTTGAGAGCA
AATGATGAAATTGTTTTTTTTTGGAGATTTTTGCATATGGAGTTTGGAGGAGTTTTAACT
TCTTTTCTCTCTTTTGTAAACATTGAACCTCATTTTTATGTTTACACATTGAACATCATT
CAAATAAATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H991TF U 1
AF RR2H991JQ C 141
BS 1 613 RR2H991TF
BS 614 731 RR2H991JQ

RD RR2H991TF 613 0 0
GGAAAACAATAAGTTCCAAGAATCTATCTGGCTTTCCAAGAATCCAAGGGGTCAGAAAAT
AGCCATGGCAGTCACAGCATTGAACACATTGAAACTTGCATCGTCGCCTCTAGATTCGTT
TCCTTCAGTCTCTTCTTCGTCTTCTTACTCGGTGTCTCTGATAAGCGTCGGCATCAGAAA
CTCCGTGGGGTCTCCTTTCAAGAGATGTCTAAAGCAGACATGTTCTGTTCGAGCCATGTC
TTCGGCTGATTCATCTTCTTCCTTCGGATCGAGAATGGAGGAGAGCGTGAAGAAAACTGT
GAATAATAACACTGTCGTTGTTTACTCCAAAACTTGGTGCCCATACTGTTCTGAAGTGAA
GACATTGTTCAAGAGAATTGGTGTTCAGCCACTGGTGATTGAATTGGATCAACTTGGTCC
ACAAGGGCCACAACTGCAGAAGGTACTGGAAAGACTTACTGGGCAACGCACTGTTCCTAA
TGTGTTCGTAGGAGGCAAGCACATTGGTGGCTGCACAGATACAGTGAAGCTGAACAGGAA
AGGAGAACTGGAGCTGATGTTAGCTGAAGCCAACGGTAAAACCGAACAGACTTGAGAGCA
AATGATGAAATTG

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2H991JQ 591 0 0
CTTCTTACTCGGTGTCTCTGATAAGCGTCGGCATCAGAAACTCCGTGGGGTCTCCTTTCA
AGAGATGTCTAAAGCAGACATGTTCTGTTCGAGCCATGTCTTCGGCTGATTCATCTTCTT
CCTTCGGATCGAGAATGGAGGAGAGCGTGAAGAAAACTGTGAATAATAACACTGTCGTTG
TTTACTCCAAAACTTGGTGCCCATACTGTTCTGAAGTGAAGACATTGTTCAAGAGAATTG
GTGTTCAGCCACTGGTGATTGAATTGGATCAACTTGGTCCACAAGGGCCACAACTGCAGA
AGGTACTGGAAAGACTTACTGGGCAACGCACTGTTCCTAATGTGTTCGTAGGAGGCAAGC
ACATTGGTGGCTGCACAGATACAGTGAAGCTGAACAGGAAAGGAGAACTGGAGCTGATGT
TAGCTGAAGCCAACGGTAAAACCGAACAGACTTGAGAGCAAATGATGAAATTGTTTTTTT
TTGGAGATTTTTGCATATGGAGTTTGGAGGAGTTTTAACTTCTTTTCTCTCTTTTGTAAA
CATTGAACCTCATTTTTATGTTTACACATTGAACATCATTCAAATAAATAC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL4572Contig1 993 2 2 U
AGGTTGCCCCTCTAGAAAAAATTGGGAAAACGGCAAAAATGTGATAAGGAGAAGGAAAGC
AAAAATGTGGTCGTCAAGCTTCTTAGCTGCTACCCATTTCTCTTCTCCTCCCAAGCTTTC
TCCATTGTCATCTTCTTCCTCCTCTTATCATCACAAGATCCAAACCTTCCTCTGTTTTAC
TCAAAATCCTTCGTCCACTTTTGGCGTTAGTTTCAGCAAGAGACACTTGAATCTCTCGAT
TCTCACGCTCTTGCTCAATGGTGGGTTCTTGTTGGATAAGGCTAAATCCATGGAAGAGTC
AGGAGATCTTCAAAGATACACTGATTTGAAAGATGGCTTCACGCTTCTTGTACCCTCTTC
TTGGACTAAGGTGGAGAAAGCAGGAGCCAATGTTCTGTTTGAAGAACCAGAGAAACGAAG
CAACAATATTGGAGTTGTGGTTAGTCCTGTCCGAATAAAGAGTCTTGAAGACTTTGGTAC
TCCTCAATTTGTAGCTGATAATCTCATCAACGCAGAGAAGCGAAAGGAAAGCACAAAGGA
AGCAGAAATTGTATCAGTAGGAAAGAGATTAGGACAAGGAAAAGGACAAGTGTATGAATT
TGAGTATAAAATTGACAGCACGAGAGGAGGGATCAAACGGGTTTTTTCAGCTGCGTTTGT
GAGCTTTCAGAAGCTTTATATACTGAACGTTGTTCATTCAGACAGTCCAGAGAATCCACT
GGATTCAAGCACGAGAGTGTTGTTGGAACAAGTTTTTCACTCCTTTGATGCTTTGCCTCT
CACATAAACTCGCCATCCAAATAATAGTATCTTTCTTGCAAGGCTCATTTTGTATTTTTG
GGCTTATTCTTGAGAGCAATTTATTAAGCCCAATAAGTTTCAGGTTTTTTTTATTACGAA
TAATGTGACGGGACTAGTCGAACACTTTTTTTTTAGTTGAACACTTATTTCTTTCTCATC
TTTATGTAATGTATTTGATTGAGAGCAACAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C902TF U 1
AF RR2C902JQ C 362
BS 1 625 RR2C902TF
BS 626 993 RR2C902JQ

RD RR2C902TF 625 0 0
AGGTTGCCCCTCTAGAAAAAATTGGGAAAACGGCAAAAATGTGATAAGGAGAAGGAAAGC
AAAAATGTGGTCGTCAAGCTTCTTAGCTGCTACCCATTTCTCTTCTCCTCCCAAGCTTTC
TCCATTGTCATCTTCTTCCTCCTCTTATCATCACAAGATCCAAACCTTCCTCTGTTTTAC
TCAAAATCCTTCGTCCACTTTTGGCGTTAGTTTCAGCAAGAGACACTTGAATCTCTCGAT
TCTCACGCTCTTGCTCAATGGTGGGTTCTTGTTGGATAAGGCTAAATCCATGGAAGAGTC
AGGAGATCTTCAAAGATACACTGATTTGAAAGATGGCTTCACGCTTCTTGTACCCTCTTC
TTGGACTAAGGTGGAGAAAGCAGGAGCCAATGTTCTGTTTGAAGAACCAGAGAAACGAAG
CAACAATATTGGAGTTGTGGTTAGTCCTGTCCGAATAAAGAGTCTTGAAGACTTTGGTAC
TCCTCAATTTGTAGCTGATAATCTCATCAACGCAGAGAAGCGAAAGGAAAGCACAAAGGA
AGCAGAAATTGTATCAGTAGGAAAGAGATTAGGACAAGGAAAAGGACAAGTGTATGAATT
TGAGTATAAAATTGACAGCACGAGA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2C902JQ 632 0 0
TGGACTAAGGTGGAGAAAGCAGGAGCCAATGTTCTGTTTGAAGAACCAGAGAAACGAAGC
AACAATATTGGAGTTGTGGTTAGTCCTGTCCGAATAAAGAGTCTTGAAGACTTTGGTACT
CCTCAATTTGTAGCTGATAATTTCATCAACGCAGAGAAGGGAAAGGAAAGCACAAAGGAA
GCAGAAATTGTATCAGTAGGAAAGAGATTAGGACAAGGAAAAGGACAAGTGTATGAATTT
GAGTATAAAATTGACAGCACGAGAGGAGGGATCAAACGGGTTTTTTCAGCTGCGTTTGTG
AGCTTTCAGAAGCTTTATATACTGAACGTTGTTCATTCAGACAGTCCAGAGAATCCACTG
GATTCAAGCACGAGAGTGTTGTTGGAACAAGTTTTTCACTCCTTTGATGCTTTGCCTCTC
ACATAAACTCGCCATCCAAATAATAGTATCTTTCTTGCAAGGCTCATTTTGTATTTTTGG
GCTTATTCTTGAGAGCAATTTATTAAGCCCAATAAGTTTCAGGTTTTTTTTATTACGAAT
AATGTGACGGGACTAGTCGAACACTTTTTTTTTAGTTGAACACTTATTTCTTTCTCATCT
TTATGTAATGTATTTGATTGAGAGCAACAATT

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL4573Contig1 473 2 1 U
GGAACCAAGTTTCCACTTTCTAAAGCCTCTCTCTTCTTACTTCTCTTGCTTTTGTTCTTT
CTCTGGTCGTTGTAAGAAGATATGCATGACTGGGCAGCACCGTTGATTGCTTCTGCTCTA
TTTGCGTTTCTATCGCCAGGGCTGATACTGCAGTTTCCTGGGAAAGAATCTCCGGTAGGT
TTCATGAACATGAAGACAACGGTAGCTTCTATTTTCGTCCACACCGTTCTTTACGGTCTC
TTTCTCATCCTCTTCCTAGTCGTTCTCAACGTCCATGTTTATGCTTAGCTTAAGCTCAAA
ATATTACACTCTGTGCTAGCCTCTGCTTGTGCTAGATGGGTTTAGCCGCAAACCTTTGTT
TTATGACTTGTCTTACTTCTTTGTTGTTGTTCTTCTTATTCTTCTTAATTACTGCTCTAA
AGATTTTAAAGTTATAACCAATTTTTCTTTAGTGTTATTCAATATATGTAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2HB11JQ C 1
AF RR2HB11TF U 1
BS 1 473 RR2HB11TF

RD RR2HB11JQ 473 0 0
GGAACCAAGTTTCCACTTTCTAAAGCCTCTCTCTTCTTACTTCTCTTGCTTTTGTTCTTT
CTCTGGTCGTTGTAAGAAGATATGCATGACTGGGCAGCACCGTTGATTGCTTCTGCTCTA
TTTGCGTTTCTATCGCCAGGGCTGATACTGCAGTTTCCTGGGAAAGAATCTCCGGTAGGT
TTCATGAACATGAAGACAACGGTAGCTTCTATTTTCGTCCACACCGTTCTTTACGGTCTC
TTTCTCATCCTCTTCCTAGTCGTTCTCAACGTCCATGTTTATGCTTAGCTTAAGCTCAAA
ATATTACACTCTGTGCTAGCCTCTGCTTGTGCTAGATGGGTTTAGCCGCAAACCTTTGTT
TTATGACTTGTCTTACTTCTTTGTTGTTGTTCTTCTTATTCTTCTTAATTACTGCTCTAA
AGATTTTAAAGTTATAACCAATTTTTCTTTAGTGTTATTCAATATATGTAGCC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2HB11TF 473 0 0
GGAACCAAGTTTCCACTTTCTAAAGCCTCTCTCTTCTTACTTCTCTTGCTTTTGTTCTTT
CTCTGGTCGTTGTAAGAAGATATGCATGACTGGGCAGCACCGTTGATTGCTTCTGCTCTA
TTTGCGTTTCTATCGCCAGGGCTGATACTGCAGTTTCCTGGGAAAGAATCTCCGGTAGGT
TTCATGAACATGAAGACAACGGTAGCTTCTATTTTCGTCCACACCGTTCTTTACGGTCTC
TTTCTCATCCTCTTCCTAGTCGTTCTCAACGTCCATGTTTATGCTTAGCTTAAGCTCAAA
ATATTACACTCTGTGCTAGCCTCTGCTTGTGCTAGATGGGTTTAGCCGCAAACCTTTGTT
TTATGACTTGTCTTACTTCTTTGTTGTTGTTCTTCTTATTCTTCTTAATTACTGCTCTAA
AGATTTTAAAGTTATAACCAATTTTTCTTTAGTGTTATTCAATATATGTAGCC

QA 1 473 1 473
DS 



AS 1 2

CO CL4574Contig1 1024 2 6 U
GGAAGGCTCTCTCACACACATACATTTACTTACATAGCAAACTATGGACCGACGTCGTTC
TATTCATCATCACATCATTTCATATCTTTTTCCCTCTTCTACGTCCATACTATTTTTGTG
TATTTCACTCCTTGTGTTTTTTACTACAACCACTAATGCTTTAGTGAGACTTCCGGAGAA
CACGACCGTTCCAGCTATAATAGTGTTCGGAGATTCAATTGTTGATGCCGGAAACAACGA
CGATTTGATAACGGAGGCTAGATGTGATTATCCTCCTTATGGTATTGATTTCGATGGTGG
AGTTCCTACGGGAAGATTCTCCAATGGAAAAGTCCCCACTGATATTCTAGCGGAAGAATT
GGGGATTAAGCCAACTATACCAGCATACCGAGATCCTAATCTTAGACAAGAAGATCTTCT
AACCGGTGTAACATTTGCTTCGGGTGGTGCTGGTTATGTTCCTTTGACAACACAAATATC
GGGAGGAATACCACTATCGCAACAACTGAATTTTTTTGAAGAGTATATAGAGAAATTGAA
TGGAATGGTGGGACGAGAGAGGACAACATTCATAATTAAGAATAGCTTGTTCGTTATTAT
ATGTGGTAGTAACGATATCGCAAACAACTTCTTTAGTCTCCCTACGACTCAGCTCCAATA
CAACGCGGCCTCTTTCACTGGTCTTATGGCCGACAATGCTCGCTCTTTTGCTACGACACT
GTACCAATATGGTGCAAGAAGAATACTTATGTTTGGTGCACCGCCAATAGGATGTGTCCC
TTCGCAGAGAACTGTAGCTGGAGGACCAACAAGGGATTGTGTTGTTCGGTTTAATGATGC
GTGTAAACTTTTCAATGCTAAACTCTCTGCAAATATAGATGGCTTGTCAAGAACCCTACA
AGACACGACTTTAATATATATTGACATCTATGATCCTCTTCTTGATCTCATCTTAAACCC
TCAACAATATGGTAATAATGTATCATTACTTTTTTATTTAGTGAAACAATCAATTTTTTA
ACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2BZ05TF U 1
AF RR2BZ05JQ C 255
BS 1 708 RR2BZ05TF
BS 709 709 RR2BZ05JQ
BS 710 724 RR2BZ05TF
BS 725 725 RR2BZ05JQ
BS 726 736 RR2BZ05TF
BS 737 1024 RR2BZ05JQ

RD RR2BZ05TF 736 0 0
GGAAGGCTCTCTCACACACATACATTTACTTACATAGCAAACTATGGACCGACGTCGTTC
TATTCATCATCACATCATTTCATATCTTTTTCCCTCTTCTACGTCCATACTATTTTTGTG
TATTTCACTCCTTGTGTTTTTTACTACAACCACTAATGCTTTAGTGAGACTTCCGGAGAA
CACGACCGTTCCAGCTATAATAGTGTTCGGAGATTCAATTGTTGATGCCGGAAACAACGA
CGATTTGATAACGGAGGCTAGATGTGATTATCCTCCTTATGGTATTGATTTCGATGGTGG
AGTTCCTACGGGAAGATTCTCCAATGGAAAAGTCCCCACTGATATTCTAGCGGAAGAATT
GGGGATTAAGCCAACTATACCAGCATACCGAGATCCTAATCTTAGACAAGAAGATCTTCT
AACCGGTGTAACATTTGCTTCGGGTGGTGCTGGTTATGTTCCTTTGACAACACAAATATC
GGGAGGAATACCACTATCGCAACAACTGAATTTTTTTGAAGAGTATATAGAGAAATTGAA
TGGAATGGTGGGACGAGAGAGGACAACATTCATAATTAAGAATAGCTTGTTCGTTATTAT
ATGTGGTAGTAACGATATCGCAAACAACTTCTTTAGTCTCCCTACGACTCAGCTCCAATA
CAACGCGGCCTCTTTCACTGGTCTTATGGCCGACAATGCTCGCTCTTT*GCTACGACACT
GTAC*AATATGGTGCA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2BZ05JQ 770 0 0
AGGCTAGATGTGATTATCCTCCTTATGGTATTGATTTCGATGGTGGAGTTCCTACGGGAA
GATTCTCCAATGGAAAAGTCCCCACTGATATTCTAGCGGAAGAATTGGGGATTAAGCCAA
CTATACCAGCATACCGAGATCCTAATCTTAGACAAGAAGATCTTCTAACCGGTGTAACAT
TTGCTTCGGGTGGTGCTGGTTATGTTCCTTTGACAACACAAATATCGGGAGGAATACCAC
TATCGCAACAACTGAATTTTTTTGAAGAGTATATAGAGAAATTGAATGGAATGGTGGGAC
GAGAGAGGACAACATTCATAATTAAGAATAGCTTGTTCGTTATTATATGTGGTAGTAACG
ATATCGCAAACAACTTCTTTAGTCTCCCTACGACTCAGCTCCAATACAACGCGGCCTCTT
TCACTGGTCTTATGGCCGACAATGCTCGCTCTTTTGCTACGACACTGTACCAATATGGTG
CAAGAAGAATACTTATGTTTGGTGCACCGCCAATAGGATGTGTCCCTTCGCAGAGAACTG
TAGCTGGAGGACCAACAAGGGATTGTGTTGTTCGGTTTAATGATGCGTGTAAACTTTTCA
ATGCTAAACTCTCTGCAAATATAGATGGCTTGTCAAGAACCCTACAAGACACGACTTTAA
TATATATTGACATCTATGATCCTCTTCTTGATCTCATCTTAAACCCTCAACAATATGGTA
ATAATGTATCATTACTTTTTTATTTAGTGAAACAATCAATTTTTTAACAT

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL4575Contig1 473 2 1 U
GATCTTGCTGCTCCTAGCAATGTTATACCCAAGAAAATATTTCACTTGAGATAATCCAAT
GACAATGGCCGAAGCACTTGTAAATCCAGATATAACCGAGTGACTAATGAAACGAATAAG
CCATCCAAGCCTGTATTGAAATCAGCAAAACAAAGGGAGAGATGCTCATGAAACAGAAAC
AAACAGAGGACTTTTTAGATTAAACGGACAACATCTCCATTGTCTGAATCCAAGCAAAAC
AAATATTCTTACCTTAAGAGGCCCATGATGCACTCCAATATTCCAACCAAAAGTGCCAGC
AAAATAGCAAGTTCAATATGCAACTCTTCCTCAGACGAATCAGCGATTCCTCCCAAAGCA
TTGGAGACGAGAAGTGAGACCAATGCTACAGGTCCGATTGCAAGCTGACGAGATGAGCCG
AATACGGCATAGACAAATATCGGAACAAATGATGAGTCTGCATCAAAGGTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BC70JQ C 1
AF RR2BC70TF U 1
BS 1 473 RR2BC70TF

RD RR2BC70JQ 473 0 0
GATCTTGCTGCTCCTAGCAATGTTATACCCAAGAAAATATTTCACTTGAGATAATCCAAT
GACAATGGCCGAAGCACTTGTAAATCCAGATATAACCGAGTGACTAATGAAACGAATAAG
CCATCCAAGCCTGTATTGAAATCAGCAAAACAAAGGGAGAGATGCTCATGAAACAGAAAC
AAACAGAGGACTTTTTAGATTAAACGGACAACATCTCCATTGTCTGAATCCAAGCAAAAC
AAATATTCTTACCTTAAGAGGCCCATGATGCACTCCAATATTCCAACCAAAAGTGCCAGC
AAAATAGCAAGTTCAATATGCAACTCTTCCTCAGACGAATCAGCGATTCCTCCCAAAGCA
TTGGAGACGAGAAGTGAGACCAATGCTACAGGTCCGATTGCAAGCTGACGAGATGAGCCG
AATACGGCATAGACAAATATCGGAACAAATGATGAGTCTGCATCAAAGGTTAC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2BC70TF 473 0 0
GATCTTGCTGCTCCTAGCAATGTTATACCCAAGAAAATATTTCACTTGAGATAATCCAAT
GACAATGGCCGAAGCACTTGTAAATCCAGATATAACCGAGTGACTAATGAAACGAATAAG
CCATCCAAGCCTGTATTGAAATCAGCAAAACAAAGGGAGAGATGCTCATGAAACAGAAAC
AAACAGAGGACTTTTTAGATTAAACGGACAACATCTCCATTGTCTGAATCCAAGCAAAAC
AAATATTCTTACCTTAAGAGGCCCATGATGCACTCCAATATTCCAACCAAAAGTGCCAGC
AAAATAGCAAGTTCAATATGCAACTCTTCCTCAGACGAATCAGCGATTCCTCCCAAAGCA
TTGGAGACGAGAAGTGAGACCAATGCTACAGGTCCGATTGCAAGCTGACGAGATGAGCCG
AATACGGCATAGACAAATATCGGAACAAATGATGAGTCTGCATCAAAGGTTAC

QA 1 473 1 473
DS 



AS 1 2

CO CL4576Contig1 852 2 2 U
GGATTGCTTCCTCACCCCATCTACTCAAGATCCTCTCCACAACATAGAGTCTCCTCCAAG
CTCCGGAGTTGTCCCCACAAAGCTCCTCCAAGTTCCCATAGCTTGGGAGCCCGTTTTGGA
TCTTGATCCGGATCCAAAACAAACCCTTTTGATGGACTCTGTTCCGTCACCAAGAGTATC
CTTCAAGAAAACGAAGGAAACTGAATTTGCCGACATGAAAACTGACCCACCAGCGAGGAT
CACGAGTCGTGTGCCTTTGATAGATGCTGCGAAGCCCTCCGATTGCGAAGGAAACGATGA
CTTGCAAGTGAAGAAAGAAAATAATGATGTGACTAGTGAACATGGTGGTGAGAAACTGAA
CTTATGGAAGATTGGTCTTAATGGGATCGGAGCTGTTTGCTCTTTTGGCGTTGCAGCAGC
AGCTGCTACAGTATGTGTCTTATTCCTCGGACACAACAACATCAAAGTTTGTAAGAAAAA
GAACCAGAAGCTTAGGTTCCAGATTTACTCCGATGATCATAAGAGGATGAATGAAGCTGT
GAATCATGCAACAAAGGTTAATGAAGCAATCTTTGCAATGAAAGGTGTTCCTGTCGTGAG
AGCTCAGATATCTTTTGGAGGTTACTACGATGGAATTTGAATCTCAACCGTCCATAATTC
TCTATGGAATCAAAGGGATCAGATCTAGTCTATCCTCATACCAGCTTCATAAGTTCAATA
GTTTATAGTGTGTATGGCCCTTGTCAATACATTTTGTAAATTTTGTTCAAATCCGATATA
TTGATAGATATAGATCATTGTAAAATTTCATGTAATATTTTTAATTGTTGTGAAATAACT
TAAATATCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A951TF U 1
AF RR2A951JQ C 90
BS 1 761 RR2A951TF
BS 762 852 RR2A951JQ

RD RR2A951TF 761 0 0
GGATTGCTTCCTCACCCCATCTACTCAAGATCCTCTCCACAACATAGAGTCTCCTCCAAG
CTCCGGAGTTGTCCCCACAAAGCTCCTCCAAGTTCCCATAGCTTGGGAGCCCGTTTTGGA
TCTTGATCCGGATCCAAAACAAACCCTTTTGATGGACTCTGTTCCGTCACCAAGAGTATC
CTTCAAGAAAACGAAGGAAACTGAATTTGCCGACATGAAAACTGACCCACCAGCGAGGAT
CACGAGTCGTGTGCCTTTGATAGATGCTGCGAAGCCCTCCGATTGCGAAGGAAACGATGA
CTTGCAAGTGAAGAAAGAAAATAATGATGTGACTAGTGAACATGGTGGTGAGAAACTGAA
CTTATGGAAGATTGGTCTTAATGGGATCGGAGCTGTTTGCTCTTTTGGCGTTGCAGCAGC
AGCTGCTACAGTATGTGTCTTATTCCTCGGACACAACAACATCAAAGTTTGTAAGAAAAA
GAACCAGAAGCTTAGGTTCCAGATTTACTCCGATGATCATAAGAGGATGAATGAAGCTGT
GAATCATGCAACAAAGGTTAATGAAGCAATCTTTGCAATGAAAGGTGTTCCTGTCGTGAG
AGCTCAGATATCTTTTGGAGGTTACTACGATGGAATTTGAATCTCAACCGTCCATAATTC
TCTATGGAATCAAAGGGATCAGATCTAGTCTATCCTCATACCAGCTTCATAAGTTCAATA
GTTTATAGTGTGTATGGCCCTTGTCAATACATTTTGTAAAT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2A951JQ 763 0 0
AAGTTCCCATAGCTTGGGAGCCCGTTTTGGATCTTGATCCGGATCCAAAACAAACCCTTT
TGATGGACTCTGTTCCGTCACCAAGAGTATCCTTCAAGAAAACGAAGGAAACTGAATTTG
CCGACATGAAAACTGACCCACCAGCGAGGATCACGAGTCGTGTGCCTTTGATAGATGCTG
CGAAGCCCTCCGATTGCGAAGGAAACGATGACTTGCAAGTGAAGAAAGAAAATAATGATG
TGACTAGTGAACATGGTGGTGAGAAACTGAACTTATGGAAGATTGGTCTTAATGGGATCG
GAGCTGTTTGCTCTTTTGGCGTTGCAGCAGCAGCTGCTACAGTATGTGTCTTATTCCTCG
GACACAACAACATCAAAGTTTGTAAGAAAAAGAACCAGAAGCTTAGGTTCCAGATTTACT
CCGATGATCATAAGAGGATGAATGAAGCTGTGAATCATGCAACAAAGGTTAATGAAGCAA
TCTTTGCAATGAAAGGTGTTCCTGTCGTGAGAGCTCAGATATCTTTTGGAGGTTACTACG
ATGGAATTTGAATCTCAACCGTCCATAATTCTCTATGGAATCAAAGGGATCAGATTTAGT
CTATCCTCATACCAGCTTCATAAGTTCAATAGTTTATAGTGTGTATGGCCCTTGTCAATA
CATTTTGTAAATTTTGTTCAAATCCGATATATTGATAGATATAGATCATTGTAAAATTTC
ATGTAATATTTTTAATTGTTGTGAAATAACTTAAATATCTTGC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL4577Contig1 947 2 2 U
GGCCTCATCTGGTTGACTCAACAACGACTCTGCCGTTCCCTTTTAGCAGCCATGACGACA
ACTCCTCCTTGCAGGACCATAAACGCTAATAATGCTGTCACCGCGCCGCCGTCGCCTTCG
GGAATGATCTTCCACGGCTGTCGTGATTTCGTTCCGATCGATAAGAGACTTGTCAAACCA
AGCTCACGTGGATTGAATTTGCCGACGAAGAGATTGGCGTGGAGCTTAAGTTCTCCGGGG
AGGTTGTTGCTCTCTTCTTCTTCTTCTCCCGTGGCGTCTAGTTCTACATCGGCGACTGTG
ACATCGAATTCTTCGAATCGATTGGAAGCTTTAGAAGAGGGGATTGAGAAGGTCATTTAT
ACATGTCGATTCATGGCGTTTCTTGGAACATTAGGATCTCTTTTCGGTTCGGTTCTGTGT
TTCATCAAGGGATGTCAGTACGTGGCAGACTCGTTTGTGCAGTACACTGTGAATCGCGGG
AAGGTGATTTTACTTCTGGTAGAAGCTATAGATACATATCTTCTAGGAACTGTGATGTTG
GTCTTTGGAATGGGACTTTACGAGCTGTTCATTAGCAACCTCACGACTTCAGAAACGATT
TCACACGATAATGTTTCCAATAGATCGAGTCTCTTTGGCATGTTCCCCTTAAAGGAGCGA
CCTCAATGGTTAGAGGTGAAAACAGTTAGTGAGCTGAAAACGAAGCTGGGACATGTTATA
GTGATGCTACTGTTGATTGGTTTGTTCGACAAGAGCAGGAAAGTTGCTATAACTTCTGTC
GCGGATTTGCTATGTATCTCTGCTTCTATCTTTCTTTCTTCGGCTTGTCTCTTCTTGCTC
TCTAGGCTCAATGGCTCACACTGAGCTAACAGCGTTACCTTTAAACATATGAAGCTTTGT
ATGATGTGTATAATGTTTTAGTAAAATTTTCACATTCTCTTTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE94TF U 1
AF RR2AE94JQ C 282
BS 1 754 RR2AE94TF
BS 755 947 RR2AE94JQ

RD RR2AE94TF 754 0 0
GGCCTCATCTGGTTGACTCAACAACGACTCTGCCGTTCCCTTTTAGCAGCCATGACGACA
ACTCCTCCTTGCAGGACCATAAACGCTAATAATGCTGTCACCGCGCCGCCGTCGCCTTCG
GGAATGATCTTCCACGGCTGTCGTGATTTCGTTCCGATCGATAAGAGACTTGTCAAACCA
AGCTCACGTGGATTGAATTTGCCGACGAAGAGATTGGCGTGGAGCTTAAGTTCTCCGGGG
AGGTTGTTGCTCTCTTCTTCTTCTTCTCCCGTGGCGTCTAGTTCTACATCGGCGACTGTG
ACATCGAATTCTTCGAATCGATTGGAAGCTTTAGAAGAGGGGATTGAGAAGGTCATTTAT
ACATGTCGATTCATGGCGTTTCTTGGAACATTAGGATCTCTTTTCGGTTCGGTTCTGTGT
TTCATCAAGGGATGTCAGTACGTGGCAGACTCGTTTGTGCAGTACACTGTGAATCGCGGG
AAGGTGATTTTACTTCTGGTAGAAGCTATAGATACATATCTTCTAGGAACTGTGATGTTG
GTCTTTGGAATGGGACTTTACGAGCTGTTCATTAGCAACCTCACGACTTCAGAAACGATT
TCACACGATAATGTTTCCAATAGATCGAGTCTCTTTGGCATGTTCCCCTTAAAGGAGCGA
CCTCAATGGTTAGAGGTGAAAACAGTTAGTGAGCTGAAAACGAAGCTGGGACATGTTATA
GTGATGCTACTGTTGATTGGTTTGTTCGACAAGA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2AE94JQ 666 0 0
TTCTACATCGGCGACTGTGACATCGAATTCTTCGAATCGATTGGAAGCTTTAGAAGAGGG
GATTGAGAAGGTCATTTATACATGTCGATTCATGGCGTTTCTTGGAACATTAGGATCTCT
TTTCGGTTCGGTTCTGTGTTTCATCAAGGGATGTCAGTACGTGGCAGACTCGTTTGTGCA
GTACACTGTGAATCGCGGGAAGGTGATTTTACTTCTGGTAGAAGCTATAGATACATATCT
TCTAGGAACTGTGATGTTGGTCTTTGGAATGGGACTTTACGAGCTGTTCATTAGCAACCT
CACGACTTCAGAAACGATTTCACACGATAATGTTTCCAATAGATCGAGTCTCTTTGGCAT
GTTCCCCTTAAAGGAGCGACCTCAATGGTTAGAGGTGAAAACAGTTAGTGAGCTGAAAAC
GAAGCTGGGACATGTTATAGTGATGCTACTGTTGATTGGTTTGTTCGACAAGAGCAGGAA
AGTTGCTATAACTTCTGTCGCGGATTTGCTATGTATCTCTGCTTCTATCTTTCTTTCTTC
GGCTTGTCTCTTCTTGCTCTCTAGGCTCAATGGCTCACACTGAGCTAACAGCGTTACCTT
TAAACATATGAAGCTTTGTATGATGTGTATAATGTTTTAGTAAAATTTTCACATTCTCTT
TTGCCC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL4578Contig1 739 2 9 U
GGATCATCCAACACACTCTCACTATCAATGGAACAACAATTAACATTAGTGTTGTTGCCT
AACAGCCCCAAAGGCGCCAGCGCCAGCGCCAACTTCGACGAACAAACCCTAGACTCCTCC
TCCTCCTCCTCCTCCTCCTGCACTCAAACCCCTCGAACCTTCCTTAAATTCTTCCTCTAC
TTCTCCCTCGTCGCTCTCGCTTACTATTTCATCATCTCCAGCTTCACCATCTCTCCTCCA
ATCTTCATCTCCCTTGATTCGCCGCCGGTATCTCCTTCCGGCAACGTTTCATTGCCAAAG
TGTGATCTTTTCAGTGGGGATTGGATACCTGATCCGTCGGGTCCTCTCTACACCAATCTC
TCATGTCACCACATTCAGGATTTTCAGAACTGTTTGTTGAATGGACGCCCTGATGTCAAC
TATCTTTTCTGGAGATGGAAGCCTCGCGACTGCGACCTCCCTAGGTTCAGCCCCTCTCAG
TTTCTCGACAGAGTCAGGAACAAATGGTGGGCTTTCGTCGGAGACTCCATCGCTCGTAAC
CATGTCCAGTCTCTCATCTGCATCCTCTCTCAGGTAGAAGAAGTGGTGGAGGTTTATCAC
GATAAGGAGTTCAGATCCAAGATTTGGAGATTCCCTTCTCACAACTTCACACTCTCTGTC
GTCTGGTCTCCTTTCCTTGTCAATCCGAAACACTTGTCAGCAGCAGCAGCTCTGATATAC
AGCTTTACCTCGACAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA22TF U 141
AF RR2C946TF U 1
BS 1 228 RR2C946TF
BS 229 229 RR2EA22TF
BS 230 573 RR2C946TF
BS 574 574 RR2EA22TF
BS 575 589 RR2C946TF
BS 590 590 RR2EA22TF
BS 591 614 RR2C946TF
BS 615 615 RR2EA22TF
BS 616 739 RR2C946TF

RD RR2EA22TF 490 0 0
CACTCAAACCCCTCGAACCTTCCTTAAATTCTTCCTCTACTTCTCCCTCGTCGCTCTCGC
TTACTATTTCATCATCTCCAGCTTCACCATCTCTCCTCCAATCTTCATCTCCCTTGATTC
GCCGCCGGTATCTCCTTCCGGCAACGTTTCATTGCCAAAGTGTGATCTTTTCAGTGGGGA
TTGGATACCTGATCCGTCGGGTCCTCTCTACACCAATCTCTCATGTCACCACATTCAGGA
TTTTCAGAACTGTTTGTTGAATGGACGCCCTGATGTCAACTATCTTTTCTGGAGATGGAA
GCCTCGCGACTGCGACCTCCCTAGGTTCAGCCCCTCTCAGTTTCTCGACAGAGTCAGGAA
CAAATGGTGGGCTTTCGTCGGAGACTCCATCGCTCGTAACCATGTCCAGTCTCTCATCTG
CATCCTCTCTCAGGTAGAAGAAGTGGTGGAGGTTTATCACGATAAGGAGTTCAGATCCAA
GATTTGGAGA

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR2C946TF 739 0 0
GGATCATCCAACACACTCTCACTATCAATGGAACAACAATTAACATTAGTGTTGTTGCCT
AACAGCCCCAAAGGCGCCAGCGCCAGCGCCAACTTCGACGAACAAACCCTAGACTCCTCC
TCCTCCTCCTCCTCCTCCTGCACTCAAACCCCTCGAACCTTCCTTAAATTCTTCCTCTAC
TTCTCCCTCGTCGCTCTCGCTTACTATTTCATCATCTCCAGCTTCACCGTCTCTCCTCCA
ATCTTCATCTCCCTTGATTCGCCGCCGGTATCTCCTTCCGGCAACGTTTCATTGCCAAAG
TGTGATCTTTTCAGTGGGGATTGGATACCTGATCCGTCGGGTCCTCTCTACACCAATCTC
TCATGTCACCACATTCAGGATTTTCAGAACTGTTTGTTGAATGGACGCCCTGATGTCAAC
TATCTTTTCTGGAGATGGAAGCCTCGCGACTGCGACCTCCCTAGGTTCAGCCCCTCTCAG
TTTCTCGACAGAGTCAGGAACAAATGGTGGGCTTTCGTCGGAGACTCCATCGCTCGTAAC
CATGTCCAGTCTCTCATCTGCATCCTCTCTCAG*TAGAAGAAGTGGTGGGGGTTTATCAC
GATAAGGAGTTCAGTTCCAAGATTTGGAGATTCCCTTCTCACAACTTCACACTCTCTGTC
GTCTGGTCTCCTTTCCTTGTCAATCCGAAACACTTGTCAGCAGCAGCAGCTCTGATATAC
AGCTTTACCTCGACAGCTC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4580Contig1 690 2 1 U
GGAAGATTCTTTCATGTGGTCGAAGAAGGAGGTGGAGGAGAAAGAGTAAGAGAAAGGCTC
TTAACTGCTTCAGAGACACAAGAGCTGTTTGTCGTAGAAAACATGACTGCCACTGAAGCT
AATAACCGCAAAGGGGACGATATTGGTATCGAAATACCTGACACTGCTCACCAAATTAGC
AGCGATTCATGGTTCCAGGTGGCGTTCGTGCTCACCACTGGTATAAACAGTGCATACGTG
TTGGGATATTCAGGAACTGTGATGGTTCCTTTAGGTTGGATTGGTGGTGTGGTTGGTCTT
ATCATTGCTACTGCAATCTCTCTCTATGCAAACAGTCTCGTTGCCAAGCTTCATGAGTTT
GGTGGCAGAAGACACTTTCGTTATAGAGACCTTGCTGGATTCATTTACGGTAGAAAGGCT
TATCACCTTACATGGGGATTACAATATGTCAATCTTTTCATGATTAATTGTGGATACATC
ATACTAGCTGGTTCTGCCTTGAAGGCTGTTTATGTGCTCTTCGGGGATGATCATATCATT
AAATTACCTCACTGTATAGCCATTGTTGGTCTTATCTGCGCGGTTTTCGCTATAGGCATT
CCTCATTTATCAGCTCTTGGGACCTGGCTTGTGGTTTCCACCATCCTCAGCCTCATCTAC
ATCGTTGTGGCAATTGTCTTATCAGCTAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H095TF U 1
AF RR2FG49TF U 1
BS 1 690 RR2FG49TF

RD RR2H095TF 326 0 0
GGAAGATTCTTTCATGTGGTC*AAGAAGGAGGTGGAGGA*AAAGA*TAAGAGAAAGGCTC
TTAACTGCTTCAGAGACACAAGAGCTGTTTGTCGTA*AAAACATGACTGCCACTGAAGCT
AATAACCGCAAAGGGGACGATATTGGTATCGAAATACCTGACACTGCTCACCAAATTAGC
AGCGATTCATGGTTCCAGGTGGCGTTCGTGCTCACCACTGGTA**AACAGTGCATACGTG
TTGGGATATTCAGGAACTGTGATGGTTCCTTTAG*TTGGATTG*TGGTGTGGTTGGTCTT
ATCATTGCTACTGCAATCTCTCTCTA

QA 1 326 1 326
DS 

RD RR2FG49TF 690 0 0
GGAAGATTCTTTCATGTGGTCGAAGAAGGAGGTGGAGGAGAAAGAGTAAGAGAAAGGCTC
TTAACTGCTTCAGAGACACAAGAGCTGTTTGTCGTAGAAAACATGACTGCCACTGAAGCT
AATAACCGCAAAGGGGACGATATTGGTATCGAAATACCTGACACTGCTCACCAAATTAGC
AGCGATTCATGGTTCCAGGTGGCGTTCGTGCTCACCACTGGTATAAACAGTGCATACGTG
TTGGGATATTCAGGAACTGTGATGGTTCCTTTAGGTTGGATTGGTGGTGTGGTTGGTCTT
ATCATTGCTACTGCAATCTCTCTCTATGCAAACAGTCTCGTTGCCAAGCTTCATGAGTTT
GGTGGCAGAAGACACTTTCGTTATAGAGACCTTGCTGGATTCATTTACGGTAGAAAGGCT
TATCACCTTACATGGGGATTACAATATGTCAATCTTTTCATGATTAATTGTGGATACATC
ATACTAGCTGGTTCTGCCTTGAAGGCTGTTTATGTGCTCTTCGGGGATGATCATATCATT
AAATTACCTCACTGTATAGCCATTGTTGGTCTTATCTGCGCGGTTTTCGCTATAGGCATT
CCTCATTTATCAGCTCTTGGGACCTGGCTTGTGGTTTCCACCATCCTCAGCCTCATCTAC
ATCGTTGTGGCAATTGTCTTATCAGCTAGA

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL4581Contig1 744 2 2 U
CATCTTTGATAAAGGGTTTTACACAAAGGTAAAAGAGCACAAGCCAGATCTTCTTTAGTT
TTAAGACAAGACTGTAAGGACCAAAATAAAATAAAGACAGAGACTGATTAAATGTAGCTG
TTTTTGGCAGTTGCCGTGACAGCAAACCTTAAGCAAAAGCAGATCACTCGGTAACAATAG
AGGAAAGAAGTTTGATTCAACCGTTCCTCAATTGGCTCGGCTTTTGAAAACATCGAGATC
CATCTCGGTCGGATCGGTAGCTTGAAGCTCAACTTGAATCCCGTCTAGCTCTCTCTTGAA
CCTGTCCTTAAAGCTCGCGTATATCATCTTGCTTCTCACTCTTGCCGTGTCCGGAGACCA
TGCAACGAAAAAAATCTTGCTCTTTTGGCAGTTCTCAGCAGTGACGAAATCAAAATCGAA
GATGGCGTATCGGCATTCATCAGCTGGAAGACTCGCTGCAAAGTCGTCATGGGATTGACC
AGGCTCTCCGAGTTTCTCAACGACCACTTGCTTCTGCAGCTCCTCGATCTTGTAAACGAT
GAAACGGTATGTCCTCTTGGCCTTCAGTTCAAGAAACTTGAGTTTGCAGTCATCGTGGAC
TGCCATTCCTGACGCTGCATTAGCCATGGCTGAATCAAACTAGTTTCTTGCTGAGACGAA
GAAGCTGGAGATGGTGATGACGAAGTCTTTTTTTTTTATTCGGTGTGAGTCTTTTCTCTT
CCTTTCCCTCAGCTTTCTGCGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H422JQB U 1
AF RR2CY59TF C 152
BS 1 653 RR2H422JQB
BS 654 744 RR2CY59TF

RD RR2H422JQB 653 0 0
CATCTTTGATAAAGGGTTTTACACAAAGGTAAAAGAGCACAAGCCAGATCTTCTTTAGTT
TTAAGACAAGACTGTAAGGACCAAAATAAAATAAAGACAGAGACTGATTAAATGTAGCTG
TTTTTGGCAGTTGCCGTGACAGCAAACCTTAAGCAAAAGCAGATCACTCGGTAACAATAG
AGGAAAGAAGTTTGATTCAACCGTTCCTCAATTGGCTCGGCTTTTGAAAACATCGAGATC
CATCTCGGTCGGATCGGTAGCTTGAAGCTCAACTTGAATCCCGTCTAGCTCTCTCTTGAA
CCTGTCCTTAAAGCTCGCGTATATCATCTTGCTTCTCACTCTTGCCGTGTCCGGAGACCA
TGCAACGAAAAAAATCTTGCTCTTTTGGCAGTTCTCAGCAGTGACGAAATCAAAATCGAA
GATGGCGTATCGGCATTCATCAGCTGGAAGACTCGCTGCAAAGTCGTCATGGGATTGACC
AGGCTCTCCGAGTTTCTCAACGACCACTTGCTTCTGCAGCTCCTCGATCTTGTAAACGAT
GAAACGGTATGTCCTCTTGGCCTTCAGTTCAAGAAACTTGAGTTTGCAGTCATCGTGGAC
TGCCATTCCTGACGCTGCATTAGCCATGGCTGAATCAAACTAGTTTCTTGCTG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2CY59TF 593 0 0
AGCAAAAGCGGATCACTCGGTAACAATAGAGGAAAGAAGTTTGATTCAACCGTTCCTCAA
TTGGCTCGGCTTTTGAAAACATCGAGATCCATCTCGGTCGGATCGGTAGCTTGAAGCTCA
ACTTGAATCCCGTCTAGCTCTCTCTTGAACCTGTCCTTAGAGCTCGCGTATATCATCTTG
CTTCTCACTCTTGCCGTGTCCGGAGACCATGCAACGAAGAAGATCTTGCTCTTTTGGCAG
TTCTCAGCAGTGACGAAATCAAAATCGAAGATGGCGTATCGGCATTCATTAGCTGGAAGA
CTCGCTGCAAAGTCGTCATGGGATTGACCAGGCTCTCCGAGTTTCTCAACGACCACTTGC
TTCTGCTGCTCCTCGATCTTGTAAACGATGAAACGGTATGTCCTCTTGGCCTTCAGTTCA
AGAAACTTGAGTTTGCAGTCATCGTGGACTGCCATTCCTGACGCTGCATTAGCCATGGCT
GAATCAAGCTAGTTTCTTGCTGAGACGAAGAAGCTGGAGATGGTGATGACGAAGTCTTTT
TTTTTTATTCGGTGTGAGTCTTTTCTCTTCCTTTCCCTCAGCTTTCTGCGGCC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

CO CL4582Contig1 900 2 2 U
GGAAGTTGAGCGTCACTTTGTGAATGGCGTCGATATCAGCCTTTGGTTACCTTCCTTCCT
CTCCACCGCTCACCGGAGCTTCTTCTTCCTCCACCAACAGATGCAGGACGACCGTGTCTG
CTCGGTTACCCGACCGAACAGATGACTTGTCTCCTCTTCGCTCGTCTGGTGGAGAGTTTG
ATCGCAGAAAATTGTTGGTTTCTTCTGTCGGTTTGCTGATTGGAGCACTAACATACGATG
ATGGAGCCATCGCTGAAGCTTCTCAGTTCGCTGACATGCCAGCGATTAGAGGCAAAGATT
ACGGCAAAACGAAAATGAAGTATCCAGATTATACAGAAACACCTTCTGGTCTTCAGTATA
AGGATTTGCGAGTAGGAACTGGGCCTATACCAAAGAAGGGAGAAAAAGTTGTGGTTGACT
GGGATGGTTACACAATTGGTTACTATGGCCGCATATTCGAAGCACGCAATAAAACCAAAG
GGGGTTCTTTTGAGGGGGAGGAGAAGGAATTTTTCAAATTTACCTTGGGATCTAATGAGG
TGATACCTGCTTTTGAGGAGGCCGTTTCTGGGATGGCTCTTGGTGGTATCAGAAGGTTGG
TTGTACCTCCAGAGTTAGGATACCCAGAAAATGACTACAACAAGAGCGCGCCGAGACCGA
CAACTTTCTCTGGACAACGTGCATTAGATTTTGTGCTCAAGAACCAAGGGCTCATAGACA
AGACACTTCTCTTTGATGTTGAACTCCTCAAAATCGTACCAAATTGATTGGACCAATCCT
ACATTGCCGTATATATTTTGTCATGTGTATACTTCAACAACACAAACAATTGTATACATT
GAACGCAGCTTATACATCAGATAATGTTAGCTCATTTACGAGCTTCAAGAACATGTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG35TF U 1
AF RR2CG35JQ C 226
BS 1 699 RR2CG35TF
BS 700 900 RR2CG35JQ

RD RR2CG35TF 699 0 0
GGAAGTTGAGCGTCACTTTGTGAATGGCGTCGATATCAGCCTTTGGTTACCTTCCTTCCT
CTCCACCGCTCACCGGAGCTTCTTCTTCCTCCACCAACAGATGCAGGACGACCGTGTCTG
CTCGGTTACCCGACCGAACAGATGACTTGTCTCCTCTTCGCTCGTCTGGTGGAGAGTTTG
ATCGCAGAAAATTGTTGGTTTCTTCTGTCGGTTTGCTGATTGGAGCACTAACATACGATG
ATGGAGCCATCGCTGAAGCTTCTCAGTTCGCTGACATGCCAGCGATTAGAGGCAAAGATT
ACGGCAAAACGAAAATGAAGTATCCAGATTATACAGAAACACCTTCTGGTCTTCAGTATA
AGGATTTGCGAGTAGGAACTGGGCCTATACCAAAGAAGGGAGAAAAAGTTGTGGTTGACT
GGGATGGTTACACAATTGGTTACTATGGCCGCATATTCGAAGCACGCAATAAAACCAAAG
GGGGTTCTTTTGAGGGGGAGGAGAAGGAATTTTTCAAATTTACCTTGGGATCTAATGAGG
TGATACCTGCTTTTGAGGAGGCCGTTTCTGGGATGGCTCTTGGTGGTATCAGAAGGTTGG
TTGTACCTCCAGAGTTAGGATACCCAGAAAATGACTACAACAAGAGCGCGCCGAGACCGA
CAACTTTCTCTGGACAACGTGCATTAGATTTTGTGCTCA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2CG35JQ 675 0 0
CACTAACATACGATGATGGAGCCATCGCTGAAGCTTCTCAGTTCGCTGACATGCCAGCGA
TTAGAGGCAAAGATTACGGCAAAACGAAAATGAAGTATCCAGATTATACAGAAACACCTT
CTGGTCTTCAGTATAAGGATTTGCGAGTAGGAACTGGGCCTATACCAAAGAAGGGAGAAA
AAGTTGTGGTTGACTGGGATGGTTACACAATTGGTTACTATGGCCGCATATTCGAAGCAC
GCAATAAAACCAAAGGGGGTTCTTTTGAGGGGGAGGAGAAGGAATTTTTCAAATTTACCT
TGGGATCTAATGAGGTGATACCTGCTTTTGAGGAGGCCGTTTCTGGGATGGCTCTTGGTG
GTATCAGAAGGTTGGTTGTACCTCCAGAGTTAGGATACCCAGAAAATGACTACAACAAGA
GCGCGCCGAGACCGACAACTTTCTCTGGACAACGTGCATTAGATTTTGTGCTCAAGAACC
AAGGGCTCATAGACAAGACACTTCTCTTTGATGTTGAACTCCTCAAAATCGTACCAAATT
GATTGGACCAATCCTACATTGCCGTATATATTTTGTCATGTGTATACTTCAACAACACAA
ACAATTGTATACATTGAACGCAGCTTATACATCAGATAATGTTAGCTCATTTACGAGCTT
CAAGAACATGTAATG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL4583Contig1 1035 2 4 U
GTCAAATTCAATGTGAAACAGAAGCTCTAGAAGAAGTTATCAGTTTGAATGATACATACC
AAGAAACTTCCATTGAAAATCAGTTTTTGGATATTACTACTCTCGAAGAAGAGGGAAACG
GTACATCTGTTGTAAAATCAACTAAGAAGGCTAAAAAGAAGACAAGAAGAAGTCGAGCCA
AGAAGATATTCTCATGTTCGAACACAGGTGTTCCTGACGAATATTCTGATGTCCTTGGTA
AGTATTGGTGCCAACGATATCTCCTCTTCTCCAGATTTGATGAAGGCATCAAAATGGACG
AGGAAGGATGGTTTTCTGTCACTCCTGAAGCTATAGCTAAGCATCATGCCACTCGGTGTA
GCGGAGGGGTAGTCATTGACTGTTTTACAGGAGTTGGTGGGAATGCTATTCAGTTCGCTT
CAAGGAATCAATATGTGATTGCAATTGATTTGGATCCAAAGAAACTTGATTTGGCAAAGC
ATAACGCTGCCATATATGGCGTTGCTGATAAAATCGACTTTGTGAAGGGAGACTTCTTTG
ATTTGGCTCATAACTTGAAGGCAGGCACTGTCTTCCTATCGCCTCCATGGGGAGGCCCTG
ATTATCTTAAAGCGAGTACGTACGACATGAAGACAACGCTGAGACCTCGTGATGGAGACG
CTCTATTTACTGCGGCAATGGACACCGCATCGACTGTCATTATGTTTCTTCCTAGAAATG
TTGATATTAACCAATTGGCAGAGCTCGCCTTATCAACATCTCCTCCATGGTCACTTGAGG
TAGAAAAGAACTACTTAAATGGGAAGCTGAAGGCAATAACAGCATACTACTTCAGACAAG
ATGGTTGTTAGAACTAGGAATAAGACAGACCTTTCTCACCCATTCAATGCATGAATGCCA
CATGTTTCTGCATTTGTGTCAGCTTGTGGAATTCAAGTGAATAACAATGGATTTAGAATC
ATAGTTTTATGCGTTTGTATATATAAAGCGTGTTTTGTATGGGTTATTACTCAGCCTCTC
ATAACACATTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT46TF U 1
AF RR2BT46JQ C 272
BS 1 717 RR2BT46TF
BS 718 718 RR2BT46JQ
BS 719 748 RR2BT46TF
BS 749 1035 RR2BT46JQ

RD RR2BT46TF 752 0 0
GTCAAATTCAATGTGAAACAGAAGCTCTAGAAGAAGTTATCAGTTTGAATGATACATACC
AAGAAACTTCCATTGAAAATCAGTTTTTGGATATTACTACTCTCGAAGAAGAGGGAAACG
GTACATCTGTTGTAAAATCAACTAAGAAGGCTAAAAAGAAGACAAGAAGAAGTCGAGCCA
AGAAGATATTCTCATGTTCGAACACAGGTGTTCCTGACGAATATTCTGATGTCCTTGGTA
AGTATTGGTGCCAACGATATCTCCTCTTCTCCAGATTTGATGAAGGCATCAAAATGGACG
AGGAAGGATGGTTTTCTGTCACTCCTGAAGCTATAGCTAAGCATCATGCCACTCGGTGTA
GCGGAGGGGTAGTCATTGACTGTTTTACAGGAGTTGGTGGGAATGCTATTCAGTTCGCTT
CAAGGAATCAATATGTGATTGCAATTGATTTGGATCCAAAGAAACTTGATTTGGCAAAGC
ATAACGCTGCCATATATGGCGTTGCTGATAAAATCGACTTTGTGAAGGGAGACTTCTTTG
ATTTGGCTCATAACTTGAAGGCAGGCACTGTCTTCCTATCGCCTCCATGGGGAGGCCCTG
ATTATCTTAAAGCGAGTACGTACGACATGAAGACAACGCTGAGACCTCGTGATGGAGACG
CTCTATTTACTGCGGCAATGGACACCGCATCGACTGTCATTATGTTTCTTCCTAGAA*TG
TTGATATTAACCAATTGGCAGAGCTCGC
TTAT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2BT46JQ 764 0 0
CAGATTTGATGAAGGCATCAAAATGGACGAGGAAGGATGGTTTTCTGTCACTCCTGAAGC
TATAGCTAAGCATCATGCCACTCGGTGTAGCGGAGGGGTAGTCATTGACTGTTTTACAGG
AGTTGGTGGGAATGCTATTCAGTTCGCTTCAAGGAATCAATATGTGATTGCAATTGATTT
GGATCCAAAGAAACTTGATTTGGCAAAGCATAACGCTGCCATATATGGCGTTGCTGATAA
AATCGACTTTGTGAAGGGAGACTTCTTTGATTTGGCTCATAACTTGAAGGCAGGCACTGT
CTTCCTATCGCCTCCATGGGGAGGCCCTGATTATCTTAAAGCGAGTACGTACGACATGAA
GACAACGCTGAGACCTCGTGATGGAGACGCTCTATTTACTGCGGCAATGGACACCGCATC
GACTGTCATTATGTTTCTTCCTAGAAATGTTGATATTAACCAATTGGCAGAGCTCGCCTT
ATCAACATCTCCTCCATGGTCACTTGAGGTAGAAAAGAACTACTTAAATGGGAAGCTGAA
GGCAATAACAGCATACTACTTCAGACAAGATGGTTGTTAGAACTAGGAATAAGACAGACC
TTTCTCACCCATTCAATGCATGAATGCCACATGTTTCTGCATTTGTGTCAGCTTGTGGAA
TTCAAGTGAATAACAATGGATTTAGAATCATAGTTTTATGCGTTTGTATATATAAAGCGT
GTTTTGTATGGGTTATTACTCAGCCTCTCATAACACATTTCTTC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL4584Contig1 930 2 6 U
TTTTTGTGGCACCAGAGATTCCTTTTGATCTCATGATTGAGATCCTGAGGAGAATGCCTG
CTAAATCGCTTATGAGGTTCAAGTGTGTCTCAAAGCTCTGGTCTGGTCTGATTCGTTCCC
GATTTTTTTGCAACTTTTATCTTAGGATGGGAGGGACGGGAGTACAGAGGATAGTGATTC
TTCGCGGTTTGATTTTATACACTTTTTGCAGAGAAGCATTTATCTATAATCCCGCCACTA
GACAAAGGTTAAACTCACCCGCTGTCACCTTTGCGCAACAAGAACTTAATAAGCATGTCT
ACTACTTTTTGGGACACGATCCTGTTCTTGATCAATACAGAATAGTCCGCAATGTTTTTG
AGAGGTGGAGAACCTCCGAGTTTTGGGTCTTCGTACTGGAACCTGGAGGTTTTTGGAAAA
AAATTGAGTACAATGATCAACCTCACGTTCCTACAGGACAAGGACTATACATCAACGGAG
TTATATATTATCTGGCTTCCACTGCTACATGTCGCCATAACGTTTACTCTTTTGACGTTA
GGTCTGAAGAATTCCGTGTGATCCAAGCACCTCATGTAATGCCTCAATTTTGTAAGTTAT
GGAATTTCATAGACCATGGTGGGAAACCTGCACTCTTTGATTATACACACATTAGAGAAA
CGGGTGTGTCGGACTTGTGGATCTTGGAGGATGGCCTGGGTGGCACATGGTCGAGGAAGT
TTCCGGCTTGTACGGTGCACAGTAGGGCTCATAACAATGAGATTATATTGGCGTTGCCTT
GTCCTCGTTACCTTCTCTATTACGATCTGATAAAGAATGACTTGAGAAAGGTTAATATCA
TTGGAGCGACAACGCGAGATATGTGGATACACGTTATGTATAATTGTGAGAACATTCTGC
ACTTGGAAACTTGAATAAAATTTGTTCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM19TF U 1
AF RR2FM19JQ C 236
BS 1 689 RR2FM19TF
BS 690 690 RR2FM19JQ
BS 691 699 RR2FM19TF
BS 700 700 RR2FM19JQ
BS 701 717 RR2FM19TF
BS 718 930 RR2FM19JQ

RD RR2FM19TF 723 0 0
TTTTTGTGGCACCAGAGATTCCTTTTGATCTCATGATTGAGATCCTGAGGAGAATGCCTG
CTAAATCGCTTATGAGGTTCAAGTGTGTCTCAAAGCTCTGGTCTGGTCTGATTCGTTCCC
GATTTTTTTGCAACTTTTATCTTAGGATGGGAGGGACGGGAGTACAGAGGATAGTGATTC
TTCGCGGTTTGATTTTATACACTTTTTGCAGAGAAGCATTTATCTATAATCCCGCCACTA
GACAAAGGTTAAACTCACCCGCTGTCACCTTTGCGCAACAAGAACTTAATAAGCATGTCT
ACTACTTTTTGGGACACGATCCTGTTCTTGATCAATACAGAATAGTCCGCAATGTTTTTG
AGAGGTGGAGAACCTCCGAGTTTTGGGTCTTCGTACTGGAACCTGGAGGTTTTTGGAAAA
AAATTGAGTACAATGATCAACCTCACGTTCCTACAGGACAAGGACTATACATCAACGGAG
TTATATATTATCTGGCTTCCACTGCTACATGTCGCCATAACGTTTACTCTTTTGACGTTA
GGTCTGAAGAATTCCGTGTGATCCAAGCACCTCATGTAATGCCTCAATTTTGTAAGTTAT
GGAATTTCATAGACCATGGTGGGAAACCTGCACTCTTTGATTATACACACATTAGAGAAA
CGGGTGTGTCGGACTTGTGGATCTTGGAG*ATGGCCTGG*TGGCACATGGTCGAGGA
GTCTCC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2FM19JQ 695 0 0
CACTAGACAAAGGTTAAACTCACCCGCTGTCACCTTTGCGCAACAAGAACTTAATAAGCA
TGTCTACTACTTTTTGGGACACGATCCTGTTCTTGATCAATACAGAATAGTCCGCAATGT
TTTTGAGAGGTGGAGAACCTCCGAGTTTTGGGTCTTCGTACTGGAACCTGGAGGTTTTTG
GAAAAAAATTGAGTACAATGATCAACCTCACGTTCCTACAGGACAAGGACTATACATCAA
CGGAGTTATATATTATCTGGCTTCCACTGCTACATGTCGCCATAACGTTTACTCTTTTGA
CGTTAGGTCTGAAGAATTCCGTGTGATCCAAGCACCTCATGTAATGCCTCAATTTTGTAA
GTTATGGAATTTCATAGACCATGGTGGGAAACCTGCACTCTTTGATTATACACACATTAG
AGAAACGGGTGTGTCGGACTTGTGGATCTTGGAGGATGGCCTGGGTGGCACATGGTCGAG
GAAGTTTCCGGCTTGTACGGTGCACAGTAGGGCTCATAACAATGAGATTATATTGGCGTT
GCCTTGTCCTCGTTACCTTCTCTATTACGATCTGATAAAGAATGACTTGAGAAAGGTTAA
TATCATTGGAGCGACAACGCGAGATATGTGGATACACGTTATGTATAATTGTGAGAACAT
TCTGCACTTGGAAACTTGAATAAAATTTGTTCTAT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL4585Contig1 576 2 2 U
GGAGACAGTTGGGAAAGATTCTTCTCCGGCGCGTCTCTCCCCTTGTCCTCGCTTCGTCGT
CTGTGAATCGATTCAGGTTAAGAAGTAGTTATGTCACGAGCCACGTACATAGTCGGTGCC
CTTGCGGGATCTGCTGTAGTAGCCTACATCTGTGACAAAGTCATTTCTGACGAAAAGATT
TTCGGAGGCAGTACACCGGGAACTATAACTAACAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAGAG
AGGCTCCAGGCATGGCCAAGAACCGCTGGTCCTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGC
CAGAACTTCATCGTCAAGTCACGCCCTGAATAAACTGCTTCCCTTCTCTCCCACCATTCC
TTATGGATTTCATTTCCATATTATTTGCTCTTTTTCTGCTTTTGACGATCGGCTAATGTC
TCTACCTGGTTGTAGTAATAATTTGTGGGGATGATTGGATGGATGGATACCACATTGTTC
AGTCCAAAGCTTTCTCGATATGCAATTGTTTTTTTGTAACGTTTTAGTGATTTTGACGAT
AAAATAAAAATCAAGCCAATAAGACTTGGCAGCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG78TF U 1
AF RR2C021TF U 68
BS 1 545 RR2AG78TF
BS 546 576 RR2C021TF

RD RR2AG78TF 545 0 0
GGAGACAGTTGGGAAAGATTCTTCTCCGGCGCGTCTCTCCCCTTGTCCTCGCTTCGTCGT
CTGTGAATCGATTCAGGTTAAGAAGTAGTTATGTCACGAGCCACGTACATAGTCGGTGCC
CTTGCGGGATCTGCTGTAGTAGCCTACATCTGTGACAAAGTCATTTCTGACGAAAAGATT
TTCGGAGGCAGTACACCGGGAACTATAACTAACAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAGAG
AGGCTCCAGGCATGGCCAAGAACCGCTGGTCCTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGC
CAGAACTTCATCGTCAAGTCACGCCCTGAATAAACTGCTTCCCTTCTCTCCCACCATTCC
TTATGGATTTCATTTCCATATTATTTGCTCTTTTTCTGCTTTTGACGATCGGCTAATGTC
TCTACCTGGTTGTAGTAATAATTTGTGGGGATGATTGGATGGATGGATACCACATTGTTC
AGTCCAAAGCTTTCTCGATATGCAATTGTTTTTTTGTAACGTTTTAGTGATTTTGACGAT
AAAAT

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2C021TF 509 0 0
TCGATTCAGGTTAAGAAGTAGTTATGTCACGAGCCACGTACATAGTCGGTGCCCTTGCGG
GATCTGCTGTAGTAGCCTACATCTGTGACAAAGTCATTTCTGACGAAAAGATTTTCGGAG
GCAGTACACCGGGAACTATAACTAACAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAGAGAGGCTCC
AGGCATGGCCAAGAACCGCTGGTCCTCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACT
TCATCGTCAAGTCACGCCCTGAATAAACTGCTTCCCTTCTCTCCCACCATTCCTTATGGA
TTTCATTTCCATATTATTTGCTCTTTTTCTGCTTTTGACGATCGGCTAATTTCTCTACCT
GGTTGTAGTAATAATTTGTGGGGATGATTGGATGGATGGATACCACATTGTTCAGTCCAA
AGCTTTCTCGATATGCAATTGTTTTTTTGTAACGTTTTAGTGATTTTGACGATAAAATAA
AAATCAAGCCAATAAGACTTGGCAGCTAT

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 2

CO CL4586Contig1 1299 2 2 U
GCGAGTCGAAACCGCGATATGGAGAACCAGATTCAGATCGGAGGCTCATCACATCTTCGT
GGTCTTCTTCATCGTGATCCCCGCAGTCTCAATGGCGGTGTACAAAGTCAAATTCGCTGA
CCGAGTCATCATCGAAACGGAGCCGTCGATACGTCAAAAGGGAATCATCAAAACTGATAT
CCATTTCCAAGAGATCCTCACTGAACATTCAAAGGCTTCAGAGAATTCATCAGCTAGGCA
TTATGATTATCCAGTGTTAGCTTACATTACTCCATGGAACTCTAAAGGATATGATATGGC
AAAGATATACAACTCCAAGTTTACTCATTTATCACCGGTTTGGTACGACCTGAAGAGTAG
TCAAGGAAATGGATTGGTTTTGGAAGGGAGGCATAATGCTGATAAGGGATGGATCCAAGA
CCTTCGTTCAAGAGGAAACGCCATGATATTACCAAGAGTTGTTCTAGAAGCAGTTCCAGA
GGAGCTGCTTAGTAAAAAGAAACTAAGGGCAAAAGCTATTAACCTGATTGTCACAGAGTG
CAAGGAAATGGAGTATGATGGTATTGTGCTAGAGTCTTGGTCAAGGTGGGCAGCTTATGG
TGTTTTGCATGACCCGAACATGCGGAAAATGGCACTGCAATTCGTAAAACAACTTGGAGA
CGCCCTTCACGAGCAGCATATGCAGTTCATGTATGTCATTGGTCCACCACGTTCGGACAC
GCTCCAAATGTACGATTTTGGACCAGAAGATCTTCAGTTCTTGAAAGATTCGGTGGACGG
ATTCTCTTTAATGACCTACGATTTCTCAAATGCCCAGAACCCTGGCCCCAATGCTCCTCT
CAAGTGGATAGATCTCACCCTCAAACTCCTACTTGGCTCATCCAACAACGTAGACTCAAG
CCTGGCAAGAAAGGTTCTTCTTGGTATCAACTTCTACGGCAACGATTTTGCAATCTCTGG
AGGAGGTGGAGGCGCTATCACTGGAAGGGATTACCTAGCTTTACTCCAGAAACACAAGCC
GACGTTGCATTGGGACAAAGAAAGCGGCGAGCATATTATCATGTATAGAGATGATAAGAA
CATCAAGCATGCTGTTTTCTATCCTACATTGATGTCAATCCTTCTACGGCTTGAGAATGC
TCGTCTCTGGGGTATCGGCATTTCCATCTGGGAGATTGGACAAGGATTAGATTATTTCTT
TGATCTTTTGTAAGTTTCTCACATTGCATCATGATTCTGTTTTATTTCATACTCTTTGTT
AACTTAAAATAACTGCTGAGAAATTGAAATTAGTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD31TF U 1
AF RR2GD31JQ C 518
BS 1 738 RR2GD31TF
BS 739 1299 RR2GD31JQ

RD RR2GD31TF 752 0 0
GCGAGTCGAAACCGCGATATGGAGAACCAGATTCAGATCGGAGGCTCATCACATCTTCGT
GGTCTTCTTCATCGTGATCCCCGCAGTCTCAATGGCGGTGTACAAAGTCAAATTCGCTGA
CCGAGTCATCATCGAAACGGAGCCGTCGATACGTCAAAAGGGAATCATCAAAACTGATAT
CCATTTCCAAGAGATCCTCACTGAACATTCAAAGGCTTCAGAGAATTCATCAGCTAGGCA
TTATGATTATCCAGTGTTAGCTTACATTACTCCATGGAACTCTAAAGGATATGATATGGC
AAAGATATACAACTCCAAGTTTACTCATTTATCACCGGTTTGGTACGACCTGAAGAGTAG
TCAAGGAAATGGATTGGTTTTGGAAGGGAGGCATAATGCTGATAAGGGATGGATCCAAGA
CCTTCGTTCAAGAGGAAACGCCATGATATTACCAAGAGTTGTTCTAGAAGCAGTTCCAGA
GGAGCTGCTTAGTAAAAAGAAACTAAGGGCAAAAGCTATTAACCTGATTGTCACAGAGTG
CAAGGAAATGGAGTATGATGGTATTGTGCTAGAGTCTTGGTCAAGGTGGGCAGCTTATGG
TGTTTTGCATGACCCGAACATGCGGAAAATGGCACTGCAATTCGTAAAACAACTTGGAGA
CGCCCTTCACGAGCAGCATATGCAGTTCATGTATGTCATTGGTCCACCACGTTCGGACAC
GCTCCAAATGTACGATTT
GGACAGAAGATCTT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2GD31JQ 782 0 0
TATTAA
CTGATTGTCACAGAGTGCAAGGAAATGGAGTATGATGGTATTGTGCTAGAGTCTTGGTCA
AGGTGGGCAGCTTATGGTGTTTTGCATGACCCGAACATGCGGAAAATGGCACTGCAATTC
GTAAAACAACTTGGAGACGCCCTTCACGAGCAGCATATGCAGTTCATGTATGTCATTGGT
CCACCACGTTCGGACACGCTCCAAATGTACGATTTTGGACCAGAAGATCTTCAGTTCTTG
AAAGATTCGGTGGACGGATTCTCTTTAATGACCTACGATTTCTCAAATGCCCAGAACCCT
GGCCCCAATGCTCCTCTCAAGTGGATAGATCTCACCCTCAAACTCCTACTTGGCTCATCC
AACAACGTAGACTCAAGCCTGGCAAGAAAGGTTCTTCTTGGTATCAACTTCTACGGCAAC
GATTTTGCAATCTCTGGAGGAGGTGGAGGCGCTATCACTGGAAGGGATTACCTAGCTTTA
CTCCAGAAACACAAGCCGACGTTGCATTGGGACAAAGAAAGCGGCGAGCATATTATCATG
TATAGAGATGATAAGAACATCAAGCATGCTGTTTTCTATCCTACATTGATGTCAATCCTT
CTACGGCTTGAGAATGCTCGTCTCTGGGGTATCGGCATTTCCATCTGGGAGATTGGACAA
GGATTAGATTATTTCTTTGATCTTTTGTAAGTTTCTCACATTGCATCATGATTCTGTTTT
ATTTCATACTCTTTGTTAACTTAAAATAACTGCTGAGAAATTGAAATTAGTTAATC

QA 7 782 7 782
DS 



AS 1 2

CO CL4587Contig1 564 2 2 U
GGATTTTCAATTGGCTACTAAGAGCATCATTAACCCAACAACTCTAATAGGAGCGTTTAA
TCATTTTTTAACAATAGATGAATTGTAAGCAATTTTGTTAAGTAACCTCTAATTAAATGT
CCTCCAGTAGTAGATGTTTATTTAAGGAGTGTTTAAATGGTTTAATCGTCGATCAAAACA
GAGAGGAAGAGTCTTCGAGCGATTCATCATCGAGGAGAGATCACCGAGAACCGCCGAGAG
AGACTCCGAGTGAGAGGCATAGTTCTCGACGAAAGCCACCGAGAATCATCGAAGAAAGAC
ACGACACAGACGCAGAGTCGTCGACGAAACCCACCGAGCCAGATGCGAACTCTTCAAAGA
AACCCACTCAGACAGAGACAGAGGCGACGAATAAACCCACCGAGACAAACACCGATTGAT
TCCCCGTCGAATTGAGATCAAGTCTCCGCCGATTGATTCATCCGTCGAGGAGAGATCAAT
CATGAAGTTTCGAAATCGAAACCGTCGACGAGAGAAAGAGATAGAAAAGGCAGAGAGATA
GCATGAATGTATGATGCGTGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AA22TF C 1
AF RR2AA22JQ U 88
BS 1 87 RR2AA22TF
BS 88 564 RR2AA22JQ

RD RR2AA22TF 564 0 0
GGATTTTCAATTGGCTACTAAGAGCATCATTAACCCAACAACTCTAATAGGAGCGTTTAA
TCATTTTTTAACAATAGATGAATTGTAAGCAATTTTGTTAAGTAACCTCTAATTAAATGT
CCTCCAGTAGTAGATGTTTATTTAAGGAGTGTTTAAATGGTTTAATCGTCGATCAAAACA
GAGAGGAAGAGTCTTCGAGCGATTCATCATCGAGGAGAGATCACCGAGAACCGCCGAGAG
AGACTCCGAGTGAGAGGCATAGTTCTCGACGAAAGCCACCGAGAATCATCGAAGAAAGAC
ACGACACAGACGCAGAGTCGTCGACGAAACCCACCGAGCCAGATGCGAACTCTTCAAAGA
AACCCACTCAGACAGAGACAGAGGCGACGAATAAACCCACCGAGACAAACACCGATTGAT
TCCCCGTCGAATTGAGATCAAGTCTCCGCCGATTGATTCATCCGTCGAGGAGAGATCAAT
CATGAAGTTTCGAAATCGAAACCGTCGACGAGAGAAAGAGATAGAAAAGGCAGAGAGATA
GCATGAATGTATGATGCGTGTCCC

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2AA22JQ 477 0 0
AGCAATTTTGTTAAGTAACCTCTAATTAAATGTCCTCCAGTAGTAGATGTTTATTTAAGG
AGTGTTTAAATGGTTTAATCGTCGATCAAAACAGAGAGGAAGAGTCTTCGAGCGATTCAT
CATCGAGGAGAGATCACCGAGAACCGCCGAGAGAGACTCCGAGTGAGAGGCATAGTTCTC
GACGAAAGCCACCGAGAATCATCGAAGAAAGACACGACACAGACGCAGAGTCGTCGACGA
AACCCACCGAGCCAGATGCGAACTCTTCAAAGAAACCCACTCAGACAGAGACAGAGGCGA
CGAATAAACCCACCGAGACAAACACCGATTGATTCCCCGTCGAATTGAGATCAAGTCTCC
GCCGATTGATTCATCCGTCGAGGAGAGATCAATCATGAAGTTTCGAAATCGAAACCGTCG
ACGAGAGAAAGAGATAGAAAAGGCAGAGAGATAGCATGAATGTATGATGCGTGTCCC

QA 1 477 1 477
DS 



AS 1 2

CO CL4588Contig1 899 2 2 U
GAAACTTAAAAGCTCCAGAGAGATTTTCCCCAGATTTCAATTTTCTACGTGAGTGACGAT
GGCGCTTCGTGCTACAACTCAAGCGACTGCTCGTATCGCGACGAATCTCGGACGTGTAGG
TCGGACTTTCTCAACTGACGCGGTGGTGGAGTCGGATTACAAGCGCGGCGAGATCGGTAG
TGTCTCCGGAATCCCGGAGGAGCATCTTGCACGAAAGGTGATAATATACTCACCGGCAAG
AACAGCGACACAGCAAGGATCTGGAAAACTTGGGAAATGGAAGATCAATTTCGTCTCCAC
CCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGATGGACTTCTACAGGTGACCCTTATGCCAATGT
TGGTGACTCCGCTCTTGGTTTTGATTCTGAGGAAGCTGCTAAGTCTTTTGCTCAGCGTCA
TGGCTGGGATTATGTGGTAATATATGTTCTTCCCTTCTTTTTCATTATGACCTCTGAGTT
GTGTCCTGTCTCCGTTCTATGATCCCTTATATTAGTTAAAGAGTACTTAAAATCGTATAC
CTTGACTCCATGGCAGGTCAAGAGTCCCAAAACACCGTTATTGAAGGCTAAGTCTTACTC
AGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATCGTTACATCATCTTCT
TCTTCCATTTCTCGACCCAAAGGAGACACTTCGCTTTGATATAAATGGAAAGCGCTCATT
TTTATTCGTTACTTTTAGCATCTGTGAGCTTTTTCTCTGAACTATTATCCATGGTTGGAT
TTTACTTTTGTTTTTCTCTATCTTCCCTTATTACTACACAATAATATGATGATGATGATG
ACAAACACACACCTCCTTTGGTATTTCATCAAGCTTTTATGGTTAATTTTACTTGATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE03TF U 1
AF RR2AE03JQ C 297
BS 1 789 RR2AE03TF
BS 790 899 RR2AE03JQ

RD RR2AE03TF 789 0 0
GAAACTTAAAAGCTCCAGAGAGATTTTCCCCAGATTTCAATTTTCTACGTGAGTGACGAT
GGCGCTTCGTGCTACAACTCAAGCGACTGCTCGTATCGCGACGAATCTCGGACGTGTAGG
TCGGACTTTCTCAACTGACGCGGTGGTGGAGTCGGATTACAAGCGCGGCGAGATCGGTAG
TGTCTCCGGAATCCCGGAGGAGCATCTTGCACGAAAGGTGATAATATACTCACCGGCAAG
AACAGCGACACAGCAAGGATCTGGAAAACTTGGGAAATGGAAGATCAATTTCGTCTCCAC
CCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGATGGACTTCTACAGGTGACCCTTATGCCAATGT
TGGTGACTCCGCTCTTGGTTTTGATTCTGAGGAAGCTGCTAAGTCTTTTGCTCAGCGTCA
TGGCTGGGATTATGTGGTAATATATGTTCTTCCCTTCTTTTTCATTATGACCTCTGAGTT
GTGTCCTGTCTCCGTTCTATGATCCCTTATATTAGTTAAAGAGTACTTAAAATCGTATAC
CTTGACTCCATGGCAGGTCAAGAGTCCCAAAACACCGTTATTGAAGGCTAAGTCTTACTC
AGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATCGTTACATCATCTTCT
TCTTCCATTTCTCGACCCAAAGGAGACACTTCGCTTTGATATAAATGGAAAGCGCTCATT
TTTATTCGTTACTTTTAGCATCTGTGAGCTTTTTCTCTGAACTATTATCCATGGTTGGAT
TTTACTTTT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2AE03JQ 603 0 0
CCACCCTCAAGTGGGAGAATCCATTGATGGGATGGACTTCTACAGGTGACCCTTATGCCA
ATGTTGGTGACTCCGCTCTTGGTTTTGATTCTGAGGAAGCTGCTAAGTCTTTTGCTCAGC
GTCATGGCTGGGATTATGTGGTAATATATGTTCTTCCCTTCTTTTTCATTATGACCTTTG
AGTTGTGTCCTGTCTCCGTTCTATGATCCCTTATATTAGTTAAAGAGTACTTAAAATCGT
ATACCTTGACTCCATGGCAGGTCAAGAGTCCCAAAACACCGTTATTGAAGGCTAAGTCTT
ACTCAGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAGCCTCAACCACAGAACTGATCGTTACATCATC
TTCTTCTTCCATTTCTCGACCCAAAGGAGACACTTCGCTTTGATATAAATGGAAGGCGCT
CATTTTTATTCGTTACTTTTAGCATCTGTGAGCTTTTTTTTTGAACTATTATCCATGGTT
GGATTTTACTTTTGTTTTTCTCTATCTTCCCTTATTACTACACAATAATATGATGATGAT
GATGACAAACACACACCTCCTTTGGTATTTCATCAAGCTTTTATGGTTAATTTTACTTGA
TAT

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL4589Contig1 1291 2 2 U
GGGCGCCAGTAAAGAATCAAATATTCACACACTGTCTGCGAAGAAAGAAGAGGATAGATT
GAACTCACGAAAACTCTGGGAGAAGAAGATTAAGAGAGAAATGCTTAGTTTGAACTCGCT
TCGTCTTCCATTCCCAAACCCTAGTCCTCCGAACTCTTCTTCCTCGTCGTCAAGGAGATG
CGTCTCCGCTTGCCCAATTTCGGTCGTTTTTTCGGTTCGATGCTTCTCTAGAGGTTTGCG
TCGAAATGAATCTCGGAGATGTTTCCAACGAAATGCGTCTTGTTACCTCGATGAGAAATC
TGAGTTTGAAGAGAAAGATAGAAATCTTGATGCATTGGTCGGCACATCGATAGCTCACCC
GACACAGAGAGTACTTAAGCTCTTGGCTGTATCCGCCCCGCTCGCATTGCTTGGAGCTGA
TCCAGCTTTTGCGGTGGTTTCGCAAATTCCGCAGTCATTTGTCACTTCTCTTGGAGACCT
CGGAGACATTAGCTCAGGTTTTGCTTCGGCCTTCTTGCTTATATTCTTCTCTGAACTTGG
AGATAAAACTTTCTTCATTGCGGCCCTTTTAGCAGCAAGGAACAATGCTGCTACTGTTTT
CGCCGGGACTTTTGGCGCTCTTGGGATTATGACGATAATATCTGTAGTGCTTGGACGGAC
TTTCCACTATGTTGATGAAATTCTCCCCTTCAGGTTTGGTGAGACGGATCTGCCTATAGA
TGATATTGCAGCAGTTTGTCTTCTGGTGTACTTCGGTGTTTCGACGTTAGCAGATGCTAT
CTCTGACGATGGACTTAAAGCTGAAGAAGAACAGAAAGAAGCAGAACTAGCGGTTTCAGA
GCTTTCAGGTAACGGAGCCGGGATAGCAGCAGCCGCGAACACCATCATCAGCACTTTCGC
ATTGGTTTTTGTTGCGGAATGGGGTGATAAATCCTTCTTCTCAACAATTGCTCTTGCGGC
AGCGTCATCGCCATTGGGTGTCATCGCTGGAGCATTGGCGGGTCACGGTGCTGCGACTCT
GCTTGCAGTTTTGGGAGGTTCTTTGCTGGGAAACTTCTTGTCAGAGAAGGCAATAGCTTA
TGTCGGAGGAGTTTTGTTTCTCGTGTTTGCTGCTGTGACAGTGTCTGAGATCATTACGTA
AGTGACGAAATTAATAATAATATTTCTTTTCCTCTTATTTGTTTGCGAATTTAAAATACA
ATTTTCCTGTTATTTGTAAATTTTTATCATTGTTTACTGTCCACTCTTTTTCTGCTAACT
ATACTGTGGATTCACAGTTTTCATGTGTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ31TF U 1
AF RR2CJ31JQ C 570
BS 1 654 RR2CJ31TF
BS 655 1291 RR2CJ31JQ

RD RR2CJ31TF 654 0 0
GGGCGCCAGTAAAGAATCAAATATTCACACACTGTCTGCGAAGAAAGAAGAGGATAGATT
GAACTCACGAAAACTCTGGGAGAAGAAGATTAAGAGAGAAATGCTTAGTTTGAACTCGCT
TCGTCTTCCATTCCCAAACCCTAGTCCTCCGAACTCTTCTTCCTCGTCGTCAAGGAGATG
CGTCTCCGCTTGCCCAATTTCGGTCGTTTTTTCGGTTCGATGCTTCTCTAGAGGTTTGCG
TCGAAATGAATCTCGGAGATGTTTCCAACGAAATGCGTCTTGTTACCTCGATGAGAAATC
TGAGTTTGAAGAGAAAGATAGAAATCTTGATGCATTGGTCGGCACATCGATAGCTCACCC
GACACAGAGAGTACTTAAGCTCTTGGCTGTATCCGCCCCGCTCGCATTGCTTGGAGCTGA
TCCAGCTTTTGCGGTGGTTTCGCAAATTCCGCAGTCATTTGTCACTTCTCTTGGAGACCT
CGGAGACATTAGCTCAGGTTTTGCTTCGGCCTTCTTGCTTATATTCTTCTCTGAACTTGG
AGATAAAACTTTCTTCATTGCGGCCCTTTTAGCAGCAAGGAACAATGCTGCTACTGTTTT
CGCCGGGACTTTTGGCGCTCTTGGGATTATGACGATAATATCTGTAGTGCTTGG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2CJ31JQ 722 0 0
TAGCAGCAAGGAACAATGCTGCTACTGTTTTCGCCGGGACTTTTGGCGCTCTTGGGATTA
TGACGATAATATCTGTAGTGCTTGGACGGACTTTCCACTATGTTGATGAAATTCTCCCCT
TCAGGTTTGGTGAGACGGATCTGCCTATAGATGATATTGCAGCAGTTTGTCTTCTGGTGT
ACTTCGGTGTTTCGACGTTAGCAGATGCTATCTCTGACGATGGACTTAAAGCTGAAGAAG
AACAGAAAGAAGCAGAACTAGCGGTTTCAGAGCTTTCAGGTAACGGAGCCGGGATAGCAG
CAGCCGCGAACACCATCATCAGCACTTTCGCATTGGTTTTTGTTGCGGAATGGGGTGATA
AATCCTTCTTCTCAACAATTGCTCTTGCGGCAGCGTCATCGCCATTGGGTGTCATCGCTG
GAGCATTGGCGGGTCACGGTGCTGCGACTCTGCTTGCAGTTTTGGGAGGTTCTTTGCTGG
GAAACTTCTTGTCAGAGAAGGCAATAGCTTATGTCGGAGGAGTTTTGTTTCTCGTGTTTG
CTGCTGTGACAGTGTCTGAGATCATTACGTAAGTGACGAAATTAATAATAATATTTCTTT
TCCTCTTATTTGTTTGCGAATTTAAAATACAATTTTCCTGTTATTTGTAAATTTTTATCA
TTGTTTACTGTCCACTCTTTTTCTGCTAACTATACTGTGGATTCACAGTTTTCATGTGTA
CT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL4590Contig1 823 2 2 U
AGATGGAAAGCAAAACGTATGGTCCATTAATAAGTGAACCACTGTTTAGCTAAAAAAAGC
AGACTCACCTTTCCAATCTTGAACACACAACACACAGTCGCCATCTCTCTCTTTATCTCA
CACCCATAAATTTAGGGAATCAAAAGAATATTAACAATAGAAAGAAAAAAAACCTTTTTA
TCTTCAAGAATTAAGAAGGTGTGTGCTGGGTTGCAAAACCTAATTCAAGATCCTCTCACT
CAAAGAAAGATTCAAGATCAGTAGCAAAGGAGGTCAGGTACAATGGCGAGAGAGAAGATA
AGGATAAAGAAGATAGATAACCTAACAGCGAGACAAGTTACGTTCTCTAAGAGAAGAAGG
GGAATCATCAAGAAAGCCGGTGAACTTTCGATTCTTTGCGATGCTGATGTTGCTCTCATC
ATCTTCTCTGCCACTGGAAAGCTCTTCGAGTTCTCTAGCTCAAGGTATGTATTCTTCCAT
TTTGTCGAATCTCTATCACTTTCTTTTTCAATCTTTGCTTGTATTATATATACAAAACAT
GATTGGAAAATGATCATTATGTTAAGATATGTAAATATATGAGATTTTTAGTTATATTTT
CTACTTTCTGAAATAATTTATTTCTTGGGCTCGGAGAAATCATGTACGGAATTAGCTCCG
TGTCACGGCGTAATTTGATGATAAATATTGAAGCAGGAAAAATAAAGGATTCTGACGACC
TAACATGATTGTACTTGTTCTTATCCCTTTTCTCTAGTAAGAATATAAGAATTATGTTTA
CTTAACTTACTCATCTTGTAATTACGTTAATATGACATAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F113TF U 1
AF RR2F113JQ C 208
BS 1 696 RR2F113TF
BS 697 823 RR2F113JQ

RD RR2F113TF 701 0 0
AGATGGAAAGCAAAACGTATGGTCCATTAATAAGTGAACCACTGTTTAGCTAAAAAAAGC
AGACTCACCTTTCCAATCTTGAACACACAACACACAGTCGCCATCTCTCTCTTTATCTCA
CACCCATAAATTTAGGGAATCAAAAGAATATTAACAATAGAAAGAAAAAAAACCTTTTTA
TCTTCAAGAATTAAGAAGGTGTGTGCTGGGTTGCAAAACCTAATTCAAGATCCTCTCACT
CAAAGAAAGATTCAAGATCAGTAGCAAAGGAGGTCAGGTACAATGGCGAGAGAGAAGATA
AGGATAAAGAAGATAGATAACCTAACAGCGAGACAAGTTACGTTCTCTAAGAGAAGAAGG
GGAATCATCAAGAAAGCCGGTGAACTTTCGATTCTTTGCGATGCTGATGTTGCTCTCATC
ATCTTCTCTGCCACTGGAAAGCTCTTCGAGTTCTCTAGCTCAAGGTATGTATTCTTCCAT
TTTGTCGAATCTCTATCACTTTCTTTTTCAATCTTTGCTTGTATTATATATACAAAACAT
GATTGGAAAATGATCATTATGTTAAGATATGTAAATATATGAGATTTTTAGTTATATTTT
CTACTTTCTGAAATAATTTATTTCTTGGGCTCGGAGAAATCATGTACGGAATTAGCTCCG
TGTCACGGCGTAATTTGATGATAAATATTGAAGCAG
AAAAT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2F113JQ 616 0 0
GGGTTGCAAAACCTAATTCAAGATCCTCTCACTCAAAGAAAGATTCAAGATCAGTAGCAA
AGGAGGTCAGGTACAATGGCGAGAGAGAAGATAAGGATAAAGAAGATAGATAACCTAACA
GCGAGACAAGTTACGTTCTTTAAGAGAAGAAGGGGAATCATCAAGAAAGCCGGTGAACTT
TCGATTCTTTGCGATGCTGATGTTGCTCTCATCATTTTTTCTGCCACTGGAAAGCTCTTC
GAGTTCTCTAGCTCAAGGTATGTATTCTTCCATTTTGTCGAATCTCTATCACTTTCTTTT
TCAATCTTTGCTTGTATTATATATACAAAACATGATTGGAAAATGATCATTATGTTAAGA
TATGTAAATATATGAGATTTTTAGTTATATTTTCTACTTTCTGAAATAATTTATTTCTTG
GGCTCGGAGAAATCATGTACGGAATTAGCTCCGTGTCACGGCGTAATTTGATGATAAATA
TTGAAGCAGGAAAAATAAAGGATTCTGACGACCTAACATGATTGTACTTGTTCTTATCCC
TTTTCTCTAGTAAGAATATAAGAATTATGTTTACTTAACTTACTCATCTTGTAATTACGT
TAATATGACATAATTT

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL4591Contig1 772 2 2 U
GGAGACAGAAGAAGGATTGTTGAGAACCAAAAAGAAAAAAAATCGAAGGAGGAAAAGGGA
TTTGGTTTTATTGGAGAGTGTGAATTTGTTTAGCAGCGCCGAGATTTACAAATAGGAGGG
TGAATTTGAGCAGAGAATGGAAGAAATAAGATCAGCGATGGAACAGCAAATGAATCTGAT
GGCGGATCTGGTCCAGAAACTCTCCGGAGAGCTCCGTACCGGATTGCAACCTGCCTACGA
TAATTTCATTGGTTTTTTCCACGCAATTGATTGGAAGGAACCTTGGATTATGGGATTAAT
GACGTTCCATGCTCTGGTGCTAATTGTGACTCTTGTTTCGAGAAGGCATCTCAACTTCCA
TATGTTCTTGTTCTTATTGTCTTTGGGTGGAGTCTACTTTGCAGAGAGTCTCAACCGAGT
CTTGAGAAAAAACTGGAGGAGCTTCTCAACTCAGAATTACTTTGGCCCCCACGGAGCCTT
CCTATCTGTTCTCTGATAAACACACTGTTCTCGCTTTGCTACCTTATTGTAAAATGGAAA
AGAGCTGAGCTCAGGCATCGTGCAAGGCTTGCTCGTCCCAAGCATGAATAATAGATCCCA
ACTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTCTTTCTCGTATCACATCCTTTTTGTCACATATATGTAT
ACTCTCCTCCCTCATTTTGCAATGCAAACTGTTAGTTTTCTTTTCTTTTTTCTTTTTCTT
TTTTTTTGTTAACAGCAAACAGTTAGTTTTCTATTTTATGTATTTCGTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK26TF U 1
AF RR2EK26JQ C 45
BS 1 703 RR2EK26TF
BS 704 772 RR2EK26JQ

RD RR2EK26TF 704 0 0
GGAGACAGAAGAAGGATTGTTGAGAACCAAAAAGAAAAAAAATCGAAGGAGGAAAAGGGA
TTTGGTTTTATTGGAGAGTGTGAATTTGTTTAGCAGCGCCGAGATTTACAAATAGGAGGG
TGAATTTGAGCAGAGAATGGAAGAAATAAGATCAGCGATGGAACAGCAAATGAATCTGAT
GGCGGATCTGGTCCAGAAACTCTCCGGAGAGCTCCGTACCGGATTGCAACCTGCCTACGA
TAATTTCATTGGTTTTTTCCACGCAATTGATTGGAAGGAACCTTGGATTATGGGATTAAT
GACGTTCCATGCTCTGGTGCTAATTGTGACTCTTGTTTCGAGAAGGCATCTCAACTTCCA
TATGTTCTTGTTCTTATTGTCTTTGGGTGGAGTCTACTTTGCAGAGAGTCTCAACCGAGT
CTTGAGAAAAAACTGGAGGAGCTTCTCAACTCAGAATTACTTTGGCCCCCACGGAGCCTT
CCTATCTGTTCTCTGATAAACACACTGTTCTCGCTTTGCTACCTTATTGTAAAATGGAAA
AGAGCTGAGCTCAGGCATCGTGCAAGGCTTGCTCGTCCCAAGCATGAATAATAGATCCCA
ACTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTCTTTCTCGTATCACATCCTTTTTGTCACATATATGTAT
ACTCTCCTCCCTCATTTTGCAATGCAAACTGTTAGTTTTCTTT
C

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2EK26JQ 728 0 0
GAAGGAGGAAAAGGGATTTGGTTTTATTGGAGAGTGTGAATTTGTTTAGCAGCGCCGAGA
TTTACAAATAGGAGGGTGAATTTGAGCAGAGAATGGAAGAAATAAGATCAGCGATGGAAC
AGCAAATGAATCTGATGGCGGATCTGGTCCAGAAACTCTCCGGAGAGCTCCGTACCGGAT
TGCAACCTGCCTACGATAATTTCATTGGTTTTTTCCACGCAATTGATTGGAAGGAACCTT
GGATTATGGGATTAATGACGTTCCATGCTCTGGTGCTAATTGTGACTCTTGTTTCGAGAA
GGCATCTCAACTTCCATATGTTCTTGTTCTTATTGTCTTTGGGTGGAGTCTACTTTGCAG
AGAGTCTCAACCGAGTCTTGAGAAAAAACTGGAGGAGCTTCTCAACTCAGAATTACTTTG
GCCCCCACGGAGCCTTCCTATCTGTTCTTTGATAAACACACTGTTCTCGCTTTGCTACCT
TATTGTAAAATGGAAAAGAGCTGAGCTCAGGCATCGTGCAAGGCTTGCTCGTCCCAAGCA
TGAATAATAGATCCCAACTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTCTTTCTCGTATCACATCCTTTT
TGTCACATATATGTATACTCTCCTCCCTCATTTTGCAATGCAAACTGTTAGTTTTCTTTT
CTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTGTTAACAGCAAACAGTTAGTTTTCTATTTTATGTATT
TCGTTTTG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL4592Contig1 1118 2 8 U
GCAGATGGTGGAGGTTCTGTTCGCATCCCTGCATCACTTTGTGGTGTAACTGGACTGAAA
ACAACATATGGTCGAACAGACATTACAGGGTCATTGTGTGCAGGTGGAACAGTTGAAGTT
GTTAGTCCAGTTGCTTCATCCCTAGAAGATACTCTCTTGGTGTATGCAGCAATCTTGGGA
TCTTCATCTGCATATAGACTTAACTTGAACCCGACACCACCTTGTCTTCCCAAGTTATTG
TCTCACAATGGAGGCAATGCTATAGGATCTCTACGGCTAGGGAAATATACAACGTGGTTT
AATGATGTTCATTCAAGTGACATCTCTGACAAATGTGAAGACATCATTAAGCTCCTATCA
AACAACCATGGTTGCCAAATAATGGAAATAGTGGTTCCTGAACTGGAAGAGATGCGTGCA
GCTCATGTTGTGTCGATTGGGTCTGCAACTTTGTGTTCTCTTACTCCTTACTGTGAAGCT
GGGAAAAATTCAAAGTTATCTTATGATACACGCACCAGCTTTGCGATCTTCAAGTCATTC
TCTGCTTCAGACTATATTGCTGCTCAGTGTCTTAGGCGAAGGTTGATGGAGTATCACTTG
GATATTTTCAAAAACGTTGATGTTATTGTGACTCCTACATGTGGTATGACAGCTCCTGTG
ATACCACTTGAGGCTGTGAAAAATGGAGAAACCAATTTTCAAGTGGCAGCTTATCTAATG
CGGTTTGTTGTAGCTGCAAATCTCCTTGGCTTCCCTGCCATATCTGTCCCTGTTGGGTAT
GATAAAGAAGGGATGCCAATAGGATTACAAATAATGGGAAGACCTTGGGCTGAAGCTACA
GTTCTTTCTCTAGCTGCTGCTGTTGAGGAGCTGGCTCCAGTTACCAAGAAACCTGTTGTA
TTTCACGATGTTCTCAATACAAACAGAATCTATACGTAGAAGTGAAAAGGCAAAGAGTTT
CTGTGAACTGGATGTTTATTTTATCTGTGGTTACATTTTGATTCATCGTGTTTATTTTCA
GGCTAAGCCTGATATAATTATAAGATTAGAAGCAATAACTGGAGGTGTTGTTGTATTAAC
ATCGTAACATTGACAGACTATGATTCATTATTATAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ89TF U 1
AF RR2BJ89JQ C 385
BS 1 791 RR2BJ89TF
BS 792 792 RR2BJ89JQ
BS 793 819 RR2BJ89TF
BS 820 820 RR2BJ89JQ
BS 821 828 RR2BJ89TF
BS 829 829 RR2BJ89JQ
BS 830 861 RR2BJ89TF
BS 862 1118 RR2BJ89JQ

RD RR2BJ89TF 861 0 0
GCAGATGGTGGAGGTTCTGTTCGCATCCCTGCATCACTTTGTGGTGTAACTGGACTGAAA
ACAACATATGGTCGAACAGACATTACAGGGTCATTGTGTGCAGGTGGAACAGTTGAAGTT
GTTAGTCCAGTTGCTTCATCCCTAGAAGATACTCTCTTGGTGTATGCAGCAATCTTGGGA
TCTTCATCTGCATATAGACTTAACTTGAACCCGACACCACCTTGTCTTCCCAAGTTATTG
TCTCACAATGGAGGCAATGCTATAGGATCTCTACGGCTAGGGAAATATACAACGTGGTTT
AATGATGTTCATTCAAGTGACATCTCTGACAAATGTGAAGACATCATTAAGCTCCTATCA
AACAACCATGGTTGCCAAATAATGGAAATAGTGGTTCCTGAACTGGAAGAGATGCGTGCA
GCTCATGTTGTGTCGATTGGGTCTGCAACTTTGTGTTCTCTTACTCCTTACTGTGAAGCT
GGGAAAAATTCAAAGTTATCTTATGATACACGCACCAGCTTTGCGATCTTCAAGTCATTC
TCTGCTTCAGACTATATTGCTGCTCAGTGTCTTAGGCGAAGGTTGATGGAGTATCACTTG
GATATTTTCAAAAACGTTGATGTTATTGTGACTCCTACATGTGGTATGACAGCTCCTGTG
ATACCACTTGAGGCTGTGAAAAATGGAGAAACCAATTTTCAAGTGGCAGCTTATCTAATG
CGGTTTGTTGTAGCTGCAAATCTCCTTGGCTTCCCTGCCATATCTGTCCCTGTTGGGTAT
GATAAAGAAGG*ATGCCAATAGGATTACAAATAATGGGA*GACCTTGG*CTGAAGCTACA
GTTCTTTCTCTAGCTGCTGCT

QA 1 861 1 861
DS 

RD RR2BJ89JQ 734 0 0
GAAATAGTGGTTCCTGAACTGGAAGAGATGCGTGCAGCTCATGTTGTGTCGATTGGGTCT
GCAACTTTGTGTTCTCTTACTCCTTACTGTGAAGCTGGGAAAAATTCAAAGTTATCTTAT
GATACACGCACCAGCTTTGCGATCTTCAAGTCATTCTCTGCTTCAGACTATATTGCTGCT
CAGTGTCTTAGGCGAAGGTTGATGGAGTATCACTTGGATATTTTCAAAAACGTTGATGTT
ATTGTGACTCCTACATGTGGTATGACAGCTCCTGTGATACCACTTGAGGCTGTGAAAAAT
GGAGAAACCAATTTTCAAGTGGCAGCTTATCTAATGCGGTTTGTTGTAGCTGCAAATCTC
CTTGGCTTCCCTGCCATATCTGTCCCTGTTGGGTATGATAAAGAAGGGATGCCAATAGGA
TTACAAATAATGGGAAGACCTTGGGCTGAAGCTACAGTTCTTTCTCTAGCTGCTGCTGTT
GAGGAGCTGGCTCCAGTTACCAAGAAACCTGTTGTATTTCACGATGTTCTCAATACAAAC
AGAATCTATACGTAGAAGTGAAAAGGCAAAGAGTTTCTGTGAACTGGATGTTTATTTTAT
CTGTGGTTACATTTTGATTCATCGTGTTTATTTTCAGGCTAAGCCTGATATAATTATAAG
ATTAGAAGCAATAACTGGAGGTGTTGTTGTATTAACATCGTAACATTGACAGACTATGAT
TCATTATTATAAAG

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL4593Contig1 951 2 2 U
GGAACGAGATCAAAGCGCTTCCTCCTCCAGAGAACTACACTCCTCCTCCTCCTCCACCGG
AGCCTAAGCCTGAGCCTAAACCGCAAGTAACCAATGATCTAGTTGACCTGAGGGAGGATG
GTGTTAGTGCTGATGACCAAGGGAACAAGTTTGCTCTCGCGCTTTTTGCTGGTCCTGCTA
GTAGTAACGGGAAATGGGAAGCTTTCTCCTCTGATAACAGCGAGGTGACATCAGCTTGGC
AGAATCCAGCAGCTGAGCAAGGGAAGGCGGATTGGGAACTTGCATTGGTCGAGACAGCTA
GTAATCTTGAGCATCAGAAAGCCGCAATGGGCGGTGGTTTAGACCCGCTCTTGCTCAACG
GGATGTACGACCAAGGAGCTGTTAGACAACACGTGAGCACCTCGGAGTTAACAGGTGGAA
GTTCAAGCAGTGTGGCGCTGCCTTTACCGAGTAAGACCAACAGCCATATATTAGCACTCC
CTGCACCAGATGGAACCGTTCAGAAAGTGAACCAAGACCCTTTCGCTGCTTCACTAACGA
TCCCACCACCTTCGTATGTGCAAATGGCTGAGATGGACAAGAAGCAGTATCTATTGACAC
AGGAGCAGCAGTTGTGGCAGCAGTATCAGCAAGAAAGAATGAGAGGTCAAGCTAGTTTGG
CTAAGATGAGTCCAGCCCCAAACGCAATGCCTTATGGGATGCCACCGGTTAACGGGATGG
GACCGCCACCGATGGGGTATTACTACAACAACCCTTATTGATTTCATTTGGCTTTTGTTC
TTTTCTTACATAAATATTATATATTTTCCGAGCAATATAATTACTTTGTGTTACAATCCT
GTTTCTTCTTGTATTGTTTCCGGTCATATGGCTCTGCTTGGAACGTGTGAGACTTTTTCT
CTTTTGAGTTTGATTAATAAAGTCATCTATAAACATTTTTCTTGAATTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ11TF U 1
AF RR2EJ11JQ C 277
BS 1 757 RR2EJ11TF
BS 758 951 RR2EJ11JQ

RD RR2EJ11TF 757 0 0
GGAACGAGATCAAAGCGCTTCCTCCTCCAGAGAACTACACTCCTCCTCCTCCTCCACCGG
AGCCTAAGCCTGAGCCTAAACCGCAAGTAACCAATGATCTAGTTGACCTGAGGGAGGATG
GTGTTAGTGCTGATGACCAAGGGAACAAGTTTGCTCTCGCGCTTTTTGCTGGTCCTGCTA
GTAGTAACGGGAAATGGGAAGCTTTCTCCTCTGATAACAGCGAGGTGACATCAGCTTGGC
AGAATCCAGCAGCTGAGCAAGGGAAGGCGGATTGGGAACTTGCATTGGTCGAGACAGCTA
GTAATCTTGAGCATCAGAAAGCCGCAATGGGCGGTGGTTTAGACCCGCTCTTGCTCAACG
GGATGTACGACCAAGGAGCTGTTAGACAACACGTGAGCACCTCGGAGTTAACAGGTGGAA
GTTCAAGCAGTGTGGCGCTGCCTTTACCGAGTAAGACCAACAGCCATATATTAGCACTCC
CTGCACCAGATGGAACCGTTCAGAAAGTGAACCAAGACCCTTTCGCTGCTTCACTAACGA
TCCCACCACCTTCGTATGTGCAAATGGCTGAGATGGACAAGAAGCAGTATCTATTGACAC
AGGAGCAGCAGTTGTGGCAGCAGTATCAGCAAGAAAGAATGAGAGGTCAAGCTAGTTTGG
CTAAGATGAGTCCAGCCCCAAACGCAATGCCTTATGGGATGCCACCGGTTAACGGGATGG
GACCGCCACCGATGGGGTATTACTACAACAACCCTTA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2EJ11JQ 675 0 0
AACTTGCATTGGTCGAGACAGCTAGTAATCTTGAGCATCAGAAAGCCGCAATGGGCGGTG
GTTTAGACCCGCTCTTGCTCAACGGGATGTACGACCAAGGAGCTGTTAGACAACACGTGA
GCACCTCGGAGTTAACAGGTGGAAGTTCAAGCAGTGTGGCGCTGCCTTTACCGAGTAAGA
CCAACAGCCATATATTAGCACTCCCTGCACCAGATGGAACCGTTCAGAAAGTGAACCAAG
ACCCTTTCGCTGCTTCACTAACGATCCCACCACCTTCGTATGTGCAAATGGCTGAGATGG
ACAAGAAGCAGTATCTATTGACACAGGAGCAGCAGTTGTGGCAGCAGTATCAGCAAGAAG
GAATGAGAGGTCAAGCTAGTTTGGCTAAGATGAGTCCAGCCCCAAACGCAATGCCTTATG
GGATGCCACCGGTTAACGGGATGGGACCGCCACCGATGGGGTATTACTACAACAACCCTT
ATTGATTTCATTTGGCTTTTGTTCTTTTCTTACATAAATATTATATATTTTCCGAGCAAT
ATAATTACTTTGTGTTACAATCCTGTTTCTTCTTGTATTGTTTCCGGTCATATGGCTCTG
CTTGGAACGTGTGAGACTTTTTCTCTTTTGAGTTTGATTAATAAAGTCATCTATAAACAT
TTTTCTTGAATTTGT

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL4594Contig1 874 2 10 U
GGGAGGAAAGATAACTAGAGTCTAGAGAGAAGAAAAGTCTGGTAAAATTAGAAGAACAAC
GCGTACAAATTGTCTTCCTTCATACCTCTCAATTTTCCTGGAGATTTTAGATTTTTTTTT
TCTCGGTGATCGGCGACGCGCTTCTCAGATTCGAAACGAGGATACGTAATCCCAGATATA
GCTTGATTGGAATGTGCTGAGGAACACTCTAAGATGGGGATTTTTGATGGTTTGCCTGTT
CCCTCCGATAAAACTTACCTTAGGGAGGAGCTGGCACGAATAGATGAGAGCTGGGCTGTT
CCACGCTTTGACTCTTTGCCGCATGTTGTCCATATCATTACGTCTAAAGACCGTGAAGCT
GACATTCCAGGTGGAGGAGAAAGTCTTGACAAACTCTACGACAGATGTACATCTGCATTA
CAGAGAATCGGCGACAAACATCAAGGTGAAAGAGTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGTGTC
ATTCGATCTCTCTACGAGAGAGCTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTCAAC
ACATCGGTCAATGTGTTCCGTTTATTCGATGGAGACAAATGGACAATCCAAGTTTGGGGG
AGATGTGTCTCATTTGGACCAAACCGGTTTCTTGCAATCCGGTTTTGGTGGTGACAGAAC
CTCCGGTTAAGATTCAATGACTCTTTCCACTGAGGTTTTCTGTAATTTAAAATTTGACTC
TGTTACTTTCTTCTTTTGCAATTTGACCTCATAACTTTGAGGTTATCCCGATTTAACCTG
TAATTGGGAGGATTAATAAAGTAATTGCTATAAGTCGAACGTGATGCGTAAAATATATCA
TCATTTTCTAGTTAAGAAATCATTTTAGTTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI71TF U 1
AF RR2EI71JQ C 274
BS 1 694 RR2EI71TF
BS 695 695 RR2EI71JQ
BS 696 711 RR2EI71TF
BS 712 712 RR2EI71JQ
BS 713 736 RR2EI71TF
BS 737 737 RR2EI71JQ
BS 738 763 RR2EI71TF
BS 764 764 RR2EI71JQ
BS 765 789 RR2EI71TF
BS 790 874 RR2EI71JQ

RD RR2EI71TF 789 0 0
GGGAGGAAAGATAACTAGAGTCTAGAGAGAAGAAAAGTCTGGTAAAATTAGAAGAACAAC
GCGTACAAATTGTCTTCCTTCATACCTCTCAATTTTCCTGGAGATTTTAGATTTTTTTTT
TCTCGGTGATCGGCGACGCGCTTCTCAGATTCGAAACGAGGATACGTAATCCCAGATATA
GCTTGATTGGAATGTGCTGAGGAACACTCTAAGATGGGGATTTTTGATGGTTTGCCTGTT
CCCTCCGATAAAACTTACCTTAGGGAGGAGCTGGCACGAATAGATGAGAGCTGGGCTGTT
CCACGCTTTGACTCTTTGCCGCATGTTGTCCATATCATTACGTCTAAAGACCGTGAAGCT
GACATTCCAGGTGGAGGAGAAAGTCTTGACAAACTCTACGACAGATGTACATCTGCATTA
CAGAGAATCGGCGACAAACATCAAGGTGAAAGAGTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGTGTC
ATTCGATCTCTCTACGAGAGAGCTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTCAAC
ACATCGGTCAATGTGTTCCGTTTATTCGATGGAGACAAATGGACAATCCAAGTTTGGGGG
AGATGTGTCTCATTTGGACCAAACCGGTTTCTTGCAATCCGGTTTTGGTGGTGACAGAAC
CTCCGGTTAAGATTCAATGACTCTTTCCACTGAG*TTTTCTGTAATTTAAA*TTTGACTC
TGTTACTTTCTTCTTT*GCAATTTGACCTCATAACTTTGAGGT*ATCCCGATTTAACCTG
TAATTGGGA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2EI71JQ 601 0 0
GCACGAATAGATGAGAGCTGGGCTGTTCCACGCTTTGACTCTTTGCCGCATGTTGTCCAT
ATCATTACGTCTAAAGACCGTGAAGCTGACATTCCAGGTGGAGGAGAAAGTCTTGACAAA
CTTTACGACAGATGTACATTTGCATTACAGAGAATCGGCGACAAACATCAAGGTGAAAGA
GTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGTGTCATTCGATCTCTTTACGAGAGAGCTCGTCCAAGT
GCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTCAACACATCGGTCAATGTGTTCCGTTTATTCGATGGA
GACAAATGGACAATCCAAGTTTGGGG*AGATGTGTTTCATTTGGACCAAACCGGTTTCTT
GCAATCCGGTTTTGGTGGTGACAGAACCTCCGGTTAAGATTCAATGACTCTTTCCACTGA
GGTTTTCTGTAATTTAAAATTTGACTCTGTTACTTTCTTCTTTTGCAATTTGACCTCATA
ACTTTGAGGTTATCCCGATTTAACCTGTAATTGGGAGGATTAATAAAGTAATTGCTATAA
GTCGAACGTGATGCGTAAAATATATCATCATTTTCTAGTTAAGAAATCATTTTAGTTTTC
G

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL4595Contig1 1064 2 2 U
ACACATTTCCTTTTTTTCTCACCGTCTCCTCGTTTATACCAAACACTGTTCTTTACCTTT
TCATCTTCTCTCCCTGTCCGAATCATAACCATAAACACACACAGATTGAATGGGAGCTGG
TACGACTGCGGGAGATCGAGTACGGAAAGATCTCTCTGAGATTTCATACAAAACGAATAA
TATTCCGACGGCAAAACCCATCGTTTCCGCCTCTCGGAAGAAGATCCACCGGCGGAGCAA
GAAAGCTGTGATCTCTCCGGTGCAGAAGCTGTTCGAAACTTGCAAGAAAGTATTCGCTAA
TGGCAAATCCGGAGCCGTCCCGTCTCAAGTACACATTAACATGCTCCGGGCCGTTCTAGA
CGAAATCAAGCCTGAAGATGTTGATGTGAGCCCTAAGATGCCGTATTTTCGATCTAAATC
GATCGGACGGCCTCCAGTGACGTATCTCCACATCTACAAATGTCATAGCTTCTCGATGGG
CATTTTCTGTTTACCACCGTCTGATGTAATCCCGCTTCACAATCACCCGGAGATGACTGT
GTTTAGTAAGCTCTTGTTTGGTACAATGCACATCAAATCATATGACTGGGTCGCTGATTC
TCCCCAGCCGAGTTCGGATACTCGTTTGGCGAAAGTGAAAGTAGATTCAGACTTCACGGC
ACCATGTGACACTTCTATACTCTACCCTGCCGATGGAGGGAATATGCATTGCTTCACCGC
GATAACGGCTTGTGCGGTTCTTGATGTTCTTGGTCCTCCATACTCCGATCCTACAGGACG
TCACTGTACTTACTACTTCGATCACCCCTTCTCAAGCTTCTCAGTTGATGGAGTTGAGGT
TGGGGAAGAGGAGAAGGAAGAGTATGAGTGGTTGAAGGAGAGGGAAGGGGAGCCTGAGGA
TTTGACGGTTACGGCGATGATGTATAGTGGACCAATCATCAAAGAATGAATGTGTAGGAA
GAAAAAAAAGGTCTCTTTTTTGTTGTTTTTAAACTTTTCTTTGTGTGGTTTTCGGGTTTC
TGTTGTTGGGGTTTGTCTGTATATAAAAAGAAGTCTTTGAAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM59TF U 1
AF RR2FM59JQ C 237
BS 1 713 RR2FM59TF
BS 714 1064 RR2FM59JQ

RD RR2FM59TF 713 0 0
ACACATTTCCTTTTTTTCTCACCGTCTCCTCGTTTATACCAAACACTGTTCTTTACCTTT
TCATCTTCTCTCCCTGTCCGAATCATAACCATAAACACACACAGATTGAATGGGAGCTGG
TACGACTGCGGGAGATCGAGTACGGAAAGATCTCTCTGAGATTTCATACAAAACGAATAA
TATTCCGACGGCAAAACCCATCGTTTCCGCCTCTCGGAAGAAGATCCACCGGCGGAGCAA
GAAAGCTGTGATCTCTCCGGTGCAGAAGCTGTTCGAAACTTGCAAGAAAGTATTCGCTAA
TGGCAAATCCGGAGCCGTCCCGTCTCAAGTACACATTAACATGCTCCGGGCCGTTCTAGA
CGAAATCAAGCCTGAAGATGTTGATGTGAGCCCTAAGATGCCGTATTTTCGATCTAAATC
GATCGGACGGCCTCCAGTGACGTATCTCCACATCTACAAATGTCATAGCTTCTCGATGGG
CATTTTCTGTTTACCACCGTCTGATGTAATCCCGCTTCACAATCACCCGGAGATGACTGT
GTTTAGTAAGCTCTTGTTTGGTACAATGCACATCAAATCATATGACTGGGTCGCTGATTC
TCCCCAGCCGAGTTCGGATACTCGTTTGGCGAAAGTGAAAGTAGATTCAGACTTCACGGC
ACCATGTGACACTTCTATACTCTACCCTGCCGATGGAGGGAATATGCATTGCT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2FM59JQ 828 0 0
GCAAGAAAGCTGTGATCTCTCCGGTGCAGAAGCTGTTCGAAACTTGCAAGAAAGTATTCG
CTAATGGCAAATCCGGAGCCGTCCCGTCTCAAGTACACATTAACATGCTCCGGGCCGTTC
TAGACGAAATCAAGCCTGAAGATGTTGATGTGAGCCCTAAGATGCCGTATTTTCGATCTA
AATCGATCGGACGGCCTCCAGTGACGTATCTCCACATCTACAAATGTCATAGCTTCTCGA
TGGGCATTTTCTGTTTACCACCGTCTGATGTAATCCCGCTTCACAATCACCCGGAGATGA
CTGTGTTTAGTAAGCTCTTGTTTGGTACAATGCACATCAAATCATATGACTGGGTCGCTG
ATTCTCCCCAGCCGAGTTCGGATACTCGTTTGGCGAAAGTGAAAGTAGATTCAGACTTCA
CGGCACCATGTGACACTTCTATACTCTACCCTGCCGATGGAGGGAATATGCATTGCTTCA
CCGCGATAACGGCTTGTGCGGTTCTTGATGTTCTTGGTCCTCCATACTCCGATCCTACAG
GACGTCACTGTACTTACTACTTCGATCACCCCTTCTCAAGCTTCTCAGTTGATGGAGTTG
AGGTTGGGGAAGAGGAGAAGGAAGAGTATGAGTGGTTGAAGGAGAGGGAAGGGGAGCCTG
AGGATTTGACGGTTACGGCGATGATGTATAGTGGACCAATCATCAAAGAATGAATGTGTA
GGAAGAAAAAAAAGGTCTCTTTTTTGTTGTTTTTAAACTTTTCTTTGTGTGGTTTTCGGG
TTTCTGTTGTTGGGGTTTGTCTGTATATAAAAAGAAGTCTTTGAAAGT

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 2

CO CL4596Contig1 703 2 2 U
GGGGAAAGGATAACCCACAAAAAAAAGAAAACTTCAAGACTTTCACTAAGATAAAACCAA
GAACCTTCACCATGGCCTCAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCTTTCACCGGCC
TCAAATCCACAGTCTCCAAACCCTCGGCCGTCGTCAGACTCCCCACCACAACATCACGGA
ACCTCACCGTGAAGTCATCTCTAAAGGACTTCGGAGTCGCGGCCGTAGCGGCTGCAGCTT
CCATCGCTTTGGCCGGAAACGCCATGGCGATAGACGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAG
CGTTGGCTTTCGTTCCCAACGAGTTCACGATAGCGAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGA
ACAACGCTGGATTCCCGCACAACGTTGTGTTCGATGAGGACGAGATCCCGAGCGGTGTTG
ACGCGAGCAAGATCTCCATGGACGAGCAGGACCTACTCAACGCCGCTGGAGAGACGTACG
AGGTTGCTTTGACTGAGCCTGGGACCTACAGCTTCTACTGTGCGCCGCATCAGGGTGCTG
GTATGGTCGGTAAAGTCACCGTTAACTAATAAAATGTGTGTAAAAGCGAAAGTGTGTCTC
TGAGGCTTCTCTTTCAGTTTTACTTACATAAGGTGTTTTGTACTACTTATAAAGAGTGTT
GGAATGGACATTAATTTGTTATAATGAGAGTGCTGATTCCATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI61JQB C 1
AF RR2GI61TF U 1
BS 1 694 RR2GI61TF
BS 695 703 RR2GI61JQB

RD RR2GI61JQB 703 0 0
GGGGAAAGGATAACCCACAAAAAAAAGAAAACTTCAAGACTTTCACTAAGATAAAACCAA
GAACCTTCACCATGGCCTCAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCTTTCACCGGCC
TCAAATCCACAGTCTCCAAACCCTCGGCCGTCGTCAGACTCCCCACCACAACATCACGGA
ACCTCACCGTGAAGTCATCTCTAAAGGACTTCGGAGTCGCGGCCGTAGCGGCTGCAGCTT
CCATCGCTTTGGCCGGAAACGCCATGGCGATAGACGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAG
CGTTGGCTTTCGTTCCCAACGAGTTCACGATAGCGAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGA
ACAACGCTGGATTCCCGCACAACGTTGTGTTCGATGAGGACGAGATCCCGAGCGGTGTTG
ACGCGAGCAAGATCTCCATGGACGAGCAGGACCTACTCAACGCCGCTGGAGAGACGTACG
AGGTTGCTTTGACTGAGCCTGGGACCTACAGCTTCTACTGTGCGCCGCATCAGGGTGCTG
GTATGGTCGGTAAAGTCACCGTTAACTAATAAAATGTGTGTAAAAGCGAAAGTGTGTCTC
TGAGGCTTCTCTTTCAGTTTTACTTACATAAGGTGTTTTGTACTACTTATAAAGAGTGTT
GGAATGGACATTAATTTGTTATAATGAGAGTGCTGATTCCATC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2GI61TF 694 0 0
GGGGAAAGGATAACCCACAAAAAAAAGAAAACTTCAAGACTTTCACTAAGATAAAACCAA
GAACCTTCACCATGGCCTCAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCTTTCACCGGCC
TCAAATCCACAGTCTCCAAACCCTCGGCCGTCGTCAGACTCCCCACCACAACATCACGGA
ACCTCACCGTGAAGTCATCTCTAAAGGACTTCGGAGTCGCGGCCGTAGCGGCTGCAGCTT
CCATCGCTTTGGCCGGAAACGCCATGGCGATAGACGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAG
CGTTGGCTTTCGTTCCCAACGAGTTCACGATAGCGAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGA
ACAACGCTGGATTCCCGCACAACGTTGTGTTCGATGAGGACGAGATCCCGAGCGGTGTTG
ACGCGAGCAAGATCTCCATGGACGAGCAGGACCTACTCAACGCCGCTGGAGAGACGTACG
AGGTTGCTTTGACTGAGCCTGGGACCTACAGCTTCTACTGTGCGCCGCATCAGGGTGCTG
GTATGGTCGGTAAAGTCACCGTTAACTAATAAAATGTGTGTAAAAGCGAAAGTGTGTCTC
TGAGGCTTCTCTTTCAGTTTTACTTACATAAGGTGTTTTGTACTACTTATAAAGAGTGTT
GGAATGGACATTAATTTGTTATAATGAGAGTGCT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4598Contig1 1091 2 2 U
GCAAATGTTGATAGACTCATGTTTAGAGGGTCAATTTTCAAGTGATGACGGGACTGAACT
GGTACGGTTAACTTCTAGATGCTTGCAGTATGAACCTCGAGAACGGCCTAACCCAAAATC
TCTAGTCACTGCAATGATCCCTCTTCAGAAGGATCTTGAGACTCCTTCACATCAACTAAT
GGGCATACCAAGCAGTGCCTCAACAACGCCTCTTTCACCACTCGGAGAAGCATGCCTAAG
AACTGATCTAACTGCCATACATGAGATTGTTGAAAAACTTGGTTATAAAGATGATGAGGG
AGCAGCAACAGAGCTTTCGTTCCAGATGTGGACCAACCAGATGCAGGACTCGCTGAACTT
CAAGAAAAAGGGTGATGTTGCTTTCAGGCATAAAGACTTTGCAAATGCTGCTGAATGTTA
TTCTCAGTTTATTGAGGGCGGGACAATGGTTTCACCAACTGTATATGCAAGGAGAAGTCT
GTGTCACCTGATGAATGATATGCCCCAAGAGGCATTGAATGATGCAAGCCAAGCCCAAGT
GATATCTCCTGCTTGGCATATCGCATCTTATCTTCAAGCTGTAGCTCTCTCAGCTCTAGG
ACAAGAGAACGAAGCACACGCTGCTCTTAAAGATGGATCAATGCTCGAAAGCAAAAGAAA
CGCTCTATGATGATGATAACAAAAACAAAAAAAAAGAGGAAAGCGAGAAGAAACAGCTCG
TAGGCTTTGCAGAATATGATCAAAACCCACACCACCATCGTCCTCATAAGTAGATAGGAG
CCACTACACGGCTCTCATATCGTGTGCATCCTCATCATTGGTCAGTTTCGTAGTTCCCTT
TTTTTTCTTTTTCAAATACTGGATGATGCATTCATTTGGTCTTGTACCGCAAATTGGACT
CTCTTTTCTTTTTGTGTGTGTGTTTTCGGTTACTGGCATGAGCATTTCCCTATTATACAG
AAGAAAAAAGTTGCCTACTTTGATGGAGATTTGATTATGGATTGGGAATGGTGTGATTGT
GGATTTTCTTTGGTGGGTTCCATGATTTGTAATCAATGTTTTTGTAATAACAAATAACAT
GTAAACTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU29TF U 1
AF RR2BU29JQ C 600
BS 1 684 RR2BU29TF
BS 685 1091 RR2BU29JQ

RD RR2BU29TF 688 0 0
GCAAATGTTGATAGACTCATGTTTAGAGGGTCAATTTTCAAGTGATGACGGGACTGAACT
GGTACGGTTAACTTCTAGATGCTTGCAGTATGAACCTCGAGAACGGCCTAACCCAAAATC
TCTAGTCACTGCAATGATCCCTCTTCAGAAGGATCTTGAGACTCCTTCACATCAACTAAT
GGGCATACCAAGCAGTGCCTCAACAACGCCTCTTTCACCACTCGGAGAAGCATGCCTAAG
AACTGATCTAACTGCCATACATGAGATTGTTGAAAAACTTGGTTATAAAGATGATGAGGG
AGCAGCAACAGAGCTTTCGTTCCAGATGTGGACCAACCAGATGCAGGACTCGCTGAACTT
CAAGAAAAAGGGTGATGTTGCTTTCAGGCATAAAGACTTTGCAAATGCTGCTGAATGTTA
TTCTCAGTTTATTGAGGGCGGGACAATGGTTTCACCAACTGTATATGCAAGGAGAAGTCT
GTGTCACCTGATGAATGATATGCCCCAAGAGGCATTGAATGATGCAAGCCAAGCCCAAGT
GATATCTCCTGCTTGGCATATCGCATCTTATCTTCAAGCTGTAGCTCTCTCAGCTCTAGG
ACAAGAGAACGAAGCACACGCTGCTCTTAAAGATGGATCAATGCTCGAAAGCAAAAGAAA
CGCTCTATGATGATGATAACAAAA
CAAA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2BU29JQ 492 0 0
GACAAGAGAACGAAGCACACGCTGCTCTTAAAGATGGATCAATGCTCGAAAGCAAAAGAA
ACGCTCTATGATGATGATAACAAAAACAAAAAAAAAGAGGAAAGCGAGAAGAAACAGCTC
GTAGGCTTTGCAGAATATGATCAAAACCCACACCACCATCGTCCTCATAAGTAGATAGGA
GCCACTACACGGCTCTCATATCGTGTGCATCCTCATCATTGGTCAGTTTCGTAGTTCCCT
TTTTTTTCTTTTTCAAATACTGGATGATGCATTCATTTGGTCTTGTACCGCAAATTGGAC
TCTCTTTTCTTTTTGTGTGTGTGTTTTCGGTTACTGGCATGAGCATTTCCCTATTATACA
GAAGAAAAAAGTTGCCTACTTTGATGGAGATTTGATTATGGATTGGGAATGGTGTGATTG
TGGATTTTCTTTGGTGGGTTCCATGATTTGTAATCAATGTTTTTGTAATAACAAATAACA
TGTAAACTTTGT

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 2

CO CL4599Contig1 772 2 2 U
GAAACAATGATGGCATGAACCTCTCAGCGCCGCAGACTTTCAGATCAAAGGAGATCTCAA
AGAGCAATGTGGTTGACGACATGGTGGCTAGTAACGGCATACTCTTTGAGCCTGGTGAAC
ATCCTGACCATGTTGTTGTCATCAAGTATGTACCTTATGTTGGGGATAGTAAGAGGGCTA
TGGACGAGTACACCTCCGAGATATTCATGGGAGGGAAGAACACGATTGTTATGCATAACA
CTTGTGAGGATTCTCTTTTGGCTGCTCCAATCATCTTGGATCTTGTTCTTCTCGCTGAAC
TCAGCACCAGAATCCAATTCAAAGCTGAAGGAGAGGGGAAGTTCCACTCTTTCCACCCAG
TAGCTACCATACTCAGTTACCTCACAAAAGCACCTCTTGTACCACCCGGGACGCCAGTGG
TGAACGCTCTATCTAAGCAGAGGGCTATGCTGGAGAACATCCTCAGGGCCTGCGTTGGGC
TTGCGCCAGAGAACAACATGATCTTGGAGTACAAGTGACAAGGAAGTAGTAAGAGCAGAG
GGACCTGAGACCTTAGAACATGGAGACGCTTATCATATTAATGCTTCATTGTTTCGTTTT
GTATGTAAAAATAATTGTGTGAGAGAGAAACATATCAAGATACTTAAGGTTAATCTGAGT
GATGGTTATCTTTGGCAGTTTTACTGTATGAGAAGATTACCTACAGCTTCTGGATCAAAT
GTGTAAAATATATTTCAGAGTAACTATGTCCGTCCCTCCTTGTCTTATGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H730JQB C 1
AF RR2BU65TF U 161
BS 1 161 RR2H730JQB
BS 162 772 RR2BU65TF

RD RR2H730JQB 766 0 0
GAAACAATGATGGCATGAACCTCTCAGCGCCGCAGACTTTCAGATCAAAGGAGATCTCAA
AGAGCAATGTGGTTGACGACATGGTGGCTAGTAACGGCATACTCTTTGAGCCTGGTGAAC
ATCCTGACCATGTTGTTGTCATCAAGTATGTACCTTATGTTGGGGATAGTAAGAGGGCTA
TGGACGAGTACACCTCCGAGATATTCATGGGAGGGAAGAACACGATTGTTATGCATAACA
CTTGTGAGGATTCTCTTTTGGCTGCTCCAATCATCTTGGATCTTGTTCTTCTCGCTGAAC
TCAGCACCAGAATCCAATTCAAAGCTGAAGGAGAGGGGAAGTTCCACTCTTTCCACCCAG
TAGCTACCATACTCAGTTACCTCACAAAAGCACCTCTTGTACCACCCGGGACGCCAGTGG
TGAACGCTCTATCTAAGCAGAGGGCTATGCTGGAGAACATCCTCAGGGCCTGCGTTGGGC
TTGCGCCAGAGAACAACATGATCTTGGAGTACAAGTGACAAGGAAGTAGTAAGAGCAGAG
GGACCTGAGACCTTAGAACATGGAGACGCTTATCATATTAATGCTTCATTGTTTCGTTTT
GTATGTAAAAATAATTGTGTGAGAGAGAAACATATCAAGATGCTTAAGGTTAATCTGAGT
GATGGTTATCTTTGGCAGTTTTACTGTATGAGAAGATTACCTACAGCTTCTGGATCAAAT
GTGTAAAATATATTTCAGAGTAACTATGTCTGTCCCTCCTTGTCT
C

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2BU65TF 612 0 0
G
GGGGATAGTAAGAGGGCTATGGACGAGTACACCTCCGAGATATTCATGGGAGGGAAGAAC
ACGATTGTTATGCATAACACTTGTGAGGATTCTCTTTTGGCTGCTCCAATCATCTTGGAT
CTTGTTCTTCTCGCTGAACTCAGCACCAGAATCCAATTCAAAGCTGAAGGAGAGGGGAAG
TTCCACTCTTTCCACCCAGTAGCTACCATACTCAGTTACCTCACAAAAGCACCTCTTGTA
CCACCCGGGACGCCAGTGGTGAACGCTCTATCTAAGCAGAGGGCTATGCTGGAGAACATC
CTCAGGGCCTGCGTTGGGCTTGCGCCAGAGAACAACATGATCTTGGAGTACAAGTGACAA
GGAAGTAGTAAGAGCAGAGGGACCTGAGACCTTAGAACATGGAGACGCTTATCATATTAA
TGCTTCATTGTTTCGTTTTGTATGTAAAAATAATTGTGTGAGAGAGAAACATATCAAGAT
ACTTAAGGTTAATCTGAGTGATGGTTATCTTTGGCAGTTTTACTGTATGAGAAGATTACC
TACAGCTTCTGGATCAAATGTGTAAAATATATTTCAGAGTAACTATGTCCGTCCCTCCTT
GTCTTATGATC

QA 2 612 2 612
DS 



AS 1 2

CO CL4600Contig1 979 2 4 U
GGAAGACAACAAGTACCATCCATTCACACGCAAAGAGAAGCTCCAAGAATCTGTCGGCTT
TTTGAGAATCCAAAGGGTCAGAAAATAGTAACAATCGCCATGGCAGTCTCAGCAGCATTC
AACCCTTTGAAACTTGCATCTTCGTCTTCTCTAGATTCGATTCCTTCTACTTCTTGTTAT
TCGTTGTTTCCGGCAAGAATCGGCATCAGAAACTCCGTCGGATCTCCTTTCAAGAGATGT
TTAAAGCAGTCGTGTTCTTCTGTTCGAGCCATGTCTTCTTCTTCTTCTTCGGCTGCTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCGGATCGAGAATGGAGGAGAGCGTGAGGAAGACGGTT
ACTGAGAACCTTGTCGTTGTTTACTCCAAAACTTGGTGCTCATACTGTACTGAAGTGAAG
ACATTATTCAAGAGACTCGGAGTTCAGCCACTGGTGATTGAATTGGATGAACTTGGTCCA
CAAGGGCCACAATTGCAGAAGGTACTGGAAAGACTAACTGGCCAACACACTGTTCCTAAT
TTTTTCGTTGGTATGTTGTTTAGTCTCTTTGCATAGATCACATATCTTCACTGAGTTGAA
TGCTTTGCTTGTAAACCTCAGGAGCATTTTACACCCTTTGTTCTTTGTATCTTTCCTAAA
TAGATGAAACATTTAGTCGCCCTCCAAAGAATTGATTAACAATGTCTAATCTTCTTGTCC
TAATGAACCAGGAGGAAAACACATTGGTGGCTGCACAGATACAGTGAAGCTGAACAGGAA
AGGAGAACTTGAACTGATGTTAGCTGAAGCCAACGCTCAAACCGATCAAACTTAAGTAGA
TGTTGGAAACTGGTAACATACGGAGCTTGGAAGAGTTTTTTCTCTTTTGTAAAGCATTAA
ACCCTCATTTTCTTTTGTCAATGCAATGAGCACCATTCAAATAATACATTTATAACTAAA
ATAACATATATACTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS88TF U 1
AF RR2CS88JQ C 236
BS 1 621 RR2CS88TF
BS 622 622 RR2CS88JQ
BS 623 717 RR2CS88TF
BS 718 979 RR2CS88JQ

RD RR2CS88TF 717 0 0
GGAAGACAACAAGTACCATCCATTCACACGCAAAGAGAAGCTCCAAGAATCTGTCGGCTT
TTTGAGAATCCAAAGGGTCAGAAAATAGTAACAATCGCCATGGCAGTCTCAGCAGCATTC
AACCCTTTGAAACTTGCATCTTCGTCTTCTCTAGATTCGATTCCTTCTACTTCTTGTTAT
TCGTTGTTTCCGGCAAGAATCGGCATCAGAAACTCCGTCGGATCTCCTTTCAAGAGATGT
TTAAAGCAGTCGTGTTCTTCTGTTCGAGCCATGTCTTCTTCTTCTTCTTCGGCTGCTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCGGATCGAGAATGGAGGAGAGCGTGAGGAAGACGGTT
ACTGAGAACCTTGTCGTTGTTTACTCCAAAACTTGGTGCTCATACTGTACTGAAGTGAAG
ACATTATTCAAGAGACTCGGAGTTCAGCCACTGGTGATTGAATTGGATGAACTTGGTCCA
CAAGGGCCACAATTGCAGAAGGTACTGGAAAGACTAACTGGCCAACACACTGTTCCTAAT
TTTTTCGTTGGTATGTTGTTTAGTCTCTTTGCATAGATCACATATCTTCACTGAGTTGAA
TGCTTTGCTTGTAAACCTCAG*AGCATTTTACACCCTTTGTTCTTTGTATCTTTCCTAAA
TAGATGAAACATTTAGTCGCCCTCCAAAGAATTGATTAACAATGTCTAATCTTCTTG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2CS88JQ 744 0 0
GATGTTTAAAGCAGTCGTGTTCTTCTGTTCGAGCCATGTCTTCTTCTTCTTCTTCGGCTG
CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCGGATCGAGAATGGAGGAGAGCGTGAGGAAGA
CGGTTACTGAGAACCTTGTCGTTGTTTACTCCAAAACTTGGTGCTCATACTGTACTGAAG
TGAAGACATTATTCAAGAGACTCGGAGTTCAGCCACTGGTGATTGAATTGGATGAACTTG
GTCCACAAGGGCCACAATTGCAGAAGGTACTGGAAAGACTAACTGGCCAACACACTGTTC
CTAATTTTTTCGTTGGTATGTTGTTTAGTCTCTTTGCATAGATCACATATCTTCACTGAG
TTGAATGCTTTGCTTGTAAACCTCAGGAGCATTTTACACCCTTTGTTCTTTGTATCTTTC
CTAAATAGATGAAACATTTAGTCGCCCTCCAAAGAATTGATTAACAATGTCTAATCTTCT
TGTCCTAATGAACCAGGAGGAAAACACATTGGTGGCTGCACAGATACAGTGAAGCTGAAC
AGGAAAGGAGAACTTGAACTGATGTTAGCTGAAGCCAACGCTCAAACCGATCAAACTTAA
GTAGATGTTGGAAACTGGTAACATACGGAGCTTGGAAGAGTTTTTTCTCTTTTGTAAAGC
ATTAAACCCTCATTTTCTTTTGTCAATGCAATGAGCACCATTCAAATAATACATTTATAA
CTAAAATAACATATATACTTAATC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL4601Contig1 825 2 4 U
GATACTGAACTCTATGTACCAGCTTTGGGTGTTGGGTGCGCTTAGCAATGTCGGAGGATT
AACTGATCTCGGGTGGAAGATGGTGGAGTTCCCGTTGGATCCACCCTCTTGCGAAGATGC
TCTTAATGGGTGAACGGCTCGACTGCATAGACGAGGTCTTGACGATCGTGTCAATGCTTT
CAGTACCTTCAGTGTTCTTCAGACCGAAAGAGAGAGCAGAAGAGAGCGATGCCGCGAGGG
AGAAGTTTTTCGTGCCGGAGTCGGATCATCTGACGCTACTGAATGTGTATAAGCAATGGA
AAGAGCATGACTACAGAGGAGACTGGTGCAATGACCACTACCTGCAAGTCAAAGGTCTGA
GGAAAGCTAGAGAAGTAAGATCCCAGCTTCTGGATATCCTCAAGCAACTCAAGATACCGC
TCAAGTCGTGTGGGCCGGATTGGGATATCGTGAGAAAAGCCATATGCTCAGCGTACTTCC
ACAACTCGGCTAGATTAAAAGGTGTTGGAGAGTATGTGAACTGTAGAACCGGGATGCCTT
GCCATCTGCACCCGAGCAGTGCACTGTATGGTCTGGGATACACACCGGACTATGTGGTGT
ATCACGAACTGATCTTAACCACGAAGGAGTACATGCAGTGTGCTACATCTGTTGAGCCGC
ATTGGCTGGCTGAGTTGGGACCGATGTTTTTCTCGGTCAAGGACTCGGATACATCGATGT
TGGAGCATAAAAAGAAGCAGAAGGAAGAGAAAACAGCGATGGAGGAAGAGATGGAGAAGC
TGAGAAGAGATCAGGCGGAGGCGGAGGTGAGAAGTAAGGAGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN81TF U 1
AF RR2GN81JQ C 16
BS 1 105 RR2GN81TF
BS 106 106 RR2GN81JQ
BS 107 497 RR2GN81TF
BS 498 825 RR2GN81JQ

RD RR2GN81TF 497 0 0
GATACTGAACTCTATGTACCAGCTTTGGGTGTTGGGTGCGCTTAGCAATGTCGGAGGATT
AACTGATCTCGGGTGGAAGATGGTGGAGTTCCCGTTGGATCCACC*TCTTGCGAAGATGC
TCTTAATGGGTGAACGGCTCGACTGCATAGACGAGGTCTTGACGATCGTGTCAATGCTTT
CAGTACCTTCAGTGTTCTTCAGACCGAAAGAGAGAGCAGAAGAGAGCGATGCCGCGAGGG
AGAAGTTTTTCGTGCCGGAGTCGGATCATCTGACGCTACTGAATGTGTATAAGCAATGGA
AAGAGCATGACTACAGAGGAGACTGGTGCAATGACCACTACCTGCAAGTCAAAGGTCTGA
GGAAAGCTAGAGAAGTAAGATCCCAGCTTCTGGATATCCTCAAGCAACTCAAGATACCGC
TCAAGTCGTGTGGGCCGGATTGGGATATCGTGAGAAAAGCCATATGCTCAGCGTACTTCC
ACAACTCGGCTAGATTA

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2GN81JQ 810 0 0
GTACCAGCTTTGGGTGTTGGGTGCGCTTAGCAATGTCGGAGGATTAACTGATCTCGGGTG
GAAGATGGTGGAGTTCCCGTTGGATCCACCCTCTTGCGAAGATGCTCTTAATGGGTGAAC
GGCTCGACTGCATAGACGAGGTCTTGACGATCGTGTCAATGCTTTCAGTACCTTCAGTGT
TCTTCAGACCGAAAGAGAGAGCAGAAGAGAGCGATGCCGCGAGGGAGAAGTTTTTCGTGC
CGGAGTCGGATCATCTGACGCTACTGAATGTGTATAAGCAATGGAAAGAGCATGACTACA
GAGGAGACTGGTGCAATGACCACTACCTGCAAGTCAAAGGTCTGAGGAAAGCTAGAGAAG
TAAGATCCCAGCTTCTGGATATCCTCAAGCAACTCAAGATACCGCTCAAGTCGTGTGGGC
CGGATTGGGATATCGTGAGAAAAGCCATATGCTCAGCGTACTTCCACAACTCGGCTAGAT
TAAAAGGTGTTGGAGAGTATGTGAACTGTAGAACCGGGATGCCTTGCCATCTGCACCCGA
GCAGTGCACTGTATGGTCTGGGATACACACCGGACTATGTGGTGTATCACGAACTGATCT
TAACCACGAAGGAGTACATGCAGTGTGCTACATCTGTTGAGCCGCATTGGCTGGCTGAGT
TGGGACCGATGTTTTTCTCGGTCAAGGACTCGGATACATCGATGTTGGAGCATAAAAAGA
AGCAGAAGGAAGAGAAAACAGCGATGGAGGAAGAGATGGAGAAGCTGAGAAGAGATCAGG
CGGAGGCGGAGGTGAGAAGTAAGGAGAGAG

QA 1 810 1 810
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4603Contig1 966 2 2 U
GGGAAGAACAAAAACCCCGAAACCAGATTAGTCTTCTCTGCAAAATCAAGACGTTGTCGG
AATCGCAGTTCCTCTTCTTCTTATTCTTGTTCAATCCACTATCAGTGGTCGAAATCAAGA
AAGATGGTGGTGGTGTCGCCAAAGATAGCTCCATCAATGCTGTCTTCGGACTTTGCAAAT
CTAGCGGCAGAGGCCAAGCGGATGGTTGATTTGGGCGCTGACTGGCTTCACATGGACATC
ATGGACGGGCATTTTGTCCCAAATCTAACCATTGGTGCTCCTGTCATCGAGAGTTTAAGA
AAGCACACAAATGCATATCTTGATTGTCACCTAATGGTGACGAACCCCATGGATTACGTG
GAGCATATGGGTAAAGCTGGGGCGTCTGGTTTCACATTCCACGCTGAGGTGGCCAAAGAG
AATTGGCAAGAACTTGTGAGGAAGATTAAGTCTGCAGGGATGAGGCCAGGTGTGGCTCTA
AAGCCTGGAACACCTGTTGAGGAAGTCTATCCTCTGGTTGAAGGGGAAACTCCGGTGGAA
ATGGTTCTAGTGATGACAGTGGAGCCTGGATTTGGAGGCCAGAAGTTCATGCCCAGCATG
ATGGACAAGGTCCGGGCATTGAGGAAGAAGTATCCAAGACTTGATATTGAGGTGGATGGA
GGGTTAGGCCCATCGACTATAGAAGCAGCGGCTGCAGCAGGGGCCAACTGTATTGTAGCT
GGAAGTTCAGTGTTTGGAGCTCCGAAGCCAGGTGAAGTCATTTCCCTTTTGCGGACCAGT
GTCGAGAAAGCCCAAGCCACCCCCTGAGAGTGCACTGCCCGTTTTTAATATTTATGCACC
CACCAAAAGCAATAATAAGAGGTGAAAACATACAAAAAGAATCGTTCAAACACTTGTTAG
TAGTTTGATATTTGCACTTGTGTAATGGGATGTTTTCGTATTGTCAAGCAAACTTGGTCA
TACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR19TF U 1
AF RR2DR19JQ C 516
BS 1 605 RR2DR19TF
BS 606 966 RR2DR19JQ

RD RR2DR19TF 605 0 0
GGGAAGAACAAAAACCCCGAAACCAGATTAGTCTTCTCTGCAAAATCAAGACGTTGTCGG
AATCGCAGTTCCTCTTCTTCTTATTCTTGTTCAATCCACTATCAGTGGTCGAAATCAAGA
AAGATGGTGGTGGTGTCGCCAAAGATAGCTCCATCAATGCTGTCTTCGGACTTTGCAAAT
CTAGCGGCAGAGGCCAAGCGGATGGTTGATTTGGGCGCTGACTGGCTTCACATGGACATC
ATGGACGGGCATTTTGTCCCAAATCTAACCATTGGTGCTCCTGTCATCGAGAGTTTAAGA
AAGCACACAAATGCATATCTTGATTGTCACCTAATGGTGACGAACCCCATGGATTACGTG
GAGCATATGGGTAAAGCTGGGGCGTCTGGTTTCACATTCCACGCTGAGGTGGCCAAAGAG
AATTGGCAAGAACTTGTGAGGAAGATTAAGTCTGCAGGGATGAGGCCAGGTGTGGCTCTA
AAGCCTGGAACACCTGTTGAGGAAGTCTATCCTCTGGTTGAAGGGGAAACTCCGGTGGAA
ATGGTTCTAGTGATGACAGTGGAGCCTGGATTTGGAGGCCAGAAGTTCATGCCCAGCATG
ATGGA

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2DR19JQ 451 0 0
GGTTGAAGGGGAAACTCCGGTGGAAATGGTTTTAGTGATGACAGTGGAGCCTGGATTTGG
AGGCCAGAAGTTCATGCCCAGCATGATGGACAAGGTCCGGGCATTGAGGAAGAAGTATCC
AAGACTTGATATTGAGGTGGATGGAGGGTTAGGCCCATCGACTATAGAAGCAGCGGCTGC
AGCAGGGGCCAACTGTATTGTAGCTGGAAGTTCAGTGTTTGGAGCTCCGAAGCCAGGTGA
AGTCATTTCCCTTTTGCGGACCAGTGTCGAGAAAGCCCAAGCCACCCCCTGAGAGTGCAC
TGCCCGTTTTTAATATTTATGCACCCACCAAAAGCAATAATAAGAGGTGAAAACATACAA
AAAGAATCGTTCAAACACTTGTTAGTAGTTTGATATTTGCACTTGTGTAATGGGATGTTT
TCGTATTGTCAAGCAAACTTGGTCATACTTT

QA 1 451 1 451
DS 



AS 1 2

CO CL4604Contig1 766 2 13 U
GCTTAAAACATAAGTTGCAAAGAGAGCTTACAGTTTTTTTTACAAGAGAGCAAGAAATAA
AAAAAAGACAGAACCAAAGGTAATAATAATTGATTGTGTCTGATTAAAACACTCTTTCTC
ATGTTGACCAAGTACAAAAGAAAACATAAAAAACAGATTCTCATATGCAAGTTCTGAGTG
AGCTATTATGCCATCCAAACCCCAAATCTCCTTCAAAGAACTCAGCCTGGCTCTGCTCCT
TTTGGCATCATGGAGTTGACAATATCATCCAAGGAACCAGCATCTGAAGGCACTGAACCA
TTCTCTAGCTTCTGTTGTCCCACAAATAAACCTTCACTTGGACCGCTACTTCTCAACAGT
TGAGCATCAGTAACCGGACCTAAGTTGTTTGCACCAAAAAAGCCTGCTTGTGCAGCATCT
GAGTTGCAGAAGTGGTTCCATTCCAAGGCGTCTGGTTTTGAATGAACATCACTCTGTGAG
ATGTTGGTTGACAATAGAGCGTTTGACCAACCTTCAAGACGCTTGTTGATCTCCAAGTGA
GGAGAGAACCCCCCAGGGTTTAAGGATGCATATGATGGCTGCTGGAGAACCAGCTGATTA
TTGGGAGCAACCATTAGAGAGCTTTGTTGTGAACTAAAGCTCGGAAAAGCCTTGTTGTTA
TTGTTGATATGAAGATCATCTAAAGGTGGAATCGGCATTCCTTGAAGTATGTAACCTCCA
TCACTGTGGTTACGAGGAAGCGATGATGAGACATGTGGGAACACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY83JQ U 35
AF RR2H371JQ U 1
BS 1 56 RR2H371JQ
BS 57 59 RR2EY83JQ
BS 60 138 RR2H371JQ
BS 139 139 RR2EY83JQ
BS 140 242 RR2H371JQ
BS 243 243 RR2EY83JQ
BS 244 292 RR2H371JQ
BS 293 293 RR2EY83JQ
BS 294 396 RR2H371JQ
BS 397 397 RR2EY83JQ
BS 398 510 RR2H371JQ
BS 511 511 RR2EY83JQ
BS 512 766 RR2H371JQ

RD RR2EY83JQ 546 0 0
TTTTTTTACAAGAGAGCAAGAAATAAAAAAAAGACAGAACCAAAGGTAATAATAATTGAT
TGTGTCTGATTAAAACACTCTTTCTCATGTTGACCAAGTACAAAAGAAAACATAAAAA*C
AGATTCTCATATGCAAGTTCTGAGTGAGCTATTATGCCATCCAAACCCCAAATCTCCTTC
AAAGAATTCAGCTTGGCTCTGCTCCTTTTGGCATCATGGAGTTGACAATATCATCCAAGG
AACCAGCATCTGAAGGCACTGAACCATTCTCTAGCTTCTGTTGTCCCACAAATAAACCTT
CACTTGGACTGCTACTTCTCAACAGTTGAGCATCAGTCATTGGACCTAAGTTGTTTGCAC
CAAAAAAGCCTGCTTGTGCAGCATCTGAGTTGCAGAAGTGGTTCCATTCCAAGGCGTCTG
GTTTTGAATGAACATCACTCTGTGGGATGTTGGTTGGCAATAGAGCGTTTGACCAACCTT
CAAGACGCTTGTTGATCTCCAAGTGAGGAGAGAACCCCCCAGGGTTTAAGGATGCATATG
ATGGCT

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2H371JQ 766 0 0
GCTTAAAACATAAGTTGCAAAGAGAGCTTACAGTTTTTTTTACAAGAGAGCAAGAA***A
AAAAAAGACAGAACCAAAGGTAATAATAATTGATTGTGTCTGATTAAAACACTCTTTCTC
ATGTTGACCAAGTACAAA*GAAAACATAAAAAACAGATTCTCATATGCAAGTTCTGAGTG
AGCTATTATGCCATCCAAACCCCAAATCTCCTTCAAAGAACTCAGCCTGGCTCTGCTCCT
TT*GGCATCATGGAGTTGACAATATCATCCAAGGAACCAGCATCTGAAGGCATTGAACCA
TTCTCTAGCTTCTGTTGTCCCACAAATAAACCTTCACTTGGACCGCTACTTCTCAACAGT
TGAGCATCAGTAACCGGACCTAAGTTGTTTGCACCAGAAAAGCCTGCTTGTGCAGCATCT
GAGTTGCAGAAGTGGTTCCATTCCAAGGCGTCTGGTTTTGAATGAACATCACTCTGTGAG
ATGTTGGTTGACAATAGAGCGTTTGACCAATCTTCAAGACGCTTGTTGATCTCCAAGTGA
GGAGAGAACCCCCCAGGGTTTAAGGATGCATATGATGGCTGCTGGAGAACCAGCTGATTA
TTGGGAGCAACCATTAGAGAGCTTTGTTGTGAACTAAAGCTCGGAAAAGCCTTGTTGTTA
TTGTTGATATGAAGATCATCTAAAGGTGGAATCGGCATTCCTTGAAGTATGTAACCTCCA
TCACTGTGGTTACGAGGAAGCGATGATGAGACATGTGGGAACACTC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL4605Contig1 950 2 4 U
GGGCATTATCCTAAACGAATAAAGTCTCCGATCACCTCTCTCTCTCTCACTCTTTCTCAA
AGTGTCCAGTCACGGGAAGTTATCTCCCACACAACATGAAGCAATTCTGGAGCCCAAACA
GTATCAACAAGAACAAAGCCATGGTGGAGAATCTTCAAAGCCATGGTGTGATTACCTCTG
ACGAAGTCGCTAAAGCTATGGAGGCTGTCGACCGAGGCCTCTTTGTACCAGACCGTTCCT
ATGCTTACGTCGACAGTCCCTTGTCTATTGGCTACAACGTCACCATATCAGCTCCTCACA
TGCACGCAATGTGCCTTGAGCTCCTCGAAAAGAATCTGAAACCAGGGATGCGTGTTCTTG
ATGTCGGCTCTGGAACCGGGTACTTAACAGCTTGCTTTGCGGTTATGGTTGGTTCCGAAG
GTCGTGCTATTGGTGTGGAGCACATCCCTGAATTGGTGGCTTCTTCCATTAAGAATATTG
AAGCGAGTGCTGCTGCTTCGCCATTTCTGAAATAAGGATCTCTGGCTATTCATGTTGGCG
ATGGAAGGCAAGGATGGGCTGAGTTTGCACCTTATGATGCTACTCATGTGGGAGCAGCGG
CACCGGAGATCCCAGAGGCATTGATTGATCAATTGAAACCTGGTGGGAGACTGGTGATCC
CGGTTGGCAACTTATTCCAAGATCTGCAAGTGGGGGATAAAAACTCTGATGGTTCGGTTA
GCATCAGGAGCGAAACGTCAGTTCGTTATGTTCCTTTAACTAGCCGTGAAGCCCAATTGA
GAGGGGGGTGATATGATGATGCTTGTTATACAACAGTACAATGTATGCTTCACTTGGTTT
TATAAATCAACCTTGTTACTCGAGAACATAAGTTTCAAGGATGTCTTTGCTTAAGTTTCA
AATGGGTAGACATGTTTATTGTTGAACGTAAATAATAGTAAGCGTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B615TF U 1
AF RR2B615JQ C 509
BS 1 693 RR2B615TF
BS 694 694 RR2B615JQ
BS 695 835 RR2B615TF
BS 836 950 RR2B615JQ

RD RR2B615TF 835 0 0
GGGCATTATCCTAAACGAATAAAGTCTCCGATCACCTCTCTCTCTCTCACTCTTTCTCAA
AGTGTCCAGTCACGGGAAGTTATCTCCCACACAACATGAAGCAATTCTGGAGCCCAAACA
GTATCAACAAGAACAAAGCCATGGTGGAGAATCTTCAAAGCCATGGTGTGATTACCTCTG
ACGAAGTCGCTAAAGCTATGGAGGCTGTCGACCGAGGCCTCTTTGTACCAGACCGTTCCT
ATGCTTACGTCGACAGTCCCTTGTCTATTGGCTACAACGTCACCATATCAGCTCCTCACA
TGCACGCAATGTGCCTTGAGCTCCTCGAAAAGAATCTGAAACCAGGGATGCGTGTTCTTG
ATGTCGGCTCTGGAACCGGGTACTTAACAGCTTGCTTTGCGGTTATGGTTGGTTCCGAAG
GTCGTGCTATTGGTGTGGAGCACATCCCTGAATTGGTGGCTTCTTCCATTAAGAATATTG
AAGCGAGTGCTGCTGCTTCGCCATTTCTGAAATAAGGATCTCTGGCTATTCATGTTGGCG
ATGGAAGGCAAGGATGGGCTGAGTTTGCACCTTATGATGCTACTCATGTGGGAGCAGCGG
CACCGGAGATCCCAGAGGCATTGATTGATCAATTGAAACCTGGTGGGAGACTGGTGATCC
CGGTTGGCAACTTATTCCAAGATCTGCAAGTGGTGGATAAAAACTCTGATGGTTCGGTTA
GCATCAGGAGCGAAACGTCAGTTCGTTATGTTCCTTTAACTAGCCGTGAAGCCCAATTGA
GAGGGGGGTGATATGATGATGCTTGTTATACAACAGTACAATGTATGCTTCACTT

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR2B615JQ 442 0 0
GAAATAAGGATTTCTGGCTATTCATGTTGGCGATGGAAGGCAAGGATGGGCTGAGTTTGC
CCCTTATGATGCTACTCATGTGGGAGCAGCGGCCCCGGAGATCCCAGAGGCATTGATTGA
TCAATTGAAACCTGGTGGGAGACTGGTGATCCCGGTTGGCAACTTATTCCAAGATTTGCA
AGTGGGGGATAAAAACTTTGATGGTTCGGTTAGCATCAGGAGGGAAACGTCAGTTCGTTA
TGTTCCTTTAACTAGCCGTGAAGCCCAATTGAGAGGGGGGTGATATGATGATGCTTGTTA
TACAACAGTACAATGTATGCTTCACTTGGTTTTATAAATCAACCTTGTTACTCGAGAACA
TAAGTTTCAAGGATGTCTTTGCTTAAGTTTCAAATGGGTAGACATGTTTATTGTTGAACG
TAAATAATAGTAAGCGTTTATT

QA 1 442 1 442
DS 



AS 1 2

CO CL4606Contig1 873 2 2 U
GGCTCGACAACGACGACTGTATTCTCTCTTTCGCTCGCATCGTTGATTCTCCGAAGCTTT
CTCTTGTCGATTCTCGTTTCTTTCCCCACCTTCGAAACTCTAAAGCAAAGGTTTGAAACA
TGTTTCTCAAAGTCGAGTTGCCATGGAACGTGATGATCCCTGCTGAAAACATGGATGCGA
AGGGTCTTATGCTGAAGAGGACTATTCTTGTTCAGTTGCTAGAGGCTTTTGCGTCGAAGA
GAGCAACCAAGGAGCTTGGCTACTACTTAACAGTCACATCGCTAGACAAGATCGGAGAAG
GCAAAATCAGGGAGCACACCGGCGAAGTTATGTTCCCTGTCGTTTTCAGCGGGATGACCT
TCAAGATCTTCAAAGGGGAGATACTCGAAGGTGTGGTGCACAAGGTGCTGAGGCACGGTG
TCTTCATGAGGTGTGGTCCTGTCGAGAACGTCTACCTCTCTCACCTGAAGATGCCTGATT
ACAAGTACCTCCCGGGAGAGAACCCCATCTTCATGAACGAGAAGATGTCTAGGATTCAGG
TTGATACTTTGGTCAGATTTGTGGTGATTGGGACCAAGTGGATGGAGGTTGAGAAGGAGT
TTCACGCGTTGGCTAGCCTAGAAAGGGACTACCTTGGACCGATCTCTGAAGAATGATCTG
TCTGGTTTTTTCATGTGATGGTGGTTTTGTGTAATCTCTTATGTTCGGTAAGTACTCTTT
TAAGCTGTGCAGACAATTAATGAACCTAGAATTTCGAATGTTGGTTGATATTCTCCACCG
TTAACAGAGGAACGCGTGGACTCATTTAGGTTTTACATGTTTGCTACAATCCATTTCTTG
AATTTCTAATCGATTGGTACCAGTTTATTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D665TF U 1
AF RR2D665JQ C 164
BS 1 647 RR2D665TF
BS 648 873 RR2D665JQ

RD RR2D665TF 647 0 0
GGCTCGACAACGACGACTGTATTCTCTCTTTCGCTCGCATCGTTGATTCTCCGAAGCTTT
CTCTTGTCGATTCTCGTTTCTTTCCCCACCTTCGAAACTCTAAAGCAAAGGTTTGAAACA
TGTTTCTCAAAGTCGAGTTGCCATGGAACGTGATGATCCCTGCTGAAAACATGGATGCGA
AGGGTCTTATGCTGAAGAGGACTATTCTTGTTCAGTTGCTAGAGGCTTTTGCGTCGAAGA
GAGCAACCAAGGAGCTTGGCTACTACTTAACAGTCACATCGCTAGACAAGATCGGAGAAG
GCAAAATCAGGGAGCACACCGGCGAAGTTATGTTCCCTGTCGTTTTCAGCGGGATGACCT
TCAAGATCTTCAAAGGGGAGATACTCGAAGGTGTGGTGCACAAGGTGCTGAGGCACGGTG
TCTTCATGAGGTGTGGTCCTGTCGAGAACGTCTACCTCTCTCACCTGAAGATGCCTGATT
ACAAGTACCTCCCGGGAGAGAACCCCATCTTCATGAACGAGAAGATGTCTAGGATTCAGG
TTGATACTTTGGTCAGATTTGTGGTGATTGGGACCAAGTGGATGGAGGTTGAGAAGGAGT
TTCACGCGTTGGCTAGCCTAGAAAGGGACTACCTTGGACCGATCTCT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2D665JQ 710 0 0
TGAAAACATGGATGCGAAGGGTCTTATGCTGAAGAGGACTATTCTTGTTCAGTTGCTAGA
GGCTTTTGCGTCGAAGAGAGCAACCAAGGAGCTTGGCTACTACTTAACAGTCACATCGCT
AGACAAGATCGGAGAAGGCAAAATCAGGGAGCACACCGGCGAAGTTATGTTCCCTGTCGT
TTTCAGCGGGATGACCTTCAAGATCTTCAAAGGGGAGATACTCGAAGGTGTGGTGCACAA
GGTGCTGAGGCACGGTGTCTTCATGAGGTGTGGTCCTGTCGAGAACGTCTACCTCTCTCA
CCTGAAGATGCCTGATTACAAGTACCTCCCGGGAGAGAACCCCATCTTCATGAACGAGAA
GATGTCTAGGATTCAGGTTGATACTTTGGTCAGATTTGTGGTGATTGGGACCAAGTGGAT
GGAGGTTGAGAAGGAGTTTCAGGCGTTGGCTAGCCTAGAAGGGGACTACCTTGGACCGAT
CTCTGAAGAATGATCTGTCTGGTTTTTTCATGTGATGGTGGTTTTGTGTAATCTCTTATG
TTCGGTAAGTACTCTTTTAAGCTGTGCAGACAATTAATGAACCTAGAATTTCGAATGTTG
GTTGATATTCTCCACCGTTAACAGAGGAACGCGTGGACTCATTTAGGTTTTACATGTTTG
CTACAATCCATTTCTTGAATTTCTAATCGATTGGTACCAGTTTATTCAGC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL4607Contig1 733 2 1 U
GTGACCAAGACAGTTTTAACGAGCATTGTTCTAAAACGCAATGTGACCATGCTTGATATA
GCAAGCACCCGTATGCTTGGTCAAGTTGGGTTTCTTGCAAAGGTATTTTCGATATTTGAG
GACCTTGAAATATCCGTAGATGTTGTCGCCACTAGTGAAGTCGGCTTATCTCTGACGCTG
GATCCGTCAAAACTCTGGAGCAGGGAACTGATTCAACAGGAACTTGATCATGTAGTTGAG
GAACTGGAGAAAATTGCAGTTGTGAATCTCTCAAAAGGAAGAGCTATAATCTCTTTAATT
GGGAATGTTCAACATTCCTCCCTGATTTTAGAGAGGGCGTTTCATGTTCTTCGGACAAAA
GGTATCAATGTCCAGATGATATCACAAGGAGCATCCAAGGTAAACATTTCTCTTATAGTA
AATGATGATGAAGCTGAAGGATGCGTTGAGGCTCTTCACAAATCCTTCTTTGAGAGCGGT
GACCTCTCAGAGTTACTGATACAACCCAGACTTGGCAACGGGTCACCCGTTAGGACAATG
CAAGTAGAAAATTGGCTTTAACGAGCTCATTGCTTGATCTGCAATTTTTCTTTGTATTGC
TTCCGAGTTTCTATGTTCTGTTTGTTTGTCCACTACTTGTTTCATTTGGTATGAGAACGT
TTTTCTTGGACCATTTGTATGATCTATTTTATTTTTAACCAATAAGAGAAAGAAATATAT
TGAGATGGTAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FH10TF U 1
AF RR2FH10JQ C 40
BS 1 733 RR2FH10TF

RD RR2FH10TF 733 0 0
GTGACCAAGACAGTTTTAACGAGCATTGTTCTAAAACGCAATGTGACCATGCTTGATATA
GCAAGCACCCGTATGCTTGGTCAAGTTGGGTTTCTTGCAAAGGTATTTTCGATATTTGAG
GACCTTGAAATATCCGTAGATGTTGTCGCCACTAGTGAAGTCGGCTTATCTCTGACGCTG
GATCCGTCAAAACTCTGGAGCAGGGAACTGATTCAACAGGAACTTGATCATGTAGTTGAG
GAACTGGAGAAAATTGCAGTTGTGAATCTCTCAAAAGGAAGAGCTATAATCTCTTTAATT
GGGAATGTTCAACATTCCTCCCTGATTTTAGAGAGGGCGTTTCATGTTCTTCGGACAAAA
GGTATCAATGTCCAGATGATATCACAAGGAGCATCCAAGGTAAACATTTCTCTTATAGTA
AATGATGATGAAGCTGAAGGATGCGTTGAGGCTCTTCACAAATCCTTCTTTGAGAGCGGT
GACCTCTCAGAGTTACTGATACAACCCAGACTTGGCAACGGGTCACCCGTTAGGACAATG
CAAGTAGAAAATTGGCTTTAACGAGCTCATTGCTTGATCTGCAATTTTTCTTTGTATTGC
TTCCGAGTTTCTATGTTCTGTTTGTTTGTCCACTACTTGTTTCATTTGGTATGAGAACGT
TTTTCTTGGACCATTTGTATGATCTATTTTATTTTTAACCAATAAGAGAAAGAAATATAT
TGAGATGGTAACT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2FH10JQ 694 0 0
AATGTGACCATGCTTGATATAGCAAGCACCCGTATGCTTGGTCAAGTTGGGTTTCTTGCA
AAGGTATTTTCGATATTTGAGGACCTTGAAATATCCGTAGATGTTGTCGCCACTAGTGAA
GTCGGCTTATCTCTGACGCTGGATCCGTCAAAACTCTGGAGCAGGGAACTGATTCAACAG
GAACTTGATCATGTAGTTGAGGAACTGGAGAAAATTGCAGTTGTGAATCTCTCAAAAGGA
AGAGCTATAATCTCTTTAATTGGGAATGTTCAACATTCCTCCCTGATTTTAGAGAGGGCG
TTTCATGTTCTTCGGACAAAAGGTATCAATGTCCAGATGATATCACAAGGAGCATCCAAG
GTAAACATTTCTCTTATAGTAAATGATGATGAAGCTGAAGGATGCGTTGAGGCTCTTCAC
AAATCCTTCTTTGAGAGCGGTGACCTCTCAGAGTTACTGATACAACCCAGACTTGGCAAC
GGGTCACCCGTTAGGACAATGCAAGTAGAAAATTGGCTTTAACGAGCTCATTGCTTGATC
TGCAATTTTTCTTTGTATTGCTTCCGAGTTTCTATGTTCTGTTTGTTTGTCCACTACTTG
TTTCATTTGGTATGAGAACGTTTTTCTTGGACCATTTGTATGATCTATTTTATTTTTAAC
CAATAAGAGAAAGAAATATATTGAGATGGTAACT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL4608Contig1 665 2 3 U
TTTTCGCGCCGTTAACACATGTGAACTAATTGCATGAAACATATTAAATCTTACATCAAC
CAAAGTACGAAACTCTTAGACTAAAACCAAAAAGAACTTGCGGGCTGAATTAGACGAGGA
CCGACCAAACAAACAGAAGGAAAAAAAAGGACAGACAAATCAAACTACTGGATATATCCG
TTACACTCATCAGGCGCAAATGAAATCAGAGGGAAGCTTTTTGTCGCAAGTATTGATGAG
CAAACTCAAGGAGATGGGAATATCAATGTTAATCCCCAAAACGTTAGCTTTGATGGCGGT
GCAAAGACAAACGGCAGCTTCAAGATCGACGAGGCCTTGAAGGAATGAGCAGCAAAGTGT
GTCTGGTGGGTTTCCGATGACTGTTCCGACCGCACCGTCCAGTATTTTTGCGCAAACTCC
GAGTTTTAGGGCGTCTCTTGGGCAGCTATGTTTTGTAGGATTGCTGATAGGGTTAGGGTT
AGGGATTGGCTTAGGCGGCAAGCAAGTGTTGCAGCCACTTACATACGCAAAAAACATGAG
ATTAAGAGATAGGAAGAGGGCTGCGGAAAAAGATCTGTTGGATTCCATTGATCTCAGAGT
TGATATACCCCAATTGGTGTTGAATTAATTTGTGATTATATAGCTAAGGATGTGATTATC
TATCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2FR08JQ U 5
AF RR2FR08TF C 1
BS 1 4 RR2FR08TF
BS 5 534 RR2FR08JQ
BS 535 665 RR2FR08TF

RD RR2FR08JQ 530 0 0
CGCGCCGTTAACACATGTGAACTAATTGCATGAAACATATTAAATCTTACATCAACCAAA
GTACGAAACTCTTAGACTAAAACCAAAAAGAACTTGCGGGCTGAATTAGACGAGGACCGA
CCAAACAAACAGAAGGAAAAAAAAGGACAGACAAATCAAACTACTGGATATATCCGTTAC
ACTCATCAGGCGCAAATGAAATCAGAGGGAAGCTTTTTGTCGCAAGTATTGATGAGCAAA
CTCAAGGAGATGGGAATATCAATGTTAATCCCCAAAACGTTAGCTTTGATGGCGGTGCAA
AGACAAACGGCAGCTTCAAGATCGACGAGGCCTTGAAGGAATGAGCAGCAAAGTGTGTCT
GGTGGGTTTCCGATGACTGTTCCGACCGCACCGTCCAGTATTTTTGCGCAAACTCCGAGT
TTTAGGGCGTCTCTTGGGCAGCTATGTTTTGTAGGATTGCTGATAGGGTTAGGGTTAGGG
ATTGGCTTAGGCGGCAAGCAAGTGTTGCAGCCACTTACATACGCAAAAAA

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2FR08TF 665 0 0
TTTTCGCGCCGTTAACACATGTGAACTAATTGCATGAAACATATTAAATCTTACATCAAC
CAAAGTACGAAACTCTTAGACTAAAACCAAAAAGAACTTGCGGGCTGAATTAGACGAGGA
CCGACCAAACAAACAGAAGGAAAAAAAAGGACAGACAAATCAAACTACTGGATATATCCG
TTACACTCATCAGGCGCAAATGAAATCAGAGGGAAGCTTTTTGTCGCAAGTATTGATGAG
CAAACTCAAGGAGATGGGAATATCAATGTTAATCCCCAGAACGTTAGCTTTGATGGCGGT
GCAAAGACAAACGGCAGCTTCAAGATCGACGAGGCCTTGAAGGAATGAGCAGCAAAGTGT
GTCTGGTGGGTTTCCGATGACTGTTCCGACCGCACCGTCCAGTATTTTTGCGCAAACTCC
GAGTTTTAGGGCGTCTCTTGGGCAGCTATGTTTTGTAGGATTGCTGATAGGGTTAGGGTT
AGGGATTGGCTTAGGCGGCAAGCAAGTGTTGCAGCCACTTACATACGCAAAAAACATGAG
ATTAAGAGATAGGAAGAGGGCTGCGGAAAAAGATCTGTTGGATTCCATTGATCTCAGAGT
TGATATACCCCAATTGGTGTTGAATTAATTTGTGATTATATAGCTAAGGATGTGATTATC
TATCC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL4609Contig1 475 2 1 U
GGACTTGCCCAATCGACACGTTGAAGCTAGGCGCTTGTGTGGACGTTCTTGGAGGTTTGA
TTCACATCGGGCTTGGTAAAGGGTACGCTAAAGAAAAGTGTTGTCCGGTTTTGGGAGGTT
TAGTTGACCTAGACGCAGCCGTTTGCTTATGTACCACCATTAAAGCCAAACTTCTCAACA
TCAACCTTATCATCCCAATTGCTCTTGAGGTTCTTGTCGCCTGTGGAAAGACTCCACCGC
CTGGCTTCAAATGTCCAGCTTGATTTATGAAGAGTCTTCCGAAGCTTTTGTTTCTGTAGA
ATGTGTTGGTTTGATGATCTCTTTTGACGAGAGGTTAATTTGTGTGTGTGGTACCTTTTA
TCACTTGTTTCATTTGATACAATAAAATGGTTTATTTGTGTGTTTCATGTTGTACTTTTA
GTAAGAAGAAAACTGTGAAACGGTAACTTTTTCTAAATATTAAACAAGTTTGTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F448JQ C 1
AF RR2F448TF U 1
BS 1 475 RR2F448TF

RD RR2F448JQ 475 0 0
GGACTTGCCCAATCGACACGTTGAAGCTAGGCGCTTGTGTGGACGTTCTTGGAGGTTTGA
TTCACATCGGGCTTGGTAAAGGGTACGCTAAAGAAAAGTGTTGTCCGGTTTTGGGAGGTT
TAGTTGACCTAGACGCAGCCGTTTGCTTATGTACCACCATTAAAGCCAAACTTCTCAACA
TCAACCTTATCATCCCAATTGCTCTTGAGGTTCTTGTCGCCTGTGGAAAGACTCCACCGC
CTGGCTTCAAATGTCCAGCTTGATTTATGAAGAGTCTTCCGAAGCTTTTGTTTCTGTAGA
ATGTGTTGGTTTGATGATCTCTTTTGACGAGAGGTTAATTTGTGTGTGTGGTACCTTTTA
TCACTTGTTTCATTTGATACAATAAAATGGTTTATTTGTGTGTTTCATGTTGTACTTTTA
GTAAGAAGAAAACTGTGAAACGGTAACTTTTTCTAAATATTAAACAAGTTTGTAG

QA 1 475 1 475
DS 

RD RR2F448TF 475 0 0
GGACTTGCCCAATCGACACGTTGAAGCTAGGCGCTTGTGTGGACGTTCTTGGAGGTTTGA
TTCACATCGGGCTTGGTAAAGGGTACGCTAAAGAAAAGTGTTGTCCGGTTTTGGGAGGTT
TAGTTGACCTAGACGCAGCCGTTTGCTTATGTACCACCATTAAAGCCAAACTTCTCAACA
TCAACCTTATCATCCCAATTGCTCTTGAGGTTCTTGTCGCCTGTGGAAAGACTCCACCGC
CTGGCTTCAAATGTCCAGCTTGATTTATGAAGAGTCTTCCGAAGCTTTTGTTTCTGTAGA
ATGTGTTGGTTTGATGATCTCTTTTGACGAGAGGTTAATTTGTGTGTGTGGTACCTTTTA
TCACTTGTTTCATTTGATACAATAAAATGGTTTATTTGTGTGTTTCATGTTGTACTTTTA
GTAAGAAGAAAACTGTGAAACGGTAACTTTTTCTAAATATTAAACAAGTTTGTAG

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 2

CO CL4610Contig1 970 2 4 U
GGGACTAGTAGCTGCCTTAATTACTCCGTCACACGCTCCACAAGAAATCTCAGATTTCAA
AAACCAAATCCAAAAAGACCTAATTGTTCAGTGCGGCGGGTCCTCTTCACAAACTCCAAT
CGCCGAGTTCTAATAAAAAAGTTGAGAGATTTGAATAAGAAGAACAGCTTCTGCTCGCTT
TTAAATCGATTTCCTTTTCAGACCCGAACAAAACTCTAGCAGTTATCCTCTAAGAGAGTC
GCAGAGGCGCGAATAGAAAACAAACAGAAATTCATAATGGCTCAGAAGCTTGAACTAATC
AGAGGTGGAGGAGGATCCATCAAAATAGGAGCCACAGGAACGGTGGCAACTCTGATGACT
CGCGAGCTAGACTCCATGAAACAACAACCTTCGCCTCAGACTCCCACAACTAAACCCATT
AGAACAACTATCCCCGTCTCTGTAGACTGTGGCACCTCTTCTTCCACTCCAAGAAGACCA
AAAGCAAGAAAATCATCAGACGAAGCTAGCAGCAGCAGCAATGTTAGAACACCAAAGGGT
CACATCACCAAAAGCACTCATCAGCTTCCTAATGTTGTTGGCTCTGATAACGTTAGAACA
CCAAAGGGTCACAATGCTAAAAAAAGCACTCATCAGCTTCCAATGCTTGGCTCTGATAAT
GTATCGCTGCAAGGAACTCCGAGAAGGGAGAAGAGAATGAACATTGTGGATATTGTGGAT
GTGAAATGCGGGAATCCTGATCGGGCTTGGGCTAATCCGATAACCAGTAGACTCAAGAAG
CTTGGCTTCTCTAAACTCAATGAGAGCATTGGTTAAAGTAGCTGAACCGAATTATTATAC
TCTGTCCCATCCGGTTTGTTTATCGGTATGAACCGAATTAAACCAAATGAGAATGTGGTA
TATTTCTTTTGTCAAACCAACAATGTAATTGTAAACGGAGCTTTTGGTTGTCATTAAAGT
CTTTTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H914TF U 1
AF RR2H914JQ C 215
BS 1 673 RR2H914TF
BS 674 674 RR2H914JQ
BS 675 691 RR2H914TF
BS 692 970 RR2H914JQ

RD RR2H914TF 704 0 0
GGGACTAGTAGCTGCCTTAATTACTCCGTCACACGCTCCACAAGAAATCTCAGATTTCAA
AAACCAAATCCAAAAAGACCTAATTGTTCAGTGCGGCGGGTCCTCTTCACAAACTCCAAT
CGCCGAGTTCTAATAAAAAAGTTGAGAGATTTGAATAAGAAGAACAGCTTCTGCTCGCTT
TTAAATCGATTTCCTTTTCAGACCCGAACAAAACTCTAGCAGTTATCCTCTAAGAGAGTC
GCAGAGGCGCGAATAGAAAACAAACAGAAATTCATAATGGCTCAGAAGCTTGAACTAATC
AGAGGTGGAGGAGGATCCATCAAAATAGGAGCCACAGGAACGGTGGCAACTCTGATGACT
CGCGAGCTAGACTCCATGAAACAACAACCTTCGCCTCAGACTCCCACAACTAAACCCATT
AGAACAACTATCCCCGTCTCTGTAGACTGTGGCACCTCTTCTTCCACTCCAAGAAGACCA
AAAGCAAGAAAATCATCAGACGAAGCTAGCAGCAGCAGCAATGTTAGAACACCAAAGGGT
CACATCACCAAAAGCACTCATCAGCTTCCTAATGTTGTTGGCTCTGATAACGTTAGAACA
CCAAAGGGTCACAATGCTAAAAAAAGCACTCATCAGCTTCCAATGCTTGGCTCTGATAAT
GTATCGCTGCAAG*AACTCCGAGAAGGGAGA
GAGATGACATTGT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2H914JQ 756 0 0
TCTAGCAGTTATCCTCTAAGAGAGTCGCAGAGGCGCGAATAGAAAACAAACAGAAATTCA
TAATGGCTCAGAAGCTTGAACTAATCAGAGGTGGAGGAGGATCCATCAAAATAGGAGCCA
CAGGAACGGTGGCAACTCTGATGACTCGCGAGCTAGACTCCATGAAACAACAACCTTCGC
CTCAGACTCCCACAACTAAACCCATTAGAACAACTATCCCCGTCTCTGTAGACTGTGGCA
CCTCTTCTTCCACTCCAAGAAGACCAAAAGCAAGAAAATCATCAGACGAAGCTAGCAGCA
GCAGCAATGTTAGAACACCAAAGGGTCACATCACCAAAAGCACTCATCAGCTTCCTAATG
TTGTTGGCTCTGATAACGTTAGAACACCAAAGGGTCACAATGCTAAAAAAAGCACTCATC
AGCTTCCAATGCTTGGCTCTGATAATGTATCGCTGCAAGGAACTCCGAGAAGGGAGAAGA
GAATGAACATTGTGGATATTGTGGATGTGAAATGCGGGAATCCTGATCGGGCTTGGGCTA
ATCCGATAACCAGTAGACTCAAGAAGCTTGGCTTCTCTAAACTCAATGAGAGCATTGGTT
AAAGTAGCTGAACCGAATTATTATACTCTGTCCCATCCGGTTTGTTTATCGGTATGAACC
GAATTAAACCAAATGAGAATGTGGTATATTTCTTTTGTCAAACCAACAATGTAATTGTAA
ACGGAGCTTTTGGTTGTCATTAAAGTCTTTTATTTT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL4611Contig1 801 2 2 U
GGGACGACTGTTATTGCAGCAACAGAACCGTCATGGCTTCTTCTACAGCTTCAAGGTTTC
TCCGGAAACTTCCTCAAACCCTTGTTCGTATCTATCCCACTAGGGTTCTAAGCTCTTCGA
TTCACAAAACCGCCGAGCCATCGCATTCGTTACGGCGAATAGGATCCAGTCTTCTCCGAC
ATGACTCCATCACTACAAGAAGCTTCTCTTCTCAAGAATGTCCTGCTCCTATCGATTACA
GTTCGATTCTGCAGGAGGATGAGTTCCACAGATTAGCAAACGCCACTATCAATCACCTTC
TTGAGAAGATTGAGGATTATGGTGATAATGTCCAGATTGATGGGTTCGACATAGATTATG
GGAATGAAGTTCTTACTCTTAAGCTTGGATCTTTAGGCACGTATGTACTCAATAAGCAAA
CTCCTAACCGACAAATCTGGATGTCTTCACCTGTCAGTGGCCCGTCTAGATTCGACTGGG
ACCCTGATGCTAATGCGTGGATTTACCGGAGGACAGAAGCAAAGTTGCATAAACTGTTGG
AAGAGGAGTTGGAGAGTCTATGTGGCGAACCAATTCAACTCTCATGAGAAAAAAAGTCTT
GAACAATATTTGTGAGTTTATCTAGGAACTTATGCCCTTCAATGGTGTATATGTCTATGA
AACATCGAGAGGAATAAACAAACTAGGCACGAGAATAAAAAAGTTGTTTCAGTGTGATTA
TACTTTTTAACAATATTGTTTCGTACATACACAGTGTGCATCCTTTGTTCTTGTACACTA
AAGCTCTCTATTCGTTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G149TF U 1
AF RR2G149JQ C 207
BS 1 682 RR2G149TF
BS 683 801 RR2G149JQ

RD RR2G149TF 682 0 0
GGGACGACTGTTATTGCAGCAACAGAACCGTCATGGCTTCTTCTACAGCTTCAAGGTTTC
TCCGGAAACTTCCTCAAACCCTTGTTCGTATCTATCCCACTAGGGTTCTAAGCTCTTCGA
TTCACAAAACCGCCGAGCCATCGCATTCGTTACGGCGAATAGGATCCAGTCTTCTCCGAC
ATGACTCCATCACTACAAGAAGCTTCTCTTCTCAAGAATGTCCTGCTCCTATCGATTACA
GTTCGATTCTGCAGGAGGATGAGTTCCACAGATTAGCAAACGCCACTATCAATCACCTTC
TTGAGAAGATTGAGGATTATGGTGATAATGTCCAGATTGATGGGTTCGACATAGATTATG
GGAATGAAGTTCTTACTCTTAAGCTTGGATCTTTAGGCACGTATGTACTCAATAAGCAAA
CTCCTAACCGACAAATCTGGATGTCTTCACCTGTCAGTGGCCCGTCTAGATTCGACTGGG
ACCCTGATGCTAATGCGTGGATTTACCGGAGGACAGAAGCAAAGTTGCATAAACTGTTGG
AAGAGGAGTTGGAGAGTCTATGTGGCGAACCAATTCAACTCTCATGAGAAAAAAAGTCTT
GAACAATATTTGTGAGTTTATCTAGGAACTTATGCCCTTCAATGGTGTATATGTCTATGA
AACATCGAGAGGAATAAACAAA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2G149JQ 595 0 0
TCTTCTCAAGAATGTCCTGCTCCTATCGATTACAGTTCGATTCTGCAGGAGGATGAGTTC
CACAGATTAGCAAACGCCACTATCAATCACCTTCTTGAGAAGATTGAGGATTATGGTGAT
AATGTCCAGATTGATGGGTTCGACATAGATTATGGGAATGAAGTTCTTACTCTTAAGCTT
GGATCTTTAGGCACGTATGTACTCAATAAGCAAACTCCTAACCGACAAATCTGGATGTCT
TCACCTGTCAGTGGCCCGTCTAGATTCGACTGGGACCCTGATGCTAATGCGTGGATTTAC
CGGAGGACAGAAGCAAAGTTGCATAAACTGTTGGAAGAGGAGTTGGAGAGTCTATGTGGC
GAACCAATTCAACTCTCATGAGAAAAAAAGTCTTGAACAATATTTGTGAGTTTATCTAGG
AACTTATGCCCTTCAATGGTGTATATGTCTATGAAACATCGAGAGGAATAAACAAACTAG
GCACGAGAATAAAAAAGTTGTTTCAGTGTGATTATACTTTTTAACAATATTGTTTCGTAC
ATACACAGTGTGCATCCTTTGTTCTTGTACACTAAAGCTCTCTATTCGTTTAACC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

CO CL4612Contig1 824 2 2 U
GGGAAACCTCCGCTTAAACCCCTCAGCTAAACAGACGTTGCAGAGAAAAAGATAAGGTTG
AAGAGTGAAGCGAAAGTGTGCAAGATGGCTTCTTTAGACGTAGCTCTTTTCTCTACTCGG
CTTCGATTCCACTCATCTTCCTCTTCGTCCATCCGTTGTGCTCTTCCAACAATCTTCAAT
CTCTCTTCACAAGCCGCGAGTTCGTGCGTAATCAAACCGACCCAGTTTCTTCACCGGCGT
TTGAGATCCAAATCGACTAACTTTTCTCTTTCTTCCTTGCCACGGAGAGGGTTTGTGTGT
AGAGCTGCGGAGTATAAGTTCCCGGATCCCATACCTGAATTCGCCGAAGCTTAGACGAAG
AAATTCAAGGACCATATGACAAAGAAACTATCAAAGAGGGATCTTTTTGAAGACTCTGTT
GATGAGATTGTCGGAGTCTGCACTGAGATCTTCGAGACGTTCTTGCGCAGCGAGTATGGA
GGACCTGGAACGCTCTTGGTCATACCTTTCATTGACATGGCTGATACTCTCAATGAAAGG
GAATTGCCTGGAGGTCCACAAGCTGCTCGGGCAGCTATCAAATGGGCTCAGGATCATGTA
GACCAGGATTGGAAGGAATGGACCGGCACTGATTAGTAACACCACCCGAACCTCAAATCA
TCAAAATATAGTTCAGTACTCATGTATCAGAGGGGATAGATTGTCTTTGTAAAACTCTAA
ATTTTGCAGATATCGGTATTCTGTTAGCTCTGTTCTTATACAATCGCTTGGCCTCATCAG
CTGTTTTCCTAGTTGATTCATGTATGGTTCGGTAGATTATCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D356TF U 1
AF RR2D356JQ C 269
BS 1 784 RR2D356TF
BS 785 824 RR2D356JQ

RD RR2D356TF 784 0 0
GGGAAACCTCCGCTTAAACCCCTCAGCTAAACAGACGTTGCAGAGAAAAAGATAAGGTTG
AAGAGTGAAGCGAAAGTGTGCAAGATGGCTTCTTTAGACGTAGCTCTTTTCTCTACTCGG
CTTCGATTCCACTCATCTTCCTCTTCGTCCATCCGTTGTGCTCTTCCAACAATCTTCAAT
CTCTCTTCACAAGCCGCGAGTTCGTGCGTAATCAAACCGACCCAGTTTCTTCACCGGCGT
TTGAGATCCAAATCGACTAACTTTTCTCTTTCTTCCTTGCCACGGAGAGGGTTTGTGTGT
AGAGCTGCGGAGTATAAGTTCCCGGATCCCATACCTGAATTCGCCGAAGCTTAGACGAAG
AAATTCAAGGACCATATGACAAAGAAACTATCAAAGAGGGATCTTTTTGAAGACTCTGTT
GATGAGATTGTCGGAGTCTGCACTGAGATCTTCGAGACGTTCTTGCGCAGCGAGTATGGA
GGACCTGGAACGCTCTTGGTCATACCTTTCATTGACATGGCTGATACTCTCAATGAAAGG
GAATTGCCTGGAGGTCCACAAGCTGCTCGGGCAGCTATCAAATGGGCTCAGGATCATGTA
GACCAGGATTGGAAGGAATGGACCGGCACTGATTAGTAACACCACCCGAACCTCAAATCA
TCAAAATATAGTTCAGTACTCATGTATCAGAGGGGATAGATTGTCTTTGTAAAACTCTAA
ATTTTGCAGATATCGGTATTCTGTTAGCTCTGTTCTTATACAATCGCTTGGCCTCATCAG
CTGT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2D356JQ 556 0 0
TTTT
TTCCTTGCCACGGAGAGGGTTTGTGTGTAGAGCTGCGGAGTATAAGTTCCCGGATCCCAT
ACCTGAATTCGCCGAAGCTTAGACGAAGAAATTCAAGGACCATATGACAAAGAAACTATC
AAAGAGGGATTTTTTTGAAGACTCTGTTGATGAGATTGTCGGAGTTTGCACTGAGATTTT
CGAGACGTTCTTGCGCAGCGAGTATGGAGGACCTGGAACGCTTTTGGTCATACCTTTCAT
TGACATGGCTGATACTCTCAATGAAAGGGAATTGCCTGGAGGTCCCCAAGCTGCTCGGGC
AGCTATCAAATGGGCTCAGGATCATGTAGACCAGGATTGGAAGGAATGGACCGGCACTGA
TTAGTAACCCCCCCCGAACCTCAAATCATCAAAATATAGTTCAGTACTCATGTATCAGAG
GGGATAGATTGTCTTTGTAAAACTTTAAATTTTGCAGATATCGGTATTCTGTTAGCTCTG
TTTTTATACAATCGCTTGGCCTCATCAGCTGTTTTCCTAGTTGATTCATGTATGGTTCGG
TAGATTATCTTG

QA 5 556 5 556
DS 



AS 1 2

CO CL4613Contig1 980 2 6 U
GCCGGTCTTCTTCTTGCCCCAGGCGGAGAGTTTGCATTTGTTGCTCTTGGAGAAGCTGTC
AATCAGGGTATAATGTCTCCTCAGTTGTCTTCGTTACTGTTTCTTGTGGTGGGAATCTCA
ATGGCTATCACACCTTGGTTAGCTGCTGGTGGCCAGTTAATTGCATCACGGTTTGAGTTG
CATGACGTTCGAAGTTTATTGCCGGTTGAAAGTGAGACGGATGATTTGCAAGATCACATA
ATTATTTGCGGATTTGGACGAGTTGGTCAGATAATTGCTCAGCTTCTTTCAGAAAGACTT
ATCCCATTCGTTGCCCTCGATGTTAATAGTGATAGAGTGACTATCGCGCGTTCCATGGAT
CTTCCTGTTTATTTTGGAGACGCTGGTAGTAGAGAGGTTCTCCACAAAATTGGAGCAGAG
AGAGCATGTGCTGCTGTGGTCGCTTTAGACGCACCAGGAACAAATTACAGATGTGTGTGG
GCTCTGAACAAGTACTACCCCAATGTGAAGACTTTTGTACGTGCACACGACGTTGTTCAC
GGTCTTAATCTTGAAAAAGCTGGTGCTACTGCTGTTGTCCCAGAGACTCTGGAGCCAAGT
CTACAGTTGGCAGCTGCTGTTCTTGCTCACGCCAAATTACCGACATCAGAAATCGCAAAC
ACGATCAACGAGTTTAGAACACGTCACCTGTCTGAACTAACGGAGCTAAGTGAAGCAAGC
GGAAGCTCTCTGGGGTACGGCTTTTCCAGGACGACGAGTAAGCCAAAACCTCAAGGGACG
GATGCATCTGAAGAGAACCAGATTATGGAAGGAGGTGGTACACTGGCGACCTGATGGCCG
TTTCTTCATTCTAGCAAGAACCAAGGAGCCTAACATTCTTGTGGTGGCCATTTCTTTTTG
CCTGGTAGTTTCTTACTTTGATGGAAAAAATGAAACAGTCTTTTGAACAGATTAGTCATA
ATATTGTTGATGTTATCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL56TF U 1
AF RR2EL56JQ C 250
BS 1 695 RR2EL56TF
BS 696 696 RR2EL56JQ
BS 697 723 RR2EL56TF
BS 724 724 RR2EL56JQ
BS 725 738 RR2EL56TF
BS 739 980 RR2EL56JQ

RD RR2EL56TF 738 0 0
GCCGGTCTTCTTCTTGCCCCAGGCGGAGAGTTTGCATTTGTTGCTCTTGGAGAAGCTGTC
AATCAGGGTATAATGTCTCCTCAGTTGTCTTCGTTACTGTTTCTTGTGGTGGGAATCTCA
ATGGCTATCACACCTTGGTTAGCTGCTGGTGGCCAGTTAATTGCATCACGGTTTGAGTTG
CATGACGTTCGAAGTTTATTGCCGGTTGAAAGTGAGACGGATGATTTGCAAGATCACATA
ATTATTTGCGGATTTGGACGAGTTGGTCAGATAATTGCTCAGCTTCTTTCAGAAAGACTT
ATCCCATTCGTTGCCCTCGATGTTAATAGTGATAGAGTGACTATCGCGCGTTCCATGGAT
CTTCCTGTTTATTTTGGAGACGCTGGTAGTAGAGAGGTTCTCCACAAAATTGGAGCAGAG
AGAGCATGTGCTGCTGTGGTCGCTTTAGACGCACCAGGAACAAATTACAGATGTGTGTGG
GCTCTGAACAAGTACTACCCCAATGTGAAGACTTTTGTACGTGCACACGACGTTGTTCAC
GGTCTTAATCTTGAAAAAGCTGGTGCTACTGCTGTTGTCCCAGAGACTCTGGAGCCAAGT
CTACAGTTGGCAGCTGCTGTTCTTGCTCACGCCAAATTACCGACATCAGAAATCGCAAAC
ACGATCAACGAGTTTAGAACACGTCACCTGTCTGA*CTAACGGAGCTAAGTGAAGCAAGC
GGA*GCTCTCTGGGGTAC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2EL56JQ 731 0 0
GGATTTGGACGAGTTGGTCAGATAATTGCTCAGCTTCTTTCAGAAAGACTTATCCCATTC
GTTGCCCTCGATGTTAATAGTGATAGAGTGACTATCGCGCGTTCCATGGATCTTCCTGTT
TATTTTGGAGACGCTGGTAGTAGAGAGGTTCTCCACAAAATTGGAGCAGAGAGAGCATGT
GCTGCTGTGGTCGCTTTAGACGCACCAGGAACAAATTACAGATGTGTGTGGGCTCTGAAC
AAGTACTACCCCAATGTGAAGACTTTTGTACGTGCACACGACGTTGTTCACGGTCTTAAT
CTTGAAAAAGCTGGTGCTACTGCTGTTGTCCCAGAGACTCTGGAGCCAAGTCTACAGTTG
GCAGCTGCTGTTCTTGCTCAGGCCAAATTACCGACATCAGAAATCGCAAACACGATCAAC
GAGTTTAGAACACGTCACCTGTCTGAACTAACGGAGCTAAGTGAAGCAAGCGGAAGCTCT
CTGGGGTACGGCTTTTCCAGGACGACGAGTAAGCCAAAACCTCAAGGGACGGATGCATCT
GAAGAGAACCAGATTATGGAAGGAGGTGGTACACTGGCGACCTGATGGCCGTTTCTTCAT
TCTAGCAAGAACCAAGGAGCCTAACATTCTTGTGGTGGCCATTTCTTTTTGCCTGGTAGT
TTCTTACTTTGATGGAAAAAATGAAACAGTCTTTTGAACAGATTAGTCATAATATTGTTG
ATGTTATCTCG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL4614Contig1 655 2 1 U
CTCAGCTGTCTAGGGTTTTTGCCTCTCTCACTCTCTTCACTCTTAAACCTAGCAGTCAGT
CTCTCTTCCTCAAATTCGCCATGGGTAAAAAATCCGCCATCAAAGCTGAAGCAGCACCTG
TTGCCATCAAGGCCACCAAGACTTTGAAGAAAGGTAAGAGAGAGCCTGAGGCTGATGTGG
ATACCAAAGTGAACCTAAAGAAGCAGAAGAAAGATGTGATTGCTGCTGTCCAGAAGGAGA
AAGCTGAGAAGAAGGTGCCTAAAAAAGTTGAGAGCTCTGACTCATCTGACTCTTCTGATA
TCGAGGAAGAAGAACCCGCACCTAAAAAGACCGTTGCTGCTACTAACGGAACTGTTGCAA
AGAAAGCAAAGGATGACTCATCCTCTGAGGAAGAATCTTCAGATGAGGAAGAAGCTGCTG
CTACCAAGAAGCCTGCTGCTGCTAAAAATGGCTCAGTGAAGGCTAAGGCAGAGAGCTCCT
CTGAGGAAGACTCTTCTGATGAATCAGAAGATGAATCTGAGGATGAGAAGAAACCTGCTG
CTGAGAAGGCAGCTCCTGCTACTACCAAGGCTGCTGACGGTTCAGATTCATCCGAGGAAG
ATTCTGATGAGGAAAGTGAAGATGAATCGGAGAGTGAAGATGAGAAAGAAACCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GE39JQ C 1
AF RR2GE39TF U 1
BS 1 655 RR2GE39TF

RD RR2GE39JQ 655 0 0
CTCAGCTGTCTAGGGTTTTTGCCTCTCTCACTCTCTTCACTCTTAAACCTAGCAGTCAGT
CTCTCTTCCTCAAATTCGCCATGGGTAAAAAATCCGCCATCAAAGCTGAAGCAGCACCTG
TTGCCATCAAGGCCACCAAGACTTTGAAGAAAGGTAAGAGAGAGCCTGAGGCTGATGTGG
ATACCAAAGTGAACCTAAAGAAGCAGAAGAAAGATGTGATTGCTGCTGTCCAGAAGGAGA
AAGCTGAGAAGAAGGTGCCTAAAAAAGTTGAGAGCTCTGACTCATCTGACTCTTCTGATA
TCGAGGAAGAAGAACCCGCACCTAAAAAGACCGTTGCTGCTACTAACGGAACTGTTGCAA
AGAAAGCAAAGGATGACTCATCCTCTGAGGAAGAATCTTCAGATGAGGAAGAAGCTGCTG
CTACCAAGAAGCCTGCTGCTGCTAAAAATGGCTCAGTGAAGGCTAAGGCAGAGAGCTCCT
CTGAGGAAGACTCTTCTGATGAATCAGAAGATGAATCTGAGGATGAGAAGAAACCTGCTG
CTGAGAAGGCAGCTCCTGCTACTACCAAGGCTGCTGACGGTTCAGATTCATCCGAGGAAG
ATTCTGATGAGGAAAGTGAAGATGAATCGGAGAGTGAAGATGAGAAAGAAACCCC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2GE39TF 655 0 0
CTCAGCTGTCTAGGGTTTTTGCCTCTCTCACTCTCTTCACTCTTAAACCTAGCAGTCAGT
CTCTCTTCCTCAAATTCGCCATGGGTAAAAAATCCGCCATCAAAGCTGAAGCAGCACCTG
TTGCCATCAAGGCCACCAAGACTTTGAAGAAAGGTAAGAGAGAGCCTGAGGCTGATGTGG
ATACCAAAGTGAACCTAAAGAAGCAGAAGAAAGATGTGATTGCTGCTGTCCAGAAGGAGA
AAGCTGAGAAGAAGGTGCCTAAAAAAGTTGAGAGCTCTGACTCATCTGACTCTTCTGATA
TCGAGGAAGAAGAACCCGCACCTAAAAAGACCGTTGCTGCTACTAACGGAACTGTTGCAA
AGAAAGCAAAGGATGACTCATCCTCTGAGGAAGAATCTTCAGATGAGGAAGAAGCTGCTG
CTACCAAGAAGCCTGCTGCTGCTAAAAATGGCTCAGTGAAGGCTAAGGCAGAGAGCTCCT
CTGAGGAAGACTCTTCTGATGAATCAGAAGATGAATCTGAGGATGAGAAGAAACCTGCTG
CTGAGAAGGCAGCTCCTGCTACTACCAAGGCTGCTGACGGTTCAGATTCATCCGAGGAAG
ATTCTGATGAGGAAAGTGAAGATGAATCGGAGAGTGAAGATGAGAAAGAAACCCC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL4615Contig1 344 2 1 U
GGTATGAATGAGATTTTCTATTTTATAGGGGCTCTTGGTCCTTTATTTATAGTTCTTGCA
TTAACCGGCCTGGAATTAGGTGTAGCTATATTACAAGCTTATGTTTTTACGATCTTAATC
TGTATTTACTTGAATGATGCTATAAATCTCCATTAAAGTTCTTCTTTCTTTTATTTAGAT
TTATAATTGAACAAAAGCGAGGGATGAGAGTAGTGTTATTTAGAGCAGTTACACAGCCCC
TCTCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCCCTCCTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATG
CTCGAGTTACTAAACACCCCCTAGGGGGCCCCTCTCTGATAAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AI76JQ C 1
AF RR2AI76TF U 1
BS 1 344 RR2AI76TF

RD RR2AI76JQ 344 0 0
GGTATGAATGAGATTTTCTATTTTATAGGGGCTCTTGGTCCTTTATTTATAGTTCTTGCA
TTAACCGGCCTGGAATTAGGTGTAGCTATATTACAAGCTTATGTTTTTACGATCTTAATC
TGTATTTACTTGAATGATGCTATAAATCTCCATTAAAGTTCTTCTTTCTTTTATTTAGAT
TTATAATTGAACAAAAGCGAGGGATGAGAGTAGTGTTATTTAGAGCAGTTACACAGCCCC
TCTCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCCCTCCTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATG
CTCGAGTTACTAAACACCCCCTAGGGGGCCCCTCTCTGATAAGG

QA 1 344 1 344
DS 

RD RR2AI76TF 344 0 0
GGTATGAATGAGATTTTCTATTTTATAGGGGCTCTTGGTCCTTTATTTATAGTTCTTGCA
TTAACCGGCCTGGAATTAGGTGTAGCTATATTACAAGCTTATGTTTTTACGATCTTAATC
TGTATTTACTTGAATGATGCTATAAATCTCCATTAAAGTTCTTCTTTCTTTTATTTAGAT
TTATAATTGAACAAAAGCGAGGGATGAGAGTAGTGTTATTTAGAGCAGTTACACAGCCCC
TCTCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCCCTCCTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATG
CTCGAGTTACTAAACACCCCCTAGGGGGCCCCTCTCTGATAAGG

QA 1 344 1 344
DS 



AS 1 2

CO CL4616Contig1 1114 2 2 U
GAGATGGAAGTGCAGAGAAAAGCTCTCGTAAAATGGACTTGAGTTCAAATGAGGAATGGT
CCATTGTCCAGGGAGCTCTTCAAATACTCACTGTAGCGGATTGCCTTACGAGCAGGTCTT
CTGTGTTTGAAGCTTCTTTGAGAGCCACTCTAGCTAGACTAAACTCCAGCTTGTCTATTT
CATTATTTGGCACAAATCTGGATCAGAACCTGTCACACCTGACAAGTGAACAAACAGCTG
GAGATTTGTCTATGGCTGGACGAGCTTCCCTGGATGTGGCAGCTATTCGGTTGGTTGATG
TTCCGGAGAAGGCTCGCAAACTCCTAAACTTATTGGAGCAGTCTAAAGACCCAAGGTTCC
ATGCATTGCCTTTGGCATCTCAGAGAGTGGCTACATCTGCGGATACAGTGAACGAACTTG
TCTATGACATCCTCATATCAAAAGTCAGACAAAGACTGGGGGAAGTATCTCGCCTACCAA
TCTGGTCTTCAGTGGAGGAACAGACCGCTTTTGCTCTACCAAACTTCAGCTCATACCCTC
AGGCTTACGTTACAAGCGTTGGAGAATATCTCCTGACTTTGCCTCAGCAGCTTGAGCCTC
TAGCTGAAGGAATCTCAACCAACGGAGATGCAAACAACGAGGATGCACAGTTCTTTGCAA
CAGAGTGGATGTTCAAGGTAGCAGAAGGCGCAACGGCTCTGTACATGGAGCAACTGAGAG
GAATCCAATACATTTGAGACCGAGGAGCACAACAACTGTGTGTAGATATAGAGTACTTGA
GCAATGTGCTTGCGGCCTTGTCCATGCCGATTCCGCCTGTGCTTGCAACTTTCCAGACGT
GTTTGGCTACACCAAGAGATGAGCTCAAAGATGTGATGAAATCAGAAGCTGGTAGTGAAC
TTGATTTCCCTACGGCTAATCTTGTTTGTAAGATGCGTCGTATCAGTTTCGATTAGTCTC
TAAACTCTCAAAAACGTGCTTTGGTGCCATTGTCATATTTTTTTACATATTGCCAAAGTT
TTGATGCTCTATATAAGACAAGTTTTTTTTCCTTGATAAAATGTAATAAAGATATAATTA
AATTCTTATTTATGCAATACTAATTTGTCTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS93TF U 1
AF RR2GS93JQB C 455
BS 1 539 RR2GS93TF
BS 540 1114 RR2GS93JQB

RD RR2GS93TF 539 0 0
GAGATGGAAGTGCAGAGAAAAGCTCTCGTAAAATGGACTTGAGTTCAAATGAGGAATGGT
CCATTGTCCAGGGAGCTCTTCAAATACTCACTGTAGCGGATTGCCTTACGAGCAGGTCTT
CTGTGTTTGAAGCTTCTTTGAGAGCCACTCTAGCTAGACTAAACTCCAGCTTGTCTATTT
CATTATTTGGCACAAATCTGGATCAGAACCTGTCACACCTGACAAGTGAACAAACAGCTG
GAGATTTGTCTATGGCTGGACGAGCTTCCCTGGATGTGGCAGCTATTCGGTTGGTTGATG
TTCCGGAGAAGGCTCGCAAACTCCTAAACTTATTGGAGCAGTCTAAAGACCCAAGGTTCC
ATGCATTGCCTTTGGCATCTCAGAGAGTGGCTACATCTGCGGATACAGTGAACGAACTTG
TCTATGACATCCTCATATCAAAAGTCAGACAAAGACTGGGGGAAGTATCTCGCCTACCAA
TCTGGTCTTCAGTGGAGGAACAGACCGCTTTTGCTCTACCAAACTTCAGCTCATACCCT

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2GS93JQB 660 0 0
ACTGGGGGAAGTATCTCGCCTACCAATCTGGTCTTCAGTGGAGGAACAGACCGCTTTTGC
TCTACCAAACTTCAGCTCATACCCTCAGGCTTACGTTACAAGCGTTGGAGAATATCTCCT
GACTTTGCCTCAGCAGCTTGAGCCTCTAGCTGAAGGAATCTCAACCAACGGAGATGCAAA
CAACGAGGATGCACAGTTCTTTGCAACAGAGTGGATGTTCAAGGTAGCAGAAGGCGCAAC
GGCTCTGTACATGGAGCAACTGAGAGGAATCCAATACATTTGAGACCGAGGAGCACAACA
ACTGTGTGTAGATATAGAGTACTTGAGCAATGTGCTTGCGGCCTTGTCCATGCCGATTCC
GCCTGTGCTTGCAACTTTCCAGACGTGTTTGGCTACACCAAGAGATGAGCTCAAAGATGT
GATGAAATCAGAAGCTGGTAGTGAACTTGATTTCCCTACGGCTAATCTTGTTTGTAAGAT
GCGTCGTATCAGTTTCGATTAGTCTCTAAACTCTCAAAAACGTGCTTTGGTGCCATTGTC
ATATTTTTTTACATATTGCCAAAGTTTTGATGCTCTATATAAGACAAGTTTTTTTTCCTT
GATAAAATGTAATAAAGATATAATTAAATTCTTATTTATGCAATACTAATTTGTCTCACT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL4617Contig1 1228 2 2 U
GTGATATCATCTTCTGTTTCTCTCCATTGCTTGCTGTCTGTTGGAAAAAAAATGATGAAT
ATATAAGTTAAAAACGAGTCTAACTTGTTCATTGGAATAAAACGAATCACAAAGTTTTTG
GTTGAAAGGGTTGCGCTGTTTGCATAAATACCATTTTCTTTCCACCAGTGTCGCTGTGTT
TCAATACTTCTTGAGTGTTCTCCAACTGGATCATTCGAGTATACTCAGATGGTACGCCGG
TTTGGATGCTTAGTTTAGTAATCTGAAACGCAGTAAACAATAAAGCAGAATGAAGAAGAT
AATCCTGAAGATGACAAAATAGAGGAACTGAACTGTAATGTAAGCAAACCTTTTCTTTTA
GCTGTTTGTCTTCCGAGAACCATGCCTCAGCAGTTAGCAAGTCAATCACATTCTTTGCAA
ACACCTGAATGACAGTTTGTGTTAAACCCGAGTGTCTTTACAAGAAATCTCCTTGAGAAT
ATGATAATGAGAAGGAAGGTGATCATACTTTATCAAGGGGAATGTCTTTCGCACTTTGTA
CAGTCAAGTCTGCAGAAAAGCTGCTAAAGTCTCCTAGCAGACCATTGGCTTTCACACTCT
CAGGGAACTTTCCTCGGTATCTCCCATATATCATCAATGGACTTGTAGAGGTTAGATCCG
GAATATTCGAAGGGTATACCTCAATTTCATCAAGATTCTGAAGGGGCTCAATTGTTATAT
TCAAAAGAACAGTGGATAAAGCCCTTGTAAACAATTTGTCTAATCGTTCCTGGATGTGAT
CAGTATTATAAACTGATTCGTGCTGGCCCCTGGATAGATTTGCAAGCATCTGCAGGAAGT
AGTGGTTACAGAATACACCTAACCCAAAAGTGTGTATCCGTGGACACATTGATCCAGCAC
TAGCAAGACGTTTCTTCATTGCATCACAAATTTGTCTCTCATCTTCAACAGACCCATCTG
TTACGAAGAAGATCATAGGAAGGGAGCCACGAGTATTCGATAGCATTTCGACAGCCTTCT
CAAGGGGAGGGAGCACGTTTGTACCATCTGCGACAACAAAGTTCTTGTTCATCCACTCAA
TGCCTCTTTCAACAGTATCTGGAGTAGCCGGCTCCATTGATGTCGAAAACAGAGAAGTAT
CATCGCCGAAAGTCATAATATTGAAGGAATCTCCCGGATTAAGCTTAGATAGAGCTGCCG
ATATCGCATTGTTTACATTCTCGAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ11TF U 1
AF RR2BK80TF C 592
BS 1 673 RR2CQ11TF
BS 674 1228 RR2BK80TF

RD RR2CQ11TF 690 0 0
GTGATATCATCTTCTGTTTCTCTCCATTGCTTGCTGTCTGTTGGAAAAAAAATGATGAAT
ATATAAGTTAAAAACGAGTCTAACTTGTTCATTGGAATAAAACGAATCACAAAGTTTTTG
GTTGAAAGGGTTGCGCTGTTTGCATAAATACCATTTTCTTTCCACCAGTGTCGCTGTGTT
TCAATACTTCTTGAGTGTTCTCCAACTGGATCATTCGAGTATACTCAGATGGTACGCCGG
TTTGGATGCTTAGTTTAGTAATCTGAAACGCAGTAAACAATAAAGCAGAATGAAGAAGAT
AATCCTGAAGATGACAAAATAGAGGAACTGAACTGTAATGTAAGCAAACCTTTTCTTTTA
GCTGTTTGTCTTCCGAGAACCATGCCTCAGCAGTTAGCAAGTCAATCACATTCTTTGCAA
ACACCTGAATGACAGTTTGTGTTAAACCCGAGTGTCTTTACAAGAAATCTCCTTGAGAAT
ATGATAATGAGAAGGAAGGTGATCATACTTTATCAAGGGGAATGTCTTTCGCACTTTGTA
CAGTCAAGTCTGCAGAAAAGCTGCTAAAGTCTCCTAGCAGACCATTGGCTTTCACACTCT
CAGGGAACTTTCCTCGGTATCTCCCATATATCATCAATGGACTTGTAGAGGTTAGATCCG
GAATATTCGAAGG
TATACCTATTAGTAATC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2BK80TF 637 0 0
TCACACTCTCAGGGAACTTTCCTCGGTATCTCCCATATATCATCAATGGACTTGTAGAGG
TTAGATCCGGAATATTCGAAGGGTATACCTCAATTTCATCAAGATTCTGAAGGGGCTCAA
TTGTTATATTCAAAAGAACAGTGGATAAAGCCCTTGTAAACAATTTGTCTAATCGTTCCT
GGATGTGATCAGTATTATAAACTGATTCGTGCTGGCCCCTGGATAGATTTGCAAGCATCT
GCAGGAAGTAGTGGTTACAGAATACACCTAACCCAAAAGTGTGTATCCGTGGACACATTG
ATCCAGCACTAGCAAGACGTTTCTTCATTGCATCACAAATTTGTCTCTCATCTTCAACAG
ACCCATCTGTTACGAAGAAGATCATAGGAAGGGAGCCACGAGTATTCGATAGCATTTCGA
CAGCCTTCTCAAGGGGAGGGAGCACGTTTGTACCATCTGCGACAACAAAGTTCTTGTTCA
TCCACTCAATGCCTCTTTCAACAGTATCTGGAGTAGCCGGCTCCATTGATGTCGAAAACA
GAGAAGTATCATCGCCGAAAGTCATAATATTGAAGGAATCTCCCGGATTAAGCTTAGATA
GAGCTGCCGATATCGCATTGTTTACATTCTCGAGAGC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL4618Contig1 1036 2 10 U
GGATTAACCAAGTAAACATACAAATTAATAAATAAGCATGGAAGATCCGAAGATGAAACT
CCATTGTGGCTTTCTCTTTCCAAATTTGGCAACTATGTTTGGCCTCCATGAAAAGGGTCT
TGACTTCGAATTTGTCTTCGTAGACTGGGTTGCTGGTGAATCCAAAGCCAAAGCTTTTCT
TACTAATCTCAACCCATTTGGTCAAGTCCCGGTTCTTGAAGATGGCGAACTTAAACTTTT
TGAATCAAAAGCGATCACGCGATACCTAGCGGAACAATACAAAGACGTTGGAACAGATCT
ATTGCCAGATGATCCGAAAGAGAGAGCAATAGTATCGATGTGGATGGAAATAGATACAAA
TCAATTTCTTCCTTTGGCATCGATACTCATCAGAGAACTCATTATAAAACCATATCAAGG
TTTAGCCACTGACTTTACATCTGTTCAAGAAAACAAAGAGAAGTTATCAGAAGTCCTAAA
CATCTATGAGGCTCGTTTAGGCGAGTCTAGTTACTTAGCCGGAGAAGGTTTCACGTTAGC
TGATCTTCATCATCTTCCACCCATTCACTACATGTTGAAAATGGAAGAAGGCGTGAAAGA
CTTGATCTATTCACGTCCCAATGTAACCGCATGGGTTGAGAAGATGAAGTCAAGACCCGC
TTGGCCTAAAACAGTCGTCAAAGGCGATCACATCTTTGAGTTGATGAAGCAACGTCGTCT
GCCTAAACAGTTAGATTCGTCATGTCACGAGGTCACCGTTGAGACTCAGAAAACTGCGAT
AGTGACCGGGAACAGTTAAGCAAAGAGTGAATCATCATGGTCCATTGTACGATCCATTAT
GTGTGTTTTCTTTTTCTTTTCCAAAAATATCATCGTATCGTTATGTGTTTGTAACAAAAT
AATAATCTATCTTGAGCATGTAATGTAAGTTCTTATTATTATGTGATTGTACTAAAAATT
ATAACTCACCTTGTCATTTAATTTAAGTTTGTAACTATTGTTAGTTCAACAGAAAATAAG
AGTAAATTTTAGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM19TF U 1
AF RR2CM19JQ C 270
BS 1 625 RR2CM19TF
BS 626 626 RR2CM19JQ
BS 627 683 RR2CM19TF
BS 684 684 RR2CM19JQ
BS 685 701 RR2CM19TF
BS 702 702 RR2CM19JQ
BS 703 736 RR2CM19TF
BS 737 737 RR2CM19JQ
BS 738 756 RR2CM19TF
BS 757 1036 RR2CM19JQ

RD RR2CM19TF 773 0 0
GGATTAACCAAGTAAACATACAAATTAATAAATAAGCATGGAAGATCCGAAGATGAAACT
CCATTGTGGCTTTCTCTTTCCAAATTTGGCAACTATGTTTGGCCTCCATGAAAAGGGTCT
TGACTTCGAATTTGTCTTCGTAGACTGGGTTGCTGGTGAATCCAAAGCCAAAGCTTTTCT
TACTAATCTCAACCCATTTGGTCAAGTCCCGGTTCTTGAAGATGGCGAACTTAAACTTTT
TGAATCAAAAGCGATCACGCGATACCTAGCGGAACAATACAAAGACGTTGGAACAGATCT
ATTGCCAGATGATCCGAAAGAGAGAGCAATAGTATCGATGTGGATGGAAATAGATACAAA
TCAATTTCTTCCTTTGGCATCGATACTCATCAGAGAACTCATTATAAAACCATATCAAGG
TTTAGCCACTGACTTTACATCTGTTCAAGAAAACAAAGAGAAGTTATCAGAAGTCCTAAA
CATCTATGAGGCTCGTTTAGGCGAGTCTAGTTACTTAGCCGGAGAAGGTTTCACGTTAGC
TGATCTTCATCATCTTCCACCCATTCACTACATGTTGAAAATGGAAGAAGGCGTGAAAGA
CTTGATCTATTCACGTCCCAATGTA*CCGCATGGGTTGAGAAGATGAAGTCAAGACCCGC
TTGGCCTAAAACAGTCGTCAAAG*CGATCACATCTTTGAGT*GATGAAGCAACGTCGTCT
GCCTAAACAGTTAGAT*CGTCATGTCACGAGGTCAC
GTGAGACTCAGAAACTG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2CM19JQ 767 0 0
CGGAACAATACAAAGACGTTGGAACAGATCTATTGCCAGATGATCCGAAAGAGAGAGCAA
TAGTATCGATGTGGATGGAAATAGATACAAATCAATTTCTTCCTTTGGCATCGATACTCA
TCAGAGAACTCATTATAAAACCATATCAAGGTTTAGCCACTGACTTTACATCTGTTCAAG
AAAACAAAGAGAAGTTATCAGAAGTCCTAAACATCTATGAGGCTCGTTTAGGCGAGTCTA
GTTACTTAGCCGGAGAAGGTTTCACGTTAGCTGATCTTCATCATCTTCCACCCATTCACT
ACATGTTGAAAATGGAAGAAGGCGTGAAAGACTTGATCTATTCACGTCCCAATGTAACCG
CATGGGTTGAGAAGATGAAGTCAAGACCCGCTTGGCCTAAAACAGTCGTCAAAGGCGATC
ACATCTTTGAGTTGATGAAGCAACGTCGTCTGCCTAAACAGTTAGATTCGTCATGTCACG
AGGTCACCGTTGAGACTCAGAAAACTGCGATAGTGACCGGGAACAGTTAAGCAAAGAGTG
AATCATCATGGTCCATTGTACGATCCATTATGTGTGTTTTCTTTTTCTTTTCCAAAAATA
TCATCGTATCGTTATGTGTTTGTAACAAAATAATAATCTATCTTGAGCATGTAATGTAAG
TTCTTATTATTATGTGATTGTACTAAAAATTATAACTCACCTTGTCATTTAATTTAAGTT
TGTAACTATTGTTAGTTCAACAGAAAATAAGAGTAAATTTTAGGTTC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL4619Contig1 927 2 4 U
GGGTCTGAGATAGGTTCTAGGTTTTCTTCTCTGTCTGCGAAATCGAGCGAGAGTGTCTCG
AGATTCTTTAGTATTGGTTGGTTTAGATCTGAAGCTTTTAGAATATAGATTACACCCGTC
GTCTCTTCTTGAGCCAAACCCCTTCCCTCACCTCTCCCGATTCGATCTGAGAAAAAAGGG
GAAAAACATGCCATCGATTGTGATTCCGAGGAACCACGCGAGCGGTCAGAACTTGGTCGA
ATCGACTAAGGTTCGTCGAGCCACATATTATGGTTTCTTGTTTCAATTGATTTTGATTTA
GAGTTCTAGGGCTCTTTGATTTAGCCTAGATCTATCTAGGCTTCTTTGATCTGTAGCATA
AGCTATATACTATATGCATTATTAGCCATATAATTATCCTATATATGTATGATTTCATTG
AATTGGCTAGAAACCTTACGACTATCTTATATAATATGCATGTTTTCAATAGATTTGCTA
TAAACATATAATTATTTTATATATCACCTATTTTTCATTTAATTACTCAATCAACAGGTA
TGATTCATTGTTTTTACTAGTGTTATATGGTATAGGTTGTTAAGTTGTTTTGTGGGGGTC
TTGGGTCGTGTCTGTTATATTGTTGTTATGCACACAATAGTGTGATGGGGGGTTTCTTCT
CTGTTCCATCAGAATTGTCCATAAGTAGATTGATCTTTCTTTCTTACTCTCTTATCTTCT
TCTTGTTCATACTTCTCTTCAATGTAGCTTTGGGTTTTAGATAGAGATGTTATAGTAGGG
TTGAGTTCATTTTTTTAGTCTGTTCCTTAGTTTCTTTGAGATTGTGATGATTCTGTAATC
AACGAATGATCCTGTTTGGTTTCTGTAAAAATATTTCTCATAATGTTCATCTTCTCTTGT
TTTCAATAAAAAAAGATTGGCACACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B641TF U 1
AF RR2B641JQ C 86
BS 1 176 RR2B641TF
BS 177 177 RR2B641JQ
BS 178 792 RR2B641TF
BS 793 927 RR2B641JQ

RD RR2B641TF 792 0 0
GGGTCTGAGATAGGTTCTAGGTTTTCTTCTCTGTCTGCGAAATCGAGCGAGAGTGTCTCG
AGATTCTTTAGTATTGGTTGGTTTAGATCTGAAGCTTTTAGAATATAGATTACACCCGTC
GTCTCTTCTTGAGCCAAACCCCTTCCCTCACCTCTCCCGATTCGATCTGAGAAAAA*GGG
GAAAAACATGCCATCGATTGTGATTCCGAGGAACCACGCGAGCGGTCAGAACTTGGTCGA
ATCGACTAAGGTTCGTCGAGCCACATATTATGGTTTCTTGTTTCAATTGATTTTGATTTA
GAGTTCTAGGGCTCTTTGATTTAGCCTAGATCTATCTAGGCTTCTTTGATCTGTAGCATA
AGCTATATACTATATGCATTATTAGCCATATAATTATCCTATATATGTATGATTTCATTG
AATTGGCTAGAAACCTTACGACTATCTTATATAATATGCATGTTTTCAATAGATTTGCTA
TAAACATATAATTATTTTATATATCACCTATTTTTCATTTAATTACTCAATCAACAGGTA
TGATTCATTGTTTTTACTAGTGTTATATGGTATAGGTTGTTAAGTTGTTTTGTGGGGGTC
TTGGGTCGTGTCTGTTATATTGTTGTTATGCACACAATAGTGTGATGGGGGGTTTCTTCT
CTGTTCCATCAGAATTGTCCATAAGTAGATTGATCTTTCTTTCTTACTCTCTTATCTTCT
TCTTGTTCATACTTCTCTTCAATGTAGCTTTGGGTTTTAGATAGAGATGTTATAGTAGGG
TTGAGTTCATTT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2B641JQ 842 0 0
GATCTGAAGCTTTTAGAATATAGATTACACCCGTCGTCTCTTCTTGAGCCAAACCCCTTC
CCTCACCTCTCCCGATTCGATCTGAGAAAAAAGGGGAAAAACATGCCATCGATTGTGATT
CCGAGGAACCACGCGAGCGGTCAGAACTTGGTCGAATCGACTAAGGTTCGTCGAGCCACA
TATTATGGTTTCTTGTTTCAATTGATTTTGATTTAGAGTTCTAGGGCTCTTTGATTTAGC
CTAGATCTATCTAGGCTTCTTTGATCTGTAGCATAAGCTATATACTATATGCATTATTAG
CCATATAATTATCCTATATATGTATGATTTCATTGAATTGGCTAGAAACCTTACGACTAT
CTTATATAATATGCATGTTTTCAATAGATTTGCTATAAACATATAATTATTTTATATATC
ACCTATTTTTCATTTAATTACTCAATCAACAGGTATGATTCATTGTTTTTACTAGTGTTA
TATGGTATAGGTTGTTAAGTTGTTTTGTGGGGGTCTTGGGTCGTGTCTGTTATATTGTTG
TTATGCACACAATAGTGTGATGGGGGGTTTCTTCTCTGTTCCATCAGAATTGTCCATAAG
TAGATTGATCTTTCTTTCTTACTCTCTTATCTTCTTCTTGTTCATACTTCTCTTCAATGT
AGCTTTGGGTTTTAGATAGAGATGTTATAGTAGGGTTGAGTTCATTTTTTTAGTCTGTTC
CTTAGTTTCTTTGAGATTGTGATGATTCTGTAATCAACGAATGATCCTGTTTGGTTTCTG
TAAAAATATTTCTCATAATGTTCATCTTCTCTTGTTTTCAATAAAAAAAGATTGGCACAC
AC

QA 1 842 1 842
DS 



AS 1 2

CO CL4620Contig1 938 2 2 U
GCGTCTTCTATCAGTATCCGTTTGATGTCCCTGCCTACTACGCTTTGATCCTGAGGTCGC
TCACCGTGCTTGAAGGTTTGGCGCTTTACGCAGATCCTGACTTCAAAGTGTTGGCTGCTT
CTTACCCCTACTTTGCCAAGAGGCTTCTCACTGATCAGAACCCGTACCTGAGAGATGCAC
TTATCGAGCTTCTGTTCAAAGATGGGAAGTTCAGGTGGAACAGGCTCGAGAACCTTCTGC
AGCAGGGGAGCAAAGATAGGGACTTCTCGTCGAAAGACGCTCTGCAGCCTGTGTTGAAGC
TGCTGCTGGATCCAAACGGAGAAGAGCTTAGAGTGCTGGTGATTAAAGAAGCTGTGAGAG
TCAGTGAAGCGTTTGCTCTTGGAAGTGTTGTTGACACGTACAACTCCATGCCTGAGTTTA
TGAGGTCTCTCGTCTTCAATGGAAATGGGAATGGTGGTGGCCCTCTGACAATGAATCCCA
CGGAGCTGGAAAGCACGCTTGAGCTAAGAGACCAGGTCGCAAGAATCTGGGGGCTTCTTC
AGTCTTCAGAAAGCTTTGACCCTGCTATTTTGCAGCCAATAGTACAGGTGTTGCAACAAC
CGGAAGTAAGAAGACTAGGAGGACGTGTTGCAGGAGGTGTAGGGCAACGTCTAGCAGCTA
GGTTTCTGCAGCAACTCCTTCGAGCCACAACATCTCCTTCACCAGTCCCATAGTTGCTTC
TTTTCTTGTCAACATCGTAATGGTAAACTGTATATTAAAGGCGAGACACATTCGCAAACC
ACAGAATTGCTTCACGTTATAGTAATATATATAGTGTCATTCTTTGTCTTTATACATGTC
TTGTGCAAAGAAAAAAGTATATAATACTACACACAGACATACAACTTTGACTACATTTCG
TGAACATATGAAAGCCAATACAGATTATATACTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G213TF U 1
AF RR2G213JQ C 539
BS 1 628 RR2G213TF
BS 629 938 RR2G213JQ

RD RR2G213TF 628 0 0
GCGTCTTCTATCAGTATCCGTTTGATGTCCCTGCCTACTACGCTTTGATCCTGAGGTCGC
TCACCGTGCTTGAAGGTTTGGCGCTTTACGCAGATCCTGACTTCAAAGTGTTGGCTGCTT
CTTACCCCTACTTTGCCAAGAGGCTTCTCACTGATCAGAACCCGTACCTGAGAGATGCAC
TTATCGAGCTTCTGTTCAAAGATGGGAAGTTCAGGTGGAACAGGCTCGAGAACCTTCTGC
AGCAGGGGAGCAAAGATAGGGACTTCTCGTCGAAAGACGCTCTGCAGCCTGTGTTGAAGC
TGCTGCTGGATCCAAACGGAGAAGAGCTTAGAGTGCTGGTGATTAAAGAAGCTGTGAGAG
TCAGTGAAGCGTTTGCTCTTGGAAGTGTTGTTGACACGTACAACTCCATGCCTGAGTTTA
TGAGGTCTCTCGTCTTCAATGGAAATGGGAATGGTGGTGGCCCTCTGACAATGAATCCCA
CGGAGCTGGAAAGCACGCTTGAGCTAAGAGACCAGGTCGCAAGAATCTGGGGGCTTCTTC
AGTCTTCAGAAAGCTTTGACCCTGCTATTTTGCAGCCAATAGTACAGGTGTTGCAACAAC
CGGAAGTAAGAAGACTAGGAGGACGTGT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2G213JQ 400 0 0
TCAGTCTTCAGAAAGCTTTGACCCTGCTATTTTGCAGCCAATAGTACAGGTGTTGCAACA
ACCGGAAGTAAGAAGACTAGGAGGACGTGTTGCAGGAGGTGTAGGGCAACGTCTAGCAGC
TAGGTTTCTGCAGCAACTCCTTCGAGCCACAACATCTCCTTCACCAGTCCCATAGTTGCT
TCTTTTCTTGTCAACATCGTAATGGTAAACTGTATATTAAAGGCGAGACACATTCGCAAA
CCACAGAATTGCTTCACGTTATAGTAATATATATAGTGTCATTCTTTGTCTTTATACATG
TCTTGTGCAAAGAAAAAAGTATATAATACTACACACAGACATACAACTTTGACTACATTT
CGTGAACATATGAAAGCCAATACAGATTATATACTTTTCC

QA 1 400 1 400
DS 



AS 1 2

CO CL4621Contig1 580 2 2 U
GCAAATTCATATTATTCATCTTGAAAGTCTTGCGAGTTTATACACCCCAATATGCCAAAC
GTAAAAAAATATAATGCAATTAACGTAGAAACATATTTAGTTCCCTTTTCACCTAAGATG
TTAGGTTATATCCTAACTAAATACGCACATTGTGATTAAAAAACAGACTACATACAAAGA
TATTCATCAGTCTCCTTTAAGTAATTGATAAGAATGTCGATAATCCACATTGGATCTCCA
ATGTCATGACGGATCTTCTCGTACTCCACGGTCCACACCACACGGCTACCGTCGGTCTCA
TCTTCCTTGGGAGTGACCGTGATGGTTGCTTTGAACGTACTGTAGCTATCCGAGACTAGA
TTTCCACACATATCCAACGTCACTGTTCTTTTCTCCCAACCCACGGACTCAGTGATCTTC
TCCTTTGATATTATGTCAAAAGTGCTATCTATGTCGTCGGTGAAAGATGTAAAGAACTCG
TCCGCCGGTGACTTGATGTCAAACTTTCCGGAAGAAACTCCATGTAGTGCTTCCATTCTC
TCTCTCTCGATACTTATACAAGTATATTTTTATGAGGTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX55TF C 1
AF RR2CX55JQ U 5
BS 1 4 RR2CX55TF
BS 5 580 RR2CX55JQ

RD RR2CX55TF 473 0 0
GCAAATTCATATTATTCATCTTGAAAGTCTTGCGAGTTTATACACCCCAATATGCCAAAC
GTAAAAAAATATAATGCAATTAACGTAGAAACATATTTAGTTCCCTTTTCACCTAAGATG
TTAGGTTATATCCTAACTAAATACGCACATTGTGATTAAAAAACAGACTACATACAAAGA
TATTCATCAGTCTCCTTTAAGTAATTGATAAGAATGTCGATAATCCACATTGGATCTCCA
ATGTCATGACGGATCTTCTCGTACTCCACGGTCCACACCACACGGCTACCGTCGGTCTCA
TCTTCCTTGGGAGTGACCGTGATGGTTGCTTTGAACGTACTGTAGCTATCCGAGACTAGA
TTTCCACACATATCCAACGTCACTGTTCTTTTCTCCCAACCCACGGACTCAGTGATCTTC
TCCTTTGATATTATGTCAAAAGTGCTATCTATGTCGTCGGTGAAAGATGTAAA

QA 1 473 1 473
DS 

RD RR2CX55JQ 576 0 0
ATTCATATTATTCATCTTGAAAGTCTTGCGAGTTTATACACCCCAATATGCCAAACGTAA
AAAAATATAATGCAATTAACGTAGAAACATATTTAGTTCCCTTTTCACCTAAGATGTTAG
GTTATATCCTAACTAAATACGCACATTGTGATTAAAAAACAGACTACATACAAAGATATT
CATCAGTCTCCTTTAAGTAATTGATAAGAATGTCGATAATCCACATTGGATCTCCAATGT
CATGACGGATCTTCTCGTACTCCACGGTCCACACCACACGGCTACCGTCGGTCTCATCTT
CCTTGGGAGTGACCGTGATGGTTGCTTTGAACGTACTGTAGCTATCCGAGACTAGATTTC
CACACATATCCAACGTCACTGTTCTTTTCTCCCAACCCACGGACTCAGTGATCTTCTCCT
TTGATATTATGTCAAAAGTGCTATCTATGTCGTCGGTGAAAGATGTAAAGAACTCGTCCG
CCGGTGACTTGATGTCAAACTTTCCGGAAGAAACTCCATGTAGTGCTTCCATTCTCTCTC
TCTCGATACTTATACAAGTATATTTTTATGAGGTCC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

CO CL4622Contig1 676 2 5 U
GGATTCCGTGACAACTGTGAGATCCGAATTTAAGTGAAAAACGCATTCGATAGAGAGAGA
CGACAACATGGCGAAACAGGAAGAAGTTACGGTCCCGATCTTCTCATCCCTTGATCATGT
CTACGGCGAAGGATCTCAGCTCCAAGAAGCCAAGTCACGATTCGATGCTTTGAAATCCAA
ATTTAACCAAGCCTTCGATGCTTCTCCCCAGCTCTTCGCTCGCTCTCCCGGAAGAGTGAA
TCTGATCGGAGAGCACATTGACTATGAGGGATACTCTGTGTTACCGATGGCTATTCGTCA
GGACACTATTATCGCAATCAGGAAACGTGAGGGTCAAAATGAGTTGAGGATAGCAAACGT
TAATGAAAAGTACTCCATGTGTACTTATCCTGCTGATCCTCACCAGGAGATTGACTTGCA
GAATCACAAATGGGGTCATTACTTCATTTGCGCGTATAAAGGGTTCCATGAGTATGCAAA
GTCAAAAGGGGTGAATGTTGATTCCCCTGTTGGACTTGATGTTGTTGTTGATGGCATTGT
TCCCACAGGATCTGGGTTGTCAAGTTCTGCTGCCTTTGTTTGCTCATCAACCATTGCTAT
TATGGCCGTCTTTGGTGAGAACTTTGAAAAGAAAGAACTTGCACAGCTTACATGTGAATG
TGAACAACACATTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT80TF U 136
AF RR2DR25TF U 1
BS 1 178 RR2DR25TF
BS 179 179 RR2DT80TF
BS 180 292 RR2DR25TF
BS 293 293 RR2DT80TF
BS 294 676 RR2DR25TF

RD RR2DT80TF 490 0 0
TCAGCTCCAAGAAGCCAAGTCACGATTCGATGCTTTGAAATCCAAATTTAACCAAGCCTT
CGATGCTTCTCCCCAGCTCTTCGCTCGCTCTCCCGGAAGAGTGAATCTGATCGGAGAGCA
CATTGACTATGAGGGATACTCTGTGTTACCGATGGCTATTCGTCAGGACACTATTATCGC
AATCAGGAAACGTGAGGGTCAAAATGAGTTGAGGATAGCAAACGTTAATGAAAAGTACTC
CATGTGTACTTATCCTGCTGATCCTCACCAGGAGATTGACTTGCAGAATCACAAATGGGG
TCATTACTTCATTTGCGCGTATAAAGGGTTCCATGAGTATGCAAAGTCAAAAGGGGTGAA
TGTTGATTCCCCTGTTGGACTTGATGTTGTTGTTGATGGCATTGTTCCCACAG*ATCTGG
GTTGTCAAGTTCTGCTGCCTTT*TTTGCTCATCAACCATTGCTATTATGGCCGTCTTTGG
TGAGA
CTTTG

QA 1 485 1 485
DS 

RD RR2DR25TF 676 0 0
GGATTCCGTGACAACTGTGAGATCCGAATTTAAGTGAAAAACGCATTCGATAGAGAGAGA
CGACAACATGGCGAAACAGGAAGAAGTTACGGTCCCGATCTTCTCATCCCTTGATCATGT
CTACGGCGAAGGATCTCAGCTCCAAGAAGCCAAGTCACGATTCGATGCTTTGAAATCCTA
ATTTAACCAAGCCTTCGATGCTTCTCCCCAGCTCTTCGCTCGCTCTCCCGGAAGAGTGAA
TCTGATCGGAGAGCACATTGACTATGAGGGATACTCTGTGTTACCGATGGCTGTTCGTCA
GGACACTATTATCGCAATCAGGAAACGTGAGGGTCAAAATGAGTTGAGGATAGCAAACGT
TAATGAAAAGTACTCCATGTGTACTTATCCTGCTGATCCTCACCAGGAGATTGACTTGCA
GAATCACAAATGGGGTCATTACTTCATTTGCGCGTATAAAGGGTTCCATGAGTATGCAAA
GTCAAAAGGGGTGAATGTTGATTCCCCTGTTGGACTTGATGTTGTTGTTGATGGCATTGT
TCCCACAGGATCTGGGTTGTCAAGTTCTGCTGCCTTTGTTTGCTCATCAACCATTGCTAT
TATGGCCGTCTTTGGTGAGAACTTTGAAAAGAAAGAACTTGCACAGCTTACATGTGAATG
TGAACAACACATTGGA

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL4623Contig1 464 2 1 U
GGGCCGTCAAACATTCAATTTTGGCAGCACAGACACCCGAAAGAACGAGAAGGGAGAAGA
GATGAACGTGGTTCATGGATTGAAGAGGATTCCTCGCATTAAGTTCCCTCAGCGTCACCT
CAAACCTTCAGAGGGAACGAAGGTGGTGGAAAATGAAGCAGTAGATACCTTCTTCTTCTC
CAACCTGAACACCCCAAAGACTATCGGCGGGAAGGCGTCGTTGCAGCCCAAGCGCACCCC
TGTTTCTAACGAAGAGATGGAAGCCATTTTGTTGGGAGGCTGCATCTGATCACAGAATCG
TGGACCTCTTCTCACCGAATATACTCAAGATTTGTTTTTTTCAGAAACTAATGTCGTTTG
ACACAATAAAACAGACTCAAATTTGCAGTCCTAAAAAACTTCTGATTTATCTTCTATACT
GATTCAGTGCATTTTGCTCCCTATTGATTGATACATTATGGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E153JQ C 1
AF RR2E153TF U 1
BS 1 464 RR2E153TF

RD RR2E153JQ 464 0 0
GGGCCGTCAAACATTCAATTTTGGCAGCACAGACACCCGAAAGAACGAGAAGGGAGAAGA
GATGAACGTGGTTCATGGATTGAAGAGGATTCCTCGCATTAAGTTCCCTCAGCGTCACCT
CAAACCTTCAGAGGGAACGAAGGTGGTGGAAAATGAAGCAGTAGATACCTTCTTCTTCTC
CAACCTGAACACCCCAAAGACTATCGGCGGGAAGGCGTCGTTGCAGCCCAAGCGCACCCC
TGTTTCTAACGAAGAGATGGAAGCCATTTTGTTGGGAGGCTGCATCTGATCACAGAATCG
TGGACCTCTTCTCACCGAATATACTCAAGATTTGTTTTTTTCAGAAACTAATGTCGTTTG
ACACAATAAAACAGACTCAAATTTGCAGTCCTAAAAAACTTCTGATTTATCTTCTATACT
GATTCAGTGCATTTTGCTCCCTATTGATTGATACATTATGGTTT

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2E153TF 464 0 0
GGGCCGTCAAACATTCAATTTTGGCAGCACAGACACCCGAAAGAACGAGAAGGGAGAAGA
GATGAACGTGGTTCATGGATTGAAGAGGATTCCTCGCATTAAGTTCCCTCAGCGTCACCT
CAAACCTTCAGAGGGAACGAAGGTGGTGGAAAATGAAGCAGTAGATACCTTCTTCTTCTC
CAACCTGAACACCCCAAAGACTATCGGCGGGAAGGCGTCGTTGCAGCCCAAGCGCACCCC
TGTTTCTAACGAAGAGATGGAAGCCATTTTGTTGGGAGGCTGCATCTGATCACAGAATCG
TGGACCTCTTCTCACCGAATATACTCAAGATTTGTTTTTTTCAGAAACTAATGTCGTTTG
ACACAATAAAACAGACTCAAATTTGCAGTCCTAAAAAACTTCTGATTTATCTTCTATACT
GATTCAGTGCATTTTGCTCCCTATTGATTGATACATTATGGTTT

QA 1 464 1 464
DS 



AS 1 2

CO CL4624Contig1 621 2 1 U
GGAAGAGAAAACTCTGAAACATAAACGAAAAAGAAAAGCATCAGGGGGAACAAGGAAAAT
GGCAGGAAGATTGAGCGGTGTGGCCTCAAGGATAATGGGTGGAAACGGCGTCGTTGCACG
ATCCAACGCCTCTTCTCTCCGCCAACGCGCCGGCATGGGTCTCCCCGTCGGCAAACACAT
CGTCCCCGATAAGCCGCTATCGGTTGACGACGAGCTGATGTGGGACAACGGGACTGCGTT
TCCAGAGCCTTGCATTGATCGGATTGCTGATACCGTCGGCAAGTACGAAGCATTGGGATG
GTTGTGTGGCGGTCTAGGGTTCTTTGCGACTCTCGGTTTACTCGCTGTTGTGAATGACAA
AGCTTCAAAGGTTCCCTTTACACCAAGAGTGTATCCGTATGACAACCTGAGAGTGGAGCT
TGGTGGAGAGCCATTGAGACCTATCAAGTGATCTGCTCATCAAACTCAAGCGTGTTTTCT
TCACAGCTTTGTTCTTCAAAACCTCTTTTAGTTTCCTTCTCAGAACTTGAAAACAAGAAT
AAAAGAGACATCGTTTTCATTTAGATGCGTTGTCTCTGTAACTAACAGTGACCGTTTGGG
TGGTATTCATAAGAGAAGACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G541TF U 1
AF RR2G541JQ C 154
BS 1 621 RR2G541TF

RD RR2G541TF 621 0 0
GGAAGAGAAAACTCTGAAACATAAACGAAAAAGAAAAGCATCAGGGGGAACAAGGAAAAT
GGCAGGAAGATTGAGCGGTGTGGCCTCAAGGATAATGGGTGGAAACGGCGTCGTTGCACG
ATCCAACGCCTCTTCTCTCCGCCAACGCGCCGGCATGGGTCTCCCCGTCGGCAAACACAT
CGTCCCCGATAAGCCGCTATCGGTTGACGACGAGCTGATGTGGGACAACGGGACTGCGTT
TCCAGAGCCTTGCATTGATCGGATTGCTGATACCGTCGGCAAGTACGAAGCATTGGGATG
GTTGTGTGGCGGTCTAGGGTTCTTTGCGACTCTCGGTTTACTCGCTGTTGTGAATGACAA
AGCTTCAAAGGTTCCCTTTACACCAAGAGTGTATCCGTATGACAACCTGAGAGTGGAGCT
TGGTGGAGAGCCATTGAGACCTATCAAGTGATCTGCTCATCAAACTCAAGCGTGTTTTCT
TCACAGCTTTGTTCTTCAAAACCTCTTTTAGTTTCCTTCTCAGAACTTGAAAACAAGAAT
AAAAGAGACATCGTTTTCATTTAGATGCGTTGTCTCTGTAACTAACAGTGACCGTTTGGG
TGGTATTCATAAGAGAAGACA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2G541JQ 468 0 0
CATGGGTCTCCCCGTCGGCAAACACATCGTCCCCGATAAGCCGCTATCGGTTGACGACGA
GCTGATGTGGGACAACGGGACTGCGTTTCCAGAGCCTTGCATTGATCGGATTGCTGATAC
CGTCGGCAAGTACGAAGCATTGGGATGGTTGTGTGGCGGTCTAGGGTTCTTTGCGACTCT
CGGTTTACTCGCTGTTGTGAATGACAAAGCTTCAAAGGTTCCCTTTACACCAAGAGTGTA
TCCGTATGACAACCTGAGAGTGGAGCTTGGTGGAGAGCCATTGAGACCTATCAAGTGATC
TGCTCATCAAACTCAAGCGTGTTTTCTTCACAGCTTTGTTCTTCAAAACCTCTTTTAGTT
TCCTTCTCAGAACTTGAAAACAAGAATAAAAGAGACATCGTTTTCATTTAGATGCGTTGT
CTCTGTAACTAACAGTGACCGTTTGGGTGGTATTCATAAGAGAAGACA

QA 1 468 1 468
DS 



AS 1 2

CO CL4625Contig1 1056 2 2 U
GAGATCGAAGCTTTGCTAGAAGACAAGCAGAAGGGCTTTGTGGTTCTCGAAAGAGACGGA
GAGACTGGGAACGTTGTTACTAAAGACGATATAGAGAGGGTCAGAGGGTATCCCAAGTCA
GGGCCTGGGACTGTTGGTGCAGACGGGGAGTGGATGGTCGGTGCGGCGATAGGGACTAGG
GAGTCTGATAAGGAGAGGCTTGAGCATTTGGTGAAGGCTGGGGTTAACGTTGTGGTGTTG
GATAGCTCTCAGGGGAACTCTATTTACCAGCTCGAGATGATTAAGTATGTGAAGAGGAGT
TATCCTGAGTTGGATGTGATTGGTGGGAACGTTGTGACGAGTTACCAGGCGCAGAACTTG
ATTCAAGCTGGAGTTGATGGGTTGAGAGTTGGTATGGGGTCTGGTTCGATATGTACCACG
CAGGAGGTTTGTGCGGTTGGTCGTGGACAGGCTACTGCTGTGTACAAGGTTTGTTCACTC
GCTGCTCAGAGCGGGATTCCGGTTATAGCGGATGGTGGTATCTCAAACTCAGGTCACATT
GTGAAAGCTCTAGTACTCGGAGCATCAACTGTTATGATGGGAAGCTTCTTAGCTGGAAGC
ACTGAGGCTCCTGGGGCTTACGAGTATAAGAATGGTAAGAGGATCAAGAAGTACCGTGGG
ATGGGATCGTTGGAAGCAATGACAAAAGGAAGTGATCAGAGATACTTGGGAGACAAAACG
AACCTCAAGATTGCTCAAGGAGTGGTTGGTGCGGTTGCGGATAAAGGCTCGGTGTTGAAG
CTGATACCTTACACGATGCACGCAGTGAAGCAAGGTTTTCAAGACCTTGGTGCTTCCTCC
TTGTAATCTGCTCATGATCTGTTGAGATCTAACGTTTTAAGGCTCGAGACTCGAACCGGT
GCAGCACAGATCGAAGGAGGAGTTCATGGTTTGGTTTCTTATGAGAAGAGATCTTTTTAA
GCTTTGGCCAAACTTTTGAGGGATATGTTTTGAGTTATTCACATACTATTGCTACTGTTA
CATTTTTCATTTTTATTTATTTTAATAACATTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT12TF U 1
AF RR2GT12JQB C 510
BS 1 602 RR2GT12TF
BS 603 1056 RR2GT12JQB

RD RR2GT12TF 602 0 0
GAGATCGAAGCTTTGCTAGAAGACAAGCAGAAGGGCTTTGTGGTTCTCGAAAGAGACGGA
GAGACTGGGAACGTTGTTACTAAAGACGATATAGAGAGGGTCAGAGGGTATCCCAAGTCA
GGGCCTGGGACTGTTGGTGCAGACGGGGAGTGGATGGTCGGTGCGGCGATAGGGACTAGG
GAGTCTGATAAGGAGAGGCTTGAGCATTTGGTGAAGGCTGGGGTTAACGTTGTGGTGTTG
GATAGCTCTCAGGGGAACTCTATTTACCAGCTCGAGATGATTAAGTATGTGAAGAGGAGT
TATCCTGAGTTGGATGTGATTGGTGGGAACGTTGTGACGAGTTACCAGGCGCAGAACTTG
ATTCAAGCTGGAGTTGATGGGTTGAGAGTTGGTATGGGGTCTGGTTCGATATGTACCACG
CAGGAGGTTTGTGCGGTTGGTCGTGGACAGGCTACTGCTGTGTACAAGGTTTGTTCACTC
GCTGCTCAGAGCGGGATTCCGGTTATAGCGGATGGTGGTATCTCAAACTCAGGTCACATT
GTGAAAGCTCTAGTACTCGGAGCATCAACTGTTATGATGGGAAGCTTCTTAGCTGGAAGC
AC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2GT12JQB 547 0 0
GGATGGTGGTATCTCAAACTCAGGTCACATTGTGAAAGCTCTAGTACTCGGAGCATCAAC
TGTTATGATGGGAAGCTTCTTAGCTGGAAGCACTGAGGCTCCTGGGGCTTACGAGTATAA
GAATGGTAAGAGGATCAAGAAGTACCGTGGGATGGGATCGTTGGAAGCAATGACAAAAGG
AAGTGATCAGAGATACTTGGGAGACAAAACGAACCTCAAGATTGCTCAAGGAGTGGTTGG
TGCGGTTGCGGATAAAGGCTCGGTGTTGAAGCTGATACCTTACACGATGCACGCAGTGAA
GCAAGGTTTTCAAGACCTTGGTGCTTCCTCCTTGTAATCTGCTCATGATCTGTTGAGATC
TAACGTTTTAAGGCTCGAGACTCGAACCGGTGCAGCACAGATCGAAGGAGGAGTTCATGG
TTTGGTTTCTTATGAGAAGAGATCTTTTTAAGCTTTGGCCAAACTTTTGAGGGATATGTT
TTGAGTTATTCACATACTATTGCTACTGTTACATTTTTCATTTTTATTTATTTTAATAAC
ATTTTTC

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 2

CO CL4626Contig1 919 2 2 U
TTGACTCAGGAGACGACTAAAGAGAATGATGATCTCAAGGAGAGTAATGATATTGTTGAG
TTTGTCAACTTTTCTTGTGATTTGCCTATAACAAGCGCCCGAGGATTCATGGAGATTGAA
GACCAAGGACTCAGCAGCAGTTTCTTCCCTTTCATAGTTGTTGAAGAGGATGACGTTTGT
TCTGAGATCCGTGTACTTGAAACCACACTAGAGTTCGCTGGAACTGATTCTGCTAAGCAA
GCTATGGAATTCATTCATGAACTCGGTTGGCTACTTCAGAGAAGTAAGCTCGGTGTGTTC
CCATTAACGCGTTTCAAGTGGCTCATCGAGTTCTCAATGGACAGAGAGTGGTGCGCTGTG
ATCAGAAAGCTGTTGAACATGTTCTTTGAAGGAGCTGTTGGTGACTACTCTTCCTCCTCC
CCCTCTGATGCCGCGCTATCAGAACTGTGCCTTCTTCACAGAGCCGTCAGGAAAAACTCT
AAGCCTATGGTGGAAATGCTCTTGAGATATGTTCCTAAGCAGCGAAGAATACACAGCTTG
TTTAGACCCGATGCTGCTGGTCCAGCAGGTTTAACACCTCTTCACATTGCAGCCGGTAAA
GATGGTTCAGAAGATGTGCTGGACGCTCTTACAGAAGATCCAGCAATGGGTGGGGATTGG
AGCATGGAGAACATCTAGGGACAGCACAGGCTTCACACCAGAAGACTACGCACGCTTACG
CGGTCACTTCTCATACATCCACTTGATTCAACGCAAGATCAATAAAAAATGTTTACTTAT
ATATAAAAAGTGTGATTTCTATATGTAACTATATAAGATATATAGAGACATGTACTTTAG
AAGGTTGGTTGTGTGTAAAACCTGGTGGATTCGCTTTCTGTAACTCTCTGATTAGTATAT
TTTATTTGTTGACATGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC23TF U 1
AF RR2BC23JQ C 124
BS 1 823 RR2BC23TF
BS 824 919 RR2BC23JQ

RD RR2BC23TF 823 0 0
TTGACTCAGGAGACGACTAAAGAGAATGATGATCTCAAGGAGAGTAATGATATTGTTGAG
TTTGTCAACTTTTCTTGTGATTTGCCTATAACAAGCGCCCGAGGATTCATGGAGATTGAA
GACCAAGGACTCAGCAGCAGTTTCTTCCCTTTCATAGTTGTTGAAGAGGATGACGTTTGT
TCTGAGATCCGTGTACTTGAAACCACACTAGAGTTCGCTGGAACTGATTCTGCTAAGCAA
GCTATGGAATTCATTCATGAACTCGGTTGGCTACTTCAGAGAAGTAAGCTCGGTGTGTTC
CCATTAACGCGTTTCAAGTGGCTCATCGAGTTCTCAATGGACAGAGAGTGGTGCGCTGTG
ATCAGAAAGCTGTTGAACATGTTCTTTGAAGGAGCTGTTGGTGACTACTCTTCCTCCTCC
CCCTCTGATGCCGCGCTATCAGAACTGTGCCTTCTTCACAGAGCCGTCAGGAAAAACTCT
AAGCCTATGGTGGAAATGCTCTTGAGATATGTTCCTAAGCAGCGAAGAATACACAGCTTG
TTTAGACCCGATGCTGCTGGTCCAGCAGGTTTAACACCTCTTCACATTGCAGCCGGTAAA
GATGGTTCAGAAGATGTGCTGGACGCTCTTACAGAAGATCCAGCAATGGGTGGGGATTGG
AGCATGGAGAACATCTAGGGACAGCACAGGCTTCACACCAGAAGACTACGCACGCTTACG
CGGTCACTTCTCATACATCCACTTGATTCAACGCAAGATCAATAAAAAATGTTTACTTAT
ATATAAAAAGTGTGATTTCTATATGTAACTATATAAGATATAT

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR2BC23JQ 796 0 0
CAAGGACTCAGCAGCAGTTTCTTCCCTTTCATAGTTGTTGAAGAGGATGACGTTTGTTCT
GAGATCCGTGTACTTGAAACCACACTAGAGTTCGCTGGAACTGATTCTGCTAAGCAAGCT
ATGGAATTCATTCATGAACTCGGTTGGCTACTTCAGAGAAGTAAGCTCGGTGTGTTCCCA
TTAACGCGTTTCAAGTGGCTCATCGAGTTCTCAATGGACAGAGAGTGGTGCGCTGTGATC
AGAAAGCTGTTGAACATGTTCTTTGAAGGAGCTGTTGGTGACTACTCTTCCTCCTCCCCC
TCTGATGCCGCGCTATCAGAACTGTGCCTTCTTCACAGAGCCGTCAGGAAAAACTCTAAG
CCTATGGTGGAAATGCTCTTGAGATATGTTCCTAAGCAGCGAAGAATACACAGCTTGTTT
AGACCCGATGCTGCTGGTCCAGCAGGTTTAACACCTCTTCACATTGCAGCCGGTAAAGAT
GGTTCAGAAGATGTGCTGGACGCTCTTACAGAAGATCCAGCAATGG*TGGGGATTGGAGC
ATGGAGAACATCTAGGGACAGCACAGGCTTCACACCAGAAGACTACGCACGCTTACGCGG
TCACTTCTCATACATCCACTTGATTCAACGCAAGATCAATAAAAAATGTTTACTTATATA
TAAAAAGTGTGATTTCTATATGTAACTATATAAGATATATAGAGACATGTACTTTAGAAG
GTTGGTTGTGTGTAAAACCTGGTGGATTCGCTTTCTGTAACTCTCTGATTAGTATATTTT
ATTTGTTGACATGACC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL4627Contig1 1058 2 2 U
GGATACAACATTTTGTTATCTCCACAGCAGATTCCAACTAAACAGGAATTAAACACACAA
GATCAAGAAGAAGATGGTGATGCTATTTATTAAGCTCTGCCTCTTCGCCATGGCCCCCCT
CTGCACTGTCGCTGCGAATGCTCAAACACAAGGAATAGGGTTTGGATATGGAGGTAGAAA
TGGACCAAACCAGTGGGGACACTTAAACCCTCACTATACTGAATGCTCGGTCGGTAAATT
GCAATCTCCAATTGATATCCAAAGGGGACAAACCTTTTACAACAGCACATTAGAACCGCT
TCACCGCGATTACTACACCACAAAAGCAACACTCGTGAACCACGTCTGCAATGTCGCCAT
GTTCTTCGCGGAAGGAGCAGGAGATGTGGTAATAAACGATAAGAACTATACCTTATTGCA
AATGCATTGGCACACTCCTTCCGAACATCATCTCCATGGTGTCCAATATGCAGCTGAACT
ACACACGGCACACCAAGCAAAAGATGGAAGCTTTGCTGTGGTAGCAAGCCTCTTCAAAAT
CGGCAGTGAAGAGCCTTTCCTCTCTCAGATGAAGGATAAATTAATGAAGCTAAAGGATGA
GAGGCTCAAAGGGAACCAAACAGCACAAGTGGAAGTTGGAAAAATAAACACAAGACATAT
CGAACGTAAGACTCGAAAGTACTTCAGATACTATGGCTCACTCACCACTCCTCCTTGTTC
CGAAAACGTATCTTGGACCATTCTTGGCAAGGTGAGGTCAATGTCAAAGGAACAAGTAGA
ACTACTACGATCTCCATTGGACATTTCTTACAAGAAAAATGCAAGACCTTGTCAACCCCT
AAACGGCCGGCGAGTTGAGATGTTCCACGAGCGCGTCACCAAAAAGGAAACCGGAAACAA
AAAGAAAAAGCCCAATTAAACTATTTCTGCATATCGATTTGTTCAGAACCTAATTAGCCC
CCAAAAAACTAGTTTTGTAAAATCGTAATGAAAAAAATAATTGTATGTGGTACTAATCTG
TTGTTTGCTGTACTTGATCTTTGATTTCCAAATTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS20TF U 1
AF RR2AS20JQ C 278
BS 1 746 RR2AS20TF
BS 747 1058 RR2AS20JQ

RD RR2AS20TF 746 0 0
GGATACAACATTTTGTTATCTCCACAGCAGATTCCAACTAAACAGGAATTAAACACACAA
GATCAAGAAGAAGATGGTGATGCTATTTATTAAGCTCTGCCTCTTCGCCATGGCCCCCCT
CTGCACTGTCGCTGCGAATGCTCAAACACAAGGAATAGGGTTTGGATATGGAGGTAGAAA
TGGACCAAACCAGTGGGGACACTTAAACCCTCACTATACTGAATGCTCGGTCGGTAAATT
GCAATCTCCAATTGATATCCAAAGGGGACAAACCTTTTACAACAGCACATTAGAACCGCT
TCACCGCGATTACTACACCACAAAAGCAACACTCGTGAACCACGTCTGCAATGTCGCCAT
GTTCTTCGCGGAAGGAGCAGGAGATGTGGTAATAAACGATAAGAACTATACCTTATTGCA
AATGCATTGGCACACTCCTTCCGAACATCATCTCCATGGTGTCCAATATGCAGCTGAACT
ACACACGGCACACCAAGCAAAAGATGGAAGCTTTGCTGTGGTAGCAAGCCTCTTCAAAAT
CGGCAGTGAAGAGCCTTTCCTCTCTCAGATGAAGGATAAATTAATGAAGCTAAAGGATGA
GAGGCTCAAAGGGAACCAAACAGCACAAGTGGAAGTTGGAAAAATAAACACAAGACATAT
CGAACGTAAGACTCGAAAGTACTTCAGATACTATGGCTCACTCACCACTCCTCCTTGTTC
CGAAAACGTATCTTGGACCATTCTTG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2AS20JQ 781 0 0
TACAACAGCACATTAGAACCGCTTCACCGCGATTACTACACCACAAAAGCAACACTCGTG
AACCACGTCTGCAATGTCGCCATGTTCTTCGCGGAAGGAGCAGGAGATGTGGTAATAAAC
GATAAGAACTATACCTTATTGCAAATGCATTGGCACACTCCTTCCGAACATCATCTCCAT
GGTGTCCAATATGCAGCTGAACTACACACGGCACACCAAGCAAAAGATGGAAGCTTTGCT
GTGGTAGCAAGCCTCTTCAAAATCGGCAGTGAAGAGCCTTTCCTCTCTCAGATGAAGGAT
AAATTAATGAAGCTAAAGGATGAGAGGCTCAAAGGGAACCAAACAGCACAAGTGGAAGTT
GGAAAAATAAACACAAGACATATCGAACGTAAGACTCGAAAGTACTTCAGATACTATGGC
TCACTCACCACTCCTCCTTGTTCCGAAAACGTATCTTGGACCATTCTTGGCAAGGTGAGG
TCAATGTCAAAGGAACAAGTAGAACTACTACGATCTCCATTGGACATTTCTTACAAGAAA
AATGCAAGACCTTGTCAACCCCTAAACGGCCGGCGAGTTGAGATGTTCCACGAGCGCGTC
ACCAAAAAGGAAACCGGAAACAAAAAGAAAAAGCCCAATTAAACTATTTCTGCATATCGA
TTTGTTCAGAACCTAATTAGCCCCCAAAAAACTAGTTTTGTAAAATCGTAATGAAAAAAA
TAATTGTATGTGGTACTAATCTGTTGTTTGCTGTACTTGATCTTTGATTTCCAAATTTGA
T

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL4628Contig1 858 2 6 U
GAAGTGTGTAACACTTAATAAGGCTATGGGAATCTTTGGATTTTCTGGCGAAGATCATAT
TGGAAAACTCAGTTTCCCTCCTGTGCAGGCAGTTCCATCATTTCCTAGCTCATTCCCACA
CTTGTTCCCTGGAAAAGACAAGCTCCGCTGCTTGATCCCTTGTGCAATTGACCAGGATCC
TTACTTCAGGATGACTCGCGATGTTGCACCTCGGTTAGGGTATAGCAAGCCTGCACTGAT
TGAGTCATCATTTTTCCCTGCTCTGCAGGGAGAGAACGGAAAAATGTCTGCGAGCGATCC
TAATTCAGCGATCTATGTGACAGATACTGCTAAAGAAATAAAAAACAAGATAAACAGGTA
TGCTTTCAGTGGTGGGCAAGACTCCATCGAAAAGCACAGAGAAATTGGAGCAAATCTTGA
GGTGGATATACCGGTCAAGTATCTTAGTTTCTTCCTAGAAGATGATACTGAGCTTGAACA
CATAAAGAAGGAATATGGAGAAGGAAGAATGCTAACGGGTGAAGTAAAGAAGCGGCTCAC
TGAAGTTTTGACAGAAATGGTGGAGAGACACCGCATGGCTCGAGCTGCTGTTACTGATGA
GATGGTGGATGCGTTCATGGCCGTGAGACCTCTCCCAAACATGTTCGAGTAACTCAGATG
AAACCCTCTCTTTTTGGGTGCAACTTCTCATCAGAAACGTTGAATTGTCTTCTGTTTTAT
TTTGATGTTTTCGAGATGATGAATCGGTTCATGAAATGTTTAAAATAGACGTTTTATATA
TAATTGTATACGTAACAGTATTACTCTCTATTACATTTCTGTCCTTGAATTTATAATTGT
ATACGTAAAAAGCTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO25TF U 1
AF RR2GO25JQ C 317
BS 1 703 RR2GO25TF
BS 704 704 RR2GO25JQ
BS 705 755 RR2GO25TF
BS 756 756 RR2GO25JQ
BS 757 795 RR2GO25TF
BS 796 858 RR2GO25JQ

RD RR2GO25TF 795 0 0
GAAGTGTGTAACACTTAATAAGGCTATGGGAATCTTTGGATTTTCTGGCGAAGATCATAT
TGGAAAACTCAGTTTCCCTCCTGTGCAGGCAGTTCCATCATTTCCTAGCTCATTCCCACA
CTTGTTCCCTGGAAAAGACAAGCTCCGCTGCTTGATCCCTTGTGCAATTGACCAGGATCC
TTACTTCAGGATGACTCGCGATGTTGCACCTCGGTTAGGGTATAGCAAGCCTGCACTGAT
TGAGTCATCATTTTTCCCTGCTCTGCAGGGAGAGAACGGAAAAATGTCTGCGAGCGATCC
TAATTCAGCGATCTATGTGACAGATACTGCTAAAGAAATAAAAAACAAGATAAACAGGTA
TGCTTTCAGTGGTGGGCAAGACTCCATCGAAAAGCACAGAGAAATTGGAGCAAATCTTGA
GGTGGATATACCGGTCAAGTATCTTAGTTTCTTCCTAGAAGATGATACTGAGCTTGAACA
CATAAAGAAGGAATATGGAGAAGGAAGAATGCTAACGGGTGAAGTAAAGAAGCGGCTCAC
TGAAGTTTTGACAGAAATGGTGGAGAGACACCGCATGGCTCGAGCTGCTGTTACTGATGA
GATGGTGGATGCGTTCATGGCCGTGAGACCTCTCCCAAACATGTTCGAGTAACTCAGATG
AAACCCTCTCTTTTTGGGTGCAACTTCTCATCAGAAACGTTGA*TTGTCTTCTGTTTTAT
TTTGATGTTTTCGAGATGATGAATCGGTTCATGAA*TGTTTAAAATAGACGTTTTATATA
TAATTGTATACGTAA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2GO25JQ 542 0 0
GTGACAGATACTGCTAAAGAAATAAAAAACAAGATAAACAGGTATGCTTTCAGTGGTGGG
CAAGACTCCATCGAAAAGCACAGAGAAATTGGAGCAAATCTTGAGGTGGATATACCGGTC
AAGTATCTTAGTTTCTTCCTAGAAGATGATACTGAGCTTGAACACATAAAGAAGGAATAT
GGAGAAGGAAGAATGCTAACGGGTGAAGTAAAGAAGCGGCTCACTGAAGTTTTGACAGAA
ATGGTGGAGAGACACCGCATGGCTCGAGCTGCTGTTACTGATGAGATGGTGGATGCGTTC
ATGGCCGTGAGACCTCTCCCAAACATGTTCGAGTAACTCAGATGAAACCCTCTCTTTTTG
GGTGCAACTTCTCATCAGAAACGTTGAATTGTCTTCTGTTTTATTTTGATGTTTTCGAGA
TGATGAATCGGTTCATGAAATGTTTAAAATAGACGTTTTATATATAATTGTATACGTAAC
AGTATTACTCTCTATTACATTTCTGTCCTTGAATTTATAATTGTATACGTAAAAAGCTTG
AT

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

CO CL4629Contig1 753 2 9 U
GGACACAAACAGTAAAATAAAAAGAAAAACAGAGTCAGAAGGGGCTTAAGCCATCCTTAC
AAGCCTCTCCTACTCTGTTTTTTTTTCTTGTATTTTTACAATTTACAATAAAACATTAAC
TTAAAAAAAAATAGAACTAAATTACCTTCTTTAATTTCTTGAAATTGTGAAGTTTGATAA
AAAAAAAAGAAAAAATGGGCTTCGATAAAGGAAACAAGAAGAAGAAATGCATCATCGCTG
GGGTTATCACGGCTTTGCTCGTTATCATGGTAGTCTCCGTGGCCGTCATAACGAACCAAC
ATGCCCGCACTTGTAATCACAAAAAAGCCGACGCGAATATTAAAATGACCAGCAAGGCAG
TCGAAGCGGTTTGTGCACCTACTGACTTCAAAGAAACATGTGTCAACAGCTTCATGAAAG
CTTCTCCCAACGCCACCGAGCCTCTCGATCTCATCAAGCTGAGCTTCAACATCACCATTC
AATCCATCAAGGATGGTATCAAGAAATCCTCTGTAGAGCTCAAAGCCAAGGCAGATGATG
AGACCAAAGGGTCTCTGGAGTTGTGTGAGACGGTTATGAACGACGCTATAGATGATCTGA
CCAAGTGTTTTGATAACTTTGCTGGCTTTTCAGTTGATCAAATTGAGAAATTCGTCGATG
ATCTTCGTGTCTGGCTCAGTGGGTCCATTTCGTATCAACAGACATGCATGGATGCTTTTG
AGGAAGTTAAGTCAACCCTTGCAGAAGACATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H340TF U 46
AF RR2AR19TF U 1
BS 1 100 RR2AR19TF
BS 101 101 RR2H340TF
BS 102 130 RR2AR19TF
BS 131 131 RR2H340TF
BS 132 163 RR2AR19TF
BS 164 164 RR2H340TF
BS 165 331 RR2AR19TF
BS 332 332 RR2H340TF
BS 333 753 RR2AR19TF

RD RR2H340TF 503 0 0
TTAAGCCATCCTTACAAGCCTCTCCTACTCTGTTTTTTTTTCTTGTATTTTTACAATTTA
CAATAAGACATTAACTTAAAAAAAAATAGAACTAAATTACCTTCTTTAATTTCTTGAAAT
TGTGAAGTTTGATAAAAAAAGAAGAAAAAATGGGCTTCGATAAAGGAAACAAGAAGAAGA
AATGCATCATCGCTGGGGTTATCACGGCTTTGCTCGTTATCATGGTAGTCTCCGTGGCCG
TCATAACGAACCAACATGCCCGTACTTGTAATCACAAAAAAGCCGACGCGAATATTAAAA
TGACCAGCAAGGCAGTCGAAGCGGTTTGTGCACCTACTGACTTCAAAGAAACATGTGTCA
ACAGCTTCATGAAAGCTTCTCCTAACGCCACCGAGCCTCTCGATCTCATCAAGCTGAGCT
TCAACATCACCATTCAATCCATCAAGGATGGTATCAAGAAATCCTCTGTAGAGCTCAAAG
CCAAGGCAGATGATGAGACCAAA

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2AR19TF 753 0 0
GGACACAAACAGTAAAATAAAAAGAAAAACAGAGTCAGAAGGGGCTTAAGCCATCCTTAC
AAGCCTCTCCTACTCTGTTTTTTTTTCTTGTATTTTTACAGTTTACAATAAAACATTAAC
TTAAAAAAAA*TAGAACTAAATTACCTTCTTTAATTTCTTGAATTTGTGAAGTTTGATAA
AAAAAAAAGAAAAAATGGGCTTCGATAAAGGAAACAAGAAGAAGAAATGCATCATCGCTG
GGGTTATCACGGCTTTGCTCGTTATCATGGTAGTCTCCGTGGCCGTCATAACGAACCAAC
ATGCCCGCACTTGTAATCACAAAAAAGCCGATGCGAATATTAAAATGACCAGCAAGGCAG
TCGAAGCGGTTTGTGCACCTACTGACTTCAAAGAAACATGTGTCAACAGCTTCATGAAAG
CTTCTCCCAACGCCACCGAGCCTCTCGATCTCATCAAGCTGAGCTTCAACATCACCATTC
AATCCATCAAGGATGGTATCAAGAAATCCTCTGTAGAGCTCAAAGCCAAGGCAGATGATG
AGACCAAAGGGTCTCTGGAGTTGTGTGAGACGGTTATGAACGACGCTATAGATGATCTGA
CCAAGTGTTTTGATAACTTTGCTGGCTTTTCAGTTGATCAAATTGAGAAATTCGTCGATG
ATCTTCGTGTCTGGCTCAGTGGGTCCATTTCGTATCAACAGACATGCATGGATGCTTTTG
AGGAAGTTAAGTCAACCCTTGCAGAAGACATGA

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL4630Contig1 650 2 15 U
TTTTTTTTTCCTGAAGACGCAGAGCTCAATGACGAAGCAGCACGCGAACTGGTCTCCATA
CGACAACAATGAAGGAACATGTGTGGCCATCGCTGGATCCGATTACTGCGTCATCGCAGC
CGATACTCGGATGTCTACCGGTTACAGCATTCTAACTCGCGATTACTCTAAGATCCATAA
ACTAGCAGACAAGGCTGTGCTATCTTCCTCTGGCTTTCAAGCTGATGTGAAAGCACTTCA
GAAAGTTCTCAAGTCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGTTG
TCCTGCAATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACTCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCCTTACTA
TGCCTTTAACGTTCTCGGTGGCCTTGATGAGCAAGGAAAAGGCTGTGTCTTTACCTATGA
CGCAGTGGGATCATATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTCAT
CATGCCCTTCCTTGACAATCAGCTCAAGAGTCCTAGCCCGCTCTTGCTTCCTGCCCAGGA
TGCTATCACACCCCTTTCTGAACCTGAAGCAGTTGACTTGGTTAAGACTGTTTTCGCATC
TGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2H111TF U 1
AF RR2BR04TF U 13
BS 1 38 RR2H111TF
BS 39 39 RR2BR04TF
BS 40 71 RR2H111TF
BS 72 72 RR2BR04TF
BS 73 99 RR2H111TF
BS 100 100 RR2BR04TF
BS 101 145 RR2H111TF
BS 146 146 RR2BR04TF
BS 147 393 RR2H111TF
BS 394 394 RR2BR04TF
BS 395 480 RR2H111TF
BS 481 481 RR2BR04TF
BS 482 522 RR2H111TF
BS 523 523 RR2BR04TF
BS 524 650 RR2H111TF

RD RR2H111TF 650 0 0
TTTTTTTTTCCTGAAGACGCAGAGCTCAATGACGAAGCGGCACGCGAACTGGTCTCCATA
CGACAACAATGGAGGAACATGTGTGGCCATCGCTGGATCGGATTACTGCGTCATCGCAGC
CGATACTCGGATGTCTACCGGTTACGGCATTCTAACTCGCGATTACTCTAAGATCCATAA
ACTAGCAGACAAGGCTGTGCTATCTTCCTCTGGCTTTCAAGCTGATGTGAAAGCACTTCA
GAAAGTTCTCAAGTCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGTTG
TCCTGCAATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACTCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCCTTACTA
TGCCTTTAACGTTCTCGGTGGCCTTGATGAGCATGGAAAAGGCTGTGTCTTTACCTATGA
CGCAGTGGGATCATATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTCAT
TATGCCCTTCCTTGACAATCAGCTCAAGAGTCCTAGCCCGCTTTTGCTTCCTGCCCAGGA
TGCTATCACACCCCTTTCTGAACCTGAAGCAGTTGACTTGGTTAAGACTGTTTTCGCATC
TGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2BR04TF 637 0 0
GGG
GACGCAGAGCTCAATGACGAAGCAGCACGCGAACTGGTCTCCATACGACAACAATGAAGG
AACATGTGTGGCCATCGCTGGATCCGATTACTGCGTCATTGCAGCCGATACTCGGATGTC
TACCGGTTACAGCATTCTAACTCGCGATTACTCTAAGATCCATAAACTAGCAGACAAGGC
TGTGCTATCTTCCTCTGGCTTTCAAGCTGATGTGAAAGCACTTCAGAAAGTTCTCAAGTC
AAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGTTGTCCTGCAATGGCTCA
GCTTCTCTCCAACACTCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCCTTACTATGCCTTTAACTTTCT
CGGTGGGCTTGATGAGCAAGGAAAAGGCTGTGTCTTTACCTATGACGCAGTGGGTTCGTA
TGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTCATCATGCCCTTCCTTGA
CAATCAGCTCAAGAGTCCTAGCCCGCTCTTGCTTCCTGCCCAGGATGCTATCACACCCCT
TTCTGAACCTGAAGCAGTTGACTTGGTTAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGA
TATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATT

QA 4 637 4 637
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4634Contig1 486 2 1 U
GGAAAATCATCCCAAAGAAAATGTTTATTTCCAAGAAAATTTTTGTTCTATCATTGGCTC
TTATAGCCATTATATGCATTGTCATGAGCACAACTGAAGCCGCAAGAATAAGTAATGGAG
CTATGGAAGCAGATAACAAGGGTTGTGCACCGGGGAAATGCATGGGTCAGGCTAACCCAT
ATACACCTGGAGGTTAATCTGGTCAAAGATGTCGTCAAGCTTGAAATTAGAATTTTTTTT
CTGGTAAATAAAAAAATTGTGACTCGAATAGTAATTAATTTTATAATTACTTTCTCGAAT
TTCTAAATAAATAAACATGTAACTATATTTTGAGAATACTGTCTAAGCAGTAGGTAATTT
ATACTAGTATTGTAAGCTTATATCGGCTAACTTTGTATTAAAATGTTTGTATACTAGCCA
ATTGTTATAAATATGGCTTTCTATGCAATATATTCAAATATAAATAAATGATTTTTTTCA
CTGTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2CG71JQ C 1
AF RR2CG71TF U 1
BS 1 486 RR2CG71TF

RD RR2CG71JQ 486 0 0
GGAAAATCATCCCAAAGAAAATGTTTATTTCCAAGAAAATTTTTGTTCTATCATTGGCTC
TTATAGCCATTATATGCATTGTCATGAGCACAACTGAAGCCGCAAGAATAAGTAATGGAG
CTATGGAAGCAGATAACAAGGGTTGTGCACCGGGGAAATGCATGGGTCAGGCTAACCCAT
ATACACCTGGAGGTTAATCTGGTCAAAGATGTCGTCAAGCTTGAAATTAGAATTTTTTTT
TTGGTAAATAAAAAAATTGTGACTCGAATAGTAATTAATTTTATAATTACTTTCTCGAAT
TTTTAAATAAATAAACATGTAACTATATTTTGAGAATACTGTTTAAGCAGTAGGTAATTT
ATACTAGTATTGTAAGCTTATATCGGCTAACTTTGTATTAAAATGTTTGTATACTAGCCA
ATTGTTATAAATATGGCTTTTTATGCAATATATTCAAATATAAATAAATGATTTTTTTCA
CTGTAT

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR2CG71TF 486 0 0
GGAAAATCATCCCAAAGAAAATGTTTATTTCCAAGAAAATTTTTGTTCTATCATTGGCTC
TTATAGCCATTATATGCATTGTCATGAGCACAACTGAAGCCGCAAGAATAAGTAATGGAG
CTATGGAAGCAGATAACAAGGGTTGTGCACCGGGGAAATGCATGGGTCAGGCTAACCCAT
ATACACCTGGAGGTTAATCTGGTCAAAGATGTCGTCAAGCTTGAAATTAGAATTTTTTTT
CTGGTAAATAAAAAAATTGTGACTCGAATAGTAATTAATTTTATAATTACTTTCTCGAAT
TTCTAAATAAATAAACATGTAACTATATTTTGAGAATACTGTCTAAGCAGTAGGTAATTT
ATACTAGTATTGTAAGCTTATATCGGCTAACTTTGTATTAAAATGTTTGTATACTAGCCA
ATTGTTATAAATATGGCTTTCTATGCAATATATTCAAATATAAATAAATGATTTTTTTCA
CTGTAT

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 2

CO CL4635Contig1 740 2 2 U
GGATTTTCTTCAGACTTGTAGTATTCTACACAAAACTCAAGACTTGTAGTCAATCCTCTT
CAAGCAAGCAAGAAGATGAAGCAAAAGATCTTGTTCAGAGTGACTATGACTGATGACAAG
ACCAGAGCAAAAGCTATGACCAAAGCAGTTCAGTTTAAAGGTGTGTCAGCCGTGGAGATA
AAAGGCGATCACAGGAACCAGATAGAGGTGACCGGTACTGAAGTTGATATGATCGGCCTC
ACCAAGAGGCTAAGAAAGAAGGTAGCCTTTGCAGAGCTTGTAAGCGTAAGCAAAGTCGAA
CCTCCAAAGAAACCAGATGAGAAGAAGGATGGGGACAAAAAGGACGGTGACAAAAAAGAC
GGTGACAAAAAAGATGGTGACAAGAAAGATTGTGACAAAAAGGATGGCGATAAGAAAGAT
GGAGACAAGAAGAAGGAAGAGGAGAAGAAGCCCGCGCCCTGTTGTAAACCATGCCCGCCG
CCATGTAAACCATGTCCGCCGCCGTGTAATCCATGTCCTCCTCCTCCTCCCTGTTATCCA
TCTCCTCAAGGATACGGTGTGCCGTCCGCCTTTCCCTACCCGTACAACCCCAACAGTTAC
ATAGGGGAACCAGTTTACAATCAGGAACCGGGTTGCACAATCCTGTGAAATGGGAGGAAG
ATTAATCTGAGAAAGAGGTCACAGCTTGTGACCAAATGTAAAAAAAACTAAATAGTCACA
TGAATAAAACTCTAAAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU48TF U 1
AF RR2BU48JQ C 151
BS 1 620 RR2BU48TF
BS 621 740 RR2BU48JQ

RD RR2BU48TF 620 0 0
GGATTTTCTTCAGACTTGTAGTATTCTACACAAAACTCAAGACTTGTAGTCAATCCTCTT
CAAGCAAGCAAGAAGATGAAGCAAAAGATCTTGTTCAGAGTGACTATGACTGATGACAAG
ACCAGAGCAAAAGCTATGACCAAAGCAGTTCAGTTTAAAGGTGTGTCAGCCGTGGAGATA
AAAGGCGATCACAGGAACCAGATAGAGGTGACCGGTACTGAAGTTGATATGATCGGCCTC
ACCAAGAGGCTAAGAAAGAAGGTAGCCTTTGCAGAGCTTGTAAGCGTAAGCAAAGTCGAA
CCTCCAAAGAAACCAGATGAGAAGAAGGATGGGGACAAAAAGGACGGTGACAAAAAAGAC
GGTGACAAAAAAGATGGTGACAAGAAAGATTGTGACAAAAAGGATGGCGATAAGAAAGAT
GGAGACAAGAAGAAGGAAGAGGAGAAGAAGCCCGCGCCCTGTTGTAAACCATGCCCGCCG
CCATGTAAACCATGTCCGCCGCCGTGTAATCCATGTCCTCCTCCTCCTCCCTGTTATCCA
TCTCCTCAAGGATACGGTGTGCCGTCCGCCTTTCCCTACCCGTACAACCCCAACAGTTAC
ATAGGGGAACCAGTTTACAA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2BU48JQ 590 0 0
CAGTTTAAAGGTGTGTCAGCCGTGGAGATAAAAGGCGATCACAGGAACCAGATAGAGGTG
ACCGGTACTGAAGTTGATATGATCGGCCTCACCAAGAGGCTAAGAAAGAAGGTAGCCTTT
GCAGAGCTTGTAAGCGTAAGCAAAGTCGAACCTCCAAAGAAACCAGATGAGAAGAAGGAT
GGGGACAAAAAGGACGGTGACAAAAAAGACGGTGACAAAAAAGATGGTGACAAGAAAGAT
TGTGACAAAAAGGATGGCGATAAGAAAGATGGAGACAAGAAGAAGGAAGAGGAGAAGAAG
CCCGCGCCCTGTTGTAAACCATGCCCGCCGCCATGTAAACCATGTCCGCCGCCGTGTAAT
CCATGTCCTCCTCCTCCTCCCTGTTATCCATCTCCTCAAGGATACGGTGTGCCGTCCGCC
TTTCCCTACCCGTACAACCCCAACAGTTACATAGGGGAACCAGTTTACAATCAGGAACCG
GGTTGCACAATCCTGTGAAATGGGAGGAAGATTAATCTGAGAAAGAGGTCACAGCTTGTG
ACCAAATGTAAAAAAAACTAAATAGTCACATGAATAAAACTCTAAAAGCC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

CO CL4636Contig1 511 2 1 U
CCCTTAGCCATGGCGACTCAACAAGCTAAAGCATCCGTGCAATGCTTCGGAAGGAAGAAG
ACGGCCGTCGCCGTCACCCACTGCAAGCGCGACTGCGGTCTTATCAAGCTCAACGGTGCC
CCGATCGAGCTATTCAACCCAGAGATCCTCCGGTTCAAGATCTTCGAGCCGGTCCTCCTC
CTCGGTAAGCACCGTTTCGCCGGAGTCGACATGAGGATCCGCGTCAACGGTGGTGGTCAC
ACTTCCCAGGTCTACGCGATTCGTCAGAGCATCGCCAAGGCTCTTGTGGCGTTTTACCAG
AAGTATGTGGATGAGCAGCCGAAGAAGTTTGGTGGGCGTGGTGCTCGCTCTCGTTTCCAG
AAGAGTTACCGTTAAAAATGTAATGTGCGTCTTTGTCTCAATGTTTCGGGGTTAAAGTTG
TTTAAGTTTGAGACTTTTAGATTTGGTATTGCGTTTTATTATTGGATAATGGTTTATTTT
CGACAAAGAAGTTAATGTTGTCGGTTTGATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ER23JQ C 1
AF RR2ER23TF U 1
BS 1 511 RR2ER23TF

RD RR2ER23JQ 511 0 0
CCCTTAGCCATGGCGACTCAACAAGCTAAAGCATCCGTGCAATGCTTCGGAAGGAAGAAG
ACGGCCGTCGCCGTCACCCACTGCAAGCGCGACTGCGGTCTTATCAAGCTCAACGGTGCC
CCGATCGAGCTATTCAACCCAGAGATCCTCCGGTTCAAGATCTTCGAGCCGGTCCTCCTC
CTCGGTAAGCACCGTTTCGCCGGAGTCGACATGAGGATCCGCGTCAACGGTGGTGGTCAC
ACTTCCCAGGTCTACGCGATTCGTCAGAGCATCGCCAAGGCTCTTGTGGCGTTTTACCAG
AAGTATGTGGATGAGCAGCCGAAGAAGTTTGGTGGGCGTGGTGCTCGCTCTCGTTTCCAG
AAGAGTTACCGTTAAAAATGTAATGTGCGTCTTTGTCTCAATGTTTCGGGGTTAAAGTTG
TTTAAGTTTGAGACTTTTAGATTTGGTATTGCGTTTTATTATTGGATAATGGTTTATTTT
CGACAAAGAAGTTAATGTTGTCGGTTTGATG

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2ER23TF 511 0 0
CCCTTAGCCATGGCGACTCAACAAGCTAAAGCATCCGTGCAATGCTTCGGAAGGAAGAAG
ACGGCCGTCGCCGTCACCCACTGCAAGCGCGACTGCGGTCTTATCAAGCTCAACGGTGCC
CCGATCGAGCTATTCAACCCAGAGATCCTCCGGTTCAAGATCTTCGAGCCGGTCCTCCTC
CTCGGTAAGCACCGTTTCGCCGGAGTCGACATGAGGATCCGCGTCAACGGTGGTGGTCAC
ACTTCCCAGGTCTACGCGATTCGTCAGAGCATCGCCAAGGCTCTTGTGGCGTTTTACCAG
AAGTATGTGGATGAGCAGCCGAAGAAGTTTGGTGGGCGTGGTGCTCGCTCTCGTTTCCAG
AAGAGTTACCGTTAAAAATGTAATGTGCGTCTTTGTCTCAATGTTTCGGGGTTAAAGTTG
TTTAAGTTTGAGACTTTTAGATTTGGTATTGCGTTTTATTATTGGATAATGGTTTATTTT
CGACAAAGAAGTTAATGTTGTCGGTTTGATG

QA 1 511 1 511
DS 



AS 1 2

CO CL4637Contig1 471 2 1 U
TAAAAACAGAACAACCACAAACATAAAGAATCAAGAACCGGAAAATGGTGAAGGTGATGT
GGGTTTCCGTTCTAGCTCTCGTGGCAGCGGTTCTCCTCGTGACGGTGGAAAAACTTCCGG
GGGCCGAAGGAGTGACCTGCTCGGTGACGGAACTGTCTCCATGTTTGGCGGCGTTTATGT
CATCTTCGTCACCGTCGGCGTCGTGCTGCGCCAAGCTGAGAGAGCAGAAGCCATGCCTTT
GTGGGTACATGAGGAACCCTAGCCTCCGCCAATACGTTAGTTCCCCAAACGCAAAAAAAG
TCTCCAACGATTGCAAGGTTGCTTCCCCAAACTGTTAATCATGATTAATAAGTGACAAGT
TTACCTGATTATGAGTGTTAAGTTACAAGTAAAAGTGGGTCTTGTCCTCTTTCACTAGTG
TTTAATATAATAATGGGTGATGATGATCATCATCATCATCATGCTTGAATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E177JQ C 1
AF RR2E177TF U 1
BS 1 471 RR2E177TF

RD RR2E177JQ 471 0 0
TAAAAACAGAACAACCACAAACATAAAGAATCAAGAACCGGAAAATGGTGAAGGTGATGT
GGGTTTCCGTTCTAGCTCTCGTGGCAGCGGTTCTCCTCGTGACGGTGGAAAAACTTCCGG
GGGCCGAAGGAGTGACCTGCTCGGTGACGGAACTGTCTCCATGTTTGGCGGCGTTTATGT
CATTTTCGTCACCGTCGGCGTCGTGCTGCGCCAAGCTGAGAGAGCAGAAGCCATGCCTTT
GTGGGTACATGAGGAACCCTAGCCTCCGCCAATACGTTAGTTCCCCAAACGCAAAAAAAG
TCTCCAACGATTGCAAGGTTGCTTCCCCAAACTGTTAATCATGATTAATAAGTGACAAGT
TTACCTGATTATGAGTGTTAAGTTACAAGTAAAAGTGGGTCTTGTCCTCTTTCACTAGTG
TTTAATATAATAATGGGTGATGATGATCATCATCATCATCATGCTTGAATG

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR2E177TF 471 0 0
TAAAAACAGAACAACCACAAACATAAAGAATCAAGAACCGGAAAATGGTGAAGGTGATGT
GGGTTTCCGTTCTAGCTCTCGTGGCAGCGGTTCTCCTCGTGACGGTGGAAAAACTTCCGG
GGGCCGAAGGAGTGACCTGCTCGGTGACGGAACTGTCTCCATGTTTGGCGGCGTTTATGT
CATCTTCGTCACCGTCGGCGTCGTGCTGCGCCAAGCTGAGAGAGCAGAAGCCATGCCTTT
GTGGGTACATGAGGAACCCTAGCCTCCGCCAATACGTTAGTTCCCCAAACGCAAAAAAAG
TCTCCAACGATTGCAAGGTTGCTTCCCCAAACTGTTAATCATGATTAATAAGTGACAAGT
TTACCTGATTATGAGTGTTAAGTTACAAGTAAAAGTGGGTCTTGTCCTCTTTCACTAGTG
TTTAATATAATAATGGGTGATGATGATCATCATCATCATCATGCTTGAATG

QA 1 471 1 471
DS 



AS 1 2

CO CL4638Contig1 722 2 6 U
ATGAGCGTCTTTGAACGCGAAGCTCTTTAAGTACATAGCCGAGTGCTTCAATTCGGAAAA
AAGGAGAAGAAATGGAACAAATGGTGTATATAGTCTCTGTTGTTTGCACTTGTCTTGCTC
TTCTTATCATCCCTGTTATCTTCGTAACTCGGCGTCTAAGTGTTCATCTCTCCTTCAAAA
ACATCCTCAGATTCATTAAACTCGTAGCTTCTCAACTCGATGATGAGGAAGAGAATAACG
AGAAAGGTGGTACGATGGGAGAGGAAGAGAAACGAAGGAGACTGCCAAAGCACGTGGCGA
TTATATTGGACGGAAACAGACGTTGGGCGGAGAAACGAGGACTAGGAACATCGGAAGGTC
ACCAGGCCGGAGCGAGGAGGCTTATCGAGAATGCTAAAGACTGTTTCGCTATGGGGATAA
ACACTGTCTCACTCTTTGCTTTCTCCACCGAAAATTGGGCAAGACCTGAGGATGAAGTTA
ATGGCCTGATGGCCTTGTTTGAGAAACATTTGAGGTCTGAGATGGCTTTCTTCCGGAGTG
ATAAAATCAAGATCTCGGTGATTGGAAACCGAACAAAAATCTCCCAGTCGCTTCTAGGTT
TGATAAAAGAAGCAGAGGAAGCTACAAAGAGTTACGAAGAGAAGCATCTCATTATAGCAA
TAGACTATAGTGGAAGATTTGATATCTTACAAGCTTGCAAAAGTCTTGCAGAAAAGCCAA
AA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2G487TF U 1
AF RR2DG52TF U 119
BS 1 278 RR2G487TF
BS 279 279 RR2DG52TF
BS 280 578 RR2G487TF
BS 579 579 RR2DG52TF
BS 580 597 RR2G487TF
BS 598 722 RR2DG52TF

RD RR2G487TF 602 0 0
ATGAGCGTCTTTGAACGCGAAGCTCTTTAAGTACATAGCCGAGTGCTTCAATTCGGAAAA
AAGGAGAAGAAATGGAACAAATGGTGTATATAGTCTCTGTTGTTTGCACTTGTCTTGCTC
TTCTTATCATCCCTGTTATCTTCGTAACTCGGCGTCTAAGTGTTCATCTCTCCTTCAAAA
ACATCCTCAGATTCATTAAACTCGTAGCTTCTCAACTCGATGATGAGGAAGAGAATAACG
AGAAAGGTGGTACGATGGGAGAGGAAGAGAAACGAAGGGGACTGCCAAAGCACGTGGCGA
TTATATTGGACGGAAACAGACGTTGGGCGGAGAAACGAGGACTAGGAACATCGGAAGGTC
ACCAGGCCGGAGCGAGGAGGCTTATCGAGAATGCTAAAGACTGTTTCGCTATGGGGATAA
ACACTGTCTCACTCTTTGCTTTCTCCACCGAAAATTGGGCAAGACCTGAGGATGAAGTTA
ATGGCCTGATGGCCTTGTTTGAGAAACATTTGAGGTCTGAGATGGCTTTCTTCCGGAGTG
ATAAAATCAAGATCTCGGTGATTGGAAACCGAACAAAA*TCTCCCAGTCGCTTCTAG
TTTGA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2DG52TF 604 0 0
TCTTCTTATCATCCCTGTTATCTTCGTAACTCGGCGTCTAAGTGTTCATCTCTCCTTCAA
AAACATCCTCAGATTCATTAAACTCGTAGCTTCTCAACTCGATGATGAGGAAGAGAATAA
CGAGAAAGGTGGTACGATGGGAGAGGAAGAGAAACGAAGGAGACTGCCAAAGCACGTGGC
GATTATATTGGACGGAAACAGACGTTGGGCGGAGAAACGAGGACTAGGAACATCGGAAGG
TCACCAGGCCGGAGCGAGGAGGCTTATCGAGAATGCTAAAGACTGTTTCGCTATGGGGAT
AAACACTGTCTCACTCTTTGCTTTCTCCACCGAAAATTGGGCAAGACCTGAGGATGAAGT
TAATGGCCTGATGGCCTTGTTTGAGAAACATTTGAGGTCTGAGATGGCTTTCTTCCGGAG
TGATGAAATCAAGATCTCGGTGATTGGAAACCGAACAAAAATCTCCCAGTCGCTTCTAGG
TTTGATAAAAGAAGCAGAGGAAGCTACAAAGAGTTACGAAGAGAAGCATCTCATTATAGC
AATAGACTATAGTGGAAGATTTGATATCTTACAAGCTTGCAAAAGTCTTGCAGAAAAGCC
AAAA

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL4639Contig1 1084 2 4 U
CGTCTACATTCACTTCGATTCAAGAGAGTTTCTGAGATACCAAGAGATCTGTGATGAGAG
GAGCTAGAGAAGAGACAGCGGCGTGGGGATACTTTAGCAGAGATGTTCTGCCGTTTGCTG
CCATGTTTACGGTGGAGTGTACCACTGTTGGGTCGAGCACACTGTACAAGGCTGCATCTC
TAAGAGGATTGAGCTTCTATGTCTTTGTCTTTTACTCTTATCTTGTTTCCACACTTCTCC
TTCTCCCACTTTCCCTCATCTTTGGAAGGTCAAGAAGATTGCCTCCAGCCAAGTTTCCTC
TGTTCTTCAAGATTTTCGTACTCGGGCTTCTTGGGTTCATGTCGCAGATAGCTGGTTGTA
AGGGCATAGAATACAGTTCTCCTACTCTCGCTTCTGCTATCAGCAACCTCACGCCAGCTT
TCACATTCACGCTCGCTGTTATCTTCAGAATGGAACAAGTAACGTTAAGGAGCTCTGCGA
GCCAGGCTAAAATCATTGGTGCAATACTATCTATATCTGGTGCTCTAGTAATTGTGCTAT
ATAAAGGCCCCAAGGTTCTCTCTGGTGCATCTTTTACACCATCATCTCCACCCATTTCGC
TTGTCCGGCATTTAGCTTCGTCCGATTCAAGTTGGATGATTGGAGGCCTATTTCTTGCTT
CACAGTATTTTTTTTTATCAGTTTGGTATATTTTTCAGGGATTTTTCATTTCAATGTTCA
GCGCGCTTACCCACATATGGGGTTTACATTTGAAAGGCCCTGTTTACATATCCTTGTTTA
GGCCATTGTTTATTGGGATTGCAGTCGCCATGAGTGCTATATTCCTCGGGGATGCACTTC
ACCTTGGGAGTGTCATTGGATCAGTGATATTGTGCTTTGGGTTTTACACTGTAATTTGGG
GCAAAGCAAGGGGGGATTCAACCAAAACTGTAGCTGGTTTTGAGCATTCACCTTTGCTGC
TTACACACGTCGTTGGAGCCAGAGACTCGTAGGATTGATGAAAGCGATAATCCTTACACT
AATGATTTGTAAAGATTTTGCACCATACCACTTTTATACTGTTCACTAAAAGGATTGGTA
AGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2CR03TF U 1
AF RR2CR03JQ C 454
BS 1 645 RR2CR03TF
BS 646 646 RR2CR03JQ
BS 647 670 RR2CR03TF
BS 671 1084 RR2CR03JQ

RD RR2CR03TF 674 0 0
CGTCTACATTCACTTCGATTCAAGAGAGTTTCTGAGATACCAAGAGATCTGTGATGAGAG
GAGCTAGAGAAGAGACAGCGGCGTGGGGATACTTTAGCAGAGATGTTCTGCCGTTTGCTG
CCATGTTTACGGTGGAGTGTACCACTGTTGGGTCGAGCACACTGTACAAGGCTGCATCTC
TAAGAGGATTGAGCTTCTATGTCTTTGTCTTTTACTCTTATCTTGTTTCCACACTTCTCC
TTCTCCCACTTTCCCTCATCTTTGGAAGGTCAAGAAGATTGCCTCCAGCCAAGTTTCCTC
TGTTCTTCAAGATTTTCGTACTCGGGCTTCTTGGGTTCATGTCGCAGATAGCTGGTTGTA
AGGGCATAGAATACAGTTCTCCTACTCTCGCTTCTGCTATCAGCAACCTCACGCCAGCTT
TCACATTCACGCTCGCTGTTATCTTCAGAATGGAACAAGTAACGTTAAGGAGCTCTGCGA
GCCAGGCTAAAATCATTGGTGCAATACTATCTATATCTGGTGCTCTAGTAATTGTGCTAT
ATAAAGGCCCCAAGGTTCTCTCTGGTGCATCTTTTACACCATCATCTCCACCCATTTCGC
TTGTCCGGCATTTAGCTTCGTCCGATTCAAGTTGGATGATTGGAG*CCTATTTCTTGCTT
CACAGTATTT
CTCT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2CR03JQ 631 0 0
AACAAGTAACGTTAAGGAGCTTTGCGAGCCAGGCTAAAATCATTGGTGCAATACTATCTA
TATCTGGTGCTCTAGTAATTGTGCTATATAAAGGCCCCAAGGTTCTTTTTGGTGCATTTT
TTACACCATCATCTCCACCCATTTCGCTTGTCCGGCATTTAGCTTCGTCCGATTCAAGTT
GGATGATTGGAGGCCTATTTCTTGCTTCACAGTATTTTTTTTTATCAGTTTGGTATATTT
TTCAGGGATTTTTCATTTCAATGTTCAGCGCGCTTACCCACATATGGGGTTTACATTTGA
AAGGCCCTGTTTACATATCCTTGTTTAGGCCATTGTTTATTGGGATTGCAGTCGCCATGA
GTGCTATATTCCTCGGGGATGCACTTCACCTTGGGAGTGTCATTGGATCAGTGATATTGT
GCTTTGGGTTTTACACTGTAATTTGGGGCAAAGCAAGGGGGGATTCAACCAAAACTGTAG
CTGGTTTTGAGCATTCACCTTTGCTGCTTACACACGTCGTTGGAGCCAGAGACTCGTAGG
ATTGATGAAAGCGATAATCCTTACACTAATGATTTGTAAAGATTTTGCACCATACCACTT
TTATACTGTTCACTAAAAGGATTGGTAAGTT

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL4640Contig1 1015 2 6 U
GGAAAGAGATTGCTTTCCTAATAATCCTCTCCAACGATCTCCCCCCGAGCAAAAATTCTC
CTCACGGTGATCACCTCGAATCGAAGAGTTCCCTTCAGGTACAAAGGTTGGAAACTCTTT
GAGTTTTAAAGATGAACACAGAGGGGTGGAGATCAACTCGAGGGATCAGACGGAGGAAAG
CGTTGATTGATCTTAACGTGGCACCCAGTGATGTTGAAGGCACCTCTGCTTCTGTCAGAG
CATCATCTCCCATTGTGACTACACCTAGTTGTGATCTTCAAAGGGAGTCTGTGGCGCCTT
CTCACCCTGCTCCGACCACGATTGATGTAGATGCTATTGAAGATGATGTTGTTGAATCAT
CCGCAATTGCTTTTGCTGAAGCTAGAAGTAAATCAACAGGTGCACGTCGGAGGCGTTTGA
TGGTTGATGTAGAGTCAGGTGGTACGACTAGATTGTCTCCAAACAAACGGAGGAGGGTTC
CTCCGAATCAACCTGTCATCGACTGTGAGCATGTCTCTGTTGACACCTTTTCTAGCTCAA
AGGCTACGGCTCCTCCACCAGAGGAGCCAAAATTCTCTTGCCCAATTTGTATGTGCCCGT
TTACTGAGGAGATGTCAACCAAATGCGGCCACATCTTCTGCAAGGCATGTATAAAGATGG
CGATATCTCGCCAAAACAAGTGCCCTACTTGTAGGAAAAAAGTGACTGCAAGAGAGCTGA
TTCGAGTATTCCTTCCAACCACCAGATGATTCGTACATCGACAGTAGCAGCCACCTTGTC
TAATGGTTTGTCTTGACTCTATCGTCAAATTCGTGTTGGAACATTGAAGGGACTTCGAGG
AATTGGCGTTTTAGTTTGAATGTTAAGAAACAAACTTAATTGTTTAAGAAGGCCCCTACC
ATTTAGTGGTAATGTCAAATTCCGAAGTAACTCTTGGTTACTAGTTGTTGTCTTATGTAA
TTTAGTGTCTCTGCAAACCTCAGTCGATGCCTCTGTCTCTGTTACAGATGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL66TF U 1
AF RR2GL66JQ C 200
BS 1 644 RR2GL66TF
BS 645 645 RR2GL66JQ
BS 646 675 RR2GL66TF
BS 676 676 RR2GL66JQ
BS 677 694 RR2GL66TF
BS 695 1015 RR2GL66JQ

RD RR2GL66TF 695 0 0
GGAAAGAGATTGCTTTCCTAATAATCCTCTCCAACGATCTCCCCCCGAGCAAAAATTCTC
CTCACGGTGATCACCTCGAATCGAAGAGTTCCCTTCAGGTACAAAGGTTGGAAACTCTTT
GAGTTTTAAAGATGAACACAGAGGGGTGGAGATCAACTCGAGGGATCAGACGGAGGAAAG
CGTTGATTGATCTTAACGTGGCACCCAGTGATGTTGAAGGCACCTCTGCTTCTGTCAGAG
CATCATCTCCCATTGTGACTACACCTAGTTGTGATCTTCAAAGGGAGTCTGTGGCGCCTT
CTCACCCTGCTCCGACCACGATTGATGTAGATGCTATTGAAGATGATGTTGTTGAATCAT
CCGCAATTGCTTTTGCTGAAGCTAGAAGTAAATCAACAGGTGCACGTCGGAGGCGTTTGA
TGGTTGATGTAGAGTCAGGTGGTACGACTAGATTGTCTCCAAACAAACGGAGGAGGGTTC
CTCCGAATCAACCTGTCATCGACTGTGAGCATGTCTCTGTTGACACCTTTTCTAGCTCAA
AGGCTACGGCTCCTCCACCAGAGGAGCCAAAATTCTCTTGCCCAATTTGTATGTGCCCGT
TTACTGAGGAGATGTCAACCAAATGCGGCCACATCTTCTGCAAG*CATGTATAAAGATGG
CGATATCTCGCCAAA*CAAGTGCCCTACTTGTAG
A

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2GL66JQ 816 0 0
GCAC
CCCAGTGATGTTGAAGGCACCTCTGCTTCTGTCAGAGCATCATCTCCCATTGTGACTACA
CCTAGTTGTGATCTTCAAAGGGAGTCTGTGGCGCCTTCTCACCCTGCTCCGACCACGATT
GATGTAGATGCTATTGAAGATGATGTTGTTGAATCATCCGCAATTGCTTTTGCTGAAGCT
AGAAGTAAATCAACAGGTGCACGTCGGAGGCGTTTGATGGTTGATGTAGAGTCAGGTGGT
ACGACTAGATTGTCTCCAAACAAACGGAGGAGGGTTCCTCCGAATCAACCTGTCATCGAC
TGTGAGCATGTCTCTGTTGACACCTTTTCTAGCTCAAAGGCTACGGCTCCTCCACCAGAG
GAGCCAAAATTCTCTTGCCCAATTTGTATGTGCCCGTTTACTGAGGAGATGTCAACCAAA
TGCGGCCACATCTTTTGCAAGGCATGTATAAAGATGGCGATATCTCGCCAAAACAAGTGC
CCTACTTGTAGGAAAAAAGTGACTGCAAGAGAGCTGATTCGAGTATTCCTTCCAACCACC
AGATGATTCGTACATCGACAGTAGCAGCCACCTTGTCTAATGGTTTGTCTTGACTCTATC
GTCAAATTCGTGTTGGAACATTGAAGGGACTTCGAGGAATTGGCGTTTTAGTTTGAATGT
TAAGAAACAAACTTAATTGTTTAAGAAGGCCCCTACCATTTAGTGGTAATGTCAAATTCC
GAAGTAACTCTTGGTTACTAGTTGTTGTCTTATGTAATTTAGTGTCTCTGCAAACCTCAG
TCGATGCCTCTGTCTCTGTTACAGATGAAAAA

QA 5 816 5 816
DS 



AS 1 2

CO CL4641Contig1 918 2 2 U
GACAAGGTAATATATTCTTGGTGGATGTTGAGTATACATGGATTCCGAGTACTTGTGGTA
GATGTGGACACTTAGGACATAAAGAGAAAAGATGTCTACTCCCTGCTGCCCAAAAGAATG
AGGAAATGCTTTCAGCGAATGAGGTGCTACATGAAGATCAAAGGGTTGGACCGGATAAGG
AACAAGCTCAGGTCTATGTTGCATCGGAAAAAGAAGTGGTACAAGTTGAAGATTCAGAAG
TGAACTTGGTTTTAGCTTCTACTGGTCAGATTTTAGAAACCACTAATGTGACAGAGATTG
AGCAACTGCAATCACAAAAGGGTGCTGAGCTTAAGGCTCTTTCAACTCCAGTAAGCTTAT
CCGCCCACTCTAAGGAAACAATAGCCATTGGCTCCAACTCTCAATTCACTATATCACCAT
TAGCAGGTATCCCTCTTGCTCTAGCTGAACCAACTATTATGGAAGAAATTTCATCTCATA
TTATTGTTTCCGAGACCAATTTGGAATCTGGAGACAATTCATTGGCCTTTATGTACACAC
CTACACATGACAGTCCTTCTCACAATAAAATTGAGCAATTTAATGTTCATGATGTTGGAG
ATGGGTTGATGAGTGATGCTACAGTAAATCTCAACATGTCAAGAGGTGGAAAGCCAAAAA
AACCAACTCAAAAGTATGAAGATTTGGATTGGACCACGATACGAGGGAAAGGTAAACGAG
GTCGTGAGGCCGTGGATACCACACTCCCTAGTATTTCGTTCTTTCTTTTCTTGCTTTATT
AAACTTATGTCCGTAAGTTTCTCTTTTCTAAATCTGTTTAGCTCAATATGAGGATTGTCT
CATCATGCTTTCTAAAACTTTATGGTTGCAAAACCATACCTTGTATGTTTTATGTTTTTA
ATTAGAATGCCCTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR67TF U 1
AF RR2GR67JQ C 194
BS 1 660 RR2GR67TF
BS 661 918 RR2GR67JQ

RD RR2GR67TF 660 0 0
GACAAGGTAATATATTCTTGGTGGATGTTGAGTATACATGGATTCCGAGTACTTGTGGTA
GATGTGGACACTTAGGACATAAAGAGAAAAGATGTCTACTCCCTGCTGCCCAAAAGAATG
AGGAAATGCTTTCAGCGAATGAGGTGCTACATGAAGATCAAAGGGTTGGACCGGATAAGG
AACAAGCTCAGGTCTATGTTGCATCGGAAAAAGAAGTGGTACAAGTTGAAGATTCAGAAG
TGAACTTGGTTTTAGCTTCTACTGGTCAGATTTTAGAAACCACTAATGTGACAGAGATTG
AGCAACTGCAATCACAAAAGGGTGCTGAGCTTAAGGCTCTTTCAACTCCAGTAAGCTTAT
CCGCCCACTCTAAGGAAACAATAGCCATTGGCTCCAACTCTCAATTCACTATATCACCAT
TAGCAGGTATCCCTCTTGCTCTAGCTGAACCAACTATTATGGAAGAAATTTCATCTCATA
TTATTGTTTCCGAGACCAATTTGGAATCTGGAGACAATTCATTGGCCTTTATGTACACAC
CTACACATGACAGTCCTTCTCACAATAAAATTGAGCAATTTAATGTTCATGATGTTGGAG
ATGGGTTGATGAGTGATGCTACAGTAAATCTCAACATGTCAAGAGGTGGAAAGCCAAAAA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2GR67JQ 725 0 0
CTATGTTGCATCGGAAAAAGAAGTGGTACAAGTTGAAGATTCAGAAGTGAACTTGGTTTT
AGCTTCTACTGGTCAGATTTTAGAAACCACTAATGTGACAGAGATTGAGCAACTGCAATC
ACAAAAGGGTGCTGAGCTTAAGGCTCTTTCAACTCCAGTAAGCTTATCCGCCCACTCTAA
GGAAACAATAGCCATTGGCTCCAACTCTCAATTCACTATATCACCATTAGCAGGTATCCC
TCTTGCTCTAGCTGAACCAACTATTATGGAAGAAATTTCATCTCATATTATTGTTTCCGA
GACCAATTTGGAATCTGGAGACAATTCATTGGCCTTTATGTACACACCTACACATGACAG
TCCTTCTCACAATAAAATTGAGCAATTTAATGTTCATGATGTTGGAGATGGGTTGATGAG
TGATGCTACAGTAAATCTCAACATGTCAAGAGGTGGAAAGCCAAAAAAACCAACTCAAAA
GTATGAAGATTTGGATTGGACCACGATACGAGGGAAAGGTAAACGAGGTCGTGAGGCCGT
GGATACCACACTCCCTAGTATTTCGTTCTTTCTTTTCTTGCTTTATTAAACTTATGTCCG
TAAGTTTCTCTTTTCTAAATCTGTTTAGCTCAATATGAGGATTGTCTCATCATGCTTTCT
AAAACTTTATGGTTGCAAAACCATACCTTGTATGTTTTATGTTTTTAATTAGAATGCCCT
TTTTC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL4642Contig1 738 2 2 U
GACTTTTCGCCGAAGAAGAAGAGAGATTCCCTCTCTACCTACGTCGATAAATCTACGAGG
GAGCTTGACCTTGAGAGGCAAGAGAAAGATGGGTTTCTTCTCGTTTCTTGGAAGAGTTCT
CTTCGCTTCTCTCTTCATCCTCTCCGCATGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGTTGATGG
TGGTCCTGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCAAAGCTTCATCTAGCTAAGGCACATCTATCTTC
TAGATTAGGTGTAACTTTACCTAGCATAGAGGCAAAACAAGTCGTTGTTGCTATAGTTGC
TTTGAAAGGAGTTGGAGGGTTACTCTTTGTTATTGGAAACATCTTCGGTGCTTATCTTCT
GGCTTTCTACTTGGTGGTTGTCAGTCCTATTCTGTATGATTTCTACAACTACGGACCTGA
GGAGCGTCATTTCTCTCCATTGTTGACTGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCACTCTTTGGAGC
ATACTCTTCTTTATTGGAATGAGGAACTCAACACCCACTAAGAGGAATCTGAAGAGGACT
CCTAAGCCGAAAGCTGCTTAGTTGGATTGCCACACTCAATATATACCTTCAGTTTTTTTT
TTTTTTTTGGTTTTGTTCGGACAAATTCGTTTCTTAACACTTTTGGTTTTCTTTTTGTTG
TATGATTCTTGGATTGGCTCATGATATCATATTATGATTTGCTAAAACGTGAACCATGCA
GCAATGGACTATGATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU25TF U 1
AF RR2FU25JQ C 144
BS 1 610 RR2FU25TF
BS 611 738 RR2FU25JQ

RD RR2FU25TF 610 0 0
GACTTTTCGCCGAAGAAGAAGAGAGATTCCCTCTCTACCTACGTCGATAAATCTACGAGG
GAGCTTGACCTTGAGAGGCAAGAGAAAGATGGGTTTCTTCTCGTTTCTTGGAAGAGTTCT
CTTCGCTTCTCTCTTCATCCTCTCCGCATGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGTTGATGG
TGGTCCTGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCAAAGCTTCATCTAGCTAAGGCACATCTATCTTC
TAGATTAGGTGTAACTTTACCTAGCATAGAGGCAAAACAAGTCGTTGTTGCTATAGTTGC
TTTGAAAGGAGTTGGAGGGTTACTCTTTGTTATTGGAAACATCTTCGGTGCTTATCTTCT
GGCTTTCTACTTGGTGGTTGTCAGTCCTATTCTGTATGATTTCTACAACTACGGACCTGA
GGAGCGTCATTTCTCTCCATTGTTGACTGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCACTCTTTGGAGC
ATACTCTTCTTTATTGGAATGAGGAACTCAACACCCACTAAGAGGAATCTGAAGAGGACT
CCTAAGCCGAAAGCTGCTTAGTTGGATTGCCACACTCAATATATACCTTCAGTTTTTTTT
TTTTTTTTGG

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2FU25JQ 595 0 0
CCGCATGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGTTGATGGTGGTCCTGCAGCTAAAGAGTTGG
CTCCAAAGCTTCATCTAGCTAAGGCACATCTATCTTCTAGATTAGGTGTAACTTTACCTA
GCATAGAGGCAAAACAAGTCGTTGTTGCTATAGTTGCTTTGAAAGGAGTTGGAGGGTTAC
TCTTTGTTATTGGAAACATCTTCGGTGCTTATCTTCTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTCA
GTCCTATTCTGTATGATTTCTACAACTACGGACCTGAGGAGCGTCATTTCTCTCCATTGT
TGACTGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCACTCTTTGGAGCATACTCTTCTTTATTGGAATGAG
GAACTCAACACCCACTAAGAGGAATCTGAAGAGGACTCCTAAGCCGAAAGCTGCTTAGTT
GGATTGCCACACTCAATATATACCTTCAGTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTGTTCGGACA
AATTCGTTTCTTAACACTTTTGGTTTTCTTTTTGTTGTATGATTCTTGGATTGGCTCATG
ATATCATATTATGATTTGCTAAAACGTGAACCATGCAGCAATGGACTATGATTTC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

CO CL4643Contig1 1394 2 2 U
GTCTGTTGCGGAATCGAGTTTCAACGATCATCTCATCTCGATCGTCTCTTCTTCCTGCTC
CAACCTCCGAAAGCTCTGTTTCTTGGTCAATCCACTTTCTCCGTCTTCCTTGCTTCCTCT
CTCTACTTCCTTGTCTCTCACTTCTCTCTCTCTCAAGTTGCTGGGACCCGTTTCGTTCCA
CTGGGTTGCTTCGTTTCCTTCTCTCAAGGACTTATCAGTCGTGTCTCCTCTAGAAACTCT
TCAGCTTCCTTAACCGGGTCAAACCCAAACCCGGATGTTGTCGAATTGGGTTTGGAGTCG
GTTTCGTTAACCGGAATCCAGTCAGACGATACCGGAGTTAGCTGGTTGTGGAAGAGATGC
AGAAAGCTAAAGAAACTGAGTTTGAAATCATGTGGAACCGTCGGAGAAACAGAGTTTTTC
GGTTTGTGTCTGAAGAATCTTGAGGAAATTGAGCTTAAGACATGTAGGAGTATAGCAGAC
GTGGTTCTGCTGAAAGTTTCAGAGATTTGTGAATCTCTCAACTCTCTGTTAATCTACGAT
GGTGGTAACAAAGACGGTTTGGTTCATTTCATGAACAATGCTAGATGCAATGATACTTTG
AAGACGTTAGATTTGCGTCTACCTATGGATTTGATGGACGAGCATCTCGTCTCTCTCGCT
GCGAATTTCAAATATTTATCTACTCTTAGGCTTACGAGCTGTTACCTCGTGACTGGTCAT
GGTCTAAAGGTCTTAGCTTTAAGCTTTAGTTCGAGTCTTGAAGAGCTTTCTTTGCGTAGC
TGCGACGCGGTTGAGAGGGAAACAGGTTTGTTGGCGACGTTAGGACAGCATTTAGGGAAG
TTATGGAAACTGGAATTGTCGTTTAACGAGTGGTTATACGACAAGGAAGTCGTTTCGATG
TTAGCTTCTTGCGGTGGTTTGGTTGAGTTGGATTTGAGAGGATGCAAGAACTTGACAGGT
TCTGTATTGGTTTCTCTGAACAGAAATTGTGTGAAGTTGAGGAGTTTAGACATTGCAAGT
TGTCGACTGATTCAGGCTGATGAAGTGGAGGTTTTTGTTATGAAGTCACAACGCTTGAAG
AAGATTGTTGTTGAAGAGAACAAGATTACAGAAGCAACCATGAAATGGGCTTCGAGTAAG
TTAATTGACGTTGTTGCTCTTGATTCAGATGGTCCTTGGTAGTTAACTTGGGTTAGTATT
TGAACAAGAAAAGTAACATATGCCACCACACAACAGAACTGTGTATGTGATGTATGTATA
AGGCATAAGTATATATTATTACATGAATAAAGTGGAAACTCAGTGATTTGTTCTTTTCAA
ATAGGTTAGGGGTTTGAATGTACATTTTGTGTAAATTATTGTGTTGAAAATTTGTAAACT
TGTAAGGATTCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG73TF U 1
AF RR2BG73JQ C 543
BS 1 687 RR2BG73TF
BS 688 1394 RR2BG73JQ

RD RR2BG73TF 687 0 0
GTCTGTTGCGGAATCGAGTTTCAACGATCATCTCATCTCGATCGTCTCTTCTTCCTGCTC
CAACCTCCGAAAGCTCTGTTTCTTGGTCAATCCACTTTCTCCGTCTTCCTTGCTTCCTCT
CTCTACTTCCTTGTCTCTCACTTCTCTCTCTCTCAAGTTGCTGGGACCCGTTTCGTTCCA
CTGGGTTGCTTCGTTTCCTTCTCTCAAGGACTTATCAGTCGTGTCTCCTCTAGAAACTCT
TCAGCTTCCTTAACCGGGTCAAACCCAAACCCGGATGTTGTCGAATTGGGTTTGGAGTCG
GTTTCGTTAACCGGAATCCAGTCAGACGATACCGGAGTTAGCTGGTTGTGGAAGAGATGC
AGAAAGCTAAAGAAACTGAGTTTGAAATCATGTGGAACCGTCGGAGAAACAGAGTTTTTC
GGTTTGTGTCTGAAGAATCTTGAGGAAATTGAGCTTAAGACATGTAGGAGTATAGCAGAC
GTGGTTCTGCTGAAAGTTTCAGAGATTTGTGAATCTCTCAACTCTCTGTTAATCTACGAT
GGTGGTAACAAAGACGGTTTGGTTCATTTCATGAACAATGCTAGATGCAATGATACTTTG
AAGACGTTAGATTTGCGTCTACCTATGGATTTGATGGACGAGCATCTCGTCTCTCTCGCT
GCGAATTTCAAATATTTATCTACTCTT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2BG73JQ 852 0 0
TGGTAACAAAGACGGTTTGGTTCATTTCATGAACAATGCTAGATGCAATGATACTTTGAA
GACGTTAGATTTGCGTCTACCTATGGATTTGATGGACGAGCATCTCGTCTCTCTCGCTGC
GAATTTCAAATATTTATCTACTCTTAGGCTTACGAGCTGTTACCTCGTGACTGGTCATGG
TCTAAAGGTCTTAGCTTTAAGCTTTAGTTCGAGTCTTGAAGAGCTTTCTTTGCGTAGCTG
CGACGCGGTTGAGAGGGAAACAGGTTTGTTGGCGACGTTAGGACAGCATTTAGGGAAGTT
ATGGAAACTGGAATTGTCGTTTAACGAGTGGTTATACGACAAGGAAGTCGTTTCGATGTT
AGCTTCTTGCGGTGGTTTGGTTGAGTTGGATTTGAGAGGATGCAAGAACTTGACAGGTTC
TGTATTGGTTTCTCTGAACAGAAATTGTGTGAAGTTGAGGAGTTTAGACATTGCAAGTTG
TCGACTGATTCAGGCTGATGAAGTGGAGGTTTTTGTTATGAAGTCACAACGCTTGAAGAA
GATTGTTGTTGAAGAGAACAAGATTACAGAAGCAACCATGAAATGGGCTTCGAGTAAGTT
AATTGACGTTGTTGCTCTTGATTCAGATGGTCCTTGGTAGTTAACTTGGGTTAGTATTTG
AACAAGAAAAGTAACATATGCCACCACACAACAGAACTGTGTATGTGATGTATGTATAAG
GCATAAGTATATATTATTACATGAATAAAGTGGAAACTCAGTGATTTGTTCTTTTCAAAT
AGGTTAGGGGTTTGAATGTACATTTTGTGTAAATTATTGTGTTGAAAATTTGTAAACTTG
TAAGGATTCTGG

QA 1 852 1 852
DS 



AS 1 2

CO CL4644Contig1 760 2 2 U
GCGCCTGGACCGAGGATGAGCACAGGTTGTTTCTACTTGGTTTGGATAAGTACGGGAAAG
GTGACTGGCGTAGCATTTCTCGCAACTTTGTGGTAACAAGAACACCGACTCAAGTCGCTA
GCCATGCTCAGAAGTACTTCATTCGTCTGAACTCGATGAACAAAGAGAGAAGACGAACGA
GCATTCACGACATCACTAGTGTTGGCGACGCAGATGTCTCAACGCCACAAGGACCGATCA
CCGGTCAGAACAATAACAACAACAACAACAACAACAACGGTTCTGCTTCTGCTGTTGCTG
GAGGAGGAGGAAACAAACCAGCAAAGCAAGCCGCCTCCCAACCACCTCCTACGTACGGAA
CACCCAGCATAGGTCAACCAGTTGTTGGAATACCTGTGAGCCTCCCAGCTCCACCTCACA
TGGCTTTTGCTGCTCCAGTCCCTGGTGCACCAGTGAACATGAGTCAGATGCCGTACACCG
TGCCGCGTACACCAACGGCTCATAGGTAACGTCTGAGAAAATACCTTTTGTGATATGGGT
AGTGCTCTTTAAGTTTTTAGGTGTAAGAAAAATTATGTGTAAAAAGGACTTGAGTGAATA
TTCAAGCTTGTTCCTTTGAGTGGATTTTTTCTGTTACTTTATAGTTTGTGGGGATTTTTT
TTGAATAAGGTGTTTAAGATCATGTGATTAGTTTCAGACTCCAGATTATTCACTAATCAC
AATAAATATAGACAAGATTCTGTTGAATAGATGATTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP37TF U 1
AF RR2BP37JQ C 9
BS 1 664 RR2BP37TF
BS 665 760 RR2BP37JQ

RD RR2BP37TF 664 0 0
GCGCCTGGACCGAGGATGAGCACAGGTTGTTTCTACTTGGTTTGGATAAGTACGGGAAAG
GTGACTGGCGTAGCATTTCTCGCAACTTTGTGGTAACAAGAACACCGACTCAAGTCGCTA
GCCATGCTCAGAAGTACTTCATTCGTCTGAACTCGATGAACAAAGAGAGAAGACGAACGA
GCATTCACGACATCACTAGTGTTGGCGACGCAGATGTCTCAACGCCACAAGGACCGATCA
CCGGTCAGAACAATAACAACAACAACAACAACAACAACGGTTCTGCTTCTGCTGTTGCTG
GAGGAGGAGGAAACAAACCAGCAAAGCAAGCCGCCTCCCAACCACCTCCTACGTACGGAA
CACCCAGCATAGGTCAACCAGTTGTTGGAATACCTGTGAGCCTCCCAGCTCCACCTCACA
TGGCTTTTGCTGCTCCAGTCCCTGGTGCACCAGTGAACATGAGTCAGATGCCGTACACCG
TGCCGCGTACACCAACGGCTCATAGGTAACGTCTGAGAAAATACCTTTTGTGATATGGGT
AGTGCTCTTTAAGTTTTTAGGTGTAAGAAAAATTATGTGTAAAAAGGACTTGAGTGAATA
TTCAAGCTTGTTCCTTTGAGTGGATTTTTTCTGTTACTTTATAGTTTGTGGGGATTTTTT
TTGA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2BP37JQ 752 0 0
ACCGAGGATGAGCACAGGTTGTTTCTACTTGGTTTGGATAAGTACGGGAAAGGTGACTGG
CGTAGCATTTCTCGCAACTTTGTGGTAACAAGAACACCGACTCAAGTCGCTAGCCATGCT
CAGAAGTACTTCATTCGTCTGAACTCGATGAACAAAGAGAGAAGACGAACGAGCATTCAC
GACATCACTAGTGTTGGCGACGCAGATGTCTCAACGCCACAAGGACCGATCACCGGTCAG
AACAATAACAACAACAACAACAACAACAACGGTTCTGCTTCTGCTGTTGCTGGAGGAGGA
GGAAACAAACCAGCAAAGCAAGCCGCCTCCCAACCACCTCCTACGTACGGAACACCCAGC
ATAGGTCAACCAGTTGTTGGAATACCTGTGAGCCTCCCAGCTCCACCTCACATGGCTTTT
GCTGCTCCAGTCCCTGGTGCACCAGTGAACATGAGTCAGATGCCGTACACCGTGCCGCGT
ACACCAACGGCTCATAGGTAACGTCTGAGAAAATACCTTTTGTGATATGGGTAGTGCTCT
TTAAGTTTTTAGGTGTAAGAAAAATTATGTGTAAAAAGGACTTGAGTGAATATTCAAGCT
TGTTCCTTTGAGTGGATTTTTTCTGTTACTTTATAGTTTGTGGGGATTTTTTTTGAATAA
GGTGTTTAAGATCATGTGATTAGTTTCAGACTCCAGATTATTCACTAATCACAATAAATA
TAGACAAGATTCTGTTGAATAGATGATTTGAC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL4645Contig1 824 2 2 U
GGGAAATTCTGTTGAACAAAAAAGAAGCTGCCAAACAGAGGAGCCGAGATCAATAAAGTC
AATCATCTTCTCTTTGCATCAACTCAAAATCAGGGTTTATCATAACACACAATCCCCAGA
AGCTCCCTTACTGTTGAAGCATCTATCAGATTCAATATCTCTGATTCAGACAAACCTCTC
TCTCTCACAAGACCGTAGCTTTCCTCCACTGATTTTCCGACAAAGCTTAAACCTTTATAT
GTTCCGATGAACTCACATCTCTTCCGCGTGATCTGTATACTCCACTCGGTAATCGCACTC
ACGAGCGGAACCCTCATGATGTTCTACGCAGAGAAAGCTTCCATCTTCGGCCACGGCAGC
GACATAGCTAACAAGCTCAAAGGCTCGACCCCTCACGACGAGCTCCTCATCCAGATCTCC
CAGTCCTTCTCCGGTTTGCTTCTCTTCGCGATGGGTCTGGTGCTTTTCATGGTCTCCTTC
GTGAAAGACAGAGACTTTCACAGCTTCTTCGCCGGAGGCTCCGTGATTCTCTACGTGCTG
ATGGCTCTGTGGAGAGTTGTCTTTGAGTGGAAGATTGAAGATCTGGCCTTTGAATGCCCC
AAGCAGGCTCTTGGAGATATTGCTTTGGCTGTCTCTTGGGTTTTCTTCCTTGTTTATACT
TGGAGGGAGAAGTATGATTGATTTGTTTTTTTTTTCTCTTTATGTGGGCTTTGATATATC
AAAGTGGCAAGTGAAAATCTTTAGATCAAAACCATTGTGAAAAAGTTGGATTCTGTAAAT
AAATTTGTTGTGAAACACTTTTGGTCAGAGAAGACCAAACTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX26TF U 1
AF RR2EX26JQ C 131
BS 1 602 RR2EX26TF
BS 603 824 RR2EX26JQ

RD RR2EX26TF 602 0 0
GGGAAATTCTGTTGAACAAAAAAGAAGCTGCCAAACAGAGGAGCCGAGATCAATAAAGTC
AATCATCTTCTCTTTGCATCAACTCAAAATCAGGGTTTATCATAACACACAATCCCCAGA
AGCTCCCTTACTGTTGAAGCATCTATCAGATTCAATATCTCTGATTCAGACAAACCTCTC
TCTCTCACAAGACCGTAGCTTTCCTCCACTGATTTTCCGACAAAGCTTAAACCTTTATAT
GTTCCGATGAACTCACATCTCTTCCGCGTGATCTGTATACTCCACTCGGTAATCGCACTC
ACGAGCGGAACCCTCATGATGTTCTACGCAGAGAAAGCTTCCATCTTCGGCCACGGCAGC
GACATAGCTAACAAGCTCAAAGGCTCGACCCCTCACGACGAGCTCCTCATCCAGATCTCC
CAGTCCTTCTCCGGTTTGCTTCTCTTCGCGATGGGTCTGGTGCTTTTCATGGTCTCCTTC
GTGAAAGACAGAGACTTTCACAGCTTCTTCGCCGGAGGCTCCGTGATTCTCTACGTGCTG
ATGGCTCTGTGGAGAGTTGTCTTTGAGTGGAAGATTGAAGATCTGGCCTTTGAATGCCCC
AA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2EX26JQ 694 0 0
CTGTTGAAGCATCTATCAGATTCAATATCTCTGATTCAGACAAACCTCTCTCTCTCACAA
GACCGTAGCTTTCCTCCACTGATTTTCCGACAAAGCTTAAACCTTTATATGTTCCGATGA
ACTCACATCTCTTCCGCGTGATCTGTATACTCCACTCGGTAATCGCACTCACGAGCGGAA
CCCTCATGATGTTCTACGCAGAGAAAGCTTCCATCTTCGGCCACGGCAGCGACATAGCTA
ACAAGCTCAAAGGCTCGACCCCTCACGACGAGCTCCTCATCCAGATCTCCCAGTCCTTTT
CCGGTTTGCTTCTCTTCGCGATGGGTCTGGTGCTTTTCATGGTCTCCTTCGTGAAAGACA
GAGACTTTCACAGCTTCTTCGCCGGAGGCTCCGTGATTCTCTACGTGCTGATGGCTCTGT
GGAGAGTTGTCTTTGAGTGGAAGATTGAAGATCTGGCCTTTGAATGCCCCAAGCAGGCTC
TTGGAGATATTGCTTTGGCTGTCTCTTGGGTTTTCTTCCTTGTTTATACTTGGAGGGAGA
AGTATGATTGATTTGTTTTTTTTTTCTCTTTATGTGGGCTTTGATATATCAAAGTGGCAA
GTGAAAATCTTTAGATCAAAACCATTGTGAAAAAGTTGGATTCTGTAAATAAATTTGTTG
TGAAACACTTTTGGTCAGAGAAGACCAAACTAGC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL4646Contig1 1054 2 2 U
TAATTTTCCGAGAAAAATTCATTTATTTGGGAGAATTCGAATTTTATATGAATTATAGTT
TCTGGGTTCGGCGATTGAAGTGATGAGCAACCTTAGAGCTATCTGTAGACCACACACGGT
GTTTGCTTCGATCGTGTGTTGTAGTAGAAACCAATCTCGATCAATCGTTAAGGTTTCGAT
TCAAAAACTCAGATTTAGAACCCGGGTCTCTAATTCGTTTCCGTCTTCGTCACGGGCCAC
GTCTAAAGATTCGAACTTTTGGTTTGGTGTGAGTCAGAGTCAGAGGAAGACTCTCGTCAG
GGCAGCTTCGAATTGGAGCGAAGAGAAGTCTCCTTACGATACTCTCGAGCTGGAACGAGA
TGCAGAGGAAGAGCAGATTAAGGTGGCATACAGACGATTAGCCAAGTATTATCATCCTGA
TGTTTACGATGGGAAAGGGACGCTTGAAGAAGGAGAGACAGCAGAAGGTAGATTCATCAA
GATTCAGGCTGCATACGAACTGCTCATGGACACGGAGAAGAGAAGTGAGTATGATATGGA
TAACCGAGTGAATCCAATGAAGGCATCACAAGCTTGGATGGAATGGCTGATGAAAAAGCG
TAAAGCATTTGATCAGAGAGGCGACATGGCTATTGCAGCTTGGGCTGAGCAACAACAGCT
TGAGATTAACCTGCGTGCTCGTCGTCTTTCTCGTTCCAAGGTGGATCCGGAAGAAGAGAG
GAAGATACTGGAGAAAGAGAAGAAAGCATCGAGAGAGTTGTTTAACAGTACTCTGAAGAG
ACACTCGCTGGTATTGAAGAAAAGAGATTTGATGCGAAAGAAGGCAGAGGAGGATAAGAA
GAAGCTCATTACTCAGTTGTTAGCAGCAGAAGGTCTCGAGCTTGATACTGAAGAAGAAGA
AGAGGAAGAAACAGCCAAGTGATCATTTTGGAAAGCTTTACTTCTCTTATATCTACTCCA
AGTATAGTACTCTATGTTTTTCTGTTTCAACTTCTAGTACATGTAGAAACATACATGTAG
ATATTAAATTTTATAATTACCAGAATTTCAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI82TF U 1
AF RR2GI82JQB C 224
BS 1 700 RR2GI82TF
BS 701 1054 RR2GI82JQB

RD RR2GI82TF 704 0 0
TAATTTTCCGAGAAAAATTCATTTATTTGGGAGAATTCGAATTTTATATGAATTATAGTT
TCTGGGTTCGGCGATTGAAGTGATGAGCAACCTTAGAGCTATCTGTAGACCACACACGGT
GTTTGCTTCGATCGTGTGTTGTAGTAGAAACCAATCTCGATCAATCGTTAAGGTTTCGAT
TCAAAAACTCAGATTTAGAACCCGGGTCTCTAATTCGTTTCCGTCTTCGTCACGGGCCAC
GTCTAAAGATTCGAACTTTTGGTTTGGTGTGAGTCAGAGTCAGAGGAAGACTCTCGTCAG
GGCAGCTTCGAATTGGAGCGAAGAGAAGTCTCCTTACGATACTCTCGAGCTGGAACGAGA
TGCAGAGGAAGAGCAGATTAAGGTGGCATACAGACGATTAGCCAAGTATTATCATCCTGA
TGTTTACGATGGGAAAGGGACGCTTGAAGAAGGAGAGACAGCAGAAGGTAGATTCATCAA
GATTCAGGCTGCATACGAACTGCTCATGGACACGGAGAAGAGAAGTGAGTATGATATGGA
TAACCGAGTGAATCCAATGAAGGCATCACAAGCTTGGATGGAATGGCTGATGAAAAAGCG
TAAAGCATTTGATCAGAGAGGCGACATGGCTATTGCAGCTTGGGCTGAGCAACAACAGCT
TGAGATTAACCTGCGTGCTCGTCGTCTTTCTCGTTCCAAG
TGGA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2GI82JQB 831 0 0
TCTTCGTCACGGGCCACGTCTAAAGAT*CGAACTTTTGGTTTG*TGTGAGTCAGAGTCAG
AGGAAGACTCTCGTCAGGGCAGCTTCGAATTGGAGCGAAGAGAAGTCTCCTTACGATACT
CTCGAGCTGGAACGAGATGCAGAGGAAGAGCAGATTAAGGTGGCATACAGACGATTAGCC
AAGTATTATCATCCTGATGTTTACGATGGGAAAGGGACGCTTGAAGAAGGAGAGACAGCA
GAAGGTAGATTCATCAAGATTCAGGCTGCATACGAACTGCTCATGGACACGGAGAAGAGA
AGTGAGTATGATATGGATAACCGAGTGAATCCAATGAAGGCATCACAAGCTTGGATGGAA
TGGCTGATGAAAAAGCGTAAAGCATTTGATCAGAGAGGCGACATGGCTATTGCAGCTTGG
GCTGAGCAACAACAGCTTGAGATTAACCTGCGTGCTCGTCGTCTTTCTCGTTCCAAGGTG
GATCCGGAAGAAGAGAGGAAGATACTGGAGAAAGAGAAGAAAGCATCGAGAGAGTTGTTT
AACAGTACTCTGAAGAGACACTCGCTGGTATTGAAGAAAAGAGATTTGATGCGAAAGAAG
GCAGAGGAGGATAAGAAGAAGCTCATTACTCAGTTGTTAGCAGCAGAAGGTCTCGAGCTT
GATACTGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAACAGCCAAGTGATCATTTTGGAAAGCTTTACTT
CTCTTATATCTACTCCAAGTATAGTACTCTATGTTTTTCTGTTTCAACTTCTAGTACATG
TAGAAACATACATGTAGATATTAAATTTTATAATTACCAGAATTTCAATTT

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 2

CO CL4647Contig1 468 2 1 U
GCAACAGCATTGCTACTGAGTGGAGTGATGATGTTACGGCACCTGAAGCTGAACGAACAA
GCAGAACAGATCCACCGTGCAATAATCAACACCATAGCGGAGGGAAAATACAGAACAGCA
GATCTTGGAGGGACATCGACCACAACGGAATTCACAAAGGCAATCTGTGACCATCTCTGA
ACAATCGTAAAAAATACTCAAAATTCTTTACCGAATCTTTCCTTTCTCGGATTAAGATTA
GAATAAAAAAGGCATTGGCTGATGAAGTTTATATAACATTTGGAAGTTCATTGTTTCTGC
CTCCAACACGGTGTTTTTAACACAGGAAAAGGATGATGATTTTCTGACAAGAGTTTTGTT
TTCTTGCTTGAATTATTTACAAACTCCCTCTCTTTGTTTGTTGTTATTCCAAACATTTGG
AGAACGAATATATGGCGAAATATTTATTTTCGTAATATTGTTTACCTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FY81TF U 1
AF RR2GJ44TF U 1
BS 1 468 RR2FY81TF

RD RR2FY81TF 468 0 0
GCAACAGCATTGCTACTGAGTGGAGTGATGATGTTACGGCACCTGAAGCTGAACGAACAA
GCAGAACAGATCCACCGTGCAATAATCAACACCATAGCGGAGGGAAAATACAGAACAGCA
GATCTTGGAGGGACATCGACCACAACGGAATTCACAAAGGCAATCTGTGACCATCTCTGA
ACAATCGTAAAAAATACTCAAAATTCTTTACCGAATCTTTCCTTTCTCGGATTAAGATTA
GAATAAAAAAGGCATTGGCTGATGAAGTTTATATAACATTTGGAAGTTCATTGTTTCTGC
CTCCAACACGGTGTTTTTAACACAGGAAAAGGATGATGATTTTCTGACAAGAGTTTTGTT
TTCTTGCTTGAATTATTTACAAACTCCCTCTCTTTGTTTGTTGTTATTCCAAACATTTGG
AGAACGAATATATGGCGAAATATTTATTTTCGTAATATTGTTTACCTG

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR2GJ44TF 468 0 0
GCAACAGCATTGCTACTGAGTGGAGTGATGATGTTACGGCACCTGAAGCTGAACGAACAA
GCAGAACAGATCCACCGTGCAATAATCAACACCATAGCGGAGGGAAAATACAGAACAGCA
GATCTTGGAGGGACATCGACCACAACGGAATTCACAAAGGCAATCTGTGACCATCTCTGA
ACAATCGTAAAAAATACTCAAAATTCTTTACCGAATCTTTCCTTTCTCGGATTAAGATTA
GAATAAAAAAGGCATTGGCTGATGAAGTTTATATAACATTTGGAAGTTCATTGTTTCTGC
CTCCAACACGGTGTTTTTAACACAGGAAAAGGATGATGATTTTCTGACAAGAGTTTTGTT
TTCTTGCTTGAATTATTTACAAACTCCCTCTCTTTGTTTGTTGTTATTCCAAACATTTGG
AGAACGAATATATGGCGAAATATTTATTTTCGTAATATTGTTTACCTG

QA 1 468 1 468
DS 



AS 1 2

CO CL4648Contig1 1054 2 8 U
GGAGACAGAGATAAACCCTAACTCTCAAACAGAGCGGTTCTCGAACCAAAAGTACGACAT
TACCGCCGTATTAACTCGGAATCTCTTCAGCCACCGTTCGATTGCTTCGTCTCCACCGAG
ATAATACTAATGGCTGAAGAAGAAGCTAAGGCAGTGGCTGTGGAAGAACCTAAGGTGATG
GCTGTAGAAGAAGCTAATAAGGGATTGGACTACATACCGGAGGTTATACTTAAGAAGAGG
AAGAACAGGGATGAGCTTGCCTTTATCAGGAAGAAGCAACTTGAGTTGGGCAATTTCGGT
AAGAAGAAGAAGAAGAAAGTTGCTGATATCAAACGACCTGAAGACTTTGTGCTTGAGTTC
AGGGCTAAGGAAATAGATCTTATCCGGATGAAGCAAAGGGTAAAGAGGCCAAGAGCATCT
CCTCCACCAGTAAAATCAAACCTCGTTTTCATCATACGCATACAAGGCAAGAATGATATG
CACCCAAAGACCAAGAAGGTCCTCAACAGTATGCAACTGAGGAGCACTTTCACTGGTGTA
TTTGCCAAAGCAACTGATGGTTTGTTTCAAAAGCTTCTCAAAGTGCAGCCTTACGTCACT
TATGGGTACCCGAATGGTAAGAGCGTTAAGGATCTTATTTTCAAAAAGGGATACACAATA
ATAGAAAGCAATCCTGTTCCTCTTACCGACAACAACATAATCGAACAGGCTCTAGGAGAA
CATGGTATCTTCTGCATAGAAGACATTGTGAATGAGATAGCAAGAGTTGGTGATCATTTC
AGAGAGGTCATGAGATTCTTGGGACCCTTGAAACTCAACAAGCCAGAGGCTGGTGTCTTG
CACGGGAAGAAACAAGTTTTCAGCGATGGAGGAGATACTGGAAACCGTGAAGACAAGATC
AATGATCTCATCATCAAAATGAATTAGAAGCAGCCAGCAGAAGTCTACTTTACTATATTT
TCCTTAAAAAGAAATCTGTATGAGGCTAAACGCAAACCACTTGGAAAAAACGCTATTGCA
ATTTTGATTGTTTTTATTTACTTCATGATAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT88TF U 1
AF RR2FT88JQ C 274
BS 1 708 RR2FT88TF
BS 709 709 RR2FT88JQ
BS 710 715 RR2FT88TF
BS 716 716 RR2FT88JQ
BS 717 751 RR2FT88TF
BS 752 752 RR2FT88JQ
BS 753 767 RR2FT88TF
BS 768 1054 RR2FT88JQ

RD RR2FT88TF 767 0 0
GGAGACAGAGATAAACCCTAACTCTCAAACAGAGCGGTTCTCGAACCAAAAGTACGACAT
TACCGCCGTATTAACTCGGAATCTCTTCAGCCACCGTTCGATTGCTTCGTCTCCACCGAG
ATAATACTAATGGCTGAAGAAGAAGCTAAGGCAGTGGCTGTGGAAGAACCTAAGGTGATG
GCTGTAGAAGAAGCTAATAAGGGATTGGACTACATACCGGAGGTTATACTTAAGAAGAGG
AAGAACAGGGATGAGCTTGCCTTTATCAGGAAGAAGCAACTTGAGTTGGGCAATTTCGGT
AAGAAGAAGAAGAAGAAAGTTGCTGATATCAAACGACCTGAAGACTTTGTGCTTGAGTTC
AGGGCTAAGGAAATAGATCTTATCCGGATGAAGCAAAGGGTAAAGAGGCCAAGAGCATCT
CCTCCACCAGTAAAATCAAACCTCGTTTTCATCATACGCATACAAGGCAAGAATGATATG
CACCCAAAGACCAAGAAGGTCCTCAACAGTATGCAACTGAGGAGCACTTTCACTGGTGTA
TTTGCCAAAGCAACTGATGGTTTGTTTCAAAAGCTTCTCAAAGTGCAGCCTTACGTCACT
TATGGGTACCCGAATGGTAAGAGCGTTAAGGATCTTATTTTCAAAAAGGGATACACAATA
ATAGAAAGCAATCCTGTTCCTCTTACCGACAACAACATAATCGAACAG*CTCTAG*AGAA
CATGGTATCTTCTGCATAGAAGACATTGTGA*TGAGATAGCAAGAGT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2FT88JQ 781 0 0
AAGCAACTTGAGTTGGGCAATTTCGGTAAGAAGAAGAAGAAGAAAGTTGCTGATATCAAA
CGACC*GAAGACTTTGTGCTTGAGTTCAGGGCTAAGGAAATAGATCTTATCCGGATGAAG
CAAAGGGTAAAGAGGCCAAGAGCATCTCCTCCACCAGTAAAATCAAACCTCGTTTTCATC
ATACGCATACAAGGCAAGAATGATATGCACCCAAAGACCAAGAAGGTCCTCAACAGTATG
CAACTGAGGAGCACTTTCACTGGTGTATTTGCCAAAGCAACTGATGGTTTGTTTCAAAAG
CTTCTCAAAGTGCAGCCTTACGTCACTTATGGGTACCCGAATGGTAAGAGCGTTAAGGAT
CTTATTTTCAAAAAGGGATACACAATAATAGAAGGCAATCCTGTTCCTCTTACCGACAAC
AACATAATCGAACAGGCTCTAGGAGAACATGGTATTTTCTGCATAGAAGACATTGTGAAT
GAGATAGCAAGAGTTGGTGATCATTTCAGAGAGGTCATGAGATTCTTGGGACCCTTGAAA
CTCAACAAGCCAGAGGCTGGTGTCTTGCACGGGAAGAAACAAGTTTTCAGCGATGGAGGA
GATACTGGAAACCGTGAAGACAAGATCAATGATCTCATCATCAAAATGAATTAGAAGCAG
CCAGCAGAAGTCTACTTTACTATATTTTCCTTAAAAAGAAATCTGTATGAGGCTAAACGC
AAACCACTTGGAAAAAACGCTATTGCAATTTTGATTGTTTTTATTTACTTCATGATAATT
T

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL4649Contig1 949 2 2 U
GGACAGATGGGTATTCTCAGATTATCTATGTCTCAATAGCATCTTAGAAGAAGCTCGTCT
TGTGCTTCAGTGGCGTTTATGATGCTGACGCGACAGGATATATTCATTGCCTAGATTGCT
AAAGCTTTTAGGGAAAAAGAGAGAAGCTTTGTGCCTTTGTCTTAAAAAAATGGCTGTTTG
GTCACCATCAGCTCGGATAGGATCTTGTTGTCTTCTTAACAAAGACATCACTGAAACAAC
ATGGAGGTTTCCTTCCGCCTGTTTTCCAACGTGTAAGAACAAGACTAAACGCGGATCTGA
GACCCTGAGAGTTACAAGTGCGTTGCAAAGTTATCATCATCGGTTGAGTAAGATTCGTGC
TTCAAAAACTTCCACCGAGCTGAAAGAAGAGGTATTATCTACGAGAAGCGCTCAGGTCGA
TGACCTAAAGAAGAAGGTAACAACAACATCCTATTCGTTCAGGACCAAGTCTGGTGCTCT
TGTTAAAGTTAAAGTCGAAAAGAAAAGGGAGGAAAAGTACAGTATCATGGTTTATGTCTC
ATCATTGGAACTGAGTAGTAGTAGTCTGGTGATGGTTTGGGGTTGAGCCAACCGAGCCAA
AGAACAATGACCTCTTCATTGGATTCAATGCAAGTGATCAACCTGAGAATGTTATATTGC
CTTCACTTCCTGATGGAAGGGAATGGAGGCGGTTGGTGGACACAGCTCTTCCTTTCCCAG
GGTTTTTCTCTGTTGAAGGAGAGACTGTTGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAAGAGATGAATC
AACCAGTGATGTATGAGATGAAGCCGTACAGTTGCACCCTTTTTGAAACAACCATCAATG
CTACTACTACTGGTTAGAAACTCAAATTATGATCTTTGTATATGTTAAAAAGATTGTGTT
GTAATGTTTGAGATAAGAATATTTAATCAAATCAATTACTTTCCACAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B192TF U 1
AF RR2B192JQ C 116
BS 1 572 RR2B192TF
BS 573 949 RR2B192JQ

RD RR2B192TF 572 0 0
GGACAGATGGGTATTCTCAGATTATCTATGTCTCAATAGCATCTTAGAAGAAGCTCGTCT
TGTGCTTCAGTGGCGTTTATGATGCTGACGCGACAGGATATATTCATTGCCTAGATTGCT
AAAGCTTTTAGGGAAAAAGAGAGAAGCTTTGTGCCTTTGTCTTAAAAAAATGGCTGTTTG
GTCACCATCAGCTCGGATAGGATCTTGTTGTCTTCTTAACAAAGACATCACTGAAACAAC
ATGGAGGTTTCCTTCCGCCTGTTTTCCAACGTGTAAGAACAAGACTAAACGCGGATCTGA
GACCCTGAGAGTTACAAGTGCGTTGCAAAGTTATCATCATCGGTTGAGTAAGATTCGTGC
TTCAAAAACTTCCACCGAGCTGAAAGAAGAGGTATTATCTACGAGAAGCGCTCAGGTCGA
TGACCTAAAGAAGAAGGTAACAACAACATCCTATTCGTTCAGGACCAAGTCTGGTGCTCT
TGTTAAAGTTAAAGTCGAAAAGAAAAGGGAGGAAAAGTACAGTATCATGGTTTATGTCTC
ATCATTGGAACTGAGTAGTAGTAGTCTGGTGA

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2B192JQ 834 0 0
TTGCTAAAGCTTTTAGGGAAAAAGAGAGAAGCTTTGTGCCTTTGTCTTAAAAAAATGGCT
GTTTGGTCACCATCAGCTCGGATAGGATCTTGTTGTCTTCTTAACAAAGACATCACTGAA
ACAACATGGAGGTTTCCTTCCGCCTGTTTTCCAACGTGTAAGAACAAGACTAAACGCGGA
TCTGAGACCCTGAGAGTTACAAGTGCGTTGCAAAGTTATCATCATCGGTTGAGTAAGATT
CGTGCTTCAAAAACTTCCACCGAGCTGAAAGAAGAGGTATTATCTACGAGAAGCGCTCAG
GTCGATGACCTAAAGAAGAAGGTAACAACAACATCCTATTCGTTCAGGACCAAGTCTGGT
GCTCTTGTTAAAGTTAAAGTCGAAAAGAAAAGGGAGGAAAAGTACAGTATCATGGTTTAT
GTCTCATCATTGGAACTGAGTAGTAGTAGTCTGGTGATGGTTTGGGGTTGAGCCAACCGA
GCCAAAGAACAATGACCTCTTCATTGGATTCAATGCAAGTGATCAACCTGAGAATGTTAT
ATTGCCTTCACTTCCTGATGGAAGGGAATGGAGGCGGTTGGTGGACACAGCTCTTCCTTT
CCCAGGGTTTTTCTCTGTTGAAGGAGAGACTGTTGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAT
GAATCAACCAGTGATGTATGAGATGAAGCCGTACAGTTGCACCCTTTTTGAAACAACCAT
CAATGCTACTACTACTGGTTAGAAACTCAAATTATGATCTTTGTATATGTTAAAAAGATT
GTGTTGTAATGTTTGAGATAAGAATATTTAATCAAATCAATTACTTTCCACAAT

QA 1 834 1 834
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4651Contig1 625 2 2 U
TTTTTTTCTTTGATCAACGATCTAAATTGTATATTTATCTGAGTTCCAAACACGATATAT
ATAGTGGAGTGGTTTTTTTGAGAAAAATATAGTGGAGTGGTTGAGAAAAGAAAACTCTCG
TACAAGCTTGTGGATCAAGCAAACTACGTTGCCACATACTCACAGTAATAATTAATTTCA
ATGCATCTTATTTAAAATGATTAGGTCTTCATTTCAGGTATTCATCACCCAGTGGAAGAC
AAAAATTCATATTTCTTAGTATATCAGAGAAATAATTATCTAGCGAGTTATTACGAATAT
TCCATGTAACAAAAGTGTATATGTATATCTATATTTCTACTATTGCTGCTAAACATTTTC
TTTTCGAATCTCCTTCACAAAATTAGCATTCTTAAAATAGGGTTGAATGTATTTTGATCA
AGTGTTTCGCAGCATGATAAGCTTATTACAAAAATATAAAACTAATGGAATTTTGGGTGG
TTGCTTTGTAACAGACAAGAACGTTCTTATAGATAGTACTATACAACTTTTAAGATTGGA
CTGATCTAAATTATCTCCTAGCAAAATATAATTTTGCCTTTAGTATCGTATGTACATTTT
GAACTTACAAACCATGGATCATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY12TF U 1
AF RR2DY12JQ C 92
BS 1 559 RR2DY12TF
BS 560 625 RR2DY12JQ

RD RR2DY12TF 559 0 0
TTTTTTTCTTTGATCAACGATCTAAATTGTATATTTATCTGAGTTCCAAACACGATATAT
ATAGTGGAGTGGTTTTTTTGAGAAAAATATAGTGGAGTGGTTGAGAAAAGAAAACTCTCG
TACAAGCTTGTGGATCAAGCAAACTACGTTGCCACATACTCACAGTAATAATTAATTTCA
ATGCATCTTATTTAAAATGATTAGGTCTTCATTTCAGGTATTCATCACCCAGTGGAAGAC
AAAAATTCATATTTCTTAGTATATCAGAGAAATAATTATCTAGCGAGTTATTACGAATAT
TCCATGTAACAAAAGTGTATATGTATATCTATATTTCTACTATTGCTGCTAAACATTTTC
TTTTCGAATCTCCTTCACAAAATTAGCATTCTTAAAATAGGGTTGAATGTATTTTGATCA
AGTGTTTCGCAGCATGATAAGCTTATTACAAAAATATAAAACTAATGGAATTTTGGGTGG
TTGCTTTGTAACAGACAAGAACGTTCTTATAGATAGTACTATACAACTTTTAAGATTGGA
CTGATCTAAATTATCTCCT

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2DY12JQ 534 0 0
GTGGAGTGGTTGAGAAAAGAAAACTCTCGTACAAGCTTGTGGATCAAGCAAACTACGTTG
CCACATACTCACAGTAATAATTAATTTCAATGCATCTTATTTAAAATGATTAGGTCTTCA
TTTCAGGTATTCATCACCCAGTGGAAGACAAAAATTCATATTTCTTAGTATATCAGAGAA
ATAATTATCTAGCGAGTTATTACGAATATTCCATGTAACAAAAGTGTATATGTATATCTA
TATTTCTACTATTGCTGCTAAACATTTTCTTTTCGAATCTCCTTCACAAAATTAGCATTC
TTAAAATAGGGTTGAATGTATTTTGATCAAGTGTTTCGCAGCATGATAAGCTTATTACAA
AAATATAAAACTAATGGAATTTTGGGTGGTTGCTTTGTAACAGACAAGAACGTTCTTATA
GATAGTACTATACAACTTTTAAGATTGGACTGATCTAAATTATCTCCTAGCAAAATATAA
TTTTGCCTTTAGTATCGTATGTACATTTTGAACTTACAAACCATGGATCATTCC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 2

CO CL4652Contig1 1002 2 2 U
GGGCGACACACACACAAGAACACAACTATGGAGCTCGTCACAACTCTGGCCAGCTGGTTA
ACGCCGACGACTCTCTTCCTCCTCCTCAATTTCACCATCGGCACCATTTTCTTCACCAAC
AAGTTCGGTCCCTGTTCCAAGAAACACCAACCGTATCAAGATGGTTTCGGTTCAGGTCAT
AACCATTCTCAGGCGCGGTTAGCCAGACCTCCCTCGTTCGTGGACAGAGTCAAGTCCATC
AACTTCAGTCTCTACAACTCTCCTTCCCATGAATCCGAGATCCACTTCCACGGGTCGGAT
TCTAACCCGAACCCGCCTCTCTCTCTCCTGCAACGGGTCAAATCCTTCAACATGCCTTCC
TTCAAGTTCCCGCAACACAATTCCGAGGGAGACTACGCTGCTTACGCACTCACGACCCCA
CCCGAAGATACGAACCGGGTCGACCCGACCGACAAGAACCCGGAAGATAACGTTAACGTA
CCGACACAACCTAGACCCGGAGGTCCATCTCTCTTGCAGCGGGTGAAATCCATCAAGCTC
CCTTCATTGTACAGATCAGAGCCAGAACAGAGCTCCGAAGAGAAAGCGCCGGAGAGGACG
AAGTCGGAGTCGAGTAAGCCGGCGACGAAGAGTAAGAAGAAGAAGAAGGCGGTGAAGAAG
ATGACGAGATCCGCTAGCGAGAAAGTCGGCGTCGGGTGCATTGGCCGGGAGGAGGAGACG
GTTGAGGCAGTGGAGAAGAGGCGCCCGGAGACGACGAGAGTCGAGAGGACGACGTCGATC
GATGAAGGAGAAGAAGGTGTCGACGACAAAGCTTCCGACTTCATCAACAAGTTTAAGCAG
CAGCTGAAACTACAGAGGCTAGATTCGTTTCTCAGGTACAGGGAGATGCTCAAGAACAAT
TGAACTTTAAAATTTACGGTTTTACCCTCTTGTCGGAATGGAGTTTCTTGTGGGGTCTAC
TTGGTTAAAAACGGAACACCCTTGTCTGAAGGGCTTTTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F746TF U 1
AF RR2F746JQ C 223
BS 1 693 RR2F746TF
BS 694 1002 RR2F746JQ

RD RR2F746TF 693 0 0
GGGCGACACACACACAAGAACACAACTATGGAGCTCGTCACAACTCTGGCCAGCTGGTTA
ACGCCGACGACTCTCTTCCTCCTCCTCAATTTCACCATCGGCACCATTTTCTTCACCAAC
AAGTTCGGTCCCTGTTCCAAGAAACACCAACCGTATCAAGATGGTTTCGGTTCAGGTCAT
AACCATTCTCAGGCGCGGTTAGCCAGACCTCCCTCGTTCGTGGACAGAGTCAAGTCCATC
AACTTCAGTCTCTACAACTCTCCTTCCCATGAATCCGAGATCCACTTCCACGGGTCGGAT
TCTAACCCGAACCCGCCTCTCTCTCTCCTGCAACGGGTCAAATCCTTCAACATGCCTTCC
TTCAAGTTCCCGCAACACAATTCCGAGGGAGACTACGCTGCTTACGCACTCACGACCCCA
CCCGAAGATACGAACCGGGTCGACCCGACCGACAAGAACCCGGAAGATAACGTTAACGTA
CCGACACAACCTAGACCCGGAGGTCCATCTCTCTTGCAGCGGGTGAAATCCATCAAGCTC
CCTTCATTGTACAGATCAGAGCCAGAACAGAGCTCCGAAGAGAAAGCGCCGGAGAGGACG
AAGTCGGAGTCGAGTAAGCCGGCGACGAAGAGTAAGAAGAAGAAGAAGGCGGTGAAGAAG
ATGACGAGATCCGCTAGCGAGAAAGTCGGCGTC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2F746JQ 780 0 0
GACAGAGTCAAGTCCATCAACTTCAGTCTCTACAACTCTCCTTCCCATGAATCCGAGATC
CACTTCCACGGGTCGGATTCTAACCCGAACCCGCCTCTCTCTCTCCTGCAACGGGTCAAA
TCCTTCAACATGCCTTCCTTCAAGTTCCCGCAACACAATTCCGAGGGAGACTACGCTGCT
TACGCACTCACGACCCCACCCGAAGATACGAACCGGGTCGACCCGACCGACAAGAACCCG
GAAGATAACGTTAACGTACCGACACAACCTAGACCCGGAGGTCCATCTCTCTTGCAGCGG
GTGAAATCCATCAAGCTCCCTTCATTGTACAGATCAGAGCCAGAACAGAGCTCCGAAGAG
AAAGCGCCGGAGAGGACGAAGTCGGAGTCGAGTAAGCCGGCGACGAAGAGTAAGAAGAAG
AAGAAGGCGGTGAAGAAGATGACGAGATCCGCTAGCGAGAAAGTCGGCGTCGGGTGCATT
GGCCGGGAGGAGGAGACGGTTGAGGCAGTGGAGAAGAGGCGCCCGGAGACGACGAGAGTC
GAGAGGACGACGTCGATCGATGAAGGAGAAGAAGGTGTCGACGACAAAGCTTCCGACTTC
ATCAACAAGTTTAAGCAGCAGCTGAAACTACAGAGGCTAGATTCGTTTCTCAGGTACAGG
GAGATGCTCAAGAACAATTGAACTTTAAAATTTACGGTTTTACCCTCTTGTCGGAATGGA
GTTTCTTGTGGGGTCTACTTGGTTAAAAACGGAACACCCTTGTCTGAAGGGCTTTTGGTC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4654Contig1 526 2 2 U
TTTTTGAAGGAAACGTTTACATCAGGAAGGAGAAGAGATATGTCTCAGACTGTGGTTCTA
AAGGTGGCTATGCCATGTGAGGGATGCGTGGGAGCTGTGAAAAGAGTCTTAGGCAAAATG
CAAGGTGTGGAGTCATTTGATGTGGATCTGAAAGAGCAGAAGGTAACGGTGAAAGGCAAC
GTGGAGCCAGAAGCTGTCCTGCAGACAGTCTCAAAGACAGGAAAGAAAACCAGTTTCTGG
GGAGCCGAGGACGCTGAAACCGCCAAGGCCTGAATTGAAAGAAGCAATAAAGCATCTAAA
ATGTCATAACTCTGTTTTAGCAGAGTTTGCTACTAATAAAATATCTTTATGTAACGAGTA
ACTCAATAAAAATCGTATCTTTGAAAAACACTTTTCTTTTTCTAAAGAAGAAACGTTGTG
TCTAGTATTTCATCATCTCAAAGCTATCTTCTGTAGTTCCCTTGCCTTAATCTTGGTAGT
GTGTGTTTATTTCGCGGTAATGAAATCCAATCGTCTATCATCACAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF26JQ C 1
AF RR2DF26TF U 1
BS 1 496 RR2DF26TF
BS 497 526 RR2DF26JQ

RD RR2DF26JQ 526 0 0
TTTTTGAAGGAAACGTTTACATCAGGAAGGAGAAGAGATATGTCTCAGACTGTGGTTCTA
AAGGTGGCTATGCCATGTGAGGGATGCGTGGGAGCTGTGAAAAGAGTTTTAGGCAAAATG
CAAGGTGTGGAGTCATTTGATGTGGATCTGAAAGAGCAGAAGGTAACGGTGAAAGGCAAC
GTGGAGCCAGAAGCTGTCCTGCAGACAGTTTCAAAGACAGGAAAGAAAACCAGTTTTTGG
GGAGCCGAGGACGCTGAAACCGCCAAGGCCTGAATTGAAAGAAGCAATAAAGCATTTAAA
ATGTCATAACTCTGTTTTAGCAGAGTTTGCTACTAATAAAATATCTTTATGTAACGAGTA
ACTCAATAAAAATCGTATCTTTGAAAAACACTTTTCTTTTTTTAAAGAAGAAACGTTGTG
TTTAGTATTTCATCATCTCAAAGCTATCTTCTGTAGTTCCCTTGCCTTAATCTTGGTAGT
GTGTGTTTATTTCGCGGTAATGAAATCCAATCGTCTATCATCACAT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2DF26TF 496 0 0
TTTTTGAAGGAAACGTTTACATCAGGAAGGAGAAGAGATATGTCTCAGACTGTGGTTCTA
AAGGTGGCTATGCCATGTGAGGGATGCGTGGGAGCTGTGAAAAGAGTCTTAGGCAAAATG
CAAGGTGTGGAGTCATTTGATGTGGATCTGAAAGAGCAGAAGGTAACGGTGAAAGGCAAC
GTGGAGCCAGAAGCTGTCCTGCAGACAGTCTCAAAGACAGGAAAGAAAACCAGTTTCTGG
GGAGCCGAGGACGCTGAAACCGCCAAGGCCTGAATTGAAAGAAGCAATAAAGCATCTAAA
ATGTCATAACTCTGTTTTAGCAGAGTTTGCTACTAATAAAATATCTTTATGTAACGAGTA
ACTCAATAAAAATCGTATCTTTGAAAAACACTTTTCTTTTTCTAAAGAAGAAACGTTGTG
TCTAGTATTTCATCATCTCAAAGCTATCTTCTGTAGTTCCCTTGCCTTAATCTTGGTAGT
GTGTGTTTATTTCGCG

QA 1 496 1 496
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4656Contig1 806 2 2 U
GGGGGAAAGTTATTAACCCTAGTTTTGATTTGTCTTCTTCAGTTCAAGTGAACCCAGAGC
AAATCAAAGTGAATCAAATTCGTCCATCGATTGAATATCCTTATTGTACCAGATTCAAGC
TCTGCTATGCGTTGATGTAGCAAGACCAAAAGAAAAATGGTTCGTCGTCTCTCATCGTGC
TTCTTCGTCGTGGTTCTGGTTCTGGTTCTACTTTCGATTCGAGAAACTTCTTCACAGTTA
GGTTCTGGTCCTCACATTACCGATGTCAATATACTATTGCCTCCGAGGATGAAGAACCCA
GTAGAGTATCGCCTCCAAGGAAGTGATGGCTGCTTCAAATGGTCATGGGATCATCATGAT
ATTCTCTCGGTTACTCCCGAGTTTAATTCGAGCAGCCATTGCTCCACCAGCGCGCGTCTG
AGATCTATTTCACCTTACAGTGGGAGGAAGGAGACTGCAGTTTACGCCACTGATATACAG
ACGGGGATGGTGATTCGCTGCAAGGTGTTTATTGACAACTTCTCACGCATTCAGATCTTT
CATAACTCTATCAAGCTTGATCTTGATGGACTTTCCATGCTTCGAGTCCGCGCTTTTGAT
AATGAAGAAAATGAGTTCTCCTCGCTGGTGGGTCTACAATTCATGTGGAAGCTGATGCCT
GAAAGTGGTGGAACAACGCATCATCTTGCTCATGTGCCTTTGAAGGAATCTCCATTGACT
GACTGCGGGGGACTGTGTGGCTACTTGGATATCCAGAAAAAGCTTGAAGATAGTGGGGTA
TTTGCAGATTTGTTTGTAGTCAAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL82TF U 1
AF RR2BL82JQ C 126
BS 1 600 RR2BL82TF
BS 601 806 RR2BL82JQ

RD RR2BL82TF 600 0 0
GGGGGAAAGTTATTAACCCTAGTTTTGATTTGTCTTCTTCAGTTCAAGTGAACCCAGAGC
AAATCAAAGTGAATCAAATTCGTCCATCGATTGAATATCCTTATTGTACCAGATTCAAGC
TCTGCTATGCGTTGATGTAGCAAGACCAAAAGAAAAATGGTTCGTCGTCTCTCATCGTGC
TTCTTCGTCGTGGTTCTGGTTCTGGTTCTACTTTCGATTCGAGAAACTTCTTCACAGTTA
GGTTCTGGTCCTCACATTACCGATGTCAATATACTATTGCCTCCGAGGATGAAGAACCCA
GTAGAGTATCGCCTCCAAGGAAGTGATGGCTGCTTCAAATGGTCATGGGATCATCATGAT
ATTCTCTCGGTTACTCCCGAGTTTAATTCGAGCAGCCATTGCTCCACCAGCGCGCGTCTG
AGATCTATTTCACCTTACAGTGGGAGGAAGGAGACTGCAGTTTACGCCACTGATATACAG
ACGGGGATGGTGATTCGCTGCAAGGTGTTTATTGACAACTTCTCACGCATTCAGATCTTT
CATAACTCTATCAAGCTTGATCTTGATGGACTTTCCATGCTTCGAGTCCGCGCTTTTGAT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2BL82JQ 681 0 0
TATGCGTTGATGTAGCAAGACCAAAAGAAAAATGGTTCGTCGTCTCTCATCGTGCTTCTT
CGTCGTGGTTCTGGTTCTGGTTCTACTTTCGATTCGAGAAACTTCTTCACAGTTAGGTTC
TGGTCCTCACATTACCGATGTCAATATACTATTGCCTCCGAGGATGAAGAACCCAGTAGA
GTATCGCCTCCAAGGAAGTGATGGCTGCTTCAAATGGTCATGGGATCATCATGATATTCT
CTCGGTTACTCCCGAGTTTAATTCGAGCAGCCATTGCTCCACCAGCGCGCGTTTGAGATC
TATTTCACCTTACAGTGGGAGGAAGGAGACTGCAGTTTACGCCACTGATATACAGACGGG
GATGGTGATTCGCTGCAAGGTGTTTATTGACAACTTCTCACGCATTCAGATCTTTCATAA
CTCTATCAAGCTTGATCTTGATGGACTTTCCATGCTTCGAGTCCGCGCTTTTGATAATGA
AGAAAATGAGTTCTCCTCGCTGGTGGGTCTACAATTCATGTGGAAGCTGATGCCTGAAAG
TGGTGGAACAACGCATCATCTTGCTCATGTGCCTTTGAAGGAATCTCCATTGACTGACTG
CGGGGGACTGTGTGGCTACTTGGATATCCAGAAAAAGCTTGAAGATAGTGGGGTATTTGC
AGATTTGTTTGTAGTCAAGGG

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL4657Contig1 896 2 4 U
GGAAGAAAATATGAAACTCCCATTTCTAAACAAGAACAACTCTTCATTTTCGTGTTCTTC
AAATTCAAATTCAGTTTCATCATCAACAAAGCCCACTTCATGGCCATGGCCTTCTTGTCA
TCAAAACCCTAAAACCATATCTTTCAGAGCAACCATCACTTTCACCAACCCTATCCATGA
CCAAGATGATGATGAACTCGACCCACCTGAGGGTACTGAGTCGATAGAGAGTGTGATAAA
AGGGCTAAGAACATCAGAGAGACTCATCTTCGAAAGCAAAGGAGAATCCAACTCTATACT
CGAAGAAGCTACGACTAAGCAAGAAGGAGAAAAAGCCGATGAGGAAGGCTTCATGCTCTT
TTCCTTGGAATCAAACGACCCTTACTCTGATTTCAAGAGATCCATGGAGGAGATGGTCGA
GGCACAAACGCTTCACCGCGACTGGAGAAGCCTCGAGAAGCTTCTCTTCCAGTTCTTGAA
AGTCAACGCCAAGACCAGCCATCGATACATCTTCGCCGCTTTTGTTGATCTCCTCTTGAA
CTTAACACTGCACACGAATGAACCCATCAATATCAACATTGCCAAAGATGACGTGGACGG
ATTCTCGGCCGCACGCGCCGCCATCGGAGAAGCAAGTGCTTCTTGTTGTAACAGTATGAG
TCTTGGCGAGTCTCCGTTGTCTCCTCTGTCACTCTTCACGTCGTGTTCTTCTTCTTCCTC
CGATGAGACTTCCTCGACGTCTGTAAGATTCTTGCCGTTGTCTTCTTTGTTAGAGATGGA
TGAGAAATGTAAAGACATTTTGGTTTAGAATGCTTTACTTCTTTATTTTTATTTTTTGTA
TAATTAAAATTTGTGTAGAATCGTAACATTGGCTACCCTTAATATTTTATATTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO09TF U 1
AF RR2EO09JQ C 133
BS 1 717 RR2EO09TF
BS 718 718 RR2EO09JQ
BS 719 800 RR2EO09TF
BS 801 896 RR2EO09JQ

RD RR2EO09TF 800 0 0
GGAAGAAAATATGAAACTCCCATTTCTAAACAAGAACAACTCTTCATTTTCGTGTTCTTC
AAATTCAAATTCAGTTTCATCATCAACAAAGCCCACTTCATGGCCATGGCCTTCTTGTCA
TCAAAACCCTAAAACCATATCTTTCAGAGCAACCATCACTTTCACCAACCCTATCCATGA
CCAAGATGATGATGAACTCGACCCACCTGAGGGTACTGAGTCGATAGAGAGTGTGATAAA
AGGGCTAAGAACATCAGAGAGACTCATCTTCGAAAGCAAAGGAGAATCCAACTCTATACT
CGAAGAAGCTACGACTAAGCAAGAAGGAGAAAAAGCCGATGAGGAAGGCTTCATGCTCTT
TTCCTTGGAATCAAACGACCCTTACTCTGATTTCAAGAGATCCATGGAGGAGATGGTCGA
GGCACAAACGCTTCACCGCGACTGGAGAAGCCTCGAGAAGCTTCTCTTCCAGTTCTTGAA
AGTCAACGCCAAGACCAGCCATCGATACATCTTCGCCGCTTTTGTTGATCTCCTCTTGAA
CTTAACACTGCACACGAATGAACCCATCAATATCAACATTGCCAAAGATGACGTGGACGG
ATTCTCGGCCGCACGCGCCGCCATCGGAGAAGCAAGTGCTTCTTGTTGTAACAGTATGAG
TCTTGGCGAGTCTCCGTTGTCTCCTCTGTCACTCTTCACGTCGTGTTCTTCTTCTTC*TC
CGATGAGACTTCCTCGACGTCTGTAAGATTCTTGCCGTTGTCTTCTTTGTTAGAGATGGA
TGAGAAATGTAAAGACATTT

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2EO09JQ 764 0 0
AACCATATCTTTCAGAGCAACCATCACTTTCACCAACCCTATCCATGACCAAGATGATGA
TGAACTCGACCCACCTGAGGGTACTGAGTCGATAGAGAGTGTGATAAAAGGGCTAAGAAC
ATCAGAGAGACTCATCTTCGAAAGCAAAGGAGAATCCAACTCTATACTCGAAGAAGCTAC
GACTAAGCAAGAAGGAGAAAAAGCCGATGAGGAAGGCTTCATGCTCTTTTCCTTGGAATC
AAACGACCCTTACTCTGATTTCAAGAGATCCATGGAGGAGATGGTCGAGGCACAAACGCT
TCACCGCGACTGGAGAAGCCTCGAGAAGCTTCTCTTCCAGTTCTTGAAAGTCAACGCCAA
GACCAGCCATCGATACATTTTCGCCGCTTTTGTTGATCTCCTCTTGAACTTAACACTGCA
CACGAATGAACCCATCAATATCAACATTGCCAAAGATGACGTGGACGGATTTTCGGCCGC
ACGCGCCGCCATCGGAGAAGCAAGTGCTTCTTGTTGTAACAGTATGAGTCTTGGCGAGTC
TCCGTTGTCTCCTCTGTCACTCTTCACGTCGTGTTCTTCTTCTTCCTCCGATGAGACTTC
CTCGACGTCTGTAAGATTCTTGCCGTTGTCTTCTTTGTTAGAGATGGATGAGAAATGTAA
AGACATTTTGGTTTAGAATGCTTTACTTCTTTATTTTTATTTTTTGTATAATTAAAATTT
GTGTAGAATCGTAACATTGGCTACCCTTAATATTTTATATTGGC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL4658Contig1 589 2 7 U
GGATCAACCAAACGCAATGGTGTTTTCTCTCATTCTCTCTTGGCTCTTTTGTCTTCGTAA
TGACGTTGTGTTATAGATGCGAACGCGGCGTCAGGAATGGCGGTGGAAGACGAATGTAAA
CTAAAGTTTTTGGAGTTAAAAGCGAAAAGAAACTATAGATTCATAATATTCAGGATAGAC
GGACAACAAGTGGTGGTTGAAAAGCTTGGAAGTCCCGAGGAGAAATACGACGATTTCTCC
AATTCCCTACCGCCCAACGAGTGCCGCTATGCTGTCTATGACTTCGACTTCACCACTGCT
GAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCATAGCTTGGTCACCGGATTCATCGAGGGGG
AGGATGAAGATGGTGTATGCGAGCTCAAAGGACAGGTTCAAGAGAGAACTGGATGGGATC
CAGGGGGAGTTACAAGCCACAGACCCAAGCGAGATGAGTTTCGACATCATCAAAAGTCGA
GCTCTCTAGATTCATATATATTACCTAATTTCTCATCATATATCCATAAATGTTCCATCA
TCAACAAATTAAAGAACTTCTCCATGTTATGTAACTTTCTTGGTTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B730TF U 1
AF RR2B730JQ C 47
BS 1 224 RR2B730TF
BS 225 225 RR2B730JQ
BS 226 358 RR2B730TF
BS 359 359 RR2B730JQ
BS 360 424 RR2B730TF
BS 425 425 RR2B730JQ
BS 426 589 RR2B730TF

RD RR2B730TF 589 0 0
GGATCAACCAAACGCAATGGTGTTTTCTCTCATTCTCTCTTGGCTCTTTTGTCTTCGTAA
TGACGTTGTGTTATAGATGCGAACGCGGCGTCAGGAATGGCGGTGGAAGACGAATGTAAA
CTAAAGTTTTTGGAGTTAAAAGCGAAAAGAAACTATAGATTCATAATATTCAGGATAGAC
GGACAACAAGTGGTGGTTGAAAAGCTTGGAAGTCCCGAGGAGAACTACGACGATTTCTCC
AATTCCCTACCGCCCAACGAGTGCCGCTATGCTGTCTATGACTTCGACTTCACCACTGCT
GAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCATAGCTTGGTCACCGGATTCATCGAGGGTG
AGGATGAAGATGGTGTATGCGAGCTCAAAGGACAGGTTCAAGAGAGAACTGGATGGGATC
CAGGTGGAGTTACAAGCCACAGACCCAAGCGAGATGAGTTTCGACATCATCAAAAGTCGA
GCTCTCTAGATTCATATATATTACCTAATTTCTCATCATATATCCATAAATGTTCCATCA
TCAACAAATTAAAGAACTTCTCCATGTTATGTAACTTTCTTGGTTCATT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2B730JQ 543 0 0
TTTTGTCTTCGTAATGACGTTGTGTTATAGATGCGAACGCGGCGTCAGGAATGGCGGTGG
AAGACGAATGTAAACTAAAGTTTTTGGAGTTAAAAGGGAAAAGAAACTATAGATTCATAA
TATTCAGGATAGACGGACAACAAGTGGTGGTTGAAAAGCTTGGAAGTCCCGAGGAGAAAT
ACGACGATTTTTCCAATTCCCTACCGCCCAACGAGTGCCGCTATGCTGTTTATGACTTCG
ACTTCACCACTGCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTTTTCATAGCTTGGTCCCCGG
ATTCATCGAGGGGGAGGATGAAGATGGTGTATGCGAGCTCAAAGGACAGGTTCAAGAGAG
AACTGGATGGGATCCAGGGGGAGTTACAAGCCACAGACCCAAGCGAGATGAGTTTTGACA
TCATCAAAAGTCGAGCTCTCTAGATTCATATATATTACCTAATTTTTCATCATATATCCA
TAAATGTTCCATCATCAACAAATTAAAGAACTTTTCCATGTTATGTAACTTTTTTGGTTC
ATT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL4659Contig1 1045 2 2 U
GGATCTCTCTCTCTCTTTCTCATACCTCTTCTTCGTGCTTTCCTCGGTTTCATCGATAAT
TACTGCGTTTTACGTCTATCTCTCAAGTACAATGCCGTCATTGGCGGTATTAACTTACGC
CAAGATCTCTGCTCCTAACGGGCGGGCCGGATCTATTCCTGGAATCCGACGGCAGCCTCC
TCAGACCAATTGGATCTCTTTTCACGTCTCCCATAATCAATCTACAACATGGAGGTTGCG
TGCGACAACCAATGAGGTTGTCTCTAACTCTACAACACCCGTGACTAACGGTGGGGGTTT
GAACGGAAACGTCAAGACCAATGTTCCTCCTGAACCCGCAACCGATCTCTCTGACTTTAT
CTCTAAAGTCTCTGGTCTTCTTAAGCTTGTGGATTCAAGAGATATAGTGGAACTTGAGCT
GAAGCAGCTCGACTGCGAGATTGTTATTCGAAAGAAGGAAGCTTTACAGCAGCAACCAGC
TCCAGTTTATCACTCCATGATTTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCAATGGCTGGCCTTCCAG
TGCCTTCATCTCCATCAGTGTCTCCTCCTACTCCCTCCTCACCCCCTGCAACAGCAACTG
CCCCATCATCTTCTCATCCTCCACTGAAGAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACAGGTCTC
CTGGACCCGGTGAACCCCCTTTTGTCAAGGTTGGAGATAAGGTGCAGAAGGGTCAAGTTG
TTTGCATTATTGAAGCTATGAAACTGATGAATGAGATTGAGGCTGAGAAGTCCGGAACCA
TCACTGAATTACTGGCTGAAGATGGAAAACCGGTCAGCGTTGACACGCCTCTGTTTACCA
TCGTACCTTGAAATGAAGAAGCTGTGGTTCATAAAACTCTTGGTTTTATGATCTATACCG
ACGTGCTGACAATCGTTAAAAAGTAATTATTTCGGTCAGGTTGGTTTGGTTTCGGTTTCT
ATTTTTCATTTGTTGTTTTTTTTTTTTGTTTTATGAACTGTCACTTTCTTCTGGGAACCA
CGTAACATAGCATTTCTTTCCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ17TF U 1
AF RR2CZ17JQ C 204
BS 1 689 RR2CZ17TF
BS 690 1045 RR2CZ17JQ

RD RR2CZ17TF 694 0 0
GGATCTCTCTCTCTCTTTCTCATACCTCTTCTTCGTGCTTTCCTCGGTTTCATCGATAAT
TACTGCGTTTTACGTCTATCTCTCAAGTACAATGCCGTCATTGGCGGTATTAACTTACGC
CAAGATCTCTGCTCCTAACGGGCGGGCCGGATCTATTCCTGGAATCCGACGGCAGCCTCC
TCAGACCAATTGGATCTCTTTTCACGTCTCCCATAATCAATCTACAACATGGAGGTTGCG
TGCGACAACCAATGAGGTTGTCTCTAACTCTACAACACCCGTGACTAACGGTGGGGGTTT
GAACGGAAACGTCAAGACCAATGTTCCTCCTGAACCCGCAACCGATCTCTCTGACTTTAT
CTCTAAAGTCTCTGGTCTTCTTAAGCTTGTGGATTCAAGAGATATAGTGGAACTTGAGCT
GAAGCAGCTCGACTGCGAGATTGTTATTCGAAAGAAGGAAGCTTTACAGCAGCAACCAGC
TCCAGTTTATCACTCCATGATTTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCAATGGCTGGCCTTCCAG
TGCCTTCATCTCCATCAGTGTCTCCTCCTACTCCCTCCTCACCCCCTGCAACAGCAACTG
CCCCATCATCTTCTCATCCTCCACTGAAGAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACAGGTCTC
CTGGACCCGGTGAACCCCCTTTTGTCAAG
TTGGA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2CZ17JQ 842 0 0
ACGTCTCCCATA*TCAATCTACAACATGGAGGTTGCGTGCGACAACCAATGAGGTTGTCT
CTAACTCTACAACACCCGTGACTAACGGTGGGGGTTTGAACGGAAACGTCAAGACCAATG
TTCCTCCTGAACCCGCAACCGATCTCTCTGACTTTATCTCTAAAGTCTCTGGTCTTCTTA
AGCTTGTGGATTCAAGAGATATAGTGGAACTTGAGCTGAAGCAGCTCGACTGCGAGATTG
TTATTCGAAAGAAGGAAGCTTTACAGCAGCAACCAGCTCCAGTTTATCACTCCATGATTT
CCTCCTTCTCCTCCTCCTCCAATGGCTGGCCTTCCAGTGCCTTCATCTCCATCAGTGTCT
CCTCCTACTCCCTCCTCACCCCCTGCAACAGCAACTGCCCCATCATTTTTTCATCCTCCA
CTGAAGAGTCCTATGGCTGGTACTTTTTACAGGTCTCCTGGACCCGGTGAACCCCCTTTT
GTCAAGGTTGGAGATAAGGTGCAGAAGGGTCAAGTTGTTTGCATTATTGAAGCTATGAAA
CTGATGAATGAGATTGAGGCTGAGAAGTCCGGAACCATCACTGAATTACTGGCTGAAGAT
GGAAAACCGGTCAGCGTTGACACGCCTCTGTTTACCATCGTACCTTGAAATGAAGAAGCT
GTGGTTCATAAAACTCTTGGTTTTATGATCTATACCGACGTGCTGACAATCGTTAAAAAG
TAATTATTTCGGTCAGGTTGGTTTGGTTTCGGTTTCTATTTTTCATTTGTTGTTTTTTTT
TTTTGTTTTATGAACTGTCACTTTCTTCTGGGAACCACGTAACATAGCATTTCTTTCCGT
CC

QA 1 842 1 842
DS 



AS 1 2

CO CL4660Contig1 937 2 4 U
GGGACAATGAATCAAACTAAAAATAGAACCAAACAAAACCAATCTCCTTATTAGAAGAAG
CATGAACATAGTGTCCGTCCGGGCTCTCTCTCCGCCCTCCAGTAACTATTTTCCATTGAT
TATATAGTTTTTCAACAATAACAATTGTGTGTTTTTTCTTTTCATATGAATTATATATAA
CGTACATGTGCTGATGTGCATGTTTGAGTTTGCAACGAGATATCGTTTTAATCTGTGAAA
TTTAATCTGTTAGGGTTGTTACATCGTGCCGAGAGATGTAGAGTGGGAGGGAGAAACTAC
GAAAAGCCTGAACTTAAACAAAGCAACTTCTCAAAAGACGAAGACGATCTCATCCTTAGG
CTTCATGCACTTCTTGGCAATAGATGGTCATTGATAGCGGGAAGGTTACCTGGACGAACT
GATACCGAAATAAGGATCCATTGGGAAACTTACTTAAAGAGGAAACTCATGAAAATGGGA
ATAGACCCAACCAACCATCGCCTCTACCATCACGCAAACTACATTTCAAGACAATACCTC
AGTTCTTCTCATAAGAAACTTGAAACAGATATCGTTAGTGACCAATCTTCTTCGGTGTCC
GAATCATATGATATGAGAATATTACCCGTTTCAAGTACCAATTGCTTTGATGATAGTGCT
AGTAGTAGTGCCGGACATAGTCGTTTGCCTGATCTCAACATTAGTCTCGTCCCGGCCGAG
ACGGTGGTTTCTTGGCCAGGTTGTGGCCTTCAAGAATCTAGCAGCAATGGTTCAACGCGT
CAAGAAACACTTCTTCTTTTCCGGTGAAATCGGATATTTTTTTTCCTACATAAAAAATGG
TGTATTTGTTTGTACTATTTTGCTATGTATATATATATATTTCTTTTTTGTAATCACTAG
ATAAAAATACTCAATTGGGAGATAATAAATGATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D750TF U 1
AF RR2D750JQ C 307
BS 1 697 RR2D750TF
BS 698 698 RR2D750JQ
BS 699 712 RR2D750TF
BS 713 937 RR2D750JQ

RD RR2D750TF 718 0 0
GGGACAATGAATCAAACTAAAAATAGAACCAAACAAAACCAATCTCCTTATTAGAAGAAG
CATGAACATAGTGTCCGTCCGGGCTCTCTCTCCGCCCTCCAGTAACTATTTTCCATTGAT
TATATAGTTTTTCAACAATAACAATTGTGTGTTTTTTCTTTTCATATGAATTATATATAA
CGTACATGTGCTGATGTGCATGTTTGAGTTTGCAACGAGATATCGTTTTAATCTGTGAAA
TTTAATCTGTTAGGGTTGTTACATCGTGCCGAGAGATGTAGAGTGGGAGGGAGAAACTAC
GAAAAGCCTGAACTTAAACAAAGCAACTTCTCAAAAGACGAAGACGATCTCATCCTTAGG
CTTCATGCACTTCTTGGCAATAGATGGTCATTGATAGCGGGAAGGTTACCTGGACGAACT
GATACCGAAATAAGGATCCATTGGGAAACTTACTTAAAGAGGAAACTCATGAAAATGGGA
ATAGACCCAACCAACCATCGCCTCTACCATCACGCAAACTACATTTCAAGACAATACCTC
AGTTCTTCTCATAAGAAACTTGAAACAGATATCGTTAGTGACCAATCTTCTTCGGTGTCC
GAATCATATGATATGAGAATATTACCCGTTTCAAGTACCAATTGCTTTGATGATAGTGCT
AGTAGTAGTGCCGGACATAGTCGTTTGCCTGATCTCA*CATTAGTCTCGTCC
GGCCGA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2D750JQ 631 0 0
CCTGAACTTAAACAAAGCAACTTCTCAAAAGACGAAGACGATCTCATCCTTAGGCTTCAT
GCACTTCTTGGCAATAGATGGTCATTGATAGCGGGAAGGTTACCTGGACGAACTGATACC
GAAATAAGGATCCATTGGGAAACTTACTTAAAGAGGAAACTCATGAAAATGGGAATAGAC
CCAACCAACCATCGCCTCTACCATCACGCAAACTACATTTCAAGACAATACCTCAGTTCT
TCTCATAAGAAACTTGAAACAGATATCGTTAGTGACCAATCTTTTTCGGTGTCCGAATCA
TATGATATGAGAATATTACCCGTTTCAAGTACCAATTGCTTTGATGATAGTGCTAGTAGT
AGTGCCGGACATAGTCGTTTGCCTGATCTCAACATTAGTCTCGTCCCGGCCGAGACGGTG
GTTTCTTGGCCAGGTTGTGGCCTTCAAGAATCTAGCAGCAATGGTTCAACGCGTCAAGAA
ACACTTCTTCTTTTCCGGTGAAATCGGATATTTTTTTTCCTACATAAAAAATGGTGTATT
TGTTTGTACTATTTTGCTATGTATATATATATATTTCTTTTTTGTAATCACTAGATAAAA
ATACTCAATTGGGAGATAATAAATGATATCC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL4661Contig1 787 2 4 U
TTTTTTTTCCTCTCAGAGCCTTCAAGACAAAACCAGTTGTGGTTCAGAGATATAGGACTG
TCGCAATTCATTTGAGGATGTTCGTAAAGCATATATATATAGAAAGTTTTACAGAATCCA
GATTCCATTGACCAAGGGTTTTCTGCAATGAGTAGAGGATGTGAAGTAGGTGAAGGGTGT
ACCGGGCAACTGAATAAGATTGCGAAAAACTTCTACATGTGTGTGACGGGGACAGAGTCC
AATGAAGTGACAAGACTCCCTGGCAAAGAAGTCGTTAAATATTCCTCTGGTGTTAGCTTA
TGGACACCATTCTTACAAGCAAGGTCCAGTTCCAAGAAGTTGAGCTGGAAAGAACAACCC
GACAGCTCAAAGAGGCGGTTCCATTCGCTAGCCAACAAACTACAAGATGCACGGCAGCAA
AAGAAGTGTGTTCCAGTCAACTTACCACTCAAGTAATTTTATAGCTGGGAGATATGGCTG
AAAGATTACCATTTGGATCCTCTCGAACTGTCAAGTAACCGAGCCAAAATTGTGTAAATT
CCTGATGTTTCCAATGGGACCATCAATTGAAGCATGAAACGATAAAGAATGGTTGAACAA
GATGAGCATGGTGTCTACATCAATCTTACAGCGTTAGCCCGATGTGTTACAGAAACTCAA
ACATGTCCGTTTCAGCCGGAGATTTTAAGCTTGAACAGAGAACAGTAGTGGCCAGACACA
GAGAGATCATGACAGTACATATATGATGTGACAACATGTGAATGTCTCTTGGACTCTGTA
CCCACAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG54TF U 1
AF RR2H380TF U 1
BS 1 137 RR2GG54TF
BS 138 138 RR2H380TF
BS 139 673 RR2GG54TF
BS 674 787 RR2H380TF

RD RR2GG54TF 673 0 0
TTTTTTTTCCTCTCAGAGCCTTCAAGACAAAACCAGTTGTGGTTCAGAGATATAGGACTG
TCGCAATTCATTTGAGGATGTTCGTAAAGCATATATATATAGAAAGTTTTACAGAATCCA
GATTCCATTGACCAAGG*TTTTCTGCAATGAGTAGAGGATGTGAAGTAGGTGAAGGGTGT
ACCGGGCAACTGAATAAGATTGCGAAAAACTTCTACATGTGTGTGACGGGGACAGAGTCC
AATGAAGTGACAAGACTCCCTGGCAAAGAAGTCGTTAAATATTCCTCTGGTGTTAGCTTA
TGGACACCATTCTTACAAGCAAGGTCCAGTTCCAAGAAGTTGAGCTGGAAAGAACAACCC
GACAGCTCAAAGAGGCGGTTCCATTCGCTAGCCAACAAACTACAAGATGCACGGCAGCAA
AAGAAGTGTGTTCCAGTCAACTTACCACTCAAGTAATTTTATAGCTGGGAGATATGGCTG
AAAGATTACCATTTGGATCCTCTCGAACTGTCAAGTAACCGAGCCAAAATTGTGTAAATT
CCTGATGTTTCCAATGGGACCATCAATTGAAGCATGAAACGATAAAGAATGGTTGAACAA
GATGAGCATGGTGTCTACATCAATCTTACAGCGTTAGCCCGATGTGTTACAGAAACTCAA
ACATGTCCGTTTC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2H380TF 787 0 0
TTTTTTTTCCTCTCAGAGCCTTCAAGACAAAACCAGTTGTGGTTCAGAGATATAGGACTG
TCGCAATTCATTTGAGGATGTTCGTAAAGCATATATATATAGAAAGTTTTACAGAATCCA
GATTCCATTGACCAAGGGTTTTCTGCAATGAGTAGAGGATGTGAAGTAGGTGAAGGGTGT
ACCGGGCAACTGAATAAGATTGCGAAAAACTTCTACATGTGTGTGACGGGGACAGAGTCC
AATGAAGTGACAAGACTCCCTGGCAAAGAAGTCGTTAAATATTCCTCTGGTGTTAGCTTA
TGGACACCATTCTTACAAGCAAGGTCCAGTTCCAAGAAGTTGAGCTGGAAAGAACAACCC
GACAGCTCAAAGAGGCGGTTCCATTCGCTAGCCAACAAACTACAAGATGCACGGCAGCAA
AAGAAGTGTGTTCCAGTCAACTTACCACTCAAGTAATTTTATAGCTGGGAGATATGGCTG
AAAGATTACCATTTGGATCCTCTCGAACTGTCAAGTAACCGAGCCAAAATTGTGTAAATT
CCTGATGTTTCCAATGGGACCATCAATTGAAGCATGAAACGATAAGGAATGGTTGAACAA
GATGAGCATGGTGTCTACATCA*TCTTACAGCGTTAGCCCGATGTGTTACAGAA*CTCAA
ACATGTCCGTTTCAGCCGGAGATTTTAAGCTTGAACAGAGAACAGTAGTGGCCAGACACA
GAGAGATCATGACAGTACATATATGATGTGACAACATGTGAATGTCTCTTGGACTCTGTA
CCCACAC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL4662Contig1 816 2 4 U
GGAAGTCTTTTATTATAAAGGAAAGAAAGAAAACTTTCCTAATTGGATCATACCAAAGTT
TTAGCTCTTCTCTATCTCTCTTGTAGTTTCTTGATTTGTTTGGTTCTTTTAGAGGAAATA
GTTTCTTAAAAAGGGATAAAAATGGGAAGGGGTAGGGTTCAATTGAAGAGGATAGAGAAC
AAGATCAATAGACAAGTGACATTCTCGAAAAGAAGAGCTGGTCTTATGAAGAAAGCTCAT
GAGATCTCTGTTCTGTGTGATGCTGAAGTTGCCCTTGTTGTCTTCTCCCATAAGGGGAAA
CTCTTTGAATACTCCACTGATTCTTGTATGGAGAAGATACTTGAACGCTATGAGAGGTAC
TCTTACGCCGAGAGACAGCTTATAGCACCAGAGTCCGACTCCAATACGAACTGGTCGATG
GAGTATAATAGGCTTAAGGCTAAGATTGAGCTTTTGGAGAGAAACCAGAGGCACTATCTT
GGGGAAGACTTGCAAGCAATGAGCCCCAAGGAGCTCCAGAATCTAGAGCAACAGCTTGAC
ACTGCTCTTAAGCACATCCGCTGTAGAAAAAACCAACTTATGTACGACTCCATCAATGAG
CTCCAAAGAAAGGAGAAGGCCATACAGGAACAAAACAGCATGCTTTCCAAGCAGATTAAG
GAAAGGGAAAAGGTTCTTAAGGCGCAACAAGAGCAATGGGACGAGCAGAACCATGGTAAT
AATATGCCTCCGCTTCCACCCCCGCAGCAGCAGCAAATCCAGCATCCTTACATGCTCTCC
CATCAGCCATCTCCTTTTCTCACATGGGTGGGCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM71TF U 1
AF RR2GS65TF U 188
BS 1 485 RR2FM71TF
BS 486 486 RR2GS65TF
BS 487 660 RR2FM71TF
BS 661 816 RR2GS65TF

RD RR2FM71TF 675 0 0
GGAAGTCTTTTATTATAAAGGAAAGAAAGAAAACTTTCCTAATTGGATCATACCAAAGTT
TTAGCTCTTCTCTATCTCTCTTGTAGTTTCTTGATTTGTTTGGTTCTTTTAGAGGAAATA
GTTTCTTAAAAAGGGATAAAAATGGGAAGGGGTAGGGTTCAATTGAAGAGGATAGAGAAC
AAGATCAATAGACAAGTGACATTCTCGAAAAGAAGAGCTGGTCTTATGAAGAAAGCTCAT
GAGATCTCTGTTCTGTGTGATGCTGAAGTTGCCCTTGTTGTCTTCTCCCATAAGGGGAAA
CTCTTTGAATACTCCACTGATTCTTGTATGGAGAAGATACTTGAACGCTATGAGAGGTAC
TCTTACGCCGAGAGACAGCTTATAGCACCAGAGTCCGACTCCAATACGAACTGGTCGATG
GAGTATAATAGGCTTAAGGCTAAGATTGAGCTTTTGGAGAGAAACCAGAGGCACTATCTT
GGGGAGGACTTGCAAGCAATGAGCCCCAAGGAGCTCCAGAATCTAGAGCAACAGCTTGAC
ACTGCTCTTAAGCACATCCGCTGTAGAAAAAACCAACTTATGTACGACTCCATCAATGAG
CTCCAAAGAAAGGAGAAGGCCATACAGGAACAAAACAGCATGCTTTCCAAGCAGATTAAG
AGAGGGAAAAGTTCT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2GS65TF 629 0 0
G
TAGACAAGTGACATTCTCGAAAAGAAGAGCTGGTCTTATGAAGAAAGCTCATGAGATCTC
TGTTCTGTGTGATGCTGAAGTTGCCCTTGTTGTCTTCTCCCATAAGGGGAAACTCTTTGA
ATACTCCACTGATTCTTGTATGGAGAAGATACTTGAACGCTATGAGAGGTACTCTTACGC
CGAGAGACAGCTTATAGCACCAGAGTCCGACTCCAATACGAACTGGTCGATGGAGTATAA
TAGGCTTAAGGCTAAGATTGAGCTTTTGGAGAGAAACCAGAGGCACTATCTTGGGGAAGA
CTTGCAAGCAATGAGCCCCAAGGAGCTCCAGAATCTAGAGCAACAGCTTGACACTGCTCT
TAAGCACATCCGCTGTAGAAAAAACCAACTTATGTACGACTCCATCAATGAGCTCCAAAG
AAAGGAGAAGGCCATACAGGAACAAAACAGCATGCTTTCCAAGCAGATTAAGGAAAGGGA
AAAGGTTCTTAAGGCGCAACAAGAGCAATGGGACGAGCAGAACCATGGTAATAATATGCC
TCCGCTTCCACCCCCGCAGCAGCAGCAAATCCAGCATCCTTACATGCTCTCCCATCAGCC
ATCTCCTTTTCTCACATGGGTGGGCTGT

QA 2 629 2 629
DS 



AS 1 2

CO CL4663Contig1 568 2 1 U
GGGTGAAGGTAAACACGGAAGTGGAGGCAAACACGGAAGTGGAGACAAACACGGAAGTGG
AGGCAAACACGGAAGTGGAGACAAACACGGAAGTGGAGGCAAACACGAGAGTGGAGGCAA
ACACGAGAGTGGAGGCAAACATGGAAGTGGAGACAAACACGGAAGTGGAGGTTCGTCAAT
GGGTGAAGGTAAACACGGGGGTGGAGGCTCTTCTAAAAAGGAGAAAAAAGAATTCCATTA
TGCAGGTTCATCTATGGATGCAAGTAGTTCAAGTGAAAGTTCAGATGGAAGTTCAGATGG
AAGTTCAGATGGTGAAAGTTCACATGGGAGTGGTGGTAAACACATGTGAGTAAACGTGAA
TTCATGGAAGAATAAAAGACATTGGTGGACCTATTCCAATGTTTAGCATATGACGTGTCA
TGAATTGTACGGCATTGTAAGGGAAAAAAAACTTTTTACAATTTTTATGTTAATATATGG
TTAAAACTGATTAATATGATAAGACAGAAAGACTATTATGATACAATGTATAGTGAAAAT
ATAAAAATAATGTAATGTGGTAACAATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G919JQ C 1
AF RR2G919TF U 1
BS 1 568 RR2G919TF

RD RR2G919JQ 568 0 0
GGGTGAAGGTAAACACGGAAGTGGAGGCAAACACGGAAGTGGAGACAAACACGGAAGTGG
AGGCAAACACGGAAGTGGAGACAAACACGGAAGTGGAGGCAAACACGAGAGTGGAGGCAA
ACACGAGAGTGGAGGCAAACATGGAAGTGGAGACAAACACGGAAGTGGAGGTTCGTCAAT
GGGTGAAGGTAAACACGGGGGTGGAGGCTCTTCTAAAAAGGAGAAAAAAGAATTCCATTA
TGCAGGTTCATCTATGGATGCAAGTAGTTCAAGTGAAAGTTCAGATGGAAGTTCAGATGG
AAGTTCAGATGGTGAAAGTTCACATGGGAGTGGTGGTAAACACATGTGAGTAAACGTGAA
TTCATGGAAGAATAAAAGACATTGGTGGACCTATTCCAATGTTTAGCATATGACGTGTCA
TGAATTGTACGGCATTGTAAGGGAAAAAAAACTTTTTACAATTTTTATGTTAATATATGG
TTAAAACTGATTAATATGATAAGACAGAAAGACTATTATGATACAATGTATAGTGAAAAT
ATAAAAATAATGTAATGTGGTAACAATT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2G919TF 568 0 0
GGGTGAAGGTAAACACGGAAGTGGAGGCAAACACGGAAGTGGAGACAAACACGGAAGTGG
AGGCAAACACGGAAGTGGAGACAAACACGGAAGTGGAGGCAAACACGAGAGTGGAGGCAA
ACACGAGAGTGGAGGCAAACATGGAAGTGGAGACAAACACGGAAGTGGAGGTTCGTCAAT
GGGTGAAGGTAAACACGGGGGTGGAGGCTCTTCTAAAAAGGAGAAAAAAGAATTCCATTA
TGCAGGTTCATCTATGGATGCAAGTAGTTCAAGTGAAAGTTCAGATGGAAGTTCAGATGG
AAGTTCAGATGGTGAAAGTTCACATGGGAGTGGTGGTAAACACATGTGAGTAAACGTGAA
TTCATGGAAGAATAAAAGACATTGGTGGACCTATTCCAATGTTTAGCATATGACGTGTCA
TGAATTGTACGGCATTGTAAGGGAAAAAAAACTTTTTACAATTTTTATGTTAATATATGG
TTAAAACTGATTAATATGATAAGACAGAAAGACTATTATGATACAATGTATAGTGAAAAT
ATAAAAATAATGTAATGTGGTAACAATT

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

CO CL4664Contig1 575 2 3 U
CAAAGATTTTTATTTCATCAACAAATGATACACACCCACTCTTTCGCATTAACCTTTTTG
AGCATAGTATAGAATGTTTCAAAAATGAGTGAGAGACAAAAGACTCAACAGTAAAGAGTG
GGGGAAAAGGTATTGTTGTTCCACACCGCAACAAACAAGAATTACAAAAGCGAAAAAAAT
AGACAGAAAGAGTAGTCACTCAAGTTTGTGCATTGGTGAGTTTGAATAGAGATGAGTGTG
TCTACTCTATCTCGCTTAGGATGGGAACAATGAGAGGCTTCATCTGCGCAATGTATACGA
TTGCCCACATCATCCAACAGCAGACAGTGGCTGTAATGACCAATGTAAAATGTAGCAAAT
TGGTGGAGGGGCCTTGGTTGAAGCAAATTCTTGTGAAAATCGAAGCAATGATGCCGAATA
CCGCGAATATTACAGATGTTACTAGAAAAGCCATGTCTGATCCTGATCCTGATCCCAAAC
AGAGTAATCAGATTCAAATTGAAACTCCTGGTCTTCGATGGCGGATCGTATATTCGTTCG
TGCCCACTGATCTGTGCAAGGCGCAGATTTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV55TF C 1
AF RR2EV55JQ U 69
BS 1 68 RR2EV55TF
BS 69 560 RR2EV55JQ
BS 561 575 RR2EV55TF

RD RR2EV55TF 575 0 0
CAAAGATTTTTATTTCATCAACAAATGATACACACCCACTCTTTCGCATTAACCTTTTTG
AGCATAGTATAGAATGTTTCAGAAATGAGTGAGAGACAAAAGACTCAACAGTAAAGAGTG
GGGGAAAAGGTATTGTTGTTCCACACCGCAACAAACAAGAATTACAAAAGCGAAGAAGAT
AGACAGAAAGAGTAGTCACTCAAGTTTGTGCATTGGTGAGTTTGAATAGAGATGAGTGTG
TCTACTCTATCTCGCTTAGGATGGGAACAATGAGAGGCTTCATCTGCGCAATGTATACGA
TTGCCCACATCATCCAACAGCAGACAGTGGCTGTAATGACCAATGTAAAATGTAGCAGAT
TGGTGGAGGGGCCTTGGTTGAAGCAGATTCTTGTGAAAATCGAAGCAATGATGCCGAATA
CCGCGAATATTACAGATGTTACTAGAAAAGCCATGTCTGATCCTGATCCTGATCCCAAAC
AGAGTAATCAGATTCAAATTGAAACTCCTGGTCTTCGATGGCGGATCGTATATTCGTTCG
TGCCCACTGATCTGTGCAAGGCGCAGATTTTCCCC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2EV55JQ 492 0 0
ATAGAATGTTTCAAAAATGAGTGAGAGACAAAAGACTCAACAGTAAAGAGTGGGGGAAAA
GGTATTGTTGTTCCACACCGCAACAAACAAGAATTACAAAAGCGAAAAAAATAGACAGAA
AGAGTAGTCACTCAAGTTTGTGCATTGGTGAGTTTGAATAGAGATGAGTGTGTCTACTCT
ATCTCGCTTAGGATGGGAACAATGAGAGGCTTCATCTGCGCAATGTATACGATTGCCCAC
ATCATCCAACAGCAGACAGTGGCTGTAATGACCAATGTAAAATGTAGCAAATTGGTGGAG
GGGCCTTGGTTGAAGCAAATTCTTGTGAAAATCGAAGCAATGATGCCGAATACCGCGAAT
ATTACAGATGTTACTAGAAAAGCCATGTCTGATCCTGATCCTGATCCCAAACAGAGTAAT
CAGATTCAAATTGAAACTCCTGGTCTTCGATGGCGGATCGTATATTCGTTCGTGCCCACT
GATCTGTGCAAG

QA 1 492 1 492
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4666Contig1 970 2 4 U
GGAAGATCATATGGCGGTATTGATCAACAACTACATTTCAAACTGTCTTAACACGCTTTG
GAATCTAAGGGGTTCTTGCAGACGACGCCGTTTCGGCTTACGAAGTGCTTCGCCAGAAAC
CTCCACCGTTAAATCTGTTCCACATCTCTTTCTCTAACGCAATCACTTCATCGTCGTCTT
CGTCCTCTGACAAATACATCGCTAACTTATCCAACTCTCCATCGTCTCTGCTCTCTAACG
GATGAATAGCGAACTGCGAGCTCCCAACTTTACACAGCCTCTTCTCGAAATCTCCATTAT
CCAACAAAACATCCGTCTTCGCTCTCCGTACTCTCCGCCGCATCATACGACGAATACCGC
GGCGGCAGATTGCGCGAGGGGCTTTGTAGACGGCGAAGACCACGAGACTCACCACGCTGT
AAGGGGCGCAGCAACATAAGGCGGCGAATCCCGCAGTCGTACCGCCGCAAAACTCCGCCG
CCGTGGAACCTCTGCAGCACAGCGGCGGCGTTGATAGACTTCGGCGGAGACTCGGTTGTT
TCCCGCCGAGAGACGATTCACAAGAGGGATTCATATATGCGAGACCAAAGCCCAAAAAAA
AAGGTAATCAACACACAAATCTCTCGATTGTCTTCGTCATCACCGATTCAAGAAAAAAAT
CGAAAATTTCCCGGGAAAATCAGGCATTGAATCTCAGACAGGGAAAAAAAAATGGGAGAG
GGACAGATACACAAGAAAGAAGAATCTATTACAAAGAGACAAAACTAGGCGACAGAAAAC
AATATTTTTCCCGAGAATCTGAAGAGTTTGTTTGGAAAGGGAGAGAGAGTCTTGTAATGG
TTTTAGCCTTTTAGTCAGTCAGTCTCTCACTCTCTGGAGATTCATTAAAGGCTGAGAGAA
ATGATTTTGGGTTACTGCTTCGGTTATGAATGTTGCTAACTTGCTAGTATATGAAGACGA
CCCATGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO60TF U 1
AF RR2CO60JQ C 223
BS 1 601 RR2CO60TF
BS 602 602 RR2CO60JQ
BS 603 658 RR2CO60TF
BS 659 970 RR2CO60JQ

RD RR2CO60TF 658 0 0
GGAAGATCATATGGCGGTATTGATCAACAACTACATTTCAAACTGTCTTAACACGCTTTG
GAATCTAAGGGGTTCTTGCAGACGACGCCGTTTCGGCTTACGAAGTGCTTCGCCAGAAAC
CTCCACCGTTAAATCTGTTCCACATCTCTTTCTCTAACGCAATCACTTCATCGTCGTCTT
CGTCCTCTGACAAATACATCGCTAACTTATCCAACTCTCCATCGTCTCTGCTCTCTAACG
GATGAATAGCGAACTGCGAGCTCCCAACTTTACACAGCCTCTTCTCGAAATCTCCATTAT
CCAACAAAACATCCGTCTTCGCTCTCCGTACTCTCCGCCGCATCATACGACGAATACCGC
GGCGGCAGATTGCGCGAGGGGCTTTGTAGACGGCGAAGACCACGAGACTCACCACGCTGT
AAGGGGCGCAGCAACATAAGGCGGCGAATCCCGCAGTCGTACCGCCGCAAAACTCCGCCG
CCGTGGAACCTCTGCAGCACAGCGGCGGCGTTGATAGACTTCGGCGGAGACTCGGTTGTT
TCCCGCCGAGAGACGATTCACAAGAGGGATTCATATATGCGAGACCAAAGCCCAAAAAAA
A*GGTAATCAACACACAAATCTCTCGATTGTCTTCGTCATCACCGATTCAAGAAAAAA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2CO60JQ 748 0 0
CGTCTCTGCTCTCTAACGGATGAATAGCGAACTGCGAGCTCCCAACTTTACACAGCCTCT
TCTCGAAATCTCCATTATCCAACAAAACATCCGTCTTCGCTCTCCGTACTCTCCGCCGCA
TCATACGACGAATACCGCGGCGGCAGATTGCGCGAGGGGCTTTGTAGACGGCGAAGACCA
CGAGACTCACCACGCTGTAAGGGGCGCAGCAACATAAGGCGGCGAATCCCGCAGTCGTAC
CGCCGCAAAACTCCGCCGCCGTGGAACCTCTGCAGCACAGCGGCGGCGTTGATAGACTTC
GGCGGAGACTCGGTTGTTTCCCGCCGAGAGACGATTCACAAGAGGGATTCATATATGCGA
GACCAAAGCCCAAAAAAAAAGGTAATCAACACACAAATCTCTCGATTGTCTTCGTCATCA
CCGATTCAAGAAAAAAATCGAAAATTTCCCGGGAAAATCAGGCATTGAATCTCAGACAGG
GAAAAAAAAATGGGAGAGGGACAGATACACAAGAAAGAAGAATCTATTACAAAGAGACAA
AACTAGGCGACAGAAAACAATATTTTTCCCGAGAATCTGAAGAGTTTGTTTGGAAAGGGA
GAGAGAGTCTTGTAATGGTTTTAGCCTTTTAGTCAGTCAGTCTCTCACTCTCTGGAGATT
CATTAAAGGCTGAGAGAAATGATTTTGGGTTACTGCTTCGGTTATGAATGTTGCTAACTT
GCTAGTATATGAAGACGACCCATGAATC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL4667Contig1 1071 2 2 U
GGATCAAACATTCTTCATTAGATATTTTCTCTTCTACTATTTTAAGCAAACAAAAGAATT
TTTTATAGTAAAGAAATGGAAGAAACAAAGGAGAGAAAGATCGTAGTAGCAGTGGACGAG
AGCGAAGAGAGCATGGAAGCTCTTTCATGGAGTCTTGACAATCTTTTTCCATATGGTTCC
AATAATACCCTCATCCTCCTCTACGTCAAGCCCCCTCTTCCCGTTTATTCTTCCATTGAT
GCCGCAGGTTAGTCTCGTTATTACACAATAAATCATTTGATTGAGTAAACCTTGATATAA
TTCTTTCAGCTTATATGGAACTTTGCTTGGTCAACTTTCTAGGGTTTATAGTGACCGGAG
ATCCGGTTGCAGCCTTGAAGAAATACGAAAATGAGCTTGTGGAATCAGTCATGGCTCGAT
CTCGAAACGTCTACCAAGATTTTGAGTCCGATGTAAGCTTCTTCCAATAAATTTTGGATC
ACTTTGTTAAAAAGATTTGACAAATTACTAAGAGGTGAAAACAATAGAATTTATAAAAGC
CGTATTAATATATGTATTCGATACGAACCCCACATATAACTAGATTAATTAGCAATCTAT
TATTTTCAACGATTGAACGAAAAAAACGAAAAAAAAAAAACTAAAGCTTATTGTTAATTA
ATGCGCAGTTTAATATAGAGAGAAAAGTTGGAAGAGGAGATGCCAAGGAAGTAATATGTA
ACGCAGTTCAGAACCTTAAGGCTGATATGTTAGTTATGGGCACACATGACTATGGCTTCT
TCAAAAGGTAAGAACTTAATTAATCTTTTATGCTTCTTTAATTTGTTTATAATGGTTATT
GATATGATTTATGTATATGTTCCGTTGATAGGGCTTTGCTAGGCAGTGTGAGCGAGTATT
GCGCCAAACGTGTGAAGTGTCCTGTGATTATTGTGAAGAAGAATATGCCTCAAAATAATT
GAGCTCAAAAGTCACAAGTCTTATGATTATGTATGTTTGAGAGCAATTGATGCAAATAGT
TGAATCAATATTCGTATGCAATCATGTATATTATATATATGAATTACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F101TF U 1
AF RR2F101JQ C 382
BS 1 625 RR2F101TF
BS 626 1071 RR2F101JQ

RD RR2F101TF 625 0 0
GGATCAAACATTCTTCATTAGATATTTTCTCTTCTACTATTTTAAGCAAACAAAAGAATT
TTTTATAGTAAAGAAATGGAAGAAACAAAGGAGAGAAAGATCGTAGTAGCAGTGGACGAG
AGCGAAGAGAGCATGGAAGCTCTTTCATGGAGTCTTGACAATCTTTTTCCATATGGTTCC
AATAATACCCTCATCCTCCTCTACGTCAAGCCCCCTCTTCCCGTTTATTCTTCCATTGAT
GCCGCAGGTTAGTCTCGTTATTACACAATAAATCATTTGATTGAGTAAACCTTGATATAA
TTCTTTCAGCTTATATGGAACTTTGCTTGGTCAACTTTCTAGGGTTTATAGTGACCGGAG
ATCCGGTTGCAGCCTTGAAGAAATACGAAAATGAGCTTGTGGAATCAGTCATGGCTCGAT
CTCGAAACGTCTACCAAGATTTTGAGTCCGATGTAAGCTTCTTCCAATAAATTTTGGATC
ACTTTGTTAAAAAGATTTGACAAATTACTAAGAGGTGAAAACAATAGAATTTATAAAAGC
CGTATTAATATATGTATTCGATACGAACCCCACATATAACTAGATTAATTAGCAATCTAT
TATTTTCAACGATTGAACGAAAAAA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2F101JQ 690 0 0
AATACGAAAATGAGCTTGTGGAATCAGTCATGGCTCGATCTCGAAACGTCTACCAAGATT
TTGAGTCCGATGTAAGCTTCTTCCAATAAATTTTGGATCACTTTGTTAAAAAGATTTGAC
AAATTACTAAGAGGTGAAAACAATAGAATTTATAAAAGCCGTATTAATATATGTATTCGA
TACGAACCCCACATATAACTAGATTAATTAGCAATTTATTATTTTCAACGATTGAACGAA
AAAAACGAAAAAAAAAAAACTAAAGCTTATTGTTAATTAATGCGCAGTTTAATATAGAGA
GAAAAGTTGGAAGAGGAGATGCCAAGGAAGTAATATGTAACGCAGTTCAGAACCTTAAGG
CTGATATGTTAGTTATGGGCACACATGACTATGGCTTCTTCAAAAGGTAAGAACTTAATT
AATCTTTTATGCTTCTTTAATTTGTTTATAATGGTTATTGATATGATTTATGTATATGTT
CCGTTGATAGGGCTTTGCTAGGCAGTGTGAGCGAGTATTGCGCCAAACGTGTGAAGTGTC
CTGTGATTATTGTGAAGAAGAATATGCCTCAAAATAATTGAGCTCAAAAGTCACAAGTCT
TATGATTATGTATGTTTGAGAGCAATTGATGCAAATAGTTGAATCAATATTCGTATGCAA
TCATGTATATTATATATATGAATTACTTTT

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL4668Contig1 812 2 2 U
GGAAGAAGATGGGAAGCCATGCAGTATGCATACAACGCGTACCGTGTCTCGGAGCCTCGC
AAGTGAATAAGAGCAAAACAGTTGGTCCCTTTTCGGTGAATATTATTACTAGAAGGAAGA
GAAGAAGCAGTGGCGTGAGGTGCAGCCTCGTTGGCTCGAGGACGTGGAAAAGCACAAGTC
AATAGCCATCTGCACTCCTCACGAGGGTGGATACGAAGGTATGTATCTTAACCGTCTCAA
AGAACAAGGCTACTACTTTCTTGACATCTCTGCTCGAGGACTTGGTGACCCAGAGACCAC
ACTCCTTAACGCCTACCCTGTTTGCCCTGCTCACCTTGGGAAACAACCAATAGCAAGGTG
GTATTATCCACCAGAAGTTGACTACAGACTCTCAGCTCTTCCGCCTAGTGCCAAGGGACT
TGTCGTCTGGGTCATTGAAGCAAAGGTCCTCTCAAAATCTGAACTCCAGTTTCTCGCTTT
GCTTCCTTCTCTCCGTCCTAATGTCAGGGTTGTTGCTGAATGTGGCAACTGGAGAAAGTT
CATGTGGAAACCCCTTGCAGAAATTGCAGAGCTAGCTGCATAAGAGTAACTTAATGAACT
CAGGCACCAATGGAGAGCTTACCATGTATAGTTTTCATGTATATCATCTCCAGCAAGTGT
AGTTAATATTCATCGCATTGTAAAACTTGAAACTTGTGTATGTCATAATAAAACCTTGCA
ACTCTGGTTGATCAAGGTTTTATTATGAGAAGAATGATGCGATCGACGATGCATTATGTT
GCTGTATTTTGATCACATTTGCTAGCTTGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX39TFB U 1
AF RR2AX39JQ C 229
BS 1 719 RR2AX39TFB
BS 720 812 RR2AX39JQ

RD RR2AX39TFB 719 0 0
GGAAGAAGATGGGAAGCCATGCAGTATGCATACAACGCGTACCGTGTCTCGGAGCCTCGC
AAGTGAATAAGAGCAAAACAGTTGGTCCCTTTTCGGTGAATATTATTACTAGAAGGAAGA
GAAGAAGCAGTGGCGTGAGGTGCAGCCTCGTTGGCTCGAGGACGTGGAAAAGCACAAGTC
AATAGCCATCTGCACTCCTCACGAGGGTGGATACGAAGGTATGTATCTTAACCGTCTCAA
AGAACAAGGCTACTACTTTCTTGACATCTCTGCTCGAGGACTTGGTGACCCAGAGACCAC
ACTCCTTAACGCCTACCCTGTTTGCCCTGCTCACCTTGGGAAACAACCAATAGCAAGGTG
GTATTATCCACCAGAAGTTGACTACAGACTCTCAGCTCTTCCGCCTAGTGCCAAGGGACT
TGTCGTCTGGGTCATTGAAGCAAAGGTCCTCTCAAAATCTGAACTCCAGTTTCTCGCTTT
GCTTCCTTCTCTCCGTCCTAATGTCAGGGTTGTTGCTGAATGTGGCAACTGGAGAAAGTT
CATGTGGAAACCCCTTGCAGAAATTGCAGAGCTAGCTGCATAAGAGTAACTTAATGAACT
CAGGCACCAATGGAGAGCTTACCATGTATAGTTTTCATGTATATCATCTCCAGCAAGTGT
AGTTAATATTCATCGCATTGTAAAACTTGAAACTTGTGTATGTCATAATAAAACCTTGC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2AX39JQ 584 0 0
TAACCGTCTCAAAGAACAAGGCTACTACTTTCTTGACATCTCTGCTCGAGGACTTGGTGA
CCCAGAGACCACACTCCTTAACGCCTACCCTGTTTGCCCTGCTCACCTTGGGAAACAACC
AATAGCAAGGTGGTATTATCCACCAGAAGTTGACTACAGACTTTCAGCTTTTCCGCCTAG
TGCCAAGGGACTTGTCGTTTGGGTCATTGAAGCAAAGGTCCTCTCAAAATTTGAACTCCA
GTTTCTCGCTTTGCTTCCTTCTTTCCGTCCTAATGTCAGGGTTGTTGCTGAATGTGGCAA
CTGGAGAAAGTTCATGTGGAAACCCCTTGCAGAAATTGCAGAGCTAGCTGCATAAGAGTA
ACTTAATGAACTCAGGCACCAATGGAGAGCTTACCATGTATAGTTTTCATGTATATCATC
TCCAGCAAGTGTAGTTAATATTCATCGCATTGTAAAACTTGAAACTTGTGTATGTCATAA
TAAAACCTTGCAACTCTGGTTGATCAAGGTTTTATTATGAGAAGAATGATGCGATCGACG
ATGCATTATGTTGCTGTATTTTGATCACATTTGCTAGCTTGGAG

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL4669Contig1 636 2 2 U
GGATGGCTCTGGAGTCTGCTTTCTCCATGAGTTTCTGGTCCTTCTCCAAATCAATCTCCT
TTGAGAGAAGCGCCTTATCCTTTCACCGAATCACCATCCCCTCGGGAGCAAAGGGAATAA
TTGCAGGAGAGGGTGAAGCTGAACCCCAGAAGAGGATAAGCTCTGATCTCAAGAGGGTTT
ACAAGAACGAGAAAGTAGTGACTAGAAACACAGTGCGGGAAGATAAGCATGAGATTTCAA
GCCAGAAGAAAGCTGTTGTAGATAGAAGCAAGGCCATAGCAAAGCTGAAATCATTAGGGG
AAAGAAGTGAGAAACGCAGGGCTATGTTCCAGAGACGAAGTATGTTCTTCATGACATCGA
TGAAGAAGCTAAAGAGAAAGCATTGATGCATCACAGCGAACGGTTAGCTATTGCTTTGGG
CTCATAAACACGCCTCCTGGGGACGACGATAAGAGTGATGAAGAACTTGAGGATTTGTGG
AGACTGCCACAACTTCATTAAGATATTATCGAGCATTGAATATAGAGAGTTCATTGTAAG
AGATAACAAGAGGTTTCATCATTTTAGAGATGGTTCTTGTTCTTGCCGAGATTATTGGTA
GATTTGTGAATTTATTAAACTAATTTCGTTTTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DG42JQ C 1
AF RR2DG42TF U 152
BS 1 151 RR2DG42JQ
BS 152 636 RR2DG42TF

RD RR2DG42JQ 636 0 0
GGATGGCTCTGGAGTCTGCTTTCTCCATGAGTTTCTGGTCCTTCTCCAAATCAATCTCCT
TTGAGAGAAGCGCCTTATCCTTTCACCGAATCACCATCCCCTCGGGAGCAAAGGGAATAA
TTGCAGGAGAGGGTGAAGCTGAACCCCAGAAGAGGATAAGCTCTGATCTCAAGAGGGTTT
ACAAGAACGAGAAAGTAGTGACTAGAAACACAGTGCGGGAAGATAAGCATGAGATTTCAA
GCCAGAAGAAAGCTGTTGTAGATAGAAGCAAGGCCATAGCAAAGCTGAAATCATTAGGG*
AAAGAAGTGAGAAACGCAGG*CTATGTTCCAGAGACGAAGTATGTTCTTCATGACATCGA
TGAAGAAGCTAAAGAGAAAGCATTGATGCATCACAGCGAACGGTTAGCTATTGCTTTGGG
CTCATAAACACGCCTCCTGGG*ACGACGATAAGAGTGATGAAGAACTTGAGGATTTGTGG
AGACTGCCACAACTTCATTAAGATATTATCGAGCATTGAATATAGAGAGTTCATTGTAAG
AGATAACAAGAGGTTTCATCATTTTAGAGATGGTTCTTGTTCTTGCCGAGATTATTGGTA
GATTTGTGAATTTATTAAACTAATTTCGTTTTACTC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2DG42TF 485 0 0
GAGGATAAGCTCTGATCTCAAGAGGGTTTACAAGAACGAGAAAGTAGTGACTAGAAACAC
AGTGCGGGAAGATAAGCATGAGATTTCAAGCCAGAAGAAAGCTGTTGTAGATAGAAGCAA
GGCCATAGCAAAGCTGAAATCATTAGGGGAAAGAAGTGAGAAACGCAGGGCTATGTTCCA
GAGACGAAGTATGTTCTTCATGACATCGATGAAGAAGCTAAAGAGAAAGCATTGATGCAT
CACAGCGAACGGTTAGCTATTGCTTTGGGCTCATAAACACGCCTCCTGGGGACGACGATA
AGAGTGATGAAGAACTTGAGGATTTGTGGAGACTGCCACAACTTCATTAAGATATTATCG
AGCATTGAATATAGAGAGTTCATTGTAAGAGATAACAAGAGGTTTCATCATTTTAGAGAT
GGTTCTTGTTCTTGCCGAGATTATTGGTAGATTTGTGAATTTATTAAACTAATTTCGTTT
TACTC

QA 1 485 1 485
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4671Contig1 862 2 4 U
GGGGAGGAAGAGAAAACCAAACCACATCCTTGTGAAGAAGCGTTAAGAGGAGGAAGAAGA
ACGATTCTTTGTCCGGAAATTCAATGGCGGTTTCTTCTGTAACTTCGTTCATATTACCCC
CTTTCGCCAACCTTACATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCACCAAACAGAAAGTCTCTCTGC
TTCCATCTTCTTCTACTCATGGCGGCATTGGCTCCTGCGTCCTTAACAAACCCTCCATCT
CGTTTACGAAGAAGGTCTTCGCAGCTCCCGAGACCCTAACTCCAGAAACCCTCGAAGAAC
CCGCCTCTGATGTCTTTTCCGAGGTTCCGAGCTCTTCCTCGATAAGTGTAGACGCGGATA
AGATGGCGCCAAAGCAAAAGATTAGGATCAAGCTAAGATCATACTGGGTGCCTCTCATTG
AGGACTCATGCAAGCAGATACTCGACGCTGCGAGGAACACCAATGCCAAGACGATGGGTC
CTGTTCCCTTGCCAACCAAGAAGCGTATCTACTGTGTTCTCAAGTCTCCCCACGTCCACA
AGGATGCAAGGCTCCATTTTGAGATCAGGACTCACCAGCGGATGATTGATATTCTCTACC
CGACTGCTCAGACCATCGACTCCTTGATGCAGCTGGATCTTCCTGCTGGTGTGGATGTGG
AAGTTAAGCTCTGAAACTTCAATGAGGCGATGGGCCCTTGCATTGCATGAACAAACTGTT
CCTGATAGAATTGGTAAACCATGTATCATCCTTTTGAAAGACTATGTAATGAATATTATC
AGCAAAGCTGGACTCTTTTAGACAATCTTTGTTCTTAGTTAATGGACAGATCTGCAAGTA
AGCAAAGTTCAAAGATGTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP02TF U 1
AF RR2CP02JQ C 273
BS 1 686 RR2CP02TF
BS 687 687 RR2CP02JQ
BS 688 752 RR2CP02TF
BS 753 862 RR2CP02JQ

RD RR2CP02TF 752 0 0
GGGGAGGAAGAGAAAACCAAACCACATCCTTGTGAAGAAGCGTTAAGAGGAGGAAGAAGA
ACGATTCTTTGTCCGGAAATTCAATGGCGGTTTCTTCTGTAACTTCGTTCATATTACCCC
CTTTCGCCAACCTTACATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCACCAAACAGAAAGTCTCTCTGC
TTCCATCTTCTTCTACTCATGGCGGCATTGGCTCCTGCGTCCTTAACAAACCCTCCATCT
CGTTTACGAAGAAGGTCTTCGCAGCTCCCGAGACCCTAACTCCAGAAACCCTCGAAGAAC
CCGCCTCTGATGTCTTTTCCGAGGTTCCGAGCTCTTCCTCGATAAGTGTAGACGCGGATA
AGATGGCGCCAAAGCAAAAGATTAGGATCAAGCTAAGATCATACTGGGTGCCTCTCATTG
AGGACTCATGCAAGCAGATACTCGACGCTGCGAGGAACACCAATGCCAAGACGATGGGTC
CTGTTCCCTTGCCAACCAAGAAGCGTATCTACTGTGTTCTCAAGTCTCCCCACGTCCACA
AGGATGCAAGGCTCCATTTTGAGATCAGGACTCACCAGCGGATGATTGATATTCTCTACC
CGACTGCTCAGACCATCGACTCCTTGATGCAGCTGGATCTTCCTGCTGGTGTGGATGTGG
AAGTTAAGCTCTGAAACTTCAATGAG*CGATGGGCCCTTGCATTGCATGAACAAACTGTT
CCTGATAGAATTGGTAAACCATGTATCATCCT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2CP02JQ 590 0 0
ACCCTAACTCCAGAAACCCTCGAAGAACCCGCCTCTGATGTCTTTTCCGAGGTTCCGAGC
TCTTCCTCGATAAGTGTAGACGCGGATAAGATGGCGCCAAAGCAAAAGATTAGGATCAAG
CTAAGATCATACTGGGTGCCTCTCATTGAGGACTCATGCAAGCAGATACTCGACGCTGCG
AGGAACACCAATGCCAAGACGATGGGTCCTGTTCCCTTGCCAACCAAGAAGCGTATCTAC
TGTGTTCTCAAGTCTCCCCACGTCCACAAGGATGCAAGGCTCCATTTTGAGATCAGGACT
CACCAGCGGATGATTGATATTCTCTACCCGACTGCTCAGACCATCGACTCCTTGATGCAG
CTGGATCTTCCTGCTGGTGTTGATGTGGAAGTTAAGCTCTGAAACTTCAATGAGGCGATG
GGCCCTTGCATTGCATGAACAAACTGTTCCTGATAGAATTGGTAAACCATGTATCATCCT
TTTGAAAGACTATGTAATGAATATTATCAGCAAAGCTGGACTCTTTTAGACAATCTTTGT
TCTTAGTTAATGGACAGATCTGCAAGTAAGCAAAGTTCAAAGATGTGTTC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

CO CL4672Contig1 1059 2 2 U
GATTCGTCAGCCACTTCTTCACAGCCATTGTCGGTATGCTTCTTTCTAGTCTGCAATCCC
TGGAACTTTACCACTATTGAGAATATCTGGTCTATCTCTAAGTATTTTCATTTCAGACCA
ATGTCTTTCTATAGTTGTGAATCTTGTGATTGGTCTAGACTTCCACTCTTTATCTTTTTT
TTTCTTTCTGTATTCTAAAGGTGCTGAATGGTGGGCTCAGCAATTGGGGCAGTCCATACC
ATTGTTTAGTTGGGTGTCATTTGTTAATGGTAAAATTATATTTCTATTGTTTTTTCCTCC
AAATTTTCTTACCGTTACTGCCTTTGCTTTCTTGAATTAAATTTGGAGTCCTCTGTTTTA
GAGATTCAAACTTCCAGAGCAGTCCTTTACATGATGATCGCGTTCGCTGTTATACCAACA
GTGGCATTCAAGTGAGTCTCTTAAACTTGAACTCCAGTGTATGTGTTAATTTTCAGCTGT
GCGATCGAAATTGAGATATTACATTAATACTCAAGTCACTTGAAGAAAGAACAGTATTCT
CGCCACATGATTCAGTGTTTGTTTCCCAAAAATGAAAGAAAAAAAGAGTATTGCCTAGTG
ATATATATAGGTCCTTCTTAAGCTGGTAAGTTACCTATTTGCTAAGCTGGTTGCACTTTT
TGCAGTGTGTCAAATGTCTACAAAGTTGTTCAATCAAGAAAAGGGAGCATGTTGTTAGCA
TTAGCTATGGTAATCTCCTAACCTGTTGCTTTAGAAACATAGCTTTTTAAAACTGTCCTG
AACTAATGTTCCTTTGATTCTTGGATGCAGCTGTATCCTTTCGTGGTTCTTCTTGGAGGT
GTTTTGATATGGTAAGTCTTATTTTATGCTCTTCTGAAAAAGACTTGCGATCTTTCTCTC
CTTTGCTTTTGAAAATTGTTTGGATCTTATTTTCTTACAGGGATTACTTGTCTCCAATCA
ATCTCATAGAAACATACCCTCATTTAGTTGTACTTGGAACTGGACTTGCATTTGGATTTC
TGGTGGTAAGTCTTTATCTCTTAGTTACACTATCATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT56TF U 1
AF RR2FT56JQ C 296
BS 1 643 RR2FT56TF
BS 644 1059 RR2FT56JQ

RD RR2FT56TF 643 0 0
GATTCGTCAGCCACTTCTTCACAGCCATTGTCGGTATGCTTCTTTCTAGTCTGCAATCCC
TGGAACTTTACCACTATTGAGAATATCTGGTCTATCTCTAAGTATTTTCATTTCAGACCA
ATGTCTTTCTATAGTTGTGAATCTTGTGATTGGTCTAGACTTCCACTCTTTATCTTTTTT
TTTCTTTCTGTATTCTAAAGGTGCTGAATGGTGGGCTCAGCAATTGGGGCAGTCCATACC
ATTGTTTAGTTGGGTGTCATTTGTTAATGGTAAAATTATATTTCTATTGTTTTTTCCTCC
AAATTTTCTTACCGTTACTGCCTTTGCTTTCTTGAATTAAATTTGGAGTCCTCTGTTTTA
GAGATTCAAACTTCCAGAGCAGTCCTTTACATGATGATCGCGTTCGCTGTTATACCAACA
GTGGCATTCAAGTGAGTCTCTTAAACTTGAACTCCAGTGTATGTGTTAATTTTCAGCTGT
GCGATCGAAATTGAGATATTACATTAATACTCAAGTCACTTGAAGAAAGAACAGTATTCT
CGCCACATGATTCAGTGTTTGTTTCCCAAAAATGAAAGAAAAAAAGAGTATTGCCTAGTG
ATATATATAGGTCCTTCTTAAGCTGGTAAGTTACCTATTTGCT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2FT56JQ 764 0 0
CCTCCAAATTTTCTTACCGTTACTGCCTTTGCTTTCTTGAATTAAATTTGGAGTCCTCTG
TTTTAGAGATTCAAACTTCCAGAGCAGTCCTTTACATGATGATCGCGTTCGCTGTTATAC
CAACAGTGGCATTCAAGTGAGTCTCTTAAACTTGAACTCCAGTGTATGTGTTAATTTTCA
GCTGTGCGATCGAAATTGAGATATTACATTAATACTCAAGTCACTTGAAGAAAGAACAGT
ATTCTCGCCACATGATTCAGTGTTTGTTTCCCAAAAATGAAAGAAAAAAAGAGTATTGCC
TAGTGATATATATAGGTCCTTCTTAAGCTGGTAAGTTACCTATTTGCTAAGCTGGTTGCA
CTTTTTGCAGTGTGTCAAATGTCTACAAAGTTGTTCAATCAAGAAAAGGGAGCATGTTGT
TAGCATTAGCTATGGTAATCTCCTAACCTGTTGCTTTAGAAACATAGCTTTTTAAAACTG
TCCTGAACTAATGTTCCTTTGATTCTTGGATGCAGCTGTATCCTTTCGTGGTTCTTCTTG
GAGGTGTTTTGATATGGTAAGTCTTATTTTATGCTCTTCTGAAAAAGACTTGCGATCTTT
CTCTCCTTTGCTTTTGAAAATTGTTTGGATCTTATTTTCTTACAGGGATTACTTGTCTCC
AATCAATCTCATAGAAACATACCCTCATTTAGTTGTACTTGGAACTGGACTTGCATTTGG
ATTTCTGGTGGTAAGTCTTTATCTCTTAGTTACACTATCATTCC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL4673Contig1 524 2 1 U
GGGGGATTGAATATTACATCGAGTTTGCTCCATTCGAGGGTGTCCCAACTACCGCTACCT
CCTTCAATCCTCTCTGAATCCGAATAATAACGCAGCGGCCTTTGTCTCCCCGACGGTGGT
CTCGGCGACGTCATGAATTATAACGAGACGGTGCTTCACCTTCCGATCAACGACGGATTT
TGTCACGCTGGGATTTGATTTGATTCTCTCCCGCAACAACAATAATAATACGACACAGTT
TGGTACAGCCTTTGTCGTTTTTTTCTTTTAGTTATTGTCTTGTTGTTATCTATGATTTGT
AATAGAAAAACAAAAGTCTAAGGCATATAAATCTGAGGTCAATTCACAATATTAACTTTT
GTTAATATTTCTTTATTTAGTCTTAAAGAAATTAATCTGTGTCGGAATTTAAATTTGAAG
AACAAATTAAGAAATAGTTAAGTATGTGAATGTTGAATTCACTGATTTGTGTCTGTTTCT
GTGATGTGTAAACATCTTATTATATAAAGTTAAATTTTGGACGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CP62JQ C 1
AF RR2CP62TF U 1
BS 1 524 RR2CP62TF

RD RR2CP62JQ 524 0 0
GGGGGATTGAATATTACATCGAGTTTGCTCCATTCGAGGGTGTCCCAACTACCGCTACCT
CCTTCAATCCTCTCTGAATCCGAATAATAACGCAGCGGCCTTTGTCTCCCCGACGGTGGT
CTCGGCGACGTCATGAATTATAACGAGACGGTGCTTCACCTTCCGATCAACGACGGATTT
TGTCACGCTGGGATTTGATTTGATTCTCTCCCGCAACAACAATAATAATACGACACAGTT
TGGTACAGCCTTTGTCGTTTTTTTCTTTTAGTTATTGTCTTGTTGTTATCTATGATTTGT
AATAGAAAAACAAAAGTCTAAGGCATATAAATCTGAGGTCAATTCACAATATTAACTTTT
GTTAATATTTCTTTATTTAGTCTTAAAGAAATTAATCTGTGTCGGAATTTAAATTTGAAG
AACAAATTAAGAAATAGTTAAGTATGTGAATGTTGAATTCACTGATTTGTGTCTGTTTCT
GTGATGTGTAAACATCTTATTATATAAAGTTAAATTTTGGACGG

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2CP62TF 524 0 0
GGGGGATTGAATATTACATCGAGTTTGCTCCATTCGAGGGTGTCCCAACTACCGCTACCT
CCTTCAATCCTCTCTGAATCCGAATAATAACGCAGCGGCCTTTGTCTCCCCGACGGTGGT
CTCGGCGACGTCATGAATTATAACGAGACGGTGCTTCACCTTCCGATCAACGACGGATTT
TGTCACGCTGGGATTTGATTTGATTCTCTCCCGCAACAACAATAATAATACGACACAGTT
TGGTACAGCCTTTGTCGTTTTTTTCTTTTAGTTATTGTCTTGTTGTTATCTATGATTTGT
AATAGAAAAACAAAAGTCTAAGGCATATAAATCTGAGGTCAATTCACAATATTAACTTTT
GTTAATATTTCTTTATTTAGTCTTAAAGAAATTAATCTGTGTCGGAATTTAAATTTGAAG
AACAAATTAAGAAATAGTTAAGTATGTGAATGTTGAATTCACTGATTTGTGTCTGTTTCT
GTGATGTGTAAACATCTTATTATATAAAGTTAAATTTTGGACGG

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

CO CL4674Contig1 685 2 2 U
GGGCTCCGGCCCTGATTACATTTGTGGGTGAGAAGCATCCAACTCGAGGGAGAGCAGAGC
ATATGGAGACTGCGATATGTGGGAGATTAGCTCTCGCACCAAACTCTCTCTTCAATTCTT
CTATATCATCAGGGGACAAACATTCTGTCTCAAAAGGACCATGCGTTAATAATCGTGGAG
TTCTCATGACCATGTCTACGTATTGAGTAAAGGAGGTGGTGTGTTGGACAAACCAATTAT
AGAGAAGACCACTCCTGGTCGTGAATCTGAGTTTGATTTGAGGAAATCAAAGAAGATGGC
TCCACCTTACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATATGTGGTTCA
GGTTTTGATGAAGGTCATACCAGGCATGACTGTAGACAACGCAGTTAACATTATGCAAGA
AGCCCACATCAACGGTTTGGCTGTTGTCATCGTCTGTGCTCAGGCCGATGCAGAGCAACA
CTGTATGCAGCTTCGCGGTAACGGTCTTCTCAGTTCTGTTGAACCTGATGGTGGAGGCTG
CTGAAACAAAAGAAACTAGTTTAAATTTCGTATAGGTTTTTCAGACCTCTCAGGACACTC
TATTTAGTAAAAAAGAAAATGTCCTTTGGTGTATATAAAAATATCAGAAAATTTGGTACT
AAGACTGTTACTATATGCAGTGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H796TF U 1
AF RR2H796JQB C 160
BS 1 641 RR2H796TF
BS 642 685 RR2H796JQB

RD RR2H796TF 641 0 0
GGGCTCCGGCCCTGATTACATTTGTGGGTGAGAAGCATCCAACTCGAGGGAGAGCAGAGC
ATATGGAGACTGCGATATGTGGGAGATTAGCTCTCGCACCAAACTCTCTCTTCAATTCTT
CTATATCATCAGGGGACAAACATTCTGTCTCAAAAGGACCATGCGTTAATAATCGTGGAG
TTCTCATGACCATGTCTACGTATTGAGTAAAGGAGGTGGTGTGTTGGACAAACCAATTAT
AGAGAAGACCACTCCTGGTCGTGAATCTGAGTTTGATTTGAGGAAATCAAAGAAGATGGC
TCCACCTTACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATATGTGGTTCA
GGTTTTGATGAAGGTCATACCAGGCATGACTGTAGACAACGCAGTTAACATTATGCAAGA
AGCCCACATCAACGGTTTGGCTGTTGTCATCGTCTGTGCTCAGGCCGATGCAGAGCAACA
CTGTATGCAGCTTCGCGGTAACGGTCTTCTCAGTTCTGTTGAACCTGATGGTGGAGGCTG
CTGAAACAAAAGAAACTAGTTTAAATTTCGTATAGGTTTTTCAGACCTCTCAGGACACTC
TATTTAGTAAAAAAGAAAATGTCCTTTGGTGTATATAAAAA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2H796JQB 526 0 0
CATGCGTTAATAATCGTGGAGTTCTCATGACCATGTCTACGTATTGAGTAAAGGAGGTGG
TGTGTTGGACAAACCAATTATAGAGAAGACCACTCCTGGTCGTGAATTTGAGTTTGATTT
GAGGAAATCAAAGAAGATGGCTCCACCTTACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAA
CAAGAGGGAATATGTGGTTCAGGTTTTGATGAAGGTCATACCAGGCATGACTGTAGACAA
CGCAGTTAACATTATGCAAGAAGCCCACATCAACGGTTTGGCTGTTGTCATCGTCTGTGC
TCAGGCCGATGCAGAGCAACACTGTATGCAGCTTCGCGGTAACGGTCTTTTCAGTTTTGT
TGAACCTGATGGTGGAGGCTGCTGAAACAAAAGAAACTAGTTTAAATTTCGTATAGGTTT
TTCAGACCTCTCAGGACACTCTATTTAGTAAAAAAGAAAATGTCCTTTGGTGTATATAAA
AATATCAGAAAATTTGGTACTAAGACTGTTACTATATGCAGTGAAA

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 2

CO CL4675Contig1 662 2 2 U
TTTTTTTGGGGACTAACCAAAGACTTATTAAGAATTTTGAAGGCAATATATATTGTTACA
ACGTCAAAAGACGACGGTCATTTTCAAGATAACAAGACAAATAACGTGACAGGACCTGTA
AGAAAAATCTTTCTTCTCACCACTCTACCTGAGACGTGTAGTAAAGCTTCTTCTTCAAGA
CACAAAACAATCAACTTCAGTACCACCGGCTCATCGCAGTATCTTGTGCTGCAGTGACTT
TCTGTGGTATATACTGAGGGTTTTGTTTCAATCTACTCGAACCTTCTGCGGCGGCGGGGT
CGCAGTCTTCATCTCCTCTGCTGCTTTTGCAAGGTTGAGTTCTCTTAGGGTACTGAGCCA
CACCAACCGGATTCCTAACCATCCTACGCTGTTGTTGTTCAAGAGCTTCAACTCCTGTTG
CTGCCCCTCCGCAGTTGTTATAGCGTAACACTGACCCAACTACTTTTCCAGGCCTAGCTA
CTGCTGCAGCACCTTGGATTGTTTGAGGGACGTTAACAGGGATTCGCTGCGGATTCCTCT
CTGCACCGCGCGGTCTCTCATCTCTGATGCTACACTTGGAGAGATCTAAATTCGATATTA
TGATGTGAATGAAGATACAGAGCAAAAGTATTAATAAATATGGTTTTTGATTTTTTTTTC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2GA40TF C 1
AF RR2GA40JQ U 8
BS 1 7 RR2GA40TF
BS 8 662 RR2GA40JQ

RD RR2GA40TF 662 0 0
TTTTTTTGGGGACTAACCAAAGACTTATTAAGAATTTTGAAGGCAATATATATTGTTACA
ACGTCAAAAGACGACGGTCATTTTCAAGATAACAAGACAAATAACGTGACAGGACCTGTA
AGAAAAATCTTTCTTCTCACCACTCTACCTGAGACGTGTAGTAAAGCTTCTTCTTCAAGA
CACAAAACAATCAACTTCAGTACCACCGGCTCATCGCAGTATCTTGTGCTGCAGTGACTT
TCTGTGGTATATACTGAGGGTTTTGTTTCAATCTACTCGAACCTTCTGCGGCGGCGGGGT
CGCAGTCTTCATCTCCTCTGCTGCTTTTGCAAGGTTGAGTTCTCTTAGGGTACTGAGCCA
CACCAACCGGATTCCTAACCATCCTACGCTGTTGTTGTTCAAGAGCTTCAACTCCTGTTG
CTGCCCCTCCGCAGTTGTTATAGCGTAACACTGACCCAACTACTTTTCCAGGCCTAGCTA
CTGCTGCAGCACCTTGGATTGTTTGAGGGACGTTAACAGGGATTCGCTGCGGATTCCTCT
CTGCACCGCGCGGTCTCTCATCTCTGATGCTACACTTGGAGAGATCTAAATTCGATATTA
TGATGTGAATGAAGATACAGAGCAAAAGTATTAATAAATATGGTTTTTGATTTTTTTTTC
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2GA40JQ 655 0 0
GGGGACTAACCAAAGACTTATTAAGAATTTTGAAGGCAATATATATTGTTACAACGTCAA
AAGACGACGGTCATTTTCAAGATAACAAGACAAATAACGTGACAGGACCTGTAAGAAAAA
TCTTTCTTCTCACCACTCTACCTGAGACGTGTAGTAAAGCTTCTTCTTCAAGACACAAAA
CAATCAACTTCAGTACCACCGGCTCATCGCAGTATCTTGTGCTGCAGTGACTTTCTGTGG
TATATACTGAGGGTTTTGTTTCAATCTACTCGAACCTTCTGCGGCGGCGGGGTCGCAGTC
TTCATCTCCTCTGCTGCTTTTGCAAGGTTGAGTTCTCTTAGGGTACTGAGCCACACCAAC
CGGATTCCTAACCATCCTACGCTGTTGTTGTTCAAGAGCTTCAACTCCTGTTGCTGCCCC
TCCGCAGTTGTTATAGCGTAACACTGACCCAACTACTTTTCCAGGCCTAGCTACTGCTGC
AGCACCTTGGATTGTTTGAGGGACGTTAACAGGGATTCGCTGCGGATTCCTCTCTGCACC
GCGCGGTCTCTCATCTCTGATGCTACACTTGGAGAGATCTAAATTCGATATTATGATGTG
AATGAAGATACAGAGCAAAAGTATTAATAAATATGGTTTTTGATTTTTTTTTCCC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL4676Contig1 805 2 2 U
GATCTCGACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTGTATATTCTGGTTTTCACCTTCTCTCTG
ATTTATTTTCACACCGAGACGTTGTGAAGTAAGTCTGGGGGAGGGTCTTCGTCGTTTACT
AACTCGTTTCTTTCTTTTGTTTATCTTTTGAGTCAGTCTGAGTCAGTTTTTAGGATCGAG
TGAGTCAAAGTTTTGTGGGAATTAGGACCTTACTCTGTGTTGATCACTAACCACCTCGTG
CTTTAGTTGTCTTATTCAGTGACCTTAGCAGTGGCGAAAGACACACATGTGGACCTGGAA
CACCCTGACATATCTCACTTGATTCTCCAGAAGTTCTCAGCCGATCAGGTTACACTGGGT
AGACTTAACTCCACCTAACTTGAACCTAATCTTGACTGAAATTCTTCTTGTTATGGGCAC
TAGATCAGGGAAACGAGAACTACACTCAGGACTTCTTATTCTTTCTATCCATCTTGTTGT
TCCTGAGTGGCTAGCTCATCTTTAGCTAGTTCCCACCATGCGCCTTAGCCTTTATTCCAC
CTTCATGCATTTGTTTTTCAGTGTTATATGTGCAGATATGTGCAAAAAGGTCGGAGAGGA
AAGGATCGACGCAGCCTCTTACTCGTTACTACTGCGCAGATTCAGTCAGAAGGAGAACAA
GCAGATTAAGGGAGCAACCGCTCCATAACCAATGAGCTGTGCAAGAACATGGGTGGAGAA
CCAGAATGATATGAACCAGAAGAACCACCAGTGGCAATCCAAGCATCTCATGTTACCTCC
TTCTTCGTCACCCCACCATCTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF20TF U 1
AF RR2GF20JQ C 182
BS 1 652 RR2GF20TF
BS 653 805 RR2GF20JQ

RD RR2GF20TF 653 0 0
GATCTCGACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTGTATATTCTGGTTTTCACCTTCTCTCTG
ATTTATTTTCACACCGAGACGTTGTGAAGTAAGTCTGGGGGAGGGTCTTCGTCGTTTACT
AACTCGTTTCTTTCTTTTGTTTATCTTTTGAGTCAGTCTGAGTCAGTTTTTAGGATCGAG
TGAGTCAAAGTTTTGTGGGAATTAGGACCTTACTCTGTGTTGATCACTAACCACCTCGTG
CTTTAGTTGTCTTATTCAGTGACCTTAGCAGTGGCGAAAGACACACATGTGGACCTGGAA
CACCCTGACATATCTCACTTGATTCTCCAGAAGTTCTCAGCCGATCAGGTTACACTGGGT
AGACTTAACTCCACCTAACTTGAACCTAATCTTGACTGAAATTCTTCTTGTTATGGGCAC
TAGATCAGGGAAACGAGAACTACACTCAGGACTTCTTATTCTTTCTATCCATCTTGTTGT
TCCTGAGTGGCTAGCTCATCTTTAGCTAGTTCCCACCATGCGCCTTAGCCTTTATTCCAC
CTTCATGCATTTGTTTTTCAGTGTTATATGTGCAGATATGTGCAAAAAGGTCGGAGAGGA
AAGGATCGACGCAGCCTCTTACTCGTTACTACTGCGCAGATTCAGTCAGAAG
A

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2GF20JQ 624 0 0
GAGTCAAAGTTTTGTGGGAATTAGGACCTTACTCTGTGTTGATCACTAACCACCTCGTGC
TTTAGTTGTCTTATTCAGTGACCTTAGCAGTGGCGAAAGACACACATGTGGACCTGGAAC
ACCCTGACATATCTCACTTGATTCTCCAGAAGTTCTCAGCCGATCAGGTTACACTGGGTA
GACTTAACTCCACCTAACTTGAACCTAATCTTGACTGAAATTCTTCTTGTTATGGGCACT
AGATCAGGGAAACGAGAACTACACTCAGGACTTCTTATTCTTTCTATCCATCTTGTTGTT
CCTGAGTGGCTAGCTCATCTTTAGCTAGTTCCCACCATGCGCCTTAGCCTTTATTCCACC
TTCATGCATTTGTTTTTCAGTGTTATATGTGCAGATATGTGCAAAAAGGTCGGAGAGGAA
AGGATCGACGCAGCCTCTTACTCGTTACTACTGCGCAGATTCAGTCAGAAGGAGAACAAG
CAGATTAAGGGAGCAACCGCTCCATAACCAATGAGCTGTGCAAGAACATGGGTGGAGAAC
CAGAATGATATGAACCAGAAGAACCACCAGTGGCAATCCAAGCATCTCATGTTACCTCCT
TCTTCGTCACCCCACCATCTTTGC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL4677Contig1 941 2 4 U
GGGTCACAGCGACCAACTTCTGTCCTCCCAACAACGCACTGCCTAATAACGCAGGTGGTT
GGTGTAACCCTCCGCTTCACCACTTTGATCTCTCTCAGCCTATCTTCCAACGCATTGCTC
ATTACAAAGCTGGTGTTGTCCCTGTTTCTTACCGAAGGGTTCCGTGTAAGAGAAGGGGAG
GTATAAGATTCACCATCAACGGCCACTCTTACTTCAACCTTGTCTTGGTCACTAATGTCG
GCGGCGCCGGAGATGTTCGGTCTGTGGCGGTTAAAGGTTCAAGAACAAACTGGCAGCCAA
TGTCTAGGAACTGGGGGCAAAACTGGCAAAGTAACAATCTGCTCAATGGTCAAGCATTGG
CCTTTAAGGTTACTGCTAGTGATGGTCAAACTGTCGTCTCCAACAATGTTGCTCCGGCTA
GCTGGTCCTTTGGACAAACCTTCTCCGGCCGTCAGTTCCGTTAAAATTGTGTCAGAAGTT
TCGGTTTTATGTAGTTTAGGGTTTGTGTTGTGTCAAGGACAGAGGAGAGAGAGTTGGAGA
GGGAGAGGGTTTAAGGCTCTGTTAGGGTTTTAATGGGAGAGTCATTAAGCTTCTTCTTTC
AACTCTTGAGGGTAAAATGGTGAAAAGGGCTTATTTTAATAGGGCTCTTTTAGTCATTTT
TAAGAACTAGGGTTATAGTAAGTGAGTATTGAGTAGAGTGGTGTGTGCATCTTTTAGCAA
AGGGACCTCTATGTAATGGCTTCCTTTGTTTTATCAACTTTTTTTTACCTTCTGTTTTTT
TATCTGAAAAAGCAGAAGTGGGTAGGGGCAGAGGAGGAACTTCACCACCCGCCATGTGTG
TTTTCTTTTTCTTCTGTCTTTTGTTTTGTCGTTGTTTACGAAGTTGTAATGTAAGGGCTG
CTCTTGTGGGCTTTCATAAGTGTTATGTTACCATTGTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK01TF U 1
AF RR2GK01JQ C 263
BS 1 574 RR2GK01TF
BS 575 575 RR2GK01JQ
BS 576 665 RR2GK01TF
BS 666 941 RR2GK01JQ

RD RR2GK01TF 665 0 0
GGGTCACAGCGACCAACTTCTGTCCTCCCAACAACGCACTGCCTAATAACGCAGGTGGTT
GGTGTAACCCTCCGCTTCACCACTTTGATCTCTCTCAGCCTATCTTCCAACGCATTGCTC
ATTACAAAGCTGGTGTTGTCCCTGTTTCTTACCGAAGGGTTCCGTGTAAGAGAAGGGGAG
GTATAAGATTCACCATCAACGGCCACTCTTACTTCAACCTTGTCTTGGTCACTAATGTCG
GCGGCGCCGGAGATGTTCGGTCTGTGGCGGTTAAAGGTTCAAGAACAAACTGGCAGCCAA
TGTCTAGGAACTGGGGGCAAAACTGGCAAAGTAACAATCTGCTCAATGGTCAAGCATTGG
CCTTTAAGGTTACTGCTAGTGATGGTCAAACTGTCGTCTCCAACAATGTTGCTCCGGCTA
GCTGGTCCTTTGGACAAACCTTCTCCGGCCGTCAGTTCCGTTAAAATTGTGTCAGAAGTT
TCGGTTTTATGTAGTTTAGGGTTTGTGTTGTGTCAAGGACAGAGGAGAGAGAGTTGGAGA
GGGAGAGGGTTTAAGGCTCTGTTAGGGTTTTAATTGGAGAGTCATTAAGCTTCTTCTTTC
AACTCTTGAGGGTAAAATGGTGAAAAGGGCTTATTTTAATAGGGCTCTTTTAGTCATTTT
TAAGA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2GK01JQ 679 0 0
TGTGGCGGTTAAAGGTTCAAGAACAAACTGGCAGCCAATGTCTAGGAACTGGGGGCAAAA
CTGGCAAAGTAACAATCTGCTCAATGGTCAAGCATTGGCCTTTAAGGTTACTGCTAGTGA
TGGTCAAACTGTCGTCTCCAACAATGTTGCTCCGGCTAGCTGGTCCTTTGGACAAACCTT
CTCCGGCCGTCAGTTCCGTTAAAATTGTGTCAGAAGTTTCGGTTTTATGTAGTTTAGGGT
TTGTGTTGTGTCAAGGACAGAGGAGAGAGAGTTGGAGAGGGAGAGGGTTTAAGGCTCTGT
TAGGGTTTTAATGGGAGAGTCATTAAGCTTCTTCTTTCAACTCTTGAGGGTAAAATGGTG
AAAAGGGCTTATTTTAATAGGGCTCTTTTAGTCATTTTTAAGAACTAGGGTTATAGTAAG
TGAGTATTGAGTAGAGTGGTGTGTGCATCTTTTAGCAAAGGGACCTCTATGTAATGGCTT
CCTTTGTTTTATCAACTTTTTTTTACCTTCTGTTTTTTTATCTGAAAAAGCAGAAGTGGG
TAGGGGCAGAGGAGGAACTTCACCACCCGCCATGTGTGTTTTCTTTTTCTTCTGTCTTTT
GTTTTGTCGTTGTTTACGAAGTTGTAATGTAAGGGCTGCTCTTGTGGGCTTTCATAAGTG
TTATGTTACCATTGTTACC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL4678Contig1 931 2 2 U
GTGTTCAAGCTCGATGGAAATTTGTGAATGCAAAGAAGTGCTTGATGACTAGGATGCAGG
AGATGTCCCTCAATTACCATTTCATGGCAGAGCAAGAATCCGGTTCCACTCGACATGCCT
TCTTTGGTTTCAATGGGACTGCGGGTGTATGGAGATTGGCAGCGATGGAAGAAGCCGGAG
GTTGGAAAGATAGGACCACCGTGGAGGACATGGACTTGGCCGTTCGTGTTGGTTTACACG
GCTGGGAATTTGTCTTCGTCAACGACATTACGGTAAAAAGTGAGCTACCAAGCCAGTTTA
AGGCTTTCAGATTCCAGCAACATCGATGGTCATGCGGTCCAGCTAATCTCTTCAGGAAAA
TGACTATGGAAATTATTCACAATAAGAGAGTAAAAATCTGGAAGAAACTGTATGTGATCT
GCAGCTTCTTCTTTGTACGGAAGATCATAGTCCATTTCTTCACCTTCTTTTTCTATTGCG
TCATTCTCCCTACGAGCGTATTCTTCAACGAAGTTAACATTCCGACTTGGTCAACTATGT
ACCTTCCTTTTATGATCACTCTCTTCAATGCCATCGCCACACCAAGATCATTCTACCTCG
TGGTTTTCTGGGTCTTGTTCGAAAATGTAATGGCTATGCATCGGACTAAAGGAACTTTCA
TTGGATTACTTGAAGGAGGAAGAGTAAACGAATGGGTCGTCACCGAGAAATTAGGAGATG
CTCTTGAGACTAAATTACTTCCACAAGTGAAAAAACCTCGCAATAGGCTTCTCGAAAGAG
TAAACTCAAAAGAGATGATGGTGGGGATATACATACTGTGTTGTGCATGCTACGACTTTG
CATATGGAAATACAAGGCTATACATTTATCTATTCATGCAGGCTCTTGCATTTATAGTAT
GTGGAGTTGGTTTTGTCGGAACTTAAAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW07TF U 1
AF RR2EW07JQ C 468
BS 1 672 RR2EW07TF
BS 673 931 RR2EW07JQ

RD RR2EW07TF 672 0 0
GTGTTCAAGCTCGATGGAAATTTGTGAATGCAAAGAAGTGCTTGATGACTAGGATGCAGG
AGATGTCCCTCAATTACCATTTCATGGCAGAGCAAGAATCCGGTTCCACTCGACATGCCT
TCTTTGGTTTCAATGGGACTGCGGGTGTATGGAGATTGGCAGCGATGGAAGAAGCCGGAG
GTTGGAAAGATAGGACCACCGTGGAGGACATGGACTTGGCCGTTCGTGTTGGTTTACACG
GCTGGGAATTTGTCTTCGTCAACGACATTACGGTAAAAAGTGAGCTACCAAGCCAGTTTA
AGGCTTTCAGATTCCAGCAACATCGATGGTCATGCGGTCCAGCTAATCTCTTCAGGAAAA
TGACTATGGAAATTATTCACAATAAGAGAGTAAAAATCTGGAAGAAACTGTATGTGATCT
GCAGCTTCTTCTTTGTACGGAAGATCATAGTCCATTTCTTCACCTTCTTTTTCTATTGCG
TCATTCTCCCTACGAGCGTATTCTTCAACGAAGTTAACATTCCGACTTGGTCAACTATGT
ACCTTCCTTTTATGATCACTCTCTTCAATGCCATCGCCACACCAAGATCATTCTACCTCG
TGGTTTTCTGGGTCTTGTTCGAAAATGTAATGGCTATGCATCGGACTAAAGGAACTTTCA
TTGGATTACTTG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2EW07JQ 464 0 0
TTTTTCTATTGCGTCATTCTCCCTACGAGCGTATTCTTCAACGAAGTTAACATTCCGACT
TGGTCAACTATGTACCTTCCTTTTATGATCACTCTCTTCAATGCCATCGCCACACCAAGA
TCATTCTACCTCGTGGTTTTCTGGGTCTTGTTCGAAAATGTAATGGCTATGCATCGGACT
AAAGGAACTTTCATTGGATTACTTGAAGGAGGAAGAGTAAACGAATGGGTCGTCACCGAG
AAATTAGGAGATGCTCTTGAGACTAAATTACTTCCACAAGTGAAAAAACCTCGCAATAGG
CTTCTCGAAAGAGTAAACTCAAAAGAGATGATGGTGGGGATATACATACTGTGTTGTGCA
TGCTACGACTTTGCATATGGAAATACAAGGCTATACATTTATCTATTCATGCAGGCTCTT
GCATTTATAGTATGTGGAGTTGGTTTTGTCGGAACTTAAAATGT

QA 1 464 1 464
DS 



AS 1 2

CO CL4679Contig1 818 2 2 U
GGATTAACAAATATACCACACTAAGTCCACATACATCTCTCTAGGCTCTCTAGCACATCT
TGATTACACATAACCTAAAGAACATGATGCTTCGTGGGTTAAGTCTCGTGTGTTTTTTCA
TGATTGTTAACAAAGCCTACGCTAGAGAATTTATGGTCGGTGGTGCAAAAGGTTGGACCG
TTCCTTACGGGTCTCAAGTTTACAGTCAATGGGCAGAACAGAGCAGATTCCAAGTAGGAG
ACTCTCTGCTGTTCGTCTACCAACCAAACCAAGATTCAGTGTTCCAAGTCACAAGACACG
CTTACGACAGCTGCAACACAGATGCACCAACCGCTAAATTTTCTGATGGCAAAACTTCCT
TCACACTAACCCACTCTGGACCATACTATTTCATCAGCGGAAACAAAGACAACTGCAACA
AAAACGAGAAGCTCGTGGTCATCGTCATGGCTAACAGAAACGGCAAGACCAACGCTACAT
CATCATCACCACCGTCTCGAGCCCCGGCTCCCTTAGGAGAAGCCGCTCCTTCTCCGCCTA
TCACAAGCAACCTTGAGCCTCCAGAAACTTCGCCTACTCAAGAAACTCCAAACAAGGCAG
CTTCCTCATCTTCTTCATTTGTCGCTGCTCTTCTTGGGGCAACTCTTGCTTCCACTCTAT
TCCTACACTAAGAAGTTTCTCTTTTGTCTTCTTTTCTCACTCTGTAAGTTTCCCAGTCTC
TTTTCACATGAGTTTGTTTCCATTGGTGTTTGCTGTTTTTGATTTTTTTTTCCCATTTGT
TTCTCATGTAAAATAAATAAAAAGTTCTACTTGTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY78TF U 1
AF RR2FY78JQ C 113
BS 1 583 RR2FY78TF
BS 584 818 RR2FY78JQ

RD RR2FY78TF 583 0 0
GGATTAACAAATATACCACACTAAGTCCACATACATCTCTCTAGGCTCTCTAGCACATCT
TGATTACACATAACCTAAAGAACATGATGCTTCGTGGGTTAAGTCTCGTGTGTTTTTTCA
TGATTGTTAACAAAGCCTACGCTAGAGAATTTATGGTCGGTGGTGCAAAAGGTTGGACCG
TTCCTTACGGGTCTCAAGTTTACAGTCAATGGGCAGAACAGAGCAGATTCCAAGTAGGAG
ACTCTCTGCTGTTCGTCTACCAACCAAACCAAGATTCAGTGTTCCAAGTCACAAGACACG
CTTACGACAGCTGCAACACAGATGCACCAACCGCTAAATTTTCTGATGGCAAAACTTCCT
TCACACTAACCCACTCTGGACCATACTATTTCATCAGCGGAAACAAAGACAACTGCAACA
AAAACGAGAAGCTCGTGGTCATCGTCATGGCTAACAGAAACGGCAAGACCAACGCTACAT
CATCATCACCACCGTCTCGAGCCCCGGCTCCCTTAGGAGAAGCCGCTCCTTCTCCGCCTA
TCACAAGCAACCTTGAGCCTCCAGAAACTTCGCCTACTCAAGA

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2FY78JQ 706 0 0
TTTTTTCATGATTGTTAACAAAGCCTACGCTAGAGAATTTATGGTCGGTGGTGCAAAAGG
TTGGACCGTTCCTTACGGGTCTCAAGTTTACAGTCAATGGGCAGAACAGAGCAGATTCCA
AGTAGGAGACTCTCTGCTGTTCGTCTACCAACCAAACCAAGATTCAGTGTTCCAAGTCAC
AAGACACGCTTACGACAGCTGCAACACAGATGCACCAACCGCTAAATTTTCTGATGGCAA
AACTTCCTTCACACTAACCCACTCTGGACCATACTATTTCATCAGCGGAAACAAAGACAA
CTGCAACAAAAACGAGAAGCTCGTGGTCATCGTCATGGCTAACAGAAACGGCAAGACCAA
CGCTACATCATCATCACCACCGTCTCGAGCCCCGGCTCCCTTAGGAGAAGCCGCTCCTTC
TCCGCCTATCACAAGCAACCTTGAGCCTCCAGAAACTTCGCCTACTCAAGAAACTCCAAA
CAAGGCAGCTTCCTCATCTTCTTCATTTGTCGCTGCTCTTCTTGGGGCAACTCTTGCTTC
CACTCTATTCCTACACTAAGAAGTTTCTCTTTTGTCTTCTTTTCTCACTCTGTAAGTTTC
CCAGTCTCTTTTCACATGAGTTTGTTTCCATTGGTGTTTGCTGTTTTTGATTTTTTTTTC
CCATTTGTTTCTCATGTAAAATAAATAAAAAGTTCTACTTGTGTGC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4681Contig1 1209 2 2 U
GGGTCGTCCGCGGTTCACTACCTTCTTTTCCAAACTATTAGGGTTACGGCGACCTCACTT
CGTACGCTCCTCCTCTGTTATCATCTCCAGATTGAAAAATGCCTCGCTTTGATGATCGAT
ATGGAAACACTCGCCTTTATGTTGGGCGCTTGTCATCTAGAACTCGTACCAGAGACCTTG
AGCGTCTTTTCAGCAGATACGGAAGAGTACGAGATGTTGATATGAAGCGCGATTATGCCC
TTGTTGAATTTAGTGATCCTCGTGACGCTGATGACGCAAGACATTACCTAGATGGGCGAG
ACTTTGATGGAAGTCGCATCACTGTGGAGGCTTCCAGAGGGGCACCTCGTGGTTCTCGGG
ATTCTCGGGATAATGGTAGTAGAGGTCCGCCTCCTGGTTCTGGTCGCTGTTTTAACTGTG
GTGTTGATGGTCACTGGGCTCGGGACTGCACAGCAGGAGACTGGAAGAACAAATGTTACC
GCTGTGGTGAAAGAGGACACATTGAGAGAAACTGCAAGAACAGTCCTAGTAGTCCTAAGA
AGGCCAGGGGTGGTGGAAGCTACTCCAGGTCACCAGTTAAATCACGCTCTCCTCGCCGCA
GAAGAAGCCCAAGCCGTAGCCGTAGTTACAGCCGTGGTCGTAGCTACAGTCGATCGCGGT
CGCCAGTGAGAAGAGAGAGAAGCGTGGAGGATAGATCACTCAGTCCCAAGGCAATGGAAC
GATCCGTATTTCCCAGAGGCAAAGACCAAAGCATGAGTCCAGACAGAAGGGTCGCAGATT
CAAGTCCAAAACGTGAAAAGCAAGAAGGATCAGACTATGAAGGCAGCCCAAAAGAGAATG
GTAATGGGAAGAACTCTGTGAGTCCAATTTTAGGAGGTGAAGAGAGTCCTGCTGGACTTG
ATGGTCAAGACAGGAGTCCCATTGATGATGAGGCTGAACTTAACCGTTCTTCCCCTAAAG
GCAGCGAGTCACCTTGATGTCTCATTGGTTGCCCCAACAGGTTAAAAAGCTCACTGCATG
TCGTTGTGTGTCAATGGATGATGCTGTTCCTTCCTTGACTTACTTTCATTGTCATGAGAC
AGCTTTCAAACTATGTTATCTTTCATACATTTCTTTTGAGCAACATACATTTATTTCTCG
TTTGACTCTGTAAGAATAAAGCTTTGAGTGTTTATTCTCTTTTTGATTATATTCAGCACT
TTTATCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV28TF U 1
AF RR2AV28JQ C 396
BS 1 704 RR2AV28TF
BS 705 1209 RR2AV28JQ

RD RR2AV28TF 704 0 0
GGGTCGTCCGCGGTTCACTACCTTCTTTTCCAAACTATTAGGGTTACGGCGACCTCACTT
CGTACGCTCCTCCTCTGTTATCATCTCCAGATTGAAAAATGCCTCGCTTTGATGATCGAT
ATGGAAACACTCGCCTTTATGTTGGGCGCTTGTCATCTAGAACTCGTACCAGAGACCTTG
AGCGTCTTTTCAGCAGATACGGAAGAGTACGAGATGTTGATATGAAGCGCGATTATGCCC
TTGTTGAATTTAGTGATCCTCGTGACGCTGATGACGCAAGACATTACCTAGATGGGCGAG
ACTTTGATGGAAGTCGCATCACTGTGGAGGCTTCCAGAGGGGCACCTCGTGGTTCTCGGG
ATTCTCGGGATAATGGTAGTAGAGGTCCGCCTCCTGGTTCTGGTCGCTGTTTTAACTGTG
GTGTTGATGGTCACTGGGCTCGGGACTGCACAGCAGGAGACTGGAAGAACAAATGTTACC
GCTGTGGTGAAAGAGGACACATTGAGAGAAACTGCAAGAACAGTCCTAGTAGTCCTAAGA
AGGCCAGGGGTGGTGGAAGCTACTCCAGGTCACCAGTTAAATCACGCTCTCCTCGCCGCA
GAAGAAGCCCAAGCCGTAGCCGTAGTTACAGCCGTGGTCGTAGCTACAGTCGATCGCGGT
CGCCAGTGAGAAGAGAGAGAAGCGTGGAGGATAGATCACTCAGT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2AV28JQ 814 0 0
GGTTCTGGTCGCTGTTTTAACTGTGGTGTTGATGGTCACTGGGCTCGGGACTGCACAGCA
GGAGACTGGAAGAACAAATGTTACCGCTGTGGTGAAAGAGGACACATTGAGAGAAACTGC
AAGAACAGTCCTAGTAGTCCTAAGAAGGCCAGGGGTGGTGGAAGCTACTCCAGGTCACCA
GTTAAATCACGCTCTCCTCGCCGCAGAAGAAGCCCAAGCCGTAGCCGTAGTTACAGCCGT
GGTTGTAGCTACAGTCGATCGCGGTCGCCAGTGAGAAGAGAGAGAAGCGTGGAGGATAGA
TCACTCAGTCCCAAGGCAATGGAACGATCCGTATTTCCCAGAGGCAAAGACCAAAGCATG
AGTCCAGACAGAAGGGTCGCAGATTCAAGTCCAAAACGTGAAAAGCAAGAAGGATCAGAC
TATGAAGGCAGCCCAAAAGAGAATGGTAATGGGAAGAACTCTGTGAGTCCAATTTTAGGA
GGTGAAGAGAGTCCTGCTGGACTTGATGGTCAAGACAGGAGTCCCATTGATGATGAGGCT
GAACTTAACCGTTCTTCCCCTAAAGGCAGCGAGTCACCTTGATGTCTCATTGGTTGCCCC
AACAGGTTAAAAAGCTCACTGCATGTCGTTGTGTGTCAATGGATGATGCTGTTCCTTCCT
TGACTTACTTTCATTGTCATGAGACAGCTTTCAAACTATGTTATCTTTCATACATTTCTT
TTGAGCAACATACATTTATTTCTCGTTTGACTCTGTAAGAATAAAGCTTTGAGTGTTTAT
TCTCTTTTTGATTATATTCAGCACTTTTATCTAT

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL4682Contig1 812 2 8 U
GCTTACTGATCAGAGAGAGACCACCATCCTCTGGAGCAAATCCACTGGTCTTCCTCTCCA
CAAAGCCATTGTCTGGATGGATGCTCGCACCAGTTCCATCTGCAGGAGACTAGAGAAGGA
ACTCTCAGGTGGAAGATCACATTTCGTTGAGTCTTGCGGATTGCCCATAAGCACATACTT
CTCTGCCATGAAGCTTCTCTGGCTGATGGAGAATGTGGATGCTGTCAAGGATGCTATCAA
GAAAGGAGACGCCATCTTCGGCACTATCGATACTTGGCTTATCTGGAACATGACTGGTGG
TATCAACGGCGGGCTACACGTCACCGACGTCACCAACGCCTCTCGCACCATGCTCATGAA
CCTCAAGACCTTGACCTGGGACCAGGAAACTCTCAAGACGCTCGGCATTCCTGCTGAGAT
CTTACCCAAGATCGTGAACAACTCAGAGGTCATTGGAGAAATCTGCAAAGGCTGGCCCAT
TCCTGGTATCAAGATCGCTGGATGTCTTGGCGACCAACACGCTGCAATGCTGGGACAAGC
TTGTAGGAAAGGTGAGGCCAAGAGTACTTACGGCACTGGCGCTTTCATTCTTCTCAACAC
AGGAGAAGTCCCCATCAAATCAGGACATGGGCTTTTGACCACGCAATCCTACAAGCTAGG
TCCTCAAGCTCAGACAAACTATGCTCTTGAAAGTTCGATTGCTATAGCAGAGCTGCTGTT
CAGTGGCTTAGAGATAGCCTTGGGATTATCAAGAGTGCTAGTGAGATTGAAGACTTGGCG
GCTATGGTGGAATCAACGGGAGGAGTGTACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH66TF U 1
AF RR2EZ91TF U 74
BS 1 382 RR2GH66TF
BS 383 383 RR2EZ91TF
BS 384 402 RR2GH66TF
BS 403 403 RR2EZ91TF
BS 404 405 RR2GH66TF
BS 406 406 RR2EZ91TF
BS 407 569 RR2GH66TF
BS 570 812 RR2EZ91TF

RD RR2GH66TF 569 0 0
GCTTACTGATCAGAGAGAGACCACCATCCTCTGGAGCAAATCCACTGGTCTTCCTCTCCA
CAAAGCCATTGTCTGGATGGATGCTCGCACCAGTTCCATCTGCAGGAGACTAGAGAAGGA
ACTCTCAGGTGGAAGATCACATTTCGTTGAGTCTTGCGGATTGCCCATAAGCACATACTT
CTCTGCCATGAAGCTTCTCTGGCTGATGGAGAATGTGGATGCTGTCAAGGATGCTATCAA
GAAAGGAGACGCCATCTTCGGCACTATCGATACTTGGCTTATCTGGAACATGACTGGTGG
TATCAACGGCGGGCTACACGTCACCGACGTCACCAACGCCTCTCGCACCATGCTCATGAA
CCTCAAGACCTTGACCTGGGACGAGGAAACTCTCAAGACGCTTGGTATTCCTGCTGAGAT
CTTACCCAAGATCGTGAACAACTCAGAGGTCATTGGAGAAATCTGCAAAGGCTGGCCCAT
TCCTGGTATCAAGATCGCTGGATGTCTTGGCGACCAACACGCTGCAATGCTGGGACAAGC
TTGTAGGAAAGGTGAGGCCAAGAGTACTT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2EZ91TF 739 0 0
G
GGATGGATGCTCGCACCAGTTCCATCTGCAGGAGACTAGAGAAGGAACTCTCAGGTGGAA
GATCACATTTCGTTGAGTCTTGCGGATTGCCCATAAGCACATACTTCTCTGCCATGAAGC
TTCTCTGGCTGATGGAGAATGTGGATGCTGTCAAGGATGCTATCAAGAAAGGAGACGCCA
TCTTCGGCACTATCGATACTTGGCTTATCTGGAACATGACTGGTGGTATCAACGGCGGGC
TACACGTCACCGACGTCACCAACGCCTCTCGCACCATGCTCATGAACCTCAAGACCTTGA
CCTGGGACCAGGAAACTCTCAAGACGCTCGGCGTTCCTGCTGAGATCTTACCGAAGATCG
TGAGCAACTCAGAGGTCATTGGAGAAATCTGCAAAGGCTGGCCCATTCCTGGTATCAAGA
TCGCTGGATGTCTTGGCGACCAACACGCTGCAATGCTGGGACAAGCTTGTAGGAAAGGTG
AGGCCAAGAGTACTTACGGCACTGGCGCTTTCATTCTTCTCAACACAGGAGAAGTCCCCA
TCAAATCAGGACATGGGCTTTTGACCACGCAATCCTACAAGCTAGGTCCTCAAGCTCAGA
CAAACTATGCTCTTGAAAGTTCGATTGCTATAGCAGAGCTGCTGTTCAGTGGCTTAGAGA
TAGCCTTGGGATTATCAAGAGTGCTAGTGAGATTGAAGACTTGGCGGCTATGGTGGAATC
AACGGGAGGAGTGTACTT

QA 2 739 2 739
DS 



AS 1 2

CO CL4683Contig1 901 2 2 U
GGAAGGCAAAGCGAAAGCAAAAGGGGACAAAACGTAAAGTGCAGAGCCTTCCTTCTTCTT
CTTCGTCAAGAAGAAGCTGCTGCAGCCTCTTCAGGACTCTATCGTCGCCTAATCGCTAAA
AAAGGAATCAACTTTGACATCGTTCATCAGACTATTCGAAAAGGATCATTGATTCTCCCG
CTCCTTAAAGTCTCGACCTTTCCAGATCTTTCGGAGCCCCGTTTACTTCAAATCGATGGG
TGCAGTGGTTGCCTGGCTTGCTACAGAGAACCTAGAACAACTGAAACTCTAAAGGATCCA
CCTTTAAATCCCACAGTTAAAACGTTTAAGAAACCAAACGCCTCTGAAGATTTTTGGTCA
ACCAGCACTGTCGATATGGACAACACCACCTTCCCTTCTCAGGGGAGCATCTCGTCGTCC
AACCAGACTTTTGAGTCTCAGTCTGGTGCTAGGAACTCTAATCCCCCTCCTCCTCCTGAA
TTTGTAAACCAAGGTCTTCTTCTTTGGAATCAGACCCGGGAGCGTTGGGTGGGCAAGGAA
AGACGTAATAGTAACCCACCGGATCACAGTCAAGGAGCTAAGATTAATTGGAACGCAGCA
TCGTATGATAACTTGCTGGGGAGCAACAAGTTATTTCCCCAACCCATTCCTCTCAATGAA
ATGGTGGATTTTCTGGTGGAGGTTTGGGAACAAGAAGGTCTATATGACTGATGAAACAGC
ACTCTCATCATATACACACACATACACAATGGTTCGAGTCATCTCAGATTTTTTTTTCTG
TTCCGGTTTTGGTTTGATTTCTGAAACCCCTTGTTGTACTATCTCAATGAGAAAATCCCT
TGTTGTACCATCTCTCAGTCTATAAAGGCTTAAGATTTATGTCCGGATTTGACCAATCAG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2A248TF U 1
AF RR2A248JQ C 218
BS 1 692 RR2A248TF
BS 693 901 RR2A248JQ

RD RR2A248TF 692 0 0
GGAAGGCAAAGCGAAAGCAAAAGGGGACAAAACGTAAAGTGCAGAGCCTTCCTTCTTCTT
CTTCGTCAAGAAGAAGCTGCTGCAGCCTCTTCAGGACTCTATCGTCGCCTAATCGCTAAA
AAAGGAATCAACTTTGACATCGTTCATCAGACTATTCGAAAAGGATCATTGATTCTCCCG
CTCCTTAAAGTCTCGACCTTTCCAGATCTTTCGGAGCCCCGTTTACTTCAAATCGATGGG
TGCAGTGGTTGCCTGGCTTGCTACAGAGAACCTAGAACAACTGAAACTCTAAAGGATCCA
CCTTTAAATCCCACAGTTAAAACGTTTAAGAAACCAAACGCCTCTGAAGATTTTTGGTCA
ACCAGCACTGTCGATATGGACAACACCACCTTCCCTTCTCAGGGGAGCATCTCGTCGTCC
AACCAGACTTTTGAGTCTCAGTCTGGTGCTAGGAACTCTAATCCCCCTCCTCCTCCTGAA
TTTGTAAACCAAGGTCTTCTTCTTTGGAATCAGACCCGGGAGCGTTGGGTGGGCAAGGAA
AGACGTAATAGTAACCCACCGGATCACAGTCAAGGAGCTAAGATTAATTGGAACGCAGCA
TCGTATGATAACTTGCTGGGGAGCAACAAGTTATTTCCCCAACCCATTCCTCTCAATGAA
ATGGTGGATTTTCTGGTGGAGGTTTGGGAACA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2A248JQ 684 0 0
CCCGTTTACTTCAAATCGATGGGTGCAGTGGTTGCCTGGCTTGCTACAGAGAACCTAGAA
CAACTGAAACTCTAAAGGATCCACCTTTAAATCCCACAGTTAAAACGTTTAAGAAACCAA
ACGCCTCTGAAGATTTTTGGTCAACCAGCACTGTCGATATGGACAACACCACCTTCCCTT
TTCAGGGGAGCATCTCGTCGTCCAACCAGACTTTTGAGTCTCAGTCTGGTGCTAGGAACT
CTAATCCCCCTCCTCCTCCTGAATTTGTAAACCAAGGTCTTCTTCTTTGGAATCAGACCC
GGGAGCGTTGGGTGGGCAAGGAAAGACGTAATAGTAACCCACCGGATCACAGTCAAGGAG
CTAAGATTAATTGGAACGCAGCATCGTATGATAACTTGCTGGGGAGCAACAAGTTATTTC
CCCAACCCATTCCTCTCAATGAAATGGTGGATTTTCTGGTGGAGGTTTGGGAACAAGAAG
GTCTATATGACTGATGAAACAGCACTCTCATCATATACACACACATACACAATGGTTCGA
GTCATCTCAGATTTTTTTTTCTGTTCCGGTTTTGGTTTGATTTCTGAAACCCCTTGTTGT
ACTATCTCAATGAGAAAATCCCTTGTTGTACCATCTCTCAGTCTATAAAGGCTTAAGATT
TATGTCCGGATTTGACCAATCAGC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL4684Contig1 581 2 1 U
GGATCCCATCATTTATCTTTCTTAAGACTCTCTCTTCTCTCTCTTTTCTCACGCAAAAGA
AGAAAAAAAATGTCAGGCCAAGGTCAAAAAACCATTTGTGACGGAAGTGCATGCGGATCA
ACCTCACAGCTAAAAAAAACTAGATGTGGCCACTACACTCTCTGTGACATGTGTATGGGA
GGAGGATACAACCTTCCTTCAATATTTTGGAAACCGAGGTTCGAGTGTGACATTTGCAAA
AGGGAGAAGAAACAGAGTAAGGAGGCTTCGGGAGAGGCTTCGGGAGAGGCTTCGGGAGAG
GCAGCAGCAAAATGAAAATCTCAAGCTTCTTCCTTTCTCTGCACAATAAAGCTCTTTGAG
CTATTTCATCTTGTTTCAATAAGCTCTATGAGCATCAGTGTGTCTCTATCCCCTTGAACT
CAATGTCGGGGCGCTTTAGTCTGGTTCGCACATCGTGTTTGTACGATGCTGCTTCTTGCT
TTGTAACCGTTTAGATTTCTTAATAAAAACATTTGTACGAAAAGCTTCTTAAACCAGGTT
TATCATACATACCATTGAAAGATAATAATAGAGAGAAGATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EM74JQ C 1
AF RR2EM74TF U 1
BS 1 581 RR2EM74TF

RD RR2EM74JQ 581 0 0
GGATCCCATCATTTATCTTTCTTAAGACTCTCTCTTCTCTCTCTTTTCTCACGCAAAAGA
AGAAAAAAAATGTCAGGCCAAGGTCAAAAAACCATTTGTGACGGAAGTGCATGCGGATCA
ACCTCACAGCTAAAAAAAACTAGATGTGGCCACTACACTCTCTGTGACATGTGTATGGGA
GGAGGATACAACCTTCCTTCAATATTTTGGAAACCGAGGTTCGAGTGTGACATTTGCAAA
AGGGAGAAGAAACAGAGTAAGGAGGCTTCGGGAGAGGCTTCGGGAGAGGCTTCGGGAGAG
GCAGCAGCAAAATGAAAATCTCAAGCTTCTTCCTTTCTCTGCACAATAAAGCTCTTTGAG
CTATTTCATCTTGTTTCAATAAGCTCTATGAGCATCAGTGTGTCTCTATCCCCTTGAACT
CAATGTCGGGGCGCTTTAGTCTGGTTCGCACATCGTGTTTGTACGATGCTGCTTCTTGCT
TTGTAACCGTTTAGATTTCTTAATAAAAACATTTGTACGAAAAGCTTCTTAAACCAGGTT
TATCATACATACCATTGAAAGATAATAATAGAGAGAAGATG

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2EM74TF 581 0 0
GGATCCCATCATTTATCTTTCTTAAGACTCTCTCTTCTCTCTCTTTTCTCACGCAAAAGA
AGAAAAAAAATGTCAGGCCAAGGTCAAAAAACCATTTGTGACGGAAGTGCATGCGGATCA
ACCTCACAGCTAAAAAAAACTAGATGTGGCCACTACACTCTCTGTGACATGTGTATGGGA
GGAGGATACAACCTTCCTTCAATATTTTGGAAACCGAGGTTCGAGTGTGACATTTGCAAA
AGGGAGAAGAAACAGAGTAAGGAGGCTTCGGGAGAGGCTTCGGGAGAGGCTTCGGGAGAG
GCAGCAGCAAAATGAAAATCTCAAGCTTCTTCCTTTCTCTGCACAATAAAGCTCTTTGAG
CTATTTCATCTTGTTTCAATAAGCTCTATGAGCATCAGTGTGTCTCTATCCCCTTGAACT
CAATGTCGGGGCGCTTTAGTCTGGTTCGCACATCGTGTTTGTACGATGCTGCTTCTTGCT
TTGTAACCGTTTAGATTTCTTAATAAAAACATTTGTACGAAAAGCTTCTTAAACCAGGTT
TATCATACATACCATTGAAAGATAATAATAGAGAGAAGATG

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL4685Contig1 909 2 4 U
GGACTCACAATTATGACTTCTCTTCATTGAATGAAGAGGAGCCTCTCTACATCACAGGTT
AAATAAGAACACACATTCCAGAGAGAGACCCTTCCATTAACATTCTTTGTTCATATCCTT
AGAAGAAACATCCACAATTAGACATGGGTGGTTGCACAAGCAAGCAAGAGAGGCCTAGTA
TGAGAAGTGTCAAGAAGGAGACTTCAACTGAGAGAAGCAGAGGAAGAAGACACATAAGAA
GAGGAACGGATGAGAGTGAGAAAGTGATGTTTGATAAACTTAGAGAGGCAGAGAGAGAGT
GGGGGAAAGAGAGGAAGAAGCTTAGAGAGCAAGTGAAGAGGCTAAGGAAGAAAGTGGAGG
AGAAAGAGGAAGCAAAGACAACAACAACAGAGGAGAGAGAGTACTGGAAATGGGTTGTTG
AGGAGATGTGTGTGGAGAGAGCAGTGAGAGATGAAGCCGTGGAGAAATGGAAACAACTTT
ATTTAGCTATCAAGAATGAGCTTGATCATCTCATCATCCACACAACTTCCTCCTCTTCTG
GAGAGGCAATGATGCAAAGGCAACTTGAGGGCAAATGTGAAGAAGAAGCAGTTAAGACAG
TGGAGGAGCTGAGAGATGAAGTTAGAGTTAAGGAAAATACCATTGAGACATTAAAAGAGA
AAATAGCATTGATGGATAGAGAAAAGTATGAGAAGGAAAGAGAGATTGATTTACTTAGAC
AGAGTTTGAGGATTTTAGGAAGCAGGAAGAATAAGAAGAAAAGAGCATCGTTTGCATCAA
TGAATTTGATGATTTTGAAGACCAAATGTGTGGGATGTACATAACACTTAAAACAGTCTT
CCTGCAACAGTGATGATATTTCTCACTTGTCAGAGAATCTTTGATCAACAATGTCATATT
ATTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM45TF U 1
AF RR2BM45JQ C 209
BS 1 695 RR2BM45TF
BS 696 696 RR2BM45JQ
BS 697 706 RR2BM45TF
BS 707 909 RR2BM45JQ

RD RR2BM45TF 706 0 0
GGACTCACAATTATGACTTCTCTTCATTGAATGAAGAGGAGCCTCTCTACATCACAGGTT
AAATAAGAACACACATTCCAGAGAGAGACCCTTCCATTAACATTCTTTGTTCATATCCTT
AGAAGAAACATCCACAATTAGACATGGGTGGTTGCACAAGCAAGCAAGAGAGGCCTAGTA
TGAGAAGTGTCAAGAAGGAGACTTCAACTGAGAGAAGCAGAGGAAGAAGACACATAAGAA
GAGGAACGGATGAGAGTGAGAAAGTGATGTTTGATAAACTTAGAGAGGCAGAGAGAGAGT
GGGGGAAAGAGAGGAAGAAGCTTAGAGAGCAAGTGAAGAGGCTAAGGAAGAAAGTGGAGG
AGAAAGAGGAAGCAAAGACAACAACAACAGAGGAGAGAGAGTACTGGAAATGGGTTGTTG
AGGAGATGTGTGTGGAGAGAGCAGTGAGAGATGAAGCCGTGGAGAAATGGAAACAACTTT
ATTTAGCTATCAAGAATGAGCTTGATCATCTCATCATCCACACAACTTCCTCCTCTTCTG
GAGAGGCAATGATGCAAAGGCAACTTGAGGGCAAATGTGAAGAAGAAGCAGTTAAGACAG
TGGAGGAGCTGAGAGATGAAGTTAGAGTTAAGGAAAATACCATTGAGACATTAAAAGAGA
AAATAGCATTGATGGATAGAGAAAAGTATGAGAAG*AAAGAGAGAT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2BM45JQ 701 0 0
TGAGAGAAGCAGAGGAAGAAGACACATAAGAAGAGGAACGGATGAGAGTGAGAAAGTGAT
GTTTGATAAACTTAGAGAGGCAGAGAGAGAGTGGGGGAAAGAGAGGAAGAAGCTTAGAGA
GCAAGTGAAGAGGCTAAGGAAGAAAGTGGAGGAGAAAGAGGAAGCAAAGACAACAACAAC
AGAGGAGAGAGAGTACTGGAAATGGGTTGTTGAGGAGATGTGTGTGGAGAGAGCAGTGAG
AGATGAAGCCGTGGAGAAATGGAAACAACTTTATTTAGCTATCAAGAATGAGCTTGATCA
TTTCATCATCCACACAACTTCCTCCTTTTCTGGAGAGGCAATGATGCAAAGGCAACTTGA
GGGCAAATGTGAAGAAGAAGCAGTTAAGACAGTGGAGGAGCTGAGAGATGAAGTTAGAGT
TAAGGAAAATACCATTGAGACATTAAAAGAGAAAATAGCATTGATGGATAGAGAAAAGTA
TGAGAAGGAAAGAGAGATTGATTTACTTAGACAGAGTTTGAGGATTTTAGGAAGCAGGAA
GAATAAGAAGAAAAGAGCATCGTTTGCATCAATGAATTTGATGATTTTGAAGACCAAATG
TGTGGGATGTACATAACACTTAAAACAGTCTTCCTGCAACAGTGATGATATTTCTCACTT
GTCAGAGAATCTTTGATCAACAATGTCATATTATTTTTTTT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL4686Contig1 431 2 1 U
GGAGATTGAAGAGTTCTTATCTGAGCTAGAGAATAAAGATCAGAAACGATTCATTGAGAA
GTACAACTTCGATATCGTTAATGACAAACCGCTCCAAGGTCGCTACAAGTGGGGATCGAT
TTAAGCCATGAAAGGAATGACAAATAACATGCGGAAGAAGATAGCTTTTTTTTTCCTAAT
CACATTCCACTTGTACAGCTCTCTTTTTCTCTAATCAGTTTAGCCTATGTTAGTTGTACA
AACAAATGAAAAAAAAAAATACAAGCTTTATGTCGAGATTTATGATCTTGAATGATTAAG
TAATCTCTATGGGTTTTGATTTTGTGGGGGTTTATCAGGTTTATTTTAATTGCATGAATA
TGGAAAGGTTTGTTCTTGTTTGGATTTTAAAACATTGGATGCTTATTACAAATTTTTATT
TGTTTCTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D341TF U 1
AF RR2D341JQ C 295
BS 1 431 RR2D341TF

RD RR2D341TF 431 0 0
GGAGATTGAAGAGTTCTTATCTGAGCTAGAGAATAAAGATCAGAAACGATTCATTGAGAA
GTACAACTTCGATATCGTTAATGACAAACCGCTCCAAGGTCGCTACAAGTGGGGATCGAT
TTAAGCCATGAAAGGAATGACAAATAACATGCGGAAGAAGATAGCTTTTTTTTTCCTAAT
CACATTCCACTTGTACAGCTCTCTTTTTCTCTAATCAGTTTAGCCTATGTTAGTTGTACA
AACAAATGAAAAAAAAAAATACAAGCTTTATGTCGAGATTTATGATCTTGAATGATTAAG
TAATCTCTATGGGTTTTGATTTTGTGGGGGTTTATCAGGTTTATTTTAATTGCATGAATA
TGGAAAGGTTTGTTCTTGTTTGGATTTTAAAACATTGGATGCTTATTACAAATTTTTATT
TGTTTCTTGCC

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR2D341JQ 137 0 0
ATTAAGTAATCTCTATGGGTTTTGATTTTGTGGGGGTTTATCAGGTTTATTTTAATTGCA
TGAATATGGAAAGGTTTGTTCTTGTTTGGATTTTAAAACATTGGATGCTTATTACAAATT
TTTATTTGTTTCTTGCC

QA 1 137 1 137
DS 



AS 1 2

CO CL4687Contig1 864 2 4 U
GTGCAAGGGACAAGCTGGTTAGTTTGCCTTTCATTCATTCTCTGTCTGTTGGTCCCGTTT
ATGTTTTTGGAGTTGTTGTTCATGTTGACAGATATAAACAATATCCACCCTTTTGACCAT
AACACACGTTATTGGTTTTTTTCCGTTTGTTGCAGAAAAGAGTGTTGATTATGAATCAAT
GGCTATTTGAATTGGGCAGGACCGCAGGTTAAAGAAAACAGTGCATGATTGGTTACTTTG
CTTACTCGTGGTTTTGCAAAGAGCAGTGTATGCATCTTCTAAGTCGGTAAAAGACTGAGC
AAGCGGAATCTGAAGCGAAGAAGCAAGTTCCTCTTGAAACTCTAGAGGCTTTGCTTTATT
TTACTTTATAGTATTTAGCAGTGTGCAAGAGAAGGATGAAAACGTGGATGGAGATCCATA
GCAAGTTTTCCAGCACCAGAATATTGGTGAGGACATGAGAAAGTATACTTTCTTGGTTGG
CTTTGGGCTTAACAGGCGGAGTCGAAATGGATATATAGTGCTGCTGTCTACTGACTTGAA
ATAGATTGGGATTAAGAAAGAGGACGGAGAGAAGATTTTGTCAATAGGATGAGTCTAAAG
TGATTACTTGGTTAAATTATTCTCACATTATATGGTCATATAGAGTGTATGCAGCCAAAT
GGTATCTTGTATGCAGCTTTACATCTTCTTTTGTCAGACATCTCTATAGACTATCATGTT
CAACTTCTACGAAAATAAATCGTGGAAGCTAGGAGAAAGATGATATACACTAATCTATCA
GAAGTTTTTCCTACTATCCCTAATCATTTACTCTGTTCAGCTCTTTTACAATTGTACAAA
TATAAAATATATGTACTTTTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B401JQ C 1
AF RR2B401TF U 1
BS 1 830 RR2B401TF
BS 831 831 RR2B401JQ
BS 832 858 RR2B401TF
BS 859 864 RR2B401JQ

RD RR2B401JQ 864 0 0
GTGCAAGGGACAAGCTGGTTAGTTTGCCTTTCATTCATTCTCTGTCTGTTGGTCCCGTTT
ATGTTTTTGGAGTTGTTGTTCATGTTGACAGATATAAACAATATCCACCCTTTTGACCAT
AACACACGTTATTGGTTTTTTTCCGTTTGTTGCAGAAAAGAGTGTTGATTATGAATCAAT
GGCTATTTGAATTGGGCAGGACCGCAGGTTAAAGAAAACAGTGCATGATTGGTTACTTTG
CTTACTCGTGGTTTTGCAAAGAGCAGTGTATGCATCTTCTAAGTCGGTAAAAGACTGAGC
AAGCGGAATCTGAAGCGAAGAAGCAAGTTCCTCTTGAAACTCTAGAGGCTTTGCTTTATT
TTACTTTATAGTATTTAGCAGTGTGCAAGAGAAGGATGAAAACGTGGATGGAGATCCATA
GCAAGTTTTCCAGCACCAGAATATTGGTGAGGACATGAGAAAGTATACTTTCTTGGTTGG
CTTTGGGCTTAACAGGCGGAGTCGAAATGGATATATAGTGCTGCTGTCTACTGACTTGAA
ATAGATTGGGATTAAGAAAGAGGACGGAGAGAAGATTTTGTCAATAGGATGAGTCTAAAG
TGATTACTTGGTTAAATTATTCTCACATTATATGGTCATATAGAGTGTATGCAGCCAAAT
GGTATCTTGTATGCAGCTTTACATCTTCTTTTGTCAGACATCTCTATAGACTATCATGTT
CAACTTCTACGAAAATAAATCGTGGAAGCTAGGAGAAAGATGATATACACTAATCTATCA
GAAGTTTTTCCTACTATCCCTAATCATTTACTCTGTTCAGCTCTTTTACAATTGTACAAA
TATAAAATATATGTACTTTTTTCC

QA 1 864 1 864
DS 

RD RR2B401TF 858 0 0
GTGCAAGGGACAAGCTGGTTAGTTTGCCTTTCATTCATTCTCTGTCTGTTGGTCCCGTTT
ATGTTTTTGGAGTTGTTGTTCATGTTGACAGATATAAACAATATCCACCCTTTTGACCAT
AACACACGTTATTGGTTTTTTTCCGTTTGTTGCAGAAAAGAGTGTTGATTATGAATCAAT
GGCTATTTGAATTGGGCAGGACCGCAGGTTAAAGAAAACAGTGCATGATTGGTTACTTTG
CTTACTCGTGGTTTTGCAAAGAGCAGTGTATGCATCTTCTAAGTCGGTAAAAGACTGAGC
AAGCGGAATCTGAAGCGAAGAAGCAAGTTCCTCTTGAAACTCTAGAGGCTTTGCTTTATT
TTACTTTATAGTATTTAGCAGTGTGCAAGAGAAGGATGAAAACGTGGATGGAGATCCATA
GCAAGTTTTCCAGCACCAGAATATTGGTGAGGACATGAGAAAGTATACTTTCTTGGTTGG
CTTTGGGCTTAACAGGCGGAGTCGAAATGGATATATAGTGCTGCTGTCTACTGACTTGAA
ATAGATTGGGATTAAGAAAGAGGACGGAGAGAAGATTTTGTCAATAGGATGAGTCTAAAG
TGATTACTTGGTTAAATTATTCTCACATTATATGGTCATATAGAGTGTATGCAGCCAAAT
GGTATCTTGTATGCAGCTTTACATCTTCTTTTGTCAGACATCTCTATAGACTATCATGTT
CAACTTCTACGAAAATAAATCGTGGAAGCTAGGAGAAAGATGATATACACTAATCTATCA
GAAGTTTTTCCTACTATCCCTAATCATTTACTCTGTTCAGCTCTTTTACA*TTGTACAAA
TATAAAATATATGTACTT

QA 1 858 1 858
DS 



AS 1 2

CO CL4688Contig1 590 2 2 U
GGGGGTTTGTTTAACGCTAATGGTGACCCTGTTTACGTGCTGAGGCTGACTAACTCGGGG
TCGGTTCTGTCGAATGATACGACGAACCAGACGTACTGTACTGCGAGAGAAGGTGCTGAT
CCTAAGATGCTTCAAGCTGCGCTTGATTGGGCTTGTGGGCCTGGGAAGATTGATTGTTCG
CCTATTAAGCAAGGAGAGGCTTGTTATGACCCTGATAATGTGGTTGCTCATGCTAACTAT
GCGTTTGATACTTATTATCATCAGACTGGGAATAATCCCGAAGCTTGCAACTTTAATGGT
GTTGCTAGTATCACTACTACAGATCCGAGTCATGGTTCATGTGTGTTTGAAGGAAGCCGC
GGTAGTGGTAAGAACGGGACGTCTGTGAACATAACGGCGCCATCGGCGAATTCAACTAGC
TCTGGAGTGGGGAGTGATTTGTATTACAGTCGGGGAATGTGGAGCATTTTACTGTGATTT
TGAACCTTGTTGCTTTCTTGTAAGAGAATCTTTCGGACATTGGGCTTTTTTAACTTGTTA
GGTGGGAATTGGAGTTAAGATTTGTGTTGGATTCAATTTTGTACACAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS81TF U 1
AF RR2GS81JQB C 49
BS 1 537 RR2GS81TF
BS 538 590 RR2GS81JQB

RD RR2GS81TF 537 0 0
GGGGGTTTGTTTAACGCTAATGGTGACCCTGTTTACGTGCTGAGGCTGACTAACTCGGGG
TCGGTTCTGTCGAATGATACGACGAACCAGACGTACTGTACTGCGAGAGAAGGTGCTGAT
CCTAAGATGCTTCAAGCTGCGCTTGATTGGGCTTGTGGGCCTGGGAAGATTGATTGTTCG
CCTATTAAGCAAGGAGAGGCTTGTTATGACCCTGATAATGTGGTTGCTCATGCTAACTAT
GCGTTTGATACTTATTATCATCAGACTGGGAATAATCCCGAAGCTTGCAACTTTAATGGT
GTTGCTAGTATCACTACTACAGATCCGAGTCATGGTTCATGTGTGTTTGAAGGAAGCCGC
GGTAGTGGTAAGAACGGGACGTCTGTGAACATAACGGCGCCATCGGCGAATTCAACTAGC
TCTGGAGTGGGGAGTGATTTGTATTACAGTCGGGGAATGTGGAGCATTTTACTGTGATTT
TGAACCTTGTTGCTTTCTTGTAAGAGAATCTTTCGGACATTGGGCTTTTTTAACTTG

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2GS81JQB 542 0 0
ACTAACTCGGGGTCGGTTCTGTCGAATGATACGACGACCCAGACGTACTGTACTGCGAGA
GAAGGTGCTGATCCTAAGATGCTTCAAGCTGCGCTTGATTGGGCTTGTGGGCCTGGGAAG
ATTGATTGTTCGCCTATTAAGCAAGGAGAGGCTTGTTATGACCCTGATAATGTGGTTGCT
CATGCTAACTATGCGTTTGATACTTATTATCATCAGACTGGGAATAATCCCGAAGCTTGC
AACTTTAATGGTGTTGCTAGTATCACTACTACAGATCCGAGTCATGGTTCATGTGTGTTT
GAAGGAAGCCGCGGTAGTGGTAAGAACGGGACGTCTGTGAACATAACGGCGCCATCGGCG
AATTCAACTAGCTCTGGAGTGGGGAGTGATTTGTATTACAGTCGGGGAATGTGGAGCATT
TTACTGTGATTTTGAACCTTGTTGCTTTCTTGTAAGAGAATCTTTCGGACATTGGGCTTT
TTTAACTTGTTAGGTGGGAATTGGAGTTAAGATTTGTGTTGGATTCAATTTTGTACACAA
CG

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

CO CL4689Contig1 561 2 1 U
GGCCCTCAATAAGCTATCTTCGTCATCGACGACAGGGAGAACACTCTTCGGCCGTTCTTC
TTCAGCTGCGTCGTCTTCTGGTCCGAATGTCGGAAAATCAGCTGGATTCGCTTTCTCGAA
CGGATCATCTTCATCTCGCTCCTCACTTCGTAGGCTCACATCCTCCAGGGTCCCAGTGGA
GCTGAGTGCAGGAGTGTCGCTTATACCGTTACATAGTGTTACTGCTTCAGCTTTACTCAC
TTCGTTGCTGTCTCTTAGCAATCAGAGCTGGGGTTGCTTATCTGAAGGATTTGGAACGAC
ACTATAACATGGACTGCGAGTTTTTGACTCCTCCAGGTTTACTTGTCAGATTCCAAGAAA
CCCTTTTCATCATTTCATCATCGGTGGTCTGCACTTTTTTTCCCCCCAAAAGGTTTCAGA
TAAAATTACTCTTTGATTTGCCCAAAAAAAAAACATTACTCTTTGAAGAGCTCCTTTGTT
GTGTTTGTTGTGTCATCTTTAGTTGGATGATTTCATTACTTCAACAATTCTGCTGAGGGA
AATAAACTACTCATTTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D989TF U 1
AF RR2D989JQ C 77
BS 1 561 RR2D989TF

RD RR2D989TF 561 0 0
GGCCCTCAATAAGCTATCTTCGTCATCGACGACAGGGAGAACACTCTTCGGCCGTTCTTC
TTCAGCTGCGTCGTCTTCTGGTCCGAATGTCGGAAAATCAGCTGGATTCGCTTTCTCGAA
CGGATCATCTTCATCTCGCTCCTCACTTCGTAGGCTCACATCCTCCAGGGTCCCAGTGGA
GCTGAGTGCAGGAGTGTCGCTTATACCGTTACATAGTGTTACTGCTTCAGCTTTACTCAC
TTCGTTGCTGTCTCTTAGCAATCAGAGCTGGGGTTGCTTATCTGAAGGATTTGGAACGAC
ACTATAACATGGACTGCGAGTTTTTGACTCCTCCAGGTTTACTTGTCAGATTCCAAGAAA
CCCTTTTCATCATTTCATCATCGGTGGTCTGCACTTTTTTTCCCCCCAAAAGGTTTCAGA
TAAAATTACTCTTTGATTTGCCCAAAAAAAAAACATTACTCTTTGAAGAGCTCCTTTGTT
GTGTTTGTTGTGTCATCTTTAGTTGGATGATTTCATTACTTCAACAATTCTGCTGAGGGA
AATAAACTACTCATTTTTGCC

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2D989JQ 485 0 0
TCTGGTCCGAATGTCGGAAAATCAGCTGGATTCGCTTTCTCGAACGGATCATCTTCATCT
CGCTCCTCACTTCGTAGGCTCACATCCTCCAGGGTCCCAGTGGAGCTGAGTGCAGGAGTG
TCGCTTATACCGTTACATAGTGTTACTGCTTCAGCTTTACTCACTTCGTTGCTGTCTCTT
AGCAATCAGAGCTGGGGTTGCTTATCTGAAGGATTTGGAACGACACTATAACATGGACTG
CGAGTTTTTGACTCCTCCAGGTTTACTTGTCAGATTCCAAGAAACCCTTTTCATCATTTC
ATCATCGGTGGTCTGCACTTTTTTTCCCCCCAAAAGGTTTCAGATAAAATTACTCTTTGA
TTTGCCCAAAAAAAAAACATTACTCTTTGAAGAGCTCCTTTGTTGTGTTTGTTGTGTCAT
CTTTAGTTGGATGATTTCATTACTTCAACAATTCTGCTGAGGGAAATAAACTACTCATTT
TTGCC

QA 1 485 1 485
DS 



AS 1 2

CO CL4690Contig1 935 2 6 U
GGCAAAGGAAATAAAAAGTTCCATTAAAATTATAAATAAAAATCGCCCAAGGGATAGAAA
TGGTCGAGACTATACTCCCGACTGATCTAAACTATGCTAAAAGATCATTATGATAAAGGC
AAAAGGCTTAGGTAACCAGATAGGTTGACCACGAAATTTTTATACACTTTATGGCATGAC
TGGACTAGCCATCCATGTCTTTAAAATTGATGCAAAAGATTGATATTGCAAAAGGCACAA
AAGAGTTATCCCAAAGAATCTCACGTTGTGTAACATGTACACGAGGGAAACTCATAAGGC
TATAATGTTCCAAGCATTTAAAAGATTTATAGCATGTTCATGAGGGGGAGAAATGACACT
CCCGTGGTCCATGAACAACACTAAAAATCCGATTGACATGGTCTATGACCATGATAGAAC
TTGGCCGAATTCTTTGTGATACAAAGATCACTAGCTAATGTTTGGGAACACATGGATTTA
CATGTAATAAAAATATGCATCAGGCCATATAAAATGAGCATAGATATTCCCATCTAAGAA
TGATAAAGGGTCATGATCCAGACATAGACCATCTTAAGAGATTATGTATAGACCACCACA
ATAATATGTGCCGTCTAGGATGGAACCTCATAAGAAGATGAGATAAGATTGGGAATATAT
GTTGGATATGAGAATGCTTTCTCCTCACGATTTTATAAGAAACCTTGAGCCAAATATGGG
TGACCAGATTAAGGCCAGGTTTACGGATTGCATGATTAAATCCGACTATCCAACATCAGG
GGGAGAAAGAAATAAGCTGGTACAAGTATAAAGAAATGGAATGGTATTAACCATCCTTGT
CTTGGCAAGATCCTCGGACCAGAGAATATGATTTAAGACGTCCAAAGAAAGATCATACAA
AGCTAGCTAAAAGAATGCCATACAGATTAGACCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW40TFB U 1
AF RR2AW40JQ C 54
BS 1 119 RR2AW40TFB
BS 120 120 RR2AW40JQ
BS 121 160 RR2AW40TFB
BS 161 161 RR2AW40JQ
BS 162 729 RR2AW40TFB
BS 730 935 RR2AW40JQ

RD RR2AW40TFB 729 0 0
GGCAAAGGAAATAAAAAGTTCCATTAAAATTATAAATAAAAATCGCCCAAGGGATAGAAA
TGGTCGAGACTATACTCCCGACTGATCTAAACTATGCTAAAAGATCATTATGATAAAGGG
AAAAGGCTTAGGTAACCAGATAGGTTGACCACGAAATTTT*ATACACTTTATGGCATGAC
TGGACTAGCCATCCATGTCTTTAAAATTGATGCAAAAGATTGATATTGCAAAAGGCACAA
AAGAGTTATCCCAAAGAATCTCACGTTGTGTAACATGTACACGAGGGAAACTCATAAGGC
TATAATGTTCCAAGCATTTAAAAGATTTATAGCATGTTCATGAGGGGGAGAAATGACACT
CCCGTGGTCCATGAACAACACTAAAAATCCGATTGACATGGTCTATGACCATGATAGAAC
TTGGCCGAATTCTTTGTGATACAAAGATCACTAGCTAATGTTTGGGAACACATGGATTTA
CATGTAATAAAAATATGCATCAGGCCATATAAAATGAGCATAGATATTCCCATCTAAGAA
TGATAAAGGGTCATGATCCAGACATAGACCATCTTAAGAGATTATGTATAGACCACCACA
ATAATATGTGCCGTCTAGGATGGAACCTCATAAGAAGATGAGATAAGATTGGGAATATAT
GTTGGATATGAGAATGCTTTCTCCTCACGATTTTATAAGAAACCTTGAGCCAAATATGGG
TGACCAGAT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2AW40JQ 882 0 0
ATAGAAATGGTCGAGACTATACTCCCGACTGATCTAAACTATGCTAAAAGATCATTATGA
TAAAGGCAAAAGGCTTAGGTAACCAGATAGGTTGACCACGAAATTTTTATACACTTTATG
GCATGACTGGACTAGCCATCCATGTCTTTAAAATTGATGCAAAAGATTGATATTGCAAAA
GGCACAAAAGAGTTATCCCAAAGAATCTCACGTTGTGTAACATGTACACGAGGGAAACTC
ATAAGGCTATAATGTTCCAAGCATTTAAAAGATTTATAGCATGTTCATGAGGGGGAGAAA
TGACACTCCCGTGGTCCATGAACAACACTAAAAATCCGATTGACATGGTTTATGACCATG
ATAGAACTTGGCCGAATTCTTTGTGATACAAAGATCACTAGCTAATGTTTGGGAACACAT
GGATTTACATGTAATAAAAATATGCATCAGGCCATATAAAATGAGCATAGATATTCCCAT
CTAAGAATGATAAAGGGTCATGATCCAGACATAGACCATCTTAAGAGATTATGTATAGAC
CACCACAATAATATGTGCCGTTTAGGATGGAACCTCATAAGAAGATGAGATAAGATTGGG
AATATATGTTGGATATGAGAATGCTTTCTCC*CACGATTTTATAAGAAACCTTGAGCCAA
ATATGGGTGACCAGATTAAGGCCAGGTTTACGGATTGCATGATTAAATCCGACTATCCAA
CATCAGGGGGAGAAAGAAATAAGCTGGTACAAGTATAAAGAAATGGAATGGTATTAACCA
TCCTTGTCTTGGCAAGATCCTCGGACCAGAGAATATGATTTAAGACGTCCAAAGAAAGAT
CATACAAAGCTAGCTAAAAGAATGCCATACAGATTAGACCCG

QA 1 882 1 882
DS 



AS 1 2

CO CL4691Contig1 1005 2 2 U
GGGCAAAGATGGGTTTAACAGATGATTTTGAAACTTCCTTGCAAGTTCTCCGTGGTTTTG
ATACTGATATTACCATTGAGGTTAATGAGATCAAGAGATCTGTGGCATCATCTACCAAAC
GTTCTGCAATTCGGTTTGTAGACCTCAAGCGCAGGAGATACTATTTCCCACTAATGGTTG
GTATAGGACTTCTTGTACTTCAACAACTGGGAGGAATTAACGGCGTCTTGTTCTATTCGA
GTACAATCTTTGAATCTGCAGGGGTCTCATCGAGTAATGTAGCAACATTCGGAGTTGGTG
CTGTTCAGGTAGTGGCGACTGCTGTAGCTACATGGTTGGTGGATAAATCAGGTCGGCGAC
TTCTGCTCATGATCGCTTCTATAGGGATGACGATAAGCCTGGTTATTGTAGCAGTCGCAT
TTTACCTTAAGGAATTTGTATCACCTGAGTCGGATATGTACAACATTCTAAGCATGGTCT
CTGTAGTTGGAGTTGTGACTATGGTTATTGCTTGCTCTCTAGGAATGGGACCAATTCCGT
GGCTGATAATGTCTGAGATTCTTCCAGTGAATATAAAAGGCTTAGCCGGGAGTATAGCAA
CTTTGGCCAACTGGTTTGTCTCGTGGTTAGTCACAATGACTGCAAATATGCTTTTAGCTT
GGAGCAGTGGTGGAACGTTTACTCTCTATGCTTTGGTTTGTGGATTCACTGTGGCTTTTG
TAAGTCTTTGGGTTCCTGAGACTAAAGGTAAAACTCTTGAAGAGATTCAAGCTTTGTTCA
GATGATTCAAGAGACGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAGACAGCATTCATTTTTTTC
ATATTTTTTTTTTTGGCCATTACAGAGCATTCTTTTGTCCTTGTCTAAGACTTTCATTTG
TGCTTTGTTCAGTGTCTTTCTTTGGGCATTGATTATATAATGTGTTTATATTGTAAAAGC
ATTTCATTTTGTGTTGTAAAAGCATTTCATTTTGTGTGTGTAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F559TF U 1
AF RR2F559JQ C 226
BS 1 710 RR2F559TF
BS 711 1005 RR2F559JQ

RD RR2F559TF 710 0 0
GGGCAAAGATGGGTTTAACAGATGATTTTGAAACTTCCTTGCAAGTTCTCCGTGGTTTTG
ATACTGATATTACCATTGAGGTTAATGAGATCAAGAGATCTGTGGCATCATCTACCAAAC
GTTCTGCAATTCGGTTTGTAGACCTCAAGCGCAGGAGATACTATTTCCCACTAATGGTTG
GTATAGGACTTCTTGTACTTCAACAACTGGGAGGAATTAACGGCGTCTTGTTCTATTCGA
GTACAATCTTTGAATCTGCAGGGGTCTCATCGAGTAATGTAGCAACATTCGGAGTTGGTG
CTGTTCAGGTAGTGGCGACTGCTGTAGCTACATGGTTGGTGGATAAATCAGGTCGGCGAC
TTCTGCTCATGATCGCTTCTATAGGGATGACGATAAGCCTGGTTATTGTAGCAGTCGCAT
TTTACCTTAAGGAATTTGTATCACCTGAGTCGGATATGTACAACATTCTAAGCATGGTCT
CTGTAGTTGGAGTTGTGACTATGGTTATTGCTTGCTCTCTAGGAATGGGACCAATTCCGT
GGCTGATAATGTCTGAGATTCTTCCAGTGAATATAAAAGGCTTAGCCGGGAGTATAGCAA
CTTTGGCCAACTGGTTTGTCTCGTGGTTAGTCACAATGACTGCAAATATGCTTTTAGCTT
GGAGCAGTGGTGGAACGTTTACTCTCTATGCTTTGGTTTGTGGATTCACT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2F559JQ 780 0 0
TCTTGTTCTATTCGAGTACAATCTTTGAATCTGCAGGGGTCTCATCGAGTAATGTAGCAA
CATTCGGAGTTGGTGCTGTTCAGGTAGTGGCGACTGCTGTAGCTACATGGTTGGTGGATA
AATCAGGTCGGCGACTTCTGCTCATGATCGCTTCTATAGGGATGACGATAAGCCTGGTTA
TTGTAGCAGTCGCATTTTACCTTAAGGAATTTGTATCACCTGAGTCGGATATGTACAACA
TTCTAAGCATGGTCTCTGTAGTTGGAGTTGTGACTATGGTTATTGCTTGCTCTCTAGGAA
TGGGACCAATTCCGTGGCTGATAATGTCTGAGATTCTTCCAGTGAATATAAAAGGCTTAG
CCGGGAGTATAGCAACTTTGGCCAACTGGTTTGTCTCGTGGTTAGTCACAATGACTGCAA
ATATGCTTTTAGCTTGGAGCAGTGGTGGAACGTTTACTCTCTATGCTTTGGTTTGTGGAT
TCACTGTGGCTTTTGTAAGTCTTTGGGTTCCTGAGACTAAAGGTAAAACTCTTGAAGAGA
TTCAAGCTTTGTTCAGATGATTCAAGAGACGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAGACA
GCATTCATTTTTTTCATATTTTTTTTTTTGGCCATTACAGAGCATTCTTTTGTCCTTGTC
TAAGACTTTCATTTGTGCTTTGTTCAGTGTCTTTCTTTGGGCATTGATTATATAATGTGT
TTATATTGTAAAAGCATTTCATTTTGTGTTGTAAAAGCATTTCATTTTGTGTGTGTAGTC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL4692Contig1 886 2 2 U
GGAAGCACAACACAGGGAAGGCTCTTCTCTTCCGATTAGATCCGACTTGGGAAGAAGAAG
AAGATTTCAGGATTCAAGCACTCTCAAGCTCTCATCCTTCAAAACTCAAGGGAGTGAGTC
ATGGCAACAGAAGAAGGTACACAGTTGGAGCAGAAGCTCAATGAAGTAGTACTCGAGGGA
GAGCAGCAGGCCAAGATGAGCCATGATGATGATCCCCCAAGAACAAGAACAAGAACAAGA
GGAGGAAGTAAGATGGAGGAGGAATACCCGGAAGAGCTCAGGACGCCGCCCGTAAGTCTG
GTGGCTCTCTTCGGATGTTCAGAGCTACACTCCTCCATTACTACTCATCTCCACTCCCAG
CAGCCTCCCATCAACGCTCTCGCCTTCCCCGACTTCTCCCATCTCCCTCTCCTCCTTGCT
CCTCCTCCTCCTCATGACCATCATTCCCATTCCTCCTCCTTCAGAGATCCTCTAAGCTCC
GATTCCTCCTCCCCTACCCTTCCTTCCGGCATCTTGAAACGGGACTGGTTGCTTAAGCAT
CGCACCAAGGTCCCTGCTCTTGTCGCTGCCTTATTCCCCTCTAATCACATCTTTGGCGAT
CCTACTCAATGGCTACAGGTTTGCTCCACTCTTGACACCCTCAAATCCGTTATCCGTCCC
AAAAACATCAAACTTGTGGTCGTTGTGGTCCAGTCTTCTCCCCATGAGGTAATCAGCGAA
GATCGTCTACTGGCATTGCGAAAGCGTGCAGAATTAGATTCTAAGTACGTCCTCTTCCTC
AACCACTCTGACCTCCCTCTCTCCCTCCCCAGAATCGCTTCTGCGTTTTCAGAGTTGGCC
CTTTCGTATTACAGAGAAGAAGCTAGGAGAATCAAAAGTCGCATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF74TF U 1
AF RR2AF74JQ C 166
BS 1 703 RR2AF74TF
BS 704 886 RR2AF74JQ

RD RR2AF74TF 703 0 0
GGAAGCACAACACAGGGAAGGCTCTTCTCTTCCGATTAGATCCGACTTGGGAAGAAGAAG
AAGATTTCAGGATTCAAGCACTCTCAAGCTCTCATCCTTCAAAACTCAAGGGAGTGAGTC
ATGGCAACAGAAGAAGGTACACAGTTGGAGCAGAAGCTCAATGAAGTAGTACTCGAGGGA
GAGCAGCAGGCCAAGATGAGCCATGATGATGATCCCCCAAGAACAAGAACAAGAACAAGA
GGAGGAAGTAAGATGGAGGAGGAATACCCGGAAGAGCTCAGGACGCCGCCCGTAAGTCTG
GTGGCTCTCTTCGGATGTTCAGAGCTACACTCCTCCATTACTACTCATCTCCACTCCCAG
CAGCCTCCCATCAACGCTCTCGCCTTCCCCGACTTCTCCCATCTCCCTCTCCTCCTTGCT
CCTCCTCCTCCTCATGACCATCATTCCCATTCCTCCTCCTTCAGAGATCCTCTAAGCTCC
GATTCCTCCTCCCCTACCCTTCCTTCCGGCATCTTGAAACGGGACTGGTTGCTTAAGCAT
CGCACCAAGGTCCCTGCTCTTGTCGCTGCCTTATTCCCCTCTAATCACATCTTTGGCGAT
CCTACTCAATGGCTACAGGTTTGCTCCACTCTTGACACCCTCAAATCCGTTATCCGTCCC
AAAAACATCAAACTTGTGGTCGTTGTGGTCCAGTCTTCTCCCC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2AF74JQ 721 0 0
GTAGTACTCGAGGGAGAGCAGCAGGCCAAGATGAGCCATGATGATGATCCCCCAAGAACA
AGAACAAGAACAAGAGGAGGAAGTAAGATGGAGGAGGAATACCCGGAAGAGCTCAGGACG
CCGCCCGTAAGTCTGGTGGCTCTCTTCGGATGTTCAGAGCTACACTCCTCCATTACTACT
CATCTCCACTCCCAGCAGCCTCCCATCAACGCTCTCGCCTTCCCCGACTTCTCCCATCTC
CCTCTCCTCCTTGCTCCTCCTCCTCCTCATGACCATCATTCCCATTCCTCCTCCTTCAGA
GATCCTTTAAGCTCCGATTCCTCCTCCCCTACCCTTCCTTCCGGCATCTTGAAACGGGAC
TGGTTGCTTAAGCATCGCACCAAGGTCCCTGCTCTTGTCGCTGCCTTATTCCCCTCTAAT
CACATCTTTGGCGATCCTACTCAATGGCTACAGGTTTGCTCCACTCTTGACACCCTCAAA
TCCGTTATCCGTCCCAAAAACATCAAACTTGTGGTCGTTGTGGTCCAGTCTTCTCCCCAT
GAGGTAATCAGCGAAGATCGTCTACTGGCATTGCGAAAGCGTGCAGAATTAGATTCTAAG
TACGTCCTCTTCCTCAACCACTCTGACCTCCCTCTCTCCCTCCCCAGAATCGCTTCTGCG
TTTTCAGAGTTGGCCCTTTCGTATTACAGAGAAGAAGCTAGGAGAATCAAAAGTCGCATC
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL4693Contig1 1509 2 2 U
GGAGATTCTCTCTCAAAGAAAAAAGCTAAAATGTGGCGATTCTCTGTTTCGACGCTCCTC
TTCTCTTATCTGGCCGTTACTTTCCTGTCCATCTCTTCATCGTCTTTGGGTGATTCGGAG
GCGACATGCTCTGGAATAGTCCCGTTACCGAACCGGAAGGATAAGATATCGATAACAGAC
TTTGGCGGCGTGGGAGACGGCACGACGGTGAACACGAACGCCTTTAGGGAAGCGATTTAT
AGAATACAGCACCTTAAGAGGAGAGGAGGCACGATCCTGTACATACCTCCGGGAGTGTTT
CTCACGGAGAGCTTCAACCTCACCAGCCATATGACTCTCTTCTTGGCTAAAGGCTGTCCT
TAAAGCTGTTCAGGATACAGGGAACTGGCCATTGATTGGTCCTTTGCCATCTTATGGAAG
AGGGAGGGAGTTACCAGGGGCACGGTATATGAGTTTTATTCATGGCGATGGCCTTCGTGA
TGTAGTCATCACTGGAGAAAACGGGACAATAGACGGTCAAGGAGAAGTGTGGTGGAACAT
GTGGCGCAGTAGAACTCTAAAGTTCACTAGACCGAATCTAATCGAGCTCAAAAACTCTAA
GGAGATCATAATTTCCAATGTTATTTTCCAGGATTCACCCTTCTGGAACATTCATCCTGT
GTATTGCAGCGATGTTGTTATCCATCACGTTACCATCTTAGCTCCACAAGACTCGCCCAA
CACTGATGGAATCGATCCAGATTCCAGCTCCAACGTCTGCATAGAAGACTCCTACATCTC
AACAGGAGACGACCTTGTTGCCGTAAAAAGCGGTTGGGACGAGTACGGAATAGCTTTTGG
CCGTCCAAGCTCAAACATAACGATCCGTCGCATCACAGGATCGACCCCTTTCGCAGGTAT
CGCTATAGGAAGCGAAACATCAGGAGGTATCAAGAACATCGTAGCAGAACACTTCAGTCT
CTCCAATATGGGGGTTGGAGTCAACATCAAGACAAACATTGGTCGTGGAGGATACATAAA
AAACATTAAAATCTCCAACGTTTATGTCGAAAACGCAAGGTACGGGATCAAGATCGCTGG
CGACACGGGAGATCACCCTGACGCGAATTATAACCCGAACGCGCTCCCAGTCGTTGAAGG
AATACATATCAATAACGTTTGGGGAGTTAACGTTCGAAACGCTGGATCCGTTCAAGGCCT
TAAGGGTTCGCCTTTTACAGGGATATGTTTGAGTGAGATTAACCTACGTGGAAGCTTCAA
CTCGGACCGGTCGTGGAAGTGTTCAGATGTTATTGGAACTTCGCTTAAGGTCAGTCCTTG
GCCGTGCTCGGAGCTGAGAACTACTGGCGGTTTTTATTCGTGTTCTTCCACTTTCTAAAA
CCTTTTGAGCACTTTTTTTTCCTCCTTGATTCGTTTTCTAAACCTAATTATTCACGAATA
TGTAGTTCCTCTCCACCAATATGTTTGTATCTAAACTCATAAAGTTATTATATAAATGGA
TACAAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU26TF U 1
AF RR2EU26JQ C 736
BS 1 808 RR2EU26TF
BS 809 1509 RR2EU26JQ

RD RR2EU26TF 808 0 0
GGAGATTCTCTCTCAAAGAAAAAAGCTAAAATGTGGCGATTCTCTGTTTCGACGCTCCTC
TTCTCTTATCTGGCCGTTACTTTCCTGTCCATCTCTTCATCGTCTTTGGGTGATTCGGAG
GCGACATGCTCTGGAATAGTCCCGTTACCGAACCGGAAGGATAAGATATCGATAACAGAC
TTTGGCGGCGTGGGAGACGGCACGACGGTGAACACGAACGCCTTTAGGGAAGCGATTTAT
AGAATACAGCACCTTAAGAGGAGAGGAGGCACGATCCTGTACATACCTCCGGGAGTGTTT
CTCACGGAGAGCTTCAACCTCACCAGCCATATGACTCTCTTCTTGGCTAAAGGCTGTCCT
TAAAGCTGTTCAGGATACAGGGAACTGGCCATTGATTGGTCCTTTGCCATCTTATGGAAG
AGGGAGGGAGTTACCAGGGGCACGGTATATGAGTTTTATTCATGGCGATGGCCTTCGTGA
TGTAGTCATCACTGGAGAAAACGGGACAATAGACGGTCAAGGAGAAGTGTGGTGGAACAT
GTGGCGCAGTAGAACTCTAAAGTTCACTAGACCGAATCTAATCGAGCTCAAAAACTCTAA
GGAGATCATAATTTCCAATGTTATTTTCCAGGATTCACCCTTCTGGAACATTCATCCTGT
GTATTGCAGCGATGTTGTTATCCATCACGTTACCATCTTAGCTCCACAAGACTCGCCCAA
CACTGATGGAATCGATCCAGATTCCAGCTCCAACGTCTGCATAGAAGACTCCTACATCTC
AACAGGAGACGACCTTGTTGCCGTAAAA

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2EU26JQ 774 0 0
TCCAGATTCCAGCTCCAACGTCTGCATAGAAGACTCCTACATCTCAACAGGAGACGACCT
TGTTGCCGTAAAAAGCGGTTGGGACGAGTACGGAATAGCTTTTGGCCGTCCAAGCTCAAA
CATAACGATCCGTCGCATCACAGGATCGACCCCTTTCGCAGGTATCGCTATAGGAAGCGA
AACATCAGGAGGTATCAAGAACATCGTAGCAGAACACTTCAGTCTCTCCAATATGGGGGT
TGGAGTCAACATCAAGACAAACATTGGTCGTGGAGGATACATAAAAAACATTAAAATCTC
CAACGTTTATGTCGAAAACGCAAGGTACGGGATCAAGATCGCTGGCGACACGGGAGATCA
CCCTGACGCGAATTATAACCCGAACGCGCTCCCAGTCGTTGAAGGAATACATATCAATAA
CGTTTGGGGAGTTAACGTTCGAAACGCTGGATCCGTTCAAGGCCTTAAGGGTTCGCCTTT
TACAGGGATATGTTTGAGTGAGATTAACCTACGTGGAAGCTTCAACTCGGACCGGTCGTG
GAAGTGTTCAGATGTTATTGGAACTTCGCTTAAGGTCAGTCCTTGGCCGTGCTCGGAGCT
GAGAACTACTGGCGGTTTTTATTCGTGTTCTTCCACTTTCTAAAACCTTTTGAGCACTTT
TTTTTCCTCCTTGATTCGTTTTCTAAACCTAATTATTCACGAATATGTAGTTCCTCTCCA
CCAATATGTTTGTATCTAAACTCATAAAGTTATTATATAAATGGATACAAATTT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL4694Contig1 486 2 1 U
GGTTCTTGCGTTTACCAGACAGGTTCTAGTTCTGGCTCATCGTCAACGTCAACTCCAGTA
GGACCAACAACACCAACTCCATCAACACAAACAGTTAACCAACCTCCTGTCACATCAACA
CCTATAACACCAACAGGAGGCGTGACAATCGGGGTTGGAACTCCACCAGCTGTTTTTAAC
CCGGCGAATCCTTCATCAAACACTCTACCCAATCCATCCTCGGAAGGTTCAGCGGTTTAC
GGGTTTGATGGTTCACCTAATGGGAACAATCCAACACCATCAGACTCTACCAACTTGCAG
ATTCACTATGGTCATATGGTGGTAACATTGATTCTTCAAGCAATGCTATTTCATTAGAAA
TAGAATATATATAGGAGTTGGATTAGTTTTATTACATAGTTATGCGCAAGTTCAAGCTCA
TTTAGAGCATCGTACTAAGAAGAAACTAGAAATGTAAGACATTATAAATTTGTTCGGTTC
AACGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2GZ27JQ C 1
AF RR2GZ27TF U 1
BS 1 486 RR2GZ27TF

RD RR2GZ27JQ 486 0 0
GGTTCTTGCGTTTACCAGACAGGTTCTAGTTCTGGCTCATCGTCAACGTCAACTCCAGTA
GGACCAACAACACCAACTCCATCAACACAAACAGTTAACCAACCTCCTGTCACATCAACA
CCTATAACACCAACAGGAGGCGTGACAATCGGGGTTGGAACTCCACCAGCTGTTTTTAAC
CCGGCGAATCCTTCATCAAACACTCTACCCAATCCATCCTCGGAAGGTTCAGCGGTTTAC
GGGTTTGATGGTTCACCTAATGGGAACAATCCAACACCATCAGACTCTACCAACTTGCAG
ATTCACTATGGTCATATGGTGGTAACATTGATTCTTCAAGCAATGCTATTTCATTAGAAA
TAGAATATATATAGGAGTTGGATTAGTTTTATTACATAGTTATGCGCAAGTTCAAGCTCA
TTTAGAGCATCGTACTAAGAAGAAACTAGAAATGTAAGACATTATAAATTTGTTCGGTTC
AACGCT

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR2GZ27TF 486 0 0
GGTTCTTGCGTTTACCAGACAGGTTCTAGTTCTGGCTCATCGTCAACGTCAACTCCAGTA
GGACCAACAACACCAACTCCATCAACACAAACAGTTAACCAACCTCCTGTCACATCAACA
CCTATAACACCAACAGGAGGCGTGACAATCGGGGTTGGAACTCCACCAGCTGTTTTTAAC
CCGGCGAATCCTTCATCAAACACTCTACCCAATCCATCCTCGGAAGGTTCAGCGGTTTAC
GGGTTTGATGGTTCACCTAATGGGAACAATCCAACACCATCAGACTCTACCAACTTGCAG
ATTCACTATGGTCATATGGTGGTAACATTGATTCTTCAAGCAATGCTATTTCATTAGAAA
TAGAATATATATAGGAGTTGGATTAGTTTTATTACATAGTTATGCGCAAGTTCAAGCTCA
TTTAGAGCATCGTACTAAGAAGAAACTAGAAATGTAAGACATTATAAATTTGTTCGGTTC
AACGCT

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 2

CO CL4695Contig1 963 2 4 U
GCTAGGCGTTTCTCACCACGTAGAAATGGCCCAAAATATTGTCTTAGCATTAGCTGACTG
TTTCGGCTTAGTCCCATTGAAAAGGTGTGCAAGTGTTGATCAATCGATCGATACACCAAG
TTACTGAATCACCCTCGGTAATTTGAGTGCGTGATGTGCCTCTCAAGGGGTAGAATCGAA
GTTTGGTATCATAAGGGGGTTTTCTGGAGACGTAAAACCCTAAACTTTTCTCTCGTTCGG
CAATGCTATAAAAATGCCAACAATTCATCGTCAGTCAACTCAACAGCAGCTCTTAAAAAA
ATTATCAAAAGTGTCTAGATGAATTCGTTAAACACAATGTCTGATTCTCCCGTCAATGAC
TTCCCCGGCCTTTACGCCACGGCTGAGGCAGGTGTGTTCTGGGACAAGGATGAATGCGAG
ATCACTAATGCATCCAGAGCTGCTCAGGTTTTGAAGAACATGAGAAAAGCCCTTGTCGGT
GGTGGTCATCGTGGTCCAGCCACATTCCACGCTTATGGTGATTTGACCGGTCTTGACTTT
GAATCAACCGACATCAAGCTCAATCATCTTTCCGCTGGAGAGAAGCATGCGAGACACACC
AAGATGTTGGAGGACATTGTGGCTTGGGCAGCTGAGCATCCTGAGCCATCGACGCTGATG
CTAGTGATGAGTGACGTCTCGCAAGACTTTCTCGATGTGGTTGATGTTTTGACTACCAAG
AAGAATTACAGGTTCATTTCAGTGCTTCCAGATCCACCACGACCACCACCAAGGCCAATG
ATGCTGCTTATAGTGCCCAATGATATACTTGATCCCAGTGGCTAGTAGGACCTCTAATCT
AATAAGTGTTGTTAACCACATTCAGGGAAAAAATAAAGTAGAGTTAAAATAAAGTAGAGT
TGTATTTTTTTCTTGGTTGTAAGAAATGTTGGATCGTCCTCTAATGGAACTTATTAGATG
CTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2DG53TF U 1
AF RR2DG53JQ C 242
BS 1 683 RR2DG53TF
BS 684 684 RR2DG53JQ
BS 685 727 RR2DG53TF
BS 728 963 RR2DG53JQ

RD RR2DG53TF 727 0 0
GCTAGGCGTTTCTCACCACGTAGAAATGGCCCAAAATATTGTCTTAGCATTAGCTGACTG
TTTCGGCTTAGTCCCATTGAAAAGGTGTGCAAGTGTTGATCAATCGATCGATACACCAAG
TTACTGAATCACCCTCGGTAATTTGAGTGCGTGATGTGCCTCTCAAGGGGTAGAATCGAA
GTTTGGTATCATAAGGGGGTTTTCTGGAGACGTAAAACCCTAAACTTTTCTCTCGTTCGG
CAATGCTATAAAAATGCCAACAATTCATCGTCAGTCAACTCAACAGCAGCTCTTAAAAAA
ATTATCAAAAGTGTCTAGATGAATTCGTTAAACACAATGTCTGATTCTCCCGTCAATGAC
TTCCCCGGCCTTTACGCCACGGCTGAGGCAGGTGTGTTCTGGGACAAGGATGAATGCGAG
ATCACTAATGCATCCAGAGCTGCTCAGGTTTTGAAGAACATGAGAAAAGCCCTTGTCGGT
GGTGGTCATCGTGGTCCAGCCACATTCCACGCTTATGGTGATTTGACCGGTCTTGACTTT
GAATCAACCGACATCAAGCTCAATCATCTTTCCGCTGGAGAGAAGCATGCGAGACACACC
AAGATGTTGGAGGACATTGTGGCTTGGGCAGCTGAGCATCCTGAGCCATCGACGCTGATG
CTAGTGATGAGTGACGTCTCGCA*GACTTTCTCGATGTGGTTGATGTTTTGACTACCAAG
AAGAATT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2DG53JQ 722 0 0
AATGCTATAAAAATGCCAACAATTCATCGTCAGTCAACTCAACAGCAGCTCTTAAAAAAA
TTATCAAAAGTGTCTAGATGAATTCGTTAAACACAATGTCTGATTCTCCCGTCAATGACT
TCCCCGGCCTTTACGCCACGGCTGAGGCAGGTGTGTTCTGGGACAAGGATGAATGCGAGA
TCACTAATGCATCCAGAGCTGCTCAGGTTTTGAAGAACATGAGAAAAGCCCTTGTCGGTG
GTGGTCATCGTGGTCCAGCCACATTCCACGCTTATGGTGATTTGACCGGTCTTGACTTTG
AATCAACCGACATCAAGCTCAATCATCTTTCCGCTGGAGAGAAGCATGCGAGACACACCA
AGATGTTGGAGGACATTGTGGCTTGGGCAGCTGAGCATCCTGAGCCATCGACGCTGATGC
TAGTGATGAGTGACGTCTCGCAAGACTTTCTCGATGTGGTTGATGTTTTGACTACCAAGA
AGAATTACAGGTTCATTTCAGTGCTTCCAGATCCACCACGACCACCACCAAGGCCAATGA
TGCTGCTTATAGTGCCCAATGATATACTTGATCCCAGTGGCTAGTAGGACCTCTAATCTA
ATAAGTGTTGTTAACCACATTCAGGGAAAAAATAAAGTAGAGTTAAAATAAAGTAGAGTT
GTATTTTTTTCTTGGTTGTAAGAAATGTTGGATCGTCCTCTAATGGAACTTATTAGATGC
TT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL4696Contig1 489 2 2 U
GGAAATAACAATCCAATCTCATACACGTTTACAAACACCTTTACCTACGATTTCCCACTA
ACTTTTGAAAGAGGAGCTTTTATTTGTTTTCGAAGAATGAGTCAATTCAACCAAAACCAA
TCTGCAGGAGCTTATCCTACGCCTCCAGTGTCTACCGGCCCCTATGTGGCACCCCTCCTG
CCGGTTACCCAACGAACGACACGAGTCGTGCCACGATGGCTCCGGTCGAGACAAAGTCTA
AGGGTGATGGATTCTTGAAAGGCTGTCTTGCGGCCATGTGTTGCTGTTGTGTCCTCGACG
CCTGCTTCTGATTTCGGACGAGTTCACTGGTCTATTTGATGTTATTGTGAATGATTTATA
TTATGTTTTACTAAACCATGTTTAGGAGTCGATTAGTTTATGGCATATGGATCTCCTTTC
TTATTTATTAATTTTTTATTTAATCTAATTGTATTGTTGATTCTTTCATTTTAATAAATT
GTTTTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2BJ78JQ C 1
AF RR2BJ78TF U 1
BS 1 486 RR2BJ78TF
BS 487 489 RR2BJ78JQ

RD RR2BJ78JQ 489 0 0
GGAAATAACAATCCAATCTCATACACGTTTACAAACACCTTTACCTACGATTTCCCACTA
ACTTTTGAAAGAGGAGCTTTTATTTGTTTTCGAAGAATGAGTCAATTCAACCAAAACCAA
TCTGCAGGAGCTTATCCTACGCCTCCAGTGTCTACCGGCCCCTATGTGGCACCCCTCCTG
CCGGTTACCCAACGAACGACACGAGTCGTGCCACGATGGCTCCGGTCGAGACAAAGTCTA
AGGGTGATGGATTCTTGAAAGGCTGTCTTGCGGCCATGTGTTGCTGTTGTGTCCTCGACG
CCTGCTTCTGATTTCGGACGAGTTCACTGGTCTATTTGATGTTATTGTGAATGATTTATA
TTATGTTTTACTAAACCATGTTTAGGAGTCGATTAGTTTATGGCATATGGATCTCCTTTC
TTATTTATTAATTTTTTATTTAATCTAATTGTATTGTTGATTCTTTCATTTTAATAAATT
GTTTTTTTT

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2BJ78TF 489 0 0
GGAAATAACAATCCAATCTCATACACGTTTACAAACACCTTTACCTACGATTTCCCACTA
ACTTTTGAAAGAGGAGCTTTTATTTGTTTTCGAAGAATGAGTCAATTCAACCAAAACCAA
TCTGCAGGAGCTTATCCTACGCCTCCAGTGTCTACCGGCCCCTATGTGGCACCCCTCCTG
CCGGTTACCCAACGAACGACACGAGTCGTGCCACGATGGCTCCGGTCGAGACAAAGTCTA
AGGGTGATGGATTCTTGAAAGGCTGTCTTGCGGCCATGTGTTGCTGTTGTGTCCTCGACG
CCTGCTTCTGATTTCGGACGAGTTCACTGGTCTATTTGATGTTATTGTGAATGATTTATA
TTATGTTTTACTAAACCATGTTTAGGAGTCGATTAGTTTATGGCATATGGATCTCCTTTC
TTATTTATTAATTTTTTATTTAATCTAATTGTATTGTTGATTCTTTCATTTTAATAAATT
GTTTTT
CTT

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 2

CO CL4697Contig1 966 2 6 U
GGACCTCTGAGACGAAGTAGAGATGAAAGCAATGAGTCTGATTACGAATAAGGTTGAGAG
AGCCGAGCTTAAACCTGGTGATCACATCTACACTTACCGAGGCGTCTTCGCCTATTCTCA
CCACGGTGTGTTTGTTGGTGGTTGTAAGGTGGTTCATTTCAAACCTGAGCAAACCTTGAA
AGCAGCTCCCACACTCTCTTCTTCTTCTTCTTCAGTTTCAGAGGTTAATGATTCTTCAGA
AGCTCCTTGCCCTACATACCCTGACTGTGGATTCAAACAACCAAACAGTGGAGTACTACT
CTCTTGCCTTGACTGCTTCCTCAAGAACGGTTCTCTCTACCGCTTCGAATATGGAGTCAG
CTCATCCATTTTCCTAACCAGAGTCCGAGGTGGTACCTGCACAACCGCTCCATCTGACCC
CTTTCAGACAGTTGTCCACAGAGCAATGCACCTTCTCCAGAACGGGTTTGGTAACTACGA
CATCTTCCAGAACAATTGCGAAGATTTTGCTCTCTACTGCAAGACGGGACTGCTCATTTT
GGATAAGAACGGTGTGGGAAGAAGCGGTCAAGCCAGCTCCATTCTCGGCGCTCCTTTAGC
TGCACTCCTCTCTTCACCTCTCACGCTGTTGATTCCGAATCCTGTTGGTGTAGCGACAGT
CACTGCTGGGATGTATTGTATGAGCAGGTATGCTACTGATATAGGTGTTAGAACCGATGT
GATCAAGGTTCCCGTTGAGGATTTGGCTCTGAACCCTGGTATTAAAACCCTCAAGAAAAG
GTGAAAAAGCTTATGGCTCTTGCATTTGCAAGTGAATATAGATTCTATCATGTACATAAG
ACTGGCCAGTTTTTTTAGCTATGATCTTGATTTGTCCTTGATCTCATCTCTTGTTTTCTA
TTGAGAAACTGTAAAGATTCTCTAGGTTTTATTGTGGTTTCCAACATTATCAAGATTTAG
TTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR56TF U 1
AF RR2FR56JQ C 453
BS 1 687 RR2FR56TF
BS 688 688 RR2FR56JQ
BS 689 704 RR2FR56TF
BS 705 705 RR2FR56JQ
BS 706 722 RR2FR56TF
BS 723 966 RR2FR56JQ

RD RR2FR56TF 722 0 0
GGACCTCTGAGACGAAGTAGAGATGAAAGCAATGAGTCTGATTACGAATAAGGTTGAGAG
AGCCGAGCTTAAACCTGGTGATCACATCTACACTTACCGAGGCGTCTTCGCCTATTCTCA
CCACGGTGTGTTTGTTGGTGGTTGTAAGGTGGTTCATTTCAAACCTGAGCAAACCTTGAA
AGCAGCTCCCACACTCTCTTCTTCTTCTTCTTCAGTTTCAGAGGTTAATGATTCTTCAGA
AGCTCCTTGCCCTACATACCCTGACTGTGGATTCAAACAACCAAACAGTGGAGTACTACT
CTCTTGCCTTGACTGCTTCCTCAAGAACGGTTCTCTCTACCGCTTCGAATATGGAGTCAG
CTCATCCATTTTCCTAACCAGAGTCCGAGGTGGTACCTGCACAACCGCTCCATCTGACCC
CTTTCAGACAGTTGTCCACAGAGCAATGCACCTTCTCCAGAACGGGTTTGGTAACTACGA
CATCTTCCAGAACAATTGCGAAGATTTTGCTCTCTACTGCAAGACGGGACTGCTCATTTT
GGATAAGAACGGTGTGGGAAGAAGCGGTCAAGCCAGCTCCATTCTCGGCGCTCCTTTAGC
TGCACTCCTCTCTTCACCTCTCACGCTGTTGATTCCGAATCCTGTTGGTGTAGCGACAGT
CACTGCTGGGATGTATTGTATGAGCAG*TATGCTACTGATATAG*TGTTAGAACCGATGT
GA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2FR56JQ 514 0 0
TTCTCCAGAACGGGTTTGGTAATTACGACATCTTCCAGAACAATTGCGAAGATTTTGCTC
TTTACTGCAAGACGGGACTGCTCATTTTGGATAAGAACGGTGTGGGAAGAAGCGGTCAAG
CCAGCTCCATTTTCGGCGCTCCTTTAGCTGCACTCCTCTCTTCACCTCTCACGCTGTTGA
TTCCGAATCCTGTTGGTGTAGCGACAGTCACTGCTGGGATGTATTGTATGAGCAGGTATG
CTACTGATATAGGTGTTAGAACCGATGTGATCAAGGTTCCCGTTGAGGATTTGGCTCTGA
ACCCTGGTATTAAAACCCTCAAGAAAAGGTGAAAAAGCTTATGGCTCTTGCATTTGCAAG
TGAATATAGATTCTATCATGTACATAAGACTGGCCAGTTTTTTTAGCTATGATCTTGATT
TGTCCTTGATCTCATCTCTTGTTTTCTATTGAGAAACTGTAAAGATTCTCTAGGTTTTAT
TGTGGTTTCCAACATTATCAAGATTTAGTTCTAC

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL4698Contig1 895 2 2 U
CTCGTGGAACGGAAACATGACGAAGAAGAAAGGCCAAAAATGGGGTACAGAGAAGACGGG
ATTTTCCAAACGGTATGCTCGGGACTTGAATGAAGAAGATACTTATCACACACAGCCCGC
TGAGGCAGAGACGCTTGCTAACGGTCAGATAGACTATGCACAGCTTGTGGCTTACACTGG
CTCAGTAAAGAAAGGAGATATTATTGCGTACCGCCTCATTGAGCTGACATCATCTTGGAC
GCCAGAAGTTTCCTCCTTTCGAGTGGGAAAGATAAGCTACTATGATCCAGGCTCCAAGAA
GGTGACTTTGATGCCTGTTGAAGAGTATCCAATTGAGAAGAAGACAGAAGAGGACGAGGA
TTCATCAATGCAAGCTGATACATCTCTTTATAAAGAAGACGGATCCTTGGAGGTTGAGTT
TTCTTCTCTGCTGGATGTCCGCAGCGTCAAAACTAGCAGCTCAGACGTTTTGGAAGTCGC
CGACAAGCCTGACCAATCAGCTACTAATGTAAAGCTGAACACAAACAACAACGGTTTGCA
AACCACTGCAAAAGAGAACGGAAAAGGGGACCCTTGGGAAGAACTAAGTGAAGCTCTAAG
TGAGAAAAAGGCAAAACTGTGTGAAGCTAACAAAGGGTGGAACAAGAAAGGGAGTTCAAG
TGGAGGGTCGTGGAGGAGAGGTAGCGGAATGGGTCCTCTCATGAACTATCTAAGATCTCA
GAAAGAGATATGAGCAATTAATTAAATTAGGGTCACATCACATCCTCATGTTTTTTCTTT
ATTCTTGATCATTTTGGATTTGGGAAAACTCAGTCAAAAGAAAGAAAAAAACGGGGTATG
TCAAGGGTCAGTGTGGGTTCTCTGGTTTTGTAAGTCATAATTAAAGTGCAATATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AI02TF U 1
AF RR2AI02JQ C 188
BS 1 677 RR2AI02TF
BS 678 895 RR2AI02JQ

RD RR2AI02TF 677 0 0
CTCGTGGAACGGAAACATGACGAAGAAGAAAGGCCAAAAATGGGGTACAGAGAAGACGGG
ATTTTCCAAACGGTATGCTCGGGACTTGAATGAAGAAGATACTTATCACACACAGCCCGC
TGAGGCAGAGACGCTTGCTAACGGTCAGATAGACTATGCACAGCTTGTGGCTTACACTGG
CTCAGTAAAGAAAGGAGATATTATTGCGTACCGCCTCATTGAGCTGACATCATCTTGGAC
GCCAGAAGTTTCCTCCTTTCGAGTGGGAAAGATAAGCTACTATGATCCAGGCTCCAAGAA
GGTGACTTTGATGCCTGTTGAAGAGTATCCAATTGAGAAGAAGACAGAAGAGGACGAGGA
TTCATCAATGCAAGCTGATACATCTCTTTATAAAGAAGACGGATCCTTGGAGGTTGAGTT
TTCTTCTCTGCTGGATGTCCGCAGCGTCAAAACTAGCAGCTCAGACGTTTTGGAAGTCGC
CGACAAGCCTGACCAATCAGCTACTAATGTAAAGCTGAACACAAACAACAACGGTTTGCA
AACCACTGCAAAAGAGAACGGAAAAGGGGACCCTTGGGAAGAACTAAGTGAAGCTCTAAG
TGAGAAAAAGGCAAAACTGTGTGAAGCTAACAAAGGGTGGAACAAGAAAGGGAGTTCAAG
TGGAGGGTCGTGGAGGA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2AI02JQ 708 0 0
AAGAAAGGAGATATTATTGCGTACCGCCTCATTGAGCTGACATCATCTTGGACGCCAGAA
GTTTCCTCCTTTCGAGTGGGAAAGATAAGCTACTATGATCCAGGCTCCAAGAAGGTGACT
TTGATGCCTGTTGAAGAGTATCCAATTGAGAAGAAGACAGAAGAGGACGAGGATTCATCA
ATGCAAGCTGATACATCTCTTTATAAAGAAGACGGATCCTTGGAGGTTGAGTTTTCTTTT
CTGCTGGATGTCCGCAGCGTCAAAACTAGCAGCTCAGACGTTTTGGAAGTCGCCGACAAG
CCTGACCAATCAGCTACTAATGTAAAGCTGAACACAAACAACAACGGTTTGCAAACCACT
GCAAAAGAGAACGGAAAAGGGGACCCTTGGGAAGAACTAAGTGAAGCTCTAAGTGAGAAA
AAGGCAAAACTGTGTGAAGCTAACAAAGGGTGGAACAAGAAAGGGAGTTCAAGTGGAGGG
TCGTGGAGGAGAGGTAGCGGAATGGGTCCTCTCATGAACTATCTAAGATCTCAGAAAGAG
ATATGAGCAATTAATTAAATTAGGGTCACATCACATCCTCATGTTTTTTCTTTATTCTTG
ATCATTTTGGATTTGGGAAAACTCAGTCAAAAGAAAGAAAAAAACGGGGTATGTCAAGGG
TCAGTGTGGGTTCTCTGGTTTTGTAAGTCATAATTAAAGTGCAATATA

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL4699Contig1 770 2 4 U
GGAGGTCGTTGGACTCTCATAATCGGATAGAGAGAGAGAGAGAATAGTAGAGAGAGAAAG
TAGATCTGGCTCCGGCGTACGGCCGCCGCTCACGCGAGCGTGCCGTTGCCGGAACCCTTT
TCCGTCCGATTGAAAAGCTTTTTTGGTTCTCTTTCGTCTTCTCTTACCTACCGTTTTGTT
TGAAAGTCGTTTCGTCAGAATAAGGTTCGATTCCGGGAGGGGAGGCTTCCCTAGCTCCGT
CGCCGCCGGCTTTGTTTCCGGGAAGAGGAGATTTACGTAGCTCCGTCGTCGCCGGATTTT
GTTTCGGAGAGTGGAGGCTTTCAAAGCTCTGCGCTGCCGGTTTGGTACCCAATGTTCATT
TGGGGTTTTTAGTTTCTGTTTTGTTTCATGGTGGTCTGGATGTAAGCTTGCCTTCGCTGT
GTTGATTGGGTTTAGCGGATGAGATTTCATAGATGATGAAACTCTCCGATGGCGATGACG
AAGACAAGAGAAGAAAGAAGAGTGTGTGGATGAGATCTCGGTTTGTCCGATTGATGCTCT
CGGTGGAAGGTCTCCGGTGGTGGAGAGATTTACAGTGACTAGATCCGATGTGGCGCCGTT
CAAGTTGCGGCGGATCTGTCGGTGGAGGCAGAGAAGGAGTGAGGCGACACGTATCTAGGG
TTTCGGCCCGTGTTGGTGGTTTTGTCTGGGCTTGAGGCCTGTTATGTATTTTATTTCGGT
TTTTTTTATTTTGGGCTTTTGGCCCTTGTAAGGTTTCGGCCCTTGGTTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS07TF U 1
AF RR2AS07JQ C 3
BS 1 636 RR2AS07TF
BS 637 637 RR2AS07JQ
BS 638 662 RR2AS07TF
BS 663 770 RR2AS07JQ

RD RR2AS07TF 662 0 0
GGAGGTCGTTGGACTCTCATAATCGGATAGAGAGAGAGAGAGAATAGTAGAGAGAGAAAG
TAGATCTGGCTCCGGCGTACGGCCGCCGCTCACGCGAGCGTGCCGTTGCCGGAACCCTTT
TCCGTCCGATTGAAAAGCTTTTTTGGTTCTCTTTCGTCTTCTCTTACCTACCGTTTTGTT
TGAAAGTCGTTTCGTCAGAATAAGGTTCGATTCCGGGAGGGGAGGCTTCCCTAGCTCCGT
CGCCGCCGGCTTTGTTTCCGGGAAGAGGAGATTTACGTAGCTCCGTCGTCGCCGGATTTT
GTTTCGGAGAGTGGAGGCTTTCAAAGCTCTGCGCTGCCGGTTTGGTACCCAATGTTCATT
TGGGGTTTTTAGTTTCTGTTTTGTTTCATGGTGGTCTGGATGTAAGCTTGCCTTCGCTGT
GTTGATTGGGTTTAGCGGATGAGATTTCATAGATGATGAAACTCTCCGATGGCGATGACG
AAGACAAGAGAAGAAAGAAGAGTGTGTGGATGAGATCTCGGTTTGTCCGATTGATGCTCT
CGGTGGAAGGTCTCCGGTGGTGGAGAGATTTACAGTGACTAGATCCGATGTGGCGCCGTT
CAAGTTGCGGCGGATCTGTCGGTGGAGGCAGAGAAG*AGTGAGGCGACACGTATCTAGGG
TT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2AS07JQ 768 0 0
AGGTCGTTGGACTCTCATAATCGGATAGAGAGAGAGAGAGAATAGTAGAGAGAGAAAGTA
GATCTGGCTCCGGCGTACGGCCGCCGCTCACGCGAGCGTGCCGTTGCCGGAACCCTTTTC
CGTCCGATTGAAAAGCTTTTTTGGTTCTCTTTCGTCTTCTCTTACCTACCGTTTTGTTTG
AAAGTCGTTTCGTCAGAATAAGGTTCGATTCCGGGAGGGGAGGCTTCCCTAGCTCCGTCG
CCGCCGGCTTTGTTTCCGGGAAGAGGAGATTTACGTAGCTCCGTCGTCGCCGGATTTTGT
TTCGGAGAGTGGAGGCTTTCAAAGCTCTGCGCTGCCGGTTTGGTACCCAATGTTCATTTG
GGGTTTTTAGTTTCTGTTTTGTTTCATGGTGGTCTGGATGTAAGCTTGCCTTCGCTGTGT
TGATTGGGTTTAGCGGATGAGATTTCATAGATGATGAAACTCTCCGATGGCGATGACGAA
GACAAGAGAAGAAAGAAGAGTGTGTGGATGAGATCTCGGTTTGTCCGATTGATGCTCTCG
GTGGAAGGTCTCCGGTGGTGGAGAGATTTACAGTGACTAGATCCGATGTGGCGCCGTTCA
AGTTGCGGCGGATCTGTCGGTGGAGGCAGAGAAGGAGTGAGGCGACACGTATCTAGGGTT
TCGGCCCGTGTTGGTGGTTTTGTCTGGGCTTGAGGCCTGTTATGTATTTTATTTCGGTTT
TTTTTATTTTGGGCTTTTGGCCCTTGTAAGGTTTCGGCCCTTGGTTCC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL4700Contig1 491 2 1 U
GGATATTTATTCTCTCCGAGTCTCTCTCTCTCTATCTCAATTCTGCAATCGCGGCGAATC
TCTCTCAGGACTTGATCGGAGCGTTTGATCTGATAAAAGGAAGATGTCGGCTACTCAGGA
AGAAGACAAGAAGCCCGGTGAACAAGGGGGAGTTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGCCA
GGATGGAAATGAAGTCTTCTTTAAGATCAAGAGGAGCACTCAGCTGAAGAAGCTAATGAA
CGCTTACTGCGACCGTCAATCTGTGGATCTCAACGCAATTGCTTTCTTGTTTGATGGGCG
TCGTCTCCGTGCGGAGCAGACTCCAGATGAGCTTGATATGGAAGATGGAGATGAGATCGA
TGCAATGCTCCATCAGACCGGTGGTGTTGCAAGTGGAGGCATGTATCTGTTCTGATTTTA
GTTGGTCTTTTATGGTTTTCGATAATATGTTGTGGCATATAATTAATGGACAGTTTTCAA
TAAGACGATGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CC54JQ C 1
AF RR2CC54TF U 1
BS 1 491 RR2CC54TF

RD RR2CC54JQ 491 0 0
GGATATTTATTCTTTCCGAGTCTCTCTCTCTCTATCTCAATTCTGCAATCGCGGCGAATC
TCTCTCAGGACTTGATCGGAGCGTTTGATTTGATAAAAGGAAGATGTCGGCTACTCAGGA
AGAAGACAAGAAGCCCGGTGAACAAGGGGGAGTTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGCCA
GGATGGAAATGAAGTCTTCTTTAAGATCAAGAGGAGCACTCAGCTGAAGAAGCTAATGAA
CGCTTACTGCGACCGTCAATCTGTGGATCTCAACGCAATTGCTTTCTTGTTTGATGGGCG
TCGTCTCCGTGCGGAGCAGACTCCAGATGAGCTTGATATGGAAGATGGAGATGAGATCGA
TGCAATGCTCCATCAGACCGGTGGTGTTGCAAGTGGAGGCATGTATCTGTTCTGATTTTA
GTTGGTCTTTTATGGTTTTCGATAATATGTTGTGGCATATAATTAATGGACAGTTTTCAA
TAAGACGATGG

QA 1 491 1 491
DS 

RD RR2CC54TF 491 0 0
GGATATTTATTCTCTCCGAGTCTCTCTCTCTCTATCTCAATTCTGCAATCGCGGCGAATC
TCTCTCAGGACTTGATCGGAGCGTTTGATCTGATAAAAGGAAGATGTCGGCTACTCAGGA
AGAAGACAAGAAGCCCGGTGAACAAGGGGGAGTTCACATCAATCTCAAAGTCAAGGGCCA
GGATGGAAATGAAGTCTTCTTTAAGATCAAGAGGAGCACTCAGCTGAAGAAGCTAATGAA
CGCTTACTGCGACCGTCAATCTGTGGATCTCAACGCAATTGCTTTCTTGTTTGATGGGCG
TCGTCTCCGTGCGGAGCAGACTCCAGATGAGCTTGATATGGAAGATGGAGATGAGATCGA
TGCAATGCTCCATCAGACCGGTGGTGTTGCAAGTGGAGGCATGTATCTGTTCTGATTTTA
GTTGGTCTTTTATGGTTTTCGATAATATGTTGTGGCATATAATTAATGGACAGTTTTCAA
TAAGACGATGG

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 2

CO CL4701Contig1 682 2 2 U
TTGAGAAATTCTCATTTATAAATCAAACAAATGGAGGGAAAATGTAATCGGCCAAACTCT
TCGGAACAAAAAAAAAGAAACATTTCAAGTACGGAAGCAATACAATTGACCTAAACAACT
CAATAGAAAGAAGAGGAGATGAGGGTGATAAAGAGAGCAGATGCAAAAGAGATAGAGACC
AAAGACGCATCGGAACTCCCGGCAGGGACTGACACTGGAGTTGCCGCATTTGCTTCACTT
GACGAAGATGGCGCACCTGCTCCGGCCGTGGGAGATAAAGCAGGGGCACTAGCAGGTGGA
GATGCAGAGACAGCGAGGCCACAACGAGCAGATGGAGGAGCAGCAACTTTACAAACTGAA
GGAAGAGAAGCAGCTTTAGCAAGATCAAGAGTAACACCAAGAGAGGCACTGTTCTTGAAA
CCCTCACAAATACATTCAGGTCCTGACCTAACCACAGTCTTGAGACCTGAGCAACATGTT
CCTTCAGGCTTCTCTACCGTACTACCGCTCGTCACGAACGACAAACAATCAGCCATGGTT
AGTATCAACGAGGAGCAGTCCACTGCGATGGCTCTCTCGCCGGACATTAATGCGACCACC
GTGAAGATCATGAGAATAGATGTCTCCATTGTTATTGACGCCATTGTAATTGGGAGAAGA
AAATTATTATGTTGGTGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX02TF C 1
AF RR2BX02JQ U 13
BS 1 19 RR2BX02TF
BS 20 682 RR2BX02JQ

RD RR2BX02TF 676 0 0
TTGAGAAATTCTCATTTATAAATCAAACAAATGGAGGGAAAATGTAATCGGCCAAACTCT
TCGGAACAAAAAAAAAGAAACATTTCAAGTACGGAAGCAATACAATTGACCTAAACAACT
CAATAGAAAGAAGAGGAGATGAGGGTGATAAAGAGAGCAGATGCAAAAGAGATAGAGACC
AAAGACGCATCGGAACTCCCGGCAGGGACTGACACTGGAGTTGCCGCATTTGCTTCACTT
GACGAAGATGGCGCACCTGCTCCGGCCGTGGGAGATAAAGCAGGGGCACTAGCAGGTGGA
GATGCAGAGACAGCGAGGCCACAACGAGCAGATGGAGGAGCAGCAACTTTACAAACTGAA
GGAAGAGAAGCAGCTTTAGCAAGATCAAGAGTAACACCAAGAGAGGCACTGTTCTTGAAA
CCCTCACAAATACATTCAGGTCCTGACCTAACCACAGTCTTGAGACCTGAGCAACATGTT
CCTTCAGGCTTCTCTACCGTACTACCGCTCGTCACGAACGACAAACAATCAGCCATGTTT
AGTATCAACGAGGAGCAGTCCACTGCGATGGCTCTCTCGCCGGACATTAATGCGACCACC
GTGAAGATCATGAGAATAGATGTCTCCATTGTTATTGACGCCATTGTAATTGGGAGAAGA
AAATTATTATGTTGGT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2BX02JQ 670 0 0
ATTTATA
AAATCAAACAAATGGAGGGAAAATGTAATCGGCCAAACTCTTCGGAACAAAAAAAAAGAA
ACATTTCAAGTACGGAAGCAATACAATTGACCTAAACAACTCAATAGAAAGAAGAGGAGA
TGAGGGTGATAAAGAGAGCAGATGCAAAAGAGATAGAGACCAAAGACGCATCGGAACTCC
CGGCAGGGACTGACACTGGAGTTGCCGCATTTGCTTCACTTGACGAAGATGGCGCACCTG
CTCCGGCCGTGGGAGATAAAGCAGGGGCACTAGCAGGTGGAGATGCAGAGACAGCGAGGC
CACAACGAGCAGATGGAGGAGCAGCAACTTTACAAACTGAAGGAAGAGAAGCAGCTTTAG
CAAGATCAAGAGTAACACCAAGAGAGGCACTGTTCTTGAAACCCTCACAAATACATTCAG
GTCCTGACCTAACCACAGTCTTGAGACCTGAGCAACATGTTCCTTCAGGCTTCTCTACCG
TACTACCGCTCGTCACGAACGACAAACAATCAGCCATGGTTAGTATCAACGAGGAGCAGT
CCACTGCGATGGCTCTCTCGCCGGACATTAATGCGACCACCGTGAAGATCATGAGAATAG
ATGTCTCCATTGTTATTGACGCCATTGTAATTGGGAGAAGAAAATTATTATGTTGGTGTG
TCC

QA 8 670 8 670
DS 



AS 1 2

CO CL4702Contig1 808 2 2 U
GGGAGCTGCAGAACCGGCAGAGACTAGAAGTTGCTCGTCAGGCTGCCTTGGCAGAAGAAG
CACGCCGTAAATCTGAAGAACATAGGAAATATCAGTTGGAGAAAAGAAAACAGGAAGACG
AACTGAGACGACTGAAGCAAGAAGAAGAAAAAATTCAACGCATAAAGGAACAATGGAAGA
GCAACACACATGGATCTCATAAGCGTAAGGAAAGAGCTGAAGATGATGATGGGGAAGGTA
GGCCGAGTGAGCGGAAAAGAAAGAAAGGTGGGAAGAGAAGAAAGAAGGACAAAAGCTCAA
GGGCTCGACATTACGAGGACGATGATGAGGAAGCAGCTACTATGGATGACCATAATGAAG
TGGAAGACGAAGACGCCAACACTAATTATAACAGGGAAGAGGAGAATCAAGAAGCTGAGG
AGCCTGTGGATGACGATGATGCTCATGATCTTCTTGCTGCTGCGGGGCTTGAAGATCCTG
ATGCTGATGATGAGGTACCTGCTTCTGTTGCGAGACGAAGAAAGGCACTTTCTTCATCAG
ATGAAGAAGGTGAATTGATGGAGGGTCATCCAAATTCAAGCCCCCAGAAAGAGAATTCTC
CAGGAAGGCAAGAAGAGAGCAATGTGGAAGAAGAAGATGATGCTAACTTGAACGATGGGG
AGTAGACCAGTTGAGATCTTTACTTAACAGATCTCTGTGTTTGTAACTTTAGTGATAAAG
ATTCTCTATTGATTGTCTTTATTCCAATTTTCCTAGGACTCGCAAGTGTGAGAACAAATA
ACATTCACATGCCAAGAATCAGTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW84TF U 1
AF RR2CW84JQ C 54
BS 1 545 RR2CW84TF
BS 546 808 RR2CW84JQ

RD RR2CW84TF 545 0 0
GGGAGCTGCAGAACCGGCAGAGACTAGAAGTTGCTCGTCAGGCTGCCTTGGCAGAAGAAG
CACGCCGTAAATCTGAAGAACATAGGAAATATCAGTTGGAGAAAAGAAAACAGGAAGACG
AACTGAGACGACTGAAGCAAGAAGAAGAAAAAATTCAACGCATAAAGGAACAATGGAAGA
GCAACACACATGGATCTCATAAGCGTAAGGAAAGAGCTGAAGATGATGATGGGGAAGGTA
GGCCGAGTGAGCGGAAAAGAAAGAAAGGTGGGAAGAGAAGAAAGAAGGACAAAAGCTCAA
GGGCTCGACATTACGAGGACGATGATGAGGAAGCAGCTACTATGGATGACCATAATGAAG
TGGAAGACGAAGACGCCAACACTAATTATAACAGGGAAGAGGAGAATCAAGAAGCTGAGG
AGCCTGTGGATGACGATGATGCTCATGATCTTCTTGCTGCTGCGGGGCTTGAAGATCCTG
ATGCTGATGATGAGGTACCTGCTTCTGTTGCGAGACGAAGAAAGGCACTTTCTTCATCAG
ATGAA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2CW84JQ 755 0 0
GAAGAAGCACGCCGTAAATCTGAAGAACATAGGAAATATCAGTTGGAGAAAAGAAAACAG
GAAGACGAACTGAGACGACTGAAGCAAGAAGAAGAAAAAATTCAACGCATAAAGGAACAA
TGGAAGAGCAACACACATGGATCTCATAAGCGTAAGGAAAGAGCTGAAGATGATGATGGG
GAAGGTAGGCCGAGTGAGCGGAAAAGAAAGAAAGGTGGGAAGAGAAGAAAGAAGGACAAA
AGCTCAAGGGCTCGACATTACGAGGACGATGATGAGGAAGCAGCTACTATGGATGACCAT
AATGAAGTGGAAGACGAAGACGCCAACACTAATTATAACAGGGAAGAGGAGAATCAAGAA
GCTGAGGAGCCTGTGGATGACGATGATGCTCATGATCTTCTTGCTGCTGCGGGGCTTGAA
GATCCTGATGCTGATGATGAGGTACCTGCTTCTGTTGCGAGACGAAGAAGGGCACTTTTT
TCATCAGATGAAGAAGGTGAATTGATGGAGGGTCATCCAAATTCAAGCCCCCAGAAAGAG
AATTCTCCAGGAAGGCAAGAAGAGAGCAATGTGGAAGAAGAAGATGATGCTAACTTGAAC
GATGGGGAGTAGACCAGTTGAGATCTTTACTTAACAGATCTCTGTGTTTGTAACTTTAGT
GATAAAGATTCTCTATTGATTGTCTTTATTCCAATTTTCCTAGGACTCGCAAGTGTGAGA
ACAAATAACATTCACATGCCAAGAATCAGTTTCAT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL4703Contig1 528 2 1 U
GGAGATCATTCAATTCATACTTTGTTCTTCATAAGATTTAGAAAATTTTGAAAACCCAAA
AAAAGAAGAAAAAAGTTAGAAAATGGCAAGAGTTCATATATTGTTATGCTTCACCCTTTT
ATTTGCATCTGTAACCCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTT
GCCTCAGATTGAAGATCCGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGT
GATGGTATTTGTGGGGGATCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAATGTT
CTTCGACAAACTCAGAGGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAA
AAGATGATGCAGACATGAAGACCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAATCCATCGCCTCTTTTG
CTATTGGAAGGGTAAGTGAAAGAGGTTATTATAATTGGTGCCATTCTGACATTTTAATTT
TTTTATTTTTCATATATACGTTCAAATAAAAATTTGTGTTTTTATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A177TF U 1
AF RR2A177JQ C 30
BS 1 528 RR2A177TF

RD RR2A177TF 528 0 0
GGAGATCATTCAATTCATACTTTGTTCTTCATAAGATTTAGAAAATTTTGAAAACCCAAA
AAAAGAAGAAAAAAGTTAGAAAATGGCAAGAGTTCATATATTGTTATGCTTCACCCTTTT
ATTTGCATCTGTAACCCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCTTT
GCCTCAGATTGAAGATCCGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGT
GATGGTATTTGTGGGGGATCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAATGTT
CTTCGACAAACTCAGAGGATTTGCCAAGTATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAA
AAGATGATGCAGACATGAAGACCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAATCCATCGCCTCTTTTG
CTATTGGAAGGGTAAGTGAAAGAGGTTATTATAATTGGTGCCATTCTGACATTTTAATTT
TTTTATTTTTCATATATACGTTCAAATAAAAATTTGTGTTTTTATTTC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2A177JQ 499 0 0
CATAAGATTTAGAAAATTTTGAAAACCCAAAAAAAGAAGAAAAAAGTTAGAAAATGGCAA
GAGTTCATATATTGTTATGCTTCACCCTTTTATTTGCATCTGTAACCCTTTTTGACGTGG
CTTCAGCTTTTTTGAAGCTAAAGCCATTTTTGCCTCAGATTGAAGATCCGAAGACGGTGG
GTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGTGATGGTATTTGTGGGGGATCTCGAGAAAG
AATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAATGTTTTTCGACAAACTCAGAGGATTTGCCAAGT
ATGTTTGCCCACTAAAAATATTTGGCAAAAAAAGATGATGCAGACATGAAGACCAAAGAA
GCAGGCATCCTCAAATCCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAGGGTAAGTGAAAGAGGTTAT
TATAATTGGTGCCATTTTGACATTTTAATTTTTTTATTTTTCATATATACGTTCAAATAA
AAATTTGTGTTTTTATTTC

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

CO CL4704Contig1 483 2 1 U
GTGTTGATCCAACAGCAAATCTTATATTTGGCGCTGTGGTTGATCCATCCTTCAGTGGTC
AAGTAAGCATTACCCTAATAGTGACGGGCTTCAAACGGCAAGAAGAAGGAGAAGGGAGGC
CACTTCAGGCGACACAAGCAGATGCATCATCATCAATGGGAGGAGTAACAACAAGACGTC
CTTCTTCTTCATCTTTCAGTTAAGGCAGTTCCATAGAGATCCCAGAGTTCTTGAAGAAGA
AAGGCCGCTCTCGCTATCCTCGCCTCTAATTACCTCATCTCGGATAAGTAATTGCCTCGC
TTGGTGATTCATTGATAGGTGTTAGAAATGGTGTTTTATTGTTGACTATATCACACAATA
ACAATAAAATGGTTATTGACATATGGTATTATAAATCTCAGTCTCTGTCACACTTGTTTC
AAGAGGTCGCCTTCTATGGGTGAAAATGTTTTTTAAATAAAAAAACTCTACTCTACTTCG
TGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2AO38JQ C 1
AF RR2AO38TF U 1
BS 1 483 RR2AO38TF

RD RR2AO38JQ 483 0 0
GTGTTGATCCAACAGCAAATCTTATATTTGGCGCTGTGGTTGATCCATCCTTCAGTGGTC
AAGTAAGCATTACCCTAATAGTGACGGGCTTCAAACGGCAAGAAGAAGGAGAAGGGAGGC
CACTTCAGGCGACACAAGCAGATGCATCATCATCAATGGGAGGAGTAACAACAAGACGTC
CTTCTTCTTCATCTTTCAGTTAAGGCAGTTCCATAGAGATCCCAGAGTTCTTGAAGAAGA
AAGGCCGCTCTCGCTATCCTCGCCTCTAATTACCTCATCTCGGATAAGTAATTGCCTCGC
TTGGTGATTCATTGATAGGTGTTAGAAATGGTGTTTTATTGTTGACTATATCACACAATA
ACAATAAAATGGTTATTGACATATGGTATTATAAATCTCAGTCTCTGTCACACTTGTTTC
AAGAGGTCGCCTTCTATGGGTGAAAATGTTTTTTAAATAAAAAAACTCTACTCTACTTCG
TGC

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR2AO38TF 483 0 0
GTGTTGATCCAACAGCAAATCTTATATTTGGCGCTGTGGTTGATCCATCCTTCAGTGGTC
AAGTAAGCATTACCCTAATAGTGACGGGCTTCAAACGGCAAGAAGAAGGAGAAGGGAGGC
CACTTCAGGCGACACAAGCAGATGCATCATCATCAATGGGAGGAGTAACAACAAGACGTC
CTTCTTCTTCATCTTTCAGTTAAGGCAGTTCCATAGAGATCCCAGAGTTCTTGAAGAAGA
AAGGCCGCTCTCGCTATCCTCGCCTCTAATTACCTCATCTCGGATAAGTAATTGCCTCGC
TTGGTGATTCATTGATAGGTGTTAGAAATGGTGTTTTATTGTTGACTATATCACACAATA
ACAATAAAATGGTTATTGACATATGGTATTATAAATCTCAGTCTCTGTCACACTTGTTTC
AAGAGGTCGCCTTCTATGGGTGAAAATGTTTTTTAAATAAAAAAACTCTACTCTACTTCG
TGC

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL4705Contig1 651 2 1 U
GGATCGAACTCTCAGGACAAACATGTCAAACGAAAGAAAAATGTATCTTATTAAGGATCT
CAAACCTTACAGAGATGAATGGCGTCTAACTCTAAAAATGTTTCATTGCTGAAAACAAAA
CACCAGTTATGGAGGAGAGAGTTTTGAGTGCGTCCTGGTACACCAAACTGGTGTTAAATC
CAGGCTTCATGCAAAAGATCTCAAATGTTTCGTGTTCAACGTTACCCCCTGTTGGTGAAT
GGAAGCTCATTGACACCTTTAAAATAACTGGAGCAGGAGGAAAATTTCACCTACAAATCA
ACAGTAAAAGTTGAATATCATAGGCTCAATTCCTTAATCTGGCTAAATACGAGGAAATAT
TCAATGGAAAGCTGAAACCCTTTTTTCTAATTGATATCGTGGGATATGTTACTGATCTTG
GAGCAGTAGCTACGGTCCAAGTTAAGGGGGTTGACACAAAAAGATCATGAGTGAGAGGTT
TCAGACAAGTGGAATTGGTTTCATTTGATGGTTCATGAAGTGATTTGTCATTTCTGCCAA
CCTATATTTCATCTATTTATGAAACACTTAACTAAAATGTTTGGATTTGCTTATGTTTTT
GGACAAGACAGTCTATTTATTCTTCTATTTTCAAACAATTAAGTTTTCTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AE66JQ C 1
AF RR2AE66TF U 1
BS 1 651 RR2AE66TF

RD RR2AE66JQ 651 0 0
GGATCGAACTCTCAGGACAAACATGTCAAACGAAAGAAAAATGTATCTTATTAAGGATCT
CAAACCTTACAGAGATGAATGGCGTCTAACTCTAAAAATGTTTCATTGCTGAAAACAAAA
CACCAGTTATGGAGGAGAGAGTTTTGAGTGCGTCCTGGTACACCAAACTGGTGTTAAATC
CAGGCTTCATGCAAAAGATCTCAAATGTTTCGTGTTCAACGTTACCCCCTGTTGGTGAAT
GGAAGCTCATTGACACCTTTAAAATAACTGGAGCAGGAGGAAAATTTCACCTACAAATCA
ACAGTAAAAGTTGAATATCATAGGCTCAATTCCTTAATCTGGCTAAATACGAGGAAATAT
TCAATGGAAAGCTGAAACCCTTTTTTTTAATTGATATCGTGGGATATGTTACTGATCTTG
GAGCAGTAGCTACGGTCCAAGTTAAGGGGGTTGACACAAAAAGATCATGAGTGAGAGGTT
TCAGACAAGTGGAATTGGTTTCATTTGATGGTTCATGAAGTGATTTGTCATTTCTGCCAA
CCTATATTTCATCTATTTATGAAACACTTAACTAAAATGTTTGGATTTGCTTATGTTTTT
GGACAAGACAGTCTATTTATTCTTCTATTTTCAAACAATTAAGTTTTCTCT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2AE66TF 651 0 0
GGATCGAACTCTCAGGACAAACATGTCAAACGAAAGAAAAATGTATCTTATTAAGGATCT
CAAACCTTACAGAGATGAATGGCGTCTAACTCTAAAAATGTTTCATTGCTGAAAACAAAA
CACCAGTTATGGAGGAGAGAGTTTTGAGTGCGTCCTGGTACACCAAACTGGTGTTAAATC
CAGGCTTCATGCAAAAGATCTCAAATGTTTCGTGTTCAACGTTACCCCCTGTTGGTGAAT
GGAAGCTCATTGACACCTTTAAAATAACTGGAGCAGGAGGAAAATTTCACCTACAAATCA
ACAGTAAAAGTTGAATATCATAGGCTCAATTCCTTAATCTGGCTAAATACGAGGAAATAT
TCAATGGAAAGCTGAAACCCTTTTTTCTAATTGATATCGTGGGATATGTTACTGATCTTG
GAGCAGTAGCTACGGTCCAAGTTAAGGGGGTTGACACAAAAAGATCATGAGTGAGAGGTT
TCAGACAAGTGGAATTGGTTTCATTTGATGGTTCATGAAGTGATTTGTCATTTCTGCCAA
CCTATATTTCATCTATTTATGAAACACTTAACTAAAATGTTTGGATTTGCTTATGTTTTT
GGACAAGACAGTCTATTTATTCTTCTATTTTCAAACAATTAAGTTTTCTCT

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL4706Contig1 886 2 2 U
GGATTCTCTCTTAACTCGTCTCTCTTTCACTCTAAAAAAATGCCAAAAATCATGTGGAAG
AGTCTCCATCTTTGCTTCCCCTCCAATCTCACCAAATGCTACTCTTCGCCGTGCCTTCCT
CCCTCCGCCGCCGCCGCTGAGGACGACGATCCTAGCCGTCCCTCTATCGTTCTCATCAAC
AACTTCAACCTACTCTACCACAATAATGACCACAAAAACCACCACCACCACCCTGCCTTT
GACTTACCTTCCTCATCCACCGCCACCACCACCTTCTCCTCTTCCGCCACGTCATCATAC
GAATCCGAGAGTCACGACACTACCGTGAATACAACGAGACTTCTAACCGGAGGTTCCGCC
GTGAAACAACACGTATACTCACCGGATCCGTTAACTGACTTCCGACGATCAATGCAGGAG
ATGATTGATGCCGCCATTGACGCCGGCGATCTTAGCCATCCCGACGACGGTTATGATTAC
TTGAACGAGCTGCTTCTCAGTTATTTAGCGCTGAATCCAACCGACATGCACAAGTTCATC
ATAAGGGCTTTTTCCGACACCATGGTCTCACTCTTGTCGGAAGAACGTCGGATGTGATGA
CGCAGCCGCCGCCTAGATTAAAAAAAAATGATCGTGTAATAAATGACCCACGTGATTTTA
TTAATTAACTCGATGGACCTAACATTTTTTTTTACATTATCGTCTTCAAGGAAGAGAAAC
CATCTCAGAAAACTACTATCAAATTTATCTTTATTTTCCTTTTTGTATTTTGTATGTTTT
TATTAAATAAACCTCTGTTTCGTAACAGAGGTAAATTAATGTTTTTGCATGCATTTACGA
CCCAAGATGACCAAATGTAATTATTGTGTAACGATATTTGATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G434TF U 1
AF RR2G434JQ C 304
BS 1 530 RR2G434TF
BS 531 886 RR2G434JQ

RD RR2G434TF 530 0 0
GGATTCTCTCTTAACTCGTCTCTCTTTCACTCTAAAAAAATGCCAAAAATCATGTGGAAG
AGTCTCCATCTTTGCTTCCCCTCCAATCTCACCAAATGCTACTCTTCGCCGTGCCTTCCT
CCCTCCGCCGCCGCCGCTGAGGACGACGATCCTAGCCGTCCCTCTATCGTTCTCATCAAC
AACTTCAACCTACTCTACCACAATAATGACCACAAAAACCACCACCACCACCCTGCCTTT
GACTTACCTTCCTCATCCACCGCCACCACCACCTTCTCCTCTTCCGCCACGTCATCATAC
GAATCCGAGAGTCACGACACTACCGTGAATACAACGAGACTTCTAACCGGAGGTTCCGCC
GTGAAACAACACGTATACTCACCGGATCCGTTAACTGACTTCCGACGATCAATGCAGGAG
ATGATTGATGCCGCCATTGACGCCGGCGATCTTAGCCATCCCGACGACGGTTATGATTAC
TTGAACGAGCTGCTTCTCAGTTATTTAGCGCTGAATCCAACCGACATGCA

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2G434JQ 583 0 0
TCCGAGAGTCACGACACTACCGTGAATACAACGAGACTTCTAACCGGAGGTTCCGCCGTG
AAACAACACGTATACTCACCGGATCCGTTAACTGACTTCCGACGATCAATGCAGGAGATG
ATTGATGCCGCCATTGACGCCGGCGATCTTAGCCATCCCGACGACGGTTATGATTACTTG
AACGAGCTGCTTTTCAGTTATTTAGCGCTGAATCCAACCGACATGCACAAGTTCATCATA
AGGGCTTTTTCCGACACCATGGTCTCACTCTTGTCGGAAGAACGTCGGATGTGATGACGC
AGCCGCCGCCTAGATTAAAAAAAAATGATCGTGTAATAAATGACCCACGTGATTTTATTA
ATTAACTCGATGGACCTAACATTTTTTTTTACATTATCGTCTTCAAGGAAGAGAAACCAT
CTCAGAAAACTACTATCAAATTTATCTTTATTTTCCTTTTTGTATTTTGTATGTTTTTAT
TAAATAAACCTCTGTTTCGTAACAGAGGTAAATTAATGTTTTTGCATGCATTTACGACCC
AAGATGACCAAATGTAATTATTGTGTAACGATATTTGATTTTC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL4707Contig1 808 2 1 U
GGAATCAGTCGGTCGTTCGGTTCTGGTCAAAGTTGAGATTCATTGCGGAAGCCTTCACTC
GCCGCCGCCGTTGCCACTGACTGGTACAGAGGACAAGAGAAGGGAGTGATGGTGTTGGTG
TCTAATTCTAGCCACCAAAACAAGGAAATACATATCAGAAGGAGAATCTCTGAGATATAC
AATAAAAGGGAAGAGGATTTTGCATCACTTAAGGACTATAATGACTACTTGGAAGAAGTG
GAGTGCATGGTATTCGATCTGGTAGATGGAATCAATGTTGAGGCGATTGAAGAGAAGATC
AAGAAGTACTCTCAAGAGAATGCTGAACAGATTATGATTAACCGTGCCCGCAAGGCGGAA
GATTTAACTGCAGCCTTGGCGGCTTGCAAGGCCCAACAACCACAAACTGATGCCGACACG
TCGTCAAACAATGGGAGTACGTCTGGAACTGCATACAGCCAGGCTCCGAGACCAACGGGA
ATGGGATCACAACCTGTACCTATAGGAGGGGGAGCAGATCATCAACGTTACTCTATGGAA
GACGAAGCGACGATGAGGCTCAAAGCGGAGAGAGCTCCACGGGCTGGAGGATTTTCTTTG
GAGATAAGCAAGAAGAGGGCTTTGGAAGAAGCTTTTGCAAGCATTTGGGTTTGATTCCTC
GAGAGAGAGACTTTACTTCTATATTCAAGACAGTGAGATATTGAGTGTTGAGCTTTGAGT
ATCGAAGTAACTAGAGTTTCCATTGTTCACTCAGTTCATTGTGTTACTCGTGCGTTGCTT
TTCTTTGTATAGTTGACAAGACTCGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B709TF U 1
AF RR2B709JQ C 47
BS 1 808 RR2B709TF

RD RR2B709TF 808 0 0
GGAATCAGTCGGTCGTTCGGTTCTGGTCAAAGTTGAGATTCATTGCGGAAGCCTTCACTC
GCCGCCGCCGTTGCCACTGACTGGTACAGAGGACAAGAGAAGGGAGTGATGGTGTTGGTG
TCTAATTCTAGCCACCAAAACAAGGAAATACATATCAGAAGGAGAATCTCTGAGATATAC
AATAAAAGGGAAGAGGATTTTGCATCACTTAAGGACTATAATGACTACTTGGAAGAAGTG
GAGTGCATGGTATTCGATCTGGTAGATGGAATCAATGTTGAGGCGATTGAAGAGAAGATC
AAGAAGTACTCTCAAGAGAATGCTGAACAGATTATGATTAACCGTGCCCGCAAGGCGGAA
GATTTAACTGCAGCCTTGGCGGCTTGCAAGGCCCAACAACCACAAACTGATGCCGACACG
TCGTCAAACAATGGGAGTACGTCTGGAACTGCATACAGCCAGGCTCCGAGACCAACGGGA
ATGGGATCACAACCTGTACCTATAGGAGGGGGAGCAGATCATCAACGTTACTCTATGGAA
GACGAAGCGACGATGAGGCTCAAAGCGGAGAGAGCTCCACGGGCTGGAGGATTTTCTTTG
GAGATAAGCAAGAAGAGGGCTTTGGAAGAAGCTTTTGCAAGCATTTGGGTTTGATTCCTC
GAGAGAGAGACTTTACTTCTATATTCAAGACAGTGAGATATTGAGTGTTGAGCTTTGAGT
ATCGAAGTAACTAGAGTTTCCATTGTTCACTCAGTTCATTGTGTTACTCGTGCGTTGCTT
TTCTTTGTATAGTTGACAAGACTCGGTT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2B709JQ 762 0 0
GGAAGCCTTCACTCGCCGCCGCCGTTGCCACTGACTGGTACAGAGGACAAGAGAAGGGAG
TGATGGTGTTGGTGTCTAATTCTAGCCACCAAAACAAGGAAATACATATCAGAAGGAGAA
TCTCTGAGATATACAATAAAAGGGAAGAGGATTTTGCATCACTTAAGGACTATAATGACT
ACTTGGAAGAAGTGGAGTGCATGGTATTCGATCTGGTAGATGGAATCAATGTTGAGGCGA
TTGAAGAGAAGATCAAGAAGTACTCTCAAGAGAATGCTGAACAGATTATGATTAACCGTG
CCCGCAAGGCGGAAGATTTAACTGCAGCCTTGGCGGCTTGCAAGGCCCAACAACCACAAA
CTGATGCCGACACGTCGTCAAACAATGGGAGTACGTCTGGAACTGCATACAGCCAGGCTC
CGAGACCAACGGGAATGGGATCACAACCTGTACCTATAGGAGGGGGAGCAGATCATCAAC
GTTACTCTATGGAAGACGAAGCGACGATGAGGCTCAAAGCGGAGAGAGCTCCACGGGCTG
GAGGATTTTCTTTGGAGATAAGCAAGAAGAGGGCTTTGGAAGAAGCTTTTGCAAGCATTT
GGGTTTGATTCCTCGAGAGAGAGACTTTACTTCTATATTCAAGACAGTGAGATATTGAGT
GTTGAGCTTTGAGTATCGAAGTAACTAGAGTTTCCATTGTTCACTCAGTTCATTGTGTTA
CTCGTGCGTTGCTTTTCTTTGTATAGTTGACAAGACTCGGTT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL4708Contig1 729 2 6 U
GACACACACACAACCCTTCAAAAAAAGAAAGAAAGAACAGACAAAAGATCTAAAGAATAA
ACAAGAACCCTACTACAATCAAATCAAGACCGAACCAAGAAGCAAAAGTTTCCTCTTATA
TTCTCTTCTCTCAAAAACTTCTCCTCTTCTAATTGTTCTTGTAAGACTAGGGTTTTGTTT
TATTGTCCGGAAGAAAAGATCTTTCATCAGAAAAAGCAATACCAAACTCATGTTTGTGTT
TGTCTGAATATAGATAAACATTGACCTCCCCTAATAATAAGGTTACATATATATAAAAGA
AGAAGAAAAATGGGAAGGGGAAGGGTAGAGCTAAAGAGGATAGAGAACAAGATTAACAGA
CAAGTCACGTTCGCTAAGCGTAGGAACGGTTTGCTGAAAAAAGCCTATGAGCTTTCTGTT
CTCTGCGATGCTGAGGTTTCTCTCATCGTCTTCTCCAACCGCGGAAAGCTCTACGAATTC
TGCAGCACCTCCAACATGCTCAAGACACTGGAAAGGTACCAGAAGTGTAGCTATGGTTCG
GTTGAAGTCAACAACAAACCTGCCAAAGAACTCGAGAATAGCTACAGAGAGTATTTGAAG
CTGAAAGGTAGATATGAAAATCTGCAACGTCAGCAGAGAAATCTACTTGGAGAGGACCTT
GGACCTCTGAATTCAAGGAGCTAGAGCAGCTTGAGCGACACTAGATGGCTCTCTTAAGCA
AGTTCGCTG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS53TF U 1
AF RR2FA02TF U 2
BS 1 22 RR2CS53TF
BS 23 23 RR2FA02TF
BS 24 514 RR2CS53TF
BS 515 515 RR2FA02TF
BS 516 674 RR2CS53TF
BS 675 729 RR2FA02TF

RD RR2CS53TF 674 0 0
GACACACACACAACCCTTCAAAGAAAGAAAGAAAGAACAGACAAAAGATCTAAAGAATAA
ACAAGAACCCTACTACAATCAAATCAAGACCGAACCAAGAAGCAAAAGTTTCCTCTTATA
TTCTCTTCTCTCAAAAACTTCTCCTCTTCTAATTGTTCTTGTAAGACTAGGGTTTTGTTT
TATTGTCCGGAAGAAAAGATCTTTCATCAGAAAAAGCAATACCAAACTCATGTTTGTGTT
TGTCTGAATATAGATAAACATTGACCTCCCCTAATAATAAGGTTACATATATATAAAAGA
AGAAGAAAAATGGGAAGGGGAAGGGTAGAGCTAAAGAGGATAGAGAACAAGATTAACAGA
CAAGTCACGTTCGCTAAGCGTAGGAACGGTTTGCTGAAAAAAGCCTATGAGCTTTCTGTT
CTCTGCGATGCTGAGGTTTCTCTCATCGTCTTCTCCAACCGCGGAAAGCTCTACGAATTC
TGCAGCACCTCCAACATGCTCAAGACACTGGAAATGTACCAGAAGTGTAGCTATGGTTCG
GTTGAAGTCAACAACAAACCTGCCAAAGAACTCGAGAATAGCTACAGAGAGTATTTGAAG
CTGAAAGGTAGATATGAAAATCTGCAACGTCAGCAGAGAAATCTACTTGGAGAGGACCTT
GGACCTCTGAATTC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2FA02TF 728 0 0
GG
ACACACACAACCCTTCAAAAAAAGAAAGAAAGAACAGACAAAAGATCTAAAGAATAAACA
AGAACCCTACTACAATCAAATCAAGACCGAACCAAGAAGCAAAAGTTTCCTCTTATATTC
TCTTCTCTCAAAAACTTCTCCTCTTCTAATTGTTCTTGTAAGACTAGGGTTTTGTTTTAT
TGTCCGGAAGAAAAGATCTTTCATCAGAAAAAGCAATACCAAACTCATGTTTGTGTTTGT
CTGAATATAGATAAACATTGACCTCCCCTAATAATAAGGTTACATATATATAAAAGAAGA
AGAAAAATGGGAAGGGGAAGGGTTGAGCTAAAGAGGATAGAGAACAAGATTAACAGACAA
GTCACGTTCGCTAAGCGTAGGAACGGTTTGCTGAAAAAAGCCTATGAGCTTTCTGTTCTC
TGCGATGCTGAGGTTTCTCTCATCGTCTTCTCCAACCGTGGAAAGCTCTACGAATTCTGC
AGCACCTCCAACATGCTCAAGACACTGGAAAGGTACCAGAAGTGTAGCTATGGTTCGGTT
GAAGTCAACAACAAACCTGCCAAAGAACTCGAGAATAGCTACAGAGAGTATTTGAAGCTG
AAAGGTAGATATGAAAATCTGCAACGTCAGCAGAGAAATCTACTTGGAGAGGACCTTGGA
CCTCTGAATTCAAGGAGCTAGAGCAGCTTGAGCGACACTAGATGGCTCTCTTAAGCAAGT
TCGCTG

QA 3 728 3 728
DS 



AS 1 2

CO CL4709Contig1 767 2 2 U
GGATCACTTCATATCTCTGAGTCTTGAGCACACAAAGACAGAGTTTCTTATCTTTCAGGA
GGTGAGAAGAAAAAAGAATGGTGTTTGTGACAACTGCGGAAGTTTGTGACGCGAATCAAG
ATCTGATCCGTAGTGGCCAGCTCAGAGCTCTGCAGCCCTGTTTCCAGATTTACGGTCGCC
GTCAGATATTCTCAGGTCCTGTTGTTACTGTCAAAGTGTTTGAGGACAATGGCTTGATCC
GTCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTTCTTGTGGTGGATGGTGGAGGGAGCT
TACGTTGCGCGATACTTGGAGGAAACCCGGTAGTACAAGCTCAGAACAACGGATGGGCGG
GGATCATAGTGAACGGTTGCATAAGAGACGTTGATGAGATCAACGGTTGCGACATTGGAG
TGAGAGCTTTGGCTTCTCATCCTATCAAGGCTAGTAAGAAAGGACTTGGTGAACAGAGAG
TCCCACTCAACATAGCTGGCACTCGGATATGCGATGGTGAATGGCTTTACACAGATACTG
ATGGTATCCTTGTTTCTCAGGTCGAATTATCGGTTTAGAAAAACAAAGAAATGGTGGAGG
AGCTTTGTCTTCTTGTTAAATGGCTATCAAAGTAAAAATGTCAATGTCTTTGAAGGGATG
CGTTTTGGGGTTTGTGGCGTTAATAAGTTAAAAGTTTTTCATTATTTGTTTGTATTATTT
TCGTGTTATGGCGTGTAACGTTTCTGAAATAAAATGGTTCTTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA36TF U 1
AF RR2CA36JQ C 63
BS 1 755 RR2CA36TF
BS 756 767 RR2CA36JQ

RD RR2CA36TF 755 0 0
GGATCACTTCATATCTCTGAGTCTTGAGCACACAAAGACAGAGTTTCTTATCTTTCAGGA
GGTGAGAAGAAAAAAGAATGGTGTTTGTGACAACTGCGGAAGTTTGTGACGCGAATCAAG
ATCTGATCCGTAGTGGCCAGCTCAGAGCTCTGCAGCCCTGTTTCCAGATTTACGGTCGCC
GTCAGATATTCTCAGGTCCTGTTGTTACTGTCAAAGTGTTTGAGGACAATGGCTTGATCC
GTCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTTCTTGTGGTGGATGGTGGAGGGAGCT
TACGTTGCGCGATACTTGGAGGAAACCCGGTAGTACAAGCTCAGAACAACGGATGGGCGG
GGATCATAGTGAACGGTTGCATAAGAGACGTTGATGAGATCAACGGTTGCGACATTGGAG
TGAGAGCTTTGGCTTCTCATCCTATCAAGGCTAGTAAGAAAGGACTTGGTGAACAGAGAG
TCCCACTCAACATAGCTGGCACTCGGATATGCGATGGTGAATGGCTTTACACAGATACTG
ATGGTATCCTTGTTTCTCAGGTCGAATTATCGGTTTAGAAAAACAAAGAAATGGTGGAGG
AGCTTTGTCTTCTTGTTAAATGGCTATCAAAGTAAAAATGTCAATGTCTTTGAAGGGATG
CGTTTTGGGGTTTGTGGCGTTAATAAGTTAAAAGTTTTTCATTATTTGTTTGTATTATTT
TCGTGTTATGGCGTGTAACGTTTCTGAAATAAAAT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2CA36JQ 705 0 0
TGAGAAGAAAAAAGAATGGTGTTTGTGACAACTGCGGAAGTTTGTGACGCGAATCAAGAT
CTGATCCGTAGTGGCCAGCTCAGAGCTCTGCAGCCCTGTTTCCAGATTTACGGTCGCCGT
CAGATATTCTCAGGTCCTGTTGTTACTGTCAAAGTGTTTGAGGACAATGGCTTGATCCGT
CAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTTCTTGTGGTGGATGGTGGAGGGAGCTTA
CGTTGCGCGATACTTGGAGGAAACCCGGTAGTACAAGCTCAGAACAACGGATGGGCGGGG
ATCATAGTGAACGGTTGCATAAGAGACGTTGATGAGATCAACGGTTGCGACATTGGAGTG
AGAGCTTTGGCTTCTCATCCTATCAAGGCTAGTAAGAAAGGACTTGGTGAACAGAGAGTC
CCACTCAACATAGCTGGCACTCGGATATGCGATGGTGAATGGCTTTACACAGATACTGAT
GGTATCCTTGTTTCTCAGGTCGAATTATCGGTTTAGAAAAACAAAGAAATGGTGGAGGAG
CTTTGTCTTCTTGTTAAATGGCTATCAAAGTAAAAATGTCAATGTCTTTGAAGGGATGCG
TTTTGGGGTTTGTGGCGTTAATAAGTTAAAAGTTTTTCATTATTTGTTTGTATTATTTTC
GTGTTATGGCGTGTAACGTTTCTGAAATAAAATGGTTCTTTATAC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL4710Contig1 784 2 3 U
TTTTTTTTATTGAAAATAGCTAGGTATAGATGGCTAGAAAAACATACAAGAACCAATGAC
GAGGAACATTTAAGAAAATATATAAAACTCTTACACATTTATTATATCACTTAAACAAAA
TTAAGATTTAAATATTAGACTGTAGCTTGCATGTATTTATTGAAACTGTAAATATTTCGT
AAAGGAAACTGTGTGTGCGTCGTATTCATAGTTGATTCAAGTGCATTCAAAACCAGACGG
AACCTTCTTGTTACACTTGTTGAGAAGAACGCTGAGAGATATAGGAACGTTAAGGTTGAT
CCCAAGAACGTTAGCTTTAAGAGCAGTGCAGAGACAAACCGCAGCCTCGAGGTCAACCAA
ACCTTGGACAACCGAGCAGCATTGTTGAGATGATGGCCGACCCAATTGTATGTTGAGTAG
GCCGCTTAGGACATTTCCACATACACCGAGCTTGAGAGCATCGATTGGACAGTTTCCGGA
TGAGCCAGGGGTCCTCGGAGGTGTGGCCGGCCTAGGGCTAGGATGTGGGACCGATGGACT
TGGGACAGAGGGACTTGGGACTGATGGACTTGGGACATGCTTGGGGGGCTTAGGACTTGG
GACCGGCTTGGGTTTCGGACTTGGGCTGCAACCACAATTAGTTGCAACGGTTAAGGTGAA
AAAGAGGATGTTGAGGGCGAAGAAAAGAGCAACAGAGGCCGAGTTCCTTGAAGCCATTCT
CTTTTTCAAAAGATGCTAGACTCAGAGTTATAAGGATTATCGAGTGTGTTTGAGAAAGAG
ATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2ED43JQ U 12
AF RR2ED43TF C 1
BS 1 11 RR2ED43TF
BS 12 509 RR2ED43JQ
BS 510 784 RR2ED43TF

RD RR2ED43JQ 498 0 0
GAAAATAGCTAGGTATAGATGGCTAGAAAAACATACAAGAACCAATGACGAGGAACATTT
AAGAAAATATATAAAACTCTTACACATTTATTATATCACTTAAACAAAATTAAGATTTAA
ATATTAGACTGTAGCTTGCATGTATTTATTGAAACTGTAAATATTTCGTAAAGGAAACTG
TGTGTGCGTCGTATTCATAGTTGATTCAAGTGCATTCAAAACCAGACGGAACCTTCTTGT
TACACTTGTTGAGAAGAACGCTGAGAGATATAGGAACGTTAAGGTTGATCCCAAGAACGT
TAGCTTTAAGAGCAGTGCAGAGACAAACCGCAGCCTCGAGGTCAACCAAACCTTGGACAA
CCGAGCAGCATTGTTGAGATGATGGCCGACCCAATTGTATGTTGAGTAGGCCGCTTAGGA
CATTTCCACATACACCGAGCTTGAGAGCATCGATTGGACAGTTTCCGGATGAGCCAGGGG
TCCTCGGAGGTGTGGCCG

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2ED43TF 784 0 0
TTTTTTTTATTGAAAATAGCTAGGTATAGATGGCTAGAAAAACATACAAGAACCAATGAC
GAGGAACATTTAAGAAAATATATAAA*CTCTTACACATTTAT*ATATCACTTAAACAAAA
TTAAGATTTAAATATTAGACTGTAGCTTGCATGTATTTATTGAAACTGTAAATATTTCGT
AGAGGAAACTGTGTGTGCGTCGTATTCATAGTTGATTCAAGTGCATTCAAAACCAGACGG
AACCTTCTTGTTACACTTGTTGAGAAGAACGCTGAGAGATATAGGAACGTTAAGGTTGAT
CCCAAGAACGTTAGCTTTAAGAGCAGTGCAGAGACAAACCGCAGCCTCGAGGTCAACCAA
ACCTTGGACAACCGAGCAGCATTGTTGAGATGATGGCCGACCCAATTGTATGTTGAGTAG
GCCGCTTAGGACATTTCCACATACACCGAGCTTGAGAGCATCGATTGGACAGTTTCCGGA
TGAGCCAGGGGTCCTCGGAGGTGTGGCCGGCCTAGGGCTAGGATGTGGGACCGATGGACT
TGGGACAGAGGGACTTGGGACTGATGGACTTGGGACATGCTTGGGGGGCTTAGGACTTGG
GACCGGCTTGGGTTTCGGACTTGGGCTGCAACCACAATTAGTTGCAACGGTTAAGGTGAA
AAAGAGGATGTTGAGGGCGAAGAAAAGAGCAACAGAGGCCGAGTTCCTTGAAGCCATTCT
CTTTTTCAAAAGATGCTAGACTCAGAGTTATAAGGATTATCGAGTGTGTTTGAGAAAGAG
ATTC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL4711Contig1 768 2 2 U
GGATCACTTTCTCCCTTCCTTTCACAGCGTCGCCGAGATACTCATCGGTCCTCCTCGCCT
CTGGTCTTGCTGTTCCTCGAACATTGTTGATTGTCGGAATCTATTGAACCTAAGATGGAG
TTGGACCCAAAGAAGGTTGTTGAAGTATACGAGAGATACGAAGCTGTTGGTGATCAGTTT
CTACTTGTTCGAAACCAGATGGTGGAGAATGATAGGGAGAGGAATGCGAACCGAGAGGCT
CTTACAGCGCTAAGGAAGAGAGCTAAGACAACAAAGACTAGCGTCCCTTCTCCTTTCGAC
TCTATGATGAAGGATACTACAACGCACGGGGGCTCAGCCAAAGCTTTGGTTCAGGAAGTT
TGCTCGACTTGTGGATCTCACGACTCTAGTGAACCCACCTGGATGATGCTCCCAGGAACT
GACCTTTTCGCTGCGGTCCCTTTTCATGCTGTTCATACAATGCTAGAGAAAGATGAAAAG
AGAATGGAGTTTGAATCAAAGAAACTGCAGAGCTTGTTGAAGGAGAAGACTCTTTTGTTA
TCAGAACTTGGAGCTCTTGCTGATAGTGTTCCTCCGAGTGTTATCAGGTCGCTGATTACG
TTGAAAGACACACCTTCAGTTCAGTAGTCTTTAGATTGACACAAACGGCGTTATCCATTT
GTGATGTTAAAGGATTAGTCTTCTTGAATGTTGAAAATGTCATGATCCCTGATCATAATT
AAAATCACAAACTGCCTTGTTTCCTCTAATAAATAATATTTTACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ95TF U 1
AF RR2EJ95JQ C 193
BS 1 681 RR2EJ95TF
BS 682 768 RR2EJ95JQ

RD RR2EJ95TF 681 0 0
GGATCACTTTCTCCCTTCCTTTCACAGCGTCGCCGAGATACTCATCGGTCCTCCTCGCCT
CTGGTCTTGCTGTTCCTCGAACATTGTTGATTGTCGGAATCTATTGAACCTAAGATGGAG
TTGGACCCAAAGAAGGTTGTTGAAGTATACGAGAGATACGAAGCTGTTGGTGATCAGTTT
CTACTTGTTCGAAACCAGATGGTGGAGAATGATAGGGAGAGGAATGCGAACCGAGAGGCT
CTTACAGCGCTAAGGAAGAGAGCTAAGACAACAAAGACTAGCGTCCCTTCTCCTTTCGAC
TCTATGATGAAGGATACTACAACGCACGGGGGCTCAGCCAAAGCTTTGGTTCAGGAAGTT
TGCTCGACTTGTGGATCTCACGACTCTAGTGAACCCACCTGGATGATGCTCCCAGGAACT
GACCTTTTCGCTGCGGTCCCTTTTCATGCTGTTCATACAATGCTAGAGAAAGATGAAAAG
AGAATGGAGTTTGAATCAAAGAAACTGCAGAGCTTGTTGAAGGAGAAGACTCTTTTGTTA
TCAGAACTTGGAGCTCTTGCTGATAGTGTTCCTCCGAGTGTTATCAGGTCGCTGATTACG
TTGAAAGACACACCTTCAGTTCAGTAGTCTTTAGATTGACACAAACGGCGTTATCCATTT
GTGATGTTAAAGGATTAGTCT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2EJ95JQ 576 0 0
AACCAGATGGTGGAGAATGATAGGGAGAGGAATGCGAACCGAGAGGCTCTTACAGCGCTA
AGGAAGAGAGCTAAGACAACAAAGACTAGCGTCCCTTCTCCTTTCGACTCTATGATGAAG
GATACTACAACGCACGGGGGCTCAGCCAAAGCTTTGGTTCAGGAAGTTTGCTCGACTTGT
GGATCTCACGACTCTAGTGAACCCACCTGGATGATGCTCCCAGGAACTGACCTTTTCGCT
GCGGTCCCTTTTCATGCTGTTCATACAATGCTAGAGAAAGATGAAAAGAGAATGGAGTTT
GAATCAAAGAAACTGCAGAGCTTGTTGAAGGAGAAGACTCTTTTGTTATCAGAACTTGGA
GCTCTTGCTGATAGTGTTCCTCCGAGTGTTATCAGGTCGCTGATTACGTTGAAGGACACA
CCTTCAGTTCAGTAGTCTTTAGATTGACACAAACGGCGTTATCCATTTGTGATGTTAAAG
GATTAGTCTTCTTGAATGTTGAAAATGTCATGATCCCTGATCATAATTAAAATCACAAAC
TGCCTTGTTTCCTCTAATAAATAATATTTTACTTTT

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

CO CL4712Contig1 820 2 3 U
GATAGCTCAGCCAAGTTTTCTTCTTTTCACAACTTGTTCCGTGCTCGCGGACAGCTTTGA
GGTCGACGACTCAGATTCTCGACAGTTTTCAGTTTACAGCGTAAGGAGTGTGTGTTGAGA
TGGGTGGGGGATCAAAGATGTCTAAAAGAGCAAGACTTTATGAAAGTGAATCAGAAGAGA
TGATGAGCGAGGAGGACAATCTCCAGGTGGAAGGGGAGAGCGAAGAGGAAGAGTTGTCTG
ATGGGATAGAAGAGGATGGTGAGGGAGATAGCATGGAAGGGAGTGAAGAAGAAGAAGAAG
ATGATGAAGGAGATAGTGAGAAGGAAGATGTGGATGGAGAAAGCGATGAACTTGATGATG
GGAATGACGATGAAAGCGATGAAGGGAATGATGACAATAAAGATGCTGCCATGGAAGAGC
TTGAGAAAGAGTACCAGGAGCTTCGTTCTCAGGAACAGGATATATTGAAAAACCTGAAGC
GTGATAAGGGTGAGGATGCTGCTAAAGGTCAAGCTGTGAAGAACCAGAAGGCTCTTTGGG
ATAAAACTTTGGAGTTCAGATTCTTACTTCAGAAAGCATTTAGTAGTTCAAACAGATTGC
CACATGAGACTGTCAAATCGTCTTTTTGTTCGGAAGATGAGAAAGTTTCAACGGCATATT
CAGAGCTAATTACTTCTTCTAAGAAGACACTAGATTCCCTCTTGGAGTTGCAAGAGGCTT
TGTTTGAGAAGAATCCCTCGGTTGACCAACAAGCAAATGGTACCGAATCCCATAATCAGA
GCGGAGATAGCGATGATGGCACCGAGTGTCTGACATGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C151TF U 29
AF RR2AK66TF U 1
BS 1 360 RR2AK66TF
BS 361 361 RR2C151TF
BS 362 820 RR2AK66TF

RD RR2C151TF 676 0 0
ACAACTTGTTCTGTGCTCGCGGACAGCTTTGAGGTCGACGACTCAGATTCTCGACAGTTT
TCAGTTTACAGCGTAAGGAGTGTGTGTTGAGATGGGTGGGGGATCAAAGATGTCTAAAAG
AGCAAGACTTTATGAAAGTGAATCAGAAGAGATGATGAGCGAGGAGGACAATCTCCAGGT
GGAAGGGGAGAGCGAAGAGGAAGAGTTGTCTGATGGGATAGAAGAGGATGGTGAGGGAGA
TAGCATGGAAGGGAGTGAAGAAGAAGAAGAAGATGATGAAGGAGATAGTGAGAAGGAAGA
TGTGGATGGAGAAAGCGATTAACTTGATGATGGGAATGACGATGAAAGCGATGAAGGGAA
TGATGACAATAAAGATGCTGCCATGGAAGAGCTTGAGAAAGAGTACCAGGAGCTTCGTTC
TTAGGAACAGGATATATTGAAAAACCTGAAGCGTGATAAGGGTGAGGATGCTGCTAAAGG
TCAAGCTGTGAAGAACCAGAAGGCTCTTTGGGATAAAACTTTGGAGTTCAGATTCTTACT
TCAGAAAGCATTTAGTAGTTCAAACAGATTGCCACATGAGACTGTCAAATCGTCTTTTTG
TTCGGAAGATGAGAAAGTTTCAACGGCATATTCAGAGCTAATTACTTCTTCTAAGA*GAC
ACTAGATTCCCTCTTG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2AK66TF 820 0 0
GATAGCTCAGCCAAGTTTTCTTCTTTTCACAACTTGTTCCGTGCTCGCGGACAGCTTTGA
GGTCGACGACTCAGATTCTCGACAGTTTTCAGTTTACAGCGTAAGGAGTGTGTGTTGAGA
TGGGTGGGGGATCAAAGATGTCTAAAAGAGCAAGACTTTATGAAAGTGAATCAGAAGAGA
TGATGAGCGAGGAGGACAATCTCCAGGTGGAAGGGGAGAGCGAAGAGGAAGAGTTGTCTG
ATGGGATAGAAGAGGATGGTGAGGGAGATAGCATGGAAGGGAGTGAAGAAGAAGAAGAAG
ATGATGAAGGAGATAGTGAGAAGGAAGATGTGGATGGAGAAAGCGATGAACTTGATGATG
TGAATGACGATGAAAGCGATGAAGGGAATGATGACAATAAAGATGCTGCCATGGAAGAGC
TTGAGAAAGAGTACCAGGAGCTTCGTTCTCAGGAACAGGATATATTGAAAAACCTGAAGC
GTGATAAGGGTGAGGATGCTGCTAAAGGTCAAGCTGTGAAGAACCAGAAGGCTCTTTGGG
ATAAAACTTTGGAGTTCAGATTCTTACTTCAGAAAGCATTTAGTAGTTCAAACAGATTGC
CACATGAGACTGTCAAATCGTCTTTTTGTTCGGAAGATGAGAAAGTTTCAACGGCATATT
CAGAGCTAATTACTTCTTCTAAGAAGACACTAGATTCCCTCTTGGAGTTGCAAGAGGCTT
TGTTTGAGAAGAATCCCTCGGTTGACCAACAAGCAAATGGTACCGAATCCCATAATCAGA
GCGGAGATAGCGATGATGGCACCGAGTGTCTGACATGCAG

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 2

CO CL4713Contig1 617 2 10 U
GGAAAAACATAATCCTGTCTCCAACAAAAACCTCTGAACACATCAAGAACATATATACAT
ATCCCTCAGACTTTTAATTTCTAAATCGGCCATGGAAGAAAATCAACAAGAAGCTTCAAT
GCAACTAGTTCCCATAGAGAGCTTCTCTTACAGTTGGTTAGTTAACTTTCCTTCTTTAGA
AGCTTCCATCGATGATTATCATCAAAACTACGAAGATTCTTCTTCCTTCATCGAGATGGA
TCCAAGATTGCCTCCTTCTAGAAGATTCTTCATCAACAAAGCCCATGAAAGTAGCTTCAA
GTTCGATACCTTTTTCTCTTTCGCCGACGAGGATCACACTTTAGTTCACGCTGACGATAT
TTTCCGTGACGGCTACGTCATGCCTTATCTATCAAAAGCCACGTCAGCAACTACTAAGGA
AAAATATGAGCCGTTGGATACGAAAACAGAGAAGAAGATGGTGACACGTGACATTCAGAG
CAAGTCTCCTTCTTGTAGAAAATTGAAGAGAGTATCAAAGTGGGTTTTGTTAAGGTATCT
TGATTTTTTGACGCCATTGTGTAAAAGATTGAGGAGATGTAGATCCGCTGGATCACATGG
AGGTACCGGTTTGGACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK47TF U 1
AF RR2DF70TF U 52
BS 1 76 RR2GK47TF
BS 77 77 RR2DF70TF
BS 78 80 RR2GK47TF
BS 81 81 RR2DF70TF
BS 82 113 RR2GK47TF
BS 114 114 RR2DF70TF
BS 115 321 RR2GK47TF
BS 322 322 RR2DF70TF
BS 323 457 RR2GK47TF
BS 458 617 RR2DF70TF

RD RR2GK47TF 457 0 0
GGAAAAACATAATCCTGTCTCCAACAAAAACCTCTGAACACATCAAGAACATATATACAT
ATCCCTCAGACTTTTA*TTTTTAAATCGGCCATGGAAGAAAATCAACAAGAAGTTTCAAT
GCAACTAGTTCCCATAGAGAGCTTCTCTTACAGTTGGTTAGTTAACTTTCCTTCTTTAGA
AGCTTCCATCGATGATTATCATCAAAACTACGAAGATTCTTCTTCCTTCATCGAGATGGA
TCCAAGATTGCCTCCTTCTAGAAGATTCTTCATCAACAAAGCCCATGAAAGTAGCTTCAA
GTTCGATACCTTTTTCTCTTTTGCCGACGAGGATCACACTTTAGTTCACGCTGACGATAT
TTTCCGTGACGGCTACGTCATGCCTTATCTATCAAAAGCCACGTCAGCAACTACTAAGGA
AAAATATGAGCCGTTGGATACGAAAACAGAGAAGAAG

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR2DF70TF 566 0 0
GATAC
ACATATCTCTCAGTCTTTTAATTTCTATATCGGCCATGGAAGAAAATCAACAAGAAGCTT
CAATGCAACTAGTTCCCATAGAGAGCTTCTCTTACAGTTGGTTAGTTAACTTTCCTTCTT
TAGAAGCTTCCATCGATGATTATCATCAAAACTACGAAGATTCTTCTTCCTTCATCGAGA
TGGATTCAAGATTGCCTCCTTCTA**AGATTCTTCATCAACAAAGCCCATGAAAGTAGCT
TCAAGTTCGATACCTTTTTCTCTTTCGCCGACGAGGATCACACTTTAGTTCACGCTGACG
ATATTTTCCGTGACGGCTACGTCATGCCTTATCTATCAAAAGCCACGTCAGCAACTACTA
AGGAAAAATATGAGCCGTTGGATACGAAAACAGGGAAGAAGATGGTGACACGTGACATTC
AGAGCAAGTCTCCTTCTTGTAGAAAATTGAAGAGAGTATCAAAGTGGGTTTTGTTAAGGT
ATCTTGATTTTTTGACGCCATTGTGTAAAAGATTGAGGAGATGTAGATCCGCTGGATCAC
ATGGAGGTACCGGTTTGGACA

QA 6 566 6 566
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4715Contig1 791 2 2 U
ACTAATTTAAAATTCACTGTTATTGAACTTGACATTTCGTAAAGTACTCTAAAATCTATT
GTTATTGAAAATATTTTAAGTTGTGGAGTTTTAAAGTTTTGAGGTGATTTTAGGGTGTTT
AGGTGGAGTTTCTTAGTTAAAAAAATTAAAACTCAAATCTCATTGTTTTAGGTGATATTC
TAGAGTAGTTTAACAAAAGTCACCTAAATCTCTGCAACTTATTAAAATCATCTAAAACTC
CATTAAAAATGAAATCACATCAAATGTTAAATTGAATACATCCCCCTTAATATATTTCAT
TAGACGGAAAAAAAAAAAAAATAGTCCGCACTCAGCTGCAGCAGTGAAATTAGGTATGGT
CTTCCATGAAGGTCTCAGGCTGTTTCCTTTTTGATGCATGAAACTATCTATCACATTAAA
TAATACATTCTTTTCCCAAAGCCTTAGCCAAACTGCTGAACTTTGGTTAACCAACTCCGA
TGTACCCTCCAAAGACAATTTCCTACTACTTCAATATTTATATAAATGTTTTTAGGCTAT
TTAGTTAATGTGATTCTAGCGAAAAGAAGACAAAGTAGAAAATATGTTACTTCATATTTA
ATAAAAAGAACATACAAAAAAAGTCTGAAAGCAAATTAAAGCATCTAAATTTTGTTTATC
TATCTAACTCCACAAAACAAAATATGCATGTCTTCATCTAACATGATAACTTTTTATTAT
CAGTAGAGGTTTGGAACTAATTGGTTGAACCTGTCGTTGTTGTGGGGAGCCAAAAATATT
TCTAAAGCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B278TF U 1
AF RR2B278JQ C 234
BS 1 307 RR2B278TF
BS 308 791 RR2B278JQ

RD RR2B278TF 307 0 0
ACTAATTTAAAATTCACTGTTATTGAACTTGACATTTCGTAAAGTACTCTAAAATCTATT
GTTATTGAAAATATTTTAAGTTGTGGAGTTTTAAAGTTTTGAGGTGATTTTAGGGTGTTT
AGGTGGAGTTTCTTAGTTAAAAAAATTAAAACTCAAATCTCATTGTTTTAGGTGATATTC
TAGAGTAGTTTAACAAAAGTCACCTAAATCTCTGCAACTTATTAAAATCATCTAAAACTC
CATTAAAAATGAAATCACATCAAATGTTAAATTGAATACATCCCCCTTAATATATTTCAT
TAGACGG

QA 1 307 1 307
DS 

RD RR2B278JQ 558 0 0
AAAACTCCATTAAAAATGAAATCACATCAAATGTTAAATTGAATACATCCCCCTTAATAT
ATTTCATTAGACGGAAAAAAAAAAAAAATAGTCCGCACTCAGCTGCAGCAGTGAAATTAG
GTATGGTCTTCCATGAAGGTCTCAGGCTGTTTCCTTTTTGATGCATGAAACTATCTATCA
CATTAAATAATACATTCTTTTCCCAAAGCCTTAGCCAAACTGCTGAACTTTGGTTAACCA
ACTCCGATGTACCCTCCAAAGACAATTTCCTACTACTTCAATATTTATATAAATGTTTTT
AGGCTATTTAGTTAATGTGATTCTAGCGAAAAGAAGACAAAGTAGAAAATATGTTACTTC
ATATTTAATAAAAAGAACATACAAAAAAAGTCTGAAAGCAAATTAAAGCATCTAAATTTT
GTTTATCTATCTAACTCCACAAAACAAAATATGCATGTCTTCATCTAACATGATAACTTT
TTATTATCAGTAGAGGTTTGGAACTAATTGGTTGAACCTGTCGTTGTTGTGGGGAGCCAA
AAATATTTCTAAAGCCAC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL4716Contig1 601 2 2 U
GGACCGATCGAATCTCGACCCATCCCCCTTGAGTGAGAGAAGAATAGAGAGAAATGATGA
AGCGCCTGGTCCCAACGTTCAACCGCATTCTTGTGCAGAGAGTCATCCAGCCTGCTAAAA
CCGAAAGCGGCATCCTCCTCCCTGAGAAAGCCTCCAAGCTGAACTCAGGGAAGGTGATAG
CAGTGGGGCCCGGTTCGAGAGATAAGGACGGGAAATTGATTCCGGTCTCTGTTAAGGAAG
GCGACACCGTTCTTCTTCCGGAATACGGTGGTACTGAGGTCAAGCTCGGTGAGAAGGAGT
ACCATCTCTTCCGTGATGAGGATGTCTTGGGAACTTTGCACGAGGATTAAAAAACCAAGT
CATTTATTTATAAGTTAAGTTTATCCTTGATGATGTGGTCGGACATTGTCGTTTGTTTTT
TTGAAATTTTACGTTAATGGACTATCTTAATCCCTTTCGAAATTGTTCCAGTTTCCAAAT
GAGTATCAGTCTTGTGATTCTTAACTCTCTTTTTTTTGTGTGTTTTCCTTGGACTGATGA
CGGCTTTGATTGAGCTTATGTGCGTTTTCTTGATCAATCTATTACTATAGCTAAAGGTTT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BD86TF U 1
AF RR2BD86JQ C 24
BS 1 575 RR2BD86TF
BS 576 601 RR2BD86JQ

RD RR2BD86TF 575 0 0
GGACCGATCGAATCTCGACCCATCCCCCTTGAGTGAGAGAAGAATAGAGAGAAATGATGA
AGCGCCTGGTCCCAACGTTCAACCGCATTCTTGTGCAGAGAGTCATCCAGCCTGCTAAAA
CCGAAAGCGGCATCCTCCTCCCTGAGAAAGCCTCCAAGCTGAACTCAGGGAAGGTGATAG
CAGTGGGGCCCGGTTCGAGAGATAAGGACGGGAAATTGATTCCGGTCTCTGTTAAGGAAG
GCGACACCGTTCTTCTTCCGGAATACGGTGGTACTGAGGTCAAGCTCGGTGAGAAGGAGT
ACCATCTCTTCCGTGATGAGGATGTCTTGGGAACTTTGCACGAGGATTAAAAAACCAAGT
CATTTATTTATAAGTTAAGTTTATCCTTGATGATGTGGTCGGACATTGTCGTTTGTTTTT
TTGAAATTTTACGTTAATGGACTATCTTAATCCCTTTCGAAATTGTTCCAGTTTCCAAAT
GAGTATCAGTCTTGTGATTCTTAACTCTCTTTTTTTTGTGTGTTTTCCTTGGACTGATGA
CGGCTTTGATTGAGCTTATGTGCGTTTTCTTGATC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2BD86JQ 578 0 0
CCCCCTTGAGTGAGAGAAGAATAGAGAGAAATGATGAAGCGCCTGGTCCCAACGTTCAAC
CGCATTTTTGTGCAGAGAGTCATCCAGCCTGCTAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTCCCT
GAGAAAGCCTCCAAGCTGAACTCAGGGAAGGTGATAGCAGTGGGGCCCGGTTCGAGAGAT
AAGGACGGGAAATTGATTCCGGTTTTTGTTAAGGAAGGGGACCCCGTTTTTTTTCCGGAA
TACGGTGGTACTGAGGTCAAGCTCGGTGAGAAGGAGTACCATTTTTTCCGTGATGAGGAT
GTTTTGGGAACTTTGCACGAGGATTAAAAAACCAAGTCATTTATTTATAAGTTAAGTTTA
TCCTTGATGATGTGGTCGGACATTGTCGTTTGTTTTTTTGAAATTTTACGTTAATGGACT
ATTTTAATCCCTTTTGAAATTGTTCCAGTTTCCAAATGAGTATCAGTCTTGTGATTTTTA
ACTTTTTTTTTTTTGTGTGTTTTCCTTGGACTGATGACGGCTTTGATTGAGCTTATGTGC
GTTTTTTTGATCAATCTATTACTATAGCTAAAGGTTTT

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL4717Contig1 661 2 4 U
GACCCACCATTAGGGCGAACGCAAAATCTAGGAGGTAACAGAGAGCGATGGCGAGTACAG
GAACTGCAGGGTCTGCGACGGGAACGACGACGGCGGCGAAGAGAAAGCCTGTGTTTGTGA
AGGTCGAACAGCTCAAGCCTGGCACGACCGGTCACACGTTGACTGTCAAGGTCGTCGACG
CCAATCCTGTGGTTCCGGCTGCGAGGAAGGCTCGTCCGGGGATCTCTATGGGTCGTCCGT
CTCAGCCGAGTCGAATCGCTGAGTGTCTCATCGGTGACGAAACCGGATGTATTCTCTTCA
CTGCTCGTAACGATCAAGTTGATCTTATGAAGCCTGGACAGACGGTGATACTGCGCAATT
CGAGGATAGACATGTTCAAGGGCACAATGAGGCTTGGGGTTGATAAATGGGGACGCATTG
AAGCCTCCACGGAACCAGCATCTTTCACAGTCAAAGAGGATAACAATCTGTCTCTTGTTG
AATACGAACTGATTAACGTTACTGATCAGTGATGTCTCTTTTTAGTTATCTTTATGCTAG
TGTTTGGTGCTCTGATTCTTCTACCGTCAATGAATGTCTTTTGATTTAGATGATGAAAGC
TTTTGTATGACTTGGTTCAGAGATGCTTGTTTCGTAGGAATGCGTTCTTTTTTTTTACTC
T


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 

AF RR2H983TF U 1
AF RR2H983JQ C 1
BS 1 637 RR2H983TF
BS 638 638 RR2H983JQ
BS 639 659 RR2H983TF
BS 660 661 RR2H983JQ

RD RR2H983TF 659 0 0
GACCCACCATTAGGGCGAACGCAAAATCTAGGAGGTAACAGAGAGCGATGGCGAGTACAG
GAACTGCAGGGTCTGCGACGGGAACGACGACGGCGGCGAAGAGAAAGCCTGTGTTTGTGA
AGGTCGAACAGCTCAAGCCTGGCACGACCGGTCACACGTTGACTGTCAAGGTCGTCGACG
CCAATCCTGTGGTTCCGGCTGCGAGGAAGGCTCGTCCGGGGATCTCTATGGGTCGTCCGT
CTCAGCCGAGTCGAATCGCTGAGTGTCTCATCGGTGACGAAACCGGATGTATTCTCTTCA
CTGCTCGTAACGATCAAGTTGATCTTATGAAGCCTGGACAGACGGTGATACTGCGCAATT
CGAGGATAGACATGTTCAAGGGCACAATGAGGCTTGGGGTTGATAAATGGGGACGCATTG
AAGCCTCCACGGAACCAGCATCTTTCACAGTCAAAGAGGATAACAATCTGTCTCTTGTTG
AATACGAACTGATTAACGTTACTGATCAGTGATGTCTCTTTTTAGTTATCTTTATGCTAG
TGTTTGGTGCTCTGATTCTTCTACCGTCAATGAATGTCTTTTGATTTAGATGATGAAAGC
TTTTGTATGACTTGGTTCAGAGATGCTTGTTTCGTAG*AATGCGTTCTTTTTTTTTACT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2H983JQ 661 0 0
GACCCACCATTAGGGCGAACGCAAAATCTAGGAGGTAACAGAGAGCGATGGCGAGTACAG
GAACTGCAGGGTCTGCGACGGGAACGACGACGGCGGCGAAGAGAAAGCCTGTGTTTGTGA
AGGTCGAACAGCTCAAGCCTGGCACGACCGGTCACACGTTGACTGTCAAGGTCGTCGACG
CCAATCCTGTGGTTCCGGCTGCGAGGAAGGCTCGTCCGGGGATCTCTATGGGTCGTCCGT
CTCAGCCGAGTCGAATCGCTGAGTGTCTCATCGGTGACGAAACCGGATGTATTCTCTTCA
CTGCTCGTAACGATCAAGTTGATCTTATGAAGCCTGGACAGACGGTGATACTGCGCAATT
CGAGGATAGACATGTTCAAGGGCACAATGAGGCTTGGGGTTGATAAATGGGGACGCATTG
AAGCCTCCACGGAACCAGCATCTTTCACAGTCAAAGAGGATAACAATCTGTCTCTTGTTG
AATACGAACTGATTAACGTTACTGATCAGTGATGTCTCTTTTTAGTTATCTTTATGCTAG
TGTTTGGTGCTCTGATTCTTCTACCGTCAATGAATGTCTTTTGATTTAGATGATGAAAGC
TTTTGTATGACTTGGTTCAGAGATGCTTGTTTCGTAGGAATGCGTTCTTTTTTTTTACTC
T

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL4718Contig1 654 2 1 U
GGATCAAAAGAAAGAAAGCTCAAAAAGCCATCGCAAAGATGATGCACATGACCTTCTACT
GGGGCATCAAAGCCACAATCCTCTTCGATTTCTGGAAAACCGATTCATGGCTCAGCTACA
TCCTCACCTTGCTCGCCTGCTTCGTCTTCGCCGCCTTCTACCAGTACCTCGAGAACCGCC
GCCTCCAATTCAAATCCCTTTCGTCCGCCCGCCACCCTCCTCCGCCGCGAGCCGGCGTCT
CCGCCCCTCTTATCCCCAAATCGGGCACCAGATCCGCCGCCAAAGCTGCCTCGGTGCTGC
TCTTCGGCGTCAACGCCGCGATCGGGTACTTGCTGATGCTCGCGGCCATGTCCTTCAACG
GAGGCGTTTTTATCGCGATCGTCGTCGGACTGACCGTCGGGTACCTCGTTTTCAGATCTG
ACGACGACGGTGGTAACGAGGCGGCGGAGAATCCGTGCGCTTGTGCTTGATTTATTATTA
CAACCAATAATGTAAACTTTCTGTAACCGAATCACTGATATTATATGTAAACATTGTTGT
CTGTTTGTAATAATTTGAGATTGCCAAGTCTCTTTACTCTTTGGTTTGTGTTGGTTAGAG
TTGCAAATGTTTCGTTTTAGATTACGACGCAGTATGTACAAGGTCCTTCCTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B347JQ C 1
AF RR2B347TF U 1
BS 1 654 RR2B347TF

RD RR2B347JQ 654 0 0
GGATCAAAAGAAAGAAAGCTCAAAAAGCCATCGCAAAGATGATGCACATGACCTTCTACT
GGGGCATCAAAGCCACAATCCTCTTCGATTTCTGGAAAACCGATTCATGGCTCAGCTACA
TCCTCACCTTGCTCGCCTGCTTCGTCTTCGCCGCCTTCTACCAGTACCTCGAGAACCGCC
GCCTCCAATTCAAATCCCTTTCGTCCGCCCGCCACCCTCCTCCGCCGCGAGCCGGCGTCT
CCGCCCCTCTTATCCCCAAATCGGGCACCAGATCCGCCGCCAAAGCTGCCTCGGTGCTGC
TCTTCGGCGTCAACGCCGCGATCGGGTACTTGCTGATGCTCGCGGCCATGTCCTTCAACG
GAGGCGTTTTTATCGCGATCGTCGTCGGACTGACCGTCGGGTACCTCGTTTTCAGATCTG
ACGACGACGGTGGTAACGAGGCGGCGGAGAATCCGTGCGCTTGTGCTTGATTTATTATTA
CAACCAATAATGTAAACTTTCTGTAACCGAATCACTGATATTATATGTAAACATTGTTGT
CTGTTTGTAATAATTTGAGATTGCCAAGTCTCTTTACTCTTTGGTTTGTGTTGGTTAGAG
TTGCAAATGTTTCGTTTTAGATTACGACGCAGTATGTACAAGGTCCTTCCTTAC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2B347TF 654 0 0
GGATCAAAAGAAAGAAAGCTCAAAAAGCCATCGCAAAGATGATGCACATGACCTTCTACT
GGGGCATCAAAGCCACAATCCTCTTCGATTTCTGGAAAACCGATTCATGGCTCAGCTACA
TCCTCACCTTGCTCGCCTGCTTCGTCTTCGCCGCCTTCTACCAGTACCTCGAGAACCGCC
GCCTCCAATTCAAATCCCTTTCGTCCGCCCGCCACCCTCCTCCGCCGCGAGCCGGCGTCT
CCGCCCCTCTTATCCCCAAATCGGGCACCAGATCCGCCGCCAAAGCTGCCTCGGTGCTGC
TCTTCGGCGTCAACGCCGCGATCGGGTACTTGCTGATGCTCGCGGCCATGTCCTTCAACG
GAGGCGTTTTTATCGCGATCGTCGTCGGACTGACCGTCGGGTACCTCGTTTTCAGATCTG
ACGACGACGGTGGTAACGAGGCGGCGGAGAATCCGTGCGCTTGTGCTTGATTTATTATTA
CAACCAATAATGTAAACTTTCTGTAACCGAATCACTGATATTATATGTAAACATTGTTGT
CTGTTTGTAATAATTTGAGATTGCCAAGTCTCTTTACTCTTTGGTTTGTGTTGGTTAGAG
TTGCAAATGTTTCGTTTTAGATTACGACGCAGTATGTACAAGGTCCTTCCTTAC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4720Contig1 524 2 1 U
GGGATTATCCCGGACCTACACCGAGGTATTGACGTTGATTCTCAAATATCACAGAACAGA
ATGTGATACGATGAGATAGAATGCAATAGAAACAAAGACACAGGGAACGGGTTACCTACT
CTTACATTCTGAATTCTTGAATTCGGAATGAATCAAATCTCCCCAAGTAGGATTCGAACC
TACGACCAATCAGTTAACAGCCGACCGCTCTACCACTGAGCTACTGAGGAACAACGGGAG
ATTAGATCTCATAGAGTTCAATTCCCGTTCTCAACCCATGACCAATATGAACTCGAAGTT
TCCTTCGTAACCCCCGGAACTTCTTCGTAGTGGCTCCGTTACATGCCTCATTTCATAGGG
AACCTCAAAGCGGCTCTATTTCATTATATTCCATCCATATCCCAATTCCATTCATTTAAT
ATCCCTTTGGTGTCATTGACATAAGAGATGTCGTTTCTAGTCTATCTCTTTCTATTTCTA
TATATGGAAAGTTGCAAAATCATCATATAATAATCCAGAAATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2HB15JQ C 1
AF RR2HB15TF U 1
BS 1 524 RR2HB15TF

RD RR2HB15JQ 524 0 0
GGGATTATCCCGGACCTACACCGAGGTATTGACGTTGATTCTCAAATATCACAGAACAGA
ATGTGATACGATGAGATAGAATGCAATAGAAACAAAGACACAGGGAACGGGTTACCTACT
CTTACATTCTGAATTCTTGAATTCGGAATGAATCAAATCTCCCCAAGTAGGATTCGAACC
TACGACCAATCAGTTAACAGCCGACCGCTCTACCACTGAGCTACTGAGGAACAACGGGAG
ATTAGATCTCATAGAGTTCAATTCCCGTTCTCAACCCATGACCAATATGAACTCGAAGTT
TCCTTCGTAACCCCCGGAACTTCTTCGTAGTGGCTCCGTTACATGCCTCATTTCATAGGG
AACCTCAAAGCGGCTCTATTTCATTATATTCCATCCATATCCCAATTCCATTCATTTAAT
ATCCCTTTGGTGTCATTGACATAAGAGATGTCGTTTCTAGTCTATCTCTTTCTATTTCTA
TATATGGAAAGTTGCAAAATCATCATATAATAATCCAGAAATTG

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2HB15TF 524 0 0
GGGATTATCCCGGACCTACACCGAGGTATTGACGTTGATTCTCAAATATCACAGAACAGA
ATGTGATACGATGAGATAGAATGCAATAGAAACAAAGACACAGGGAACGGGTTACCTACT
CTTACATTCTGAATTCTTGAATTCGGAATGAATCAAATCTCCCCAAGTAGGATTCGAACC
TACGACCAATCAGTTAACAGCCGACCGCTCTACCACTGAGCTACTGAGGAACAACGGGAG
ATTAGATCTCATAGAGTTCAATTCCCGTTCTCAACCCATGACCAATATGAACTCGAAGTT
TCCTTCGTAACCCCCGGAACTTCTTCGTAGTGGCTCCGTTACATGCCTCATTTCATAGGG
AACCTCAAAGCGGCTCTATTTCATTATATTCCATCCATATCCCAATTCCATTCATTTAAT
ATCCCTTTGGTGTCATTGACATAAGAGATGTCGTTTCTAGTCTATCTCTTTCTATTTCTA
TATATGGAAAGTTGCAAAATCATCATATAATAATCCAGAAATTG

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

CO CL4721Contig1 984 2 2 U
GGAACCAAAGGGGAAACGCGAGAGAGAGATCTTGGATCAAACGATCTCCCAAACCTCTCG
AGGGAAGAAGAAGAAGAAGACAAGGAGGAGTAAAAACAAGAAGAAGAAGATCAAGGGAGG
AGAAAATGTTGCCCACTACTTCCAGATCTCGCTCTTCACCTTCTTCATCCCGAGCTAACC
CAATGTTCCTTCAGTATTTTCGCCGGATCGTCAAGTGGCAGCAAATGGATGTTGAATATA
CTTTCTGGCAAATGCTTAACCTCTGTACATCTCCCAAAGTTGTCTATCAACACACTAAGT
ATCACAAACAGACGAAAAACCAATGGGCACGTGATGACCCTGCTTTTATTGTGATCTGTA
GCCTGCTTCTTATTGTTGCAACTTTAGCCTACTGTGCCACGTATGACCATAGTGGCTCTC
ATGCTGTCGTCGTAGTTGTATCAGTGTTCCTCACCCATTTCTTAATCACTGGTGCAGTTA
TAGCTACGTGCTGTTGGTTTCTGACGAACTCTTACCTTCGCGAGGAGGCTCCTAATAGTC
ATGTGGTGGAACAACGTGTTGAATGGCTGTATACGTTTGATGTTCACTGCAACTCGTTCT
TTCCAATGTTTGTGCTGCTCTACGTCGTACACTATTTCATATCACCACTCCTGATAACTC
ATGGATTCATCGCTCTACTACTTTCAAATCTGCTTTTCATGGTCGGGGCTTCGTATTACC
ATTATCTCAACTTCCTAGGATATGACGTGCTTCCATTTTTGGAACGAACAACCTTCTTCC
TCTACCCTATTGGCATCGTGATTGTCCTGTCCCCTATCTTGATCTTAAGTGGATTCAACC
CCTCAAGATATTTCATGAACATGTACTTCAGCCAAAGATTATAAATCAAAACAAGCCACA
TCAGTGGAATCTCAAGGGCTCTGCACTGCATATACATCACCAAGGAAGAAGAGAGTATGA
ATTTTTTTTTTTGGTTACCTGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C705TF U 1
AF RR2C705JQ C 239
BS 1 729 RR2C705TF
BS 730 984 RR2C705JQ

RD RR2C705TF 731 0 0
GGAACCAAAGGGGAAACGCGAGAGAGAGATCTTGGATCAAACGATCTCCCAAACCTCTCG
AGGGAAGAAGAAGAAGAAGACAAGGAGGAGTAAAAACAAGAAGAAGAAGATCAAGGGAGG
AGAAAATGTTGCCCACTACTTCCAGATCTCGCTCTTCACCTTCTTCATCCCGAGCTAACC
CAATGTTCCTTCAGTATTTTCGCCGGATCGTCAAGTGGCAGCAAATGGATGTTGAATATA
CTTTCTGGCAAATGCTTAACCTCTGTACATCTCCCAAAGTTGTCTATCAACACACTAAGT
ATCACAAACAGACGAAAAACCAATGGGCACGTGATGACCCTGCTTTTATTGTGATCTGTA
GCCTGCTTCTTATTGTTGCAACTTTAGCCTACTGTGCCACGTATGACCATAGTGGCTCTC
ATGCTGTCGTCGTAGTTGTATCAGTGTTCCTCACCCATTTCTTAATCACTGGTGCAGTTA
TAGCTACGTGCTGTTGGTTTCTGACGAACTCTTACCTTCGCGAGGAGGCTCCTAATAGTC
ATGTGGTGGAACAACGTGTTGAATGGCTGTATACGTTTGATGTTCACTGCAACTCGTTCT
TTCCAATGTTTGTGCTGCTCTACGTCGTACACTATTTCATATCACCACTCCTGATAACTC
ATGGATTCATCGCTCTACTACTTTCAAATCTGCTTTTCATGGTCGGGGCTTCGTATTACC
ATTATCTCA
CT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2C705JQ 746 0 0
TACTTTCTGGCAAATGCTTAACCTCTGTACATCTCCCAAAGTTGTCTATCAACACACTAA
GTATCACAAACAGACGAAAAACCAATGGGCACGTGATGACCCTGCTTTTATTGTGATCTG
TAGCCTGCTTCTTATTGTTGCAACTTTAGCCTACTGTGCCACGTATGACCATAGTGGCTC
TCATGCTGTCGTCGTAGTTGTATCAGTGTTCCTCACCCATTTCTTAATCACTGGTGCAGT
TATAGCTACGTGCTGTTGGTTTCTGACGAACTCTTACCTTCGCGAGGAGGCTCCTAATAG
TCATGTGGTGGAACAACGTGTTGAATGGCTGTATACGTTTGATGTTCACTGCAACTCGTT
CTTTCCAATGTTTGTGCTGCTTTACGTCGTACACTATTTCATATCACCACTCCTGATAAC
TCATGGATTCATCGCTCTACTACTTTCAAATCTGCTTTTCATGGTCGGGGCTTCGTATTA
CCATTATCTCAACTTCCTAGGATATGACGTGCTTCCATTTTTGGAACGAACAACCTTCTT
CCTCTACCCTATTGGCATCGTGATTGTCCTGTCCCCTATCTTGATCTTAAGTGGATTCAA
CCCCTCAAGATATTTCATGAACATGTACTTCAGCCAAAGATTATAAATCAAAACAAGCCA
CATCAGTGGAATCTCAAGGGCTCTGCACTGCATATACATCACCAAGGAAGAAGAGAGTAT
GAATTTTTTTTTTTGGTTACCTGTAA

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL4722Contig1 729 2 4 U
GACACAACAATACACCAATTCTGCCAAATAGCGTTTTGAGATTCGTCTAAAGCTAAAATA
ACAATTTAAAGATTTTTCTTGTTAGGATCGAAAACTCTGTTTTGCGGATTTTGAGTTTTT
GAATCAAAGATGGGGAGGTTGTTTGTGGTTCACCTTGAAGGGAAGATCTATAGCTGCAAA
CACTGCAAGACTCATCTTGCTGTATATGAAGACATCATCTCCAAGTCTTTTCACTGTAAG
CATGGAAAAGCTTATCTTTTCAACAAAGTTTCCAATGTTACAATTGGAGAAACAGAAGAC
AGAATGATGATGACAGGAAAACATACAGTGGCTGACATTTTCTGTGTCTCATGTGGATCA
ATAGTTGGTTGGAGATATGAGACTGCTCATGAGAAGAGCCAGAAGTACAAAGAAGGAAAG
TCAGTTCTTGAAAGATTTAAGATATCGGGTCCTGATGGGAGCAACTACTGGGTGAGTAGC
CATGGAAGGCATATAGGTGGAAGTGATGCAGATGATTCTTGAACTCATCCTCTATCCTTC
TTATTTGACATCCCCTGTAAATGTAAATTCGTCAATCTCCACTCCAACTTGGTCTTATAA
GTAACGAAAACACTTCTTTTCTTGCTTTCATTATGATCTGAAAAATCCCTCAGTAAATGA
AGTCTGATTCTGTGTAATAATCATGTTTCATCAAAACCTATGCTTTTCATATTGCAATAA
CAAAATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG18TF U 1
AF RR2GG18JQB C 23
BS 1 706 RR2GG18TF
BS 707 707 RR2GG18JQB
BS 708 716 RR2GG18TF
BS 717 729 RR2GG18JQB

RD RR2GG18TF 727 0 0
GACACAACAATACACCAATTCTGCCAAATAGCGTTTTGAGATTCGTCTAAAGCTAAAATA
ACAATTTAAAGATTTTTCTTGTTAGGATCGAAAACTCTGTTTTGCGGATTTTGAGTTTTT
GAATCAAAGATGGGGAGGTTGTTTGTGGTTCACCTTGAAGGGAAGATCTATAGCTGCAAA
CACTGCAAGACTCATCTTGCTGTATATGAAGACATCATCTCCAAGTCTTTTCACTGTAAG
CATGGAAAAGCTTATCTTTTCAACAAAGTTTCCAATGTTACAATTGGAGAAACAGAAGAC
AGAATGATGATGACAGGAAAACATACAGTGGCTGACATTTTCTGTGTCTCATGTGGATCA
ATAGTTGGTTGGAGATATGAGACTGCTCATGAGAAGAGCCAGAAGTACAAAGAAGGAAAG
TCAGTTCTTGAAAGATTTAAGATATCGGGTCCTGATGGGAGCAACTACTGGGTGAGTAGC
CATGGAAGGCATATAGGTGGAAGTGATGCAGATGATTCTTGAACTCATCCTCTATCCTTC
TTATTTGACATCCCCTGTAAATGTAAATTCGTCAATCTCCACTCCAACTTGGTCTTATAA
GTAACGAAAACACTTCTTTTCTTGCTTTCATTATGATCTGAAAAATCCCTCAGTAAATGA
AGTCTGATTCTGTGTAATAATCATGTTTCATCAAAACCTATGCTTT*CATATTGCA
TAACAAATGTC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2GG18JQB 707 0 0
GCCAAATAGCGTTTTGAGATTCGTCTAAAGCTAAAATAACAATTTAAAGATTTTTCTTGT
TAGGATCGAAAACTCTGTTTTGCGGATTTTGAGTTTTTGAATCAAAGATGGGGAGGTTGT
TTGTGGTTCACCTTGAAGGGAAGATCTATAGCTGCAAACACTGCAAGACTCATCTTGCTG
TATATGAAGACATCATCTCCAAGTCTTTTCACTGTAAGCATGGAAAAGCTTATCTTTTCA
ACAAAGTTTCCAATGTTACAATTGGAGAAACAGAAGACAGAATGATGATGACAGGAAAAC
ATACAGTGGCTGACATTTTCTGTGTCTCATGTGGATCAATAGTTGGTTGGAGATATGAGA
CTGCTCATGAGAAGAGCCAGAAGTACAAAGAAGGAAAGTCAGTTCTTGAAAGATTTAAGA
TATCGGGTCCTGATGGGAGCAACTACTGGGTGAGTAGCCATGGAAGGCATATAGGTGGAA
GTGATGCAGATGATTCTTGAACTCATCCTCTATCCTTCTTATTTGACATCCCCTGTAAAT
GTAAATTCGTCAATCTCCACTCCAACTTGGTCTTATAAGTAACGAAAACACTTCTTTTCT
TGCTTTCATTATGATCTGAAAAATCCCTCAGTAAATGAAGTCTGATTCTGTGTAATAATC
ATGTTTCATCAAAACCTATGCTTTTCATATTGCAATAACAAAATGTC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL4723Contig1 612 2 2 U
GTGAAAACATGAATATTTCTCATATCATTTTGTTTCCCCAGACAATTTACAGAATGTTGT
TATCAGATCCATAAGAACAAACAGCAAAGATTTTACAGGTAACTATTATCATCTTTAGCT
GATGCCGCTATTTATCTTTCGCGAGGTTTCTTCTTGTTCATATCCCATTTTGCAGCTTAT
TGGTGCTGTCTTGGCCTTCTTAGTTTGTTGTTGCATGTCTTTTTTCTTTGCCTGAAGCCT
GTTATGCCTTCTCTGGGTTTTGTAGCTGGGAGCAGATTTGCGCTTTGATATGCTCTTTTC
TCTCTGCAACTCTTCTGTGTCCTCTTCCGATATGCTTTCAAATTGGAGAGGAATATCGTT
GGAGGCACAGCTCTCCAACTCGCCAGCTATACTAAAAGATGTATTCTTTCTAACCAATCT
TTGACTTTTCATTTGAACGTTTCTTCCAGCCTCTATCTGAGTGCTGTCTGGTACACGAGT
TGCCATCCAGCGCTCTAGCCAATTCCAACCGATGTTTGATTCATCTTCACCGTTGCGTTC
TACTTGCTTCTTCTTTGTGCAAATCCTTAGCTGCTGTGAAAATGCGTAAGCAAGTGCTCT
CTCCCGTTTTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G585JQ U 1
AF RR2H874JQ U 1
BS 1 487 RR2G585JQ
BS 488 612 RR2H874JQ

RD RR2G585JQ 487 0 0
GTGAAAACATGAATATTTCTCATATCATTTTGTTTCCCCAGACAATTTACAGAATGTTGT
TATCAGATCCATAAGAACAAACAGCAAAGATTTTACAGGTAACTATTATCATCTTTAGCT
GATGCCGCTATTTATCTTTCGCGAGGTTTCTTCTTGTTCATATCCCATTTTGCAGCTTAT
TGGTGCTGTCTTGGCCTTCTTAGTTTGTTGTTGCATGTCTTTTTTCTTTGCCTGAAGCCT
GTTATGCCTTCTCTGGGTTTTGTAGCTGGGAGCAGATTTGCGCTTTGATATGCTCTTTTC
TCTCTGCAACTCTTCTGTGTCCTCTTCCGATATGCTTTCAAATTGGAGAGGAATATCGTT
GGAGGCACAGCTCTCCAACTCGCCAGCTATACTAAAAGATGTATTCTTTCTAACCAATCT
TTGACTTTTCATTTGAACGTTTCTTCCAGCCTCTATCTGAGTGCTGTCTGGTACACGAGT
TGCCATC

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR2H874JQ 612 0 0
GTGAAAACATGAATATTTCTCATATCATTTTGTTTCCCCAGACAATTTACAGAATGTTGT
TATCAGATCCATAAGAACAAACAGCAAAGATTTTACAGGTAACTATTATCATCTTTAGCT
GATGCCGCTATTTATCTTTCGCGAGGTTTCTTCTTGTTCATATCCCATTTTGCAGCTTAT
TGGTGCTGTCTTGGCCTTCTTAGTTTGTTGTTGCATGTCTTTTTTCTTTGCCTGAAGCCT
GTTATGCCTTCTCTGGGTTTTGTAGCTGGGAGCAGATTTGCGCTTTGATATGCTCTTTTC
TCTCTGCAACTCTTCTGTGTCCTCTTCCGATATGCTTTCAAATTGGAGAGGAATATCGTT
GGAGGCACAGCTCTCCAACTCGCCAGCTATACTAAAAGATGTATTCTTTCTAACCAATCT
TTGACTTTTCATTTGAACGTTTCTTCCAGCCTCTATCTGAGTGCTGTCTGGTACACGAGT
TGCCATCCAGCGCTCTAGCCAATTCCAACCGATGTTTGATTCATCTTCACCGTTGCGTTC
TACTTGCTTCTTCTTTGTGCAAATCCTTAGCTGCTGTGAAAATGCGTAAGCAAGTGCTCT
CTCCCGTTTTGT

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL4724Contig1 914 2 2 U
TTACTTCTTCAGAGCTATACAAGAACACCAAGGTTCGAGATATCTCCGGAACATTCAGAT
GGGCACCTTTCCTAGCTCTGCAGAAAGAGAACTCCTTTTTAACCATGTTGTTGCTTCTTT
CCAAGTACAAAATGAAGAGCATCCCAGTGGTTGATCTAGGGGAAGCAAAGATTGAGAACA
TAATCACACAGTCAGGAGTTATCCATATGCTAGCAGAATGCGCTGGACTTCACTGGTTTG
AAGATTGGGGAGTCAAAACTCTATCTGAAGTCGGTCTTCCCACTATGTCAAAAGATCATA
TCATAAAGATTTATGAAGATGAACCAGTTCTTCAGGCGTTCAAGCTGATGAGGAGAAAGA
GAATCGGAGGCTTGCCCGTTGTTGAAAGACAAACTGAGAAGCCAGTAGGCAACATTAGCC
TTAGAGATGTCCACTTTCTCCTCACTGCACCAGAGATCTACCATGACTACAGGTCAACCA
CAACGAAGAACTTCTTAGTAGCGGTTAGGGAGCATCTGGAGAAGCATGGAGATACTTCAG
CACCTATCTTGAGTGGTGTCATTGCTTGCACTAAAAACCATACGTTGAAGGAACTGATTT
TGATGCTAGACGCTGAGAAGATCCATAGGATGTATGTGGTGGATGATTCAGGTAACCTGG
AAGGACTCATCACTCTCAGAGACATCATTGCAAGACTTGTACATGAGCCACCTGGCTATT
TTGGTGATTTCTTTGACGGTGTTATGCCTCTACCTCAGAACTACCGAGTTTAAGAAATGC
TTTCTTTCTTTCTTTGTGTAGACTTGTCTTTGCTTTAGTAATGCTTCTCTGTATGTTTGT
GCGAAAGTTCATGAATTTGTGTTTAAACGTTTTAACAGAAAATAATAAATGAAGAAAGAG
AAGTCTTTGAGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B212TF U 1
AF RR2B212JQ C 160
BS 1 711 RR2B212TF
BS 712 914 RR2B212JQ

RD RR2B212TF 711 0 0
TTACTTCTTCAGAGCTATACAAGAACACCAAGGTTCGAGATATCTCCGGAACATTCAGAT
GGGCACCTTTCCTAGCTCTGCAGAAAGAGAACTCCTTTTTAACCATGTTGTTGCTTCTTT
CCAAGTACAAAATGAAGAGCATCCCAGTGGTTGATCTAGGGGAAGCAAAGATTGAGAACA
TAATCACACAGTCAGGAGTTATCCATATGCTAGCAGAATGCGCTGGACTTCACTGGTTTG
AAGATTGGGGAGTCAAAACTCTATCTGAAGTCGGTCTTCCCACTATGTCAAAAGATCATA
TCATAAAGATTTATGAAGATGAACCAGTTCTTCAGGCGTTCAAGCTGATGAGGAGAAAGA
GAATCGGAGGCTTGCCCGTTGTTGAAAGACAAACTGAGAAGCCAGTAGGCAACATTAGCC
TTAGAGATGTCCACTTTCTCCTCACTGCACCAGAGATCTACCATGACTACAGGTCAACCA
CAACGAAGAACTTCTTAGTAGCGGTTAGGGAGCATCTGGAGAAGCATGGAGATACTTCAG
CACCTATCTTGAGTGGTGTCATTGCTTGCACTAAAAACCATACGTTGAAGGAACTGATTT
TGATGCTAGACGCTGAGAAGATCCATAGGATGTATGTGGTGGATGATTCAGGTAACCTGG
AAGGACTCATCACTCTCAGAGACATCATTGCAAGACTTGTACATGAGCCAC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2B212JQ 755 0 0
GGGAAGCAAAGATTGAGAACATAATCACACAGTCAGGAGTTATCCATATGCTAGCAGAAT
GCGCTGGACTTCACTGGTTTGAAGATTGGGGAGTCAAAACTCTATCTGAAGTCGGTCTTC
CCACTATGTCAAAAGATCATATCATAAAGATTTATGAAGATGAACCAGTTCTTCAGGCGT
TCAAGCTGATGAGGAGAAAGAGAATCGGAGGCTTGCCCGTTGTTGAAAGACAAACTGAGA
AGCCAGTAGGCAACATTAGCCTTAGAGATGTCCACTTTCTCCTCACTGCACCAGAGATCT
ACCATGACTACAGGTCAACCACAACGAAGAACTTCTTAGTAGCGGTTAGGGAGCATCTGG
AGAAGCATGGAGATACTTCAGCACCTATCTTGAGTGGTGTCATTGCTTGCACTAAAAACC
ATACGTTGAAGGAACTGATTTTGATGCTAGACGCTGAGAAGATCCATAGGATGTATGTGG
TGGATGATTCAGGTAACCTGGAAGGACTCATCACTCTCAGAGACATCATTGCAAGACTTG
TACATGAGCCACCTGGCTATTTTGGTGATTTCTTTGACGGTGTTATGCCTCTACCTCAGA
ACTACCGAGTTTAAGAAATGCTTTCTTTCTTTCTTTGTGTAGACTTGTCTTTGCTTTAGT
AATGCTTCTCTGTATGTTTGTGCGAAAGTTCATGAATTTGTGTTTAAACGTTTTAACAGA
AAATAATAAATGAAGAAAGAGAAGTCTTTGAGTGG

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL4725Contig1 729 2 2 U
GGGAAGAAAGAAGAAGATCTTCAAAGAGATTTAACATCTCAAGCGCGTTGAGACGGTGAA
TTTAAATTAAATTACAAAATGGGTTACTGGAATTCGAAGGTTGTTCCGAGGTTCAAGAAG
ATATTCGAGAAGAACAGTGCTAAGAAGGCTGCTGCTGCTGAAGCTTGCAAGACCTTTGAT
GAGTCTAAGGAAACAATCAACAAGGAAATTGAGGAGAAAAAGACAGAACTCCAACCAAAG
GTCGTGGAGACCTATGAGGCCACGTCGGCTGAAGTCAAGGCTTTGGTGAGAGACCCTAAG
GAGGCTGGTTTGAAGAAAAACTCTGCGGCTGTGCTGAAATATCTCGAGGAGAAGAAACCT
GAAGTAGAAAAGGAGGAGGAGAAGAAGCCTGTCGTCGAAGAAGTGAAAAAGGAAGAAGCT
GCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCGGTGGTTGAAACTCCGGTTACGGCACCAGCTGAA
ACGACAACGCCGGCGCCAGTGGCTGAGCCACCGAAGCCTTGATTCGTTTCAAGATGGTAC
GGTTTGCTTTATCTTGTATGAAAACATCTTTGTACGTGACAAAAACTGAAAGGAACAAAA
AAAAACAAACTATTTTCATTCTTTTTATTTTATTTGGTTTGTCTTTGTGTGGATAAATCT
CTGTTTCTGGAAGTCGTTGATGTGTTGTTTATTTGTATTCATTTGAATTTGTAAAAAAAG
TATTGGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR85TF U 1
AF RR2DR85JQ C 50
BS 1 585 RR2DR85TF
BS 586 729 RR2DR85JQ

RD RR2DR85TF 585 0 0
GGGAAGAAAGAAGAAGATCTTCAAAGAGATTTAACATCTCAAGCGCGTTGAGACGGTGAA
TTTAAATTAAATTACAAAATGGGTTACTGGAATTCGAAGGTTGTTCCGAGGTTCAAGAAG
ATATTCGAGAAGAACAGTGCTAAGAAGGCTGCTGCTGCTGAAGCTTGCAAGACCTTTGAT
GAGTCTAAGGAAACAATCAACAAGGAAATTGAGGAGAAAAAGACAGAACTCCAACCAAAG
GTCGTGGAGACCTATGAGGCCACGTCGGCTGAAGTCAAGGCTTTGGTGAGAGACCCTAAG
GAGGCTGGTTTGAAGAAAAACTCTGCGGCTGTGCTGAAATATCTCGAGGAGAAGAAACCT
GAAGTAGAAAAGGAGGAGGAGAAGAAGCCTGTCGTCGAAGAAGTGAAAAAGGAAGAAGCT
GCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCGGTGGTTGAAACTCCGGTTACGGCACCAGCTGAA
ACGACAACGCCGGCGCCAGTGGCTGAGCCACCGAAGCCTTGATTCGTTTCAAGATGGTAC
GGTTTGCTTTATCTTGTATGAAAACATCTTTGTACGTGACAAAAA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2DR85JQ 680 0 0
GAGACGGTGAATTTAAATTAAATTACAAAATGGGTTACTGGAATTCGAAGGTTGTTCCGA
GGTTCAAGAAGATATTCGAGAAGAACAGTGCTAAGAAGGCTGCTGCTGCTGAAGCTTGCA
AGACCTTTGATGAGTCTAAGGAAACAATCAACAAGGAAATTGAGGAGAAAAAGACAGAAC
TCCAACCAAAGGTCGTGGAGACCTATGAGGCCACGTCGGCTGAAGTCAAGGCTTTGGTGA
GAGACCCTAAGGAGGCTGGTTTGAAGAAAAACTCTGCGGCTGTGCTGAAATATCTCGAGG
AGAAGAAACCTGAAGTAGAAAAGGAGGAGGAGAAGAAGCCTGTCGTCGAAGAAGTGAAAA
AGGAAGAAGCTGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCGGTGGTTGAAACTCCGGTTACGG
CACCAGCTGAAACGACAACGCCGGCGCCAGTGGCTGAGCCACCGAAGCCTTGATTCGTTT
CAAGATGGTACGGTTTGCTTTATCTTGTATGAAAACATCTTTGTACGTGACAAAAACTGA
AAGGAACAAAAAAAAACAAACTATTTTCATTCTTTTTATTTTATTTGGTTTGTCTTTGTG
TGGATAAATCTCTGTTTCTGGAAGTCGTTGATGTGTTGTTTATTTGTATTCATTTGAATT
TGTAAAAAAAGTATTGGTGG

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL4726Contig1 971 2 2 U
GGAACTATGCGAATAGCTCTGCGAACAGCGTCGCTTTCGGTGCTGCTGATACTGATGGAG
TTGGTGGTGTGCCGAATCGCTTTCTTGGAATAACACCTGCTTATCTATCATATGTCCAGC
TCCAAAATTCTATGTCCATGGATATGGCTGACTACCAAATGTTTCTTGCTCGTGAGATAG
AAGGTCGATTGAAGGACAAGTGTGATAAGTTGGCTGATGCAATTGTTGACGACACTGATT
CATCTACTGGAAATCAAAATTCAAGTGCTAGACTCCCAGAAAGAGTTAAGTTTATAATTG
AGGAGATTGAAAGGGAAGAAGCTGCTCTACGAGAGGACCTCTACTCTGCTGATAGGAAAT
TTGCAGAATATTACAATGTCCTGGAACAAATACTCGGGGTACTTATAAAGCTCGTGAAGG
ATCTGAAGTTAGAACACCAACACAAATATGATGAGATGCAGAAGACTTGGTTGTGTAAAA
GGTGTGAGACCATGAACGCAAAATTAAGGGTTTTAGAACATATTCTCTTACTTGAGACAT
ACACCCCTGAGTCTATACCAGCCCTGCACAGCATCAGGAATTATCTAGTGGAGGCTACTG
AAGAAGCTTCAGCTGCATACAACAAAGCGGTTACACGGCTAAGAGAATATCAAGGAGTAG
ATCCGCATTTTGATACAATTGCGAGACAATACCATGACATTGTTAAGAAACTGGAAAATA
TGCAATGGACAATCCATCAAGTAGAAATGGACCTTAAAGCGCATACCTGATTGCTACATT
CTCTCTCTCTCACACGTCATTTTGCCAGCAACCGTTATGATATATTAACAAATCTGTATG
AGAGAAAAGGTCAGTGTAATTTAAAATACATCCATTTAAATGTTTCATCCACTACTTGGC
ATTATTCTACAGTCGCTCGATTACTATGGTTTAAACTGTAACAAAACAGAACCTTAAAAA
ATGAAACTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH76TF U 1
AF RR2AH76JQ C 353
BS 1 840 RR2AH76TF
BS 841 971 RR2AH76JQ

RD RR2AH76TF 840 0 0
GGAACTATGCGAATAGCTCTGCGAACAGCGTCGCTTTCGGTGCTGCTGATACTGATGGAG
TTGGTGGTGTGCCGAATCGCTTTCTTGGAATAACACCTGCTTATCTATCATATGTCCAGC
TCCAAAATTCTATGTCCATGGATATGGCTGACTACCAAATGTTTCTTGCTCGTGAGATAG
AAGGTCGATTGAAGGACAAGTGTGATAAGTTGGCTGATGCAATTGTTGACGACACTGATT
CATCTACTGGAAATCAAAATTCAAGTGCTAGACTCCCAGAAAGAGTTAAGTTTATAATTG
AGGAGATTGAAAGGGAAGAAGCTGCTCTACGAGAGGACCTCTACTCTGCTGATAGGAAAT
TTGCAGAATATTACAATGTCCTGGAACAAATACTCGGGGTACTTATAAAGCTCGTGAAGG
ATCTGAAGTTAGAACACCAACACAAATATGATGAGATGCAGAAGACTTGGTTGTGTAAAA
GGTGTGAGACCATGAACGCAAAATTAAGGGTTTTAGAACATATTCTCTTACTTGAGACAT
ACACCCCTGAGTCTATACCAGCCCTGCACAGCATCAGGAATTATCTAGTGGAGGCTACTG
AAGAAGCTTCAGCTGCATACAACAAAGCGGTTACACGGCTAAGAGAATATCAAGGAGTAG
ATCCGCATTTTGATACAATTGCGAGACAATACCATGACATTGTTAAGAAACTGGAAAATA
TGCAATGGACAATCCATCAAGTAGAAATGGACCTTAAAGCGCATACCTGATTGCTACATT
CTCTCTCTCTCACACGTCATTTTGCCAGCAACCGTTATGATATATTAACAAATCTGTATG

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2AH76JQ 619 0 0
TAGGAAATTTGCAGAATATTACAATGTCCTGGAACAAATACTCGGGGTACTTATAAAGCT
CGTGAAGGATCTGAAGTTAGAACACCAACACAAATATGATGAGATGCAGAAGACTTGGTT
GTGTAAAAGGTGTGAGACCATGAACGCAAAATTAAGGGTTTTAGAACATATTCTCTTACT
TGAGACATACACCCCTGAGTCTATACCAGCCCTGCACAGCATCAGGAATTATCTAGTGGA
GGCTACTGAAGAAGCTTCAGCTGCATACAACAAAGCGGTTACACGGCTAAGAGAATATCA
AGGAGTAGATCCGCATTTTGATACAATTGCGAGACAATACCATGACATTGTTAAGAAACT
GGAAAATATGCAATGGACAATCCATCAAGTAGAAATGGACCTTAAAGCGCATACCTGATT
GCTACATTCTCTCTCTCTCACACGTCATTTTGCCAGCAACCGTTATGATATATTAACAAA
TCTGTATGAGAGAAAAGGTCAGTGTAATTTAAAATACATCCATTTAAATGTTTCATCCAC
TACTTGGCATTATTCTACAGTCGCTCGATTACTATGGTTTAAACTGTAACAAAACAGAAC
CTTAAAAAATGAAACTAAT

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL4727Contig1 936 2 2 U
GCAAACATCAGAATTCATGCTGTGAAATTTGTGGCCAACCTAGCAGCTGAAGAGGCAAAT
CAGGAAAGGATTGTTGAAGCTGGAGGTCTTGGATCACTGCTGATGCTTCTCAGGAGTTAC
GAAGATGAAACTGTCCGAAGAGTTGCGGCTGGTGCAATTGCGAATCTCGCAATGAACGAA
GTGAGCCAACAACTGATTGTGGACCAAGGAGGAATCAGCTTGCTATCGTTAACAGCTGCA
GATGCAGAGGATCCGCAGACCTTACGAATGGTTGCTGGAGCTATTGCCAATCTCTGTGGC
AACGACAAACTACAAGCAAGACTATGGTCGGATGGTGGAATAAAAGCGTTGTTAGGAATG
GTTAGATGTGGACATCCGGATGTTCTTGCTCAGGTGGCTCGCGGAATTGCCAACTTTGCA
AAGTGTGAATCCAGAGCAACCACGCAAGGTGTGAAGAGTGGGAGATCACTGCTAATAGAA
GATGGAGCTCTTCCCTGGATAGTACAGCACGCTAACGATGAAGCTGCACCAATCAGGCGC
CACATAGAGCTCGCTTTATGCCATTTGCCCAGCACGAGGTGAATGCGAAGGAGATGATAA
GCGGAGGAGCGTTGTGGGAACTGGTGAGAATATCGAAAGAATGCTCAAGAGAAGACATTC
GGAGTTTGGCTCATCGTACTCTCTCTTCCAGTCCCGTCTTCCGCTCTGAGATCCGCCGCT
TAGGCATTCACTTTTGATTTCTCCCAATTATGTATGTAATCATGTATTTTTATAAAACTA
TCCATCACCAGCAACATTCTCTATTCATTCAATTTTTGTACTAACCTTTTGCATCTCGCT
ATTTAGCTTAATATTCGCTTTTATGTTGTAAGACCATGTTTGTGTAATACATTCAAACCT
CAAAAAATAAAGTAAAGAATATTTGTTTTAAGACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY52TF U 1
AF RR2EY52JQ C 225
BS 1 720 RR2EY52TF
BS 721 936 RR2EY52JQ

RD RR2EY52TF 720 0 0
GCAAACATCAGAATTCATGCTGTGAAATTTGTGGCCAACCTAGCAGCTGAAGAGGCAAAT
CAGGAAAGGATTGTTGAAGCTGGAGGTCTTGGATCACTGCTGATGCTTCTCAGGAGTTAC
GAAGATGAAACTGTCCGAAGAGTTGCGGCTGGTGCAATTGCGAATCTCGCAATGAACGAA
GTGAGCCAACAACTGATTGTGGACCAAGGAGGAATCAGCTTGCTATCGTTAACAGCTGCA
GATGCAGAGGATCCGCAGACCTTACGAATGGTTGCTGGAGCTATTGCCAATCTCTGTGGC
AACGACAAACTACAAGCAAGACTATGGTCGGATGGTGGAATAAAAGCGTTGTTAGGAATG
GTTAGATGTGGACATCCGGATGTTCTTGCTCAGGTGGCTCGCGGAATTGCCAACTTTGCA
AAGTGTGAATCCAGAGCAACCACGCAAGGTGTGAAGAGTGGGAGATCACTGCTAATAGAA
GATGGAGCTCTTCCCTGGATAGTACAGCACGCTAACGATGAAGCTGCACCAATCAGGCGC
CACATAGAGCTCGCTTTATGCCATTTGCCCAGCACGAGGTGAATGCGAAGGAGATGATAA
GCGGAGGAGCGTTGTGGGAACTGGTGAGAATATCGAAAGAATGCTCAAGAGAAGACATTC
GGAGTTTGGCTCATCGTACTCTCTCTTCCAGTCCCGTCTTCCGCTCTGAGATCCGCCGCT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2EY52JQ 712 0 0
ATCGTTAACAGCTGCAGATGCAGAGGATCCGCAGACCTTACGAATGGTTGCTGGAGCTAT
TGCCAATCTCTGTGGCAACGACAAACTACAAGCAAGACTATGGTCGGATGGTGGAATAAA
AGCGTTGTTAGGAATGGTTAGATGTGGACATCCGGATGTTCTTGCTCAGGTGGCTCGCGG
AATTGCCAACTTTGCAAAGTGTGAATCCAGAGCAACCACGCAAGGTGTGAAGAGTGGGAG
ATCACTGCTAATAGAAGATGGAGCTCTTCCCTGGATAGTACAGCACGCTAACGATGAAGC
TGCACCAATCAGGCGCCACATAGAGCTCGCTTTATGCCATTTGCCCAGCACGAGGTGAAT
GCGAAGGAGATGATAAGCGGAGGAGCGTTGTGGGAACTGGTGAGAATATCGAAGGAATGC
TCAAGAGAAGACATTCGGAGTTTGGCTCATCGTACTCTCTCTTCCAGTCCCGTCTTCCGC
TTTGAGATCCGCCGCTTAGGCATTCACTTTTGATTTCTCCCAATTATGTATGTAATCATG
TATTTTTATAAAACTATCCATCACCAGCAACATTCTCTATTCATTCAATTTTTGTACTAA
CCTTTTGCATCTCGCTATTTAGCTTAATATTCGCTTTTATGTTGTAAGACCATGTTTGTG
TAATACATTCAAACCTCAAAAAATAAAGTAAAGAATATTTGTTTTAAGACTT

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL4728Contig1 488 2 1 U
GGGGAAAAGAAGGAGTTCAAAGTTAAGAACTGTGTCACTGACATTGACCCTGAGAGGGAG
AAGGAGAAGAGAGAAAGGATGGAAAGCCAAAACCTCAAGTCTAGTACAAAGCTGAGTCAA
GCGAGGGAGAAAATCAAGCGCAAGTATCCACTTCCTGTTGCAAGGAGACAACTCTCCACT
GGATACTTGGAAGATGCTCTCGAAGAGGACGAAGAGACAGACCACTATGGTTCTCACCGC
TCAAACCGTGGCTATGAGGAGGATCTGGAAGCTGAAGCGCAACGGGAACGACGAATTATG
AACGCCAAGAAGAGCCAGAAAGGCTTTCCGGGGAGGTCTTCAATGAGTTCAGCGAGGCCG
ACAAGGCGTCAAGCGGAGTATTCAGAGAGCGAGAGGGAGGAATCAGAGTATGAGACCGAA
GAAGAGGAAGAAGAGGAGGAAAGGCCACGTTCCCGTAAAAGAGTCAAGGAACCAGAAGAT
GGGTACGA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C248JQ C 1
AF RR2C248TF U 1
BS 1 488 RR2C248TF

RD RR2C248JQ 488 0 0
GGGGAAAAGAAGGAGTTCAAAGTTAAGAACTGTGTCACTGACATTGACCCTGAGAGGGAG
AAGGAGAAGAGAGAAAGGATGGAAAGCCAAAACCTCAAGTCTAGTACAAAGCTGAGTCAA
GCGAGGGAGAAAATCAAGCGCAAGTATCCACTTCCTGTTGCAAGGAGACAACTCTCCACT
GGATACTTGGAAGATGCTCTCGAAGAGGACGAAGAGACAGACCACTATGGTTCTCACCGC
TCAAACCGTGGCTATGAGGAGGATCTGGAAGCTGAAGCGCAACGGGAACGACGAATTATG
AACGCCAAGAAGAGCCAGAAAGGCTTTCCGGGGAGGTCTTCAATGAGTTCAGCGAGGCCG
ACAAGGCGTCAAGCGGAGTATTCAGAGAGCGAGAGGGAGGAATCAGAGTATGAGACCGAA
GAAGAGGAAGAAGAGGAGGAAAGGCCACGTTCCCGTAAAAGAGTCAAGGAACCAGAAGAT
GGGTACGA

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2C248TF 488 0 0
GGGGAAAAGAAGGAGTTCAAAGTTAAGAACTGTGTCACTGACATTGACCCTGAGAGGGAG
AAGGAGAAGAGAGAAAGGATGGAAAGCCAAAACCTCAAGTCTAGTACAAAGCTGAGTCAA
GCGAGGGAGAAAATCAAGCGCAAGTATCCACTTCCTGTTGCAAGGAGACAACTCTCCACT
GGATACTTGGAAGATGCTCTCGAAGAGGACGAAGAGACAGACCACTATGGTTCTCACCGC
TCAAACCGTGGCTATGAGGAGGATCTGGAAGCTGAAGCGCAACGGGAACGACGAATTATG
AACGCCAAGAAGAGCCAGAAAGGCTTTCCGGGGAGGTCTTCAATGAGTTCAGCGAGGCCG
ACAAGGCGTCAAGCGGAGTATTCAGAGAGCGAGAGGGAGGAATCAGAGTATGAGACCGAA
GAAGAGGAAGAAGAGGAGGAAAGGCCACGTTCCCGTAAAAGAGTCAAGGAACCAGAAGAT
GGGTACGA

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 2

CO CL4729Contig1 756 2 1 U
GGGATAATCGAAGCTAAGATGAGTTTCGGGAAACTCCTATAGAATCCGAGTTCCATCTGC
ATTTGCTATTCCCCGCCAAAAAAAAAACTCCTCCTTAAGCAAATGTAGCTTTTGATTCCG
AAAATTATATTAAAAAAGAAGCTAAGGTTTCTAGATTACTTGGTCCTCGCTGATTCGATC
GGAGTTTCTGGGTTTAGGGTTAGATGAAGAAGATATTCGGAGGCCCAGGAACAGTGTGTG
GCCTGTTCCTGAGAATCGGACAATGTGCTTCCGCTGCTGCCTCAATCGGCGTTATGCTCT
CTTCCACTGAGTTCTATAATCGCACTGCTTTCTGCTACTTGATTGCTTCAATGGGTCTTC
AATTGCTGTGGAGCTTTGGCCTTGCATGTCTTGATGTTTATGCTCTGAGAGGCAAGAAAG
ATCTCCAAAACCCAATCTTGGTTAGCTTATTCGTCGTTGGTGATTGGGTGACTGCAATGT
TATCGCTCGCAGCTGCGTGTTCATCAGCGGGTGTTGTAGTCTTATTTGCCAGAGATCTTA
AGTATTGCAATATCCGTGAGCAGTTTTCATGTCTTAGGTATCAAGTAGCTGTAGCTCTGG
CTTTCGTCTCTTGGTTTCAGATCGCTATTTCTTCTCATGTCACATTTTGGATCTTAGCCT
CTGTTTAGTTTCTTCTTGAAATGTTGAGAACAACATCTTGTAGCTTTCGATGACGTATAA
CGTTTGGTTCAAATCTTATCCATCAGTTGTTTCTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AZ46JQ C 1
AF RR2AZ46TFB U 1
BS 1 756 RR2AZ46TFB

RD RR2AZ46JQ 756 0 0
GGGATAATCGAAGCTAAGATGAGTTTCGGGAAACTCCTATAGAATCCGAGTTCCATCTGC
ATTTGCTATTCCCCGCCAAAAAAAAAACTCCTCCTTAAGCAAATGTAGCTTTTGATTCCG
AAAATTATATTAAAAAAGAAGCTAAGGTTTCTAGATTACTTGGTCCTCGCTGATTCGATC
GGAGTTTCTGGGTTTAGGGTTAGATGAAGAAGATATTCGGAGGCCCAGGAACAGTGTGTG
GCCTGTTCCTGAGAATCGGACAATGTGCTTCCGCTGCTGCCTCAATCGGCGTTATGCTCT
CTTCCACTGAGTTCTATAATCGCACTGCTTTCTGCTACTTGATTGCTTCAATGGGTCTTC
AATTGCTGTGGAGCTTTGGCCTTGCATGTCTTGATGTTTATGCTCTGAGAGGCAAGAAAG
ATCTCCAAAACCCAATCTTGGTTAGCTTATTCGTCGTTGGTGATTGGGTGACTGCAATGT
TATCGCTCGCAGCTGCGTGTTCATCAGCGGGTGTTGTAGTCTTATTTGCCAGAGATCTTA
AGTATTGCAATATCCGTGAGCAGTTTTCATGTCTTAGGTATCAAGTAGCTGTAGCTCTGG
CTTTCGTCTCTTGGTTTCAGATCGCTATTTCTTCTCATGTCACATTTTGGATCTTAGCCT
CTGTTTAGTTTCTTCTTGAAATGTTGAGAACAACATCTTGTAGCTTTCGATGACGTATAA
CGTTTGGTTCAAATCTTATCCATCAGTTGTTTCTCG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2AZ46TFB 756 0 0
GGGATAATCGAAGCTAAGATGAGTTTCGGGAAACTCCTATAGAATCCGAGTTCCATCTGC
ATTTGCTATTCCCCGCCAAAAAAAAAACTCCTCCTTAAGCAAATGTAGCTTTTGATTCCG
AAAATTATATTAAAAAAGAAGCTAAGGTTTCTAGATTACTTGGTCCTCGCTGATTCGATC
GGAGTTTCTGGGTTTAGGGTTAGATGAAGAAGATATTCGGAGGCCCAGGAACAGTGTGTG
GCCTGTTCCTGAGAATCGGACAATGTGCTTCCGCTGCTGCCTCAATCGGCGTTATGCTCT
CTTCCACTGAGTTCTATAATCGCACTGCTTTCTGCTACTTGATTGCTTCAATGGGTCTTC
AATTGCTGTGGAGCTTTGGCCTTGCATGTCTTGATGTTTATGCTCTGAGAGGCAAGAAAG
ATCTCCAAAACCCAATCTTGGTTAGCTTATTCGTCGTTGGTGATTGGGTGACTGCAATGT
TATCGCTCGCAGCTGCGTGTTCATCAGCGGGTGTTGTAGTCTTATTTGCCAGAGATCTTA
AGTATTGCAATATCCGTGAGCAGTTTTCATGTCTTAGGTATCAAGTAGCTGTAGCTCTGG
CTTTCGTCTCTTGGTTTCAGATCGCTATTTCTTCTCATGTCACATTTTGGATCTTAGCCT
CTGTTTAGTTTCTTCTTGAAATGTTGAGAACAACATCTTGTAGCTTTCGATGACGTATAA
CGTTTGGTTCAAATCTTATCCATCAGTTGTTTCTCG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL4730Contig1 1074 2 2 U
GGCTCCCCATTACAATATTCAAAATCACAATCTCTCTCTATCTCAAAAAAACTTACATCA
ATGGCCCTGAGAAACATCGAAAACGCTCTTCCGATCTCGCAGGAACGACCTAAGAAGCTT
CCGAAACTCTCAAAGAACCCAGAGATTGGTGGTCCGAACGACGAAAACATCCTCGTACCT
CCTCCCACTGAATCAACCATCGACTACATCGCTTCCGAAAATCTCAAAGTTTGTGAATCA
CTCAACGACACAAGAAGATTAGCAGTTCATCACTCTTCTCTGTTGCTACCAATTCTAGAA
AAGCTTATGGTTGTGATGGTGAAAGCCATGAAGAACCCTAGAAGCGCCTTGTGCAAGACT
TCGATTATGGCTTGTTCTGATATCTTCAAAGCCTACGGAGAAAAGTTAACTCTTTTGAAA
ACTATGGACGATCTGTTATTACAGCTGCTAATGAAAGCTTCACAAGACAAGAAGTTTGTT
TGTGAAGAGGCAGACAAAGCGCTGAACACGATGGTTAACTCGGTGGCTCCTTTGCTTCTT
CTGCGTAAGCTCAAGACTTATGTTCGACACAATAACCCTCGCGTTAGGGCCAAAGCTGCT
GTGTCTACCTCAAACTGCGTTTCTAAAATGGAGGTAAATGAAATGGAGGAGTTCGGGATG
GTTGTGATTGTGCAAATGGCTGCGGATTTGTTGAATGATAAGTTACCAGAGGCAAGGGAG
GCTGCGAGGAGTATGGTGAACTCTGTTTACGAGAAATTCACTTGGAATGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGGTGAAGAAGGAAACAAACAAGAAGCTTGGCAGAGGTTTTGTGAG
AAGAATCTAACAGGGCTCAATGCACAAGCCATGATCAAGATCGTCTCATCTCAATAACGT
TTCTGAAGAAGAAACACCTTGTCTCTTATGTAACGTACGTATTCACATGATTGTAATAAC
AATCTTTCAGTTTCTTCTATTCATCACATGATTGAATGGAGACAATGAGACAGTATGATC
TCTTATTTTGTGTATTGCTTTATCTTGTGAAGGGACTTAATGGATCTTCTAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO61TF U 1
AF RR2AO61JQ C 220
BS 1 707 RR2AO61TF
BS 708 1074 RR2AO61JQ

RD RR2AO61TF 707 0 0
GGCTCCCCATTACAATATTCAAAATCACAATCTCTCTCTATCTCAAAAAAACTTACATCA
ATGGCCCTGAGAAACATCGAAAACGCTCTTCCGATCTCGCAGGAACGACCTAAGAAGCTT
CCGAAACTCTCAAAGAACCCAGAGATTGGTGGTCCGAACGACGAAAACATCCTCGTACCT
CCTCCCACTGAATCAACCATCGACTACATCGCTTCCGAAAATCTCAAAGTTTGTGAATCA
CTCAACGACACAAGAAGATTAGCAGTTCATCACTCTTCTCTGTTGCTACCAATTCTAGAA
AAGCTTATGGTTGTGATGGTGAAAGCCATGAAGAACCCTAGAAGCGCCTTGTGCAAGACT
TCGATTATGGCTTGTTCTGATATCTTCAAAGCCTACGGAGAAAAGTTAACTCTTTTGAAA
ACTATGGACGATCTGTTATTACAGCTGCTAATGAAAGCTTCACAAGACAAGAAGTTTGTT
TGTGAAGAGGCAGACAAAGCGCTGAACACGATGGTTAACTCGGTGGCTCCTTTGCTTCTT
CTGCGTAAGCTCAAGACTTATGTTCGACACAATAACCCTCGCGTTAGGGCCAAAGCTGCT
GTGTCTACCTCAAACTGCGTTTCTAAAATGGAGGTAAATGAAATGGAGGAGTTCGGGATG
GTTGTGATTGTGCAAATGGCTGCGGATTTGTTGAATGATAAGTTACC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2AO61JQ 855 0 0
AATCTCAAAGTTTGTGAATCACTCAACGACACAAGAAGATTAGCAGTTCATCACTCTTCT
CTGTTGCTACCAATTCTAGAAAAGCTTATGGTTGTGATGGTGAAAGCCATGAAGAACCCT
AGAAGCGCCTTGTGCAAGACTTCGATTATGGCTTGTTCTGATATCTTCAAAGCCTACGGA
GAAAAGTTAACTCTTTTGAAAACTATGGACGATCTGTTATTACAGCTGCTAATGAAAGCT
TCACAAGACAAGAAGTTTGTTTGTGAAGAGGCAGACAAAGCGCTGAACACGATGGTTAAC
TCGGTGGCTCCTTTGCTTCTTCTGCGTAAGCTCAAGACTTATGTTCGACACAATAACCCT
CGCGTTAGGGCCAAAGCTGCTGTGTCTACCTCAAACTGCGTTTCTAAAATGGAGGTAAAT
GAAATGGAGGAGTTCGGGATGGTTGTGATTGTGCAAATGGCTGCGGATTTGTTGAATGAT
AAGTTACCAGAGGCAAGGGAGGCTGCGAGGAGTATGGTGAACTCTGTTTACGAGAAATTC
ACTTGGAATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGTGAAGAAGGAAACAAACAAGAA
GCTTGGCAGAGGTTTTGTGAGAAGAATCTAACAGGGCTCAATGCACAAGCCATGATCAAG
ATCGTCTCATCTCAATAACGTTTCTGAAGAAGAAACACCTTGTCTCTTATGTAACGTACG
TATTCACATGATTGTAATAACAATCTTTCAGTTTCTTCTATTCATCACATGATTGAATGG
AGACAATGAGACAGTATGATCTCTTATTTTGTGTATTGCTTTATCTTGTGAAGGGACTTA
ATGGATCTTCTAAAG

QA 1 855 1 855
DS 



AS 1 2

CO CL4731Contig1 934 2 2 U
GGGTGTGATCAAAAAAGAAAATGTTAGCGATATTCGACAAGAACGTGGCGAAAGCCCCCG
AGGCTCTAAAGAGTCAGGAAGGTGGATCTGTTTGTGCTCTTAAAGATGGCTTCTTACCAA
ACCACTTCGCTTCCATCCACCCTGGTGCCGTCACCACCAATCTCGGATCTTCTGGTCTCA
TCGCTTGCACTCTCGACAAGCAGAACCCTCTTCTTCCCAGATTGTTTGCTGTGAATGATG
ATATGTTCTGCATCTTCCAAGGACATATAGAGAACATACCGTTCCTTAAACAGCAATATG
GACTGACAAAAACAGCAACCGAGGTCACCGTTGTGATCGAAGCCTACAGAGCCCTCAGAG
ACCGTGGTCCATACCCTGCCTACCAAGTTGTTAGAGACTTTCAAGGGAGATTTGCGTTTA
TGCTCTTTGACTGCACCACAAAGAATGTCTTCCTTGCTGCGGACGCAGATGGTAGCGTTC
CTCTCTTCTGGGGAACTGATGGTGAAGGTCATCTCGTTATCTCTGAGGATGTTGAAACCG
TGAAGAAAGGTTGTGGTAAATCCTTTGCGCCATTCCCTAAAGGGTTTCTTTACCTCGTCT
GGAGGGTTGAGGAGCTTTGAGTTTCCACTGAACGAGCTAAAGCCTGTACCAAGGGTGGAC
AGTTCTGGCCAGGTGTGCGGTGCGACTTTCAAAGTGGATTCCGAGGCCAAGAAAGAAAGC
GCAATGCCTCGAGTCGGCAGTGTTCAGAACTGGTCTCAACAAATCTGAAAGGCTAAAATG
TGATTTTAGCTGAGCTTTTCTTTTTTCTTTTCACTTTGCTGAACTCTGGCTGTGTTTCAA
TCTTTCTCTTGATTTTCTCACACTGGTCACTCTAAGGTTTCTCTGGATCTATTAATGCTC
ATGAAGCTACGAATAAAGGACAAACTTCTGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS56TF U 1
AF RR2AS56JQ C 19
BS 1 652 RR2AS56TF
BS 653 934 RR2AS56JQ

RD RR2AS56TF 658 0 0
GGGTGTGATCAAAAAAGAAAATGTTAGCGATATTCGACAAGAACGTGGCGAAAGCCCCCG
AGGCTCTAAAGAGTCAGGAAGGTGGATCTGTTTGTGCTCTTAAAGATGGCTTCTTACCAA
ACCACTTCGCTTCCATCCACCCTGGTGCCGTCACCACCAATCTCGGATCTTCTGGTCTCA
TCGCTTGCACTCTCGACAAGCAGAACCCTCTTCTTCCCAGATTGTTTGCTGTGAATGATG
ATATGTTCTGCATCTTCCAAGGACATATAGAGAACATACCGTTCCTTAAACAGCAATATG
GACTGACAAAAACAGCAACCGAGGTCACCGTTGTGATCGAAGCCTACAGAGCCCTCAGAG
ACCGTGGTCCATACCCTGCCTACCAAGTTGTTAGAGACTTTCAAGGGAGATTTGCGTTTA
TGCTCTTTGACTGCACCACAAAGAATGTCTTCCTTGCTGCGGACGCAGATGGTAGCGTTC
CTCTCTTCTGGGGAACTGATGGTGAAGGTCATCTCGTTATCTCTGAGGATGTTGAAACCG
TGAAGAAAGGTTGTGGTAAATCCTTTGCGCCATTCCCTAAAGGGTTTCTTTACCTCGTCT
GGAGGGTTGAGGAGCTTTGAGTTTCCACTGAACGAGCTAAAGCCTGTACCAA
AGGGTG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2AS56JQ 916 0 0
AAATGTTAGCGATATTCGACAAGAACGTGGCGAAAGCCCCCGAGGCTCTAAAGAGTCAGG
AAGGTGGATCTGTTTGTGCTCTTAAAGATGGCTTCTTACCAAACCACTTCGCTTCCATCC
ACCCTGGTGCCGTCACCACCAATCTCGGATCTTCTGGTCTCATCGCTTGCACTCTCGACA
AGCAGAACCCTCTTCTTCCCAGATTGTTTGCTGTGAATGATGATATGTTCTGCATCTTCC
AAGGACATATAGAGAACATACCGTTCCTTAAACAGCAATATGGACTGACAAAAACAGCAA
CCGAGGTCACCGTTGTGATCGAAGCCTACAGAGCCCTCAGAGACCGTGGTCCATACCCTG
CCTACCAAGTTGTTAGAGACTTTCAAGGGAGATTTGCGTTTATGCTCTTTGACTGCACCA
CAAAGAATGTCTTCCTTGCTGCGGACGCAGATGGTAGCGTTCCTCTCTTCTGGGGAACTG
ATGGTGAAGGTCATCTCGTTATCTCTGAGGATGTTGAAACCGTGAAGAAAGGTTGTGGTA
AATCCTTTGCGCCATTCCCTAAAGGGTTTCTTTACCTCGTCTGGAGGGTTGAGGAGCTTT
GAGTTTCCACTGAACGAGCTAAAGCCTGTACCAAGGGTGGACAGTTCTGGCCAGGTGTGC
GGTGCGACTTTCAAAGTGGATTCCGAGGCCAAGAAAGAAAGCGCAATGCCTCGAGTCGGC
AGTGTTCAGAACTGGTCTCAACAAATCTGAAAGGCTAAAATGTGATTTTAGCTGAGCTTT
TCTTTTTTCTTTTCACTTTGCTGAACTCTGGCTGTGTTTCAATCTTTCTCTTGATTTTCT
CACACTGGTCACTCTAAGGTTTCTCTGGATCTATTAATGCTCATGAAGCTACGAATAAAG
GACAAACTTCTGATTC

QA 1 916 1 916
DS 



AS 1 2

CO CL4732Contig1 526 2 1 U
CAACAAATCAAACTTTCTTGTTCTTCAGTTTACTCATTTCCTCTTCTCTCTAGACTTTCC
TAAAGACTTTACTCACTTTCTTCTTCTTCACTCGAGACTTTCCAGAAGACTTTTGACCTT
TGATTGACTTCGATAAGCAGAATATGGAAGGAAGAGGAAAAGTCAGCATGATCAACGGTG
GAAATGGAACTAGGAGAGATGCCAGAGAACACAGTAGCCGTCCAATACCAAAGAGAGGGC
AAGTCAAAGTTGGGATCTTGCTCGGCTTTGCTAATTCTTTTGCTTCTATCTTTGGCTCCA
CGAGAAACTTCCTTGGATCCTAAACTGCTGCTTCTCATATTAAATATTTTTATTGATTTC
TTCAGAATTTTCTGTGGTTTATTAGAGTGAAACTGAAACCTCATATTAAAGATTGGTGAT
CATGTTTAGTCTCTAGGTCGTGAGTTTCTTTTCGTTTTATCTTCTTTTTGTACAAATCCA
GTGTGGTGTCAAGAGTCACTTGATCAATAGTATATTATCTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GR15TF U 1
AF RR2GR15JQ C 45
BS 1 526 RR2GR15TF

RD RR2GR15TF 526 0 0
CAACAAATCAAACTTTCTTGTTCTTCAGTTTACTCATTTCCTCTTCTCTCTAGACTTTCC
TAAAGACTTTACTCACTTTCTTCTTCTTCACTCGAGACTTTCCAGAAGACTTTTGACCTT
TGATTGACTTCGATAAGCAGAATATGGAAGGAAGAGGAAAAGTCAGCATGATCAACGGTG
GAAATGGAACTAGGAGAGATGCCAGAGAACACAGTAGCCGTCCAATACCAAAGAGAGGGC
AAGTCAAAGTTGGGATCTTGCTCGGCTTTGCTAATTCTTTTGCTTCTATCTTTGGCTCCA
CGAGAAACTTCCTTGGATCCTAAACTGCTGCTTCTCATATTAAATATTTTTATTGATTTC
TTCAGAATTTTCTGTGGTTTATTAGAGTGAAACTGAAACCTCATATTAAAGATTGGTGAT
CATGTTTAGTCTCTAGGTCGTGAGTTTCTTTTCGTTTTATCTTCTTTTTGTACAAATCCA
GTGTGGTGTCAAGAGTCACTTGATCAATAGTATATTATCTTCTTCC

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2GR15JQ 482 0 0
TCTCTCTAGACTTTCCTAAAGACTTTACTCACTTTTTTTTTCTTCACTCGAGACTTTCCA
GAAGACTTTTGACCTTTGATTGACTTCGATAAGCAGAATATGGAAGGAAGAGGAAAAGTC
AGCATGATCAACGGTGGAAATGGAACTAGGAGAGATGCCAGAGAACACAGTAGCCGTCCA
ATACCAAAGAGAGGGCAAGTCAAAGTTGGGATCTTGCTCGGCTTTGCTAATTCTTTTGCT
TCTATCTTTGGCTCCACGAGAAACTTCCTTGGATCCTAAACTGCTGCTTCTCATATTAAA
TATTTTTATTGATTTCTTCAGAATTTTCTGTGGTTTATTAGAGTGAAACTGAAACCTCAT
ATTAAAGATTGGTGATCATGTTTAGTCTCTAGGTCGTGAGTTTCTTTTCGTTTTATCTTC
TTTTTGTACAAATCCAGTGTGGTGTCAAGAGTCACTTGATCAATAGTATATTATCTTCTT
CC

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL4733Contig1 891 2 4 U
AGGGAAGCTATGGTGCGCCGATGCTCACGGTGGCCTCGTTGTGCCGGCGATACAACGGAG
TTTGAAAAACCTTAAGCTGGACTATCTTGATCTGTACCTGATTCATTGGCCGGTTAGTTC
GAAACCGGGGAAGTACAAGTTCCCAATTGAAGAAGGTGATTTTCTGCCAATGGATTATGA
AGCGGTCTGGTCTGAAATGGAGGAATGCAAGAGACTCGGGCTTGCGAAGTGTATAGGAGT
GAGCAACTTCTCCTGCAAGAAGCTTCAACACATCCTTTCTATCGCCACAATCCCGCCTAG
CGTCAATCAAGTGGAGATGAGTCCAGTATGGCAACAGAGGAAACTAAAGGAGCTTTGTAA
GTCCAAGGGCATTGTTTTGACAGCTTACTCGGTGTTGGGATCAAGAGGAGCCTTTTGGGG
AACTCCCAAAATCATGGAGTCTGATGTTCTTAAAGAAATTGCTGACGCCAAGGGCAAAAC
CGTTGCACAGGTGAGTATGAGATGGGCATACGAGGAAGGAGTCAGCATGGTGGTGAAGAG
CTTTACAAAACAGAGACTAGAGGAGAATCTTAAGATATTCGATTGGTCTTTGACTGAGGA
AGAGATGCACAGAATCTCCACAGAGATTCCTCAGTGCAGAATCGTCGGGGGGTGAAGTTT
ATATCTCCAAGAAGGGCTCCATTAAATCTCTAGACGAAATGTGGGATGGTGAGATCTAAA
TCACTTCGTGTGGAAGTGACCCAGTAGATCCCATTTTGTATCGTGATCGTAACTATTACT
TGTCATTATCTTGCTTCATTCTTATGGTCATCATAACTTCCACCGAAACAAGGCCAAACG
GTCCCATGTTAAGCTCAAGGGTTAATTATATCAGACCCAAATAATGACAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU32TF U 1
AF RR2DU32JQ C 176
BS 1 659 RR2DU32TF
BS 660 660 RR2DU32JQ
BS 661 670 RR2DU32TF
BS 671 891 RR2DU32JQ

RD RR2DU32TF 670 0 0
AGGGAAGCTATGGTGCGCCGATGCTCACGGTGGCCTCGTTGTGCCGGCGATACAACGGAG
TTTGAAAAACCTTAAGCTGGACTATCTTGATCTGTACCTGATTCATTGGCCGGTTAGTTC
GAAACCGGGGAAGTACAAGTTCCCAATTGAAGAAGGTGATTTTCTGCCAATGGATTATGA
AGCGGTCTGGTCTGAAATGGAGGAATGCAAGAGACTCGGGCTTGCGAAGTGTATAGGAGT
GAGCAACTTCTCCTGCAAGAAGCTTCAACACATCCTTTCTATCGCCACAATCCCGCCTAG
CGTCAATCAAGTGGAGATGAGTCCAGTATGGCAACAGAGGAAACTAAAGGAGCTTTGTAA
GTCCAAGGGCATTGTTTTGACAGCTTACTCGGTGTTGGGATCAAGAGGAGCCTTTTGGGG
AACTCCCAAAATCATGGAGTCTGATGTTCTTAAAGAAATTGCTGACGCCAAGGGCAAAAC
CGTTGCACAGGTGAGTATGAGATGGGCATACGAGGAAGGAGTCAGCATGGTGGTGAAGAG
CTTTACAAAACAGAGACTAGAGGAGAATCTTAAGATATTCGATTGGTCTTTGACTGAGGA
AGAGATGCACAGAATCTCCACAGAGATTCCTCAGTGCAGAATCGTCGGGGGGTGAAGTT*
ATATCTCCAA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2DU32JQ 716 0 0
TATGAAGCGGTCTGGTCTGAAATGGAGGAATGCAAGAGACTCGGGCTTGCGAAGTGTATA
GGAGTGAGCAACTTCTCCTGCAAGAAGCTTCAACACATCCTTTCTATCGCCACAATCCCG
CCTAGCGTCAATCAAGTGGAGATGAGTCCAGTATGGCAACAGAGGAAACTAAAGGAGCTT
TGTAAGTCCAAGGGCATTGTTTTGACAGCTTACTCGGTGTTGGGATCAAGAGGAGCCTTT
TGGGGAACTCCCAAAATCATGGAGTCTGATGTTCTTAAAGAAATTGCTGACGCCAAGGGC
AAAACCGTTGCACAGGTGAGTATGAGATGGGCATACGAGGAAGGAGTCAGCATGGTGGTG
AAGAGCTTTACAAAACAGAGACTAGAGGAGAATCTTAAGATATTCGATTGGTCTTTGACT
GAGGAAGAGATGCACAGAATCTCCACAGAGATTCCTCAGTGCAGAATCGTCGGGGG*TGA
AGTTTATATCTCCAAGAAGGGCTCCATTAAATCTCTAGACGAAATGTGGGATGGTGAGAT
CTAAATCACTTCGTGTGGAAGTGACCCAGTAGATCCCATTTTGTATCGTGATCGTAACTA
TTACTTGTCATTATCTTGCTTCATTCTTATGGTCATCATAACTTCCACCGAAACAAGGCC
AAACGGTCCCATGTTAAGCTCAAGGGTTAATTATATCAGACCCAAATAATGACAAT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL4734Contig1 511 2 4 U
GAGATCCAGATAATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAGCATCTGATGTGCGATGTCGGT
GACGGCCAAGGTCACCACCTCACCGCTGCCGCCATCATCGGCCATGACGGTAGCGTTTGG
GCTCAGAGTGCTAATTTTCCTCAGTTCAAACCTCAAGAGATGACAGATATCATGAAAGAT
TTCGATGAGCCTGGTCACCTCGCTCCCACAGGCTTGTTCCTCGCAGGACTTAAGTATATG
GTTATCCAAGGCGAGCCTGGTGCAGTCATTCGTGGCAAAAAGGGGGCTGGAGGAATCACA
ATCAAAAAGACAGGACAGTCAATGGTGTTTGGTCTGTACGAAGAACCAGTGACTCCAGGA
CAATGTAACATGGTCGTCGAGAGGCTGGGTGATTACTTGGTCGAACAGGATTTTTGAAAC
CTTATAGAATGCTATATTGATGTTGTTCCAATCCTTTGAACCATTGTTTCACTTTTATTT
TTGGCTGGGTGCATGGGTTTTATGTTTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ17TF U 1
AF RR2DZ17JQ C 47
BS 1 264 RR2DZ17TF
BS 265 265 RR2DZ17JQ
BS 266 308 RR2DZ17TF
BS 309 511 RR2DZ17JQ

RD RR2DZ17TF 308 0 0
GAGATCCAGATAATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAGCATCTGATGTGCGATGTCGGT
GACGGCCAAGGTCACCACCTCACCGCTGCCGCCATCATCGGCCATGACGGTAGCGTTTGG
GCTCAGAGTGCTAATTTTCCTCAGTTCAAACCTCAAGAGATGACAGATATCATGAAAGAT
TTCGATGAGCCTGGTCACCTCGCTCCCACAGGCTTGTTCCTCGCAGGACTTAAGTATATG
GTTATCCAAGGCGAGCCTGGTGCA*TCATTCGTGGCAAAAAGGGGGCTGGAGGAATCACA
ATCAAAAA

QA 1 308 1 308
DS 

RD RR2DZ17JQ 465 0 0
TGTGCGATGTCGGTGACGGCCAAGGTCACCACCTCACCGCTGCCGCCATCATCGGCCATG
ACGGTAGCGTTTGGGCTCAGAGTGCTAATTTTCCTCAGTTCAAACCTCAAGAGATGACAG
ATATCATGAAAGATTTCGATGAGCCTGGTCACCTCGCTCCCACAGGCTTGTTCCTCGCAG
GACTTAAGTATATGGTTATCCAAGGCGAGCCTGGTGCAGTCATTCGTGGCAAAAAGGGGG
CTGGAGGAATCACAATCAAAAAGACAGGACAGTCAATGGTGTTTGGTCTGTACGAAGAAC
CAGTGACTCCAGGACAATGTAACATGGTCGTCGAGAGGCTGGGTGATTACTTGGTCGAAC
AGGATTTTTGAAACCTTATAGAATGCTATATTGATGTTGTTCCAATCCTTTGAACCATTG
TTTCACTTTTATTTTTGGCTGGGTGCATGGGTTTTATGTTTTCCT

QA 1 465 1 465
DS 



AS 1 2

CO CL4735Contig1 896 2 8 U
GATGAAAAAAATGGGAAAGTTGAAGTCCGTGAACACGGGACGAACCGTGGAGAGCTAAAA
GAGTTTTCCGTGCCTTATCCGGCTGAGTACATCACAGCCGTTGGTGGAAGCTACAAGCAT
ATTTTCAGCTATGATACAACGCTTATTACATCGATATACTTCACAACCTCCAAAGGATTT
ACGTCTCCATTGTTCGGTGAGATGAAGGGAACAGAATTCGAGTTCAAAGGCGAAAATGGT
GGAAAGCTTGTTGGATTCCATGGACGTGGTGGCTATGCTATTGATGCCATCGGTGCACAT
TTTGCTGCAGCTACAAACTCTTCTCCATCTTCTCTCATCAAAGTGGAAGCTGTAGGAGGA
AAGGGTGAAGAAACATTCGATGATGGTGGTGCTTTGATCATGTAAGAAAAGTTTTTGTTG
GTCAAGGCAATTCCGGTGTGGCTTATATCAAGTTTGAATACGAGAAAGAGACATCCCTAG
GAACAGAGGAGTTCGAGGTTGGTCAAGGCGACGACATCACATCTGTGAAAGTTTACCACG
ATAAACTCTTTGGCTCGAAGACAGAGATAATAACGTCTCTTACGTTCAAGACACTGAAGG
GCATCACCTCTCAGCCGTTTGGAATGACCTCAGAGAATTTTTCCTTGCTCGAAGGTGGCA
AAATCACCGGTTTTCATGGAAGTTCGACGGACGTTCTTCATTCTCTCGGAGCTTATACAG
TGGCTTGTGTCGGGAGCTTATAAGCTATGATGCACGGGGACGGCATATCCTTGACGTCTC
CTGTTCCGTGTTTGGTGGGTTTGTGAGTTTTAAGAGGTCATTTGCTTGTGTGTTTTAGAA
ATGTCTACATTTTACGTGTGTTTGGTCTTTATGAAATAAATCCAATCAATAAGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL21TF U 1
AF RR2BL21JQ C 336
BS 1 654 RR2BL21TF
BS 655 655 RR2BL21JQ
BS 656 689 RR2BL21TF
BS 690 690 RR2BL21JQ
BS 691 708 RR2BL21TF
BS 709 709 RR2BL21JQ
BS 710 730 RR2BL21TF
BS 731 896 RR2BL21JQ

RD RR2BL21TF 730 0 0
GATGAAAAAAATGGGAAAGTTGAAGTCCGTGAACACGGGACGAACCGTGGAGAGCTAAAA
GAGTTTTCCGTGCCTTATCCGGCTGAGTACATCACAGCCGTTGGTGGAAGCTACAAGCAT
ATTTTCAGCTATGATACAACGCTTATTACATCGATATACTTCACAACCTCCAAAGGATTT
ACGTCTCCATTGTTCGGTGAGATGAAGGGAACAGAATTCGAGTTCAAAGGCGAAAATGGT
GGAAAGCTTGTTGGATTCCATGGACGTGGTGGCTATGCTATTGATGCCATCGGTGCACAT
TTTGCTGCAGCTACAAACTCTTCTCCATCTTCTCTCATCAAAGTGGAAGCTGTAGGAGGA
AAGGGTGAAGAAACATTCGATGATGGTGGTGCTTTGATCATGTAAGAAAAGTTTTTGTTG
GTCAAGGCAATTCCGGTGTGGCTTATATCAAGTTTGAATACGAGAAAGAGACATCCCTAG
GAACAGAGGAGTTCGAGGTTGGTCAAGGCGACGACATCACATCTGTGAAAGTTTACCACG
ATAAACTCTTTGGCTCGAAGACAGAGATAATAACGTCTCTTACGTTCAAGACACTGAAGG
GCATCACCTCTCAGCCGTTTGGAATGACCTCAGAGAATTTTTCCTTGCTCGAAG*TGGCA
AAATCACCGGTTTTCATGGAAGTTCGACG*ACGTTCTTCATTCTCTCG*AGCTTATACAG
TGGCTTGTGT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2BL21JQ 561 0 0
CATCAAAGTGGAAGCTGTAGGAGGAAAGGGTGAAGAAACATTCGATGATGGTGGTGCTTT
GATCATGTAAGAAAAGTTTTTGTTGGTCAAGGCAATTCCGGTGTGGCTTATATCAAGTTT
GAATACGAGAAAGAGACATCCCTAGGAACAGAGGAGTTCGAGGTTGGTCAAGGCGACGAC
ATCACATCTGTGAAAGTTTACCACGATAAACTCTTTGGCTCGAAGACAGAGATAATAACG
TTTCTTACGTTCAAGACACTGAAGGGCATCACCTTTCAGCCGTTTGGAATGACCTCAGAG
AATTTTTCCTTGCTCGAAGGTGGCAAAATCACCGGTTTTCATGGAAGTTCGACGGACGTT
TTTCATTCTCTCGGAGCTTATACAGTGGCTTGTGTCGGGAGCTTATAAGCTATGATGCAC
GGGGACGGCATATCCTTGACGTCTCCTGTTCCGTGTTTGGTGGGTTTGTGAGTTTTAAGA
GGTCATTTGCTTGTGTGTTTTAGAAATGTCTACATTTTACGTGTGTTTGGTCTTTATGAA
ATAAATCCAATCAATAAGAGT

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL4736Contig1 715 2 3 U
TTTTTTTTTGGGAAATAAAAAGACTGAACCAAATTAAAGTACACAAACAGCACACACATA
AGTCAACAAGATCCAGAGTTTGTCAAATACAAGCAGTAAAGAAACCTGCAACTGGTAGTT
GAGGCTTCCTTAATAAAAAAAAACAAATAAACTAGAGATAGGTTTTAAAAGGGAGGGTAC
ACGCTTACTCTCAGTACTCCTCCTCTTGTTGGTAGTCTCCTTCTTCCTCATCCTCGTACT
CACCTTCTTCATCAGCAGTTGCGTCTTGGTATTGTTGGTACTCTGAAACAAGATCATTCA
TGTTGCTCCCTGCCTCCGTGAACTCCATCTCGTCCATTCCTTCAACTGTGTACCAGTGCA
AGAAAGCCTTCCTCCTGAACATAGCTGTGAACTGCTCACTCACACGCCTGAACATCTCTT
GGATCGATGTTGAGTTCCCAATGAAAGTGGAAGCCATCTTCAGACCAGTAGGTGGGATGT
CACAGACCGTTGACTTCACATTGTTGGGAATCCACTCAACGAAGTAGGATGAGTTCTTGT
TCTGCACGTTCAGCATCTGCTCATCGACTTCCTTCGTGCTCATCTTGCCACGGAACATGG
CGGACGCTGTGAGGTAGCGGCCGTGTCTTGGGTCAGCAGCACACATCATGTTCTTGGAGT
CCCACATTTGCTGGGTGAGTTCAGGGACGGTGAGGGAACGGTACTGCTGAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H360JQ U 10
AF RR2H360TF C 1
BS 1 9 RR2H360TF
BS 10 461 RR2H360JQ
BS 462 715 RR2H360TF

RD RR2H360JQ 452 0 0
GGGAAATAAAAAGACTGAACCAAATTAAAGTACACAAACAGCACACACATAAGTCAACAA
GATCCAGAGTTTGTCAAATACAAGCAGTAAAGAAACCTGCAACTGGTAGTTGAGGCTTCC
TTAATAAAAAAAAACAAATAAACTAGAGATAGGTTTTAAAAGGGAGGGTACACGCTTACT
CTCAGTACTCCTCCTCTTGTTGGTAGTCTCCTTCTTCCTCATCCTCGTACTCACCTTCTT
CATCAGCAGTTGCGTCTTGGTATTGTTGGTACTCTGAAACAAGATCATTCATGTTGCTCC
CTGCCTCCGTGAACTCCATCTCGTCCATTCCTTCAACTGTGTACCAGTGCAAGAAAGCCT
TCCTCCTGAACATAGCTGTGAACTGCTCACTCACACGCCTGAACATCTCTTGGATCGATG
TTGAGTTCCCAATGAAAGTGGAAGCCATCTTC

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2H360TF 715 0 0
TTTTTTTTTGGGAAATAAAAAGACTGAACCAAATTAAAGTACACAAACAGCACACACATA
AGTCAACAAGATCCAGAGTTTGTCAAATACAAGCAGTAAAGAAACCTGCAACTGGTAGTT
GAGGCTTCCTTAATAAAAAAAAACAAATAAACTAGAGATAGGTTTTAAAAGGGAGGGTAC
ACGCTTACTCTCAGTACTCCTCCTCTTGTTGGTAGTCTCCTTCTTCCTCATCCTCGTACT
CACCTTCTTCATCAGCAGTTGCGTCTTGGTATTGTTGGTACTCTGAGACAAGATCATTCA
TGTTGCTCCCTGCCTCCGTGAACTCCATCTCGTCCATTCCTTCAACTGTGTACCAGTGCA
AGAAAGCCTTCCTCCTGAACATAGCTGTGAACTGCTCACTCACACGCCTGAACATCTCTT
GGATCGATGTTGAGTTCCCAATGAAAGTGGAAGCCATCTTCAGACCAGTAGGTGGGATGT
CACAGACCGTTGACTTCACATTGTTGGGAATCCACTCAACGAAGTAGGATGAGTTCTTGT
TCTGCACGTTCAGCATCTGCTCATCGACTTCCTTCGTGCTCATCTTGCCACGGAACATGG
CGGACGCTGTGAGGTAGCGGCCGTGTCTTGGGTCAGCAGCACACATCATGTTCTTGGAGT
CCCACATTTGCTGGGTGAGTTCAGGGACGGTGAGGGAACGGTACTGCTGAGAGCC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL4737Contig1 1140 2 2 U
TTTTTGTTTTCAATCATAAATGTTCAGAAATATTTAGGTGAATTCTGAATCTTCGGTTTC
AATGTGATCTTGGTAAAAGCACCGATATTTCTCCTATGATAAAAGCATTACATATATATG
AATTTATTTAGATAGTGTCCTCTACCTTCTCATTTTATATTTTCAACCTAGTTAATTTCA
AATTACTATAATCAAAATGAGTTATGTACGCACTGTCAAAAACTCAAAAACAAAAAGGCA
TCTGCAGTGGTGAGAAACCATAATAAATTTCTCAAGAATAAAATTAAATACTTTTAATTG
TTAAATTATTATTTGGTTGAAAAATGGCAGATACGTTTCTTAAGGCCATGGAAAAATATC
TTTATGAAGGTACGATCCTTCCCTCTCTCCTCTTCTTTTCTATAAAATTTTTAATTCTAA
AAATTTTGGGAAGATACAGCAACTACCCATGGTCTAATAATTTTACAAACAAAATAACAG
GGGAGCCTTTAGCTTTTGGCGCGCATCCGGTTATCATCAAAGCAATAGCAAGTTATTTAT
AAATTTGCAGTACTATATATATCTAAGTCAAGTTGAATTTTTTAATCGTTTAACTGTAAC
CCTTTGTCCTTTAATTTGAATACAATGTACTCCTACTACGCAGGACTATTCTAAATGTCC
TATGCTAACATAAATCAAAGTTAAGCTAGCTTGATTAGAAAAGAAGAAGAGGGGAACACT
TAGAGGTGGTAAACGTGGAACCCTTGGCTAGCTAGTCTACTATACCAGTTTGCTAAAGAT
TCAATAATGTAGCTTTCTTACTAATGCTTATCGGTTTCTCATACCTTGTTTACGTGTATG
GTAATCACTTTCTTACTTGTTTAAACTATGCAATAACCTTGTATGCTTCTAGAAAACGAA
GGGAAAAAGGTCAAGAGCGAGGAGTGGTGAACGTGTCCCTATTAATAGCGCATCTCGAGG
ATCAAGATGCAATCAATATTTAACAAGACTTTACAATGCATGAACATAACTCTATACTGA
CAATTGCTACATTAAGAAACTACTAGTTGTATACAAATAGTTTCAGAGAAAAAGTAATTT
AATTTGTAAGACTGGACTTATAATTTAACACTAAATAACCATAACTTGCGAAAGAAATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK64TF U 1
AF RR2BK64JQ C 473
BS 1 643 RR2BK64TF
BS 644 1140 RR2BK64JQ

RD RR2BK64TF 648 0 0
TTTTTGTTTTCAATCATAAATGTTCAGAAATATTTAGGTGAATTCTGAATCTTCGGTTTC
AATGTGATCTTGGTAAAAGCACCGATATTTCTCCTATGATAAAAGCATTACATATATATG
AATTTATTTAGATAGTGTCCTCTACCTTCTCATTTTATATTTTCAACCTAGTTAATTTCA
AATTACTATAATCAAAATGAGTTATGTACGCACTGTCAAAAACTCAAAAACAAAAAGGCA
TCTGCAGTGGTGAGAAACCATAATAAATTTCTCAAGAATAAAATTAAATACTTTTAATTG
TTAAATTATTATTTGGTTGAAAAATGGCAGATACGTTTCTTAAGGCCATGGAAAAATATC
TTTATGAAGGTACGATCCTTCCCTCTCTCCTCTTCTTTTCTATAAAATTTTTAATTCTAA
AAATTTTGGGAAGATACAGCAACTACCCATGGTCTAATAATTTTACAAACAAAATAACAG
GGGAGCCTTTAGCTTTTGGCGCGCATCCGGTTATCATCAAAGCAATAGCAAGTTATTTAT
AAATTTGCAGTACTATATATATCTAAGTCAAGTTGAATTTTTTAATCGTTTAACTGTAAC
CCTTTGTCCTTTAATTTGAATACAATGTACTCCTACTACGCAG
ACTAT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2BK64JQ 668 0 0
AATAACAGGGGAGCCTTTAGCTTTTGGCGCGCATCCGGTTATCATCAAAGCAATAGCAAG
TTATTTATAAATTTGCAGTACTATATATATCTAAGTCAAGTTGAATTTTTTAATCGTTTA
ACTGTAACCCTTTGTCCTTTAATTTGAATACAATGTACTCCTACTACGCAGGACTATTCT
AAATGTCCTATGCTAACATAAATCAAAGTTAAGCTAGCTTGATTAGAAAAGAAGAAGAGG
GGAACACTTAGAGGTGGTAAACGTGGAACCCTTGGCTAGCTAGTCTACTATACCAGTTTG
CTAAAGATTCAATAATGTAGCTTTCTTACTAATGCTTATCGGTTTCTCATACCTTGTTTA
CGTGTATGGTAATCACTTTCTTACTTGTTTAAACTATGCAATAACCTTGTATGCTTCTAG
AAAACGAAGGGAAAAAGGTCAAGAGCGAGGAGTGGTGAACGTGTCCCTATTAATAGCGCA
TCTCGAGGATCAAGATGCAATCAATATTTAACAAGACTTTACAATGCATGAACATAACTC
TATACTGACAATTGCTACATTAAGAAACTACTAGTTGTATACAAATAGTTTCAGAGAAAA
AGTAATTTAATTTGTAAGACTGGACTTATAATTTAACACTAAATAACCATAACTTGCGAA
AGAAATAA

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL4738Contig1 517 2 2 U
GGGACTACCGCTGTTGCGGCAACCATCCCTCACATGACAGTGGATGATCTTTCGGTGCCT
CCTGCACGAGAAAGCCTCACTGTACTCGATCCCCTGCAGCGTGGAAGAGCTACTTGGTTT
AAACATGATAAAGACAAAATTTCCAAAGCTATATTAAAGTTTACGAAATCTGACTTACCG
TCAGCGTATCCTACTTATAATCATCTACCTTGTGATGTGAAAACACGATGGTTTAGAGTA
TTTGAGCAATAATTTCATTGGGAATGAAGCGTTACTGAGACACTAAAGGTTGCTTGCTAT
GAGAAAAAGGCCGAGAAATCTTTCTCAAGCTACTTGTGTGCTTGGAACGGTAAACGGAAG
CTGAACAAAGATCCTCCGGACTGGGTAGATGAAGATGCAACTCAAGAATAATTATGTATT
AGTTTTTATGTTTCCATTTTGTGGTTAAAACTTTAGTCACCAAGTGTAATGTTCTTTGTT
AGCTTCATGTGTTCAAATTTTATTCAAGTATTATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D875JQ C 1
AF RR2D875TF U 32
BS 1 31 RR2D875JQ
BS 32 517 RR2D875TF

RD RR2D875JQ 517 0 0
GGGACTACCGCTGTTGCGGCAACCATCCCTCACATGACAGTGGATGATCTTTCGGTGCCT
CCTGCACGAGAAAGCCTCACTGTACTCGATCCCCTGCAGCGTGGAAGAGCTACTTGGTTT
AAACATGATAAAGACAAAATTTCCAAAGCTATATTAAAGTTTACGAAATCTGACTTACCG
TCAGCGTATCCTACTTATAATCATCTACCTTGTGATGTGAAAACACGATGGTTTAGAGTA
TTTGAGCAATAATTTCATTGGGAATGAAGCGTTACTGAGACACTAAAGGTTGCTTGCTAT
GAGAAAAAGGCCGAGAAATCTTTCTCAAGCTACTTGTGTGCTTGGAACGGTAAACGGAAG
CTGAACAAAGATCCTCCGGACTGGGTAGATGAAGATGCAACTCAAGAATAATTATGTATT
AGTTTTTATGTTTCCATTTTGTGGTTAAAACTTTAGTCACCAAGTGTAATGTTCTTTGTT
AGCTTCATGTGTTCAAATTTTATTCAAGTATTATGCC

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2D875TF 486 0 0
ACATGACAGTGGATGATCTTTCGGTGCCTCCTGCACGAGAAAGCCTCACTGTACTCGATC
CCCTGCAGCGTGGAAGAGCTACTTGGTTTAAACATGATAAAGACAAAATTTCCAAAGCTA
TATTAAAGTTTACGAAATCTGACTTACCGTCAGCGTATCCTACTTATAATCATCTACCTT
GTGATGTGAAAACACGATGGTTTAGAGTATTTGAGCAATAATTTCATTGGGAATGAAGCG
TTACTGAGACACTAAAGGTTGCTTGCTATGAGAAAAAGGCCGAGAAATCTTTCTCAAGCT
ACTTGTGTGCTTGGAACGGTAAACGGAAGCTGAACAAAGATCCTCCGGACTGGGTAGATG
AAGATGCAACTCAAGAATAATTATGTATTAGTTTTTATGTTTCCATTTTGTGGTTAAAAC
TTTAGTCACCAAGTGTAATGTTCTTTGTTAGCTTCATGTGTTCAAATTTTATTCAAGTAT
TATGCC

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 2

CO CL4739Contig1 805 2 2 U
GGGCCGTCAAACCGTCCTCCTCCTCCGACTACTCCTTCTTCCCCTCCGAGCTACCTGCTC
GCCCGGGGATGGAAACAGCTACAACGATCTCCGGCGATTCGAGAAAAAACTTAGAACAAA
ACGACGACGTTAGATCAGAGAGGGTCCTATACGACATCGTTTCGAAGTCTATTTCCTCCG
CAGCGTTGATTATTCAAGGGATGGCTGATGAAACACTCGAGTCAGCTAAAGAGTACTTAC
GGAACTTAATCGATTCTCCGGATAAGAAGGAGAAGCTGACGAGTCTTCAGAGCCAGATCG
ACAGAAGATCCGATCTCTGCAAAGAGACCTTATCCAAATGCGTCAAGGATCAGCTCGACA
TCTTGGTCGCCGTGAGAACCGGGCTCAAGTACTTCCTCTCGGGTAAAATCCGTATCCCGA
TGAACGAGCTGGTGGAGATCTTTATGTTTCTGAGATGCAGGAACGTGAACTGCAAGAGCC
TGTTGCCTGTCGACGACTGCGAGTGCAAGATCTGTTCCAACAACAAAGGCTTTTGCAGCT
CGTGTATGTGTCCTGTTTGCTTGAGGTTTGATTCGGCGAGTAATACTTGTAGTTGGGTGG
GGTGTGATGTTTGCTCTCATTGGTGTCACGCTGCGTGTGGGATTCAGAGGAATCTTATTA
GGCCGGGACATAGCTTGAAGAGTCCTAGGGGGAATAAGACGGAGATGCTGTTCCATTGCG
TTGGGTGCGGTCATATGTCTGAGATGTTTGGGTTCGTTAAGATGTGTTTGTGTGTTGCGC
TAAGAATTGGGGACCTGAGACGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC06TF U 1
AF RR2E838TF U 189
BS 1 685 RR2FC06TF
BS 686 805 RR2E838TF

RD RR2FC06TF 685 0 0
GGGCCGTCAAACCGTCCTCCTCCTCCGACTACTCCTTCTTCCCCTCCGAGCTACCTGCTC
GCCCGGGGATGGAAACAGCTACAACGATCTCCGGCGATTCGAGAAAAAACTTAGAACAAA
ACGACGACGTTAGATCAGAGAGGGTCCTATACGACATCGTTTCGAAGTCTATTTCCTCCG
CAGCGTTGATTATTCAAGGGATGGCTGATGAAACACTCGAGTCAGCTAAAGAGTACTTAC
GGAACTTAATCGATTCTCCGGATAAGAAGGAGAAGCTGACGAGTCTTCAGAGCCAGATCG
ACAGAAGATCCGATCTCTGCAAAGAGACCTTATCCAAATGCGTCAAGGATCAGCTCGACA
TCTTGGTCGCCGTGAGAACCGGGCTCAAGTACTTCCTCTCGGGTAAAATCCGTATCCCGA
TGAACGAGCTGGTGGAGATCTTTATGTTTCTGAGATGCAGGAACGTGAACTGCAAGAGCC
TGTTGCCTGTCGACGACTGCGAGTGCAAGATCTGTTCCAACAACAAAGGCTTTTGCAGCT
CGTGTATGTGTCCTGTTTGCTTGAGGTTTGATTCGGCGAGTAATACTTGTAGTTGGGTGG
GGTGTGATGTTTGCTCTCATTGGTGTCACGCTGCGTGTGGGATTCAGAGGAATCTTATTA
GGCCGGGACATAGCTTGAAGAGTCC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2E838TF 617 0 0
GG
TATTCAAGGGATGGCTGATGAAACACTCGAGTCAGCTAAAGAGTACTTACGGAACTTAAT
CGATTCTCCGGATAAGAAGGAGAAGCTGACGAGTCTTCAGAGCCAGATCGACAGAAGATC
CGATCTCTGCAAAGAGACCTTATCCAAATGCGTCAAGGATCAGCTCGACATCTTGGTCGC
CGTGAGAACCGGGCTCAAGTACTTCCTCTCGGGTAAAATCCGTATCCCGATGAACGAGCT
GGTGGAGATCTTTATGTTTCTGAGATGCAGGAACGTGAACTGCAAGAGCCTGTTGTCTGT
CGACGACTGCGAGTGCAAGATCTGTTCCAACAACAAAGGCTTTTGCAGCTCGTGTATGTG
TCCTGTTTGCTTGAGGTTTGATTCGGCGAGTAATACTTGTAGTTGGGTGGGGTGTGATGT
TTGCTCTCATTGGTGT*ACGCTGCGTGTGGGATTCAGAGGAATCTTATTAGGCCGGGACA
TAGCTTGAAGAGTCCTAGGGGGAATAAGACGGAGATGCTGTTCCATTGCGTTGGGTGCGG
TCATATGTCTGAGATGTTTGGGTTCGTTAAGATGTGTTTGTGTGTTGCGCTAAGAATTGG
GGACCTGAGACGTTG

QA 3 617 3 617
DS 



AS 1 2

CO CL4740Contig1 487 2 1 U
GGAATTTGATTACGAATTTAGGGATCTGTAGTTTTGGGGGGGACGGCGAGAAATGGCCGG
GAAGAGTGGTGACAAGGTTTGGCTATAGGAGTGTTGAACCTTGCAATCGTTATTCCCCAG
ATGATAGTCTCGCTTGGAGCGGGTCCATGGGATGCATTGTTTGGAGGAGGAAACTTACCT
GCGTTTGTTTTGGCGTCTGTTGCTGCTTTTGCTGCAGGAGTTATTGCTTTGCGTAGCCTT
CCTACACTATCTAGTTCTTTCCAGTCTACTGGTTTCCACATCGGGTGAAATATTTTAAAC
CGGAACTCCAATACAAAACCGAGCCACACAGTCTTTTTTCATAAGGTATAGACTTAAGAT
TCAAATTCTTTTTGGCCATGTTCTCGTCTCTCTATATATATGCATGTAGATTTCGTACAT
TTAGTTTTGTTGTAATGTAAAGACACAACAATGTGACGCTAAATTTCAAATACACCTCTT
TTATTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GW61JQ C 1
AF RR2GW61TF U 1
BS 1 487 RR2GW61TF

RD RR2GW61JQ 487 0 0
GGAATTTGATTACGAATTTAGGGATCTGTAGTTTTGGGGGGGACGGCGAGAAATGGCCGG
GAAGAGTGGTGACAAGGTTTGGCTATAGGAGTGTTGAACCTTGCAATCGTTATTCCCCAG
ATGATAGTCTCGCTTGGAGCGGGTCCATGGGATGCATTGTTTGGAGGAGGAAACTTACCT
GCGTTTGTTTTGGCGTCTGTTGCTGCTTTTGCTGCAGGAGTTATTGCTTTGCGTAGCCTT
CCTACACTATCTAGTTCTTTCCAGTCTACTGGTTTCCACATCGGGTGAAATATTTTAAAC
CGGAACTCCAATACAAAACCGAGCCACACAGTCTTTTTTCATAAGGTATAGACTTAAGAT
TCAAATTCTTTTTGGCCATGTTCTCGTCTCTCTATATATATGCATGTAGATTTCGTACAT
TTAGTTTTGTTGTAATGTAAAGACACAACAATGTGACGCTAAATTTCAAATACACCTCTT
TTATTTC

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR2GW61TF 487 0 0
GGAATTTGATTACGAATTTAGGGATCTGTAGTTTTGGGGGGGACGGCGAGAAATGGCCGG
GAAGAGTGGTGACAAGGTTTGGCTATAGGAGTGTTGAACCTTGCAATCGTTATTCCCCAG
ATGATAGTCTCGCTTGGAGCGGGTCCATGGGATGCATTGTTTGGAGGAGGAAACTTACCT
GCGTTTGTTTTGGCGTCTGTTGCTGCTTTTGCTGCAGGAGTTATTGCTTTGCGTAGCCTT
CCTACACTATCTAGTTCTTTCCAGTCTACTGGTTTCCACATCGGGTGAAATATTTTAAAC
CGGAACTCCAATACAAAACCGAGCCACACAGTCTTTTTTCATAAGGTATAGACTTAAGAT
TCAAATTCTTTTTGGCCATGTTCTCGTCTCTCTATATATATGCATGTAGATTTCGTACAT
TTAGTTTTGTTGTAATGTAAAGACACAACAATGTGACGCTAAATTTCAAATACACCTCTT
TTATTTC

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL4741Contig1 1296 2 2 U
GAACGTTCACATGGTACAGACGAAGGAAACAGAGGATAGGAAGCAGCCTCGATGCTGCTA
TGGACGGTAGGATAAGCACAGAGTACAACTTCAAAGAAGCTTCTAGAAGAAAAAGCTCTT
CTCCGTTGATCAGCTTAGAGTACGCCAACGGTTGGGATCCGTTAGGGAGAGGACAGAGCA
GTAGTAACAACAGTAGTGCCTTGTCCCAAGAAGTCTTTGAGAGCTTTATGTTCAATCTCG
AGGAGATCGAGAGAGCTACTCAGAGCTTCTCCGAGGTTAACTTGTTGGGGAAAAGTAACG
TCTCTTCGGTTTACAAAGGTATCCTTAGAGATGGCTCTGTTGCAGCAATCAAATGTATCG
CGAAATCGAGCTGTAAGTCTGACGAATCGGAGTTTCTCAGAGGTTTGAAGATGCTGACGT
TGCTGAAGCATGAGAACTTAGTGAGGCTGAGAGGGTTTTGTTGCTCTAAAGGGAGAGGAG
AGTGTTTCCTTATCTACGAGTTTGTCCCTAATGGTAATCTTTCACAGTATCTGGACGTGA
AGGATGAGAGTGAAGAGGTTCTTGAATGGACTACTCGAGTCTCCATCATAAATGGAATCG
CCAAAGGTATTGTTTACTTGCATGGAGAAAATGTGAAGAAGCCATCAATAGTTCATCAGA
ATCTATCGGCAGAGAAGATTCTAGTTGATCATTGGTACAATCCTTACCTTGGGGATTCTG
GTCTTCACAAGCTTTTCACAGATGATATCGTTTTCTCGAAGCTCAAAGCAAGCGCTGCAA
TGGGATACTTAGCTCCTGAGTACATAACTACGGGAAGGTTCACTGACAAGAGCGACGTCT
ACGCCTTTGGTATGATTCTGTTGCAGATACTCAGTGGTAAAAGCAAAATCAGCCATCTGA
TGATCTCACAAGCTGTAGAGTCTGGACGACTGAATGAAGACTTCATTGATCCGAACCTTC
GGATGAGCTTTCCGGAGGCAGAAGCGGGACAGCTCGCTAGACTTGGTCTTCTATGCACTC
ATGAATCCTCGAACCAGAGACCATCCATGGAAGATGTTATGCAAGAACTGAATAAACTTG
CCGCGAGTTATTAGCTTCAAAGTTAACAAGATTTTTGCTTAGTCTCACCAAGAGTTTCAG
ACTATTAACCACTCCCTGATCTTAGCTCTTATTAGGTTCCTCATGATGTAACATCTTTTC
TCTCCTTGCAACTGTAGCTGATGTATGTAGGCTGTAAAAACAAGAGCTTTTAAGATATTT
TGAATCATCTTGTGAGAATCAGCTTTTAAGACAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC10TF U 1
AF RR2AC10JQ C 512
BS 1 779 RR2AC10TF
BS 780 1296 RR2AC10JQ

RD RR2AC10TF 779 0 0
GAACGTTCACATGGTACAGACGAAGGAAACAGAGGATAGGAAGCAGCCTCGATGCTGCTA
TGGACGGTAGGATAAGCACAGAGTACAACTTCAAAGAAGCTTCTAGAAGAAAAAGCTCTT
CTCCGTTGATCAGCTTAGAGTACGCCAACGGTTGGGATCCGTTAGGGAGAGGACAGAGCA
GTAGTAACAACAGTAGTGCCTTGTCCCAAGAAGTCTTTGAGAGCTTTATGTTCAATCTCG
AGGAGATCGAGAGAGCTACTCAGAGCTTCTCCGAGGTTAACTTGTTGGGGAAAAGTAACG
TCTCTTCGGTTTACAAAGGTATCCTTAGAGATGGCTCTGTTGCAGCAATCAAATGTATCG
CGAAATCGAGCTGTAAGTCTGACGAATCGGAGTTTCTCAGAGGTTTGAAGATGCTGACGT
TGCTGAAGCATGAGAACTTAGTGAGGCTGAGAGGGTTTTGTTGCTCTAAAGGGAGAGGAG
AGTGTTTCCTTATCTACGAGTTTGTCCCTAATGGTAATCTTTCACAGTATCTGGACGTGA
AGGATGAGAGTGAAGAGGTTCTTGAATGGACTACTCGAGTCTCCATCATAAATGGAATCG
CCAAAGGTATTGTTTACTTGCATGGAGAAAATGTGAAGAAGCCATCAATAGTTCATCAGA
ATCTATCGGCAGAGAAGATTCTAGTTGATCATTGGTACAATCCTTACCTTGGGGATTCTG
GTCTTCACAAGCTTTTCACAGATGATATCGTTTTCTCGAAGCTCAAAGCAAGCGCTGCA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2AC10JQ 785 0 0
TGGTAATCTTTCACAGTATCTGGACGTGAAGGATGAGAGTGAAGAGGTTCTTGAATGGAC
TACTCGAGTCTCCATCATAAATGGAATCGCCAAAGGTATTGTTTACTTGCATGGAGAAAA
TGTGAAGAAGCCATCAATAGTTCATCAGAATCTATCGGCAGAGAAGATTCTAGTTGATCA
TTGGTACAATCCTTACCTTGGGGATTCTGGTCTTCACAAGCTTTTCACAGATGATATCGT
TTTCTCGAAGCTCAAAGCAAGCGCTGCAATGGGATACTTAGCTCCTGAGTACATAACTAC
GGGAAGGTTCACTGACAAGAGCGACGTCTACGCCTTTGGTATGATTCTGTTGCAGATACT
CAGTGGTAAAAGCAAAATCAGCCATCTGATGATCTCACAAGCTGTAGAGTCTGGACGACT
GAATGAAGACTTCATTGATCCGAACCTTCGGATGAGCTTTCCGGAGGCAGAAGCGGGACA
GCTCGCTAGACTTGGTCTTCTATGCACTCATGAATCCTCGAACCAGAGACCATCCATGGA
AGATGTTATGCAAGAACTGAATAAACTTGCCGCGAGTTATTAGCTTCAAAGTTAACAAGA
TTTTTGCTTAGTCTCACCAAGAGTTTCAGACTATTAACCACTCCCTGATCTTAGCTCTTA
TTAGGTTCCTCATGATGTAACATCTTTTCTCTCCTTGCAACTGTAGCTGATGTATGTAGG
CTGTAAAAACAAGAGCTTTTAAGATATTTTGAATCATCTTGTGAGAATCAGCTTTTAAGA
CAACC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL4742Contig1 803 2 4 U
GGATTATCTACTTGGCTGCTCTCTCTCTCTCTTTCATAAACCCTAGATCTCTCCTCGATA
AGCAGCAACAATGGCAGACGCCGAAACTTTTGCTTTCCAAGCGGAGATCAACCAATTGCT
CTCCCTCATCATCAACACCTTCTACAGCAACAAGGAGATCTTCCTTCGTGAGCTCATCAG
TAACTCCTCCGATGCTTTGGACAAGATTAGGTTCGAGTCCTTGACTGACAAGAGCAAGCT
TGATGGACGGCCCGAGCTTTTCATTCACATCATTCCTGACAATACTAACAACACCTTGAC
CATCATTGATAGTGGTATCGGTATGACCAAGGCTGATTTGGTCAACAACCTTGGTACTAT
TGCAAGGTCTGGCACCAAGGAGTTCATGGAGGCTTTGGCTGCTGGTGCTGACGTTAGCAT
GATTGGGCAGTTTGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTTGCTGACAAGGTTATCGT
GACCCCCAAGCACAACGATGACGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCTGGTGGGTCTTT
CACTGTGACCAGAGACACCTCTGGGGAGAGTCTTGGTAGGGGTACTAAGATGGTCCTTCA
CCTTAAGGAGGATCAGTTGGAGTACCTTGAGGAGAGGAGGCTTAAGGATTTGGTCAAGAA
GCACTCTGAGTTCATCAGCTACCCTATCTCCCTGTGGATCGAGAAGACTATTTAGAAAGA
GATCTCTGATGACGAGGATGAGGAAGAGAAGAACGACGAGGAGGGAAAGGTTGAGGAAGT
AGATGAGGAGAAAGAAAAGGAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM92TF U 1
AF RR2AM92JQ C 1
BS 1 742 RR2AM92TF
BS 743 743 RR2AM92JQ
BS 744 758 RR2AM92TF
BS 759 803 RR2AM92JQ

RD RR2AM92TF 758 0 0
GGATTATCTACTTGGCTGCTCTCTCTCTCTCTTTCATAAACCCTAGATCTCTCCTCGATA
AGCAGCAACAATGGCAGACGCCGAAACTTTTGCTTTCCAAGCGGAGATCAACCAATTGCT
CTCCCTCATCATCAACACCTTCTACAGCAACAAGGAGATCTTCCTTCGTGAGCTCATCAG
TAACTCCTCCGATGCTTTGGACAAGATTAGGTTCGAGTCCTTGACTGACAAGAGCAAGCT
TGATGGACGGCCCGAGCTTTTCATTCACATCATTCCTGACAATACTAACAACACCTTGAC
CATCATTGATAGTGGTATCGGTATGACCAAGGCTGATTTGGTCAACAACCTTGGTACTAT
TGCAAGGTCTGGCACCAAGGAGTTCATGGAGGCTTTGGCTGCTGGTGCTGACGTTAGCAT
GATTGGGCAGTTTGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTTGCTGACAAGGTTATCGT
GACCCCCAAGCACAACGATGACGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCTGGTGGGTCTTT
CACTGTGACCAGAGACACCTCTGGGGAGAGTCTTGGTAGGGGTACTAAGATGGTCCTTCA
CCTTAAGGAGGATCAGTTGGAGTACCTTGAGGAGAGGAGGCTTAAGGATTTGGTCAAGAA
GCACTCTGAGTTCATCAGCTACCCTATCTCCCTGTGGATCGAGAAGACTATTTAGAAAGA
GATCTCTGATGACGAGGATGAG*AAGAGAAGAACGACG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2AM92JQ 803 0 0
GGATTATCTACTTGGCTGCTCTCTCTCTCTCTTTCATAAACCCTAGATCTCTCCTCGATA
AGCAGCAACAATGGCAGACGCCGAAACTTTTGCTTTCCAAGCGGAGATCAACCAATTGCT
CTCCCTCATCATCAACACCTTCTACAGCAACAAGGAGATCTTCCTTCGTGAGCTCATCAG
TAACTCCTCCGATGCTTTGGACAAGATTAGGTTCGAGTCCTTGACTGACAAGAGCAAGCT
TGATGGACGGCCCGAGCTTTTCATTCACATCATTCCTGACAATACTAACAACACCTTGAC
CATCATTGATAGTGGTATCGGTATGACCAAGGCTGATTTGGTCAACAACCTTGGTACTAT
TGCAAGGTCTGGCACCAAGGAGTTCATGGAGGCTTTGGCTGCTGGTGCTGACGTTAGCAT
GATTGGGCAGTTTGGTGTTGGTTTTTACTCTGCTTACTTGGTTGCTGACAAGGTTATCGT
GACCCCCAAGCACAACGATGACGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCTGGTGGGTCTTT
CACTGTGACCAGAGACACCTCTGGGGAGAGTCTTGGTAGGGGTACTAAGATGGTCCTTCA
CCTTAAGGAGGATCAGTTGGAGTACCTTGAGGAGAGGAGGCTTAAGGATTTGGTCAAGAA
GCACTCTGAGTTCATCAGCTACCCTATCTCCCTGTGGATCGAGAAGACTATTTAGAAGGA
GATCTCTGATGACGAGGATGAGGAAGAGAAGAAGGACGAGGAGGGAAAGGTTGAGGAAGT
AGATGAGGAGAAAGAAAAGGAGG

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL4743Contig1 499 2 1 U
GGAACACACAGCAATCACAAAAAAAAAGAGAGAGAAATAATTCAGAAAAATTCAGAAGAA
AAATGTCGGGTCGTGGAAAGGGAGGCAAGGGTTTGGGGAAAGGAGGAGCGAAGCGACACA
GGAAGGTCCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAGCCTGCGATACGCCGTCTTGCTC
GTAGAGGAGGCGTGAAGCGTATCAGCGGTCTGATATACGAGGAGACACGTGGAGTGCTCA
AGATCTTTTTGGAGAACGTCATCCGCGACGCCGTCACATACACCGAGCACGCGCGTAGGA
AGACGGTCACCGCTATGGATGTGGTGTATGCTCTCAAGAGGCAAGGCAGGACTCTCTATG
GATTCGGCGGCTAGGGTTTTACAATTTGTTTTTTCTTTTTTTTTTTTGGTTTTTAATCGA
CTCAGATGTGATTTTTGTTTTAGTAAGTTTCAGTTTGCTTTTTTTGTATCATCGAGAAAT
ATATGAAATTCAATATTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FY76JQ C 1
AF RR2FY76TF U 1
BS 1 499 RR2FY76TF

RD RR2FY76JQ 499 0 0
GGAACACACAGCAATCACAAAAAAAAAGAGAGAGAAATAATTCAGAAAAATTCAGAAGAA
AAATGTCGGGTCGTGGAAAGGGAGGCAAGGGTTTGGGGAAAGGAGGAGCGAAGCGACACA
GGAAGGTCCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAGCCTGCGATACGCCGTCTTGTTC
GTAGAGGAGGCGTGAAGCGTATCAGCGGTTTGATATACGAGGAGACACGTGGAGTGCTCA
AGATCTTTTTGGAGAACGTCATCCGGGACGCCGTCACATACACCGAGCACGCGCGTAGGA
AGACGGTCACCGCTATGGATGTGGTGTATGCTCTCAAGAGGCAAGGCAGGACTCTCTATG
GATTCGGCGGCTAGGGTTTTACAATTTGTTTTTTCTTTTTTTTTTTTGGTTTTTAATCGA
CTCAGATGTGATTTTTGTTTTAGTAAGTTTCAGTTTGCTTTTTTTGTATCATCGAGAAAT
ATATGAAATTCAATATTTG

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR2FY76TF 499 0 0
GGAACACACAGCAATCACAAAAAAAAAGAGAGAGAAATAATTCAGAAAAATTCAGAAGAA
AAATGTCGGGTCGTGGAAAGGGAGGCAAGGGTTTGGGGAAAGGAGGAGCGAAGCGACACA
GGAAGGTCCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAGCCTGCGATACGCCGTCTTGCTC
GTAGAGGAGGCGTGAAGCGTATCAGCGGTCTGATATACGAGGAGACACGTGGAGTGCTCA
AGATCTTTTTGGAGAACGTCATCCGCGACGCCGTCACATACACCGAGCACGCGCGTAGGA
AGACGGTCACCGCTATGGATGTGGTGTATGCTCTCAAGAGGCAAGGCAGGACTCTCTATG
GATTCGGCGGCTAGGGTTTTACAATTTGTTTTTTCTTTTTTTTTTTTGGTTTTTAATCGA
CTCAGATGTGATTTTTGTTTTAGTAAGTTTCAGTTTGCTTTTTTTGTATCATCGAGAAAT
ATATGAAATTCAATATTTG

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

CO CL4744Contig1 607 2 2 U
GCTCGCAGCCATATATAAAATCACATTAGCCATGATGACACTAGGACAAGATCTTACAGT
TAGACCATAAATAACCAATAGAAAAGGGTGTAACATTCCCCATGAAATTCTGGTTTTTTT
CAACAGTGCAAATGAAAAAAAGGAGATAAGAATGTCTTAATCCGAACCAGTGTTCTAAAC
AGCATTTATGATCCGGGGAAGACCACATAAATAGACATGCGTGTTCAGGAATAAATTAAA
CTTTCAAAGAAAGCTTCTGAGCAGCAAGTGCTTCAGCCTCAAGGGTTGGCTCCCAGAGAA
GTGTGGTCTCTGCCAACAGTGAAGTCACAATGTATGGGTCCATGTTAGACGCTGGACGCC
GATCTTCCAAGTAACCTTTTCCTTTCTTCTCGGTATCACGTCCAACACGAATTGAGCATC
CACGGTTAGCCACGCCCTGCCAAGTCAATGTTTAATGCAAATGAGCGTATGAAACGTGAA
GATATCTTGAAGGCTCTTATTGCATATTTATACCCATGAGAATTGGTCGATACTGGCTGT
CTCGTGCTTTCCGGTCAACCTTCTCTCATTGCCTTCACCGTAGGCACTGATGTGCTCCAT
GTGACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AB46TF C 1
AF RR2AB46JQ U 121
BS 1 120 RR2AB46TF
BS 121 607 RR2AB46JQ

RD RR2AB46TF 607 0 0
GCTCGCAGCCATATATAAAATCACATTAGCCATGATGACACTAGGACAAGATCTTACAGT
TAGACCATAAATAACCAATAGAAAAGGGTGTAACATTCCCCATGAAATTCTGGTTTTTTT
CAACAGTGCAAATGAAAAAAAGGAGATAAGAATGTCTTAATCCGAACCAGTGTTCTAAAC
AGCATTTATGATCCGGGGAAGACCACATAAATAGACATGCGTGTTCAGGAATAAATTAAA
CTTTCAAAGAAAGCTTCTGAGCAGCAAGTGCTTCAGCCTCAAGGGTTGGCTCCCAGAGAA
GTGTGGTCTCTGCCAACAGTGAAGTCACAATGTATGGGTCCATGTTAGACGCTGGACGCC
GATCTTCCAAGTAACCTTTTCCTTTCTTCTCGGTATCACGTCCAACACGAATTGAGCATC
CACGGTTAGCCACGCCCTGCCAAGTCAATGTTTAATGCAAATGAGCGTATGAAACGTGAA
GATATCTTGAAGGCTCTTATTGCATATTTATACCCATGAGAATTGGTCGATACTGGCTGT
CTCGTGCTTTCCGGTCAACCTTCTCTCATTGCCTTCACCGTAGGCACTGATGTGCTCCAT
GTGACGC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2AB46JQ 487 0 0
CAACAGTGCAAATGAAAAAAAGGAGATAAGAATGTCTTAATCCGAACCAGTGTTCTAAAC
AGCATTTATGATCCGGGGAAGACCACATAAATAGACATGCGTGTTCAGGAATAAATTAAA
CTTTCAAAGAAAGCTTCTGAGCAGCAAGTGCTTCAGCCTCAAGGGTTGGCTCCCAGAGAA
GTGTGGTCTCTGCCAACAGTGAAGTCACAATGTATGGGTCCATGTTAGACGCTGGACGCC
GATCTTCCAAGTAACCTTTTCCTTTCTTCTCGGTATCACGTCCAACACGAATTGAGCATC
CACGGTTAGCCACGCCCTGCCAAGTCAATGTTTAATGCAAATGAGCGTATGAAACGTGAA
GATATCTTGAAGGCTCTTATTGCATATTTATACCCATGAGAATTGGTCGATACTGGCTGT
CTCGTGCTTTCCGGTCAACCTTCTCTCATTGCCTTCACCGTAGGCACTGATGTGCTCCAT
GTGACGC

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL4745Contig1 815 2 1 U
GGTAACAAACTATGTTTTAATGTTTAATGCAAACAGAATAATTCATTACTCAAACACACA
CAAACCATATAATGTTTTACCCCCACAAAAAAAACTTGCTTTTAAACAACAAAAGCTTAT
TAGTAGTCTCCACTAAACCAAAAATCAAGCCAACATTAACAGACAGAGACAGATACACAA
ACAGAGACTAACCCCTTGCTCTGCCTGTACTTCTGTCAGACACAGACTCATTCATATAGG
ACGGGAGTTTTTTTTTATTATTATTCCAGGGATATAAGAAAGAGTTCCGGTAGCCAGATG
AGTATGGAAGTAGTAGGATAGGGATGGAGACAGAACCTTCAAAAGCCTCTTCTTGTGCTG
TAACGGTGGCATATATTACCTTCTTGAGAAAAGGTGATAAGAGGCAAGCTTTGAAAAAGA
TGGAAACTGACTTTTGTTAACATTAGTCCCTTGTCTTGGCTCTCTTCATGCCGAGGCTAT
TGTAAGGAGAGACGGAACCAGACATTGGAGATCCTTCTTCTCGAAAACTACCGTTGAGTA
GGGCCAGTTCCCTGAGCTGTTGTTTCTTGTAGAAGTCATGTGTTTCCTCCACAGGAGTAA
GTAGATCGTCTAGGATTTCACGAGCTTGCATAAGACGTGCATCGACTAACTCAATGGGTA
ACTCTGCTTCGATTAAGATGTGGAGTTGTTCGTTCAGGTGCTCATAACCAGGCTTCCCTC
TCATCATTTCCTCCTTAACCGGGTCTTTAATGCTGCCTCTCCCCCTAATAAGAACACGGC
AATCAGTACTAGCTTCAACTCGTTTGAGAGAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP47JQ U 14
AF RR2AE25JQ U 1
BS 1 815 RR2AE25JQ

RD RR2GP47JQ 506 0 0
GC
TTTAATGTTTAATGCAAACAGAATAATTCATTACTCAAACACACACAAACCATATAATGT
TTTACCCCCACAAAAAAA*CTTGCTTTTAAACAACAAAAGCTTATTAGTAGTCTCCACTA
AACCAAAAATCAAGCCAACATTAACAGACAGAGACAGATACACAAACAGAGACTAACCCC
TTGCTCTGCCTGTACTTCTGTCAGACACAGACTCATTCATATAGGACGGGAGTTTTTTTT
*ATTATTATTCCAGGGATATAAGAGAGAGTTCCGGTAGCCAGATGAGTATGGAAGTAGTA
GGATAGGGATGGAGACAGAACCTTCAAAAGCCTCTTCTTGTGCTGTAACGGTGGCATATA
TTACCTTCTTGAGAAAAGGTGATAAGAGGCAAGCTTTGAAAAAGATGGAAACTGGCTTTT
GTTAACATTAGTCCCTTGTCTTGGCTCTCTTCATGCCGAGGCTATTGTAAGGAGAGACGG
AACCAGACATTGGAGATCCTTCTT

QA 3 506 3 506
DS 

RD RR2AE25JQ 815 0 0
GGTAACAAACTATGTTTTAATGTTTAATGCAAACAGAATAATTCATTACTCAAACACACA
CAAACCATATAATGTTTTACCCCCACAAAAAAAACTTGCTTTTAAACAACAAAAGCTTAT
TAGTAGTCTCCACTAAACCAAAAATCAAGCCAACATTAACAGACAGAGACAGATACACAA
ACAGAGACTAACCCCTTGCTCTGCCTGTACTTCTGTCAGACACAGACTCATTCATATAGG
ACGGGAGTTTTTTTTTATTATTATTCCAGGGATATAAGAAAGAGTTCCGGTAGCCAGATG
AGTATGGAAGTAGTAGGATAGGGATGGAGACAGAACCTTCAAAAGCCTCTTCTTGTGCTG
TAACGGTGGCATATATTACCTTCTTGAGAAAAGGTGATAAGAGGCAAGCTTTGAAAAAGA
TGGAAACTGACTTTTGTTAACATTAGTCCCTTGTCTTGGCTCTCTTCATGCCGAGGCTAT
TGTAAGGAGAGACGGAACCAGACATTGGAGATCCTTCTTCTCGAAAACTACCGTTGAGTA
GGGCCAGTTCCCTGAGCTGTTGTTTCTTGTAGAAGTCATGTGTTTCCTCCACAGGAGTAA
GTAGATCGTCTAGGATTTCACGAGCTTGCATAAGACGTGCATCGACTAACTCAATGGGTA
ACTCTGCTTCGATTAAGATGTGGAGTTGTTCGTTCAGGTGCTCATAACCAGGCTTCCCTC
TCATCATTTCCTCCTTAACCGGGTCTTTAATGCTGCCTCTCCCCCTAATAAGAACACGGC
AATCAGTACTAGCTTCAACTCGTTTGAGAGAGTTT

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL4746Contig1 662 2 6 U
TTTTTTTTTCTGGCTAAGAATATGCTGAGGCTATTACTTATTTTTTCTAACTATAACAAA
AATTCAGAGCTTGTTTGGTAAATTTGTGATTCTTCCTTCTCCTTCTTTGTGTCTTTTCGT
CTTTGTCTCTGCTCTTCTTGGTGAGATGTTTGTCTTCGGTGGAAATGCTTGTCGTTCTAT
ATTGTTGAGATCGTCGTCACCGGAGCGTCGTTGTCCTCGTAATTGTATAGGGTCTGCTTG
GAAGAATCAGTTTGCAGCAAAGGTCTAATTTTGCGCCAACTATGGGAGCAATGACAATCG
AGCTAGGTCTGCTCTGGATTAGGTTCAACGGCGGCGGTTAATCTCGAGGACATGCTGCAG
TTTTTCAGGATGTTCTTTGCGGTAGACGATTGTATGGTAAAATTGATGTTGCTTGTCTTT
GAAGGGATTTGCGTAAGTGAGATGAATTGTTAACCGAAGTCACACAATTCGTAGAGGCTA
TTGTGGCAGACATTTACCCAAGCAAACAATTAAACGTGTATTAGAGTTGACTACGTGTTG
TTCGTGTGTGCTGGTGGAGGTGTACACATGTACTATGAAGTTTTTGAACATATGTACATT
TGTAAAAGATACGTCCATGTGGACAGTAACACATGTATACACTATTTCATTATCACCAAA
AC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2DR42TF U 1
AF RR2DR42JQ C 7
BS 1 263 RR2DR42TF
BS 264 264 RR2DR42JQ
BS 265 307 RR2DR42TF
BS 308 308 RR2DR42JQ
BS 309 317 RR2DR42TF
BS 318 662 RR2DR42JQ

RD RR2DR42TF 317 0 0
TTTTTTTTTCTGGCTAAGAATATGCTGAGGCTATTACTTATTTTTTCTAACTATAACAAA
AATTCAGAGCTTGTTTGGTAAATTTGTGATTCTTCCTTCTCCTTCTTTGTGTCTTTTCGT
CTTTGTCTCTGCTCTTCTTGGTGAGATGTTTGTCTTCGGTGGAAATGCTTGTCGTTCTAT
ATTGTTGAGATCGTCGTCACCGGAGCGTCGTTGTCCTCGTAATTGTATAGGGTCTGCTTG
GAAGAATCAGTTTGCAGCAAAGG*CTAATTTTGCGCCAACTATGGGAGCAATGACAATCG
AGCTAGG*CTGCTCTGG

QA 1 317 1 317
DS 

RD RR2DR42JQ 656 0 0
TTTCTGGCTAAGAATATGCTGAGGCTATTACTTATTTTTTCTAACTATAACAAAAATTCA
GAGCTTGTTTGGTAAATTTGTGATTCTTCCTTCTCCTTCTTTGTGTCTTTTCGTCTTTGT
CTCTGCTCTTCTTGGTGAGATGTTTGTCTTCGGTGGAAATGCTTGTCGTTCTATATTGTT
GAGATCGTCGTCACCGGAGCGTCGTTGTCCTCGTAATTGTATAGGGTCTGCTTGGAAGAA
TCAGTTTGCAGCAAAGGTCTAATTTTGCGCCAACTATGGGAGCAATGACAATCGAGCTAG
GTCTGCTCTGGATTAGGTTCAACGGCGGCGGTTAATCTCGAGGACATGCTGCAGTTTTTC
AGGATGTTCTTTGCGGTAGACGATTGTATGGTAAAATTGATGTTGCTTGTCTTTGAAGGG
ATTTGCGTAAGTGAGATGAATTGTTAACCGAAGTCACACAATTCGTAGAGGCTATTGTGG
CAGACATTTACCCAAGCAAACAATTAAACGTGTATTAGAGTTGACTACGTGTTGTTCGTG
TGTGCTGGTGGAGGTGTACACATGTACTATGAAGTTTTTGAACATATGTACATTTGTAAA
AGATACGTCCATGTGGACAGTAACACATGTATACACTATTTCATTATCACCAAAAC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL4747Contig1 487 2 1 U
GGACACTTAACACACATCTCCCCCCCCTCAATCTCTCACCATGAAAGACATCTCTAGATC
TCCCTCAACAAAAAACGACGGATTCCACCGCTACTTAAAGCCAGGCGCGCTCGCTCAGAT
CCGAAACTCTCGAATCAACTTTAGATCCACCTCTCTCCTATCTATCTCCCTGCCATCGCC
TCCGGTTGATTCGCCGTCCCCTTCCGCTGCAGCGAACAATCTGACGGTGGATCAGGTGCC
GCATCTCCTGAGGAAGATCTACGGTGGTCCGTACAGTTACCAGAGGAAGAAACTAGGCGC
TGCTAGATCATCATCGATGATGATGATTATGGTCAATTTGAACAATCCTATTATTGAATC
GGGCGGCGGTAACAGCAGTGATGTAATTGCTCATTGAATTTTATTTAAACTACTTTGTAT
AATTTCTATTTGTGTTAAGCTGTTTATGATGATACAATTGTGTGGGGAATAATACTTTTA
TTTATAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EL19JQ C 1
AF RR2EL19TF U 1
BS 1 487 RR2EL19TF

RD RR2EL19JQ 487 0 0
GGACACTTAACACACATCTCCCCCCCCTCAATCTCTCACCATGAAAGACATCTCTAGATC
TCCCTCAACAAAAAACGACGGATTCCACCGCTACTTAAAGCCAGGCGCGCTCGCTCAGAT
CCGAAACTCTCGAATCAACTTTAGATCCACCTCTCTCCTATCTATCTCCCTGCCATCGCC
TCCGGTTGATTCGCCGTCCCCTTCCGCTGCAGCGAACAATCTGACGGTGGATCAGGTGCC
GCATCTCCTGAGGAAGATCTACGGTGGTCCGTACAGTTACCAGAGGAAGAAACTAGGCGC
TGCTAGATCATCATCGATGATGATGATTATGGTCAATTTGAACAATCCTATTATTGAATC
GGGCGGCGGTAACAGCAGTGATGTAATTGCTCATTGAATTTTATTTAAACTACTTTGTAT
AATTTCTATTTGTGTTAAGCTGTTTATGATGATACAATTGTGTGGGGAATAATACTTTTA
TTTATAT

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR2EL19TF 487 0 0
GGACACTTAACACACATCTCCCCCCCCTCAATCTCTCACCATGAAAGACATCTCTAGATC
TCCCTCAACAAAAAACGACGGATTCCACCGCTACTTAAAGCCAGGCGCGCTCGCTCAGAT
CCGAAACTCTCGAATCAACTTTAGATCCACCTCTCTCCTATCTATCTCCCTGCCATCGCC
TCCGGTTGATTCGCCGTCCCCTTCCGCTGCAGCGAACAATCTGACGGTGGATCAGGTGCC
GCATCTCCTGAGGAAGATCTACGGTGGTCCGTACAGTTACCAGAGGAAGAAACTAGGCGC
TGCTAGATCATCATCGATGATGATGATTATGGTCAATTTGAACAATCCTATTATTGAATC
GGGCGGCGGTAACAGCAGTGATGTAATTGCTCATTGAATTTTATTTAAACTACTTTGTAT
AATTTCTATTTGTGTTAAGCTGTTTATGATGATACAATTGTGTGGGGAATAATACTTTTA
TTTATAT

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL4748Contig1 464 2 1 U
GGGGTTGACATATAGTGCGACTTGTCAGATATATTGGGCTATATGGGATTTCCCCATTTT
CTCCCTCGATCGAGATATCCTCTGTTTCGCTCAAAAAGATTGATTGAATTATCAAAAATT
TGTAACGCGAAGCGCAAAAAATAAATTAGAATTAAATGCAGGGAGTATTTAGATTGATAT
TAGATTATCAAAAATTTTTTATGGTTTACGTGATCGGACTAATAAAATTAAGTATCCAGG
CTCCGTTTAGCAAAAATCCAATTGATAATTAATATATAATATTTTTATAATTACTACTTA
ATATGGTATGAATATGATATCAAAATTATGATAAAAATTCTATTAAAAAATATAAAAAAT
ACAAAAAATTGAAACAGGGTGATCTAAAACTGTTGATCAAATCAAATAATATAATTAAAA
ATTTGTTGACTATTTGACAGAAGACATGTGAAAGAAATTAATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GB54JQ C 1
AF RR2GB54TF U 1
BS 1 464 RR2GB54TF

RD RR2GB54JQ 464 0 0
GGGGTTGACATATAGTGCGACTTGTCAGATATATTGGGCTATATGGGATTTCCCCATTTT
CTCCCTCGATCGAGATATCCTCTGTTTCGCTCAAAAAGATTGATTGAATTATCAAAAATT
TGTAACGCGAAGCGCAAAAAATAAATTAGAATTAAATGCAGGGAGTATTTAGATTGATAT
TAGATTATCAAAAATTTTTTATGGTTTACGTGATCGGACTAATAAAATTAAGTATCCAGG
CTCCGTTTAGCAAAAATCCAATTGATAATTAATATATAATATTTTTATAATTACTACTTA
ATATGGTATGAATATGATATCAAAATTATGATAAAAATTCTATTAAAAAATATAAAAAAT
ACAAAAAATTGAAACAGGGTGATCTAAAACTGTTGATCAAATCAAATAATATAATTAAAA
ATTTGTTGACTATTTGACAGAAGACATGTGAAAGAAATTAATTG

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2GB54TF 464 0 0
GGGGTTGACATATAGTGCGACTTGTCAGATATATTGGGCTATATGGGATTTCCCCATTTT
CTCCCTCGATCGAGATATCCTCTGTTTCGCTCAAAAAGATTGATTGAATTATCAAAAATT
TGTAACGCGAAGCGCAAAAAATAAATTAGAATTAAATGCAGGGAGTATTTAGATTGATAT
TAGATTATCAAAAATTTTTTATGGTTTACGTGATCGGACTAATAAAATTAAGTATCCAGG
CTCCGTTTAGCAAAAATCCAATTGATAATTAATATATAATATTTTTATAATTACTACTTA
ATATGGTATGAATATGATATCAAAATTATGATAAAAATTCTATTAAAAAATATAAAAAAT
ACAAAAAATTGAAACAGGGTGATCTAAAACTGTTGATCAAATCAAATAATATAATTAAAA
ATTTGTTGACTATTTGACAGAAGACATGTGAAAGAAATTAATTG

QA 1 464 1 464
DS 



AS 1 2

CO CL4749Contig1 726 2 9 U
CAATTCAATGGAGATTATTAAGACTAAAGAAGAAACTACCCAAGCACAAACTTCGAGTCT
TTGATTCCTATCAGTAGTTCTTGGAGAAAGAAAAAAAAACCGTAAAGCATGATGATAATA
ACGTTTCAAAAAACAAAAAACAAAGCAGCCAAGGCAACAACAACACATTCTATAAAGGTC
TTCTTCTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTCTTGTAATGTTTAGTCCCATTGTTGTTCCCAGAA
GTAGGTCCACTCTGAAGAGTTGACCGTGTTTTTGCCATCAGCTGAAACAAGATCATAACG
TGAGTCCTCAGAAAATTCAGTTGGCATCGATTTCCAGTGAAGCGACGGTGTCCATTCCGC
TTCTTTCACCACTCTCAGTATCTCTGCAGCCACCAGTTTGCTTCCTTGCGCTGACAAATG
AATCCCATCTGTGAAGCAAACGGTTTCACAGTCATCTGATTTCTGAAGAGTGGAGAAGAG
ATCAACTACTTGTAAACCTAGCTCTTGGCACAGCTCCACGCAAGCGTCTGAATAAGTCTT
GCAGAGCTCGTTTGTGCGGATCACCTCGCTCAAGTATGGGCTTTGGTTCTGACGAAGTTT
GCCTTCGTCCACTGGAGGGCAGCTTAGAAATATGATACGAGTCGAGTCCGAAAGGCTCTG
AAGATGAAGAGCGATGTTCTTCATGTTGTCAACGTATTCGCTAAGTGGAACGTGAGGTCC
TAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2G630JQ U 18
AF RR2AW88JQ U 1
BS 1 128 RR2AW88JQ
BS 129 129 RR2G630JQ
BS 130 135 RR2AW88JQ
BS 136 136 RR2G630JQ
BS 137 206 RR2AW88JQ
BS 207 207 RR2G630JQ
BS 208 312 RR2AW88JQ
BS 313 313 RR2G630JQ
BS 314 726 RR2AW88JQ

RD RR2G630JQ 462 0 0
TTAAGACTAAAGAAGAAACTACCCAAGCACAAACTTCGAGTCTTTGATTCCTATCAGTAG
TTCTTGGAGAAAGAAAAAAAAACCGTAAAGCATGATGATAATAACGTTTCAAAAAACAAA
AAACAAAGCAGCCAAGGCAACAACAACACATTCTATAAAGGTCTTCTTCTTGTTGTTGTT
GTTGTTGTTCTTGTAATGTTTAGTCCCATTGTTGTTCCCAGAAGTAGGTCCACTCTGAAG
AGTTGACCGTGTTTTTGCCATCAGCTGAAACAAGATCATAACGTGAGTCCTCAGAAAATT
CAGTTGGCATCGATTTCCAGTGAAGCGACGGTGTCCATTCCGCTTCTTTCACCACTCTCA
GTATCTCTGCAGCCACCAGTTTGCTTCCTTGCGCTGACAAATGAATCCCATCTGTGAAGC
AAACGGTTTCCCAGTCATCTGATTTCTGAAGAGTGGAGAAGA

QA 1 462 1 462
DS 

RD RR2AW88JQ 726 0 0
CAATTCAATGGAGATTATTAAGACTAAAGAAGAAACTACCCAAGCACAAACTTCGAGTCT
TTGATTCCTATCAGTAGTTCTTGGAGAAAGAAAAAAAAACCGTAAAGCATGATGATAATA
ACGTTTCAGAAAACAGAAAACAAAGCAGCCAAGGCAACAACAACACATTCTATAAAGGTC
TTCTTCTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTAATGTTTAGTCCCATTGTTGTTCCCAGAA
GTAGGTCCACTCTGAAGAGTTGACCGTGTTTTTGCCATCAGCTGAAACAAGATCATAACG
TGAGTCCTCAGAGAATTCAGTTGGCATCGATTTCCAGTGAAGCGACGGTGTCCATTCCGC
TTCTTTCACCACTCTCAGTATCTCTGCAGCCACCAGTTTGCTTCCTTGCGCTGACAAATG
AATCCCATCTGTGAAGCAAACGGTTTCACAGTCATCTGATTTCTGAAGAGTGGAGAAGAG
ATCAACTACTTGTAAACCTAGCTCTTGGCACAGCTCCACGCAAGCGTCTGAATAAGTCTT
GCAGAGCTCGTTTGTGCGGATCACCTCGCTCAAGTATGGGCTTTGGTTCTGACGAAGTTT
GCCTTCGTCCACTGGAGGGCAGCTTAGAAATATGATACGAGTCGAGTCCGAAAGGCTCTG
AAGATGAAGAGCGATGTTCTTCATGTTGTCAACGTATTCGCTAAGTGGAACGTGAGGTCC
TAGACC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL4750Contig1 529 2 1 U
GGTCTCCTCTTCTGCTTCGCTTGAAACAAAACAACGTTCGTCGTCTCCGCGATCTGAGAA
AATCGAAGGTGGAAAGATGGGTTATATCGGAGAAACCATAGATTCAATCAAATCTATACA
GATCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCATAAGCCTTGGGATGATTGTGACGTCAGCTTTGAT
CATATGGAAAGCTTTGATGTGTGTGACTGGAAGTGAATCTCCCGTGGTTGTTGTTCTCTC
CGGAAGCATGGAACCTGGTTTCAAGAGGGGAGATATATTGTTCTTGCCTTATGTTGGATG
GGTGACTATCATTATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATATTCTCATAGGTGCGTTGGG
TTTACTTGTTATAACGTCCAAGGATTGAAGTCTTTTGGAGATATGGGACTCTGCAAACCC
TCGTGTGTTGTGTTATTATCCTTCCTGTCTTGTTATATCAACTTGGTCATTTTGTGGTTT
AGACCACTTCTAAAACAGTATAATCAATCAGAAGCTAACTTTTTAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GR31TF U 1
AF RR2GR31JQ C 47
BS 1 529 RR2GR31TF

RD RR2GR31TF 529 0 0
GGTCTCCTCTTCTGCTTCGCTTGAAACAAAACAACGTTCGTCGTCTCCGCGATCTGAGAA
AATCGAAGGTGGAAAGATGGGTTATATCGGAGAAACCATAGATTCAATCAAATCTATACA
GATCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCATAAGCCTTGGGATGATTGTGACGTCAGCTTTGAT
CATATGGAAAGCTTTGATGTGTGTGACTGGAAGTGAATCTCCCGTGGTTGTTGTTCTCTC
CGGAAGCATGGAACCTGGTTTCAAGAGGGGAGATATATTGTTCTTGCCTTATGTTGGATG
GGTGACTATCATTATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATATTCTCATAGGTGCGTTGGG
TTTACTTGTTATAACGTCCAAGGATTGAAGTCTTTTGGAGATATGGGACTCTGCAAACCC
TCGTGTGTTGTGTTATTATCCTTCCTGTCTTGTTATATCAACTTGGTCATTTTGTGGTTT
AGACCACTTCTAAAACAGTATAATCAATCAGAAGCTAACTTTTTAATTT

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2GR31JQ 483 0 0
CCGCGATCTGAGAAAATCGAAGGTGGAAAGATGGGTTATATCGGAGAAACCATAGATTCA
ATCAAATCTATACAGATCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCATAAGCCTTGGGATGATTGTG
ACGTCAGCTTTGATCATATGGAAAGCTTTGATGTGTGTGACTGGAAGTGAATCTCCCGTG
GTTGTTGTTCTTTCCGGAAGCATGGAACCTGGTTTCAAGAGGGGAGATATATTGTTCTTG
CCTTATGTTGGATGGGTGACTATCATTATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATATTCTC
ATAGGTGCGTTGGGTTTACTTGTTATAACGTCCAAGGATTGAAGTCTTTTGGAGATATGG
GACTCTGCAAACCCTCGTGTGTTGTGTTATTATCCTTCCTGTCTTGTTATATCAACTTGG
TCATTTTGTGGTTTAGACCACTTCTAAAACAGTATAATCAATCAGAAGCTAACTTTTTAA
TTT

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL4751Contig1 929 2 4 U
GAGAGCTCTGGAAGCAAGATGGGGAACTCGGAGAGCTCAGGGATGAGGAGGCTGAGCGAT
GATGGAGAGATGGATGAGACTGGGATTGAGGTTTCAGGGCTGAACTATGAGTCTGATGAG
CTGAACGAGAGCGGTAAAGCTTCTGAGGGTGTTCAGAACGGTGGAGGAGGAGGAGGTAAA
GGGAAGAAGAAAGGAATGCCTGCTAAGAATCTGATGGCTGAGAGGAGAAGGAGGAAGAAG
CTTAATGATAGGCTCTACATGCTTAGATCAGTTGTCCCCAAGATCAGCAAAATGGATAGA
GCATCAATACTTGGAGATGCAATTGATTATCTAAAGGAGCTTTTACAGAGGATCAATGAT
CTTCACAACGAACTTGAGTCAACTCCAACTGGATCTTTGCCACCAACTTCATCAAGCTTC
CATCCGTTAACACCTACACCTCAGACTCTTTCTTGCCGTGTTAAGGAAGAGTTATGTCCC
TCTTCTTTGCCAAGCCCTAAAGGCCAGCAAGCAAGAGTTGAGGTTAGACTAAGGGAAGGA
AGAGCAGTGAACATTCACATGTTTTTGTGGTCGTAGACCTGGTCTTTTGCTAGCTACCAT
GAAGGCCTTGGATAATCTTGGACTAGATGTTCAGCAAGCAGTGATCAGCTGTTTCAACGG
GTTTTCCTTGGATGTTTTCCGTGCTGAGCAATGCCAAGAAGGACAGGAGATATTGCCTGA
TCAAATCAAAGCAGTGCTTTTCGATACAGCGGGGTACGCTGGTATGATATGAGCTGATCC
TGAGTCAAGGTCCTTAAGCATCTGATGAAGCAGGAGGCTAGAAGAACTAAAGCCTTCAAA
ATCTGCAATTTTCTTCTATGTTTTCTTTTTATTTACTAAACCTGTTTGAACTAAGCATGA
CTTCAAACCCTTTTTTTTTAGCAATGTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH89TF U 1
AF RR2GH89JQB C 205
BS 1 656 RR2GH89TF
BS 657 657 RR2GH89JQB
BS 658 690 RR2GH89TF
BS 691 929 RR2GH89JQB

RD RR2GH89TF 698 0 0
GAGAGCTCTGGAAGCAAGATGGGGAACTCGGAGAGCTCAGGGATGAGGAGGCTGAGCGAT
GATGGAGAGATGGATGAGACTGGGATTGAGGTTTCAGGGCTGAACTATGAGTCTGATGAG
CTGAACGAGAGCGGTAAAGCTTCTGAGGGTGTTCAGAACGGTGGAGGAGGAGGAGGTAAA
GGGAAGAAGAAAGGAATGCCTGCTAAGAATCTGATGGCTGAGAGGAGAAGGAGGAAGAAG
CTTAATGATAGGCTCTACATGCTTAGATCAGTTGTCCCCAAGATCAGCAAAATGGATAGA
GCATCAATACTTGGAGATGCAATTGATTATCTAAAGGAGCTTTTACAGAGGATCAATGAT
CTTCACAACGAACTTGAGTCAACTCCAACTGGATCTTTGCCACCAACTTCATCAAGCTTC
CATCCGTTAACACCTACACCTCAGACTCTTTCTTGCCGTGTTAAGGAAGAGTTATGTCCC
TCTTCTTTGCCAAGCCCTAAAGGCCAGCAAGCAAGAGTTGAGGTTAGACTAAGGGAAGGA
AGAGCAGTGAACATTCACATGTTTTTGTGGTCGTAGACCTGGTCTTTTGCTAGCTACCAT
GAAGGCCTTGGATAATCTTGGACTAGATGTTCAGCAAGCAGTGATCAGCTGTTTCACCGG
GTTTTCCTTGGATGTTTTCCGTGCTGAGCA
TGCCAGAA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2GH89JQB 725 0 0
AAGAATCTGATGGCTGAGAGGAGAAGGAGGAAGAAGCTTAATGATAGGCTCTACATGCTT
AGATCAGTTGTCCCCAAGATCAGCAAAATGGATAGAGCATCAATACTTGGAGATGCAATT
GATTATCTAAAGGAGCTTTTACAGAGGATCAATGATCTTCACAACGAACTTGAGTCAACT
CCAACTGGATCTTTGCCACCAACTTCATCAAGCTTCCATCCGTTAACACCTACACCTCAG
ACTCTTTCTTGCCGTGTTAAGGAAGAGTTATGTCCCTCTTCTTTGCCAAGCCCTAAAGGC
CAGCAAGCAAGAGTTGAGGTTAGACTAAGGGAAGGAAGAGCAGTGAACATTCACATGTTT
T*GTGGTCGTAGACCTGGTCTTTTGCTAGCTACCATGAAGGCCTTGGATAATCTTGGACT
AGATGTTCAGCAAGCAGTGATCAGCTGTTTCAACGGGTTTTCCTTGGATGTTTTCCGTGC
TGAGCAATGCCAAGAAGGACAGGAGATATTGCCTGATCAAATCAAAGCAGTGCTTTTCGA
TACAGCGGGGTACGCTGGTATGATATGAGCTGATCCTGAGTCAAGGTCCTTAAGCATCTG
ATGAAGCAGGAGGCTAGAAGAACTAAAGCCTTCAAAATCTGCAATTTTCTTCTATGTTTT
CTTTTTATTTACTAAACCTGTTTGAACTAAGCATGACTTCAAACCCTTTTTTTTTAGCAA
TGTTA

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL4752Contig1 383 2 1 U
GGCCAAGGACCATAATCATCCTTTGATGCCTGGAAGGGTTCGAAGGGGCTGTATCTATGA
TCAATATCCGAACGAGCACGACAAAATCCAGGAGCTGATGCAGCAGCTAGCTGCAGAGAA
AAAGAGAGCTGCTACTTACAAGAGGCATCTGGAGGTGCTGTTTGAACATATCGAACAGCA
CAATGAAGGCCTTACTAAAAGAATCCAACACATAGTAGACAATGTGAGGGATCTAGAACA
GAGAGATCATCAACAGAACCAAGTATAGTCTATTTTTGGTTTCTCCGGTTCTTCCTTGTT
TATTTTTCACCAGTTTGATTTAGGAGATAGATCTTCTCTTCTGTATTCCCAGTATCCTCT
TTCAATAAAGATTTTTCTCATCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AD40JQ C 1
AF RR2AD40TF U 1
BS 1 383 RR2AD40TF

RD RR2AD40JQ 383 0 0
GGCCAAGGACCATAATCATCCTTTGATGCCTGGAAGGGTTCGAAGGGGCTGTATCTATGA
TCAATATCCGAACGAGCACGACAAAATCCAGGAGCTGATGCAGCAGCTAGCTGCAGAGAA
AAAGAGAGCTGCTACTTACAAGAGGCATCTGGAGGTGCTGTTTGAACATATCGAACAGCA
CAATGAAGGCCTTACTAAAAGAATCCAACACATAGTAGACAATGTGAGGGATCTAGAACA
GAGAGATCATCAACAGAACCAAGTATAGTCTATTTTTGGTTTCTCCGGTTCTTCCTTGTT
TATTTTTCACCAGTTTGATTTAGGAGATAGATCTTCTCTTCTGTATTCCCAGTATCCTCT
TTCAATAAAGATTTTTCTCATCG

QA 1 383 1 383
DS 

RD RR2AD40TF 383 0 0
GGCCAAGGACCATAATCATCCTTTGATGCCTGGAAGGGTTCGAAGGGGCTGTATCTATGA
TCAATATCCGAACGAGCACGACAAAATCCAGGAGCTGATGCAGCAGCTAGCTGCAGAGAA
AAAGAGAGCTGCTACTTACAAGAGGCATCTGGAGGTGCTGTTTGAACATATCGAACAGCA
CAATGAAGGCCTTACTAAAAGAATCCAACACATAGTAGACAATGTGAGGGATCTAGAACA
GAGAGATCATCAACAGAACCAAGTATAGTCTATTTTTGGTTTCTCCGGTTCTTCCTTGTT
TATTTTTCACCAGTTTGATTTAGGAGATAGATCTTCTCTTCTGTATTCCCAGTATCCTCT
TTCAATAAAGATTTTTCTCATCG

QA 1 383 1 383
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4754Contig1 512 2 12 U
GTAGAGATAGAAATTAGGTAGTATTTTATTTAACCAAATGTGACACAAACACGAGTGATA
TTAGCTTTAGCTATGTAATTGATTCTTGGTCTTACTTGTAACCTTAAAACATCAAAGATG
ACCAACTACTTGACAACATTCGCCGTTAATAAGGTCACACACATCCCAAAAACCAGCCTT
TCACCTTAAGTTTGTTCTATCCATCGCAACAACTCAAAGCACACAGAAAATAGTAGAGAC
TAGTAGGAGGCACGAGCTGTTTTTAGTCCTTGAGGACACGATAAGAAATGAATCTGTCGT
CACTAAACAGCATCTCCGCATCTTCAGGAAGAATCATATCTGGGTTCCATGGTCGACAAA
CTACATGTTGGCCACCTGGTATACTCCGGTACCCACTTCCCATTACCAGCTTCTTCTCAC
ATGATTCATTATAATTGTTTGTTGGTTTCTGAAACAAGTCAGTAACATCAACGTTCATCT
CCATAGCATTGGTAGCTGGTGCGACTGTAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2CC68JQ U 1
AF RR2FL80JQ U 6
BS 1 90 RR2CC68JQ
BS 91 91 RR2FL80JQ
BS 92 301 RR2CC68JQ
BS 302 302 RR2FL80JQ
BS 303 332 RR2CC68JQ
BS 333 333 RR2FL80JQ
BS 334 432 RR2CC68JQ
BS 433 433 RR2FL80JQ
BS 434 464 RR2CC68JQ
BS 465 465 RR2FL80JQ
BS 466 510 RR2CC68JQ
BS 511 512 RR2FL80JQ

RD RR2CC68JQ 510 0 0
GTAGAGATAGAAATTAGGTAGTATTTTATTTAACCAAATGTGACACAAACACGAGTGATA
TTAGCTTTAGCTATGTAATTGATTCTTGGTTTTACTTGTAACCTTAAAACATCAAAGATG
ACCAACTACTTGACAACATTCGCCGTTAATAAGGTCACACACATCCCAAAAACCAGCCTT
TCACCTTAAGTTTGTTCTATCCATCGCAACAACTCAAAGCACACAGAAAATAGTAGAGAC
TAGTAGGAGGCACGAGCTGTTTTTAGTCCTTGAGGACACGATAAGAAATGAATCTGTCGT
CTCTAAACAGCATCTCCGCATCTTCAGGAAGAGTCATATCTGGGTTCCATGGTCGACAAA
CTACATGTTGGCCACCTGGTATACTCCGGTACCCACTTCCCATTACCAGCTTCTTCTCAC
ATGATTCATTATCATTGTTTGTTGGTTTCTGAAACAAGTCAGTAGCATCAACGTTCATCT
CCATAGCATTGGTAGCTGGTGCGACTGTAA

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2FL80JQ 507 0 0
GG
TAGAAATTAGGTAGTATTTTATTTAACCAAATGTGACACAAACACGAGTGATATTAGCTT
TAGCTATGTAGTTGATTCTTGGTCTTACTTGTAACCTTAAAACATCAAAGATGACCAACT
ACTTGACAACATTCGCCGTTAATAAGGTCACACACATCCCAAAAACCAGCCTTTCACCTT
AAGTTTGTTCTATCCATCGCAACAACTCAAAGCACACAGAAAATAGTAGAGACTAGTAGG
AGGCACGAGCTGTTTTTAGTCCTTGAGGACACGATAAGAAATGAATCTGTCGTCACTAAA
CAGCATCTCCGCATCTTCAGGAAGAATCATATCTGGGTTCCATGGTCGACAAACTACATG
TTGGCCACCTGGTATACTCCGGTACCCACTTCCCATTACCAGCTTCTTCTCACATGATTC
ATTATAATTGTTTGTTGGTTTCTGAAACAAGTCAGTAACATCAACGTTCATCTCCATAGC
ATTGGTAGCTGGTGCGACTGTAAGA

QA 3 507 3 507
DS 



AS 1 2

CO CL4755Contig1 898 2 4 U
GGTCCACTGTATTCGTCTGTGTCTGCAACTAGAGGCGTAACTTTTGGTTCCACCACAATC
GTCGCAATTCGCCATTAGAGAGACTGAGGTGCAGTCGGTGTGACGATTCCATTTGTTGGT
TTTGATCCGGTCCTTTCGCCTTCTTTCGATCAATCGAAATGAGGTTAGCTTAGCTCCTCT
TCAAACCATCTTTGTCGACTTTCATGGCCAAATAAGAGGAGATCGAGAAGAACAAGTGGG
AGGTTTGGAAAAGGATTTAAGCTCAGCTTTGTTGTGTCGAAGAAGAGACCGGGCGATTGG
ATCTTCAGACTATGTTTCTTTGTTGAGGGAAGAAGTCGAAAAGATTTAACAGCTTCCGTT
GGGAAAAAACACCTCCTGGAAAACAAGAAGAGACCAAAAACTGTTCAGAAGCAAATAATA
GGACATAACACAGGCTCTTATGACCCCCCTGACGCTGACGAAACATGATCAAAGGTCAGA
GTCACTGCATATAACTTCACCGAAAACCATAAGACTTTCACCGTAAGCGCATCGTTGATG
AGATTGGCCGTGAACCAGTACCTGACGTGGCTGATTGTGCAAGGACCAGGGTGATGATGA
CGATGGTGATGACGACAAGCCAGCTGTCAAGCCAGTTGCTGTTATGTCTGAATCTGCAGG
GGGCAGTGGTAATACGCAGAAGCAGACGGCCAACTCAGATTTGAAGGTGGTTAAAAAGGC
GCGTGTTGCTTGACATGAAGTTTCAATAAATTTATGATCAGACTATGCATCTTAATAATG
CTTTTGCATCTTTATTGCCTTTCACGTATTTTTTTTTTAGACTGAAAACCGTTCACGTCT
TTTTCTTTCTATGTTTTGACTTTCTCCAATATTATGAGCACTCTACGTTTGTTCCAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR73TF U 1
AF RR2BR73JQ C 173
BS 1 285 RR2BR73TF
BS 286 286 RR2BR73JQ
BS 287 655 RR2BR73TF
BS 656 898 RR2BR73JQ

RD RR2BR73TF 655 0 0
GGTCCACTGTATTCGTCTGTGTCTGCAACTAGAGGCGTAACTTTTGGTTCCACCACAATC
GTCGCAATTCGCCATTAGAGAGACTGAGGTGCAGTCGGTGTGACGATTCCATTTGTTGGT
TTTGATCCGGTCCTTTCGCCTTCTTTCGATCAATCGAAATGAGGTTAGCTTAGCTCCTCT
TCAAACCATCTTTGTCGACTTTCATGGCCAAATAAGAGGAGATCGAGAAGAACAAGTGGG
AGGTTTGGAAAAGGATTTAAGCTCAGCTTTGTTGTGTCGAAGAAGGGACCGGGCGATTGG
ATCTTCAGACTATGTTTCTTTGTTGAGGGAAGAAGTCGAAAAGATTTAACAGCTTCCGTT
GGGAAAAAACACCTCCTGGAAAACAAGAAGAGACCAAAAACTGTTCAGAAGCAAATAATA
GGACATAACACAGGCTCTTATGACCCCCCTGACGCTGACGAAACATGATCAAAGGTCAGA
GTCACTGCATATAACTTCACCGAAAACCATAAGACTTTCACCGTAAGCGCATCGTTGATG
AGATTGGCCGTGAACCAGTACCTGACGTGGCTGATTGTGCAAGGACCAGGGTGATGATGA
CGATGGTGATGACGACAAGCCAGCTGTCAAGCCAGTTGCTGTTATGTCTGAATCT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2BR73JQ 726 0 0
GCTCCTCTTCAAACCATCTTTGTCGACTTTCATGGCCAAATAAGAGGAGATCGAGAAGAA
CAAGTGGGAGGTTTGGAAAAGGATTTAAGCTCAGCTTTGTTGTGTCGAAGAAGAGACCGG
GCGATTGGATCTTCAGACTATGTTTCTTTGTTGAGGGAAGAAGTCGAAAAGATTTAACAG
CTTCCGTTGGGAAAAAACACCTCCTGGAAAACAAGAAGAGACCAAAAACTGTTCAGAAGC
AAATAATAGGACATAACACAGGCTCTTATGACCCCCCTGACGCTGACGAAACATGATCAA
AGGTCAGAGTCACTGCATATAACTTCACCGAAAACCATAAGACTTTCACCGTAAGCGCAT
CGTTGATGAGATTGGCCGTGAACCAGTACCTGACGTGGCTGATTGTGCAAGGACCAGGGT
GATGATGACGATGGTGATGACGACAAGCCAGCTGTCAAGCCAGTTGCTGTTATGTCTGAA
TCTGCAGGGGGCAGTGGTAATACGCAGAAGCAGACGGCCAACTCAGATTTGAAGGTGGTT
AAAAAGGCGCGTGTTGCTTGACATGAAGTTTCAATAAATTTATGATCAGACTATGCATCT
TAATAATGCTTTTGCATCTTTATTGCCTTTCACGTATTTTTTTTTTAGACTGAAAACCGT
TCACGTCTTTTTCTTTCTATGTTTTGACTTTCTCCAATATTATGAGCACTCTACGTTTGT
TCCAGG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL4756Contig1 845 2 2 U
GGATAACCCAAAGATCCTTATTCCAAATCGAAATTCGAACCAAGAAACTAAGAGATGGAG
AGGAAATCTGATAATGCTACTGCTAATCGTATTTACGATGAATTTGATCCAATCTTTAAT
TGGAAAACTGAACAAGGCTTTGAAACTCTCACTATTTACCTTCCAGGGTTTAGGAAAGAG
CAACTTAAAGTGCAAGTAACCACAACGAGGAAGGTCAGAGTGATGGGAGAACGTCCTGCA
GGAGCCAACAAATGGATCCGTTTCCGCAAGGAGTTTCCTATTCAAGCAAACATTGATGTT
GACTCCATTGGTGCTAAATTTGAAGGCGCAAATCTTGTTGTGAAGCTCCCTAGACTACCA
ATGGGCAGGGGCGGACAAACTTCCCCGATTGGAACAACCGCAAAACCTTCTCCGGTTCCT
AAGGAAACCTCAACAAAAGAGAAAGAAGCGGGAGTAGAGAAACATGCAGAGAAGGCTCCA
CTGCCAAAGCCATCAAGAGAGGAAGAGACCAAGCGGGCTGAGAAAGAGAAAGCTCTTAAA
GCAACAGAGAAGGAAAACGTTTGTGATGGAGTTAAGCAAGACTATAGAAGTAAAGTGAAT
GCATACAAGGAGAATCTTGGAGGATATGTGGCCTTGATGAAGAATAACCAGAGAGCAATC
ACACTTGGTATGGTTGCTCCCGCGGCCGCGGTTCTCTTGCTGTCGCTTGGATTCTATGCT
GGTCAAATGTTTACTTCTTAACAACCCCTTTGAAGAATCCTAAAAGGCAGATAAAATGTA
TTAACTTTGCATATATATATGAAATCATATTAATAAACAAAAACAAAGGAACAAATATTA
TTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2B064TF U 1
AF RR2B064JQ C 70
BS 1 771 RR2B064TF
BS 772 845 RR2B064JQ

RD RR2B064TF 771 0 0
GGATAACCCAAAGATCCTTATTCCAAATCGAAATTCGAACCAAGAAACTAAGAGATGGAG
AGGAAATCTGATAATGCTACTGCTAATCGTATTTACGATGAATTTGATCCAATCTTTAAT
TGGAAAACTGAACAAGGCTTTGAAACTCTCACTATTTACCTTCCAGGGTTTAGGAAAGAG
CAACTTAAAGTGCAAGTAACCACAACGAGGAAGGTCAGAGTGATGGGAGAACGTCCTGCA
GGAGCCAACAAATGGATCCGTTTCCGCAAGGAGTTTCCTATTCAAGCAAACATTGATGTT
GACTCCATTGGTGCTAAATTTGAAGGCGCAAATCTTGTTGTGAAGCTCCCTAGACTACCA
ATGGGCAGGGGCGGACAAACTTCCCCGATTGGAACAACCGCAAAACCTTCTCCGGTTCCT
AAGGAAACCTCAACAAAAGAGAAAGAAGCGGGAGTAGAGAAACATGCAGAGAAGGCTCCA
CTGCCAAAGCCATCAAGAGAGGAAGAGACCAAGCGGGCTGAGAAAGAGAAAGCTCTTAAA
GCAACAGAGAAGGAAAACGTTTGTGATGGAGTTAAGCAAGACTATAGAAGTAAAGTGAAT
GCATACAAGGAGAATCTTGGAGGATATGTGGCCTTGATGAAGAATAACCAGAGAGCAATC
ACACTTGGTATGGTTGCTCCCGCGGCCGCGGTTCTCTTGCTGTCGCTTGGATTCTATGCT
GGTCAAATGTTTACTTCTTAACAACCCCTTTGAAGAATCCTAAAAGGCAGA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2B064JQ 776 0 0
GATAATGCTACTGCTAATCGTATTTACGATGAATTTGATCCAATCTTTAATTGGAAAACT
GAACAAGGCTTTGAAACTCTCACTATTTACCTTCCAGGGTTTAGGAAAGAGCAACTTAAA
GTGCAAGTAACCACAACGAGGAAGGTCAGAGTGATGGGAGAACGTCCTGCAGGAGCCAAC
AAATGGATCCGTTTCCGCAAGGAGTTTCCTATTCAAGCAAACATTGATGTTGACTCCATT
GGTGCTAAATTTGAAGGCGCAAATCTTGTTGTGAAGCTCCCTAGACTACCAATGGGCAGG
GGCGGACAAACTTCCCCGATTGGAACAACCGCAAAACCTTCTCCGGTTCCTAAGGAAACC
TCAACAAAAGAGAAAGAAGCGGGAGTAGAGAAACATGCAGAGAAGGCTCCACTGCCAAAG
CCATCAAGAGAGGAAGAGACCAAGCGGGCTGAGAAAGAGAAAGCTCTTAAAGCAACAGAG
AAGGAAAACGTTTGTGATGGAGTTAAGCAAGACTATAGAAGTAAAGTGAATGCATACAAG
GAGAATCTTGGAGGATATGTGGCCTTGATGAAGAATAACCAGAGAGCAATCACACTTGGT
ATGGTTGCTCCCGCGGCCGCGGTTCTCTTGCTGTCGCTTGGATTCTATGCTGGTCAAATG
TTTACTTCTTAACAACCCCTTTGAAGAATCCTAAAAGGCAGATAAAATGTATTAACTTTG
CATATATATATGAAATCATATTAATAAACAAAAACAAAGGAACAAATATTATTCAG

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL4757Contig1 862 2 2 U
GGAAGACTCCTTGAACTTTCCTTCTTCGTATTTGCCGACGGCAAGGAAAGTTCTCGATCA
CATCTCCCTCCTCCGATCAACAACACACGATGCAGCACTTACTCTTCGCGGTTGTACTCT
CCGAGGTCGCGGTGATACTGGCGCTCTCTTTCAAAACGCCGATTCGGAAGCTCCTGATCA
TGAGCCTGGATCGCGCGAAGCGCGGGCGCGGACCGGTGGTGGTCCAGACCGTCTCCGCGA
CGGTGTGCGTGGTGCTGGTGGCGAGCGTGTACAGTATGATGAAGATCCAGGAGCGATGGA
TCGAGGAGGGTGCAATGAACCCGACGGATGAGGTCATCATGTCTAAGCATCTCCTTGAAT
CGACTCTCATGGGTGGGTTTCTTTTCCTTGGGCTGATGATAGACAGGCTGCACCACTACA
TGAGAGAGCTACGCATGAGAAGGAAGACCATGGAAGTTGTAAAGAAGGAAGGATCGGTTT
TGGAAGGTGAGAAAGCCAGAGCTTCAGATGAAGTCAAAAGCTTGAAACAAGAAATCACAT
CTCTTCGGGAAAGACAAAAGCAGCTGGAGTCTGAGATCGAGGCAAAGACTAAAGAGATCC
GTACTGAAGAAACAAGTGGAATAGCTCTACAGAAGCAGTCTGAAGGGTTCCTGATTGAGT
TTAACCGGTTGTCTGAGGAAAACCAGGATCTTCGTTACCAATTGCACACTGTGGATTCAA
GAATTTCGCGTTCAAGCATCAAGAAGAATACTTGAGCCAGTCTTTACTCCAACATTTTTT
TTTAGTTTAAACTTGTTTGTGATATTACGTTTGGTGTTTGTTAATAGGGTGCTTTGCTGC
TTGGTAATTGAATCTTGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV73TF U 1
AF RR2GV73JQB C 234
BS 1 553 RR2GV73TF
BS 554 862 RR2GV73JQB

RD RR2GV73TF 553 0 0
GGAAGACTCCTTGAACTTTCCTTCTTCGTATTTGCCGACGGCAAGGAAAGTTCTCGATCA
CATCTCCCTCCTCCGATCAACAACACACGATGCAGCACTTACTCTTCGCGGTTGTACTCT
CCGAGGTCGCGGTGATACTGGCGCTCTCTTTCAAAACGCCGATTCGGAAGCTCCTGATCA
TGAGCCTGGATCGCGCGAAGCGCGGGCGCGGACCGGTGGTGGTCCAGACCGTCTCCGCGA
CGGTGTGCGTGGTGCTGGTGGCGAGCGTGTACAGTATGATGAAGATCCAGGAGCGATGGA
TCGAGGAGGGTGCAATGAACCCGACGGATGAGGTCATCATGTCTAAGCATCTCCTTGAAT
CGACTCTCATGGGTGGGTTTCTTTTCCTTGGGCTGATGATAGACAGGCTGCACCACTACA
TGAGAGAGCTACGCATGAGAAGGAAGACCATGGAAGTTGTAAAGAAGGAAGGATCGGTTT
TGGAAGGTGAGAAAGCCAGAGCTTCAGATGAAGTCAAAAGCTTGAAACAAGAAATCACAT
CTCTTCGGGAAAG

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2GV73JQB 629 0 0
TCCGCGACGGTGTGCGTGGTGCTGGTGGCGAGCGTGTACAGTATGATGAAGATCCAGGAG
CGATGGATCGAGGAGGGTGCAATGAACCCGACGGATGAGGTCATCATGTCTAAGCATCTC
CTTGAATCGACTCTCATGGGTGGGTTTCTTTTCCTTGGGCTGATGATAGACAGGCTGCAC
CACTACATGAGAGAGCTACGCATGAGAAGGAAGACCATGGAAGTTGTAAAGAAGGAAGGA
TCGGTTTTGGAAGGTGAGAAAGCCAGAGCTTCAGATGAAGTCAAAAGCTTGAAACAAGAA
ATCACATCTCTTCGGGAAAGACAAAAGCAGCTGGAGTCTGAGATCGAGGCAAAGACTAAA
GAGATCCGTACTGAAGAAACAAGTGGAATAGCTCTACAGAAGCAGTCTGAAGGGTTCCTG
ATTGAGTTTAACCGGTTGTCTGAGGAAAACCAGGATCTTCGTTACCAATTGCACACTGTG
GATTCAAGAATTTCGCGTTCAAGCATCAAGAAGAATACTTGAGCCAGTCTTTACTCCAAC
ATTTTTTTTTAGTTTAAACTTGTTTGTGATATTACGTTTGGTGTTTGTTAATAGGGTGCT
TTGCTGCTTGGTAATTGAATCTTGTCTCC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL4758Contig1 767 2 2 U
AGAGGCTCTTTCTTCTTGTTAACTACTAGATCTCTCTTTTGTTTCATCTCATTCTTCTTC
TTATTCTTTATCATCATCTTCTTATTTTATTCTCTACTTTCTGCTATCTCGTGGCTCTGA
CCAGCTCCCGAGTTGTTCGTTTCTGGTTAATGGATATTGAACCCTCTTGGGATCTTGGTG
GGTGGGTTATCTCTTTTTCTAAATTGCATGGCAACATCAAATGACCAAACCAATACTAAA
TCATCACATTCTAATACTCTTCTTCTTTACATCATATTCTTATCTTTCATTCTCTTCATC
AACCTTATGATCCCCATGACTCATCATCGATCCACATCTACGGTTGCTCCCTTCGAGAGG
GTTCTTCTCGAATCTTCCGTTTCAGCTTCATCAACAATGGATCTGCATCCAAAGGCTCGC
ACACGTCGCAGCCATACTTCTAGAAGGAGAAAGTTTGCAAATGATGATCATGAAGTTCCT
AGTGGTCCAAACCCTATTTCCAACCAGGTGAGCTGGCGTATCTGGTTTTACCCGTGAGTT
TGAAGGATTTTTATAGATCAATATGATATCATATGGGCGATGCTTCTTATCGATGGAGAC
CGGAGAAGAACTTAACTGTTATGGATTTAGAATATATCTTTGGATGAATCACTTTGGTCT
ATCATTTCCTTCTTACGTCTTTTGTCCATTTATATTGCTTGGGTACCATGTTTTAAGTTT
TGATTAGAGTTGTAAAGAAGAGGTATACTATTATTCGTTAATCGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN53TF U 1
AF RR2EN53JQ C 85
BS 1 563 RR2EN53TF
BS 564 767 RR2EN53JQ

RD RR2EN53TF 563 0 0
AGAGGCTCTTTCTTCTTGTTAACTACTAGATCTCTCTTTTGTTTCATCTCATTCTTCTTC
TTATTCTTTATCATCATCTTCTTATTTTATTCTCTACTTTCTGCTATCTCGTGGCTCTGA
CCAGCTCCCGAGTTGTTCGTTTCTGGTTAATGGATATTGAACCCTCTTGGGATCTTGGTG
GGTGGGTTATCTCTTTTTCTAAATTGCATGGCAACATCAAATGACCAAACCAATACTAAA
TCATCACATTCTAATACTCTTCTTCTTTACATCATATTCTTATCTTTCATTCTCTTCATC
AACCTTATGATCCCCATGACTCATCATCGATCCACATCTACGGTTGCTCCCTTCGAGAGG
GTTCTTCTCGAATCTTCCGTTTCAGCTTCATCAACAATGGATCTGCATCCAAAGGCTCGC
ACACGTCGCAGCCATACTTCTAGAAGGAGAAAGTTTGCAAATGATGATCATGAAGTTCCT
AGTGGTCCAAACCCTATTTCCAACCAGGTGAGCTGGCGTATCTGGTTTTACCCGTGAGTT
TGAAGGATTTTTATAGATCAATA

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2EN53JQ 683 0 0
TTTTATTCTCTACTTTCTGCTATCTCGTGGCTCTGACCAGCTCCCGAGTTGTTCGTTTCT
GGTTAATGGATATTGAACCCTCTTGGGATCTTGGTGGGTGGGTTATCTCTTTTTCTAAAT
TGCATGGCAACATCAAATGACCAAACCAATACTAAATCATCACATTCTAATACTCTTCTT
CTTTACATCATATTCTTATCTTTCATTCTCTTCATCAACCTTATGATCCCCATGACTCAT
CATCGATCCACATCTACGGTTGCTCCCTTCGAGAGGGTTCTTCTCGAATCTTCCGTTTCA
GCTTCATCAACAATGGATCTGCATCCAAAGGCTCGCACACGTCGCAGCCATACTTCTAGA
AGGAGAAAGTTTGCAAATGATGATCATGAAGTTCCTAGTGGTCCAAACCCTATTTCCAAC
CAGGTGAGCTGGCGTATCTGGTTTTACCCGTGAGTTTGAAGGATTTTTATAGATCAATAT
GATATCATATGGGCGATGCTTCTTATCGATGGAGACCGGAGAAGAACTTAACTGTTATGG
ATTTAGAATATATCTTTGGATGAATCACTTTGGTCTATCATTTCCTTCTTACGTCTTTTG
TCCATTTATATTGCTTGGGTACCATGTTTTAAGTTTTGATTAGAGTTGTAAAGAAGAGGT
ATACTATTATTCGTTAATCGTCT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL4759Contig1 695 2 2 U
GCTTAAACCCATAACCAACCATACATTCGATGTATTGAATTGAGAGTTCTTACACGATTA
TCTGAGTAAATACCAAATATAAAAGAAAAAAAAAACATTGTTTCTTGTGCCGAAAAAGGC
GAGAGATCTATTTGGGTCAGCCTTTAGAAAAAAAACAAAATAAAAGATCACAGCAAAAAA
GAGATCAGACCTGACTAGTCCTGTTCCGTAATAATGATGCCATATGAGATTGATATGCTT
ACTTCCTCCATTGTACACTGTACTGATTGCTACTAGCTTCACACCACCCTAATCTATATT
CATACCCATTTCTTCTTCCTCTGGAGCTGTGCTTTTCTCTTGGACAGGTTTGCTTCTCTC
AGTGTCCATTTTGGATGACTCTTTCACCTCTGCATTCTCCGAAAGTAACTCACAAGGAAT
CGCAGCTGTGTCTAGCTCCACACAACCCGCTGGTGCGTTTTCAGCTTCTTTCCCAGTAAG
AATGTAGTGAGGCACTTGTGAGAGAATCTAAACATTTCTTCCTTTGGGATCTTTCTCACA
TTGTTTTGATCTGTGCTTCTGCGGAAAACCGACTTGAATCCTTCAGCTTTGAGTAAGGGA
GCAACAGTTAAACTTTGCTTGTCTTCGGTGTAGTAATCAAGAACTTCAACCATGTCGTAC
TTGTGTTTGACTTCATCAGGGACATCACCGTCCCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AL05TF C 1
AF RR2AL05JQ U 2
BS 1 1 RR2AL05TF
BS 2 695 RR2AL05JQ

RD RR2AL05TF 695 0 0
GCTTAAACCCATAACCAACCATACATTCGATGTATTGAATTGAGAGTTCTTACACGATTA
TCTGAGTAAATACCAAATATAAAAGAAAAAAAAAACATTGTTTCTTGTGCCGAAAAAGGC
GAGAGATCTATTTGGGTCAGCCTTTAGAAAAAAAACAAAATAAAAGATCACAGCAAAAAA
GAGATCAGACCTGACTAGTCCTGTTCCGTAATAATGATGCCATATGAGATTGATATGCTT
ACTTCCTCCATTGTACACTGTACTGATTGCTACTAGCTTCACACCACCCTAATCTATATT
CATACCCATTTCTTCTTCCTCTGGAGCTGTGCTTTTCTCTTGGACAGGTTTGCTTCTCTC
AGTGTCCATTTTGGATGACTCTTTCACCTCTGCATTCTCCGAAAGTAACTCACAAGGAAT
CGCAGCTGTGTCTAGCTCCACACAACCCGCTGGTGCGTTTTCAGCTTCTTTCCCAGTAAG
AATGTAGTGAGGCACTTGTGAGAGAATCTAAACATTTCTTCCTTTGGGATCTTTCTCACA
TTGTTTTGATCTGTGCTTCTGCGGAAAACCGACTTGAATCCTTCAGCTTTGAGTAAGGGA
GCAACAGTTAAACTTTGCTTGTCTTCGGTGTAGTAATCAAGAACTTCAACCATGTCGTAC
TTGTGTTTGACTTCATCAGGGACATCACCGTCCCC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2AL05JQ 694 0 0
CTTAAACCCATAACCAACCATACATTCGATGTATTGAATTGAGAGTTCTTACACGATTAT
CTGAGTAAATACCAAATATAAAAGAAAAAAAAAACATTGTTTCTTGTGCCGAAAAAGGCG
AGAGATCTATTTGGGTCAGCCTTTAGAAAAAAAACAAAATAAAAGATCACAGCAAAAAAG
AGATCAGACCTGACTAGTCCTGTTCCGTAATAATGATGCCATATGAGATTGATATGCTTA
CTTCCTCCATTGTACACTGTACTGATTGCTACTAGCTTCACACCACCCTAATCTATATTC
ATACCCATTTCTTCTTCCTCTGGAGCTGTGCTTTTCTCTTGGACAGGTTTGCTTCTCTCA
GTGTCCATTTTGGATGACTCTTTCACCTCTGCATTCTCCGAAAGTAACTCACAAGGAATC
GCAGCTGTGTCTAGCTCCACACAACCCGCTGGTGCGTTTTCAGCTTCTTTCCCAGTAAGA
ATGTAGTGAGGCACTTGTGAGAGAATCTAAACATTTCTTCCTTTGGGATCTTTCTCACAT
TGTTTTGATCTGTGCTTCTGCGGAAAACCGACTTGAATCCTTCAGCTTTGAGTAAGGGAG
CAACAGTTAAACTTTGCTTGTCTTCGGTGTAGTAATCAAGAACTTCAACCATGTCGTACT
TGTGTTTGACTTCATCAGGGACATCACCGTCCCC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL4760Contig1 447 2 1 U
GATACGATCTCTTGCATGCATGGACTGTCTTTTCAGACATTAAAAGCAAAGGATGCAGTG
CGGAGGATCTATTACTTGAGATGGATAGGATTCTTAGACCTACAGGATTCATCATCATCA
GAGATAAGGAGAGCATTGTTGAATCGATCAAGAAGTATATGAAGGCTCTGCATTGGGAGG
TTGTGGCGTCAGAGAAGGTAACTACAGGTTCAGAACTTGACCAAGACAGTGACGATGGTG
AGAACAATGTCATTTTCATTGTCAGGAAGAAACTGTGGCTCACCAGTGAAAGCCTTAGGA
ACACTGAGTGATCAAATGAAAAGCAGAAGAGAAAAAAAGAAACAAATTGTTTTATTCCCA
CAAGTTTCATATAGTTTTATTTGTTTCTTTTTTGTAGTTGATTTGTACCACATAAGCAAT
ATTATATAAATACTGAATTAATCGTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DQ33JQ C 1
AF RR2DQ33TF U 1
BS 1 447 RR2DQ33TF

RD RR2DQ33JQ 447 0 0
GATACGATCTCTTGCATGCATGGACTGTCTTTTCAGACATTAAAAGCAAAGGATGCAGTG
CGGAGGATCTATTACTTGAGATGGATAGGATTCTTAGACCTACAGGATTCATCATCATCA
GAGATAAGGAGAGCATTGTTGAATCGATCAAGAAGTATATGAAGGCTCTGCATTGGGAGG
TTGTGGCGTCAGAGAAGGTAACTACAGGTTCAGAACTTGACCAAGACAGTGACGATGGTG
AGAACAATGTCATTTTCATTGTCAGGAAGAAACTGTGGCTCACCAGTGAAAGCCTTAGGA
ACACTGAGTGATCAAATGAAAAGCAGAAGAGAAAAAAAGAAACAAATTGTTTTATTCCCA
CAAGTTTCATATAGTTTTATTTGTTTCTTTTTTGTAGTTGATTTGTACCACATAAGCAAT
ATTATATAAATACTGAATTAATCGTTG

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR2DQ33TF 447 0 0
GATACGATCTCTTGCATGCATGGACTGTCTTTTCAGACATTAAAAGCAAAGGATGCAGTG
CGGAGGATCTATTACTTGAGATGGATAGGATTCTTAGACCTACAGGATTCATCATCATCA
GAGATAAGGAGAGCATTGTTGAATCGATCAAGAAGTATATGAAGGCTCTGCATTGGGAGG
TTGTGGCGTCAGAGAAGGTAACTACAGGTTCAGAACTTGACCAAGACAGTGACGATGGTG
AGAACAATGTCATTTTCATTGTCAGGAAGAAACTGTGGCTCACCAGTGAAAGCCTTAGGA
ACACTGAGTGATCAAATGAAAAGCAGAAGAGAAAAAAAGAAACAAATTGTTTTATTCCCA
CAAGTTTCATATAGTTTTATTTGTTTCTTTTTTGTAGTTGATTTGTACCACATAAGCAAT
ATTATATAAATACTGAATTAATCGTTG

QA 1 447 1 447
DS 



AS 1 2

CO CL4761Contig1 772 2 2 U
GAGTCTCAGATCTCAAAAGATGGCGACGAAAATCTCTCAGCTTGCGTGTTTCTCCTCCAC
CACCAATCGCCAATTCCACTTCCAAAACCGACCGTTTCCATGCCTTAGGTCTCGCCCCGA
GCTTTTGATGATGCAGTCTTTTGTAGTTAGAAGCGTTGATGGGAACAGCTCAGAAACACC
ACCAGCTTCTCTGAGCTACACAGCTGAGGTTTCGAAAACACGAGAACCGGTAGAGGAACA
TGTTGTTGCCACGGCACAGCCGAAAAGAGCAGCAAAGATCCACGACTTCTGTTTCGGCAT
TCCTTATGGAGGTCTCGTTATGAGTGGAGGGTTGCTTGGATTTGCGTTTTCACGGAACCT
AACAAGTTTAAGTACTGGGGTCCTCTACGGTGGTGGCCTTCTAGCTCTTAGTACATTGAG
CTTAAAGATTTGGCGTCAGGGACAATCTAGTTTCCCTTATATACTTGGTCAAGCAGTGCT
TTCAGCTGTCGTCTTCTGGAAGAACTTCACAGCTTATTCTATGAATAAGAAGCTGTTTCC
TGCTGGGATTTTTGCTGTCGTCAGTGCTGCCATGTTGTGTTTCTATTCATATGTGGTGCT
CTCTGGAGGAAACCCACCTCCAAAGAAATTGAAACCCTCATCTGGTAGCCCTTCATACTG
AAGAAGCTTCCCATAGGTTAGATTAAAGACATGGGAGGTCTCAGTCTTTTATGACTGGTG
TGTTGGATTCCTGGTGTAATTTTATATACTTAATAATAGAGGCGACTCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ11TF U 1
AF RR2AJ11JQ C 194
BS 1 672 RR2AJ11TF
BS 673 772 RR2AJ11JQ

RD RR2AJ11TF 672 0 0
GAGTCTCAGATCTCAAAAGATGGCGACGAAAATCTCTCAGCTTGCGTGTTTCTCCTCCAC
CACCAATCGCCAATTCCACTTCCAAAACCGACCGTTTCCATGCCTTAGGTCTCGCCCCGA
GCTTTTGATGATGCAGTCTTTTGTAGTTAGAAGCGTTGATGGGAACAGCTCAGAAACACC
ACCAGCTTCTCTGAGCTACACAGCTGAGGTTTCGAAAACACGAGAACCGGTAGAGGAACA
TGTTGTTGCCACGGCACAGCCGAAAAGAGCAGCAAAGATCCACGACTTCTGTTTCGGCAT
TCCTTATGGAGGTCTCGTTATGAGTGGAGGGTTGCTTGGATTTGCGTTTTCACGGAACCT
AACAAGTTTAAGTACTGGGGTCCTCTACGGTGGTGGCCTTCTAGCTCTTAGTACATTGAG
CTTAAAGATTTGGCGTCAGGGACAATCTAGTTTCCCTTATATACTTGGTCAAGCAGTGCT
TTCAGCTGTCGTCTTCTGGAAGAACTTCACAGCTTATTCTATGAATAAGAAGCTGTTTCC
TGCTGGGATTTTTGCTGTCGTCAGTGCTGCCATGTTGTGTTTCTATTCATATGTGGTGCT
CTCTGGAGGAAACCCACCTCCAAAGAAATTGAAACCCTCATCTGGTAGCCCTTCATACTG
AAGAAGCTTCCC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2AJ11JQ 579 0 0
AGCTACACAGCTGAGGTTTCGAAAACACGAGAACCGGTAGAGGAACATGTTGTTGCCACG
GCACAGCCGAAAAGAGCAGCAAAGATCCACGACTTCTGTTTCGGCATTCCTTATGGAGGT
CTCGTTATGAGTGGAGGGTTGCTTGGATTTGCGTTTTCACGGAACCTAACAAGTTTAAGT
ACTGGGGTCCTCTACGGTGGTGGCCTTCTAGCTCTTAGTACATTGAGCTTAAAGATTTGG
CGTCAGGGACAATCTAGTTTCCCTTATATACTTGGTCAAGCAGTGCTTTCAGCTGTCGTC
TTCTGGAAGAACTTCACAGCTTATTCTATGAATAAGAAGCTGTTTCCTGCTGGGATTTTT
GCTGTCGTCAGTGCTGCCATGTTGTGTTTCTATTCATATGTGGTGCTCTCTGGAGGAAAC
CCACCTCCAAAGAAATTGAAACCCTCATCTGGTAGCCCTTCATACTGAAGAAGCTTCCCA
TAGGTTAGATTAAAGACATGGGAGGTCTCAGTCTTTTATGACTGGTGTGTTGGATTCCTG
GTGTAATTTTATATACTTAATAATAGAGGCGACTCCTTC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL4762Contig1 787 2 2 U
GGGTAGAGGGATACAACAGAGCATTCGTAGCAGAGGAGAGGACAATAGGTTTCCAAAAAT
GAAGAAGGAAAATAGCTCTCTGATGTCGATTTTACTGCTGCTATCACTCTCATTTCTGGC
TAGCTCGAAACGTCACGGAAACCCTGCTAGTGAAATGGTGAACGTCTTGAACCAGAACAG
AACAGCCTGGAAACTTGGAAAACTAGATGAGAGCCCTGGCCTTGGCTGCATAGCCCTCCA
GTATGCTGAGCTCTGCGAGGGTAATTGCAATGTCAACAACACTTTGACCTGCAAACCCCC
TGAAGACGACTTCACACAGGTTTTTGCCCCCAACTGTGGTGTAGAACTTCCCACTTTTGG
TACCATAACAGGCCACGTTCTCGGCTGCGGCACCCACTATGCGACCCCACAAGCCTCCTT
CTCAGACATTCTCTTCCGAGATAACAAATCCTTGTTGGTGCTCAGAAACAGGTCGCACAC
TAAGGTTGGAGTGGGAATGGCTAGGTTGGATAAAGGTACCTACTTTTGGTGCATTCTGTT
TAGTGATGGTGGGATAAACTCTTCCTTTGCTCTGGAAGCCAATGGCCGGGGAATCAAACA
AAGAAAAGGCTGCTACAGCGGAAGTGCTTTTTCTTGTAGCAATGCACACACTATTTGTAT
GCGTCTTCTCAACAGCTGTCTGGGCATTCTTTTGTCTTCCTTCTGTCTATTTAGACATTA
TTGTTGGTGTCCTTTTTTCTAAGTGTGTGTAGTTTCTTTGACCTAAATAATGAAAGACTA
ATGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI37TF U 1
AF RR2DI37JQ C 255
BS 1 741 RR2DI37TF
BS 742 787 RR2DI37JQ

RD RR2DI37TF 741 0 0
GGGTAGAGGGATACAACAGAGCATTCGTAGCAGAGGAGAGGACAATAGGTTTCCAAAAAT
GAAGAAGGAAAATAGCTCTCTGATGTCGATTTTACTGCTGCTATCACTCTCATTTCTGGC
TAGCTCGAAACGTCACGGAAACCCTGCTAGTGAAATGGTGAACGTCTTGAACCAGAACAG
AACAGCCTGGAAACTTGGAAAACTAGATGAGAGCCCTGGCCTTGGCTGCATAGCCCTCCA
GTATGCTGAGCTCTGCGAGGGTAATTGCAATGTCAACAACACTTTGACCTGCAAACCCCC
TGAAGACGACTTCACACAGGTTTTTGCCCCCAACTGTGGTGTAGAACTTCCCACTTTTGG
TACCATAACAGGCCACGTTCTCGGCTGCGGCACCCACTATGCGACCCCACAAGCCTCCTT
CTCAGACATTCTCTTCCGAGATAACAAATCCTTGTTGGTGCTCAGAAACAGGTCGCACAC
TAAGGTTGGAGTGGGAATGGCTAGGTTGGATAAAGGTACCTACTTTTGGTGCATTCTGTT
TAGTGATGGTGGGATAAACTCTTCCTTTGCTCTGGAAGCCAATGGCCGGGGAATCAAACA
AAGAAAAGGCTGCTACAGCGGAAGTGCTTTTTCTTGTAGCAATGCACACACTATTTGTAT
GCGTCTTCTCAACAGCTGTCTGGGCATTCTTTTGTCTTCCTTCTGTCTATTTAGACATTA
TTGTTGGTGTCCTTTTTTCTA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2DI37JQ 533 0 0
GCGAGGGTAATTGCAATGTCAACAACACTTTGACCTGCAAACCCCCTGAAGACGACTTCA
CACAGGTTTTTGCCCCCAACTGTGGTGTAGAACTTCCCACTTTTGGTACCATAACAGGCC
ACGTTCTCGGCTGCGGCACCCACTATGCGACCCCACAAGCCTCCTTTTCAGACATTTTCT
TCCGAGATAACAAATCCTTGTTGGTGCTCAGAAACAGGTCGCACACTAAGGTTGGAGTGG
GAATGGCTAGGTTGGATAAAGGTACCTACTTTTGGTGCATTCTGTTTAGTGATGGTGGGA
TAAACTCTTCCTTTGCTCTGGAAGCCAATGGCCGGGGAATCAAACAAAGAAAAGGCTGCT
ACAGCGGAAGTGCTTTTTCTTGTAGCAATGCACACACTATTTGTATGCGTCTTCTCAACA
GCTGTCTGGGCATTCTTTTGTCTTCCTTCTGTCTATTTAGACATTATTGTTGGTGTCCTT
TTTTCTAAGTGTGTGTAGTTTCTTTGACCTAAATAATGAAAGACTAATGAGCC

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 2

CO CL4763Contig1 807 2 10 U
GAAGTGAGCTTCAGCTACTACTACTTATTGCTTATTAATTCCTAAAAAGCTTTAAAATGG
CTGCAAATTACAACGAGAAGCTTCTTCTCAACTATGTTCCCGTATACGTTATGCTTCCGT
TGGGAGTGGTGAATGTGGAAAACGTATTCGTGGACCCTGAAACGCTTGAAACGCAGCTCA
AGCGTCTCAAAGAAGAAGCTGGAATCGATGGCGTTATGGTCGACGTTTGGTGGGGAATCA
TTGAATCCAAAGGCCCAAAACAATATGACTGGACCGCTTACAAAACGCTTTTCCAGCTAA
TCGCACGTTTAGGACTCAAAATCCAAGCAATCATGTCATTTCACCAATGCGGTGGAAACG
TTGGCGACGTCGTCACTATCCCAATCCCGAAATGGGTTCGAGAGGTTGGTGAGAGCGATC
CAGATATCTACTACACTAACCGTAGAGGAACAAGAGATATTGAGTATCTCTCACTCGGTG
TCGACAATCTTCCTCTCTTTGCTGGAAGAACTCCTGTTCAGATGTATAGTGACTACATGA
GTAGCTTCAAGGAAAACATGTTGGAGCTACTAGAAGCTGGAACCATTGTTGACATTGAGG
TCGGTCTTGGTCCTGCCGGTGAGCTTCGTTACCCTTCTTATCCACAAAGCCAAGGATGGG
TATTTCCAGGCATTGGAGAATTCCAGTGTTACGATAAGTACTTGAAGAAAGAATTCAAGG
AAGCAGCCGCGAAAGCAGTCATCCGGAGTGGGATCTGCCCGAGACGCCGAGATACACGAT
AGCCGAGGAAACTGGGTTTTTAGACAA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A720TF U 1
AF RR2DL13TF U 5
BS 1 164 RR2A720TF
BS 165 165 RR2DL13TF
BS 166 256 RR2A720TF
BS 257 257 RR2DL13TF
BS 258 566 RR2A720TF
BS 567 567 RR2DL13TF
BS 568 661 RR2A720TF
BS 662 662 RR2DL13TF
BS 663 766 RR2A720TF
BS 767 807 RR2DL13TF

RD RR2A720TF 766 0 0
GAAGTGAGCTTCAGCTACTACTACTTATTGCTTATTAATTCCTAAAAAGCTTTAAAATGG
CTGCAAATTACAACGAGAAGCTTCTTCTCAACTATGTTCCCGTATACGTTATGCTTCCGT
TGGGAGTGGTGAATGTGGAAAACGTATTCGTGGACCCTGAAACGGTTGAAACGCAGCTCA
AGCGTCTCAAAGAAGAAGCTGGAATCGATGGCGTTATGGTCGACGTTTGGTGGGGAATCA
TTGAATCCAAAGGCCCTAAACAATATGACTGGACCGCTTACAAAACGCTTTTCCAGCTAA
TCGCACGTTTAGGACTCAAAATCCAAGCAATCATGTCATTTCACCAATGCGGTGGAAACG
TTGGCGACGTCGTCACTATCCCAATCCCGAAATGGGTTCGAGAGGTTGGTGAGAGCGATC
CAGATATCTACTACACTAACCGTAGAGGAACAAGAGATATTGAGTATCTCTCACTCGGTG
TCGACAATCTTCCTCTCTTTGCTGGAAGAACTCCTGTTCAGATGTATAGTGACTACATGA
GTAGCTTCAAGGAAAACATGTTGGAGTTACTAGAAGCTGGAACCATTGTTGACATTGAGG
TCGGTCTTGGTCCTGCCGGTGAGCTTCGTTACCCTTCTTATCCACAAAGCCAAGGATGGG
TGTTTCCAGGCATTGGAGAATTCCAGTGTTACGATAAGTACTTGAAGAAAGAATTCAAGG
AAGCAGCCGCGAAAGCAGTCATCCGGAGTGGGATCTGCCCGAGACG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2DL13TF 803 0 0
G
GAGCTTCAGCTACTACTACTTATTGCTTATTAATTCCTAAAAAGCTTTAAAATGGCTGCA
AATTACAACGAGAAGCTTCTTCTCAACTATGTTCCCGTATACGTTATGCTTCCGTTGGGA
GTGGTGAATGTGGAAAACGTATTCGTGGACCCTGAAACGCTTGAAACGCAGCTCAAGCGT
CTCAAAGAAGAAGCTGGAATCGATGGCGTTATGGTCGACGTTTGGTGGGGAATCATTGAA
TCCAAAGGCTCAAAACAATATGACTGGACCGCTTACAAAACGCTTTTCCAGCTAATCGCA
CGTTTAGGACTCAAAATCCAAGCAATCATGTCATTTCACCAATGCGGTGGAAACGTTGGC
GACGTCGTCACTATCCCAATCCCGAAATGGGTTCGAGAGGTTGGTGAGAGCGATCCAGAT
ATCTACTACACTAACCGTAGAGGAACAAGAGATATTGAGTATCTCTCACTCGGTGTCGAC
AATCTTCCTCTCTTTGCTGGAAGAACTCCTGTTCAGATGTATAGTGACTACATGAGTAGC
TTCAAGGAAAACATGTTGGAGCTACTAGAAGCTGGAACCATTGTTGACATTGAGGTCGGT
CTTGGTCCTGCCGGTGAGCTTCGTTACCCTTCTTATCCACAAAGCCAAG*ATGGGTATTT
CCAGGCATTGGAGAGTTTCAGTGTTATGATAAGTACTTGAAGAA*GAATTCAAG*AAGCA
GCCGCGAA*GCAGTCATCCGGAGTGG*ATCTGCCGGAGACGCCGAGATACACGATAGCCG
AGGAAACTGGGTTTTTAGACAA

QA 2 803 2 803
DS 



AS 1 2

CO CL4764Contig1 1411 2 2 U
GGAACTCAAAACTCAGACTCCAATTCTCTACCTGTTTAGGTCACATAAAAGATGGAGAAC
TCTAGCCTGAAGGATCTTTCACGAATCCTCCCTCGCGTCCTTGTTGTCTCTAGACGCACA
CTTCGCAAGAATAAATTTGTTGATTTCGTTGGTGAATACCATCTTGATCTTATAGTCGAG
TATGGTGCTGTCCCGGTGATTGTACCACGAGTAGCTGGCGTTGACAAGTTACTCGAAAGC
TTCAAGCCCATCCATGGAGTTCTTCTCTGTGAGGGAGAAGACATCGACCCTTCTTTCTAC
GAGTCAGAAATATCATCCCTTTCACCTGAAGAACTCGATGAGATCCGGAAAACACACGCG
AGTGATGCAGCTATTGACAAGGAAAAAGACTCTATTGAGTTTGCTCTTGCCAAGCTATGC
CTTGAACAGAACATTCCTTACTTGGGAATTTGCAGAGGATCACAAGTTTTGAATGTTGCT
TGTGGTGGGAGTCTATATCAGGACCTGGAGAAAGAGATCACAACTAAGCTCCCCGAAGAA
CGTAGAAGAAAGCACATTGATTATGATGACTATGATGGTTATAGACATGAGGTGAAGATA
GTAGAAAACAGTCCTTTGCATAAATGGTTCAAAGATTCCTTGGATGAAGAAACTATGGAG
ATATTGGTCAACAGTTATCATCACCAGGGGGTTAAGAGATTGGCTCAGGGATTCGTGCCA
ATGGCCTTTGCTCCGGATGGATTGATCGAAGGGTTTTATGATCCTGATATGTATAATCCC
AAAGAAGGCAAGTTTCTCATGGGTTTACAGTTCCATCCAGAGAGGATGAGAAAGAATGGT
CTGGAAGAATTCGATTTCCCTGGTTGTCCTCGTGCTTATCAGGAATTTGCTAAGGCAGTT
ATAGCATATCAAAAGAAAGTGAATAGCTCATTGTCTGTTCCTAAAAAATTGGAACTCAAT
CCAGAGATGGAGAACAAAAGAAAGATACTTGTCAGGAGCTTCTCGCTTGCAAGTCAATGT
ACACCAGATCTTATTCGATGAAGAACCAATCCACAGAATCAGAACTCGACGTTGGAGCTG
AGTTTCTTGAGTCAAATACGGCCTTAAGTATGGATCAAGAGATGAAGCTCAGAGAGATGG
GTGCTACGACGAGGAACGGAGGATCATTTACGCAAAAGCTGAAGCTTGATGAGGATAAGC
AGAGAAAAGCAATGAACATAATGAAGAAGATGAACGTGGAGCGACTCTCTGAGCTCATTG
CTTTCTATACCTTGATGGGGAAGATCTCTAGTGAGGTATTGGAGAGAAAGCTTAATGGCT
CACTCGATGACCACAGTCTCACTCCTCAATGGCGTCAGAAAAACGCTGAATGTTAAAATT
TGGTTATTATATATATATTTTTTTTTTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C091TF U 1
AF RR2C091JQ C 618
BS 1 700 RR2C091TF
BS 701 1411 RR2C091JQ

RD RR2C091TF 705 0 0
GGAACTCAAAACTCAGACTCCAATTCTCTACCTGTTTAGGTCACATAAAAGATGGAGAAC
TCTAGCCTGAAGGATCTTTCACGAATCCTCCCTCGCGTCCTTGTTGTCTCTAGACGCACA
CTTCGCAAGAATAAATTTGTTGATTTCGTTGGTGAATACCATCTTGATCTTATAGTCGAG
TATGGTGCTGTCCCGGTGATTGTACCACGAGTAGCTGGCGTTGACAAGTTACTCGAAAGC
TTCAAGCCCATCCATGGAGTTCTTCTCTGTGAGGGAGAAGACATCGACCCTTCTTTCTAC
GAGTCAGAAATATCATCCCTTTCACCTGAAGAACTCGATGAGATCCGGAAAACACACGCG
AGTGATGCAGCTATTGACAAGGAAAAAGACTCTATTGAGTTTGCTCTTGCCAAGCTATGC
CTTGAACAGAACATTCCTTACTTGGGAATTTGCAGAGGATCACAAGTTTTGAATGTTGCT
TGTGGTGGGAGTCTATATCAGGACCTGGAGAAAGAGATCACAACTAAGCTCCCCGAAGAA
CGTAGAAGAAAGCACATTGATTATGATGACTATGATGGTTATAGACATGAGGTGAAGATA
GTAGAAAACAGTCCTTTGCATAAATGGTTCAAAGATTCCTTGGATGAAGAAACTATGGAG
ATATTGGTCAACAGTTATCATCACCAGGGGGTTAAGAGAT
GGCTC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2C091JQ 794 0 0
GCATAAATGGTTCAAAGATTC*TTGGATGAAGAAACTATGGAGATATTGGTCAACAGTTA
TCATCACCAGGGGGTTAAGAGATTGGCTCAGGGATTCGTGCCAATGGCCTTTGCTCCGGA
TGGATTGATCGAAGGGTTTTATGATCCTGATATGTATAATCCCAAAGAAGGCAAGTTTCT
CATGGGTTTACAGTTCCATCCAGAGAGGATGAGAAAGAATGGTCTGGAAGAATTCGATTT
CCCTGGTTGTCCTCGTGCTTATCAGGAATTTGCTAAGGCAGTTATAGCATATCAAAAGAA
AGTGAATAGCTCATTGTCTGTTCCTAAAAAATTGGAACTCAATCCAGAGATGGAGAACAA
AAGAAAGATACTTGTCAGGAGCTTCTCGCTTGCAAGTCAATGTACACCAGATCTTATTCG
ATGAAGAACCAATCCACAGAATCAGAACTCGACGTTGGAGCTGAGTTTCTTGAGTCAAAT
ACGGCCTTAAGTATGGATCAAGAGATGAAGCTCAGAGAGATGGGTGCTACGACGAGGAAC
GGAGGATCATTTACGCAAAAGCTGAAGCTTGATGAGGATAAGCAGAGAAAAGCAATGAAC
ATAATGAAGAAGATGAACGTGGAGCGACTCTCTGAGCTCATTGCTTTCTATACCTTGATG
GGGAAGATCTCTAGTGAGGTATTGGAGAGAAAGCTTAATGGCTCACTCGATGACCACAGT
CTCACTCCTCAATGGCGTCAGAAAAACGCTGAATGTTAAAATTTGGTTATTATATATATA
TTTTTTTTTTGGCC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL4765Contig1 1241 2 2 U
GTGAGGGGGATCAACGCTTTCTTGCCGCCACTTCTTTCTATACTTCTAAAGGAAAGTCCT
CCGCTGCAAGTAATGAGATTGAGGTGTCACTTCTCATGCTTGTACTCAATTCCATTGCAG
CAATCACGAAACTTGGCCCGGCAAAATTTTCCTGCCCGCCCTTCTTTTCGTCGCTTCCAG
ACACAACTGGAAGACTGATGGAAAAAGTTGTAGACTTCGTTCCACTCCCTCAAGCGTATC
ATTCAATCAAAAGCATAGGCCTACAAAGAGAATTTCTTACTCATTTTGGTCCTCGGGCAG
CACTGGGCAGAGTACAAGGTGACTCTGCTACAGATGAAGTTGTTTTCTGGGTTGATCTTA
TACAGAAACAACTGCAGCGGGCTATAGATCGGGAGAAAATATGGTCAAGGTTAACAACTT
CCGAAAGTATAGAGGTTTTGGAGAGGGATTTAGCCATCTTTGGATTCTTCATTGCCTTGG
GCAGGAGCACGCAGTCCTATTTAGCTGCAAATGGTTTTGATTCTCTTGAGAACCCTTTGG
AAGACCTTGTTAGGCATCTCATTGGGGGCAGCGTCCTGTACTATCCACAACTTTCAGCCA
TCAGTTCATACCAACTGTATGTAGAGGTTGTTTGCGAAGAACTAGAATGGATTCCTTTCT
ATCCGAACAGTACTGGCGCACAGCCTCCAAAACAATCACACGGGCATAGGAGCAAACCAG
AAGGGCCACCTAATTACGAAGTGATTCCCCAAGTGCTGGATGTTTGCTCTTATTGGCTAC
AGAGCTTCATTAAACATAGTAAATGGCCAGAGAACCCTTCTAATGTCAAGGCAGCAAAAT
TCCTATCCAAGGGGCACAAGAGTGTGATTCGGTGCAGGGAAGAACTAGCGATATCAAAGA
ATGCGTCATCAGCTGTTAGAGAGTCGGACTCATTTGACAAGGCCCTAGAAAGTGTAGATG
AAGCCCTCGTGAGATTGGAAAGCCTGCTACAGGAGTTGTATGTATCCAACTCATCGTCTG
GAAAGGAACAAATAAAAGCCGCTTGCTCTGACCTAGAGAAAATACGGAAGCTTAAAAAAG
AGGCTGAGTTTTTGGAGGCAACATTCAGAGCCAAAACAGCTTTCCTGAACTCGGTCAGAT
ATGTAATATTCAAAAACTTAACCTTACTATGTTCATATCTCATTCCTTGTATTACTTCAG
AGATATAACTGTTGTGGATAGGGTCAGGTTCCATCTTCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO43TF U 1
AF RR2DO43JQ C 480
BS 1 561 RR2DO43TF
BS 562 1241 RR2DO43JQ

RD RR2DO43TF 561 0 0
GTGAGGGGGATCAACGCTTTCTTGCCGCCACTTCTTTCTATACTTCTAAAGGAAAGTCCT
CCGCTGCAAGTAATGAGATTGAGGTGTCACTTCTCATGCTTGTACTCAATTCCATTGCAG
CAATCACGAAACTTGGCCCGGCAAAATTTTCCTGCCCGCCCTTCTTTTCGTCGCTTCCAG
ACACAACTGGAAGACTGATGGAAAAAGTTGTAGACTTCGTTCCACTCCCTCAAGCGTATC
ATTCAATCAAAAGCATAGGCCTACAAAGAGAATTTCTTACTCATTTTGGTCCTCGGGCAG
CACTGGGCAGAGTACAAGGTGACTCTGCTACAGATGAAGTTGTTTTCTGGGTTGATCTTA
TACAGAAACAACTGCAGCGGGCTATAGATCGGGAGAAAATATGGTCAAGGTTAACAACTT
CCGAAAGTATAGAGGTTTTGGAGAGGGATTTAGCCATCTTTGGATTCTTCATTGCCTTGG
GCAGGAGCACGCAGTCCTATTTAGCTGCAAATGGTTTTGATTCTCTTGAGAACCCTTTGG
AAGACCTTGTTAGGCATCTCA

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2DO43JQ 762 0 0
GGCAGGAGCACGCAGTCCTATTTAGCTGCAAATGGTTTTGATTCTCTTGAGAACCCTTTG
GAAGACCTTGTTAGGCATCTCATTGGGGGCAGCGTCCTGTACTATCCACAACTTTCAGCC
ATCAGTTCATACCAACTGTATGTAGAGGTTGTTTGCGAAGAACTAGAATGGATTCCTTTC
TATCCGAACAGTACTGGCGCACAGCCTCCAAAACAATCACACGGGCATAGGAGCAAACCA
GAAGGGCCACCTAATTACGAAGTGATTCCCCAAGTGCTGGATGTTTGCTCTTATTGGCTA
CAGAGCTTCATTAAACATAGTAAATGGCCAGAGAACCCTTCTAATGTCAAGGCAGCAAAA
TTCCTATCCAAGGGGCACAAGAGTGTGATTCGGTGCAGGGAAGAACTAGCGATATCAAAG
AATGCGTCATCAGCTGTTAGAGAGTCGGACTCATTTGACAAGGCCCTAGAAAGTGTAGAT
GAAGCCCTCGTGAGATTGGAAAGCCTGCTACAGGAGTTGTATGTATCCAACTCATCGTCT
GGAAAGGAACAAATAAAAGCCGCTTGCTCTGACCTAGAGAAAATACGGAAGCTTAAAAAA
GAGGCTGAGTTTTTGGAGGCAACATTCAGAGCCAAAACAGCTTTCCTGAACTCGGTCAGA
TATGTAATATTCAAAAACTTAACCTTACTATGTTCATATCTCATTCCTTGTATTACTTCA
GAGATATAACTGTTGTGGATAGGGTCAGGTTCCATCTTCGCC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL4766Contig1 742 2 1 U
GGATCTTAGCTCTTTTAACTAACCCCCCGCTTCTTTGGACTTCTCTAGCTAGCTCGCTGC
CTTGTTCTTCCAATGGAGTCTTCTGCAGCTCTCGGATCTCTCCCTCAGACTTTTGGTTCC
TCCATAAATGTTCACTCGCTTTCTGGTAACTGGTCTGCCTCTGAAAAAGTGTCTCCATTT
ATTAATGCTGCATACCGAAAATCATCGAAGTTGGCTGCTTTGGATGCATCTGGATCCAAC
AACTATGTCCTAGTCACATCACCTTCAGTGGGCAAGTTTCAGAGAAGCAGAACTGTAAAG
GGAAAGAAACAAGGTCCTAGCTGCAAAGAGGGTGATGCAATAAAGGAAGGCCAAGTGATT
GGATACGTACATCAGTTGGGAAAAGAACTTCCAGTAACGTCTGATGTAGCTGGCGAAGTT
CTCAAGCTTCTTTCGGATGATGGAGACTCTATAGGGTATGGGGAGCCTCTGGTTGCGGTC
TTGCCATCGTTCCATGATATCAACATCCAGTGATGATGTCAGCGCAGTTCCACAATAAAT
TAATAGCATCTTCATCTGGAGACTGTACTCTTCTTCATCTTTCCCTTTTATGGAGTTTGA
GAATCTATTTTGATCTTCATCTTTGATCACATGATTTGTGTGGAGATTTAATTCCTGAAC
ATGTGACACGCAGCTATATTGTTTTTGTCACTCTTTTGGAGTTTTGGTTCGTCTTAATAT
GGGATCATCTATTTTTCTGCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B664JQ C 1
AF RR2B664TF U 1
BS 1 742 RR2B664TF

RD RR2B664JQ 742 0 0
GGATCTTAGCTCTTTTAACTAACCCCCCGCTTCTTTGGACTTCTCTAGCTAGCTCGCTGC
CTTGTTCTTCCAATGGAGTCTTCTGCAGCTCTCGGATCTCTCCCTCAGACTTTTGGTTCC
TCCATAAATGTTCACTCGCTTTCTGGTAACTGGTCTGCCTCTGAAAAAGTGTCTCCATTT
ATTAATGCTGCATACCGAAAATCATCGAAGTTGGCTGCTTTGGATGCATCTGGATCCAAC
AACTATGTCCTAGTCACATCACCTTCAGTGGGCAAGTTTCAGAGAAGCAGAACTGTAAAG
GGAAAGAAACAAGGTCCTAGCTGCAAAGAGGGTGATGCAATAAAGGAAGGCCAAGTGATT
GGATACGTACATCAGTTGGGAAAAGAACTTCCAGTAACGTCTGATGTAGCTGGCGAAGTT
CTCAAGCTTCTTTCGGATGATGGAGACTCTATAGGGTATGGGGAGCCTCTGGTTGCGGTC
TTGCCATCGTTCCATGATATCAACATCCAGTGATGATGTCAGCGCAGTTCCACAATAAAT
TAATAGCATCTTCATCTGGAGACTGTACTCTTCTTCATCTTTCCCTTTTATGGAGTTTGA
GAATCTATTTTGATCTTCATCTTTGATCACATGATTTGTGTGGAGATTTAATTCCTGAAC
ATGTGACACGCAGCTATATTGTTTTTGTCACTCTTTTGGAGTTTTGGTTCGTCTTAATAT
GGGATCATCTATTTTTCTGCAC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2B664TF 742 0 0
GGATCTTAGCTCTTTTAACTAACCCCCCGCTTCTTTGGACTTCTCTAGCTAGCTCGCTGC
CTTGTTCTTCCAATGGAGTCTTCTGCAGCTCTCGGATCTCTCCCTCAGACTTTTGGTTCC
TCCATAAATGTTCACTCGCTTTCTGGTAACTGGTCTGCCTCTGAAAAAGTGTCTCCATTT
ATTAATGCTGCATACCGAAAATCATCGAAGTTGGCTGCTTTGGATGCATCTGGATCCAAC
AACTATGTCCTAGTCACATCACCTTCAGTGGGCAAGTTTCAGAGAAGCAGAACTGTAAAG
GGAAAGAAACAAGGTCCTAGCTGCAAAGAGGGTGATGCAATAAAGGAAGGCCAAGTGATT
GGATACGTACATCAGTTGGGAAAAGAACTTCCAGTAACGTCTGATGTAGCTGGCGAAGTT
CTCAAGCTTCTTTCGGATGATGGAGACTCTATAGGGTATGGGGAGCCTCTGGTTGCGGTC
TTGCCATCGTTCCATGATATCAACATCCAGTGATGATGTCAGCGCAGTTCCACAATAAAT
TAATAGCATCTTCATCTGGAGACTGTACTCTTCTTCATCTTTCCCTTTTATGGAGTTTGA
GAATCTATTTTGATCTTCATCTTTGATCACATGATTTGTGTGGAGATTTAATTCCTGAAC
ATGTGACACGCAGCTATATTGTTTTTGTCACTCTTTTGGAGTTTTGGTTCGTCTTAATAT
GGGATCATCTATTTTTCTGCAC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL4767Contig1 584 2 1 U
GCAAAAGGAGAATAAGAAGAAGGTCATCTCCCTTGCTCCGATCGCTAAACCCCTTGCCGG
CAAAAAGCTCCAAAAGAGGACATTCAAACTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAGAAATGTTT
GAAGAGAGGTGTAAAGGAAGTGGTTAAGAGCATAAGACGTGGCCAAAAAGGAATATGTGT
TATAGCTGGAAACATATCTCCCATTGATGTGATTACACATCTTCCAATCTTGTGCGAGGA
AGCTGGTGTTCCTTACCTCTACGTTCCTTCCAAAGAGGATCTTGCGCAAGCTGGTTCTAC
AAAACGACCAACTTGTTGTGTATTGGTCATGCTTAAACCGGCAAAAGGAGAGCTAAGTGC
AGAAGATCTTGAAAAGCTAAAGACAGACTACGAACAAGTCTCTGACGATGTTAAAGAGCT
TGCCTCTGATGTAATCTGATTAGAAACTAGTATCAAAGAACAAACTTAACATTTGTTTCT
ATTTTGCTTAATGAATATGATTATGTTAATCAGAGTTGGTATCAATTTTGTTGACGTCTT
TATTGTAGTGGTTTTGTATTGACTTTGATTTAGAAATCCGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FM83TF U 1
AF RR2FM83JQ C 30
BS 1 584 RR2FM83TF

RD RR2FM83TF 584 0 0
GCAAAAGGAGAATAAGAAGAAGGTCATCTCCCTTGCTCCGATCGCTAAACCCCTTGCCGG
CAAAAAGCTCCAAAAGAGGACATTCAAACTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAGAAATGTTT
GAAGAGAGGTGTAAAGGAAGTGGTTAAGAGCATAAGACGTGGCCAAAAAGGAATATGTGT
TATAGCTGGAAACATATCTCCCATTGATGTGATTACACATCTTCCAATCTTGTGCGAGGA
AGCTGGTGTTCCTTACCTCTACGTTCCTTCCAAAGAGGATCTTGCGCAAGCTGGTTCTAC
AAAACGACCAACTTGTTGTGTATTGGTCATGCTTAAACCGGCAAAAGGAGAGCTAAGTGC
AGAAGATCTTGAAAAGCTAAAGACAGACTACGAACAAGTCTCTGACGATGTTAAAGAGCT
TGCCTCTGATGTAATCTGATTAGAAACTAGTATCAAAGAACAAACTTAACATTTGTTTCT
ATTTTGCTTAATGAATATGATTATGTTAATCAGAGTTGGTATCAATTTTGTTGACGTCTT
TATTGTAGTGGTTTTGTATTGACTTTGATTTAGAAATCCGAAGC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2FM83JQ 555 0 0
CCCTTGCTCCGATCGCTAAACCCCTTGCCGGCAAAAAGCTCCAAAAGAGGACATTCAAAC
TCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAGAAATGTTTGAAGAGAGGTGTAAAGGAAGTGGTTAAGA
GCATAAGACGTGGCCAAAAAGGAATATGTGTTATAGCTGGAAACATATCTCCCATTGATG
TGATTACACATCTTCCAATCTTGTGCGAGGAAGCTGGTGTTCCTTACCTTTACGTTCCTT
CCAAAGAGGATCTTGCGCAAGCTGGTTTTACAAAACGACCAACTTGTTGTGTATTGGTCA
TGCTTAAACCGGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAAGATCTTGAAAAGCTAAAGACAGACT
ACGAACAAGTTTCTGACGATGTTAAAGAGCTTGCCTCTGATGTAATCTGATTAGAAACTA
GTATCAAAGAACAAACTTAACATTTGTTTTTATTTTGCTTAATGAATATGATTATGTTAA
TCAGAGTTGGTATCAATTTTGTTGACGTCTTTATTGTAGTGGTTTTGTATTGACTTTGAT
TTAGAAATCCGAAGC

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

CO CL4768Contig1 478 2 1 U
GGGATTGTACAAATAGAAACACTTCATTTATTTCCCAAAATTTTAACCCACTATCAATCC
ATTTCTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTCTACTCTTATTCACCTTATTAATTGCCTT
CATCATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATGCGCAGAAAAAGGAGAAAAAACTATGTCC
TTCTCCAATCAAGTTAGGCCGTTTTTGTCTTCCAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAA
GAAATTCCCAACTCCTCGTATTGGTTTTGGTAGTGGTTTTTGTGCAGATTTAGAGAAGGG
AATTTGTAACTTTGTGAATATAATACACAACCTAAATTCTATATTACCGTTTTAACTAAA
ATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTATGATATTTGTATCGGATCTTT
GGTTTATTTATAATAAATAACAATATGAATGTTAAATAATTGCAATCTTTATTAATAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FG83JQ C 1
AF RR2FG83TF U 1
BS 1 478 RR2FG83TF

RD RR2FG83JQ 478 0 0
GGGATTGTACAAATAGAAACACTTCATTTATTTCCCAAAATTTTAACCCACTATCAATCC
ATTTCTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTCTACTCTTATTCACCTTATTAATTGCCTT
CATCATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATGCGCAGAAAAAGGAGAAAAAACTATGTCC
TTCTCCAATCAAGTTAGGCCGTTTTTGTCTTCCAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAA
GAAATTCCCAACTCCTCGTATTGGTTTTGGTAGTGGTTTTTGTGCAGATTTAGAGAAGGG
AATTTGTAACTTTGTGAATATAATACACAACCTAAATTCTATATTACCGTTTTAACTAAA
ATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTATGATATTTGTATCGGATCTTT
GGTTTATTTATAATAAATAACAATATGAATGTTAAATAATTGCAATCTTTATTAATAA

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2FG83TF 478 0 0
GGGATTGTACAAATAGAAACACTTCATTTATTTCCCAAAATTTTAACCCACTATCAATCC
ATTTCTGTTATCCACGATGAGGAAATCCCTTCTACTCTTATTCACCTTATTAATTGCCTT
CATCATTCTTTCACTAGGAATGACGACAAATGCGCAGAAAAAGGAGAAAAAACTATGTCC
TTCTCCAATCAAGTTAGGCCGTTTTTGTCTTCCAGCACTATGTCGAAGTGAGTGTAAGAA
GAAATTCCCAACTCCTCGTATTGGTTTTGGTAGTGGTTTTTGTGCAGATTTAGAGAAGGG
AATTTGTAACTTTGTGAATATAATACACAACCTAAATTCTATATTACCGTTTTAACTAAA
ATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTATGATATTTGTATCGGATCTTT
GGTTTATTTATAATAAATAACAATATGAATGTTAAATAATTGCAATCTTTATTAATAA

QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 2

CO CL4769Contig1 863 2 2 U
GGGTGGGTGAATAGATCTGAATCATCAGAATTCAGAACCCTTTAATAGCAAAGAACCCTA
GATTGGATTCTAATCGATTCACAGTAGTGAGCAGCAGGGTTTTTGGATTCTCGATCCTGT
CTTTGCATCGGATCTATCTTCTTTAGAAATCAAAATCGGCAAAAAAAAAAATGAAAGAAG
GGAGATCTGGGAAGTCGAATCATCATCATCAAGACCACGATGAACATGTTCACCACCAAA
ACAGTCATCTCAGTTCTTTCAAATTCGCCAAACTGTTCGATTCAGATGCTTCCTGGGACA
AGGACCAACTAGGAGATGTGTTGCATTGGATCAGACAAGTTGTTGGATTACTCTGCGGTT
TGCTTTGGTGTGCCATACCTTTGGTCGGAGGCATCTGGTTACTTCTGTTTCTGGCAATTT
CTTCAGGGATTGTATACGGTTACTATGCACTGATTCTGAAGATCGATGAAGAAGACTATG
GTGGTCATGCAGCTCTGCTCCAGGACGGTCTTTTTGCTTCTCTTAGTGTATTCCTGCTTG
CGTGGATTCTGGTGTATAGCTTGTCTAGCTTCTGACAGACAGAGACACACTGTCTTGCGC
TTGAGTTTGCGTTACCCCCCCTGCTCGGAAGAATTTTAGCAGAAGGTGGATTTCATGGTG
TCAAGTGTCCGACGACATTCTTCTTTTTACATTTGTTTTTGACGCTTTTGTTTTGCACAA
GATGAGAACTAGCTTTTCTTTGGTTTTCCTCAAGTATATTATCGTTTTGTTTTGTTTAAT
AAATTACGGAGTCTGTTTATGCTACAAAACGGTATTTCTTCCTGTTTTGGACAAAAGAAA
AACAATAGTATCGAACTATTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A551TF U 1
AF RR2A551JQ C 105
BS 1 808 RR2A551TF
BS 809 863 RR2A551JQ

RD RR2A551TF 814 0 0
GGGTGGGTGAATAGATCTGAATCATCAGAATTCAGAACCCTTTAATAGCAAAGAACCCTA
GATTGGATTCTAATCGATTCACAGTAGTGAGCAGCAGGGTTTTTGGATTCTCGATCCTGT
CTTTGCATCGGATCTATCTTCTTTAGAAATCAAAATCGGCAAAAAAAAAAATGAAAGAAG
GGAGATCTGGGAAGTCGAATCATCATCATCAAGACCACGATGAACATGTTCACCACCAAA
ACAGTCATCTCAGTTCTTTCAAATTCGCCAAACTGTTCGATTCAGATGCTTCCTGGGACA
AGGACCAACTAGGAGATGTGTTGCATTGGATCAGACAAGTTGTTGGATTACTCTGCGGTT
TGCTTTGGTGTGCCATACCTTTGGTCGGAGGCATCTGGTTACTTCTGTTTCTGGCAATTT
CTTCAGGGATTGTATACGGTTACTATGCACTGATTCTGAAGATCGATGAAGAAGACTATG
GTGGTCATGCAGCTCTGCTCCAGGACGGTCTTTTTGCTTCTCTTAGTGTATTCCTGCTTG
CGTGGATTCTGGTGTATAGCTTGTCTAGCTTCTGACAGACAGAGACACACTGTCTTGCGC
TTGAGTTTGCGTTACCCCCCCTGCTCGGAAGAATTTTAGCAGAAGGTGGATTTCATGGTG
TCAAGTGTCCGACGACATTCTTCTTTTTACATTTGTTTTTGACGCTTTTGTTTTGCACAA
GATGAGAACTAGCTTTTCTTTGGTTTTCCTCAAGTATATTATCGTTTTGTTTTGTTTAAT
AAATTACGGAGTCTGTTTATGCTACAAA
CGGTAT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2A551JQ 759 0 0
GGATTCTCGATCCTGTCTTTGCATCGGATCTATCTTCTTTAGAAATCAAAATCGGCAAAA
AAAAAAATGAAAGAAGGGAGATCTGGGAAGTCGAATCATCATCATCAAGACCACGATGAA
CATGTTCACCACCAAAACAGTCATCTCAGTTCTTTCAAATTCGCCAAACTGTTCGATTCA
GATGCTTCCTGGGACAAGGACCAACTAGGAGATGTGTTGCATTGGATCAGACAAGTTGTT
GGATTACTTTGCGGTTTGCTTTGGTGTGCCATACCTTTGGTCGGAGGCATCTGGTTACTT
CTGTTTCTGGCAATTTCTTCAGGGATTGTATACGGTTACTATGCACTGATTCTGAAGATC
GATGAAGAAGACTATGGTGGTCATGCAGCTTTGCTCCAGGACGGTCTTTTTGCTTCTCTT
AGTGTATTCCTGCTTGCGTGGATTCTGGTGTATAGCTTGTCTAGCTTCTGACAGACAGAG
ACACACTGTCTTGCGCTTGAGTTTGCGTTACCCCCCCTGCTCGGAAGAATTTTAGCAGAA
GGTGGATTTCATGGTGTCAAGTGTCCGACGACATTCTTCTTTTTACATTTGTTTTTGACG
CTTTTGTTTTGCTCAAGATGAGAACTAGCTTTTCTTTGGTTTTCCTCAAGTATATTATCG
TTTTGTTTTGTTTAATAAATTACGGAGTCTGTTTATGCTACAAAACGGTATTTCTTCCTG
TTTTGGACAAAAGAAAAACAATAGTATCGAACTATTTCG

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL4770Contig1 512 2 1 U
GAATCCATCCGCCATTGCAATGGCCGCGAAGCTCTCTCTCTCCTCCGCCACAGCCGTTTT
CTCTCTCCTCGTCTGTTTCTATCCGTCGTCATCTTCGTCGGATGGCTTGTGTTTAGTAAG
GAGACTGGGGAGCTGGAGTACGAGGTAACGTTTAAGAGTGTTGTGCTTGGTGGCGGGGTT
GGATCGGTTCCGGGTCATGAGTTCGGGTCGATTGTATGGACAGATGGTGAGCATGTTGTT
AAGAGCCCGGTGGCTGTTCAGTGGAGTCAGGGCTCAGTTCAGTCATTCTGATTGATGATT
AAGTTGGGCTTTGGATTTCGATTGGGTTTATTAATGGGTCGAGTTGTAAATTGAGCCCAT
CATTTTACTCATTGTTGAGCCCTTACTCTTGGGTTAGAAGAGTACTATGCATGGGGTGAA
TGGACAGACAATTCGATTTGCATTGTGAAATGTTTTCATGTAATAAAACAGTCCATTTCG
TTACAATTGAAAAAAAAAGAGTCGTTTTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EY77TF U 1
AF RR2EY77JQ C 48
BS 1 512 RR2EY77TF

RD RR2EY77TF 512 0 0
GAATCCATCCGCCATTGCAATGGCCGCGAAGCTCTCTCTCTCCTCCGCCACAGCCGTTTT
CTCTCTCCTCGTCTGTTTCTATCCGTCGTCATCTTCGTCGGATGGCTTGTGTTTAGTAAG
GAGACTGGGGAGCTGGAGTACGAGGTAACGTTTAAGAGTGTTGTGCTTGGTGGCGGGGTT
GGATCGGTTCCGGGTCATGAGTTCGGGTCGATTGTATGGACAGATGGTGAGCATGTTGTT
AAGAGCCCGGTGGCTGTTCAGTGGAGTCAGGGCTCAGTTCAGTCATTCTGATTGATGATT
AAGTTGGGCTTTGGATTTCGATTGGGTTTATTAATGGGTCGAGTTGTAAATTGAGCCCAT
CATTTTACTCATTGTTGAGCCCTTACTCTTGGGTTAGAAGAGTACTATGCATGGGGTGAA
TGGACAGACAATTCGATTTGCATTGTGAAATGTTTTCATGTAATAAAACAGTCCATTTCG
TTACAATTGAAAAAAAAAGAGTCGTTTTCTTG

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2EY77JQ 465 0 0
CCACAGCCGTTTTCTCTCTCCTCGTCTGTTTCTATCCGTCGTCATCTTCGTCGGATGGCT
TGTGTTTAGTAAGGAGACTGGGGAGCTGGAGTACGAGGTAACGTTTAAGAGTGTTGTGCT
TGGTGGCGGGGTTGGATCGGTTCCGGGTCATGAGTTCGGGTCGATTGTATGGACAGATGG
TGAGCATGTTGTTAAGAGCCCGGTGGCTGTTCAGTGGAGTCAGGGCTCAGTTCAGTCATT
CTGATTGATGATTAAGTTGGGCTTTGGATTTCGATTGGGTTTATTAATGGGTCGAGTTGT
AAATTGAGCCCATCATTTTACTCATTGTTGAGCCCTTACTCTTGGGTTAGAAGAGTACTA
TGCATGGGGTGAATGGACAGACAATTCGATTTGCATTGTGAAATGTTTTCATGTAATAAA
ACAGTCCATTTCGTTACAATTGAAAAAAAAAGAGTCGTTTTCTTG

QA 1 465 1 465
DS 



AS 1 2

CO CL4771Contig1 787 2 1 U
GGGTCGCTCATTTTCACAGAAGAGGTTTTCTCTGGAAAAATAATGGCGGGTTGGCAGAGT
AATCTACAGTTAATTCGTCAAGTTGCGGGAAGAGTGACGAACAGTAACATTTCGACAGCC
AATTACTCTTCAGCTCGTAGTTTGGAATCCCCTTTCTCAAAAGGTTACTTGCAGGGTCTG
TTGAGACCAACCTACACCTCAACACCACTGCATCATTATCTACAGCAAGTGGGGATTTCG
ACCTCAAGAAAACTCAAGGCTGGTGAAGAGCCTGTTTCATCACCTTTGTCATCTCCAGCT
CTGTTGGGTACTAGAAAAGAAGAAGAAGATGAGCAGAAGATTATCCCTAAGCGTAAGAAA
GTGCAGGCTGTACTCAAGGCCATTAAGCAGAGTCCTAAGAAGGTCAACCTAGTTGCAGCG
CTAGTACGTGGTATGCGAGTTGAAGATGCTCTGATGCAACTGCAAGTCACTGTTAAACGG
GCTTCCCATACCGTGTACCGGGTTATCCACGCCGCCCGAGCTAATGCTTCTCATAACCAT
GGACTAGATCCTGACCGTCTCATCATTGCGGAAGCGTTTGTTGGGAAGGGATTCTTCAAG
AAGAGGATATCTATCCATGGAAAAGGAAAATCCGGGGTGATGATAAGACCCGAGTGTCGT
CTAACTGTCGTAGTTAGAGAGACGACTCCAGAGGAGAAGCTGAGATTGCCAAGCTCCAGG
TCACACTGCAGAGAGCTAAGCAAGCGGGAGAGGAGGCTTGTCCCTTCAGCTCATTGAGAC
ACTCCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL90TF U 202
AF RR2BV77TF U 1
BS 1 787 RR2BV77TF

RD RR2FL90TF 101 0 0
AGGG
CACTGCATCATTATCTACAGCAAGTGGGGATTTCGACCTCAAGAAAACTCAAGGCTGGTG
AAGAGCCTGTTTC*TCACCTTTGTCATCTCCAGCTCT

QA 5 101 5 101
DS 

RD RR2BV77TF 787 0 0
GGGTCGCTCATTTTCACAGAAGAGGTTTTCTCTGGAAAAATAATGGCGGGTTGGCAGAGT
AATCTACAGTTAATTCGTCAAGTTGCGGGAAGAGTGACGAACAGTAACATTTCGACAGCC
AATTACTCTTCAGCTCGTAGTTTGGAATCCCCTTTCTCAAAAGGTTACTTGCAGGGTCTG
TTGAGACCAACCTACACCTCAACACCACTGCATCATTATCTACAGCAAGTGGGGATTTCG
ACCTCAAGAAAACTCAAGGCTGGTGAAGAGCCTGTTTCATCACCTTTGTCATCTCCAGCT
CTGTTGGGTACTAGAAAAGAAGAAGAAGATGAGCAGAAGATTATCCCTAAGCGTAAGAAA
GTGCAGGCTGTACTCAAGGCCATTAAGCAGAGTCCTAAGAAGGTCAACCTAGTTGCAGCG
CTAGTACGTGGTATGCGAGTTGAAGATGCTCTGATGCAACTGCAAGTCACTGTTAAACGG
GCTTCCCATACCGTGTACCGGGTTATCCACGCCGCCCGAGCTAATGCTTCTCATAACCAT
GGACTAGATCCTGACCGTCTCATCATTGCGGAAGCGTTTGTTGGGAAGGGATTCTTCAAG
AAGAGGATATCTATCCATGGAAAAGGAAAATCCGGGGTGATGATAAGACCCGAGTGTCGT
CTAACTGTCGTAGTTAGAGAGACGACTCCAGAGGAGAAGCTGAGATTGCCAAGCTCCAGG
TCACACTGCAGAGAGCTAAGCAAGCGGGAGAGGAGGCTTGTCCCTTCAGCTCATTGAGAC
ACTCCAA

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL4772Contig1 1239 2 2 U
GGGAACGGATGTGATGCCCCCAATTCCAATAGAGACAAAGCACCATCCATCGTCAGTTGA
CTTGCTGCTTATCAAGCGCCTTGTTACAGACACTTCCAAAAAGACCCTTCTGCAGTTTCT
TCAGAATGAATTTGTGAATATTAACAAAAACCTTGCAGCCCGATTAATTGGGGAAATGGG
ACCCGATTTCAGCCCTGGCATGGCTGTCAAGTCTGTGACAGCTCAGCAAATGGTGCGTAT
ACATCAGTTATTCCGCCAAGCTAAATTTGACGACCCTAGTGGTGATTGTCTTAGCCCGGC
AGGAGAATACAATCTTCGTCTAGGGATTATCAAGGAGCTGCATCCAGATATGGTGGCAAC
GCATTCAGGCAGTGCTCAGGTCTTTGAAGGTCATCCTTTCATTGTTGAAGCTGGTGTTAG
TGTGGGCGGAAGAGATGTAAAACAGGGGATGAACATATTCCGTTTTGCAAACCGTATTCC
TCTCCTTTTTGAACAAGGAGGTGATGTTGTCACCAGGACAGCCTTAAAGAGAATCAATTG
GAATAGCTATAAGATTAATCAGACCCAAGATAAAATAGGAGTATTTGTGAGCATAGTGAG
TACCAAAATCCCTTTCAAAGGGACAGGGAAAGAATACATAGGAGATGACATCAGTGAGAT
AGCTACTGCAGTTAAGTCTGCAATTCAACAATGCTGCATTCAACTGAAATCCAAAATAGT
CAAGAGACTTCAAGCACGCGAACAACAAGAGAAAAACGCAGCTTGAGCAGGTACATACCG
GATGCAACGGGAGCGGTGTACGAGGTTCTAAAGCAAATGACAGAAGGACATACAAATAAG
AGAAAGCGTTACAAAGAGGAAGAAACAGCTATGCTTGAGAAAGTGTCTAAACGTATAATC
ACAAAAGAAACATTGAAAGAAAAACTTGCTGAGCATGTGGAACAGGTGGATTACGAGATG
GCATTAGAGTATGCAGCACAAAGTGGAGTGAGTGAAGAACCCAGAGAAAATATATATCTC
CAACAATGAATCCCAATCATTCCAACTTCATTGACCTTCACAGTCCAACGTTTGTCTTTA
GGCTCATCTCGTAAACTGTTTTCTATTACGACTCATTCTTACGACTCACAGTCCAATTTC
TTCACTTTCTTGTGCGGTGTTTTGTTTAAGAATTGGGAGTTTTCAGACACTCGAAAAGTG
CAAAAAGGGAAATCATTTAATATTTTTATGATTCGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL43TF U 1
AF RR2EL43JQ C 492
BS 1 574 RR2EL43TF
BS 575 1239 RR2EL43JQ

RD RR2EL43TF 574 0 0
GGGAACGGATGTGATGCCCCCAATTCCAATAGAGACAAAGCACCATCCATCGTCAGTTGA
CTTGCTGCTTATCAAGCGCCTTGTTACAGACACTTCCAAAAAGACCCTTCTGCAGTTTCT
TCAGAATGAATTTGTGAATATTAACAAAAACCTTGCAGCCCGATTAATTGGGGAAATGGG
ACCCGATTTCAGCCCTGGCATGGCTGTCAAGTCTGTGACAGCTCAGCAAATGGTGCGTAT
ACATCAGTTATTCCGCCAAGCTAAATTTGACGACCCTAGTGGTGATTGTCTTAGCCCGGC
AGGAGAATACAATCTTCGTCTAGGGATTATCAAGGAGCTGCATCCAGATATGGTGGCAAC
GCATTCAGGCAGTGCTCAGGTCTTTGAAGGTCATCCTTTCATTGTTGAAGCTGGTGTTAG
TGTGGGCGGAAGAGATGTAAAACAGGGGATGAACATATTCCGTTTTGCAAACCGTATTCC
TCTCCTTTTTGAACAAGGAGGTGATGTTGTCACCAGGACAGCCTTAAAGAGAATCAATTG
GAATAGCTATAAGATTAATCAGACCCAAGATAAA

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2EL43JQ 748 0 0
AACAAGGAGGTGATGTTGTCACCAGGACAGCCTTAAAGAGAATCAATTGGAATAGCTATA
AGATTAATCAGACCCAAGATAAAATAGGAGTATTTGTGAGCATAGTGAGTACCAAAATCC
CTTTCAAAGGGACAGGGAAAGAATACATAGGAGATGACATCAGTGAGATAGCTACTGCAG
TTAAGTCTGCAATTCAACAATGCTGCATTCAACTGAAATCCAAAATAGTCAAGAGACTTC
AAGCACGCGAACAACAAGAGAAAAACGCAGCTTGAGCAGGTACATACCGGATGCAACGGG
AGCGGTGTACGAGGTTCTAAAGCAAATGACAGAAGGACATACAAATAAGAGAAAGCGTTA
CAAAGAGGAAGAAACAGCTATGCTTGAGAAAGTGTCTAAACGTATAATCACAAAAGAAAC
ATTGAAAGAAAAACTTGCTGAGCATGTGGAACAGGTGGATTACGAGATGGCATTAGAGTA
TGCAGCACAAAGTGGAGTGAGTGAAGAACCCAGAGAAAATATATATCTCCAACAATGAAT
CCCAATCATTCCAACTTCATTGACCTTCACAGTCCAACGTTTGTCTTTAGGCTCATCTCG
TAAACTGTTTTCTATTACGACTCATTCTTACGACTCACAGTCCAATTTCTTCACTTTCTT
GTGCGGTGTTTTGTTTAAGAATTGGGAGTTTTCAGACACTCGAAAAGTGCAAAAAGGGAA
ATCATTTAATATTTTTATGATTCGTTTC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL4773Contig1 941 2 2 U
GACTTGGAGATAACCTCACCAAGAAACTAGAAATGTTCTTGACAAAGAACAGAGAGTAAA
AACTCATAAAAAGAAAGAAAATTCGTTGATGTATTGCAATGACAAAGGGGGTACATTTTA
TAGTGTTTCTAGTCAAAGAGAATAAAAGAAAAGTGGAGAAAACAATGCATAGAAAATATA
AAATTGACCAAGACTAGTCAAAGTTTGAAAATTGAGGGAGACTTGACGAGATTCATTGAC
TGTCCAGGTTCATGGAGTGTCCAGGTTCTTGCAGTGATGATCAGGTCGTGCACACCATGC
TGCGAAGGATATGGACACACGCGGGACGATCCACACATGTCTGAATTCGCGAGAACTGAA
CATCACCTGATTTGTACATGGCATAACTCCCTTATCTGAACTCCGTTTGATCTGATTCTT
CTTCGAGGAGTTCCATAATTGAGTTGAGCATATTATCCAAGTAGTTTCACGCCAAGAAAC
ATCATGGTTTAGAAGATATGCTTCGAACAATGAACGTATGTCTGTGTTGCTTCTCGGGTG
GTTTGATGGTCGAACCAGCTCGGAAGATCGAACCAACTTGCTCAGCTCGTCCGGGTGAGT
GTTAGTCCAGCTCAGCTCGTCCATGATAGTGTCAGTCCAGCTCACTTGAGTACTCAGCTC
ATCCAAGATTGCATAATCTGATGAGAAAACCTCGGGTAGGTCTAGCTGGTCGAAAAGGTC
ACCATCTTGGGCCGCGTCCATGAACCAAGCAGGAAGGTGCTGGATTTTGGGTGCATCAGA
AGTTTCACTGGTTTAGAGCTCGTGCATATACCACGAACACAAAATAAAAAGGCGTACAAC
TTAGCACGTAGTGCAAGGAAACAATCGTCTTTTGTCGTTCACATGGATGCGGAGCTCCCA
GTTTGGTTTACAGAATCTATATGAGTCTGTATCTTATTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS49TF U 1
AF RR2CS49JQ C 211
BS 1 689 RR2CS49TF
BS 690 941 RR2CS49JQ

RD RR2CS49TF 689 0 0
GACTTGGAGATAACCTCACCAAGAAACTAGAAATGTTCTTGACAAAGAACAGAGAGTAAA
AACTCATAAAAAGAAAGAAAATTCGTTGATGTATTGCAATGACAAAGGGGGTACATTTTA
TAGTGTTTCTAGTCAAAGAGAATAAAAGAAAAGTGGAGAAAACAATGCATAGAAAATATA
AAATTGACCAAGACTAGTCAAAGTTTGAAAATTGAGGGAGACTTGACGAGATTCATTGAC
TGTCCAGGTTCATGGAGTGTCCAGGTTCTTGCAGTGATGATCAGGTCGTGCACACCATGC
TGCGAAGGATATGGACACACGCGGGACGATCCACACATGTCTGAATTCGCGAGAACTGAA
CATCACCTGATTTGTACATGGCATAACTCCCTTATCTGAACTCCGTTTGATCTGATTCTT
CTTCGAGGAGTTCCATAATTGAGTTGAGCATATTATCCAAGTAGTTTCACGCCAAGAAAC
ATCATGGTTTAGAAGATATGCTTCGAACAATGAACGTATGTCTGTGTTGCTTCTCGGGTG
GTTTGATGGTCGAACCAGCTCGGAAGATCGAACCAACTTGCTCAGCTCGTCCGGGTGAGT
GTTAGTCCAGCTCAGCTCGTCCATGATAGTGTCAGTCCAGCTCACTTGAGTACTCAGCTC
ATCCAAGATTGCATAATCTGATGAGAAAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2CS49JQ 731 0 0
ATTGAGGGAGACTTGACGAGATTCATTGACTGTCCAGGTTCATGGAGTGTCCAGGTTCTT
GCAGTGATGATCAGGTCGTGCACACCATGCTGCGAAGGATATGGACACACGCGGGACGAT
CCACACATGTCTGAATTCGCGAGAACTGAACATCACCTGATTTGTACATGGCATAACTCC
CTTATCTGAACTCCGTTTGATCTGATTCTTCTTCGAGGAGTTCCATAATTGAGTTGAGCA
TATTATCCAAGTAGTTTCACGCCAAGAAACATCATGGTTTAGAAGATATGCTTCGAACAA
TGAACGTATGTCTGTGTTGCTTCTCGGGTGGTTTGATGGTCGAACCAGCTCGGAAGATCG
AACCAACTTGCTCAGCTCGTCCGGGTGAGTGTTAGTCCAGCTCAGCTCGTCCATGATAGT
GTCAGTCCAGCTCACTTGAGTACTCAGCTCATCCAAGATTGCATAATCTGATGAGAAAAC
CTCGGGTAGGTCTAGCTGGTCGAAAAGGTCACCATCTTGGGCCGCGTCCATGAACCAAGC
AGGAAGGTGCTGGATTTTGGGTGCATCAGAAGTTTCACTGGTTTAGAGCTCGTGCATATA
CCACGAACACAAAATAAAAAGGCGTACAACTTAGCACGTAGTGCAAGGAAACAATCGTCT
TTTGTCGTTCACATGGATGCGGAGCTCCCAGTTTGGTTTACAGAATCTATATGAGTCTGT
ATCTTATTGAC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL4774Contig1 1682 2 4 U
GGTGTGACGCTAGGCTTATGAGGTTGTTCGGAAAGGAGCGAGTGGATCACTTGGAAATGT
TAAAGCTTCTTGATTCTCACTTCCTGGATCAAGAAAGGTCTCCGGCTACGGATACCTCAG
CCGGTGAAACTATGTCCTTCCAGGTGGATGATAGGCTGAATACCTCTGAACAACATGCGG
TTGTAAAGTCTGAAACATGTGCTGCTATGTCCAACAAGCCTATCGATGACATGGATTTGA
ATATGGTATGGTTATATGGAGATCCTGATGGGAAGATTCATGGACCGTTTTCTTTAATGA
ACCTGCGACAGTGGAATGCAAGTGGTTACTTCCCGCCTGAGCTGAGAATATGGAAGTTGG
GTGAACAGCAAAGGAGCTCCATACTACTGACCGACGCCTTAAATGGGCAGTTCCATAAAA
CAGTACCTCTTCAGGAAGAGGCGGCTAAGGACCAAAACAAGAGTGTGGCTGTTGCTAGAT
TAGAGACTAGAGTACTTGACTTCAGCCCCAACTCAGTGTCCACCGACCAGAGTGTTAACA
GTGTCATCACAAGGAGCTCGGATACTAGCAACAAAAGCCATTTGGATTTCACACTTTCTA
ATGAAAGGGAGGGTGTGGACAAAACAAAAGTCGAAAGTCCCTTGCCTGGACAGAGCCCTA
TAAGCTGTTCGCTTTCACTGTCTACACTCCCCGGAACCTCAAACTGCTCTCTGCCGCTAC
AGGAAAGATGGAATGGTGGTCAAACAGAGGCAGTAAAGAACGGTTGCAATCAAAACGACA
TTGGCCTTACCGGAGCGGCTGAGAAACAAGTCACGGCTACAGTTCAGTCATGCGGACAGA
ACTGGAATGCTGCTACTCCAAGCACTGCTTCAAACGTGTGGGATTCGAACTCCGGTCTGG
TGTCTTTCACAGACAATCAAGAAATAGACTTCCTAGATCTCTTTAGTCCAACCTTCAAAT
TCAACTTTGCCTCTACTACCACGGATTGGCGGCCCATTGTAACCGGACCCGACGAGTGTG
ACGAGTCAGTGTCGGATCTTTTGGCGGAAGTTGAAGCTATGGAGTCCCAAAAACGTCTAT
CTTCTCCAACTTCAACATTCCGTGGTCCCGGAGAGTTGCTCCAACAACACTCCATCAACG
ATAGCAGCTTCAGTCCTGCTGCAGAAGGGCACAGCCCGGCATTTGATGTAAGTAAAGGTG
ACTCCATGAGCTCCACAAACGATCTGCATATGCGTTTACGAACTAACAACGTCATGGACT
TTTTGCCGTGGGGGGTTTAGATATAGAGAATCATATCAGGGCTCATAGGTTGTACCCAAG
ATCGATGGTGGACTATGCTCTCTCTCTACTCTTTTTGCAGGATTGTTATTACGGAACATA
AATAAGTGGCCAATATATCATCATCATCATCAGCAGCAGCAGAAAAAGAGAAAAAAAAAG
AGTGGTGCAGAAGAAGAAGATATGTTCAAATGTTTCTTGGTGATATTTTTGTCTGCTGCA
CCGACCATTGTTTTTGGTATCTAGGTTCTGTACGTTATCCTGTTTTAAGATTTGCACAGA
CCCAGCTTGTGTATCTTTTACATTGTTTGTGTACTTAGGGTAAATTATAAAAGTGTCAAT
GGATGTAATCAAAACACTGTAGGGATCATTACGTATTCTATATATATATATGATAATCTG
GT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2B968TF U 1
AF RR2B968JQ C 797
BS 1 845 RR2B968TF
BS 846 846 RR2B968JQ
BS 847 881 RR2B968TF
BS 882 1682 RR2B968JQ

RD RR2B968TF 881 0 0
GGTGTGACGCTAGGCTTATGAGGTTGTTCGGAAAGGAGCGAGTGGATCACTTGGAAATGT
TAAAGCTTCTTGATTCTCACTTCCTGGATCAAGAAAGGTCTCCGGCTACGGATACCTCAG
CCGGTGAAACTATGTCCTTCCAGGTGGATGATAGGCTGAATACCTCTGAACAACATGCGG
TTGTAAAGTCTGAAACATGTGCTGCTATGTCCAACAAGCCTATCGATGACATGGATTTGA
ATATGGTATGGTTATATGGAGATCCTGATGGGAAGATTCATGGACCGTTTTCTTTAATGA
ACCTGCGACAGTGGAATGCAAGTGGTTACTTCCCGCCTGAGCTGAGAATATGGAAGTTGG
GTGAACAGCAAAGGAGCTCCATACTACTGACCGACGCCTTAAATGGGCAGTTCCATAAAA
CAGTACCTCTTCAGGAAGAGGCGGCTAAGGACCAAAACAAGAGTGTGGCTGTTGCTAGAT
TAGAGACTAGAGTACTTGACTTCAGCCCCAACTCAGTGTCCACCGACCAGAGTGTTAACA
GTGTCATCACAAGGAGCTCGGATACTAGCAACAAAAGCCATTTGGATTTCACACTTTCTA
ATGAAAGGGAGGGTGTGGACAAAACAAAAGTCGAAAGTCCCTTGCCTGGACAGAGCCCTA
TAAGCTGTTCGCTTTCACTGTCTACACTCCCCGGAACCTCAAACTGCTCTCTGCCGCTAC
AGGAAAGATGGAATGGTGGTCAAACAGAGGCAGTAAAGAACGGTTGCAATCAAAACGACA
TTGGCCTTACCGGAGCGGCTGAGAAACAAGTCACGGCTACAGTTCAGTCATGCGGACAGA
ACTGGGATGCTGCTACTCCAAGCACTGCTTCAAACGTGTGG

QA 1 881 1 881
DS 

RD RR2B968JQ 886 0 0
GGCTGAGAAACAAGTCACGGCTACAGTTCAGTCATGCGGACAGAACTGGAATGCTGCTAC
TCCAAGCACTGCTTCAAACGTGTGGGATTCGAACTCCGGTCTGGTGTCTTTCACAGACAA
TCAAGAAATAGACTTCCTAGATCTCTTTAGTCCAACCTTCAAATTCAACTTTGCCTCTAC
TACCACGGATTGGCGGCCCATTGTAACCGGACCCGACGAGTGTGACGAGTCAGTGTCGGA
TCTTTTGGCGGAAGTTGAAGCTATGGAGTCCCAAAAACGTCTATCTTCTCCAACTTCAAC
ATTCCGTGGTCCCGGAGAGTTGCTCCAACAACACTCCATCAACGATAGCAGCTTCAGTCC
TGCTGCAGAAGGGCACAGCCCGGCATTTGATGTAAGTAAAGGTGACTCCATGAGCTCCAC
AAACGATCTGCATATGCGTTTACGAACTAACAACGTCATGGACTTTTTGCCGTGGGGGGT
TTAGATATAGAGAATCATATCAGGGCTCATAGGTTGTACCCAAGATCGATGGTGGACTAT
GCTCTCTCTCTACTCTTTTTGCAGGATTGTTATTACGGAACATAAATAAGTGGCCAATAT
ATCATCATCATCATCAGCAGCAGCAGAAAAAGAGAAAAAAAAAGAGTGGTGCAGAAGAAG
AAGATATGTTCAAATGTTTCTTGGTGATATTTTTGTCTGCTGCACCGACCATTGTTTTTG
GTATCTAGGTTCTGTACGTTATCCTGTTTTAAGATTTGCACAGACCCAGCTTGTGTATCT
TTTACATTGTTTGTGTACTTAGGGTAAATTATAAAAGTGTCAATGGATGTAATCAAAACA
CTGTAGGGATCATTACGTATTCTATATATATATATGATAATCTGGT

QA 1 886 1 886
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4776Contig1 892 2 2 U
GGAACGCTCTTTCCATAAAACCCTAGACGACAACAATGTTGGAGCTACGTCTTGTTCAGG
GCTCTCTGCTAAAAAAGGTTCTCGAATCGGTCAAGGATCTGGTCAACGATGCGAACTTCG
ACTGCTCCAGCACCGGCTTCTCCCTCCAAGCCATGGACTCCAGCCACGTGGCGCTGGTCT
CCCTCCTGCTCAGATCCGAAGGCTTCGAGCACTACAGGTGCGACAGGAACCTCTCCATGG
GGATGAATCTCGGCAACATGTCCAAGATGCTCAAGTGCGCCGGAAACGATGACATCATCA
CCATCAAAGCCGATGACGGCGGCGACACCGTCACCTTCATGTTCGAGAGTCCCACGCAAG
ACAAGATTGCAGATTTTGAGATGAAGCTGATGGATATAGACAGTGAGCATTTGGGGATAC
CTGATGCTGAGTACCATTCCATTGTGAGGATGCCGTCAAGTGAGTTCTCGAGGATTTGTA
AAGATCTCAGTACCATCGGTGACACTGTTGTGATCTCTGTGACTAAAGAAGGGGTTAAGT
TTTCTACTGCTGGTGACATCGGGACAGCTAATATTGTCTTGAGACAGAACACAACTGTAG
ACAAGCCGGAAGATGCAATTGTGATAGAGATGAACGAGCCTGTGTCACTCTCGTTTGCCA
GTTGTGGTGGAGTATAAAGTGGCTGAGATGGGTTACATTCGTTACTACTTGGCTCCTAAG
ATTGAAGAAGAAGAAGATGACAACAAGGCCTAAGACCCCGTTTGTATCCCAACAGCTTCT
ATTCATCTTTGTTGCTGTCATTGTGTGTTTCCGTTGTATGCTAGAATCAGTTGTTTTTTC
TTAGACTCGTTATGCTTCACGTTCCCAATGTTTGGCAAAGTTATTGCAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY28TFB U 1
AF RR2AY28JQ C 247
BS 1 729 RR2AY28TFB
BS 730 892 RR2AY28JQ

RD RR2AY28TFB 729 0 0
GGAACGCTCTTTCCATAAAACCCTAGACGACAACAATGTTGGAGCTACGTCTTGTTCAGG
GCTCTCTGCTAAAAAAGGTTCTCGAATCGGTCAAGGATCTGGTCAACGATGCGAACTTCG
ACTGCTCCAGCACCGGCTTCTCCCTCCAAGCCATGGACTCCAGCCACGTGGCGCTGGTCT
CCCTCCTGCTCAGATCCGAAGGCTTCGAGCACTACAGGTGCGACAGGAACCTCTCCATGG
GGATGAATCTCGGCAACATGTCCAAGATGCTCAAGTGCGCCGGAAACGATGACATCATCA
CCATCAAAGCCGATGACGGCGGCGACACCGTCACCTTCATGTTCGAGAGTCCCACGCAAG
ACAAGATTGCAGATTTTGAGATGAAGCTGATGGATATAGACAGTGAGCATTTGGGGATAC
CTGATGCTGAGTACCATTCCATTGTGAGGATGCCGTCAAGTGAGTTCTCGAGGATTTGTA
AAGATCTCAGTACCATCGGTGACACTGTTGTGATCTCTGTGACTAAAGAAGGGGTTAAGT
TTTCTACTGCTGGTGACATCGGGACAGCTAATATTGTCTTGAGACAGAACACAACTGTAG
ACAAGCCGGAAGATGCAATTGTGATAGAGATGAACGAGCCTGTGTCACTCTCGTTTGCCA
GTTGTGGTGGAGTATAAAGTGGCTGAGATGGGTTACATTCGTTACTACTTGGCTCCTAAG
ATTGAAGAA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2AY28JQ 646 0 0
ATCTCGGCAACATGTCCAAGATGCTCAAGTGCGCCGGAAACGATGACATCATCACCATCA
AAGCCGATGACGGCGGCGACACCGTCACCTTCATGTTCGAGAGTCCCACGCAAGACAAGA
TTGCAGATTTTGAGATGAAGCTGATGGATATAGACAGTGAGCATTTGGGGATACCTGATG
CTGAGTACCATTCCATTGTGAGGATGCCGTCAAGTGAGTTCTCGAGGATTTGTAAAGATC
TCAGTACCATCGGTGACACTGTTGTGATCTCTGTGACTAAAGAAGGGGTTAAGTTTTCTA
CTGCTGGTGACATCGGGACAGCTAATATTGTCTTGAGACAGAACACAACTGTAGACAAGC
CGGAAGATGCAATTGTGATAGAGATGAACGAGCCTGTGTCACTCTCGTTTGCCAGTTGTG
GTGGAGTATAAGGTGGCTGAGATGGGTTACATTCGTTACTACTTGGCTCCTAAGATTGAA
GAAGAAGAAGATGACAACAAGGCCTAAGACCCCGTTTGTATCCCAACAGCTTCTATTCAT
CTTTGTTGCTGTCATTGTGTGTTTCCGTTGTATGCTAGAATCAGTTGTTTTTTCTTAGAC
TCGTTATGCTTCACGTTCCCAATGTTTGGCAAAGTTATTGCAACTC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL4777Contig1 478 2 1 U
GGGCGTCCCAGAGATGGCATCGGTTTGCAGGTCAGCGCTGGTGAGTGGTTCCAGGAATTT
AGTATCTAGATCCAGGACCGTAACTCAAAAGTATCTCAATCTTAAACCGACTACGACGAC
TTCAGCTCCTTTTGCGTCAGTGTCGCAATCCATCCCTCGGGCTTCATGGGTTCTGTCGGC
TTTGGGAAGCGTTGAAACGATGATTCCGCTTCACAGTGCGGTTGCTTCAGCTCGGCTCCG
GTCAAGCATCGCTGCTGATTCCTCTTGTTGGAGCTTGCTTTCCGAGGGATTTGCCACGCC
TTTGTGACCCCCGCCCCCGGTCTGCTGGAATCTATCTATATAAGGCGAAAAAATAATCAA
AAATTATTAGGACTTGCTTTCAGACAATGAATGAACAAGGATACTACTTTCTTCTAGTTT
TAACTCTTTCGTCCTTGTATTTGTTATAGTTCACAAAGACTTGATGCTTCAGAGTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DB29JQ C 1
AF RR2DB29TF U 1
BS 1 478 RR2DB29TF

RD RR2DB29JQ 478 0 0
GGGCGTCCCAGAGATGGCATCGGTTTGCAGGTCAGCGCTGGTGAGTGGTTCCAGGAATTT
AGTATCTAGATCCAGGACCGTAACTCAAAAGTATCTCAATCTTAAACCGACTACGACGAC
TTCAGCTCCTTTTGCGTCAGTGTCGCAATCCATCCCTCGGGCTTCATGGGTTCTGTCGGC
TTTGGGAAGCGTTGAAACGATGATTCCGCTTCACAGTGCGGTTGCTTCAGCTCGGCTCCG
GTCAAGCATCGCTGCTGATTCCTCTTGTTGGAGCTTGCTTTCCGAGGGATTTGCCACGCC
TTTGTGACCCCCGCCCCCGGTCTGCTGGAATCTATCTATATAAGGCGAAAAAATAATCAA
AAATTATTAGGACTTGCTTTCAGACAATGAATGAACAAGGATACTACTTTCTTCTAGTTT
TAACTCTTTCGTCCTTGTATTTGTTATAGTTCACAAAGACTTGATGCTTCAGAGTTCT

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2DB29TF 478 0 0
GGGCGTCCCAGAGATGGCATCGGTTTGCAGGTCAGCGCTGGTGAGTGGTTCCAGGAATTT
AGTATCTAGATCCAGGACCGTAACTCAAAAGTATCTCAATCTTAAACCGACTACGACGAC
TTCAGCTCCTTTTGCGTCAGTGTCGCAATCCATCCCTCGGGCTTCATGGGTTCTGTCGGC
TTTGGGAAGCGTTGAAACGATGATTCCGCTTCACAGTGCGGTTGCTTCAGCTCGGCTCCG
GTCAAGCATCGCTGCTGATTCCTCTTGTTGGAGCTTGCTTTCCGAGGGATTTGCCACGCC
TTTGTGACCCCCGCCCCCGGTCTGCTGGAATCTATCTATATAAGGCGAAAAAATAATCAA
AAATTATTAGGACTTGCTTTCAGACAATGAATGAACAAGGATACTACTTTCTTCTAGTTT
TAACTCTTTCGTCCTTGTATTTGTTATAGTTCACAAAGACTTGATGCTTCAGAGTTCT

QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 2

CO CL4778Contig1 668 2 1 U
CTTCCTCGTCTCTCTTCTGGTGCTATCTATCTATCTCTCTCTCTCTCTCTAACTGCGCTG
GGGCGGGTGTGAAACTTTTGGCGGGAAAATGTCGGGGAAAGGAGCGAAAGGATTGATAAT
GGGGAAACCTAGCGGTAGCGACAAGGACAAGGACAAGAAGAAACAACCCATCACCCGCTC
TGCTCGAGCTGGTCTTCAGTTCCCAGTAGGTAGGGTGCATCGACTATTGAAGACAAGGTC
CACTGCTCACGGAATGGTTGGTGCAACCGCGGCGGTTTACACAGCAGCCATACTCGAGTA
TCTGACCGCAGAAGTTCTGGAGTTGGCTGGTAACGCCAGCAAGGACCTCAAGGTGAAACG
TATCTCCCCAAGGCACTTGCAGCTTGCCATCCGTGGAGATGAGGAGCTTGATACCCTCAT
CAAAGGTACTATTGCTGGTGGTGGTGTCATCCCTCACATCCACAAGTCTCTCATCAACAA
ATCCGCCAAGGAATAGATTCTTCTTGCTTTTGCTTCTCATGTTTCTTTCTTTTTAAGTAT
TACGAGAGTCTGTGTGTGTGTGTTTGATCAAGACGCTAGAGAGAGCCTCTTGTTAGGAAT
CTCGTTTGTTATTCTTCCATCAGCCTCTACTTTGATTCCTTTCGAGTTATCTATCTTTAT
TCATATGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AA65JQ C 1
AF RR2AA65TF U 1
BS 1 668 RR2AA65TF

RD RR2AA65JQ 668 0 0
CTTCCTCGTCTCTCTTCTGGTGCTATCTATCTATCTCTCTCTCTCTCTCTAACTGCGCTG
GGGCGGGTGTGAAACTTTTGGCGGGAAAATGTCGGGGAAAGGAGCGAAAGGATTGATAAT
GGGGAAACCTAGCGGTAGCGACAAGGACAAGGACAAGAAGAAACAACCCATCACCCGCTC
TGCTCGAGCTGGTCTTCAGTTCCCAGTAGGTAGGGTGCATCGACTATTGAAGACAAGGTC
CACTGCTCACGGAATGGTTGGTGCAACCGCGGCGGTTTACACAGCAGCCATACTCGAGTA
TCTGACCGCAGAAGTTCTGGAGTTGGCTGGTAACGCCAGCAAGGACCTCAAGGTGAAACG
TATCTCCCCAAGGCACTTGCAGCTTGCCATCCGTGGAGATGAGGAGCTTGATACCCTCAT
CAAAGGTACTATTGCTGGTGGTGGTGTCATCCCTCACATCCACAAGTCTCTCATCAACAA
ATCCGCCAAGGAATAGATTCTTCTTGCTTTTGCTTCTCATGTTTCTTTCTTTTTAAGTAT
TACGAGAGTCTGTGTGTGTGTGTTTGATCAAGACGCTAGAGAGAGCCTCTTGTTAGGAAT
CTCGTTTGTTATTCTTCCATCAGCCTCTACTTTGATTCCTTTCGAGTTATCTATCTTTAT
TCATATGG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2AA65TF 668 0 0
CTTCCTCGTCTCTCTTCTGGTGCTATCTATCTATCTCTCTCTCTCTCTCTAACTGCGCTG
GGGCGGGTGTGAAACTTTTGGCGGGAAAATGTCGGGGAAAGGAGCGAAAGGATTGATAAT
GGGGAAACCTAGCGGTAGCGACAAGGACAAGGACAAGAAGAAACAACCCATCACCCGCTC
TGCTCGAGCTGGTCTTCAGTTCCCAGTAGGTAGGGTGCATCGACTATTGAAGACAAGGTC
CACTGCTCACGGAATGGTTGGTGCAACCGCGGCGGTTTACACAGCAGCCATACTCGAGTA
TCTGACCGCAGAAGTTCTGGAGTTGGCTGGTAACGCCAGCAAGGACCTCAAGGTGAAACG
TATCTCCCCAAGGCACTTGCAGCTTGCCATCCGTGGAGATGAGGAGCTTGATACCCTCAT
CAAAGGTACTATTGCTGGTGGTGGTGTCATCCCTCACATCCACAAGTCTCTCATCAACAA
ATCCGCCAAGGAATAGATTCTTCTTGCTTTTGCTTCTCATGTTTCTTTCTTTTTAAGTAT
TACGAGAGTCTGTGTGTGTGTGTTTGATCAAGACGCTAGAGAGAGCCTCTTGTTAGGAAT
CTCGTTTGTTATTCTTCCATCAGCCTCTACTTTGATTCCTTTCGAGTTATCTATCTTTAT
TCATATGG

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL4779Contig1 686 2 24 U
GGAGATCGGTCCTCCACACTCGTGTTAATATTATTCCGCCATTATCATCTTCCACTTTGA
AAATCTCTTCATCATTCAATGGCGGCCAGAAAGCCAGGAGTGATCGCTTTGTTCGATGTC
GACGGTACTCTCACTGCTCCAAGGAAGGAAGCTACTCCTGAACTGCTCCATTTTATCAGA
CAATTGCGAAAGGTGGTTACCGTTGGAGTCGTTGGTGGATCTGATCTAAGCAAGATATCT
GAGCAGCTTGGCAAAACAGTCACTACCGACTATGATTATTGCTTCTCTGAGAATGGTCTT
GTTGCCCATAAAGACGGGAAGCCCATTGGAATCCAGAGCCTAAAGCTGCACCTTGGAGAA
GATAAGCTCAAGGAGTTGATAAATTTCGCGCTGCACTACATTGCAGACTTGGATATTCCA
ATCAAAAGGGGAACATTTATAGAATTCCGAAATGGAATGCTCAATGTGTCACCGATTGGT
CGCAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGATGAGTTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACATC
CGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTTAACCTTACTTTCTCT
ATTGGAGGACAGATTAGCTTCGATGTCTTCCCTAAAGTTGGGATAAGACTTACTGCTTGC
AGTACCTTGAAGACTTCAGTGAAATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E354TF U 1
AF RR2GD86TF U 1
BS 1 26 RR2E354TF
BS 27 27 RR2GD86TF
BS 28 62 RR2E354TF
BS 63 63 RR2GD86TF
BS 64 180 RR2E354TF
BS 181 181 RR2GD86TF
BS 182 188 RR2E354TF
BS 189 189 RR2GD86TF
BS 190 251 RR2E354TF
BS 252 252 RR2GD86TF
BS 253 266 RR2E354TF
BS 267 267 RR2GD86TF
BS 268 314 RR2E354TF
BS 315 315 RR2GD86TF
BS 316 341 RR2E354TF
BS 342 342 RR2GD86TF
BS 343 380 RR2E354TF
BS 381 381 RR2GD86TF
BS 382 386 RR2E354TF
BS 387 387 RR2GD86TF
BS 388 539 RR2E354TF
BS 540 540 RR2GD86TF
BS 541 611 RR2E354TF
BS 612 686 RR2GD86TF

RD RR2E354TF 611 0 0
GGAGATCGGTCCTCCACACTCGTGTTTATATTATTCCGCCATTATCATCTTCCACTTTGA
AA*TCTCTTCATCATTCAATGGCGGCCAGAAAGCCAGGAGTGATCGCTTTGTTCGATGTC
GACGGTACTCTCACTGCTCCAAGGAAGGAAGCTACTCCTGAACTGCTCCATTTTATCAGA
GAATTGCGCAAGGTGGTTACCGTTGGAGTCGTTGGTGGATCTGATCTAAGCAAGATATCT
GAGCAGCTTGGTAAAACAGTCACTACGGACTATGATTATTGCTTCTCTGAGAATGGTCTT
GTTGCCCATAAAGATGGGAAGCCCATTGGAATCCAGAGCCTGAAGCTGCACCTTGGAGAA
GATAAGCTCAAGGAGTTGATTAATTTTGCGCTGCACTACATTGCAGACTTGGATATTCCA
ATCAAAAGGGGAACATTTATAGAATTCCGAAATGGAATGCTCAATGTGTCACCGATTGGT
CGCAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGATGAGTTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACATT
CGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTTAACCTTACTTTCTCT
ATTGGAGGACA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2GD86TF 686 0 0
GGAGATCGGTCCTCCACACTCGT*TTAATATTATTCCGCCATTATCATCTTCCACTTTGA
AAATCTCTTCATCTTTCAATGGCGGCCAGAAAGCCAGGAGTGATCGCTTTGTTCGATGTC
GACGGTACTCTCACTGCTCCAAGGAAGGAAGCTACTCCTGAACTGCTCCATTTTATCAGA
CAATTGCGAAAGGTGGTTACTGTTGGAGTCGTTGGTGGATCTGATCTAAGCAAGATTTCT
GAGCAGCTTGGCAAAACAGTCACTACCGACTATGATTATTGCTTCTCTGAGAATGGTCTT
GTTGCCCATAAAGACGGGAAGCCCATTGGAATCCAGAGCCTAAAGCTGCACCTTGGAGAA
GATAAGCTCAAGGAGTTGATAAATTTCGCGCTGCACTACATTGCAGACTTGGATATTCCA
ATCAAAAGGGGAACATTTATAGAATTCCGAAATGGAATGCTCAATGTGTCACCGATTGGT
CGCAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGATGAGTTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACATC
CGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTTAACCTTACTTTCTCT
ATTGGAGGACAGATTAGCTTCGATGTCTTCCCTAAAGTTGGGATAAGACTTACTGCTTGC
AGTACCTTGAAGACTTCAGTGAAATC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL4780Contig1 703 2 5 U
ATCACCCGCTACATCCTCACTGGCAAAGCTTGGAATAACATGATTGAGAACAGGACTGCA
TTCACAACCAAGAAAGACTACGGAAGGGGAGAAAGAGAGGCCCAATGGGCTCTAGCTCAA
CGTACACTCCATGGACTTAAACCCCCGGAGTCGATGTTTGAAGACAAGGCAACCTTCACT
GAGCTCTCTGAGATCGCTGAACAGGCTAAAAAGCGTGCTGAAGTCGCAAGGCTAAGAGAA
GTGCACACTCTCAAAGGCCACGTGGAGTCTGTCGTAAAGCTTAAGGGCCTTGACATTGAT
AATCTCAACCAGCACTACACCGTCTAAGCCAAACTACAATGATATTTTAAGCACAGACGT
ATGACGATGATTTGATCAATAAAGTTAGAGAAAATGGCTTTATAAAGATTAAAGATAAAG
AAGGAGGTTCCGATTTGGAATATTCTTCGGTTTTGATTTCATTTCTCTTGGTTAAGAAAT
GATATCAATAGTGAAATTCTTCTTAGCTTAAGGATAAAAAAAAGAAGCTGATGACAGGAT
GGACGAGTGAGAGAATAAAGAAACGAGACGCATTGAGAGTTATGTAATAAATTATTATTC
TATTCTTTTTTTTCTACTTCTTGTTTTTTTTGTTATGCATTTGTTCTGTTCTTTTTTTTA
TAATAATATGAGGTTGATGGTGCTAGAAAATATAATCTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA55JQ C 1
AF RR2H791TF U 196
BS 1 195 RR2GA55JQ
BS 196 630 RR2H791TF
BS 631 631 RR2GA55JQ
BS 632 686 RR2H791TF
BS 687 703 RR2GA55JQ

RD RR2GA55JQ 703 0 0
ATCACCCGCTACATCCTCACTGGCAAAGCTTGGAATAACATGATTGAGAACAGGACTGCA
TTCACAACCAAGAAAGACTACGGAAGGGGAGAAAGAGAGGCCCAATGGGCTCTAGCTCAA
CGTACACTCCATGGACTTAAACCCCCGGAGTCGATGTTTGAAGACAAGGCAACCTTCACT
GAGCTCTCTGAGATCGCTGAACAGGCTAAAAAGCGTGCTGAAGTCGCAAGGCTAAGAGAA
GTGCACACTCTCAAAGGCCACGTGGAGTCTGTCGTAAAGCTTAAGGGCCTTGACATTGAT
AATCTCAACCAGCACTACACCGTTTAAGCCAAACTACAATGATATTTTAAGCACAGACGT
ATGACGATGATTTGATCAATAAAGTTAGAGAAAATGGCTTTATAAAGATTAAAGATAAAG
AAGGAGGTTCCGATTTGGAATATTCTTCGGTTTTGATTTCATTTCTCTTGGTTAAGAAAT
GATATCAATAGTGAAATTCTTCTTAGCTTAAGGATAAAAAAA*GAAGCTGATGACAGGAT
GGACGAGTGAGAGAATAAAGAAACGAGACGCATTGAGAGTTATGTAATAAATTATTATTC
TATTCTTTTTTTTCTACTTCTTGTTTTTTTTGTTATGCATTTGTTCTGTTCTTTTTTTTA
TAATAATATGAGGTTGATGGTGCTAGAAAATATAATCTTTTTC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2H791TF 491 0 0
GCTGAACAGGCTAAAAAGCGTGCTGAAGTCGCAAGGCTAAGAGAAGTGCACACTCTCAAA
GGCCACGTGGAGTCTGTCGTAAAGCTTAAGGGCCTTGACATTGATAATCTCAACCAGCAC
TACACCGTCTAAGCCAAACTACAATGATATTTTAAGCACAGACGTATGACGATGATTTGA
TCAATAAAGTTAGAGAAAATGGCTTTATAAAGATTAAAGATAAAGAAGGAGGTTCCGATT
TGGAATATTCTTCGGTTTTGATTTCATTTCTCTTGGTTAAGAAATGATATCAATAGTGAA
ATTCTTCTTAGCTTAAGGATAAAAAAAAGAAGCTGATGACAGGATGGACGAGTGAGAGAA
TAAAGAAACGAGACGCATTGAGAGTTATGTAATAAATTATTATTCTATTCTTTTTTTTCT
ACTTCTTGTTTTTTT*GTTATGCATTTGTTCTGTTCTTTTTTTTATAATAATATGAGGTT
GATGGTGCTAG

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 2

CO CL4781Contig1 1056 2 10 U
GGAGCGCAGGAGAGAAAAAACGTGGCACGTTCAGTTCATTGGGAGCTTTCAAATCTGCGC
TTCAATGGAACTTTAGGTCTCTTTTCTGGATTCTCGTCGATTCGAAGAGAGAACGTCGAT
CAGTTTTCTTTTCTGGTTTCCCGGAAAATTTTGTCGCCGATCGTCTCCTCGCGTCGTCTT
TGCTTTGCTTGATCAACCATGAATATCTTCAGATTCGCTGGCGATATGACTCACTTGATC
AGTATCTTAATCCTTCTTCTCAAAATCTACGCCACCAAATCTTGCGCCGGAATCTCTCTC
AAGACTCAGGAGCTATACGCGCTTGTGTTCTTGACTCGTTACATGGATCTCATCACGGAC
TATGTGTCTCTCTACAACACCGTGATGAAGATCGTCTTCATTGTCAGCTCTTTGGCTATC
GTTTGGTGTATGCGTAGGCATCCGTTATTGAGGAGGTCGTACGATAAGGATCTTGACACG
TTTCGTCATCAGTACGTTGTGTTGGCATGCTTTGGTTTGGCACTTGTCCTCAATGAGAAA
TTCACGTTTCAAGAGGTGTTCTGGGCCTTTTCTATATACTTGGAGGCAGTTGCTATCCTT
CCTCAGTTGGTTCTGCTACAGAGAAGTGGGAATGTGGACAATTTAACTGGACAATATGTT
CTCTTTCTTGGGGCGTATCGTGGACTATATATCATCAACTGGATCTATCGCTATTTCACA
GAAGATCATTTCACCAGATGGATCGCTTGTGTCTCCGGTCTTGTCCAAACAGCTCTCTAT
GCGGATTTCTTCTACTACTACTTAAGCTGGAAAACCAATACCAAGCTTAAGCTTCCGGCT
TGAGAAGAACCAGACAAATTTTGCAAGAGTGTCAAAATTCAGGAAGTTACAACGATGGGG
ACACTAGAGATCGAAAAAAAGACATGGTTACAATCTAACATCGAGTTGAATGATGCAGAA
TTGTTGTTTAAGATGTGCTTTTAGCCTTTCAGTGAACATTGTAAGTTTGTAACTCTCACG
TTGAAGTTGAAATCAAAACTCAAGTCTTTCTGGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP50TF U 1
AF RR2EP50JQ C 403
BS 1 730 RR2EP50TF
BS 731 731 RR2EP50JQ
BS 732 757 RR2EP50TF
BS 758 758 RR2EP50JQ
BS 759 768 RR2EP50TF
BS 769 769 RR2EP50JQ
BS 770 802 RR2EP50TF
BS 803 803 RR2EP50JQ
BS 804 813 RR2EP50TF
BS 814 1056 RR2EP50JQ

RD RR2EP50TF 821 0 0
GGAGCGCAGGAGAGAAAAAACGTGGCACGTTCAGTTCATTGGGAGCTTTCAAATCTGCGC
TTCAATGGAACTTTAGGTCTCTTTTCTGGATTCTCGTCGATTCGAAGAGAGAACGTCGAT
CAGTTTTCTTTTCTGGTTTCCCGGAAAATTTTGTCGCCGATCGTCTCCTCGCGTCGTCTT
TGCTTTGCTTGATCAACCATGAATATCTTCAGATTCGCTGGCGATATGACTCACTTGATC
AGTATCTTAATCCTTCTTCTCAAAATCTACGCCACCAAATCTTGCGCCGGAATCTCTCTC
AAGACTCAGGAGCTATACGCGCTTGTGTTCTTGACTCGTTACATGGATCTCATCACGGAC
TATGTGTCTCTCTACAACACCGTGATGAAGATCGTCTTCATTGTCAGCTCTTTGGCTATC
GTTTGGTGTATGCGTAGGCATCCGTTATTGAGGAGGTCGTACGATAAGGATCTTGACACG
TTTCGTCATCAGTACGTTGTGTTGGCATGCTTTGGTTTGGCACTTGTCCTCAATGAGAAA
TTCACGTTTCAAGAGGTGTTCTGGGCCTTTTCTATATACTTGGAGGCAGTTGCTATCCTT
CCTCAGTTGGTTCTGCTACAGAGAAGTGGGAATGTGGACAATTTAACTGGACAATATGTT
CTCTTTCTTGGGGCGTATCGTGGACTATATATCATCAACTGGATCTATCGCTATTTCACA
GAAGATCATT*CACCAGATGGATCGCTTGTGTCTCCG*TCTTGTCCAA*CAGCTCTCTAT
GCGGATTTCTTCTACTACTACT*AAGCTGGAAA
CCATACAA

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2EP50JQ 654 0 0
GTCAGCTCTTTGGCTATCGTTTGGTGTATGCGTAGGCATCCGTTATTGAGGAGGTCGTAC
GATAAGGATCTTGACACGTTTCGTCATCAGTACGTTGTGTTGGCATGCTTTGGTTTGGCA
CTTGTCCTCAATGAGAAATTCACGTTTCAAGAGGTGTTCTGGGCCTTTTCTATATACTTG
GAGGCAGTTGCTATCCTTCCTCAGTTGGTTCTGCTACAGAGAAGTGGGAATGTGGACAAT
TTAACTGGACAATATGTTCTCTTTCTTGGGGCGTATCGTGGACTATATATCATCAACTGG
ATCTATCGCTATTTCACAGAAGATCATTTCACCAGATGGATCGCTTGTGTCTCCGGTCTT
GTCCAAACAGCTCTCTATGCGGATTTCTTCTACTACTACTTAAGCTGGAAAACCAATACC
AAGCTTAAGCTTCCGGCTTGAGAAGAACCAGACAAATTTTGCAAGAGTGTCAAAATTCAG
GAAGTTACAACGATGGGGACACTAGAGATCGAAAAAAAGACATGGTTACAATCTAACATC
GAGTTGAATGATGCAGAATTGTTGTTTAAGATGTGCTTTTAGCCTTTCAGTGAACATTGT
AAGTTTGTAACTCTCACGTTGAAGTTGAAATCAAAACTCAAGTCTTTCTGGGGC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL4782Contig1 1264 2 2 U
AAGACGGTTGCCTTTAAAGTACTTGCAAAGGCACTGATAAGTGTAGAGAAAGGAGAAGAG
TTAGACGAGTTAAAGAAAGAGTTTGAACAATTCATCAAAGGGCTTATGTCATTGCCAGTT
AACTTCCCTGGAACCCAACTTCATAGATCTCTCCAAGCTAAAAAGAAAATGGTGAAGCAA
GTTGAAAGAATCATAGAAGGCAAAGTTAGGAAAGCAAAAAACAGAGACGAAGATGGTGTT
ATTGCAAAAGATGTTGTGGATGTGTTGCTTAAGGACTCAAGTGAAAATTTAACTCACAAT
TTGATTGCTAACAATATGGTTGACATGATGATTCCTGGCCACGATTCTGTACCTGTCCTC
ATCACCCTAGCCGTCAAATTTCTCTCTGATTCTCCTAGTGCTCTTCATTTTCTAACGGAA
GAAAACATGGAGCTGAAAAGATTGAAGGAATTGACAGGAGAGCCACTATATTGGAATGAC
TATTTGTCATTACCTTTTACACAAAAGGTCATTACAGAGACACTGAGAATGGGAAATGTT
ATAATTGGAGTAATGCGGAAAGCAATGAAAGATGTTGAAATAAAAGGATACGTAATACCA
AAAGGATGGTGCTTCTTGGCTTATCTCAGATCAGTCCATCTTGATAAACTTTATTATGAG
TCTCCCTACAAATTTAATCCTTGGAGATGGCAAGAAAGGGACATGAACACGAGTAGTTTC
AGTCCTTTTGGAGGTGGTCAGAGATTGTGCCCTGGTCTTGATTTGGCCCGTCTTGAAGCT
TCAATTTTCCTTCACCTTCTTGTCACTCGCTTCAGATGGACTACAGAAGAAGATACAATT
ATCAATTTTCCTACAGTGCATATGAAGAACAAGTTACCCATCTGGATCAAACGAAGATGA
TTGTTGTGGAAAACGGAGAATCAATTTTGCATTATCAAAAGCTAAAAGGTTAAAGAAGCC
ACGAGTGTTTGTAAGTGGGAGTGAATGAAAGTGATAGTGAGACAGAACAGACAACATGAT
GGAGTGTAGAGACAAAAAGGAATCGCACGTGTAGGAAGCAACATAACACGTGTTCACTAT
TTGTCGTTTTCCGTCAAAAGGCAAATAAGGACACAATCACCAAACCTTATGTTTGTTGAG
TTGTCTGCATGTAGACCCAACGTAGTGCTTATTTCTATTGTTGACCATAACACTTGCTCT
GTAGTAAATGGCGTGTGATATTGATATATGTGTACATGATGTAGAATCCTAATTTCCATG
AACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2AZ24TFB U 1
AF RR2AZ24JQ C 503
BS 1 582 RR2AZ24TFB
BS 583 1264 RR2AZ24JQ

RD RR2AZ24TFB 582 0 0
AAGACGGTTGCCTTTAAAGTACTTGCAAAGGCACTGATAAGTGTAGAGAAAGGAGAAGAG
TTAGACGAGTTAAAGAAAGAGTTTGAACAATTCATCAAAGGGCTTATGTCATTGCCAGTT
AACTTCCCTGGAACCCAACTTCATAGATCTCTCCAAGCTAAAAAGAAAATGGTGAAGCAA
GTTGAAAGAATCATAGAAGGCAAAGTTAGGAAAGCAAAAAACAGAGACGAAGATGGTGTT
ATTGCAAAAGATGTTGTGGATGTGTTGCTTAAGGACTCAAGTGAAAATTTAACTCACAAT
TTGATTGCTAACAATATGGTTGACATGATGATTCCTGGCCACGATTCTGTACCTGTCCTC
ATCACCCTAGCCGTCAAATTTCTCTCTGATTCTCCTAGTGCTCTTCATTTTCTAACGGAA
GAAAACATGGAGCTGAAAAGATTGAAGGAATTGACAGGAGAGCCACTATATTGGAATGAC
TATTTGTCATTACCTTTTACACAAAAGGTCATTACAGAGACACTGAGAATGGGAAATGTT
ATAATTGGAGTAATGCGGAAAGCAATGAAAGATGTTGAAATA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2AZ24JQ 762 0 0
AAAAGGTCATTACAGAGACACTGAGAATGGGAAATGTTATAATTGGAGTAATGCGGAAAG
CAATGAAAGATGTTGAAATAAAAGGATACGTAATACCAAAAGGATGGTGCTTCTTGGCTT
ATCTCAGATCAGTCCATCTTGATAAACTTTATTATGAGTCTCCCTACAAATTTAATCCTT
GGAGATGGCAAGAAAGGGACATGAACACGAGTAGTTTCAGTCCTTTTGGAGGTGGTCAGA
GATTGTGCCCTGGTCTTGATTTGGCCCGTCTTGAAGCTTCAATTTTCCTTCACCTTCTTG
TCACTCGCTTCAGATGGACTACAGAAGAAGATACAATTATCAATTTTCCTACAGTGCATA
TGAAGAACAAGTTACCCATCTGGATCAAACGAAGATGATTGTTGTGGAAAACGGAGAATC
AATTTTGCATTATCAAAAGCTAAAAGGTTAAAGAAGCCACGAGTGTTTGTAAGTGGGAGT
GAATGAAAGTGATAGTGAGACAGAACAGACAACATGATGGAGTGTAGAGACAAAAAGGAA
TCGCACGTGTAGGAAGCAACATAACACGTGTTCACTATTTGTCGTTTTCCGTCAAAAGGC
AAATAAGGACACAATCACCAAACCTTATGTTTGTTGAGTTGTCTGCATGTAGACCCAACG
TAGTGCTTATTTCTATTGTTGACCATAACACTTGCTCTGTAGTAAATGGCGTGTGATATT
GATATATGTGTACATGATGTAGAATCCTAATTTCCATGAACT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL4783Contig1 819 2 2 U
TTTTTGTTGACATCTCCGTTCCAAGAAACGTTGGTTCTTGTGTGAACGAAGTAGAAACCG
CACGGGTTTACAATGTGGACGACCTCAAGGAAGTAGTTGCGGCTAATAAAGAAGACAGGT
TGAGGAAAGCGATGGAAGCTCAGACCATTATCGCGGAGGAGTCAAACCAGTTTGAAGCGT
GGAGGGATTCGCTAGAGACGGTTCCTACGATCAAGAAGTTAAGAGCTTATGCAGAGAGAA
TCAGGATGGCAGAACTCGAGAAGTGCATGTCCAAAATGGGAGATGACATCAACAAGAAAA
CGACGAGAGCTGTTGATGACTTAAGCCGAGGTATCGTGAACAGGTTCTTACATGGTCCAA
TGCAGCATCTGAGATGTGATGGGAGTGACAGTAGAACGCTTAGCGAGACACTTGAGAATA
TGCATGCTTTGAACAGAATGTATGGTCTCGAGAAGGACATTTTGGAGGAGAAGCTCAAGG
CGATGACATCTGGACAACAAAAGTAAAAGATAGGGTCCGGTCCATCTCTTTTGACAGACA
ATATTACATGGATGTGGCTTCCCTGCAAATCCGAGTAAATTGCATATATCATTAAGCTGA
GGATCTATATGATTCATTTAATTTGTGCACAAGAGACAGGTTTCTTTTGCTAACATTTTA
TGTCGTCTAAAGTGTAAGTGTTTGTGAAGCTAAGCAAGCTTTTTTGCATGTTTTTGGCTT
CATAAACTCGAATATAACGGTACTGATCCAAGTACTGTTACTCTTCTGTAATATATAAAC
TTTGGTTAATATGATATAGAGATGTTTTTCCTTTTGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP81TF U 1
AF RR2CP81JQ C 132
BS 1 613 RR2CP81TF
BS 614 819 RR2CP81JQ

RD RR2CP81TF 613 0 0
TTTTTGTTGACATCTCCGTTCCAAGAAACGTTGGTTCTTGTGTGAACGAAGTAGAAACCG
CACGGGTTTACAATGTGGACGACCTCAAGGAAGTAGTTGCGGCTAATAAAGAAGACAGGT
TGAGGAAAGCGATGGAAGCTCAGACCATTATCGCGGAGGAGTCAAACCAGTTTGAAGCGT
GGAGGGATTCGCTAGAGACGGTTCCTACGATCAAGAAGTTAAGAGCTTATGCAGAGAGAA
TCAGGATGGCAGAACTCGAGAAGTGCATGTCCAAAATGGGAGATGACATCAACAAGAAAA
CGACGAGAGCTGTTGATGACTTAAGCCGAGGTATCGTGAACAGGTTCTTACATGGTCCAA
TGCAGCATCTGAGATGTGATGGGAGTGACAGTAGAACGCTTAGCGAGACACTTGAGAATA
TGCATGCTTTGAACAGAATGTATGGTCTCGAGAAGGACATTTTGGAGGAGAAGCTCAAGG
CGATGACATCTGGACAACAAAAGTAAAAGATAGGGTCCGGTCCATCTCTTTTGACAGACA
ATATTACATGGATGTGGCTTCCCTGCAAATCCGAGTAAATTGCATATATCATTAAGCTGA
GGATCTATATGAT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2CP81JQ 688 0 0
ATGGAAGCTCAGACCATTATCGCGGAGGAGTCAAACCAGTTTGAAGCGTGGAGGGATTCG
CTAGAGACGGTTCCTACGATCAAGAAGTTAAGAGCTTATGCAGAGAGAATCAGGATGGCA
GAACTCGAGAAGTGCATGTCCAAAATGGGAGATGACATCAACAAGAAAACGACGAGAGCT
GTTGATGACTTAAGCCGAGGTATCGTGAACAGGTTCTTACATGGTCCAATGCAGCATCTG
AGATGTGATGGGAGTGACAGTAGAACGCTTAGCGAGACACTTGAGAATATGCATGCTTTG
AACAGAATGTATGGTCTCGAGAAGGACATTTTGGAGGAGAAGCTCAAGGCGATGACATCT
GGACAACAAAAGTAAAAGATAGGGTCCGGTCCATCTCTTTTGACAGACAATATTACATGG
ATGTGGCTTCCCTGCAAATCCGAGTAAATTGCATATATCATTAAGCTGAGGATCTATATG
ATTCATTTAATTTGTGCACAAGAGACAGGTTTCTTTTGCTAACATTTTATGTCGTCTAAA
GTGTAAGTGTTTGTGAAGCTAAGCAAGCTTTTTTGCATGTTTTTGGCTTCATAAACTCGA
ATATAACGGTACTGATCCAAGTACTGTTACTCTTCTGTAATATATAAACTTTGGTTAATA
TGATATAGAGATGTTTTTCCTTTTGTCT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL4784Contig1 688 2 3 U
CCGATATACTGAAAGCATTGATCTGTGTAAGAATACATAGAAATTTGTTACAAAACATAG
AAAGACAATTAAAAGCGAAAGAGTTTTATGGTGTTGGAGCTTTCTGGATTGCATTAGAAT
CTCCCTCTCTCTCTCTTCGTATTGGTGTATCTATAATGCCAAAACTCTGTATGACAGAAG
AAGCGATGCCTTGCGTTCTTGTTCTACCTGTCACGCCGGTCCTTGGGGAGTTGATCGATC
TTCCTTAATCTGAACCTGAACCTCAAGCCGGTGTTTCTAGAGAGGAACTTCAGAATCTCA
TCAATGATGATAACTGGAAACGAAAGATACAGAACGGCGGTCCAATCGCCCAAGGACAAT
GGCGTGACAGAAAATAAGACTGCTAGTGGATGAACATATAATATTAGTATGTGCAGAACC
ATCGTCAGGATAATTGACCCAACGAGCCATAAATTACTCCTCGGGGTTATAACCAGAAGG
GATTGATTTTCGCTGAGGTTATTTAGAGCATTAAACATCTCCACTACAACAAGTACTGTC
ATAGCCACGGTTGATGGATGTCGATCCTCAAATATGCTGCAGGGATAACTTGTCTCTCTA
AGTGCGCACGTTTCAAAATTCATCAGTTCACTGTAAGTAAGTTTAGGACCACCATCAGAG
TAAATACCACCATATAAAGCCAGCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES32JQ U 8
AF RR2ES32TF C 1
BS 1 8 RR2ES32TF
BS 9 490 RR2ES32JQ
BS 491 688 RR2ES32TF

RD RR2ES32JQ 483 0 0
C
CTGAAAGCATTGATCTGTGTAAGAATACATAGAAATTTGTTACAAAACATAGAAAGACAA
TTAAAAGCGAAAGAGTTTTATGGTGTTGGAGCTTTCTGGATTGCATTAGAATCTCCCTCT
CTCTCTCTTCGTATTGGTGTATCTATAATGCCAAAACTCTGTATGACAGAAGAAGCGATG
CCTTGCGTTCTTGTTCTACCTGTCACGCCGGTCCTTGGGGAGTTGATCGATCTTCCTTAA
TCTGAACCTGAACCTCAAGCCGGTGTTTCTAGAGAGGAACTTCAGAATCTCATCAATGAT
GATAACTGGAAACGAAAGATACAGAACGGCGGTCCAATCGCCCAAGGACAATGGCGTGAC
AGAAAATAAGACTGCTAGTGGATGAACATATAATATTAGTATGTGCAGAACCATCGTCAG
GATAATTGACCCAACGAGCCATAAATTACTCCTCGGGGTTATAACCAGAAGGGATTGATT
TT

QA 2 483 2 483
DS 

RD RR2ES32TF 688 0 0
CCGATATACTGAAAGCATTGATCTGTGTAAGAATACATAGAAATTTGTTACAAAACATAG
AAAGACAATTAAAAGCGAAAGAGTTTTATGGTGTTGGAGCTTTCTGGATTGCATTAGAAT
CTCCCTCTCTCTCTCTTCGTATTGGTGTATCTATAATGCCAAAACTCTGTATGACAGAAG
AAGCGATGCCTTGCGTTCTTGTTCTACCTGTCACGCCGGTCCTTGGGGAGTTGATCGATC
TTCCTTAATCTGAACCTGAACCTCAAGCCGGTGTTTCTAGAGAGGAACTTCAGAATCTCA
TCAATGATGATAACTGGAAACGAAAGATACAGAACGGCGGTCCAATCGCCCAAGGACAAT
GGCGTGACAGAAAATAAGACTGCTAGTGGATGAACATATAATATTAGTATGTGCAGAACC
ATCGTCAGGATAATTGACCCAACGAGCCATAAATTACTCCTCGGGGTTATAACCAGAAGG
GATTGATTTTCGCTGAGGTTATTTAGAGCATTAAACATCTCCACTACAACAAGTACTGTC
ATAGCCACGGTTGATGGATGTCGATCCTCAAATATGCTGCAGGGATAACTTGTCTCTCTA
AGTGCGCACGTTTCAAAATTCATCAGTTCACTGTAAGTAAGTTTAGGACCACCATCAGAG
TAAATACCACCATATAAAGCCAGCAACC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL4785Contig1 980 2 2 U
GGAAACCTTGAAAACATCAAGCACAACAACAAAAAAACACACTTCCTGTTTCATTAAATT
CTTCTAGTTGTCCTAAGATCATGGAAATAAACTCCAATTCTACTACACTCCCTCCAGGTT
TCCGATTTCATCCTACCGATGAAGGGCTCATCGTTTACTATCTCCGAAACCAGACCATGT
CTAAGCCATGCCCTGTCTCCATCATCCCAGAAGTAGATATCTACAAATTCGACCCATGGC
AGTTACCCGAGAAAACAGAGTTTGGAGAAAATGAATGGTATTTCTTCAGCCCGAGAGAGC
GAAAGTATCCGAACGGAGTCAGGCCGAACCGGGCTGCTGTTTCCGGTTATTGGAAAGCAA
CCGGTACAGACAAAGCAATTCACAGTGGTTCGAGAAACGTGGGTGTCAAGAAAGCTCTCG
TTTTCTACAAAGGCCGACCTCCCAAAGGGATCAAAACTGATTGGATCATGCACGAGTACC
GTCTCCATGATTCACGTAAAGCATCAACAAAACGTAACGGGTCGATGAGGTTAGATGAAT
GGGTACTATGTAGAATATACAAGAAGAAGGGAGCAGGGAAGCTTCTAGATGAGAAAGAAG
GTTCCATGGATGAAGTACAAATTGATGAGACGTTAGCAGAGAGAAGAAATGAGGAAGAGA
TAATGATGATGACGTCGACAAAACTTCCAAGAACGTGTTCGCTTGCTCATTTGCTAGAAA
TGGATTATATGGGACCCATTTCTCACATTTTAACACCGTTCGATCTTCATCATCCTGATT
TGAACGGCATGAACGAGTCTGGATGGTTCGGAGATCTACAGGTTGACCAAGACGAGATCT
CGAACCATCATCGTCAGGCTAGTATGTTCCAGTTTTAGTGGTGAAAAGAGATGTACTTGG
AAAGTTAATCTCCCACATGAAAATTGTAAAATATTAACTAGAAAGACCCATATGAATGTG
AAATGAAAACATGTTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B018TF U 1
AF RR2B018JQ C 147
BS 1 801 RR2B018TF
BS 802 980 RR2B018JQ

RD RR2B018TF 801 0 0
GGAAACCTTGAAAACATCAAGCACAACAACAAAAAAACACACTTCCTGTTTCATTAAATT
CTTCTAGTTGTCCTAAGATCATGGAAATAAACTCCAATTCTACTACACTCCCTCCAGGTT
TCCGATTTCATCCTACCGATGAAGGGCTCATCGTTTACTATCTCCGAAACCAGACCATGT
CTAAGCCATGCCCTGTCTCCATCATCCCAGAAGTAGATATCTACAAATTCGACCCATGGC
AGTTACCCGAGAAAACAGAGTTTGGAGAAAATGAATGGTATTTCTTCAGCCCGAGAGAGC
GAAAGTATCCGAACGGAGTCAGGCCGAACCGGGCTGCTGTTTCCGGTTATTGGAAAGCAA
CCGGTACAGACAAAGCAATTCACAGTGGTTCGAGAAACGTGGGTGTCAAGAAAGCTCTCG
TTTTCTACAAAGGCCGACCTCCCAAAGGGATCAAAACTGATTGGATCATGCACGAGTACC
GTCTCCATGATTCACGTAAAGCATCAACAAAACGTAACGGGTCGATGAGGTTAGATGAAT
GGGTACTATGTAGAATATACAAGAAGAAGGGAGCAGGGAAGCTTCTAGATGAGAAAGAAG
GTTCCATGGATGAAGTACAAATTGATGAGACGTTAGCAGAGAGAAGAAATGAGGAAGAGA
TAATGATGATGACGTCGACAAAACTTCCAAGAACGTGTTCGCTTGCTCATTTGCTAGAAA
TGGATTATATGGGACCCATTTCTCACATTTTAACACCGTTCGATCTTCATCATCCTGATT
TGAACGGCATGAACGAGTCTG

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2B018JQ 834 0 0
CTCATCGTTTACTATCTCCGAAACCAGACCATGTCTAAGCCATGCCCTGTCTCCATCATC
CCAGAAGTAGATATCTACAAATTCGACCCATGGCAGTTACCCGAGAAAACAGAGTTTGGA
GAAAATGAATGGTATTTCTTCAGCCCGAGAGAGCGAAAGTATCCGAACGGAGTCAGGCCG
AACCGGGCTGCTGTTTCCGGTTATTGGAAAGCAACCGGTACAGACAAAGCAATTCACAGT
GGTTCGAGAAACGTGGGTGTCAAGAAAGCTCTCGTTTTCTACAAAGGCCGACCTCCCAAA
GGGATCAAAACTGATTGGATCATGCACGAGTACCGTCTCCATGATTCACGTAAAGCATCA
ACAAAACGTAACGGGTCGATGAGGTTAGATGAATGGGTACTATGTAGAATATACAAGAAG
AAGGGAGCAGGGAAGCTTCTAGATGAGAAAGAAGGTTCCATGGATGAAGTACAAATTGAT
GAGACGTTAGCAGAGAGAAGAAATGAGGAAGAGATAATGATGATGACGTCGACAAAACTT
CCAAGAACGTGTTCGCTTGCTCATTTGCTAGAAATGGATTATATGGGACCCATTTCTCAC
ATTTTAACACCGTTCGATCTTCATCATCCTGATTTGAACGGCATGAACGAGTCTGGATGG
TTCGGAGATCTACAGGTTGACCAAGACGAGATCTCGAACCATCATCGTCAGGCTAGTATG
TTCCAGTTTTAGTGGTGAAAAGAGATGTACTTGGAAAGTTAATCTCCCACATGAAAATTG
TAAAATATTAACTAGAAAGACCCATATGAATGTGAAATGAAAACATGTTTAACC

QA 1 834 1 834
DS 



AS 1 2

CO CL4786Contig1 859 2 8 U
GGATCTTGAATTGAGAAAACGGATTTACTAGATATGTATCTTAGTCGGAGAATGCAGAGC
GGTAGTTACGCGGTGTACAGGCAGGGACTCGCGGAGGTTTTGCAAACATACAACAAGGTT
GAGAGGAAAACATCTATGAATCCATGTCCGAAGATTATTCTATTTGGAAGAGACTACAGT
ATTCAAACGAGTCAACAAAGTCTGAAGTTATCAAATTCGGTTAATGCTGGGAAGTACTTT
AGAAATAATTTCAACAACTCTAAGATGCAATCTTCTCCTCCAAACCCATGGGGAAGATGG
GTCATAGGTTCTGCGATTTCCGTGGTGTTATCTTTCTGGAACAATAATTGGATGCAGAAA
CTGAAACGGATCAAAGCGGAGGCCGAATTGGCGTTGGAGGGGATGGAGGCTGTAGCAGAA
ATGGTAGAAAAAGTGGCGACGGCCACTGAAGAAATGGCTGAAGTAATGGAAAAGAATCTG
CCTGAGCAAAGCAGACTTAAACAAGTGGCTGTGGTTCTGGAACACATTTCAGAGGTTGCT
GCACATGAAGCACATCTAACCCAAGATTTCCTTCACAAGGTGGAAGAAATCGCCCAAGAT
TTGGATGAGCTGGAGGCAATGATAGAGCCTTTGGTGGACAAAAATGAGGCAAATGCTGAA
ACTAAGCAACAAGGTGATGAAAAAGAAGCAAACTCTAAGCCTTCACGCCACTAATCTGTT
CATCATCTAATTTATACGCCAAAATATATATATATTAAAAACTCTATATATTCTTTTCTT
TCGTTTATTCTTTTCAATAACTTGTGTACATTATTTTTATAAGAATATGTTATCGAAGAA
ATATAGTTCTTGGCTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL10TF U 1
AF RR2BL10JQ C 273
BS 1 683 RR2BL10TF
BS 684 684 RR2BL10JQ
BS 685 743 RR2BL10TF
BS 744 744 RR2BL10JQ
BS 745 760 RR2BL10TF
BS 761 761 RR2BL10JQ
BS 762 772 RR2BL10TF
BS 773 859 RR2BL10JQ

RD RR2BL10TF 772 0 0
GGATCTTGAATTGAGAAAACGGATTTACTAGATATGTATCTTAGTCGGAGAATGCAGAGC
GGTAGTTACGCGGTGTACAGGCAGGGACTCGCGGAGGTTTTGCAAACATACAACAAGGTT
GAGAGGAAAACATCTATGAATCCATGTCCGAAGATTATTCTATTTGGAAGAGACTACAGT
ATTCAAACGAGTCAACAAAGTCTGAAGTTATCAAATTCGGTTAATGCTGGGAAGTACTTT
AGAAATAATTTCAACAACTCTAAGATGCAATCTTCTCCTCCAAACCCATGGGGAAGATGG
GTCATAGGTTCTGCGATTTCCGTGGTGTTATCTTTCTGGAACAATAATTGGATGCAGAAA
CTGAAACGGATCAAAGCGGAGGCCGAATTGGCGTTGGAGGGGATGGAGGCTGTAGCAGAA
ATGGTAGAAAAAGTGGCGACGGCCACTGAAGAAATGGCTGAAGTAATGGAAAAGAATCTG
CCTGAGCAAAGCAGACTTAAACAAGTGGCTGTGGTTCTGGAACACATTTCAGAGGTTGCT
GCACATGAAGCACATCTAACCCAAGATTTCCTTCACAAGGTGGAAGAAATCGCCCAAGAT
TTGGATGAGCTGGAGGCAATGATAGAGCCTTTGGTGGACAAAAATGAGGCAAATGCTGAA
ACTAAGCAACAAGGTGATGAAAA*GAAGCAAACTCTAAGCCTTCACGCCACTAATCTGTT
CATCATCTAATTTATACGCCAAA*TATATATATATTAAAA*CTCTATATATT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2BL10JQ 587 0 0
TTCTCCTCCAAACCCATGGGGAAGATGGGTCATAGGTTCTGCGATTTCCGTGGTGTTATC
TTTCTGGAACAATAATTGGATGCAGAAACTGAAACGGATCAAAGCGGAGGCCGAATTGGC
GTTGGAGGGGATGGAGGCTGTAGCAGAAATGGTAGAAAAAGTGGCGACGGCCACTGAAGA
AATGGCTGAAGTAATGGAAAAGAATCTGCCTGAGCAAAGCAGACTTAAACAAGTGGCTGT
GGTTCTGGAACACATTTCAGAGGTTGCTGCACATGAAGCACATCTAACCCAAGATTTCCT
TCACAAGGTGGAAGAAATCGCCCAAGATTTGGATGAGCTGGAGGCAATGATAGAGCCTTT
GGTGGACAAAAATGAGGCAAATGCTGAAACTAAGCAACAAGGTGATGAAAAAGAAGCAAA
CTTTAAGCCTTCACGCCACTAATCTGTTCATCATTTAATTTATACGCCAAAATATATATA
TATTAAAAACTCTATATATTCTTTTCTTTCGTTTATTCTTTTCAATAACTTGTGTACATT
ATTTTTATAAGAATATGTTATCGAAGAAATATAGTTCTTGGCTGGAC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL4787Contig1 873 2 2 U
GATCGGACAAATGTGAAGGTTCTGAATTTTCTTGCTTGTCTTTTCCTCTGGCAACTAAAA
TGAGCCGTGACTTAGCCCACACACCCAAAAAGACCGTTTACGAAAACCTAATCAATTATT
TGTTTCTGGAAAAAAAAAACTAATCATTAGCGTTAGAAAACCAAACTTTTAAGTTAAGTC
CGGGAAAGCCTAACCCCAAATTGAAAAAAATGCGAAGAGAATAAATGAGCAACAAACCCT
AAAGTTAGACCCTACTCTACTGCCGACCAAAATAAGTTCAAAATCTTAAAACCACAAAAT
TAAATATTTGTTTACAAATAAACATTTGCAGGAGTAGTCGTTATTCTATATATGTAAATG
AAAGCTTGAGCCTTGTAGTACCTGTGTAACTTAAGACTCACAGCTTTAACCTGAACACTC
GTGCAAATCCCCATGATTTTGAGACGGATCAGACAAAACCCATTTTTCTCTCTCAAGAAG
TTACATATCAAAATGTGAGGACAGAGAGATTTTGAAATGGTTTTGTTTTCTAGCTGGATA
AAAGTACATATTAAAGAAACCGAACATGAAGTTAATAAGAAAGGAAACTCTCGCTCACTT
AATTTCTTTGTCAACAATGAAATAGCTAGGGAGAGAGAGAAGTTTCTATCGACGGTTAGC
AATTTTGCTACGAGTAGCTGCGAGAAAGAGAGAGAGAGGCGTTGGGGAGTGGCAATTATG
ACGGACTATCCAGCCTTTAAAGTTTAAGCCCATCTCTTTATTTTCAATACATTTAAAAGT
TTAATGTTCATTTTGTTTTTTTTTTGTCTCCGTTAATTTTGTTTTTACACAAAATTTAAT
GTAACCGCTATGGCAATAAGCTATTTAGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG86TF U 1
AF RR2DG86JQ C 680
BS 1 759 RR2DG86TF
BS 760 873 RR2DG86JQ

RD RR2DG86TF 759 0 0
GATCGGACAAATGTGAAGGTTCTGAATTTTCTTGCTTGTCTTTTCCTCTGGCAACTAAAA
TGAGCCGTGACTTAGCCCACACACCCAAAAAGACCGTTTACGAAAACCTAATCAATTATT
TGTTTCTGGAAAAAAAAAACTAATCATTAGCGTTAGAAAACCAAACTTTTAAGTTAAGTC
CGGGAAAGCCTAACCCCAAATTGAAAAAAATGCGAAGAGAATAAATGAGCAACAAACCCT
AAAGTTAGACCCTACTCTACTGCCGACCAAAATAAGTTCAAAATCTTAAAACCACAAAAT
TAAATATTTGTTTACAAATAAACATTTGCAGGAGTAGTCGTTATTCTATATATGTAAATG
AAAGCTTGAGCCTTGTAGTACCTGTGTAACTTAAGACTCACAGCTTTAACCTGAACACTC
GTGCAAATCCCCATGATTTTGAGACGGATCAGACAAAACCCATTTTTCTCTCTCAAGAAG
TTACATATCAAAATGTGAGGACAGAGAGATTTTGAAATGGTTTTGTTTTCTAGCTGGATA
AAAGTACATATTAAAGAAACCGAACATGAAGTTAATAAGAAAGGAAACTCTCGCTCACTT
AATTTCTTTGTCAACAATGAAATAGCTAGGGAGAGAGAGAAGTTTCTATCGACGGTTAGC
AATTTTGCTACGAGTAGCTGCGAGAAAGAGAGAGAGAGGCGTTGGGGAGTGGCAATTATG
ACGGACTATCCAGCCTTTAAAGTTTAAGCCCATCTCTTT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2DG86JQ 194 0 0
GCGAGAAAGAGAGAGAGAGGCGTTGGGGAGTGGCAATTATGACGGACTATCCAGCCTTTA
AAGTTTAAGCCCATCTCTTTATTTTCAATACATTTAAAAGTTTAATGTTCATTTTGTTTT
TTTTTTGTCTCCGTTAATTTTGTTTTTACACAAAATTTAATGTAACCGCTATGGCAATAA
GCTATTTAGTTTTT

QA 1 194 1 194
DS 



AS 1 2

CO CL4788Contig1 765 2 3 U
ACAAAAAAAAAGCCCATCACCAAAGCAAATCAAAACCATTGACAAAGCACAATCCCCTTT
GAGGTTTTCAAAAGTACATAAACAAATAAAATTCTAATTTAGATTAATTAAAACTTGTAC
CGAATAACCATTTTTCTTTTAAAGATCATGACATAGTCTTATTTATGCTTGCGTTTTGAA
CCTGTAGATCACCTTCTTCTTCTTAAACGTATTGTTATCAATCGTGATGATGATCTTTCC
CGGTTCACCCGCCTTGAAAGAATTAGTTATCACGGGTTCATCAGTTAAACCGATTTTCCT
GTTCTTAGAGACGATCACGGTGTAGATTGACTCGCTGGTCGGCTCAAATTGCGCTCCATA
GCTCACGTCCGCGCCCAAAACCCTAAGCTCCCAGGAGAGCGTTGAACCCTCGGAAGCAGG
CAATTCAATAGTGTGCTTAGCTGAGGATTTAACTACGGCCTCGGTGACTCCATCTTCAAC
AGTGAATGGGCTTTCTTTGCTGAGTCCACCGTATTTAACCGGGACAACTTCAGGAGCTAC
ATATTTGAATATGGTTGCAGCGGATTTGGATGGACCAGCAAGGACCATTTTGCTCCTTGT
CCTTGGAGATATAATGATATTCCCGAATGTTTTGTAGTAAGGAATGTACCACCATGGGAC
ATTAATGAACAGCTCTTTAGCGACAAATTCTGGATAGTTGTCTTCGAACTGCTTAACGGC
GCGTCGGATAAACTGCCACAATGATCTCTTACCGAGCCCTGGCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY63JQ U 191
AF RR2A932JQ U 1
BS 1 649 RR2A932JQ
BS 650 650 RR2CY63JQ
BS 651 765 RR2A932JQ

RD RR2CY63JQ 503 0 0
ACCTTCTTCTTCTTAAACGTATTGTTATCAATCGTGATGATGATCTTTCCCGGTTCACCC
GCCTTGAAAGAATTAGTTATCACGGGTTCATCAGTTAAACCGATTTTCCTGTTCTTAGAG
ACGATCACGGTGTAGCTTGACTCGCTGGTCGGCTCAAATTGCGCTCCATAGCTCACGTCC
GCGCCCAAAACCCTAAGCTCCCAGGAGAGCGTTGAACCCTCGGAAGCAGGCAATTCAATA
GTGTGTTTAGCTGAGGATTTAACTACGGCCTCGGTGACTCCATCTTCAACAGTGAATGGG
CTTTCTTTGCTGAGTCCACCGTATTTAACCGGGACAACTTCAGGAGCTACATATTTGAAT
ATGGTTGCAGCGGATTTGGATGGACCAGCAAGGACCATTTTGCTCCTTGTCCTTGGAGAT
ATAATGATATTCCCGAATGTTTTGTAGTAAGGAATGTACCACCATGGGACATTAATGAAC
AGCTCTTTAGCGACAAATTCTGG

QA 1 503 1 503
DS 

RD RR2A932JQ 765 0 0
ACAAAAAAAAAGCCCATCACCAAAGCAAATCAAAACCATTGACAAAGCACAATCCCCTTT
GAGGTTTTCAAAAGTACATAAACAAATAAAATTCTAATTTAGATTAATTAAAACTTGTAC
CGAATAACCATTTTTCTTTTAAAGATCATGACATAGTCTTATTTATGCTTGCGTTTTGAA
CCTGTAGATCACCTTCTTCTTCTTAAACGTATTGTTATCAATCGTGATGATGATCTTTCC
CGGTTCACCCGCCTTGAAAGAATTAGTTATCACGGGTTCATCAGTTAAACCGATTTTCCT
GTTCTTAGAGACGATCACGGTGTAGATTGACTCGCTGGTCGGCTCAAATTGCGCTCCATA
GCTCACGTCCGCGCCCAAAACCCTAAGCTCCCAGGAGAGCGTTGAACCCTCGGAAGCAGG
CAATTCAATAGTGTGCTTAGCTGAGGATTTAACTACGGCCTCGGTGACTCCATCTTCAAC
AGTGAATGGGCTTTCTTTGCTGAGTCCACCGTATTTAACCGGGACAACTTCAGGAGCTAC
ATATTTGAATATGGTTGCAGCGGATTTGGATGGACCAGCAAGGACCATTTTGCTCCTTGT
CCTTGGAGATATAATGATATTCCCGAATGTTTTGTAGTAAGGAATGTACTACCATGGGAC
ATTAATGAACAGCTCTTTAGCGACAAATTCTGGATAGTTGTCTTCGAACTGCTTAACGGC
GCGTCGGATAAACTGCCACAATGATCTCTTACCGAGCCCTGGCGC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL4789Contig1 810 2 2 U
GGCCAGACTACGCCACGTGCGTCAAGATCTCAACAGACGCTTCCATCAAGGAGATGATTC
CTCCTGGTTGCCTTGTCATGCTTACACCTCTCATTGTTGGTTTCTTCTTTGGTGTTGAGA
CTCTCTCTGGTGTTTTGGCTGGCTCCCTTGTTTCCGGTGTTCAGATTGCTATTTCTGCAT
CTAACACTGGTGGTGCCTGGGACAACGCCAAGAAATACATCGAGGCGGGTGTATCAGAGC
ATGCAAAGAGTCTAGGACCAAAGGACTCAGAGCCACGCAAGGCAGCTGTGATTGGAGACA
CTATCGGAGACCCATTGAAGGATACATCAGGACCTTCGTTGAACATCTTGATCAAGCTCA
TGGCTGTTGAGTCTCTCGTCTTTGCTCCCTTCTTTGCCACTCACGGTGGTATCCTTTTCA
AGTACCTCTAAACTCAAACCCTGAGTGAAGAAGAAAGATGATGATGAAGAAGAAGATATT
GGCTATCGATTCAAAACCTCTCTTCTTTCTTTTTTTACCATTCTTGTTTTTCGTTTTGCG
TAGGTGGTTAAAAGTTAAAACATGTTTTTGTTGATGGGAGCTCATTTAAAGAACCAACCA
AATGATGACTCTCTTTCTCTTTATATCTTTTTGTGCTGTCTAGAATTTAGAAAACCCCCA
AGTATTTGAGACTTGTTTTTAGCCGTTACTTCTCCCTGCTTTGTTTTTCTTATGTTTGTT
TTGGTCTTGAACTATGTTTGTTTCTTATCTTTTTTGTGCTGTCTAGAATTTAGAAAACCA
CCAAGTATTTGAGACTTGTTTTTAGCCGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F663TF U 1
AF RR2F663JQ C 130
BS 1 611 RR2F663TF
BS 612 810 RR2F663JQ

RD RR2F663TF 611 0 0
GGCCAGACTACGCCACGTGCGTCAAGATCTCAACAGACGCTTCCATCAAGGAGATGATTC
CTCCTGGTTGCCTTGTCATGCTTACACCTCTCATTGTTGGTTTCTTCTTTGGTGTTGAGA
CTCTCTCTGGTGTTTTGGCTGGCTCCCTTGTTTCCGGTGTTCAGATTGCTATTTCTGCAT
CTAACACTGGTGGTGCCTGGGACAACGCCAAGAAATACATCGAGGCGGGTGTATCAGAGC
ATGCAAAGAGTCTAGGACCAAAGGACTCAGAGCCACGCAAGGCAGCTGTGATTGGAGACA
CTATCGGAGACCCATTGAAGGATACATCAGGACCTTCGTTGAACATCTTGATCAAGCTCA
TGGCTGTTGAGTCTCTCGTCTTTGCTCCCTTCTTTGCCACTCACGGTGGTATCCTTTTCA
AGTACCTCTAAACTCAAACCCTGAGTGAAGAAGAAAGATGATGATGAAGAAGAAGATATT
GGCTATCGATTCAAAACCTCTCTTCTTTCTTTTTTTACCATTCTTGTTTTTCGTTTTGCG
TAGGTGGTTAAAAGTTAAAACATGTTTTTGTTGATGGGAGCTCATTTAAAGAACCAACCA
AATGATGACTC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2F663JQ 681 0 0
GTGTTTTGGCTGGCTCCCTTGTTTCCGGTGTTCAGATTGCTATTTCTGCATCTAACACTG
GTGGTGCCTGGGACAACGCCAAGAAATACATCGAGGCGGGTGTATCAGAGCATGCAAAGA
GTCTAGGACCAAAGGACTCAGAGCCACGCAAGGCAGCTGTGATTGGAGACACTATCGGAG
ACCCATTGAAGGATACATCAGGACCTTCGTTGAACATCTTGATCAAGCTCATGGCTGTTG
AGTCTCTCGTCTTTGCTCCCTTCTTTGCCACTCACGGTGGTATCCTTTTCAAGTACCTCT
AAACTCAAACCCTGAGTGAAGAAGAAAGATGATGATGAAGAAGAAGATATTGGCTATCGA
TTCAAAACCTCTCTTCTTTCTTTTTTTACCATTCTTGTTTTTCGTTTTGCGTAGGTGGTT
AAAAGTTAAAACATGTTTTTGTTGATGGGAGCTCATTTAAAGAACCAACCAAATGATGAC
TCTCTTTCTCTTTATATCTTTTTGTGCTGTCTAGAATTTAGAAAACCCCCAAGTATTTGA
GACTTGTTTTTAGCCGTTACTTCTCCCTGCTTTGTTTTTCTTATGTTTGTTTTGGTCTTG
AACTATGTTTGTTTCTTATCTTTTTTGTGCTGTCTAGAATTTAGAAAACCACCAAGTATT
TGAGACTTGTTTTTAGCCGTT

QA 1 681 1 681
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4791Contig1 937 2 4 U
GGAGCTCTGACTTTTGAGATATCATTTCATGGCTGTTTCTCCTAAACATATCCAGCTTCC
TTCTTCTTCTACGCTTCTCCCATCTTCTTCTTCATTCATCTCATCCATTCCCTCAACTCC
ACTCTTTGTTACTACTACTATTCGAGTCTCCACAAAACTCTGTTCACTACGCGTCCGTTT
CAGCCGATGATCCATCGTAAGATACAACGACGACAACGCGGGAGAAGATGAAGAAGACGA
GGATGAAGAGAACTGGAACTTTGAGGAAGCTGTCTCTCTCTTCAACCAGAGAGATTATTA
CAAAAGCCACGACGCCCTGGAAGCACTCTGGATTCGAGCTGAGGAGCCAGCTCGAACGCT
GTTCCATGGGATACTTCAGTGTGCCGTCGGATTCCACCATCTCTTCAACAACAACCATAA
AGGAGCGATGATGGAGTTAGGAGAAGGAGTGTGTAAGCTAAGGAAGATGAACTTTGAAGA
CGGACCGTTTCAAGATTTCGAGAGAGATGTCTCTGCCGTTCTTGAATTCGTTTATCAAAC
TCAGCTCGAACTCGCTGCTTGTTCGGAAGATATGTGTTTGACAATGGATCAATCAGACCG
ATCATATCAACTGTTGGGTGGTTATGCTGCTGGAGAGAGCATCTACACCTTAGAGACTCT
GGTTGATTTCAACAATGGCATGTCTGAAACAAGTGTTATACTCTTCTCTCCTTCAAGCTC
CTCCTCTGAGCCAACTAGAGTCAAACTCCCAACTCTGGCCGCAACCGATAAGCACCTTAT
TGCGTTTACAGGCGGCGAGAGTTTTTAAGAGAAATGATTCATTAAGGATCTTATTTGCAT
TCCACAAAACCATGATGCAGAGTGAATAATACAGAAATGATTAGACACTGCATCAGCATA
GTGATTACAGATTAGAAACAGAGTTACAAATGTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E229TF U 1
AF RR2E229JQ C 686
BS 1 751 RR2E229TF
BS 752 752 RR2E229JQ
BS 753 763 RR2E229TF
BS 764 937 RR2E229JQ

RD RR2E229TF 768 0 0
GGAGCTCTGACTTTTGAGATATCATTTCATGGCTGTTTCTCCTAAACATATCCAGCTTCC
TTCTTCTTCTACGCTTCTCCCATCTTCTTCTTCATTCATCTCATCCATTCCCTCAACTCC
ACTCTTTGTTACTACTACTATTCGAGTCTCCACAAAACTCTGTTCACTACGCGTCCGTTT
CAGCCGATGATCCATCGTAAGATACAACGACGACAACGCGGGAGAAGATGAAGAAGACGA
GGATGAAGAGAACTGGAACTTTGAGGAAGCTGTCTCTCTCTTCAACCAGAGAGATTATTA
CAAAAGCCACGACGCCCTGGAAGCACTCTGGATTCGAGCTGAGGAGCCAGCTCGAACGCT
GTTCCATGGGATACTTCAGTGTGCCGTCGGATTCCACCATCTCTTCAACAACAACCATAA
AGGAGCGATGATGGAGTTAGGAGAAGGAGTGTGTAAGCTAAGGAAGATGAACTTTGAAGA
CGGACCGTTTCAAGATTTCGAGAGAGATGTCTCTGCCGTTCTTGAATTCGTTTATCAAAC
TCAGCTCGAACTCGCTGCTTGTTCGGAAGATATGTGTTTGACAATGGATCAATCAGACCG
ATCATATCAACTGTTGGGTGGTTATGCTGCTGGAGAGAGCATCTACACCTTAGAGACTCT
GGTTGATTTCAACAATGGCATGTCTGAAACAAGTGTTATACTCTTCTCTCCTTCAAGCTC
CTCCTCTGAGCCAACTAGAGTCAAACTCCCA*CTCTGGCCGCA
CCGAT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2E229JQ 252 0 0
GAAACAAGTGTTATACTCTTCTCTCCTTCAAGCTCCTCCTCTGAGCCAACTAGAGTCAAA
CTCCCAACTCTGGCCGCAACCGATAAGCACCTTATTGCGTTTACAGGCGGCGAGAGTTTT
TAAGAGAAATGATTCATTAAGGATCTTATTTGCATTCCACAAAACCATGATGCAGAGTGA
ATAATACAGAAATGATTAGACACTGCATCAGCATAGTGATTACAGATTAGAAACAGAGTT
ACAAATGTTGTC

QA 1 252 1 252
DS 



AS 1 2

CO CL4792Contig1 908 2 2 U
GGGACATAAGCTGGCCAGAAGACGTCGACTGGACTCTCAAGCTCACCGTCGAGATCGATC
AGGGCCCACAAGCCGTCAACGTGAACGACGACCTCGCGAGAGAGATGGCGTTCTACACAC
AAGCCCTAGAAGGGACGAGGGAGGCCTTCGGGAAGCTCGAGGAGATGGGGCTGCCTTTTT
TAAGACCGGGGGATTACTACGCGGATATGGTGAAGTCGGACACGCACATGGAGAAGGTGA
AGTCGAAGCTTCTGTACGAGAAGAAGCAGATGGAGGAGGCGGAGGAGAGGAGGAAAGCTA
GGGATAACAAGAAGATGGCGAAGGAGGTGCAGTCTCAGAAGATGAAGGAGAGGGCTAAGC
AGAAGAAGGATGAGATTGAGTCTGTTAAGAAGTGGAGGAAACAGAGGCAGCAGAGTGGGT
TTAGTGAGAAAGGTGGTGGCGCGGGGGAGCTTGATCTTGAGTTTGGTAATGGGAAGAGTT
TTCAGAGAGGTGGTGGTGGTGGGAAGAAGAGGCCTGGTGTGTCTCCTGGTGATCGGTCGG
GAGGGAAAGGGAAGTCTGCTTCGAGGATGAATAATAAGAAGAGGGAGTTTAGGGATTCTG
AGTTTGGTCATGGTGGTAGGAAAGGGTTGAGCAAGCAGAACACTGCGGAGACTACTAATG
ATTTTAAAGGCGGGTTTCGTGGAGGCAAAGCTGGTGGAGGTAACAAGAGACAGAAGAGAT
AAGATAATTGAAATGGTTTTTATCATCTAAACCCATCGGCAACTTGAATACTATAATTTT
ATTTGTTATCTTGGATTATGTTCTTTAGAGAATGCTTTTTGTTCTGTTGTACGAATGATT
TCGTGAATTAACGAACTCCAATGTGTTTTGAAGAATTTGAGTTCCAAGAAAGTGTTATTT
TCATATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ60TF U 1
AF RR2AQ60JQ C 214
BS 1 695 RR2AQ60TF
BS 696 908 RR2AQ60JQ

RD RR2AQ60TF 695 0 0
GGGACATAAGCTGGCCAGAAGACGTCGACTGGACTCTCAAGCTCACCGTCGAGATCGATC
AGGGCCCACAAGCCGTCAACGTGAACGACGACCTCGCGAGAGAGATGGCGTTCTACACAC
AAGCCCTAGAAGGGACGAGGGAGGCCTTCGGGAAGCTCGAGGAGATGGGGCTGCCTTTTT
TAAGACCGGGGGATTACTACGCGGATATGGTGAAGTCGGACACGCACATGGAGAAGGTGA
AGTCGAAGCTTCTGTACGAGAAGAAGCAGATGGAGGAGGCGGAGGAGAGGAGGAAAGCTA
GGGATAACAAGAAGATGGCGAAGGAGGTGCAGTCTCAGAAGATGAAGGAGAGGGCTAAGC
AGAAGAAGGATGAGATTGAGTCTGTTAAGAAGTGGAGGAAACAGAGGCAGCAGAGTGGGT
TTAGTGAGAAAGGTGGTGGCGCGGGGGAGCTTGATCTTGAGTTTGGTAATGGGAAGAGTT
TTCAGAGAGGTGGTGGTGGTGGGAAGAAGAGGCCTGGTGTGTCTCCTGGTGATCGGTCGG
GAGGGAAAGGGAAGTCTGCTTCGAGGATGAATAATAAGAAGAGGGAGTTTAGGGATTCTG
AGTTTGGTCATGGTGGTAGGAAAGGGTTGAGCAAGCAGAACACTGCGGAGACTACTAATG
ATTTTAAAGGCGGGTTTCGTGGAGGCAAAGCTGGT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2AQ60JQ 695 0 0
AGTCGGACACGCACATGGAGAAGGTGAAGTCGAAGCTTCTGTACGAGAAGAAGCAGATGG
AGGAGGCGGAGGAGAGGAGGAAAGCTAGGGATAACAAGAAGATGGCGAAGGAGGTGCAGT
CTCAGAAGATGAAGGAGAGGGCTAAGCAGAAGAAGGATGAGATTGAGTCTGTTAAGAAGT
GGAGGAAACAGAGGCAGCAGAGTGGGTTTAGTGAGAAAGGTGGTGGCGCGGGGGAGCTTG
ATCTTGAGTTTGGTAATGGGAAGAGTTTTCAGAGAGGTGGTGGTGGTGGGAAGAAGAGGC
CTGGTGTGTCTCCTGGTGATCGGTCGGGAGGGAAAGGGAAGTCTGCTTCGAGGATGAATA
ATAAGAAGAGGGAGTTTAGGGATTCTGAGTTTGGTCATGGTGGTAGGAAAGGGTTGAGCA
AGCAGAACACTGCGGAGACTACTAATGATTTTAAAGGCGGGTTTCGTGGAGGCAAAGCTG
GTGGAGGTAACAAGAGACAGAAGAGATAAGATAATTGAAATGGTTTTTATCATCTAAACC
CATCGGCAACTTGAATACTATAATTTTATTTGTTATCTTGGATTATGTTCTTTAGAGAAT
GCTTTTTGTTCTGTTGTACGAATGATTTCGTGAATTAACGAACTCCAATGTGTTTTGAAG
AATTTGAGTTCCAAGAAAGTGTTATTTTCATATTT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL4793Contig1 482 2 1 U
GGACATTTTCTAGCATTCTAAGATTTAAACATGAAGAAATCAGTTTTCTCCTTCTTCATC
ACAGTCTCTCTTCTGCTTCTTCTCGCGGCTGCATCTACATGGAACGGCACAAGTGAGTTG
AGATATGATGGATGTGTTCCAGGAGATAGCGTCAGAGAATGCATAATGGCGTCGGCCGAG
AAGGAGGAGGTGGTACGGCGGATTCTGCAGCCAAGAAAGTTTATAAGCCCAAAACCTCTG
CAGCGACAGCCTGCTTTACCCTGTAATATTGCCGCTAATTGCATCAAACAGGTTAATGGG
AAAGACGCAACTTGCACCTACTACGACCGTTGCCAACGCTCAGCTTAAATTTTTCCTCTT
CCTTTTTTATCATTGTATCTTTTATATGTTGCTTTTTCCCCTTAATCATGTGTGTTTTAT
GATAATTTGGTTAAAAGAGTGAGTGAGTGTAACAATAATAAGCAAGTCAGTCTGTTGAAA
CC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2B987JQ C 1
AF RR2B987TF U 1
BS 1 482 RR2B987TF

RD RR2B987JQ 482 0 0
GGACATTTTCTAGCATTCTAAGATTTAAACATGAAGAAATCAGTTTTCTCCTTCTTCATC
ACAGTCTCTCTTCTGCTTCTTCTCGCGGCTGCATCTACATGGAACGGCACAAGTGAGTTG
AGATATGATGGATGTGTTCCAGGAGATAGCGTCAGAGAATGCATAATGGCGTCGGCCGAG
AAGGAGGAGGTGGTACGGCGGATTCTGCAGCCAAGAAAGTTTATAAGCCCAAAACCTCTG
CAGCGACAGCCTGCTTTACCCTGTAATATTGCCGCTAATTGCATCAAACAGGTTAATGGG
AAAGACGCAACTTGCACCTACTACGACCGTTGCCAACGCTCAGCTTAAATTTTTCCTCTT
CCTTTTTTATCATTGTATCTTTTATATGTTGCTTTTTCCCCTTAATCATGTGTGTTTTAT
GATAATTTGGTTAAAAGAGTGAGTGAGTGTAACAATAATAAGCAAGTCAGTCTGTTGAAA
CC

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR2B987TF 482 0 0
GGACATTTTCTAGCATTCTAAGATTTAAACATGAAGAAATCAGTTTTCTCCTTCTTCATC
ACAGTCTCTCTTCTGCTTCTTCTCGCGGCTGCATCTACATGGAACGGCACAAGTGAGTTG
AGATATGATGGATGTGTTCCAGGAGATAGCGTCAGAGAATGCATAATGGCGTCGGCCGAG
AAGGAGGAGGTGGTACGGCGGATTCTGCAGCCAAGAAAGTTTATAAGCCCAAAACCTCTG
CAGCGACAGCCTGCTTTACCCTGTAATATTGCCGCTAATTGCATCAAACAGGTTAATGGG
AAAGACGCAACTTGCACCTACTACGACCGTTGCCAACGCTCAGCTTAAATTTTTCCTCTT
CCTTTTTTATCATTGTATCTTTTATATGTTGCTTTTTCCCCTTAATCATGTGTGTTTTAT
GATAATTTGGTTAAAAGAGTGAGTGAGTGTAACAATAATAAGCAAGTCAGTCTGTTGAAA
CC

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL4794Contig1 608 2 13 U
GGGGAAAATTTGACTTCGATTAATATCTAAAAAGTGCAAAGGATATCCCATTGAAAGAGG
GGGAAGCAGAAAAACAAATTTGAAATCTTGTTCGGTACAAACGCTAAATACCAAAAAAAA
AAAAAATACAAAAAGAAAGGTAAAAAAAAAACCGGTGGGTGCTGCAAACGCGGACAAAAA
ACACACTAATAAAAAAAAAGTTTTTGAGCTTTTGGATTGGTTTACTCATCGCCTTGGCCA
TCATCCTTCACCAGTTTGATCATGTCGTCCATTCTCAAAATCGTAATTGCTGCCTCTGTT
GCAAACTGGATAATTTTCACTTTGCCAATTGTTCGCGAGAGCCCAAGGTTGTAGCAAGGG
GCTCCAGATACACAGACAATGCTGACTCAACTGCACCTCCACCCGCAACCACCGTGGTGG
ACTCGAGGGTCCTCTTGACAATACACAAAGAATCGTGCAGTGCTCTCTCCATCTCATCAA
GCATGTAGTCATTTGCACCTCTCAAGATCATGGATACCGCACTGCTGGTTTTGGTTCCCT
TTATCAATAACAACATCGTCATCCGCAATTCTCTCCTCCACAACTTCACCTGCCGATCCA
AGGTGTGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H491JQB U 1
AF RR2G164JQ U 1
BS 1 145 RR2G164JQ
BS 146 146 RR2H491JQB
BS 147 194 RR2G164JQ
BS 195 195 RR2H491JQB
BS 196 269 RR2G164JQ
BS 270 270 RR2H491JQB
BS 271 277 RR2G164JQ
BS 278 278 RR2H491JQB
BS 279 359 RR2G164JQ
BS 360 360 RR2H491JQB
BS 361 416 RR2G164JQ
BS 417 417 RR2H491JQB
BS 418 608 RR2G164JQ

RD RR2H491JQB 421 0 0
GGGGAAAATTTGACTTCGATTAATATCTAAAAAGTGCAAAGGATATCCCATTGAAAGAGG
GGGAAGCAGAAAAACAAATTTGAAATCTTGTTCGGTACAAACGCTAAATACCAAAAAAAA
AAAAAATACAAAAAGAAAGGTAAAAAAAAAACCGGTGGGTGCTGCAAACGCGGACAAAAA
ACACACTAATAAAAAAAAAGTTTTTGAGCTTTTGGATTGGTTTACTCATCGCCTTGGCCA
TCATCCTTCACCAGTTTGATCATGTCGTCCATTCTCAAAATCGTAATTGCTGCCTCTGTT
GCAAACTGGATAATTTTCACTTTGCCAATTGTTCGCGAGAGCCCAAGGTTGTAGCAAGGG
GCTCCAGATACACAGACAATGCTGACTCAACTGCACCTCCACCCGCAACCACCGTGGTGG
A

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR2G164JQ 608 0 0
GGGGAAAATTTGACTTCGATTAATATCTAAAAAGTGCAAAGGATATCCCATTGAAAGAGG
GGGAAGCAGAAAAACAAATTTGAAATCTTGTTCGGTACAAACGCTAAATACCAAAAAAAA
AAAAAATACAAAAAGAAAGGTAAAAGAAAAACCGGTGGGTGCTGCAAACGCGGACAAAAA
ACACACTAATAAAAGAAAAGTTTTTGAGCTTTTGGATTGGTTTACTCATCGCCTTGGCCA
TCATCCTTCACCAGTTTGATCATGTCGTCGATTCTCAGAATCGTAATTGCTGCCTCTGTT
GCAAACTGGATAATTTTCACTTTGCCAATTGTTCGCGAGAGCCCAAGGTTGTAGCAAGGT
GCTCCAGATACACAGACAATGCTGACTCAACTGCACCTCCACCCGCAACCACCGTGTTGG
ACTCGAGGGTCCTCTTGACAATACACAAAGAATCGTGCAGTGCTCTCTCCATCTCATCAA
GCATGTAGTCATTTGCACCTCTCAAGATCATGGATACCGCACTGCTGGTTTTGGTTCCCT
TTATCAATAACAACATCGTCATCCGCAATTCTCTCCTCCACAACTTCACCTGCCGATCCA
AGGTGTGC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL4795Contig1 482 2 1 U
GCGCTTGGAGGCTAAGGAGGCTGGAGCTGCAGCTAGAGTCAGAGAAGACGTCTAGACAAA
GGGAGAAGATGGAGGAGATTGAGGCGAAGATGAAGGCTCTGAGGGAAGAGCAGAAGATGG
CAATGGAGAAGATTGAAGGAGAGTATAGAGAACAGCTTGTGGGTTTGAGGAGAGACGCTG
AGGCCAAGGAGCAGAAACTAGCTGATCAATGGAGCTCTAAGCATATCAGGCTCACTAAGT
TTCTTGAGCAGAACATTGGTTGCAGACAGAGGCTAGACCGGCCCTGAAACCTGAACCAAA
CCATGAAAACACCTACTACTAAGAGATGTCTTCTCCTCTTTCTTGTGTCATGTAATGTAA
GCTTTTTTGCTTTGAGTTTCTTTTTGTTTCATTTGGTGTCTCCAATGTTAATCAGACTTT
TTGGTTCCTTAACTCAGCTTTTAATGTATGTTTTGGTTTATCTTCTTTAATCATTTGGTG
CC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2F163JQ C 1
AF RR2F163TF U 1
BS 1 482 RR2F163TF

RD RR2F163JQ 482 0 0
GCGCTTGGAGGCTAAGGAGGCTGGAGCTGCAGCTAGAGTCAGAGAAGACGTCTAGACAAA
GGGAGAAGATGGAGGAGATTGAGGCGAAGATGAAGGCTCTGAGGGAAGAGCAGAAGATGG
CAATGGAGAAGATTGAAGGAGAGTATAGAGAACAGCTTGTGGGTTTGAGGAGAGACGCTG
AGGCCAAGGAGCAGAAACTAGCTGATCAATGGAGCTCTAAGCATATCAGGCTCACTAAGT
TTCTTGAGCAGAACATTGGTTGCAGACAGAGGCTAGACCGGCCCTGAAACCTGAACCAAA
CCATGAAAACACCTACTACTAAGAGATGTCTTCTCCTCTTTCTTGTGTCATGTAATGTAA
GCTTTTTTGCTTTGAGTTTCTTTTTGTTTCATTTGGTGTCTCCAATGTTAATCAGACTTT
TTGGTTCCTTAACTCAGCTTTTAATGTATGTTTTGGTTTATCTTCTTTAATCATTTGGTG
CC

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR2F163TF 482 0 0
GCGCTTGGAGGCTAAGGAGGCTGGAGCTGCAGCTAGAGTCAGAGAAGACGTCTAGACAAA
GGGAGAAGATGGAGGAGATTGAGGCGAAGATGAAGGCTCTGAGGGAAGAGCAGAAGATGG
CAATGGAGAAGATTGAAGGAGAGTATAGAGAACAGCTTGTGGGTTTGAGGAGAGACGCTG
AGGCCAAGGAGCAGAAACTAGCTGATCAATGGAGCTCTAAGCATATCAGGCTCACTAAGT
TTCTTGAGCAGAACATTGGTTGCAGACAGAGGCTAGACCGGCCCTGAAACCTGAACCAAA
CCATGAAAACACCTACTACTAAGAGATGTCTTCTCCTCTTTCTTGTGTCATGTAATGTAA
GCTTTTTTGCTTTGAGTTTCTTTTTGTTTCATTTGGTGTCTCCAATGTTAATCAGACTTT
TTGGTTCCTTAACTCAGCTTTTAATGTATGTTTTGGTTTATCTTCTTTAATCATTTGGTG
CC

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL4796Contig1 495 2 4 U
ATCTGCGCATCTCTCTCTTACTCCCTTATCTTCTCGATTAATTTCTCTCAGTATCATGTT
GACTGAAACTCCGTTTAGACCAAGAGAGAAGCTTCTTGAGAAGCAGAGGTTGTTCCAAAG
TATCCAAAGGCACACTTACCTCAAAGGACCAATGGACAAGGTCACTTCCGTTGCCATTCC
TCTTGCCTTGGCTGCATCTTCTCTCTACATGATTGGAACAGGAATCTACAGCATGTCGAA
TGGAATCGGGAAGAAGGAATAAGCAAAACAACTTCTTCTTCTTTTTTCCTTTTTATTTAC
GCCTTTGAGGGTTCTTTCTATGTGTATCCAGTGGCTAGCATGATGCTTTTGCAGACTAAT
GGTTGTACTGGTCTTTTTCTTGCATTTTTGCCAAATAATTGCAGACAATGTCTAAAGATT
AAAGATGTTTGATGGTATAAAGTTCCAATACTTGGAAAGTTCTTCATTTGCTTATGACAA
AGTTGAATTCTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CQ35JQ C 1
AF RR2CQ35TF U 9
BS 1 8 RR2CQ35JQ
BS 9 24 RR2CQ35TF
BS 25 25 RR2CQ35JQ
BS 26 495 RR2CQ35TF

RD RR2CQ35JQ 495 0 0
ATCTGCGCATCTCTCTCTTACTCCCTTATCTTCTCGATTAATTTCTCTCAGTATCATGTT
GACTGAAACTCCGTTTAGACCAAGAGAGAAGCTTCTTGAGAAGCAGAGGTTGTTCCAAAG
TATCCAAAGGCACACTTACCTCAAAGGACCAATGGACAAGGTCACTTCCGTTGCCATTCC
TCTTGCCTTGGCTGCATCTTCTCTCTACATGATTGGAACAGGAATCTACAGCATGTCGAA
TGGAATCGGGAAGAAGGAATAAGCAAAACAACTTCTTCTTCTTTTTTCCTTTTTATTTAC
GCCTTTGAGGGTTCTTTCTATGTGTATCCAGTGGCTAGCATGATGCTTTTGCAGACTAAT
GGTTGTACTGGTCTTTTTCTTGCATTTTTGCCAAATAATTGCAGACAATGTCTAAAGATT
AAAGATGTTTGATGGTATAAAGTTCCAATACTTGGAAAGTTCTTCATTTGCTTATGACAA
AGTTGAATTCTTTTC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RR2CQ35TF 487 0 0
ATCTCTCTCTTACTCC*TTATCTTCTCGATTAATTTCTCTCAGTATCATGTTGACTGAAA
CTCCGTTTAGACCAAGAGAGAAGCTTCTTGAGAAGCAGAGGTTGTTCCAAAGTATCCAAA
GGCACACTTACCTCAAAGGACCAATGGACAAGGTCACTTCCGTTGCCATTCCTCTTGCCT
TGGCTGCATCTTCTCTCTACATGATTGGAACAGGAATCTACAGCATGTCGAATGGAATCG
GGAAGAAGGAATAAGCAAAACAACTTCTTCTTCTTTTTTCCTTTTTATTTACGCCTTTGA
GGGTTCTTTCTATGTGTATCCAGTGGCTAGCATGATGCTTTTGCAGACTAATGGTTGTAC
TGGTCTTTTTCTTGCATTTTTGCCAAATAATTGCAGACAATGTCTAAAGATTAAAGATGT
TTGATGGTATAAAGTTCCAATACTTGGAAAGTTCTTCATTTGCTTATGACAAAGTTGAAT
TCTTTTC

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL4797Contig1 910 2 2 U
TTTTTTTCTTGTAGCTGTTCTACTTCTGACTCTCTCCTCTTCCTCCTTCACACGAGGCCA
GAGAATCATACAGATTCCTCCACCACGTCCGTTATGCGCCTCTCAATACGCCCTGGCTAA
CTACGCCTGCTCACGTCTCCCAATGAACACTGTCCCACTTCCTTCCCCCATTGCCCCACC
TCCTCCTCCCATCTTTCCCCTCCTCCTCCTAACCATGACCACGACCATGATCATGATGAC
CACGACCATGACGACGATGACCATGATCACGACCATAATCATGACCATGATCACGACCAT
GATCACGACCATGATGATGATGATGACGACGATCACGATCACGATCATGATGACGACGAT
CACGATCATGATCACAACCGTGACCACGATCATGATGACCACGATGACCATGACCATGAC
CACGACCATGATCACGGTGATCATGACCACGATCATGATGATGATCACGATCACCACAAC
AATAACGACAACAGCCATAACCACCGTCGCCGCCGCCGTCACCATCACCACCACCATCGT
CATCACCGACACAGAGAAGAGACGTATGCTCAACAAGAGTGCTGCAAGTGGTTGAAGCAA
ATGGACAACGAATGCGTTTGCGACCTTCTGGTTCGGCTTCCGCCATTGCTAGCCAAACCT
GCTCACAACTATACAGTTTTTGTGGATGAGTCGTGCATCGTCACTTACACCTGTGGAGGC
AGACTCATGAGTTGATACTTTTTCCTTTTTAAACTAGTTATACTGTCCCATGCCTTGTTT
TCCTTCAAAAGCCCCTTTTGTTTATTTGTTTTTTTTTACCCTTCAGTAGTATAATTGTTG
TACGTTTCAAACTCGACCAACCAAAAGTCAAATTAAACACAAAAAGAAAAAACAAACAGT
AATACGGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF09TF U 1
AF RR2GF09JQ C 391
BS 1 652 RR2GF09TF
BS 653 910 RR2GF09JQ

RD RR2GF09TF 652 0 0
TTTTTTTCTTGTAGCTGTTCTACTTCTGACTCTCTCCTCTTCCTCCTTCACACGAGGCCA
GAGAATCATACAGATTCCTCCACCACGTCCGTTATGCGCCTCTCAATACGCCCTGGCTAA
CTACGCCTGCTCACGTCTCCCAATGAACACTGTCCCACTTCCTTCCCCCATTGCCCCACC
TCCTCCTCCCATCTTTCCCCTCCTCCTCCTAACCATGACCACGACCATGATCATGATGAC
CACGACCATGACGACGATGACCATGATCACGACCATAATCATGACCATGATCACGACCAT
GATCACGACCATGATGATGATGATGACGACGATCACGATCACGATCATGATGACGACGAT
CACGATCATGATCACAACCGTGACCACGATCATGATGACCACGATGACCATGACCATGAC
CACGACCATGATCACGGTGATCATGACCACGATCATGATGATGATCACGATCACCACAAC
AATAACGACAACAGCCATAACCACCGTCGCCGCCGCCGTCACCATCACCACCACCATCGT
CATCACCGACACAGAGAAGAGACGTATGCTCAACAAGAGTGCTGCAAGTGGTTGAAGCAA
ATGGACAACGAATGCGTTTGCGACCTTCTGGTTCGGCTTCCGCCATTGCTAG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2GF09JQ 520 0 0
CATGATGACCACGATGACCATGACCATGACCACGACCATGATCACGGTGATCATGACCAC
GATCATGATGATGATCACGATCACCACAACAATAACGACAACAGCCATAACCACCGTTGC
CGCCGCCGTCACCATCACCACCACCATTGTCATCACCGACACAGAGAAGAGACGTATGCT
CAACAAGAGTGCTGCAAGTGGTTGAAGCAAATGGACAACGAATGGGTTTGCGACCTTTTG
GTTTGGCTTCCGCCATTGCTAGCCAAACCTGCTCACAACTATACAGTTTTTGTGGATGAG
TCGTGCATCGTCACTTACACCTGTGGAGGCAGACTCATGAGTTGATACTTTTTCCTTTTT
AAACTAGTTATACTGTCCCATGCCTTGTTTTCCTTCAAAAGCCCCTTTTGTTTATTTGTT
TTTTTTTACCCTTCAGTAGTATAATTGTTGTACGTTTCAAACTCGACCAACCAAAAGTCA
AATTAAACACAAAAAGAAAAAACAAACAGTAATACGGATT

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 2

CO CL4798Contig1 718 2 5 U
GCGTTCTTGTCTGAATAGATTAGATGTAGATAATATATGACAATGGACCAACCTGATCAT
GTTCTCAAAAGGGGCATAAAAATCCCAAAAGAAGAAGAAAAAAGACACCCAGCTCAACGG
CTGCGCTCCGGTTTATCCTAATTTTACAACAGAAACTCACACGGTTCTCAATCCGTCTGA
AGAAGCTACATAGATAGCTCATAATATTACAGCTAGAATGCAGAGAAGAAGAAACCTGAA
GAGATGGTTTCAGAGCACTGCTTGTCCCTTGGCGTTGTTATTCTTCCTCAGCTCATCGTT
CTCCTGGCGCAGTGCATCGATCCTGGACTGGAGAATACTGATCATAGCTTCCGCACTCAT
CATCTCAAGCTTGAACGTCTCTCTCTCAACAGACATCTGGTGAACCTCCTTCTGGAGATC
ATTGAGCTTCTCTTCAGGAGAGGGAAGCGGAACAGGAGGAGAAGCTTCCTTGTTAGGAGG
TTGCTGCTGGTTTTCTTTCTTTGCGGAAATACCCATGAGAGAGAATTCAAGCAACGCAGA
GATGGCAGTGTTGGTGGCAGCAGCAGCAGATGACGATGAGATTAAAGCTGTTGGTGGTGT
ATTGTCGACGGTTGTTGTTGTGGACGAACAGTGATCCTGTGTGGTCCTGCTTGAGTTGTT
GTTGTTGGGTTCGTTTTGGCGTCTGCGTTTGTACTGGAGGAGAGGCAATGGAGCTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM86JQ U 45
AF RR2BV68JQ U 1
BS 1 153 RR2BV68JQ
BS 154 154 RR2AM86JQ
BS 155 451 RR2BV68JQ
BS 452 452 RR2AM86JQ
BS 453 718 RR2BV68JQ

RD RR2AM86JQ 499 0 0
GGACCAACCTGATCATGTTCTCAAAAGGTGCATAAAAATCCCAAAAGAAGAAGAAAAAAG
ACACCCAGCTCAACGGCTGCGCTCCGGTTTATCCTAATTTTACAACAGAAACTCACACGG
TTCTCAATCCGTCTGAAGAAGCTACATAGATAGCTCATAATATTACAGCTAGAATGCAGA
GAAGAAGAAACCTGAAGAGATGGTTTCAGAGCACTGCTTGTCCCTTGGCGTTGTTATTCT
TCCTCAGCTCATCGTTCTCCTGGCGCAGTGCATCGATCCTGGACTGGAGAATACTGATCA
TAGCTTCCGCACTCATCATCTCAAGCTTGAACGTCTCTCTCTCAACAGACATCTGGTGAA
CCTCCTTCTGGAGATCATTGAGCTTCTCTTCAGGAGAGGGAAGCGGAACAGGAGGAGAAG
CTTCCTTGTTAGGAGGTTGCTGCTGGTTTTCTTTCTTTGCGGAGATACCCATGAGAGAGA
ATTCAAGCAACGCAGA
AAT

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2BV68JQ 718 0 0
GCGTTCTTGTCTGAATAGATTAGATGTAGATAATATATGACAATGGACCAACCTGATCAT
GTTCTCAAAAGGGGCATAAAAATCCCAAAAGAAGAAGAAAAAAGACACCCAGCTCAACGG
CTGCGCTCCGGTTTATCCTAATTTTACAACAGAGACTCACACGGTTCTCAATCCGTCTGA
AGAAGCTACATAGATAGCTCATAATATTACAGCTAGAATGCAGAGAAGAAGAAACCTGAA
GAGATGGTTTCAGAGCACTGCTTGTCCCTTGGCGTTGTTATTCTTCCTCAGCTCATCGTT
CTCCTGGCGCAGTGCATCGATCCTGGACTGGAGAATACTGATCATAGCTTCCGCACTCAT
CATCTCAAGCTTGAACGTCTCTCTCTCAACAGACATCTGGTGAACCTCCTTCTGGAGATC
ATTGAGCTTCTCTTCAGGAGAGGGAAGCGGAGCAGGAGGAGAAGCTTCCTTGTTAGGAGG
TTGCTGCTGGTTTTCTTTCTTTGCGGAAATACCCATGAGAGAGAATTCAAGCAACGCAGA
GATGGCAGTGTTGGTGGCAGCAGCAGCAGATGACGATGAGATTAAAGCTGTTGGTGGTGT
ATTGTCGACGGTTGTTGTTGTGGACGAACAGTGATCCTGTGTGGTCCTGCTTGAGTTGTT
GTTGTTGGGTTCGTTTTGGCGTCTGCGTTTGTACTGGAGGAGAGGCAATGGAGCTTCT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL4799Contig1 834 2 2 U
GGGTCTGTAATCAAGAGAATCGGAAGAGGAAGAAGAGTTATGTCATGCAGCATGGGATCT
TCATCATGTTGTTTTAATGTGCTGCTCATCATCATGAGCCTTATGGTTCTGAGTTTGTCG
GCTGATGCGTACAAGAACTACACTGTGGGTGAGTCCAAAGGATGGTTCGATATCCAGGAG
AGAGCCTCTTTAAATTATCAGAAATGGGCAGATTCCAAATCCTTTTCTTTGGGTGATTTC
CTCATATTCAACACAGATAGCAACCATTCAGTGGTGCAAACATATGACTTCAAAACATAC
AAATCATGTGATTACAACAATAATGAAGACAATAGCACAAGAGAGTGGTCGGCTGCAAAA
CCATCAGCAACATCTCCAGTTCCAGTCACAGTCAAAGTTCCTCTTGTCAAAGAAGGCTCC
AATTATTTCTTCTCGGGAAACTATGATGGTGAACAATGCAAATTTGGACAACATTTCATG
ATAAATGTAACACATGGTCAAGGCCTACCAGTACCAGATGAAGATGATGAGACGGCTCCT
GGACCAGGCCAATCCTCTCAATCAGGTGGTGGTGATGATGAAGTTGCTCCTGATACTATA
GTTCCCGCCAATTTTGACCATCCTAAAGATATTGAGAGTGATGATGATGATGATAGTTTG
GTTAAGGGTCGAAAAAATTCTTCTTCCATGATAAAGTATAATTCGTTATGTGTGGTTTTT
GTGGGGTTCTTGGCATCATTCTTTTAATCGATTCTCCTTCGGTTCTGATGACTACAGGTT
TTGTATGTGTAGTAAGTATAAAGCATCCTGGAGGTGTAATAATAATTATTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D410TF U 1
AF RR2D410JQ C 187
BS 1 667 RR2D410TF
BS 668 834 RR2D410JQ

RD RR2D410TF 669 0 0
GGGTCTGTAATCAAGAGAATCGGAAGAGGAAGAAGAGTTATGTCATGCAGCATGGGATCT
TCATCATGTTGTTTTAATGTGCTGCTCATCATCATGAGCCTTATGGTTCTGAGTTTGTCG
GCTGATGCGTACAAGAACTACACTGTGGGTGAGTCCAAAGGATGGTTCGATATCCAGGAG
AGAGCCTCTTTAAATTATCAGAAATGGGCAGATTCCAAATCCTTTTCTTTGGGTGATTTC
CTCATATTCAACACAGATAGCAACCATTCAGTGGTGCAAACATATGACTTCAAAACATAC
AAATCATGTGATTACAACAATAATGAAGACAATAGCACAAGAGAGTGGTCGGCTGCAAAA
CCATCAGCAACATCTCCAGTTCCAGTCACAGTCAAAGTTCCTCTTGTCAAAGAAGGCTCC
AATTATTTCTTCTCGGGAAACTATGATGGTGAACAATGCAAATTTGGACAACATTTCATG
ATAAATGTAACACATGGTCAAGGCCTACCAGTACCAGATGAAGATGATGAGACGGCTCCT
GGACCAGGCCAATCCTCTCAATCAGGTGGTGGTGATGATGAAGTTGCTCCTGATACTATA
GTTCCCGCCAATTTTGACCATCCTAAAGATATTGAGAGTGATGATGATGATGATAGTTTG
GTTAAGG
TC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2D410JQ 648 0 0
TCTTTAAATTATCAGAAATGGGCAGATTCCAAATCCTTTTCTTTGGGTGATTTCCTCATA
TTCAACACAGATAGCAACCATTCAGTGGTGCAAACATATGACTTCAAAACATACAAATCA
TGTGATTACAACAATAATGAAGACAATAGCACAAGAGAGTGGTCGGCTGCAAAACCATCA
GCAACATCTCCAGTTCCAGTCACAGTCAAAGTTCCTCTTGTCAAAGAAGGCTCCAATTAT
TTCTTCTCGGGAAACTATGATGGTGAACAATGCAAATTTGGACAACATTTCATGATAAAT
GTAACACATGGTCAAGGCCTACCAGTACCAGATGAAGATGATGAGACGGCTCCTGGACCA
GGCCAATCCTCTCAATCAGGTGGTGGTGATGATGAAGTTGCTCCTGATACTATAGTTCCC
GCCAATTTTGACCATCCTAAAGATATTGAGAGTGATGATGATGATGATAGTTTGGTTAAG
GGTCGAAAAAATTCTTCTTCCATGATAAAGTATAATTCGTTATGTGTGGTTTTTGTGGGG
TTCTTGGCATCATTCTTTTAATCGATTCTCCTTCGGTTCTGATGACTACAGGTTTTGTAT
GTGTAGTAAGTATAAAGCATCCTGGAGGTGTAATAATAATTATTTACC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL4800Contig1 696 2 2 U
TTGACATAACAAAGATCTTGTTTTATTATTACGTCGTCGAATTAAATATATATAAGCACG
ACAAAAAAACATCAATAATGCAGAACGTAACAACTATACTCAACAGTAGCATCCCCGTTC
TTGATATTAAACCACTTTGTCCGAGCCTCGACATAGCCTCTAGCAAATCTGAAAGCCCAC
TTCCTCCAACGATCGGCATTTCTCTGACCTCCGAAAATGGGGTGTTCCGACCAAGAATCG
TGATCGTGCTTCCGTTGTACTTCCCTGTCTTAAAAACAAAGTTCATCGCCATTAGAAAAC
CTAACTCTTTTTGGGCCGCTCCGGCGTAAAAACCTTGGGCCTGGCCAACTAACGTGGAGT
TCGTCGGGACTTTCGCAGTCAACGCGTCGTCGATCATAGTGATTCCTCCAAAGTAGGTAG
TAGAGTTTGTAACCGGTGGCTGGATCTTAATGGAGGTTGGGTTTGGACCGCTTAAGATGT
CGTGCCAATAGACTTTGAAATGTGTTAGCTTCTCTTTTCTGTGAAGACCGAGAAGTTTCC
TATCTATGGTTCTTGCAAAGTTTTCTCCATCATCTCCATCATCTCCAGTGGAAGAAACGA
CGGAGAGGAGGAGGATTTGGAGGGAGATGAAGAAAATGAGCTTAACCATGAGTTTTTCTT
TTTGGTTTTAGTATAGGTCTGTTATAAATCATGCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C154TF C 1
AF RR2C154JQ U 3
BS 1 2 RR2C154TF
BS 3 696 RR2C154JQ

RD RR2C154TF 696 0 0
TTGACATAACAAAGATCTTGTTTTATTATTACGTCGTCGAATTAAATATATATAAGCACG
ACAAAAAAACATCAATAATGCAGAACGTAACAACTATACTCAACAGTAGCATCCCCGTTC
TTGATATTAAACCACTTTGTCCGAGCCTCGACATAGCCTCTAGCAAATCTGAAAGCCCAC
TTCCTCCAACGATCGGCATTTCTCTGACCTCCGAAAATGGGGTGTTCCGACCAAGAATCG
TGATCGTGCTTCCGTTGTACTTCCCTGTCTTAAAAACAAAGTTCATCGCCATTAGAAAAC
CTAACTCTTTTTGGGCCGCTCCGGCGTAAAAACCTTGGGCCTGGCCAACTAACGTGGAGT
TCGTCGGGACTTTCGCAGTCAACGCGTCGTCGATCATAGTGATTCCTCCAAAGTAGGTAG
TAGAGTTTGTAACCGGTGGCTGGATCTTAATGGAGGTTGGGTTTGGACCGCTTAAGATGT
CGTGCCAATAGACTTTGAAATGTGTTAGCTTCTCTTTTCTGTGAAGACCGAGAAGTTTCC
TATCTATGGTTCTTGCAAAGTTTTCTCCATCATCTCCATCATCTCCAGTGGAAGAAACGA
CGGAGAGGAGGAGGATTTGGAGGGAGATGAAGAAAATGAGCTTAACCATGAGTTTTTCTT
TTTGGTTTTAGTATAGGTCTGTTATAAATCATGCCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2C154JQ 694 0 0
GACATAACAAAGATCTTGTTTTATTATTACGTCGTCGAATTAAATATATATAAGCACGAC
AAAAAAACATCAATAATGCAGAACGTAACAACTATACTCAACAGTAGCATCCCCGTTCTT
GATATTAAACCACTTTGTCCGAGCCTCGACATAGCCTCTAGCAAATCTGAAAGCCCACTT
CCTCCAACGATCGGCATTTCTCTGACCTCCGAAAATGGGGTGTTCCGACCAAGAATCGTG
ATCGTGCTTCCGTTGTACTTCCCTGTCTTAAAAACAAAGTTCATCGCCATTAGAAAACCT
AACTCTTTTTGGGCCGCTCCGGCGTAAAAACCTTGGGCCTGGCCAACTAACGTGGAGTTC
GTCGGGACTTTCGCAGTCAACGCGTCGTCGATCATAGTGATTCCTCCAAAGTAGGTAGTA
GAGTTTGTAACCGGTGGCTGGATCTTAATGGAGGTTGGGTTTGGACCGCTTAAGATGTCG
TGCCAATAGACTTTGAAATGTGTTAGCTTCTCTTTTCTGTGAAGACCGAGAAGTTTCCTA
TCTATGGTTCTTGCAAAGTTTTCTCCATCATCTCCATCATCTCCAGTGGAAGAAACGACG
GAGAGGAGGAGGATTTGGAGGGAGATGAAGAAAATGAGCTTAACCATGAGTTTTTCTTTT
TGGTTTTAGTATAGGTCTGTTATAAATCATGCCC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL4801Contig1 878 2 4 U
GTCTGCGAGACTCCCACGAGCCTCATCGAGCGCAAAAAGAACGAAGAAGGCAAAGAAGCC
CTAAGGAAGATCAGAGGAGTTGAAGATATAAATGAGGAGTATGAATCTATCGTCCATGCC
TGCGAAATCGCGAGTCAAGTCAAGGATCCTTACAGGAAACTGTTAAAGCCAGCGAGTCGC
CCACCTTTCATCATTGGAAGAATCTTGCTTGGCTTTGGTGTCGGCTTTGGCAATCAGGCA
GTGCCGCTTTTCCTGTCGGAGATTGCTCCGGCTCAGCTAAGGGGAGGTCTCAACATTGTG
TTCCAACTCATGGTCACTATTGGAATCTTTATTGCCAACCTTGTCAATTACTTCACTGCC
ACGGTTCACCCTAACGGATGGCGTATTGCTCTCGGTGGAGCTGCAGTACAAGCCATTATC
CTCCTCTTCGGTTCATTCATCATCTGCGAGACTCCCACGAGCCTCATCGAGCGCAAAAGG
AACGAAGAAGGCAAAGAAGCCCTAAGGAAGATCAGAGGAGTTGAAGATATAAATGAGGAG
ATTCCTTCTTCTCCAATCTTCCGTTCACATGCTCATCTGTCCGTTGATCATTGTGATGGG
ACTGTTTGCGATGTTCTTCGTACCAGAAACTAAAGGAGTCGCTATTGATGACATGAGGGA
AAGAGTGTGGAAGCCACATTGGTTCTGGAAGAGGTATATGCTTGCTGAGGATGATGACGT
GGAGAAGAGAACTGAATGAAACCACACCTGTCTTTGTGTGTTTCTTTTTCTTGTTGATGT
TTGAATTCTTTTGTTAATTATTTTGTTTCGTGGGAACATAGAGTGTGTAATAAGACAAAC
TTGTTGATTCAGGTTAGGTATTTTATCAATGAAACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO86TF U 1
AF RR2CO86JQ C 205
BS 1 409 RR2CO86TF
BS 410 410 RR2CO86JQ
BS 411 688 RR2CO86TF
BS 689 878 RR2CO86JQ

RD RR2CO86TF 688 0 0
GTCTGCGAGACTCCCACGAGCCTCATCGAGCGCAAAAAGAACGAAGAAGGCAAAGAAGCC
CTAAGGAAGATCAGAGGAGTTGAAGATATAAATGAGGAGTATGAATCTATCGTCCATGCC
TGCGAAATCGCGAGTCAAGTCAAGGATCCTTACAGGAAACTGTTAAAGCCAGCGAGTCGC
CCACCTTTCATCATTGGAAGAATCTTGCTTGGCTTTGGTGTCGGCTTTGGCAATCAGGCA
GTGCCGCTTTTCCTGTCGGAGATTGCTCCGGCTCAGCTAAGGGGAGGTCTCAACATTGTG
TTCCAACTCATGGTCACTATTGGAATCTTTATTGCCAACCTTGTCAATTACTTCACTGCC
ACGGTTCACCCTAACGGATGGCGTATTGCTCTCGGTGGAGCTGCAGTACCAGCCATTATC
CTCCTCTTCGGTTCATTCATCATCTGCGAGACTCCCACGAGCCTCATCGAGCGCAAAAGG
AACGAAGAAGGCAAAGAAGCCCTAAGGAAGATCAGAGGAGTTGAAGATATAAATGAGGAG
ATTCCTTCTTCTCCAATCTTCCGTTCACATGCTCATCTGTCCGTTGATCATTGTGATGGG
ACTGTTTGCGATGTTCTTCGTACCAGAAACTAAAGGAGTCGCTATTGATGACATGAGGGA
AAGAGTGTGGAAGCCACATTGGTTCTGG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2CO86JQ 674 0 0
TTGCTTGGCTTTGGTGTCGGCTTTGGCAATCAGGCAGTGCCGCTTTTCCTGTCGGAGATT
GCTCCGGCTCAGCTAAGGGGAGGTCTCAACATTGTGTTCCAACTCATGGTCACTATTGGA
ATCTTTATTGCCAACCTTGTCAATTACTTCACTGCCACGGTTCACCCTAACGGATGGCGT
ATTGCTCTCGGTGGAGCTGCAGTACAAGCCATTATCCTCCTCTTCGGTTCATTCATCATC
TGCGAGACTCCCACGAGCCTCATCGAGCGCAAAAGGAACGAAGAAGGCAAAGAAGCCCTA
AGGAAGATCAGAGGAGTTGAAGATATAAATGAGGAGATTCCTTCTTCTCCAATCTTCCGT
TCACATGCTCATCTGTCCGTTGATCATTGTGATGGGACTGTTTGCGATGTTCTTCGTACC
AGAAACTAAAGGAGTCGCTATTGATGACATGAGGGAAAGAGTGTGGAAGCCACATTGGTT
CTGGAAGAGGTATATGCTTGCTGAGGATGATGACGTGGAGAAGAGAACTGAATGAAACCA
CACCTGTCTTTGTGTGTTTCTTTTTCTTGTTGATGTTTGAATTCTTTTGTTAATTATTTT
GTTTCGTGGGAACATAGAGTGTGTAATAAGACAAACTTGTTGATTCAGGTTAGGTATTTT
ATCAATGAAACTCC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL4802Contig1 677 2 8 U
GGAAACTTTCCTCATTCATTCGCACGCAATTCATCTCCTCCTATCGGACTTCGCCACACA
CACCACATCGGGCAATCAATCTCAAAGCTTCTCTCTTTCTTTTTCTTTTTTTAATTCCTT
CTTCTACCTTCTCCAAATTCCCGAGAGATTCAATGAAGCAGTAAAGAGAAGCAAAAATTG
GAAATTTATATATATTTTCTTCGGAGCTTAAGACCTGAGTCTGTCTGATCTGTCGGAGAG
AAAAGAGAGGACGTGTCTCGCATCTTTGTCTGACTCTCTCTATAATTTTAGCTCATAATA
TAAAGAATGGGAACGAGCGAAGAAAAGACGCCTTCCAAACAAGCATCCTCCGCACAGGAC
ATTCCTCCCACGCCGTATCCAGACTGGTCAAACTCAATGCAGGCTTATTATGGAGGAGGA
GGTACTCCGAATCCTTTTTTCCCATCTCCTGTTGGATCTCCTAGTCCTCACCCCTACATG
TGGGGTGCTCAACACCATATGATGCCGCCTTATGGGACTCCGGTTCCGTACCCAGCCATG
TACCCCCCAGGGGCGGCATATGCCCATCCTGGCATGCCCTTGCCACCTACTTCTGCTCCA
ACCAACAAGGAGACCGTGAAAGAACAAGCTCCCGGAAAGAAGTCAAAAGGGAACTTGAAA
AGAAAGAGTGAAAGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA53TF U 1
AF RR2AA06TF U 113
BS 1 368 RR2GA53TF
BS 369 369 RR2AA06TF
BS 370 556 RR2GA53TF
BS 557 557 RR2AA06TF
BS 558 609 RR2GA53TF
BS 610 610 RR2AA06TF
BS 611 650 RR2GA53TF
BS 651 677 RR2AA06TF

RD RR2GA53TF 656 0 0
GGAAACTTTCCTCATTCATTCGCACGCAATTCATCTCCTCCTATCGGACTTCGCCACACA
CACCACATCGGGCAATCAATCTCAAAGCTTCTCTCTTTCTTTTTCTTTTTTTAATTCCTT
CTTCTACCTTCTCCAAATTCCCGAGAGATTCAATGAAGCAGTAAAGAGAAGCAAAAATTG
GAAATTTATATATATTTTCTTCGGAGCTTAAGACCTGAGTCTGTCTGATCTGTCGGAGAG
AAAAGAGAGGACGTGTCTCGCATCTTTGTCTGACTCTCTCTATAATTTTAGCTCATAATA
TAAAGAATGGGAACGAGCGAAGAAAAGACGCCTTCCAAACAAGCATCCTCCGCACAGGAC
ATTCCTCCGACGCCGTATCCAGACTGGTCAAACTCAATGCAGGCTTATTATGGAGGAGGA
GGTACTCCGAATCCTTTTTTCCCATCTCCTGTTGGATCTCCTAGTCCTCACCCCTACATG
TGGGGTGCTCAACACCATATGATGCCGCCTTATGGGACTCCGGTTCCGTACCCAGCCATG
TACCCCCCAGGGGCGGTATATGCCCATCCTGGCATGCCCTTGCCACCTACTTCTGCTCCA
ACCAACAAG*AGACCGTGAAAGAACAAGCTCCCGGAAAGAAGTCAAAAGG
AACTTG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2AA06TF 565 0 0
AATTCCTTCTTCTACCTTCTCCAATTTCCCGAGAGATTCAATGAAGCAGTAAAGAGAAGC
AAAAATTGGAAATTTATATATATTTTCTTCGGAGCTTATGACCTGAGTCTGTCTGATCTG
TCGGAGAGAAAAGAGAGGACGTGTCTCGCATCTTTGTCTGACTCTCTCTATAATTTTAGC
TCATAATATAAAGAATGGGAACGAGCGAAGAAAAGACGCCTTCCAAACAAGCATCCTCCG
CACAGGACATTCCTCCCACGCCGTATCCAGACTGGTCAAACTCAATGCAGGCTTATTATG
GAGGAGGAGGTACTCCGAATCCTTTTTTCCCATCTCCTGTTGGATCTCCTAGTCCTCACC
CCTACATGTGGGGTGCTCAACACCATATGATGCCGCCTTATGGGACTCCGGTTCCGTACC
CAGCCATGTACCCCCCAGGGGCGGCATATGCCCATCCTGGCATGCCCTTGCCACCTACTT
CTGCTCCAACCAACAAGGAGACCGTGAAAGA*CAAGCTCCCGGAAAGAAGTCAAAAGGGA
ACTTGAAAAGAAAGAGTGAAAGGAG

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL4803Contig1 1024 2 2 U
GCAACCGCCGCGGTTTCATCCCCGTTGCTTCCTCTGGCGGTTTGCTCTGTTTTCGCTGCT
CTGTTTCTGGCGACTTCTTTCTCTGTAATCCCATCACGGGATCTTCTCTTGACCTTCCTT
CTATAGATAACAGCAAACCTCTCCAAGCTGTAGCCATGACTGCAACTCTCACTCCCTCCG
GCTATAAGCTCGTTACAATCTCTGGAGAAGCCCCAAACCTCTGTTTCCGGTTCTACGAAT
CAGATTCCGGTTCACGGAGCAAAGAGTTGAACTTAGTGAAGAAGAACGATGGAGATGAGT
ACAATGATGATTCATCAGATGATGATAATGGAACAGTCTACTTTCTTAGCAAGATAGGAA
CCGTGGTTGTAGCGAGTAACAATCTCCAGAGAAGTCCCTCGAAGCAATACTCTTCTGTTA
TAACCGTTAAAGACAATGCAGAGACCGTCTACTTTCTCAGCTCTTACGGAACCATCATAG
CTTGTGACCTCACCAAAAGATGCTCCACCGAGCTACCTAAGCTTCTTCCTCCGTTTCTTG
AGTATTCCATCGACTTGGTGGAATGTAACGGAACCATGTTTGTGATTCTTCTCTCTGAGT
TCTACGAAAGCACCAGCTTGAGGATTGGAAACTAGAGAACCAGAGTTGGGTTCATGTCGG
GATGTTGCCTCCTGCAATGTCCCATGAGTTGTATGGGAGAGAAGGTGACATAAACTGTGT
TGGAGGAGCTGGAAACAAGATACTTGTGTGTTTCAACACCAATCCTCCTGAGATGTATTA
TAGATACTTTGTGTATGACTTAGTTGCAGAACAGTGGAGTGAGTTGCCAAAATGCTACAA
GGATGGAGAAGCTGTGGAGTTCGTTTCTGCTCTTTCGTTCCAGCCTCGGATCGAAGCAAC
AGTTTGAAGTTTTAGCTCTTTAAGGATCTGATTTCATTTTTTTTTCAGATAAATGCACTG
TAACTTGATTTATATAATGTATTGACAATCATTGAGTTAGAACATGAATGATCTGTGGTA
AGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2DA76TF U 1
AF RR2DA76JQ C 597
BS 1 655 RR2DA76TF
BS 656 1024 RR2DA76JQ

RD RR2DA76TF 655 0 0
GCAACCGCCGCGGTTTCATCCCCGTTGCTTCCTCTGGCGGTTTGCTCTGTTTTCGCTGCT
CTGTTTCTGGCGACTTCTTTCTCTGTAATCCCATCACGGGATCTTCTCTTGACCTTCCTT
CTATAGATAACAGCAAACCTCTCCAAGCTGTAGCCATGACTGCAACTCTCACTCCCTCCG
GCTATAAGCTCGTTACAATCTCTGGAGAAGCCCCAAACCTCTGTTTCCGGTTCTACGAAT
CAGATTCCGGTTCACGGAGCAAAGAGTTGAACTTAGTGAAGAAGAACGATGGAGATGAGT
ACAATGATGATTCATCAGATGATGATAATGGAACAGTCTACTTTCTTAGCAAGATAGGAA
CCGTGGTTGTAGCGAGTAACAATCTCCAGAGAAGTCCCTCGAAGCAATACTCTTCTGTTA
TAACCGTTAAAGACAATGCAGAGACCGTCTACTTTCTCAGCTCTTACGGAACCATCATAG
CTTGTGACCTCACCAAAAGATGCTCCACCGAGCTACCTAAGCTTCTTCCTCCGTTTCTTG
AGTATTCCATCGACTTGGTGGAATGTAACGGAACCATGTTTGTGATTCTTCTCTCTGAGT
TCTACGAAAGCACCAGCTTGAGGATTGGAAACTAGAGAACCAGAGTTGGGTTCAT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2DA76JQ 428 0 0
GAGTTCTACGAAAGCACCAGCTTGAGGATTGGAAACTAGAGAACCAGAGTTGGGTTCATG
TCGGGATGTTGCCTCCTGCAATGTCCCATGAGTTGTATGGGAGAGAAGGTGACATAAACT
GTGTTGGAGGAGCTGGAAACAAGATACTTGTGTGTTTCAACACCAATCCTCCTGAGATGT
ATTATAGATACTTTGTGTATGACTTAGTTGCAGAACAGTGGAGTGAGTTGCCAAAATGCT
ACAAGGATGGAGAAGCTGTGGAGTTCGTTTCTGCTCTTTCGTTCCAGCCTCGGATCGAAG
CAACAGTTTGAAGTTTTAGCTCTTTAAGGATCTGATTTCATTTTTTTTTCAGATAAATGC
ACTGTAACTTGATTTATATAATGTATTGACAATCATTGAGTTAGAACATGAATGATCTGT
GGTAAGAG

QA 1 428 1 428
DS 



AS 1 2

CO CL4804Contig1 732 2 3 U
TTTTTTTTTAGTAGGAACAGCGATTATGATATTTAGGGCGACGATATTACACACATAAGT
AGCTAAAACGATGAATTAAGTAGCAGGAAACAACTCATCCCAAAGACGCTCAAGAACATA
GACAGCTTATTACAATACTGTAGGAGCTTTTATTTGAGTACTAGCGCCATTTCGTTGCTT
AAGCAGTAACTCCCAACAGTTTCTTCAGGTCCTTCTCAATGCTGAGAGGGGAAGTAGTTG
GGGCGTAACGGTCCACAACATTCCCATCTTTGTCAACCAAGAACTTGGCGAAGTTCCACT
TGATTCCGTCTCCAAAAAGCCCACCTTGAAGCGGGTACAGGCAAACTGAACAATCTCTTC
ATTAGAACCAGGTTCTTGATTCCCAAACTGGTTACAGGGGAACGCAAGGATCTCAAACCC
ATGATCTTTGTACTTCTGGTACAGCTGTGCAAGCTCAGTATAGTTCGAATTGGTCAAACC
ACACTGAGAAGCAACGTTGACAATCAAGAGAACCTTCCCCTTGTAAGTGCTTAGATCAAC
ATCTTTTCCCTTCGCATCATTGACGGTGAAATCATAGATGGACTTGGGCTCGGAGGAAGT
AGCCATGGAATGTTCCGACCTAGAGAGTTTAGCTCCCGTTGTTGGTAATGGAACCTGACG
ATGAGAAGTGAAAAGTGGTTTCGCAGAATTGGAGGACTTAGACGAGAACAGAGAGAGCGA
TGATGATGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC29JQ U 10
AF RR2EC29TF C 1
BS 1 9 RR2EC29TF
BS 10 498 RR2EC29JQ
BS 499 732 RR2EC29TF

RD RR2EC29JQ 489 0 0
AGTAGGAACAGCGATTATGATATTTAGGGCGACGATATTACACACATAAGTAGCTAAAAC
GATGAATTAAGTAGCAGGAAACAACTCATCCCAAAGACGCTCAAGAACATAGACAGCTTA
TTACAATACTGTAGGAGCTTTTATTTGAGTACTAGCGCCATTTCGTTGCTTAAGCAGTAA
CTCCCAACAGTTTCTTCAGGTCCTTCTCAATGCTGAGAGGGGAAGTAGTTGGGGCGTAAC
GGTCCACAACATTCCCATCTTTGTCAACCAAGAACTTGGCGAAGTTCCACTTGATTCCGT
CTCCAAAAAGCCCACCTTGAAGCGGGTACAGGCAAACTGAACAATCTCTTCATTAGAACC
AGGTTCTTGATTCCCAAACTGGTTACAGGGGAACGCAAGGATCTCAAACCCATGATCTTT
GTACTTCTGGTACAGCTGTGCAAGCTCAGTATAGTTCGAATTGGTCAAACCACACTGAGA
AGCAACGTT

QA 1 489 1 489
DS 

RD RR2EC29TF 732 0 0
TTTTTTTTTAGTAGGAACAGCGATTATGATATT*AGGGCGACGATAT*ACACACATAAGT
AGCTAAAACGATGAATTAAGTAGCAGGAAACAACTCATCCCAAAGACGCTCAAGAACATA
GACAGCTTATTACAATACTGTAGGAGCTTTTATTTGAGTACTAGCGCCATTTCGTTGCTT
AAGCAGTAACTCCCAACAGTTTCTTCAGGTCCTTCTCAATGCTGAGAGGGGAAGTAGTTG
GGGCGTAACGGTCCACAACATTCCCATCTTTGTCAACCAAGAACTTGGCGAAGTTCCACT
TGATTCCGTCTCCAAAAAGCCCACCTTGAAGCGGGTACAGGCAAACTGAACAATCTCTTC
ATTAGAACCAGGTTCTTGATTCCCAAACTGGTTACAGGGGAACGCAAGGATCTCAAACCC
ATGATCTTTGTACTTCTGGTACAGCTGTGCAAGCTCAGTATAGTTCGAATTGGTCAAACC
ACACTGAGAAGCAACGTTGACAATCAAGAGAACCTTCCCCTTGTAAGTGCTTAGATCAAC
ATCTTTTCCCTTCGCATCATTGACGGTGAAATCATAGATGGACTTGGGCTCGGAGGAAGT
AGCCATGGAATGTTCCGACCTAGAGAGTTTAGCTCCCGTTGTTGGTAATGGAACCTGACG
ATGAGAAGTGAAAAGTGGTTTCGCAGAATTGGAGGACTTAGACGAGAACAGAGAGAGCGA
TGATGATGATCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL4805Contig1 927 2 2 U
GTTGTGGTTGGAGGTGGTCCCACTGGTGTAGAGTTCAGTGGTGAGCTGAGTGATTTCATC
ATGAAAGATGTTCGTCAGAGATACGCTCATGTCAAAGATGACATCCGTGTTACTTTAATC
GAGGCAAGGGATATACTTTCTTCTTTTGACGATGGGCTCAGACAGTATGCAATCAACCAG
CTAAACAAGTCTGGAGTGAAGCTAGTACGTGGGATTGTGAAAGAAGCGAAGCCTCAAAGG
CTAATACTTGACGACGGAACCGAAGTTCCTTACGGTCTCTTAGTCTGGTCAACTGGTGTT
GGTCCATCTTCATTTGTAAGGTCTCTCGATCTTCCAAAAGATCCAGGTGGAAGGATTGGA
ATTGATGAGTGGATGCGTGTGCCTTCTGTACAAGACGTGTTTGCAATTGGTGACTGTAGT
GGATATCTTGAGAGCACAGGGAAGTCAACACTTCCCGCTCTTGCACAGGTGGCTGAGAGA
GAAGGCAAGTACTTGGCGAATCTACTGAACGTGATGGGGAAAGCTGGAGGAGGAAGAGCC
TGGAGCGCAAAGGACACTGAACTCGGAGAACCGTTTGTGTACAAGCATTTGGGAAGTATG
GCTACTATTGGGAGATACAAAGCTCTCGTTGATCTTCGTGAGAGCAAGCAAGGAAAAGGG
ATATCAATGGGTGGTTTTCTGAGCTTTTTCATATGGAGGTCAGCGTATCTGACTCGAGTC
GTCAGCTGGAGAAACCGCTTCTACGTCTTTATTAACTGGATCACCACTTTCGTTTTCGGC
CGTGACACTAGCCGTCTCTGATCCAACTCTTCCACATTGCTGATACCTACTTTTCTCTCT
CACTCTCTTGTTTATTTTACAAGTCCCTCATACTGTTTACCACCTCAAATGTTGTTGGTT
ATTTGAAACAAGGAGATCGTTTAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM86TF U 1
AF RR2GM86JQ C 152
BS 1 632 RR2GM86TF
BS 633 927 RR2GM86JQ

RD RR2GM86TF 632 0 0
GTTGTGGTTGGAGGTGGTCCCACTGGTGTAGAGTTCAGTGGTGAGCTGAGTGATTTCATC
ATGAAAGATGTTCGTCAGAGATACGCTCATGTCAAAGATGACATCCGTGTTACTTTAATC
GAGGCAAGGGATATACTTTCTTCTTTTGACGATGGGCTCAGACAGTATGCAATCAACCAG
CTAAACAAGTCTGGAGTGAAGCTAGTACGTGGGATTGTGAAAGAAGCGAAGCCTCAAAGG
CTAATACTTGACGACGGAACCGAAGTTCCTTACGGTCTCTTAGTCTGGTCAACTGGTGTT
GGTCCATCTTCATTTGTAAGGTCTCTCGATCTTCCAAAAGATCCAGGTGGAAGGATTGGA
ATTGATGAGTGGATGCGTGTGCCTTCTGTACAAGACGTGTTTGCAATTGGTGACTGTAGT
GGATATCTTGAGAGCACAGGGAAGTCAACACTTCCCGCTCTTGCACAGGTGGCTGAGAGA
GAAGGCAAGTACTTGGCGAATCTACTGAACGTGATGGGGAAAGCTGGAGGAGGAAGAGCC
TGGAGCGCAAAGGACACTGAACTCGGAGAACCGTTTGTGTACAAGCATTTGGGAAGTATG
GCTACTATTGGGAGATACAAAGCTCTCGTTGA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2GM86JQ 776 0 0
ATGGGCTCAGACAGTATGCAATCAACCAGCTAAACAAGTCTGGAGTGAAGCTAGTACGTG
GGATTGTGAAAGAAGCGAAGCCTCAAAGGCTAATACTTGACGACGGAACCGAAGTTCCTT
ACGGTCTCTTAGTCTGGTCAACTGGTGTTGGTCCATCTTCATTTGTAAGGTCTCTCGATC
TTCCAAAAGATCCAGGTGGAAGGATTGGAATTGATGAGTGGATGCGTGTGCCTTCTGTAC
AAGACGTGTTTGCAATTGGTGACTGTAGTGGATATCTTGAGAGCACAGGGAAGTCAACAC
TTCCCGCTCTTGCACAGGTGGCTGAGAGAGAAGGCAAGTACTTGGCGAATCTACTGAACG
TGATGGGGAAAGCTGGAGGAGGAAGAGCCTGGAGCGCAAAGGACACTGAACTCGGAGAAC
CGTTTGTGTACAAGCATTTGGGAAGTATGGCTACTATTGGGAGATACAAAGCTCTCGTTG
ATCTTCGTGAGAGCAAGCAAGGAAAAGGGATATCAATGGGTGGTTTTCTGAGCTTTTTCA
TATGGAGGTCAGCGTATCTGACTCGAGTCGTCAGCTGGAGAAACCGCTTCTACGTCTTTA
TTAACTGGATCACCACTTTCGTTTTCGGCCGTGACACTAGCCGTCTCTGATCCAACTCTT
CCACATTGCTGATACCTACTTTTCTCTCTCACTCTCTTGTTTATTTTACAAGTCCCTCAT
ACTGTTTACCACCTCAAATGTTGTTGGTTATTTGAAACAAGGAGATCGTTTAGACC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4807Contig1 664 2 1 U
GGGCCCTCTCAAAGTTGGGTTATAGTGGTAAGGTGTTTATCCATGCTTATGGTGATTCCG
ATAAAATCTTGGATGACTTAATCCCGTCAGTTCCAATAGAAGATGAAATTTCAACTCTAG
ACCTTGGGGAAGCATCATCCATCAGTGCTACGAATCCAACTGTGGTTGTCAAAGAAACAC
CCGATAATTTTGATTACCGTGGTACCACATCTGTTTATGCTCAAGATGATCAGTCAACAC
CTCTATTAATGCTCAACCACTCATCAGGGGATAAAGATGCGATGCTTGGGAGGTTTTTAG
TAGACTTTATGATGTGGGCAGTTGATAATCCTGCACCAGCAAATATTATACTAGTCCTCG
GAGACAACATGTCAAGACGTCAGGAGTTGTTCAAAATTGCTCTTCGCCAAGTCAATATGC
TAAGTTACAACATCCACTTTGCATATCCTCAAAACGCAACATGCCCCTCTTTTCCTTCTG
TTAATATCAAATGGCTTTGGAAAAGTCTATCACTTGGAGGTAACCCTGTGGAGGAGGAGA
AGAATGAAGAGGAGAATGAGGAGGAGAATGAAGAGGAGGATTAGTTTATTTAGTCTTGTT
TGAGTGTAATGAATCTCTAGTCATGTGATGAAATGAAACAGAAGAACTAAACCCTTTCAT
TACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2A473JQ C 1
AF RR2A473TF U 1
BS 1 664 RR2A473TF

RD RR2A473JQ 664 0 0
GGGCCCTCTCAAAGTTGGGTTATAGTGGTAAGGTGTTTATCCATGCTTATGGTGATTCCG
ATAAAATCTTGGATGACTTAATCCCGTCAGTTCCAATAGAAGATGAAATTTCAACTCTAG
ACCTTGGGGAAGCATCATCCATCAGTGCTACGAATCCAACTGTGGTTGTCAAAGAAACAC
CCGATAATTTTGATTACCGTGGTACCACATCTGTTTATGCTCAAGATGATCAGTCAACAC
CTCTATTAATGCTCAACCACTCATCAGGGGATAAAGATGCGATGCTTGGGAGGTTTTTAG
TAGACTTTATGATGTGGGCAGTTGATAATCCTGCACCAGCAAATATTATACTAGTCCTCG
GAGACAACATGTCAAGACGTCAGGAGTTGTTCAAAATTGCTCTTCGCCAAGTCAATATGC
TAAGTTACAACATCCACTTTGCATATCCTCAAAACGCAACATGCCCCTCTTTTCCTTCTG
TTAATATCAAATGGCTTTGGAAAAGTCTATCACTTGGAGGTAACCCTGTGGAGGAGGAGA
AGAATGAAGAGGAGAATGAGGAGGAGAATGAAGAGGAGGATTAGTTTATTTAGTCTTGTT
TGAGTGTAATGAATCTCTAGTCATGTGATGAAATGAAACAGAAGAACTAAACCCTTTCAT
TACC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2A473TF 664 0 0
GGGCCCTCTCAAAGTTGGGTTATAGTGGTAAGGTGTTTATCCATGCTTATGGTGATTCCG
ATAAAATCTTGGATGACTTAATCCCGTCAGTTCCAATAGAAGATGAAATTTCAACTCTAG
ACCTTGGGGAAGCATCATCCATCAGTGCTACGAATCCAACTGTGGTTGTCAAAGAAACAC
CCGATAATTTTGATTACCGTGGTACCACATCTGTTTATGCTCAAGATGATCAGTCAACAC
CTCTATTAATGCTCAACCACTCATCAGGGGATAAAGATGCGATGCTTGGGAGGTTTTTAG
TAGACTTTATGATGTGGGCAGTTGATAATCCTGCACCAGCAAATATTATACTAGTCCTCG
GAGACAACATGTCAAGACGTCAGGAGTTGTTCAAAATTGCTCTTCGCCAAGTCAATATGC
TAAGTTACAACATCCACTTTGCATATCCTCAAAACGCAACATGCCCCTCTTTTCCTTCTG
TTAATATCAAATGGCTTTGGAAAAGTCTATCACTTGGAGGTAACCCTGTGGAGGAGGAGA
AGAATGAAGAGGAGAATGAGGAGGAGAATGAAGAGGAGGATTAGTTTATTTAGTCTTGTT
TGAGTGTAATGAATCTCTAGTCATGTGATGAAATGAAACAGAAGAACTAAACCCTTTCAT
TACC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL4808Contig1 827 2 11 U
GGGTTCGACTAGTAGTGTGATACACTCTGTTTCGTGATCATAGAGAAAGAGAGCAGAGAG
AGAAAGGGAAGCTCGTTCGTTTCGTCTTCTTCTTCGCTTCCACGCTCGATCGTCAGGGAA
TGATCATTGACTAGGGATTTAAAATCAATCTGGAGCAAATGTCGAGTTTGAATCTGAAGG
TAGACGTGAATCAGAACGGGGATGTCAAGAACGCTGCTGATACATTGGACGATATCGATG
ACATTGATTTCTCCAAGTTGCTTGAGAAACCGAGGCCGTTGAACATTGAAAGACTGAGAT
CACTTGACGAAAGGTCTCTCACGGAGCTATCTGGATCGCCGCAGCTTAGAAACGCGGATA
ATGCTTCTCGGGCCCATGACCATGCTGATAGTTATGTGTTTTCACCGAGTGTGGGTAAGA
GGTCTGGATTCAACACTCCTCGGTCAGTGCATGGATTTGAGTCTCATCCGATGGTGGGAG
AGGCATGGGATGCTTTGAGGCGCTCTATGGTGTACTTCCGTGGTCAGCCTGTTGGTACCA
TTGCTGCTGTGGATAACTCCGAAGAGAAACTCAACTATGATCAGGTGTTTGTGAGAGACT
TTGTGCCAAGTGCTTTGGCATTCTTGATGAACGGAGAACCAGATATAGTCAGAAACTTTC
TTTTGAAGACTCTTCGTCTTCAGTCGTGGGAGAAAAAGATTGATAGGTTCCAGCTTGGTG
AAGAGTTATGCCTGCTAGCTTCAAAGTTTTCCATGATCCTGTTAGAACCATGAACGTTGA
TAGCTGATTTTGGTGAGAGCGCGATTGGAGAGTAGCGCAGTGATCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP28TF U 27
AF RR2A333TF U 1
BS 1 45 RR2A333TF
BS 46 46 RR2FP28TF
BS 47 175 RR2A333TF
BS 176 176 RR2FP28TF
BS 177 189 RR2A333TF
BS 190 190 RR2FP28TF
BS 191 417 RR2A333TF
BS 418 418 RR2FP28TF
BS 419 480 RR2A333TF
BS 481 481 RR2FP28TF
BS 482 827 RR2A333TF

RD RR2FP28TF 684 0 0
GG
GTTTCGTGATCATAGAGAAAGAGAGCAGAGAGAGAAAGGGAAGCTCGTTCGTTTCGTCTT
CTTCTTCGCTTCCACGCTCGATCGTCAGGGAATGATCATTGACTAGGGATTTAAAATCAA
TCTGGAGCAAATGTCGAGTTTGAATCTGAAGGTAGACGTGAATCAGAACGGGGATGTCAA
GAACGCTGCTGATACATTGGACGATATCGATGACATTGATTTCTCCAAGTTGCTTGAGAA
ACCGAGGCCGTTGAACATTGAAAGACTGAGATCACTTGACGAAAGGTCTCTCACGGAGCT
ATCTGGATCGCCGCAGCTTAGAAACGCGGATAATGCTTCTCGGGCCCATGACCATGCTGA
TAGTTATGTGTTTTCACCGAGTGTGGGTAAGAGGTCTGGATTCAACACTCCTCGGTCAGT
GCATGGATTTGAGTCTCATCCGATGGTGGGAGAGGCATGGGATGCTTTGAGGCGCTCTAT
GGTGTACTTCCGTGGTCAGCCTGTTGGTACCATTGCTGCTGTGGATAACTCCGAAGAGAA
ACTCAACTATGATCAGGTGTTTGTGAGAGACTTTGTGCCAAGTGCTTTGGCATTCTTGAT
GAACGGAGAACCAGATATAGTCAGAAACTTTCTTTTGAAGACTCTTCGTCTTCAGTCGTG
GGAGAAAA*GATTGATAGGT
CC

QA 3 682 3 682
DS 

RD RR2A333TF 827 0 0
GGGTTCGACTAGTAGTGTGATACACTCTGTTTCGTGATCATAGAGGAAGAGAGCAGAGAG
AGAAAGGGAAGCTCGTTCGTTTCGTCTTCTTCTTCGCTTCCACGCTCGATCGTCAGGGAA
TGATCATTGACTAGGGATTTAAAATCAATCTGGAGCAAATGTCGAGTTTGAATCTTAAGG
TAGACGTGAGTCAGAACGGGGATGTCAAGAACGCTGCTGATACATTGGACGATATCGATG
ACATTGATTTCTCCAAGTTGCTTGAGAAACCGAGGCCGTTGAACATTGAAAGACTGAGAT
CACTTGACGAAAGGTCTCTCACGGAGCTATCTGGATCGCCGCAGCTTAGAAACGCGGATA
ATGCTTCTCGGGCCCATGACCATGCTGATAGTTATGTGTTTTCACCGAGTGTGGGTAGGA
GGTCTGGATTCAACACTCCTCGGTCAGTGCATGGATTTGAGTCTCATCCGATGGTGGGAG
GGGCATGGGATGCTTTGAGGCGCTCTATGGTGTACTTCCGTGGTCAGCCTGTTGGTACCA
TTGCTGCTGTGGATAACTCCGAAGAGAAACTCAACTATGATCAGGTGTTTGTGAGAGACT
TTGTGCCAAGTGCTTTGGCATTCTTGATGAACGGAGAACCAGATATAGTCAGAAACTTTC
TTTTGAAGACTCTTCGTCTTCAGTCGTGGGAGAAAAAGATTGATAGGTTCCAGCTTGGTG
AAGAGTTATGCCTGCTAGCTTCAAAGTTTTCCATGATCCTGTTAGAACCATGAACGTTGA
TAGCTGATTTTGGTGAGAGCGCGATTGGAGAGTAGCGCAGTGATCTG

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 2

CO CL4809Contig1 662 2 2 U
TTTTTTTGCAATTCAACATTTCAGCGCATTTTCTTCTTCATTCATGTACTGTACATGAAA
TTTGACTTTATATAAAAAGCCTACTCGAGTAAATAACAAAAAGAACTGCAACAAAACAGA
TTTAACCCCACGAATGTTGAAACCAACCTCATCATAAGTCTTAACAGAGACGATGGGGGT
TTAATCATAAAACTAGTAACTAATCAAGGCAGTGAAGTCTTGTCAGAAACAGAAGAAGAC
TTGTCCAGTGATTGAGCAGATTTAGAAGCTGTTACTGCAGTAGCTTGTTCGTCTTGGACG
AGTTTCCTAAGTTTGGTCTGAAGGCCACGAACACGATCCTCGGTTCTCCTCAGCTTCCTC
CATCTATAAGCAGTCCAAAGGAAAAGACCGCCGTAGACAACAGTGTAAGAACCCCAAACA
TATGGATAAGCTTCGGCGTGATCTCTCAGTTTCTTGTACTTTTCTTCAATTGCTCCTACA
AAACCAGGAGCCCTTGGTTTGGTTGGACTTCCTGGTTTTCTATCCCGCTCTGCTCCGTAG
TCGCCATCTCAAGTCACAAAAACTCAGCTTCTGACAAGAATCTGGAGTTAGAAGAAGCGT
TGACAAAGTCGCCGATGATGATTTCCCTAAGCTCAGAGACCCATCGATGCTTAAACCCTC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2D240TF C 1
AF RR2D240JQ U 8
BS 1 7 RR2D240TF
BS 8 662 RR2D240JQ

RD RR2D240TF 662 0 0
TTTTTTTGCAATTCAACATTTCAGCGCATTTTCTTCTTCATTCATGTACTGTACATGAAA
TTTGACTTTATATAAAAAGCCTACTCGAGTAAATAACAAAAAGAACTGCAACAAAACAGA
TTTAACCCCACGAATGTTGAAACCAACCTCATCATAAGTCTTAACAGAGACGATGGGGGT
TTAATCATAAAACTAGTAACTAATCAAGGCAGTGAAGTCTTGTCAGAAACAGAAGAAGAC
TTGTCCAGTGATTGAGCAGATTTAGAAGCTGTTACTGCAGTAGCTTGTTCGTCTTGGACG
AGTTTCCTAAGTTTGGTCTGAAGGCCACGAACACGATCCTCGGTTCTCCTCAGCTTCCTC
CATCTATAAGCAGTCCAAAGGAAAAGACCGCCGTAGACAACAGTGTAAGAACCCCAAACA
TATGGATAAGCTTCGGCGTGATCTCTCAGTTTCTTGTACTTTTCTTCAATTGCTCCTACA
AAACCAGGAGCCCTTGGTTTGGTTGGACTTCCTGGTTTTCTATCCCGCTCTGCTCCGTAG
TCGCCATCTCAAGTCACAAAAACTCAGCTTCTGACAAGAATCTGGAGTTAGAAGAAGCGT
TGACAAAGTCGCCGATGATGATTTCCCTAAGCTCAGAGACCCATCGATGCTTAAACCCTC
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2D240JQ 655 0 0
GCAATTCAACATTTCAGCGCATTTTCTTCTTCATTCATGTACTGTACATGAAATTTGACT
TTATATAAAAAGCCTACTCGAGTAAATAACAAAAAGAACTGCAACAAAACAGATTTAACC
CCACGAATGTTGAAACCAACCTCATCATAAGTCTTAACAGAGACGATGGGGGTTTAATCA
TAAAACTAGTAACTAATCAAGGCAGTGAAGTCTTGTCAGAAACAGAAGAAGACTTGTCCA
GTGATTGAGCAGATTTAGAAGCTGTTACTGCAGTAGCTTGTTCGTCTTGGACGAGTTTCC
TAAGTTTGGTCTGAAGGCCACGAACACGATCCTCGGTTCTCCTCAGCTTCCTCCATCTAT
AAGCAGTCCAAAGGAAAAGACCGCCGTAGACAACAGTGTAAGAACCCCAAACATATGGAT
AAGCTTCGGCGTGATCTCTCAGTTTCTTGTACTTTTCTTCAATTGCTCCTACAAAACCAG
GAGCCCTTGGTTTGGTTGGACTTCCTGGTTTTCTATCCCGCTCTGCTCCGTAGTCGCCAT
CTCAAGTCACAAAAACTCAGCTTCTGACAAGAATCTGGAGTTAGAAGAAGCGTTGACAAA
GTCGCCGATGATGATTTCCCTAAGCTCAGAGACCCATCGATGCTTAAACCCTCCC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL4810Contig1 976 2 2 U
GCACTCGTGGCTAGGCGTGGAGCGTTGGTTTATATACGACAACAACAGCGACGACGATAT
AAAAGAGGAGATTGAATTGCTTAACTCGGAGAATTACAATGTGAGCCGACACGTGTGGCC
GTGGATCAAGACTCAAGAAGCTGGTTTCTCGCATTGTGCGGTTAGAGCGAAAGAGGAGTG
CAACTGGGTCGGATTCTTCGACGTGGACGAGTTCTACTACTTCCCCACGCATCGCCCTCA
AGGCTTACCTAGCAAAAACGCTTTAAGCTCGCTAGTCTCTAACTACACTTCGTGGGATTT
GGTGGGAGAGATCAGAACAGAGTGTCATAGTTACGGTCCATCCGGTCTAACTTCTGTTCC
ATCGCAAGGCGTGACGGTGGGTTACACTTGCAGACAAGCGAACCCGGAGAGGCATAAGTC
GATAATCAGACCGGAGCTGCTGACGAGCTCGTTGCTCAACGAAGTTCATCATTTTCAGAT
GAGGGAAGGAGTAGGGCATATGAGTTTGGTGGAGAGTGTTGCGGTTGTGAACCATTACAA
GTACCAAGTTTGGGATACTTTTAAAGCCAAGTTTCAGAGAAGAGTGGCTACTTATGTTGT
GGACTGGCGAGAGAATCAGAACCAAGGGTCTAAAGATCGAGCTCCGGGGCTTGGTACTGA
GGCAATTGAACCGGTTGATTGGAGTAGACGGTTCTGTGAAGTGTGGGATACTGGTTTGAA
GGATTTGGTTTTGTCTAATTTTGCTGATCAAGTGACTGGTTATTTGCCGTGGCAGAGGCA
ACAACTGCAGCAACTACAAGAATGACTTTTTTTTTTGGTTACTTGGTTTGTGATGAGATT
ATGTACATTTGACGAGTATACATTAATATTTTGTTCTTTTGTTTTTTGGTGGGGATAATT
GAAATGGTTTCTATTTTTGTTTTTTTTTGGTTTACCACATTTGTAAATTTCATTTTTTTT
TGGTTCTTCTTACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH67TF U 1
AF RR2AH67JQ C 185
BS 1 665 RR2AH67TF
BS 666 976 RR2AH67JQ

RD RR2AH67TF 665 0 0
GCACTCGTGGCTAGGCGTGGAGCGTTGGTTTATATACGACAACAACAGCGACGACGATAT
AAAAGAGGAGATTGAATTGCTTAACTCGGAGAATTACAATGTGAGCCGACACGTGTGGCC
GTGGATCAAGACTCAAGAAGCTGGTTTCTCGCATTGTGCGGTTAGAGCGAAAGAGGAGTG
CAACTGGGTCGGATTCTTCGACGTGGACGAGTTCTACTACTTCCCCACGCATCGCCCTCA
AGGCTTACCTAGCAAAAACGCTTTAAGCTCGCTAGTCTCTAACTACACTTCGTGGGATTT
GGTGGGAGAGATCAGAACAGAGTGTCATAGTTACGGTCCATCCGGTCTAACTTCTGTTCC
ATCGCAAGGCGTGACGGTGGGTTACACTTGCAGACAAGCGAACCCGGAGAGGCATAAGTC
GATAATCAGACCGGAGCTGCTGACGAGCTCGTTGCTCAACGAAGTTCATCATTTTCAGAT
GAGGGAAGGAGTAGGGCATATGAGTTTGGTGGAGAGTGTTGCGGTTGTGAACCATTACAA
GTACCAAGTTTGGGATACTTTTAAAGCCAAGTTTCAGAGAAGAGTGGCTACTTATGTTGT
GGACTGGCGAGAGAATCAGAACCAAGGGTCTAAAGATCGAGCTCCGGGGCTTGGTACTGA
GGCAA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2AH67JQ 792 0 0
TGGGTCGGATTCTTCGACGTGGACGAGTTCTACTACTTCCCCACGCATCGCCCTCAAGGC
TTACCTAGCAAAAACGCTTTAAGCTCGCTAGTCTCTAACTACACTTCGTGGGATTTGGTG
GGAGAGATCAGAACAGAGTGTCATAGTTACGGTCCATCCGGTCTAACTTCTGTTCCATCG
CAAGGCGTGACGGTGGGTTACACTTGCAGACAAGCGAACCCGGAGAGGCATAAGTCGATA
ATCAGACCGGAGCTGCTGACGAGCTCGTTGCTCAACGAAGTTCATCATTTTCAGATGAGG
GAAGGAGTAGGGCATATGAGTTTGGTGGAGAGTGTTGCGGTTGTGAACCATTACAAGTAC
CAAGTTTGGGATACTTTTAAAGCCAAGTTTCAGAGAAGAGTGGCTACTTATGTTGTGGAC
TGGCGAGAGAATCAGAACCAAGGGTCTAAAGATCGAGCTCCGGGGCTTGGTACTGAGGCA
ATTGAACCGGTTGATTGGAGTAGACGGTTCTGTGAAGTGTGGGATACTGGTTTGAAGGAT
TTGGTTTTGTCTAATTTTGCTGATCAAGTGACTGGTTATTTGCCGTGGCAGAGGCAACAA
CTGCAGCAACTACAAGAATGACTTTTTTTTTTGGTTACTTGGTTTGTGATGAGATTATGT
ACATTTGACGAGTATACATTAATATTTTGTTCTTTTGTTTTTTGGTGGGGATAATTGAAA
TGGTTTCTATTTTTGTTTTTTTTTGGTTTACCACATTTGTAAATTTCATTTTTTTTTGGT
TCTTCTTACATG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL4811Contig1 751 2 2 U
ATCACGAAAATGGTCTTATTGATGGATAATTTCATAATACTCGATCATCTGAATTCACAG
AGACCAAACACACAACTTTACCAAAGTTTTCAAGGAGAAAAAACACAAACGCACGACATT
ATTATTCGAAACAACAACAAAACTAAAAAAGCTTTTAAATTCCCTCTTCCTTCTCGTCCT
CGCTAGTGCAGCTACTGTTGCTGCTCCACTCACACTTCAAGGGAGATCTCGGAAAACCGC
AATACATTCCCAGCTTCTCAAACCTCTGATACATAACCGATCCTCTCTCTTCCCCTAAAG
CTTCCACAGTCGACTCCTTGCATCCGTAATCCTCAAGGTCTACAGAAAGACCAAAGTCGT
AGCTGCTCTTCTGCGACACGCTAGAGTGTACAGCTACCGAAAATTGCTTTGGCTCGAAGC
AAGCCAGCACCTTCGAGACGAGGGGGCTCAAGTCCATGGGGGTGAAGTCGTACCCCACTG
CCTCAAAGCTAGCGTAGCTAAATCCGTCTTCAGGGGTCACGTGGATGGTGGAGATGGCGT
CACCTTCGACGCTGTTCATCGAGTAGCCGCATGGCTCGAACTCAAAGTCGCAGATTTGGG
ATCCAGGAAGTATCTTCCTGATGCCAGCGTTATCAGTCATGGAGGAGCCAACCGAGCTCG
ACTCGTTCTTGTAGAACACAGACGCCTTGTCTTTGTCCAGACCAGTCATACACATCTCGA
GAGTGTAGACATTCTTGTTCTCGCCGTTGGA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B230JQ U 1
AF RR2FB75JQ U 1
BS 1 531 RR2B230JQ
BS 532 751 RR2FB75JQ

RD RR2B230JQ 531 0 0
ATCACGAAAATGGTCTTATTGATGGATAATTTCATAATACTCGATCATCTGAATTCACAG
AGACCAAACACACAACTTTACCAAAGTTTTCAAGGAGAAAAAACACAAACGCACGACATT
ATTATTCGAAACAACAACAAAACTAAAAAAGCTTTTAAATTCCCTCTTCCTTCTCGTCCT
CGCTAGTGCAGCTACTGTTGCTGCTCCACTCACACTTCAAGGGAGATCTCGGAAAACCGC
AATACATTCCCAGCTTCTCAAACCTCTGATACATAACCGATCCTCTCTCTTCCCCTAAAG
CTTCCACAGTCGACTCCTTGCATCCGTAATCCTCAAGGTCTACAGAAAGACCAAAGTCGT
AGCTGCTCTTCTGCGACACGCTAGAGTGTACAGCTACCGAAAATTGCTTTGGCTCGAAGC
AAGCCAGCACCTTCGAGACGAGGGGGCTCAAGTCCATGGGGGTGAAGTCGTACCCCACTG
CCTCAAAGCTAGCGTAGCTAAATCCGTCTTCAGGGGTCACGTGGATGGTGG

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2FB75JQ 751 0 0
G
TCACGAAAATGGTCTTATTGATGGATAATTTCATAATACTCGATCATCTGAATTCACAGA
GACCAAACACACAACTTTACCAAAGTTTTCAAGGAGAAAAAACACAAACGCACGACATTA
TTATTCGAAACAACAACAAAACTAAAAAAGCTTTTAGATTCCCTCTTCCTTCTCGTCCTC
GCTAGTGCAGCTACTGTTGCTGCTCCACTCACACTTCAAGGTAGATCTCGGAGAACCGCA
A**CATTCCCAGCTTCTCAAACCTCTGATACATAACCGATCCTCTCTCTTCCCCTAGAGC
TTCCACAGTCGACTCCTTGCATCCGTAATCCTCAAGGTCTACAGAGAGACCAGAGTCGTA
GCTGCTCTTCTGCGATACGCTAGAGTGTACAGCTACCGAGAATTGCTTTGGCTCGAAGCA
AGCCAGCACCTTCGAGACGAGGTGGCTCAAGTCCATGGTGGTGAAGTCGTACCCCACTGC
CTCAAAGCTAGCGTAGCTAAATCCGTCTTCAGGGGTCACGTGGATGGTGGAGATGGCGTC
ACCTTCGACGCTGTTCATCGAGTAGCCGCATGGCTCGAACTCAAAGTCGCAGATTTGGGA
TCCAGGAAGTATCTTCCTGATGCCAGCGTTATCAGTCATGGAGGAGCCAACCGAGCTCGA
CTCGTTCTTGTAGAACACAGACGCCTTGTCTTTGTCCAGACCAGTCATACACATCTCGAG
AGTGTAGACATTCTTGTTCTCGCCGTTGGA

QA 2 751 2 751
DS 



AS 1 2

CO CL4812Contig1 482 2 2 U
GGCAGAAACGTACGAATTCGCATTAAAAAAAAGATACGTACAAACTAAATTTCGGTATTA
AATTGAAATACTTAAAATCGATTTACATTATCCAAACTGAGAATAAAAAAAAGTTAAGAA
AAAAACTGAAAAAAAATAACAAAAAGTTAAAGAGTTTACCATACAAAAATAAAAACTAAC
TTGTTAGAATCTGCAACCGCAACAAAGAAAGAAGAAAGCAAGCTTAGAAACCAAAATCAT
TCCTTCGATGACAGACATGATTCTAAACCTCAAACTTTCGAAAAAGGACATCCCAAGATT
CAATCTTTTCCACTTTAGCCCTCCAAGTCTCCAAAATTTCAACTTCGTCCTCTCTTTCCT
CGTCTTGAATATCGAAAAGCTCCCTTTTCCCACCATCTTTTAGTTTTGAGATCCTCTAGA
AATGAATTGTGAAGAGAGAAGAATTAGCTTATTAAGTTTGGTTTTATGGTTCCTTGTGAT
CC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2A302TF C 1
AF RR2A302JQ U 2
BS 1 1 RR2A302TF
BS 2 482 RR2A302JQ

RD RR2A302TF 482 0 0
GGCAGAAACGTACGAATTCGCATTAAAAAAAAGATACGTACAAACTAAATTTCGGTATTA
AATTGAAATACTTAAAATCGATTTACATTATCCAAACTGAGAATAAAAAAAAGTTAAGAA
AAAAACTGAAAAAAAATAACAAAAAGTTAAAGAGTTTACCATACAAAAATAAAAACTAAC
TTGTTAGAATCTGCAACCGCAACAAAGAAAGAAGAAAGCAAGCTTAGAAACCAAAATCAT
TCCTTCGATGACAGACATGATTCTAAACCTCAAACTTTCGAAAAAGGACATCCCAAGATT
CAATCTTTTCCACTTTAGCCCTCCAAGTCTCCAAAATTTCAACTTCGTCCTCTCTTTCCT
CGTCTTGAATATCGAAAAGCTCCCTTTTCCCACCATCTTTTAGTTTTGAGATCCTCTAGA
AATGAATTGTGAAGAGAGAAGAATTAGCTTATTAAGTTTGGTTTTATGGTTCCTTGTGAT
CC

QA 1 482 1 482
DS 

RD RR2A302JQ 481 0 0
GCAGAAACGTACGAATTCGCATTAAAAAAAAGATACGTACAAACTAAATTTCGGTATTAA
ATTGAAATACTTAAAATCGATTTACATTATCCAAACTGAGAATAAAAAAAAGTTAAGAAA
AAAACTGAAAAAAAATAACAAAAAGTTAAAGAGTTTACCATACAAAAATAAAAACTAACT
TGTTAGAATCTGCAACCGCAACAAAGAAAGAAGAAAGCAAGCTTAGAAACCAAAATCATT
CCTTCGATGACAGACATGATTCTAAACCTCAAACTTTCGAAAAAGGACATCCCAAGATTC
AATCTTTTCCACTTTAGCCCTCCAAGTCTCCAAAATTTCAACTTCGTCCTCTCTTTCCTC
GTCTTGAATATCGAAAAGCTCCCTTTTCCCACCATCTTTTAGTTTTGAGATCCTCTAGAA
ATGAATTGTGAAGAGAGAAGAATTAGCTTATTAAGTTTGGTTTTATGGTTCCTTGTGATC
C

QA 1 481 1 481
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4814Contig1 831 2 2 U
TCAGAGTTTGGATGGTAGTACAAGTGCGGAGTCTATGCAAGAGCAGACACTTGATGCTCC
AAAAGAAACTAATGGCAATGACAATGAGAGTTCAAATGGTGGTGCTGTGTGGGATATCTT
TCGAAGAGAGGATGTTCCAAAACTTATCGAGTATTTGAATAGACACAAGCATGAGTTTCG
TCATTTCTTTAACGAACCTGTGGAATCTGTTACTCACCCAATTCATGACCAGACCTTGTT
CTTGACTGAAAGGCAAAAGAAGCAGCTGAAAGAAGAGTTCGATATAGAGCCATGGACGTT
TGTGCAACACTTAGGTGAAGCTGTTTTTATCCCTGCAGGTTGTCCTCACCAAGTGAGGAA
TATACAGTCTTGCATAAAGGTGGCACTTGATTTTGTTGCTCCTGAAAGCGTAGAGGAATG
CCTTAGGCTAACACAGGAGTTCCGGAGGCTACCAAAAGACCACAGATCTAATGAAGATAA
ACTAGAGCTTAAGAAAATAGTGCTGCATGCTGCCAGCTCAGCCATAGTAGAAGCACAAGA
TCTAATGCAAAAGTCCATGACTGAATGATGCTAACAAAAGACTCCGAATAAGGATATCAA
GCTCTTCATTGTAGGAGACTTGGTTTGTTCCCAAAGATAAAAATCAGAAGAAAGCCCTCT
GTTTACTTTGTCAGGTAACAAACTCCCATGTAACATTATTTGTATCAGTAGAACTATTCC
GTGGCATTTATTTATGTAACATTATTGTATCAGTAAAACTATTTTATGGCATTTTACTTC
TGTAATGTTAGAACAAAGATCCTTCCCTCTTATTTTAATGCAGTTGTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB86TF U 1
AF RR2HB86JQ C 407
BS 1 641 RR2HB86TF
BS 642 831 RR2HB86JQ

RD RR2HB86TF 641 0 0
TCAGAGTTTGGATGGTAGTACAAGTGCGGAGTCTATGCAAGAGCAGACACTTGATGCTCC
AAAAGAAACTAATGGCAATGACAATGAGAGTTCAAATGGTGGTGCTGTGTGGGATATCTT
TCGAAGAGAGGATGTTCCAAAACTTATCGAGTATTTGAATAGACACAAGCATGAGTTTCG
TCATTTCTTTAACGAACCTGTGGAATCTGTTACTCACCCAATTCATGACCAGACCTTGTT
CTTGACTGAAAGGCAAAAGAAGCAGCTGAAAGAAGAGTTCGATATAGAGCCATGGACGTT
TGTGCAACACTTAGGTGAAGCTGTTTTTATCCCTGCAGGTTGTCCTCACCAAGTGAGGAA
TATACAGTCTTGCATAAAGGTGGCACTTGATTTTGTTGCTCCTGAAAGCGTAGAGGAATG
CCTTAGGCTAACACAGGAGTTCCGGAGGCTACCAAAAGACCACAGATCTAATGAAGATAA
ACTAGAGCTTAAGAAAATAGTGCTGCATGCTGCCAGCTCAGCCATAGTAGAAGCACAAGA
TCTAATGCAAAAGTCCATGACTGAATGATGCTAACAAAAGACTCCGAATAAGGATATCAA
GCTCTTCATTGTAGGAGACTTGGTTTGTTCCCAAAGATAAA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2HB86JQ 425 0 0
AGCGTAGAGGAATGCCTTAGGCTAACACAGGAGTTCCGGAGGCTACCAAAAGACCACAGA
TCTAATGAAGATAAACTAGAGCTTAAGAAAATAGTGCTGCATGCTGCCAGTTCAGCCATA
GTAGAAGCACAAGATTTAATGCAAAAGTCCATGACTGAATGATGCTAACAAAAGACTCCG
AATAAGGATATCAAGCTTTTCATTGTAGGAGACTTGGTTTGTTCCCAAAGATAAAAATCA
GAAGAAAGCCCTCTGTTTACTTTGTCAGGTAACAAACTCCCATGTAACATTATTTGTATC
AGTAGAACTATTCCGTGGCATTTATTTATGTAACATTATTGTATCAGTAAAACTATTTTA
TGGCATTTTACTTCTGTAATGTTAGAACAAAGATCCTTCCCTCTTATTTTAATGCAGTTG
TAGCC

QA 1 425 1 425
DS 



AS 1 2

CO CL4815Contig1 1252 2 8 U
GCCACGACCCGAACACGACGAGTCCAGAGACCCGAGAAGGTATCCTAATCACAGGGAAGT
CTTGGCTTACCTCAAAGACTTCGCAAGAGAGTTCAAACTCGTGGAGATGGTTCGGTTCGG
GACAGAAGTGGTTCTTGTCGAGCAGGATGGTCGGAAGTGGAAGATCCGATCGAGAAACTC
TGATGGGGTGACCAGAGATGAGATCTTTGACTCCGTTGTCGTGTGTAATGGACACTACAC
AGAGCCTCGTGTTGCTCAAGTTCCTGGTATAGATGTATGGCCAGGGAAGCAACTTCATAG
TCACAACTACAGAGTTCCTGATCCATTCAAAGACCAGGTGGTGGTAGTGATAGGAAACTT
TGCGAGTGGATCAGATATCAGCAGGGACTTAACAGGAGTGGCTAAAGAAGTCCATATCGC
GGCTAGGTCCAAACCGGCTGAGACATATGAGAAGCTTCCAGGGGCCAACAATCTATGGCT
TCACCCTATGATAGAAACCGCACGTAAAGATGGTTCTATTGTTTTCAAGAGTGGTAAGGT
TGTACAGGCAGATACTATTGTGCACTGCACGGGTTACATATATTACTTCCCGTTTCTTAA
TACCAATGGATATATTACCGATGAGGATAACTGTGTTGGACCTCTTTACAAACATGTGTT
TCCACCTGCACTTGCTCCGGGGCTTTCCTTCGTTGGTTTACCATGGATGACATTGCTATT
CACTATGTTTGAGCTTCAAAGCAAGTGGGTGGCTGCAGTTTTGTCCGGTCGTGTCACACT
TCCTTCAGAAGAAAAAATGATGGAGGACACTAACGTCCTCTATGCAAAGCGTGATGCTAA
CGGGTTCCCCAAGAGATACACGCATCGTCTTGGTGTCGTCGCTCAGGTTGAGTACCTCAA
ATGGATAGCTGATCAGATTGGTGAACCACCTGTTGAACAGTGGAGAAACCAGGAGTTAGA
AGGCGGCTATGTCAGACTTGCAACACAATCAGACACGTTCCGTGATAAGTGGGACGATGA
TCATCTCATTGTTGAGGCTTATGAGGATTTCTTGAGACATAAGTTGATCAGTGCTATTCC
CTTTCAGATATTGGGGTGATGATGCCTTTTACCAAATGATTGATCTCTATATATGTGTCG
TTCATGTGATATTGAACTTCACCATTTTCGTTGTCTTTATACTTACTATTTTGCAATAAA
AAAAAACAAATGTTTTTATACAGATTGAATAAAAGCACTAAGCATGTTGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H416TF U 1
AF RR2H416JQB C 557
BS 1 681 RR2H416TF
BS 682 682 RR2H416JQB
BS 683 739 RR2H416TF
BS 740 740 RR2H416JQB
BS 741 767 RR2H416TF
BS 768 768 RR2H416JQB
BS 769 796 RR2H416TF
BS 797 1252 RR2H416JQB

RD RR2H416TF 796 0 0
GCCACGACCCGAACACGACGAGTCCAGAGACCCGAGAAGGTATCCTAATCACAGGGAAGT
CTTGGCTTACCTCAAAGACTTCGCAAGAGAGTTCAAACTCGTGGAGATGGTTCGGTTCGG
GACAGAAGTGGTTCTTGTCGAGCAGGATGGTCGGAAGTGGAAGATCCGATCGAGAAACTC
TGATGGGGTGACCAGAGATGAGATCTTTGACTCCGTTGTCGTGTGTAATGGACACTACAC
AGAGCCTCGTGTTGCTCAAGTTCCTGGTATAGATGTATGGCCAGGGAAGCAACTTCATAG
TCACAACTACAGAGTTCCTGATCCATTCAAAGACCAGGTGGTGGTAGTGATAGGAAACTT
TGCGAGTGGATCAGATATCAGCAGGGACTTAACAGGAGTGGCTAAAGAAGTCCATATCGC
GGCTAGGTCCAAACCGGCTGAGACATATGAGAAGCTTCCAGGGGCCAACAATCTATGGCT
TCACCCTATGATAGAAACCGCACGTAAAGATGGTTCTATTGTTTTCAAGAGTGGTAAGGT
TGTACAGGCAGATACTATTGTGCACTGCACGGGTTACATATATTACTTCCCGTTTCTTAA
TACCAATGGATATATTACCGATGAGGATAACTGTGTTGGACCTCTTTACAAACATGTGTT
TCCACCTGCACTTGCTCCGGG*CTTTCCTTCGTTGGTTTACCATGGATGACATTGCTATT
CACTATGTTTGAGCTTCAA*GCAAGTGGGTGGCTGCAGTTTTGTCCG*TCGTGTCACACT
TCCTTCAGAAGAAAAA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2H416JQB 696 0 0
ATTGTGCACTGCACGGGTTACATATATTACTTCCCGTTTCTTAATACCAATGGATATATT
ACCGATGAGGATAACTGTGTTGGACCTCTTTACAAACATGTGTTTCCACCTGCACTTGCT
CCGGGGCTTTCCTTCGTTGGTTTACCATGGATGACATTGCTATTCACTATGTTTGAGCTT
CAAAGCAAGTGGGTGGCTGCAGTTTTGTCCGGTCGTGTCACACTTCCTTCAGAAGAAAAA
ATGATGGAGGACACTAACGTCCTCTATGCAAAGCGTGATGCTAACGGGTTCCCCAAGAGA
TACACGCATCGTCTTGGTGTCGTCGCTCAGGTTGAGTACCTCAAATGGATAGCTGATCAG
ATTGGTGAACCACCTGTTGAACAGTGGAGAAACCAGGAGTTAGAAGGCGGCTATGTCAGA
CTTGCAACACAATCAGACACGTTCCGTGATAAGTGGGACGATGATCATCTCATTGTTGAG
GCTTATGAGGATTTCTTGAGACATAAGTTGATCAGTGCTATTCCCTTTCAGATATTGGGG
TGATGATGCCTTTTACCAAATGATTGATCTCTATATATGTGTCGTTCATGTGATATTGAA
CTTCACCATTTTCGTTGTCTTTATACTTACTATTTTGCAATAAAAAAAAACAAATGTTTT
TATACAGATTGAATAAAAGCACTAAGCATGTTGTAC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL4816Contig1 1118 2 2 U
GATTTTCGTGTACCGTCTTTAATTTCTCTTACGCCGACAATACAAGGACGCCGTTCCGTT
ACCGATTAGTAGTTAGTTGTGTAGTGTTTCCTCACTGTGTCAATCGATTGAGATAATTGA
TCTTCGGCCATGTCGTGGTCCAAGGCATGTAGAGGGACTCGAATTTCTTCATATTTAGAG
AATCTTCATAGGACTGTGCCTCTTGTTCCTAGCTCTCGTTATTACACTCATGGAGCTTGT
AATGGCAATCAGCATAATCTCTTAAACAAGAGAGGGCTTTTGGGAAGCTCATCTTCGTTT
TTCACTTTGAATTCTCATTCTGCTGCTGCTGCTAAATCGATGTTACTTAGTACTGCTCAT
CTCCAGTATTATTCTACTCAGTCGATAACAGAAACCAAATCAAAGAAAATGCTCTATTAC
CTCACTGCTGTCGTCTTTGGCATGGTTGGGCTAACCTACGCCGCTGTGCCATTGTATAGA
ACCTTCTGCCAAGCTACTGGATATGGTGGTACTGTTCAACGCAAAGAGACTGTTGAGGAG
AAGATTGCTAGGCATTCAGAATCTGGTACCGTCACTGAAAGGGAGATTGTGGTGCAGTTC
AATGCTGATGTTGCAGATGGGATGCAGCAAGTTCACTCCAACTCAAAGAGAGGGGAGAGT
AAAGCCAGGAGAAAGCGCGCTCGCCTTTTACACTGCTGAAAACAAAAGTTCAGCTCCAAT
AACCGGAGTCTCCACTTACAATGTCACTCCCATGAAGGCAGGAGTTTATTTCAACAAGAT
ACAATGCTTTTGCTTTGAGGAGCAGCGACTTCTTCCCGGAGAACAGATCGACATGCCGGT
GTTCTTCTACATTGATCCTGAGTTTGAGACTGATTCAAGAATGGACGGAATCAACAACCT
GATATTGTCTTACACTTTCTTCAAAGTGTCCGAGGAAAATACTACAGATTCGGTCGACAA
GAACAGCTCTGTTCCAGTTCAAGAAAGCAAGTAAAATGTGTCATTTTTTCTAAAGAGAAA
CTCTCTCTAATCGTTGTCGAATTTTATGAAGGCATCTTTGTTATGCAATTGTCTCTTAGT
TATGTGCTTTATATCTAAGAAACATAAGATTATTTATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY52TF U 1
AF RR2CY52JQ C 461
BS 1 686 RR2CY52TF
BS 687 1118 RR2CY52JQ

RD RR2CY52TF 686 0 0
GATTTTCGTGTACCGTCTTTAATTTCTCTTACGCCGACAATACAAGGACGCCGTTCCGTT
ACCGATTAGTAGTTAGTTGTGTAGTGTTTCCTCACTGTGTCAATCGATTGAGATAATTGA
TCTTCGGCCATGTCGTGGTCCAAGGCATGTAGAGGGACTCGAATTTCTTCATATTTAGAG
AATCTTCATAGGACTGTGCCTCTTGTTCCTAGCTCTCGTTATTACACTCATGGAGCTTGT
AATGGCAATCAGCATAATCTCTTAAACAAGAGAGGGCTTTTGGGAAGCTCATCTTCGTTT
TTCACTTTGAATTCTCATTCTGCTGCTGCTGCTAAATCGATGTTACTTAGTACTGCTCAT
CTCCAGTATTATTCTACTCAGTCGATAACAGAAACCAAATCAAAGAAAATGCTCTATTAC
CTCACTGCTGTCGTCTTTGGCATGGTTGGGCTAACCTACGCCGCTGTGCCATTGTATAGA
ACCTTCTGCCAAGCTACTGGATATGGTGGTACTGTTCAACGCAAAGAGACTGTTGAGGAG
AAGATTGCTAGGCATTCAGAATCTGGTACCGTCACTGAAAGGGAGATTGTGGTGCAGTTC
AATGCTGATGTTGCAGATGGGATGCAGCAAGTTCACTCCAACTCAAAGAGAGGGGAGAGT
AAAGCCAGGAGAAAGCGCGCTCGCCT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2CY52JQ 658 0 0
CCGCTGTGCCATTGTATAGAACCTTCTGCCAAGCTACTGGATATGGTGGTACTGTTCAAC
GCAAAGAGACTGTTGAGGAGAAGATTGCTAGGCATTCAGAATCTGGTACCGTCACTGAAA
GGGAGATTGTGGTGCAGTTCAATGCTGATGTTGCAGATGGGATGCAGCAAGTTCACTCCA
ACTCAAAGAGAGGGGAGAGTAAAGCCAGGAGAAAGCGCGCTCGCCTTTTACACTGCTGAA
AACAAAAGTTCAGCTCCAATAACCGGAGTCTCCACTTACAATGTCACTCCCATGAAGGCA
GGAGTTTATTTCAACAAGATACAATGCTTTTGCTTTGAGGAGCAGCGACTTCTTCCCGGA
GAACAGATCGACATGCCGGTGTTCTTCTACATTGATCCTGAGTTTGAGACTGATTCAAGA
ATGGACGGAATCAACAACCTGATATTGTCTTACACTTTCTTCAAAGTGTCCGAGGAAAAT
ACTACAGATTCGGTCGACAAGAACAGCTCTGTTCCAGTTCAAGAAAGCAAGTAAAATGTG
TCATTTTTTCTAAAGAGAAACTCTCTCTAATCGTTGTCGAATTTTATGAAGGCATCTTTG
TTATGCAATTGTCTCTTAGTTATGTGCTTTATATCTAAGAAACATAAGATTATTTATA

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL4817Contig1 1037 2 2 U
GGAAAACGATTTAAGGCAGGACCTCAAACCAACCGAAGGGAAAGCAGACAAGACCGTGAC
TGGTTATATTCTCCGACCTCGTTTTCTGTGACTCTCTCCGGTTACCTAAAATTTGTTTTC
TTTCTTTCTTTCTCAGGAAAATGAGTTATTATTCTCAAAAAAAAAAGATGAGAGTTATAT
TTTTTTCTAGGGAAAATGGATTTAGGAAAAAATTGAGTAAGTGAGAGAGCTGAGATCAAG
AAGGTTGTGATCTATGAGAAAGATAAGATCTTTTACATGTTATAAGCCAAGAAACTGGAG
CTTGAGTGAGAGAGATCTTATGGAATTTATGAATTTATAGCCAGATTGGTCTTCTGCCAA
TCCAAACAAATTGGGAAGACAAAGAGGACGAGGAAGAAAGAAACAGAGAGAAACTGCCAA
GATTCGGACAAGTCATGGTTCCCTTTCTAGAATATAATTAATAATGTTTGATGGAATAAC
AACAGCAAATCTCTAATGCTCTGGATAAAGGAAAAATAATAATTAAAAGCATTCGATGGA
AGGAAACAAACTAGACTTCTCTTTTCTTGGGTATGTTCTTCTAATGATCTGTAAGAGAAT
TGTAGTATCAGATTATCAGAAGAACATACGAGAAAAAAAAGAAAAAAAAAGTGAGAAACA
ATTTTGGTTAGAGAGGTGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAATCGATTGGAGGAACATTA
GATGCGCCGTCGTGGCGGAGAGAGAAGGTGAGACCAACACACAAAATGCGGGTCAAACAC
TCTCTAAAATCATCTATTGCATGAATGAATTTCTTCTTTATTTAATTTTCTAATTCTCTT
TACTCTGATGAGTGAATTATTTGTATTTATTAACTGCACCACATTTGTTGATACTTAAGA
TGTGCTGTGCACAAAGAAAGGTATTCATCGTTACACATTCTAATTACAGAAATTAGGTCA
CACTCTACATTTTGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY08TF U 1
AF RR2EY08JQ C 528
BS 1 632 RR2EY08TF
BS 633 1037 RR2EY08JQ

RD RR2EY08TF 632 0 0
GGAAAACGATTTAAGGCAGGACCTCAAACCAACCGAAGGGAAAGCAGACAAGACCGTGAC
TGGTTATATTCTCCGACCTCGTTTTCTGTGACTCTCTCCGGTTACCTAAAATTTGTTTTC
TTTCTTTCTTTCTCAGGAAAATGAGTTATTATTCTCAAAAAAAAAAGATGAGAGTTATAT
TTTTTTCTAGGGAAAATGGATTTAGGAAAAAATTGAGTAAGTGAGAGAGCTGAGATCAAG
AAGGTTGTGATCTATGAGAAAGATAAGATCTTTTACATGTTATAAGCCAAGAAACTGGAG
CTTGAGTGAGAGAGATCTTATGGAATTTATGAATTTATAGCCAGATTGGTCTTCTGCCAA
TCCAAACAAATTGGGAAGACAAAGAGGACGAGGAAGAAAGAAACAGAGAGAAACTGCCAA
GATTCGGACAAGTCATGGTTCCCTTTCTAGAATATAATTAATAATGTTTGATGGAATAAC
AACAGCAAATCTCTAATGCTCTGGATAAAGGAAAAATAATAATTAAAAGCATTCGATGGA
AGGAAACAAACTAGACTTCTCTTTTCTTGGGTATGTTCTTCTAATGATCTGTAAGAGAAT
TGTAGTATCAGATTATCAGAAGAACATACGAG

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2EY08JQ 510 0 0
AGCATTCGATGGAAGGAAACAAACTAGACTTCTCTTTTCTTGGGTATGTTCTTCTAATGA
TCTGTAAGAGAATTGTAGTATCAGATTATCAGAAGAACATACGAGAAAAAAAAGAAAAAA
AAAGTGAGAAACAATTTTGGTTAGAGAGGTGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAATCGAT
TGGAGGAACATTAGATGCGCCGTCGTGGCGGAGAGAGAAGGTGAGACCAACACACAAAAT
GCGGGTCAAACACTCTCTAAAATCATCTATTGCATGAATGAATTTCTTCTTTATTTAATT
TTCTAATTCTCTTTACTCTGATGAGTGAATTATTTGTATTTATTAACTGCACCACATTTG
TTGATACTTAAGATGTGCTGTGCACAAAGAAAGGTATTCATCGTTACACATTCTAATTAC
AGAAATTAGGTCACACTCTACATTTTGAAA

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL4818Contig1 882 2 2 U
GTGGATGGCAGTATATCTCTGGGAGCTTGCCTGATGGCCACGAGCTTGATCGCTTGGACA
ATCCTGCGATACAAGGCGCAAAGTATGACCCGGAAGGGGAGTACATAAGGCAATGGCTAC
CCGAGCTGGCGAGGTTGCCAACTGAATGGATCCATCATCCATGGGACGCTCCATTAACCG
TACTCAAAGCTTCCGGTGTGGAACTCGGAACAAACTATGCCAAACCCATCGTAGATATCG
ACACAGCTCGTGAGCTGCTAACCAAAGCCATATCAAGAACTCGTGAAGCACAGATCATGA
TCGGAGCAGCGCCTGATGAGATTGTAGCTGATAGCTTCGAGGCCTTAGAGGCTGCTAATA
CCGTTAAAGAACATGGTCTTTGCCCGTCGTCTAATGACCAGCAAGTACCGTCGGATGTTC
GTTACAATGGATCGAAGAGAATGAAACCCGTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGG
AGAGAGAGATGAAGAAACTTAGAGGGTTCAATGAAGTTATTAGAGAAGAAGAAGAAAGGG
GTTTGTTTTCTACTGCTGAGTCTTCTTCTTCTTCGAGTGTTACGAGTGTGTTCATGGTTT
CTCATTCTTGCTCGCTCGTATCAGAAGGGAAGAATCTGGAAGGTATTCAAGATTCTTCGG
ATCAGATTGCTACAAGTTTGGGGAAAAATGGTTAGAAATGATCAAAGATAAAGCTTTAAT
GTTATTCTCGCTTTTGCTATTACTATAAAACCTAACATGTAGAAGTATGAATGTGTGTGT
GTCTCTCGACTCTTTGCTCCTTGTGATGATCAAAGATGGAATAAGCTTATATTATATATC
TTCTGATAGATGTGTGGATAAAATAATAAAAGATATTTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E430TF U 1
AF RR2E430JQ C 393
BS 1 623 RR2E430TF
BS 624 882 RR2E430JQ

RD RR2E430TF 623 0 0
GTGGATGGCAGTATATCTCTGGGAGCTTGCCTGATGGCCACGAGCTTGATCGCTTGGACA
ATCCTGCGATACAAGGCGCAAAGTATGACCCGGAAGGGGAGTACATAAGGCAATGGCTAC
CCGAGCTGGCGAGGTTGCCAACTGAATGGATCCATCATCCATGGGACGCTCCATTAACCG
TACTCAAAGCTTCCGGTGTGGAACTCGGAACAAACTATGCCAAACCCATCGTAGATATCG
ACACAGCTCGTGAGCTGCTAACCAAAGCCATATCAAGAACTCGTGAAGCACAGATCATGA
TCGGAGCAGCGCCTGATGAGATTGTAGCTGATAGCTTCGAGGCCTTAGAGGCTGCTAATA
CCGTTAAAGAACATGGTCTTTGCCCGTCGTCTAATGACCAGCAAGTACCGTCGGATGTTC
GTTACAATGGATCGAAGAGAATGAAACCCGTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGG
AGAGAGAGATGAAGAAACTTAGAGGGTTCAATGAAGTTATTAGAGAAGAAGAAGAAAGGG
GTTTGTTTTCTACTGCTGAGTCTTCTTCTTCTTCGAGTGTTACGAGTGTGTTCATGGTTT
CTCATTCTTGCTCGCTCGTATCA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2E430JQ 490 0 0
AATGACCAGCAAGTCCCGTCGGATGTTCGTTACAATGGATCGAAGAGAATGAAACCCGTT
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAGAGAGAGATGAAGAAACTTAGAGGGTTCAAT
GAAGTTATTAGAGAAGAAGAAGAAAGGGGTTTGTTTTCTACTGCTGAGTCTTCTTCTTCT
TCGAGTGTTAGGAGTGTGTTCATGGTTTCTCATTCTTGCTCGCTCGTATCAGAAGGGAAG
AATCTGGAAGGTATTCAAGATTCTTCGGATCAGATTGCTACAAGTTTGGGGAAAAATGGT
TAGAAATGATCAAAGATAAAGCTTTAATGTTATTCTCGCTTTTGCTATTACTATAAAACC
TAACATGTAGAAGTATGAATGTGTGTGTGTCTCTCGACTCTTTGCTCCTTGTGATGATCA
AAGATGGAATAAGCTTATATTATATATCTTCTGATAGATGTGTGGATAAAATAATAAAAG
ATATTTCTAC

QA 1 490 1 490
DS 



AS 1 2

CO CL4819Contig1 951 2 2 U
GGATACTTCGGCTCCCCCAACGAGAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTG
GTCGAATCGAGTAGGTCAGGTATGTTAAAGGATCGTGCTTTGAAGAAGAAGAGATAAGAT
GAGTGGGAGTGGAGATAATAGTCTCTGGAACGACAAAGACACCTTCTGATTTCCTCAAAT
CCATCCGTGGGAGACCTGTTGTTCTCAAGCTCAACTCTGGTGTTGATTATCGTGGCATCC
TTACTTGTCTTGATGGGTACATGAACATAGCAATGGAGCAGACAGAAGAGTATGTTAACA
GGCAGCTCAAGAGCAAATACGGTGATGCTTTTATCCGTGGAAACAATGTTCTCTACATCA
GTACGGTAAACACACCTTTACCTGACGGAGCTTAGACCCTTCCTCATGCATCATCAGCAG
CAGACATGGCCACTGTGTTTAAAATGGCGAGCGCCTTTGTCGCCATGGCGTAAGGCGCAC
CAAGGCGAAGGCCCTAACGCCATAGACCTCTAAGGCGAGGGTGGGTTCCGCAAAGCGCTC
GCCATGGTGCGCCTTTGCCTTAATCGATGGTGTCAAAGGCGATTAAAAGGCGCGCCTTAG
AAATCTCACGTTGTTTTGACTTCTCACTTCCCTCTCGACCCTCTTCTTCTCACTTATCTC
TCTACCCTCTTCTTCTCACTTATCTCTCTACTCTCTTCTTCTCAGTTCATCTCTGTCTCA
ACTTCTAATTTCATTTGTTTTCTTTTATTCTTAGGTCACATATCCATAATTAAATTTCCT
CTGTTTATATTTGATTGTTTGATCACAGATTCACAGTACGTAACACGTTTTTGAAAATGT
TCCTATTGATTTTTGGTTCTTCTCTGTGTTAGTGACACGTTTATGAACACGTGTTTACTT
TGGTTTCTTACATTAGCTATTTGTCTTTGGTGTTTCTGTTTTGAATAATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR42TF U 1
AF RR2CR42JQ C 246
BS 1 460 RR2CR42TF
BS 461 951 RR2CR42JQ

RD RR2CR42TF 460 0 0
GGATACTTCGGCTCCCCCAACGAGAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTG
GTCGAATCGAGTAGGTCAGGTATGTTAAAGGATCGTGCTTTGAAGAAGAAGAGATAAGAT
GAGTGGGAGTGGAGATAATAGTCTCTGGAACGACAAAGACACCTTCTGATTTCCTCAAAT
CCATCCGTGGGAGACCTGTTGTTCTCAAGCTCAACTCTGGTGTTGATTATCGTGGCATCC
TTACTTGTCTTGATGGGTACATGAACATAGCAATGGAGCAGACAGAAGAGTATGTTAACA
GGCAGCTCAAGAGCAAATACGGTGATGCTTTTATCCGTGGAAACAATGTTCTCTACATCA
GTACGGTAAACACACCTTTACCTGACGGAGCTTAGACCCTTCCTCATGCATCATCAGCAG
CAGACATGGCCACTGTGTTTAAAATGGCGAGCGCCTTTGT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2CR42JQ 706 0 0
TGTCTTGATGGGTACATGAACATAGCAATGGAGCAGACAGAAGAGTATGTTAACAGGCAG
CTCAAGAGCAAATACGGTGATGCTTTTATCCGTGGAAACAATGTTCTCTACATCAGTACG
GTAAACACACCTTTACCTGACGGAGCTTAGACCCTTCCTCATGCATCATCAGCAGCAGAC
ATGGCCACTGTGTTTAAAATGGCGAGCGCCTTTGTCGCCATGGCGTAAGGCGCACCAAGG
CGAAGGCCCTAACGCCATAGACCTCTAAGGCGAGGGTGGGTTCCGCAAAGCGCTCGCCAT
GGTGCGCCTTTGCCTTAATCGATGGTGTCAAAGGCGATTAAAAGGCGCGCCTTAGAAATC
TCACGTTGTTTTGACTTCTCACTTCCCTCTCGACCCTCTTCTTCTCACTTATCTCTCTAC
CCTCTTCTTCTCACTTATCTCTCTACTCTCTTCTTCTCAGTTCATCTCTGTCTCAACTTC
TAATTTCATTTGTTTTCTTTTATTCTTAGGTCACATATCCATAATTAAATTTCCTCTGTT
TATATTTGATTGTTTGATCACAGATTCACAGTACGTAACACGTTTTTGAAAATGTTCCTA
TTGATTTTTGGTTCTTCTCTGTGTTAGTGACACGTTTATGAACACGTGTTTACTTTGGTT
TCTTACATTAGCTATTTGTCTTTGGTGTTTCTGTTTTGAATAATTG

QA 1 706 1 706
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4823Contig1 704 2 3 U
CATATATCATTATAGTCCATAGAAACTCCCATATTAAAGTTTTGATAAAAGTTACACAAG
CCAACTTTTGTTTTTAAATCCATCATTCATCAAATCATAAGCGTTTGAAGCTGTATCAGC
CTTAAGTAAGCTCAAATCCTATGTGTTTGAAGCTGTAACAGCCTTGAATAAGCTCTCTCT
GGTCGGCTAACAAGCTCGGAATGGCTTCCTTGCCCCACAATTCCCCCGTCTTGAATCACA
CCAATGGAATCAACCCCCCTTATGGTCGACAAACGGTGAGCAACTACCACGGGGGTCCGG
CCTCTCATGAGCCTCTCCAAAGCTTCCTGCAGCACGCATTCCGATTCCGCATCTAGTGCG
CTTGTTGCTTCATCAAAAAGCAACACAGTAGGGTTCTTGAGCACTGCTCTCGCTATTGCA
ATCCTCTGTTTCTGTCCACCTGATAACTGCACTCCTCTTTCACCCACTGGAGTTTGGTAA
CCTTCCGGCAAACCACTGATGAAACCATGAGCGTTTGCTGCTCGAGCAGCCTCAATAACC
TCGGACTCAGTGGCACCATCTTTCCCATATGCAATGTTGTCGAAGATGGTCGCTGCGAAA
AGAGCTGGCTCTTGCTGAACAAGACCTATTTTGAGCCTCAGAGATTTTAGGTTTAGCCTG
CGGATGTCTTTGCCGTCAATCATGACTTTTCCGGAAAGGGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER81JQ U 186
AF RR2ER81TF C 1
BS 1 185 RR2ER81TF
BS 186 434 RR2ER81JQ
BS 435 704 RR2ER81TF

RD RR2ER81JQ 249 0 0
GCTAACAAGCTCGGAATGGCTTCCTTGCCCCACAATTCCCCCGTCTTGAATCACACCAAT
GGAATCAACCCCCCTTATGGTCGACAAACGGTGAGCAACTACCACGGGGGTCCGGCCTCT
CATGAGCCTCTCCAAAGCTTCCTGCAGCACGCATTCCGATTCCGCATCTAGTGCGCTTGT
TGCTTCATCAAAAAGCAACACAGTAGGGTTCTTGAGCACTGCTCTCGCTATTGCAATCCT
CTGTTTCTG

QA 1 249 1 249
DS 

RD RR2ER81TF 704 0 0
CATATATCATTATAGTCCATAGAAACTCCCATATTAAAGTTTTGATAAAAGTTACACAAG
CCAACTTTTGTTTTTAAATCCATCATTCATCAAATCATAAGCGTTTGAAGCTGTATCAGC
CTTAAGTAAGCTCAAATCCTATGTGTTTGAAGCTGTAACAGCCTTGAATAAGCTCTCTCT
GGTCGGCTAACAAGCTCGGAATGGCTTCCTTGCTCCACAATTCTCCCGTCTTGAATCACA
CCAATGGAATCAACCCCTCTTATGGTCGACAAACGGTGAGCAACTACCACGGTGGTCCGG
CCTCTCATGAGCCTCTCCAAAGCTTCCTGCAGCACGCATTCCGATTCCGCATCTAGTGCG
CTTGTTGCTTCATCAAGAAGCAACACAGTAGGGTTCTTGAGCACTGCTCTCGCTATTGCA
ATCCTCTGTTTCTGTCCACCTGATAACTGCACTCCTCTTTCACCCACTGGAGTTTGGTAA
CCTTCCGGCAAACCACTGATGAAACCATGAGCGTTTGCTGCTCGAGCAGCCTCAATAACC
TCGGACTCAGTGGCACCATCTTTCCCATATGCAATGTTGTCGAAGATGGTCGCTGCGAAA
AGAGCTGGCTCTTGCTGAACAAGACCTATTTTGAGCCTCAGAGATTTTAGGTTTAGCCTG
CGGATGTCTTTGCCGTCAATCATGACTTTTCCGGAAAGGGGATC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL4824Contig1 828 2 2 U
AAAAAGAGCAGGCTGGTTCGAGTGCGTGGTACTGATGGACGTCAGACTTTTGGGCAGTTT
GGAGAAGCTGAAGTTGTTAGTGCCCGAGGGAGAGCGGCAAGTAAGGGAACTGGTTTCGTA
GGTGGTGCAGGAGAAACTGAGCTTCAGCTTCAACGCCGAAGAATAGCAGATCGGAGGCTT
CGCTTGTTATCCCAAATTAAAGAAGCCCAACGAACACGGCTATTGCAACGTGCTGCACGT
AAGAGACAAAGTGGAATAGCGGGCAAAAGTTTAGCCACCATTGCTGTATTTGGTTACACG
AATGCTGGAAAATCAACTTTGACAAGTGCTTTAACAAGGACTGCTCTCTATTGCAATGAG
CGATTGTTTGCCACTTTAGATCCGACACTCAAGAATGCCATCCTTCCTTCTGGAAGGAAA
GTGCTTTTTAGTGACACTGTTGGATTCATATCAGATCTGCCTATTCAGTTGGTGGAAGCA
TTTCAATCGACTCTGGAAGAAGTTGTAGAAGCTGATCTACTTCTGCATGTAGTTGATTCA
ACGGCTCCAAATATCGAGGAGCATCGTTCAACAGTGTTTCATGTCCTTAATCAAATTGGA
GTACCAGAAGAGAAGCTTAACAATATGATTGAAGTCTGGAATAAAATTGATTATGAAGAG
GAAGAGGAAGAGGAAGACATGCATTATCTAGATGATGGCAAGGGAGAAGAAGAAGGTGAG
TTGACTGATGGTTCAATAGCTGAAGAAACTTTGGAAGCATCTTCTGTAGCAACAGTTGAT
GAAGACCAAATCCAAAACGAAGAGGATGACTCTGATGAGTGGCTACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ47TF U 1
AF RR2FQ47JQ C 425
BS 1 653 RR2FQ47TF
BS 654 828 RR2FQ47JQ

RD RR2FQ47TF 653 0 0
AAAAAGAGCAGGCTGGTTCGAGTGCGTGGTACTGATGGACGTCAGACTTTTGGGCAGTTT
GGAGAAGCTGAAGTTGTTAGTGCCCGAGGGAGAGCGGCAAGTAAGGGAACTGGTTTCGTA
GGTGGTGCAGGAGAAACTGAGCTTCAGCTTCAACGCCGAAGAATAGCAGATCGGAGGCTT
CGCTTGTTATCCCAAATTAAAGAAGCCCAACGAACACGGCTATTGCAACGTGCTGCACGT
AAGAGACAAAGTGGAATAGCGGGCAAAAGTTTAGCCACCATTGCTGTATTTGGTTACACG
AATGCTGGAAAATCAACTTTGACAAGTGCTTTAACAAGGACTGCTCTCTATTGCAATGAG
CGATTGTTTGCCACTTTAGATCCGACACTCAAGAATGCCATCCTTCCTTCTGGAAGGAAA
GTGCTTTTTAGTGACACTGTTGGATTCATATCAGATCTGCCTATTCAGTTGGTGGAAGCA
TTTCAATCGACTCTGGAAGAAGTTGTAGAAGCTGATCTACTTCTGCATGTAGTTGATTCA
ACGGCTCCAAATATCGAGGAGCATCGTTCAACAGTGTTTCATGTCCTTAATCAAATTGGA
GTACCAGAAGAGAAGCTTAACAATATGATTGAAGTCTGGAATAAAATTGATTA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2FQ47JQ 404 0 0
TTTTTAGTGACACTGTTGGATTCATATCAGATCTGCCTATTCAGTTGGTGGAAGCATTTC
AATCGACTCTGGAAGAAGTTGTAGAAGCTGATCTACTTCTGCATGTAGTTGATTCAACGG
CTCCAAATATCGAGGAGCATCGTTCAACAGTGTTTCATGTCCTTAATCAAATTGGAGTAC
CAGAAGAGAAGCTTAACAATATGATTGAAGTCTGGAATAAAATTGATTATGAAGAGGAAG
AGGAAGAGGAAGACATGCATTATCTAGATGATGGCAAGGGAGAAGAAGAAGGTGAGTTGA
CTGATGGTTCAATAGCTGAAGAAACTTTGGAAGCATCTTCTGTAGCAACAGTTGATGAAG
ACCAAATCCAAAACGAAGAGGATGACTCTGATGAGTGGCTACTG

QA 1 404 1 404
DS 



AS 1 2

CO CL4825Contig1 917 2 4 U
GGATTCCCTTGAATCTCTCTCTCTGGGTAAATTCGTCACCGTCTCCTCCAAATCTATCTT
CGTCGTCTCATCTGTCCTCTGTTTCGATAACAAGAGGAAACACAAAAAAAATAAAAAAAA
ATTGGAAGTTTTATTTTCAATTGGGAGGGCGATGGGACAAGCATTTCGTAAGCTATTCGA
TACTTTCTTCGGCAATCAAGAGATGAGGGTGGTGATGCTGGGGCTGGATGCTGCTGGCAA
AACTACTATTCTCTATAAACTTCACATTGGTGAAGTTCTCTCTACTGTTCCCACCATTGG
ATTCAACGTTGAGAAAGTTGAGTACAAGAATGTGATGTTCACGGTTTGGGATGTTGGTGG
CCAAGAGAAACTCAGACCTCTTTGGAGGCACTACTTCAATAACACTGATGGTCTTATATA
CGTGGTAGACTCTTTGGACCGAGAGAGGCTTGGGAAAGCAAAGCAAGAATTTCAGGAGAT
TATAAAAGATCCATTCATGCTCAACAGTATCATTCTGGTCTTTGCAAACAAACAAGACAT
GAGAGGAGCCATGTCACCGAGAGAAGTATGTGAAGGATTAGGCTTATTTGATCTCAGGAA
CAGGAAGTGGCACATACAAGGAACTTGTGCTCTTCGTGGCGACGGCCTTTATGAAGGCTT
GGACTGGTTATCATCTACCCTTAAGGATGTCAAAGCCGCTGGATTCACCTCCGTTGGACC
CTCGTTCTAACTCTTTCACGCTGGTAATATATGAAAAAACGCCTGACAAACCCCACCAAG
CTAATCAATCTCAGTGATCTTGGTCTTGAAAATGTCTTTTCTTCTTGTAGGTATCAAAGC
AGTAATCACACCAAAACAAAATCAGAACCTCTAAATCCTTTTGTTAGGGAAAGAATCATC
CTTCTCTCATGGTGGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR94TF U 1
AF RR2AR94JQ C 395
BS 1 580 RR2AR94TF
BS 581 581 RR2AR94JQ
BS 582 589 RR2AR94TF
BS 590 917 RR2AR94JQ

RD RR2AR94TF 589 0 0
GGATTCCCTTGAATCTCTCTCTCTGGGTAAATTCGTCACCGTCTCCTCCAAATCTATCTT
CGTCGTCTCATCTGTCCTCTGTTTCGATAACAAGAGGAAACACAAAAAAAATAAAAAAAA
ATTGGAAGTTTTATTTTCAATTGGGAGGGCGATGGGACAAGCATTTCGTAAGCTATTCGA
TACTTTCTTCGGCAATCAAGAGATGAGGGTGGTGATGCTGGGGCTGGATGCTGCTGGCAA
AACTACTATTCTCTATAAACTTCACATTGGTGAAGTTCTCTCTACTGTTCCCACCATTGG
ATTCAACGTTGAGAAAGTTGAGTACAAGAATGTGATGTTCACGGTTTGGGATGTTGGTGG
CCAAGAGAAACTCAGACCTCTTTGGAGGCACTACTTCAATAACACTGATGGTCTTATATA
CGTGGTAGACTCTTTGGACCGAGAGAGGCTTGGGAAAGCAAAGCAAGAATTTCAGGAGAT
TATAAAAGATCCATTCATGCTCAACAGTATCATTCTGGTCTTTGCAAACAAACAAGACAT
GAGAGGAGCCATGTCACCGAGAGAAGTATGTGAAGGATTATGCTTATTT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2AR94JQ 523 0 0
TTCAATAACACTGATGGTCTTATATACGTGGTAGACTCTTTGGACCGAGAGAGGCTTGGG
AAAGCAAAGCAAGAATTTCAGGAGATTATAAAAGATCCATTCATGCTCAACAGTATCATT
CTGGTCTTTGCAAACAAACAAGACATGAGAGGAGCCATGTCACCGAGAGAAGTATGTGAA
GGATTAGGCTTATTTGATCTCAGGAACAGGAAGTGGCACATACAAGGAACTTGTGCTCTT
CGTGGCGACGGCCTTTATGAAGGCTTGGACTGGTTATCATCTACCCTTAAGGATGTCAAA
GCCGCTGGATTCACCTCCGTTGGACCCTCGTTCTAACTCTTTCACGCTGGTAATATATGA
AAAAACGCCTGACAAACCCCACCAAGCTAATCAATCTCAGTGATCTTGGTCTTGAAAATG
TCTTTTCTTCTTGTAGGTATCAAAGCAGTAATCACACCAAAACAAAATCAGAACCTCTAA
ATCCTTTTGTTAGGGAAAGAATCATCCTTCTCTCATGGTGGTA

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 2

CO CL4826Contig1 665 2 1 U
GGATGGATGATGATGGATAAAACATAAAAAGAAGTTAAAATTAAAGAGAGAGCTGTAAAA
AGTGGGTAAACACGTGATGATGAAAGCAACCTTCTTATCATCTTACGTTATTTGTTAGGT
ACAACTAGTCGTCATTACCCAGAAAACAAAATAAAAAAACAGCGATCTGCGTTTTCTTGA
ATCAGAATCAAACCAAAGAAGAGAAAAAAATGTTACAGCTGTTTTTCACGATAGCCTTTT
CGGCGGCGCCGTTAACGCTGTACATACCGCCGATAAGATGTTTGACGGTGTTTGTTGAGA
CGATGGAGGAGATGGGAATGGAAGGTAGGGTTTATAGCCGGATAGTCTTTCCTCGTGCAA
GAATTGCTTGGTCTAGGCTTCTTGATTGCTTCTTCTCCTCTTCTCCTCCTCCTCGCCGTC
CTTGATTTTAATTGGTCCTTCTTCTCTTTGTAGATATATCTATATCCCCTCTCTGTTTCC
TTGTGTTATGACTTATAATCACGTATATGTTTTCGATTTGAGATCATTCAAGATGAGTTT
TAGGTTTCGTTGTTCTTGATATCTTAATAAATTAGAGATGGTTATGAATTCTCCTTTTGT
TTTCTCTATCAATTGTTTAAACAAGTTCATATTTATTGTATGTAAAGTGAGATTTATTTT
CTGAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2B820JQ C 1
AF RR2B820TF U 1
BS 1 665 RR2B820TF

RD RR2B820JQ 665 0 0
GGATGGATGATGATGGATAAAACATAAAAAGAAGTTAAAATTAAAGAGAGAGCTGTAAAA
AGTGGGTAAACACGTGATGATGAAAGCAACCTTCTTATCATCTTACGTTATTTGTTAGGT
ACAACTAGTCGTCATTACCCAGAAAACAAAATAAAAAAACAGCGATCTGCGTTTTCTTGA
ATCAGAATCAAACCAAAGAAGAGAAAAAAATGTTACAGCTGTTTTTCACGATAGCCTTTT
CGGCGGCGCCGTTAACGCTGTACATACCGCCGATAAGATGTTTGACGGTGTTTGTTGAGA
CGATGGAGGAGATGGGAATGGAAGGTAGGGTTTATAGCCGGATAGTCTTTCCTCGTGCAA
GAATTGCTTGGTCTAGGCTTCTTGATTGCTTCTTCTCCTCTTCTCCTCCTCCTCGCCGTC
CTTGATTTTAATTGGTCCTTCTTCTCTTTGTAGATATATCTATATCCCCTCTCTGTTTCC
TTGTGTTATGACTTATAATCACGTATATGTTTTCGATTTGAGATCATTCAAGATGAGTTT
TAGGTTTCGTTGTTCTTGATATCTTAATAAATTAGAGATGGTTATGAATTCTCCTTTTGT
TTTCTCTATCAATTGTTTAAACAAGTTCATATTTATTGTATGTAAAGTGAGATTTATTTT
CTGAG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2B820TF 665 0 0
GGATGGATGATGATGGATAAAACATAAAAAGAAGTTAAAATTAAAGAGAGAGCTGTAAAA
AGTGGGTAAACACGTGATGATGAAAGCAACCTTCTTATCATCTTACGTTATTTGTTAGGT
ACAACTAGTCGTCATTACCCAGAAAACAAAATAAAAAAACAGCGATCTGCGTTTTCTTGA
ATCAGAATCAAACCAAAGAAGAGAAAAAAATGTTACAGCTGTTTTTCACGATAGCCTTTT
CGGCGGCGCCGTTAACGCTGTACATACCGCCGATAAGATGTTTGACGGTGTTTGTTGAGA
CGATGGAGGAGATGGGAATGGAAGGTAGGGTTTATAGCCGGATAGTCTTTCCTCGTGCAA
GAATTGCTTGGTCTAGGCTTCTTGATTGCTTCTTCTCCTCTTCTCCTCCTCCTCGCCGTC
CTTGATTTTAATTGGTCCTTCTTCTCTTTGTAGATATATCTATATCCCCTCTCTGTTTCC
TTGTGTTATGACTTATAATCACGTATATGTTTTCGATTTGAGATCATTCAAGATGAGTTT
TAGGTTTCGTTGTTCTTGATATCTTAATAAATTAGAGATGGTTATGAATTCTCCTTTTGT
TTTCTCTATCAATTGTTTAAACAAGTTCATATTTATTGTATGTAAAGTGAGATTTATTTT
CTGAG

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL4827Contig1 658 2 5 U
TGTATTCATGCACCAGCAAGAAATCAATAAGATCGCAAATAGAAAGCGTTTTCGCTTCTT
CGACCAACGCTTCGTTAAACCTTAAAGGCAAAGAGGAAAGAATCTTGCTGACCACTTCTT
TATCTTCGACCTCCCATCCGCAAGACCTCATACGAAACACAAGTTCCATTAGCTTCCCAG
TGAATTCATGAACTGTTTCCGTGTCGCTCATTTTCATATCGTCATACTCTTTCTTGAGAT
CAAGAAGCTTTCTAGCTTGATACATAGGCCCACCTAGTGATTTCGCTGACAAAAGCTCCC
ATGCCTCCTTTGATGACGAAGCAGACGCTATCCACGGAAAAATCTCAAAGGTTAATGCGT
TTTGGATCATATGAAGCGCTGTTGTGTCCTTCATATCCATCCATTGTTTCCACGAGGCTG
AAGCAGTGAATGATGATGATGATGATGATGATGCATAACCTTCTTCAAATTTTTGATATG
CCGATGAAAATTCCTCTTGTTGAAATATTCCCGTCTCCACGACATCCCATAGATCGATAG
CCTTCAAAAAGGTTTTCATTTTTACGCTCCAACACTCATAATGAGTCCCATCAAACACAG
GAACAACCATCGTCATAAGCCCTGATCGTATCAAGTATACGAGCACACCCCAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H811JQ U 10
AF RR2H811TF C 1
BS 1 12 RR2H811TF
BS 13 88 RR2H811JQ
BS 89 89 RR2H811TF
BS 90 243 RR2H811JQ
BS 244 658 RR2H811TF

RD RR2H811JQ 234 0 0
GCC
CCAGCAAGAAATCAATAAGATCGCAAATAGAAAGCGTTTTCGCTTCTTCGACCAACGCTT
CGTTAAACCTTAAAGGGAAAGAGGAAAGAATCTTGCTGACCACTTCTTTATCTTCGACCT
CCCATCCGCAAGACCTCATACGAAACACAAGTTCCATTAGCTTCCCAGTGAATTCATGAA
CTGTTTCCGTGTCGCTCATTTTCATATCGTCATACTCTTTCTTGAGATCAA

QA 4 234 4 234
DS 

RD RR2H811TF 658 0 0
TGTATTCATGCACCAGCAAGAAATCAATAAGATCGCAAATAGAAAGCGTTTTCGCTTCTT
CGACCAACGCTTCGTTAAACCTTAAAGGCAAAGAGGAAAGAATCTTGCTGACCACTTCTT
TATCTTCGACCTCCCATCCGCAAGACCTCATACGAAACACAAGTTCCATTAGCTTCCCAG
TGAATTCATGAACTGTTTCCGTGTCGCTCATTTTCATATCGTCATACTCTTTCTTGAGAT
CAAGAAGCTTTCTAGCTTGATACATAGGCCCACCTAGTGATTTCGCTGACAAAAGCTCCC
ATGCCTCCTTTGATGACGAAGCAGACGCTATCCACGGAAAAATCTCAAAGGTTAATGCGT
TTTGGATCATATGAAGCGCTGTTGTGTCCTTCATATCCATCCATTGTTTCCACGAGGCTG
AAGCAGTGAATGATGATGATGATGATGATGATGCATAACCTTCTTCAAATTTTTGATATG
CCGATGAAAATTCCTCTTGTTGAAATATTCCCGTCTCCACGACATCCCATAGATCGATAG
CCTTCAAAAAGGTTTTCATTTTTACGCTCCAACACTCATAATGAGTCCCATCAAACACAG
GAACAACCATCGTCATAAGCCCTGATCGTATCAAGTATACGAGCACACCCCAAAAAAA

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL4828Contig1 1391 2 4 U
GGAAGAAACCTTTGTTCATTAAAAAAAGTGAATACCTGAAAAACCTAATCGAGGCCTGGC
CGTTTTATTCTTCCTTGGGAGAGAAGAGAATGATGATATCCGATCTTCCCCACCACTTAC
TAGAGGAAATACTCTCTAGGGTTCCGGCGACAACTCTGATACGGTTGCGACCTACTTGTA
AACAATGGAATGCTTTACTCAAAGACCAACTATTCACCGAGAAGCACCACCGTAAAGCTC
CAAAGCAACCTCTACTTCTCATGCTGAAGGAGTTTAGGATTTGTCCAGTGAGCGTTGAAA
TCGATCTCAGCGACAATGTTCCATCTATAGAGTTTAAGGATGCACTTGACCTAAAGGGTT
CCCACTCTAGTTCACAAGATTACGATATAATGGAAGTCTTTCACTGCGAAGGTTTGTTGT
TATGCGTTACCAGAGACAATAAGCTCCTAGTTTGGAATCCACTTTTAGGGGAAACAAAAT
GGATTCATCATTACAAGGAAAAATCTAGTTATGCTTTAGGATACAAAAACAACGAATCTT
GCCACCGTGACTACAAAATCTTGAGGTATTGGCAGAGTTACAGGAGCGAAGACCAAGTTG
TGGAGTTTGAAATATTTGAATTTAGTTCTGATTCATGGAGGTTTCTTGATGGAATCTCTC
TCGACTACTATATACATGCATTTGGATACGTATCTTTGCAAGGAAATTCATATTGGGTTG
CTTCAGAGAGAACAGACAAGGATTCTATGTTCTTACTCGGTTTTGATTTCACAACAGAGA
GATTTATACGTCTAAATCTTCCTCCAGTTCCGCCGACTATGATGCTATCTCTTGTTAGAG
AAGAACAAATCTCAGTGTTACATATGAACTATTTTCCAATATTAAAGATGGAGCTGTGGG
TGACCAGTAACTTTGGTACTGAAGCTGCCTTGTCGTGGAGCAAGTCCTTTGAAGTGGATT
TACACGTTCTTGAAGAACGTTACCCGTTCTTCATGACTTTTTTACTCGACGAGGACAAGA
AAGTGGTCGTGTGTCCAGGACCAAGTGGTCCGAACTTGAAGAACGTGGTCTACATTATTG
GAGAGGACGATGAATATCACACAGAAATCCCTTATCAAAATTCTACACAGAAACCATGGC
TGCCACGTATATTCAATTATGTGCCAAGTTTGGTTCAAATCCAGCAACCAACGCAGACAC
AGACACGGAAGAGAAAGAGAAACGGAAACTAGAAGAAAAGAAGACACAGTAGTCACATTG
AGACTGTCAATGTTGAGTAGTTTTCTTCATTTTTTTAAGAAACAATGTCACACTATTATA
CAAAAAACCTAGGTTTTGTTTTATTTATTCCATGTGGTAGCAAAAGCCAGATCTATCAGA
ATGCAAATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ15TF U 1
AF RR2CJ15JQ C 628
BS 1 702 RR2CJ15TF
BS 703 703 RR2CJ15JQ
BS 704 731 RR2CJ15TF
BS 732 1391 RR2CJ15JQ

RD RR2CJ15TF 735 0 0
GGAAGAAACCTTTGTTCATTAAAAAAAGTGAATACCTGAAAAACCTAATCGAGGCCTGGC
CGTTTTATTCTTCCTTGGGAGAGAAGAGAATGATGATATCCGATCTTCCCCACCACTTAC
TAGAGGAAATACTCTCTAGGGTTCCGGCGACAACTCTGATACGGTTGCGACCTACTTGTA
AACAATGGAATGCTTTACTCAAAGACCAACTATTCACCGAGAAGCACCACCGTAAAGCTC
CAAAGCAACCTCTACTTCTCATGCTGAAGGAGTTTAGGATTTGTCCAGTGAGCGTTGAAA
TCGATCTCAGCGACAATGTTCCATCTATAGAGTTTAAGGATGCACTTGACCTAAAGGGTT
CCCACTCTAGTTCACAAGATTACGATATAATGGAAGTCTTTCACTGCGAAGGTTTGTTGT
TATGCGTTACCAGAGACAATAAGCTCCTAGTTTGGAATCCACTTTTAGGGGAAACAAAAT
GGATTCATCATTACAAGGAAAAATCTAGTTATGCTTTAGGATACAAAAACAACGAATCTT
GCCACCGTGACTACAAAATCTTGAGGTATTGGCAGAGTTACAGGAGCGAAGACCAAGTTG
TGGAGTTTGAAATATTTGAATTTAGTTCTGATTCATGGAGGTTTCTTGATGGAATCTCTC
TCGACTACTATATACATGCATTTGGATACGTATCTTTGCAAG*AAATTCATATTGGGTTG
CTTCAGAGAGA
CAGA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2CJ15JQ 764 0 0
CTGATTCATGGAGGTT*CTTGATGGAATCTCTCTCGACTACTATATACATGCATTTGGAT
ACGTATCTTTGCAAGGAAATTCATATTGGGTTGCTTCAGAGAGAACAGACAAGGATTCTA
TGTTCTTACTCGGTTTTGATTTCACAACAGAGAGATTTATACGTCTAAATCTTCCTCCAG
TTCCGCCGACTATGATGCTATCTCTTGTTAGAGAAGAACAAATCTCAGTGTTACATATGA
ACTATTTTCCAATATTAAAGATGGAGCTGTGGGTGACCAGTAACTTTGGTACTGAAGCTG
CCTTGTCGTGGAGCAAGTCCTTTGAAGTGGATTTACACGTTCTTGAAGAACGTTACCCGT
TCTTCATGACTTTTTTACTCGACGAGGACAAGAAAGTGGTCGTGTGTCCAGGACCAAGTG
GTCCGAACTTGAAGAACGTGGTCTACATTATTGGAGAGGACGATGAATATCACACAGAAA
TCCCTTATCAAAATTCTACACAGAAACCATGGCTGCCACGTATATTCAATTATGTGCCAA
GTTTGGTTCAAATCCAGCAACCAACGCAGACACAGACACGGAAGAGAAAGAGAAACGGAA
ACTAGAAGAAAAGAAGACACAGTAGTCACATTGAGACTGTCAATGTTGAGTAGTTTTCTT
CATTTTTTTAAGAAACAATGTCACACTATTATACAAAAAACCTAGGTTTTGTTTTATTTA
TTCCATGTGGTAGCAAAAGCCAGATCTATCAGAATGCAAATTAT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL4829Contig1 1385 2 4 U
GGATCTGACCTGTTGGGGTTACAGATATTCAAACAACTCATCCATTTCCCTTCGTTCGCC
TCTCTCTGGAGTCTGTCTGGATTCGAAAGAACTGATTAGGATTTCTCGATTCGATTCAAA
CCGTACCTCACCGAATATAACAGAAAAACGAGGAGGAGGATGACGGATTCGAGCCTGGTG
ATGATGCCTGTGGAGATGGCACAAATCTTGGCGACGGAGATGACGAATTGGTGGGAGGAG
GTTAACGAGTCAACTCAGTGGCAAGATGGGATCTTCTTCGCTCTCTCTGGTGCTTATGCT
CTTGTCTCCGCCATCGCTCTTGTCCAGTTGGTAAGGATCCAAATGAGAGTGCCTGAGTAT
GGGTGGACCACTCAGAAGGTCTTTCATCTTATGAACTTTGTCGTCAATGGAGTTCGCGCT
GTTCTATTTGGATTTCACCATCAAGTGTTTCTCGTCCATCCCAAGGCTCTTTGCTGGATA
CTATTGGATCTTCCGGGGCTCCTCTTTTTCTCGGCATACACACTGCTCGTCCTGTTCTGG
GCAGAGATATATCACCAGGCAAGAAGCTTACCAACGGATAAGCTTCGGATAACGTATATC
TCAGTCAATGTGGCTGTATATTTGACTCAGGTTGCTATCTGGGTATGCATCTGGGTTAAT
GATAACAGCACTGTGGAGTTAGTTGGAAAGATATTTATGTCAGTTGTGTCTTTCATCGCC
GCGTTAGGCTTCTTGCTGTACGGAGGAAGGTTGTTTATTATGCTAAGAAGGTTCCCTATT
GAGTCAAAAGGAAGAAGGAAGAAGCTCCATGAGGTTGGATCTGTTACAGCCATATGCTTC
ACCTGCTTCCTCATAAGATGCATTGTGGTGGGTGTATCAGCTTTTGACAGGGATTTAACA
CTGGATGCTCTTGATCACCCGGTTTTGAACTTAATTTACTATATGGTGGTTGAAGTACTT
CCATCGGCACTAGTCCTCTTCATTTTGCGTAAGCTACCTCCAAAGAGAGTATCAGCTCAA
TACCATCCCATCCAGTAGGCTTTTTGTTTGAAGCCTATCACACGGTGAGTTTGATGATGT
TTCAAGAGAGAGAGTAAAGAATCAGTTGGGGGCAAAAAAAGACTGAAGAAGAAGAAATCG
TTGTGGAATTTGCGTGAGTTTTTGGATTGCAAGATCATAAATGATTTTTACTGCTTTAGT
ACTTTCATGTTACTGCAACTTTGAAAAATCTGGTCAGGACAAGAGGTTTGTTTAACATTC
GTTTGGAGTGTTTATGTTACATTGGGTTGAAAATAAACAAACTGTTTAATTTTGTTTACT
GTTATCATTTTCTTCACTTTTGATGTCACTATATTTGGTTTTCCCATCAAATATTTATCC
TAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2AK14TF U 1
AF RR2AK14JQ C 542
BS 1 629 RR2AK14TF
BS 630 630 RR2AK14JQ
BS 631 767 RR2AK14TF
BS 768 1385 RR2AK14JQ

RD RR2AK14TF 767 0 0
GGATCTGACCTGTTGGGGTTACAGATATTCAAACAACTCATCCATTTCCCTTCGTTCGCC
TCTCTCTGGAGTCTGTCTGGATTCGAAAGAACTGATTAGGATTTCTCGATTCGATTCAAA
CCGTACCTCACCGAATATAACAGAAAAACGAGGAGGAGGATGACGGATTCGAGCCTGGTG
ATGATGCCTGTGGAGATGGCACAAATCTTGGCGACGGAGATGACGAATTGGTGGGAGGAG
GTTAACGAGTCAACTCAGTGGCAAGATGGGATCTTCTTCGCTCTCTCTGGTGCTTATGCT
CTTGTCTCCGCCATCGCTCTTGTCCAGTTGGTAAGGATCCAAATGAGAGTGCCTGAGTAT
GGGTGGACCACTCAGAAGGTCTTTCATCTTATGAACTTTGTCGTCAATGGAGTTCGCGCT
GTTCTATTTGGATTTCACCATCAAGTGTTTCTCGTCCATCCCAAGGCTCTTTGCTGGATA
CTATTGGATCTTCCGGGGCTCCTCTTTTTCTCGGCATACACACTGCTCGTCCTGTTCTGG
GCAGAGATATATCACCAGGCAAGAAGCTTACCAACGGATAAGCTTCGGATAACGTATATC
TCAGTCAATGTGGCTGTATATTTGACTCATGTTGCTATCTGGGTATGCATCTGGGTTAAT
GATAACAGCACTGTGGAGTTAGTTGGAAAGATATTTATGTCAGTTGTGTCTTTCATCGCC
GCGTTAGGCTTCTTGCTGTACGGAGGAAGGTTGTTTATTATGCTAAG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2AK14JQ 844 0 0
CAGAGATATATCACCAGGCAAGAAGCTTACCAACGGATAAGCTTCGGATAACGTATATCT
CAGTCAATGTGGCTGTATATTTGACTCAGGTTGCTATCTGGGTATGCATCTGGGTTAATG
ATAACAGCACTGTGGAGTTAGTTGGAAAGATATTTATGTCAGTTGTGTCTTTCATCGCCG
CGTTAGGCTTCTTGCTGTACGGAGGAAGGTTGTTTATTATGCTAAGAAGGTTCCCTATTG
AGTCAAAAGGAAGAAGGAAGAAGCTCCATGAGGTTGGATCTGTTACAGCCATATGCTTCA
CCTGCTTCCTCATAAGATGCATTGTGGTGGGTGTATCAGCTTTTGACAGGGATTTAACAC
TGGATGCTCTTGATCACCCGGTTTTGAACTTAATTTACTATATGGTGGTTGAAGTACTTC
CATCGGCACTAGTCCTCTTCATTTTGCGTAAGCTACCTCCAAAGAGAGTATCAGCTCAAT
ACCATCCCATCCAGTAGGCTTTTTGTTTGAAGCCTATCACACGGTGAGTTTGATGATGTT
TCAAGAGAGAGAGTAAAGAATCAGTTGGGGGCAAAAAAAGACTGAAGAAGAAGAAATCGT
TGTGGAATTTGCGTGAGTTTTTGGATTGCAAGATCATAAATGATTTTTACTGCTTTAGTA
CTTTCATGTTACTGCAACTTTGAAAAATCTGGTCAGGACAAGAGGTTTGTTTAACATTCG
TTTGGAGTGTTTATGTTACATTGGGTTGAAAATAAACAAACTGTTTAATTTTGTTTACTG
TTATCATTTTCTTCACTTTTGATGTCACTATATTTGGTTTTCCCATCAAATATTTATCCT
AAAG

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 2

CO CL4830Contig1 665 2 7 U
TTTGAAATATACGTTTATTATTTGTTTGCCACTGAATTCGTTTAACATCATGTAGAAATG
AGATTCTAGGCATACATTAGAATACAACAGAGAGACCAAGTGCAGTTGACAATGCATACA
CAAAGGCGGACAGATCTGAAGTTGTTGCTGCTGTGACCAGCTTGTCATCTGTCACGCACC
TCTCTGATTCCACGATCTGACCACCAGCAACCTTCACAGCCACCTTTGTCCCATAACCAC
TTGCACATCTCTTATTCTTAAAAGCGCCAGTAGCGGCAAGTAGCCAGTTTCCCATTCCAA
TGGCAGCAACAAACTTGCCCTTCTCGACAAACTTCTTGACTAATCCGACGGCTTTGTCGT
TCATCACCAAAAGCTCCGGCGACCTTCCTCCGGGAACCACAATGCAGTCATAATCATCCA
CAGAGACATCTTCCCAGGCGACAGTCACATAGAAGTTGTGGCTGGACTTCTCGGTTGGAA
GTTGCCTTCCGTCCTCGAGGTCGTGAACGATGGTTGCACATTTATCACCCTTTTTCTTGT
TTGGTGACACTGCGTCCACTTTACATCCGAGAGCTTGAAACGCTTTAGATGGTACGTTGA
CACTGTAATCTTCAACACAATCCCCAATCAAGAATAGCAAAGAAGACTGATTCTCCTTGG
AGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2CO38JQ U 180
AF RR2CO38TF C 1
BS 1 181 RR2CO38TF
BS 182 221 RR2CO38JQ
BS 222 222 RR2CO38TF
BS 223 238 RR2CO38JQ
BS 239 239 RR2CO38TF
BS 240 418 RR2CO38JQ
BS 419 665 RR2CO38TF

RD RR2CO38JQ 239 0 0
CC
CTCTGATTCCACGATCTGACCACCAGCAACCTTCACAGCCCCCTTTGTCCCATAACCCCT
TGCACATCTCTTATTCTTAAAAGCGCCAGTAGCGGCAAGTAGCCAGTTTCCCATTCCAAT
GGCAGCAACAAACTTGCCCTTCTCGACAAACTTCTTGACTAATCCGACGGCTTTGTCGTT
CATCACCAAAAGCTCCGGCGACCTTCCTCCGGGAACCACAATGCAGTCATAATCATC

QA 3 239 3 239
DS 

RD RR2CO38TF 665 0 0
TTTGAAATATACGTTTATTATTTGTTTGCCACTGAATTCGTTTAACATCATGTAGAAATG
AGATTCTAGGCATACATTAGAATACAACAGAGAGACCAAGTGCAGTTGACAATGCATACA
CAAAGGCGGACAGATCTGAAGTTGTTGCTGCTGTGACCAGCTTGTCATCTGTCACGCACC
TCTCTGATTCCACGATCTGACCACCAGCAACCTTCACAGCCACCTTTGTCCCATAACCAC
TTGCACATCTCTTATTCTTAAGAGCGCCAGTAGCGGCAAGTAGCCAGTTTCCCATTCCAA
TGGCAGCAACAAACTTGCCCTTCTCGACAAACTTCTTGACTAATCCGACGGCTTTGTCGT
TCATCACCAAGAGCTCCGGCGACCTTCCTCCGGGAACCACAATGCAGTCATAATCATCCA
CAGAGACATCTTCCCAGGCGACAGTCACATAGAAGTTGTGGCTGGACTTCTCGGTTGGAA
GTTGCCTTCCGTCCTCGAGGTCGTGAACGATGGTTGCACATTTATCACCCTTTTTCTTGT
TTGGTGACACTGCGTCCACTTTACATCCGAGAGCTTGAAACGCTTTAGATGGTACGTTGA
CACTGTAATCTTCAACACAATCCCCAATCAAGAATAGCAAAGAAGACTGATTCTCCTTGG
AGCAC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL4831Contig1 1129 2 2 U
GGATCCCCAAGAGGCAGAGAGGGAGCGATATAGAAAACGAGTCTCTCCCTTTATAAATCC
CATTTTACAAATCTCTTTTCCCTCTCTAAAATCTCATCACTCTTGTGTGTATATAAAGCC
TTCCCCTTTTTTTTCAAATCCTTCCTCTTTCAATCATTTTGGGGCTAACTAAACCCTAGA
TTTCAGATTCCGGATTGCAAACTAGCCAAAGAGAATGGCTGAGCAAGGAATGGAAGGGAG
CCAGCCAGTTGACCTTAGCAGGCATCCTTCAGGGATTGTTCCTACTCTTCAAAACATTGT
CTCAACAGTCAACTTAGACTGCAAACTTGATCTTAAAGCCATTGCGTTGCAGGCTCGTAA
TGCTGAATATAACCCCAAGCGTTTTGCTGCGGTAATCATGAGGATAAGAGAGCCAAAGAC
CACCGCTTTGATCTTTGCTTCTGGAAAAATGGTGTGTACTGGAGCTAAGAGTGAACACCT
TTCAAAACTGGCTGCGAGGAAGTACGCTCGGATTGTTCAAAAGCTTGGCTTTCCTGCAAA
GTTCAAGGATTTCAAGATTCAGAACATTGTAGGCTCTTGTGATGTCAAATTCCCCATTAG
GCTTGAAGGTCTTGCATACTCTCACAGTGCTTTCTCAAGTTACGAGCCTGAACTATTCCC
AGGACTGATATATAGGATGAAACAACCAAAGATAGTACTCCTTATTTTTGTGTCTGGAAA
GATTGTTATAACTGGAGCCAAAATGAGAGAAGAGACTTACACCGCCTTTGAGAATATCTA
CCCAGTTCTTACAGAGTTCAGGAAAATCCAACAATAATACTAGTCTATACACCAGAAAAC
ATGTTCACATTTGGATTGTCATGAACTAGAGATCTCAGGATGGTGGCAAGCGCTTGGTGA
GGTTATCTTACTTCAATAAGGACTTGGTCTGATCCAGATTGAAAACCAAAAACTGTAAAT
ACCGAAAGGGGATGCCAATGTATCTCTTTTTTTTTTTGTTGTATGTTTCTTCCACGTATC
TTTTTCCTGTAATGTTTGTTTCAATGAGCAATACCATAGTAGCTTAGAACCTCTCTACTA
ACCATCTGTAATAAGACACCAAGACTCTGTAATAAACTCCTTTAAACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX68TF U 1
AF RR2EX68JQ C 389
BS 1 606 RR2EX68TF
BS 607 1129 RR2EX68JQ

RD RR2EX68TF 614 0 0
GGATCCCCAAGAGGCAGAGAGGGAGCGATATAGAAAACGAGTCTCTCCCTTTATAAATCC
CATTTTACAAATCTCTTTTCCCTCTCTAAAATCTCATCACTCTTGTGTGTATATAAAGCC
TTCCCCTTTTTTTTCAAATCCTTCCTCTTTCAATCATTTTGGGGCTAACTAAACCCTAGA
TTTCAGATTCCGGATTGCAAACTAGCCAAAGAGAATGGCTGAGCAAGGAATGGAAGGGAG
CCAGCCAGTTGACCTTAGCAGGCATCCTTCAGGGATTGTTCCTACTCTTCAAAACATTGT
CTCAACAGTCAACTTAGACTGCAAACTTGATCTTAAAGCCATTGCGTTGCAGGCTCGTAA
TGCTGAATATAACCCCAAGCGTTTTGCTGCGGTAATCATGAGGATAAGAGAGCCAAAGAC
CACCGCTTTGATCTTTGCTTCTGGAAAAATGGTGTGTACTGGAGCTAAGAGTGAACACCT
TTCAAAACTGGCTGCGAGGAAGTACGCTCGGATTGTTCAAAAGCTTGGCTTTCCTGCAAA
GTTCAAGGATTTCAAGATTCAGAACATTGTAGGCTCTTGTGATGTCAAATTCCCCATTAG
GCTTGA
GGTCTTGC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2EX68JQ 741 0 0
GCGGTAATCATGAGGATAAGAGAGCCAAAGACCACCGCTTTGATCTTTGCTTCTGGAAAA
ATGGTGTGTACTGGAGCTAAGAGTGAACACCTTTCAAAACTGGCTGCGAGGAAGTACGCT
CGGATTGTTCAAAAGCTTGGCTTTCCTGCAAAGTTCAAGGATTTCAAGATTCAGAACATT
GTAGGCTCTTGTGATGTCAAATTCCCCATTAGGCTTGAAGGTCTTGCATACTCTCACAGT
GCTTTCTCAAGTTACGAGCCTGAACTATTCCCAGGACTGATATATAGGATGAAACAACCA
AAGATAGTACTCCTTATTTTTGTGTCTGGAAAGATTGTTATAACTGGAGCCAAAATGAGA
GAAGAGACTTACACCGCCTTTGAGAATATCTACCCAGTTCTTACAGAGTTCAGGAAAATC
CAACAATAATACTAGTCTATACACCAGAAAACATGTTCACATTTGGATTGTCATGAACTA
GAGATCTCAGGATGGTGGCAAGCGCTTGGTGAGGTTATCTTACTTCAATAAGGACTTGGT
CTGATCCAGATTGAAAACCAAAAACTGTAAATACCGAAAGGGGATGCCAATGTATCTCTT
TTTTTTTTTGTTGTATGTTTCTTCCACGTATCTTTTTCCTGTAATGTTTGTTTCAATGAG
CAATACCATAGTAGCTTAGAACCTCTCTACTAACCATCTGTAATAAGACACCAAGACTCT
GTAATAAACTCCTTTAAACCG

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL4832Contig1 975 2 2 U
GGGAATTTTGGGTTGAATTACTCTCTCTCTCTCTTAAAATTAGATTTCAAAGGGTCTTAC
CTTTTTGTCTTCCTCGTATCTCGCAGCCTCGAGGGCTTCCGACGTTCTCAGCGATTATGC
TCGAATCCGAAGAGGAAGGGACATAAAAGAGCAAGTCTTTGGAGTTAAGAGTAAGAGACT
CTTGTGTGTTGTGCGGTGATGGATCAAATAGTTTCAGGAGAAGAAGAAGAAGAGCTTGGT
GTTGACATTGAAGAAGGTGTTGGCTTCAATGATATAACGACCAATCAAGAAGATGTTGTT
CTGGATCAGGTTTGGAATGGGCGTTTGGGTTATGAACACAGGTCTGAAAATACCACTGAT
GATGACGATGAGGATGGTGGTCTGATAAACCCCTTGATTCAAGATGGGAAGAGGAGAGAA
AGAAGCAGCCAAAGTCTAGACCTTTCTGATAGAAAATTCGATAGTGTCAAGGTTAATAAG
ACGAGGAAGCCTTCCAAGCCTCCTAGACCTCCTAAAGGTCCTTTGTTGACTGCAAACGAC
CAGAAGCTGATGAGGGAGATCGCAGAGCTCGCTATGCGGAAGCGTGCTAGGATCGAACGT
ATGAGAAGAATGAAAGCAGCAAAGTCTTCTTCTCCTTGCAGTAGCATTTTGGCTATGATT
GTCACTGTTATCTTCTTCGCCTTTCTTATCTTTCAAGGGTTCTTCACAAGCAATGCAAGT
TTGAGTTCAGACAATTCCCCTGCACCAGACAATAACCGTATGGTCTCTGTTCAGTTCTAC
AATGAGTTTGCTCCTCGTGAGAGAATAGATCCCAGCCCTATTACGACGTTCAGGTATAAG
AAGTCTCGGGTGCAGACAATGAAGAGAACCCAAGAGAAGTTAACAGATGAGATAGCTCTC
TTGGGATTCTTGTAATGTAAACCAAAACCAGTACTTTTTTTTGTTTTGTACTTAAATTCT
TGACATCATTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB71TF U 1
AF RR2CB71JQ C 452
BS 1 693 RR2CB71TF
BS 694 975 RR2CB71JQ

RD RR2CB71TF 693 0 0
GGGAATTTTGGGTTGAATTACTCTCTCTCTCTCTTAAAATTAGATTTCAAAGGGTCTTAC
CTTTTTGTCTTCCTCGTATCTCGCAGCCTCGAGGGCTTCCGACGTTCTCAGCGATTATGC
TCGAATCCGAAGAGGAAGGGACATAAAAGAGCAAGTCTTTGGAGTTAAGAGTAAGAGACT
CTTGTGTGTTGTGCGGTGATGGATCAAATAGTTTCAGGAGAAGAAGAAGAAGAGCTTGGT
GTTGACATTGAAGAAGGTGTTGGCTTCAATGATATAACGACCAATCAAGAAGATGTTGTT
CTGGATCAGGTTTGGAATGGGCGTTTGGGTTATGAACACAGGTCTGAAAATACCACTGAT
GATGACGATGAGGATGGTGGTCTGATAAACCCCTTGATTCAAGATGGGAAGAGGAGAGAA
AGAAGCAGCCAAAGTCTAGACCTTTCTGATAGAAAATTCGATAGTGTCAAGGTTAATAAG
ACGAGGAAGCCTTCCAAGCCTCCTAGACCTCCTAAAGGTCCTTTGTTGACTGCAAACGAC
CAGAAGCTGATGAGGGAGATCGCAGAGCTCGCTATGCGGAAGCGTGCTAGGATCGAACGT
ATGAGAAGAATGAAAGCAGCAAAGTCTTCTTCTCCTTGCAGTAGCATTTTGGCTATGATT
GTCACTGTTATCTTCTTCGCCTTTCTTATCTTT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2CB71JQ 524 0 0
GAAAATTCGATAGTGTCAAGGTTAATAAGACGAGGAAGCCTTCCAAGCCTCCTAGACCTC
CTAAAGGTCCTTTGTTGACTGCAAACGACCAGAAGCTGATGAGGGAGATCGCAGAGCTCG
CTATGCGGAAGCGTGCTAGGATCGAACGTATGAGAAGAATGAAAGCAGCAAAGTTTTTTT
CTCCTTGCAGTAGCATTTTGGCTATGATTGTCACTGTTATTTTTTTCGCCTTTTTTATCT
TTCAAGGGTTCTTCACAAGCAATGCAAGTTTGAGTTCAGACAATTCCCCTGCACCAGACA
ATAACCGTATGGTCTCTGTTCAGTTCTACAATGAGTTTGCTCCTCGTGAGAGAATAGATC
CCAGCCCTATTACGACGTTCAGGTATAAGAAGTCTCGGGTGCAGACAATGAAGAGAACCC
AAGAGAAGTTAACAGATGAGATAGCTCTCTTGGGATTCTTGTAATGTAAACCAAAACCAG
TACTTTTTTTTGTTTTGTACTTAAATTCTTGACATCATTTTATT

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

CO CL4833Contig1 677 2 5 U
AAAAGGCCAGAGAAAAAGAGCCAACAATATTTTATTTACCAAAAACTCATTTGCTAAACA
AAAATCCTTTTTTCTTGCCCTTCTTTCTCTGCAAAGCCTTCTTAATAAATAATCTGAGGG
GGAGAACAATTGGATCTCTTGAGCAGCTAAAATCCGTTGCTTCATTATCCACCACCCGAA
AGAGATGCTCCACGCCATCACTACCAATAATCACAAAATCCCCCGGCTGTTCAAAGGGAA
TCACAACAGCGGTAGAAAAGGAGAACTTTTCTGTAATTACAGGATCGTTACTAGGTTTGA
TGCTATAGCCTTCTTTCTTGATAGACAAAGTAGCTGCTTCCCATATATCCATATAACCAA
TCGCATAGGAAACCTTAAACGATGCATGACTGTTGTGAAGATTCCTCTCTATATGGCTCT
GCATCTCTGGATGACATGTAATCTTGCAATTCTCATTGGCAAAGACCTTCACAAGCTCCC
CCTTGCGATTATTGTCGTCCAAGGGGTGAACTTCAATAGCAAGATATAAATCAACATCAT
CGGCAGTAACAAGATAATTTGGCTTCTTTGCTCCATCAATGTAATTAACTGATCCATCTT
CCAGATGCCGCGCCCACTCAAAATTACATTTTGTCGTTCCGTGGATGGAATGACCAGAAG
CCAGAAGCTCTCGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ01JQ U 13
AF RR2CJ01TF C 1
BS 1 12 RR2CJ01TF
BS 13 226 RR2CJ01JQ
BS 227 227 RR2CJ01TF
BS 228 262 RR2CJ01JQ
BS 263 677 RR2CJ01TF

RD RR2CJ01JQ 250 0 0
AAAAAGAGCCAACAATATTTTATTTACCAAAAACTCATTTGCTAAACAAAAATCCTTTTT
TCTTGCCCTTCTTTCTCTGCAAAGCCTTCTTAATAAATAATCTGAGGGGGAGAACAATTG
GATCTCTTGAGCAGCTAAAATCCGTTGCTTCATTATCCACCACCCGAAAGAGATGCTCCA
CGCCATCACTACCAATAATCACAAAATCCCCCGGGTGTTCAAAGGGAATCACAACAGCGG
TAGAAAAGGA

QA 1 250 1 250
DS 

RD RR2CJ01TF 677 0 0
AAAAGGCCAGAGAAAAAGAGCCAACAATATTTTATTTACCAAAAACTCATTTGCTAAACA
AAAATCCTTTTT*CTTGCCCTTCTTTCTCTGCAGAGCCTTCTTAATAAATAATCTGAGGG
TGAGAACAATTGTATCTCTTGAGCAGCTAAAATCCGTTGCTTCATTATCCACCACCCGAA
AGAGATGCTCCACGCCATCACTACCAATAATCACAAAATCCGCCGGCTGTTCAAAGGGAA
TCACAACAGCGGTAGAAGAGGAGAACTTTTCTGTAATTACAGGATCGTTACTAGGTTTGA
TGCTATAGCCTTCTTTCTTGATAGACAAAGTAGCTGCTTCCCATATATCCATATAACCAA
TCGCATAGGAAACCTTAAACGATGCATGACTGTTGTGAAGATTCCTCTCTATATGGCTCT
GCATCTCTGGATGACATGTAATCTTGCAATTCTCATTGGCAAAGACCTTCACAAGCTCCC
CCTTGCGATTATTGTCGTCCAAGGGGTGAACTTCAATAGCAAGATATAAATCAACATCAT
CGGCAGTAACAAGATAATTTGGCTTCTTTGCTCCATCAATGTAATTAACTGATCCATCTT
CCAGATGCCGCGCCCACTCAAAATTACATTTTGTCGTTCCGTGGATGGAATGACCAGAAG
CCAGAAGCTCTCGTCCC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4835Contig1 702 2 1 U
GCCTTCCAATCAACCATCACTGTAATCCCCCTCTCCGCCTCTCTGTTCCCCATAAACCCA
CCTTCAATCTCTCCCACAGAAACCCTAAAACCATTGTCTCCGCCGTCACACCCTCCACTG
AACCCTCTCCTCGATTCCCCTTCTCCGACTCGACCAAATCAATCACAACCCTCGCGATTC
TCGCCGGAATCGTAACCAAATCCCTAATTCACAAACTCTCCGCCGCGGTCGTAACCTTAT
CCCCACAGTTCCAAGCATCTCTCCGAATCTCCGGTCCGTTGTTCTTCGCGGCGGTTCGCG
ACCGTCCCGCCGGGTATCTCAACACGCCGTTGACGGTTGTCGCGGCGGGTTTATCCAAGT
GGCTTGATATCTACAGTGGTGTGCTGATGGTTAGGGTTTTGCTCAGTTGGTTCCCCAACA
TTCCTTGGGATCGTCAGCCTCTCTCCGCCATTAGAGATCTTTGTGATCCTTATCTGAATC
TCTTCAGGAACATTATCCCTCCTGTCTTTGATACCCTTGATGTTAGCCCTTTGCTTGCTT
TTGCTGTTTTGGGTACTTTGGGTTCCATTCTCAACAATAGCAGATGATAAAGCTGTCGGA
TTCATACGAATGGAGGTTTTTATTTTCTATGGCAATTAGTGAGATTCTTGTTTTCACTAT
GTACTATATTGTTGTTGGTTTTAATAATAAATTTGGACATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D427TF U 1
AF RR2D427JQ C 478
BS 1 702 RR2D427TF

RD RR2D427TF 702 0 0
GCCTTCCAATCAACCATCACTGTAATCCCCCTCTCCGCCTCTCTGTTCCCCATAAACCCA
CCTTCAATCTCTCCCACAGAAACCCTAAAACCATTGTCTCCGCCGTCACACCCTCCACTG
AACCCTCTCCTCGATTCCCCTTCTCCGACTCGACCAAATCAATCACAACCCTCGCGATTC
TCGCCGGAATCGTAACCAAATCCCTAATTCACAAACTCTCCGCCGCGGTCGTAACCTTAT
CCCCACAGTTCCAAGCATCTCTCCGAATCTCCGGTCCGTTGTTCTTCGCGGCGGTTCGCG
ACCGTCCCGCCGGGTATCTCAACACGCCGTTGACGGTTGTCGCGGCGGGTTTATCCAAGT
GGCTTGATATCTACAGTGGTGTGCTGATGGTTAGGGTTTTGCTCAGTTGGTTCCCCAACA
TTCCTTGGGATCGTCAGCCTCTCTCCGCCATTAGAGATCTTTGTGATCCTTATCTGAATC
TCTTCAGGAACATTATCCCTCCTGTCTTTGATACCCTTGATGTTAGCCCTTTGCTTGCTT
TTGCTGTTTTGGGTACTTTGGGTTCCATTCTCAACAATAGCAGATGATAAAGCTGTCGGA
TTCATACGAATGGAGGTTTTTATTTTCTATGGCAATTAGTGAGATTCTTGTTTTCACTAT
GTACTATATTGTTGTTGGTTTTAATAATAAATTTGGACATCT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2D427JQ 225 0 0
ATCTCTTCAGGAACATTATCCCTCCTGTCTTTGATACCCTTGATGTTAGCCCTTTGCTTG
CTTTTGCTGTTTTGGGTACTTTGGGTTCCATTCTCAACAATAGCAGATGATAAAGCTGTC
GGATTCATACGAATGGAGGTTTTTATTTTTTATGGCAATTAGTGAGATTCTTGTTTTCAC
TATGTACTATATTGTTGTTGGTTTTAATAATAAATTTGGACATCT

QA 1 225 1 225
DS 



AS 1 2

CO CL4836Contig1 1078 2 2 U
GGAGAGTATTCTTCTTCAGGGCTCAAATCGAAGAGCGAGCGATAGAGTGAAATTGATCAG
TAAGCTATGGACAGAGAATGGGGATCGAAGCCAGGAGGCGGAGGCGCCGCCTCGAGCCAG
AACGAGGCCATAGATCGCCGTGAGCGTCTCCGTCGTCTCGCTCTCGAAACCATAGACATA
GCGAAAGATCCCTATTTCATGCGAAACCATCTCGGAAGCTATGAGTGCAAACTGTGTCTA
ACGCTGCACAACAACGAAGGAAACTACTTGGCGCATACACAAGGTAAGAGGCATCAGACC
AACTTGGCTAAGAGAGCTGCTCGTGAGGCATCAGAAGCTCCTACTCAGCCTCAGCCTCAC
AAGCGCACTGTCTCTGTTCGCAGAACGGTGAAAATCGGTAGACCAGGTTACCGCGTTACA
AAGCAGTACGACCCTGAGCTGAAGCAAAGATCTCTTCTGTTCCAGATTGAGTATCCTGAA
ATAGAGGACAACATAAGGCCTAAACATCGTGTCATGTCTTCATTCGAGCAGAAAGTTCAA
CCTTACGACAAGAAATACCAGTATCTTCTGTTTGCAGCTGAACCATATGAAACCATAGCC
TTCAAGGTTCCAAGCACAGAAATAGACAAGTCAACCCCAAAGTTTTTCTCTCACTGGGAT
CCAGACTCAAAGATGTTTACTTTGCAGGTGTATTTCAAGCCGAACAAACCAGAACCATTC
AAGCCTCAGTCCACTATTGAATCAAATGGCCTTCTGCCACCACCACCACCACCGCCTCAA
GCTCAACCGCCACCACCTCCTCCATCTGGTTCACTTCCACCACCACCACCCCCGATGATG
ACTAATGGTAGTGGGGCCTACCCACCACCTCCGCCACCACCTTCTGGAGGTTACATGTGA
AAGTGAAACTAGGATATGCTAGAATCAAACTACAAACCGTTTGAACACAGTAGTCTTTTT
CACTGTTTATCCCAAGAGAGTGTACTAAAATATCAAAATCTGTTATGACATGGATCTTTG
AAGCTGATTTCTGCAGATGTATTAGCTATCCTGGGCGTATGTTGAAGTTCTCTGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP48TF U 1
AF RR2DP48JQ C 462
BS 1 682 RR2DP48TF
BS 683 1078 RR2DP48JQ

RD RR2DP48TF 682 0 0
GGAGAGTATTCTTCTTCAGGGCTCAAATCGAAGAGCGAGCGATAGAGTGAAATTGATCAG
TAAGCTATGGACAGAGAATGGGGATCGAAGCCAGGAGGCGGAGGCGCCGCCTCGAGCCAG
AACGAGGCCATAGATCGCCGTGAGCGTCTCCGTCGTCTCGCTCTCGAAACCATAGACATA
GCGAAAGATCCCTATTTCATGCGAAACCATCTCGGAAGCTATGAGTGCAAACTGTGTCTA
ACGCTGCACAACAACGAAGGAAACTACTTGGCGCATACACAAGGTAAGAGGCATCAGACC
AACTTGGCTAAGAGAGCTGCTCGTGAGGCATCAGAAGCTCCTACTCAGCCTCAGCCTCAC
AAGCGCACTGTCTCTGTTCGCAGAACGGTGAAAATCGGTAGACCAGGTTACCGCGTTACA
AAGCAGTACGACCCTGAGCTGAAGCAAAGATCTCTTCTGTTCCAGATTGAGTATCCTGAA
ATAGAGGACAACATAAGGCCTAAACATCGTGTCATGTCTTCATTCGAGCAGAAAGTTCAA
CCTTACGACAAGAAATACCAGTATCTTCTGTTTGCAGCTGAACCATATGAAACCATAGCC
TTCAAGGTTCCAAGCACAGAAATAGACAAGTCAACCCCAAAGTTTTTCTCTCACTGGGAT
CCAGACTCAAAGATGTTTACTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2DP48JQ 617 0 0
CCAGATTGAGTATCCTGAAATAGAGGACAACATAAGGCCTAAACATCGTGTCATGTCTTC
ATTCGAGCAGAAAGTTCAACCTTACGACAAGAAATACCAGTATCTTCTGTTTGCAGCTGA
ACCATATGAAACCATAGCCTTCAAGGTTCCAAGCACAGAAATAGACAAGTCAACCCCAAA
GTTTTTCTCTCACTGGGATCCAGACTCAAAGATGTTTACTTTGCAGGTGTATTTCAAGCC
GAACAAACCAGAACCATTCAAGCCTCAGTCCACTATTGAATCAAATGGCCTTCTGCCACC
ACCACCACCACCGCCTCAAGCTCAACCGCCACCACCTCCTCCATCTGGTTCACTTCCACC
ACCACCACCCCCGATGATGACTAATGGTAGTGGGGCCTACCCACCACCTCCGCCACCACC
TTCTGGAGGTTACATGTGAAAGTGAAACTAGGATATGCTAGAATCAAACTACAAACCGTT
TGAACACAGTAGTCTTTTTCACTGTTTATCCCAAGAGAGTGTACTAAAATATCAAAATCT
GTTATGACATGGATCTTTGAAGCTGATTTCTGCAGATGTATTAGCTATCCTGGGCGTATG
TTGAAGTTCTCTGTTAT

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL4837Contig1 982 2 4 U
GGGAGAAAAAAAAATCTGCTTGAAGCTTCGTCCTTTTTGCTTGTGGGGGAAATCGCCTGG
GTGGATTCTTTTCTCTCCCAGACGATTTTGCGTTGGCAAAAATCCAGAGTATCTCAATCA
ACACCGCCGAGTCAACTCGGTCCACCAAGCCATGAATCGGCTGAGAGGGCGAGGGGCATG
GATTCTAGGTTCGGCAGCTATGCCTCATCTTAAGAAGAGAGCCCAGAACTCATTGGTCGC
TATCCAAGACTCCTATCTCTCCACCAAGGATTTGCTCGAGAGGCAGAGGGTCGTGTTTAC
AGTTGCAACTTCTGTTGCATCTGTCGCTACCGCTTGGATTGGTTATTCATTACGACACTA
CAATGAAACTAGGATCGATCAGAGGCTGGAATCGATTGAGAATGCGATGAAACACACCCA
TGAATTGGAACGAGGAGAACTCAAGGAGCTTGTTGATCCAGTGGGTTCCAGATTCACTTC
AACAATTGCCACCGCTGAAACCACTTTGATCATCGGGTATGGGTTGGGGTGGCGCGGAGG
GATATGGTATGCAAACAGGAAGTTTAAAAGAGAACAAATGAGATTGGCTGGTCAGTTAAA
ACCGAGGGAGTGGAAGTTATTGTTGGGGAGAATAAAACCCCGAGCTTGGCCTACCTCGAG
GCTCCTCAGACGACCGTTCCCAAGGCAGAACAAAACAACCACAGAAAATGCTTTGAAGAC
ACCACCTGAGAATGCTGCTTGAAAGAACCAGAAAACTGGTCTGGGGAGAAACAATTCAAA
AGCAATAGCTAATCGGAACAAAGAACGATTATTTTTCTTTTTACACTCTCTGTAGATTCT
TGACATTAATCTAAAGTCTACACATCGGTTTTGTCATGAAGCCAAAAAGCTGTTCCTCTT
TGTTCCTCGTAATTGATCAAGTTCAAATACTGTTGTATGTATCTTTTATCTTCTTCTTGA
GACAATACTAATTGCTTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL48TF U 1
AF RR2EL48JQ C 407
BS 1 497 RR2EL48TF
BS 498 498 RR2EL48JQ
BS 499 633 RR2EL48TF
BS 634 982 RR2EL48JQ

RD RR2EL48TF 633 0 0
GGGAGAAAAAAAAATCTGCTTGAAGCTTCGTCCTTTTTGCTTGTGGGGGAAATCGCCTGG
GTGGATTCTTTTCTCTCCCAGACGATTTTGCGTTGGCAAAAATCCAGAGTATCTCAATCA
ACACCGCCGAGTCAACTCGGTCCACCAAGCCATGAATCGGCTGAGAGGGCGAGGGGCATG
GATTCTAGGTTCGGCAGCTATGCCTCATCTTAAGAAGAGAGCCCAGAACTCATTGGTCGC
TATCCAAGACTCCTATCTCTCCACCAAGGATTTGCTCGAGAGGCAGAGGGTCGTGTTTAC
AGTTGCAACTTCTGTTGCATCTGTCGCTACCGCTTGGATTGGTTATTCATTACGACACTA
CAATGAAACTAGGATCGATCAGAGGCTGGAATCGATTGAGAATGCGATGAAACACACCCA
TGAATTGGAACGAGGAGAACTCAAGGAGCTTGTTGATCCAGTGGGTTCCAGATTCACTTC
AACAATTGCCACCGCTGGAACCACTTTGATCATCGGGTATGGGTTGGGGTGGCGCGGAGG
GATATGGTATGCAAACAGGAAGTTTAAAAGAGAACAAATGAGATTGGCTGGTCAGTTAAA
ACCGAGGGAGTGGAAGTTATTGTTGGGGAGAAT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2EL48JQ 576 0 0
ATGAAACACACCCATGAATTGGAACGAGGAGAACTCAAGGAGCTTGTTGATCCAGTGGGT
TCCAGATTCACTTCAACAATTGCCACCGCTGAAACCACTTTGATCATCGGGTATGGGTTG
GGGTGGCGCGGAGGGATATGGTATGCAAACAGGAAGTTTAAAAGAGAACAAATGAGATTG
GCTGGTCAGTTAAAACCGAGGGAGTGGAAGTTATTGTTGGGGAGAATAAAACCCCGAGCT
TGGCCTACCTCGAGGCTCCTCAGACGACCGTTCCCAAGGCAGAACAAAACAACCACAGAA
AATGCTTTGAAGACACCACCTGAGAATGCTGCTTGAAAGAACCAGAAAACTGGTCTGGGG
AGAAACAATTCAAAAGCAATAGCTAATCGGAACAAAGAACGATTATTTTTCTTTTTACAC
TCTCTGTAGATTCTTGACATTAATCTAAAGTCTACACATCGGTTTTGTCATGAAGCCAAA
AAGCTGTTCCTCTTTGTTCCTCGTAATTGATCAAGTTCAAATACTGTTGTATGTATCTTT
TATCTTCTTCTTGAGACAATACTAATTGCTTTTGAC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

CO CL4838Contig1 968 2 4 U
GGAAATCAAATCAAAAGAGAGGTTAATGGAGCGATCAAGCGATCCCCATCACTCCACCGC
CGATCTTCTCTCTTGGTCCCAGATCCACCACTCCTCCGCCGCTAATCCCTCCAACCAGAA
TTCTGATGACATCGGCGACGTCCTTGGCGGTGGTGGTAGAACCACCAACAAAGAAGCCGA
ATCGCTTAACAAGAATGTATCATACAGGAAGAACTGTTCTGGTCACAAGCTAAAAGAAAT
GACTGGTAGCGATATCTTCTCTGATAATGGTAACGTTACTAACAACGCTTATCCAAGCCA
CACTTCAAGAATCCATTACCATCATGATCAGGATAGTCAGATATCTTTCAGCGGCGAAGA
GAACGCTGCTGTGACGACTCCTAAGAAACCTACAAACTCTTCTGCTAAGCAGCTTAAGGA
GTTGGGCAGGTCTGTAGAAACTCAGGCTGACTCCACGAGGAAAAAGAAGCAGAGCAAAGC
AATCACCTTTGCCTCTCCTTCTCCTCCTGCAATAAAACAACAAGTTAAAGGAAACAACAT
GGAGGAATCTGCTAAAGCCTCCAATGTTAAAGGGCAAAGCCGTAACGGTGAAGAACATGT
TGTGAAGTCATCAAGGAAGGGACACAACAACCCCAAGTTTCAGCAACTCACCAGCAACGG
TATCTTCAAGTCTGATAAGATACCTCCTGGTTATTCGGAGAAGATGCATAGCTCAGCTAA
ATCGCGGGAAATGAGGGGAAACAATATATTTGCAGACGGCAAGTCTGAGTATAGGGATTA
CTATGGTGGCGCCAGGAGGCCTCCGGGTGGTGAGAGCAGCATTTCGTTGGTCTAAAAATG
AGTTCCAAGTTCTAGGTTTCGTAGGGGTCTAGTTTTCCTAAAGATGTTGTGACCAAAGTG
GTTTGTGTTCGTGTGGTGTCTCGACTATGGTCTCATTTTATAATATAAAACGTACGGCTT
TTGTAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR71TF U 1
AF RR2GR71JQ C 510
BS 1 701 RR2GR71TF
BS 702 702 RR2GR71JQ
BS 703 737 RR2GR71TF
BS 738 968 RR2GR71JQ

RD RR2GR71TF 739 0 0
GGAAATCAAATCAAAAGAGAGGTTAATGGAGCGATCAAGCGATCCCCATCACTCCACCGC
CGATCTTCTCTCTTGGTCCCAGATCCACCACTCCTCCGCCGCTAATCCCTCCAACCAGAA
TTCTGATGACATCGGCGACGTCCTTGGCGGTGGTGGTAGAACCACCAACAAAGAAGCCGA
ATCGCTTAACAAGAATGTATCATACAGGAAGAACTGTTCTGGTCACAAGCTAAAAGAAAT
GACTGGTAGCGATATCTTCTCTGATAATGGTAACGTTACTAACAACGCTTATCCAAGCCA
CACTTCAAGAATCCATTACCATCATGATCAGGATAGTCAGATATCTTTCAGCGGCGAAGA
GAACGCTGCTGTGACGACTCCTAAGAAACCTACAAACTCTTCTGCTAAGCAGCTTAAGGA
GTTGGGCAGGTCTGTAGAAACTCAGGCTGACTCCACGAGGAAAAAGAAGCAGAGCAAAGC
AATCACCTTTGCCTCTCCTTCTCCTCCTGCAATAAAACAACAAGTTAAAGGAAACAACAT
GGAGGAATCTGCTAAAGCCTCCAATGTTAAAGGGCAAAGCCGTAACGGTGAAGAACATGT
TGTGAAGTCATCAAGGAAGGGACACAACAACCCCAAGTTTCAGCAACTCACCAGCAACGG
TATCTTCAAGTCTGATAAGATACCTCCTGGTTATTCGGAGA*GATGCATAGCTCAGCTAA
ATCGCGGGAAATGAGGG
AA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2GR71JQ 459 0 0
CAATAAAACAACAAGTTAAAGGAAACAACATGGAGGAATCTGCTAAAGCCTCCAATGTTA
AAGGGCAAAGCCGTAACGGTGAAGAACATGTTGTGAAGTCATCAAGGAAGGGACACAACA
ACCCCAAGTTTCAGCAACTCACCAGCAACGGTATCTTCAAGTCTGATAAGATACCTCCTG
GTTATTCGGAGAAGATGCATAGCTCAGCTAAATCGCGGGAAATGAGGGGAAACAATATAT
TTGCAGACGGCAAGTCTGAGTATAGGGATTACTATGGTGGCGCCAGGAGGCCTCCGGGTG
GTGAGAGCAGCATTTCGTTGGTCTAAAAATGAGTTCCAAGTTCTAGGTTTCGTAGGGGTC
TAGTTTTCCTAAAGATGTTGTGACCAAAGTGGTTTGTGTTCGTGTGGTGTCTCGACTATG
GTCTCATTTTATAATATAAAACGTACGGCTTTTGTAGTT

QA 1 459 1 459
DS 



AS 1 2

CO CL4839Contig1 1301 2 2 U
GGGGGTGCCGTTCTCTGACTCTCTCCGTTAGCACAATGTCCAGGTCGATAGAGATGCCAC
GCGCTCGTTTTACCCAAAGATACGCAGCGGCCAACGTGGGTGTATTCTGGGACATCACTG
ATTTCCCCATTCCCGATTATCTTGATTCATATGCCTTTTATGAAGATGTGAAAACAAATC
TTCGGGAAAAGGGTTTTGTTGGTAGCTTTTCATTACAGCTATACGCAGATGGCGACCCCT
ACATGCCTGCCAGATTGGTAAACCGATTTCAGTGTCCCGAACTTGGAGTCAGTTACATAC
CTTCAGGTGGTGAATTTTGTAGAGATTCTTTGATCTTGTTAGACATCCTTAAGTGGTCAA
TTCAGAATCCATCTTCAAATGTCATGATTCTTGCCAAGAATTTCAAAGAAGAAGCGGCAG
TCAAGATTTCCTACCTGGGTAATAGTCACAACCTCTTCTTAGCGTATGATCTTCGTACCG
AAAGCCCTGAATGGCTTTGTTCTTTCTCTATGAGACCTCGAAGTGCACATCTGATGAAAT
CCAGTTTCATGCCGACGAAGACGAAGATCGAATTCGACTCTTTTCTCTCCCTTTTCAGGA
AATTTGACACCTCTTTCCGTTTTTTTCCCAAGGCCATACAGACTTCACACAAAGGTCGTC
GTACACAAGTCTTCTGGGATGTCTCAGATTCCTCAAAACTTGAAGTTTTGGATCCCCGAG
GGGTTGCTGCCCATATCAGTGGAGCGCTTGTTGGTAATGGTTACTCTCTTCCTCTTTGTA
GTACTCTCGTCTACATTGACGAGAATACCGTCTTACCTGATACCTTATCAAGATATGTCC
ATGCTAATCTAATTTTGCATCCAGTCCCCAACAGAAACAAGTTTGCTAGAATGCATAGTA
TTGCACTGGACTTGCTTTTCCATGCAAAGACTTGTAGTAAACCATCAACTTTTTTTTTAC
TCTCAGAAGACATCGATGAGGATCCTCTGTTCTCAACAGTTCTTGATTTCCTGCAAAGGG
GTTTGCAATCACGCCTTCCACTTCCACTGCATCAGCAGATGGCTAAAGACTCGTCAAGTT
TGCCCTTTGGATAACAGTGAGTGGGAGTTCCAGAAATATGGTCACTAATCCTCCCATCAA
TATATAAGAAAGATATCATGTTCACTTCGCTGCGGCATATGACATACTCAAACTTCTTGT
TTTCCTTTTCTGTTTTTTCCCCTTGCTGTGTGTGATTTACTTTCACTGAATCTATTATTC
TTTTTACTTCGGTAATGTCTTTAAAAATTTTAAAATTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ58TF U 1
AF RR2BJ58JQ C 676
BS 1 897 RR2BJ58TF
BS 898 1301 RR2BJ58JQ

RD RR2BJ58TF 897 0 0
GGGGGTGCCGTTCTCTGACTCTCTCCGTTAGCACAATGTCCAGGTCGATAGAGATGCCAC
GCGCTCGTTTTACCCAAAGATACGCAGCGGCCAACGTGGGTGTATTCTGGGACATCACTG
ATTTCCCCATTCCCGATTATCTTGATTCATATGCCTTTTATGAAGATGTGAAAACAAATC
TTCGGGAAAAGGGTTTTGTTGGTAGCTTTTCATTACAGCTATACGCAGATGGCGACCCCT
ACATGCCTGCCAGATTGGTAAACCGATTTCAGTGTCCCGAACTTGGAGTCAGTTACATAC
CTTCAGGTGGTGAATTTTGTAGAGATTCTTTGATCTTGTTAGACATCCTTAAGTGGTCAA
TTCAGAATCCATCTTCAAATGTCATGATTCTTGCCAAGAATTTCAAAGAAGAAGCGGCAG
TCAAGATTTCCTACCTGGGTAATAGTCACAACCTCTTCTTAGCGTATGATCTTCGTACCG
AAAGCCCTGAATGGCTTTGTTCTTTCTCTATGAGACCTCGAAGTGCACATCTGATGAAAT
CCAGTTTCATGCCGACGAAGACGAAGATCGAATTCGACTCTTTTCTCTCCCTTTTCAGGA
AATTTGACACCTCTTTCCGTTTTTTTCCCAAGGCCATACAGACTTCACACAAAGGTCGTC
GTACACAAGTCTTCTGGGATGTCTCAGATTCCTCAAAACTTGAAGTTTTGGATCCCCGAG
GGGTTGCTGCCCATATCAGTGGAGCGCTTGTTGGTAATGGTTACTCTCTTCCTCTTTGTA
GTACTCTCGTCTACATTGACGAGAATACCGTCTTACCTGATACCTTATCAAGATATGTCC
ATGCTAATCTAATTTTGCATCCAGTCCCCAACAGAAACAAGTTTGCTAGAATGCATA

QA 1 897 1 897
DS 

RD RR2BJ58JQ 626 0 0
GGGATGTCTCAGATTCCTCAAAACTTGAAGTTTTGGATCCCCGAGGGGTTGCTGCCCATA
TCAGTGGAGCGCTTGTTGGTAATGGTTACTCTCTTCCTCTTTGTAGTACTCTCGTCTACA
TTGACGAGAATACCGTCTTACCTGATACCTTATCAAGATATGTCCATGCTAATCTAATTT
TGCATCCAGTCCCCAACAGAAACAAGTTTGCTAGAATGCATAGTATTGCACTGGACTTGC
TTTTCCATGCAAAGACTTGTAGTAAACCATCAACTTTTTTTTTACTCTCAGAAGACATCG
ATGAGGATCCTCTGTTCTCAACAGTTCTTGATTTCCTGCAAAGGGGTTTGCAATCACGCC
TTCCACTTCCACTGCATCAGCAGATGGCTAAAGACTCGTCAAGTTTGCCCTTTGGATAAC
AGTGAGTGGGAGTTCCAGAAATATGGTCACTAATCCTCCCATCAATATATAAGAAAGATA
TCATGTTCACTTCGCTGCGGCATATGACATACTCAAACTTCTTGTTTTCCTTTTCTGTTT
TTTCCCCTTGCTGTGTGTGATTTACTTTCACTGAATCTATTATTCTTTTTACTTCGGTAA
TGTCTTTAAAAATTTTAAAATTATGT

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL4840Contig1 766 2 1 U
GGCTCTATTGATGACATGATACAGATCTTCAATGATAAGGTTCTTGTATTTCGTGTAAGG
AGATGCATACGCACTGCCATGAAACTTCGTAGGAAGTACATGTATAAGAGTCAGGTAATC
AAGACCAAGAGCCACACTAACCAGGTTCAGATTGAGCATCAAACCCATATGGAGAGCCAG
AACCATGAAGAAGAGACTCAAAGACATGGTGAGAACCAGGGCCAAACAAAGAGTTCTTCG
CATCATAGTCCTGCCTCTCAGAATGGTGACTAAGTCAGATTCTACGTATAAACAACAGTA
TAATAAGATAAAACTAAAACGAAGAAGAAGAAGTAGCTTAGACAACAAGTAGGTCATCTT
TTGATAGTGAGTTTCGAGGAAGAGGTTTGTGTCGAAGACGACATGTTTGACAACTTTTTT
GAGCTACCAGGAAGGAAGGAATAGGCAAGAAGAGACTGAGGAGCTTGTGAGACATTAAAT
GGCTTGTCACTACACAAACTGAGAGAGTCTTAAGACTCTCATGAACCAAAGAGGTTAGAC
ACAAATAAAAAATATTATTTTCTCTTTCGTGCGTGCGGGAACAATTTTGACTGCATACAC
TTTATACTTATGTGAATACCAGTAAAAAAAATCTACTTTTTAGAAATAGACACACAAAGA
AGAATCAATCTCTGTTGGTGTTAGCTATAGAGAAGCCTTTTTCACGGCGATCACAATGTA
ATAAATGACGACATAAATCAATATCATAAACATAGAGTTTTCAACC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ER37TF U 1
AF RR2ER37JQ C 2
BS 1 766 RR2ER37TF

RD RR2ER37TF 766 0 0
GGCTCTATTGATGACATGATACAGATCTTCAATGATAAGGTTCTTGTATTTCGTGTAAGG
AGATGCATACGCACTGCCATGAAACTTCGTAGGAAGTACATGTATAAGAGTCAGGTAATC
AAGACCAAGAGCCACACTAACCAGGTTCAGATTGAGCATCAAACCCATATGGAGAGCCAG
AACCATGAAGAAGAGACTCAAAGACATGGTGAGAACCAGGGCCAAACAAAGAGTTCTTCG
CATCATAGTCCTGCCTCTCAGAATGGTGACTAAGTCAGATTCTACGTATAAACAACAGTA
TAATAAGATAAAACTAAAACGAAGAAGAAGAAGTAGCTTAGACAACAAGTAGGTCATCTT
TTGATAGTGAGTTTCGAGGAAGAGGTTTGTGTCGAAGACGACATGTTTGACAACTTTTTT
GAGCTACCAGGAAGGAAGGAATAGGCAAGAAGAGACTGAGGAGCTTGTGAGACATTAAAT
GGCTTGTCACTACACAAACTGAGAGAGTCTTAAGACTCTCATGAACCAAAGAGGTTAGAC
ACAAATAAAAAATATTATTTTCTCTTTCGTGCGTGCGGGAACAATTTTGACTGCATACAC
TTTATACTTATGTGAATACCAGTAAAAAAAATCTACTTTTTAGAAATAGACACACAAAGA
AGAATCAATCTCTGTTGGTGTTAGCTATAGAGAAGCCTTTTTCACGGCGATCACAATGTA
ATAAATGACGACATAAATCAATATCATAAACATAGAGTTTTCAACC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2ER37JQ 765 0 0
GCTCTATTGATGACATGATACAGATCTTCAATGATAAGGTTCTTGTATTTCGTGTAAGGA
GATGCATACGCACTGCCATGAAACTTCGTAGGAAGTACATGTATAAGAGTCAGGTAATCA
AGACCAAGAGCCACACTAACCAGGTTCAGATTGAGCATCAAACCCATATGGAGAGCCAGA
ACCATGAAGAAGAGACTCAAAGACATGGTGAGAACCAGGGCCAAACAAAGAGTTCTTCGC
ATCATAGTCCTGCCTCTCAGAATGGTGACTAAGTCAGATTCTACGTATAAACAACAGTAT
AATAAGATAAAACTAAAACGAAGAAGAAGAAGTAGCTTAGACAACAAGTAGGTCATCTTT
TGATAGTGAGTTTCGAGGAAGAGGTTTGTGTCGAAGACGACATGTTTGACAACTTTTTTG
AGCTACCAGGAAGGAAGGAATAGGCAAGAAGAGACTGAGGAGCTTGTGAGACATTAAATG
GCTTGTCACTACACAAACTGAGAGAGTCTTAAGACTCTCATGAACCAAAGAGGTTAGACA
CAAATAAAAAATATTATTTTTTCTTTCGTGCGTGCGGGAACAATTTTGACTGCATACACT
TTATACTTATGTGAATACCAGTAAAAAAAATCTACTTTTTAGAAATAGACACACAAAGAA
GAATCAATCTCTGTTGGTGTTAGCTATAGAGAAGCCTTTTTCACGGCGATCACAATGTAA
TAAATGACGACATAAATCAATATCATAAACATAGAGTTTTCAACC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL4841Contig1 1344 2 2 U
GGTCAATGGATTATACAAAGGGGGGTTTGGCATATTGACGACTGTTTGCTCTTTGTATTG
CCGTGGACTCCAGAGGGTTCATTCAAAATCCCAGCAATATCAACACTCCCAGTATGGGTG
ACTTTGAAGGATATCCCAGATTGCTGCTACTCTAGACTAGGTATTAGTCATGTTGCATCT
GGTCTTGGAGAGCCTATCTTAACGCAAAAACCTCGTCTTGATCCTTCCAACATGGGGGAA
ACAAAGGTATTGGTGGAAATGGAATTGGATAAGGACTTCCCGAAGCTTATAGCCCTTGAC
GATAAGCAGGGCAATATCTTTCTGGTTAAGGTTGAGTATACTTGGATACCGTCAACATGT
GAGAGGTGTGGGTGCTTAGGACACAAATCTAAAAGATGCTTACAGCCTCCTAAGGCTCCA
GAGGATAAAACCTTGTCATCGAAGTCAGTGGCTTCTAGTGTTGAGGTTCCTGTGGTGGAT
ATCGACATCATTCTTCACCAAAATGAGAGTGCTGCCCCATCTCTTTCACCATTTGACCCA
AAGGAACTCACTGGTGAAGAGACACTACCTGATACTACCTCGGCACACGAGGCTCCAATG
ATACGGAATCAGTTCAATGCTCTGGATGTTATTGATGTCAGTTCTGAAGTGGAAGAAAAA
ACCACTGAAAAAGCTGTTACAAACTCAGATTTTGGTTTGGCACAAGACCAAGACACACCA
TTTGTTGCATCAAATGTTTCTGTGGAAAGCCGAGGAAATATTGTATCAGCGCAAAGTACT
ATCTCATCCTCAAGGAATCAAAAAGATATTCAAACTTCCCAGCCAAGCTTTATCACTTCT
ACGCCCATATTAGCAGATTTTCAATCCGCTCCAGCTGTAACACTTTTTATGGAGTCTCCT
CCATCACACAAAATTATTAGCAATGAAGTTGAAAGAACTTCAGTTGTTAATCCCTCAACC
ACACCATCTAATGTTATTGAATTCAAGAGTCCTTCTTGTTTTTCAGCTCTAGGTGTTGTG
GATGAAGCTGAGATCGAGTCAACGAGCTCGCTTGGCTTGACAAGAGGTGGGAGAGAGAGT
AAACCTCCTATCAAATTCCAAGACTTGGAATGGACAATACAAGGAAGAGGGAAGCATGGT
CACCGTGGTCGTGGTCGTGGTCCTAAACACTAGCTATTGTCTACTATTTCATCATTGGTT
TTTTCTAGTTTCTACCTAAGTTGTTTCATAGGTATGAAATGTCATCTATCATGAAATATT
CATGCAAGCTTTTTCTCGCTATAGGATTTCACCATCCTATCTTGTAAACTTTTAATGTTC
TTTTTAATTTGAAAGCCCTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B338TF U 1
AF RR2B338JQ C 573
BS 1 794 RR2B338TF
BS 795 1344 RR2B338JQ

RD RR2B338TF 797 0 0
GGTCAATGGATTATACAAAGGGGGGTTTGGCATATTGACGACTGTTTGCTCTTTGTATTG
CCGTGGACTCCAGAGGGTTCATTCAAAATCCCAGCAATATCAACACTCCCAGTATGGGTG
ACTTTGAAGGATATCCCAGATTGCTGCTACTCTAGACTAGGTATTAGTCATGTTGCATCT
GGTCTTGGAGAGCCTATCTTAACGCAAAAACCTCGTCTTGATCCTTCCAACATGGGGGAA
ACAAAGGTATTGGTGGAAATGGAATTGGATAAGGACTTCCCGAAGCTTATAGCCCTTGAC
GATAAGCAGGGCAATATCTTTCTGGTTAAGGTTGAGTATACTTGGATACCGTCAACATGT
GAGAGGTGTGGGTGCTTAGGACACAAATCTAAAAGATGCTTACAGCCTCCTAAGGCTCCA
GAGGATAAAACCTTGTCATCGAAGTCAGTGGCTTCTAGTGTTGAGGTTCCTGTGGTGGAT
ATCGACATCATTCTTCACCAAAATGAGAGTGCTGCCCCATCTCTTTCACCATTTGACCCA
AAGGAACTCACTGGTGAAGAGACACTACCTGATACTACCTCGGCACACGAGGCTCCAATG
ATACGGAATCAGTTCAATGCTCTGGATGTTATTGATGTCAGTTCTGAAGTGGAAGAAAAA
ACCACTGAAAAAGCTGTTACAAACTCAGATTTTGGTTTGGCACAAGACCAAGACACACCA
TTTGTTGCATCAAATGTTTCTGTGGAAAGCCGAGGAAATATTGTATCAGCGCAAAGTACT
ATCTCATCCTCAAG
AAT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2B338JQ 772 0 0
TACTACCTCGGCACACGAGGCTCCAATGATACGGAATCAGTTCAATGCTCTGGATGTTAT
TGATGTCAGTTCTGAAGTGGAAGAAAAAACCACTGAAAAAGCTGTTACAAACTCAGATTT
TGGTTTGGCACAAGACCAAGACACACCATTTGTTGCATCAAATGTTTCTGTGGAAAGCCG
AGGAAATATTGTATCAGCGCAAAGTACTATCTCATCCTCAAGGAATCAAAAAGATATTCA
AACTTCCCAGCCAAGCTTTATCACTTCTACGCCCATATTAGCAGATTTTCAATCCGCTCC
AGCTGTAACACTTTTTATGGAGTCTCCTCCATCACACAAAATTATTAGCAATGAAGTTGA
AAGAACTTCAGTTGTTAATCCCTCAACCACACCATCTAATGTTATTGAATTCAAGAGTCC
TTCTTGTTTTTCAGCTCTAGGTGTTGTGGATGAAGCTGAGATCGAGTCAACGAGCTCGCT
TGGCTTGACAAGAGGTGGGAGAGAGAGTAAACCTCCTATCAAATTCCAAGACTTGGAATG
GACAATACAAGGAAGAGGGAAGCATGGTCACCGTGGTCGTGGTCGTGGTCCTAAACACTA
GCTATTGTCTACTATTTCATCATTGGTTTTTTCTAGTTTCTACCTAAGTTGTTTCATAGG
TATGAAATGTCATCTATCATGAAATATTCATGCAAGCTTTTTCTCGCTATAGGATTTCAC
CATCCTATCTTGTAAACTTTTAATGTTCTTTTTAATTTGAAAGCCCTTTCTC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL4842Contig1 933 2 4 U
GGTTGGAAGCCATAGCTCTTGGTAAGCCTGTTGTTACACCTCTATGGCTGGAGAGCTGTG
GACAAACAAGATGCCTGTTAGATGAGAAGAATTACATCTTAAAAGATAGCAAAAAGGAAA
AGGAAGGGTTTTCCATGCGTACATCTTTGGCCCGTGCAAAGCAGCATCCCCTTCTTAAGG
GATTAAAAGTCTGCATAACTCCCAACATTAAACCGGGCAGGGGTATGATTTCTCACTTAG
TGAAGTTGACTCAAGGGCAGGTAGTGGAGATAAGTGAAATAATTGCTGCAGCGAATAGAA
AAATTCCAGATGATCTATTGATTATTTCTTGCGAAGACGATAGAGATTTATGTCTTCCTT
TCATTGATCAAGGAGCTGAAATCTACACCGCAGAGCTTTTGCTGAATGGAATCGTGATTC
AGAAACTGGAATATGACAGGCATTGTCTCTTCTAAATTGCTTGCAAAAGGAAACACAAAG
TTTGCAGCAACACATACGGATCTACTCGTTGGTGCAAGCAGTGAATGAAAGCCATTTTAT
CAAAATCTTTCATGAATCTGACTGTTTGTTATAATAGATCTTTCATCATTCTATGGAAAT
AAGAATAGTACATAAAATTATGCAATTAACGTACACTACATCTCGACCTCTCCACACGGA
TTAGATTAGAAAAGGGAATTCAGCACCAGGGTTCGGATTGTTGAAGCCAACACTTGGTGG
AGCAGCAGTTGGATTTGTATGATAAGGAGGAGGAGGAGGAAGTCCAGTGTAATTGGGAGG
TGGCGCACCACCTTGACCTGGTATTGGAGCCAATCCTGGTGGCCTAAGAATACCATTTTG
TGGAGGTGGTGGTGGTAGAGGACCACCAGGTGGTGCCATCATCTGTGGTACTCCTGGAGG
AGGCATGTAACCTGTAAAGGTACAAAATTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C643TF U 1
AF RR2C643JQ C 471
BS 1 677 RR2C643TF
BS 678 679 RR2C643JQ
BS 680 705 RR2C643TF
BS 706 933 RR2C643JQ

RD RR2C643TF 705 0 0
GGTTGGAAGCCATAGCTCTTGGTAAGCCTGTTGTTACACCTCTATGGCTGGAGAGCTGTG
GACAAACAAGATGCCTGTTAGATGAGAAGAATTACATCTTAAAAGATAGCAAAAAGGAAA
AGGAAGGGTTTTCCATGCGTACATCTTTGGCCCGTGCAAAGCAGCATCCCCTTCTTAAGG
GATTAAAAGTCTGCATAACTCCCAACATTAAACCGGGCAGGGGTATGATTTCTCACTTAG
TGAAGTTGACTCAAGGGCAGGTAGTGGAGATAAGTGAAATAATTGCTGCAGCGAATAGAA
AAATTCCAGATGATCTATTGATTATTTCTTGCGAAGACGATAGAGATTTATGTCTTCCTT
TCATTGATCAAGGAGCTGAAATCTACACCGCAGAGCTTTTGCTGAATGGAATCGTGATTC
AGAAACTGGAATATGACAGGCATTGTCTCTTCTAAATTGCTTGCAAAAGGAAACACAAAG
TTTGCAGCAACACATACGGATCTACTCGTTGGTGCAAGCAGTGAATGAAAGCCATTTTAT
CAAAATCTTTCATGAATCTGACTGTTTGTTATAATAGATCTTTCATCATTCTATGGAAAT
AAGAATAGTACATAAAATTATGCAATTAACGTACACTACATCTCGACCTCTCCACACGGA
TTAGATTAGAAAAGGGA**TCAGCACCAGGGTTCGGATTGTTGAA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2C643JQ 463 0 0
AAACACAAAGTTTGCAGCAACACATACGGATTTACTCGTTGGTGCAAGCAGTGAATGAAA
GCCATTTTATCAAAATCTTTCATGAATCTGACTGTTTGTTATAATAGATCTTTCATCATT
CTATGGAAATAAGAATAGTACATAAAATTATGCAATTAACGTACACTACATCTCGACCTC
TCCACACGGATTAGATTAGAAAAGGGGATTCAGCACCAGGGTTCGGATTGTTGAAGCCAA
CACTTGGTGGAGCAGCAGTTGGATTTGTATGATAAGGAGGAGGAGGAGGAAGTCCAGTGT
AATTGGGAGGTGGCGCACCACCTTGACCTGGTATTGGAGCCAATCCTGGTGGCCTAAGAA
TACCATTTTGTGGAGGTGGTGGTGGTAGAGGACCACCAGGTGGTGCCATCATCTGTGGTA
CTCCTGGAGGAGGCATGTAACCTGTAAAGGTACAAAATTACAT

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 2

CO CL4843Contig1 670 2 2 U
TTTTTTTTCGGTGGTGAACCATTTATTTTGGAAGGTGAAACTTTTATCGTCACTCGCATA
AACGAACGCAATGTAAAAAAAAAAGACGAGAGCAACGTAACTGTTTTTCTAACAACAGAA
CACCAAATCTGACAAGTTATATCACACACTCTGAACCCAAACTATAAGTCAGAACATCAA
ATCCTCCTCGTCTCCTAATCGTCTTCTCTCTCTGGAGGAAGGCCGCACGGTAACAGCATT
TTCTGCATGAAGTTGTAGCGTTCGCGGCCAATGGACTCGTTCTCAGCGATAGCAAAGTAA
GCAAGCATTGGGTAGTGGCCAATGTATGAAGCATAGCTATCACGCTGAATGTTCACTGCC
CACTCAAATCTGCTCAAATCAGCATGACCAGTTCCAACGTATTTAGCTTGAAGATGCTCG
AGCTGAGAATTGATGTTAAACCTATCACTTGCCTGCACACACACACACAAGAAAAAAACA
ATCTTTCAAAGAAAGTGTGGATGTATCCTTAGAGGATCTCATAACGAAAGCCTTAAGGTA
AAGGAAGCTGTTCCCAATTTCAAAGAAAGCTACGCTTAAGAAACTAATAGTAGATGAAGC
TAATAATACTAAGGAGATGAGAGGCTAAAGAGTGATGCGAAAGTTAGGGTTTCCGATCCA
GAAAGCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EK35TF C 1
AF RR2EK35JQ U 9
BS 1 8 RR2EK35TF
BS 9 670 RR2EK35JQ

RD RR2EK35TF 670 0 0
TTTTTTTTCGGTGGTGAACCATTTATTTTGGAAGGTGAAACTTTTATCGTCACTCGCATA
AACGAACGCAATGTAAAAAAAAAAGACGAGAGCAACGTAACTGTTTTTCTAACAACAGAA
CACCAAATCTGACAAGTTATATCACACACTCTGAACCCAAACTATAAGTCAGAACATCAA
ATCCTCCTCGTCTCCTAATCGTCTTCTCTCTCTGGAGGAAGGCCGCACGGTAACAGCATT
TTCTGCATGAAGTTGTAGCGTTCGCGGCCAATGGACTCGTTCTCAGCGATAGCAAAGTAA
GCAAGCATTGGGTAGTGGCCAATGTATGAAGCATAGCTATCACGCTGAATGTTCACTGCC
CACTCAAATCTGCTCAAATCAGCATGACCAGTTCCAACGTATTTAGCTTGAAGATGCTCG
AGCTGAGAATTGATGTTAAACCTATCACTTGCCTGCACACACACACACAAGAAAAAAACA
ATCTTTCAAAGAAAGTGTGGATGTATCCTTAGAGGATCTCATAACGAAAGCCTTAAGGTA
AAGGAAGCTGTTCCCAATTTCAAAGAAAGCTACGCTTAAGAAACTAATAGTAGATGAAGC
TAATAATACTAAGGAGATGAGAGGCTAAAGAGTGATGCGAAAGTTAGGGTTTCCGATCCA
GAAAGCGTCC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2EK35JQ 662 0 0
CGGTGGTGAACCATTTATTTTGGAAGGTGAAACTTTTATCGTCACTCGCATAAACGAACG
CAATGTAAAAAAAAAAGACGAGAGCAACGTAACTGTTTTTCTAACAACAGAACACCAAAT
CTGACAAGTTATATCACACACTCTGAACCCAAACTATAAGTCAGAACATCAAATCCTCCT
CGTCTCCTAATCGTCTTCTCTCTCTGGAGGAAGGCCGCACGGTAACAGCATTTTCTGCAT
GAAGTTGTAGCGTTCGCGGCCAATGGACTCGTTCTCAGCGATAGCAAAGTAAGCAAGCAT
TGGGTAGTGGCCAATGTATGAAGCATAGCTATCACGCTGAATGTTCACTGCCCACTCAAA
TCTGCTCAAATCAGCATGACCAGTTCCAACGTATTTAGCTTGAAGATGCTCGAGCTGAGA
ATTGATGTTAAACCTATCACTTGCCTGCACACACACACACAAGAAAAAAACAATCTTTCA
AAGAAAGTGTGGATGTATCCTTAGAGGATCTCATAACGAAAGCCTTAAGGTAAAGGAAGC
TGTTCCCAATTTCAAAGAAAGCTACGCTTAAGAAACTAATAGTAGATGAAGCTAATAATA
CTAAGGAGATGAGAGGCTAAAGAGTGATGCGAAAGTTAGGGTTTCCGATCCAGAAAGCGT
CC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL4844Contig1 662 2 1 U
GGAGATTAGTCCCCTTTGCTTGGCTTAGGATTGTTCTTGCATCATCTTAAAAAATAAAAA
TGGCTTCGCTTTCTTTACTCAGCGGCGGTGCTCTCCAGGGTCGTTGTGCAAGACATGCAC
ATGTTAGCCCACGCGCGGCGCATCCTACCAAACCCGCGCCTCCGTCCTTCTTGCCAACCG
GCGCCTCTCGCAGGAACTTGCTGTTTTCCCTGACGGCAGCCACGGTGGTGACGGGACTGC
AGCCTGCATCAATGGCGGAGACTATTCCGTTGTTCGGGATCAGAAAGAAGCTGAAGAAGG
CGGAAGAAGAAGCGGTGGAGATCGTGAAGGAAGGCTTCGAGACGGCGGAGAAAGGCGTAG
AGGCGGCTGAGAAGGGATTAGAGGCGGCGGAGAAGGGAGTAGAGACGGCGGAGAAAGAAA
TCGAGACGGCCGTTAGTTATAACGGATTGACGCAGGCGGGAGCAGTCGTGGCTGCTGAGT
TCGTTGGAGTTCTTGTCGCGACTTCGGTCGTCAACGGGATTTTAGGACCTGAAGCCCAGA
AATCTTGACTTTTATCATTTCAAGATGGAAAAACATTTGATCTTCGAGTGTAATATTGTG
TCTAAAAGTTGTGTTTAATTACGCGTTGATAATATATATCGTAATTTTGTTTGAGTTTTG
GC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2FV04JQ C 1
AF RR2FV04TF U 1
BS 1 662 RR2FV04TF

RD RR2FV04JQ 662 0 0
GGAGATTAGTCCCCTTTGCTTGGCTTAGGATTGTTCTTGCATCATCTTAAAAAATAAAAA
TGGCTTCGCTTTCTTTACTCAGCGGCGGTGCTCTCCAGGGTCGTTGTGCAAGACATGCAC
ATGTTAGCCCACGCGCGGCGCATCCTACCAAACCCGCGCCTCCGTCCTTCTTGCCAACCG
GCGCCTCTCGCAGGAACTTGCTGTTTTCCCTGACGGCAGCCACGGTGGTGACGGGACTGC
AGCCTGCATCAATGGCGGAGACTATTCCGTTGTTCGGGATCAGAAAGAAGCTGAAGAAGG
CGGAAGAAGAAGCGGTGGAGATCGTGAAGGAAGGCTTCGAGACGGCGGAGAAAGGCGTAG
AGGCGGCTGAGAAGGGATTAGAGGCGGCGGAGAAGGGAGTAGAGACGGCGGAGAAAGAAA
TCGAGACGGCCGTTAGTTATAACGGATTGACGCAGGCGGGAGCAGTCGTGGCTGCTGAGT
TCGTTGGAGTTCTTGTCGCGACTTCGGTCGTCAACGGGATTTTAGGACCTGAAGCCCAGA
AATCTTGACTTTTATCATTTCAAGATGGAAAAACATTTGATCTTCGAGTGTAATATTGTG
TCTAAAAGTTGTGTTTAATTACGCGTTGATAATATATATCGTAATTTTGTTTGAGTTTTG
GC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2FV04TF 662 0 0
GGAGATTAGTCCCCTTTGCTTGGCTTAGGATTGTTCTTGCATCATCTTAAAAAATAAAAA
TGGCTTCGCTTTCTTTACTCAGCGGCGGTGCTCTCCAGGGTCGTTGTGCAAGACATGCAC
ATGTTAGCCCACGCGCGGCGCATCCTACCAAACCCGCGCCTCCGTCCTTCTTGCCAACCG
GCGCCTCTCGCAGGAACTTGCTGTTTTCCCTGACGGCAGCCACGGTGGTGACGGGACTGC
AGCCTGCATCAATGGCGGAGACTATTCCGTTGTTCGGGATCAGAAAGAAGCTGAAGAAGG
CGGAAGAAGAAGCGGTGGAGATCGTGAAGGAAGGCTTCGAGACGGCGGAGAAAGGCGTAG
AGGCGGCTGAGAAGGGATTAGAGGCGGCGGAGAAGGGAGTAGAGACGGCGGAGAAAGAAA
TCGAGACGGCCGTTAGTTATAACGGATTGACGCAGGCGGGAGCAGTCGTGGCTGCTGAGT
TCGTTGGAGTTCTTGTCGCGACTTCGGTCGTCAACGGGATTTTAGGACCTGAAGCCCAGA
AATCTTGACTTTTATCATTTCAAGATGGAAAAACATTTGATCTTCGAGTGTAATATTGTG
TCTAAAAGTTGTGTTTAATTACGCGTTGATAATATATATCGTAATTTTGTTTGAGTTTTG
GC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4846Contig1 1142 2 6 U
GGGAGCTCTCATCCACAGAACAAAAAAGATGGCCTCGGCGATTATTCCATCGCTCAGGCT
AAGGCCCAGCTTCTCTACCGCCACGTCACTATCGTCATTCTCTTCCTCCGGCGACGTCAA
ACCCCGTCCCGCTGTCATTCTCCCGGGTTTAGGCAACAATTCAGGAGACTACAAGAAGCT
GGAGGTAACACTGGGTGAGTACGGTGTTCCTTCAGTGGTTGCAGATGTATCAAGGCTCGA
TTGGTTTAGAAATGCAGCCGGTTTGGTTGATCCTGCCTACTGGCGTGGCACTCTACGCCC
TCGTCCTGTTCTTGATTGGTACTTGAAAAGAATTGATGATACCGTCCGTGAAGCCAATGA
GTTAGCCCAAGGTAAAGGATTGTCTTTGATTGGACACTCAGCTGGAGGATGGCTTGCTAG
AGTTTACATGGAAGAATACGGAAGCGCTGATATCTCCTTGTTGCTTACACTTGGTACGCC
TCACTTGCCACCACCGAGAGGACTAGCAGGGGTTATTGATCAAACAAGAGGTCTTCTCTA
TTATGTCGAAGAGAACTGTGCAAAAGCTGTTTACACTCCTGAGCTGAGATATGTCTGCAT
CGCCGGGAGATACATTCGTGGAGCTCCTTTAGTGGATAAAGCAGATGCAAATCTTGATTC
TAATGTGACTGTTGGAATCGACGGTGGTGAAACCATCTCAGAGCTCGCTATAGCAAGCAA
CGAGACTGGGGATTCGCAGGTTTCTTCAGGGCCTAGTTTCCGTGCTCGTTTTGTAGGGCA
AGGATACAAGCAAGTATGTGGGAGAGCTGATGTGTGGGGTGATGGAGTGGTCCCTGAGGT
TTCAGCTCATCTTGAAGGTGCACTTAACGTTAGCTTCGACGGTGTTTACCATTCGCCTGT
TGGTTCAGACGATGAAACCAGACCTTGGTATGGTTCACCGGTTATTGTAAAAGACTGGAT
TCACCACCTTCTTGAGTGAGTTTTCAGGTTACTGTAAAAACATTCATCAGAATCTCAAGA
ACTTGTTATCTTCCGTTGTCTCTATCTCTTCACTCCAAATACTCAAAACTCTAATCACAC
TATGTATTTATACTCTTCAACTTTTTGAAGCCGTCAAGTGTATCTATCTCTGTTTTTTTT
GG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2E185TF U 1
AF RR2E185JQ C 527
BS 1 739 RR2E185TF
BS 740 740 RR2E185JQ
BS 741 750 RR2E185TF
BS 751 751 RR2E185JQ
BS 752 773 RR2E185TF
BS 774 1142 RR2E185JQ

RD RR2E185TF 773 0 0
GGGAGCTCTCATCCACAGAACAAAAAAGATGGCCTCGGCGATTATTCCATCGCTCAGGCT
AAGGCCCAGCTTCTCTACCGCCACGTCACTATCGTCATTCTCTTCCTCCGGCGACGTCAA
ACCCCGTCCCGCTGTCATTCTCCCGGGTTTAGGCAACAATTCAGGAGACTACAAGAAGCT
GGAGGTAACACTGGGTGAGTACGGTGTTCCTTCAGTGGTTGCAGATGTATCAAGGCTCGA
TTGGTTTAGAAATGCAGCCGGTTTGGTTGATCCTGCCTACTGGCGTGGCACTCTACGCCC
TCGTCCTGTTCTTGATTGGTACTTGAAAAGAATTGATGATACCGTCCGTGAAGCCAATGA
GTTAGCCCAAGGTAAAGGATTGTCTTTGATTGGACACTCAGCTGGAGGATGGCTTGCTAG
AGTTTACATGGAAGAATACGGAAGCGCTGATATCTCCTTGTTGCTTACACTTGGTACGCC
TCACTTGCCACCACCGAGAGGACTAGCAGGGGTTATTGATCAAACAAGAGGTCTTCTCTA
TTATGTCGAAGAGAACTGTGCAAAAGCTGTTTACACTCCTGAGCTGAGATATGTCTGCAT
CGCCGGGAGATACATTCGTGGAGCTCCTTTAGTGGATAAAGCAGATGCAAATCTTGATTC
TAATGTGACTGTTGGAATCGACGGTGGTGAAACCATCTCAGAGCTCGCTATAGCAAGCAA
CGAGACTGGGGATTCGCAG*TTTCTTCAGG*CCTAGTTTCCGTGCTCGTTTTG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2E185JQ 616 0 0
AGAGGTCTTCTCTATTATGTCGAAGAGAACTGTGCAAAAGCTGTTTACACTCCTGAGCTG
AGATATGTCTGCATCGCCGGGAGATACATTCGTGGAGCTCCTTTAGTGGATAAGGCAGAT
GCAAATCTTGATTCTAATGTGACTGTTGGAATCGACGGTGGTGAAACCATCTCAGAGCTC
GCTATAGCAAGCAACGAGACTGGGGATTCGCAGGTTTCTTCAGGGCCTAGTTTCCGTGCT
CGTTTTGTAGGGCAAGGATACAAGCAAGTATGTGGGAGAGCTGATGTGTGGGGTGATGGA
GTGGTCCCTGAGGTTTCAGCTCATCTTGAAGGTGCACTTAACGTTAGCTTCGACGGTGTT
TACCATTCGCCTGTTGGTTCAGACGATGAAACCAGACCTTGGTATGGTTCACCGGTTATT
GTAAAAGACTGGATTCACCACCTTCTTGAGTGAGTTTTCAGGTTACTGTAAAAACATTCA
TCAGAATCTCAAGAACTTGTTATCTTCCGTTGTCTCTATCTCTTCACTCCAAATACTCAA
AACTCTAATCACACTATGTATTTATACTCTTCAACTTTTTGAAGCCGTCAAGTGTATCTA
TCTCTGTTTTTTTTGG

QA 1 616 1 616
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4848Contig1 964 2 4 U
GGAACGCTGGAATTGCTCAACATCGTGCTGGGCTTTCTGTTTCCGCGAAGCTGTCTTGCA
TATATTTAAGTCAACGGGATCATCTGTTCCGTGTTGGTTGGTATATAGAAAGAGTCTCTT
TGTCGGTTAATTCTTCCTCTTCCTCCTTATCTAAAAAGCTATGAGATTTTGATCATCCTC
TCTTCATAATACAATTCTTATTTTTCCCTTACCAATCTTGTTGCTACTGCAATATAATTC
TTGGCTTTTTTGGGTACAAAATTTTTCTACAGAAACTCCAGATCCCATCAAGGAAGCAAA
ACAATGGCTTCTTCTCCGTTAACTCTGTTGGCTCCTCCATCTTCTCTACCTCGCAATTGG
ATACATCACGTCTTCCCAAGCTTCCACGGGGCAGATGTCCGCAAAAACTTTCTCAGCCAC
GTTCTCAAGGAGCTCAGAAGCAAAGCAATCGACTCATTCATTGACAATGATATAGAGAGG
GGTAAGCTGATCGGCCCTGCGCTCGAAGAAGTTATAAGAGGATCGAGGATTGCTATTGTC
TTGCTCTCGAAGAACTACGCTTCGTCTACTTGGTGCTTGAACGAGCTACTGGAGATCATG
AAGTGCAGAGAAAGGTTTGGTCAAACAGTGATACCCGTTTTCTATCAAGTGGATCCAACT
GATGTAAAGAAGCAGACTGGGTGATTTTGGGAAAGTCTTTGAAGAAACTTGTAAAGGAAA
AACAGAGGAGGATATTCGAAGATGGAAACATGCTTTGACGGAAGTGGCCCAAATCGCAGG
TTACGATTCATCCTCAACAGAATGGTTCGTCCTCTTAATCTTTCTAACACATTAACCTCT
CTCCTGCACTTGTAAACAGCCATCCTTAATCGAATAAGTAGGAGAATAGCCTCAATCATC
TTTGATCTACAATCCCCTATATATTAATCCAGGAACATTTGAAAATTTGTAACCTCAAAT
TTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2AB60TF U 1
AF RR2AB60JQ C 164
BS 1 779 RR2AB60TF
BS 780 780 RR2AB60JQ
BS 781 834 RR2AB60TF
BS 835 964 RR2AB60JQ

RD RR2AB60TF 834 0 0
GGAACGCTGGAATTGCTCAACATCGTGCTGGGCTTTCTGTTTCCGCGAAGCTGTCTTGCA
TATATTTAAGTCAACGGGATCATCTGTTCCGTGTTGGTTGGTATATAGAAAGAGTCTCTT
TGTCGGTTAATTCTTCCTCTTCCTCCTTATCTAAAAAGCTATGAGATTTTGATCATCCTC
TCTTCATAATACAATTCTTATTTTTCCCTTACCAATCTTGTTGCTACTGCAATATAATTC
TTGGCTTTTTTGGGTACAAAATTTTTCTACAGAAACTCCAGATCCCATCAAGGAAGCAAA
ACAATGGCTTCTTCTCCGTTAACTCTGTTGGCTCCTCCATCTTCTCTACCTCGCAATTGG
ATACATCACGTCTTCCCAAGCTTCCACGGGGCAGATGTCCGCAAAAACTTTCTCAGCCAC
GTTCTCAAGGAGCTCAGAAGCAAAGCAATCGACTCATTCATTGACAATGATATAGAGAGG
GGTAAGCTGATCGGCCCTGCGCTCGAAGAAGTTATAAGAGGATCGAGGATTGCTATTGTC
TTGCTCTCGAAGAACTACGCTTCGTCTACTTGGTGCTTGAACGAGCTACTGGAGATCATG
AAGTGCAGAGAAAGGTTTGGTCAAACAGTGATACCCGTTTTCTATCAAGTGGATCCAACT
GATGTAAAGAAGCAGACTGGGTGATTTTGGGAAAGTCTTTGAAGAAACTTGTAAAGGAAA
AACAGAGGAGGATATTCGAAGATGGAAACATGCTTTGACGGAAGTGGCCCAAATCGCAG*
TTACGATTCATCCTCAACAGAATGGTTCGTCCTCTTAATCTTTCTAACACATTA

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR2AB60JQ 801 0 0
AGATTTTGATCATCCTCTCTTCATAATACAATTCTTATTTTTCCCTTACCAATCTTGTTG
CTACTGCAATATAATTCTTGGCTTTTTTGGGTACAAAATTTTTCTACAGAAACTCCAGAT
CCCATCAAGGAAGCAAAACAATGGCTTCTTCTCCGTTAACTCTGTTGGCTCCTCCATCTT
CTCTACCTCGCAATTGGATACATCACGTCTTCCCAAGCTTCCACGGGGCAGATGTCCGCA
AAAACTTTCTCAGCCACGTTCTCAAGGAGCTCAGAAGCAAAGCAATCGACTCATTCATTG
ACAATGATATAGAGAGGGGTAAGCTGATCGGCCCTGCGCTCGAAGAAGTTATAAGAGGAT
CGAGGATTGCTATTGTCTTGCTCTCGAAGAACTACGCTTCGTCTACTTGGTGCTTGAACG
AGCTACTGGAGATCATGAAGTGCAGAGAAAGGTTTGGTCAAACAGTGATACCCGTTTTCT
ATCAAGTGGATCCAACTGATGTAAAGAAGCAGACTGG*TGATTTTGGGAAAGTCTTTGAA
GAAACTTGTAAAGGAAAAACAGAGGAGGATATTCGAAGATGGAAACATGCTTTGACGGAA
GTGGCCCAAATCGCAGGTTACGATTCATCCTCAACAGAATGGTTCGTCCTCTTAATCTTT
CTAACACATTAACCTCTCTCCTGCACTTGTAAACAGCCATCCTTAATCGAATAAGTAGGA
GAATAGCCTCAATCATCTTTGATCTACAATCCCCTATATATTAATCCAGGAACATTTGAA
AATTTGTAACCTCAAATTTAT

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL4849Contig1 1016 2 6 U
GGACTCTCTCTTTGATTCAATCTCCTCGTCTGCACCAGAAGATCATTCTGAAAAGATGAG
TAGTAGCGTGGTGGAGACGACGAGAGCAGAGCTGGGGCTGGTGGTAGTGTATTTGAACAA
AGCGGAGGCGAGGGACAAGATATGCAGAGCTATACAGTACGGATCCAAGTTCTTGAGTGA
TGGACAGCCTGGCACTGCTCAGAATGTGGACAAGTCAACCAGCTTGGCCCGTAAAGTGTT
CCGTCTCTTCAAGTTTGTGAATGACCTTCATGCCCTCATTAGCCCTCTTCCCAAAGGCAC
TCCACTCTCTCTCGCTCTCCTCGGAAAGTCCAAGAGCGCATTGCTCTCTACCTTCCTGTT
CCTTGATCAAATTGTCTGGCTTGGCAGGACTGGCATTTACAAGGTAAGTGTCTCTGCTTT
TTTAAATAATTTAATTAATATATAGTGTAAATCTTCAATTTTAAACTAAGTTTTCTGTTT
TTTTTTTTTGAATATGCTTTGCTGATACTTAAATAAGAACAAAGAACGAGCTGAGCTTCT
TGGACGTATATCCCTCTTCTGTTGGATGGGTTCTTCGGCTTGCACATCCTTAGTCGAGAT
TGGGGAGCTTGGTAGGCTCTCAGCTTCAATTAAGAAGCTTGAAAAAGAGATCAGCAACAA
GGATAAACACCAAAATGAGCAATACCGCTCGAAACTGCAGAGATCAAACGAGAGGTCATT
GGCTCTGATCAAAGCCGGAATGGATTTCGTTGTTGCTTTCGGTTTGCTTCAATTGGCTCC
CAAGAAAGTCACTCCCCGTGTCACTGGCGCTTTCGGTTTCGCCTCCTCTCTTATCTCTTG
TTATCAGTTATTGCCATCGCATCCCAAGTCCAAGACGGTTTAGGAAACAAGGAAAAGATG
TAGAGAGTCAGAGTTTCTTGATGTTCCATAGTGTGTTCTTCTGCATTAACTTACTTTTGT
GTTTGATTTGTCTTTAATACTTGATTTTGTGATAAAACGTTTCCGTCTGTTTGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR36TF U 1
AF RR2GR36JQ C 481
BS 1 615 RR2GR36TF
BS 616 616 RR2GR36JQ
BS 617 645 RR2GR36TF
BS 646 646 RR2GR36JQ
BS 647 723 RR2GR36TF
BS 724 1016 RR2GR36JQ

RD RR2GR36TF 723 0 0
GGACTCTCTCTTTGATTCAATCTCCTCGTCTGCACCAGAAGATCATTCTGAAAAGATGAG
TAGTAGCGTGGTGGAGACGACGAGAGCAGAGCTGGGGCTGGTGGTAGTGTATTTGAACAA
AGCGGAGGCGAGGGACAAGATATGCAGAGCTATACAGTACGGATCCAAGTTCTTGAGTGA
TGGACAGCCTGGCACTGCTCAGAATGTGGACAAGTCAACCAGCTTGGCCCGTAAAGTGTT
CCGTCTCTTCAAGTTTGTGAATGACCTTCATGCCCTCATTAGCCCTCTTCCCAAAGGCAC
TCCACTCTCTCTCGCTCTCCTCGGAAAGTCCAAGAGCGCATTGCTCTCTACCTTCCTGTT
CCTTGATCAAATTGTCTGGCTTGGCAGGACTGGCATTTACAAGGTAAGTGTCTCTGCTTT
TTTAAATAATTTAATTAATATATAGTGTAAATCTTCAATTTTAAACTAAGTTTTCTGTTT
TTTTTTTTTGAATATGCTTTGCTGATACTTAAATAAGAACAAAGAACGAGCTGAGCTTCT
TGGACGTATATCCCTCTTCTGTTGGATGGGTTCTTCGGCTTGCACATCCTTAGTCGAGAT
TGGGGAGCTTGGTAG*CTCTCAGCTTCAATTAAGAAGCTTGAAAA*GAGATCAGCAACAA
GGATAAACACCAAAATGAGCAATACCGCTCGAAACTGCAGAGATCAAACGAGAGGTCATT
GGC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2GR36JQ 536 0 0
TTTTTTTTTGAATATGCTTTGCTGATACTTAAATAAGAACAAAGAACGAGCTGAGCTTCT
TGGACGTATATCCCTCTTCTGTTGGATGGGTTCTTCGGCTTGCACATCCTTAGTCGAGAT
TGGGGAGCTTGGTAGGCTCTCAGCTTCAATTAAGAAGCTTGAAAAAGAGATCAGCAACAA
GGATAAACACCAAAATGAGCAATACCGCTCGAAACTGCAGAGATCAAACGAGAGGTCATT
GGCTCTGATCAAAGCCGGAATGGATTTCGTTGTTGCTTTCGGTTTGCTTCAATTGGCTCC
CAAGAAAGTCACTCCCCGTGTCACTGGCGCTTTCGGTTTCGCCTCCTCTCTTATCTCTTG
TTATCAGTTATTGCCATCGCATCCCAAGTCCAAGACGGTTTAGGAAACAAGGAAAAGATG
TAGAGAGTCAGAGTTTCTTGATGTTCCATAGTGTGTTCTTCTGCATTAACTTACTTTTGT
GTTTGATTTGTCTTTAATACTTGATTTTGTGATAAAACGTTTCCGTCTGTTTGGAG

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 2

CO CL4850Contig1 618 2 2 U
GGAACGAGATAAAAAATCATTGGAATACGAAGATCAAGAAGAAGATGAAACATCTTGGTT
TAGATCCGGCTACGCGTGAACCAATGAATAATATTACCGACCAAACCGAATCTAACCAGA
TAACAAAACCAAACATGTGTTCTACCATCAAGGAAGGAGAAGAAACCAAAGAACAGGCTC
TCGAAGACGAAGTAGACATCGGATCTCTATTCGAAATGCAAGGCAACGAGATATCTATCT
CGTCTTCTTCTTTGTATAGTAACATTTCAAGAAGTGAATCTTCATCGAATTTTGCAGAAG
ATTCAATTTCTTTAGAGCAATGGGACTTGACCTATATGACGGATCCTTTGGTACCATGGG
ACTTCTTCACCAATCTTGATGATAATCTTTTCCTTTGATGACAGAATGTGATATAACATT
GTAATATAAATCTACAAATATATAAATAATCTCAAGTAATTTGTAGCCTTGTTTCATGTA
TGTAAGATGTGTTTATGCATGGCGGACGCGCGATGATGTATATTTTTTCATATAAAATGT
ATGCATATATATATTTTGAAAGTTAAAACTATATATATGGAGACGTAGAAACTGAAAAAG
TCTTGGAATAAAACGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ42TF U 1
AF RR2GQ42JQ C 245
BS 1 505 RR2GQ42TF
BS 506 618 RR2GQ42JQ

RD RR2GQ42TF 505 0 0
GGAACGAGATAAAAAATCATTGGAATACGAAGATCAAGAAGAAGATGAAACATCTTGGTT
TAGATCCGGCTACGCGTGAACCAATGAATAATATTACCGACCAAACCGAATCTAACCAGA
TAACAAAACCAAACATGTGTTCTACCATCAAGGAAGGAGAAGAAACCAAAGAACAGGCTC
TCGAAGACGAAGTAGACATCGGATCTCTATTCGAAATGCAAGGCAACGAGATATCTATCT
CGTCTTCTTCTTTGTATAGTAACATTTCAAGAAGTGAATCTTCATCGAATTTTGCAGAAG
ATTCAATTTCTTTAGAGCAATGGGACTTGACCTATATGACGGATCCTTTGGTACCATGGG
ACTTCTTCACCAATCTTGATGATAATCTTTTCCTTTGATGACAGAATGTGATATAACATT
GTAATATAAATCTACAAATATATAAATAATCTCAAGTAATTTGTAGCCTTGTTTCATGTA
TGTAAGATGTGTTTATGCATGGCGG

QA 1 505 1 505
DS 

RD RR2GQ42JQ 374 0 0
TTT
TTCTTTGTATAGTAACATTTCAAGAAGTGAATTTTCATCGAATTTTGCAGAAGATTCAAT
TTTTTTAGAGCAATGGGACTTGACCTATATGACGGATCCTTTGGTACCATGGGACTTTTT
CACCAATCTTGATGATAATTTTTTCCTTTGATGACAGAATGTGATATAACATTGTAATAT
AAATTTACAAATATATAAATAATTTCAAGTAATTTGTAGCCTTGTTTCATGTATGTAAGA
TGTGTTTATGCATGGCGGACGCGCGATGATGTATATTTTTTCATATAAAATGTATGCATA
TATATATTTTGAAAGTTAAAACTATATATATGGAGACGTAGAAACTGAAAAAGTCTTGGA
ATAAAACGGGT

QA 4 374 4 374
DS 



AS 1 2

CO CL4851Contig1 311 2 3 U
CAGACTCAACAATCAATCACCATAATTTCTCAAGAAAGATAAGGTCTACAAATCAAAAGT
CCAACACCAAAACCGACTCAAAACCCCACACACGAATTAATACCAACACAAAGACAAACT
CAGAAACCTAAACCTCAAAATCGATACACAACTTGCTCCAGTACGATAAAACAATACTTA
AAATGTCAAAGCCTTTCTAAGTCCAACTCTTTTAGTCTTTTACTAATCTCTTCAAGATCA
AAGCAACGCATGTTTATATCGCCTCACTCTATACAGAGTTTTTCCTAAGAAGTAGCTTCT
CTCTGTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES69JQ U 47
AF RR2ES69TF C 1
BS 1 46 RR2ES69TF
BS 47 288 RR2ES69JQ
BS 289 311 RR2ES69TF

RD RR2ES69JQ 245 0 0
TACAAATCAAAAGTCCAACACCAAAACCGACTCAAAACCCCACACACGAATTAATACCAA
CACAAAGACAAACTCAGAAACCTAAACCTCAAAATCGATACACAACTTGCTCCAGTACGA
TAAAACAATACTTAAAATGTCAAAGCCTTTCTAAGTCCAACTCTTTTAGTCTTTTACTAA
TCTCTTCAAGATCAAAGCAACGCATGTTTATATCGCCTCACTCTATACAGAGTTTTTCCT
AA
AAA

QA 1 242 1 242
DS 

RD RR2ES69TF 311 0 0
CAGACTCAACAATCAATCACCATAATTTCTCAAGAAAGATAAGGTCTACAAATCAAAAGT
CCAACACCAAAACCGACTCAAAACCCCACACACGAATTAATACCAACACAAAGACAAACT
CAGAAACCTAAACCTCAGAATCGATACACAACTTGCTCCAGTACGATAAAACAATACTTA
AAATGTCAGAGCCTTTCTAAGTCCAACTCTTTTAGTCTTTTACTAATCTCTTCAAGATCA
AAGCAACGCATGTTTATATCGCCTCACTCTATACAGAGTTTTTCCTAAGAAGTAGCTTCT
CTCTGTCTCCC

QA 1 311 1 311
DS 



AS 1 2

CO CL4852Contig1 680 2 2 U
GGAGTCAACGAATGCTTTGATTGGCTTGACTCAAAACCGCCTGGTTCAGTGATCTACGTC
CCATTCGGGAGCTTAGCGGTTCTAAAAGACGATCAAATGATTGAAGTTGCGGCTGGTCTA
AAACAAACCGGTCTTAGTTTCTTATGGGTGGTTAGAGAAAAAGAGACAAAGAAGCTCCCA
AGCAATTACATAGAGGAAATTGGTGAGAGAGGACTGATTGTGAATTGGTGTCCTCAGCTA
CAGGTTCTTGCGCATAAATCGATTGGTTGTTTCATAACGCATTGCGGATGGAATTCAACT
CTAGAGGCATTGAGCTTAGGAGTAGCTTTGATTGGGATGCCGGCTTATAGCGATCAGCCG
ACTAATGCTAAGTTTATAGAAGATGTGTGGAAGGTTGGAACAAGGGTTAAGGCAGATAAA
TATGGGTTTGTGACGAAAGAAGAGATTGTGAGATGTGTTGGAGAAGTTATGGAGGAGACG
TCGGAGAAAGGGAAAGAGATTAGAAAGAATGTTCTAAGATTGATGAAGTTTGCAAAGGAA
GCTTTTGCTGAAGGAGGAAACTCTGATAAGAATATTGATGAGTTCGTTGCTAAAATTGCT
AGGTAAACTGATCGTAATAATACTAGTGTTTTTGCAGTTTCAGAAAACTAAAAAAGTTAT
AATGTGTTTGGTTTGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW35TF U 1
AF RR2DW35JQ C 245
BS 1 478 RR2DW35TF
BS 479 680 RR2DW35JQ

RD RR2DW35TF 478 0 0
GGAGTCAACGAATGCTTTGATTGGCTTGACTCAAAACCGCCTGGTTCAGTGATCTACGTC
CCATTCGGGAGCTTAGCGGTTCTAAAAGACGATCAAATGATTGAAGTTGCGGCTGGTCTA
AAACAAACCGGTCTTAGTTTCTTATGGGTGGTTAGAGAAAAAGAGACAAAGAAGCTCCCA
AGCAATTACATAGAGGAAATTGGTGAGAGAGGACTGATTGTGAATTGGTGTCCTCAGCTA
CAGGTTCTTGCGCATAAATCGATTGGTTGTTTCATAACGCATTGCGGATGGAATTCAACT
CTAGAGGCATTGAGCTTAGGAGTAGCTTTGATTGGGATGCCGGCTTATAGCGATCAGCCG
ACTAATGCTAAGTTTATAGAAGATGTGTGGAAGGTTGGAACAAGGGTTAAGGCAGATAAA
TATGGGTTTGTGACGAAAGAAGAGATTGTGAGATGTGTTGGAGAAGTTATGGAGGAGA

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2DW35JQ 436 0 0
TTCTTGCGCATAAATCGATTGGTTGTTTCATAACGCATTGCGGATGGAATTCAACTCTAG
AGGCATTGAGCTTAGGAGTAGCTTTGATTGGGATGCCGGCTTATAGCGATCAGCCGACTA
ATGCTAAGTTTATAGAAGATGTGTGGAAGGTTGGAACAAGGGTTAAGGCAGATAAATATG
GGTTTGTGACGAAAGAAGAGATTGTGAGATGTGTTGGAGAAGTTATGGAGGAGACGTCGG
AGAAAGGGAAAGAGATTAGAAAGAATGTTCTAAGATTGATGAAGTTTGCAAAGGAAGCTT
TTGCTGAAGGAGGAAACTCTGATAAGAATATTGATGAGTTCGTTGCTAAAATTGCTAGGT
AAACTGATCGTAATAATACTAGTGTTTTTGCAGTTTCAGAAAACTAAAAAAGTTATAATG
TGTTTGGTTTGTTTTT

QA 1 436 1 436
DS 



AS 1 2

CO CL4853Contig1 1186 2 2 U
GGCGTAAGTAAAACATGGCGCCTCTCAAACATCTGGAGATGGAGAATCCAATCATCGACG
CATCTTTCCGAGATTTCTGCTCTTCTCATGGGATCCTCACAGTTGAAGATTTCCTTATTC
ATGATCTCTACGAACTTGCTGCGTTTGCTGAAAGGCAAGTAGATGCTGATAGATTGAAGG
AGGGTATCACTGTCATGCTTTCTTTGGTAGAGGTTAAGTGTCGGCCATTGTTGAACGGTA
TGGAGTTGTTGGAGGATCTACGGCGTAATAAACATACTCTGTCGAGTGGAGACAACGGGA
CGGACTCGTTACTTCAAGGTGGGTTACGTGAGGGTCAGGTTACAGAACTAGTTGGACCAT
CGTCTTCTGGTAAAACACAGTTTTGTATGCAAGCTGCTGCGAGCGTGGCAGAGAAGCAAG
AAGGCAGTGTCTTTTATATAGACACGGGGAACTCTTTTTCTGCCCGACGCATTGCTCAAT
TTATCTGTGGCAGTTCGGCTGCCGCTGCTTTACGAAAGAGAGTCTTGAGCAGGATATCAT
GCCACACGGTCTATGACATCTATACAATGTTTGATACGCTGCAAGGTCTAGAGGTTGCTT
TGAGGTCTCAGATGAATGTGAACGAGTACCGGTTACGGTTGTTGGTTGTTGATTCGATCT
CTTCTCTGATAACCCCAATTTTCGGAGGCAGTGGCTCACAGGGTATATGTCCTTGACGTG
CTTTAATGGTGGCACTTGGATATTCGCTTAAGAAGCTGGCACATGAACATAACATTGCTG
TTCTGGTATTAATGAAGTTTCAGGGCATTGGGTGTGTCATTTTGCTTCAAAGTTCCTTTT
TTAATCTCTCCTTCTGTATTAAAGGTGACGAACCACACGGTGGGTGCTGGAGAAAACGGT
AAAACCAAACCGGCTCTTGGCGAAACTTGGAAAAGCATTCCACACGTCAGACTTATGCTA
TCACGTGACAACAGGAACAACAGCTGCACTATCTCCATCTTAAAACACACATCAATGCCT
TCTGGCCAGACTGTGACTCGCAAGGACAATCAACAATGTTTATAGCCAACTAGTAGTGCT
GGTTTCACCAGCGATGAATAAGCTTGGATTTGCGATAAACAGCGATAGATATGTAATGCT
AAAATGTACTGTTTAACAACTGAATAACTTTCAAGATTTACTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC53TF U 1
AF RR2CC53JQ C 367
BS 1 612 RR2CC53TF
BS 613 1186 RR2CC53JQ

RD RR2CC53TF 612 0 0
GGCGTAAGTAAAACATGGCGCCTCTCAAACATCTGGAGATGGAGAATCCAATCATCGACG
CATCTTTCCGAGATTTCTGCTCTTCTCATGGGATCCTCACAGTTGAAGATTTCCTTATTC
ATGATCTCTACGAACTTGCTGCGTTTGCTGAAAGGCAAGTAGATGCTGATAGATTGAAGG
AGGGTATCACTGTCATGCTTTCTTTGGTAGAGGTTAAGTGTCGGCCATTGTTGAACGGTA
TGGAGTTGTTGGAGGATCTACGGCGTAATAAACATACTCTGTCGAGTGGAGACAACGGGA
CGGACTCGTTACTTCAAGGTGGGTTACGTGAGGGTCAGGTTACAGAACTAGTTGGACCAT
CGTCTTCTGGTAAAACACAGTTTTGTATGCAAGCTGCTGCGAGCGTGGCAGAGAAGCAAG
AAGGCAGTGTCTTTTATATAGACACGGGGAACTCTTTTTCTGCCCGACGCATTGCTCAAT
TTATCTGTGGCAGTTCGGCTGCCGCTGCTTTACGAAAGAGAGTCTTGAGCAGGATATCAT
GCCACACGGTCTATGACATCTATACAATGTTTGATACGCTGCAAGGTCTAGAGGTTGCTT
TGAGGTCTCAGA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2CC53JQ 820 0 0
TCT
GTAAAACACAGTTTTGTATGCAAGCTGCTGCGAGCGTGGCAGAGAAGCAAGAAGGCAGTG
TCTTTTATATAGACACGGGGAACTCTTTT*CTGCCCGACGCATTGCTCAATTTATCTGTG
GCAGTTCGGCTGCCGCTGCTTTACGAAAGAGAGTCTTGAGCAGGATATCATGCCACACGG
TCTATGACATCTATACAATGTTTGATACGCTGCAAGGTCTAGAGGTTGCTTTGAGGTCTC
AGATGAATGTGAACGAGTACCGGTTACGGTTGTTGGTTGTTGATTCGATCTCTTCTCTGA
TAACCCCAATTTTCGGAGGCAGTGGCTCACAGGGTATATGTCCTTGACGTGCTTTAATGG
TGGCACTTGGATATTCGCTTAAGAAGCTGGCACATGAACATAACATTGCTGTTCTGGTAT
TAATGAAGTTTCAGGGCATTGGGTGTGTCATTTTGCTTCAAAGTTCCTTTTTTAATCTCT
CCTTCTGTATTAAAGGTGACGAACCACACGGTGGGTGCTGGAGAAAACGGTAAAACCAAA
CCGGCTCTTGGCGAAACTTGGAAAAGCATTCCACACGTCAGACTTATGCTATCACGTGAC
AACAGGAACAACAGCTGCACTATCTCCATCTTAAAACACACATCAATGCCTTCTGGCCAG
ACTGTGACTCGCAAGGACAATCAACAATGTTTATAGCCAACTAGTAGTGCTGGTTTCACC
AGCGATGAATAAGCTTGGATTTGCGATAAACAGCGATAGATATGTAATGCTAAAATGTAC
TGTTTAACAACTGAATAACTTTCAAGATTTACTTTCG

QA 4 820 4 820
DS 



AS 1 2

CO CL4854Contig1 256 2 2 U
GCTGAAACTAAAAGTGTCTCGTTTTCGGTTAGTGTCTCGACCACACATAAAATCAACACT
GGATTCTATTTTGGACGCTTGATTTGGAGTGACGCTGTGCATAACGTAGCTATTCCTGTG
TCTGTGAGAACACAGATTCTGCAAAACTACTATGATGAGAACTAATGACTCCTGTTTTTG
ATGAATAAAATGTATACCAAATCTTGTCTTTGCTGCTCATTTTATCGTTAATAGTAATAC
ATATTGGGTTCTAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FU90JQ C 1
AF RR2FU90TF U 20
BS 1 19 RR2FU90JQ
BS 20 256 RR2FU90TF

RD RR2FU90JQ 256 0 0
GCTGAAACTAAAAGTGTCTCGTTTTCGGTTAGTGTCTCGACCACACATAAAATCAACACT
GGATTCTATTTTGGACGCTTGATTTGGAGTGACGCTGTGCATAACGTAGCTATTCCTGTG
TCTGTGAGAACACAGATTCTGCAAAACTACTATGATGAGAACTAATGACTCCTGTTTTTG
ATGAATAAAATGTATACCAAATCTTGTCTTTGCTGCTCATTTTATCGTTAATAGTAATAC
ATATTGGGTTCTAGAC

QA 1 256 1 256
DS 

RD RR2FU90TF 237 0 0
CGTTTTCGGTTAGTGTCTCGACCACACATAAAATCAACACTGGATTCTATTTTGGACGCT
TGATTTGGAGTGACGCTGTGCATAACGTAGCTATTCCTGTGTCTGTGAGAACACAGATTC
TGCAAAACTACTATGATGAGAACTAATGACTCCTGTTTTTGATGAATAAAATGTATACCA
AATCTTGTCTTTGCTGCTCATTTTATCGTTAATAGTAATACATATTGGGTTCTAGAC

QA 1 237 1 237
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4856Contig1 238 2 1 U
GAAGTTAAAGTTATTTTCTCTCGACTCTGTATCTCCACTGTCTCTACGTATTATGTAGCT
AACAATGTTTAATTATCACTCGCCATGTGGCTCATGTGAAATTAGATGTCACTTCTCGAA
TGGAAACAGAGCGCCATGGCTAAACGAGCGAGTTTAGCTTCTTTCGAACGAGCAATTACT
ATCACGTGTGAATCAAGAAACTTCTTGATTCATACAAAAAGAATAATATATTTTGCGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CM21JQ C 1
AF RR2CM21TF U 1
BS 1 238 RR2CM21TF

RD RR2CM21JQ 238 0 0
GAAGTTAAAGTTATTTTCTCTCGACTCTGTATCTCCACTGTCTCTACGTATTATGTAGCT
AACAATGTTTAATTATCACTCGCCATGTGGCTCATGTGAAATTAGATGTCACTTCTCGAA
TGGAAACAGAGCGCCATGGCTAAACGAGCGAGTTTAGCTTCTTTCGAACGAGCAATTACT
ATCACGTGTGAATCAAGAAACTTCTTGATTCATACAAAAAGAATAATATATTTTGCGG

QA 1 238 1 238
DS 

RD RR2CM21TF 238 0 0
GAAGTTAAAGTTATTTTCTCTCGACTCTGTATCTCCACTGTCTCTACGTATTATGTAGCT
AACAATGTTTAATTATCACTCGCCATGTGGCTCATGTGAAATTAGATGTCACTTCTCGAA
TGGAAACAGAGCGCCATGGCTAAACGAGCGAGTTTAGCTTCTTTCGAACGAGCAATTACT
ATCACGTGTGAATCAAGAAACTTCTTGATTCATACAAAAAGAATAATATATTTTGCGG

QA 1 238 1 238
DS 



AS 1 2

CO CL4857Contig1 784 2 2 U
GGGCCCTGTCTCTCACGTCTTTCCCCCTTCAAAAGGTCTCTCTCGACTCTCTCGCTTTTA
TCGCCGACCAGATTGAAAAGACCCATGTCTCCGTGTCCCATGTTAACCGCCTCGTTTCTC
TTCCTCTTCTGCATCACTCCGCCGTTCATCACCGCCGCAACAGACGTCGACGATCTCCCG
ACGGCGTATTCTCTCCTCCAGAGCTACAACTTCCCCGTAGGAATCCTCCCGAAAGGAGTC
GCATCATACGATCTGGACAAATCGACGGGGAAGTTCCACGCGTACTTCAACAAGTCGTGT
AGCTTCGCTCTCCAAGGCTCTTACCAATTGGATTACAGTTCGACGATCTCTGGCGTCATA
TCGGAGAACAAGCTCACGAAGCTTACCGGCGTGAAGGTGAAGGTTCTCTTCTTGTGGCTC
AACATCGTCGAGGTTCTCAGGAACGGAGACCAGCTCGAGTTCTCCGTAGGGATCACATCG
GCGAATTTCGCTATTGGGGAGTTTTACGAGTCGCCGCAGTGCGGATGCGGGTTTGATTGC
AATGGATTGAAGTTGAAAACTGAGAGTTTGGGAAGAAGAACAAACCTTTTTGTCTCTTCG
GTTTGAAAAAGGAGATGAGAGTTTCTTACAGAAAGTCAAAGTCAACTCTTTTGGATGCTT
TTGTTCCTTTTACAACAATTATGTTTCTCTGTTTTTTTTTTCTTCCAAGGATCCTTAAAC
CAAATGTTAAGAGAAATGTTGAGATAGCAAACGAAATGGAATAAGAGAGAGTGCCTTTAA
TCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2E609TF U 1
AF RR2E609JQ C 188
BS 1 423 RR2E609TF
BS 424 784 RR2E609JQ

RD RR2E609TF 423 0 0
GGGCCCTGTCTCTCACGTCTTTCCCCCTTCAAAAGGTCTCTCTCGACTCTCTCGCTTTTA
TCGCCGACCAGATTGAAAAGACCCATGTCTCCGTGTCCCATGTTAACCGCCTCGTTTCTC
TTCCTCTTCTGCATCACTCCGCCGTTCATCACCGCCGCAACAGACGTCGACGATCTCCCG
ACGGCGTATTCTCTCCTCCAGAGCTACAACTTCCCCGTAGGAATCCTCCCGAAAGGAGTC
GCATCATACGATCTGGACAAATCGACGGGGAAGTTCCACGCGTACTTCAACAAGTCGTGT
AGCTTCGCTCTCCAAGGCTCTTACCAATTGGATTACAGTTCGACGATCTCTGGCGTCATA
TCGGAGAACAAGCTCACGAAGCTTACCGGCGTGAAGGTGAAGGTTCTCTTCTTGTGGCTC
AAC

QA 1 423 1 423
DS 

RD RR2E609JQ 597 0 0
ATTCTCTCCTCCAGAGCTACAACTTCCCCGTAGGAATCCTCCCGAAAGGAGTCGCATCAT
ACGATCTGGACAAATCGACGGGGAAGTTCCACGCGTACTTCAACAAGTCGTGTAGCTTCG
CTCTCCAAGGCTCTTACCAATTGGATTACAGTTCGACGATCTCTGGCGTCATATCGGAGA
ACAAGCTCACGAAGCTTACCGGCGTGAAGGTGAAGGTTCTCTTCTTGTGGCTCAACATCG
TCGAGGTTCTCAGGAACGGAGACCAGCTCGAGTTCTCCGTAGGGATCACATCGGCGAATT
TCGCTATTGGGGAGTTTTACGAGTCGCCGCAGTGCGGATGCGGGTTTGATTGCAATGGAT
TGAAGTTGAAAACTGAGAGTTTGGGAAGAAGAACAAACCTTTTTGTCTCTTCGGTTTGAA
AAAGGAGATGAGAGTTTCTTACAGAAAGTCAAAGTCAACTCTTTTGGATGCTTTTGTTCC
TTTTACAACAATTATGTTTCTCTGTTTTTTTTTTCTTCCAAGGATCCTTAAACCAAATGT
TAAGAGAAATGTTGAGATAGCAAACGAAATGGAATAAGAGAGAGTGCCTTTAATCTT

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL4858Contig1 982 2 2 U
GGATCATAAAACAACTGCAAATCTTCACGTGTTCTCTTTTGCTCATCACATGTTATCTTC
TTTCTTCGCCTATCTCTGCAAATCTAATCCTTTCTCTTTTTTGGCATCCCTAGGCCCTTT
CTGTGATTCATCTTCCAATAATAAAACCCTTTAAAACTTACATACATACATATCCACCTA
CTCAACTTTGGCATGGACAAGAAAAAGGTTGTTGCAGCTTCATCGTCATCTTCTTCGTCT
TTTGATCATATATTTGGTCCAAGAGTCTCTTCTTCATCTTCTTCAGCAACCACTGGATTG
TTCACAACCATCTTCCCACGACCCTCTGCGGGGATGTTGGGGAGGCAAATGGACTTTCCA
AGTCAAGGTGGACATGTGAAGTATCAATCTGCAAATGAACGAGGAAAAAGAAGCAACATA
AAGGAGAAAAACAGTTATCATAACGAGGAAACAGAACCGCCATGCAACTTGAGCTCTTCA
ATTTACTATGGAGGCCAAGAGAAATATTCGTCTACAACGAATACTAACAAAGATACTGTA
AGTCGTAGTCGCAACTATCATACACATAACACCTACTACAAGAAAGATGCACAGGAAGGC
GATTCCAAAAGCGCATCAAGAGGTAACTGGTGGGAAGGGTCGCTTTATTACTAACATGCA
CTGCATGTCACGCAATACTGATTTGAGCAACCGGGAATAAGAGACATCATGGTCTAACCT
TAATATGAAATCTGAATGAAACCTACATAAATGCCCTTGCAAAATGAAAGAGTAGTATAT
TTTGCATAAACAAAGAGTGACTTGTTCTTGAGATGTTGATTTGTTTGTTTACGTAAAACG
CAACGCTAAAGACAAGCCTCTTTCTGATGATTTTAAAGTTTGTCTAATATTGTCTATGTG
AAATGATGTTTTATGAATAATTGTAATGGTACTTTATATTTTACATCATAATGAAGCACA
TTTGTTACTGCCTACTGGTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E716TF U 1
AF RR2E716JQ C 356
BS 1 590 RR2E716TF
BS 591 982 RR2E716JQ

RD RR2E716TF 590 0 0
GGATCATAAAACAACTGCAAATCTTCACGTGTTCTCTTTTGCTCATCACATGTTATCTTC
TTTCTTCGCCTATCTCTGCAAATCTAATCCTTTCTCTTTTTTGGCATCCCTAGGCCCTTT
CTGTGATTCATCTTCCAATAATAAAACCCTTTAAAACTTACATACATACATATCCACCTA
CTCAACTTTGGCATGGACAAGAAAAAGGTTGTTGCAGCTTCATCGTCATCTTCTTCGTCT
TTTGATCATATATTTGGTCCAAGAGTCTCTTCTTCATCTTCTTCAGCAACCACTGGATTG
TTCACAACCATCTTCCCACGACCCTCTGCGGGGATGTTGGGGAGGCAAATGGACTTTCCA
AGTCAAGGTGGACATGTGAAGTATCAATCTGCAAATGAACGAGGAAAAAGAAGCAACATA
AAGGAGAAAAACAGTTATCATAACGAGGAAACAGAACCGCCATGCAACTTGAGCTCTTCA
ATTTACTATGGAGGCCAAGAGAAATATTCGTCTACAACGAATACTAACAAAGATACTGTA
AGTCGTAGTCGCAACTATCATACACATAACACCTACTACAAGAAAGATGC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2E716JQ 627 0 0
TTCCAAGTCAAGGTGGACATGTGAAGTATCAATCTGCAAATGAACGAGGAAAAAGAAGCA
ACATAAAGGAGAAAAACAGTTATCATAACGAGGAAACAGAACCGCCATGCAACTTGAGCT
CTTCAATTTACTATGGAGGCCAAGAGAAATATTCGTCTACAACGAATACTAACAAAGATA
CTGTAAGTCGTAGTCGCAACTATCATACACATAACACCTACTACAAGAAAGATGCACAGG
AAGGCGATTCCAAAAGCGCATCAAGAGGTAACTGGTGGGAAGGGTCGCTTTATTACTAAC
ATGCACTGCATGTCACGCAATACTGATTTGAGCAACCGGGAATAAGAGACATCATGGTCT
AACCTTAATATGAAATCTGAATGAAACCTACATAAATGCCCTTGCAAAATGAAAGAGTAG
TATATTTTGCATAAACAAAGAGTGACTTGTTCTTGAGATGTTGATTTGTTTGTTTACGTA
AAACGCAACGCTAAAGACAAGCCTCTTTCTGATGATTTTAAAGTTTGTCTAATATTGTCT
ATGTGAAATGATGTTTTATGAATAATTGTAATGGTACTTTATATTTTACATCATAATGAA
GCACATTTGTTACTGCCTACTGGTATT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL4859Contig1 1269 2 6 U
GGATGAAACGCAATCATCGAACCAAATCCCAGTTGATCTGGTCATCGATATACTCTCTCT
CCTACCGACAAAGTCCATAGCTAGGTTTCGTTGCGTATCAAAATCCTGGGCATCCATATT
TCGCCGTCAAGATTTCACTGAGCTTTTTCTGACAAAGTCTTCCACTCGTCCACGGCTCTT
GTTCACCTTCAAAGTTGATGGTAAGTTGTTTCTATACTCTACACTTCAGCCTCATAATCC
AGACGATAACTCTTCCATTGTAGCCACCCCTCATAAGTCTTTTCCCAAACAAGTTGCATC
TTCCACAAGTACACCGGCTTGTGGACTGGTCTTGCTTCATGGAGGGAGAAAAAAGGTGAT
TTGTAACCCCGCCACGGGAGAGTTCAGAACCTTGCCCAGAGTGGTTTTTTTAAAAGAAAA
GAATGTGCTTGCTAAGAGTAATTACCTGGACACAGTAGCAAATGAGAAGGTTGTTGGGAT
GTATTTAGGCTATGATCCCAAGGGAAAAGAGTTCAAAGTGTTGTGTTTGACCGCTTCACG
TTGTTCTGGAGATAGAGACAGTGCTCATAGGGTTTTGACACTGGGGCCTGGAAAGCGTTT
TTGGAGACCGGTCGAACCCAAATTCCATTTCGTGAAAAGCAATTGGATAAGTAATGAAAT
ATGCGTAAATGGTGTTTTATATTTCGGAGCTTGGATCGGACATTATTCTACGATAGTTTG
CTTCGACGTGGGTTCTGAGGAGTTCAGGTTTATCTACACAGACGACGAAGAAACGGCACG
TTCCTATTATACGGGTAATTCGAATTTGTTCAACTACAAAGGTAAATTAGGTCTACACGA
GTATAGTGCTGAAGATAGGCTTATGTTTTGGGTTTTAGAAGATGCTGAAAATCATAAATG
GTCCAAGCATTTGTACGAACCGTCTCCTTTGGGGGAAAACATGATCAGATATAGCAGCTT
TGTTGGAATGACTGGTACAGGTGAACTTGTGTGGTGGTCGTCATACGACAACGCACCACC
ACGTTCACTCTACCTTACCTTCTATAATTTGGAAAGTGGAACTTGTAGAAAAGTCAATAT
TCAGGGATTTGACGATTTTAAGCAGCATCGTTCTATATGGGTTGCGACCTATCTAGACTA
TGTGGAGAATGTGAAGTGGCCTATGTAACACCGTCCAAGTGCTCTTTCATATATTATTAT
TACTTGAGACTTTGGATTTCAACTCTTTCTGTTATTTTGTTTCGATTTTGAACTCTATAA
TTTTGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DB50TF U 1
AF RR2DB50JQ C 536
BS 1 691 RR2DB50TF
BS 692 692 RR2DB50JQ
BS 693 747 RR2DB50TF
BS 748 748 RR2DB50JQ
BS 749 783 RR2DB50TF
BS 784 1269 RR2DB50JQ

RD RR2DB50TF 788 0 0
GGATGAAACGCAATCATCGAACCAAATCCCAGTTGATCTGGTCATCGATATACTCTCTCT
CCTACCGACAAAGTCCATAGCTAGGTTTCGTTGCGTATCAAAATCCTGGGCATCCATATT
TCGCCGTCAAGATTTCACTGAGCTTTTTCTGACAAAGTCTTCCACTCGTCCACGGCTCTT
GTTCACCTTCAAAGTTGATGGTAAGTTGTTTCTATACTCTACACTTCAGCCTCATAATCC
AGACGATAACTCTTCCATTGTAGCCACCCCTCATAAGTCTTTTCCCAAACAAGTTGCATC
TTCCACAAGTACACCGGCTTGTGGACTGGTCTTGCTTCATGGAGGGAGAAAAAAGGTGAT
TTGTAACCCCGCCACGGGAGAGTTCAGAACCTTGCCCAGAGTGGTTTTTTTAAAAGAAAA
GAATGTGCTTGCTAAGAGTAATTACCTGGACACAGTAGCAAATGAGAAGGTTGTTGGGAT
GTATTTAGGCTATGATCCCAAGGGAAAAGAGTTCAAAGTGTTGTGTTTGACCGCTTCACG
TTGTTCTGGAGATAGAGACAGTGCTCATAGGGTTTTGACACTGGGGCCTGGAAAGCGTTT
TTGGAGACCGGTCGAACCCAAATTCCATTTCGTGAAAAGCAATTGGATAAGTAATGAAAT
ATGCGTAAATGGTGTTTTATATTTCGGAGCT*GGATCGGACATTATTCTACGATAGTTTG
CTTCGACGTGGGTTCTGAGGAGTTCAG*TTTATCTACACAGACGACGAAGAAACGGCACG
TTC
TATTA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2DB50JQ 734 0 0
TTCACGTT
TTCTGGAGATAGAGACAGTGCTCATAGGGTTTTGACACTGGGGCCTGGAAAGCGTTTTTG
GAGACCGGTCGAACCCAAATTCCATTTCGTGAAAAGCAATTGGATAAGTAATGAAATATG
CGTAAATGGTGTTTTATATTTCGGAGCTTGGATCGGACATTATTCTACGATAGTTTGCTT
CGACGTGGGTTCTGAGGAGTTCAGGTTTATCTACACAGACGACGAAGAAACGGCACGTTC
CTATTATACGGGTAATTCGAATTTGTTCAACTACAAAGGTAAATTAGGTCTACACGAGTA
TAGTGCTGAAGATAGGCTTATGTTTTGGGTTTTAGAAGATGCTGAAAATCATAAATGGTC
CAAGCATTTGTACGAACCGTCTCCTTTGGGGGAAAACATGATCAGATATAGCAGCTTTGT
TGGAATGACTGGTACAGGTGAACTTGTGTGGTGGTCGTCATACGACAACGCACCACCACG
TTCACTCTACCTTACCTTCTATAATTTGGAAAGTGGAACTTGTAGAAAAGTCAATATTCA
GGGATTTGACGATTTTAAGCAGCATCGTTCTATATGGGTTGCGACCTATCTAGACTATGT
GGAGAATGTGAAGTGGCCTATGTAACACCGTCCAAGTGCTCTTTCATATATTATTATTAC
TTGAGACTTTGGATTTCAACTCTTTCTGTTATTTTGTTTCGATTTTGAACTCTATAATTT
TGTCTT

QA 9 734 9 734
DS 



AS 1 2

CO CL4860Contig1 721 2 2 U
GGGAAGCCGAATGAGAAAACGCCTGTTGAGTGGAGCAGGAATGTTGTTTTGCCTACTGGA
GGTGATGCTATGATCGCTGCTGGTGCTGCTGCCGCTCCTGAGAAGGTTGAGGCTGAGAGT
GGAGAAGTGCGCAAGCGTAAGCATGATGAGAGCAGCGCCAGCCCTGCGGCTGTGTCCACC
AAGAAAGCCAAAACAAAAGATGTTGAGGTTGAAGAGAAGGTGAAGTCTGAGAAGAAGGAG
AAGAAGAAGAAGGAGGACAAGGAGGAGGATAAAGAAGAGTTGGCAACACCGAAGTCAGAG
AAGAAGAAGAAAAAGAAGAGCAAGGAGACAGATGAAGCTGCTGCTGCGGTTAATGGTGAA
GATGAATCACCAGCAGAGAAGAGTGAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGACAAGGAGACA
GATGAAGCTGGTGGTGGTGAATCAGCAGAGAAGAGTGACAAGAAGAAAAAGAAGGAGAAG
AAGAAGAAAAGCAAAGACAGCGATGACGAATAATGAGATGAGTTTGTCTTATGCTACTCT
TTAAGTTTCGAATCTTTTGTTTTATGGTATCTATTCTGGGAAAAGTGAGACAAAAGGCAT
TTATGCTTGTATCCAAAAGTCTCACTTCAGATTAGTTTTGTTTTTTTAGTTTTTATGTTA
TGTTTGTCCTTTTATCTGTGAGATTCGTTTCACTCAGCTATAAACTTTATGAATATGATG
A


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2C960TF U 1
AF RR2C960JQ C 4
BS 1 668 RR2C960TF
BS 669 721 RR2C960JQ

RD RR2C960TF 668 0 0
GGGAAGCCGAATGAGAAAACGCCTGTTGAGTGGAGCAGGAATGTTGTTTTGCCTACTGGA
GGTGATGCTATGATCGCTGCTGGTGCTGCTGCCGCTCCTGAGAAGGTTGAGGCTGAGAGT
GGAGAAGTGCGCAAGCGTAAGCATGATGAGAGCAGCGCCAGCCCTGCGGCTGTGTCCACC
AAGAAAGCCAAAACAAAAGATGTTGAGGTTGAAGAGAAGGTGAAGTCTGAGAAGAAGGAG
AAGAAGAAGAAGGAGGACAAGGAGGAGGATAAAGAAGAGTTGGCAACACCGAAGTCAGAG
AAGAAGAAGAAAAAGAAGAGCAAGGAGACAGATGAAGCTGCTGCTGCGGTTAATGGTGAA
GATGAATCACCAGCAGAGAAGAGTGAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGACAAGGAGACA
GATGAAGCTGGTGGTGGTGAATCAGCAGAGAAGAGTGACAAGAAGAAAAAGAAGGAGAAG
AAGAAGAAAAGCAAAGACAGCGATGACGAATAATGAGATGAGTTTGTCTTATGCTACTCT
TTAAGTTTCGAATCTTTTGTTTTATGGTATCTATTCTGGGAAAAGTGAGACAAAAGGCAT
TTATGCTTGTATCCAAAAGTCTCACTTCAGATTAGTTTTGTTTTTTTAGTTTTTATGTTA
TGTTTGTC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2C960JQ 718 0 0
AAGCCGAATGAGAAAACGCCTGTTGAGTGGAGCAGGAATGTTGTTTTGCCTACTGGAGGT
GATGCTATGATCGCTGCTGGTGCTGCTGCCGCTCCTGAGAAGGTTGAGGCTGAGAGTGGA
GAAGTGCGCAAGCGTAAGCATGATGAGAGCAGCGCCAGCCCTGCGGCTGTGTCCACCAAG
AAAGCCAAAACAAAAGATGTTGAGGTTGAAGAGAAGGTGAAGTCTGAGAAGAAGGAGAAG
AAGAAGAAGGAGGACAAGGAGGAGGATAAAGAAGAGTTGGCAACACCGAAGTCAGAGAAG
AAGAAGAAAAAGAAGAGCAAGGAGACAGATGAAGCTGCTGCTGCGGTTAATGGTGAAGAT
GAATCACCAGCAGAGAAGAGTGAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGACAAGGAGACAGAT
GAAGCTGGTGGTGGTGAATCAGCAGAGAAGAGTGACAAGAAGAAAAAGAAGGAGAAGAAG
AAGAAAAGCAAAGACAGCGATGACGAATAATGAGATGAGTTTGTCTTATGCTACTCTTTA
AGTTTCGAATCTTTTGTTTTATGGTATCTATTCTGGGAAAAGTGAGACAAAAGGCATTTA
TGCTTGTATCCAAAAGTCTCACTTCAGATTAGTTTTGTTTTTTTAGTTTTTATGTTATGT
TTGTCCTTTTATCTGTGAGATTCGTTTCACTCAGCTATAAACTTTATGAATATGATGA

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL4861Contig1 453 2 3 U
AGTCGCCACAACCAAAAAACTCCGTTTACATTAAAAGGTATAGTTCAAGCCTTAACACTC
ATATAAGTCTGATTTAAGTTGGACAGAAAAAAAAAAAGATGTTCTTTTGTTCACTGAAAC
TAGAGGGGGATAGTATTTGAGCAAGAAGGATGATCAGACATAAACACCACTAGCAAGTAG
CAAAAACAGTGATCCAAACCCCAAGAAAACAGATGCTACTACTGCAGTCGCTAGCTCCTT
TGCGAGGCTACGGTTTTTCCTGGATGATGTAGCTTCATAGATGAAGAAGAAAGCGGTGAT
GATGAGGCCAATCGCCAGAGTGAACACCGACAAAGTCGGGTACATCGTCACCGGAATCGG
ACTCGTAATCGGACTCGCCGCCATTGTCACGTCGCTAGCTAACTATCTTCTTCTTCTTCG
CTTCGATCTGAGAGTAACGACGAGGAGCAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G861JQ U 43
AF RR2G861TF C 1
BS 1 42 RR2G861TF
BS 43 184 RR2G861JQ
BS 185 453 RR2G861TF

RD RR2G861JQ 142 0 0
GTTCAAGCCTTAACACTCATATAAGTCTGATTTAAGTTGGACAGAAAAAAAAAAAGATGT
TCTTTTGTTCACTGAAACTAGAGGGGGATAGTATTTGAGCAAGAAGGATGATCAGACATA
AACACCACTAGCAAGTAGCAAA

QA 1 142 1 142
DS 

RD RR2G861TF 453 0 0
AGTCGCCACAACCAAAAAACTCCGTTTACATTAAAAGGTATAGTTCAAGCCTTAACACTC
ATATAAGTCTGATTTAAGTTGGACAGAAAAAAAAAAAGATGTTCTTTTGTTCACTGAAAC
TAGAGGGGGATAGTATTTGAGCAAGAAGGATGATCAGACATAAACACCACTAGCAAGTAG
CAAAAACAGTGATCCAAACCCCAAGAAAACAGATGCTACTACTGCAGTCGCTAGCTCCTT
TGCGAGGCTACGGTTTTTCCTGGATGATGTAGCTTCATAGATGAAGAAGAAAGCGGTGAT
GATGAGGCCAATCGCCAGAGTGAACACCGACAAAGTCGGGTACATCGTCACCGGAATCGG
ACTCGTAATCGGACTCGCCGCCATTGTCACGTCGCTAGCTAACTATCTTCTTCTTCTTCG
CTTCGATCTGAGAGTAACGACGAGGAGCAGCCC

QA 1 453 1 453
DS 



AS 1 2

CO CL4862Contig1 1069 2 2 U
GAGATCTTTAAAAACAAGTTTAATGGTCCATACTACAGCTGGACTGTTGTGCCTCGGGAA
AGACAAGAAAGATGGTTTGTAGAGTTTGCAAAAACTAACACATGGCGTCCTACACTAACC
GGTTTAGTTCAGAAGAAGTTTGAGAAGATAGGTCAGCTCTGTCTCAAAGGCATTGTTAGC
ACTCGTAGGACTACTCGAAAGAAGCCAAATTGGATTAAGAAAAATTGTGGAGAAAAATGT
GTGCTTTTTGGGACACTGATAAAGCCAAAGAAAAGAGTTTGACGGCTTCAGCTGCTCGGA
TGTCTGACCGTAAAGGTCTTGGTCCTCACAAGCACAACTCTGGGTAGAAGTCTTTCAAAC
AAATCGAGCAAGAATTGGTAGAGGAATTGGGCAGACCGGTGACTCTTAGTGAAGTCTTCA
TTAAGACTCATACAAAAAAAGGATGGGACCTTTGTGGATATGAAAGCACAGGAGGTTGTT
GAGGTGTATCGGTGGAACAAACAGTCAATGTTGGATGACCTTGAGGCTGAAAACTCAGAC
CCTTCAGAGTCTAGTTCACAAGCTCCAGAGCTCTCTATAGATGAGGATAATGAGATATTA
CTCCTGTCTACTTTCACAGACAAAAGAGGAAAACATTATGGAATTGGAAGCCTCAAGAGT
ACTCTCGTCAATGGAAAGCGGAAGTACAGTGCACCCTCTTTAATCCTGGACCTGCAAACA
CAGCTTGATGAAGCTCACCGCAAGATTTAGGAGCAGGCCGCCCAAAATGCAAACAATTTC
CGCATAATTGAGGAGCAGGCTGCTCATAGCGCAGAGCAGGGAGCACAGCTCAAGGAGTTA
TCTATAATGAACAAGTTTTTGACTGCAACAAATCCTCAGTAAGTTGAATTCGTCCCAGCT
AACAAGTCTGGTGATTAAGTTCTCTCTTTCTTTGAATTTAAGTTCTTTCTTTTGTGTACT
TTCAAACTTATGATCAGGTGTTAATATTTTCACCCTGTTAAACTCCTAAATAAGAGGAGT
TCTTTTGTATCAAACGTAAGCTAATTTAAATTTTCAAATTCTTATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F781TF U 1
AF RR2F781JQ C 453
BS 1 682 RR2F781TF
BS 683 1069 RR2F781JQ

RD RR2F781TF 682 0 0
GAGATCTTTAAAAACAAGTTTAATGGTCCATACTACAGCTGGACTGTTGTGCCTCGGGAA
AGACAAGAAAGATGGTTTGTAGAGTTTGCAAAAACTAACACATGGCGTCCTACACTAACC
GGTTTAGTTCAGAAGAAGTTTGAGAAGATAGGTCAGCTCTGTCTCAAAGGCATTGTTAGC
ACTCGTAGGACTACTCGAAAGAAGCCAAATTGGATTAAGAAAAATTGTGGAGAAAAATGT
GTGCTTTTTGGGACACTGATAAAGCCAAAGAAAAGAGTTTGACGGCTTCAGCTGCTCGGA
TGTCTGACCGTAAAGGTCTTGGTCCTCACAAGCACAACTCTGGGTAGAAGTCTTTCAAAC
AAATCGAGCAAGAATTGGTAGAGGAATTGGGCAGACCGGTGACTCTTAGTGAAGTCTTCA
TTAAGACTCATACAAAAAAAGGATGGGACCTTTGTGGATATGAAAGCACAGGAGGTTGTT
GAGGTGTATCGGTGGAACAAACAGTCAATGTTGGATGACCTTGAGGCTGAAAACTCAGAC
CCTTCAGAGTCTAGTTCACAAGCTCCAGAGCTCTCTATAGATGAGGATAATGAGATATTA
CTCCTGTCTACTTTCACAGACAAAAGAGGAAAACATTATGGAATTGGAAGCCTCAAGAGT
ACTCTCGTCAATGGAAAGCGGA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2F781JQ 617 0 0
TGTGGATATGAAAGCACAGGAGGTTGTTGAGGTGTATCGGTGGAACAAACAGTCAATGTT
GGATGACCTTGAGGCTGAAAACTCAGACCCTTCAGAGTCTAGTTCACAAGCTCCAGAGCT
CTCTATAGATGAGGATAATGAGATATTACTCCTGTCTACTTTCACAGACAAAAGAGGAAA
ACATTATGGAATTGGAAGCCTCAAGAGTACTCTCGTCAATGGAAAGCGGAAGTACAGTGC
ACCCTCTTTAATCCTGGACCTGCAAACACAGCTTGATGAAGCTCACCGCAAGATTTAGGA
GCAGGCCGCCCAAAATGCAAACAATTTCCGCATAATTGAGGAGCAGGCTGCTCATAGCGC
AGAGCAGGGAGCACAGCTCAAGGAGTTATCTATAATGAACAAGTTTTTGACTGCAACAAA
TCCTCAGTAAGTTGAATTCGTCCCAGCTAACAAGTCTGGTGATTAAGTTCTCTCTTTCTT
TGAATTTAAGTTCTTTCTTTTGTGTACTTTCAAACTTATGATCAGGTGTTAATATTTTCA
CCCTGTTAAACTCCTAAATAAGAGGAGTTCTTTTGTATCAAACGTAAGCTAATTTAAATT
TTCAAATTCTTATTATT

QA 1 617 1 617
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4864Contig1 763 2 7 U
GGATTCAATCTCCCATTCATCAACGATAAGAGGAGACAGATAGGCAACACAGTTTCTTTA
CAGATTCCAACACCCCACAACGACCTTCTTCTCCTTTTCTTGTACGGACCAAACCCATCA
TTCTCAACTTCTTCGATTCGGATCCATTTTCTCAATCCTCGATTTCTCCGACTGGCACAG
AGCAATGGCTAGCTCCAAGGGAACACAGAGTGTGAAAGACTTGATGCACCCAGGCAAAAA
CGCTTTGCTCCCTCCAAAGATTCCGTTTCCTACCGTATCAGCACCATACTCCGAGTATAT
CCCCATTGCTTCAAGGCACGGTCACAAACTTAACGATGAGAAACCGCACCAGCGGACTTC
CTCCGAGAGCGATTTGGTTGAAGAGCCTCCCTCTTGGCTTGATGATCTCCTCAATGAGCC
GGAGAGCCCTGTTCGCAAATGCGGTCATCGCCGCTCGTCCAGTGACTCTTACGCTTACCT
AGACATGGCTAATGCTAAAAACATTAGCTTGACTCTCCAAAACGATTTCAGTTATAGGAA
TATGGGTTCTTCTCCCTCTCAGAGAGGTGGGGTTCATGAGCTTGATTGGAGCAGAAACGC
TCAGGACGCTGCCTTCTACGCTGATTCTAATTTTCTAATCGTCAGAGGGATTCTTTGGTG
GCACCTGGTCCTCGTCCTTCTTGGCTACCTTTTACTAGAGAGAGTGCTGGTGGAAAACAC
ATGGGACCTTCATCGTATATGCCTCAGAAGCACCAGAGGCAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT80TF U 29
AF RR2G370TF U 1
BS 1 49 RR2G370TF
BS 50 50 RR2FT80TF
BS 51 76 RR2G370TF
BS 77 77 RR2FT80TF
BS 78 177 RR2G370TF
BS 178 178 RR2FT80TF
BS 179 763 RR2G370TF

RD RR2FT80TF 249 0 0
GGG
GGAGACAGATAGGCAACACAGTTTCTTTACAGATTCCAACACCCCACAACGACCTTCTTC
TCCTTTTCTTGTACGGACCGAACCCATCATTCTCAACTTCTTCGATTCGGATCCATTTTC
TCAATCCTCGATTTCTCCGACTGGCACAGAGCAATGGCTAGCTCCAAGGGAACACAGAGT
GTGAAAGACTTGATGCACCCAGGCAAAAACGCTTTGCTCCCTCCAAAGATTCCGTTTCCT
ACCGTA

QA 4 249 4 249
DS 

RD RR2G370TF 763 0 0
GGATTCAATCTCCCATTCATCAACGATAAGAGGAGACAGATAGGCAACAGAGTTTCTTTA
CAGATTCCAACACCCCCCAACGACCTTCTTCTCCTTTTCTTGTACGGACCAAACCCATCA
TTCTCAACTTCTTCGATTCGGATCCATTTTCTCAATCCTCGATTTCTCCGACTGGCAGAG
AGCAATGGCTAGCTCCAAGGGAACACAGAGTGTGAAAGACTTGATGCACCCAGGCAAAAA
CGCTTTGCTCCCTCCAAAGATTCCGTTTCCTACCGTATCAGCACCATACTCCGAGTATAT
CCCCATTGCTTCAAGGCACGGTCACAAACTTAACGATGAGAAACCGCACCAGCGGACTTC
CTCCGAGAGCGATTTGGTTGAAGAGCCTCCCTCTTGGCTTGATGATCTCCTCAATGAGCC
GGAGAGCCCTGTTCGCAAATGCGGTCATCGCCGCTCGTCCAGTGACTCTTACGCTTACCT
AGACATGGCTAATGCTAAAAACATTAGCTTGACTCTCCAAAACGATTTCAGTTATAGGAA
TATGGGTTCTTCTCCCTCTCAGAGAGGTGGGGTTCATGAGCTTGATTGGAGCAGAAACGC
TCAGGACGCTGCCTTCTACGCTGATTCTAATTTTCTAATCGTCAGAGGGATTCTTTGGTG
GCACCTGGTCCTCGTCCTTCTTGGCTACCTTTTACTAGAGAGAGTGCTGGTGGAAAACAC
ATGGGACCTTCATCGTATATGCCTCAGAAGCACCAGAGGCAAG

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL4865Contig1 1405 2 2 U
GGATCCAACGCAAGGACACATCACTCCAATCCGCCAATTCTGTAAACGACTCATCTCTAA
AGGTCTTAAAACCACTCTCACTCTCACCACTTTTGTCTTCAACTCCATCAAACCTATCCA
TCTGGTCCAGTCTCCATAGCCACCATCTCCGACGGCTATGACCAGGGCTGCAAGTCACCA
TACACCATCCACGAGTACCTCCAAAACTTCAAAACCTTCGGTTCCAGAACCATAGCAGAC
ATCATCCGCAAACACCAGACAAGTGATAGTCCTATCACTTGTATGGTCTATGATGCTTTC
ATGCCATGGGCACTCGACATTGCCCAAGAATTTGGTTTAGCTGCAGCTCCTTTCTTTACG
CAGTCTTGTGCTGTTAACTACGTTTACTATCTTTCTTACATAAACCATGGAAGCTTGAAG
CTTCCCATTGAAGACTTGTCTTTTCTTGAGCTTCAAGATTTGCCTTCTTTTTTATCTGTT
TCTGGATCTTACCCTGCTTTCCTTGAGATGGTGCTCCAACAGTTTACAAACTTTGAAAAA
GCTGATTTCATACTCGTTAATACCTTCCAAGAGCTGGAGCTTCATGAGAAAGAGTTGTTG
TCGAAAGTTTGTCCTGTGTTGACAATTGGTCCGACTGTTCCATCAATGTACGTAGACCAA
AGGATCAAATCAGACACAGACTACGATCTGATTCTTTTTGATTCGAAAGATGCTGCCTTC
TGCACTAGCTGGCTGGACACAAGGCCACAAGGGTCGGTGGTGTATGTAGCATTTGGGAGC
CTTGCTAAGCTGAGCAATATGCAGATGGAGGAGCTTGCTTTAGCAGTAAGTAACTTCAGC
TTCCTGTGGGTTGTCAGAGATTCAGAGGAGGAAAAACTGCCATCAGGGTTTCTTGAGACA
CTCGATAAAGACAAGAGTTTGGTCTTGAAATGGAGTCCTCAGCTTGAAGTTCTATCAAAC
AAAGCTATGGGTTGTTTCTTGACTCATTGTGGCTGGAACTCAACTATGGAGGCATTAACC
TTTGGTGTTCCCATGGTGGCTATGCCTCAATGGACTGATCAACCTATGAACGCAAAGTAC
ATACAAGATGTGTGGAAGGTTGGAGTTAGTGTGAAGACTGACAATGAGAGTGGGATTGCA
AAGAGGGAAGAGATTGAGCTAAGCATTAAGGAAGTGATGGAAGGAGAGAAGAGCAAAGAG
ATGAAGGAGAATGCAAAGAAATGGAGGGACTTGGCTGTGAAGTCATCCAGTGAAGGAGGT
TCTACAGATGTTAACATTGACACATTTGTGTCAACGGTTCAGAGCAAATAAGATATCACA
TGAAGTATAAAAAATATCTTCTATAGTGTCTTGTCGGGCTAGTCTTTCATTCAGTGTAAT
CTTTAAGTTGATTCTTCAATTTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ90TF U 1
AF RR2GZ90JQ C 615
BS 1 730 RR2GZ90TF
BS 731 1405 RR2GZ90JQ

RD RR2GZ90TF 730 0 0
GGATCCAACGCAAGGACACATCACTCCAATCCGCCAATTCTGTAAACGACTCATCTCTAA
AGGTCTTAAAACCACTCTCACTCTCACCACTTTTGTCTTCAACTCCATCAAACCTATCCA
TCTGGTCCAGTCTCCATAGCCACCATCTCCGACGGCTATGACCAGGGCTGCAAGTCACCA
TACACCATCCACGAGTACCTCCAAAACTTCAAAACCTTCGGTTCCAGAACCATAGCAGAC
ATCATCCGCAAACACCAGACAAGTGATAGTCCTATCACTTGTATGGTCTATGATGCTTTC
ATGCCATGGGCACTCGACATTGCCCAAGAATTTGGTTTAGCTGCAGCTCCTTTCTTTACG
CAGTCTTGTGCTGTTAACTACGTTTACTATCTTTCTTACATAAACCATGGAAGCTTGAAG
CTTCCCATTGAAGACTTGTCTTTTCTTGAGCTTCAAGATTTGCCTTCTTTTTTATCTGTT
TCTGGATCTTACCCTGCTTTCCTTGAGATGGTGCTCCAACAGTTTACAAACTTTGAAAAA
GCTGATTTCATACTCGTTAATACCTTCCAAGAGCTGGAGCTTCATGAGAAAGAGTTGTTG
TCGAAAGTTTGTCCTGTGTTGACAATTGGTCCGACTGTTCCATCAATGTACGTAGACCAA
AGGATCAAATCAGACACAGACTACGATCTGATTCTTTTTGATTCGAAAGATGCTGCCTTC
TGCACTAGCT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2GZ90JQ 791 0 0
TGTGTTGACAATTGGTCCGACTGTTCCATCAATGTACGTAGACCAAAGGATCAAATCAGA
CACAGACTACGATCTGATTCTTTTTGATTCGAAAGATGCTGCTTTCTGCACTAGCTGGCT
GGACACAAGGCCACAAGGGTCGGTGGTGTATGTAGCATTTGGGAGCCTTGCTAAGCTGAG
CAATATGCAGATGGAGGAGCTTGCTTTAGCAGTAAGTAACTTCAGCTTCCTGTGGGTTGT
CAGAGATTCAGAGGAGGAAAAACTGCCATCAGGGTTTCTTGAGACACTCGATAAAGACAA
GAGTTTGGTCTTGAAATGGAGTCCTCAGCTTGAAGTTCTATCAAACAAAGCTATGGGTTG
TTTCTTGACTCATTGTGGCTGGAACTCAACTATGGAGGCATTAACCTTTGGTGTTCCCAT
GGTGGCTATGCCTCAATGGACTGATCAACCTATGAACGCAAAGTACATACAAGATGTGTG
GAAGGTTGGAGTTAGTGTGAAGACTGACAATGAGAGTGGGATTGCAAAGAGGGAAGAGAT
TGAGCTAAGCATTAAGGAAGTGATGGAAGGAGAGAAGAGCAAAGAGATGAAGGAGAATGC
AAAGAAATGGAGGGACTTGGCTGTGAAGTCATCCAGTGAAGGAGGTTCTACAGATGTTAA
CATTGACACATTTGTGTCAACGGTTCAGAGCAAATAAGATATCACATGAAGTATAAAAAA
TATCTTCTATAGTGTCTTGTCGGGCTAGTCTTTCATTCAGTGTAATCTTTAAGTTGATTC
TTCAATTTTTA

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL4866Contig1 913 2 2 U
GTCTTAGCTCTGTATAAATATATCGGCAAGAGCTTCGGTGCCTAAACTAAACGTAGTGTT
GTCATCAAAGGTTGTATCTGTGTTCTTCTTTGCCTCTTCTTCGTCAAGCGATCTTCCATC
TTCTTCATCCCAAGCGTTGCCAGTTACGGATTAATACCCCTACAACCCTCATTTAATCTT
TAATCCTCGATCTACATTCAATGAGAATTTTTTTTCTCTAAAAGACGGTGGAGGTTGTAC
TATCAAAAAAGATTTTCATCTTTCATGAATCTTAAAAGAGATCTCAAAACGTCGGCAGCC
AGCCATGGCTATCACTAAAGTCCATAGAACTATGATCCTGCTAAATAAAGCTAAGATCCA
AATTTGGCTATTTAAACAGAAAGATCTGGGCACTGAAGAAATATTAATATCTGAGCGAGA
GTATGAGACTGGGTAATTGATGTCTCTTGGGTTTTGCAAGTGTCCAAGAATTCCGGGTGT
TTTCTTGGTACTTATGGTCTCTTATGTTGATCTAGAGTACAAAAAATACACAGTGATATA
GATCGATCATCAATTACTTGGAGATGCAATCCATTATCTCAACGACCGTTTGCAGAGGAT
GAATGATCTTCACAACGAACTTCGGTCAACTCCACCTGGATCTTTGCCTCCAGCTTCAAC
AAGTTTCCATCCATTAACACTTACACCTCGTACTCTTTCTTTCCGTGTGAAGGAAGAGCT
ATGTCCCTCATACCGAGCCTTAAAGGACAACAATCAAGAGTAAACAAAGCTTCATGGGTA
GTTTTCGTTTCATAGAGTAGTTTTCGTTTCATGTGTTTTTGTTATCTACATGTTGAGGTT
AGACTAAGGGAAGGAAGACCAGTCAACATTTGCGTGATTTGTTTGGCTTGAATGTTGTTC
ACGTTGAGGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP54TF U 1
AF RR2GP54JQ C 235
BS 1 463 RR2GP54TF
BS 464 913 RR2GP54JQ

RD RR2GP54TF 465 0 0
GTCTTAGCTCTGTATAAATATATCGGCAAGAGCTTCGGTGCCTAAACTAAACGTAGTGTT
GTCATCAAAGGTTGTATCTGTGTTCTTCTTTGCCTCTTCTTCGTCAAGCGATCTTCCATC
TTCTTCATCCCAAGCGTTGCCAGTTACGGATTAATACCCCTACAACCCTCATTTAATCTT
TAATCCTCGATCTACATTCAATGAGAATTTTTTTTCTCTAAAAGACGGTGGAGGTTGTAC
TATCAAAAAAGATTTTCATCTTTCATGAATCTTAAAAGAGATCTCAAAACGTCGGCAGCC
AGCCATGGCTATCACTAAAGTCCATAGAACTATGATCCTGCTAAATAAAGCTAAGATCCA
AATTTGGCTATTTAAACAGAAAGATCTGGGCACTGAAGAAATATTAATATCTGAGCGAGA
GTATGAGACTGGGTAATTGATGTCTCTTGGGTTTTGCAAGTGT
TC

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2GP54JQ 679 0 0
TTGTACTATCAAAAAAGATTTTCATCTTTCATGAATCTTAAAAGAGATCTCAAAACGTCG
GCAGCCAGCCATGGCTATCACTAAAGTCCATAGAACTATGATCCTGCTAAATAAAGCTAA
GATCCAAATTTGGCTATTTAAACAGAAAGATCTGGGCACTGAAGAAATATTAATATCTGA
GCGAGAGTATGAGACTGGGTAATTGATGTCTCTTGGGTTTTGCAAGTGTCCAAGAATTCC
GGGTGTTTTCTTGGTACTTATGGTCTCTTATGTTGATCTAGAGTACAAAAAATACACAGT
GATATAGATCGATCATCAATTACTTGGAGATGCAATCCATTATCTCAACGACCGTTTGCA
GAGGATGAATGATCTTCACAACGAACTTCGGTCAACTCCACCTGGATCTTTGCCTCCAGC
TTCAACAAGTTTCCATCCATTAACACTTACACCTCGTACTCTTTCTTTCCGTGTGAAGGA
AGAGCTATGTCCCTCATACCGAGCCTTAAAGGACAACAATCAAGAGTAAACAAAGCTTCA
TGGGTAGTTTTCGTTTCATAGAGTAGTTTTCGTTTCATGTGTTTTTGTTATCTACATGTT
GAGGTTAGACTAAGGGAAGGAAGACCAGTCAACATTTGCGTGATTTGTTTGGCTTGAATG
TTGTTCACGTTGAGGTTAC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL4867Contig1 698 2 6 U
GGAAGGCGTGGCAGAGAAGGTGATTTGGTTGTTGGTGGTCTTTTGAACCAGTTTCTCACT
GAACTGCACGGTGGAGATAGACGTGACGTTTATGTCATCGGAGCTACGAACAGGCTCGAT
GTGATTGATCCTGCCTTCTTGAGACCAGGTAGGTTTGGGAATCGTGTGTACGTACCCCTC
CCTAACGCGGATGAGCGTGTTTCGATCCTAAAATCCATTGCAAAGAAGAGACCCATAGAT
CCTAGTGCTGATCTGGATGCCATTGCAAACAAGTACTGTGAAGGTTTCAGCGGAGCTGAT
CTCGCTAACCTGATGGACCAAGCTATACACGTGGCTGTGAAGGAGAAGTTCCAGTCCATT
GAGTCGTCTGAAGATGGCGATATGGATTCTAGTGATTGCACCATCAAGATGACTCATTTC
AAGCAAGCCTTGTCCTTAGTCACACCATCTGTCAGCAAACAGCAAATAAAACACTACGAG
GAACAACGGAAGAAATATCAAAGCAGCACCAACATGGACCAAATCAACGTAGGACCATCT
TTTGCCCTCGAGTGATTTAAAAAAATAAATAAAATAGAACTCTCTTAATTTATAAGTAAA
AAAACTTTTCCCCTTGCGGGAATTACCATTTGCTTTTGTTTTTTTTTTTTTTCCCAACTT
GAGACATTCAATCATATGGACTCTAAGTTTTGTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG96TF U 1
AF RR2CG96JQ C 393
BS 1 564 RR2CG96TF
BS 565 565 RR2CG96JQ
BS 566 603 RR2CG96TF
BS 604 604 RR2CG96JQ
BS 605 647 RR2CG96TF
BS 648 698 RR2CG96JQ

RD RR2CG96TF 647 0 0
GGAAGGCGTGGCAGAGAAGGTGATTTGGTTGTTGGTGGTCTTTTGAACCAGTTTCTCACT
GAACTGCACGGTGGAGATAGACGTGACGTTTATGTCATCGGAGCTACGAACAGGCTCGAT
GTGATTGATCCTGCCTTCTTGAGACCAGGTAGGTTTGGGAATCGTGTGTACGTACCCCTC
CCTAACGCGGATGAGCGTGTTTCGATCCTAAAATCCATTGCAAAGAAGAGACCCATAGAT
CCTAGTGCTGATCTGGATGCCATTGCAAACAAGTACTGTGAAGGTTTCAGCGGAGCTGAT
CTCGCTAACCTGATGGACCAAGCTATACACGTGGCTGTGAAGGAGAAGTTCCAGTCCATT
GAGTCGTCTGAAGATGGCGATATGGATTCTAGTGATTGCACCATCAAGATGACTCATTTC
AAGCAAGCCTTGTCCTTAGTCACACCATCTGTCAGCAAACAGCAAATAAAACACTACGAG
GAACAACGGAAGAAATATCAAAGCAGCACCAACATGGACCAAATCAACGTAGGACCATCT
TTTGCCCTCGAGTGATTTAAAAAA*TAAATAAAATAGAACTCTCTTAATTTATAAGTAAA
AAA*CTTTTCCCCTTGCGGGAATTACCATTTGCTTTTGTTTTTTTTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2CG96JQ 306 0 0
TGATTGCACCATCAAGATGACTCATTTCAAGCAAGCCTTGTCCTTAGTCACACCATTTGT
CAGCAAACAGCAAATAAAACACTACGAGGAACAACGGAAGAAATATCAAAGCAGCACCAA
CATGGACCAAATCAACGTAGGACCATTTTTTGCCCTCGAGTGATTTAAAAAAATAAATAA
AATAGAACTTTTTTAATTTATAAGTAAAAAAACTTTTCCCCTTGCGGGAATTACCATTTG
CTTTTGTTTTTTTTTTTTTTCCCAACTTGAGACATTCAATCATATGGACTCTAAGTTTTG
TGTGTT

QA 1 306 1 306
DS 



AS 1 2

CO CL4868Contig1 1002 2 2 U
GGAAAGCCAAAACCAAATCCCCTTTAATTCAATTTCAAAATCGAACCACCACCACCGAGA
AACCCTACGACTGCTCTGTCCCCCAATGGATATAGCTCTCTTCTCGCCGTCCTCCCTCTT
CGCCGGTGACGATGACTCCTCGGATGGAGAGACGACGGAGACTAGCCAGAGCTTCGTTGA
TAGGAATCACCAGTTTCCTGGAATGGAATTGAATATCCGGGAATTCGGTTTCCACCAGCT
GAATGCAAACTTGCTCTGGCCTGGTTCATTCGCCTTCGCTGATTGGTTAGTTCAACATCC
CCACCTCATCCGTAACCGCCGCTGTCTCGAGATTGGAAGCGGCACGGGTGCTCTAGCTAT
TTTCCTTAAAAAGGAGTTTAATCTAGACATAACTACTTCAGACTACGATGACCAGGAGAT
TCAAGACAACATTGCTCATAACTGTGTTGCAAACAACATCACCCCTTCTCTCCCCCATAT
CAACCATACATGGGGAGATGAATTTCCAACCTCAGTACCAGATTGGGATTTGATCATTGC
CAGTGATATCCTTCTATATGTGAAACAGTACCCAAACTTGATAAAGTCTCTCTCTTTTCT
TCTCAAGTCCTACAAACCTAAAGACACCACCAATGCCGTTCGTCCAGCAGAGCGCAAGCT
AAATGTAGGATCAGAGTCTGATATGCTACCGTGGCCGGTGTTCTTAATGAGTTGGAGAAG
AAGGATTGGGAAAGAGGATGAGTCTTTATTCTTTAGTGGTTGCCAAGAAGCTGGCCTCGA
GGTGGAGCATCTTGGAAACCGAGTTTATTGCATCAGCCTTAGAGAAACCAACCTCTGAAG
AATACGTTACTATACTACTCCCCTCATGAGTCTGGTCTCCTTCCGCAGATTGTTCGCCTC
CGAAATTAGTATTACTCTTGCAGCTTATTTGGATTTGCGTCTCTTTTTATTTGGGTCAAA
GTTAGAGGTGAAATGAGATACTGTTGTAGATTGAACTTTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB15TF U 1
AF RR2CB15JQ C 474
BS 1 706 RR2CB15TF
BS 707 1002 RR2CB15JQ

RD RR2CB15TF 714 0 0
GGAAAGCCAAAACCAAATCCCCTTTAATTCAATTTCAAAATCGAACCACCACCACCGAGA
AACCCTACGACTGCTCTGTCCCCCAATGGATATAGCTCTCTTCTCGCCGTCCTCCCTCTT
CGCCGGTGACGATGACTCCTCGGATGGAGAGACGACGGAGACTAGCCAGAGCTTCGTTGA
TAGGAATCACCAGTTTCCTGGAATGGAATTGAATATCCGGGAATTCGGTTTCCACCAGCT
GAATGCAAACTTGCTCTGGCCTGGTTCATTCGCCTTCGCTGATTGGTTAGTTCAACATCC
CCACCTCATCCGTAACCGCCGCTGTCTCGAGATTGGAAGCGGCACGGGTGCTCTAGCTAT
TTTCCTTAAAAAGGAGTTTAATCTAGACATAACTACTTCAGACTACGATGACCAGGAGAT
TCAAGACAACATTGCTCATAACTGTGTTGCAAACAACATCACCCCTTCTCTCCCCCATAT
CAACCATACATGGGGAGATGAATTTCCAACCTCAGTACCAGATTGGGATTTGATCATTGC
CAGTGATATCCTTCTATATGTGAAACAGTACCCAAACTTGATAAAGTCTCTCTCTTTTCT
TCTCAAGTCCTACAAACCTAAAGACACCACCAATGCCGTTCGTCCAGCAGAGCGCAAGCT
AAATGTAGGATCAGAGTCTGATATGCTACCGTGGCCGGTGTTCTTA
TGAGTGGA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2CB15JQ 529 0 0
CCCATATCAACCATACATGGGGAGATGAATTTCCAACCTCAGTACCAGATTGGGATTTGA
TCATTGCCAGTGATATCCTTCTATATGTGAAACAGTACCCAAACTTGATAAAGTCTCTCT
CTTTTCTTCTCAAGTCCTACAAACCTAAAGACACCACCAATGCCGTTCGTCCAGCAGAGC
GCAAGCTAAATGTAGGATCAGAGTTTGATATGCTACCGTGGCCGGTGTTCTTAATGAGTT
GGAGAAGAAGGATTGGGAAAGAGGATGAGTCTTTATTCTTTAGTGGTTGCCAAGAAGCTG
GCCTCGAGGTGGAGCATCTTGGAAACCGAGTTTATTGCATCAGCCTTAGAGAAACCAACC
TCTGAAGAATACGTTACTATACTACTCCCCTCATGAGTCTGGTCTCCTTCCGCAGATTGT
TCGCCTCCGAAATTAGTATTACTCTTGCAGCTTATTTGGATTTGCGTCTCTTTTTATTTG
GGTCAAAGTTAGAGGTGAAATGAGATACTGTTGTAGATTGAACTTTTAA

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL4869Contig1 1309 2 6 U
GGAATTGTTTCTAGTTCCCGAGTGAGTGAGTTTGGAATAGGAACACGTTTGTTGTTTCAT
CTCCACAAGAGAATGGAGTCTGCCTTGGCGACATCGAGTTTCATGGGTACCCAAGTGATG
GTTCCCGCCACTCCGTTTTGCAGACGAGCTCGAGTAGCGTCTCTCACCGTCACGGCAAGT
AGCACTACTAAGATTTACACGAGGCTCGACTCTTGTCTCGTGATTCCTCCTCCCCCCATT
TTCAAGAAACCGCGCGCCATTATCAAGTTCTTGGGAGGCGCCTTCGTCGGAGCTGTCCCT
GAACTCACCTACAGTTACCTAAAGGAGCTACTGGCTAAAGAAGGGTATTTAATTGTATCT
GTGCCGTATAACGTTACTTTTGATCACGAACAAGCTGCAAAGCAGGTTTACCAGAGGTTC
AACTCCTGCTTGGACACGATTGTCTTATCTGGAGTTCCAAATGCCACTTTTAACCCTCGA
GATCTAGCCAACCTTCCTGTTTTCTCTGTTGGTCACAGTAATGGTGCGCTGCTCCAAGTC
TTGACCGGAAGTTATTTTTCTGACAAGATACCAAAGGTTAATGCCATCATTTCATTCAAC
AACAAATCAGCCACAGAGGCTGTTCCATATTTTGAGCAGCTTGGTCCTCTCATGCAGCAG
ATGATGCCAGTCGTGGAAGCTTCTCCGTTATATGAAATAGCTCGAAATGCTTCAGGTGGT
GCGTTGAAAGTACTACTGGATGCCGCTGGGACAACGATTCTGAACAATGATCAAGAAGCT
CTTAAGTCGTTTACTAATTTGGTGGATCAGTTGCCCTCAGTATTTGGTGAGGTTGGACAA
GGGGTGTCGGAATTCAGACCATCACCACTTGAGAATCGTACTTGCTTCAAATGCTCCTAC
AGCGTTCCACACACTTTACTGGTACAATTCAACTCTGATGCAATCGACGAGACTGATTTA
CTGGAAGAGACCCTAAGGCCTCGGGTAGAATCTTTTGGTGGTTCACTTGAAAAGGTTCGG
CTGAACGGAAACCATCTCACACCTTGCGTACAGGACCCGAAGTGGCAAATTGGGTCTGTC
TACACGCCAGCAGACGCTGTGGCTCAGGCGCTGAAGGCAATACCTCTGAGGGACACCCGT
GTTCTTTCAAGGACAATCGTCGATTGGTTTACAAGGTTTGAGAATTGAGCCAGGCTCGTG
GTGTATTGTTAAAGAAATGGTCAAATATGCATGTATATGTACATGGTTCATGGTATTTGA
AATAAAAATATTTATGTGTATATTTCGATAAATGACATAGATAGGTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH40TF U 1
AF RR2FH40JQ C 515
BS 1 706 RR2FH40TF
BS 707 707 RR2FH40JQ
BS 708 715 RR2FH40TF
BS 716 716 RR2FH40JQ
BS 717 753 RR2FH40TF
BS 754 1309 RR2FH40JQ

RD RR2FH40TF 767 0 0
GGAATTGTTTCTAGTTCCCGAGTGAGTGAGTTTGGAATAGGAACACGTTTGTTGTTTCAT
CTCCACAAGAGAATGGAGTCTGCCTTGGCGACATCGAGTTTCATGGGTACCCAAGTGATG
GTTCCCGCCACTCCGTTTTGCAGACGAGCTCGAGTAGCGTCTCTCACCGTCACGGCAAGT
AGCACTACTAAGATTTACACGAGGCTCGACTCTTGTCTCGTGATTCCTCCTCCCCCCATT
TTCAAGAAACCGCGCGCCATTATCAAGTTCTTGGGAGGCGCCTTCGTCGGAGCTGTCCCT
GAACTCACCTACAGTTACCTAAAGGAGCTACTGGCTAAAGAAGGGTATTTAATTGTATCT
GTGCCGTATAACGTTACTTTTGATCACGAACAAGCTGCAAAGCAGGTTTACCAGAGGTTC
AACTCCTGCTTGGACACGATTGTCTTATCTGGAGTTCCAAATGCCACTTTTAACCCTCGA
GATCTAGCCAACCTTCCTGTTTTCTCTGTTGGTCACAGTAATGGTGCGCTGCTCCAAGTC
TTGACCGGAAGTTATTTTTCTGACAAGATACCAAAGGTTAATGCCATCATTTCATTCAAC
AACAAATCAGCCACAGAGGCTGTTCCATATTTTGAGCAGCTTGGTCCTCTCATGCAGCAG
ATGATGCCAGTCGTGGAAGCTTCTCCGTTATATGAAATAGCTCGAA*TGCTTCAG*TGGT
GCGTTGAAAGTACTACTGGATGCCGCTGGGACA
CGATCTGACATGAT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2FH40JQ 795 0 0
ACAGTAATGGTGCGCTGCTCCAAGTCTTGACCGGAAGTTATTTTTCTGACAAGATACCAA
AGGTTAATGCCATCATTTCATTCAACAACAAATCAGCCACAGAGGCTGTTCCATATTTTG
AGCAGCTTGGTCCTCTCATGCAGCAGATGATGCCAGTCGTGGAAGCTTCTCCGTTATATG
AAATAGCTCGAAATGCTTCAGGTGGTGCGTTGAAAGTACTACTGGATGCCGCTGGGACAA
CGATTCTGAACAATGATCAAGAAGCTCTTAAGTCGTTTACTAATTTGGTGGATCAGTTGC
CCTCAGTATTTGGTGAGGTTGGACAAGGGGTGTCGGAATTCAGACCATCACCACTTGAGA
ATCGTACTTGCTTCAAATGCTCCTACAGCGTTCCACACACTTTACTGGTACAATTCAACT
CTGATGCAATCGACGAGACTGATTTACTGGAAGAGACCCTAAGGCCTCGGGTAGAATCTT
TTGGTGGTTCACTTGAAAAGGTTCGGCTGAACGGAAACCATCTCACACCTTGCGTACAGG
ACCCGAAGTGGCAAATTGGGTCTGTCTACACGCCAGCAGACGCTGTGGCTCAGGCGCTGA
AGGCAATACCTCTGAGGGACACCCGTGTTCTTTCAAGGACAATCGTCGATTGGTTTACAA
GGTTTGAGAATTGAGCCAGGCTCGTGGTGTATTGTTAAAGAAATGGTCAAATATGCATGT
ATATGTACATGGTTCATGGTATTTGAAATAAAAATATTTATGTGTATATTTCGATAAATG
ACATAGATAGGTCAT

QA 1 795 1 795
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4871Contig1 633 2 2 U
GGAGTCTCTCACTTTCCGATCGCTTCGCCGTCGCAGAAATGACGAAGCTCAGGAAGCTCG
GCCGGCACACGGGTCACCGTATGTCCATGCTCAGGACGCTGGTTTCTCAATTGGTGAAAC
ACGAGCGAATTGAGACCACTGTAACTAAGGCTAAAGAGGTTCGTCGTCTTGCCGATAACA
TGGTTCAACTCGGCAAAGAGGGCTCACTCGATGCAGCTAGACGAGCTGCTGGGTTTGTTA
GAGGAGACGATGTGATTCACAAGATCTTCACAGAGTTTGCTTATCGATACAAAGATAGAG
CTGGTGGATACACAAGAATGCTTCGCACTCGCATACGAGTTGGTGACGCTGCACCAATGG
CCTATATCGAGTTTATCGATAGAGAGAATGAGCTAAGACAATCAAACCCACCAACACCTC
AACCGCCACAACGAGTCCCGCTCGACCCATGGGCCAGATCACGTCTCATGAGGCAGTACG
CACCACCAAAGGAGGAGAAAATTTCTGATTCCGATCTATTATAAACATAAAAGATCTCTT
TTGCTCTCTCCCACCAAGAGATCATGTTTTTGTTGTCTCTCCTTGAACACATATCCTGTT
TGTGTCACACTATCATTCAATACATGTTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL26TF U 1
AF RR2EL26JQ C 397
BS 1 621 RR2EL26TF
BS 622 633 RR2EL26JQ

RD RR2EL26TF 621 0 0
GGAGTCTCTCACTTTCCGATCGCTTCGCCGTCGCAGAAATGACGAAGCTCAGGAAGCTCG
GCCGGCACACGGGTCACCGTATGTCCATGCTCAGGACGCTGGTTTCTCAATTGGTGAAAC
ACGAGCGAATTGAGACCACTGTAACTAAGGCTAAAGAGGTTCGTCGTCTTGCCGATAACA
TGGTTCAACTCGGCAAAGAGGGCTCACTCGATGCAGCTAGACGAGCTGCTGGGTTTGTTA
GAGGAGACGATGTGATTCACAAGATCTTCACAGAGTTTGCTTATCGATACAAAGATAGAG
CTGGTGGATACACAAGAATGCTTCGCACTCGCATACGAGTTGGTGACGCTGCACCAATGG
CCTATATCGAGTTTATCGATAGAGAGAATGAGCTAAGACAATCAAACCCACCAACACCTC
AACCGCCACAACGAGTCCCGCTCGACCCATGGGCCAGATCACGTCTCATGAGGCAGTACG
CACCACCAAAGGAGGAGAAAATTTCTGATTCCGATCTATTATAAACATAAAAGATCTCTT
TTGCTCTCTCCCACCAAGAGATCATGTTTTTGTTGTCTCTCCTTGAACACATATCCTGTT
TGTGTCACACTATCATTCAAT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2EL26JQ 237 0 0
GACAATCAAACCCACCAACACCTCAACCGCCACAACGAGTCCCGCTCGACCCATGGGCCA
GATCACGTCTCATGAGGCAGTACGCACCACCAAAGGAGGAGAAAATTTCTGATTCCGATC
TATTATAAACATAAAAGATCTCTTTTGCTCTCTCCCACCAAGAGATCATGTTTTTGTTGT
CTCTCCTTGAACACATATCCTGTTTGTGTCACACTATCATTCAATACATGTTTTGAC

QA 1 237 1 237
DS 



AS 1 2

CO CL4872Contig1 279 2 2 U
CTACCCTTTTTGACTTTCTATTTATCTTAGTCTTTGAAATAGTTTCTTTTTTATACATTT
ATAATTTTTTATACTGCTATACATCACAATTCTATATTTGATTTTTTGGGAGCTTCAAAA
GAATCATCATCATCATATCATCTTCTCAAACTTATCAAGCTTATTTACCCTTTGCATAGA
TCTCAATACCAATAACATGAATATCCCTGCACCAACGAAGGATCCATTAGCAACAAGCTG
ACTTCCTTGGTTGCTAAACGTAACCCCAATGTTAAGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G812TF C 1
AF RR2G812JQ U 47
BS 1 46 RR2G812TF
BS 47 279 RR2G812JQ

RD RR2G812TF 279 0 0
CTACCCTTTTTGACTTTCTATTTATCTTAGTCTTTGAAATAGTTTCTTTTTTATACATTT
ATAATTTTTTATACTGCTATACATCACAATTCTATATTTGATTTTTTGGGAGCTTCAAAA
GAATCATCATCATCATATCATCTTCTCAAACTTATCAAGCTTATTTACCCTTTGCATAGA
TCTCAATACCAATAACATGAATATCCCTGCACCAACGAAGGATCCATTAGCAACAAGCTG
ACTTCCTTGGTTGCTAAACGTAACCCCAATGTTAAGCAC

QA 1 279 1 279
DS 

RD RR2G812JQ 233 0 0
TTTTTTATACATTTATAATTTTTTATACTGCTATACATCACAATTCTATATTTGATTTTT
TGGGAGCTTCAAAAGAATCATCATCATCATATCATCTTCTCAAACTTATCAAGCTTATTT
ACCCTTTGCATAGATCTCAATACCAATAACATGAATATCCCTGCACCAACGAAGGATCCA
TTAGCAACAAGCTGACTTCCTTGGTTGCTAAACGTAACCCCAATGTTAAGCAC

QA 1 233 1 233
DS 



AS 1 2

CO CL4873Contig1 609 2 2 U
TTTTTCAGTCCTCCTCAAGTTCCTGAGGACGAAGATGATCTTGATGATGACATGGCTGAT
GAACTCCAAGGCGAGATGGAGCATGACTATGATATCGGGTCAACCATTAAAGAGAAAATC
ATCTCGCATGCTGTGTCATGGTTCACTGGTGGAGCTGTTGATCCAGATGACCGTGATATT
GATGAGGATGAGGATGATGATGATGAGATTGATGAAGATGACGAGGAAGATGATGAGGAA
GAGGATGATGATGATGAAGAGGATGAAGAGGAAGAGCAAGGAAAGAAGAGCAGAAAGAAG
TCGTCAGCTGGGCACAAGGTTTAACAATCACTCAAATCTCAACCAAGTCTGGAAGAAGTC
AACTTGCAGAAGGTCAACAAGGTGAGAGGCCAGCGGAGTGTAAGCAGCAGTGAGTAATGA
TGAAGAAGAGTCAGTGAGGTCTTTCGTGTTTTTTTTTTTAATTTAAGAGTCATGGTCCGG
TTTATATGATATAAATCAAGTTTTGGGTAATGGTTTGTTTGAAAAAAAATGTTCTGTGGT
TTGGGTTTTTGGTTGCGTCTGATTTTTTCATTTGTAATGCGTTGTTGTTCTTCATGAACT
GGTTTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU07TF U 1
AF RR2GU07JQB C 230
BS 1 464 RR2GU07TF
BS 465 609 RR2GU07JQB

RD RR2GU07TF 464 0 0
TTTTTCAGTCCTCCTCAAGTTCCTGAGGACGAAGATGATCTTGATGATGACATGGCTGAT
GAACTCCAAGGCGAGATGGAGCATGACTATGATATCGGGTCAACCATTAAAGAGAAAATC
ATCTCGCATGCTGTGTCATGGTTCACTGGTGGAGCTGTTGATCCAGATGACCGTGATATT
GATGAGGATGAGGATGATGATGATGAGATTGATGAAGATGACGAGGAAGATGATGAGGAA
GAGGATGATGATGATGAAGAGGATGAAGAGGAAGAGCAAGGAAAGAAGAGCAGAAAGAAG
TCGTCAGCTGGGCACAAGGTTTAACAATCACTCAAATCTCAACCAAGTCTGGAAGAAGTC
AACTTGCAGAAGGTCAACAAGGTGAGAGGCCAGCGGAGTGTAAGCAGCAGTGAGTAATGA
TGAAGAAGAGTCAGTGAGGTCTTTCGTGTTTTTTTTTTTAATTT

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2GU07JQB 380 0 0
ATGATGAGGAAGAGGATGATGATGATGAAGAGGATGAAGAGGAAGAGCAAGGAAAGAAGA
GCAGAAAGAAGTCGTCAGCTGGGCACAAGGTTTAACAATCACTCAAATTTCAACCAAGTC
TGGAAGAAGTCAACTTGCAGAAGGTCAACAAGGTGAGAGGCCAGCGGAGTGTAAGCAGCA
GTGAGTAATGATGAAGAAGAGTCAGTGAGGTCTTTCGTGTTTTTTTTTTTAATTTAAGAG
TCATGGTCCGGTTTATATGATATAAATCAAGTTTTGGGTAATGGTTTGTTTGAAAAAAAA
TGTTCTGTGGTTTGGGTTTTTGGTTGCGTCTGATTTTTTCATTTGTAATGCGTTGTTGTT
CTTCATGAACTGGTTTGAGC

QA 1 380 1 380
DS 



AS 1 2

CO CL4874Contig1 1263 2 4 U
GGGTGATGGAATGTGTCATGGGAGGAGAATTATTCGACAGAATTGTTTCAAAAGGAAAAC
TATCGGAAACCGAGGGAAGAAAAATGTTTCAGCAGCTCATCGATGGAATCAGCTACTGTC
ACAGCAAAGGTGTTTTCCACAGGGATCTCAAGCTAGAGAATGTTCTTCTTGATGCAAATG
GACATATCAAGATCACTGACTTTGGCCTCAGTGCTCTGCCTCAGCATTTTAGGGATGATG
GATTGCTACATACAACCTGTGGAAGTCCTAACTACGTAGCGCCTGAGGTTTTAGCCAACA
GAGGCTACGATGGTGCAGCATCTGATATATGGTCGTGTGGTGTAATCCTCTATGTGATTC
TAACCGGATGTCTCCCTTTCGACGATAGAAACCTTGCAGTTCTCTACCAGAAGATATGCA
AAGGAGACCCACCAATACCAAGATGGTTATCACCAGGTGCAAGAACCATGGTCAAGAGAA
TGCTTGATCCAAATCCAGTCACGAGGATCACAGTCACGGGTATTAAAGCCAGCGAATGGT
TCAAGCAAGACTACACTCCTTCGGTTCCAGATGATGATGTTGACGAAAAAGAAGTTGACA
CAGATGATGATTCTTCCTCAATCCAAGAACTCGGATCTGAAGAAGGAAAGGGCAGTGATT
CACCAACTATCATTAACGCGTTTCAGTTAATCGGAATGTCTTCCTTCCTTGACCTGTCTG
GTTTCTTTGAACAAGAGGATGTATCAGAGAGGAGGATAAGATTCACTTCAAATAGCTCAG
CAAGAGATCTACTGGAGAAAATCGAAACCGCAGTTACAGAAATGGGACTCAGTGTACAAA
AGAAACATGCAAAGTTAAAAGTAAAGCAAGAAGAACCTAACCAGAAAGGTCAAGTTGGTT
TGTTAGTAACAGCTGAGGTTTTTGAGATAAAGCCGTCACTGAACGTGGTTGAGCTAAGAA
AATCTTATGGAGATTCATGTTTGTATAGACAGTTGTACGAGAGACTATTAAAAGACGTGG
GCACGTCCTCGCAGGAACAAGAGCTAGTATCATAGGTGTTGGTGTATTTACACCATCCAT
TGTTAATAACCTTTCATCAATATAAATACAAAAAGTTCAGTTTATACAATTAGTGCGAAA
AAAGTTGCCTTAGTATATAGAAAAAGTTGGCGAAAATCACCTGCTAATATACACGTATAT
ATTTTGTAAATATTTATGCACTAAATAGATTCATTTTCAATTAACAAGCACATTATAGGA
CTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2G802TF U 1
AF RR2G802JQ C 427
BS 1 648 RR2G802TF
BS 649 650 RR2G802JQ
BS 651 684 RR2G802TF
BS 685 1263 RR2G802JQ

RD RR2G802TF 684 0 0
GGGTGATGGAATGTGTCATGGGAGGAGAATTATTCGACAGAATTGTTTCAAAAGGAAAAC
TATCGGAAACCGAGGGAAGAAAAATGTTTCAGCAGCTCATCGATGGAATCAGCTACTGTC
ACAGCAAAGGTGTTTTCCACAGGGATCTCAAGCTAGAGAATGTTCTTCTTGATGCAAATG
GACATATCAAGATCACTGACTTTGGCCTCAGTGCTCTGCCTCAGCATTTTAGGGATGATG
GATTGCTACATACAACCTGTGGAAGTCCTAACTACGTAGCGCCTGAGGTTTTAGCCAACA
GAGGCTACGATGGTGCAGCATCTGATATATGGTCGTGTGGTGTAATCCTCTATGTGATTC
TAACCGGATGTCTCCCTTTCGACGATAGAAACCTTGCAGTTCTCTACCAGAAGATATGCA
AAGGAGACCCACCAATACCAAGATGGTTATCACCAGGTGCAAGAACCATGGTCAAGAGAA
TGCTTGATCCAAATCCAGTCACGAGGATCACAGTCACGGGTATTAAAGCCAGCGAATGGT
TCAAGCAAGACTACACTCCTTCGGTTCCAGATGATGATGTTGACGAAAAAGAAGTTGACA
CAGATGATGATTCTTCCTCAATCCAAGAACTCGGATCTGAAGAAGGAA**GGCAGTGATT
CACCAACTATCATTAACGCGTTTC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2G802JQ 837 0 0
ACCCACCAATACCAAGATG*TTATCACCAGGTGCAAGAACCATG*TCAAGAGAATGCTTG
ATCCAAATCCAGTCACGAGGATCACAGTCACGGGTAT*AAAGCCAGCGAATGGTTCAAGC
AAGACTACACTC*TTCGGTTCCAGATGATGATGTTGACGAAAAAGAAGTTGACACAGATG
ATGATTCTTCCTCAATCCAAGAACTCGGATCTGAAGAAGGGAAGGGCAGTGATTCACCAA
CTATCATTAACGCGTTTCAGTTAATCGGAATGTCTTCCTTCCTTGACCTGTCTGGTTTCT
TTGAACAAGAGGATGTATCAGAGAGGAGGATAAGATTCACTTCAAATAGCTCAGCAAGAG
ATCTACTGGAGAAAATCGAAACCGCAGTTACAGAAATGGGACTCAGTGTACAAAAGAAAC
ATGCAAAGTTAAAAGTAAAGCAAGAAGAACCTAACCAGAAAGGTCAAGTTGGTTTGTTAG
TAACAGCTGAGGTTTTTGAGATAAAGCCGTCACTGAACGTGGTTGAGCTAAGAAAATCTT
ATGGAGATTCATGTTTGTATAGACAGTTGTACGAGAGACTATTAAAAGACGTGGGCACGT
CCTCGCAGGAACAAGAGCTAGTATCATAGGTGTTGGTGTATTTACACCATCCATTGTTAA
TAACCTTTCATCAATATAAATACAAAAAGTTCAGTTTATACAATTAGTGCGAAAAAAGTT
GCCTTAGTATATAGAAAAAGTTGGCGAAAATCACCTGCTAATATACACGTATATATTTTG
TAAATATTTATGCACTAAATAGATTCATTTTCAATTAACAAGCACATTATAGGACTG

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 2

CO CL4875Contig1 990 2 2 U
GGAAACAAAACCAACTTGACAACCGACAGCGAACAAGATCAAAAGACCTCTCTTCTTTTC
TCATCAACCAATATATACGAATCCATCGTTTCTCATTCAGATCAGAGACTCATCACAGAG
AGAGAGAAGAAGAATAAGAAGAGGGAGAGAGATCAGAGATGAGATCACCGGTGCAGCTCC
ATCACGGCTCGGACGCCCCGAACGGCTTTCACACGCTGCAGACTCACGACCAAACCGACG
GTCTGGTCAGACGAGTATGTCTCACGCGCGGTATGCATGTGCCGGAGCACGTGGCGATGC
ACCACACACACGACGTTGGCCCGGACCAGTGCTGCTCCTCGGTGGTGCAGATGATAAACG
CGCCGGTGGAGTCTGTCTGGGCACTAGTGCGTCGTTTCGATAACCCAAAAGTCTACAAGA
ACTTCATCAGGCAGTGCCGTATTGTCCAGGGAGACGGGCTCCACGCCGGAGATCTCCGGG
AGGTCATGGTCGTTTCGGGACTCCCGGCGGTATCGAGCACCGAGAGGCTCGAGATCTTGG
ACGAGGAGCGTCACGTGATAAGCTTTAGCGTCGTGGGTGGGGACCATAGGCTGGAGAACT
ACCGATCGGTGACGACACTTCACGCGTCAGACGACGAAGGAACCGTGGTGGTGGAGTCTT
ACATCGTCGATGTACCACCGGGAAACACGGAGGAGGAGACTGCTAGCTTTGTTGATACTA
TCGTCCGGTGCAACCTTCAGTCTCTCGCTAGAAGCTGTACCAGCCGGCAATAATCTCGTC
TTTAATAGTTTTATTAATTGCAATTATGTATCTATTTTTCTCTTCTTAATAGTATTTTCT
TTTGGATGTTTCTATCGATCATCACATGGAAGAAAATTTATTTGGGACTTCGTAGATTTA
TGTTGGGAATCAAAATATTATTGGAGGGATTCATAAAAAGGGATTTAGGATTGGTACATA
ATAACATATTTCCATTTGAATATGTTACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB18TF U 1
AF RR2GB18JQ C 355
BS 1 585 RR2GB18TF
BS 586 990 RR2GB18JQ

RD RR2GB18TF 585 0 0
GGAAACAAAACCAACTTGACAACCGACAGCGAACAAGATCAAAAGACCTCTCTTCTTTTC
TCATCAACCAATATATACGAATCCATCGTTTCTCATTCAGATCAGAGACTCATCACAGAG
AGAGAGAAGAAGAATAAGAAGAGGGAGAGAGATCAGAGATGAGATCACCGGTGCAGCTCC
ATCACGGCTCGGACGCCCCGAACGGCTTTCACACGCTGCAGACTCACGACCAAACCGACG
GTCTGGTCAGACGAGTATGTCTCACGCGCGGTATGCATGTGCCGGAGCACGTGGCGATGC
ACCACACACACGACGTTGGCCCGGACCAGTGCTGCTCCTCGGTGGTGCAGATGATAAACG
CGCCGGTGGAGTCTGTCTGGGCACTAGTGCGTCGTTTCGATAACCCAAAAGTCTACAAGA
ACTTCATCAGGCAGTGCCGTATTGTCCAGGGAGACGGGCTCCACGCCGGAGATCTCCGGG
AGGTCATGGTCGTTTCGGGACTCCCGGCGGTATCGAGCACCGAGAGGCTCGAGATCTTGG
ACGAGGAGCGTCACGTGATAAGCTTTAGCGTCGTGGGTGGGGACC

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2GB18JQ 636 0 0
TAAACGCGCCGGTGGAGTCTGTCTGGGCACTAGTGCGTCGTTTCGATAACCCAAAAGTCT
ACAAGAACTTCATCAGGCAGTGCCGTATTGTCCAGGGAGACGGGCTCCACGCCGGAGATC
TCCGGGAGGTCATGGTCGTTTCGGGACTCCCGGCGGTATCGAGCACCGAGAGGCTCGAGA
TCTTGGACGAGGAGCGTCACGTGATAAGCTTTAGCGTCGTGGGTGGGGACCATAGGCTGG
AGAACTACCGATCGGTGACGACACTTCACGCGTCAGACGACGAAGGAACCGTGGTGGTGG
AGTCTTACATCGTCGATGTACCACCGGGAAACACGGAGGAGGAGACTGCTAGCTTTGTTG
ATACTATCGTCCGGTGCAACCTTCAGTCTCTCGCTAGAAGCTGTACCAGCCGGCAATAAT
CTCGTCTTTAATAGTTTTATTAATTGCAATTATGTATCTATTTTTCTCTTCTTAATAGTA
TTTTCTTTTGGATGTTTCTATCGATCATCACATGGAAGAAAATTTATTTGGGACTTCGTA
GATTTATGTTGGGAATCAAAATATTATTGGAGGGATTCATAAAAAGGGATTTAGGATTGG
TACATAATAACATATTTCCATTTGAATATGTTACTT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL4876Contig1 709 2 4 U
GGACGAGCTCTTCGTCTCCTCTGCTGCGATCTACCTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
ACATCGCAAAGTGTGAAGCTTTTGGCGGGAAAATGTCGGGTAAAGGAGCAAAGGGTCTGA
TTATGGGGAAACCCAGCGGTAACGAGAAAGACAAGGACAAGAAGAAACGACCCATCACCC
GTTCTGCTCGAGCTGGTCTTCAATTCCCTGTAGGAAGGGTGCATCGGCTGTTGAAGACTA
GATCCACTGCTCACGGAAGAGTCGGAGCAACTGCAGCTGTTTACACAGCGGCGATACTTG
AGTATCTGACCGCAGAAGTCTTGGAGTTGGCTGGTAACGCGAGCAAGGACCTCAAGGTGA
AACGTATCTCCCCCAGGCACTTGCAGCTTGCGATTCGTGGAGATGAAGAGCTTGATACTC
TCATCAAAGGAACTATAGCTGGTGGTGGTGTCATCCCTCACATCCACAAGTCTCTCATCA
ACAAATCCGCCAAGGAATAGACTTTTTTTAAGAAGACTGGTAGAGTGCTCTTTGTTTAGG
ATCTGTTTGTTATTGTTCTACCATCGGTTTACTTGGTCTATCTTTATGCATATGTATTTG
ATGCTTATCTAAACCCTTTTGTGACTACTACCCTTTGGTTTATTCCTATCAATGTAACAT
ATAATTGCCGGAGAGTTTTTAAGCAAATTAATACATATAAAAGAATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F880TF U 1
AF RR2F880JQ C 31
BS 1 679 RR2F880TF
BS 680 680 RR2F880JQ
BS 681 697 RR2F880TF
BS 698 709 RR2F880JQ

RD RR2F880TF 697 0 0
GGACGAGCTCTTCGTCTCCTCTGCTGCGATCTACCTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
ACATCGCAAAGTGTGAAGCTTTTGGCGGGAAAATGTCGGGTAAAGGAGCAAAGGGTCTGA
TTATGGGGAAACCCAGCGGTAACGAGAAAGACAAGGACAAGAAGAAACGACCCATCACCC
GTTCTGCTCGAGCTGGTCTTCAATTCCCTGTAGGAAGGGTGCATCGGCTGTTGAAGACTA
GATCCACTGCTCACGGAAGAGTCGGAGCAACTGCAGCTGTTTACACAGCGGCGATACTTG
AGTATCTGACCGCAGAAGTCTTGGAGTTGGCTGGTAACGCGAGCAAGGACCTCAAGGTGA
AACGTATCTCCCCCAGGCACTTGCAGCTTGCGATTCGTGGAGATGAAGAGCTTGATACTC
TCATCAAAGGAACTATAGCTGGTGGTGGTGTCATCCCTCACATCCACAAGTCTCTCATCA
ACAAATCCGCCAAGGAATAGACTTTTTTTAAGAAGACTGGTAGAGTGCTCTTTGTTTAGG
ATCTGTTTGTTATTGTTCTACCATCGGTTTACTTGGTCTATCTTTATGCATATGTATTTG
ATGCTTATCTAAACCCTTTTGTGACTACTACCCTTTGGTTTATTCCTATCAATGTAACAT
ATAATTGCCGGAGAGTTTT*AAGCAAATTAATACATA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2F880JQ 679 0 0
CTACCTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACATCGCAAAGTGTGAAGCTTTTGGCGGGA
AAATGTCGGGTAAAGGAGCAAAGGGTCTGATTATGGGGAAACCCAGCGGTAACGAGAAAG
ACAAGGACAAGAAGAAACGACCCATCACCCGTTCTGCTCGAGCTGGTCTTCAATTCCCTG
TAGGAAGGGTGCATCGGCTGTTGAAGACTAGATCCACTGCTCACGGAAGAGTCGGAGCAA
CTGCAGCTGTTTACACAGCGGCGATACTTGAGTATCTGACCGCAGAAGTCTTGGAGTTGG
CTGGTAACGCGAGCAAGGACCTCAAGGTGAAACGTATCTCCCCCAGGCACTTGCAGCTTG
CGATTCGTGGAGATGAAGAGCTTGATACTCTCATCAAAGGAACTATAGCTGGTGGTGGTG
TCATCCCTCACATCCACAAGTCTCTCATCAACAAATCCGCCAAGGAATAGACTTTTTTTA
AGAAGACTGGTAGAGTGCTCTTTGTTTAGGATCTGTTTGTTATTGTTCTACCATCGGTTT
ACTTGGTCTATCTTTATGCATATGTATTTGATGCTTATCTAAACCCTTTTGTGACTACTA
CCCTTTGGTTTATTCCTATCAATGTAACATATAATTGCCGGAGAGTTTTTAAGCAAATTA
ATACATATAAAAGAATGCC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL4877Contig1 998 2 2 U
GACGATCATCGTTGCCGATTGATTTCTACATATCATCATGTACAGTTATCACGATCCCAT
TCAATTCTATTCTTTACTCTCTTATTTACATTCAATTCTATTCTTTACTCTTATTTACAT
GACATATTTTATCTTTTCACCTCCCTTTTTATCCTCCTATATAATTTCATTCATTAAAGC
TTTCGTCTAACCAAAATCTACATCATCCTTAATATCAAGCGATGGCCATGAAATTGGTTC
ATACCCCCCGGTGATTAGCCGTATAAGCTAAAGCGTTTATTGAGAGTAACCTTTCTCCTA
TCTTTCAACTTCTCTGCTCCAATAACAGCATCATGATTTCTCTCTCTCTTTCTCTCATGA
TGACTGGAGATCCATTCGAGGGTTTCCGACATCCAAGTCACCTCTGATACACGCACATGT
AGAATTTAATGAGTTTGGTGGGATCTTAGTGTTAGCTGCAACTTTTGATTGTGACGAAGA
ACTCTAGGAAAATTATATTAAATCACTCCAGGAGACTATGCTGCAGGGTCAGGTTTGTTA
TGCTGTGGTGAGGTTACAAAGGGAACCTCTAGGAGTATTTATTCTGAGGAAGATTCATGC
CCCTATGAAAAGGGCGTATTACCCTGTTGTAGAGAAGGCTTCGGAGATGATAAAGCAGAA
GCGTTCATCCCTTAGCAAGGTCGTTCTTGCATGCAACAGCATAGTTATAAGATATAGCAT
ATACCATTATGACCCCATTGCTTGGCTTTCATAGTTACAGCACCAAGGGCATGATGCTTA
TCAGTTTTGTCTCCAACCACCAGGTGCACCAGATTTTGTGGGAAACACGGTTTGTTACAA
AAAGTCTGTTTATACATTTTATTTGATTTCAGTAGTTCACATGTATTAGGGCGAAACAGG
CCTCACATTAACATGTCTATGTTACATGATCTTTGTGTAACAGCCTGAGAGACTTTTCCA
AAAGAATTAGTAAGGTGTCTGCAGTGAAGCTTTGGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C496TF U 1
AF RR2C496JQ C 407
BS 1 631 RR2C496TF
BS 632 998 RR2C496JQ

RD RR2C496TF 631 0 0
GACGATCATCGTTGCCGATTGATTTCTACATATCATCATGTACAGTTATCACGATCCCAT
TCAATTCTATTCTTTACTCTCTTATTTACATTCAATTCTATTCTTTACTCTTATTTACAT
GACATATTTTATCTTTTCACCTCCCTTTTTATCCTCCTATATAATTTCATTCATTAAAGC
TTTCGTCTAACCAAAATCTACATCATCCTTAATATCAAGCGATGGCCATGAAATTGGTTC
ATACCCCCCGGTGATTAGCCGTATAAGCTAAAGCGTTTATTGAGAGTAACCTTTCTCCTA
TCTTTCAACTTCTCTGCTCCAATAACAGCATCATGATTTCTCTCTCTCTTTCTCTCATGA
TGACTGGAGATCCATTCGAGGGTTTCCGACATCCAAGTCACCTCTGATACACGCACATGT
AGAATTTAATGAGTTTGGTGGGATCTTAGTGTTAGCTGCAACTTTTGATTGTGACGAAGA
ACTCTAGGAAAATTATATTAAATCACTCCAGGAGACTATGCTGCAGGGTCAGGTTTGTTA
TGCTGTGGTGAGGTTACAAAGGGAACCTCTAGGAGTATTTATTCTGAGGAAGATTCATGC
CCCTATGAAAAGGGCGTATTACCCTGTTGTA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2C496JQ 592 0 0
ATACACGCACATGTAGAATTTAATGAGTTTGGTGGGATCTTAGTGTTAGCTGCAACTTTT
GATTGTGACGAAGAACTCTAGGAAAATTATATTAAATCACTCCAGGAGACTATGCTGCAG
GGTCAGGTTTGTTATGCTGTGGTGAGGTTACAAAGGGAACCTCTAGGAGTATTTATTTTG
AGGAAGATTCATGCCCCTATGAAAAGGGCGTATTACCCTGTTGTAGAGAAGGCTTCGGAG
ATGATAAAGCAGAAGCGTTCATCCCTTAGCAAGGTCGTTCTTGCATGCAACAGCATAGTT
ATAAGATATAGCATATACCATTATGACCCCATTGCTTGGCTTTCATAGTTACAGCACCAA
GGGCATGATGCTTATCAGTTTTGTCTCCAACCACCAGGTGCACCAGATTTTGTGGGAAAC
ACGGTTTGTTACAAAAAGTCTGTTTATACATTTTATTTGATTTCAGTAGTTCACATGTAT
TAGGGCGAAACAGGCCTCACATTAACATGTCTATGTTACATGATCTTTGTGTAACAGCCT
GAGAGACTTTTCCAAAAGAATTAGTAAGGTGTCTGCAGTGAAGCTTTGGCCG

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL4878Contig1 208 2 1 U
CGATAAGCATACGCATGCATTGTCCTCGAGACGATTTTGAATACTATGTTTTTTGTTTTG
TTTCGTTTCCAAGGTGGTGAAACTTAGTAAATTAAATTTATTATGTAACATTAAAAATAT
ATTATGAGGTCGGATGTAATGTGGTGCGCTTAGCGGTTGAGCTTATGTCTTTTGTAATTG
TGTGGTATAAAAAGAGATGATTCTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BA23JQ C 1
AF RR2BA23TF U 1
BS 1 208 RR2BA23TF

RD RR2BA23JQ 208 0 0
CGATAAGCATACGCATGCATTGTCCTCGAGACGATTTTGAATACTATGTTTTTTGTTTTG
TTTCGTTTCCAAGGTGGTGAAACTTAGTAAATTAAATTTATTATGTAACATTAAAAATAT
ATTATGAGGTCGGATGTAATGTGGTGCGCTTAGCGGTTGAGCTTATGTCTTTTGTAATTG
TGTGGTATAAAAAGAGATGATTCTTTTT

QA 1 208 1 208
DS 

RD RR2BA23TF 208 0 0
CGATAAGCATACGCATGCATTGTCCTCGAGACGATTTTGAATACTATGTTTTTTGTTTTG
TTTCGTTTCCAAGGTGGTGAAACTTAGTAAATTAAATTTATTATGTAACATTAAAAATAT
ATTATGAGGTCGGATGTAATGTGGTGCGCTTAGCGGTTGAGCTTATGTCTTTTGTAATTG
TGTGGTATAAAAAGAGATGATTCTTTTT

QA 1 208 1 208
DS 



AS 1 2

CO CL4879Contig1 1236 2 6 U
GGACATAAAATCAACCGTTGTCACCGGAGCTCCGATCTTTGCCATTCGACAATATGTCTG
TTTCCGATGATGAAGACGAGTGCTTCGCTCGGTTCCTCGAATCAGAAGTCTCCTCGGTAG
AGGAGGAAGAAAAAACTAAAGAACCTGAACCGAAACGACAACGTCTTGACAAGGACAAGA
CAAAGGCTGTAGACAAGGATGGAGATCAAAAGGAAGATGGTAATAATAACAACAAAGATA
GGAATGTTGTAAAGAGAATAGAGAGTGGAGTTTTCAGCAAAGTTCCTACAGAGCTTTTTC
GTCATATCTTCAAGTTCTTATCCTCTGAGGATCTTCTATCATGCTCTTTAGTGTGTAAAT
TTCTCAACTTTGCTGCCTCTGATGAATCCTTATGGCGTCGCCTGTACTGTATACGTTGGG
GTCTAATGCCTTCAACTAGAATGTTACGTGAGTGTGCTTGGAAGAAGCTTTATATCGATC
GTGACGAGAAGGACATGATTGAACTTGTGAGAAGCTGTCCAACGGATTTTAAAGAGTATT
ACATTCAAATGCAAGCAGCAAAGCGAAGCCAAGCACCTCTTGCGGCCCAGATGGTGGATG
ACCAGATAGTGCTTGACAAAACTGTACTTGACAAAGTATCTCTGTGGAAGAAAAGCAAAG
GACTTCCCGATAAGGCCGTAGTTGGCCATGTTTGTTTGGGAACAAAATGTGATTACCATC
AGATCGACGACGTTTTCATATGCCAAGAGACTGGAAATGTTCATGTATGTGATGACAACT
GCAAGGAAGTAATATTTTGTCGGGAGAGTGGTAACATGGTGTGTACTATCTCAGGGCTTT
GTTCTGAAAGTTTGCTCGTACAAGATGATTCAGACGCAGATGAGGAAGAAGCTGAACAAG
AAGCTGAAGTTTTAACAGGAAGAGGCCGTTTTGGTCGAGCTTTTGAATTTGGATACAACT
GCGAGAGTGAGCAGGAGTTAGATCGCTCCTTTGGGTTCTGCTGATCAAAACTCTCAGCCT
TTTCGTTCAGTTCCAAAATTTTTACTGTCTCTAATACCAAGTCTGCATGAGTTTTCACGG
TAAAACATCTGTAGAGTGCAATGAATCAAAAGTAGCTTGTTGTTTTAGTAGTCTTAATGT
TTCTTTGTAATTTATGCAGATCTTTGTCTGTAATTTGCTATACAATCGCCCTTACAAAAA
TGTTTACTTGTAGTAATTAATCTCCATTATTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E982TF U 1
AF RR2E982JQ C 487
BS 1 660 RR2E982TF
BS 661 661 RR2E982JQ
BS 662 674 RR2E982TF
BS 675 675 RR2E982JQ
BS 676 702 RR2E982TF
BS 703 1236 RR2E982JQ

RD RR2E982TF 702 0 0
GGACATAAAATCAACCGTTGTCACCGGAGCTCCGATCTTTGCCATTCGACAATATGTCTG
TTTCCGATGATGAAGACGAGTGCTTCGCTCGGTTCCTCGAATCAGAAGTCTCCTCGGTAG
AGGAGGAAGAAAAAACTAAAGAACCTGAACCGAAACGACAACGTCTTGACAAGGACAAGA
CAAAGGCTGTAGACAAGGATGGAGATCAAAAGGAAGATGGTAATAATAACAACAAAGATA
GGAATGTTGTAAAGAGAATAGAGAGTGGAGTTTTCAGCAAAGTTCCTACAGAGCTTTTTC
GTCATATCTTCAAGTTCTTATCCTCTGAGGATCTTCTATCATGCTCTTTAGTGTGTAAAT
TTCTCAACTTTGCTGCCTCTGATGAATCCTTATGGCGTCGCCTGTACTGTATACGTTGGG
GTCTAATGCCTTCAACTAGAATGTTACGTGAGTGTGCTTGGAAGAAGCTTTATATCGATC
GTGACGAGAAGGACATGATTGAACTTGTGAGAAGCTGTCCAACGGATTTTAAAGAGTATT
ACATTCAAATGCAAGCAGCAAAGCGAAGCCAAGCACCTCTTGCGGCCCAGATGGTGGATG
ACCAGATAGTGCTTGACAAAACTGTACTTGACAAAGTATCTCTGTGGAAGAAAAGCAAAG
*ACTTCCCGATAAG*CCGTAGTTGGCCATGTTTGTTTGGGAA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2E982JQ 750 0 0
AGAAGGACATGATTGAACTTGTGAGAAGCTGTCCAACGGATTTTAAAGAGTATTACATTC
AAATGCAAGCAGCAAAGCGAAGCCAAGCACCTCTTGCGGCCCAGATGGTGGATGACCAGA
TAGTGCTTGACAAAACTGTACTTGACAAAGTATCTCTGTGGAAGAAAAGCAAAGGACTTC
CCGATAAGGCCGTAGTTGGCCATGTTTGTTTGGGAACAAAATGTGATTACCATCAGATCG
ACGACGTTTTCATATGCCAAGAGACTGGAAATGTTCATGTATGTGATGACAACTGCAAGG
AAGTAATATTTTGTCGGGAGAGTGGTAACATGGTGTGTACTATCTCAGGGCTTTGTTCTG
AAAGTTTGCTCGTACAAGATGATTCAGACGCAGATGAGGAAGAAGCTGAACAAGAAGCTG
AAGTTTTAACAGGAAGAGGCCGTTTTGGTCGAGCTTTTGAATTTGGATACAACTGCGAGA
GTGAGCAGGAGTTAGATCGCTCCTTTGGGTTCTGCTGATCAAAACTCTCAGCCTTTTCGT
TCAGTTCCAAAATTTTTACTGTCTCTAATACCAAGTCTGCATGAGTTTTCACGGTAAAAC
ATCTGTAGAGTGCAATGAATCAAAAGTAGCTTGTTGTTTTAGTAGTCTTAATGTTTCTTT
GTAATTTATGCAGATCTTTGTCTGTAATTTGCTATACAATCGCCCTTACAAAAATGTTTA
CTTGTAGTAATTAATCTCCATTATTTTTCC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL4880Contig1 896 2 6 U
GGAGGCGTAACCCTAGAAAATTGGAGCCATGAGGGGTCTGATCTCCGGCGCGAAGAGGCT
GTGGACACCATCACCGCAGACGGCGATAACCACCGCCATAGCGAGAAGAAGAAGCTACAG
TGTAATACCGATGGTTATCGAGACTTCATCGCGAGGCGAGAGAGCTTACGACATCTTCTC
GCGACTGCTCAAGGAGCGTATCATCTGCATCAACGGCCCCATAAACGACGACACGTCCCA
CGTCGTCGTGGCTCAGCTCCTCTACCTCGAGTCCGAAAATCCTTCGAAGCCGATTCACAT
GTACCTCAATTCACCAGGCGGACACGTCACCGCCGGCCTTGCAATCTATGATACAATGCA
GTACATTCGATCTCCAATAAGCACGATTTGTTTAGGTCAAGCTGCGTCCATGGCGTCTCT
TCTGTTGGCAGCAGGTGCTAAAGGACAGAGACGGTCACTTCCCAATGCGAGCGTCATGAT
TCATCAACCTTCGGGAGGATACAGCGGACAAGCCAAGGATATGACTATCCACACGAAGCA
GATTGTTCGTGTCTGGGATGCTTTGAACCAGCTGTACGTGAAACACACGGGGCAACCCAT
CGATGTGGTTGAGAAGAACATGGATAGGGATCATTTCATGACTCCTGAGGAGGCTAAAGC
GTTTGGTATAATCGATGAAGTGATTGACGAGAGACCGATGGAGTTGGTCAAGGATGCTGT
TGGAGATGAAAGCAAAGATAAAAGTTAAGAGAAGCTGGTAATCAAAGTAATAAACCTTTT
TTTACTCTCTTTTTTTTTCTCATTTTGCTCTTGTTAGAGATTTATTTCCCCTTGATGATG
ATATTGATAACCTCTCGCAAACCATTTTTATTTTTCTTCATATCAAATCCTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G050TF U 1
AF RR2G050JQ C 555
BS 1 649 RR2G050TF
BS 650 650 RR2G050JQ
BS 651 742 RR2G050TF
BS 743 743 RR2G050JQ
BS 744 769 RR2G050TF
BS 770 896 RR2G050JQ

RD RR2G050TF 775 0 0
GGAGGCGTAACCCTAGAAAATTGGAGCCATGAGGGGTCTGATCTCCGGCGCGAAGAGGCT
GTGGACACCATCACCGCAGACGGCGATAACCACCGCCATAGCGAGAAGAAGAAGCTACAG
TGTAATACCGATGGTTATCGAGACTTCATCGCGAGGCGAGAGAGCTTACGACATCTTCTC
GCGACTGCTCAAGGAGCGTATCATCTGCATCAACGGCCCCATAAACGACGACACGTCCCA
CGTCGTCGTGGCTCAGCTCCTCTACCTCGAGTCCGAAAATCCTTCGAAGCCGATTCACAT
GTACCTCAATTCACCAGGCGGACACGTCACCGCCGGCCTTGCAATCTATGATACAATGCA
GTACATTCGATCTCCAATAAGCACGATTTGTTTAGGTCAAGCTGCGTCCATGGCGTCTCT
TCTGTTGGCAGCAGGTGCTAAAGGACAGAGACGGTCACTTCCCAATGCGAGCGTCATGAT
TCATCAACCTTCGGGAGGATACAGCGGACAAGCCAAGGATATGACTATCCACACGAAGCA
GATTGTTCGTGTCTGGGATGCTTTGAACCAGCTGTACGTGAAACACACGGGGCAACCCAT
CGATGTGGTTGAGAAGAACATGGATAGGGATCATTTCATGACTCCTGAG*AGGCTAAAGC
GTTTGGTATAATCGATGAAGTGATTGACGAGAGACCGATGGAGTTGGTCAAGGATGCTGT
TGGAGATGAAAGCAAAGATAAA*GTTAAGAGAAGCTGGTAATCAAAGTA
TAAACC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2G050JQ 342 0 0
GGGATGCTTTGAACCAGCTGTACGTGAAACACACGGGGCAACCCATCGATGTGGTTGAGA
AGAACATGGATAGGGATCATTTCATGACTCCTGAGGAGGCTAAAGCGTTTGGTATAATCG
ATGAAGTGATTGACGAGAGACCGATGGAGTTGGTCAAGGATGCTGTTGGAGATGAAAGCA
AAGATAAAAGTTAAGAGAAGCTGGTAATCAAAGTAATAAACCTTTTTTTACTCTCTTTTT
TTTTCTCATTTTGCTCTTGTTAGAGATTTATTTCCCCTTGATGATGATATTGATAACCTC
TCGCAAACCATTTTTATTTTTCTTCATATCAAATCCTTTCTC

QA 1 342 1 342
DS 



AS 1 2

CO CL4881Contig1 714 2 5 U
TTGATACTTAGTGTGCGATAAAACTCAAGAGAATAAAACACAAGTTACAAGAGAGAATAT
CAGATATTGGATTTCTAAGGAATAAGAGGGAAGATGTTACTAGAGTCATGAAGGATCTCT
GAATAGTAAAGGTTGAAGTTGAGGCAATCCCAGAAGCGAGAGAGCCCAAACATCCCCATG
TTTTGGTGATCTCCGGTGACACATATACAGATCCTTCATCTCTTTCTCAAACTTCTGCTT
CACCATCATCACCTGACATTTGTCTATGCCTAACGTCTTTGTCCATGAATCGTTTGGAAC
TCCACCTGTGCCTCGGGGAAAACAAAACCGGAAGTCCAGTGCGCACTGTAATATGTTCTC
TATGACGTTTGATACCACTCGGGTTTCGTCAGATAGGAAACATATGCGCAGAGCTTCACT
TAGATAAACCATATGCACAGACTCAAGATCCATCATATCCTTCACCTTATTCTTCAGGGA
ATGAAGGAACTTGGACCATGATACGTGAGACAATTCCGAATGCACATATTGTTGTAGTGT
TGATACAAAATGGTTGACCTGATGCCTTAGTTTCATCAATATGTTTAACCACCGGAGTTC
TTGCTTCGCTATCCCCTCTTTATTCCTATGCATCGTATGTCGTACATCCTTCAGTGAACA
CCAAACGTCAGTTAATGCATAGGCTGCTAGTTTCACTTGAACCAGAAAGCTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT78JQ U 155
AF RR2BT78TF C 1
BS 1 162 RR2BT78TF
BS 163 176 RR2BT78JQ
BS 177 177 RR2BT78TF
BS 178 391 RR2BT78JQ
BS 392 714 RR2BT78TF

RD RR2BT78JQ 241 0 0
AGCGAAAA
AGCCCAAACATCCC*ATGTTTTGGTGATCTCCGGTGACACATATACAGATCCTTCATCTC
TTTCTCAAACTTCTGCTTCACCATCATCACCTGACATTTGTCTATGCCTAACGTCTTTGT
CCATGAATCGTTTGGAACTCCACCTGTGCCTCGGGGAAAACAAAACCGGAAGTCCAGTGC
GCACTGTAATATGTTCTCTATGACGTTTGATACCACTCGGGTTTCGTCA
AAAA

QA 9 237 9 237
DS 

RD RR2BT78TF 714 0 0
TTGATACTTAGTGTGCGATAAAACTCAAGAGAATAAAACACAAGTTACAAGAGAGAATAT
CAGATATTGGATTTCTAAGGAATAAGAGGGAAGATGTTACTAGAGTCATGAAGGATCTCT
GAATAGTAAAGGTTGAAGTTGAGGCAATCCCAGAAGCGAGAGAGCCCAAACATCCCCATG
TTTTGGTGATCTCCGGTGACACATATACAGATCCTTCATCTCTTTCTCAAACTTCTGCTT
CACCATCATCACCTGACATTTGTCTATGCCTAACGTCTTTGTCCATGAATCGTTTGGAAC
TCGACCTGTGCCTCGGGGAAGACAAGACCGGAAGTCCAGTGCGCACTGTAATATGTTCTC
TATGACGTTTGATACGACTCGGGTTTCGTCAGATAGGAAACATATGCGCAGAGCTTCACT
TAGATAAACCATATGCACAGACTCAAGATCCATCATATCCTTCACCTTATTCTTCAGGGA
ATGAAGGAACTTGGACCATGATACGTGAGACAATTCCGAATGCACATATTGTTGTAGTGT
TGATACAAAATGGTTGACCTGATGCCTTAGTTTCATCAATATGTTTAACCACCGGAGTTC
TTGCTTCGCTATCCCCTCTTTATTCCTATGCATCGTATGTCGTACATCCTTCAGTGAACA
CCAAACGTCAGTTAATGCATAGGCTGCTAGTTTCACTTGAACCAGAAAGCTGAA

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL4882Contig1 586 2 5 U
GGAAGAGAGATTTGAGAAAGAATGACATCGAGGTACTGGGTGGTGTCTCTACCAGTGAAG
GACTCTTCTTCCACCTTGTGGAATCGTCTACAGGAGCAGATCTCCAAGCATTCCTTTGAC
ACTCCAGTTTATCGGTTCAACATTCCTAATCTTCGTGTTGGAACATTAGATTCTCTGCTA
GCCCTCGGCGATGATCTGCTAAAATCAAACAGCTTTGTGGAAGGAGTATCGCAGAAGATA
AGGAGACAGATCGAAGAATTGGAGAGGATCTCTGGTGTGGAGAGCAACGCTCTTACTGTT
GATGGAGTTCCTGTTGATTCTTATCTCACCAGGTTTGTGTGGGATGAAGCTAAGTACCCA
ACAATGTCACCTCTCAAGGAGGTTGTGGACAACATTCAGTCTCGGGTTGCAAAGATTGAG
GATGATCTCAAGGTTCGTGTTGCTGAGTATAACAATGTCCGCAGTCAACTCAATGCCATT
AACAGAAAGCAAAGTGGAAGTTTAGCTGTTCGCGACCTTTCAAGCTTGGTTAAGCCAGAA
GATATTGTCGCATCGGAACATCTCGAGACTCTCCTTGCAGTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC30TF U 17
AF RR2D844TF U 1
BS 1 203 RR2D844TF
BS 204 204 RR2CC30TF
BS 205 212 RR2D844TF
BS 213 213 RR2CC30TF
BS 214 586 RR2D844TF

RD RR2CC30TF 217 0 0
G
AAGAATGACATCGAGGTACTGGGTGGTGTCTCTACCAGTGAAGGACTCTTCTTCCACCTT
GTGGAATCGTCTACAGGAGCAGATCTCCAAGCATTCCTTTGACACTCCAGTTTATCGGTT
CAACATTCCTAATCTTCGTGTTGGAACATTAGATTCTCTGCTCGCCCTCGGCGATGATCT
GCTAAAATCAAACAGCTTTGTGGAAGGAGTATCGCA

QA 2 217 2 217
DS 

RD RR2D844TF 586 0 0
GGAAGAGAGATTTGAGAAAGAATGACATCGAGGTACTGGGTGGTGTCTCTACCAGTGAAG
GACTCTTCTTCCACCTTGTGGAATCGTCTACAGGAGCAGATCTCCAAGCATTCCTTTGAC
ACTCCAGTTTATCGGTTCAACATTCCTAATCTTCGTGTTGGAACATTAGATTCTCTGCTA
GCCCTCGGCGATGATCTGCTAAAGTCAAACAGTTTTGTGGAAGGAGTATCGCAGAAGATA
AGGAGACAGATCGAAGAATTGGAGAGGATCTCTGGTGTGGAGAGCAACGCTCTTACTGTT
GATGGAGTTCCTGTTGATTCTTATCTCACCAGGTTTGTGTGGGATGAAGCTAAGTACCCA
ACAATGTCACCTCTCAAGGAGGTTGTGGACAACATTCAGTCTCGGGTTGCAAAGATTGAG
GATGATCTCAAGGTTCGTGTTGCTGAGTATAACAATGTCCGCAGTCAACTCAATGCCATT
AACAGAAAGCAAAGTGGAAGTTTAGCTGTTCGCGACCTTTCAAGCTTGGTTAAGCCAGAA
GATATTGTCGCATCGGAACATCTCGAGACTCTCCTTGCAGTTGTTT

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL4883Contig1 1064 2 2 U
GATGCTAAAGGAGGAAAATGCATTGTTTTCACCCAAACCAAACGGGACGCTGATCGCCTT
TCATATGGCTTGGCAAGAACCTTCAAGTGCGAAGCTTTACACGGTGATATATCTCAGAGT
CAGAGGGAAAGAACACTTGCTGGTTTCCGTGATGGGCATTTCAACATTCTTGTTGCCACT
GATGTTGCTGCCCGTGGTCTTGATGTTCCTAATGTCGATTTGGTGATTCATTATGAGCTT
CCGAATAACACGGAGACATTTGTCCACAGAACGGGGAGAACAGGCCGTGCTGGGAAAAAA
GGAAGTGCTATTCTCATCTACAGCCAAGATCAATCCAGGGCTGTTAAAATAATTGAGAGA
GAAGTCGGGAGCCGTTTCACTGAGCTCCCTAGCATTGCTGTGGAACGTGGTGGAAGCATA
TATGAAGGAATAGGTGGTCGATCTGGTGAGTCCTTTGGAGGAGGCATGAGAGATCGTGGT
TCAAGCTTTGGTGGCCGTTCAGGGGGTGGTGGTGGTTATGGTGGTTACGGGAGCAGCAGT
GGACGTTCAGGTGGTTCAGCCAACCGATACTTGGTGGTTCGGATCGTTCTGGCTTTGGGA
GCTTTGGTTCAGACCGTTCCTCTGGTTTCGGGGGCTTTGGTTCGGATCGTTCTTCTCAGT
CAAGCGGAAGGGGCGGGTTTGGTGGTCGTTCAGATGATTATGGTAGCAGTGGTGGCCGTA
GCAACCGTTCTTCTGGTTTCGGTTCAGATCGTTCTTCTGGTTTCGGGGGCTTTGGTTCGG
ATTGTTCTTCTCAGTCAGGTGGAAGGGGCAGCTTTGGTGGTTTTGGCTCAAACGATGGTA
AAAGGTCTTACTGAGAAAGTTACATGAAGTATTGGGTATGTTTTGACTCGACCCGGTAAT
AAGTGGTTGTCCTAGGAGGATTCGGTTTATCGGTTTAGAGTAGTTTACTAAGGGATACAA
GGAGTCGGGCTATATATAAATTTGTAGTTATGTAATCAAACATACTATTTCTAAGTTTCT
GTCTCTTTGGTTTGATATGTTCTTTTGCGCATAAACCAAGAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ16TF U 1
AF RR2CQ16JQ C 307
BS 1 509 RR2CQ16TF
BS 510 1064 RR2CQ16JQ

RD RR2CQ16TF 509 0 0
GATGCTAAAGGAGGAAAATGCATTGTTTTCACCCAAACCAAACGGGACGCTGATCGCCTT
TCATATGGCTTGGCAAGAACCTTCAAGTGCGAAGCTTTACACGGTGATATATCTCAGAGT
CAGAGGGAAAGAACACTTGCTGGTTTCCGTGATGGGCATTTCAACATTCTTGTTGCCACT
GATGTTGCTGCCCGTGGTCTTGATGTTCCTAATGTCGATTTGGTGATTCATTATGAGCTT
CCGAATAACACGGAGACATTTGTCCACAGAACGGGGAGAACAGGCCGTGCTGGGAAAAAA
GGAAGTGCTATTCTCATCTACAGCCAAGATCAATCCAGGGCTGTTAAAATAATTGAGAGA
GAAGTCGGGAGCCGTTTCACTGAGCTCCCTAGCATTGCTGTGGAACGTGGTGGAAGCATA
TATGAAGGAATAGGTGGTCGATCTGGTGAGTCCTTTGGAGGAGGCATGAGAGATCGTGGT
TCAAGCTTTGGTGGCCGTTCAGGGGGTGG

QA 1 509 1 509
DS 

RD RR2CQ16JQ 758 0 0
GCTATTCTCATCTACAGCCAAGATCAATCCAGGGCTGTTAAAATAATTGAGAGAGAAGTC
GGGAGCCGTTTCACTGAGCTCCCTAGCATTGCTGTGGAACGTGGTGGAAGCATATATGAA
GGAATAGGTGGTCGATCTGGTGAGTCCTTTGGAGGAGGCATGAGAGATCGTGGTTCAAGC
TTTGGTGGCCGTTCAGGGGGTGGTGGTGGTTATGGTGGTTACGGGAGCAGCAGTGGACGT
TCAGGTGGTTCAGCCAACCGATACTTGGTGGTTCGGATCGTTCTGGCTTTGGGAGCTTTG
GTTCAGACCGTTCCTCTGGTTTCGGGGGCTTTGGTTCGGATCGTTCTTCTCAGTCAAGCG
GAAGGGGCGGGTTTGGTGGTCGTTCAGATGATTATGGTAGCAGTGGTGGCCGTAGCAACC
GTTCTTCTGGTTTCGGTTCAGATCGTTCTTCTGGTTTCGGGGGCTTTGGTTCGGATTGTT
CTTCTCAGTCAGGTGGAAGGGGCAGCTTTGGTGGTTTTGGCTCAAACGATGGTAAAAGGT
CTTACTGAGAAAGTTACATGAAGTATTGGGTATGTTTTGACTCGACCCGGTAATAAGTGG
TTGTCCTAGGAGGATTCGGTTTATCGGTTTAGAGTAGTTTACTAAGGGATACAAGGAGTC
GGGCTATATATAAATTTGTAGTTATGTAATCAAACATACTATTTCTAAGTTTCTGTCTCT
TTGGTTTGATATGTTCTTTTGCGCATAAACCAAGAAAT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL4884Contig1 1070 2 2 U
GGAGGTCTTGGATCCTCCTCAATCGCGAAACCCTAGTTGTGAGGATCGTTAGTCTTTGTG
TTCGTCGAGAATGAGTCAGCCATGTGTAGTTCTCGCAACAGCGAGCTATGATCACACGAT
CCGATTCTGGGAAGCCGAGAGTGGTCGCTGTTACCGTACCATTCAGTATCCTGACTCGCA
TGTGAATAGGCTGGAGATAACGCCAGATAAGCGTCATCTAGCTGCAGCTTGCAATCCTCA
TATACGTCTCTTTGATGTCAATTCCAACAGCCCTCAACCTGTGATGACATATGATTCACA
CACCAACAATGTTATGGCAGTGGGGTTCCAGTGTGATGGAAAATGGATGTATTCTGGATC
AGAGGATGGTACTGTCAAGATCTGGGACTTGAGGGCTCCAGGTTGCCAAAGGGAGTATGA
GAGTGTTGCCGCTGTTAACACTGTTGTTTTACATCCAAACCAGACTGAATTGATATCTGG
AGACCAAAACGGGAATATCCGTGCATGGGATCTCAGAGCTAACTCGTGTAGCTGTGAACT
GGTACCAGAAGTTGATACACCTGTACGGTCTCTAACGGTGATGTGGGATGGGACTATGGT
TGTTGCTGCTAACAACCGTGGAACATGTTATGTATGGCGCTTGTTGCGCGGAAAACAGAC
AATGACAGAGTTTGAGCCACTTCATAAGCTACAAGCTCATAACGGCCATATCCTTAAATG
CCTACTCTCTCCTGCAAACAAATATCTAGCGACTGCATCATCTGATAAAACTGTCAAGAT
ATGGAACGTCGATGGTTTCAAACTAGAGAAAGTTTTAACAGGACATCAAAGATGGGTATG
GGACTGTGTCTTCTCAGTGGATGGAGAGTTTCTTGTAACAGCATCATCGGACATGACAGC
TAGGTTGTGGTCTATGCCAGCAGGAAAAGAAGTGAAGGTCTACCAAGGTCATCACAAAGC
CACCGTGTGTTGTGCCCTCCATGATTAAAGAAAACATGAATTTATAGACAAACAAACTAA
ATAAATAACAGATAAATGGTTCCTTTCTTTGTCTGTGTGTTTAGGAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG56TF U 1
AF RR2EG56JQ C 448
BS 1 654 RR2EG56TF
BS 655 1070 RR2EG56JQ

RD RR2EG56TF 656 0 0
GGAGGTCTTGGATCCTCCTCAATCGCGAAACCCTAGTTGTGAGGATCGTTAGTCTTTGTG
TTCGTCGAGAATGAGTCAGCCATGTGTAGTTCTCGCAACAGCGAGCTATGATCACACGAT
CCGATTCTGGGAAGCCGAGAGTGGTCGCTGTTACCGTACCATTCAGTATCCTGACTCGCA
TGTGAATAGGCTGGAGATAACGCCAGATAAGCGTCATCTAGCTGCAGCTTGCAATCCTCA
TATACGTCTCTTTGATGTCAATTCCAACAGCCCTCAACCTGTGATGACATATGATTCACA
CACCAACAATGTTATGGCAGTGGGGTTCCAGTGTGATGGAAAATGGATGTATTCTGGATC
AGAGGATGGTACTGTCAAGATCTGGGACTTGAGGGCTCCAGGTTGCCAAAGGGAGTATGA
GAGTGTTGCCGCTGTTAACACTGTTGTTTTACATCCAAACCAGACTGAATTGATATCTGG
AGACCAAAACGGGAATATCCGTGCATGGGATCTCAGAGCTAACTCGTGTAGCTGTGAACT
GGTACCAGAAGTTGATACACCTGTACGGTCTCTAACGGTGATGTGGGATGGGACTATGGT
TGTTGCTGCTAACAACCGTGGAACATGTTATGTATGGCGCTTGTTGCGCGGAAA
CA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2EG56JQ 623 0 0
TTTACATCCAAACCAGACTGAATTGATATCTGGAGACCAAAACGGGAATATCCGTGCATG
GGATCTCAGAGCTAACTCGTGTAGCTGTGAACTGGTACCAGAAGTTGATACACCTGTACG
GTCTCTAACGGTGATGTGGGATGGGACTATGGTTGTTGCTGCTAACAACCGTGGAACATG
TTATGTATGGCGCTTGTTGCGCGGAAAACAGACAATGACAGAGTTTGAGCCACTTCATAA
GCTACAAGCTCATAACGGCCATATCCTTAAATGCCTACTCTCTCCTGCAAACAAATATCT
AGCGACTGCATCATCTGATAAAACTGTCAAGATATGGAACGTCGATGGTTTCAAACTAGA
GAAAGTTTTAACAGGACATCAAAGATGGGTATGGGACTGTGTCTTCTCAGTGGATGGAGA
GTTTCTTGTAACAGCATCATCGGACATGACAGCTAGGTTGTGGTCTATGCCAGCAGGAAA
AGAAGTGAAGGTCTACCAAGGTCATCACAAAGCCACCGTGTGTTGTGCCCTCCATGATTA
AAGAAAACATGAATTTATAGACAAACAAACTAAATAAATAACAGATAAATGGTTCCTTTC
TTTGTCTGTGTGTTTAGGAAACT

QA 1 623 1 623
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4886Contig1 734 2 3 U
AGTGCATGCAAACACATGCACTGAGCTAGCCAATGTTTCTGTAGCTCTTATTTATTTTCA
CATTCACACCAGTAACTCTTTGCTTTGCTTCCATAGCTTCACAATAATTCACAAATATGG
TTCTGAAATTCCTTTGGCATATGTACATGTTTCCTGGTTATTCGGAAAAATCCCCTTTAG
GTTTAATAACCACAACAGGGCAGTGCACATGGTTGGGGCAGTAGTTGCTTACACTTCCCA
AAAACATCCTCTTAATGCGGCCATGAGCCCGAGAGCCGATGACAAGCATATCTGCGTGCA
AATTCTCAACAGTCTCGCATATCTTATACTTAGGATCACCAACCACCACTTGCGTTTTCA
CATTCACCGATCTATCTGCAAAAATCAGACGAGCGTGATCCATGATGGTGTCTGTGATCC
GTTTCTGGTGCTGTTCGATCGCCGAGGTGAAAGCAGGAACCTCTAGACCACTGGGACCAC
CGAAAGGGATGGTTCCGGGGCTAACGCCTGCGGCGACAGAAGGCGAAGGCTGGACATGGA
GGACGACGAATGATGAATCGGGAGAAGACGATGAGAGCTTGAGGTTGTCCAGTGCCCACC
TCAGAGCTTCCATGCTCACCTCGCTTCCATCTACCGCCACGACAACGCAAGTCAAGCTTA
CTGACATGTCCATGACTTCTTCAAGAAAACTCAATCTCTCTTCTCTGTTCCAAACTATGT
TTCAGTTTGTATCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H669JQB U 4
AF RR2H669TF C 1
BS 1 3 RR2H669TF
BS 4 223 RR2H669JQB
BS 224 734 RR2H669TF

RD RR2H669JQB 220 0 0
GCATGCAAACACATGCACTGAGCTAGCCAATGTTTCTGTAGCTCTTATTTATTTTCACAT
TCACACCAGTAACTCTTTGCTTTGCTTCCATAGCTTCACAATAATTCACAAATATGGTTC
TGAAATTCCTTTGGCATATGTACATGTTTCCTGGTTATTCGGAAAAATCCCCTTTAGGTT
TAATAACCACAACAGGGCAGTGCACATGGTTGGGGCAGTA

QA 1 220 1 220
DS 

RD RR2H669TF 734 0 0
AGTGCATGCAAACACATGCACTGAGCTAGCCAATGTTTCTGTAGCTCTTATTTATTTTCA
CATTCACACCAGTAACTCTTTGCTTTGCTTCCATAGCTTCACAATAATTCACAAATATGG
TTCTGATATTCCTTTGGCATATGTACATGTTTCCTGGTTATTCGGAAGAATCCCCTTTAG
GTTTAATAACCACAACAGGGCAGTGCACATGGTTGGTGCAGTAGTTGCTTACACTTCCCA
AAAACATCCTCTTAATGCGGCCATGAGCCCGAGAGCCGATGACAAGCATATCTGCGTGCA
AATTCTCAACAGTCTCGCATATCTTATACTTAGGATCACCAACCACCACTTGCGTTTTCA
CATTCACCGATCTATCTGCAAAAATCAGACGAGCGTGATCCATGATGGTGTCTGTGATCC
GTTTCTGGTGCTGTTCGATCGCCGAGGTGAAAGCAGGAACCTCTAGACCACTGGGACCAC
CGAAAGGGATGGTTCCGGGGCTAACGCCTGCGGCGACAGAAGGCGAAGGCTGGACATGGA
GGACGACGAATGATGAATCGGGAGAAGACGATGAGAGCTTGAGGTTGTCCAGTGCCCACC
TCAGAGCTTCCATGCTCACCTCGCTTCCATCTACCGCCACGACAACGCAAGTCAAGCTTA
CTGACATGTCCATGACTTCTTCAAGAAAACTCAATCTCTCTTCTCTGTTCCAAACTATGT
TTCAGTTTGTATCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL4887Contig1 670 2 2 U
GGGCCATCGTCGCATTAAGCCAGGGGGAATATATCGTGTTAACAAGAGAAAACTCTCAAA
TGGTTAATGCCATCAAAGGAGTGTTCATCACCTGCGATATTCCAATGGCGCAGTTCATAG
TGAACATGAACAATTCGATGCCATCGTCTCAGAAGTTCATTATTCACGTACTTGATAGTA
CTCACCTGTTTGTGCAGCCCCACGTTGAGCAGATGATCCGCAGCGCCGTTGCTGAGTTTC
GTGATCAAAACTCTTACGAGAAGCCTACTTAAATAATAAGTCACACCCCCACCCCATCCG
TCAAAATGTTTTTTTTTTGGGTCAGATTATAAGATATCGTCTGTGTTGTGTAAGATTGAT
TATTAGATCTCTCATATGCCTGCTTATAATGGAAACTCGTGTCAAATAATCAGTCTATTT
TCTCTGGTTATGTTTTGATTAGTTGGAGACACTCATGTTGGCATGCTGTTGGGAAGGGAA
AGATAATTTTGAGACTTGTCTCTCTGTCTTGTTTTTTTTCTCTTTGAAGCAATCAGCTTT
CCCAAACCAAATCAGGTTATACATCAGTTGTTTTCCTGTTAGTTTAGTTTGAGAATTTGG
ACTCAAATAGTCAAATTGTCTTGTTTAGTGTAACCAGGTCTTTTTGATTAATAACATTTA
CGATCTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C259JQ C 1
AF RR2C259TF U 6
BS 1 5 RR2C259JQ
BS 6 670 RR2C259TF

RD RR2C259JQ 670 0 0
GGGCCATCGTCGCATTAAGCCAGGGGGAATATATCGTGTTAACAAGAGAAAACTCTCAAA
TGGTTAATGCCATCAAAGGAGTGTTCATCACCTGCGATATTCCAATGGCGCAGTTCATAG
TGAACATGAACAATTCGATGCCATCGTCTCAGAAGTTCATTATTCACGTACTTGATAGTA
CTCACCTGTTTGTGCAGCCCCACGTTGAGCAGATGATCCGCAGCGCCGTTGCTGAGTTTC
GTGATCAAAACTCTTACGAGAAGCCTACTTAAATAATAAGTCACACCCCCACCCCATCCG
TCAAAATGTTTTTTTTTTGGGTCAGATTATAAGATATCGTCTGTGTTGTGTAAGATTGAT
TATTAGATCTCTCATATGCCTGCTTATAATGGAAACTCGTGTCAAATAATCAGTCTATTT
TCTCTGGTTATGTTTTGATTAGTTGGAGACACTCATGTTGGCATGCTGTTGGGAAGGGAA
AGATAATTTTGAGACTTGTCTCTCTGTCTTGTTTTTTTTCTCTTTGAAGCAATCAGCTTT
CCCAAACCAAATCAGGTTATACATCAGTTGTTTTCCTGTTAGTTTAGTTTGAGAATTTGG
ACTCAAATAGTCAAATTGTCTTGTTTAGTGTAACCAGGTCTTTTTGATTAATAACATTTA
CGATCTTCCG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2C259TF 665 0 0
ATCGTCGCATTAAGCCAGGGGGAATATATCGTGTTAACAAGAGAAAACTCTCAAATGGTT
AATGCCATCAAAGGAGTGTTCATCACCTGCGATATTCCAATGGCGCAGTTCATAGTGAAC
ATGAACAATTCGATGCCATCGTCTCAGAAGTTCATTATTCACGTACTTGATAGTACTCAC
CTGTTTGTGCAGCCCCACGTTGAGCAGATGATCCGCAGCGCCGTTGCTGAGTTTCGTGAT
CAAAACTCTTACGAGAAGCCTACTTAAATAATAAGTCACACCCCCACCCCATCCGTCAAA
ATGTTTTTTTTTTGGGTCAGATTATAAGATATCGTCTGTGTTGTGTAAGATTGATTATTA
GATCTCTCATATGCCTGCTTATAATGGAAACTCGTGTCAAATAATCAGTCTATTTTCTCT
GGTTATGTTTTGATTAGTTGGAGACACTCATGTTGGCATGCTGTTGGGAAGGGAAAGATA
ATTTTGAGACTTGTCTCTCTGTCTTGTTTTTTTTCTCTTTGAAGCAATCAGCTTTCCCAA
ACCAAATCAGGTTATACATCAGTTGTTTTCCTGTTAGTTTAGTTTGAGAATTTGGACTCA
AATAGTCAAATTGTCTTGTTTAGTGTAACCAGGTCTTTTTGATTAATAACATTTACGATC
TTCCG

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL4888Contig1 1377 2 2 U
GGATTGAACGAAACCTCACAAATAATAGCTTTCTCTACAAATCAAGTACTTGGAGTTGAG
TTAACGTATGTCATATCAAGGAAAATCATCAAATGGATACTATCCTGGTTCTAGAGTGGA
TCAAACTACCGAGTCTGAGACGGTTACCGAAAATGAATATGAAACTGGGAATCTAGAAGA
TGATTCTAACAAGCTTTTAAGAAACCAAAACGAAATACCATCTTCCCACAGTCAGAATTC
CAAATGTGTGTACGGAAAAAAAATTCTCGTAGTTCATCTTCAGCACGCAAGTGACGATCA
ACAAAGGTTTTACATGACTTCATGACAAATGAAGCCTACATGAAACAAACAGACATTTAT
GAACGAGTCCAAGATAACATGTTTGAACGTGCAATTGCCTCATCACAAACACTACCTGGT
CTTTAGTATGAATCTTCGTTATATTGGGGAGCACTGACTATGCTTCAAACTAATGAGACA
CATGCGCATGTTTGTCTTACACTATCCGACGACGATGCTAGAATTAAATATCTCGAAAGG
ATAACATGAATCGACCGAGAAGCTGAATAAGGAAAAAAAATTACTTCAATAATTTTCTTT
TCTCATATTTTAATTCATATTTGCTTTTAATAATTAGTTTTTTATTTGGGGTTATTTATT
TATTGAATAACATTTATCTATTGTAATAAGATAATTTTTTTTTGTTTTTGTTTGAAAGAA
GCATTTTACCGAATGCTTGAAGATGATGAAGCAGAAGATGGAAGCAGTAATTCATATATG
TGCTCAAAGAAAGTGTTGCAGATGATGAATATCAGTTGAAAAGAGACTGATAATGAAACC
ATAAGTAGGAAATTCTATGAAGTGTTGAGTGTTCTTGAAAAGATGGCTGTTCATTTGCTT
AGATCTGGTCCAGATGAGCTCACACAGCCTCATCCTAGGTTACAATCCAATAAAAATTAT
TGGCCTTAAAGTTCATCGGTACAATCGATGGAACACATGTTTCTATCACTATTGCAGGAA
AAGATTCAGAAAAGTATTGGAACATGAAAAGTGACACGATTTTATGAATGTTTTAGCTAT
ATGAAATATGGACATGTTGTTTACATATGCATATATAGGTATTCCGGGATCAGTTCATGA
TGCAGAAGTTCTAGCACTAGCAATGGAGGGGCCTCATCAATTTCCGATTGCACCTTTTGA
AAAATATTATTTGGAAGATTTGGGTTATTTTTTTCGACATGATTTCTTACTCCTTATAGA
GTGGAAAGATATCATCCTAGCCAATACGGTGGAGTTAGCCCGCCCAGTATTTCTAAAGAA
ATGTTTAACAAATGACATTATTTATTACGATTTTTTATTGAAAAGACTTTTGGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A616TF U 1
AF RR2A616JQ C 541
BS 1 754 RR2A616TF
BS 755 1377 RR2A616JQ

RD RR2A616TF 754 0 0
GGATTGAACGAAACCTCACAAATAATAGCTTTCTCTACAAATCAAGTACTTGGAGTTGAG
TTAACGTATGTCATATCAAGGAAAATCATCAAATGGATACTATCCTGGTTCTAGAGTGGA
TCAAACTACCGAGTCTGAGACGGTTACCGAAAATGAATATGAAACTGGGAATCTAGAAGA
TGATTCTAACAAGCTTTTAAGAAACCAAAACGAAATACCATCTTCCCACAGTCAGAATTC
CAAATGTGTGTACGGAAAAAAAATTCTCGTAGTTCATCTTCAGCACGCAAGTGACGATCA
ACAAAGGTTTTACATGACTTCATGACAAATGAAGCCTACATGAAACAAACAGACATTTAT
GAACGAGTCCAAGATAACATGTTTGAACGTGCAATTGCCTCATCACAAACACTACCTGGT
CTTTAGTATGAATCTTCGTTATATTGGGGAGCACTGACTATGCTTCAAACTAATGAGACA
CATGCGCATGTTTGTCTTACACTATCCGACGACGATGCTAGAATTAAATATCTCGAAAGG
ATAACATGAATCGACCGAGAAGCTGAATAAGGAAAAAAAATTACTTCAATAATTTTCTTT
TCTCATATTTTAATTCATATTTGCTTTTAATAATTAGTTTTTTATTTGGGGTTATTTATT
TATTGAATAACATTTATCTATTGTAATAAGATAATTTTTTTTTGTTTTTGTTTGAAAGAA
GCATTTTACCGAATGCTTGAAGATGATGAAGCAG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2A616JQ 837 0 0
ATAACATGAATCGACCGAGAAGCTGAATAAGGAAAAAAAATTACTTCAATAATTTTCTTT
TCTCATATTTTAATTCATATTTGCTTTTAATAATTAGTTTTTTATTTGGGGTTATTTATT
TATTGAATAACATTTATCTATTGTAATAAGATAATTTTTTTT*GTTTTTGTTTGAAAGAA
GCATTTTACCGAATGCTTGAAGATGATGAAGCAGAAGATGGAAGCAGTAATTCATATATG
TGCTCAAAGAAAGTGTTGCAGATGATGAATATCAGTTGAAAAGAGACTGATAATGAAACC
ATAAGTAGGAAATTCTATGAAGTGTTGAGTGTTCTTGAAAAGATGGCTGTTCATTTGCTT
AGATCTGGTCCAGATGAGCTCACACAGCCTCATCCTAGGTTACAATCCAATAAAAATTAT
TGGCCTTAAAGTTCATCGGTACAATCGATGGAACACATGTTTCTATCACTATTGCAGGAA
AAGATTCAGAAAAGTATTGGAACATGAAAAGTGACACGATTTTATGAATGTTTTAGCTAT
ATGAAATATGGACATGTTGTTTACATATGCATATATAGGTATTCCGGGATCAGTTCATGA
TGCAGAAGTTCTAGCACTAGCAATGGAGGGGCCTCATCAATTTCCGATTGCACCTTTTGA
AAAATATTATTTGGAAGATTTGGGTTATTTTTTTCGACATGATTTCTTACTCCTTATAGA
GTGGAAAGATATCATCCTAGCCAATACGGTGGAGTTAGCCCGCCCAGTATTTCTAAAGAA
ATGTTTAACAAATGACATTATTTATTACGATTTTTTATTGAAAAGACTTTTGGTGTG

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 2

CO CL4889Contig1 905 2 2 U
AAACCCTAATTTTTCTCGCTTCAGTCAACCACCACTGCACTGTACACATCGATGGTGAAG
AAGCCATGATGATTTGAAAAAAGAGTGAAGTTTCTGTCTTTTTTCTTTTTTACATTTCTT
ATTAATTTTCAGAATGGGTGATTCCGGCAAGGACTCCGGTGGAGGGCAAAACGGACAGTC
TGCGTTGTCTCCCAGAGAACAAGACAGGTTCCTACCGATCGCTAACGTTAGCAGGATCAT
GAAGAAGGCCTTGCCGGCGAACGCCAAGATCTCCAAAGATGCTAAAGAGACGATGCAGGA
GTGCGTCTCCGAGTTTATAAGCTTCGTCACGGGAGAGGCGTCGGATAAGTGCCAGAAGGA
GAAGAGGAAGACGATCAACGGCGACGATTTGCTTTGGGCTATGACCACTCTAGGGTTCGA
GGATTACGTTGAGCCGCTGAAGGTTTACTTGCAGAGGTTTAGGGAGATCGAAGGGGAGAG
GGGTGGACTTGGGAGGCCACATACAGGTGGTGAAGCTGGAGAGCATCAGCAAGATGGAGG
TGGATTCTACGGTGGTGGTGGGATGTAGTATCACCAGCATCATCAGTTTCTTCACCAGCA
GAACCATATGAATGGATCCACAGGTAGCGGTGGTGGTGGAGCTGGCTCCGGTAGGACAAG
GACTTGAAAGATTGGTGGAAGTGGATCTCTGTATATAGATACATTAAAAAACATGCCTAT
TCATACCCATAAGAGCTCGTAACATCAATATATTCAAGTATCATGTTGGTTATATAGGCT
TTGTAAAGCGGATCAAGTGTGTCTGAAACAATAGGATTCGCTAACGAATCTGCTCCGTCT
AATCTTGTATTTAAACTATTGGATTTAGATCACATTGAATGCAAATGTTTTCAGACTCAA
GTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2E483TF U 1
AF RR2E483JQ C 146
BS 1 263 RR2E483TF
BS 264 905 RR2E483JQ

RD RR2E483TF 263 0 0
AAACCCTAATTTTTCTCGCTTCAGTCAACCACCACTGCACTGTACACATCGATGGTGAAG
AAGCCATGATGATTTGAAAAAAGAGTGAAGTTTCTGTCTTTTTTCTTTTTTACATTTCTT
ATTAATTTTCAGAATGGGTGATTCCGGCAAGGACTCCGGTGGAGGGCAAAACGGACAGTC
TGCGTTGTCTCCCAGAGAACAAGACAGGTTCCTACCGATCGCTAACGTTAGCAGGATCAT
GAAGAAGGCCTTGCCGGCGAACG

QA 1 263 1 263
DS 

RD RR2E483JQ 760 0 0
GGCAAGGACTCCGGTGGAGGGCAAAACGGACAGTCTGCGTTGTCTCCCAGAGAACAAGAC
AGGTTCCTACCGATCGCTAACGTTAGCAGGATCATGAAGAAGGCCTTGCCGGCGAACGCC
AAGATCTCCAAAGATGCTAAAGAGACGATGCAGGAGTGCGTCTCCGAGTTTATAAGCTTC
GTCACGGGAGAGGCGTCGGATAAGTGCCAGAAGGAGAAGAGGAAGACGATCAACGGCGAC
GATTTGCTTTGGGCTATGACCACTCTAGGGTTCGAGGATTACGTTGAGCCGCTGAAGGTT
TACTTGCAGAGGTTTAGGGAGATCGAAGGGGAGAGGGGTGGACTTGGGAGGCCACATACA
GGTGGTGAAGCTGGAGAGCATCAGCAAGATGGAGGTGGATTCTACGGTGGTGGTGGGATG
TAGTATCACCAGCATCATCAGTTTCTTCACCAGCAGAACCATATGAATGGATCCACAGGT
AGCGGTGGTGGTGGAGCTGGCTCCGGTAGGACAAGGACTTGAAAGATTGGTGGAAGTGGA
TCTCTGTATATAGATACATTAAAAAACATGCCTATTCATACCCATAAGAGCTCGTAACAT
CAATATATTCAAGTATCATGTTGGTTATATAGGCTTTGTAAAGCGGATCAAGTGTGTCTG
AAACAATAGGATTCGCTAACGAATCTGCTCCGTCTAATCTTGTATTTAAACTATTGGATT
TAGATCACATTGAATGCAAATGTTTTCAGACTCAAGTATT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL4890Contig1 1067 2 2 U
GGACGGTCTCAGAGAGTCCGAGTTCTCAAATCTTATCTTGATTCTTCTCGGATCACGATG
CAGCACCCACCACCACCCGGAGGTCTCCTTCCCCACCACGTTCCTCCTCCGTCTGCTCAA
CAGCACTACGGTTACCAGCAACCGCCTCCTTACGCTGCTCCTCCACCACAGATGTGGAAT
CCACAGGCGCCGCCACCAAGCCAGCCTATGACCGCCGACGAGATCCGTACTCTCTGGATC
GGTGACTTACAGTTCTGGATGGATGAGAGTTTCCTCTACAGTTGTTTTGCTCACACCGGA
GAGGTTCTTTCTGTTAAAGTCATCCGTAACAAGCAGACATCTCAGGTTGAATGCTACGGT
TTCATCGAGTTTGTATCTCACGCTGCTGCAGAACGAGCTCTACAAACATACAACAGCACT
CCCGTCCCTGGCCTTCCTGACCAGCTCTTTAGATTGAACTGGGCCTCGTTGGGCTCTGGA
GATAAACGTGACGATTCGCCTGATTACACCATCTTCGTTGGTGATCTGGCCGCTGATGTT
ACGGACTATGTCTTGCTAGAGACGTTCAAAGCCTCTCATCCTTCGGTTAAGGATGCAAAG
GTTGTTATCGATAGAGCCACTGGGCGTACAAAGGGATATGGTTTCGTCAGGCTATCATGG
GGACGAAGTCCTTCATCTAAACAGGCGGCCGATCCGAGTCAGTATTATTACGGTGGGTAT
GGACAAGGTCAGGAGCATTATGGGTACTCCATGCCGCAAGATCCTAACGCATATTACGGA
GGCTACCCTGGTGGGTATCAGCAGCCACCACAGGTGGGGCAGCAACCACCTCAGCAGCCA
CCACAGCAGCAACAAGTCGGGTTCAGCTACTAGCTGGCGAGAGTGTTCTTAGCTCCACTG
TTTGTTGTTTGTCTACTTTGTCATTAAACAGACACAGTTGATCTGTCTCTCTTTGTCTCC
TCTCTCTCTCTCTCTCTTTAGGAGAGTTTCTTTTCCTCAGCACTGATAATACTAAAGGAG
TGTGAAGAGATTTGACTCTTAATAATGCTTTGTGATGCTTCTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ79TF U 1
AF RR2EQ79JQ C 420
BS 1 627 RR2EQ79TF
BS 628 1067 RR2EQ79JQ

RD RR2EQ79TF 627 0 0
GGACGGTCTCAGAGAGTCCGAGTTCTCAAATCTTATCTTGATTCTTCTCGGATCACGATG
CAGCACCCACCACCACCCGGAGGTCTCCTTCCCCACCACGTTCCTCCTCCGTCTGCTCAA
CAGCACTACGGTTACCAGCAACCGCCTCCTTACGCTGCTCCTCCACCACAGATGTGGAAT
CCACAGGCGCCGCCACCAAGCCAGCCTATGACCGCCGACGAGATCCGTACTCTCTGGATC
GGTGACTTACAGTTCTGGATGGATGAGAGTTTCCTCTACAGTTGTTTTGCTCACACCGGA
GAGGTTCTTTCTGTTAAAGTCATCCGTAACAAGCAGACATCTCAGGTTGAATGCTACGGT
TTCATCGAGTTTGTATCTCACGCTGCTGCAGAACGAGCTCTACAAACATACAACAGCACT
CCCGTCCCTGGCCTTCCTGACCAGCTCTTTAGATTGAACTGGGCCTCGTTGGGCTCTGGA
GATAAACGTGACGATTCGCCTGATTACACCATCTTCGTTGGTGATCTGGCCGCTGATGTT
ACGGACTATGTCTTGCTAGAGACGTTCAAAGCCTCTCATCCTTCGGTTAAGGATGCAAAG
GTTGTTATCGATAGAGCCACTGGGCGT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2EQ79JQ 648 0 0
TCCCGTCCCTGGCCTTCCTGACCAGCTCTTTAGATTGAACTGGGCCTCGTTGGGCTCTGG
AGATAAACGTGACGATTCGCCTGATTACACCATCTTCGTTGGTGATCTGGCCGCTGATGT
TACGGACTATGTCTTGCTAGAGACGTTCAAAGCCTCTCATCCTTCGGTTAAGGATGCAAA
GGTTGTTATCGATAGAGCCACTGGGCGTACAAAGGGATATGGTTTCGTCAGGCTATCATG
GGGACGAAGTCCTTCATCTAAACAGGCGGCCGATCCGAGTCAGTATTATTACGGTGGGTA
TGGACAAGGTCAGGAGCATTATGGGTACTCCATGCCGCAAGATCCTAACGCATATTACGG
AGGCTACCCTGGTGGGTATCAGCAGCCACCACAGGTGGGGCAGCAACCACCTCAGCAGCC
ACCACAGCAGCAACAAGTCGGGTTCAGCTACTAGCTGGCGAGAGTGTTCTTAGCTCCACT
GTTTGTTGTTTGTCTACTTTGTCATTAAACAGACACAGTTGATCTGTCTCTCTTTGTCTC
CTCTCTCTCTCTCTCTCTTTAGGAGAGTTTCTTTTCCTCAGCACTGATAATACTAAAGGA
GTGTGAAGAGATTTGACTCTTAATAATGCTTTGTGATGCTTCTGTTTT

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL4891Contig1 675 2 4 U
GGATTTTCGGTCATCAAAACGATTGACTTCCTCTCACCTATCCCTCCCATATCTTTTACA
GGGAGGATGAAGAGAAAGTTTTTGTTTTTTGGTTAATCTTCTGATCTTAGTTGAATCATA
CGTTTTTTCGGCTTAGGCCGACTTTGTCTTTCCTTACCGGATTTCTTTTTGTTGTGTTTC
TCAACTCATAACAGAGCAATATTTCATGGTTTGTTTTATTTACCTCTGTTAATGAATTTG
GAATAAAATTCTGCTCTTTGATCAGATTTGTTCTCTCTTTCGCAAGTTTAATTCAAATCT
CGATCTCTTGTCTTCGCTTATTTTTATCGCAGGAATGCTCTGAATCCTATCCTAAATTTT
TGTCTTCTTTGGCCGGATTCTTGGTTTCAAGGGGTTAAGCTTTTCTGTTGGAAAGGCTAA
AGAAGATGATGGATTAATTGAGCAATCCATGTGTTTAATAATCTGCAGATGCAAGGATCG
CAATCGCTGGAGTTGGTTAGGGCGGAAGGGATTTTGGTAGAGGATACACAGGAGGACAGA
GGGAGATCGGAGAAGCTGATTGGGACGTGTTTTTTCAATTGTTGTTTTAATGTATTTTAC
TGGGCCTGTTTTGTAAGTACAATATCAAATGTTGTAACTGAGCTTTTTGGGCTCCAATTA
ATGAAAAAGGTTGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D252JQ C 1
AF RR2D252TF U 1
BS 1 574 RR2D252TF
BS 575 575 RR2D252JQ
BS 576 668 RR2D252TF
BS 669 675 RR2D252JQ

RD RR2D252JQ 675 0 0
GGATTTTCGGTCATCAAAACGATTGACTTCCTCTCACCTATCCCTCCCATATCTTTTACA
GGGAGGATGAAGAGAAAGTTTTTGTTTTTTGGTTAATCTTCTGATCTTAGTTGAATCATA
CGTTTTTTCGGCTTAGGCCGACTTTGTCTTTCCTTACCGGATTTCTTTTTGTTGTGTTTC
TCAACTCATAACAGAGCAATATTTCATGGTTTGTTTTATTTACCTCTGTTAATGAATTTG
GAATAAAATTCTGCTCTTTGATCAGATTTGTTCTCTCTTTCGCAAGTTTAATTCAAATCT
CGATCTCTTGTCTTCGCTTATTTTTATCGCAGGAATGCTCTGAATCCTATCCTAAATTTT
TGTCTTCTTTGGCCGGATTCTTGGTTTCAAGGGGTTAAGCTTTTCTGTTGGAAAGGCTAA
AGAAGATGATGGATTAATTGAGCAATCCATGTGTTTAATAATCTGCAGATGCAAGGATCG
CAATCGCTGGAGTTGGTTAGGGCGGAAGGGATTTTGGTAGAGGATACACAGGAGGACAGA
GGGAGATCGGAGAAGCTGATTGGGACGTGTTTTTTCAATTGTTGTTTTAATGTATTTTAC
TGGGCCTGTTTTGTAAGTACAATATCAAATGTTGTAACTGAGCTTTTTGGGCTCCAATTA
ATGAAAAAGGTTGAC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2D252TF 668 0 0
GGATTTTCGGTCATCAAAACGATTGACTTCCTCTCACCTATCCCTCCCATATCTTTTACA
GGGAGGATGAAGAGAAAGTTTTTGTTTTTTGGTTAATCTTCTGATCTTAGTTGAATCATA
CGTTTTTTCGGCTTAGGCCGACTTTGTCTTTCCTTACCGGATTTCTTTTTGTTGTGTTTC
TCAACTCATAACAGAGCAATATTTCATGGTTTGTTTTATTTACCTCTGTTAATGAATTTG
GAATAAAATTCTGCTCTTTGATCAGATTTGTTCTCTCTTTCGCAAGTTTAATTCAAATCT
CGATCTCTTGTCTTCGCTTATTTTTATCGCAGGAATGCTCTGAATCCTATCCTAAATTTT
TGTCTTCTTTGGCCGGATTCTTGGTTTCAAGGGGTTAAGCTTTTCTGTTGGAAAGGCTAA
AGAAGATGATGGATTAATTGAGCAATCCATGTGTTTAATAATCTGCAGATGCAAGGATCG
CAATCGCTGGAGTTGGTTAGGGCGGAAGGGATTTTGGTAGAGGATACACAGGAGGACAGA
GGGAGATCGGAGAAGCTGATTGGGACGTGTTTTT*CAATTGTTGTTTTAATGTATTTTAC
TGGGCCTGTTTTGTAAGTACAATATCAAATGTTGTAACTGAGCTTTTTGGGCTCCAATTA
ATGAAAAA

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL4892Contig1 535 2 1 U
GGTTACTATTCACATGTTGTCACAAGAGAAGGATTTATCACAGTGCCATAACGGGAAGTT
GATGTCTTACCTAAATCCATTAAAGAGCTTCTAAGTCTAGCTGGTGAAAAGTTTGGAGGA
TGCAGCTTCACAAAGATCACGAATGTAGAGAACACTGAGATTGATGATTTAGATGTCATT
TGGGATGGTGATCATTTGTTTTTTTCATCAAACTGAGTTTGAAGGTAGTAACTGAGACAG
CCTTCCTTCGTTACAGCAATGTCTATTTGCGCCAGTCTATCCTTACTCGGTTTCATAGAA
CAATAAGATAATCAAAAACCATAATCTAAACTGATATGGATTGACACAACAACAGTATCA
ATAGTTTGTGGAATGTATATGATATCTAATTTAATAACAAAAAACTTGAAAAAAGTAAGA
AGTCGAAAGAAAGTAATGCAGTGAATAAATTTATGTTGTCTATATCTTCTTAAACCACAG
TACTTTAATTCATAGAGTACAATTCCTATGAGTTTTCTATACAGTTTAGAAACTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DE27JQ C 1
AF RR2DE27TF U 1
BS 1 535 RR2DE27TF

RD RR2DE27JQ 535 0 0
GGTTACTATTCACATGTTGTCACAAGAGAAGGATTTATCACAGTGCCATAACGGGAAGTT
GATGTCTTACCTAAATCCATTAAAGAGCTTCTAAGTCTAGCTGGTGAAAAGTTTGGAGGA
TGCAGCTTCACAAAGATCACGAATGTAGAGAACACTGAGATTGATGATTTAGATGTCATT
TGGGATGGTGATCATTTGTTTTTTTCATCAAACTGAGTTTGAAGGTAGTAACTGAGACAG
CCTTCCTTCGTTACAGCAATGTCTATTTGCGCCAGTCTATCCTTACTCGGTTTCATAGAA
CAATAAGATAATCAAAAACCATAATCTAAACTGATATGGATTGACACAACAACAGTATCA
ATAGTTTGTGGAATGTATATGATATCTAATTTAATAACAAAAAACTTGAAAAAAGTAAGA
AGTCGAAAGAAAGTAATGCAGTGAATAAATTTATGTTGTCTATATCTTCTTAAACCACAG
TACTTTAATTCATAGAGTACAATTCCTATGAGTTTTCTATACAGTTTAGAAACTT

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2DE27TF 535 0 0
GGTTACTATTCACATGTTGTCACAAGAGAAGGATTTATCACAGTGCCATAACGGGAAGTT
GATGTCTTACCTAAATCCATTAAAGAGCTTCTAAGTCTAGCTGGTGAAAAGTTTGGAGGA
TGCAGCTTCACAAAGATCACGAATGTAGAGAACACTGAGATTGATGATTTAGATGTCATT
TGGGATGGTGATCATTTGTTTTTTTCATCAAACTGAGTTTGAAGGTAGTAACTGAGACAG
CCTTCCTTCGTTACAGCAATGTCTATTTGCGCCAGTCTATCCTTACTCGGTTTCATAGAA
CAATAAGATAATCAAAAACCATAATCTAAACTGATATGGATTGACACAACAACAGTATCA
ATAGTTTGTGGAATGTATATGATATCTAATTTAATAACAAAAAACTTGAAAAAAGTAAGA
AGTCGAAAGAAAGTAATGCAGTGAATAAATTTATGTTGTCTATATCTTCTTAAACCACAG
TACTTTAATTCATAGAGTACAATTCCTATGAGTTTTCTATACAGTTTAGAAACTT

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 2

CO CL4893Contig1 1319 2 4 U
GGGGAGGATCTTAGCTTAGCTTGTTCGTATATGGTCCATTTGAATTTGAATGAAAGTGAG
CTCTTATGATCCTCATCACCTCCGCTCGAGCTTTTAACGCTATGAATCACCGGATGATGT
ACTCTACTCGATCGTCTTCCAAATCCATCTCCTCAGAATCCCTAACTCTTCCTTCCAATT
CCAATTCCACTTCTAATTCAGAATCAGCCAATAAAGCTTCCGGTTCTGAGAGGCGAGTAT
CATCACCTCTAAGGAAGAAAAGGCTAAAACAGGAAGATTTGGAGCCTGTGGAGAAAGTTT
CAAACAGAGGAATCAATGGCCATGATGAGATGTGTGGATTATTACCAGATATAGAAGACC
TTTCTTACAAGAAGCCAAATGTATCTCCTCCTCCTTCATCTAGGACGTCAAAGCTAAACT
CAAAAGAAGCTAGCACATCCGCAACGTTAATCACAATAGCAGGCAGACCACCTGAGAACT
GGGAAAAGGTGCTGGAGGGTATTCGAAAAATGACATCTTCAGAAGAAGCAACAGTTGACC
CTTTAAATTGCGATAGAACAGGAAGCTTTTTACCTCCCAAGGAAAGGCGATTTTATGTTC
TCATAGGAACACTTCTTTCAAGTCAGACTAAAGATCACGTAACTGGTGCGGCAGTAGAAC
GTCTTCGTCTGAATGGCCTTCTCACTCCTGAGGCTATTGATAAAGCCGATGAATCAACCA
TAAAGGAATTGATTTACCCGGTCGGGTTCTATACTAGAAAGGCTACTAATGTGAAGAAAG
TTGCTGAGATTTGTCTCATGAAGTATGACGGTGACATTCCAAGGTCTTTGGAAGAGCTAC
TCTCACTTCCAGGAGTTGGTCCTAAGATTGCTCATCTGGTTTTGCATATAGCACGGAATG
ATGTTCAAGGGATCTGTGTAGACACACATGTGCATCGCATTTGCAATCGGCTTGGTTGGG
TGTTTAAACCAGGAAGGAAACAGAAAACGTCTACTCCCGAGGAAACTAGAGTATCTCTGC
AACAATGGCTTCCAAAAGAAGAATGGGTCGCTATTAACTTTCTTTTGGTAGGTTTCGGAC
AAAAGATATGCACACCGCTAAGACCACGCTGCGGAGTGTGTAGTATCAGTGAGCTTTGCC
CTTCTGCCTTCAAGGAGACCCCAATCAAATCCTCCAAAAGGAAGAAATCTATCAAAAGCA
AGAAGCTTTAATTGCTGTGTCTCTGGACTCTCCTCCTTGATCATTTCTTAAACCATTTTG
TGATTAGTCCACCTCTGTAAAACATAAATTTTATCCAAGAAGTTGTATAGTTTTATGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ74TF U 1
AF RR2AJ74JQ C 525
BS 1 727 RR2AJ74TF
BS 728 728 RR2AJ74JQ
BS 729 736 RR2AJ74TF
BS 737 1319 RR2AJ74JQ

RD RR2AJ74TF 736 0 0
GGGGAGGATCTTAGCTTAGCTTGTTCGTATATGGTCCATTTGAATTTGAATGAAAGTGAG
CTCTTATGATCCTCATCACCTCCGCTCGAGCTTTTAACGCTATGAATCACCGGATGATGT
ACTCTACTCGATCGTCTTCCAAATCCATCTCCTCAGAATCCCTAACTCTTCCTTCCAATT
CCAATTCCACTTCTAATTCAGAATCAGCCAATAAAGCTTCCGGTTCTGAGAGGCGAGTAT
CATCACCTCTAAGGAAGAAAAGGCTAAAACAGGAAGATTTGGAGCCTGTGGAGAAAGTTT
CAAACAGAGGAATCAATGGCCATGATGAGATGTGTGGATTATTACCAGATATAGAAGACC
TTTCTTACAAGAAGCCAAATGTATCTCCTCCTCCTTCATCTAGGACGTCAAAGCTAAACT
CAAAAGAAGCTAGCACATCCGCAACGTTAATCACAATAGCAGGCAGACCACCTGAGAACT
GGGAAAAGGTGCTGGAGGGTATTCGAAAAATGACATCTTCAGAAGAAGCAACAGTTGACC
CTTTAAATTGCGATAGAACAGGAAGCTTTTTACCTCCCAAGGAAAGGCGATTTTATGTTC
TCATAGGAACACTTCTTTCAAGTCAGACTAAAGATCACGTAACTGGTGCGGCAGTAGAAC
GTCTTCGTCTGAATGGCCTTCTCACTCCTGAGGCTATTGATAAAGCCGATGAATCAACCA
TAAAGGATTTGATTTA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2AJ74JQ 795 0 0
GAAGCAACAGTTGACCCTTTAAATTGCGATAGAACAGGAAGCTTTTTACCTCCCAAGGAA
AGGCGATTTTATGTTCTCATAGGAACACTTCTTTCAAGTCAGACTAAAGATCACGTAACT
GGTGCGGCAGTAGAACGTCTTCGTCTGAATGGCCTTCTCACTCCTGAGGCTATTGATAAA
GCCGATGAATCAACCATAAAGGAATTGATTTACCCGGTCGGGTTCTATACTAGAAAGGCT
ACTAATGTGAAGAAAGTTGCTGAGATTTGTCTCATGAAGTATGACGGTGACATTCCAAGG
TCTTTGGAAGAGCTACTCTCACTTCCAGGAGTTGGTCCTAAGATTGCTCATCTGGTTTTG
CATATAGCACGGAATGATGTTCAAGGGATCTGTGTAGACACACATGTGCATCGCATTTGC
AATCGGCTTGGTTGGGTGTTTAAACCAGGAAGGAAACAGAAAACGTCTACTCCCGAGGAA
ACTAGAGTATCTCTGCAACAATGGCTTCCAAAAGAAGAATGGGTCGCTATTAACTTTCTT
TTGGTAGGTTTCGGACAAAAGATATGCACACCGCTAAGACCACGCTGCGGAGTGTGTAGT
ATCAGTGAGCTTTGCCCTTCTGCCTTCAAGGAGACCCCAATCAAATCCTCCAAAAGGAAG
AAATCTATCAAAAGCAAGAAGCTTTAATTGCTGTGTCTCTGGACTCTCCTCCTTGATCAT
TTCTTAAACCATTTTGTGATTAGTCCACCTCTGTAAAACATAAATTTTATCCAAGAAGTT
GTATAGTTTTATGGG

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

CO CL4894Contig1 921 2 4 U
ATTTGATAAGGGCTCCGATTGTGGATTAGGAAGCTTTTGTGGCACCAAGCGCATCAGTCA
TTGGGAACGTTTAGGTTGGAAGAGGATCATCTATTTGGTATGGATGCTGTCCTACGAGGG
GATGTGAATACCATTAGTGTTGGATCAGGAACTAATATTTAGGACAACTCACTTGTGCAT
GTGGTAAAATAAAACTTAAGCGGGAAGGTGCATCCAGCCATCATCGGAGACAATGTACCC
ATTGATATATAACAGGTCATAGTGCTGTTTTGCATGGATGTACTGTTGAGGATGAGGCCT
TTATCGGGATGGATACGACACTTCTTGACGGTCTCGTCGGTATTGGTTGCTGCTGCTGCG
CTTGTTTCGACAAAACACTAGAAATCCTTCTGGAGAGGACTCAGATATGGGGAGGAAACC
CAGAAAAGGTGCCCCGGGAAGCTCCGTAATAAGGAACCTCACGTTGCAGAGAATGCAAAG
CCACTAAATGCGATCGAGTTCGAGAAGGGTCTGCGCAAGAGATATGCTCAAAAAGACGAG
GAGTATGAGTCAATGCTTGGTATTGTGAGAGAAGCTCCACGGACCTTAAACTCCCTAACA
TCATAGAGCCTGATAAAGAAGCCATGCGTCCTTCAACTGTGAACTGATCTTTTTGGGGTA
CGCTATCTGATCGAAACCTTAATAGTATGAGATGTCTCAATAAATATTATGTTTCGATCT
CTGGTTTGAATAATGGCAAGTAGAGTACACTAGAGTAGACTAAATTTCCAGCGTTTGCTC
GACTTTTTCGTCATGGTTTCTTAGGGAATGGTCTTGTCAGGAGAAAAAACTTTGGATGCT
ATTACTTTGGTTTGAAAATAAGAATCAAATGTTATGAAACATGAGGAGTGAGTGAGTAAT
AATAGACTGATATGCATGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ74TFB U 1
AF RR2AZ74JQ C 218
BS 1 339 RR2AZ74TFB
BS 340 340 RR2AZ74JQ
BS 341 424 RR2AZ74TFB
BS 425 921 RR2AZ74JQ

RD RR2AZ74TFB 424 0 0
ATTTGATAAGGGCTCCGATTGTGGATTAGGAAGCTTTTGTGGCACCAAGCGCATCAGTCA
TTGGGAACGTTTAGGTTGGAAGAGGATCATCTATTTGGTATGGATGCTGTCCTACGAGGG
GATGTGAATACCATTAGTGTTGGATCAGGAACTAATATTTAGGACAACTCACTTGTGCAT
GTGGTAAAATAAAACTTAAGCGGGAAGGTGCATCCAGCCATCATCGGAGACAATGTACCC
ATTGATATATAACAGGTCATAGTGCTGTTTTGCATGGATGTACTGTTGAGGATGAGGCCT
TTATCGGGATGGATACGACACTTCTTGACGGTCTCGTCG*TATTGGTTGCTGCTGCTGCG
CTTGTTTCGACAAAACACTAGAAATCCTTCTGGAGAGGACTCAGATATGGGGAGGAAACC
CAGA

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR2AZ74JQ 704 0 0
CCATCATCGGAGACAATGTACCCATTGATATATAACAGGTCATAGTGCTGTTTTGCATGG
ATGTACTGTTGAGGATGAGGCCTTTATCGGGATGGATACGACACTTCTTGACGGTCTCGT
CGGTATTGGTTGCTGCTGCTGCGCTTGTTTCGACAAAACACTAGAAATCCTTCTGGAGAG
GACTCAGATATGGGGAGGAAACCCAGAAAAGGTGCCCCGGGAAGCTCCGTAATAAGGAAC
CTCACGTTGCAGAGAATGCAAAGCCACTAAATGCGATCGAGTTCGAGAAGGGTCTGCGCA
AGAGATATGCTCAAAAAGACGAGGAGTATGAGTCAATGCTTGGTATTGTGAGAGAAGCTC
CACGGACCTTAAACTCCCTAACATCATAGAGCCTGATAAAGAAGCCATGCGTCCTTCAAC
TGTGAACTGATCTTTTTGGGGTACGCTATCTGATCGAAACCTTAATAGTATGAGATGTCT
CAATAAATATTATGTTTCGATCTCTGGTTTGAATAATGGCAAGTAGAGTACACTAGAGTA
GACTAAATTTCCAGCGTTTGCTCGACTTTTTCGTCATGGTTTCTTAGGGAATGGTCTTGT
CAGGAGAAAAAACTTTGGATGCTATTACTTTGGTTTGAAAATAAGAATCAAATGTTATGA
AACATGAGGAGTGAGTGAGTAATAATAGACTGATATGCATGTGC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4896Contig1 1057 2 2 U
CCTCCTCCATCGTACGAGCAACCGTCGTCCAGGCATGCACCATCTTCTACGATACTCCCG
CCACCCTAGACAAGGCGGAGAGGTTACTTGCCGAGGCGGCGGATAACGGGTCACAGCTCG
TTGTGTTCCCGGAGGCGTTCATCGGCGGATATCCTCGCGGGTCAAGCTTCGAGCTTGCCA
TTGGTGCTCGAACGGCTAAAGGAAGAGACGACTTTCGCAAGTATCTTGCTTCTGCCATCC
ATGTTCCCGGCCCTGAAGTTGAACGTTTGGGGGAGATGGCTAGGAAGTACAAAGTGTTCT
TGGTCATGGGTGTGATTGAAAGGGAAGGCTATACTCTATACTGTTCTGTCCTTTTCTTTG
ACTCGCAAGGTCAGTTCTTGGGTAAGCACAGGAAACTCATGCCTGCGGCTCTTGAACGTT
GCATCTGGGGGTTCGGAGATGGATCAACCATCCCTGTTTTCGATACTCCTATTGGCAAAA
TCGGTGCTGCTATTTGTTGGGAGAATAGGATGCCGTCTTTAAGAACCGCAATGTATGCCA
AAGGCATTGAGATATATTGTGCACCTACTGCTGATGCTAGAGAAACTTGGCTAGCGTCGA
TGACTCACATCGCTCTGGAAGGTGGATGTTTTGTTTTATCATCTAACCAGTTCTGTCGCC
GGAAAGACTACCCTCCTCCACCGGAATACACGTTTTCCGGTTCAGAAGAGAGCCTTACAC
CTGATTCTGTTGTCTGTGCTGGTGGAAGCTCTATCATTTCGCCTTTAGGAATTGTTCTAG
CCGGACCAAACTATGAAGGAGAGGGTCTTATCTCAGCTGATCTAGATCTTGGAGACATAG
CACGAGCTAAGTTTGACTTCGATGTGGTGGGTCATTACTCGAGGCCTGAAGTGTTTAGCT
TGAACATAAGGGAGCGTCCGAGAAAAGCGGTCAGCTTCACCTCCGAGGCAACCAAAGATG
AGACCGTCAAAAAGTGAGAGACCAACGTTCAACTTCAAAGACTTGTTGGTGTTTTATTGT
ATATTTAATAACTGTAATTGAATCAATATCAGATCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F206TF U 1
AF RR2F206JQ C 416
BS 1 537 RR2F206TF
BS 538 1057 RR2F206JQ

RD RR2F206TF 537 0 0
CCTCCTCCATCGTACGAGCAACCGTCGTCCAGGCATGCACCATCTTCTACGATACTCCCG
CCACCCTAGACAAGGCGGAGAGGTTACTTGCCGAGGCGGCGGATAACGGGTCACAGCTCG
TTGTGTTCCCGGAGGCGTTCATCGGCGGATATCCTCGCGGGTCAAGCTTCGAGCTTGCCA
TTGGTGCTCGAACGGCTAAAGGAAGAGACGACTTTCGCAAGTATCTTGCTTCTGCCATCC
ATGTTCCCGGCCCTGAAGTTGAACGTTTGGGGGAGATGGCTAGGAAGTACAAAGTGTTCT
TGGTCATGGGTGTGATTGAAAGGGAAGGCTATACTCTATACTGTTCTGTCCTTTTCTTTG
ACTCGCAAGGTCAGTTCTTGGGTAAGCACAGGAAACTCATGCCTGCGGCTCTTGAACGTT
GCATCTGGGGGTTCGGAGATGGATCAACCATCCCTGTTTTCGATACTCCTATTGGCAAAA
TCGGTGCTGCTATTTGTTGGGAGAATAGGATGCCGTCTTTAAGAACCGCAATGTATG

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2F206JQ 642 0 0
ACGTTGCATCTGGGGGTTCGGAGATGGATCAACCATCCCTGTTTTCGATACTCCTATTGG
CAAAATCGGTGCTGCTATTTGTTGGGAGAATAGGATGCCGTCTTTAAGAACCGCAATGTA
TGCCAAAGGCATTGAGATATATTGTGCACCTACTGCTGATGCTAGAGAAACTTGGCTAGC
GTCGATGACTCACATCGCTCTGGAAGGTGGATGTTTTGTTTTATCATCTAACCAGTTCTG
TCGCCGGAAAGACTACCCTCCTCCACCGGAATACACGTTTTCCGGTTCAGAAGAGAGCCT
TACACCTGATTCTGTTGTCTGTGCTGGTGGAAGCTCTATCATTTCGCCTTTAGGAATTGT
TCTAGCCGGACCAAACTATGAAGGAGAGGGTCTTATCTCAGCTGATCTAGATCTTGGAGA
CATAGCACGAGCTAAGTTTGACTTCGATGTGGTGGGTCATTACTCGAGGCCTGAAGTGTT
TAGCTTGAACATAAGGGAGCGTCCGAGAAAAGCGGTCAGCTTCACCTCCGAGGCAACCAA
AGATGAGACCGTCAAAAAGTGAGAGACCAACGTTCAACTTCAAAGACTTGTTGGTGTTTT
ATTGTATATTTAATAACTGTAATTGAATCAATATCAGATCCA

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL4897Contig1 1004 2 2 U
GGAAAAGAACAAAAAAAAAAAATTAATGGCGAGACTCTTCGTCTCTATCCCTATGCAAAC
GGCAGCCCTGTCGGCGCTTTCTCAGCCTCTATTTTCGCCGCCGGTGAGCTATTTCACCGA
TGGAGGGGTGGGAGGATTATGTTTTTCCAGAAGAATCAGATACCGTTCCGTGGTGGTGCG
AGCAGGGCCCAGTACGAGTAACTACTTGCTCGCGTTCGCCATTCCTGCGACTCTTATCGC
CGCTACTGTTTTCACTTCGGCTAAGATTGCTGATAAGCTTGATGATGACTTCCTCGAAGA
TGTAAGGATGGGCTGTCTCCACCAAACAATGTCCTTATATACATCTTTGCTAGTTCTTAG
TTCAGATTCGACTTTGGTCTGTTTTTTTTTTTTTAAATTAGTGTTGTCGTTGATTTAAGT
TCTAGAGTATTGTCTCAGTTTGGCCTAAAGTGTTGCTTGGTAGTAGGGTGTTAATAATCT
CTTAGTACATTACTTAAGTAAGAAGCTCCTCTGTAAAAATCTGTCGGGAACACCCTTGTA
TCTATTTCATATGGTCTGTAAAACTAACCAGCATTATGATTACAGATTGCGTTGAACCAG
GCGATAAAAGCAGCAGAAGATGGAGAGAATGGCCAAGGTGAAATCTCGATGGACGATTTG
ATTAAAGAGCCTGTGCTTCAACGAACACGTAAACGTCCTAAGCGTGAAGTTTAAGCAAAA
CACACACACACACACTTAAGGCTTCTTCTTAAAGGAGTTTCATTCAATGATCCATGACTG
TTATAATGTCTTGTGTTTGTACAAGCATGTAATAACATTTATAGTTGTAGTTACTGAAAA
ATTTATTAAAAATAGTTTTGATCATTTGTATAAAATAAGATGGTGATAGAGCTGAAACGA
TGACACACTCCTCATTTTCTAACAGTGTCCATCTCATTTTCTTGTCACCGAGATTTTTTT
TGCGGTACATTTGTAACTATGGAAGAAGTAGAAGGGTATAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D873TF U 1
AF RR2D873JQ C 395
BS 1 596 RR2D873TF
BS 597 1004 RR2D873JQ

RD RR2D873TF 596 0 0
GGAAAAGAACAAAAAAAAAAAATTAATGGCGAGACTCTTCGTCTCTATCCCTATGCAAAC
GGCAGCCCTGTCGGCGCTTTCTCAGCCTCTATTTTCGCCGCCGGTGAGCTATTTCACCGA
TGGAGGGGTGGGAGGATTATGTTTTTCCAGAAGAATCAGATACCGTTCCGTGGTGGTGCG
AGCAGGGCCCAGTACGAGTAACTACTTGCTCGCGTTCGCCATTCCTGCGACTCTTATCGC
CGCTACTGTTTTCACTTCGGCTAAGATTGCTGATAAGCTTGATGATGACTTCCTCGAAGA
TGTAAGGATGGGCTGTCTCCACCAAACAATGTCCTTATATACATCTTTGCTAGTTCTTAG
TTCAGATTCGACTTTGGTCTGTTTTTTTTTTTTTAAATTAGTGTTGTCGTTGATTTAAGT
TCTAGAGTATTGTCTCAGTTTGGCCTAAAGTGTTGCTTGGTAGTAGGGTGTTAATAATCT
CTTAGTACATTACTTAAGTAAGAAGCTCCTCTGTAAAAATCTGTCGGGAACACCCTTGTA
TCTATTTCATATGGTCTGTAAAACTAACCAGCATTATGATTACAGATTGCGTTGAA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2D873JQ 610 0 0
AAATTAGTGTTGTCGTTGATTTAAGTTCTAGAGTATTGTCTCAGTTTGGCCTAAAGTGTT
GCTTGGTAGTAGGGTGTTAATAATCTCTTAGTACATTACTTAAGTAAGAAGCTCCTCTGT
AAAAATCTGTCGGGAACACCCTTGTATCTATTTCATATGGTCTGTAAAACTAACCAGCAT
TATGATTACAGATTGCGTTGAACCAGGCGATAAAAGCAGCAGAAGATGGAGAGAATGGCC
AAGGTGAAATCTCGATGGACGATTTGATTAAAGAGCCTGTGCTTCAACGAACACGTAAAC
GTCCTAAGCGTGAAGTTTAAGCAAAACACACACACACACACTTAAGGCTTCTTCTTAAAG
GAGTTTCATTCAATGATCCATGACTGTTATAATGTCTTGTGTTTGTACAAGCATGTAATA
ACATTTATAGTTGTAGTTACTGAAAAATTTATTAAAAATAGTTTTGATCATTTGTATAAA
ATAAGATGGTGATAGAGCTGAAACGATGACACACTCCTCATTTTCTAACAGTGTCCATCT
CATTTTCTTGTCACCGAGATTTTTTTTGCGGTACATTTGTAACTATGGAAGAAGTAGAAG
GGTATAGTTG

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL4898Contig1 983 2 4 U
ATCAGGTGATGAAGTAGAAGAGAATAATAAGAAGAGGGAGATAGAGGAAGATGCAAACAC
TGAAAAGCTTCCAGCTTTGGAGGTGGAGAAGAACAACGAAGCTTCTGTTGATACAACATC
TGCTGTTGTTGTTACTACTAGCAGAGATGTGATCGTGTCGAATCCATCGGTTTCGAGGAG
AAAACTTCTCGTTCTTGATCTGAATGGGTTGCTTGCAGATATAGCTTCTCCTCTTGCAGG
TTGTAAAGCTGATATTAACATTGGAAGAAGAGCGATTTTTAAGAGACCCTTTTGTGAAGA
CTTCTTGAAGTTCTGCTTTGACAAGTTTGAAGTTGGTATCTGGTCCTCTAGAAAAAAGAA
CAATGTTGACAGAATCACTGACTTCTTGCTCGGTGATATGACGAGGAAACTGTTGTTTTG
CTGGGACATGTCTTACTGTGCTACCACGACTCTTGGTTCACTTGAAAATAGACACAAATG
TGTGGTGTTTAAGGATCTAAAGAAGCTTTGGGAGAAACACGACCCGAGACTTCCTTGGCA
AAGGGGTGCTTACAACGAAACTAACACTGTTTTGCTAGATGATTCTCCTTACAAGGCTTT
GCTTAACCCTCCATATACAGCGATATTCCCACACTCATACAGCCATCACAACAAGTCAGA
CACATCCTTAGGTACTGATGGTGATCTAGACTTCATCTGGAGAAGTTAGTAGAAGCTGAA
AACGTTCAAGATTTCATCAAGAATAACTCTTTTGGGCAAGAAGCTATTACGGAAGCTAGT
GAAACTTGGGAGTTTTATAGAGAGGCCACTAGTATGCATACACATACACGCATTTAGAAA
CCTCATACGGTAGATAAGAGAAGGATTGTTGCATGATTATTTCTATGTCGTTGATGTTGT
TGTTATAGTGTTTTTTTTTTGGATGTTTCACTGTAGAGGCTGGAAACTACAGGTAATTTG
CTTACTTAAATCTGGTTTATCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ48TFB U 1
AF RR2AZ48JQ C 238
BS 1 339 RR2AZ48TFB
BS 340 340 RR2AZ48JQ
BS 341 442 RR2AZ48TFB
BS 443 983 RR2AZ48JQ

RD RR2AZ48TFB 442 0 0
ATCAGGTGATGAAGTAGAAGAGAATAATAAGAAGAGGGAGATAGAGGAAGATGCAAACAC
TGAAAAGCTTCCAGCTTTGGAGGTGGAGAAGAACAACGAAGCTTCTGTTGATACAACATC
TGCTGTTGTTGTTACTACTAGCAGAGATGTGATCGTGTCGAATCCATCGGTTTCGAGGAG
AAAACTTCTCGTTCTTGATCTGAATGGGTTGCTTGCAGATATAGCTTCTCCTCTTGCAGG
TTGTAAAGCTGATATTAACATTGGAAGAAGAGCGATTTTTAAGAGACCCTTTTGTGAAGA
CTTCTTGAAGTTCTGCTTTGACAAGTTTGAAGTTGGTATGTGGTCCTCTAGAAAAAAGAA
CAATGTTGACAGAATCACTGACTTCTTGCTCGGTGATATGACGAGGAAACTGTTGTTTTG
CTGGGACATGTCTTACTGTGCT

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR2AZ48JQ 746 0 0
AGGTTGTAAAGCTGATATTAACATTGGAAGAAGAGCGATTTTTAAGAGACCCTTTTGTGA
AGACTTCTTGAAGTTCTGCTTTGACAAGTTTGAAGTTGGTATCTGGTCCTCTAGAAAAAA
GAACAATGTTGACAGAATCACTGACTTCTTGCTCGGTGATATGACGAGGAAACTGTTGTT
TTGCTGGGACATGTCTTACTGTGCTACCACGACTCTTGGTTCACTTGAAAATAGACACAA
ATGTGTGGTGTTTAAGGATCTAAAGAAGCTTTGGGAGAAACACGACCCGAGACTTCCTTG
GCAAAGGGGTGCTTACAACGAAACTAACACTGTTTTGCTAGATGATTCTCCTTACAAGGC
TTTGCTTAACCCTCCATATACAGCGATATTCCCACACTCATACAGCCATCACAACAAGTC
AGACACATCCTTAGGTACTGATGGTGATCTAGACTTCATCTGGAGAAGTTAGTAGAAGCT
GAAAACGTTCAAGATTTCATCAAGAATAACTCTTTTGGGCAAGAAGCTATTACGGAAGCT
AGTGAAACTTGGGAGTTTTATAGAGAGGCCACTAGTATGCATACACATACACGCATTTAG
AAACCTCATACGGTAGATAAGAGAAGGATTGTTGCATGATTATTTCTATGTCGTTGATGT
TGTTGTTATAGTGTTTTTTTTTTGGATGTTTCACTGTAGAGGCTGGAAACTACAGGTAAT
TTGCTTACTTAAATCTGGTTTATCGG

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL4899Contig1 1088 2 2 U
TTTTTTGCTCTTTCACAGAAAAAAAAGTAGAAATAATTTTTGCCAATGGCTCTGCGTGGA
GATGAGCATGAGTTTATGAACTTAAGAGAATGGGATCGAAGAGCTCGATTGATCCGCGAA
AACCCTTCTTCAAGAAGGTTCTCTGCTTCATACGTTGGAAGCTTTAGAGAAGATCATAAG
TCTTCTTCAAGAACAAACTTAAGCAACATCTCTAGTACTGCCTCTTCTCCTGGCTACACC
CTCAAAGACGAGATTGACCCAGCAACATATTCCTTCACCAATGCACTCAAGGCGTTACAA
GCGAAGACAAATTTTAATAACAGAGAATGGTTAACACAAGAAGGATTTGCGTTGAATTCG
AAGTGGAACGAAGCAGAGAAATATATATGTAATCCAGTGTCTGGAGAAGTTCCAATGGAG
TGTTTGTCTTCTAAAACACTAAGTGCAAGATCTTTCAGAAACTTGACCACCATGTCTGCT
CCTCTTCACTACCCTAATCTTAATCCATTGGTGAATAATATTGGACCAAACAAACCCAAT
GATAATCCCAACGTTAGAGTTATCCACGAGGATCTTTATGCTCCTGATCCTGTTATTGTT
CGAGAAAAGAAAGTTGTGGGGCTGAAACAAGATGTGGGCATTCAGAGTACGTCGGTGGAT
CTTAACTCCGGTAGCCCTAGTCCGGCAAAGACGCCTATGATCATGGAACGGTCACTGAAA
CGACACGTGAAGGATAATGATTCGCCAGTGGATTTTACTCTCAAACTAGAAGGTCAACGA
GAGGATTTGAAGTTAGAAGAAGAAGAGAAAGAAGAAGAGAAGCAAGAAACGAGTAAAGAA
GGAGAAGAAACAGATGAGAAGCGAGAGGTGAGTATTAAAGAAGGCGAAGAAAAAGAAGAG
AAGCAAGAGATGAGTTATAATAAAGAAGAAGAAGAGAAGCAAGAGATGAGTATCAAAGAA
GAAGAAGAGGAAAAAATGAAGAAGCAGAAGAAGAGAGGAGGTAGATGCTTCTCATGGAGA
AGATCAAAACAAAGAAAACCAAAGTACATCTTCCCTATTTGTGTTCCTCATCTTGTCAAA
GGTTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS39TF U 1
AF RR2GS39JQB C 537
BS 1 603 RR2GS39TF
BS 604 1088 RR2GS39JQB

RD RR2GS39TF 603 0 0
TTTTTTGCTCTTTCACAGAAAAAAAAGTAGAAATAATTTTTGCCAATGGCTCTGCGTGGA
GATGAGCATGAGTTTATGAACTTAAGAGAATGGGATCGAAGAGCTCGATTGATCCGCGAA
AACCCTTCTTCAAGAAGGTTCTCTGCTTCATACGTTGGAAGCTTTAGAGAAGATCATAAG
TCTTCTTCAAGAACAAACTTAAGCAACATCTCTAGTACTGCCTCTTCTCCTGGCTACACC
CTCAAAGACGAGATTGACCCAGCAACATATTCCTTCACCAATGCACTCAAGGCGTTACAA
GCGAAGACAAATTTTAATAACAGAGAATGGTTAACACAAGAAGGATTTGCGTTGAATTCG
AAGTGGAACGAAGCAGAGAAATATATATGTAATCCAGTGTCTGGAGAAGTTCCAATGGAG
TGTTTGTCTTCTAAAACACTAAGTGCAAGATCTTTCAGAAACTTGACCACCATGTCTGCT
CCTCTTCACTACCCTAATCTTAATCCATTGGTGAATAATATTGGACCAAACAAACCCAAT
GATAATCCCAACGTTAGAGTTATCCACGAGGATCTTTATGCTCCTGATCCTGTTATTGTT
CGA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2GS39JQB 552 0 0
CAATGATAATCCCAACGTTAGAGTTATCCACGAGGATCTTTATGCTCCTGATCCTGTTAT
TGTTCGAGAAAAGAAAGTTGTGGGGCTGAAACAAGATGTGGGCATTCAGAGTACGTCGGT
GGATCTTAACTCCGGTAGCCCTAGTCCGGCAAAGACGCCTATGATCATGGAACGGTCACT
GAAACGACACGTGAAGGATAATGATTCGCCAGTGGATTTTACTCTCAAACTAGAAGGTCA
ACGAGAGGATTTGAAGTTAGAAGAAGAAGAGAAAGAAGAAGAGAAGCAAGAAACGAGTAA
AGAAGGAGAAGAAACAGATGAGAAGCGAGAGGTGAGTATTAAAGAAGGCGAAGAAAAAGA
AGAGAAGCAAGAGATGAGTTATAATAAAGAAGAAGAAGAGAAGCAAGAGATGAGTATCAA
AGAAGAAGAAGAGGAAAAAATGAAGAAGCAGAAGAAGAGAGGAGGTAGATGCTTCTCATG
GAGAAGATCAAAACAAAGAAAACCAAAGTACATCTTCCCTATTTGTGTTCCTCATCTTGT
CAAAGGTTGTTG

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL4900Contig1 785 2 3 U
TTTATCTAACAAAATCGACATATATAATATATATCACATTAAACTCTTAGCCAGACATTA
CTATTTATATATATTTGAGATGGTACATGAAATAAAACATTTCTTAAGTACTAATTTGAA
AATTAGTACTTTTTACCATATGCATTAATCAAGGACAATGCGTTGCTGGTTTCCTGGCCC
ATGTTAACGATTCTAGCCCGAACCGAGTTCTTGATCCGTCCATCCATAAATCGACCCGAG
AACCCATCGGAGCAAGTGTTCTCATCAGTCAAAGCAGCACTAGTCCAAGTCTGAGCATTA
CTCATGTGGAACGCAAACTGTTCTTGATTCTTGGCACTAGCACATAGCTTCATCTCTTGG
ACCGACTTGGTCAAACGTTCGATGGTATCATTGATCTCCTCGACGCAGTCCTTGACGGCT
TCGACCTCACGCTTCTTAAGGGTCTTGAAACGCGTCAGACGCGAGACAAAGAGCTTCGTG
GATTGGACTCGGCTTAGGGTAACGGCTAGAGCGGTCTCGGCTAAGCGTTGAGGGCTTGTT
TGGATGGCGTTTGCGTAGGCGGATAAGGAACGGAAGCACACGGTTGGGTATGTGGTGGTT
TTGCAAGAGGATTGGATGAAGTTCACTGCTTTGTTGGAAGCTCCGGCAGGTGAGGCTGCG
GTGAGCTCCAGCGAGAAGAAGTAGGAGATTGAGAGGATTAGAAAGAGAGTTTGATATAGT
TTTGCCATTGTTGTTTCTTGTGAGAGAGATAGAGAGAATGGGTGAGATAGTTGAGTTTGT
GTGCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2DP21JQ U 3
AF RR2DP21TF C 1
BS 1 3 RR2DP21TF
BS 4 666 RR2DP21JQ
BS 667 785 RR2DP21TF

RD RR2DP21JQ 664 0 0
A
ATCTAACAAAATCGACATATATAATATATATCACATTAAACTCTTAGCCAGACATTACTA
TTTATATATATTTGAGATGGTACATGAAATAAAACATTTCTTAAGTACTAATTTGAAAAT
TAGTACTTTTTACCATATGCATTAATCAAGGACAATGCGTTGCTGGTTTCCTGGCCCATG
TTAACGATTCTAGCCCGAACCGAGTTCTTGATCCGTCCATCCATAAATCGACCCGAGAAC
CCATCGGAGCAAGTGTTCTCATCAGTCAAAGCAGCACTAGTCCAAGTCTGAGCATTACTC
ATGTGGAACGCAAACTGTTCTTGATTCTTGGCACTAGCACATAGCTTCATCTCTTGGACC
GACTTGGTCAAACGTTCGATGGTATCATTGATCTCCTCGACGCAGTCCTTGACGGCTTCG
ACCTCACGCTTCTTAAGGGTCTTGAAACGCGTCAGACGCGAGACAAAGAGCTTCGTGGAT
TGGACTCGGCTTAGGGTAACGGCTAGAGCGGTCTCGGCTAAGCGTTGAGGGCTTGTTTGG
ATGGCGTTTGCGTAGGCGGATAAGGAACGGAAGCACACGGTTGGGTATGTGGTGGTTTTG
CAAGAGGATTGGATGAAGTTCACTGCTTTGTTGGAAGCTCCGGCAGGTGAGGCTGCGGTG
AGC

QA 2 664 2 664
DS 

RD RR2DP21TF 785 0 0
TTTATCTAACAAAATCGACATATATAATATATATCACATTAAACTCTTAGCCAGACATTA
CTATTTATATATATTTGAGATGGTACATGAAATAAAACATTTCTTAAGTACTAATTTGAA
AATTAGTACTTTTTACCATATGCATTAATCAAGGACAATGCGTTGCTGGTTTCCTGGCCC
ATGTTAACGATTCTAGCCCGAACCGAGTTCTTGATCCGTCCATCCATAAATCGACCCGAG
AACCCATCGGAGCAAGTGTTCTCATCAGTCAAAGCAGCACTAGTCCAAGTCTGAGCATTA
CTCATGTGGAACGCAAACTGTTCTTGATTCTTGGCACTAGCACATAGCTTCATCTCTTGG
ACCGACTTGGTCAAACGTTCGATGGTATCATTGATCTCCTCGACGCAGTCCTTGACGGCT
TCGACCTCACGCTTCTTAAGGGTCTTGAAACGCGTCAGACGCGAGACAAAGAGCTTCGTG
GATTGGACTCGGCTTAGGGTAACGGCTAGAGCGGTCTCGGCTAAGCGTTGAGGGCTTGTT
TGGATGGCGTTTGCGTAGGCGGATAAGGAACGGAAGCACACGGTTGGGTATGTGGTGGTT
TTGCAAGAGGATTGGATGAAGTTCACTGCTTTGTTGGAAGCTCCGGCAGGTGAGGCTGCG
GTGAGCTCCAGCGAGAAGAAGTAGGAGATTGAGAGGATTAGAAAGAGAGTTTGATATAGT
TTTGCCATTGTTGTTTCTTGTGAGAGAGATAGAGAGAATGGGTGAGATAGTTGAGTTTGT
GTGCC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL4901Contig1 201 2 1 U
GCGGTGGTGCCGGAGGAGAAAGCGGTGAACACTGAAGAGAAACCAATAGAAGCTGAAGTT
AAACCTGAAGGCAAGGAGTGATCATGTAAACAAATTTCTACGTGTTTCGAGTGTTAAACA
TAAGTTTCTTTGCATAATGAGCAAACTTTGCTTCATTACTAACTAAAAAAAGAAATCAAA
AAATGTTTTGTGGAGTTATAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E418JQ C 1
AF RR2E418TF U 1
BS 1 201 RR2E418TF

RD RR2E418JQ 201 0 0
GCGGTGGTGCCGGAGGAGAAAGCGGTGAACACTGAAGAGAAACCAATAGAAGCTGAAGTT
AAACCTGAAGGCAAGGAGTGATCATGTAAACAAATTTCTACGTGTTTCGAGTGTTAAACA
TAAGTTTCTTTGCATAATGAGCAAACTTTGCTTCATTACTAACTAAAAAAAGAAATCAAA
AAATGTTTTGTGGAGTTATAG

QA 1 201 1 201
DS 

RD RR2E418TF 201 0 0
GCGGTGGTGCCGGAGGAGAAAGCGGTGAACACTGAAGAGAAACCAATAGAAGCTGAAGTT
AAACCTGAAGGCAAGGAGTGATCATGTAAACAAATTTCTACGTGTTTCGAGTGTTAAACA
TAAGTTTCTTTGCATAATGAGCAAACTTTGCTTCATTACTAACTAAAAAAAGAAATCAAA
AAATGTTTTGTGGAGTTATAG

QA 1 201 1 201
DS 



AS 1 2

CO CL4902Contig1 686 2 2 U
GACCCCAAGCCCCGCAAAGTTGGAATCTTCGATGTAGGTCGGTGAAAGAGATCGCTGCAG
TCGTCTTGCAAGAACCATGAGAAGAAGTTTAACTGGATCAAGATTTCCGTATGCTTTGAA
TTTCTCGATGTTGACAGAAAATCATTGTTACATCCAGCAGCCCCACTTCAAGACTCAATT
ATCTGAAGGCTTTAGCTTCAAAAATCCATGTGGTATTGTCCACCAAAGGGCCTTGGATGG
AAGACAAACGTATATCTTCCTGGTGGGTGGTGGACTTAGGCGAATATCACCAGCTATTAC
ACTTTTAGACGACGGGTCAAGAGCGTACTCTAGGTCCTGGAAGTTTCAGGAATCAACGGA
TTGGAAAACTTGGACGAACTTGGGAACTCTACGGTTACTTGAAACTCTAGGGTTACTTCC
GTTGAAAACTACACTGCAGTGAAATGGCATGTTGACTGTCTCCACTACACACGTGTGCCT
TTCAATTACCATATCTAGACACAGTGAAGGAAGTTTTCCAAGAGACAACATTTATACAGT
ACGTGGTAGCAGATGAAAGCGATATGGAAGGTGTTCCACCAGCTTGCTCGAGGATACTGA
ACTGGCATGCTCGAGGATGAATTGCTCGAGAACCTATCTTCTGATTTCTTGATGATCAAG
TAAATAAATTGTCTATCAATTTGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW06TF U 1
AF RR2EW06JQ C 365
BS 1 567 RR2EW06TF
BS 568 686 RR2EW06JQ

RD RR2EW06TF 567 0 0
GACCCCAAGCCCCGCAAAGTTGGAATCTTCGATGTAGGTCGGTGAAAGAGATCGCTGCAG
TCGTCTTGCAAGAACCATGAGAAGAAGTTTAACTGGATCAAGATTTCCGTATGCTTTGAA
TTTCTCGATGTTGACAGAAAATCATTGTTACATCCAGCAGCCCCACTTCAAGACTCAATT
ATCTGAAGGCTTTAGCTTCAAAAATCCATGTGGTATTGTCCACCAAAGGGCCTTGGATGG
AAGACAAACGTATATCTTCCTGGTGGGTGGTGGACTTAGGCGAATATCACCAGCTATTAC
ACTTTTAGACGACGGGTCAAGAGCGTACTCTAGGTCCTGGAAGTTTCAGGAATCAACGGA
TTGGAAAACTTGGACGAACTTGGGAACTCTACGGTTACTTGAAACTCTAGGGTTACTTCC
GTTGAAAACTACACTGCAGTGAAATGGCATGTTGACTGTCTCCACTACACACGTGTGCCT
TTCAATTACCATATCTAGACACAGTGAAGGAAGTTTTCCAAGAGACAACATTTATACAGT
ACGTGGTAGCAGATGAAAGCGATATGG

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2EW06JQ 322 0 0
AAAACTTGGACGAACTTGGGAACTCTACGGTTACTTGAAACTCTAGGGTTACTTCCGTTG
AAAACTACACTGCAGTGAAATGGCATGTTGACTGTCTCCACTACACACGTGTGCCTTTCA
ATTACCATATCTAGACACAGTGAAGGAAGTTTTCCAAGAGACAACATTTATACAGTACGT
GGTAGCAGATGAAAGCGATATGGAAGGTGTTCCACCAGCTTGCTCGAGGATACTGAACTG
GCATGCTCGAGGATGAATTGCTCGAGAACCTATCTTCTGATTTCTTGATGATCAAGTAAA
TAAATTGTCTATCAATTTGACT

QA 1 322 1 322
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4904Contig1 1404 2 2 U
GGGAGGAAGAAAGAACAAATCGATTCTCTGCGAATCCCTAAGAACGAACCCTAAATTTCC
CAATTCGATCGAACGATGGGCAAGAACGATTTCCTCACCCCGAAGGCGATCGCGAATCGC
ATGAAAGCGAAAGGGCTCCAGAAGCTCCGGTGGTACTGCCAGATGTGCCAGAAACAGTGC
CGCGACGAGAACGGGTTCAAGTGCCACTGCATGAGCGAGTCTCACCAGCGTCAGATGCAG
GTCTTCGGCCACAACCCCAACCGCGTCCTCCAGGGCTACTCCGAGGAGTTCGAGAAGACG
TTCCTCGATCTCATGCGTCGGAGCCACCGTTTCTCCCGCATCGCCGCCACCGTGGTCTAC
AACGAGTACATCAACGACAGGCACCACGTGCATATGAACTCGACTCAGTGGGCCACGTTG
ACGGAGTTTATCAAGTATTTGGGGAAGACTGGCAAGTGTAAGGTGGATGAAACGCCTAAA
GGTTGGTTTATTACTTATATCGATAGAGATTCGGAGACGATTTTTAAAGAGAGGTTGAAG
AATAAGAGGGTGAAGAGTGATTTGGCTGAGGAGGAGAAGAAGGAGAGGGAGATTCTGAAA
CAGATTGAGAGAGCTAAGGAAGGTGGTGAAGGTAGTGGTAAAGATGATGGTGAGGAGGAG
GAGAAGAAGAAAGGTGAAGACTTGGGGTTGAAGAGTGGTGTTAAGGTTGGGTTTTCACTT
GGTGTTAAGCAGGTTGTTGAGAGCTCCAGCTCGAGCTCGAAACGTGTGTTTGAGGAGGAA
GAGAATGAGAGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGAGGAGAAAAGGTGGAGACTTGGAG
AAGGAGAGGAGGTCTGCTTTGGATGAGTTGATGAAGGAGGAAGAGAGGAAGAAGGAGAGG
ATGAATCGTAAACCTTACTGGCTGTTCCAAGGGATTGTTGTGAAGGTGATGAGTAAAGCT
CTGGCGGATAAAGGGTATTATAAGCAGAAGGGTGTTGTGAGGAAAGTGATTGATGACTAT
GTGGGGGAGATTGAGATGATTGATTCCAAGCATGTGCTGCGAGTTGACCAGGAGGAGCTT
GAGACTGTGATTCCACAGATTGGAGGGTTGGTGAAGATTGTGAATGGGGCGTATCGCGGT
TCAAATGCTAGGTTGTTAGGTGTGGATACGGAGAAGCTTTGTGCTAAAGTGCAGATTGAG
AAGGGTGTCTATGAAGGAAGAATCATCAAGTCCATTGAGTATGAAGACATTTGCAAACTT
GCGTAGTTGCTATATCTTTAGACCATTATATCAGCTTTATGATACATTGTGTTTCCACTT
TGAACCTTTTTTGTGTCTGCAAACCTTTCTTTGTGTCTGCAAGTGAGTTTCAGACAACTC
ACTGTCAATGATAAAACAGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB40TF U 1
AF RR2AB40JQ C 526
BS 1 728 RR2AB40TF
BS 729 1404 RR2AB40JQ

RD RR2AB40TF 728 0 0
GGGAGGAAGAAAGAACAAATCGATTCTCTGCGAATCCCTAAGAACGAACCCTAAATTTCC
CAATTCGATCGAACGATGGGCAAGAACGATTTCCTCACCCCGAAGGCGATCGCGAATCGC
ATGAAAGCGAAAGGGCTCCAGAAGCTCCGGTGGTACTGCCAGATGTGCCAGAAACAGTGC
CGCGACGAGAACGGGTTCAAGTGCCACTGCATGAGCGAGTCTCACCAGCGTCAGATGCAG
GTCTTCGGCCACAACCCCAACCGCGTCCTCCAGGGCTACTCCGAGGAGTTCGAGAAGACG
TTCCTCGATCTCATGCGTCGGAGCCACCGTTTCTCCCGCATCGCCGCCACCGTGGTCTAC
AACGAGTACATCAACGACAGGCACCACGTGCATATGAACTCGACTCAGTGGGCCACGTTG
ACGGAGTTTATCAAGTATTTGGGGAAGACTGGCAAGTGTAAGGTGGATGAAACGCCTAAA
GGTTGGTTTATTACTTATATCGATAGAGATTCGGAGACGATTTTTAAAGAGAGGTTGAAG
AATAAGAGGGTGAAGAGTGATTTGGCTGAGGAGGAGAAGAAGGAGAGGGAGATTCTGAAA
CAGATTGAGAGAGCTAAGGAAGGTGGTGAAGGTAGTGGTAAAGATGATGGTGAGGAGGAG
GAGAAGAAGAAAGGTGAAGACTTGGGGTTGAAGAGTGGTGTTAAGGTTGGGTTTTCACTT
GGTGTTAA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2AB40JQ 879 0 0
AAAGAGAGGTTGAAGAATAAGAGGGTGAAGAGTGATTTGGCTGAGGAGGAGAAGAAGGAG
AGGGAGATTCTGAAACAGATTGAGAGAGCTAAGGAAGGTGGTGAAGGTAGTGGTAAAGAT
GATGGTGAGGAGGAGGAGAAGAAGAAAGGTGAAGACTTGGGGTTGAAGAGTGGTGTTAAG
GTTGGGTTTTCACTTGGTGTTAAGCAGGTTGTTGAGAGCTCCAGCTCGAGCTCGAAACGT
GTGTTTGAGGAGGAAGAGAATGAGAGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGAGGAGAAAA
GGTGGAGACTTGGAGAAGGAGAGGAGGTCTGCTTTGGATGAGTTGATGAAGGAGGAAGAG
AGGAAGAAGGAGAGGATGAATCGTAAACCTTACTGGCTGTTCCAAGGGATTGTTGTGAAG
GTGATGAGTAAAGCTCTGGCGGATAAAGGGTATTATAAGCAGAAGGGTGTTGTGAGGAAA
GTGATTGATGACTATGTGGGGGAGATTGAGATGATTGATTCCAAGCATGTGCTGCGAGTT
GACCAGGAGGAGCTTGAGACTGTGATTCCACAGATTGGAGGGTTGGTGAAGATTGTGAAT
GGGGCGTATCGCGGTTCAAATGCTAGGTTGTTAGGTGTGGATACGGAGAAGCTTTGTGCT
AAAGTGCAGATTGAGAAGGGTGTCTATGAAGGAAGAATCATCAAGTCCATTGAGTATGAA
GACATTTGCAAACTTGCGTAGTTGCTATATCTTTAGACCATTATATCAGCTTTATGATAC
ATTGTGTTTCCACTTTGAACCTTTTTTGTGTCTGCAAACCTTTCTTTGTGTCTGCAAGTG
AGTTTCAGACAACTCACTGTCAATGATAAAACAGTGTCC

QA 1 879 1 879
DS 



AS 1 2

CO CL4905Contig1 1444 2 4 U
GGACGTTATGGTTTCATTTATCATTGGAGGATTCGTATCATTGTCAAAAATGGCTTCTTT
TTTTATTAATATAGAAACCTAGAGCTACACTTTGATGACGAGTTTATTTAGTTCCATTTG
TACCCAACTACGTGTTGTATTTATCATGTTTTGGGTTTTTTTTGTGCAGGAGGTTGACCG
CTTTGATGATTTAGATGGCCTTCTTAAACTTAGGGGCTTTCAAGGTGTTCACAAGCGTCG
AACTGGAGAAGCGAGTGATGGTTGTTCTATATTCTGGAAAGAGAAACTTTTCGCTGTGAA
TGCAGATTCAAACTCTTACACCATGAAGAAATAGAGTTTGATAGATTTGGCATGCGAAAC
AATGTTGCTCAACTATGTGTTTTAGAGGTGAACTGTGAGGACCCAGAATCTAAATTATGC
ATGCAGTCTTCAGAGCAAACATCTACAAGTCCTCGAAGGCTAGTGGTTGGGAATATACAT
GTCCTGTTTAATCCTAAGCGTGGCGATATTAAGCTAGGCCAGGTAAGACTTTTGCTAGAG
AAGGCTTACAAGCTATCACAGGAATGGGGAAATATTCCCAGTGGCAATTGCTGGTGATCT
GAACAGCACTCCAAATAGCGCAATCTATGATTTTGTAGCTTCAGCCGATTTGGATACACG
ACTCCATGACCGAAAGCAAATTTCTGGTCAGTCTGAACTCGATACAAAGAGGAGCCCGTT
TAGAAACCAACATGCAGTTAGTGCATCCCAAACCAATGAATGGAGCCAGGAAGAACTACA
GCTTGCAACTGGTGGTCAAGCAACTACTCATGTCCGACATCAGCTGAAGCTTAACAGCGC
ATATGCTGGAGTTCCTGGTACACTAAGAACGAGAGATCAATGCGGTGAACCATTGGCGAC
AACATGTCATTCGAGGTTCCAAGGAACTTTTGATTATATATGGCACACCAAGGAACTTGT
TCCTGTGAGGGTTCTTGAAACCTTGCCAACTGATGTTTTGAGAAGAACAGGTGGACTACC
AAGTGAGAAATGGGGAAGTGACCATCTCGCCATCGCATGTGAACTCGGCTTTATGGGTGA
GTGATATTGAGGCTACGAGTTTAACGTCAAAACTCCCCCCACGGATTCACCTGACTTCGT
CATCCCTTGAAGTTCATGATCATGGAGGCTTGTGAACTGAAGTGTGATGAAATAGCTTGG
TTGAAACTGTAACAAATAAGCACCCAAAACATACTTTCAACTGTTTTTTTTTAAACTAAT
AATACACGATTTTTTTGTAAGATGTTTATGTTTCTAATACACATGTTTCAGTTAAAATGT
TTAGACAATAAGTAAGGAAGTTGTTGATGAGCTTCTTGTGTTCATAATCTTACAGAACCA
AAGTGGGTTATTAAACAAGAGTGTTGTTCATTCTTTTTTTTGGTCAAAGGAGTGTTGTTT
ATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2B909TF U 1
AF RR2B909JQ C 492
BS 1 578 RR2B909TF
BS 579 579 RR2B909JQ
BS 580 722 RR2B909TF
BS 723 1444 RR2B909JQ

RD RR2B909TF 722 0 0
GGACGTTATGGTTTCATTTATCATTGGAGGATTCGTATCATTGTCAAAAATGGCTTCTTT
TTTTATTAATATAGAAACCTAGAGCTACACTTTGATGACGAGTTTATTTAGTTCCATTTG
TACCCAACTACGTGTTGTATTTATCATGTTTTGGGTTTTTTTTGTGCAGGAGGTTGACCG
CTTTGATGATTTAGATGGCCTTCTTAAACTTAGGGGCTTTCAAGGTGTTCACAAGCGTCG
AACTGGAGAAGCGAGTGATGGTTGTTCTATATTCTGGAAAGAGAAACTTTTCGCTGTGAA
TGCAGATTCAAACTCTTACACCATGAAGAAATAGAGTTTGATAGATTTGGCATGCGAAAC
AATGTTGCTCAACTATGTGTTTTAGAGGTGAACTGTGAGGACCCAGAATCTAAATTATGC
ATGCAGTCTTCAGAGCAAACATCTACAAGTCCTCGAAGGCTAGTGGTTGGGAATATACAT
GTCCTGTTTAATCCTAAGCGTGGCGATATTAAGCTAGGCCAGGTAAGACTTTTGCTAGAG
AAGGCTTACAAGCTATCACAGGAATGGGGAAATATTCC*AGTGGCAATTGCTGGTGATCT
GAACAGCACTCCAAATAGCGCAATCTATGATTTTGTAGCTTCAGCCGATTTGGATACACG
ACTCCATGACCGAAAGCAAATTTCTGGTCAGTCTGAACTCGATACAAAGAGGAGCCCGTT
TA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2B909JQ 953 0 0
TAATCTAAGCGTGCGATA
TAAGCTAGGCCAG*TAAGACTTT*GCTAGAGAAGGCTTACAAGCTATCACAGGAATGGGG
AAATATTCCCAGTGGCAATTGCTGGTGATCTGAACAGCACTCCAAATAGCGCAATCTATG
ATTTTGTAGCTTCAGCCGATTTGGATACACGACTCCATGACCGAAGGCAAATTTCTGGTC
AGTCTGAACTCGATACAAAGAGGAGCCCGTTTAGAAACCAACATGCAGTTAGTGCATCCC
AAACCAATGAATGGAGCCAGGAAGAACTACAGCTTGCAACTGGTGGTCAAGCAACTACTC
ATGTCCGACATCAGCTGAAGCTTAACAGCGCATATGCTGGAGTTCCTGGTACACTAAGAA
CGAGAGATCAATGCGGTGAACCATTGGCGACAACATGTCATTCGAGGTTCCAAGGAACTT
TTGATTATATATGGCACACCAAGGAACTTGTTCCTGTGAGGGTTCTTGAAACCTTGCCAA
CTGATGTTTTGAGAAGAACAGGTGGACTACCAAGTGAGAAATGGGGAAGTGACCATCTCG
CCATCGCATGTGAACTCGGCTTTATGGGTGAGTGATATTGAGGCTACGAGTTTAACGTCA
AAACTCCCCCCACGGATTCACCTGACTTCGTCATCCCTTGAAGTTCATGATCATGGAGGC
TTGTGAACTGAAGTGTGATGAAATAGCTTGGTTGAAACTGTAACAAATAAGCACCCAAAA
CATACTTTCAACTGTTTTTTTTTAAACTAATAATACACGATTTTTTTGTAAGATGTTTAT
GTTTCTAATACACATGTTTCAGTTAAAATGTTTAGACAATAAGTAAGGAAGTTGTTGATG
AGCTTCTTGTGTTCATAATCTTACAGAACCAAAGTGGGTTATTAAACAAGAGTGTTGTTC
ATTCTTTTTTTTGGTCAAAGGAGTGTTGTTTATTC

QA 19 953 19 953
DS 



AS 1 2

CO CL4906Contig1 859 2 2 U
GGCCCACTCGAGAGTCTTCAACGACAAGCATATCAAAACCCAGAAACACAATCTCAAAAT
CTCATCTTTTCTTCTCTCTTCATCATCAAATGGCGTCAATGAAGCATTTTTTTGGCAAGC
CTAAATACATCTATCCCCAACCAGAGCCAGAGATGTCCGAAAACGACGAGAATGTCTCTG
AGTTCGACGAATCCGACATTCATAACTTAGGCGATCACCGGTTACCGAGTTCATTCGAGG
CCAAGAGATCGATATCAATCTCTCGGTTGCGGAGAAAACCGGCCAAAGTCGGAGATTCCC
CTGTTTCCGTTAACCGGAAAGCGCCAAAGACCGGTTCGCTTCCGGTTAACATACCCGACT
GGTCGAAGATTCTGAAGAGTGAGTATGGGAGCCATGTTGTACCTGACGACGACACCGACG
AAGATGAGGAGGACGAGGAAGACATCAACGGCGACGCGGCGGCGGCGGGAGGAAGACGGA
TCATTCCGCCGCACGAGTATTTAGCGCGGCGGAGAGGGTCTTCGTTCACGATGGACGAAG
GGATCGGTGGAACGGCAAAGGGAAGAGATCTAAAGATATTGAGGAACGTGATTTGGGAGA
AGATTGGACTTCTGGATTAGTGATAATTAGTATATCAATTAATTATAAACTCCAATAGGT
TATATAGATATCATATGTTAATTAGTTAACTCAGTTAGGACCGGTTATAGTTTCGGTCCT
AATGAGATTTTTTCGATAATCTTTTTTTCTTCCTTTTTTGCTTATTTCATCTTCTAGTTT
TTCCTTTTTTTTATATATGTTGTGGAGTTTTGATCATCCTATCCTTTTCATTTCGGGTAA
TGATAAATAAAAATTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX26TF U 1
AF RR2DX26JQ C 368
BS 1 569 RR2DX26TF
BS 570 859 RR2DX26JQ

RD RR2DX26TF 569 0 0
GGCCCACTCGAGAGTCTTCAACGACAAGCATATCAAAACCCAGAAACACAATCTCAAAAT
CTCATCTTTTCTTCTCTCTTCATCATCAAATGGCGTCAATGAAGCATTTTTTTGGCAAGC
CTAAATACATCTATCCCCAACCAGAGCCAGAGATGTCCGAAAACGACGAGAATGTCTCTG
AGTTCGACGAATCCGACATTCATAACTTAGGCGATCACCGGTTACCGAGTTCATTCGAGG
CCAAGAGATCGATATCAATCTCTCGGTTGCGGAGAAAACCGGCCAAAGTCGGAGATTCCC
CTGTTTCCGTTAACCGGAAAGCGCCAAAGACCGGTTCGCTTCCGGTTAACATACCCGACT
GGTCGAAGATTCTGAAGAGTGAGTATGGGAGCCATGTTGTACCTGACGACGACACCGACG
AAGATGAGGAGGACGAGGAAGACATCAACGGCGACGCGGCGGCGGCGGGAGGAAGACGGA
TCATTCCGCCGCACGAGTATTTAGCGCGGCGGAGAGGGTCTTCGTTCACGATGGACGAAG
GGATCGGTGGAACGGCAAAGGGAAGAGAT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2DX26JQ 492 0 0
GATTCTGAAGAGTGAGTATGGGAGCCATGTTGTACCTGACGACGACACCGACGAAGATGA
GGAGGACGAGGAAGACATCAACGGCGACGCGGCGGCGGCGGGAGGAAGACGGATCATTCC
GCCGCACGAGTATTTAGCGCGGCGGAGAGGGTCTTCGTTCACGATGGACGAAGGGATCGG
TGGAACGGCAAAGGGAAGAGATCTAAAGATATTGAGGAACGTGATTTGGGAGAAGATTGG
ACTTCTGGATTAGTGATAATTAGTATATCAATTAATTATAAACTCCAATAGGTTATATAG
ATATCATATGTTAATTAGTTAACTCAGTTAGGACCGGTTATAGTTTCGGTCCTAATGAGA
TTTTTTCGATAATCTTTTTTTCTTCCTTTTTTGCTTATTTCATCTTCTAGTTTTTCCTTT
TTTTTATATATGTTGTGGAGTTTTGATCATCCTATCCTTTTCATTTCGGGTAATGATAAA
TAAAAATTTTAT

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 2

CO CL4907Contig1 970 2 2 U
GGGATTACCTTGACAACGATTGAATTATGTTATCATCATCACCGGCGGCCATCATCGCAC
ATCCACCTCCGTCGCCGGAATCCTACAAACTTCCTCTGAACTTACTTTCCTTGCCGCATA
TTACCCGTAGACACCTTATCAAGACTCTCTCCTTATGTCTCGCCGCACCATCACTCTCAG
TAGCACCAGTCCACGCACGCGGCCTGTTTCAAATGCCGCCTCTCCGTCTCTCTAATCGTT
ACTACCTGGTGAGAGCTGGCGAATCTGATTACGAAAGCTTAGGGATCATCAACACCAACC
CCGTGGAGAAAACGTCGGTAGATAGCGGATTGTCAGAGAAAGGTAAAAAGCAGACTGTGA
GAGCTGCGTTACAGTTAAAGGCAATGGGAGCATGTGACAGAAACTGTTGGCTATGGCCTT
CCATTACACAGAGAGCTTATCAGGCTGCTGAAATCATCGCCTCCATCAATGGGATTAGTC
GCAGCTATATAGTTCCGGAATATAGCTTCTTAGATGCTCGTGGTTTAGGAGCTTACGAAG
GCAAGAAGATTGATTCCATATCAGAAGTGTATGCATTAGACTCGATATCTATGAAGACAA
AACCTCCTCCTATCAGCGACGGTACCCCTAACGAGAGTGTATCAGATGTATTCGTGCGTG
TGACGCAGCTAATGTCCATTCTCGAGACTCAGTATTCAGAGGACACGGTCGTCATTGTAT
CGCCTGATTCAGACAACTTATCTGTGTTACAAGCTGGTGTTCAAGGTCTCGACCTACGAA
GGCATTCTGAGTTGTATTTTGGACCAGGAGAAGTAAGGTTGTTGGATGCAGATAGCATCC
CTGTCTATAAGCAACCTGCTTCTGCTGTATATAAATGCACTAACCCACCAAACTGTGACT
AATCTCGCTTCTATTAGTATACTAAATTGAGATACAGTTATGATTATTAAAGAGGCATTA
TGTTGTAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU77TF U 1
AF RR2EU77JQ C 224
BS 1 425 RR2EU77TF
BS 426 970 RR2EU77JQ

RD RR2EU77TF 425 0 0
GGGATTACCTTGACAACGATTGAATTATGTTATCATCATCACCGGCGGCCATCATCGCAC
ATCCACCTCCGTCGCCGGAATCCTACAAACTTCCTCTGAACTTACTTTCCTTGCCGCATA
TTACCCGTAGACACCTTATCAAGACTCTCTCCTTATGTCTCGCCGCACCATCACTCTCAG
TAGCACCAGTCCACGCACGCGGCCTGTTTCAAATGCCGCCTCTCCGTCTCTCTAATCGTT
ACTACCTGGTGAGAGCTGGCGAATCTGATTACGAAAGCTTAGGGATCATCAACACCAACC
CCGTGGAGAAAACGTCGGTAGATAGCGGATTGTCAGAGAAAGGTAAAAAGCAGACTGTGA
GAGCTGCGTTACAGTTAAAGGCAATGGGAGCATGTGACAGAAACTGTTGGCTATGGCCTT
CCATT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RR2EU77JQ 747 0 0
CCGTCTCTCTAATCGTTACTACCTGGTGAGAGCTGGCGAATCTGATTACGAAAGCTTAGG
GATCATCAACACCAACCCCGTGGAGAAAACGTCGGTAGATAGCGGATTGTCAGAGAAAGG
TAAAAAGCAGACTGTGAGAGCTGCGTTACAGTTAAAGGCAATGGGAGCATGTGACAGAAA
CTGTTGGCTATGGCCTTCCATTACACAGAGAGCTTATCAGGCTGCTGAAATCATCGCCTC
CATCAATGGGATTAGTCGCAGCTATATAGTTCCGGAATATAGCTTCTTAGATGCTCGTGG
TTTAGGAGCTTACGAAGGCAAGAAGATTGATTCCATATCAGAAGTGTATGCATTAGACTC
GATATCTATGAAGACAAAACCTCCTCCTATCAGCGACGGTACCCCTAACGAGAGTGTATC
AGATGTATTCGTGCGTGTGACGCAGCTAATGTCCATTCTCGAGACTCAGTATTCAGAGGA
CACGGTCGTCATTGTATCGCCTGATTCAGACAACTTATCTGTGTTACAAGCTGGTGTTCA
AGGTCTCGACCTACGAAGGCATTCTGAGTTGTATTTTGGACCAGGAGAAGTAAGGTTGTT
GGATGCAGATAGCATCCCTGTCTATAAGCAACCTGCTTCTGCTGTATATAAATGCACTAA
CCCACCAAACTGTGACTAATCTCGCTTCTATTAGTATACTAAATTGAGATACAGTTATGA
TTATTAAAGAGGCATTATGTTGTAGTT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL4908Contig1 1102 2 8 U
TTTTTTTCCTTTCTCTCTCTCTCTTGCTCCGACCCTTTTCAAAATTTGTAGCTAATTATG
GCCTTAGAGGCTATTGTTTACCCAAAAGACCCATTCTCCTACATCTCTTACAAAGATTTT
CAGTCTCACGACTTATATTTTCAACAAGAAGAAGATCGAGACCCCCTAGAAACCAAGAAC
AACATTAAGCTAGGGCAAGAACAAAGACAAGGGTTTGCGAGTAAAAGCGGAGATAACAAT
GATGATTATAACTACAACGATCAGGAGGATCTTCAATGGCCACGAGACGACCTTCCTTAT
GGACCTATCGTCGACACTGAGAACCAGCCTCCACTGTTGGTTTTAGCGACGGTAGAAGGG
AGGAGAAAGAGGAGGAGGACGAAGAGTAGCAAGAACAAGGAAGGGATCGAGAACCAGAGG
ATGACTCACATCGCCGTCGAGAGAAACCGTCGGAAACAAATGAATGAGTACCTCGCCGTT
CTCCGTTCTCTCATGCCACCTTCTTATGCTCAAAGGGGAGATCAAGCGTCAGTAGTAGGC
GGAGCCATTAACTACTTAAAGGAGCTTGAGCATCATTTACAATCAATGGAACCTCCGTTA
AGCACCCCCGCCATAGGAGAAGCCGGAGGCGGCCCCGGCGACCATAAAACCATTGCTGCC
AGCTCATCTGGACCATTCTCAGATTTTTTCGCTTTTCCTCAATACTCGAGAAGGCCTTCC
TCGTCGTTGGTGGCTGAAGGAACGGCGGAGATAGAGGTGACGATGGTGGAGAGCCATGCA
AGTGTGAAGATACTTGCGAAGAAGAGACCAAAACAACTTCTTAAACTGGTGGCATCGATA
CAGAGCTTAAGGCTTACTGTTATTCATCAATTCTTATTTGTTAAAAATACAAAATCTGAC
TATCAAAATAATGATTCTTGTAAGAATCAGGGACCAGAAAGATGACATATGCCTATACAT
GTGTGTATGTGTGTACATGTGTACTTGTGGAAGTTTTGGTGGTCACATTGACAGAACTGT
GGACGCGCACTGTGCACGGCAGAACGAAATGACGCCACTAGTTTCAGACACTCATAAGCC
TCTTCCTCAAACATATAGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C435TF U 1
AF RR2A046TF U 426
BS 1 507 RR2C435TF
BS 508 508 RR2A046TF
BS 509 608 RR2C435TF
BS 609 609 RR2A046TF
BS 610 628 RR2C435TF
BS 629 629 RR2A046TF
BS 630 642 RR2C435TF
BS 643 1102 RR2A046TF

RD RR2C435TF 645 0 0
TTTTTTTCCTTTCTCTCTCTCTCTTGCTCCGACCCTTTTCAAAATTTGTAGCTAATTATG
GCCTTAGAGGCTATTGTTTACCCAAAAGACCCATTCTCCTACATCTCTTACAAAGATTTT
CAGTCTCACGACTTATATTTTCAACAAGAAGAAGATCGAGACCCCCTAGAAACCAAGAAC
AACATTAAGCTAGGGCAAGAACAAAGACAAGGGTTTGCGAGTAAAAGCGGAGATAACAAT
GATGATTATAACTACAACGATCAGGAGGATCTTCAATGGCCACGAGACGACCTTCCTTAT
GGACCTATCGTCGACACTGAGAACCAGCCTCCACTGTTGGTTTTAGCGACGGTAGAAGGG
AGGAGAAAGAGGAGGAGGACGAAGAGTAGCAAGAACAAGGAAGGGATCGAGAACCAGAGG
ATGACTCACATCGCCGTCGAGAGAAACCGTCGGAAACAAATGAATGAGTACCTCGCCGTT
CTCCGTTCTCTCATGCCACCTTCTTAT*CTCAAAGGGGAGATCAAGCGTCAGTAGTAGGC
GGAGCCATTAACTACTTAAAGGAGCTTGAGCATCATTTACAATCAATGGAACCTCCGTTA
AGCACCCC*GCCATAGGAGAAGCCGGAG*CGGCCCCGGCGAC
ATA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2A046TF 677 0 0
TCACATCGCCGTCGAGAGAAACCGTCGGAAACAAATGAATGAGTACCTCGCCGTTCTCCG
TTCTCTCATGCCACCTTCTTATGCTCAAAGGGGAGATCAAGCGTCAGTAGTAGGCGGAGC
CATTAACTACTTAAAGGAGCTTGAGCATCATTTACAATCAATGGAACCTCCGTTAAGCAC
CCCCGCCATAGGAGAAGCCGGAGGCGGCCCCGGCGACCATAAAACCATTGCTGCCAGCTC
ATCTGGACCATTCTCAGATTTTTTCGCTTTTCCTCAATACTCGAGAAGGCCTTCCTCGTC
GTTGGTGGCTGAAGGAACGGCGGAGATAGAGGTGACGATGGTGGAGAGCCATGCAAGTGT
GAAGATACTTGCGAAGAAGAGACCAAAACAACTTCTTAAACTGGTGGCATCGATACAGAG
CTTAAGGCTTACTGTTATTCATCAATTCTTATTTGTTAAAAATACAAAATCTGACTATCA
AAATAATGATTCTTGTAAGAATCAGGGACCAGAAAGATGACATATGCCTATACATGTGTG
TATGTGTGTACATGTGTACTTGTGGAAGTTTTGGTGGTCACATTGACAGAACTGTGGACG
CGCACTGTGCACGGCAGAACGAAATGACGCCACTAGTTTCAGACACTCATAAGCCTCTTC
CTCAAACATATAGATTT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL4909Contig1 596 2 2 U
GGGGGTTGTCTTCAACTAAGTACAGAATCAAGTTTCAGACAGACAGAGAGAGAAAGAGGA
AAACACAATAGACGACTAAAGAACTCTGTAAAGCCTCCGATATAGCCAGAAAGGTTTTGG
TCAAAGAAGAATACGATGAACTCTCGGGCGATCTACGCTGTCATCGCCATCCTCACGATC
GTAATCTCAACCGCACAAGCAAGCGTCTGCGACTTCGGAGGTTCGCTTGACTTCGTGCGA
ACCGGATCTTCTTCTCTCTTCTCCGGATGCAAAGGGTCCATCGCTGAGTGTATCGCCGAG
GAAGAGGAGATGGAGTTCGACTCCGAGATCAGCAGGCGCATGTTAACGCAGAAGAAGTAC
GTTAGCTACGGTGCGATGAGGAAGAACAGTGTGCCTTGCTCGCGACGTGGAGCTTCCTAC
TACAACTGCCAGCGTGGCGCTCAGGCGAATCCTTACCGCCGTGGATGCAGCACCATCACA
AGGTGCAGGCGTTGAATTTGGAAAGTGATTCAAATTCGTATTTTGCCTTTTTGTGTTTCT
ATTTATTTGTTCTTTTAATTTATTTTCCGGGATATATATATATATAATATGAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G392TF U 1
AF RR2G392JQ C 249
BS 1 439 RR2G392TF
BS 440 596 RR2G392JQ

RD RR2G392TF 439 0 0
GGGGGTTGTCTTCAACTAAGTACAGAATCAAGTTTCAGACAGACAGAGAGAGAAAGAGGA
AAACACAATAGACGACTAAAGAACTCTGTAAAGCCTCCGATATAGCCAGAAAGGTTTTGG
TCAAAGAAGAATACGATGAACTCTCGGGCGATCTACGCTGTCATCGCCATCCTCACGATC
GTAATCTCAACCGCACAAGCAAGCGTCTGCGACTTCGGAGGTTCGCTTGACTTCGTGCGA
ACCGGATCTTCTTCTCTCTTCTCCGGATGCAAAGGGTCCATCGCTGAGTGTATCGCCGAG
GAAGAGGAGATGGAGTTCGACTCCGAGATCAGCAGGCGCATGTTAACGCAGAAGAAGTAC
GTTAGCTACGGTGCGATGAGGAAGAACAGTGTGCCTTGCTCGCGACGTGGAGCTTCCTAC
TACAACTGCCAGCGTGGCG

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2G392JQ 348 0 0
TTT
TTCTTTCTTCTCCGGATGCAAAGGGTCCATCGCTGAGTGTATCGCCGAGGAAGAGGAGAT
GGAGTTCGACTCCGAGATCAGCAGGCGCATGTTAGCGCAGAAGAAGTACGTTAGCTACGG
TGCGATGAGGAAGAACAGTGTGCCTTGCTCGCGACGTGGAGCTTCCTACTACAACTGCCA
GCGTGGCGCTCAGGCGAATCCTTACCGCCGTGGATGCAGCACCATCACAAGGTGCAGGCG
TTGAATTTGGAAAGTGATTCAAATTCGTATTTTGCCTTTTTGTGTTTCTATTTATTTGTT
CTTTTAATTTATTTTCCGGGATATATATATATATAATATGAGTTT

QA 4 348 4 348
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4911Contig1 765 2 1 U
GGGGAAGCAGAGTGGGTCTGATGCGTAACGAACGATGCAGTCGTCCGCATCAATCTCATC
GCCTTCATCTCTAGCGCTTCTCTCAACCAAAACTCGATCTCCACTCTCCTTCTTCTTCTT
CCTCGCTCCCAAAGCCACAACCAGAATCCCTGATGATCATCTTCCTTCTTCTCTCTTTGC
TTCCCGGCGACCCCGCGATTTCATCAACGGGAGGGATGACTTGAGCTGGAACCGGAAGAT
CAGACCGGAGTACGAGTTCGATGAAGAGGAAGACGAGCGTGACGAGGAAGAAGAAGAAGA
AGATAGAAGCTTGGATCTTTTGCTTAGGTTCGTCGAGAATGTGTTCAGAAAAGTCTCCAA
GAGAGCTAGGAAAGCCGTCCGATCAATCTTGCCTGTTTCCATCTCCACCAAGCTGGTGGG
TTTCTCAGTGAATGGCGTACTTATACTTGCGTTTTTGTGGATCTCGAAGGCCTTTCTCGA
GGTAGCTTGCACACTTGGGACTATTGTGTTTACGAGCATTCTACTTATACGGGGGCTTTG
GGCTGGTGTGGCATACGTACAAGAAAGCCGCAACAACCGTATCAACGAACTCGCTGATGA
CCCGCGTGCGTGGAACGGGGTGCAACCAGCGTCATGATTAATTCGCTTTTATGTTTCAGA
GAATCTCAAGTTTCTGACTTTCTGAGTTCTGAATCAGAGAGCACGTACAGTGGATGATGT
TCTTTCGCTATGTGTTGATTTAGTAATTAGAAAAGAACAAAATAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BC26JQ C 1
AF RR2BC26TF U 1
BS 1 765 RR2BC26TF

RD RR2BC26JQ 765 0 0
GGGGAAGCAGAGTGGGTCTGATGCGTAACGAACGATGCAGTCGTCCGCATCAATCTCATC
GCCTTCATCTCTAGCGCTTCTCTCAACCAAAACTCGATCTCCACTCTCCTTCTTCTTCTT
CCTCGCTCCCAAAGCCACAACCAGAATCCCTGATGATCATCTTCCTTCTTCTCTCTTTGC
TTCCCGGCGACCCCGCGATTTCATCAACGGGAGGGATGACTTGAGCTGGAACCGGAAGAT
CAGACCGGAGTACGAGTTCGATGAAGAGGAAGACGAGCGTGACGAGGAAGAAGAAGAAGA
AGATAGAAGCTTGGATCTTTTGCTTAGGTTCGTCGAGAATGTGTTCAGAAAAGTCTCCAA
GAGAGCTAGGAAAGCCGTCCGATCAATCTTGCCTGTTTCCATCTCCACCAAGCTGGTGGG
TTTCTCAGTGAATGGCGTACTTATACTTGCGTTTTTGTGGATCTCGAAGGCCTTTCTCGA
GGTAGCTTGCACACTTGGGACTATTGTGTTTACGAGCATTCTACTTATACGGGGGCTTTG
GGCTGGTGTGGCATACGTACAAGAAAGCCGCAACAACCGTATCAACGAACTCGCTGATGA
CCCGCGTGCGTGGAACGGGGTGCAACCAGCGTCATGATTAATTCGCTTTTATGTTTCAGA
GAATCTCAAGTTTCTGACTTTCTGAGTTCTGAATCAGAGAGCAGGTACAGTGGATGATGT
TCTTTCGCTATGTGTTGATTTAGTAATTAGAAAAGAACAAAATAC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2BC26TF 765 0 0
GGGGAAGCAGAGTGGGTCTGATGCGTAACGAACGATGCAGTCGTCCGCATCAATCTCATC
GCCTTCATCTCTAGCGCTTCTCTCAACCAAAACTCGATCTCCACTCTCCTTCTTCTTCTT
CCTCGCTCCCAAAGCCACAACCAGAATCCCTGATGATCATCTTCCTTCTTCTCTCTTTGC
TTCCCGGCGACCCCGCGATTTCATCAACGGGAGGGATGACTTGAGCTGGAACCGGAAGAT
CAGACCGGAGTACGAGTTCGATGAAGAGGAAGACGAGCGTGACGAGGAAGAAGAAGAAGA
AGATAGAAGCTTGGATCTTTTGCTTAGGTTCGTCGAGAATGTGTTCAGAAAAGTCTCCAA
GAGAGCTAGGAAAGCCGTCCGATCAATCTTGCCTGTTTCCATCTCCACCAAGCTGGTGGG
TTTCTCAGTGAATGGCGTACTTATACTTGCGTTTTTGTGGATCTCGAAGGCCTTTCTCGA
GGTAGCTTGCACACTTGGGACTATTGTGTTTACGAGCATTCTACTTATACGGGGGCTTTG
GGCTGGTGTGGCATACGTACAAGAAAGCCGCAACAACCGTATCAACGAACTCGCTGATGA
CCCGCGTGCGTGGAACGGGGTGCAACCAGCGTCATGATTAATTCGCTTTTATGTTTCAGA
GAATCTCAAGTTTCTGACTTTCTGAGTTCTGAATCAGAGAGCACGTACAGTGGATGATGT
TCTTTCGCTATGTGTTGATTTAGTAATTAGAAAAGAACAAAATAC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL4912Contig1 1050 2 6 U
GGAGGGTTCATCTGTTCCATGATTCAACACCGACCAACCTCTATTCAAAGCTTCCGCCTC
TAATTAATCGCTTGACATTCTTGCTACTGGTTCTCACAATCTAACGGCATTACGTAATCC
AGTGAATCCAATCGTCGTGATTAAGGTTCTCATTAATAGCATATTCCCACTCTTCATACG
ATTTCGCATTCAATACATCCACTTATAACTTCTGCAGGGTGAGTCTATAATCTATAAATA
TGTGAGTTTTTCTTCATTTTCTTAATCTTCCTAAAATTTTCGTATAACTTCCGAGTCGTC
ACCGTAGAGGCGTAGAGTATCACGTTTCTTCGAGCAGGAAGAGAGCTTCGCGGCGTAGTT
TGTCAAACACTTCATCGTCACTGAGAAGGAATGTGACAGAGGAGAGAGAGATGAAAATGA
AAAGGCCGGGGGTCGTCATAGATTTCGGCTTCTCTGATGGTCGTAAAAGATGCGCTTGGA
TCACTCCGAAATCTGGTTAAATACAGGTATAGAGTTGCATATTTCCCATCCTTTTGGCTT
CCCACAGGAGAAGACATTTGGGAACATCGTCTGGAAAACATAGAATTCTTTCTTTACCTT
CACCTAAAACAAACAGAGATGAAAGGAGTGTTCAGAAAATGTCCAGATTAATACAGAGTT
AACCAGAAGACTATGAACGCACATGAGGCAGAAGCAGCTGCAGAGCATGCAGTTTCAAAG
GTAGAAGCTGCCATGACAGCCGCTGAAGAAGCTGCAAAGGGAGCAGATGCAGCAGAAGCT
GCTCGAGCTTATGCCGAAGAAGCTTCAAAGACACTGAAAGGAAAAAACATCTGCAAAGTG
ATGGTTTGTACGTGAGGTGACAGAAGAAGAAGAAGCTAAATGTGTTGCAGGTGATGAGAG
AGAAGCGCAGAAGTAGTGTTTGTGCGTTGATGATTTTCCACTTAGAAACTCTTTTTAGCT
GTAAAGCAGTAATCTCAGATGCTAAAGCCATTGTATTATTGTTCACACTTCTACTCTACG
GCCAAAATAAGTTATAAAAACTGAAGACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK54TF U 1
AF RR2CK54JQ C 456
BS 1 625 RR2CK54TF
BS 626 626 RR2CK54JQ
BS 627 648 RR2CK54TF
BS 649 649 RR2CK54JQ
BS 650 683 RR2CK54TF
BS 684 1050 RR2CK54JQ

RD RR2CK54TF 683 0 0
GGAGGGTTCATCTGTTCCATGATTCAACACCGACCAACCTCTATTCAAAGCTTCCGCCTC
TAATTAATCGCTTGACATTCTTGCTACTGGTTCTCACAATCTAACGGCATTACGTAATCC
AGTGAATCCAATCGTCGTGATTAAGGTTCTCATTAATAGCATATTCCCACTCTTCATACG
ATTTCGCATTCAATACATCCACTTATAACTTCTGCAGGGTGAGTCTATAATCTATAAATA
TGTGAGTTTTTCTTCATTTTCTTAATCTTCCTAAAATTTTCGTATAACTTCCGAGTCGTC
ACCGTAGAGGCGTAGAGTATCACGTTTCTTCGAGCAGGAAGAGAGCTTCGCGGCGTAGTT
TGTCAAACACTTCATCGTCACTGAGAAGGAATGTGACAGAGGAGAGAGAGATGAAAATGA
AAAGGCCGGGGGTCGTCATAGATTTCGGCTTCTCTGATGGTCGTAAAAGATGCGCTTGGA
TCACTCCGAAATCTGGTTAAATACAGGTATAGAGTTGCATATTTCCCATCCTTTTGGCTT
CCCACAGGAGAAGACATTTGGGAACATCGTCTGGAAAACATAGAATTCTTTCTTTACCTT
CACCTAAAACAAACAGAGATGAAAG*AGTGTTCAGAAAATGTCCAGAT*AATACAGAGTT
AACCAGAAGACTATGAACGCACA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2CK54JQ 595 0 0
GATGGTCGTAAAAGATGCGCTTGGATCACTCCGAAATCTGGTTAAATACAGGTATAGAGT
TGCATATTTCCCATCCTTTTGGCTTCCCACAGGAGAAGACATTTGGGAACATCGTCTGGA
AAACATAGAATTCTTTCTTTACCTTCACCTAAAACAAACAGAGATGAAAGGAGTGTTCAG
AAAATGTCCAGATTAATACAGAGTTAACCAGAAGACTATGAACGCACATGAGGCAGAAGC
AGCTGCAGAGCATGCAGTTTCAAAGGTAGAAGCTGCCATGACAGCCGCTGAAGAAGCTGC
AAAGGGAGCAGATGCAGCAGAAGCTGCTCGAGCTTATGCCGAAGAAGCTTCAAAGACACT
GAAAGGAAAAAACATCTGCAAAGTGATGGTTTGTACGTGAGGTGACAGAAGAAGAAGAAG
CTAAATGTGTTGCAGGTGATGAGAGAGAAGCGCAGAAGTAGTGTTTGTGCGTTGATGATT
TTCCACTTAGAAACTCTTTTTAGCTGTAAAGCAGTAATCTCAGATGCTAAAGCCATTGTA
TTATTGTTCACACTTCTACTCTACGGCCAAAATAAGTTATAAAAACTGAAGACAT

QA 1 595 1 595
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4914Contig1 1408 2 2 U
GGGGGAGAAGAGAAGAGAAGAAGAGAACCCTAAATGTTCCATCTCTCACGAAAGAAATCG
TCGTCTCCGCTTTGATTTCTGCGATTCTACTCGAACCATATAGCCAATGGAAGAGAGTGG
GAGAAACGGAGGAGGAGGAGCGCAAGCAGTGATAAATCTGGGTGTTGGATCTTCGGTGCC
GATCTCGTATCACCCATGCTTTGGTCCACACGATGATCTTCTTCTTCTCGAAGCCGATAA
CACTCTCATCTCAGGTATCTTCAACGGAAGGGTAACGTTGAGAGGACTACCTGATGAGGA
TGCTGTTCTCTGCACCAAGTCCAAGACTTACGCAATCAAGTTCGTTGGTAACTCTAACTC
CATGTTCCTTATTCCTCCAACAAACTGCCCTGGTCTCATCCAAGATGATGATGCGAATGA
TGATAAAGTATCTGTCATCAAACTCGCTCCTGGTAACATGGAGCTCGTTGAGGTTTCTCC
TAAGCTTGACAAACTCAAGCAGCTTCTCTTAGAAAGGCCTTTTGGTCCTGGTGAAGTAGA
AGAACCCATGATGATGATGGATGATGATGGGACAGAGAAGAACCTAGCTTTGTTGTACAC
GTGGAGTGATTTGGTTAACATAATCCAAGCAAGCGATGAGGAGTTACGCAAGGGGTTGGA
GAGTCTCTCTGCTATCGAGATTGACGGTTACTGGAGGATTGTAGACGAGAGTTACCTAGA
CATGATTTTGAAAATGCTGCTTAACAACTGTGTCCTGAACGGTTGGTGTTTCGATGATCT
AGACGAGGAGGATGTTGTGAGCGCGTTGGTGGCTGACGAGTTCCCTAGCGAACTCGCGAG
CCACTGTTTGCGCGTGTTTGGCTCCGAGGTGAAGGGAGCTGGTAAGTGGAAGCTGGAGCC
GAGGCTTGTGTGTTTGCACTTCGCTAGGCAGGTGCTGAGAGAGGAGAAGATGAGGGTGGA
GAGTTTTATGGACGAGTGGAGGAAGAAGATACCGGAAGGGATGGAAGGAAAGTTGGAGAT
GCTTGAAGGTGAGGTTTTGACTGAGAAGATTGGGATCGAGACGAGGGTTTACACGTTTAG
CGTACGGTCTCTGCCTTCGACTCCAGCGGAGAGGTTCGCAGTGCTGTTTAAACACAGACC
GAAGTGGGAATGGAAAGACTTGGAGCCTTACTTAAGGGATCTTCAAGTTCCTAGACTTTC
TATGGAAGGTTTGCTACTGAAGTACACACGCAGAGCACAGTCTAGACCTGATGCAGAGCC
TGTATTTAGTGCAAGGTAGCCAGTTTTCGTTTCTCACTAGAGCTTGTTTTTTTTGTGTTT
TGTGTTGATTGTTATAAACTAATGTTAAATTAGTTGTCAGAAATATCCAAGATCTTATCT
TTCTGTTATTTATTTTTGTTGGGCCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ89TF U 1
AF RR2AJ89JQ C 539
BS 1 756 RR2AJ89TF
BS 757 1408 RR2AJ89JQ

RD RR2AJ89TF 756 0 0
GGGGGAGAAGAGAAGAGAAGAAGAGAACCCTAAATGTTCCATCTCTCACGAAAGAAATCG
TCGTCTCCGCTTTGATTTCTGCGATTCTACTCGAACCATATAGCCAATGGAAGAGAGTGG
GAGAAACGGAGGAGGAGGAGCGCAAGCAGTGATAAATCTGGGTGTTGGATCTTCGGTGCC
GATCTCGTATCACCCATGCTTTGGTCCACACGATGATCTTCTTCTTCTCGAAGCCGATAA
CACTCTCATCTCAGGTATCTTCAACGGAAGGGTAACGTTGAGAGGACTACCTGATGAGGA
TGCTGTTCTCTGCACCAAGTCCAAGACTTACGCAATCAAGTTCGTTGGTAACTCTAACTC
CATGTTCCTTATTCCTCCAACAAACTGCCCTGGTCTCATCCAAGATGATGATGCGAATGA
TGATAAAGTATCTGTCATCAAACTCGCTCCTGGTAACATGGAGCTCGTTGAGGTTTCTCC
TAAGCTTGACAAACTCAAGCAGCTTCTCTTAGAAAGGCCTTTTGGTCCTGGTGAAGTAGA
AGAACCCATGATGATGATGGATGATGATGGGACAGAGAAGAACCTAGCTTTGTTGTACAC
GTGGAGTGATTTGGTTAACATAATCCAAGCAAGCGATGAGGAGTTACGCAAGGGGTTGGA
GAGTCTCTCTGCTATCGAGATTGACGGTTACTGGAGGATTGTAGACGAGAGTTACCTAGA
CATGATTTTGAAAATGCTGCTTAACAACTGTGTCCT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2AJ89JQ 870 0 0
GAAGAACCCATGATGATGATGGATGATGATGGGACAGAGAAGAACCTAGCTTTGTTGTAC
ACGTGGAGTGATTTGGTTAACATAATCCAAGCAAGCGATGAGGAGTTACGCAAGGGGTTG
GAGAGTCTCTCTGCTATCGAGATTGACGGTTACTGGAGGATTGTAGACGAGAGTTACCTA
GACATGATTTTGAAAATGCTGCTTAACAACTGTGTCCTGAACGGTTGGTGTTTCGATGAT
CTAGACGAGGAGGATGTTGTGAGCGCGTTGGTGGCTGACGAGTTCCCTAGCGAACTCGCG
AGCCACTGTTTGCGCGTGTTTGGCTCCGAGGTGAAGGGAGCTGGTAAGTGGAAGCTGGAG
CCGAGGCTTGTGTGTTTGCACTTCGCTAGGCAGGTGCTGAGAGAGGAGAAGATGAGGGTG
GAGAGTTTTATGGACGAGTGGAGGAAGAAGATACCGGAAGGGATGGAAGGAAAGTTGGAG
ATGCTTGAAGGTGAGGTTTTGACTGAGAAGATTGGGATCGAGACGAGGGTTTACACGTTT
AGCGTACGGTCTCTGCCTTCGACTCCAGCGGAGAGGTTCGCAGTGCTGTTTAAACACAGA
CCGAAGTGGGAATGGAAAGACTTGGAGCCTTACTTAAGGGATCTTCAAGTTCCTAGACTT
TCTATGGAAGGTTTGCTACTGAAGTACACACGCAGAGCACAGTCTAGACCTGATGCAGAG
CCTGTATTTAGTGCAAGGTAGCCAGTTTTCGTTTCTCACTAGAGCTTGTTTTTTTTGTGT
TTTGTGTTGATTGTTATAAACTAATGTTAAATTAGTTGTCAGAAATATCCAAGATCTTAT
CTTTCTGTTATTTATTTTTGTTGGGCCAGC

QA 1 870 1 870
DS 



AS 1 2

CO CL4915Contig1 787 2 3 U
GGAAGAATCACCGGAACAAGAATGGCTGGAGAAGGAGCGACCTTGGAGTACACACCAACA
TGGGTGGTGGCTCTCGTCTGCTCCGTCATCGTCTCCATCTCTTTCGCGGTTGAGCGTGGT
CTCCACCGTGCCGGAAAGCACTTTGATAAGAACAATCAGAAGCAGCTTTTCGGGGCATTA
CAGAAAGTCAAAGAAGAACTTATGCTGCTAGGGTTCATATCGTTACTGCTATCAGTAGGC
CAGTCAAGAATAGCAAAAATTTGCATATCAAAGAAGTTAAGTCAAAAGCTTCTCCCCTGT
AAGAAACCAACAGAAGATAAGTCCCTAAAAGACAACTCTCATTTCCAGTTCAGCTTCACC
GGCCGTCATCTCCTTGCCGGAGACTCTGCCGCCGGCGACTACTGCTCTCAAAAGGGAAAG
GCTCCTTTGATGTCATTATCAGCTCTGCATGAGCTTCATATATTCATCTTCGTGTTAGCT
ATTGCTCACATTATTTTCTGCCTCTTGACCATTATTCTTGGTACTATGAAGATAATGAAA
TGGAAAAAATGGGAGGATCAAGTTCTAGAAAAAGACTACGACCAAGACCAAGCGATCCAG
AAGAATTATACAGCGGTCAGAGAACACGACTTCATCAGGGGACGATTTCTTGGAGTTGGA
AAAGCTGATGCTTTCTTTGGATGGGTGCATTCGTTTATGAAGCAGTTTCTTGCATCAGTC
AACGAATCAGATTACATCACTATGAGGCTAGGGTTTGTAATGACTCATTGCAAGACCAAT
CCAAAGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU76TF U 1
AF RR2AO15TF U 1
BS 1 516 RR2AO15TF
BS 517 517 RR2BU76TF
BS 518 787 RR2AO15TF

RD RR2BU76TF 635 0 0
GGAAGAATCACCGGAACAAGAATGGCTGGAGAAGGAGCGACCTTGGAGTACACACCAACA
TGGGTGGTGGCTCTCGTCTGCTCCGTCATCGTCTCCATCTCTTTCGCGGTTGAGCGTGGT
CTCCACCGTGCCGGAAAGCACTTTGATAAGAACAATCAGAAGCAGCTTTTCGGGGCATTA
CAGAAAGTCAAAGAAGAACTTATGCTGCTAGGGTTCATATCGTTACTGCTATCAGTAGTC
CAGTCAAGAATAGCAAAAATTTGCATATCAAAGAAGTTAAGTCAAAAGCTTCTCCCCTGT
AAGAAACCAACAGAAGATAAGTCCCTAAAAGACAACTCTCATTTCCAGTTCAGCTTCACC
GGCCGTCATCTCCTTGCCGGAGACTCTGCCGCCGGCGACTACTGCTCTCAAAAGGGAAAG
GCTCCTTTGATGTCATTATCAGCTCTGCATGAGCTTCATATATTCATCTTCGTGTTAGCT
ATTGCTCACATTATTTTCTGCCTCTTGACCATTATTCTTGGTACTATGAAGATAATGAAA
TGGAAAAAATGGGAGGATCAAGTTCTAGAAAAAGACTACGACCAAGACCAAGTGATCCAG
AAGAATTATACAGCGGTCAGAGAACACGACTTCAT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2AO15TF 787 0 0
GGAAGAATCACCGGAACAAGAATGGCTGGAGAAGGAGCGACCTTGGAGTACACACCAACA
TGGGTGGTGGCTCTCGTCTGCTCCGTCATCGTCTCCATCTCTTTCGCGGTTGAGCGTGGT
CTCCACCGTGCCGGAAAGCACTTTGATAAGAACAATCAGAAGCAGCTTTTCGGGGCATTA
CAGAAAGTCAAAGAAGAACTTATGCTGCTAGGGTTCATATCGTTACTGCTATCAGTAGGC
CAGTCAAGAATAGCAAAAATTTGCATATCAAAGAAGTTAAGTCAAAAGCTTCTCCCCTGT
AAGAAACCAACAGAAGATAAGTCCCTAAAAGACAACTCTCATTTCCAGTTCAGCTTCACC
GGCCGTCATCTCCTTGCCGGAGACTCTGCCGCCGGCGACTACTGCTCTCAAAAGGGAAAG
GCTCCTTTGATGTCATTATCAGCTCTGCATGAGCTTCATATATTCATCTTCGTGTTAGCT
ATTGCTCACATTATTTTCTGCCTCTTGACCATTATTTTTGGTACTATGAAGATAATGAAA
TGGAAAAAATGGGAGGATCAAGTTCTAGAAAAAGACTACGACCAAGACCAAGCGATCCAG
AAGAATTATACAGCGGTCAGAGAACACGACTTCATCAGGGGACGATTTCTTGGAGTTGGA
AAAGCTGATGCTTTCTTTGGATGGGTGCATTCGTTTATGAAGCAGTTTCTTGCATCAGTC
AACGAATCAGATTACATCACTATGAGGCTAGGGTTTGTAATGACTCATTGCAAGACCAAT
CCAAAGT

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL4916Contig1 623 2 6 U
ACCATGTCAAAAGCCACTTGCAGAAGTATAGACTAGCAAAGTATATGCCAGAGAGAAAAG
AAGAGAAAAAGAATGTTAACTCAGAGGAAAAGAAACTCGCTTTGAGCAACAGTGAAGCTG
ATGAGAAGAAAAGAGGGGCAATACAATTAACTGAAGCTCTGCGTATGCAGATGGAAGTTC
AAAAGCAATTGCATGAACAGCTCGAGGTGCAACGGGTGCTTCAGCTGCGGATAGAAGAGC
ATGCTAAATACTTGGAAAAGATGCTTGAAGAACAACGCAAAGCCGGAAGGCTATTTTCAC
CTAGTGATGACTCTAAACCAGATTCTCAAAACATGTCCCAAACCGAAGTATTTCTGCCTC
AGCCGCCATCATCTGCAAAGAACATAGCTTCTGAAACCGAAGATGATCAGTGTGAGTCGC
CTCAGAAACGTCGCAAGCTTGAGGACAATACTGAACCTCAAGATTCTGAGAGATAGCAGG
TTTCTTTTTTAAGTATATGTATATATGATATGGTTTTGTGTACGTAGTTTGGTAAAGGGG
ATCTTTGTCGGACACGTGTGAACTTATTAAGTATCTTTGAGGATGTTCCTTGGATTTGCT
TGCTGATTCCAAGTCGTTTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FE36JQ C 1
AF RR2EI34TF U 360
BS 1 359 RR2FE36JQ
BS 360 553 RR2EI34TF
BS 554 554 RR2FE36JQ
BS 555 561 RR2EI34TF
BS 562 562 RR2FE36JQ
BS 563 623 RR2EI34TF

RD RR2FE36JQ 593 0 0
ACCATGTCAAAAGCCACTTGCAGAAGTATAGACTAGCAAAGTATATGCCAGAGAGAAAAG
AAGAGAAAAAGAATGTTAACTCAGAGGAAAAGAAACTCGCTTTGAGCAACAGTGAAGCTG
ATGAGAAGAAAAGAGGGGCAATACAATTAACTGAAGCTCTGCGTATGCAGATGGAAGTTC
AAAAGCAATTGCATGAACAGCTCGAGGTGCAACGGGTGCTTCAGCTGCGGATAGAAGAGC
ATGCTAAATACTTGGAAAAGATGCTTGAAGAACAACGCAAAGCCGGAAGGCTATTTTCAC
CTAGTGATGACTCTAAACCAGATTCTCAAAACATGTCCCAAACCGAAGTATTTCTGCCTC
AGCCGCCATCATCTGCAAAGAACATAGCTTTTGAAACCGAAGATGATCAGTGTGAGTCGC
CTCAGAAACGTCGCAAGCTTGAGGACAATACTGAACCTCAAGATTTTGAGAGATAGCAGG
TTTCTTTTTTAAGTATATGTATATATGATATGGTTTTGTGTACGTAGTTTGGTAAAGGGG
ATCTTTGTCGGACACGTGTGAACTTATTAAGTATCTTTGAGGATGTTCCTTGG

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2EI34TF 264 0 0
CAGCCGCCATCATCTGCAAAGAACATAGCTTCTGAAACCGAAGATGATCAGTGTGAGTCG
CCTCAGAAACGTCGCAAGCTTGAGGACAATACTGAACCTCAAGATTCTGAGAGATAGCAG
GTTTCTTTTTTAAGTATATGTATATATGATATGGTTTTGTGTACGTAGTTTGGTAAAGGG
GATCTTTGTCGGACGCGTGTGAGCTTATTAAGTATCTTTGAGGATGTTCCTTGGATTTGC
TTGCTGATTCCAAGTCGTTTAAGG

QA 1 264 1 264
DS 



AS 1 2

CO CL4917Contig1 216 2 2 U
GATAATATCAATTAGTGCTGTCTAGCATTTAATGGTACAAATACAGTAAAAGAATTTTTG
TAAATTTGAAAGATTACCGAGTTGAAGAAAGGCCAAGTTTCCATGTTCTGAACCTTGAGT
GTATCCACATTAATAGATTGGTAGTTTGTTATTGACCTCAAGAACCTTGGTTTCTGTTCC
CATTGTTTAAATATAAAGAGAATCACACAACAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CZ14JQ C 1
AF RR2CZ14TF U 10
BS 1 9 RR2CZ14JQ
BS 10 216 RR2CZ14TF

RD RR2CZ14JQ 216 0 0
GATAATATCAATTAGTGCTGTCTAGCATTTAATGGTACAAATACAGTAAAAGAATTTTTG
TAAATTTGAAAGATTACCGAGTTGAAGAAAGGCCAAGTTTCCATGTTCTGAACCTTGAGT
GTATCCACATTAATAGATTGGTAGTTTGTTATTGACCTCAAGAACCTTGGTTTCTGTTCC
CATTGTTTAAATATAAAGAGAATCACACAACAAGCC

QA 1 216 1 216
DS 

RD RR2CZ14TF 207 0 0
AATTAGTGCTGTCTAGCATTTAATGGTACAAATACAGTAAAAGAATTTTTGTAAATTTGA
AAGATTACCGAGTTGAAGAAAGGCCAAGTTTCCATGTTCTGAACCTTGAGTGTATCCACA
TTAATAGATTGGTAGTTTGTTATTGACCTCAAGAACCTTGGTTTCTGTTCCCATTGTTTA
AATATAAAGAGAATCACACAACAAGCC

QA 1 207 1 207
DS 



AS 1 2

CO CL4918Contig1 682 2 3 U
GAGAGTAATCCTTGAGATATTTGCTGAGAAGTTCTAGCAGATGAACTGAGGCCAGTACTG
CACCTGATGCACCAATTATGATCTTGTTCTCATAATCAGCTAGCGGAAAGCTAAAGAGTG
TAGCTACTGTGATTTCTTTCGCTTCCATGGTTCCAGATCTGAGGAACTTGCACTATATAT
AGATGTGACTGCTCCTACAAGCATGATTAGTTCTTTGTTGTTTTCGTGTATGGAAAGGTT
AAGAACGCCAGTGACAGCTTTCTCCTGCGTTTCAACGTCGTCTGATGTGATGTCTCAGAA
GGTTGCCTAAACAGTATTTGGTCCTACCTCTCATGTAAGTGTAACCACATGGCCTCTCAA
TGTTGTGCTTAGTGCACCACTGAGAGATGAGACTTTGAGAGCGTGTTTGGAGTAAGAGTA
AAGTTTGTATGTAAGACCTCTCGTATGTCTATTGCCAAGAAGTGCATGAAGCCTAAGGAT
GAGATCGTCTTCATCTTTTTGAGAAGTTGCTTTGTTTAAGTTCAGGCTTTTCGTAGTTTC
TCCCTCCCACTCTACATCTCTCGACACGATGTAGCAACCCTAAAACATTGTGGAGGGCGG
AGAGAGAGTCCGGACGGACACTATGTTCATGCTTCTTCTAATAAGGAGATTGGTTTTTGG
TTCTATTTTTATTTCCCCCGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A156JQ U 387
AF RR2A156TF C 1
BS 1 386 RR2A156TF
BS 387 584 RR2A156JQ
BS 585 682 RR2A156TF

RD RR2A156JQ 198 0 0
ATGAGACTTTGAGAGCGTGTTTGGAGTAAGAGTAAAGTTTGTATGTAAGACCTCTCGTAT
GTCTATTGCCAAGAAGTGCATGAAGCCTAAGGATGAGATCGTCTTCATCTTTTTGAGAAG
TTGCTTTGTTTAAGTTCAGGCTTTTCGTAGTTTCTCCCTCCCACTCTACATCTCTCGACA
CGATGTAGCAACCCTAAA

QA 1 198 1 198
DS 

RD RR2A156TF 682 0 0
GAGAGTAATCCTTGAGATATTTGCTGAGAAGTTCTAGCAGATGAACTGAGGCCAGTACTG
CACCTGATGCACCAATTATGATCTTGTTCTCATAATCAGCTAGCGGAAAGCTAAAGAGTG
TAGCTACTGTGATTTCTTTCGCTTCCATGGTTCCAGATCTGAGGAACTTGCACTATATAT
AGATGTGACTGCTCCTACAAGCATGATTAGTTCTTTGTTGTTTTCGTGTATGGAAAGGTT
AAGAACGCCAGTGACAGCTTTCTCCTGCGTTTCAACGTCGTCTGATGTGATGTCTCAGAA
GGTTGCCTAAACAGTATTTGGTCCTACCTCTCATGTAAGTGTAACCACATGGCCTCTCAA
TGTTGTGCTTAGTGCACCACTGAGAGATGAGACTTTGAGAGCGTGTTTGGAGTAAGAGTA
AAGTTTGTATGTAAGACCTCTCGTATGTCTATTGCCAAGAAGTGCATGAAGCCTAAGGAT
GAGATCGTCTTCATCTTTT*GAGAAGTTGCTTTGTTTAAGTTCAGGCTTTTCGTAGTTTC
TCCCTCCCACTCTACATCTCTCGACACGATGTAGCAACCCTAAAACATTGTGGAGGGCGG
AGAGAGAGTCCGGACGGACACTATGTTCATGCTTCTTCTAATAAGGAGATTGGTTTTTGG
TTCTATTTTTATTTCCCCCGGC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL4919Contig1 558 2 2 U
GGAATTAAACCAAGAGATCTCGATCATTCCTTACATTTCCTTGCATACAATTCTTGTTAT
TTATTTGATCACCAGAAGAAATGGCTACTTCGCGTCTAGCAAGGTTTGTATCGGAGGTTG
CTCCGCCTCAGTTTGTGACGGTTATTAGGAGGCATAGAGCAGCGAAGCAGAAGCTAGACA
CGATCAAAGAAGAAGAGCATAAAGAAGATTGTTTCAACAGTGGGATGATGATGAGGTCGT
CTAATAAGATGACATCATGTCATCATCATGCTTCCTCTACTTCGGTTTCTGATCCTGGAT
CTACCTCTAAGAGTTTTTTTCGTTGAGGCTCGAAGCTCTTTTTCTGTTTTCGAAAATTAA
GATCAGCTTATATGCAAGGAATTTATATTTTGAATTGATCGGGTCCGTATTTTTGTGTGC
ACCCGTTTCTATATGTAGTTTGCTTAAGAGTCGAACCTTTTTATTATTATCTAAAAGGTC
CGATATATATATTTAAATGTTGTATGATTGTACTATTGAGGGTTCTACATGTTGTAATTT
TGAAACCCTGCATTAATA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX23TF U 1
AF RR2EX23JQ C 1
BS 1 121 RR2EX23TF
BS 122 558 RR2EX23JQ

RD RR2EX23TF 121 0 0
GGAATTAAACCAAGAGATCTCGATCATTCCTTACATTTCCTTGCATACAATTCTTGTTAT
TTATTTGATCACCAGAAGAAATGGCTACTTCGCGTCTAGCAAGGTTTGTATCGGAGGTTG
C

QA 1 121 1 121
DS 

RD RR2EX23JQ 558 0 0
GGAATTAAACCAAGAGATCTCGATCATTCCTTACATTTCCTTGCATACAATTCTTGTTAT
TTATTTGATCACCAGAAGAAATGGCTACTTCGCGTCTAGCAAGGTTTGTATCGGAGGTTG
CTCCGCCTCAGTTTGTGACGGTTATTAGGAGGCATAGAGCAGCGAAGCAGAAGCTAGACA
CGATCAAAGAAGAAGAGCATAAAGAAGATTGTTTCAACAGTGGGATGATGATGAGGTCGT
CTAATAAGATGACATCATGTCATCATCATGCTTCCTCTACTTCGGTTTCTGATCCTGGAT
CTACCTCTAAGAGTTTTTTTCGTTGAGGCTCGAAGCTCTTTTTCTGTTTTCGAAAATTAA
GATCAGCTTATATGCAAGGAATTTATATTTTGAATTGATCGGGTCCGTATTTTTGTGTGC
ACCCGTTTCTATATGTAGTTTGCTTAAGAGTCGAACCTTTTTATTATTATCTAAAAGGTC
CGATATATATATTTAAATGTTGTATGATTGTACTATTGAGGGTTCTACATGTTGTAATTT
TGAAACCCTGCATTAATA

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL4920Contig1 865 2 2 U
GCAGTGAATCTTACCCGAAAGGTGTGTCTACCGTTAACTGTGTGAAAGGGAAAGATGCCG
ATGGTCCAGGGTCGGACTTTGAGCTCGTCGTTATAATTACTGCTAGAAAACTCAGTCCTC
AGAACTTCTGTAATGGCAGTTGGAGATCTGTATGGAACATTGAGTTCCAGGATGAATCTC
AGGTGCTTGACATAAAAGGGAAAGTGCAGGTAGGAGCCCATTACTTCGAAGAGGGGAATG
TGGAGTTAGATGCAAAGAAAGAGTTCCAGGTTTCGACAATATTTCAGTGTGCGGATGACT
GTGCGATAGCCATAGCCAATACCATCAGGCACCATGAGACAGAGTACCTTGCAGCTCTAG
AGGTCTCCAAATAGCTTACTCACAATTATCTTTTCCTCGTTCTTTTTCCTTTTGTTTCTG
TTAGGGATGTTATTGTGTTGTTAATCATGCTTCCCACACAATCATTAGGTAGCCTATTCT
AAATTACCGGATAACACTTTCAAGGTAAATTTTTTTGATGGCTGTAACTTAGAGCCTGGA
GGTGTGTATTTGTACTCATCAATCTGGTTTTTGGGATTATTTGCATGCAGGATCTGAGGA
GGAAACTTCGAACTCTGTTCCCATGGCAGAACACTTTACAGTTCAGCCTAACCAGAGAGG
TAGAGAAAGAACTTGGACTTGGTGGCAAGTGACTAATTATCAGACCTCAACCTCATTTTT
TTCCGTTTTGTTAGCAAGTTTCTGTGAAGGGGAATAGTATCATCGATTATGTTTCTGCTG
TGTCTGTGTATTTGTTTCTTCCTTTGTCGGCTATGTACAAAACTGCATGCTAAGTGTTGA
ATCATTGATAATGTTAGTGGAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF07TF U 1
AF RR2EF07JQ C 367
BS 1 587 RR2EF07TF
BS 588 865 RR2EF07JQ

RD RR2EF07TF 587 0 0
GCAGTGAATCTTACCCGAAAGGTGTGTCTACCGTTAACTGTGTGAAAGGGAAAGATGCCG
ATGGTCCAGGGTCGGACTTTGAGCTCGTCGTTATAATTACTGCTAGAAAACTCAGTCCTC
AGAACTTCTGTAATGGCAGTTGGAGATCTGTATGGAACATTGAGTTCCAGGATGAATCTC
AGGTGCTTGACATAAAAGGGAAAGTGCAGGTAGGAGCCCATTACTTCGAAGAGGGGAATG
TGGAGTTAGATGCAAAGAAAGAGTTCCAGGTTTCGACAATATTTCAGTGTGCGGATGACT
GTGCGATAGCCATAGCCAATACCATCAGGCACCATGAGACAGAGTACCTTGCAGCTCTAG
AGGTCTCCAAATAGCTTACTCACAATTATCTTTTCCTCGTTCTTTTTCCTTTTGTTTCTG
TTAGGGATGTTATTGTGTTGTTAATCATGCTTCCCACACAATCATTAGGTAGCCTATTCT
AAATTACCGGATAACACTTTCAAGGTAAATTTTTTTGATGGCTGTAACTTAGAGCCTGGA
GGTGTGTATTTGTACTCATCAATCTGGTTTTTGGGATTATTTGCATG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2EF07JQ 499 0 0
CCAAATAGCTTACTCACAATTATCTTTTCCTCGTTCTTTTTCCTTTTGTTTCTGTTAGGG
ATGTTATTGTGTTGTTAATCATGCTTCCCACACAATCATTAGGTAGCCTATTCTAAATTA
CCGGATAACACTTTCAAGGTAAATTTTTTTGATGGCTGTAACTTAGAGCCTGGAGGTGTG
TATTTGTACTCATCAATCTGGTTTTTGGGATTATTTGCATGCAGGATCTGAGGAGGAAAC
TTCGAACTCTGTTCCCATGGCAGAACACTTTACAGTTCAGCCTAACCAGAGAGGTAGAGA
AAGAACTTGGACTTGGTGGCAAGTGACTAATTATCAGACCTCAACCTCATTTTTTTCCGT
TTTGTTAGCAAGTTTCTGTGAAGGGGAATAGTATCATCGATTATGTTTCTGCTGTGTCTG
TGTATTTGTTTCTTCCTTTGTCGGCTATGTACAAAACTGCATGCTAAGTGTTGAATCATT
GATAATGTTAGTGGAGTTC

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

CO CL4921Contig1 744 2 3 U
GGAAGAAGAGAGAGAGAGATAATGGCGATGAGGAGATACGCTTTGTTTTCGATCCTTGTG
TTGTCGCTGTTCGCTTCCTCCGTGAGAAGCGAGGATACGGCGGCGGCGACGGAGACGAAG
GAGTTCGTGTTGACCTTGGATCACACTAACTTCACCGATACCATCAACAAGCACGATTTC
ATCGTCGTCGAGTTCTACGCCCCATGGTGTGGACACTGCAAGCAGCTAGCTCCTGAGTAC
GAGAAGGCTGCATCTGAGTTGAGCAGTCACGTGCCTCCAGTGGTTCTCGCCAAGATCGAT
GCGAGCGAGGAGACCAACAGGGAGTTTGCTACTCAGTACGAGGTTCAGGGCTTCCCAACG
ATCAAGATCTTCAGAAACGGAGGGAAAGCTGTTCAGGAATACAACGGACCTCGTGAAGCT
GAGGGTATTGTTACTTACTTGAAGAAACAAAGCGGGCCTGCTTCTTTTGAGATCAAGTCT
GCTGATGATGCTGCTGAGTTTGACAAGAAGGTTATTGTGGTTGGAGTTTTCCCTAAATTA
TCTGGTTCCGAGTATGAATCTTTCTTGGCAACTGCTGAGAAACTGCGCTCTGACTTTGAT
TTCGCACACACCTCCGATGCTAAGCTTCTTCCTCGTGGAGAGACTGTGACAGGACCTGTG
GTCAGCTGTTCAAACCATTTGATGAATTGTTTGTTGATTCCAAGGATTTGATGGAGAAGC
TTTGGAGAAATTTGTCAAGATCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY78TF U 372
AF RR2BU92TF U 1
BS 1 395 RR2BU92TF
BS 396 396 RR2CY78TF
BS 397 744 RR2BU92TF

RD RR2CY78TF 225 0 0
CAGAAACGGAGGGAAAGCTGTTCAGGAATACAACGGACCTCGTGAAGCTGAGGGTATTGT
TACTTACTTGAAGAAACAAAGCGGGCCTGCTTCTTTTGAGATCAAGTCTGCTGATGATGC
TGCTGAGTTTGACAAGAAGGTTATTGTGGTTGGAGTTTTCCCTAAATTATCTGGTTCCGA
GTATGAATCTTTCTTGGCAACTGCTGAGAAACTGCGCTCTGACTT

QA 1 225 1 225
DS 

RD RR2BU92TF 744 0 0
GGAAGAAGAGAGAGAGAGATAATGGCGATGAGGAGATACGCTTTGTTTTCGATCCTTGTG
TTGTCGCTGTTCGCTTCCTCCGTGAGAAGCGAGGATACGGCGGCGGCGACGGAGACGAAG
GAGTTCGTGTTGACCTTGGATCACACTAACTTCACCGATACCATCAACAAGCACGATTTC
ATCGTCGTCGAGTTCTACGCCCCATGGTGTGGACACTGCAAGCAGCTAGCTCCTGAGTAC
GAGAAGGCTGCATCTGAGTTGAGCAGTCACGTGCCTCCAGTGGTTCTCGCCAAGATCGAT
GCGAGCGAGGAGACCAACAGGGAGTTTGCTACTCAGTACGAGGTTCAGGGCTTCCCAACG
ATCAAGATCTTCAGAAACGGAGGGAAAGCTGTTCATGAATACAACGGACCTCGTGAAGCT
GAGGGTATTGTTACTTACTTGAAGAAACAAAGCGGGCCTGCTTCTTTTGAGATCAAGTCT
GCTGATGATGCTGCTGAGTTTGACAAGAAGGTTATTGTGGTTGGAGTTTTCCCTAAATTA
TCTGGTTCCGAGTATGAATCTTTCTTGGCAACTGCTGAGAAACTGCGCTCTGACTTTGAT
TTCGCACACACCTCCGATGCTAAGCTTCTTCCTCGTGGAGAGACTGTGACAGGACCTGTG
GTCAGCTGTTCAAACCATTTGATGAATTGTTTGTTGATTCCAAGGATTTGATGGAGAAGC
TTTGGAGAAATTTGTCAAGATCAA

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL4922Contig1 1274 2 4 U
TTGTTTCTTCTACAACGGTGAGAGAGTTGCAGCCACTTCGTCTCCTTCGTTTCGTGCATC
GCGAACTTCTTCAAGAGAAATGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTGCTCTTTATAG
AATCTCAAATCTCCAGAATCATATCTCCCCTCTTGAGGCAAACAACAAGCTTAGGAGTCT
GGTGAAGGTATCTCCAGAAGTATCTGAAGCCATATCCAACGGACGTGCTGTGGTCGCTCT
TGAGTCAACCATTATCTCCCATGGGATGCCTTACCCTCAGAATCTGCAAACAGCAAAAGA
GGTTGAGTCAATTGTGAGAGAGAATGGAGCAGTCCCTGCCACAATTGCTATCTTGAACGG
AGTACCTTGCATTGGTCTGAACGAAGAAGAGCTTGAACGTCTTGCATCTCTGGGGAAGAG
TGTCCAAAAGACTGCAGGCAGGGACATAGCATATGTTGTGGCTACAAGAGGAAACGGTGC
AACTACAGTCTCTGCAACATTGTTTTTCGCTTCAATGGTTGGGATCCAAGTTTTTGTAAC
CGGCGGAATTGGAGGTGTGCATAGGCATGCCAACCAGACTATGGATATATCATCCGATCT
TACTGCTCTCGGAAGGACTCCTATAGCTGTGATATCAGCAGGCGTTAAATCCATACTTGA
TATTCCAAAGACTCTTGAATATTTGGAAACTCAAGAAGTGTATGTTGCTGCATACAAGAG
CGATGAGTTTCCGGCATTTTTCACTGAAAAAAGCGGTTGTAAGGCACCTTCTCGTGTAGA
TAGCCCTGAAGACTGTGCTCGAGTAATAGATGCAAACATGAAGCTAAACCGTCAGGCAGG
GATTCTATTTGCTGTTCCAATTCCTAAACAGCATTCAGCCGCTGGAAACCTTATCGAATC
AGCAATACAGCGTGCTCTTGCAGAAGCAAGGGAACAAAACGTGACTGGAAATGCAGAAAC
CCCGTTCTTACTTGCACGGGTAAATGAGTTAACTGGAGGCACTTCACTTGCAGCAAACAT
TGCGCTTGTGAAAAACAATGCCCTTATCGGTTCGCAGATTGCAGTAGCCCTTTCTCAGCT
AATGTGATCTTCCTTATCAATCTCAAGCTCAGGTTCAGGTTCAGGTTCATGTTCAGGATT
CACGACATCTCAAAAACGTTTTGGATTGGTAGTTACGGAGTGTTTTTTTAATGTTGCGTA
TCAAAGATTTTTTTCTTTAGCCCAGAAATTCTTTTTAGCATATTTTCACATGTTATAGAG
ACTATATCTATAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA68TF U 1
AF RR2CA68JQ C 587
BS 1 678 RR2CA68TF
BS 679 679 RR2CA68JQ
BS 680 688 RR2CA68TF
BS 689 1274 RR2CA68JQ

RD RR2CA68TF 690 0 0
TTGTTTCTTCTACAACGGTGAGAGAGTTGCAGCCACTTCGTCTCCTTCGTTTCGTGCATC
GCGAACTTCTTCAAGAGAAATGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTGCTCTTTATAG
AATCTCAAATCTCCAGAATCATATCTCCCCTCTTGAGGCAAACAACAAGCTTAGGAGTCT
GGTGAAGGTATCTCCAGAAGTATCTGAAGCCATATCCAACGGACGTGCTGTGGTCGCTCT
TGAGTCAACCATTATCTCCCATGGGATGCCTTACCCTCAGAATCTGCAAACAGCAAAAGA
GGTTGAGTCAATTGTGAGAGAGAATGGAGCAGTCCCTGCCACAATTGCTATCTTGAACGG
AGTACCTTGCATTGGTCTGAACGAAGAAGAGCTTGAACGTCTTGCATCTCTGGGGAAGAG
TGTCCAAAAGACTGCAGGCAGGGACATAGCATATGTTGTGGCTACAAGAGGAAACGGTGC
AACTACAGTCTCTGCAACATTGTTTTTCGCTTCAATGGTTGGGATCCAAGTTTTTGTAAC
CGGCGGAATTGGAGGTGTGCATAGGCATGCCAACCAGACTATGGATATATCATCCGATCT
TACTGCTCTCGGAAGGACTCCTATAGCTGTGATATCAGCAGGCGTTAAATCCATACTTGA
TATTCCAAAGACTCTTGA*TATTTGGAA
CT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2CA68JQ 688 0 0
ATATCATCCGATCTTACTGCTCTCGGAAGGACTCCTATAGCTGTGATATCAGCAGGCGTT
AAATCCATACTTGATATTCCAAAGACTCTTGAATATTTGGAAACTCAAGAAGTGTATGTT
GCTGCATACAAGAGCGATGAGTTTCCGGCATTTTTCACTGAAAAAAGCGGTTGTAAGGCA
CCTTCTCGTGTAGATAGCCCTGAAGACTGTGCTCGAGTAATAGATGCAAACATGAAGCTA
AACCGTCAGGCAGGGATTCTATTTGCTGTTCCAATTCCTAAACAGCATTCAGCCGCTGGA
AACCTTATCGAATCAGCAATACAGCGTGCTCTTGCAGAAGCAAGGGAACAAAACGTGACT
GGAAATGCAGAAACCCCGTTCTTACTTGCACGGGTAAATGAGTTAACTGGAGGCACTTCA
CTTGCAGCAAACATTGCGCTTGTGAAAAACAATGCCCTTATCGGTTCGCAGATTGCAGTA
GCCCTTTCTCAGCTAATGTGATCTTCCTTATCAATCTCAAGCTCAGGTTCAGGTTCAGGT
TCATGTTCAGGATTCACGACATCTCAAAAACGTTTTGGATTGGTAGTTACGGAGTGTTTT
TTTAATGTTGCGTATCAAAGATTTTTTTCTTTAGCCCAGAAATTCTTTTTAGCATATTTT
CACATGTTATAGAGACTATATCTATAGT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4924Contig1 1357 2 6 U
GGAAAGCGCTTGCGGAAAATCGATTCAGGGCCAAAACAATCGCTTCTGCTTGAGACCCTA
AGGTTGTTGAGATCGTACTCTGAGCTCCTCGGGATTATCCATTCCTGATCTTTCCCAATG
GTGGTCTGTAAATGCAGAAAGGCTACGAAGCTGTATTGCTTTGTTCACAAGGTCCCTGTT
TGTGGAGAATGCATTTGCTTCCCGGAGCATCAAACTTGTGTGGTCCGGACTTATTCAGAA
TGGGTGATAGATGGAGAGTATGACCAGCCAAAGTGTTGTCAATGCCAAGCAACATTTGAT
GACGGGGGAGGTCTTCAAGTCACTCGTTTGGGTTGCTTGCATGCTATACACACAAGTTGC
TTGGTTTCTCTTATCAAGAGTTTTCCTCCCCATACTGCACCTGCTGGTTATATCTGCCCT
TCTTGTAGCACCCCTATATGGCCTCCTAAGATGGTAAAAGATGCAGGATCTCGGCTTCAT
GCACAGTTAAGGGAAGCGATTTTGCAGACTGGTCTTGAGAAGAATCTATTTGGGAACCAT
CCAGTTTCGCGATCCTCTGAATCTCGTAGCCCACCCCCTGCATTTGCATCAGATGCATTG
ATTAATGTATCATCATCTTCTCATACACAAGAAGGGAAGAATCTTCCTGATGGTTATTCA
GTAGCTGGCAATGGAGAATATTCCAAATCTGCGGTTTCAGAGATAGTTGAAATAGATGTT
CCTGCTTCTGCTGGGAATTACATGAAAACCTCAAGCCCTGGATTTGCTGCTGCTGCTGCT
CGGAAAGGTGTACCCGCTGTGGACAGACAGAACTCTGAGACTCTATATTATGCAGACGAC
GAAGACGGGAATAAAAAAAAGTACTCAAGAAGAGGTCCTCTTCGTCACAAGTTCTTGCGG
GCTTTACTACCATTCTGGTCAAATGCATTACCAACTCTACCCGTGACTGCACCACCTCGT
AAAGATGCAACAAAGGGAGAAGAGGGTTCAGAAGGACGTGTAAGACATCGATCATCAAGG
ATGGATATAAGAAAAATACTCCTTTTCATAGCAATCATAGCTTGTATGGCTACAATGGGG
ATCTTGTACTACAGACTTGCACAACGGGTAATTGGTCAAGAAGTACCCGATGAGGAGCAG
CAATGAAAGGTAATATCGTATCGGACAGGGTGATAAGACTGGCTCAGCATAGATACACTC
CTTGCTTATCCAAATCAGTTTGCGCTGCTTTAGATCCTTTTGGACGTCTAGAAAATGTTA
ATTTCGAGAATTGTGGGATGCGGTTCTTTGATTGTCATCTGTTTCTGTTTCTTGACATGT
TTGGTATAGACGAAAATGCAATTTATGGACGCTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO93TF U 1
AF RR2EO93JQ C 565
BS 1 747 RR2EO93TF
BS 748 748 RR2EO93JQ
BS 749 787 RR2EO93TF
BS 788 788 RR2EO93JQ
BS 789 803 RR2EO93TF
BS 804 1357 RR2EO93JQ

RD RR2EO93TF 803 0 0
GGAAAGCGCTTGCGGAAAATCGATTCAGGGCCAAAACAATCGCTTCTGCTTGAGACCCTA
AGGTTGTTGAGATCGTACTCTGAGCTCCTCGGGATTATCCATTCCTGATCTTTCCCAATG
GTGGTCTGTAAATGCAGAAAGGCTACGAAGCTGTATTGCTTTGTTCACAAGGTCCCTGTT
TGTGGAGAATGCATTTGCTTCCCGGAGCATCAAACTTGTGTGGTCCGGACTTATTCAGAA
TGGGTGATAGATGGAGAGTATGACCAGCCAAAGTGTTGTCAATGCCAAGCAACATTTGAT
GACGGGGGAGGTCTTCAAGTCACTCGTTTGGGTTGCTTGCATGCTATACACACAAGTTGC
TTGGTTTCTCTTATCAAGAGTTTTCCTCCCCATACTGCACCTGCTGGTTATATCTGCCCT
TCTTGTAGCACCCCTATATGGCCTCCTAAGATGGTAAAAGATGCAGGATCTCGGCTTCAT
GCACAGTTAAGGGAAGCGATTTTGCAGACTGGTCTTGAGAAGAATCTATTTGGGAACCAT
CCAGTTTCGCGATCCTCTGAATCTCGTAGCCCACCCCCTGCATTTGCATCAGATGCATTG
ATTAATGTATCATCATCTTCTCATACACAAGAAGGGAAGAATCTTCCTGATGGTTATTCA
GTAGCTGGCAATGGAGAATATTCCAAATCTGCGGTTTCAGAGATAGTTGAAATAGATGTT
CCTGCTTCTGCTGGGAATTACATGAAA*CCTCAAGCCCTGGATTTGCTGCTGCTGCTGCT
CGGAAAG*TGTACCCGCTGTGGA

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2EO93JQ 793 0 0
CGTAGCCCACCCC*TGCATT*GCATCAGATGCATTGATTAATGTATCATCATCTTCTCAT
ACACAAGAAGGGAAGAATCTTCCTGATGGTTATTCAGTAGCTGGCAATGGAGAATATTCC
AAATCTGCGGTTTCAGAGATAGTTGAAATAGATGTTCCTGCTTCTGCTGGGAATTACATG
AAAACCTCAAGCCCTGGATTTGCTGCTGCTGCTGCTCGGAAAGGTGTACCCGCTGTGGAC
AGACAGAACTCTGAGACTCTATATTATGCAGACGACGAAGACGGGAATAAAAAAAAGTAC
TCAAGAAGAGGTCCTCTTCGTCACAAGTTCTTGCGGGCTTTACTACCATTCTGGTCAAAT
GCATTACCAACTCTACCCGTGACTGCACCACCTCGTAAAGATGCAACAAAGGGAGAAGAG
GGTTCAGAAGGACGTGTAAGACATCGATCATCAAGGATGGATATAAGAAAAATACTCCTT
TTCATAGCAATCATAGCTTGTATGGCTACAATGGGGATCTTGTACTACAGACTTGCACAA
CGGGTAATTGGTCAAGAAGTACCCGATGAGGAGCAGCAATGAAAGGTAATATCGTATCGG
ACAGGGTGATAAGACTGGCTCAGCATAGATACACTCCTTGCTTATCCAAATCAGTTTGCG
CTGCTTTAGATCCTTTTGGACGTCTAGAAAATGTTAATTTCGAGAATTGTGGGATGCGGT
TCTTTGATTGTCATCTGTTTCTGTTTCTTGACATGTTTGGTATAGACGAAAATGCAATTT
ATGGACGCTTAGC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL4925Contig1 220 2 1 U
GAGTTCCGGGATTTATGGCTCCAACGAAGAAACCAAAGAAGAGCATAACAACTTTTTCAA
ATAGGCTCAAATGAGTAAAAGAAAGAGTGTCATCACCATTTACAACATGGTTTCCTCTGA
CTCAAGTAACTTTTTCATTCACAAGAATATTTTTTTCCCTGGAGTTCAGAAAGAGTGTCA
TCACCATTTACAACATGGTTTCTATACATTCTGTGTACAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FE66JQ C 1
AF RR2FE66TF U 1
BS 1 220 RR2FE66TF

RD RR2FE66JQ 220 0 0
GAGTTCCGGGATTTATGGCTCCAACGAAGAAACCAAAGAAGAGCATAACAACTTTTTCAA
ATAGGCTCAAATGAGTAAAAGAAAGAGTGTCATCACCATTTACAACATGGTTTCCTCTGA
CTCAAGTAACTTTTTCATTCACAAGAATATTTTTTTCCCTGGAGTTCAGAAAGAGTGTCA
TCACCATTTACAACATGGTTTCTATACATTCTGTGTACAC

QA 1 220 1 220
DS 

RD RR2FE66TF 220 0 0
GAGTTCCGGGATTTATGGCTCCAACGAAGAAACCAAAGAAGAGCATAACAACTTTTTCAA
ATAGGCTCAAATGAGTAAAAGAAAGAGTGTCATCACCATTTACAACATGGTTTCCTCTGA
CTCAAGTAACTTTTTCATTCACAAGAATATTTTTTTCCCTGGAGTTCAGAAAGAGTGTCA
TCACCATTTACAACATGGTTTCTATACATTCTGTGTACAC

QA 1 220 1 220
DS 



AS 1 2

CO CL4926Contig1 1187 2 4 U
GGAAACCTAATCCTGCCAAAAACACCTCAATTCACTATCAACAAAATCACTTTATCAAAA
CCTAATTCACAGAATTCCAGAAACTCAATTCATCCCAAATCTAGATCCTTTTGCTAATCA
ATAAAGAACAAAAAAACTCAAATCTGTTTGAGAGCTATAGCTTCTGAGATTAGTTTTCTT
TTCTGGCTGAGAGAGGAATGGTGATGGAGAAGAAGATGTAGTCTTCTAAAGCCTTGCCGC
ATCACTAACAATTTTTCTTGGGGGATCTGGAAAAAAAATGCTAAGATCTTGAAGAAGTGT
TCGAGGGGTTTTGACGACAAGTTTGTGGCTGCCTTCCAAGGATTCAAGGATGATTCATAT
ATCGATTCAGATGATTTCCTCACCGATTCAAAACTATTTGTGTTCACCACGACTCAAAAA
TCCATCATCTCCTCTGCAGGTAACTCAGCTTCCACAATGGTCAAGTTCTTTTTTTTTACC
ATCTGATCCTTTAACTTTCAGCTTTTGTAATTTGACCACAAAATTCTTGAATTTGCTTAT
AAATCCTTTTGGTTTCACCTTAAACTTCTAAGTATGTATTCTGGCCATTGTGAACAATCC
TCTTGTCAGCAAAATTCATATCCACATCCAAACTCATATCCACATCCACTCTCTGCAAAT
CTCCTCACAACTCCTCCACACACAGCTCCCCCGTATACCACTCCCCCATACACAACTCCC
CTGAACACGCTTCACCCATCCACAACTCCCATGTCTACATCTCCTCTGAACACACTTCAC
CCATCCACAACTCCCATTTCCTGAGTTAATTCAGAAGTTATGACGATCTCAAGCTTTCTT
GCTCTCTCTCTATCTATTGGAGGAAGATAGATTTGACTACACTTTTTGTGGATGTGGATA
CAAGTTTATGGATAAATTTATGTATACAAAAGCTTGTTCACAACTTTTTATTTTTCTGTT
CATGTATTTTCCATTTTTATGTCCATATCCACAATCTTCGTTTTGTTTTAATGTACAAAT
TAACTTTTTGGTTTGTTTAGCTTTGTTTTTCAAAAAAATTGTTTTTTCTTTCCTAGACTT
GTACCCATTGGTTTAAAGTTATCAGTTTGTTTATCTTTGAGATTGTGGATACATTTGCTG
GTGTCCATATCCATAGTTTTTCAATATATTAAAGTTTAATGTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G387TF U 1
AF RR2G387JQ C 500
BS 1 691 RR2G387TF
BS 692 692 RR2G387JQ
BS 693 716 RR2G387TF
BS 717 1187 RR2G387JQ

RD RR2G387TF 716 0 0
GGAAACCTAATCCTGCCAAAAACACCTCAATTCACTATCAACAAAATCACTTTATCAAAA
CCTAATTCACAGAATTCCAGAAACTCAATTCATCCCAAATCTAGATCCTTTTGCTAATCA
ATAAAGAACAAAAAAACTCAAATCTGTTTGAGAGCTATAGCTTCTGAGATTAGTTTTCTT
TTCTGGCTGAGAGAGGAATGGTGATGGAGAAGAAGATGTAGTCTTCTAAAGCCTTGCCGC
ATCACTAACAATTTTTCTTGGGGGATCTGGAAAAAAAATGCTAAGATCTTGAAGAAGTGT
TCGAGGGGTTTTGACGACAAGTTTGTGGCTGCCTTCCAAGGATTCAAGGATGATTCATAT
ATCGATTCAGATGATTTCCTCACCGATTCAAAACTATTTGTGTTCACCACGACTCAAAAA
TCCATCATCTCCTCTGCAGGTAACTCAGCTTCCACAATGGTCAAGTTCTTTTTTTTTACC
ATCTGATCCTTTAACTTTCAGCTTTTGTAATTTGACCACAAAATTCTTGAATTTGCTTAT
AAATCCTTTTGGTTTCACCTTAAACTTCTAAGTATGTATTCTGGCCATTGTGAACAATCC
TCTTGTCAGCAAAATTCATATCCACATCCAAACTCATATCCACATCCACTCTCTGCAAAT
CTCCTCACAACTCCTCCACACACAGCTCCCC*GTATACCACTCCCCCATACACAAC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2G387JQ 688 0 0
AGCTTTTGTAATTTGACCACAAAATTCTTGAATTTGCTTATAAATCCTTTTGGTTTCACC
TTAAACTTCTAAGTATGTATTCTGGCCATTGTGAACAATCCTCTTGTCAGCAAAATTCAT
ATCCACATCCAAACTCATATCCACATCCACTCTCTGCAAATCTCCTCACAACTCCTCCAC
ACACAGCTCCCCCGTATACCACTCCCCCATACACAACTCCCCTGAACACGCTTCACCCAT
CCACAACTCCCATGTCTACATCTCCTCTGAACACACTTCACCCATCCACAACTCCCATTT
CCTGAGTTAATTCAGAAGTTATGACGATCTCAAGCTTTCTTGCTCTCTCTCTATCTATTG
GAGGAAGATAGATTTGACTACACTTTTTGTGGATGTGGATACAAGTTTATGGATAAATTT
ATGTATACAAAAGCTTGTTCACAACTTTTTATTTTTCTGTTCATGTATTTTCCATTTTTA
TGTCCATATCCACAATCTTCGTTTTGTTTTAATGTACAAATTAACTTTTTGGTTTGTTTA
GCTTTGTTTTTCAAAAAAATTGTTTTTTCTTTCCTAGACTTGTACCCATTGGTTTAAAGT
TATCAGTTTGTTTATCTTTGAGATTGTGGATACATTTGCTGGTGTCCATATCCATAGTTT
TTCAATATATTAAAGTTTAATGTTTATT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL4927Contig1 1026 2 2 U
CGTACAATGCATTAGCACAGTCTCTACAGGGGAGGAGTAGCTGCTGCTGCTGCTTCATCC
CAAAAGCCTTGTTCATCAGAGATGCTAAGCAAAGAAGCAGATCCTGTCTCGTATTCGCTT
CTAATGATAAGAACATTGCTCTTCAAGCTAAGGTAGATAAGTTGTTGGACTGCATAAAAT
GGGATGACAAAGGACTAGCTGTGGCAATAGCACAAAACGTTGACACTGGAGCAGTGTTAA
TGCAAGGCTTTGCTAACAAAGAGGCTCTCTCCACAACCATCACTTCTCGTAAAGCTACAT
TCTTCAGTCGATCAAGATCTACCTTATGGACTAAGGGAGAGACGTCCAATAACTTCATCA
ATGTTCTTGATGTTTACCTTGACTGTGATCGTGATTCGATAATTTACCTTGGAACGCCAG
ATGGGCCTACTTGTCACACAGGGGCTGAGACTTGTTACTACACATCAGTTTTGGATCAAT
TGAACGATGATGAGTCTTCAGGAGACAAGCTAGCATCAACAACATTGTACTCGCTAGAAT
CGATCATTTCAAAGCGGAAGGAGGAATCAAAAGTTCCTCAAGAAGGCAAACCGTCATGGA
CGCGGCGGTTATTGACCGATGATGCTCTGCTTTGCTCAAAGATCAGGGAAGAAGCAGATG
AGTTATGCAGAACGCTTGAGGATAAGGAGGAAGTATCAAGAACAGCATCAGAGATGGCAG
ATGTGTTGTACCATGCGATGGTGCTTCTGTCTAAAAGGGATGTCAAGTTTGAAGATGTTC
TTGAAGTTCTTAGGAAACGCTTCTCTCAGTCTGGTATCGAGGAGAAGCAAAGCCGTTCAA
AGTGACCGTATAAACTGTTGTATTTGCCAGAATGTAAACTATTCCACTGCTCATTTAGAT
CTTTGTAAATTGCAAAATAATAAATTGTAACCTTTGCTAAAGGTATTGATACATCTTTTT
CTTTTGCATTTATTGGCTGGAATTTATTACATTTAACTCAATATAAATAAATATATACAA
CTCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2E648TF U 1
AF RR2E648JQ C 333
BS 1 544 RR2E648TF
BS 545 1026 RR2E648JQ

RD RR2E648TF 544 0 0
CGTACAATGCATTAGCACAGTCTCTACAGGGGAGGAGTAGCTGCTGCTGCTGCTTCATCC
CAAAAGCCTTGTTCATCAGAGATGCTAAGCAAAGAAGCAGATCCTGTCTCGTATTCGCTT
CTAATGATAAGAACATTGCTCTTCAAGCTAAGGTAGATAAGTTGTTGGACTGCATAAAAT
GGGATGACAAAGGACTAGCTGTGGCAATAGCACAAAACGTTGACACTGGAGCAGTGTTAA
TGCAAGGCTTTGCTAACAAAGAGGCTCTCTCCACAACCATCACTTCTCGTAAAGCTACAT
TCTTCAGTCGATCAAGATCTACCTTATGGACTAAGGGAGAGACGTCCAATAACTTCATCA
ATGTTCTTGATGTTTACCTTGACTGTGATCGTGATTCGATAATTTACCTTGGAACGCCAG
ATGGGCCTACTTGTCACACAGGGGCTGAGACTTGTTACTACACATCAGTTTTGGATCAAT
TGAACGATGATGAGTCTTCAGGAGACAAGCTAGCATCAACAACATTGTACTCGCTAGAAT
CGAT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2E648JQ 694 0 0
AAGGGAGAGACGTCCAATAACTTCATCAATGTTCTTGATGTTTACCTTGACTGTGATCGT
GATTCGATAATTTACCTTGGAACGCCAGATGGGCCTACTTGTCACACAGGGGCTGAGACT
TGTTACTACACATCAGTTTTGGATCAATTGAACGATGATGAGTCTTCAGGAGACAAGCTA
GCATCAACAACATTGTACTCGCTAGAATCGATCATTTCAAAGCGGAAGGAGGAATCAAAA
GTTCCTCAAGAAGGCAAACCGTCATGGACGCGGCGGTTATTGACCGATGATGCTCTGCTT
TGCTCAAAGATCAGGGAAGAAGCAGATGAGTTATGCAGAACGCTTGAGGATAAGGAGGAA
GTATCAAGAACAGCATCAGAGATGGCAGATGTGTTGTACCATGCGATGGTGCTTCTGTCT
AAAAGGGATGTCAAGTTTGAAGATGTTCTTGAAGTTCTTAGGAAACGCTTCTCTCAGTCT
GGTATCGAGGAGAAGCAAAGCCGTTCAAAGTGACCGTATAAACTGTTGTATTTGCCAGAA
TGTAAACTATTCCACTGCTCATTTAGATCTTTGTAAATTGCAAAATAATAAATTGTAACC
TTTGCTAAAGGTATTGATACATCTTTTTCTTTTGCATTTATTGGCTGGAATTTATTACAT
TTAACTCAATATAAATAAATATATACAACTCTAG

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL4928Contig1 1105 2 2 U
GAAATCCAGAATTTTGTACAAAATGTTCTCTTTTCTCAGCACATTGTTGGATGTTATTAA
GGTTGTTGTTGCTTCCGTGACTTCTGTAGTCTTATTTGCATTTGCGTGTCTAACACTCGC
CGGTTCAGCCGTGGCATTAGTTGTATCCACACCGCTTTTCCTCATATTCAGTCCAATTCT
CCTTCCCGCCACTATAGCCACTACTCTCCTAGCCTCTGGGCTAACGGCCGGTGCCACCCT
CGGAATCACCGCCATTAGTCTCATCTTGGGGCTCATCAAGTAATATTAAGAAAATTCTTT
TGAAATTAACTCGAGATTTTGCTTATATAATATTCACATACGTGCACATTCATGACGTAG
TAGCCTTTGGCCAAGGCTTACGGTATCAGATTAAACAAATATTTAGAAGCCACACATTTG
AATGTGATTGTAGCTTGTGATGATTTTGATTTCTCAGGGTTCGATCAGCTGCCCACATCT
AAAACCAATCGAAATTTAAAATTTTGTTCAGTCATCTTTATCCTTGTGTTTAAGGTTCCT
TTTTACATACTACCACAAAAAAAAATTTGAATTAATTTTTTGTTCCTATCACATTTCTTC
TTTTTTAGCTGTCTTTTCACTGGCAACTTCTGTGTGTGATTTATAGGACAGCGGAAGGAA
CTTCGTTGGCCCTCTTAGCCCAAACACCATTGAAAATGTTTAAGTTTTCAGGTGGCTTTG
GAGGATCATGGGGAGGAAAATCATTTTCTGGAACATTTGGAAATAAACCAGGTGGTGGAG
TTCGACGTCCGGAAATATCCCAGAATGGTTAAAAAATCTACTCAAAGGTGTACCAACGGG
TGGGGCGGTACCTGCGGCAGGAGGAGCAGCACCTGCACCCGCAGCAGGAGGAGCTACACC
CCCAGGATAAGGGAGATTAGCCGAGCATGGTCCAAACATATAGCATATATTCTAATTGTG
TATAACTTAATAGTTTTATCAAACTAAAAGGAAAAAGTCTTTTTATTAATACATTTTATG
TAATGGTGAAAAATATGTGGCTACATATATATATGGATAATTTCCTGAGCTCTAATAAGA
CAGAGTAAAGAAGATCAAGAATCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H124TF U 1
AF RR2H124JQ C 431
BS 1 641 RR2H124TF
BS 642 1105 RR2H124JQ

RD RR2H124TF 641 0 0
GAAATCCAGAATTTTGTACAAAATGTTCTCTTTTCTCAGCACATTGTTGGATGTTATTAA
GGTTGTTGTTGCTTCCGTGACTTCTGTAGTCTTATTTGCATTTGCGTGTCTAACACTCGC
CGGTTCAGCCGTGGCATTAGTTGTATCCACACCGCTTTTCCTCATATTCAGTCCAATTCT
CCTTCCCGCCACTATAGCCACTACTCTCCTAGCCTCTGGGCTAACGGCCGGTGCCACCCT
CGGAATCACCGCCATTAGTCTCATCTTGGGGCTCATCAAGTAATATTAAGAAAATTCTTT
TGAAATTAACTCGAGATTTTGCTTATATAATATTCACATACGTGCACATTCATGACGTAG
TAGCCTTTGGCCAAGGCTTACGGTATCAGATTAAACAAATATTTAGAAGCCACACATTTG
AATGTGATTGTAGCTTGTGATGATTTTGATTTCTCAGGGTTCGATCAGCTGCCCACATCT
AAAACCAATCGAAATTTAAAATTTTGTTCAGTCATCTTTATCCTTGTGTTTAAGGTTCCT
TTTTACATACTACCACAAAAAAAAATTTGAATTAATTTTTTGTTCCTATCACATTTCTTC
TTTTTTAGCTGTCTTTTCACTGGCAACTTCTGTGTGTGATT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2H124JQ 675 0 0
TAGCTTGTGATGATTTTGATTTCTCAGGGTTCGATCAGCTGCCCACATCTAAAACCAATC
GAAATTTAAAATTTTGTTCAGTCATCTTTATCCTTGTGTTTAAGGTTCCTTTTTACATAC
TACCACAAAAAAAAATTTGAATTAATTTTTTGTTCCTATCACATTTCTTCTTTTTTAGCT
GTCTTTTCACTGGCAACTTCTGTGTGTGATTTATAGGACAGCGGAAGGAACTTCGTTGGC
CCTCTTAGCCCAAACACCATTGAAAATGTTTAAGTTTTCAGGTGGCTTTGGAGGATCATG
GGGAGGAAAATCATTTTCTGGAACATTTGGAAATAAACCAGGTGGTGGAGTTCGACGTCC
GGAAATATCCCAGAATGGTTAAAAAATCTACTCAAAGGTGTACCAACGGGTGGGGCGGTA
CCTGCGGCAGGAGGAGCAGCACCTGCACCCGCAGCAGGAGGAGCTACACCCCCAGGATAA
GGGAGATTAGCCGAGCATGGTCCAAACATATAGCATATATTCTAATTGTGTATAACTTAA
TAGTTTTATCAAACTAAAAGGAAAAAGTCTTTTTATTAATACATTTTATGTAATGGTGAA
AAATATGTGGCTACATATATATATGGATAATTTCCTGAGCTCTAATAAGACAGAGTAAAG
AAGATCAAGAATCAG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL4929Contig1 1349 2 2 U
GGGTTCATCAAAGTTTTGAACTCTTTATTATAGTCATTAGAAAAAGCAAAAAGTTTATAA
TGAAAACACAGTCACAGCTTCTTGAAGCCCGTCGCTCTGCACACTATCGACCGTCTCTTT
GGGAACACGAGAATCTCCTCTCGCTCGGGAACAAATATGCGGTATATAAAGAGGACAACA
TCGAGAGAGCTAAGTTATTGAAGCAAGAAGTTAGTAAAATGCTTGATGAAACAGAGGGTC
TGCTTGAACAGCTAGAGCTCGTTGACACTTTACAAAGACTCGGAATTTCTTACCGTTTCG
AACGTGGAATCAAGAAGATTCTAACGAATGTTCACGTTAGACATGTTAGGCACAGAAAGA
GGGTAGATCGGAAGATATCTGAATACTTATATGCGACTGCCCTTGAGTTCCGACTCCTAA
GGCAACATGGCTTTAATATCGCACAAGATGTTTTTGACTGCAATTTTGGATATGGTTTGG
ATGATGAAGACATCAAGAGTGTTCTTTCACTATATGAAGCTTCATATCTCTCGACTAGAT
TCGATACTAAATTGAAAGAGACCATATACTATACAACAACACGACTTAAAAAGTTCGTGG
AAATGAAGAGCAATGAGACCACATCTTATGTTCGAAAGATGGTGATACGTGCGCTAGAAA
TGCCATACCATCGGAGAGTTCAAAGACTAGAAGCAAGATGGTACATAGACGTGTATGGCG
AGACACCCGACATGAACTCTAACTTACTAGAATTGGCGAAACTTGATTTCAATTTCGTAC
AAGTTATCCATCAAGACGAGCTCAAATCTCTCTCTAGCGGCGCATATCTCCCTATCGAGA
AGATTCTCAAATGATGGTTACTGGATAGCAATTATGGTAAATGTTTTTTTTATATATTTG
GATGATTTTCAATGACAGCTTTGTAAATGATTTTCTTAATAAACTTGCGTAAAGTTAAGA
CTGATTTATTTCTTACACATCAAAGAGATCAACACTCTAGTTTTCATGGAAAGTCGTGCA
ATTAAAGGTAACAGTTTTGGATTTGCAAGATTGCCAGACCCAGGACAACTACCTTCTTCA
GCTAGTTTCATGTCTACTTCGGACCAAGCAGAACACAAATGGGAAGAGAGCTAACTTACC
ATGTTGATGAGCAAATTTCCAGAATTACTTGTTGTAGAAGAAGACGCCACTGAAAAATAG
TTCTGTAATAGTTATTTTGCTTGCATTTTTGTGGTTAAAAATTCAGTAACGAGCAATTCT
AGCTTTCTTATAATTTTTTTAACTTTATGTAAGTATGCTAAGACAATTTCAATGTTAATT
ATTTAGGTTTCAACTTTAAAATTTATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG69TF U 1
AF RR2AG69JQ C 551
BS 1 762 RR2AG69TF
BS 763 1349 RR2AG69JQ

RD RR2AG69TF 762 0 0
GGGTTCATCAAAGTTTTGAACTCTTTATTATAGTCATTAGAAAAAGCAAAAAGTTTATAA
TGAAAACACAGTCACAGCTTCTTGAAGCCCGTCGCTCTGCACACTATCGACCGTCTCTTT
GGGAACACGAGAATCTCCTCTCGCTCGGGAACAAATATGCGGTATATAAAGAGGACAACA
TCGAGAGAGCTAAGTTATTGAAGCAAGAAGTTAGTAAAATGCTTGATGAAACAGAGGGTC
TGCTTGAACAGCTAGAGCTCGTTGACACTTTACAAAGACTCGGAATTTCTTACCGTTTCG
AACGTGGAATCAAGAAGATTCTAACGAATGTTCACGTTAGACATGTTAGGCACAGAAAGA
GGGTAGATCGGAAGATATCTGAATACTTATATGCGACTGCCCTTGAGTTCCGACTCCTAA
GGCAACATGGCTTTAATATCGCACAAGATGTTTTTGACTGCAATTTTGGATATGGTTTGG
ATGATGAAGACATCAAGAGTGTTCTTTCACTATATGAAGCTTCATATCTCTCGACTAGAT
TCGATACTAAATTGAAAGAGACCATATACTATACAACAACACGACTTAAAAAGTTCGTGG
AAATGAAGAGCAATGAGACCACATCTTATGTTCGAAAGATGGTGATACGTGCGCTAGAAA
TGCCATACCATCGGAGAGTTCAAAGACTAGAAGCAAGATGGTACATAGACGTGTATGGCG
AGACACCCGACATGAACTCTAACTTACTAGAATTGGCGAAAC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2AG69JQ 799 0 0
ATTGAAAGAGACCATATACTATACAACAACACGACTTAAAAAGTTCGTGGAAATGAAGAG
CAATGAGACCACATCTTATGTTCGAAAGATGGTGATACGTGCGCTAGAAATGCCATACCA
TCGGAGAGTTCAAAGACTAGAAGCAAGATGGTACATAGACGTGTATGGCGAGACACCCGA
CATGAACTCTAACTTACTAGAATTGGCGAAACTTGATTTCAATTTCGTACAAGTTATCCA
TCAAGACGAGCTCAAATCTCTCTCTAGCGGCGCATATCTCCCTATCGAGAAGATTCTCAA
ATGATGGTTACTGGATAGCAATTATGGTAAATGTTTTTTTTATATATTTGGATGATTTTC
AATGACAGCTTTGTAAATGATTTTCTTAATAAACTTGCGTAAAGTTAAGACTGATTTATT
TCTTACACATCAAAGAGATCAACACTCTAGTTTTCATGGAAAGTCGTGCAATTAAAGGTA
ACAGTTTTGGATTTGCAAGATTGCCAGACCCAGGACAACTACCTTCTTCAGCTAGTTTCA
TGTCTACTTCGGACCAAGCAGAACACAAATGGGAAGAGAGCTAACTTACCATGTTGATGA
GCAAATTTCCAGAATTACTTGTTGTAGAAGAAGACGCCACTGAAAAATAGTTCTGTAATA
GTTATTTTGCTTGCATTTTTGTGGTTAAAAATTCAGTAACGAGCAATTCTAGCTTTCTTA
TAATTTTTTTAACTTTATGTAAGTATGCTAAGACAATTTCAATGTTAATTATTTAGGTTT
CAACTTTAAAATTTATTTG

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL4930Contig1 566 2 2 U
GGATCACACTGAGAGGCCACGAAACGAAAATACGATCCTCCAATCCATCATCATCGTCCA
CAAGGAGCTTCATTCCGATCTGGTCAGACACGGCTTTCCTTGTGACATCGTTAATATTCG
CTGTGGTCGGCATCATTGCTTCGATTTTCACAAGAATCTGCTTCAACCAAGGCCCCTCCA
CCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCACTGTCTGCTGTTGGTTAATGTGGG
CAATCGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGTCCCAATCCTCAGCGAGGTTGAGT
AGAAACCATCTCTACTCACACTAGGCAACCCAATGCACGGATTTGGTTGTCTGCTAGCTC
TTTCTGTGTTTCCCTCTTCAATCATATCGGGTTTTCCTTTCCCTTTTGTAATTTTTACAG
CTGTGTGGAACAAACAATACGTTTGCCTCTTCTTCACTGTTAAATCTCGTCTCTCATTCT
TTTATATAACAGTCTGCATCATACTCAAAAGACTGCCAGAGAGTTCAGTCTGTATTATTT
GTTGATGAAATAAGAATCTTTGGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO95TF U 1
AF RR2CN95TF U 17
BS 1 231 RR2GO95TF
BS 232 566 RR2CN95TF

RD RR2GO95TF 231 0 0
GGATCACACTGAGAGGCCACGAAACGAAAATACGATCCTCCAATCCATCATCATCGTCCA
CAAGGAGCTTCATTCCGATCTGGTCAGACACGGCTTTCCTTGTGACATCGTTAATATTCG
CTGTGGTCGGCATCATTGCTTCGATTTTCACAAGAATCTGCTTCAACCAAGGCCCCTCCA
CCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCACTGTCTGCTGTTGGT

QA 1 231 1 231
DS 

RD RR2CN95TF 550 0 0
GG
ACGAAACGAAAATACGATCCTCCAATCCATCATCATCGTCCACAAGGAGCTTCATTCCGA
TCTGGTCAGACATGGCTTTCCTTGTGACATCGTTAATATTCGCTGTGGTCGGCATCATTG
CTTCGATTTTCACAAGAATCTGCTTCAACCAAGGCCCCTCCACCAATCTGCTACATTTTA
CTTTGGTCATTACAGCCACTGTCTGCTGTTGGTTAATGTGGGCAATCGTATACATTGCGC
AGATGAAGCCTCTCATTGTCCCAATCCTCAGCGAGGTTGAGTAGAAACCATCTCTACTCA
CACTAGGCAACCCAATGCACGGATTTGGTTGTCTGCTAGCTCTTTCTGTGTTTCCCTCTT
CAATCATATCGGGTTTTCCTTTCCCTTTTGTAATTTTTACAGCTGTGTGGAACAAACAAT
ACGTTTGCCTCTTCTTCACTGTTAAATCTCGTCTCTCATTCTTTTATATAACAGTCTGCA
TCATACTCAAAAGACTGCCAGAGAGTTCAGTCTGTATTATTTGTTGATGAAATAAGAATC
TTTGGAGG

QA 3 550 3 550
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4932Contig1 569 2 2 U
GATTCATAATGTTACACACTCACACATGATAATATCAAATAGGATAAATCAGTCCACAAG
ACTTTCATACGTATTAAAACAAAAGCAGATCACACCTTTTTTTTTAACACTCAAAAGCAA
ATCACACATTCATATGAAACGATAAGACAATAGATTCATAGTAAACACCGGGTTCAGTTT
CTAAGCACAGATCTGCTGTGCCGACATGCGACTATCTGTTTTCTCGCGGGGCATCCCTGG
TTCGGTCGTCTTACAAGCCACCATGCCATGATCAGTTAAACCTGCAAATCCGGTTTTAGT
TTCCATATTGTCATCACTACCCGGAACTTTGTCCTCAAATTTCAATTGGTCCGGTAAAGA
GACAGGGAGAAAACCCTTTTGACGACATGTCTCAATTGATTCCACCAACATATCCTCGAG
ACTATACTTGAAGTTAAATCCCATATCAATCAGCTTCTTGGAACTGAACACAATGCTCTT
CAAATTCTCATCCACTCCTTCAAACGATGAAGGAACGTTATATTCTGGGTATTTTTGCCT
GATAAATTCTGAAATGCTAAGAATCGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ25JQ U 1
AF RR2A517JQ U 342
BS 1 559 RR2AQ25JQ
BS 560 569 RR2A517JQ

RD RR2AQ25JQ 559 0 0
GATTCATAATGTTACACACTCACACATGATAATATCAAATAGGATAAATCAGTCCACAAG
ACTTTCATACGTATTAAAACAAAAGCAGATCACACCTTTTTTTTTAACACTCAAAAGCAA
ATCACACATTCATATGAAACGATAAGACAATAGATTCATAGTAAACACCGGGTTCAGTTT
CTAAGCACAGATCTGCTGTGCCGACATGCGACTATCTGTTTTCTCGCGGGGCATCCCTGG
TTCGGTCGTCTTACAAGCCACCATGCCATGATCAGTTAAACCTGCAAATCCGGTTTTAGT
TTCCATATTGTCATCACTACCCGGAACTTTGTCCTCAAATTTCAATTGGTCCGGTAAAGA
GACAGGGAGAAAACCCTTTTGACGACATGTCTCAATTGATTCCACCAACATATCCTCGAG
ACTATACTTGAAGTTAAATCCCATATCAATCAGCTTCTTGGAACTGAACACAATGCTCTT
CAAATTCTCATCCACTCCTTCAAACGATGAAGGAACGTTATATTCTGGGTATTTTTGCCT
GATAAATTCTGAAATGCTA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2A517JQ 228 0 0
TCAATTGGTCCGGTAAAGAGACAGGGAGAAAACCCTTTTGACGACATGTCTCAATTGATT
CCACCAACATATCCTCGAGACTATACTTGAAGTTAAATCCCATATCAATCAGCTTCTTGG
AACTGAACACAATGCTCTTCAGATTCTCATCCACTCCTTCAAACGATGAAGGAACGTTAT
ATTCTGGGTATTTTTGCCTGATAAATTCTGAGATGCTAAGAATCGTTG

QA 1 228 1 228
DS 



AS 1 2

CO CL4933Contig1 836 2 2 U
GGGTGACTCAGAAAAATACAAATGGATAACATTTGGGTTCTACCACTTCTCTTCCTAATC
CTTTCTGGGGTAATCGCCGCTTACAGACATTCAAAGAGGCGGCAACACCGGAAACCACCT
TCTCCTCCTGGTTATCCAATCATCGGAAACTTACACCAGCTCGGAGTTTTACCACACCAA
TCTCTATGGAATATGTCAAAGAAGTATGTCCCGTGATGCTTTTGAACCTTGGAAAAGTCC
CAATGGTCGTGCTTTCTTCTGTTGAAACCGCAAAACAAGCTCTAAGAGACCATGACATCC
ACTGTTGTAGCCGTCCTACAGTAGCAGGGCTTAGAGAACTCTCTTACAACAATCTGTACA
TAGCTTTCTCTCCTTTTAGTGATTACTGGAAAGAAGTAAGGAAGCTAGCTGTTATGGAAC
TATTTAGTGCTAAACAAGTACTTTCCATTAAACCCATCATGGACGAGCAGGTCAAGAAAC
TGATCGACTCAGTTACCGAATCAGCCTCTCAAAAATTACCTATCAGTGTGAATAAAACAT
TTCTTGATTTAACTAAACGTGAGGTATAATTTTGATTGGAAATTGCCAGAAGGCATAGCG
GTTGAAGACATCGACGTAGAAGAATCTCCTGGACTTAGTGTGAGCAAGAAAAGTGAGCTT
CTACTTGTTCCTATGAAGTACTTAGATCATTGACTTCAAATGAGTTCTTCATCTACAATA
CGTCAGTATTGTCATATATAAAGAAATGTCTTGTTCCTTTTTTGTCGTCCTATTGGTCAA
CGAAAGCTCTACCAAACGTTTAAGATAATTTTAAAAGTGTAATAGTTTGTTAGATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX29TF U 1
AF RR2BX29JQ C 278
BS 1 399 RR2BX29TF
BS 400 836 RR2BX29JQ

RD RR2BX29TF 399 0 0
GGGTGACTCAGAAAAATACAAATGGATAACATTTGGGTTCTACCACTTCTCTTCCTAATC
CTTTCTGGGGTAATCGCCGCTTACAGACATTCAAAGAGGCGGCAACACCGGAAACCACCT
TCTCCTCCTGGTTATCCAATCATCGGAAACTTACACCAGCTCGGAGTTTTACCACACCAA
TCTCTATGGAATATGTCAAAGAAGTATGTCCCGTGATGCTTTTGAACCTTGGAAAAGTCC
CAATGGTCGTGCTTTCTTCTGTTGAAACCGCAAAACAAGCTCTAAGAGACCATGACATCC
ACTGTTGTAGCCGTCCTACAGTAGCAGGGCTTAGAGAACTCTCTTACAACAATCTGTACA
TAGCTTTCTCTCCTTTTAGTGATTACTGGAAAGAAGTAA

QA 1 399 1 399
DS 

RD RR2BX29JQ 559 0 0
AGCTCTAAGAGACCATGACATCCACTGTTGTAGCCGTCCTACAGTAGCAGGGCTTAGAGA
ACTCTCTTACAACAATCTGTACATAGCTTTCTCTCCTTTTAGTGATTACTGGAAAGAAGT
AAGGAAGCTAGCTGTTATGGAACTATTTAGTGCTAAACAAGTACTTTCCATTAAACCCAT
CATGGACGAGCAGGTCAAGAAACTGATCGACTCAGTTACCGAATCAGCCTCTCAAAAATT
ACCTATCAGTGTGAATAAAACATTTCTTGATTTAACTAAACGTGAGGTATAATTTTGATT
GGAAATTGCCAGAAGGCATAGCGGTTGAAGACATCGACGTAGAAGAATCTCCTGGACTTA
GTGTGAGCAAGAAAAGTGAGCTTCTACTTGTTCCTATGAAGTACTTAGATCATTGACTTC
AAATGAGTTCTTCATCTACAATACGTCAGTATTGTCATATATAAAGAAATGTCTTGTTCC
TTTTTTGTCGTCCTATTGGTCAACGAAAGCTCTACCAAACGTTTAAGATAATTTTAAAAG
TGTAATAGTTTGTTAGATA

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL4934Contig1 1005 2 2 U
GGAAATCGTTTGGGAGGTTTTGGGTTCGATAGAAAGACAGAGAGCTTTAACAATGTCAGA
AACGAGTTGGTACTTTACGAGAGAAGAGATAGAAAAAACATCGCCATCGAGAATCGACGG
TATCGACTCAAGGCAAGAGACTTTCCAACGTTGGTCTTACACTACATTCCTCCAAGAGCT
TGGCCAGAGACTCAACAATCCTCAGAGATCCATAGCGACATCGATAGTCCTCTGTCAAAG
ATTCTTCACACGCCAGTCACTCGCGAAGAACGACCCGAAAACAATGAGCATCGTATGCAT
GTTCATCGCTGGGAAAGTCGAAGGGTCTCCGAGACCAGTGGGAGACGTCATCGCCGTAGC
CTACAGAGTATTACACGACAAGGAACCGTTGAGGGAAGTGTACGAGAGACTGAAGAAAAC
TGTCCTAACCGGGGAGAAGTTTGTGCTCTCTACGTTAGGGTTTGATCTGGAAATTGAGCA
CCCTTATAAAACGGTGTCGGATTGGGTTAAGAGATCGGTTAAGGTGGAGAGTGATGCTAA
AAGATTGTCTCAGGCTGCGTTTAATTTCGTTAATGACAGTTTAAGGTCGTCGCTCTGTTT
GCAGTTTAAGCCGAGTCAGATTGCTGCGGCTGCTATATATCTCGGGTCGCGCGTGGCTAA
TGTGAAGTTGCCGTGGGATGGGGAGAAAGTTTGGTGGCAAGAGTTCAGTGTCACGAAACT
ACAATTGTGTGAGATCAGTAACCAGACGATTTCTATTTATGAACAGGACTTCCTCATCCC
GAGCGAACAAGAAGCAAAGTATAAGCTTGGTGATGGAGAGTTATTAAGACCAGAGCAAAA
GCAGAGCAAGGATGATGGAACTAAATATTGTCATGGTGTTGAAGGTCATGAAGATCATAA
GGGAATTGTGATAAATGGGGCTGATAAAGCTAAGAAACCTTGTTGAAACTGTTGATAATG
TACCTTTTGGAGCATTCTGAAAAATACATGTAGTTGTTGAGAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E474TF U 1
AF RR2E474JQ C 452
BS 1 665 RR2E474TF
BS 666 1005 RR2E474JQ

RD RR2E474TF 665 0 0
GGAAATCGTTTGGGAGGTTTTGGGTTCGATAGAAAGACAGAGAGCTTTAACAATGTCAGA
AACGAGTTGGTACTTTACGAGAGAAGAGATAGAAAAAACATCGCCATCGAGAATCGACGG
TATCGACTCAAGGCAAGAGACTTTCCAACGTTGGTCTTACACTACATTCCTCCAAGAGCT
TGGCCAGAGACTCAACAATCCTCAGAGATCCATAGCGACATCGATAGTCCTCTGTCAAAG
ATTCTTCACACGCCAGTCACTCGCGAAGAACGACCCGAAAACAATGAGCATCGTATGCAT
GTTCATCGCTGGGAAAGTCGAAGGGTCTCCGAGACCAGTGGGAGACGTCATCGCCGTAGC
CTACAGAGTATTACACGACAAGGAACCGTTGAGGGAAGTGTACGAGAGACTGAAGAAAAC
TGTCCTAACCGGGGAGAAGTTTGTGCTCTCTACGTTAGGGTTTGATCTGGAAATTGAGCA
CCCTTATAAAACGGTGTCGGATTGGGTTAAGAGATCGGTTAAGGTGGAGAGTGATGCTAA
AAGATTGTCTCAGGCTGCGTTTAATTTCGTTAATGACAGTTTAAGGTCGTCGCTCTGTTT
GCAGTTTAAGCCGAGTCAGATTGCTGCGGCTGCTATATATCTCGGGTCGCGCGTGGCTAA
TGTGA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2E474JQ 554 0 0
ACGTTAGGGTTTGATCTGGAAATTGAGCACCCTTATAAAACGGTGTCGGATTGGGTTAAG
AGATCGGTTAAGGTGGAGAGTGATGCTAAAAGATTGTCTCAGGCTGCGTTTAATTTCGTT
AATGACAGTTTAAGGTCGTCGCTCTGTTTGCAGTTTAAGCCGAGTCAGATTGCTGCGGCT
GCTATATATCTCGGGTCGCGCGTGGCTAATGTGAAGTTGCCGTGGGATGGGGAGAAAGTT
TGGTGGCAAGAGTTCAGTGTCACGAAACTACAATTGTGTGAGATCAGTAACCAGACGATT
TCTATTTATGAACAGGACTTCCTCATCCCGAGCGAACAAGAAGCAAAGTATAAGCTTGGT
GATGGAGAGTTATTAAGACCAGAGCAAAAGCAGAGCAAGGATGATGGAACTAAATATTGT
CATGGTGTTGAAGGTCATGAAGATCATAAGGGAATTGTGATAAATGGGGCTGATAAAGCT
AAGAAACCTTGTTGAAACTGTTGATAATGTACCTTTTGGAGCATTCTGAAAAATACATGT
AGTTGTTGAGAGGT

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 2

CO CL4935Contig1 689 2 2 U
GGAAACCCTAATTCTCGTCTGTTAGATTTGCTCAAGCCGTCGAAAATGTCGAAGCGAGGA
CGTGGAGGAACGTCGGGTAACAAGTTCAGGATGTCGCTAGGTCTTCCAGTGGCGGCGACG
GTGAACTGCGCCGACAACACCGGTGCCAAGAACCTTTACATCATATCGGTGAAAGGGATC
AAAGGTCGCCTTAACCGATTGCCTTCTGCTTGCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTC
AAGAAAGGAAAGCCTGATCTCCGTAAAAAGGTTATGCCTGCTGTCATCGTTAGGCAGAGG
AAGCCATGGCGCCGAAAGTATGGTGTCTTCATGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATC
GTCAACCCCAAGGGAGAAATGAAAGGTTCTGCGATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGC
GCTGATCTCTGGCCGAGGATTGCTAGTGCTGCCAATGCCATTGTCTAATGATCAGTGCAA
TATCTAGTCTGTCTTTGCTGGTTTTTGATTATCATTCTAAACTTTGTTGGAGTTTTAAAA
TCATATCAAAAGAAATTTGAGAATTTTGGTAAAAGGTATTTTGATATCTGTCAATGCGAC
ATTCAAATATCTTGGTTATTTTTCTAATCCATTTTTGGAGTTTTTGTAGTTTTGTTATTA
CATTAAACCTGGTCATGATCAAAGTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI82TF U 1
AF RR2DI82JQ C 387
BS 1 571 RR2DI82TF
BS 572 689 RR2DI82JQ

RD RR2DI82TF 571 0 0
GGAAACCCTAATTCTCGTCTGTTAGATTTGCTCAAGCCGTCGAAAATGTCGAAGCGAGGA
CGTGGAGGAACGTCGGGTAACAAGTTCAGGATGTCGCTAGGTCTTCCAGTGGCGGCGACG
GTGAACTGCGCCGACAACACCGGTGCCAAGAACCTTTACATCATATCGGTGAAAGGGATC
AAAGGTCGCCTTAACCGATTGCCTTCTGCTTGCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTC
AAGAAAGGAAAGCCTGATCTCCGTAAAAAGGTTATGCCTGCTGTCATCGTTAGGCAGAGG
AAGCCATGGCGCCGAAAGTATGGTGTCTTCATGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATC
GTCAACCCCAAGGGAGAAATGAAAGGTTCTGCGATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGC
GCTGATCTCTGGCCGAGGATTGCTAGTGCTGCCAATGCCATTGTCTAATGATCAGTGCAA
TATCTAGTCTGTCTTTGCTGGTTTTTGATTATCATTCTAAACTTTGTTGGAGTTTTAAAA
TCATATCAAAAGAAATTTGAGAATTTTGGTA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2DI82JQ 303 0 0
TTCTGCGATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGATCTCTGGCCGAGGATTGCTAG
TGCTGCCAATGCCATTGTCTAATGATCAGTGCAATATCTAGTCTGTCTTTGCTGGTTTTT
GATTATCATTCTAAACTTTGTTGGAGTTTTAAAATCATATCAAAAGAAATTTGAGAATTT
TGGTAAAAGGTATTTTGATATCTGTCAATGCGACATTCAAATATCTTGGTTATTTTTCTA
ATCCATTTTTGGAGTTTTTGTAGTTTTGTTATTACATTAAACCTGGTCATGATCAAAGTC
TTG

QA 1 303 1 303
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4938Contig1 1131 2 2 U
GGGCTTTCTCTTTAGCACCAAGCTGTTTCCATGGCTATCTCACCAGCTGTTCATTCTCCA
CCACTCATTTTTTTCCCGTCTTCTCTCTCTTGCGACGGCGTCTCTGCTTCTCCCGTTTCG
AAGCTAAGAACATGTGTTAAGTTCGATAAGTTTCAAGGTGATGCTCCTCTTGAACAGACC
ACATCAGCTTCTGCTTCACAAGAAGTACCATTAGAAGCTGATGACCCACCAGAAGAAGAA
GACGACGACTGTTTGCCTAATGATCTGGTGGGAGCTGTTAGGCAATCTGGTGAAGCGAGT
GCCTCGTTTGTGAACTCGGGAGGAACAAGAGCCATCGTGGAGCTCTTGATTCCTCAACTG
CAGTTCTTAGACGATGAAGGTGCGCAAGCTGAGCTTTGGGAGCTTTCTCGGGTTTTCTTG
GAGACACTCATTAAAGACACTGGTTGTGAGAGAGTTAAAGCTGTGTTTCCAGATGCTGGA
GCTGCTGCGTTGCTAAAATATAAGTGGAAGGATGCAGCTTTTGGATTCGCTAGCTTAAGT
GACCGTAAACCAGTGGAGAAAGAAGATGAGATCATTGTCATGGTTGTTCCTGATTACCAA
ATGCTGGAGTATGTTGAGAAAATTGCAAAAGGGCTTGCTGATGACCCGCCAAGGCCTCTG
GTTATGTGGAACCCTCGTCTTATAAGCGAGGAAGTTGGGGTTGGGTTTAACGTTAGAAAG
CTAAGGCGTTACTTCCTAAGTTCTTTTACTACGGTTTACTCGATGAGACCTCTGGCTGCT
GGTGCTGTTTTCAGGTGTTATCCTGGTAAATGGAAAGTGTTCTATGACAATAAAGACAGA
CCTGGCCGGTATCTACTCGCCAAAGAACTCATTGGTCGACCCGATGCTGAGGATCTCGAG
ATTATATATGGGAACGTGGAAGAGAAACCAGATGAAGAGCCATCTTTATTGAGTCAAGCT
GCTGGAATTTTCTCATCTATTAACAGGTTCATGAAAGCTATGTGAAAGATGATTTCTTCT
CTCTCAGAGTAGTACTGTCTACTAGTCTGGTATTATGAATGTAACTAAAGGGAATGTTTG
TATATCTTTTGTATGCTATTTACATCATAACGAAATAGAATGCATACTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO85TF U 1
AF RR2BO85JQ C 436
BS 1 648 RR2BO85TF
BS 649 1131 RR2BO85JQ

RD RR2BO85TF 648 0 0
GGGCTTTCTCTTTAGCACCAAGCTGTTTCCATGGCTATCTCACCAGCTGTTCATTCTCCA
CCACTCATTTTTTTCCCGTCTTCTCTCTCTTGCGACGGCGTCTCTGCTTCTCCCGTTTCG
AAGCTAAGAACATGTGTTAAGTTCGATAAGTTTCAAGGTGATGCTCCTCTTGAACAGACC
ACATCAGCTTCTGCTTCACAAGAAGTACCATTAGAAGCTGATGACCCACCAGAAGAAGAA
GACGACGACTGTTTGCCTAATGATCTGGTGGGAGCTGTTAGGCAATCTGGTGAAGCGAGT
GCCTCGTTTGTGAACTCGGGAGGAACAAGAGCCATCGTGGAGCTCTTGATTCCTCAACTG
CAGTTCTTAGACGATGAAGGTGCGCAAGCTGAGCTTTGGGAGCTTTCTCGGGTTTTCTTG
GAGACACTCATTAAAGACACTGGTTGTGAGAGAGTTAAAGCTGTGTTTCCAGATGCTGGA
GCTGCTGCGTTGCTAAAATATAAGTGGAAGGATGCAGCTTTTGGATTCGCTAGCTTAAGT
GACCGTAAACCAGTGGAGAAAGAAGATGAGATCATTGTCATGGTTGTTCCTGATTACCAA
ATGCTGGAGTATGTTGAGAAAATTGCAAAAGGGCTTGCTGATGACCCG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2BO85JQ 696 0 0
GACACTGGTTGTGAGAGAGTTAAAGCTGTGTTTCCAGATGCTGGAGCTGCTGCGTTGCTA
AAATATAAGTGGAAGGATGCAGCTTTTGGATTCGCTAGCTTAAGTGACCGTAAACCAGTG
GAGAAAGAAGATGAGATCATTGTCATGGTTGTTCCTGATTACCAAATGCTGGAGTATGTT
GAGAAAATTGCAAAAGGGCTTGCTGATGACCCGCCAAGGCCTCTGGTTATGTGGAACCCT
CGTCTTATAAGCGAGGAAGTTGGGGTTGGGTTTAACGTTAGAAAGCTAAGGCGTTACTTC
CTAAGTTCTTTTACTACGGTTTACTCGATGAGACCTCTGGCTGCTGGTGCTGTTTTCAGG
TGTTATCCTGGTAAATGGAAAGTGTTCTATGACAATAAAGACAGACCTGGCCGGTATCTA
CTCGCCAAAGAACTCATTGGTCGACCCGATGCTGAGGATCTCGAGATTATATATGGGAAC
GTGGAAGAGAAACCAGATGAAGAGCCATCTTTATTGAGTCAAGCTGCTGGAATTTTCTCA
TCTATTAACAGGTTCATGAAAGCTATGTGAAAGATGATTTCTTCTCTCTCAGAGTAGTAC
TGTCTACTAGTCTGGTATTATGAATGTAACTAAAGGGAATGTTTGTATATCTTTTGTATG
CTATTTACATCATAACGAAATAGAATGCATACTCGT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL4939Contig1 1310 2 6 U
GAGAGCGTATTGGATGGGGAGGAACACAGAATCATTGATTGGTTATTGTACGAGAGGTCT
TCCATTATATGTTTGCAGGAGTTTTGGGTAGGCAACGAAGAGCTTGTTAGTTTATACGAG
AAGAGACTTGGAGACGCTGGTTATCTCTGTTACAAGCTTGGCCGTACCAACAATCGTGGT
GACGGTTTGCTTACGGCTGTTCATAAGGACTACTTTAGAGTTGTGAACTCGAGGGACTTG
CTTTTCAACGATTGTGGTGACCGAGTTGCGCAGCTTCTACATGTAGAATTAGTGCCTCCT
TATTCTCAGTATGAGTCGCATCAACAAGTTTTGATCATCAACACTCATTTGCTCTTTCCT
CATGATTCAACACTCTCTATAGTAAGATTGCAGCAGGTTTATAAGATTCTTCAGTATGTA
GAATCTTATCAGAAAGAAGTTAATTTAAGTCCCATGCCTATTATGCTTTGCGGAGATTGG
AACGGAAGCAAGCGTGGACATGTCTACAAGTTTCTCAGGTCACAGGGTTTTGTGTCTTCT
TACGACACTGCTCATCGTTACACAGATTCAGATGCTCATAAGTGGGTAAGCCACAGGAAC
CACCGGGGTAACATATGTGCTGTGGACTTCATATGGCTACTAAATCCAAATCGGTATAGA
AAGCTTCTAAAAACAAGTTGGAGTGAGGCTGTGTTTGGCATGTTCAGGTATCTACTGAGA
AGAGCATCCCTGACAGCTGAAGATGCTTTTGCCTTTTTGAAAACCGACAATGATGGTGAC
TACATTACACTCATGGGCTTCTGTGTACTCTTCGACAGCTTAATCTAACCGGTCACTGCA
ATGGGCTCACCACAAAGGAGATCAAAGATCTGTGGACTCAAGCTGACATTGATGGAAATG
GTCTTGTAGATTACAAGGAGTTTCAGCAAAGAATATGGAACCAGAACTGGTCAGAACAGA
GAGAAGCAGAGGACGGAGAAGCAAAAGGTAGCAAAGAACAAACCGTTGGTTTCAGCGTCA
AGAACGCAGTCTTGTTTCCACCTGAAGTGGAAAAAGGAAGGTGGCCGGAAAATTACTCTC
CCTCGGATCACGCGAGGCTAACAGTTGTATTCTCTCCCATAAGAATGCCTTGTTCTCAAT
TGGTTTCATGACAAAAGTACTCAAAAACAAACCTTTAGCTTCCATTTAAAGAGACTTTTT
GAGTTTTAATGTATCCCTTAGAGAGCAGAATCAAAGTATGCACAACACAAAGGTGTTTTA
CATTACACACTGTACAGACATGTAAACAAACATTTTGGAAGCTTTCATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD93TF U 1
AF RR2GD93JQ C 521
BS 1 672 RR2GD93TF
BS 673 673 RR2GD93JQ
BS 674 707 RR2GD93TF
BS 708 708 RR2GD93JQ
BS 709 742 RR2GD93TF
BS 743 1310 RR2GD93JQ

RD RR2GD93TF 742 0 0
GAGAGCGTATTGGATGGGGAGGAACACAGAATCATTGATTGGTTATTGTACGAGAGGTCT
TCCATTATATGTTTGCAGGAGTTTTGGGTAGGCAACGAAGAGCTTGTTAGTTTATACGAG
AAGAGACTTGGAGACGCTGGTTATCTCTGTTACAAGCTTGGCCGTACCAACAATCGTGGT
GACGGTTTGCTTACGGCTGTTCATAAGGACTACTTTAGAGTTGTGAACTCGAGGGACTTG
CTTTTCAACGATTGTGGTGACCGAGTTGCGCAGCTTCTACATGTAGAATTAGTGCCTCCT
TATTCTCAGTATGAGTCGCATCAACAAGTTTTGATCATCAACACTCATTTGCTCTTTCCT
CATGATTCAACACTCTCTATAGTAAGATTGCAGCAGGTTTATAAGATTCTTCAGTATGTA
GAATCTTATCAGAAAGAAGTTAATTTAAGTCCCATGCCTATTATGCTTTGCGGAGATTGG
AACGGAAGCAAGCGTGGACATGTCTACAAGTTTCTCAGGTCACAGGGTTTTGTGTCTTCT
TACGACACTGCTCATCGTTACACAGATTCAGATGCTCATAAGTGGGTAAGCCACAGGAAC
CACCGGGGTAACATATGTGCTGTGGACTTCATATGGCTACTAAATCCAAATCGGTATAGA
AAGCTTCTAAAA*CAAGTTGGAGTGAGGCTGTGTTTGGCATGTTCAG*TATCTACTGAGA
AGAGCATCCCTGACAGCTGAAG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2GD93JQ 790 0 0
CACAGGGTTTTGTGTCTTCTTACGACACTGCTCATCGTTACACAGATTCAGATGCTCATA
AGTGGGTAAGCCACAGGAACCACCGGGGTAACATATGTGCTGTGGACTTCATATGGCTAC
TAAATCCAAATCGGTATAGAAAGCTTCTAAAAACAAGTTGGAGTGAGGCTGTGTTTGGCA
TGTTCAGGTATCTACTGAGAAGAGCATCCCTGACAGCTGAAGATGCTTTTGCCTTTTTGA
AAACCGACAATGATGGTGACTACATTACACTCATGGGCTTCTGTGTACTCTTCGACAGCT
TAATCTAACCGGTCACTGCAATGGGCTCACCACAAAGGAGATCAAAGATCTGTGGACTCA
AGCTGACATTGATGGAAATGGTCTTGTAGATTACAAGGAGTTTCAGCAAAGAATATGGAA
CCAGAACTGGTCAGAACAGAGAGAAGCAGAGGACGGAGAAGCAAAAGGTAGCAAAGAACA
AACCGTTGGTTTCAGCGTCAAGAACGCAGTCTTGTTTCCACCTGAAGTGGAAAAAGGAAG
GTGGCCGGAAAATTACTCTCCCTCGGATCACGCGAGGCTAACAGTTGTATTCTCTCCCAT
AAGAATGCCTTGTTCTCAATTGGTTTCATGACAAAAGTACTCAAAAACAAACCTTTAGCT
TCCATTTAAAGAGACTTTTTGAGTTTTAATGTATCCCTTAGAGAGCAGAATCAAAGTATG
CACAACACAAAGGTGTTTTACATTACACACTGTACAGACATGTAAACAAACATTTTGGAA
GCTTTCATGT

QA 1 790 1 790
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4941Contig1 762 2 3 U
GGATGACGACGGGTGTGTGGATGATTGGGAAGCTCTTGCTGATGCATTAGCTGAGGAGGA
ACAGAATCTCCTCCGCGAGTCCGTCAAGGAGGAGCAAGAGAGTGTTGGACAATCAGCTTC
CAATGCGGATGATGATTCGATGAGGAAGCAAAAGAAGAGCAGTCGAGCTTGGAGGCCTGA
CGATGACCTTCGCCCTCAGGGGTTACCTAATCTAGGGAAGCAGCTTAGTTTCCCGGAGTT
GGACAAGCGTTATACCACCGCCGTCTCGATTCCTTCTTCGTGTCCCATCTGCTACGAAGA
CTTGGACTTGACGGATTCGAGTTTCCTTCCGTGTCCTTGCGGGTTCAGGCTCTGTCTTTT
CTGCCACAAGACGATTTGCGATGGAGACGGGCGTTGTCCAGGGTGCAGGAAACCGTATGA
TCAGAATGACGTCAAGGGTGAGACTAGTAGTGGTGGTTTCACTATTCGGTTGGCTCGTTC
ATCTAGCATGTTTTGCAGGTTTTGAGAAAAAAATGAAAAATAAAGAGAGAGGTGTGTGTG
GTTTTTCTCAAACCACCCTGTGTTGTTTTCTCTGTTTTCATTCCCCGCATCTTTGCTTTA
GGTAATGTGTGGGTATAATGTTGTCTTTTGGCACTTGAGAACTTTGAATCTTTGTTTTCT
TTGTCATGGAACACTGTGATGATGTATGTGAATACATAAAAAAAAAAAGGTGGTACAGAA
AATTCAAATATATAGTTTCAATAATATGTTTGTTCGGTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H266TF U 135
AF RR2H266JQ C 1
BS 1 134 RR2H266JQ
BS 135 346 RR2H266TF
BS 347 762 RR2H266JQ

RD RR2H266TF 212 0 0
ATTCGATGAGGAAGCAAAAGAAGAGCAGTCGAGCTTGGAGGCCTGACGATGACCTTCGCC
CTCAGGGGTTACCTAATCTAGGGAAGCAGCTTAGTTTCCCGGAGTTGGACAAGCGTTATA
CCACCGCCGTCTCGATTCCTTCTTCGTGTCCCATCTGCTACGAAGACTTGGACTTGACGG
ATTCGAGTTTCCTTCCGTGTCCTTGCGGGTTC

QA 1 212 1 212
DS 

RD RR2H266JQ 762 0 0
GGATGACGACGGGTGTGTGGATGATTGGGAAGCTCTTGCTGATGCATTAGCTGAGGAGGA
ACAGAATCTCCTCCGCGAGTCCGTCAAGGAGGAGCAAGAGAGTGTTGGACAATCAGCTTC
CAATGCGGATGATGATTCGATGAGGAAGCAAAAGAAGAGCAGTCGAGCTTGGAGGCCTGA
CGATGACCTTCGCCCTCAGGGGTTACCTAATCTAGGGAAGCAGCTTAGTTTCCCGGAGTT
GGACAAGCGTTATACCACCGCCGTCTCGATTCCTTCTTCGTGTCCCATCTGCTACGAAGA
CTTGGACTTGACGGATTCGAGTTTCCTTCCGTGTCCTTGCGGGTTCAGGCTCTGTCTTTT
CTGCCACAAGACGATTTGCGATGGAGACGGGCGTTGTCCAGGGTGCAGGAAACCGTATGA
TCAGAATGACGTCAAGGGTGAGACTAGTAGTGGTGGTTTCACTATTCGGTTGGCTCGTTC
ATCTAGCATGTTTTGCAGGTTTTGAGAAAAAAATGAAAAATAAAGAGAGAGGTGTGTGTG
GTTTTTCTCAAACCACCCTGTGTTGTTTTCTCTGTTTTCATTCCCCGCATCTTTGCTTTA
GGTAATGTGTGGGTATAATGTTGTCTTTTGGCACTTGAGAACTTTGAATCTTTGTTTTCT
TTGTCATGGAACACTGTGATGATGTATGTGAATACATAAAAAAAAAAAGGTGGTACAGAA
AATTCAAATATATAGTTTCAATAATATGTTTGTTCGGTCTAC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL4942Contig1 850 2 4 U
TTTTTGTTAGATACTGTATCCTCTTTCCCTTGAGGTGCATGACTTTGGCTTTTGGGTGGT
TTATTTTCCTTTCAACGTTTATCCCTATACATTCTCTCCTCAAAGGTCAGGATAGGTTGA
GGAAAAAGATTGAGAGAGTCTTGGTGGAAATGATATGCAGCTTCTTTGTAGCCTCATGGA
CAGGAGTTGTTAGATACCACGGGCCACGCCCTAGCATCCGTCCTAAGCAGGTCTATGTTG
CCAACCATACTTCGATGATTGATTTCATGTCTTGGAGCAGATGACCGCTTTTGCTGTTAT
AATGCAGAAGCATCCTGGTTGGGTTGGGCTTCTGCAAAGCACAATACTAGAGAGCGTAGG
ATGTATCTGGTTCAATCGTTCCGAGGCAAAGGATCGTGAAATTGTGGCAAGAAAGTTAAG
GAACCATGTTCAAGGAAGTGACAATAACCCTCTTCTCATATTTCCCGAGGGGACTTGTGT
GAATAACAATTACACTGTCATGTTTAAGAAGGGTTCTTTTGAATTGGACTGCACTGTTTG
TCCAATCGCCATTAAATACAATAAGATCTTTGTCGACGCCTTCTGGAACAGCAGAAAACA
ATCATTTACTATGCACTTACTGCAACTCATGACATCGTGGGCTGTTGTGTGTGAAGTGTG
GTACTTGGAACCCCAAACAATAAGGCCTGATGAAACGGCAATTGAGTTTGCAGAGAGGGT
CAGAGACATGATATCTCATAGGGCAGGTTTCAAAAAGGTTCCTTGGGATGGATACTTGAA
GTATTGGAGGCCAAGTTCCAAGCATAGTGAACGCAAGCAACAGAGTTTTGCAGAGTCGAT
CCTGGCTAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP78TF U 1
AF RR2EP78JQ C 614
BS 1 684 RR2EP78TF
BS 685 685 RR2EP78JQ
BS 686 741 RR2EP78TF
BS 742 850 RR2EP78JQ

RD RR2EP78TF 741 0 0
TTTTTGTTAGATACTGTATCCTCTTTCCCTTGAGGTGCATGACTTTGGCTTTTGGGTGGT
TTATTTTCCTTTCAACGTTTATCCCTATACATTCTCTCCTCAAAGGTCAGGATAGGTTGA
GGAAAAAGATTGAGAGAGTCTTGGTGGAAATGATATGCAGCTTCTTTGTAGCCTCATGGA
CAGGAGTTGTTAGATACCACGGGCCACGCCCTAGCATCCGTCCTAAGCAGGTCTATGTTG
CCAACCATACTTCGATGATTGATTTCATGTCTTGGAGCAGATGACCGCTTTTGCTGTTAT
AATGCAGAAGCATCCTGGTTGGGTTGGGCTTCTGCAAAGCACAATACTAGAGAGCGTAGG
ATGTATCTGGTTCAATCGTTCCGAGGCAAAGGATCGTGAAATTGTGGCAAGAAAGTTAAG
GAACCATGTTCAAGGAAGTGACAATAACCCTCTTCTCATATTTCCCGAGGGGACTTGTGT
GAATAACAATTACACTGTCATGTTTAAGAAGGGTTCTTTTGAATTGGACTGCACTGTTTG
TCCAATCGCCATTAAATACAATAAGATCTTTGTCGACGCCTTCTGGAACAGCAGAAAACA
ATCATTTACTATGCACTTACTGCAACTCATGACATCGTGGGCTGTTGTGTGTGAAGTGTG
GTACTTGGAACCCCAAACAATAAG*CCTGATGAAACGGCAATTGAGTTTGCAGAGAGGGT
CAGAGACATGATATCTCATAG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2EP78JQ 237 0 0
CACTTACTGCAACTCATGACATCGTGGGCTGTTGTGTGTGAAGTGTGGTACTTGGAACCC
CAAACAATAAGGCCTGATGAAACGGCAATTGAGTTTGCAGAGAGGGTCAGAGACATGATA
TTTCATAGGGCAGGTTTCAAAAAGGTTCCTTGGGATGGATACTTGAAGTATTGGAGGCCA
AGTTCCAAGCATAGTGAACGCAAGCAACAGAGTTTTGCAGAGTCGATCCTGGCTAGA

QA 1 237 1 237
DS 



AS 1 2

CO CL4943Contig1 898 2 2 U
GAGGATCAGATTACGGAAGAAGTGAAAGGTGTGTTGGAGTTCATTGACTATGCGTACAAA
ATCTTTGGCTTCACCTATGAGCTGAAGCTTTCAACGAGGCCAGAAAAGTACCTTGGAGAT
TTGGCGACATGGGATAAAGCTGAAAATGATCTCAAAGTTGCCCTAGATGCCTTTGGAAAG
GCATGGCAGTTGAACGAAGGAGATGGTGCCTTTTATGGACCTAAGATAGATATCACTGTC
TCTGATGCGCTGAACAGGAAATTCCAGTGTGCTACATTACAGCTTGACTTTCAACTTCCT
GATCGCTTCAAACTGGAGTACTCAGGTGACGACGAAGCGAAGAGGAACAGGCCTGTGATT
ATACACAGGGCCGTGCTGGGATCTGTGGAACGCATGTTCGCCATCTTACTGGAGCATTAC
AAAGGGAAATGGCCGTTCTGGTTAAGTCCGCGACAGGCCATAGTGTGCCCTATATCGAAG
AAGTCTGAGGAGTATGCTTTGAAGGTGAAAGCCCAAATTCATGACGCTGGGTACTACGTG
GATGCCGACATAACTGACAGAAAGATCGATAAAAAGGTGCGAGAAGCTCAGCTTGCGCAG
TACAACTACATACTTGTGGTTGGTGAAACCGAAGCTGCTACAGGACAGGTGAGTGTTCGG
ATAAGAGACAGTGCAGCTCACTCGGTGAAGAGCATCGAGGATTTACTGGAAGAATTCAAG
ACCAAGACTGCCGAGTATCAATGAGAGATCAGACTCTTGAAAGTTCAAGTTTGATTTTAT
TTTGATGAATACTGTTTTGTCTTTTAATTTAATTATGCAAAAAATAGAGTAAAGACCAGA
TTGAAGTGTTTACTTCTCTTTATCATTAAACCAGATTCTAAAGTTTCATTTCTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF72TF U 1
AF RR2EF72JQ C 378
BS 1 640 RR2EF72TF
BS 641 898 RR2EF72JQ

RD RR2EF72TF 640 0 0
GAGGATCAGATTACGGAAGAAGTGAAAGGTGTGTTGGAGTTCATTGACTATGCGTACAAA
ATCTTTGGCTTCACCTATGAGCTGAAGCTTTCAACGAGGCCAGAAAAGTACCTTGGAGAT
TTGGCGACATGGGATAAAGCTGAAAATGATCTCAAAGTTGCCCTAGATGCCTTTGGAAAG
GCATGGCAGTTGAACGAAGGAGATGGTGCCTTTTATGGACCTAAGATAGATATCACTGTC
TCTGATGCGCTGAACAGGAAATTCCAGTGTGCTACATTACAGCTTGACTTTCAACTTCCT
GATCGCTTCAAACTGGAGTACTCAGGTGACGACGAAGCGAAGAGGAACAGGCCTGTGATT
ATACACAGGGCCGTGCTGGGATCTGTGGAACGCATGTTCGCCATCTTACTGGAGCATTAC
AAAGGGAAATGGCCGTTCTGGTTAAGTCCGCGACAGGCCATAGTGTGCCCTATATCGAAG
AAGTCTGAGGAGTATGCTTTGAAGGTGAAAGCCCAAATTCATGACGCTGGGTACTACGTG
GATGCCGACATAACTGACAGAAAGATCGATAAAAAGGTGCGAGAAGCTCAGCTTGCGCAG
TACAACTACATACTTGTGGTTGGTGAAACCGAAGCTGCTA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2EF72JQ 521 0 0
GGGATCTGTGGAACGCATGTTCGCCATCTTACTGGAGCATTACAAAGGGAAATGGCCGTT
CTGGTTAAGTCCGCGACAGGCCATAGTGTGCCCTATATCGAAGAAGTCTGAGGAGTATGC
TTTGAAGGTGAAAGCCCAAATTCATGACGCTGGGTACTACGTGGATGCCGACATAACTGA
CAGAAAGATCGATAAAAAGGTGCGAGAAGCTCAGCTTGCGCAGTACAACTACATACTTGT
GGTTGGTGAAACCGAAGCTGCTACAGGACAGGTGAGTGTTCGGATAAGAGACAGTGCAGC
TCACTCGGTGAAGAGCATCGAGGATTTACTGGAAGAATTCAAGACCAAGACTGCCGAGTA
TCAATGAGAGATCAGACTCTTGAAAGTTCAAGTTTGATTTTATTTTGATGAATACTGTTT
TGTCTTTTAATTTAATTATGCAAAAAATAGAGTAAAGACCAGATTGAAGTGTTTACTTCT
CTTTATCATTAAACCAGATTCTAAAGTTTCATTTCTTCTCC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 2

CO CL4944Contig1 746 2 1 U
AGGGACCGAGAAGATTCACTAAGCGAGCGAGATAGAGCGAAGGAACTCGAACAATGGCGG
CGGTTCAACAGCAGCAAGCGATGCAGAAGAACACGTTGTACGTCGGAGGTCTAGCCGACG
AAGTAAACGAATCGATCCTCCACGCCGCGTTTATACCGTTCGGCGACATCAAGGACGTGA
AGACGCCGTTGGACCAAGCCAATCAGAAGCACAGATCCTTCGGATTCGTCACTTTCCTGG
AGAGAGAAGATGCTTCCGCCGCCATGGATAACATGGACGGCGCCGAGCTTTACGGCCGTG
TTCTCACCGTCAACTATGCTCTCCCCGAGAAGATCAAGGGTGGAGAACAGGGCTGGGCCG
CACATCCACTTTGGGCGGATGCAGACACGTGGTTTGAGCGGCAGCAACAAGAAGAGGAAA
TTATCAAGATGCAAGCCGAGAACAAGGCTGCTATGGAGGCTGCTGAGGAACTTCACAGGA
AGAAATTGGCGCAAGACCGACAAGGCGAGATGGAAGAAGATACGGAGGTTAAAGATGATC
CTATGGCCAGAGCTGAAGCCGATGCTCTAAGCAGCCATGACAACAACAACAACCCCCAGT
GAAAGTAAGCTTTTGCCGGTTTTGCGTCCGAGTTGTCTCATATCATCACCTATTGAGTGT
GAGACTAGATTGTTTCATGAAGTTTCTGATCATGTTTTTGTTATAATTACTAGTTTGTTG
AAACTTGCATGAATAGAATAGTTATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AP52JQ C 1
AF RR2AP52TF U 1
BS 1 746 RR2AP52TF

RD RR2AP52JQ 746 0 0
AGGGACCGAGAAGATTCACTAAGCGAGCGAGATAGAGCGAAGGAACTCGAACAATGGCGG
CGGTTCAACAGCAGCAAGCGATGCAGAAGAACACGTTGTACGTCGGAGGTCTAGCCGACG
AAGTAAACGAATCGATCCTCCACGCCGCGTTTATACCGTTCGGCGACATCAAGGACGTGA
AGACGCCGTTGGACCAAGCCAATCAGAAGCACAGATCCTTCGGATTCGTCACTTTCCTGG
AGAGAGAAGATGCTTCCGCCGCCATGGATAACATGGACGGCGCCGAGCTTTACGGCCGTG
TTCTCACCGTCAACTATGCTCTCCCCGAGAAGATCAAGGGTGGAGAACAGGGCTGGGCCG
CACATCCACTTTGGGCGGATGCAGACACGTGGTTTGAGCGGCAGCAACAAGAAGAGGAAA
TTATCAAGATGCAAGCCGAGAACAAGGCTGCTATGGAGGCTGCTGAGGAACTTCACAGGA
AGAAATTGGCGCAAGACCGACAAGGCGAGATGGAAGAAGATACGGAGGTTAAAGATGATC
CTATGGCCAGAGCTGAAGCCGATGCTCTAAGCAGCCATGACAACAACAACAACCCCCAGT
GAAAGTAAGCTTTTGCCGGTTTTGCGTCCGAGTTGTCTCATATCATCACCTATTGAGTGT
GAGACTAGATTGTTTCATGAAGTTTCTGATCATGTTTTTGTTATAATTACTAGTTTGTTG
AAACTTGCATGAATAGAATAGTTATT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2AP52TF 746 0 0
AGGGACCGAGAAGATTCACTAAGCGAGCGAGATAGAGCGAAGGAACTCGAACAATGGCGG
CGGTTCAACAGCAGCAAGCGATGCAGAAGAACACGTTGTACGTCGGAGGTCTAGCCGACG
AAGTAAACGAATCGATCCTCCACGCCGCGTTTATACCGTTCGGCGACATCAAGGACGTGA
AGACGCCGTTGGACCAAGCCAATCAGAAGCACAGATCCTTCGGATTCGTCACTTTCCTGG
AGAGAGAAGATGCTTCCGCCGCCATGGATAACATGGACGGCGCCGAGCTTTACGGCCGTG
TTCTCACCGTCAACTATGCTCTCCCCGAGAAGATCAAGGGTGGAGAACAGGGCTGGGCCG
CACATCCACTTTGGGCGGATGCAGACACGTGGTTTGAGCGGCAGCAACAAGAAGAGGAAA
TTATCAAGATGCAAGCCGAGAACAAGGCTGCTATGGAGGCTGCTGAGGAACTTCACAGGA
AGAAATTGGCGCAAGACCGACAAGGCGAGATGGAAGAAGATACGGAGGTTAAAGATGATC
CTATGGCCAGAGCTGAAGCCGATGCTCTAAGCAGCCATGACAACAACAACAACCCCCAGT
GAAAGTAAGCTTTTGCCGGTTTTGCGTCCGAGTTGTCTCATATCATCACCTATTGAGTGT
GAGACTAGATTGTTTCATGAAGTTTCTGATCATGTTTTTGTTATAATTACTAGTTTGTTG
AAACTTGCATGAATAGAATAGTTATT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL4945Contig1 993 2 4 U
GCTAATTCAAAGGTGAAAAGAAAAGAAAAGCTTATTAGAGTGATGGCAAGAAGGCAAGTA
GGTTCGACGAGGCGTGTAGGAGATAGTGGAAGCTTCCCTTTCGTAGGAGCTTTGCACTCA
AAGTCTCGTTCCTCTCCTCTCTTATCTATTTGTCTTGTTCTCCTTGGAGCATGCCTTCTC
ATTGGTTATGCTTTCAGTGGACCAGGTATGTTTAAGAGTATCAGAGAGGTCAGCAAGATC
ACAGGTGACTATTCTTGCACATCTGAAGTTCAAAGAGCCATCCCTCTTCTCAAGAACGCT
TACGGAGACAGCATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGACACATGTGCGGTGGTCTCT
ACTCTGTTGAAGGAAGATGAGACCGAAGCGTGGGGTGTTGAACCGTACGACGTGGAGGAT
GCAGACTCCAGCTGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCTTGGTACGTGTGGCTGACATCAAG
TTCCCGCTGCCTTACCGCGCAAAGTCGTTTTCTCTCGTCATCGTCTCGGATGCCCTGGAT
TACCTCTCGCCCAAGTATCTCAACAAGACCGTTCCTGAACTTGCACGTGTTGTTTCAGAT
GGTCTCCTTCTCTTTGCAGGTAATCCTGGTAAGCAAAAGGCCAAAGCTGCGGAACTATCC
AAGTTTGGAAGACCTGCTAAAATGCGAAGCTCGTCTTGGTGGAACCGTTTCTTCTCACAG
ACGAATCTAGAGGAAAACGAAGCAGCTAGCAAGAAGTTCGAAAAAGCAGCTACCAAGGTT
TCATACACACCAGCTTGTCAAATCTTCCACCTCAAGCCATTACATTAGAAACATTATTGT
TATTACTGGGTCTTGAAAAGCATCAGAAGACCAGATATGTCTCTTCCTCTTATGTTATAT
GCCTTCTTCCCCTCTTATAGAAAGAAACAGAAAGTTACACAGAGTTATAACCCAGTCTCA
ACAATTTGATTCATAATTTTACTATTTAATAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK78TF U 1
AF RR2CK78JQ C 312
BS 1 454 RR2CK78TF
BS 455 455 RR2CK78JQ
BS 456 574 RR2CK78TF
BS 575 993 RR2CK78JQ

RD RR2CK78TF 587 0 0
GCTAATTCAAAGGTGAAAAGAAAAGAAAAGCTTATTAGAGTGATGGCAAGAAGGCAAGTA
GGTTCGACGAGGCGTGTAGGAGATAGTGGAAGCTTCCCTTTCGTAGGAGCTTTGCACTCA
AAGTCTCGTTCCTCTCCTCTCTTATCTATTTGTCTTGTTCTCCTTGGAGCATGCCTTCTC
ATTGGTTATGCTTTCAGTGGACCAGGTATGTTTAAGAGTATCAGAGAGGTCAGCAAGATC
ACAGGTGACTATTCTTGCACATCTGAAGTTCAAAGAGCCATCCCTCTTCTCAAGAACGCT
TACGGAGACAGCATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGACACATGTGCGGTGGTCTCT
ACTCTGTTGAAGGAAGATGAGACCGAAGCGTGGGGTGTTGAACCGTACGACGTGGAGGAT
GCAGACTCCAGCTGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAG*CTTGGTACGTGTGGCTGACATCAAG
TTCCCGCTGCCTTACCGCGCAAAGTCGTTTTCTCTCGTCATCGTCTCGGATGCCCTGGAT
TACCTCTCGCCCAAGTATCTCAACAAGACCGTTC
TGACTTGCACGTG

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2CK78JQ 682 0 0
CATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGACACATGTGCGGTGGTCTCTACTCTGTTGAA
GGAAGATGAGACCGAAGCGTGGGGTGTTGAACCGTACGACGTGGAGGATGCAGACTCCAG
CTGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCTTGGTACGTGTGGCTGACATCAAGTTCCCGCTGCC
TTACCGCGCAAAGTCGTTTTCTCTCGTCATCGTCTCGGATGCCCTGGATTACCTCTCGCC
CAAGTATCTCAACAAGACCGTTCCTGAACTTGCACGTGTTGTTTCAGATGGTCTCCTTCT
CTTTGCAGGTAATCCTGGTAAGCAAAAGGCCAAAGCTGCGGAACTATCCAAGTTTGGAAG
ACCTGCTAAAATGCGAAGCTCGTCTTGGTGGAACCGTTTCTTCTCACAGACGAATCTAGA
GGAAAACGAAGCAGCTAGCAAGAAGTTCGAAAAAGCAGCTACCAAGGTTTCATACACACC
AGCTTGTCAAATCTTCCACCTCAAGCCATTACATTAGAAACATTATTGTTATTACTGGGT
CTTGAAAAGCATCAGAAGACCAGATATGTCTCTTCCTCTTATGTTATATGCCTTCTTCCC
CTCTTATAGAAAGAAACAGAAAGTTACACAGAGTTATAACCCAGTCTCAACAATTTGATT
CATAATTTTACTATTTAATAAG

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL4946Contig1 1287 2 2 U
GGATATAAAATTTCTGAATTCGAAATTATTGAATTGAATTTTCTGCAAACACACATCCTT
CTTAGAAGCGTAGATCAAAAGGTTGTTGTTGTTGTTAACCAGATCTCGGATTCGAATTGC
TCTGTGACGAGTCTGCTCACCGATTTGTTTCTTCGTCGCCTTCTCTTCTTCACCCAGGCG
AAGATGAACGGCGGTCCCTCCGGTTTCCATAGTACTCCGGTAACGAAAGCCTTCGTCATA
ACGAGCGCTCTTTTCACCGTCTTCTTCGGGATCCAGGGCCGTTCCTCCAAGCTCGGTTTG
TCTTACCAGGATGTTTTTGAGAAGTTTCGAATATGGAAGCTAATCATGTCGACTTTCGCC
TTCTCCTCCACACCAGAATTGATGTTCGGATTGTATTTGCTCTACTACTTTCGAGTTTTT
GAGAGACAGATTGGCTCAAATAAGTACTCGGTGTTTATCTTGTTCTCAGGGACTTTATCG
CTACTACTAGAGATCGTTTTGTTATCACTGCTTAAAGATACCACAGCAAATTTACTTACC
TCTGGACCATACGGCTTGATATTTGCTTCGTTTATACCCTTCTACTTGGACATCCCAGTT
TCAACAAGGTTTCGTGTATTCGGTGTCAACTTCTCCGATAAGTCATTCATATATCTTGCA
GGAGTTCAGCTTCTACTATCCTCTTGGAAAAGATCCATCTTTCCTGGAGTTTGCGGCATA
ATTGCTGGTTCCCTGTATCGTTTGAACATCCTCGGCATCCGAAAGGCCAAGTTCCCCGAG
ATTGTTGCTTCGTTCTTTTCAAGGCTTTCTTTACCGTCCTTCAGTAGCGCTTCTCTTCCA
GCACCAAGCAGAAACATCGTTGGGACTACATCACCCAATACAGTTCGCCGAGTAGAGAGA
TCTCAGCCAGCTCCAATGGCGTCAAGTGTGGAGCCATCCGAAGAAGCCATAGCTACATTG
GTATCAATGGGTTTCGATAGAAACGCTGCGAGACAGGCACTCGTGCACGCCAGAAATGAT
GTCAACGCCGCCACAAACATCCTTCTCGAAGCACAGTCTCACTAATTCAATCTGTATCAG
AAAACAGGGGAGTTCCTTTGTTGCTGTTGATCAACCTCGGAGCCAAAATGTCTCACTGTA
TATGATCACACTAAAGACCTTACCAACTTTCTCTCATTCCATTTCTAGTGTAGGATGAGT
TGCATAGGTTTATGTAGCACAGATTTGCGGGTTAAGAGAAACACTGAGAAATTACCTATT
TGAAACTTCGAAAACATTACAAATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG60TF U 1
AF RR2AG60JQ C 498
BS 1 759 RR2AG60TF
BS 760 1287 RR2AG60JQ

RD RR2AG60TF 759 0 0
GGATATAAAATTTCTGAATTCGAAATTATTGAATTGAATTTTCTGCAAACACACATCCTT
CTTAGAAGCGTAGATCAAAAGGTTGTTGTTGTTGTTAACCAGATCTCGGATTCGAATTGC
TCTGTGACGAGTCTGCTCACCGATTTGTTTCTTCGTCGCCTTCTCTTCTTCACCCAGGCG
AAGATGAACGGCGGTCCCTCCGGTTTCCATAGTACTCCGGTAACGAAAGCCTTCGTCATA
ACGAGCGCTCTTTTCACCGTCTTCTTCGGGATCCAGGGCCGTTCCTCCAAGCTCGGTTTG
TCTTACCAGGATGTTTTTGAGAAGTTTCGAATATGGAAGCTAATCATGTCGACTTTCGCC
TTCTCCTCCACACCAGAATTGATGTTCGGATTGTATTTGCTCTACTACTTTCGAGTTTTT
GAGAGACAGATTGGCTCAAATAAGTACTCGGTGTTTATCTTGTTCTCAGGGACTTTATCG
CTACTACTAGAGATCGTTTTGTTATCACTGCTTAAAGATACCACAGCAAATTTACTTACC
TCTGGACCATACGGCTTGATATTTGCTTCGTTTATACCCTTCTACTTGGACATCCCAGTT
TCAACAAGGTTTCGTGTATTCGGTGTCAACTTCTCCGATAAGTCATTCATATATCTTGCA
GGAGTTCAGCTTCTACTATCCTCTTGGAAAAGATCCATCTTTCCTGGAGTTTGCGGCATA
ATTGCTGGTTCCCTGTATCGTTTGAACATCCTCGGCATC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2AG60JQ 790 0 0
TTTGTTATCACTGCTTAAAGATACCACAGCAAATTTACTTACCTCTGGACCATACGGCTT
GATATTTGCTTCGTTTATACCCTTCTACTTGGACATCCCAGTTTCAACAAGGTTTCGTGT
ATTCGGTGTCAACTTCTCCGATAAGTCATTCATATATCTTGCAGGAGTTCAGCTTCTACT
ATCCTCTTGGAAAAGATCCATCTTTCCTGGAGTTTGCGGCATAATTGCTGGTTCCCTGTA
TCGTTTGAACATCCTCGGCATCCGAAAGGCCAAGTTCCCCGAGATTGTTGCTTCGTTCTT
TTCAAGGCTTTCTTTACCGTCCTTCAGTAGCGCTTCTCTTCCAGCACCAAGCAGAAACAT
CGTTGGGACTACATCACCCAATACAGTTCGCCGAGTAGAGAGATCTCAGCCAGCTCCAAT
GGCGTCAAGTGTGGAGCCATCCGAAGAAGCCATAGCTACATTGGTATCAATGGGTTTCGA
TAGAAACGCTGCGAGACAGGCACTCGTGCACGCCAGAAATGATGTCAACGCCGCCACAAA
CATCCTTCTCGAAGCACAGTCTCACTAATTCAATCTGTATCAGAAAACAGGGGAGTTCCT
TTGTTGCTGTTGATCAACCTCGGAGCCAAAATGTCTCACTGTATATGATCACACTAAAGA
CCTTACCAACTTTCTCTCATTCCATTTCTAGTGTAGGATGAGTTGCATAGGTTTATGTAG
CACAGATTTGCGGGTTAAGAGAAACACTGAGAAATTACCTATTTGAAACTTCGAAAACAT
TACAAATCTC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL4947Contig1 617 2 1 U
GGATTTTGTGATCAAACAAATAATATCAATCAAAAGATGGAAGGCAAAGCTATGATCTTA
AATGTGTTAATAATAAGTCTTTTGATGACGCATATTCAAGTAGAAGCAGAACGGGTCTGT
TGTCCTAACAAATTAGATAGAAAAAAGTTTGATTTATGCCGTGCTACAGGTTTTGGCATG
AGCACTTGTGCAAGACTCAGTGAATGCAAAATCTTTCCTGGCGATACATGCCCGTCAGAC
TTTCCAGCAAATCGTCTCGAAACCTCTGCTGATGCTGTCGATGAGTTCTGCAAGTTGGGG
TGTATATCCTCTGTGTGTGGTCCCTTGACCACTTTCCTGAACTCCGGTGCAAGTGAATTT
GGAGATGGAGCGGTTGATCACTGTGTCAAAGCTTGTTCTACTTTCTGCACTAATGGTCCT
ACCAAGATTGCAGCTGAAACCGCCTAAACAAGCATATCGTGGAAGATAATACAAAATCTA
AGTTTCAGAGTGTTTTACTTTTGTTCAAACAGCAGTGTGCTAGTATTTAAATAAGCTGTT
TCTTGTTCGTGTATGTATCGTAGAAGGTTATCGATCGTACCTTCTACTTCCTATCAATAA
ATAAATATTATGTTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY32TF U 1
AF RR2D971TF U 345
BS 1 617 RR2BY32TF

RD RR2BY32TF 617 0 0
GGATTTTGTGATCAAACAAATAATATCAATCAAAAGATGGAAGGCAAAGCTATGATCTTA
AATGTGTTAATAATAAGTCTTTTGATGACGCATATTCAAGTAGAAGCAGAACGGGTCTGT
TGTCCTAACAAATTAGATAGAAAAAAGTTTGATTTATGCCGTGCTACAGGTTTTGGCATG
AGCACTTGTGCAAGACTCAGTGAATGCAAAATCTTTCCTGGCGATACATGCCCGTCAGAC
TTTCCAGCAAATCGTCTCGAAACCTCTGCTGATGCTGTCGATGAGTTCTGCAAGTTGGGG
TGTATATCCTCTGTGTGTGGTCCCTTGACCACTTTCCTGAACTCCGGTGCAAGTGAATTT
GGAGATGGAGCGGTTGATCACTGTGTCAAAGCTTGTTCTACTTTCTGCACTAATGGTCCT
ACCAAGATTGCAGCTGAAACCGCCTAAACAAGCATATCGTGGAAGATAATACAAAATCTA
AGTTTCAGAGTGTTTTACTTTTGTTCAAACAGCAGTGTGCTAGTATTTAAATAAGCTGTT
TCTTGTTCGTGTATGTATCGTAGAAGGTTATCGATCGTACCTTCTACTTCCTATCAATAA
ATAAATATTATGTTTTA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2D971TF 263 0 0
G
GGTGCAAGTGAATTTGGAGATGGAGCGGTTGATCACTGTGTCAAAGCTTGTTCTACTTTC
TGCACTAATGGTCCTACCAAGATTGCAGCTGAAACCGCCTAAACAAGCATATCGTGGAAG
ATAATACAAAATCTAAGTTTCAGAGTGTTTTACTTTTGTTCAAACAGCAGTGTGCTAGTA
TTTAAATAAGCTGTTTCTTGTTCGTGTATGTATCGTAGAAGGTTATCGATCGTACCTTCT
ACTTCCTATCAATAAATAAATA

QA 2 263 2 263
DS 



AS 1 2

CO CL4948Contig1 1416 2 6 U
AAACAACGAAACACAGTAAATATTAACAAGTACCAATGCCTGGACATACTGGTGTTTATA
TATACAGAGCAAAGTCATTGTGTATCAAACAAAAGAGATTTTGAGTTTCTGAAGGAGAAA
AAGAAGACTAAAACAAATAAAACCAAACCGAAGTACATCATTCGTAGTTTTGACTAGTTT
GAGGCAGTTTCAGGATTCAAGAGAACAGTTTTCCAGCTTTGGAAATGAGACACCTAGTTG
CATTCCGACAGTAACTAAAGTCTCCAAGGACCTAGCGCTGTTAGCTAAAAGATCCTCGTC
GATCTTAATCGAGTCCTTTTCAAAGACGCAGATAACTGTGCTTCCACCAAATGAGAAGTA
ACCAAGCTCGTCTCCTTTCTTTATATGGTCTCCCTCTTTTCTAACAAAGGTGATGCTACC
AACCATTGTGGCTCCAATCGCAACAAATGCGACCTTTCCAAACTCTGCTGTTGATATCAT
TACGACGGTCCGTTTATTCTCAGTGAACACATTACAGTACTTGCTATTGACTGCAATCGG
ATTAACTGTATATAAGCTTCCAGGAACGTCGACAAACTTTTCAATGACGAAAGAAACAGG
AGAATGAAAACGATGATAGTCCTGCGGAGCTAATCGGAATATCACCAAAGATCCATCAAG
GAAAGCATCTGAATCTACATCCTTCCCAAGGAGGCCTTTAATTGAGAACTTACGACCCTT
GATCCAGAACCGCGTGCTATCATCCACCGACTGAAACGCCATTAATCGACAATCAGCAGC
TGATACAGCAACATCATCCCGATCAATGCACGCAATTGGTCTTGCACCAGGCTTTAACTC
CCGTATGAAGAATTCATTGAACGTCTTAAAATGGTCTAGAGGATACTTGACTTCAGACAT
GTTTATTTGATCCTTGAAAAACTCGAGAAAGCTGGGTATATTTTGGGCAGATTCAGCTGT
GTTCATTTTCATCCCCTGCTTCTCAGGTTCTGCAAAATCTCTTTTGCTCCTTGATCCATA
AGCCCGAGTCCAATTTTTGACTGGTAAATAGCTCTCATCGACATAACAATCTTTGAATCA
ATCAACTCTTCGACGAGCCTCTTAGTCTTCCGATCAATCACCACAATATGAGAAGCACTT
GAACCAGTATTCAAACCAACATCATAAGTTGATAGATGAGTCCATTCACTTAGTTTGAAC
ATCCACCCATATGAAGCCTGCCTATCAGTCAAGAACCCTCCGGTCATTTGATTACCAGTT
CCTTCGTCAAAACAAAGAGTCATATGGATCATTGCGTTGAACTTGTCAGACAGTTGAAGA
GCCTCCCCACAGACCGGACAACTATTTATAATTGGCTCTTGTTCTTGTTGGACGGCAAGA
AGTGCAGCCAACTCATCAATCGTAACAACACCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP45JQ U 1
AF RR2FI55TF C 711
BS 1 714 RR2GP45JQ
BS 715 715 RR2FI55TF
BS 716 767 RR2GP45JQ
BS 768 768 RR2FI55TF
BS 769 806 RR2GP45JQ
BS 807 1416 RR2FI55TF

RD RR2GP45JQ 810 0 0
AAACAACGAAACACAGTAAATATTAACAAGTACCAATGCCTGGACATACTGGTGTTTATA
TATACAGAGCAAAGTCATTGTGTATCAAACAAAAGAGATTTTGAGTTTCTGAAGGAGAAA
AAGAAGACTAAAACAAATAAAACCAAACCGAAGTACATCATTCGTAGTTTTGACTAGTTT
GAGGCAGTTTCAGGATTCAAGAGAACAGTTTTCCAGCTTTGGAAATGAGACACCTAGTTG
CATTCCGACAGTAACTAAAGTCTCCAAGGACCTAGCGCTGTTAGCTAAAAGATCCTCGTC
GATCTTAATCGAGTCCTTTTCAAAGACGCAGATAACTGTGCTTCCACCAAATGAGAAGTA
ACCAAGCTCGTCTCCTTTCTTTATATGGTCTCCCTCTTTTCTAACAAAGGTGATGCTACC
AACCATTGTGGCTCCAATCGCAACAAATGCGACCTTTCCAAACTCTGCTGTTGATATCAT
TACGACGGTCCGTTTATTCTCAGTGAACACATTACAGTACTTGCTATTGACTGCAATCGG
ATTAACTGTATATAAGCTTCCAGGAACGTCGACAAACTTTTCAATGACGAAAGAAACAGG
AGAATGAAAACGATGATAGTCCTGCGGAGCTAATCGGAATATCACCAAAGATCCATCAAG
GAAAGCATCTGAATCTACATCCTTCCCAAGGAGGCCTTTAATTGAGAACTTACGGCCCTT
GATCCAGAACCGCGTGCTATCATCCACCGACTGAAACGCCATTAATCTACAATCAGCAGC
TGATACAGCAACATCATCCCGATCAA
CGCA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2FI55TF 706 0 0
TACGACCCTTGATCCAGAACCGCGTGCTATCATCCACCGATTGAAACGCCATTAATCGAC
AATCAGCAGCTGATACAGCAACATCATCCCGATCAATGCACGCAATTGGTCTTGCACCAG
GCTTTAACTCCCGTATGAAGAATTCATTGAACGTCTTAAAATGGTCTAGAGGATACTTGA
CTTCAGACATGTTTATTTGATCCTTGAAAAACTCGAGAAAGCTGGGTATATTTTGGGCAG
ATTCAGCTGTGTTCATTTTCATCCCCTGCTTCTCAGGTTCTGCAAAATCTCTTTTGCTCC
TTGATCCATAAGCCCGAGTCCAATTTTTGACTGGTAAATAGCTCTCATCGACATAACAAT
CTTTGAATCAATCAACTCTTCGACGAGCCTCTTAGTCTTCCGATCAATCACCACAATATG
AGAAGCACTTGAACCAGTATTCAAACCAACATCATAAGTTGATAGATGAGTCCATTCACT
TAGTTTGAACATCCACCCATATGAAGCCTGCCTATCAGTCAAGAACCCTCCGGTCATTTG
ATTACCAGTTCCTTCGTCAAAACAAAGAGTCATATGGATCATTGCGTTGAACTTGTCAGA
CAGTTGAAGAGCCTCCCCACAGACCGGACAACTATTTATAATTGGCTCTTGTTCTTGTTG
GACGGCAAGAAGTGCAGCCAACTCATCAATCGTAACAACACCATCC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL4949Contig1 1005 2 6 U
GGATTACATCCCAAACCAACACCATTAAAACCTTCGAGCAGCACCAGCAACAACAACAAC
ACCACAAACCAAGCATGCGCCGCTTGCAAATACCAACGTAGAAAATGCGCTCCTGATTGT
CTTCTCGCTCCTTACTTCCCTCACGACCGTCACCGACAATTCCTCAACGCGCATAAGCTC
TTTGGTGTAAGCAACATCACCAAGATCATCAAAGACCTTAGCCCTCCTGATAAAGACGCC
GCTATGTATACAATCATGTTTCAATCCGATGCACGTGCTAATGATCCCATTGAAGGATGC
TATAGCATCATTAGAAAGCTTCAGTACCAGATCGAATACTCAAAAAACGAGTTGGAGATG
GTTGTTCAGCAATTGGCTGTGTTCCGTAATCATCATCAAGGACCGCATATTCAGATTCAA
GAACCTGAGGATCTCTCGAGTTTTTCGAGTTCTTGTGATCTAAACAACAACAGCAACTCG
ATGCCTTACAACTACCCTCTTCATCATGTCCAAGAACCAATTCAACAGCAACAAGAACAA
CAACAATATTGTTCCTCTGGAAACTTTAATGGGTTACAAGAAGACATGTGGTGTCTTCAA
CTTCAAGATTCATCAACGACGGTGAATATGAAAGTTGGCTTCATTGATGAATGTGAGGAC
GTTAAGCCTGTGGAAGAGGTTTCTAGTGAAACACACGAGTTCGAGCATCATCATGATGGT
TTGGTTGAAGAACCATACATCATTTCTTTTTAGCTTTTCCTTTTTCTTTTGGTCTGTTGG
ACTTTTATTATTTTCTTGATTTTAGAATCATTTTTCTAGGGCTAACAAAATCTCCTTTTT
CGCTGATCGATCTCAATAGTTATTTTTTAACTAAATTTATTTTCTTTTGGATTTTTTTTT
TTGTATTTCATTTGGTAAAATTTGTATTAGATGTGAAAGAAACATGGAATCTTCAAGATA
AATGTTAAACAAGAATTTGATGGAATAAAACACATTTTAATGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO71TF U 1
AF RR2CO71JQ C 441
BS 1 650 RR2CO71TF
BS 651 651 RR2CO71JQ
BS 652 674 RR2CO71TF
BS 675 675 RR2CO71JQ
BS 676 712 RR2CO71TF
BS 713 1005 RR2CO71JQ

RD RR2CO71TF 712 0 0
GGATTACATCCCAAACCAACACCATTAAAACCTTCGAGCAGCACCAGCAACAACAACAAC
ACCACAAACCAAGCATGCGCCGCTTGCAAATACCAACGTAGAAAATGCGCTCCTGATTGT
CTTCTCGCTCCTTACTTCCCTCACGACCGTCACCGACAATTCCTCAACGCGCATAAGCTC
TTTGGTGTAAGCAACATCACCAAGATCATCAAAGACCTTAGCCCTCCTGATAAAGACGCC
GCTATGTATACAATCATGTTTCAATCCGATGCACGTGCTAATGATCCCATTGAAGGATGC
TATAGCATCATTAGAAAGCTTCAGTACCAGATCGAATACTCAAAAAACGAGTTGGAGATG
GTTGTTCAGCAATTGGCTGTGTTCCGTAATCATCATCAAGGACCGCATATTCAGATTCAA
GAACCTGAGGATCTCTCGAGTTTTTCGAGTTCTTGTGATCTAAACAACAACAGCAACTCG
ATGCCTTACAACTACCCTCTTCATCATGTCCAAGAACCAATTCAACAGCAACAAGAACAA
CAACAATATTGTTCCTCTGGAAACTTTAATGGGTTACAAGAAGACATGTGGTGTCTTCAA
CTTCAAGATTCATCAACGACGGTGAATATGAAAGTTGGCTTCATTGATGA*TGTGAGGAC
GTTAAGCCTGTGGA*GAGGTTTCTAGTGAAACACACGAGTTCGAGCATCATC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2CO71JQ 565 0 0
TTTTTCGAGTTCTTGTGATCTAAACAACAACAGCAACTCGATGCCTTACAACTACCCTCT
TCATCATGTCCAAGAACCAATTCAACAGCAACAAGAACAACAACAATATTGTTCCTCTGG
AAACTTTAATGGGTTACAAGAAGACATGTGGTGTCTTCAACTTCAAGATTCATCAACGAC
GGTGAATATGAAAGTTGGCTTCATTGATGAATGTGAGGACGTTAAGCCTGTGGAAGAGGT
TTCTAGTGAAACACACGAGTTCGAGCATCATCATGATGGTTTGGTTGAAGAACCATACAT
CATTTCTTTTTAGCTTTTCCTTTTTCTTTTGGTCTGTTGGACTTTTATTATTTTCTTGAT
TTTAGAATCATTTTTCTAGGGCTAACAAAATCTCCTTTTTCGCTGATCGATCTCAATAGT
TATTTTTTAACTAAATTTATTTTCTTTTGGATTTTTTTTTTTGTATTTCATTTGGTAAAA
TTTGTATTAGATGTGAAAGAAACATGGAATCTTCAAGATAAATGTTAAACAAGAATTTGA
TGGAATAAAACACATTTTAATGACC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL4950Contig1 265 2 1 U
GTCTAAAAGACGTCATAAGCATTGCAAAAGTATCTTCTTGTTTACATATGGTCCATGATA
TGGATGAGTTTTTTTCCTCCTGGAGTACATGAACGACATTGTAAAGTCATACATCAATAC
AAATTGCATTTTTCTATGTAAATTATGTCCGAATAATACGAAAAAAACTGGGGGTCAATC
CCAGTTACAGTTTTCGAACCACAATCATATTTATGAAGTTTAGTTCCGGGAACTGCTGGC
ATTGAGGTTCTGAAAGAGCTCAGGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GW25JQ U 1
AF RR2HA75JQ U 1
BS 1 265 RR2GW25JQ

RD RR2GW25JQ 265 0 0
GTCTAAAAGACGTCATAAGCATTGCAAAAGTATCTTCTTGTTTACATATGGTCCATGATA
TGGATGAGTTTTTTTCCTCCTGGAGTACATGAACGACATTGTAAAGTCATACATCAATAC
AAATTGCATTTTTCTATGTAAATTATGTCCGAATAATACGAAAAAAACTGGGGGTCAATC
CCAGTTACAGTTTTCGAACCACAATCATATTTATGAAGTTTAGTTCCGGGAACTGCTGGC
ATTGAGGTTCTGAAAGAGCTCAGGA

QA 1 265 1 265
DS 

RD RR2HA75JQ 265 0 0
GTCTAAAAGACGTCATAAGCATTGCAAAAGTATCTTCTTGTTTACATATGGTCCATGATA
TGGATGAGTTTTTTTCCTCCTGGAGTACATGAACGACATTGTAAAGTCATACATCAATAC
AAATTGCATTTTTCTATGTAAATTATGTCCGAATAATACGAAAAAAACTGGGGGTCAATC
CCAGTTACAGTTTTCGAACCACAATCATATTTATGAAGTTTAGTTCCGGGAACTGCTGGC
ATTGAGGTTCTGAAAGAGCTCAGGA

QA 1 265 1 265
DS 



AS 1 2

CO CL4951Contig1 1201 2 2 U
GGGAGAGTCAATAATATTTCTTCCAATTCTATAATCTCATCATTCTATCATGGTATCAGA
GCCAAGATCCAAAACCTTTGTGGATCTCTATTTTTTTCTTACTTTCTACTAAAATAAAGA
AGAAGTAGAAGTCACGTGTGAAGTGCTCTTCGCGAGTTTATTAATTGCTTCTCTATAGTC
ACTTCTATGTGAAAGAGCAATTCATCATCAAATTCTACATGGGGTGGTGAGTCGTTACAT
TACCTTACTACTCAAGCAATTGAGCTTTATAAAACTGTTGCTTCTTCATTCATACCAAAG
CAGCCTTTTGTTTCCATTCATGGCAATAAGATCGCTGCTTAAGCACTACTTTACTACTCA
AGCCATCGGCAGCTGCACAAGCCGTCGTAGCTTCCGCAACATGAACAATCGTCATTGTTT
CACAAACTAGTGTTGCATTTTCTTCGAGTTACTACTTCTACTGCTGCGCTCCATCAACTC
GCCACCACTACTACTTCTACTACAGCCGTTTCATCAAGCAGCGTTCAAGTTCTACTTCTA
CACAAGCAAACGAGCTTCATCAAGCCGTCGGCATCTTTAAAAACCCGCCTTTGTTTCATT
CACGACAACAAGGCCGTCACTTTCGCACTATTTTACAACTACAAATAGTTGTTGCTTACT
ACCACCAAACAAATCGCTGCAAATTCAACGCATCAGACTGTTTGTGGTGCACATGTTTCT
GCATGGTTTCTTACGTAGCCTTCCATCATAATTAAGAAGCATGAACTCATGATGGTATAA
AGGTATACGTACTTCAACTACTACTACTACTCAAGCTAAGTATTTGGTGACCCCAAAACA
AGCGATTTTCTACCTCTACATTAACTACTCTTAAGAAGAGTTGGATGTTACAGATCCAGA
GCCGTTGATTCTCCCATCAATTACTTCTACGACCATATTTTGAAGATTTATCCAATCTCA
CACGTGTTACCAACCACGTATGAGCTTGCGGGAGGGTATTGGAAGATCTAGAAGATCGAC
CCAAATCTAAGATAAAGATATATGTCAATATATTAGAATAGGAAACTTGTCATTATCTAT
AATGTAATATTCCATTAGTTTAGTAATTAGGTTTAGTAATTAGGTTAGTAATCTCTATAT
AAACTTATGTATATCGTAATCTATTCTGGATGAGAGTCAATAATATTTCTTCCAATTCTA
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BB60TF U 1
AF RR2BB60JQ C 503
BS 1 764 RR2BB60TF
BS 765 1201 RR2BB60JQ

RD RR2BB60TF 764 0 0
GGGAGAGTCAATAATATTTCTTCCAATTCTATAATCTCATCATTCTATCATGGTATCAGA
GCCAAGATCCAAAACCTTTGTGGATCTCTATTTTTTTCTTACTTTCTACTAAAATAAAGA
AGAAGTAGAAGTCACGTGTGAAGTGCTCTTCGCGAGTTTATTAATTGCTTCTCTATAGTC
ACTTCTATGTGAAAGAGCAATTCATCATCAAATTCTACATGGGGTGGTGAGTCGTTACAT
TACCTTACTACTCAAGCAATTGAGCTTTATAAAACTGTTGCTTCTTCATTCATACCAAAG
CAGCCTTTTGTTTCCATTCATGGCAATAAGATCGCTGCTTAAGCACTACTTTACTACTCA
AGCCATCGGCAGCTGCACAAGCCGTCGTAGCTTCCGCAACATGAACAATCGTCATTGTTT
CACAAACTAGTGTTGCATTTTCTTCGAGTTACTACTTCTACTGCTGCGCTCCATCAACTC
GCCACCACTACTACTTCTACTACAGCCGTTTCATCAAGCAGCGTTCAAGTTCTACTTCTA
CACAAGCAAACGAGCTTCATCAAGCCGTCGGCATCTTTAAAAACCCGCCTTTGTTTCATT
CACGACAACAAGGCCGTCACTTTCGCACTATTTTACAACTACAAATAGTTGTTGCTTACT
ACCACCAAACAAATCGCTGCAAATTCAACGCATCAGACTGTTTGTGGTGCACATGTTTCT
GCATGGTTTCTTACGTAGCCTTCCATCATAATTAAGAAGCATGA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2BB60JQ 699 0 0
CAGCCGTTTCATCAAGCAGCGTTCAAGTTCTACTTCTACACAAGCAAACGAGCTTCATCA
AGCCGTCGGCATCTTTAAAAACCCGCCTTTGTTTCATTCACGACAACAAGGCCGTCACTT
TCGCACTATTTTACAACTACAAATAGTTGTTGCTTACTACCACCAAACAAATCGCTGCAA
ATTCAACGCATCAGACTGTTTGTGGTGCACATGTTTCTGCATGGTTTCTTACGTAGCCTT
CCATCATAATTAAGAAGCATGAACTCATGATGGTATAAAGGTATACGTACTTCAACTACT
ACTACTACTCAAGCTAAGTATTTGGTGACCCCAAAACAAGCGATTTTCTACCTCTACATT
AACTACTCTTAAGAAGAGTTGGATGTTACAGATCCAGAGCCGTTGATTCTCCCATCAATT
ACTTCTACGACCATATTTTGAAGATTTATCCAATCTCACACGTGTTACCAACCACGTATG
AGCTTGCGGGAGGGTATTGGAAGATCTAGAAGATCGACCCAAATCTAAGATAAAGATATA
TGTCAATATATTAGAATAGGAAACTTGTCATTATCTATAATGTAATATTCCATTAGTTTA
GTAATTAGGTTTAGTAATTAGGTTAGTAATCTCTATATAAACTTATGTATATCGTAATCT
ATTCTGGATGAGAGTCAATAATATTTCTTCCAATTCTAT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL4952Contig1 259 2 7 U
TTTTTCTCATCACAAATTTTATGATCTGGAACAAGACTTCTTGAAGAGATTGCTCAAGCA
GTGTCCTACGTGAACTTCTCTCCCTCAGACTCCTCTCCAGGGTCTGTAACTAGTTTAGAG
TGGTGAGACTTTCCGGTTGGGGATTTAGTGGGCTGCTGAAGGACATTGAGATTGATATAC
CATTGTTCCCAGTATAGCCGTTCAATTTTATTAGTGAACCAAGAGGGCTGTTTGGTTTTG
ACTTCATAAAACGATAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2BK42TF C 1
AF RR2BK42JQ U 54
BS 1 53 RR2BK42TF
BS 54 83 RR2BK42JQ
BS 84 84 RR2BK42TF
BS 85 213 RR2BK42JQ
BS 214 214 RR2BK42TF
BS 215 256 RR2BK42JQ
BS 257 259 RR2BK42TF

RD RR2BK42TF 259 0 0
TTTTTCTCATCACAAATTTTATGATCTGGAACAAGACTTCTTGAAGAGATTGCTCAAGCA
GTGTCCTACGTGAACTTCTCTCCCTCAGACTCCTCTCCAGGGTCTGTAACTAGTTTAGAG
TGGTGAGACTTTCCGGTTGGGGATTTAGTGGGCTGCTGAAGGACATTGAGATTGATATAC
CATTGTTCCCAGTATAGCCGTTCAATTTTATTAGTGAACCAAGAGGGCTGTTTGGTTTTG
ACTTCATAAAACGATAGAG

QA 1 259 1 259
DS 

RD RR2BK42JQ 203 0 0
TCAAGCAGTGTCCTACGTGAACTTCTCTCC*TCAGACTCCTCTCCAGGGTCTGTAACTAG
TTTAGAGTGGTGAGACTTTCCGGTTGGGGATTTAGTGGGCTGCTGAAGGACATTGAGATT
GATATACCATTGTTCCCAGTATAGCCGTTCAATTTTATTA*TGAACCAAGAGGGCTGTTT
GGTTTTGACTTCATAAAACGATA

QA 1 203 1 203
DS 



AS 1 2

CO CL4953Contig1 794 2 5 U
GGGGTCGTTACTCATTACAGATACACCGTCTCAGAAACTGGATCAGACAAGAAGTGACGT
CTGACGGAGAAAACCAAACAGAAGAGAAAACAATGACTAGAACTATTCTCCTCAGAGCTC
TGACGAAGAAGAAGCTCGTCCCCTCCAATTCTCATCGATCCATCTCCATCACCAACATCT
CCAGATGCATTAGCACTCTGATTCTAGCGGAACATGAGAGCGGTTCCATCAAACCTCAGA
CAGTGAGTACAGTAGTTGCAGCGAACCAATTGGGTGAGAGCTCTTCAGTTTCTTTGCTAG
TAGCTGGTACTGGCTCTTCTCTTCAAGAAGCTGCTTCTCAAGCTGCCTCTTGTCATCCTT
CTGTCGCCGAGGTACTTGTTGCTGATTCAGATAGATTTGAGTACCCTTTAGCTGAACCTT
GGGCAAAATTAGTTGACTTTGTTCGGCAACAAAGAGGAGATTACTCTCACATCCTTGCTT
CCTCTAGCTCATTTGGCAAGAACATACTACCCCGAGTTGCGGCTCTTTTGGATGTCTCTC
CTGTTACTGATGTTGTCAAAATCTTAGGACCCAACGAGTTTATCACGCCTATATATGCGG
GAAACGCCTTGTGTAGAGTTCGTTATACTGGTACTGGTCCTTGTGTTTTGACTATTAGAA
CTACATCTTTTCCTGTTACCCCAGTGAGTCAAAGAAAGCTACTATCTCTCAGATTGATCT
CTCAATTTCAAGAAGATTTGTGAGTAGATCCAGATACGTGGGGCAATCAACTCAGATACA
GAACGGCTGATCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH90TF U 282
AF RR2GB23TF U 1
BS 1 299 RR2GB23TF
BS 300 300 RR2DH90TF
BS 301 365 RR2GB23TF
BS 366 366 RR2DH90TF
BS 367 794 RR2GB23TF

RD RR2DH90TF 282 0 0
TCTTCAGTTTCTTTGCTAGTAGCTGGTTCTGGCTCTTCTCTTCAAGAAGCTGCTTCTCAA
GCTGCCTCTTGTGATCCTTCTGTCGCCGAGGTACTTGTTGCTGATTCAGATAGATTTGAG
TACCCTTTAGCTGAACCTTGGGCAAAATTAGTTGACTTTGTTCGGCAACAAAGAGGAGAT
TACTCTCACATCCTTGCTTCCTCTAGCTCATTTGGCAAGAACATACTACCCCGAGTTGCG
GCTCTTTTGGATGTCTCTCCTGTTACTGATGTTGTCAAAATC

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR2GB23TF 794 0 0
GGGGTCGTTACTCATTACAGATACACCGTCTCAGAAACTGGATCAGACAAGAAGTGACGT
CTGACGGAGAAAACCAAACAGAAGAGAAAACAATGACTAGAACTATTCTCCTCAGAGCTC
TGACGAAGAAGAAGCTCGTCCCCTCCAATTCTCATCGATCCATCTCCATCACCAACATCT
CCAGATGCATTAGCACTCTGATTCTAGCGGAACATGAGAGCGGTTCCATCAAACCTCAGA
CAGTGAGTACAGTAGTTGCAGCGAACCAATTGGGTGAGAGCTCTTCAGTTTCTTTGCTAT
TAGCTGGTACTGGCTCTTCTCTTCAAGAAGCTGCTTCTCAAGCTGCCTCTTGTCATCCTT
CTGTCTCCGAGGTACTTGTTGCTGATTCAGATAGATTTGAGTACCCTTTAGCTGAACCTT
GGGCAAAATTAGTTGACTTTGTTCGGCAACAAAGAGGAGATTACTCTCACATCCTTGCTT
CCTCTAGCTCATTTGGCAAGAACATACTACCCCGAGTTGCGGCTCTTTTGGATGTCTCTC
CTGTTACTGATGTTGTCAAAATCTTAGGACCCAACGAGTTTATCACGCCTATATATGCGG
GAAACGCCTTGTGTAGAGTTCGTTATACTGGTACTGGTCCTTGTGTTTTGACTATTAGAA
CTACATCTTTTCCTGTTACCCCAGTGAGTCAAAGAAAGCTACTATCTCTCAGATTGATCT
CTCAATTTCAAGAAGATTTGTGAGTAGATCCAGATACGTGGGGCAATCAACTCAGATACA
GAACGGCTGATCTG

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL4954Contig1 854 2 6 U
GATCCTTGCTAGGAATACGATAACGAACCAAGTCAACGGATTCTTAGTCCAGAAAGATGC
GCCTGGCCTAACGGTTACTAAGATCCCGAATAAAATAGGTTTACGTATTGTTCAGAATGG
AGACATTCTACTACAGAATGTCTTTGTTCCGGATGAGGAGCGCTTACCTGGGGTAAATTC
ATTTCAGGACACAAGCAAGGTCCTGGCTGTCTCACGTGTAATGGTGGCCTGGCAACCAAT
TGGTATATCAATGGGAGTCTACGATATGTGTCACAGGTATCTAAAGGAGAGGAAACAGTT
TGGAGCACCGTTGGCTGCTTTCCAGATAAACCAACAGAAGCTTGTGAAGATGCTGGGCAA
TGTTCAAGCGATGTTTATGATGGGTTGGCGCCTCTGCAAGCTATATGAGACGGGTCAGAT
GACTCCAGGTCAAGCCAGTTTAGGATGGCATGGATTACATCCAAGGCAAGGGAAACTGCT
TCGCTAGGTCGGGAATTACTCGGTGGGAATGGAGTTTTAGGGGATTTTCTGGTGGCAAAG
GCTTTTGGTGACCTTGAACCCATTTATACATACGAAGGGACGTACGACATAAACACCTTA
GTGACGGGGGAGGGAAGTTACCGGGATTGCGAGTTTCAAACCCCCAGCTTCACGGGGCCG
TAGCCGTCTTTAAGGTTGTGCAGTGTTTGTTGCTGTTGGCTGTTAAATTATATTTACCTG
GAGTACAAAGTGCGCCAAATAAAAGGGACATATTGCAATAATGGACCCGTGCTCTGTAAG
GCATGTAGGGGGGGAATATTCCTTTTGTAAACATTTAATGAATTGAAGTATGAAATGATA
AATTACTTTTCGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG77TF U 1
AF RR2DG77JQ C 486
BS 1 642 RR2DG77TF
BS 643 643 RR2DG77JQ
BS 644 674 RR2DG77TF
BS 675 675 RR2DG77JQ
BS 676 778 RR2DG77TF
BS 779 854 RR2DG77JQ

RD RR2DG77TF 778 0 0
GATCCTTGCTAGGAATACGATAACGAACCAAGTCAACGGATTCTTAGTCCAGAAAGATGC
GCCTGGCCTAACGGTTACTAAGATCCCGAATAAAATAGGTTTACGTATTGTTCAGAATGG
AGACATTCTACTACAGAATGTCTTTGTTCCGGATGAGGAGCGCTTACCTGGGGTAAATTC
ATTTCAGGACACAAGCAAGGTCCTGGCTGTCTCACGTGTAATGGTGGCCTGGCAACCAAT
TGGTATATCAATGGGAGTCTACGATATGTGTCACAGGTATCTAAAGGAGAGGAAACAGTT
TGGAGCACCGTTGGCTGCTTTCCAGATAAACCAACAGAAGCTTGTGAAGATGCTGGGCAA
TGTTCAAGCGATGTTTATGATGGGTTGGCGCCTCTGCAAGCTATATGAGACGGGTCAGAT
GACTCCAGGTCAAGCCAGTTTAGGATGGCATGGATTACATCCAAGGCAAGGGAAACTGCT
TCGCTAGGTCGGGAATTACTCGGTGGGAATGGAGTTTTAGGGGATTTTCTGGTGGCAAAG
GCTTTTGGTGACCTTGAACCCATTTATACATACGAAGGGACGTACGACATAAACACCTTA
GTGACGGGGGAGGGAAGTTACCGGGATTGCGAGTTTCAAACCGCCAGCTTCACGGGGCCG
TAGCCGTCTTTAAG*TTGTGCAGTGTTTGTTGCTGTTGGCTGTTAAATTATATTTACCTG
GAGTACAAAGTGCGCCAAATAAAAGGGACATATTGCAATAATGGACCCGTGCTCTGTA

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2DG77JQ 369 0 0
AGGTCGGGAATTACTCGGTGGGAATGGAGTTTTAGGGGATTTTTTGGTGGCAAAGGCTTT
TGGTGCCCTTGAACCCATTTATACATACGAAGGGACGTACGACATAAACCCCTTAGTGAC
GGGG*AGGGAAGTTACCGGGATTGGGAGTTTCAAACCCCCAGCTTCACGGGGCCGTAGCC
GTCTTTAAGGTTGTGCAGTGTTTGTTGCTGTTGGCTGTTAAATTATATTTACCTGGAGTA
CAAAGTGCGCCAAATAAAAGGGACATATTGCAATAATGGACCCGTGCTCTGTAAGGCATG
TAGGGGGGGAATATTCCTTTTGTAAACATTTAATGAATTGAAGTATGAAATGATAAATTA
CTTTTCGTT

QA 1 369 1 369
DS 



AS 1 2

CO CL4955Contig1 809 2 6 U
GCCTTGAATTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCTTACTTGGTCTATCG
CCATCAGATTATCAATGTTTATAACCAACAATATGAGAGCTGTGGAGCGTTCTGGCCGCA
CGTTCATGGTCGGATAATAGCTAGCTTGTTGATATCTCAGCTTCTGCTGATGGGACTTTT
AACATCTAAAAAGGCAACTAACTCAACCCCATTGCTTATCATCTTACCCATTCTCACTCT
TTCTTTCCACAAGTACTGCAAACACCGCTTCGAACCCGCCTTCGGTAAATACCCACTCGA
GGATGCAATGGCAAAAGACAAGCTGGAGAAGGAGACAGAACCGGAGTTGAACATGAAAGC
TGATCTTGCAGACGCGTACTTACACCCGATTTTCTTTTCATTCGACGAAGAATTAGATGA
AGAAGATGAGAGGCACCAAAAGGAGGCAACGGAGGTAAGAGTGGACAAACATGAAACACA
GTCGTCTAGTCCTGTGGCCGAGCTCGGCACCCCTTCCCATTATCATCATCATGAAGTCTA
CAATCCTTCTTCCCCTTCTCCGCATTATGCTTCAGCTTACGAGCAGTCATCTTCTCAGTA
TGAGTACCATTACGAGACTCATCGGTATGAGGAGCATGGTGGATACCGTTACAACAATTG
ATCTTATACGAGTGTAACTTGTATAAGTAGTTCGTTTTAAAATTTAATTTAATAGTCTAG
GTTGCTAGGAGATTGGTGTTGTTTTATTGTCACAAAAATTGGTTTACTGTGAAATATGAA
TGTTTTAATTATTTGCAAATGCTTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO07TF U 1
AF RR2FO07JQ C 18
BS 1 720 RR2FO07TF
BS 721 721 RR2FO07JQ
BS 722 757 RR2FO07TF
BS 758 758 RR2FO07JQ
BS 759 772 RR2FO07TF
BS 773 809 RR2FO07JQ

RD RR2FO07TF 772 0 0
GCCTTGAATTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCTTACTTGGTCTATCG
CCATCAGATTATCAATGTTTATAACCAACAATATGAGAGCTGTGGAGCGTTCTGGCCGCA
CGTTCATGGTCGGATAATAGCTAGCTTGTTGATATCTCAGCTTCTGCTGATGGGACTTTT
AACATCTAAAAAGGCAACTAACTCAACCCCATTGCTTATCATCTTACCCATTCTCACTCT
TTCTTTCCACAAGTACTGCAAACACCGCTTCGAACCCGCCTTCGGTAAATACCCACTCGA
GGATGCAATGGCAAAAGACAAGCTGGAGAAGGAGACAGAACCGGAGTTGAACATGAAAGC
TGATCTTGCAGACGCGTACTTACACCCGATTTTCTTTTCATTCGACGAAGAATTAGATGA
AGAAGATGAGAGGCACCAAAAGGAGGCAACGGAGGTAAGAGTGGACAAACATGAAACACA
GTCGTCTAGTCCTGTGGCCGAGCTCGGCACCCCTTCCCATTATCATCATCATGAAGTCTA
CAATCCTTCTTCCCCTTCTCCGCATTATGCTTCAGCTTACGAGCAGTCATCTTCTCAGTA
TGAGTACCATTACGAGACTCATCGGTATGAGGAGCATGGTGGATACCGTTACAACAATTG
ATCTTATACGAGTGTAACTTGTATAAGTAGTTCGTTTTAAAATTTAATTTAATAGTCTAG
*TTGCTAGGAGATTGGTGTTGTTTTATTGTCACAAAA*TTGGTTTACTGTGA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2FO07JQ 792 0 0
CCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCTTACTTGGTCTATCGCCATCAGATTATCAATG
TTTATAACCAACAATATGAGAGCTGTGGAGCGTTCTGGCCGCACGTTCATGGTCGGATAA
TAGCTAGCTTGTTGATATCTCAGCTTCTGCTGATGGGACTTTTAACATCTAAAAAGGCAA
CTAACTCAACCCCATTGCTTATCATCTTACCCATTCTCACTCTTTCTTTCCACAAGTACT
GCAAACACCGCTTCGAACCCGCCTTCGGTAAATACCCACTCGAGGATGCAATGGCAAAAG
ACAAGCTGGAGAAGGAGACAGAACCGGAGTTGAACATGAAAGCTGATCTTGCAGACGCGT
ACTTACACCCGATTTTCTTTTCATTCGACGAAGAATTAGATGAAGAAGATGAGAGGCACC
AAAAGGAGGCAACGGAGGTAAGAGTGGACAAACATGAAACACAGTCGTCTAGTCCTGTGG
CCGAGCTCGGCACCCCTTCCCATTATCATCATCATGAAGTCTACAATCCTTCTTCCCCTT
CTCCGCATTATGCTTCAGCTTACGAGCAGTCATCTTCTCAGTATGAGTACCATTACGAGA
CTCATCGGTATGAGGAGCATGGTGGATACCGTTACAACAATTGATCTTATACGAGTGTAA
CTTGTATAAGTAGTTCGTTTTAAAATTTAATTTAATAGTCTAGGTTGCTAGGAGATTGGT
GTTGTTTTATTGTCACAAAAATTGGTTTACTGTGAAATATGAATGTTTTAATTATTTGCA
AATGCTTTAATC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4957Contig1 1050 2 10 U
GGGTCGACGACAAAACCATATCCGCTCAAAATTTGTTGAAAAAGGCAAAAACTTCTAACT
TCCCCAGTTACGAGTTGTCTTGTCTTCTTCGTACGGGTGAAGTGAGTGTGGGGGTACAAG
CGAATGTTCTTCGATGGTGGATATCACCTATAATGTTTCCTGGACCAATTGACTTTGATA
CTGATGAAATGGGTTATGCAATGAGTAGACTCGAGATTGAATCCGACCTTTGCGATGCTG
GCAAAGGCTATTTTGGTGTCGGTGGTAGCAGCAACAGTGGTGGTACTCACCGATCAAGCG
AGCGTTTGGCTGATTTAGACCATGAGATCAGCCATGTCACTAAGCTCAAGTCTTGTCCTC
ATCAACGGTTTAGCCGTCAAGTCCCCGGGAGACATCAGTTGCCTGTTTCCACCGTCAGGA
TGTTGGCTGGTCGTGAAAGTAACTTCTCTGGAAGAGGAGGAAGGTTTTCTTCAGCTGATT
GTTGCCATATACTAAGCAGATACTTGCCTGTTAAGGGTCCTGGGCTTGTGGATCAGATGG
ACAGCCGAGCTTATGTCTCTCAGTTTTCAACTGATGGGTCTCTCTTCATTGCTGGCTTTC
AGGGAAGCCATATTCGGATTTACAATGTAGAGAAAGGTTGGAAAGTTCAAAAAGATATTC
TTACAAAAAGCTTGCGTTGGACTGTTACTGACACTTCTCTGTCCCCTGATCAGTGAAACC
TGGTCTATGCAAGCATGTCACCTATTGTTCACATCGTCGATGTTGGGTCTGGTACAACCG
AGTCTCATGCAAATGTTACGGAGATCCATGATGGATTAGACTTCTCTTCTGATGAAGATG
GAGGTTACTCCTTTGGGATATTCTCTGTGAAGTTTTCAACCGATGGACGAGAACTTGTTG
CTGGGAGCAGTGATGATTCCATCTATGTTTATGATCTTGAAGCAAACCGAGTTTCACTCC
GGACTGTTGCACACACGTCTGATGTGAATACTGTGTGCTTTGCCGATGAAAGTGGAAACC
TGATTCTCTCTGGAGTGATGATAATCTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM01TF U 1
AF RR2AJ19TF U 338
BS 1 412 RR2BM01TF
BS 413 413 RR2AJ19TF
BS 414 484 RR2BM01TF
BS 485 485 RR2AJ19TF
BS 486 490 RR2BM01TF
BS 491 492 RR2AJ19TF
BS 493 521 RR2BM01TF
BS 522 522 RR2AJ19TF
BS 523 631 RR2BM01TF
BS 632 1050 RR2AJ19TF

RD RR2BM01TF 631 0 0
GGGTCGACGACAAAACCATATCCGCTCAAAATTTGTTGAAAAAGGCAAAAACTTCTAACT
TCCCCAGTTACGAGTTGTCTTGTCTTCTTCGTACGGGTGAAGTGAGTGTGGGGGTACAAG
CGAATGTTCTTCGATGGTGGATATCACCTATAATGTTTCCTGGACCAATTGACTTTGATA
CTGATGAAATGGGTTATGCAATGAGTAGACTCGAGATTGAATCCGACCTTTGCGATGCTG
GCAAAGGCTATTTTGGTGTCGGTGGTAGCAGCAACAGTGGTGGTACTCACCGATCAAGCG
AGCGTTTGGCTGATTTAGACCATGAGATCAGCCATGTCACTAAGCTCAAGTCTTGTCCTC
ATCAACGGTTTAGCCGTCAAGTCCCCGGGAGACATCAGTTGCCTGTTTCCACTGTCAGGA
TGTTGGCTGGTCGTGAAAGTAACTTCTCTGGAAGAGGAGGAAGGTTTTCTTCAGCTGATT
GTTGTCATATCTTAAGCAGATACTTGCCTGTTAAGGGTCCTTGGCTTGTGGATCAGATGG
ACAGCCGAGCTTATGTCTCTCAGTTTTCAACTGATGGGTCTCTCTTCATTGCTGGCTTTC
AGGGAAGCCATATTCGGATTTACAATGTAGA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2AJ19TF 713 0 0
G
ACTAAGCTGAAGTCTTGTCCTCATCAACGGTTTAGCCGTCAAGTCCCTGGGAGACATCAG
TTGCCTGTTTCCACCGTCAGGATGTTGGCTGGTCGTGAAAGTAACTTCTCTGGAAGAGGA
GGAAGGTTTTCTTCAGCTGATTGTTGCCATATACTAAGCAGATACTTGCCTGTTAAGGGT
CCTGGGCTTGTGGATCAGATGGACAGCCGAGCTTATGTCTCTCAGTTTTCAACTGATGGG
TCTCTCTTCATTGCTGGCTTTCAGGGAAGCCATATTCGGATTTACAATGTAGAGAAAGGT
TGGAAAGTTCAAAAAGATATTCTTACAAAAAGCTTGCGTTGGACTGTTACTGACACTTCT
CTGTCCCCTGATCAGTGAAACCTGGTCTATGCAAGCATGTCACCTATTGTTCACATCGTC
GATGTTGGGTCTGGTACAACCGAGTCTCATGCAAATGTTACGGAGATCCATGATGGATTA
GACTTCTCTTCTGATGAAGATGGAGGTTACTCCTTTGGGATATTCTCTGTGAAGTTTTCA
ACCGATGGACGAGAACTTGTTGCTGGGAGCAGTGATGATTCCATCTATGTTTATGATCTT
GAAGCAAACCGAGTTTCACTCCGGACTGTTGCACACACGTCTGATGTGAATACTGTGTGC
TTTGCCGATGAAAGTGGAAACCTGATTCTCTCTGGAGTGATGATAATCTCTG

QA 2 713 2 713
DS 



AS 1 2

CO CL4958Contig1 1178 2 2 U
GACTTCTTTGGAAGATGGAACTGCTTAAGTCTGCTGTTGCGTCTGCGAATACTCACATAC
ACGCGGTCAGAACTGAAACACTGATACTTCTCAGTGGACGTGATCAATGGCTGCTGAATG
AAGCAGACATTGACAGATTCACACGCACATTGCCAAACTGTATTGTCCGTAAGCTTAAAG
ACAATGGACACTTTCTTTTTTTTGAGGACAATGTAGACCTGGTTACTATCATCAAATGCA
CTTATTTCTATCGCCGTGGGAAGTCTCATGATAACCTTTCAGATTACATTAAGCTTACCA
AATACGAGTTAAAGCAACTACTAAACGATCAAAAACTGTTACTAGATGCTACTTCACCTG
TATATCTATCAACATTAGCAAACGGTAAAGTTGTGCGGGGCCTTGAAGGTATACCCTCAG
AAGGGCCTGTACTATACGTTGGCTATCACGTGTTATTGGGACTAGAGATTGTTCCAATGA
TAACTCAGTTCTTGAAAGAGAGAAACATTCACATGCGGGGGTTGGCACATCCAATGCTTT
TGTGGAACATCCAAGATGATAGGTTAGGAGACCCACAGATGTTGGACAAATATAAGTTAA
TCGGTGCAGTTCCTGTCTCCAACTTCAGTATCTACAAACTACTGCAATCAAAGTCTCATG
CGCTTTTGTATCCTGGTGGTATCCGTGAATCTTTTCATAGAAAGGGTGAAGAATACAAGT
TGTTCTGGCCGGAGCAACAAGAGTTCGTGAGGGTTGCATCTAAGTTTGGAGCCAAGATTG
TCCCATTTGGTGTTGTTGGAGAAGACGACATTTGTCATCCTGTCCTCGATTCCGATGATC
AAAGAAACATTCCAATCCTAAAGGATTTCATGGAAGAGGCAACAAAGCAAGCTGGAAACT
TAAGGGAAGGAGATGAGACCGAACTTGGAAACCAGATATGCTATCTCCCAGGAGTTGTAC
CTAAGATTCCTGGGCGGTTTTACTTTTACTTTGGGAAACCAATCGAAACAGCAGGCAAGG
AACAAGAGCTAAAAGACAAAGACAAGGCTCAAGAGTTTTACTTGCAAGTCAAGTCTGAGG
TTGAACAATGCATTGCCTATTTGAAGATGAAAAGAGAGAGTGATCCTTACAGACACTTGT
TGCCAAGGATGATGTATCAGGCCTCACATGGTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH08TF U 1
AF RR2GH08JQB C 508
BS 1 766 RR2GH08TF
BS 767 1178 RR2GH08JQB

RD RR2GH08TF 767 0 0
GACTTCTTTGGAAGATGGAACTGCTTAAGTCTGCTGTTGCGTCTGCGAATACTCACATAC
ACGCGGTCAGAACTGAAACACTGATACTTCTCAGTGGACGTGATCAATGGCTGCTGAATG
AAGCAGACATTGACAGATTCACACGCACATTGCCAAACTGTATTGTCCGTAAGCTTAAAG
ACAATGGACACTTTCTTTTTTTTGAGGACAATGTAGACCTGGTTACTATCATCAAATGCA
CTTATTTCTATCGCCGTGGGAAGTCTCATGATAACCTTTCAGATTACATTAAGCTTACCA
AATACGAGTTAAAGCAACTACTAAACGATCAAAAACTGTTACTAGATGCTACTTCACCTG
TATATCTATCAACATTAGCAAACGGTAAAGTTGTGCGGGGCCTTGAAGGTATACCCTCAG
AAGGGCCTGTACTATACGTTGGCTATCACGTGTTATTGGGACTAGAGATTGTTCCAATGA
TAACTCAGTTCTTGAAAGAGAGAAACATTCACATGCGGGGGTTGGCACATCCAATGCTTT
TGTGGAACATCCAAGATGATAGGTTAGGAGACCCACAGATGTTGGACAAATATAAGTTAA
TCGGTGCAGTTCCTGTCTCCAACTTCAGTATCTACAAACTACTGCAATCAAAGTCTCATG
CGCTTTTGTATCCTGGTGGTATCCGTGAATCTTTTCATAGAAAGGGTGAAGAATACAAGT
TGTTCTGGCCGGAGCAACAAGAGTTCGTGAGGGTTGCATCTAAGTT
G

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2GH08JQB 671 0 0
TTCACATGCGGGGGTTGGCACATCCAATGCTTTTGTGGAACATCCAAGATGATAGGTTAG
GAGACCCACAGATGTTGGACAAATATAAGTTAATCGGTGCAGTTCCTGTCTCCAACTTCA
GTATCTACAAACTACTGCAATCAAAGTCTCATGCGCTTTTGTATCCTGGTGGTATCCGTG
AATCTTTTCATAGAAAGGGTGAAGAATACAAGTTGTTCTGGCCGGAGCAACAAGAGTTCG
TGAGGGTTGCATCTAAGTTTGGAGCCAAGATTGTCCCATTTGGTGTTGTTGGAGAAGACG
ACATTTGTCATCCTGTCCTCGATTCCGATGATCAAAGAAACATTCCAATCCTAAAGGATT
TCATGGAAGAGGCAACAAAGCAAGCTGGAAACTTAAGGGAAGGAGATGAGACCGAACTTG
GAAACCAGATATGCTATCTCCCAGGAGTTGTACCTAAGATTCCTGGGCGGTTTTACTTTT
ACTTTGGGAAACCAATCGAAACAGCAGGCAAGGAACAAGAGCTAAAAGACAAAGACAAGG
CTCAAGAGTTTTACTTGCAAGTCAAGTCTGAGGTTGAACAATGCATTGCCTATTTGAAGA
TGAAAAGAGAGAGTGATCCTTACAGACACTTGTTGCCAAGGATGATGTATCAGGCCTCAC
ATGGTTTTTTT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4960Contig1 758 2 7 U
ACAGATAAGTATAGGCTTGTAGTATTAGTGAGGGTAAAAGATACAAGGCTAGCATGAGAT
AATGCATGTGTTTTGAACACTAAACACGAAGCAGTTCATTATTATGGGAAGCTAGTACTG
AAAAACACTTGGGGAACAAAGTGAAACAGCAGTTTACATACAGAGCAGACTCTGAGCAGC
TTTGTTTATTGGTCTCAGCGGTAGAGACGATAGGTGGGGCTGTACATGCTACTTTCTGCA
CACTTGACAATCTCCTTTGGCCGTGGAAGTCTCCCCGCCAGTCCTAGTTCATATGCTTTA
GTTGCTACATTGGCAGCGATATGCGCTGATATGTTGCGTATGGAAGAAAAGGAAGGATAT
ATCATTCCTTTCTCATAGTTCTCTTTGTTTACTTGTCCAGCTAATGCCTCAACTGCAGCC
AGAAGCATATCGTCGTGTACTCGTATGGCTCCTGAGATGACCAAGCCAAGCCCAAAACCA
GGGAATATGTAGGCATTGTTCGCCTGAGTGGATACAAACACACTTCCTTCATACTCAACT
GGATCAAACGGGCTTCCACTTGCAAATATTGCACGACCCTTACTCCAGGTATAAGCTTCT
TCAGCTGTACATTCTGATTGTGTTGTTGGGTTAGAGAGCGCCATTACCAAAGGTGTCTCA
TTAATGGAAGACATGGCTTCAATCACTTCTTTTGTGAAAGACCGTCCAATGCCAGCAGAT
CCAATCAGAACATTCGGTTTTATGGCCTTGATGGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX52JQ U 210
AF RR2BK35JQ U 1
BS 1 246 RR2BK35JQ
BS 247 247 RR2GX52JQ
BS 248 347 RR2BK35JQ
BS 348 348 RR2GX52JQ
BS 349 411 RR2BK35JQ
BS 412 412 RR2GX52JQ
BS 413 758 RR2BK35JQ

RD RR2GX52JQ 242 0 0
ATAGGTGGGGCTGTACATGCTACTTTCTGCACACTTGACAATCTCCTTTGGCCGTGGAAG
TCTCCCCGCCAGTCCTAGTTCATATGCTTTAGTTGCTACATTGGCAGCGATATGCGCTGA
TATGTTGCGTATGGAAGAAAAGGAAGGATATATCATTCCTTTCTCATAGTTCTCTTTGTT
TACTTGTCCAGCTAATGCCTCAACTGCAGCCAGAAGCATATCGTCGTGTACTCGTATGGC
TC

QA 1 242 1 242
DS 

RD RR2BK35JQ 758 0 0
ACAGATAAGTATAGGCTTGTAGTATTAGTGAGGGTAAAAGATACAAGGCTAGCATGAGAT
AATGCATGTGTTTTGAACACTAAACACGAAGCAGTTCATTATTATGGGAAGCTAGTACTG
AAAAACACTTGGGGAACAAAGTGAAACAGCAGTTTACATACAGAGCAGACTCTGAGCAGC
TTTGTTTATTGGTCTCAGCGGTAGAGACGATAGGTGGGGCTGTACATGCTACTTTCTGCA
CACTTGTCAATCTCCTTTGGCCGTGGAAGTCTCCCCGCCAGTCCTAGTTCATATGCTTTA
GTTGCTACATTGGCAGCGATATGCGCTGATATGTTGCGTATGGAAGAGAAGGAAGGATAT
ATCATTCCTTTCTCATAGTTCTCTTTGTTTACTTGTCCAGCTAATGCCTCAGCTGCAGCC
AGAAGCATATCGTCGTGTACTCGTATGGCTCCTGAGATGACCAAGCCAAGCCCAAAACCA
GGGAATATGTAGGCATTGTTCGCCTGAGTGGATACAAACACACTTCCTTCATACTCAACT
GGATCAAACGGGCTTCCACTTGCAAATATTGCACGACCCTTACTCCAGGTATAAGCTTCT
TCAGCTGTACATTCTGATTGTGTTGTTGGGTTAGAGAGCGCCATTACCAAAGGTGTCTCA
TTAATGGAAGACATGGCTTCAATCACTTCTTTTGTGAAAGACCGTCCAATGCCAGCAGAT
CCAATCAGAACATTCGGTTTTATGGCCTTGATGGCACC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL4961Contig1 1327 2 4 U
GGAAAGGAAAAATAGAAAAAAGAAAAGTATTATCAAAGATCAAATATATAACCGCCTCCA
GGCTTCTCTCTCTGAAACGCAGTTAGCAAGTTTTCTCTATTCTCTTACTTGGCAACAGTA
AATCGAAATAATATGTGAAAGCATATAGCCTGCACCAACGAACGAGCATGATGATGAAGT
TGAAGTTTGATTACCATGAGGAATATATAAGAAACTCGAGAGACGTTGAGTTGTTCGCTT
GCAGATGGGTTCCATCTTCTTCTCCTCCCAAAGCTCTCATCTTCCTCTGCCATGGCTATG
GGATGGAGTGCAGTGTCTTCATGAGAGAATGCGGGATACGTCTGGCTTCAGCAGGATATG
CGGTATTTGGAATGGACTACGAAGGTCATGGTCGTTCCAAAGGAGCTCGTTGTTACATCA
AGAAGTTTAGTAACATAGTAAACGACTGCTACGACTATTACACTTCAATCTCTGCGCTAG
AAGAATACAAAGAAAAAGGCAGATTCTTGTATGGAGAATCTATGGGAGGTGCGGTTGCTT
TGTTGCTTCACAAGAGAGATCCTTCTTTCTGGAATGCTGCCCTTCTCGTTGCTCCTATGT
GTAAGATATCAGAAAAGGCAAAACCACATCCCAGTAGCGATTAATCTACTAACGAGAGTG
GAAGAGATTATACCAAAATGGAAGATCGTGCCCACCAAAGATGTTATCGATGCTGCTTTC
AAAGATCCGGTCAAGCGCGAAGAGATAAAGAACAACAAGCTGATATATCAAGACAAACCG
AGGCTCAAGACAGCACTTGAGATGCTTAGAACGAGCATGAACCTCGAAGATAGTCTCCAC
GAGATCACGTTACCCTTCCTTGTTCTTCGCGGTGAAGCAGACATATTGACTGATCCAGAG
ATTAGCAAAGCCCTGTTCGAGAAAGCAAGCTCACGTGACAAAACCATTAAACTTTATCCA
GGGATGTGGCATGGGTTGACTTCTGGTGAGCCTGACTCTAACGTTGACCTCGTTTTTGCT
GACATCATTAATTGGCTTGATGATCGTACCGGCGACTCCGCTTCTCTCATTATCACTCCG
GTTCGTCGAGATGTCATCTCAAACGTACAAAAGGTCGTGGAAGGCGCTTGTAACGATCGA
GGGAAACCTAAACGGCAGTATGCTAGTCTGCTTTGTGGGTTAAACGGTGGTGGACGCCGC
TTGGTCCATCGATCTTCTATGTAATAAACAAAACAGAGGACAATCTGTTTCTTGTGTTCA
TTTTGTATTAGTCCTTGCTCTATGACCTACTTAATATCAGGGTCTTAAAATAAAATGATT
TAGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK47TF U 1
AF RR2AK47JQ C 586
BS 1 631 RR2AK47TF
BS 632 632 RR2AK47JQ
BS 633 854 RR2AK47TF
BS 855 1327 RR2AK47JQ

RD RR2AK47TF 854 0 0
GGAAAGGAAAAATAGAAAAAAGAAAAGTATTATCAAAGATCAAATATATAACCGCCTCCA
GGCTTCTCTCTCTGAAACGCAGTTAGCAAGTTTTCTCTATTCTCTTACTTGGCAACAGTA
AATCGAAATAATATGTGAAAGCATATAGCCTGCACCAACGAACGAGCATGATGATGAAGT
TGAAGTTTGATTACCATGAGGAATATATAAGAAACTCGAGAGACGTTGAGTTGTTCGCTT
GCAGATGGGTTCCATCTTCTTCTCCTCCCAAAGCTCTCATCTTCCTCTGCCATGGCTATG
GGATGGAGTGCAGTGTCTTCATGAGAGAATGCGGGATACGTCTGGCTTCAGCAGGATATG
CGGTATTTGGAATGGACTACGAAGGTCATGGTCGTTCCAAAGGAGCTCGTTGTTACATCA
AGAAGTTTAGTAACATAGTAAACGACTGCTACGACTATTACACTTCAATCTCTGCGCTAG
AAGAATACAAAGAAAAAGGCAGATTCTTGTATGGAGAATCTATGGGAGGTGCGGTTGCTT
TGTTGCTTCACAAGAGAGATCCTTCTTTCTGGAATGCTGCCCTTCTCGTTGCTCCTATGT
GTAAGATATCAGAAAAGGCAAAACCACATCC*AGTAGCGATTAATCTACTAACGAGAGTG
GAAGAGATTATACCAAAATGGAAGATCGTGCCCACCAAAGATGTTATCGATGCTGCTTTC
AAAGATCCGGTCAAGCGCGAAGAGATAAAGAACAACAAGCTGATATATCAAGACAAACCG
AGGCTCAAGACAGCACTTGAGATGCTTAGAACGAGCATGAACCTCGAAGATAGTCTCCAC
GAGATCACGTTACC

QA 1 854 1 854
DS 

RD RR2AK47JQ 742 0 0
TCGTTGCTCCTATGTGTAAGATATCAGAAAAGGCAAAACCACATCCCAGTAGCGATTAAT
CTACTAACGAGAGTGGAAGAGATTATACCAAAATGGAAGATCGTGCCCACCAAAGATGTT
ATCGATGCTGCTTTCAAAGATCCGGTCAAGCGCGAAGAGATAAGGAACAACAAGCTGATA
TATCAAGACAAACCGAGGCTCAAGACAGCACTTGAGATGCTTAGAACGAGCATGAACCTC
GAAGATAGTCTCCACGAGATCACGTTACCCTTCCTTGTTCTTCGCGGTGAAGCAGACATA
TTGACTGATCCAGAGATTAGCAAAGCCCTGTTCGAGAAAGCAAGCTCACGTGACAAAACC
ATTAAACTTTATCCAGGGATGTGGCATGGGTTGACTTCTGGTGAGCCTGACTCTAACGTT
GACCTCGTTTTTGCTGACATCATTAATTGGCTTGATGATCGTACCGGCGACTCCGCTTCT
CTCATTATCACTCCGGTTCGTCGAGATGTCATCTCAAACGTACAAAAGGTCGTGGAAGGC
GCTTGTAACGATCGAGGGAAACCTAAACGGCAGTATGCTAGTCTGCTTTGTGGGTTAAAC
GGTGGTGGACGCCGCTTGGTCCATCGATCTTCTATGTAATAAACAAAACAGAGGACAATC
TGTTTCTTGTGTTCATTTTGTATTAGTCCTTGCTCTATGACCTACTTAATATCAGGGTCT
TAAAATAAAATGATTTAGTACC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL4962Contig1 1277 2 10 U
GTACAACTAATCCCGGTGTAAATCTAACAGATGGATGCAGCTTGTGTTCTAGAGTAAAAC
GAATCTATTTGGTCGGCGTTAAGAACATTTAATTCAGATCCTTTTAAAAAAGAACATTAA
TTCAAATACACAACGGTTAACTTCTTTTTCTGTGATTGTAATTGTGTAAACTATATTAAG
AAAAATGAAAAAAGAAGAGAAAATCAAACTCAGAAAGAATTACCACTACTAGTCTGCTAT
CTGAGTTTTGTGTCTGAAGAGGTCTAAGATATAAAAATTTAAAAGCATAGTTAAGATTGC
TACTTAATTGTATATTTTATGGAAATTAATCAACGAGATCTACGAAAGAAACAGTCGCAT
CTCACTCAAAACTTTACTTCTCATCGAGCTTACTAGAGTCGTCACTTTCACAAGGAATCT
TCTTTTTGATTTTTGCAAAAAAACAAGATCTAAAATTCGAACAGAAAGAAGAAGAAGGGG
TTACCTGCAACTGTCTGCGCTTTTTGATTTTGTGACCATGAGAGCAATCAAACATTTCAG
AGACATGATCAAGAACACCCATTTTGTCTTTTAACACTAGAAAGAACCGGATAGATCTAT
CCAAGGAAGAACTGTACAAAAGGTATAACCTCTAGGAGAAAGGAGATGGAGAAGAGAGAG
TATAAATGAGTTGCACACAGCACAGTGATCTCAGAGGCAAAGGGAAAGTGGATAGGAAGT
AAATGATAGAGACGATAATTTAAATAGGGGAGAAAGAGGATACAAAGACAATAAAATAGT
AGTCCGGTAAATATAATTCAAAGTAAAATTAACTTTTTATTTATTTCAAAGTTAAAATAA
TTAAATGGATGAAGGCTCACCCTTCCTCTCCTGGTCCCACCACCAGTTTCATAGTCGACG
TCTCTAAAAATCTTTTCTTACATTTTTTTACAAATAAAAAATATCTTATCTTCATTATTT
TTTTGTTTTTTGGAAATCTTGTCCGCATTAATTATTCTTCTGTATATATTTATTGTAATA
ATTCAGTTTCATATTTTGGGTGCTCGGTTTGGCTACAGTTGGATTGGTGTAATAATAAGG
AGGAAAAGGAAAAGCTTGAAGAAGAATATAAACTATATTTTCTCAAAAAGAAAAAAGAAT
ATAAGCTATAATTTAGCAAAATAAGAATATAAACTATAATTTGAAGAAGAATATAAACTG
TTGTTTGTTGACAAAAAAAAACTGTTGTTTACCAATAAAAAAAGAATATAAACTGTTTAT
AAACTGTAGTTTGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G326TF U 1
AF RR2G326JQ C 501
BS 1 696 RR2G326TF
BS 697 697 RR2G326JQ
BS 698 706 RR2G326TF
BS 707 707 RR2G326JQ
BS 708 749 RR2G326TF
BS 750 750 RR2G326JQ
BS 751 765 RR2G326TF
BS 766 766 RR2G326JQ
BS 767 775 RR2G326TF
BS 776 1277 RR2G326JQ

RD RR2G326TF 775 0 0
GTACAACTAATCCCGGTGTAAATCTAACAGATGGATGCAGCTTGTGTTCTAGAGTAAAAC
GAATCTATTTGGTCGGCGTTAAGAACATTTAATTCAGATCCTTTTAAAAAAGAACATTAA
TTCAAATACACAACGGTTAACTTCTTTTTCTGTGATTGTAATTGTGTAAACTATATTAAG
AAAAATGAAAAAAGAAGAGAAAATCAAACTCAGAAAGAATTACCACTACTAGTCTGCTAT
CTGAGTTTTGTGTCTGAAGAGGTCTAAGATATAAAAATTTAAAAGCATAGTTAAGATTGC
TACTTAATTGTATATTTTATGGAAATTAATCAACGAGATCTACGAAAGAAACAGTCGCAT
CTCACTCAAAACTTTACTTCTCATCGAGCTTACTAGAGTCGTCACTTTCACAAGGAATCT
TCTTTTTGATTTTTGCAAAAAAACAAGATCTAAAATTCGAACAGAAAGAAGAAGAAGGGG
TTACCTGCAACTGTCTGCGCTTTTTGATTTTGTGACCATGAGAGCAATCAAACATTTCAG
AGACATGATCAAGAACACCCATTTTGTCTTTTAACACTAGAAAGAACCGGATAGATCTAT
CCAAGGAAGAACTGTACAAAAGGTATAACCTCTAGGAGAAAGGAGATGGAGAAGAGAGAG
TATAAATGAGTTGCACACAGCACAGTGATCTCAGAG*CAAAGGGAA*GTGGATAGGAAGT
AAATGATAGAGACGATAATTTAAATAGGG*AGAAAGAGGATACAA*GACAATAAA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2G326JQ 777 0 0
TTTTTGATTTTGTGACCATGAGAGCAATCAAACATTTCAGAGACATGATCAAGAACACCC
ATTTTGTCTTTTAACACTAGAAAGAACCGGATAGATCTATCCAAGGAAGAACTGTACAAA
AGGTATAACCTCTAGGAGAAAGGAGATGGAGAAGAGAGAGTATAAATGAGTTGCACACAG
CACAGTGATCTCAGAGGCAAAGGGAAAGTGGATAGGAAGTAAATGATAGAGACGATAATT
TAAATAGGGGAGAAAGAGGATACAAAGACAATAAAATAGTAGTCCGGTAAATATAATTCA
AAGTAAAATTAACTTTTTATTTATTTCAAAGTTAAAATAATTAAATGGATGAAGGCTCAC
CCTTCCTCTCCTGGTCCCACCACCAGTTTCATAGTCGACGTCTCTAAAAATCTTTTCTTA
CATTTTTTTACAAATAAAAAATATCTTATCTTCATTATTTTTTTGTTTTTTGGAAATCTT
GTCCGCATTAATTATTCTTCTGTATATATTTATTGTAATAATTCAGTTTCATATTTTGGG
TGCTCGGTTTGGCTACAGTTGGATTGGTGTAATAATAAGGAGGAAAAGGAAAAGCTTGAA
GAAGAATATAAACTATATTTTCTCAAAAAGAAAAAAGAATATAAGCTATAATTTAGCAAA
ATAAGAATATAAACTATAATTTGAAGAAGAATATAAACTGTTGTTTGTTGACAAAAAAAA
ACTGTTGTTTACCAATAAAAAAAGAATATAAACTGTTTATAAACTGTAGTTTGACCC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL4963Contig1 1207 2 2 U
GAACAAGTAAAAATGGAAGAGGAAGAGGAGGAGTCGTGGATCATACCCGGCTTGACGGAC
GACGTAGCGGCACTCTGCCTATCACGATTCCCACGCTCACACTTTCGGATCCTTTCTCAG
GTCTGCCGTCGATGGAAGAATTTACTCAGGAGCGAATATTTCAACGGTGTTAGAAAGTTG
ACCGGGACGATGGAGGAGTTCATGTGTGTTCTGATGGAAGATATGCCTGGCACAATCGTG
TACTGGGAAGTTTTCGACAGCTCCGGGAACAAATTGGGACGGATTCCTAACGTCCCTAAC
CCTGGGCCAAAGAAGTGGGGTTACGGCGTCACAGTGCTTAACGACAAGATCTTTTTCATC
GGTGGATTTATGGGGGGCATTGGCTGTCCAATTGCTTCGGCTGATGTTTACGAGTTCAGT
CCTGCTACTAACAGCTGGAGAAAACTGGCAGACATGCAAATACCACGTTACAGCTTTTCA
CTATCTGTAGTGGATGGCCTGTTGTATGTGTTCCGAGGTTGTACCAAATATGGTTATCCC
CTTTCAAGCTATGAAGTATACAACCCGGAAACTAACCAGTGGACCCTTGAGGATAGTCCA
AACACCCATGTCGACATTGGCTTTGCATTCTCCTTCAAGTCCAAAATCTACGTTTTTGAC
AATGGAACACCCATAATCGACATATATGACACCGAAACGAATACATGGGATAAGTTAAAA
TCAGATGAAATAATGGGTGTTTATTCCTACACTGTTGTGAGGAACAAAGTGTATTTCTTG
GACAGCGAACTGTCTGGATGTCTGGGATTGTTGGATCCAGAGACGGACACATGGTTCACA
GTGAATGTGCCTACGGAGCCGGGAGGCTCCCAGTCTAAATTAGGGCAATGGAACAACAAA
GTTTTTCTGTTTTTACAGAATCCTGTAGGTAAGACCAAAATGAACGCTTTTACTAAAGAT
GAAGGGTACTACAGGTGGAGAGTCTGTGATCAAATCAAACTATCTGGTTATCACCTGTTC
AACGTTCTCATCAAGTTCTAATTTCCCTAATAGTGTGTGTTTAAGGTTTTGGGGCTGCGA
GTCTTTGTGTCTCGCCACAATTACCCCCTCAACTTTGTCAATGATTCTTATATATGTTTG
GTTTGTAATGGACCACTGAACTCGTGTGCGTGTGTTTTTGTGTGTTTTGGTGAGTGCAAA
CTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT90TF U 1
AF RR2FT90JQ C 503
BS 1 759 RR2FT90TF
BS 760 1207 RR2FT90JQ

RD RR2FT90TF 759 0 0
GAACAAGTAAAAATGGAAGAGGAAGAGGAGGAGTCGTGGATCATACCCGGCTTGACGGAC
GACGTAGCGGCACTCTGCCTATCACGATTCCCACGCTCACACTTTCGGATCCTTTCTCAG
GTCTGCCGTCGATGGAAGAATTTACTCAGGAGCGAATATTTCAACGGTGTTAGAAAGTTG
ACCGGGACGATGGAGGAGTTCATGTGTGTTCTGATGGAAGATATGCCTGGCACAATCGTG
TACTGGGAAGTTTTCGACAGCTCCGGGAACAAATTGGGACGGATTCCTAACGTCCCTAAC
CCTGGGCCAAAGAAGTGGGGTTACGGCGTCACAGTGCTTAACGACAAGATCTTTTTCATC
GGTGGATTTATGGGGGGCATTGGCTGTCCAATTGCTTCGGCTGATGTTTACGAGTTCAGT
CCTGCTACTAACAGCTGGAGAAAACTGGCAGACATGCAAATACCACGTTACAGCTTTTCA
CTATCTGTAGTGGATGGCCTGTTGTATGTGTTCCGAGGTTGTACCAAATATGGTTATCCC
CTTTCAAGCTATGAAGTATACAACCCGGAAACTAACCAGTGGACCCTTGAGGATAGTCCA
AACACCCATGTCGACATTGGCTTTGCATTCTCCTTCAAGTCCAAAATCTACGTTTTTGAC
AATGGAACACCCATAATCGACATATATGACACCGAAACGAATACATGGGATAAGTTAAAA
TCAGATGAAATAATGGGTGTTTATTCCTACACTGTTGTG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2FT90JQ 705 0 0
TGTATGTGTTCCGAGGTTGTACCAAATATGGTTATCCCCTTTCAAGCTATGAAGTATACA
ACCCGGAAACTAACCAGTGGACCCTTGAGGATAGTCCAAACACCCATGTCGACATTGGCT
TTGCATTCTCCTTCAAGTCCAAAATCTACGTTTTTGACAATGGAACACCCATAATCGACA
TATATGACACCGAAACGAATACATGGGATAAGTTAAAATCAGATGAAATAATGGGTGTTT
ATTCCTACACTGTTGTGAGGAACAAAGTGTATTTCTTGGACAGCGAACTGTCTGGATGTC
TGGGATTGTTGGATCCAGAGACGGACACATGGTTCACAGTGAATGTGCCTACGGAGCCGG
GAGGCTCCCAGTCTAAATTAGGGCAATGGAACAACAAAGTTTTTCTGTTTTTACAGAATC
CTGTAGGTAAGACCAAAATGAACGCTTTTACTAAAGATGAAGGGTACTACAGGTGGAGAG
TCTGTGATCAAATCAAACTATCTGGTTATCACCTGTTCAACGTTCTCATCAAGTTCTAAT
TTCCCTAATAGTGTGTGTTTAAGGTTTTGGGGCTGCGAGTCTTTGTGTCTCGCCACAATT
ACCCCCTCAACTTTGTCAATGATTCTTATATATGTTTGGTTTGTAATGGACCACTGAACT
CGTGTGCGTGTGTTTTTGTGTGTTTTGGTGAGTGCAAACTGTTTT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL4964Contig1 1101 2 2 U
GTCTCGAATTCATCCAGGTCGACTAGTCTACACCTGCGCAAATGTAGATGATGGCGACTG
CCATGTATGTAAATGGTGGGATGTCGCCATTATGGAGGAGATGCGAGCAAGGGATATGCA
CACCCTTGAACTGGCTCAGAAGGTAGATTCACTTACTCTTATGGGTGACTATGTTACTGA
GCAGAAGGTGGCTAACCTAGAGTTGATAGTTTCTGAGCTAAGTAAGAAGAGTCAGGCTGG
AAGCAAGAAGTTTGAAATGGTTGTTGCTGTGATGTTTGTTGTGTTTGTGGTGATAGGAAT
GGTGGTAATGTTTAAGTAGAAATGGTTGTTGCTGTGATGGTTCTATGTTGTTCTTGTCTA
ATTATGAATGTTGTTCTTCTCTAATTATGAATGTTGGACTTGTAGAAACATATATGATGT
GTAATATGGTCTTGTTGTTGTATTGAACGTACTGTGATAATATGTTTTATTAATTGCTCT
TCTCTCATGTCGGTATTATAAAACAAGAGAACAAAACAAAAGCATCACGGGAGTTTGATT
TCTATAAAACCCGTGAAGTGTCACAAGACTTGTCACAAGACTTGGACACTAAAAACTACA
AAACAAGCAACTGTCACAAGACTTGGACAGTAAAACATCACGGGAGGTATAGGGAAATGT
CACAAGGGAACATCACGAGAGGTATAGGGAAGTGTCAAACTCATTCTCTCTATAAGTATG
ATACTTCTTTCTTCATTATCTTCACCACTACTCATCCCTCTTCAACTCTCTTTGAAAACT
TTTCCTCTCCATATTTTTTTTAAACTATGGCTTCCTCATCTCATTATCATTTCCACAGAG
AGGATGATGTCTGATATTCAGAAGTTTTACAATGTGGTCGTTGAAGAGTTGCCAAACAAT
GTTGCTGATCTTTTCTGAGTCCTCCTGTTTGTTGTGGCAGAGCATGGTAACTTCTTTCTT
TCTTTTTTTACCGAGAAACTGCTGAATTTTACTACGTTTTGTTTCCAGTTTACTTTAGAG
TTTTTGGCAAAATGAGAAGAGAACTCATCTCATGGCTTTATTGTTTTTGTCGGCATTTAT
GTTATAACTTTCTTGTTACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FV86TF U 1
AF RR2FV86JQ C 403
BS 1 660 RR2FV86TF
BS 661 1101 RR2FV86JQ

RD RR2FV86TF 660 0 0
GTCTCGAATTCATCCAGGTCGACTAGTCTACACCTGCGCAAATGTAGATGATGGCGACTG
CCATGTATGTAAATGGTGGGATGTCGCCATTATGGAGGAGATGCGAGCAAGGGATATGCA
CACCCTTGAACTGGCTCAGAAGGTAGATTCACTTACTCTTATGGGTGACTATGTTACTGA
GCAGAAGGTGGCTAACCTAGAGTTGATAGTTTCTGAGCTAAGTAAGAAGAGTCAGGCTGG
AAGCAAGAAGTTTGAAATGGTTGTTGCTGTGATGTTTGTTGTGTTTGTGGTGATAGGAAT
GGTGGTAATGTTTAAGTAGAAATGGTTGTTGCTGTGATGGTTCTATGTTGTTCTTGTCTA
ATTATGAATGTTGTTCTTCTCTAATTATGAATGTTGGACTTGTAGAAACATATATGATGT
GTAATATGGTCTTGTTGTTGTATTGAACGTACTGTGATAATATGTTTTATTAATTGCTCT
TCTCTCATGTCGGTATTATAAAACAAGAGAACAAAACAAAAGCATCACGGGAGTTTGATT
TCTATAAAACCCGTGAAGTGTCACAAGACTTGTCACAAGACTTGGACACTAAAAACTACA
AAACAAGCAACTGTCACAAGACTTGGACAGTAAAACATCACGGGAGGTATAGGGAAATGT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2FV86JQ 699 0 0
TAGAAACATATATGATGTGTAATATGGTCTTGTTGTTGTATTGAACGTACTGTGATAATA
TGTTTTATTAATTGCTCTTCTCTCATGTCGGTATTATAAAACAAGAGAACAAAACAAAAG
CATCACGGGAGTTTGATTTCTATAAAACCCGTGAAGTGTCACAAGACTTGTCACAAGACT
TGGACACTAAAAACTACAAAACAAGCAACTGTCACAAGACTTGGACAGTAAAACATCACG
GGAGGTATAGGGAAATGTCACAAGGGAACATCACGAGAGGTATAGGGAAGTGTCAAACTC
ATTCTCTCTATAAGTATGATACTTCTTTCTTCATTATCTTCACCACTACTCATCCCTCTT
CAACTCTCTTTGAAAACTTTTCCTCTCCATATTTTTTTTAAACTATGGCTTCCTCATCTC
ATTATCATTTCCACAGAGAGGATGATGTCTGATATTCAGAAGTTTTACAATGTGGTCGTT
GAAGAGTTGCCAAACAATGTTGCTGATCTTTTCTGAGTCCTCCTGTTTGTTGTGGCAGAG
CATGGTAACTTCTTTCTTTCTTTTTTTACCGAGAAACTGCTGAATTTTACTACGTTTTGT
TTCCAGTTTACTTTAGAGTTTTTGGCAAAATGAGAAGAGAACTCATCTCATGGCTTTATT
GTTTTTGTCGGCATTTATGTTATAACTTTCTTGTTACGC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL4965Contig1 736 2 4 U
GGATTTTCGAAAATTCTCAAACTTTACACAATACTTTTTCTCGCTTTCTCAACACCCTAA
ATCCTCCCGATCTATACAACCTCCGATCAGAAAACATTCCCCCCCCCGGCGGCGGAGGAT
GTCGTTTGAGTAATGGTGTGAGAAGTGATTTGTAATCAATGGGCGTAGTAGCTGAGGCGT
GGAGGCCGCCGCCTCAGCTCAACAAGAGCGGCGGCGGCGGGGGGTTATGGAAGTGGAGAT
CTTTGTTGTTGTCGGGTGGTCAGCACAAGAGAAGCGTAATGTGATGGAAATGGGTTTGCG
GTTTCATGCTTTTCTCCTTAGCTGTCATCTCTCTCTTCACCGGTCATGTTGTCTCCCACC
TCGAGTGGGCCCAGCAACTAAGCAAACGCAGCTTACTTGATATGAGGCGTAAGGAACCAA
TTGATGTATGGAAGTCAAAGTATTCTAAGTTCTTCTATGGATGCAGTGACAGAGGAAATA
ACTTCCCACCTGCTGTTCAGGAGCATAAGTCTAATGGGTATTTGCTGATTGCAGCTAGTG
GAGGTCTCAACCAGCAAAGAACAGGAATAATAGATGCAGTGGTTGTTGCACGGATTCTTA
ATGCTACTCTAGTTGTACCTGAGTTGGATCACCATTCTTATTGGAAAGATGACAGTGACT
TCAATGACGTTTTTGACGTTAACTGGTTCATCTCTTCCCTCACAAAGATGTGACTATAGT
AAAGAGAGTTCTGACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT47TF U 1
AF RR2G228TF U 417
BS 1 564 RR2GT47TF
BS 565 565 RR2G228TF
BS 566 679 RR2GT47TF
BS 680 736 RR2G228TF

RD RR2GT47TF 679 0 0
GGATTTTCGAAAATTCTCAAACTTTACACAATACTTTTTCTCGCTTTCTCAACACCCTAA
ATCCTCCCGATCTATACAACCTCCGATCAGAAAACATTCCCCCCCCCGGCGGCGGAGGAT
GTCGTTTGAGTAATGGTGTGAGAAGTGATTTGTAATCAATGGGCGTAGTAGCTGAGGCGT
GGAGGCCGCCGCCTCAGCTCAACAAGAGCGGCGGCGGCGGGGGGTTATGGAAGTGGAGAT
CTTTGTTGTTGTCGGGTGGTCAGCACAAGAGAAGCGTAATGTGATGGAAATGGGTTTGCG
GTTTCATGCTTTTCTCCTTAGCTGTCATCTCTCTCTTCACCGGTCATGTTGTCTCCCACC
TCGAGTGGGCCCAGCAACTAAGCAAACGCAGCTTACTTGATATGAGGCGTAAGGAACCAA
TTGATGTATGGAAGTCAAAGTATTCTAAGTTCTTCTATGGATGCAGTGACAGAGGAAATA
ACTTCCCACCTGCTGTTCAGGAGCATAAGTCTAATGGGTATTTGCTGATTGCAGCTAGTG
GAGGTCTCAACCAGCAAAGAACAG*AATAATAGATGCAGTGGTTGTTGCACGGATTCTTA
ATGCTACTCTAGTTGTACCTGAGTTGGATCACCATTCTTATTGGAAAGATGACAGTGACT
TCAATGACGTTTTTGACGT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2G228TF 320 0 0
CCAATTGATGTATGGAAGTCAAAGTATTCTAAGTTCTTCTATGGATGCAGTGACAGAGGA
AATAACTTCCCACCTGCTGTTCAGGAGCATAAGTCTAATGGGTATTTGCTGATTGCAGCT
AGTGGAGGTCTCAACCAGCAAAGAACAGGAATAATAGATGCAGTGGTTGTTGCACGGATT
CTTAATGCTACTCTAGTTGTACCTGAGTTGGATCACCATTCTTATTGGAAAGATGACAGT
GACTTCAATGACGTTTTTGACGTTAACTGGTTCATCTCTTCCCTCACAAAGATGTGACTA
TAGTAAAGAGAGTTCTGACA

QA 1 320 1 320
DS 



AS 1 2

CO CL4966Contig1 1252 2 12 U
TTTTTTTATTATTATTGTAAAGGGGAAAAGAGTAATGGCGCCGGTTCTTCAGAGCGCACA
GCCATGGGTTGAGAAATACCGGCCGAAGCAAGTGAAGGACGTAGCGCATCAGGAGGAGGT
GGTTCGAGTCCTCACCAACACTCTCGAGACTGCTAATTGTCCGCACATGCTCTTTTATGG
ACCACCAGGAACCGGGAAAACCACTACTGCACTTGCCATCGCCCACCAGCTATTTGGACC
TGAGTTGTACAAGTCTAGGGTGTTGGAGCTGAATGCAAGTGATGACAGAGGGATTAATGT
CGTTCGGACGAAGATCAAGGATTTTGCTGCTGTTGCTGTTGGGTCCAGTAACCGTCAAGG
TGGTTATCCTTGCCCATCGTTTAAGATCATTGTCCTAGATGAGGCTGATTCGATGACGGA
AGATGCTCAGAACGCGTTGAGGCGCACAATGGAAACTTACTCCAAAGTCACCAGATTCTT
CTTCATATGTAATTATATCAGCAGGATCATAGAGCCCCTTGCTTCAAGATGTGCCAAGTT
CAGGTTTAAACCACTTTCTGAAGAAGTCATGAGTAACCGTATCTTGCATATTTGTAATGA
AGAAGGTCTCAACCTTGGTGGAGAGGCTCTTACAACTTTGAGTATCATATCACAAGGTGA
TCTCCGTAGGGCCATCACGTATCTGCAGAGTGGTGCTCGGTTGTTTGGATCAACAATAAC
TTCGACGGATTTACTCAATGTGTCTGGGGTAGTCCCTGTGGAGGTAGTTAAGAGATTTTT
TACTGCATGCAGAAGTGGTGATTTCGATATTGCAAACAAGGAAGTGGACAACATAGTTGC
AGAAGGATATCCTGCATCTCAAATCATCAATCAGTTATTTGATATAGTCGTGGAAACTGG
TGATGACATAACGGACAATCAGAAGGCTAAGATCTGCAAATGTCTAGCTGAGACAGATAA
GAGACTTGTAGATGGTGCGGATGAGTACCTGCAGCTTCTGGACGTGGCAAGCAATACAAT
TACTGCACTTTCAGAAATGGCTCAAGACTACTAAAGCAAATACCCTCTAAATCTCTGCAT
CTAGGTTTGAATTTTGGCTGTGTTTTGAAACGGACATCTACGGTATGAATTGTCATAATG
ACACTTGTCGAGTTATTATTATTTAATGTTGACAAACAAAAAAAAAACTTGGGAGGTTAC
AACTGAAAAAAAGTTGGGTAGTCAATTGCAGACAGAACCTGATTCTGCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI94TF U 1
AF RR2EI94JQ C 506
BS 1 672 RR2EI94TF
BS 673 673 RR2EI94JQ
BS 674 715 RR2EI94TF
BS 716 716 RR2EI94JQ
BS 717 727 RR2EI94TF
BS 728 728 RR2EI94JQ
BS 729 755 RR2EI94TF
BS 756 756 RR2EI94JQ
BS 757 780 RR2EI94TF
BS 781 781 RR2EI94JQ
BS 782 790 RR2EI94TF
BS 791 1252 RR2EI94JQ

RD RR2EI94TF 790 0 0
TTTTTTTATTATTATTGTAAAGGGGAAAAGAGTAATGGCGCCGGTTCTTCAGAGCGCACA
GCCATGGGTTGAGAAATACCGGCCGAAGCAAGTGAAGGACGTAGCGCATCAGGAGGAGGT
GGTTCGAGTCCTCACCAACACTCTCGAGACTGCTAATTGTCCGCACATGCTCTTTTATGG
ACCACCAGGAACCGGGAAAACCACTACTGCACTTGCCATCGCCCACCAGCTATTTGGACC
TGAGTTGTACAAGTCTAGGGTGTTGGAGCTGAATGCAAGTGATGACAGAGGGATTAATGT
CGTTCGGACGAAGATCAAGGATTTTGCTGCTGTTGCTGTTGGGTCCAGTAACCGTCAAGG
TGGTTATCCTTGCCCATCGTTTAAGATCATTGTCCTAGATGAGGCTGATTCGATGACGGA
AGATGCTCAGAACGCGTTGAGGCGCACAATGGAAACTTACTCCAAAGTCACCAGATTCTT
CTTCATATGTAATTATATCAGCAGGATCATAGAGCCCCTTGCTTCAAGATGTGCCAAGTT
CAGGTTTAAACCACTTTCTGAAGAAGTCATGAGTAACCGTATCTTGCATATTTGTAATGA
AGAAGGTCTCAACCTTGGTGGAGAGGCTCTTACAACTTTGAGTATCATATCACAAGGTGA
TCTCCGTAGGGC*ATCACGTATCTGCAGAGTGGTGCTCGGTTGTTTGGATCAACA*TAAC
TTCGACG*ATTTACTCAATGTGTCTGGGGTAGTCC*TGTGGAGGTAGTTAAGAGATTTTT
*ACTGCATGC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2EI94JQ 747 0 0
ATCATAGAGCCCCTTGCTTCAAGATGTGCCAAGTTCAGGTTTAAACCACTTTCTGAAGAA
GTCATGAGTAACCGTATCTTGCATATTTGTAATGAAGAAGGTCTCAACCTTGGTGGAGAG
GCTCTTACAACTTTGAGTATCATATCACAAGGTGATCTCCGTAGGGCCATCACGTATCTG
CAGAGTGGTGCTCGGTTGTTTGGATCAACAATAACTTCGACGGATTTACTCAATGTGTCT
GGGGTAGTCCCTGTGGAGGTAGTTAAGAGATTTTTTACTGCATGCAGAAGTGGTGATTTC
GATATTGCAAACAAGGAAGTGGACAACATAGTTGCAGAAGGATATCCTGCATCTCAAATC
ATCAATCAGTTATTTGATATAGTCGTGGAAACTGGTGATGACATAACGGACAATCAGAAG
GCTAAGATCTGCAAATGTCTAGCTGAGACAGATAAGAGACTTGTAGATGGTGCGGATGAG
TACCTGCAGCTTCTGGACGTGGCAAGCAATACAATTACTGCACTTTCAGAAATGGCTCAA
GACTACTAAAGCAAATACCCTCTAAATCTCTGCATCTAGGTTTGAATTTTGGCTGTGTTT
TGAAACGGACATCTACGGTATGAATTGTCATAATGACACTTGTCGAGTTATTATTATTTA
ATGTTGACAAACAAAAAAAAAACTTGGGAGGTTACAACTGAAAAAAAGTTGGGTAGTCAA
TTGCAGACAGAACCTGATTCTGCTGTT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL4967Contig1 1053 2 6 U
GGAAAAACACAACCATCGAACAAAAATTTGGAGCCAAGTATTCCTTCAAAACTTTTAACA
AAAATAAAATTAAATATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAATCT
ATATCCAAAAAAGTGCTCTCTCTTCTCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCAGGTTGTTAGT
GCTGTCATTGTAACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCTCAGTC
GTGGGATTAATCGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTACCAGCA
ACTATAGCTACCACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTGCCTTATTTGGAGTGCCG
GCGGGTGCTCTCATAATTTGGCTCCTTAAGTAAAATCTTAACAAAGACTTCTTTCCTTTT
TAGTATGCTCCTTAAGTCATACATCAACATATCTTTTTCCCCATCATACATCAGCACATC
TAGGTTTAGATTGATTCGATTTCCGTTTATTAGTTATTTATGGATGGTCCTACTCGTTAT
CAATTGGATCATGACTATAAAGAAATCAGCTGTAATATAAATCAAAACCCAAAAATCTAA
ACTCAATTGAACGTAAAGTTTAAATTTCAGACAATCAATATGTTTTTTTTTTTTTTATTA
AACGTCCTTTTCTTCTTTTATGTTTGAGTAAAATCTAGCGTCCTTTAAAAACTCGTGTGA
GTGTTATGCATGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCCACCTCCAGCAGGAGCT
CCACCCACCGAAGCAGTTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAAACCAAATGATAAATCA
GCTGGAGGAGCAACAAGTAAGCCAAATGATAAACCAGCTGGAGGAGCAACCGATAAGCCA
GAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGCTGGACCAGCA
GATAAGCCAGGAGGCAAATCCCTAGAATATGTGTTATATTTTTTTTGTAATTGAGTCTTG
TGGCTCAGCTCAAAATAGGAATTCGATTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA79TF U 1
AF RR2CA79JQ C 454
BS 1 655 RR2CA79TF
BS 656 656 RR2CA79JQ
BS 657 710 RR2CA79TF
BS 711 711 RR2CA79JQ
BS 712 728 RR2CA79TF
BS 729 1053 RR2CA79JQ

RD RR2CA79TF 728 0 0
GGAAAAACACAACCATCGAACAAAAATTTGGAGCCAAGTATTCCTTCAAAACTTTTAACA
AAAATAAAATTAAATATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAATCT
ATATCCAAAAAAGTGCTCTCTCTTCTCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCAGGTTGTTAGT
GCTGTCATTGTAACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCTCAGTC
GTGGGATTAATCGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTACCAGCA
ACTATAGCTACCACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTGCCTTATTTGGAGTGCCG
GCGGGTGCTCTCATAATTTGGCTCCTTAAGTAAAATCTTAACAAAGACTTCTTTCCTTTT
TAGTATGCTCCTTAAGTCATACATCAACATATCTTTTTCCCCATCATACATCAGCACATC
TAGGTTTAGATTGATTCGATTTCCGTTTATTAGTTATTTATGGATGGTCCTACTCGTTAT
CAATTGGATCATGACTATAAAGAAATCAGCTGTAATATAAATCAAAACCCAAAAATCTAA
ACTCAATTGAACGTAAAGTTTAAATTTCAGACAATCAATATGTTTTTTTTTTTTT*ATTA
AACGTCCTTTTCTTCTTTTATGTTTGAGTAAAATCTAGCGTCCTTTAAAA*CTCGTGTGA
GTGTTATG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2CA79JQ 600 0 0
TTTTTCCCCATCATACATCAGCACATCTAGGTTTAGATTGATTCGATTTCCGTTTATTAG
TTATTTATGGATGGTCCTACTCGTTATCAATTGGATCATGACTATAAAGAAATCAGCTGT
AATATAAATCAAAACCCAAAAATTTAAACTCAATTGAACGTAAAGTTTAAATTTCAGACA
ATCAATATGTTTTTTTTTTTTTTATTAAACGTCCTTTTCTTCTTTTATGTTTGAGTAAAA
TCTAGCGTCCTTTAAAAACTCGTGTGAGTGTTATGCATGCATAGAATGGGAGTACACCCG
AAGAATAATCCACCTCCAGCAGGAGCTCCACCCACCGAAGCAGTTAAACCAGCTGGTGGA
GCAACAGATAAACCAAATGATAAATCAGCTGGAGGAGCAACAAGTAAGCCAAATGATAAA
CCAGCTGGAGGAGCAACCGATAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAG
CCAGGAGGTAAACCGGCTGGACCAGCAGATAAGCCAGGAGGCAAATCCCTAGAATATGTG
TTATATTTTTTTTGTAATTGAGTCTTGTGGCTCAGCTCAAAATAGGAATTCGATTTTTGC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

CO CL4968Contig1 1227 2 10 U
GGAGAGAAAACAAAACAAAAAGAAGTAACCACTTTATAGATATAATTCTGCAAAATCCAG
CGAAGAAGAAGAAGACGAAGAACCTTGATTAGGTAAAGGGAGAACTGAAACCACCGATGA
GTTCTTCAGGAGGAGAAGACGAGTGCTTGAGTTGGGCTGCACGAGATCCATCTGGTCTCC
TCTCTCCTCACACCTTCACACGCAGATCTGTTACAAGTGATGACGTTTCACTAAAAATCA
CACACTGTGGTGTCTGTTACGCTGACGTCATCTGGACAAGAAACAAACATGGTGACTCTA
AGTACCCTTTGGTTCCTGGGCATGAGATTGCTGGAATAGTGAGTAAGGTTGGATCTAATG
TTACTCGATTCAAAGTTGGAGACCATGTTGGTGTTGGAACGTATGTTAACTCCTGCAGGG
AGTGTGATTACTGTGAGGAAGGACAAGAGGTCAGCTGTGTGAAAGGGCAAGTTTTCACTT
TCAATGGCGTTGATTACGATGGCTCTGTTACTAAAGGAGGCTACTCCAGCCATATTGTTG
TTCACGAGAGGTACTGCTACAAGATACCTGTGGACTATCCTTTGGAATCAGCTGCGCCGT
TGCTATGCGCTGGAGTCACTGTTTACGCGCCCATGATGCGTCACGGTATGAACCAGCCTG
GTAAATCTCTAGGGGTGATTGGACTCGGTGGGCTTGGTCACATGGCGGTTAAGTTTGGTA
AGGCCTTTGGACTTGATGTGACGGTGTTCAGCACTAGCGTTTCCAAGAAAGAGGAGGCTT
TGAATCTTCTGGGAGCTAACAACTTCGTTATCTCATCTGATCATGACCAAATGAAGGCAC
TAGCGAAATCTCTAGACTTTATCATCGACACAGCATCTGGTGATCACGCGTTTGATCCTT
ACATGTCGCTTTTGAAGATTGCTGGAACTTATGTCCTGGTTGGTTTCCCAAGTGAGATTA
AAATCCAGCCTGCCACTCTCAACCTTGGTATGAGAGTGCTTGCGGGAAGCGTGAGTGGGG
GTACCAAGGTGACTCAGGAGATGTTAGACTTCTGTGCAGCTCATAAGATATATCCGAACA
TAGAGGTGATTCCCATTCAAAAGGCAAACGAAGCTCTTGAAAGGGTGGTGAAGAAGGACA
TCAAGTACCGTTTTGTTATTGATATCAAGAATTCTCTGAAATAGAGATGTTGAGAGTCTT
AATAAAAGAACAGCTCTATGAGTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC56TF U 1
AF RR2FC56JQ C 477
BS 1 664 RR2FC56TF
BS 665 665 RR2FC56JQ
BS 666 722 RR2FC56TF
BS 723 724 RR2FC56JQ
BS 725 733 RR2FC56TF
BS 734 734 RR2FC56JQ
BS 735 743 RR2FC56TF
BS 744 744 RR2FC56JQ
BS 745 761 RR2FC56TF
BS 762 1227 RR2FC56JQ

RD RR2FC56TF 763 0 0
GGAGAGAAAACAAAACAAAAAGAAGTAACCACTTTATAGATATAATTCTGCAAAATCCAG
CGAAGAAGAAGAAGACGAAGAACCTTGATTAGGTAAAGGGAGAACTGAAACCACCGATGA
GTTCTTCAGGAGGAGAAGACGAGTGCTTGAGTTGGGCTGCACGAGATCCATCTGGTCTCC
TCTCTCCTCACACCTTCACACGCAGATCTGTTACAAGTGATGACGTTTCACTAAAAATCA
CACACTGTGGTGTCTGTTACGCTGACGTCATCTGGACAAGAAACAAACATGGTGACTCTA
AGTACCCTTTGGTTCCTGGGCATGAGATTGCTGGAATAGTGAGTAAGGTTGGATCTAATG
TTACTCGATTCAAAGTTGGAGACCATGTTGGTGTTGGAACGTATGTTAACTCCTGCAGGG
AGTGTGATTACTGTGAGGAAGGACAAGAGGTCAGCTGTGTGAAAGGGCAAGTTTTCACTT
TCAATGGCGTTGATTACGATGGCTCTGTTACTAAAGGAGGCTACTCCAGCCATATTGTTG
TTCACGAGAGGTACTGCTACAAGATACCTGTGGACTATCCTTTGGAATCAGCTGCGCCGT
TGCTATGCGCTGGAGTCACTGTTTACGCGCCCATGATGCGTCACGGTATGAACCAGCCTG
GTAA*TCTCTAGGGGTGATTGGACTCGGTGGGCTTGGTCACATGGCGGTTAAGTTTGGTA
AG**CTTTGGACT*GATGTGACG*TGTTCAGCACTAGCGTT
CC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2FC56JQ 751 0 0
ACTTTCAATGGCGTTGATTACGATGGCTCTGTTACTAAAGGAGGCTACTCCAGCCATATT
GTTGTTCACGAGAGGTACTGCTACAAGATACCTGTGGACTATCCTTTGGAATCAGCTGCG
CCGTTGCTATGCGCTGGAGTCACTGTTTACGCGCCCATGATGCGTCACGGTATGAACCAG
CCTGGTAAATCTCTAGGGGTGATTGGACTCGGTGGGCTTGGTCACATGGCGGTTAAGTTT
GGTAAGGCTTTTGGACTTGATGTGACGGTGTTCAGCACTAGCGTTTCCAAGAAAGAGGAG
GCTTTGAATCTTCTGGGAGCTAACAACTTCGTTATCTCATCTGATCATGACCAAATGAAG
GCACTAGCGAAATCTCTAGACTTTATCATCGACACAGCATCTGGTGATCACGCGTTTGAT
CCTTACATGTCGCTTTTGAAGATTGCTGGAACTTATGTCCTGGTTGGTTTCCCAAGTGAG
ATTAAAATCCAGCCTGCCACTCTCAACCTTGGTATGAGAGTGCTTGCGGGAAGCGTGAGT
GGGGGTACCAAGGTGACTCAGGAGATGTTAGACTTCTGTGCAGCTCATAAGATATATCCG
AACATAGAGGTGATTCCCATTCAAAAGGCAAACGAAGCTCTTGAAAGGGTGGTGAAGAAG
GACATCAAGTACCGTTTTGTTATTGATATCAAGAATTCTCTGAAATAGAGATGTTGAGAG
TCTTAATAAAAGAACAGCTCTATGAGTTGTG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL4969Contig1 1095 2 2 U
GAGATACTGGTTTAAATTCAACAAGCGCCGTAGGTTCTATATCTTTGCTTCTGCTTCGTC
GTCGACCCCAACCTATACTCAGCAGCCATGGCCGTCGGGAAGAACAAGCGAATCTCCAAA
GGAAGAAAGGGAGGCAAGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATTGGTATGAT
ATCAAGGCTCCCTCTAACTTCACCCATAGAAATGTCGGGAAGACACTTGTTTCCAGAACT
CAGGGTACCAAGATTGCTTCAGAGGGTTTGAAACACAGAGTTTTCGAGGTGTCTCTTGCT
GATCTTCAAAATGATGAAGATAACGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTT
CAGGGAAGGAATGTCTTGACTCAGTTCTGGGGCATGGACTTCACCACTGATAAACTCAGA
TCCTTGGTGAAGAAGTGGCAGACTTTGATTGAGTCTCATGTTGATGTTAAGACCACCGAC
AACTACACATTGAGGCTTTTCTGCATTGCTTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAG
AGAACTTGCTATGCTCAGTCAAGCCAAATCCGTCAGATTCGCAGCAAGATGAGGGAGATT
ATGATCAAGGAAGCTTCCTCTTCTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAA
TCTATTGGTAAAGAGATTGAGAAAGCAACTCAGGGAATCTACCCTCTTCAGAATGTTTTC
ATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAAGGCTCCCAAATTCGACCTTGGAAAGCTCATGGAGGTT
CACGGAGACTACACAGCAGAGGATGTTGGTGTGAAGGTTGACAGGCCGGCCGATGAGACT
GTGGTCGAAGAACCTACTGAGATCATTGGAGCTTAAGAGAGGTTTTTCAAGAAATGTTAG
AGTTGAGCGATCGTTTTGACTTCTAAGCTTTAGTTTCTTTAATGCTTTGTGTCTTCTCAC
ACTCGTTTGGTCCCTCAGCTTCTTGTTTTTGATATATTTGTGCCTTTTCTCAGTATAAAC
TTGTCAGTTTTGGATAATTTATGCAACGCTTCTTTCAGACACATTCCCCATGATTTTCCT
TAACGTTTTGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM73TF U 1
AF RR2EM73JQ C 447
BS 1 712 RR2EM73TF
BS 713 1095 RR2EM73JQ

RD RR2EM73TF 712 0 0
GAGATACTGGTTTAAATTCAACAAGCGCCGTAGGTTCTATATCTTTGCTTCTGCTTCGTC
GTCGACCCCAACCTATACTCAGCAGCCATGGCCGTCGGGAAGAACAAGCGAATCTCCAAA
GGAAGAAAGGGAGGCAAGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATTGGTATGAT
ATCAAGGCTCCCTCTAACTTCACCCATAGAAATGTCGGGAAGACACTTGTTTCCAGAACT
CAGGGTACCAAGATTGCTTCAGAGGGTTTGAAACACAGAGTTTTCGAGGTGTCTCTTGCT
GATCTTCAAAATGATGAAGATAACGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTT
CAGGGAAGGAATGTCTTGACTCAGTTCTGGGGCATGGACTTCACCACTGATAAACTCAGA
TCCTTGGTGAAGAAGTGGCAGACTTTGATTGAGTCTCATGTTGATGTTAAGACCACCGAC
AACTACACATTGAGGCTTTTCTGCATTGCTTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAG
AGAACTTGCTATGCTCAGTCAAGCCAAATCCGTCAGATTCGCAGCAAGATGAGGGAGATT
ATGATCAAGGAAGCTTCCTCTTCTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAA
TCTATTGGTAAAGAGATTGAGAAAGCAACTCAGGGAATCTACCCTCTTCAGA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2EM73JQ 649 0 0
GATTGAGTCTCATGTTGATGTTAAGACCACCGACAACTACACATTGAGGCTTTTCTGCAT
TGCTTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGCTATGCTCAGTCAAGCCA
AATCCGTCAGATTCGCAGCAAGATGAGGGAGATTATGATCAAGGAAGCTTCCTCTTCTGA
CCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAATCTATTGGTAAAGAGATTGAGAAGGC
AACTCAGGGAATCTACCCTCTTCAGAATGTTTTCATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAAGGC
TCCCAAATTCGACCTTGGAAAGCTCATGGAGGTTCACGGAGACTACACAGCAGAGGATGT
TGGTGTGAAGGTTGACAGGCCGGCCGATGAGACTGTGGTCGAAGAACCTACTGAGATCAT
TGGAGCTTAAGAGAGGTTTTTCAAGAAATGTTAGAGTTGAGCGATCGTTTTGACTTCTAA
GCTTTAGTTTCTTTAATGCTTTGTGTCTTCTCACACTCGTTTGGTCCCTCAGCTTCTTGT
TTTTGATATATTTGTGCCTTTTCTCAGTATAAACTTGTCAGTTTTGGATAATTTATGCAA
CGCTTCTTTCAGACACATTCCCCATGATTTTCCTTAACGTTTTGATTCC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL4970Contig1 951 2 4 U
GGAAGTTCTTATATAAATCGTTTTGAGGCATTTCCCTCCTCATTGCTTTTCGAGCAACAA
TGACAGGATCAATGGCCAGCTTTGATATTCAAAACTGTTTCATCTTTACTCTCCTCTTCC
TCTTCCCAACCCTCTTTTTCTTTGCCTTCTTGTTCTTCTTCAAGGAACCAAAGAAATAAT
CAACAACCCTAATATCCTTGAAAGACTGAGAGAAGAAATCGATTCAGTGGTGGGGACAAA
TAGGCTGGTTCAAGAAACTGATCTACCAAAACTCCCTTACTTGCAAGCGGTAGTCAAGGA
AGCTCTAAGATTGCACCCTGTGGGATCTGTGGTGCCAAGGGAGTTTCAAGAAGGCTGTAC
GATAGGAGGGTTCTACATACCGGAGGGAACCTCACTTGCTGTCAATTCTTATGCTATCAT
GAGAGATCCTGATTCTTGGGAAGATCCTTATGAGTTTAAGCCAGAGAGGTTTCTAACTTC
TTCAAGGTCATGGAAAGAGGAGGAGAGAAAAGAGCAAGCACTTAAGTTCCTGGCGTTTGG
GGCTGGAAGGAGAGGATGTCCTGGATCGAATCTAGGGAGTACTTTTGTAGGAACCGCGGT
TGGAGTGATGGTGCAGGGCTTTGACTGGGAAATTGAAGGAGATAAAGTCAACATGGAAGA
AGCCTCAGGATTGAGATTCTTTATGGCTTTGGCTAAGCCACTTAAGTGCACTCCTCGTCC
TCGAAATATGAGCCCTTTACCTTTTGATATGCAGATTCCAAATATGAACCATCTTACGGT
AAGATTCTTACCGTCTGATTCAGGAGGTCAGGATTACACTCAATTTACAAACATATAATT
TATTACATATTTACATGCCTTGTATATTTTTGCATTCGTACGTTGATATTGTTGAATGCA
ATTTCCTTAAAACATTGTATATAATTATTATAATCAATAAGTATTTCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK23TF U 1
AF RR2FN12JQ C 330
BS 1 474 RR2GK23TF
BS 475 475 RR2FN12JQ
BS 476 590 RR2GK23TF
BS 591 951 RR2FN12JQ

RD RR2GK23TF 597 0 0
GGAAGTTCTTATATAAATCGTTTTGAGGCATTTCCCTCCTCATTGCTTTTCGAGCAACAA
TGACAGGATCAATGGCCAGCTTTGATATTCAAAACTGTTTCATCTTTACTCTCCTCTTCC
TCTTCCCAACCCTCTTTTTCTTTGCCTTCTTGTTCTTCTTCAAGGAACCAAAGAAATAAT
CAACAACCCTAATATCCTTGAAAGACTGAGAGAAGAAATCGATTCAGTGGTGGGGACAAA
TAGGCTGGTTCAAGAAACTGATCTACCAAAACTCCCTTACTTGCAAGCGGTAGTCAAGGA
AGCTCTAAGATTGCACCCTGTGGGATCTGTGGTGCCAAGGGAGTTTCAAGAAGGCTGTAC
GATAGGAGGGTTCTACATACCGGAGGGAACCTCACTTGCTGTCAATTCTTATGCTATCAT
GAGAGATCCTGATTCTTGGGAAGATCCTTATGAGTTTAAGCCAGAGAGGTTTCTGACTTC
TTCAAGGTCATGGAAAGAGGAGGAGAGAAAAGAGCAAGCACTTAAGTTCCTGGCGTTTGG
GGCTGGAAGGAGAGGATGTCCTGGATCGAATCTAGGGAGTACTTTTGTAG
AACCGCG

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2FN12JQ 622 0 0
TGGTGCCAAGGGAGTTTCAAGAAGGCTGTACGATAGGAGGGTTCTACATACCGGAGGGAA
CCTCACTTGCTGTCAATTCTTATGCTATCATGAGAGATCCTGATTCTTGGGAAGATCCTT
ATGAGTTTAAGCCAGAGAGGTTTCTAACTTCTTCAAGGTCATGGAAAGAGGAGGAGAGAA
AAGAGCAAGCACTTAAGTTCCTGGCGTTTGGGGCTGGAAGGAGAGGATGTCCTGGATCGA
ATCTAGGGAGTACTTTTGTAGGAACCGCGGTTGGAGTGATGGTGCAGGGCTTTGACTGGG
AAATTGAAGGAGATAAAGTCAACATGGAAGAAGCCTCAGGATTGAGATTCTTTATGGCTT
TGGCTAAGCCACTTAAGTGCACTCCTCGTCCTCGAAATATGAGCCCTTTACCTTTTGATA
TGCAGATTCCAAATATGAACCATCTTACGGTAAGATTCTTACCGTCTGATTCAGGAGGTC
AGGATTACACTCAATTTACAAACATATAATTTATTACATATTTACATGCCTTGTATATTT
TTGCATTCGTACGTTGATATTGTTGAATGCAATTTCCTTAAAACATTGTATATAATTATT
ATAATCAATAAGTATTTCAATT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL4971Contig1 679 2 2 U
TCTCCAACTTGCAGCGTGGTGCAATGCGCTTGGCACCCAAGGTTGAATCAGATATTTGCA
ACATCTGGAGACAAAAGCCAAGGAGGAACTCACATTCTGTACGGCCCAACTCAGAGCGAG
AGAGGTGCATGTGTGTGCGTTGCACGTGCACCAAGGAAGAAATCTGTAGACGATTACCAA
CCAGAACCAATAATACACAATCCCCATGCATTACCGTTGTTCAGAGACGCACCAAGCCGT
AAACGACAAAGGGAGAAAACACTGAAGGATCCTCTTAAAGCCCATAAGCCTGAGCTTCCC
ATGAGTGGTCCTGGTCATGGTGGAAGAGTTGGGACCACTGGTAGCAGCTTATTAACTCAG
TATCTTCTCAAGCAAGGTGGGATGATAAAAGAGACATGGATGGAGGAAGATCCAAGAGAA
GCGATATTGAAATACGCAGATGTTGCTGTTAAAGATCCAAAGTTTATTGCTCCTGCTTAT
TTTCAGACCCAGCCTGAGACCATCTTTGCTAAAACGGATGATGAAGAAGAAGAAGGTGAT
GCCAAAAAATAACTAGGATTCCAAAGATACTTCACTTTTCCTTGTATTATATAATGAACA
TTTAAGTCTTGTCAAAAAGATCATGTCATGGCGCTTTAGAATAACGGAAACATTTATCGA
GGAGTTGCATTTTTGGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD16TF U 1
AF RR2DD16JQ C 69
BS 1 332 RR2DD16TF
BS 333 679 RR2DD16JQ

RD RR2DD16TF 332 0 0
TCTCCAACTTGCAGCGTGGTGCAATGCGCTTGGCACCCAAGGTTGAATCAGATATTTGCA
ACATCTGGAGACAAAAGCCAAGGAGGAACTCACATTCTGTACGGCCCAACTCAGAGCGAG
AGAGGTGCATGTGTGTGCGTTGCACGTGCACCAAGGAAGAAATCTGTAGACGATTACCAA
CCAGAACCAATAATACACAATCCCCATGCATTACCGTTGTTCAGAGACGCACCAAGCCGT
AAACGACAAAGGGAGAAAACACTGAAGGATCCTCTTAAAGCCCATAAGCCTGAGCTTCCC
ATGAGTGGTCCTGGTCATGGTGGAAGAGTTGG

QA 1 332 1 332
DS 

RD RR2DD16JQ 611 0 0
AGACAAAAGCCAAGGAGGAACTCACATTCTGTACGGCCCAACTCAGAGCGAGAGAGGTGC
ATGTGTGTGCGTTGCACGTGCACCAAGGAAGAAATCTGTAGACGATTACCAACCAGAACC
AATAATACACAATCCCCATGCATTACCGTTGTTCAGAGACGCACCAAGCCGTAAACGACA
AAGGGAGAAAACACTGAAGGATCCTTTTAAAGCCCATAAGCCTGAGCTTCCCATGAGTGG
TCCTGGTCATGGTGGAAGAGTTGGGACCACTGGTAGCAGCTTATTAACTCAGTATCTTCT
CAAGCAAGGTGGGATGATAAAAGAGACATGGATGGAGGAAGATCCAAGAGAAGCGATATT
GAAATACGCAGATGTTGCTGTTAAAGATCCAAAGTTTATTGCTCCTGCTTATTTTCAGAC
CCAGCCTGAGACCATCTTTGCTAAAACGGATGATGAAGAAGAAGAAGGTGATGCCAAAAA
ATAACTAGGATTCCAAAGATACTTCACTTTTCCTTGTATTATATAATGAACATTTAAGTC
TTGTCAAAAAGATCATGTCATGGCGCTTTAGAATAACGGAAACATTTATCGAGGAGTTGC
ATTTTTGGTGG

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL4972Contig1 1388 2 4 U
GAGGCAACAATAAGGATCTTAATGTTTACGAGTCTATATATAGTAACCGTGACTCAGAAA
GCTTTAAGTCATCCAATACAATCAAGTTTTGTCTGTTTGTCTTAAGTTGATTAATTGAGT
ATAATTTGTTTCAATATGGAATCCAACTGTGTTCAATTTCTTGGGGACAAGACGATTCTC
ATCACCGGTGCTCCTGGTTTTCTTGCCAAAGTTCTAGTAGAGAAAATTATGAGGTTGCAG
CCAAATGTGAAGAAGATGTACCTTCTGTTGAGAGCTTCCGACGATAAAGCAGCCATGCAA
CGCTTACGTAGTGAGGTTGTGGAGATTGACCTGTTTAGGGTGTTGAGGAAAGATTTAGGT
GAAGAGAATCTGAATGCATTAGTGCGTGAAAAAATTGTGCCTGTTCCCGGTGATATATCG
GTCCATAATCTGGGATTGAAAGACTCTGATCTCTTGCAACGTATGTGGAGTGAGATTGAT
ATCATCATCAATATCGCAGCCACAACTAATTTCGATGAAAGATATGATATTGGTCTTGGC
ATCAATACATTTGGAGCTCTCAATGTTCTCAACTTCGCCAAAAAGTGTGTTAAGGCACAA
TTGCTTCTCCATGTCTCAACCGCGTATGTTTGCGGAGAAAAAACAGGATTACTCCTAGAG
AAACCATTCAAGATGGGGGAGAGTCTCAGCGGGGATAAGAAACTAGACATCAATGTAGAA
TTCGAGTTGATGAAGCAGAAACTGAAAGAGCTAGAGCATCAAGATTGTTCTGAAGAGGAG
ATCTCGCAGTCGATGAAAGATCTTGGAATGTCAAGGGCAAAGCTTCATGGATGGCCAAAT
ACATATGTATTCACTAAAAAGCCTCTGGTTGCTCGCAATGGCTCACCAATCATAGTGTCA
AAAGGAACGATTCTACCCACCATGGCTCAATTCAGCCTCTACATGACCCTTCGTTACAAG
CTTCCTCTACAGATACTTCGATTGATTAATATAATTTATCCATGGAGTGAAGGAGATAAA
TACAACGACCTTAGCCGCAAACTCAAGCTAGCTATGCGACTCGTTGAGCTTTACGAGCCT
TACTTACTCTTCAAGGGCATATTTGATGATTTAAATACCGAAAGACTGCGAATAAGAAGA
AAAGAGAACATCAAAGAGATGGATGGATCGTTTGAATTTGATCCCAAGTCCATCAACTGG
GACGATTATATCGCAAACATACACATTCCTGGTCTCATCACCTATGTTCTTAAACAATAA
ATTATAATAATTATGTTCTTGAATACTAGTAAAATCGTATTGTGATGAAGTATTGAAAGG
AGTTCAAATCTCGTGTGTAATATGTTTATATACCAACGCATTGTATGAATATGATTATAT
GTCACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO42TF U 1
AF RR2EO42JQ C 524
BS 1 642 RR2EO42TF
BS 643 643 RR2EO42JQ
BS 644 796 RR2EO42TF
BS 797 1388 RR2EO42JQ

RD RR2EO42TF 796 0 0
GAGGCAACAATAAGGATCTTAATGTTTACGAGTCTATATATAGTAACCGTGACTCAGAAA
GCTTTAAGTCATCCAATACAATCAAGTTTTGTCTGTTTGTCTTAAGTTGATTAATTGAGT
ATAATTTGTTTCAATATGGAATCCAACTGTGTTCAATTTCTTGGGGACAAGACGATTCTC
ATCACCGGTGCTCCTGGTTTTCTTGCCAAAGTTCTAGTAGAGAAAATTATGAGGTTGCAG
CCAAATGTGAAGAAGATGTACCTTCTGTTGAGAGCTTCCGACGATAAAGCAGCCATGCAA
CGCTTACGTAGTGAGGTTGTGGAGATTGACCTGTTTAGGGTGTTGAGGAAAGATTTAGGT
GAAGAGAATCTGAATGCATTAGTGCGTGAAAAAATTGTGCCTGTTCCCGGTGATATATCG
GTCCATAATCTGGGATTGAAAGACTCTGATCTCTTGCAACGTATGTGGAGTGAGATTGAT
ATCATCATCAATATCGCAGCCACAACTAATTTCGATGAAAGATATGATATTGGTCTTGGC
ATCAATACATTTGGAGCTCTCAATGTTCTCAACTTCGCCAAAAAGTGTGTTAAGGCACAA
TTGCTTCTCCATGTCTCAACCGCGTATGTTTGCGGAGAAAAA*CAGGATTACTCCTAGAG
AAACCATTCAAGATGGGGGAGAGTCTCAGCGGGGATAAGAAACTAGACATCAATGTAGAA
TTCGAGTTGATGAAGCAGAAACTGAAAGAGCTAGAGCATCAAGATTGTTCTGAAGAGGAG
ATCTCGCAGTCGATGA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2EO42JQ 865 0 0
ATATGATATTGTC
TGGCATCAATACATTTGGAGCTCTCAATGTTCTCAACTTCGCCAAAAAGTGTGTTAAGGC
ACAATTGCTTCTCCATGTCTCAACCGCGTATGTTTGCGGAGAAAAAACAGGATTACTCCT
AGAGAAACCATTCAAGATGGGGGAGAGTCTCAGCGGGGATAAGAAACTAGACATCAATGT
AGAATTCGAGTTGATGAAGCAGAAACTGAAAGAGCTAGAGCATCAAGATTGTTCTGAAGA
GGAGATCTCGCAGTCGATGAAAGATCTTGGAATGTCAAGGGCAAAGCTTCATGGATGGCC
AAATACATATGTATTCACTAAAAAGCCTCTGGTTGCTCGCAATGGCTCACCAATCATAGT
GTCAAAAGGAACGATTCTACCCACCATGGCTCAATTCAGCCTCTACATGACCCTTCGTTA
CAAGCTTCCTCTACAGATACTTCGATTGATTAATATAATTTATCCATGGAGTGAAGGAGA
TAAATACAACGACCTTAGCCGCAAACTCAAGCTAGCTATGCGACTCGTTGAGCTTTACGA
GCCTTACTTACTCTTCAAGGGCATATTTGATGATTTAAATACCGAAAGACTGCGAATAAG
AAGAAAAGAGAACATCAAAGAGATGGATGGATCGTTTGAATTTGATCCCAAGTCCATCAA
CTGGGACGATTATATCGCAAACATACACATTCCTGGTCTCATCACCTATGTTCTTAAACA
ATAAATTATAATAATTATGTTCTTGAATACTAGTAAAATCGTATTGTGATGAAGTATTGA
AAGGAGTTCAAATCTCGTGTGTAATATGTTTATATACCAACGCATTGTATGAATATGATT
ATATGTCACTAC

QA 14 865 14 865
DS 



AS 1 2

CO CL4973Contig1 566 2 2 U
GGAAGCTAAGAGAAGAGCAAACAAGTAGTTGCAAAAACAATTGGTGAGAACTCTCTGAAA
ATACTAAAAATCAATGGAGCCAAACACTAAGCTTGTCGTTATTACCTTGGTTCTTGCCTT
GACACTCACGGCAGCAACCGGAGAGTTCTGTGGTATGAGCGTTGGTGATCTGTACTCTTG
CAAGCCCTATGTGCAGACTAAGAACCCAGTGACCACCGCAATTGATCCCAAGGGCCCTTG
CTGCACAGCCCTGTCTAATGCTGACTTCCAGTGTCTCTGCAAGCAGAAAACCAAAACTAA
TCCTTTCCTCAGTGGGATCGACCTCGACCTCGCTTCTAAACTCCCGGAGAAGTGTGGATT
ATCTGGTGCACCTTGCTAAGACATGTTTCCTTTTGGAAGGTTTCGCTTTGTGTTTTGATT
TTCTTCATGAGTCCATTGTTCTTGTACTGTTTCTGTTCCTGTTGTTGTTGTTGTTTTTGT
TTTTGTTGTTCTGTGTTGATCTGATGTTGTTTCCATCGTTGTTGTCTTAATTGTATTGCA
TTGCAATTGTGTTCCTTGATTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2DT10TF U 1
AF RR2DT10JQ C 294
BS 1 562 RR2DT10TF
BS 563 566 RR2DT10JQ

RD RR2DT10TF 564 0 0
GGAAGCTAAGAGAAGAGCAAACAAGTAGTTGCAAAAACAATTGGTGAGAACTCTCTGAAA
ATACTAAAAATCAATGGAGCCAAACACTAAGCTTGTCGTTATTACCTTGGTTCTTGCCTT
GACACTCACGGCAGCAACCGGAGAGTTCTGTGGTATGAGCGTTGGTGATCTGTACTCTTG
CAAGCCCTATGTGCAGACTAAGAACCCAGTGACCACCGCAATTGATCCCAAGGGCCCTTG
CTGCACAGCCCTGTCTAATGCTGACTTCCAGTGTCTCTGCAAGCAGAAAACCAAAACTAA
TCCTTTCCTCAGTGGGATCGACCTCGACCTCGCTTCTAAACTCCCGGAGAAGTGTGGATT
ATCTGGTGCACCTTGCTAAGACATGTTTCCTTTTGGAAGGTTTCGCTTTGTGTTTTGATT
TTCTTCATGAGTCCATTGTTCTTGTACTGTTTCTGTTCCTGTTGTTGTTGTTGTTTTTGT
TTTTGTTGTTCTGTGTTGATCTGATGTTGTTTCCATCGTTGTTGTCTTAATTGTATTGCA
TTGCAATTGTGTTCCTTGATTT
CT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2DT10JQ 273 0 0
AAACTAATCCTTTCCTCAGTGGGATCGACCTCGACCTCGCTTCTAAACTCCCGGAGAAGT
GTGGATTATTTGGTGCACCTTGCTAAGACATGTTTCCTTTTGGAAGGTTTCGCTTTGTGT
TTTGATTTTCTTCATGAGTCCATTGTTCTTGTACTGTTTCTGTTCCTGTTGTTGTTGTTG
TTTTTGTTTTTGTTGTTCTGTGTTGATCTGATGTTGTTTCCATCGTTGTTGTTTTAATTG
TATTGCATTGCAATTGTGTTCCTTGATTTTTTC

QA 1 273 1 273
DS 



AS 1 2

CO CL4974Contig1 1345 2 2 U
GGGGTTTCTTTGAGGGGAAAGATGCTCAGAGAGATAGTTCTTTCAAAGACGATGAGAGTT
TTGGTTTGTTTCAGGGTAAAGATGCTCAGAGAAATAGTGCTTTGAAAGAGGATGCTAATT
TTGGTTTGTTCGAGGGTGAAGATGGTCAGAGTAATAGTGCTTCTAAAGAGGATGAAGATT
TTGGTTTGTTTGAGGCAGCATTATCATCAAATGCTGGGATCAAGTCTTTCGATGACAAGG
TTGTTACCTCTTCTTCTACTTGGGATTCTGACTTTCAATCTGTTTCCCAGGAAAAGAGTA
GTAGCGACCCGTTTGTAAGTTCTCCGGTTGATCTGTCTGCTCATATGGATACTGTCTTTG
GTTCCGGAAAAGATTTATTCTATGAAAAACCAGAAGATTCTTCAACTACTTATGTTTCCA
ATGCTGGTGATTGGCTGCAAGATGATTTGTTTGGTGATGTTACTGGCAAGACTCAAAACA
ACGACCAGACTGTCCATGAGGGACAAGTTGTGGGAGGCAATGGAAGTTCATCCATGGATA
TTGATTGGATGGGAGATGATCTTTGGCAAACCAGTGAAAAGAAAGCCGTTGAGCAGACAC
CTACAGATGATTTTGCAAGCTCAGTTAACTCCAAGACTCCTAGTAATCTCCTTTCGAGAA
CCATGGAAAGTTCCCAAGAGGAGGAGATATTTGATGGGCTGGCGCATGTTAAGAACGATG
TTAATGAACAGAGCAAAGATGAGAAGCAGAATACTGGTATAGCACGCGTGATATCTGACA
TAGGCAAAGGTCAAGAAGATGATCTCTTTGGGAATTGGGATACTTTCACATCCTCAACCG
TTTTGCAAACACCTGTGCAGTCTCACACGAACCAAGTGTATTCATCTGCTGAGCTGAATC
CGGAAGTGTACTTGTTTGGGGATAATAGCCATCGCAGTGACCTTGCTTTTGATTGCTTTC
CGGAAAGTACTGGAGGCCAAACCAAATCAGAGGAAGTCACAGCCATGCCTTCTGGAACCT
CCACCTTAGAGAGAACCAGTGATCCTGATGGTAAAGATAAAACACTCGATCTTGTAGGCA
CAACAACATCTCACAAGTCAAAGAGTGATGTTGCGGAAGAGCTGATATCACAGATGCATG
ATCTCTCGTTTATGCTCGAGACCAAACTCTCTGTACCTCCAATCACCAAGGCAGAGTAAT
ATTAATACATTGTACTCTCTCTCTCTCTCGCCTCATGTTTTTCTTGGGGGCTAGAAAGAT
TGTTATATATATTTCATTTTCAATAACTCCAAATATCCCTTTTGCTGGCGTTGTCGCCAA
GAAATGATGTTAGTCTACCAGTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA46TF U 1
AF RR2BA46JQ C 507
BS 1 779 RR2BA46TF
BS 780 1345 RR2BA46JQ

RD RR2BA46TF 779 0 0
GGGGTTTCTTTGAGGGGAAAGATGCTCAGAGAGATAGTTCTTTCAAAGACGATGAGAGTT
TTGGTTTGTTTCAGGGTAAAGATGCTCAGAGAAATAGTGCTTTGAAAGAGGATGCTAATT
TTGGTTTGTTCGAGGGTGAAGATGGTCAGAGTAATAGTGCTTCTAAAGAGGATGAAGATT
TTGGTTTGTTTGAGGCAGCATTATCATCAAATGCTGGGATCAAGTCTTTCGATGACAAGG
TTGTTACCTCTTCTTCTACTTGGGATTCTGACTTTCAATCTGTTTCCCAGGAAAAGAGTA
GTAGCGACCCGTTTGTAAGTTCTCCGGTTGATCTGTCTGCTCATATGGATACTGTCTTTG
GTTCCGGAAAAGATTTATTCTATGAAAAACCAGAAGATTCTTCAACTACTTATGTTTCCA
ATGCTGGTGATTGGCTGCAAGATGATTTGTTTGGTGATGTTACTGGCAAGACTCAAAACA
ACGACCAGACTGTCCATGAGGGACAAGTTGTGGGAGGCAATGGAAGTTCATCCATGGATA
TTGATTGGATGGGAGATGATCTTTGGCAAACCAGTGAAAAGAAAGCCGTTGAGCAGACAC
CTACAGATGATTTTGCAAGCTCAGTTAACTCCAAGACTCCTAGTAATCTCCTTTCGAGAA
CCATGGAAAGTTCCCAAGAGGAGGAGATATTTGATGGGCTGGCGCATGTTAAGAACGATG
TTAATGAACAGAGCAAAGATGAGAAGCAGAATACTGGTATAGCACGCGTGATATCTGAC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2BA46JQ 839 0 0
GTTGTGGGAGGCAATGGAAGTTCATCCATGGATATTGATTGGATGGGAGATGATCTTTGG
CAAACCAGTGAAAAGAAAGCCGTTGAGCAGACACCTACAGATGATTTTGCAAGCTCAGTT
AACTCCAAGACTCCTAGTAATCTCCTTTCGAGAACCATGGAAAGTTCCCAAGAGGAGGAG
ATATTTGATGGGCTGGCGCATGTTAAGAACGATGTTAATGAACAGAGCAAAGATGAGAAG
CAGAATACTGGTATAGCAGGCGTGATATCTGACATAGGCAAAGGTCAAGAAGATGATCTC
TTTGGGAATTGGGATACTTTCACATCCTCAACCGTTTTGCAAACACCTGTGCAGTCTCAC
ACGAACCAAGTGTATTCATCTGCTGAGCTGAATCCGGAAGTGTACTTGTTTGGGGATAAT
AGCCATCGCAGTGACCTTGCTTTTGATTGCTTTCCGGAAAGTACTGGAGGCCAAACCAAA
TCAGAGGAAGTCACAGCCATGCCTTCTGGAACCTCCACCTTAGAGAGAACCAGTGATCCT
GATGGTAAAGATAAAACACTCGATCTTGTAGGCACAACAACATCTCACAAGTCAAAGAGT
GATGTTGCGGAAGAGCTGATATCACAGATGCATGATCTCTCGTTTATGCTCGAGACCAAA
CTCTCTGTACCTCCAATCACCAAGGCAGAGTAATATTAATACATTGTACTCTCTCTCTCT
CTCGCCTCATGTTTTTCTTGGGGGCTAGAAAGATTGTTATATATATTTCATTTTCAATAA
CTCCAAATATCCCTTTTGCTGGCGTTGTCGCCAAGAAATGATGTTAGTCTACCAGTAGC

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

CO CL4975Contig1 300 2 2 U
GCGCATGGAGAAAGAATCTGCAAAATGGTTCACTGAATTCCTCAAACCGGGTCTGAAACA
AAAATCATCCAAGTCGACCTTCAGCGAGGAGCTCTAAGTTAAAGTCAAGTTCTCTACAAG
ATGTCAAAACTTTAGTCCCGTGGGACAATAAAAGAAGGATGAGTTTGTGTTGGAGTTCTT
CTTATGTTGTTTAGTTTATGGTGCACTGTAGTTAGAAGTGGTCTTCAATAAAGAAAAATG
GGTAAATATACCCAAACATGTGTGTTTACAAAAATATGTAAATATGTACATCAGTTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DB75JQ C 1
AF RR2DB75TF U 32
BS 1 31 RR2DB75JQ
BS 32 300 RR2DB75TF

RD RR2DB75JQ 300 0 0
GCGCATGGAGAAAGAATCTGCAAAATGGTTCACTGAATTCCTCAAACCGGGTCTGAAACA
AAAATCATCCAAGTCGACCTTCAGCGAGGAGCTCTAAGTTAAAGTCAAGTTCTCTACAAG
ATGTCAAAACTTTAGTCCCGTGGGACAATAAAAGAAGGATGAGTTTGTGTTGGAGTTCTT
CTTATGTTGTTTAGTTTATGGTGCACTGTAGTTAGAAGTGGTCTTCAATAAAGAAAAATG
GGTAAATATACCCAAACATGTGTGTTTACAAAAATATGTAAATATGTACATCAGTTGCTC

QA 1 300 1 300
DS 

RD RR2DB75TF 269 0 0
ACTGAATTCCTCAAACCGGGTCTGAAACAAAAATCATCCAAGTCGACCTTCAGCGAGGAG
CTCTAAGTTAAAGTCAAGTTCTCTACAAGATGTCAAAACTTTAGTCCCGTGGGACAATAA
AAGAAGGATGAGTTTGTGTTGGAGTTCTTCTTATGTTGTTTAGTTTATGGTGCACTGTAG
TTAGAAGTGGTCTTCAATAAAGAAAAATGGGTAAATATACCCAAACATGTGTGTTTACAA
AAATATGTAAATATGTACATCAGTTGCTC

QA 1 269 1 269
DS 



AS 1 2

CO CL4976Contig1 1069 2 6 U
GTGGGAAGAGTGTGGAGGAGAAGAAAGGTTTGTTGGCTAAATGTGCTGCTACCACTCTTT
CCTCTAAGCTTATTGGTGGAGAGAAGGAGTTTTTTGCTACTATGGTTGTTGATGCTGTTA
TGGCTATTGGGGATGACGACAGGCTTAATTTGATTGGCATCAAAAAGATTCCAGGTGGTA
ACATGCGAGACTCTTTCCTAGTTGATGGCGTGGCTGCTGCCGCCGGAGGAACAGTTCAGA
CAAGTGTTAACAATATAATACCCGAGGTTCTCGGAACTTGTGAGATATTTGAGGAAAAAC
AAGTTGGTGGGGAGAGGTTTAACATATTCAGTGGTTGCCCTTCAGGACGTACAGCAACTA
TTGTCCTCCGTGGTGGTGCTGATCAGTTCATCGAAGAAGCTGAGCGGAGCTTGCATGATG
CTATTATGATTGTGAGAAGAGCTGTGAAGAACTCAACTGTTGTGCCTGGAGGTGGAGCCA
TAGATATGGAGATAAGCAAGTACCTGAGGATGCATTCACGAACAATTGCTGGGAAGTCAC
AGCTTTTCATCAACTCGTATGCAAAGGCCCTGGAGGTTATTCCACGACAGCTATGTGACA
ATGCTGGATTTGATGCAACTGATGTCCTGAATAAATTAAGACAAAAACACGCCATGCAAA
GCGGTGAAGGAGCTTCTTATGGAGTGGACATAAACACTGGAGGAATCGCTGATTCATTTG
CTAACTTCGTCTGGGAACCAGCAGTTGTGAAGATTAATGCTATAAACGCTGCAACTGAAG
CAGCGTGCCTTATTCTAAGCGTGGATGAAACCGTGAAGAATCCTAAATCCGAGAGCGCAC
AAGGAGATGCTGCCGCAGGTGCTATGGGAAGAGGACGCGGTGGAGGTCGTGGCCGTGGTA
TGCGCAGGCGATAAGTTTTAAATCTCTAATGGCAAACTTGCAGATTTTTCTCTGAATTTT
ATTTTTGCTGAATTTTGGTGATCTTCAACAATCAAAGGCTAGTGTCGTGGTGTGTTTGTT
GACGTATGTCCATACAATTTGTTAAATGAAATTTCAGTGTGGTTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU03TF U 1
AF RR2DU03JQ C 403
BS 1 646 RR2DU03TF
BS 647 647 RR2DU03JQ
BS 648 669 RR2DU03TF
BS 670 670 RR2DU03JQ
BS 671 680 RR2DU03TF
BS 681 1069 RR2DU03JQ

RD RR2DU03TF 680 0 0
GTGGGAAGAGTGTGGAGGAGAAGAAAGGTTTGTTGGCTAAATGTGCTGCTACCACTCTTT
CCTCTAAGCTTATTGGTGGAGAGAAGGAGTTTTTTGCTACTATGGTTGTTGATGCTGTTA
TGGCTATTGGGGATGACGACAGGCTTAATTTGATTGGCATCAAAAAGATTCCAGGTGGTA
ACATGCGAGACTCTTTCCTAGTTGATGGCGTGGCTGCTGCCGCCGGAGGAACAGTTCAGA
CAAGTGTTAACAATATAATACCCGAGGTTCTCGGAACTTGTGAGATATTTGAGGAAAAAC
AAGTTGGTGGGGAGAGGTTTAACATATTCAGTGGTTGCCCTTCAGGACGTACAGCAACTA
TTGTCCTCCGTGGTGGTGCTGATCAGTTCATCGAAGAAGCTGAGCGGAGCTTGCATGATG
CTATTATGATTGTGAGAAGAGCTGTGAAGAACTCAACTGTTGTGCCTGGAGGTGGAGCCA
TAGATATGGAGATAAGCAAGTACCTGAGGATGCATTCACGAACAATTGCTGGGAAGTCAC
AGCTTTTCATCAACTCGTATGCAAAGGCCCTGGAGGTTATTCCACGACAGCTATGTGACA
ATGCTGGATTTGATGCAACTGATGTCCTGAATAAATTAAGACAAAA*CACGCCATGCAAA
GCGGTGAAG*AGCTTCTTAT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2DU03JQ 667 0 0
AGCGGAGCTTGCATGATGCTATTATGATTGTGAGAAGAGCTGTGAAGAACTCAACTGTTG
TGCCTGGAGGTGGAGCCATAGATATGGAGATAAGCAAGTACCTGAGGATGCATTCACGAA
CAATTGCTGGGAAGTCACAGCTTTTCATCAACTCGTATGCAAAGGCCCTGGAGGTTATTC
CACGACAGCTATGTGACAATGCTGGATTTGATGCAACTGATGTCCTGAATAAATTAAGAC
AAAAACACGCCATGCAAAGCGGTGAAGGAGCTTCTTATGGAGTGGACATAAACACTGGAG
GAATCGCTGATTCATTTGCTAACTTCGTCTGGGAACCAGCAGTTGTGAAGATTAATGCTA
TAAACGCTGCAACTGAAGCAGCGTGCCTTATTCTAAGCGTGGATGAAACCGTGAAGAATC
CTAAATCCGAGAGCGCACAAGGAGATGCTGCCGCAGGTGCTATGGGAAGAGGACGCGGTG
GAGGTCGTGGCCGTGGTATGCGCAGGCGATAAGTTTTAAATCTCTAATGGCAAACTTGCA
GATTTTTCTCTGAATTTTATTTTTGCTGAATTTTGGTGATCTTCAACAATCAAAGGCTAG
TGTCGTGGTGTGTTTGTTGACGTATGTCCATACAATTTGTTAAATGAAATTTCAGTGTGG
TTTTTGT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL4977Contig1 694 2 2 U
GGAGGGTTTCGATTCAGTTGCTTCATCTTCTTCATTCCGATCCAGAAATCTACCAGTTAC
AGATTCATCATCTTAAAGTTCTCCTTAAATCCATCCTCCATGATTTACATTCAATGTTAG
CTTCGCTCTTGCAAGGCGGTGGAGATTCAAGTATAAAAAGGTTAGCGTCTTACTCTCGAT
TAGACGAAGAAGAAATCTCACTAGATTAGAATTTCCCGTTTTGCGTGTTTCCAGTGTTCA
AGAGATTTGTGTATTGAGTTAAAAAAAAAGCAACGACCTTTGATCTCTTATGATTTTTGG
ATTTGCTTTTGAATTCAAAATCTTTTCATTTTCCTACAGAGACCAATTTTGTGCTCTGTA
TTTTTGTAAATTTAGTAAATAACTTCATCTCCATCAATGGAGAACGGAGGCTCCACCTCC
TCTTCCTCGGGATCATCATCGTATCTTCCCTTCAAGCCTCTATGAAAGAATTCAAACTCT
TTGAGACTCAATCGGTACCATACTACTTCCACCTTTCACATTTTGAATCGCTTGGTTAAT
TTGTAGCTAACATGAATACATGATGATATCATTTTTTTCTTTTCAGAATTTCTATATGAT
TGGTTGGAATGATAATAGAGTGTATAGAATACTAAAGAAAGACTGTCTTGATGCGTATGA
GCTTAATCCCAGTGAAGATTCCACTGCCTATACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR85TF U 1
AF RR2BR85JQ C 1
BS 1 269 RR2BR85TF
BS 270 694 RR2BR85JQ

RD RR2BR85TF 269 0 0
GGAGGGTTTCGATTCAGTTGCTTCATCTTCTTCATTCCGATCCAGAAATCTACCAGTTAC
AGATTCATCATCTTAAAGTTCTCCTTAAATCCATCCTCCATGATTTACATTCAATGTTAG
CTTCGCTCTTGCAAGGCGGTGGAGATTCAAGTATAAAAAGGTTAGCGTCTTACTCTCGAT
TAGACGAAGAAGAAATCTCACTAGATTAGAATTTCCCGTTTTGCGTGTTTCCAGTGTTCA
AGAGATTTGTGTATTGAGTTAAAAAAAAA

QA 1 269 1 269
DS 

RD RR2BR85JQ 694 0 0
GGAGGGTTTCGATTCAGTTGCTTCATCTTCTTCATTCCGATCCAGAAATCTACCAGTTAC
AGATTCATCATCTTAAAGTTCTCCTTAAATCCATCCTCCATGATTTACATTCAATGTTAG
CTTCGCTCTTGCAAGGCGGTGGAGATTCAAGTATAAAAAGGTTAGCGTCTTACTCTCGAT
TAGACGAAGAAGAAATCTCACTAGATTAGAATTTCCCGTTTTGCGTGTTTCCAGTGTTCA
AGAGATTTGTGTATTGAGTTAAAAAAAAAGCAACGACCTTTGATCTCTTATGATTTTTGG
ATTTGCTTTTGAATTCAAAATCTTTTCATTTTCCTACAGAGACCAATTTTGTGCTCTGTA
TTTTTGTAAATTTAGTAAATAACTTCATCTCCATCAATGGAGAACGGAGGCTCCACCTCC
TCTTCCTCGGGATCATCATCGTATCTTCCCTTCAAGCCTCTATGAAAGAATTCAAACTCT
TTGAGACTCAATCGGTACCATACTACTTCCACCTTTCACATTTTGAATCGCTTGGTTAAT
TTGTAGCTAACATGAATACATGATGATATCATTTTTTTCTTTTCAGAATTTCTATATGAT
TGGTTGGAATGATAATAGAGTGTATAGAATACTAAAGAAAGACTGTCTTGATGCGTATGA
GCTTAATCCCAGTGAAGATTCCACTGCCTATACC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL4978Contig1 1212 2 2 U
GGGCTTCGTTGGCGTTTCAATCCACCGGATTCGATCTCCGTCTCTCGATCGAAGCCTAAT
AAAGTTTCCACCTTTCGATGGATTTGGATAGCATGGACTGTGCTTCCACCGTAGATATCA
CAGATGACGAAGAGATCCACCAAGATCGCCATTCCTACGCATCAGTTTCGAAGCATCACA
GTAATAACAGCAACGCGAATGCTGCTGCTTCTGGTCTTCTTCCGACAACCACCAGTGTTC
ACGAGCTTCTCGAATGTCCTGTCTGCACCAATTCTATGTACCCTCCTATTCATCAGTGTC
ACAATGGACATACTCTATGTTCAACTTGTAAGAACAGGGTTCACAATCGATGCCCTACTT
GTAGACAAGAGCTCGGTGATATCCGTTGCTTGGCACTCGAAAAAGTAGCGGAATCTCTTG
AGCTACCTTGCAAGTACATGTCGCTTGGCTGTCCTGAGATATTCCCTTATTACAGTAAGC
TGAAACACGAGACTGTTTGTAACTTCAGGCCTTATAACTGTCCGTATGCTGGATCAGAGT
GTTCTGTTATGGGTGATATCCCTTTCTTAGTTGCTCATCTGAGGGATGATCACAAGGTGG
ATATGCATTCTGGGTGTACTTTCAACCATCGTTATGTCAAGTCTAATCCTCGTGAAGTCG
AAAACGCCACGTGGATGTTAACTGTCTTTCACTGCTTTGGTCAATACTTCCGTCTCCACT
TTGAGGCATTCCAGCTCGGTATGGCTCCAGTGTACATGGCGTTCCTGCGTTTCATGGGGG
ACGAGACAGAGGCTCGGAACTACAACTACAGTTTAGAAGTTGGGGGTTATGGTCGGAAGC
TGATTTGGGAAGGAACACCGAGAAGCGTAAGAGACAGTCACAGGAAAGTTAGAGACAGTC
ATGATGGGCTAATCATACAGAGGAACATGGCTCTCTTCTTCTCAGGTGGAGACAGGAAAG
AGCTGAAACTGCGAGTTACTGGAAGAATCTGGAAAGAGCAGCAGCAGCAAAGTGGTGAAG
GTGGAGGAGGAGCTTGTATCCCAAACTTGTCTTAATAATAAATTGATTTTTGAAACTCTT
CACTTGGCTCTGTCTATGTAACCATGGTTCTTGGAAGTGTCTGTAATTAAAGGCTGTGTC
TGTGATCTATGATGTAAACTTGGGTTGTGGCTTCTTTTGTTTTTCTCATGTCATGGAGAG
TTTAAATGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX14TF U 1
AF RR2BX14JQ C 415
BS 1 694 RR2BX14TF
BS 695 1212 RR2BX14JQ

RD RR2BX14TF 694 0 0
GGGCTTCGTTGGCGTTTCAATCCACCGGATTCGATCTCCGTCTCTCGATCGAAGCCTAAT
AAAGTTTCCACCTTTCGATGGATTTGGATAGCATGGACTGTGCTTCCACCGTAGATATCA
CAGATGACGAAGAGATCCACCAAGATCGCCATTCCTACGCATCAGTTTCGAAGCATCACA
GTAATAACAGCAACGCGAATGCTGCTGCTTCTGGTCTTCTTCCGACAACCACCAGTGTTC
ACGAGCTTCTCGAATGTCCTGTCTGCACCAATTCTATGTACCCTCCTATTCATCAGTGTC
ACAATGGACATACTCTATGTTCAACTTGTAAGAACAGGGTTCACAATCGATGCCCTACTT
GTAGACAAGAGCTCGGTGATATCCGTTGCTTGGCACTCGAAAAAGTAGCGGAATCTCTTG
AGCTACCTTGCAAGTACATGTCGCTTGGCTGTCCTGAGATATTCCCTTATTACAGTAAGC
TGAAACACGAGACTGTTTGTAACTTCAGGCCTTATAACTGTCCGTATGCTGGATCAGAGT
GTTCTGTTATGGGTGATATCCCTTTCTTAGTTGCTCATCTGAGGGATGATCACAAGGTGG
ATATGCATTCTGGGTGTACTTTCAACCATCGTTATGTCAAGTCTAATCCTCGTGAAGTCG
AAAACGCCACGTGGATGTTAACTGTCTTTCACTG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2BX14JQ 798 0 0
ATCTCTGAGCTA
CTTGCAAGTACATGTCGCTTGGCTGTC*TGAGATATTCCCTTATTACAGTAAGCTGAAAC
ACGAGACTGTTTGTAACTTCAGGCCTTATAACTGTCCGTATGCTGGATCAGAGTGTTCTG
TTATGGGTGATATCCCTTTCTTAGTTGCTCATCTGAGGGATGATCACAAGGTGGATATGC
ATTCTGGGTGTACTTTCAACCATCGTTATGTCAAGTCTAATCCTCGTGAAGTCGAAAACG
CCACGTGGATGTTAACTGTCTTTCACTGCTTTGGTCAATACTTCCGTCTCCACTTTGAGG
CATTCCAGCTCGGTATGGCTCCAGTGTACATGGCGTTCCTGCGTTTCATGGGGGACGAGA
CAGAGGCTCGGAACTACAACTACAGTTTAGAAGTTGGGGGTTATGGTCGGAAGCTGATTT
GGGAAGGAACACCGAGAAGCGTAAGAGACAGTCACAGGAAAGTTAGAGACAGTCATGATG
GGCTAATCATACAGAGGAACATGGCTCTCTTCTTCTCAGGTGGAGACAGGAAAGAGCTGA
AACTGCGAGTTACTGGAAGAATCTGGAAAGAGCAGCAGCAGCAAAGTGGTGAAGGTGGAG
GAGGAGCTTGTATCCCAAACTTGTCTTAATAATAAATTGATTTTTGAAACTCTTCACTTG
GCTCTGTCTATGTAACCATGGTTCTTGGAAGTGTCTGTAATTAAAGGCTGTGTCTGTGAT
CTATGATGTAAACTTGGGTTGTGGCTTCTTTTGTTTTTCTCATGTCATGGAGAGTTTAAA
TGGTCC

QA 13 798 13 798
DS 



AS 1 2

CO CL4979Contig1 1252 2 4 U
GTCAGCAAACATCTTCAAAACGCTAAACCCACAGCCACGCGAGAACAAAGTCATCGACGC
TTTAGACCTCGAGGAGGAAGAGCCTTCCATGGACCTCGCCTGGCCTCACTTGCAGCTCGT
CTACGAGCTTTTCCTGAGGTTCGTTGCTTCTCCTGAGACTGGCACCAAGCTGGCCAAAAG
ATACATAGACCAATCCTTCGTCCTGAGGTTACTAGACCTGTTTGACTCAGAGGATCCTAG
AGAGAGAGACTGCCTCAAAACAATCCTCCACCGGATCTACGGTAAATTCATGGTCCACCG
TCCTTTCATCAGGAAGTCGATAAACAACATCTTCTACAGGTTCGTCTTCGAGACAGAGAA
ACACAACGGGATCGCCGAGTTTCTTGAAATCTTGGGAAGTATAATCAACGGTTTTGCTCT
TCCTTTGAAAGAAGAGCACAAAGTGTTTCTCGTTCGGGTTTTGATACCGCTCCACCAAAC
CGAAAGGGTTGCAGATGTATCACCAGCAGTTGTCTTATTGCATCACGCAGTTTGTGGAGA
AGGATTGCAAACTCGCTGATACGGTTATAAGAGGGTTGCTCAAGTACTGGCCCGTGACGA
ATAGTTCTAAAGAAGTCATGTTTCTGAATGAGCTGGAGGAAGTGCTTGAAGCGACGCAGC
CTCCGGAGTTCCAGCGGTGTATGGTGCCGCTCTTTCGCCAGATAGCTCGGTGTTTGAACA
GCCTGCATTTTCAGGTTGCAGAGAGAGCTTTATTCTTATGGAGCAACAATCACATAGAGA
ATCTGATAATGCAGAGCCGCAAAGTCATTCTCCCAATTATATTCCCTGCGTTGGAGAGAA
ACGCACAGAAACATTGGAACCAAGCTGTTCATAGCTTGGCGCTAAACGTGAGGAAGATAT
TCCAAGACCTGGACCCTGAGCTGTTCAAGGAATGCCTCGCTAAGTTCAAAGAAGACGAAT
CAAAGGAAGGTGAGACCAAGGCCAAACGTGAGGCCACTTGGAAACGGTTGGAAGAAGTTG
GAATGCGAAAAGGGTAAATGAGATTTAGAGCTATAGAGGATTGTGACATCATCAATTCAG
GAGAAAAGTTTCAATATTTGGGTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCAAGTTCCCATTATTA
TTATTATAATATTTTTTTTGTTTCCTGTAAAATCTTCTTGTTAATTGTTTTTTTTGTTGT
TGTTGCTACATTGTCTATGTTCCCACGTTCTTGAGACTGTCTTTGTTCATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP23TF U 1
AF RR2AP23JQ C 449
BS 1 475 RR2AP23TF
BS 476 476 RR2AP23JQ
BS 477 725 RR2AP23TF
BS 726 1252 RR2AP23JQ

RD RR2AP23TF 725 0 0
GTCAGCAAACATCTTCAAAACGCTAAACCCACAGCCACGCGAGAACAAAGTCATCGACGC
TTTAGACCTCGAGGAGGAAGAGCCTTCCATGGACCTCGCCTGGCCTCACTTGCAGCTCGT
CTACGAGCTTTTCCTGAGGTTCGTTGCTTCTCCTGAGACTGGCACCAAGCTGGCCAAAAG
ATACATAGACCAATCCTTCGTCCTGAGGTTACTAGACCTGTTTGACTCAGAGGATCCTAG
AGAGAGAGACTGCCTCAAAACAATCCTCCACCGGATCTACGGTAAATTCATGGTCCACCG
TCCTTTCATCAGGAAGTCGATAAACAACATCTTCTACAGGTTCGTCTTCGAGACAGAGAA
ACACAACGGGATCGCCGAGTTTCTTGAAATCTTGGGAAGTATAATCAACGGTTTTGCTCT
TCCTTTGAAAGAAGAGCACAAAGTGTTTCTCGTTCGGGTTTTGATACCGCTCCAC*AAAC
CGAAAGGGTTGCAGATGTATCACCAGCAGTTGTCTTATTGCATCACGCAGTTTGTGGAGA
AGGATTGCAAACTCGCTGATACGGTTATAAGAGGGTTGCTCAAGTACTGGCCCGTGACGA
ATAGTTCTAAAGAAGTCATGTTTCTGAATGAGCTGGAGGAAGTGCTTGAAGCGACGCAGC
CTCCGGAGTTCCAGCGGTGTATGGTGCCGCTCTTTCGCCAGATAGCTCGGTGTTTGAACA
GCCTG

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2AP23JQ 804 0 0
CTCGTTCGGGTTTTGATACCGCTCCCCCAAACCGAAAGGGTTGCAGATGTATCACCAGCA
GTTGTCTTATTGCATCACGCAGTTTGTGGAGAAGGATTGCAAACTCGCTGATACGGTTAT
AAGAGGGTTGCTCAAGTACTGGCCCGTGACGAATAGTTCTAAAGAAGTCATGTTTCTGAA
TGAGCTGGAGGAAGTGCTTGAAGCGACGCAGCCTCCGGAGTTCCAGCGGTGTATGGTGCC
GCTCTTTCGCCAGATAGCTCGGTGTTTGAACAGCCTGCATTTTCAGGTTGCAGAGAGAGC
TTTATTCTTATGGAGCAACAATCACATAGAGAATCTGATAATGCAGAGCCGCAAAGTCAT
TCTCCCAATTATATTCCCTGCGTTGGAGAGAAACGCACAGAAACATTGGAACCAAGCTGT
TCATAGCTTGGCGCTAAACGTGAGGAAGATATTCCAAGACCTGGACCCTGAGCTGTTCAA
GGAATGCCTCGCTAAGTTCAAAGAAGACGAATCAAAGGAAGGTGAGACCAAGGCCAAACG
TGAGGCCACTTGGAAACGGTTGGAAGAAGTTGGAATGCGAAAAGGGTAAATGAGATTTAG
AGCTATAGAGGATTGTGACATCATCAATTCAGGAGAAAAGTTTCAATATTTGGGTCTCTT
CTTCTTCTTCTTCTTCCAAGTTCCCATTATTATTATTATAATATTTTTTTTGTTTCCTGT
AAAATCTTCTTGTTAATTGTTTTTTTTGTTGTTGTTGCTACATTGTCTATGTTCCCACGT
TCTTGAGACTGTCTTTGTTCATTC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL4980Contig1 1087 2 4 U
GGATAAACCCTAAAAGTTTCTCTCTCAAAAACCAAATTTGCATTTGCTTCTTCATCATCT
ACTCCTTACTTTTTTTTCTCCCTGCGAAACAGAGTAGCATCTCGGGTTCAGCAGCTTCAT
TTAGGCCTGACTGGTTTAACCGCAGCGGTTGCGTTTGCGGTTGCGGGAGTTTACGGGTGC
GGGTGGTTGCGGTTTCAAGCGTTTTCTAGAGATTTGTACGACTGAACTAAAAGTAATCAG
AATTGCTTGATCATAATCATGGAGGAAGCAACTCAAGTAGCGAGTTCCGAGGTTCCTGTA
GTGAAAGGAGATGCTGATGACCTTAAGACAGTTGATGTTTCTGTCAAGGCTGTGAACGGA
GATGTGACGAAGGAAGGTAAAGGAGAGGATGATGGGGAGTTCATAAAAGTTGAGAAGGAA
GCTTTTGACGCCAAAGATGATGCAGAGAAAAATCAAGTTTCAATTGAAAGAAGCTCGAGT
GGTTCGCTAAGAGAACTACAAGAATCACAAGAGAAGGCGAAGGAGCTAGAGCTGGAGTTG
GAAAGAAAGAGAGAGAGAGTAGAAGAGGTAGAAGCAATGGAGGGAGCAGAAGAAGCTGGA
GCGGAGATAATGGTTGATTCAAAGGACTTACAGCAACAAAGCAAAGCTTTAGACAAGCTT
ACCGATCGCGTTGAGGATCGCCAGCTCGATTCTAATCGTGTTCAATCGGCTATGGCTTCG
ATTGCTGCTTCTAGAGAGGCTGATCTGAATGCTAAGAGATTGAGGGAGAAGGAACTGGCT
TCTGTTAAGATCAATGCTGCAGATGTTGAGCCCATTGTAAACGAACTCGAGCTGGAGAAG
AATGTTGTGGAGAGAACTCTAAGGGAGCACAAAGGCGATGCAGTTGCTGCAACTAGGGAA
TTGCTTTCTCGATATCCACTTTGATCGATCATTACCTGCTTTACTTCTCGCAGTTTCTTT
TGTCTGTGTAAGGTGTCCGAATATTCAACTCATGTTTGAAGTTTCCGTACTAAACTTATG
AGATATTATTGCAACAGTGGCACATGCTAAAAGCAAGACAATAATAAGTTTAACATTAAT
CCGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D861TF U 1
AF RR2D861JQ C 478
BS 1 738 RR2D861TF
BS 739 739 RR2D861JQ
BS 740 750 RR2D861TF
BS 751 1087 RR2D861JQ

RD RR2D861TF 750 0 0
GGATAAACCCTAAAAGTTTCTCTCTCAAAAACCAAATTTGCATTTGCTTCTTCATCATCT
ACTCCTTACTTTTTTTTCTCCCTGCGAAACAGAGTAGCATCTCGGGTTCAGCAGCTTCAT
TTAGGCCTGACTGGTTTAACCGCAGCGGTTGCGTTTGCGGTTGCGGGAGTTTACGGGTGC
GGGTGGTTGCGGTTTCAAGCGTTTTCTAGAGATTTGTACGACTGAACTAAAAGTAATCAG
AATTGCTTGATCATAATCATGGAGGAAGCAACTCAAGTAGCGAGTTCCGAGGTTCCTGTA
GTGAAAGGAGATGCTGATGACCTTAAGACAGTTGATGTTTCTGTCAAGGCTGTGAACGGA
GATGTGACGAAGGAAGGTAAAGGAGAGGATGATGGGGAGTTCATAAAAGTTGAGAAGGAA
GCTTTTGACGCCAAAGATGATGCAGAGAAAAATCAAGTTTCAATTGAAAGAAGCTCGAGT
GGTTCGCTAAGAGAACTACAAGAATCACAAGAGAAGGCGAAGGAGCTAGAGCTGGAGTTG
GAAAGAAAGAGAGAGAGAGTAGAAGAGGTAGAAGCAATGGAGGGAGCAGAAGAAGCTGGA
GCGGAGATAATGGTTGATTCAAAGGACTTACAGCAACAAAGCAAAGCTTTAGACAAGCTT
ACCGATCGCGTTGAGGATCGCCAGCTCGATTCTAATCGTGTTCAATCGGCTATGGCTTCG
ATTGCTGCTTCTAGAGAG*CTGATCTGAAT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2D861JQ 610 0 0
AGTGGTTCGCTAAGAGAACTACAAGAATCACAAGAGAAGGCGAAGGAGCTAGAGCTGGAG
TTGGAAAGAAAGAGAGAGAGAGTAGAAGAGGTAGAAGCAATGGAGGGAGCAGAAGAAGCT
GGAGCGGAGATAATGGTTGATTCAAAGGACTTACAGCAACAAAGCAAAGCTTTAGACAAG
CTTACCGATCGCGTTGAGGATCGCCAGCTCGATTCTAATCGTGTTCAATCGGCTATGGCT
TCGATTGCTGCTTCTAGAGAGGCTGATCTGAATGCTAAGAGATTGAGGGAGAAGGAACTG
GCTTCTGTTAAGATCAATGCTGCAGATGTTGAGCCCATTGTAAACGAACTCGAGCTGGAG
AAGAATGTTGTGGAGAGAACTCTAAGGGAGCACAAAGGCGATGCAGTTGCTGCAACTAGG
GAATTGCTTTCTCGATATCCACTTTGATCGATCATTACCTGCTTTACTTCTCGCAGTTTC
TTTTGTCTGTGTAAGGTGTCCGAATATTCAACTCATGTTTGAAGTTTCCGTACTAAACTT
ATGAGATATTATTGCAACAGTGGCACATGCTAAAAGCAAGACAATAATAAGTTTAACATT
AATCCGTTGT

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL4981Contig1 1392 2 2 U
ATCACGCGCCACTCTTCTTCCACCACCACCTCTCTTTAACGACGAGATGAATAGCTTGAC
GACGACGACGACGAGTCCAATGGCTCGAGCCTTGGTGCATCTTCACTCTTATGCACCGTT
AAACTTACGTTCGAGACAGCCACCTGCAGGAGTATGTTTAAGACCGCCACGCAGGACTCC
ACGACTCGTCTGTATGGCCGAGCCTTACCTCATCACGAAAATGGAGTCTGTTGAGAAGAC
ATGGAAGGAGTTATCTGTAAAACTAGCAGACCCAGATGTTGTTTCTAATCCTTCTGAATA
CCAGAAACTTGCACAGTCCATGTCCGAGCTTGACGAGGTTGTATCCGTATTTAGGAGATT
CAAGGACTGTGAGAAGCAGTTACAAGAATCCAAAGTTTTGGCGAAAGAGGCCGGAGATGA
TGAAGATATGGCTGAAATGATAGGATCTGAAATCAATTCCCTCTCTAAAGAAATTGAGGA
GCTTGAAAAACAACTTAAGATGCTACTTCTTCCCACCAACCCTCTTGATGCCAGAAACAT
ATTGCTCGAAGTCAGAGCAGGAACTGGTGGAGATGAAGCTGCTATTTGGACTGGTGACCT
TGTGCGGATGTATCAGAGGTACAGCGAGCGCAGCTCTTGGAAGTTTTCTCTGGTTTCATG
CTCTGAGGCTGAACATGGAGGTTACAAGACGTGTGTGATGGAGATAAAAGGAAACCGTGT
CTATAGCAAGCTCAAATACGAATCTGGTGTTCATAGAGTCCAGCGTGTCCCTCAAACAGA
AACACAGGGCCGTGTTCACACTTCTACAGCAACTGTAGCCATCATGCCAGAGGCTGATGA
AGTGGAAGTTGTGATTGACCCCAAGGACATTGAACTTACAACTGCGAGATCTGGTGGCGC
TGGAGGGCAAAATGTGAACAAAGTGGAGACGGCTATAGACCTAGTCCATAAACCATCAGG
GATACGCATTTTCTGTACTGAAGAAAGGACTCAGATACGAAACAAGGCTCGTGCTTTCCA
GCTTCTGCGAGCAAAACTGTATGAAATCAAATTAAGGGAACAACAAGAGAAGATAAGGGA
TCAAAGAAAATCTCAGGTTGGGACTGGAGCTCGTTCAGAAAAGATAAGAACATATAATTA
TAGGGATAGTAGAGTGACTGATCATAGGCTAAAGATGAACTTTGCGCTTACATCATTTCT
TGAAGGTGGCTTAGAGGATGCAGTGCAGGCTTGTGCTGCTTTGGAGCAAAAGGAACTCAT
GGAAGAACTGTCTGAGTCTGTAGCTGCTTCCTGATAAAGCCTCTCATTACTATACTCAAC
AGAGATCATAACTATAAAATCTCTATTTGTTTATGAAAGTCTTTGAACAGATATCATATT
TATAAAGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA56TF U 1
AF RR2BA56JQ C 552
BS 1 824 RR2BA56TF
BS 825 1392 RR2BA56JQ

RD RR2BA56TF 824 0 0
ATCACGCGCCACTCTTCTTCCACCACCACCTCTCTTTAACGACGAGATGAATAGCTTGAC
GACGACGACGACGAGTCCAATGGCTCGAGCCTTGGTGCATCTTCACTCTTATGCACCGTT
AAACTTACGTTCGAGACAGCCACCTGCAGGAGTATGTTTAAGACCGCCACGCAGGACTCC
ACGACTCGTCTGTATGGCCGAGCCTTACCTCATCACGAAAATGGAGTCTGTTGAGAAGAC
ATGGAAGGAGTTATCTGTAAAACTAGCAGACCCAGATGTTGTTTCTAATCCTTCTGAATA
CCAGAAACTTGCACAGTCCATGTCCGAGCTTGACGAGGTTGTATCCGTATTTAGGAGATT
CAAGGACTGTGAGAAGCAGTTACAAGAATCCAAAGTTTTGGCGAAAGAGGCCGGAGATGA
TGAAGATATGGCTGAAATGATAGGATCTGAAATCAATTCCCTCTCTAAAGAAATTGAGGA
GCTTGAAAAACAACTTAAGATGCTACTTCTTCCCACCAACCCTCTTGATGCCAGAAACAT
ATTGCTCGAAGTCAGAGCAGGAACTGGTGGAGATGAAGCTGCTATTTGGACTGGTGACCT
TGTGCGGATGTATCAGAGGTACAGCGAGCGCAGCTCTTGGAAGTTTTCTCTGGTTTCATG
CTCTGAGGCTGAACATGGAGGTTACAAGACGTGTGTGATGGAGATAAAAGGAAACCGTGT
CTATAGCAAGCTCAAATACGAATCTGGTGTTCATAGAGTCCAGCGTGTCCCTCAAACAGA
AACACAGGGCCGTGTTCACACTTCTACAGCAACTGTAGCCATCA

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2BA56JQ 841 0 0
TCAGAGCAGGAACTGGTGGAGATGAAGCTGCTATTTGGACTGGTGAC*TTGTGCGGATGT
ATCAGAGGTACAGCGAGCGCAGCTCTTGGAAGTTTTCTCTGGTTTCATGCTCTGAGGCTG
AACATGGAGGTTACAAGACGTGTGTGATGGAGATAAAAGGAAACCGTGTCTATAGCAAGC
TCAAATACGAATCTGGTGTTCATAGAGTCCAGCGTGTCCCTCAAACAGAAACACAGGGCC
GTGTTCACACTTCTACAGCAACTGTAGCCATCATGCCAGAGGCTGATGAAGTGGAAGTTG
TGATTGACCCCAAGGACATTGAACTTACAACTGCGAGATCTGGTGGCGCTGGAGGGCAAA
ATGTGAACAAAGTGGAGACGGCTATAGACCTAGTCCATAAACCATCAGGGATACGCATTT
TCTGTACTGAAGAAAGGACTCAGATACGAAACAAGGCTCGTGCTTTCCAGCTTCTGCGAG
CAAAACTGTATGAAATCAAATTAAGGGAACAACAAGAGAAGATAAGGGATCAAAGAAAAT
CTCAGGTTGGGACTGGAGCTCGTTCAGAAAAGATAAGAACATATAATTATAGGGATAGTA
GAGTGACTGATCATAGGCTAAAGATGAACTTTGCGCTTACATCATTTCTTGAAGGTGGCT
TAGAGGATGCAGTGCAGGCTTGTGCTGCTTTGGAGCAAAAGGAACTCATGGAAGAACTGT
CTGAGTCTGTAGCTGCTTCCTGATAAAGCCTCTCATTACTATACTCAACAGAGATCATAA
CTATAAAATCTCTATTTGTTTATGAAAGTCTTTGAACAGATATCATATTTATAAAGTCTC
C

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 2

CO CL4982Contig1 284 2 2 U
GAGGATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTCCAATGCATCAGTTTCATCGCCTACAA
GCCACCAAGCCTCACCGATGCTTAATCACGTTACAAGACATTCATAAATAATATCTACTC
ATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCTTTTTTTTTCTTTGGCTTTTTGTTTATGAGATATCG
GATTGTCAAGTGTCTGATTTATGAACATGTAATCTCTATATTGCATTTTCTTTTTGGTTA
CTTATTGATGGCTATTAGGTTATCAATTATTACTGGTACAAGGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AA77JQ C 1
AF RR2AA77TF U 1
BS 1 282 RR2AA77TF
BS 283 284 RR2AA77JQ

RD RR2AA77JQ 284 0 0
GAGGATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTCCAATGCATCAGTTTCATCGCCTACAA
GCCACCAAGCCTCACCGATGCTTAATCACGTTACAAGACATTCATAAATAATATTTACTC
ATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTTTTTTTTTTTCTTTGGCTTTTTGTTTATGAGATATCG
GATTGTCAAGTGTTTGATTTATGAACATGTAATCTCTATATTGCATTTTCTTTTTGGTTA
CTTATTGATGGCTATTAGGTTATCAATTATTACTGGTACAAGGG

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2AA77TF 284 0 0
GAGGATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTCCAATGCATCAGTTTCATCGCCTACAA
GCCACCAAGCCTCACCGATGCTTAATCACGTTACAAGACATTCATAAATAATATCTACTC
ATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCTTTTTTTTTCTTTGGCTTTTTGTTTATGAGATATCG
GATTGTCAAGTGTCTGATTTATGAACATGTAATCTCTATATTGCATTTTCTTTTTGGTTA
CTTATTGATGGCTATTAGGTTATCAATTATTACTGGTACAAG
AG

QA 1 282 1 282
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4984Contig1 709 2 4 U
CTGAAGAAAAAAAGGATGAAGCCTATGTTTTACTTCCTTGTTGCCTTAACCGCTGTTTTG
GCCGTGACCATAAACGCCCAACCAGTTCTCGACACTGATGGTGATATCATATTCGGTGGC
AATTACTACGTTCTCCCCGCCATCTTCGGTGCTGGAGGTGGCGGCCTGAATCTCGCCCCC
CGTGGTAACAACCAATGTCCCCTCTTTGTCGGACAGGAAATCTCAGAGGTCAACAGGGGG
ATCCCCGTAAAATTCTCAAACTGGAGGATTAAAGTTCCGTTCGTTCCCGAATCAACTAAC
CTTAACATCGAGATGGACGTCAAAGCCACGATATGCGTTCAGTCAACCTATTGGTGGGTC
ACTGGGGCCCCAAGTCACTCTAGGACATTGTTCATAACGGCTGGTCCTAACCCTGAAGCT
GGAGAAGATTCGTCGAGGAGTTTCTTCAAGATCGAGAAAGCTAAAGGTTTTCCTGGCGGT
TACCAGATTGTGTCTTGTCCTAACGGTAATGATTGCATCAACGTCGGTATAATTAACGAC
GAATATGGCGTGAGACGTTTGGCTTTAACCTCTACACCATTTTCGTTTGTGTTCATGAAA
GCTGATGAGACAGAGACTTATCCCAAGACTATGTCTATCATCTGAGAGAAATTAAAGACT
ACAAAATTAAGAAGATAAGAGTTTTAACCTACGACTAATAATAAAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT92TF U 1
AF RR2GT92JQB C 186
BS 1 294 RR2GT92TF
BS 295 295 RR2GT92JQB
BS 296 307 RR2GT92TF
BS 308 709 RR2GT92JQB

RD RR2GT92TF 307 0 0
CTGAAGAAAAAAAGGATGAAGCCTATGTTTTACTTCCTTGTTGCCTTAACCGCTGTTTTG
GCCGTGACCATAAACGCCCAACCAGTTCTCGACACTGATGGTGATATCATATTCGGTGGC
AATTACTACGTTCTCCCCGCCATCTTCGGTGCTGGAGGTGGCGGCCTGAATCTCGCCCCC
CGTGGTAACAACCAATGTCCCCTCTTTGTCGGACAGGAAATCTCAGAGGTCAACAGGGGG
ATCCCCGTAAAATTCTCAAACTGGAGGATTAAAGTTCCGTTCGTTCCCGAATCAGCTAAC
CTTAACA

QA 1 307 1 307
DS 

RD RR2GT92JQB 524 0 0
TAACAACCAATGTCCCCTCTTTGTCGGACAGGAAATCTCAGAGGTCAACAGGGGGATCCC
CGTAAAATTCTCAAACTGGAGGATTAAAGTTCCGTTCGTTCCCGAATCAACTAACCTTAA
CATCGAGATGGACGTCAAAGCCACGATATGCGTTCAGTCAACCTATTGGTGGGTCACTGG
GGCCCCAAGTCACTCTAGGACATTGTTCATAACGGCTGGTCCTAACCCTGAAGCTGGAGA
AGATTCGTCGAGGAGTTTCTTCAAGATCGAGAAAGCTAAAGGTTTTCCTGGCGGTTACCA
GATTGTGTCTTGTCCTAACGGTAATGATTGCATCAACGTCGGTATAATTAACGACGAATA
TGGCGTGAGACGTTTGGCTTTAACCTCTACACCATTTTCGTTTGTGTTCATGAAAGCTGA
TGAGACAGAGACTTATCCCAAGACTATGTCTATCATCTGAGAGAAATTAAAGACTACAAA
ATTAAGAAGATAAGAGTTTTAACCTACGACTAATAATAAAACTC

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

CO CL4985Contig1 764 2 2 U
TTTGCTTCTAAGAGAAATAATTATTTGTTGGTCGTAACAAAGTGTGAAGCTACATACGCT
CATCAAGTCATCATCATCACAAAATTGCTCGAGAACAAAAAAAAAACACAAAAGCAAATG
ACATGGTTTACGGGATCACGTTTTTGATCACACACCGTATCGAATCAAAATACAATTCAG
GAGCAACAACAGAATAACAAACATAGGAAGTATATATTATACGAAACAAATGTTTAAAAA
TCAATCGGTCGATGTTAATAAGTATAGAACTCAGCCAATTCTTCAACGGGTCCTCCTTCC
TGACCAGTCTTTAGCATCCACAACAAGTGTTCGAACAAAACAACTTCACAAGCTACAACA
ATCTCACGATCTTGTTCATCGGATCTAGAAGACCTATCCACCAGTTCTTGAAAAAGTGGG
TGAGAGATGATGTCCGGTCTAAGCATGTAAGGTCTTCGAGTCTGACCAACATAAACAACA
TGGAGATTGTTGTTCTCTGAGAGCTCATCGGAGACAGCAGCCGAGGAGGACGAGTGGTGG
TGATTCTTGGCGAAGGAAGGCCATTTCTTTATTGCCGACTTGAGCTTTGTCAGCTTCCCA
ACTTTGGCCATTGCTTTTGAAACTAACCTCTTTCTTCTTGGATTCGGAACAAGAGTGTTG
TCGAAACAAGATAGGGTTTAGGGTTTATGAGAATATATGATTTATGAGTGTGTGTTGGTC
AAAAGATTGAATGAAGAATAGAAAATGTTTTGAGATGTTCTTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F289TF C 1
AF RR2F289JQ U 4
BS 1 3 RR2F289TF
BS 4 764 RR2F289JQ

RD RR2F289TF 764 0 0
TTTGCTTCTAAGAGAAATAATTATTTGTTGGTCGTAACAAAGTGTGAAGCTACATACGCT
CATCAAGTCATCATCATCACAAAATTGCTCGAGAACAAAAAAAAAACACAAAAGCAAATG
ACATGGTTTACGGGATCACGTTTTTGATCACACACCGTATCGAATCAAAATACAATTCAG
GAGCAACAACAGAATAACAAACATAGGAAGTATATATTATACGAAACAAATGTTTAAAAA
TCAATCGGTCGATGTTAATAAGTATAGAACTCAGCCAATTCTTCAACGGGTCCTCCTTCC
TGACCAGTCTTTAGCATCCACAACAAGTGTTCGAACAAAACAACTTCACAAGCTACAACA
ATCTCACGATCTTGTTCATCGGATCTAGAAGACCTATCCACCAGTTCTTGAAAAAGTGGG
TGAGAGATGATGTCCGGTCTAAGCATGTAAGGTCTTCGAGTCTGACCAACATAAACAACA
TGGAGATTGTTGTTCTCTGAGAGCTCATCGGAGACAGCAGCCGAGGAGGACGAGTGGTGG
TGATTCTTGGCGAAGGAAGGCCATTTCTTTATTGCCGACTTGAGCTTTGTCAGCTTCCCA
ACTTTGGCCATTGCTTTTGAAACTAACCTCTTTCTTCTTGGATTCGGAACAAGAGTGTTG
TCGAAACAAGATAGGGTTTAGGGTTTATGAGAATATATGATTTATGAGTGTGTGTTGGTC
AAAAGATTGAATGAAGAATAGAAAATGTTTTGAGATGTTCTTCC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2F289JQ 761 0 0
GCTTCTAAGAGAAATAATTATTTGTTGGTCGTAACAAAGTGTGAAGCTACATACGCTCAT
CAAGTCATCATCATCACAAAATTGCTCGAGAACAAAAAAAAAACACAAAAGCAAATGACA
TGGTTTACGGGATCACGTTTTTGATCACACACCGTATCGAATCAAAATACAATTCAGGAG
CAACAACAGAATAACAAACATAGGAAGTATATATTATACGAAACAAATGTTTAAAAATCA
ATCGGTCGATGTTAATAAGTATAGAACTCAGCCAATTCTTCAACGGGTCCTCCTTCCTGA
CCAGTCTTTAGCATCCACAACAAGTGTTCGAACAAAACAACTTCACAAGCTACAACAATC
TCACGATCTTGTTCATCGGATCTAGAAGACCTATCCACCAGTTCTTGAAAAAGTGGGTGA
GAGATGATGTCCGGTCTAAGCATGTAAGGTCTTCGAGTCTGACCAACATAAACAACATGG
AGATTGTTGTTCTCTGAGAGCTCATCGGAGACAGCAGCCGAGGAGGACGAGTGGTGGTGA
TTCTTGGCGAAGGAAGGCCATTTCTTTATTGCCGACTTGAGCTTTGTCAGCTTCCCAACT
TTGGCCATTGCTTTTGAAACTAACCTCTTTCTTCTTGGATTCGGAACAAGAGTGTTGTCG
AAACAAGATAGGGTTTAGGGTTTATGAGAATATATGATTTATGAGTGTGTGTTGGTCAAA
AGATTGAATGAAGAATAGAAAATGTTTTGAGATGTTCTTCC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL4986Contig1 1204 2 2 U
GTACCGTTTTGTTTAACATGCCAGTCAACCATAGCAGGTGACCTTGCGTATGTTTCTCTA
TATTAAGGAATGGGAAGTGGAGAGAATATGTAGTTACCTCGCCAGATGATGCCATGAAAT
TCATCAAGCAATAAATTGATCCTTTATGGCCACCTGTATATCTACGCGCAAGCTACAAGG
AAGTAAACATTCAGAGAAATTAACACAGATTTGTAACTATAGCTCTCACCTTAAACCCAG
TAGAAAAAAATAAAATAAACATTCAATTTTGGAACAAGCATACCTTCCATGTTATCATTG
ATAAAACCCTAATAACACCATCAGTTGAACCAAATGCAACTAAAGGGCCATCACCACCAG
ATGATCTGGAAAGAAACTCCATGCTGCAATGAAAGGAGAAAGTCTAACATTGGAGCAGAA
GAATTCGGAAAAGCAGACAGCCTCTTTGAACACCACACTTAAAGGCTAAAGCACACACAC
AGACATTAACTTGTCATAGTCTACATTCGACTCTAATATTTCCAGCGTAGTAACTAATGG
AGGTCTTTACCGGATCCAAGCAACAAGCGTATTAGCAGACTAGATAAATCAAGCAAGCTA
TGATCTAAAATCATAAATTGGCAAAGAACTTACCAGAGAAGAGATCTGTTGTCAAGCTCT
TGCTTTGGCACATCTCGGCCACGCATTGTCACCAAGCCCAAGAAAATGGCTTTATTCTCA
CAACAGATAACCAGAAAATGCCGGCCTTTAGTCGACGGAGCAGGAGAAGTAAAACCGGAC
GTGAGATGATTGACAGCAGATGGAGATTCAGCAGCTGCAGAGCGATTGCGCCACAGTTGC
CAATAACGCACATCATCGTCATAAAACTCCACCTGCTTAACACTTGTAGATGGAAATAAA
CAAGATTTCAGCAGATTATCATTTTTTTTTAAAATCTCGGCAAAGATGTAATAATACCTT
CCTCCTCGAATGGCTTCGGTAGGTTTGCCTTTATAGTCTGAGCAAAAAACATGAACGCCA
ATCATTAACCGCATAATCATTAATCCAGAATAAAATGAAGAAGTTGATTATAGCTCACCA
GAGTCTCCCTCGGCTAACTTCTCTAGCTTAGCACCAACTAAACGCCGCTCGTCGACTCCA
CCGGCTTTCAATTCATAAATCACCTACAAACACGTTGAGGAGGAGATACTCGATTCGAGA
ACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2G273TF U 1
AF RR2G273JQ C 428
BS 1 700 RR2G273TF
BS 701 1204 RR2G273JQ

RD RR2G273TF 700 0 0
GTACCGTTTTGTTTAACATGCCAGTCAACCATAGCAGGTGACCTTGCGTATGTTTCTCTA
TATTAAGGAATGGGAAGTGGAGAGAATATGTAGTTACCTCGCCAGATGATGCCATGAAAT
TCATCAAGCAATAAATTGATCCTTTATGGCCACCTGTATATCTACGCGCAAGCTACAAGG
AAGTAAACATTCAGAGAAATTAACACAGATTTGTAACTATAGCTCTCACCTTAAACCCAG
TAGAAAAAAATAAAATAAACATTCAATTTTGGAACAAGCATACCTTCCATGTTATCATTG
ATAAAACCCTAATAACACCATCAGTTGAACCAAATGCAACTAAAGGGCCATCACCACCAG
ATGATCTGGAAAGAAACTCCATGCTGCAATGAAAGGAGAAAGTCTAACATTGGAGCAGAA
GAATTCGGAAAAGCAGACAGCCTCTTTGAACACCACACTTAAAGGCTAAAGCACACACAC
AGACATTAACTTGTCATAGTCTACATTCGACTCTAATATTTCCAGCGTAGTAACTAATGG
AGGTCTTTACCGGATCCAAGCAACAAGCGTATTAGCAGACTAGATAAATCAAGCAAGCTA
TGATCTAAAATCATAAATTGGCAAAGAACTTACCAGAGAAGAGATCTGTTGTCAAGCTCT
TGCTTTGGCACATCTCGGCCACGCATTGTCACCAAGCCCA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2G273JQ 777 0 0
GAAAAGCAGACAGCCTCTTTGAACACCACACTTAAAGGCTAAAGCACACACACAGACATT
AACTTGTCATAGTCTACATTCGACTCTAATATTTCCAGCGTAGTAACTAATGGAGGTCTT
TACCGGATCCAAGCAACAAGCGTATTAGCAGACTAGATAAATCAAGCAAGCTATGATCTA
AAATCATAAATTGGCAAAGAACTTACCAGAGAAGAGATCTGTTGTCAAGCTCTTGCTTTG
GCACATTTCGGCCACGCATTGTCACCAAGCCCAAGAAAATGGCTTTATTCTCACAACAGA
TAACCAGAAAATGCCGGCCTTTAGTCGACGGAGCAGGAGAAGTAAAACCGGACGTGAGAT
GATTGACAGCAGATGGAGATTCAGCAGCTGCAGAGCGATTGCGCCACAGTTGCCAATAAC
GCACATCATCGTCATAAAACTCCACCTGCTTAACACTTGTAGATGGAAATAAACAAGATT
TCAGCAGATTATCATTTTTTTTTAAAATCTCGGCAAAGATGTAATAATACCTTCCTCCTC
GAATGGCTTCGGTAGGTTTGCCTTTATAGTCTGAGCAAAAAACATGAACGCCAATCATTA
ACCGCATAATCATTAATCCAGAATAAAATGAAGAAGTTGATTATAGCTCACCAGAGTCTC
CCTCGGCTAACTTCTCTAGCTTAGCACCAACTAAACGCCGCTCGTCGACTCCACCGGCTT
TCAATTCATAAATCACCTACAAACACGTTGAGGAGGAGATACTCGATTCGAGAACAG

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL4987Contig1 1142 2 4 U
GGGACTTGCTCCTAGCTTTGGACGTGTCGTCCCCCAGAAGCAGGTTCCGACAAGAGGATC
TTTGTGACTTACCTAAGATGGAGGAAGGCACTTCTTCCGGCTCACGACGAACACGGTCTC
AAGTTGCTCCGGACTGGACACTCGAAGACTGTCTGATCCTCGTCAACGAGATCGCTGCTA
TCGAGTCAGACTGCTCCAACGCTTTATCCAGCTTCCAGAAATGGACAATGATCTCAGACA
ACTGCAACGCTTTGGACGTACACAGAACGTTTAACCAGTGCAGGAGGAAATGGGATTCGC
TGGTCTCCGATTACAGCCAGATCAATAAGTGGGAGGAACGAGGCAGTGGTGGTCATTCGT
ATTGGTCGCTAAGTGTTGAGAAGAGGAGGAAACTGAATCTCCCTGTGGATGTAGATAACG
AGCTTTTCCAAGCCATCGATGCTGTTGTGATGATCCAAGAGAACAAAGATGGGAGTGAAC
CTGATAGTGATAGTGATAGTGACGCGGATACTCAACAAGACTTTGACGTTGTTGATGTCA
CTCCTGAGTTAGGATCAAAAAGGTCAAGACAGAGAACAATGGTCGTCATGAAGAAGGAGA
ATCCACCACAAAAGAGAAAGACAGAAGAGGAGGAGACACAGAGGAAAAACATTATTCAAG
AGCAACGTGCAAAAGCAACCCATCAGAAGAAAACCTCGGAAGAGGAGAAGAAGAAGAAGA
AGCCGGTGGTGGAAATCTCCACTGATGAAGAAGAAGAGGAGGAAAACACAATGAGCATAG
AAGAAGAGGTCAAAGCGTTGGAAGCGAAGCTAGGTGAGAAAGCTGACTTGATACATGCAA
TAGTCGGGAGAAATCTAGCAAAGGGAAGTGAAACAGGGGGGGATGATGATGTTGGCATTG
AGGACAAGCTAAAGTTTGTGAGACAGCAAGGAGACGAGCTCATCGCTTGTCTGAGTGAGA
TTGCTAATACACTTAATAGGTTCCGTGAAGTTCCACAAGAAAACTGAGTGATAAGATGAT
TTTCCAAGCTGATTAACTTTCAGATGTAAATGTTATTATGGTAAGGCTTTTTGCTCGTTT
GGACTTATCTAGTTTTATCATGTTTCAAAAGACTAGCTGTATGTGTGTCAGACGTATATT
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2DV32TF U 1
AF RR2DV32JQ C 340
BS 1 648 RR2DV32TF
BS 649 649 RR2DV32JQ
BS 650 675 RR2DV32TF
BS 676 1142 RR2DV32JQ

RD RR2DV32TF 675 0 0
GGGACTTGCTCCTAGCTTTGGACGTGTCGTCCCCCAGAAGCAGGTTCCGACAAGAGGATC
TTTGTGACTTACCTAAGATGGAGGAAGGCACTTCTTCCGGCTCACGACGAACACGGTCTC
AAGTTGCTCCGGACTGGACACTCGAAGACTGTCTGATCCTCGTCAACGAGATCGCTGCTA
TCGAGTCAGACTGCTCCAACGCTTTATCCAGCTTCCAGAAATGGACAATGATCTCAGACA
ACTGCAACGCTTTGGACGTACACAGAACGTTTAACCAGTGCAGGAGGAAATGGGATTCGC
TGGTCTCCGATTACAGCCAGATCAATAAGTGGGAGGAACGAGGCAGTGGTGGTCATTCGT
ATTGGTCGCTAAGTGTTGAGAAGAGGAGGAAACTGAATCTCCCTGTGGATGTAGATAACG
AGCTTTTCCAAGCCATCGATGCTGTTGTGATGATCCAAGAGAACAAAGATGGGAGTGAAC
CTGATAGTGATAGTGATAGTGACGCGGATACTCAACAAGACTTTGACGTTGTTGATGTCA
CTCCTGAGTTAGGATCAAAAAGGTCAAGACAGAGAACAATGGTCGTCATGAAGAAGGAGA
ATCCACCACAAAAGAGAAAGACAGAAGAGGAGGAGACACAGAGGAAAA*CATTATTCAAG
AGCAACGTGCAAAAG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2DV32JQ 803 0 0
GAGGCAGTGGTGGTCATTCGTATTGGTCGCTAAGTGTTGAGAAGAGGAGGAAACTGAATC
TCCCTGTGGATGTAGATAACGAGCTTTTCCAAGCCATCGATGCTGTTGTGATGATCCAAG
AGAACAAAGATGGGAGTGAACCTGATAGTGATAGTGATAGTGACGCGGATACTCAACAAG
ACTTTGACGTTGTTGATGTCACTCCTGAGTTAGGATCAAAAAGGTCAAGACAGAGAACAA
TGGTCGTCATGAAGAAGGAGAATCCACCACAAAAGAGAAAGACAGAAGAGGAGGAGACAC
AGAGGAAAAACATTATTCAAGAGCAACGTGCAAAAGCAACCCATCAGAAGAAAACCTCGG
AAGAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGCCGGTGGTGGAAATCTCCACTGATGAAGAAGAAGAGG
AGGAAAACACAATGAGCATAGAAGAAGAGGTCAAAGCGTTGGAAGCGAAGCTAGGTGAGA
AAGCTGACTTGATACATGCAATAGTCGGGAGAAATCTAGCAAAGGGAAGTGAAACAGGGG
GGGATGATGATGTTGGCATTGAGGACAAGCTAAAGTTTGTGAGACAGCAAGGAGACGAGC
TCATCGCTTGTCTGAGTGAGATTGCTAATACACTTAATAGGTTCCGTGAAGTTCCACAAG
AAAACTGAGTGATAAGATGATTTTCCAAGCTGATTAACTTTCAGATGTAAATGTTATTAT
GGTAAGGCTTTTTGCTCGTTTGGACTTATCTAGTTTTATCATGTTTCAAAAGACTAGCTG
TATGTGTGTCAGACGTATATTTT

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL4988Contig1 270 2 1 U
GGGGTATCAGAGTTCGGCGAATTCACCATGAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGTATGAGG
AGGTTGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGAGATCTAAGTAGTCTGTTGTCATCGTA
TGCCTTATCTATAAATCTCTGTGTTGTTCCCTTTCTTGTTTCTCGAACCAGTTATGTTTT
TTAATTTTCACATTTTAAGTTTCGAACTATCTTCTGTAGAACATGTCTTGCTCACTCGTT
TTACTATCTACTACAAGCAGAGATTTATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BH30JQ C 1
AF RR2BH30TF U 1
BS 1 270 RR2BH30TF

RD RR2BH30JQ 270 0 0
GGGGTATCAGAGTTCGGCGAATTCACCATGAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGTATGAGG
AGGTTGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGAGATCTAAGTAGTCTGTTGTCATCGTA
TGCCTTATCTATAAATCTCTGTGTTGTTCCCTTTCTTGTTTCTCGAACCAGTTATGTTTT
TTAATTTTCACATTTTAAGTTTCGAACTATCTTCTGTAGAACATGTCTTGCTCACTCGTT
TTACTATCTACTACAAGCAGAGATTTATCC

QA 1 270 1 270
DS 

RD RR2BH30TF 270 0 0
GGGGTATCAGAGTTCGGCGAATTCACCATGAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGTATGAGG
AGGTTGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGAGATCTAAGTAGTCTGTTGTCATCGTA
TGCCTTATCTATAAATCTCTGTGTTGTTCCCTTTCTTGTTTCTCGAACCAGTTATGTTTT
TTAATTTTCACATTTTAAGTTTCGAACTATCTTCTGTAGAACATGTCTTGCTCACTCGTT
TTACTATCTACTACAAGCAGAGATTTATCC

QA 1 270 1 270
DS 



AS 1 2

CO CL4989Contig1 1104 2 2 U
GTGAGAACGAAATGGATTGTAGTGAGGATGACCGACATGTTAACAGAGATGGAGAACTCA
GTTTTGACTACATAACAAGTGAGCAGAGAGTAGAACTAGAAGCTCTACCTACACCACAAG
GAGCATTGAATGTATATGCAGATCATAGAGAAGAGAACCCAAGAAGGAGCAGTCATTCAG
CACCGTTGTTCCCTGAAGAAGTCTGATTTAGCTGAAAAGCCGTCTGCAAATGCTTACGTG
TTACCAACTCCTGTTACATGCTTCACGCAAGCAAACCACAGTGCACACTTATGGCATTCG
TCTCCGCTTGAACCCATAAAAACCGCTCATAAAGATGCGGAAACCAACCTCTATTCCCGT
CTTCCTCGTCCTACAGAAGCTGGACCACGACACGCATTTTCTGGACCGGTGAAACCATCC
TCAACCCGTCTTCCAGTTCCAGCGCAGGCTCACTCATCTTCTCCAAGGATGTCTCCCACT
GCTTCACCCCCGCTCGCTTCTTCTCCACGGATCACCGAGCCCCATGAGCTTCCAAGACCA
CCTGGTCAATTTGCTCTTCCACGACGCTCTAAGTCTCCCGTTCTGACTGGTCACTCAGCT
CCTGTTACCGCTTGGAGTCAAGAAAGAGGCAATGTTGCTGTGTCCAAGAACATTGTAGCA
TCACCTCTTCCGGTTCCTCCTTTGGTTGTACCAAGAAGCTACTCGATACCATCAAGAAAC
CAGAGTGAACAACCCTCCTTGCCTGAAACGAACCAAAACAGAGTTGTGTCTCCACCGCCT
CTGCCTCTTACTCCAGCGTCTCTGATGAATCTCAGATCGCTGTCTCGGTCTCGGGTCGGG
GAATCTGCTCAGAGCGGTCAAATAAGAAGAGGAGTACAAGTGATTGGACGATGAAGCTGT
TAGTAGCTAGCGTGGCGTTTGATGAAAGCGTTGGTTGTAGAAAGTAAATATACAAGTCAG
ATATTTTTCTACTTCTTTAGTTTTAACCCTATACTTTTTTTTCTTCCCTTATTTATCTTT
TTTGTCACTTTGAAAAGAATTAGTTGTTGTTTTCTGAAAATTAGGAGAAGGAAAATGAGA
AATTAGGGTAAATGTTACCTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF25TF U 1
AF RR2GF25JQ C 353
BS 1 626 RR2GF25TF
BS 627 1104 RR2GF25JQ

RD RR2GF25TF 626 0 0
GTGAGAACGAAATGGATTGTAGTGAGGATGACCGACATGTTAACAGAGATGGAGAACTCA
GTTTTGACTACATAACAAGTGAGCAGAGAGTAGAACTAGAAGCTCTACCTACACCACAAG
GAGCATTGAATGTATATGCAGATCATAGAGAAGAGAACCCAAGAAGGAGCAGTCATTCAG
CACCGTTGTTCCCTGAAGAAGTCTGATTTAGCTGAAAAGCCGTCTGCAAATGCTTACGTG
TTACCAACTCCTGTTACATGCTTCACGCAAGCAAACCACAGTGCACACTTATGGCATTCG
TCTCCGCTTGAACCCATAAAAACCGCTCATAAAGATGCGGAAACCAACCTCTATTCCCGT
CTTCCTCGTCCTACAGAAGCTGGACCACGACACGCATTTTCTGGACCGGTGAAACCATCC
TCAACCCGTCTTCCAGTTCCAGCGCAGGCTCACTCATCTTCTCCAAGGATGTCTCCCACT
GCTTCACCCCCGCTCGCTTCTTCTCCACGGATCACCGAGCCCCATGAGCTTCCAAGACCA
CCTGGTCAATTTGCTCTTCCACGACGCTCTAAGTCTCCCGTTCTGACTGGTCACTCAGCT
CCTGTTACCGCTTGGAGTCAAGAAAG

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2GF25JQ 752 0 0
ATTCCCGTCTTCCTCGTC*TACAGAAGCTGGACCACGACACGCATTTTCTGGACCGGTGA
AACCATCCTCAACCCGTCTTCCAGTTCCAGCGCAGGCTCACTCATCTTCTCCAAGGATGT
CTCCCACTGCTTCACCCCCGCTCGCTTCTTCTCCACGGATCACCGAGCCCCATGAGCTTC
CAAGACCACCTGGTCAATTTGCTCTTCCACGACGCTCTAAGTCTCCCGTTCTGACTGGTC
ACTCAGCTCCTGTTACCGCTTGGAGTCAAGAAAGAGGCAATGTTGCTGTGTCCAAGAACA
TTGTAGCATCACCTCTTCCGGTTCCTCCTTTGGTTGTACCAAGAAGCTACTCGATACCAT
CAAGAAACCAGAGTGAACAACCCTCCTTGCCTGAAACGAACCAAAACAGAGTTGTGTCTC
CACCGCCTCTGCCTCTTACTCCAGCGTCTCTGATGAATCTCAGATCGCTGTCTCGGTCTC
GGGTCGGGGAATCTGCTCAGAGCGGTCAAATAAGAAGAGGAGTACAAGTGATTGGACGAT
GAAGCTGTTAGTAGCTAGCGTGGCGTTTGATGAAAGCGTTGGTTGTAGAAAGTAAATATA
CAAGTCAGATATTTTTCTACTTCTTTAGTTTTAACCCTATACTTTTTTTTCTTCCCTTAT
TTATCTTTTTTGTCACTTTGAAAAGAATTAGTTGTTGTTTTCTGAAAATTAGGAGAAGGA
AAATGAGAAATTAGGGTAAATGTTACCTTACC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4991Contig1 1436 2 12 U
GGAGAAAAATCCTCCAACGGATCCGTCGCCATGACAGCTCGCAAGAGAACCACTTCTTCA
GCGACTAACTCAGACAACCCGCCTTCTTCTGCGACGACGGAGCATAAACCCAAACCCAAC
GTCGCTTCCCCTGAAGATTTCCGTCTCGCGCGGCCGAAACTGGGAGTGATCTTCGTGATC
TCTTCGCTTCTGTGTTCGCTATACCTCTACCTTCTCTGTTTCCACTACAATGTCGATGGT
GAGCTCAAGCGTCCGATCCTCATCAACGCTGGGCTTAGCTTGGTGGGGTTCTTCGTCACG
CTCAAGTTGATTCCGGTGGCTGCTAGATACGTTCTGAGGCGTAACATGTTTGGTTTCGAT
ATCAATAAACGAGGCACTCCTCAAGGTGATGTTAAAGTGCCTGAGTCGTTGGGAATCGTT
GTGGGCATTGTCTTCTTGATTGTGGCGATTATATTTCAGTTCTTTAACTTCACTGAAGAT
TCCTTGTGGCTTGTGGAGTACAATGCAGCACTGGCATCTATTTGTTTCATGATATTGCTT
GGGTTTGTAGATGACGTCCTTGATGTGCCTTGGAGAGTGAAGCTTCTCCTGCCATCTTTT
GCAACCCTTCCTCTGCTGATGGCTTATGCTGGACATACAACTATCGTTATACCAAAACCT
CTTGTTTCTTATGTTGGCTTGGAAATACTTGATCTAGGTCGGATATATAAGTTATATATG
GCTCTACTGGCTGTCTTTTGCACTAACTCGATAAACATTCACGCTGGTCTCAATGGCCCT
GAGATCGGTCAAACCGTAGTTATTGCTGCTGCTATCTTGATACACAACGTTATGCAAATC
GGAGCATCTGTGGATTCTGAACTTCGTCAAGCTCATGCCTTCTCTATATATCTTACTCAG
CCATTGATGGCAACATCCTTGGCGATGCTTGCTTTCAACTGGTATCCTTCCGCAGTTTTT
GTTGGAGACACTTACACAGTCTTTGCAGGAATGACTATGGCAGTTGTTGGCATTCTTGGT
CACTTCAGTGAAACCCTCCTAATCTTTTTTCTTCCACAAGTGTTGAACTTTCTTTTGTCG
CTGCCGCAGCTTGCTGGCATCGTGAAATGTCCACGGCATCGCCTCCCCAAGTTTGATCCT
GCTACAGGATTACTAACGGGAACAAAAGATGGGACGCTCGTCAACGTCTACTTGAGGATT
TTTGGTAGAAAATCAGAAACGTCTCTTTGCATTCATCTTCTTGTTTTCCAGGCCCTAGCT
TGCGCCTTCTGTTTCCTGCTTCGGCATTTTCTTACTGGTTGGTACAAATAAAAACTCTGC
AAAATCTTTAAACGGTTCCTCGTATCATCTCTTCCTTCAAGAATCACACATACAGAACAG
AACTTAGTTTTGTAATAGTTTTACCGAATTGTTTCATTAAAATATATTTTTACCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H580TF U 1
AF RR2H580JQB C 679
BS 1 697 RR2H580TF
BS 698 698 RR2H580JQB
BS 699 738 RR2H580TF
BS 739 739 RR2H580JQB
BS 740 745 RR2H580TF
BS 746 746 RR2H580JQB
BS 747 772 RR2H580TF
BS 773 773 RR2H580JQB
BS 774 792 RR2H580TF
BS 793 793 RR2H580JQB
BS 794 819 RR2H580TF
BS 820 1436 RR2H580JQB

RD RR2H580TF 819 0 0
GGAGAAAAATCCTCCAACGGATCCGTCGCCATGACAGCTCGCAAGAGAACCACTTCTTCA
GCGACTAACTCAGACAACCCGCCTTCTTCTGCGACGACGGAGCATAAACCCAAACCCAAC
GTCGCTTCCCCTGAAGATTTCCGTCTCGCGCGGCCGAAACTGGGAGTGATCTTCGTGATC
TCTTCGCTTCTGTGTTCGCTATACCTCTACCTTCTCTGTTTCCACTACAATGTCGATGGT
GAGCTCAAGCGTCCGATCCTCATCAACGCTGGGCTTAGCTTGGTGGGGTTCTTCGTCACG
CTCAAGTTGATTCCGGTGGCTGCTAGATACGTTCTGAGGCGTAACATGTTTGGTTTCGAT
ATCAATAAACGAGGCACTCCTCAAGGTGATGTTAAAGTGCCTGAGTCGTTGGGAATCGTT
GTGGGCATTGTCTTCTTGATTGTGGCGATTATATTTCAGTTCTTTAACTTCACTGAAGAT
TCCTTGTGGCTTGTGGAGTACAATGCAGCACTGGCATCTATTTGTTTCATGATATTGCTT
GGGTTTGTAGATGACGTCCTTGATGTGCCTTGGAGAGTGAAGCTTCTCCTGCCATCTTTT
GCAACCCTTCCTCTGCTGATGGCTTATGCTGGACATACAACTATCGTTATACCAAAACCT
CTTGTTTCTTATGTTGGCTTGGAAATACTTGATCTAG*TCGGATATATAAGTTATATATG
GCTCTACTGGCTGTCTTT*GCACTA*CTCGATAAACATTCACGCTGGTCTCA*TGGCCCT
GAGATCGGTCAA*CCGTAGTTATTGCTGCTGCTATCTTG

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2H580JQB 758 0 0
TTGGAAATACTTGATCTAGGTCGGATATATAAGTTATATATGGCTCTACTGGCTGTCTTT
TGCACTAACTCGATAAACATTCACGCTGGTCTCAATGGCCCTGAGATCGGTCAAACCGTA
GTTATTGCTGCTGCTATCTTGATACACAACGTTATGCAAATCGGAGCATCTGTGGATTCT
GAACTTCGTCAAGCTCATGCCTTCTCTATATATCTTACTCAGCCATTGATGGCAACATCC
TTGGCGATGCTTGCTTTCAACTGGTATCCTTCCGCAGTTTTTGTTGGAGACACTTACACA
GTCTTTGCAGGAATGACTATGGCAGTTGTTGGCATTCTTGGTCACTTCAGTGAAACCCTC
CTAATCTTTTTTCTTCCACAAGTGTTGAACTTTCTTTTGTCGCTGCCGCAGCTTGCTGGC
ATCGTGAAATGTCCACGGCATCGCCTCCCCAAGTTTGATCCTGCTACAGGATTACTAACG
GGAACAAAAGATGGGACGCTCGTCAACGTCTACTTGAGGATTTTTGGTAGAAAATCAGAA
ACGTCTCTTTGCATTCATCTTCTTGTTTTCCAGGCCCTAGCTTGCGCCTTCTGTTTCCTG
CTTCGGCATTTTCTTACTGGTTGGTACAAATAAAAACTCTGCAAAATCTTTAAACGGTTC
CTCGTATCATCTCTTCCTTCAAGAATCACACATACAGAACAGAACTTAGTTTTGTAATAG
TTTTACCGAATTGTTTCATTAAAATATATTTTTACCGC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL4992Contig1 942 2 2 U
GACCATGCTGTTCGGTGTGAGGGTGGTTCTTGATCCGATGAGGAAGAGTGTGAGTTTGAA
CAACTTGTCAGAGTACGAGCAGACGGAAGAGATCCCAAAGATCATCGCTGAGGATGAGAA
GAACAAAACTTCCTCTGGTTACGCCTCCGCGGACGAGGCTGTTCCCATAACTTCTAGCCG
CGAGAGGAAACGAGGAGTTCCATGGACAGAGGAAGAGCACAAGCTGTTCTTGCTTGGGCT
GCAGAAAGTAGGGAAAGGAGATTGGAAAGGAATATCTAAAAACTTTGTCAAGAGCAGGAC
GTCTACACAAGTAGCTAGTCACGCTCAGAAGTACTTCCTCCGGCGAAGTAATCTCAACCG
TCGCCGGCGAAGATCTAGTCTTTTTGACATGACAACTGACACGGTCATGCCCATGAAAGA
AGATCAAGTGCTTGTACAGGAGAACACACCACAACAGGAAGTCAACAACTTCTCTGTACA
CCCGGTTATGCAAGTGTTTCCATCTAGTGATAATGCATCAGGGACTCAATCTTATGGACA
TCTTTCTTCCTCTAACCTAATCAACTTGGTCCCATATACTTTTCAAGCAAGGCCTGAACC
GATCTCACTCAGCCTCACACTAGCCTCGTCTAATCTCAATGAGCCTTCTTCCTCAAGGCA
CTCAGCATTCAACACGATTGGAGTCGCTTAGAGAAACCCCTCCCAAAAGGTTGAATCTGT
AACACACCTTGTTTGTTTCTCTGTTGTACAGATAGGTCTTGAGACTTTCTATGTATTTGG
CTGAAGAGACCTGTGTCAAAAGAAGAATAATAGACAGAGAAGTTTGGTTTTTTTAGGGTT
TCATCATCATCTTTTGTTTTTTTTTCCTTCCATTCTTGGGAGTTGTTGTAATACTACTTA
TCTGGTCATTCGTGTGGATCTATATCAAAACTATATTAACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA36TF U 1
AF RR2AA36JQ C 254
BS 1 519 RR2AA36TF
BS 520 942 RR2AA36JQ

RD RR2AA36TF 519 0 0
GACCATGCTGTTCGGTGTGAGGGTGGTTCTTGATCCGATGAGGAAGAGTGTGAGTTTGAA
CAACTTGTCAGAGTACGAGCAGACGGAAGAGATCCCAAAGATCATCGCTGAGGATGAGAA
GAACAAAACTTCCTCTGGTTACGCCTCCGCGGACGAGGCTGTTCCCATAACTTCTAGCCG
CGAGAGGAAACGAGGAGTTCCATGGACAGAGGAAGAGCACAAGCTGTTCTTGCTTGGGCT
GCAGAAAGTAGGGAAAGGAGATTGGAAAGGAATATCTAAAAACTTTGTCAAGAGCAGGAC
GTCTACACAAGTAGCTAGTCACGCTCAGAAGTACTTCCTCCGGCGAAGTAATCTCAACCG
TCGCCGGCGAAGATCTAGTCTTTTTGACATGACAACTGACACGGTCATGCCCATGAAAGA
AGATCAAGTGCTTGTACAGGAGAACACACCACAACAGGAAGTCAACAACTTCTCTGTACA
CCCGGTTATGCAAGTGTTTCCATCTAGTGATAATGCATC

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2AA36JQ 689 0 0
AAAGGAGATTGGAAAGGAATATCTAAAAACTTTGTCAAGAGCAGGACGTCTACACAAGTA
GCTAGTCACGCTCAGAAGTACTTCCTCCGGCGAAGTAATCTCAACCGTCGCCGGCGAAGA
TCTAGTCTTTTTGACATGACAACTGACACGGTCATGCCCATGAAAGAAGATCAAGTGCTT
GTACAGGAGAACACACCACAACAGGAAGTCAACAACTTCTCTGTACACCCGGTTATGCAA
GTGTTTCCATCTAGTGATAATGCATCAGGGACTCAATCTTATGGACATCTTTCTTCCTCT
AACCTAATCAACTTGGTCCCATATACTTTTCAAGCAAGGCCTGAACCGATCTCACTCAGC
CTCACACTAGCCTCGTCTAATCTCAATGAGCCTTCTTCCTCAAGGCACTCAGCATTCAAC
ACGATTGGAGTCGCTTAGAGAAACCCCTCCCAAAAGGTTGAATCTGTAACACACCTTGTT
TGTTTCTCTGTTGTACAGATAGGTCTTGAGACTTTCTATGTATTTGGCTGAAGAGACCTG
TGTCAAAAGAAGAATAATAGACAGAGAAGTTTGGTTTTTTTAGGGTTTCATCATCATCTT
TTGTTTTTTTTTCCTTCCATTCTTGGGAGTTGTTGTAATACTACTTATCTGGTCATTCGT
GTGGATCTATATCAAAACTATATTAACGG

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL4993Contig1 1413 2 2 U
GGGAAAACATATAAGACAACGTACCAAGTTACATGCAAAGGACAACATATAATAACAACA
TTTCTTCTCTTCACTCTCTTCAAGTTTCTTTATGTCGGCTCTTCAATGTCTTACTTTCCT
CTTCTTGTTTCTCCTTCTCCAAGACGCCACCTCAGCTTCGTCTCTCCCTCTTGGCCGGAG
AAGGCCGATCCTGGACAACAGCAACCACAGCAACTTCGCCAAGCATCCACGTCGGGTTGT
TTTTCCGGTGAACAGAGGTAACTGCGATCTGTCCTCCGGCGAGTGGGTACGGGATGAGGC
TTACCCACTCTACCGAGCGAAAGAATGCGGCGGAGGAATGATAGATCCTGGATTCGACTG
CCAGACTTACGGCAGACCTGACTCCGATTATCTCAAGTTCCGGCGGAAGCCTTTCAACTG
TGACGTCCCAAGGTTTAATGGGGTGAAGTTTCTACAAGAGATGAGGAACAAAACAATAAT
GTTCGTAGGTGATTCACTGGGTAGGAACCAGTGGGAATCGTTGATATGCATGATCACTTC
ATCAGCACCGTTCATTCATACACATATCATTCATGAAGATCCTCTCTCTACCTTCAAGAT
CCTTGATTACAACGTTAAAGTATCATTTTATAGAGCTCCTTATCTCGTAGACATAGAAAG
AATTCACGGAAAGACAACTCTTAAACTCGATGAAATCTCTGCCGATGCATCCAATGCTTG
GCGCACGGCCGACGTTCTGCTGTTCAACACTGGTCATTGGTGGAGCCACACAGGGTCTCT
ACGAGGGTGGGAGCAGATGGAGATAGGAGGGAGATATTACGGAGACATGGATAGGTTGGT
GGCAATGAGAAAAGGACTAACAACTTGGTCTAATTGGGTTCTTCGTTATATCAACTCTCC
CCTCACTAGAGTTTTCTTCCTCTCCGTCTCACCCACACACTACAATGCAAATGAGTGGAC
ATCAGGATCAAAAGCTTCAACGATAACTCAAGGAGGAAAAACCTGCTACAGTCAAACGAC
GCCCTTTAGTGGGACATCGTACCCGACGAGCTCATACGTAGACCAGAAGAAAGTGATTGA
CGAAGTGGTGAAAGAGATGAAATCTCATGTCTCGTTGATGGATATATCAATGCTTTCAGC
TCTTCGAATCGACGGTCATCCTTCAATCTATAGTGGAGATCTGAATCCTTCTCTAAAGAA
AAATCCTGATCGTTCATCTGATTGTAGCCACTGGTGTCTTCCTGGTCTCCCAGATACCTG
GAACCAGTTGTTCTATGCTGCTTTGTTGTTTTAACATTCGAGTAGTCATTTATCAACCAA
ATGTACCTATTGAACTTATAGTTTTGCTTTTTATTGTAATTTGGTACGTTTAACCAAACA
TATAATTGTGATCCGTGAAGCTCTCTATGACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ71TF U 1
AF RR2AQ71JQ C 644
BS 1 723 RR2AQ71TF
BS 724 1413 RR2AQ71JQ

RD RR2AQ71TF 723 0 0
GGGAAAACATATAAGACAACGTACCAAGTTACATGCAAAGGACAACATATAATAACAACA
TTTCTTCTCTTCACTCTCTTCAAGTTTCTTTATGTCGGCTCTTCAATGTCTTACTTTCCT
CTTCTTGTTTCTCCTTCTCCAAGACGCCACCTCAGCTTCGTCTCTCCCTCTTGGCCGGAG
AAGGCCGATCCTGGACAACAGCAACCACAGCAACTTCGCCAAGCATCCACGTCGGGTTGT
TTTTCCGGTGAACAGAGGTAACTGCGATCTGTCCTCCGGCGAGTGGGTACGGGATGAGGC
TTACCCACTCTACCGAGCGAAAGAATGCGGCGGAGGAATGATAGATCCTGGATTCGACTG
CCAGACTTACGGCAGACCTGACTCCGATTATCTCAAGTTCCGGCGGAAGCCTTTCAACTG
TGACGTCCCAAGGTTTAATGGGGTGAAGTTTCTACAAGAGATGAGGAACAAAACAATAAT
GTTCGTAGGTGATTCACTGGGTAGGAACCAGTGGGAATCGTTGATATGCATGATCACTTC
ATCAGCACCGTTCATTCATACACATATCATTCATGAAGATCCTCTCTCTACCTTCAAGAT
CCTTGATTACAACGTTAAAGTATCATTTTATAGAGCTCCTTATCTCGTAGACATAGAAAG
AATTCACGGAAAGACAACTCTTAAACTCGATGAAATCTCTGCCGATGCATCCAATGCTTG
GCG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2AQ71JQ 770 0 0
CTCGTAGACATAGAAAGAATTCACGGAAAGACAACTCTTAAACTCGATGAAATCTCTGCC
GATGCATCCAATGCTTGGCGCACGGCCGACGTTCTGCTGTTCAACACTGGTCATTGGTGG
AGCCACACAGGGTCTCTACGAGGGTGGGAGCAGATGGAGATAGGAGGGAGATATTACGGA
GACATGGATAGGTTGGTGGCAATGAGAAAAGGACTAACAACTTGGTCTAATTGGGTTCTT
CGTTATATCAACTCTCCCCTCACTAGAGTTTTCTTCCTCTCCGTCTCACCCACACACTAC
AATGCAAATGAGTGGACATCAGGATCAAAAGCTTCAACGATAACTCAAGGAGGAAAAACC
TGCTACAGTCAAACGACGCCCTTTAGTGGGACATCGTACCCGACGAGCTCATACGTAGAC
CAGAAGAAAGTGATTGACGAAGTGGTGAAAGAGATGAAATCTCATGTCTCGTTGATGGAT
ATATCAATGCTTTCAGCTCTTCGAATCGACGGTCATCCTTCAATCTATAGTGGAGATCTG
AATCCTTCTCTAAAGAAAAATCCTGATCGTTCATCTGATTGTAGCCACTGGTGTCTTCCT
GGTCTCCCAGATACCTGGAACCAGTTGTTCTATGCTGCTTTGTTGTTTTAACATTCGAGT
AGTCATTTATCAACCAAATGTACCTATTGAACTTATAGTTTTGCTTTTTATTGTAATTTG
GTACGTTTAACCAAACATATAATTGTGATCCGTGAAGCTCTCTATGACTC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4997Contig1 868 2 2 U
GGGGGGGGGGAGAAGCGATGGGTTGTGTTTAGACGAGAAGAGGACCCAACCTCTGTTCCT
GTTGAATGGATATGTTGGCTGAATGGGCAGCGAAAAAGAGCTCCTACTCCAGAGGAAATG
GCTGAACTTGAAGCAAGGCGTGAGCGTGTGAAGCTTAATGTTGCCCGTCTCAAGAAGGAA
GAGGAGGAGAGGAAAGCCAGAGAAGGAACTGGCCGCAAAATCACGACCATCGGTAAAGTT
GAGGGTCCAGATTTGACAAGCTTTGTTCGCCATTTCCCACCGGATTCTAAAGGTGATAAA
ACAGAGGATGCTAGTGAAGAAGCAGATCAATCAAGGGTCAAGGAACATGAACCCGAGATA
GTTACTGCAGAACCACCAGAACCAAAGACAACAGAGCCATCAGGGTCCGGATCATCATTA
GGCCCGGGACCTGGCAGCCACCATCCTAAACACATCTCAATATCTCATGTTCACGCTCGC
AGTAACAACCAACAAAGTTGTTTTGTCCAGTCTTCTGTTTGTTGTAGTCTATTGGTTTGA
ATCTTACATATTATTATTCAGAGAGAGCTTGTGAGGACCCTAAAATGTGCGGCCTTTCAC
ACGTTGTTATTGAGGACTTAGAAGAGTCAAAAATGAAAAGCCATCTCCCTTATTATGATT
TGTTTTGTTTGGGTGGAGTTGTCTCTTGGCATTGTGCTCGAGACTTTGATTTTCTTTGTC
CTTAATAGCTTAAGAAGAGTCCTATCATTCACCCTCTTCCTCGTTGACTTTTATTTATCA
GGATTTAAACGATTTTTTATTTCATAGGCAAATTGGACATCATCGTCATGTAACACTAAT
CATGATTGAATAAAAAGTATTTATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ62TF U 1
AF RR2AQ62JQ C 64
BS 1 755 RR2AQ62TF
BS 756 868 RR2AQ62JQ

RD RR2AQ62TF 755 0 0
GGGGGGGGGGAGAAGCGATGGGTTGTGTTTAGACGAGAAGAGGACCCAACCTCTGTTCCT
GTTGAATGGATATGTTGGCTGAATGGGCAGCGAAAAAGAGCTCCTACTCCAGAGGAAATG
GCTGAACTTGAAGCAAGGCGTGAGCGTGTGAAGCTTAATGTTGCCCGTCTCAAGAAGGAA
GAGGAGGAGAGGAAAGCCAGAGAAGGAACTGGCCGCAAAATCACGACCATCGGTAAAGTT
GAGGGTCCAGATTTGACAAGCTTTGTTCGCCATTTCCCACCGGATTCTAAAGGTGATAAA
ACAGAGGATGCTAGTGAAGAAGCAGATCAATCAAGGGTCAAGGAACATGAACCCGAGATA
GTTACTGCAGAACCACCAGAACCAAAGACAACAGAGCCATCAGGGTCCGGATCATCATTA
GGCCCGGGACCTGGCAGCCACCATCCTAAACACATCTCAATATCTCATGTTCACGCTCGC
AGTAACAACCAACAAAGTTGTTTTGTCCAGTCTTCTGTTTGTTGTAGTCTATTGGTTTGA
ATCTTACATATTATTATTCAGAGAGAGCTTGTGAGGACCCTAAAATGTGCGGCCTTTCAC
ACGTTGTTATTGAGGACTTAGAAGAGTCAAAAATGAAAAGCCATCTCCCTTATTATGATT
TGTTTTGTTTGGGTGGAGTTGTCTCTTGGCATTGTGCTCGAGACTTTGATTTTCTTTGTC
CTTAATAGCTTAAGAAGAGTCCTATCATTCACCCT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2AQ62JQ 805 0 0
GAATGGATATGTTGGCTGAATGGGCAGCGAAAAAGAGCTCCTACTCCAGAGGAAATGGCT
GAACTTGAAGCAAGGCGTGAGCGTGTGAAGCTTAATGTTGCCCGTCTCAAGAAGGAAGAG
GAGGAGAGGAAAGCCAGAGAAGGAACTGGCCGCAAAATCACGACCATCGGTAAAGTTGAG
GGTCCAGATTTGACAAGCTTTGTTCGCCATTTCCCACCGGATTCTAAAGGTGATAAAACA
GAGGATGCTAGTGAAGAAGCAGATCAATCAAGGGTCAAGGAACATGAACCCGAGATAGTT
ACTGCAGAACCACCAGAACCAAAGACAACAGAGCCATCAGGGTCCGGATCATCATTAGGC
CCGGGACCTGGCAGCCACCATCCTAAACACATCTCAATATCTCATGTTCACGCTCGCAGT
AACAACCAACAAAGTTGTTTTGTCCAGTCTTCTGTTTGTTGTAGTCTATTGGTTTGAATC
TTACATATTATTATTCAGAGAGAGCTTGTGAGGACCCTAAAATGTGCGGCCTTTCACACG
TTGTTATTGAGGACTTAGAAGAGTCAAAAATGAAAAGCCATCTCCCTTATTATGATTTGT
TTTGTTTGGGTGGAGTTGTCTCTTGGCATTGTGCTCGAGACTTTGATTTTCTTTGTCCTT
AATAGCTTAAGAAGAGTCCTATCATTCACCCTCTTCCTCGTTGACTTTTATTTATCAGGA
TTTAAACGATTTTTTATTTCATAGGCAAATTGGACATCATCGTCATGTAACACTAATCAT
GATTGAATAAAAAGTATTTATTTTC

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

CO CL4998Contig1 1140 2 2 U
GGCCTGATTTTCTAGTTTCAACGATTCGTAGAGTGTGGCTGTGCTTCTAAAGCGCTATGA
CTGGGATCACCAGCACCATCTCGTTCAACGCCATCGTCGCCGGAACCACCAAAACGGTGT
CGCATCGCCCATTTTCTGTCAAGTCTAACCTCTTCGGTTTTCGACTCTATTTGCCTGAAC
TATCATCAGTCATCACTCTCTCCCCCTACCATCGCCGTTTCCCCACCGCCATCACCTGCC
GTTACGGTGGCGGCGGTGGAGGAGGCGGAGGCTCTCGATTCCCCGGAGATAGGCGTGGTA
GGCAAAAAGAATCCGAGGATGACGATGCGCTTGATATCTCTGCTATTAGGTCAGCTACTG
TCAGGCTCATTGATGGGCAACAGAACATGATTGGTATTGTTTCCAAGGAGGAAGCTGTTC
GAAGAGCTGAAGAAGCTGAGCTTGATCTGGTGATTCTTTCACCGGATGCAGATCCTCCGG
TTGTCAGAATGATGGATTATAGTAAATATAGATACGAACAGCAAAAGCGAAAGAAGGAAC
AGCAGAAGAAAACTACTCGCATGGACTTGAAGGAGCTTAAAATGGGTTATAACATTGACC
AGCATGACTATTCTGTACGCATGAGAGCAGCCCGGAAGTTTTTGCAAGATGGTGACAAGG
TTAAAGTGATTGTGAACATGAAAGGCAGGGAAAACGAGTTCAGAAATATTGCTATTGAGC
TCCTCAGACGTTTTCAGACTGAAATAGGAGAGCTTGCGACTGAGGAAAGTAAAAACTTCC
GGGACAGAAACTTGTTTATCGTCTTGGTGCCAAACAAGGAAGTTGTTCGGAAAGCACAAG
AACCATCCCCTAAAAAGAAGAAAAAGCCAGCTGATGATGAAGTTTCAGCTGCAGGTATAA
CTGCAACTTAAAATATCTGAATACATGATGCACAATTGCTAAAGGTATAAAGTCACAGAG
AGTTTGATAAATGTCTTTGTATAGTTTCCCTTTTTACTATGCTTCTTGCATTCCCATCTA
TCTGTAACCATAGAAAGGTATTTGAATGAAGATTTTTCGTATATACCATAAGTTTTCAGC
TTTTAAGCTTAGCCGTATAGATTGTAACAAAGAAATCAATACTTAAAAGAATTATCAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F106TF U 1
AF RR2F106JQ C 572
BS 1 681 RR2F106TF
BS 682 1140 RR2F106JQ

RD RR2F106TF 681 0 0
GGCCTGATTTTCTAGTTTCAACGATTCGTAGAGTGTGGCTGTGCTTCTAAAGCGCTATGA
CTGGGATCACCAGCACCATCTCGTTCAACGCCATCGTCGCCGGAACCACCAAAACGGTGT
CGCATCGCCCATTTTCTGTCAAGTCTAACCTCTTCGGTTTTCGACTCTATTTGCCTGAAC
TATCATCAGTCATCACTCTCTCCCCCTACCATCGCCGTTTCCCCACCGCCATCACCTGCC
GTTACGGTGGCGGCGGTGGAGGAGGCGGAGGCTCTCGATTCCCCGGAGATAGGCGTGGTA
GGCAAAAAGAATCCGAGGATGACGATGCGCTTGATATCTCTGCTATTAGGTCAGCTACTG
TCAGGCTCATTGATGGGCAACAGAACATGATTGGTATTGTTTCCAAGGAGGAAGCTGTTC
GAAGAGCTGAAGAAGCTGAGCTTGATCTGGTGATTCTTTCACCGGATGCAGATCCTCCGG
TTGTCAGAATGATGGATTATAGTAAATATAGATACGAACAGCAAAAGCGAAAGAAGGAAC
AGCAGAAGAAAACTACTCGCATGGACTTGAAGGAGCTTAAAATGGGTTATAACATTGACC
AGCATGACTATTCTGTACGCATGAGAGCAGCCCGGAAGTTTTTGCAAGATGGTGACAAGG
TTAAAGTGATTGTGAACATGA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2F106JQ 569 0 0
GGAGCTTAAAATGGGTTATAACATTGACCAGCATGACTATTCTGTACGCATGAGAGCAGC
CCGGAAGTTTTTGCAAGATGGTGACAAGGTTAAAGTGATTGTGAACATGAAAGGCAGGGA
AAACGAGTTCAGAAATATTGCTATTGAGCTCCTCAGACGTTTTCAGACTGAAATAGGAGA
GCTTGCGACTGAGGAAAGTAAAAACTTCCGGGACAGAAACTTGTTTATCGTCTTGGTGCC
AAACAAGGAAGTTGTTCGGAAAGCACAAGAACCATCCCCTAAAAAGAAGAAAAAGCCAGC
TGATGATGAAGTTTCAGCTGCAGGTATAACTGCAACTTAAAATATCTGAATACATGATGC
ACAATTGCTAAAGGTATAAAGTCACAGAGAGTTTGATAAATGTCTTTGTATAGTTTCCCT
TTTTACTATGCTTCTTGCATTCCCATCTATCTGTAACCATAGAAAGGTATTTGAATGAAG
ATTTTTCGTATATACCATAAGTTTTCAGCTTTTAAGCTTAGCCGTATAGATTGTAACAAA
GAAATCAATACTTAAAAGAATTATCAGTT

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

CO CL4999Contig1 952 2 6 U
GGCAGCGACCGGAAAATTAGCTTCGGTTCCGGGATTATACGTGTTCGGAGATTCATTGGT
TGATGCCGGGAACAATAATTACTTAGCAATCTCGATATCCAAAGCTAATTATCCACATAA
CGGCGTCGATTTTCCTAACAAGAAAGCCACCGGAAGATTCTGTAACGGCAAGAACGCCGC
CGATGCTATCGTGACCGGTGTGAATTTTGCTTCAGGGGGAGCCGGAATTTTCAACAGTTC
CGACCATAAACTTGGACAAGCTATTCCTTTGTCACACCAAGTGAACCATTGGCTCTCTAT
TCATCAAGAACTGACGAGTCAGCTCGTACCAGCCGAAGCACAAAACCATCTATCCAAATC
TCTGTTCGCTGTGGTCATTGGCAGTAACGATCTTTTCGACTACTTTGGATCGTTCAAACT
TAGACAAGAGACGAATCCTCAACAATATACACAATTAATGGCTGATGAACTCAAAAAGCA
ACTGAAGAGAATTCACGACACTGGAGCACGTAGATTCCTAGTAATCGGAGTAGCAGAGAT
TGGTTGCATACCGGGGAAAAGAGCGAAGAACTCGACGGTCCATGAGTGTGACGAAGAGGC
AAACAGGTGGTGCTCTTTGTATAACGAAGCTCTAGTAAAGGTGTTGCAACAACTCAAACA
AGAGTTGCAAAGCTCAATGACTTACTCTTACTTTGACAACTTCAAGTCCTTACATGACAT
TATTTCCAACCCTGCCCGTTACGGTTTTACTGACGTGACATCAGCATGTTGTGGAAATGG
GAAACTAAACGCAGATATTCCTTGTCTTCCAATCGCGAAGTATTGTTCAGACAGAACCAA
GTATCTCTTCTGGGATCGCTATGGTCATCCCACGGAAGCTGCTGCTCGTATCCTCGTGGA
TCTTATGTTATTTGATGATTCGCAATATTCATCTCCTTTAACTCTCACTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A329TF U 1
AF RR2A329JQ C 263
BS 1 835 RR2A329TF
BS 836 836 RR2A329JQ
BS 837 874 RR2A329TF
BS 875 876 RR2A329JQ
BS 877 889 RR2A329TF
BS 890 952 RR2A329JQ

RD RR2A329TF 889 0 0
GGCAGCGACCGGAAAATTAGCTTCGGTTCCGGGATTATACGTGTTCGGAGATTCATTGGT
TGATGCCGGGAACAATAATTACTTAGCAATCTCGATATCCAAAGCTAATTATCCACATAA
CGGCGTCGATTTTCCTAACAAGAAAGCCACCGGAAGATTCTGTAACGGCAAGAACGCCGC
CGATGCTATCGTGACCGGTGTGAATTTTGCTTCAGGGGGAGCCGGAATTTTCAACAGTTC
CGACCATAAACTTGGACAAGCTATTCCTTTGTCACACCAAGTGAACCATTGGCTCTCTAT
TCATCAAGAACTGACGAGTCAGCTCGTACCAGCCGAAGCACAAAACCATCTATCCAAATC
TCTGTTCGCTGTGGTCATTGGCAGTAACGATCTTTTCGACTACTTTGGATCGTTCAAACT
TAGACAAGAGACGAATCCTCAACAATATACACAATTAATGGCTGATGAACTCAAAAAGCA
ACTGAAGAGAATTCACGACACTGGAGCACGTAGATTCCTAGTAATCGGAGTAGCAGAGAT
TGGTTGCATACCGGGGAAAAGAGCGAAGAACTCGACGGTCCATGAGTGTGACGAAGAGGC
AAACAGGTGGTGCTCTTTGTATAACGAAGCTCTAGTAAAGGTGTTGCAACAACTCAAACA
AGAGTTGCAAAGCTCAATGACTTACTCTTACTTTGACAACTTCAAGTCCTTACATGACAT
TATTTCCAACCCTGCCCGTTACGGTTTTACTGACGTGACATCAGCATGTTGTGGAAATGG
GAAACTAAACGCAGATATTCCTTGTCTTCCAATCGCGAAGTATTGTTCAGACAGA*CCAA
GTATCTCTTCTGGGATCGCTATGGTCATCCCACG**AGCTGCTGCTCGT

QA 1 889 1 889
DS 

RD RR2A329JQ 690 0 0
ATTCCTTTGTCACACCAAGTGAACCATTGGCTCTCTATTCATCAAGAACTGACGAGTCAG
CTCGTACCAGCCGAAGCACAAAACCATCTATCCAAATCTCTGTTCGCTGTGGTCATTGGC
AGTAACGATCTTTTCGACTACTTTGGATCGTTCAAACTTAGACAAGAGACGAATCCTCAA
CAATATACACAATTAATGGCTGATGAACTCAAAAAGCAACTGAAGAGAATTCACGACACT
GGAGCACGTAGATTCCTAGTAATCGGAGTAGCAGAGATTGGTTGCATACCGGGGAAAAGA
GCGAAGAACTCGACGGTCCATGAGTGTGACGAAGAGGCAAACAGGTGGTGCTCTTTGTAT
AACGAAGCTCTAGTAAAGGTGTTGCAACAACTCAAACAAGAGTTGCAAAGCTCAATGACT
TACTCTTACTTTGACAACTTCAAGTCCTTACATGACATTATTTCCAACCCTGCCCGTTAC
GGTTTTACTGACGTGACATCAGCATGTTGTGGAAATGGGAAACTAAACGCAGATATTCCT
TGTCTTCCAATCGCGAAGTATTGTTCAGACAGAACCAAGTATCTCTTCTGGGATCGCTAT
GGTCATCCCACGGAAGCTGCTGCTCGTATCCTCGTGGATCTTATGTTATTTGATGATTCG
CAATATTCATCTCCTTTAACTCTCACTCAA

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL5000Contig1 657 2 2 U
TGAGAACGAAGCTGTGGAGGAACCAGAGCCTAAACGAAGACTTAACAAGGAGAACACACA
AAGTTCAGTTTCTGTCTCCAAACCTGGAAAGAAACATAGACACGTTGTACACGCAGCTGA
TGATGTTGGGATCTCAGGTGATGGATACAGATGGCGTAAATACGGGCAGAAAATGGTGAA
GGGGAATCCTAATCCGAGGAACTACTATCGATGTACTTCTACTGGTTGTCCTGTCCGTAA
ACACATTGAGACAGCAGTAGAGAACACGAGAGCTGTCGTAATCACATACAAAGGAGAGCA
CAACCATGACACGCCGGTTCCAAAGAAAGGCCGTGATACACCTAGCTCAGTGCTCTTATC
CCCAACGTCAATGAGAACTAGGTTGGAAGATCAGGTGAACCAGTGCTCGGTGGGACGAGA
AAGTGAGAAGCAGAGCAGTGAAGCATTGGATGTTGTTGGTGGCTAGAAAGCGTGATGGAG
TAGTAGACTTTGGATTCTAAAATAAAGCAATGCTGATTGTATGTATTTATGAGCTAGAGT
TGATCGACTGACTCCATTCTCAGTCTCCTTGTTCTTGTTATATAATAAAACAAAACAAAA
CTCATGAAGATGTCTCTTCTATATTTCCAACTAAATTATAATTTGTAATTTTCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW69TF U 1
AF RR2DW69JQ C 359
BS 1 626 RR2DW69TF
BS 627 657 RR2DW69JQ

RD RR2DW69TF 626 0 0
TGAGAACGAAGCTGTGGAGGAACCAGAGCCTAAACGAAGACTTAACAAGGAGAACACACA
AAGTTCAGTTTCTGTCTCCAAACCTGGAAAGAAACATAGACACGTTGTACACGCAGCTGA
TGATGTTGGGATCTCAGGTGATGGATACAGATGGCGTAAATACGGGCAGAAAATGGTGAA
GGGGAATCCTAATCCGAGGAACTACTATCGATGTACTTCTACTGGTTGTCCTGTCCGTAA
ACACATTGAGACAGCAGTAGAGAACACGAGAGCTGTCGTAATCACATACAAAGGAGAGCA
CAACCATGACACGCCGGTTCCAAAGAAAGGCCGTGATACACCTAGCTCAGTGCTCTTATC
CCCAACGTCAATGAGAACTAGGTTGGAAGATCAGGTGAACCAGTGCTCGGTGGGACGAGA
AAGTGAGAAGCAGAGCAGTGAAGCATTGGATGTTGTTGGTGGCTAGAAAGCGTGATGGAG
TAGTAGACTTTGGATTCTAAAATAAAGCAATGCTGATTGTATGTATTTATGAGCTAGAGT
TGATCGACTGACTCCATTCTCAGTCTCCTTGTTCTTGTTATATAATAAAACAAAACAAAA
CTCATGAAGATGTCTCTTCTATATTT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2DW69JQ 299 0 0
TCCCCAACGTCAATGAGAACTAGGTTGGAAGATCAGGTGAACCAGTGCTCGGTGGGACGA
GAAAGTGAGAAGCAGAGCAGTGAAGCATTGGATGTTGTTGGTGGCTAGAAAGCGTGATGG
AGTAGTAGACTTTGGATTCTAAAATAAAGCAATGCTGATTGTATGTATTTATGAGCTAGA
GTTGATCGACTGACTCCATTCTCAGTCTCCTTGTTCTTGTTATATAATAAAACAAAACAA
AACTCATGAAGATGTCTCTTCTATATTTCCAACTAAATTATAATTTGTAATTTTCTTGC

QA 1 299 1 299
DS 



AS 1 2

CO CL5001Contig1 983 2 2 U
GGACTTTGAAAACCTTCTCTCTCTCTCTCTCCGGTTTGACCCGATAAGTTCTCCACCAGA
GACGCACCAATCTCTCTCTCTCTTCGTAGATCTGTTTCGTTTCCTGACGTCATCTGAGAT
CGGAACCTCTCGTTCTCAGATCTATTCGATCTCTCGTTCCCCTATGCTCTGCTCCCAGAT
CCGTCTCGATTACAATGGCGGAGACTCTCAAAAAAGAAGACTCAATCACGATTCGAGAGG
TCTGGAACGACAACCTCCTCGAGGAATTCGCCCTAATCCGTGAGATCGTCGACACGTTCA
CCTACATCGCCATGGACACGGAGTTCCCGGGAGTCGTCCTCAAGCCCGTCGAGACCTTCA
AGCACAACGGCGGTTACGATTTCGGTTATTTGGTGAAGCTGCTGACGTGTAAAGAGCTGC
CGATGACGCAGGCGGATTTCTTCAAGCTGTTGTATGTGTATTTCCCAACGGTGTACGACA
TCAAGCACTTGATGACGTTTTGTAATGGGCTGTTTGGTGGGCTGAACAGGCTTGCGGAGC
TTATGGGGGTGGAGAGAGTTGGGGTTTGTCATCAGGCGGGGTCGGATAGCTTGCTTACGT
TGGGGTCGTTTAGGAAGCTCAAGGAGCGTTATTTCACTGGGTCGACTGAGAGATGCACTG
GTGTTCTGTATGGTCTAGGTGTGGAAGATGGTGGTGGTGGTACTAATGTTGCTAATTAAG
AGGGAAATAATGATAATAAGGTTAATTATTATTGAGGGAAAGTGGATTATTATTAGGTTT
TTAGGATTTGTGAGTGTGAAGAAGAGACCAATTAGAACTTTGTCTATGTGTAAATTGGCA
AAAATTGGTTTCAGTAAGTGACTGTTGTGTCTTTGTTGTTCATCTTTCAGGAAAAAAAAC
CCCTCTGATCAAGTGAGGGGTTGAGTTTATGAATGTATATCAATTCAGCTACCCTTTTTA
TTAATAAATAATCTCCAAATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E404TF U 1
AF RR2E404JQ C 305
BS 1 572 RR2E404TF
BS 573 983 RR2E404JQ

RD RR2E404TF 572 0 0
GGACTTTGAAAACCTTCTCTCTCTCTCTCTCCGGTTTGACCCGATAAGTTCTCCACCAGA
GACGCACCAATCTCTCTCTCTCTTCGTAGATCTGTTTCGTTTCCTGACGTCATCTGAGAT
CGGAACCTCTCGTTCTCAGATCTATTCGATCTCTCGTTCCCCTATGCTCTGCTCCCAGAT
CCGTCTCGATTACAATGGCGGAGACTCTCAAAAAAGAAGACTCAATCACGATTCGAGAGG
TCTGGAACGACAACCTCCTCGAGGAATTCGCCCTAATCCGTGAGATCGTCGACACGTTCA
CCTACATCGCCATGGACACGGAGTTCCCGGGAGTCGTCCTCAAGCCCGTCGAGACCTTCA
AGCACAACGGCGGTTACGATTTCGGTTATTTGGTGAAGCTGCTGACGTGTAAAGAGCTGC
CGATGACGCAGGCGGATTTCTTCAAGCTGTTGTATGTGTATTTCCCAACGGTGTACGACA
TCAAGCACTTGATGACGTTTTGTAATGGGCTGTTTGGTGGGCTGAACAGGCTTGCGGAGC
TTATGGGGGTGGAGAGAGTTGGGGTTTGTCAT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2E404JQ 679 0 0
CATCGCCATGGACACGGAGTTCCCGGGAGTCGTCCTCAAGCCCGTCGAGACCTTCAAGCA
CAACGGCGGTTACGATTTCGGTTATTTGGTGAAGCTGCTGACGTGTAAAGAGCTGCCGAT
GACGCAGGCGGATTTCTTCAAGCTGTTGTATGTGTATTTCCCAACGGTGTACGACATCAA
GCACTTGATGACGTTTTGTAATGGGCTGTTTGGTGGGCTGAACAGGCTTGCGGAGCTTAT
GGGGGTGGAGAGAGTTGGGGTTTGTCATCAGGCGGGGTCGGATAGCTTGCTTACGTTGGG
GTCGTTTAGGAAGCTCAAGGAGCGTTATTTCACTGGGTCGACTGAGAGATGCACTGGTGT
TCTGTATGGTCTAGGTGTGGAAGATGGTGGTGGTGGTACTAATGTTGCTAATTAAGAGGG
AAATAATGATAATAAGGTTAATTATTATTGAGGGAAAGTGGATTATTATTAGGTTTTTAG
GATTTGTGAGTGTGAAGAAGAGACCAATTAGAACTTTGTCTATGTGTAAATTGGCAAAAA
TTGGTTTCAGTAAGTGACTGTTGTGTCTTTGTTGTTCATCTTTCAGGAAAAAAAACCCCT
CTGATCAAGTGAGGGGTTGAGTTTATGAATGTATATCAATTCAGCTACCCTTTTTATTAA
TAAATAATCTCCAAATTAT

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL5002Contig1 678 2 2 U
GGACATAAACAAACCAACAAAGAGAAAAGTACCAAAGAAAATGTCTGCCCAAAAAGCTGT
CAAGAGTTCTCACCACGAGGCAGAAGAATCCAACATGGAACAAGATATCGTTAGAAAAGC
ATGGGTGTTTAAGCCAAGTGGTCTTAACTTCGTATGGGGTGGTGACTCTCGTTACTGGGT
CATCCCTAAAGAAGACAGGACGCCTGCTGAACTGAAGATGGTGAGTTGGTTAGAAGTAAC
CGGTTCGTTTGACAAGGTGGAGCCAGGCAAAACGTACCGAATCGGTTTCAAAATCTCCTT
CACAGGCGATGCAACCGGATGGGACAAGGCTCCCGTTTTCATGTCTGCCAAAGTTGGTAA
GAAAGGGAAAACGATCTGGAAGAGGATCAAATCTATTAACACCAACTTCGAGAGGCTCAA
AGGCGGGACAGAACAAGTCACCATACCGGATGAGACGGATGGAAGATTCGAGATCTTCGT
CAGTCCCAAGGAGCCAATAACACAGGACACCAAGCTTCAGTTTGGTTTGTACGAAGTGTG
GACCGGGAAATGGAAGTCAGGTCTGTTGATTTATGACGCTTTTGTTCAAGAAGTGAAACA
GAGATTATGAAAATCATCACTTCTAAAGATTGTATGTCACAAGAACCTTACCACACTATA
ATAAGAATCAGTTTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU51TF U 1
AF RR2DU51JQ C 286
BS 1 556 RR2DU51TF
BS 557 678 RR2DU51JQ

RD RR2DU51TF 556 0 0
GGACATAAACAAACCAACAAAGAGAAAAGTACCAAAGAAAATGTCTGCCCAAAAAGCTGT
CAAGAGTTCTCACCACGAGGCAGAAGAATCCAACATGGAACAAGATATCGTTAGAAAAGC
ATGGGTGTTTAAGCCAAGTGGTCTTAACTTCGTATGGGGTGGTGACTCTCGTTACTGGGT
CATCCCTAAAGAAGACAGGACGCCTGCTGAACTGAAGATGGTGAGTTGGTTAGAAGTAAC
CGGTTCGTTTGACAAGGTGGAGCCAGGCAAAACGTACCGAATCGGTTTCAAAATCTCCTT
CACAGGCGATGCAACCGGATGGGACAAGGCTCCCGTTTTCATGTCTGCCAAAGTTGGTAA
GAAAGGGAAAACGATCTGGAAGAGGATCAAATCTATTAACACCAACTTCGAGAGGCTCAA
AGGCGGGACAGAACAAGTCACCATACCGGATGAGACGGATGGAAGATTCGAGATCTTCGT
CAGTCCCAAGGAGCCAATAACACAGGACACCAAGCTTCAGTTTGGTTTGTACGAAGTGTG
GACCGGGAAATGGAAG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2DU51JQ 393 0 0
TTTCAAAATCTCCTTCACAGGCGATGCAACCGGATGGGACAAGGCTCCCGTTTTCATGTC
TGCCAAAGTTGGTAAGAAAGGGAAAACGATCTGGAAGAGGATCAAATTTATTAACACCAA
CTTCGAGAGGCTCAAAGGCGGGACAGAACAAGTCACCATACCGGATGAGACGGATGGAAG
ATTCGAGATCTTCGTCAGTCCCAAGGAGCCAATAACACAGGACACCAAGCTTCAGTTTGG
TTTGTACGAAGTGTGGACCGGGAAATGGAAGTCAGGTCTGTTGATTTATGACGCTTTTGT
TCAAGAAGTGAAACAGAGATTATGAAAATCATCACTTCTAAAGATTGTATGTCACAAGAA
CCTTACCACACTATAATAAGAATCAGTTTGTGC

QA 1 393 1 393
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5004Contig1 556 2 2 U
AATCAAATTTCAAACCATTGTCTTAAAACCATCCAAAACATGTTCCGACAAACTACAAAA
ACCATACTGTAGATTCCATTACAAAAAAACGATAAAACTTCTCAAAACCTGAGCTTGGTG
AAGAACCACCTGTTCTTCCCAGTCTTGAACCTCTCCTCGAGCTTAGCCTTGGCCTCCTTA
AGAGCCGCCACCTTCTTATCCTTCGAAGACAGAGCTTCTAGAGTCGCCACCTCCTTCAGA
TCCACGTCGAGCGCGTAGCGAGTAGGCATCAGATGCTGGTAGTTCACGACCTTGATGAAG
CACTTGACCCTCGACTTCTTCGCCGTCTTCTTGGCAGAGTCCTTGCGGATCACCTTGCTC
GGGTACTTCTTGAGTCCCGCGACGAGGCAGTGTCCGTATGGTCGCTCGCGGTTCCCATCG
TCGAAGGAGCGGATGATCACAGCTTTCTTGCCGGCGTAACGGCCTTGGAGGAGGATCACC
GCTTTGTTCTGCTTTAGGAACTTAACCATGGCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCTAA
GCTCCCTCTTTCCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EP60TF C 1
AF RR2EP60JQ U 52
BS 1 51 RR2EP60TF
BS 52 556 RR2EP60JQ

RD RR2EP60TF 556 0 0
AATCAAATTTCAAACCATTGTCTTAAAACCATCCAAAACATGTTCCGACAAACTACAAAA
ACCATACTGTAGATTCCATTACAAAAAAACGATAAAACTTCTCAAAACCTGAGCTTGGTG
AAGAACCACCTGTTCTTCCCAGTCTTGAACCTCTCCTCGAGCTTAGCCTTGGCCTCCTTA
AGAGCCGCCACCTTCTTATCCTTCGAAGACAGAGCTTCTAGAGTCGCCACCTCCTTCAGA
TCCACGTCGAGCGCGTAGCGAGTAGGCATCAGATGCTGGTAGTTCACGACCTTGATGAAG
CACTTGACCCTCGACTTCTTCGCCGTCTTCTTGGCAGAGTCCTTGCGGATCACCTTGCTC
GGGTACTTCTTGAGTCCCGCGACGAGGCAGTGTCCGTATGGTCGCTCGCGGTTCCCATCG
TCGAAGGAGCGGATGATCACAGCTTTCTTGCCGGCGTAACGGCCTTGGAGGAGGATCACC
GCTTTGTTCTGCTTTAGGAACTTAACCATGGCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCTAA
GCTCCCTCTTTCCCGC

QA 1 556 1 556
DS 

RD RR2EP60JQ 505 0 0
ACTACAAAAACCATACTGTAGATTCCATTACAAAAAAACGATAAAACTTCTCAAAACCTG
AGCTTGGTGAAGAACCACCTGTTCTTCCCAGTCTTGAACCTCTCCTCGAGCTTAGCCTTG
GCCTCCTTAAGAGCCGCCACCTTCTTATCCTTCGAAGACAGAGCTTCTAGAGTCGCCACC
TCCTTCAGATCCACGTCGAGCGCGTAGCGAGTAGGCATCAGATGCTGGTAGTTCACGACC
TTGATGAAGCACTTGACCCTCGACTTCTTCGCCGTCTTCTTGGCAGAGTCCTTGCGGATC
ACCTTGCTCGGGTACTTCTTGAGTCCCGCGACGAGGCAGTGTCCGTATGGTCGCTCGCGG
TTCCCATCGTCGAAGGAGCGGATGATCACAGCTTTCTTGCCGGCGTAACGGCCTTGGAGG
AGGATCACCGCTTTGTTCTGCTTTAGGAACTTAACCATGGCTTCTTCTCTCTCTCTCTCT
CTCCCCTAAGCTCCCTCTTTCCCGC

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 2

CO CL5005Contig1 654 2 3 U
ACCTTCAACGGCTATTGCTACTAAGGCAGTGGGAACACCCGAATATGTAATTTGTTCCCC
ATGGTTAAAAAGTGAGCTACTACAAAGCATCTTCGTGATAAAAATGAAGCCCTAATCCAA
GTCTTGCACAGGCACGGCGAAACGCCATAGCTTCGGCCTTTTGCACAGCATCACCATAGC
CTTTGTCATTTACTGAAGTGGTCCCTGTTGATTCCCTGTAAATCTCAACATCAGTGCCGT
AAAAAGTGACACGGTAAGCAACAGTGACGGTGTTACCATCAGGAAAGTAAGTGACACTCC
GAACTTCACCAAACCATTCTGGAGCATGCAGGTTCATTATCCTATTCACAGTATGCCAAG
GAATGTATTTCATGGCGAACCCATCTTCGACACGTGTCTTGATGGCGGAATCCGGAACCT
TTTTGTTGAGCTCCTTGAGGATCTTGGCGAGAGGTCCGCCGATTCCTGATGTTGGTACGT
CGTTCTCTGGTTCAGAGCAGAATCCGCGACATCTCTTCGCCAATTCGAGCGAGCAAGGTT
TGGAAAGAGTACTGGCAGCTGCTACGCTCCTCAACGTCGATGTAGCCGCCTTGAGGCGTA
ACCCTAGACTCGTCGCCATTTCTTTCGCCGGAGAAAATGCTCTCTGCTTTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC77JQ U 63
AF RR2AC77TF C 1
BS 1 62 RR2AC77TF
BS 63 361 RR2AC77JQ
BS 362 654 RR2AC77TF

RD RR2AC77JQ 299 0 0
GGTTAAAAAGTGAGCTACTACAAAGCATCTTCGTGATAAAAATGAAGCCCTAATCCAAGT
CTTGCACAGGCACGGCGAAACGCCATAGCTTCGGCCTTTTGCACAGCATCACCATAGCCT
TTGTCATTTACTGAAGTGGTCCCTGTTGATTCCCTGTAAATCTCAACATCAGTGCCGTAA
AAAGTGACACGGTAAGCAACAGTGACGGTGTTACCATCAGGAAAGTAAGTGACACTCCGA
ACTTCACCAAACCATTCTGGAGCATGCAGGTTCATTATCCTATTCACAGTATGCCAAGG

QA 1 299 1 299
DS 

RD RR2AC77TF 654 0 0
ACCTTCAACGGCTATTGCTACTAAGGCAGTGGGAACACCCGAATATGTAATTTGTTCCCC
ATGGTTAAAAAGTGAGCTACTACAGAGCATCTTCGTGATAGAGATGAAGCCCTAATCCAA
GTCTTGCACAGGCACGGCGAAACGCCATAGCTTCGGCCTTTTGCACAGCATCACCATAGC
CTTTGTCATTTACTGAAGTGGTCCCTGTTGATTCCCTGTAAATCTCAGCATCAGTGCCGT
AGAGAGTGACACGGTAAGCAACAGTGACGGTGTTACCATCAGGAGAGTAAGTGACACTCC
GAACTTCACCAGACCATTCTGGAGCATGCAGGTTCATTATCCTATTCACAGTATGCCAAG
GAATGTATTTCATGGCGAACCCATCTTCGACACGTGTCTTGATGGCGGAATCCGGAACCT
TTTTGTTGAGCTCCTTGAGGATCTTGGCGAGAGGTCCGCCGATTCCTGATGTTGGTACGT
CGTTCTCTGGTTCAGAGCAGAATCCGCGACATCTCTTCGCCAATTCGAGCGAGCAAGGTT
TGGAAAGAGTACTGGCAGCTGCTACGCTCCTCAACGTCGATGTAGCCGCCTTGAGGCGTA
ACCCTAGACTCGTCGCCATTTCTTTCGCCGGAGAAAATGCTCTCTGCTTTAGCC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL5006Contig1 396 2 1 U
TTTTTTCTAATCTCCATTTCTCCCTCTCGGTGTGTTTCGCCGTTCCTCTGCGATTCTGAA
ATTCTTCTTTAAAGCTTTGATCCTTTGTTTCAGAATCGTAGTAGCAATGGCTTTTTGATT
CCCCCTTTTTTTTTCCTTTTTCAAGGGGATTAGATATTGCTTTTTGGTGTATCTCCCCCA
ATCCATCCATCAATCTTCATATCTCGCCGCCGGCAGATGAACAACAACAAGTCGTCATCA
TCATCACAAAATCCTCCGAGCTTGGTGGATTTTTGGTTTCTTCTCAATTAGCAGCTGTGT
ATTCATCATGACCGGAGTTATAATGTAATATTCTCTGTATGGATTTTGAAAGTCATCTAT
ATTTATTTTGTCAGTGAAGAGGTGCTGAATCTTTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FE04JQ C 1
AF RR2FE04TF U 1
BS 1 396 RR2FE04TF

RD RR2FE04JQ 396 0 0
TTTTTTCTAATCTCCATTTCTCCCTCTCGGTGTGTTTCGCCGTTCCTCTGCGATTCTGAA
ATTCTTCTTTAAAGCTTTGATCCTTTGTTTCAGAATCGTAGTAGCAATGGCTTTTTGATT
CCCCCTTTTTTTTTCCTTTTTCAAGGGGATTAGATATTGCTTTTTGGTGTATCTCCCCCA
ATCCATCCATCAATCTTCATATCTCGCCGCCGGCAGATGAACAACAACAAGTCGTCATCA
TCATCACAAAATCCTCCGAGCTTGGTGGATTTTTGGTTTCTTCTCAATTAGCAGCTGTGT
ATTCATCATGACCGGAGTTATAATGTAATATTCTCTGTATGGATTTTGAAAGTCATCTAT
ATTTATTTTGTCAGTGAAGAGGTGCTGAATCTTTGT

QA 1 396 1 396
DS 

RD RR2FE04TF 396 0 0
TTTTTTCTAATCTCCATTTCTCCCTCTCGGTGTGTTTCGCCGTTCCTCTGCGATTCTGAA
ATTCTTCTTTAAAGCTTTGATCCTTTGTTTCAGAATCGTAGTAGCAATGGCTTTTTGATT
CCCCCTTTTTTTTTCCTTTTTCAAGGGGATTAGATATTGCTTTTTGGTGTATCTCCCCCA
ATCCATCCATCAATCTTCATATCTCGCCGCCGGCAGATGAACAACAACAAGTCGTCATCA
TCATCACAAAATCCTCCGAGCTTGGTGGATTTTTGGTTTCTTCTCAATTAGCAGCTGTGT
ATTCATCATGACCGGAGTTATAATGTAATATTCTCTGTATGGATTTTGAAAGTCATCTAT
ATTTATTTTGTCAGTGAAGAGGTGCTGAATCTTTGT

QA 1 396 1 396
DS 



AS 1 2

CO CL5007Contig1 1194 2 2 U
GGTTGCTTCCTGCTAGAATGTTTCAGTGAATTTGGTTAGATAAGAGTTCTGGTTTTGGTT
TAGCCGGTTTTCTTTGGTAACCACATTTTGTTTGATTTTCTATCAGATGTTCTCGATGTC
AAGTAAATATTTAAGAGTTGATTTAGTTCAATTTCATATCTCATATCTTACTAAAGAAAA
ATAATGTAGTTTATATGGACAATGACAAGGGAAAAAAATACATAAAAGAATAATGCAATA
GAACAAAAATAGATGGGTGGCTTTTTGCATTATAGATAACATACTAAGAAAATATTTAAA
TTTTATAAGTTGTCAACGCACCAAACGTTTACCGCGAGCTGCACTCACCAATTCCGCGGT
AAAAAATGGCTACGCCCCACTTGTGGTTGCTGCGTTTGCCATTCAGAGCCTCAAGCAATG
AAGCATCATCAGTGAAAACGGAGCTAATGTGTAGAAGATCTTTTTAGAGACATTTGGCTT
CAATTTCTTCAAGAGTGAGACCCTTTGTCTCAGGCACAATGAAGTATATGAAGAAGAGAG
ACACTATACATATCACTCCAAATCCAAAGAACAACACTCCTGCTCCAAACAGCTCCTGCA
GGAAACATTACAAGGTGAGCTAAAACAGAAGAAGATATGGAACCAACAAGATATACGTAT
CTTGTGTTTACTTAGTGCATGGTCACTGTAATTCAATATCTACGTTGTATTGAAAGAATA
TGTATATCGAGAAGGAGTTTCTTGGTTCTAGAATCTTTACCTTTAAAGGTGAGAAAGCGA
ATGTCACAAGCGCGTTTGTGCCGAAATTCACAAGCACTGCTATACTGATTCCTCTGCCTC
TTAATTTCAAGGGGAATATCTCTGAAATCATCAGCCAACCAATAGGGCCAAAGGATAACT
GTGCAAGATTGAGGACAAATCTTTTGAGATCACAGAGTTTTTAAGACTATAAATATCAAC
AACTTAAAGTTGTCAAAATTGAACTTCTACCAGAAAAAAATGTGAAAAGGTTTAACCTGA
TAGCAGCCCACATATAGTAGCAATGCAACTACAGCAACAGCTGGTACAGTGTTGTAAAAA
ATGTAGTATGACCCCAGGAGGAACAATGAGATCACCTGTTATACAATTAAAAACACACAA
GAGGTTAAGTTTCTAAATCAATTATGTGATTCTGTCTCATGTAATAGATAAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A703TF U 1
AF RR2A703JQ C 488
BS 1 730 RR2A703TF
BS 731 1194 RR2A703JQ

RD RR2A703TF 730 0 0
GGTTGCTTCCTGCTAGAATGTTTCAGTGAATTTGGTTAGATAAGAGTTCTGGTTTTGGTT
TAGCCGGTTTTCTTTGGTAACCACATTTTGTTTGATTTTCTATCAGATGTTCTCGATGTC
AAGTAAATATTTAAGAGTTGATTTAGTTCAATTTCATATCTCATATCTTACTAAAGAAAA
ATAATGTAGTTTATATGGACAATGACAAGGGAAAAAAATACATAAAAGAATAATGCAATA
GAACAAAAATAGATGGGTGGCTTTTTGCATTATAGATAACATACTAAGAAAATATTTAAA
TTTTATAAGTTGTCAACGCACCAAACGTTTACCGCGAGCTGCACTCACCAATTCCGCGGT
AAAAAATGGCTACGCCCCACTTGTGGTTGCTGCGTTTGCCATTCAGAGCCTCAAGCAATG
AAGCATCATCAGTGAAAACGGAGCTAATGTGTAGAAGATCTTTTTAGAGACATTTGGCTT
CAATTTCTTCAAGAGTGAGACCCTTTGTCTCAGGCACAATGAAGTATATGAAGAAGAGAG
ACACTATACATATCACTCCAAATCCAAAGAACAACACTCCTGCTCCAAACAGCTCCTGCA
GGAAACATTACAAGGTGAGCTAAAACAGAAGAAGATATGGAACCAACAAGATATACGTAT
CTTGTGTTTACTTAGTGCATGGTCACTGTAATTCAATATCTACGTTGTATTGAAAGAATA
TGTATATCGA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2A703JQ 707 0 0
TTCAAGAGTGAGACCCTTTGTCTCAGGCACAATGAAGTATATGAAGAAGAGAGACACTAT
ACATATCACTCCAAATCCAAAGAACAACACTCCTGCTCCAAACAGCTCCTGCAGGAAACA
TTACAAGGTGAGCTAAAACAGAAGAAGATATGGAACCAACAAGATATACGTATCTTGTGT
TTACTTAGTGCATGGTCACTGTAATTCAATATCTACGTTGTATTGAAAGAATATGTATAT
CGAGAAGGAGTTTCTTGGTTCTAGAATCTTTACCTTTAAAGGTGAGAAAGCGAATGTCAC
AAGCGCGTTTGTGCCGAAATTCACAAGCACTGCTATACTGATTCCTCTGCCTCTTAATTT
CAAGGGGAATATCTCTGAAATCATCAGCCAACCAATAGGGCCAAAGGATAACTGTGCAAG
ATTGAGGACAAATCTTTTGAGATCACAGAGTTTTTAAGACTATAAATATCAACAACTTAA
AGTTGTCAAAATTGAACTTCTACCAGAAAAAAATGTGAAAAGGTTTAACCTGATAGCAGC
CCACATATAGTAGCAATGCAACTACAGCAACAGCTGGTACAGTGTTGTAAAAAATGTAGT
ATGACCCCAGGAGGAACAATGAGATCACCTGTTATACAATTAAAAACACACAAGAGGTTA
AGTTTCTAAATCAATTATGTGATTCTGTCTCATGTAATAGATAAGAT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5011Contig1 757 2 2 U
TTTTGTCGTGAGAGAGAGAAGATGGAGGATTCATCGGCGTCGTTTGTAGGGAACAGATAT
TGGGTGCTCCGACATGGAAAGAGCATTCCCAACGAGAGAGGCCTCGTCGTCTCTTCAATG
GAAAATGGTGTGCTCCCAGAGTACCAGTTAGCCCCTGATGGTGTCGCTCAGGCTCAGCTC
GCTGGCCAATCCTTCCTCAAGCAACTGGAGGAAAGTAAGATATCACTGGACAAGGTCCGC
ATATGCTACTCCCCCTTCTCTAGAACCACTCACACCGCTAAGGTTGTCGCTCAGGTCCTC
AATCTGCCTTTTGATTCCCCTCAATGCAAGATGATGGAAACTCTGCGAGAACGCTACTTT
GGACCTACATTTGAACTCAAGTCACATGACAAGTATCCGGAGATATGGGATCTTGATGAG
AAAGATCCATTCATGGGACCAGAAGGAGGTGAAAGCGCTGACGATGTTGTGTCCAGACTC
GCCACTGCCATGTTATCCATGGAAGCAGAATTTCAAGGGTGTGCAATTCTGGTGGTGAGC
CATGGAGATCCACTGCAGATGTTGCAGAACATAATGCATTCAGCAAAGCAACAGAGCGGA
GGAGATGGTGGTGATTTAGCAGAGAGAATTCAGATGAGCAGAGTTGCTTCTGTCTTGTCA
CAGCACCGCAAGTTTGCTTTGCTCACTGGCGAACTCCGACCCCTCGTCTGATTTTTTTTC
AAACCAAACAATAAAGTATTCAACTTTGGCATGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA41TF U 1
AF RR2CA41JQ C 427
BS 1 673 RR2CA41TF
BS 674 757 RR2CA41JQ

RD RR2CA41TF 673 0 0
TTTTGTCGTGAGAGAGAGAAGATGGAGGATTCATCGGCGTCGTTTGTAGGGAACAGATAT
TGGGTGCTCCGACATGGAAAGAGCATTCCCAACGAGAGAGGCCTCGTCGTCTCTTCAATG
GAAAATGGTGTGCTCCCAGAGTACCAGTTAGCCCCTGATGGTGTCGCTCAGGCTCAGCTC
GCTGGCCAATCCTTCCTCAAGCAACTGGAGGAAAGTAAGATATCACTGGACAAGGTCCGC
ATATGCTACTCCCCCTTCTCTAGAACCACTCACACCGCTAAGGTTGTCGCTCAGGTCCTC
AATCTGCCTTTTGATTCCCCTCAATGCAAGATGATGGAAACTCTGCGAGAACGCTACTTT
GGACCTACATTTGAACTCAAGTCACATGACAAGTATCCGGAGATATGGGATCTTGATGAG
AAAGATCCATTCATGGGACCAGAAGGAGGTGAAAGCGCTGACGATGTTGTGTCCAGACTC
GCCACTGCCATGTTATCCATGGAAGCAGAATTTCAAGGGTGTGCAATTCTGGTGGTGAGC
CATGGAGATCCACTGCAGATGTTGCAGAACATAATGCATTCAGCAAAGCAACAGAGCGGA
GGAGATGGTGGTGATTTAGCAGAGAGAATTCAGATGAGCAGAGTTGCTTCTGTCTTGTCA
CAGCACCGCAAGT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2CA41JQ 331 0 0
CCATTCATGGGACCAGAAGGAGGTGAAAGCGCTGACGATGTTGTGTCCAGACTCGCCACT
GCCATGTTATCCATGGAAGCAGAATTTCAAGGGTGTGCAATTCTGGTGGTGAGCCATGGA
GTTCCACTGCAGATGTTGCAGAACATAATGCATTCAGCAAAGCAACAGAGCGGAGGAGAT
GGTGGTGATTTAGCAGAGAGAATTCAGATGAGCAGAGTTGCTTCTGTCTTGTCACAGCAC
CGCAAGTTTGCTTTGCTCACTGGCGAACTCCGACCCCTCGTCTGATTTTTTTTCAAACCA
AACAATAAAGTATTCAACTTTGGCATGTTTT

QA 1 331 1 331
DS 



AS 1 2

CO CL5012Contig1 1160 2 2 U
GCACACTTTCAGAGATGTTTGATTCCAAATCTTGGAAAGATCGTATAGTTTTGATCACTC
TAATAATCTCTGGTTCTGCAACTGTTGTCTACTTTCTTTATTCGTATTTTGATACAGCAG
ACCAAGAGAAGAGCTTAGATCATGCAAGGTTTGAGCTCATGTCAGAAGTACATAAGCATT
TGCAGAAATTTTCACCTCAAAGCTTTATAAAAAATGGACAACTAAGTAAGGAGAGCTTGC
ACAGATTGTTTGAAAAAATAGATGTAAACAAAGATGGAAAGATCCAAGTGTCAGAGCTTA
AAGATCTGACTGTGGAGTTTGGGATGTTAGGGAGAATGAAGTGTGACATACATGAGCTTG
CTACAACATTGCTTGCTGATTTCGATAGCGATAGCGATGGTGAGATCGATGAGGCTGAAT
TCGAGAAAGGGATCTCAAGATGGCTGAAACAGTACAAGTTTAGTTTCGATAGCACCGAGT
GTCAAAGAGATAACCGAGCTGAGGATAGAGTTTTGAAGATGGAACAACCAAAGGAAAGTC
TTGTAGCGAAGTTGCTCTCCCAGAGAACCATGAGAGCTACCATTGAAGTTATTTTAGGGA
TTCTAATTGTCCTCTTTCTTGCAACACCTTTCATGATGAACATCGAGCTTTTGTCTAAAT
CAGCCGGAGTTCCTTCCTTCTATGTTGTGTTTGTGGTGATCCCTTTGGCAAGAAACCTAA
GAAACGCTTTGTCTGCTCACTTCTGTCGCAAGAAAGACAAAGCTAGAGTCACATCAGATA
CATTTTTTGAGATATACAAGGATGTTACAATGAATAATTTGCTGGGAATTTCGATTATAT
TGGCGATTGTATACACAAGAGGATTGACTTGGGATTACAATACAGAAGTTCTCATTATTG
TGATCGTTGGCCTCATAATAGGCGTACCAGCATATGTTAGATCAACTTATCCGTTTTGGA
TATGTGTCTTGGCGTTTGCTCTTTACTTCTTCTCTTTAGTCCTTGTCTATCTCCATTTCA
ATTCTCTAGGCAAGAGGGCACCGTTCACCTCTAACATATAGATCAAAAATAGGTATTTTG
AAAGTTCCGTTTGCGTTGTATTTTTACAAGCTCTTTCGTTTTAAACATTCCGAGATAGAA
TAATGTTTCAGACTTTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D365TF U 1
AF RR2D365JQ C 470
BS 1 710 RR2D365TF
BS 711 1160 RR2D365JQ

RD RR2D365TF 716 0 0
GCACACTTTCAGAGATGTTTGATTCCAAATCTTGGAAAGATCGTATAGTTTTGATCACTC
TAATAATCTCTGGTTCTGCAACTGTTGTCTACTTTCTTTATTCGTATTTTGATACAGCAG
ACCAAGAGAAGAGCTTAGATCATGCAAGGTTTGAGCTCATGTCAGAAGTACATAAGCATT
TGCAGAAATTTTCACCTCAAAGCTTTATAAAAAATGGACAACTAAGTAAGGAGAGCTTGC
ACAGATTGTTTGAAAAAATAGATGTAAACAAAGATGGAAAGATCCAAGTGTCAGAGCTTA
AAGATCTGACTGTGGAGTTTGGGATGTTAGGGAGAATGAAGTGTGACATACATGAGCTTG
CTACAACATTGCTTGCTGATTTCGATAGCGATAGCGATGGTGAGATCGATGAGGCTGAAT
TCGAGAAAGGGATCTCAAGATGGCTGAAACAGTACAAGTTTAGTTTCGATAGCACCGAGT
GTCAAAGAGATAACCGAGCTGAGGATAGAGTTTTGAAGATGGAACAACCAAAGGAAAGTC
TTGTAGCGAAGTTGCTCTCCCAGAGAACCATGAGAGCTACCATTGAAGTTATTTTAGGGA
TTCTAATTGTCCTCTTTCTTGCAACACCTTTCATGATGAACATCGAGCTTTTGTCTAAAT
CAGCCGGAGTTCCTTCCTTCTATGTTGTGTTTGTGGTGATCCCTTTGGCA
GAAACC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2D365JQ 691 0 0
TAGCACCGAGTGTCAAAGAGATAACCGAGCTGAGGATAGAGTTTTGAAGATGGAACAACC
AAAGGAAAGTCTTGTAGCGAAGTTGCTCTCCCAGAGAACCATGAGAGCTACCATTGAAGT
TATTTTAGGGATTCTAATTGTCCTCTTTCTTGCAACACCTTTCATGATGAACATCGAGCT
TTTGTCTAAATCAGCCGGAGTTCCTTCCTTCTATGTTGTGTTTGTGGTGATCCCTTTGGC
AAGAAACCTAAGAAACGCTTTGTCTGCTCACTTCTGTCGCAAGAAAGACAAAGCTAGAGT
CACATCAGATACATTTTTTGAGATATACAAGGATGTTACAATGAATAATTTGCTGGGAAT
TTCGATTATATTGGCGATTGTATACACAAGAGGATTGACTTGGGATTACAATACAGAAGT
TCTCATTATTGTGATCGTTGGCCTCATAATAGGCGTACCAGCATATGTTAGATCAACTTA
TCCGTTTTGGATATGTGTCTTGGCGTTTGCTCTTTACTTCTTCTCTTTAGTCCTTGTCTA
TCTCCATTTCAATTCTCTAGGCAAGAGGGCACCGTTCACCTCTAACATATAGATCAAAAA
TAGGTATTTTGAAAGTTCCGTTTGCGTTGTATTTTTACAAGCTCTTTCGTTTTAAACATT
CCGAGATAGAATAATGTTTCAGACTTTGTTG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL5013Contig1 725 2 4 U
GGGTTTTATCTGCCTGAGATGTACCCGAAGCTGCATAGGATACTTTTCTTGGACGATGAC
GTGGTTGTGCAGAAGGATTTGACGGGGCTTTGGGGGATTGATATGGATGGGAAAGTGAAT
GGAGCTGTGGAGGCTTGTTTCGGTTCGTTCCATCGGTATGCGCAGTACATGAACTTCTCC
CATCCTTTGATCAAAGAGAAGTTTAATCCCAAGGCATGCGCGTGGGCTTATGGGATGAAC
TTCTTTGATCTTGATGCTTGGAGAAGAGAGAAGTGCACTGAAGAGTATCACTACTGGCAA
AACCTGAACGAGAACAGGGCTCTGTGGAAGCTGGGGACGTTACCACCGGGGCTGATCACG
TTTTACTCGACCACGAAGCCCCTGGACAAATCGTGGCATGTGCTTGGACTGGGTTACAAT
CCGAGCATTAGTATGGAGGAGATTCGTAACGCTGCGGTGGTACACTTCAACGGTAATATG
AAGCCGTGGCTGGACATAGCTATGAACCAGTTTAGGCCGCTTTGGACCAAACACGTTGAC
TACGACTTGGAGTTTGTCCAGGCTTGCAATTTCGGCCACTGAACTATGGATTAATTTTCT
CTCTATATGAAATTTGTAACTTAGTTTGTTCTGTCTGTTTATTTATATATTTTTGAGGGG
GAAATTAGAATAATTGTATTTTTGTTCAGAGCTGTCGTAATTCTATGGCAACCTATAATC
AAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2DU76TF U 1
AF RR2DU76JQ C 221
BS 1 396 RR2DU76TF
BS 397 397 RR2DU76JQ
BS 398 468 RR2DU76TF
BS 469 725 RR2DU76JQ

RD RR2DU76TF 468 0 0
GGGTTTTATCTGCCTGAGATGTACCCGAAGCTGCATAGGATACTTTTCTTGGACGATGAC
GTGGTTGTGCAGAAGGATTTGACGGGGCTTTGGGGGATTGATATGGATGGGAAAGTGAAT
GGAGCTGTGGAGGCTTGTTTCGGTTCGTTCCATCGGTATGCGCAGTACATGAACTTCTCC
CATCCTTTGATCAAAGAGAAGTTTAATCCCAAGGCATGCGCGTGGGCTTATGGGATGAAC
TTCTTTGATCTTGATGCTTGGAGAAGAGAGAAGTGCACTGAAGAGTATCACTACTGGCAA
AACCTGAACGAGAACAGGGCTCTGTGGAAGCTGGGGACGTTACCACCGGGGCTGATCACG
TTTTACTCGACCACGAAGCCCCTGGACAAATCGTGG*ATGTGCTTGGACTGGGTTACAAT
CCGAGCATTAGTATGGAGGAGATTCGTAACGCTGCGGTGGTACACTTC

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR2DU76JQ 505 0 0
CGTGGGCTTATGGGATGAACTTCTTTGATCTTGATGCTTGGAGAAGAGAGAAGTGCACTG
AAGAGTATCACTACTGGCAAAACCTGAACGAGAACAGGGCTCTGTGGAAGCTGGGGACGT
TACCACCGGGGCTGATCACGTTTTACTCGACCACGAAGCCCCTGGACAAATCGTGGCATG
TGCTTGGACTGGGTTACAATCCGAGCATTAGTATGGAGGAGATTCGTAACGCTGCGGTGG
TACACTTCAACGGTAATATGAAGCCGTGGCTGGACATAGCTATGAACCAGTTTAGGCCGC
TTTGGACCAAACACGTTGACTACGACTTGGAGTTTGTCCAGGCTTGCAATTTCGGCCACT
GAACTATGGATTAATTTTCTCTCTATATGAAATTTGTAACTTAGTTTGTTCTGTCTGTTT
ATTTATATATTTTTGAGGGGGAAATTAGAATAATTGTATTTTTGTTCAGAGCTGTCGTAA
TTCTATGGCAACCTATAATCAAAGC

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 2

CO CL5014Contig1 722 2 2 U
GGGGTGAAAATGATCATGAGATTGGAAGTACTTTCCAGAGTCACTCAACTCTGGTGGTGG
ATGAGACCATGCTTGAAAAAATCCTTGGGCCTCCAAGGTTTGATGACAGTGAAGCAGCTG
ATAGAGTGGCGTCAGCTGGCGTTTCGGTGGGTCTCGTGTGTACTACTTTTGGTGGGGAGG
TTCAGTTCGTGGAGGCTACATCGATGGTGGGCAAGGGGGAACTGCATTTGACTGGCCAAC
TGGGAGATGTTATCAAAGAATCTGCTCAGTTAGCTCTTACATGGGTAAGAGCCCGTGCGT
CGGATTTCAAGCTAGCACTTGCAGGAGACATGAATGTTCTCGATGGACGAGACATCCACA
TTCACTTTCCTGCTGGTGCTGTCCCGAAAGACGGACCTTCAGCGGGAGTGACTTTGGTAA
CAGCTCTGGTTTCGCTGTTCAGTCAGAAACGCGTAAGAGCAGACACAGCCATGACCGGAG
AAATGACACTCAGAGGTCTCGTCCTACCCGTTGGTGGCATCAAAGATAAGATATTGGCTG
CACATCGTTACGGAATCAAGAGAGTGATTCTACCGCAGAGGAACTCGAAGGACTTGGTTG
AAGTACCCGCCGCTGTACTTTCCAGCCTTGAGGTGATATTGGCAAAGAGAATGGAAGACG
TTTTGGAGAATGCATTTGAAGGAGGTTGTCCATGGCGGAACCACACTAAATTATGACAAA
AA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2D917TF U 1
AF RR2D917JQ C 340
BS 1 586 RR2D917TF
BS 587 722 RR2D917JQ

RD RR2D917TF 586 0 0
GGGGTGAAAATGATCATGAGATTGGAAGTACTTTCCAGAGTCACTCAACTCTGGTGGTGG
ATGAGACCATGCTTGAAAAAATCCTTGGGCCTCCAAGGTTTGATGACAGTGAAGCAGCTG
ATAGAGTGGCGTCAGCTGGCGTTTCGGTGGGTCTCGTGTGTACTACTTTTGGTGGGGAGG
TTCAGTTCGTGGAGGCTACATCGATGGTGGGCAAGGGGGAACTGCATTTGACTGGCCAAC
TGGGAGATGTTATCAAAGAATCTGCTCAGTTAGCTCTTACATGGGTAAGAGCCCGTGCGT
CGGATTTCAAGCTAGCACTTGCAGGAGACATGAATGTTCTCGATGGACGAGACATCCACA
TTCACTTTCCTGCTGGTGCTGTCCCGAAAGACGGACCTTCAGCGGGAGTGACTTTGGTAA
CAGCTCTGGTTTCGCTGTTCAGTCAGAAACGCGTAAGAGCAGACACAGCCATGACCGGAG
AAATGACACTCAGAGGTCTCGTCCTACCCGTTGGTGGCATCAAAGATAAGATATTGGCTG
CACATCGTTACGGAATCAAGAGAGTGATTCTACCGCAGAGGAACTC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2D917JQ 383 0 0
TCGATGGACGAGACATCCACATTCACTTTCCTGCTGGTGCTGTCCCGAAAGACGGACCTT
CAGCGGGAGTGACTTTGGTAACAGCTCTGGTTTCGCTGTTCAGTCAGAAACGCGTAAGAG
CAGACACAGCCATGACCGGAGAAATGACACTCAGAGGTTTCGTCCTACCCGTTGGTGGCA
TCAAAGATAAGATATTGGCTGCACATCGTTACGGAATCAAGAGAGTGATTCTACCGCAGA
GGAACTCGAAGGACTTGGTTGAAGTACCCGCCGCTGTACTTTCCAGCCTTGAGGTGATAT
TGGCAAAGAGAATGGAAGACGTTTTGGAGAATGCATTTGAAGGAGGTTGTCCATGGCGGA
ACCACACTAAATTATGACAAAAA

QA 1 383 1 383
DS 



AS 1 2

CO CL5015Contig1 1108 2 2 U
GGGCGGTTCATTCCGCTGCTTACTCTGGCGCAATGGCTAATCCTTTGTACGCACCTGAAT
CTGCACTCAGTGGATTGAATGGAGACGTCTTGGAGAAGTTCGTTTCCGAGAACTACACTG
CCCCACGAATGGTGTTAGCAGCTAGTGGAGTAGAACATGAGGAGCTTTTAAAAGTGGTTG
AGCCATTACTCTCTGACCTTCCTAATGTAACTCGACCAGCGGAGCCTAAGTCTGAATATG
TTGGTGGAGATTTTCGTCAACATACTGGTGATGAGGCTACACATTTTGCGCTTTCTTTTG
GAGTGCCAGGATGGGATAAAGAGAAGGAAGCTGTTATGGCCACTGTTCTTCAGATGCTTA
TGGGAGGAGGTGGCTCATTCTCTGCGGGAGGTCCTGGCAAGGGAATGCACTCTTGGCTCT
ATCTCCGTATTTCGAACCAATACCAGGAGTTTCAATCATGCACTGCATTCACTAGCATCT
TTAACAACGCCGGATTGTTTGGAATCTATGGTTGCACTAGTCCTGAGTATGCTACAAAGG
GAATTGAATTAGTAGCTGATGAAATGAAAGCTGTTGCTGAAGGAAAAGTTAACCAGAAAC
ATCTTGATCGTGCCAAGGCAGCAACGAAATCTGCAATTCTGATGAATCTTGAATCTAGGA
TGATTGTATCAGAAGATATCGGCAGACAGATCCTTACATACGGAGAGAGGAAGCCAGTGG
ATGCATTCTTGAAGACAGTTGACCAACTCACCTTAAAGGACATAGCTGATTTCACCAGCA
AGATTATTGCGAAGCCTTTGACGATGGCATCTTTAGGATCAGTGTTGAATGTTCCAAGCT
ACGACTCCGTAAGCAGTAGATTTTCTTGAAGCTCTTTGCTTTAAGCAAACGATCTTTCCT
TGCGTCATAAGAAAGAGTGGGGCGGGGGAGGGCTTGTAAGATAAAGAGAAAGCATTTTTT
AGGAAGATGCAACTACTTTTCTTTCTTATTCTCTTCTCTTATTGTTTCATCTCATAGTTT
TTTAATTCTTAGAGTGGATAATCCCTTCAAAATGACGACTATTTACGACCATGTCTCCAA
CTTTTCTTGAATAATGTTTGTTACGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS37TF U 1
AF RR2FS37JQ C 485
BS 1 730 RR2FS37TF
BS 731 1108 RR2FS37JQ

RD RR2FS37TF 730 0 0
GGGCGGTTCATTCCGCTGCTTACTCTGGCGCAATGGCTAATCCTTTGTACGCACCTGAAT
CTGCACTCAGTGGATTGAATGGAGACGTCTTGGAGAAGTTCGTTTCCGAGAACTACACTG
CCCCACGAATGGTGTTAGCAGCTAGTGGAGTAGAACATGAGGAGCTTTTAAAAGTGGTTG
AGCCATTACTCTCTGACCTTCCTAATGTAACTCGACCAGCGGAGCCTAAGTCTGAATATG
TTGGTGGAGATTTTCGTCAACATACTGGTGATGAGGCTACACATTTTGCGCTTTCTTTTG
GAGTGCCAGGATGGGATAAAGAGAAGGAAGCTGTTATGGCCACTGTTCTTCAGATGCTTA
TGGGAGGAGGTGGCTCATTCTCTGCGGGAGGTCCTGGCAAGGGAATGCACTCTTGGCTCT
ATCTCCGTATTTCGAACCAATACCAGGAGTTTCAATCATGCACTGCATTCACTAGCATCT
TTAACAACGCCGGATTGTTTGGAATCTATGGTTGCACTAGTCCTGAGTATGCTACAAAGG
GAATTGAATTAGTAGCTGATGAAATGAAAGCTGTTGCTGAAGGAAAAGTTAACCAGAAAC
ATCTTGATCGTGCCAAGGCAGCAACGAAATCTGCAATTCTGATGAATCTTGAATCTAGGA
TGATTGTATCAGAAGATATCGGCAGACAGATCCTTACATACGGAGAGAGGAAGCCAGTGG
ATGCATTCTT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2FS37JQ 624 0 0
CAACGCCGGATTGTTTGGAATCTATGGTTGCACTAGTCCTGAGTATGCTACAAAGGGAAT
TGAATTAGTAGCTGATGAAATGAAAGCTGTTGCTGAAGGAAAAGTTAACCAGAAACATCT
TGATCGTGCCAAGGCAGCAACGAAATCTGCAATTCTGATGAATCTTGAATCTAGGATGAT
TGTATCAGAAGATATCGGCAGACAGATCCTTACATACGGAGAGAGGAAGCCAGTGGATGC
ATTCTTGAAGACAGTTGACCAACTCACCTTAAAGGACATAGCTGATTTCACCAGCAAGAT
TATTGCGAAGCCTTTGACGATGGCATCTTTAGGATCAGTGTTGAATGTTCCAAGCTACGA
CTCCGTAAGCAGTAGATTTTCTTGAAGCTCTTTGCTTTAAGCAAACGATCTTTCCTTGCG
TCATAAGAAAGAGTGGGGCGGGGGAGGGCTTGTAAGATAAAGAGAAAGCATTTTTTAGGA
AGATGCAACTACTTTTCTTTCTTATTCTCTTCTCTTATTGTTTCATCTCATAGTTTTTTA
ATTCTTAGAGTGGATAATCCCTTCAAAATGACGACTATTTACGACCATGTCTCCAACTTT
TCTTGAATAATGTTTGTTACGTTT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL5016Contig1 1127 2 6 U
GAGCGTTGAATCTAGCGGAGGAAAGCTCGGTTCGGATTCTTCGCCGTTTGATTCCTTCCC
GGTGGATTGCATCTCCAAGATAGACTCATTCACAAGTCCACGTGATGCCTGCGTCGCCGC
TACGGTATCGAAAGCCTTTGAATCTGCGGCCAAGTCAGATGTGGTGTGGGATAAGTTTCT
TCCGCCGGAGTATGAATCTCTGGTTCCTTCATCGCGTCATTTCTCATCCAAGAAAGAGCT
CTACTTCGCGTTTTGCGAGGAGCCTGTTCTCATCGACGATGGTACAAAGGTATAATAATA
ATCCAATAAGTTCTGGTTTGAGAACCATGATCTGTGATGCTAACGAAATGATTCTGTTTT
GCTCTTGAAATCAAAAAGAGCTTTTGGTTAGAGAAAGCAAGTGGGAAGAGGTGTTTAATG
TTATCTGCGATGAACATCTCAATCATATGGGGAGATTCTCCGCAGTATTGGAAATGGATT
ACGATTCCTGAAGCTAGGTATCTACTCTTTCTCCATTTTGTAATAAACTGTGATTGGTTA
AGAGACTTGATGGTGGGTGTGTTTATAGGTTTAAAAGTGTTGCGAAACTTCGTCATGTAC
GTTGGTTTGAGATTCGAGGCAGGGTGAAAACTCGTGTCCTATCTCCAAAAACCCGTTACT
CGGCTTACCTTGTGTTCAAGAAAACGGATAGTTGTTATGGCTTTGATGATGTGGCTGTAG
AAGCTGGGGTTGGAGTGGTGGGTCATGAAGCTTCTACAAGAACCATATGCTTTGAAATGG
ATGTGGATAATGAGCGAGAGATGAGATGGGTATACCCAGAGGAGAGGGAAGATGGTTGGA
TGGAGGTTGATCTTGGGGAATTCTTCAGTGGAGAGGAGATAATGAATGGTGATGAGATTG
AGATGAGTGCTTTAGAGACTAGGGACCTCGGTTGGAAGCGTGGCTTGATCATTCAAGGAA
TTGAAATCCGTCCTGCGAAAATCCAATAAAGAGAAAATAATGCCGGGAGTATTCATCTAT
ATTGGTATTATTATAAATTGGTTATGCGATCGAGTTAAGAGGTACAATCCAATTGATAGA
CAAGTGTGTTCAATTGTGCTTGTTATATTACTCATGTGAACAAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET16TF U 1
AF RR2ET16JQ C 488
BS 1 623 RR2ET16TF
BS 624 624 RR2ET16JQ
BS 625 683 RR2ET16TF
BS 684 684 RR2ET16JQ
BS 685 742 RR2ET16TF
BS 743 1127 RR2ET16JQ

RD RR2ET16TF 742 0 0
GAGCGTTGAATCTAGCGGAGGAAAGCTCGGTTCGGATTCTTCGCCGTTTGATTCCTTCCC
GGTGGATTGCATCTCCAAGATAGACTCATTCACAAGTCCACGTGATGCCTGCGTCGCCGC
TACGGTATCGAAAGCCTTTGAATCTGCGGCCAAGTCAGATGTGGTGTGGGATAAGTTTCT
TCCGCCGGAGTATGAATCTCTGGTTCCTTCATCGCGTCATTTCTCATCCAAGAAAGAGCT
CTACTTCGCGTTTTGCGAGGAGCCTGTTCTCATCGACGATGGTACAAAGGTATAATAATA
ATCCAATAAGTTCTGGTTTGAGAACCATGATCTGTGATGCTAACGAAATGATTCTGTTTT
GCTCTTGAAATCAAAAAGAGCTTTTGGTTAGAGAAAGCAAGTGGGAAGAGGTGTTTAATG
TTATCTGCGATGAACATCTCAATCATATGGGGAGATTCTCCGCAGTATTGGAAATGGATT
ACGATTCCTGAAGCTAGGTATCTACTCTTTCTCCATTTTGTAATAAACTGTGATTGGTTA
AGAGACTTGATGGTGGGTGTGTTTATAGGTTTAAAAGTGTTGCGAAACTTCGTCATGTAC
GTTGGTTTGAGATTCGAGGCAGG*TGAAAACTCGTGTCCTATCTCCAAAAACCCGTTACT
CGGCTTACCTTGTGTTCAAGAAA*CGGATAGTTGTTATGGCTTTGATGATGTGGCTGTAG
AAGCTGGGGTTGGAGTGGTGGG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2ET16JQ 640 0 0
CTGAAGCTAGGTATCTACTCTTTCTCCATTTTGTAATAAACTGTGATTGGTTAAGAGACT
TGATGGTGGGTGTGTTTATAGGTTTAAAAGTGTTGCGAAACTTCGTCATGTACGTTGGTT
TGAGATTCGAGGCAGGGTGAAAACTCGTGTCCTATCTCCAAAAACCCGTTACTCGGCTTA
CCTTGTGTTCAAGAAAACGGATAGTTGTTATGGCTTTGATGATGTGGCTGTAGAAGCTGG
GGTTGGAGTGGTGGGTCATGAAGCTTCTACAAGAACCATATGCTTTGAAATGGATGTGGA
TAATGAGCGAGAGATGAGATGGGTATACCCAGAGGAGAGGGAAGATGGTTGGATGGAGGT
TGATCTTGGGGAATTCTTCAGTGGAGAGGAGATAATGAATGGTGATGAGATTGAGATGAG
TGCTTTAGAGACTAGGGACCTCGGTTGGAAGCGTGGCTTGATCATTCAAGGAATTGAAAT
CCGTCCTGCGAAAATCCAATAAAGAGAAAATAATGCCGGGAGTATTCATCTATATTGGTA
TTATTATAAATTGGTTATGCGATCGAGTTAAGAGGTACAATCCAATTGATAGACAAGTGT
GTTCAATTGTGCTTGTTATATTACTCATGTGAACAAGTGC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL5017Contig1 669 2 2 U
GGAACAAAACAACACGCAGTTTCCGTCTTAATCAGATTTATGTTTTCTTCTTCATCACTA
GCTCTGGGCCCTGTCAAAAAACTCTCTGAGACCAAACATAAGGGCTTCTGCGATTTTCCT
GTTTCGTATCTAATCTGATTTAGGGGGAAGTAGATGGGTTTCATAATGGAGTTCGCGGAG
AATCTGGTGCTGAGGTTGATGGAGGATCCGGAGGTGAGAGACAGGAAAGCGAGGGAGCAC
ATATATGAGATGCACGAGAGGTGCAAGAAGATTAAGGAGATGTGGGCTTTGCCTATTCGT
CCTTATGGTTTCTGGACTTTTGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATC
AGTCAGGTTGCTGGTCGCAGGGACCCTTATGATGATCTCCTTCAGGACCACCCTTCTTCC
TCAAACTAATCATACAATGGCAGAAGATGTGTTGTGATGATATCTGGATAGATGCATATG
TCTCTGTTTCAGTTCCCGATTTTGTACTCCCTTCGTTGCTTTTTTCTTTGAGGTATTTTG
AAGCGTGGTACAAACTCAATAATAATCACTGTAGACTTGTTTGCAAATGAGAGAGGAGTA
TACTCATTGTTTCTTAGTAAAGTTGTTTTGATTCTCCATTTGCATCTTTGAATATGAATA
TACTTTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2BT59JQ C 1
AF RR2BT59TF U 1
BS 1 666 RR2BT59TF
BS 667 669 RR2BT59JQ

RD RR2BT59JQ 669 0 0
GGAACAAAACAACACGCAGTTTCCGTCTTAATCAGATTTATGTTTTCTTCTTCATCACTA
GCTCTGGGCCCTGTCAAAAAACTCTCTGAGACCAAACATAAGGGCTTCTGCGATTTTCCT
GTTTCGTATCTAATCTGATTTAGGGGGAAGTAGATGGGTTTCATAATGGAGTTCGCGGAG
AATCTGGTGCTGAGGTTGATGGAGGATCCGGAGGTGAGAGACAGGAAAGCGAGGGAGCAC
ATATATGAGATGCACGAGAGGTGCAAGAAGATTAAGGAGATGTGGGCTTTGCCTATTCGT
CCTTATGGTTTCTGGACTTTTGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATC
AGTCAGGTTGCTGGTCGCAGGGACCCTTATGATGATCTCCTTCAGGACCACCCTTTTTCC
TCAAACTAATCATACAATGGCAGAAGATGTGTTGTGATGATATCTGGATAGATGCATATG
TCTCTGTTTCAGTTCCCGATTTTGTACTCCCTTCGTTGCTTTTTTCTTTGAGGTATTTTG
AAGCGTGGTACAAACTCAATAATAATCACTGTAGACTTGTTTGCAAATGAGAGAGGAGTA
TACTCATTGTTTCTTAGTAAAGTTGTTTTGATTCTCCATTTGCATCTTTGAATATGAATA
TACTTTTTG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2BT59TF 669 0 0
GGAACAAAACAACACGCAGTTTCCGTCTTAATCAGATTTATGTTTTCTTCTTCATCACTA
GCTCTGGGCCCTGTCAAAAAACTCTCTGAGACCAAACATAAGGGCTTCTGCGATTTTCCT
GTTTCGTATCTAATCTGATTTAGGGGGAAGTAGATGGGTTTCATAATGGAGTTCGCGGAG
AATCTGGTGCTGAGGTTGATGGAGGATCCGGAGGTGAGAGACAGGAAAGCGAGGGAGCAC
ATATATGAGATGCACGAGAGGTGCAAGAAGATTAAGGAGATGTGGGCTTTGCCTATTCGT
CCTTATGGTTTCTGGACTTTTGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATC
AGTCAGGTTGCTGGTCGCAGGGACCCTTATGATGATCTCCTTCAGGACCACCCTTCTTCC
TCAAACTAATCATACAATGGCAGAAGATGTGTTGTGATGATATCTGGATAGATGCATATG
TCTCTGTTTCAGTTCCCGATTTTGTACTCCCTTCGTTGCTTTTTTCTTTGAGGTATTTTG
AAGCGTGGTACAAACTCAATAATAATCACTGTAGACTTGTTTGCAAATGAGAGAGGAGTA
TACTCATTGTTTCTTAGTAAAGTTGTTTTGATTCTCCATTTGCATCTTTGAATATGAATA
TACTTT
CTG

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL5018Contig1 423 2 4 U
CTTGCATCCTCCTCTGCGCAGGTCTCGCCGCCGTTTTAAGCAGCACTTATAGCATCAAGA
AACCACTAAATGACGCCGTATTTGGATCTCATGGTGACTTCACAGTGGCACTCAAATACG
TAACAATCCTCACAATATTCCTCTTCGCCTTCTTTTCTCATTCTCTCTCCATCCGCTTCA
TCAACCAAGTCAACATCCTCATTAACTCTCCTCAAGATCCATCCTCCGATGACTTTGGTG
GAATCGGAAGCTTCCTGACTACTCCGGAGTAGGTCTCTGAGCTACTTGAGAAAGCTTTCT
TGCTAAACACGGTAGGTAATAGGTTGTTCTACATGGGCTTGCCTTTTGATGTTATGGATA
TTTGGACCCGTGCTTGTGTTCTTGAGCTCTGCGTTGATGGTTCCCGTACTTTATAACTTG
GAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 

AF RR2B925TF U 1
AF RR2B925JQ C 161
BS 1 271 RR2B925TF
BS 272 272 RR2B925JQ
BS 273 418 RR2B925TF
BS 419 423 RR2B925JQ

RD RR2B925TF 418 0 0
CTTGCATCCTCCTCTGCGCAGGTCTCGCCGCCGTTTTAAGCAGCACTTATAGCATCAAGA
AACCACTAAATGACGCCGTATTTGGATCTCATGGTGACTTCACAGTGGCACTCAAATACG
TAACAATCCTCACAATATTCCTCTTCGCCTTCTTTTCTCATTCTCTCTCCATCCGCTTCA
TCAACCAAGTCAACATCCTCATTAACTCTCCTCAAGATCCATCCTCCGATGACTTTGGTG
GAATCGGAAGCTTCCTGACTACTCCGGAGTATGTCTCTGAGCTACTTGAGAAAGCTTTCT
TGCTAAACACGGTAGGTAATAGGTTGTTCTACATGGGCTTGCCTTTTGATGTTATGGATA
TTTGGACCCGTGCTTGTGTTCTTGAGCTCTGCGTTGATGGTTCCCGTACTTTATAACT

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR2B925JQ 263 0 0
TTCTCTCTCCATCCGCTTCATCAACCAAGTCAACATCCTCATTAACTCTCCTCAAGATCC
ATCCTCCGATGACTTTGGTGGAATCGGAAGCTTCCTGACTATTCCGGAGTAGGTCTCTGA
GCTACTTGAGAAAGCTTTCTTGCTAAACACGGTAGGTAATAGGTTGTTCTACATGGGCTT
GCCTTT*GATGTTATGGATATTTGGACCCGTGCTTGTGTTCTTGAGCTCTGCGTTGATGG
TTCCCGTACTTTATAACTTGGAC

QA 1 263 1 263
DS 



AS 1 2

CO CL5019Contig1 491 2 5 U
GTGTGCCCTTCTTGTGAGAGACTCAGCGGTGGTGCTGCTGGAGGAGGCGGAGGAGGTACG
GTGGCGGTTGATGGAGGAACGGGGAAGGGAGCTTTCTCCATCGTCACAAAGCCTCGCTTT
TACGGCCATTTCACTAATCCTTCTGCAGCTTGTTAACTACTTACTAATTAATTTGTTTTT
TTTATATATCCATTTAGAAATTAGTTAGAAGGTCCCACGGGAAAAGTCTAATGTTAAAAA
TTGGGGAAATGGGTAGTCCTTATAGATAAGACTCTTCAACGATCCCGCTTTATTTTTCGG
TGGGATTGTTTAATGAAGAAAAAAAAAAGTTTGTAATTATAGTTTGCAATTTGTAGAGAA
AAAGAAGAATATTAGTAGTACTTACTAATCCATCTTCTTTTGTTATTTTCTTTAAATGTA
TTATAATTATGGTGTAATTTTGCTTGTAGCAAACATGAATATTATTTTTATTTTATTTTC
TTACAACTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK11TF U 199
AF RR2AU92TF U 1
BS 1 215 RR2AU92TF
BS 216 216 RR2CK11TF
BS 217 332 RR2AU92TF
BS 333 333 RR2CK11TF
BS 334 491 RR2AU92TF

RD RR2CK11TF 260 0 0
AATTAGTTAGAAGGTCCCACGGGAAAAGTCTAATGTTAAAAATTGGGGAAATGGGTAGTC
CTTATAGATAAGACTCTTCAATGATCCCGCTTTATTTTTCGGTGGGATTGTTTAATGAAG
AAAAAAAATAGTTTGTAATTATAGTTTGCAATTTGTAGAGAAAAAGAAGAATATTAGTAG
TACTTACTAATCCATCTTCTTTTGTTATTTTCTTTAAATGTATTATAATTATGGTGTAAT
TTTGCTTGTAGCAAACATGA

QA 1 260 1 260
DS 

RD RR2AU92TF 491 0 0
GTGTGCCCTTCTTGTGAGAGACTCAGCGGTGGTGCTGCTGGAGGAGGCGGAGGAGGTACG
GTGGCGGTTGATGGAGGAACGGGGAAGGGAGCTTTCTCCATCGTCACAAAGCCTCGCTTT
TACGGCCATTTCACTAATCCTTCTGCAGCTTGTTAACTACTTACTAATTAATTTGTTTTT
TTTATATATCCATTTAGAAATTAGTTAGAAGGTCCTACGGGAAAAGTCTAATGTTAAAAA
TTGGGGAAATGGGTAGTCCTTATAGATAAGACTCTTCAACGATCCCGCTTTATTTTTCGG
TGGGATTGTTTAATGAAGAAAAAAAAAAGTTTTTAATTATAGTTTGCAATTTGTAGAGAA
AAAGAAGAATATTAGTAGTACTTACTAATCCATCTTCTTTTGTTATTTTCTTTAAATGTA
TTATAATTATGGTGTAATTTTGCTTGTAGCAAACATGAATATTATTTTTATTTTATTTTC
TTACAACTAAG

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 2

CO CL5020Contig1 1094 2 4 U
GGTGGAGTTTGAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTTA
ATCTGTGTGTGTGCATTTTTAGAGTAGGTCAAGATGCAAACGCATCAGAGATAAAGAGAT
ATTACTACAAGCTCTCTCTCGAACATCATCCATATAAGAATCCTGATCCTGAATCCAAGA
AGCTCTTTGTCAAAATCGCCACTGCTTATGAGATTTTGAAAGATAACGAGACTCGGGCAC
AATATGATTATGCAATTGAGCATCCAAGTGAGGTCAGTACAACATTTAATTTCAAGTGTC
AATCTCATTCTTGTTTTCTACATCTTTTAAAACAATTTCAACACCAGCCACACTGTGTTT
TTCTTTTTGTTATTTACGTATTTTACAACACTGCTCAATACTACCGAGCCAAATATGGAC
ACACGTCGGATCCCGTGCTGTTCTTGTTGGTCTACTGGTAGTTTTGTCTGCGTTCCAATA
TATGAACAACGTAGCAAGGTATAATGAGGCGTTGGCAACAGTTAAGCGAACTCCTGCTTA
CAAAAACAGGCTCAAGGCCTTAGAACTCGAACGCACTGGTGGAGTATCTAGCAAGAAGAA
AGGTCCAAAGCAAATCGACCAGAAACTTCAGCAAGAGCTAAGCAATGAACTCGACCTACA
AATCAAAGGAGCTGAAAAACCGTCAGTCTGGGATCTTCTCGGTGTTCGATTCGTTCTCCT
ACCTTACACTATCATCAAGCCTCTAGTATGGTACAGCAGTTGGGTATGAAGATATAAGGT
TAAGAAAGCTCCTTATTCATGGGAAGGCGCATATTACCTAACCCAAAAATCACTTGGGGT
GCCTCTGGACGCATGGACCAATCTCGATGCATATAAGAAGGAAGATCTGGTACAGAGAAG
GCTGTGGGAGAAGCAGAATCTTGAGAACTACTATGCAGAAATGCGTAAAGAATCGAAGCG
GAGAAGATAGGTCCACTTGTCACTTACTATGCTAGGAGGGATACACATGAGAACTTAAGT
TCCATAAACACTTTTGTTGCCATTATTACTTTTAATGTTATTAAGATATCTGAACAAACA
AACCGAGTTACACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG91TF U 1
AF RR2BG91JQ C 369
BS 1 516 RR2BG91TF
BS 517 517 RR2BG91JQ
BS 518 620 RR2BG91TF
BS 621 1094 RR2BG91JQ

RD RR2BG91TF 620 0 0
GGTGGAGTTTGAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTTA
ATCTGTGTGTGTGCATTTTTAGAGTAGGTCAAGATGCAAACGCATCAGAGATAAAGAGAT
ATTACTACAAGCTCTCTCTCGAACATCATCCATATAAGAATCCTGATCCTGAATCCAAGA
AGCTCTTTGTCAAAATCGCCACTGCTTATGAGATTTTGAAAGATAACGAGACTCGGGCAC
AATATGATTATGCAATTGAGCATCCAAGTGAGGTCAGTACAACATTTAATTTCAAGTGTC
AATCTCATTCTTGTTTTCTACATCTTTTAAAACAATTTCAACACCAGCCACACTGTGTTT
TTCTTTTTGTTATTTACGTATTTTACAACACTGCTCAATACTACCGAGCCAAATATGGAC
ACACGTCGGATCCCGTGCTGTTCTTGTTGGTCTACTGGTAGTTTTGTCTGCGTTCCAATA
TATGAACAACGTAGCAAGGTATAATGAGGCGTTGGCTACAGTTAAGCGAACTCCTGCTTA
CAAAAACAGGCTCAAGGCCTTAGAACTCGAACGCACTGGTGGAGTATCTAGCAAGAAGAA
AGGTCCAAAGCAAATCGACC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2BG91JQ 726 0 0
GTTATTTACGTATTTTACAACACTGCTCAATACTACCGAGCCAAATATGGACACACGTCG
GATCCCGTGCTGTTCTTGTTGGTCTACTGGTAGTTTTGTCTGCGTTCCAATATATGAACA
ACGTAGCAAGGTATAATGAGGCGTTGGCAACAGTTAAGCGAACTCCTGCTTACAAAAACA
GGCTCAAGGCCTTAGAACTCGAACGCACTGGTGGAGTATCTAGCAAGAAGAAGGGTCCAA
AGCAAATCGACCAGAAACTTCAGCAAGAGCTAAGCAATGAACTCGACCTACAAATCAAAG
GAGCTGAAAAACCGTCAGTCTGGGATCTTCTCGGTGTTCGATTCGTTCTCCTACCTTACA
CTATCATCAAGCCTCTAGTATGGTACAGCAGTTGGGTATGAAGATATAAGGTTAAGAAAG
CTCCTTATTCATGGGAAGGCGCATATTACCTAACCCAAAAATCACTTGGGGTGCCTCTGG
ACGCATGGACCAATCTCGATGCATATAAGAAGGAAGATCTGGTACAGAGAAGGCTGTGGG
AGAAGCAGAATCTTGAGAACTACTATGCAGAAATGCGTAAAGAATCGAAGCGGAGAAGAT
AGGTCCACTTGTCACTTACTATGCTAGGAGGGATACACATGAGAACTTAAGTTCCATAAA
CACTTTTGTTGCCATTATTACTTTTAATGTTATTAAGATATCTGAACAAACAAACCGAGT
TACACG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5022Contig1 1289 2 2 U
GGATCCCACGTGAGCAAATTCTAGGTGCTGAAGCGCTAAGTAAGGTTCCAGAGGAGTTCG
TGGTTCAGTACCCGAGTAATGGCAATCCACCAACACTATTTTTGGTTATACGTGATCTGA
TAGATGGTATAAAGACGGAAAAGTTTATGGCATCAGAAAGGGATGAAATATTGTCATTCC
TTGAGCGGGCTTCCGTACGCTTAGATGCATGGTTTCAGTGGTTTAATACTTCGCAGACAG
GTAAGGAGAGAGGAAGCTACTTTTGGCATGGCAGAGACAACACAACAACTCGAGAACTTA
ACCCTAAGACGCTTTCCTCCGGGCTGGATGATTATCCGCGGGCTTCGCACCCAAGTGAAG
ATGAGCGACACGTTGATCTTAGATGCTGGATGTATCTCGCTGCAGATTGCATGAATTCCA
TTACAAAGCTTTTGGGAAAAGAAAATAAAATTTCAAAGGAGCATTACGATTCAACTGCCA
AGCTGCTTTCAAATTTCGATCTTCTAAATCAGATGCACTATGATAAGGACCATGGGGCTT
ACTTTGACTTTGGTAATCATACAGAAAAAGTTAAGTTAGTATGGAAGGAGGTAATTTCAG
AAAATGGTCACCTCTCTCGGCAGCTTGTAAGGAAGACTTCTGGAAAACCAAAGTTAAGAT
TGGTTCCTCAAGTCGGTTATGTCAGTTTCTTTCCCTTCATGTCTAGAATCATCCCAGCTG
CATCGCCAATCCTGGAGAAACAGCTTGATCTAATTTCAAACAGGAGCTTATTATGGAGTG
ACTATGGACTAGTTTCACTTGCCAAAACCAGTTCGATGTATATGAAACGTAACACTGAGC
ATGATGCACCATACTGGAGAGGTCCTATATGGATGAACATGAACTACATGATTCTTTCAT
CTCTGCACCATTACTCTTCAGGGGATGGGCCATATAGCGAAAAGGCAAGAGCAATTTACA
AGGAACTGAGGAGCAATTTGATAAGGAACGTGGTAAGAAACTATTATGAGACGGGGTACA
TCTGGGAACAATATGATCAAGATAAGGGAACAGGCAAAGGCACACGTCTCTTCACCGGCT
GGTCTGCACTTACCTTGTTAATAATGTCCGAAGAGTATCCTATTTTTTGAAAACCTCTTT
GATCAAAACTCGAGGGAAAGAAAGTTAAAAACTACAAACATGTTAGTTAGAAGAACAGTT
TTGATGTGTTTAGGGCTTTCTATATTCGGACTCAACACGTAAGGATAATACCAAAACCTC
TGTAATATCTATGCCAACATTTGATAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H921TF U 1
AF RR2H921JQ C 526
BS 1 769 RR2H921TF
BS 770 1289 RR2H921JQ

RD RR2H921TF 769 0 0
GGATCCCACGTGAGCAAATTCTAGGTGCTGAAGCGCTAAGTAAGGTTCCAGAGGAGTTCG
TGGTTCAGTACCCGAGTAATGGCAATCCACCAACACTATTTTTGGTTATACGTGATCTGA
TAGATGGTATAAAGACGGAAAAGTTTATGGCATCAGAAAGGGATGAAATATTGTCATTCC
TTGAGCGGGCTTCCGTACGCTTAGATGCATGGTTTCAGTGGTTTAATACTTCGCAGACAG
GTAAGGAGAGAGGAAGCTACTTTTGGCATGGCAGAGACAACACAACAACTCGAGAACTTA
ACCCTAAGACGCTTTCCTCCGGGCTGGATGATTATCCGCGGGCTTCGCACCCAAGTGAAG
ATGAGCGACACGTTGATCTTAGATGCTGGATGTATCTCGCTGCAGATTGCATGAATTCCA
TTACAAAGCTTTTGGGAAAAGAAAATAAAATTTCAAAGGAGCATTACGATTCAACTGCCA
AGCTGCTTTCAAATTTCGATCTTCTAAATCAGATGCACTATGATAAGGACCATGGGGCTT
ACTTTGACTTTGGTAATCATACAGAAAAAGTTAAGTTAGTATGGAAGGAGGTAATTTCAG
AAAATGGTCACCTCTCTCGGCAGCTTGTAAGGAAGACTTCTGGAAAACCAAAGTTAAGAT
TGGTTCCTCAAGTCGGTTATGTCAGTTTCTTTCCCTTCATGTCTAGAATCATCCCAGCTG
CATCGCCAATCCTGGAGAAACAGCTTGATCTAATTTCAAACAGGAGCTT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2H921JQ 764 0 0
AGGACCATGGGGCTTACTTTGACTTTGGTAATCATACAGAAAAAGTTAAGTTAGTATGGA
AGGAGGTAATTTCAGAAAATGGTCACCTCTCTCGGCAGCTTGTAAGGAAGACTTCTGGAA
AACCAAAGTTAAGATTGGTTCCTCAAGTCGGTTATGTCAGTTTCTTTCCCTTCATGTCTA
GAATCATCCCAGCTGCATCGCCAATCCTGGAGAAACAGCTTGATCTAATTTCAAACAGGA
GCTTATTATGGAGTGACTATGGACTAGTTTCACTTGCCAAAACCAGTTCGATGTATATGA
AACGTAACACTGAGCATGATGCACCATACTGGAGAGGTCCTATATGGATGAACATGAACT
ACATGATTCTTTCATCTCTGCACCATTACTCTTCAGGGGATGGGCCATATAGCGAAAAGG
CAAGAGCAATTTACAAGGAACTGAGGAGCAATTTGATAAGGAACGTGGTAAGAAACTATT
ATGAGACGGGGTACATCTGGGAACAATATGATCAAGATAAGGGAACAGGCAAAGGCACAC
GTCTCTTCACCGGCTGGTCTGCACTTACCTTGTTAATAATGTCCGAAGAGTATCCTATTT
TTTGAAAACCTCTTTGATCAAAACTCGAGGGAAAGAAAGTTAAAAACTACAAACATGTTA
GTTAGAAGAACAGTTTTGATGTGTTTAGGGCTTTCTATATTCGGACTCAACACGTAAGGA
TAATACCAAAACCTCTGTAATATCTATGCCAACATTTGATAGTC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5024Contig1 1330 2 2 U
GGACCGCGAGAGTTGCTGCAACTGTAATGGCGACGGAGTCAGTTTCTCTTAACCCTCTAT
CTTTCTCAAGGTCAACGACGAACCCATCAAATCAATTTCGTAAAAGGAGAAAACTTTCCT
GTCGAACTCGTCGTTCTCAACTCGGTGCAATCTGCTCGAAAACATCTGATTATCAAGATT
ACCAGAGCTATGCAAGACCTTTGCGTCTCTTACCAGCAGAAGAAGTGAAAGTTTCTATTG
CAAGCCCATCTTTCACTGTGAGAGAATCTCGATCTCTTTATAAAGTGAAGCTGCAGACAA
GTAACGTGTTCGGCTCAGGAATTAGCGATATGAATGCTAGAGTTCTTATATGCTTGATAG
ACGACAAGGGTGATTCAGTGTTACAGACTATACCTGCAACTTTGTCAAGCAATGATGAAA
GCTTCAAGTTTCAGAGAGGCTCTGTTGATGAGTTCACGTTTTTAGGACCGGAACTCGGCA
AGATCAGAGCTTTTTGGATCAGTCTTGAGTCTGGCCAATGGAGAGTTGGAGGAGTGAGCT
TGTGGGTGGTTAAAGCACCTGGTCTTGGAGAGACCAATGTAGAAGAAGCCTACTGTTACC
GATATGATTTTGAAGTCGATGATATCTTGCTTGGAGAGGGCAGTGACCTGTCAATGGTGG
AACTCAGACCTTCACGTATCACTGAACTCGCTGACTCTGATCAAATATCTTCGCCTTCAG
CTCCGAGTCTTGACCGTACAGTCATCTCCAACGAGGAAAGCATGGAAGAATACGCAAACT
TGAAGCTCTCTCTGCTTCTCTATGATGCAGTTCTCATCCTCCTCGGAAGTTCTGTCTTCT
CCTTCTCTCTAGGTGAAAATTCCGCCATTGCTTTCTTCTTTGGTGAAACAGTTGGGTTTC
TCTACTTGCTGCTCCTTCAGAGATCAGTGGATGAACTGCAAGCCTCAGGATCTTCTTCTA
CATCTGAAAACTCCAGTCAAATCCTCAGGGGAAGACTCAAGATTCCGGTTTTAAGTCTCG
CATTGGCCACAGGATTGTCGGTTTTAGCAGTCAGAGGTTACAGTGGAGAAGGTGCCACTG
CCTTTGCAATCACTCCAAGAGTGATTGTGGTGGGGACTTTGGGGTTTCTTGTGTGCAAAG
TAGCCGTTGTTTTGGCTGCGTTTAAGCCCTTGAAGGATGGGTCTTAACACTTTTAACGAG
AGGCAATGTTTGTCTTGTCTTCTCTTCTATGCCTGGGAAGCTCTCACTTTAGTGTTTAAA
GCCTGAATATAGATGTACATAACTTTGTATACAAAAGATATATGTAAATAAGAATAGATC
CTTGTGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ81TF U 1
AF RR2CZ81JQ C 472
BS 1 716 RR2CZ81TF
BS 717 1330 RR2CZ81JQ

RD RR2CZ81TF 716 0 0
GGACCGCGAGAGTTGCTGCAACTGTAATGGCGACGGAGTCAGTTTCTCTTAACCCTCTAT
CTTTCTCAAGGTCAACGACGAACCCATCAAATCAATTTCGTAAAAGGAGAAAACTTTCCT
GTCGAACTCGTCGTTCTCAACTCGGTGCAATCTGCTCGAAAACATCTGATTATCAAGATT
ACCAGAGCTATGCAAGACCTTTGCGTCTCTTACCAGCAGAAGAAGTGAAAGTTTCTATTG
CAAGCCCATCTTTCACTGTGAGAGAATCTCGATCTCTTTATAAAGTGAAGCTGCAGACAA
GTAACGTGTTCGGCTCAGGAATTAGCGATATGAATGCTAGAGTTCTTATATGCTTGATAG
ACGACAAGGGTGATTCAGTGTTACAGACTATACCTGCAACTTTGTCAAGCAATGATGAAA
GCTTCAAGTTTCAGAGAGGCTCTGTTGATGAGTTCACGTTTTTAGGACCGGAACTCGGCA
AGATCAGAGCTTTTTGGATCAGTCTTGAGTCTGGCCAATGGAGAGTTGGAGGAGTGAGCT
TGTGGGTGGTTAAAGCACCTGGTCTTGGAGAGACCAATGTAGAAGAAGCCTACTGTTACC
GATATGATTTTGAAGTCGATGATATCTTGCTTGGAGAGGGCAGTGACCTGTCAATGGTGG
AACTCAGACCTTCACGTATCACTGAACTCGCTGACTCTGATCAAATATCTTCGCCT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2CZ81JQ 859 0 0
AACTCGGCAAGATCAGAGCTTTT*GGATCAGTCTTGAGTCTGGCCAATGGAGAGTTGGAG
GAGTGAGCTTGTGGGTGGTTAAAGCACCTGGTCTTGGAGAGACCAATGTAGAAGAAGCCT
ACTGTTACCGATATGATTTTGAAGTCGATGATATCTTGCTTGGAGAGGGCAGTGACCTGT
CAATGGTGGAACTCAGACCTTCACGTATCACTGAACTCGCTGACTCTGATCAAATATCTT
CGCCTTCAGCTCCGAGTCTTGACCGTACAGTCATCTCCAACGAGGAAAGCATGGAAGAAT
ACGCAAACTTGAAGCTCTCTCTGCTTCTCTATGATGCAGTTCTCATCCTCCTCGGAAGTT
CTGTCTTCTCCTTCTCTCTAGGTGAAAATTCCGCCATTGCTTTCTTCTTTGGTGAAACAG
TTGGGTTTCTCTACTTGCTGCTCCTTCAGAGATCAGTGGATGAACTGCAAGCCTCAGGAT
CTTCTTCTACATCTGAAAACTCCAGTCAAATCCTCAGGGGAAGACTCAAGATTCCGGTTT
TAAGTCTCGCATTGGCCACAGGATTGTCGGTTTTAGCAGTCAGAGGTTACAGTGGAGAAG
GTGCCACTGCCTTTGCAATCACTCCAAGAGTGATTGTGGTGGGGACTTTGGGGTTTCTTG
TGTGCAAAGTAGCCGTTGTTTTGGCTGCGTTTAAGCCCTTGAAGGATGGGTCTTAACACT
TTTAACGAGAGGCAATGTTTGTCTTGTCTTCTCTTCTATGCCTGGGAAGCTCTCACTTTA
GTGTTTAAAGCCTGAATATAGATGTACATAACTTTGTATACAAAAGATATATGTAAATAA
GAATAGATCCTTGTGTGCC

QA 1 859 1 859
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5026Contig1 845 2 4 U
GCTCATGGTATGGAATATTGCTACGGAGCTCACGAGTATTCATCGAGTGGTGTATATGAG
GTTGAGCCTAAGAACTGTCCCGGGTTCGTCTTTAGACGCTCTCTTCTCCTCGGAACTACA
CCCATGTCCCCGTCTGATTTCCGCTCTTACATGGAGAAGCTTTCCTCCAAGTATCACGGC
GACACTTACCATTTGATCGCCAAGAACTGTAACCATTTCACCGAAGAGGTTTGCTTGCAG
CTCACGGGTAAGCCTATTCCTGGTTGGATCAATCTCCTCGCCCGACTAGGTTCCTTCTGT
AATTGTCTTCTACCGGAAAGCATTCGGCTCACAGCTGTTAGTGCTCCTTCTGAACGCCTT
GAGTTCTCTGATGGGGATGAATCAAACTCAGAGGCATCTTCTGTGTCAGATGATGATGAT
GAAGAAGAAGAAGAGGGATCAGAGAAGCATCTCATAAACGTAGCAGACAGAGAGGTTGTG
TATCTACAGAACAAACCAGTGCGACTTACCAGAGAGTAGATGTAATATACCCTGAAGCAA
ATCATCAGAACTTGCAGTGTGTTTCTTACACAAATTATAGCCATGGAAAGCCCAAAGTGG
GTAAATTGATATTCGTCTCCTTATTGCTGCGCTTGTTCTGCCGGGAAAAAAAATCAGTTT
AGTATTCTTTTCATTCTAGAAATGTAAAAAAAAAACATATTCCAGATTTATAAAAATCAA
GCCACCCTTTGCAGTAAAAAATCTGGGATAAGTCATATATTGCTTACTTTTAATATAAAT
TATTGTATGTTTTATTTTCCTTTTTATTTGTCTTTTAGGTCAATAGAGAAACAAACCAAT
TTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2GD44TF U 1
AF RR2GD44JQ C 429
BS 1 652 RR2GD44TF
BS 653 653 RR2GD44JQ
BS 654 685 RR2GD44TF
BS 686 845 RR2GD44JQ

RD RR2GD44TF 685 0 0
GCTCATGGTATGGAATATTGCTACGGAGCTCACGAGTATTCATCGAGTGGTGTATATGAG
GTTGAGCCTAAGAACTGTCCCGGGTTCGTCTTTAGACGCTCTCTTCTCCTCGGAACTACA
CCCATGTCCCCGTCTGATTTCCGCTCTTACATGGAGAAGCTTTCCTCCAAGTATCACGGC
GACACTTACCATTTGATCGCCAAGAACTGTAACCATTTCACCGAAGAGGTTTGCTTGCAG
CTCACGGGTAAGCCTATTCCTGGTTGGATCAATCTCCTCGCCCGACTAGGTTCCTTCTGT
AATTGTCTTCTACCGGAAAGCATTCGGCTCACAGCTGTTAGTGCTCCTTCTGAACGCCTT
GAGTTCTCTGATGGGGATGAATCAAACTCAGAGGCATCTTCTGTGTCAGATGATGATGAT
GAAGAAGAAGAAGAGGGATCAGAGAAGCATCTCATAAACGTAGCAGACAGAGAGGTTGTG
TATCTACAGAACAAACCAGTGCGACTTACCAGAGAGTAGATGTAATATACCCTGAAGCAA
ATCATCAGAACTTGCAGTGTGTTTCTTACACAAATTATAGCCATGGAAAGCCCAAAGTGG
GTAAATTGATATTCGTCTCCTTATTGCTGCGCTTGTTCTGCCGGGAAAAAAA*TCAGTTT
AGTATTCTTTTCATTCTAGAAATGT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2GD44JQ 417 0 0
AGAAGAGGGATCAGAGAAGCATTTCATAAACGTAGCAGACAGAGAGGTTGTGTATTTACA
GAACAAACCAGTGCGACTTACCAGAGAGTAGATGTAATATACCCTGAAGCAAATCATCAG
AACTTGCAGTGTGTTTTTTACACAAATTATAGCCATGGAAAGCCCAAAGTGGGTAAATTG
ATATTCGTCTCCTTATTGCTGCGCTTGTTCTGCCGGGAAAAAAAATCAGTTTAGTATTCT
TTTCATTCTAGAAATGTAAAAAAAAAACATATTCCAGATTTATAAAAATCAAGCCACCCT
TTGCAGTAAAAAATCTGGGATAAGTCATATATTGCTTACTTTTAATATAAATTATTGTAT
GTTTTATTTTCCTTTTTATTTGTCTTTTAGGTCAATAGAGAAACAAACCAATTTCAC

QA 1 417 1 417
DS 



AS 1 2

CO CL5027Contig1 403 2 2 U
GTATCAGAATTCGATCCACATAGATCCGACAAAAATCTGTCTCATCGATACTTGCCCAAA
CATGTGGCAGTGGGTAAAACACTATTTGGTTATACCAAATTTCTTTTTTTTAAACATAAA
AAAGTGAGTTAGACAAAAAGAGAAGTAACTTGGACAAAAAACGAAGTAACTTTGTTATAC
CAAATTGAAACTACGATTAATTGGTGGAACCAGAAGATTGTAGTCCAGCACTATAAAGTT
TTTGTATAAGACGTGGGTCAAATTTTGTATAAATATAATATTAGGCTTTAAGAGTACATT
AATATTGGACAGAACCCGTAATTAGACCAAGAAGGTTAGGAAATAAGAAGAGACTTGTCC
GAAACGGGTTTACCAACCAAACCCAACACACAGTGTGAAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU49TF U 1
AF RR2GU49JQB C 9
BS 1 258 RR2GU49TF
BS 259 403 RR2GU49JQB

RD RR2GU49TF 258 0 0
GTATCAGAATTCGATCCACATAGATCCGACAAAAATCTGTCTCATCGATACTTGCCCAAA
CATGTGGCAGTGGGTAAAACACTATTTGGTTATACCAAATTTCTTTTTTTTAAACATAAA
AAAGTGAGTTAGACAAAAAGAGAAGTAACTTGGACAAAAAACGAAGTAACTTTGTTATAC
CAAATTGAAACTACGATTAATTGGTGGAACCAGAAGATTGTAGTCCAGCACTATAAAGTT
TTTGTATAAGACGTGGGT

QA 1 258 1 258
DS 

RD RR2GU49JQB 395 0 0
ATTCGATCCACATAGATCCGACAAAAATTTGTTTCATCGATACTTGCCCAAACATGTGGC
AGTGGGTAAAACACTATTTGGTTATACCAAATTTTTTTTTTTTAAACATAAAAAAGTGAG
TTAGACAAAAAGAGAAGTAACTTGGACAAAAAACGAAGTAACTTTGTTATACCAAATTGA
AACTACGATTAATTGGTGGAACCAGAAGATTGTAGTCCAGCACTATAAAGTTTTTGTATA
AGACGTGGGTCAAATTTTGTATAAATATAATATTAGGCTTTAAGAGTACATTAATATTGG
ACAGAACCCGTAATTAGACCAAGAAGGTTAGGAAATAAGAAGAGACTTGTCCGAAACGGG
TTTACCAACCAAACCCAACACACAGTGTGAAGTTG

QA 1 395 1 395
DS 



AS 1 2

CO CL5028Contig1 714 2 2 U
GGCCATACTCCGGAGTGCTCTCGCAACCTTAATCGCAAATGGCGTCGGAGAAGAAGCTAA
CGAACCCAATGAGGGACATAAAAGTGCAGAAGCTGGTGCTCAACATCCCGTCGGCGAGAG
TGGTGATCGTCTCACCAGAGCCTCCAAGGTCTTGGAACAGTTGAGTGGCCAGACTCCTGT
TTTCTCCAAAGCAAGGTACACTGTTCGTTCTTTTGGTATCAGACGTAACGAGAAAATTGC
TTGCTACGTTACCGTCAGGGGAGATAAAGCTATGCAGCTCCTTGAAAGTGGACTCAAGGT
TAAAGAGTATGAGCTCTTGAGAAGGGACTTTAGCGACACTGGTTGCTTCGGTTTCGGTAT
CCAGGAGCACATTGATCTGGGTATCAAGTATGACCCGTCGACTGGAATCTACGGTATGGA
CTTCTATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGTTACCGTGTGGCGCGTCGCAGAAGATGCAAGAC
TCGTGTTGGAATCCAGCACAGAGTCACCAAAGATGATGCCATGAAATGGTTCCAAGTTAA
GTACGAAGGAGTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTGGTTAAACAACAGAATTGTC
TCAGTTAGAGAGATCTGTAATCTGTGTGTTTTGTCCACCCCTGGTTTGAATCGTATTTTA
TCAGTTTTGTGTTCTTCAGACATTTGAGTTTCTTTTTAGACATTGCCTATTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ83TF U 1
AF RR2DZ83JQ C 47
BS 1 284 RR2DZ83TF
BS 285 714 RR2DZ83JQ

RD RR2DZ83TF 284 0 0
GGCCATACTCCGGAGTGCTCTCGCAACCTTAATCGCAAATGGCGTCGGAGAAGAAGCTAA
CGAACCCAATGAGGGACATAAAAGTGCAGAAGCTGGTGCTCAACATCCCGTCGGCGAGAG
TGGTGATCGTCTCACCAGAGCCTCCAAGGTCTTGGAACAGTTGAGTGGCCAGACTCCTGT
TTTCTCCAAAGCAAGGTACACTGTTCGTTCTTTTGGTATCAGACGTAACGAGAAAATTGC
TTGCTACGTTACCGTCAGGGGAGATAAAGCTATGCAGCTCCTTG

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2DZ83JQ 668 0 0
GGAGAAGAAGCTAACGAACCCAATGAGGGACATAAAAGTGCAGAAGCTGGTGCTCAACAT
CCCGTCGGCGAGAGTGGTGATCGTCTCACCAGAGCCTCCAAGGTCTTGGAACAGTTGAGT
GGCCAGACTCCTGTTTTCTCCAAAGCAAGGTACACTGTTCGTTCTTTTGGTATCAGACGT
AACGAGAAAATTGCTTGCTACGTTACCGTCAGGGGAGATAAAGCTATGCAGCTCCTTGAA
AGTGGACTCAAGGTTAAAGAGTATGAGCTCTTGAGAAGGGACTTTAGCGACACTGGTTGC
TTCGGTTTCGGTATCCAGGAGCACATTGATCTGGGTATCAAGTATGACCCGTCGACTGGA
ATCTACGGTATGGACTTCTATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGTTACCGTGTGGCGCGTCGC
AGAAGATGCAAGACTCGTGTTGGAATCCAGCACAGAGTCACCAAAGATGATGCCATGAAA
TGGTTCCAAGTTAAGTACGAAGGAGTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTGGTTAA
ACAACAGAATTGTCTCAGTTAGAGAGATCTGTAATCTGTGTGTTTTGTCCACCCCTGGTT
TGAATCGTATTTTATCAGTTTTGTGTTCTTCAGACATTTGAGTTTCTTTTTAGACATTGC
CTATTTAC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL5029Contig1 1369 2 2 U
GGAAAAATATATTGTACCAAGGAAACAAAAACAAAAGTTCTTTTGTAAAAGACACACAGA
AGAATAAATTCGAAGACAAAAAGAGAGAGATAGATGGAAAGTAATGGTGGAGCAGGAGAA
GTAAGAAGAGTGAGATTAGTTTATTTCCTCAGCCGTGCTGGTCATGTTGACCAGCCTCAT
CTCTTTTCTGTTCAACATATCTCCCGTAATGGTGTCTTCCTTCGAGATGTGAAGCGATGG
TTAGCGGGTGTACGAGGCGATGCGATGCCAGACGCATATTCTTGGTCGTGTAAGAGGAGG
TATAAGAATGGATATGTATGGCAAGATTTATTGGACGACGATCTTATTACACCAATCTCC
GACAACGAATATGTGCTAAAAGGATCTGAGATACTCCTAAAACCTCCAAAGGAGGATTCT
CTTCATGCGGGAAAGAAAGCTTGCGAGACAAGAAACGGTGGTGGCGGCGGAAAAGCCGCT
AAGATGATCCACAAAGAATCTCCGGTCTTCTGCTCTCAGAGATCGACGGCGACTACGTCG
ACAGTCACCGATGAATCCACCACGAACGTAGAAGACATGGTCGTTCTCAAGAAACCAGAC
AGGGAAAAAGTATCCGGTGAAAGAGACGTTTCGACGCGAAACGGGTCGGGTAACGACATA
GAGTCGGGTCGACCCAGTGTATCGTCCTCGACTTCGTCGTCTTCGAGTTTTGTTAAGAGT
ACTAAGAGCTATTCCAGCTTGCGTGCCTCCCATGTGCTTAGGAACTTGATGAAGTGTGGT
GGTATGGACACAAACGATGTCGTTTTGATGCCTTTGAACAAGGCTGCGTCTGGGGCTTTT
GGTGCGACTTGGGAAGATGAACGCAGATTCCAATACCACCAACAGCACAATGCTCGAAAA
AGCTTAGAAGGGGCATGGAGTGGCATAAAGATGAAAGAGACAATTGAATTTTGTAAACCA
AAGGTGGCATCAAGCAAGCCTTCCATCATGGCTCCATTATGCTCGCAATGTGGGAAGTCA
TTTAAACCAGAGAAGATGCATTCACACATGAAATTGTGTCCAAAGATGAAGAATTCATCG
GCGAGGAATGATTTGATGTTGGGAAATAATCAGGATACCGTTAAACCGAGGCAGCAAAGG
TGCAGAAACATTCCGGGACATCAACGTCGAGTGAGGACCATTCTTAAAGAGTGATGATGC
TTAGTCATAGTTGATTCTCTAGTTGTGAAATGGTGCGGACAAGTGTTTGCCTAGTTTGGT
GAATGTATCTTTGATGAAGTGGATTTGGATCATGAGGTATTTGGTCATCATATAGTGAAT
TTGGATAATCTAATTGAAGATTTTAGTAACCAATTGGTCACAATTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F893TF U 1
AF RR2F893JQ C 510
BS 1 757 RR2F893TF
BS 758 1369 RR2F893JQ

RD RR2F893TF 757 0 0
GGAAAAATATATTGTACCAAGGAAACAAAAACAAAAGTTCTTTTGTAAAAGACACACAGA
AGAATAAATTCGAAGACAAAAAGAGAGAGATAGATGGAAAGTAATGGTGGAGCAGGAGAA
GTAAGAAGAGTGAGATTAGTTTATTTCCTCAGCCGTGCTGGTCATGTTGACCAGCCTCAT
CTCTTTTCTGTTCAACATATCTCCCGTAATGGTGTCTTCCTTCGAGATGTGAAGCGATGG
TTAGCGGGTGTACGAGGCGATGCGATGCCAGACGCATATTCTTGGTCGTGTAAGAGGAGG
TATAAGAATGGATATGTATGGCAAGATTTATTGGACGACGATCTTATTACACCAATCTCC
GACAACGAATATGTGCTAAAAGGATCTGAGATACTCCTAAAACCTCCAAAGGAGGATTCT
CTTCATGCGGGAAAGAAAGCTTGCGAGACAAGAAACGGTGGTGGCGGCGGAAAAGCCGCT
AAGATGATCCACAAAGAATCTCCGGTCTTCTGCTCTCAGAGATCGACGGCGACTACGTCG
ACAGTCACCGATGAATCCACCACGAACGTAGAAGACATGGTCGTTCTCAAGAAACCAGAC
AGGGAAAAAGTATCCGGTGAAAGAGACGTTTCGACGCGAAACGGGTCGGGTAACGACATA
GAGTCGGGTCGACCCAGTGTATCGTCCTCGACTTCGTCGTCTTCGAGTTTTGTTAAGAGT
ACTAAGAGCTATTCCAGCTTGCGTGCCTCCCATGTGC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2F893JQ 860 0 0
CTGCTCTCAGAGATCGACGGCGACTACGTCGACAGTCACCGATGAATCC*CCACGAACGT
AGAAGACATGGTCGT*CTCAAGAAACCAGACAGGGAAAAAGTATCCGGTGAAAGAGACGT
TTCGACGCGAAACGGGTCGGGTAACGACATAGAGTCGGGTCGACCCAGTGTATCGTCCTC
GACTTCGTCGTCTTCGAGTTTTGTTAAGAGTACTAAGAGCTATTCCAGCTTGCGTGCCTC
CCATGTGCTTAGGAACTTGATGAAGTGTGGTGGTATGGACACAAACGATGTCGTTTTGAT
GCCTTTGAACAAGGCTGCGTCTGGGGCTTTTGGTGCGACTTGGGAAGATGAACGCAGATT
CCAATACCACCAACAGCACAATGCTCGAAAAAGCTTAGAAGGGGCATGGAGTGGCATAAA
GATGAAAGAGACAATTGAATTTTGTAAACCAAAGGTGGCATCAAGCAAGCCTTCCATCAT
GGCTCCATTATGCTCGCAATGTGGGAAGTCATTTAAACCAGAGAAGATGCATTCACACAT
GAAATTGTGTCCAAAGATGAAGAATTCATCGGCGAGGAATGATTTGATGTTGGGAAATAA
TCAGGATACCGTTAAACCGAGGCAGCAAAGGTGCAGAAACATTCCGGGACATCAACGTCG
AGTGAGGACCATTCTTAAAGAGTGATGATGCTTAGTCATAGTTGATTCTCTAGTTGTGAA
ATGGTGCGGACAAGTGTTTGCCTAGTTTGGTGAATGTATCTTTGATGAAGTGGATTTGGA
TCATGAGGTATTTGGTCATCATATAGTGAATTTGGATAATCTAATTGAAGATTTTAGTAA
CCAATTGGTCACAATTTGGT

QA 1 860 1 860
DS 



AS 1 2

CO CL5030Contig1 217 2 2 U
GGTTTCACGGCTGCCACTTTCTTCTTCTCGGCTTGACCATTCCTCTTAGAACTTTTATGT
TCCTTGAACTTCGATGAAGACTGCGGCTCCTGTTCTATATGATCAGACTTCTGCTTTCTC
GAAGAGTTATCTGGCTCCAAATTATGACCACTTTTCACCTTTGTCTCGCTAATTTCTTTT
CTGACTAAATCAGGAGCTTTGCCTCCTTTGTGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BL89TF C 1
AF RR2BL89JQ U 2
BS 1 6 RR2BL89TF
BS 7 217 RR2BL89JQ

RD RR2BL89TF 217 0 0
GGTTTCACGGCTGCCACTTTCTTCTTCTCGGCTTGACCATTCCTCTTAGAACTTTTATGT
TCCTTGAACTTCGATGAAGACTGCGGCTCCTGTTCTATATGATCAGACTTCTGCTTTCTC
GAAGAGTTATCTGGCTCCAAATTATGACCACTTTTCACCTTTGTCTCGCTAATTTCTTTT
CTGACTAAATCAGGAGCTTTGCCTCCTTTGTGTATCC

QA 1 217 1 217
DS 

RD RR2BL89JQ 216 0 0
GGTTT
ACGGCTGCCACTTTCTTCTTCTCGGCTTGACCATTCCTCTTAGAACTTTTATGTTCCTTG
AACTTCGATGAAGACTGCGGCTCCTGTTCTATATGATCAGACTTCTGCTTTCTCGAAGAG
TTATCTGGCTCCAAATTATGACCACTTTTCACCTTTGTCTCGCTAATTTCTTTTCTGACT
AAATCAGGAGCTTTGCCTCCTTTGTGTATCC

QA 6 216 6 216
DS 



AS 1 2

CO CL5031Contig1 670 2 1 U
GGAAGAAAACGTTGTACATTGATGATTGATATGCAAAAGGGTTTTGTAGAACAAGAAAAA
GTAACAAGCAAGAACTAAAAATCTACAAGATACACTCTGACTTAAACTAAAAGAAGAAAG
AAAAGAGGTACAAATCTCCAGAGGCAGAAGACAGAAAAAACGAAGTGTGTTTTTGCTTTC
ACTCTTTTTTATACAGAAGTTGTTTGGTGATATGATTAAGGACCACCTTTGGGCTCTTCA
CTGTATTCAAACCATAACTGAAAGACACAGACAGACAGTTATAGTGGAAGTCCGTATCTG
GAGCCTAGCTTGAGCTATGGAATCGTTATCTTGAGAGAGAGAAGACTAAGACTTCCCCAT
TTTCGGTACCTTCTTGAGAGGATGGCCGATGCTAGAAGCTGTGGCTGGTTTCATAATCTC
AAAAGAGCAAACAAGAGACTCGTCCACGCTCAGTAACGCACCAGCGTTGTCAAACTCCCC
ACCATAGTTTGGAGCTGAGAATATCGTGACTAATCTCCGTTTAGCAAAAAACTCGTACCC
ATCTTCCACTACCTGATGGCCTCGGCAAATGAGGTCAAGATCATTCTTATCCAAGAACTC
AGCGACTTTATCAGCTCCAAAAGTACAAGAAATGCCACGATCACTATCAGCCCACCCTTC
AATCTTCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B292JQ U 10
AF RR2F930JQ U 1
BS 1 670 RR2F930JQ

RD RR2B292JQ 242 0 0
CGTTGTACATTGATGATTGATATGCAAAAGGGTTTTGTAGAACAAGAAAAAGTAACAAGC
AAGAACTAAAAATCTACAAGATACACTCTGACTTAAACTAAAAGAAGAAAGAAAAGAGGT
ACAAATCTCCAGAGGCAGAAGACAGAAAAAACGAAGTGTGTTTTTGCTTTCACTCTTTTT
TATACAGAAGTTGTTTGGTGATATGATTAAGGACCACCTTTGGGCTCTTCACTGTATTCA
AA

QA 1 242 1 242
DS 

RD RR2F930JQ 670 0 0
GGAAGAAAACGTTGTACATTGATGATTGATATGCAAAAGGGTTTTGTAGAACAAGAAAAA
GTAACAAGCAAGAACTAAAAATCTACAAGATACACTCTGACTTAAACTAAAAGAAGAAAG
AAAAGAGGTACAAATCTCCAGAGGCAGAAGACAGAAAAAACGAAGTGTGTTTTTGCTTTC
ACTCTTTTTTATACAGAAGTTGTTTGGTGATATGATTAAGGACCACCTTTGGGCTCTTCA
CTGTATTCAAACCATAACTGAAAGACACAGACAGACAGTTATAGTGGAAGTCCGTATCTG
GAGCCTAGCTTGAGCTATGGAATCGTTATCTTGAGAGAGAGAAGACTAAGACTTCCCCAT
TTTCGGTACCTTCTTGAGAGGATGGCCGATGCTAGAAGCTGTGGCTGGTTTCATAATCTC
AAAAGAGCAAACAAGAGACTCGTCCACGCTCAGTAACGCACCAGCGTTGTCAAACTCCCC
ACCATAGTTTGGAGCTGAGAATATCGTGACTAATCTCCGTTTAGCAAAAAACTCGTACCC
ATCTTCCACTACCTGATGGCCTCGGCAAATGAGGTCAAGATCATTCTTATCCAAGAACTC
AGCGACTTTATCAGCTCCAAAAGTACAAGAAATGCCACGATCACTATCAGCCCACCCTTC
AATCTTCTGA

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL5032Contig1 798 2 8 U
CCCAACCAAAAGAGATTTTTCCAAATGAAAAAAATAACAAAAGTAGTAAGTGGGTGCGCC
CACACTCTCTATCTTCCTGTGTCCCTCCATCTTTTAAGATTACATCACACAAACCAAAAT
AGAGAGATAAAATTGTGAAAAGAGAGAGCACTATTATAGTTAATTCAAGAACACAAATTT
CCAAAAAAATCAAGTTGGAATCCGGAGGATGACCTTACTCGTCCTCACTGCCATACGTTT
CTCTTTATTCTTTCAAACAAAAAATCCTAATTTTTTTTTTTATCATCATCATTTAGTCTT
AGGCTTTGGCTTCAGCTGCTGCGATGGCAGGGACTGGAGCAACACCACCGGTGGTTGGCA
GGCCAACAAACACTTTGAAGGCATCGTATAAACCCCATTGTGCTCCAGTCAATGTTCCTA
TCATCACAATTCTAAGAGGAAGTCCCCTTGTGAACAGTCCCACCATTCCTATCTTCTTCA
CCGCATCTCCAACGGTTGCTCCCTTAGCGTTGTTGAAAAACGACACTAGATTATCTGCAG
GATGGGAGACAATCGCACAAAACACTCCAGCAACATAACCTCCTGCAAAACTCACACCGA
GTTGCAGCCCTTTGCTGCACTCGTGTTTTGGGTTGGGGATTGCGTACTTGTAAATCATCT
CCACGATGGTCTCAAACGAAGCAAACTTCATCATCGTGTAAGGAATCTGACGTCCCCAGA
GTGGAGCAAGACCCTTGTACAAGCCTCCGTATCCTTCGGACTTGACAAACTTAGGAAACC
CATCAGACATCCCCCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR89JQ U 1
AF RR2C887JQ U 36
BS 1 279 RR2BR89JQ
BS 280 281 RR2C887JQ
BS 282 516 RR2BR89JQ
BS 517 517 RR2C887JQ
BS 518 652 RR2BR89JQ
BS 653 653 RR2C887JQ
BS 654 752 RR2BR89JQ
BS 753 798 RR2C887JQ

RD RR2BR89JQ 752 0 0
CCCAACCAAAAGAGATTTTTCCAAATGAAAAAAATAACAAAAGTAGTAAGTGGGTGCGCC
CACACTCTCTATCTTCCTGTGTCCCTCCATCTTTTAAGATTACATCACACAAACCAAAAT
AGAGAGATAAAATTGTGAAAAGAGAGAGCACTATTATAGTTAATTCAAGAACACAAATTT
CCAAAAAAATCAAGTTGGAATCCGGAGGATGACCTTACTCGTCCTCACTGCCATACGTTT
CTCTTTATTCTTTCAAACAAAAAATCCTAATTTTTTTTT**ATCATCATCATTTAGTCTT
AGGCTTTGGCTTCAGCTGCTGCGATGGCAGGGACTGGAGCAACACCACCGGTGGTTGGCA
GGCCAACAAACACTTTGAAGGCATCGTATAAACCCCATTGTGCTCCAGTCAATGTTCCTA
TCATCACAATTCTAAGAGGAAGTCCCCTTGTGAACAGTCCCACCATTCCTATCTTCTTCA
CCGCATCTCCAACGGTTGCTCCCTTAGCGTTGTTGAGAAACGACACTAGATTATCTGCAG
GATGGGAGACAATCGCACAAAACACTCCAGCAACATAACCTCCTGCAAAACTCACACCGA
GTTGCAGCCCTTTGCTGCACTCGTGTTTTGGGTTGGGGATTGCGTACTTGTAGATCATCT
CCACGATGGTCTCAAACGAAGCAAACTTCATCATCGTGTAAGGAATCTGACGTCCCCAGA
GTGGAGCAAGACCCTTGTACAAGCCTCCGTAT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2C887JQ 763 0 0
AACAAAAGTAGTAAGTGGGTGCGCCCACACTCTCTATCTTCCTGTGTCCCTCCATCTTTT
AAGATTACATCACACAAACCAAAATAGAGAGATAAAATTGTGAAAAGAGAGAGCACTATT
ATAGTTAATTCAAGAACACAAATTTCCAAAAAAATCAAGTTGGAATCCGGAGGATGACCT
TACTCGTCCTCACTGCCATACGTTTCTCTTTATTCTTTCAAACAAAAAATCCTAATTTTT
TTTTTTATCATCATCATTTAGTCTTAGGCTTTGGCTTCAGCTGCTGCGATGGCAGGGACT
GGAGCAACACCACCGGTGGTTGGCAGGCCAACAAACACTTTGAAGGCATCGTATAAACCC
CATTGTGCTCCAGTCAATGTTCCTATCATCACAATTCTAAGAGGAAGTCCCCTTGTGAAC
AGTCCCACCATTCCTATCTTCTTCACCGCATCTCCAACGGTTGCTCCCTTAGCGTTGTTG
AAAAACGACACTAGATTATCTGCAGGATGGGAGACAATCGCACAAAACACTCCAGCAACA
TAACCTCCTGCAAAACTCACACCGAGTTGCAGCCCTTTGCTGCACTCGTGTTTTGGGTTG
GGGATTGCGTACTTGTAAATCATCTCCACGATGGTCTCAAACGAAGCAAACTTCATCATC
GTGTAAGGAATCTGACGTCCCCAGAGTGGAGCAAGACCCTTGTACAAGCCTCCGTATCCT
TCGGACTTGACAAACTTAGGAAACCCATCAGACATCCCCCTGG

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL5033Contig1 814 2 3 U
TTCACTGTGACGTTGGCACAAGGATCAGAGAAGAGTGTAACATTTTCGGTAGAGCAGGTG
ACATCCTTTGCATAAGCGGAAGAGTAATAATTAATGCCAATGGAATCATATGCGCCCATA
AGCATCTTAGATTGTTCTGCAGTGAATGTTGGCAAACGACCGCCTTTCACATTGTTGACC
ATGTCCACTGGGTATTTACCGGTCACAAGTGGTTCCAGAAAGTAGTCAATTGTGAAGGCC
ATGACTCGTGCCACGGCTAACCTATCTTCGGCTGATTCTGTATAGGGCAAGTACCAACCC
GCGTTCAGAGCGATACCAACTTGACCTTTTTGAGATCCCTTGTATTTTTCTCTGTAGACT
TTTACCGCGGATCCGTGAGCAAGGATGAGATTGTGACCCACGATATAAGGCTCGGTGGCT
CCATCTCCGCCGGTGCAATTAGGGTTTGTGAATTTGGAACATCTTCCTGGAGCCAATCCA
CCTGCAACATATCCTTGTTGCACTACTGCCAATGGCTCGTTCAATGTCATCCAGTGCTTA
CTCTGTCTCCAAAATTCTTAAAGCAAATATCCGCATAATTGCGGAAATCGTTTACAATTT
CTGCGCCAAGGAATCCACCGTAAGCATCTTCAAGGCTTTGTGGTGTGTCCCAATGGAAAA
TGGTGACAAAAGGCTTAATTCCTTTGGACAGAAGCTCATTGATCAAGTTGTTGTAATAGT
TAATACCAGCTTGGTTGATTCCTCCTTTAAGATTCCCTCGAGGCAATATTCTCGACCATG
AGATAGAGAATCTGTAAGCATTGAAGCCAATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A166JQ U 137
AF RR2A166TF C 1
BS 1 136 RR2A166TF
BS 137 379 RR2A166JQ
BS 380 814 RR2A166TF

RD RR2A166JQ 243 0 0
CTGCAGTGAATGTTGGCAAACGACCGCCTTTCACATTGTTGACCATGTCCACTGGGTATT
TACCGGTCACAAGTGGTTCCAGAAAGTAGTCAATTGTGAAGGCCATGACTCGTGCCACGG
CTAACCTATCTTCGGCTGATTCTGTATAGGGCAAGTACCAACCCGCGTTCAGAGCGATAC
CAACTTGACCTTTTTGAGATCCCTTGTATTTTTCTCTGTAGACTTTTACCGCGGATCCGT
GAG

QA 1 243 1 243
DS 

RD RR2A166TF 814 0 0
TTCACTGTGACGTTGGCACAAGGATCAGAGAAGAGTGTAACATTTTCGGTAGAGCAGGTG
ACATCCTTTGCATAAGCGGAAGAGTAATAATTAATGCCAATGGAATCATATGCGCCCATA
AGCATCTTAGATTGTTCTGCAGTGAATGTTGGCAAACGACCGCCTTTCACATTGTTGACC
ATGTCCACTGGGTATTTACCGGTCACAAGTGGTTCCAGAAAGTAGTCAATTGTGAAGGCC
ATGACTCGTGCCACGGCTAACCTATCTTCGGCTGATTCTGTATAGGGCAAGTACCAACCC
GCGTTCAGAGCGATACCAACTTGACCTTTTTGAGATCCCTTGTATTTTTCTCTGTAGACT
TTTACCGCGGATCCGTGAGCAAGGATGAGATTGTGACCCACGATATAAGGCTCGGTGGCT
CCATCTCCGCCGGTGCAATTAGGGTTTGTGAATTTGGAACATCTTCCTGGAGCCAATCCA
CCTGCAACATATCCTTGTTGCACTACTGCCAATGGCTCGTTCAATGTCATCCAGTGCTTA
CTCTGTCTCCAAAATTCTTAAAGCAAATATCCGCATAATTGCGGAAATCGTTTACAATTT
CTGCGCCAAGGAATCCACCGTAAGCATCTTCAAGGCTTTGTGGTGTGTCCCAATGGAAAA
TGGTGACAAAAGGCTTAATTCCTTTGGACAGAAGCTCATTGATCAAGTTGTTGTAATAGT
TAATACCAGCTTGGTTGATTCCTCCTTTAAGATTCCCTCGAGGCAATATTCTCGACCATG
AGATAGAGAATCTGTAAGCATTGAAGCCAATTTG

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL5034Contig1 1006 2 4 U
GGCCGACACCTCTTAACTTTTCTGTTCTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTACCACCGGACTT
TTGCTTTTCCAGGTTCCAAAACGCATCTCCTCCTCCTCCTCCGTCTCCTAGGCTTCCTTG
TCACGCAAACCTTTGAACCAACGAAAGCTATGAAGATCACCGCCCTGCTCGTTCTCAAGG
CCGCCCCCGAAACATCGGATCCAGTCATCCTCGCAAACGCCTCTGACGTTTCTCACTTTG
GCTATTTCCAGCGATCCAGCGTCAAGGAGTTCGTCGTCTTCGTCGGCCGCACCGTTGCTA
GCCGAACACCTCCTTCCCAGCGCCAGTCCGTCCAGCACGAAGAGTATAAGGTTCATGCTT
ACAATAGAAATGGGCTTTGTGCGGTGGGATTCATGGACGATCATTACCCTGTTCGAAGTG
CCTTTTCTCTTCTCAATCAGGTGATAGATGAGTACCAGAAGAGTTTTGGTGAGACATGGA
GGTCTGCTAAAGAAGACTCCTCTCAGCCTTGGCCTTACTTAGCCGAAGCTCTTACCAAGT
TTCAGGACCCAGCAGAGGCTGATAAGCTGTTGAAAATCCAGAGGGAGTTAGATGAGACCA
AGATTATCCTTCATAAGACCATTGATAGCGTTCTAGCCCGTGGTGAGAAGCTGGACAGCC
TAGTCGAGAAAAGCTCTGATTTGAGCATGGCATCCCAGATGTTCTACAAGCAAGCAAAGA
AAACGAATTCATGCTGCACTATTCTGTGAGCTGCAACTCTCTCTCTCTCTGGATGTCTTG
GGTATATATATATAGTCAACCAAACTTTTGCTGGGGGCAGAGGCGAGACTACAGTTTATC
ATTTTATATAAATTTGAATCCCTTCTCGTTTGCATGCACTTTGAAAATTCCATAAGACTC
ATGTCGTGTGGCGTGTTATCCAAATACAGTTTCTATCGTCTCTACTCTCTACCAAGATTA
TATGATTGCTTTTGTTTATGTTTTCTAATGGTAACAACATTATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP10TF U 1
AF RR2GP10JQ C 526
BS 1 755 RR2GP10TF
BS 756 756 RR2GP10JQ
BS 757 772 RR2GP10TF
BS 773 1006 RR2GP10JQ

RD RR2GP10TF 772 0 0
GGCCGACACCTCTTAACTTTTCTGTTCTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTACCACCGGACTT
TTGCTTTTCCAGGTTCCAAAACGCATCTCCTCCTCCTCCTCCGTCTCCTAGGCTTCCTTG
TCACGCAAACCTTTGAACCAACGAAAGCTATGAAGATCACCGCCCTGCTCGTTCTCAAGG
CCGCCCCCGAAACATCGGATCCAGTCATCCTCGCAAACGCCTCTGACGTTTCTCACTTTG
GCTATTTCCAGCGATCCAGCGTCAAGGAGTTCGTCGTCTTCGTCGGCCGCACCGTTGCTA
GCCGAACACCTCCTTCCCAGCGCCAGTCCGTCCAGCACGAAGAGTATAAGGTTCATGCTT
ACAATAGAAATGGGCTTTGTGCGGTGGGATTCATGGACGATCATTACCCTGTTCGAAGTG
CCTTTTCTCTTCTCAATCAGGTGATAGATGAGTACCAGAAGAGTTTTGGTGAGACATGGA
GGTCTGCTAAAGAAGACTCCTCTCAGCCTTGGCCTTACTTAGCCGAAGCTCTTACCAAGT
TTCAGGACCCAGCAGAGGCTGATAAGCTGTTGAAAATCCAGAGGGAGTTAGATGAGACCA
AGATTATCCTTCATAAGACCATTGATAGCGTTCTAGCCCGTGGTGAGAAGCTGGACAGCC
TAGTCGAGAAAAGCTCTGATTTGAGCATGGCATCCCAGATGTTCTACAAGCAAGCAAAGA
AAACGAATTCATGCTGCACTATTCTGTGAGCTGCA*CTCTCTCTCTCTCTGG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2GP10JQ 481 0 0
AAGCTCTTACCAAGTTTCAGGACCCAGCAGAGGCTGATAAGCTGTTGAAAATCCAGAGGG
AGTTAGATGAGACCAAGATTATCCTTCATAAGACCATTGATAGCGTTCTAGCCCGTGGTG
AGAAGCTGGACAGCCTAGTCGAGAAAAGCTCTGATTTGAGCATGGCATCCCAGATGTTCT
ACAAGCAAGCAAAGAAAACGAATTCATGCTGCACTATTCTGTGAGCTGCAACTCTCTCTC
TCTCTGGATGTCTTGGGTATATATATATAGTCAACCAAACTTTTGCTGGGGGCAGAGGCG
AGACTACAGTTTATCATTTTATATAAATTTGAATCCCTTCTCGTTTGCATGCACTTTGAA
AATTCCATAAGACTCATGTCGTGTGGCGTGTTATCCAAATACAGTTTCTATCGTCTCTAC
TCTCTACCAAGATTATATGATTGCTTTTGTTTATGTTTTCTAATGGTAACAACATTATCT
C

QA 1 481 1 481
DS 



AS 1 2

CO CL5035Contig1 635 2 6 U
GGGCGTCTCTCTCTCGCTCAAAATCACATTCACTAGGGTTCCCTCAGACTCGGTATCGTC
ACCGTCTTCGCCCCCTGCGAAGCTCAGTTCGAAGATGTTCACGGCGGATATACCACCGAA
TCAGTCAATCTACATCAAAAACCTCAATGAACGAATCAAGAAAGAAGAATTGAAGAGATC
TCCTTACTGTTTGTTCTCACAGTTTGGGAGGATACTTGATGTGGTTGCTTTGAAGACTCC
TAAGCTCCGTGGTCAAGCTTGGGTTGCCTTTAGTGACGTCACTGCTGCTACTAATGCCGT
TCGCCAGATGCAGAACTTCCCTTTCTATGATAAGCCTATGCGCATACAGTTCGCAAAAGA
AAAGTCAGATTGTATTGCTAAAGAGGAAGGAACTTTCGTTCCCAAAGATAAGAAGAGGAA
GAAACAAGAGAAAGCTGAAAGAAAGCGTGAAGAAACCCAACGACCAAACACAGCTAATGG
CCCAACTCCACAGAACGGAGCCCCTCCGCCATCATCGTACAAGCCTAGCGGACAAGAAGC
GATGCCACCAAACAACATACTCTTCATTCAGAATCTTCCGCACGATACAACAACCGCTAT
GCTCGAGTTTCTCTTCCGTCAGTATCCTGGATTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX22TF U 1
AF RR2DC52TF U 24
BS 1 42 RR2DX22TF
BS 43 43 RR2DC52TF
BS 44 75 RR2DX22TF
BS 76 76 RR2DC52TF
BS 77 287 RR2DX22TF
BS 288 635 RR2DC52TF

RD RR2DX22TF 287 0 0
GGGCGTCTCTCTCTCGCTCAAAATCACATTCACTAGGGTTCCTTCAGACTCGGTATCGTC
ACCGTCTTCGCCCCC*GCGAAGCTCAGTTCGAAGATGTTCACGGCGGATATACCACCGAA
TCAGTCAATCTACATCAAAAACCTCAATGAACGAATCAAGAAAGAAGAATTGAAGAGATC
TCCTTACTGTTTGTTCTCACAGTTTGGGAGGATACTTGATGTGGTTGCTTTGAAGACTCC
TAAGCTCCGTGGTCAAGCTTGGGTTGCCTTTAGTGACGTCACTGCTG

QA 1 287 1 287
DS 

RD RR2DC52TF 612 0 0
GG
ACATTCATTAGGGTTCTCTCAGACTCGGTATCGTCACCGTCTTCGCCCCCTGCGAAGCTC
AGTTCGAAGATGTTCACGGCGGATATACCACCGAATCAGTCAATCTACATCAAAAACCTC
AATGAACGAATCAAGAAAGAAGAATTGAAGAGATCTCTTTACTGTTTGTTCTCACAGTTT
GGGAGGATACTTGATGTGGTTGCTTTGAAGACTCCTAAGCTCCGTGGTCAAGCTTGGGTT
GCCTTTAGTGACGTCACTGCTGCTACTAATGCCGTTCGCCAGATGCAGAACTTCCCTTTC
TATGATAAGCCTATGCGCATACAGTTCGCAAAAGAAAAGTCAGATTGTATTGCTAAAGAG
GAAGGAACTTTCGTTCCCAAAGATAAGAAGAGGAAGAAACAAGAGAAAGCTGAAAGAAAG
CGTGAAGAAACCCAACGACCAAACACAGCTAATGGCCCAACTCCACAGAACGGAGCCCCT
CCGCCATCATCGTACAAGCCTAGCGGACAAGAAGCGATGCCACCAAACAACATACTCTTC
ATTCAGAATCTTCCGCACGATACAACAACCGCTATGCTCGAGTTTCTCTTCCGTCAGTAT
CCTGGATTCA

QA 3 612 3 612
DS 



AS 1 2

CO CL5036Contig1 716 2 2 U
GGGAATCCAACGATGGTGATCACGTTTTATTCCAACAAACCGAGCGGTGTTTTTACCAAA
ACGCCCGAGAGATCTGCTTCGTCTTCCGACTCATTTTGTTTACTCCATCCCCACGTGAAA
AGCAAGCTTCTTTTCGTTAAAACCACCGACCGTTAATATTTACCCACGTGTCACCTCTCC
GTCGTTCATCCAGTACCATAGCGCCACGTCATTTATAATGACAAACGTGTTTATCAGTGG
CGAAACTAAGCCTGAGCCTCGTCTCGTTGATTCTTATCGGTCTCGTCGCGATCGCCTCCG
CAGCAGTTATCTTCGAGGAGCGCTTTGATGATGGATGGGAGAAGAGATGGGTTAAATCTG
AGTGGAAGAAAGATGACAAGTCTGCTGGGGAGTGGAGCCACACTGCCGGAAACTGGTCTG
GTGATGCTAGCGATAAAGGTATCCAGACAAGTGAGGACTACAGATTCTACCATTTCAGCT
AAGTTCCCTGAGTTCAGTAATAGGGACAATATCTAAATATACAAATAATCATATCTAAAT
CACAGGAATCACTCAAAACAATAATATACACTGAAAAAAAAAAGTAATAATCCTCATAGG
AAGAATGAAGAACAAAATACGTACCTCGAGTTTTGGATTTAAGGTCAGAGACCATGATTA
TTCAGCAAGCTTTGTTTTTCTCGAAAGAGCCAAGGAACCTCCACAAACACACACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F681TF U 1
AF RR2F681JQ C 387
BS 1 638 RR2F681TF
BS 639 716 RR2F681JQ

RD RR2F681TF 639 0 0
GGGAATCCAACGATGGTGATCACGTTTTATTCCAACAAACCGAGCGGTGTTTTTACCAAA
ACGCCCGAGAGATCTGCTTCGTCTTCCGACTCATTTTGTTTACTCCATCCCCACGTGAAA
AGCAAGCTTCTTTTCGTTAAAACCACCGACCGTTAATATTTACCCACGTGTCACCTCTCC
GTCGTTCATCCAGTACCATAGCGCCACGTCATTTATAATGACAAACGTGTTTATCAGTGG
CGAAACTAAGCCTGAGCCTCGTCTCGTTGATTCTTATCGGTCTCGTCGCGATCGCCTCCG
CAGCAGTTATCTTCGAGGAGCGCTTTGATGATGGATGGGAGAAGAGATGGGTTAAATCTG
AGTGGAAGAAAGATGACAAGTCTGCTGGGGAGTGGAGCCACACTGCCGGAAACTGGTCTG
GTGATGCTAGCGATAAAGGTATCCAGACAAGTGAGGACTACAGATTCTACCATTTCAGCT
AAGTTCCCTGAGTTCAGTAATAGGGACAATATCTAAATATACAAATAATCATATCTAAAT
CACAGGAATCACTCAAAACAATAATATACACTGAAAAAAAAAAGTAATAATCCTCATAGG
AAGAATGAAGAACAAAATACGTACCTCGAGTTTTGGAT
C

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2F681JQ 330 0 0
GGGGAGTGGAGCCACACTGCCGGAAATTGGTTTGGTGATGCTAGCGATAAAGGTATCCAG
ACAAGTGAGGACTACAGATTTTACCATTTCAGCTAAGTTCCCTGAGTTCAGTAATAGGGA
CAATATCTAAATATACAAATAATCATATCTAAATCACAGGAATCACTCAAAACAATAATA
TACACTGAAAAAAAAAAGTAATAATCCTCATAGGAAGAATGAAGAACAAAATACGTACCT
CGAGTTTTGGATTTAAGGTCAGAGACCATGATTATTCAGCAAGCTTTGTTTTTCTCGAAA
GAGCCAAGGAACCTCCACAAACACACACAC

QA 1 330 1 330
DS 



AS 1 2

CO CL5037Contig1 718 2 9 U
TCTAAATCAAAACTGATCAACATGATAAAGGTACAAAAATATTATCCATCAAGCAAAAAA
CGTTTCAAACAACAAACCCTCACAAGAGTTAAATCCCCCAAACCCTCCTTTACAGTCCAA
GTGTCTTTGCCACAAAACTGAATTATGCCTTTTTGCGCAAACTTAAGTCTTTAACTGTTT
CACCAGGAATCTGTACATGAACATAGCCAAAAGCCAAAAAAACAGCCTTCCGAAAAATTT
AGTCCTCAGCTTCAAGAAATAGGCTGAGTTCCACATACCTCTCATGTGAGGAAGATCTTC
GACCTCTTAAGCTCAAGCTATCCTCGTTATGTGGTGCAAGCAACAGAGCACCACTGCGTT
CTTCAGTCACACCCCTACTATCATCTTCATCCATGTCCCTTAGACCTCTTAGGGCCATTG
AATCTGAAACCGGGAAGTAGACAAGCAAGCAAATGGAAACCACGCAAAAGCAGAAGAGGG
ACAAGAAGGCTAAGAAGGAAAGGGCTTCGAACACAATCTTGTCTGCTTTTGCGAATACCG
ACAAACAGAGCATAGCAATCCTCAACGGAAGGAAACTAAAGACAGAGAATATCAAAGTGC
GTACCCTCTTCTGCAGACGCTTATTGATGACCAGTTTCAGTATCTGCCTTCCAAGCAAGA
ACAAGTAAGCTGTTAGTATGGCTGCAAACACAGCGAGGATGATGGTACTCAGTAGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C052JQ U 24
AF RR2B914JQ U 1
BS 1 55 RR2B914JQ
BS 56 56 RR2C052JQ
BS 57 117 RR2B914JQ
BS 118 118 RR2C052JQ
BS 119 218 RR2B914JQ
BS 219 219 RR2C052JQ
BS 220 288 RR2B914JQ
BS 289 289 RR2C052JQ
BS 290 718 RR2B914JQ

RD RR2C052JQ 276 0 0
GG
TAAAGGTACAAAAATATTATCCATCAAGCAAAAAACGTTTCAAACAACAAACCCTCGCAA
GAGTTAAATCCCCCAAACCCTCCTTTACAGTCCAAGTGTCTTTGCCACAAAACTGAATTA
TGCCTTTTTGCGCAAACTTAAGTCTTTAACTGTTTCACCAGGAATCTGTACATGAACATA
GTCAAAAGCCAAAAAAACAGCCTTCCGAAAAATTTAGTTCTCAGCTTCAAGAAATAGGCT
GAGTTCCACATACCTCTCCTGTGAGGAAGATCTT

QA 3 276 3 276
DS 

RD RR2B914JQ 718 0 0
TCTAAATCAAAACTGATCAACATGATAAAGGTACAAAAATATTATCCATCAAGCAGAAAA
CGTTTCAAACAACAAACCCTCACAAGAGTTAAATCCCCCAAACCCTCCTTTACAGTCGAA
GTGTCTTTGCCACAAAACTGAATTATGCCTTTTTGCGCAAACTTAAGTCTTTAACTGTTT
CACCAGGAATCTGTACATGAACATAGCCAAAAGCCAAAGAAACAGCCTTCCGAAAAATTT
AGTCCTCAGCTTCAAGAAATAGGCTGAGTTCCACATACCTCTCATGTGGGGAAGATCTTC
GACCTCTTAAGCTCAAGCTATCCTCGTTATGTGGTGCAAGCAACAGAGCACCACTGCGTT
CTTCAGTCACACCCCTACTATCATCTTCATCCATGTCCCTTAGACCTCTTAGGGCCATTG
AATCTGAAACCGGGAAGTAGACAAGCAAGCAAATGGAAACCACGCAAAAGCAGAAGAGGG
ACAAGAAGGCTAAGAAGGAAAGGGCTTCGAACACAATCTTGTCTGCTTTTGCGAATACCG
ACAAACAGAGCATAGCAATCCTCAACGGAAGGAAACTAAAGACAGAGAATATCAAAGTGC
GTACCCTCTTCTGCAGACGCTTATTGATGACCAGTTTCAGTATCTGCCTTCCAAGCAAGA
ACAAGTAAGCTGTTAGTATGGCTGCAAACACAGCGAGGATGATGGTACTCAGTAGAGG

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL5038Contig1 1061 2 2 U
GGACACAATCCAATTTCAGTTCTTTAAACTTGTCTCCTTTTAAACCCCATCTTCTATCTC
TTATCTCCTTGCCTTTCTATTGTCACTAAAAGAGAAGCCTTTGCTCTGAGAATCTTGAAA
ATGGATTCTTTGATCAAACTCTTCTTCTGCCTCTCTGTATTTCTCCTCTTTGGAGAAATA
AATGGAGTTGAGGGCTCGGATAAAAATCAGCGCATGTACGGCTTTAGACCAACGAAGCTG
TTTGTGTTCGGAGATTCATATGCTGATACAGGGAACATTAAGAAGTCTCTCTCTAGTTCT
TGGAAATTCCCTTATGGTATCACTTTCCCTGGTAAACCAGCCGGCCGTTTTTCCGACGGC
CGCGTCTCTACCGATTTTCTTGCAAAATTCGTTGGGATAAAATCACCAATCCCATACTTC
TGGAAAGATTACGCGGGAAAGAAACGGAAGTGAAGAAAATAGCAGTACCGTCGTTGCAGC
CTCTCGGTTGCATCCCTGGAATCACCGTTGCCTCCTCGTTCCAGCGTTGCAACGAGTCAC
AAAACGCTTTAGTGAAACTTCACAACAGTTTACTGCAACAAGTCGTGACAAAGCTCAATA
ACGAAACCAAGCAGTCGACTTTCATCATCCTTGATCTCTACAACGCTTTCTTGACCGTGT
TCAAGAACAAAGGAGCTTACCCAGGAAGTACAACGTTACAGAGTCCATTGAAGCCGTGTT
GCGTAGGCTTGAGCAGTGAGTATTTCTGTGGAAGTGTGGATGAAAAGGGAGTGAAGAAGT
ATGTTATATGTGATAACCCTAAAGCTGCTTTCTTTTGGGATGGAAGTCACCCTACAGAAG
AAGGGTGGAGATCGGTTTACTCTGTTTTACGTGAAAGTCTTACCGCGTCTTTTATTAAAG
CGTGAGGAGCAAGAAACACATGTTTTTTTAGGCTTCTTTTTAAAAAAAAATCTCAATGTT
TGTTCTTTTTGTGTTTTTAGTCTCTCTTCATTCATTTGTGTTTCAGTGTTGAATGTTAAA
AGGTAGTGTGACTAATAAAACCCACTAAACTGTTCATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E030TF U 1
AF RR2E030JQ C 375
BS 1 615 RR2E030TF
BS 616 1061 RR2E030JQ

RD RR2E030TF 615 0 0
GGACACAATCCAATTTCAGTTCTTTAAACTTGTCTCCTTTTAAACCCCATCTTCTATCTC
TTATCTCCTTGCCTTTCTATTGTCACTAAAAGAGAAGCCTTTGCTCTGAGAATCTTGAAA
ATGGATTCTTTGATCAAACTCTTCTTCTGCCTCTCTGTATTTCTCCTCTTTGGAGAAATA
AATGGAGTTGAGGGCTCGGATAAAAATCAGCGCATGTACGGCTTTAGACCAACGAAGCTG
TTTGTGTTCGGAGATTCATATGCTGATACAGGGAACATTAAGAAGTCTCTCTCTAGTTCT
TGGAAATTCCCTTATGGTATCACTTTCCCTGGTAAACCAGCCGGCCGTTTTTCCGACGGC
CGCGTCTCTACCGATTTTCTTGCAAAATTCGTTGGGATAAAATCACCAATCCCATACTTC
TGGAAAGATTACGCGGGAAAGAAACGGAAGTGAAGAAAATAGCAGTACCGTCGTTGCAGC
CTCTCGGTTGCATCCCTGGAATCACCGTTGCCTCCTCGTTCCAGCGTTGCAACGAGTCAC
AAAACGCTTTAGTGAAACTTCACAACAGTTTACTGCAACAAGTCGTGACAAAGCTCAATA
ACGAAACCAAGCAGT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2E030JQ 687 0 0
TTTTCTTGCAAAATTCGTTGGGATAAAATCACCAATCCCATACTTCTGGAAAGATTACGC
GGGAAAGAAACGGAAGTGAAGAAAATAGCAGTACCGTCGTTGCAGCCTCTCGGTTGCATC
CCTGGAATCACCGTTGCCTCCTCGTTCCAGCGTTGCAACGAGTCACAAAACGCTTTAGTG
AAACTTCACAACAGTTTACTGCAACAAGTCGTGACAAAGCTCAATAACGAAACCAAGCAG
TCGACTTTCATCATCCTTGATCTCTACAACGCTTTCTTGACCGTGTTCAAGAACAAAGGA
GCTTACCCAGGAAGTACAACGTTACAGAGTCCATTGAAGCCGTGTTGCGTAGGCTTGAGC
AGTGAGTATTTCTGTGGAAGTGTGGATGAAAAGGGAGTGAAGAAGTATGTTATATGTGAT
AACCCTAAAGCTGCTTTCTTTTGGGATGGAAGTCACCCTACAGAAGAAGGGTGGAGATCG
GTTTACTCTGTTTTACGTGAAAGTCTTACCGCGTCTTTTATTAAAGCGTGAGGAGCAAGA
AACACATGTTTTTTTAGGCTTCTTTTTAAAAAAAAATCTCAATGTTTGTTCTTTTTGTGT
TTTTAGTCTCTCTTCATTCATTTGTGTTTCAGTGTTGAATGTTAAAAGGTAGTGTGACTA
ATAAAACCCACTAAACTGTTCATTTTT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL5039Contig1 254 2 1 U
CATAAACTTTATCTTCTTCCTTAAACTCTCTCTCTCTATCGTCACCATCATTCATCTTCA
TCATTCATCTATCATCAGTTCATCACCATCATCACACAAACCCAGCATCTTCGAGATGAT
CCCTCTTCCCTTTTAGATCGTCTTCTAGACCTGTGTTCACCTTCCTTAAGCTCTTGGTGA
GTTCTAGGTTGGCTATCTACTCTGTTCTAACCCACACTGTTACATTGGTATCAGAGCTTT
CGAGCTTCGGACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FP27JQ C 1
AF RR2FP27TF U 1
BS 1 254 RR2FP27TF

RD RR2FP27JQ 254 0 0
CATAAACTTTATCTTCTTCCTTAAACTCTCTCTCTCTATCGTCACCATCATTCATCTTCA
TCATTCATCTATCATCAGTTCATCACCATCATCACACAAACCCAGCATCTTCGAGATGAT
CCCTCTTCCCTTTTAGATCGTCTTCTAGACCTGTGTTCACCTTCCTTAAGCTCTTGGTGA
GTTCTAGGTTGGCTATCTACTCTGTTCTAACCCACACTGTTACATTGGTATCAGAGCTTT
CGAGCTTCGGACCC

QA 1 254 1 254
DS 

RD RR2FP27TF 254 0 0
CATAAACTTTATCTTCTTCCTTAAACTCTCTCTCTCTATCGTCACCATCATTCATCTTCA
TCATTCATCTATCATCAGTTCATCACCATCATCACACAAACCCAGCATCTTCGAGATGAT
CCCTCTTCCCTTTTAGATCGTCTTCTAGACCTGTGTTCACCTTCCTTAAGCTCTTGGTGA
GTTCTAGGTTGGCTATCTACTCTGTTCTAACCCACACTGTTACATTGGTATCAGAGCTTT
CGAGCTTCGGACCC

QA 1 254 1 254
DS 



AS 1 2

CO CL5040Contig1 747 2 9 U
CACTACTGCCGGTCGCTTCGTTTTGATGATAAACCAGACTACGCTTACCTCAAAAGGATA
TTCAGAGACCTCTTTATCCGTGAAGGGTTTCAATTTGATTATGTCTTTGACTGGACCATC
TTGAAGTACCAACAGTCACAACTAACCGCTCCTCCGACTCGTAATCACAACCCTGCGGTT
GGTACTAGCGCTGCATTGCCACCTGGCGTTTCAAACATTGATAGATACACAGGCGAGGAA
GAAGGGAGACCGGTTGGTTACTCGCATATGGAATCATCTCGACGGAGAGCTTCAGGCACT
CTTGACCACTCAGGGAATCTTTCCAACCATCAGACATCATCATTTAACAGAGACTCCATG
ATGCCGAGCTCCTCGATGTTTGCACAATCAGCAGGATCATCGAGGAGAGTAGCTGCAGTG
AGTAGCAGCCGAGACAATCTTCTGAGCGGGGAAGAGTTTCAGAGAAACCGTACAGGTGAC
GTAAGCCGAGGAGGAGGAGGAGTGATCTCTAGGAACTCCCCAGTGGAGGCTGGGAAGAGG
TCTTCTTCCTCAAGAAGACAGTACGAATCAGCCATTAAAGGCATTGATAATCTTCAAGTC
TCCTCCGACAACAAGTTTCACCACCACCACTAATAATAATATAACAACATTAATTGTACT
TTCACCGTATTGGTCAAACGACCACAGAAGTTTCATATTTTTATTTCGTAATTACACTAC
GGAAGTTTGAATACAGTTGAGTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ77TFB U 199
AF RR2CM35JQ C 1
BS 1 199 RR2CM35JQ
BS 200 259 RR2AZ77TFB
BS 260 260 RR2CM35JQ
BS 261 296 RR2AZ77TFB
BS 297 297 RR2CM35JQ
BS 298 398 RR2AZ77TFB
BS 399 399 RR2CM35JQ
BS 400 473 RR2AZ77TFB
BS 474 747 RR2CM35JQ

RD RR2AZ77TFB 275 0 0
G
CACCTGGCGTTTCAAACATTGATAGATACACAGGCGAGGAAGAAGGGAGACCGGTTGGTT
TCTCGCATATGGAATCATCTCGACGGAGAGCTTCAGGGACTCTTGACCACTCAGGGAATC
TTTCCAACCATCAGACATCATCATTTAACAGAGACTCCATGATGCCGAGCTCCTCGATGT
TTGCACAATCAGCAGGATCGTCGAGGAGAGTAGCTGCAGTGAGTAGCAGCCGAGACAATC
TTCTGAGCGGGGAAGAGTTTCAGAGAAACCGTAC

QA 2 275 2 275
DS 

RD RR2CM35JQ 747 0 0
CACTACTGCCGGTCGCTTCGTTTTGATGATAAACCAGACTACGCTTACCTCAAAAGGATA
TTCAGAGACCTCTTTATCCGTGAAGGGTTTCAATTTGATTATGTCTTTGACTGGACCATC
TTGAAGTACCAACAGTCACAACTAACCGCTCCTCCGACTCGTAATCACAACCCTGCGGTT
GGTACTAGCGCTGCATTGCCACCTGGGGTTTCAAACATTGATAGATACACAGGCGAGGAA
GAAGGGAGACCGGTTGGTTATTCGCATATGGAATCATCTCGACGGAGAGCTTCAGGCACT
CTTGACCACTCAGGGAATCTTTCCAACCATCAGACATCATCATTTAACAGAGACTCCATG
ATGCCGAGCTCCTCGATGTTTGCACAATCAGCAGGATCATCGAGGAGAGTAGCTGCAGTG
AGTAGCAGCCGAGACAATCTTCTGAGCGGGGAAGAGTTTCAGAGAAACCGTACAGGTGAC
GTAAGCCGAGGAGGAGGAGGAGTGATCTCTAGGAACTCCCCAGTGGAGGCTGGGAAGAGG
TCTTCTTCCTCAAGAAGACAGTACGAATCAGCCATTAAAGGCATTGATAATCTTCAAGTC
TCCTCCGACAACAAGTTTCACCACCACCACTAATAATAATATAACAACATTAATTGTACT
TTCACCGTATTGGTCAAACGACCACAGAAGTTTCATATTTTTATTTCGTAATTACACTAC
GGAAGTTTGAATACAGTTGAGTTAATC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5042Contig1 775 2 4 U
GGTAGCAAAATTGAAGGGAAAATGGGGTATGAGGATTTTGTGTATTTCATTCTTGCGGAA
GAAGATAAATCGTCGGAGCCTAGCCTAGAATACTGGTTTAAGTGCGTAGACTTGGATGGG
AATGGGATTATTACGCGAAATGAAATGCAGTTCTTTTATGAGGAGCAGTTGCATCGAATG
GAGTGCATGGCGCAAGAGGCTGTTCTTTTTGAGGATATCTTATGCCAGATAATTGATATG
ATCGGGCCAGAGGAAGAAAGCTATATAACTCTGAGTGACCTGAAGGGCTCCAAGCTCTCT
GGCAACGTCTTCAGCATCCTTTTTAATCTTAATAAGTTTATGGCATTTGAAACACGGGAT
CCGTTCCTCATTCGCCAGGAACGTGAAAACCCTACATTGACAGAGTGGGATCGTTTTGCA
CATAGAGAGTACATAAGGCTTTCAATGGAAGAAGATGTTGAAGATGCTTCCAATGGAAGT
GCTGAGGTTTGGGATGAGTCATTGGAGGCTCCCTTCTGAGTTCGTAAAGTTGAGAAAAGA
TGTTGGGAACTTGCTGTAGTGAAACGAAAGAAAGAGAAAGAAGAGTATTTATATATCCGC
TTCGCAATTGGGAATGCACGTTTGAAATCGGGAAACTGGTGTTTTCCTTTTCAGTTAGCT
GTTGTTATATATAGACAAGTTTTTTCCATTTTATTTATTATTATTACAAACAGCAAGCGA
TGCAGACTGCATGTTTTACAGAGTTTCTAGTTTCTATGGTACTTTTCCATTCAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2CN57JQ C 1
AF RR2CN57TF U 1
BS 1 736 RR2CN57TF
BS 737 737 RR2CN57JQ
BS 738 770 RR2CN57TF
BS 771 775 RR2CN57JQ

RD RR2CN57JQ 775 0 0
GGTAGCAAAATTGAAGGGAAAATGGGGTATGAGGATTTTGTGTATTTCATTCTTGCGGAA
GAAGATAAATCGTCGGAGCCTAGCCTAGAATACTGGTTTAAGTGCGTAGACTTGGATGGG
AATGGGATTATTACGCGAAATGAAATGCAGTTCTTTTATGAGGAGCAGTTGCATCGAATG
GAGTGCATGGCGCAAGAGGCTGTTCTTTTTGAGGATATCTTATGCCAGATAATTGATATG
ATCGGGCCAGAGGAAGAAAGCTATATAACTCTGAGTGACCTGAAGGGCTCCAAGCTCTCT
GGCAACGTCTTCAGCATCCTTTTTAATCTTAATAAGTTTATGGCATTTGAAACACGGGAT
CCGTTCCTCATTCGCCAGGAACGTGAAAACCCTACATTGACAGAGTGGGATCGTTTTGCA
CATAGAGAGTACATAAGGCTTTCAATGGAAGAAGATGTTGAAGATGCTTCCAATGGAAGT
GCTGAGGTTTGGGATGAGTCATTGGAGGCTCCCTTCTGAGTTCGTAAAGTTGAGAAAAGA
TGTTGGGAACTTGCTGTAGTGAAACGAAAGAAAGAGAAAGAAGAGTATTTATATATCCGC
TTCGCAATTGGGAATGCAGGTTTGAAATCGGGAAACTGGTGTTTTCCTTTTCAGTTAGCT
GTTGTTATATATAGACAAGTTTTTTCCATTTTATTTATTATTATTACAAACAGCAAGCGA
TGCAGACTGCATGTTTTACAGAGTTTCTAGTTTCTATGGTACTTTTCCATTCAGC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2CN57TF 774 0 0
GGTAGCAAAATTGAAGGGAAAATGGGGTATGAGGATTTTGTGTATTTCATTCTTGCGGAA
GAAGATAAATCGTCGGAGCCTAGCCTAGAATACTGGTTTAAGTGCGTAGACTTGGATGGG
AATGGGATTATTACGCGAAATGAAATGCAGTTCTTTTATGAGGAGCAGTTGCATCGAATG
GAGTGCATGGCGCAAGAGGCTGTTCTTTTTGAGGATATCTTATGCCAGATAATTGATATG
ATCGGGCCAGAGGAAGAAAGCTATATAACTCTGAGTGACCTGAAGGGCTCCAAGCTCTCT
GGCAACGTCTTCAGCATCCTTTTTAATCTTAATAAGTTTATGGCATTTGAAACACGGGAT
CCGTTCCTCATTCGCCAGGAACGTGAAAACCCTACATTGACAGAGTGGGATCGTTTTGCA
CATAGAGAGTACATAAGGCTTTCAATGGAAGAAGATGTTGAAGATGCTTCCAATGGAAGT
GCTGAGGTTTGGGATGAGTCATTGGAGGCTCCCTTCTGAGTTCGTAAAGTTGAGAAAAGA
TGTTGGGAACTTGCTGTAGTGAAACGAAAGAAAGAGAAAGAAGAGTATTTATATATCCGC
TTCGCAATTGGGAATGCACGTTTGAAATCGGGAAACTGGTGTTTTCCTTTTCAGTTAGCT
GTTGTTATATATAGACAAGTTTTTTCCATTTTATTTATTATTATTACAAACAGCAAGCGA
TGCAGACTGCATGTTT*ACAGAGTTTCTAGTTTCTATGGTACTTTTCCAT
CAGC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL5043Contig1 1072 2 4 U
GAACAAAATCTGGTTTCAAGATGGTTGGCAAGAGTTTGTTGACCGTTACTCAATCCGCAT
TGGTTACCTTTTGATATTCAGATACGAAGGCAACTCTGCCTTCAGCGTCTACATTTACAA
CTTATCACACTCCGAGATCAACTACCATTCCACCGGTCTCATGGATTCTGCACACAACCA
CTTCAAACGTGCACGCTTGTTTGAGGACCTTGAAGATGAAGATGTTGAGGTCGTTCATCC
TTCTTCTTTGTTGTACCCGTCACAGCATCCTGAAACTACTACTGCGCACGCTAGTAAAGG
GCATACTAGTTCAGCTATCCAGAGCTTCTTCGCTGGTCCTGTTAAAGCTGAGGAGACAAC
ACCAACCCCAAAAGTTCCAAAAAAGAGAGGGAGGAAGAAGAAGAACGCTGATCCTGAGGA
AATAAACTCATCTGCTCCAAGGGATGATGACCCAGAGAACCGTTCAAAGTTCTACGAGAG
TGCTTCTGCGAGAAAGAGAACCGTGACTGCAGAGGAAAGAGAGAGGGCTATTAATGCAGC
CAAAACGTTCGAGCCAACAAACCCTTTCTTCAGAGTTGTTCTACGACCATCTTATCTATA
CAGAGGTTGCATCATGTATCTGCCGTCTGGTTTTGCTGAGAAGTATTTAAGCGGGATCTC
ACGATTCATCAAGGTCCAGCTCGGGGAGAAACAGTGGCCAGTGAGATGTCTCTACAAAGC
AGGGAGAGCCAAGTTCAGCCAAGGATGGTACGAGTTCACTCTTGAGAACAACCTTGGAGA
AGGTGACGTCTGCGTGTTCGAGCTGCTCAGAACCAGAGACTTCGTTCTGAAAGTGACTGC
CTTTCGAGTCAGCGAGTATGTCTGAAACAGAGATTCACTCTCTGTAGTTACTATGGTGGG
TGATTCCGTGTAGGATGTCTTCATTTAAACTCGCTTGTTATCTATGTGTCATTGCATGTG
GATATGTGTTGTTTTACCATTATATATAACCTTGGAGTGGAACTCAAGTTAGGGTTTAAG
AAACTTTTAGAGGTTTGTAAATACCTAATCTCCATCAAATTAGGTGTTGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN11TF U 1
AF RR2GN11JQ C 424
BS 1 605 RR2GN11TF
BS 606 606 RR2GN11JQ
BS 607 671 RR2GN11TF
BS 672 1072 RR2GN11JQ

RD RR2GN11TF 671 0 0
GAACAAAATCTGGTTTCAAGATGGTTGGCAAGAGTTTGTTGACCGTTACTCAATCCGCAT
TGGTTACCTTTTGATATTCAGATACGAAGGCAACTCTGCCTTCAGCGTCTACATTTACAA
CTTATCACACTCCGAGATCAACTACCATTCCACCGGTCTCATGGATTCTGCACACAACCA
CTTCAAACGTGCACGCTTGTTTGAGGACCTTGAAGATGAAGATGTTGAGGTCGTTCATCC
TTCTTCTTTGTTGTACCCGTCACAGCATCCTGAAACTACTACTGCGCACGCTAGTAAAGG
GCATACTAGTTCAGCTATCCAGAGCTTCTTCGCTGGTCCTGTTAAAGCTGAGGAGACAAC
ACCAACCCCAAAAGTTCCAAAAAAGAGAGGGAGGAAGAAGAAGAACGCTGATCCTGAGGA
AATAAACTCATCTGCTCCAAGGGATGATGACCCAGAGAACCGTTCAAAGTTCTACGAGAG
TGCTTCTGCGAGAAAGAGAACCGTGACTGCAGAGGAAAGAGAGAGGGCTATTAATGCAGC
CAAAACGTTCGAGCCAACAAACCCTTTCTTCAGAGTTGTTCTACGACCATCTTATCTATA
CAGAG*TTGCATCATGTATCTGCCGTCTGGTTTTGCTGAGAAGTATTTAAGCGGGATCTC
ACGATTCATCA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2GN11JQ 649 0 0
AAACTCATCTGCTCCAAGGGATGATGACCCAGAGAACCGTTCAAAGTTCTACGAGAGTGC
TTCTGCGAGAAAGAGAACCGTGACTGCAGAGGAAAGAGAGAGGGCTATTAATGCAGCCAA
AACGTTCGAGCCAACAAACCCTTTCTTCAGAGTTGTTCTACGACCATCTTATCTATACAG
AGGTTGCATCATGTATCTGCCGTCTGGTTTTGCTGAGAAGTATTTAAGCGGGATCTCAGG
ATTCATCAAGGTCCAGCTCGGGGAGAAACAGTGGCCAGTGAGATGTCTCTACAAAGCAGG
GAGAGCCAAGTTCAGCCAAGGATGGTACGAGTTCACTCTTGAGAACAACCTTGGAGAAGG
TGACGTCTGCGTGTTCGAGCTGCTCAGAACCAGAGACTTCGTTCTGAAAGTGACTGCCTT
TCGAGTCAGCGAGTATGTCTGAAACAGAGATTCACTCTCTGTAGTTACTATGGTGGGTGA
TTCCGTGTAGGATGTCTTCATTTAAACTCGCTTGTTATCTATGTGTCATTGCATGTGGAT
ATGTGTTGTTTTACCATTATATATAACCTTGGAGTGGAACTCAAGTTAGGGTTTAAGAAA
CTTTTAGAGGTTTGTAAATACCTAATCTCCATCAAATTAGGTGTTGACG

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL5044Contig1 1105 2 2 U
TAGAAAATCAATCGACGTTCTGTTTCCGATTCGAAAGATAGAACAACAAAATCAAAAGGA
GTAATCTCATGTCTTTTTCATCTCGGTGGGTTATAAAAAGAGTAAATGATCTTTGTTAAG
TTAACGGAACAGAGCACTGAGATCTCAGATCTGCTCAGATCGTGTTAAGAACTTAGATCA
AAAAGAAACAAAATGAAACAGAAGCTTCAAAACTCTGTAGATTCACCGAGGATTTGACCA
TACCCTATATCTAGCTGAAGGCAAAATCTTGAAAAGAAAGATGAATCTGAGTCTCCAAAG
CAGTTAGAAACTTCTATGAAACCCCTAAAACAAAGAGTACAGTGTATAATCCCGAGGTTT
TGACCAGTCAGAAACGTCAGTGGGCAAAATATCAGGTCCTATATTTGAAAGGATCATAAA
CCAATAAAGGATCCCTCAAGGCTTTTTGAAAGTGTTGTTGTGGTTGGACTTCATCCTAAT
TGTGATATTCAAGCACTTGAAAGCCAGTACATTGCACGAAAATCCAAAGGCTCTACCGGG
AGATTGCGAAGTGCACTTCAAGTCTCTTAATATCATTCCCGTGTAGAACCCTCTCTCAGA
ACCTCAGGTCCATGCTGTTCAGAGAACCCCTTCCATGAGCGAGTTGAATGAGATAATTCT
CAGTCAGGGTTTGACCAAAAATGAGTTGATTTGATGGGGTTAGCAAGTAGTAGGGATTGA
GCATGAAGCAGAATTCGTATAGGCTGAACAATAAGTGCTTGAATTTTTAAAAGCCTTTGC
TTATTTGGTGATGGGCTTTAATATTATAGGATTTAAATATCGCAGCATTCTATTGGAAGA
TTTAATGTGGTTGATTTTTTTTTTAAAAAGAAGGCAGTGGTATTTGGTTGTAATTAATTT
GAAAAGTTAGGGGCATAATCTTAGGAGGGATTCTGTTTTAATAGTATAGACTAGATTTTG
ACCCGTGCTTTAAAAGCGCGGAAGTATTTTTGGCTTAATTCAATTTTGTTATTTTGTTAT
TTTTTTGTTTAGTTTGGTTTAAATTTTGGTTTTTTATCAAAGATATATGAACAATTTGGA
TATATATCAATTTAGATTTAGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ50TF U 1
AF RR2BZ50JQ C 354
BS 1 604 RR2BZ50TF
BS 605 1105 RR2BZ50JQ

RD RR2BZ50TF 604 0 0
TAGAAAATCAATCGACGTTCTGTTTCCGATTCGAAAGATAGAACAACAAAATCAAAAGGA
GTAATCTCATGTCTTTTTCATCTCGGTGGGTTATAAAAAGAGTAAATGATCTTTGTTAAG
TTAACGGAACAGAGCACTGAGATCTCAGATCTGCTCAGATCGTGTTAAGAACTTAGATCA
AAAAGAAACAAAATGAAACAGAAGCTTCAAAACTCTGTAGATTCACCGAGGATTTGACCA
TACCCTATATCTAGCTGAAGGCAAAATCTTGAAAAGAAAGATGAATCTGAGTCTCCAAAG
CAGTTAGAAACTTCTATGAAACCCCTAAAACAAAGAGTACAGTGTATAATCCCGAGGTTT
TGACCAGTCAGAAACGTCAGTGGGCAAAATATCAGGTCCTATATTTGAAAGGATCATAAA
CCAATAAAGGATCCCTCAAGGCTTTTTGAAAGTGTTGTTGTGGTTGGACTTCATCCTAAT
TGTGATATTCAAGCACTTGAAAGCCAGTACATTGCACGAAAATCCAAAGGCTCTACCGGG
AGATTGCGAAGTGCACTTCAAGTCTCTTAATATCATTCCCGTGTAGAACCCTCTCTCAGA
ACCT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2BZ50JQ 752 0 0
GAGGTTTTGACCAGTCAGAAACGTCAGTGGGCAAAATATCAGGTCCTATATTTGAAAGGA
TCATAAACCAATAAAGGATCCCTCAAGGCTTTTTGAAAGTGTTGTTGTGGTTGGACTTCA
TCCTAATTGTGATATTCAAGCACTTGAAAGCCAGTACATTGCACGAAAATCCAAAGGCTC
TACCGGGAGATTGCGAAGTGCACTTCAAGTCTCTTAATATCATTCCCGTGTAGAACCCTC
TCTCAGAACCTCAGGTCCATGCTGTTCAGAGAACCCCTTCCATGAGCGAGTTGAATGAGA
TAATTCTCAGTCAGGGTTTGACCAAAAATGAGTTGATTTGATGGGGTTAGCAAGTAGTAG
GGATTGAGCATGAAGCAGAATTCGTATAGGCTGAACAATAAGTGCTTGAATTTTTAAAAG
CCTTTGCTTATTTGGTGATGGGCTTTAATATTATAGGATTTAAATATCGCAGCATTCTAT
TGGAAGATTTAATGTGGTTGATTTTTTTTTTAAAAAGAAGGCAGTGGTATTTGGTTGTAA
TTAATTTGAAAAGTTAGGGGCATAATCTTAGGAGGGATTCTGTTTTAATAGTATAGACTA
GATTTTGACCCGTGCTTTAAAAGCGCGGAAGTATTTTTGGCTTAATTCAATTTTGTTATT
TTGTTATTTTTTTGTTTAGTTTGGTTTAAATTTTGGTTTTTTATCAAAGATATATGAACA
ATTTGGATATATATCAATTTAGATTTAGTTTC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL5045Contig1 896 2 4 U
GTGATGACGAATCTGATAGTAACTGTCATGACATTCCTGATGAGCAACGAAGAAACACTC
CGGTTAATGATCAAAATGTGGAGGACCGTGTTTTAGAACAAGGAGAAACATCAGCTCGTG
GCTATGGAACACAAACCTGGGATGCAGATGAAATAGAGGAGTCTGAGAATTGGAATCATT
CAGCTGTATTCAAACGCCCCAGATCAATCAGTGCAGAGATAAAACCGCTAGATGATGAAT
CAAACTTCGGTTCAAGAGAAGACGAGACAGAAGCAAGTAAGATGGTCTCTGCGCAGGTCT
CTTGTGTCATACGCTGGACGGGGTTCAGTTCCACTAGAGGCATTCTCCCTTGTGGCCACA
GGTTTTGTTATTCCTGCATCCAGCAATGGGTAGACCGTTTGGTTTCCGAGAGAAAGAAGA
AAACATGTCCATTGTGCAAGTACAGTTTCGTAACCATCACTAAGATGGAAGACGCAGGAT
CTTCTGATCAAAAGATATATTCACAAACAGTCCCTGACCCATCTTCAACAAACAACTCTC
TTGTAGTACTCCCTGAAGAGGAAGAAGAAGAAAGGCAAAGTTTCAATCCAATGTCTCGAG
CTTCAGCTTGTGGCAGATGCTCCCTCAGTGAGCCAGAGGATCTTCTCATTAGATGTCACA
TCTGCAATTTCCGGCGGATCCGTACTTACTGTTTAGACCCTTATTTGGTTCCTTGGACCT
GCAACCATTGCAATGGTCTTCAGATGCTTTACCAGCGCCGTGGCTACTAAAAAAAGTGCC
ATCATTAAAAGATATTCCCATTTATTTATGGTTTTGTCATATGAGTATAGGAACGTCATT
AAAAACTAGTTTGTGATAATTTGTTCTGTTTTCGTTTACATGAAATGAACTCAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H539TF U 1
AF RR2H539JQB C 375
BS 1 638 RR2H539TF
BS 639 639 RR2H539JQB
BS 640 653 RR2H539TF
BS 654 896 RR2H539JQB

RD RR2H539TF 653 0 0
GTGATGACGAATCTGATAGTAACTGTCATGACATTCCTGATGAGCAACGAAGAAACACTC
CGGTTAATGATCAAAATGTGGAGGACCGTGTTTTAGAACAAGGAGAAACATCAGCTCGTG
GCTATGGAACACAAACCTGGGATGCAGATGAAATAGAGGAGTCTGAGAATTGGAATCATT
CAGCTGTATTCAAACGCCCCAGATCAATCAGTGCAGAGATAAAACCGCTAGATGATGAAT
CAAACTTCGGTTCAAGAGAAGACGAGACAGAAGCAAGTAAGATGGTCTCTGCGCAGGTCT
CTTGTGTCATACGCTGGACGGGGTTCAGTTCCACTAGAGGCATTCTCCCTTGTGGCCACA
GGTTTTGTTATTCCTGCATCCAGCAATGGGTAGACCGTTTGGTTTCCGAGAGAAAGAAGA
AAACATGTCCATTGTGCAAGTACAGTTTCGTAACCATCACTAAGATGGAAGACGCAGGAT
CTTCTGATCAAAAGATATATTCACAAACAGTCCCTGACCCATCTTCAACAAACAACTCTC
TTGTAGTACTCCCTGAAGAGGAAGAAGAAGAAAGGCAAAGTTTCAATCCAATGTCTCGAG
CTTCAGCTTGTGGCAGATGCTCCCTCAGTGAGCCAGAG*ATCTTCTCATTAGA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2H539JQB 522 0 0
TGCATCCAGCAATGGGTAGACCGTTTGGTTTCCGAGAGAAAGAAGAAAACATGTCCATTG
TGCAAGTACAGTTTCGTAACCATCACTAAGATGGAAGACGCAGGATTTTTTGATCAAAAG
ATATATTCACAAACAGTCCCTGACCCATTTTCAACAAACAACTTTTTTGTAGTACTCCCT
GAAGAGGAAGAAGAAGAAAGGCAAAGTTTCAATCCAATGTCTCGAGCTTCAGCTTGTGGC
AGATGCTCCCTCAGTGAGCCAGAGGATCTTCTCATTAGATGTCACATCTGCAATTTCCGG
CGGATCCGTACTTACTGTTTAGACCCTTATTTGGTTCCTTGGACCTGCAACCATTGCAAT
GGTCTTCAGATGCTTTACCAGCGCCGTGGCTACTAAAAAAAGTGCCATCATTAAAAGATA
TTCCCATTTATTTATGGTTTTGTCATATGAGTATAGGAACGTCATTAAAAACTAGTTTGT
GATAATTTGTTCTGTTTTCGTTTACATGAAATGAACTCAGCG

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 2

CO CL5046Contig1 657 2 2 U
GGACCAATCAAAAAGCTCTTTTGACTTTCTGAAGAAGCAACAGAGAGATCTTTAAATGGC
GGCCATGAACTCGAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGCGCTAGCTCAGTAGA
TCTAAACCAGAAAGTGGGTTTGGCGAACTCATCGGTTGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGAC
GGTTCCTGTGATCAAAGCAGCTCAACGAGTTGGTGGTGATGATGATGTTATAAATGGAAG
AAGATCCGCAATGGTGTTCTTAGCTGCTACACTCTTCTCCACTGCTGCTGTGTCTGCTAA
TGCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAATACCTTGAGAAGAGCAAAGCCAACAAAAAACTGAA
TTATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCAAGAGCATTCACTGTTCAATT
TGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGATGTCAAGATCTTGCCAAGCAAAAGAA
AGTACCATTCATCTCAGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTTCAAGTG
TGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGATCATGTTCTGTTTTGTCTCTTTAATCCATTCT
TGTATAAACTGATATATCTATCAAAGTTCTCTCATATCCATTAACTAACTTCCCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2BW72TF U 1
AF RR2BW72JQ C 299
BS 1 652 RR2BW72TF
BS 653 657 RR2BW72JQ

RD RR2BW72TF 655 0 0
GGACCAATCAAAAAGCTCTTTTGACTTTCTGAAGAAGCAACAGAGAGATCTTTAAATGGC
GGCCATGAACTCGAGTGTTCTCACCTGCAGCTACGCAATCTCTGGCGCTAGCTCAGTAGA
TCTAAACCAGAAAGTGGGTTTGGCGAACTCATCGGTTGGGTTTGGTCAGAAGAAACAGAC
GGTTCCTGTGATCAAAGCAGCTCAACGAGTTGGTGGTGATGATGATGTTATAAATGGAAG
AAGATCCGCAATGGTGTTCTTAGCTGCTACACTCTTCTCCACTGCTGCTGTGTCTGCTAA
TGCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAATACCTTGAGAAGAGCAAAGCCAACAAAAAACTGAA
TTATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCAAGAGCATTCACTGTTCAATT
TGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGATGTCAAGATCTTGCCAAGCAAAAGAA
AGTACCATTCATCTCAGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAAAGACAAGTTCAAGTG
TGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGATCATGTTCTGTTTTGTCTCTTTAATCCATTCT
TGTATAAACTGATATATCTATCAAAGTTCTCTCATATCCATTAACTAACTTC
ACC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2BW72JQ 359 0 0
AATGCTAATGCTAGGGTTTTCGATGAATACCTTGGGAAGAGCAAAGCCAACAAAAAACTG
AATTATAAGAAGAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCAAGAGCATTCACTGTTCAA
TTTGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGATGTCAAGATCTTGCCAAGCAAAAG
AAAGTACCATTCATTTCAGAAGATTTGGCGTTGGAATGGGAAGGCAAAGACAAGTTCAAG
TGTGGTTCCAATGTTTTCTGGAAATGGTGATCATGTTTTGTTTTGTCTCTTTAATCCATT
TTTGTATAAACTGATATATCTATCAAAGTTCTCTCATATCCATTAACTAACTTCCCCAT

QA 1 359 1 359
DS 



AS 1 2

CO CL5047Contig1 1240 2 2 U
GGGACTATCTCCCAATCAAACAAACAAACACGATACAGAGAGATACAGTGAAGAAGAAAA
GACTTATCGAGATATAATAAGCTTCCAAGAATGTCGATGCTCACGGCGGTCAAAACCCCT
TCCCTCTGCAACACCCTAAACCTAACAGCTACTTCACCGAGACTCCCACAACGTGCGAAT
CCTCCTCGCGCAGCGAGATCGGTGAATCCGACGGCGAGGATCCAAACACGCATCCATCGT
CTGATCCAAGACCAGGGCATCATCCTCATGCCTGGATGCTACGATGCTTTATCGGCTGCC
ATCGTTCAGCAAACCGGATTCTCCGCCGGTTTCATCTCCGGTTACGCTCTCTCCGCTTCT
CTTTTGGGTAAACCGGACTTCGGTTTGCTAACACCACCGGAGATGGCTGCGACGGCGAGG
TCCGTCTGTGCTTCGGCTCCAAACATCCCCATTATTGCAGATGCCGATACTGGTGGAGGT
AATGCACTAAACGTTCAAAGAACTGTAAAGGACTTGATCGCAGCTGGTGCTGTTGGTTGC
TTCCTTGAGGATCAAGCATGGCCAAAGAAATGCGGTCATATGCGTGGCAAACAGGTTATA
TCAGCAGAAGAACATGCTGCCAAGATAGCATCAGCACGAGACGCTATTGGAGATTCTGAC
TTCTTCCTTGTCGCCAGAACAGACGCACGTGCCACTTCTGCTAAATCAGGGCTCGAAGAC
GCCATCGCCCGTGTCAATCTCTACATGGAGGCGGGAGCTGATGCTTCCTTTGTGGAGGCG
CCGAGAGACGACGATGAGTTCAAGGAAATAGGCAAACGAACAAAGGGTTTCAGAGTCTGC
AACATGATCGAATGCGGAGTCACGCCGTTGCACACCCCTGAGGAGCTTAAAGAAATGGGG
TTTCACTTGATTGTTCACCCCTTGACCGCACTCTACGCATCGGCTCGAGCACTTGTGGAT
GTTCTCAAGACTCTTAAAGAAAACGGAACCACGAGAGGTCACTTGGAAAAGATGGCTACT
TTTGAGGAGTTCAATAGTTTGGTGGATTTAGAGTCGTGGTTTGAGCTCGAAGCTCGTTAT
TCGAACCTTAGGAACGCTCTTGGGACGACAACAAAATCTTGAAGAGGCTGCTGCTACTAG
AGAGCCACAAGTTTTATCCTCTTTCAAAATGTCTCTGAAGCTCTTCTGTTTTGCTAATTT
TACAGACGATTTATTTGAGCAATTGTCTCATCATCAATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH50TF U 1
AF RR2FH50JQ C 589
BS 1 707 RR2FH50TF
BS 708 1240 RR2FH50JQ

RD RR2FH50TF 707 0 0
GGGACTATCTCCCAATCAAACAAACAAACACGATACAGAGAGATACAGTGAAGAAGAAAA
GACTTATCGAGATATAATAAGCTTCCAAGAATGTCGATGCTCACGGCGGTCAAAACCCCT
TCCCTCTGCAACACCCTAAACCTAACAGCTACTTCACCGAGACTCCCACAACGTGCGAAT
CCTCCTCGCGCAGCGAGATCGGTGAATCCGACGGCGAGGATCCAAACACGCATCCATCGT
CTGATCCAAGACCAGGGCATCATCCTCATGCCTGGATGCTACGATGCTTTATCGGCTGCC
ATCGTTCAGCAAACCGGATTCTCCGCCGGTTTCATCTCCGGTTACGCTCTCTCCGCTTCT
CTTTTGGGTAAACCGGACTTCGGTTTGCTAACACCACCGGAGATGGCTGCGACGGCGAGG
TCCGTCTGTGCTTCGGCTCCAAACATCCCCATTATTGCAGATGCCGATACTGGTGGAGGT
AATGCACTAAACGTTCAAAGAACTGTAAAGGACTTGATCGCAGCTGGTGCTGTTGGTTGC
TTCCTTGAGGATCAAGCATGGCCAAAGAAATGCGGTCATATGCGTGGCAAACAGGTTATA
TCAGCAGAAGAACATGCTGCCAAGATAGCATCAGCACGAGACGCTATTGGAGATTCTGAC
TTCTTCCTTGTCGCCAGAACAGACGCACGTGCCACTTCTGCTAAATC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2FH50JQ 652 0 0
AAACAGGTTATATCAGCAGAAGAACATGCTGCCAAGATAGCATCAGCACGAGACGCTATT
GGAGATTCTGACTTCTTCCTTGTCGCCAGAACAGACGCACGTGCCACTTCTGCTAAATCA
GGGCTCGAAGACGCCATCGCCCGTGTCAATCTCTACATGGAGGCGGGAGCTGATGCTTCC
TTTGTGGAGGCGCCGAGAGACGACGATGAGTTCAAGGAAATAGGCAAACGAACAAAGGGT
TTCAGAGTCTGCAACATGATCGAATGCGGAGTCACGCCGTTGCACACCCCTGAGGAGCTT
AAAGAAATGGGGTTTCACTTGATTGTTCACCCCTTGACCGCACTCTACGCATCGGCTCGA
GCACTTGTGGATGTTCTCAAGACTCTTAAAGAAAACGGAACCACGAGAGGTCACTTGGAA
AAGATGGCTACTTTTGAGGAGTTCAATAGTTTGGTGGATTTAGAGTCGTGGTTTGAGCTC
GAAGCTCGTTATTCGAACCTTAGGAACGCTCTTGGGACGACAACAAAATCTTGAAGAGGC
TGCTGCTACTAGAGAGCCACAAGTTTTATCCTCTTTCAAAATGTCTCTGAAGCTCTTCTG
TTTTGCTAATTTTACAGACGATTTATTTGAGCAATTGTCTCATCATCAATAA

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL5048Contig1 1112 2 2 U
GGGATGGCCGTTACTGGCTGAGGAGCAATCTTAAATTCTTTCTTCCTTCTCTCTCTCTCT
GGTTTTACAACGATGACGAGTCTTGTGTTTGGCCAGTCGCTGGGTTTAACTCTATTCGGT
GATGACAATTCAAGAAGACGAGGTGTAAAGTCTAAGTTTCTCTTTGTGAATCGGAGGAGA
CTAGCTTGTGCAGCTCTTGTTCAAGCTAGGCCCAGGGGGGAAGATGGAGCTGCCCCAAGT
CCTCCCTCATCCTCGTCAAGACCAACCCCTGCGCCTGTTGTACAATACAAACGTGCTGAT
CTCGCGGATGATCTTCAAGCGGAGGGGCGTGCTCTTGGTCGTGCTGTCGACGCTTCTGTT
TATTCCCCGGAGCTTATCGCCAGGAAACATGGCTCTCAGCCTCTCAAGGCTTTGCGGAGA
AGTGTGGAGATATTGACAGCTTTGGGTGGCTTCGCTCTGAAGCTTGGGATTGATCAAAGG
AAAGGGAAGCTAGAGCTGAACATGAAGAAGAGAGCCGGTTAGCTCCGAAGGATCTTCACT
CGTCTGGGGCCCACTTTTGTTAAGTTGGGTCAAGGTTTATCCACCCGACCCGACCTCTGT
CCTCCCGATTACCTCGAAGAGCTTGCTGAGCTTCAGGATGCTTTGCCAACCTTCCCTGAT
GCAGAGGCCTTTGCTTGCATCGAAAGAGAGTTGGATTTGTCTTTAGAATCCATTTTTTCC
AACATATCCCCCGACCCAATCGCAGCAGCCAGTTTTGGCCAGGTTTACAAAGCCCACCTG
AGGTACTCGGGTCAGGTTGTTGCTGTCAAAGTCCAACGCCCCGGGATCGAAGAAGCCATT
GGTCTTGACTTCTACCTCATCAGAGGAGTTGGGAAACTCATCAACAAGTACGTGGACTTC
ATCACCACCGACGTCCTCGCCCTTATCGACGGGAAACTAGCAACAACCGGAAGCAAGAAG
ACTAGGAGGACGTGTTGCAGGAGGTGTAGGGCAACGTCTAGCAGCTAGGTTTTTGCAGCA
ACTCCTTCGAGCCACAACATCTCCTTCACCAGTCCCATAGTTGCTTCTTTTCTTGTCAAC
ATCGTAATGGTAAACTGTATATTAAAGGCGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW07TF U 1
AF RR2CW07JQ C 406
BS 1 662 RR2CW07TF
BS 663 1112 RR2CW07JQ

RD RR2CW07TF 662 0 0
GGGATGGCCGTTACTGGCTGAGGAGCAATCTTAAATTCTTTCTTCCTTCTCTCTCTCTCT
GGTTTTACAACGATGACGAGTCTTGTGTTTGGCCAGTCGCTGGGTTTAACTCTATTCGGT
GATGACAATTCAAGAAGACGAGGTGTAAAGTCTAAGTTTCTCTTTGTGAATCGGAGGAGA
CTAGCTTGTGCAGCTCTTGTTCAAGCTAGGCCCAGGGGGGAAGATGGAGCTGCCCCAAGT
CCTCCCTCATCCTCGTCAAGACCAACCCCTGCGCCTGTTGTACAATACAAACGTGCTGAT
CTCGCGGATGATCTTCAAGCGGAGGGGCGTGCTCTTGGTCGTGCTGTCGACGCTTCTGTT
TATTCCCCGGAGCTTATCGCCAGGAAACATGGCTCTCAGCCTCTCAAGGCTTTGCGGAGA
AGTGTGGAGATATTGACAGCTTTGGGTGGCTTCGCTCTGAAGCTTGGGATTGATCAAAGG
AAAGGGAAGCTAGAGCTGAACATGAAGAAGAGAGCCGGTTAGCTCCGAAGGATCTTCACT
CGTCTGGGGCCCACTTTTGTTAAGTTGGGTCAAGGTTTATCCACCCGACCCGACCTCTGT
CCTCCCGATTACCTCGAAGAGCTTGCTGAGCTTCAGGATGCTTTGCCAACCTTCCCTGAT
GC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2CW07JQ 707 0 0
AAGGCTTTGCGGAGAAGTGTGGAGATATTGACAGCTTTGGGTGGCTTCGCTCTGAAGCTT
GGGATTGATCAAAGGAAAGGGAAGCTAGAGCTGAACATGAAGAAGAGAGCCGGTTAGCTC
CGAAGGATCTTCACTCGTCTGGGGCCCACTTTTGTTAAGTTGGGTCAAGGTTTATCCACC
CGACCCGACCTCTGTCCTCCCGATTACCTCGAAGAGCTTGCTGAGCTTCAGGATGCTTTG
CCAACCTTCCCTGATGCAGAGGCCTTTGCTTGCATCGAAAGAGAGTTGGATTTGTCTTTA
GAATCCATTTTTTCCAACATATCCCCCGACCCAATCGCAGCAGCCAGTTTTGGCCAGGTT
TACAAAGCCCACCTGAGGTACTCGGGTCAGGTTGTTGCTGTCAAAGTCCAACGCCCCGGG
ATCGAAGAAGCCATTGGTCTTGACTTCTACCTCATCAGAGGAGTTGGGAAACTCATCAAC
AAGTACGTGGACTTCATCACCACCGACGTCCTCGCCCTTATCGACGGGAAACTAGCAACA
ACCGGAAGCAAGAAGACTAGGAGGACGTGTTGCAGGAGGTGTAGGGCAACGTCTAGCAGC
TAGGTTTTTGCAGCAACTCCTTCGAGCCACAACATCTCCTTCACCAGTCCCATAGTTGCT
TCTTTTCTTGTCAACATCGTAATGGTAAACTGTATATTAAAGGCGAG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL5049Contig1 1056 2 2 U
GGGATGGATGATTAGAAACGACGACTCACGCATTTCGGAACGTTTGGAGAAATTTCTCTT
GACAGACTAAGCAGACCTTTCTTCTTCGTCCAAGTTTTTCGATGGCAGAGGGAAGCGCCG
CTTCGCGTTACGTGAAATTGAGGAAAGAGCAGGCTCCTGTGGAAGATATCACCCCCGGCG
AACTCAACCAGCCCATTGATGTTCCTCAGTTGAACGTTCGCAAGTGCCATGAATGTATGC
AAGTTCTTCCTGAAACCTATGAACCTCCTTCTGATGAAAACTGGACCACTGGCATTTTTG
CTTGCGCTGAAGACCCCGACAGCTGCAGGACTGGTCTCTTTTGCCCCTGTGTACTGTATG
GGCGTAACATTGAAGCTGTGAGGGAAGAGATTCCTTGGACTCAACCATGTGTGTGCCATG
CTGTCTGTGTTGAGGGAGGAATGGCACTTGCAGCCGTAACCGCACTCTTCAGTGGCTACA
TTGATCCTCAAACAACAGTCGTCATATGCGAAGGCCTCTTCTTTGCGTGGTGGATGTGTG
GAATCTACTCAGGCTTGTTCCGCCAAGAACTCCAGAAGAAGTATCATCTCAAGAATGCGC
CGTGTGATCACTGCATGGTTCACTGCTGCTTGCATTGGTGCGCTCTGTGTCAAGAACACA
GGGAGATGAGGAATCATCTCTCTGATGCCGATGCTTCTTCTTCAACTACTATGGATCCTC
CTCCAGTTCAAGCAATGAACACCGAAGGGAACAAAGACGCTTCGTCTTCTTCATCATCAT
CGTCTCCATCATCCGCCAAAAGCCAACACAATGATCTCGAGATGGTCCCTCTTTAGAAAA
CATTCCTTGGCATCTCTGCTGCTGCGTATCCTCGCTAAGCTGTTAACGTTTTTGTGCAGA
GACGTTTTCTTACCAGCTGATTAATGTTGGTTTTACAGATGCAAGTTTGTCCTAAGAACA
AGTTCATTAGTACTTTTTTTTCTTACATTTTACTAAACTTAACTTTTGAGGTCATTGAAT
GTCTTTGGATATGGAAGTAAATTATTTATTTTAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F525TF U 1
AF RR2F525JQ C 398
BS 1 654 RR2F525TF
BS 655 1056 RR2F525JQ

RD RR2F525TF 654 0 0
GGGATGGATGATTAGAAACGACGACTCACGCATTTCGGAACGTTTGGAGAAATTTCTCTT
GACAGACTAAGCAGACCTTTCTTCTTCGTCCAAGTTTTTCGATGGCAGAGGGAAGCGCCG
CTTCGCGTTACGTGAAATTGAGGAAAGAGCAGGCTCCTGTGGAAGATATCACCCCCGGCG
AACTCAACCAGCCCATTGATGTTCCTCAGTTGAACGTTCGCAAGTGCCATGAATGTATGC
AAGTTCTTCCTGAAACCTATGAACCTCCTTCTGATGAAAACTGGACCACTGGCATTTTTG
CTTGCGCTGAAGACCCCGACAGCTGCAGGACTGGTCTCTTTTGCCCCTGTGTACTGTATG
GGCGTAACATTGAAGCTGTGAGGGAAGAGATTCCTTGGACTCAACCATGTGTGTGCCATG
CTGTCTGTGTTGAGGGAGGAATGGCACTTGCAGCCGTAACCGCACTCTTCAGTGGCTACA
TTGATCCTCAAACAACAGTCGTCATATGCGAAGGCCTCTTCTTTGCGTGGTGGATGTGTG
GAATCTACTCAGGCTTGTTCCGCCAAGAACTCCAGAAGAAGTATCATCTCAAGAATGCGC
CGTGTGATCACTGCATGGTTCACTGCTGCTTGCATTGGTGCGCTCTGTGTCAAG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2F525JQ 659 0 0
GACTCAACCATGTGTGTGCCATGCTGTCTGTGTTGAGGGAGGAATGGCACTTGCAGCCGT
AACCGCACTCTTCAGTGGCTACATTGATCCTCAAACAACAGTCGTCATATGCGAAGGCCT
CTTCTTTGCGTGGTGGATGTGTGGAATCTACTCAGGCTTGTTCCGCCAAGAACTCCAGAA
GAAGTATCATCTCAAGAATGCGCCGTGTGATCACTGCATGGTTCACTGCTGCTTGCATTG
GTGCGCTCTGTGTCAAGAACACAGGGAGATGAGGAATCATCTCTCTGATGCCGATGCTTC
TTCTTCAACTACTATGGATCCTCCTCCAGTTCAAGCAATGAACACCGAAGGGAACAAAGA
CGCTTCGTCTTCTTCATCATCATCGTCTCCATCATCCGCCAAAAGCCAACACAATGATCT
CGAGATGGTCCCTCTTTAGAAAACATTCCTTGGCATCTCTGCTGCTGCGTATCCTCGCTA
AGCTGTTAACGTTTTTGTGCAGAGACGTTTTCTTACCAGCTGATTAATGTTGGTTTTACA
GATGCAAGTTTGTCCTAAGAACAAGTTCATTAGTACTTTTTTTTCTTACATTTTACTAAA
CTTAACTTTTGAGGTCATTGAATGTCTTTGGATATGGAAGTAAATTATTTATTTTAGTT

QA 1 659 1 659
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5051Contig1 1079 2 6 U
GGAAGCTCAGCAGCAGCCTTGGCAAGGTGAAGAAGGTTGATCCGTTTCTTCTTCTTTTGA
TTGGTTAGGGATTTTGTTTGTTGGTGTGGTTTATAGATTTCTCGTCTAAGGGTCTTGTGG
TTTGAGCTGTTCTTCTCAGCTGCTGATTTTTGTCTTCTTTTAATCTCCAGAAATTGAATT
TCGTTGCGGGTTGTTCAGTGTAACCGTGTAAGTTTTGTGACTCATATGTTATTATTGCTC
TGTGATTATGCAACTTTGGACTTGTCGGTCGCTTCAAAATCATAATTTAACAACCGAAAG
TGAAAAGATTTTTTAGTCTCTTGAACATTCTTTGTGGCATATAAATTCTGAAACTTTTCC
TCTCTCTCTGACCTAAATCCTGATACTGAACTATTTGGATAATTAGATTGAAACTGTCGT
TTAGTTGAGATTTTCTCTTCCTATGTTAGGTAGAAGAGTAGAAGTTATGACTGAATTGAA
AATGGAGGTAGAGAGCAAGAAGGCCATGAGTGAGTTGCAAATGGAGGAGGTAGAGACCAA
TCCCTCTTCGCAAGTGTCTCTCCCGAAGCCTCAATCCATGTACAGGTGTAAGAAATGCAG
AAGAATAGTGGCTATTGAGGAAAACATTGTTCCTCATGAACCAGGGAAAGGTGAAGAATG
CTTTGCTTGGAAAAAGAGAAGCGGTAACTATGCTGAACAAGTGCAATGCTCTTCCATCTT
TGTCGAGCCTATGAAATGGATGCAAACTATACATGATGGAACTGTTGAAGAGAAGCTTCT
TTGTTTGGGATGTAACGCCCGGTTAGGTTATTTCAACTGGGCTGGCATGCAATGTAGCTG
TGGCGCCTGGGTTAATCCCGCTTTCCAGCTCCATAAAAGCCGATTAGACGAGTGTAAGTC
CGAGGAGCCAAACCCAAATCAGGCAACTGTATGAAACCAAAGTTTCTTGGATAACTAAGG
GTTATAGTAAGATCAAATTAAAGCTTTATTGTATTTGATCATCTTAATGTGTGTTTTCAT
TTGATAAAATCCAACAAAAGTTCATTAGCTTAATGTTTTTCTACAAGTATACTAAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F294TF U 1
AF RR2F294JQ C 509
BS 1 674 RR2F294TF
BS 675 675 RR2F294JQ
BS 676 735 RR2F294TF
BS 736 736 RR2F294JQ
BS 737 773 RR2F294TF
BS 774 1079 RR2F294JQ

RD RR2F294TF 773 0 0
GGAAGCTCAGCAGCAGCCTTGGCAAGGTGAAGAAGGTTGATCCGTTTCTTCTTCTTTTGA
TTGGTTAGGGATTTTGTTTGTTGGTGTGGTTTATAGATTTCTCGTCTAAGGGTCTTGTGG
TTTGAGCTGTTCTTCTCAGCTGCTGATTTTTGTCTTCTTTTAATCTCCAGAAATTGAATT
TCGTTGCGGGTTGTTCAGTGTAACCGTGTAAGTTTTGTGACTCATATGTTATTATTGCTC
TGTGATTATGCAACTTTGGACTTGTCGGTCGCTTCAAAATCATAATTTAACAACCGAAAG
TGAAAAGATTTTTTAGTCTCTTGAACATTCTTTGTGGCATATAAATTCTGAAACTTTTCC
TCTCTCTCTGACCTAAATCCTGATACTGAACTATTTGGATAATTAGATTGAAACTGTCGT
TTAGTTGAGATTTTCTCTTCCTATGTTAGGTAGAAGAGTAGAAGTTATGACTGAATTGAA
AATGGAGGTAGAGAGCAAGAAGGCCATGAGTGAGTTGCAAATGGAGGAGGTAGAGACCAA
TCCCTCTTCGCAAGTGTCTCTCCCGAAGCCTCAATCCATGTACAGGTGTAAGAAATGCAG
AAGAATAGTGGCTATTGAGGAAAACATTGTTCCTCATGAACCAGGGAAAGGTGAAGAATG
CTTTGCTTGGAAAA*GAGAAGCGGTAACTATGCTGAACAAGTGCAATGCTCTTCCATCTT
TGTCGAGCCTATGAA*TGGATGCAAACTATACATGATGGAACTGTTGAAGAGA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2F294JQ 571 0 0
AGTGAGTTGCAAATGGAGGAGGTAGAGACCAATCCCTCTTCGCAAGTGTCTCTCCCGAAG
CCTCAATCCATGTACAGGTGTAAGAAATGCAGAAGAATAGTGGCTATTGAGGAAAACATT
GTTCCTCATGAACCAGGGAAAGGTGAAGAATGCTTTGCTTGGAAAAAGAGAAGCGGTAAC
TATGCTGAACAAGTGCAATGCTCTTCCATCTTTGTCGAGCCTATGAAATGGATGCAAACT
ATACATGATGGAACTGTTGAAGAGAAGCTTCTTTGTTTGGGATGTAACGCCCGGTTAGGT
TATTTCAACTGGGCTGGCATGCAATGTAGCTGTGGCGCCTGGGTTAATCCCGCTTTCCAG
CTCCATAAAAGCCGATTAGACGAGTGTAAGTCCGAGGAGCCAAACCCAAATCAGGCAACT
GTATGAAACCAAAGTTTCTTGGATAACTAAGGGTTATAGTAAGATCAAATTAAAGCTTTA
TTGTATTTGATCATCTTAATGTGTGTTTTCATTTGATAAAATCCAACAAAAGTTCATTAG
CTTAATGTTTTTCTACAAGTATACTAAATTC

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

CO CL5052Contig1 754 2 3 U
TTGTGAACGAAACAGAACAAATTGGAACCAAAGTCAATGTGATTTGCTTTATTACATGAC
AAGTTCACGAGTCACGACCAAAGTAGAGTTATCAACAGAGTGAATCGGATAACACCACCA
TTCATGAGAGGTTCAGAAGCTTCTTGATGTCATGCTCTAGTGTAAGAGGAGAAGTAGTTG
GGTAGTAACGTTCAACAGCTTGACCATTCTTGTCAACAAGAAACTTGGCAAAGTTCCACT
GAATCTCGTCCCCGAAAATTCCCCATTTGCCTTTTTTCAAGAACTTATAAAGAGGAAAAG
CATTCTCTCCGTTCACTTCAATCTTGTTGAAAATGGGGAACTCAGTTTTGAAGCGTGTAC
AGACAAACTCTGTAACTTGGGCAGTAGTTCCAGGTTCCTCTTCACCAAATTGGTTACAAG
GAAATGCTAGAATCTCCAGACCTTTGTCTTTGTACTTGTTGTAAAGCTCATTCAATTCAG
TGTAGTTAGAGTTCGTCATGCCACATTTGGAAGCGACATTGACAATTAGAAGAACTTTGC
CTTTGTATTGACTGAGTTCTAAGCTGTTGCCATTTGCATCCTTGATGCTTATATCGTAAA
CAGATTCTGGGTCTTTCGTCGCCATAGAAGTAGAGTAGAATTTGAGAAGCAGGAGAAATG
AGAGAGAGGAGTTAGCTGCTAGGAGGACAAAAGAGAGAAAGCTAAAAGGCATGAAAGATG
CAGTCTCTGCTCTGCTCTAGCATATCCGTCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G275JQ U 168
AF RR2G275TF C 1
BS 1 171 RR2G275TF
BS 172 434 RR2G275JQ
BS 435 754 RR2G275TF

RD RR2G275JQ 267 0 0
GGAA
AAGTAGTTGGGTAGTAACGTTCAACAGCTTGACCATTCTTGTCAACAAGAAACTTGGCAA
AGTTCCACTGAATCTCGTCCCCGAAAATTCCCCATTTGCCTTTTTTCAAGAACTTATAAA
GAGGAAAAGCATTCTCTCCGTTCACTTCAATCTTGTTGAAAATGGGGAACTCAGTTTTGA
AGCGTGTACAGACAAACTCTGTAACTTGGGCAGTAGTTCCAGGTTCCTCTTCACCAAATT
GGTTACAAGGAAATGCTAGAATC

QA 5 267 5 267
DS 

RD RR2G275TF 754 0 0
TTGTGAACGAAACAGAACAAATTGGAACCAAAGTCAATGTGATTTGCTTTATTACATGAC
AAGTTCACGAGTCACGACCAAAGTAGAGTTATCAACAGAGTGAATCGGATAACACCACCA
TTCATGAGAGGTTCAGAAGCTTCTTGATGTCATGCTCTAGTGTAAGAGGAGAAGTAGTTG
GGTAGTAACGTTCAACAGCTTGACCATTCTTGTCAACAAGAAACTTGGCAAAGTTCCACT
GAATCTCGTCCCCGAAGATTCCCCATTTGCCTTTTTTCAAGAACTTATAAAGAGGAGAAG
CATTCTCTCCGTTCACTTCAATCTTGTTGAAAATGGGGAACTCAGTTTTGAAGCGTGTAC
AGACAAACTCTGTAACTTGGGCAGTAGTTCCAGGTTCCTCTTCACCAAATTGGTTACAAG
GAAATGCTAGAATCTCCAGACCTTTGTCTTTGTACTTGTTGTAAAGCTCATTCAATTCAG
TGTAGTTAGAGTTCGTCATGCCACATTTGGAAGCGACATTGACAATTAGAAGAACTTTGC
CTTTGTATTGACTGAGTTCTAAGCTGTTGCCATTTGCATCCTTGATGCTTATATCGTAAA
CAGATTCTGGGTCTTTCGTCGCCATAGAAGTAGAGTAGAATTTGAGAAGCAGGAGAAATG
AGAGAGAGGAGTTAGCTGCTAGGAGGACAAAAGAGAGAAAGCTAAAAGGCATGAAAGATG
CAGTCTCTGCTCTGCTCTAGCATATCCGTCCCCC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL5053Contig1 724 2 5 U
GGATCTAAAATAAATAAATAAAACAATAGTCAAATAAAATGGAGTTCTCTCTAAAACCTT
CAACTTTAAAGATGACTCGGACAAGTTTTGTTATAGTAGTAGTTTTGGCAATAAGCAGTT
TTCAGATGATTGAATCATCTCCAGATTTAGCCAACAAGGCGAAGGCAAATATTCAATATA
ACGCGATTAATTGTCGAAAACATAGCGCAGTTATAACCAAATTTGGAGCCGTGGGTGATG
GAAAAACATCAAACACAAAAGCGTTTAAGGAAGCCATTACCAAGCTTGCTCCCAAGGCGG
CCGACGGTGGAGTGCAGCTCATTGTTCCACCGGGAAAATGGCTTACCGGAAGTTTCAACC
TGACCAGCCATTTTACTTTGTTCATTCAGAAAGATGCAACTATTCTTGCTTCTCAGGATG
AATCTGAATATCCAGTGGTTGCACCATTGCCATCATATGGACAAGGAAGAGATGCAGCTG
GGCCAACATTTGCTAGTTTAATCTCTGGCACAAACCTAACTGATGTTGTTATCACCGGTA
ACAACGGAACAATCAACGGACAAGGAAAATACTGGTGGGTGAAGTATAGAAGTGGTGGAT
TTAAGAATATCACGAGACCTTACACACTAGAGATCATGTTCTCTAAGACGTTCAGATCTC
GAACATCACGATCATCGACTCGCCTGCATGGAATATTCATCCAGTGTACTGCACTAACGT
CATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2EO68TF U 116
AF RR2FW08TF U 1
BS 1 140 RR2FW08TF
BS 141 141 RR2EO68TF
BS 142 218 RR2FW08TF
BS 219 219 RR2EO68TF
BS 220 724 RR2FW08TF

RD RR2EO68TF 268 0 0
CAGTTTTCAGATGATTGAATCATCTCCAGATTTAGCCAACAAGGCGAAGGCAAATATTCA
ATATAACGCGATTAATTGTCGAAAACATAGCGCAGTTATAACCAAATTTGGAGCCGTGGG
TGATGGAAAAACATCAAACACAAAAGCGTTTAAGGAAGCCATTACCAAGCTTGCTCCCAA
GGCGGCCGACGGTGGAGTGCAGCTCATTGTTCCACCGGGAAAATGGCTTACTGGAAGTTT
CAACCTGACCAGCCATTTTACTTTGTTC

QA 1 268 1 268
DS 

RD RR2FW08TF 724 0 0
GGATCTAAAATAAATAAATAAAACAATAGTCAAATAAAATGGAGTTCTCTCTAAAACCTT
CAACTTTAAAGATGACTCGGACAAGTTTTGTTATAGTAGTAGTTTTGGCAATAAGCAGTT
TTCAGATGATTGAATCATCTTCAGATTTAGCCAACAAGGCGAAGGCAAATATTCAATATA
ACGCGATTAATTGTCGAAAACATAGCGCAGTTATAACCGAATTTGGAGCCGTGGGTGATG
GAAAAACATCAAACACAAAAGCGTTTAAGGAAGCCATTACCAAGCTTGCTCCCAAGGCGG
CCGACGGTGGAGTGCAGCTCATTGTTCCACCGGGAAAATGGCTTACCGGAAGTTTCAACC
TGACCAGCCATTTTACTTTGTTCATTCAGAAAGATGCAACTATTCTTGCTTCTCAGGATG
AATCTGAATATCCAGTGGTTGCACCATTGCCATCATATGGACAAGGAAGAGATGCAGCTG
GGCCAACATTTGCTAGTTTAATCTCTGGCACAAACCTAACTGATGTTGTTATCACCGGTA
ACAACGGAACAATCAACGGACAAGGAAAATACTGGTGGGTGAAGTATAGAAGTGGTGGAT
TTAAGAATATCACGAGACCTTACACACTAGAGATCATGTTCTCTAAGACGTTCAGATCTC
GAACATCACGATCATCGACTCGCCTGCATGGAATATTCATCCAGTGTACTGCACTAACGT
CATC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL5054Contig1 1220 2 4 U
GGGTTTAACGATCAAATCAGCAGCAACACGATGGAGCTTCTCTGCTCGCCAGCGTCTCTT
TCCTCCTCCTTCGCTCTCTCATCTTCTCTTCCAGTTCCTCCGTCCTTCTCCATGGGAGGG
ACAAAGAGGTTCATGGTTTTGTGTAGCTCTCAGAAATCCCAAAAGGAAGATCAGATGACA
GTGTCAGTAACTGGAGCAACTGGATTTGTAGGGAGACGATTGGTTCACAAACTTCGTTCT
GATAATCACTCTGTCCGTGTCTTAACTCGCTCTAAATCCAAAGCTGAGCTTATTTTTCCT
GCCAAGGACTTCCCAGGTATCGTGATTGCTGAGGAACGGGAGTGGCGAGACTGCATTCAA
GGCTCTACTGCTGTTGTCAACTTGGCTGGTCTGCCTATTAGTACAAGATGGTCTCCCGAG
ATCAAGAAAGAGATCAAGGACAGCCGAGTCCGCGTCACCTCTAAAGTTGTTGAGTTGATT
AATAATTCACCGGTGGATGCTCGACCTACCGTTCTAGTTAGCGCCACAGCTTTTGGTTAC
TATGGTACTAGTGAGACGGGAGTATTTGATGAAAAGAGCCCATCAGGAAATGATTATCTT
TCAGAGGCTTGCAGAGAATGGGAAAGAACCGCGCTGAAAGCGAATAAGGATGTAAGAGTT
GCACTTATCCGCATTGGTGTTGTTCTTGGTAAAGATGGTGGGGCTTTAGCCATGATGATA
CCCTTTTTCCAAATGTTTGCTGGAGGACCTCTCGGTTCAGGACAACAATGGTTCTCTTGG
ATTCACGTGAATGACTTGGTGAATCTAATCTATGAGGCCCTCACTAAACCATCCTATCAA
GGAGTTATAAATGGGACAGCGCCAAACCCAGTTAGGCTAGGGGAGATGTGCCAGCAGCTA
GGCAGCGTTCTTGGTCGACCGTCGTGGCTACCAGTTCCTGACTTTGCACTCAAAGCTTTA
CTCGGAGAAGGTGCCACTGTGGTTCTTGAAGGACAGAAGGTTTTACCTGTAAGAGCCAAA
GAGCTTGGCTTTGAATTCAAGTACAAATACGTGAAAGATGCACTCAGAGCCGTTATGCAG
TAAGGTGACAACACCATCAGATTTGGTCACAGAAAAACAAGAGATTCTTTTGCTATTTGT
TATTTTTGAGCAAAAACTCAGAGGCGATGTATGTATCTGACAATAGAAAACAAGTGATTC
TATCATCTCTCTCTTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL41TF U 1
AF RR2EL41JQ C 520
BS 1 586 RR2EL41TF
BS 587 587 RR2EL41JQ
BS 588 644 RR2EL41TF
BS 645 1220 RR2EL41JQ

RD RR2EL41TF 644 0 0
GGGTTTAACGATCAAATCAGCAGCAACACGATGGAGCTTCTCTGCTCGCCAGCGTCTCTT
TCCTCCTCCTTCGCTCTCTCATCTTCTCTTCCAGTTCCTCCGTCCTTCTCCATGGGAGGG
ACAAAGAGGTTCATGGTTTTGTGTAGCTCTCAGAAATCCCAAAAGGAAGATCAGATGACA
GTGTCAGTAACTGGAGCAACTGGATTTGTAGGGAGACGATTGGTTCACAAACTTCGTTCT
GATAATCACTCTGTCCGTGTCTTAACTCGCTCTAAATCCAAAGCTGAGCTTATTTTTCCT
GCCAAGGACTTCCCAGGTATCGTGATTGCTGAGGAACGGGAGTGGCGAGACTGCATTCAA
GGCTCTACTGCTGTTGTCAACTTGGCTGGTCTGCCTATTAGTACAAGATGGTCTCCCGAG
ATCAAGAAAGAGATCAAGGACAGCCGAGTCCGCGTCACCTCTAAAGTTGTTGAGTTGATT
AATAATTCACCGGTGGATGCTCGACCTACCGTTCTAGTTAGCGCCACAGCTTTTGGTTAC
TATGGTACTAGTGAGACGGGAGTATTTGATGAAAAGAGCCCATCAG*AAATGATTATCTT
TCAGAGGCTTGCAGAGAATGGGAAAGAACCGCGCTGAAAGCGAA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2EL41JQ 701 0 0
AGCGCCACAGCTTTTGGTTACTATGGTACTAGTGAGACGGGAGTATTTGATGAAAAGAGC
CCATCAGGAAATGATTATCTTTCAGAGGCTTGCAGAGAATGGGAAAGAACCGCGCTGAAA
GCGAATAAGGATGTAAGAGTTGCACTTATCCGCATTGGTGTTGTTCTTGGTAAAGATGGT
GGGGCTTTAGCCATGATGATACCCTTTTTCCAAATGTTTGCTGGAGGACCTCTCGGTTCA
GGACAACAATGGTTCTCTTGGATTCACGTGAATGACTTGGTGAATCTAATCTATGAGGCC
CTCACTAAACCATCCTATCAAGGAGTTATAAATGGGACAGCGCCAAACCCAGTTAGGCTA
GGGGAGATGTGCCAGCAGCTAGGCAGCGTTCTTGGTCGACCGTCGTGGCTACCAGTTCCT
GACTTTGCACTCAAAGCTTTACTCGGAGAAGGTGCCACTGTGGTTCTTGAAGGACAGAAG
GTTTTACCTGTAAGAGCCAAAGAGCTTGGCTTTGAATTCAAGTACAAATACGTGAAAGAT
GCACTCAGAGCCGTTATGCAGTAAGGTGACAACACCATCAGATTTGGTCACAGAAAAACA
AGAGATTCTTTTGCTATTTGTTATTTTTGAGCAAAAACTCAGAGGCGATGTATGTATCTG
ACAATAGAAAACAAGTGATTCTATCATCTCTCTCTTTCATC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL5055Contig1 632 2 3 U
GTGGCTAATAATAATCATCTGTTCAAATGCGCTAGCTTAACACTGAAGAGTAGTATCTTC
AAGGTGACCATCAATACAATACTTGATCCATTAAAAGGTTTTCCTAAAGAAAATGATAAA
ACAGAAAAGGTAATCCAAGCATGACTGGTGTCCAAAGCATAAAGAATTAAAACAAGAAAA
ACACGAAAACTAAGCTGATTAACAAAAGTCTTCTAGTTGGTGGTGCAAGGAAAACACTGA
GCTCCTCCTTAGTACGGATTTGAGAACCTGGCAACCTCTGCCTCGAATTGGGACTTGAGA
AAGTCAAGCTCCTTGTCAAGGTCATTGATAGCCTGATTGTATGCTTGCATAGGAGAAGAC
TGGCTTGTGGTGTGAATCCTGACTATGATTTTGTACTTGAGAGGGTGAGGCAGCTGGTAT
CCAGCAAACAACACATTCTCGTCTCGGTGAAGCTGCATGCGGACGATGTTGCCAATGGTG
TGGTCTTCTCTATCAATCGTGAAGGAAGCAGCGTTGATGATCTTCGTGTCCCTCTCGTAC
GAAACCTTTTTGGTGCCTTCTGGGACGACGAATCGTTCGTATCTGTCGGGAGCGTTCATG
GCTGACCGAAAATTCTCGCTTAGGTATCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G237JQ U 68
AF RR2G237TF C 1
BS 1 67 RR2G237TF
BS 68 248 RR2G237JQ
BS 249 632 RR2G237TF

RD RR2G237JQ 181 0 0
CCATCAATACAATACTTGATCCATTAAAAGGTTTTCCTAAAGAAAATGATAAAACAGAAA
AGGTAATCCAAGCATGACTGGTGTCCAAAGCATAAAGAATTAAAACAAGAAAAACACGAA
AACTAAGCTGATTAACAAAAGTCTTCTAGTTGGTGGTGCAAGGAAAACACTGAGCTCCTC
C

QA 1 181 1 181
DS 

RD RR2G237TF 632 0 0
GTGGCTAATAATAATCATCTGTTCAAATGCGCTAGCTTAACACTGAAGAGTAGTATCTTC
AAGGTGACCATCAATACAATACTTGATCCATTAAAAGGTTTTC*TAAAGAAAATGATAAA
ACAGAAAAGGTAATCCAAGCATGACTGGTGTCCAAAGCATAAAGAATTAAAACAAGAAAA
ACACGAAAACTAAGCTGATTAACAAAAGTCTTCTAGTTGGTGGTGCAAGGAAAACACTGA
GCTCCTCCTTAGTACGGATTTGAGAACCTGGCAACCTCTGCCTCGAATTGGGACTTGAGA
AAGTCAAGCTCCTTGTCAAGGTCATTGATAGCCTGATTGTATGCTTGCATAGGAGAAGAC
TGGCTTGTGGTGTGAATCCTGACTATGATTTTGTACTTGAGAGGGTGAGGCAGCTGGTAT
CCAGCAAACAACACATTCTCGTCTCGGTGAAGCTGCATGCGGACGATGTTGCCAATGGTG
TGGTCTTCTCTATCAATCGTGAAGGAAGCAGCGTTGATGATCTTCGTGTCCCTCTCGTAC
GAAACCTTTTTGGTGCCTTCTGGGACGACGAATCGTTCGTATCTGTCGGGAGCGTTCATG
GCTGACCGAAAATTCTCGCTTAGGTATCACCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL5056Contig1 647 2 5 U
TTAAACTGAAGCATAATTTATTATAAATTTAGCACTACTACGTCAAATATACAACAAACA
AAACCCACCAAAACAATATACGCCAAACCAACAAACAAAAAGCCACAGCCACGAAGAAAC
CCACAAAACCATTCTTAACCGAAAGAAAAGCAAAAAATTAGACAACAAAGACGTCTAAGT
TAAAAGAAGTTAAAACTGGCTTTTTACCGGATATCGACACGAAAACGTCTAAGTTCAGTA
AGGAAAGCGGGAGTAGAAGTGAGAGTCCGATGAGCAAGACTTCTTATGTCTTCTCTCGAA
CATTCTCTCGAGATCCTCACCAGTTCCCATATTGCTCCTTCCTTTACCATCTCTTTCGCA
TTCCCTTCGTGTTGTGCCAAGTGGCAGAGAGCTAATTCGATATGCCGCTTAATAGCTGTA
GTTTCGGTTTTGGCATTTTGAACAATCCAAGAGAGTGCACCGTCTTCTATTAATAGTGAT
TTCCCTCTCTTAGTTCCTTGTGTTGATGCTCTTGACTCGCATTTAGCAAAGTTTGCAATG
CCACGAGCAACTTGTGCAAGCACCTCAGGATGTCCACATCTTACCATTCCCAACAATGCT
GCAATCCCTCCTTCTGATCTTAGCTTTGTCTGCAATTTATCATTTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H431JQB U 3
AF RR2H431TF C 1
BS 1 2 RR2H431TF
BS 3 243 RR2H431JQB
BS 244 244 RR2H431TF
BS 245 258 RR2H431JQB
BS 259 647 RR2H431TF

RD RR2H431JQB 256 0 0
AAACTGAAGCATAATTTATTATAAATTTAGCACTACTACGTCAAATATACAACAAACAAA
ACCCACCAAAACAATATACGCCAAACCAACAAACAAAAAGCCACAGCCACGAAGAAACCC
ACAAAACCATTCTTAACCGAAAGAAAAGCAAAAAATTAGACAACAAAGACGTCTAAGTTA
AAAGAAGTTAAAACTGGCTTTTTACCGGATATCGACACGAAAACGTCTAAGTTCAGTAAG
GGAAGCGGGAGTAGAA

QA 1 256 1 256
DS 

RD RR2H431TF 647 0 0
TTAAACTGAAGCATAATTTATTATAAATTTAGCACTACTACGTCAAATATACAACAAACA
AAACCCACCAAAACAATATACGCCAAACCAACAAACAAAAAGCCACAGCCACGAAGAAAC
CCACAAAACCATTCTTAACCGAAAGAAAAGCAAAAAATTAGACAACAAAGACGTCTAAGT
TAAAAGAAGTTAAAACTGGCTTTTTACCGGATATCGACACGAAGACGTCTAAGTTCAGTA
AGGAAAGCGGGAGTAGAAGTGAGAGTCCGATGAGCAAGACTTCTTATGTCTTCTCTCGAA
CATTCTCTCGAGATCCTCACCAGTTCCCATATTGCTCCTTCCTTTACCATCTCTTTCGCA
TTCCCTTCGTGTTGTGCCAAGTGGCAGAGAGCTAATTCGATATGCCGCTTAATAGCTGTA
GTTTCGGTTTTGGCATTTTGAACAATCCAAGAGAGTGCACCGTCTTCTATTAATAGTGAT
TTCCCTCTCTTAGTTCCTTGTGTTGATGCTCTTGACTCGCATTTAGCAAAGTTTGCAATG
CCACGAGCAACTTGTGCAAGCACCTCAGGATGTCCACATCTTACCATTCCCAACAATGCT
GCAATCCCTCCTTCTGATCTTAGCTTTGTCTGCAATTTATCATTTCC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL5057Contig1 701 2 4 U
GGATCAACGTGATGGAAAAGATGGAGCGAGAGAGAATGAAATGTGAGGAAGCTTGGAGGC
AACAAGAAATGGAGAGGATGAAACAGAGCGAAGAGGCACGGATGCAAGAGATGTCACGCA
GCTCGTCTCTCATCTCTTTCATCAAAAGTTTAACTGGTGAAGAGATCAAGATCCCTCAGC
CTCTCCAGACTATTCCCAAACAATGTGAATGGAATCAGACACGAGGAGAGGTAAAGTTTG
TGTTTCCAACCGGAAGAAGGTGGCCGCAAGAGGAAGTGCAGGCGTTGATAGCTAGCAGAA
ACGAAGTGGAGGAGAAGACAGGGGTGGTTCACAAGGGAGCGATATGGAATGAGATATCAG
CAAGAATGAAGGTCAAAGGGTACGAACGATTTGCTAAGAAGTGTAAGGAGAAGTGGGAGA
ACATGAACAAGTACTACAAGAGAGTGATGGAAGGTAGCAAGAAACTGCCTGAGCACACCG
AGACTCGCTCTTACTTTGAGAAACTAGGAAACTTTTACAAGACCAACTCAGTGACTGCTG
AACACTCGGGAGAGAGGGCACAATGAGTGTGCGGGTAAACGTTTTAAATTAGTTTTTTTT
CTTACGGAAGCTTGTAGATGAGTTCTCGAGTTTTTTTAAATGTTGGTGTAGTTACGAGTT
TGTACTTTGTATTGTGTTGAGTTTAGAAGGTTAGAAATAAA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV56TF U 1
AF RR2BV56JQ C 2
BS 1 230 RR2BV56TF
BS 231 231 RR2BV56JQ
BS 232 256 RR2BV56TF
BS 257 701 RR2BV56JQ

RD RR2BV56TF 256 0 0
GGATCAACGTGATGGAAAAGATGGAGCGAGAGAGAATGAAATGTGAGGAAGCTTGGAGGC
AACAAGAAATGGAGAGGATGAAACAGAGCGAAGAGGCACGGATGCAAGAGATGTCACGCA
GCTCGTCTCTCATCTCTTTCATCAAAAGTTTAACTGGTGAAGAGATCAAGATCCCTCAGC
CTCTCCAGACTATTCCCAAACAATGTGAATGGAATCAGACACGAGGAGAG*TAAAGTTTG
TGTTTCCAACCGGAAG

QA 1 256 1 256
DS 

RD RR2BV56JQ 700 0 0
GATCAACGTGATGGAAAAGATGGAGCGAGAGAGAATGAAATGTGAGGAAGCTTGGAGGCA
ACAAGAAATGGAGAGGATGAAACAGAGCGAAGAGGCACGGATGCAAGAGATGTCACGCAG
CTCGTCTCTCATCTCTTTCATCAAAAGTTTAACTGGTGAAGAGATCAAGATCCCTCAGCC
TCTCCAGACTATTCCCAAACAATGTGAATGGAATCAGACACGAGGAGAGGTAAAGTTTGT
GTTTCCAACCGGAAGAAGGTGGCCGCAAGAGGAAGTGCAGGCGTTGATAGCTAGCAGAAA
CGAAGTGGAGGAGAAGACAGGGGTGGTTCACAAGGGAGCGATATGGAATGAGATATCAGC
AAGAATGAAGGTCAAAGGGTACGAACGATTTGCTAAGAAGTGTAAGGAGAAGTGGGAGAA
CATGAACAAGTACTACAAGAGAGTGATGGAAGGTAGCAAGAAACTGCCTGAGCACACCGA
GACTCGCTCTTACTTTGAGAAACTAGGAAACTTTTACAAGACCAACTCAGTGACTGCTGA
ACACTCGGGAGAGAGGGCACAATGAGTGTGCGGGTAAACGTTTTAAATTAGTTTTTTTTC
TTACGGAAGCTTGTAGATGAGTTCTCGAGTTTTTTTAAATGTTGGTGTAGTTACGAGTTT
GTACTTTGTATTGTGTTGAGTTTAGAAGGTTAGAAATAAA

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL5058Contig1 249 2 1 U
GGGTAAATGAAAAAAACATATTTTGCCACCTAAAAATATACATATAAAGGGTGGTCACAG
AGCGGATATCTAGAATTTTAAAGATATCCGTGATCTGATCCACTTCGTACAAATAATTAA
TTTTTCGATCCGATCCATAATCTTTCGGATATTTGGTATTTATGGATATCCAGAAAAATT
AGTATATTTTACCGGATATCCGATTCGATCCGTCGATCTGATAAAAAATAACAAAAAATA
TTTTTTTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AS19JQ C 1
AF RR2AS19TF U 1
BS 1 249 RR2AS19TF

RD RR2AS19JQ 249 0 0
GGGTAAATGAAAAAAACATATTTTGCCACCTAAAAATATACATATAAAGGGTGGTCACAG
AGCGGATATCTAGAATTTTAAAGATATCCGTGATCTGATCCACTTCGTACAAATAATTAA
TTTTTCGATCCGATCCATAATCTTTCGGATATTTGGTATTTATGGATATCCAGAAAAATT
AGTATATTTTACCGGATATCCGATTCGATCCGTCGATCTGATAAAAAATAACAAAAAATA
TTTTTTTGG

QA 1 249 1 249
DS 

RD RR2AS19TF 249 0 0
GGGTAAATGAAAAAAACATATTTTGCCACCTAAAAATATACATATAAAGGGTGGTCACAG
AGCGGATATCTAGAATTTTAAAGATATCCGTGATCTGATCCACTTCGTACAAATAATTAA
TTTTTCGATCCGATCCATAATCTTTCGGATATTTGGTATTTATGGATATCCAGAAAAATT
AGTATATTTTACCGGATATCCGATTCGATCCGTCGATCTGATAAAAAATAACAAAAAATA
TTTTTTTGG

QA 1 249 1 249
DS 



AS 1 2

CO CL5059Contig1 966 2 2 U
GGACACCACCACACAACAACAACAATGGCTATTTTGAGAAAGTTTATTTCCTCAAACCTC
TTCATCTTCTTCCTGGTTATAGCTACAACCAATGGTCAGGCTCCAGCTCCAACCCCTTCC
GGTCCAACCAACATAACCGCAGTCCTAGAAAAGGCTGGTCAATTCACAATGTTCATAAGA
CTCCTCAAGAGCACCCAAGCCGCAGACCAAATCAACACTCAGCTCAATTCATCCTCGAGC
CAAGGCCTAACCGTGTTTGCCCCAACCGATAACGCCTTTAGCAGCCTCAAATCCGGAACC
TTAAACTCATTATCTGACCAGCAAAAAGTTCAGCTTGTTCAGTTCCATGTCCTTCCTACA
CTCTTAACCATGCCTCAGTTTCAAACTGTCAGTAACCCCTTACGCACGCAAGCTGGCGAT
GGACAGAACGGTCAATTCCCTCTTAACATCACTAGCTCTGGTAACCAAGTCAACATCACC
ACGGGTGTTGTGAGCGCCACCGTGGCTAACTCTGTATACAGCGATAAGCAGCTCGCCGTG
TATCAAGTGGATCAAGTTTTGTTACCATTAGCAATGTTTGGTTCAAGCTCGGCGGCTCCT
GCTCCGGCGCCTGAGAAAGGCGGCTCGGTTACGACAGGTTCAGCTTCCGGTAGCGACGGT
GGTGGAGATACTTTTACTGATTCATTTAATGCAGAGAAAATCAGATACGTGATAATCGCC
ACTGTGGCAGCCATTGCTGCTTTTTCTCTGTGGATATAACTCGAGAGAGAGAGCTTTTCA
AGAGTCTCCACATTGGCTTTTACGAATAATGATGAGTTTAAGTTTGGTTGTAATTTGAGA
TTGTGTTATCATGTTAATGTTTTGATTCAAAATGAGACAACGAGTTGCGATTGCACAAAA
CTTTTTTGGTGAAAAAAACGCAACATGTGTTTTGAGTATAATTTGAATTTGAAGCTTTCG
ATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2D035TF U 1
AF RR2D035JQ C 366
BS 1 617 RR2D035TF
BS 618 966 RR2D035JQ

RD RR2D035TF 617 0 0
GGACACCACCACACAACAACAACAATGGCTATTTTGAGAAAGTTTATTTCCTCAAACCTC
TTCATCTTCTTCCTGGTTATAGCTACAACCAATGGTCAGGCTCCAGCTCCAACCCCTTCC
GGTCCAACCAACATAACCGCAGTCCTAGAAAAGGCTGGTCAATTCACAATGTTCATAAGA
CTCCTCAAGAGCACCCAAGCCGCAGACCAAATCAACACTCAGCTCAATTCATCCTCGAGC
CAAGGCCTAACCGTGTTTGCCCCAACCGATAACGCCTTTAGCAGCCTCAAATCCGGAACC
TTAAACTCATTATCTGACCAGCAAAAAGTTCAGCTTGTTCAGTTCCATGTCCTTCCTACA
CTCTTAACCATGCCTCAGTTTCAAACTGTCAGTAACCCCTTACGCACGCAAGCTGGCGAT
GGACAGAACGGTCAATTCCCTCTTAACATCACTAGCTCTGGTAACCAAGTCAACATCACC
ACGGGTGTTGTGAGCGCCACCGTGGCTAACTCTGTATACAGCGATAAGCAGCTCGCCGTG
TATCAAGTGGATCAAGTTTTGTTACCATTAGCAATGTTTGGTTCAAGCTCGGCGGCTCCT
GCTCCGGCGCCTGAGAA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2D035JQ 601 0 0
AACCATGCCTCAGTTTCAAACTGTCAGTAACCCCTTACGCACGCAAGCTGGCGATGGACA
GAACGGTCAATTCCCTCTTAACATCACTAGCTTTGGTAACCAAGTCAACATCACCACGGG
TGTTGTGAGCGCCACCGTGGCTAACTCTGTATACAGCGATAAGCAGCTCGCCGTGTATCA
AGTGGATCAAGTTTTGTTACCATTAGCAATGTTTGGTTCAAGCTCGGCGGCTCCTGCTCC
GGCGCCTGAGAAAGGCGGCTCGGTTACGACAGGTTCAGCTTCCGGTAGCGACGGTGGTGG
AGATACTTTTACTGATTCATTTAATGCAGAGAAAATCAGATACGTGATAATCGCCACTGT
GGCAGCCATTGCTGCTTTTTCTCTGTGGATATAACTCGAGAGAGAGAGCTTTTCAAGAGT
CTCCACATTGGCTTTTACGAATAATGATGAGTTTAAGTTTGGTTGTAATTTGAGATTGTG
TTATCATGTTAATGTTTTGATTCAAAATGAGACAACGAGTTGCGATTGCACAAAACTTTT
TTGGTGAAAAAAACGCAACATGTGTTTTGAGTATAATTTGAATTTGAAGCTTTCGATTTT
G

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL5060Contig1 706 2 6 U
GGAGAATCGGATCTTCCGTCTTAACACGACACCGTATTCCTTTCGTCGGCGCGTTTTGCG
TGTTAAGCTTGGGTTTCTCGTCCCTCTCATCGTCTTCCTATAAACCGGGTTGTGCACAGT
CTCTCTCTTTTGCCCCTCTCTTAATAAGGTCTAAGTTTAGCAGTAAGGCTTCTTCTTCTT
CATCTTCATCATCGAACAAAATGGAGGAGAGCAGCAAAACTGTGCCCAGCATTGTCGTCT
ACGTCACTGTTCTTAACAGAGAAGCAGGAAAGAAGTTGGCTAATAGCATAGTCCAAGAAA
AGCTTGCTGCGTGTGTCAACATTGTCCCAGGTGTTGAATCGGTGTACGAGTGGGAAGGAA
AGGTTCAGAGTGATTCCGAGGAACTACTGATAATCAAAACAAGGCAGTTTCTTCTAGAGT
CTCTAACCGAGCACGTCAATGCTAATCACGAATACGATGTGCCAGAAGTAATTGCGTTGC
CTATAACTGGTGGGAGCGACAAGTATCTAGAATGGTTGAAAAACAGTACAAGGAACTGAA
ACATCTCGCTAGCTTTCCGTCCCCCATCAATAACTTTTGGAGTTTTTTTTGTTTCTCAAA
TAAAGAGCTTTCCCCCCACCATCTGTGGATTATGCCATTGTGTGTCATGTGTAATAGTTA
CTAAGACCAGTTCACTTAAGTTAAGTGTAGTAAAATTTGTACTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E527TF U 1
AF RR2E527JQ C 197
BS 1 263 RR2E527TF
BS 264 264 RR2E527JQ
BS 265 274 RR2E527TF
BS 275 275 RR2E527JQ
BS 276 326 RR2E527TF
BS 327 706 RR2E527JQ

RD RR2E527TF 326 0 0
GGAGAATCGGATCTTCCGTCTTAACACGACACCGTATTCCTTTCGTCGGCGCGTTTTGCG
TGTTAAGCTTGGGTTTCTCGTCCCTCTCATCGTCTTCCTATAAACCGGGTTGTGCACAGT
CTCTCTCTTTTGCCCCTCTCTTAATAAGGTCTAAGTTTAGCAGTAAGGCTTCTTCTTCTT
CATCTTCATCATCGAACAAAATGGAGGAGAGCAGCAAAACTGTGCCCAGCATTGTCGTCT
ACGTCACTGTTCTTAACAGAGAA*CAGGAAAGAA*TTGGCTAATAGCATAGTCCAAGAAA
AGCTTGCTGCGTGTGTCAACATTGTC

QA 1 326 1 326
DS 

RD RR2E527JQ 510 0 0
CAAAATGGAGGAGAGCAGCAAAACTGTGCCCAGCATTGTCGTCTACGTCACTGTTCTTAA
CAGAGAAGCAGGAAAGAAGTTGGCTAATAGCATAGTCCAAGAAAAGCTTGCTGCGTGTGT
CAACATTGTCCCAGGTGTTGAATCGGTGTACGAGTGGGAAGGAAAGGTTCAGAGTGATTC
CGAGGAACTACTGATAATCAAAACAAGGCAGTTTCTTCTAGAGTCTCTAACCGAGCACGT
CAATGCTAATCACGAATACGATGTGCCAGAAGTAATTGCGTTGCCTATAACTGGTGGGAG
CGACAAGTATCTAGAATGGTTGAAAAACAGTACAAGGAACTGAAACATCTCGCTAGCTTT
CCGTCCCCCATCAATAACTTTTGGAGTTTTTTTTGTTTCTCAAATAAAGAGCTTTCCCCC
CACCATCTGTGGATTATGCCATTGTGTGTCATGTGTAATAGTTACTAAGACCAGTTCACT
TAAGTTAAGTGTAGTAAAATTTGTACTCGT

QA 1 510 1 510
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5062Contig1 1276 2 4 U
GGTCGAATCCTAAACCCTAATTTTGACCTTTGAAGCTATCGGTAATGGCAGATCAGAGCA
AGAACAACGCTCCTGAGATCTTCGAGCTCAACAATGGATCCATGCATGTCAAGATCTCAA
ATTATGGCGCCACCATCACCTCCTTGTCTGTCCCCGACAAGAACGGAAAATTGGCTGATG
TAGTCCTCGGATTCGACTCGGTGGATCCATATGTGAAAGTGCTTGCACCCTACTTTGGGT
GCATAGTTGGTCGTGTAGCAAATCGGATCAAAGAGGGCAAGTTTAGTCTCAATGGAGTCG
ACTACACTCTTCCCATCAACAAGCCTCCCAACAGCCTCCACGGTGGTAACAAAGGTTTCG
ATAAGAAGGTATGGGACGTTGCAGGACACAAGAAAGACGGTGAAAAACCTTTCATCATTT
TCAAATATCACAGCGCCGATGGTGAAGAAGGTTACCCCGGTGCGGTTGCTGTGACGGCAA
CGTACACTCTCGTGTCAGCAACGACTATGAGACTTGACATGGAAGCAGTTCTGGAGAACA
AAGACACTCCCATTAGCTTAGCTCAGCATACATACTGGAACTTGGCTGGTCACGACTCAG
GAAACATTCTCGACCACAGGATCCAGATTTGGGGGTCTCATGTCACCCCTGTGGATCAAT
TCACAGTTCCTACAGGGGAGATTTTACCGGTAAAGGGAACTCCTTTCGATTTCACCGAGG
AAAAACGTATAGGCGAGTCTATTGGAGAGGTGGGTTTAGGATACGACCACAACTACGTGT
TGGACTGTCCTGACCAAGAGAAGGAGGGGCTGAAACACGCGGCGAAGCTAAGAGATGGTG
CGAGCTCGAGGGTGATGGACTTGTGGACAAATGCTCCGGGGGTGCAGTTTTATACGGGGA
ACTATGTGAATGGAGTGGTTGGGAAAGGGAATGCGGTTTATGGGAAGCATGCAGGTGTGT
GCCTTGAGACGCAAGGCTTCCCAAACGCGATTAACCAGTCTAATTTCCCGTCTGTTGTGG
TTAAGGCTGGTGAGAAGTATAAGCATACTATGTTGTTTGAGTTTTCAGCTTGAGTGAGAC
GACTGGTGGTTTTAGATGGATGTTTAAGGTGTTAGACTTGGATGATTGGAATAAAGGGCC
GGTTTGATTGGTCCACAGAACCGGAAAGAGTGTTTTTATTTTATTTTATCTTGTCCTGGT
TCTGGTATAAACTACAAACTGAACCGAATTTCTTTAAAGAAAAAGTACTCTAACTTTGAA
TTATCTAGTTCCCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G546TF U 1
AF RR2G546JQ C 439
BS 1 677 RR2G546TF
BS 678 678 RR2G546JQ
BS 679 691 RR2G546TF
BS 692 1276 RR2G546JQ

RD RR2G546TF 691 0 0
GGTCGAATCCTAAACCCTAATTTTGACCTTTGAAGCTATCGGTAATGGCAGATCAGAGCA
AGAACAACGCTCCTGAGATCTTCGAGCTCAACAATGGATCCATGCATGTCAAGATCTCAA
ATTATGGCGCCACCATCACCTCCTTGTCTGTCCCCGACAAGAACGGAAAATTGGCTGATG
TAGTCCTCGGATTCGACTCGGTGGATCCATATGTGAAAGTGCTTGCACCCTACTTTGGGT
GCATAGTTGGTCGTGTAGCAAATCGGATCAAAGAGGGCAAGTTTAGTCTCAATGGAGTCG
ACTACACTCTTCCCATCAACAAGCCTCCCAACAGCCTCCACGGTGGTAACAAAGGTTTCG
ATAAGAAGGTATGGGACGTTGCAGGACACAAGAAAGACGGTGAAAAACCTTTCATCATTT
TCAAATATCACAGCGCCGATGGTGAAGAAGGTTACCCCGGTGCGGTTGCTGTGACGGCAA
CGTACACTCTCGTGTCAGCAACGACTATGAGACTTGACATGGAAGCAGTTCTGGAGAACA
AAGACACTCCCATTAGCTTAGCTCAGCATACATACTGGAACTTGGCTGGTCACGACTCAG
GAAACATTCTCGACCACAGGATCCAGATTTGGGGGTCTCATGTCACCCCTGTGGATCAAT
TCACAGTTCCTACAGGG*AGATTTTACCGGT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2G546JQ 838 0 0
ATGGTGAAGAAGGTTACCCCGGTGCGGTTGCTGTGACGGCAACGTACACTCTCGTGTCAG
CAACGACTATGAGACTTGACATGGAAGCAGTTCTGGAGAACAAAGACACTCCCATTAGCT
TAGCTCAGCATACATACTGGAACTTGGCTGGTCACGACTCAGGAAACATTCTCGACCACA
GGATCCAGATTTGGGGGTCTCATGTCACCCCTGTGGATCAATTCACAGTTCCTACAGGGG
AGATTTTACCGGTAAAGGGAACTCCTTTCGATTTCACCGAGGAAAAACGTATAGGCGAGT
CTATTGGAGAGGTGGGTTTAGGATACGACCACAACTACGTGTTGGACTGTCCTGACCAAG
AGAAGGAGGGGCTGAAACACGCGGCGAAGCTAAGAGATGGTGCGAGCTCGAGGGTGATGG
ACTTGTGGACAAATGCTCCGGGGGTGCAGTTTTATACGGGGAACTATGTGAATGGAGTGG
TTGGGAAAGGGAATGCGGTTTATGGGAAGCATGCAGGTGTGTGCCTTGAGACGCAAGGCT
TCCCAAACGCGATTAACCAGTCTAATTTCCCGTCTGTTGTGGTTAAGGCTGGTGAGAAGT
ATAAGCATACTATGTTGTTTGAGTTTTCAGCTTGAGTGAGACGACTGGTGGTTTTAGATG
GATGTTTAAGGTGTTAGACTTGGATGATTGGAATAAAGGGCCGGTTTGATTGGTCCACAG
AACCGGAAAGAGTGTTTTTATTTTATTTTATCTTGTCCTGGTTCTGGTATAAACTACAAA
CTGAACCGAATTTCTTTAAAGAAAAAGTACTCTAACTTTGAATTATCTAGTTCCCCAT

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 2

CO CL5063Contig1 1027 2 4 U
GTCTTTGTCACAGGAAAAGCTTGAGAGTGTAATCGATGTGGAGACATCACTTGCAGTTCC
TCGGGGTGCTGGGGGAAACCGAGCTGGGCTATTTAGAACTCCTATATCTGGTGGAGTTCA
GAATGCTACATCAGCTCATGCCTTACCACGTCCTGCGTTAGCTGTACGCAACTTGCTGGA
GCAGGCTAGGTTTGCTCATCTATGCACAATGATGTCTAAAATGCACCACCGTAGAGAAGG
GTACCCATTTGGCTCTTTGGTTGATTTTGCACCTGATCGTATGGGCCATCCAATATTCTT
ACTTTCACCATTGGCCATCCACACACGAAACCTCTTGGCTGAACCTAGATGCAGTCTCGT
TGTTCAGATGCCTGGATGGAGTTGCTTGTCTAATGCAAGAGTGACATTATTTGGTGATGT
GTACCCATTGTCCGATGATGAACAGGAGTGGGCTCATAAGCAATACATTGCAAAGCACCA
ACACGGAACTTCCGAGCAGTGGGGAAACTTTCACTATTTTAGAATGCACAACATCAGTGA
TATATATTTCATTGGAGGCTTTGGAACGGTGGCATGGGTTGATGTCAAAGAGTATGAAGC
CTTACAGCCAGACAAGATCGCTGTTGATGGTGGTGAGCAGAACCTCAAGGAACTAAATGC
CATCTTTTCAAAGCCGCTTAGAGAGCTACTGTCTTCTGAATCAGAGGTAGACGACGCTGC
TCTCATTTCTATTGATAGCAAAGGGATAGATGTACGGGTTCGCCAAGGTGCTCAGTTCAA
CATACAAAGGCTAGCATTTGAAGAAGGTCATGGTGTTGAAACACTAGAAGAAGCTAAAGC
TGCACTATGGAAAGTGATAGAGAAAGTCAAACTGAACTATTTGCCGAAATGACCAAGAAC
CTTTGAGTTTGCAGAAATAACCAAACCTCCTTTTCTCTATGTTTTTTGTTTGCCCAAAAT
GGATGTCAATCTGGAACTACGGGATTGAGATCTGAGTTTAATAAATATTTTGGGTTTTAT
TGCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU72TF U 1
AF RR2DU72JQ C 429
BS 1 649 RR2DU72TF
BS 650 650 RR2DU72JQ
BS 651 683 RR2DU72TF
BS 684 1027 RR2DU72JQ

RD RR2DU72TF 683 0 0
GTCTTTGTCACAGGAAAAGCTTGAGAGTGTAATCGATGTGGAGACATCACTTGCAGTTCC
TCGGGGTGCTGGGGGAAACCGAGCTGGGCTATTTAGAACTCCTATATCTGGTGGAGTTCA
GAATGCTACATCAGCTCATGCCTTACCACGTCCTGCGTTAGCTGTACGCAACTTGCTGGA
GCAGGCTAGGTTTGCTCATCTATGCACAATGATGTCTAAAATGCACCACCGTAGAGAAGG
GTACCCATTTGGCTCTTTGGTTGATTTTGCACCTGATCGTATGGGCCATCCAATATTCTT
ACTTTCACCATTGGCCATCCACACACGAAACCTCTTGGCTGAACCTAGATGCAGTCTCGT
TGTTCAGATGCCTGGATGGAGTTGCTTGTCTAATGCAAGAGTGACATTATTTGGTGATGT
GTACCCATTGTCCGATGATGAACAGGAGTGGGCTCATAAGCAATACATTGCAAAGCACCA
ACACGGAACTTCCGAGCAGTGGGGAAACTTTCACTATTTTAGAATGCACAACATCAGTGA
TATATATTTCATTGGAGGCTTTGGAACGGTGGCATGGGTTGATGTCAAAGAGTATGAAGC
CTTACAGCCAGACAAGATCGCTGTTGATGGTGGTGAGCAGAACCTCAAG*AACTAAATGC
CATCTTTTCAAAGCCGCTTAGAG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2DU72JQ 599 0 0
TGTCCGATGATGAACAGGAGTGGGCTCATAAGCAATACATTGCAAAGCACCAACACGGAA
CTTCCGAGCAGTGGGGAAACTTTCACTATTTTAGAATGCACAACATCAGTGATATATATT
TCATTGGAGGCTTTGGAACGGTGGCATGGGTTGATGTCAAAGAGTATGAAGCCTTACAGC
CAGACAAGATCGCTGTTGATGGTGGTGAGCAGAACCTCAAGGAACTAAATGCCATCTTTT
CAAAGCCGCTTAGAGAGCTACTGTCTTCTGAATCAGAGGTAGACGACGCTGCTCTCATTT
CTATTGATAGCAAAGGGATAGATGTACGGGTTCGCCAAGGTGCTCAGTTCAACATACAAA
GGCTAGCATTTGAAGAAGGTCATGGTGTTGAAACACTAGAAGAAGCTAAAGCTGCACTAT
GGAAAGTGATAGAGAAAGTCAAACTGAACTATTTGCCGAAATGACCAAGAACCTTTGAGT
TTGCAGAAATAACCAAACCTCCTTTTCTCTATGTTTTTTGTTTGCCCAAAATGGATGTCA
ATCTGGAACTACGGGATTGAGATCTGAGTTTAATAAATATTTTGGGTTTTATTGCTTTT

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL5064Contig1 731 2 2 U
GAGTATAAACACATGATTTATTAATCAAACAACAACCAGTACAACAACACCCCCAGTGAC
TGTGTAAGAGACAAAATAAAAACAAATGCGAAGTTTAGAGTTGTAAGAATCACATACACA
CATACATAAACACATAGAAAATATTACAGAATATATATTACGTATATTATCTTGTCTATC
CAAACAAGAAGATATGTATGTTGACATGAAGTGTTGGTTGTCTAATTATAATTTTGATTA
GCATTGGAAACCAGGGGGAACCTTTTTGCTACAAACATTGAGAAGCAGACTGAGAGAGAT
AGGGATGTTCAGGTTGATCCCAAGGATGTTAGCCTTAAGCGCGGTGCAAAGACAAGCCGC
GGCTTCAAGATCAGCAAGTCCTTTGATAAGGTTGCAACATGGCTTCACCGGTGGCTTCCC
AAGGGTGATGTTGAGTAGACCGCTGAGTACGTTGGCACAGACTCCTAGTTTAAGAGCGTC
TCTAGGGCATTTGGCTGTGACAGGGCTAGGGGTTGGAGTTGGGGTTGGTTTGGGTTTAGG
ATTAGGTTTTGGCTTATGGGACGGGTGAGGTTTTGGCTTGGGAGAAGGGCAATCGCAGTT
ACCGAAGGCAGAGATTGCTGTGCAGAAAAGGATGTTCAGAATCAAGAAAATGGCTAAAGG
GCTTTTCGTTCTAGAAGCCATTGTTAAATTCCTCTTTTGGTTAGATGCAAAAGAGACTTT
GTTGTGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C716TF C 1
AF RR2C716JQ U 612
BS 1 611 RR2C716TF
BS 612 731 RR2C716JQ

RD RR2C716TF 731 0 0
GAGTATAAACACATGATTTATTAATCAAACAACAACCAGTACAACAACACCCCCAGTGAC
TGTGTAAGAGACAAAATAAAAACAAATGCGAAGTTTAGAGTTGTAAGAATCACATACACA
CATACATAAACACATAGAAAATATTACAGAATATATATTACGTATATTATCTTGTCTATC
CAAACAAGAAGATATGTATGTTGACATGAAGTGTTGGTTGTCTAATTATAATTTTGATTA
GCATTGGAAACCAGGGGGAACCTTTTTGCTACAAACATTGAGAAGCAGACTGAGAGAGAT
AGGGATGTTCAGGTTGATCCCAAGGATGTTAGCCTTAAGCGCGGTGCAAAGACAAGCCGC
GGCTTCAAGATCAGCAAGTCCTTTGATAAGGTTGCAACATGGCTTCACCGGTGGCTTCCC
AAGGGTGATGTTGAGTAGACCGCTGAGTACGTTGGCACAGACTCCTAGTTTAAGAGCGTC
TCTAGGGCATTTGGCTGTGACAGGGCTAGGGGTTGGAGTTGGGGTTGGTTTGGGTTTAGG
ATTAGGTTTTGGCTTATGGGACGGGTGAGGTTTTGGCTTGGGAGAAGGGCAATCGCAGTT
ACCGAAGGCAGAGATTGCTGTGCAGAAAAGGATGTTCAGAATCAAGAAAATGGCTAAAGG
GCTTTTCGTTCTAGAAGCCATTGTTAAATTCCTCTTTTGGTTAGATGCAAAAGAGACTTT
GTTGTGTGTCC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2C716JQ 120 0 0
AGATTGCTGTGCAGAAAAGGATGTTCAGAATCAAGAAAATGGCTAAAGGGCTTTTCGTTC
TAGAAGCCATTGTTAAATTCCTCTTTTGGTTAGATGCAAAAGAGACTTTGTTGTGTGTCC

QA 1 120 1 120
DS 



AS 1 2

CO CL5065Contig1 1158 2 2 U
GAAGTGAAAGATCAGCTGGCTGCTGATTCCGATGATCTGAAGGAAAAACTGGGAATCTCT
GCTACAGACTCCAGCGACGTCCCTCGAGAGTTATTGCTACCTAACAAGAAGTTATCAGCT
TCAGCTGTCCCATTCAACCCATCATCACCTCCAAGTATCATACGTCCTACTCCAATAGGC
ATGAACATTGGACCGTCGTGGCCAGTGAACATGACTCTTCATCACGGACCTCCTTTCCCT
TCACCTCCTACAACTCCAAACTTGATGCAGCCAATGTCCTTTGTATACCCTCCTCCTTAC
ACTCAATCAGTCCCCACAAGTACGTATCCTGTAACCAGCGGTCCTTTCCATCCCAATCAG
TTCCCATGGCCGCTTAATATGTCGGAGTTTGTACCAAGAACGGTTTGGCCCGGATGCCAT
CCCGTTGAGTTTTCCCCTCCCCACATGATGGCTGCCGAGCCTGTAGCTGCAACTGTGTTA
GAGCCCACTGTGATTCTACCAACTGATATTGACACTTCAGGAGTGGAAGAAAGCAAGCAA
GATGTGGCGGCAACCGCGGGTGAAACTATGGATTCTGTTAATCATGTGAATGTAGTTGCT
AGCATTGAAATGGAGAATGGAAACAAGAAATTTGAGGATGACGAGAGGACTTTTAGCATT
TTGTTAAGAGGAAGAAGAAACAGGAAACAGACTCTGAGAATGCCCATCAGTTTGCTCAAC
AGGCCTTATGATTTTCAACCGTTCAAGATTGCTTATAGCAGAGTCATCAGAGGCAGGGAG
GCTCCAAAGTCCGCAGCTTGAAACCAAAGATTTCAGCATCGTCGATGAAATTCATCGCTC
ACGCACATCTCTCTCTCCCTGATCCTTGCTGTTTCTTAGGGGACAGTTTAAAAGGTAATT
TCGTTATCAGTCATCGGAAGCTGTGGCTTGTGATAGTCTCAAAATGATTTGATCTGGATT
TTAAGAGAAGAGAGGTTGAAGAGGGGAAAAAGCGCAGAATTATTCTTTTTTTTTTTATAC
CATGTGAGAGGTGCTGAAGTATTGTTTTCTGGGTTTAAATTTTTAATTCAGCCAATAAAA
TTTTAGGAAATTTTGGACATACAGTAATTGTTTTTTCATATCCCATTGTGGCCATGTTAA
AAAAACTTTTGTTAAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN39TF U 1
AF RR2AN39JQ C 529
BS 1 675 RR2AN39TF
BS 676 1158 RR2AN39JQ

RD RR2AN39TF 675 0 0
GAAGTGAAAGATCAGCTGGCTGCTGATTCCGATGATCTGAAGGAAAAACTGGGAATCTCT
GCTACAGACTCCAGCGACGTCCCTCGAGAGTTATTGCTACCTAACAAGAAGTTATCAGCT
TCAGCTGTCCCATTCAACCCATCATCACCTCCAAGTATCATACGTCCTACTCCAATAGGC
ATGAACATTGGACCGTCGTGGCCAGTGAACATGACTCTTCATCACGGACCTCCTTTCCCT
TCACCTCCTACAACTCCAAACTTGATGCAGCCAATGTCCTTTGTATACCCTCCTCCTTAC
ACTCAATCAGTCCCCACAAGTACGTATCCTGTAACCAGCGGTCCTTTCCATCCCAATCAG
TTCCCATGGCCGCTTAATATGTCGGAGTTTGTACCAAGAACGGTTTGGCCCGGATGCCAT
CCCGTTGAGTTTTCCCCTCCCCACATGATGGCTGCCGAGCCTGTAGCTGCAACTGTGTTA
GAGCCCACTGTGATTCTACCAACTGATATTGACACTTCAGGAGTGGAAGAAAGCAAGCAA
GATGTGGCGGCAACCGCGGGTGAAACTATGGATTCTGTTAATCATGTGAATGTAGTTGCT
AGCATTGAAATGGAGAATGGAAACAAGAAATTTGAGGATGACGAGAGGACTTTTAGCATT
TTGTTAAGAGGAAGA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2AN39JQ 630 0 0
GAAAGCAAGCAAGATGTGGCGGCAACCGCGGGTGAAACTATGGATTCTGTTAATCATGTG
AATGTAGTTGCTAGCATTGAAATGGAGAATGGAAACAAGAAATTTGAGGATGACGAGAGG
ACTTTTAGCATTTTGTTAAGAGGAAGAAGAAACAGGAAACAGACTCTGAGAATGCCCATC
AGTTTGCTCAACAGGCCTTATGATTTTCAACCGTTCAAGATTGCTTATAGCAGAGTCATC
AGAGGCAGGGAGGCTCCAAAGTCCGCAGCTTGAAACCAAAGATTTCAGCATCGTCGATGA
AATTCATCGCTCACGCACATCTCTCTCTCCCTGATCCTTGCTGTTTCTTAGGGGACAGTT
TAAAAGGTAATTTCGTTATCAGTCATCGGAAGCTGTGGCTTGTGATAGTCTCAAAATGAT
TTGATCTGGATTTTAAGAGAAGAGAGGTTGAAGAGGGGAAAAAGCGCAGAATTATTCTTT
TTTTTTTTATACCATGTGAGAGGTGCTGAAGTATTGTTTTCTGGGTTTAAATTTTTAATT
CAGCCAATAAAATTTTAGGAAATTTTGGACATACAGTAATTGTTTTTTCATATCCCATTG
TGGCCATGTTAAAAAAACTTTTGTTAAAAC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL5066Contig1 1129 2 2 U
GGACTTGTGTGACACTTCAGACATAAAAAACCTCGTTCGTCCAACGCGACGAATCAGCAA
TGGATTCTCCTCCTCCTCCGCCGACGAGGCTTGATTATCATGTAGACATGTTTGAACTTC
AATCCCTAGCCAGATTTCTCTCCTTATTCAAGGGGGAGGATGGACGTAGAGCTGTTATAT
TGGATTCGACGGTGTTCCATCCGCAAGGTGGAGGCCAGCCAGCAGACACCGGTTTAATCC
AATTCCCCGGTTCGGATTTCAACTTCTCCGTTCAAGATGTTCGATCCAAAGATGGAATCG
TTCTCCATTACGGAGTTTTCGAAGGTTGTTCGAATCCTGAAGATATTGAAAAGGGGAAAC
AAGTTCAGTTGCTTGTTGATGAATCAAGGCGCAAACTCAACTCCAGGTTGCACTCAGCTG
GACACTTGCTAGATTTGTGTATGCACAAGGTTGGATTAGGACATTTGGAGCCTGGGAAAG
GCTACCATTTCCCTGACGGTCCTTTTGTGGAATACAAAGGAGTCGTTGCACAGTCTGAAC
TGCAGGTGAAGCAGAAAGAGTTGGAGGTAGAAGCTAGTGAACTGATATCCAAAGGAGGAA
AGGTTTATGCTGCTATATTACCCTATGAAGAGGCATCCCTGCTCTGTGGTGGCACTCTTC
CTGATTATATTCCCAAGGGTAGCACTCCCCGAGTCTTAAGATTAGGTGAAAACCCTGGGT
GTCCGTGTGGTGGAACCCATGTTTCCGATATATCTGATATCATAAGCATGAAGATCACAC
AGATGAGAACAAAGAAAGGAATGACAAAAGTTTTCTACACCATTGCATCTTAATTCCAGT
ATACAAAACAAAAAAGTCAAGGGAAGGAATTGAAGTGATGACGACTGTTTCAATCAGTTG
GCTTCAACAGCAAGCAGCCTCTCCTGTGCTCAACAGCCACGAATTAGTATTTTGTGGGTA
TTTATTTTTTATCAAAACTACTAAACGACTCTCCCTATCATTGATAAGTCGTATTAATGA
TATGATATTGATGTGATATGATCTTCCACTCAGCCTCTTAATTAGCATTACAATATTGAC
TCTTGGTTTGTATAATCATACCAAACATTTGGTCCGATAATTTTTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ30TF U 1
AF RR2DQ30JQ C 407
BS 1 656 RR2DQ30TF
BS 657 1129 RR2DQ30JQ

RD RR2DQ30TF 656 0 0
GGACTTGTGTGACACTTCAGACATAAAAAACCTCGTTCGTCCAACGCGACGAATCAGCAA
TGGATTCTCCTCCTCCTCCGCCGACGAGGCTTGATTATCATGTAGACATGTTTGAACTTC
AATCCCTAGCCAGATTTCTCTCCTTATTCAAGGGGGAGGATGGACGTAGAGCTGTTATAT
TGGATTCGACGGTGTTCCATCCGCAAGGTGGAGGCCAGCCAGCAGACACCGGTTTAATCC
AATTCCCCGGTTCGGATTTCAACTTCTCCGTTCAAGATGTTCGATCCAAAGATGGAATCG
TTCTCCATTACGGAGTTTTCGAAGGTTGTTCGAATCCTGAAGATATTGAAAAGGGGAAAC
AAGTTCAGTTGCTTGTTGATGAATCAAGGCGCAAACTCAACTCCAGGTTGCACTCAGCTG
GACACTTGCTAGATTTGTGTATGCACAAGGTTGGATTAGGACATTTGGAGCCTGGGAAAG
GCTACCATTTCCCTGACGGTCCTTTTGTGGAATACAAAGGAGTCGTTGCACAGTCTGAAC
TGCAGGTGAAGCAGAAAGAGTTGGAGGTAGAAGCTAGTGAACTGATATCCAAAGGAGGAA
AGGTTTATGCTGCTATATTACCCTATGAAGAGGCATCCCTGCTCTGTGGTGGCACT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2DQ30JQ 723 0 0
GTTGCACTCAGCTGGACACTTGCTAGATTTGTGTATGCACAAGGTTGGATTAGGACATTT
GGAGCCTGGGAAAGGCTACCATTTCCCTGACGGTCCTTTTGTGGAATACAAAGGAGTCGT
TGCACAGTCTGAACTGCAGGTGAAGCAGAAAGAGTTGGAGGTAGAAGCTAGTGAACTGAT
ATCCAAAGGAGGAAAGGTTTATGCTGCTATATTACCCTATGAAGAGGCATCCCTGCTCTG
TGGTGGCACTCTTCCTGATTATATTCCCAAGGGTAGCACTCCCCGAGTCTTAAGATTAGG
TGAAAACCCTGGGTGTCCGTGTGGTGGAACCCATGTTTCCGATATATCTGATATCATAAG
CATGAAGATCACACAGATGAGAACAAAGAAAGGAATGACAAAAGTTTTCTACACCATTGC
ATCTTAATTCCAGTATACAAAACAAAAAAGTCAAGGGAAGGAATTGAAGTGATGACGACT
GTTTCAATCAGTTGGCTTCAACAGCAAGCAGCCTCTCCTGTGCTCAACAGCCACGAATTA
GTATTTTGTGGGTATTTATTTTTTATCAAAACTACTAAACGACTCTCCCTATCATTGATA
AGTCGTATTAATGATATGATATTGATGTGATATGATCTTCCACTCAGCCTCTTAATTAGC
ATTACAATATTGACTCTTGGTTTGTATAATCATACCAAACATTTGGTCCGATAATTTTTA
TTG

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL5067Contig1 1219 2 2 U
TAAGCAAAAAAACAAAGATAGAGAGAATTATCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCCTGCGCCTTGTCGCTGTTAAAAATCGTAATAGTGTTTAACTTCCAGACAATACAAG
AAAGCTTTGATCTTTTGTTTTCCATTGGTGACATTATCGGATCTCAAAGCTTCTTCAGAC
AGGTTCTCCCATAGTCCCATTCATCGGACAAAGGTGGTGGTGGTCTCTGTATCCTGAGAC
TGTGTGGGTATGGTGCTGATTTTGTAATGGAGAAAGGCAAGAGTGAGTCATCTGAGAGAA
GCTTTGGTGAATCAGATTCTGTAGTCTCTTCCCAATCTGACATTCAACCTGAGAGCACAA
TGGAGAGTCATGAAGATGAGACAAAACAACCTGCGGAGGCTTCTCTTGAAGGGGAAACTG
TGAATGAAGATTTAAAAGATAGCATCAGGACTCTAACTGAGAAGCTTTCAGCTGCTCTTG
CTAATGTGAGTGCTAAGGATGATCTGGTGAACCAACACGTCAAAGTAGCTGAAGAAGCTG
TCGCTGGATGGGAGAAAGCTGAGAACGAAGCTGTTGAGTTAAAGGAGAAGCTGGAAGCCG
CTGATGAAAACAAGAGAGTATTGGAAGATAGAGTGAGCCATCTCGACGGAGCTCTCAAGG
AGTGTGTCAGACAGTTACGCCAAGCGAGAAAGGAGAGGTTAGCTTCTGATGAGCTTAGAA
GAAAATGTGAGGCTCTTGAAGAAGAAGTCACTCTCCATCAAGAAAACGCTATAGAACCAC
CCAAGATCAAACAGGAAGACATGGCAACGGCTGCAGGGAAACTAGCTAACTGTCAGAAGA
CAATAGCTTCGTTGGGGAAACAGTTACAGTCTCTGGCGACGCTTGAAGACTTCTTGGTCG
ATACAGCGAGCATTCCAGTGGCTGCTACTAATGGTGTAAGCAGCAACACAGAGAGTTGGA
GAGTACACAAGAATGATACTTACATGGCAATCATGAAACCTACCAAAGAAACATCATCTT
CTGATGCTGCTTCATCAATAAACAGAGGGAGTTCTGATAAGAACCGGAATGGATTTGCCA
AAGTGTTTACTCGGAGTAAAGATGGGATACATTTGGTGATTTAGCAATAACTTTTCTTTG
GCACTAGGCAAGAGGAAACAATCTGTTAGGTTTAAAAAGAGTTGAAAACACCTCTTTTGT
ATGTTCCATTTCCAGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV92TF U 1
AF RR2AV92JQ C 396
BS 1 645 RR2AV92TF
BS 646 1219 RR2AV92JQ

RD RR2AV92TF 645 0 0
TAAGCAAAAAAACAAAGATAGAGAGAATTATCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCCTGCGCCTTGTCGCTGTTAAAAATCGTAATAGTGTTTAACTTCCAGACAATACAAG
AAAGCTTTGATCTTTTGTTTTCCATTGGTGACATTATCGGATCTCAAAGCTTCTTCAGAC
AGGTTCTCCCATAGTCCCATTCATCGGACAAAGGTGGTGGTGGTCTCTGTATCCTGAGAC
TGTGTGGGTATGGTGCTGATTTTGTAATGGAGAAAGGCAAGAGTGAGTCATCTGAGAGAA
GCTTTGGTGAATCAGATTCTGTAGTCTCTTCCCAATCTGACATTCAACCTGAGAGCACAA
TGGAGAGTCATGAAGATGAGACAAAACAACCTGCGGAGGCTTCTCTTGAAGGGGAAACTG
TGAATGAAGATTTAAAAGATAGCATCAGGACTCTAACTGAGAAGCTTTCAGCTGCTCTTG
CTAATGTGAGTGCTAAGGATGATCTGGTGAACCAACACGTCAAAGTAGCTGAAGAAGCTG
TCGCTGGATGGGAGAAAGCTGAGAACGAAGCTGTTGAGTTAAAGGAGAAGCTGGAAGCCG
CTGATGAAAACAAGAGAGTATTGGAAGATAGAGTGAGCCATCTCG

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2AV92JQ 824 0 0
GAGGCTTCTCTTGAAGGGGAAACTGTGAATGAAGATTTAAAAGATAGCATCAGGACTCTA
ACTGAGAAGCTTTCAGCTGCTCTTGCTAATGTGAGTGCTAAGGATGATCTGGTGAACCAA
CACGTCAAAGTAGCTGAAGAAGCTGTCGCTGGATGGGAGAAAGCTGAGAACGAAGCTGTT
GAGTTAAAGGAGAAGCTGGAAGCCGCTGATGAAAACAAGAGAGTATTGGAAGATAGAGTG
AGCCATCTCGACGGAGCTCTCAAGGAGTGTGTCAGACAGTTACGCCAAGCGAGAAAGGAG
AGGTTAGCTTCTGATGAGCTTAGAAGAAAATGTGAGGCTCTTGAAGAAGAAGTCACTCTC
CATCAAGAAAACGCTATAGAACCACCCAAGATCAAACAGGAAGACATGGCAACGGCTGCA
GGGAAACTAGCTAACTGTCAGAAGACAATAGCTTCGTTGGGGAAACAGTTACAGTCTCTG
GCGACGCTTGAAGACTTCTTGGTCGATACAGCGAGCATTCCAGTGGCTGCTACTAATGGT
GTAAGCAGCAACACAGAGAGTTGGAGAGTACACAAGAATGATACTTACATGGCAATCATG
AAACCTACCAAAGAAACATCATCTTCTGATGCTGCTTCATCAATAAACAGAGGGAGTTCT
GATAAGAACCGGAATGGATTTGCCAAAGTGTTTACTCGGAGTAAAGATGGGATACATTTG
GTGATTTAGCAATAACTTTTCTTTGGCACTAGGCAAGAGGAAACAATCTGTTAGGTTTAA
AAAGAGTTGAAAACACCTCTTTTGTATGTTCCATTTCCAGATTT

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

CO CL5068Contig1 973 2 2 U
GCTTGAAAATGGTTGTCTTGGATCAAGCCACTTCCGTTTACATCTTGGCTGAAGGGACCC
TGGGAGACTCGCTTGGAAACTTCTTGTATTCAGCTAACCAACAAGCTAATGAAGCTGTTC
AGGATCAGCTCTCAGCTCTCAGTGTAACAAGTTTGGCAGTAATATTTGGGGCAGGACTTG
TGACAAGTCTTTCTCCATGTACACTCAGTGTTCTGCCTTTGACCCTTGGTTATATTGGTG
CGTTTGGATCTGGCAAAAGCAGAGGTCAGGTCATTGGAGATGCAATTGCTTTCTCACTGG
GATTAGCAACTACCTTAGCACTTCTTGGGATAGTAGCATCTTTTGCCGGAAAAGCATATG
GACAAATAGGACAAGGACTACCAGTAGCTGCATCAGGTCTGGCTATTGTAATGGGTCTCA
ATCTCCTTGAGGTGATCCAACTCCAGCTTCCATCTTTCTTTGACAACTTTGATCCTCGCG
CAGCAGCAGCAAACTTCCCATCTAGTGTACAAGCGTATCTAGCGGGTCTCACGTTCGCAT
TAGCTGCCTCACCTTGTAGTACTCCAGTTCTAGCCACCCTTCTTGGCTATGTGGCTACTT
CCAAGGATCCAGTAATAGGTGGAAGCTTACTATTGACGTATACAACAGGTTACGTTGCTC
CACTCATCCTCGCTGCTTCTTTCGCTGGAGCTTTACAGAGCTTACTCTCGTTTCGAAAAG
TTTTTTCATGGATCAATCCCATAAGTGGTGCTCTTCTACTTGGAGGAGGTTTGTATACTT
TTTTGGATAGGCTTTTCCCTGCTACTACTATGGCCATGTAAATATTTGTTACTAAGAAGA
ATCACATACTCATTTTTACCCAAAAAAAAACAACAACAAAAGGGTGTGTGTATAGTATTT
TAAAACATTCATATTGATTAATAATGTAAAAATTTTAAACACAAGCAAACAATAGAATCG
ATCACTACTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP51TF U 1
AF RR2EP51JQ C 390
BS 1 647 RR2EP51TF
BS 648 973 RR2EP51JQ

RD RR2EP51TF 650 0 0
GCTTGAAAATGGTTGTCTTGGATCAAGCCACTTCCGTTTACATCTTGGCTGAAGGGACCC
TGGGAGACTCGCTTGGAAACTTCTTGTATTCAGCTAACCAACAAGCTAATGAAGCTGTTC
AGGATCAGCTCTCAGCTCTCAGTGTAACAAGTTTGGCAGTAATATTTGGGGCAGGACTTG
TGACAAGTCTTTCTCCATGTACACTCAGTGTTCTGCCTTTGACCCTTGGTTATATTGGTG
CGTTTGGATCTGGCAAAAGCAGAGGTCAGGTCATTGGAGATGCAATTGCTTTCTCACTGG
GATTAGCAACTACCTTAGCACTTCTTGGGATAGTAGCATCTTTTGCCGGAAAAGCATATG
GACAAATAGGACAAGGACTACCAGTAGCTGCATCAGGTCTGGCTATTGTAATGGGTCTCA
ATCTCCTTGAGGTGATCCAACTCCAGCTTCCATCTTTCTTTGACAACTTTGATCCTCGCG
CAGCAGCAGCAAACTTCCCATCTAGTGTACAAGCGTATCTAGCGGGTCTCACGTTCGCAT
TAGCTGCCTCACCTTGTAGTACTCCAGTTCTAGCCACCCTTCTTGGCTATGTGGCTACTT
CCAAGGATCCAGTAATAGGTGGAAGCTTACTATTGACGTATACAACA
CGT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2EP51JQ 584 0 0
GCATCAGGTCTGGCTATTGTAATGGGTCTCAATCTCCTTGAGGTGATCCAACTCCAGCTT
CCATCTTTCTTTGACAACTTTGATCCTCGCGCAGCAGCAGCAAACTTCCCATTTAGTGTA
CAAGCGTATCTAGCGGGTCTCACGTTCGCATTAGCTGCCTCACCTTGTAGTACTCCAGTT
CTAGCCACCCTTTTTGGCTATGTGGCTACTTCCAAGGATCCAGTAATAGGTGGAAGCTTA
CTATTGACGTATACAACAGGTTACGTTGCTCCACTCATCCTCGCTGCTTCTTTCGCTGGA
GCTTTACAGAGCTTACTCTCGTTTCGAAAAGTTTTTTCATGGATCAATCCCATAAGTGGT
GCTCTTCTACTTGGAGGAGGTTTGTATACTTTTTTGGATAGGCTTTTCCCTGCTACTACT
ATGGCCATGTAAATATTTGTTACTAAGAAGAATCACATACTCATTTTTACCCAAAAAAAA
ACAACAACAAAAGGGTGTGTGTATAGTATTTTAAAACATTCATATTGATTAATAATGTAA
AAATTTTAAACACAAGCAAACAATAGAATCGATCACTACTCACT

QA 1 584 1 584
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5070Contig1 1236 2 12 U
GGAAGAGTTGCAGCTTCTTCAGGAACCTGGTTCCTATGTCGGTGAAGTGGTCAAAGTGAT
GGGAAAAAACAAGGTCTTGGTTAAGGTTCGTCCAGAGGGGAAGTATGTTGTTGATATTGA
CAAAAGCATAGACATAACGAAAATCACTCCATCGACAAGAGTTGCTCTTCGTAACGATAG
TTATGTTCTCCACCTCGTCCTACCGAGTAAAGTTGATCCGCTAGTCAACTTGATGAAGGT
TGAGAAGGTTCCCGACTCTACATATGACATGATTGGTGGTCTTGACCAGCAAATTAAGGA
AATAAAGGAGGTCATTGAGCTGCCAATCAAGCATCCTGAACTGTTCGAGTCTCTTGGAAT
TGCGCAGCCAAAGGGTGTGTTGTTATATGGTCCACCCGGAACTGGGAAGACACTTTTGGC
TCGAGCTGTGGCACATCACACTGACTGTACCTTCATCAGAGTTTCTGGTTCCGAGCTGGT
CCAGAAATATATTGGAGAAGGTTCAAGAATGGTCAGAGAACTCTTTGTGATGGCAAGGGA
GCATGCACCATCAATCATCTTCATGGATGAGATCGACAGTATCGGGTCTGCTCGTATGGA
ATCTGGAAGTGGAAACGGTGACAGTGAGGTGCAAAGGACTATGCTTGAGCTTCTCAATCA
ACTTGACGGATTCGAAGCGTCAAACAAAATCAAGGTTTTGATGGCGACAAATCGTATTGA
TATTCTGGATCAAGCTCTTCTCAGGCCAGGAAGGATTGATAGGAAAATCGAATTTCCCAA
TCCTAATGAAGATTCACGTTTTGATATCTTGAAGATTCACTCGAGGAAGATGAATTTGAT
GCGTGGAATTGATCTGAAAAAAATTGCAGAGAAGATGAATGGTGCCTCGGGTGCTGAACT
GAAGGCGGTGTGCACGGAGGCGGGTATGTTTGCACTGCGGGAGAGGAGAGTACACGTGAC
ACAGGAAGACTTTGAGATGGCAGTGGGGAAGGTAATGAAGAAAGACACAGAGAAGAACAT
GTCTTTGCGTAAGCTCTGGAAGTAGAGGAATCTCTGTGTCACCTGTATTCCAAAGATTGG
TTTCACACCCGAGGAGTTTTAGAGTTACTTTTATTGCATGTGTGCTTCTTATTTCTGAAA
TAAATTTATGTTTGTTTTTTGAAGCATTTGAAAACAAAGTTGTTTACTACGTAAACACTA
GTGTATACTTAGTGTTCTTAAGCACAACAGTTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN89TF U 1
AF RR2EN89JQ C 517
BS 1 694 RR2EN89TF
BS 695 695 RR2EN89JQ
BS 696 744 RR2EN89TF
BS 745 745 RR2EN89JQ
BS 746 756 RR2EN89TF
BS 757 757 RR2EN89JQ
BS 758 766 RR2EN89TF
BS 767 767 RR2EN89JQ
BS 768 774 RR2EN89TF
BS 775 775 RR2EN89JQ
BS 776 785 RR2EN89TF
BS 786 1236 RR2EN89JQ

RD RR2EN89TF 796 0 0
GGAAGAGTTGCAGCTTCTTCAGGAACCTGGTTCCTATGTCGGTGAAGTGGTCAAAGTGAT
GGGAAAAAACAAGGTCTTGGTTAAGGTTCGTCCAGAGGGGAAGTATGTTGTTGATATTGA
CAAAAGCATAGACATAACGAAAATCACTCCATCGACAAGAGTTGCTCTTCGTAACGATAG
TTATGTTCTCCACCTCGTCCTACCGAGTAAAGTTGATCCGCTAGTCAACTTGATGAAGGT
TGAGAAGGTTCCCGACTCTACATATGACATGATTGGTGGTCTTGACCAGCAAATTAAGGA
AATAAAGGAGGTCATTGAGCTGCCAATCAAGCATCCTGAACTGTTCGAGTCTCTTGGAAT
TGCGCAGCCAAAGGGTGTGTTGTTATATGGTCCACCCGGAACTGGGAAGACACTTTTGGC
TCGAGCTGTGGCACATCACACTGACTGTACCTTCATCAGAGTTTCTGGTTCCGAGCTGGT
CCAGAAATATATTGGAGAAGGTTCAAGAATGGTCAGAGAACTCTTTGTGATGGCAAGGGA
GCATGCACCATCAATCATCTTCATGGATGAGATCGACAGTATCGGGTCTGCTCGTATGGA
ATCTGGAAGTGGAAACGGTGACAGTGAGGTGCAAAGGACTATGCTTGAGCTTCTCAATCA
ACTTGACGGATTCGAAGCGTCAAACAAAATCAAG*TTTTGATGGCGACAAATCGTATTGA
TATTCTGGATCAAGCTCTTCTCAG*CCAGGAAGGAT*GATAGGAAA*TCGAATT*CCCAA
TCCTA
TGAAGATCACG

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2EN89JQ 720 0 0
AGAACTCTTTGTGATGGCAAGGGAGCATGCACCATCAATCATCTTCATGGATGAGATCGA
CAGTATCGGGTCTGCTCGTATGGAATCTGGAAGTGGAAACGGTGACAGTGAGGTGCAAAG
GACTATGCTTGAGCTTCTCAATCAACTTGACGGATTCGAAGCGTCAAACAAAATCAAGGT
TTTGATGGCGACAAATCGTATTGATATTCTGGATCAAGCTCTTCTCAGGCCAGGAAGGAT
TGATAGGAAAATCGAATTTCCCAATCCTAATGAAGATTCACGTTTTGATATCTTGAAGAT
TCACTCGAGGAAGATGAATTTGATGCGTGGAATTGATCTGAAAAAAATTGCAGAGAAGAT
GAATGGTGCCTCGGGTGCTGAACTGAAGGCGGTGTGCACGGAGGCGGGTATGTTTGCACT
GCGGGAGAGGAGAGTACACGTGACACAGGAAGACTTTGAGATGGCAGTGGGGAAGGTAAT
GAAGAAAGACACAGAGAAGAACATGTCTTTGCGTAAGCTCTGGAAGTAGAGGAATCTCTG
TGTCACCTGTATTCCAAAGATTGGTTTCACACCCGAGGAGTTTTAGAGTTACTTTTATTG
CATGTGTGCTTCTTATTTCTGAAATAAATTTATGTTTGTTTTTTGAAGCATTTGAAAACA
AAGTTGTTTACTACGTAAACACTAGTGTATACTTAGTGTTCTTAAGCACAACAGTTCCTC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5072Contig1 883 2 6 U
GGGTTTCGAGGGTGACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACC
AACTCTCCTTGAGGCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGACCCTCTGACAAGCCCCT
CCGTCTCCCACTTCAGGATGTCTATAAGATCGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACG
TGTTGAGACTGGTCTGCTCAAGCCCGGTATGGTTGTCACCTTCGCTCCTTCAGGGTTGAC
CACTGAGGTTAAATCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTGTGGAGGCACTTCCAGGTGA
CAACGTTGGATTCAATGTTAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTCAAGCGTGGGTATGTTGC
ATCCAACTCCAAGGATGACCCTGCTAAGGGAGCTGCCAACTTCACATCCCAGGTCATCAT
CATGAACCACCCTGGTCAGATCGGTAACGGATACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACGTC
CCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGATCTGGTAAGGA
GATCGAGAAGGAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTTAAGATGACTCC
GACCAAGCCCATGGTTGTCGAGACTTTCTCTGAGTACCCACCGTTGGGACGTTTCGCTGT
CAGGGACATGAGGCAGACCGTTGCTGTGGGTGTCATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCC
AACCGGTGCCAAGGTCACCAAGGCCGCAGTGAAGAAGGGAGCCAAATGATGAGATTTCTC
TCGTCTTTTGTGTTTTCTTTTGCTTTAAAAAAAAACTTTGATGGCGTTTGAGCCTTTGTT
CTTTTATTTTCTGTTACTTTCTCATCTCTACCTCCTTTTTGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS50TF U 1
AF RR2GS50JQB C 560
BS 1 664 RR2GS50TF
BS 665 665 RR2GS50JQB
BS 666 672 RR2GS50TF
BS 673 673 RR2GS50JQB
BS 674 710 RR2GS50TF
BS 711 883 RR2GS50JQB

RD RR2GS50TF 725 0 0
GGGTTTCGAGGGTGACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACC
AACTCTCCTTGAGGCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGACCCTCTGACAAGCCCCT
CCGTCTCCCACTTCAGGATGTCTATAAGATCGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACG
TGTTGAGACTGGTCTGCTCAAGCCCGGTATGGTTGTCACCTTCGCTCCTTCAGGGTTGAC
CACTGAGGTTAAATCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTGTGGAGGCACTTCCAGGTGA
CAACGTTGGATTCAATGTTAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTCAAGCGTGGGTATGTTGC
ATCCAACTCCAAGGATGACCCTGCTAAGGGAGCTGCCAACTTCACATCCCAGGTCATCAT
CATGAACCACCCTGGTCAGATCGGTAACGGATACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACGTC
CCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGATCTGGTAAGGA
GATCGAGAAGGAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTTAAGATGACTCC
GACCAAGCCCATGGTTGTCGAGACTTTCTCTGAGTACCCACCGTTGGGACGTTTCGCTGT
CAGG*ACATGAG*CAGACCGTTGCTGTGGGTGTCATCAAGAGTGTTGACA
GAAGACCAACCGGTG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2GS50JQB 324 0 0
TTTTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTGTC
GAGACTTTCTCTGAGTACCCACCGTTGGGACGTTTCGCTGTCAGGGACATGAGGCAGACC
GTTGCTGTGGGTGTCATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGTGCCAAGGTCACC
AAGGCCGCAGTGAAGAAGGGAGCCAAATGATGAGATTTCTCTCGTCTTTTGTGTTTTCTT
TTGCTTTAAAAAAAAACTTTGATGGCGTTTGAGCCTTTGTTCTTTTATTTTCTGTTACTT
TCTCATCTCTACCTCCTTTTTGCA

QA 1 324 1 324
DS 



AS 1 2

CO CL5073Contig1 665 2 3 U
GACACACCTGAGTCTCCAGGAGATGCCACTAGAAACCTGTCACAGCAATGTCTTAACGCC
ATAGCCAAAGTTGTACCCGGTTTCCTCGGTGGAAGTGCTGACCTTGCATCTTCCAACATG
ACACTGCTCAAAGCCTCTGGTGACTTCCAAAAGGCAACACCGGAAGAAAGGAACCTTAAG
TTCGGTGTCAGGGAGCACGGAATGGGAGCCATCTGCAACGGCATTGCCCTCCACAGCCCT
GGACTCATCCCTTACTGTGCAACGTTCTTTGTCTTCACTGACTACATGAGAGGTGCGATG
AGAATCTCAGCCTTGTCCGAAGCTGGAGTGATCTATGTGATGACGCATGACTCCATTGGT
CTTGGAGAAGATGGACCAACCCATCAGCCCAATGAACACATCGCTAGCTTCCGTGCCATG
CCCAACACTCTCATGTTCCGTCCTGCGGATGGAAACGAGACGGCCGGTGCGTACAAGATC
GCTGTCACCAAGCGTAAGACGCCGTCTATCTTGGCTTTGTCTAGACAGAAGCTTCCTCAG
CTTCCAGGGACGTCCATCGAGGGAGTTGAGAAGGGTGGATACACAATCTCTGACAACTCG
TCCGGGAAAGGGAAGTCTATTGGTATTAACTCGTTTGGGGCAAGTGCACCTGCTCCCTTG
CTCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2DM44TF U 60
AF RR2CR44TF U 1
BS 1 178 RR2CR44TF
BS 179 179 RR2DM44TF
BS 180 665 RR2CR44TF

RD RR2DM44TF 129 0 0
G
ATAGCCAAAGTTGTACCCGGTTTCCTCGGTGGAAGTGCTGACCTTGCATCTTCCAACATG
ACACTGCTCAAAGCCTCTGGTGACTTCCAAAAGGCAACACCGGAAGAAAGGAACCTTAAG
TTCGGTGT

QA 2 129 2 129
DS 

RD RR2CR44TF 665 0 0
GACACACCTGAGTCTCCAGGAGATGCCACTAGAAACCTGTCACAGCAATGTCTTAACGCC
ATAGCCAAAGTTGTACCCGGTTTCCTCGGTGGAAGTGCTGACCTTGCATCTTCCAACATG
ACACTGCTCAAAGCCTCTGGTGACTTCCAAAAGGCAACACCGGAAGAAAGGAACCTTAGG
TTCGGTGTCAGGGAGCACGGAATGGGAGCCATCTGCAACGGCATTGCCCTCCACAGCCCT
GGACTCATCCCTTACTGTGCAACGTTCTTTGTCTTCACTGACTACATGAGAGGTGCGATG
AGAATCTCAGCCTTGTCCGAAGCTGGAGTGATCTATGTGATGACGCATGACTCCATTGGT
CTTGGAGAAGATGGACCAACCCATCAGCCCAATGAACACATCGCTAGCTTCCGTGCCATG
CCCAACACTCTCATGTTCCGTCCTGCGGATGGAAACGAGACGGCCGGTGCGTACAAGATC
GCTGTCACCAAGCGTAAGACGCCGTCTATCTTGGCTTTGTCTAGACAGAAGCTTCCTCAG
CTTCCAGGGACGTCCATCGAGGGAGTTGAGAAGGGTGGATACACAATCTCTGACAACTCG
TCCGGGAAAGGGAAGTCTATTGGTATTAACTCGTTTGGGGCAAGTGCACCTGCTCCCTTG
CTCTA

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL5074Contig1 1254 2 4 U
GCATTGAGGAGAAGTTATTGTTAGCATCTACAAGGAAGCTTGAACAAACGCTAACGGTGG
AAGAACGGCAACGCAACAGCGTGATGCTTGATTTGTTATACGTACACCCCAATCATCCAC
TGGGCCAGCGGGTTATGCAGTACTACCAGTTCTACAACCAGTTGCCACCAAATGAATGTC
TTCCATGGATGATAGACCCGAATGCTAGCCAAGGGATGAACGGTTTCCTGTGGTTTAGTG
AAAGGAACGGTTTCCAAACTAGAGTTGTTTCTCCTGTCAATGGCTTGCCATGCATTGAGC
AGAACCGAGCCTTAAATGTTACATACTTGAATCCTGCCAAACACTCTCATATCCCAGAAC
CACCAAGAGGAGCTATCATTCCGGACAAGATCTTGACGCCGTTAGATATAAAGCCATTTC
CTGCTTTATGGCACGAAGACAATAGCAACCGGCGCCGACAAGCTCGAGATAGACCACAAG
TGGCTGGTGCTATAGCCGGAAATACACTGGGAGAAGCTGCTCATCGTCTGATCAAAAGCA
CCCTTAATATGAAATCTTCCACTGGTTTTTCGGCTTCAGGATTAATTGACCCAAACTCAT
ACAACCGAAATATACCTGGTAATTATCAGTACGGTGGACCAAGAGCAGCGGGTTCCTCTT
CTTACAGGAAATCATATGGCGATGACTCGAGCTACTACTATCAAGGAAACTATAACAGTA
GTTCTCAAGGAATGCACAGCAACGGTCCGAGATATCCTGGTCCATTAAATGGATCACCAG
ACTATAACCGGAACTACAACAAACAACAGAACCGTGGTGGAATCAGAGCTGGTTTATCAA
CAGAAGATAACAACGGCAGAAGCAAACAGCAATCGTATTCAAGCTATACAGAAGCTGCTA
ATGCGAATATCAACCCATTGCCATCACCGCCAACACAATGGACTGGTACAGCGACGCAAG
GTGGGAATCTCGGCGGTGGATACTATAGGGAAGGAGTTGGGTATGGTGATATGAATGGAA
AGAAAGTGATTTATCAGCCTAAGACACAACCAAGTCATCGAGGCTCAAATGAATTAGATT
AGATTTCTTCCGTCTGTCGATAATCAAGTTTCTTTCCTTTGCCGCAATCTTCTCCCATAT
TTCTTGTTGAAGGCAAGTGTATAATGTACGTTTTGACAGAGTTTTCTTATACTTTTTTAA
ATTAAGTGTTATTTCGACATTTTTCATATGGATTACAAAAAAAAATATGTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F858TF U 1
AF RR2F858JQ C 575
BS 1 705 RR2F858TF
BS 706 706 RR2F858JQ
BS 707 725 RR2F858TF
BS 726 1254 RR2F858JQ

RD RR2F858TF 725 0 0
GCATTGAGGAGAAGTTATTGTTAGCATCTACAAGGAAGCTTGAACAAACGCTAACGGTGG
AAGAACGGCAACGCAACAGCGTGATGCTTGATTTGTTATACGTACACCCCAATCATCCAC
TGGGCCAGCGGGTTATGCAGTACTACCAGTTCTACAACCAGTTGCCACCAAATGAATGTC
TTCCATGGATGATAGACCCGAATGCTAGCCAAGGGATGAACGGTTTCCTGTGGTTTAGTG
AAAGGAACGGTTTCCAAACTAGAGTTGTTTCTCCTGTCAATGGCTTGCCATGCATTGAGC
AGAACCGAGCCTTAAATGTTACATACTTGAATCCTGCCAAACACTCTCATATCCCAGAAC
CACCAAGAGGAGCTATCATTCCGGACAAGATCTTGACGCCGTTAGATATAAAGCCATTTC
CTGCTTTATGGCACGAAGACAATAGCAACCGGCGCCGACAAGCTCGAGATAGACCACAAG
TGGCTGGTGCTATAGCCGGAAATACACTGGGAGAAGCTGCTCATCGTCTGATCAAAAGCA
CCCTTAATATGAAATCTTCCACTGGTTTTTCGGCTTCAGGATTAATTGACCCAAACTCAT
ACAACCGAAATATACCTGGTAATTATCAGTACGGTGGACCAAGAGCAGCGGGTTCCTCTT
CTTACAGGAAATCATATGGCGATGACTCGAGCTACTACTATCAAG*AAACTATAACAGTA
GTTCT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2F858JQ 680 0 0
TTCAGGATTAATTGACCCAAACTCATACAACCGAAATATACCTGGTAATTATCAGTACGG
TGGACCAAGAGCAGCGGGTTCCTCTTCTTACAGGAAATCATATGGCGATGACTCGAGCTA
CTACTATCAAGGAAACTATAACAGTAGTTCTCAAGGAATGCACAGCAACGGTCCGAGATA
TCCTGGTCCATTAAATGGATCACCAGACTATAACCGGAACTACAACAAACAACAGAACCG
TGGTGGAATCAGAGCTGGTTTATCAACAGAAGATAACAACGGCAGAAGCAAACAGCAATC
GTATTCAAGCTATACAGAAGCTGCTAATGCGAATATCAACCCATTGCCATCACCGCCAAC
ACAATGGACTGGTACAGCGACGCAAGGTGGGAATCTCGGCGGTGGATACTATAGGGAAGG
AGTTGGGTATGGTGATATGAATGGAAAGAAAGTGATTTATCAGCCTAAGACACAACCAAG
TCATCGAGGCTCAAATGAATTAGATTAGATTTCTTCCGTCTGTCGATAATCAAGTTTCTT
TCCTTTGCCGCAATCTTCTCCCATATTTCTTGTTGAAGGCAAGTGTATAATGTACGTTTT
GACAGAGTTTTCTTATACTTTTTTAAATTAAGTGTTATTTCGACATTTTTCATATGGATT
ACAAAAAAAAATATGTTGCT

QA 1 680 1 680
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5076Contig1 1257 2 4 U
GGAACCCTCCATTGATTTACGATAAGCAACAATCTTTTTCTCGAGGGGAGTTTTTTTTGT
ATACCTTTTCTTCTCATTTCACCAAAAATCTCTCTTCTCTCTGTTCCATAATTGCTCTTG
GAAATGTCTAAAACTGATTAGATTGACAAAAAAGAAAAACAGAGCTTGTGTGTGGTGTAG
AGTAGTTATGAATCATTCACTGTTCTTCTAAGAAGAAACACTCACTGGATCTCAATATAA
CTAGCTGAGGTGATGATAACTAACAATTGTGCTGTTAAAGTTTTGTTTATTTCTGAATTG
ATAGATTTGTAGTTGGTTTCGGGGTTAGCAGAAATGCAGGAGAAAGCTTTAGTCCTCTTA
CTGAATGTGTGTGGTTTTAATTTACGAAAACATTCAAGATACTGACAGCTCAGTCTTCGA
ATTTTTTCACAGGTTTGCCTGGAGTTCTCTGGGTTTTACCTGACTCCTACATAGATGTCA
AGAACAAGGACTATGGAGGTAACCCCATCTAAGCCCTTATCATTGATTACAGTGTCTCCA
ATATCTATCTCTCTTCCTCCCTATCTCATAGTTGGAAGTTTTTTTGTCCGGTTTCGCCAT
GTCCCTCGACACGCTGAACAACTTCCCCGAGCTCAAAGCCTCTGCTCAAGAGCAAGTCGA
GTTCATGCTTTCCCAACGAGATACTTGTGATTGCTCAGAGCTGTGAGTTAGGTGTGAAAG
TGAAGCTGGTTGAGGTTACAGGGAAGGTTCTAGAAGCGGTTGGTTATGGAGTTGTGATTG
TTCCTTGTAGAAGCAGAGCTTGTCTTCTGAAGCTATGGTTGCCTTTCGTAAGGAGGTTAA
AGACTCTGGTTGATGCACAGGGATCTGAGTCTGAGTACAGAATGGATGAAGATCTCTGTG
AGTTGTTAGAAGGGTCTATGGTGTCTTTGGTTTTGACACTGCCTTCGAGTGACCAAGCGG
AAGTGTTTGGGGAGTGGATGAGAGGGGTTGCGTTGGAAGGAGTCAAGTTTCCGGATTTGA
GTGAAGCCTTTGAGGTTTGGTGTTATAGAAGTAAGTCTGCAAAGCGAAGGTTGTTGGAAA
AATGTGATAGACTTGCAACTGAAAACCTTGCCCTTTGATTGTTAACATAAAGGACTCTCA
AGATGTACCTAATCATGTAATGTTGTACCATCTTTACTCGCTTTGATTAGCTAGCTGATT
CATTGTAATCCTGGATTGTATTGGGAATGACAGAAAGCTTCTGATTCTTATAGTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD09TF U 1
AF RR2DD09JQ C 588
BS 1 711 RR2DD09TF
BS 712 712 RR2DD09JQ
BS 713 734 RR2DD09TF
BS 735 1257 RR2DD09JQ

RD RR2DD09TF 735 0 0
GGAACCCTCCATTGATTTACGATAAGCAACAATCTTTTTCTCGAGGGGAGTTTTTTTTGT
ATACCTTTTCTTCTCATTTCACCAAAAATCTCTCTTCTCTCTGTTCCATAATTGCTCTTG
GAAATGTCTAAAACTGATTAGATTGACAAAAAAGAAAAACAGAGCTTGTGTGTGGTGTAG
AGTAGTTATGAATCATTCACTGTTCTTCTAAGAAGAAACACTCACTGGATCTCAATATAA
CTAGCTGAGGTGATGATAACTAACAATTGTGCTGTTAAAGTTTTGTTTATTTCTGAATTG
ATAGATTTGTAGTTGGTTTCGGGGTTAGCAGAAATGCAGGAGAAAGCTTTAGTCCTCTTA
CTGAATGTGTGTGGTTTTAATTTACGAAAACATTCAAGATACTGACAGCTCAGTCTTCGA
ATTTTTTCACAGGTTTGCCTGGAGTTCTCTGGGTTTTACCTGACTCCTACATAGATGTCA
AGAACAAGGACTATGGAGGTAACCCCATCTAAGCCCTTATCATTGATTACAGTGTCTCCA
ATATCTATCTCTCTTCCTCCCTATCTCATAGTTGGAAGTTTTTTTGTCCGGTTTCGCCAT
GTCCCTCGACACGCTGAACAACTTCCCCGAGCTCAAAGCCTCTGCTCAAGAGCAAGTCGA
GTTCATGCTTTCCCAACGAGATACTTGTGATTGCTCAGAGCTGTGAGTTAG*TGTGAAAG
TGAAGCTGGTTGAG
T

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2DD09JQ 670 0 0
CCGGTTTCGCCATGTCCCTCGACACGCTGAACAACTTCCCCGAGCTCAAAGCCTCTGCTC
AAGAGCAAGTCGAGTTCATGCTTTCCCAACGAGATACTTGTGATTGCTCAGAGCTGTGAG
TTAGGTGTGAAAGTGAAGCTGGTTGAGGTTACAGGGAAGGTTCTAGAAGCGGTTGGTTAT
GGAGTTGTGATTGTTCCTTGTAGAAGCAGAGCTTGTCTTCTGAAGCTATGGTTGCCTTTC
GTAAGGAGGTTAAAGACTCTGGTTGATGCACAGGGATCTGAGTCTGAGTACAGAATGGAT
GAAGATCTCTGTGAGTTGTTAGAAGGGTCTATGGTGTCTTTGGTTTTGACACTGCCTTCG
AGTGACCAAGCGGAAGTGTTTGGGGAGTGGATGAGAGGGGTTGCGTTGGAAGGAGTCAAG
TTTCCGGATTTGAGTGAAGCCTTTGAGGTTTGGTGTTATAGAAGTAAGTCTGCAAAGCGA
AGGTTGTTGGAAAAATGTGATAGACTTGCAACTGAAAACCTTGCCCTTTGATTGTTAACA
TAAAGGACTCTCAAGATGTACCTAATCATGTAATGTTGTACCATCTTTACTCGCTTTGAT
TAGCTAGCTGATTCATTGTAATCCTGGATTGTATTGGGAATGACAGAAAGCTTCTGATTC
TTATAGTGGG

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL5077Contig1 1347 2 12 U
TTCCCTCAATTTCTTAAAATGGATATCAAGAGTGCTACATTCTAGGATTATTATAATTTT
GTTCATCCACCTCTATTCGAAGCTTAATAGAAAGATTATTCCTCCTTGTCTTTGGGGACT
AATAAGATTTCTGGTTGTCTGATCCAATGGCTGCAACCACTGAGATGCCCACTGATGTTG
TCAATGATGTTAGTATCAACAAGGATGGTGAAAAGGGCATTGATAGCGGAATTGAGAATA
ACTCTTCGATCACGACCTCGAAACCCAAAACTGAATCCGATCTGGATATGCAAAAGCTTG
TGGCTATGTTCAAGAAACTAAATCCAATGGCTAAGGAGTTTTTCCCTTCTTATTACAATC
CCAAGAAGAACAATCAGACAGGAAAAGACAACCAACTTCTGTCTGCTGATGATGTGGCGC
CCACAAAAAACAATCTGGTGAAGAAGTTGATCTTAATGGAAAGAAAGGTGACAATAACCA
GAAGAGAAGAAACAGCTATAGCCAAGGGAGGAGGAGGTTAACTGGAAGAATTTCTAAGGC
TTAGAGAGAGGATAGTATGAGAAGAACGGTCTATGTTTCTGACATTGACCAGAGTGTGAC
TGAGGAGGGTCTTGCTGGCTTGTTTAGTAACTGTGGACAAGTTGTTGATTGTCGGATTTG
TGGGGATCCACATTCAGTTCTTCGATTTGCGTTTGTCGAGTTTGCTGATGACCAGGGCGC
CCGGGAAGCTTTAAGCCTTGGTGGAACGATGCTCGGGTACTACCCGGTGAGGGTCTGCCC
TCCAAAACTGCTATTCTTCCAGTGAATCCCACATTTCTTCCCAGGTCAGAAGATGAAAGG
GAGATGTGTTCAAGGACAATTTATTGCACAAATATTGACAAGAAGGTCACTCAAGCTGAT
GTGAGAAACTTGTTTGAGACGGCATGTGGTGGGGTAACTCGCCTGAGGCTTCTTGGTGAT
CAACTGCATTCAACTCGTATAGCTTTTGTTGAGTTTGCTTTGGCAGATAGTGCACTTAGG
GCGCTCAACTGCAGCGGTATGGTCGTTGGATCCCAACCCATAAGGGTAAGTCCTTCAAAG
ACACCAGTAAGGCCACGAATCACTCGACCACCGTTTACAAACTAGAAAGAGAGCTTGCTT
TCCAGAAGAGAGAGTATTTCAAACTTCTTTTTTCGATTTTCTCTTTTTGACGTTTTAGAA
CAGTTTATCTTCTCCAGTTACACTTGTAACTGGAAGGTGGAAACCCTTATGGTTCTTTTT
TTTGAATTTGGAATTATTATTAGGCTTTGTCTTTTCTGACTGAGATACTTGCATCTGTTT
CATCATCTTTCTTTAAGAGATTTTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP64TF U 1
AF RR2GP64JQ C 573
BS 1 629 RR2GP64TF
BS 630 630 RR2GP64JQ
BS 631 639 RR2GP64TF
BS 640 640 RR2GP64JQ
BS 641 654 RR2GP64TF
BS 655 655 RR2GP64JQ
BS 656 716 RR2GP64TF
BS 717 717 RR2GP64JQ
BS 718 726 RR2GP64TF
BS 727 727 RR2GP64JQ
BS 728 740 RR2GP64TF
BS 741 1347 RR2GP64JQ

RD RR2GP64TF 740 0 0
TTCCCTCAATTTCTTAAAATGGATATCAAGAGTGCTACATTCTAGGATTATTATAATTTT
GTTCATCCACCTCTATTCGAAGCTTAATAGAAAGATTATTCCTCCTTGTCTTTGGGGACT
AATAAGATTTCTGGTTGTCTGATCCAATGGCTGCAACCACTGAGATGCCCACTGATGTTG
TCAATGATGTTAGTATCAACAAGGATGGTGAAAAGGGCATTGATAGCGGAATTGAGAATA
ACTCTTCGATCACGACCTCGAAACCCAAAACTGAATCCGATCTGGATATGCAAAAGCTTG
TGGCTATGTTCAAGAAACTAAATCCAATGGCTAAGGAGTTTTTCCCTTCTTATTACAATC
CCAAGAAGAACAATCAGACAGGAAAAGACAACCAACTTCTGTCTGCTGATGATGTGGCGC
CCACAAAAAACAATCTGGTGAAGAAGTTGATCTTAATGGAAAGAAAGGTGACAATAACCA
GAAGAGAAGAAACAGCTATAGCCAAGGGAGGAGGAGGTTAACTGGAAGAATTTCTAAGGC
TTAGAGAGAGGATAGTATGAGAAGAACGGTCTATGTTTCTGACATTGACCAGAGTGTGAC
TGAGGAGGGTCTTGCTGGCTTGTTTAGTA*CTGTGGACA*GTTGTTGATTGTCG*ATTTG
TGGGGATCCACATTCAGTTCTTCGATTTGCGTTTGTCGAGTTTGCTGATGACCAGG*CGC
CCGGGA*GCTTTAAGCCTTG

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2GP64JQ 775 0 0
ATGTTTCTGACATTGACCAGAGTGTGACTGAGGAGGGTCTTGCTGGCTTGTTTAGTAACT
GTGGACAAGTTGTTGATTGTCGGATTTGTGGGGATCCACATTCAGTTCTTCGATTTGCGT
TTGTCGAGTTTGCTGATGACCAGGGCGCCCGGGAAGCTTTAAGCCTTGGTGGAACGATGC
TCGGGTACTACCCGGTGAGGGTCTGCCCTCCAAAACTGCTATTCTTCCAGTGAATCCCAC
ATTTCTTCCCAGGTCAGAAGATGAAAGGGAGATGTGTTCAAGGACAATTTATTGCACAAA
TATTGACAAGAAGGTCACTCAAGCTGATGTGAGAAACTTGTTTGAGACGGCATGTGGTGG
GGTAACTCGCCTGAGGCTTCTTGGTGATCAACTGCATTCAACTCGTATAGCTTTTGTTGA
GTTTGCTTTGGCAGATAGTGCACTTAGGGCGCTCAACTGCAGCGGTATGGTCGTTGGATC
CCAACCCATAAGGGTAAGTCCTTCAAAGACACCAGTAAGGCCACGAATCACTCGACCACC
GTTTACAAACTAGAAAGAGAGCTTGCTTTCCAGAAGAGAGAGTATTTCAAACTTCTTTTT
TCGATTTTCTCTTTTTGACGTTTTAGAACAGTTTATCTTCTCCAGTTACACTTGTAACTG
GAAGGTGGAAACCCTTATGGTTCTTTTTTTTGAATTTGGAATTATTATTAGGCTTTGTCT
TTTCTGACTGAGATACTTGCATCTGTTTCATCATCTTTCTTTAAGAGATTTTTAG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL5078Contig1 741 2 3 U
CTTTACGAGATTCTACGCTCTGTCAAAGCCAATACTACCGGCTTGTTACTCAGTGATGGT
GTAACAGAACTAACGACCAAGAACCGACCAAAGGATGCTTTCTTTGATTGGTTTCTGCAT
CCGTTTTTGATACTAAAGGAGCAGATGCAAGCTACAAACTTGTCTGATGAAGAAGAAGAG
TATCTCGGGAGATTGGTGTTGCTTTATGGAGACTCAGAGAGGCTCAAGAACTCGTATGCT
GATTCTGCTTTTCCTACTCTCACAGAGCGTAAAAGAGCTGAGCTTGACGCCTTTGCTCGC
ACGATTAATGGGCTAACGAAAACAGTATCAAGGTATCCAACCTTCCGTAGACATTTTGTG
TGTTTAGTGAAGAAACTATCAGAGGACTTGGACCTGAAGGATGGCGGTTCGGTAAAGGAG
GAAGGGTCTATAACAGAAGCGCCTGCTCCTGCTAAAATATTTTCTAGGATGTTCAGTAAG
AGTCAAAGATCGTTCAGAAGAAAAGGGAGTATCAATGGATCCGATCAAGAAACACGGAAG
GGTGTTTCAAGAAGTGTACATATCGTTTAATCAATGCATGGGACATGTGGTGGTGGATGT
TTGAAAACGTAAGGTCTTTTGCTCTTTGCTCGACAAAAAAAATGGTTGTTACTTGTAAAG
ATTGTTCAGACAGATTGTTTTGATTTATAGAACAGTGTTTGTTTTCGGACAAGAAACTGG
AACTTTGGAAGTCTCCCTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F161TF U 72
AF RR2F161JQ C 1
BS 1 71 RR2F161JQ
BS 72 373 RR2F161TF
BS 374 741 RR2F161JQ

RD RR2F161TF 302 0 0
AACGACCAAGAACCGACCAAAGGATGCTTTCTTTGATTGGTTTCTGCATCCGTTTTTGAT
ACTAAAGGAGCAGATGCAAGCTACAAACTTGTCTGATGAAGAAGAAGAGTATCTCGGGAG
ATTGGTGTTGCTTTATGGAGACTCAGAGAGGCTCAAGAACTCGTATGCTGATTCTGCTTT
TCCTACTCTCACAGAGCGTAAAAGAGCTGAGCTTGACGCCTTTGCTCGCACGATTAATGG
GCTAACGAAAACAGTATCAAGGTATCCAACCTTCCGTAGACATTTTGTGTGTTTAGTGAA
GA

QA 1 302 1 302
DS 

RD RR2F161JQ 741 0 0
CTTTACGAGATTCTACGCTCTGTCAAAGCCAATACTACCGGCTTGTTACTCAGTGATGGT
GTAACAGAACTAACGACCAAGAACCGACCAAAGGATGCTTTCTTTGATTGGTTTCTGCAT
CCGTTTTTGATACTAAAGGAGCAGATGCAAGCTACAAACTTGTCTGATGAAGAAGAAGAG
TATCTCGGGAGATTGGTGTTGCTTTATGGAGACTCAGAGAGGCTCAAGAACTCGTATGCT
GATTCTGCTTTTCCTACTCTCACAGAGCGTAAAAGAGCTGAGCTTGACGCCTTTGCTCGC
AGGATTAATGGGCTAACGAAAACAGTATCAAGGTATCCAACCTTCCGTAGACATTTTGTG
TGTTTAGTGAAGAAACTATCAGAGGACTTGGACCTGAAGGATGGCGGTTCGGTAAAGGAG
GAAGGGTCTATAACAGAAGCGCCTGCTCCTGCTAAAATATTTTCTAGGATGTTCAGTAAG
AGTCAAAGATCGTTCAGAAGAAAAGGGAGTATCAATGGATCCGATCAAGAAACACGGAAG
GGTGTTTCAAGAAGTGTACATATCGTTTAATCAATGCATGGGACATGTGGTGGTGGATGT
TTGAAAACGTAAGGTCTTTTGCTCTTTGCTCGACAAAAAAAATGGTTGTTACTTGTAAAG
ATTGTTCAGACAGATTGTTTTGATTTATAGAACAGTGTTTGTTTTCGGACAAGAAACTGG
AACTTTGGAAGTCTCCCTAGT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL5079Contig1 375 2 3 U
CCTCTTAATCTCCATAGCCTCTCTCCAAGCTCTCTCACTCTCCTCGAACTCTCTCAGCTC
CTTCTCTCTCTTCCGCTCCTCCTCTTCCTCGATCGCCTTCAGTTTCTCCTGCTCCGCCGG
ATCGTTTAACTTCGCCTCCGCCTCTTCTCTCTCCTTCAATGCTATCTCCTTCCTCACCTG
CTTCCTCTTCAGTTTCTTCATCGCTTTTCGCTTCTCCTTGCGGCTCATCTCCGCCGATTT
CTCTTTACTCTCTTCCATCGATTCTTCGAGTCGCTCTCCTTCTTCCGGCTTTTCGTTCTG
CGGCTCCGTCATCACGATCGCGTTAACCTCTCTCGCTGGGAGGTTGAAGAAGAAGAAGGA
ACCCTCTTGAGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D837JQ U 39
AF RR2D837TF C 1
BS 1 38 RR2D837TF
BS 39 188 RR2D837JQ
BS 189 375 RR2D837TF

RD RR2D837JQ 150 0 0
TCTCCTCGAACTCTCTCAGCTCCTTCTCTCTCTTCCGCTCCTCCTCTTCCTCGATCGCCT
TCAGTTTCTCCTGCTCCGCCGGATCGTTTAACTTCGCCTCCGCCTCTTCTCTCTCCTTCA
ATGCTATCTCCTTCCTCACCTGCTTCCTCT

QA 1 150 1 150
DS 

RD RR2D837TF 375 0 0
CCTCTTAATCTCCATAGCCTCTCTCCAAGCTCTCTCACTCTCCTCGAACTCTCTCAGCTC
CTTCTCTCTCTTCCGCTCCTCCTCTTCCTCGATCGCCTTCAGTTTCTCCTGCTCCGCCGG
ATCGTTTAACTTCGCCTCCGCCTCTTCTCTCTCCTTCGATGCTATCTCCTTCCTCACCTG
CTTCCTCTTCAGTTTCTTCATCGCTTTTCGCTTCTCCTTGCGGCTCATCTCCGCCGATTT
CTCTTTACTCTCTTCCATCGATTCTTCGAGTCGCTCTCCTTCTTCCGGCTTTTCGTTCTG
CGGCTCCGTCATCACGATCGCGTTAACCTCTCTCGCTGGGAGGTTGAAGAAGAAGAAGGA
ACCCTCTTGAGTCCC

QA 1 375 1 375
DS 



AS 1 2

CO CL5080Contig1 938 2 2 U
GAAGAAATATCAAGAATTGAGAAAGGCCAAGCCAAAATTTGCCATGGAGGAATTGAGACA
GTCATATGTACTTCTCCAAGTATAGTTTGCCTTACGCAAAAGTTGATAGCTGAGGTGATA
GGGACGTATTTTGTAATATTTTCTGGATGTGGAGTGGTGGTAGTGAATGTATTATACGGT
GGAACAGTGACGTTTCCGGGGGTATGTGTGACTTGGGGTCTCATTGTTATGGTTATGATT
TACTCTACTGGTCACATCTCTGGTGCACATTTCAATCCTGCCGTCACCTTCACTTTTGCT
ATTTTCCGGCGATTTCCCTGGTATCAGGTACCATTGTATATAGGTGCACAACTTGCAGGA
TCGTTACTAGCGAGTTTGACATTAAGACTAATGTTCAAAGTAACACCTGAAGCTTACTTC
GGAACAACTCCAACTGATTCGGCTGCACGAGCGCTCGTTGCGGAGATCATTATCTCATTT
CTTCTCATGTTCATTATATCCGGCGTTTCAACGGATAGTCGAGCGATTGGAGAATTAGCT
GGAATTGCGGTAGGGATGACTATAATGTTAAATGTTTTTGTGGCCGGACCGATTTCAGGA
GCATCAATGAATCCAGCGAGAAGTCTAGGACCAGCAATTGTAATGGGAGTTTACAAAGAC
ATATGGGTTTACATTGTAGGTCCTATCGTCGGCGTTATGACCGGAGGTTTTGTTTACAAC
TTTATCAGGTTTACTGATAAGCCCCTTCGAGAACTCACCAAGAGTGCTTCTTTTCTCCGT
AGCATCTCTCCAAAACAATAATTCGACAAGCTAATATTGTGTTAGTTCCAGATATGTATG
TACAAATTGATATCTTTCACTAATGAAAACTGACTCCATTTTCAAAATTTGTTAATGAGA
TATTAATTTATACAGCTGAGGATTAATACCGTTTTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE49TF U 1
AF RR2BE49JQ C 236
BS 1 384 RR2BE49TF
BS 385 938 RR2BE49JQ

RD RR2BE49TF 384 0 0
GAAGAAATATCAAGAATTGAGAAAGGCCAAGCCAAAATTTGCCATGGAGGAATTGAGACA
GTCATATGTACTTCTCCAAGTATAGTTTGCCTTACGCAAAAGTTGATAGCTGAGGTGATA
GGGACGTATTTTGTAATATTTTCTGGATGTGGAGTGGTGGTAGTGAATGTATTATACGGT
GGAACAGTGACGTTTCCGGGGGTATGTGTGACTTGGGGTCTCATTGTTATGGTTATGATT
TACTCTACTGGTCACATCTCTGGTGCACATTTCAATCCTGCCGTCACCTTCACTTTTGCT
ATTTTCCGGCGATTTCCCTGGTATCAGGTACCATTGTATATAGGTGCACAACTTGCAGGA
TCGTTACTAGCGAGTTTGACATTA

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR2BE49JQ 703 0 0
TGATTTACTCTACTGGTCACATCTCTGGTGCACATTTCAATCCTGCCGTCACCTTCACTT
TTGCTATTTTCCGGCGATTTCCCTGGTATCAGGTACCATTGTATATAGGTGCACAACTTG
CAGGATCGTTACTAGCGAGTTTGACATTAAGACTAATGTTCAAAGTAACACCTGAAGCTT
ACTTCGGAACAACTCCAACTGATTCGGCTGCACGAGCGCTCGTTGCGGAGATCATTATCT
CATTTCTTCTCATGTTCATTATATCCGGCGTTTCAACGGATAGTCGAGCGATTGGAGAAT
TAGCTGGAATTGCGGTAGGGATGACTATAATGTTAAATGTTTTTGTGGCCGGACCGATTT
CAGGAGCATCAATGAATCCAGCGAGAAGTCTAGGACCAGCAATTGTAATGGGAGTTTACA
AAGACATATGGGTTTACATTGTAGGTCCTATCGTCGGCGTTATGACCGGAGGTTTTGTTT
ACAACTTTATCAGGTTTACTGATAAGCCCCTTCGAGAACTCACCAAGAGTGCTTCTTTTC
TCCGTAGCATCTCTCCAAAACAATAATTCGACAAGCTAATATTGTGTTAGTTCCAGATAT
GTATGTACAAATTGATATCTTTCACTAATGAAAACTGACTCCATTTTCAAAATTTGTTAA
TGAGATATTAATTTATACAGCTGAGGATTAATACCGTTTTAGG

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL5081Contig1 1033 2 2 U
GGTGCGAGTGTCGTCTTCTCCACTCTCTCTCTCTCTCGCAATAGATCACTCCGTTGACTC
TGCTTTCACCGGGAGAAGATCTGTGGTTCCGGAGATTGTAGCTGATTCGCTGTTGAAACT
AACTCGGCAGCCATGAGCTCGGTTCTGCAGGGTTTTACGAAGTCACTCGCGATGACTTTT
GTGTCGGAGATTGGCGACAAGACCTTCTTCGCCGCCGCTATTCTGGCGATGCGTTATCCT
AGGAGACTTGTGTTGGCTGGTTGTGTATCTGCTCTGATTGTCACAACTATCCTCTCTGCT
GCCATTGGATGGGCTGCTCCTAATCTGATCTCTCGCAAATGGACCCATCACATAACGACC
TTGTTGTTCTTTGGTTTCGGGCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGAAGGAGGG
GATTCTGACGAATTGGCCGAAGTGGAAGCAGAACTGGATTCTGATTTGAAGGCTAATGGT
AAAACTACAAAAGATAACAGTAAGATTGAAGATGAAAAAAAGAAACAGAAAAGGCCATTC
CTCACACAATTCTTCTCTCCTATTTTTCTCAAGGCCTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAA
TTTGGTGACAAGAGTCAGCTTGCTACAATTGGTTTAGCCGCTGATGAAAACCCGTTTGGG
GTTGTCCTTGGTGGAGTTGTGGCACAGCTTGTGTGTACCTCTGCTGCTGTGATTGGAGGA
AAGAGCTTAGCTTCTCAGATATCCGAACGAATTGTTGCTCCTTCTGGTGGAGTGCTGTTC
ATTATCTTTGGCATCCAATCGTTTCTTACCTCTGTTCAGGCCTAATGCTTCTTTCTGGGT
TGTAGGGAGTGCTGAAGATGACGATGAAGAACTCTGATATCAACACTTTCTTTAGATATG
TAATCTTGATACTAGATGTTTTACGCAAGTCATTACAAAACAAATCGGAAAGTTTATTAA
CCTTGAAAAAAAACATTAAAAGGGGCGCTGAAGCAGCCATTTGACTTCAATAAAGTTCTG
GTAATCTTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM13TF U 1
AF RR2AM13JQ C 667
BS 1 814 RR2AM13TF
BS 815 1033 RR2AM13JQ

RD RR2AM13TF 814 0 0
GGTGCGAGTGTCGTCTTCTCCACTCTCTCTCTCTCTCGCAATAGATCACTCCGTTGACTC
TGCTTTCACCGGGAGAAGATCTGTGGTTCCGGAGATTGTAGCTGATTCGCTGTTGAAACT
AACTCGGCAGCCATGAGCTCGGTTCTGCAGGGTTTTACGAAGTCACTCGCGATGACTTTT
GTGTCGGAGATTGGCGACAAGACCTTCTTCGCCGCCGCTATTCTGGCGATGCGTTATCCT
AGGAGACTTGTGTTGGCTGGTTGTGTATCTGCTCTGATTGTCACAACTATCCTCTCTGCT
GCCATTGGATGGGCTGCTCCTAATCTGATCTCTCGCAAATGGACCCATCACATAACGACC
TTGTTGTTCTTTGGTTTCGGGCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGAAGGAGGG
GATTCTGACGAATTGGCCGAAGTGGAAGCAGAACTGGATTCTGATTTGAAGGCTAATGGT
AAAACTACAAAAGATAACAGTAAGATTGAAGATGAAAAAAAGAAACAGAAAAGGCCATTC
CTCACACAATTCTTCTCTCCTATTTTTCTCAAGGCCTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAA
TTTGGTGACAAGAGTCAGCTTGCTACAATTGGTTTAGCCGCTGATGAAAACCCGTTTGGG
GTTGTCCTTGGTGGAGTTGTGGCACAGCTTGTGTGTACCTCTGCTGCTGTGATTGGAGGA
AAGAGCTTAGCTTCTCAGATATCCGAACGAATTGTTGCTCCTTCTGGTGGAGTGCTGTTC
ATTATCTTTGGCATCCAATCGTTTCTTACCTCTG

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR2AM13JQ 367 0 0
CTTGGTGGAGTTGTGGCACAGCTTGTGTGTACCTCTGCTGCTGTGATTGGAGGAAAGAGC
TTAGCTTCTCAGATATCCGAACGAATTGTTGCTCCTTCTGGTGGAGTGCTGTTCATTATC
TTTGGCATCCAATCGTTTCTTACCTCTGTTCAGGCCTAATGCTTCTTTCTGGGTTGTAGG
GAGTGCTGAAGATGACGATGAAGAACTCTGATATCAACACTTTCTTTAGATATGTAATCT
TGATACTAGATGTTTTACGCAAGTCATTACAAAACAAATCGGAAAGTTTATTAACCTTGA
AAAAAAACATTAAAAGGGGCGCTGAAGCAGCCATTTGACTTCAATAAAGTTCTGGTAATC
TTTGGTT

QA 1 367 1 367
DS 



AS 1 2

CO CL5082Contig1 1403 2 2 U
GGAGGGATTTGATCTTCTTCGCGTGATTTCGCTCTCATCAACAGCGATTCTTCTCCAATC
CACATCGATCCCGTCCTAAAAAACACACTTTAATTTCACTTGGATTGTATAGCTCTAAAC
AGCCTTCTCATTTTGTGACAATGGACCCTCAACATACCGGTGATTTGATGAAGCATTTGG
AGAAGCAGAATGAATTACTCAAGGAAACTCAGATGACCATGTCACATGAACTCCAAAAAC
TCATGGTGGAAGAAGAGATGATGATGCATAAACTCTGTGAGCTAATGGTTACTCAACGTA
GAAACATGAAGGAAATGAAGAAAACTCAGAATCTGTTGGAAGGAAAAGAAACAGTTGAAT
CTTCTGTTGTTACAGTCGAGGCCCAACAACGCCCACCCATCATATACCAATACAGCAGGA
GGAAGAGTAAGGCCCAGCAAGAAACGGCTCAGGTCTCCAAGGAATAAGTAACGGCTCAAG
TGGGATGTTTGTGTAAGAGCATGATTATCGGCGCTTCTTAATGGAGTTGCTTAGTAATAA
TGACCCAAAAAATAAATCAAAATTAGGGAAAAAGCTAAGGACGTGTCTTAATTAAGAACT
TTTCGACAACGTCCTTAAGGGGCACGTGGTGTAATGAGATAGGTTTACTCTTCCCCAATC
CTCTGAGACTTGATCTCTTCTCCCCCGTCCATAGCCAATTTTCTCCTCTTGATGCCGAAG
TATTCTTCCTCTGTGGGCACACGATTCATTTTGGCTCAAGCTCGAATCTGGGTTTAGTGT
AACAAAATCGATTTTAGTGAGAAAAATCTGGTGAGAGGAACCGTGGAGGATTCGTAAGGA
GGGAAATATGAGGAGGCGGAGGGTAGCTAGAAGGAGATTGTTGAGTTGGATATAGCTTCT
CCTTGCTTATTTCTCTGTTGCTGGATTGGTTCTATTCATGGTTCAGCATCGTTATCAACA
ACAAGATCCATTTCAGCTAACACTTGCAAGTGAAACAGATAACATCACGTATGAAGAGAG
AAATCTTGGTTTTGAATGATGATTATAATATGTAGAGTGATGGTTTGCACGGCTATAGAA
ATGTTCCCTTTGAAGTTGCTTTTGTGTTGATGATTTGGATTATATAGGAAGCTTTCTTGG
AGAAGATTAGGTCCGAGAAGTCAAGTTCAATGTTTTTTTCATTCTCGGTTGGAAAATTTA
TCAAGTGGCAGTTCAACTGAACAAGTTTGATTATATACTTTCAAGCAAGTTGAGCGATGA
CTGCAAAAGCTAAGATGTAGAGTAAATTACCATACTCTCAAGTTCACTGTTTTTTTTTGG
AAATCATTAGTTCTCTTGCTTACTGTTTTTTTATTTTGTAATGATACTAAGAAACAACAC
AAGTATCTACCAATAATCTGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG66TF U 1
AF RR2AG66JQ C 620
BS 1 768 RR2AG66TF
BS 769 1403 RR2AG66JQ

RD RR2AG66TF 768 0 0
GGAGGGATTTGATCTTCTTCGCGTGATTTCGCTCTCATCAACAGCGATTCTTCTCCAATC
CACATCGATCCCGTCCTAAAAAACACACTTTAATTTCACTTGGATTGTATAGCTCTAAAC
AGCCTTCTCATTTTGTGACAATGGACCCTCAACATACCGGTGATTTGATGAAGCATTTGG
AGAAGCAGAATGAATTACTCAAGGAAACTCAGATGACCATGTCACATGAACTCCAAAAAC
TCATGGTGGAAGAAGAGATGATGATGCATAAACTCTGTGAGCTAATGGTTACTCAACGTA
GAAACATGAAGGAAATGAAGAAAACTCAGAATCTGTTGGAAGGAAAAGAAACAGTTGAAT
CTTCTGTTGTTACAGTCGAGGCCCAACAACGCCCACCCATCATATACCAATACAGCAGGA
GGAAGAGTAAGGCCCAGCAAGAAACGGCTCAGGTCTCCAAGGAATAAGTAACGGCTCAAG
TGGGATGTTTGTGTAAGAGCATGATTATCGGCGCTTCTTAATGGAGTTGCTTAGTAATAA
TGACCCAAAAAATAAATCAAAATTAGGGAAAAAGCTAAGGACGTGTCTTAATTAAGAACT
TTTCGACAACGTCCTTAAGGGGCACGTGGTGTAATGAGATAGGTTTACTCTTCCCCAATC
CTCTGAGACTTGATCTCTTCTCCCCCGTCCATAGCCAATTTTCTCCTCTTGATGCCGAAG
TATTCTTCCTCTGTGGGCACACGATTCATTTTGGCTCAAGCTCGAATC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2AG66JQ 784 0 0
GGGCACGTGGTGTAATGAGATAGGTTTACTCTTCCCCAATCCTCTGAGACTTGATCTCTT
CTCCCCCGTCCATAGCCAATTTTCTCCTCTTGATGCCGAAGTATTCTTCCTCTGTGGGCA
CACGATTCATTTTGGCTCAAGCTCGAATCTGGGTTTAGTGTAACAAAATCGATTTTAGTG
AGAAAAATCTGGTGAGAGGAACCGTGGAGGATTCGTAAGGAGGGAAATATGAGGAGGCGG
AGGGTAGCTAGAAGGAGATTGTTGAGTTGGATATAGCTTCTCCTTGCTTATTTCTCTGTT
GCTGGATTGGTTCTATTCATGGTTCAGCATCGTTATCAACAACAAGATCCATTTCAGCTA
ACACTTGCAAGTGAAACAGATAACATCACGTATGAAGAGAGAAATCTTGGTTTTGAATGA
TGATTATAATATGTAGAGTGATGGTTTGCACGGCTATAGAAATGTTCCCTTTGAAGTTGC
TTTTGTGTTGATGATTTGGATTATATAGGAAGCTTTCTTGGAGAAGATTAGGTCCGAGAA
GTCAAGTTCAATGTTTTTTTCATTCTCGGTTGGAAAATTTATCAAGTGGCAGTTCAACTG
AACAAGTTTGATTATATACTTTCAAGCAAGTTGAGCGATGACTGCAAAAGCTAAGATGTA
GAGTAAATTACCATACTCTCAAGTTCACTGTTTTTTTTTGGAAATCATTAGTTCTCTTGC
TTACTGTTTTTTTATTTTGTAATGATACTAAGAAACAACACAAGTATCTACCAATAATCT
GTAT

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL5083Contig1 1128 2 2 U
GGAGAACAAGACAAAACACGAGGAGAGGATCGTTCCTGGAAAGAAAAAAAAATTCATTTT
GCACTTTTCCGACCAAACACTGAGAGAACCTTCCAATCGATGAATTAGTCAACTGATTCT
CTTCATACAGGAAAAATTTTCTCATTGAATTTTTCTCCGTGCTTCTGGATTTTCTCAGGC
TTCTTTATATCAAAAGGACAAGTGTTAGCTTCTGGTTTTTGCGGGAGGCAGAGAGACATC
TTCTGTGGAATTAGCTTTCTGTTAGCTTGGAAACATGGGAGCTCTCTGTTGTTGCTTTCA
AGTTGATCTCTTTGAGAGTTATGCGAATCCAAACACTTCAATGTCGAGGAACTGTCCTTG
CCTTAACTGCTTCCTCCAGAGTTTCATGGGTTTGTATGCATCGATATTTAACAGAGTTGG
TATGCATCCAATACCTTCAACTGTGGAAGCTTCCTCAGTGATGAATTCCACAACTTCATT
TGATGACTCATCTCTCTCTGATGTCTATCATTCTCCTCCTAGGCCCTTGCCTTACGATGC
TGATCCTAGGTATTTCCGTTTTGCTAAGGGATCAAGCCATTCGGGTGGAGAAACAGAACC
GTTAAGAGGTGATACTGAAATGAGCTCTGAAATTTTGGGAGGTGGAGCCAAACGGAACAA
TTCTGGTTACGAAGATGGTTCGAAAGAAGCGTATTCGAAAGGTTCACCCACCAATGAAAA
GTCGAAGATAGAGCTTTCTTATGCAGATTCGGATGATGAGGATATCTGTCCAACCTGCCT
TGATGATTACACGCCAGAGAATCCGAAGATAATCACCAAATGCTCTCACCATTTCCACCT
TAGCTGTATTTATGAATGGATGGAGAGAAGTGAAACCTGCCCCGTCTGTGGAAAGGTGAT
GGCATTTGATGAAACTGGCTAAGAGGATAAAAAGTGGCAGTGAGTCTTTGCATGATAAAA
TAATACAGAGATCACTTGTATATATAAATCTTCTGTCAAAGTTGTGAATATCCAGATGCC
TTTTACAGTAAATATGAGAGTGTGATTGCTCTTAGTTTTTATCGACTCATTATTTATATA
CATTTTTTTCTTCAATAAGATTACTGGAATGAAAACGCAGGTTGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH11TF U 1
AF RR2EH11JQ C 514
BS 1 637 RR2EH11TF
BS 638 1128 RR2EH11JQ

RD RR2EH11TF 637 0 0
GGAGAACAAGACAAAACACGAGGAGAGGATCGTTCCTGGAAAGAAAAAAAAATTCATTTT
GCACTTTTCCGACCAAACACTGAGAGAACCTTCCAATCGATGAATTAGTCAACTGATTCT
CTTCATACAGGAAAAATTTTCTCATTGAATTTTTCTCCGTGCTTCTGGATTTTCTCAGGC
TTCTTTATATCAAAAGGACAAGTGTTAGCTTCTGGTTTTTGCGGGAGGCAGAGAGACATC
TTCTGTGGAATTAGCTTTCTGTTAGCTTGGAAACATGGGAGCTCTCTGTTGTTGCTTTCA
AGTTGATCTCTTTGAGAGTTATGCGAATCCAAACACTTCAATGTCGAGGAACTGTCCTTG
CCTTAACTGCTTCCTCCAGAGTTTCATGGGTTTGTATGCATCGATATTTAACAGAGTTGG
TATGCATCCAATACCTTCAACTGTGGAAGCTTCCTCAGTGATGAATTCCACAACTTCATT
TGATGACTCATCTCTCTCTGATGTCTATCATTCTCCTCCTAGGCCCTTGCCTTACGATGC
TGATCCTAGGTATTTCCGTTTTGCTAAGGGATCAAGCCATTCGGGTGGAGAAACAGAACC
GTTAAGAGGTGATACTGAAATGAGCTCTGAAATTTTG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2EH11JQ 615 0 0
TCCTCCTAGGCCCTTGCCTTACGATGCTGATCCTAGGTATTTCCGTTTTGCTAAGGGATC
AAGCCATTCGGGTGGAGAAACAGAACCGTTAAGAGGTGATACTGAAATGAGCTCTGAAAT
TTTGGGAGGTGGAGCCAAACGGAACAATTCTGGTTACGAAGATGGTTCGAAAGAAGCGTA
TTCGAAAGGTTCACCCACCAATGAAAAGTCGAAGATAGAGCTTTCTTATGCAGATTCGGA
TGATGAGGATATCTGTCCAACCTGCCTTGATGATTACACGCCAGAGAATCCGAAGATAAT
CACCAAATGCTCTCACCATTTCCACCTTAGCTGTATTTATGAATGGATGGAGAGAAGTGA
AACCTGCCCCGTCTGTGGAAAGGTGATGGCATTTGATGAAACTGGCTAAGAGGATAAAAA
GTGGCAGTGAGTCTTTGCATGATAAAATAATACAGAGATCACTTGTATATATAAATCTTC
TGTCAAAGTTGTGAATATCCAGATGCCTTTTACAGTAAATATGAGAGTGTGATTGCTCTT
AGTTTTTATCGACTCATTATTTATATACATTTTTTTCTTCAATAAGATTACTGGAATGAA
AACGCAGGTTGAATC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL5084Contig1 295 2 3 U
GGAACAATCATTACAATGGAACTGATGATGAGCAATATAGCCTTACAAGAACCTTAAGAG
CACAACACTATATTCTATCTGCGATTTCAACCCTGAGGAGGCGCATCTTCCATCAGACTG
ACAAGCGGCCTTACAATTACTAGCTAACTAAAAGTGTTAACAAATAACTGCGATTGTTTT
TTTGCCAACATGACAAGGAATCGGAATTTATGCGGCCCTTTACTTGAAACAGTGATATCC
CCGCTTGGTTTTGCTTCAAGAATGAAGGCTTCTTTTGTTGACTTAAAGTTCACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2DH52JQ U 1
AF RR2D776JQ U 141
BS 1 150 RR2DH52JQ
BS 151 151 RR2D776JQ
BS 152 295 RR2DH52JQ

RD RR2DH52JQ 295 0 0
GGAACAATCATTACAATGGAACTGATGATGAGCAATATAGCCTTACAAGAACCTTAAGAG
CACAACACTATATTCTATCTGCGATTTCAACCCTGAGGAGGCGCATCTTCCATCAGACTG
ACAAGCGGCCTTACAATTACTAGCTAACTAGAAGTGTTAACAAATAACTGCGATTGTTTT
TTTGCCAACATGACAAGGAATCGGAATTTATGCGGCCCTTTACTTGAAACAGTGATATCC
CCGCTTGGTTTTGCTTCAAGAATGAAGGCTTCTTTTGTTGACTTAAAGTTCACTG

QA 1 295 1 295
DS 

RD RR2D776JQ 154 0 0
TAC
CTAACTAAAAGTGTTAACAAATAACTGCGATTGTTTTTTTGCCAACATGACAAGGAATCG
GAATTTATGCGGCCCTTTACTTGAAACAGTGATATCCCCGCTTGGTTTTGCTTCAAGAAT
GAAGGCTTCTTTTGTTGACTTAAAGTTCACT

QA 4 154 4 154
DS 



AS 1 2

CO CL5085Contig1 1136 2 2 U
GGATATGAGAGTAAAAGCAGAGGCGAGAGGGGCTGGTAATAACGATCCAAAGCTGAACAC
GCCTAGGTCAAAACATTCTGCTACAGAACAACGGAGGAGGAGCAAAATCAATGATAGGTT
TCAAATGTTGAGACAGTTAATACCTAACAGCGACCAAAAGCGGGACAAGGCCTCCTTCTT
GCTAGAGGTTATCGAGTATATTCAGTTCTTACAGGAGAAAACAAGCAAGTACGAGACTCC
TTACCAAGGATGGAATCAAGGACCTGCCAAGCTATTGAATTGGCAGAGAAACAACCAGCA
GCTTGTCCCTGAAGGAACCGTTTCTTTTGCTCCAAAACTTGAACAAGAGAAGAATAACAT
TCCTGTCCTTGCAACAGCTGAAACACTGAACCGAGAAAGGTTTCCTTTGTCGGTTTAAAG
CAGCAGTCTATTCTCTCCTGTTATTGCGGGTAACCCCGTAACTGAGTTGCAAGCAAGAGT
CGCATCATCATCAGAGACCGCAGAACCAAACCCGAGTTCTCGGAGTCATACTCAGCCATT
GAAAGAAGAGGGTGATGATGAGGAAGGTTGCGAGGGTAACAACATCAGTATATCAAGTGT
TTACTCACAAGGATTAGTGAAAAGATTAAGAGAAGCATTGGAGAAATCAGGAGTGGACTT
AACAAAAACAAGCATCTCAGTCGAAATCGAACTTGCTAAACAATTATCTTCCTTCAAGAA
TCATGAAGTCTGTGACCCGGTTTCTCGAACGGGAAATGATAAGCAAACTCGGAAACCTAA
ACGTCTCAAGACGTACAACACAAGTTAAAAGTTTAAAAAAAAAACAGCGGAGTCGGGTAA
AACACCAAAGTTATATCATAGATATATAAATTCTTTTTTCTTCTTTTGTACATTGGAAAC
TATAGTATTGCGGGTCCATAATCTTTTGAGACCAAAGAGACTAGTGAGACCCGGGTTATG
CTAACCGCATTTTTAGACTGTAATCTCAAAAACTTCTTTGGGGGTTTCTTTCGAGGAATA
TCATTAATTAAGAGGAAGGCTTTCATTGTTTTACGTAAGCTTCCTGTATTTAGTGATGTC
ACTGTTCACTACTTTGTATCATCATCATCATCATCTCACACTGTTTACATTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX51TF U 1
AF RR2GX51JQ C 523
BS 1 646 RR2GX51TF
BS 647 1136 RR2GX51JQ

RD RR2GX51TF 646 0 0
GGATATGAGAGTAAAAGCAGAGGCGAGAGGGGCTGGTAATAACGATCCAAAGCTGAACAC
GCCTAGGTCAAAACATTCTGCTACAGAACAACGGAGGAGGAGCAAAATCAATGATAGGTT
TCAAATGTTGAGACAGTTAATACCTAACAGCGACCAAAAGCGGGACAAGGCCTCCTTCTT
GCTAGAGGTTATCGAGTATATTCAGTTCTTACAGGAGAAAACAAGCAAGTACGAGACTCC
TTACCAAGGATGGAATCAAGGACCTGCCAAGCTATTGAATTGGCAGAGAAACAACCAGCA
GCTTGTCCCTGAAGGAACCGTTTCTTTTGCTCCAAAACTTGAACAAGAGAAGAATAACAT
TCCTGTCCTTGCAACAGCTGAAACACTGAACCGAGAAAGGTTTCCTTTGTCGGTTTAAAG
CAGCAGTCTATTCTCTCCTGTTATTGCGGGTAACCCCGTAACTGAGTTGCAAGCAAGAGT
CGCATCATCATCAGAGACCGCAGAACCAAACCCGAGTTCTCGGAGTCATACTCAGCCATT
GAAAGAAGAGGGTGATGATGAGGAAGGTTGCGAGGGTAACAACATCAGTATATCAAGTGT
TTACTCACAAGGATTAGTGAAAAGATTAAGAGAAGCATTGGAGAAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2GX51JQ 614 0 0
GAGTCATACTCAGCCATTGAAAGAAGAGGGTGATGATGAGGAAGGTTGCGAGGGTAACAA
CATCAGTATATCAAGTGTTTACTCACAAGGATTAGTGAAAAGATTAAGAGAAGCATTGGA
GAAATCAGGAGTGGACTTAACAAAAACAAGCATCTCAGTCGAAATCGAACTTGCTAAACA
ATTATCTTCCTTCAAGAATCATGAAGTCTGTGACCCGGTTTCTCGAACGGGAAATGATAA
GCAAACTCGGAAACCTAAACGTCTCAAGACGTACAACACAAGTTAAAAGTTTAAAAAAAA
AACAGCGGAGTCGGGTAAAACACCAAAGTTATATCATAGATATATAAATTCTTTTTTCTT
CTTTTGTACATTGGAAACTATAGTATTGCGGGTCCATAATCTTTTGAGACCAAAGAGACT
AGTGAGACCCGGGTTATGCTAACCGCATTTTTAGACTGTAATCTCAAAAACTTCTTTGGG
GGTTTCTTTCGAGGAATATCATTAATTAAGAGGAAGGCTTTCATTGTTTTACGTAAGCTT
CCTGTATTTAGTGATGTCACTGTTCACTACTTTGTATCATCATCATCATCATCTCACACT
GTTTACATTTTTCC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL5086Contig1 1201 2 2 U
GAGAAGCGGTGGACATGATTCTTGATCCAAGAGAAAGTGAAAGGAATGTAGTAAATGAGG
CCCGGGAATACTACAAAGAAACTGGAGACATTGACGGGACTCTAAGGCAACTACCGCGAT
ACCTAGTTGCTGAAAGAGCTATTCTGCAGTGTCTGAAGAAATGTCCTGGGAACTACCTGC
AGGCTCTGAAAGGCATACCCAGAACTTTGAGAATGATGTATGTACATAGTTATCAAAGCT
ACTTATGGAACAATGCAGCAAGTCTGCGTGTCAAAAAATATGGCACCAACCAAGTTGTGT
TGGGGGATTTGGTAAGTACAAAGGTAGATGATGCGAAGAGAACCGTGGACAGTTTGACCT
CTGAACACAAGGAAAACAGCGACGAGGCATTGGATTGTGACCAATTAGATGATACTGCTG
TTGTTGATCTTCCAGGAGAAAGGAGTGATCTTGTTAAGGTTATAGGTATAGAAGACATAG
AAGCTGGAACTTACTCTGCCAGTGACATTGTCCTCCCTCTTCCTGGTTCCAGAGTTATTT
ACCCGTCCAATGACATTGCAAAAATTTTTCATGATTTAGCAAAGAAGGACGGTATCAGCC
TAACAGAGAGCATTCACGGTGTAAAGGAATTCTCAATAACTAGCATGACTGGTGGTTATA
GACGTGTTTTCCAGAAGCCAATTGACTTTGAATGGGAGTTACTGACTTACACTGACAGCA
ATAAACCATTGGCAGAGACGGACCTGGACAGGATAACCGTGGAAAAGCCGGTGGATAAAG
TTGAATCAGCTGAAGAAACTGAATCGATAAAATCCGATAGCAACCAACCAGAATCATGTG
AAACCGATTTGAAAGATGCAGAGCAGACACAGTTGGCTCTCAAAATGGCACTTACACTTC
CATCTTCTTGCTATGCAACAATGGCAATCAGAGAGCTGTTAAAGACGTCAACTTCTGTTG
CATATCATAAGACACTAAACTAGTGATTAACACACTGCTAAGAAGCCATCTACTCGACAT
CTTTGCTGATTGTGTTACTCTGTTTTAGTTGCCTCGAGTCTATTCAGAACTCTGTTGTCT
TCTTTTGTCATTTATCAAGGATATGATTTGGCAAATTTTGTCTGAAGTAAGCATCAAACC
GACAATGACAGTTGTAACTTCTTAAAATTCAACGTATCAGTTACAGAGACGTTAGCTACG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2CK80TF U 1
AF RR2CK80JQ C 526
BS 1 672 RR2CK80TF
BS 673 1201 RR2CK80JQ

RD RR2CK80TF 672 0 0
GAGAAGCGGTGGACATGATTCTTGATCCAAGAGAAAGTGAAAGGAATGTAGTAAATGAGG
CCCGGGAATACTACAAAGAAACTGGAGACATTGACGGGACTCTAAGGCAACTACCGCGAT
ACCTAGTTGCTGAAAGAGCTATTCTGCAGTGTCTGAAGAAATGTCCTGGGAACTACCTGC
AGGCTCTGAAAGGCATACCCAGAACTTTGAGAATGATGTATGTACATAGTTATCAAAGCT
ACTTATGGAACAATGCAGCAAGTCTGCGTGTCAAAAAATATGGCACCAACCAAGTTGTGT
TGGGGGATTTGGTAAGTACAAAGGTAGATGATGCGAAGAGAACCGTGGACAGTTTGACCT
CTGAACACAAGGAAAACAGCGACGAGGCATTGGATTGTGACCAATTAGATGATACTGCTG
TTGTTGATCTTCCAGGAGAAAGGAGTGATCTTGTTAAGGTTATAGGTATAGAAGACATAG
AAGCTGGAACTTACTCTGCCAGTGACATTGTCCTCCCTCTTCCTGGTTCCAGAGTTATTT
ACCCGTCCAATGACATTGCAAAAATTTTTCATGATTTAGCAAAGAAGGACGGTATCAGCC
TAACAGAGAGCATTCACGGTGTAAAGGAATTCTCAATAACTAGCATGACTGGTGGTTATA
GACGTGTTTTCC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2CK80JQ 676 0 0
GTTCCAGAGTTATTTACCCGTCCAATGACATTGCAAAAATTTTTCATGATTTAGCAAAGA
AGGACGGTATCAGCCTAACAGAGAGCATTCACGGTGTAAAGGAATTCTCAATAACTAGCA
TGACTGGTGGTTATAGACGTGTTTTCCAGAAGCCAATTGACTTTGAATGGGAGTTACTGA
CTTACACTGACAGCAATAAACCATTGGCAGAGACGGACCTGGACAGGATAACCGTGGAAA
AGCCGGTGGATAAAGTTGAATCAGCTGAAGAAACTGAATCGATAAAATCCGATAGCAACC
AACCAGAATCATGTGAAACCGATTTGAAAGATGCAGAGCAGACACAGTTGGCTCTCAAAA
TGGCACTTACACTTCCATCTTCTTGCTATGCAACAATGGCAATCAGAGAGCTGTTAAAGA
CGTCAACTTCTGTTGCATATCATAAGACACTAAACTAGTGATTAACACACTGCTAAGAAG
CCATCTACTCGACATCTTTGCTGATTGTGTTACTCTGTTTTAGTTGCCTCGAGTCTATTC
AGAACTCTGTTGTCTTCTTTTGTCATTTATCAAGGATATGATTTGGCAAATTTTGTCTGA
AGTAAGCATCAAACCGACAATGACAGTTGTAACTTCTTAAAATTCAACGTATCAGTTACA
GAGACGTTAGCTACGC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL5087Contig1 1125 2 4 U
GGAAGCAAAAGCTTACGTGCGCACCTGCTCTGCTCTGCTCCGAAGGAGACTCAACACTCG
TCGCCATTTTCTTCGCTCTCCAAAGCAATGTATTCAAGAAGAGAGCTGGATGATCTGGAG
TACAGATACTACTCTGAAATGAAAGATGGCTCTTGCAAGAACTTAATGGCTACTGAAGAG
CAAAACAAAGCTGATAAAGAAATGACGAGATTGGCAAAACAGCAACAGAGGGAGAAAGAT
GAGTTACGTGGGAGAGTAAAAAATCTGGAGAAGAAACTTGATGATGATCTGGCACTGGAG
CTGAAGATAGAGAGAATGAGGGGTGGACTGCAGGTGATGAGACACATGGAAGATCCTGAT
ATGAAGGAAGAGATTGAAAAGACTAAAGAAAAACTCAAGGAGAAGGAAGAGGAGTCTGAA
TACCAAGAGTCACTCTATCAAGCTCTTGTTGTTAAACATTGCTACACTAACGATGAGCTT
CAGGATGCTCGCAAGGCTTTGATCAGATCAATGCAAGAGTTGGGAGTAAGTGGTCAGATC
TCAGTGAAGAGAATGGGAGCTTTGGATGAGAAACCATTCCAAAAACTAGCTAAAGAGAGA
TATCCGGCAGAAGACGCTGATGTAGAAGCTGCAAAGCTTTGTTCCTTATGGGACGACCAC
TTGAGAGACTTGGCTTGGCATCCGATTAAGGTCATCCAGATAGACGGAATCCACAAGGAG
GTGCTGAATGAGGAAGATGAGAAGCTGAAGGAACTGAAGAAAGAGATGGGTGATGAAGTG
TTTGAAGCAGCGACACAAGCGCTTATGGAGAGGAACGAGTATAATGGAAGTGGGAGGTAC
ATAGTGCCTGAACTTTGGAACTTTAAAGAAGGAAGAAAGGGGACTTTCAAAGAAGGTGTG
GTTTGTTTCATGAACTTGTGGAAGCATTTGAAGCCAAAGCCGAAGGGTAAGTAGCAAGCA
AATAAAAATAAAAGAAAATGAGACCGAGGTTGTTGCTAATAAGTTGATACTCCTTTTAAG
ACTAAGTGAGTTTTTATGATTTTTTTACCCCAAGACAAGAGTAGAGAGACAATTATTAAG
GTGACATTTTGGACGCAGATAATTAATTTATGTGCTTGGTTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX23TF U 1
AF RR2BX23JQ C 552
BS 1 690 RR2BX23TF
BS 691 691 RR2BX23JQ
BS 692 706 RR2BX23TF
BS 707 1125 RR2BX23JQ

RD RR2BX23TF 714 0 0
GGAAGCAAAAGCTTACGTGCGCACCTGCTCTGCTCTGCTCCGAAGGAGACTCAACACTCG
TCGCCATTTTCTTCGCTCTCCAAAGCAATGTATTCAAGAAGAGAGCTGGATGATCTGGAG
TACAGATACTACTCTGAAATGAAAGATGGCTCTTGCAAGAACTTAATGGCTACTGAAGAG
CAAAACAAAGCTGATAAAGAAATGACGAGATTGGCAAAACAGCAACAGAGGGAGAAAGAT
GAGTTACGTGGGAGAGTAAAAAATCTGGAGAAGAAACTTGATGATGATCTGGCACTGGAG
CTGAAGATAGAGAGAATGAGGGGTGGACTGCAGGTGATGAGACACATGGAAGATCCTGAT
ATGAAGGAAGAGATTGAAAAGACTAAAGAAAAACTCAAGGAGAAGGAAGAGGAGTCTGAA
TACCAAGAGTCACTCTATCAAGCTCTTGTTGTTAAACATTGCTACACTAACGATGAGCTT
CAGGATGCTCGCAAGGCTTTGATCAGATCAATGCAAGAGTTGGGAGTAAGTGGTCAGATC
TCAGTGAAGAGAATGGGAGCTTTGGATGAGAAACCATTCCAAAAACTAGCTAAAGAGAGA
TATCCGGCAGAAGACGCTGATGTAGAAGCTGCAAAGCTTTGTTCCTTATGGGACGACCAC
TTGAGAGACTTGGCTTGGCATCCGATTAAG*TCATCCAGATAGACG
AATCCACA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2BX23JQ 574 0 0
AATGGGAGCTTTGGATGAGAAACCATTCCAAAAACTAGCTAAAGAGAGATATCCGGCAGA
AGAGGGTGATGTAGAAGCTGCAAAGCTTTGTTCCTTATGGGACGACCACTTGAGAGACTT
GGCTTGGCATCCGATTAAGGTCATCCAGATAGACGGAATCCACAAGGAGGTGCTGAATGA
GGAAGATGAGAAGCTGAAGGAACTGAAGAAAGAGATGGGTGATGAAGTGTTTGAAGCAGC
GACACAAGCGCTTATGGAGAGGAACGAGTATAATGGAAGTGGGAGGTACATAGTGCCTGA
ACTTTGGAACTTTAAAGAAGGAAGAAAGGGGACTTTCAAAGAAGGTGTGGTTTGTTTCAT
GAACTTGTGGAAGCATTTGAAGCCAAAGCCGAAGGGTAAGTAGCAAGCAAATAAAAATAA
AAGAAAATGAGACCGAGGTTGTTGCTAATAAGTTGATACTCCTTTTAAGACTAAGTGAGT
TTTTATGATTTTTTTACCCCAAGACAAGAGTAGAGAGACAATTATTAAGGTGACATTTTG
GACGCAGATAATTAATTTATGTGCTTGGTTTACG

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL5088Contig1 1237 2 8 U
GGATCAGCTCTTTCTTACATCACTGTTCCAATATTTCTCACTTTATACTAGAGTACGTAA
AGATCCTATGGCTTTAAAAACATGGAAGCCATTCCTAACTGTTATTTCTCTACAATTCGG
ATACGCTGGACTATCGATCATAGCGAAGTTTGCACTGGACCGAGGCATGAGCCCTCACGT
TCTTGCTGCTTATCGTCATATCTTAGCTACAATTTTCATTGCTCCATTTGCTTTTTTCTT
GGATAGAAAAGTGAGGCCAAAGATGACGCTGCCCATCTTCTTGAAGATAGCGTTGCTTGG
GTTATTGGAACCAACAATTGATCAGAACTTATACTACACTGGTATGAAGTACACTTCGGC
AACTTTCACAGCTGCAATGACCAATGTTCTTCCTGCCTTTGCCTTTCTTATGGCATGGAT
CTTCAGGCTTGAAAAGGTTAACATCAAGATTCATCTAATCCCGGTGTCACACCAGATCTT
ACAAAAGGCGCTCTCCTCATTGCTATCGGTTGCATCTGTTGGGCCGGTTTTGTCAATCTC
CAAGCAATCACGCTTAAATCGTACCCGGTGGAGCTATCCTTGACAGCTTACATATGCTTA
ATGGGGTCTATTGAAAGCACTATTGTGGCACTTTTTATTGAAAGGGGAAATCCTTCTGCT
TGGGCTATTCAACTGGATTCAAAATTGCTAGCCGCTGTTTATGGTGGAGTAATATGTTCA
GGTGTTGGTTACTATGTTCAAGGAGTAATAATGAAAACTAGAGGACCGGTGTTTGTGACT
GCTTTCAATCCACTAAGCATGGTCATTGTTGCGATTTTGGGCTCTATTATTCTTGCTGAG
GTTATGTATCTTGGAAGGATTCTTGGAGCAATAGTGATAGTTCTTGGGCTCTATTCGGTT
TTGTGGGGCAAAAGCAAAGACGAACCATTTAATTCGTTTTCAGACATGGACACAGAGCTC
CCACGTAGTACTCCACAATTTGTGACATTCTCGTTGAAAGCAAACACAGAAACGGACACC
AAGGATGCCAGTGTTGTGATCTCAAGGGCTAACACCAGTGAATCAGTCTAAATAAAACAA
AGCACTAACGGGGATTTTAAAATATAATAAACGAAAACAATGAGTCCGATTTCCAAATAC
AGGATCGGTACTGATTGGTAGAGTCAAGAGTTTGTATTGCTAATTTTGGCTTTGTTAAAT
TTTGTATCCGACTATAATATACGAAATGTTTGGCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN91TF U 1
AF RR2EN91JQ C 632
BS 1 711 RR2EN91TF
BS 712 712 RR2EN91JQ
BS 713 721 RR2EN91TF
BS 722 722 RR2EN91JQ
BS 723 756 RR2EN91TF
BS 757 757 RR2EN91JQ
BS 758 787 RR2EN91TF
BS 788 1237 RR2EN91JQ

RD RR2EN91TF 788 0 0
GGATCAGCTCTTTCTTACATCACTGTTCCAATATTTCTCACTTTATACTAGAGTACGTAA
AGATCCTATGGCTTTAAAAACATGGAAGCCATTCCTAACTGTTATTTCTCTACAATTCGG
ATACGCTGGACTATCGATCATAGCGAAGTTTGCACTGGACCGAGGCATGAGCCCTCACGT
TCTTGCTGCTTATCGTCATATCTTAGCTACAATTTTCATTGCTCCATTTGCTTTTTTCTT
GGATAGAAAAGTGAGGCCAAAGATGACGCTGCCCATCTTCTTGAAGATAGCGTTGCTTGG
GTTATTGGAACCAACAATTGATCAGAACTTATACTACACTGGTATGAAGTACACTTCGGC
AACTTTCACAGCTGCAATGACCAATGTTCTTCCTGCCTTTGCCTTTCTTATGGCATGGAT
CTTCAGGCTTGAAAAGGTTAACATCAAGATTCATCTAATCCCGGTGTCACACCAGATCTT
ACAAAAGGCGCTCTCCTCATTGCTATCGGTTGCATCTGTTGGGCCGGTTTTGTCAATCTC
CAAGCAATCACGCTTAAATCGTACCCGGTGGAGCTATCCTTGACAGCTTACATATGCTTA
ATGGGGTCTATTGAAAGCACTATTGTGGCACTTTTTATTGAAAGGGGAAATCCTTCTGCT
TGGGCTATTCAACTGGATTCAAAATTGCTAGCCGCTGTTTATGGTGGAGTA*TATGTTCA
G*TGTTGGTTACTATGTTCAAGGAGTAATAATGAAA*CTAGAGGACCGGTGTTTGTGACT
GCTTTCA
T

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2EN91JQ 606 0 0
TTTTTATTGAAAGGGGAAATCCTTCTGCTTGGGCTATTCAACTGGATTCAAAATTGCTAG
CCGCTGTTTATGGTGGAGTAATATGTTCAGGTGTTGGTTACTATGTTCAAGGAGTAATAA
TGAAAACTAGAGGACCGGTGTTTGTGACTGCTTTCAATCCACTAAGCATGGTCATTGTTG
CGATTTTGGGCTCTATTATTCTTGCTGAGGTTATGTATCTTGGAAGGATTCTTGGAGCAA
TAGTGATAGTTCTTGGGCTCTATTCGGTTTTGTGGGGCAAAAGCAAAGACGAACCATTTA
ATTCGTTTTCAGACATGGACACAGAGCTCCCACGTAGTACTCCACAATTTGTGACATTCT
CGTTGAAAGCAAACACAGAAACGGACACCAAGGATGCCAGTGTTGTGATCTCAAGGGCTA
ACACCAGTGAATCAGTCTAAATAAAACAAAGCACTAACGGGGATTTTAAAATATAATAAA
CGAAAACAATGAGTCCGATTTCCAAATACAGGATCGGTACTGATTGGTAGAGTCAAGAGT
TTGTATTGCTAATTTTGGCTTTGTTAAATTTTGTATCCGACTATAATATACGAAATGTTT
GGCATT

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL5089Contig1 874 2 2 U
GACTGCACGCGCATTGGAGTACTTGCATGAAGTTTGCTCACCGTCTATAGTCCACAAGAA
CATCAAATCAGCTAATATTTTACTTGACGCAGAGCTGAACCCTCACCTCTCAGACGCTGG
TCTCGCTACCTTCCTCCCTACTGCTAATGAGCTACTGAGCCAAAACGATGAAGGATACAG
CGCACCAGAAGTATCAATGTCAGGCCAATACTCACTGAAGAGCGATGTGTACAGTTTTGG
AGTAGTGATGCTTGAGCTTTTAACCGGAAGAAAACCATTTGACAGCACAAGGTCAAGATC
GGAGCAGTCATTGGTGAGATGGGCAACACCTCAGCTACATGACATTGATGCATTGGGGAA
AATGGTTGATCCAGCTCTCAAAGGGCTTTACCCTGTTAAATCTCTATCCCGGTTTGCAGA
TGTTATCGCACTCTGCGTCCAGCCGGAGCCAGAGTTTAGACCACCGATGTCTGAAGTGGT
GCAAGCGTTGGTTGTGCTTGTGCAGAGAGCTAACATGAGCAAGAGAACTGTCGGAGTCGG
GTCTGGTGGTAGCTCTGGAGCTAATGACTACATGTAAATTCTTTACCTGAGAAACCAAAA
GACGAACAAAATCAACAAAACAGAAGTTTTTTCTTTTTTTTTTGTTCTTCATAAAACTGA
GAGAATAACGACAACAACAACAACAAACTTTACGCATTGTACAATCCCATGTTTCCTTGT
AATATGTTCCCAAGTCTGTAGCTTTTTTTAGATTCCGACACGATGAACAAAACCATGTCC
TTTTGTGAGTTTTTGGAGCCAAGACTGTCTTTATCCATATTCTGTATTATTTTTGTTTCT
CAATTATTTTCTTGTTAATAAATCGAATTACAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E635TF U 1
AF RR2E635JQ C 435
BS 1 575 RR2E635TF
BS 576 874 RR2E635JQ

RD RR2E635TF 575 0 0
GACTGCACGCGCATTGGAGTACTTGCATGAAGTTTGCTCACCGTCTATAGTCCACAAGAA
CATCAAATCAGCTAATATTTTACTTGACGCAGAGCTGAACCCTCACCTCTCAGACGCTGG
TCTCGCTACCTTCCTCCCTACTGCTAATGAGCTACTGAGCCAAAACGATGAAGGATACAG
CGCACCAGAAGTATCAATGTCAGGCCAATACTCACTGAAGAGCGATGTGTACAGTTTTGG
AGTAGTGATGCTTGAGCTTTTAACCGGAAGAAAACCATTTGACAGCACAAGGTCAAGATC
GGAGCAGTCATTGGTGAGATGGGCAACACCTCAGCTACATGACATTGATGCATTGGGGAA
AATGGTTGATCCAGCTCTCAAAGGGCTTTACCCTGTTAAATCTCTATCCCGGTTTGCAGA
TGTTATCGCACTCTGCGTCCAGCCGGAGCCAGAGTTTAGACCACCGATGTCTGAAGTGGT
GCAAGCGTTGGTTGTGCTTGTGCAGAGAGCTAACATGAGCAAGAGAACTGTCGGAGTCGG
GTCTGGTGGTAGCTCTGGAGCTAATGACTACATGT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2E635JQ 440 0 0
GCGTCCAGCCGGAGCCAGAGTTTAGACCACCGATGTCTGAAGTGGTGCAAGCGTTGGTTG
TGCTTGTGCAGAGAGCTAACATGAGCAAGAGAACTGTCGGAGTCGGGTCTGGTGGTAGCT
CTGGAGCTAATGACTACATGTAAATTCTTTACCTGAGAAACCAAAAGACGAACAAAATCA
ACAAAACAGAAGTTTTTTCTTTTTTTTTTGTTCTTCATAAAACTGAGAGAATAACGACAA
CAACAACAACAAACTTTACGCATTGTACAATCCCATGTTTCCTTGTAATATGTTCCCAAG
TCTGTAGCTTTTTTTAGATTCCGACACGATGAACAAAACCATGTCCTTTTGTGAGTTTTT
GGAGCCAAGACTGTCTTTATCCATATTCTGTATTATTTTTGTTTCTCAATTATTTTCTTG
TTAATAAATCGAATTACAAA

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 2

CO CL5090Contig1 1084 2 4 U
GGGCTTACACTAGAAGGTCAACCAAACTTTTCATTTGTCTCCCTCCAAACGTTCACAACA
TGAGAAGTCATCACACGCATTCTTCTTTTTCCTTATCCTTCATCTTCTTCATTTTCCTAT
TCTTCAATATCTTCTCATTCTCCACACCAAAACTCGAACCCGTAAATCCTGGTCCAATCG
GATCATACCATAAACGTAAACAACCAGTCTCAGCTATTCTGGTTTTTGGAGATTCAACCG
TGGATCCTGGCAATAACAACTACATCGAAACAGCATTCAAGTGTAACTTTCCTCCTTATG
GGCTTGATTTCAAAAACAGCATTCCCACCGGTAGATTTTGTAATGGTCGACTGGTGACAG
ATTTCGTCGGTTCATACATCGGGGTGAAAGAATTTGTGCCGGCATATTTGGACCCAAATC
TTGGAATAAATGACCTAATGAGTGGAGTTAGCTTTGCTTCAGCTGGTTCTGGATTTGATC
CCCTCACTCCAACCATTGGTAACGTGATAGACATACCAACTCAACTGGAGCATTTCAGAG
AATACAAGAGAAAATTGGAGAGTAAAATTGGAAAACAAAATATGGAAAAACACATAAAAG
AAGCTATATCTTGTGTTAGTGCAGGAACCAACGATTTCGTCATAAACTATTTTTTGGTTC
CAATTAGAAGGAAACGTTTCACTATTGAAGCTTATCAGCAATTCGTTACTTACAATCTCA
AGCAACTTATCCAGGGTTTGAAGAAGTGAGCAGGGGATGTTGTGGAATTGGATACTTAGA
GGCATCGGTCTTGTGCAATCCAAAGTCATATTTGTGCTCTAATACATCTGCTTATGTCTT
TTTTGATTCCATCCATCCAAGTGAGAAGACTTACTTTATCCTCTTTAAGGCACTCCGACC
AATTATTGATTCCTTTCTGGGTTCTTTCTGAAAACTATAATTAGTTAATACATCTGATTG
TCACTATTAGCTAATTGATCAGTTGATCCTAAATACACTGATATCATGTTTGGTGATGAA
ATGTAGTTATGGCTTATGTAATAATAATACAAATTGAAATCAAATGAAACTTATAAGTTA
CTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2DX05TF U 1
AF RR2DX05JQ C 474
BS 1 589 RR2DX05TF
BS 590 590 RR2DX05JQ
BS 591 620 RR2DX05TF
BS 621 1084 RR2DX05JQ

RD RR2DX05TF 620 0 0
GGGCTTACACTAGAAGGTCAACCAAACTTTTCATTTGTCTCCCTCCAAACGTTCACAACA
TGAGAAGTCATCACACGCATTCTTCTTTTTCCTTATCCTTCATCTTCTTCATTTTCCTAT
TCTTCAATATCTTCTCATTCTCCACACCAAAACTCGAACCCGTAAATCCTGGTCCAATCG
GATCATACCATAAACGTAAACAACCAGTCTCAGCTATTCTGGTTTTTGGAGATTCAACCG
TGGATCCTGGCAATAACAACTACATCGAAACAGCATTCAAGTGTAACTTTCCTCCTTATG
GGCTTGATTTCAAAAACAGCATTCCCACCGGTAGATTTTGTAATGGTCGACTGGTGACAG
ATTTCGTCGGTTCATACATCGGGGTGAAAGAATTTGTGCCGGCATATTTGGACCCAAATC
TTGGAATAAATGACCTAATGAGTGGAGTTAGCTTTGCTTCAGCTGGTTCTGGATTTGATC
CCCTCACTCCAACCATTGGTAACGTGATAGACATACCAACTCAACTGGAGCATTTCAGAG
AATACAAGAGAAAATTGGAGAGTAAAATTGGAAAACAAAATATGGAAAA*CACATAAAAG
AAGCTATATCTTGTGTTAGT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2DX05JQ 611 0 0
TTTGATCCCCTCACTCCAACCATTGGTAACGTGATAGACATACCAACTCAACTGGAGCAT
TTCAGAGAATACAAGAGAAAATTGGAGAGTAAAATTGGAAAACAAAATATGGAAAAACAC
ATAAAAGAAGCTATATCTTGTGTTAGTGCAGGAACCAACGATTTCGTCATAAACTATTTT
TTGGTTCCAATTAGAAGGAAACGTTTCACTATTGAAGCTTATCAGCAATTCGTTACTTAC
AATCTCAAGCAACTTATCCAGGGTTTGAAGAAGTGAGCAGGGGATGTTGTGGAATTGGAT
ACTTAGAGGCATCGGTCTTGTGCAATCCAAAGTCATATTTGTGCTCTAATACATCTGCTT
ATGTCTTTTTTGATTCCATCCATCCAAGTGAGAAGACTTACTTTATCCTCTTTAAGGCAC
TCCGACCAATTATTGATTCCTTTCTGGGTTCTTTCTGAAAACTATAATTAGTTAATACAT
CTGATTGTCACTATTAGCTAATTGATCAGTTGATCCTAAATACACTGATATCATGTTTGG
TGATGAAATGTAGTTATGGCTTATGTAATAATAATACAAATTGAAATCAAATGAAACTTA
TAAGTTACTAG

QA 1 611 1 611
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5092Contig1 948 2 2 U
GGTCTGATCTTCGCTTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTATCATCGCTGGAAATTGAC
GTTCCATGGCAAGAGTTTCGTTCAAGAATTCTCTGAAAGCTCTCGAAGCAGATATCCAAC
ACGCTAACACTGTAGCTTTAGATTATCCTCGGGAGAAGGATGGAGCTCGTGTTCAGATGA
GGCTATCTTACAACCCGGCAGCTCAGTTTTTACTCTTTCTCGTCCAATGGACTGATTGCC
ACCTCGCCGGTGCACTCGGTTTGCTCAGAGTTCTCATTTACATGACCTATGCGGATGGGA
AGACCACAATGTCGGTTTACGAGAGAAAAACCAGTATTAAAGATTTCTATGCTGTGATAT
TTCCATCGCTGTTGCAACTAGAAAGGGGCATCACAGACGTGGATGACCGCAAACAGAAAG
AGGTCTGCAAAGTACGGTACAGGAACAAAGAGGAGATGGAAAGAGTAAAGCTCTCGGAGA
TTGACGTGGAGAGAGACGAAGAGTGTGGTATATGTATGGAGATGAACAGCATGGTTGTTC
TCCCCAACTGTACACATTCTTTATGCATCAAGTGTTACCGTGACTGGCATGGGAGGTCAG
AGTCATGCCCTTTCTGCAGGGACAGTCTGAAGAGAGTGAACTCAGGGGACTTGTGGATGT
TGATGGAGAAATCAGATACGGTCAGTCTCCATACAGTGGAGAGGGAGAATAAGAAGAGGC
TGTTTGTGTACATGGAGAAGCTTCCTCTAGTGGTTCCAGATCAAGTGTTTGCTTCTTCTC
CATACGATTGCCATGTCAAGTTAGTAAATATTAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGCTTTTATA
AAAGGCTAAACCGGTTCTGGTAAACCTTTATATGAATGTATATATAATGTTTTTAGAGTA
GTAGTAAGTAAGTAATAATAATTTAGTAACCATTCTCTTGGGGAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD49TF U 1
AF RR2DD49JQ C 164
BS 1 304 RR2DD49TF
BS 305 948 RR2DD49JQ

RD RR2DD49TF 304 0 0
GGTCTGATCTTCGCTTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTATCATCGCTGGAAATTGAC
GTTCCATGGCAAGAGTTTCGTTCAAGAATTCTCTGAAAGCTCTCGAAGCAGATATCCAAC
ACGCTAACACTGTAGCTTTAGATTATCCTCGGGAGAAGGATGGAGCTCGTGTTCAGATGA
GGCTATCTTACAACCCGGCAGCTCAGTTTTTACTCTTTCTCGTCCAATGGACTGATTGCC
ACCTCGCCGGTGCACTCGGTTTGCTCAGAGTTCTCATTTACATGACCTATGCGGATGGGA
AGAC

QA 1 304 1 304
DS 

RD RR2DD49JQ 785 0 0
AGCTCGTGTTCAGATGAGGCTATCTTACAACCCGGCAGCTCAGTTTTTACTCTTTCTCGT
CCAATGGACTGATTGCCACCTCGCCGGTGCACTCGGTTTGCTCAGAGTTCTCATTTACAT
GACCTATGCGGATGGGAAGACCACAATGTCGGTTTACGAGAGAAAAACCAGTATTAAAGA
TTTCTATGCTGTGATATTTCCATCGCTGTTGCAACTAGAAAGGGGCATCACAGACGTGGA
TGACCGCAAACAGAAAGAGGTCTGCAAAGTACGGTACAGGAACAAAGAGGAGATGGAAAG
AGTAAAGCTCTCGGAGATTGACGTGGAGAGAGACGAAGAGTGTGGTATATGTATGGAGAT
GAACAGCATGGTTGTTCTCCCCAACTGTACACATTCTTTATGCATCAAGTGTTACCGTGA
CTGGCATGGGAGGTCAGAGTCATGCCCTTTCTGCAGGGACAGTCTGAAGAGAGTGAACTC
AGGGGACTTGTGGATGTTGATGGAGAAATCAGATACGGTCAGTCTCCATACAGTGGAGAG
GGAGAATAAGAAGAGGCTGTTTGTGTACATGGAGAAGCTTCCTCTAGTGGTTCCAGATCA
AGTGTTTGCTTCTTCTCCATACGATTGCCATGTCAAGTTAGTAAATATTAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAGCTTTTATAAAAGGCTAAACCGGTTCTGGTAAACCTTTATATGAATGTATAT
ATAATGTTTTTAGAGTAGTAGTAAGTAAGTAATAATAATTTAGTAACCATTCTCTTGGGG
AAGTC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL5093Contig1 1006 2 2 U
GGAGGCAGCTTTCCCAGAAGGAAGCAGACATCAAGATGATGTGCGCTGCTGAGGTTCACC
TCGGAACCAAGAATTGCAACTACCAAATGGAGCGTTACGTCTTCAAGAGGCGCAACGACG
GTATTTACATCTTTAACCTTGGCAAAACATGGGACAAGCTGATGATGGCTGCACGAGTTA
TCGTTGCTATCGAGAACCCGCAAGACATCATTGTGCAGTCCGCTAGGCCCTATGGTCAGA
GAGCTGTCTTGAAGTTCGCTCAGTACACTGGAGCCAACGCCATTGCTGGGAGGCACACTC
CCGGTACATTCACCAATCAGATGCAGACATCGTTCAGTGAGCCCAGGCTTTTGATTCTTA
CTGATCCACGTACCGACCACCAGCCAATCAAGGAAGGTGCTTTGGGAAACATTCCAATCA
TTGCTTTCTGTGACACTGACTCTCCCATGAGGTTTGTCGACATTGGCATCCCCGCCAACA
ACAAGGGCAAGCACAGCATTGGTTGTCTTTTCTGGCTTCTTGCTCGCATGGTCCTTCAGA
TGCGTGGAACCATTCGCCCTGCTCAGAAGTGGGATGTCATGGTTGATCTGTTCTTCTACA
GAGAGCCAGAGGAGACCAAGCCAGAGGATGAGGATGAAGTTGCACCTCACGCAGAGTATG
GACTACCTGCTCCCGAGTATGCAGGTGGTGAACAATGGACCACTGCTGCCATCCCTGATG
CTGCATGGCCAGGAGAAGCTCAGTCGCCAATTTCAGGTGCTCCTGCCGGTGGTTCATGGA
ACGATTCCGTTGTTCCAGCAGCAGAAGGTGGATGGGACGCGGCTGTGCCACCCACAAATG
CAGTGACCAATTGGGAATAAAGTTGATAGCCTTTTAAAATGGCTATTGACATTGTTTTTT
TTGTTACTCTTGGGATTCGAAGAGCTCACTGTTTTTTTTTCCCCTCTTTTAAGACAAGAC
ACACTTAGATTACTCTTGTTTTGCACCCTTTTTTTGTTGAATGGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D682TF U 1
AF RR2D682JQ C 528
BS 1 680 RR2D682TF
BS 681 1006 RR2D682JQ

RD RR2D682TF 680 0 0
GGAGGCAGCTTTCCCAGAAGGAAGCAGACATCAAGATGATGTGCGCTGCTGAGGTTCACC
TCGGAACCAAGAATTGCAACTACCAAATGGAGCGTTACGTCTTCAAGAGGCGCAACGACG
GTATTTACATCTTTAACCTTGGCAAAACATGGGACAAGCTGATGATGGCTGCACGAGTTA
TCGTTGCTATCGAGAACCCGCAAGACATCATTGTGCAGTCCGCTAGGCCCTATGGTCAGA
GAGCTGTCTTGAAGTTCGCTCAGTACACTGGAGCCAACGCCATTGCTGGGAGGCACACTC
CCGGTACATTCACCAATCAGATGCAGACATCGTTCAGTGAGCCCAGGCTTTTGATTCTTA
CTGATCCACGTACCGACCACCAGCCAATCAAGGAAGGTGCTTTGGGAAACATTCCAATCA
TTGCTTTCTGTGACACTGACTCTCCCATGAGGTTTGTCGACATTGGCATCCCCGCCAACA
ACAAGGGCAAGCACAGCATTGGTTGTCTTTTCTGGCTTCTTGCTCGCATGGTCCTTCAGA
TGCGTGGAACCATTCGCCCTGCTCAGAAGTGGGATGTCATGGTTGATCTGTTCTTCTACA
GAGAGCCAGAGGAGACCAAGCCAGAGGATGAGGATGAAGTTGCACCTCACGCAGAGTATG
GACTACCTGCTCCCGAGTAT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2D682JQ 479 0 0
ATGGTCCTTCAGATGCGTGGAACCATTCGCCCTGCTCAGAAGTGGGATGTCATGGTTGAT
TTGTTTTTCTACAGAGAGCCAGAGGAGACCAAGCCAGAGGATGAGGATGAAGTTGCACCT
CAGGCAGAGTATGGACTACCTGCTCCCGAGTATGCAGGTGGTGAACAATGGACCACTGCT
GCCATCCCTGATGCTGCATGGCCAGGAGAAGCTCAGTCGCCAATTTCAGGTGCTCCTGCC
GGTGGTTCATGGAACGATTCCGTTGTTCCAGCAGCAGAAGGTGGATGGGACGCGGCTGTG
CCACCCACAAATGCAGTGACCAATTGGGAATAAAGTTGATAGCCTTTTAAAATGGCTATT
GACATTGTTTTTTTTGTTACTCTTGGGATTCGAAGAGCTCACTGTTTTTTTTTCCCCTCT
TTTAAGACAAGACACACTTAGATTACTCTTGTTTTGCACCCTTTTTTTGTTGAATGGAA

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 2

CO CL5094Contig1 1218 2 2 U
GCCTTCCCTTGACACCATCTCCAGAGTGAGGAACGAGAAGGCGAGGAGGTACTTGACAAG
CATGAGGAAAAAGCCACCTATTCCGTTTACTCAGAAGTTTCCAAACGCAGATCCTTTGTC
TTTGAAGTTGTTAGAGAGGCTTCTTGCTTTCAATCCAAAAGACCGACCAACTGCTGAAGA
GGCACTTGCTGATCCGTATTTCAAAGGATTGGCGAAAGTGGAGAGGGAGCCTTCGTGTCA
GCCCATTACGAAGATGGAGTTTGAGTTCGAGAGAAGAAAAGTCACTAAAGAGGATATCAG
AGAACTAATCTCTAGAGAGATACTTGAGTACCATCCTCAGCTGCTAAAAGATCACATGAA
CGGAGCTGATAAAACGAATTTTCTCTATCCAAGTGCTGTTGATCAGTTTAGGAGACAGTT
TGCACATCTTGAAGAAAACAGCGGCAAAACTGGCCCTGTTGCACCTCTAGAAAGGAAACA
TGCTTCTCTTCCCAGATCAACAGTTGTACACTCAACCACAGTTGCAAGAGGAGGACAACC
GAAATTTATGAACAACACAAACACATTGAGCCCTGAAACTACTCAAAACATTCCTCTTAA
TCATCATCATGCTGCAGCAGTACAAGCACATCAAAGAAACCTCTCAGCTGCAAAACCAAG
CGCATTCATGGGTCCAGTGGCGCCTTTTGACGACGGTAGAAGCAGTAGAGATGCATATGA
CCCGAGATCATTCATCCGCAGCACTACTAGTAGTACTCTACCCTTTCAACAACAGTCTGC
ATCAACAGTCGCCATGGGAAGGCAACAAGAGAGGAGAACAACAACAACAACAACCATGGA
GTCTGAAAAGCAGGCAAGACAAATACATCAGTACAATAGATACGTCGCACCAGATGTAGC
CATCAACATAGATAGCAACCCGTTTGTCATGTCTCGAACCACTGGAATGATGCACAAGGC
GGAAAACATGAGTGTTGATCACCGGATCATAATAGATACGAATCTGTTACAGGCGACAGC
AGGAATAGGAGTTGCTGCGGCGGCTGCAGCAGCTGCTCCTGGTGGTTCTGCTCACCGGAA
AGTTGGAGCTGTTCGGTACGGCATGTCAAAGATGTACTAGAAGTCTAGATCACACAGTAA
CATCGTATGTTTTTCTATCATAAAAGAAAAATTGTCTTTTAGACACAAAACTATAAATAT
GAAATTTCTTCTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR69TF U 1
AF RR2DR69JQ C 468
BS 1 608 RR2DR69TF
BS 609 1218 RR2DR69JQ

RD RR2DR69TF 608 0 0
GCCTTCCCTTGACACCATCTCCAGAGTGAGGAACGAGAAGGCGAGGAGGTACTTGACAAG
CATGAGGAAAAAGCCACCTATTCCGTTTACTCAGAAGTTTCCAAACGCAGATCCTTTGTC
TTTGAAGTTGTTAGAGAGGCTTCTTGCTTTCAATCCAAAAGACCGACCAACTGCTGAAGA
GGCACTTGCTGATCCGTATTTCAAAGGATTGGCGAAAGTGGAGAGGGAGCCTTCGTGTCA
GCCCATTACGAAGATGGAGTTTGAGTTCGAGAGAAGAAAAGTCACTAAAGAGGATATCAG
AGAACTAATCTCTAGAGAGATACTTGAGTACCATCCTCAGCTGCTAAAAGATCACATGAA
CGGAGCTGATAAAACGAATTTTCTCTATCCAAGTGCTGTTGATCAGTTTAGGAGACAGTT
TGCACATCTTGAAGAAAACAGCGGCAAAACTGGCCCTGTTGCACCTCTAGAAAGGAAACA
TGCTTCTCTTCCCAGATCAACAGTTGTACACTCAACCACAGTTGCAAGAGGAGGACAACC
GAAATTTATGAACAACACAAACACATTGAGCCCTGAAACTACTCAAAACATTCCTCTTAA
TCATCATC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2DR69JQ 751 0 0
TAGAAAGGAAACATGCTTCTCTTCCCAGATCAACAGTTGTACACTCAACCACAGTTGCAA
GAGGAGGACAACCGAAATTTATGAACAACACAAACACATTGAGCCCTGAAACTACTCAAA
ACATTCCTCTTAATCATCATCATGCTGCAGCAGTACAAGCACATCAAAGAAACCTCTCAG
CTGCAAAACCAAGCGCATTCATGGGTCCAGTGGCGCCTTTTGACGACGGTAGAAGCAGTA
GAGATGCATATGACCCGAGATCATTCATCCGCAGCACTACTAGTAGTACTCTACCCTTTC
AACAACAGTCTGCATCAACAGTCGCCATGGGAAGGCAACAAGAGAGGAGAACAACAACAA
CAACAACCATGGAGTCTGAAAAGCAGGCAAGACAAATACATCAGTACAATAGATACGTCG
CACCAGATGTAGCCATCAACATAGATAGCAACCCGTTTGTCATGTCTCGAACCACTGGAA
TGATGCACAAGGCGGAAAACATGAGTGTTGATCACCGGATCATAATAGATACGAATCTGT
TACAGGCGACAGCAGGAATAGGAGTTGCTGCGGCGGCTGCAGCAGCTGCTCCTGGTGGTT
CTGCTCACCGGAAAGTTGGAGCTGTTCGGTACGGCATGTCAAAGATGTACTAGAAGTCTA
GATCACACAGTAACATCGTATGTTTTTCTATCATAAAAGAAAAATTGTCTTTTAGACACA
AAACTATAAATATGAAATTTCTTCTTTTTTT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5097Contig1 746 2 2 U
GGACTAACAAAAGAAAAGGAAAAAAGAATGATGAGTGAAGATCAATAGGCAAAGACACAC
TCCGAGGAACCGGGTGAATACTGGTAAGCTGCGTACTTCCGTGAAGCGGCTGGCCAAACC
CAACTACTTTTATCGACTGATATTACATATCTCATGTAAGGTATAATAGAAAAGGGCAAA
GCAGAACTAGTGTGTGTTCCGTTCTTGATTTTACAAGTGGTGTCTAGTGTGGTTATTTTT
TGGCTTTGGTCTCTTACCGGTATCCACCACCATATTGTTGTTGTTGAGGATTGTAACCGC
CTTGACCCATCATCGGATTATAGTTGTTGTTGTTGCCTGGCATGTTCTGACCAGGGACCA
TCCCTGGGTTTTGTGGTTGCATTGGATAGCCTTGGCCATATCCTCCTCCCATGTTCATGT
TCATGTTCATGTTCATGTCTGGTCCCATTCCCATACCCATACCCATGGGTTGTTGGTTTT
GGTTCATACCCCCATACCCACCAACACCCATTCCCCCACCGCTCATGGGCATGCCAGAGC
CTACCATTGGGTTTGGTGGAGGTCTCATAGCAGTTGCACCTGCACGCCCTAACCCAATTC
CTGATCCCATTGCTTTACCCATGTTGATAGTCGATGTCGGTGCTGGTGTGTTTGTAGGTT
TCTCAAGCCGTTTCTCCCTCCTGTTGATCGCCTCAAAGTCAACTCCTATGTCTGCCAATG
GGTTTGTTTTAGCTGCACATAAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV12TF U 1
AF RR2DV12JQ C 486
BS 1 636 RR2DV12TF
BS 637 746 RR2DV12JQ

RD RR2DV12TF 636 0 0
GGACTAACAAAAGAAAAGGAAAAAAGAATGATGAGTGAAGATCAATAGGCAAAGACACAC
TCCGAGGAACCGGGTGAATACTGGTAAGCTGCGTACTTCCGTGAAGCGGCTGGCCAAACC
CAACTACTTTTATCGACTGATATTACATATCTCATGTAAGGTATAATAGAAAAGGGCAAA
GCAGAACTAGTGTGTGTTCCGTTCTTGATTTTACAAGTGGTGTCTAGTGTGGTTATTTTT
TGGCTTTGGTCTCTTACCGGTATCCACCACCATATTGTTGTTGTTGAGGATTGTAACCGC
CTTGACCCATCATCGGATTATAGTTGTTGTTGTTGCCTGGCATGTTCTGACCAGGGACCA
TCCCTGGGTTTTGTGGTTGCATTGGATAGCCTTGGCCATATCCTCCTCCCATGTTCATGT
TCATGTTCATGTTCATGTCTGGTCCCATTCCCATACCCATACCCATGGGTTGTTGGTTTT
GGTTCATACCCCCATACCCACCAACACCCATTCCCCCACCGCTCATGGGCATGCCAGAGC
CTACCATTGGGTTTGGTGGAGGTCTCATAGCAGTTGCACCTGCACGCCCTAACCCAATTC
CTGATCCCATTGCTTTACCCATGTTGATAGTCGATG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2DV12JQ 261 0 0
ATACCCCCATACCCACCAACACCCATTCCCCCACCGCTCATGGGCATGCCAGAGCCTACC
ATTGGGTTTGGTGGAGGTTTCATAGCAGTTGCACCTGCACGCCCTAACCCAGTTCCTGAT
CCCATTGCTTTACCCATGTTGATAGTCGATGTCGGTGCTGGTGTGTTTGTAGGTTTCTCA
AGCCGTTTCTCCCTCCTGTTGATCGCCTCAAAGTCAACTCCTATGTCTGCCAATGGGTTT
GTTTTAGCTGCACATAAGTTG

QA 1 261 1 261
DS 



AS 1 2

CO CL5098Contig1 1315 2 6 U
GGGCGTTTCCTCTGTCTTAATTATATCACAGCTCATTTTTTGCGATAGATAACGTTCCTT
TCAAAGACATGGAGAACATCAACGTTTATTCACCGGAATGTTCACCGGAAAACGTCTCAC
CACCACCACCACCTCCTCCTCCGGTAAAATCAAACTCCTGTACGAAATTGAAGAAGTCAA
CGGTACAAAAATGCAGTAGCTTTGTTTCTAAAGCTACAAGAGATGCATGGGATCGTATGT
TCGACGAAGCTCATGGAGCTGATGTTCTGATCCATACGGATGATAATGGCTTGATCTACG
CGCATTCTAACGTCATCGGAATGGCTTCAGATGTAATTAGAGGAATGATGAAGCAAGACA
AGAGAAAACCTCATCGCAAATCAATCTCAATACTCGGTGTTCCTCACGATGCTGTTCGCG
TTTTCATTCGATTTTTATACTCTTCTTGCTACGAGAAACAAGACATGGAAGACTTTGCGA
TACATCTTCTTGTACTATCACACGTCTACGTGGTTCCGCATCTGAAACGAGTATGCGAGT
CACACTTCGAAAACACTCTGCTCAACAAAGAGAATGTGATCGATGTGTTTCAGCTAGCTC
TTCTCTGCGACGCTCCTCGTCTCGCTCTTCTCTGCCACAGAATGATACTAAACAGCTTCG
AAGAAGTCTCTACTTCTGAAGGATGGCAAGCCATGAAACAAAGCCACCCTAGTCTCCAGA
AAGAGCTCTTACGCTCTGTCTCCTACGAGCTTAATGTAAAGAAGCAAAGAAGCAGGAAAC
AGAAAGAGATTCAGACATACACTCAGCTGTACGATGCAATGGAAGCTTTTGTCCACATAT
GTAGAGACGGATGCAGAGAGATCGGTCCAACAAAGGTCGAAAACCCTCACGTCTCTTGCG
GGTTTCAAGCCTGCGGCGGTTTGGAGAAGCTGTTGAAACATATGGCCGGATGCAAGCTGA
GATCAATCCCCGGTGGTTGCAGCCGTTGTAAGAGAATGTGGCAGCTTCTTGAGCTTCATT
CGCGTATCTGCGTCGACTCGGAGCAGTGCAGAGTCCCTCTCTGCGGTGACTTCAAGGAGA
GGATGAAGAAACAGAGCAGGAAAGATGAGAAACGATGGAAACTTTTGGTGAAGAATGTTT
TGAGCACCAAGAGGATTGGAGGGTCTCCATACTTTTTGCAGGCTATTGATGTTACTCTAT
GACAACATTATTATTATTATTTCATTTCATTATAAGATTTAGAGATTGCATATAAATGTA
TACAGTACAGATTCTTTATTAATAGAGAAGAAAGAGATTCAAAATTCAGTGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK93TF U 1
AF RR2BK93JQ C 578
BS 1 651 RR2BK93TF
BS 652 652 RR2BK93JQ
BS 653 681 RR2BK93TF
BS 682 682 RR2BK93JQ
BS 683 730 RR2BK93TF
BS 731 1315 RR2BK93JQ

RD RR2BK93TF 730 0 0
GGGCGTTTCCTCTGTCTTAATTATATCACAGCTCATTTTTTGCGATAGATAACGTTCCTT
TCAAAGACATGGAGAACATCAACGTTTATTCACCGGAATGTTCACCGGAAAACGTCTCAC
CACCACCACCACCTCCTCCTCCGGTAAAATCAAACTCCTGTACGAAATTGAAGAAGTCAA
CGGTACAAAAATGCAGTAGCTTTGTTTCTAAAGCTACAAGAGATGCATGGGATCGTATGT
TCGACGAAGCTCATGGAGCTGATGTTCTGATCCATACGGATGATAATGGCTTGATCTACG
CGCATTCTAACGTCATCGGAATGGCTTCAGATGTAATTAGAGGAATGATGAAGCAAGACA
AGAGAAAACCTCATCGCAAATCAATCTCAATACTCGGTGTTCCTCACGATGCTGTTCGCG
TTTTCATTCGATTTTTATACTCTTCTTGCTACGAGAAACAAGACATGGAAGACTTTGCGA
TACATCTTCTTGTACTATCACACGTCTACGTGGTTCCGCATCTGAAACGAGTATGCGAGT
CACACTTCGAAAACACTCTGCTCAACAAAGAGAATGTGATCGATGTGTTTCAGCTAGCTC
TTCTCTGCGACGCTCCTCGTCTCGCTCTTCTCTGCCACAGAATGATACTAA*CAGCTTCG
AAGAAGTCTCTACTTCTGAAG*ATGGCAAGCCATGAAACAAAGCCACCCTAGTCTCCAGA
AAGAGCTCTT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2BK93JQ 738 0 0
GATCGATGTGTTTCAGCTAGCTCTTCTCTGCGACGCTCCTCGTCTCGCTCTTCTCTGCCA
CAGAATGATACTAAACAGCTTCGAAGAAGTCTCTACTTCTGAAGGATGGCAAGCCATGAA
ACAAAGCCACCCTAGTCTCCAGAAAGAGCTCTTACGCTCTGTCTCCTACGAGCTTAATGT
AAAGAAGCAAAGAAGCAGGAAACAGAAAGAGATTCAGACATACACTCAGCTGTACGATGC
AATGGAAGCTTTTGTCCACATATGTAGAGACGGATGCAGAGAGATCGGTCCAACAAAGGT
CGAAAACCCTCACGTCTCTTGCGGGTTTCAAGCCTGCGGCGGTTTGGAGAAGCTGTTGAA
ACATATGGCCGGATGCAAGCTGAGATCAATCCCCGGTGGTTGCAGCCGTTGTAAGAGAAT
GTGGCAGCTTCTTGAGCTTCATTCGCGTATCTGCGTCGACTCGGAGCAGTGCAGAGTCCC
TCTCTGCGGTGACTTCAAGGAGAGGATGAAGAAACAGAGCAGGAAAGATGAGAAACGATG
GAAACTTTTGGTGAAGAATGTTTTGAGCACCAAGAGGATTGGAGGGTCTCCATACTTTTT
GCAGGCTATTGATGTTACTCTATGACAACATTATTATTATTATTTCATTTCATTATAAGA
TTTAGAGATTGCATATAAATGTATACAGTACAGATTCTTTATTAATAGAGAAGAAAGAGA
TTCAAAATTCAGTGTTCT

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL5099Contig1 1035 2 2 U
GATTCATTGAGGCGCAAGAAGATCATCTCTTTCGCAGCGGCTGATTCCTTTTCAGGTTCA
GCTTTTGTGCCGTTGAAGACGTTGTTTCACACGCTTCCTCTATCAATAGCCTATCTTATG
TACATGCTAGCTTCTATGGCGTCTGTCAGAGGGGTTAATGTTCCCATGTACACCACGCTT
AGGCGTACCACTGTGGCGTTTACCATGGTGATTGAGTATATTCTCACAGGTCAGAGATAT
ACTCGGTCTATCATCGGAAGTGTTGGCGTTATCATCTTTGGAGCGTTTTTCGCTGGAGCG
AGAGACTTGTCATTCGACTTTTATGGATATGCTATTGTCTTCTTAGCCAACATAACAACA
GCAGTGTATCTAGCAACTATCGCCCGGATTGGGAAATCAAGTGGCTTGAATAGCTTTGGC
CTCATGTGGTGCAATGGTATCATATGCGGACCTATATTGATGGTTTGGACGTTTATGAGC
GGTGACTTGGAGAAGACAATTAGCTTTCCTTACCTCTTTTCTCCTGGTTTCTTGGTTGTG
TTACTCTGCTCGTGTGTGCTGGCTTTCTTCTTAAACTACAGCATTTTTCTTAACACCACT
CTCAACTCCGCTCTCACGCAGACAATTTGTGGCAATATGAAGGATTTATTTACGGTTGGG
CTAGGCTGGATGGTCTTTGGTGGACTCCCATTCGACCTGATGAATGTGATTGGGCAGTTT
CTTGGTTTCTTAGGCTCTGGTTTATATGCATATTATAAGATCATTGGGAAGTAACTACTA
CTCCATAACCAAAGAAGAGCTAATAAATAACAGGAGTGGCCATCATAAAGGGAAAGAAAC
CAAGGGAAAGCCTTAGTTCAAGGAGAAGTTGTTAGACCATTAATTTTCAGCTTTGGTTAT
TTTGCAGGTGAGTTAGAAGAGTAGTATTAATATTTTAATAATGTGAGGCATGATTTTTCG
AACTTGTGTTACTCAACAAGGCCAACAGTTTTTTTTTCTCTCACTTTGGGACTACTTATT
TACTCATTCTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW21TF U 1
AF RR2GW21JQ C 508
BS 1 651 RR2GW21TF
BS 652 1035 RR2GW21JQ

RD RR2GW21TF 651 0 0
GATTCATTGAGGCGCAAGAAGATCATCTCTTTCGCAGCGGCTGATTCCTTTTCAGGTTCA
GCTTTTGTGCCGTTGAAGACGTTGTTTCACACGCTTCCTCTATCAATAGCCTATCTTATG
TACATGCTAGCTTCTATGGCGTCTGTCAGAGGGGTTAATGTTCCCATGTACACCACGCTT
AGGCGTACCACTGTGGCGTTTACCATGGTGATTGAGTATATTCTCACAGGTCAGAGATAT
ACTCGGTCTATCATCGGAAGTGTTGGCGTTATCATCTTTGGAGCGTTTTTCGCTGGAGCG
AGAGACTTGTCATTCGACTTTTATGGATATGCTATTGTCTTCTTAGCCAACATAACAACA
GCAGTGTATCTAGCAACTATCGCCCGGATTGGGAAATCAAGTGGCTTGAATAGCTTTGGC
CTCATGTGGTGCAATGGTATCATATGCGGACCTATATTGATGGTTTGGACGTTTATGAGC
GGTGACTTGGAGAAGACAATTAGCTTTCCTTACCTCTTTTCTCCTGGTTTCTTGGTTGTG
TTACTCTGCTCGTGTGTGCTGGCTTTCTTCTTAAACTACAGCATTTTTCTTAACACCACT
CTCAACTCCGCTCTCACGCAGACAATTTGTGGCAATATGAAGGATTTATTT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2GW21JQ 528 0 0
CCTTACCTCTTTTCTCCTGGTTTCTTGGTTGTGTTACTCTGCTCGTGTGTGCTGGCTTTC
TTCTTAAACTACAGCATTTTTCTTAACACCACTCTCAACTCCGCTCTCACGCAGACAATT
TGTGGCAATATGAAGGATTTATTTACGGTTGGGCTAGGCTGGATGGTCTTTGGTGGACTC
CCATTCGACCTGATGAATGTGATTGGGCAGTTTCTTGGTTTCTTAGGCTCTGGTTTATAT
GCATATTATAAGATCATTGGGAAGTAACTACTACTCCATAACCAAAGAAGAGCTAATAAA
TAACAGGAGTGGCCATCATAAAGGGAAAGAAACCAAGGGAAAGCCTTAGTTCAAGGAGAA
GTTGTTAGACCATTAATTTTCAGCTTTGGTTATTTTGCAGGTGAGTTAGAAGAGTAGTAT
TAATATTTTAATAATGTGAGGCATGATTTTTCGAACTTGTGTTACTCAACAAGGCCAACA
GTTTTTTTTTCTCTCACTTTGGGACTACTTATTTACTCATTCTTGTTT

QA 1 528 1 528
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5101Contig1 1356 2 2 U
GGAACGCCTTCATCTTCTTCATCTCTGCTCTCCTGCTTCGTCGTCCTCCCTCCCCTCTCA
TTTCGTTCGCCGGCGTTAACGAGCTTAGTTCGACGATCGTACGGATTGTAAATTTACATA
ACAGTGTATAAATGTCGGTGAGCAATTCCTTGAAGAAGCTCTCGTCTTGTGTTCTTATTG
ATCTCGATGGAACCCTAATCAACACAGATGGTGTAGTGGGTGATATATTGAGGAAGTATT
TAAGTAAATATGGGAAGCAGTGGGATGGAATAGAAGCGCTTAAGATAGTAGGCAAGACTC
CTTTAGAAGCTGCGACTACTATCGTTGAGGATTATGGACTTCCTTGTGGTGTTGATGAGT
TCAATTCTGAGTTCTACCCTTTGTTCTCTGCTCAGATGGATAAGATCAAGTCCCTTCCAG
GTGCTAATAGGTTGATTAGGCATTTGAAAGGGCATGGTGTACCTATGGCCTTGGCTTCTA
ATTCCTCTAGGGCTAATGTTGAATCCAAGATCTCTTTTCATCAAGGCTGGAAGGAATGTT
TCTCGGTTATTGTTGGTAGTGATGAAGTTTCCAAAGGGAAGCCTTCTCCTGATATTTTTC
TTGAAGCAGCGAGAAAGTTGAATAAAGATCCAGGAGAGTGTTTGGTTATTGAAGATTCTG
TGCCTGGTGTTTTGGCTGGTAAAGCTGCTGGGGCTAAAGTGATTGCTGTTCCTTCTCTGC
CTAAACAAACACATCTTTATACATCTGCAGACGAAGTCATCAATTCTCTGCTTGACTTAA
AACCTGAAAAATGGGGTCTTCCTCCGTTTCAAGATTGGATAGAGAACACTTTACCAATTG
ATCCTTGGCGTATTGGAGGTCCAGTTATCAAAGGATTTGGCCGTGGCTCTAAAGTACTCG
GAATCCCCACAGCAAACTTGTCAACGGAGGATTACGCGGAGGAGCTAGTGGAGCATCCTT
CGGGAGTGTACTTTGGTTGGGCAGGGTTAGCAACTAGAGGTGTCTTTAAAATGGTCATGA
GCATTGGTTGGAATCCTTATTTCAACAATACCGAGAAAACTATTGAGCCATGGTTGCTTC
ACGATTTCACTGAAGATTTCTATGGAGAAGAGCTACGTCTTATAATTGTTGGCTATATAC
GTCCTGAGGCTAACTTTCCTTCACTGGAGAGTCTAGTAGCAAAGATTCACGAGGACAGGG
AAGTCGCAGAGAAAGCTCTTGATCTTCCATCGTATGCTAAGTTTAAGGATGATCCTTACC
TGACTAAATATGATTAAAGTCATTTATGTAAAGAATCAAAAACTCTTGTTTTTTTTCTCA
CATTCTTGATTATGAATTGATTTAATAATCAAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D512TF U 1
AF RR2D512JQ C 634
BS 1 775 RR2D512TF
BS 776 1356 RR2D512JQ

RD RR2D512TF 775 0 0
GGAACGCCTTCATCTTCTTCATCTCTGCTCTCCTGCTTCGTCGTCCTCCCTCCCCTCTCA
TTTCGTTCGCCGGCGTTAACGAGCTTAGTTCGACGATCGTACGGATTGTAAATTTACATA
ACAGTGTATAAATGTCGGTGAGCAATTCCTTGAAGAAGCTCTCGTCTTGTGTTCTTATTG
ATCTCGATGGAACCCTAATCAACACAGATGGTGTAGTGGGTGATATATTGAGGAAGTATT
TAAGTAAATATGGGAAGCAGTGGGATGGAATAGAAGCGCTTAAGATAGTAGGCAAGACTC
CTTTAGAAGCTGCGACTACTATCGTTGAGGATTATGGACTTCCTTGTGGTGTTGATGAGT
TCAATTCTGAGTTCTACCCTTTGTTCTCTGCTCAGATGGATAAGATCAAGTCCCTTCCAG
GTGCTAATAGGTTGATTAGGCATTTGAAAGGGCATGGTGTACCTATGGCCTTGGCTTCTA
ATTCCTCTAGGGCTAATGTTGAATCCAAGATCTCTTTTCATCAAGGCTGGAAGGAATGTT
TCTCGGTTATTGTTGGTAGTGATGAAGTTTCCAAAGGGAAGCCTTCTCCTGATATTTTTC
TTGAAGCAGCGAGAAAGTTGAATAAAGATCCAGGAGAGTGTTTGGTTATTGAAGATTCTG
TGCCTGGTGTTTTGGCTGGTAAAGCTGCTGGGGCTAAAGTGATTGCTGTTCCTTCTCTGC
CTAAACAAACACATCTTTATACATCTGCAGACGAAGTCATCAATTCTCTGCTTGA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2D512JQ 723 0 0
GAGAGTGTTTGGTTATTGAAGATTCTGTGCCTGGTGTTTTGGCTGGTAAAGCTGCTGGGG
CTAAAGTGATTGCTGTTCCTTCTCTGCCTAAACAAACACATCTTTATACATCTGCAGACG
AAGTCATCAATTCTCTGCTTGACTTAAAACCTGAAAAATGGGGTCTTCCTCCGTTTCAAG
ATTGGATAGAGAACACTTTACCAATTGATCCTTGGCGTATTGGAGGTCCAGTTATCAAAG
GATTTGGCCGTGGCTCTAAAGTACTCGGAATCCCCACAGCAAACTTGTCAACGGAGGATT
ACGCGGAGGAGCTAGTGGAGCATCCTTCGGGAGTGTACTTTGGTTGGGCAGGGTTAGCAA
CTAGAGGTGTCTTTAAAATGGTCATGAGCATTGGTTGGAATCCTTATTTCAACAATACCG
AGAAAACTATTGAGCCATGGTTGCTTCACGATTTCACTGAAGATTTCTATGGAGAAGAGC
TACGTCTTATAATTGTTGGCTATATACGTCCTGAGGCTAACTTTCCTTCACTGGAGAGTC
TAGTAGCAAAGATTCACGAGGACAGGGAAGTCGCAGAGAAAGCTCTTGATCTTCCATCGT
ATGCTAAGTTTAAGGATGATCCTTACCTGACTAAATATGATTAAAGTCATTTATGTAAAG
AATCAAAAACTCTTGTTTTTTTTCTCACATTCTTGATTATGAATTGATTTAATAATCAAA
CTC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5104Contig1 1254 2 2 U
GGTGGCTGGAATCCTCACCATTACCATGTTCGTCATGCTCGGACAAATGCTTCACAGAGA
TTACTTTGATGCTCAGGTTCAAGGGGACTTGTTAGATCCAGGGAAGGGAATCATGGGCCT
TGGATGGAAGATAGCCATGATCTTAAACCTTGTTGGTCAATATCTGAATCTGATGAAGCT
GTATCTTCAAAGGGTTATGTTACATTCTCCTTAACCAATGGTCCTGAGTACCATGTCTCT
CAGATTACTGATGCTGTGATGGTGGCTAAGCATCTTGGAGCAACGCTTGTGCTCCCTGAC
ATAAGAGGAAGCAAACCTGGTGATGAAATGAACTTTGAAGACATCTATGATGCAGATAAA
CTCGTTAAAAGCCTTGAAAGCGTTCTCAAAGTTGTGAAGAAGTTGCCAAGCCACGTTTCT
CTAAGAGACATCGCCATTGTTAAAGTTCCCACCAGAGTTGCGGAAGACTACATCAAGGAA
CACATCAACCCCATCTTCAAATCAAAAGGGAACATCAGAGTTACAACCTACTTCCCTTCC
GTGAACTTGAGGAAGTCTTCTCTGGATGGTGAGACGGACCCTGTGTCTTGCTTGGCGATG
TTTGGTTCCTTGGAGTTGCAACCTGGAGTGAATGAGCTGGTGGAGTCGATGGTTCAGAGG
CTGAAGAGCAAGAGCTCTGGTGGACGGTTCATAGCCATAGACTTGAGAGTTGAGATACTT
GAGAAGAAAAACTGCCATGAGACAGGTGCAGGGGGGTCCAAAACATGTTACAACGCTCAA
GAGATCGCAGTGTTCTTGAGGAAGCTTGGATTTGATGGTGACACAACTATATACCTGACT
CAGCCTAGATGGGATAGCAGCCTCAATATTCTTAAGGACATCTTCCCTAAAACGTTTACT
AAGGAGGCGATAATGCCTGCAGAGAAGAAGTCTAAGTACCTTGAGTTAGAGAACTCAGAG
TATGAAAATGTTATTGACTTCTACATAAGTTCAAGGAGTGATGTGTTTGTGCCAGCCATT
CCTGGTTTGTTTTACGCTAATACGGTTGGGAAAAGGATAGCTTTAGGGAAGCCTCAAGTT
CTAGTTCCAGCTGAGATCTCAGGAACGTCTGGTCTTTCTACTGATTACATCTCTCCTTAT
ATCTCAAAGAAGAACCATTTGGCGTATTCATGCTTTTGCTGACCTTTTCTGATGTAAAAT
TTTATGAGGGTAATGTTTTGCCAACAAAATCTATAAAAAGGGTCTTTTCTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E969TF U 1
AF RR2E969JQ C 540
BS 1 693 RR2E969TF
BS 694 1254 RR2E969JQ

RD RR2E969TF 693 0 0
GGTGGCTGGAATCCTCACCATTACCATGTTCGTCATGCTCGGACAAATGCTTCACAGAGA
TTACTTTGATGCTCAGGTTCAAGGGGACTTGTTAGATCCAGGGAAGGGAATCATGGGCCT
TGGATGGAAGATAGCCATGATCTTAAACCTTGTTGGTCAATATCTGAATCTGATGAAGCT
GTATCTTCAAAGGGTTATGTTACATTCTCCTTAACCAATGGTCCTGAGTACCATGTCTCT
CAGATTACTGATGCTGTGATGGTGGCTAAGCATCTTGGAGCAACGCTTGTGCTCCCTGAC
ATAAGAGGAAGCAAACCTGGTGATGAAATGAACTTTGAAGACATCTATGATGCAGATAAA
CTCGTTAAAAGCCTTGAAAGCGTTCTCAAAGTTGTGAAGAAGTTGCCAAGCCACGTTTCT
CTAAGAGACATCGCCATTGTTAAAGTTCCCACCAGAGTTGCGGAAGACTACATCAAGGAA
CACATCAACCCCATCTTCAAATCAAAAGGGAACATCAGAGTTACAACCTACTTCCCTTCC
GTGAACTTGAGGAAGTCTTCTCTGGATGGTGAGACGGACCCTGTGTCTTGCTTGGCGATG
TTTGGTTCCTTGGAGTTGCAACCTGGAGTGAATGAGCTGGTGGAGTCGATGGTTCAGAGG
CTGAAGAGCAAGAGCTCTGGTGGACGGTTCATA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2E969JQ 715 0 0
CGTGAACTTGAGGAAGTCTTCTCTGGATGGTGAGACGGACCCTGTGTCTTGCTTGGCGAT
GTTTGGTTCCTTGGAGTTGCAACCTGGAGTGAATGAGCTGGTGGAGTCGATGGTTCAGAG
GCTGAAGAGCAAGAGCTCTGGTGGACGGTTCATAGCCATAGACTTGAGAGTTGAGATACT
TGAGAAGAAAAACTGCCATGAGACAGGTGCAGGGGGGTCCAAAACATGTTACAACGCTCA
AGAGATCGCAGTGTTCTTGAGGAAGCTTGGATTTGATGGTGACACAACTATATACCTGAC
TCAGCCTAGATGGGATAGCAGCCTCAATATTCTTAAGGACATCTTCCCTAAAACGTTTAC
TAAGGAGGCGATAATGCCTGCAGAGAAGAAGTCTAAGTACCTTGAGTTAGAGAACTCAGA
GTATGAAAATGTTATTGACTTCTACATAAGTTCAAGGAGTGATGTGTTTGTGCCAGCCAT
TCCTGGTTTGTTTTACGCTAATACGGTTGGGAAAAGGATAGCTTTAGGGAAGCCTCAAGT
TCTAGTTCCAGCTGAGATCTCAGGAACGTCTGGTCTTTCTACTGATTACATCTCTCCTTA
TATCTCAAAGAAGAACCATTTGGCGTATTCATGCTTTTGCTGACCTTTTCTGATGTAAAA
TTTTATGAGGGTAATGTTTTGCCAACAAAATCTATAAAAAGGGTCTTTTCTCACC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL5105Contig1 1329 2 6 U
GGGGAAGTGCAAAACTCCATCACCAGGAAAACACCTTCTTGAACCTAAAAGACTTCAGAA
CTTCACCATTCTCTTGAAAGCACTCAACGCAACAGCTGATCAAATCTGCTCTGCCTTAGG
GAAAGGGGAAGGTTTGTGTTTACAGCAACTAGAAGCATTGGTGAAGATGGTGCCGACAAA
AGAAGAAGAGTTGAAGCTGTGTAGCTACAAAGGAGCAGTAGATGAGCTTGGCTCGGCTGA
GAAATTTCTCAGGGCACTTGTGGGAGTTCCATCTGCTTTTCAAAGAGCTGAAGCAATGCT
TTATAGAGAAACATTTGAAGACGAAGTGGTTCATCTCAGAAACTCCTTCTCAATGCTTGA
GGAAGCTTGCAAGGAGCTAAAGTCAAGCAGGTTATTCCTGAAGCTGTTAGAAGCTGTCCT
TAAGACTGGGAACAGGATGAATGTAGGAACCATACGCGGTGGCGCGAAAGCCTTCAAGCT
TGACGCTCTGCTCAAGCTATCTGATGTGAAGGGCACAGATGGGAAGACAACTCTGCTCCA
CTTTGTCGTGCAAGAGATATCTAGGTCTGAGGGAATCAGGGTTTCAGACAGCATCATGGG
ACGGATTATGAACCAGAGATCAAACAAAAACAGAACAGCCGAGGAGAAAGAGGAGGATTA
CAGAAGGATGGGTCTAGATCTTGTCTCGGGTCTAAACACGGAGCTAAGAAACGTGAAGAA
GACAGCAACGATTGATCTTGAAGGACTCGTTAGCTCGGTTTCAAACCTAAGAGACGGCTT
AGAGCAGTTGAGGTGTCTAGCGAGCAACGAAGAAAACAGAGCGTTTGTTAGTTCGATGAG
CTCGTTCTTGAGATACGGAGAGAGGAGCTTGGAGGAGTTGAGGGAAGACGAGAAGAGGAT
AATGGAGAGGGTTGGAGAGATCGCTGAGTATTTTCATGGAGACGTGAGAGGAGATGACAA
GAACCCGTTGAGGATCTTTGTGATTGTTAGGGATTTTCTTGGGATGTTGGATCAAGTTTG
TAGATAGTTGAGATGTGTTAGGGTTCCCAACAGCCCTAGCCCTTTGGCTCCGTTTCGATG
AGCTACGAACAGAGGTTTGATTGTTTGGTTTCTGTAGGATTTTTATTGATGAAGTTGTTT
ATGATATAACAGGGTAATGTGAAGATCGTTATGCATGGATTTGTATATGTATCATATGCT
TAAATCTTGATTAAAAGGAATATTTCTAGACTTTGATATTTTTAGTTTTGTTTCTTTTGT
TTAAATAAAAATTTTTTGTGTGTGTTTGAAATTGTAATAATCTTTGAATGATGATTCTTT
TATTTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA74TF U 1
AF RR2HA74JQ C 573
BS 1 666 RR2HA74TF
BS 667 667 RR2HA74JQ
BS 668 726 RR2HA74TF
BS 727 727 RR2HA74JQ
BS 728 739 RR2HA74TF
BS 740 1329 RR2HA74JQ

RD RR2HA74TF 739 0 0
GGGGAAGTGCAAAACTCCATCACCAGGAAAACACCTTCTTGAACCTAAAAGACTTCAGAA
CTTCACCATTCTCTTGAAAGCACTCAACGCAACAGCTGATCAAATCTGCTCTGCCTTAGG
GAAAGGGGAAGGTTTGTGTTTACAGCAACTAGAAGCATTGGTGAAGATGGTGCCGACAAA
AGAAGAAGAGTTGAAGCTGTGTAGCTACAAAGGAGCAGTAGATGAGCTTGGCTCGGCTGA
GAAATTTCTCAGGGCACTTGTGGGAGTTCCATCTGCTTTTCAAAGAGCTGAAGCAATGCT
TTATAGAGAAACATTTGAAGACGAAGTGGTTCATCTCAGAAACTCCTTCTCAATGCTTGA
GGAAGCTTGCAAGGAGCTAAAGTCAAGCAGGTTATTCCTGAAGCTGTTAGAAGCTGTCCT
TAAGACTGGGAACAGGATGAATGTAGGAACCATACGCGGTGGCGCGAAAGCCTTCAAGCT
TGACGCTCTGCTCAAGCTATCTGATGTGAAGGGCACAGATGGGAAGACAACTCTGCTCCA
CTTTGTCGTGCAAGAGATATCTAGGTCTGAGGGAATCAGGGTTTCAGACAGCATCATGGG
ACGGATTATGAACCAGAGATCAAACAAAAACAGAACAGCCGAGGAGAAAGAGGAGGATTA
CAGAAG*ATGGGTCTAGATCTTGTCTCGGGTCTAAACACGGAGCTAAGAAACGTGAAGAA
GACAGCGACGATTGATCTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2HA74JQ 757 0 0
GAATCAGGGTTTCAGACAGCATCATGGGACGGATTATGAACCAGAGATCAAACAAAAACA
GAACAGCCGAGGAGAAAGAGGAGGATTACAGAAGGATGGGTCTAGATCTTGTCTCGGGTC
TAAACACGGAGCTAAGAAACGTGAAGAAGACGGCAACGATTGATCTTGAAGGACTCGTTA
GCTCGGTTTCAAACCTAAGAGACGGCTTAGAGCAGTTGAGGTGTCTAGCGAGCAACGAAG
AAAACAGAGCGTTTGTTAGTTCGATGAGCTCGTTCTTGAGATACGGAGAGAGGAGCTTGG
AGGAGTTGAGGGAAGACGAGAAGAGGATAATGGAGAGGGTTGGAGAGATCGCTGAGTATT
TTCATGGAGACGTGAGAGGAGATGACAAGAACCCGTTGAGGATCTTTGTGATTGTTAGGG
ATTTTCTTGGGATGTTGGATCAAGTTTGTAGATAGTTGAGATGTGTTAGGGTTCCCAACA
GCCCTAGCCCTTTGGCTCCGTTTCGATGAGCTACGAACAGAGGTTTGATTGTTTGGTTTC
TGTAGGATTTTTATTGATGAAGTTGTTTATGATATAACAGGGTAATGTGAAGATCGTTAT
GCATGGATTTGTATATGTATCATATGCTTAAATCTTGATTAAAAGGAATATTTCTAGACT
TTGATATTTTTAGTTTTGTTTCTTTTGTTTAAATAAAAATTTTTTGTGTGTGTTTGAAAT
TGTAATAATCTTTGAATGATGATTCTTTTATTTCCTC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5107Contig1 1304 2 2 U
GGACACATTCGTGTACCGTTTCCTTCTTTATTCTCTCTCTCTTTATGAGAAAGATTGTTT
CTTTTGATCTGTGAAGAGATCAAGCTGTTTCGTGTGTCTTTAAAAGAATCTAAAAGTTGA
AACCTTTTTGATTGTTTGGTTTTATGGTTTTGATCGGTGATCGAATTTGAATTCCAGCTT
ATTTTGTTCTTTCTCCTGATTGATTTTGGAAACGATGAGTGGTTTCCGTGATGTTTGTTC
ATCAAGTGGGTCGGTGAATGTGATGATCGGAGTATCACCAGCTGAAGAAGGAGACGACAA
CGCCGCCGCCACCGCTCTGTCTTCGGAGGATTCGTCTTCCCCCGACGAGACGGTGGCAGG
AACAGAGCTCGACTTAGCTCTGGGTCTTAGCGTTGGTAGGAATCACTCAAAGGTTCGGTC
TTTTTCTTCATCTTTGGCTTCCTCTTCTTCTTCCTCTTCTCTGACCAGAGAAAGTGGAAC
GAAACGGTCTGCTGATTCCTCTGCGGCTGCCTCAAAAGGAAATGTTGCGGGTAGGGTGGC
CGCCTCTAAGGACTTACAGAATCAACAGTTTGGTCAACCAATCAAAGTTCTCGCCCGCTG
AAGACGACATTCAAAAGGACACAACGAAAAACGGCGTGAAGAACAATGACGCTTCCTTCG
TCAAGTGTCCCATGCCTTGTGAAGGTTACAATGGACGGAGTTATAATTGGAAGGAAGATT
GATCTGAATGCTCTTGATTCTTATGAAGCCTTGGCGAACACTTTGGAACAAATGTTTTTC
CACACACCTTCTTCTGTAACAACAAGTCGGTTCTTTCTTCATTCCGTTTTTATTTACTTT
GGTGGTGGATCGGTTATAATTGATCAAATTTTATAGGATGCAAGGAAACAAGACGTGGTT
CAGAACTGCTGGATGGTTCATCAGAATATATCATAACGTATCAAGATAAAGACGGAGATT
GGATGCTTGTAGGAGATGTTCCATGGCTGATGTTCCTTGGGTCTGTTAAAAGACTGAGAA
TCATGAGAAGATCAGGTGAAACTGGAGTTGGCAAGTAGGGATTCATCTTCTCTGAGAAGA
CTCTCTCAGCTCAACATCTCTGTTAATCAGCCAGATAAAACTGAGACGAGAACACATATA
TAATGTTTTACACGCGAACCAAAGTTTATGGTTAACCTGGTCTGTAAATTGGCAAAATCT
TGTTCAGATAATCACACATATATATAATACATGTATTTATTATGAGTTATTATACATGTG
TCTGCAGTGGTTTGTGAATATCAAACAAAAGTTTCATTAAGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B191TF U 1
AF RR2B191JQ C 548
BS 1 709 RR2B191TF
BS 710 1304 RR2B191JQ

RD RR2B191TF 709 0 0
GGACACATTCGTGTACCGTTTCCTTCTTTATTCTCTCTCTCTTTATGAGAAAGATTGTTT
CTTTTGATCTGTGAAGAGATCAAGCTGTTTCGTGTGTCTTTAAAAGAATCTAAAAGTTGA
AACCTTTTTGATTGTTTGGTTTTATGGTTTTGATCGGTGATCGAATTTGAATTCCAGCTT
ATTTTGTTCTTTCTCCTGATTGATTTTGGAAACGATGAGTGGTTTCCGTGATGTTTGTTC
ATCAAGTGGGTCGGTGAATGTGATGATCGGAGTATCACCAGCTGAAGAAGGAGACGACAA
CGCCGCCGCCACCGCTCTGTCTTCGGAGGATTCGTCTTCCCCCGACGAGACGGTGGCAGG
AACAGAGCTCGACTTAGCTCTGGGTCTTAGCGTTGGTAGGAATCACTCAAAGGTTCGGTC
TTTTTCTTCATCTTTGGCTTCCTCTTCTTCTTCCTCTTCTCTGACCAGAGAAAGTGGAAC
GAAACGGTCTGCTGATTCCTCTGCGGCTGCCTCAAAAGGAAATGTTGCGGGTAGGGTGGC
CGCCTCTAAGGACTTACAGAATCAACAGTTTGGTCAACCAATCAAAGTTCTCGCCCGCTG
AAGACGACATTCAAAAGGACACAACGAAAAACGGCGTGAAGAACAATGACGCTTCCTTCG
TCAAGTGTCCCATGCCTTGTGAAGGTTACAATGGACGGAGTTATAATTG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2B191JQ 757 0 0
AAGGACTTACAGAATCAACAGTTTGGTCAACCAATCAAAGTTCTCGCCCGCTGAAGACGA
CATTCAAAAGGACACAACGAAAAACGGCGTGAAGAACAATGACGCTTCCTTCGTCAAGTG
TCCCATGC*TTGTGAAGGTTACAATGGACGGAGTTATAATTGGAAGGAAGATTGATCTGA
ATGCTCTTGATTCTTATGAAGCCTTGGCGAACACTTTGGAACAAATGTTTTTCCACACAC
CTTCTTCTGTAACAACAAGTCGGTTCTTTCTTCATTCCGTTTTTATTTACTTTGGTGGTG
GATCGGTTATAATTGATCAAATTTTATAGGATGCAAGGAAACAAGACGTGGTTCAGAACT
GCTGGATGGTTCATCAGAATATATCATAACGTATCAAGATAAAGACGGAGATTGGATGCT
TGTAGGAGATGTTCCATGGCTGATGTTCCTTGGGTCTGTTAAAAGACTGAGAATCATGAG
AAGATCAGGTGAAACTGGAGTTGGCAAGTAGGGATTCATCTTCTCTGAGAAGACTCTCTC
AGCTCAACATCTCTGTTAATCAGCCAGATAAAACTGAGACGAGAACACATATATAATGTT
TTACACGCGAACCAAAGTTTATGGTTAACCTGGTCTGTAAATTGGCAAAATCTTGTTCAG
ATAATCACACATATATATAATACATGTATTTATTATGAGTTATTATACATGTGTCTGCAG
TGGTTTGTGAATATCAAACAAAAGTTTCATTAAGAAC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL5108Contig1 1074 2 4 U
GGGCCTAGCCAAGTATCTCATCTTTCTCCTTCTTTCTTTCGTAAATAAAATCACACATCA
CTCACCTCTACTCCTCAATCAGTATCTTCAAAATATATTTTGGAGCGTGAGAGACAAATT
TTGTTTCATCTTTACGATTTCACCAGAGATGATAAAGTTTCAAGGACTCGTTTCATCGAC
CTTTGTCCTCTTACTGACCCTCTCTCTGTGTTCTGCCGAAAATGATGTTTTTTCTTCCAC
AGGGTATGTCCAAATTGAGTGCTTGAGAGTACCGCCGTTGGAGTTCGCCGGAGCGGCAAA
AACCGCCTTCGACTCAGTCAGGAAAGCCGGAGCTTTAGTGTCGAAATTCGACAAGAAATT
TGGGAACTCACGTGTGGGCCATGCCATTCTTGATTGCCTTGATCTTCTTGATTCTGCCTC
TGAAGAGCTTTCTTGGATTATATCTGCCTCTCAGAACCCCAACGGTAAAGACAATAGTAC
AGGAGACGTGGCTTCGGATCTAAGGACGTGGATAAGCGCCGCCCTTTCTAACCAGGACAC
CTGTCTTGACGGCTTCGAGGGCACTAATGGAATTGTCAAAAAAGTTGTGGCCGGTGGTCT
AAGCCAGGTCGGTAAAACCATCCGAAACCTACTAACAATGGTCCACTTTTCCTCCAAACC
CAAACCTAAGCCCAATAGAGCCCACAAGACAACCACCGGTCATAGCGGCTTCAGTAAGTT
TCCCACATGGGTTAGACCCGGTGATCGGAAGTTGCTACAAATTGATGGCTTATCAATAGC
GGCCGATGCATTTGTAGCAGCAGATGGGACAGGGAACTTCACTACGATAAGCGAGGCGGT
ACTGGCCGCGCCGGACTACAGTACAAAAAGATATGTGATACATGTGAAAAGAGGTATATA
TGTCGAGAATGTAGAGATTAAGAAGAAGAAATGGAACATTATGATGGTCGGTGACGGCAT
TGATGCCACCGTGATCACCGGCAACCGAAGTTTCATCGACGGTTGGACAACGTTCCGTTC
TGCTACTTTTGCTGTGAGCGGGAGAGGATTTCTCGCACGGGACATAACGTTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU44TF U 1
AF RR2D507TF U 593
BS 1 686 RR2DU44TF
BS 687 687 RR2D507TF
BS 688 749 RR2DU44TF
BS 750 1074 RR2D507TF

RD RR2DU44TF 759 0 0
GGGCCTAGCCAAGTATCTCATCTTTCTCCTTCTTTCTTTCGTAAATAAAATCACACATCA
CTCACCTCTACTCCTCAATCAGTATCTTCAAAATATATTTTGGAGCGTGAGAGACAAATT
TTGTTTCATCTTTACGATTTCACCAGAGATGATAAAGTTTCAAGGACTCGTTTCATCGAC
CTTTGTCCTCTTACTGACCCTCTCTCTGTGTTCTGCCGAAAATGATGTTTTTTCTTCCAC
AGGGTATGTCCAAATTGAGTGCTTGAGAGTACCGCCGTTGGAGTTCGCCGGAGCGGCAAA
AACCGCCTTCGACTCAGTCAGGAAAGCCGGAGCTTTAGTGTCGAAATTCGACAAGAAATT
TGGGAACTCACGTGTGGGCCATGCCATTCTTGATTGCCTTGATCTTCTTGATTCTGCCTC
TGAAGAGCTTTCTTGGATTATATCTGCCTCTCAGAACCCCAACGGTAAAGACAATAGTAC
AGGAGACGTGGCTTCGGATCTAAGGACGTGGATAAGCGCCGCCCTTTCTAACCAGGACAC
CTGTCTTGACGGCTTCGAGGGCACTAATGGAATTGTCAAAAAAGTTGTGGCCGGTGGTCT
AAGCCAGGTCGGTAAAACCATCCGAAACCTACTAACAATGGTCCACTTTTCCTCCAAACC
CAAACCTAAGCCCAATAGAGCCCACA*GACAACCACCGGTCATAGCGGCTTCAGTAAGTT
TCCCACATGGGTTAGACCCGGTGATCGGA
GTGCTACAGA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2D507TF 482 0 0
GGTGGTCTAAGCCAGGTCGGTAAAACCATCCGAAACCTACTAACAATGGTCCACTTTTCC
TCCAAACCCAAACCTAAGCCCAATAGAGCCCACAAGACAACCACCGGTCATAGCGGCTTC
AGTAAGTTTCCCACATGGGTTAGACCCGGTGATCGGAAGTTGCTACAAATTGATGGCTTA
TCAATAGCGGCCGATGCATTTGTAGCAGCAGATGGGACAGGGAACTTCACTACGATAAGC
GAGGCGGTACTGGCCGCGCCGGACTACAGTACAAAAAGATATGTGATACATGTGAAAAGA
GGTATATATGTCGAGAATGTAGAGATTAAGAAGAAGAAATGGAACATTATGATGGTCGGT
GACGGCATTGATGCCACCGTGATCACCGGCAACCGAAGTTTCATCGACGGTTGGACAACG
TTCCGTTCTGCTACTTTTGCTGTGAGCGGGAGAGGATTTCTCGCACGGGACATAACGTTT
CA

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL5109Contig1 819 2 3 U
CCGACGACACAAGCGGTGGTGCTGGAGGTTACTCTTCAATGGAGGGTCTATATGGGGTTT
ACTCCGGTGAAGATCCAACGGCAAGAAGGAAAAGAGTGATGGTTGTGGTGGATGAGACTT
CAAGGTCTAAACATGCTATGATGTGGGCTTTGACGCACTTGACTAACAAAGGAGACTTGA
TGACTCTTCTTCATGTTGTGTCTCCTCATGATGAAGCTTCGCCTTCTTTGGTTCAGTCAC
TTGGCTCTCTTTGCAAAGCTTGTAAACCCGAGGTGGATGTGGAGGCGTTGGTGATTCAAG
GACCAAAGTTAGCAACTGTACTCAGCCAAGTGAAGAAACTTGAAGTCACTGTTCTTGTTT
TGGGTCAGAAGAAATCTGCACCATTCATCTCCTGGTGCGTAATCTCAATCGTCAGATCTC
TTTGCCCTCATCATGATTCTCTCGTTCCAATAATTACTTTTCATTTTTTTGTCGTTTTGT
ACGTAGCTTATGTGGACCCAGTAGATCAGAGGAGTTCGTGAATCGATGTATCAACGGTGC
AGATTGTTTGACGATTGGTGTGAGGAAACAAAGCAACTGTGTTAGTGGCTACTTGATTAA
CACACGATGGCAGAAGAACTTCTGGCTTTTGGCTTAATCGCAACTTCTAATATTAGCAGC
CGTAGACCGGTTCCATAAGTTGGTGGTTAATTTGTAGTCTAAAAAACTTTGCATCTCTCT
CTCTTGTCCCATGTTTAACATAACTTTGTCTTATGTCCTGTAAGGAATTAAAGTTAAATA
TTTGTATCTCAGTTTCCACATGAATGATTCCCCCTTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX09TFB U 401
AF RR2AX09JQ C 1
BS 1 400 RR2AX09JQ
BS 401 553 RR2AX09TFB
BS 554 819 RR2AX09JQ

RD RR2AX09TFB 153 0 0
AATCTCAATCGTCAGATCTCTTTGCCCTCATCATGATTCTCTCGTTCCAATAATTACTTT
TCATTTTTTTGTCGTTTTGTACGTAGCTTATGTGGACCCAGTAGATCAGAGGAGTTCGTG
AATCGATGTATCAACGGTGCAGATTGTTTGACG

QA 1 153 1 153
DS 

RD RR2AX09JQ 819 0 0
CCGACGACACAAGCGGTGGTGCTGGAGGTTACTCTTCAATGGAGGGTCTATATGGGGTTT
ACTCCGGTGAAGATCCAACGGCAAGAAGGAAAAGAGTGATGGTTGTGGTGGATGAGACTT
CAAGGTCTAAACATGCTATGATGTGGGCTTTGACGCACTTGACTAACAAAGGAGACTTGA
TGACTCTTCTTCATGTTGTGTCTCCTCATGATGAAGCTTCGCCTTCTTTGGTTCAGTCAC
TTGGCTCTCTTTGCAAAGCTTGTAAACCCGAGGTGGATGTGGAGGCGTTGGTGATTCAAG
GACCAAAGTTAGCAACTGTACTCAGCCAAGTGAAGAAACTTGAAGTCACTGTTCTTGTTT
TGGGTCAGAAGAAATCTGCACCATTCATCTCCTGGTGCGTAATCTCAATCGTCAGATCTC
TTTGCCCTCATCATGATTCTCTCGTTCCAATAATTACTTTTCATTTTTTTGTCGTTTTGT
ACGTAGCTTATGTGGACCCAGTAGATCAGAGGAGTTCGTGAATCGATGTATCAACGGTGC
AGATTGTTTGACGATTGGTGTGAGGAAACAAAGCAACTGTGTTAGTGGCTACTTGATTAA
CACACGATGGCAGAAGAACTTCTGGCTTTTGGCTTAATCGCAACTTCTAATATTAGCAGC
CGTAGACCGGTTCCATAAGTTGGTGGTTAATTTGTAGTCTAAAAAACTTTGCATCTCTCT
CTCTTGTCCCATGTTTAACATAACTTTGTCTTATGTCCTGTAAGGAATTAAAGTTAAATA
TTTGTATCTCAGTTTCCACATGAATGATTCCCCCTTAAA

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 2

CO CL5110Contig1 813 2 2 U
GATCACAAACTCAATTCCCTTTTCATCATCACCAAATCATAAGCGGCTCTCTCTCAAATT
AGGGTTTTTTGTTCTAAGTCAGGTTTCATTTGATTGATATAAAAAGAAGAGATCGAAAAA
CTCCAGATCGAGATCAAAATATATTTCATATACATAAGAGCGTGAATGAGATTATGATGG
AATCGAAAGCTGGTAATAAAAAGTCGTCGTCGTCAAGTAGTTCCTTATTTTACGAAGCTC
CCCTCGGTTACAGCATTGAAGACGTTCGTCCCAACGGTGGCATCAAGAAATTCAAATCCT
CTGTCTACTCCAACTGCGCGAAGAGGCCTTCCTGAGTACCCTTCAGTTCAGACATTCCTC
GTAGTTTAACTAGTTTTTCGATTTCAGTTTTTACTTTCTGTCCAAAGCAATTCTCGGTAG
CTGTACACTCTAGCGTGTCGCAGAAGAGCAGCTACGACTCTGGTCTCTCTGTAGACCTTG
AGGATTACGGATGCAAGGAGTCGACTGTGGAAGCTCTAGGGGAAGAGAGAGGATCGGTTA
TGTATCAGAGGTTTGAGAAGCTGGGAATGTATTGCGGTTCTCCGAGATCTACCTTGAAGT
GTGAGTGGAGCAGCAACAGTAGCTGCACTAGCGAGGACGAGAAGGAAGAGGGAATCTAAA
AGCTTTTTTAGTTTTGTTGTTGTTTCGAATAATAATGTCGTGCGTTTGTGTTTTTTCTCC
TTGAAAACTTTGGTAAAGTTGTGTGTTTGGTCTCTGTGAATTCAGATGATCGAGTATTAT
GAAATTATCCATCAATAAGACCATTTTCGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A561TF U 1
AF RR2A561JQ C 27
BS 1 689 RR2A561TF
BS 690 813 RR2A561JQ

RD RR2A561TF 689 0 0
GATCACAAACTCAATTCCCTTTTCATCATCACCAAATCATAAGCGGCTCTCTCTCAAATT
AGGGTTTTTTGTTCTAAGTCAGGTTTCATTTGATTGATATAAAAAGAAGAGATCGAAAAA
CTCCAGATCGAGATCAAAATATATTTCATATACATAAGAGCGTGAATGAGATTATGATGG
AATCGAAAGCTGGTAATAAAAAGTCGTCGTCGTCAAGTAGTTCCTTATTTTACGAAGCTC
CCCTCGGTTACAGCATTGAAGACGTTCGTCCCAACGGTGGCATCAAGAAATTCAAATCCT
CTGTCTACTCCAACTGCGCGAAGAGGCCTTCCTGAGTACCCTTCAGTTCAGACATTCCTC
GTAGTTTAACTAGTTTTTCGATTTCAGTTTTTACTTTCTGTCCAAAGCAATTCTCGGTAG
CTGTACACTCTAGCGTGTCGCAGAAGAGCAGCTACGACTCTGGTCTCTCTGTAGACCTTG
AGGATTACGGATGCAAGGAGTCGACTGTGGAAGCTCTAGGGGAAGAGAGAGGATCGGTTA
TGTATCAGAGGTTTGAGAAGCTGGGAATGTATTGCGGTTCTCCGAGATCTACCTTGAAGT
GTGAGTGGAGCAGCAACAGTAGCTGCACTAGCGAGGACGAGAAGGAAGAGGGAATCTAAA
AGCTTTTTTAGTTTTGTTGTTGTTTCGAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2A561JQ 787 0 0
CATCACCAAATCATAAGCGGCTCTCTCTCAAATTAGGGTTTTTTGTTCTAAGTCAGGTTT
CATTTGATTGATATAAAAAGAAGAGATCGAAAAACTCCAGATCGAGATCAAAATATATTT
CATATACATAAGAGCGTGAATGAGATTATGATGGAATCGAAAGCTGGTAATAAAAAGTCG
TCGTCGTCAAGTAGTTCCTTATTTTACGAAGCTCCCCTCGGTTACAGCATTGAAGACGTT
CGTCCCAACGGTGGCATCAAGAAATTCAAATCCTCTGTCTACTCCAACTGCGCGAAGAGG
CCTTCCTGAGTACCCTTCAGTTCAGACATTCCTCGTAGTTTAACTAGTTTTTCGATTTCA
GTTTTTACTTTCTGTCCAAAGCAATTCTCGGTAGCTGTACACTCTAGCGTGTCGCAGAAG
AGCAGCTACGACTCTGGTCTCTCTGTAGACCTTGAGGATTACGGATGCAAGGAGTCGACT
GTGGAAGCTCTAGGGGAAGAGAGAGGATCGGTTATGTATCAGAGGTTTGAGAAGCTGGGA
ATGTATTGCGGTTCTCCGAGATCTACCTTGAAGTGTGAGTGGAGCAGCAACAGTAGCTGC
ACTAGCGAGGACGAGAAGGAAGAGGGAATCTAAAAGCTTTTTTAGTTTTGTTGTTGTTTC
GAATAATAATGTCGTGCGTTTGTGTTTTTTCTCCTTGAAAACTTTGGTAAAGTTGTGTGT
TTGGTCTCTGTGAATTCAGATGATCGAGTATTATGAAATTATCCATCAATAAGACCATTT
TCGTGAC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5112Contig1 1051 2 2 U
GGGCATAATCTCCTAGAAATCTAACAAAACTTTCAAATCCTGATTTGTTTTGGTGTACTT
GATCAGTTGGAATCTATAAGAAAGTATAAAGATGCGGATGAGTTGTAATGGATGCAGAGT
TCTTCGGAAAGGGTGTAGTGAGGATTGTAGTATAAGACCGTGTTTGGGTTGGATCAAATC
CCCTGAAGCGCAAGCAAACGCAACAGTGTTTCTCGCCAAGTTCTATGGCCGTGCTGGACT
CATGAACCCCATCAACGCCGGTCCCGATCGCCTTCGTCCTGGGATTTTCCGGTCGTTGTT
GCATGAAGCTTGCGGGAGGATTGTGAATCCGATCTACGGTTCGGTGGGGTTGTTATGGTC
GGGAAACTGGCAGCTTTGTCAATCCGCCGTGGAGGCGGTGATGAGAGGCGAATCGATCAC
TGAGATGGCCACGGATGCGGCGACGAGTGGGCAAGGTCCGCCGCTGAAAATGTACGACAT
CCGACATATCTCCAAGGACGAGAACTCCCCCGCTGCAGCAGCTGCTGGTTCAACCGATCC
GAAACGAGGAAAGAAAGCTCGCCGGGCTAAGCGGGTCGCCTCCGCCGCCGCCGTCGCTAA
ACCGGCGGAATCAGAGGGGAAATCCGCCGGGGGAGAAGGAGAAGCTAGTCACGACTCGTC
GTTGAGTCACCAGTCTGAAGTTGTGGCTCCTCATGAAGAAGAGAGCAATATCTCGGAGGT
GATGACATTCTCGCCAACGACGGCTGCGGCTTCCGGTGAGATCAAACTCGACCTAACGTT
AGGGCTGGAGCCGGCGTCACGCGCGGATCACGTGGTGCCTGTTAAGAAGAGAAAGATGGG
CGTGTTTAGCACGTGGCAGGAAGAGAGTTCGTGTAAGACTGACCTTGTACTCTAATTATT
CCTTTGAAGTTTTGCCCGTATCAGCTCAGTTATGATACCATAACTTTTCTCTTTGTTATC
TATTTCTGCCTTTAATTTGCATCTTCCTTTGGTGATGAAAGATAGAGCAATGTACAAACT
TATTTACAGAGTTAAATTCAAGATTAGCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FE46TF U 1
AF RR2FE46JQ C 416
BS 1 575 RR2FE46TF
BS 576 1051 RR2FE46JQ

RD RR2FE46TF 575 0 0
GGGCATAATCTCCTAGAAATCTAACAAAACTTTCAAATCCTGATTTGTTTTGGTGTACTT
GATCAGTTGGAATCTATAAGAAAGTATAAAGATGCGGATGAGTTGTAATGGATGCAGAGT
TCTTCGGAAAGGGTGTAGTGAGGATTGTAGTATAAGACCGTGTTTGGGTTGGATCAAATC
CCCTGAAGCGCAAGCAAACGCAACAGTGTTTCTCGCCAAGTTCTATGGCCGTGCTGGACT
CATGAACCCCATCAACGCCGGTCCCGATCGCCTTCGTCCTGGGATTTTCCGGTCGTTGTT
GCATGAAGCTTGCGGGAGGATTGTGAATCCGATCTACGGTTCGGTGGGGTTGTTATGGTC
GGGAAACTGGCAGCTTTGTCAATCCGCCGTGGAGGCGGTGATGAGAGGCGAATCGATCAC
TGAGATGGCCACGGATGCGGCGACGAGTGGGCAAGGTCCGCCGCTGAAAATGTACGACAT
CCGACATATCTCCAAGGACGAGAACTCCCCCGCTGCAGCAGCTGCTGGTTCAACCGATCC
GAAACGAGGAAAGAAAGCTCGCCGGGCTAAGCGGG

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2FE46JQ 636 0 0
ATCACTGAGATGGCCACGGATGCGGCGACGAGTGGGCAAGGTCCGCCGCTGAAAATGTAC
GACATCCGACATATCTCCAAGGACGAGAACTCCCCCGCTGCAGCAGCTGCTGGTTCAACC
GATCCGAAACGAGGAAAGAAAGCTCGCCGGGCTAAGCGGGTCGCCTCCGCCGCCGCCGTC
GCTAAACCGGCGGAATCAGAGGGGAAATCCGCCGGGGGAGAAGGAGAAGCTAGTCACGAC
TCGTCGTTGAGTCACCAGTCTGAAGTTGTGGCTCCTCATGAAGAAGAGAGCAATATCTCG
GAGGTGATGACATTCTCGCCAACGACGGCTGCGGCTTCCGGTGAGATCAAACTCGACCTA
ACGTTAGGGCTGGAGCCGGCGTCACGCGCGGATCACGTGGTGCCTGTTAAGAAGAGAAAG
ATGGGCGTGTTTAGCACGTGGCAGGAAGAGAGTTCGTGTAAGACTGACCTTGTACTCTAA
TTATTCCTTTGAAGTTTTGCCCGTATCAGCTCAGTTATGATACCATAACTTTTCTCTTTG
TTATCTATTTCTGCCTTTAATTTGCATCTTCCTTTGGTGATGAAAGATAGAGCAATGTAC
AAACTTATTTACAGAGTTAAATTCAAGATTAGCTAT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL5113Contig1 725 2 4 U
CGTTCAGCCAACGTGTTCTTCTGACCCTCGAAGAGAAAAAACTTCCTTGCAAGATCCATC
TGATTAATGTCTCTGACAAACCCCAGTGGTTTTTAGACATTAGTCCGGAAGGCAAAGTTC
CGGTGATGAAGCTTGACGGCAAATGGGTTACTGATTCAGACGTCATCGTCGGGATCCTCG
AGGAGAAATATCCAGAGCCTTCTCTAAAGACTCCTCCTGAGTTCACCTCTGTTGAATCAA
AAATCTTTGGTGCTTTTGTGACTTTCTTGACAAGCAAAGACCCCAACGACGGTTCCGACA
AGGCTTTGGTTAACGAGTTAGAAACCCTGGAGAATCACCTTAAGTCACTTTCCTGGTTCC
TTTTGTAGCTGGAGAGAAACTCACTGGGGTTGATCTGAGTTTAGCACCAAAGCTTTACCA
TCTTGAGATCGCTCTTGGTCATTACAAGAAATGGTCTGTCCCTGAGAGTTTGACCCATGT
TGGTAGCTACGCCAACGCTTTGTTCTCTAGAGAGTCCTTCGAGAAGACCAAAGCTAGGAA
GGAGTTTGTGGTCGCGGGTTGGGCATCTAAGGTGAACAAGTGATGCGTGGATGGATCCAT
GCTTACAAGTACTATTACTATTCAGAAAATAATAAAATGAGCGAATAATCTTGTGTTATC
AAGCAATAATGATGCAATAAACAATCATATATTATGTCTTATTCAATTTAGTACTATTAC
AGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2DB45TF U 1
AF RR2DB45JQ C 220
BS 1 234 RR2DB45TF
BS 235 235 RR2DB45JQ
BS 236 391 RR2DB45TF
BS 392 725 RR2DB45JQ

RD RR2DB45TF 391 0 0
CGTTCAGCCAACGTGTTCTTCTGACCCTCGAAGAGAAAAAACTTCCTTGCAAGATCCATC
TGATTAATGTCTCTGACAAACCCCAGTGGTTTTTAGACATTAGTCCGGAAGGCAAAGTTC
CGGTGATGAAGCTTGACGGCAAATGGGTTACTGATTCAGACGTCATCGTCGGGATCCTCG
AGGAGAAATATCCAGAGCCTTCTCTAAAGACTCCTCCTGAGTTCACCTCTGTTGGATCAA
AAATCTTTGGTGCTTTTGTGACTTTCTTGACAAGCAAAGACCCCAACGACGGTTCCGACA
AGGCTTTGGTTAACGAGTTAGAAACCCTGGAGAATCACCTTAAGTCACTTTCCTGGTTCC
TTTTGTAGCTGGAGAGAAACTCACTGGGGTT

QA 1 391 1 391
DS 

RD RR2DB45JQ 506 0 0
AGTTCACCTCTGTTGAATCAAAAATCTTTGGTGCTTTTGTGACTTTCTTGACAAGCAAAG
ACCCCAACGACGGTTCCGACAAGGCTTTGGTTAACGAGTTAGAAACCCTGGAGAATCACC
TTAAGTCACTT*CCTGGT*CCTTTTGTAGCTGGAGAGAAACTCACTGGGGTTGATCTGAG
TTTAGCACCAAAGCTTTACCATCTTGAGATCGCTCTTGGTCATTACAAGAAATGGTCTGT
CCCTGAGAGTTTGACCCATGTTGGTAGCTACGCCAACGCTTTGTTCTCTAGAGAGTCCTT
CGAGAAGACCAAAGCTAGGAAGGAGTTTGTGGTCGCGGGTTGGGCATCTAAGGTGAACAA
GTGATGCGTGGATGGATCCATGCTTACAAGTACTATTACTATTCAGAAAATAATAAAATG
AGCGAATAATCTTGTGTTATCAAGCAATAATGATGCAATAAACAATCATATATTATGTCT
TATTCAATTTAGTACTATTACAGACC

QA 1 506 1 506
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5116Contig1 1187 2 2 U
GGAAGCCAAGCCAGAAAAGAGATTTGCGATTGAAAGAACGATTTGATCAATCTCGATAGA
AGAGGAAGATGTCGACTCTTTCAGCTGCCAGGGCAGATAACTTTTACTACCCACCAGAAT
GGACACCGGATCAAGGTTCCTTGAACAAGTTTCAAGGACAGCATCCTCTCAGAGAGAGGG
CAAGGAAACTAGGCGAGGGGATTTTGATCATAAGGTTCGGGATGCCCTATAATATATGGT
GTGGTGGCTGCAATTCTATGATTGCCAAGGGTGTTCGATTCAATGCAGAGAAGAAGCAAG
TTGGGAACTATTATTCTACAAAGATATGGAGCTTTGCGATGAAAGCACCATGCTGCAAAC
AAGAGATAGTCATTCAGACAGATCCTCAGAACTGCGAGTATGTAATTACAAGTGGTGCTC
AGAAGAAGGTTGAGGAATATGACGTAGAAGACGCTGAAACCATGGAGCTCACTGCTGAAG
AAGAGAAGGGAAAGCTTGCAGACCCGTTTTATCGGTTAGAGCACCAGGAAGTTGATTTGC
AGAAGAAGAAAGCAGCAGAACCGCTTTTGGTCCGTCTCCAGCGAGTCTCAGATGCAAGTC
ATGCAGATGACTACTCCCTGAACAAAGCTCTACGCGCACAAATTAGAGGGCACAGGAAAC
GTGTAGCTTAAGAAGAGGCTGCTTCAAGGAAACTAGGGTTGGGGATAAGACTTCTTCCGA
AGAGCGAAGAAGATGTTGCAGCTGCATCAAACGTGAAGTTCAGGACCAAGTTTGATAAGA
ATCGAAAGGATAAACGAGCTCTGATTCATTCATCTTCCATATTTCCAGAGTCAGCTTACT
CGATGTCATCATCATCAAGCAAGAAAAGGTTGGAGCTAGAAGCAAAGAGACGGAAAATAT
GTGCAGCGTCGGCGTCTAGTTTGTTGAGCGGGGGATTCAAAGCTTCATCATTGTCTAAGA
ACCAATCATCAGCAAGCAAGTCCAAGAGTTCAATAGTTTCTGTAAGGAAGATGTAGTTTT
GAAACTGTGCTTGTTGAATCCTTAAGAAGTTTTAAGGAAAAGAATAAAGTCGACTCATTA
CAATAGTGGCGATCTTTTTTACGTGTGGAAAGTTGAATTTGATCCTGGCTTTGGTATACT
GTTCTTTAATTCTTTTTTATGTTCAAGCTTCGAACGTCCCAGATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM38TF U 1
AF RR2EM38JQ C 334
BS 1 496 RR2EM38TF
BS 497 1187 RR2EM38JQ

RD RR2EM38TF 496 0 0
GGAAGCCAAGCCAGAAAAGAGATTTGCGATTGAAAGAACGATTTGATCAATCTCGATAGA
AGAGGAAGATGTCGACTCTTTCAGCTGCCAGGGCAGATAACTTTTACTACCCACCAGAAT
GGACACCGGATCAAGGTTCCTTGAACAAGTTTCAAGGACAGCATCCTCTCAGAGAGAGGG
CAAGGAAACTAGGCGAGGGGATTTTGATCATAAGGTTCGGGATGCCCTATAATATATGGT
GTGGTGGCTGCAATTCTATGATTGCCAAGGGTGTTCGATTCAATGCAGAGAAGAAGCAAG
TTGGGAACTATTATTCTACAAAGATATGGAGCTTTGCGATGAAAGCACCATGCTGCAAAC
AAGAGATAGTCATTCAGACAGATCCTCAGAACTGCGAGTATGTAATTACAAGTGGTGCTC
AGAAGAAGGTTGAGGAATATGACGTAGAAGACGCTGAAACCATGGAGCTCACTGCTGAAG
AAGAGAAGGGAAAGCT

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2EM38JQ 854 0 0
TTGCGATGAAAGCACCATGCTGCAAACAAGAGATAGTCAT*CAGACAGATCCTCAGAACT
GCGAGTATGTAATTACAAGTGGTGCTCAGAAGAAGGTTGAGGAATATGACGTAGAAGACG
CTGAAACCATGGAGCTCACTGCTGAAGAAGAGAAGGGAAAGCTTGCAGACCCGTTTTATC
GGTTAGAGCACCAGGAAGTTGATTTGCAGAAGAAGAAAGCAGCAGAACCGCTTTTGGTCC
GTCTCCAGCGAGTCTCAGATGCAAGTCATGCAGATGACTACTCCCTGAACAAAGCTCTAC
GCGCACAAATTAGAGGGCACAGGAAACGTGTAGCTTAAGAAGAGGCTGCTTCAAGGAAAC
TAGGGTTGGGGATAAGACTTCTTCCGAAGAGCGAAGAAGATGTTGCAGCTGCATCAAACG
TGAAGTTCAGGACCAAGTTTGATAAGAATCGAAAGGATAAACGAGCTCTGATTCATTCAT
CTTCCATATTTCCAGAGTCAGCTTACTCGATGTCATCATCATCAAGCAAGAAAAGGTTGG
AGCTAGAAGCAAAGAGACGGAAAATATGTGCAGCGTCGGCGTCTAGTTTGTTGAGCGGGG
GATTCAAAGCTTCATCATTGTCTAAGAACCAATCATCAGCAAGCAAGTCCAAGAGTTCAA
TAGTTTCTGTAAGGAAGATGTAGTTTTGAAACTGTGCTTGTTGAATCCTTAAGAAGTTTT
AAGGAAAAGAATAAAGTCGACTCATTACAATAGTGGCGATCTTTTTTACGTGTGGAAAGT
TGAATTTGATCCTGGCTTTGGTATACTGTTCTTTAATTCTTTTTTATGTTCAAGCTTCGA
ACGTCCCAGATGAC

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 2

CO CL5117Contig1 1191 2 4 U
GGAAAGCAGCTCTCTCTTATAAAATTACAATAATTGAACCCTCTCTCTTCTTCATCTTCT
CTTCTCCGATTGCAACTTGAATCACTCACTACTCGTAGAGAAGAAAGGGATCGCCTTTCA
TCAACTCTCTGTGTCGTATCTCGATTTCGCGACAAAGGTTGATTGCATTCGAGTCCTGAA
GACCTGAAAAAGGAATTTATCACATTCGTGTCAGATAGTTACCTCTGAGGAGTGCCGTCC
TTTTGAACTTATTATTCTCCATGGGAAGTAATGAGAATCTACCACCCAATGTTATCAGGC
AGCTCGCCAAGGAACTCAAGAGTCTTGACGAATCTCCTCCTGAAGGCATCAAGGTTTTGC
TCAATGACGAGGATTTCTCGCAGATATGTGCTGACATTGAAGGACCAGTTGGGACTCCTT
ATGAGAATGGAGTTTTCCGTATGAAGTTAGCACTGTCGCATGATTTTCCTCATTCCCCAC
CTAAAGGCTACTTCATGACAAAGATATTCCATCCCAATATTGCTTCTAATGGAGAGATCT
GCGTTAACACGCTTAAGAAAGATTGGAATCCTAGTCTTGGATTAAGACATGTCCTCTCTG
TTGTGAGGTGCTTACTGATCGAGCCGTTTCCAGAATCTGCATTAAACGAACAGGCTGGGA
AGATGCTACTTGAGAACTATGAAGAGTATGCTAGGCATGTTCGGCTTTACACGGGTATCC
ATGCTAAACCGAAACCTAAGTTCAAGACAGGAGCTATCTCAGAGTCAACGACGGCTCTAA
ACGTTGGCCAGACTAACAACGAGACGCCTGGTGCTGCTTCTGCAGCACCCTCTTCAGTGG
CAGACATCAACAGAGTAACAACAACGAGTGGCCAAGACCAACAAGAAGTGACTAACAATT
CTGTAGCAGCAGCAGGTTCTGCGAGTGTGGTCACTACGACACAGAAAAGGGAAGCCGGTT
TGGCCAAGGTTCAGGCAGACAAGAAGAAGGTAGACGCCAGAAAGAAGAGCTTGAGGAGAC
TGTGATGATGCTACTTTTCAAGAGCCATTGTAGGCTTTTATGTAATCAGGCATGTCTGGT
TATGTTGATTTGTTGGTCTATATAATCACTCTTTTGTAATCGGTTTACAGTAACCGAACC
AGGCTTGAGATATTCCTTATAATTTTAGTGCGACTAATAAACTGGTTATTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ50TF U 1
AF RR2FJ50JQ C 533
BS 1 675 RR2FJ50TF
BS 676 676 RR2FJ50JQ
BS 677 694 RR2FJ50TF
BS 695 1191 RR2FJ50JQ

RD RR2FJ50TF 699 0 0
GGAAAGCAGCTCTCTCTTATAAAATTACAATAATTGAACCCTCTCTCTTCTTCATCTTCT
CTTCTCCGATTGCAACTTGAATCACTCACTACTCGTAGAGAAGAAAGGGATCGCCTTTCA
TCAACTCTCTGTGTCGTATCTCGATTTCGCGACAAAGGTTGATTGCATTCGAGTCCTGAA
GACCTGAAAAAGGAATTTATCACATTCGTGTCAGATAGTTACCTCTGAGGAGTGCCGTCC
TTTTGAACTTATTATTCTCCATGGGAAGTAATGAGAATCTACCACCCAATGTTATCAGGC
AGCTCGCCAAGGAACTCAAGAGTCTTGACGAATCTCCTCCTGAAGGCATCAAGGTTTTGC
TCAATGACGAGGATTTCTCGCAGATATGTGCTGACATTGAAGGACCAGTTGGGACTCCTT
ATGAGAATGGAGTTTTCCGTATGAAGTTAGCACTGTCGCATGATTTTCCTCATTCCCCAC
CTAAAGGCTACTTCATGACAAAGATATTCCATCCCAATATTGCTTCTAATGGAGAGATCT
GCGTTAACACGCTTAAGAAAGATTGGAATCCTAGTCTTGGATTAAGACATGTCCTCTCTG
TTGTGAGGTGCTTACTGATCGAGCCGTTTCCAGAATCTGCATTAAACGAACAGGCTGGGA
AGATGCTACTTGAGA*CTATGAAGAGTATGCTAG
CATGC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2FJ50JQ 659 0 0
AGAGATCTGCGTTAACACGCTTAAGAAAGATTGGAATCCTAGTCTTGGATTAAGACATGT
CCTCTCTGTTGTGAGGTGCTTACTGATCGAGCCGTTTCCAGAATCTGCATTAAACGAACA
GGCTGGGAAGATGCTACTTGAGAACTATGAAGAGTATGCTAGGCATGTTCGGCTTTACAC
GGGTATCCATGCTAAACCGAAACCTAAGTTCAAGACAGGAGCTATCTCAGAGTCAACGAC
GGCTCTAAACGTTGGCCAGACTAACAACGAGACGCCTGGTGCTGCTTCTGCAGCACCCTC
TTCAGTGGCAGACATCAACAGAGTAACAACAACGAGTGGCCAAGACCAACAAGAAGTGAC
TAACAATTCTGTAGCAGCAGCAGGTTCTGCGAGTGTGGTCACTACGACACAGAAAAGGGA
AGCCGGTTTGGCCAAGGTTCAGGCAGACAAGAAGAAGGTAGACGCCAGAAAGAAGAGCTT
GAGGAGACTGTGATGATGCTACTTTTCAAGAGCCATTGTAGGCTTTTATGTAATCAGGCA
TGTCTGGTTATGTTGATTTGTTGGTCTATATAATCACTCTTTTGTAATCGGTTTACAGTA
ACCGAACCAGGCTTGAGATATTCCTTATAATTTTAGTGCGACTAATAAACTGGTTATTA

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL5118Contig1 783 2 2 U
TCTCTCTTCCTCCTCATCCTTTGCTTCAGGGACATGGTCACCATCACAATCATCATCACT
GATCCCTAAGGTCAGATTCCCTGAGGTTTCATCCTTTAACCAGAGAAGCTGGGCATCATC
ATCTAGAGCCCCCCAAGATGGTTACGATGAGCATAAGATCAGCATCGGACCACAAGACAA
GAAAGTTGACAACGACGATGGAAGTGTGGTTTACCACGGCCCAATCTCATCAACCATAAA
GAAAGTGAAACTCCTCTCGCTCTCCACCTGCTGCCTCTCCGTCTCTTTCGGCCCTGTCAT
CACCTTCATGACTTCCCCCGGACTCAACGTGATCATGAAAGGCGCGGTTGCCTCCACCGT
GATCTTCCTCAGCGCTTCCACCACCGCTGCTCTCCACTGGTTCGTCAGCCCTTACGTCCA
CAAGCTGAGGTGGCAGCCTGGTTCCGACACTTTCGAGGTGGAGATGATGACTTGGCTCGC
GACTTTTGCGCCGAAGACGCTGAAGTTTTCGGACGTGCGTTATCCGGACACGCAGAGGCC
GTTTGTGAGCTTTAAGGCGGATGGGGAGTACTACTTTGTGGATGCGGAGCGGTGTCCCAA
CAAGGCGTTGTTGGCTAGGCTTACTCCTCCCAAGGATGCTCATGACTCTGCTTTCAAGAA
CTTGTGATTCCAGATACCGTTTTTCCTCTTCTTTATCATTCTCTATCTTGGGTTTGCATC
ACTTTTGGATCCCTTGGACTACCGGAGAATTCAGATAATAAAAGAGTTTATAAATGCTGA
CAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2AJ09TF U 1
AF RR2AJ09JQ C 85
BS 1 208 RR2AJ09TF
BS 209 783 RR2AJ09JQ

RD RR2AJ09TF 208 0 0
TCTCTCTTCCTCCTCATCCTTTGCTTCAGGGACATGGTCACCATCACAATCATCATCACT
GATCCCTAAGGTCAGATTCCCTGAGGTTTCATCCTTTAACCAGAGAAGCTGGGCATCATC
ATCTAGAGCCCCCCAAGATGGTTACGATGAGCATAAGATCAGCATCGGACCACAAGACAA
GAAAGTTGACAACGACGATGGAAGTGTG

QA 1 208 1 208
DS 

RD RR2AJ09JQ 699 0 0
GGTTTCATCCTTTAACCAGAGAAGCTGGGCATCATCATCTAGAGCCCCCCAAGATGGTTA
CGATGAGCATAAGATCAGCATCGGACCACAAGACAAGAAAGTTGACAACGACGATGGAAG
TGTGGTTTACCACGGCCCAATCTCATCAACCATAAAGAAAGTGAAACTCCTCTCGCTCTC
CACCTGCTGCCTCTCCGTCTCTTTCGGCCCTGTCATCACCTTCATGACTTCCCCCGGACT
CAACGTGATCATGAAAGGCGCGGTTGCCTCCACCGTGATCTTCCTCAGCGCTTCCACCAC
CGCTGCTCTCCACTGGTTCGTCAGCCCTTACGTCCACAAGCTGAGGTGGCAGCCTGGTTC
CGACACTTTCGAGGTGGAGATGATGACTTGGCTCGCGACTTTTGCGCCGAAGACGCTGAA
GTTTTCGGACGTGCGTTATCCGGACACGCAGAGGCCGTTTGTGAGCTTTAAGGCGGATGG
GGAGTACTACTTTGTGGATGCGGAGCGGTGTCCCAACAAGGCGTTGTTGGCTAGGCTTAC
TCCTCCCAAGGATGCTCATGACTCTGCTTTCAAGAACTTGTGATTCCAGATACCGTTTTT
CCTCTTCTTTATCATTCTCTATCTTGGGTTTGCATCACTTTTGGATCCCTTGGACTACCG
GAGAATTCAGATAATAAAAGAGTTTATAAATGCTGACAC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL5119Contig1 595 2 2 U
GCAAGAGCTCCAAGAAAAGTTCTCCGAGAAATCAAGACAGAAGAGGAAGCTCGATGAGAT
GTATGACCAGTTAAGAAGTGAATATGAGTCAGTCAAACGAACATCCATACAACCAGCAAA
TAACTTCTACTCACGACACCAGGAGCCTGACTTTTTCCAAACCAACCAGTTAATATGATG
GAGAACAGAGAGCCCACTCGCAAAGGTTAACTAACTAACAACAACATTATTTCTGTATTT
TGAGCTTAGTGCGCTTGTGATTCTAAGTCTTCTGTTGAGCCTAGTCCTTATCATTTCGCC
TATTAAACGATTTCAGCTCTCTCGTTCCCGCCCTCCACTGTTTACATAGCTTAAGGAACA
AGGTCAAGTGCTCTGAACCTGACTTGGTAGAAGTGGGAGGCATAAGTTGTCACATTCAGT
AAATGACTCTTCTTTTTTTATAAGCTTACTGTCTTATGTTAGTAAACTTAGAGAGAAAGT
GTAGGATTTAAAAAAAAAAACTCTCGTCTAACGAATCATGCTTTAGCAGAATCAATATAG
TGAAACTACCTACAAGGATGTAAGATGACGAACAAACATAAAAGGACACTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F010TF U 1
AF RR2F010JQ C 154
BS 1 311 RR2F010TF
BS 312 595 RR2F010JQ

RD RR2F010TF 312 0 0
GCAAGAGCTCCAAGAAAAGTTCTCCGAGAAATCAAGACAGAAGAGGAAGCTCGATGAGAT
GTATGACCAGTTAAGAAGTGAATATGAGTCAGTCAAACGAACATCCATACAACCAGCAAA
TAACTTCTACTCACGACACCAGGAGCCTGACTTTTTCCAAACCAACCAGTTAATATGATG
GAGAACAGAGAGCCCACTCGCAAAGGTTAACTAACTAACAACAACATTATTTCTGTATTT
TGAGCTTAGTGCGCTTGTGATTCTAAGTCTTCTGTTGAGCCTAGTCCTTATCATTTCGCC
TATTAAACGAT
C

QA 1 311 1 311
DS 

RD RR2F010JQ 442 0 0
TTTCCAAACCAACCAGTTAATATGATGGAGAACAGAGAGCCCACTCGCAAAGGTTAACTA
ACTAACAACAACATTATTTCTGTATTTTGAGCTTAGTGCGCTTGTGATTCTAAGTCTTCT
GTTGAGCCTAGTCCTTATCATTTCGCCTATTAAACGATTTCAGCTCTCTCGTTCCCGCCC
TCCACTGTTTACATAGCTTAAGGAACAAGGTCAAGTGCTCTGAACCTGACTTGGTAGAAG
TGGGAGGCATAAGTTGTCACATTCAGTAAATGACTCTTCTTTTTTTATAAGCTTACTGTC
TTATGTTAGTAAACTTAGAGAGAAAGTGTAGGATTTAAAAAAAAAAACTCTCGTCTAACG
AATCATGCTTTAGCAGAATCAATATAGTGAAACTACCTACAAGGATGTAAGATGACGAAC
AAACATAAAAGGACACTTTTGT

QA 1 442 1 442
DS 



AS 1 2

CO CL5120Contig1 838 2 3 U
AAAGTTTGCAGTGTAATGATCATGCCACATAGTAGATGGAGTTTGGGAGCTAAAGGTTCT
TTGGGAAGAGGACAGCTGCAAAACTGCTCCATTTGCTTCCCATCACTCCCCAGACTCTGT
AACCAAGACCCATCAACCATGCTCTCTTCTCTGACATGTACTCTTTAACTTCCTTGTGCT
CATCTTCTATTCCCCTGAGAATGAGGTTGGACCAGCCATAGTAACCAGCTTGGATGAGGT
TGTCAACAGTGGCAGATCTGAGATATTCTTTACGGGAAGAGACCAAGAAGATCTTGATGC
CTCTTTCTCTGATGTCTTGGTACAGTTTCACTATGTGTGGCACAGCTGGTGCTTTCCTCT
TCCTTATCCAGTCCTCAAATTTAGTAGAGTTCAATTTCTCTCCTCCAAAGAAGCCATTGT
TCTCGTGGTAAGGAATGGTAGAGAGAAGCGTGTCATCGATATCAAAGATCCAAGCGTCCA
TACCATCACACTTCGTCTTGGTACAACACATGCTCCCGAAATGAAGGATGACCTCATCAA
CGGCTCTCTCCACGTCATCCTCGTACTGCGATGACGTCATGTACTTCTTGACGTGCGACA
CGCACTCCTGAGGCACCACATCGAAGTTTCTGATGTTGTGTACTTCCACGTTGATCCTCC
AGCTTTCGCAGTAACGTTTCAGGTTGGTCGAGACCCCTGAAGAAACAATACCGTTTTGGC
TTGAAGATGAAGACAGTCCTTTGAGCTGGTTCAAGATGTTCCAGTCACGAGCTGAGACGA
CTCCGACCAAGAGTGAGGCTAGTGCTAGAGAAAGAACTATGGATCGGTCCATGTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC30JQ U 134
AF RR2BC30TF C 1
BS 1 133 RR2BC30TF
BS 134 287 RR2BC30JQ
BS 288 838 RR2BC30TF

RD RR2BC30JQ 154 0 0
CAACCATGCTCTCTTCTCTGACATGTACTCTTTAACTTCCTTGTGCTCATCTTCTATTCC
CCTGAGAATGAGGTTGGACCAGCCATAGTAACCAGCTTGGATGAGGTTGTCAACAGTGGC
AGATCTGAGATATTCTTTACGGGAAGAGACCAAG

QA 1 154 1 154
DS 

RD RR2BC30TF 838 0 0
AAAGTTTGCAGTGTAATGATCATGCCACATAGTAGATGGAGTTTGGGAGCTAAAGGTTCT
TTGGGAAGAGGACAGCTGCAAAACTGCTCCATTTGCTTCCCATCACTCCCCAGACTCTGT
AACCAAGACCCATCAACCATGCTCTCTTCTCTGACATGTACTCTTTAACTTCTTTGTGCT
CATCTTCTATTCCCCTGAGAATGAGGTTGGACCAGCCATAGTAACCAGCTTGGATGAGGT
TGTCAACAGTGGCAGATCTGAGATATTCTTTACGGGAAGAGACCAAGAAGATCTTGATGC
CTCTTTCTCTGATGTCTTGGTACAGTTTCACTATGTGTGGCACAGCTGGTGCTTTCCTCT
TCCTTATCCAGTCCTCAAATTTAGTAGAGTTCAATTTCTCTCCTCCAAAGAAGCCATTGT
TCTCGTGGTAAGGAATGGTAGAGAGAAGCGTGTCATCGATATCAAAGATCCAAGCGTCCA
TACCATCACACTTCGTCTTGGTACAACACATGCTCCCGAAATGAAGGATGACCTCATCAA
CGGCTCTCTCCACGTCATCCTCGTACTGCGATGACGTCATGTACTTCTTGACGTGCGACA
CGCACTCCTGAGGCACCACATCGAAGTTTCTGATGTTGTGTACTTCCACGTTGATCCTCC
AGCTTTCGCAGTAACGTTTCAGGTTGGTCGAGACCCCTGAAGAAACAATACCGTTTTGGC
TTGAAGATGAAGACAGTCCTTTGAGCTGGTTCAAGATGTTCCAGTCACGAGCTGAGACGA
CTCCGACCAAGAGTGAGGCTAGTGCTAGAGAAAGAACTATGGATCGGTCCATGTTTTG

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 2

CO CL5121Contig1 701 2 2 U
TTTTTGTATCAGAGGGGGGTTTTTGCTTTCTTCATTTTCTGATTGATATCCGCGGTCTCA
CGATGAACCACCTCGTCCGTAAAACTTCCCTCGGTCCCACCGCCGCGAGGTCCATTGGAT
ACCTCCGGCAATCTTCCGCCGCCTCTCCATCCCCGATTTACTCCACCGTCCGCCAGTTCA
CCTCTGCCGGCTATCCATCCAACAGCTTTCAATTAACTCCACCGGTGAACTGGGGAGTAC
GGATAGTACCGGAGAAGAAGGCCTTTGTGATCGAGCGATTCGGGAAATTCGCGAAGACAT
TGCCGTCGGGGATTCACTTCCTCATCCCCTTTGTTGATCGAATTGCTTATGTTCATTCCC
TCAAGGAAGAAGCGATTCCCATTCCTAATCAGACTGCCATTACTAAAGACAACGTTAGCA
TACACATCGACGGCGTTCTCTATGTCAAGATAGTGGATCCTAAGTTAGCTTCTTATGGAG
TTGAGAGTCCTATCTATGCTGTTGTCCAGCTGGCTCAGACCACCATGCGTAGTGAGCTTG
GTAAGATCACCCTTGATAAGACCTTTGAGGAACGAGATACTCTCAACGAGAAGATTGTGG
AAGCCATCAATGTTGTTGCAAGAGACTGGGGTCTTCAGTGTCTTCGTTATGAGATAAAGG
GATATTATGCCCCCTCATGGAGTGAGGGTTGCTATGGGGAT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS76TF U 1
AF RR2AN22TF U 6
BS 1 155 RR2DS76TF
BS 156 701 RR2AN22TF

RD RR2DS76TF 155 0 0
TTTTTGTATCAGAGGGGGGTTTTTGCTTTCTTCATTTTCTGATTGATATCCGCGGTCTCA
CGATGAACCACCTCGTCCGTAAAACTTCCCTCGGTCCCACCGCCGCGAGGTCCATTGGAT
ACCTCCGGCAATCTTCCGCCGCCTCTCCATCCCCG

QA 1 155 1 155
DS 

RD RR2AN22TF 696 0 0
GTATCAGAGGGGGGTTTTTGCTTTCTTCATTTTCTGATTGATATCCGCGGTCTCACGATG
AACCACCTCGTCCGTAAAACTTCCCTCGGTCCCACCGCCGCGAGGTCCATTGGATACCTC
CGGCAATCTTCCGCCGCCTCTCCATCCCCGATTTACTCCACCGTCCGCCAGTTCACCTCT
GCCGGCTATCCATCCAACAGCTTTCAATTAACTCCACCGGTGAACTGGGGAGTACGGATA
GTACCGGAGAAGAAGGCCTTTGTGATCGAGCGATTCGGGAAATTCGCGAAGACATTGCCG
TCGGGGATTCACTTCCTCATCCCCTTTGTTGATCGAATTGCTTATGTTCATTCCCTCAAG
GAAGAAGCGATTCCCATTCCTAATCAGACTGCCATTACTAAAGACAACGTTAGCATACAC
ATCGACGGCGTTCTCTATGTCAAGATAGTGGATCCTAAGTTAGCTTCTTATGGAGTTGAG
AGTCCTATCTATGCTGTTGTCCAGCTGGCTCAGACCACCATGCGTAGTGAGCTTGGTAAG
ATCACCCTTGATAAGACCTTTGAGGAACGAGATACTCTCAACGAGAAGATTGTGGAAGCC
ATCAATGTTGTTGCAAGAGACTGGGGTCTTCAGTGTCTTCGTTATGAGATAAAGGGATAT
TATGCCCCCTCATGGAGTGAGGGTTGCTATGGGGAT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL5122Contig1 1042 2 4 U
GGGAAGCTCTATGATGAAGTTAAGGGGAGTCAAACTGTGCGGAGAGAGTATGATGAAAAG
TGCAGAGTTCTAAGAGAACTTGAATCAGAAGGCAAAGGTTCAAAAACAATAGACAAGACA
CGTGCGGTAGTCAAGGACCTTCACTCCAGAATCAGAGTGGCTATTCATAGGATCGACTCA
ATATCGAGACGGATTGAAGAGCTCCGTGACAAAGAGCTGCAACCTCAACTCGAGGAACTC
ATTGAAGGGTTGAGTCGAATGTGGGAAGTGATGTTGGAATGCCACAAGGTTCAGTTTAGG
TTAATCTCAGCGTGTCACAGAAGCGGTAACATTAAACTCAACATGCAGTCAGAGCTGCAC
AGACAAGTAACATGTCACCTAGAAGATGAACTCAGGGGGTTGGCTTCAAGCTTCACAAAG
TGGATCACAGGTCAAAGATCATATGTTAAAGCTATAAACGAATGGCTGGAGAAATGTGTC
ACCTTACCACAAAGATCCTCCAAGCGGAAAAGGCGCGTGCCTGAAATCTCTCCGAGGAAC
CATGGTCCTCCCATTTACGCAACATGTGGGATCTGGCTAGAGAAGCTCGAAGCTTTGCCT
ACCAAAGAGGTTTCGAGCTCCATCAAAGCGCTTGCTTCTGATGTCGCCAGGTTCTTGCCA
CGGCAGGAGAAGAATCGCAACAAGAAACATCGGTCTGGCGAGAACCAAAACGATCACCTG
TTGCAAGATGAGACATTGGAAGATTGTGGTCCGGGATTTGATCGGTTTAGGACACGCTTG
GAAGGATTTGCTGGCCAGCTCAACCAGTTTGCAGAATTGTCTGTGAAATTGTATGAGGAA
CTTAAGAAGGGTATCCAAGAAGCCAAGAACAAGTACGAGCATATGAAGGCTTATTCCCAG
GGTAATTAAGATTTATTTTATTTTTTTCATTTTCTGGTAAGAATGGAGTTTGTGACAGGT
CAAAGTTTTAAAGAGACAAATTGGATTAAACATTTGTAAATGCGAGAGAGGTATGAGGTA
TCTATTATAAGAAAATTGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK94TF U 1
AF RR2FK94JQ C 521
BS 1 666 RR2FK94TF
BS 667 667 RR2FK94JQ
BS 668 679 RR2FK94TF
BS 680 1042 RR2FK94JQ

RD RR2FK94TF 686 0 0
GGGAAGCTCTATGATGAAGTTAAGGGGAGTCAAACTGTGCGGAGAGAGTATGATGAAAAG
TGCAGAGTTCTAAGAGAACTTGAATCAGAAGGCAAAGGTTCAAAAACAATAGACAAGACA
CGTGCGGTAGTCAAGGACCTTCACTCCAGAATCAGAGTGGCTATTCATAGGATCGACTCA
ATATCGAGACGGATTGAAGAGCTCCGTGACAAAGAGCTGCAACCTCAACTCGAGGAACTC
ATTGAAGGGTTGAGTCGAATGTGGGAAGTGATGTTGGAATGCCACAAGGTTCAGTTTAGG
TTAATCTCAGCGTGTCACAGAAGCGGTAACATTAAACTCAACATGCAGTCAGAGCTGCAC
AGACAAGTAACATGTCACCTAGAAGATGAACTCAGGGGGTTGGCTTCAAGCTTCACAAAG
TGGATCACAGGTCAAAGATCATATGTTAAAGCTATAAACGAATGGCTGGAGAAATGTGTC
ACCTTACCACAAAGATCCTCCAAGCGGAAAAGGCGCGTGCCTGAAATCTCTCCGAGGAAC
CATGGTCCTCCCATTTACGCAACATGTGGGATCTGGCTAGAGAAGCTCGAAGCTTTGCCT
ACCAAAGAGGTTTCGAGCTCCATCAAAGCGCTTGCTTCTGATGTCGCCAGGTTCTTGCCA
CGGCAG*AGAAGAATCGCA
CAGAAAC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2FK94JQ 522 0 0
CTGAAATCTTTCCGAGGAACCATGGTCCTCCCATTTACGCAACATGTGGGATCTGGCTAG
AGAAGCTCGAAGCTTTGCCTACCAAAGAGGTTTCGAGCTCCATCAAAGCGCTTGCTTCTG
ATGTCGCCAGGTTCTTGCCACGGCAGGAGAAGAATCGCAACAAGAAACATCGGTCTGGCG
AGAACCAAAACGATCACCTGTTGCAAGATGAGACATTGGAAGATTGTGGTCCGGGATTTG
ATCGGTTTAGGACACGCTTGGAAGGATTTGCTGGCCAGCTCAACCAGTTTGCAGAATTGT
CTGTGAAATTGTATGAGGAACTTAAGAAGGGTATCCAAGAAGCCAAGAACAAGTACGAGC
ATATGAAGGCTTATTCCCAGGGTAATTAAGATTTATTTTATTTTTTTCATTTTCTGGTAA
GAATGGAGTTTGTGACAGGTCAAAGTTTTAAAGAGACAAATTGGATTAAACATTTGTAAA
TGCGAGAGAGGTATGAGGTATCTATTATAAGAAAATTGCTCC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 2

CO CL5123Contig1 964 2 4 U
GGGGAAAATCTCGTCTGTGTATTTGAATCAGAGGATATTTTTAGTATGGGAATCCAATTG
TTTGACAAGGCGGATCTATGGAAGAGCTTGCTGTTACTCAAGGTCCAGCTCCGTGATCGA
TTTCGAATCGCCGTCGACGATCACCGTGGCAGAGCCGCGGTTTTGTATACGGACGGTTAC
TTCTCTTCCTCCTTCCACCGCTTGGCTGCTCGATTCCGGAACTTCCGCCGCGAGTCTCCC
CCTTCTGCCCCAGCTTTCTATCGCAGAAGAGTTCCTAAAGACTTGACGGCAGAAGAAGAG
TCTGCTCTCTTCCGGATGCTTCAAGCTGTGGCTGTTCCACTTATCGGAAACGCTTGTCAT
GTTTTCATGAATGGCCTTAACCGTGTTCAGGTGTATGGTTTAGAGAAGTTGCATGATGCT
CTGCTCAACAGACCAAAGAATAAGCCTCTTGTGACGGTTAGCAATCATGTGGCTTCCTTA
GATGATCCATTTGTCATTGCTTCGTTGCTTCCGCCTAAGCTTCTACTTGATGCGCGTAAT
TTGAGGTGGACGCTTTGTGCTACAGATAGATGCTTTAAGAACCCTGTAACTTCAGCTTTC
TTCCGATCCGTCAAGGTTTTGCCAGTTTCACGCGGTGAAGGAATTTATCAGCAGGGAATG
GACATTGCGATTTCGAAGCTGAATAGTGGAGGGTGGGTTCACATATTTCCAGAAGGTAGT
CGCTCTCGAGATGGTGGTAAAACTATGAGTGCAGCAAAAAGAGGTATTGGAAAGTTGATT
TTGGACGCAGATACCCTCCCCATGGTTGTTCCATTTGTGCATACTGGTATGCAAGATATA
ATGCCTATAGAGCCAGTGTTCCACGGATTGGCAAACAGTGACAGTAATCATTGGAGATCC
TATTCACTTAAGCGACTTTCAGACACTGAGAGCAAAACGTCAGAGCAGTGTACGACGCTG
TATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2DE43TF U 1
AF RR2G513TF U 231
BS 1 251 RR2DE43TF
BS 252 252 RR2G513TF
BS 253 401 RR2DE43TF
BS 402 964 RR2G513TF

RD RR2DE43TF 404 0 0
GGGGAAAATCTCGTCTGTGTATTTGAATCAGAGGATATTTTTAGTATGGGAATCCAATTG
TTTGACAAGGCGGATCTATGGAAGAGCTTGCTGTTACTCAAGGTCCAGCTCCGTGATCGA
TTTCGAATCGCCGTCGACGATCACCGTGGCAGAGCCGCGGTTTTGTATACGGACGGTTAC
TTCTCTTCCTCCTTCCACCGCTTGGCTGCTCGATTCCGGAACTTCCGCCGCGAGTCTCCC
CCTTCTGCCCCTGCTTTCTATCGCAGAAGAGTTCCTAAAGACTTGACGGCAGAAGAAGAG
TCTGCTCTCTTCCGGATGCTTCAAGCTGTGGCTGTTCCACTTATCGGAAACGCTTGTCAT
GTTTTCATGAATGGCCTTAACCGTGTTCAGGTGTATGGTTT
GGA

QA 1 401 1 401
DS 

RD RR2G513TF 734 0 0
G
GAGTCTCTCCCTTCTGCCCCAGCTTTCTATCGCAGAAGAGTTCCTAAAGATTTGACGGCA
GAAGAAGAGTCTGCTCTCTTCCGGATGCTTCAAGCTGTGGCTGTTCCACTTATCGGAAAT
GCTTGTCATGTTTTCATGAATGGTCTTAACCGTGTTCAGGTGTATGGTTTAGAGAAGTTG
CATGATGCTCTGCTCAACAGACCAAAGAATAAGCCTCTTGTGACGGTTAGCAATCATGTG
GCTTCCTTAGATGATCCATTTGTCATTGCTTCGTTGCTTCCGCCTAAGCTTCTACTTGAT
GCGCGTAATTTGAGGTGGACGCTTTGTGCTACAGATAGATGCTTTAAGAACCCTGTAACT
TCAGCTTTCTTCCGATCCGTCAAGGTTTTGCCAGTTTCACGCGGTGAAGGAATTTATCAG
CAGGGAATGGACATTGCGATTTCGAAGCTGAATAGTGGAGGGTGGGTTCACATATTTCCA
GAAGGTAGTCGCTCTCGAGATGGTGGTAAAACTATGAGTGCAGCAAAAAGAGGTATTGGA
AAGTTGATTTTGGACGCAGATACCCTCCCCATGGTTGTTCCATTTGTGCATACTGGTATG
CAAGATATAATGCCTATAGAGCCAGTGTTCCACGGATTGGCAAACAGTGACAGTAATCAT
TGGAGATCCTATTCACTTAAGCGACTTTCAGACACTGAGAGCAAAACGTCAGAGCAGTGT
ACGACGCTGTATC

QA 2 734 2 734
DS 



AS 1 2

CO CL5124Contig1 1274 2 4 U
GTGAGGGAAAAGAAGGCGATGCGAAGCGAATGAAGAAAAAGCCAGAGAGCTCTGGCGTGA
ACAAGTGAAGAAGAAGAAGAGAGAGGGAGGAATGGGTACTCCTTGGTACTTTGTCGCACT
ACTTCTCACTATTCTTACCAGTTCTCAGGGAATTTTAACAAGTCTTTCTCAAAATGAAGG
AGGAGGTTATAACTACGATTACGCTACTGTTCCCTTTCTTGCCGAAGTCTTCAAGCTGAT
CATTTCTGGTCTGTTTCTCTGGAGAGAAACGAAGACATCTTCTTCAAAGATTACTAAGGA
TTGGAAGAGCGTGCGCTTATTTGTCATTCCTTCTATTATATATCTCATCCATAACAATGT
CCAGTTTGCTACATTGACCTATGTGGACACATCCACTTATCAGATCATGGGTAATCTCAA
GATTGTCACCACTGCCATTCTCTTTAGGTTATTTTTGAAGAGGAAATTATCAAACCTTCA
GTGGATGGCTATTGGTCTTTTAGCTGTTGGTACTACCACCAGCCAGGTTAAGGGTTGTGG
AGAAGCTTCATGTGATTCACTATTCACAGCACCAATACAAGGCTATTTGTTGGGTATTCT
CTCAGCCGCTTTGTCCGCACTAGTCGGAACCTACACTGAGTTTCTGATGAAGAGAAACAA
TGACAGCTTATACTGGCAAAACTTGCAGTTGTATACGTAGGTTTGGTTCACTTTTCAACG
TTGCTCGGCTTATAGCAGATGATTTCAGACTCGGGTTTGAAAAGGGTCCTTGGTGGCAAC
GTATCTTTGATGGCTATAGCATCACCACTTGGTTGGTTGTTCTTAATCTCGGATCCACCG
GCTTACTCGTCTCTTGGTTAATGAAGTACGCAGACAATATCGTCAAGGTATATTTTACTT
CAATGGCCATGCTACTTACTATGGTAGCATCCATATACCTCTTCAGCTTCAAACCAACGG
TCCAGCTTTTCTTGGGTATAATCATATGCATCATGTCACTCCACATGTACTTTGCTCCTC
CACAAACGCTGGTGGACTTGCCCGTCACAAACGAAGCGCATCCGAAGACCTTAAAGCAAG
TTGTCGTAGAAGAAAAGACAGATTCTTGATTCAAAGGGACGAAATGGTTTATTATTACGA
AAATTCTCATCAGTGAAGATGGTCTTACAATTTTTTACGTGCTAGTAAATGGCTTCACCT
TCCTTGGTATATGACTACTTAAACAATGATCTTATAAGTTCACTTGGAATTTATATATTT
GATGTGTCATACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU14TF U 1
AF RR2CU14JQ C 543
BS 1 680 RR2CU14TF
BS 681 681 RR2CU14JQ
BS 682 696 RR2CU14TF
BS 697 1274 RR2CU14JQ

RD RR2CU14TF 696 0 0
GTGAGGGAAAAGAAGGCGATGCGAAGCGAATGAAGAAAAAGCCAGAGAGCTCTGGCGTGA
ACAAGTGAAGAAGAAGAAGAGAGAGGGAGGAATGGGTACTCCTTGGTACTTTGTCGCACT
ACTTCTCACTATTCTTACCAGTTCTCAGGGAATTTTAACAAGTCTTTCTCAAAATGAAGG
AGGAGGTTATAACTACGATTACGCTACTGTTCCCTTTCTTGCCGAAGTCTTCAAGCTGAT
CATTTCTGGTCTGTTTCTCTGGAGAGAAACGAAGACATCTTCTTCAAAGATTACTAAGGA
TTGGAAGAGCGTGCGCTTATTTGTCATTCCTTCTATTATATATCTCATCCATAACAATGT
CCAGTTTGCTACATTGACCTATGTGGACACATCCACTTATCAGATCATGGGTAATCTCAA
GATTGTCACCACTGCCATTCTCTTTAGGTTATTTTTGAAGAGGAAATTATCAAACCTTCA
GTGGATGGCTATTGGTCTTTTAGCTGTTGGTACTACCACCAGCCAGGTTAAGGGTTGTGG
AGAAGCTTCATGTGATTCACTATTCACAGCACCAATACAAGGCTATTTGTTGGGTATTCT
CTCAGCCGCTTTGTCCGCACTAGTCGGAACCTACACTGAGTTTCTGATGAAGAGAAACAA
TGACAGCTTATACTGGCAAA*CTTGCAGTTGTATAC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2CU14JQ 732 0 0
AAGCTTCATGTGATTCACTATTCACAGCACCAATACAAGGCTATTTGTTGGGTATTCTCT
CAGCCGCTTTGTCCGCACTAGTCGGAACCTACACTGAGTTTCTGATGAAGAGAAACAATG
ACAGCTTATACTGGCAAAACTTGCAGTTGTATACGTAGGTTTGGTTCACTTTTCAACGTT
GCTCGGCTTATAGCAGATGATTTCAGACTCGGGTTTGAAAAGGGTCCTTGGTGGCAACGT
ATCTTTGATGGCTATAGCATCACCACTTGGTTGGTTGTTCTTAATCTCGGATCCACCGGC
TTACTCGTCTCTTGGTTAATGAAGTACGCAGACAATATCGTCAAGGTATATTTTACTTCA
ATGGCCATGCTACTTACTATGGTAGCATCCATATACCTCTTCAGCTTCAAACCAACGGTC
CAGCTTTTCTTGGGTATAATCATATGCATCATGTCACTCCACATGTACTTTGCTCCTCCA
CAAACGCTGGTGGACTTGCCCGTCACAAACGAAGCGCATCCGAAGACCTTAAAGCAAGTT
GTCGTAGAAGAAAAGACAGATTCTTGATTCAAAGGGACGAAATGGTTTATTATTACGAAA
ATTCTCATCAGTGAAGATGGTCTTACAATTTTTTACGTGCTAGTAAATGGCTTCACCTTC
CTTGGTATATGACTACTTAAACAATGATCTTATAAGTTCACTTGGAATTTATATATTTGA
TGTGTCATACCT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL5125Contig1 1260 2 2 U
GGGTGTGTAATCTGATTCCTACACTCAGAGTCTTCAACGGCGTCAATGTCTGAGAACGCA
GCCAACAACAACAACATGGAGAAGAACCAGATTTGTAAAGACGGCATCGTGTCTGAACTA
CAGAAGAAGAAAGTCCATCTCTTTTACTGCCTAGAGTGTGAAGAACTAGCTCGCAACATC
GCCTCTGAATCTGATCACATCACTCTCCAATCCATCAACTGGAGGAGCTTTGCTGATGGG
TTCCCAAATCTGTTTATTAACAACGCACATGAGATCAGAGGACAGCACGTTGCTTTCCTT
GCTTCGTTCAGTTCTCCTGCGGTCATCTTTGAGCAGATCTCTGTCATTTACTTGCTCCCT
CGCTTGTTTGTTGCTTCCTTCACGTTGGTGTTGCCTTTCTTCCCTACTGGGTCCTTTGAG
AGGATGGAAGAGGAAGGAGACGTAGCTACTGCTTTCACCATGGCTAGGATTGTGTCTAAC
ATCCCCATTTCGCGTGGTGGTCCCACTAGTGTAGTCATCTATGGCATCCACGCCCTACAG
GAAAGGTTTTACTTTGCTGATCAGGTTCTTCCTTTGTTTGAGACTGGTATCCCCTTGTTG
ACCAAACGTCTTCAGCAACTTCCTGAAACTGACAAGATCATAGTTGCATTTCCGGATGAT
GGAGCCTGGAAGCGTTTCCACAAGCTGTTGGATCAGTATCCCACGGTGGTGTGCACAAAG
GTTCGTGAAGGTGATAAGAGAATAGTCAGGCTGAAGGAAGGGAACCCCGCTGGTTGCCAC
GTTGTCATCGTTGATGATCTTGTGCAATCTGGTGGTACACTCATTGAATGCCAGAAAGTA
TTGGCAGCTCATGGAGCTGCGAAGGTGAGTGCTTATGTAACTCACGGTGTCTTCCCAAAG
AGCTCCTGGGAGCGTTTCACTCACAAGAACAATGGATCAGAGGAAGCGTTTGCATACTTT
TGGATCACGGATTCTTGTCCAAAGACGGTTAAGTCCATAGGAAACAAGGCACCTTTTGAA
GTCTTGAGCCTCGCAGGATCCATTGCTGATGCTTTGCAGATTTGAAACAAATACCTTGCT
GGTCTTTGGTTGGTTGTTTCGCCTTGGTGTTGTACTCTTAAGAGATGTTACCTAGATTAT
CAATTTATGAAATAATCATATCACTTTTGCTGAGAGACAGATTGTTGAAACCTCGTACCG
CTGTTCTTGACTTATTGTTGATTGATCTTTGTTTGCAACGGAATGAATTGTTAAGTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ56TF U 1
AF RR2BZ56JQ C 497
BS 1 648 RR2BZ56TF
BS 649 1260 RR2BZ56JQ

RD RR2BZ56TF 648 0 0
GGGTGTGTAATCTGATTCCTACACTCAGAGTCTTCAACGGCGTCAATGTCTGAGAACGCA
GCCAACAACAACAACATGGAGAAGAACCAGATTTGTAAAGACGGCATCGTGTCTGAACTA
CAGAAGAAGAAAGTCCATCTCTTTTACTGCCTAGAGTGTGAAGAACTAGCTCGCAACATC
GCCTCTGAATCTGATCACATCACTCTCCAATCCATCAACTGGAGGAGCTTTGCTGATGGG
TTCCCAAATCTGTTTATTAACAACGCACATGAGATCAGAGGACAGCACGTTGCTTTCCTT
GCTTCGTTCAGTTCTCCTGCGGTCATCTTTGAGCAGATCTCTGTCATTTACTTGCTCCCT
CGCTTGTTTGTTGCTTCCTTCACGTTGGTGTTGCCTTTCTTCCCTACTGGGTCCTTTGAG
AGGATGGAAGAGGAAGGAGACGTAGCTACTGCTTTCACCATGGCTAGGATTGTGTCTAAC
ATCCCCATTTCGCGTGGTGGTCCCACTAGTGTAGTCATCTATGGCATCCACGCCCTACAG
GAAAGGTTTTACTTTGCTGATCAGGTTCTTCCTTTGTTTGAGACTGGTATCCCCTTGTTG
ACCAAACGTCTTCAGCAACTTCCTGAAACTGACAAGATCATAGTTGCA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2BZ56JQ 764 0 0
TGT
GTCCCACTAGTGTAGTCATCTATGGCATCCACGCCCTACAGGAAAGGTTTTACTTTGCTG
ATCAGGTTCTTCCTTTGTTTGAGACTGGTATCCCCTTGTTGACCAAACGTCTTCAGCAAC
TTCCTGAAACTGACAAGATCATAGTTGCATTTCCGGATGATGGAGCCTGGAAGCGTTTCC
ACAAGCTGTTGGATCAGTATCCCACGGTGGTGTGCACAAAGGTTCGTGAAGGTGATAAGA
GAATAGTCAGGCTGAAGGAAGGGAACCCCGCTGGTTGCCACGTTGTCATCGTTGATGATC
TTGTGCAATCTGGTGGTACACTCATTGAATGCCAGAAAGTATTGGCAGCTCATGGAGCTG
CGAAGGTGAGTGCTTATGTAACTCACGGTGTCTTCCCAAAGAGCTCCTGGGAGCGTTTCA
CTCACAAGAACAATGGATCAGAGGAAGCGTTTGCATACTTTTGGATCACGGATTCTTGTC
CAAAGACGGTTAAGTCCATAGGAAACAAGGCACCTTTTGAAGTCTTGAGCCTCGCAGGAT
CCATTGCTGATGCTTTGCAGATTTGAAACAAATACCTTGCTGGTCTTTGGTTGGTTGTTT
CGCCTTGGTGTTGTACTCTTAAGAGATGTTACCTAGATTATCAATTTATGAAATAATCAT
ATCACTTTTGCTGAGAGACAGATTGTTGAAACCTCGTACCGCTGTTCTTGACTTATTGTT
GATTGATCTTTGTTTGCAACGGAATGAATTGTTAAGTTCAC

QA 4 764 4 764
DS 



AS 1 2

CO CL5126Contig1 1240 2 4 U
GAGTTGGCGAAAAGCTCGTCGAGGATGTGAAAAAGGCGGGAGGGATAATAACGATGGATG
ACTTAAGAAGCTATAAAGTCAGAGTCACCAATGCGATGGCCGTGGATGTTATGGGTTACA
GGATCTACGGAATGCCACCACCGTCGAGCGGAACGGTTGGTTTCTCGATGGTTATGGACA
TCTTGGACAGCTACTCGGAGCTATACACTAGTTCAGGTTCTGACCTTGGTCTGCACCGTT
TGATAGAAGCAATGAAACATATGTTCGCAGCTCGTATGGATCTTGGAGACCCTGAGTTTG
TCGACATAACAAACGCTATGAAGCAAATGCTATCAAAGCCTCGCGCGGAAAGTATACGAG
AGAGGATCTTGGACAACACCACGTTCCCTCCTGAGCACTACTTGAACCGTTGGAGCCAGC
TCAGGGACCAAGGGACGAGTCATTTCAGCATTGTGGATTCGGACAGAAACACCGTGTCTA
TGACAACAACAGTGAACTTTGTTTTCGGTGCTAAAGTCTTGTCTCCTTCCACGGGGATCG
TGCTGAACAACGAGATGGATGATTTCTCTGTACCGACGGAGAACACTCCTGACAATCTCC
CTCCAGCTCCTACGAACTTCATCGAACCAAACAAGAGACCTTTGTCTTCCATGACACCTC
TTGTTATCACCAAGGACGGTGAGTTGGTGGCGACGCTTGGAGGAAGTGGAGGAATGAAGA
TAATCCCGGCAGTGGTTCAAGTCTTCCTTAACTTCTTTGTGTTGAAGATGAAACCATTAG
AAGCTGTAGAGAGTGCAAGAGTTTACCACAAGTTAGTACCTAACGTTGTTCAATATGAGA
ACTTCACGGCGATTAACGGTGATCACATAGGAGTTACTAAAGATAGTAAGATGTTCTTAG
CAGAGAGGGGACATGAACTTGAGGAGATATCAGGTGGAGCTATTGTTCAACTAATTGTTC
AGAGTCTCAAGGAAGAAGAAGATAAAGAGAAAATTATTGAACTTGGAAGGAAGCTTGGTA
AAGACTCTACCAAGAGATTGAAACCGTTCAAGGGATTGCTCACTGCAGTTAGCGATCCTC
GTAAAGATGGTAAGCCAGCTGCAGTTTGATTTATACTAATAGTTTCCTCATATTCAAGTA
TCATTTTTCTATCATGTAAAGTTTAATAAACCATGTATATAAACTTCATTGTTATAAATT
GTAAAATCAAACCAAAAGTTATTACATTATTTTCACAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH68TF U 1
AF RR2FH68JQ C 545
BS 1 674 RR2FH68TF
BS 675 675 RR2FH68JQ
BS 676 698 RR2FH68TF
BS 699 1240 RR2FH68JQ

RD RR2FH68TF 698 0 0
GAGTTGGCGAAAAGCTCGTCGAGGATGTGAAAAAGGCGGGAGGGATAATAACGATGGATG
ACTTAAGAAGCTATAAAGTCAGAGTCACCAATGCGATGGCCGTGGATGTTATGGGTTACA
GGATCTACGGAATGCCACCACCGTCGAGCGGAACGGTTGGTTTCTCGATGGTTATGGACA
TCTTGGACAGCTACTCGGAGCTATACACTAGTTCAGGTTCTGACCTTGGTCTGCACCGTT
TGATAGAAGCAATGAAACATATGTTCGCAGCTCGTATGGATCTTGGAGACCCTGAGTTTG
TCGACATAACAAACGCTATGAAGCAAATGCTATCAAAGCCTCGCGCGGAAAGTATACGAG
AGAGGATCTTGGACAACACCACGTTCCCTCCTGAGCACTACTTGAACCGTTGGAGCCAGC
TCAGGGACCAAGGGACGAGTCATTTCAGCATTGTGGATTCGGACAGAAACACCGTGTCTA
TGACAACAACAGTGAACTTTGTTTTCGGTGCTAAAGTCTTGTCTCCTTCCACGGGGATCG
TGCTGAACAACGAGATGGATGATTTCTCTGTACCGACGGAGAACACTCCTGACAATCTCC
CTCCAGCTCCTACGAACTTCATCGAACCAAACAAGAGACCTTTGTCTTCCATGACACCTC
TTGTTATCACCAAG*ACGGTGAGTTGGTGGCGACGCTT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2FH68JQ 696 0 0
GAACAACGAGATGGATGATTTCTCTGTACCGACGGAGAACACTCCTGACAATCTCCCTCC
AGCTCCTACGAACTTCATCGAACCAAACAAGAGACCTTTGTCTTCCATGACACCTCTTGT
TATCACCAAGGACGGTGAGTTGGTGGCGACGCTTGGAGGAAGTGGAGGAATGAAGATAAT
CCCGGCAGTGGTTCAAGTCTTCCTTAACTTCTTTGTGTTGAAGATGAAACCATTAGAAGC
TGTAGAGAGTGCAAGAGTTTACCACAAGTTAGTACCTAACGTTGTTCAATATGAGAACTT
CACGGCGATTAACGGTGATCACATAGGAGTTACTAAAGATAGTAAGATGTTCTTAGCAGA
GAGGGGACATGAACTTGAGGAGATATCAGGTGGAGCTATTGTTCAACTAATTGTTCAGAG
TCTCAAGGAAGAAGAAGATAAAGAGAAAATTATTGAACTTGGAAGGAAGCTTGGTAAAGA
CTCTACCAAGAGATTGAAACCGTTCAAGGGATTGCTCACTGCAGTTAGCGATCCTCGTAA
AGATGGTAAGCCAGCTGCAGTTTGATTTATACTAATAGTTTCCTCATATTCAAGTATCAT
TTTTCTATCATGTAAAGTTTAATAAACCATGTATATAAACTTCATTGTTATAAATTGTAA
AATCAAACCAAAAGTTATTACATTATTTTCACAGTT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL5127Contig1 1342 2 4 U
GGATTGTGTAGGGGGTTGATGGCGGAGGAAGTGGAATTGTCGCCGTTGGTTCCACCGACG
CCGGTGATGGATCCATCCGAGATCGATCTCGAAGCTGGACATGGCGAACAAATTCAGTGT
CGAATCTGCCTTGAATCTGACGGTAGAGATTTTATTGCACCTTGCAAATGCGAAGGAACA
TCAAAGTATGTACATCGTGATTGTTTGGATCACTGGAGAGCTATTAAGGAAGGTTTTGCG
TTTGCGCACTGCACAACTTGCAAGGCACCGTATTATCTTCGAGTACACGGTGCGGGTGAT
AGGAAACGGAGGACCTTGAAGTTTCGCTTCTTTGTTACTCGTGACATCTTATCCATCTTT
CTTGCTGTTCAGCTTGTGATTGCTGCGTTGGCATACATGGTCTATTTCATTGATAGCTAC
CAGCAGTCATGGCTTCGTCATATTTGGGGTTTTGACAGTGAGGTCACGTTCTATTACATG
TCTGGAGCTTTACTATTCTTTGCTCTGCTGAGTCTATCTGGATGCTTCATAACTTGCTAC
GACCGCAGAGTTCGCAATGATCTAGCTCAGCCTTGCCGTGAATTGTGTCTCTGTTGCTGT
TAGCCTGGACTGCCATCTACCGGGAACTATTTGTATGTGGGCAGATTGCACAGCATGTAC
TGAAGGTTGTGCAAGTGCAGTTAGTGAATGTAGTGGTTGCCTTGGAGGTGCAGGGGAAGC
CGGATTGCCATTGCTCTTCATTATGGCATTAGTAGTTCTTGGTTTGTTTACGGTTATAGG
AATATTCTACAGCGTATTGGTTGCAACCATGGTTGGACAACGTATTTGGCAGCGCCATTA
TCACATTCTCGCTAAAAGAATGCTAACAAAGGAGTATGTGGTTGAGGATGTAGATGGGGA
AATGATGGGATCTGAATGGTCGCCACCCGCTTTACCGTCTGAGCATGTCCAGCAGCTGAA
GACGCTTGGCCTTCTGTGAAAACAATATTGGCTTGTGATTGAATGCTATGGAAAGATTTT
TCAACTGCTTACAGGGGAATTCCATCTGATCAAGAGGTGAGAGATAAGACAAGAGTTTGA
AGATTATGAATGTTAGAATCTTAGAGATGCTTCGTATTTGTAAAGGAACGATCCCAAATT
TAGAGTCAGAGACCTCCTCCCATTGACGAATTGAGTTTTCATGTCGAATGTTTATTCTTA
ACGGTTTGTTATATAGGTAAATATGCAGAAGTGTTGTTTTCTCGTGGATATTTTTTGCCA
CAACCAATCACCCCCAAAATGTTATAGACAGCCAAAATGTAGTTTAAAACAATAAATGTC
AACAATTAAGCTTTCTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG23TF U 1
AF RR2CG23JQ C 555
BS 1 665 RR2CG23TF
BS 666 666 RR2CG23JQ
BS 667 707 RR2CG23TF
BS 708 1342 RR2CG23JQ

RD RR2CG23TF 711 0 0
GGATTGTGTAGGGGGTTGATGGCGGAGGAAGTGGAATTGTCGCCGTTGGTTCCACCGACG
CCGGTGATGGATCCATCCGAGATCGATCTCGAAGCTGGACATGGCGAACAAATTCAGTGT
CGAATCTGCCTTGAATCTGACGGTAGAGATTTTATTGCACCTTGCAAATGCGAAGGAACA
TCAAAGTATGTACATCGTGATTGTTTGGATCACTGGAGAGCTATTAAGGAAGGTTTTGCG
TTTGCGCACTGCACAACTTGCAAGGCACCGTATTATCTTCGAGTACACGGTGCGGGTGAT
AGGAAACGGAGGACCTTGAAGTTTCGCTTCTTTGTTACTCGTGACATCTTATCCATCTTT
CTTGCTGTTCAGCTTGTGATTGCTGCGTTGGCATACATGGTCTATTTCATTGATAGCTAC
CAGCAGTCATGGCTTCGTCATATTTGGGGTTTTGACAGTGAGGTCACGTTCTATTACATG
TCTGGAGCTTTACTATTCTTTGCTCTGCTGAGTCTATCTGGATGCTTCATAACTTGCTAC
GACCGCAGAGTTCGCAATGATCTAGCTCAGCCTTGCCGTGAATTGTGTCTCTGTTGCTGT
TAGCCTGGACTGCCATCTACCGGGAACTATTTGTATGTGGGCAGATTGCACAGCATGTAC
TGAAG*TTGTGCAAGTGCAGTTAGTGAATGTAGTGGTTGCCTTGGAG
TGCA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2CG23JQ 788 0 0
CAATGATCTAGCTCAGCCTTGCCGTGAATTGTGTCTCTGTTGCTGTTAGCCTGGACTGCC
ATCTACCGGGAACTATTTGTATGTGGGCAGATTGCACAGCATGTACTGAAGGTTGTGCAA
GTGCAGTTAGTGAATGTAGTGGTTGCCTTGGAGGTGCAGGGGAAGCCGGATTGCCATTGC
TCTTCATTATGGCATTAGTAGTTCTTGGTTTGTTTACGGTTATAGGAATATTCTACAGCG
TATTGGTTGCAACCATGGTTGGACAACGTATTTGGCAGCGCCATTATCACATTCTCGCTA
AAAGAATGCTAACAAAGGAGTATGTGGTTGAGGATGTAGATGGGGAAATGATGGGATCTG
AATGGTCGCCACCCGCTTTACCGTCTGAGCATGTCCAGCAGCTGAAGACGCTTGGCCTTC
TGTGAAAACAATATTGGCTTGTGATTGAATGCTATGGAAAGATTTTTCAACTGCTTACAG
GGGAATTCCATCTGATCAAGAGGTGAGAGATAAGACAAGAGTTTGAAGATTATGAATGTT
AGAATCTTAGAGATGCTTCGTATTTGTAAAGGAACGATCCCAAATTTAGAGTCAGAGACC
TCCTCCCATTGACGAATTGAGTTTTCATGTCGAATGTTTATTCTTAACGGTTTGTTATAT
AGGTAAATATGCAGAAGTGTTGTTTTCTCGTGGATATTTTTTGCCACAACCAATCACCCC
CAAAATGTTATAGACAGCCAAAATGTAGTTTAAAACAATAAATGTCAACAATTAAGCTTT
CTTTTTTC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL5128Contig1 741 2 2 U
TCTCACAACCAGAAAAGAAAAAAACAAGATGGTTCTAAGTCGAGCGGCCCGCGAAAGTGA
CGAAAATGTTTGCTCGACGTTCGGATCTCGCTATGTCCGCACTTCTTTGCCCAAGTATGA
GATTGGTGAGGGCTCGATACCGAAGGAGGCTGCGTATCAGATCATAAAAGATGAGCTGAT
GCTTGATGGTAACCCGAGGCTTAACCTGGCTTCCTTTGTGACGACATGGATGGAGCCTGA
GTGTGACAAACTCATTATGGAATCCATCAACAAGAACTACGTCGACATGGACGAGTATCC
TGTCACTACCGAGCTCCAGGTCTCTCTCCATCTCTCTATAACTCTTTATTTTCTTAATTA
TGTTGCTACTTGCTAGATCTCGTTTTAGTTTCTAGTATTATATCAGCCAAATCGAAATTA
ACCCAAAAATGTTATAGAATGGTTACATGTTGCGCAATGGTTTTAACAAAATGTATTATT
ATTTTTATATTAATAAAAGTTATGTGTGGTCAAATTAGTATTTGTATTCTGTGTCAGATG
ACAAATGTTGTTTTAGTGAACCCGCCATATTCCTTGTTAAATTAGTATCAGTCCTTTGCA
TTTATCATACCTTACCACTAGGAGAAGACAAATATTACCCTAGTCATGACTGTTCGTTCC
TTTTTTCTTTTATCAAGAAGTATGACCCATACGTTTTTAGCCTTTATTGGCCGACATATC
AAGTTTTTAAGACTAGTGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2F139TF U 1
AF RR2F139JQ C 77
BS 1 739 RR2F139TF
BS 740 741 RR2F139JQ

RD RR2F139TF 739 0 0
TCTCACAACCAGAAAAGAAAAAAACAAGATGGTTCTAAGTCGAGCGGCCCGCGAAAGTGA
CGAAAATGTTTGCTCGACGTTCGGATCTCGCTATGTCCGCACTTCTTTGCCCAAGTATGA
GATTGGTGAGGGCTCGATACCGAAGGAGGCTGCGTATCAGATCATAAAAGATGAGCTGAT
GCTTGATGGTAACCCGAGGCTTAACCTGGCTTCCTTTGTGACGACATGGATGGAGCCTGA
GTGTGACAAACTCATTATGGAATCCATCAACAAGAACTACGTCGACATGGACGAGTATCC
TGTCACTACCGAGCTCCAGGTCTCTCTCCATCTCTCTATAACTCTTTATTTTCTTAATTA
TGTTGCTACTTGCTAGATCTCGTTTTAGTTTCTAGTATTATATCAGCCAAATCGAAATTA
ACCCAAAAATGTTATAGAATGGTTACATGTTGCGCAATGGTTTTAACAAAATGTATTATT
ATTTTTATATTAATAAAAGTTATGTGTGGTCAAATTAGTATTTGTATTCTGTGTCAGATG
ACAAATGTTGTTTTAGTGAACCCGCCATATTCCTTGTTAAATTAGTATCAGTCCTTTGCA
TTTATCATACCTTACCACTAGGAGAAGACAAATATTACCCTAGTCATGACTGTTCGTTCC
TTTTTTCTTTTATCAAGAAGTATGACCCATACGTTTTTAGCCTTTATTGGCCGACATATC
AAGTTTTTAAGACTAGTGC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2F139JQ 665 0 0
ACGTTCGGATCTCGCTATGTCCGCACTTCTTTGCCCAAGTATGAGATTGGTGAGGGCTCG
ATACCGAAGGAGGCTGCGTATCAGATCATAAAAGATGAGCTGATGCTTGATGGTAACCCG
AGGCTTAACCTGGCTTCCTTTGTGACGACATGGATGGAGCCTGAGTGTGACAAACTCATT
ATGGAATCCATCAACAAGAACTACGTCGACATGGACGAGTATCCTGTCACTACCGAGCTC
CAGGTCTCTCTCCATCTCTCTATAACTCTTTATTTTCTTAATTATGTTGCTACTTGCTAG
ATCTCGTTTTAGTTTCTAGTATTATATCAGCCAAATCGAAATTAACCCAAAAATGTTATA
GAATGGTTACATGTTGCGCAATGGTTTTAACAAAATGTATTATTATTTTTATATTAATAA
AAGTTATGTGTGGTCAAATTAGTATTTGTATTCTGTGTCAGATGACAAATGTTGTTTTAG
TGAACCCGCCATATTCCTTGTTAAATTAGTATCAGTCCTTTGCATTTATCATACCTTACC
ACTAGGAGAAGACAAATATTACCCTAGTCATGACTGTTCGTTCCTTTTTTCTTTTATCAA
GAAGTATGACCCATACGTTTTTAGCCTTTATTGGCCGACATATCAAGTTTTTAAGACTAG
TGCAC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL5129Contig1 1323 2 2 U
GGATGTTGGATCTATCCTCACTATATTCCATCATCGAATCAACTCTTTTCACATGTTTGG
AACAATGGAAGACTTCAGTGAAGAAGAAGAAGAGTTCAGATTTGAACAATGTGCATCCGT
AGATCCAAGAAGATCAAGAAACGCGAAGAAAAGAAAACTCGAATCTCAAGTCGTCTCTAT
TCTGAATCATTTGTTTGTAAATACTCAATACTTGTACCCACATACTGGTCGAGACTGTTG
GATCGATACGAATTCATCAGATACATCATGTAGCTTAAATTTTGCGAAAATTGGAAAGTT
TACATCAAGATCTCCTCCTCCTCCTTTGATCAAATCTGGAGCTGGATTAGATATTGGTCA
TCTTTTCAAATCCGCATTAGCAGGAGGAATCTCATGCGCCTCCTCTGCCTTTCTAATGCA
TCCCGTCGACACTGTCAAGACACAAGTTCAAGCATCAACGACACTGTCATTTATTGAAAT
AATGTCAAAGATTCCAGAGATTGGCGCTCGAGGTTTATACAAAGGATCTATTCCCGCCGT
TGTTGGTCAATTCACTAGCCATGGTTTACGAACAAGTATATATGAAGCAAGTAGACTCGC
TTTACCACTCCTTGCTCCTGGTCTCCTCGACATCCAAGTTCAGCCAATCGCGTCATTTCT
TGGCACGGTCTTGGGGACAACGCTGCGGATACCGTGCGAAGTCCTGAAACAACGGCTACA
AGCCAATCAGTTCGATAACATCGTGGAAGCCACGCTTTCCACTTGGCGCCAAGACGGTCT
CAAAGGACTCTTTCGCGGCACCGGCGTCACTCTTCTCCGCGAGGTTCCCTTTTACGTCGC
CGGTATGGGACTCTACACCCAATCGAAGAAGCTGGTGGAGAGGCGACTAGGGAGAGAGCT
CGAGCCGTGGGAGGCCATCGCGGTTGGAGCCTTGTCAGGTGGTTTCACTGCTGTCATGAC
GACGCCGTTCGATGTGATCAAAACTAGAATGATGACGGCTCCTCATGGCGTGGATTTGTC
CATGTGGATGGCTGCGTGTTCCATTATGACGCATGAGGGGTTTCTTGCTTTCTACAAAGG
TGCTGTTCCGAGGTTTTTCTGGACTGCTCCTCTTGGTGCGTTGAACTTGGCGGGATACGA
ACTTCTTCAAAAGGCTTTCGTCACAGTACCTCTTGACCAATCAGTGCATAGCGATTGACA
TTAGTATTTACTATTCACTTTTGAAATCAGAGCTCTGTCTATCCTTTTTTTCTTGTGAAT
TATTTTCAAATCTAAAATTTCTTTTGCCAATCTTGTAACTACAGAGAGACCGTTTGTTAC
ATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2A259TF U 1
AF RR2A259JQ C 631
BS 1 781 RR2A259TF
BS 782 1323 RR2A259JQ

RD RR2A259TF 781 0 0
GGATGTTGGATCTATCCTCACTATATTCCATCATCGAATCAACTCTTTTCACATGTTTGG
AACAATGGAAGACTTCAGTGAAGAAGAAGAAGAGTTCAGATTTGAACAATGTGCATCCGT
AGATCCAAGAAGATCAAGAAACGCGAAGAAAAGAAAACTCGAATCTCAAGTCGTCTCTAT
TCTGAATCATTTGTTTGTAAATACTCAATACTTGTACCCACATACTGGTCGAGACTGTTG
GATCGATACGAATTCATCAGATACATCATGTAGCTTAAATTTTGCGAAAATTGGAAAGTT
TACATCAAGATCTCCTCCTCCTCCTTTGATCAAATCTGGAGCTGGATTAGATATTGGTCA
TCTTTTCAAATCCGCATTAGCAGGAGGAATCTCATGCGCCTCCTCTGCCTTTCTAATGCA
TCCCGTCGACACTGTCAAGACACAAGTTCAAGCATCAACGACACTGTCATTTATTGAAAT
AATGTCAAAGATTCCAGAGATTGGCGCTCGAGGTTTATACAAAGGATCTATTCCCGCCGT
TGTTGGTCAATTCACTAGCCATGGTTTACGAACAAGTATATATGAAGCAAGTAGACTCGC
TTTACCACTCCTTGCTCCTGGTCTCCTCGACATCCAAGTTCAGCCAATCGCGTCATTTCT
TGGCACGGTCTTGGGGACAACGCTGCGGATACCGTGCGAAGTCCTGAAACAACGGCTACA
AGCCAATCAGTTCGATAACATCGTGGAAGCCACGCTTTCCACTTGGCGCCAAGACGGTCT
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2A259JQ 693 0 0
CATCCAAGTTCAGCCAATCGCGTCATTTCTTGGCACGGTCTTGGGGACAACGCTGCGGAT
ACCGTGCGAAGTCCTGAAACAACGGCTACAAGCCAATCAGTTCGATAACATCGTGGAAGC
CACGCTTTCCACTTGGCGCCAAGACGGTCTCAAAGGACTCTTTCGCGGCACCGGCGTCAC
TCTTCTCCGCGAGGTTCCCTTTTACGTCGCCGGTATGGGACTCTACACCCAATCGAAGAA
GCTGGTGGAGAGGCGACTAGGGAGAGAGCTCGAGCCGTGGGAGGCCATCGCGGTTGGAGC
CTTGTCAGGTGGTTTCACTGCTGTCATGACGACGCCGTTCGATGTGATCAAAACTAGAAT
GATGACGGCTCCTCATGGCGTGGATTTGTCCATGTGGATGGCTGCGTGTTCCATTATGAC
GCATGAGGGGTTTCTTGCTTTCTACAAAGGTGCTGTTCCGAGGTTTTTCTGGACTGCTCC
TCTTGGTGCGTTGAACTTGGCGGGATACGAACTTCTTCAAAAGGCTTTCGTCACAGTACC
TCTTGACCAATCAGTGCATAGCGATTGACATTAGTATTTACTATTCACTTTTGAAATCAG
AGCTCTGTCTATCCTTTTTTTCTTGTGAATTATTTTCAAATCTAAAATTTCTTTTGCCAA
TCTTGTAACTACAGAGAGACCGTTTGTTACATT

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL5130Contig1 1180 2 2 U
GGATAAACCCTCCTTTCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTTCT
TAATTTTTTTCTTGGGGAGCAAGATGGGAAGTCAAGCAGCGGTTTCTTTCCTCACGAATT
TAGCGAAGGCGGCCTTCGGTCTCGGAGTGTCTGCGACGGTTCTGTCCTCGTCGCTCTACA
CTGTCGATGGTGGCGAGAGAGCGGTGCTGTTCGATCGGTTCCGAGGAGTGTTGGATCAGA
CCGTCGGTGAAGGGACTCACTTCCTGATACCCATTCTCCAGAGGCCTCACATCTTCGACA
TCCGCACGAAGCCACACACTTTCTCCTCCGTGTCCGGTACCAAGGATCTCCAGATGGTTA
ATCTCACCCTTCGTGTTCTTTCTCGCCCCGAGGTTTCGCGTCCGCCCACCATTTTTCAAA
CATTGGGTCTCGAGTACGACGAAAAGGTTCTTCCTTCCATTGGAAACGAGGTCTTGAAGG
CTGTGGTTGCTCAGTTCAATGCTGATCAGCTCCTCACAGAGCGTCCTCAAGTGTCGGCAC
TTGTCCGTGACTCTCTCATCAAGCGTGCTAGGGACTTTAACATTGAGCTCGACGATGTTG
CCATCACGCACTTGTCATACGGTATGGAGTTCTCGAGGGCTGTGGAGGCGAAGCAAGTGG
CTCAGCAGGAAGCCGAGAGGTCCAAGTTTGTGGTGATGAAGGCTGATCAGGAGAGGAGAG
CGGCTGTTATTAGAGCTGAAGGTGAGAGTGAAGCTGCTCAGTTGATATCTGATGCAACTG
CTAAAGCAGGGATGGGGCTGATCGAGCTCAGGAGGATTGAGGCCTCGAGGGAGGTTGCAG
CTACACTGGCTAGGTCTCCGAACGTGGCCTACTTACCCGGTGGACAAAGCATGCTCTTTA
ACTTGAACGCTGGTCGTTGAGCAAGCGAGTGATGGGAAGAGGAGAGCTTAAGTGACAAAG
AAAACGATGGAGTTGTGAATTTATCCTTTCTTTCTGATGAACAATGTGAAAAAGTTAACT
TTTAAGTTGCTATATTGAGCCTTTTAGGTTATCTCTGTTTTGAATCCGAGGCTGAAGTTT
TTTTTTTGTTGTTATAACACTGTTTCCTCTCCCCCCTACTATGGATTTGTTTGGCTTTTT
TTTTCTTAACAATGAAGCATTAATAATTGAGAGAGACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DB01TF U 1
AF RR2DB01JQ C 513
BS 1 664 RR2DB01TF
BS 665 1180 RR2DB01JQ

RD RR2DB01TF 664 0 0
GGATAAACCCTCCTTTCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTTCT
TAATTTTTTTCTTGGGGAGCAAGATGGGAAGTCAAGCAGCGGTTTCTTTCCTCACGAATT
TAGCGAAGGCGGCCTTCGGTCTCGGAGTGTCTGCGACGGTTCTGTCCTCGTCGCTCTACA
CTGTCGATGGTGGCGAGAGAGCGGTGCTGTTCGATCGGTTCCGAGGAGTGTTGGATCAGA
CCGTCGGTGAAGGGACTCACTTCCTGATACCCATTCTCCAGAGGCCTCACATCTTCGACA
TCCGCACGAAGCCACACACTTTCTCCTCCGTGTCCGGTACCAAGGATCTCCAGATGGTTA
ATCTCACCCTTCGTGTTCTTTCTCGCCCCGAGGTTTCGCGTCCGCCCACCATTTTTCAAA
CATTGGGTCTCGAGTACGACGAAAAGGTTCTTCCTTCCATTGGAAACGAGGTCTTGAAGG
CTGTGGTTGCTCAGTTCAATGCTGATCAGCTCCTCACAGAGCGTCCTCAAGTGTCGGCAC
TTGTCCGTGACTCTCTCATCAAGCGTGCTAGGGACTTTAACATTGAGCTCGACGATGTTG
CCATCACGCACTTGTCATACGGTATGGAGTTCTCGAGGGCTGTGGAGGCGAAGCAAGTGG
CTCA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2DB01JQ 668 0 0
CTCACAGAGCGTCCTCAAGTGTCGGCACTTGTCCGTGACTCTCTCATCAAGCGTGCTAGG
GACTTTAACATTGAGCTCGACGATGTTGCCATCACGCACTTGTCATACGGTATGGAGTTC
TCGAGGGCTGTGGAGGCGAAGCAAGTGGCTCAGCAGGAAGCCGAGAGGTCCAAGTTTGTG
GTGATGAAGGCTGATCAGGAGAGGAGAGCGGCTGTTATTAGAGCTGAAGGTGAGAGTGAA
GCTGCTCAGTTGATATCTGATGCAACTGCTAAAGCAGGGATGGGGCTGATCGAGCTCAGG
AGGATTGAGGCCTCGAGGGAGGTTGCAGCTACACTGGCTAGGTCTCCGAACGTGGCCTAC
TTACCCGGTGGACAAAGCATGCTCTTTAACTTGAACGCTGGTCGTTGAGCAAGCGAGTGA
TGGGAAGAGGAGAGCTTAAGTGACAAAGAAAACGATGGAGTTGTGAATTTATCCTTTCTT
TCTGATGAACAATGTGAAAAAGTTAACTTTTAAGTTGCTATATTGAGCCTTTTAGGTTAT
CTCTGTTTTGAATCCGAGGCTGAAGTTTTTTTTTTGTTGTTATAACACTGTTTCCTCTCC
CCCCTACTATGGATTTGTTTGGCTTTTTTTTTCTTAACAATGAAGCATTAATAATTGAGA
GAGACACC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL5131Contig1 1399 2 2 U
ACGCAATGTTTTGCTTGTGGAGGCTCAGCATAGTCCTGACTCAGGGAGAGTTAAGCATCA
CGCTCGTGCACTTGAGTCATTTTGTTCGAGTAATGGAATAAAGTTATCTTCACTACATGC
TACACCTGGAGGCCCGAAACCATCTCCAGGAACTGCTTTCCCAACACCATTTAACTCTCC
TCTAATAAGCGGAAGCTTGCCTACGAGCCCCCTTCTTTTTACTCCTGATCATGGCCCACA
AAAGTTTAACAGGATCGACATGTTTCCACCACTTAGCTTGGACGGAGGTCATGCCGGAAA
GACGGTCATGTCTCCTCCGTCATCTCCTCCACCAAAAAGACAACTCTATCTTCCATTACG
ACAAATGCATGAAAAGCTACAGAACTTGCCCCAAGTTGGGATCATACATCTCGCCCTTCA
GAATGATTCTAATGGTTCGATCCTAAGTTGGCAAAATGATGTATTTGTGGTTGCTGAACC
TGGAGATCTAGCTGATAAGTTTCTCCAGAGCGTCAAATACAGTATATTATCAGTCATGCA
AAGCAATCGCCGAAAGGCTGCATCAGTTCTTTCCAACATCTGCTCAATCTCGGATCTGGT
GCGTAGCAAGAAATGCTTCCAGGTTGGGAATATCATCCACCGTTATATCGGACGCCAAAC
CCAAGTGATGGAAGATGATCAATAAATTGCAGCATTTATGTTCCGCAGAACTGTCCCTTC
CACACACCTAACTCCTGATGACATTCGCTGGATGGTAGGAGCATGGAGAGACAGGATAAT
ACTCTACTCAGGAACATTTGGACCAACACAAGCTGTAGTTAAAGCCTTCTTAGACTCTGG
TGCCAAAGCTGTGATTGGTCCTTCAACCGAACCGCAAGAGACGCCTCTAATCACATCTCA
AGGTTCCCCATTTGAATACGACATTGGAGACAACGGTAAGTTCGAGATTGGTGAAGAAGA
AGACGAGGAAGAAGAGGAAGCTGATAGGGAACAGACGGAACCACCGACCCCGACAGCGAC
AAGTGACTGGGAAGATAGTGACCATGAGAAGATGAACAGAGAGGACAATAAGTGCTCTGG
TCTTTGGGAAGACGAAGAAGAGCAAGTGTCTGAGTTTGTTTGCCAGTTATATGATATGTT
ATTCAGAGAGAACTCAAGTGTCGATGTTGCTCTTCAGAAAGCTCTTGCCTCTCATCGAAA
GCTCAGGTACACTTGTCATCTTCCCAATGTATAGAGGAGACAACAATCTTTTTTATTAAT
ATTTATACCTTTTTTGACCGGAGGTAGAAGAAAACTGAAAAATACAATAATTTGTTCGTT
TCTGCATATAACAGCAAGTTCCTTGCTTATAAATCTATAAAGAAGTACAAGAAATAAAGA
TTTTTTTACAAATTTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G205TF U 1
AF RR2G205JQ C 588
BS 1 716 RR2G205TF
BS 717 1399 RR2G205JQ

RD RR2G205TF 716 0 0
ACGCAATGTTTTGCTTGTGGAGGCTCAGCATAGTCCTGACTCAGGGAGAGTTAAGCATCA
CGCTCGTGCACTTGAGTCATTTTGTTCGAGTAATGGAATAAAGTTATCTTCACTACATGC
TACACCTGGAGGCCCGAAACCATCTCCAGGAACTGCTTTCCCAACACCATTTAACTCTCC
TCTAATAAGCGGAAGCTTGCCTACGAGCCCCCTTCTTTTTACTCCTGATCATGGCCCACA
AAAGTTTAACAGGATCGACATGTTTCCACCACTTAGCTTGGACGGAGGTCATGCCGGAAA
GACGGTCATGTCTCCTCCGTCATCTCCTCCACCAAAAAGACAACTCTATCTTCCATTACG
ACAAATGCATGAAAAGCTACAGAACTTGCCCCAAGTTGGGATCATACATCTCGCCCTTCA
GAATGATTCTAATGGTTCGATCCTAAGTTGGCAAAATGATGTATTTGTGGTTGCTGAACC
TGGAGATCTAGCTGATAAGTTTCTCCAGAGCGTCAAATACAGTATATTATCAGTCATGCA
AAGCAATCGCCGAAAGGCTGCATCAGTTCTTTCCAACATCTGCTCAATCTCGGATCTGGT
GCGTAGCAAGAAATGCTTCCAGGTTGGGAATATCATCCACCGTTATATCGGACGCCAAAC
CCAAGTGATGGAAGATGATCAATAAATTGCAGCATTTATGTTCCGCAGAACTGTCC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2G205JQ 812 0 0
TCTCGGATCTG*TGCGTAGCAAGAAATGCTTCCAGGTTGGGAATATCATCCACCGTTATA
TCGGACGCCAAACCCAAGTGATGGAAGATGATCAATAAATTGCAGCATTTATGTTCCGCA
GAACTGTCCCTTCCACACACCTAACTCCTGATGACATTCGCTGGATGGTAGGAGCATGGA
GAGACAGGATAATACTCTACTCAGGAACATTTGGACCAACACAAGCTGTAGTTAAAGCCT
TCTTAGACTCTGGTGCCAAAGCTGTGATTGGTCCTTCAACCGAACCGCAAGAGACGCCTC
TAATCACATCTCAAGGTTCCCCATTTGAATACGACATTGGAGACAACGGTAAGTTCGAGA
TTGGTGAAGAAGAAGACGAGGAAGAAGAGGAAGCTGATAGGGAACAGACGGAACCACCGA
CCCCGACAGCGACAAGTGACTGGGAAGATAGTGACCATGAGAAGATGAACAGAGAGGACA
ATAAGTGCTCTGGTCTTTGGGAAGACGAAGAAGAGCAAGTGTCTGAGTTTGTTTGCCAGT
TATATGATATGTTATTCAGAGAGAACTCAAGTGTCGATGTTGCTCTTCAGAAAGCTCTTG
CCTCTCATCGAAAGCTCAGGTACACTTGTCATCTTCCCAATGTATAGAGGAGACAACAAT
CTTTTTTATTAATATTTATACCTTTTTTGACCGGAGGTAGAAGAAAACTGAAAAATACAA
TAATTTGTTCGTTTCTGCATATAACAGCAAGTTCCTTGCTTATAAATCTATAAAGAAGTA
CAAGAAATAAAGATTTTTTTACAAATTTTGGT

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

CO CL5132Contig1 167 2 1 U
GCTGATGCTTAAGTCGTGTCCATATAATAATATCTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTG
TTGCTTTTTTTCTCTTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGT
CTGATTTATGAAACATGTAATTTCTATATTGCTTCTTCTTCTTGGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A863JQ C 1
AF RR2A863TF U 1
BS 1 167 RR2A863TF

RD RR2A863JQ 167 0 0
GCTGATGCTTAAGTCGTGTCCATATAATAATATCTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTG
TTGCTTTTTTTCTCTTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGT
TTGATTTATGAAACATGTAATTTTTATATTGCTTTTTTTTCTTGGTT

QA 1 167 1 167
DS 

RD RR2A863TF 167 0 0
GCTGATGCTTAAGTCGTGTCCATATAATAATATCTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTG
TTGCTTTTTTTCTCTTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGT
CTGATTTATGAAACATGTAATTTCTATATTGCTTCTTCTTCTTGGTT

QA 1 167 1 167
DS 



AS 1 2

CO CL5133Contig1 1050 2 2 U
GGACACAAAGGAAGAAAATAAAAAAATGGGAAACTCTCTGGTCTTTCTTTTCCCAATCTT
CCACTTGTTGGTGTTATTAGGATCCTCAGTAAATGCTTATTGGCCACCATCACCTGGTTA
CTGGCCAAGCTCCAAGGTTGGCTCCTTGAGCTTCTACAAAGGTTTTAAGAATCTTTGGGG
TCCTCAGCATCAGAGAATGGACCAAGATGGCCTCACCATTTGGCTCGATAGAACCTCAGG
AAGTGGATTCAAGTCAGTGAAGCCATTCAGATCAGGCTACTTTGGAGCTTCCATCAAACT
TCAGCCTGGCTACACTGCCGGAGTCATCACATCTCTCTATCTATCAAATAGTGAGGCACA
TCCAGGATTCCATGATGGAGTGGACATAGAATTTTTGGGGACGACATTTGGAAAACCATA
CACACTTCAGACAAATGTGTACATAAGAGGAAGTGGTGATGGCAAAATCATTGGTCGTGA
GATGAAGTTTCGCTTGTGGTTTGATCCAACTTCGGGGTTTCACCACTATGCTATTCTTTG
GAACCCTAGAGAAATCATTTTTTTGGTGGATGACATTCCCATAAGAAGTTACCCAAAAAA
AGAGTGCAGCTACATTTCCTTTAAGACCAATGTGGCTTTATGGTTCCATATGGGACGCTT
CTTCTTGGGCAACTGAAGATGGTAAATACAAAGCCGACTATAAATATCAGCCTTTTACTG
CCAAATACACTAATTTCAAAGCCATTGGTTGCACCGCCTACTCACCAGCACGATGTCATC
CAGTTTCCGCTTCCCCGTACCGTTTTGGGGGGCTAACCCGAAAACAATACCAAGCAATGA
GAGGGGTACAAACACATAATATGGTATACAATTACTGCAGAGATTATAAGGGTGATCATT
TTTTAACGCCTGAATGTTGGCGTTAAATGTCTTGAACTTGAATATTTTTTGATACCATAA
AATGTTCGGGGAATTATTGGAGAGTTTTTAGTAATGTATTACGATGTGGTTTTTTTCCAG
TAAAAATAAATTTTTATTTTTTGGCTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET81TF U 1
AF RR2ET81JQ C 614
BS 1 775 RR2ET81TF
BS 776 1050 RR2ET81JQ

RD RR2ET81TF 775 0 0
GGACACAAAGGAAGAAAATAAAAAAATGGGAAACTCTCTGGTCTTTCTTTTCCCAATCTT
CCACTTGTTGGTGTTATTAGGATCCTCAGTAAATGCTTATTGGCCACCATCACCTGGTTA
CTGGCCAAGCTCCAAGGTTGGCTCCTTGAGCTTCTACAAAGGTTTTAAGAATCTTTGGGG
TCCTCAGCATCAGAGAATGGACCAAGATGGCCTCACCATTTGGCTCGATAGAACCTCAGG
AAGTGGATTCAAGTCAGTGAAGCCATTCAGATCAGGCTACTTTGGAGCTTCCATCAAACT
TCAGCCTGGCTACACTGCCGGAGTCATCACATCTCTCTATCTATCAAATAGTGAGGCACA
TCCAGGATTCCATGATGGAGTGGACATAGAATTTTTGGGGACGACATTTGGAAAACCATA
CACACTTCAGACAAATGTGTACATAAGAGGAAGTGGTGATGGCAAAATCATTGGTCGTGA
GATGAAGTTTCGCTTGTGGTTTGATCCAACTTCGGGGTTTCACCACTATGCTATTCTTTG
GAACCCTAGAGAAATCATTTTTTTGGTGGATGACATTCCCATAAGAAGTTACCCAAAAAA
AGAGTGCAGCTACATTTCCTTTAAGACCAATGTGGCTTTATGGTTCCATATGGGACGCTT
CTTCTTGGGCAACTGAAGATGGTAAATACAAAGCCGACTATAAATATCAGCCTTTTACTG
CCAAATACACTAATTTCAAAGCCATTGGTTGCACCGCCTACTCACCAGCACGATG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2ET81JQ 437 0 0
ATTTCCTTTAAGACCAATGTGGCTTTATGGTTCCATATGGGACGCTTTTTTTTGGGCAAC
TGAAGATGGTAAATACAAAGCCGACTATAAATATCAGCCTTTTACTGCCAAATACACTAA
TTTCAAAGCCATTGGTTGCCCCGCCTACTCACCAGCACGATGTCATCCAGTTTCCGCTTC
CCCGTACCGTTTTGGGGGGCTAACCCGAAAACAATACCAAGCAATGAGAGGGGTACAAAC
ACATAATATGGTATACAATTACTGCAGAGATTATAAGGGTGATCATTTTTTAACGCCTGA
ATGTTGGCGTTAAATGTCTTGAACTTGAATATTTTTTGATACCATAAAATGTTCGGGGAA
TTATTGGAGAGTTTTTAGTAATGTATTACGATGTGGTTTTTTTCCAGTAAAAATAAATTT
TTATTTTTTGGCTTATC

QA 1 437 1 437
DS 



AS 1 2

CO CL5134Contig1 1346 2 4 U
GGGAACAAGTATGTGGGTGTTTCACTCGTTGGCAAGACTCTTGCAGTCATGGGATTCGGG
AAAGTTGGGACCGAAGTTGCTCGTCGTGCCAAAGGTCTCGGCATGCGTGTGATCGCTCAT
GATCCCTATGCACCAGCAGACCGTGCGCACGCCATTGGTGTTGAGCTGGTGAGCTTCGAC
GAAGCATTGGCTACTGCGGATTTCATTTCGCTCCACATGCCTCTTACACCTGCAACGAAC
AAGGTACTCAACGACGAGACGTTCGCCAAGATGAAGAAGGGAGTTCGTATTGTGAACGTT
GCTCGTGGAGGTGTGATAGACGAAGGCGCGTTGGTGAGGGCATTGGATGCTGGGATTGTT
GCTCAGGCTGCGCTTGATGTGTTCACTAAAGAGCCGCCGGCTAAAGACAGTCCTCTTGTG
CAGCATGAGAGGGTTACAGTGACACCTCATCTTGGAGCCAGCACAATGGAGGCTCAGGAA
GGAGTTGCTATTGAAATTGCTGAAGCTGTTGTTGGTGCTTTGAATGGAGAGCTTGCTGCT
ACTGCTGTCAATGCTCCTATGGTTTCTGCTGAGGTTCTGACTGAGCTGAAACCATACGTG
ATACTAGCCGAGAAGCTAGGGAGACTAGCGGTGCAGCTAGTGGCTGGAGGAAGCGGCGTG
AAGAACGTGAAAGTCTCATACACGTCAGCAAGAGCCACTGATGATCTCGACACAAGACTA
CTCCGAGCCATGATCACCAAGGGAATCATCGAGCCGATCTCTGACGTATTCGTCAACTTG
GTCAACGCTGACTTCACAGCCAAGCAGAGAGGTCTCAGACTCTCAGAGGAGCGTGTGCTC
TTGGACGGGTCGCCAGAGAACCCCTTGGAGACCATGACTGTTCAGCTGGGGAACGTGGAG
TCCAAGTTCGCTAGTTCCTTGTCTGAATCAGGAGAGGTGAAAGTGGAAGGAAGGGTGAAA
GACGGGATCCCGCATTTGACAAAGGTTGGGTCTTTTGGAGTGGATGTGACTCTTGAAGGT
AGTATCATCCTTTGCAGGCAGGTTGATCAGCCGGGTATGATTGGGACGGTGGGTAGCATT
CTTGGAGAGTCTAATGTGAATGTTAACTTCATGAGCGTTGGGAGGATTGCGCCGAGGAAG
CAAGCGATCATGGCGATTGGTGTAGATGATCAGCCAAGCAAGGAGACGCTTAAGAAGATT
GGAGAGATCCCAGCGGTCGAGGAGTTTGTTTTCCTCAAGCTCTAAGTTTGCTGCATTGTT
GTTGTTGTTGTTGTTGATTTTTGAACCTTGAATATTGAATGTGAGGGAGAGGATTTGATG
AAGTGTTTTACGTTTGTTGGGTTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI30TF U 1
AF RR2EI30JQ C 561
BS 1 690 RR2EI30TF
BS 691 691 RR2EI30JQ
BS 692 714 RR2EI30TF
BS 715 1346 RR2EI30JQ

RD RR2EI30TF 719 0 0
GGGAACAAGTATGTGGGTGTTTCACTCGTTGGCAAGACTCTTGCAGTCATGGGATTCGGG
AAAGTTGGGACCGAAGTTGCTCGTCGTGCCAAAGGTCTCGGCATGCGTGTGATCGCTCAT
GATCCCTATGCACCAGCAGACCGTGCGCACGCCATTGGTGTTGAGCTGGTGAGCTTCGAC
GAAGCATTGGCTACTGCGGATTTCATTTCGCTCCACATGCCTCTTACACCTGCAACGAAC
AAGGTACTCAACGACGAGACGTTCGCCAAGATGAAGAAGGGAGTTCGTATTGTGAACGTT
GCTCGTGGAGGTGTGATAGACGAAGGCGCGTTGGTGAGGGCATTGGATGCTGGGATTGTT
GCTCAGGCTGCGCTTGATGTGTTCACTAAAGAGCCGCCGGCTAAAGACAGTCCTCTTGTG
CAGCATGAGAGGGTTACAGTGACACCTCATCTTGGAGCCAGCACAATGGAGGCTCAGGAA
GGAGTTGCTATTGAAATTGCTGAAGCTGTTGTTGGTGCTTTGAATGGAGAGCTTGCTGCT
ACTGCTGTCAATGCTCCTATGGTTTCTGCTGAGGTTCTGACTGAGCTGAAACCATACGTG
ATACTAGCCGAGAAGCTAGGGAGACTAGCGGTGCAGCTAGTGGCTGGAGGAAGCGGCGTG
AAGAACGTGAAAGTCTCATACACGTCAGCA*GAGCCACTGATGATCTCGACACA
GACTA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2EI30JQ 786 0 0
GGTTTCTGCTGAGGTTCTGACTGAGCTGAAACCATACGTGATACTAGCCGAGAAGCTAGG
GAGACTAGCGGTGCAGCTAGTGGCTGGAGGAAGCGGCGTGAAGAACGTGAAAGTCTCATA
CACGTCAGCAAGAGCCACTGATGATCTCGACACAAGACTACTCCGAGCCATGATCACCAA
GGGAATCATCGAGCCGATCTCTGACGTATTCGTCAACTTGGTCAACGCTGACTTCACAGC
CAAGCAGAGAGGTCTCAGACTCTCAGAGGAGCGTGTGCTCTTGGACGGGTCGCCAGAGAA
CCCCTTGGAGACCATGACTGTTCAGCTGGGGAACGTGGAGTCCAAGTTCGCTAGTTCCTT
GTCTGAATCAGGAGAGGTGAAAGTGGAAGGAAGGGTGAAAGACGGGATCCCGCATTTGAC
AAAGGTTGGGTCTTTTGGAGTGGATGTGACTCTTGAAGGTAGTATCATCCTTTGCAGGCA
GGTTGATCAGCCGGGTATGATTGGGACGGTGGGTAGCATTCTTGGAGAGTCTAATGTGAA
TGTTAACTTCATGAGCGTTGGGAGGATTGCGCCGAGGAAGCAAGCGATCATGGCGATTGG
TGTAGATGATCAGCCAAGCAAGGAGACGCTTAAGAAGATTGGAGAGATCCCAGCGGTCGA
GGAGTTTGTTTTCCTCAAGCTCTAAGTTTGCTGCATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGATTT
TTGAACCTTGAATATTGAATGTGAGGGAGAGGATTTGATGAAGTGTTTTACGTTTGTTGG
GTTTTA

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL5135Contig1 1366 2 2 U
GGACGACAAAAAGAAGAGTAAAAGTCAAAAAGTAAAGAGAAGCACTTTGTGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGAGAGAAAAAAACCCGCGGAGGATGATGATGTCCGTCGCGGCGGTAGAGCAG
TTGCGCAGAAAGAAGAAGAAGAAGAGGAGAAGGGTTGAGTCTCCATCATCATCATGTGGG
TTAATGTCTTTGCCATATGACATGGTTCAAAACTGCTTGGCCCGCGTGTCTAGATCCGAC
CTAGGGGCCTTATCTCTGGTCTCAAAGAGCATCCACTCACTGGTGGCTTCGCCGGAGATG
TACGAGACCCGATGTCGAATGGGTTTGAGGGAGGAGTGCATCTACGTATGCTTGGGAACT
AATTTTGGCACAATTACAAATCCTCTGGGATGGTTCATCCTCAGAAGAAAAGGGAATAAT
AGGCTGATCCCAATCCCGATCCCTTCGTTCCCATCTCCGCGTAGAGCTACCTATGTCTCC
ATGGGATGTGGGATCTATGTAATTGGAGGAAGGATAGAAGCCGTGACGACATCGCGTGTC
TCCTTCCTGGATTGTCGGACTCACACGTGGAGCGAGCTCCCCTCCATGAGGTTTGCTCGC
TGTGAAGCCAACACAGGGGTTTTAGACGGAAAGATATACGTCATGGGAGGCTGCGGTGAT
CCATTCTCCCGCGACAATCCAGAGGTTTTCGATCCAATGACGCAAACTTGGAGCAGTGTG
TGTATACCTGATCCGGTGATGAGCAAGGAGGCTTGCAGGGTTGTTGGGCCGGATAATAAT
AATATTTCGTTCAAGTTTCGGAGTGAAGAAGGTTTGTGGAATGATTTATTTCTAAACGCA
AAAGAGGATTGTTGTTGTGCAATAGACAGGTTGTTATTCAGTTGTGATTTTGACGGGAGA
ATCAAGTGGTGTGACCCTTGGAGTGGGGTGAGGAAAGGGAGCCTGGAGTGGTACACGGTG
ATTGGTTTGGATGATCTTCAAGGGTTCCTCAAGTTTGACACTTCCAACATAAATTCAATC
ATTTTCGACGGGGAGTGTGCCGATGTGTGGAATTGCCATATGCTCAATCGTGGTTACACA
AACGGCCTCCTAGGCTTAGTTCCGGGCTTCAAAATCAGCAAATCCGCTGCCAACATTGTC
ATCTTCTGGTCCGTGCTCGTCGGGGATAAGTTGCAGGTTTGGTGTGCTGAGATTTCACTT
GAGAGGCGGGTGCACCACATTTGGGGGAACATCCAGTGCACTGATCATGTCTTCACTGTG
GACCCTGACCTCTATATTTTGTCTACTATTAATGTTAGTCTCTGAACATACTTTTTTTTT
ATCGCTCTTTTATTTACAGACTTAATTGGTAGACACTCTTTGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES83TF U 1
AF RR2ES83JQ C 576
BS 1 726 RR2ES83TF
BS 727 1366 RR2ES83JQ

RD RR2ES83TF 726 0 0
GGACGACAAAAAGAAGAGTAAAAGTCAAAAAGTAAAGAGAAGCACTTTGTGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGAGAGAAAAAAACCCGCGGAGGATGATGATGTCCGTCGCGGCGGTAGAGCAG
TTGCGCAGAAAGAAGAAGAAGAAGAGGAGAAGGGTTGAGTCTCCATCATCATCATGTGGG
TTAATGTCTTTGCCATATGACATGGTTCAAAACTGCTTGGCCCGCGTGTCTAGATCCGAC
CTAGGGGCCTTATCTCTGGTCTCAAAGAGCATCCACTCACTGGTGGCTTCGCCGGAGATG
TACGAGACCCGATGTCGAATGGGTTTGAGGGAGGAGTGCATCTACGTATGCTTGGGAACT
AATTTTGGCACAATTACAAATCCTCTGGGATGGTTCATCCTCAGAAGAAAAGGGAATAAT
AGGCTGATCCCAATCCCGATCCCTTCGTTCCCATCTCCGCGTAGAGCTACCTATGTCTCC
ATGGGATGTGGGATCTATGTAATTGGAGGAAGGATAGAAGCCGTGACGACATCGCGTGTC
TCCTTCCTGGATTGTCGGACTCACACGTGGAGCGAGCTCCCCTCCATGAGGTTTGCTCGC
TGTGAAGCCAACACAGGGGTTTTAGACGGAAAGATATACGTCATGGGAGGCTGCGGTGAT
CCATTCTCCCGCGACAATCCAGAGGTTTTCGATCCAATGACGCAAACTTGGAGCAGTGTG
TGTATA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2ES83JQ 791 0 0
GCTCCCCTCCATGAGGTTTGCTCGCTGTGAAGCCAACACAGGGGTTTTAGACGGAAAGAT
ATACGTCATGGGAGGCTGCGGTGATCCATTCTCCCGCGACAATCCAGAGGTTTTCGATCC
AATGACGCAAACTTGGAGCAGTGTGTGTATACCTGATCCGGTGATGAGCAAGGAGGCTTG
CAGGGTTGTTGGGCCGGATAATAATAATATTTCGTTCAAGTTTCGGAGTGAAGAAGGTTT
GTGGAATGATTTATTTCTAAACGCAAAAGAGGATTGTTGTTGTGCAATAGACAGGTTGTT
ATTCAGTTGTGATTTTGACGGGAGAATCAAGTGGTGTGACCCTTGGAGTGGGGTGAGGAA
AGGGAGCCTGGAGTGGTACACGGTGATTGGTTTGGATGATCTTCAAGGGTTCCTCAAGTT
TGACACTTCCAACATAAATTCAATCATTTTCGACGGGGAGTGTGCCGATGTGTGGAATTG
CCATATGCTCAATCGTGGTTACACAAACGGCCTCCTAGGCTTAGTTCCGGGCTTCAAAAT
CAGCAAATCCGCTGCCAACATTGTCATCTTCTGGTCCGTGCTCGTCGGGGATAAGTTGCA
GGTTTGGTGTGCTGAGATTTCACTTGAGAGGCGGGTGCACCACATTTGGGGGAACATCCA
GTGCACTGATCATGTCTTCACTGTGGACCCTGACCTCTATATTTTGTCTACTATTAATGT
TAGTCTCTGAACATACTTTTTTTTTATCGCTCTTTTATTTACAGACTTAATTGGTAGACA
CTCTTTGTTGT

QA 1 791 1 791
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5137Contig1 543 2 1 U
GGACAATAAACCATCTTTCAAAACACTTCAAAGCAATGGCAAAGCAAATTCTCTACACCC
TCTTTCTATTCCTCTTCTTATCTACGACGATGGATCTTGGTTCGAGCCAAGGCTATGATG
ACTTAGCATTTGCTCTCGATGAGCTCTTTGGTGTCCGTGGCATTGCAGTGACCTTGAAAG
ATGGTGATAACTGCGACTACGTTACCATATACGAAGACAAAGATGGAGACTGGATGCTGG
CGGGAGATGTACCATGGGGAATGTTCATAGAGTCATGCAAGAGGTTGAGGATTATGAAAA
GATCGGATGCTACCGGGTTTGGGCTGCAGCCTAGAGGTGTTGTGACGAGTGATACGATGT
CCTGAACAAGAAGCAAGTACCTGATTAATTATTTATCCTTTTTAAGTATCAAGATCCTCT
AGAACATTTTTCCTATTCATCTTATATATGTTATGGTTTGTATAATTATATTCAGAAAGA
CAGCTATATATATACAATACTTGTTTCTTGATTATGAATGAAGACATTATCCTGTTTGAA
ATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2B066JQ C 1
AF RR2B066TF U 1
BS 1 543 RR2B066TF

RD RR2B066JQ 543 0 0
GGACAATAAACCATCTTTCAAAACACTTCAAAGCAATGGCAAAGCAAATTCTCTACACCC
TCTTTCTATTCCTCTTCTTATCTACGACGATGGATCTTGGTTCGAGCCAAGGCTATGATG
ACTTAGCATTTGCTCTCGATGAGCTCTTTGGTGTCCGTGGCATTGCAGTGACCTTGAAAG
ATGGTGATAACTGCGACTACGTTACCATATACGAAGACAAAGATGGAGACTGGATGCTGG
CGGGAGATGTACCATGGGGAATGTTCATAGAGTCATGCAAGAGGTTGAGGATTATGAAAA
GATCGGATGCTACCGGGTTTGGGCTGCAGCCTAGAGGTGTTGTGACGAGTGATACGATGT
CCTGAACAAGAAGCAAGTACCTGATTAATTATTTATCCTTTTTAAGTATCAAGATCCTCT
AGAACATTTTTCCTATTCATCTTATATATGTTATGGTTTGTATAATTATATTCAGAAAGA
CAGCTATATATATACAATACTTGTTTCTTGATTATGAATGAAGACATTATCCTGTTTGAA
ATT

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2B066TF 543 0 0
GGACAATAAACCATCTTTCAAAACACTTCAAAGCAATGGCAAAGCAAATTCTCTACACCC
TCTTTCTATTCCTCTTCTTATCTACGACGATGGATCTTGGTTCGAGCCAAGGCTATGATG
ACTTAGCATTTGCTCTCGATGAGCTCTTTGGTGTCCGTGGCATTGCAGTGACCTTGAAAG
ATGGTGATAACTGCGACTACGTTACCATATACGAAGACAAAGATGGAGACTGGATGCTGG
CGGGAGATGTACCATGGGGAATGTTCATAGAGTCATGCAAGAGGTTGAGGATTATGAAAA
GATCGGATGCTACCGGGTTTGGGCTGCAGCCTAGAGGTGTTGTGACGAGTGATACGATGT
CCTGAACAAGAAGCAAGTACCTGATTAATTATTTATCCTTTTTAAGTATCAAGATCCTCT
AGAACATTTTTCCTATTCATCTTATATATGTTATGGTTTGTATAATTATATTCAGAAAGA
CAGCTATATATATACAATACTTGTTTCTTGATTATGAATGAAGACATTATCCTGTTTGAA
ATT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL5138Contig1 815 2 3 U
GAGGTCCGCTAGATTTGAAGTTTCCATCGCCGGTTAGCTCGAAACGGTACGGTTCCGGTG
GTGTCGGTTTGGGTATCGTGGCTGCGCTGGAGGAAAGTAACACTGGGATTAACCGGTACG
ATCCGGTTTGTTTCTCCGGGAGATTCCGATGCCCTGAGATTGATCTGTCGGAGGAGGAAT
ACACTTGCGTGACGAGCCGTGATGGGCCGACCAGAGTGTATTACAACGATGACGGGTTTG
AATTGTTTGAAAATGGGTCGGAGTTCGATGATCGGAGAAGGCAGAAACCGATGGTTGAAC
CACCGGTTACTAAGAGACAGGTTCGTAGGGAACCGACAGAGTTCCTGAGCTCGTGTTGCT
TGTGTAAGAAGAGACTTCAAGGCAAAGACATTTACATGTACAAAGGAGAGATGGGATTCT
GCAGTGCAGAGTGTAGATCAGTGCAGATCATGAACGACGAGCGAAATGAGCAATCTAAAC
CGCAAGTTTCGAGAAACGTCGACGTTTTGAGTTCTCCTTATGCCGCCGGCGAACAGACTT
TCGCCGCCGGGATATTCGTATTTTAGGATAGCATAATAATTTACATTTAGAAAAGAAAAA
AAAGAGTGATCACCATTCTATTTATAAGAAAAATATAAGGAAAGAAAACAAAATGAATTG
ATAAAAAAAAATGAAAATTTTGGTTAGGTTAAAAGCAACTTGTATAGAAGCTTTGCTTTT
GGTTTTGATTTTGATTTTGGAATAACGTCTAATGTTTGTATGTTTGGTTTCTATATCAAA
TAAATCAATAAAAAAAACTAGAGATGATTTAACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW84TFB U 188
AF RR2AW84JQ C 1
BS 1 187 RR2AW84JQ
BS 188 316 RR2AW84TFB
BS 317 815 RR2AW84JQ

RD RR2AW84TFB 129 0 0
CGTGACGAGCCGTGATGGGCCGACCAGAGTGTATTACAACGATGACGGGTTTGAATTGTT
TGAAAATGGGTCGGAGTTCGATGATCGGAGAAGGCAGAAACCGATGGTTGAACCACCGGT
TACTAAGAG

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR2AW84JQ 815 0 0
GAGGTCCGCTAGATTTGAAGTTTCCATCGCCGGTTAGCTCGAAACGGTACGGTTCCGGTG
GTGTCGGTTTGGGTATCGTGGCTGCGCTGGAGGAAAGTAACACTGGGATTAACCGGTACG
ATCCGGTTTGTTTCTCCGGGAGATTCCGATGCCCTGAGATTGATCTGTCGGAGGAGGAAT
ACACTTGCGTGACGAGCCGTGATGGGCCGACCAGAGTGTATTACAACGATGACGGGTTTG
AATTGTTTGAAAATGGGTCGGAGTTCGATGATCGGAGAAGGCAGAAACCGATGGTTGAAC
CACCGGTTACTAAGAGACAGGTTCGTAGGGAACCGACAGAGTTCCTGAGCTCGTGTTGCT
TGTGTAAGAAGAGACTTCAAGGCAAAGACATTTACATGTACAAAGGAGAGATGGGATTCT
GCAGTGCAGAGTGTAGATCAGTGCAGATCATGAACGACGAGCGAAATGAGCAATCTAAAC
CGCAAGTTTCGAGAAACGTCGACGTTTTGAGTTCTCCTTATGCCGCCGGCGAACAGACTT
TCGCCGCCGGGATATTCGTATTTTAGGATAGCATAATAATTTACATTTAGAAAAGAAAAA
AAAGAGTGATCACCATTCTATTTATAAGAAAAATATAAGGAAAGAAAACAAAATGAATTG
ATAAAAAAAAATGAAAATTTTGGTTAGGTTAAAAGCAACTTGTATAGAAGCTTTGCTTTT
GGTTTTGATTTTGATTTTGGAATAACGTCTAATGTTTGTATGTTTGGTTTCTATATCAAA
TAAATCAATAAAAAAAACTAGAGATGATTTAACAG

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL5139Contig1 746 2 2 U
GGACGCAAAAGTAAAATCAGAGTAATAAATTATGGGAAGAGTTTGGTGAAAATTGGGGGT
AAAAGTTAAAAGTTACGCAGTTAAAACTGAATCCGAGTAAAATGAGAGTGATAGGGTTTA
AGGTTTTAAAAAAGAGGAGTCGATTTCATTAAAAAGGATCATAGCAACGGAGATCTGAAC
GGAGAGCTGAGGTTCGAAATGGCGATCAAAGCGGGAAAGGTTCTGAGAACGGCGTCGGCT
GCCTCTAGGAAGATCTTAGCATCACAGCCGGCTCCTCCAGCCGTATCATCGCTGGCTCCA
GCCGGTGTGACTTCATCTTCCCCTGTAGGAGCATTTCTGGGTATTGTCGACGCTCCTCGC
TCCACCACCGATATGTTGATCTCCAAGTACATCAGACTCTCCCAGAACCGTTTGACGAAG
AAGGGTGATTTCACAGAGGAGAAGCTAATGACAATGTTGTCTGGTAATATCGGCATCAGC
GAGACTGTCAAGTTACTCGATGGACGCAAAACTAGCGCTGATTTTTCTTCTCCGAAGTTA
ACCAACACCCCATCCATTGCCAAGCCCAAGAAAAATAAATAAAACTCCTCTGTTTCTTCG
CTTTTTTTTTTCTTTAACGAATAATATAAAGCTTCAAGCTTTTGCATTTCTGCTTTTGCA
AGTTTGTTTCTTTTTGAGTTTCAAACTAGTTGCTGAACATATGGATTATTATGCATTCCC
TCGAAAGATAGTTTTTAGTTGTTGCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR08TF U 1
AF RR2GR08JQ C 1
BS 1 668 RR2GR08TF
BS 669 746 RR2GR08JQ

RD RR2GR08TF 668 0 0
GGACGCAAAAGTAAAATCAGAGTAATAAATTATGGGAAGAGTTTGGTGAAAATTGGGGGT
AAAAGTTAAAAGTTACGCAGTTAAAACTGAATCCGAGTAAAATGAGAGTGATAGGGTTTA
AGGTTTTAAAAAAGAGGAGTCGATTTCATTAAAAAGGATCATAGCAACGGAGATCTGAAC
GGAGAGCTGAGGTTCGAAATGGCGATCAAAGCGGGAAAGGTTCTGAGAACGGCGTCGGCT
GCCTCTAGGAAGATCTTAGCATCACAGCCGGCTCCTCCAGCCGTATCATCGCTGGCTCCA
GCCGGTGTGACTTCATCTTCCCCTGTAGGAGCATTTCTGGGTATTGTCGACGCTCCTCGC
TCCACCACCGATATGTTGATCTCCAAGTACATCAGACTCTCCCAGAACCGTTTGACGAAG
AAGGGTGATTTCACAGAGGAGAAGCTAATGACAATGTTGTCTGGTAATATCGGCATCAGC
GAGACTGTCAAGTTACTCGATGGACGCAAAACTAGCGCTGATTTTTCTTCTCCGAAGTTA
ACCAACACCCCATCCATTGCCAAGCCCAAGAAAAATAAATAAAACTCCTCTGTTTCTTCG
CTTTTTTTTTTCTTTAACGAATAATATAAAGCTTCAAGCTTTTGCATTTCTGCTTTTGCA
AGTTTGTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2GR08JQ 746 0 0
GGACGCAAAAGTAAAATCAGAGTAATAAATTATGGGAAGAGTTTGGTGAAAATTGGGGGT
AAAAGTTAAAAGTTACGCAGTTAAAACTGAATCCGAGTAAAATGAGAGTGATAGGGTTTA
AGGTTTTAAAAAAGAGGAGTCGATTTCATTAAAAAGGATCATAGCAACGGAGATCTGAAC
GGAGAGCTGAGGTTCGAAATGGCGATCAAAGCGGGAAAGGTTCTGAGAACGGCGTCGGCT
GCCTCTAGGAAGATCTTAGCATCACAGCCGGCTCCTCCAGCCGTATCATCGCTGGCTCCA
GCCGGTGTGACTTCATCTTCCCCTGTAGGAGCATTTCTGGGTATTGTCGACGCTCCTCGC
TCCACCACCGATATGTTGATCTCCAAGTACATCAGACTCTCCCAGAACCGTTTGACGAAG
AAGGGTGATTTCACAGAGGAGAAGCTAATGACAATGTTGTCTGGTAATATCGGCATCAGC
GAGACTGTCAAGTTACTCGATGGACGCAAAACTAGCGCTGATTTTTTTTCTCCGAAGTTA
ACCAACACCCCATCCATTGCCAAGCCCAAGAAAAATAAATAAAACTCCTCTGTTTCTTCG
CTTTTTTTTTTCTTTAACGAATAATATAAAGCTTCAAGCTTTTGCATTTCTGCTTTTGCA
AGTTTGTTTCTTTTTGAGTTTCAAACTAGTTGCTGAACATATGGATTATTATGCATTCCC
TCGAAAGATAGTTTTTAGTTGTTGCG

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL5140Contig1 785 2 2 U
GCAAGAAAGCCAAGATTTTCCACTACGGTTCCATTAGCTTGATCTCTGAGCCATGTAGAG
CGGCACACATGGCTGCTATGAAAACCGCCAAGGACGCAGGAGTTTTACTCTCTTACGACC
CTAATGTTCGGTTGCCTCTTTGGCCTTCCACTGAGGCTGCCATAGAAGGCATCAAAAGCA
TCTGGAATGAGGCTGATATTATCAAGGTAAGCGATGACGAGGTAACATTACTCACTGGGG
GAGATGCAGAGAAGGATGATGTTGTTTTGTCTCTAATGCATGACAAGCTCAAGCTGCTTA
TTGTAACTGACGGAGAGAAAGGTTGCAGATACTACACAAAGAAATTCAAAGGGAAAGTGC
CTGGATACTCTGTGAAAACAGTTGATACAACTGGAGCCGGTGATTCTTTTGTTGGTGCAT
TTCTTGTCTCACTGGGGAAAGATGGCTCCATACTCGATGATGAAGGAAAGCTTAAGGAGG
CTCTTGCATTTGCGAATGCATGTGGAGCTGTGTGTACAACTCAGAAAGGAGCTATTCCAG
CACTTCCATCTCCATCTGATGCTCAGCAACTCATGAAATCTAAGTCCAAATAATTTTATT
TTGTGTTGTTTCTCAAATGTCACTCATGCTTCTTTTGTTCTTCAATTTTGTATTGACTCT
AGTCTGCTTTTTGTTTTGTTGTTTCTATCAGTTATCTGAATAAGTTAGTGTTAATTTCCC
TGCCTATTTTAGTAGTGAAATGATAAGTGGATACTGTTCTTTTCGTATGTTATAATTCAG
TTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2DY33TF U 1
AF RR2DY33JQ C 161
BS 1 290 RR2DY33TF
BS 291 785 RR2DY33JQ

RD RR2DY33TF 292 0 0
GCAAGAAAGCCAAGATTTTCCACTACGGTTCCATTAGCTTGATCTCTGAGCCATGTAGAG
CGGCACACATGGCTGCTATGAAAACCGCCAAGGACGCAGGAGTTTTACTCTCTTACGACC
CTAATGTTCGGTTGCCTCTTTGGCCTTCCACTGAGGCTGCCATAGAAGGCATCAAAAGCA
TCTGGAATGAGGCTGATATTATCAAGGTAAGCGATGACGAGGTAACATTACTCACTGGGG
GAGATGCAGAGAAGGATGATGTTGTTTTGTCTCTAATGCATGACAAGCTC
GA

QA 1 290 1 290
DS 

RD RR2DY33JQ 625 0 0
CATAGAAGGCATCAAAAGCATCTGGAATGAGGCTGATATTATCAAGGTAAGCGATGACGA
GGTAACATTACTCACTGGGGGAGATGCAGAGAAGGATGATGTTGTTTTGTCTCTAATGCA
TGACAAGCTCAAGCTGCTTATTGTAACTGACGGAGAGAAAGGTTGCAGATACTACACAAA
GAAATTCAAAGGGAAAGTGCCTGGATACTCTGTGAAAACAGTTGATACAACTGGAGCCGG
TGATTCTTTTGTTGGTGCATTTCTTGTCTCACTGGGGAAAGATGGCTCCATACTCGATGA
TGAAGGAAAGCTTAAGGAGGCTCTTGCATTTGCGAATGCATGTGGAGCTGTGTGTACAAC
TCAGAAAGGAGCTATTCCAGCACTTCCATCTCCATCTGATGCTCAGCAACTCATGAAATC
TAAGTCCAAATAATTTTATTTTGTGTTGTTTCTCAAATGTCACTCATGCTTCTTTTGTTC
TTCAATTTTGTATTGACTCTAGTCTGCTTTTTGTTTTGTTGTTTCTATCAGTTATCTGAA
TAAGTTAGTGTTAATTTCCCTGCCTATTTTAGTAGTGAAATGATAAGTGGATACTGTTCT
TTTCGTATGTTATAATTCAGTTCTG

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL5141Contig1 1206 2 2 U
GGACAGAAAAAGGTCTGCTTCGGACATCCCTCCCTCCGCTTCATCGCCATCTCTTCGCTG
TCGCCTGACCAAAAAAAATGACAGAGGAAGAGGTGGCGATGGAGATGGAAGCCGTAGAAG
CAGTTTACGGCGACGAAGCCGTCATAGTGGATTCATATCCTCCTCATCTTCACCTCCACA
TCAAGCCCCGTACCGCCGAGATCTCTTCTCAGCAGTTTGTGGAAGCTGTTGTGAGAATAC
AAGCAGGTTCTAAGTATCCAGAAGAGCCGCCGGAGATCAGCCTGATTGAATCCAAGGGTC
TTGATGAGCAAAGGCAAAAGCTTTTGATTGGGTTTGTGCAAGAGAAAGCTTCTGAGCTAT
CATCTTCTCTAATGCTAGTAGCACTTTGTGAGGAAGCAGTTGAGAGGCTGACGATAATGA
ACCATCCGGATGGAGATTGTCCACTTTGTTTGTATCCCTTATTCCCTGAGGATGGCGAGA
GTAATCCAATGCCCTTTATGAAGCTCATGTCTTGCTTCCACTGTTTCCACTGGTGGTGGA
ATTGGCTTCACACAGAGAAAGAAGCTGATTCAGAACATGGTAACTCTGGATCAGTAGATA
AAAGCTTGGGGAACTGTCCAGTGTGCCGGAAAGCTGTTCATGCAAGTGATATTGAGCATG
TTCTCGGCTTAGTTGGTGCTCAGTCATCTCAACAGGATTTTGTTTTGGTACAAGGTGAGG
ACAAAGAAGACCCACTGCTCCAGTCAGAGTCAGAGATGAGAAGAGAGCGGTTTGAGGCGA
TTTTAAAGACGCAGGAAGAAAAGGGAGGTTTGGTTCAACCAAAGAAAAACATATCGGTTG
TGCCCGGTATGTATTTTCCTCCTCCACCAGCTCCTGCATCATTTTCATCAAACCAAGAAG
AAGCTCAAGAACAAGGACAACAAGTGGAACACAAAGAAGCTGAATCAGAGACAAACTCTA
GCAGCTCCAACAACAGGAGAGGGAGAGGAAGAGGCCGAGGGGGGCGGGGACATAGTAATG
TCAACAGAAGAAAGCAGACCTCGCAAGATCCAAGAAAACCTACGAAGCAGTGGGTGCAGA
GGAGTTGACAAAACTCATGTATTATTTATATATATCGAGAGAGAGAGAGAGAGATCAAAC
TCAACTCGAAAACAGACTACAAATACAAAAATAAATCCTCCGTTTTACAAGGATATTTTT
TAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2A212TF U 1
AF RR2A212JQ C 543
BS 1 670 RR2A212TF
BS 671 1206 RR2A212JQ

RD RR2A212TF 670 0 0
GGACAGAAAAAGGTCTGCTTCGGACATCCCTCCCTCCGCTTCATCGCCATCTCTTCGCTG
TCGCCTGACCAAAAAAAATGACAGAGGAAGAGGTGGCGATGGAGATGGAAGCCGTAGAAG
CAGTTTACGGCGACGAAGCCGTCATAGTGGATTCATATCCTCCTCATCTTCACCTCCACA
TCAAGCCCCGTACCGCCGAGATCTCTTCTCAGCAGTTTGTGGAAGCTGTTGTGAGAATAC
AAGCAGGTTCTAAGTATCCAGAAGAGCCGCCGGAGATCAGCCTGATTGAATCCAAGGGTC
TTGATGAGCAAAGGCAAAAGCTTTTGATTGGGTTTGTGCAAGAGAAAGCTTCTGAGCTAT
CATCTTCTCTAATGCTAGTAGCACTTTGTGAGGAAGCAGTTGAGAGGCTGACGATAATGA
ACCATCCGGATGGAGATTGTCCACTTTGTTTGTATCCCTTATTCCCTGAGGATGGCGAGA
GTAATCCAATGCCCTTTATGAAGCTCATGTCTTGCTTCCACTGTTTCCACTGGTGGTGGA
ATTGGCTTCACACAGAGAAAGAAGCTGATTCAGAACATGGTAACTCTGGATCAGTAGATA
AAAGCTTGGGGAACTGTCCAGTGTGCCGGAAAGCTGTTCATGCAAGTGATATTGAGCATG
TTCTCGGCTT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2A212JQ 664 0 0
TGGCTTCACACAGAGAAAGAAGCTGATTCAGAACATGGTAACTCTGGATCAGTAGATAAA
AGCTTGGGGAACTGTCCAGTGTGCCGGAAAGCTGTTCATGCAAGTGATATTGAGCATGTT
CTCGGCTTAGTTGGTGCTCAGTCATCTCAACAGGATTTTGTTTTGGTACAAGGTGAGGAC
AAAGAAGACCCACTGCTCCAGTCAGAGTCAGAGATGAGAAGAGAGCGGTTTGAGGCGATT
TTAAAGACGCAGGAAGAAAAGGGAGGTTTGGTTCAACCAAAGAAAAACATATCGGTTGTG
CCCGGTATGTATTTTCCTCCTCCACCAGCTCCTGCATCATTTTCATCAAACCAAGAAGAA
GCTCAAGAACAAGGACAACAAGTGGAACACAAAGAAGCTGAATCAGAGACAAACTCTAGC
AGCTCCAACAACAGGAGAGGGAGAGGAAGAGGCCGAGGGGGGCGGGGACATAGTAATGTC
AACAGAAGAAAGCAGACCTCGCAAGATCCAAGAAAACCTACGAAGCAGTGGGTGCAGAGG
AGTTGACAAAACTCATGTATTATTTATATATATCGAGAGAGAGAGAGAGAGATCAAACTC
AACTCGAAAACAGACTACAAATACAAAAATAAATCCTCCGTTTTACAAGGATATTTTTTA
AAAG

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL5142Contig1 734 2 8 U
TTTTTACTCAATCACGAGCGGCGTCTGCGTCAACTTCACACTGATTTTAGGGTCGTTCAT
CTTCTTCAATCTCAGACAACAATAATCTTCTTATATGTTCTCCTACACCAACAATGGAGT
TTCAAGAGAGTGGATGAATCAAATCGTTGTGAAGAATCTCTCTCTGGGTCTTCAATTGTG
TCATTTAATCTTCTGTTCTAACATAAATAGTGAGGAATCATCCCCTAATCAAAACACAAG
GTTTCTTCCCTAATCCAGTTTAATCAGAAAAATCAGACAGGGGACCAGTGGCTTTGCGGC
TGTGCCTACACACGAGGCGTGATAAATTCACGAGTGACGTTACAAAGGAGGGAGTAATGC
TAGCTAAGATACATGATAAGTTCAGCTCAGGAAACAGAGGTGCTGCATGTTCTGAGAAAG
TTAATATCAGTGTCTTCCGGGTATATGTACGTATATCCTTTGCTTAACTAGATGGACACC
ATTGATAATGGCTCATGGCACCGGAACTGGCTCGAGGAAATCTTGAACACAACCACTGAT
CAGCCACAAGAGCATGCGGCTGGTGAGGAAATGATTGTTTAACTCCATGTTGTGACCCTT
TTCCTGTCTGTATGGAAAGAAAATGCACTGTACCTTCTGGATGTGGTCATGAGTTCTGAC
CTAAACACCATAAATAAAAGACACCACAAGCCACACCAGGATCATACACATGTGGCATGA
CACTGTCTCTTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F784TF U 1
AF RR2GX37TF U 235
BS 1 279 RR2F784TF
BS 280 280 RR2GX37TF
BS 281 337 RR2F784TF
BS 338 338 RR2GX37TF
BS 339 361 RR2F784TF
BS 362 362 RR2GX37TF
BS 363 386 RR2F784TF
BS 387 734 RR2GX37TF

RD RR2F784TF 386 0 0
TTTTTACTCAATCACGAGCGGCGTCTGCGTCAACTTCACACTGATTTTAGGGTCGTTCAT
CTTCTTCAATCTCAGACAACAATAATCTTCTTATATGTTCTCCTACACCAACAATGGAGT
TTCAAGAGAGTGGATGAATCAAATCGTTGTGAAGAATCTCTCTCTGGGTCTTCAATTGTG
TCATTTAATCTTCTGTTCTAACATAAATAGTGAGGAATCATCCCCTAATCAAAACACAAG
GTTTCTTCCCTAATCCAGTTTAATCAGAAAAATCAGACATGGGACCAGTGGCTTTGCGGC
TGTGCCTACACACGAGGCGTGATAAATTCACGAGTGATGTTACAAAGGAGGGAGTAATGC
TGGCTAAGATACATGATAAGTTCAGC

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR2GX37TF 500 0 0
GAGGTTCG
TTCTTCCCTAATCCAGTTTAATCAGAAAAATCAGACAGGGGATCAGTGGCTTTGCGGCTG
TGCCTACACACGAGGCGTGATAAATTCACGAGTGACGTTACAAAGGAGGGAGTAATGCTA
GCTAAGATACATGATAAGTTCAGCTCAGGAAACAGAGGTGCTGCATGTTCTGAGAAAGTT
AATATCAGTGTCTTCCGGGTATATGTACGTATATCCTTTGCTTAACTAGATGGACACCAT
TGATAATGGCTCATGGCACCGGAACTGGCTCGAGGAAATCTTGAACACAACCACTGATCA
GCCACAAGAGCATGCGGCTGGTGAGGAAATGATTGTTTAACTCCATGTTGTGACCCTTTT
CCTGTCTGTATGGAAAGAAAATGCACTGTACCTTCTGGATGTGGTCATGAGTTCTGACCT
AAACACCATAAATAAAAGACACCACAAGCCACACCAGGATCATACACATGTGGCATGACA
CTGTCTCTTTCA

QA 9 500 9 500
DS 



AS 1 2

CO CL5143Contig1 537 2 2 U
GGGATTGACCAAAAAAGACGGCAGCTTTAGAGAGAGAGGATAAGAGATAAGAGAGAGATG
TCAGCTTCTTTATTCGTTTCAGGTATGGCGGTTGGAGTTCCCAGGCTCTCTAGCTCGGGC
TCTGTTCACCGGAGATTGGAACCAATGAAGAAGAAGACCATGAGTAGTGTCAAATTCGTG
ACTACCTTCCGAACTCCCTCTCCAAACTCAGGGACAAAACGGTCATTCCGCGTCATGGTT
TCCGATAACCGGTCGGAACAAGCAGATAACGGTCAAGGAACTCAGGAGGACTTGAGCTAC
CTGTTGAAGCTAGGAGCTGGTTCTGTATTAGGCGCAGCTTTAATCAAATACGGAAGCATT
TTGTTCCCGGAGATTACAACACCTAACCTCACTCAAGCCCTCTTCATTATATTTGCTCCT
GTTGTAATCTCTGTTTTACTTTTGATCAGATCATCTTCTTCCAAGAACCAGAACTAGAGT
TCAGCTCATTGTGAAAAGATTGTGTTCTTATGAAGAGTGTAAAAGTTTCACTATATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM56TF U 1
AF RR2EM56JQ C 1
BS 1 129 RR2EM56TF
BS 130 537 RR2EM56JQ

RD RR2EM56TF 129 0 0
GGGATTGACCAAAAAAGACGGCAGCTTTAGAGAGAGAGGATAAGAGATAAGAGAGAGATG
TCAGCTTCTTTATTCGTTTCAGGTATGGCGGTTGGAGTTCCCAGGCTCTCTAGCTCGGGC
TCTGTTCAC

QA 1 129 1 129
DS 

RD RR2EM56JQ 537 0 0
GGGATTGACCAAAAAAGACGGCAGCTTTAGAGAGAGAGGATAAGAGATAAGAGAGAGATG
TCAGCTTCTTTATTCGTTTCAGGTATGGCGGTTGGAGTTCCCAGGCTCTCTAGCTCGGGC
TCTGTTCACCGGAGATTGGAACCAATGAAGAAGAAGACCATGAGTAGTGTCAAATTCGTG
ACTACCTTCCGAACTCCCTCTCCAAACTCAGGGACAAAACGGTCATTCCGCGTCATGGTT
TCCGATAACCGGTCGGAACAAGCAGATAACGGTCAAGGAACTCAGGAGGACTTGAGCTAC
CTGTTGAAGCTAGGAGCTGGTTCTGTATTAGGCGCAGCTTTAATCAAATACGGAAGCATT
TTGTTCCCGGAGATTACAACACCTAACCTCACTCAAGCCCTCTTCATTATATTTGCTCCT
GTTGTAATCTCTGTTTTACTTTTGATCAGATCATCTTCTTCCAAGAACCAGAACTAGAGT
TCAGCTCATTGTGAAAAGATTGTGTTCTTATGAAGAGTGTAAAAGTTTCACTATATT

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

CO CL5144Contig1 833 2 3 U
CCCATTAAATCCCACCACCAAACAACTTTGCCCACAAAGAAAAAAAAACACGATTTGACT
TACAAAAACTACAGCAACAAACACAGGGCCAACGAATATTAATGCAAAAAAAAGTACACA
AACACACCAAAAATATCCTCTCGACCAGAAGTTTTCCGAAAGTTCAACTTCTTGATTGAC
CAGAACCTAAGAACCACATATACATTGTTTGAATTCATGTAAGGTGGGGAAAGAAATGCA
ACGTACCGAACGGTCTCCGATGATGACACGAGCTCTTAGGCTCGCTGCGACTGTCTTTGT
CCTCGAGCCACAACAGTCTTAAACAAAATCTCTTCAAGATATTCACAGCGACCTCTATGG
TGGTCGATCCACACACATAATTGCCTTATAGCTTCTCTTTTCTCTTCTCCAAGCCCCATC
AAAGTCTCCTTCATCGTCTCCTTCTCCTTTTCATCTGCTCGTACCTTTTCTCCAAGCTTC
TTCATCTCCTCCTCTTTCCTCTCCATCTCTTCCTTCATCTTCTCCTTCTCGTGATTCCTC
TCAATCACCCAATTCGTTGCCGTCCACAGTAATTTTGATGCCTCCATTACAGTCTTCTCG
TACTTCCCTTGCTTCTCCGTGATTTTTTCCGACACTGATTGAAACCCATCAAGTGTTGCG
TTCACTTTCTCAGCTATCGCTTTTATCATACCTCGATATGTCTCATGAGTCACCGTGAGG
CTTTTCTCAAGCAATGCTTGTTCCTCTATGTGCTTAGCTTCTTCTCTCCTGAAAGTTTCC
TCTTTCTCTGTTACATCTATTCGTTACCCTCAGTTTCTGGTTCGATAAACGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G277JQ U 1
AF RR2G265JQ U 1
BS 1 40 RR2G265JQ
BS 41 41 RR2G277JQ
BS 42 833 RR2G265JQ

RD RR2G277JQ 133 0 0
CCCATTAAATCCCACCACCAAACAACTTTGCCCACAAAGAAAAAAAAACACGATTTGACT
TACAAAAACTACAGCAACAAACACAGGGCCAACGAATATTAATGCAAAAAAAAGTACACA
AACACACCAAAAA

QA 1 133 1 133
DS 

RD RR2G265JQ 833 0 0
CCCATTAAATCCCACCACCAAACAACTTTGCCCACAAAGAGAAAAAAACACGATTTGACT
TACAAAAACTACAGCAACAAACACAGGGCCAACGAATATTAATGCAAAAAAAAGTACACA
AACACACCAAAAATATCCTCTCGACCAGAAGTTTTCCGAAAGTTCAACTTCTTGATTGAC
CAGAACCTAAGAACCACATATACATTGTTTGAATTCATGTAAGGTGGGGAAAGAAATGCA
ACGTACCGAACGGTCTCCGATGATGACACGAGCTCTTAGGCTCGCTGCGACTGTCTTTGT
CCTCGAGCCACAACAGTCTTAAACAAAATCTCTTCAAGATATTCACAGCGACCTCTATGG
TGGTCGATCCACACACATAATTGCCTTATAGCTTCTCTTTTCTCTTCTCCAAGCCCCATC
AAAGTCTCCTTCATCGTCTCCTTCTCCTTTTCATCTGCTCGTACCTTTTCTCCAAGCTTC
TTCATCTCCTCCTCTTTCCTCTCCATCTCTTCCTTCATCTTCTCCTTCTCGTGATTCCTC
TCAATCACCCAATTCGTTGCCGTCCACAGTAATTTTGATGCCTCCATTACAGTCTTCTCG
TACTTCCCTTGCTTCTCCGTGATTTTTTCCGACACTGATTGAAACCCATCAAGTGTTGCG
TTCACTTTCTCAGCTATCGCTTTTATCATACCTCGATATGTCTCATGAGTCACCGTGAGG
CTTTTCTCAAGCAATGCTTGTTCCTCTATGTGCTTAGCTTCTTCTCTCCTGAAAGTTTCC
TCTTTCTCTGTTACATCTATTCGTTACCCTCAGTTTCTGGTTCGATAAACGAA

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 2

CO CL5145Contig1 762 2 1 U
TTTTTCAAAATTGAAATCTTCAGTTTCTTCCCACTCCAAACCCAAACCCAAAAAAAAAAG
CTAAAGAGAAAGTTCAGAGCATCGATGGAGAAATCGACGGAGAAGAGCGTGAGCTCTGTT
GCTTCTGGGAACTCAATCAACTCGAAGCTGAGGTATCCTCTCAGATCTGCTCTCAGATCG
AAGGAAGGGAAGCCTCCTGTTCCAGATTTCTCAAGCGCCTCTTCAGCGCCCAGAAGGGGA
CGAGTTGCATCTGCTGTTAGTCAGAGTACTACGGTTCTCGATCTTTCTGCTAAGAAGAGC
GTTGTTGATCGCGCCAAGCCGCCGAGAAGAATGTCGATTCCTAACAAGGCCTCGAGCAAC
TCTTCCGTTAGGTCAGTCAGCAGCAGCTTCACTTCTTTGTCGGAGAGCAAGGCGAATAGA
CTTCCTGGAGGCAGCAATCCCAGGAGGAGCTTGAATGTAACAACAACGCCTGTCTCTAGT
GTGATGAGATCAGGGGCGAGAAGAAAAGTTGAGGATTTGTCTCCCTCTGCTTACTGGCTG
GCGCATATCAAGCTTGCTGAATCAGTGGAGAAACACTCGGTCTCTCTTGGGCTTTTTAAA
CTTGCTCTTCATGCAGGGTGTGAGCCACTTGACAAGATGAAAGAGGAGTTGAAGTCATAT
GCTGCTCGCACAACATGGATGGGCTTGCTGATGCTGTGAAGGACTTTCCGAGCTGTACTG
TATCTCAGATGATCCAAGCAGACGCAGAAGTCTCAGAGACCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY81TF U 31
AF RR2BU74TF U 1
BS 1 762 RR2BU74TF

RD RR2DY81TF 141 0 0
GGAT
TCCAAACCCAAACCCAAAAAAAAAAGCTAAAGAGAAAGTTCAGAGCATCGATGGAGAAAT
CGACGGAGAAGAGCGTGAGCTCTGTTGCTTCTGGGAACTCA*TCAACTCGAAGCTGAGGT
ATCCTCTCAGATCTGCT

QA 5 141 5 141
DS 

RD RR2BU74TF 762 0 0
TTTTTCAAAATTGAAATCTTCAGTTTCTTCCCACTCCAAACCCAAACCCAAAAAAAAAAG
CTAAAGAGAAAGTTCAGAGCATCGATGGAGAAATCGACGGAGAAGAGCGTGAGCTCTGTT
GCTTCTGGGAACTCAATCAACTCGAAGCTGAGGTATCCTCTCAGATCTGCTCTCAGATCG
AAGGAAGGGAAGCCTCCTGTTCCAGATTTCTCAAGCGCCTCTTCAGCGCCCAGAAGGGGA
CGAGTTGCATCTGCTGTTAGTCAGAGTACTACGGTTCTCGATCTTTCTGCTAAGAAGAGC
GTTGTTGATCGCGCCAAGCCGCCGAGAAGAATGTCGATTCCTAACAAGGCCTCGAGCAAC
TCTTCCGTTAGGTCAGTCAGCAGCAGCTTCACTTCTTTGTCGGAGAGCAAGGCGAATAGA
CTTCCTGGAGGCAGCAATCCCAGGAGGAGCTTGAATGTAACAACAACGCCTGTCTCTAGT
GTGATGAGATCAGGGGCGAGAAGAAAAGTTGAGGATTTGTCTCCCTCTGCTTACTGGCTG
GCGCATATCAAGCTTGCTGAATCAGTGGAGAAACACTCGGTCTCTCTTGGGCTTTTTAAA
CTTGCTCTTCATGCAGGGTGTGAGCCACTTGACAAGATGAAAGAGGAGTTGAAGTCATAT
GCTGCTCGCACAACATGGATGGGCTTGCTGATGCTGTGAAGGACTTTCCGAGCTGTACTG
TATCTCAGATGATCCAAGCAGACGCAGAAGTCTCAGAGACCA

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL5146Contig1 1212 2 4 U
GGACTCAGATGAATGCACTTTGTCCCTTGTTGTCGCATATTCGAAATCCCCATCTTTCCT
TTCATGGCATCCTCCTCCCCCACTCACCCCTTCTATCTCTCCCATGATCCTTCTTCTTCC
ACCTCTCTCCTTCATCTTCAAACCCAAATAACGATCTCAGGTTCTAAGGACTTTGAGAAG
ACCCGTTTGAGAATTCCCGTTTCTTTCAGGAAAAAAGCTGCCAACTTGCAAATGATGGCA
TCAGGGAAGACACCTGGACTGACTCAGGAAGCTACAATTGACAGAGAAGATAACGCTGAC
GTGTTCAACGACATGAAACAGCGGTTCCTCGCCTTTAAGAAGCAAAAGTACATGGATAAC
TTGGAACACTACAAAAAACTGGCAGATGCTCAAGCTCCAAAGTTTCTGGTGATTGCTTGT
GCAGACTCTAGGGTTTGTCCTTCCGCCATACTGGGATTCCAACCTGGTGATGCATTCACT
GTTCGTAACATTGCAAACTTAGTACCTTCATATGAGTCTGGACCTACTGAAACAAAAGCT
GCTCTGGAGTTCTCTGTGAATACTCTTAAAGTGGAGAACATCTTAGTTATTGGTCATAGC
CGGTGTGGAGGAATTCAAGCTTTGATGGGTATGCAAGACGAAGGAGATCCCAGAAGTTTC
ATACATAACTGGGTGATTGTGGGGAAAAAGGCAAAGGAAAGCACAAAAGCTGTTGCTTCA
AACCTCAATTTTGATCATCAGTGCCAACATTGTGAAAAGGCTTCGATAAACCATTCATTA
GAAAGGCTGCTTGGTTATCCCTGGATAGAAGAGAAAGTGCGGAAAGGGTCACTGTCTCTC
CATGGTGGGTACTATGATTTTGTAAACTGTTCATTTGAGAAATGGACCGTAGATTATGGA
GAAAGCAGAGGCAAGAAAGAAGGCAGTGGGATTGCTGTTAAAAACCGGTCTGTTTGGTGA
TGTATGACTTATGACCATCTCCATCTTCATAGGATAATTTTGAGACTCCATTTTCTTGGA
TTGAGATCAAGCTTACGTGTTTTATTTGTTGCAGTTGTGTGTTGAAACTTTGGGAGATTC
CTACAGAGACTTACGTTTGTTTCTTCTTTTGATTTTCTTGATATAATCATCTTTGTCCAC
TGTAGTGGGGGGGTAAGATGCTTACAGTCAGTACTCAATACATTTGTCACTCATTTATAA
TTTTATTGTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E927TF U 1
AF RR2E927JQ C 546
BS 1 643 RR2E927TF
BS 644 644 RR2E927JQ
BS 645 685 RR2E927TF
BS 686 1212 RR2E927JQ

RD RR2E927TF 685 0 0
GGACTCAGATGAATGCACTTTGTCCCTTGTTGTCGCATATTCGAAATCCCCATCTTTCCT
TTCATGGCATCCTCCTCCCCCACTCACCCCTTCTATCTCTCCCATGATCCTTCTTCTTCC
ACCTCTCTCCTTCATCTTCAAACCCAAATAACGATCTCAGGTTCTAAGGACTTTGAGAAG
ACCCGTTTGAGAATTCCCGTTTCTTTCAGGAAAAAAGCTGCCAACTTGCAAATGATGGCA
TCAGGGAAGACACCTGGACTGACTCAGGAAGCTACAATTGACAGAGAAGATAACGCTGAC
GTGTTCAACGACATGAAACAGCGGTTCCTCGCCTTTAAGAAGCAAAAGTACATGGATAAC
TTGGAACACTACAAAAAACTGGCAGATGCTCAAGCTCCAAAGTTTCTGGTGATTGCTTGT
GCAGACTCTAGGGTTTGTCCTTCCGCCATACTGGGATTCCAACCTGGTGATGCATTCACT
GTTCGTAACATTGCAAACTTAGTACCTTCATATGAGTCTGGACCTACTGAAACAAAAGCT
GCTCTGGAGTTCTCTGTGAATACTCTTAAAGTGGAGAACATCTTAGTTATTGGTCATAGC
CGGTGTGGAGGAATTCAAGCTTTGATGGGTATGCAAGACGAAG*AGATCCCAGAAGTTTC
ATACATAACTGGGTGATTGTGGGGA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2E927JQ 667 0 0
GGAGTTCTCTGTGAATACTCTTAAGGTGGAGAACATCTTAGTTATTGGTCATAGCCGGTG
TGGAGGAATTCAAGCTTTGATGGGTATGCAAGACGAAGGAGATCCCAGAAGTTTCATACA
TAACTGGGTGATTGTGGGGAAAAAGGCAAAGGAAAGCACAAAAGCTGTTGCTTCAAACCT
CAATTTTGATCATCAGTGCCAACATTGTGAAAAGGCTTCGATAAACCATTCATTAGAAAG
GCTGCTTGGTTATCCCTGGATAGAAGAGAAAGTGCGGAAAGGGTCACTGTCTCTCCATGG
TGGGTACTATGATTTTGTAAACTGTTCATTTGAGAAATGGACCGTAGATTATGGAGAAAG
CAGAGGCAAGAAAGAAGGCAGTGGGATTGCTGTTAAAAACCGGTCTGTTTGGTGATGTAT
GACTTATGACCATCTCCATCTTCATAGGATAATTTTGAGACTCCATTTTCTTGGATTGAG
ATCAAGCTTACGTGTTTTATTTGTTGCAGTTGTGTGTTGAAACTTTGGGAGATTCCTACA
GAGACTTACGTTTGTTTCTTCTTTTGATTTTCTTGATATAATCATCTTTGTCCACTGTAG
TGGGGGGGTAAGATGCTTACAGTCAGTACTCAATACATTTGTCACTCATTTATAATTTTA
TTGTATG

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL5147Contig1 963 2 2 U
GGAACAGCTCCTACTGCATTACCAGCTGATCGTACAAAAGGGTGGCAGCCATCTTATTCT
CTCGATGAAGACGCTATTCTTCACCAGTTACGCGCTAATCTTGTACAGGCTATTGATGCC
GCCATGCTAAGGCTGCGTACAGAGAACCAGCAGTTTCAGCAACAACAACATCAACAGCAA
GCGGCACTAATACCCGTTATGCAGGAATGTGTTGATGCCATTAGCGAACATCAGAGGCTT
CAGGGTTTAATGAAAGGAGAGTGGGTGAAGGGACTACTTCCGCGCAGCAGCATTCCAGCA
GACTACACGGTGCAAAGAATCCGAGAGCTCGCGGAAGGAACTTGTGTGAAGAACTACGAA
TCCAACGGTAGGGCAGATGCTCGTGAGAAAAACAAGAAATGGAGCCTGGAGCCTCCAACC
GATTCTCATCTGCTTCTGTACTTGTTCTGTGCTTACTTGGAACACCCAAAATGGATGTTA
CATCTGGACCCAAGTTCTTATATAGGGACTCAGTCAAGCCGGAACCCGTTGTTCTTAGGG
GTTTTGCCTCCAAAAGAAAGATTCCCGGAGAAGTACATAGCTGTGGTATCCGGTGTTCCT
TCTACGCTCCATCCCGGTGCATGTGTACTTGCTGTGGACAAGCAATGCCCCCCTGCGTTT
GCCTTGTACTGGGATAAGAAAGTGCAGTTTACCCTTCAGGGACGAACAGCGCTATGGGAC
TCTATCCTGATGATGTGCCACAGAATCAAGGTGGGATATGGAGGTGTTGTTCGTGGGATG
AATCTTGGTTCTTCGGCTCTTAACATCCTTCAAGTTGTTGATTCTGAAACTGATGATTGA
TTAAAACATCTAACATTTGAAGGAAAATTGTACTTTGCTTGAGACTGCTAAGTTTTACTC
GGTGGAGGAGAAATTGTAGTAAGAATAGTTATTATCTTTGGATATCAATGTATTCTTGTG
TTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2G907TF U 1
AF RR2G907JQ C 430
BS 1 561 RR2G907TF
BS 562 963 RR2G907JQ

RD RR2G907TF 561 0 0
GGAACAGCTCCTACTGCATTACCAGCTGATCGTACAAAAGGGTGGCAGCCATCTTATTCT
CTCGATGAAGACGCTATTCTTCACCAGTTACGCGCTAATCTTGTACAGGCTATTGATGCC
GCCATGCTAAGGCTGCGTACAGAGAACCAGCAGTTTCAGCAACAACAACATCAACAGCAA
GCGGCACTAATACCCGTTATGCAGGAATGTGTTGATGCCATTAGCGAACATCAGAGGCTT
CAGGGTTTAATGAAAGGAGAGTGGGTGAAGGGACTACTTCCGCGCAGCAGCATTCCAGCA
GACTACACGGTGCAAAGAATCCGAGAGCTCGCGGAAGGAACTTGTGTGAAGAACTACGAA
TCCAACGGTAGGGCAGATGCTCGTGAGAAAAACAAGAAATGGAGCCTGGAGCCTCCAACC
GATTCTCATCTGCTTCTGTACTTGTTCTGTGCTTACTTGGAACACCCAAAATGGATGTTA
CATCTGGACCCAAGTTCTTATATAGGGACTCAGTCAAGCCGGAACCCGTTGTTCTTAGGG
GTTTTGCCTCCAAAAGAAAGA

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2G907JQ 534 0 0
CTGCTTCTGTACTTGTTCTGTGCTTACTTGGAACACCCAAAATGGATGTTACATCTGGAC
CCAAGTTCTTATATAGGGACTCAGTCAAGCCGGAACCCGTTGTTCTTAGGGGTTTTGCCT
CCAAAAGAAAGATTCCCGGAGAAGTACATAGCTGTGGTATCCGGTGTTCCTTCTACGCTC
CATCCCGGTGCATGTGTACTTGCTGTGGACAAGCAATGCCCCCCTGCGTTTGCCTTGTAC
TGGGATAAGAAAGTGCAGTTTACCCTTCAGGGACGAACAGCGCTATGGGACTCTATCCTG
ATGATGTGCCACAGAATCAAGGTGGGATATGGAGGTGTTGTTCGTGGGATGAATCTTGGT
TCTTCGGCTCTTAACATCCTTCAAGTTGTTGATTCTGAAACTGATGATTGATTAAAACAT
CTAACATTTGAAGGAAAATTGTACTTTGCTTGAGACTGCTAAGTTTTACTCGGTGGAGGA
GAAATTGTAGTAAGAATAGTTATTATCTTTGGATATCAATGTATTCTTGTGTTG

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 2

CO CL5148Contig1 1316 2 4 U
GGAGATAATAAAAAAAGAGTGAAAAAGCAGAAAATTCAAATCGGAGGAAAAATCTGAAGG
AAGATGGCGGGATCCCTAACTGCATCAGTCCACCGAGGAAACGCGGAGGCTTCGGGAAAT
TTCCGATGGTTAATCAGCTTCGCTCGGTCTATTCCGTTTCCATCTTCTCCATCTCCGTAT
CCAGGACTCGTTCCTCTCGGAAAGAGAGAGCTCAGCTCGTCGCCCATAGGTACGTGGTTG
TCGACGTCTTTCTCGAAGGTGTATCTCACCCTGGTGGACGAAGTCAACAGATCCGATGCG
ATTCTCTCCGTCGAACTCGCCGGAAAAATCCTCGAAGAACACTACATTTCAAAGCTGAAT
ATCTCGTGGCCTCACATGACGTGCGTTTCTGGATTCCCACCTCGTGGTAGCCGAGTGATT
CTCGTTAGCTACATGGATTCTGAAAACGAGATTCAAAAGTTCGCTTTAAGGTTCTCCACA
TGTGATGCAGCGGTGACCTTTGTGGCAGCTCTTAAGGAGAAACTCAAGGGCTTAGAGGAA
ACTGGGATCCAGGAACGTGAGTCCGATGCTAGTTTCCAGTCAGATTACAACACTGGAAAT
GAGATTATCATCCCCAGAACCACTGAAGAAGGGCCAAATCTGTTTAGACCTCCTAATAGT
TATGTTCCTGAAATGTTACCAAGGCTCGAGTATCAACAATCCGCCACTGCGGAAGAGCCA
AACATGGTTAAACATCTTGGTAGCTATGTTCCTGAAATGCAAGCAAGGCTCGAGTATCAA
ACTGGTCAAACCTTCTATACACCACAAATCGCCGCTGTGGAGGAGCCAACCATGGTTAAA
CATATTGGTAGCTATGTCCCTGAAATGCAACCAAGGCTTGAGTATCAAACTGGGCAAACC
TTATACCGACCACAATCCACCCTTAGCCAAATCCCTAACGATGCTATTAGTAACCTCCCT
CCGAGTTTCACCACCTTACTCTCTGGTTGCTTCCCAAACTCCACTCTTGATGCAGGCCAA
ACAACTATAAAGCAGGATCCTGAGCTAAAGTCACAGATACTGAAGTACATGGAAGATTCT
TCATTTCACGACATGTTGCAGAAAGTAGAGAGAGTTATGGAAGAAATAGGAGGTAGCTGG
ATTCCCTGAGTTTCATCTCACATATATATTCAAAATCTCAGTCTTGTTTTCCAAAATCCA
GTATATTTTGTTTGATGCAACGTATATGGTTCAGACATTGTTGATACTCTTTGTACTTGT
GAACGCGAACACTATACTTTAACATTTCTGAATATCAAATGCCCACCCTTATAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C065TF U 1
AF RR2C065JQ C 507
BS 1 632 RR2C065TF
BS 633 633 RR2C065JQ
BS 634 646 RR2C065TF
BS 647 1316 RR2C065JQ

RD RR2C065TF 646 0 0
GGAGATAATAAAAAAAGAGTGAAAAAGCAGAAAATTCAAATCGGAGGAAAAATCTGAAGG
AAGATGGCGGGATCCCTAACTGCATCAGTCCACCGAGGAAACGCGGAGGCTTCGGGAAAT
TTCCGATGGTTAATCAGCTTCGCTCGGTCTATTCCGTTTCCATCTTCTCCATCTCCGTAT
CCAGGACTCGTTCCTCTCGGAAAGAGAGAGCTCAGCTCGTCGCCCATAGGTACGTGGTTG
TCGACGTCTTTCTCGAAGGTGTATCTCACCCTGGTGGACGAAGTCAACAGATCCGATGCG
ATTCTCTCCGTCGAACTCGCCGGAAAAATCCTCGAAGAACACTACATTTCAAAGCTGAAT
ATCTCGTGGCCTCACATGACGTGCGTTTCTGGATTCCCACCTCGTGGTAGCCGAGTGATT
CTCGTTAGCTACATGGATTCTGAAAACGAGATTCAAAAGTTCGCTTTAAGGTTCTCCACA
TGTGATGCAGCGGTGACCTTTGTGGCAGCTCTTAAGGAGAAACTCAAGGGCTTAGAGGAA
ACTGGGATCCAGGAACGTGAGTCCGATGCTAGTTTCCAGTCAGATTACAACACTGGAAAT
GAGATTATCATCCCCAGAACCACTGAAGAAGG*CCAAATCTGTTTA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2C065JQ 810 0 0
CAGCTC
TAAGGAGAAACTCAAGGGCTTAGAGGAAACTGGGATCCAGGAACGTGAGTCCGATGCTAG
TTTCCAGTCAGATTACAACACTGGAAATGAGATTATCATCCCCAGAACCACTGAAGAAGG
GCCAAATCTGTTTAGACCTCCTAATAGTTATGTTCCTGAAATGTTACCAAGGCTCGAGTA
TCAACAATCCGCCACTGCGGAAGAGCCAAACATGGTTAAACATCTTGGTAGCTATGTTCC
TGAAATGCAAGCAAGGCTCGAGTATCAAACTGGTCAAACCTTCTATACACCACAAATCGC
CGCTGTGGAGGAGCCAACCATGGTTAAACATATTGGTAGCTATGTCCCTGAAATGCAACC
AAGGCTTGAGTATCAAACTGGGCAAACCTTATACCGACCACAATCCACCCTTAGCCAAAT
CCCTAACGATGCTATTAGTAACCTCCCTCCGAGTTTCACCACCTTACTCTCTGGTTGCTT
CCCAAACTCCACTCTTGATGCAGGCCAAACAACTATAAAGCAGGATCCTGAGCTAAAGTC
ACAGATACTGAAGTACATGGAAGATTCTTCATTTCACGACATGTTGCAGAAAGTAGAGAG
AGTTATGGAAGAAATAGGAGGTAGCTGGATTCCCTGAGTTTCATCTCACATATATATTCA
AAATCTCAGTCTTGTTTTCCAAAATCCAGTATATTTTGTTTGATGCAACGTATATGGTTC
AGACATTGTTGATACTCTTTGTACTTGTGAACGCGAACACTATACTTTAACATTTCTGAA
TATCAAATGCCCACCCTTATAAGC

QA 7 810 7 810
DS 



AS 1 2

CO CL5149Contig1 1126 2 2 U
GAAGCCTCCTGGTGGGAACTTGGGAAGCAATCCTCTTCTTGATAATAATTGCCAAGATCC
AACGAAAAAGACTGAAGCGGCATGTGATTGTCATCTAAACATGAACGAGAGTCTCCCCAA
TAATCATCACTCACGCGTCGGGAGCAATAACTTTGAAATGAGTTCCACGACTGAGAATAA
AGCTTTCACAAAGCCTGGAGCTCCAAAAGTGAGCTCGGCAGGATCTTCATCGGTAAAGCA
GCCTCTACCCTGTGATCATCATCATCATCACTCGTCCTATAATCCTGTCCACATCCCTGA
GCGGAAGTTACAGCCACAACGTGGATCCTCAAATGAGGCGACTGAAGGTAACAACAACGG
AGTGAATTACAGTGTGAATGGAAGTGGATCAGGAAGTGGTCATGGAAGCAATGATCCATA
TGGAAGCAGCAATGGCATGAATGCTGGAGGGATGAATACGGGAAGTGGTAATGGTGCTGG
GGGAAGTGGTGATGGCAGTGGAAGTGGCAGTGGAAGTGGGACTCTGGCAGATGAAAATAA
GATGTCTCAAAGAGAAGCTGCTTTGACAAAGTTCCGTCAGAAGAGAAAAGAGAGGTGCTT
CAGAAAGAAGGTACGATACCAAAGCCGGAAAAAACTAGCAGAACAACGCCCACGTGTCCG
TGGCCAATTCGTACGCAAAACAGCTGATTGAACGAACGACAACGACATAAAAAACGCTGA
GGATAGCTGACGTGAAGATCTCTACGAAACCAACCTTTCGAGCCTAAAAAAAAATATTTG
GTAACCTTCTCATCATCTTTGTTGGGACCCTATCAATCAATCAATCACCTGTTTTTAACA
AAACTTTCATTAAAGTCTGATTCTTTGATATTACTACTACAACAACTATTCCACGAAACA
AGGACACGAGAGACGTTTGATTGTTTGTTAGTTGTCGTCGTATGGTCTGGTTTGTGGATT
CAGGACAAAGGAGTTGGTTCATGAATTGTAGATGTGTTTGTTGTAAACTTGTAAAACAAT
AACCCCTGGTTGTATATTTCTTTTGTATAAGCTTTGTTTTTGGAGCCGAGTAGAGGACAC
AGTCTCGTATTGTATTTAATGTATCAGGCATTATCTCTTCTTGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF64TF U 1
AF RR2EF64JQ C 457
BS 1 586 RR2EF64TF
BS 587 1126 RR2EF64JQ

RD RR2EF64TF 586 0 0
GAAGCCTCCTGGTGGGAACTTGGGAAGCAATCCTCTTCTTGATAATAATTGCCAAGATCC
AACGAAAAAGACTGAAGCGGCATGTGATTGTCATCTAAACATGAACGAGAGTCTCCCCAA
TAATCATCACTCACGCGTCGGGAGCAATAACTTTGAAATGAGTTCCACGACTGAGAATAA
AGCTTTCACAAAGCCTGGAGCTCCAAAAGTGAGCTCGGCAGGATCTTCATCGGTAAAGCA
GCCTCTACCCTGTGATCATCATCATCATCACTCGTCCTATAATCCTGTCCACATCCCTGA
GCGGAAGTTACAGCCACAACGTGGATCCTCAAATGAGGCGACTGAAGGTAACAACAACGG
AGTGAATTACAGTGTGAATGGAAGTGGATCAGGAAGTGGTCATGGAAGCAATGATCCATA
TGGAAGCAGCAATGGCATGAATGCTGGAGGGATGAATACGGGAAGTGGTAATGGTGCTGG
GGGAAGTGGTGATGGCAGTGGAAGTGGCAGTGGAAGTGGGACTCTGGCAGATGAAAATAA
GATGTCTCAAAGAGAAGCTGCTTTGACAAAGTTCCGTCAGAAGAGA

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2EF64JQ 670 0 0
TACGGGAAGTGGTAATGGTGCTGGGGGAAGTGGTGATGGCAGTGGAAGTGGCAGTGGAAG
TGGGACTCTGGCAGATGAAAATAAGATGTCTCAAAGAGAAGCTGCTTTGACAAAGTTCCG
TCAGAAGAGAAAAGAGAGGTGCTTCAGAAAGAAGGTACGATACCAAAGCCGGAAAAAACT
AGCAGAACAACGCCCACGTGTCCGTGGCCAATTCGTACGCAAAACAGCTGATTGAACGAA
CGACAACGACATAAAAAACGCTGAGGATAGCTGACGTGAAGATCTCTACGAAACCAACCT
TTCGAGCCTAAAAAAAAATATTTGGTAACCTTCTCATCATCTTTGTTGGGACCCTATCAA
TCAATCAATCACCTGTTTTTAACAAAACTTTCATTAAAGTCTGATTCTTTGATATTACTA
CTACAACAACTATTCCACGAAACAAGGACACGAGAGACGTTTGATTGTTTGTTAGTTGTC
GTCGTATGGTCTGGTTTGTGGATTCAGGACAAAGGAGTTGGTTCATGAATTGTAGATGTG
TTTGTTGTAAACTTGTAAAACAATAACCCCTGGTTGTATATTTCTTTTGTATAAGCTTTG
TTTTTGGAGCCGAGTAGAGGACACAGTCTCGTATTGTATTTAATGTATCAGGCATTATCT
CTTCTTGTAT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL5150Contig1 1352 2 8 U
GGGGACTGCTTGTCAACAACACACGAATCGGAGGGGTTTCTTGTAAATATCGTCAAAACC
ATTTTTTTCTTAATTGAAAAAAAAACTGTGAGTCGGAGCTTCTCGTCGGCGTTTGAGATA
ATGTGGGAGTCGATTTGCCTGACGCTTGCGGCCACCGCCGGTAACAATATCGGAAAGGTT
CTTCAGAAGAAGGGGACTATCATCCTCCCTCCTCTCTCCCTCAAGCTCAAGGTGATAAGA
GCGTATGCTGTTAATAAACCATGGGCGTTAGGTTTTCTCATGGACATTTTTGGGGCTTTG
TTGATGCTCAGGGCACTCTCTCTCGCCCCTGTGTCTGTTGTTCAGCCAGTCTCTGGATGT
GGACTTGCCATTCTTTCCGTCTTTTCGCATTTTTATCTCAAGGAAGTCATGAATGTTTTT
GACTGGATTGGGATTACCATGGCTGGCATTGGCACCATAGGAGTTGGTGCTGGTGGTGAG
GAGCAAAAAGCATCTTTGATATCTGTCTTCCAGTTGCTCTGGCTTGCACTTGTTGTTGCC
TTCTTGTTTGTACTACTAAATGCGTGGCTTCATATCTATAAACGCCAGCGCAGGGAGCAG
GAGCTGATGGAATATGAAGTGGTGGAAGAAATCATATATGGCTTGGAATCTGGGGTTTTA
TTCGGGATGGCATCTGTAGTATCAAAGATGGGTTTTGTATTCGTGGAGCAGGGGTTTTCT
ACAATGTTCATTCCCATGTGCATTTCGATTAGTATATGCTGTAGTGGAACAGGATTTTTC
TACCAGACTCGGGGACTAAAACATGGGAGAGCAATTGTAGTATCCACTTGCGCTGCTGTG
GCGTCAATTGTAACAGGCGTGGTTGCTGGAATGTTTGCTCTTGGTGAGAAATTGCCCACT
TCACCATCAGGACGGCTTTTACTTCTCCTGGGATGGTTACTTATCATGCTAGGTGTTGTG
TTACTTGTGACTTCATCGCGACTTATCAGACATCTTCCGCGGTCATTCCGGCGTTCCAGA
CAGGCCAGTTTAGAAAGAGGTTTCAGCACAAGGCGGACAGCTTCTCACGTATCGAAAGAT
ACAAACCCAAGTGCGGTTATACAAGCAGCAACATTGCACCATCTCTTATCAGCCCCATCA
AAAGAGAAAGACTAAAGACTTGATAAACACCAGAGAGGCACGTTTTTGCTTTACACAGTT
TTTCTTCCGGATCTGTGGACTAAAGGTGTCTGATTTCCAGGGGTTCATCTTATTGATATT
CTAGTTGTGGGATCAGTTAAAAAAAGTCAAGAGCTTTGGATTAATTTTTGATGTTACTTT
TGGTATCTGAAATGCAAAATATGAGTTCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH61TF U 1
AF RR2EH61JQ C 569
BS 1 600 RR2EH61TF
BS 601 601 RR2EH61JQ
BS 602 645 RR2EH61TF
BS 646 646 RR2EH61JQ
BS 647 658 RR2EH61TF
BS 659 659 RR2EH61JQ
BS 660 712 RR2EH61TF
BS 713 1352 RR2EH61JQ

RD RR2EH61TF 712 0 0
GGGGACTGCTTGTCAACAACACACGAATCGGAGGGGTTTCTTGTAAATATCGTCAAAACC
ATTTTTTTCTTAATTGAAAAAAAAACTGTGAGTCGGAGCTTCTCGTCGGCGTTTGAGATA
ATGTGGGAGTCGATTTGCCTGACGCTTGCGGCCACCGCCGGTAACAATATCGGAAAGGTT
CTTCAGAAGAAGGGGACTATCATCCTCCCTCCTCTCTCCCTCAAGCTCAAGGTGATAAGA
GCGTATGCTGTTAATAAACCATGGGCGTTAGGTTTTCTCATGGACATTTTTGGGGCTTTG
TTGATGCTCAGGGCACTCTCTCTCGCCCCTGTGTCTGTTGTTCAGCCAGTCTCTGGATGT
GGACTTGCCATTCTTTCCGTCTTTTCGCATTTTTATCTCAAGGAAGTCATGAATGTTTTT
GACTGGATTGGGATTACCATGGCTGGCATTGGCACCATAGGAGTTGGTGCTGGTGGTGAG
GAGCAAAAAGCATCTTTGATATCTGTCTTCCAGTTGCTCTGGCTTGCACTTGTTGTTGCC
TTCTTGTTTGTACTACTAAATGCGTGGCTTCATATCTATAAACGCCAGCGCAGGGAGCAG
*AGCTGATGGAATATGAAGTGGTGGAAGAAATCATATATGGCTTG*AATCTGGGGTTT*A
TTCGGGATGGCATCTGTAGTATCAAAGATGGGTTTTGTATTCGTGGAGCAGG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2EH61JQ 784 0 0
TTCATATCTATAAACGCCAGCGCAGGGAGCAGGAGCTGATGGAATATGAAGTGGTGGAAG
AAATCATATATGGCTTGGAATCTGGGGTTTTATTCGGGATGGCATCTGTAGTATCAAAGA
TGGGTTTTGTATTCGTGGAGCAGGGGTTTTCTACAATGTTCATTCCCATGTGCATTTCGA
TTAGTATATGCTGTAGTGGAACAGGATTTTTCTACCAGACTCGGGGACTAAAACATGGGA
GAGCAATTGTAGTATCCACTTGCGCTGCTGTGGCGTCAATTGTAACAGGCGTGGTTGCTG
GAATGTTTGCTCTTGGTGAGAAATTGCCCACTTCACCATCAGGACGGCTTTTACTTCTCC
TGGGATGGTTACTTATCATGCTAGGTGTTGTGTTACTTGTGACTTCATCGCGACTTATCA
GACATCTTCCGCGGTCATTCCGGCGTTCCAGACAGGCCAGTTTAGAAAGAGGTTTCAGCA
CAAGGCGGACAGCTTCTCACGTATCGAAAGATACAAACCCAAGTGCGGTTATACAAGCAG
CAACATTGCACCATCTCTTATCAGCCCCATCAAAAGAGAAAGACTAAAGACTTGATAAAC
ACCAGAGAGGCACGTTTTTGCTTTACACAGTTTTTCTTCCGGATCTGTGGACTAAAGGTG
TCTGATTTCCAGGGGTTCATCTTATTGATATTCTAGTTGTGGGATCAGTTAAAAAAAGTC
AAGAGCTTTGGATTAATTTTTGATGTTACTTTTGGTATCTGAAATGCAAAATATGAGTTC
CCCC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL5151Contig1 499 2 5 U
TATGTTGAGAGGGACTCTCTGTTCACCGAGTCCTTTCTTACTAGCCTTTATGGGATGAGA
AGCCAAAGCTCTCACTCTAATGTCGCAACCGTTGATCTCATCAACGTCTCTTATGCAGCC
GTTCACTACGATCCCCGCCCATCCGTTGTTCTGAGCTTGTACTACTGGGTTTCCTCCGAG
TATCGCACAGCGTAAACTTCCTCCACCATCCACCACAAGGACTCTTCCATTGCCTTTCTC
TTCGAGAAACTGACGGATCAAGCCATTGTCTTCAAAAACTTTGACAGTAACAACGGGACC
TGAGAATATTTGACGACGACCGTATATCTGGAAACAGGGTTGCAGAGCTCGGAGCTGGCC
ACTACGGATCAGATCTTGATTCGCGTCACAAACTTCTGCAGTGGTCACAAACGCCATCTC
TCTCCTTCTAACCTGAAATAGAAGAAACTTGAATGAAGAGAAGAAAAACTCTCTGTCTGT
CTGTGTGGTCAAGTATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E672JQ U 67
AF RR2E672TF C 1
BS 1 66 RR2E672TF
BS 67 96 RR2E672JQ
BS 97 97 RR2E672TF
BS 98 201 RR2E672JQ
BS 202 499 RR2E672TF

RD RR2E672JQ 135 0 0
AGCTCTCACTCTAATGTCGCAACCGTTGATTTCATCAACGTCTCTTATGCAGCCGTTCAC
TACGATCCCCGCCCATCCGTTGTTCTGAGCTTGTACTACTGGGTTTCCTCCGAGTATCGC
ACAGCGTAAACTTCC

QA 1 135 1 135
DS 

RD RR2E672TF 499 0 0
TATGTTGAGAGGGACTCTCTGTTCACCGAGTCCTTTCTTACTAGCCTTTATGGGATGAGA
AGCCAAAGCTCTCACTCTAATGTCGCAACCGTTGATCTCATCAACGTCTCTTATGCAGCC
GTTCACTACGATCCCCGCCCATCCGTTGTTCTGAGCTTGTACTACTGGGTTTCCTCCGAG
TATCGCACAGCGTAAACTTCCTCCACCATCCACCACAAGGACTCTTCCATTGCCTTTCTC
TTCGAGAAACTGACGGATCAAGCCATTGTCTTCAAAAACTTTGACAGTAACAACGGGACC
TGAGAATATTTGACGACGACCGTATATCTGGAAACAGGGTTGCAGAGCTCGGAGCTGGCC
ACTACGGATCAGATCTTGATTCGCGTCACAAACTTCTGCAGTGGTCACAAACGCCATCTC
TCTCCTTCTAACCTGAAATAGAAGAAACTTGAATGAAGAGAAGAAAAACTCTCTGTCTGT
CTGTGTGGTCAAGTATCCC

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

CO CL5152Contig1 1347 2 2 U
GGATCAAACCTTTCTTCACCACATTTCACCGAGAGCCCACATATAGAGAGAGAGAAACTT
CTCCCAAATCTCTCTCCAGCAATGGTTGTTGCTATGGACCAGCGCAGCAATGTGAACGGA
GTTTCCGGTGCTCGGAAGGAAGAAGGGTTTGATCCAAGCGCACAACCACCGTTTAAGATC
GGAGATATAAGGGCGGCCATTCCGAAGCATTGTTGGGTCAAGAGTCCTTTGAGATCTATG
AGCTATGTCGCCAGAGACATTTTCGCCGTCGCGGCTCTGGCCATGGCCGCTGTGTATTTT
GATAGCTGGTTCCTCTGGCCACTCTACTGGGTTGCCCAAGGAACCCTTTTCTGGGCCATC
TTCGTTCTTGGCCACGACTGTGGGCACGTAAGTTTCTCAGACATTCCTCTGCTGAACAGT
GTGGTTGGTCACATTTCATTCATTCATCCTCGTTCCTTACCATGGTTGGAGAATAAGCCA
TCGGACACACCACCAGAACCATGGCCATGTTGAAAACGACGAGTCTTGGGTTCCGCTGCC
AGAAAAGTTGTACAAGAGCTTGCCCCATATTACTCGGATGCTCAGATACACTGTCCCTCT
GCCCATGCTCGCTTACCCGATCTATCTGTGGTACAGAAGTCCTGGAAAAGAAGGGTCACA
TTATAACCCATACAGTAGTTTATTTGCTCCAAGCGAGAGGAAGCTTATTGCAACTTCAAC
TACTTGCTGGTCCATAATGCTGGCCACTCTTGCTTATCTATCGTTCCTCCTTGGTCCAGT
CACAGTTCTCAAAGTCTATGGTGTTCCTTACATTATCTTTGTGATGTGGTTGGGCGCTGT
CACGTACTTGCATCATCATGGTCATGATGAGAAGTTGCCGTGGTACAGAGGCAAGGAATG
GAGTTATTTACGTGGAGGATTAACAACTATTGATAGAGATTATGGAATCTTCAACAACAT
CCATCACGACATTGGAACTCACGTGATCCATCATCTTTTCCCACAAATCCCTCACTATCA
CTTGGTCGACGCCACGAAAGCAGCTAAACATGTGCTGGGAAGATACTACAGAGAGCCGAA
GACGTCAGGAGCAATACCGGTTCACTTGGTGGAGAGTTTGGTCGCAAGTATTAAAAAAGA
TCACTACGTCAGTGACACTGGTGATATTGTCTTCTACGAGACAGATCCAGATCTCTACGT
TTATGCTTCTGACAAATCTAAAATCAATTAACCCTTCTCCCTGGCTCTATTAGGAATAAG
CACTCCTTTTCTTTTGCTTATTTGTTGCTGTTTTAAGTTTAAAATGTACTCGTGGAACCT
TTCTTTTTATTAATGTATTTACATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG64TF U 1
AF RR2DG64JQ C 621
BS 1 751 RR2DG64TF
BS 752 1347 RR2DG64JQ

RD RR2DG64TF 751 0 0
GGATCAAACCTTTCTTCACCACATTTCACCGAGAGCCCACATATAGAGAGAGAGAAACTT
CTCCCAAATCTCTCTCCAGCAATGGTTGTTGCTATGGACCAGCGCAGCAATGTGAACGGA
GTTTCCGGTGCTCGGAAGGAAGAAGGGTTTGATCCAAGCGCACAACCACCGTTTAAGATC
GGAGATATAAGGGCGGCCATTCCGAAGCATTGTTGGGTCAAGAGTCCTTTGAGATCTATG
AGCTATGTCGCCAGAGACATTTTCGCCGTCGCGGCTCTGGCCATGGCCGCTGTGTATTTT
GATAGCTGGTTCCTCTGGCCACTCTACTGGGTTGCCCAAGGAACCCTTTTCTGGGCCATC
TTCGTTCTTGGCCACGACTGTGGGCACGTAAGTTTCTCAGACATTCCTCTGCTGAACAGT
GTGGTTGGTCACATTTCATTCATTCATCCTCGTTCCTTACCATGGTTGGAGAATAAGCCA
TCGGACACACCACCAGAACCATGGCCATGTTGAAAACGACGAGTCTTGGGTTCCGCTGCC
AGAAAAGTTGTACAAGAGCTTGCCCCATATTACTCGGATGCTCAGATACACTGTCCCTCT
GCCCATGCTCGCTTACCCGATCTATCTGTGGTACAGAAGTCCTGGAAAAGAAGGGTCACA
TTATAACCCATACAGTAGTTTATTTGCTCCAAGCGAGAGGAAGCTTATTGCAACTTCAAC
TACTTGCTGGTCCATAATGCTGGCCACTCTT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2DG64JQ 727 0 0
TCTATCTGTGGTACAGAAGTCCTGGAAAAGAAGGGTCACATTATAACCCATACAGTAGTT
TATTTGCTCCAAGCGAGAGGAAGCTTATTGCAACTTCAACTACTTGCTGGTCCATAATGC
TGGCCACTCTTGCTTATCTATCGTTCCTCCTTGGTCCAGTCACAGTTCTCAAAGTCTATG
GTGTTCCTTACATTATCTTTGTGATGTGGTTGGGCGCTGTCACGTACTTGCATCATCATG
GTCATGATGAGAAGTTGCCGTGGTACAGAGGCAAGGAATGGAGTTATTTACGTGGAGGAT
TAACAACTATTGATAGAGATTATGGAATCTTCAACAACATCCATCACGACATTGGAACTC
ACGTGATCCATCATCTTTTCCCACAAATCCCTCACTATCACTTGGTCGACGCCACGAAAG
CAGCTAAACATGTGCTGGGAAGATACTACAGAGAGCCGAAGACGTCAGGAGCAATACCGG
TTCACTTGGTGGAGAGTTTGGTCGCAAGTATTAAAAAAGATCACTACGTCAGTGACACTG
GTGATATTGTCTTCTACGAGACAGATCCAGATCTCTACGTTTATGCTTCTGACAAATCTA
AAATCAATTAACCCTTCTCCCTGGCTCTATTAGGAATAAGCACTCCTTTTCTTTTGCTTA
TTTGTTGCTGTTTTAAGTTTAAAATGTACTCGTGGAACCTTTCTTTTTATTAATGTATTT
ACATTAC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL5153Contig1 1245 2 6 U
GGTAGGATTTGAATGGGCAACGAAGGAGTACAACAAAGCTGCAGAAAAATACGAACAAGC
GGTTGAAGTTAAATCTGATTTCTACGAAGCTCTTCTTGCACTAGGGCAACAACAGTTTGA
GCAGGCTAAGCTTTGCCGGTATCATGCGCTAAGCAACAAGATAGATATGGAAAGCGAGGC
TTCTCAGGATGTATTAAAGCTTTATAACAAAGCTGAGGAGAGTATGGAAAAGGGTATGCA
AATTTGGGAAGAGATGGAAGAACGCCGGATGAATGGAATCTCCAACTTTGATAGACATAA
AGCAATGCTGCAGAAGCTGGGCTTGGATGGGGAGTTTAGTGAAGCGTCTGGTGAAGAAAA
CGCAGAGCAAACAGCTAATATGAGCTCTCAGATTAACCTTTTGTGGGGTTCTTTATTGTA
TGAACGGTCTATTGTTGAGTATAAGCTTGGCCTACCTTCTTGGGATGAATGCTTGGAGGT
TGCAGTGGAGAAATTTGAATTAGCTGGAGCTTCTGCAACTGATATAGCTGTCATGGTAAA
GAATCATTGCTCAAACGAGAATGCACTTGAAGGTATGGGATTCAAGATCGATGAGATTGT
ACAAGCTTGGAATGAGATGTATGATGCCAAAAGATGGCAGATCGGTGTCCCATCTTTCCG
GCTAGAACCTTTGTTCCGGAGACGGTCACCAAAACTGCATGATATTTTAGAGAATGTGTT
TTCAGGGCCTCAGTGATGAAACCGTCATCATATAAACAGACCGCACATGTCATCAGCTGA
ACATATATTCAGACCGAACATATCATCAGCTTTCATATTTCACTAGGTATTGGTATTTAC
TGGGTGTTGCATTCAACTTTTCTTCTTTTTTGGTTGGTCTTTCAGCTTTTTGGAAGCAAT
ATTTTTTTTTCTCTTGGCGGGTATGTATGGCCGTGAAGATGCGTGATGATTTTTTTGTGC
ACTTTGGGTTCAAAAATATTTTTTTACTTTTCATTTTGGTGGGTTTGTAATTATATCATT
GTTTTGTAATATATTTTTTTGTATTGATTGGTTATGTTTATCCAAAAGGTCATTAGCTCA
ACTGAAAAAATCCTCACCATTGTGTTTGAGGTTCTCAACTGCTGGGACGAAACCAATATT
ACATGTTGTGGTTGTGGTTTTGGATCTGGAGAATTAGGGTTTCGGTCGAACCTCTTAGTG
ATTGTTTCATTCTTATTATCTTATATGAAGATTCTGATTTGCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT87TF U 1
AF RR2CT87JQ C 538
BS 1 631 RR2CT87TF
BS 632 632 RR2CT87JQ
BS 633 660 RR2CT87TF
BS 661 661 RR2CT87JQ
BS 662 672 RR2CT87TF
BS 673 1245 RR2CT87JQ

RD RR2CT87TF 672 0 0
GGTAGGATTTGAATGGGCAACGAAGGAGTACAACAAAGCTGCAGAAAAATACGAACAAGC
GGTTGAAGTTAAATCTGATTTCTACGAAGCTCTTCTTGCACTAGGGCAACAACAGTTTGA
GCAGGCTAAGCTTTGCCGGTATCATGCGCTAAGCAACAAGATAGATATGGAAAGCGAGGC
TTCTCAGGATGTATTAAAGCTTTATAACAAAGCTGAGGAGAGTATGGAAAAGGGTATGCA
AATTTGGGAAGAGATGGAAGAACGCCGGATGAATGGAATCTCCAACTTTGATAGACATAA
AGCAATGCTGCAGAAGCTGGGCTTGGATGGGGAGTTTAGTGAAGCGTCTGGTGAAGAAAA
CGCAGAGCAAACAGCTAATATGAGCTCTCAGATTAACCTTTTGTGGGGTTCTTTATTGTA
TGAACGGTCTATTGTTGAGTATAAGCTTGGCCTACCTTCTTGGGATGAATGCTTGGAGGT
TGCAGTGGAGAAATTTGAATTAGCTGGAGCTTCTGCAACTGATATAGCTGTCATGGTAAA
GAATCATTGCTCAAACGAGAATGCACTTGAAGGTATGGGATTCAAGATCGATGAGATTGT
ACAAGCTTGGAATGAGATGTATGATGCCAAA*GATGGCAGATCGGTGTCCCATCTTTCCG
*CTAGAACCTTT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2CT87JQ 708 0 0
AAAGAATCATTGCTCAAACGAGAATGCACTTGAAGGTATGGGATTCAAGATCGATGAGAT
TGTACAAGCTTGGAATGAGATGTATGATGCCAAAAGATGGCAGATCGGTGTCCCATCTTT
CCGGCTAGAACCTTTGTTCCGGAGACGGTCACCAAAACTGCATGATATTTTAGAGAATGT
GTTTTCAGGGCCTCAGTGATGAAACCGTCATCATATAAACAGACCGCACATGTCATCAGC
TGAACATATATTCAGACCGAACATATCATCAGCTTTCATATTTCACTAGGTATTGGTATT
TACTGGGTGTTGCATTCAACTTTTCTTCTTTTTTGGTTGGTCTTTCAGCTTTTTGGAAGC
AATATTTTTTTTTCTCTTGGCGGGTATGTATGGCCGTGAAGATGCGTGATGATTTTTTTG
TGCACTTTGGGTTCAAAAATATTTTTTTACTTTTCATTTTGGTGGGTTTGTAATTATATC
ATTGTTTTGTAATATATTTTTTTGTATTGATTGGTTATGTTTATCCAAAAGGTCATTAGC
TCAACTGAAAAAATCCTCACCATTGTGTTTGAGGTTCTCAACTGCTGGGACGAAACCAAT
ATTACATGTTGTGGTTGTGGTTTTGGATCTGGAGAATTAGGGTTTCGGTCGAACCTCTTA
GTGATTGTTTCATTCTTATTATCTTATATGAAGATTCTGATTTGCAGC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL5154Contig1 1331 2 10 U
GTCTAGAAGTACGAGCAAAGAATTTCTTAAGTGGTCAGGTTGATACTCAGCTACAAATTA
GTGGATCAATGTTGCAGCCAACTACATCAGGAAATATTAAATTAAGCCATGGGGAAGCTT
ATCTACCTCATGATAAGGGTGGAGGAGCTGCCCCTCTCAACAGATTGGCAACCAATCAAT
CAAGGATTCCAGGTGCTTCTATTAATCAAGCAGTTGCTTCACGATATTTTGCTCGATTCT
TTGGTACAGAACCGGCTTCCTCAAGGATGAAGTTCTCCCAGACAACTGGTGAATCAAATG
CTGTTGAAAAGGAGATTGAAGAAGTGAGGATGAAACCAAATATGGATATCCGTCTGAGTG
ATCTGAAACTTGTTTTGGGACCAGAGTTGAGGATAGTGTATCCTTTAATCCTTAATTTTG
CTATTAGCGGTGAGCTTGAGCTTGATGGCATGGCTCATCCCAAATATCTAAAACCAAAGG
GTTTCCTCACACTCGAGAATGGAGATGTCAATCTTGTGGCTACTCAGGTACGCCTGAAAA
GAGAACACCTCAATGTTGCAAAGTTTGAGCCTGAACATGGATTAGATCCTCTGTTAGATT
TAGCTTTAGTTGGTTCAGAATGGCAATTCAGGATCCAGAGTCGTGCCAGCAATTGGCAGG
ACAAACTTGTGGTGACTTCAACTCGTTCTGTGGAACAGGATGCTCTCTCACCGTCCGAGG
CTGCAAAGGTGTTTGAGAGCCAATTAGCAGAATCGATATTAGAAGGAGATGGGCAACTTG
CTTTCAAGAAACTTGCAACCGCAACGCTTGATGCCTTGATGCCAAGGATAGAAGGGAAAG
GAGAGTTTGGACAGGCGAGGTGGAGGTTGGTGTATGCCCCACAGATCCCAAGTTTACTCT
CTGTTGATCCAACTGTCGATCCTCTCAAGTCTCTGGCCAGCAATATCTCCTTTGGAACGG
AAGTCGAACTGCAGCTCGGAAAACGTCTTCAGGCCTCTGTGGTGAGACAGATGAAAGATT
CTGAGATGGCGATGCAATGGACATTGATTTATAAGCTCACAAGCCGATTGCGTGTCCTCC
TTCAGTCTGCTCCTTCAGAACGTTTGCTTTTTGAATACTCTGCAACGTCACAAGACTAAA
AAAGCTTGTGATCTTCCTCTGTTTAAGGATGATGGATGAAGCCGTCTGTTGCAAAGGAAG
GGAGTTGTAGTGACTTTTGGTTATTAGCATTTGTTATTGACAAGAAAATTGTTTTATTAT
TTGGTCAGGTTGTTTCATTGTTTGTAGAAAATTACGTTGTAAATGTTAATTATTAGGGCA
TACAAAATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU13TF U 1
AF RR2EU13JQ C 608
BS 1 631 RR2EU13TF
BS 632 632 RR2EU13JQ
BS 633 659 RR2EU13TF
BS 660 660 RR2EU13JQ
BS 661 698 RR2EU13TF
BS 699 699 RR2EU13JQ
BS 700 728 RR2EU13TF
BS 729 729 RR2EU13JQ
BS 730 750 RR2EU13TF
BS 751 1331 RR2EU13JQ

RD RR2EU13TF 750 0 0
GTCTAGAAGTACGAGCAAAGAATTTCTTAAGTGGTCAGGTTGATACTCAGCTACAAATTA
GTGGATCAATGTTGCAGCCAACTACATCAGGAAATATTAAATTAAGCCATGGGGAAGCTT
ATCTACCTCATGATAAGGGTGGAGGAGCTGCCCCTCTCAACAGATTGGCAACCAATCAAT
CAAGGATTCCAGGTGCTTCTATTAATCAAGCAGTTGCTTCACGATATTTTGCTCGATTCT
TTGGTACAGAACCGGCTTCCTCAAGGATGAAGTTCTCCCAGACAACTGGTGAATCAAATG
CTGTTGAAAAGGAGATTGAAGAAGTGAGGATGAAACCAAATATGGATATCCGTCTGAGTG
ATCTGAAACTTGTTTTGGGACCAGAGTTGAGGATAGTGTATCCTTTAATCCTTAATTTTG
CTATTAGCGGTGAGCTTGAGCTTGATGGCATGGCTCATCCCAAATATCTAAAACCAAAGG
GTTTCCTCACACTCGAGAATGGAGATGTCAATCTTGTGGCTACTCAGGTACGCCTGAAAA
GAGAACACCTCAATGTTGCAAAGTTTGAGCCTGAACATGGATTAGATCCTCTGTTAGATT
TAGCTTTAGTTGGTTCAGAATGGCAATTCAG*ATCCAGAGTCGTGCCAGCAATTGGCAG*
ACAAACTTGTGGTGACTTCAACTCGTTCTGTGGAACAG*ATGCTCTCTCACCGTCCGAGG
CTGCAAAG*TGTTTGAGAGCCAATTAGCAG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2EU13JQ 724 0 0
AGTTGGTTCAGAATGGCAATTCAGGATCCAGAGTCGTGCCAGCAATTGGCAGGACAAACT
TGTGGTGACTTCAACTCGTTCTGTGGAACAGGATGCTCTCTCACCGTCCGAGGCTGCAAA
GGTGTTTGAGAGCCAATTAGCAGAATCGATATTAGAAGGAGATGGGCAACTTGCTTTCAA
GAAACTTGCAACCGCAACGCTTGATGCCTTGATGCCAAGGATAGAAGGGAAAGGAGAGTT
TGGACAGGCGAGGTGGAGGTTGGTGTATGCCCCACAGATCCCAAGTTTACTCTCTGTTGA
TCCAACTGTCGATCCTCTCAAGTCTCTGGCCAGCAATATCTCCTTTGGAACGGAAGTCGA
ACTGCAGCTCGGAAAACGTCTTCAGGCCTCTGTGGTGAGACAGATGAAAGATTCTGAGAT
GGCGATGCAATGGACATTGATTTATAAGCTCACAAGCCGATTGCGTGTCCTCCTTCAGTC
TGCTCCTTCAGAACGTTTGCTTTTTGAATACTCTGCAACGTCACAAGACTAAAAAAGCTT
GTGATCTTCCTCTGTTTAAGGATGATGGATGAAGCCGTCTGTTGCAAAGGAAGGGAGTTG
TAGTGACTTTTGGTTATTAGCATTTGTTATTGACAAGAAAATTGTTTTATTATTTGGTCA
GGTTGTTTCATTGTTTGTAGAAAATTACGTTGTAAATGTTAATTATTAGGGCATACAAAA
TTAT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL5155Contig1 1502 2 2 U
GGATCTACAGCGAATAATCAAAACAAGTAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAACTAGGG
TTTACGAATCAAACATAAACTTGAAGAAGAAGATCATGGCGACGAGAAGAGTTATTCCTC
AACGAGTTCGAGGTGATGATCCCGTCGTCGCGGAAGCAAAGAACCGTCGCGCTCTCGGGG
ACATCGGAAACATCGCTTCTCTTCTTCCCGGAGTCGAAGCTGGAAAATTTAATCGACCCT
TGACCCGTAACTTCCGTGCCCAGTTGCTTGAAAACGCTAACAAAAAGCAAATCAATGTAG
CCAAGAAACCAGAAGCGGTTCAAAGGAAAACAAGAGCTGTCGTTAAGCCTAATCCTCCAC
AGACTCATGAAGTGATTGTGATCAGTCCTGATACTAACGAGGTTGCTAAAGCTAAACACG
AGTCATCCAAGAAGAAAGTTACTTACACTTCCGTTCTCAATGCTCGAAGCAAGGTAGCTG
CTGCTGCTGCTTCCAAGACTCTTGATATTGATTCCGCGGACAAAGACAACGACCTTGCTG
CTGTGGAGTATGTTGAGGACATGTACTCTTTCTACAAAGAGGTTGAGAATGAGAGCAAGG
CTCAGATGTATATGCAGACACAGACTGAGATCAACGAGAAGATGAGATCGATTCTTGTTG
ACTGGCTTGTAGACGTTCATGTCAAGTTTGATCTCTCCCCTGAGACTCTCTACCTCACCA
TCAACATAATTGATCGGTTCCTGTCTCTCAAAACTATCCCGAGGAGAGAGCTACAGCTTC
TAGGTGTTAGTGCTTTGCTCATAGCCTCCAAATACGAAGAGATCTGGCCTCCTCAGGTGA
ATGATTTGGTGTATGTCACAGACAACACGTACCAGAGCAAGCAGATTCTAGTGATGGAGA
AGACCATTTTGGGATGTCTTGAGTGGTACCTGACGGTTCCAACGCAGTATGTGTTCCTCG
CGAGGTTTATCAAAGCTGCGGTTCCTGACCCGGAGATGGAGAGCAAGGTTCACTTCTTAG
CTGAGTTGGGTCTGATGCAGTACGACGCTTTGAAGTTCCGCCCTTCGATGCTGGCTGCTT
CAGCAGTGTACACCGCGAGATGCTGCTTGAACAAGACCCCGGCGTGGACTGAAACTCTCG
AATTCCACACTGGTTACTCTGAACATGAGCTCATGGACTGCTCGAAGCTATTAGCATTCA
TTCACTCGAGAGCTGGGGAGAGCAAGCTGCGAGCTGTGTTTAAGAAGTATTCGAAAGCTG
AAAGATGTGCTGTTGCTTTGGTCTCACCAGCAAAGTCTCTTCTTCTGTCTTCTTCTGCCT
GCTCCTTGGAGAAGTCTTGAAAGAAACCAAAGCAAAACTCTGCATTGTGTTGTTTGTTTA
GATCTCTCTCTGATCTTCTGGATGTGTAGCATATGTTTTAGTGCTGAGAATTGATGTCAG
TATTAATGAATTCTTCTTTGTACTAAAATCATTTTGGTCTTCTAATATGATATTTGAATT
GG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2BC03TF U 1
AF RR2BC03JQ C 704
BS 1 779 RR2BC03TF
BS 780 1502 RR2BC03JQ

RD RR2BC03TF 779 0 0
GGATCTACAGCGAATAATCAAAACAAGTAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAACTAGGG
TTTACGAATCAAACATAAACTTGAAGAAGAAGATCATGGCGACGAGAAGAGTTATTCCTC
AACGAGTTCGAGGTGATGATCCCGTCGTCGCGGAAGCAAAGAACCGTCGCGCTCTCGGGG
ACATCGGAAACATCGCTTCTCTTCTTCCCGGAGTCGAAGCTGGAAAATTTAATCGACCCT
TGACCCGTAACTTCCGTGCCCAGTTGCTTGAAAACGCTAACAAAAAGCAAATCAATGTAG
CCAAGAAACCAGAAGCGGTTCAAAGGAAAACAAGAGCTGTCGTTAAGCCTAATCCTCCAC
AGACTCATGAAGTGATTGTGATCAGTCCTGATACTAACGAGGTTGCTAAAGCTAAACACG
AGTCATCCAAGAAGAAAGTTACTTACACTTCCGTTCTCAATGCTCGAAGCAAGGTAGCTG
CTGCTGCTGCTTCCAAGACTCTTGATATTGATTCCGCGGACAAAGACAACGACCTTGCTG
CTGTGGAGTATGTTGAGGACATGTACTCTTTCTACAAAGAGGTTGAGAATGAGAGCAAGG
CTCAGATGTATATGCAGACACAGACTGAGATCAACGAGAAGATGAGATCGATTCTTGTTG
ACTGGCTTGTAGACGTTCATGTCAAGTTTGATCTCTCCCCTGAGACTCTCTACCTCACCA
TCAACATAATTGATCGGTTCCTGTCTCTCAAAACTATCCCGAGGAGAGAGCTACAGCTT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2BC03JQ 799 0 0
GACTCTCTACCTCACCATCAACATAATTGATCGGTTCCTGTCTCTCAAAACTATCCCGAG
GAGAGAGCTACAGCTTCTAGGTGTTAGTGCTTTGCTCATAGCCTCCAAATACGAAGAGAT
CTGGCCTCCTCAGGTGAATGATTTGGTGTATGTCACAGACAACACGTACCAGAGCAAGCA
GATTCTAGTGATGGAGAAGACCATTTTGGGATGTCTTGAGTGGTACCTGACGGTTCCAAC
GCAGTATGTGTTCCTCGCGAGGTTTATCAAAGCTGCGGTTCCTGACCCGGAGATGGAGAG
CAAGGTTCACTTCTTAGCTGAGTTGGGTCTGATGCAGTACGACGCTTTGAAGTTCCGCCC
TTCGATGCTGGCTGCTTCAGCAGTGTACACCGCGAGATGCTGCTTGAACAAGACCCCGGC
GTGGACTGAAACTCTCGAATTCCACACTGGTTACTCTGAACATGAGCTCATGGACTGCTC
GAAGCTATTAGCATTCATTCACTCGAGAGCTGGGGAGAGCAAGCTGCGAGCTGTGTTTAA
GAAGTATTCGAAAGCTGAAAGATGTGCTGTTGCTTTGGTCTCACCAGCAAAGTCTCTTCT
TCTGTCTTCTTCTGCCTGCTCCTTGGAGAAGTCTTGAAAGAAACCAAAGCAAAACTCTGC
ATTGTGTTGTTTGTTTAGATCTCTCTCTGATCTTCTGGATGTGTAGCATATGTTTTAGTG
CTGAGAATTGATGTCAGTATTAATGAATTCTTCTTTGTACTAAAATCATTTTGGTCTTCT
AATATGATATTTGAATTGG

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL5156Contig1 1518 2 6 U
GTGATGAAATTGGATCCCATCTTCAGAAAGAGGCTGGTTTTGAAGAAACTGTTAAACGCT
TGGAAACTGAGAATGAAGCTCACATACAGAAAGAGGCACTGTTAGAAGAGAGGCTTGAGC
ATTTAAGAACAGAAAATGAAGCTCACATACAGAAAGGGGTACTGTTAGAAGAAAGGCTTG
AACATTTGAGAGCAGAATGTGAAGCTCACATACAGAAAGAGGCACTATTAGAAGAAAGGC
TTGAGCATCTGAGAACAGCAAATGAAGCTCACGTACAAAGTCAGGCACTATTAGAAGAAA
GGCTACTGCATTTGAGTACAGAGAATGAAGCTTACATACAAAAAGAGGCACTGCTTGAAG
AAACGCTCTTGCATCTGAGAACAGAGAATGAAGCTTACATACAAAAAGAGGCACTGTTAG
AGGAAAGGCTCTTGTATTTGAGAACTGAGAATGAAGCTCTCAAACAGAACGAGGAAAAGT
TGGAGGAAAGACTTGTTCAGTATAAAACAAAGAACGGCGTGCTCGTTCATGAAATGTCTA
GTACAGAAGTCAAAATGAGAGAGTTGCTTGACGAAAGATCAACCTTCGCTCAGAAAGAGA
CAAGTCTAGAAGAGAAACTTCAACAACGTCAACATGATGAAGAATCTTCGGTTGCAGCTG
CTGAGAAGTCATCCAGAGAAATGATTTCAAGCCTGAACAGTGAAATTGGAACACCGCGAG
CACAGTTTGGCAGGTAATGAAACTGGAAGAATCTAGGAGTAGTCTTCAGGAGCAGAACAA
TAGTCTTGTGGGAACCGTATCCAATCTTCAAGTCCAGCGTGAAAACCATGACAATAACGT
GAAGGGTGCTTCAGAGGAAGAACTAAACTCACAGATTGAAGCAGCTTGTACTCTAGTTGA
AAAGCTTATCACTGAAAATGCTGAACTTGTTGAGAAGGTGAACGAGTTGTGCATTCAGCT
AAACCAATCGCAGCATGCTTTTGCTTCACCACCTGAGAGCCTAGCAATTGAAGTACAGAA
GTCTGATACCTTAGAAGAAATACCCATTCACGACGAGTTGATTAGAATTGATGACGATGG
AGACATGGAAACTGCACTGTTAGAGAGAAACTTACCGGAGGAAACAGTGCCTGGATCTGT
GAACCCTAATGGGGAAATAGATGTGGAGTCACAGGTTGTAGTAGGGGGAGAAGAAGAAGA
AGCCAGTGGTGGTGTGCCTCTGGTTGACGCTCCACTGATCGGTGCACCGTTCAGGCTCGT
CTCTTTTGTAGCAAGATACGTGAGTGGTGCAGATTTGGCGGAAAAGAAACAGTTTTTGTA
AAACCCAAACAACACATTTGGAGGCAGAGAAGATTGCATCAAGTTCTGTATCTCTCTTCT
CTCTTTCTCTTACTACACACATACACTCAGTGAGGATCGTTGATTAGCTTTTTTCTTTGC
ACAACACTTAACAGGACACAAATGTTTATTGTAATTTTTTTGGTAGGATAATGATGGTGA
TGATACATCATGTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B765TF U 1
AF RR2B765JQ C 697
BS 1 733 RR2B765TF
BS 734 734 RR2B765JQ
BS 735 769 RR2B765TF
BS 770 770 RR2B765JQ
BS 771 824 RR2B765TF
BS 825 1518 RR2B765JQ

RD RR2B765TF 838 0 0
GTGATGAAATTGGATCCCATCTTCAGAAAGAGGCTGGTTTTGAAGAAACTGTTAAACGCT
TGGAAACTGAGAATGAAGCTCACATACAGAAAGAGGCACTGTTAGAAGAGAGGCTTGAGC
ATTTAAGAACAGAAAATGAAGCTCACATACAGAAAGGGGTACTGTTAGAAGAAAGGCTTG
AACATTTGAGAGCAGAATGTGAAGCTCACATACAGAAAGAGGCACTATTAGAAGAAAGGC
TTGAGCATCTGAGAACAGCAAATGAAGCTCACGTACAAAGTCAGGCACTATTAGAAGAAA
GGCTACTGCATTTGAGTACAGAGAATGAAGCTTACATACAAAAAGAGGCACTGCTTGAAG
AAACGCTCTTGCATCTGAGAACAGAGAATGAAGCTTACATACAAAAAGAGGCACTGTTAG
AGGAAAGGCTCTTGTATTTGAGAACTGAGAATGAAGCTCTCAAACAGAACGAGGAAAAGT
TGGAGGAAAGACTTGTTCAGTATAAAACAAAGAACGGCGTGCTCGTTCATGAAATGTCTA
GTACAGAAGTCAAAATGAGAGAGTTGCTTGACGAAAGATCAACCTTCGCTCAGAAAGAGA
CAAGTCTAGAAGAGAAACTTCAACAACGTCAACATGATGAAGAATCTTCGGTTGCAGCTG
CTGAGAAGTCATCCAGAGAAATGATTTCAAGCCTGAACAGTGAAATTGGAACACCGCGAG
CACAGTTTGGCAG*TAATGAAACTGGAAGAATCTAGGAGTAGTCTTCAG*AGCAGAACAA
TAGTCTTGTGGGAACCGTATCCAATCTTCAAGTCCAGCGTGAAA
CCATGACATAACGT

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2B765JQ 822 0 0
ACAGTGAAATTGGAACACCGCGAGCACAGTTTGGCAGGTAATGAAACTGGAAGAATCTAG
GAGTAGTCTTCAGGAGCAGAACAATAGTCTTGTGGGAACCGTATCCAATCTTCAAGTCCA
GCGTGAAAACCATGACAATAACGTGAAGGGTGCTTCAGAGGAAGAACTAAACTCACAGAT
TGAAGCAGCTTGTACTCTAGTTGAAAAGCTTATCACTGAAAATGCTGAACTTGTTGAGAA
GGTGAACGAGTTGTGCATTCAGCTAAACCAATCGCAGCATGCTTTTGCTTCACCACCTGA
GAGCCTAGCAATTGAAGTACAGAAGTCTGATACCTTAGAAGAAATACCCATTCACGACGA
GTTGATTAGAATTGATGACGATGGAGACATGGAAACTGCACTGTTAGAGAGAAACTTACC
GGAGGAAACAGTGCCTGGATCTGTGAACCCTAATGGGGAAATAGATGTGGAGTCACAGGT
TGTAGTAGGGGGAGAAGAAGAAGAAGCCAGTGGTGGTGTGCCTCTGGTTGACGCTCCACT
GATCGGTGCACCGTTCAGGCTCGTCTCTTTTGTAGCAAGATACGTGAGTGGTGCAGATTT
GGCGGAAAAGAAACAGTTTTTGTAAAACCCAAACAACACATTTGGAGGCAGAGAAGATTG
CATCAAGTTCTGTATCTCTCTTCTCTCTTTCTCTTACTACACACATACACTCAGTGAGGA
TCGTTGATTAGCTTTTTTCTTTGCACAACACTTAACAGGACACAAATGTTTATTGTAATT
TTTTTGGTAGGATAATGATGGTGATGATACATCATGTTGCCC

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

CO CL5157Contig1 1326 2 4 U
GGCCGGTAACAAGAACCGTCGGAAAAGAAAATACCGGACCATGGAGAGTGAGGCTTGGAA
GGCACACGTGGCCATGGTCTGCGTTCAATTGTTCAACGGAGGTTATCACGTGATCACCAA
AGTAGCTCTCAACGTCGGGGTGAACCAACTCGTCTTCTGCGTCTTTCGTGATCTCATTGC
TCTCTCCATTCTCGCTCCTCTTGCTTATATCCGTGACAAGAAGACAAGACCTCCTTTGAA
CCGAAGCTTTCTCTTAGCTTTCTTCTTCCTCGGCTTAACTGGGATATTTGGGAACCAGCT
TTTGTTCCTCGTTGGTCTCAATTACACCAATCCCACTTATGCTGCAGCCATTCAGCCCTC
TATTCCCGTTTTTACTTTCATCTTGGCTCTCATTATGGGAACAGAGAGATTGAATTTATT
CAAACTAGAAGGTCAAGCTAAGGTAGGAGGTACGCTGGTCTGTGTCTCTGGGGCCGTGTT
GATGGTTTTGTTTCGTGGACCGGCTTTGTTTGGGGAAACAGAGCCTGACTTCTTGGGTCA
TGGTGAGATAAGACACCCTGAAGCATCTGGATCTGGACACTTGGTGTCTAGCTTTCTCAA
TGGACTTGGGAGATGGAATCTGGGAGTTTTGTGCTTGATTGGGAACTGCACTTGCATGGC
TGCTTTTCTTGCTATTCAGGCTCCAGTTTTGAAGAAGTATCCGGCAAATCTTTCAGTTAC
AGCGTACTCGTATTTCTTTGGGACCATGTTCATGGTGACATCTGCTTTTTTCATGACTAA
TGAGTCAACCAACTGGAGTCTCACAAGATCCGAGTTTTTTGCAGTTGTCTATGCAGGAGT
AATCGCATCTGCCCTTAACTATGGTCTCTTGACGTGGTCAAATAAGATTTTGGGTCCTTC
CTTGGTTGCTCTGTATAACCCTCTTCAACCTGGAGCCTCAGCCTTCTTGTCCAGAATCTT
CCTAGGAAGCCCTATCTACTTGGGGAGCATTTTAGGCGGGTGTGCAATCATCGCAGGTCT
TTACAGTGTCACTTGGGCGTTTTACAAGGAAAAGAAAGCAGCAGCAGCAGCAACAGGTAC
CATCCCGATCACCTCAAAGGAAGCTGAACCCTTGATCTACAAAGACCACAAGAACAAACC
AATGGGACATCTATTCACAAACATTCCCATCTCTTCACCAAAATCTGCTGATTGAACCAA
ATGTCAGGCTTCTTGAAATCGGGCCTGTGATGTTTTCTTCATCTTCTTTTGCGGTACTAG
TGACTATTAAACACATCAATATTTACATGCCTTAAACAAATCATAGAATTTAAGAGCTTT
CATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2DE71TF U 1
AF RR2DE71JQ C 563
BS 1 679 RR2DE71TF
BS 680 680 RR2DE71JQ
BS 681 692 RR2DE71TF
BS 693 1326 RR2DE71JQ

RD RR2DE71TF 692 0 0
GGCCGGTAACAAGAACCGTCGGAAAAGAAAATACCGGACCATGGAGAGTGAGGCTTGGAA
GGCACACGTGGCCATGGTCTGCGTTCAATTGTTCAACGGAGGTTATCACGTGATCACCAA
AGTAGCTCTCAACGTCGGGGTGAACCAACTCGTCTTCTGCGTCTTTCGTGATCTCATTGC
TCTCTCCATTCTCGCTCCTCTTGCTTATATCCGTGACAAGAAGACAAGACCTCCTTTGAA
CCGAAGCTTTCTCTTAGCTTTCTTCTTCCTCGGCTTAACTGGGATATTTGGGAACCAGCT
TTTGTTCCTCGTTGGTCTCAATTACACCAATCCCACTTATGCTGCAGCCATTCAGCCCTC
TATTCCCGTTTTTACTTTCATCTTGGCTCTCATTATGGGAACAGAGAGATTGAATTTATT
CAAACTAGAAGGTCAAGCTAAGGTAGGAGGTACGCTGGTCTGTGTCTCTGGGGCCGTGTT
GATGGTTTTGTTTCGTGGACCGGCTTTGTTTGGGGAAACAGAGCCTGACTTCTTGGGTCA
TGGTGAGATAAGACACCCTGAAGCATCTGGATCTGGACACTTGGTGTCTAGCTTTCTCAA
TGGACTTGGGAGATGGAATCTGGGAGTTTTGTGCTTGATTGGGAACTGCACTTGCATGGC
TGCTTTTCTTGCTATTCAG*CTCCAGTTTTGA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2DE71JQ 764 0 0
GCATCTGGATCTGGACACTTGGTGTCTAGCTTTCTCAATGGACTTGGGAGATGGAATCTG
GGAGTTTTGTGCTTGATTGGGAACTGCACTTGCATGGCTGCTTTTCTTGCTATTCAGGCT
CCAGTTTTGAAGAAGTATCCGGCAAATCTTTCAGTTACAGCGTACTCGTATTTCTTTGGG
ACCATGTTCATGGTGACATCTGCTTTTTTCATGACTAATGAGTCAACCAACTGGAGTCTC
ACAAGATCCGAGTTTTTTGCAGTTGTCTATGCAGGAGTAATCGCATCTGCCCTTAACTAT
GGTCTCTTGACGTGGTCAAATAAGATTTTGGGTCCTTCCTTGGTTGCTCTGTATAACCCT
CTTCAACCTGGAGCCTCAGCCTTCTTGTCCAGAATCTTCCTAGGAAGCCCTATCTACTTG
GGGAGCATTTTAGGCGGGTGTGCAATCATCGCAGGTCTTTACAGTGTCACTTGGGCGTTT
TACAAGGAAAAGAAAGCAGCAGCAGCAGCAACAGGTACCATCCCGATCACCTCAAAGGAA
GCTGAACCCTTGATCTACAAAGACCACAAGAACAAACCAATGGGACATCTATTCACAAAC
ATTCCCATCTCTTCACCAAAATCTGCTGATTGAACCAAATGTCAGGCTTCTTGAAATCGG
GCCTGTGATGTTTTCTTCATCTTCTTTTGCGGTACTAGTGACTATTAAACACATCAATAT
TTACATGCCTTAAACAAATCATAGAATTTAAGAGCTTTCATCCC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL5158Contig1 172 2 1 U
GCAAAAGAGAGAGAAGAAACCAGAGTTTTCTTCTTCTTTTGTGAGTTTCTCTTCTATGTG
TTTCTTTTCACTTACGTTTTGTAGGATTTACATTTTTGTTGTTTACGATTGGTGTTGTCT
TGTCTGATTCGTATCGACCAACCTTATTACATATTTTTTTCATCTGTAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A907TF U 1
AF RR2A907JQ C 36
BS 1 172 RR2A907TF

RD RR2A907TF 172 0 0
GCAAAAGAGAGAGAAGAAACCAGAGTTTTCTTCTTCTTTTGTGAGTTTCTCTTCTATGTG
TTTCTTTTCACTTACGTTTTGTAGGATTTACATTTTTGTTGTTTACGATTGGTGTTGTCT
TGTCTGATTCGTATCGACCAACCTTATTACATATTTTTTTCATCTGTAATAT

QA 1 172 1 172
DS 

RD RR2A907JQ 137 0 0
CTTTTGTGAGTTTTTTTTCTATGTGTTTCTTTTCACTTACGTTTTGTAGGATTTACATTT
TTGTTGTTTACGATTGGTGTTGTCTTGTTTGATTCGTATCGACCAACCTTATTACATATT
TTTTTCATCTGTAATAT

QA 1 137 1 137
DS 



AS 1 2

CO CL5159Contig1 1223 2 2 U
TTTTTTGAGCATGGTACAAACAAACAGAGAAAAGAACTCGCTGAACAAGTTACTGGACAC
GTTTTGGCTCTCTCTCTACAAATGTATGGCTGCAGGGTTATCCAAAAGGCGTTGGAGGTG
GTTGATGTGGAGCAGCAAACTCGAATGGTGCAAGAGCTTGATGGGTCTGTCTTGAAATGC
GTTCATGATCAGAATGGTAATCATGTGATCCAGAAGTGTATAGAGCGTCTTCCTCAGGAT
TGCATCCAGTTCATTATCTCCTCATTTTACGGGAAAGTCTTAACCCTTTCAACACACCCT
TATGGATGCCGTGTAATCCAGAGGGTACTGGAGCATATTGATGACGTAGAAACCCAACGG
ATCATTATGGGGGAAATCATGAACTCAGTCTGCACTCTAGCTCAAGATCAGTACGGAAAT
TATGTTATTCAGCATATAATACAACACGGTAAACCACACTAACGGACAGAAATTATCAAT
AAGCTTGCTGGGCAGATTGTGACAATGAGTCAACAGAAGTTTGCTTCTAACGTTGTTGAA
AAGTGCTTAACATTTGGCGGTCCAGAGGAACGCCAGGTTCTAGTGAATGAGATGCTTGGT
TATACTGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCTATGATGAAGGATCCATTCGGGAACTACGTA
GTGCAGAAGGTTCTTGAAACATGCGATGATCAAAGCCTTGCACTCATTATTTCTCGCATC
AAAGTCCACTTGAATGCCTTGAAGAGATACACATATGGGAAACATATCGTTGCCCGGGTT
GAGAAACTTATCACCACTGGAGAGAGAAGGATCGGGCTCTCATCATCTCTAGCCGCAAAT
ACTTCTCCTTAGCCATGTAAGTAAACCTCAAGCTCATAACACAACCAGAGAAAGAGGGGA
TAATTTGATGAACAGAGAGAGCTATATATGTACAGCCTAACTAAGCAAAGCACTGGTTCA
TGTTTATATATATAATTTTGTAAATAAAAAGGAGGGTTTTTAATTTAAGTCGGTAAATAA
AATGTATTTTGGATTTCCTCTGGCTTAAGTTAAAACCTTCTTTTGGTTGTGTAAAAAGTG
AAGCATTGCTGTTTTATTATGTAAAGCAATGGCTTATCTTAGTTCTCTTATTTTTCACGT
AAGAACAATGTAAATATCTTGAGGCTTTGCTCCCCAAGAATTGCAATATTTATTGTTTTA
AGCAATGAAGTTTTAATTCGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F582TF U 1
AF RR2F582JQ C 496
BS 1 620 RR2F582TF
BS 621 1223 RR2F582JQ

RD RR2F582TF 620 0 0
TTTTTTGAGCATGGTACAAACAAACAGAGAAAAGAACTCGCTGAACAAGTTACTGGACAC
GTTTTGGCTCTCTCTCTACAAATGTATGGCTGCAGGGTTATCCAAAAGGCGTTGGAGGTG
GTTGATGTGGAGCAGCAAACTCGAATGGTGCAAGAGCTTGATGGGTCTGTCTTGAAATGC
GTTCATGATCAGAATGGTAATCATGTGATCCAGAAGTGTATAGAGCGTCTTCCTCAGGAT
TGCATCCAGTTCATTATCTCCTCATTTTACGGGAAAGTCTTAACCCTTTCAACACACCCT
TATGGATGCCGTGTAATCCAGAGGGTACTGGAGCATATTGATGACGTAGAAACCCAACGG
ATCATTATGGGGGAAATCATGAACTCAGTCTGCACTCTAGCTCAAGATCAGTACGGAAAT
TATGTTATTCAGCATATAATACAACACGGTAAACCACACTAACGGACAGAAATTATCAAT
AAGCTTGCTGGGCAGATTGTGACAATGAGTCAACAGAAGTTTGCTTCTAACGTTGTTGAA
AAGTGCTTAACATTTGGCGGTCCAGAGGAACGCCAGGTTCTAGTGAATGAGATGCTTGGT
TATACTGATGAAAACGAGCC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2F582JQ 728 0 0
ATTGTGACAATGAGTCAACAGAAGTTTGCTTCTAACGTTGTTGAAAAGTGCTTAACATTT
GGCGGTCCAGAGGAACGCCAGGTTCTAGTGAATGAGATGCTTGGTTATACTGATGAAAAC
GAGCCTCTTCAGGCTATGATGAAGGATCCATTCGGGAACTACGTAGTGCAGAAGGTTCTT
GAAACATGCGATGATCAAAGCCTTGCACTCATTATTTCTCGCATCAAAGTCCACTTGAAT
GCCTTGAAGAGATACACATATGGGAAACATATCGTTGCCCGGGTTGAGAAACTTATCACC
ACTGGAGAGAGAAGGATCGGGCTCTCATCATCTCTAGCCGCAAATACTTCTCCTTAGCCA
TGTAAGTAAACCTCAAGCTCATAACACAACCAGAGAAAGAGGGGATAATTTGATGAACAG
AGAGAGCTATATATGTACAGCCTAACTAAGCAAAGCACTGGTTCATGTTTATATATATAA
TTTTGTAAATAAAAAGGAGGGTTTTTAATTTAAGTCGGTAAATAAAATGTATTTTGGATT
TCCTCTGGCTTAAGTTAAAACCTTCTTTTGGTTGTGTAAAAAGTGAAGCATTGCTGTTTT
ATTATGTAAAGCAATGGCTTATCTTAGTTCTCTTATTTTTCACGTAAGAACAATGTAAAT
ATCTTGAGGCTTTGCTCCCCAAGAATTGCAATATTTATTGTTTTAAGCAATGAAGTTTTA
ATTCGATC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL5160Contig1 1049 2 8 U
GGAGATCCAACAAACACCAAGAAGAAACAAAACATATTAAAAAAAAAATAGAGATCTCCA
CACAAAGATTCCTCTGTTTTTATGAAACATAACAGCGAGAACTGGTCTTCGTTCACCATG
ACTATTGTTCTTTTTTCTCTGTTTCATTTCTTGGTGGCCAAACTCTCTGCTTCTCACTTC
TTTTCCGAAAATCTCACTTCTTTGGAGTGATATAAGATCACTCAGCCCCATACAGACAGA
TCACTTTGAAAACCTTTTTCTTTTTCCCTGCTTTGTCCTCTGTTGAAGAGAATCATCTAA
ATGGATTCAATTAAGTTTCAACACTTTAAGATGGAGAAACCTAGAGGAATCTTTAACTTG
TCAGCAATAAAGTCTTTCACGAACATATTCAGACTGATCGAACTGATTCTTCTACTAATC
TTGATCTCCAAACTCTCTTTCCCTTCAGTGAAACTCTCCGGTGACCTTTTCAGGGAAGCA
TCAGTGTTTCTCGTTAGCCCGAGATTCGTTTTCTTCGTCGGAAACGCTATCGTAATTACT
CTTTTTGCGAAATCCGGACGATACAGCTCCGCTCACGAGCCAACAGAAGCGGCAAGCAGC
AACGATCTTTACCAAGAACTTCTTTGCATGACCGAGAAGAAGACATCTGAAGTTCATGAG
AGGAAAACAGAACAGTCAAAGAAGCTGAAAAGGGTTAGTTTCGAGAGATGCCAATCGCAG
AAAGCGTTTGACGCGGTTCACCCGCTTGAGAGTGCACACGGTGGGAAGATCATGAGGAGG
TATGATTCGGAGAAGCATTTTAAGGTTTGTGACTCGGACAAGAAAGTAGTGGTGAGAGTT
AAGAAACCAGAAGATAAGATGAGCAACGAACAGTTTAGGACAAAGATTGAAGCATTCATC
GCGAGACAGAAGAGGATTCAAAAGGATGAAGAACACTTGACAATTTAGTGAATGTTTGTT
AGTGAATATGTTTTTCCGTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATAACTCTTGTAAGCCTTAAGGG
TAATAGTAAAAAAAAAGGTATTGGATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH51TF U 1
AF RR2GH51JQB C 620
BS 1 695 RR2GH51TF
BS 696 696 RR2GH51JQB
BS 697 711 RR2GH51TF
BS 712 712 RR2GH51JQB
BS 713 737 RR2GH51TF
BS 738 738 RR2GH51JQB
BS 739 760 RR2GH51TF
BS 761 1049 RR2GH51JQB

RD RR2GH51TF 772 0 0
GGAGATCCAACAAACACCAAGAAGAAACAAAACATATTAAAAAAAAAATAGAGATCTCCA
CACAAAGATTCCTCTGTTTTTATGAAACATAACAGCGAGAACTGGTCTTCGTTCACCATG
ACTATTGTTCTTTTTTCTCTGTTTCATTTCTTGGTGGCCAAACTCTCTGCTTCTCACTTC
TTTTCCGAAAATCTCACTTCTTTGGAGTGATATAAGATCACTCAGCCCCATACAGACAGA
TCACTTTGAAAACCTTTTTCTTTTTCCCTGCTTTGTCCTCTGTTGAAGAGAATCATCTAA
ATGGATTCAATTAAGTTTCAACACTTTAAGATGGAGAAACCTAGAGGAATCTTTAACTTG
TCAGCAATAAAGTCTTTCACGAACATATTCAGACTGATCGAACTGATTCTTCTACTAATC
TTGATCTCCAAACTCTCTTTCCCTTCAGTGAAACTCTCCGGTGACCTTTTCAGGGAAGCA
TCAGTGTTTCTCGTTAGCCCGAGATTCGTTTTCTTCGTCGGAAACGCTATCGTAATTACT
CTTTTTGCGAAATCCGGACGATACAGCTCCGCTCACGAGCCAACAGAAGCGGCAAGCAGC
AACGATCTTTACCAAGAACTTCTTTGCATGACCGAGAAGAAGACATCTGAAGTTCATGAG
AGGAAAACAGAACAGTCAAAGAAGCTGAAAAGGGT*AGTTTCGAGAGATGC*AATCGCAG
AAAGCGTTTGACGCGGT*CACCCGCTTGAGAGTGCACACG
TGGGAGATCATG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2GH51JQB 430 0 0
TTT
TTTGCATGACCGAGAAGAAGACATTTGAAGTTCATGAGAGGAAAACAGAACAGTCAAAGA
AGCTGAAAAGGGTTAGTTTCGAGAGATGCCAATCGCAGAAAGCGTTTGACGCGGTTCACC
CGCTTGAGAGTGCACACGGTGGGAAGATCATGAGGAGGTATGATTCGGAGAAGCATTTTA
AGGTTTGTGACTCGGACAAGAAAGTAGTGGTGAGAGTTAAGAAACCAGAAGATAAGATGA
GCAACGAACAGTTTAGGACAAAGATTGAAGCATTCATCGCGAGACAGAAGAGGATTCAAA
AGGATGAAGAACACTTGACAATTTAGTGAATGTTTGTTAGTGAATATGTTTTTCCGTTTT
TTTTTTTTTTTTTAAATAACTCTTGTAAGCCTTAAGGGTAATAGTAAAAAAAAAGGTATT
GGATGTC

QA 4 430 4 430
DS 



AS 1 2

CO CL5161Contig1 1284 2 2 U
ATATGGAGATGGAGCGTGTTCATGAGTTTCCTCATACTCACATGGATCGCCGTCCTCGAA
AGAGAGCGCGTCTCGGCTGGGACGTGTTGCCTCCAGCGCCTAAGGCTCAGGTAGGAATGT
TTTGTGGACAAGAGATTGGGAATATGTCAAGCTTTGGAGCTTCTTCGGAGATTAGTAGCT
CTACTTCTCTTTCTGTTAAGACTGTTGCTCGTAATGATTCTCCTCCCTGGCGTGAAGATG
ACAAGGACGGACATTACATGTTTGAACTGGGAGATGACTTAACTCCACGCTATAAAATAT
ATAGCAAGATGGGCGAAGGAACGTTTGGTCAAGTGTTAGAATGTTGGGATAGGGAGAGGA
AGGAAATGGTGGCTGTGAAAATTGTTCGTGGAGTGAAGAAATACCGTGAGGCGGCTATGA
TTGAAATTGAGATGCTTCAACAGCTTGGTAAACATGACAAGGGTGGCAATCGTTATGCAT
GACTTGCGCATGATTCATACGGACCTGAAACCAGAAAACATTCTGTTAGTCTCCTCAGAC
TATGTGAAAATTCCCGAGTACAAGGGTTCCCGATTACAGAGGGATGTTTCCTATAAACGA
GTGCCTAAATCAAGTGCAATAAAGGTTATTGATTTTGGTAGCACAACTTATGAGCGACAG
GAGCAAAGCTACATTGTGTCAACTAGACATTACAGGGCACCAGAAGTCATTTTAGGACTT
GGCTGGAGTTATCCTTGTGATGTTTGGAGCATTGGATGTATCATAGTGGAGCTGTGCACG
GGAGAGGCATTGTTCCAAACACATGAAAACCTGGAGCATCTAGCGATGATGGAGCGTGTT
CTTGGTCCGTTTCCTCAACAAATGCTGAAGAAAGTGGACCGACACGCTGAGAAATATGTG
AGAAGAGGCCGTTTGGATTGGCCTGATGGGGCAACCTCAAGAGACAGCCTGAAAGCAGTA
TTGAAGCTTCCTCGGCTTCAGAATCTGATAATGCAACATGTGGACCATTCGGCGGGAGAG
TTGATAAACATGGTGCAAGGGCTACTTAGGTATGATCCGGCAGAAAGACTAACCGCTCGT
GAAGCACTTAGACATCCTTTTTTCGCAAGGAGAAGATGACGTGACCTTGAATTTGACGGA
TGTATATAGTGAGATGTGTGTTTGTAGTAGTAACAACTAGTAAAACCTTTACGACATTGT
GTTACGTGATAACCCTCTACAAATTCTGATATCTATTTTGTTAAAACAAATGCTTTGAAT
CACTCTTTTTTGAAGTGAAGAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C068TF U 1
AF RR2C068JQ C 440
BS 1 567 RR2C068TF
BS 568 1284 RR2C068JQ

RD RR2C068TF 578 0 0
ATATGGAGATGGAGCGTGTTCATGAGTTTCCTCATACTCACATGGATCGCCGTCCTCGAA
AGAGAGCGCGTCTCGGCTGGGACGTGTTGCCTCCAGCGCCTAAGGCTCAGGTAGGAATGT
TTTGTGGACAAGAGATTGGGAATATGTCAAGCTTTGGAGCTTCTTCGGAGATTAGTAGCT
CTACTTCTCTTTCTGTTAAGACTGTTGCTCGTAATGATTCTCCTCCCTGGCGTGAAGATG
ACAAGGACGGACATTACATGTTTGAACTGGGAGATGACTTAACTCCACGCTATAAAATAT
ATAGCAAGATGGGCGAAGGAACGTTTGGTCAAGTGTTAGAATGTTGGGATAGGGAGAGGA
AGGAAATGGTGGCTGTGAAAATTGTTCGTGGAGTGAAGAAATACCGTGAGGCGGCTATGA
TTGAAATTGAGATGCTTCAACAGCTTGGTAAACATGACAAGGGTGGCAATCGTTATGCAT
GACTTGCGCATGATTCATACGGACCTGAAACCAGAAAACATTCTGTTAGTCTCCTCAGAC
TATGTGAAAATTCCCGAGTACAAGGGT
CCCGATACAGA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2C068JQ 845 0 0
ACAGCTTGGTAAACATGACAAGGGTGGCAATCGTTATGCATGACTTGCGCATGATTCATA
CGGAC*TGAAACCAGAAAACATTCTGTTAGTCTCCTCAGACTATGTGAAAATTCCCGAGT
ACAAGGGTTCCCGATTACAGAGGGATGTTTCCTATAAACGAGTGCCTAAATCAAGTGCAA
TAAAGGTTATTGATTTTGGTAGCACAACTTATGAGCGACAGGAGCAAAGCTACATTGTGT
CAACTAGACATTACAGGGCACCAGAAGTCATTTTAGGACTTGGCTGGAGTTATCCTTGTG
ATGTTTGGAGCATTGGATGTATCATAGTGGAGCTGTGCACGGGAGAGGCATTGTTCCAAA
CACATGAAAACCTGGAGCATCTAGCGATGATGGAGCGTGTTCTTGGTCCGTTTCCTCAAC
AAATGCTGAAGAAAGTGGACCGACACGCTGAGAAATATGTGAGAAGAGGCCGTTTGGATT
GGCCTGATGGGGCAACCTCAAGAGACAGCCTGAAAGCAGTATTGAAGCTTCCTCGGCTTC
AGAATCTGATAATGCAACATGTGGACCATTCGGCGGGAGAGTTGATAAACATGGTGCAAG
GGCTACTTAGGTATGATCCGGCAGAAAGACTAACCGCTCGTGAAGCACTTAGACATCCTT
TTTTCGCAAGGAGAAGATGACGTGACCTTGAATTTGACGGATGTATATAGTGAGATGTGT
GTTTGTAGTAGTAACAACTAGTAAAACCTTTACGACATTGTGTTACGTGATAACCCTCTA
CAAATTCTGATATCTATTTTGTTAAAACAAATGCTTTGAATCACTCTTTTTTGAAGTGAA
GAGCG

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

CO CL5162Contig1 1521 2 2 U
GGGAACTTGTTATTTGTTTCGCTTTCCCCTCTCTCTCTCTCGCCCTTTCGAGCTCCTCAC
TTCTTGGCTCGACACTCATGTCACAATCCAAATCAATCACGTAACCAAAACCATCTCCCC
CTTTCTTCTCCTCGCTCATCTCACACAATCCCTAAATCTCCCCGCCTCATGGACATTCTT
CGATTAGGTACGATTCCACCTCATAGAAGAAGAAGGAAATGGCTGATTCTAGTATCCCTC
CTCGGAGTCTCGAGCTACGGAGCTTACAAATTCTACACCTCCCCGTACATCGCGAGGAAG
AGGAAGCGTCTCACGAACCTCTTCGAATCAATCGCCTCCTTCGCCGAGCTAGTCACCGAC
TCATCTGAAACCATAACTCTCGTCTCCCGAGACTTGAAGCAGTTCCTCGAATCCGACTCC
GACGAAATCCCGAACAGCTTGAAACAGATCGCGAAAATCGCCAAATCGAAAGAGTTCACC
GATTCGATATCTAGGGTTTCAGAGGCAGTAACCGTCGGTGTCCTCCGTGGTTATAACAAC
GTCGAAGAAGCGGAATCGAACCCAGGCGTGGTGGAGAGAGTTCTGTTCTCAGAGGCGGGG
ACTGGTTTCGTCTCGGTTCTCGTCGGTAGCTTCGCGAAGAATCTCGTCCTTGGATTCCAC
GAGGTTGAGAGTAGTAATCTCGAAACGACGACGTCGGAGAAACCTAGATGGATGAGTTTG
TTATGCGATGAGAAGATTAAAGAGCTGTTAGCTGATTGCATAGAGAGATTCACCATCTCT
GCTGTAACCGTCTACATCGAGAAAACCGCCGGGGTCAACGCATACGATCAGATATTCTCC
GGTTTGACTAATCCGAAACACCGAGACGGAGCGCGAGACGTTCTCGTCTCGGTCTGTAAC
GGAGCTCTCGAGACGTTCATGAGAACGTCTCACCAAGTGTACACATCTTCAAACTCGGGA
GAAGAAGAAGAGACCGTTAGAGATTCTTCTTCTTCTTATTCTTCTTTCGGATGGGCGGAG
GCGCTCACGACTACGTTAGCGGTTCCGAGCAACAGGAAGTTTATGTTCGATGTTACGGGA
AGAGTGACGTTAGAGACAATGAGATCGATTCTTGAGTCTGTGGTGTTGAAGACATCGCAG
AGCTTTAGGAGGAGTTTCGGTTCGGTTCGTGGAGAGGTTACTGATAGAGGGCGGCAAGTG
GTTGGGTATGTTGGTGCGAAATCTTCGGTGATAATCACCCTTTGCCTTGCGGTTTATTTT
CATGTTGTGAACCGGTTTGTTCGGGGTTCTTCGGTTCGCTTAAACCAGCATCTCTAGTCG
TTTAGAGTAATGTTAGGGGGACGTGAGATCTTCAGCTTCCACTTTCTATTGGTTTATATA
GTTTAGAGCTGAATAATGTAGATTTTTGTGCTGTCCACAGATTGATTCTAATTGATAAAG
AAATTTCTTGAGATAATATGTGCTAAATGCATTAATATCAGTTTGCGTTTCAAAAAAAAG
AGATAATATGTGCATTTGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A805TF U 1
AF RR2A805JQ C 706
BS 1 830 RR2A805TF
BS 831 1521 RR2A805JQ

RD RR2A805TF 830 0 0
GGGAACTTGTTATTTGTTTCGCTTTCCCCTCTCTCTCTCTCGCCCTTTCGAGCTCCTCAC
TTCTTGGCTCGACACTCATGTCACAATCCAAATCAATCACGTAACCAAAACCATCTCCCC
CTTTCTTCTCCTCGCTCATCTCACACAATCCCTAAATCTCCCCGCCTCATGGACATTCTT
CGATTAGGTACGATTCCACCTCATAGAAGAAGAAGGAAATGGCTGATTCTAGTATCCCTC
CTCGGAGTCTCGAGCTACGGAGCTTACAAATTCTACACCTCCCCGTACATCGCGAGGAAG
AGGAAGCGTCTCACGAACCTCTTCGAATCAATCGCCTCCTTCGCCGAGCTAGTCACCGAC
TCATCTGAAACCATAACTCTCGTCTCCCGAGACTTGAAGCAGTTCCTCGAATCCGACTCC
GACGAAATCCCGAACAGCTTGAAACAGATCGCGAAAATCGCCAAATCGAAAGAGTTCACC
GATTCGATATCTAGGGTTTCAGAGGCAGTAACCGTCGGTGTCCTCCGTGGTTATAACAAC
GTCGAAGAAGCGGAATCGAACCCAGGCGTGGTGGAGAGAGTTCTGTTCTCAGAGGCGGGG
ACTGGTTTCGTCTCGGTTCTCGTCGGTAGCTTCGCGAAGAATCTCGTCCTTGGATTCCAC
GAGGTTGAGAGTAGTAATCTCGAAACGACGACGTCGGAGAAACCTAGATGGATGAGTTTG
TTATGCGATGAGAAGATTAAAGAGCTGTTAGCTGATTGCATAGAGAGATTCACCATCTCT
GCTGTAACCGTCTACATCGAGAAAACCGCCGGGGTCAACGCATACGATCA

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR2A805JQ 816 0 0
AGATGGATGAGTTTGTTATGCGATGAGAAGATTAAAGAGCTGTTAGCTGATTGCATAGAG
AGATTCACCATCTCTGCTGTAACCGTCTACATCGAGAAAACCGCCGGGGTCAACGCATAC
GATCAGATATTCTCCGGTTTGACTAATCCGAAACACCGAGACGGAGCGCGAGACGTTCTC
GTCTCGGTCTGTAACGGAGCTCTCGAGACGTTCATGAGAACGTCTCACCAAGTGTACACA
TCTTCAAACTCGGGAGAAGAAGAAGAGACCGTTAGAGATTCTTCTTCTTCTTATTCTTCT
TTCGGATGGGCGGAGGCGCTCACGACTACGTTAGCGGTTCCGAGCAACAGGAAGTTTATG
TTCGATGTTACGGGAAGAGTGACGTTAGAGACAATGAGATCGATTCTTGAGTCTGTGGTG
TTGAAGACATCGCAGAGCTTTAGGAGGAGTTTCGGTTCGGTTCGTGGAGAGGTTACTGAT
AGAGGGCGGCAAGTGGTTGGGTATGTTGGTGCGAAATCTTCGGTGATAATCACCCTTTGC
CTTGCGGTTTATTTTCATGTTGTGAACCGGTTTGTTCGGGGTTCTTCGGTTCGCTTAAAC
CAGCATCTCTAGTCGTTTAGAGTAATGTTAGGGGGACGTGAGATCTTCAGCTTCCACTTT
CTATTGGTTTATATAGTTTAGAGCTGAATAATGTAGATTTTTGTGCTGTCCACAGATTGA
TTCTAATTGATAAAGAAATTTCTTGAGATAATATGTGCTAAATGCATTAATATCAGTTTG
CGTTTCAAAAAAAAGAGATAATATGTGCATTTGTGG

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

CO CL5163Contig1 1305 2 2 U
GTGACTTCCGCCTCGTCTTACTCGACCAAGAAGAGAGAATAACAGATTTGCCACTGGACA
ACGGAGTCCGATCCCTCTTGATCGGATGCAAGAAACTCAGACGGTTTGCATTCTATCTCA
GACAAGGCGGCTTAACCGACGTGGGGTTAAGCTACATCGGACAGTACAGTCCAAACGTGA
GGTGGATGCTTCTCGGTTACGTAGGTGAATCAGACGAAGGCCTGATGGAGTTCTCAAGAG
GATGCCCTAAACTACAGAAGCTAGAGATGAGAGGCTGTTGCTTCAGCGAGAGAGCAATAG
CTGCAGCGGTATTGAAACTGCCTTCGCTGAGGTACCTTTGGGTACAAGGCTACAGAGCAT
CGGCGACAGGACAAGACCTGAGGCTAATGTCTAGACCTTACTGGAACATCGAGTTGATTC
CGGCAAGAAAAGTCCCGGAAGTGAATGAGCTAGGAGAGGTAAGAGAGATGGAGCATCCGG
CTCATATACTGGCTTACCACTCTCTGGCTGGGGAGAGAACAGATTGTCCACCAACTGTTA
AAGTCCTGAGGGAGGCATGATGATGATTCAAAGCAGGTTTGTATATAAAGATTTGGTTTT
GAGGATTCCATGAACTGTGTCGAATGGATTCTATTTTTTTTTTCCTTCTTGTTTGTATTG
TCTGTAGTTTTGAGAGATTACATAAGACATTTTTTGAGAGATTGAAATAAGAAGAGAGAA
ACTAAGTCTCTTCAGAATATTTCCGTATATGTTTTGTGATCTGTCTAATTAGTGACAATG
AGAGGCTCTCTCGAGTCAGATGGAGCTACTCCACATATGTATTCACCAACCATGGTCAGG
TTTGGATCCTCCTGATACTGGCTCCACGCTGACTCAAACTGTAACCTTTTGCACTCGCGG
AGTAGCTTCAAGATACGGAGGATAAGAGGTCTAATCTCGTCACGCTCCTTACGCATGGAT
GACTCTTTGTACAAGGAAACAAGCTCATCCACCAATCTTGTAAACACAGGCGAGTTTCTA
ATCCATGTCAACCTCACAACCGTCTCCACTCTCTCAAGAACCAACAAAACGGTTTCGGCA
TCATCTGAATGCATCCACTGGAAGAAAAGAGGGAAGATGCGTCTAAAATGAGCAAGCAAG
AAAAGCCCCAAAGAGTTCAAGAGTGGCTCAACGAACGTTAACCAAGCCACACGTCTCTCT
CTGTTTCTTGGTTGACGTTCTAGATGACCAAGCATCTCATTCATGATCCTCTCGTACCAT
GAGCTGCGAGGATTATTAGGATGCAGTTTAGTGACAAGAAGCACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H929JQ C 1
AF RR2FH39JQ U 619
BS 1 618 RR2H929JQ
BS 619 1305 RR2FH39JQ

RD RR2H929JQ 746 0 0
GTGACTTCCGCCTCGTCTTACTCGACCAAGAAGAGAGAATAACAGATTTGCCACTGGACA
ACGGAGTCCGATCCCTCTTGATCGGATGCAAGAAACTCAGACGGTTTGCATTCTATCTCA
GACAAGGCGGCTTAACCGACGTGGGGTTAAGCTACATCGGACAGTACAGTCCAAACGTGA
GGTGGATGCTTCTCGGTTACGTAGGTGAATCAGACGAAGGCCTGATGGAGTTCTCAAGAG
GATGCCCTAAACTACAGAAGCTAGAGATGAGAGGCTGTTGCTTCAGCGAGAGAGCAATAG
CTGCAGCGGTATTGAAACTGCCTTCGCTGAGGTACCTTTGGGTACAAGGCTACAGAGCAT
CGGCGACAGGACAAGACCTGAGGCTAATGTCTAGACCTTACTGGAACATCGAGTTGATTC
CGGCAAGAAAAGTCCCGGAAGTGAATGAGCTAGGAGAGGTAAGAGAGATGGAGCATCCGG
CTCATATACTGGCTTACCACTCTCTGGCTGGGGAGAGAACAGATTGTCCACCAACTGTTA
AAGTCCTGAGGGAGGCATGATGATGATTCAAAGCAGGTTTGTATATAAAGATTTGGTTTT
GAGGATTCCATGAACTGTGTCGAATGGATTCTATTTTTTTTTTCCTTCTTGTTTGTATTG
TCTGTAGTTTTGAGAGATTACATAAGACATTTTTTGAGAGATTGAAATAAGAAGAGAGAA
ACTAAGTCTCTTCAGAATATTTCCGT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2FH39JQ 687 0 0
GTCGAATGGATTCTATTTTTTTTTTCCTTCTTGTTTGTATTGTCTGTAGTTTTGAGAGAT
TACATAAGACATTTTTTGAGAGATTGAAATAAGAAGAGAGAAACTAAGTCTCTTCAGAAT
ATTTCCGTATATGTTTTGTGATCTGTCTAATTAGTGACAATGAGAGGCTCTCTCGAGTCA
GATGGAGCTACTCCACATATGTATTCACCAACCATGGTCAGGTTTGGATCCTCCTGATAC
TGGCTCCACGCTGACTCAAACTGTAACCTTTTGCACTCGCGGAGTAGCTTCAAGATACGG
AGGATAAGAGGTCTAATCTCGTCACGCTCCTTACGCATGGATGACTCTTTGTACAAGGAA
ACAAGCTCATCCACCAATCTTGTAAACACAGGCGAGTTTCTAATCCATGTCAACCTCACA
ACCGTCTCCACTCTCTCAAGAACCAACAAAACGGTTTCGGCATCATCTGAATGCATCCAC
TGGAAGAAAAGAGGGAAGATGCGTCTAAAATGAGCAAGCAAGAAAAGCCCCAAAGAGTTC
AAGAGTGGCTCAACGAACGTTAACCAAGCCACACGTCTCTCTCTGTTTCTTGGTTGACGT
TCTAGATGACCAAGCATCTCATTCATGATCCTCTCGTACCATGAGCTGCGAGGATTATTA
GGATGCAGTTTAGTGACAAGAAGCACA

QA 1 687 1 687
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5165Contig1 564 2 2 U
GTGTTAAAAGTAGTATAAATATATAAATTCTAAAACATCTAAAGAAACAGTACTTTATGA
ATCGCAACAAAAAAAATTAACAAGTAATAAGCTAGCAACTTCTCCATGCTAAAAGTTTGT
TAACCATAAACAAAATCAAGACATCCAAGCTATTCTTGTTTGCGTCTGTGCCAGGCTCAA
AAACCCAACTTTGAATCACAGCAATATGAATGGTTTACGAGAGTATTTAATATCACAAGG
CGGATGCTTCTGGTAAGAATTTAGCCAAGACCAAACATATATGAGAGAATATAGATAACA
TGGACGTTGCTCTCCTTTCCACAGACACGGCCTCACTGTTGTCACTTTCTTTAAATCACT
TGTTACATGGTAAGCAAGTTGGATGGACTTGATTTTCCTAAGGAGGTAAGGAGTGATGTC
TCTTGCATTGTATAATCTCGGATGCCATTTTCCCTCTGACCAGTCAACATGTGTCACCGA
CCAGTTTGCTATTCCATTTGGATCAATCATATTGAAAAGAGTTGGGAAATAATGTTCGTC
GCATAGCAGTTGCGTCCTTCCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A533JQ U 1
AF RR2CO28JQ U 83
BS 1 217 RR2A533JQ
BS 218 564 RR2CO28JQ

RD RR2A533JQ 217 0 0
GTGTTAAAAGTAGTATAAATATATAAATTCTAAAACATCTAAAGAAACAGTACTTTATGA
ATCGCAACAAAAAAAATTAACAAGTAATAAGCTAGCAACTTCTCCATGCTAAAAGTTTGT
TAACCATAAACAAAATCAAGACATCCAAGCTATTCTTGTTTGCGTCTGTGCCAGGCTCAA
AAACCCAACTTTGAATCACAGCAATATGAATGGTTTA

QA 1 217 1 217
DS 

RD RR2CO28JQ 482 0 0
AGTAATAAGCTAGCAACTTCTCCATGCTAAAAGTTTGTTAACCATAAACAAAATCAAGAC
ATCCA*GCTATTCTTGTTTGCGTCTGTGCCAGGCTCAAGAACCCAACTTTGAATCACAGC
AATATGAATGGTTTACGAGAGTATTTAATATCACAAGGCGGATGCTTCTGGTAAGAATTT
AGCCAAGACCAAACATATATGAGAGAATATAGATAACATGGACGTTGCTCTCCTTTCCAC
AGACACGGCCTCACTGTTGTCACTTTCTTTAAATCACTTGTTACATGGTAAGCAAGTTGG
ATGGACTTGATTTTCCTAAGGAGGTAAGGAGTGATGTCTCTTGCATTGTATAATCTCGGA
TGCCATTTTCCCTCTGACCAGTCAACATGTGTCACCGACCAGTTTGCTATTCCATTTGGA
TCAATCATATTGAAAAGAGTTGGGAAATAATGTTCGTCGCATAGCAGTTGCGTCCTTCCA
TC

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL5166Contig1 1218 2 4 U
GAAGTCTCAGAACAACTCCAAGCCGTCTCTTATCATGGCCTTCTTCTCCTGTCTTGCTTG
GCTCTACGTCGCTGGCCGGTTATGGCAAGATTCCAGCACAGAGTCGCACTCAACACTGTG
CTTCAGAAAAATTATGAACTGAGGCCTAAGGCTCTTACGGTTGATGACAAGCTGATGGTT
CTTGGATGCAAAGATCTTGAGAGAAGAATTGTTGAAACCGAAATGGAGTTGGCACAAGCG
AAGAGTCAAGGCTATCTTAAAAACCAGAAAAGTCTTTCTTCTTCTTCTTCAGGGAAGAAG
TTGCTTGCTGTGATTGGAGTCTACACAGGCTTCGGGAGTCACTTGAAGCGCAATAAATTT
AGAGGGTCTTGGATGCCACGAGATGACGCTTTGAAAAAGCTTGAGGAAAGAGGAGTTGTC
ATACGCTTTGTGATTGGTCGGAGTGCTAACCGAGGTGATAGTTTAGACCGGAAAATTGAC
CAAGAAAATCTTGCAACTAAAGACTTTTTGATTCTTGAGAATCACGAGGAAGCCCAAGAA
GAGTTACCTAAGAAAGTGAAATTTTTCTACAGTGCTGCTGTTCAGAACTGGGATGCAGAG
TTTTATGTCAAAGTTGATGACAACGTTGACCTAGATCTTGAGGGGTTGATTGGGCTACTT
GAAAGCCGACGTGGTCAAGATGGTGCTTACATTGGGTGCATGAAGTCTGGAGATGTGGTT
ACTCAAGAGGGAAGTCAATGGTACGAGTTTGAGTGGTGGAAATTTGGAGACGACAAATCG
TACTTCCGTCATGCAACTGGTTCGTTTGTAATACTTTCCAAGAATTTGGCTCAGTATATC
AATATAAACAGTGGATTGTTGAATACATATGCGTTTGATGATACCCCCATTGGATCTTGG
ATGATTGGTGTCCAGGCAACATATATAGACGACAACCGCCTTTGCTGCAGCGGCGCAATA
CAAGAAAAAGTATGTTCCATGGCATGATCACTGGGTAGCTGATTCCCTTGTCCCAAACAA
AATACAGCTCGTTTTTTTCACATCCTTGCGCTTCGATACTCTTTGAGAGGAAGTTTTTGG
AGCCGATGCCAAATTTATAGTTTTTTTGGTACAATGAAAGTATGATTAGGCCATTCATTA
CAGTTTTGTGATTAGTGCATACCCCTTGAGCTTTGGATTAAGAGAATGGGGAAATGGTAT
AGCTGTGAATTAAGTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH05TF U 1
AF RR2CH05JQ C 577
BS 1 626 RR2CH05TF
BS 627 627 RR2CH05JQ
BS 628 707 RR2CH05TF
BS 708 1218 RR2CH05JQ

RD RR2CH05TF 707 0 0
GAAGTCTCAGAACAACTCCAAGCCGTCTCTTATCATGGCCTTCTTCTCCTGTCTTGCTTG
GCTCTACGTCGCTGGCCGGTTATGGCAAGATTCCAGCACAGAGTCGCACTCAACACTGTG
CTTCAGAAAAATTATGAACTGAGGCCTAAGGCTCTTACGGTTGATGACAAGCTGATGGTT
CTTGGATGCAAAGATCTTGAGAGAAGAATTGTTGAAACCGAAATGGAGTTGGCACAAGCG
AAGAGTCAAGGCTATCTTAAAAACCAGAAAAGTCTTTCTTCTTCTTCTTCAGGGAAGAAG
TTGCTTGCTGTGATTGGAGTCTACACAGGCTTCGGGAGTCACTTGAAGCGCAATAAATTT
AGAGGGTCTTGGATGCCACGAGATGACGCTTTGAAAAAGCTTGAGGAAAGAGGAGTTGTC
ATACGCTTTGTGATTGGTCGGAGTGCTAACCGAGGTGATAGTTTAGACCGGAAAATTGAC
CAAGAAAATCTTGCAACTAAAGACTTTTTGATTCTTGAGAATCACGAGGAAGCCCAAGAA
GAGTTACCTAAGAAAGTGAAATTTTTCTACAGTGCTGCTGTTCAGAACTGGGATGCAGAG
TTTTATGTCAAAGTTGATGACAACGT*GACCTAGATCTTGAGGGGTTGATTGGGCTACTT
GAAAGCCGACGTGGTCAAGATGGTGCTTACATTGGGTGCATGAAGTC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2CH05JQ 642 0 0
GCTGTTCAGAACTGGGATGCAGAGTTTTATGTCAAAGTTGATGACAACGTTGACCTAGAT
CTTGAGGGGTTGATTGGGCTACTTGAAAGCCGACGTGGTCAAGATGGTGCTTACATTGGG
TGCATGAAGTCTGGAGATGTGGTTACTCAAGAGGGAAGTCAATGGTACGAGTTTGAGTGG
TGGAAATTTGGAGACGACAAATCGTACTTCCGTCATGCAACTGGTTCGTTTGTAATACTT
TCCAAGAATTTGGCTCAGTATATCAATATAAACAGTGGATTGTTGAATACATATGCGTTT
GATGATACCCCCATTGGATCTTGGATGATTGGTGTCCAGGCAACATATATAGACGACAAC
CGCCTTTGCTGCAGCGGCGCAATACAAGAAAAAGTATGTTCCATGGCATGATCACTGGGT
AGCTGATTCCCTTGTCCCAAACAAAATACAGCTCGTTTTTTTCACATCCTTGCGCTTCGA
TACTCTTTGAGAGGAAGTTTTTGGAGCCGATGCCAAATTTATAGTTTTTTTGGTACAATG
AAAGTATGATTAGGCCATTCATTACAGTTTTGTGATTAGTGCATACCCCTTGAGCTTTGG
ATTAAGAGAATGGGGAAATGGTATAGCTGTGAATTAAGTATT

QA 1 642 1 642
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5168Contig1 1236 2 2 U
GCAATCTGCTGGGGTTATGAACTAGTATGGAACTGATCGTCGTCACACGAAAACAAGAAT
AAGAAGAAAATCAATAAAGAGAGATGACGCTTTACATTCGTCGCGAATCTTCCAAGCTGT
GGAAGAGATTTTGCTCGGAGATAACGACGGAGATCGGTCTCCTCGCTGAGAACTGGAAGT
ACCTTGTCGCTGGTATTATCTGTCAGTACATTCATGGTTTGGCTGCTAAAGGAGTTCATT
ATATTCATCGCCCTGGACCGACTCTCCAGGATCTTGGCTTCTTTCTTCTTCCGGAGCTTG
GTCAAGAGAGAAGCTACATAAGTGAGACTGTGTTCACTACTGTATTTGTTTCCTTCTTCC
TGTGGACTTTCCATCCATTCATCCTGAAAAGCAAAAAGATATACACCGTCTTGATATGGT
GCAGAGTTCTAGCATTCTTAGTTGCCTGTCAGTTTCTCCGTGTTATAACATTCTATTCAA
CTCAGCTTCCTGGCCCAAACTATCACTGTCGTGAGGGCTCTAAAGTTGCCAGGATGCCAT
GGCCCAAAAACCCTCTTGAGGTTCTCGAGATTAACCCTCATGGGGTGATGTACGGATGTG
GAGGCCTGATTTTCTCATCGCATATGATCTTCACGCTAGTCTTTGTCCTCACTTACCAGA
AGTACGGCACTAAGAGGTTCATAAAGCTGTTTGGTTGGCTCACTGCTTTCGTGCAGAGCC
TCTTGATCATTGCCTCCCGTAAACATTACACTGTCGATGTCGTTGTTGCATGGTATACTG
TGAATCTGGTGGTGTTCTGTCTAGACAAGAAACTGCCAGAACTACCAGACCGGACTACGG
TGTTGCTCCCAGTAATCTCGAAAGACAGAACAACGAAAGAAGAGAACCACAAGCTGTTGT
TGAATGGGAACGGTGTTGATCCTGCTGACTGGAGACCAAGGGCTCAAGTGAACGGGAAGA
TAGATAGCAACGGAGTTCACACTGATAACTCAATCAATGGCGCATGAAACTCACCACCAG
ACCTTGGGACAATATGTATATGAAAACAGATAATCAATGGCTGTCATGAAGACGACCTGA
ATTCTGTAAGGGTGGTAAAGTTTTGTTTTTTGGTCATTGTTCCAGAAAGGAAGAACAATT
CATAGAGAGGAGTGGGGTCTATGATATGCTATTTTGTATATGTTCCAGTTGCTTGATCCC
CAAGTAATCATCTTTTTGTTGGATCTCTGTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA84TF U 1
AF RR2EA84JQ C 532
BS 1 658 RR2EA84TF
BS 659 1236 RR2EA84JQ

RD RR2EA84TF 658 0 0
GCAATCTGCTGGGGTTATGAACTAGTATGGAACTGATCGTCGTCACACGAAAACAAGAAT
AAGAAGAAAATCAATAAAGAGAGATGACGCTTTACATTCGTCGCGAATCTTCCAAGCTGT
GGAAGAGATTTTGCTCGGAGATAACGACGGAGATCGGTCTCCTCGCTGAGAACTGGAAGT
ACCTTGTCGCTGGTATTATCTGTCAGTACATTCATGGTTTGGCTGCTAAAGGAGTTCATT
ATATTCATCGCCCTGGACCGACTCTCCAGGATCTTGGCTTCTTTCTTCTTCCGGAGCTTG
GTCAAGAGAGAAGCTACATAAGTGAGACTGTGTTCACTACTGTATTTGTTTCCTTCTTCC
TGTGGACTTTCCATCCATTCATCCTGAAAAGCAAAAAGATATACACCGTCTTGATATGGT
GCAGAGTTCTAGCATTCTTAGTTGCCTGTCAGTTTCTCCGTGTTATAACATTCTATTCAA
CTCAGCTTCCTGGCCCAAACTATCACTGTCGTGAGGGCTCTAAAGTTGCCAGGATGCCAT
GGCCCAAAAACCCTCTTGAGGTTCTCGAGATTAACCCTCATGGGGTGATGTACGGATGTG
GAGGCCTGATTTTCTCATCGCATATGATCTTCACGCTAGTCTTTGTCCTCACTTACCA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2EA84JQ 705 0 0
GGATGCCATGGCCCAAAAACCCTCTTGAGGTTCTCGAGATTAACCCTCATGGGGTGATGT
ACGGATGTGGAGGCCTGATTTTCTCATCGCATATGATCTTCACGCTAGTCTTTGTCCTCA
CTTACCAGAAGTACGGCACTAAGAGGTTCATAAAGCTGTTTGGTTGGCTCACTGCTTTCG
TGCAGAGCCTCTTGATCATTGCCTCCCGTAAACATTACACTGTCGATGTCGTTGTTGCAT
GGTATACTGTGAATCTGGTGGTGTTCTGTCTAGACAAGAAACTGCCAGAACTACCAGACC
GGACTACGGTGTTGCTCCCAGTAATCTCGAAAGACAGAACAACGAAAGAAGAGAACCACA
AGCTGTTGTTGAATGGGAACGGTGTTGATCCTGCTGACTGGAGACCAAGGGCTCAAGTGA
ACGGGAAGATAGATAGCAACGGAGTTCACACTGATAACTCAATCAATGGCGCATGAAACT
CACCACCAGACCTTGGGACAATATGTATATGAAAACAGATAATCAATGGCTGTCATGAAG
ACGACCTGAATTCTGTAAGGGTGGTAAAGTTTTGTTTTTTGGTCATTGTTCCAGAAAGGA
AGAACAATTCATAGAGAGGAGTGGGGTCTATGATATGCTATTTTGTATATGTTCCAGTTG
CTTGATCCCCAAGTAATCATCTTTTTGTTGGATCTCTGTTTTTTT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL5169Contig1 499 2 5 U
CTGGAAGTTAAAAGTTGTTATTTAAGCAGAAACATAACATTGTTTGATAGCACATTTTAT
GACCAAGAACATGTAGGATAATAATAACACCTTTGAAACAAGACTCGAAAGGATTATGGC
ATTCATTGTTATTATCATCATTGTCGGGAACAATAGTCTCTTAGAGCCGAAGGGAATTCT
TCTAGCGTGAAGTCAAACCTCTCTTTAAAACAATCTGCACTGAGACCTAAGAAGGCATGA
CAACAAGAATGACCAACAGTCCCGATTTCTCCGTTTACTAACGATTGGATAATTTCTGGG
AAACAGTTGGGAATAACAAACATGGATGGCATACAATCTGTTGGGTCCTGTCCAGGTATA
GGCTGTGAAGGCAACGTTTGAACTGTACCGAACACGGCCATGAATGCAACTGGCAGAAGG
AATAAAAACTTGTTGATCAACCACATTTTTGATAAGAGAATTGTAATAAGTTATTGGGTT
TTTTTTTTTTAATCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ83JQ U 239
AF RR2CZ83TF C 1
BS 1 238 RR2CZ83TF
BS 239 329 RR2CZ83JQ
BS 330 330 RR2CZ83TF
BS 331 389 RR2CZ83JQ
BS 390 499 RR2CZ83TF

RD RR2CZ83JQ 154 0 0
GACAACAAGAATGACCAACAGTCCCGATTTCTCCGTTTACTAACGATTGGATAATTTCTG
GGAAACAGTTGGGAATAACAAACATGGATGGGATACAATCTGTTGGGTCCTGTCCAGGTA
TAGGCTGTGAAGGCAACGTTTGAACTGTACC
CAA

QA 1 151 1 151
DS 

RD RR2CZ83TF 499 0 0
CTGGAAGTTAAAAGTTGTTATTTAAGCAGAAACATAACATTGTTTGATAGCACATTTTAT
GACCAAGAACATGTAGGATAATAATAACACCTTTGAAACAAGACTCGAAAGGATTATGGC
ATTCATTGTTATTATCATCATTGTCGGGAACAATAGTCTCTTAGAGCCGAAGGGAATTCT
TCTAGCGTGAAGTCAAACCTCTCTTTAAAACAATCTGCACTGAGACCTAAGAAGGCATGA
CAACAAGAATGACCAACAGTCCCGATTTCTCCGTTTACTAACGATTGGATAATTTCTGGG
ATACAGTTGGGAATAACAAACATGGATGGCATACAATCTGTTGGGTCCTGTCCAGGTATA
GGCTGTGAAGGCAACGTTTGAGCTGTACCGAACACGGCCATGAATGCAACTGGCAGAAGG
AATAAAAACTTGTTGATCAACCACATTTTTGATAAGAGAATTGTAATAAGTTATTGGGTT
TTTTTTTTTTAATCTTTCC

QA 1 499 1 499
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5172Contig1 1460 2 2 U
CAGGTATATGATGCAGCTGTTGGGGATATTGCAATCGTCCCAACCAGGTCCAAATTAGTA
GATTTCTCGCAGCCATATGCGTCCACAGGCCTTGTGGTGGTAATTCCGACTAATGACGAC
AATGCCACTTGGATCTTTCTAAGACCCTTCACCATCGGGTTGTGGTGCGTTGTTCTAGCT
TCATTCTTCTGTATTGCCATAGTCATCTGGATCCTTGAACATCGGATCAATCAAGATTTC
AGAGGGCCACCCCGACGACAACTCATCACAATGATCTTGTTCAGCTTCTCAACTCTTTTT
AAGAGAAATCAGGAAGATACGATAAGCAATTTAGCGAGACTAGTGATGATTGTATGGCTC
TTTCTACTAATGGTTTTAACCGCGAGCTACACAGCGAATCTCACCTCAATCCTCACAGTT
CAACAGCTTCCCTCTGCCATTACTGGCATTGACAGCTTGCGGGCAAGTGAGGTGCCTGTC
GGTTACCAGTCTGGGACGTTCACTTTAGAGTACTTAACCTACAGTCTTGGCATGGCTCGC
TCTAGGCTGGTCCCACTTGATTCGACTGAGGAGTATGAAAGGGCTCTAAAGCTTGGACCA
ACCGCTTTTGGAGGCGTAGCTGCCATTGTTGACGAGCTCCCTTACATTGAACTGTTTCTA
GCGGAACGGACGGGTTTCAAGATTGTTGGAGAGCCCTTTATGCACCATGGTTTGGGGATT
TGCGTTTAAGAGAGATTCTCCACTGGCTATAGACATGTCAACATCGATCTTAAAACTTGC
TGAGACGAGAAAAATGCAAGAGATTCGGAAGAGATGGTTATGCAATACGAGCTGCGCAGA
GAAGACAGACTGGAACCCAGAGACAAACCAGCTCCATCTCAAGAGCTTCAAAGGGTTGTA
CATTGTCTGCATTTCAATCACGGTCTCTGCATTTTTGGTATTTGGTCTCAGGATGATACG
TCAGTTCGTGCGGTACAGACGGATGGAGAGGGCAAGTTCGCTGCCGCTGGCTTCTTGGTC
GTCTTCTCCTTCGATGCGGTTAAGGGAATTGGTGTTTGGTTTCGTGGAGTTTGTGGATGA
GAAAGAAGAAGCTATCAAGAGAATGTTCAGAAGGAGTGATGACTCCAGCAACAACCCATC
CCATGTTGTGGAAGTTCAAGCTGATTCTGAGGTACGACAAATTTGATCAAGTAAATTCCA
CTTTATACGAAAAGAATTGTATTTGTAGCTAGGATGAAGTCAATCAATATTCGAATCTTT
GTTCATTAGATATGATTGTAACTAACCAGCACAGGAATGCTGGTAAGAGCCAATGACTAT
TACCATGGTTAAATATAGCTATATATAGATTTTCGAGTTAAGTAGCTTTTTTTAACCTTT
GTTGTTCATGTAAGAAGCAGACAGTGTTTATAATTTCAGAAACACACATGAAAAAATCTA
CATCGTGTTATCTTCTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH27TF U 1
AF RR2AH27JQ C 643
BS 1 786 RR2AH27TF
BS 787 1460 RR2AH27JQ

RD RR2AH27TF 786 0 0
CAGGTATATGATGCAGCTGTTGGGGATATTGCAATCGTCCCAACCAGGTCCAAATTAGTA
GATTTCTCGCAGCCATATGCGTCCACAGGCCTTGTGGTGGTAATTCCGACTAATGACGAC
AATGCCACTTGGATCTTTCTAAGACCCTTCACCATCGGGTTGTGGTGCGTTGTTCTAGCT
TCATTCTTCTGTATTGCCATAGTCATCTGGATCCTTGAACATCGGATCAATCAAGATTTC
AGAGGGCCACCCCGACGACAACTCATCACAATGATCTTGTTCAGCTTCTCAACTCTTTTT
AAGAGAAATCAGGAAGATACGATAAGCAATTTAGCGAGACTAGTGATGATTGTATGGCTC
TTTCTACTAATGGTTTTAACCGCGAGCTACACAGCGAATCTCACCTCAATCCTCACAGTT
CAACAGCTTCCCTCTGCCATTACTGGCATTGACAGCTTGCGGGCAAGTGAGGTGCCTGTC
GGTTACCAGTCTGGGACGTTCACTTTAGAGTACTTAACCTACAGTCTTGGCATGGCTCGC
TCTAGGCTGGTCCCACTTGATTCGACTGAGGAGTATGAAAGGGCTCTAAAGCTTGGACCA
ACCGCTTTTGGAGGCGTAGCTGCCATTGTTGACGAGCTCCCTTACATTGAACTGTTTCTA
GCGGAACGGACGGGTTTCAAGATTGTTGGAGAGCCCTTTATGCACCATGGTTTGGGGATT
TGCGTTTAAGAGAGATTCTCCACTGGCTATAGACATGTCAACATCGATCTTAAAACTTGC
TGAGAC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2AH27JQ 818 0 0
TACATTGAACTGTTTCTAGCGGAACGGACGGGTTTCAAGATTGTTGGAGAGCCCTTTATG
CACCATGGTT*GGGGATTTGCGTTTAAGAGAGATTCTCCACTGGCTATAGACATGTCAAC
ATCGATCTTAAAACTTGCTGAGACGAGAAAAATGCAAGAGATTCGGAAGAGATGGTTATG
CAATACGAGCTGCGCAGAGAAGACAGACTGGAACCCAGAGACAAACCAGCTCCATCTCAA
GAGCTTCAAAGGGTTGTACATTGTCTGCATTTCAATCACGGTCTCTGCATTTTTGGTATT
TGGTCTCAGGATGATACGTCAGTTCGTGCGGTACAGACGGATGGAGAGGGCAAGTTCGCT
GCCGCTGGCTTCTTGGTCGTCTTCTCCTTCGATGCGGTTAAGGGAATTGGTGTTTGGTTT
CGTGGAGTTTGTGGATGAGAAAGAAGAAGCTATCAAGAGAATGTTCAGAAGGAGTGATGA
CTCCAGCAACAACCCATCCCATGTTGTGGAAGTTCAAGCTGATTCTGAGGTACGACAAAT
TTGATCAAGTAAATTCCACTTTATACGAAAAGAATTGTATTTGTAGCTAGGATGAAGTCA
ATCAATATTCGAATCTTTGTTCATTAGATATGATTGTAACTAACCAGCACAGGAATGCTG
GTAAGAGCCAATGACTATTACCATGGTTAAATATAGCTATATATAGATTTTCGAGTTAAG
TAGCTTTTTTTAACCTTTGTTGTTCATGTAAGAAGCAGACAGTGTTTATAATTTCAGAAA
CACACATGAAAAAATCTACATCGTGTTATCTTCTTGAC

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL5173Contig1 748 2 3 U
CAGTCTTAGTGATAATGTCCACTTGTTATTATCGTTGGCTTTGTCTAAACATGATTATAC
GCGGTGATGGATTATCGAATTTACATAAACCATGGACCACGAAGTAGACACCTATGAACC
TAACTAATTATTTTATTCATTAAATCGTAATTACCAAATGAAATATGCATTATTTTAGCA
AAATCATTAGCGGAAAAGCGATTACCATGCCTTGATCTGCCACAAAATTTAACGAAACAT
TGCTTAACCGTGGACGTAAATATCTTTTTCTTATTTTGAAATTAATTCGAAAAAGATTTT
AACTTCCATTGATTAGTTACTTATAGGTAAGTCGTAATGTTGACGGTGTCTCTTTAGGGG
GAAACTAATTGAGTTTTGACATTTCAACTAATACTATTAGATTCCACCAAATGTAGTACT
CATGACTACACGCCAAATGTTTAGAAAGTGTCACACCACTATCCAAAATGTTTGCAACGC
TCCTTTACTGATTTTCTAATAAGTTTTGTAATTTCGGATGTGCTTTTCATATTGGTTTGG
TAAGAGACTGAGATCTCCAAAATTAGTTATAGATTAATAAAAAAATATTAAAGACTCACA
TACATCAACTTGGATTTAGAATCTTTTTTTTTAAGATTCTTTGCTTAAGCTTTCGTAATA
ATAATGGTGGTTAAGGAATCATAATTTAGATCCAAACCCCAAAGCGAGCTAGAAAACGCA
AAGAAAAAAAGAAAGAGAAAAGGGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A186TF U 70
AF RR2A186JQ C 1
BS 1 69 RR2A186JQ
BS 70 207 RR2A186TF
BS 208 748 RR2A186JQ

RD RR2A186TF 138 0 0
GATTATCGAATTTACATAAACCATGGACCACGAAGTAGACACCTATGAACCTAACTAATT
ATTTTATTCATTAAATCGTAATTACCAAATGAAATATGCATTATTTTAGCAAAATCATTA
GCGGAAAAGCGATTACCA

QA 1 138 1 138
DS 

RD RR2A186JQ 748 0 0
CAGTCTTAGTGATAATGTCCACTTGTTATTATCGTTGGCTTTGTCTAAACATGATTATAC
GCGGTGATGGATTATCGAATTTACATAAACCATGGACCACGAAGTAGACACCTATGAACC
TAACTAATTATTTTATTCATTAAATCGTAATTACCAAATGAAATATGCATTATTTTAGCA
AAATCATTAGCGGAAAAGCGATTACCATGCCTTGATCTGCCACAAAATTTAACGAAACAT
TGCTTAACCGTGGACGTAAATATCTTTTTCTTATTTTGAAATTAATTCGAAAAAGATTTT
AACTTCCATTGATTAGTTACTTATAGGTAAGTCGTAATGTTGACGGTGTCTCTTTAGGGG
GAAACTAATTGAGTTTTGACATTTCAACTAATACTATTAGATTCCACCAAATGTAGTACT
CATGACTACACGCCAAATGTTTAGAAAGTGTCACACCACTATCCAAAATGTTTGCAACGC
TCCTTTACTGATTTTCTAATAAGTTTTGTAATTTCGGATGTGCTTTTCATATTGGTTTGG
TAAGAGACTGAGATCTCCAAAATTAGTTATAGATTAATAAAAAAATATTAAAGACTCACA
TACATCAACTTGGATTTAGAATCTTTTTTTTTAAGATTCTTTGCTTAAGCTTTCGTAATA
ATAATGGTGGTTAAGGAATCATAATTTAGATCCAAACCCCAAAGCGAGCTAGAAAACGCA
AAGAAAAAAAGAAAGAGAAAAGGGTACC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL5174Contig1 1144 2 2 U
GGCTTTACAAAACAAAAGGAAATCAACAATAAATCAGAACAAACTGATGAGTCAAGAGAA
ACCCATGTCTTGTTGCTGTGTTCTTGATGCTTCCACTTATGTGGGTTTCTGGATTCTCAA
CAAATTGCTCACCAGAGGCTACTCTGTTCGTGCAGCCATCCGTAAAAACGGGGAGAGTAT
GCTTGAGGAGAATATCAGGAACATGCAAGCCACAGAGGAGAGATTAGTGGTTTACGATGT
GGATGTGTTGGATTACCAGAGCATCCTTGTTTCTCTCAACAACTGTAACGCTGTGTTCTG
TTGCTTGGATAATCCTGAAGGGTACGATGAAATGGAAGTTGATTTGGAGGTGAGAGGAGC
GATTAATGTGGTGGAAGCATGTGCAAGAACAGAGAGTATAGACAAGATCATCTTCTCTTC
TTCACTAACTGCTGCAATTTGGAGAGATAACATTGGAACTCAAAAAGATGTTGATGAGAA
GTCTTGGAGCGATCTAAACTTTTGTCTCGAAAAGAAGCTATGGCATGCTCTCGCCAAAAC
ACAATCTGAGAAGGCGGCTTGGGCATTAGCCATGGACCGCATGGTCAACATGGTCTCAGT
TAACCCAGGGCTCATTGTTGGACCCTCGGTGACTCAACACAACCCTAGACCCACCATGTC
TTTCCTCAAAGGAGCTGCACAGATGTATGAGAACGGTGTGTTAGCCTACGCAAACGTGGA
ATTTGTAGCAGATGTTCACATTCGAGTTTTCGAAGATATTTCGGCTTGTGGTAGATACTT
TTGCTTCAACCAAATTGTGAATACCGAAGAAGAAGCTTTCAAACTTGTGGAGATTCTATC
TCCTTTAATTCCTATGCCACCAAGGTATGAGAAAGAGATGCACGGAAGTGAAGTTCATGC
AGAGAGGTTGAGAAACAATAAACTCAACAAGCTGGTAGAAGCTGGCTTTGCTTGTTAATT
AGGTGGAGAATTGGAGATAGTACAATGTTATATATAAAACTAAAGAGAAAACAAAAATAT
ACATAGTATGTTATCATAAGAATATTTTCTTTACTTTCTTTTGTTTGTTGCTTGCAATCT
GAATTCAGTATAAATAATATTTTCTTGTACCCTTAAATTGAAAAAGATGCTATATAAAAA
TGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2FU22TF U 1
AF RR2FU22JQ C 598
BS 1 735 RR2FU22TF
BS 736 1144 RR2FU22JQ

RD RR2FU22TF 735 0 0
GGCTTTACAAAACAAAAGGAAATCAACAATAAATCAGAACAAACTGATGAGTCAAGAGAA
ACCCATGTCTTGTTGCTGTGTTCTTGATGCTTCCACTTATGTGGGTTTCTGGATTCTCAA
CAAATTGCTCACCAGAGGCTACTCTGTTCGTGCAGCCATCCGTAAAAACGGGGAGAGTAT
GCTTGAGGAGAATATCAGGAACATGCAAGCCACAGAGGAGAGATTAGTGGTTTACGATGT
GGATGTGTTGGATTACCAGAGCATCCTTGTTTCTCTCAACAACTGTAACGCTGTGTTCTG
TTGCTTGGATAATCCTGAAGGGTACGATGAAATGGAAGTTGATTTGGAGGTGAGAGGAGC
GATTAATGTGGTGGAAGCATGTGCAAGAACAGAGAGTATAGACAAGATCATCTTCTCTTC
TTCACTAACTGCTGCAATTTGGAGAGATAACATTGGAACTCAAAAAGATGTTGATGAGAA
GTCTTGGAGCGATCTAAACTTTTGTCTCGAAAAGAAGCTATGGCATGCTCTCGCCAAAAC
ACAATCTGAGAAGGCGGCTTGGGCATTAGCCATGGACCGCATGGTCAACATGGTCTCAGT
TAACCCAGGGCTCATTGTTGGACCCTCGGTGACTCAACACAACCCTAGACCCACCATGTC
TTTCCTCAAAGGAGCTGCACAGATGTATGAGAACGGTGTGTTAGCCTACGCAAACGTGGA
ATTTGTAGCAGATGT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2FU22JQ 547 0 0
AGTTAACCCAGGGCTCATTGTTGGACCCTCGGTGACTCAACACAACCCTAGACCCACCAT
GTCTTTCCTCAAAGGAGCTGCACAGATGTATGAGAACGGTGTGTTAGCCTACGCAAACGT
GGAATTTGTAGCAGATGTTCACATTCGAGTTTTCGAAGATATTTCGGCTTGTGGTAGATA
CTTTTGCTTCAACCAAATTGTGAATACCGAAGAAGAAGCTTTCAAACTTGTGGAGATTCT
ATCTCCTTTAATTCCTATGCCACCAAGGTATGAGAAAGAGATGCACGGAAGTGAAGTTCA
TGCAGAGAGGTTGAGAAACAATAAACTCAACAAGCTGGTAGAAGCTGGCTTTGCTTGTTA
ATTAGGTGGAGAATTGGAGATAGTACAATGTTATATATAAAACTAAAGAGAAAACAAAAA
TATACATAGTATGTTATCATAAGAATATTTTCTTTACTTTCTTTTGTTTGTTGCTTGCAA
TCTGAATTCAGTATAAATAATATTTTCTTGTACCCTTAAATTGAAAAAGATGCTATATAA
AAATGAA

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 2

CO CL5175Contig1 1057 2 2 U
GGACTCTCTTCTCTATAGATTTCTGGCTTATATGATCTTATTGGTTTCCACCCGTAAAAT
CAATGCGTGGAGGGATTCAGATTTCTGGCTTATCCTCATGTAATTTTAAGATCACTGGAT
CAACATGGGTTTGCAAGGGACAAAATCTGGGTAATCGATGAAAATCTACCTCCTCTTTAG
TTGATCTTCATTGACATGGATGGCGTGATTTATTTAGAAACATCAATGGCAAGAGCCCTT
CAGATTCTCATTTACATATCATACTTACTTTTGCTGTCTCAGATATAAGTTCCACGATTG
AAGGGTTGGAAACATTTGACTACTTGGAGAACCTCCTCAAAAAGGAGCTTTTGACAGAAC
AGTGCGACAGAAATAACCTTTGGATCTGAGATGGACAGGACTTACTTTGGATATCCCAGA
GTTGTAGAAGACCATGAACGGAAAAGAACATATGTTATTGGAAAAGAAGGACTTCTAAAC
ACGGTTCTGGATTTTGCTTAAGAGTTTGACAAGAAAGGCCCAGTTCTCAGAAGTTGAGCT
GTAAAAACAACCAAGCAGCTCAAAAGAGGCATTTGCAATCTCTAGCGGAGAAACGATAAG
ATGTGCGGCAACAAAAAGAAGTTTTCAAATCACTTACTGCTCAAGTGAAAGACATGTCCT
CACTCCTCATAAGTCATGTAATCTGTCCTCACTCCTCATATGGCATGTAAATTCTACATG
TAAAAAAAATTTGGTGTTATGAGTCAACGGGGTTCGATCAATTTGTAGATTCATTGCAAC
ATTTGGGGAGTAAAGAACTACCACAGATTATTACAGCCATTTCTTCCATGGTACTCATCA
CTAATTATGGAAAAAATGTTTCAGAAGAACTGGATAAATTATGGCATGGGGTGGAGCACT
CAAGCCTCAAGGCACACCAAGTTGAGAAAAGAAAAGTAGGACGAAGTTTTACTTACGTTT
GTTTGCTAATTGTGTTTAAAATTTTAGTGATGCACTTTTTCTATAGTTTAAATTTTGTCA
AAATCGTGGATTTTTTTAATGTGTTCAGCTTCTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX24TF U 1
AF RR2FX24JQ C 583
BS 1 720 RR2FX24TF
BS 721 1057 RR2FX24JQ

RD RR2FX24TF 720 0 0
GGACTCTCTTCTCTATAGATTTCTGGCTTATATGATCTTATTGGTTTCCACCCGTAAAAT
CAATGCGTGGAGGGATTCAGATTTCTGGCTTATCCTCATGTAATTTTAAGATCACTGGAT
CAACATGGGTTTGCAAGGGACAAAATCTGGGTAATCGATGAAAATCTACCTCCTCTTTAG
TTGATCTTCATTGACATGGATGGCGTGATTTATTTAGAAACATCAATGGCAAGAGCCCTT
CAGATTCTCATTTACATATCATACTTACTTTTGCTGTCTCAGATATAAGTTCCACGATTG
AAGGGTTGGAAACATTTGACTACTTGGAGAACCTCCTCAAAAAGGAGCTTTTGACAGAAC
AGTGCGACAGAAATAACCTTTGGATCTGAGATGGACAGGACTTACTTTGGATATCCCAGA
GTTGTAGAAGACCATGAACGGAAAAGAACATATGTTATTGGAAAAGAAGGACTTCTAAAC
ACGGTTCTGGATTTTGCTTAAGAGTTTGACAAGAAAGGCCCAGTTCTCAGAAGTTGAGCT
GTAAAAACAACCAAGCAGCTCAAAAGAGGCATTTGCAATCTCTAGCGGAGAAACGATAAG
ATGTGCGGCAACAAAAAGAAGTTTTCAAATCACTTACTGCTCAAGTGAAAGACATGTCCT
CACTCCTCATAAGTCATGTAATCTGTCCTCACTCCTCATATGGCATGTAAATTCTACATG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2FX24JQ 475 0 0
TAGCGGAGAAACGATAAGATGTGCGGCAACAAAAAGAAGTTTTCAAATCACTTACTGCTC
AAGTGAAAGACATGTCCTCACTCCTCATAAGTCATGTAATCTGTCCTCACTCCTCATATG
GCATGTAAATTCTACATGTAAAAAAAATTTGGTGTTATGAGTCAACGGGGTTCGATCAAT
TTGTAGATTCATTGCAACATTTGGGGAGTAAAGAACTACCACAGATTATTACAGCCATTT
CTTCCATGGTACTCATCACTAATTATGGAAAAAATGTTTCAGAAGAACTGGATAAATTAT
GGCATGGGGTGGAGCACTCAAGCCTCAAGGCACACCAAGTTGAGAAAAGAAAAGTAGGAC
GAAGTTTTACTTACGTTTGTTTGCTAATTGTGTTTAAAATTTTAGTGATGCACTTTTTCT
ATAGTTTAAATTTTGTCAAAATCGTGGATTTTTTTAATGTGTTCAGCTTCTAATT

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 2

CO CL5176Contig1 1246 2 4 U
GGACGAGTCGTTTTAATTTTCCGTTACGAAAAGCTTCGATAGCGATTTAAACCCGAAAAA
AAAAGAAACGTGCCACCGGATCATTATTGATTTGATCTAATCCGTCGGATAAGTTCAATC
GTGCCACCGGCGACACTCGGTAGATCTATAAAACCCAAATTGTTTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTGTGGTTTCTGAGAAGTGAAAGCGTTCGAGGTCGATACGACGCCGATTTGTTAT
TTTCCCGGCGATAGAGAGAGGTTTGGAGATGGATGATCTAGGAGGAGGCTCGTTCGTGGC
GGTGAGGAGAGTTGCTCCACGGCTTGAACAGGGAAGCGTTTACCATTCTTCATCCTCTGC
TGAGGTTGTGGCTGGATCGGCAGCATGGTTAGGCCGTGGCCTTTCCTGTGTTTGTGCTCA
GGGAACTCATGGCGACTCCCGTCCTTCTTTTGATCTTACGCCTGCTCAGGAGGAATGCCT
GCAGAAGTTGCAGACCCGCATCGATGTAGCGTATGACAGCTCAATTACTCAGCATCACGA
AGCTTTAAAGGATCTTTGGAAACTAGCCTTTCCTGAAGAAGAGCTACACGGAATTGTATC
TGACCAGTGGAAGGAAATGGGGTGGCAGGGAAAAGATCCTTCAACAGATTTTAGGTAATC
TCACTTCTCTTCTCATTGTCACTATCTTTAGAGTTATCCACTTCACTTGTGACTCACACT
GGAGCATCTGTCACTGGCAGGGGTGGTGGTTTCATATCTCTTGAAAACTTGCTGTACTTC
GCTAAGAATTTCCCGAAATCCTTCCAAGACCTTCTGCGAAAGCAGGTTGGGGATCGTTCT
GTGTGGGAATACCCGTTTGCCGTTGCTGGCATCAATATTACCTTCATGCTTATCCAGATG
CTTGGCCTTGAAGCTGTGAAACCACGAAGTATTGTTGGCGAAACATTCTTGAGATTCCTT
TCGGTGAACGAATCTGCGTTTGACCTTCTGTATTGTATTGCGTTCAAGCTAATGGATCAG
CAATGGCTCTCCATGCGTGCTTCATACATGGAATTTAACACGGTAATGAAATCGACAAGG
CGGCAATTGGAAAGAGAGATAATGCTGGAAGACATAACAAGTATTGAAGATATGCCATCA
TACAGCCTTTTAAGTCAATAAATAGCAAACAGCTTACGAAGGACTACTAACACCTCAAGA
AACTCTTATTATCGAAAAGCCTAAGACAAGAACAGAGCAAACAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E878TF U 1
AF RR2E878JQ C 450
BS 1 579 RR2E878TF
BS 580 580 RR2E878JQ
BS 581 607 RR2E878TF
BS 608 1246 RR2E878JQ

RD RR2E878TF 607 0 0
GGACGAGTCGTTTTAATTTTCCGTTACGAAAAGCTTCGATAGCGATTTAAACCCGAAAAA
AAAAGAAACGTGCCACCGGATCATTATTGATTTGATCTAATCCGTCGGATAAGTTCAATC
GTGCCACCGGCGACACTCGGTAGATCTATAAAACCCAAATTGTTTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTGTGGTTTCTGAGAAGTGAAAGCGTTCGAGGTCGATACGACGCCGATTTGTTAT
TTTCCCGGCGATAGAGAGAGGTTTGGAGATGGATGATCTAGGAGGAGGCTCGTTCGTGGC
GGTGAGGAGAGTTGCTCCACGGCTTGAACAGGGAAGCGTTTACCATTCTTCATCCTCTGC
TGAGGTTGTGGCTGGATCGGCAGCATGGTTAGGCCGTGGCCTTTCCTGTGTTTGTGCTCA
GGGAACTCATGGCGACTCCCGTCCTTCTTTTGATCTTACGCCTGCTCAGGAGGAATGCCT
GCAGAAGTTGCAGACCCGCATCGATGTAGCGTATGACAGCTCAATTACTCAGCATCACGA
AGCTTTAAAGGATCTTTGGAAACTAGCCTTTCCTGAAGA*GAGCTACACGGAATTGTATC
TGACCAG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2E878JQ 797 0 0
TTTTGATCTACG
CTGCTCAGGAGGAATGC*TGCAGAAGTTGCAGACCCGCATCGATGTAGCGTATGACAGCT
CAATTACTCAGCATCAGGAAGCTTTAAAGGATCTTTGGAAACTAGCCTTTCCTGAAGAAG
AGCTACACGGAATTGTATCTGACCAGTGGAAGGAAATGGGGTGGCAGGGAAAAGATCCTT
CAACAGATTTTAGGTAATCTCACTTCTCTTCTCATTGTCACTATCTTTAGAGTTATCCAC
TTCACTTGTGACTCACACTGGAGCATCTGTCACTGGCAGGGGTGGTGGTTTCATATCTCT
TGAAAACTTGCTGTACTTCGCTAAGAATTTCCCGAAATCCTTCCAAGACCTTCTGCGAAA
GCAGGTTGGGGATCGTTCTGTGTGGGAATACCCGTTTGCCGTTGCTGGCATCAATATTAC
CTTCATGCTTATCCAGATGCTTGGCCTTGAAGCTGTGAAACCACGAAGTATTGTTGGCGA
AACATTCTTGAGATTCCTTTCGGTGAACGAATCTGCGTTTGACCTTCTGTATTGTATTGC
GTTCAAGCTAATGGATCAGCAATGGCTCTCCATGCGTGCTTCATACATGGAATTTAACAC
GGTAATGAAATCGACAAGGCGGCAATTGGAAAGAGAGATAATGCTGGAAGACATAACAAG
TATTGAAGATATGCCATCATACAGCCTTTTAAGTCAATAAATAGCAAACAGCTTACGAAG
GACTACTAACACCTCAAGAAACTCTTATTATCGAAAAGCCTAAGACAAGAACAGAGCAAA
CAAGC

QA 13 797 13 797
DS 



AS 1 2

CO CL5177Contig1 588 2 3 U
ACGGGATTGAGAGTGTTGTGTTCTTTGAAAGTCTCTTCAAGAAAAGCAGACTGATTCTTA
GATAGTCTGAGCTTCTTCCTCGACGTTTCACCGCCGCCGTCTTCTTCTTCATCGGAGGTT
CCACGTGAGTAACCTCTATCCGGAGTGGTCTCATCCTGGTCTCTCTCACTCCTCTTCCCC
GCCGCTTATTGTGCTCGAGATCGTACTGTTAGGAGATGAAACTCCCGCTTCCTCCTCGCA
ATACACCGTTGATGGAAGAATGTTCACGTCTATATTGCGAAGATCTGCAAAGAGCAGAAA
AGAAATACAGAATCAAATATTAAAATTTTCAAAGAGCACAAATAAAACTCTAGTAAGCTA
ACTAAAGAGAATGAAAAAGGAAAAACTAAAGAGAATGAAAGAGAACTGAAAATGTCATAA
GCAAGTACCTGATGTAGAAGCAAATGTCTGGTTCCATGGAAATCTATGGTGGTCGTTGGA
TATGGACGAACTAGGATCGTGATTTTGTGGAAAACCTAAGCTTAGGCTCAAACCAAGATC
TTCTTCTCCCATCATCATGATCTATCCACTAAAACTTTCCTATATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A168JQ U 287
AF RR2A168TF C 1
BS 1 286 RR2A168TF
BS 287 430 RR2A168JQ
BS 431 588 RR2A168TF

RD RR2A168JQ 144 0 0
GCAAAGAGCAGAAAAGAAATACAGAATCAAATATTAAAATTTTCAAAGAGCACAAATAAA
ACTCTAGTAAGCTAACTAAAGAGAATGAAAAAGGAAAAACTAAAGAGAATGAAAGAGAAC
TGAAAATGTCATAAGCAAGTACCT

QA 1 144 1 144
DS 

RD RR2A168TF 588 0 0
ACGGGATTGAGAGTGTTGTGTTCTTTGAAAGTCTCTTCAAGAAAAGCAGACTGATTCTTA
GATAGTCTGAGCTTCTTCCTCGACGTTTCACCGCCGCCGTCTTCTTCTTCATCGGAGGTT
CCACGTGAGTAACCTCTATCCGGAGTGGTCTCATCCTGGTCTCTCTCACTCCTCTTCCCC
GCCGCTTATTGTGCTCGAGATCGTACTGTTAGGAGATGAAACTCCCGCTTCCTCCTCGCA
ATACACCGTTGATGGAAGAATGTTCACGTCTATATTGCGAAGATCTGCAAAGAGCAGAAA
AGAAATACAGAATCAAATATTAAAATTTTCAAAGAGCACAAATAAAACTCTAGTAAGCTA
ACTAAAGAGAATGAAAAAGGAAAAACTAAAGAGAATGAAAGAGATCTGAAAATGTCATAA
GCAAGTACCTGATGTAGAAGCAAATGTCTGGTTCCATGGAAATCTATGGTGGTCGTTGGA
TATGGACGAACTAGGATCGTGATTTTGTGGAAAACCTAAGCTTAGGCTCAAACCAAGATC
TTCTTCTCCCATCATCATGATCTATCCACTAAAACTTTCCTATATATG

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL5178Contig1 934 2 2 U
GGTCTTGAGAAAATAAACCCTTGGCCATGGTGGTTGGTGGTCTTAGAGAGTTCGCGCTCA
GAAGAAACGGAGATGGCACACCAGCTCTGGACGAGTCTAACGGCGAGGAGCTTATGCACG
TGCAGCCCTCAGTCGCCGTCGCTCTCGGCAACCGCTCCGTCGAGTCTCCCGGAACTCTCT
ACATCACTTCCAGGAAATTGATTTGGCTGAGTGATGTAGACGTGGCGAAAGGCTATGCCG
TGGATTTCTTGTCGATATCGCTTCACGCGGTTTCTAGAGATCCACAAACTTATTCATCTC
CTTGTATTTATACTCAGATTGAAGTTGTAGAAGATGAGGATGAAGATGGTGAGGATGATA
CAGAGTCCACTGGAGTGTTGGACTTGTCTAAGATCAGAGAGATGAGGCTTGTTCCTTCTG
ACTCTACTCAGTTGGATACTCTGTTTGATGTGTTCTGCGAATGTGCTGAGCTCAATCCTG
AACCAGTTGAAGAAGAAGAAGAAAGTGGACATAACTGGGTGTTTAGTGCTGATCAGATGG
TTGTTGGTGGAGGAGGGGAAGAAGATGCAGGATGGCAAATATCTCAGAGCCCGACGAGTG
TAATTGGTCATTCCAATGGAGATGAAAGTATTGCTCAGCCTATGCTAGAGCTCCGGATCA
ATGATCAGAGGTTTGATGATGCTGAAGAGATGGTTCATGAAAGTGAGAACAAAGATCACT
AATTTGTTAAAACAATGTACTCTAAAACCCAGAGTTGTTTTTTATGTTTAAAACAGTGTT
GTATCCGTCTTCTTTAATGTTTATGTACTTGGTTAAATATGAGTCGAGACAGATAGATTA
AGCTCATCTGTTACCTCTCTCATTAATCATTACTCGTTGAAGAACCAGACCGTTAATGAA
AAAGTTTACGAAATAATAGCTCCTATGTTATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H707TF U 1
AF RR2H707JQB C 474
BS 1 612 RR2H707TF
BS 613 934 RR2H707JQB

RD RR2H707TF 612 0 0
GGTCTTGAGAAAATAAACCCTTGGCCATGGTGGTTGGTGGTCTTAGAGAGTTCGCGCTCA
GAAGAAACGGAGATGGCACACCAGCTCTGGACGAGTCTAACGGCGAGGAGCTTATGCACG
TGCAGCCCTCAGTCGCCGTCGCTCTCGGCAACCGCTCCGTCGAGTCTCCCGGAACTCTCT
ACATCACTTCCAGGAAATTGATTTGGCTGAGTGATGTAGACGTGGCGAAAGGCTATGCCG
TGGATTTCTTGTCGATATCGCTTCACGCGGTTTCTAGAGATCCACAAACTTATTCATCTC
CTTGTATTTATACTCAGATTGAAGTTGTAGAAGATGAGGATGAAGATGGTGAGGATGATA
CAGAGTCCACTGGAGTGTTGGACTTGTCTAAGATCAGAGAGATGAGGCTTGTTCCTTCTG
ACTCTACTCAGTTGGATACTCTGTTTGATGTGTTCTGCGAATGTGCTGAGCTCAATCCTG
AACCAGTTGAAGAAGAAGAAGAAAGTGGACATAACTGGGTGTTTAGTGCTGATCAGATGG
TTGTTGGTGGAGGAGGGGAAGAAGATGCAGGATGGCAAATATCTCAGAGCCCGACGAGTG
TAATTGGTCATT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2H707JQB 461 0 0
AATCCTGAACCAGTTGAAGAAGAAGAAGAAAGTGGACATAACTGGGTGTTTAGTGCTGAT
CAGATGGTTGTTGGTGGAGGAGGGGAAGAAGATGCAGGATGGCAAATATCTCAGAGCCCG
ACGAGTGTAATTGGTCATTCCAATGGAGATGAAAGTATTGCTCAGCCTATGCTAGAGCTC
CGGATCAATGATCAGAGGTTTGATGATGCTGAAGAGATGGTTCATGAAAGTGAGAACAAA
GATCACTAATTTGTTAAAACAATGTACTCTAAAACCCAGAGTTGTTTTTTATGTTTAAAA
CAGTGTTGTATCCGTCTTCTTTAATGTTTATGTACTTGGTTAAATATGAGTCGAGACAGA
TAGATTAAGCTCATCTGTTACCTCTCTCATTAATCATTACTCGTTGAAGAACCAGACCGT
TAATGAAAAAGTTTACGAAATAATAGCTCCTATGTTATTGT

QA 1 461 1 461
DS 



AS 1 2

CO CL5179Contig1 997 2 2 U
GGACACTTCTCACTCTATCTCTCTATCTCAAAGTCCACTTGCTTTGTCTGTCCACTTCAT
AAACTACTAGGTCCGTTTCCACATAGTTGTACGATCGATCATGGTAGTAGCGGAAACAGC
GGAGGCCACGATGGTTTTCACGACGGAGGGACCTCGCATTTCCTTCTCCGCCGATCTGTC
GTCATCAGACAGCGAGGGAGACTACATCTGCATCAACCCGGACAATCTGCTTCCACAAGA
CAGAAGCTCGGTGAAAGTCACCGGAGACTTTGAGTTTCTGTCGAACACACAAACGATGCT
CACCGCCGCAGATGAGCTGTTCTCCGAAGGGAAGCTGCTTCCTTATTGGCAGGTCAAACA
CTCGGAGAAGCTTCAAAACGTTACATTGAAAACAAAAGTTGTCGACGTGGAAGAAGAAGT
AGAAGAAGATCGTAGAGTGGTTAAAGAAGAGACTGTTCACAACAACAGCACCAAGGAGCA
GGAGAGTAATAATAACAATAACAGAGGAAGCTGGTTTCTTGACGATGATCCTTCTCCTCG
TCCACCAAATTGCACTGTTCTTTGGAAGGAGCTTTTGCGGCTGAAGAAACAGAGGACCAC
TAAGACTACAACGACGGTTTCTTCAACTAAGGCATCAACTCTCTCGCCGTCTTCATCCTC
AAGCTCGACTTCGTCTTCTTCGAGCTCTATCGGGGATGCGGTGAAGGAGGAGAGCGAGAA
GAAAGGGAAGAAAGGGTTAGAGAGGACTAGATCTGTGACTATGAGGATAAGACCCATGAT
TCATGTTCCTGTTTGTACTCCCTCTAAGCCTCCTCTGTTTCCTCTAAAGCTTCAGAGGAA
CAGAGCAGAGAAAAGAACTTGATGAATGGTGATGAACACTGTTTTATCTATTTGTCTTTG
TATTATCTTTTGTGATTAGATGGATTGTGTTTTTGTTGAGCTTTTGTGGTTGAGATCTGT
GGTGTGACAGTGTGTATAAATGTGAAGACATTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ87TF U 1
AF RR2FZ87JQ C 427
BS 1 566 RR2FZ87TF
BS 567 997 RR2FZ87JQ

RD RR2FZ87TF 566 0 0
GGACACTTCTCACTCTATCTCTCTATCTCAAAGTCCACTTGCTTTGTCTGTCCACTTCAT
AAACTACTAGGTCCGTTTCCACATAGTTGTACGATCGATCATGGTAGTAGCGGAAACAGC
GGAGGCCACGATGGTTTTCACGACGGAGGGACCTCGCATTTCCTTCTCCGCCGATCTGTC
GTCATCAGACAGCGAGGGAGACTACATCTGCATCAACCCGGACAATCTGCTTCCACAAGA
CAGAAGCTCGGTGAAAGTCACCGGAGACTTTGAGTTTCTGTCGAACACACAAACGATGCT
CACCGCCGCAGATGAGCTGTTCTCCGAAGGGAAGCTGCTTCCTTATTGGCAGGTCAAACA
CTCGGAGAAGCTTCAAAACGTTACATTGAAAACAAAAGTTGTCGACGTGGAAGAAGAAGT
AGAAGAAGATCGTAGAGTGGTTAAAGAAGAGACTGTTCACAACAACAGCACCAAGGAGCA
GGAGAGTAATAATAACAATAACAGAGGAAGCTGGTTTCTTGACGATGATCCTTCTCCTCG
TCCACCAAATTGCACTGTTCTTTGGA

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2FZ87JQ 571 0 0
AGATCGTAGAGTGGTTAAAGAAGAGACTGTTCACAACAACAGCACCAAGGAGCAGGAGAG
TAATAATAACAATAACAGAGGAAGCTGGTTTCTTGACGATGATCCTTCTCCTCGTCCACC
AAATTGCACTGTTCTTTGGAAGGAGCTTTTGCGGCTGAAGAAACAGAGGACCACTAAGAC
TACAACGACGGTTTCTTCAACTAAGGCATCAACTCTCTCGCCGTCTTCATCCTCAAGCTC
GACTTCGTCTTCTTCGAGCTCTATCGGGGATGCGGTGAAGGAGGAGAGCGAGAAGAAAGG
GAAGAAAGGGTTAGAGAGGACTAGATCTGTGACTATGAGGATAAGACCCATGATTCATGT
TCCTGTTTGTACTCCCTCTAAGCCTCCTCTGTTTCCTCTAAAGCTTCAGAGGAACAGAGC
AGAGAAAAGAACTTGATGAATGGTGATGAACACTGTTTTATCTATTTGTCTTTGTATTAT
CTTTTGTGATTAGATGGATTGTGTTTTTGTTGAGCTTTTGTGGTTGAGATCTGTGGTGTG
ACAGTGTGTATAAATGTGAAGACATTTTCAT

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

CO CL5180Contig1 1164 2 2 U
GGGGAGGAGTATCCTGACAGGATGATGTTGACGTTCTCCGTGTTCCCGTCGCCTAAAGTG
TCTGACACTGTTGTGGAGTCTTACAATGCAACTCTCTCTGTACATCAGCTTGTGGAGAAT
GCAGATGAGTGTATGGTTCTTGACAACGAAGCTCTCTATGACATTTGCTTCAGAACTCTT
AAGCTCACCACTCCTAGCTTTGGAGACTTGAACCATCTCATCTCTGCCACCATGAGTGGT
GTCACTTGCTGCCTACGTTTCCCTGGCCAGCTAAACTCTGACCTGCGCAAGCTTGCGGTG
AACTTAATCCCATTCCCTCGTCTCCACTTCTTCATGGTCGGATTCGCACCTCGCACATCA
CGTGGATCGCAGCAGTACAGAGCCTTAACCGTCCCTGAGCTGACCCAACAGGTGTGGGAC
GCTAAGAACATGATGTGCGCAGCTGACCCGCGCCACGGCAGGTACCTGACTGCATCAGCC
ATGTTCAGAGGCAAAATGAGCACCAAAGAAGTCGACGAGCAGATGATCAACGTTCAGAAC
AAGAACTCATCCTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACGTGAAGTCAACCGTGTGTGAC
ATTCCACCGACGGGTCTGAAAATGGCTTCCACTTTCATCGGGAACTCGACCTCGATCCAG
GAGATGTTCAGGCGTGTGAGCGAGCAGTTCACTTCTATGTTCAGAAGGAAGGCTTTCTTG
CATTGGTACACAGGTGAAGGAATGGACGAGATGGAGTTCACGGAGGCAGAAAGTAACATG
AACGATTTGGTGTCGGAGTATCAACAGTACCAAGATGCGACGGCTGATGATGAAGAAGGG
TATGAGTATGAAGAAGATGAAGAGGAAGTGTAGGAGGAGCAATGACCGGTAAAAAGAAGA
AAATGCCTCGTATAGCTCTTGTCGTGTGTGTGAGTTTTTTTTTTAAAATTAGTGTCTTCT
TATCTCTCATGTTGTTTGGCTTGGTTTTTCTTTTATTCCGTTTTGGTTTTCTTGTATTGA
CATTTGGATATGTGTGTTTAGAGCTTAGGAAAATATGTGTTTATATAAGTCTTTTCGAGT
GATTGGATTTGATGTATTGTTTGTTAGTTCTCCCCCTAAACGTTTTGTGGTAATATGATT
TTTCTCGTGATTCCCTCTGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN95TF U 1
AF RR2FN95JQ C 563
BS 1 702 RR2FN95TF
BS 703 1164 RR2FN95JQ

RD RR2FN95TF 702 0 0
GGGGAGGAGTATCCTGACAGGATGATGTTGACGTTCTCCGTGTTCCCGTCGCCTAAAGTG
TCTGACACTGTTGTGGAGTCTTACAATGCAACTCTCTCTGTACATCAGCTTGTGGAGAAT
GCAGATGAGTGTATGGTTCTTGACAACGAAGCTCTCTATGACATTTGCTTCAGAACTCTT
AAGCTCACCACTCCTAGCTTTGGAGACTTGAACCATCTCATCTCTGCCACCATGAGTGGT
GTCACTTGCTGCCTACGTTTCCCTGGCCAGCTAAACTCTGACCTGCGCAAGCTTGCGGTG
AACTTAATCCCATTCCCTCGTCTCCACTTCTTCATGGTCGGATTCGCACCTCGCACATCA
CGTGGATCGCAGCAGTACAGAGCCTTAACCGTCCCTGAGCTGACCCAACAGGTGTGGGAC
GCTAAGAACATGATGTGCGCAGCTGACCCGCGCCACGGCAGGTACCTGACTGCATCAGCC
ATGTTCAGAGGCAAAATGAGCACCAAAGAAGTCGACGAGCAGATGATCAACGTTCAGAAC
AAGAACTCATCCTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACGTGAAGTCAACCGTGTGTGAC
ATTCCACCGACGGGTCTGAAAATGGCTTCCACTTTCATCGGGAACTCGACCTCGATCCAG
GAGATGTTCAGGCGTGTGAGCGAGCAGTTCACTTCTATGTTC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2FN95JQ 602 0 0
AGTGGATCCCCAACAACGTGAAGTCAACCGTGTGTGACATTCCACCGACGGGTCTGAAAA
TGGCTTCCACTTTCATCGGGAACTCGACCTCGATCCAGGAGATGTTCAGGCGTGTGAGCG
AGCAGTTCACTTCTATGTTCAGAAGGAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACAGGTGAAGGAA
TGGACGAGATGGAGTTCACGGAGGCAGAAAGTAACATGAACGATTTGGTGTCGGAGTATC
AACAGTACCAAGATGCGACGGCTGATGATGAAGAAGGGTATGAGTATGAAGAAGATGAAG
AGGAAGTGTAGGAGGAGCAATGACCGGTAAAAAGAAGAAAATGCCTCGTATAGCTCTTGT
CGTGTGTGTGAGTTTTTTTTTTAAAATTAGTGTCTTCTTATCTCTCATGTTGTTTGGCTT
GGTTTTTCTTTTATTCCGTTTTGGTTTTCTTGTATTGACATTTGGATATGTGTGTTTAGA
GCTTAGGAAAATATGTGTTTATATAAGTCTTTTCGAGTGATTGGATTTGATGTATTGTTT
GTTAGTTCTCCCCCTAAACGTTTTGTGGTAATATGATTTTTCTCGTGATTCCCTCTGTGT
CC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL5181Contig1 937 2 2 U
GGTGATAGCCAAGGAGATGATTGTTCGTGGAGAAGAAACAAGTGGAGAACTCGGGGATGA
ACGCGAAGAGTTGACTGTTAGTACGGCGGAAGTTGATGAGTCCACAGCTTGTGTATTTCA
AGAAAACGTAGTAGCAGAGGAGATTATCAATCGAGGACAAGAGGAGGAACTTTCATCGAC
AGAAGGAATAAGTTCTTTTGTAGAAAGAAGAGAAGTCGTAGTCACAAAGTCTGAGGAGGT
TATGGCTGAAGAGAGTAACAGTGTGGAGGATAAGATGGAGTTGAATACTGAAGAGCAAGA
AGAGTTGAGTATCGAAGAAGATGATGATGATGATTGGGAGGGAATTGAGAGGAGTGAACT
TGAGAAAGCCTTTGTGGCTGCTTCAAATCTTCTGGAAGAATCAGGGAAAGGTGAGCAAAT
TGGTGCTGAGGTTAAGTTGGAGTTGTATGGCCTTCTCAAGATCGCTACTGAAGGTTCATG
CCGAGAGGCACAGCCTATGGCCCTCATGCTCTCTGCTCGTGCTAAATGGAATGCCTGGCA
AAAACTTGGAAACATGAGTCAGGAGGAGGCAATGGAGCAGTATCTTCAACTTGTTTCGAA
GGAAATTCCTGGTTTGGTGAATACTGATCATCATACTTTAGGGAAGATTTCAAAAACGGA
AACCTCTGTTGTCCTGCCTCCAAATTCAGGTTCATTAGAAGATCCGACCAACTTAGACAC
GACTGGTGTTGCATCCAGCAAAACTGGATAAATATAAATCCAATTTTTAAGCAGGCAATG
CTTGAAGAAAGAAAATCCTTGGGAGAACGAAGGCAGAACTATTCTTTTTCGTAGAAAACA
AAAGTATGTTACTCAAAAGATAATATCATAAATGCAGTAAATAAACCATTTGGTGAAACT
TGGTTGTATAGTGTTGTTCTACATAATTGTTATCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E710TF U 1
AF RR2E710JQ C 395
BS 1 537 RR2E710TF
BS 538 937 RR2E710JQ

RD RR2E710TF 537 0 0
GGTGATAGCCAAGGAGATGATTGTTCGTGGAGAAGAAACAAGTGGAGAACTCGGGGATGA
ACGCGAAGAGTTGACTGTTAGTACGGCGGAAGTTGATGAGTCCACAGCTTGTGTATTTCA
AGAAAACGTAGTAGCAGAGGAGATTATCAATCGAGGACAAGAGGAGGAACTTTCATCGAC
AGAAGGAATAAGTTCTTTTGTAGAAAGAAGAGAAGTCGTAGTCACAAAGTCTGAGGAGGT
TATGGCTGAAGAGAGTAACAGTGTGGAGGATAAGATGGAGTTGAATACTGAAGAGCAAGA
AGAGTTGAGTATCGAAGAAGATGATGATGATGATTGGGAGGGAATTGAGAGGAGTGAACT
TGAGAAAGCCTTTGTGGCTGCTTCAAATCTTCTGGAAGAATCAGGGAAAGGTGAGCAAAT
TGGTGCTGAGGTTAAGTTGGAGTTGTATGGCCTTCTCAAGATCGCTACTGAAGGTTCATG
CCGAGAGGCACAGCCTATGGCCCTCATGCTCTCTGCTCGTGCTAAATGGAATGCCTG

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2E710JQ 543 0 0
GAAGAATCAGGGAAAGGTGAGCAAATTGGTGCTGAGGTTAAGTTGGAGTTGTATGGCCTT
CTCAAGATCGCTACTGAAGGTTCATGCCGAGAGGCACAGCCTATGGCCCTCATGCTTTCT
GCTCGTGCTAAATGGAATGCCTGGCAAAAACTTGGAAACATGAGTCAGGAGGAGGCAATG
GAGCAGTATCTTCAACTTGTTTCGAAGGAAATTCCTGGTTTGGTGAATACTGATCATCAT
ACTTTAGGGAAGATTTCAAAAACGGAAACCTCTGTTGTCCTGCCTCCAAATTCAGGTTCA
TTAGAAGATCCGACCAACTTAGACACGACTGGTGTTGCATCCAGCAAAACTGGATAAATA
TAAATCCAATTTTTAAGCAGGCAATGCTTGAAGAAAGAAAATCCTTGGGAGAACGAAGGC
AGAACTATTCTTTTTCGTAGAAAACAAAAGTATGTTACTCAAAAGATAATATCATAAATG
CAGTAAATAAACCATTTGGTGAAACTTGGTTGTATAGTGTTGTTCTACATAATTGTTATC
CCC

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL5182Contig1 1122 2 2 U
GCTCAAGAGGAATCTAGAAATGGAGAAAACGAGACAAAGGAGAAAGAAGAAGAGTCTTCA
TCTCAAGGGGAAAGTAAAGATGGAGAAACTGAAACAAAGGAGAAAGAAGAGTCTTCTCAA
GAGGAATCTAAAGAGAAAGAAATAGAGAGAAAGGAGAAAGAAGAAGAGTCTTCATCTCAA
GAGGAAAGTAAAGACAAAGAAAACAAGACAGATGAGAAAGAAGAGCCTTCATCTCAAGAG
GAGTCTAAAGAGAAAGAACCAGAGGAGACAAAGGAGAAAGAAGAGCCTTCATCTCAAGAG
GAAACTAAAGATGGAGAAACAGAGACAAAGGAGAAAGAAGAAGAGTCTTCTCAAGAGGAA
TCTAAAGACAAGGAAACCGAGACAAAGGAGAAAGAAGAAGAGTCTTCGTCCCAAGGGGAA
ACCAAAGACAAAGAAACTGAGACAAAAGAGAAAGAGGAGTCTTTGTTGCAAGAGAAGAAA
GAAGACAACAAGGAAACCGAGAAAGTTGTGAAAGAGGAAGAGTCTTCCTCCCAAGAAGAA
AATAAAGAGAAAGAAACAGAGGAGACAAAGGAGAAAGAAGAGTCTTCTTCCCAAGAAAAA
CCAAAGATAAGGAGCCCGAATCAAAGGAGAAAGAGGAGTCTACGTCCCAAGAGGAAACTA
AAGAGAAAGAAGAGTCTTCTTCATCCAACGATAATTCACAGGGAAATGAAAGTACTGAGA
GTGAGAAGAAGGAAGGAGTCGAGGAAACCGAGAAGAAGTCTGACGAAGGCACTAGTGAAA
CTGGCAGTACTGAGACTGAACAAAAGCAACCAGAGGATACTACACAAACAGAGTCAGAGA
AAGAGGAAAGCAACAAGAATGGTGAGACAGAGGTGGTGGTGACCGAGAACGATCAAGAAC
ATTCTGACAATAGTCTTCCTCAAGAAGTAAAAGATGTTCGTACCGATCTTGAAACTCTGC
CAGATTCTGGTAATGGAGGTAACAGTGATACCATTGCGGCTGAGTAGATCAAATTCTCTC
ATTCATGTTGTTTAGTAGAGATTTCGAATTTGTGTCATGTAATCTGTTGTAACCTTTCTA
TTACACATATGGGCTCTAGTCACATTTATTTTTTATTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH95TF U 1
AF RR2DH95JQ C 493
BS 1 631 RR2DH95TF
BS 632 1122 RR2DH95JQ

RD RR2DH95TF 631 0 0
GCTCAAGAGGAATCTAGAAATGGAGAAAACGAGACAAAGGAGAAAGAAGAAGAGTCTTCA
TCTCAAGGGGAAAGTAAAGATGGAGAAACTGAAACAAAGGAGAAAGAAGAGTCTTCTCAA
GAGGAATCTAAAGAGAAAGAAATAGAGAGAAAGGAGAAAGAAGAAGAGTCTTCATCTCAA
GAGGAAAGTAAAGACAAAGAAAACAAGACAGATGAGAAAGAAGAGCCTTCATCTCAAGAG
GAGTCTAAAGAGAAAGAACCAGAGGAGACAAAGGAGAAAGAAGAGCCTTCATCTCAAGAG
GAAACTAAAGATGGAGAAACAGAGACAAAGGAGAAAGAAGAAGAGTCTTCTCAAGAGGAA
TCTAAAGACAAGGAAACCGAGACAAAGGAGAAAGAAGAAGAGTCTTCGTCCCAAGGGGAA
ACCAAAGACAAAGAAACTGAGACAAAAGAGAAAGAGGAGTCTTTGTTGCAAGAGAAGAAA
GAAGACAACAAGGAAACCGAGAAAGTTGTGAAAGAGGAAGAGTCTTCCTCCCAAGAAGAA
AATAAAGAGAAAGAAACAGAGGAGACAAAGGAGAAAGAAGAGTCTTCTTCCCAAGAAAAA
CCAAAGATAAGGAGCCCGAATCAAAGGAGAA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2DH95JQ 630 0 0
GAAACCGAGAAAGTTGTGAAAGAGGAAGAGTCTTCCTCCCAAGAAGAAAATAAAGAGAAA
GAAACAGAGGAGACAAAGGAGAAAGAAGAGTCTTCTTCCCAAGAAAAACCAAAGATAAGG
AGCCCGAATCAAAGGAGAAAGAGGAGTCTACGTCCCAAGAGGAAACTAAAGAGAAAGAAG
AGTCTTCTTCATCCAACGATAATTCACAGGGAAATGAAAGTACTGAGAGTGAGAAGAAGG
AAGGAGTCGAGGAAACCGAGAAGAAGTCTGACGAAGGCACTAGTGAAACTGGCAGTACTG
AGACTGAACAAAAGCAACCAGAGGATACTACACAAACAGAGTCAGAGAAAGAGGAAAGCA
ACAAGAATGGTGAGACAGAGGTGGTGGTGACCGAGAACGATCAAGAACATTCTGACAATA
GTCTTCCTCAAGAAGTAAAAGATGTTCGTACCGATCTTGAAACTCTGCCAGATTCTGGTA
ATGGAGGTAACAGTGATACCATTGCGGCTGAGTAGATCAAATTCTCTCATTCATGTTGTT
TAGTAGAGATTTCGAATTTGTGTCATGTAATCTGTTGTAACCTTTCTATTACACATATGG
GCTCTAGTCACATTTATTTTTTATTGTTTT

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL5183Contig1 1366 2 10 U
GCACCTTCTTTCCATTATGATCTGCTTCTTCTAGGTTTCTTGACAATCCTATGCGGTCTC
ATTGGGATTCCTCCATCTAATGGTGTCATCCCACAATCACCAATGCATACTAAAAGCTTA
GCAACACTGAAACACCAGTTACTACGAAACAAACTCGTGGTAGCTGCACGCAAATGCATC
AGAAACAAGGCAACATTAGGAGAAGTCTATGTAAGCATGGAAGAAGCTTACCAGCAGATG
CAGAGCCCTCTGATACACCAAGGACCTTCTCGGATTAAGGGGCTTAAACAGTCACAAATG
CAGAAGGGTTTAGGATTAGCAAACGCAGACACACTGGTGGATGAAGCGGTGTTCGATGTG
GAGACAGAAGTGGAGAATGTGTTGCCGGTGGAAGTAAAAGAGCAAAGACTAAGCAACTTT
CTTCAAGCTATGTTGGTTGCTGGATGCGTTGCAGCGATGCCGTTGATCAAAAGGATCCCG
AGTTCGGTTCTTTGGGGTTACTTTGCTTACATGGCCATTGAAAGCCTCCCAGGGAATCAG
TTCTGGGAGAGGATTGTGCTTCTCTTCACTGCTCCAAGCAGGAGATTCAAAGTTCTTGAG
GATAACCATGCGGTTTTCGTTGAAACGGTGCCGTTTAAGACGACGGCGATGTTCACTCTG
TTTCAGACGGGGTACTTGCTGGTTTGCTTTGGGATCACGTGGGTTCCGGTGGCTGGAGTT
CTGTTCCCGTTGATGATAATGTTTCTTGTTCCGGTGAGGCAATACGTGTTGCCTAACTTC
TTTAAAGGAGCTCATCTTCAAGACTTGGACGCTGCTGAGTATGAAGAAGCACCTGCTCTC
TTGTCATTCAACCTCAAACCAGAAGGTGAAGTGAACCGTGCGACGTCGTTTGCGGACAGT
GGAGAAGTGATGGACGGGATGTTCACGAGAAGCAGAGGAGAGATAAGGAGAGTGAGCAGC
ATTAAGCTTGGTGGTGGTAGCGGAGGATGTGGATCAGCGGGAGGTTCGCCTGCGGGTGGA
GTGGAGTTGATGAGGAGAGTGGTGAGTTTTCAGAATCCAAGAGTTTCGGAGAAAGTGTAT
ATACGGAGCTTAAGTGATTACAGAGGAGGAGGAGGAGGAGAGAGTAGTCCAAGGTCGCCT
GCTGGAAGAGCTCCTCTCAGTCCACGGTTCACCGCCGCAGGAGGTGGAGGAGAACAGAGA
CTTTCTATTTTAGGAAAGTCTGTTTAGTAAAATATTGTTAGCGTCTTTAATTCATCTTTA
GTAACCAACGACCGACACTACGAAGGCTATCTTTCTGTTATAACGAAATTACTGAAATGG
AAAAGGAAAAAAAAAAGATTATTCCGGAGAATTTAATTATTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC42TF U 1
AF RR2DC42JQ C 593
BS 1 645 RR2DC42TF
BS 646 646 RR2DC42JQ
BS 647 671 RR2DC42TF
BS 672 672 RR2DC42JQ
BS 673 708 RR2DC42TF
BS 709 709 RR2DC42JQ
BS 710 727 RR2DC42TF
BS 728 728 RR2DC42JQ
BS 729 749 RR2DC42TF
BS 750 1366 RR2DC42JQ

RD RR2DC42TF 749 0 0
GCACCTTCTTTCCATTATGATCTGCTTCTTCTAGGTTTCTTGACAATCCTATGCGGTCTC
ATTGGGATTCCTCCATCTAATGGTGTCATCCCACAATCACCAATGCATACTAAAAGCTTA
GCAACACTGAAACACCAGTTACTACGAAACAAACTCGTGGTAGCTGCACGCAAATGCATC
AGAAACAAGGCAACATTAGGAGAAGTCTATGTAAGCATGGAAGAAGCTTACCAGCAGATG
CAGAGCCCTCTGATACACCAAGGACCTTCTCGGATTAAGGGGCTTAAACAGTCACAAATG
CAGAAGGGTTTAGGATTAGCAAACGCAGACACACTGGTGGATGAAGCGGTGTTCGATGTG
GAGACAGAAGTGGAGAATGTGTTGCCGGTGGAAGTAAAAGAGCAAAGACTAAGCAACTTT
CTTCAAGCTATGTTGGTTGCTGGATGCGTTGCAGCGATGCCGTTGATCAAAAGGATCCCG
AGTTCGGTTCTTTGGGGTTACTTTGCTTACATGGCCATTGAAAGCCTCCCAGGGAATCAG
TTCTGGGAGAGGATTGTGCTTCTCTTCACTGCTCCAAGCAGGAGATTCAAAGTTCTTGAG
GATAACCATGCGGTTTTCGTTGAAACGGTGCCGTTTAAGACGACG*CGATGTTCACTCTG
TTTCAGACGGG*TACTTGCTGGTTTGCTTTGGGATCACGTGGGTTCCG*TGGCTGGAGTT
CTGTTCC*GTTGATGATAATGTTTCTTGT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2DC42JQ 774 0 0
TTCTTGAGGATAACCATGCGGTTTTCGTTGAAACGGTGCCGTTTAAGACGACGGCGATGT
TCACTCTGTTTCAGACGGGGTACTTGCTGGTTTGCTTTGGGATCACGTGGGTTCCGGTGG
CTGGAGTTCTGTTCCCGTTGATGATAATGTTTCTTGTTCCGGTGAGGCAATACGTGTTGC
CTAACTTCTTTAAAGGAGCTCATCTTCAAGACTTGGACGCTGCTGAGTATGAAGAAGCAC
CTGCTCTCTTGTCATTCAACCTCAAACCAGAAGGTGAAGTGAACCGTGCGACGTCGTTTG
CGGACAGTGGAGAAGTGATGGACGGGATGTTCACGAGAAGCAGAGGAGAGATAAGGAGAG
TGAGCAGCATTAAGCTTGGTGGTGGTAGCGGAGGATGTGGATCAGCGGGAGGTTCGCCTG
CGGGTGGAGTGGAGTTGATGAGGAGAGTGGTGAGTTTTCAGAATCCAAGAGTTTCGGAGA
AAGTGTATATACGGAGCTTAAGTGATTACAGAGGAGGAGGAGGAGGAGAGAGTAGTCCAA
GGTCGCCTGCTGGAAGAGCTCCTCTCAGTCCACGGTTCACCGCCGCAGGAGGTGGAGGAG
AACAGAGACTTTCTATTTTAGGAAAGTCTGTTTAGTAAAATATTGTTAGCGTCTTTAATT
CATCTTTAGTAACCAACGACCGACACTACGAAGGCTATCTTTCTGTTATAACGAAATTAC
TGAAATGGAAAAGGAAAAAAAAAAGATTATTCCGGAGAATTTAATTATTATTCC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL5184Contig1 1223 2 2 U
GGTCTCTCTGTTTCTCATATCTTCTCTCTCAGCGTGCTCTCTCCTCTCTCGCTTATCTTT
GCTCAGGTGTTCTTTGTGTGGATCAAGAGTGAAGGAAAAAAAGATGAATCATTGTAACTT
CCAGCAGCAGAACGCCTTCATGTCTCGCGAGGAGATGATGGGATTCGAACGCAAGGATCT
CGTTGTTCGTCCTAAGCCACGACGTGTTGTTGGATGCTTACTCACCAACAACCATATTCG
CCCTCTGAGATTACACATGAGTCAAGCTGCTGCTGATTTGTGTGATTCCAAAGCTGGTGC
TGAGCTTTTAGACATAATTCGTAGAAAGGAGGATAATAATAATAACGGACCAATAGGGCA
GTTACTATCATCATCACCTGTATCTTCGTCACCGTATTTCCCCGGTTCACCTCCGAGCAG
AGCAGCGAACCCATTAGCTCAAGATGCTCGCTTTCGCGACGTCGAGAAACTCAGTCCCGT
CTCACCAAACTCTCCTTTCCTTCAGCCCAATTCAGCAACCGCGTTTCCATCTCCATCAGC
TTCTTCGTCATCGTCGTCGTCTCGTGGCTGCGTTAGGATGAAATTTGGGCTAAAACCACC
TGCGGTTAGAGTTGAAGGATTCGAATGCTTGAACCAAAACTCGGGCATTCCTGCCATGGC
TTAAAGTAGACAAGACGAGACGGACAAAGTGTGTATATAGAGATTCCATCGTTTGTTCAC
CACCAGGGCAGGGCCTAACAGAAGAGAAGGATTTGATTACTAGTACGACCACCACCATTT
TGAAGCAAATGAAATATTGTGAAATATCTTTAGTGTTTTACCATCTTTTCCTGAGAGAGT
GAGAGTGAGGGAGGAGAGGAAGGAGATGAAGATCAGTTACCGTTGTCTGTGTTTTGTTGA
CTTATTATTTCAGGTTAGTCTTTTGTATATAAAGAGTCCAAATCTCTATGTATTCGTTTT
GGTGTTCTTTTTTTCTGGCTCAGGCTGATCTTTTTAATGTATAATTAAGGGGAAGATTTA
GAAGAATCTGTAAAATATAATCGAATCATTTTTCTCCACCATTGTATTTGTTAATGTGTC
TCTTTAACTTTGTTTGAGGAGTTTAAGCTCTCTCACAACACCACCTTTGTATTTGTATTT
GGTGTGTATATTAATGCCTTCTTGTTATTTGACTTATATTTGTGATAAAAGCAAAAACCG
TTTTGTGCTTTACTTCTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ04TF U 1
AF RR2BQ04JQ C 564
BS 1 702 RR2BQ04TF
BS 703 1223 RR2BQ04JQ

RD RR2BQ04TF 702 0 0
GGTCTCTCTGTTTCTCATATCTTCTCTCTCAGCGTGCTCTCTCCTCTCTCGCTTATCTTT
GCTCAGGTGTTCTTTGTGTGGATCAAGAGTGAAGGAAAAAAAGATGAATCATTGTAACTT
CCAGCAGCAGAACGCCTTCATGTCTCGCGAGGAGATGATGGGATTCGAACGCAAGGATCT
CGTTGTTCGTCCTAAGCCACGACGTGTTGTTGGATGCTTACTCACCAACAACCATATTCG
CCCTCTGAGATTACACATGAGTCAAGCTGCTGCTGATTTGTGTGATTCCAAAGCTGGTGC
TGAGCTTTTAGACATAATTCGTAGAAAGGAGGATAATAATAATAACGGACCAATAGGGCA
GTTACTATCATCATCACCTGTATCTTCGTCACCGTATTTCCCCGGTTCACCTCCGAGCAG
AGCAGCGAACCCATTAGCTCAAGATGCTCGCTTTCGCGACGTCGAGAAACTCAGTCCCGT
CTCACCAAACTCTCCTTTCCTTCAGCCCAATTCAGCAACCGCGTTTCCATCTCCATCAGC
TTCTTCGTCATCGTCGTCGTCTCGTGGCTGCGTTAGGATGAAATTTGGGCTAAAACCACC
TGCGGTTAGAGTTGAAGGATTCGAATGCTTGAACCAAAACTCGGGCATTCCTGCCATGGC
TTAAAGTAGACAAGACGAGACGGACAAAGTGTGTATATAGAG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2BQ04JQ 660 0 0
GTGGCTGCGTTAGGATGAAATTTGGGCTAAAACCACCTGCGGTTAGAGTTGAAGGATTCG
AATGCTTGAACCAAAACTCGGGCATTCCTGCCATGGCTTAAAGTAGACAAGACGAGACGG
ACAAAGTGTGTATATAGAGATTCCATCGTTTGTTCACCACCAGGGCAGGGCCTAACAGAA
GAGAAGGATTTGATTACTAGTACGACCACCACCATTTTGAAGCAAATGAAATATTGTGAA
ATATCTTTAGTGTTTTACCATCTTTTCCTGAGAGAGTGAGAGTGAGGGAGGAGAGGAAGG
AGATGAAGATCAGTTACCGTTGTCTGTGTTTTGTTGACTTATTATTTCAGGTTAGTCTTT
TGTATATAAAGAGTCCAAATCTCTATGTATTCGTTTTGGTGTTCTTTTTTTCTGGCTCAG
GCTGATCTTTTTAATGTATAATTAAGGGGAAGATTTAGAAGAATCTGTAAAATATAATCG
AATCATTTTTCTCCACCATTGTATTTGTTAATGTGTCTCTTTAACTTTGTTTGAGGAGTT
TAAGCTCTCTCACAACACCACCTTTGTATTTGTATTTGGTGTGTATATTAATGCCTTCTT
GTTATTTGACTTATATTTGTGATAAAAGCAAAAACCGTTTTGTGCTTTACTTCTTTTCCC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL5185Contig1 1343 2 8 U
GGGGCTTTAGAGTGAAGAAGAAGGATCATCAAAAAATGGAGAGCGACTCAGTGATGGTAC
CGTTGCCTCTGTTACCTATACCGATAGAATCAAACTACAGAGCGTGCACCATTCCTTATC
GATTCCCTTCTGATAACCCCAAGAAGGCTACTCCCACTGAGATCTCTTGGATCGATCTCT
TCCTCAACTCCATCCCTTCTTTCAAGGAGCGTGCAGAGAGCGATACATCTGTTCCAGATG
CTCCTGTTCGAGCTGAAAAGTTTGCTCAAAGGTATGCGGAGATTCTGGAGGACTTGAAGA
AAGATCCGGAGAGCCATGGTGGACCACCAGATTGCATTCTTCTTTGTAGAATTCGTGAAC
TAATACTCAGAGAATTGGGATTCAGAGACATTTTCAAGAAAGTTAAGGATGAGGAGAATG
CAAAGGCTATATCACTATTTCCTGAAGTCGTCCGTCTTAGTGATGCTATTGAAGATGAAG
GCAAGCGCATTGAGAGTCTTGTAAGAGGTATTTTCGCTGGAAACATCTTTGATCTCGGTT
CTGCACAGCTTGCGGAAGTATTCTCAAAGGATGGAATGTCATTCTTGGCTAGCTGTCAAA
ACTTGGTTCCACGGCCATGGGTCATTGATGACTTGGACAACTTTCAAGCTAGATGGCTCA
AGAAGCCTTGGAAGAAGGCTGTGATATTTGTTGACAACTCTGGTGCAGACATAATTTTGG
GTATCTTGCCGTTTGCTAGAGAAATGCTACGTCAAGGAATGCAGGTGGTGCTGGCTGCTA
ATGAGCTTCCATCTATCAATGATGTCACTTATACCGAGCTTGCAGAGATCTTGTCCAAGC
TTAAGGATGAAAATGGACAACTGATGGGTGTTGATATCTCGAATCTTCTGATTGCAAACT
CTGGGAATGACCTACCGGTTATTGATCTGGCAAGAGTATCACAGGAGGTTGCATACCTCT
CGACCGATGCAGACTTGGTCATCTTAGAAGGCATGGGACGTGGAATAGAGACAAACCTTT
ATGCTCAGTTCAAGTGTGATTCCCTCAAGATTGGAATGGTGAAGCATCCAGAGGTAGCAC
AGTTTCTGGGAGGACGGCTTTATGACTGCGTCATCAAATACAATGAAGTTCAGAGCTGAT
TGTATTCCACAACCTACATTTTTTCACAGAACCAAGCCAAACAGTTTATTATGTTAAAAA
CTGCTAGGCTTTGTAAGTTTTAGTTTAAACTCCTCCCTCTACTCTCTATCTCTGCACTCA
GATATAAGAATTGGAAAACTCTTTCAACATTCTTGCTATGGTATTTGAGCATTTTAGAGG
ACTCCCAATGAAAGAAATATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H746TF U 1
AF RR2H746JQB C 609
BS 1 675 RR2H746TF
BS 676 676 RR2H746JQB
BS 677 677 RR2H746TF
BS 678 678 RR2H746JQB
BS 679 696 RR2H746TF
BS 697 697 RR2H746JQB
BS 698 754 RR2H746TF
BS 755 1343 RR2H746JQB

RD RR2H746TF 756 0 0
GGGGCTTTAGAGTGAAGAAGAAGGATCATCAAAAAATGGAGAGCGACTCAGTGATGGTAC
CGTTGCCTCTGTTACCTATACCGATAGAATCAAACTACAGAGCGTGCACCATTCCTTATC
GATTCCCTTCTGATAACCCCAAGAAGGCTACTCCCACTGAGATCTCTTGGATCGATCTCT
TCCTCAACTCCATCCCTTCTTTCAAGGAGCGTGCAGAGAGCGATACATCTGTTCCAGATG
CTCCTGTTCGAGCTGAAAAGTTTGCTCAAAGGTATGCGGAGATTCTGGAGGACTTGAAGA
AAGATCCGGAGAGCCATGGTGGACCACCAGATTGCATTCTTCTTTGTAGAATTCGTGAAC
TAATACTCAGAGAATTGGGATTCAGAGACATTTTCAAGAAAGTTAAGGATGAGGAGAATG
CAAAGGCTATATCACTATTTCCTGAAGTCGTCCGTCTTAGTGATGCTATTGAAGATGAAG
GCAAGCGCATTGAGAGTCTTGTAAGAGGTATTTTCGCTGGAAACATCTTTGATCTCGGTT
CTGCACAGCTTGCGGAAGTATTCTCAAAGGATGGAATGTCATTCTTGGCTAGCTGTCAAA
ACTTGGTTCCACGGCCATGGGTCATTGATGACTTGGACAACTTTCAAGCTAGATGGCTCA
AGAAGCCTTGGAAGACG*CTGTGATATTTGTTGACA*CTCTGGTGCAGACATAATTTTGG
GTATCTTGCCGTTTGCTAGAGAAATGCTACGTCA
GG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2H746JQB 735 0 0
CCACGGCCATGGGTCATTGATGACTTGGACAACTTTCAAGCTAGATGGCTCAAGAAGCCT
TGGAAGAAGGCTGTGATATTTGTTGACAACTCTGGTGCAGACATAATTTTGGGTATCTTG
CCGTTTGCTAGAGAAATGCTACGTCAAGGAATGCAGGTGGTGCTGGCTGCTAATGAGCTT
CCATCTATCAATGATGTCACTTATACCGAGCTTGCAGAGATCTTGTCCAAGCTTAAGGAT
GAAAATGGACAACTGATGGGTGTTGATATCTCGAATCTTCTGATTGCAAACTCTGGGAAT
GACCTACCGGTTATTGATCTGGCAAGAGTATCACAGGAGGTTGCATACCTCTCGACCGAT
GCAGACTTGGTCATCTTAGAAGGCATGGGACGTGGAATAGAGACAAACCTTTATGCTCAG
TTCAAGTGTGATTCCCTCAAGATTGGAATGGTGAAGCATCCAGAGGTAGCACAGTTTCTG
GGAGGACGGCTTTATGACTGCGTCATCAAATACAATGAAGTTCAGAGCTGATTGTATTCC
ACAACCTACATTTTTTCACAGAACCAAGCCAAACAGTTTATTATGTTAAAAACTGCTAGG
CTTTGTAAGTTTTAGTTTAAACTCCTCCCTCTACTCTCTATCTCTGCACTCAGATATAAG
AATTGGAAAACTCTTTCAACATTCTTGCTATGGTATTTGAGCATTTTAGAGGACTCCCAA
TGAAAGAAATATGAC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL5186Contig1 693 2 3 U
GGAGGGTTTCGAATTTAAAAAAGTTTAAGCGCGCGCGGCGGCGGCGAAGCCATGGTTCTC
AAGACTGAGCTTTGCCGATTCAGTGGTCACAAGATTTACCCAGGCAGGGGGATCAGATTC
ATCAGATCCGACTCTCAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCGAAATGTAAGCATTACTTTCAC
AATAAGTTGAAACCGTCCAAGCTTGCATGGACCGCCATGTACCGTAAACAGCACAAAAAG
GATGCTGCTCAAGAGGCTGTGAAAAAGAGGAGACGTGCAACAAAGAAGCCGTACTCTAGG
TCTATCGTTGGCGCTACTTTGGAGGTCATTCAAAAAAAGCGAGCAGAGAAGCCTGAAGTT
CGTGATGCAGCCAGAGAAGCTGCCCTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAG
GACGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAGAAGTCTCAAGTGAAG
GGTAATATTCCCAAGAGTGCTGCACCCAAGGCTGCTAAGTTGGGTGGTGGTGGTGGCAGA
CGTTGAATTGTGTTATAGAACTCATCTCTCTCTGCACTTACTTTCTTTAATTGTTTCGAC
CTCACAAGATTTTGAAGACCGTTTTGCACCTATCTAATATACTTTTTGACTCAGAGGTTT
CTTTATGCCGATAAAATTTGGGAACTTGGCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY09TFB U 285
AF RR2AY09JQ C 1
BS 1 284 RR2AY09JQ
BS 285 521 RR2AY09TFB
BS 522 693 RR2AY09JQ

RD RR2AY09TFB 237 0 0
GAAGCCGTACTCTAGGTCTATCGTTGGCGCTACTTTGGAGGTCATTCAAAAAAAGCGAGC
AGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGCAGCCAGAGAAGCTGCCCTACGTGACATTAAGGAGAG
AATCAAGAAGACTAAGGACGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACA
GAAGTCTCAAGTGAAGGGTAATATTCCCAAGAGTGCTGCACCCAAGGCTGCTAAGTT

QA 1 237 1 237
DS 

RD RR2AY09JQ 693 0 0
GGAGGGTTTCGAATTTAAAAAAGTTTAAGCGCGCGCGGCGGCGGCGAAGCCATGGTTCTC
AAGACTGAGCTTTGCCGATTCAGTGGTCACAAGATTTACCCAGGCAGGGGGATCAGATTC
ATCAGATCCGACTCTCAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCGAAATGTAAGCATTACTTTCAC
AATAAGTTGAAACCGTCCAAGCTTGCATGGACCGCCATGTACCGTAAACAGCACAAAAAG
GATGCTGCTCAAGAGGCTGTGAAAAAGAGGAGACGTGCAACAAAGAAGCCGTACTCTAGG
TCTATCGTTGGCGCTACTTTGGAGGTCATTCAAAAAAAGCGAGCAGAGAAGCCTGAAGTT
CGTGATGCAGCCAGAGAAGCTGCCCTACGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACTAAG
GACGAGAAGAAGGCAAAGAAGGCCGAGTTTGCTTCCAAGCAACAGAAGTCTCAAGTGAAG
GGTAATATTCCCAAGAGTGCTGCACCCAAGGCTGCTAAGTTGGGTGGTGGTGGTGGCAGA
CGTTGAATTGTGTTATAGAACTCATCTCTCTCTGCACTTACTTTCTTTAATTGTTTCGAC
CTCACAAGATTTTGAAGACCGTTTTGCACCTATCTAATATACTTTTTGACTCAGAGGTTT
CTTTATGCCGATAAAATTTGGGAACTTGGCTGC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL5187Contig1 1126 2 4 U
GGAGGCCGAAGATGTTCACTTTCAGCTCTCAACTGTACTCCAATGGTGGAATCATCTCTC
TGCCCCACAAGAACCAAAGCTCTCCGTCCAAAAAGCATCTCACTTTCTCCAAACCCTCGA
GAGTACAAGTCATATCCGCCGTCCAGTCCCGACCTTGCATCGACATCCACAAGGGGAAAG
TGAAACAAATAGTTGGATCCACTCTAAGCGACTTGAAGGAAGAAGATGGGTCGGCGGTCC
TCGTTACAAACTTCGAATCAGACAAGTCAGCGGAAGAGTATGCGAAGATGTACAGAGAAG
ATGAGCTCACGGGTGGTCACGTGATCATGCTTGGAGCTGACCCTTTAAGCCAAGCTGCAG
CTTTAGGAGCGTTACATGCTTATCCCGGCGGTTTGCAAGTTGGAGGTGGAATCAATGCAG
AGAATTGCTTGAGTTATATTGAGGAAGGAGCAAGTCATGTCATTGTTACTTCGTATGTGT
TCAATAATGGGAAGCTTGATCTTGAAAGACTGAAAGATCTTGTGAAGATTGTTGGGAAGC
AAAGACTGATCTTAGACCTTAACTGCAGAAAGAAGGATGGAAGAAGATACGCCATCGTTA
CTGATAGATGGCAGAAGTTCAGCGACGTCTTGCTTGATGAGGAATCACTGGAGTTTCTTG
GAGGGTTTGCTGATGAGTTTCTGGTGCATGGTGTTGATGTTGAAGGAAAGAAGCTAGGGA
TCGATGAAGAGCTTGTAGCATTGCTTGGCAACTATTCTCCGATTCCAGTAACGTATGCGG
GAGGCGTAACGGTGATGGATGATGTAGAGAGGATCAAAGAAGCTGGAAAGGGACGTGTGG
ATGTAACTGTAGGAAGTGCCTTGGACATTTTTGGGGGAAACCTACCTTACAAAGACGTTG
TCACTTGGCATCACAAGCAAGCAGCAGAACCCTCCTCCTCAACTCTCCACTAAAAGTCAC
CACCCCCATTTTTAGATTTCGATGTGTTTCTTCAATAAAAAGCGAATATCATCAAAAGAG
TAATTGGAGTTGTGATATACTTGCATGTCAGGCTTCTCCACTGAAACAGAATAAATTTTG
GATGATTCAGACATATATTTTGGAATGCCAATGCTCCATATATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC22TF U 1
AF RR2DC22JQ C 605
BS 1 705 RR2DC22TF
BS 706 706 RR2DC22JQ
BS 707 743 RR2DC22TF
BS 744 1126 RR2DC22JQ

RD RR2DC22TF 743 0 0
GGAGGCCGAAGATGTTCACTTTCAGCTCTCAACTGTACTCCAATGGTGGAATCATCTCTC
TGCCCCACAAGAACCAAAGCTCTCCGTCCAAAAAGCATCTCACTTTCTCCAAACCCTCGA
GAGTACAAGTCATATCCGCCGTCCAGTCCCGACCTTGCATCGACATCCACAAGGGGAAAG
TGAAACAAATAGTTGGATCCACTCTAAGCGACTTGAAGGAAGAAGATGGGTCGGCGGTCC
TCGTTACAAACTTCGAATCAGACAAGTCAGCGGAAGAGTATGCGAAGATGTACAGAGAAG
ATGAGCTCACGGGTGGTCACGTGATCATGCTTGGAGCTGACCCTTTAAGCCAAGCTGCAG
CTTTAGGAGCGTTACATGCTTATCCCGGCGGTTTGCAAGTTGGAGGTGGAATCAATGCAG
AGAATTGCTTGAGTTATATTGAGGAAGGAGCAAGTCATGTCATTGTTACTTCGTATGTGT
TCAATAATGGGAAGCTTGATCTTGAAAGACTGAAAGATCTTGTGAAGATTGTTGGGAAGC
AAAGACTGATCTTAGACCTTAACTGCAGAAAGAAGGATGGAAGAAGATACGCCATCGTTA
CTGATAGATGGCAGAAGTTCAGCGACGTCTTGCTTGATGAGGAATCACTGGAGTTTCTTG
GAGGGTTTGCTGATGAGTTTCTGGTGCATGGTGTTGATGTTGAAG*AAAGAAGCTAGGGA
TCGATGAAGAGCTTGTAGCATTG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2DC22JQ 522 0 0
TAGATGGCAGAAGTTCAGCGACGTCTTGCTTGATGAGGAATCACTGGAGTTTCTTGGAGG
GTTTGCTGATGAGTTTCTGGTGCATGGTGTTGATGTTGAAGGAAAGAAGCTAGGGATCGA
TGAAGAGCTTGTAGCATTGCTTGGCAACTATTCTCCGATTCCAGTAACGTATGCGGGAGG
CGTAACGGTGATGGATGATGTAGAGAGGATCAAAGAAGCTGGAAAGGGACGTGTGGATGT
AACTGTAGGAAGTGCCTTGGACATTTTTGGGGGAAACCTACCTTACAAAGACGTTGTCAC
TTGGCATCACAAGCAAGCAGCAGAACCCTCCTCCTCAACTCTCCACTAAAAGTCACCACC
CCCATTTTTAGATTTCGATGTGTTTCTTCAATAAAAAGCGAATATCATCAAAAGAGTAAT
TGGAGTTGTGATATACTTGCATGTCAGGCTTCTCCACTGAAACAGAATAAATTTTGGATG
ATTCAGACATATATTTTGGAATGCCAATGCTCCATATATAAA

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 2

CO CL5188Contig1 1075 2 2 U
TGCAATGGCTTCTTTCAATAATAACCTCAGCCTTGAAGCCTCTAGCCATGGCGGATTCTT
CCTCTTCTACCTTTCTCTCCCATCCTTCACTCTCCACTAGCATCTTATCCTCCAAAACTC
GCTCCTCCAACTTTTCTCTCCTCACCGGACGCACTAACCTACCCTTCTCCTTCACCAGCT
TCTCCCTCTCTCTCAACTCCAAAACCCACCTCAAAAAAATCCCCCTTTCTCTCCTCCCTC
GCCCAGACTTCGGATTGGGCTCAGCCAGACGGGGAGGAAAGCGGAGAGTTGAGCGCTTCG
GTCGCCGTTGAAGAGGAGAACGACCCTGAAGCCACGTTCTCGGAAGAAGAAGGAGGAGCT
GGCTATTTCCCGGAGCCACCGGAAGAAGCGAAGCTCTTCGTCGGAAACTTGGCTTACGAC
GTTGACAGCCAGGCCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCTGGTACTGTTGAAATCGCCGAG
GTTATCTACAATAGGGAAACCGATCAGAGTCGTGGATTTGGATTTGTGACTATGAGTACG
GTGGAAGAAGCTGAGACTGCTGTTGACAAGTTTAACCGTTATGATCTGAACGGACGGGCT
TTGACAGTAAACAAGGCAGCTCCAAGAGGCTCACGCCCAGAACGCCAACCTCGGGTATAC
GAGCCTGCATTCAGAGTCTACGTGGGAAACCTACCGTGGGATGTTGACAACGGTCGTCTA
GAGCAAGTATTCAGTGAGCATGGCAAAGTAGTGGAAGCTCGTGTGGTTTATTACCGTGAG
ACAGGCCGTTCACGTGGGTTCGGGTTTGTCACAATGTCTAACGAGACTGAACTCAACGAC
GCTATCGCTGCTCTTGATGGACAGAACATGGAGGGTAGAGCTATCAGAGTAAATGTAGCG
GAGGAGCGCCCTAGGCGATTTTAAGATTCATATCTCTTTGTACCCTTAACTCTCTTCACA
CCTCTTGTGGTTTGTTTAGACGAGATTCTTACACTCTTTTGGCGATTTTTTTTTGTTTGT
TTGAATTCTGAATGCGAAGCTTCTTCTAAAAGTAATTTATATGTGATGGTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET91TF U 1
AF RR2ET91JQ C 404
BS 1 536 RR2ET91TF
BS 537 1075 RR2ET91JQ

RD RR2ET91TF 536 0 0
TGCAATGGCTTCTTTCAATAATAACCTCAGCCTTGAAGCCTCTAGCCATGGCGGATTCTT
CCTCTTCTACCTTTCTCTCCCATCCTTCACTCTCCACTAGCATCTTATCCTCCAAAACTC
GCTCCTCCAACTTTTCTCTCCTCACCGGACGCACTAACCTACCCTTCTCCTTCACCAGCT
TCTCCCTCTCTCTCAACTCCAAAACCCACCTCAAAAAAATCCCCCTTTCTCTCCTCCCTC
GCCCAGACTTCGGATTGGGCTCAGCCAGACGGGGAGGAAAGCGGAGAGTTGAGCGCTTCG
GTCGCCGTTGAAGAGGAGAACGACCCTGAAGCCACGTTCTCGGAAGAAGAAGGAGGAGCT
GGCTATTTCCCGGAGCCACCGGAAGAAGCGAAGCTCTTCGTCGGAAACTTGGCTTACGAC
GTTGACAGCCAGGCCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCTGGTACTGTTGAAATCGCCGAG
GTTATCTACAATAGGGAAACCGATCAGAGTCGTGGATTTGGATTTGTGACTATGAG

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2ET91JQ 672 0 0
GAAACTTGGCTTACGACGTTGACAGCCAGGCCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCTGGTA
CTGTTGAAATCGCCGAGGTTATCTACAATAGGGAAACCGATCAGAGTCGTGGATTTGGAT
TTGTGACTATGAGTACGGTGGAAGAAGCTGAGACTGCTGTTGACAAGTTTAACCGTTATG
ATCTGAACGGACGGGCTTTGACAGTAAACAAGGCAGCTCCAAGAGGCTCACGCCCAGAAC
GCCAACCTCGGGTATACGAGCCTGCATTCAGAGTCTACGTGGGAAACCTACCGTGGGATG
TTGACAACGGTCGTCTAGAGCAAGTATTCAGTGAGCATGGCAAAGTAGTGGAAGCTCGTG
TGGTTTATTACCGTGAGACAGGCCGTTCACGTGGGTTCGGGTTTGTCACAATGTCTAACG
AGACTGAACTCAACGACGCTATCGCTGCTCTTGATGGACAGAACATGGAGGGTAGAGCTA
TCAGAGTAAATGTAGCGGAGGAGCGCCCTAGGCGATTTTAAGATTCATATCTCTTTGTAC
CCTTAACTCTCTTCACACCTCTTGTGGTTTGTTTAGACGAGATTCTTACACTCTTTTGGC
GATTTTTTTTTGTTTGTTTGAATTCTGAATGCGAAGCTTCTTCTAAAAGTAATTTATATG
TGATGGTTAAGC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL5189Contig1 909 2 2 U
GGGAAGCTTGGAATCTCACTGTTCAAGAATGAAATAATGAGGGTTTCCAACAGTTGTGAT
GAAGTGCTAGAAAGGGTTCTAGTGCAACACAAAGAGAAACAACCACAGAAGGAGGATCAA
GGAACAGATATGATGGATGTGTTGTTGGCAGCAGCTTATGAAGACAATAATGCTGAGTAC
AAGATCACTAGAAACCACATCAAGGCATTTTTTATGGAGCTTTTGTTTGGAGCCACTGAC
ACCTCTTCAACAACAATACTGTGGGCAATGGCTGAGATAATCAACAACCCCAACGTCCTT
GAGAAACTGAGAGAAGAACTCGATTCCGTTGTAGGGAAAACAAGGTTGATTCAAGAAACA
GATATACCAAACCTCCCTTATTTGCAAGCGGTGGTCAAGGAAACATTAAGGCTGCACCCT
CCTGCGCCTCTCTTGCCAAGAGAATTCCAAAAAGAGTGAGATCGGAGGATTCTATGTACC
GGAGAAGACAAGACTTGTAGTTAATGTTTATGATATAATGAGAGATCCTGGTCTTTGGGT
AGATCCTCTTAAATTTATGCCAGAGAGGTTTCTAGCTTCTTCAAAAACTGGCCAAGAAGA
TGAGAGAAAAGAGAAAGTACTAAAGTACCTTCCTTTTGGCAGCGGAAGGAGAGGATGTCC
TGGCTCAGCTCTAGGTTATGTCGTAGTGGGAACCGCAATAGGAGTGATAGTGCATGGTTT
TGAGTGGAGAATGGATGGAGATAAAGTCAATATGGAAGAGGTTATGGGAGGGGTCATCCT
AACCATGGCTCATCCACTTAAATTCATTCCCGTTACTCGATATGTACCCTTGCCGTAGAA
ATTAAACTGAATCCCATATATAATAAGCGTCTGGTAGATCCTTAAAAGTAATAAAGACAG
CTTGTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL77TF U 1
AF RR2DL77JQ C 434
BS 1 565 RR2DL77TF
BS 566 909 RR2DL77JQ

RD RR2DL77TF 565 0 0
GGGAAGCTTGGAATCTCACTGTTCAAGAATGAAATAATGAGGGTTTCCAACAGTTGTGAT
GAAGTGCTAGAAAGGGTTCTAGTGCAACACAAAGAGAAACAACCACAGAAGGAGGATCAA
GGAACAGATATGATGGATGTGTTGTTGGCAGCAGCTTATGAAGACAATAATGCTGAGTAC
AAGATCACTAGAAACCACATCAAGGCATTTTTTATGGAGCTTTTGTTTGGAGCCACTGAC
ACCTCTTCAACAACAATACTGTGGGCAATGGCTGAGATAATCAACAACCCCAACGTCCTT
GAGAAACTGAGAGAAGAACTCGATTCCGTTGTAGGGAAAACAAGGTTGATTCAAGAAACA
GATATACCAAACCTCCCTTATTTGCAAGCGGTGGTCAAGGAAACATTAAGGCTGCACCCT
CCTGCGCCTCTCTTGCCAAGAGAATTCCAAAAAGAGTGAGATCGGAGGATTCTATGTACC
GGAGAAGACAAGACTTGTAGTTAATGTTTATGATATAATGAGAGATCCTGGTCTTTGGGT
AGATCCTCTTAAATTTATGCCAGAG

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2DL77JQ 476 0 0
TGCCAAGAGAATTCCAAAAAGAGTGAGATCGGAGGATTCTATGTACCGGAGAAGACAAGA
CTTGTAGTTAATGTTTATGATATAATGAGAGATCCTGGTCTTTGGGTAGATCCTCTTAAA
TTTATGCCAGAGAGGTTTCTAGCTTCTTCAAAAACTGGCCAAGAAGATGAGAGAAAAGAG
AAAGTACTAAAGTACCTTCCTTTTGGCAGCGGAAGGAGAGGATGTCCTGGCTCAGCTCTA
GGTTATGTCGTAGTGGGAACCGCAATAGGAGTGATAGTGCATGGTTTTGAGTGGAGAATG
GATGGAGATAAAGTCAATATGGAAGAGGTTATGGGAGGGGTCATCCTAACCATGGCTCAT
CCACTTAAATTCATTCCCGTTACTCGATATGTACCCTTGCCGTAGAAATTAAACTGAATC
CCATATATAATAAGCGTCTGGTAGATCCTTAAAAGTAATAAAGACAGCTTGTTGTT

QA 1 476 1 476
DS 



AS 1 2

CO CL5190Contig1 955 2 2 U
AACAGAACAAGGACCCTGCTGTGGCTCATGTGGTTGACAGAAGTTATTCAATGCTTCGTC
CAGATAGGTATTTATTTTTTAATAGTCAGTCAGTCCATGGCTTGATCTGCGTTGAGAAAT
TAGGAAACCCTCAAATTTGGAACCCAACTACGAGGCGCTTCTCAACATTACCCATTCCCG
CACGTAGCTGGAGAGACGGCTCGGTGAGCTTTTTGGGATACGACCCGGTTGACTCTACAT
ACAAAGTACTGTCTATGCCTTGTGGTGGACGTTGTCGTCCTCGTCAGCCTCGGGCTCTTA
CACTGGGAGGAGACGGTCTATGGAGAGTCATCCAAGGTGTCCCTGAACATGCCCCTTTCC
GCCATGGAGCCCTATGTGTTAATGGGGTTCTGTATTATTTAGCCGCTCCCACTAGACCTG
AACATTATACTAATCAGTCTCTGGCCTGCTTCCATGTCAGATCTGAAAAGTTGAGTATGA
TTAAAGTACCATGGAATCTGACTTCTGGTTTTCGTTCCCTTGTACATTGTGGGAATAAGT
TAACTTGCGTTATTTCCCTAGGGGATGATATTAATATGTGGACCCTAGAGGATGCAGAGA
AACGCGAGTGGTCCCACAGACATGTTTGTTTACCTTTTCCTCGCCATGATCCAGTAACCA
AAACCCGGTTTACCTTAAAAGGTGTTAATGGTGCTGGTGAGTTTATGTATGTACCAAGAG
CTTTGGCGAATCCATTCCATATTATATATTTTGATCCAAAGGGAAACGGCTTCAGAAGAT
GCGTGGTTGATGGAGTTGCGGATGACCAATACAGGCGCCTGAATGGTTTGTGGGATGGAC
CTCTCAGGACCACCTCTGCTTATTCCAATCATGTGGAAACTCTCATGGCATTGTAAGATT
TTGTAAAATCAATATTTCTTTGTCTTCCTCACAATAATGGCACTTAATGTTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX74TFB U 1
AF RR2AX74JQ C 213
BS 1 337 RR2AX74TFB
BS 338 955 RR2AX74JQ

RD RR2AX74TFB 337 0 0
AACAGAACAAGGACCCTGCTGTGGCTCATGTGGTTGACAGAAGTTATTCAATGCTTCGTC
CAGATAGGTATTTATTTTTTAATAGTCAGTCAGTCCATGGCTTGATCTGCGTTGAGAAAT
TAGGAAACCCTCAAATTTGGAACCCAACTACGAGGCGCTTCTCAACATTACCCATTCCCG
CACGTAGCTGGAGAGACGGCTCGGTGAGCTTTTTGGGATACGACCCGGTTGACTCTACAT
ACAAAGTACTGTCTATGCCTTGTGGTGGACGTTGTCGTCCTCGTCAGCCTCGGGCTCTTA
CACTGGGAGGAGACGGTCTATGGAGAGTCATCCAAGG

QA 1 337 1 337
DS 

RD RR2AX74JQ 743 0 0
TTGGGATACGACCCGGTTGACTCTACATACAAAGTACTGTCTATGCCTTGTGGTGGACGT
TGTCGTCCTCGTCAGCCTCGGGCTCTTACACTGGGAGGAGACGGTCTATGGAGAGTCATC
CAAGGTGTCCCTGAACATGCCCCTTTCCGCCATGGAGCCCTATGTGTTAATGGGGTTCTG
TATTATTTAGCCGCTCCCACTAGACCTGAACATTATACTAATCAGTCTCTGGCCTGCTTC
CATGTCAGATCTGAAAAGTTGAGTATGATTAAAGTACCATGGAATCTGACTTCTGGTTTT
CGTTCCCTTGTACATTGTGGGAATAAGTTAACTTGCGTTATTTCCCTAGGGGATGATATT
AATATGTGGACCCTAGAGGATGCAGAGAAACGCGAGTGGTCCCACAGACATGTTTGTTTA
CCTTTTCCTCGCCATGATCCAGTAACCAAAACCCGGTTTACCTTAAAAGGTGTTAATGGT
GCTGGTGAGTTTATGTATGTACCAAGAGCTTTGGCGAATCCATTCCATATTATATATTTT
GATCCAAAGGGAAACGGCTTCAGAAGATGCGTGGTTGATGGAGTTGCGGATGACCAATAC
AGGCGCCTGAATGGTTTGTGGGATGGACCTCTCAGGACCACCTCTGCTTATTCCAATCAT
GTGGAAACTCTCATGGCATTGTAAGATTTTGTAAAATCAATATTTCTTTGTCTTCCTCAC
AATAATGGCACTTAATGTTTACG

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL5191Contig1 1355 2 2 U
GGATCGATCATTGACCGAAAAAAAGAAGAAGAATCGATCATCTCTCTCAATCAAACTTCT
GGTGATTCCTTAATCACGCTTTACCTTCGTCACGATCTGAGATCTGTAAGAAGACTACTC
GCCAAGCTCCGAAAATTCGGATATATCCTTTGCTGATTGACTCACACGATGGAGAGTGTA
GTACATGAGAACGAATCTTCGGATCAATCGAAAGAGACACAAACATCGCTTATAAGCGGA
GTCCCTGACGATATTTTGAATCTCTGCTTAGCTAGAGTTCCTAGAGAACACCACATGGCC
ATGAAATGCGTTTCCAGAGATGGAGAGATTCCATCTGCAGTGATGGCTTCTGTGATTATC
GCAGCAAGTCTAACTTGGCTGAGTCTTGGATCTACGCCTTGTGCCGCCACACATCAGGCC
GTGTCTACTTGCACGTGCTGATTCCTTCGAGAAGGTCATGGAGAAGAGTCAGTCAGATTC
CTCGGCATATCACTTTTAGAGACGGTATGGGTTTTGCAGTGTTGGGTAAGAGACTGTTTG
TGTTGGGTGGGTGTGGCTGGGTGGAAGATGCTAGTGATGATGTTTATTGCTATGATGCTG
CTATGAACACTTGGCCTCACTTACTCCCTCCTCTTTCAACTAAAAGATGCTTCTTTGCTT
GTGAGACGCTGGATGGGAAAGTCATGGCTATTGGTGGGTTAGGTGTGAACTCAAGAGCTT
CACAGACTTGGGACATCTATGATCCTATAACGAGAGAATGTGTATCATGTTCAGACGCGA
GTATTGTCCCTGAAATCGAGGATTCATTTGTGATGGATGGGAAGGTTTATGTTCGTGGTG
CTGCTGGATCTTCAGCTGCAGTCTATGATGGGTCTACCAAGGTTTGGGAACGAGTGGACG
ATGATATGGCATCAGGATGGCTAGGTCCAGCAGTTGTTGTAGGAGATGATCTCTATGTTT
TGGATCAGAGTTTTGGAGCTACGCTTACAATGTGGTGCAAGGAGCCGAGGATGTGGATTC
GTATAGGGAAACTATCTCAGTTTGTGATGACGCAGCAATGTCGGCTTGTTTGTGTTGGGA
GTAATATATTTGTGATTGGTAAAGATTGCTCTACTGTGGTGATTGATGTGGAGAATGCGT
GGAAGACAACGATGAATGGAGTAATGGTGTGTTCTTCTATACCCAAGACTTGGGATGATC
ATATTTATGTTATTAGCTGTAAATCTATAGCTATATAGTGTTTTAACACTCTACTGTTGA
ACCTTGCAAACTGTTTCTGTTGCTCGTGTAAAATCACAAGCCTGTCTGCCTGTGTGAATC
ATGCGATACTGTAACAGCCAGCTTCGTCGTCCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F048TF U 1
AF RR2F048JQ C 678
BS 1 734 RR2F048TF
BS 735 1355 RR2F048JQ

RD RR2F048TF 734 0 0
GGATCGATCATTGACCGAAAAAAAGAAGAAGAATCGATCATCTCTCTCAATCAAACTTCT
GGTGATTCCTTAATCACGCTTTACCTTCGTCACGATCTGAGATCTGTAAGAAGACTACTC
GCCAAGCTCCGAAAATTCGGATATATCCTTTGCTGATTGACTCACACGATGGAGAGTGTA
GTACATGAGAACGAATCTTCGGATCAATCGAAAGAGACACAAACATCGCTTATAAGCGGA
GTCCCTGACGATATTTTGAATCTCTGCTTAGCTAGAGTTCCTAGAGAACACCACATGGCC
ATGAAATGCGTTTCCAGAGATGGAGAGATTCCATCTGCAGTGATGGCTTCTGTGATTATC
GCAGCAAGTCTAACTTGGCTGAGTCTTGGATCTACGCCTTGTGCCGCCACACATCAGGCC
GTGTCTACTTGCACGTGCTGATTCCTTCGAGAAGGTCATGGAGAAGAGTCAGTCAGATTC
CTCGGCATATCACTTTTAGAGACGGTATGGGTTTTGCAGTGTTGGGTAAGAGACTGTTTG
TGTTGGGTGGGTGTGGCTGGGTGGAAGATGCTAGTGATGATGTTTATTGCTATGATGCTG
CTATGAACACTTGGCCTCACTTACTCCCTCCTCTTTCAACTAAAAGATGCTTCTTTGCTT
GTGAGACGCTGGATGGGAAAGTCATGGCTATTGGTGGGTTAGGTGTGAACTCAAGAGCTT
CACAGACTTGGGAC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2F048JQ 678 0 0
AAAGTCATGGCTATTGGTGGGTTAGGTGTGAACTCAAGAGCTTCACAGACTTGGGACATC
TATGATCCTATAACGAGAGAATGTGTATCATGTTCAGACGCGAGTATTGTCCCTGAAATC
GAGGATTCATTTGTGATGGATGGGAAGGTTTATGTTCGTGGTGCTGCTGGATCTTCAGCT
GCAGTCTATGATGGGTCTACCAAGGTTTGGGAACGAGTGGACGATGATATGGCATCAGGA
TGGCTAGGTCCAGCAGTTGTTGTAGGAGATGATCTCTATGTTTTGGATCAGAGTTTTGGA
GCTACGCTTACAATGTGGTGCAAGGAGCCGAGGATGTGGATTCGTATAGGGAAACTATCT
CAGTTTGTGATGACGCAGCAATGTCGGCTTGTTTGTGTTGGGAGTAATATATTTGTGATT
GGTAAAGATTGCTCTACTGTGGTGATTGATGTGGAGAATGCGTGGAAGACAACGATGAAT
GGAGTAATGGTGTGTTCTTCTATACCCAAGACTTGGGATGATCATATTTATGTTATTAGC
TGTAAATCTATAGCTATATAGTGTTTTAACACTCTACTGTTGAACCTTGCAAACTGTTTC
TGTTGCTCGTGTAAAATCACAAGCCTGTCTGCCTGTGTGAATCATGCGATACTGTAACAG
CCAGCTTCGTCGTCCACT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL5192Contig1 962 2 4 U
GGATTTTCTCTTTTGTAATAATTTCGTAAAGAAGAACTCTTTTTAAAAAAAGTCGCTTCT
TTTTTTCTCCTTCACTGGAGACTCCAAAACAGTCAATCAAAAAGCCATTGATTCTCTTCT
TCTCTCTCACTATTGTTTTGTGTTCTTCAAGATTTTCTTTCAAAAAAGAAGAGCACACCT
AGCTATGTCGTCGACAAACGGAGGTGGTTTCAAGTGTTTTTCACCGGAGAACACAAACTG
GATTTTTCAAGAAGTCAAAGATGTCGTGTGGACGGTGGAGGAAAACAAACGTTTCGAGAA
AGCCCTCGTCTTTATTGACGACAAAGAAGACGTAGAGAGCTGGTCGAAGATCGCCGCTTT
GATCCCGGGGAAAACCGTATATGACGTCATTAAACGATACAAGAAAGAACGGAAGAAAGG
AGTTCCATGGACCGAGGAAGAACACCGACGATTTCTAATGGGTCTGAGGAAATATGGAGA
AGGAGATTGGCGAAACATTGCAAGAAACTTTGTGACAACTCGAACGCCGACGCAAGTTGC
TTCGCACGCTCAAAAATATTTCATTCGACAGCTTACGGATTGTAAAGACAAACGGCGGTC
AAGCATTCACGACATCACAACCGTTAACGTCCCCGAGGCAAACGCACCAACAACCACCAC
ACCCGCCGCTGCAACAGTCTCTCTTACTCCAGCCACTCCTTTTGACGTTTTCCTTCCAAA
GCCTCATCACAGTTTCGCGTTTTCGCCTGCGTCTAGTTATCATAACGCGTTTCCGCAGTG
GAGTTAAAAATCATATATAAATCTAGAGCTTGCCTCATATATTGTTATATATGTTTTCTA
CGCCTATCCAATTATTCATGCAGGATTTTGTAAATATTTGTAAATAACTTTTAAAGTTTG
TGTGATCATGCAAATATAGGTTTTGATTGATTGTAATTTCCAGTTAAGCAAGTTTATATT
AC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2EN27TF U 1
AF RR2EN27JQ C 248
BS 1 363 RR2EN27TF
BS 364 364 RR2EN27JQ
BS 365 383 RR2EN27TF
BS 384 962 RR2EN27JQ

RD RR2EN27TF 383 0 0
GGATTTTCTCTTTTGTAATAATTTCGTAAAGAAGAACTCTTTTTAAAAAAAGTCGCTTCT
TTTTTTCTCCTTCACTGGAGACTCCAAAACAGTCAATCAAAAAGCCATTGATTCTCTTCT
TCTCTCTCACTATTGTTTTGTGTTCTTCAAGATTTTCTTTCAAAAAAGAAGAGCACACCT
AGCTATGTCGTCGACAAACGGAGGTGGTTTCAAGTGTTTTTCACCGGAGAACACAAACTG
GATTTTTCAAGAAGTCAAAGATGTCGTGTGGACGGTGGAGGAAAACAAACGTTTCGAGAA
AGCCCTCGTCTTTATTGACGACAAAGAAGACGTAGAGAGCTGGTCGAAGATCGCCGCTTT
GATTCCGGGGAAAACCGTATATG

QA 1 383 1 383
DS 

RD RR2EN27JQ 715 0 0
CAAGAAGTCAAAGATGTCGTGTGGACGGTGGAGGAAAACAAACGTTTCGAGAAAGCCCTC
GTCTTTATTGACGACAAAGAAGACGTAGAGAGCTGGTCGAAGATCGCCGCTTTGATCCCG
GGGAAAACCGTATATGACGTCATTAAACGATACAAGAAAGAACGGAAGAAAGGAGTTCCA
TGGACCGAGGAAGAACACCGACGATTTCTAATGGGTCTGAGGAAATATGGAGAAGGAGAT
TGGCGAAACATTGCAAGAAACTTTGTGACAACTCGAACGCCGACGCAAGTTGCTTCGCAC
GCTCAAAAATATTTCATTCGACAGCTTACGGATTGTAAAGACAAACGGCGGTCAAGCATT
CACGACATCACAACCGTTAACGTCCCCGAGGCAAACGCACCAACAACCACCACACCCGCC
GCTGCAACAGTCTCTCTTACTCCAGCCACTCCTTTTGACGTTTTCCTTCCAAAGCCTCAT
CACAGTTTCGCGTTTTCGCCTGCGTCTAGTTATCATAACGCGTTTCCGCAGTGGAGTTAA
AAATCATATATAAATCTAGAGCTTGCCTCATATATTGTTATATATGTTTTCTACGCCTAT
CCAATTATTCATGCAGGATTTTGTAAATATTTGTAAATAACTTTTAAAGTTTGTGTGATC
ATGCAAATATAGGTTTTGATTGATTGTAATTTCCAGTTAAGCAAGTTTATATTAC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL5193Contig1 1648 2 4 U
GATACTTCGATCCTTTCAGATCTCCACCGTTTCTTCTCTTTCTTGTAAAGCTTCATCAGG
TGTCTTTTCTGATCTTCTCTCTCGTCACTACAAAACCCTTGTCTAAGATCAAGATTGCTT
TGAATCTCGATTCTGGAGTTCCCGTTGATTAGCGTCATCTTCCGTATCTGTTGACTTCTC
CCTGTTACATCTGCTTGTATTGCCTTTGACTGATGTGGAGGAAGAGAAAGAGGGTTTCCC
TGATGGCATGAGGGGGATATGTTAATAACAACTTTGATGAAACTTTTGAGCGCTTGTCTG
TGGCCTTCTTCATCATCGGGCAGGTCCGTTGATTCAACTGGAAAACATGATGGACTCCTC
TGGTACAAAGACTCTGGTCAGCGCCTACTCGGTGACTTCTCTATGGCTGTTGTTCAGGCC
AACAATCTCCTCGAGGATCAGAGCCAAGTCGAGTCTGGCCCTTTGAGTACCCTTGACTCT
GGTTCTGGTCCTTATGGTACTTTTATTGGAATCTATGACGGTCATGGGGGGCCTGAGACC
TCCCGCTTTGTCAATGATCATCTCTTTCAGCATTTAAAGAGGTTTGCAGCGGAGCAGGGG
TGTATGTCTATGGATGTGATTAGAAAGGCGTATGAAGCTACTGAAGAAGGGTTTCTTGGG
GTTGTGACAAAGCAGTGGCCGGTTAAGCCACTGATTGCAGCGGTTGGGTCTTGCTGCCTT
GTGGGTGTTATATGCGGAGGGATGCTCTACATAGCTAACGTTGGGGATTCACGTGCTGTC
CTTGGGAGGGCTATGAAGGCGACTGGTGAGGCTATTGCGCTTCAGCTCTCAGCTGAACAT
AATGTGAGCATCGAGTCTGTTAGACAGGAGATGCACTCCTTGCACCCGGATGACTCGCAT
ATTGTCGTGTTGAAGCACAATGTGTGGCGCGTTAAGGGCCTTATTCAGGTATCTAGATCC
ATAGGAGACATGTATCTTAAGAAGGCGGAGTTCAACAGGGAACCGTTGTACACGAAGTAT
AGACTCAGAGAGCCGATCAAAAGACCAATCTTGAGTGGGGAACCGTCGATAACAGAGCAT
GAGCTCCAACCACAAGATCAGTTTCTTATATTTGCTTCTGGTGGACTATGGGAACAGCTT
AGCAACCAAGAAGCTGTTGACATCGTTCAGAACCACCCACGAAACGGGATAGCACGTAGA
CTGGTGAAGATGGCAATGCAAGCGGCAGCGAAGAAGAGAGAAATGAGATACTCTGATCTG
ATGGAGATAGAGAGAGGCGTGAGGAGGCATTTCCACGATGACATCACTGTGGTAGTCATC
TACCTTGATACCAATGTAGTCAGCTCTGCCAAAGGACCTTCTCTTTCTATCCGAGGCCGC
GGTATGACTTTCCCCAAGAAACTCTAAAGCTACTCACTCCCACGCTTTAGGTTCCCCATC
TTTTGTAGTTATTTACAAAAATATATATATATCTATCTATCACTCTTTGTTGGTATAAAA
GAATGTATAATTTTAACGTGAAAGGTCACACACACGTTTGGAACCGAACCCATTCCGGTA
ATTATTGATTTTTATTTGTTCAACAAGACTTGTGTGTAATGATGTAATTGTTGTTGATGG
ATGAATGAATGTAGTAAGCCTTTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE54TF U 1
AF RR2BE54JQ C 741
BS 1 860 RR2BE54TF
BS 861 861 RR2BE54JQ
BS 862 882 RR2BE54TF
BS 883 1648 RR2BE54JQ

RD RR2BE54TF 882 0 0
GATACTTCGATCCTTTCAGATCTCCACCGTTTCTTCTCTTTCTTGTAAAGCTTCATCAGG
TGTCTTTTCTGATCTTCTCTCTCGTCACTACAAAACCCTTGTCTAAGATCAAGATTGCTT
TGAATCTCGATTCTGGAGTTCCCGTTGATTAGCGTCATCTTCCGTATCTGTTGACTTCTC
CCTGTTACATCTGCTTGTATTGCCTTTGACTGATGTGGAGGAAGAGAAAGAGGGTTTCCC
TGATGGCATGAGGGGGATATGTTAATAACAACTTTGATGAAACTTTTGAGCGCTTGTCTG
TGGCCTTCTTCATCATCGGGCAGGTCCGTTGATTCAACTGGAAAACATGATGGACTCCTC
TGGTACAAAGACTCTGGTCAGCGCCTACTCGGTGACTTCTCTATGGCTGTTGTTCAGGCC
AACAATCTCCTCGAGGATCAGAGCCAAGTCGAGTCTGGCCCTTTGAGTACCCTTGACTCT
GGTTCTGGTCCTTATGGTACTTTTATTGGAATCTATGACGGTCATGGGGGGCCTGAGACC
TCCCGCTTTGTCAATGATCATCTCTTTCAGCATTTAAAGAGGTTTGCAGCGGAGCAGGGG
TGTATGTCTATGGATGTGATTAGAAAGGCGTATGAAGCTACTGAAGAAGGGTTTCTTGGG
GTTGTGACAAAGCAGTGGCCGGTTAAGCCACTGATTGCAGCGGTTGGGTCTTGCTGCCTT
GTGGGTGTTATATGCGGAGGGATGCTCTACATAGCTAACGTTGGGGATTCACGTGCTGTC
CTTGGGAGGGCTATGAAGGCGACTGGTGAGGCTATTGCGCTTCAGCTCTCAGCTGAACAT
AATGTGAGCATCGAGTCTGT*AGACAGGAGATGCACTCCTTG

QA 1 882 1 882
DS 

RD RR2BE54JQ 908 0 0
GATGCTCTACATAGCTAACGTTGGGGATTCACGTGCTGTCCTTGGGAGGGCTATGAAGGC
GACTGGTGAGGCTATTGCGCTTCAGCTCTCAGCTGAACATAATGTGAGCATCGAGTCTGT
TAGACAGGAGATGCACTCCTTGCACCCGGATGACTCGCATATTGTCGTGTTGAAGCACAA
TGTGTGGCGCGTTAAGGGCCTTATTCAGGTATCTAGATCCATAGGAGACATGTATCTTAA
GAAGGCGGAGTTCAACAGGGAACCGTTGTACACGAAGTATAGACTCAGAGAGCCGATCAA
AAGACCAATCTTGAGTGGGGAACCGTCGATAACAGAGCATGAGCTCCAACCACAAGATCA
GTTTCTTATATTTGCTTCTGGTGGACTATGGGAACAGCTTAGCAACCAAGAAGCTGTTGA
CATCGTTCAGAACCACCCACGAAACGGGATAGCACGTAGACTGGTGAAGATGGCAATGCA
AGCGGCAGCGAAGAAGAGAGAAATGAGATACTCTGATCTGATGGAGATAGAGAGAGGCGT
GAGGAGGCATTTCCACGATGACATCACTGTGGTAGTCATCTACCTTGATACCAATGTAGT
CAGCTCTGCCAAAGGACCTTCTCTTTCTATCCGAGGCCGCGGTATGACTTTCCCCAAGAA
ACTCTAAAGCTACTCACTCCCACGCTTTAGGTTCCCCATCTTTTGTAGTTATTTACAAAA
ATATATATATATCTATCTATCACTCTTTGTTGGTATAAAAGAATGTATAATTTTAACGTG
AAAGGTCACACACACGTTTGGAACCGAACCCATTCCGGTAATTATTGATTTTTATTTGTT
CAACAAGACTTGTGTGTAATGATGTAATTGTTGTTGATGGATGAATGAATGTAGTAAGCC
TTTCCTCC

QA 1 908 1 908
DS 



AS 1 2

CO CL5194Contig1 1330 2 2 U
GGATAAACTCATCTCTTCTTCTCCTACCTTTCATCAATCATCATCATCACTCTCTCTTTC
TCCCCTCAACCTAAAAAGAGAAAAGCTTCCTCTACAATTCTCGACTTTGCATCTGTACAG
AGGATGCCAGCGACGGATTTTCACGGAACATTCGGGAGGTCGTTGCTAAGTTTCCGGCGA
GACCAAGTTGACTCCAACGCAGCCAGTCACAACAACAACATGGAAGTCGAGCTAGATTCT
TTCCAGAGACAAGTCGCAGAGAAGTTCACCGATCTCAACGCCTCCTCCTCCGGCGACGAC
CTTCTCTCTCTCGAATGGATCGGAAAGCTTCTGGACTCGTTCCTCTGCTGCCAAGAGGAG
TTCCGAGCCATCGTCTTCAACCACCGCTCTCAGATCTCCGCGTCATCATCTCCGACGAAC
CGTCTCGTCTCCGATTACTTCGAGCGGAGCATCAAAGCCCTCGACGTCTGCAACGCGATC
CGCGACGGCGTCGAGCAGATCCGCCAGTGGCAGAAGCTCTCCGACATCGTGATCTCGGCG
CTAGACAGCCGCCGCGCCAACGTCGGAGAAGGTCAGCTCCGGCGAGCGAAGAAGGCTCTT
GTCGATCTAGCGATCGGGATGCTCGACGAGAAAGATTCCACGAGGCTGGCTCATCGCAAC
CGTTCGTTCGGGAGAGTCAAAGACAGCCACAATCACCGTTCGATGGGAGGACACTTGAGA
TCTCTCTCGTGGAGCGTCTCGAGGTCGTGGTCAGCTTCCAAGCAGTTACAAGCCTTGGCG
AGCAATTTAACGACGCCGAGACAGAACGACGTCGGTTTAGCCGTACCGGTTTATACCATG
ACGTCGGTTTTGTTGTTCGTGATGTGGGTTTTGGTGGCTGCGATTCCTTGTCAGGATCGT
GGGCTGCAGGTTAGTTTCTCGTGCCAAGGCAGTTCCGTTGGGCGGCTCCGGTTATGTCGT
TGCACGACAAGATCGTGGAGGAATCGAAGAGGAGAGACAGGAAGAATTGTTGTGGGTTGC
TTAAAGAGATTGGTCGGATTGAGAGGAGTTCGAGGGTGATGAACGAATTGATCGATTCGA
TTCAGTTCCCGATGAGTGAGGAGAAGGAGATTGAGGTGAAACAGAGAGTGGAGGAGCTTG
TGGAGGTTCACGAGGCTTTGAAAAATGGGTTGGATCCGTTTGAGAGGAAAGTAAGAGAAG
TTTTCCATCGGATTGTGAGAAGCAGAACCGAGAGTCTTGATTCTCTTTGTTAATGGGTCT
TGTCCTGAACATGTTTGTTTGTCCTAATATGATGTTTCATATTCGGATTTTTTTTTGTTT
TGGTCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A006TF U 1
AF RR2A006JQ C 515
BS 1 663 RR2A006TF
BS 664 1330 RR2A006JQ

RD RR2A006TF 663 0 0
GGATAAACTCATCTCTTCTTCTCCTACCTTTCATCAATCATCATCATCACTCTCTCTTTC
TCCCCTCAACCTAAAAAGAGAAAAGCTTCCTCTACAATTCTCGACTTTGCATCTGTACAG
AGGATGCCAGCGACGGATTTTCACGGAACATTCGGGAGGTCGTTGCTAAGTTTCCGGCGA
GACCAAGTTGACTCCAACGCAGCCAGTCACAACAACAACATGGAAGTCGAGCTAGATTCT
TTCCAGAGACAAGTCGCAGAGAAGTTCACCGATCTCAACGCCTCCTCCTCCGGCGACGAC
CTTCTCTCTCTCGAATGGATCGGAAAGCTTCTGGACTCGTTCCTCTGCTGCCAAGAGGAG
TTCCGAGCCATCGTCTTCAACCACCGCTCTCAGATCTCCGCGTCATCATCTCCGACGAAC
CGTCTCGTCTCCGATTACTTCGAGCGGAGCATCAAAGCCCTCGACGTCTGCAACGCGATC
CGCGACGGCGTCGAGCAGATCCGCCAGTGGCAGAAGCTCTCCGACATCGTGATCTCGGCG
CTAGACAGCCGCCGCGCCAACGTCGGAGAAGGTCAGCTCCGGCGAGCGAAGAAGGCTCTT
GTCGATCTAGCGATCGGGATGCTCGACGAGAAAGATTCCACGAGGCTGGCTCATCGCAAC
CGT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2A006JQ 816 0 0
AAGCTCT
CGACATCGTGATCTCG*CGCTAGACAGCCGCCGCGCCAACGTCGGAGAAGGTCAGCTCCG
GCGAGCGAAGAAGGCTCT*GTCGATCTAGCGATCGGGATGCTCGACGAGAAAGATTCCAC
GAGGCTGGCTCATCGCAACCGTTCGTTCGGGAGAGTCAAAGACAGCCACAATCACCGTTC
GATGGGAGGACACTTGAGATCTCTCTCGTGGAGCGTCTCGAGGTCGTGGTCAGCTTCCAA
GCAGTTACAAGCCTTGGCGAGCAATTTAACGACGCCGAGACAGAACGACGTCGGTTTAGC
CGTACCGGTTTATACCATGACGTCGGTTTTGTTGTTCGTGATGTGGGTTTTGGTGGCTGC
GATTCCTTGTCAGGATCGTGGGCTGCAGGTTAGTTTCTCGTGCCAAGGCAGTTCCGTTGG
GCGGCTCCGGTTATGTCGTTGCACGACAAGATCGTGGAGGAATCGAAGAGGAGAGACAGG
AAGAATTGTTGTGGGTTGCTTAAAGAGATTGGTCGGATTGAGAGGAGTTCGAGGGTGATG
AACGAATTGATCGATTCGATTCAGTTCCCGATGAGTGAGGAGAAGGAGATTGAGGTGAAA
CAGAGAGTGGAGGAGCTTGTGGAGGTTCACGAGGCTTTGAAAAATGGGTTGGATCCGTTT
GAGAGGAAAGTAAGAGAAGTTTTCCATCGGATTGTGAGAAGCAGAACCGAGAGTCTTGAT
TCTCTTTGTTAATGGGTCTTGTCCTGAACATGTTTGTTTGTCCTAATATGATGTTTCATA
TTCGGATTTTTTTTTGTTTTGGTCTTTTT

QA 8 816 8 816
DS 



AS 1 2

CO CL5195Contig1 1258 2 2 U
GGACCTCTCAAATCTCGAGTCTTGCCCAAACGAAAAGGACATGACAGGCTCGATCTCAAC
CTCATGGCTTTTGTTGTCTCCTCCGAATCCAAAATCCATCGCCATGCAAAGTCCATCTCT
TTCCCGCCCCGAGTTCGACTCTCATCGAGATCTCCGTCACCCTCAACAACCCAAATCCGA
GCCGGAATCCGCGAGCTACGAGAACGAATCGACACCGTAAAAAACACTCAGAAGATCACA
GAAGCGATGAAACTCGTGGCGGCGGCTAGGGTTCGCCGAGCTCAAGAAGCTGTCATCAAT
TGCAGACCTTTCACCGAGACCCTCGTCGGAATCCTCCACTCCATCAACCAGTGCGCTCAA
TCGGAAGACATAGACTTCCCTCTGAGCAACGTCAGACCCGTAAAGAGAGTCGCTTTGGTC
GTCGTCACAGGTGACAAAGGCTTGTGCGGCGGTTTCAACAACGCAGTGATCAAGAAAGCT
AACTCGCGGGTCGACGAGTTGAAGCAGAGAGGTGTAAGCTGCGTTGTGGTGGGCGTAGGG
AAGAAAGGGTACGCTTACTTTAGTCGTAGAGATGATGTTGAAGTGGACAAGTGTATCGAA
GGAGGAGGTGTTTACCCGACGGCTAAAGAAGCTCAGGTTATAGCAGACGACGTGTTCTCA
TTGTTCGTGAGCGAGGAGTTTGATAAAGTCGAGCTCGTGTACACAAAGTTCGTGTCTTTG
GTGAAATCCGATCCTGTGATCCACACTCTGTTACCGTTGTCTGTCAAAGGAGAGTCTCGC
GACGTGAACGGAGAGTGTGTTGACGCTATGGAGGATGAGATGTTTAGGCTGACGAGCAAA
GACGGGAAGCTCGCTGTGGAGAGGACGAAAGTTGAGGTTGTTGAGAGACCGGAGATGATC
TCGCCGTTGATGCAGTTTGAGCAAGACCCTGTTCAGATTCTCGACGCGATGATGCCTTTG
TATTTGAACAGTCAGATTCTGAGAGCGTTGCAGGAGTCTTTGGCGAGTGAGCTTGCCTCG
AGGATGAGTGCTATGAGCAATGCGACGGATAATGCGGTTGAGTTGAAGAAGAGTCTGACG
GTTGCTTATAATCGGGAGAGACAGGCTAAGATCACTGGGGAGTTGCTGGAAATTGTGGCT
GGTGCCGAAGCACTTCGAGGGACTTAGTTAGGAGAAAACTATATTTTTGTTAAAACCATT
TGTTGTTTGTGTAACAATGTCATGAAAGAATAAAAACATCGACAAAACACTGATACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H821TF U 1
AF RR2H821JQ C 509
BS 1 632 RR2H821TF
BS 633 1258 RR2H821JQ

RD RR2H821TF 632 0 0
GGACCTCTCAAATCTCGAGTCTTGCCCAAACGAAAAGGACATGACAGGCTCGATCTCAAC
CTCATGGCTTTTGTTGTCTCCTCCGAATCCAAAATCCATCGCCATGCAAAGTCCATCTCT
TTCCCGCCCCGAGTTCGACTCTCATCGAGATCTCCGTCACCCTCAACAACCCAAATCCGA
GCCGGAATCCGCGAGCTACGAGAACGAATCGACACCGTAAAAAACACTCAGAAGATCACA
GAAGCGATGAAACTCGTGGCGGCGGCTAGGGTTCGCCGAGCTCAAGAAGCTGTCATCAAT
TGCAGACCTTTCACCGAGACCCTCGTCGGAATCCTCCACTCCATCAACCAGTGCGCTCAA
TCGGAAGACATAGACTTCCCTCTGAGCAACGTCAGACCCGTAAAGAGAGTCGCTTTGGTC
GTCGTCACAGGTGACAAAGGCTTGTGCGGCGGTTTCAACAACGCAGTGATCAAGAAAGCT
AACTCGCGGGTCGACGAGTTGAAGCAGAGAGGTGTAAGCTGCGTTGTGGTGGGCGTAGGG
AAGAAAGGGTACGCTTACTTTAGTCGTAGAGATGATGTTGAAGTGGACAAGTGTATCGAA
GGAGGAGGTGTTTACCCGACGGCTAAAGAAGC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2H821JQ 750 0 0
GAGGTGTAAGCTGCGTTGTGGTGGGCGTAGGGAAGAAAGGGTACGCTTACTTTAGTCGTA
GAGATGATGTTGAAGTGGACAAGTGTATCGAAGGAGGAGGTGTTTACCCGACGGCTAAAG
AAGCTCAGGTTATAGCAGACGACGTGTTCTCATTGTTCGTGAGCGAGGAGTTTGATAAAG
TCGAGCTCGTGTACACAAAGTTCGTGTCTTTGGTGAAATCCGATCCTGTGATCCACACTC
TGTTACCGTTGTCTGTCAAAGGAGAGTCTCGCGACGTGAACGGAGAGTGTGTTGACGCTA
TGGAGGATGAGATGTTTAGGCTGACGAGCAAAGACGGGAAGCTCGCTGTGGAGAGGACGA
AAGTTGAGGTTGTTGAGAGACCGGAGATGATCTCGCCGTTGATGCAGTTTGAGCAAGACC
CTGTTCAGATTCTCGACGCGATGATGCCTTTGTATTTGAACAGTCAGATTCTGAGAGCGT
TGCAGGAGTCTTTGGCGAGTGAGCTTGCCTCGAGGATGAGTGCTATGAGCAATGCGACGG
ATAATGCGGTTGAGTTGAAGAAGAGTCTGACGGTTGCTTATAATCGGGAGAGACAGGCTA
AGATCACTGGGGAGTTGCTGGAAATTGTGGCTGGTGCCGAAGCACTTCGAGGGACTTAGT
TAGGAGAAAACTATATTTTTGTTAAAACCATTTGTTGTTTGTGTAACAATGTCATGAAAG
AATAAAAACATCGACAAAACACTGATACTC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5197Contig1 713 2 2 U
GGGTTTCGCTTCACTTCTCTGAGGTTAGCCAGCTGCTTTGCGTTTCTCCCCCCTTGCTCG
TTCGTCTCTTATCCCTACCTGATTGCTCCGTCGCTCAAAACCCTAATCCTCTCCGCCTCA
TATCTTCCACCTTAACCTTCACCTCCATCGAAAACCATCCAATCATGGCGGGCCAAACTC
CGAATCTAGAGTGCCGGATGTACGAAGCCAAGTACCCAGAGGTGGACATGGCGGTGATGA
TCCAAGTCAAAGACATCGCCGGCATGGGAGCCTACGTGTCCCTCCTCGAGTACAACAACA
TCGAAGGCATGATCCTCTTCTCCGAGCTCTCCCGCCGCCGGATCCGGAGTGTGAGCAGCT
TGATCAAAGTCGGTAGAATCGAGCCGGTGATGGTTCTTCGCGTGGACAAGGAGAAGGGTT
ACATTGATCTGAGCAAACGTAGAGTCAGCGAGGAAGATATACAGACATGCGAAGAGAGGT
ATAACAAGAGCAAGCTTGTTCATTCTACCATGCGTCATGTTGCCGAGACTCTTTCTATCG
ATTTGGAGGAGTTGTATGTGAACATTGGTTGGCCTTTGTACCGGAAACATGGTCATGCTT
TTGAGGCATTCAAGATCTTAGTGACTGATCCTGATTCTGTGTTGGGTTCACTCACACGTG
AGATCAAAGAAGTTGGACCTGATGGGCAGAGTGACTAAAGTTGTACCTGCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A562TF U 1
AF RR2DB83TF U 19
BS 1 154 RR2A562TF
BS 155 713 RR2DB83TF

RD RR2A562TF 154 0 0
GGGTTTCGCTTCACTTCTCTGAGGTTAGCCAGCTGCTTTGCGTTTCTCCCCCCTTGCTCG
TTCGTCTCTTATCCCTACCTGATTGCTCCGTCGCTCAAAACCCTAATCCTCTCCGCCTCA
TATCTTCCACCTTAACCTTCACCTCCATCGAAAA

QA 1 154 1 154
DS 

RD RR2DB83TF 695 0 0
GG
GAGGTTAGCCAGCTGCTTTGCGTTTCTCCCCCCTTGCTCGTTCGTCTCTTATCCCTACCT
GATTGCTCCGTCGCTCAAAACCCTAATCCTCTCCGCCTCATATCTTCCACCTTAACCTTC
ACCTCCATCGAAAACCATCCAATCATGGCGGGCCAAACTCCGAATCTAGAGTGCCGGATG
TACGAAGCCAAGTACCCAGAGGTGGACATGGCGGTGATGATCCAAGTCAAAGACATCGCC
GGCATGGGAGCCTACGTGTCCCTCCTCGAGTACAACAACATCGAAGGCATGATCCTCTTC
TCCGAGCTCTCCCGCCGCCGGATCCGGAGTGTGAGCAGCTTGATCAAAGTCGGTAGAATC
GAGCCGGTGATGGTTCTTCGCGTGGACAAGGAGAAGGGTTACATTGATCTGAGCAAACGT
AGAGTCAGCGAGGAAGATATACAGACATGCGAAGAGAGGTATAACAAGAGCAAGCTTGTT
CATTCTACCATGCGTCATGTTGCCGAGACTCTTTCTATCGATTTGGAGGAGTTGTATGTG
AACATTGGTTGGCCTTTGTACCGGAAACATGGTCATGCTTTTGAGGCATTCAAGATCTTA
GTGACTGATCCTGATTCTGTGTTGGGTTCACTCACACGTGAGATCAAAGAAGTTGGACCT
GATGGGCAGAGTGACTAAAGTTGTACCTGCTGT

QA 3 695 3 695
DS 



AS 1 2

CO CL5198Contig1 1106 2 4 U
GTACCACGAGCGATCTGAAGCATCAGATCAACCGCGACAGGTAGGGAGAGAGGGTTCTTC
CTCCTCGGACCACACACCTCTTTGACGTGCGTCCCAAGGCTTTTACTCATCAGTTCCATA
ACAAGGAAACACTCTTTCTTCTCCTCGTCGGCGAATCCACAAAGGTAATACACAATGTTT
GGGTGTGAAAGAGATAGCAATGAAGTGACCTGAGGAAGCAAAGCATCGATGTCTCCGAAG
AAATGCCTAAGCGCAAAGGTTTCACCTAGCCATGTTATCTCCTTGTACTGACTTCCATTG
CCTAATCTCTTTCTCACTTGATAATCTTTCGAGCCGACCAGAATAGAAGATGGAAACAGG
CCAGGACTCTCGTTATCATTCTTCAGAAGGAACTCAGCTATCTTCCTGTCTTGTTTGCTT
GAACCGGAACGCCTTTTCTCTTGAAGCTCCTTCGTTAGAATCCACATGTCCTCTCTCCAT
GCACTCCCGTACCGGCTGCACAAGTCCTCGGTCACCAAATACTCTCTCCCGAACTTCCAT
GTAAACATCTGAGAGTCGTTCCATTGCTTCATGTACTTGTTCGAATGCACCAACCTCTTC
TTGTTCATCTCCTGTTCGTCCCACCCTGAAACCTCACTCGCCATCTCTATAGCCTCGATG
ATGATGGGTACGCATGATAGCAAGTTATGCACGTGAAGCTCGGTGCAATCTTTGTTGTGT
TGTAAGAAAACAGCTTTAGCCCAAAACCCTAGTTTAGGCTCTAGAGAGAATCTAACGTAA
GCCTCCCCTTCTCGTACCACGCTTAGAAGCTCCCTCAAGGGCTGATCTAGAATCTTCCAC
TTGGCCGTGTTCTTCACCCCGAAACGTAGGTTCGATCTCATGGATTCGGAAACTGAATCG
TACGTGGCGGTGAAGAGGTCGAGTAATAGAGTGCATTGACGCTGGTTGATATGAATGTTG
TCCTTGAGCACCATTAAGGCTCTTATGCTTCCTAATACCTCTCCTATCTCTCGAAGTTGT
TCCATTTTGCATCCCTTCAATGGAATTAAAACTTTTAGTACAAAACCTCTTTGAGATTTT
AGACACAAACTAGTTGGTTGATTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C351TF U 1
AF RR2C351JQ C 598
BS 1 724 RR2C351TF
BS 725 725 RR2C351JQ
BS 726 736 RR2C351TF
BS 737 1106 RR2C351JQ

RD RR2C351TF 736 0 0
GTACCACGAGCGATCTGAAGCATCAGATCAACCGCGACAGGTAGGGAGAGAGGGTTCTTC
CTCCTCGGACCACACACCTCTTTGACGTGCGTCCCAAGGCTTTTACTCATCAGTTCCATA
ACAAGGAAACACTCTTTCTTCTCCTCGTCGGCGAATCCACAAAGGTAATACACAATGTTT
GGGTGTGAAAGAGATAGCAATGAAGTGACCTGAGGAAGCAAAGCATCGATGTCTCCGAAG
AAATGCCTAAGCGCAAAGGTTTCACCTAGCCATGTTATCTCCTTGTACTGACTTCCATTG
CCTAATCTCTTTCTCACTTGATAATCTTTCGAGCCGACCAGAATAGAAGATGGAAACAGG
CCAGGACTCTCGTTATCATTCTTCAGAAGGAACTCAGCTATCTTCCTGTCTTGTTTGCTT
GAACCGGAACGCCTTTTCTCTTGAAGCTCCTTCGTTAGAATCCACATGTCCTCTCTCCAT
GCACTCCCGTACCGGCTGCACAAGTCCTCGGTCACCAAATACTCTCTCCCGAACTTCCAT
GTAAACATCTGAGAGTCGTTCCATTGCTTCATGTACTTGTTCGAATGCACCAACCTCTTC
TTGTTCATCTCCTGTTCGTCCCACCCTGAAACCTCACTCGCCATCTCTATAGCCTCGATG
ATGATGGGTACGCATGATAGCAAGTTATGCACGTGAAGCTCGGTGCAATCTTTGTTGTGT
TGTA*GAAAACAGCTT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2C351JQ 509 0 0
TTCTTGTTCATCTCCTGTTCGTCCCACCCTGAAACCTCACTCGCCATCTCTATAGCCTCG
ATGATGATGGGTACGCATGATAGCAAGTTATGCACGTGAAGCTCGGTGCAATCTTTGTTG
TGTTGTAAGAAAACAGCTTTAGCCCAAAACCCTAGTTTAGGCTCTAGAGAGAATCTAACG
TAAGCCTCCCCTTCTCGTACCACGCTTAGAAGCTCCCTCAAGGGCTGATCTAGAATCTTC
CACTTGGCCGTGTTCTTCACCCCGAAACGTAGGTTCGATCTCATGGATTCGGAAACTGAA
TCGTACGTGGCGGTGAAGAGGTCGAGTAATAGAGTGCATTGACGCTGGTTGATATGAATG
TTGTCCTTGAGCACCATTAAGGCTCTTATGCTTCCTAATACCTCTCCTATCTCTCGAAGT
TGTTCCATTTTGCATCCCTTCAATGGAATTAAAACTTTTAGTACAAAACCTCTTTGAGAT
TTTAGACACAAACTAGTTGGTTGATTGAC

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 2

CO CL5199Contig1 1302 2 6 U
CATAACCGAGATGCATTCGACGAGATTCGTCGACCATTCGTTCCACACCACGAGGGAGTT
GATACATAGGAAGCTCTTGAAAGTGATGGAGAGTTTCTCAAAGTCACAAGAAGCTTTTGA
TCTTCAAGAGGTTCTTTTGAGGTTGACGTTTGATAATATCTGCATCGCGGGTCTCGGCGA
TGATCCTGGCACTTTGGACGTTGATCTTCCTCAAGTTCCATTCGCTAAGGCCTTTGAAGA
AGCTACGGAGAGTACTATGTTTAGGTTCATGATTCCACCGTTTTTGTGGAAACCTATGAA
GTTTTTTGACTTAGGGTACGAGAAAGGGCTGAGGAAAGCTGTTGAGACGGTTCATGGGTT
TATAGACGAGATGGTTGTGGACAGAATCAAGATGCTTAAAGAAGAAGGAACGTTAGAGAG
AAACAAATCAGATGTCCTCTCGAGGCTAATCCTTATAGAAAGTCACAAAAGAGGCAATGA
GAATGATCGGTTCACCCTCAAGTTTTTCAGACAGTTCTGCACAAGTTTCATCTTAGCGGG
ACGTGACACGAGTTCTGTCGGGCTTTCTTGGTTCTTCTGGTTGATAACGAAACATCCTGA
AGTTGAAAACAAGATCCTCCAAGAAATAACAGAAATCTTGAGCCGAAGAGACAATAATCT
TGATGAGAGTTGTTGTCACTTCACAGTCAAGGAGCTAAACGACATGGTGTACCTACAAGC
GGCCTTGTCTGAAACTCTTAGACTCTATCCACCAATACCAATGGAGATGAAACAAGCAAC
AGAAGAAGACGTGTTTCCAGATGGGACTCTCTTGGAGAAAGGTTCGAGGGTTTACTTCTC
TATCTATGCCATGGGAAGGATGAAATCAATATGGGGTGAAGACTGTGAAATGTTTAGACC
AGAAAGATGGATACAAGGAGGACAGTACGTGAGTGATGATCAGTTTAAATACGTTGTGTT
CAATGGCGGTCCAAGGCTTTGTCTAGGGAAAACATTTGCTTACTTGCAGATGAAAATGGT
GGCTGCTTCCATCTTGTTGAACTACTCAATCAAGGTTGATCAAGATCATGTTGTTGTGCC
TCGAGTTACAACTACTTTGTACATGAAACATGGTCTTAAGGTCAGGATCACGAAGAGATC
TTTAGAGGAGAGGAAGCAAGATTCATAAGTAAATAAGAAGAAATCAACTAAATGTTACAT
GGAATTTGTTACTAAAATATTTGTTTATGTATGGTTAATGTAAGATCTTCACCCTTTGTT
CTATCTTAAAGTAGATTAGATACTTATATAATCTTTGTTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB81TF U 1
AF RR2EB81JQ C 602
BS 1 691 RR2EB81TF
BS 692 692 RR2EB81JQ
BS 693 733 RR2EB81TF
BS 734 734 RR2EB81JQ
BS 735 745 RR2EB81TF
BS 746 1302 RR2EB81JQ

RD RR2EB81TF 745 0 0
CATAACCGAGATGCATTCGACGAGATTCGTCGACCATTCGTTCCACACCACGAGGGAGTT
GATACATAGGAAGCTCTTGAAAGTGATGGAGAGTTTCTCAAAGTCACAAGAAGCTTTTGA
TCTTCAAGAGGTTCTTTTGAGGTTGACGTTTGATAATATCTGCATCGCGGGTCTCGGCGA
TGATCCTGGCACTTTGGACGTTGATCTTCCTCAAGTTCCATTCGCTAAGGCCTTTGAAGA
AGCTACGGAGAGTACTATGTTTAGGTTCATGATTCCACCGTTTTTGTGGAAACCTATGAA
GTTTTTTGACTTAGGGTACGAGAAAGGGCTGAGGAAAGCTGTTGAGACGGTTCATGGGTT
TATAGACGAGATGGTTGTGGACAGAATCAAGATGCTTAAAGAAGAAGGAACGTTAGAGAG
AAACAAATCAGATGTCCTCTCGAGGCTAATCCTTATAGAAAGTCACAAAAGAGGCAATGA
GAATGATCGGTTCACCCTCAAGTTTTTCAGACAGTTCTGCACAAGTTTCATCTTAGCGGG
ACGTGACACGAGTTCTGTCGGGCTTTCTTGGTTCTTCTGGTTGATAACGAAACATCCTGA
AGTTGAAAACAAGATCCTCCAAGAAATAACAGAAATCTTGAGCCGAAGAGACAATAATCT
TGATGAGAGTTGTTGTCACTTCACAGTCAAG*AGCTAAACGACATGGTGTACCTACAAGC
GGCCTTGTCTGAA*CTCTTAGACTC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2EB81JQ 701 0 0
GTTGAAAACAAGATCCTCCAAGAAATAACAGAAATCTTGAGCCGAAGAGACAATAATCTT
GATGAGAGTTGTTGTCACTTCACAGTCAAGGAGCTAAACGACATGGTGTACCTACAAGCG
GCCTTGTCTGAAACTCTTAGACTCTATCCACCAATACCAATGGAGATGAAACAAGCAACA
GAAGAAGACGTGTTTCCAGATGGGACTCTCTTGGAGAAAGGTTCGAGGGTTTACTTCTCT
ATCTATGCCATGGGAAGGATGAAATCAATATGGGGTGAAGACTGTGAAATGTTTAGACCA
GAAAGATGGATACAAGGAGGACAGTACGTGAGTGATGATCAGTTTAAATACGTTGTGTTC
AATGGCGGTCCAAGGCTTTGTCTAGGGAAAACATTTGCTTACTTGCAGATGAAAATGGTG
GCTGCTTCCATCTTGTTGAACTACTCAATCAAGGTTGATCAAGATCATGTTGTTGTGCCT
CGAGTTACAACTACTTTGTACATGAAACATGGTCTTAAGGTCAGGATCACGAAGAGATCT
TTAGAGGAGAGGAAGCAAGATTCATAAGTAAATAAGAAGAAATCAACTAAATGTTACATG
GAATTTGTTACTAAAATATTTGTTTATGTATGGTTAATGTAAGATCTTCACCCTTTGTTC
TATCTTAAAGTAGATTAGATACTTATATAATCTTTGTTAGT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5201Contig1 728 2 2 U
GGGCGAATCGAATTAAGGTGAAATACAAAGAAGGGAGCAAAGATCGAAAGGACGAGAGAA
ACTTGAAACAGTTAATCCGTTAATGGTGGTGATGATCATCAAGGGTATATTCAGGAGATA
TGAGAAATGGAATCCCGTTCATCCCACTTATGGAGCATTTTGGGGAATGGGGATTGGCAT
TGGCTGCGGCGTCGGATGGGGACCTGGTTTTGGCCCTGAGGTCATTGGATACGTAGGTGC
TGGCTGCGGTGTTGGTTTCAGTGTTGGCATTACACTCGCTGGTCTCGGCATTGGTCTCCC
CACAAACCTTCTTCTCGCAGCTCCTTATAACAGTATATCTTCTTCTTGCAGCTCCTTACA
AAGACAAGTGGGTGGGATGTGTTCTGGTTTTAGCAAGAAGCCGCCTCGCTTAGGTGATGC
AATTGACTTACGAAGTTTGCCTTTGTTCATTCCACATGATTGTGGAAGATCTGGGAGCCA
TCTTCTCCGTATGCGGCGCAAAGGTTTGGAGAACAAAAACCATGGAGATTCATCAGCTAT
GTAATGGCATTAGACCGCGAGGATCTCAAGCAGCCGAGACACTCCTTACGAGAATTTGGT
TGAATAGAGAGTTACTTTCGTTTGGCATGTGTGTGTATGACTATGAAATATACTTGGCAC
AAATCAGAACCTGTTTCCTGTTTTGTTTGGAGGGTACACACTATGAAACAATCCTGAAGA
ATTTGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK09TF U 1
AF RR2DK09JQ C 481
BS 1 671 RR2DK09TF
BS 672 728 RR2DK09JQ

RD RR2DK09TF 671 0 0
GGGCGAATCGAATTAAGGTGAAATACAAAGAAGGGAGCAAAGATCGAAAGGACGAGAGAA
ACTTGAAACAGTTAATCCGTTAATGGTGGTGATGATCATCAAGGGTATATTCAGGAGATA
TGAGAAATGGAATCCCGTTCATCCCACTTATGGAGCATTTTGGGGAATGGGGATTGGCAT
TGGCTGCGGCGTCGGATGGGGACCTGGTTTTGGCCCTGAGGTCATTGGATACGTAGGTGC
TGGCTGCGGTGTTGGTTTCAGTGTTGGCATTACACTCGCTGGTCTCGGCATTGGTCTCCC
CACAAACCTTCTTCTCGCAGCTCCTTATAACAGTATATCTTCTTCTTGCAGCTCCTTACA
AAGACAAGTGGGTGGGATGTGTTCTGGTTTTAGCAAGAAGCCGCCTCGCTTAGGTGATGC
AATTGACTTACGAAGTTTGCCTTTGTTCATTCCACATGATTGTGGAAGATCTGGGAGCCA
TCTTCTCCGTATGCGGCGCAAAGGTTTGGAGAACAAAAACCATGGAGATTCATCAGCTAT
GTAATGGCATTAGACCGCGAGGATCTCAAGCAGCCGAGACACTCCTTACGAGAATTTGGT
TGAATAGAGAGTTACTTTCGTTTGGCATGTGTGTGTATGACTATGAAATATACTTGGCAC
AAATCAGAACC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2DK09JQ 248 0 0
TT
TTCTCCGTATGGGGCGCAAAGGTTTGGAGAACAAAAACCATGGAGATTCATCAGCTATGT
AATGGCATTAGACCGCGAGGATCTCAAGCAGCCGAGACACTCCTTACGAGAATTTGGTTG
AATAGAGAGTTACTTTCGTTTGGCATGTGTGTGTATGACTATGAAATATACTTGGCACAA
ATCAGAACCTGTTTCCTGTTTTGTTTGGAGGGTACACACTATGAAACAATCCTGAAGAAT
TTGGGT

QA 3 248 3 248
DS 



AS 1 2

CO CL5202Contig1 512 2 3 U
ATAAGGAGAGCTTACTTATATTTAAAAATTTAAGTAAATGATCCCAAGTAAATTTAAGAC
AATTATTATTATTTTGCTGTCTGCTGCTTGCGGAAACACAAAACAAACACAGGGTGACAG
AACCAACTCAATCACCATTCTTACCAGAAAAAACAATAAAAAAACACCGCATTAAAGAAA
ACAAAGCAAGAAAACCCTTCCTTTATCTATTTAATTCAGGTTCGGCCTTTTGGAGCAGGG
GAAGGTTCTGGGCTTTGGATCCCCAGTTCTTGTGACAAGCTATATCCTGCCGGTCCTGGC
GAGTATACTGGGGATGTTGGCGAGTATCCTGGGCTTTGGATCCCCAGTTCTTGAGACCGA
GTCACCATAGGAGCCACTGCTGACGTCTGATACGCTTGTGGTATGCTATATCCTGCTGGT
CCTGGCGAGTATGCTGGGGACGATAGCGAGTATCCTGGGGATGTTGGCGAGTATGTTGGG
GACGTTGGCGAGTATGTTGGGGATGTTGGCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV09JQ U 144
AF RR2EV09TF C 1
BS 1 143 RR2EV09TF
BS 144 327 RR2EV09JQ
BS 328 512 RR2EV09TF

RD RR2EV09JQ 184 0 0
CCAGAAAAAACAATAAAAAAACACCGCATTAAAGAAAACAAAGCAAGAAAACCCTTCCTT
TATCTATTTAATTCAGGTTCGGCCTTTTGGAGCAGGGGAAGGTTCTGGGCTTTGGATCCC
CAGTTCTTGTGACAAGCTATATCCTGCCGGTCCTGGCGAGTATACTGGGGATGTTGGCGA
GTAT

QA 1 184 1 184
DS 

RD RR2EV09TF 512 0 0
ATAAGGAGAGCTTACTTATATTTAAAAATTTAAGTAAATGATCCCAAGTAAATTTAAGAC
AATTATTATTATTTTGCTGTCTGCTGCTTGCGGAAACACAAAACAAACACAGGGTGACAG
AACCAACTCAATCACCATTCTTACCAGAAAAAACAATAAAAAAACACCGCATTAAAGAAA
ACAAAGCAAGAAAACCCTTCCTTTATCTATTTAATTCAGGTTCGGCCTTTTGGAGCAGGG
GAAGGTTCTGGGCTTTGGATCCCCAGTTCTTGTGACAAGCTATATCCTGCCGGTCCTGGC
GAGTATACTGGGGATGTTGGCGAGTATCCTGGGCTTTGGATCCCCAGTTCTTGAGACCGA
GTCACCATAGGAGCCACTGCTGACGTCTGATACGCTTGTGGTATGCTATATCCTGCTGGT
CCTGGCGAGTATGCTGGGGACGATAGCGAGTATCCTGGGGATGTTGGCGAGTATGTTGGG
GACGTTGGCGAGTATGTTGGGGATGTTGGCGC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL5203Contig1 692 2 1 U
GGATCTGACTATGAATCCCATTTGGCCACTAAGTTTTGATATTTATATGTACATATTCCT
TTGCCAATGCGAACTAGACTTCAGTATAAGTTCGTACTGAACAAAATAAGGAGAAACAAG
AATGAAAGTGGACACAGACAGTGTTTTAGTGCCCTTGAGTGTGTTCATAGCAGTGGGATA
TCATGTCTTCCTCTGGAACACCTTCAAGCACAATCCTTCTCGTACTTCTCTTGGCATTGA
TTCCTCCAAACGCAAATCTTGGTTCCGTGACATCAAAGAGGGTGACGATAAGACTGGCAT
GTTGGCAGTGCAAAGCCTGAGGAACAAAAAAATGGTTACAATTCTCACTGCTACAGTCTC
CATCCTTATCTTGCTTTCTCTAGCTGCGGTTACTAACAACGCGTTTAAAGCAAGCCACCT
CTTCACAACCGCGGACGACGTTGTTTTAGGCTCCAAAAACCCTACAATCTTCGTCCTCAA
GTATGCATCTACCTCTCTGCTTCTTGCAGTAAGCTTTTTCTTCAGCTCACTTGCTGTGAG
TTACTTGATGGATGCCAATTTTCTCATAAACGCCATTGCTAAAATGCATGAAAGAGACTG
CGATTGCGATTATGAATTGACGGGACTGGATCGTTTAGGGAGTATACAAGATTAGTGTTG
GAGAGAGGGTTTTTTATGGCTATGATTGGGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB77TF U 1
AF RR2GJ66TF U 1
BS 1 692 RR2GB77TF

RD RR2GB77TF 692 0 0
GGATCTGACTATGAATCCCATTTGGCCACTAAGTTTTGATATTTATATGTACATATTCCT
TTGCCAATGCGAACTAGACTTCAGTATAAGTTCGTACTGAACAAAATAAGGAGAAACAAG
AATGAAAGTGGACACAGACAGTGTTTTAGTGCCCTTGAGTGTGTTCATAGCAGTGGGATA
TCATGTCTTCCTCTGGAACACCTTCAAGCACAATCCTTCTCGTACTTCTCTTGGCATTGA
TTCCTCCAAACGCAAATCTTGGTTCCGTGACATCAAAGAGGGTGACGATAAGACTGGCAT
GTTGGCAGTGCAAAGCCTGAGGAACAAAAAAATGGTTACAATTCTCACTGCTACAGTCTC
CATCCTTATCTTGCTTTCTCTAGCTGCGGTTACTAACAACGCGTTTAAAGCAAGCCACCT
CTTCACAACCGCGGACGACGTTGTTTTAGGCTCCAAAAACCCTACAATCTTCGTCCTCAA
GTATGCATCTACCTCTCTGCTTCTTGCAGTAAGCTTTTTCTTCAGCTCACTTGCTGTGAG
TTACTTGATGGATGCCAATTTTCTCATAAACGCCATTGCTAAAATGCATGAAAGAGACTG
CGATTGCGATTATGAATTGACGGGACTGGATCGTTTAGGGAGTATACAAGATTAGTGTTG
GAGAGAGGGTTTTTTATGGCTATGATTGGGAA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2GJ66TF 663 0 0
GGATCTGACTATGAATCCCATTTGGCCACTAAGTTTTGATATTTATATGTACATATTCCT
TTGCCAATGCGAACTAGACTTCAGTATAAGTTCGTACTGAACAAAATAAGGAGAAACAAG
AATGAAAGTGGACACAGACAGTGTTTTAGTGCCCTTGAGTGTGTTCATAGCAGTGGGATA
TCATGTCTTCCTCTGGAACACCTTCAAGCACAATCCTTCTCGTACTTCTCTTGGCATTGA
TTCCTCCAAACGCAAATCTTGGTTCCGTGACATCAAAGAGGGTGACGATAAGACTGGCAT
GTTGGCAGTGCAAAGCCTGAGGAACAAAAAAATGGTTACAATTCTCACTGCTACAGTCTC
CATCCTTATCTTGCTTTCTCTAGCTGCGGTTACTAACAACGCGTTTAAAGCAAGCCACCT
CTTCACAACCGCGGACGACGTTGTTTTAGGCTCCAAAAACCCTACAATCTTCGTCCTCAA
GTATGCATCTACCTCTCTGCTTCTTGCAGTAAGCTTTTTCTTCAGCTCACTTGCTGTGAG
TTACTTGATGGATGCCAATTTTCTCATAAACGCCATTGCTAAAATGCATGAAAGAGACTG
CGATTGCGATTATGAATTGACGGGACTGGATCGTTTAGGGAGTATACAAGATTAGTGTTG
GAG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL5204Contig1 1094 2 2 U
GGGCTAAAACGCGACTCTTCTCTCCTGCGACAGGGAAACATGTTGTCAGATCGTTAAAAG
CATGTCGTATCCGTTGCTCCTCCAATGATCCTGGTTTTGACTAGGTTCACGTGATGTTTC
GTCTCCAGTAGGAGAAAAATGGTTGTCATGTTGTCCACTGTGCAGCTTCTGTCTCATTTG
CTTCCTCCAAACGGAAAGGCAGCTGACATGTATCCAATGATGAAAGATGAGATAAGGAGA
GTGGTGACGAAGGGTAAAGCTGCTGGTGTGCTTCGTTTAGTGTTTCATGATGCTGGAACC
TTTGAACTCGGTGATAACACAGGTGGAATCAACGGGTCTATTGTTAAAGAACTCGAGAGA
CCTGAAAACGCAGGTTTGAAGAGATCCTTAAAGGTTCTAGAGAAAGCAAAGCTTAGGGTT
GATGAGATACAACCAGTGTCTTGGGCGGATATGATCGCTGTAGCTGGCTCTGAAGCAGTC
TCAATGTGTGGAGGCCCAACAATTCCAGTAGTTTTGGGAAGGCTTGATTCAACGCAACCT
GATCCAGAAGACAAGTTACCTCCAGAATCCCTCAATGCCTCGGGTTTGAAAGAATGTTTC
CAAAGAAAAGGATTCTCGACCCAAGAACTTGTTGCCTTGTCTGGTGCACATACGATTGGG
AGTAAAGGCTTTGGAGATCCGTTTACTTTTGACAATGCATACTACAAAATCCTTCTTGAA
AAGCCTTGGAGATCGACGACATCCAAAATGACAAGTATGGTTGGGCTTCCTTCGGATCAC
GCCCTCGTGGAGGATGATGAGTGCTTAAGGTGGGTGAAGCAGTATGCGGATGATCAAGAC
AAGTTCTTCAGAGACTTCACTAATGCTTATATCAAACTAGTTAACTCTGGGGCCAAATGG
AAAACATTATGATGATCTTATGTTAGTTCATACTTCATGAGTCCTAAATAGTTTTGGTTG
TAATGCTTATTTAATTATTTTTACCTTTTCTAAAAACATGATCAACGTTTCAGCAAAGAC
ACTATATGTTTTGTTTAGAGCTTTTAAATGTTGATTCATGTAAATTTTGACTGTTTATGT
TTCGTTCACGTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ96TF U 1
AF RR2EQ96JQ C 391
BS 1 575 RR2EQ96TF
BS 576 1094 RR2EQ96JQ

RD RR2EQ96TF 575 0 0
GGGCTAAAACGCGACTCTTCTCTCCTGCGACAGGGAAACATGTTGTCAGATCGTTAAAAG
CATGTCGTATCCGTTGCTCCTCCAATGATCCTGGTTTTGACTAGGTTCACGTGATGTTTC
GTCTCCAGTAGGAGAAAAATGGTTGTCATGTTGTCCACTGTGCAGCTTCTGTCTCATTTG
CTTCCTCCAAACGGAAAGGCAGCTGACATGTATCCAATGATGAAAGATGAGATAAGGAGA
GTGGTGACGAAGGGTAAAGCTGCTGGTGTGCTTCGTTTAGTGTTTCATGATGCTGGAACC
TTTGAACTCGGTGATAACACAGGTGGAATCAACGGGTCTATTGTTAAAGAACTCGAGAGA
CCTGAAAACGCAGGTTTGAAGAGATCCTTAAAGGTTCTAGAGAAAGCAAAGCTTAGGGTT
GATGAGATACAACCAGTGTCTTGGGCGGATATGATCGCTGTAGCTGGCTCTGAAGCAGTC
TCAATGTGTGGAGGCCCAACAATTCCAGTAGTTTTGGGAAGGCTTGATTCAACGCAACCT
GATCCAGAAGACAAGTTACCTCCAGAATCCCTCAA

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2EQ96JQ 704 0 0
AAGGTTCTAGAGAAAGCAAAGCTTAGGGTTGATGAGATACAACCAGTGTCTTGGGCGGAT
ATGATCGCTGTAGCTGGCTCTGAAGCAGTCTCAATGTGTGGAGGCCCAACAATTCCAGTA
GTTTTGGGAAGGCTTGATTCAACGCAACCTGATCCAGAAGACAAGTTACCTCCAGAATCC
CTCAATGCCTCGGGTTTGAAAGAATGTTTCCAAAGAAAAGGATTCTCGACCCAAGAACTT
GTTGCCTTGTCTGGTGCACATACGATTGGGAGTAAAGGCTTTGGAGATCCGTTTACTTTT
GACAATGCATACTACAAAATCCTTCTTGAAAAGCCTTGGAGATCGACGACATCCAAAATG
ACAAGTATGGTTGGGCTTCCTTCGGATCACGCCCTCGTGGAGGATGATGAGTGCTTAAGG
TGGGTGAAGCAGTATGCGGATGATCAAGACAAGTTCTTCAGAGACTTCACTAATGCTTAT
ATCAAACTAGTTAACTCTGGGGCCAAATGGAAAACATTATGATGATCTTATGTTAGTTCA
TACTTCATGAGTCCTAAATAGTTTTGGTTGTAATGCTTATTTAATTATTTTTACCTTTTC
TAAAAACATGATCAACGTTTCAGCAAAGACACTATATGTTTTGTTTAGAGCTTTTAAATG
TTGATTCATGTAAATTTTGACTGTTTATGTTTCGTTCACGTAGC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL5205Contig1 559 2 2 U
GGGGCAATAACTCTCGTTCTCTGCAGAAACTAGAAAGAGGATAAAACAATTTCGAGAAAA
ATCTCAGTGATCAGCAAAAATGTCTTCGGCTCGTTCTGCGATCGCACGTCTTGGTTTGGC
TCGGTCCTTGAGGGAGAGTCAGATCGGTGCATCTCGATCCGTTGGATCGATTCGGTGCTT
CAGCGACGACAAAGGTCGTGTGCTCAGCGATGAGGAGCGCGCCAAAGAGACCATCTACAT
CCAGAAAATGGAGAAGGAGATACTAGAGAGGAAGAAGAAACTCGAGCAACAGAAGCCAGA
AAGTGCTGGAAAGAAACCAGAGGAAAAGAAGCCCTGAGTTCAGCATCTGCAGTAGCATAT
GTGGGTCACAAGGCAAGCAACAGTGAAGAATAAGCCTTTGACAGTTTGACCTTTGTCCTC
TCTTGGTTTGAGACTTTGTACTTGTCACCCTCCTTGTATGTTTGTTTGTGTGTGTGTGTT
CTAAACAAATCAAGTTTGAGACGATGATATAAATGACCGCGCCGATTTAAAAAGAAAAAC
ATCCATATGCATTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC54TF U 1
AF RR2DC54JQ C 112
BS 1 299 RR2DC54TF
BS 300 559 RR2DC54JQ

RD RR2DC54TF 299 0 0
GGGGCAATAACTCTCGTTCTCTGCAGAAACTAGAAAGAGGATAAAACAATTTCGAGAAAA
ATCTCAGTGATCAGCAAAAATGTCTTCGGCTCGTTCTGCGATCGCACGTCTTGGTTTGGC
TCGGTCCTTGAGGGAGAGTCAGATCGGTGCATCTCGATCCGTTGGATCGATTCGGTGCTT
CAGCGACGACAAAGGTCGTGTGCTCAGCGATGAGGAGCGCGCCAAAGAGACCATCTACAT
CCAGAAAATGGAGAAGGAGATACTAGAGAGGAAGAAGAAACTCGAGCAACAGAAGCCAG

QA 1 299 1 299
DS 

RD RR2DC54JQ 448 0 0
TGGTTTGGCTCGGTCCTTGAGGGAGAGTCAGATCGGTGCATCTCGATCCGTTGGATCGAT
TCGGTGCTTCAGCGACGACAAAGGTCGTGTGTTCAGCGATGAGGAGCGCGCCAAAGAGAC
CATCTACATCCAGAAAATGGAGAAGGAGATACTAGAGAGGAAGAAGAAACTCGAGCAACA
GAAGCCAGAAAGTGCTGGAAAGAAACCAGAGGAAAAGAAGCCCTGAGTTCAGCATCTGCA
GTAGCATATGTGGGTCACAAGGCAAGCAACAGTGAAGAATAAGCCTTTGACAGTTTGACC
TTTGTCCTCTCTTGGTTTGAGACTTTGTACTTGTCACCCTCCTTGTATGTTTGTTTGTGT
GTGTGTGTTCTAAACAAATCAAGTTTGAGACGATGATATAAATGACCGCGCCGATTTAAA
AAGAAAAACATCCATATGCATTTGATCC

QA 1 448 1 448
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5207Contig1 696 2 5 U
GAAAAATACGTTTTCATTAAGAAAGCAGAGTGATTGAGAAGCAACGAGATGTTGGATCAT
CAATCATTGTAGTTGTTTGAAGCAAAGTTACAAGCATAATTACACCACAACTTATTAATC
TCCCACAAAGAGACATTTTATACTACTTTTCTTTTGTTTCCTTCACATCTTGGAGATCGA
GTAGTCCATCGCTTCCACGAGATAATCTGCGTCATCCTTCGTGAAGCAGAGAGGTGGTGT
GATTCTAAACACGTTTCCAAAAAAGCCTCCTTTTCCAACCAACACACCCAACTCTTTCAT
TTGATCCATAATGGGCAGGGTTTCGGCCGTTGCAGGAGTCTTGATCTTGCGATCACTTAC
CAGCTCTACTCCAAGCATCAGTCCTCTTCCACGTACGTCCCCAAAAATTTCATGTTTCTC
TTTCAGCTGATTGAGTTTTCCTTTAAGATAAGATCCGACCATTGATGCATTCTCCTGAAG
CTTCTCTTTCTCAATCACATTCAGAACAGCGAGACCAGCTGTAGTAGACACAGCATTCCC
ACCAAATGTGTTGAAGTAGCATCGGCGTGTCAACACTCCTGCTATCTCCGGAGTTGTCAC
AACCGCTCCCAAAGGAAACCCATTCCCAATTCCCTTTGCCATGGTTACTATGTCAGGGAC
AACATTGTGAGCTTCAAATCCCCAGAAGTTGCCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV38JQ U 247
AF RR2EV38TF C 1
BS 1 246 RR2EV38TF
BS 247 345 RR2EV38JQ
BS 346 346 RR2EV38TF
BS 347 446 RR2EV38JQ
BS 447 696 RR2EV38TF

RD RR2EV38JQ 205 0 0
AAACACGTTTCCAAAAAAGCCTCCTTTTCCAACCAACACACCCAACTCTTTCATTTGATC
CATAATGGGCAGGGTTTCGGCCGTTGCAGGAGTCTTGATTTTGCGATCACTTACCAGCTC
TACTCCAAGCATCAGTCCTCTTCCACGTACGTCCCCAAAAATTTCATGTTTCTCTTTCAG
CTGATTGAGTTTTCCTTTAA
AAAAA

QA 1 200 1 200
DS 

RD RR2EV38TF 696 0 0
GAAAAATACGTTTTCATTAAGAAAGCAGAGTGATTGAGAAGCAACGAGATGTTGGATCAT
CAATCATTGTAGTTGTTTGAAGCAAAGTTACAAGCATAATTACACCACAACTTATTAATC
TCCCACAAAGAGACATTTTATACTACTTTTCTTTTGTTTCCTTCACATCTTGGAGATCGA
GTAGTCCATCGCTTCCACGAGATAATCTGCGTCATCCTTCGTGAAGCAGAGAGGTGGTGT
GATTCTAAACACGTTTCCAAAATAGCCTCCTTTTCCAACCAACACACCCAACTCTTTCAT
TTGATCCATAATGTGCAGGGTTTCGGCCGTTGCAGGAGTCTTGATCTTGCGATCACTTAC
CAGCTCTACTCCAAGCATCAGTCCTCTTCCACGTACGTCCCCAATAATTTCATGTTTCTC
TTTCAGCTGATTGAGTTTTCCTTTAAGATAAGATCCGACCATTGATGCATTCTCCTGAAG
CTTCTCTTTCTCAATCACATTCAGAACAGCGAGACCAGCTGTAGTAGACACAGCATTCCC
ACCAAATGTGTTGAAGTAGCATCGGCGTGTCAACACTCCTGCTATCTCCGGAGTTGTCAC
AACCGCTCCCAAAGGAAACCCATTCCCAATTCCCTTTGCCATGGTTACTATGTCAGGGAC
AACATTGTGAGCTTCAAATCCCCAGAAGTTGCCAGC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL5208Contig1 577 2 1 U
GGTCTCCAACACTCACATCTATCTCTCTCTCTAATGGCGGCGGCGCAGATGGATCCCGAT
GCAGTGGCCAAGGCCTTCGTGGAGCATTACTACTCGACCTTCGACAACAACCGCGTAGGT
CTGGGAGGTCTCTACCAGGAAGCTTCAATGCTCACCTTCGAAGGTCAGAAGATCCAAGGA
GTCCAGAGCATCGTCGCCAAGCTCACCTCTCTCCCTTTCCAGCAGTGCAAACACAACATC
TCCACCGTCGATTGCCAGCCTCCTGGTCCCGCCTCCGGTATGCTCGTTTTCGTCTCCGGT
AACCTCCAACTCGCCGGCGAGGAACACGCTCTCAAGTTCAGCCAGATGTTTCACTTGATG
CCGACGCCACAAGGAAGCTTTTACGTGTTTAATGATATATTCAGGTTGAACTACGCCTGA
AGAGGAATCTCGGATTGTTTTAGCATACATCAATGTTGCATTCCTACTTTATACTATTTT
TATCTTGAGAAGAGAGCAAAGCTGTGTGCCTTTTGTATTTCGGTTTGCATGACTTGATAA
GACAAATTTAAATTGTTTACGATATGCTTTTCATCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ES96JQ C 1
AF RR2ES96TF U 1
BS 1 577 RR2ES96TF

RD RR2ES96JQ 577 0 0
GGTCTCCAACACTCACATCTATCTCTCTCTCTAATGGCGGCGGCGCAGATGGATCCCGAT
GCAGTGGCCAAGGCCTTCGTGGAGCATTACTACTCGACCTTCGACAACAACCGCGTAGGT
CTGGGAGGTCTCTACCAGGAAGCTTCAATGCTCACCTTCGAAGGTCAGAAGATCCAAGGA
GTCCAGAGCATCGTCGCCAAGCTCACCTCTCTCCCTTTCCAGCAGTGCAAACACAACATC
TCCACCGTCGATTGCCAGCCTCCTGGTCCCGCCTCCGGTATGCTCGTTTTCGTCTCCGGT
AACCTCCAACTCGCCGGCGAGGAACACGCTCTCAAGTTCAGCCAGATGTTTCACTTGATG
CCGACGCCACAAGGAAGCTTTTACGTGTTTAATGATATATTCAGGTTGAACTACGCCTGA
AGAGGAATCTCGGATTGTTTTAGCATACATCAATGTTGCATTCCTACTTTATACTATTTT
TATCTTGAGAAGAGAGCAAAGCTGTGTGCCTTTTGTATTTCGGTTTGCATGACTTGATAA
GACAAATTTAAATTGTTTACGATATGCTTTTCATCCC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2ES96TF 577 0 0
GGTCTCCAACACTCACATCTATCTCTCTCTCTAATGGCGGCGGCGCAGATGGATCCCGAT
GCAGTGGCCAAGGCCTTCGTGGAGCATTACTACTCGACCTTCGACAACAACCGCGTAGGT
CTGGGAGGTCTCTACCAGGAAGCTTCAATGCTCACCTTCGAAGGTCAGAAGATCCAAGGA
GTCCAGAGCATCGTCGCCAAGCTCACCTCTCTCCCTTTCCAGCAGTGCAAACACAACATC
TCCACCGTCGATTGCCAGCCTCCTGGTCCCGCCTCCGGTATGCTCGTTTTCGTCTCCGGT
AACCTCCAACTCGCCGGCGAGGAACACGCTCTCAAGTTCAGCCAGATGTTTCACTTGATG
CCGACGCCACAAGGAAGCTTTTACGTGTTTAATGATATATTCAGGTTGAACTACGCCTGA
AGAGGAATCTCGGATTGTTTTAGCATACATCAATGTTGCATTCCTACTTTATACTATTTT
TATCTTGAGAAGAGAGCAAAGCTGTGTGCCTTTTGTATTTCGGTTTGCATGACTTGATAA
GACAAATTTAAATTGTTTACGATATGCTTTTCATCCC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

CO CL5209Contig1 1239 2 2 U
GACACCTAACTTGTCGGCCACCTGTAGCGTGTCTTCGTGTCCCTATTCCCAATGCTGGCA
CGGACGGATCAATGTAGTAAATTCAGCTCGCGACTTCGGCGGATTAGTAATCTCAGGTTG
TCTCTCTTCGTTTGATTCTTCATCTCCACCGTCTTTGGTCTATCTATGGTCCTAAGATGA
AGCTCGTGAGTGGTAAGTTCCCTTCCTTATTCCTTCTAGTTTCCTTAGATGCTTCTGTTT
TCAATTCTTTCAACTTGCTTAATCTCAAATTCATGAATGATACTTTTGTAGTGGGATATT
TAATACATATCTGGTTATTGTACTTTATGTGATTCTCTGCTGTTTGGTTTAGCATGACTA
ATGTTTTCGAGTTATTATCTCGGTGAGGGAATGTATGTGTTTGGTTACTTACAAGAATAG
CCTAAACTGGATATTATGGATGGTATTCTAGAGCTCAGTTAGTACACTATTATAATGGCT
GTAACTAAATACATTGTCCGATTTACTGTATAAAGGCAAGGAAAGAATGTATCTAAACTA
TTAAAACTGAAGTACAATTAGTACTTAACCCTAGATTTTCCCTAATAATTACGATAGACT
GCCACTAACGTAAAACAATGTCGTTTTAAAATTTTCCTAAACCAATCAGAATAAATTGAC
GTCATTTAGCCTTAAATAATAAAATCTACCGTATCAACATCCCTTGGAAGCCATAGATCC
CAGCGGTTTGGTCTTTTGATCTTTAGGTTTTTGGTGAATTTTTGTTCGATATTGGTTTGA
TTTCTGAAAGATTATTATGAGTTGTTTGAATAATCCCTGATTTCATCCAAAGTGATTGGG
TTCAATTTATTGGTTGAGTAACTCCGGCTATATACTGTGGAAGGAGCACGGTGGTGATGG
AAATAAAAATTTGTTGGACGGCTTAGTCGAAGTTTTAATATTAGACGTAGCCCCTCGAAT
GTTCGAGCTTTGCGAAAGTCAATTATTTCACATGGTTAAAGTTTTTAGATGGAAGGGTTA
TATTTGTGGAGGAAGCTAAACCAAGGTCAGATATTCAAAGAGCTAAACCCGGATCAGATT
TCAACAGATCTCAAACTAAACCTCGCACCTTTTGCACCTGGTACCTAGTTTGATACTATC
TCCAACTCTAATTCTGTGTAATTTTCAATCTAGTTTTAACATTTGAGGTTATACAATGGA
CTCATTGGTTAACTCCTACCGCTGAGGGAACTTTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM29TF U 1
AF RR2DM29JQ C 523
BS 1 711 RR2DM29TF
BS 712 1239 RR2DM29JQ

RD RR2DM29TF 713 0 0
GACACCTAACTTGTCGGCCACCTGTAGCGTGTCTTCGTGTCCCTATTCCCAATGCTGGCA
CGGACGGATCAATGTAGTAAATTCAGCTCGCGACTTCGGCGGATTAGTAATCTCAGGTTG
TCTCTCTTCGTTTGATTCTTCATCTCCACCGTCTTTGGTCTATCTATGGTCCTAAGATGA
AGCTCGTGAGTGGTAAGTTCCCTTCCTTATTCCTTCTAGTTTCCTTAGATGCTTCTGTTT
TCAATTCTTTCAACTTGCTTAATCTCAAATTCATGAATGATACTTTTGTAGTGGGATATT
TAATACATATCTGGTTATTGTACTTTATGTGATTCTCTGCTGTTTGGTTTAGCATGACTA
ATGTTTTCGAGTTATTATCTCGGTGAGGGAATGTATGTGTTTGGTTACTTACAAGAATAG
CCTAAACTGGATATTATGGATGGTATTCTAGAGCTCAGTTAGTACACTATTATAATGGCT
GTAACTAAATACATTGTCCGATTTACTGTATAAAGGCAAGGAAAGAATGTATCTAAACTA
TTAAAACTGAAGTACAATTAGTACTTAACCCTAGATTTTCCCTAATAATTACGATAGACT
GCCACTAACGTAAAACAATGTCGTTTTAAAATTTTCCTAAACCAATCAGAATAAATTGAC
GTCATTTAGCCTTAAATAATAAAATCTACCGTATCAACATCCCTTGGAAGC
AT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2DM29JQ 717 0 0
AAGAATGTATCTAAACTATTAAAACTGAAGTACAATTAGTACTTAACCCTAGATTTTCCC
TAATAATTACGATAGACTGCCACTAACGTAAAACAATGTCGTTTTAAAATTTTCCTAAAC
CAATCAGAATAAATTGACGTCATTTAGCCTTAAATAATAAAATCTACCGTATCAACATCC
CTTGGAAGCCATAGATCCCAGCGGTTTGGTCTTTTGATCTTTAGGTTTTTGGTGAATTTT
TGTTCGATATTGGTTTGATTTCTGAAAGATTATTATGAGTTGTTTGAATAATCCCTGATT
TCATCCAAAGTGATTGGGTTCAATTTATTGGTTGAGTAACTCCGGCTATATACTGTGGAA
GGAGCACGGTGGTGATGGAAATAAAAATTTGTTGGACGGCTTAGTCGAAGTTTTAATATT
AGACGTAGCCCCTCGAATGTTCGAGCTTTGCGAAAGTCAATTATTTCACATGGTTAAAGT
TTTTAGATGGAAGGGTTATATTTGTGGAGGAAGCTAAACCAAGGTCAGATATTCAAAGAG
CTAAACCCGGATCAGATTTCAACAGATCTCAAACTAAACCTCGCACCTTTTGCACCTGGT
ACCTAGTTTGATACTATCTCCAACTCTAATTCTGTGTAATTTTCAATCTAGTTTTAACAT
TTGAGGTTATACAATGGACTCATTGGTTAACTCCTACCGCTGAGGGAACTTTTCTTC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL5210Contig1 1247 2 2 U
GCGACATCGTGTCTTAAAAACTTAACATACTCTCTCACTTCAAAAAAACACATCAGATTC
CCAAAGTTTTAGATTCGGAAAGCTATGGAGCAAATTCAAGTCGGAGATTCGAAATGCGGC
GGAGGAATTTCTGTCGGAACGACGACGTCGCGGTTCGATGCGTTGCCGGAAGACTGTATC
TCGATGGTGATCAACCATACCACACCACGCGATGCTTGCGTCGTGGCATCGGTTTCGAAA
ACCGTTAGGTCGGCGGCTGAGTCCGATTTGGTCTGGGAGAAGTTTCTTCCCCCGGAGTGC
TCGTCTCTCGCTCTTGTTCTTCCTCCGTCGCTGGATTGCTCTTCGAAGAAGAAGATGTAT
CTCTCTCTCGCTGATGATCCCGTCCTAATCGATGAGGGCAAAAAGAGCTTTTGGTTGGAG
AAAGCTAGTGGGAAGAAGTGTTACACGTTGTCTGCGATGGATTTGAATATCACATGGAGT
GATTCTCCCGCGTATTGGCAATGGGTTACAGTTCCTGAATCTAAGTTTGAGAAAGTAGCA
GAGCTTTGTAACGTGTGTTGGTTCGAGATTCGAGGCAAGATAAGTGTTGGAATGCTGTCT
AAGGGGACACATTACTCTGTTTACTTAGTGTTCAAGAGAGCGAGTAGTAGATCATACGGT
TTCGACCACACGCCCATCGAAACTGAAGTTGGGTTTGCCGGGAAAGGAGGCTAAGAAGAC
GTTTGTGTTTCTCGAACCGAGCGATACGGATCCTCGCAGCGGGTATGGTTACTCGGGTGT
TTCGTTAGCGGCGGTGTCTAGAGCGTTTAGGACGAGGCGTCCGTGGATGAGGTTCCCGAG
GGAAGAATTTGAAGGAGAGAGGGAGAGCGGTGGGAACGTGGAGGAGCCCAAGGAGAGAGG
TGATAAGTGGAGTGAAGTGAAGCTTGGGAGTTTTTACATTAACGATGGAGGTTGTGAGGA
TGGTGATGAGGTTGAGATTGCTATCATGGAGACTCAGATGGGACAATGGAAGAGTGGTTT
GGTTTTCCAGGGGATTGAGATAAGGCCTGTGAAGGAAGAAGTAACTAAATGATCAAAATC
AGATAATACTGTGTTCTTTGGAAGTATGAACAGAGTATAAATGAAAATACTGTGTACTGG
TATTCCATGTCTCGAGTTTAACGGTTTGAGTTTTTGAAATGAAAAAGCACAGATGTTTTG
ATGATTTTGTTTCTTGTCTGCCAATGATTGAATACAATAATTTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD68TF U 1
AF RR2BD68JQ C 523
BS 1 715 RR2BD68TF
BS 716 1247 RR2BD68JQ

RD RR2BD68TF 715 0 0
GCGACATCGTGTCTTAAAAACTTAACATACTCTCTCACTTCAAAAAAACACATCAGATTC
CCAAAGTTTTAGATTCGGAAAGCTATGGAGCAAATTCAAGTCGGAGATTCGAAATGCGGC
GGAGGAATTTCTGTCGGAACGACGACGTCGCGGTTCGATGCGTTGCCGGAAGACTGTATC
TCGATGGTGATCAACCATACCACACCACGCGATGCTTGCGTCGTGGCATCGGTTTCGAAA
ACCGTTAGGTCGGCGGCTGAGTCCGATTTGGTCTGGGAGAAGTTTCTTCCCCCGGAGTGC
TCGTCTCTCGCTCTTGTTCTTCCTCCGTCGCTGGATTGCTCTTCGAAGAAGAAGATGTAT
CTCTCTCTCGCTGATGATCCCGTCCTAATCGATGAGGGCAAAAAGAGCTTTTGGTTGGAG
AAAGCTAGTGGGAAGAAGTGTTACACGTTGTCTGCGATGGATTTGAATATCACATGGAGT
GATTCTCCCGCGTATTGGCAATGGGTTACAGTTCCTGAATCTAAGTTTGAGAAAGTAGCA
GAGCTTTGTAACGTGTGTTGGTTCGAGATTCGAGGCAAGATAAGTGTTGGAATGCTGTCT
AAGGGGACACATTACTCTGTTTACTTAGTGTTCAAGAGAGCGAGTAGTAGATCATACGGT
TTCGACCACACGCCCATCGAAACTGAAGTTGGGTTTGCCGGGAAAGGAGGCTAAG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2BD68JQ 725 0 0
AAGTTTGAGAAAGTAGCAGAGCTTTGTAACGTGTGTTGGTTCGAGATTCGAGGCAAGATA
AGTGTTGGAATGCTGTCTAAGGGGACACATTACTCTGTTTACTTAGTGTTCAAGAGAGCG
AGTAGTAGATCATACGGTTTCGACCACACGCCCATCGAAACTGAAGTTGGGTTTGCCGGG
AA*GGAGGCTAAGAAGACGTTTGTGTTTCTCGAACCGAGCGATACGGATCCTCGCAGCGG
GTATGGTTACTCGGGTGTTTCGTTAGCGGCGGTGTCTAGAGCGTTTAGGACGAGGCGTCC
GTGGATGAGGTTCCCGAGGGAAGAATTTGAAGGAGAGAGGGAGAGCGGTGGGAACGTGGA
GGAGCCCAAGGAGAGAGGTGATAAGTGGAGTGAAGTGAAGCTTGGGAGTTTTTACATTAA
CGATGGAGGTTGTGAGGATGGTGATGAGGTTGAGATTGCTATCATGGAGACTCAGATGGG
ACAATGGAAGAGTGGTTTGGTTTTCCAGGGGATTGAGATAAGGCCTGTGAAGGAAGAAGT
AACTAAATGATCAAAATCAGATAATACTGTGTTCTTTGGAAGTATGAACAGAGTATAAAT
GAAAATACTGTGTACTGGTATTCCATGTCTCGAGTTTAACGGTTTGAGTTTTTGAAATGA
AAAAGCACAGATGTTTTGATGATTTTGTTTCTTGTCTGCCAATGATTGAATACAATAATT
TAATT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL5211Contig1 1114 2 2 U
GGGCAAAAAGCAATTATTTTAAAGTGAGAGGAAAAGAGAAAACGTTAAGGGTAGATCCGA
ACCCCTTCTTCTACGGGTCGGGAAGAAACTTCTGAAGCCTCAGAAAAGAAAAAAAAACTT
TATTATATCAAATCTACGAGATTTATCATCAGAGCAGTGACTACAGAACCCAGATCAACT
GAAACTCTTCTAAATGATCCACTTTCCAATTCCGTAGCTCCAAGAGTTAAGAAACCCAGC
GTCTCCGATATGGACAACATCAGCTTTCCTTCTCAGCGATGAAGCATATCATCCAGCCAG
ACTTTTGATTCTCAATCTGTTTCCAGAAACTCAAATCCCCTGCCTGAGTTTGTAAACCAA
GGCCTTCTTCTTTGGAATCAGACAAGGGCCTTGTGAGAGCAAGGAAAGACCTAATAACAA
TCCATCGGATTGCAATCAAGGATCCAAGATAAAGTGAGTGGCCTCATTATTCACACACTA
TTGTTGGAACCAGCATTGTATGATAGTCTGCTGGGGAGCAACAATTTTTTTCCCCAACCC
ATTCCGCTCAATGGGCATGGATAATTATAAAAGAAAGCGCGAGGCCTTTGATAAATCAAT
GGAAAGGAAGGAATTAGCAGAGCAGGAAGCAGTCTGAAAGAACCTGGAAGCTTTCCACTA
GAGAAACTATTGGCGATATTCCAGTGCTTTGTCGCTGTAGGAGATTCTTCATTTGGCGAA
GAGGATGATGAAGAAGGAGAAGAAGAAGCTACTGGTTACGACAAGGAGAGTAATAATATG
GTGTCAAATAGCATAGGGTGAAACAGTAGATTATGCTCTGATGCACTTTGTGTGTGTTTT
GTTTGCCTTTTATTTGGTTTATAGGTTGTGAGAAGCCTCAGCTTTCCACTGTCCAAGTAC
TTGTAGAGAAGATAACACTATATGGGAAATCCAAAAGCTTTGAGGAAGAAACTAACGGTA
AATCTTCTTGGAGAAGACACTATATGGACGCCATGCATCCTCTAAGCTCTAAACCCGGTT
TAAGCAAGAATCTCCTTGATTTTGTGGTTTGAGAATTTATTTTATCACACTAAAACTTAT
TAATCTTATAATAATGTGGTCCAAACTTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H171TF U 1
AF RR2H171JQ C 405
BS 1 593 RR2H171TF
BS 594 1114 RR2H171JQ

RD RR2H171TF 593 0 0
GGGCAAAAAGCAATTATTTTAAAGTGAGAGGAAAAGAGAAAACGTTAAGGGTAGATCCGA
ACCCCTTCTTCTACGGGTCGGGAAGAAACTTCTGAAGCCTCAGAAAAGAAAAAAAAACTT
TATTATATCAAATCTACGAGATTTATCATCAGAGCAGTGACTACAGAACCCAGATCAACT
GAAACTCTTCTAAATGATCCACTTTCCAATTCCGTAGCTCCAAGAGTTAAGAAACCCAGC
GTCTCCGATATGGACAACATCAGCTTTCCTTCTCAGCGATGAAGCATATCATCCAGCCAG
ACTTTTGATTCTCAATCTGTTTCCAGAAACTCAAATCCCCTGCCTGAGTTTGTAAACCAA
GGCCTTCTTCTTTGGAATCAGACAAGGGCCTTGTGAGAGCAAGGAAAGACCTAATAACAA
TCCATCGGATTGCAATCAAGGATCCAAGATAAAGTGAGTGGCCTCATTATTCACACACTA
TTGTTGGAACCAGCATTGTATGATAGTCTGCTGGGGAGCAACAATTTTTTTCCCCAACCC
ATTCCGCTCAATGGGCATGGATAATTATAAAAGAAAGCGCGAGGCCTTTGATA

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2H171JQ 710 0 0
AAAGACCTAATAACAATCCATCGGATTGCAATCAAGGATCCAAGATAAAGTGAGTGGCCT
CATTATTCACACACTATTGTTGGAACCAGCATTGTATGATAGTCTGCTGGGGAGCAACAA
TTTTTTTCCCCAACCCATTCCGCTCAATGGGCATGGATAATTATAAAAGAAAGCGCGAGG
CCTTTGATAAATCAATGGAAAGGAAGGAATTAGCAGAGCAGGAAGCAGTCTGAAAGAACC
TGGAAGCTTTCCACTAGAGAAACTATTGGCGATATTCCAGTGCTTTGTCGCTGTAGGAGA
TTCTTCATTTGGCGAAGAGGATGATGAAGAAGGAGAAGAAGAAGCTACTGGTTACGACAA
GGAGAGTAATAATATGGTGTCAAATAGCATAGGGTGAAACAGTAGATTATGCTCTGATGC
ACTTTGTGTGTGTTTTGTTTGCCTTTTATTTGGTTTATAGGTTGTGAGAAGCCTCAGCTT
TCCACTGTCCAAGTACTTGTAGAGAAGATAACACTATATGGGAAATCCAAAAGCTTTGAG
GAAGAAACTAACGGTAAATCTTCTTGGAGAAGACACTATATGGACGCCATGCATCCTCTA
AGCTCTAAACCCGGTTTAAGCAAGAATCTCCTTGATTTTGTGGTTTGAGAATTTATTTTA
TCACACTAAAACTTATTAATCTTATAATAATGTGGTCCAAACTTTTTATT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL5212Contig1 1071 2 2 U
GGCAGATTTAAGCAAATATCGAATTGTATTCCGAGCTTGCTGGAGGAGGAAGAAAGAGCC
GCGATTTCCTTTCATTCGTTATCGTAGTTAACTCTATTTTCACGGTTGTTTAGAGCTTTG
TATTCGAGAATGGCGAGGAAGCGCACAAGGTCACGTTGAATGTCTACGACCTAAGCCGAG
GCTTGGCACGCCAGCTCTCTGCTTCATTTTTGGGGAAGGTTATCGAAGGTGTCTGGCATA
CGGGAGTGGTTGTGTATGGAAGTGAATACTTTTTCGGAGGAGGAATCCAGCATTTGCCTG
CTGGAACCACCCCATACGGAGCACCGCTGCGAACGGTGGAGTTGGGTGAAACACACGTTC
CTAAAGACGTGTTCGAGATGTACTTGGATGAGATCAGTCCACGTTACACAGCTGAATCCT
ACAATCTGCTGGCTCACAACTGCAACAATTTCAGCAACGAGGTCGCTCAGTTTCTTGTCG
GTAAAGGGATTCCAGACTACATTCTTGACCTTCCGAACGAGGTCATGAACAGCCCCATGG
ATGGTCTTATAATGCCTATGATTCAAAACCTCGAGACGACTCTGAGAGCCGGTGCTGTTC
CTAACGCTCCCCAGTTTAGGCCTCAGGCACAGCCTTTTGGTGCTTTTGGCAAGGATGAAG
GTCCGAAACTACCGAGCAAGCCCAAGGAGAATCACTCGAAATCTGAGGATGCCAAAACCT
CGGTTCCAGCTGAAAAAGTGGCACCTGCTGTTGCTCAAGCTTCTTCTAGTAAAGAGAAGG
TGAGGGAGGATCCATTGGGTGATGCTAGGACCAAGATTCAGGAAGAGATCACGCGTGAGT
TTGCAGCTCTCATGGCACAAGGCACACTAAGAGCAAGTGAAGCAGCCGCCATGGCCACCA
AAAGAGTGATGCAAAAGTATGGACATCTCAATATATCTGCCTAGTCTAATGAAAACAGAT
TAAACCGTTTATCTTGCTGTTGTATTGAAACCGATTCCATGATTTTGAACGATTTTTATT
ACTATTTTTTCCAACTACATTCGTATATTAATGTTAAACGATTCACAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E110TF U 1
AF RR2E110JQ C 431
BS 1 656 RR2E110TF
BS 657 1071 RR2E110JQ

RD RR2E110TF 656 0 0
GGCAGATTTAAGCAAATATCGAATTGTATTCCGAGCTTGCTGGAGGAGGAAGAAAGAGCC
GCGATTTCCTTTCATTCGTTATCGTAGTTAACTCTATTTTCACGGTTGTTTAGAGCTTTG
TATTCGAGAATGGCGAGGAAGCGCACAAGGTCACGTTGAATGTCTACGACCTAAGCCGAG
GCTTGGCACGCCAGCTCTCTGCTTCATTTTTGGGGAAGGTTATCGAAGGTGTCTGGCATA
CGGGAGTGGTTGTGTATGGAAGTGAATACTTTTTCGGAGGAGGAATCCAGCATTTGCCTG
CTGGAACCACCCCATACGGAGCACCGCTGCGAACGGTGGAGTTGGGTGAAACACACGTTC
CTAAAGACGTGTTCGAGATGTACTTGGATGAGATCAGTCCACGTTACACAGCTGAATCCT
ACAATCTGCTGGCTCACAACTGCAACAATTTCAGCAACGAGGTCGCTCAGTTTCTTGTCG
GTAAAGGGATTCCAGACTACATTCTTGACCTTCCGAACGAGGTCATGAACAGCCCCATGG
ATGGTCTTATAATGCCTATGATTCAAAACCTCGAGACGACTCTGAGAGCCGGTGCTGTTC
CTAACGCTCCCCAGTTTAGGCCTCAGGCACAGCCTTTTGGTGCTTTTGGCAAGGAT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2E110JQ 641 0 0
GGCTCACAACTGCAACAATTTCAGCAACGAGGTCGCTCAGTTTCTTGTCGGTAAAGGGAT
TCCAGACTACATTCTTGACCTTCCGAACGAGGTCATGAACAGCCCCATGGATGGTCTTAT
AATGCCTATGATTCAAAACCTCGAGACGACTCTGAGAGCCGGTGCTGTTCCTAACGCTCC
CCAGTTTAGGCCTCAGGCACAGCCTTTTGGTGCTTTTGGCAAGGATGAAGGTCCGAAACT
ACCGAGCAAGCCCAAGGAGAATCACTCGAAATCTGAGGATGCCAAAACCTCGGTTCCAGC
TGAAAAAGTGGCACCTGCTGTTGCTCAAGCTTCTTCTAGTAAAGAGAAGGTGAGGGAGGA
TCCATTGGGTGATGCTAGGACCAAGATTCAGGAAGAGATCACGCGTGAGTTTGCAGCTCT
CATGGCACAAGGCACACTAAGAGCAAGTGAAGCAGCCGCCATGGCCACCAAAAGAGTGAT
GCAAAAGTATGGACATCTCAATATATCTGCCTAGTCTAATGAAAACAGATTAAACCGTTT
ATCTTGCTGTTGTATTGAAACCGATTCCATGATTTTGAACGATTTTTATTACTATTTTTT
CCAACTACATTCGTATATTAATGTTAAACGATTCACAGACC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL5213Contig1 612 2 2 U
GAACTTTCTGAAAGCCTTTCTTTCAGTTTCACAATTTCATTGTCGTCTATTCTTAGAGGT
TTCTCTATTTGTAAGAAGGTAAGAGAAACACAACAATAAAAAATGGAAGGGAAAGAGAAA
GAAGAAGCGAAGAGGAGGACGATGTTGAATAAGATCAAACTCAAGGAGACAGAACAACAA
GAGATCAGCCAAGAAGACGCCAAAAGACAAGAGGCTTACAACATGTCCCCACGTGCACGT
GGTGGTGGTGGTCCGGCGGGTATGATGAAGTCGTCGAGTGTGAGGCAAAGCTGTTTATGC
GCGCCAACCACACACCCTGGCTCCTTCAGGTGCCGTTACCACCGTCGTAACGCTGGACTT
GGAATGTCACGTGGCATATCCGTACCGTCTAACCTTTCCATGTTGGCTGGAGGAGCAGGC
TCTGATGCTACCTCTGGCTCTCTCAAGTCCTGAAGTCATCCCACGGTTAAAATAACATAT
AATGAAATGTTTTCTTCTCAATTCTAAACTTCTTAAATGTGTGTTTGTATATATAATATT
GAGACAGGCTTTGATTTTCTTTTCTTGTTATTATGTTGGTAAATAATTTTCTTTACTTTA
TATTATGTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF83TF U 1
AF RR2G014TF U 367
BS 1 557 RR2FF83TF
BS 558 612 RR2G014TF

RD RR2FF83TF 557 0 0
GAACTTTCTGAAAGCCTTTCTTTCAGTTTCACAATTTCATTGTCGTCTATTCTTAGAGGT
TTCTCTATTTGTAAGAAGGTAAGAGAAACACAACAATAAAAAATGGAAGGGAAAGAGAAA
GAAGAAGCGAAGAGGAGGACGATGTTGAATAAGATCAAACTCAAGGAGACAGAACAACAA
GAGATCAGCCAAGAAGACGCCAAAAGACAAGAGGCTTACAACATGTCCCCACGTGCACGT
GGTGGTGGTGGTCCGGCGGGTATGATGAAGTCGTCGAGTGTGAGGCAAAGCTGTTTATGC
GCGCCAACCACACACCCTGGCTCCTTCAGGTGCCGTTACCACCGTCGTAACGCTGGACTT
GGAATGTCACGTGGCATATCCGTACCGTCTAACCTTTCCATGTTGGCTGGAGGAGCAGGC
TCTGATGCTACCTCTGGCTCTCTCAAGTCCTGAAGTCATCCCACGGTTAAAATAACATAT
AATGAAATGTTTTCTTCTCAATTCTAAACTTCTTAAATGTGTGTTTGTATATATAATATT
GAGACAGGCTTTGATTT

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2G014TF 246 0 0
G
CACGTGGCATATCCGTACCGTCTAACCTTTCCATGTTGGCTGGAGGAGCAGGCTCTGATG
CTACCTCTGGTTCTCTCAAGTCCTGAAGTCATCCCACGGTTAAAATAACATATAATGAAA
TGTTTTCTTCTCAATTCTAAACTTCTTAAATGTGTGTTTGTATATATAATATTGAGACAG
GCTTTGATTTTCTTTTCTTGTTATTATGTTGGTAAATAATTTTCTTTACTTTATATTATG
TTCTG

QA 2 246 2 246
DS 



AS 1 2

CO CL5214Contig1 438 2 6 U
CAACCCCTAACAACAAGTAACAAGTAACAATTAAACGAACAATTACAGGGAAAACGTTTT
GAAACTTCAAATTCCAATTTCAAAATGATTAAATAATTAATTTTCTCAAAATCTATATAC
AAAAGGACACATGAAAAAAAACAAAAAAAAACTACCAATGGGTTGGGGGGATGTAATCAT
ATACTCGGACTTGGTGCCACTCTCAATCCGAAAGTAGCTGAACTACCCAGCATAAGTTTG
CTTCAAATACTCTATGATTTCTGCACTCTCAAACATATTTACTCCAGTGTTTGGATCTTC
CAGGTAAGGCACCTGAAAGTGACCAGCTTTCATAAGCAATTCCTGCCGTTTGGAACTACC
ACGAGCACAGCTGCGTTGAATGTGTGGTAACTCTAGTTCCACAAGAACTTCGCGTACAAG
CTTGCAAAACGGAGAACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY05JQ U 1
AF RR2GY13JQ U 1
BS 1 74 RR2GY05JQ
BS 75 75 RR2GY13JQ
BS 76 137 RR2GY05JQ
BS 138 138 RR2GY13JQ
BS 139 197 RR2GY05JQ
BS 198 438 RR2GY13JQ

RD RR2GY05JQ 197 0 0
CAACCCCTAACAACAAGTAACAAGTAACAATTAAACGAACAATTACAGGGAAAACGTTTT
GAAACTTCAAATTCGAATTTCAAAATGATTAAATAATTAATTTTCTCAAAATCTATATAC
AAAAGGACACATGAAAAGAAACAAAAAAAAACTACCAATGGGTTGGGGGGATGTAATCAT
ATACTCGGACTTGGTGC

QA 1 197 1 197
DS 

RD RR2GY13JQ 438 0 0
CAACCCCTAACAACAAGTAACAAGTAACAATTAAACGAACAATTACAGGGAAAACGTTTT
GAAACTTCAAATTCCAATTTCAAAATGATTAAATAATTAATTTTCTCAAAATCTATATAC
AAAAGGACACATGAAAAAAAACAAAAAAAAACTACCAATGTGTTGGGGGGATGTAATCAT
ATACTCGGACTTGGTGCCACTCTCAATCCGAAAGTAGCTGAACTACCCAGCATAAGTTTG
CTTCAAATACTCTATGATTTCTGCACTCTCAAACATATTTACTCCAGTGTTTGGATCTTC
CAGGTAAGGCACCTGAAAGTGACCAGCTTTCATAAGCAATTCCTGCCGTTTGGAACTACC
ACGAGCACAGCTGCGTTGAATGTGTGGTAACTCTAGTTCCACAAGAACTTCGCGTACAAG
CTTGCAAAACGGAGAACC

QA 1 438 1 438
DS 



AS 1 2

CO CL5215Contig1 1009 2 10 U
GAGGTGATATCAGTACAAGTAGCCGAGACCCCATGAGACCTGTTGTTCCGATTACTTCAC
GAATTTAGAAATATATAGGCTTTGCTTAGTCGATTTAGTTGTTTATGATTAATAAAATCT
TCATGTTAGAGTTACTATGCAGTCTGGTAATATGTTTATACACTAGATCGATTAGAAAGA
TTAAAAAAACAGTTTTATAATGTTAAGATCCACAAAGAAAAACAGAGACGTTTGATAATA
AGAAAAAACACATGGGAGGACTCGGAAACTAGTTCGTCTACATGAACCTGCCATGCCAAA
AAAAAAAAACAAGACAAACGTGATCATTAACCAGCCTGAACCTTCTTCCCATCTTCAATG
AAGAAAATTGATCTTTCAGGTACCTGTAAATAGGCAATGCAACAGTCAATAGTGTTATTA
GGAAGGGGATTCTGAAACATATTTAAAGAAGCTACTCATACGAATGGACGAAGAGAAAAG
AAAAAGGGATAAGTTCTGTTACGTCGGGCCAAGTGTCTGTAATGAATTCAACGATGTCAT
AAATTATATCTCCTTGAACATCAATTTGCTCCTTCTCAGTTGGTCCCTGAAACAGCAGAA
ACATAGATAAACCTCTAAGCATAAGATGAAAGAAAAGGAAACAAACAGAGTGGTTCCCAT
GGCGGGTGAATGTCTAAACTCTAATTACAAACTCTACAAAACCATAAGCTACTTAACCTA
GATCATACTTGTTCCTATTGATCACAAAATCACTAATATATCTAAGCACATAACCTACTA
TTCATAATTGATTTGCTACATACCTTGACAACTGATGCTCCAGTTGCAAACTTCTTCCCA
AGCTTTTTAGACGCATCGCTGAGTTTTATCCCCGATGAACACATTTAAAGGGTCAAAAGG
AGGTTTGTTTAAGCCAATAGGAATATAAAGACGATTCATCCAAATAACTCACCAAAGAGT
TCTAGCCCTTTCACAATGGTGATAGACTTGCGCTTGTTGCGCACAACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG34TF U 1
AF RR2GG34JQB C 596
BS 1 654 RR2GG34TF
BS 655 655 RR2GG34JQB
BS 656 700 RR2GG34TF
BS 701 701 RR2GG34JQB
BS 702 748 RR2GG34TF
BS 749 749 RR2GG34JQB
BS 750 774 RR2GG34TF
BS 775 775 RR2GG34JQB
BS 776 805 RR2GG34TF
BS 806 1009 RR2GG34JQB

RD RR2GG34TF 805 0 0
GAGGTGATATCAGTACAAGTAGCCGAGACCCCATGAGACCTGTTGTTCCGATTACTTCAC
GAATTTAGAAATATATAGGCTTTGCTTAGTCGATTTAGTTGTTTATGATTAATAAAATCT
TCATGTTAGAGTTACTATGCAGTCTGGTAATATGTTTATACACTAGATCGATTAGAAAGA
TTAAAAAAACAGTTTTATAATGTTAAGATCCACAAAGAAAAACAGAGACGTTTGATAATA
AGAAAAAACACATGGGAGGACTCGGAAACTAGTTCGTCTACATGAACCTGCCATGCCAAA
AAAAAAAAACAAGACAAACGTGATCATTAACCAGCCTGAACCTTCTTCCCATCTTCAATG
AAGAAAATTGATCTTTCAGGTACCTGTAAATAGGCAATGCAACAGTCAATAGTGTTATTA
GGAAGGGGATTCTGAAACATATTTAAAGAAGCTACTCATACGAATGGACGAAGAGAAAAG
AAAAAGGGATAAGTTCTGTTACGTCGGGCCAAGTGTCTGTAATGAATTCAACGATGTCAT
AAATTATATCTCCTTGAACATCAATTTGCTCCTTCTCAGTTGGTCCCTGAAACAGCAGAA
ACATAGATAAACCTCTAAGCATAAGATGAAAGAAAAGGAAACAAACAGAGTGGT*CCCAT
GGCGGGTGAATGTCTAAACTCTAATTACAAACTCTACAAA*CCATAAGCTACTTAACCTA
GATCATACTTGTTCCTATTGATCACAAA*TCACTAATATATCTAAGCACATAAC*TACTA
TTCATAATTGATTTGCTACATACCT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2GG34JQB 414 0 0
CAGAAACATAGATAAACCTCTAAGCATAAGATGAAAGAAAAGGAAACAAACAGAGTGGTT
CCCATGGCGG*TGAATGTCTAAACTCTAATTACAAACTCTACAAAACCATAAGCTACTTA
ACCTAGATCATACTTGTTCCTATTGATCACAAAATCACTAATATATCTAAGCACATAACC
TACTATTCATAATTGATTTGCTACATACCTTGACAACTGATGCTCCAGTTGCAAACTTCT
TCCCAAGCTTTTTAGACGCATCGCTGAGTTTTATCCCCGATGAACACATTTAAAGGGTCA
AAAGGAGGTTTGTTTAAGCCAATAGGAATATAAAGACGATTCATCCAAATAACTCACCAA
AGAGTTCTAGCCCTTTCACAATGGTGATAGACTTGCGCTTGTTGCGCACAACCT

QA 1 414 1 414
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5217Contig1 925 2 6 U
ACACAAGTCACAAGATCGAGAAAACCCCATAAATCTCCCAAAATGGCAAACACTTACTTC
CTTCCTCTGTTTCTTTCTCTTACCGTCATCTCTTCTGTTTCAGCTAATTTCCAGAGAGAC
GTTGAGATCACTTGGGGAGACGGACGTGGACAAATCACAAACAATGGAGAGCTTCTCACT
TTATCTCTAGACAAATCATCTGGCTCTGGCTTCCAATCCAAGAACGAGTACTTGTTCGGT
AAAATCGACATGCAGATGAAACTTGTCCCGGGAAACTCCGCAGGAACAGTCACAACACTC
TACTTGAAATCACCTGGAACAACATGGGACGAGATTGACTTCGAGTTCTTAGGAAACCTA
AGTGGAGATCCTTACACACTCCACACAAATGTCTACACACAAGGCAAAGGAGACAAAGAA
CAGCAGTTCAAACTCTGGTTCGATCCAACAGCTGATTTCCACACGTACACCATAATATGG
AACCCACAACGAATCATTTTCACCGTCGATGGAACTCCCATTAGAGAATTCAAGAACATG
GAATCTGTTGGCACTCTATTTCCCAAGAACCAACCAATGAGAATGTATTCCAGTCTTTGG
AACGCTGATGATTGGGCCACGAGAGGTGGTTTGGTCAAAACCGATTGGTCTAAGGCTCCT
TTCACTGCTTCTTACCGTGGCTTCAACCAAGAAGCTTGTGTTTGGTCAAACGGCAAGTCA
TCTTGTCCTAATGGCTCGGGACAGGGGACCACCGGCTCTTGGGTGTCCCAGGAGCTTGAT
TCAACGGCTCAAGAAAGGGTGAGATGGGTGCAGAAGAACTACATGATTTACAACTATTGC
ACGGATACGAAGAGATTCCCTCACGGTCTCCCTAAAGAGTGCTTAGCTGCATAGAGAGTA
AAGAGTTGTTATTGTTATAATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C731TF U 1
AF RR2C731JQ C 512
BS 1 654 RR2C731TF
BS 655 655 RR2C731JQ
BS 656 685 RR2C731TF
BS 686 686 RR2C731JQ
BS 687 705 RR2C731TF
BS 706 925 RR2C731JQ

RD RR2C731TF 705 0 0
ACACAAGTCACAAGATCGAGAAAACCCCATAAATCTCCCAAAATGGCAAACACTTACTTC
CTTCCTCTGTTTCTTTCTCTTACCGTCATCTCTTCTGTTTCAGCTAATTTCCAGAGAGAC
GTTGAGATCACTTGGGGAGACGGACGTGGACAAATCACAAACAATGGAGAGCTTCTCACT
TTATCTCTAGACAAATCATCTGGCTCTGGCTTCCAATCCAAGAACGAGTACTTGTTCGGT
AAAATCGACATGCAGATGAAACTTGTCCCGGGAAACTCCGCAGGAACAGTCACAACACTC
TACTTGAAATCACCTGGAACAACATGGGACGAGATTGACTTCGAGTTCTTAGGAAACCTA
AGTGGAGATCCTTACACACTCCACACAAATGTCTACACACAAGGCAAAGGAGACAAAGAA
CAGCAGTTCAAACTCTGGTTCGATCCAACAGCTGATTTCCACACGTACACCATAATATGG
AACCCACAACGAATCATTTTCACCGTCGATGGAACTCCCATTAGAGAATTCAAGAACATG
GAATCTGTTGGCACTCTATTTCCCAAGAACCAACCAATGAGAATGTATTCCAGTCTTTGG
AACGCTGATGATTGGGCCACGAGAGGTGGTTTGGTCAAAACCGATTGGTCTAAG*CTCCT
TTCACTGCTTCTTACCGTGGCTTCA*CCAAGAAGCTTGTGTTTGG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2C731JQ 414 0 0
GAACTCCCATTAGAGAATTCAAGAACATGGAATCTGTTGGCACTTTATTTCCCAAGAACC
AACCAATGAGAATGTATTCCAGTCTTTGGAACGCTGATGATTGGGCCACGAGAGGTGGTT
TGGTCAAAACCGATTGGTCTAAGGCTCCTTTCACTGCTTCTTACCGTGGCTTCAACCAAG
AAGCTTGTGTTTGGTCAAACGGCAAGTCATCTTGTCCTAATGGCTCGGGACAGGGGACCA
CCGGCTCTTGGGTGTCCCAGGAGCTTGATTCAACGGCTCAAGAAAGGGTGAGATGGGTGC
AGAAGAACTACATGATTTACAACTATTGCACGGATACGAAGAGATTCCCTCACGGTCTCC
CTAAAGAGTGCTTAGCTGCATAGAGAGTAAAGAGTTGTTATTGTTATAATTTTT

QA 1 414 1 414
DS 



AS 1 2

CO CL5218Contig1 1171 2 2 U
GGAAGCAAGAGGTGAGAGAGAGTTCCATTTTCGTCGGGTCAAAACCACAGTCGGGGAGCG
AGGATCAATGGCGGCGATATTAATCGGAAGAGCCTTCAATTCAGCTAAAGTCCTCCGTGC
TCGATCATTCTGCACAGTCTCCGCCGCTCGTAAACCCGATTCCGACGGTCACTCATCGGA
ACCTTCTCCCTCGTCCTCTTCGTTCACGTTCGACGAGGAAAACGAGAAACCCATCCTCGT
GAAAGCCCCGAACGCACGACGGAACAACAACGATTCGGACTCGGTGACGATGCCGACGTC
TTTCATGACGGGGTCGATCGTGGGGAAGAGGTTCTACAAGAAGGTGACGACGAGAGAGGC
AGACGATGGGAATGGATGGACTGTGATGCTCGATTACAGGACGCTTAAAACTCCTTCGAA
GAGACCTCTCAAGCTTCCTTCTTTGGCTCTCGCTAAGGCCATTGCAGCTGAATGGGAGTA
TCAGCTAGCAGAAGGAATCAGACCATTCACAATGCCGCTGATGAAACTAGCATGTACTGC
ACTTGAAAGAGTTCCTCCCACACGCCCAAAGATTATTGAGCATCTATTAAGAAAGTTACA
TCAAGATCTCGTCTTTTTCCGAGCGCCTGAAGATAACGATCTAACTAGTGACGTCCATGA
GGTTCAGGTGGAGAGGATTGATCCTCTACTTGAGTGGGTAGAATCAGAGTTTGGGATCAA
ACCCAAAGTGTATGCAAGCATCTTTGGAGGAAAACAAGATGAGAAGCTAGTCAAAGCAGT
AGAGAATCTGCTTAAGAAGACAAATGATGGTGAACTTGCAAGCATCGATGCGCTTGAAGC
ATCGCTCACTCTGTAGTAATTGCGCTTGGCGTCTACTGTGGGAAGTTGCAGATCGATGAT
GCAATTAAATTGATTAGACTCGAAGAAGATTTACAGGTGGACAAGTGGGGACTAGTGGAA
GGTGGACATGATATTGATATTGCTGATCTCAAAGTTCAAATCTCAGCGGCTACCGTGTTT
CTTGCTCTGTCCCGTCAGAACTGATCATAACTCTATTTTGCTCAAATACCTTTTCATTTA
TTCCAAAAAATAAAGCTGGTCTCTTAGCATTATCTGTTTGTAGAATTGATGATTGTAAGG
GTTACATCAATACAAGAATGAATCTAAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F421TF U 1
AF RR2F421JQ C 433
BS 1 613 RR2F421TF
BS 614 1171 RR2F421JQ

RD RR2F421TF 613 0 0
GGAAGCAAGAGGTGAGAGAGAGTTCCATTTTCGTCGGGTCAAAACCACAGTCGGGGAGCG
AGGATCAATGGCGGCGATATTAATCGGAAGAGCCTTCAATTCAGCTAAAGTCCTCCGTGC
TCGATCATTCTGCACAGTCTCCGCCGCTCGTAAACCCGATTCCGACGGTCACTCATCGGA
ACCTTCTCCCTCGTCCTCTTCGTTCACGTTCGACGAGGAAAACGAGAAACCCATCCTCGT
GAAAGCCCCGAACGCACGACGGAACAACAACGATTCGGACTCGGTGACGATGCCGACGTC
TTTCATGACGGGGTCGATCGTGGGGAAGAGGTTCTACAAGAAGGTGACGACGAGAGAGGC
AGACGATGGGAATGGATGGACTGTGATGCTCGATTACAGGACGCTTAAAACTCCTTCGAA
GAGACCTCTCAAGCTTCCTTCTTTGGCTCTCGCTAAGGCCATTGCAGCTGAATGGGAGTA
TCAGCTAGCAGAAGGAATCAGACCATTCACAATGCCGCTGATGAAACTAGCATGTACTGC
ACTTGAAAGAGTTCCTCCCACACGCCCAAAGATTATTGAGCATCTATTAAGAAAGTTACA
TCAAGATCTCGTC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2F421JQ 739 0 0
GCTTCCTTCTTTGGCTCTCGCTAAGGCCATTGCAGCTGAATGGGAGTATCAGCTAGCAGA
AGGAATCAGACCATTCACAATGCCGCTGATGAAACTAGCATGTACTGCACTTGAAAGAGT
TCCTCCCACACGCCCAAAGATTATTGAGCATCTATTAAGAAAGTTACATCAAGATCTCGT
CTTTTTCCGAGCGCCTGAAGATAACGATCTAACTAGTGACGTCCATGAGGTTCAGGTGGA
GAGGATTGATCCTCTACTTGAGTGGGTAGAATCAGAGTTTGGGATCAAACCCAAAGTGTA
TGCAAGCATCTTTGGAGGAAAACAAGATGAGAAGCTAGTCAAAGCAGTAGAGAATCTGCT
TAAGAAGACAAATGATGGTGAACTTGCAAGCATCGATGCGCTTGAAGCATCGCTCACTCT
GTAGTAATTGCGCTTGGCGTCTACTGTGGGAAGTTGCAGATCGATGATGCAATTAAATTG
ATTAGACTCGAAGAAGATTTACAGGTGGACAAGTGGGGACTAGTGGAAGGTGGACATGAT
ATTGATATTGCTGATCTCAAAGTTCAAATCTCAGCGGCTACCGTGTTTCTTGCTCTGTCC
CGTCAGAACTGATCATAACTCTATTTTGCTCAAATACCTTTTCATTTATTCCAAAAAATA
AAGCTGGTCTCTTAGCATTATCTGTTTGTAGAATTGATGATTGTAAGGGTTACATCAATA
CAAGAATGAATCTAAAGCC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL5219Contig1 1230 2 2 U
GGATACTAGTAAACGAATGTTGCGTGCACGCGCCGAATCGTATCGTGTGGCCACCATCTC
TCGAACCGAACAGCCTCCCCACCACACGCTTCTTCTTCTACTGTTTTGTCTTTTCAATAG
TTTTTTCCGGCGAGGGTTAGATATTTTTTTTGTTTATCATGGCTGGCACTTGCAGCTCGA
TTAGGCCTCGCATCATTGGTGCTTCTTCGACTGTTAAGCTCTCCAGGTTGATTAACGGAG
CAGGAGTTCCTTTCTCCGTTAGGATCTCTACCAGAACAAGAAGCCACGGAGGTGGTTTCA
CCGCATCCATTTCATCGTCACGTGAGGAAGGCCCTTCCTGTATCTTCGTCGGTCCGATTG
ATTCCGCAAGAAAAGAAACTCTAGAAGCTCTTTACCGCCAAGCGAAGAATGCTTACTACA
ATGGAAAGCCGTTGATAGTTGATGACATGTTTGACAGAGTCGAGCTGAAGCTTCGGTGGT
ATGGTTCGAAGTCTGTTGTCAAGTACCCTCGTTGCAGCCTCCTGCGACAGTCAACTTATG
CTGATGCAGAGGATGATGCATCACAAGTTCTCCTGTTAGCTACCATATGGATCTTGATTC
TCTTGTTTGGTAGCTCAGCATGCGTTTTCCCCTCCATGTATGGCCTCGGCTTAGTCTATG
GAGGAGATCCTTTCGACTCGGGGCTTTTCTATAGCAGCAGCTCATCTTCTGTGCCTCTTC
TGACAAAGCTGAACGGCATCCTCCTCACCGTGCTAGGACCTGCTTTTGGATACCCGATTG
CATCTTCTGCAGTAAGGGTTCTTAAAGGGCTATGGAGAAATGACTTAACGGCTCTAAAAG
GAGACTGCCCTAACTGTGGGGAAGAGGTTTTTGCATTCGTTAGATCAGACCAATCAAACA
GATCAGCTCACAAAGCCGACTGTCATGTCTGTGAGTGCCCCCTGGAGTTCCGTACCAAAG
TGGAGAAATTTGCGTCGCTATTGGGTAGAAAATGGGTATACGGGAGGATATACCTCGTTT
CACGGCCTAGGAGAGGTCGGCGTTCCAAGTATCCATAGCTCTGACAAAGACAAGAAATTT
TGGGGAATGTTTCTACTCAATTGTCTATTTATTTCTAAAAAAAGTTACTAGAAGCTAGAA
AGCTTTTGTAACATCCAAAAATCTCACAAAACTGTAAAACTATAAACGTTTCTACACACC
TGAAAGTATAGTATTTTAGAGAATTTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F811TF U 1
AF RR2F811JQ C 511
BS 1 692 RR2F811TF
BS 693 1230 RR2F811JQ

RD RR2F811TF 692 0 0
GGATACTAGTAAACGAATGTTGCGTGCACGCGCCGAATCGTATCGTGTGGCCACCATCTC
TCGAACCGAACAGCCTCCCCACCACACGCTTCTTCTTCTACTGTTTTGTCTTTTCAATAG
TTTTTTCCGGCGAGGGTTAGATATTTTTTTTGTTTATCATGGCTGGCACTTGCAGCTCGA
TTAGGCCTCGCATCATTGGTGCTTCTTCGACTGTTAAGCTCTCCAGGTTGATTAACGGAG
CAGGAGTTCCTTTCTCCGTTAGGATCTCTACCAGAACAAGAAGCCACGGAGGTGGTTTCA
CCGCATCCATTTCATCGTCACGTGAGGAAGGCCCTTCCTGTATCTTCGTCGGTCCGATTG
ATTCCGCAAGAAAAGAAACTCTAGAAGCTCTTTACCGCCAAGCGAAGAATGCTTACTACA
ATGGAAAGCCGTTGATAGTTGATGACATGTTTGACAGAGTCGAGCTGAAGCTTCGGTGGT
ATGGTTCGAAGTCTGTTGTCAAGTACCCTCGTTGCAGCCTCCTGCGACAGTCAACTTATG
CTGATGCAGAGGATGATGCATCACAAGTTCTCCTGTTAGCTACCATATGGATCTTGATTC
TCTTGTTTGGTAGCTCAGCATGCGTTTTCCCCTCCATGTATGGCCTCGGCTTAGTCTATG
GAGGAGATCCTTTCGACTCGGGGCTTTTCTAT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2F811JQ 720 0 0
GTTGCAGCCTCCTGCGACAGTCAACTTATGCTGATGCAGAGGATGATGCATCACAAGTTC
TCCTGTTAGCTACCATATGGATCTTGATTCTCTTGTTTGGTAGCTCAGCATGCGTTTTCC
CCTCCATGTATGGCCTCGGCTTAGTCTATGGAGGAGATCCTTTCGACTCGGGGCTTTTCT
ATAGCAGCAGCTCATCTTCTGTGCCTCTTCTGACAAAGCTGAACGGCATCCTCCTCACCG
TGCTAGGACCTGCTTTTGGATACCCGATTGCATCTTCTGCAGTAAGGGTTCTTAAAGGGC
TATGGAGAAATGACTTAACGGCTCTAAAAGGAGACTGCCCTAACTGTGGGGAAGAGGTTT
TTGCATTCGTTAGATCAGACCAATCAAACAGATCAGCTCACAAAGCCGACTGTCATGTCT
GTGAGTGCCCCCTGGAGTTCCGTACCAAAGTGGAGAAATTTGCGTCGCTATTGGGTAGAA
AATGGGTATACGGGAGGATATACCTCGTTTCACGGCCTAGGAGAGGTCGGCGTTCCAAGT
ATCCATAGCTCTGACAAAGACAAGAAATTTTGGGGAATGTTTCTACTCAATTGTCTATTT
ATTTCTAAAAAAAGTTACTAGAAGCTAGAAAGCTTTTGTAACATCCAAAAATCTCACAAA
ACTGTAAAACTATAAACGTTTCTACACACCTGAAAGTATAGTATTTTAGAGAATTTCTTG

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL5220Contig1 789 2 5 U
GGTTTCGCCCGTCATTGCAAGGGTGGCATTGGACGATAATGCCAATTACACAAGAACAGA
GCTTTTATATAAGATGGGTTTGGCTCAAGAACCGAACAACACTTTGCTCTTAGCTAACTA
CGCTCAGTTCCTTTACCTCGTCTCTCAAGACTACGACAGAGCGGAGAAGTGTTTTAAGAA
AGCCATGGAGTCAGGAGAAGCAGACGCGGAAGCCTACAGCAAGTACGCCATCTTCCAGTG
GAAAGCTAGGAAGGATCTATGGGCGGCTGAGGAGAACTTTCTAGAAGCTATATCTGCAGA
ACCTACCAACTCCTTCTACGCTGCCAGCTACGCTAACTTCCTCTGGCAAACCGGTGGTGA
AGAAACGTGTTTCCCGTTAGATTCTTCTGATTCTCCTCAGGAAATCGCTTGAGAGAATGG
TGTGGGGATTTGATTAGCAGCAAAATCGGCAGTAAAAGAGATAGTGACTGAAGTTAGATA
GACGAAAGAAACAAAGAGGAAAAGTGTGACTGTGAGCAGTGTTTTTGAGTGAATCAGTGC
TGCTAATGAAAACATTGCTCCTCTTGCTCCTGTGTTTGTTTTATTGTGCATTTTTTTTAC
CACTTAGAAGTCCATACGGTGGCAGAGTCCACCACTGATACTGGATGGGGAGTGTGGACA
AAATAAGAGACATGTGTAGATACAAACAGTTAATAATCATTGAGCATTGCTTTTTCAGTT
TTGGGTTACGTTTTTTCTTTAACTTGTATTGTTCCCAAGACATGTTATTATGCATTTGAT
TCCAATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 10 

AF RR2B076JQ C 1
AF RR2B076TF U 109
BS 1 108 RR2B076JQ
BS 109 783 RR2B076TF
BS 784 784 RR2B076JQ
BS 785 788 RR2B076TF
BS 789 789 RR2B076JQ

RD RR2B076JQ 789 0 0
GGTTTCGCCCGTCATTGCAAGGGTGGCATTGGACGATAATGCCAATTACACAAGAACAGA
GCTTTTATATAAGATGGGTTTGGCTCAAGAACCGAACAACACTTTGCTCTTAGCTAACTA
CGCTCAGTTCCTTTACCTCGTCTCTCAAGACTACGACAGAGCGGAGAAGTGTTTTAAGAA
AGCCATGGAGTCAGGAGAAGCAGACGCGGAAGCCTACAGCAAGTACGCCATCTTCCAGTG
GAAAGCTAGGAAGGATCTATGGGCGGCTGAGGAGAACTTTCTAGAAGCTATATCTGCAGA
ACCTACCAACTCCTTTTACGCTGCCAGCTACGCTAACTTCCTCTGGCAAACCGGTGGTGA
AGAAACGTGTTTCCCGTTAGATTCTTCTGATTCTCCTCAGGAAATCGCTTGAGAGAATGG
TGTGGGGATTTGATTAGCAGCAAAATCGGCAGTAAAAGAGATAGTGACTGAAGTTAGATA
GACGAAAGAAACAAAGAGGAAAAGTGTGACTGTGAGCAGTGTTTTTGAGTGAATCAGTGC
TGCTAATGAAAACATTGCTCCTCTTGCTCCTGTGTTTGTTTTATTGTGCATTTTTTTTAC
CACTTAGAAGTCCATACGGTGGCAGAGTCCACCACTGATACTGGATGGG*AGTGTGGACA
AAATAAGAGACATGTGTAGATACAAACAGTTAATAATCATTGAGCATTGCTTTTTCAGTT
TTGG*TTACGTTTTTTCTTTAACTTGTATTGTTCCCAAGACATGTTATTATGCATTTGAT
TCCAATTAC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2B076TF 680 0 0
CTTAGCTAACTACGCTCAGTTCCTTTACCTCGTCTCTCAAGACTACGACAGAGCGGAGAA
GTGTTTTAAGAAAGCCATGGAGTCAGGAGAAGCAGACGCGGAAGCCTACAGCAAGTACGC
CATCTTCCAGTGGAAAGCTAGGAAGGATCTATGGGCGGCTGAGGAGAACTTTCTAGAAGC
TATATCTGCAGAACCTACCAACTCCTTCTACGCTGCCAGCTACGCTAACTTCCTCTGGCA
AACCGGTGGTGAAGAAACGTGTTTCCCGTTAGATTCTTCTGATTCTCCTCAGGAAATCGC
TTGAGAGAATGGTGTGGGGATTTGATTAGCAGCAAAATCGGCAGTAAAAGAGATAGTGAC
TGAAGTTAGATAGACGAAAGAAACAAAGAGGAAAAGTGTGACTGTGAGCAGTGTTTTTGA
GTGAATCAGTGCTGCTAATGAAAACATTGCTCCTCTTGCTCCTGTGTTTGTTTTATTGTG
CATTTTTTTTACCACTTAGAAGTCCATACGGTGGCAGAGTCCACCACTGATACTGGATGG
GGAGTGTGGACAAAATAAGAGACATGTGTAGATACAAACAGTTAATAATCATTGAGCATT
GCTTTTTCAGTTTTGGGTTACGTTTTTTCTTTAACTTGTATTGTTCCCAAGACATGTTAT
TATGCATTTGATTCCCATTA

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL5221Contig1 799 2 2 U
AGGGAAACACATTTGCATTTGAAAAAAAATTTGGAAGAGAATACAAAAAATGGCAACGCG
AGGAGCTGCTGCTGCGTTCGTAATATGGAAGCACCGAAGCAACCCTTCTCTTCGATCTCT
ATCATCACACCATTTCTATCCTGTTTTCAAACCTCAAATCATCCCAAAAGGGTTTAGATA
TCAAATTAGGGCGATACAAGGAGCAAGTGTTGATCCCGTTACACAATTGAAGAACAACGA
CGAGCCAAAACCTGAGAATTGGAAAATCAAAATGCTTTACGATGGGGATTGCCCTCTCTG
TATGCGTGAGGTTAATATGCTTAAGGAAAGGAATGAGGAAAATGGAACGATAAAGTTCGT
TGACATCAGTTCCAATGATTATTCCCCGCAAGAGAATCAAGGGCTTGATTACAAAACAGT
TATGGGGCAAATCCACGCGATTCAGTCCGATGGAAATGTGGTAACGGGTGTGGAGGCATT
TAGGAAACTGTATGAAGAGGTTGGGCTTGGGTGGGTTTACACTATTACTAAATTTGAACC
AATAGGGAAGGTAGCTGATGCAGTGTATGATTTCTGGGCTAAGTATCGACTTCAGGTCAC
AGGGCGGCCACCTATAGAAGCTATTTTGGAAGCGAGAAAGAAAAATAAGGTAGAGACATG
TGGTGACAGTAAGGCGTGCAAGACGTGATTTTTCTTACAAATTTACATATATCACAGCCA
GTTTGGACTTACTTATACTCTCTTGCCCACATTTTGTAAACTTAAGTGTTTCTATGTATT
AGAAAATACCTCGTTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT86TF U 1
AF RR2BT86JQ C 109
BS 1 288 RR2BT86TF
BS 289 799 RR2BT86JQ

RD RR2BT86TF 288 0 0
AGGGAAACACATTTGCATTTGAAAAAAAATTTGGAAGAGAATACAAAAAATGGCAACGCG
AGGAGCTGCTGCTGCGTTCGTAATATGGAAGCACCGAAGCAACCCTTCTCTTCGATCTCT
ATCATCACACCATTTCTATCCTGTTTTCAAACCTCAAATCATCCCAAAAGGGTTTAGATA
TCAAATTAGGGCGATACAAGGAGCAAGTGTTGATCCCGTTACACAATTGAAGAACAACGA
CGAGCCAAAACCTGAGAATTGGAAAATCAAAATGCTTTACGATGGGGA

QA 1 288 1 288
DS 

RD RR2BT86JQ 691 0 0
TCTTCGATCTCTATCATCACACCATTTCTATCCTGTTTTCAAACCTCAAATCATCCCAAA
AGGGTTTAGATATCAAATTAGGGCGATACAAGGAGCAAGTGTTGATCCCGTTACACAATT
GAAGAACAACGACGAGCCAAAACCTGAGAATTGGAAAATCAAAATGCTTTACGATGGGGA
TTGCCCTCTCTGTATGCGTGAGGTTAATATGCTTAAGGAAAGGAATGAGGAAAATGGAAC
GATAAAGTTCGTTGACATCAGTTCCAATGATTATTCCCCGCAAGAGAATCAAGGGCTTGA
TTACAAAACAGTTATGGGGCAAATCCACGCGATTCAGTCCGATGGAAATGTGGTAACGGG
TGTGGAGGCATTTAGGAAACTGTATGAAGAGGTTGGGCTTGGGTGGGTTTACACTATTAC
TAAATTTGAACCAATAGGGAAGGTAGCTGATGCAGTGTATGATTTCTGGGCTAAGTATCG
ACTTCAGGTCACAGGGCGGCCACCTATAGAAGCTATTTTGGAAGCGAGAAAGAAAAATAA
GGTAGAGACATGTGGTGACAGTAAGGCGTGCAAGACGTGATTTTTCTTACAAATTTACAT
ATATCACAGCCAGTTTGGACTTACTTATACTCTCTTGCCCACATTTTGTAAACTTAAGTG
TTTCTATGTATTAGAAAATACCTCGTTACAT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL5222Contig1 180 2 1 U
GGAACTTTATGGGTTTTAATAAATAGATTTTGATCTAAAATACATAAAGCTAGAGTCTTT
CATACTTACTGCTGTTTTAGATCTTCTGGGTTGATTCTCAAATTTTGGATTAAACTATAT
ATTACATAAGTTTGTTCTAGCTGTTCCTGTTTGATAAGTGTTCCTTTAGATGTTTGATGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GH77JQB C 1
AF RR2GH77TF U 1
BS 1 180 RR2GH77TF

RD RR2GH77JQB 180 0 0
GGAACTTTATGGGTTTTAATAAATAGATTTTGATCTAAAATACATAAAGCTAGAGTCTTT
CATACTTACTGCTGTTTTAGATCTTCTGGGTTGATTCTCAAATTTTGGATTAAACTATAT
ATTACATAAGTTTGTTCTAGCTGTTCCTGTTTGATAAGTGTTCCTTTAGATGTTTGATGC

QA 1 180 1 180
DS 

RD RR2GH77TF 180 0 0
GGAACTTTATGGGTTTTAATAAATAGATTTTGATCTAAAATACATAAAGCTAGAGTCTTT
CATACTTACTGCTGTTTTAGATCTTCTGGGTTGATTCTCAAATTTTGGATTAAACTATAT
ATTACATAAGTTTGTTCTAGCTGTTCCTGTTTGATAAGTGTTCCTTTAGATGTTTGATGC

QA 1 180 1 180
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5224Contig1 1230 2 2 U
GGGCACAGATCAGAGAAGAAAGCAAAGAAAACACAGAGAGATCGTCGTCAATTCATCCAT
GGCTACGCTCTTCACCACCACCTCTCGTCCTTTCTCCGTAAATCCTACCAAGACCTTCTC
TCCTTCTCTCTCCCTAAAAACCAATGCTCTCTCCTTTTCACTACCCCACCACCGTCCCAA
GCCTCTCCGGTTTTCCAAAATCCGATCCTCGGATTCAGACTCCGAACCGGAAGGCGGATA
TTCGATTACAGACGAGTGGGGGGAGGAACCGGTCGAACCGTTATCTCAGCCGGATAACGC
CGCGATCTCAGACGAATGGGGCGAGAAATCCGAACCGGTACCCGAGGAGACAGTGACCCG
GTTCGCGGAATCGGATCCTCCGACGAACGAGGACGAGTGGGAGGAAAGTGATGATGGAGG
AGGAGTCGACAAGACTCTGGAGCTGAAGAGGTGTTTGGCGGACACGGTGTACGGAACCGA
ATTAGGGTTCAGAGCTGGGTCTGAAGTCCGCGCGGAGGTTTTGGAGATCGTGAATCAGTT
GGAAGCTCTTAACCCTACTCAGGCTCCGGTTGAGAATCCGGAGCTCCTCGATGGCAATTG
GGTTTTGCTGTACACTGCGTTCTCTGAGTTGCTTCCTCTTCTAGCTGCGGGCTCCACACC
TTTTTTGAAAGTGAAGAGTATAACTCAGTCTATAGACACAAAGAGTCTCTCTATAGACAA
CTCCACTACTCTCTCCAGCCCCTTTGCTGACTTCTCCTTCAGTGCTACTGCTTCTTTTGA
AGTTCGAAGCCCTTCCAGAATTGAGGTTTCTTTCAAAGAAGGTACGCTAAAGCCTCCAGA
GATCAAGTCAAGTGTATATCTCCCGGAGAGCGTGGGTGTCTTCGGGCAGGAGGTTAACCT
TTCGTTCCTGAAGCAGTCTTTGAACCCTTTACAAGATGTGGCGGCAAACATTTCGCGGGC
AATCTCTGGTCAACCACCTCTCAAGCTTCCGTTTCCGGGAAACCGTGGTGGCAGCTCTTG
GCTCTTGACCACTTATCTCGACAAGGATCGCAGGATTTCGAGAGGAGACGGTGGGCTTTT
CGTGCTTGCTAGAGAAGGAAGCTCTCTGCTTGAGCTCTGAAATATTTGATGAGGTATATA
TACCAAGCAGGCTTCTTGTAAAAACAGTACCCATTAGAGGGATCATCATAATAATACTGA
ATGCAAATTATTGGACCATATTGTTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E021TF U 1
AF RR2E021JQ C 594
BS 1 716 RR2E021TF
BS 717 1230 RR2E021JQ

RD RR2E021TF 716 0 0
GGGCACAGATCAGAGAAGAAAGCAAAGAAAACACAGAGAGATCGTCGTCAATTCATCCAT
GGCTACGCTCTTCACCACCACCTCTCGTCCTTTCTCCGTAAATCCTACCAAGACCTTCTC
TCCTTCTCTCTCCCTAAAAACCAATGCTCTCTCCTTTTCACTACCCCACCACCGTCCCAA
GCCTCTCCGGTTTTCCAAAATCCGATCCTCGGATTCAGACTCCGAACCGGAAGGCGGATA
TTCGATTACAGACGAGTGGGGGGAGGAACCGGTCGAACCGTTATCTCAGCCGGATAACGC
CGCGATCTCAGACGAATGGGGCGAGAAATCCGAACCGGTACCCGAGGAGACAGTGACCCG
GTTCGCGGAATCGGATCCTCCGACGAACGAGGACGAGTGGGAGGAAAGTGATGATGGAGG
AGGAGTCGACAAGACTCTGGAGCTGAAGAGGTGTTTGGCGGACACGGTGTACGGAACCGA
ATTAGGGTTCAGAGCTGGGTCTGAAGTCCGCGCGGAGGTTTTGGAGATCGTGAATCAGTT
GGAAGCTCTTAACCCTACTCAGGCTCCGGTTGAGAATCCGGAGCTCCTCGATGGCAATTG
GGTTTTGCTGTACACTGCGTTCTCTGAGTTGCTTCCTCTTCTAGCTGCGGGCTCCACACC
TTTTTTGAAAGTGAAGAGTATAACTCAGTCTATAGACACAAAGAGTCTCTCTATAG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2E021JQ 637 0 0
GCAATTGGGTTTTGCTGTACACTGCGTTCTCTGAGTTGCTTCCTCTTCTAGCTGCGGGCT
CCACACCTTTTTTGAAAGTGAAGAGTATAACTCAGTCTATAGACACAAAGAGTCTCTCTA
TAGACAACTCCACTACTCTCTCCAGCCCCTTTGCTGACTTCTCCTTCAGTGCTACTGCTT
CTTTTGAAGTTCGAAGCCCTTCCAGAATTGAGGTTTCTTTCAAAGAAGGTACGCTAAAGC
CTCCAGAGATCAAGTCAAGTGTATATCTCCCGGAGAGCGTGGGTGTCTTCGGGCAGGAGG
TTAACCTTTCGTTCCTGAAGCAGTCTTTGAACCCTTTACAAGATGTGGCGGCAAACATTT
CGCGGGCAATCTCTGGTCAACCACCTCTCAAGCTTCCGTTTCCGGGAAACCGTGGTGGCA
GCTCTTGGCTCTTGACCACTTATCTCGACAAGGATCGCAGGATTTCGAGAGGAGACGGTG
GGCTTTTCGTGCTTGCTAGAGAAGGAAGCTCTCTGCTTGAGCTCTGAAATATTTGATGAG
GTATATATACCAAGCAGGCTTCTTGTAAAAACAGTACCCATTAGAGGGATCATCATAATA
ATACTGAATGCAAATTATTGGACCATATTGTTTCCCC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL5225Contig1 1132 2 2 U
GCAACGTCGCCGGTCAAACACAGCTTGACTCTCTCATAGCTAACTATTTCAACACCGGTT
GGTCAACATACAATCCTCTCTTGTCAGCAACGACTACAAAACCCACAGATGGCTCTACAC
CACCACCACCACCACTACCTATCTCGTCAGAACAAGCCTTCTTCACAAACCCACTTCAAC
AAAATCTGAGAGCAGTTTCAAACACAAACACAAGTAGTCCCATGTGTTCTGTCTCCACCG
ACAAGAAAAACGGTCTGGCCACAGCACGGAATCTAAAGAAGAGATCTAGAGTTTCGAGAC
GAGCGCCTACGACTGTTTTGACCACCGACACTTCAAACTTCAGAGCCATGGTTCAAGAGT
TCACTGGTAGTCCTTCTACTCCTTTCACCGGATCACTATCACCTTCGTTTCCAAGATCAA
GATTTGATCTCTTCAGTCCTTCTTCATCTTCACGACCCTTGAAACCTTTTCCTCACAAAC
TTATCCCACCATCATCAACGAGTCACCAATACCTAAATCCTCCTTCTACAAATTATCACC
AGAGTCTTCTCCGTAACACGAACACGCAAAACATCGCAAACCATTTTCTTATCAACCAAT
CTCCTAGCAACGTCCCTTTGATGGATCAGTCGTTGAGTTTGAGAACAAGTAATGGTGTTG
GACACGTGGACGTGGGAACAAACTTTGAGGAGCTTCACAGCATTATCGCCTCTTCGTCGT
CATCCATGACGCAGCCAACCCTAAATACTATGCATGGATTAGACATGGTACCGGCGCAAA
GATCTGATGGTTACACAACACCGGTTGCTTTTGGAACGGAGAATAATTTAGGAGTTGTGA
GAAATGAAGGTACGGTGGACTTATCATGGATTTTTTTTTTTTCAGATTAAGTAGATGAAA
TTTGACCTTTGTTTATTACAACATTATGATCGTATTAATTATTATATTCATATAAAAAAG
GAATATAAAATTTTAGCGAAAAACATTTGATGAATAGAACATTAGTTAGCGAAAAATTTT
TTATGTTTTAAAGCTTTTATGGTTTGATTACATTGACTTTCTATACATTCAAACAATGTT
TTTTCTTTAAAAGTTAATATATCAGCTTGACGTTTGCGTACGTTGAAATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E756TF U 1
AF RR2E756JQ C 592
BS 1 790 RR2E756TF
BS 791 1132 RR2E756JQ

RD RR2E756TF 790 0 0
GCAACGTCGCCGGTCAAACACAGCTTGACTCTCTCATAGCTAACTATTTCAACACCGGTT
GGTCAACATACAATCCTCTCTTGTCAGCAACGACTACAAAACCCACAGATGGCTCTACAC
CACCACCACCACCACTACCTATCTCGTCAGAACAAGCCTTCTTCACAAACCCACTTCAAC
AAAATCTGAGAGCAGTTTCAAACACAAACACAAGTAGTCCCATGTGTTCTGTCTCCACCG
ACAAGAAAAACGGTCTGGCCACAGCACGGAATCTAAAGAAGAGATCTAGAGTTTCGAGAC
GAGCGCCTACGACTGTTTTGACCACCGACACTTCAAACTTCAGAGCCATGGTTCAAGAGT
TCACTGGTAGTCCTTCTACTCCTTTCACCGGATCACTATCACCTTCGTTTCCAAGATCAA
GATTTGATCTCTTCAGTCCTTCTTCATCTTCACGACCCTTGAAACCTTTTCCTCACAAAC
TTATCCCACCATCATCAACGAGTCACCAATACCTAAATCCTCCTTCTACAAATTATCACC
AGAGTCTTCTCCGTAACACGAACACGCAAAACATCGCAAACCATTTTCTTATCAACCAAT
CTCCTAGCAACGTCCCTTTGATGGATCAGTCGTTGAGTTTGAGAACAAGTAATGGTGTTG
GACACGTGGACGTGGGAACAAACTTTGAGGAGCTTCACAGCATTATCGCCTCTTCGTCGT
CATCCATGACGCAGCCAACCCTAAATACTATGCATGGATTAGACATGGTACCGGCGCAAA
GATCTGATGG

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2E756JQ 541 0 0
TCAACCAATTTCCTAGCAACGTCCCTTTGATGGATCAGTCGTTGAGTTTGAGAACAAGTA
ATGGTGTTGGACACGTGGACGTGGGAACAAACTTTGAGGAGCTTCACAGCATTATCGCCT
TTTTGTCGTCATCCATGACGCAGCCAACCCTAAATACTATGCATGGATTAGACATGGTAC
CGGCGCAAAGATTTGATGGTTACACAACACCGGTTGCTTTTGGAACGGAGAATAATTTAG
GAGTTGTGAGAAATGAAGGTACGGTGGACTTATCATGGATTTTTTTTTTTTCAGATTAAG
TAGATGAAATTTGACCTTTGTTTATTACAACATTATGATCGTATTAATTATTATATTCAT
ATAAAAAAGGAATATAAAATTTTAGCGAAAAACATTTGATGAATAGAACATTAGTTAGCG
AAAAATTTTTTATGTTTTAAAGCTTTTATGGTTTGATTACATTGACTTTCTATACATTCA
AACAATGTTTTTTCTTTAAAAGTTAATATATCAGCTTGACGTTTGCGTACGTTGAAATTT
C

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 2

CO CL5226Contig1 1434 2 2 U
GGATATTAGAGAGCTGACAAGATACTGTTTTCTCTACTACTACATCCTCTTACTAGTAGT
ATCTTTCAAAAATAGTATCTTCTAATGTCTACTAGTCATTAACACAGGTTGCTTTGCAAA
AAAAATATCTCGGTCTTTCTTTTCCGGTGACTTCCCGACGGCAGATTCTGATAGATTCTG
GAAGAAAAAGGTAGAATAATGGTTAGCTCTCTCGAAGTCACAGGACCTGAATCCAAGCCA
CTCGAACAGAAGTTCGAGTCCAACATCGTCATAGCCGATGAAGAAGGCGAGGAGGAAAAC
GATAGTCCAATAGAAGAAGTCCGCTTAACCGTACCGATAACCGACGATCCATCTCAGCCG
GTCTTGACATTCCGTACATGGTTCCTAGGAATAATCTCGTGCATGGTACTCGCGTTCGTT
AACCAGTTTTTTGGTTACCGGTCGAACCAGCTCATGGTATCTTCGGTCGTGGCTCAGATA
GTCACTCTTCCACTAGGAAAGCTCATGGCCACGACTCTACCGACGAGAAAATTCCCGTTA
CCAGGTACAAATTGGTCCGGTTCGTTGAATCCTGGACCATTCAACATGAAGGAACATGTG
TTGATCACTATCTTCGCTATAGCAAATTTCTTTGGCGGTTTCATCGTCTACTTCTATATT
ATCCTTCCTATCTTCTACTGGAGCAACGCCTATGAGGCGAAGAAGTTCCCTTTCTATACC
TCTCAGACATTTGATCAAACCGGTCAGCATTTCAACATCACTAGGATCCTTAACCAGAAA
ACGTTTGATATCAATCTTCCCGCTTACGAAAGCTATAGCAAGCTTTACCTTAGTGTTATG
TTTGCTCTCATCTATGGACTCAGTTTTGGTACTCTTACCGCAACCATTTCTCATGTCGCT
CTCTTTGATGGAAAGTTTATATGGGGGATGTGGAAGAAGGCGACATTGACCACAAAGGAC
AAGTTTGGAGATGTGCATACAAGACTAATGAAGAGGAACTATAAGGAAGTACCTCAATGG
TGGTTTGTTTCGGTTCTCATTGTTTCCTTTTGTCTAGCTCTTTACGCGTGTGAGGGATTT
AACAAACAGCTTCAGCTTCCGTGGTGGGGACTTCTCCTCGCTTGTGCCATCTCCTTTACA
TTCACATTACAGAACAACAACATATATTTTCCTAATTGGTGGGGGAGTGAGAACACGGAC
CATTGCCCCTTGGCTCAATGCCCTACGGAGAAAGGGATTGTCATTAAGGGCTGTCCGGTG
TTCTAAAAGAGTATCTGCTCTGAAAGTTTCTTAGAGCTACAGGTGAGTGACGGTAGCTGC
CATATGGGTTTTGGTGGCAATAATATTGTTGTGTAAAGTCTTTGTGAGTTTGGGAAAGAA
CTCAAACAATGTGTGAACAATTGTTTTTAGAATATGTTTCTTATTGAATAAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE01TF U 1
AF RR2BE01JQ C 717
BS 1 880 RR2BE01TF
BS 881 1434 RR2BE01JQ

RD RR2BE01TF 880 0 0
GGATATTAGAGAGCTGACAAGATACTGTTTTCTCTACTACTACATCCTCTTACTAGTAGT
ATCTTTCAAAAATAGTATCTTCTAATGTCTACTAGTCATTAACACAGGTTGCTTTGCAAA
AAAAATATCTCGGTCTTTCTTTTCCGGTGACTTCCCGACGGCAGATTCTGATAGATTCTG
GAAGAAAAAGGTAGAATAATGGTTAGCTCTCTCGAAGTCACAGGACCTGAATCCAAGCCA
CTCGAACAGAAGTTCGAGTCCAACATCGTCATAGCCGATGAAGAAGGCGAGGAGGAAAAC
GATAGTCCAATAGAAGAAGTCCGCTTAACCGTACCGATAACCGACGATCCATCTCAGCCG
GTCTTGACATTCCGTACATGGTTCCTAGGAATAATCTCGTGCATGGTACTCGCGTTCGTT
AACCAGTTTTTTGGTTACCGGTCGAACCAGCTCATGGTATCTTCGGTCGTGGCTCAGATA
GTCACTCTTCCACTAGGAAAGCTCATGGCCACGACTCTACCGACGAGAAAATTCCCGTTA
CCAGGTACAAATTGGTCCGGTTCGTTGAATCCTGGACCATTCAACATGAAGGAACATGTG
TTGATCACTATCTTCGCTATAGCAAATTTCTTTGGCGGTTTCATCGTCTACTTCTATATT
ATCCTTCCTATCTTCTACTGGAGCAACGCCTATGAGGCGAAGAAGTTCCCTTTCTATACC
TCTCAGACATTTGATCAAACCGGTCAGCATTTCAACATCACTAGGATCCTTAACCAGAAA
ACGTTTGATATCAATCTTCCCGCTTACGAAAGCTATAGCAAGCTTTACCTTAGTGTTATG
TTTGCTCTCATCTATGGACTCAGTTTTGGTACTCTTACCG

QA 1 880 1 880
DS 

RD RR2BE01JQ 718 0 0
TACCTCTCAGACATTTGATCAAACCGGTCAGCATTTCAACATCACTAGGATCCTTAACCA
GAAAACGTTTGATATCAATCTTCCCGCTTACGAAAGCTATAGCAAGCTTTACCTTAGTGT
TATGTTTGCTCTCATCTATGGACTCAGTTTTGGTACTCTTACCGCAACCATTTCTCATGT
CGCTCTCTTTGATGGAAAGTTTATATGGGGGATGTGGAAGAAGGCGACATTGACCACAAA
GGACAAGTTTGGAGATGTGCATACAAGACTAATGAAGAGGAACTATAAGGAAGTACCTCA
ATGGTGGTTTGTTTCGGTTCTCATTGTTTCCTTTTGTCTAGCTCTTTACGCGTGTGAGGG
ATTTAACAAACAGCTTCAGCTTCCGTGGTGGGGACTTCTCCTCGCTTGTGCCATCTCCTT
TACATTCACATTACAGAACAACAACATATATTTTCCTAATTGGTGGGGGAGTGAGAACAC
GGACCATTGCCCCTTGGCTCAATGCCCTACGGAGAAAGGGATTGTCATTAAGGGCTGTCC
GGTGTTCTAAAAGAGTATCTGCTCTGAAAGTTTCTTAGAGCTACAGGTGAGTGACGGTAG
CTGCCATATGGGTTTTGGTGGCAATAATATTGTTGTGTAAAGTCTTTGTGAGTTTGGGAA
AGAACTCAAACAATGTGTGAACAATTGTTTTTAGAATATGTTTCTTATTGAATAAGCT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL5227Contig1 567 2 3 U
ATCGTTTATAGATGAACAATGACCTCGGGGGAGTCTCCAGAACTGGTCTCGGGTAAGACA
AGCTCGCAAGCAGCTTTCTTGTTGGCATCAGTAATAGCATTGTGGCATAAAGCAAGAGTG
CGAACCATGGCCATGTCTCTAGCACGTGAGTTCATTAAACTCCCTTTCGAGTTGGTGAAG
TAGTCACCAAAGTCATCGATTACAACTGCAGCAGGGAGATTAAGATGAAGATGAAACGCA
GCAAAGTAGTTCCTGAGTCCTTCATCATCATCCACATACTTCATTTGGATTCGATTGAAT
ACATGGGAGGAAGGGTCGATTCCCTGGGAGAGGAAGGGAGGGTTGGATTCGATTCTTTTG
CGGTGGCAGATGAAGACGACGTGATTGGTTAGAGAAGCAGTGGCTATATTGAGTGCGAAT
TGGAATAGCAGAGAGGTTTTGCCTGAGGTAATGGGGCCGGAGAGGAGAGTGAGGTTATCT
CGCCGGTGATTCCCGGAGTCGTCGCAGCTTGGTTTTGTCGGGAAGAATCTCTCCGTCATT
TGCTTCACCGGGGTTTGGAAAATGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ18JQ U 45
AF RR2CZ18TF C 1
BS 1 44 RR2CZ18TF
BS 45 170 RR2CZ18JQ
BS 171 567 RR2CZ18TF

RD RR2CZ18JQ 126 0 0
GGTCTCGGGTAAGACAAGCTCGCAAGCAGCTTTCTTGTTGGCATCAGTAATAGCATTGTG
GCATAAAGCAAGAGTGCGAACCATGGCCATGTCTCTAGCACGTGAGTTCATTAAACTCCC
TTTCGA

QA 1 126 1 126
DS 

RD RR2CZ18TF 567 0 0
ATCGTTTATAGATGAACAATGACCTCGGGGGAGTCTCCAGAACTGGTCTCGGGTAAGACA
AGCTCGCAAGCAGCTTTCTTGTTGGCATCAGTAATAGCATTGTGGCATAGAGCAAGAGTG
CGAACCATGGCCATGTCTCTAGCACGTGAGTTCATTAAACTCCCTTTCGAGTTGGTGAAG
TAGTCACCAAAGTCATCGATTACAACTGCAGCAGGGAGATTAAGATGAAGATGAAACGCA
GCAAAGTAGTTCCTGAGTCCTTCATCATCATCCACATACTTCATTTGGATTCGATTGAAT
ACATGGGAGGAAGGGTCGATTCCCTGGGAGAGGAAGGGAGGGTTGGATTCGATTCTTTTG
CGGTGGCAGATGAAGACGACGTGATTGGTTAGAGAAGCAGTGGCTATATTGAGTGCGAAT
TGGAATAGCAGAGAGGTTTTGCCTGAGGTAATGGGGCCGGAGAGGAGAGTGAGGTTATCT
CGCCGGTGATTCCCGGAGTCGTCGCAGCTTGGTTTTGTCGGGAAGAATCTCTCCGTCATT
TGCTTCACCGGGGTTTGGAAAATGTTG

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL5228Contig1 264 2 3 U
GGGAATAGAGAAGCTCGGTCTGTATTTAAAGAAGAGAGAGATGTTGCTTGCAAAGGCATC
AAACTTTTTGTAACGTTTAGAAATACACTTTTTCGTTATACTTTTCTAAAAATTTAATTT
ATAGACTTGAGGATTTTCTAAATTAGGGGTACTTGCTATTTAATTTTGTTTGACAGAAGG
ATCTCATAGTAATGGTGGTGAAGTCGACAGCGTAAGAGAGGACTTTTTATATACTTCGGT
TAATGTTAATTGTCGTTTGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2B826JQ C 1
AF RR2B826TF U 70
BS 1 69 RR2B826JQ
BS 70 261 RR2B826TF
BS 262 264 RR2B826JQ

RD RR2B826JQ 264 0 0
GGGAATAGAGAAGCTCGGTCTGTATTTAAAGAAGAGAGAGATGTTGCTTGCAAAGGCATC
AAACTTTTTGTAACGTTTAGAAATACACTTTTTCGTTATACTTTTTTAAAAATTTAATTT
ATAGACTTGAGGATTTTTTAAATTAGGGGTACTTGCTATTTAATTTTGTTTGACAGAAGG
ATCTCATAGTAATGGTGGTGAAGTCGACAGCGTAAGAGAGGACTTTTTATATACTTCGGT
TAATGTTAATTGTCGTTTGTTTTT

QA 1 264 1 264
DS 

RD RR2B826TF 195 0 0
GTAACGTTTAGAAATACACTTTTTCGTTATACTTTTCTAAAAATTTAATTTATAGACTTG
AGGATTTTCTAAATTAGGGGTACTTGCTATTTAATTTTGTTTGACAGAAGGATCTCATAG
TAATGGTGGTGAAGTCGACAGCGTAAGAGAGGACTTTTTATATACTTCGGTTAATGTTAA
TTGTCGTTTGTT
CTT

QA 1 192 1 192
DS 



AS 1 2

CO CL5229Contig1 474 2 13 U
TGTCTCTAAGAGTAGCAAGAACCCCGCAGGGCCCCACTCTCACTTTCAAAATCCATCAGT
ATTCGTTAGCATCCGATATAGCTCAGTCTCAGACACGCCCTAGGTGTCTCCAGATCTTTT
CAAGAGTCCCCCTTTGATTGTTCTTTCTGGGTTCGGTACTCAGGAGCTGCATCTGAAGCT
AGCAACCATCATGTTTCAGAACATATTCCCAGCTATTGATATCAACACTGTCAAGCTCTC
GACATGCCGGAGATTAGTACTCTTGAACTACAACAAGGACACGAAACTCATTGATTTCAG
GCATTATTCGATAAGGCTGCAGCCTGTAGGAGTGTCTCGTAAGCTCAGAAATTTTGTGCA
GACACACAAGGCTCCTGATCTTAGGAATCTGCAGGATGTTAGTGATTTTATCACCAAGGC
TGGATATGGATCAGAGAGCGAAGGGAGATGAAGAAGCGGCAACAGTGACACTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A380TF U 105
AF RR2A380JQ C 1
BS 1 107 RR2A380JQ
BS 108 163 RR2A380TF
BS 164 164 RR2A380JQ
BS 165 176 RR2A380TF
BS 177 177 RR2A380JQ
BS 178 200 RR2A380TF
BS 201 201 RR2A380JQ
BS 202 277 RR2A380TF
BS 278 278 RR2A380JQ
BS 279 300 RR2A380TF
BS 301 301 RR2A380JQ
BS 302 315 RR2A380TF
BS 316 474 RR2A380JQ

RD RR2A380TF 219 0 0
GTC
CTCCAGATCTTTTCAAGAGTCCCCCTTTGATTGTTCTTTCTGGGTTCGGTACTCAG*AGC
TGCATCTGA*GCTAGCAACCATCATGTTTCAGA*CATATTCCCAGCTATTGATATCAACA
CTGTCAAGCTCTCGACATGCCGGAGATTAGTACTCTTGAACTACAACAAG*ACACGAAAC
TCATTGATTTCAG*CATTATTCGATAAG
CTGCACCT

QA 4 211 4 211
DS 

RD RR2A380JQ 474 0 0
TGTCTCTAAGAGTAGCAAGAACCCCGCAGGGCCCCACTCTCACTTTCAAAATCCATCAGT
ATTCGTTAGCATCCGATATAGCTCAGTCTCAGACACGCCCTAGGTGTCTCCAGATCTTTT
CAAGAGTCCCCCTTTGATTGT*CTTTCTGGGTTCGGTACTCAGGAGCTGCATCTGAAGCT
AGCAACCATCATGTTTCAGAACATATTCCCAGCTATTGATATCAACACTGTCAAGCTCTC
GACATGCCGGAGATTAGTACTCTTGAACTACAACAAGGACACGAAACTCATTGATTTCAG
GCATTATTCGATAAGGCTGCAGCCTGTAGGAGTGTCTCGTAAGCTCAGAAATTTTGTGCA
GACACACAAGGCTCCTGATCTTAGGAATCTGCAGGATGTTAGTGATTTTATCACCAAGGC
TGGATATGGATCAGAGAGCGAAGGGAGATGAAGAAGCGGCAACAGTGACACTTA

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 2

CO CL5230Contig1 1184 2 2 U
GCAATGGGTGTATCATGCCAGCCTATGGAGAATGCTCAGATCCGTAGCATCTATCAGATG
AGTTCTGAAATGACAGGGGTTCTTATAAGCAAGATTAACCCTCTCTCCGATGCTCATAGA
ATTTTGAAGAAGGAAGATGTTATTCTCGCTTTTGATGGTGTTCCCATAGGAAATGAACTC
GTTGGAGCTAGGAGATATACCGCTTCTGAGGGAGGAAGTGTTTGTAGTTGGATATCCTCA
AGGTGGTGACAACATCTCTGTTACAAAAGGTGTTGTATCTCGAGTTGAGCCCACCCAATA
TGTTCACGGTGCCACCCAGCTAATGGCTATACAAATAGATGCTGCTATCAACCCTGGAAA
CAGCGGTGGCCCAGCAATCATGGGAAACAGAGTAGCTGGCGTTGCTTTTCAAAATCTTGC
TGGTGGTGAGAACATAGGTTATATCATTCCAACACCTGTAATCAAGCATTTCATAAACGG
TGTTGAAGAATCTGGCAAATACACTGGTTTCTGCTCAATGGGTGTATCATGCCAGCCTAT
GGAGAATGCTCAGATCCGTAGCATCTATCAGATGAGTTCTGAAATGACAGGGGTTCTTAT
AAGCAAGATTAACCCTCTCTCCGATGCTCATAGAATTTTGAAGAAGGAGAGGATCACTTT
TGATCATATGGTATCTATGAAGAAACCAGATGAAACAGCTCTGGTTAAAGTCTTGAGGGA
AGGAAAAGAACATGAGTTTAGCATCACTCTCAGACCTCTGCAACCGCTGGTTCCAGTGCA
TCAGTTCGACCAGCTTCCAAGTTATTATATATTTGCGGGCTTTGTATTCGTACCTCTCAC
CCAGCCTTACCTTCATGAATATGGAGAAGACTGGTATAACACTTGTCCCCGCAGATTGTG
CGAGCGTGCGTTAAGAGATTTACCTGAAAAATCCAATCAAGAACTTGTCATTATCTCTCA
GGTGTTAATGGATGATATCAACACAGGATTTGAGCGTCTTGCAGAGCTGCAAGTGAAGAA
AGTGAATGGAGTGGAAGTGGATAATTTGAGACATTTATGCCAGCTCATAGAGAACTGTGA
CGCAGAAAATCTTAAATTGGATTTAGACGATGGGAGAGTACTCGCCTTGAAGTACCAAGA
CGCAAGATTAGCCACTAGTCTGATTTTGAAACGCCACAGAATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD19TF U 1
AF RR2AD19JQ C 625
BS 1 806 RR2AD19TF
BS 807 1184 RR2AD19JQ

RD RR2AD19TF 806 0 0
GCAATGGGTGTATCATGCCAGCCTATGGAGAATGCTCAGATCCGTAGCATCTATCAGATG
AGTTCTGAAATGACAGGGGTTCTTATAAGCAAGATTAACCCTCTCTCCGATGCTCATAGA
ATTTTGAAGAAGGAAGATGTTATTCTCGCTTTTGATGGTGTTCCCATAGGAAATGAACTC
GTTGGAGCTAGGAGATATACCGCTTCTGAGGGAGGAAGTGTTTGTAGTTGGATATCCTCA
AGGTGGTGACAACATCTCTGTTACAAAAGGTGTTGTATCTCGAGTTGAGCCCACCCAATA
TGTTCACGGTGCCACCCAGCTAATGGCTATACAAATAGATGCTGCTATCAACCCTGGAAA
CAGCGGTGGCCCAGCAATCATGGGAAACAGAGTAGCTGGCGTTGCTTTTCAAAATCTTGC
TGGTGGTGAGAACATAGGTTATATCATTCCAACACCTGTAATCAAGCATTTCATAAACGG
TGTTGAAGAATCTGGCAAATACACTGGTTTCTGCTCAATGGGTGTATCATGCCAGCCTAT
GGAGAATGCTCAGATCCGTAGCATCTATCAGATGAGTTCTGAAATGACAGGGGTTCTTAT
AAGCAAGATTAACCCTCTCTCCGATGCTCATAGAATTTTGAAGAAGGAGAGGATCACTTT
TGATCATATGGTATCTATGAAGAAACCAGATGAAACAGCTCTGGTTAAAGTCTTGAGGGA
AGGAAAAGAACATGAGTTTAGCATCACTCTCAGACCTCTGCAACCGCTGGTTCCAGTGCA
TCAGTTCGACCAGCTTCCAAGTTATT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2AD19JQ 560 0 0
TGCTCATAGAATTTTGAAGAAGGAGAGGATCACTTTTGATCATATGGTATCTATGAAGAA
ACCAGATGAAACAGCTCTGGTTAAAGTCTTGAGGGAAGGAAAAGAACATGAGTTTAGCAT
CACTCTCAGACCTCTGCAACCGCTGGTTCCAGTGCATCAGTTCGACCAGCTTCCAAGTTA
TTATATATTTGCGGGCTTTGTATTCGTACCTCTCACCCAGCCTTACCTTCATGAATATGG
AGAAGACTGGTATAACACTTGTCCCCGCAGATTGTGCGAGCGTGCGTTAAGAGATTTACC
TGAAAAATCCAATCAAGAACTTGTCATTATCTCTCAGGTGTTAATGGATGATATCAACAC
AGGATTTGAGCGTCTTGCAGAGCTGCAAGTGAAGAAAGTGAATGGAGTGGAAGTGGATAA
TTTGAGACATTTATGCCAGCTCATAGAGAACTGTGACGCAGAAAATCTTAAATTGGATTT
AGACGATGGGAGAGTACTCGCCTTGAAGTACCAAGACGCAAGATTAGCCACTAGTCTGAT
TTTGAAACGCCACAGAATAG

QA 1 560 1 560
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5232Contig1 1129 2 4 U
GGTCATGATGAAAAGACTAAGTAGCTCAGATTCAATGCGTGGTCTAGTCTCCAATTCTCC
AGATGAGCAGAGCCCACGAGGGTACGGAAGTAATTTCCAGTCTATGCTAGATGGATACGA
AGAAGACGGCACAATAGTAGAGGAATATTCCGGCAACCAACACATGGGTCTGTCGGAGAA
GAAGAGGAGGCTACGTGTCGACCAAGTCAAAGCTCTCGAGAAGAATTTCGAGCTTGAGAA
CAAACTCGAACCCGAGAGAAAAACCAAACTAGCACAAGAGCTTGGTCTCCAACCTCGTCA
AGTAGCGGTCTGGTTCCAAAACCGCCGCGCACGGTGGAAGACAAAACAGCTCGAAAAAGA
CTACGGACTTCTCAAGAGCCAATACGACTCTCTCCGCCACAACTTCGATTCACTCCGTCG
CGATAATGATTCTCTTCTCCAAGAGATTAGTAAAATGAAAGGAAAGATCAACGGAGAAGA
AGATAACAACAACAACATCAAGGCTACGACGGAGAGTGATATCTCCGCCGTGAAGGAAGA
AGAAGATCAGATTCCTTCGTCTCCTCCTCAGTTTCTCGAACACTCAACCGGTTTTAACTA
CCGGCGAAGCTTCACCGATCTCCGTGATCTTCTACCGAACCCCGTCGTCGAAGCTGGATC
TTCCGACAGCTGCGACTCAAGCGCTGTCCTAAACGAAGAGACCAGCTCGGAGAACGGAAG
ATTAACGCCGCCGGCGGCCGCGGTTACCGGCGGGAGTTTCTTGCAGTTCGTGAAAACAGA
GCAAACAGAGGATCACGACGAGTTTTTCAGCGGCGAAGAAGCGTGTGGTTTCTTTTCCGA
CGAACAACCTCCTTCTCTTAATTGGTACTCCGCCTCGGATCACTGGACATGAAAAAGTCG
TTGATCGGAGGAGAAAGAACGATGGGTTTACTGTGCTGTGTTATCACTCTTTGGAGGATA
AAACTGGAATAATGAAAAAATAAGGGGACTTAAATGTTAATTAACGATGTGGGGAGGGGT
TTGTCACGAATATGAAAGTCATCGGAGAAAATTCAGATAAAAGTTTACTCCTCTAGTCCC
AATTGTATTCCAAAGTTTACCCTTAAAAGATTTCACTTTGTCTTTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH31TF U 1
AF RR2DH31JQ C 560
BS 1 718 RR2DH31TF
BS 719 719 RR2DH31JQ
BS 720 733 RR2DH31TF
BS 734 1129 RR2DH31JQ

RD RR2DH31TF 738 0 0
GGTCATGATGAAAAGACTAAGTAGCTCAGATTCAATGCGTGGTCTAGTCTCCAATTCTCC
AGATGAGCAGAGCCCACGAGGGTACGGAAGTAATTTCCAGTCTATGCTAGATGGATACGA
AGAAGACGGCACAATAGTAGAGGAATATTCCGGCAACCAACACATGGGTCTGTCGGAGAA
GAAGAGGAGGCTACGTGTCGACCAAGTCAAAGCTCTCGAGAAGAATTTCGAGCTTGAGAA
CAAACTCGAACCCGAGAGAAAAACCAAACTAGCACAAGAGCTTGGTCTCCAACCTCGTCA
AGTAGCGGTCTGGTTCCAAAACCGCCGCGCACGGTGGAAGACAAAACAGCTCGAAAAAGA
CTACGGACTTCTCAAGAGCCAATACGACTCTCTCCGCCACAACTTCGATTCACTCCGTCG
CGATAATGATTCTCTTCTCCAAGAGATTAGTAAAATGAAAGGAAAGATCAACGGAGAAGA
AGATAACAACAACAACATCAAGGCTACGACGGAGAGTGATATCTCCGCCGTGAAGGAAGA
AGAAGATCAGATTCCTTCGTCTCCTCCTCAGTTTCTCGAACACTCAACCGGTTTTAACTA
CCGGCGAAGCTTCACCGATCTCCGTGATCTTCTACCGAACCCCGTCGTCGAAGCTGGATC
TTCCGACAGCTGCGACTCAAGCGCTGTCCTAAACGAAGAGACCAGCTCGGAGAACGGA*G
ATTAACGCCGCCG
CGCCG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2DH31JQ 570 0 0
TCTCCTCCTCAGTTTCTCGAACACTCAACCGGTTTTAACTACCGGCGAAGCTTCACCGAT
CTCCGTGATCTTCTACCGAACCCCGTCGTCGAAGCTGGATCTTCCGACAGCTGCGACTCA
AGCGCTGTCCTAAACGAAGAGACCAGCTCGGAGAACGGAAGATTAACGCCGCCGGCGGCC
GCGGTTACCGGCGGGAGTTTCTTGCAGTTCGTGAAAACAGAGCAAACAGAGGATCACGAC
GAGTTTTTCAGCGGCGAAGAAGCGTGTGGTTTCTTTTCCGACGAACAACCTCCTTCTCTT
AATTGGTACTCCGCCTCGGATCACTGGACATGAAAAAGTCGTTGATCGGAGGAGAAAGAA
CGATGGGTTTACTGTGCTGTGTTATCACTCTTTGGAGGATAAAACTGGAATAATGAAAAA
ATAAGGGGACTTAAATGTTAATTAACGATGTGGGGAGGGGTTTGTCACGAATATGAAAGT
CATCGGAGAAAATTCAGATAAAAGTTTACTCCTCTAGTCCCAATTGTATTCCAAAGTTTA
CCCTTAAAAGATTTCACTTTGTCTTTGGTC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL5233Contig1 508 2 1 U
GGACAGTTCGAGTATTTTGTTCGAGAAAGAAAGTTAGAAAATTTTGCCTTTGTTCTTTCG
TTACACAGTGTATGTGTATTTGTATATAGTCATTTATGTAAATCAAAACTTACCTGTTTC
CCCACTTAGCATGAAGTTCCATGATGATAAGTTGCTCCTCCGGCGTGATGTTTCCACGTC
GTACGTCAGGGCGGAGATAGTTCAGCCACCTGAGCCGGCAACTTTTCCCGGATGTAAAGT
TTATCGGAGGTTCTAGAGTACTGCAAGCAGAGTCATTCATTGTGATCATCTGCTACAGAA
AGCTAGAGTTTGTCCACGAAGTTATCGTACATGCAGAACCATTCGTCGATCCAAATATTT
TAGAGAAAGATTCATTGTAGAATCATTATCCGTGAAATTGTTCATAAAGTTGCAGGTAGT
TGATATCATATGTAATAGAACTAGAGATTATATGATGTAATTGGTGATTTAGCCAATGTT
ACCAAATAATATAAAGTTAAATTAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E781TF U 1
AF RR2E781JQ C 307
BS 1 508 RR2E781TF

RD RR2E781TF 508 0 0
GGACAGTTCGAGTATTTTGTTCGAGAAAGAAAGTTAGAAAATTTTGCCTTTGTTCTTTCG
TTACACAGTGTATGTGTATTTGTATATAGTCATTTATGTAAATCAAAACTTACCTGTTTC
CCCACTTAGCATGAAGTTCCATGATGATAAGTTGCTCCTCCGGCGTGATGTTTCCACGTC
GTACGTCAGGGCGGAGATAGTTCAGCCACCTGAGCCGGCAACTTTTCCCGGATGTAAAGT
TTATCGGAGGTTCTAGAGTACTGCAAGCAGAGTCATTCATTGTGATCATCTGCTACAGAA
AGCTAGAGTTTGTCCACGAAGTTATCGTACATGCAGAACCATTCGTCGATCCAAATATTT
TAGAGAAAGATTCATTGTAGAATCATTATCCGTGAAATTGTTCATAAAGTTGCAGGTAGT
TGATATCATATGTAATAGAACTAGAGATTATATGATGTAATTGGTGATTTAGCCAATGTT
ACCAAATAATATAAAGTTAAATTAATGC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2E781JQ 202 0 0
AGTTTGTCCACGAAGTTATGGTACATGCAGAACCATTCGTCGATCCAAATATTTTAGAGA
AAGATTCATTGTAGAATCATTATCCGTGAAATTGTTCATAAAGTTGCAGGTAGTTGATAT
CATATGTAATAGAACTAGAGATTATATGATGTAATTGGTGATTTAGCCAATGTTACCAAA
TAATATAAAGTTAAATTAATGC

QA 1 202 1 202
DS 



AS 1 2

CO CL5234Contig1 863 2 2 U
GCGTGCGTGTTGAATGGCGGGTTACAAAGCAGATGATGATTACGATTACCTATTCAAGGT
TGTTTTAATCGGCGATTCAGGTGTTGGTAAGTCCAATCTGCTTTCTCGATTCACGAGGAA
CGAGTTTAGCCTCGAGTCCAAGTCCACCATCGGCGTCGAGTTCGCCACTCGTAGCTTGAC
TGTTAACGACAAAGTCATCAAAGCCCAGATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAGGTACCG
AGCGATCACTAGTGCATACTACCGAGGAGCTGTTGGTGCGCTTCTTGTCTACGACGTTAC
TCGACACTCCACGTTCGAAAACGTTGAGAGATGGCTAAGGGAGCTCCGAGACCATACCGA
CCCAAACATAGTCGTGATGCTCGTGGGAAACAAATCTGATCTTCGTCATCTTATTGCGGT
TCAAACCGAAGATGCTAGGTCTTTTGCGGAGAAAGAATCACTCTACTTCATGGAGACTTC
AGCTCTCGAGTCTACTAACGTTGAGAACGCGTTTTCTGAAGTACTCACTCAGATTCACCG
AGTTGTGAGCAAGAAAGCAATGGAGGCTGGTGGTGGTGACGATTCGAATTCGGGTAATGT
TCCTTCTAAAGGAGAGAAGATTGATATTGATGTATCGGCTGTGAAGAAAACTGGTTGCTG
CTCGAGCTAAAAAAACTCGTTAGTCTCTTGCAGATTGTTACGGATTTGGTCTGTTTCCTT
GATCGTTCTTTTATACATTCAAAATTCTTTTGAAGATGTCTTGTCTTTTTTTTTATAATT
AGGAAACAAGCAATGTTATGCTTTGCTTGAAAACTGCTTTGCTGTGGTTCTGGTTCTGTA
CTGGTTAAGCAATTTTGTAATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD91TF U 1
AF RR2BD91JQ C 1
BS 1 668 RR2BD91TF
BS 669 863 RR2BD91JQ

RD RR2BD91TF 668 0 0
GCGTGCGTGTTGAATGGCGGGTTACAAAGCAGATGATGATTACGATTACCTATTCAAGGT
TGTTTTAATCGGCGATTCAGGTGTTGGTAAGTCCAATCTGCTTTCTCGATTCACGAGGAA
CGAGTTTAGCCTCGAGTCCAAGTCCACCATCGGCGTCGAGTTCGCCACTCGTAGCTTGAC
TGTTAACGACAAAGTCATCAAAGCCCAGATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAGGTACCG
AGCGATCACTAGTGCATACTACCGAGGAGCTGTTGGTGCGCTTCTTGTCTACGACGTTAC
TCGACACTCCACGTTCGAAAACGTTGAGAGATGGCTAAGGGAGCTCCGAGACCATACCGA
CCCAAACATAGTCGTGATGCTCGTGGGAAACAAATCTGATCTTCGTCATCTTATTGCGGT
TCAAACCGAAGATGCTAGGTCTTTTGCGGAGAAAGAATCACTCTACTTCATGGAGACTTC
AGCTCTCGAGTCTACTAACGTTGAGAACGCGTTTTCTGAAGTACTCACTCAGATTCACCG
AGTTGTGAGCAAGAAAGCAATGGAGGCTGGTGGTGGTGACGATTCGAATTCGGGTAATGT
TCCTTCTAAAGGAGAGAAGATTGATATTGATGTATCGGCTGTGAAGAAAACTGGTTGCTG
CTCGAGCT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2BD91JQ 863 0 0
GCGTGCGTGT*GAATGGCGGGTTACAAAGCAGATGATGATTACGATTACCTATTCAAGGT
TGTTTTAATCGGCGATTCAGGTGTTGGTAAGTCCAATCTGCTTTCTCGATTCACGAGGAA
CGAGTTTAGCCTCGAGTCCAAGTCCACCATCGGCGTCGAGTTCGCCACTCGTAGCTTGAC
TGTTAACGACAAAGTCATCAAAGCCCAGATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAGGTACCG
AGCGATCACTAGTGCATACTACCGAGGAGCTGTTGGTGCGCTTCTTGTCTACGACGTTAC
TCGACACTCCACGTTCGAAAACGTTGAGAGATGGCTAAGGGAGCTCCGAGACCATACCGA
CCCAAACATAGTCGTGATGCTCGTGGGAAACAAATCTGATCTTCGTCATCTTATTGCGGT
TCAAACCGAAGATGCTAGGTCTTTTGCGGAGAAAGAATCACTCTACTTCATGGAGACTTC
AGCTCTCGAGTCTACTAACGTTGAGAACGCGTTTTCTGAAGTACTCACTCAGATTCACCG
AGTTGTGAGCAAGAAAGCAATGGAGGCTGGTGGTGGTGACGATTCGAATTCGGGTAATGT
TCCTTCTAAAGGAGAGAAGATTGATATTGATGTATCGGCTGTGAAGAAAACTGGTTGCTG
CTCGAGCTAAAAAAACTCGTTAGTCTCTTGCAGATTGTTACGGATTTGGTCTGTTTCCTT
GATCGTTCTTTTATACATTCAAAATTCTTTTGAAGATGTCTTGTCTTTTTTTTTATAATT
AGGAAACAAGCAATGTTATGCTTTGCTTGAAAACTGCTTTGCTGTGGTTCTGGTTCTGTA
CTGGTTAAGCAATTTTGTAATTT

QA 1 863 1 863
DS 



AS 1 2

CO CL5235Contig1 1340 2 4 U
GGCCTCTAATTCATCCCCCTTTCTTTCTTCAAACCTACTTTCTCCCAGTTTCGTATCTGA
TCCGTTAATCGAAGATAGATCCGGCAGTTTTGAGCTGAATTCGAAAGAAAGAAACAGAGT
AATAATGGCGAACAGAGATGTGGAGAGAGAAGGGAAGCAGAACAGCATCAACAACAACAA
CAACAACAACTATTTCTATGACGAAAGCTCCATCGATACTCACTGGACTTCGTGGCTCGT
TCCACTGATCGTTGTGGCGAATCTCGCCGTCTTTGTCGCCGTTATGTTCGTTAACGACTG
TCCCAAGAAGATCAACGGACCAAACAAAGCTTGCGTCACTAGATTCCTCGGAAGATTCTC
GTTTCAGCCACTTAGAGAGAATCCTCTCTTTGGCCCTTCTTCTTCTACATTGGAGAAAAT
GGGAGCACTGGAGTGGAGGAAAGTAGTACATGAGCATCAAGGATGGAGACTCGTCACTTG
TATGTGGCTACACGCTGGTATCATTCATCTTCTCGCCAATATGTTGAGTTTGATCTTCAT
CGGTATCCGCCTTGAGCAGCAGTTTGGCTTCATAAGAGTCGGGCTTATCTACTTAATCTC
TGGTCTCGGTGGAAGCATACTCTCGTCTCTTTTCCTCCAAGAAAGTATCTCTGTTGGTGC
TTCCGGTGCTCTCTTTGGACTTCTTGGAGCAATGCTATCCGAGCTTCTCACTAATTGGAC
TATCTATGCCAACAAGGCGGCTGCTCTGTTCACACTCCTATTCATCATAGCAATCAACTT
AGGACTAGGCTTGCTTCCTCGCGTTGACAATTTCGCACATATCGGAGGATTTATAACCGG
GTTCTGCCTCGGTTTTATCCTCCTTATCCGGCCACAGCACGGTTGGGAAAGTTCCCGCAC
CAACACTACTTCCCTTACCAAACGCAAGTATAGCATCTACCAGTACGTTCTGTTCTTAGT
TGCGGCCCTTATACTTGTGGTTTGTTTAGCCGTTGGATCAGTGATGCTTTTCAAAGGAGA
GAATGGTAACAAACATTGCAAATGGTGTCATCGCCTCAGCTGTTTCCCTACTTCTAAATG
GACCTGTTAATCATCGTCATCACCATCATCATCATTATCCTCTAAAACTATTATATGTGT
TCTTGTAACAGATAATTTGTTTGTTCTTTTTGCCTTTGTCCTCTCTTATACCTTTTATAA
CATACATGTACATTACTAAATTTGTCGTGTAAAAAAGGGGAAAGAAACAAAAGAGTGTAT
TACATTTAAAAATTAGAAGTACATAAAACAGTATTGTTGGATTGAAGGTACTTAATCTCA
TTATAGTACTTCATTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY56TF U 1
AF RR2FY56JQ C 555
BS 1 736 RR2FY56TF
BS 737 737 RR2FY56JQ
BS 738 757 RR2FY56TF
BS 758 1340 RR2FY56JQ

RD RR2FY56TF 757 0 0
GGCCTCTAATTCATCCCCCTTTCTTTCTTCAAACCTACTTTCTCCCAGTTTCGTATCTGA
TCCGTTAATCGAAGATAGATCCGGCAGTTTTGAGCTGAATTCGAAAGAAAGAAACAGAGT
AATAATGGCGAACAGAGATGTGGAGAGAGAAGGGAAGCAGAACAGCATCAACAACAACAA
CAACAACAACTATTTCTATGACGAAAGCTCCATCGATACTCACTGGACTTCGTGGCTCGT
TCCACTGATCGTTGTGGCGAATCTCGCCGTCTTTGTCGCCGTTATGTTCGTTAACGACTG
TCCCAAGAAGATCAACGGACCAAACAAAGCTTGCGTCACTAGATTCCTCGGAAGATTCTC
GTTTCAGCCACTTAGAGAGAATCCTCTCTTTGGCCCTTCTTCTTCTACATTGGAGAAAAT
GGGAGCACTGGAGTGGAGGAAAGTAGTACATGAGCATCAAGGATGGAGACTCGTCACTTG
TATGTGGCTACACGCTGGTATCATTCATCTTCTCGCCAATATGTTGAGTTTGATCTTCAT
CGGTATCCGCCTTGAGCAGCAGTTTGGCTTCATAAGAGTCGGGCTTATCTACTTAATCTC
TGGTCTCGGTGGAAGCATACTCTCGTCTCTTTTCCTCCAAGAAAGTATCTCTGTTGGTGC
TTCCGGTGCTCTCTTTGGACTTCTTGGAGCAATGCTATCCGAGCTTCTCACTAATTGGAC
TATCTATGCCAACAAG*CGGCTGCTCTGTTCACACTC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2FY56JQ 786 0 0
AGCAGCAGTTTGGCTTCATAAGAGTCGGGCTTATCTACTTAATCTCTGGTCTCGGTGGAA
GCATACTCTCGTCTCTTTTCCTCCAAGAAAGTATCTCTGTTGGTGCTTCCGGTGCTCTCT
TTGGACTTCTTGGAGCAATGCTATCCGAGCTTCTCACTAATTGGACTATCTATGCCAACA
AGGCGGCTGCTCTGTTCACACTCCTATTCATCATAGCAATCAACTTAGGACTAGGCTTGC
TTCCTCGCGTTGACAATTTCGCACATATCGGAGGATTTATAACCGGGTTCTGCCTCGGTT
TTATCCTCCTTATCCGGCCACAGCACGGTTGGGAAAGTTCCCGCACCAACACTACTTCCC
TTACCAAACGCAAGTATAGCATCTACCAGTACGTTCTGTTCTTAGTTGCGGCCCTTATAC
TTGTGGTTTGTTTAGCCGTTGGATCAGTGATGCTTTTCAAAGGAGAGAATGGTAACAAAC
ATTGCAAATGGTGTCATCGCCTCAGCTGTTTCCCTACTTCTAAATGGACCTGTTAATCAT
CGTCATCACCATCATCATCATTATCCTCTAAAACTATTATATGTGTTCTTGTAACAGATA
ATTTGTTTGTTCTTTTTGCCTTTGTCCTCTCTTATACCTTTTATAACATACATGTACATT
ACTAAATTTGTCGTGTAAAAAAGGGGAAAGAAACAAAAGAGTGTATTACATTTAAAAATT
AGAAGTACATAAAACAGTATTGTTGGATTGAAGGTACTTAATCTCATTATAGTACTTCAT
TTATAT

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL5236Contig1 163 2 4 U
ATGGACCCCCCAAAAAATACCCCAAAATATTGGCAAAAACCTGCTGGAAAGGCTTGATTA
GGGCTTTGTTCCTGTAACTTACGTGGAACTTAACCTTACCCAAAAAACCCTCGGGGTCAA
ATTCCCCAAATTCAACAGCTACCCTGATATCTGTAATCATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA35JQ U 1
AF RR2A039JQ U 20
BS 1 67 RR2HA35JQ
BS 68 68 RR2A039JQ
BS 69 157 RR2HA35JQ
BS 158 163 RR2A039JQ

RD RR2HA35JQ 157 0 0
ATGGACCCCCCAAAAAATACCCCAAAATATTGGCAAAAACCTGCTGGAAAGGCTTGATTA
GGGCTTTTTTCCTGTAACTTACGTGGAACTTAACCTTACCCAAAAAACCCTCGGGGTCAA
ATTCCCCAAATTCAACAGCTACCCTGATATCTGTAAT

QA 1 157 1 157
DS 

RD RR2A039JQ 144 0 0
CCT
CAAACTATTGGTAAAAACCTGCTGGAAAGGCTTGATTAGGGCTTTGTTCCTGTAACTTAC
GTGGAACTTAACCTTACCCAAAAAACCCTCGGGGTCAAATTCCCCAAATTCAACAGCTAC
CCTGATATCTGTAATCATCTT

QA 4 144 4 144
DS 



AS 1 2

CO CL5237Contig1 697 2 1 U
GGGTATCTTAAACCTAGAATCAAATCTCAGAACACAAGTCGCCTCTTTCTCTCTGATCAC
ATCTCTATCTTTAAAAGAGAGATCGAGAGAGCGATTTCTGGCACATCCGAATTTCTTCCG
ACAATAGCCAGACTGTTTTGTTTTATATTTCGATCCATGATCGATTTTATGTTGTGATTT
TCAATTTTCCATCAGTTCCTTCAAATTTATATTTCTTTCATCAGTTGAAGTTGATTAAAT
AAAGTTTCAGTCTTTTTTTTCTTGACTAAAGTTTCAGTCTTTTGGAATGGGTTTTGTTTG
TAATATATTTCTCTCGGTTAAAACTAATTTTCAATTCCGATCTTAGATTAGATTTAATGG
CATCTCACCGGTTTCAATTGATTTTATTCCTTTACTTTTCTTGGTGAATCTCTTCTGTTT
CTAGGGAGTGATATCAGCAACATCCCTTTGCTGTCAGTACTGAGTGTGGTGGTCTTAATA
TCCTCGCGGTGGTTTTTTCTGATGAGGGTTGCGCTTCTCAAGCAGTTGAGCATAACCGAT
GAAGAGGAGGATTTAAGCGACGAAGGTGAAACGGCCGGAGTTTTAGGTCAAGATTCAGAT
GCATGTCCAACTTGCTTCCTCACATTGTGTTTTCGTTTTGGGCCTTGGTCCAATTGTGGT
ATAATTGACCCAACACATTAATAAAACTTCCATTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AI51TF U 1
AF RR2AI51JQ C 501
BS 1 697 RR2AI51TF

RD RR2AI51TF 697 0 0
GGGTATCTTAAACCTAGAATCAAATCTCAGAACACAAGTCGCCTCTTTCTCTCTGATCAC
ATCTCTATCTTTAAAAGAGAGATCGAGAGAGCGATTTCTGGCACATCCGAATTTCTTCCG
ACAATAGCCAGACTGTTTTGTTTTATATTTCGATCCATGATCGATTTTATGTTGTGATTT
TCAATTTTCCATCAGTTCCTTCAAATTTATATTTCTTTCATCAGTTGAAGTTGATTAAAT
AAAGTTTCAGTCTTTTTTTTCTTGACTAAAGTTTCAGTCTTTTGGAATGGGTTTTGTTTG
TAATATATTTCTCTCGGTTAAAACTAATTTTCAATTCCGATCTTAGATTAGATTTAATGG
CATCTCACCGGTTTCAATTGATTTTATTCCTTTACTTTTCTTGGTGAATCTCTTCTGTTT
CTAGGGAGTGATATCAGCAACATCCCTTTGCTGTCAGTACTGAGTGTGGTGGTCTTAATA
TCCTCGCGGTGGTTTTTTCTGATGAGGGTTGCGCTTCTCAAGCAGTTGAGCATAACCGAT
GAAGAGGAGGATTTAAGCGACGAAGGTGAAACGGCCGGAGTTTTAGGTCAAGATTCAGAT
GCATGTCCAACTTGCTTCCTCACATTGTGTTTTCGTTTTGGGCCTTGGTCCAATTGTGGT
ATAATTGACCCAACACATTAATAAAACTTCCATTGCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2AI51JQ 197 0 0
GATGAGGGTTGCGCTTCTCAAGCAGTTGAGCATAACCGATGAAGAGGAGGATTTAAGCGA
CGAAGGTGAAACGGCCGGAGTTTTAGGTCAAGATTCAGATGCATGTCCAACTTGCTTCCT
CACATTGTGTTTTCGTTTTGGGCCTTGGTCCAATTGTGGTATAATTGACCCAACACATTA
ATAAAACTTCCATTGCC

QA 1 197 1 197
DS 



AS 1 2

CO CL5238Contig1 1128 2 2 U
GATGTCTTGAATTACGGTTTATAGTTCCTTACTGTACATCACTATCATCATTCATGTCTC
TACTTCTCAGCCGGATCTCGAAGCTCCGCCTTGGGGAACCATCGTTGCTGACGAGATCAT
GTTTTCGTCTTCTCTCCAATGGCTTCTCGTCTTCCATGTTTCCTGCTTGTTCCATCGCAA
GAGCTGAACCTTGTGGAGATGATCTTGGCAAACTCGTCATTAGGGTTGATAAAGAATTTT
GCGACACTTATTTGGAAAAGAAGGTGCCTCTAGAGTTGATGAATGAAATGGTGACGGTTG
GTGCATCTCATGGTTGGGTAGCTACTTTAAAGGAGGACGGCATAGTGCGTCTCCAAGATG
ATTTGAACCCGGTTGCATCTGACCCAACCCAAAACGCATAGCTCTGCCTCCTCTTGTGAC
TCTACCTCATTGCCAAACCAAAGTTGTGACGAACGTGGCCATGTCCACCTCTTCTCCTGA
GGATGAAGACTGTGTTGTGGCTGTCAAGTTCTTGGGACCACAACTCAGCCTTTGCAGACC
CGCTCAATGTAAGTGGACCAACATCATGATCAAGAACCCCTGTTTCTTCTCCTCCCGTGT
CATGTTTTCCGAAAAAGATGACATGTTTCGCATGCCCGGATCAGGAGGCCACCTCATTGG
GTCATGGGATCGTTTCGGCAAACAACACAAGTTTCAGAGGTTACAGTTTAAAAACCTTCC
CGAGCTGACAAAGGCCAAGCGAGAGCTTTTGAGTTCTTGTTCTGTGAGCGAACATTTGGT
GGAGTCAAGAACTACAGGCGGGACTTTCTTGGTCAAGTGGTTTAGGAAGGCTACACCAAA
ATGTTTGTCGAAAATGAAAACAAGAGGTTTAATGGTTTTCAAGCTAGACGAACAAGGAAA
AGCTGTTTACACTCGAGATATAGGTTATCTCAACATTTTCATTTCAAAATCTGAAGCTTT
CTGTGACCCTGCCACTGAGAAACCCTCTAACTTCGCTGAGCTCTTGGATTTTGATGAAAT
GACCACTGTCTGTTTGGATGATTACTTCATTACCAGTGGAAATTTTACATCCAGGGCCCC
CTACTTTATTCCACCTCAAAATCAAATATAGATTATGTTTGTATTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AU38TF U 1
AF RR2AU38JQ C 415
BS 1 611 RR2AU38TF
BS 612 1128 RR2AU38JQ

RD RR2AU38TF 611 0 0
GATGTCTTGAATTACGGTTTATAGTTCCTTACTGTACATCACTATCATCATTCATGTCTC
TACTTCTCAGCCGGATCTCGAAGCTCCGCCTTGGGGAACCATCGTTGCTGACGAGATCAT
GTTTTCGTCTTCTCTCCAATGGCTTCTCGTCTTCCATGTTTCCTGCTTGTTCCATCGCAA
GAGCTGAACCTTGTGGAGATGATCTTGGCAAACTCGTCATTAGGGTTGATAAAGAATTTT
GCGACACTTATTTGGAAAAGAAGGTGCCTCTAGAGTTGATGAATGAAATGGTGACGGTTG
GTGCATCTCATGGTTGGGTAGCTACTTTAAAGGAGGACGGCATAGTGCGTCTCCAAGATG
ATTTGAACCCGGTTGCATCTGACCCAACCCAAAACGCATAGCTCTGCCTCCTCTTGTGAC
TCTACCTCATTGCCAAACCAAAGTTGTGACGAACGTGGCCATGTCCACCTCTTCTCCTGA
GGATGAAGACTGTGTTGTGGCTGTCAAGTTCTTGGGACCACAACTCAGCCTTTGCAGACC
CGCTCAATGTAAGTGGACCAACATCATGATCAAGAACCCCTGTTTCTTCTCCTCCCGTGT
CATGTTTTCCG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2AU38JQ 714 0 0
TGTGACTCTACCTCATTGCCAAACCAAAGTTGTGACGAACGTGGCCATGTCCACCTCTTC
TCCTGAGGATGAAGACTGTGTTGTGGCTGTCAAGTTCTTGGGACCACAACTCAGCCTTTG
CAGACCCGCTCAATGTAAGTGGACCAACATCATGATCAAGAACCCCTGTTTCTTCTCCTC
CCGTGTCATGTTTTCCGAAAAAGATGACATGTTTCGCATGCCCGGATCAGGAGGCCACCT
CATTGGGTCATGGGATCGTTTCGGCAAACAACACAAGTTTCAGAGGTTACAGTTTAAAAA
CCTTCCCGAGCTGACAAAGGCCAAGCGAGAGCTTTTGAGTTCTTGTTCTGTGAGCGAACA
TTTGGTGGAGTCAAGAACTACAGGCGGGACTTTCTTGGTCAAGTGGTTTAGGAAGGCTAC
ACCAAAATGTTTGTCGAAAATGAAAACAAGAGGTTTAATGGTTTTCAAGCTAGACGAACA
AGGAAAAGCTGTTTACACTCGAGATATAGGTTATCTCAACATTTTCATTTCAAAATCTGA
AGCTTTCTGTGACCCTGCCACTGAGAAACCCTCTAACTTCGCTGAGCTCTTGGATTTTGA
TGAAATGACCACTGTCTGTTTGGATGATTACTTCATTACCAGTGGAAATTTTACATCCAG
GGCCCCCTACTTTATTCCACCTCAAAATCAAATATAGATTATGTTTGTATTAAC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL5239Contig1 861 2 3 U
AGGGTCGAAATCTCGAGGGTATCATTCACCATCTGCTGAAATATCTTTAGACTTCTTCAA
GTGACACTTGACAATATGCATTTGGCCGATCAAGACTTGAATGTTTCTCTCTCGGTCACT
CGGTTTCCTCGTCGAGCAACTTCCATAGCTTCATTCAACATATCAAAGACAGAAGAGTCG
TCATGAGACTTGTGCATTACCATAGCTAGACCGTGCAAAGCTCTGATGAGAAGAGGGTTA
TCTTTGAGAATATTCTTAAACAATCTCTTGGCTTTGCTCAACTGTCCCATCGTCTCGTAG
CAAAGCGCTTCGAGAAGCTTCCACTCAACTTCACGAGGCTCTAACTTAATCAGCTTCTCG
ACGTACTTGACAGCGTCTTCTGTCTTCCCTCTCCTCATCTTCTTATACAAAACAGCCTTC
ATCGCCTCCATGTTCTCCGGCTCTCTTTCCAGAACCTTCTCGAACATTTCTTCTTCCTCC
GATTGAGAGCTCGCGGTACTCGCAGTGGGCAGCGCTAAAGCAGGTTTCGAAGAAGAGAAT
CCTAGCAGGAGGACAAACGATCCGACGAGCAGAACCGCGGCTTTTCTCGCTAGAGTCTGG
AGGAAACCCTTGGAAGAAGGAGGAGGAGACGGAGAAGAGCGTACGTGAGGGAGGTGTGAA
GAGGGCGCAGCGAAATCGAGGGATTGGGAGAGTTTGGGAGCGAAAGGTCGAGACTTTCTC
CACGGAAATGGAAACCCATTTGGATTAGGGAAGTGGGTCGGAGTAAAAGTCTGTGCTTTT
TCCCGGCGACGGTGAAATTTAGCCGGAGAAGCGAGGGCATAGACTCCGATTGAACTCATA
TTTCTTAGGAGACAATCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN63JQ U 195
AF RR2AN63TF C 1
BS 1 194 RR2AN63TF
BS 195 391 RR2AN63JQ
BS 392 861 RR2AN63TF

RD RR2AN63JQ 197 0 0
CATTACCATAGCTAGACCGTGCAAAGCTCTGATGAGAAGAGGGTTATCTTTGAGAATATT
CTTAAACAATCTCTTGGCTTTGCTCAACTGTCCCATCGTCTCGTAGCAAAGCGCTTCGAG
AAGCTTCCACTCAACTTCACGAGGCTCTAACTTAATCAGCTTCTCGACGTACTTGACAGC
GTCTTCTGTCTTCCCTC

QA 1 197 1 197
DS 

RD RR2AN63TF 861 0 0
AGGGTCGAAATCTCGAGGGTATCATTCACCATCTGCTGAAATATCTTTAGACTTCTTCAA
GTGACACTTGACAATATGCATTTGGCCGATCAAGACTTGAATGTTTCTCTCTCGGTCACT
CGGTTTCCTCGTCGAGCAACTTCCATAGCTTCATTCAACATATCAAAGACAGAAGAGTCG
TCATGAGACTTGTGCATTACCATAGCTAGACCGTGCAAAGCTCTGATGAGAAGAGGGTTA
TCTTTGAGAATATTCTTAAACAATCTCTTGGCTTTGCTCAACTGTCCCATCGTCTCGTAG
CAAAGCGCTTCGAGAAGCTTCCACTCAACTTCACGAGGCTCTAACTTAATCAGCTTCTCG
ACGTACTTGACAGCGTCTTCTGTCTTCCCTCTCCTCATCTTCTTATACAAAACAGCCTTC
ATCGCCTCCATGTTCTCCGGCTCTCTTTCCAGAACCTTCTCGAACATTTCTTCTTCCTCC
GATTGAGAGCTCGCGGTACTCGCAGTGGGCAGCGCTAAAGCAGGTTTCGAAGAAGAGAAT
CCTAGCAGGAGGACAAACGATCCGACGAGCAGAACCGCGGCTTTTCTCGCTAGAGTCTGG
AGGAAACCCTTGGAAGAAGGAGGAGGAGACGGAGAAGAGCGTACGTGAGGGAGGTGTGAA
GAGGGCGCAGCGAAATCGAGGGATTGGGAGAGTTTGGGAGCGAAAGGTCGAGACTTTCTC
CACGGAAATGGAAACCCATTTGGATTAGGGAAGTGGGTCGGAGTAAAAGTCTGTGCTTTT
TCCCGGCGACGGTGAAATTTAGCCGGAGAAGCGAGGGCATAGACTCCGATTGAACTCATA
TTTCTTAGGAGACAATCTCCC

QA 1 861 1 861
DS 



AS 1 2

CO CL5240Contig1 958 2 2 U
GGAAGCTTAAGAACTTAAAAATGTTTGTCCATTTGGCTAGCGAGGTGATCAAAATGGGAA
GAAGGCCTTGCTGTGACAAGAAAGGTTTGAAGAAAGGTCCATGGACTCCTGAAGAAGATG
AGATTCTCGTTGAATATATCAAGCAAAACAGCCACGCCAGCTGGAGAACACTTCCAAAGA
AAGCTGGTTTACTTCGCTGTGGAAAGAGTTGTAGACTGAGATGGACCAACTATCTCAGAC
CAGACATAAAGCGAGGTCCGTTCACTCCAGCGGAGGAGAAACTCGTTGTCCAGCTTCACG
CCATTCTCGGCAACAGGTGGGCTGCTATAGCAGCACAGCTTCCAGGGAGAACAGACAACG
AGATCAAGAATTTATGGAATACTCACTTAAAGAAACGTCTTCTAAGTATGGGTCTTCATC
CCAAAACCCATGAGCCGTTACCTTCATATGGGGTAGCCAAACAAGCGCCAGCTTCACCAA
CAACTCGCCACATGGCTCAATGGGAAAGTGCTAGGGTTGAAGCTGAGGCAAGGCTTTCTC
GAGAGTCAACGCTTGTTAAATCTGATTGTGATCACTTCTTACGCATTTGGAACTCTGAGA
TTGGTGAATCTTTCAGAAACATTGCTCCATCTGATCAGTCAACTACTAGTCAAACCCTTA
GCTCTAGGACAACATCTTCTTCATCTACACTTGTAGGGAAAGAGATTGTTGTGAGGACTC
ATGGATCTGATTCTTCTCCTTGTTGGAATAATCTTGAAGATGTTTCATCAGACTCTGCTT
TTCAACTTCTGCTTGATTTCCCTATAAGTGATGATGATATGAGCTTCTTGGAAGAGAACT
TTAGTTTGTTTTATAACTTGAATAGTGTCCATGTTGATTCTTCTTAATAGTTAGCAAGCA
TTCCTCTCTTTATGTTTTGATGATGCTACTAAGAGAAACAACAATGAACATATTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX08TF U 1
AF RR2DX08JQ C 327
BS 1 523 RR2DX08TF
BS 524 958 RR2DX08JQ

RD RR2DX08TF 523 0 0
GGAAGCTTAAGAACTTAAAAATGTTTGTCCATTTGGCTAGCGAGGTGATCAAAATGGGAA
GAAGGCCTTGCTGTGACAAGAAAGGTTTGAAGAAAGGTCCATGGACTCCTGAAGAAGATG
AGATTCTCGTTGAATATATCAAGCAAAACAGCCACGCCAGCTGGAGAACACTTCCAAAGA
AAGCTGGTTTACTTCGCTGTGGAAAGAGTTGTAGACTGAGATGGACCAACTATCTCAGAC
CAGACATAAAGCGAGGTCCGTTCACTCCAGCGGAGGAGAAACTCGTTGTCCAGCTTCACG
CCATTCTCGGCAACAGGTGGGCTGCTATAGCAGCACAGCTTCCAGGGAGAACAGACAACG
AGATCAAGAATTTATGGAATACTCACTTAAAGAAACGTCTTCTAAGTATGGGTCTTCATC
CCAAAACCCATGAGCCGTTACCTTCATATGGGGTAGCCAAACAAGCGCCAGCTTCACCAA
CAACTCGCCACATGGCTCAATGGGAAAGTGCTAGGGTTGAAGC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2DX08JQ 632 0 0
ATAGCAGCACAGCTTCCAGGGAGAACAGACAACGAGATCAAGAATTTATGGAATACTCAC
TTAAAGAAACGTCTTCTAAGTATGGGTCTTCATCCCAAAACCCATGAGCCGTTACCTTCA
TATGGGGTAGCCAAACAAGCGCCAGCTTCACCAACAACTCGCCACATGGCTCAATGGGAA
AGTGCTAGGGTTGAAGCTGAGGCAAGGCTTTCTCGAGAGTCAACGCTTGTTAAATCTGAT
TGTGATCACTTCTTACGCATTTGGAACTCTGAGATTGGTGAATCTTTCAGAAACATTGCT
CCATCTGATCAGTCAACTACTAGTCAAACCCTTAGCTCTAGGACAACATCTTCTTCATCT
ACACTTGTAGGGAAAGAGATTGTTGTGAGGACTCATGGATCTGATTCTTCTCCTTGTTGG
AATAATCTTGAAGATGTTTCATCAGACTCTGCTTTTCAACTTCTGCTTGATTTCCCTATA
AGTGATGATGATATGAGCTTCTTGGAAGAGAACTTTAGTTTGTTTTATAACTTGAATAGT
GTCCATGTTGATTCTTCTTAATAGTTAGCAAGCATTCCTCTCTTTATGTTTTGATGATGC
TACTAAGAGAAACAACAATGAACATATTTTCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL5241Contig1 1284 2 4 U
TTTTTGCTTCTCTTCCACTATTTCCTTTACGTTTTTTTTGTTTTCTCCACTGCGATTCAA
TTCTCGAAACCCTAATTTTCTTTTGCAATTTCTTTTGAGAGCGATTCTTTTCCGAAACCC
TAGAAAGCCAATTCCGATTGAAAATATGCAGCAGTCCAACGAAGAATTTGTGAAGTTTCT
TGGAGAAGGCGCTTACGGTTACGTAAACCTAGTCCGCTACACTAATCCCGACGGTGGATC
TTCTTTTCTCTCCGCCGTCAAGAACTCTTACGACGCAGACTACGACAGTCTCCGAAGAGA
GTTAGAGATTCTTCTCAAACTCAGGGGATGTCCCAGGATCGTCACGTGTCTCGGAGACTC
TCTTCAACACGGTGTAAGCAGTTACGGTAACAAAGTCCACAAACTGCAACTCGAGTACGC
CTCCGAAGGTAGCTTGAAAGCTTTCATGAACCGTTACCCCGACAGAAAGTTGCCGGAGCC
GTTGATTAAAGATTTCACGCGGATGATTCTTGAAGGTTTGGTCTCGATTCACGGACATGG
TTATGTTCATTGTGACCTCAAACCAGATAACTTGCTTGTCTTTCCTTCTTCAAGACAAGC
TTCATCGTACGAGATCAAGATTTCTGATTTTGGCAACTCGCTAGAGGTAGGAGAGGTTCC
TCTGTTCTGGGAAACTGATTATCCGTGGGTGGGGACTCCCATCTACATGCCTCCCGAGTC
TGTGCGTGATGGCGTGGCCAACAAGTCTCTAGATTTGTGGTCGTTGGGATGTTTGGTGCG
GGAGATGTACACGGGTGTGATGCCGTGGGAAGGCATTGAACTTGATGATATCGCTACTCT
TCTCATCTGTGGTGAAGCTCCATGGATACCTGAGTGTTTACCTTCCGATGCTAAGGCTTT
TATCCAAACGTGCTTCTCAAGTGACCCTGAGGATAGAGGAAGCGCTTATGAGTTGTTGTT
TCATCCGTTTTTGCCTCGTCCTGAAGTTGAAGAAGAGGAGAAGAAAACGGTGGACAAGAC
AAGAAACTCGTTTCTTTTGAAGCTGTTGAAGTTGAGAATCAGACGGAGAAGTTCCAACAA
GAAGCCAACGACAGATGCTGTTTCTGTTTCTGTTTTTGAGAAGAAGCCTCTGAAGTTGAG
GTTTTTCCCGGCAAAGACCACACAGTTTAAGAGAAGTCTTAACAAAGTCTTGAGGTTGAA
GAACTCTAACGGCTTCAGTTTAGTGTCTGTTCATTAAGTTTTAGTACCTAGTTTCCTGTT
GATTAAGTCTGTAGTATTCTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C077TF U 1
AF RR2C077JQ C 523
BS 1 635 RR2C077TF
BS 636 636 RR2C077JQ
BS 637 650 RR2C077TF
BS 651 1284 RR2C077JQ

RD RR2C077TF 651 0 0
TTTTTGCTTCTCTTCCACTATTTCCTTTACGTTTTTTTTGTTTTCTCCACTGCGATTCAA
TTCTCGAAACCCTAATTTTCTTTTGCAATTTCTTTTGAGAGCGATTCTTTTCCGAAACCC
TAGAAAGCCAATTCCGATTGAAAATATGCAGCAGTCCAACGAAGAATTTGTGAAGTTTCT
TGGAGAAGGCGCTTACGGTTACGTAAACCTAGTCCGCTACACTAATCCCGACGGTGGATC
TTCTTTTCTCTCCGCCGTCAAGAACTCTTACGACGCAGACTACGACAGTCTCCGAAGAGA
GTTAGAGATTCTTCTCAAACTCAGGGGATGTCCCAGGATCGTCACGTGTCTCGGAGACTC
TCTTCAACACGGTGTAAGCAGTTACGGTAACAAAGTCCACAAACTGCAACTCGAGTACGC
CTCCGAAGGTAGCTTGAAAGCTTTCATGAACCGTTACCCCGACAGAAAGTTGCCGGAGCC
GTTGATTAAAGATTTCACGCGGATGATTCTTGAAGGTTTGGTCTCGATTCACGGACATGG
TTATGTTCATTGTGACCTCAAACCAGATAACTTGCTTGTCTTTCCTTCTTCAAGACAAGC
TTCATCGTACGAGATCAAGATTTCTGATTTTGGCA*CTCGCTAGAGGTAG
A

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2C077JQ 762 0 0
CTCGATTCACGGACATGGTTATGTTCATTGTGACCTCAAACCAGATAACTTGCTTGTCTT
TCCTTCTTCAAGACAAGCTTCATCGTACGAGATCAAGATTTCTGATTTTGGCAACTCGCT
AGAGGTAGGAGAGGTTCCTCTGTTCTGGGAAACTGATTATCCGTGGGTGGGGACTCCCAT
CTACATGCCTCCCGAGTCTGTGCGTGATGGCGTGGCCAACAAGTCTCTAGATTTGTGGTC
GTTGGGATGTTTGGTGCGGGAGATGTACACGGGTGTGATGCCGTGGGAAGGCATTGAACT
TGATGATATCGCTACTCTTCTCATCTGTGGTGAAGCTCCATGGATACCTGAGTGTTTACC
TTCCGATGCTAAGGCTTTTATCCAAACGTGCTTCTCAAGTGACCCTGAGGATAGAGGAAG
CGCTTATGAGTTGTTGTTTCATCCGTTTTTGCCTCGTCCTGAAGTTGAAGAAGAGGAGAA
GAAAACGGTGGACAAGACAAGAAACTCGTTTCTTTTGAAGCTGTTGAAGTTGAGAATCAG
ACGGAGAAGTTCCAACAAGAAGCCAACGACAGATGCTGTTTCTGTTTCTGTTTTTGAGAA
GAAGCCTCTGAAGTTGAGGTTTTTCCCGGCAAAGACCACACAGTTTAAGAGAAGTCTTAA
CAAAGTCTTGAGGTTGAAGAACTCTAACGGCTTCAGTTTAGTGTCTGTTCATTAAGTTTT
AGTACCTAGTTTCCTGTTGATTAAGTCTGTAGTATTCTGTTG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL5242Contig1 1168 2 4 U
TTTTTATTACTTTCCCTCATTACTACTATTTTGTCTGTTTCCCCCGCTCTCGTGCTCTCG
CCGCCGACTACGTAACGGTCGCCGGCCACATTACGCCGACAAACACGTTCCTCTCGCCGT
CGAAGTTTACCTGAAGTAAGCACAATGATTGGATCGTTTCTAACAAGAGGACTTGTAATG
GTGTTTGGATATGCGTATCCTGCTTACGAATGCTACAAAGCTGTTGAGAAGAACAAGCCT
GAGATTCAACACCTTCGTTTCTGGTGCCAATACTGGATTCTGGTGGCTGCTCTGACGGTT
CGAAAGAGTTGGTGATACTTTCGCGTCATGGGTTCCGCTCTACAGCGAGGCAAAGCTGGC
GTTTTTCATATATCTTTGGTTCCCTAAGACCAGAGGAACTACGTATGTTTATGATTCTTT
CTTTAGACCCTATGTTGCAAAGCACGAGAATGAAATCGACCGCAACTTGGTTGAGCTAAG
GACCAGAGCTGGAGATATGGCGGTGATTTACTGCCGAAAAGCAGTGTGCTATGGACAGAC
AAGAGTCACTGATATCCTCCAGTTTGTAGCTCTACAATCAACACCAAAACCTAAACCTAA
GGAAAAGAAGCAGACTCCACCGGAAGCAGAGGAACAGAAACAACCTGATGATCTTGAGGC
GGCGAGCCAAGCAGCTTCTAGTAGTCTTCAAGCGCGTCCAGAGCCCAAGAAACCACAGCT
TCTAACCAAAGAACCTATACCGGCAAAGCCTATTATATCTCCTCGTAAGCAGCTGCAAGC
AGAAACCAAGGAAGCTAAACCCAGCGGGTCGTCACTCCCTCCTCTTACTCCACCATCATC
ACCTTCAACCGCCACTAAACCAAACGCTGATCCAGCACAGCAATCATCATCAACTGCAGA
GGCAGAGAAAGCGTCAGAGACTGTTGGTGCGTTACCAGCGTCTGCGATTAAGCGAGCGTC
ATCTTCGAAAGAGACAATCAGGGAGACAATAATGGAGGAAACACTGAGGGTCACACGTGG
GAGTCTGAGAAAAGCTCGTTCAACGGGGACACGCTAAAGGAATAATAGAGAAGGGAAACA
CACGAGTTCAAATCTCGGTCTGTTCTTTAATGTGGTTTCTTTTTCCTTACTAAGTCAAGC
CAAAACAAGAATAATCGATTTTATTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY36TF U 1
AF RR2CY36JQ C 505
BS 1 658 RR2CY36TF
BS 659 659 RR2CY36JQ
BS 660 709 RR2CY36TF
BS 710 1168 RR2CY36JQ

RD RR2CY36TF 709 0 0
TTTTTATTACTTTCCCTCATTACTACTATTTTGTCTGTTTCCCCCGCTCTCGTGCTCTCG
CCGCCGACTACGTAACGGTCGCCGGCCACATTACGCCGACAAACACGTTCCTCTCGCCGT
CGAAGTTTACCTGAAGTAAGCACAATGATTGGATCGTTTCTAACAAGAGGACTTGTAATG
GTGTTTGGATATGCGTATCCTGCTTACGAATGCTACAAAGCTGTTGAGAAGAACAAGCCT
GAGATTCAACACCTTCGTTTCTGGTGCCAATACTGGATTCTGGTGGCTGCTCTGACGGTT
CGAAAGAGTTGGTGATACTTTCGCGTCATGGGTTCCGCTCTACAGCGAGGCAAAGCTGGC
GTTTTTCATATATCTTTGGTTCCCTAAGACCAGAGGAACTACGTATGTTTATGATTCTTT
CTTTAGACCCTATGTTGCAAAGCACGAGAATGAAATCGACCGCAACTTGGTTGAGCTAAG
GACCAGAGCTGGAGATATGGCGGTGATTTACTGCCGAAAAGCAGTGTGCTATGGACAGAC
AAGAGTCACTGATATCCTCCAGTTTGTAGCTCTACAATCAACACCAAAACCTAAACCTAA
GGAAAAGAAGCAGACTCCACCGGAAGCAGAGGAACAGAAACAACCTGATGATCTTGAG*C
GGCGAGCCAAGCAGCTTCTAGTAGTCTTCAAGCGCGTCCAGAGCCCAAG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2CY36JQ 664 0 0
GATTTACTGCCGAAAAGCAGTGTGCTATGGACAGACAAGAGTCACTGATATCCTCCAGTT
TGTAGCTCTACAATCAACACCAAAACCTAAACCTAAGGAAAAGAAGCAGACTCCACCGGA
AGCAGAGGAACAGAAACAACCTGATGATCTTGAGGCGGCGAGCCAAGCAGCTTCTAGTAG
TCTTCAAGCGCGTCCAGAGCCCAAGAAACCACAGCTTCTAACCAAAGAACCTATACCGGC
AAAGCCTATTATATCTCCTCGTAAGCAGCTGCAAGCAGAAACCAAGGAAGCTAAACCCAG
CGGGTCGTCACTCCCTCCTCTTACTCCACCATCATCACCTTCAACCGCCACTAAACCAAA
CGCTGATCCAGCACAGCAATCATCATCAACTGCAGAGGCAGAGAAAGCGTCAGAGACTGT
TGGTGCGTTACCAGCGTCTGCGATTAAGCGAGCGTCATCTTCGAAAGAGACAATCAGGGA
GACAATAATGGAGGAAACACTGAGGGTCACACGTGGGAGTCTGAGAAAAGCTCGTTCAAC
GGGGACACGCTAAAGGAATAATAGAGAAGGGAAACACACGAGTTCAAATCTCGGTCTGTT
CTTTAATGTGGTTTCTTTTTCCTTACTAAGTCAAGCCAAAACAAGAATAATCGATTTTAT
TGGT

QA 1 664 1 664
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5244Contig1 1167 2 2 U
GGCCTCTCTCTCTCTCTCTGAGCTTTCCATGAAAAGCGTCGGGAAAATGGGGAAATACAT
AAAGAAGAGCAAACTCGACGGAGGAGAATCTCTATCTCTAATCGACGTCTCTCCTTCTCC
CCTCGGTGTCCTCACTCGAGCTAAATCCCTAGCTCTCCAGCGCCGCCTTCAAAAACCCTC
CTCGCCTTCTCCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGAAACAGAAGACGACGACGGATTGCGGCGG
AGGCTCGTATCTTCAGCTGAGGAGTCGTCGGCTACAGAAGAAGCCTCCGATTGTAGTGAT
TCGTCGGAGGAAGAAGCAGCGGAGGGTCCGAAACCCTAATTCCCAAAATCAGGATTCGGG
TCGTGGGTCTGGTGGTGACGGGTCTAGGTCGGATTCGGTTGCTGAGAGTGCTGTGTGTGG
TAAAGCTAAGGACTTTAATGGTGAAATCAACTTGGATGAGCTTCATGGCAGTGAAAGGAC
CACAAGGGAATCCACGCCATGCAGTTTGATGAGAAAACCGGAAACCGTCACAAGCCCGGG
TTCATCTCCGAAGCTTAACAATGTTGTAAGTGATGACAGCAACGAGAGAGAAGAGAGTTT
GTCGGGAAGCCGTGGTCACCTACCGACCACACCTGAAATGGACGAGTTCTTCTCTGGTGC
TGAAGAGGAGCAACAAAAGCAATTCATTGACAAGTACAACTTTGATCCTGTGAACGAACA
ACCACTACCAGGACGGTTTGAATGGAAGAAGCTAGATGATTAGAAACAACAACGAAAGGG
TGTAGGGTGGTGTTAATAGTTAACAAGGCTATATTAACATTTTCCTGCTAATTATCCAGT
TTGATCTTTTATTTCCATCATCCGTTTCTTTAACTTGTAAAGAACTTAGGACCAAAAAAA
ACCCATGTAGCGTTGGTGTCTGTAACATAAGTGGCTGAGAAGGGTTTGTGTAACACACAA
CTGATACCAATCCTTTTCAGTTCTAAACAGATCACCTTAGTAGTAGTACTAAACCATAAG
TGGGAGGTTAACCCAAAGTCTGTTGGGGTTTAGCGTTTAGGGGTTTAGAGTTCTTTCGGT
TAATGGTTTATTGTAACTCTTTGTCTTGTATCCATTTGTGGTGTATACATGTACTGATCC
GAAAACTCATTTCAATAAAGACTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES35TF U 1
AF RR2ES35JQ C 511
BS 1 710 RR2ES35TF
BS 711 1167 RR2ES35JQ

RD RR2ES35TF 710 0 0
GGCCTCTCTCTCTCTCTCTGAGCTTTCCATGAAAAGCGTCGGGAAAATGGGGAAATACAT
AAAGAAGAGCAAACTCGACGGAGGAGAATCTCTATCTCTAATCGACGTCTCTCCTTCTCC
CCTCGGTGTCCTCACTCGAGCTAAATCCCTAGCTCTCCAGCGCCGCCTTCAAAAACCCTC
CTCGCCTTCTCCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGAAACAGAAGACGACGACGGATTGCGGCGG
AGGCTCGTATCTTCAGCTGAGGAGTCGTCGGCTACAGAAGAAGCCTCCGATTGTAGTGAT
TCGTCGGAGGAAGAAGCAGCGGAGGGTCCGAAACCCTAATTCCCAAAATCAGGATTCGGG
TCGTGGGTCTGGTGGTGACGGGTCTAGGTCGGATTCGGTTGCTGAGAGTGCTGTGTGTGG
TAAAGCTAAGGACTTTAATGGTGAAATCAACTTGGATGAGCTTCATGGCAGTGAAAGGAC
CACAAGGGAATCCACGCCATGCAGTTTGATGAGAAAACCGGAAACCGTCACAAGCCCGGG
TTCATCTCCGAAGCTTAACAATGTTGTAAGTGATGACAGCAACGAGAGAGAAGAGAGTTT
GTCGGGAAGCCGTGGTCACCTACCGACCACACCTGAAATGGACGAGTTCTTCTCTGGTGC
TGAAGAGGAGCAACAAAAGCAATTCATTGACAAGTACAACTTTGATCCTG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2ES35JQ 657 0 0
GAGAAAACCGGAAACCGTCACAAGCCCGGGTTCATCTCCGAAGCTTAACAATGTTGTAAG
TGATGACAGCAACGAGAGAGAAGAGAGTTTGTCGGGAAGCCGTGGTCACCTACCGACCAC
ACCTGAAATGGACGAGTTCTTCTCTGGTGCTGAAGAGGAGCAACAAAAGCAATTCATTGA
CAAGTACAACTTTGATCCTGTGAACGAACAACCACTACCAGGACGGTTTGAATGGAAGAA
GCTAGATGATTAGAAACAACAACGAAAGGGTGTAGGGTGGTGTTAATAGTTAACAAGGCT
ATATTAACATTTTCCTGCTAATTATCCAGTTTGATCTTTTATTTCCATCATCCGTTTCTT
TAACTTGTAAAGAACTTAGGACCAAAAAAAACCCATGTAGCGTTGGTGTCTGTAACATAA
GTGGCTGAGAAGGGTTTGTGTAACACACAACTGATACCAATCCTTTTCAGTTCTAAACAG
ATCACCTTAGTAGTAGTACTAAACCATAAGTGGGAGGTTAACCCAAAGTCTGTTGGGGTT
TAGCGTTTAGGGGTTTAGAGTTCTTTCGGTTAATGGTTTATTGTAACTCTTTGTCTTGTA
TCCATTTGTGGTGTATACATGTACTGATCCGAAAACTCATTTCAATAAAGACTTATC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL5245Contig1 1198 2 2 U
CATGGAAGTCAAGAGAAAGTGAGCATGACAGAGTTCAAAGAAGTGTTGTCAGATATTTTG
TTGGGCATGGCTGCTGGTCTAAAACGCGACCCCATCGTCATCCTCAGGATGGACGGTGAG
GATCTGTCGGAGTTCATCCACAGCCCTGGATACGAAGCCGAGATCGTCTCCGTCTACTTC
TCAGCGGTCTCCGGCTGCGAGGAAGCATCACTCAGTGATTGCATCGTGAAAGCTCTCCAG
TCGCTTTCTGTTGATCATGGAATGCCTCCTTCTAACGATCCATGGGTAATGAGCAACATT
GTAGAACCGATCGTTGACTCTTGTCTTGATGAAGAAGATAAGAGAGAGAAGAGTGTGTCA
CAGGAAAGATTCTTGGAAGGATTCAAGAGAGTTGTGGAGAGAGTAGCTCAACGTCTCAAT
GAACAGCCCGTGATCGTCGCCCACAGCGAAAACACCTTCGATGGGAGCGGCATCAGAAGG
CTCCTGTCCAATAAGTTCGAGTTCGACAAGGCATTAAACGTTGGGTTGGAGATCATTCCA
AAATACCGTCATGGTAAGGTGTCTAAAGAGTATCTACGAGCTGTGCTAGATACTGTTGCA
CCATCTGCGACTTTACCACCAATAGGTGCAGTGTCCCAGATGGATGATATGATAACGGAA
GCACTGAAGATGGTGAAGGGAGATGATGGAAAGGTGGTGAAGGAAGAGGAGTTTAAGAAA
ACAATGGCAGAGATATTGGGAAGTATAATGTTGCAGCTTGAGGGTAATCCGATATCTGTC
TCCTCTAACTCAGTGGTTCACGAGCCGCTCACCTCCGCCACCTTTCTACCTCCGCCTCCG
GCTGAGTCGCCAGAGGAGCCTTCTAACTAATTATACTCGTTTAAGTGGGGAGAAACAATA
ACAAAAACGTTATGGTTAATGAGTTTTTACCCCCCTTTAAGTTTTTAAATATTCGAGGAA
GACCAGCTTTACTTTGGGATGTGTAAGAAAAAGGCCACTCTTTTCATTTCTTTGGGATGA
TAGAGAGAAATGGGCGTTTTTAGTAGTGAACATATTCAAAGCTTGTGGTTTCCTCGTATG
GGAGTGGTGATTATGCTCATGTGCCTTTGTCTTTTATTTTCATCATGGAATGCAATGTTT
TATTATGTGTTTATTTTCCGTCTTGAATCATGTAATCTTATAATTAAAAGTAGTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A171TF U 1
AF RR2A171JQ C 500
BS 1 699 RR2A171TF
BS 700 1198 RR2A171JQ

RD RR2A171TF 699 0 0
CATGGAAGTCAAGAGAAAGTGAGCATGACAGAGTTCAAAGAAGTGTTGTCAGATATTTTG
TTGGGCATGGCTGCTGGTCTAAAACGCGACCCCATCGTCATCCTCAGGATGGACGGTGAG
GATCTGTCGGAGTTCATCCACAGCCCTGGATACGAAGCCGAGATCGTCTCCGTCTACTTC
TCAGCGGTCTCCGGCTGCGAGGAAGCATCACTCAGTGATTGCATCGTGAAAGCTCTCCAG
TCGCTTTCTGTTGATCATGGAATGCCTCCTTCTAACGATCCATGGGTAATGAGCAACATT
GTAGAACCGATCGTTGACTCTTGTCTTGATGAAGAAGATAAGAGAGAGAAGAGTGTGTCA
CAGGAAAGATTCTTGGAAGGATTCAAGAGAGTTGTGGAGAGAGTAGCTCAACGTCTCAAT
GAACAGCCCGTGATCGTCGCCCACAGCGAAAACACCTTCGATGGGAGCGGCATCAGAAGG
CTCCTGTCCAATAAGTTCGAGTTCGACAAGGCATTAAACGTTGGGTTGGAGATCATTCCA
AAATACCGTCATGGTAAGGTGTCTAAAGAGTATCTACGAGCTGTGCTAGATACTGTTGCA
CCATCTGCGACTTTACCACCAATAGGTGCAGTGTCCCAGATGGATGATATGATAACGGAA
GCACTGAAGATGGTGAAGGGAGATGATGGAAAGGTGGTG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2A171JQ 699 0 0
AGTTCGACAAGGCATTAAACGTTGGGTTGGAGATCATTCCAAAATACCGTCATGGTAAGG
TGTCTAAAGAGTATCTACGAGCTGTGCTAGATACTGTTGCACCATCTGCGACTTTACCAC
CAATAGGTGCAGTGTCCCAGATGGATGATATGATAACGGAAGCACTGAAGATGGTGAAGG
GAGATGATGGAAAGGTGGTGAAGGAAGAGGAGTTTAAGAAAACAATGGCAGAGATATTGG
GAAGTATAATGTTGCAGCTTGAGGGTAATCCGATATCTGTCTCCTCTAACTCAGTGGTTC
ACGAGCCGCTCACCTCCGCCACCTTTCTACCTCCGCCTCCGGCTGAGTCGCCAGAGGAGC
CTTCTAACTAATTATACTCGTTTAAGTGGGGAGAAACAATAACAAAAACGTTATGGTTAA
TGAGTTTTTACCCCCCTTTAAGTTTTTAAATATTCGAGGAAGACCAGCTTTACTTTGGGA
TGTGTAAGAAAAAGGCCACTCTTTTCATTTCTTTGGGATGATAGAGAGAAATGGGCGTTT
TTAGTAGTGAACATATTCAAAGCTTGTGGTTTCCTCGTATGGGAGTGGTGATTATGCTCA
TGTGCCTTTGTCTTTTATTTTCATCATGGAATGCAATGTTTTATTATGTGTTTATTTTCC
GTCTTGAATCATGTAATCTTATAATTAAAAGTAGTATTT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL5246Contig1 1269 2 6 U
CGGAGCTTAGGTTGGCTGAGACTGTTGCTGATGGTGTTTTGACTAAAGAGCCTGAATCCG
ATAAGTCTGACTCTGTTGGGATGTTGAGGTTGCATGTTGTTGATGTAAGTCCTGAGCAGG
AGCCACCTTTGCCTGAGGAGGAGGAGGAAGAAGTGGTGGTTGAAGAAGAGGAGGAAGTGG
AAGAGAAGCCTGTTGAAGAAGATATCCGTGAAACAGTATCGGAAACAGAGGCCAGCAATG
AGAAATCAGATAAGGAGAAAACACCTTCTTCTGAAGATCCTGAGATGAAGGAACTGGAGA
TGGATGATTGGTTGTTCGACTTTGCTCTGAGGCGCTGGAAAGGAAAAGGTTGCGGAGCAG
CTTCAGACTGCTTACGAGTGGGTGAAAGATAGATACACTCTAGCTAAGGAAAAGTATGAG
CACGCCTTGTCCATCAAACCTGACTTTTATGAGGGTTTGCTCGCTTTGGGACAGCAACAG
TTCGAGATGGCAAAGCTCCATTGGTCTTTTGCTTTGGCACAAAAGATAGATTTGTCTGCA
TGGGATGCAACGGAGACGTTGGCCCTCTTTGATAGTGCAGAAGAGAAGATGAAAGCTGCG
ACTGAGATGTGGGAGAAGCTTGAAGCACAAGGGATGAATGATCTGAAAAACCCGAACAAG
AAAGAGGAAGTCTCAAAGAGGAGAAAGAAGCAAGGAGATGGTGAAAATGGGGAGGCTTCG
GAAGCTGTTACAGCAGCAGAAGCAGCGGAGCAAGCGATTGCTATGGGATCACAGATCCAT
CTGTTCTGGGGAAATATGCTGTTTGAAAGATTACAAGTGGAATGCAAAATCAGTGTAAGC
GGCTGGGAGAAGAATCTTGACTCAGCAGTTGGGAGATTCAAACTTGCTGGTGCTTCTGAA
ACTGACATATCGACTGTTGTCAAGAACCATTGTTCAAACGAAGCAGCTGCTGAAGGAGAT
GAGAAGAAGGTAACTGAATCTTGAAGACCTTGGCAGATGGAACCCATTCGATCATAGGAA
AGCTAAAACCAAAAGGCTAAACAGAAGGGGCATCTCTGCTACTTGCACTCATTGGATAAG
CTGCAACCATTTTGATGATTTTGATTGGATTGGTTTTCCTAATTCAGTTTTAATTATGTG
TGTGAGTTTTGTGTGTTTTTGCTTTGTGGAATTTACTGATGAGATGATCAATGTTTCTGA
TCTTTATTGTAACTTATATATTCATGTCTTTTTCAATATTCACTTAACCACACCAGAGTC
ATCAGTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D982TF U 1
AF RR2D982JQ C 463
BS 1 649 RR2D982TF
BS 650 650 RR2D982JQ
BS 651 658 RR2D982TF
BS 659 659 RR2D982JQ
BS 660 668 RR2D982TF
BS 669 1269 RR2D982JQ

RD RR2D982TF 676 0 0
CGGAGCTTAGGTTGGCTGAGACTGTTGCTGATGGTGTTTTGACTAAAGAGCCTGAATCCG
ATAAGTCTGACTCTGTTGGGATGTTGAGGTTGCATGTTGTTGATGTAAGTCCTGAGCAGG
AGCCACCTTTGCCTGAGGAGGAGGAGGAAGAAGTGGTGGTTGAAGAAGAGGAGGAAGTGG
AAGAGAAGCCTGTTGAAGAAGATATCCGTGAAACAGTATCGGAAACAGAGGCCAGCAATG
AGAAATCAGATAAGGAGAAAACACCTTCTTCTGAAGATCCTGAGATGAAGGAACTGGAGA
TGGATGATTGGTTGTTCGACTTTGCTCTGAGGCGCTGGAAAGGAAAAGGTTGCGGAGCAG
CTTCAGACTGCTTACGAGTGGGTGAAAGATAGATACACTCTAGCTAAGGAAAAGTATGAG
CACGCCTTGTCCATCAAACCTGACTTTTATGAGGGTTTGCTCGCTTTGGGACAGCAACAG
TTCGAGATGGCAAAGCTCCATTGGTCTTTTGCTTTGGCACAAAAGATAGATTTGTCTGCA
TGGGATGCAACGGAGACGTTGGCCCTCTTTGATAGTGCAGAAGAGAAGATGAAAGCTGCG
ACTGAGATGTGGGAGAAGCTTGAAGCACAAGGGATGAATGATCTGAAAA*CCCGAACA*G
AAAGAGGA
GTCTCAAA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2D982JQ 807 0 0
CGC
TTGGGACAGCAACAGTTCGAGATGGCAAAGCTCCATTGGTCTTTTGCTTTGGCACAAAAG
ATAGATTTGTCTGCATGGGATGCAACGGAGACGTTGGCCCTCTTTGATAGTGCAGAAGAG
AAGATGAAAGCTGCGACTGAGATGTGGGAGAAGCTTGAAGCACAAGGGATGAATGATCTG
AAAAACCCGAACAAGAAAGAGGAAGTCTCAAAGAGGAGAAAGAAGCAAGGAGATGGTGAA
AATGGGGAGGCTTCGGAAGCTGTTACAGCAGCAGAAGCAGCGGAGCAAGCGATTGCTATG
GGATCACAGATCCATCTGTTCTGGGGAAATATGCTGTTTGAAAGATTACAAGTGGAATGC
AAAATCAGTGTAAGCGGCTGGGAGAAGAATCTTGACTCAGCAGTTGGGAGATTCAAACTT
GCTGGTGCTTCTGAAACTGACATATCGACTGTTGTCAAGAACCATTGTTCAAACGAAGCA
GCTGCTGAAGGAGATGAGAAGAAGGTAACTGAATCTTGAAGACCTTGGCAGATGGAACCC
ATTCGATCATAGGAAAGCTAAAACCAAAAGGCTAAACAGAAGGGGCATCTCTGCTACTTG
CACTCATTGGATAAGCTGCAACCATTTTGATGATTTTGATTGGATTGGTTTTCCTAATTC
AGTTTTAATTATGTGTGTGAGTTTTGTGTGTTTTTGCTTTGTGGAATTTACTGATGAGAT
GATCAATGTTTCTGATCTTTATTGTAACTTATATATTCATGTCTTTTTCAATATTCACTT
AACCACACCAGAGTCATCAGTGAT

QA 4 807 4 807
DS 



AS 1 2

CO CL5247Contig1 629 2 3 U
GAAGAGTACAAAGTTGAACCAATCTCGTGGTTCCAAAAGGAGATAAGAGGAGACAATAAA
CTTCTCACTGATCACATTTGCAAAGAGATGAACGAACTAAACCTCATTAGATGTACGAAA
ATCCCAAAGAGGCCAGGTGCTGATTGGCGTGACCTCCCTGAAGAAAAGGTGACTTTATCA
AAAGGGCAAGTGGTAGATTTGATTCCGTGGTGTCTGCCAAACACTGCTAAGCGACACAAC
CAGTGGAAAGGACTGTTTGGGAGATTAGATTGGGAAGGTAACTTTCCAACATCCATCACT
GATCCTCAGCCTATGGGAAAGGTTGGGATGTGCTTCCATCCTGACCAAGACAGGATCATC
ACTGTCCGTGAATGCGCCCGGTCTCAGGGGTTTCCGGATAGCTATCAGTTTGAAGGGAAC
ATAATACACAGGCATAGGCAGATTGGGAATGCAGTACCTCCACCTTTGGCATTTGCTCTT
GGTCGCAAGCTCAAAGAAGCGGTTCAACTCAAGGAGGCCCCCAAAACAAACTAGATTTGT
GTTTCCTTTTATTTTATTTTTGTTTTGGCAAACGATTAGCACTTTTATCACACACTGTTT
GATATAGTTAAGTCGCTGTATTAATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AZ91JQ C 1
AF RR2AZ91TFB U 428
BS 1 427 RR2AZ91JQ
BS 428 627 RR2AZ91TFB
BS 628 629 RR2AZ91JQ

RD RR2AZ91JQ 629 0 0
GAAGAGTACAAAGTTGAACCAATCTCGTGGTTCCAAAAGGAGATAAGAGGAGACAATAAA
CTTCTCACTGATCACATTTGCAAAGAGATGAACGAACTAAACCTCATTAGATGTACGAAA
ATCCCAAAGAGGCCAGGTGCTGATTGGCGTGACCTCCCTGAAGAAAAGGTGACTTTATCA
AAAGGGCAAGTGGTAGATTTGATTCCGTGGTGTCTGCCAAACACTGCTAAGCGACACAAC
CAGTGGAAAGGACTGTTTGGGAGATTAGATTGGGAAGGTAACTTTCCAACATCCATCACT
GATCCTCAGCCTATGGGAAAGGTTGGGATGTGCTTCCATCCTGACCAAGACAGGATCATC
ACTGTCCGTGAATGCGCCCGGTCTCAGGGGTTTCCGGATAGCTATCAGTTTGAAGGGAAC
ATAATACACAGGCATAGGCAGATTGGGAATGCAGTACCTCCACCTTTGGCATTTGCTCTT
GGTCGCAAGCTCAAAGAAGCGGTTCAACTCAAGGAGGCCCCCAAAACAAACTAGATTTGT
GTTTCCTTTTATTTTATTTTTGTTTTGGCAAACGATTAGCACTTTTATCACACACTGTTT
GATATAGTTAAGTCGCTGTATTAATTATC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2AZ91TFB 200 0 0
ACAGGCATAGGCAGATTGGGAATGCAGTACCTCCACCTTTGGCATTTGCTCTTGGTCGCA
AGCTCAAAGAAGCGGTTCAACTCAAGGAGGCCCCCAAAACAAACTAGATTTGTGTTTCCT
TTTATTTTATTTTTGTTTTGGCAAACGATTAGCACTTTTATCACACACTGTTTGATATAG
TTAAGTCGCTGTATTAATTA

QA 1 200 1 200
DS 



AS 1 2

CO CL5248Contig1 1012 2 2 U
TGGCTGGAAAGGCTCTTTTGCTCGCTGGACCTCCTGGTACGGGGAAAACTGCGTTGGCTC
TTGGAATATCCCAAGAGCTGGGAAGTAAGGTTCCCTTCTGTCCAATGGTTGGATCTGAGG
TTTACTCATCAGAGGTTAAGAAAACTGAGGTTCTCATGGAGAATTTTAGACGTGCCATTG
GGCTACGTATCAAGGAAACCAAAGACGTCTGTGAAGGAGAGGTTCACAAAAAGAAAGAGA
TAGTGCAGGATGTCACGCTTCAAGATCTGGACGCAGCAAATGCTCGACCTCAAGGTGGGC
AGGATATACTTTCCTTGATGGGCCAAATGATGAAACCCAGGAAGACTGAGATCACTGATA
AGCTGCGGCAAGAAATCAACAAGGTGGTGAACCGTTATATAGATGAAGGTGTTGCAGAAC
TTGTTCCCGGAGTTCTGTTTATCGATGAGGTTCATATGCTTGATATGGAGTGCTTTTCCT
ACTTAAACCGTGCTCTTGAGAGCTCGTTATCTCCAATAGTGATATTCGCAACAAATAGAG
GAGTTTGCAACGTAAGAGGGACTGATATTCCGAGTCCCCATGGAGTCCCTATTGACTTGT
TGGATCGGTTGGTCATTATCCGGACCCAAATCTACAACCCCTCTGAAATGATACAGATTA
TAGCAATTCGTGCGCAAGTAGAAGAGCTAACAGTAGATGAAGAATGCTTGGTCCTACTTG
GGGACATTGGGCAGAGAACATCCCTAAGGCACGCAGTTCAGCTTCTGTCTCCTGCCAGCA
TCGTGGCGAAAATGAATGGACGTGACAATATTTGCAAGGCTGATATAGAGGAAGTCACAT
CACTCTACCTTGACGCCAAATCTTCAGCAAAGCTTTTGCACGAGCAGCAAGAAAAATACA
TCTCTTGAGTGGAACATTAATCAAATGTTTTTTTTTTTGCTTCTCTTTAAGCGGATTATG
TAAACATGGATTAAATCTAAAATTTAATGGATAGAATTGGTTTCATGATAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ73TFB U 1
AF RR2AZ73JQ C 207
BS 1 406 RR2AZ73TFB
BS 407 1012 RR2AZ73JQ

RD RR2AZ73TFB 406 0 0
TGGCTGGAAAGGCTCTTTTGCTCGCTGGACCTCCTGGTACGGGGAAAACTGCGTTGGCTC
TTGGAATATCCCAAGAGCTGGGAAGTAAGGTTCCCTTCTGTCCAATGGTTGGATCTGAGG
TTTACTCATCAGAGGTTAAGAAAACTGAGGTTCTCATGGAGAATTTTAGACGTGCCATTG
GGCTACGTATCAAGGAAACCAAAGACGTCTGTGAAGGAGAGGTTCACAAAAAGAAAGAGA
TAGTGCAGGATGTCACGCTTCAAGATCTGGACGCAGCAAATGCTCGACCTCAAGGTGGGC
AGGATATACTTTCCTTGATGGGCCAAATGATGAAACCCAGGAAGACTGAGATCACTGATA
AGCTGCGGCAAGAAATCAACAAGGTGGTGAACCGTTATATAGATGA

QA 1 406 1 406
DS 

RD RR2AZ73JQ 806 0 0
GTCTGTGAAGGAGAGGTTCACAAAAAGAAAGAGATAGTGCAGGATGTCACGCTTCAAGAT
CTGGACGCAGCAAATGCTCGACCTCAAGGTGGGCAGGATATACTTTCCTTGATGGGCCAA
ATGATGAAACCCAGGAAGACTGAGATCACTGATAAGCTGCGGCAAGAAATCAACAAGGTG
GTGAACCGTTATATAGATGAAGGTGTTGCAGAACTTGTTCCCGGAGTTCTGTTTATCGAT
GAGGTTCATATGCTTGATATGGAGTGCTTTTCCTACTTAAACCGTGCTCTTGAGAGCTCG
TTATCTCCAATAGTGATATTCGCAACAAATAGAGGAGTTTGCAACGTAAGAGGGACTGAT
ATTCCGAGTCCCCATGGAGTCCCTATTGACTTGTTGGATCGGTTGGTCATTATCCGGACC
CAAATCTACAACCCCTCTGAAATGATACAGATTATAGCAATTCGTGCGCAAGTAGAAGAG
CTAACAGTAGATGAAGAATGCTTGGTCCTACTTGGGGACATTGGGCAGAGAACATCCCTA
AGGCACGCAGTTCAGCTTCTGTCTCCTGCCAGCATCGTGGCGAAAATGAATGGACGTGAC
AATATTTGCAAGGCTGATATAGAGGAAGTCACATCACTCTACCTTGACGCCAAATCTTCA
GCAAAGCTTTTGCACGAGCAGCAAGAAAAATACATCTCTTGAGTGGAACATTAATCAAAT
GTTTTTTTTTTTGCTTCTCTTTAAGCGGATTATGTAAACATGGATTAAATCTAAAATTTA
ATGGATAGAATTGGTTTCATGATAAC

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL5249Contig1 1059 2 2 U
AGAGCAATGTGACTACGAGGTTGAGTATGCTGATGGAGGGTCTTCTCTCGGTGTACTCGT
TAGAGATGTCTTCTCCTTGAACTATACAGAAGGTCTCCGGCTCACTCCACGTCTTGCTCT
CGGATGCGGATACGATCAAATCCCAGGGGCATCGAGTCATCATCCTTTAGATGGAGTGTT
GGGACTAGGTAGGGGGAAAGTAAGCATTCTTTCGCAGCTTCATAGCCAAGGTCATGTCAA
GAATGTTATCGGTCATTTGCTTAAGCAGCCTAGGTGGAGGGATTCTGTTTTTTGGAGACG
ACCTTTATGATTCTTCAAGAGTCTCTTGGACACCCATGTCCCGTGAAAACTCAAAGCACT
ACTCTCCTGCGATGGGAGGGGAACTTCTATTCGGGGGAAGAACAACGGGGTTGAAGAATC
TATTGACAATATTTGATAGTGGCAGTTCTTACACTTATTTTAACACCAAGGCGTATCAGG
CAGTCACATACTTGCTGAAAGAGAGCTAAGTGGAAAACCGTTGAAAGAAGCAAGCGATGA
TCACACGCTGCCTCTGTGTGGGCAAGGACGTAGACCGTTCATGAGCATTGAAGAAGTGAA
GAAGTATTTTAAGCCTCTAGCTTTAAGCTTCAAAACCGGGTGGAGATCAAAAACTCTGTT
TGAAACACCCCCTGAGGCTTATCTCATCATCTCTAGGAAGGGAAATGTATGTTTAGGAAT
CTTGAATGGCACAGAGATAGGTCTCCAGAACCTAAACCTCATTGGTGATATATCGATGCA
AGATCAGATGATAATCTACGATAATGAGAAGCAATCCATTGGGTGGATTCCAGCAGATTG
CGATGAACTGGCTTCACTACAAGCTTCTGCTGCTCAAGTTTATGAATATTGAGAAATGAT
ATGCTGCTGCTGCTCAAGTGCACGGATATTTGAGAAATTGTATACTATATAGTGTTTATT
ATAAACCATTGGTGAAAGACATGTATTGAAAAACTTAATTGTTATAGTTGTATACTTGTT
TGCCAAGCTAAGTTTGTAATAGATAACTTTTCTTATCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL18TF U 1
AF RR2FL18JQ C 491
BS 1 580 RR2FL18TF
BS 581 1059 RR2FL18JQ

RD RR2FL18TF 580 0 0
AGAGCAATGTGACTACGAGGTTGAGTATGCTGATGGAGGGTCTTCTCTCGGTGTACTCGT
TAGAGATGTCTTCTCCTTGAACTATACAGAAGGTCTCCGGCTCACTCCACGTCTTGCTCT
CGGATGCGGATACGATCAAATCCCAGGGGCATCGAGTCATCATCCTTTAGATGGAGTGTT
GGGACTAGGTAGGGGGAAAGTAAGCATTCTTTCGCAGCTTCATAGCCAAGGTCATGTCAA
GAATGTTATCGGTCATTTGCTTAAGCAGCCTAGGTGGAGGGATTCTGTTTTTTGGAGACG
ACCTTTATGATTCTTCAAGAGTCTCTTGGACACCCATGTCCCGTGAAAACTCAAAGCACT
ACTCTCCTGCGATGGGAGGGGAACTTCTATTCGGGGGAAGAACAACGGGGTTGAAGAATC
TATTGACAATATTTGATAGTGGCAGTTCTTACACTTATTTTAACACCAAGGCGTATCAGG
CAGTCACATACTTGCTGAAAGAGAGCTAAGTGGAAAACCGTTGAAAGAAGCAAGCGATGA
TCACACGCTGCCTCTGTGTGGGCAAGGACGTAGACCGTTC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2FL18JQ 569 0 0
TTGCTGA
AAAGAGAGCTAAGTGGAAAACCGTTGAAAGAAGCAAGCGATGATCACACGCTGCCTCTGT
GTTGGCAAGGACGTAGACCGTTCATGAGCATTGAAGAAGTGAAGAAGTATTTTAAGCCTC
TAGCTTTAAGCTTCAAAACCGGGTGGAGATCAAAAACTCTGTTTGAAACACCCCCTGAGG
CTTATCTCATCATCTCTAGGAAGGGAAATGTATGTTTAGGAATCTTGAATGGCACAGAGA
TAGGTCTCCAGAACCTAAACCTCATTGGTGATATATCGATGCAAGATCAGATGATAATCT
ACGATAATGAGAAGCAATCCATTGGGTGGATTCCAGCAGATTGCGATGAACTGGCTTCAC
TACAAGCTTCTGCTGCTCAAGTTTATGAATATTGAGAAATGATATGCTGCTGCTGCTCAA
GTGCACGGATATTTGAGAAATTGTATACTATATAGTGTTTATTATAAACCATTGGTGAAA
GACATGTATTGAAAAACTTAATTGTTATAGTTGTATACTTGTTTGCCAAGCTAAGTTTGT
AATAGATAACTTTTCTTATCTG

QA 8 569 8 569
DS 



AS 1 2

CO CL5250Contig1 1275 2 4 U
CCGGCACCACAGACGATTTCTAGAGAGGTTAGGATTCAAGGGTTTGGGGGTTTCGGGTTC
GTTCGTGTTTCTTGTGTCCTCTGTTCGTTCGATTGCTAGGGGAAATAAATAAGAAGAGCA
GGCGAAGTGAAGAGCTTTTGTGATTTAGGATTTTTTTTTTTGCGTGGGTCTGATTCCGAA
ATCAAGAAGCTCGATTTCATTTAGTTCCTAAGGTCAACAATAGATGGCAATAGCGCGAAC
TGGAGTTTATGTTGATGATTACCTTGAGTATGCAAGCACTTTCCCTGCGGAGCTTCAGAG
ATTGCTGAATACAGTTCGCGAACTGGACGAGAGATCTCAATCGCTCATAAACCAGACGAG
GCAGCAAACTAAGTATTGCTTAGGGCTTGCCTCACAAAGTTCCAAGAAGGGCATTGGCAA
TAATCATTACAACACTGGTCTTGATGAAGAAGAAACCATTGAAAAAATGCGTAAAGAGAT
TGAGTCCAGCCAGGAAAATGCGTTAAGTTTGTGTACGGAGAAGGTCTTATTGGCCCGGCA
AGCTTATGATCTTATTGACAGTCACATAAAACGACTTGATGAAGATCTCAATAATTTTGC
TGAAGATTTGAAGCAAGAGGGGAAAATTCCACCAGACGAGCCCTCTGTTCTTCCTCCACT
ACCTATAGCTCCTAAGCAGGAAAAGCGCAAGTCTTTTTATGGCACACCACAGCCTAAGAA
GATTGATTACAGAGATAGAGAGTGGGATCGTGACAGGGACTTCGAGCTCATGCCTCCTCC
AGGAAGCCATCGGAAAGACTTCACCCTTATTGATGAGCAGCCAATCGATCCAGACGAACC
GACGTACTGTGTCTGCCATCAGGTGTCCTTTGGGGACATGATTGCCTGTGACAATGAGAA
TTGTCAAGGAGGTGAATGGTTTCACTATACATGTGTTGGCCTCACCCCCGAAACCAGATT
CAAAGGGAAATGGTATTGCCCTACCTGCAGGCTCCTCCCACAGTCACATTAGTATCATTC
GTTCTTGTTGTGACGAGGTGGCAGTGACATCTTCTTTGGTACCTTTTCTTCTAGACCAAT
CTCCATCTTTATTGCAATTATATGTCATGTTTTATACAACCTCGGATTAATCCTAATTTT
TCAAATACTAAATACTACTGTGTCATCTCCTGTTACAATGGATAAGACATTGGAGTCAGA
TGGAGATGAAATATTTGAAGCATATAATGTGGAGCAAAAACACAAGTTAGAAGTATAAAA
TTCTTCATCATCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CN29TF U 1
AF RR2CN29JQ C 491
BS 1 679 RR2CN29TF
BS 680 681 RR2CN29JQ
BS 682 694 RR2CN29TF
BS 695 1275 RR2CN29JQ

RD RR2CN29TF 694 0 0
CCGGCACCACAGACGATTTCTAGAGAGGTTAGGATTCAAGGGTTTGGGGGTTTCGGGTTC
GTTCGTGTTTCTTGTGTCCTCTGTTCGTTCGATTGCTAGGGGAAATAAATAAGAAGAGCA
GGCGAAGTGAAGAGCTTTTGTGATTTAGGATTTTTTTTTTTGCGTGGGTCTGATTCCGAA
ATCAAGAAGCTCGATTTCATTTAGTTCCTAAGGTCAACAATAGATGGCAATAGCGCGAAC
TGGAGTTTATGTTGATGATTACCTTGAGTATGCAAGCACTTTCCCTGCGGAGCTTCAGAG
ATTGCTGAATACAGTTCGCGAACTGGACGAGAGATCTCAATCGCTCATAAACCAGACGAG
GCAGCAAACTAAGTATTGCTTAGGGCTTGCCTCACAAAGTTCCAAGAAGGGCATTGGCAA
TAATCATTACAACACTGGTCTTGATGAAGAAGAAACCATTGAAAAAATGCGTAAAGAGAT
TGAGTCCAGCCAGGAAAATGCGTTAAGTTTGTGTACGGAGAAGGTCTTATTGGCCCGGCA
AGCTTATGATCTTATTGACAGTCACATAAAACGACTTGATGAAGATCTCAATAATTTTGC
TGAAGATTTGAAGCAAGAGGGGAAAATTCCACCAGACGAGCCCTCTGTTCTTCCTCCACT
ACCTATAGCTCCTAAGCAG**AAAGCGCAAGTCT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2CN29JQ 785 0 0
CAGGAAAATGCGTTAAGTT*GTGTACGGAGAAGGTCTTATTGGCCCGGCAAGCTTATGAT
CTTATTGACAGTCACATAAAACGACTTGATGAAGATCTCAATAATTTTGCTGAAGATTTG
AAGCAAGAGGGGAAAATTCCACCAGACGAGCCCTCTGTTCTTCCTCCACTACCTATAGCT
CCTAAGCAGGAAAAGCGCAAGTCTTTTTATGGCACACCACAGCCTAAGAAGATTGATTAC
AGAGATAGAGAGTGGGATCGTGACAGGGACTTCGAGCTCATGCCTCCTCCAGGAAGCCAT
CGGAAAGACTTCACCCTTATTGATGAGCAGCCAATCGATCCAGACGAACCGACGTACTGT
GTCTGCCATCAGGTGTCCTTTGGGGACATGATTGCCTGTGACAATGAGAATTGTCAAGGA
GGTGAATGGTTTCACTATACATGTGTTGGCCTCACCCCCGAAACCAGATTCAAAGGGAAA
TGGTATTGCCCTACCTGCAGGCTCCTCCCACAGTCACATTAGTATCATTCGTTCTTGTTG
TGACGAGGTGGCAGTGACATCTTCTTTGGTACCTTTTCTTCTAGACCAATCTCCATCTTT
ATTGCAATTATATGTCATGTTTTATACAACCTCGGATTAATCCTAATTTTTCAAATACTA
AATACTACTGTGTCATCTCCTGTTACAATGGATAAGACATTGGAGTCAGATGGAGATGAA
ATATTTGAAGCATATAATGTGGAGCAAAAACACAAGTTAGAAGTATAAAATTCTTCATCA
TCAGC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL5251Contig1 1133 2 4 U
CGGGGGATCTCTCTCTGTTCGTTCGTCTTCTTCCTCAATCATCTTTTAGGGTTTGAAACG
AAATCTCTGAAACAATGTACGATTGTATGGTGGATGAGGCCGAGCTGTGGCTGGACGAAC
CTCCGCATCGTAAGAGGAAGCTCGAAGCTCCACCACCACCACCACCGATCGTAGACTATT
CATTAACGACGACGTTTTCAGATTCCGACGAGGAAGAGATCGATCCGGTGGAACGCGAGA
AGTATCGAAAACAAGTGGTCGAATCCGGCGGGTTCGATGTTGACTGTTTCCCTGTCTATG
GAAGCTTATACCAATCTGGATCCACTCCTTCCACTGTACTGTTGAGCAAGGTGGGACTCC
ATACCTACAACTTTGACAAGGGGACGAATTTACAGTTCAGGAGTGTAGAGAAAGCCAACG
AGGAGTATGCTTCGTTTACTACGTACTATATAACGGTTGAAGCGATGGATCCGATCAATG
ATGATTCAACTGTTACTTTCCAAACCTCTGTTTGGGATGCTGCTACAAAGAGCAACGAGA
GCTCCAGATTTATCACTAGAGTGTCCAGAATCAAAGGAACCAAAGAAGAAACTTCTCTGT
GGGACCACAATGCTGTAGATGAGTTCTATAAAGATGATATCTCTTGGCTAGAGGATGATG
CTCTTACAGGAAGTCATAAGCTACAATACTATGAGGTGAAGGAATCGGATATGCGAGATA
ACAACGAATGGCTTCATCTATATGCTGAAGTTGTAATGTTCTCCAAGTGGGCAACTGACC
TTAGCGCTTATTTGCCGGTGAAGATGAAGAAAGTAGTGGTACGAACAAGGGAAGATGTAG
AGTCGAGTATGAAGCTCAAGTCAAAGAATGCAACTTTCTACATGAGTTTCACGGCCTGTG
GAGGTCTCGAGTGCAGGGGCATAATAAGGCGGACGACGGATGGAAGACCACAACACATGA
GCCTTCAAGCTATATGTTGGATCGACAACTAACTGTCCCTTTTATGAATTTAATTGATCT
TTGCAATTGTTAAAATAATATACGCTTCACGTTTCAGAGAGCCTAGTTTTATTTAGGGGA
TGTTAGAACTTTGACATTGTTGGAAATGATATTAAGTACATATTTAAACATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ27TF U 1
AF RR2GJ27JQB C 453
BS 1 576 RR2GJ27TF
BS 577 577 RR2GJ27JQB
BS 578 649 RR2GJ27TF
BS 650 1133 RR2GJ27JQB

RD RR2GJ27TF 649 0 0
CGGGGGATCTCTCTCTGTTCGTTCGTCTTCTTCCTCAATCATCTTTTAGGGTTTGAAACG
AAATCTCTGAAACAATGTACGATTGTATGGTGGATGAGGCCGAGCTGTGGCTGGACGAAC
CTCCGCATCGTAAGAGGAAGCTCGAAGCTCCACCACCACCACCACCGATCGTAGACTATT
CATTAACGACGACGTTTTCAGATTCCGACGAGGAAGAGATCGATCCGGTGGAACGCGAGA
AGTATCGAAAACAAGTGGTCGAATCCGGCGGGTTCGATGTTGACTGTTTCCCTGTCTATG
GAAGCTTATACCAATCTGGATCCACTCCTTCCACTGTACTGTTGAGCAAGGTGGGACTCC
ATACCTACAACTTTGACAAGGGGACGAATTTACAGTTCAGGAGTGTAGAGAAAGCCAACG
AGGAGTATGCTTCGTTTACTACGTACTATATAACGGTTGAAGCGATGGATCCGATCAATG
ATGATTCAACTGTTACTTTCCAAACCTCTGTTTGGGATGCTGCTACAAAGAGCAACGAGA
GCTCCAGATTTATCACTAGAGTGTCCAGAATCAAAG*AACCAAAGAAGAAACTTCTCTGT
GGGACCACAATGCTGTAGATGAGTTCTATAAAGATGATATCTCTTGGCT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2GJ27JQB 681 0 0
ACGGTTGAAGCGATGGATCCGATCAATGATGATTCAACTGTTACTTTCCAAACCTCTGTT
TGGGATGCTGCTACAAAGAGCAACGAGAGCTCCAGATTTATCACTAGAGTGTCCAGAATC
AAAGGAACCAAAGAAGAAACTTCTCTGTGGGACCACAATGCTGTAGATGAGTTCTATAAA
GATGATATCTCTTGGCTAGAGGATGATGCTCTTACAGGAAGTCATAAGCTACAATACTAT
GAGGTGAAGGAATCGGATATGCGAGATAACAACGAATGGCTTCATCTATATGCTGAAGTT
GTAATGTTCTCCAAGTGGGCAACTGACCTTAGCGCTTATTTGCCGGTGAAGATGAAGAAA
GTAGTGGTACGAACAAGGGAAGATGTAGAGTCGAGTATGAAGCTCAAGTCAAAGAATGCA
ACTTTCTACATGAGTTTCACGGCCTGTGGAGGTCTCGAGTGCAGGGGCATAATAAGGCGG
ACGACGGATGGAAGACCACAACACATGAGCCTTCAAGCTATATGTTGGATCGACAACTAA
CTGTCCCTTTTATGAATTTAATTGATCTTTGCAATTGTTAAAATAATATACGCTTCACGT
TTCAGAGAGCCTAGTTTTATTTAGGGGATGTTAGAACTTTGACATTGTTGGAAATGATAT
TAAGTACATATTTAAACATCG

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL5252Contig1 663 2 1 U
GGATAGATAATCACATCCTTAGCTATATAATCACAAATTAATTCAACACCAATTGGGGTT
TATCAACTTTGAGATCAATGGAATCCAACAGATCTTTTTCCGCAGCCCTCTTCCTATCTC
TTAATCTCATGTTTTTTGCGTATGTAAGTGGCTGCAACACTTGCTTGCCGCCTAAGCCAA
TCCCTAACCCTAACCCTATCAGCAATCCTACAAAACATAGCTGCCCAAGAGACGCCCTAA
AACTCGGAGTTTGCGCCAAAATACTGGACGGTGCGGTCGGAGCAGTCATCGGAAACCCAC
CAGACACACCTTGCTGCTCATTCCTACAAGGCCTCGTCGATCTTGAAGCTGCCGTTTGTC
TTTGCACCGCCATTAAAGCTAACATTCTGGGGATTAACATTGATATTCCCATCTCCTTGA
GCTTACTCATCAATACTTGCGGCAAAAAGCTTCCCTCTGATTTTATTTGCGCCTGATGAG
TGTAAAGCGGACAGATCGAGTAGTTTGATTTGTTTGTACTCTTTTGCTTCTGTTTGTTTG
GTCGGTCCTCGTCTAGTTCAGTCCGCAATTTCTTTTTCTTTTGGTCATCTCTAAGAGTTT
CGTACTTTGGTTGATGTAATATTTGATCTGTTTCATGCTATCAGTTCACATGTGTTAAGT
GCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2CH32JQ C 1
AF RR2CH32TF U 1
BS 1 663 RR2CH32TF

RD RR2CH32JQ 663 0 0
GGATAGATAATCACATCCTTAGCTATATAATCACAAATTAATTCAACACCAATTGGGGTT
TATCAACTTTGAGATCAATGGAATCCAACAGATCTTTTTCCGCAGCCCTCTTCCTATCTC
TTAATCTCATGTTTTTTGCGTATGTAAGTGGCTGCAACACTTGCTTGCCGCCTAAGCCAA
TCCCTAACCCTAACCCTATCAGCAATCCTACAAAACATAGCTGCCCAAGAGACGCCCTAA
AACTCGGAGTTTGCGCCAAAATACTGGACGGTGCGGTCGGAGCAGTCATCGGAAACCCAC
CAGACACACCTTGCTGCTCATTCCTACAAGGCCTCGTCGATCTTGAAGCTGCCGTTTGTC
TTTGCACCGCCATTAAAGCTAACATTCTGGGGATTAACATTGATATTCCCATCTCCTTGA
GCTTACTCATCAATACTTGCGGCAAAAAGCTTCCCTCTGATTTTATTTGCGCCTGATGAG
TGTAAAGCGGACAGATCGAGTAGTTTGATTTGTTTGTACTCTTTTGCTTCTGTTTGTTTG
GTCGGTCCTCGTCTAGTTCAGTCCGCAATTTCTTTTTCTTTTGGTCATCTCTAAGAGTTT
CGTACTTTGGTTGATGTAATATTTGATCTGTTTCATGCTATCAGTTCACATGTGTTAAGT
GCG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2CH32TF 663 0 0
GGATAGATAATCACATCCTTAGCTATATAATCACAAATTAATTCAACACCAATTGGGGTT
TATCAACTTTGAGATCAATGGAATCCAACAGATCTTTTTCCGCAGCCCTCTTCCTATCTC
TTAATCTCATGTTTTTTGCGTATGTAAGTGGCTGCAACACTTGCTTGCCGCCTAAGCCAA
TCCCTAACCCTAACCCTATCAGCAATCCTACAAAACATAGCTGCCCAAGAGACGCCCTAA
AACTCGGAGTTTGCGCCAAAATACTGGACGGTGCGGTCGGAGCAGTCATCGGAAACCCAC
CAGACACACCTTGCTGCTCATTCCTACAAGGCCTCGTCGATCTTGAAGCTGCCGTTTGTC
TTTGCACCGCCATTAAAGCTAACATTCTGGGGATTAACATTGATATTCCCATCTCCTTGA
GCTTACTCATCAATACTTGCGGCAAAAAGCTTCCCTCTGATTTTATTTGCGCCTGATGAG
TGTAAAGCGGACAGATCGAGTAGTTTGATTTGTTTGTACTCTTTTGCTTCTGTTTGTTTG
GTCGGTCCTCGTCTAGTTCAGTCCGCAATTTCTTTTTCTTTTGGTCATCTCTAAGAGTTT
CGTACTTTGGTTGATGTAATATTTGATCTGTTTCATGCTATCAGTTCACATGTGTTAAGT
GCG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL5253Contig1 1107 2 2 U
GCATCTTCGGTCTGATCCATGACTTACGGCGATGGCGTCGATAAGACGGTGCCTGAGCTG
AAATTGAGAATGGAAGATCCAGAGAATGGAGATTATGTGAAATTAAGAGGAAGATCGGAG
GATGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGATCATCGTGTGGGGGATGTTCGTTAGGGTCGGTGACG
TCTGTGTGGTTCTGGGTTAAATTCATCTCCCTCCTCGCTTGTCTTGCTGTATTGGCCTTT
GTTATCATTAAATGGATTGCTCCATTTTTGATCGAAAAGGAACTGATTCCGTTTATAAAT
TGGGTGGGAAGCACATTCAGCATCCCGGTGCTCGGACTTCTCCTCTTTGCCTCTGTTGCA
TTGTTCCCAACCATTCTTCTCCCTTCCTCTCCTTCCATGTGGATGGCTGGTCTTACCTTT
GGTTATGGAAAAGGCTTTCTGTTGATTCTATCTGCAGCATCAATCGGTGTTACTCTTCCT
TTCTTGATTGGACATCTCTTCCTCCACAACATGCAAGAATGGTTGAAGCAATACCCGAAA
AAAGCAGCCATACTTCGAGCTGCCGGTGAAGGAACCTGGTTCCATCAGTTTCAAGCAGTC
ACCTTGATCCGTGTCTCTCCATTCCCTTACATGATTTACAACTACTGCGCATTGGCCACT
GGAGTTCACTACGGTCCTTACATCTTAGGCTCTCTTGTTGGAATGGTCCCTGAGATCTTT
GTCTCCATCTACACGGGAATAATGCTAAGAACACTAGCTGTTGCATCAGAAAAGAGACAC
GGTCTTTCGGCCATGGAGATAGTAGTGAATGTTCTTGGTTTCTGTGTAACTGCAAGCGCG
ACTATAGTCTGCACCATCTATGCGAAGAAGAAGCTAAGCGCAATGCAATCAGAGGAAGCA
GCGGAGACGTCATAAAAGTACACACGCTGCTTGAAGAACTCTTTTCATCACCAAAACGCT
TAAAGAGCCCAATCACTAAACAATCTAACACGATCTTGGAAGTTATACGAAAATATTTTG
TTTTTGTTTCGTTCAGATGAATATCTCTGCTTTTTTCTTGTATAGATATAATTCAACTAG
ATAATCTAATTATTATTTTTTTTCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN55TF U 1
AF RR2DN55JQ C 480
BS 1 669 RR2DN55TF
BS 670 1107 RR2DN55JQ

RD RR2DN55TF 669 0 0
GCATCTTCGGTCTGATCCATGACTTACGGCGATGGCGTCGATAAGACGGTGCCTGAGCTG
AAATTGAGAATGGAAGATCCAGAGAATGGAGATTATGTGAAATTAAGAGGAAGATCGGAG
GATGAAGAGGAAGAAGAAGAAGGATCATCGTGTGGGGGATGTTCGTTAGGGTCGGTGACG
TCTGTGTGGTTCTGGGTTAAATTCATCTCCCTCCTCGCTTGTCTTGCTGTATTGGCCTTT
GTTATCATTAAATGGATTGCTCCATTTTTGATCGAAAAGGAACTGATTCCGTTTATAAAT
TGGGTGGGAAGCACATTCAGCATCCCGGTGCTCGGACTTCTCCTCTTTGCCTCTGTTGCA
TTGTTCCCAACCATTCTTCTCCCTTCCTCTCCTTCCATGTGGATGGCTGGTCTTACCTTT
GGTTATGGAAAAGGCTTTCTGTTGATTCTATCTGCAGCATCAATCGGTGTTACTCTTCCT
TTCTTGATTGGACATCTCTTCCTCCACAACATGCAAGAATGGTTGAAGCAATACCCGAAA
AAAGCAGCCATACTTCGAGCTGCCGGTGAAGGAACCTGGTTCCATCAGTTTCAAGCAGTC
ACCTTGATCCGTGTCTCTCCATTCCCTTACATGATTTACAACTACTGCGCATTGGCCACT
GGAGTTCAC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2DN55JQ 628 0 0
TTTCTTGATTGGACATCTCTTCCTCCACAACATGCAAGAATGGTTGAAGCAATACCCGAA
AAAAGCAGCCATACTTCGAGCTGCCGGTGAAGGAACCTGGTTCCATCAGTTTCAAGCAGT
CACCTTGATCCGTGTCTCTCCATTCCCTTACATGATTTACAACTACTGCGCATTGGCCAC
TGGAGTTCACTACGGTCCTTACATCTTAGGCTCTCTTGTTGGAATGGTCCCTGAGATCTT
TGTCTCCATCTACACGGGAATAATGCTAAGAACACTAGCTGTTGCATCAGAAAAGAGACA
CGGTCTTTCGGCCATGGAGATAGTAGTGAATGTTCTTGGTTTCTGTGTAACTGCAAGCGC
GACTATAGTCTGCACCATCTATGCGAAGAAGAAGCTAAGCGCAATGCAATCAGAGGAAGC
AGCGGAGACGTCATAAAAGTACACACGCTGCTTGAAGAACTCTTTTCATCACCAAAACGC
TTAAAGAGCCCAATCACTAAACAATCTAACACGATCTTGGAAGTTATACGAAAATATTTT
GTTTTTGTTTCGTTCAGATGAATATCTCTGCTTTTTTCTTGTATAGATATAATTCAACTA
GATAATCTAATTATTATTTTTTTTCCTT

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL5254Contig1 744 2 3 U
ATCAGAAATCAAGAGGAAGGTAGGAAGGAAGTTAATGGCGATGGCTCCTAGGACGAGGAG
GAAGATAAGCAAGGAAGAAGTTATGGAGAAGCTTAAGGACGACGGCGATTTTGACAGTCT
CCGCCTCCAAATCATACGCCGCCTCAAGGATAACGAGGAACTACGAAACAACATGATATC
AGTTGTCAAGGAGTCAAGAGCTTTGAATGGAGAGGATGCTCAAAACATGAAAACCAGGCA
ACTCTTTGATGCCATATTCCAAGAAGTCGGGAGCAAGATGTTGAGTCAGCTCTCAGATGG
GCTGTGGGGGATAATAAGATCAGAAGACGGGATGAAGAAGGAAATCAGAGACACTGTTCA
ATCCGTTTACGCTACATTATCAAACCCTGGAGGCCTTCAAGACGGACCATCCACGACAGT
AGAGCTCCCAAAAGATAGTAAGCAACCCACGTTTGATCCATTAAGTAAACAGAAGCAAGA
ACTGATTCAAGGATCAGTCGAAGAAAACAGAGGAGAAGCAGCATGTAGTAGCACTAACAA
CATTAACTGTGATGATGATGATGAAGAAGATCCTGAACTCCCTCCTGGTTTTGGCTAAAC
ATGTAATTAGTATTATTTTTTTCTGTTAAATTTTGATGATGTTATTTGTGTAAGAAAGAT
AAATAGCAGCAAACTCAAATCTTGTAAGAACAACCAATTTATTCTGTTATTTAGAAATAA
AAATATAAAGGCAGCGACTTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY07TFB U 56
AF RR2AY07JQ C 1
BS 1 55 RR2AY07JQ
BS 56 245 RR2AY07TFB
BS 246 744 RR2AY07JQ

RD RR2AY07TFB 192 0 0
AGGAGGAAGATAAGCAAGGAAGAAGTTATGGAGAAGCTTAAGGACGACGGCGATTTTGAC
AGTCTCCGCCTCCAAATCATACGCCGCCTCAAGGATAACGAGGAACTACGAAACAACATG
ATATCAGTTGTCAAGGAGTCAAGAGCTTTGAATGGAGAGGATGCTCAAAACATGAAAACC
AGGCAACTCT
CT

QA 1 190 1 190
DS 

RD RR2AY07JQ 744 0 0
ATCAGAAATCAAGAGGAAGGTAGGAAGGAAGTTAATGGCGATGGCTCCTAGGACGAGGAG
GAAGATAAGCAAGGAAGAAGTTATGGAGAAGCTTAAGGACGACGGCGATTTTGACAGTCT
CCGCCTCCAAATCATACGCCGCCTCAAGGATAACGAGGAACTACGAAACAACATGATATC
AGTTGTCAAGGAGTCAAGAGCTTTGAATGGAGAGGATGCTCAAAACATGAAAACCAGGCA
ACTCTTTGATGCCATATTCCAAGAAGTCGGGAGCAAGATGTTGAGTCAGCTCTCAGATGG
GCTGTGGGGGATAATAAGATCAGAAGACGGGATGAAGAAGGAAATCAGAGACACTGTTCA
ATCCGTTTACGCTACATTATCAAACCCTGGAGGCCTTCAAGACGGACCATCCACGACAGT
AGAGCTCCCAAAAGATAGTAAGCAACCCACGTTTGATCCATTAAGTAAACAGAAGCAAGA
ACTGATTCAAGGATCAGTCGAAGAAAACAGAGGAGAAGCAGCATGTAGTAGCACTAACAA
CATTAACTGTGATGATGATGATGAAGAAGATCCTGAACTCCCTCCTGGTTTTGGCTAAAC
ATGTAATTAGTATTATTTTTTTCTGTTAAATTTTGATGATGTTATTTGTGTAAGAAAGAT
AAATAGCAGCAAACTCAAATCTTGTAAGAACAACCAATTTATTCTGTTATTTAGAAATAA
AAATATAAAGGCAGCGACTTTATG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5256Contig1 1041 2 2 U
GTCCACGTCAGCAAGTTCGCCATCGGGTTCGGCCCGATCCTCGCCAAGTTCGATTTCAAG
AACGTCGAGTATTCCCTCAGGGCGTTCCCTCTCGGCGGGTTCGTTGGTTTCCCCGACAAC
GATCCCGACAGCGAGATCGCAACCGACGATAAGAACTTGCTCAAGAACAGACCGGTTTTA
GATAGATCGATTGTAGTTTCCGCTGGAATCATAGCTAATGTGGTTTTCGCTTACGTTATA
ATCTTTGTGCAAGTCTTGTCTGTTGGTTTGCCTGTTCAAGAAGCCTTCCCTGGTGTGCTC
GTCCCCGAAGTTAAGACCTTTTCTGCTGCTTCCCGTGATGGGTTGCTCTCTGGCGATGTG
ATTCTCTCTGTGGATGGTGCTGAGCTCTCTAAAACTGGACCTGACGCTGTCTCCAAAGTT
GTTGATATGGTTAAAAGAAGCCCCGAGAGTGATGTGTTGTTTAGGATCGCGAGAGGGAAT
AAAGATTTGGTTTCGGGTTAGACCGGATAAGAACTTTGATGGGATGGGGAAGATCGGTGT
TCAGCTGTCTCCCAACGTTAGAATCACCAAGGTGATACCGAGGGACGTTGGTGAAACGTT
TAGGTTCGTTGGGAAGGAGTTTACGGGGCTGTCTTCTAACGTCGTGGACGGTCTGAAGCA
GACGTTCTTCAACTTCTCTCAGACAGCGAGTAAAGTAGCGGGTCCCGTGGCGATCATCGC
AGTGGGAGCAGAGGTGGCGAGGTCGAACGCCGACGGGCTTTACCAGTTTGCAGCGTTGCT
GAATATCAACATGGCGGTGATCAATCTCTTGCCGTTGCCTGCGCTCGACGGTGGAACGTT
GGCGTTGATATTGTTGGAAGCGGTTAGAGGAGGGAGGAAGCTTCCTGTGGAGGTGGAACA
AGGGATCATGTCTTCAGGGATCATGCTTGTGATATTCCTTGGATTGTTTCTCATTGTCAA
GGACACACTTAGCCTTGATTTCATTCAAGAAATGTTGTAGTTTTACATCTCTTTTGCCCA
AAAGAAAAAAGTGTTTTCGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H385TF U 1
AF RR2H385JQ C 334
BS 1 523 RR2H385TF
BS 524 1041 RR2H385JQ

RD RR2H385TF 523 0 0
GTCCACGTCAGCAAGTTCGCCATCGGGTTCGGCCCGATCCTCGCCAAGTTCGATTTCAAG
AACGTCGAGTATTCCCTCAGGGCGTTCCCTCTCGGCGGGTTCGTTGGTTTCCCCGACAAC
GATCCCGACAGCGAGATCGCAACCGACGATAAGAACTTGCTCAAGAACAGACCGGTTTTA
GATAGATCGATTGTAGTTTCCGCTGGAATCATAGCTAATGTGGTTTTCGCTTACGTTATA
ATCTTTGTGCAAGTCTTGTCTGTTGGTTTGCCTGTTCAAGAAGCCTTCCCTGGTGTGCTC
GTCCCCGAAGTTAAGACCTTTTCTGCTGCTTCCCGTGATGGGTTGCTCTCTGGCGATGTG
ATTCTCTCTGTGGATGGTGCTGAGCTCTCTAAAACTGGACCTGACGCTGTCTCCAAAGTT
GTTGATATGGTTAAAAGAAGCCCCGAGAGTGATGTGTTGTTTAGGATCGCGAGAGGGAAT
AAAGATTTGGTTTCGGGTTAGACCGGATAAGAACTTTGATGGG

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2H385JQ 708 0 0
CGTGATGGGTTGCTCTCTGGCGATGTGATTCTCTCTGTGGATGGTGCTGAGCTCTCTAAA
ACTGGACCTGACGCTGTCTCCAAAGTTGTTGATATGGTTAAAAGAAGCCCCGAGAGTGAT
GTGTTGTTTAGGATCGCGAGAGGGAATAAAGATTTGGTTTCGGGTTAGACCGGATAAGAA
CTTTGATGGGATGGGGAAGATCGGTGTTCAGCTGTCTCCCAACGTTAGAATCACCAAGGT
GATACCGAGGGACGTTGGTGAAACGTTTAGGTTCGTTGGGAAGGAGTTTACGGGGCTGTC
TTCTAACGTCGTGGACGGTCTGAAGCAGACGTTCTTCAACTTCTCTCAGACAGCGAGTAA
AGTAGCGGGTCCCGTGGCGATCATCGCAGTGGGAGCAGAGGTGGCGAGGTCGAACGCCGA
CGGGCTTTACCAGTTTGCAGCGTTGCTGAATATCAACATGGCGGTGATCAATCTCTTGCC
GTTGCCTGCGCTCGACGGTGGAACGTTGGCGTTGATATTGTTGGAAGCGGTTAGAGGAGG
GAGGAAGCTTCCTGTGGAGGTGGAACAAGGGATCATGTCTTCAGGGATCATGCTTGTGAT
ATTCCTTGGATTGTTTCTCATTGTCAAGGACACACTTAGCCTTGATTTCATTCAAGAAAT
GTTGTAGTTTTACATCTCTTTTGCCCAAAAGAAAAAAGTGTTTTCGAG

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL5257Contig1 527 2 2 U
AAATCCTTACATGGGACATTTAGCTTGGGGTGATGCCTTTGTAGTGACAGCAGATTCTGT
CAGTCTCATAAGCGAAGCCTGCAGCACCGGGAAACCAGTGTATGTGATTGGAGCTGATCA
CTGTAAATGGAAGATTGCAGATTTCCACAAGTCTTTGAGGGAACGAGGAGTCGTTCGCCC
ATTTACAGGTCTCGAAGACATGTCGGAAAGTTGGAGTTATCCGCCACTGAATGACACAGC
AGAAGCAGCAGCGAGAGTACGGAGTGCATTAGCTGCACGTGGATGGAGTCTACGCTCTTG
AAAACTATCATACGTTTTTTTTTTTGTACAATTTATTTTGGGAATCAACATTTTCTCGAA
AGCTATAGAGAAAGAGAAGCCTAAAACAATAATCGGATGTGCAGGAAGAAAAGGTGACTA
CACCATTTTGAAGGGCTTTTATTCACATTTCCTGTACCCTAAATTTTTTTGGGGAAAATT
GTATTTTTTAGACCAAACAAAAATGATAACTATACACCAAACAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ53TF U 1
AF RR2CZ53JQ C 271
BS 1 474 RR2CZ53TF
BS 475 527 RR2CZ53JQ

RD RR2CZ53TF 474 0 0
AAATCCTTACATGGGACATTTAGCTTGGGGTGATGCCTTTGTAGTGACAGCAGATTCTGT
CAGTCTCATAAGCGAAGCCTGCAGCACCGGGAAACCAGTGTATGTGATTGGAGCTGATCA
CTGTAAATGGAAGATTGCAGATTTCCACAAGTCTTTGAGGGAACGAGGAGTCGTTCGCCC
ATTTACAGGTCTCGAAGACATGTCGGAAAGTTGGAGTTATCCGCCACTGAATGACACAGC
AGAAGCAGCAGCGAGAGTACGGAGTGCATTAGCTGCACGTGGATGGAGTCTACGCTCTTG
AAAACTATCATACGTTTTTTTTTTTGTACAATTTATTTTGGGAATCAACATTTTCTCGAA
AGCTATAGAGAAAGAGAAGCCTAAAACAATAATCGGATGTGCAGGAAGAAAAGGTGACTA
CACCATTTTGAAGGGCTTTTATTCACATTTCCTGTACCCTAAATTTTTTTGGGG

QA 1 474 1 474
DS 

RD RR2CZ53JQ 257 0 0
AGCTGCACGTGGATGGAGTTTACGCTCTTGAAAACTATCATACGTTTTTTTTTTTGTACA
ATTTATTTTGGGAATCAACATTTTCTCGAAAGCTATAGAGAAAGAGAAGCCTAAGACAAT
AATCGGATGTGCAGGAAGAAAAGGTGACTACACCATTTTGAAGGGCTTTTATTCACATTT
CCTGTACCCTAAATTTTTTTGGGGAAAATTGTATTTTTTAGACCAAACAAAAATGATAAC
TATACACCAAACAAAAA

QA 1 257 1 257
DS 



AS 1 2

CO CL5258Contig1 1238 2 2 U
GAACATGAGCGTGAAGTACCAGCTACCAAACGAGGATCTTGACGCGTTGATCTCCGTATC
AACGGACGAGGATGTAGAGAACATGATGGAAGAATACGACCGCGTCGCACTGAATCAAAA
CCCCCGCTCCTCTCGTCTCCGTCTCTTCCTCTTCGCCAAAAGCATCGCCGGAGAAGAAGA
AGATAACGATAGTCGAGCAAGCAGCATCAGCTCTCTCCTCGATAGCTCCGTCAATCGAGA
GCAGTGGTTCCTCGACGCTCTCAATCACGGCTCCTCCGCCGCATCTAACGGTGGTTCCGC
CAAAGGTTTCGAGCGCGTCAGGTCTGAAGTCTCCTCGATCGTCTCCGAAGTTCCTGATTA
CCTCTTCGGGTTGGATCACTTCGACGAGACTGCTCCGCCGCACGATCGTGATCCGAGAGC
TAAGATCCGACGAGAAGCCTCGACGCTTTCGGATCCTGGCTCGCCTCGTCGTGATGTTCC
TTCGCCGTATGGTTCAACCTCTTCGGCTCATGTGATCACGTCATCTACACCGGAACTTCC
ACCGGTTAAAATTAAACCGGAAAGTCCAGAAACGGTTTTGACTCCAAAAGCAGATCCTCA
ACCGGAGCAAGTAATTCAACAGATTCCCGGTTAACTCGCATTGGCAATACGTTGCCCCTG
GCCCACAGTTTCATTACCAACCACCGGTTTATATGGTTCAACCGGGCAGTCATATGGTTC
AACGAGGTAATCATATGGTTCAACAGAATAATCATATGGTTCAACCGGTTCTAATGCCGG
GTCAGCGTATTCCACAATACCAGCATGTACCGATGGGATACCATCACCAACCACAGCCTC
AACAGATTCCTGGTTTGGGTCAAGTATATGGTGAAACGGGTAGGCCGGTTATGATGGCAG
TTGATGGAGTCAACCGTACTGCTTATTATGGTATGAATGCATCCGGTCCGGTTCAGATGT
ATCATCATCAACCTGGTATGGTTGTCCCAGGCGTAGAAGAACAATACAGAACTAAAACGG
ATTCGGATCCGGGTGGGGCTTTTTAGCTGGTTTAAGAGACACGTGAAAGTCGTTTTCGTC
CTTTGTGGCGTGTCTCAGCATGAACTGCGTAATACATTTCTTTGCTTTATTTGAATCTTT
TATGTAATTTTGTCAACTTTTCTTTACAAACTACGATAACAATGAAACCCAATGTCAACA
TCTTGTAATAAATAATAAATATACATCTGTGATTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI93TF U 1
AF RR2GI93JQB C 539
BS 1 738 RR2GI93TF
BS 739 1238 RR2GI93JQB

RD RR2GI93TF 738 0 0
GAACATGAGCGTGAAGTACCAGCTACCAAACGAGGATCTTGACGCGTTGATCTCCGTATC
AACGGACGAGGATGTAGAGAACATGATGGAAGAATACGACCGCGTCGCACTGAATCAAAA
CCCCCGCTCCTCTCGTCTCCGTCTCTTCCTCTTCGCCAAAAGCATCGCCGGAGAAGAAGA
AGATAACGATAGTCGAGCAAGCAGCATCAGCTCTCTCCTCGATAGCTCCGTCAATCGAGA
GCAGTGGTTCCTCGACGCTCTCAATCACGGCTCCTCCGCCGCATCTAACGGTGGTTCCGC
CAAAGGTTTCGAGCGCGTCAGGTCTGAAGTCTCCTCGATCGTCTCCGAAGTTCCTGATTA
CCTCTTCGGGTTGGATCACTTCGACGAGACTGCTCCGCCGCACGATCGTGATCCGAGAGC
TAAGATCCGACGAGAAGCCTCGACGCTTTCGGATCCTGGCTCGCCTCGTCGTGATGTTCC
TTCGCCGTATGGTTCAACCTCTTCGGCTCATGTGATCACGTCATCTACACCGGAACTTCC
ACCGGTTAAAATTAAACCGGAAAGTCCAGAAACGGTTTTGACTCCAAAAGCAGATCCTCA
ACCGGAGCAAGTAATTCAACAGATTCCCGGTTAACTCGCATTGGCAATACGTTGCCCCTG
GCCCACAGTTTCATTACCAACCACCGGTTTATATGGTTCAACCGGGCAGTCATATGGTTC
AACGAGGTAATCATATGG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2GI93JQB 700 0 0
CCACCGGTTAAAATTAAACCGGAAAGTCCAGAAACGGTTTTGACTCCAAAAGCAGATCCT
CAACCGGAGCAAGTAATTCAACAGATTCC*GGTTAACTCGCATTGGCAATACGTTGCCCC
TGGCCCACAGTTTCATTACCAACCACCGGTTTATATGGTTCAACCGGGCAGTCATATGGT
TCAACGAGGTAATCATATGGTTCAACAGAATAATCATATGGTTCAACCGGTTCTAATGCC
GGGTCAGCGTATTCCACAATACCAGCATGTACCGATGGGATACCATCACCAACCACAGCC
TCAACAGATTCCTGGTTTGGGTCAAGTATATGGTGAAACGGGTAGGCCGGTTATGATGGC
AGTTGATGGAGTCAACCGTACTGCTTATTATGGTATGAATGCATCCGGTCCGGTTCAGAT
GTATCATCATCAACCTGGTATGGTTGTCCCAGGCGTAGAAGAACAATACAGAACTAAAAC
GGATTCGGATCCGGGTGGGGCTTTTTAGCTGGTTTAAGAGACACGTGAAAGTCGTTTTCG
TCCTTTGTGGCGTGTCTCAGCATGAACTGCGTAATACATTTCTTTGCTTTATTTGAATCT
TTTATGTAATTTTGTCAACTTTTCTTTACAAACTACGATAACAATGAAACCCAATGTCAA
CATCTTGTAATAAATAATAAATATACATCTGTGATTTGCG

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL5259Contig1 1201 2 6 U
GGATATCCAGGCTATTTACGGCTTTCTTCCTCTCAAACCTACGACGTTCCTCTTGCGACG
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTGCGGCGATGAGTTGTGCCGATTCAGTTCCTCCACAGGCTGT
AACGTTGTTAGTTAAAACTTGGTGATCAATCCCGTCTTTCGCTCCCCCTTTATGTCCTCT
TTAATGCCTCGTTGGAACCGGAATGGCGGTGATATCTGCGTATAAATACGGGCCGGCAAG
TGCTCCTCCGCCGTAGAGGCCAGACTATTGAGGTTTTGGGAGGCTAGGAACGTGAAGCGT
GGCGGCGAGCTCATGTGGGTCGAGACATGCTGATGGTGGGCGTCAACGTTCGATGATCAC
GATGTTTCATCGCTCTGCAATCTTGGAGCAGAGGAGCTGCAACTTCTGTTCATCTCCTTC
GTCCAGGTAGTTGGTCCGTACCCTAAGCTATACGATGCTGGAGCAGTGCAAGCAGTCAAG
TTCGATCCGTGAGAAGTACAGTGAGTGACATTCCTCAAGTAGAATAGCAGTTACGGCGAG
GCGAATATCAAGATCGACAGGATTCCGGGGTATCCAGGGGTTGTTGTTGCAAGTAGCATA
AACACAAAATTGTAGGAGGACGTTTGTTCTTGAATGCCACCTCGGGAACACATGTGATTT
TCGACCAGGAAACTGATGCAGAAGCTAGACATGTTTCTTTCATTTAGAGATCAGTCAAAA
CAGAAGACATTCAGACTATAGTACATGAAGAAGTTTCAGGTAGATATTTCTTTCTCTGTG
TCATCTAATCTTCTTATTGTTCAAAGTATGAAGGCTGTCGCAAGAACGGAGATGTCGATT
GCATCATCCTTAGCACGTTAAACATGACAAGACATGATCTTTAGAAGAGAGAAATAGATG
TGTATTTGCTGCAGATGTACGGCTACTGAGATAGAGGACACAAAAGAGGATAAATACAAA
ACAGAGATCTGCAGTACTTTGATGACCTAGAAGCTAGATTTGATGTGTAGCCTTCTCCCA
AACTGGAACCATCAACAATTTACTTTGTCTTAATATAAAAAGAGTTTTAACAGCAAGTAG
GGTGTAATCACATCTACTTAATATACAAGCCCACATGTAGAAAAATCATACGAGTGTACA
CAAGGATTTAGTTTATGTGTTTTTGTATAACATTTGGTTCATCAATTGATATGTTCACTG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2CP79TF U 1
AF RR2CP79JQ C 563
BS 1 608 RR2CP79TF
BS 609 609 RR2CP79JQ
BS 610 647 RR2CP79TF
BS 648 648 RR2CP79JQ
BS 649 694 RR2CP79TF
BS 695 1201 RR2CP79JQ

RD RR2CP79TF 697 0 0
GGATATCCAGGCTATTTACGGCTTTCTTCCTCTCAAACCTACGACGTTCCTCTTGCGACG
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTGCGGCGATGAGTTGTGCCGATTCAGTTCCTCCACAGGCTGT
AACGTTGTTAGTTAAAACTTGGTGATCAATCCCGTCTTTCGCTCCCCCTTTATGTCCTCT
TTAATGCCTCGTTGGAACCGGAATGGCGGTGATATCTGCGTATAAATACGGGCCGGCAAG
TGCTCCTCCGCCGTAGAGGCCAGACTATTGAGGTTTTGGGAGGCTAGGAACGTGAAGCGT
GGCGGCGAGCTCATGTGGGTCGAGACATGCTGATGGTGGGCGTCAACGTTCGATGATCAC
GATGTTTCATCGCTCTGCAATCTTGGAGCAGAGGAGCTGCAACTTCTGTTCATCTCCTTC
GTCCAGGTAGTTGGTCCGTACCCTAAGCTATACGATGCTGGAGCAGTGCAAGCAGTCAAG
TTCGATCCGTGAGAAGTACAGTGAGTGACATTCCTCAAGTAGAATAGCAGTTACGGCGAG
GCGAATATCAAGATCGACAGGATTCCGGGGTATCCAGGGGTTGTTGTTGCAAGTAGCATA
AACACAAA*TTGTAGGAGGACGTTTGTTCTTGAATGCCACCTCGGGA*CACATGTGATTT
TCGACCAGGAAACTGATGCAGAAGCTAGACATGT
CTC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2CP79JQ 639 0 0
TTCCGGGGTATCCAGGGGTTGTTGTTGCAAGTAGCATAAACACAAAATTGTAGGAGGACG
TTTGTTCTTGAATGCCACCTCGGGAACACATGTGATTTTCGACCAGGAAACTGATGCAGA
AGCTAGACATGTTTCTTTCATTTAGAGATCAGTCAAAACAGAAGACATTCAGACTATAGT
ACATGAAGAAGTTTCAGGTAGATATTTCTTTCTCTGTGTCATCTAATCTTCTTATTGTTC
AAAGTATGAAGGCTGTCGCAAGAACGGAGATGTCGATTGCATCATCCTTAGCACGTTAAA
CATGACAAGACATGATCTTTAGAAGAGAGAAATAGATGTGTATTTGCTGCAGATGTACGG
CTACTGAGATAGAGGACACAAAAGAGGATAAATACAAAACAGAGATCTGCAGTACTTTGA
TGACCTAGAAGCTAGATTTGATGTGTAGCCTTCTCCCAAACTGGAACCATCAACAATTTA
CTTTGTCTTAATATAAAAAGAGTTTTAACAGCAAGTAGGGTGTAATCACATCTACTTAAT
ATACAAGCCCACATGTAGAAAAATCATACGAGTGTACACAAGGATTTAGTTTATGTGTTT
TTGTATAACATTTGGTTCATCAATTGATATGTTCACTGC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL5260Contig1 1010 2 6 U
GCGGTTGACGCGGCGCCGGCAACTAACGGAACCGTTAAGTTTGTGATAGGGATCAGGGAA
GGCGTGTATGAGGAAACCGTCAGGGTTCCGTTTGAGAAAAAGAACGTCGTGTTCATCGGG
GACGGGATGGGTAAAACGGTAATTACGGGTTCGTTGAATGTAGGTCAACCAGGGATGACA
ACGTTCAACTCTGCAACCGTCGGAGTTCTCGGTGATGGGTTCATGGCACGTGACTTAACA
ATAGAGAACACGGCGGGAGTAGACGCGCATCAAGCGGTTGCGTTTAGGTCAGACAGCGAC
TACTCGATACTCGAAAACTGCGAGTTTCTTGGGAACCAAGACACGGTTTACTCTCACTCT
CTTCGCCAATTCTACAAACAGTGTCGTATCCAAGGCAACGTGGACTTCATATTCGGTAAC
TCGGCTGCTGTTTTCCAAGATTGCAACATCTTAATCGCTTCGAAAAATTCAAAACTAGAC
CAAGGCGGAGGCGCAAACAACGCGATCACAGCACACGGGAGGATCGACGCGGCGCAGTCC
ACGGGGTTCGTGTTCTTGAACTGTTCGATTAACGGAACGGAGGAGTACATGAAGGAGTTT
CAAGCTAACCCTAAGGGGCATACGAACTATCTGGGAAGGCCGTGGAAGGAGTTTTCGAGG
ACGGGGTTTGTAAACTGTAATCTTGAGTCTTTGATTAGTCCTGAGGGATGGATGCCTTGG
GACGGGGATTTCGCGTTGAAGACGTTGTATTACGGGGAGTATAAGAATACGGGTCCCGTG
TCGGTTAGGTCGAAGAGGGTTCCTTGGAGTAGTGAGATACCTGAGAAGCATGTTGATGTT
TACTCGGTGGCTAGTTTTATTCAGGGTGATGGGGGGGCTTTTTCCAAGTTTGCTTGATGT
TGTAAAGGAGAGTGGAGTGCTTTTAGGATTTTGAAAAGAGGAGAGATGTCGTTGTAAAGT
GTTGAAAATATCGAAGCATATATAACATATCATATTTTTTTGAGGGGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B946TF U 1
AF RR2B946JQ C 553
BS 1 664 RR2B946TF
BS 665 665 RR2B946JQ
BS 666 755 RR2B946TF
BS 756 756 RR2B946JQ
BS 757 764 RR2B946TF
BS 765 1010 RR2B946JQ

RD RR2B946TF 764 0 0
GCGGTTGACGCGGCGCCGGCAACTAACGGAACCGTTAAGTTTGTGATAGGGATCAGGGAA
GGCGTGTATGAGGAAACCGTCAGGGTTCCGTTTGAGAAAAAGAACGTCGTGTTCATCGGG
GACGGGATGGGTAAAACGGTAATTACGGGTTCGTTGAATGTAGGTCAACCAGGGATGACA
ACGTTCAACTCTGCAACCGTCGGAGTTCTCGGTGATGGGTTCATGGCACGTGACTTAACA
ATAGAGAACACGGCGGGAGTAGACGCGCATCAAGCGGTTGCGTTTAGGTCAGACAGCGAC
TACTCGATACTCGAAAACTGCGAGTTTCTTGGGAACCAAGACACGGTTTACTCTCACTCT
CTTCGCCAATTCTACAAACAGTGTCGTATCCAAGGCAACGTGGACTTCATATTCGGTAAC
TCGGCTGCTGTTTTCCAAGATTGCAACATCTTAATCGCTTCGAAAAATTCAAAACTAGAC
CAAGGCGGAGGCGCAAACAACGCGATCACAGCACACGGGAGGATCGACGCGGCGCAGTCC
ACGGGGTTCGTGTTCTTGAACTGTTCGATTAACGGAACGGAGGAGTACATGAAGGAGTTT
CAAGCTAACCCTAAGGGGCATACGAACTATCTGGGAAGGCCGTGGAAGGAGTTTTCGAGG
ACGGTGTTTGTAAACTGTAATCTTGAGTCTTTGATTAGTCCTGAGGGATGGATGCCTTGG
GACGGGGATTTCGCGTTGAAGACGTTGTATTACGGTGAGTATAA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2B946JQ 458 0 0
TTCTTGAACTGTTCGATTAACGGAACGGAGGAGTACATGAAGGAGTTTCAAGCTAACCCT
AAGGGGCATACGAACTATTTGGGAAGGCCGTGGAAGGAGTTTTTGAGGACGGGGTTTGTA
AACTGTAATCTTGAGTCTTTGATTAGTCCTGAGGGATGGATGCCTTGGGACGGGGATTTC
GCGTTGAAGACGTTGTATTACGGGGAGTATAAGAATACGGGTCCCGTGTCGGTTAGGTCG
AAGAGGGTTCCTTGGAGTAGTGAGATACCTGAGAAGCATGTTGATGTTTACTCGGTGGCT
AGTTTTATTCAGGGTGATGGGGGGGCTTTTTCCAAGTTTGCTTGATGTTGTAAAGGAGAG
TGGAGTGCTTTTAGGATTTTGAAAAGAGGAGAGATGTCGTTGTAAAGTGTTGAAAATATC
GAAGCATATATAACATATCATATTTTTTTGAGGGGTTG

QA 1 458 1 458
DS 



AS 1 2

CO CL5261Contig1 1092 2 4 U
GGATATTAGAAGAAAACCACAAACAGGCATTTCTTCTTCTTCTCTGTTTTCCAGCTTTTG
TCTTTGGAGTTTGGTTTCTGGAGAAGACAAAAGTTTCACACTTTTTAAGAGTTCGAGACC
CATTATCCATAAGTACTCTATAAGTGGAGATCATTCATAATAATTAAGAAGTCTTCTCGA
GTCTTGTGAGCCTTCGATTCTTGATTTGGTGATGATGGATATGGAGGTTAAGCAGATATT
GAAGAGTCTATGTTTCAGATATGGATGGTCTTATGCTGTCTATTGGTGCTATGACCCCAT
CAATCCCATGTTACTGAGAGTTGAAGAAGCACACAATGATGAACAGTCAGCCGCATTCGT
CGATGATATGATTCTCCAGACTCATGTCTTAGGCCAAGGCATCGTGGGTGAAGCTGCTTT
AACCGGTAACTACCAATGGCTGTTCTCAGACACACTTGTTCAGTGTGAGCATGAGTTTCA
GAATCAGTTTCTCTCTGGCTTTAAGACTATCGCAATCATTCCAATAGGATCAAGCGGCGT
TGTTCAGTTAGGATCTACTCAAAAGATTGTTGAGAGCCCAGAGATGTTGGAAGAAACAGA
AAGAGCTCTGCTGGAGAAGCATTCTTTCAAACTAAAGGATCAGTCGGTGGATCTTGATAG
TTTGTTCGAGTCTCTAGTACCACTTGTAGACTGTGAGATTGTCCCTGAATCTTATCAAGG
ACAAATGCAGATAGAGATGGTGTGCCAGGAAAATGGGGATGAGTTTCTTGATATTGCGAA
TGTGGTGAGAGGTCTAGGATTGAACATACTGAAAGGAGTGATGGAAACAAGACATGGAAA
GATATGGGCACACTTGATCGTTGAGGCGAAGCCACACATCACAAGGCTTCAACTCTTTTA
CTCACTTGTGCACCTCTTTCACTCCTCTTCTTCCTAATCCCACCACCAAATATGACGACT
TATAATAGGATTCACTTACTATTCATTTATGTATGCTTTGGTTAATTTCTTACATCTGAT
TTTTATGATTGGTGGATGGCAAAGAAAGCTGTTGATAGTTTAGTAGTTCCCTCTCAAAGC
GTTTGTACTATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP79TF U 1
AF RR2GP79JQ C 524
BS 1 637 RR2GP79TF
BS 638 638 RR2GP79JQ
BS 639 719 RR2GP79TF
BS 720 1092 RR2GP79JQ

RD RR2GP79TF 723 0 0
GGATATTAGAAGAAAACCACAAACAGGCATTTCTTCTTCTTCTCTGTTTTCCAGCTTTTG
TCTTTGGAGTTTGGTTTCTGGAGAAGACAAAAGTTTCACACTTTTTAAGAGTTCGAGACC
CATTATCCATAAGTACTCTATAAGTGGAGATCATTCATAATAATTAAGAAGTCTTCTCGA
GTCTTGTGAGCCTTCGATTCTTGATTTGGTGATGATGGATATGGAGGTTAAGCAGATATT
GAAGAGTCTATGTTTCAGATATGGATGGTCTTATGCTGTCTATTGGTGCTATGACCCCAT
CAATCCCATGTTACTGAGAGTTGAAGAAGCACACAATGATGAACAGTCAGCCGCATTCGT
CGATGATATGATTCTCCAGACTCATGTCTTAGGCCAAGGCATCGTGGGTGAAGCTGCTTT
AACCGGTAACTACCAATGGCTGTTCTCAGACACACTTGTTCAGTGTGAGCATGAGTTTCA
GAATCAGTTTCTCTCTGGCTTTAAGACTATCGCAATCATTCCAATAGGATCAAGCGGCGT
TGTTCAGTTAGGATCTACTCAAAAGATTGTTGAGAGCCCAGAGATGTTGGAAGAAACAGA
AAGAGCTCTGCTGGAGAAGCATTCTTTCAAACTAAAG*ATCAGTCGGTGGATCTTGATAG
TTTGTTCGAGTCTCTAGTACCACTTGTAGACTGTGAGATTGTCCCTGAATCTTATCAAG
ACAA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2GP79JQ 569 0 0
ATAGGATCAAGCGGCGTTGTTCAGTTAGGATCTACTCAAAAGATTGTTGAGAGCCCAGAG
ATGTTGGAAGAAACAGAAAGAGCTCTGCTGGAGAAGCATTCTTTCAAACTAAAGGATCAG
TCGGTGGATCTTGATAGTTTGTTCGAGTCTCTAGTACCACTTGTAGACTGTGAGATTGTC
CCTGAATCTTATCAAGGACAAATGCAGATAGAGATGGTGTGCCAGGAAAATGGGGATGAG
TTTCTTGATATTGCGAATGTGGTGAGAGGTCTAGGATTGAACATACTGAAAGGAGTGATG
GAAACAAGACATGGAAAGATATGGGCACACTTGATCGTTGAGGCGAAGCCACACATCACA
AGGCTTCAACTCTTTTACTCACTTGTGCACCTCTTTCACTCCTCTTCTTCCTAATCCCAC
CACCAAATATGACGACTTATAATAGGATTCACTTACTATTCATTTATGTATGCTTTGGTT
AATTTCTTACATCTGATTTTTATGATTGGTGGATGGCAAAGAAAGCTGTTGATAGTTTAG
TAGTTCCCTCTCAAAGCGTTTGTACTATA

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

CO CL5262Contig1 1114 2 2 U
GGCTTGGACCAACCACATCATCTTTCTCTCTATAACTCTCCAAGGAGACTCGCCCATACG
CCCATTTTACGACTGTCTTTTATCACAACTTGACATAAAAACTTCTTTAGCCTTCTCTCA
TCTTCACTCACAAGTCAGGAGAAGGATCAAAATCAGAAACTTCTGATTTCGAATCGAGTA
AAAAAAGCTTAAAACTCCAAAAGAAAGAGTGAAGAGAGAAACACATCGTGGGTTTCAGCA
AACAAGACGAATTTTGAAGGTAAGTGATCAAGTTTTCTGATCTCCTCTGTTTCCCAAGCA
TACCTCAAAAGATGGCTCGGGTGTTACTTGAGCCGCAAGCAAACGCACCCGCTGAAGCAA
ACCCTAAAGCCAGAACAGGCTTTAACGACACCTACTTCGACACTAATATGGTCATTATTT
TAGCTGCTCTACTCTGTGCTCTGATATGTGCTCTAAGCCTCAACTCCGCCTTGCGATGTG
TGCTACGCATCACAAGCAGATTCACACCGGATCAAGACGCAGCCGCTTCAAACGCAAACG
TAAACGCAAATACTGGACGTTTAGCGGCTACCACGGGGCTCAAGAAACGGGCGTTGAAAC
AAATCCCCGTGGGGTTGTACGGATCAGGGATCATTAACATGAAAGCTACAGAGTGTTTGA
TCTGTCTCGGGGATTTCGTGGAAGGAGAGAAAGTTAGGTTTTTGCCAAAATGTAACCATG
GCTTTCACGTGAGGTGCATCGACACTTGGTTGCTTTCACGTGACTCTTGTCCTACTTGCA
GACAATCTCTTGCCCTTGAGCAACCGTCGCCAATTGGTTGTAGTTCTCGCCGGGATGATG
ACGTGGCAGTTTCTGTCGTAGGGTCATAACTTGATGGTTATTTATAAACTTTGCTGTGTC
TCAGGTGTGATTGGTTGGTTACGTAATATTGTTTCTTATTTTACTAGGTCTAAGTTGATG
TGATTGTTTGCACATGTATATTCTTGTGCGTTGGTGATTTTTGTTTGATTGGTTTGGAAC
TTTGATTTTTTCTTTTTTGAAAATTCGTAAATTTGGAACTTGAATTGTAACAGAATGTAT
TTTTTTTGTTTTCCTTTAGTAGCTCCGTAATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK53TF U 1
AF RR2GK53JQ C 455
BS 1 617 RR2GK53TF
BS 618 1114 RR2GK53JQ

RD RR2GK53TF 617 0 0
GGCTTGGACCAACCACATCATCTTTCTCTCTATAACTCTCCAAGGAGACTCGCCCATACG
CCCATTTTACGACTGTCTTTTATCACAACTTGACATAAAAACTTCTTTAGCCTTCTCTCA
TCTTCACTCACAAGTCAGGAGAAGGATCAAAATCAGAAACTTCTGATTTCGAATCGAGTA
AAAAAAGCTTAAAACTCCAAAAGAAAGAGTGAAGAGAGAAACACATCGTGGGTTTCAGCA
AACAAGACGAATTTTGAAGGTAAGTGATCAAGTTTTCTGATCTCCTCTGTTTCCCAAGCA
TACCTCAAAAGATGGCTCGGGTGTTACTTGAGCCGCAAGCAAACGCACCCGCTGAAGCAA
ACCCTAAAGCCAGAACAGGCTTTAACGACACCTACTTCGACACTAATATGGTCATTATTT
TAGCTGCTCTACTCTGTGCTCTGATATGTGCTCTAAGCCTCAACTCCGCCTTGCGATGTG
TGCTACGCATCACAAGCAGATTCACACCGGATCAAGACGCAGCCGCTTCAAACGCAAACG
TAAACGCAAATACTGGACGTTTAGCGGCTACCACGGGGCTCAAGAAACGGGCGTTGAAAC
AAATCCCCGTGGGGTTG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2GK53JQ 660 0 0
AAGCTTCAACTCCGCCTTGCGATGTGTGCTACGCATCACAAGCAGATTCACACCGGATCA
AGACGCAGCCGCTTCAAACGCAAACGTAAACGCAAATACTGGACGTTTAGCGGCTACCAC
GGGGCTCAAGAAACGGGCGTTGAAACAAATCCCCGTGGGGTTGTACGGATCAGGGATCAT
TAACATGAAAGCTACAGAGTGTTTGATCTGTCTCGGGGATTTCGTGGAAGGAGAGAAAGT
TAGGTTTTTGCCAAAATGTAACCATGGCTTTCACGTGAGGTGCATCGACACTTGGTTGCT
TTCACGTGACTCTTGTCCTACTTGCAGACAATCTCTTGCCCTTGAGCAACCGTCGCCAAT
TGGTTGTAGTTCTCGCCGGGATGATGACGTGGCAGTTTCTGTCGTAGGGTCATAACTTGA
TGGTTATTTATAAACTTTGCTGTGTCTCAGGTGTGATTGGTTGGTTACGTAATATTGTTT
CTTATTTTACTAGGTCTAAGTTGATGTGATTGTTTGCACATGTATATTCTTGTGCGTTGG
TGATTTTTGTTTGATTGGTTTGGAACTTTGATTTTTTCTTTTTTGAAAATTCGTAAATTT
GGAACTTGAATTGTAACAGAATGTATTTTTTTTGTTTTCCTTTAGTAGCTCCGTAATTAT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5264Contig1 744 2 8 U
GGGCAGAAGCAAAGATCGGTCTTTCAACAGTCAGTGAAAGGTGAAATCAAGTGAAAGAGA
AAACAAAGAGGGTTTAACTATGGTGACGACTCAACATCCTTTCACTCTGCTTCTCCTTAC
TCTCGCCGTCATCGGGATCTTCTCCTCCTCTTCTCAGGTTAACGCAACCAATGTCAGAAT
CGAATCATTCTCTTCGCCTTTCTCTACCGATCTCGCAACGCTGCAATCTAAAATTGGCTA
CAACTTCACAAACATCAACCTCCTTCGCCGTGCAATGACTCACGCTTCCTTCTCTCAAGA
GAACAACAAAGCCCTCAGTATCTTCGGATCCCATCTCATCGAAACCTCTGTCTCTCTTCA
GCTTCTCTCTAAAGACATCGACACCTCCTCCAAAGCCTTGACACGTTTGATAGCGGAGGT
TTCGAGTGTGGAGTCCTCGTGTGCTCTTGATGGCAACCGGTTGGGTTTGGAGAGGGTTAT
CAGGGTTTCTCCCAAGACTGATGCCTCGAACTCTGCCATCGTTTGCGGGGGGTTTAGAGC
CATCTTTGGAGCTGTTGCTGTTGATTCTGGATCGGTTGATGAGGCTATGAAGGTTTTTTG
GAGAGTACATGGAGATCGAAGTGGGAGACTAGTAGGGTCTATGCTGTAATATTAGTGTTT
TGCTTCCGATGGTAAAAGTTCTTAGAGATTCGTCTTTAAGGCTTATATGGTACTAGTTAG
TACTACTAATCGCTTCCCTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG72TF U 1
AF RR2CG72JQ C 504
BS 1 528 RR2CG72TF
BS 529 529 RR2CG72JQ
BS 530 635 RR2CG72TF
BS 636 636 RR2CG72JQ
BS 637 700 RR2CG72TF
BS 701 701 RR2CG72JQ
BS 702 735 RR2CG72TF
BS 736 744 RR2CG72JQ

RD RR2CG72TF 735 0 0
GGGCAGAAGCAAAGATCGGTCTTTCAACAGTCAGTGAAAGGTGAAATCAAGTGAAAGAGA
AAACAAAGAGGGTTTAACTATGGTGACGACTCAACATCCTTTCACTCTGCTTCTCCTTAC
TCTCGCCGTCATCGGGATCTTCTCCTCCTCTTCTCAGGTTAACGCAACCAATGTCAGAAT
CGAATCATTCTCTTCGCCTTTCTCTACCGATCTCGCAACGCTGCAATCTAAAATTGGCTA
CAACTTCACAAACATCAACCTCCTTCGCCGTGCAATGACTCACGCTTCCTTCTCTCAAGA
GAACAACAAAGCCCTCAGTATCTTCGGATCCCATCTCATCGAAACCTCTGTCTCTCTTCA
GCTTCTCTCTAAAGACATCGACACCTCCTCCAAAGCCTTGACACGTTTGATAGCGGAGGT
TTCGAGTGTGGAGTCCTCGTGTGCTCTTGATGGCAACCGGTTGGGTTTGGAGAGGGTTAT
CAGGGTTTCTCCCAAGACTGATGCCTCGAACTCTGCCATCGTTTGCGGTGGGTTTAGAGC
CATCTTTGGAGCTGTTGCTGTTGATTCTGGATCGGTTGATGAGGCTATGAAGGTTTTTTG
GAGAGTACATGGAGATCGAAGTGGGAGACTAGTAGTGTCTATGCTGTAATATTAGTGTTT
TGCTTCCGATGGTAAAAGTTCTTAGAGATTCGTCTTTAAG*CTTATATGGTACTAGTTAG
TACTACTAATCGCTT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2CG72JQ 241 0 0
CCTCGAACTTTGCCATCGTTTGCGGGGGGTTTAGAGCCATCTTTGGAGCTGTTGCTGTTG
ATTTTGGATCGGTTGATGGGGCTATGAAGGTTTTTTGGGGAGTACATGGAGATCGAAGTG
GGAGACTAGTAGGGTTTATGCTGTAATATTAGTGTTTTGCTTCCGATGGTAAAAGTTTTT
AGAGATTCGTCTTTAAGGCTTATATGGTACTAGTTAGTACTACTAATCGCTTCCCTTTCT
T

QA 1 241 1 241
DS 



AS 1 2

CO CL5265Contig1 1184 2 4 U
GAGAAATTCTAGAGAATGTTTGCTACCCTGAAATTTTCTTATCTTTCTTAACCGATAAGG
AGAAAAAAAAATTGGGTCAAAAGAAAATGCTATTTTGGAGTTTTATCAACAATTTTCTTG
TGTAGGTGGGGATCCAATATTTTCTGAATCCTTATGTAAGGAATTACAAAAAAATTCTTT
CACCAAAGGTGTGAATTGGGGAGGATTGGTCGCCGAAATATTAACTGGAGACTGAATCTT
AATATACCTCAGAACAATATATTTTTGTTACCACGAGATATGTTAGCAGCTGCCGATCAT
TTGATTGGGATGAAATTTGGAATGGGTACACTTGATGATATGAATCATTTGAAAAATAAA
CGTATTCGCTCTGTAGCGGATCTTTTACAAGACCAGCTCGGGTTGGCTCTGGCTCGTTTA
GAAAATGTAGTTAAGGGAACTATAGGCGGAGCAATTAGGCATAAATTGATACCTACTCCT
CAGAATTTGGTAACTTCAACTCCGTTAACAACTACTTATGAATCCTTTTTCGGATTACAT
CCATTATCTCAAGTTTTGGATCGAACTAATCCATTGACACAAATCGTTCATGGGAGAAAG
TTGAGTTATTTGGGCCCTGGCGGATTAACAGGGCGAACTGCTAATTTTCGAATACGAGAT
ATCCATCCTAGTCACTATGGGCGTATTTGCCCCATTGACACGTCTGAAGGAATCAATGTG
GGACTTATTGGATCTTTATCAATTCATGCCAGGATTGGTGATTGGGGGTCATTAGAAAGT
CCGTTTTATGAACTCGTTGAGAAATCAAAAAAGGCGCGGATACGGATGCTTTTTTTATCA
CCAAGTCAAGATGAATATTATATGATAGCGGCAGGAAATTCTTTGGCTCTTAATCGGGGC
ATTCAAGAAGAACAGGCTGTACCAGCTCGATACCGCCAAGAATTTTTGACTATCGCATGG
GAAGAGGTTCATCTTCGAAGCATTTTTCCTTTCCAATATTTTTCCATTGGAGCTTCCCTA
ATTCCTTTTATCGAACATAATGATGCGAATCGAGCTTTAATGAGTTCTAATATGCAACGT
CAAGCAGTTCCACTTTCTCGGTCCGAAAAGTGCATTGTTGGAACTGGATTGGAACGCCAA
GTGGCTTTAGATTCGGGGGTTCCCGCTATAGCCGAACACGAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D280TF U 1
AF RR2D280JQ C 540
BS 1 711 RR2D280TF
BS 712 712 RR2D280JQ
BS 713 724 RR2D280TF
BS 725 1184 RR2D280JQ

RD RR2D280TF 724 0 0
GAGAAATTCTAGAGAATGTTTGCTACCCTGAAATTTTCTTATCTTTCTTAACCGATAAGG
AGAAAAAAAAATTGGGTCAAAAGAAAATGCTATTTTGGAGTTTTATCAACAATTTTCTTG
TGTAGGTGGGGATCCAATATTTTCTGAATCCTTATGTAAGGAATTACAAAAAAATTCTTT
CACCAAAGGTGTGAATTGGGGAGGATTGGTCGCCGAAATATTAACTGGAGACTGAATCTT
AATATACCTCAGAACAATATATTTTTGTTACCACGAGATATGTTAGCAGCTGCCGATCAT
TTGATTGGGATGAAATTTGGAATGGGTACACTTGATGATATGAATCATTTGAAAAATAAA
CGTATTCGCTCTGTAGCGGATCTTTTACAAGACCAGCTCGGGTTGGCTCTGGCTCGTTTA
GAAAATGTAGTTAAGGGAACTATAGGCGGAGCAATTAGGCATAAATTGATACCTACTCCT
CAGAATTTGGTAACTTCAACTCCGTTAACAACTACTTATGAATCCTTTTTCGGATTACAT
CCATTATCTCAAGTTTTGGATCGAACTAATCCATTGACACAAATCGTTCATGGGAGAAAG
TTGAGTTATTTGGGCCCTGGCGGATTAACAGGGCGAACTGCTAATTTTCGAATACGAGAT
ATCCATCCTAGTCACTATGGGCGTATTTGCCCCATTGACACGTCTGAAGGA*TCAATGTG
GGAC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2D280JQ 645 0 0
TCCATTATCTCAAGTTTTGGATCGAACTAATCCATTGACACAAATCGTTCATGGGAGAAA
GTTGAGTTATTTGGGCCCTGGCGGATTAACAGGGCGAACTGCTAATTTTCGAATACGAGA
TATCCATCCTAGTCACTATGGGCGTATTTGCCCCATTGACACGTCTGAAGGAATCAATGT
GGGACTTATTGGATCTTTATCAATTCATGCCAGGATTGGTGATTGGGGGTCATTAGAAAG
TCCGTTTTATGAACTCGTTGAGAAATCAAAAAAGGCGCGGATACGGATGCTTTTTTTATC
ACCAAGTCAAGATGAATATTATATGATAGCGGCAGGAAATTCTTTGGCTCTTAATCGGGG
CATTCAAGAAGAACAGGCTGTACCAGCTCGATACCGCCAAGAATTTTTGACTATCGCATG
GGAAGAGGTTCATCTTCGAAGCATTTTTCCTTTCCAATATTTTTCCATTGGAGCTTCCCT
AATTCCTTTTATCGAACATAATGATGCGAATCGAGCTTTAATGAGTTCTAATATGCAACG
TCAAGCAGTTCCACTTTCTCGGTCCGAAAAGTGCATTGTTGGAACTGGATTGGAACGCCA
AGTGGCTTTAGATTCGGGGGTTCCCGCTATAGCCGAACACGAGGG

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL5266Contig1 619 2 4 U
GGGAAGTCTAGTTGATTTCAGTGGTGGAGACGCTATGGACTCAAACGAACTGCTTATCCA
TGAGTGTGATGTTCTCATTCCTTGTGCTCTTGGTGGTGTCTTGAACAAGGAAAATGCTGG
AGATGTGAAGGCAAAGTTCATAATAGAGGCTGCAAACCATCCAACTGATCCAGATGCTGA
TGAGATTCTGTCGAAGAAAGGAGTGATTATACTACCAGATATATACGCAAACGCAGGAGG
AGTGACGGTGAGTTACTTTGAGTGGGTGCAGAACATTCAGGGGTTCATGTGGGAAGAGGA
AAAAGTGAACCTGGAGCTGCAGAAGTACATGACTCGAGCCTTTCACAACATCAAGTCAAT
GTGCCATACTCATTCCTGTAACCTCCGTATGGGAGCTTTCACTCTTGGAGTTAACCGTGT
TGCTAGAGCCACTCAGTTGCGTGGTTGGGAAGCTTGATTCTATTAAATTTCCCCCCCTTG
TACTCTGTTTTTCCCTGTTTTCCCCTGTTTTTTTTGTTTGGTTTCATTGTTCCTGATCAT
TGATGTCCCGAAATGGAAAACAAAACAAATGAATAACTTAAAAATGAATAAAATATTTTT
ACCGATTTTTCTTTTCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM71TF U 1
AF RR2E730TF U 400
BS 1 514 RR2DM71TF
BS 515 515 RR2E730TF
BS 516 584 RR2DM71TF
BS 585 619 RR2E730TF

RD RR2DM71TF 584 0 0
GGGAAGTCTAGTTGATTTCAGTGGTGGAGACGCTATGGACTCAAACGAACTGCTTATCCA
TGAGTGTGATGTTCTCATTCCTTGTGCTCTTGGTGGTGTCTTGAACAAGGAAAATGCTGG
AGATGTGAAGGCAAAGTTCATAATAGAGGCTGCAAACCATCCAACTGATCCAGATGCTGA
TGAGATTCTGTCGAAGAAAGGAGTGATTATACTACCAGATATATACGCAAACGCAGGAGG
AGTGACGGTGAGTTACTTTGAGTGGGTGCAGAACATTCAGGGGTTCATGTGGGAAGAGGA
AAAAGTGAACCTGGAGCTGCAGAAGTACATGACTCGAGCCTTTCACAACATCAAGTCAAT
GTGCCATACTCATTCCTGTAACCTCCGTATGGGAGCTTTCACTCTTGGAGTTAACCGTGT
TGCTAGAGCCACTCAGTTGCGTGGTTGGGAAGCTTGATTCTATTAAATTTCCCCCCCTTG
TACTCTGTTTTTCCCTGTTTTCCCCTGTTTTTTT*GTTTGGTTTCATTGTTCCTGATCAT
TGATGTCCCGAAATGGAAAACAAAACAAATGAATAACTTAAAAA

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2E730TF 220 0 0
G
ACTCTTGGAGTTAACCGTGTTGCTAGAGCCACTCAGTTGCGTGGTTGGGAAGCTTGATTC
TATTAAATTTTCCCCCCTTGTACTCTGTTTTTCTCTGTTTTCCCCTGTTTTTTTTGTTTG
GTTTCATTGTTCCTGATCATTGATGTTCCGAAATGGAAAACAAAACAAATGAATAACTTA
AAAATGAATAAAATATTTTTACCGATTTTTCTTTTCTGT

QA 2 220 2 220
DS 



AS 1 2

CO CL5267Contig1 1037 2 4 U
GGGCGTCGATGAGGTGAGGTGTATTCTCTGATGATATCTCGAGTATAGTTCATAGAAGAT
CGGAGGTGTTTCTAGGTTTGATCATGGAGGGAGAAGAGAGTGTGTTGGATGCTATATATG
AAGAAGAAGACGGATTTGATACCATGGAAGATGTTGACATGGTTGATGTGGAAGAAGGGG
AGATTGTTGGGGTGCATGAGTTAGATTCTGGAGAGGGGCATAATGGTGGCATGGATGGAG
AGAAAGATAAAGAAGGGCTCTTGGGTAAGAAGGATGGGCAGAATCATCAGCCAAACAAGA
ACAAGAGGAAGAAGAAGAATAAGAAGAAACGAAGAAACGGTCCTGTGATGGGCAAACCGA
TGGATTTAGACAGGTTTGTTAGGGACACTTGTAGACGCCTCAAGGAGAAGAAGTCTTACA
TGGTATACACAGCTGTTGGATGTCTTGGAATTCCCGCCTTGAGTGATCTTGTCAATGAGG
TGGAAGCAATCGAGACATGTGGAGGTCAGGTGACGGCTGATGGCAGTAGGAAACGGTCTG
GAGGTGGTGTGTTGTGGAACATCATCAAAGCGAGACAGCCCGCATCTTACAGAGAGATAA
TGAAAAAAACCAAGGAGTTTGAGAAGCAATTTAGGTACCCAAACACAAGACCGAAGGTAG
GGCCAAAAAGAGATGAGGGTAGCTCCTCCGAAGGACTTGCCTCTGCAAATGCATCTTCTG
ATGAAGCTCTGGTCACTGAGATGTGTGCTATGCCTGTAGCTGAGCAGACTGAATCCAACC
CGCAGAAAGAAAGGAAGTCTGGTCATGAGAGGATCCGAGTACCTGTTTCATATGATGACC
TTTTCGGAGAAGTACCTGTGGATACTTCAGAAGCACAAGCACACGCACAAGACTCTTCTG
TTTAAGTTCTTCACGTTATAACATGTTTGCCTTGGAATTTTTTTTTTGACTGGGTAAACA
ATTATAAGTTTATATAACTAAGCAGCTGGGTTACTTGCGGAAAGCAAAGATTTTGTTGAG
AAATATATTATCCGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX52TF U 1
AF RR2EM65TF U 437
BS 1 454 RR2BX52TF
BS 455 455 RR2EM65TF
BS 456 608 RR2BX52TF
BS 609 1037 RR2EM65TF

RD RR2BX52TF 608 0 0
GGGCGTCGATGAGGTGAGGTGTATTCTCTGATGATATCTCGAGTATAGTTCATAGAAGAT
CGGAGGTGTTTCTAGGTTTGATCATGGAGGGAGAAGAGAGTGTGTTGGATGCTATATATG
AAGAAGAAGACGGATTTGATACCATGGAAGATGTTGACATGGTTGATGTGGAAGAAGGGG
AGATTGTTGGGGTGCATGAGTTAGATTCTGGAGAGGGGCATAATGGTGGCATGGATGGAG
AGAAAGATAAAGAAGGGCTCTTGGGTAAGAAGGATGGGCAGAATCATCAGCCAAACAAGA
ACAAGAGGAAGAAGAAGAATAAGAAGAAACGAAGAAACGGTCCTGTGATGGGCAAACCGA
TGGATTTAGACAGGTTTGTTAGGGACACTTGTAGACGCCTCAAGGAGAAGAAGTCTTACA
TGGTATACACAGCTGTTGGATGTCTTGGAATTCCTGCCTTGAGTGATCTTGTCAATGAGG
TGGAAGCAATCGAGACATGTGGAGGTCAGGTGACGGCTGATGGCAGTAGGAAACGGTCTG
GAGGTGGTGTGTTGTGGAACATCATCAAAGCGAGACAGCCCGCATCTTACAGAGAGATAA
TGAAAAAA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2EM65TF 601 0 0
G
GGATGTCTTGGAATTCCCGCCTTGAGTGATCTTGTCAATGAGGTGGAAGCAATCGAGACA
TGTGGAGGTCAGGTGACGGCTGATGGCAGTAGGAAACGGTCTGGAGGTGGTGTGTTGTGG
AACATCATCAAAGCGAGACAGCCCGCATCTTACAGAGAGATAATGAAAAAAACCAAGGAG
TTTGAGAAGCAATTTAGGTACCCAAACACAAGACCGAAGGTAGGGCCAAAAAGAGATGAG
GGTAGCTCCTCCGAAGGACTTGCCTCTGCAAATGCATCTTCTGATGAAGCTCTGGTCACT
GAGATGTGTGCTATGCCTGTAGCTGAGCAGACTGAATCCAACCCGCAGAAAGAAAGGAAG
TCTGGTCATGAGAGGATCCGAGTACCTGTTTCATATGATGACCTTTTCGGAGAAGTACCT
GTGGATACTTCAGAAGCACAAGCACACGCACAAGACTCTTCTGTTTAAGTTCTTCACGTT
ATAACATGTTTGCCTTGGAATTTTTTTTTTGACTGGGTAAACAATTATAAGTTTATATAA
CTAAGCAGCTGGGTTACTTGCGGAAAGCAAAGATTTTGTTGAGAAATATATTATCCGATC

QA 2 601 2 601
DS 



AS 1 2

CO CL5268Contig1 1183 2 2 U
GATTCGTCTCAACGCAAAGCGAGTTTTGTCCCTGACAAATCACGAGAGCAGTATATCAAC
GATGTCGAGAGGTGTATGCAGTATATCAAAGACGGGGAGAGCTACGAGCTCTGTCTGACT
ACGCAGAACAGGTGGAGAATAGGGAACACTGATCCTTTGGGGCTTTATCTCCACCTGAGA
GAGAGGAATCCAGCACCATACGCAGCTTTTCTCAACTTCTCAAATGCAGATTTGTCTTTA
TGCTGTTCGTCTCCTGAGAGGTTTCTTCAGCTTGACAGAAACGGGATGCTAGAAGCAAAG
CCGATTAAGGGTACAATAGCTCGTGGCTCCACACCTGAAGAAGATGAACTATTGAAATTC
GAATTGAAACTCAGTGAGAAGAACCAAGCTGAGAATCTGATGATCGTTGACCTTCTGAGG
AACGATCTCGGCCGTGTCTGTGAGCCTGGCTCAGTCCACGTGCCTAACCTAATGGACGTG
GAAACATACACAACGGTACACACTATGGTGAGCACCATCCGTGGATTGAAGAAAACAGAC
ATTAGTCCAGTGGAATGTGTGAGAGCAGCCTTCCCTGGCGGTTCGATGACCGGTGCTCCA
AAACTAAGATCCGTCGAGATTCTTGATTCGCTTGAGAACTGTTCGAGAGGCCTTTACTCG
GGGTCAATAGGGTATTTCTCGTATAATGGTACGTTTGATCTGAATATTGTGATAAGAACA
GTGGTGATACATGAGGATGAAGCCACCATTGGAGCAGGAGGAGCAATTGTTGCGTTGTCA
GACCCAGGAGATGAGTTTGAGGAAATGATTCTTAAGACTAGAGCTCCTGCTAGTGCGGTC
ATGGAGTTTTGTAGTGGTTCCAGTGGAAGATGCTAAGTAGTGTCTCTTGAAACAACTCCA
TTGTTAATGGGGGATTTACTCATTCATTAAAAGGAAAGAAGACATTGCTTTCGTGTTGTG
GCTTTAAACACTTCTTTAAGATATATCTGTAGAAAAATATAAATAGATATATAGTTTTGT
AAGAGATTTTGGGGTGGAGTTGTTTTCTCTATGTCTCTGTTGTTGTTCCGTTTTATAGGG
CCTTGTCTCTGGAGATATCAATTTATTCATACGGTTTTGATTTTGTGTTTTGTTCAAGTC
TTATGTATTATGAATCTTATTTTTTTAATGAAAGAAATAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CN03TF U 1
AF RR2CN03JQ C 473
BS 1 637 RR2CN03TF
BS 638 1183 RR2CN03JQ

RD RR2CN03TF 644 0 0
GATTCGTCTCAACGCAAAGCGAGTTTTGTCCCTGACAAATCACGAGAGCAGTATATCAAC
GATGTCGAGAGGTGTATGCAGTATATCAAAGACGGGGAGAGCTACGAGCTCTGTCTGACT
ACGCAGAACAGGTGGAGAATAGGGAACACTGATCCTTTGGGGCTTTATCTCCACCTGAGA
GAGAGGAATCCAGCACCATACGCAGCTTTTCTCAACTTCTCAAATGCAGATTTGTCTTTA
TGCTGTTCGTCTCCTGAGAGGTTTCTTCAGCTTGACAGAAACGGGATGCTAGAAGCAAAG
CCGATTAAGGGTACAATAGCTCGTGGCTCCACACCTGAAGAAGATGAACTATTGAAATTC
GAATTGAAACTCAGTGAGAAGAACCAAGCTGAGAATCTGATGATCGTTGACCTTCTGAGG
AACGATCTCGGCCGTGTCTGTGAGCCTGGCTCAGTCCACGTGCCTAACCTAATGGACGTG
GAAACATACACAACGGTACACACTATGGTGAGCACCATCCGTGGATTGAAGAAAACAGAC
ATTAGTCCAGTGGAATGTGTGAGAGCAGCCTTCCCTGGCGGTTCGATGACCGGTGCTCCA
AAACTAAGATCCGTCGAGATTCTTGATTCGCTTGAGA
CTGTTCG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2CN03JQ 711 0 0
TGGACGTGGAAACATACACAACGGTACACACTATGGTGAGCACCATCCGTGGATTGAAGA
AAACAGACATTAGTCCAGTGGAATGTGTGAGAGCAGCCTTCCCTGGCGGTTCGATGACCG
GTGCTCCAAAACTAAGATCCGTCGAGATTCTTGATTCGCTTGAGAACTGTTCGAGAGGCC
TTTACTCGGGGTCAATAGGGTATTTCTCGTATAATGGTACGTTTGATCTGAATATTGTGA
TAAGAACAGTGGTGATACATGAGGATGAAGCCACCATTGGAGCAGGAGGAGCAATTGTTG
CGTTGTCAGACCCAGGAGATGAGTTTGAGGAAATGATTCTTAAGACTAGAGCTCCTGCTA
GTGCGGTCATGGAGTTTTGTAGTGGTTCCAGTGGAAGATGCTAAGTAGTGTCTCTTGAAA
CAACTCCATTGTTAATGGGGGATTTACTCATTCATTAAAAGGAAAGAAGACATTGCTTTC
GTGTTGTGGCTTTAAACACTTCTTTAAGATATATCTGTAGAAAAATATAAATAGATATAT
AGTTTTGTAAGAGATTTTGGGGTGGAGTTGTTTTCTCTATGTCTCTGTTGTTGTTCCGTT
TTATAGGGCCTTGTCTCTGGAGATATCAATTTATTCATACGGTTTTGATTTTGTGTTTTG
TTCAAGTCTTATGTATTATGAATCTTATTTTTTTAATGAAAGAAATAGTTG

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL5269Contig1 747 2 3 U
GGGACGATCTGGAAGTGGATACATGGACAACGTGTACTCGATGTATGGACCTTACATGAG
TGGCTACGGATATGATTCTTACGGTGGTTACAGCACCTACACTCCAAACTGTTACGCGTT
TGATAATGGTTACAAGACAAAAGGTTACGGCTTTTGCGGGTACGGCAAGGAGAATGCCGA
GTGGCTAAACGAGCTGAACAGAGGGCCAAGAGCCAAGGGCTTCAAGATTGGTCAGCCTGA
AACTTTTAAAGCAGCACCGGTGGGTGCTTTTGTTCCGGATTCGAAGGAGTACAACAAGGA
AGATTTTTTTGATACCTACATCAACGGGAAGCTCTTTGTGATCAAATTTTACAGTGAAGA
TGATATTCACAAAAGCATCAAGTATAATGTGTGGTCCAGCACCCCCAATGGAAACAAGAA
GCTTAACGCTGCATATAATGAAGCTAAAGAGAAGTCCATTGAGGAGTGCGTGAAAGCCGG
ATGCTACGCGTCCAACGTGGTGATCCAAAGATCTGGCTGCACCTACCCTGAGAAGCCAGA
CTTCAACTAAGTTATTGGTCCATGCCTCAGTTTTGTGATATCTTGTTCCAAATAAAAACA
ATTATCTCTCAACGATTATTGCTCGAGTGTTTTTCACTTTTGGTTTGAATCACCCTTTTA
TTATCATTGTCAGCATTTATAATGTAACACCGTTATTACTAAAGAGGTGTAGATGCAATG
CAAGCAACAAAGCTACTAGTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX08TFB U 31
AF RR2AX08JQ C 1
BS 1 30 RR2AX08JQ
BS 31 197 RR2AX08TFB
BS 198 747 RR2AX08JQ

RD RR2AX08TFB 167 0 0
CGTGTACTCGATGTATGGACCTTACATGAGTGGCTACGGATATGATTCTTACGGTGGTTA
CAGCACCTACACTCCAAACTGTTACGCGTTTGATAATGGTTACAAGACAAAAGGTTACGG
CTTTTGCGGGTACGGCAAGGAGAATGCCGAGTGGCTAAACGAGCTGA

QA 1 167 1 167
DS 

RD RR2AX08JQ 747 0 0
GGGACGATCTGGAAGTGGATACATGGACAACGTGTACTCGATGTATGGACCTTACATGAG
TGGCTACGGATATGATTCTTACGGTGGTTACAGCACCTACACTCCAAACTGTTACGCGTT
TGATAATGGTTACAAGACAAAAGGTTACGGCTTTTGCGGGTACGGCAAGGAGAATGCCGA
GTGGCTAAACGAGCTGAACAGAGGGCCAAGAGCCAAGGGCTTCAAGATTGGTCAGCCTGA
AACTTTTAAAGCAGCACCGGTGGGTGCTTTTGTTCCGGATTCGAAGGAGTACAACAAGGA
AGATTTTTTTGATACCTACATCAACGGGAAGCTCTTTGTGATCAAATTTTACAGTGAAGA
TGATATTCACAAAAGCATCAAGTATAATGTGTGGTCCAGCACCCCCAATGGAAACAAGAA
GCTTAACGCTGCATATAATGAAGCTAAAGAGAAGTCCATTGAGGAGTGCGTGAAAGCCGG
ATGCTACGCGTCCAACGTGGTGATCCAAAGATCTGGCTGCACCTACCCTGAGAAGCCAGA
CTTCAACTAAGTTATTGGTCCATGCCTCAGTTTTGTGATATCTTGTTCCAAATAAAAACA
ATTATCTCTCAACGATTATTGCTCGAGTGTTTTTCACTTTTGGTTTGAATCACCCTTTTA
TTATCATTGTCAGCATTTATAATGTAACACCGTTATTACTAAAGAGGTGTAGATGCAATG
CAAGCAACAAAGCTACTAGTTTTTTTT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL5270Contig1 783 2 2 U
GGGGGGGGGATAAGGAGTTTTACTTTCTGTTGCCGGTTCGGAGTATTTTGGGTGGGCCGT
TGGGTCCTAGGCATCATCATGTCCCCGGTGGGGTTGTTCCGTACCAGAGTTATCATTCGG
GTGGGGGTTCCGGGTCGGGTAAGAAGAGTGGGAGGAGTAGAGAGTTTTATGAGGAGGAGG
ATGATGAGGAGGAGGATGATGAGGTGGATGTTAGGGGGAGTGGGAAGAAAGCTAGGAGAG
ATGGACATGATGAATATGCTTCCACTGAGAAGAAGAGAGAGGGGAGAACAAAGATAGATC
GTGAAGCTGATGATCAGCAAGTTTTGCAGCTGGAGGAGAAGGATGTTGTGTCATCTGTTG
CCACTGTGCTCTCCGATTTGTGCGTTCCTGGAGATTGGATGCCCATGGAGAAACTTCACT
CGGTGATATTAAAGAAGTATGGAAACATATGGCATCACAGTCGAGTAAGAAGGTACCTGG
CACAAGAAGACTGGGCGATCCCTGAAGCAAACGGTAAACCATGGTACGGTTTGCTGATGC
TGCTGAGAAAATACCCGGAGCATTTCGTAATCAACACTAGATCCAAAGGAAGAGTTACGC
TAGAATTTGTATCCCTTGTCTCCCTACTCTCATGAACACTGTAATCGCACCAACATGATT
GTGCTTGTTTCTGTTCTTCTATGTGGTGGATTATTGTTATTAATATCTTTTGATTTCTCC
CACGAACTGAGTGTATAAACGGGGTTGCTTTAAGGTTTTCTATCCTATTGTTGCTTACTC
TCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2A987TF U 1
AF RR2A987JQ C 1
BS 1 142 RR2A987TF
BS 143 783 RR2A987JQ

RD RR2A987TF 142 0 0
GGGGGGGGGATAAGGAGTTTTACTTTCTGTTGCCGGTTCGGAGTATTTTGGGTGGGCCGT
TGGGTCCTAGGCATCATCATGTCCCCGGTGGGGTTGTTCCGTACCAGAGTTATCATTCGG
GTGGGGGTTCCGGGTCGGGTAA

QA 1 142 1 142
DS 

RD RR2A987JQ 783 0 0
GGGGGGGGGATAAGGAGTTTTACTTTCTGTTGCCGGTTCGGAGTATTTTGGGTGGGCCGT
TGGGTCCTAGGCATCATCATGTCCCCGGTGGGGTTGTTCCGTACCAGAGTTATCATTCGG
GTGGGGGTTCCGGGTCGGGTAAGAAGAGTGGGAGGAGTAGAGAGTTTTATGAGGAGGAGG
ATGATGAGGAGGAGGATGATGAGGTGGATGTTAGGGGGAGTGGGAAGAAAGCTAGGAGAG
ATGGACATGATGAATATGCTTCCACTGAGAAGAAGAGAGAGGGGAGAACAAAGATAGATC
GTGAAGCTGATGATCAGCAAGTTTTGCAGCTGGAGGAGAAGGATGTTGTGTCATCTGTTG
CCACTGTGCTCTCCGATTTGTGCGTTCCTGGAGATTGGATGCCCATGGAGAAACTTCACT
CGGTGATATTAAAGAAGTATGGAAACATATGGCATCACAGTCGAGTAAGAAGGTACCTGG
CACAAGAAGACTGGGCGATCCCTGAAGCAAACGGTAAACCATGGTACGGTTTGCTGATGC
TGCTGAGAAAATACCCGGAGCATTTCGTAATCAACACTAGATCCAAAGGAAGAGTTACGC
TAGAATTTGTATCCCTTGTCTCCCTACTCTCATGAACACTGTAATCGCACCAACATGATT
GTGCTTGTTTCTGTTCTTCTATGTGGTGGATTATTGTTATTAATATCTTTTGATTTCTCC
CACGAACTGAGTGTATAAACGGGGTTGCTTTAAGGTTTTCTATCCTATTGTTGCTTACTC
TCG

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL5271Contig1 925 2 2 U
GAGACTTACTTATAGACACCTGGGTACCGATAGGAGTTGTCCTAGATGTGCTGCCCCAGT
GGAGTCGACTAATCATCTTCTTTTTGAATGCCCTCCGGCCCTTCAGGTTTGGGCTTTATC
GGACTATTCGTCCCTTCCGGGTTACTTCCTGAGTACATCTATCTACCAAAACATGAACTT
TCTGTTTTGGAGGAGAAAAGAAGTGGCTCCCATGAGTCCACAATTCGATACATTCCCATG
GATCTGTTGGTACATTTGGAAGGCGAGGAACGACAAGCTCTTTAATGGGAAAGTCGTATC
CCCGATGGATACTCTTCAACACGCCTCACTGGAGGCTGAGTGTTGGAGGAAGGCTAACGA
AAAGGAGGAAGTAGAGAAGGAACTCGATGACTCCCTCACTATGGAGATGGAAACAGCGCC
CCCTTGGACACCCCGAATCCCGGCATGCCGAATCGATGCTTCATGGATCGCTAATGGCAG
CGTCAGTGGCTTAGGGTGGAGTTTTAAGGATCACATGGGCTCTGAATTCTTTGGATTGCG
AGCATGTAGTAGGACCCTTTCAGCTTTGCATGCTGAGATGGAAGGTCTACTCTGGGCAGC
TTCATGTATTAGGAACATGAGGATAACCACGATGAGGTTCGAGACCGATTGTACGGACCT
AGTAGATATGGTCACAAACCCGGAGGATTGGCCGGCTTTTGTGAGAGAGACCGACTTGTT
TCAGAGTCTCCAGGAAGGTTTTGAGGATGTGAGAGTTTCTCATATTCCACGGGATCGGAA
TGGACGTGCAGTCGCTTTAGCTAAGGAGGCAAGAAATAGAGGCTATACCTTTACCCACAT
AGATCAGACCCGGTCAGACGGAGGGGATCCTCGGAGAACCGACTCGTCTAACCACCACTT
GATCTAATAAAGATGGGCAGCCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN89TF U 1
AF RR2GN89JQ C 339
BS 1 504 RR2GN89TF
BS 505 925 RR2GN89JQ

RD RR2GN89TF 504 0 0
GAGACTTACTTATAGACACCTGGGTACCGATAGGAGTTGTCCTAGATGTGCTGCCCCAGT
GGAGTCGACTAATCATCTTCTTTTTGAATGCCCTCCGGCCCTTCAGGTTTGGGCTTTATC
GGACTATTCGTCCCTTCCGGGTTACTTCCTGAGTACATCTATCTACCAAAACATGAACTT
TCTGTTTTGGAGGAGAAAAGAAGTGGCTCCCATGAGTCCACAATTCGATACATTCCCATG
GATCTGTTGGTACATTTGGAAGGCGAGGAACGACAAGCTCTTTAATGGGAAAGTCGTATC
CCCGATGGATACTCTTCAACACGCCTCACTGGAGGCTGAGTGTTGGAGGAAGGCTAACGA
AAAGGAGGAAGTAGAGAAGGAACTCGATGACTCCCTCACTATGGAGATGGAAACAGCGCC
CCCTTGGACACCCCGAATCCCGGCATGCCGAATCGATGCTTCATGGATCGCTAATGGCAG
CGTCAGTGGCTTAGGGTGGAGTTT

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2GN89JQ 587 0 0
AGTGTTGGAGGAAGGCTAACGAAAAGGAGGAAGTAGAGAAGGAACTCGATGACTCCCTCA
CTATGGAGATGGAAACAGCGCCCCCTTGGACACCCCGAATCCCGGCATGCCGAATCGATG
CTTCATGGATCGCTAATGGCAGCGTCAGTGGCTTAGGGTGGAGTTTTAAGGATCACATGG
GCTCTGAATTCTTTGGATTGCGAGCATGTAGTAGGACCCTTTCAGCTTTGCATGCTGAGA
TGGAAGGTCTACTCTGGGCAGCTTCATGTATTAGGAACATGAGGATAACCACGATGAGGT
TCGAGACCGATTGTACGGACCTAGTAGATATGGTCACAAACCCGGAGGATTGGCCGGCTT
TTGTGAGAGAGACCGACTTGTTTCAGAGTCTCCAGGAAGGTTTTGAGGATGTGAGAGTTT
CTCATATTCCACGGGATCGGAATGGACGTGCAGTCGCTTTAGCTAAGGAGGCAAGAAATA
GAGGCTATACCTTTACCCACATAGATCAGACCCGGTCAGACGGAGGGGATCCTCGGAGAA
CCGACTCGTCTAACCACCACTTGATCTAATAAAGATGGGCAGCCGAC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL5272Contig1 1334 2 6 U
GGGGTCGCTCCTCGAGACAAAATCGGAACTAAAGACGATTGAGTGAAGTTAAGAGCATCG
TCGGATACAGGCAAAATCTGCATCTGATTAGATTGAAGTGGAGTGGAGTGTCGGAAAGAC
GAAGGAGAGGGACGCCGTTTGATTCTTGTATAGATCCACCCAAAGAGGAGATTTGACTGC
CTGATGATTTTGACCAGCAACAACTCATTAGTTTCGCTCCAACGTTTATATCTCTTAGCC
TGATGGAAGCAGACGACGGTGGGAACAATTCTGGTCATGCTTCCAAACAACGTTTGCGTT
GGACGCACGAGCTACACGAACGCTTCGTTGATGCCGTGGCTCAACTTGGTGGCCCTGACA
GAGCTACACCTAAAGGCGTTCTTAGAGTGATGGGTGTACAAGGGTTAACTATATATCATG
TCAAGAGTCACTTACAGAAATATCGACTTGCAAAGTATCTGCCAGATTCATCGTCTGAAG
GGAAGAAGATCGATAAGAAAGAATCTGGAGATGTGCTTTCTGGGTTGGACGGTTCACCGG
GAACGCAGATTACTGAAGCCCTCAAGTTGCAGATGGAAGTTCAGAAACGATTGCACGAGC
AACTTGAAGTGCAAAGACAGCTGCAACTACGGATAGAAGCACAAGGGAAGTACTTGAAGA
AGATAATTGAAGAGCAACAGCGACTCAGTGGAGAACTTGGCGAATCCTCAGGCCCAGTAA
CAGGCGAATCAGATCCTGCAACCCCTGCCCCAACGTCCGAGTTTCCCCTACAGGGTAAAT
CTGGCAAAGAATGTGAGCCAGACAAGAGCCTTTCAGTTGAAGAGTCTCATTCATCTTACC
GGGAGGCATCGACACCAGACTCGGGGGTGCAACATTGGGTCTCAAGATGAGAGCGCAGGA
GAAGAGAGATCATCAAAGAAGCCTAGATTGATGAGAGGTGGTGCAGCTGGTTATACATTT
GAGATGGTAGTTGCGCACCCAATACTGGAGTCAGGCTTGAACGCTTTTTACCATCAGTCA
GACCATACTCTCGCTTTTGACGTTCCATTTACATCACTGCTAGGAGCTGAAAACGGACTG
GACAATGTCTCAGGAGACGATCTATGAGTTGTGTGTATCAGGTGGCATCTGTAGTTGAGT
GTATTACATGTAGTTTTGTTGTCTATCCTTATTCCTATTTTAGTGAGGAGTTTACTCTTA
GTAAGGTGGCCACAGCTCTCTTATTATATACACTTGCCACTAGCATGAACAATGAATATA
TATGTCGTGTTGTGCTGTAATTTGGTAAAAACCCCAACAAACTACTTTCTTACAACCCAC
TGAAAGTTGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B857TF U 1
AF RR2B857JQ C 708
BS 1 804 RR2B857TF
BS 805 805 RR2B857JQ
BS 806 845 RR2B857TF
BS 846 846 RR2B857JQ
BS 847 888 RR2B857TF
BS 889 1334 RR2B857JQ

RD RR2B857TF 888 0 0
GGGGTCGCTCCTCGAGACAAAATCGGAACTAAAGACGATTGAGTGAAGTTAAGAGCATCG
TCGGATACAGGCAAAATCTGCATCTGATTAGATTGAAGTGGAGTGGAGTGTCGGAAAGAC
GAAGGAGAGGGACGCCGTTTGATTCTTGTATAGATCCACCCAAAGAGGAGATTTGACTGC
CTGATGATTTTGACCAGCAACAACTCATTAGTTTCGCTCCAACGTTTATATCTCTTAGCC
TGATGGAAGCAGACGACGGTGGGAACAATTCTGGTCATGCTTCCAAACAACGTTTGCGTT
GGACGCACGAGCTACACGAACGCTTCGTTGATGCCGTGGCTCAACTTGGTGGCCCTGACA
GAGCTACACCTAAAGGCGTTCTTAGAGTGATGGGTGTACAAGGGTTAACTATATATCATG
TCAAGAGTCACTTACAGAAATATCGACTTGCAAAGTATCTGCCAGATTCATCGTCTGAAG
GGAAGAAGATCGATAAGAAAGAATCTGGAGATGTGCTTTCTGGGTTGGACGGTTCACCGG
GAACGCAGATTACTGAAGCCCTCAAGTTGCAGATGGAAGTTCAGAAACGATTGCACGAGC
AACTTGAAGTGCAAAGACAGCTGCAACTACGGATAGAAGCACAAGGGAAGTACTTGAAGA
AGATAATTGAAGAGCAACAGCGACTCAGTGGAGAACTTGGCGAATCCTCAGGCCCAGTAA
CAGGCGAATCAGATCCTGCAACCCCTGCCCCAACGTCCGAGTTTCCCCTACAGGGTAAAT
CTGGCAAAGAATGTGAGCCAGACA*GAGCCTTTCAGTTGAAGAGTCTCATTCATCTTACC
GGGAG*CATCGACACCAGACTCGGGGGTGCAACATTGGGTCTCAAGAT

QA 1 888 1 888
DS 

RD RR2B857JQ 627 0 0
TCAGGCCCAGTAACAGGCGAATCAGATCCTGCAACCCCTGCCCCAACGTCCGAGTTTCCC
CTACAGGGTAAATCTGGCAAAGAATGTGAGCCAGACAAGAGCCTTTCAGTTGAAGAGTCT
CATTCATCTTACCGGGAGGCATCGACACCAGACTCGGGG*TGCAACATTGGGTCTCAAGA
TGAGAGCGCAGGAGAAGAGAGATCATCAAAGAAGCCTAGATTGATGAGAGGTGGTGCAGC
TGGTTATACATTTGAGATGGTAGTTGCGCACCCAATACTGGAGTCAGGCTTGAACGCTTT
TTACCATCAGTCAGACCATACTCTCGCTTTTGACGTTCCATTTACATCACTGCTAGGAGC
TGAAAACGGACTGGACAATGTCTCAGGAGACGATCTATGAGTTGTGTGTATCAGGTGGCA
TCTGTAGTTGAGTGTATTACATGTAGTTTTGTTGTCTATCCTTATTCCTATTTTAGTGAG
GAGTTTACTCTTAGTAAGGTGGCCACAGCTCTCTTATTATATACACTTGCCACTAGCATG
AACAATGAATATATATGTCGTGTTGTGCTGTAATTTGGTAAAAACCCCAACAAACTACTT
TCTTACAACCCACTGAAAGTTGTTTTT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL5273Contig1 508 2 3 U
GGTCACTCGGCGTTCTTGAAGAAGCATTGGAACAGAGAAAGAGACATAAAAAAAATGTCG
GAAAAGAAGGGAAGGAAAGAGGAGGTGGTGACCAGAGAGTACACCATCAACCTTCACAGA
CGCCTTCATAGCTGTACCTTCAAGAAGAAGGCTCCGAAGGCAATCAAAGAGATAAGGAAG
TTTGCTGAGAAGGCAATGGGGACAAAGGACGTGAGAGTTGATGTGAAGCTGAACAAGCAG
ATTTGGAGCAAAGGTATCAGAGGTCCTCCTAGAAGGATCAGAGTCCGAGTTGCTCGTAAG
AGAAACGATGACGAAGATGCAAAGGAAGAGTTCTTCTCCCTTGTCACTGTCGCTGAAATC
CCCGCAGAAGGTCTCTCCGGTCTTGGCACTAAAGTCATCGATGAAGAGGATTGAACAATC
TTGTAATCTCTTATCAGATAGTTTTGTTTCTCAACTTTGGAATTACTTTCGAATCAATGA
TCCAGTTTATTGGAGAGAACGTTTATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2EM18JQ C 1
AF RR2C442TF U 333
BS 1 332 RR2EM18JQ
BS 333 503 RR2C442TF
BS 504 508 RR2EM18JQ

RD RR2EM18JQ 508 0 0
GGTCACTCGGCGTTCTTGAAGAAGCATTGGAACAGAGAAAGAGACATAAAAAAAATGTCG
GAAAAGAAGGGAAGGAAAGAGGAGGTGGTGACCAGAGAGTACACCATCAACCTTCACAGA
CGCCTTCATAGCTGTACCTTCAAGAAGAAGGCTCCGAAGGCAATCAAAGAGATAAGGAAG
TTTGCTGAGAAGGCAATGGGGACAAAGGACGTGAGAGTTGATGTGAAGCTGAACAAGCAG
ATTTGGAGCAAAGGTATCAGAGGTCCTCCTAGAAGGATCAGAGTCCGAGTTGCTCGTAAG
AGAAACGATGACGAAGATGCAAAGGAAGAGTTCTTCTCCCTTGTCACTGTCGCTGAAATC
CCCGCAGAAGGTCTCTCCGGTCTTGGCACTAAAGTCATCGATGAAGAGGATTGATCAATC
TTGTAATCTCTTATCAGATAGTTTTGTTTCTCAACTTTGGAATTACTTTCGAATCAATGA
TCCAGTTTATTGGAGAGAACGTTTATCT

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2C442TF 171 0 0
CTTCTCCCTTGTCACTGTCGCTGAAATCCCCGCAGAAGGTCTCTCCGGTCTTGGCACTAA
AGTCATCGATGAAGAGGATTGAACAATCTTGTAATCTCTTATCAGATAGTTTTGTTTCTC
AACTTTGGAATTACTTTCGAATCAATGATCCAGTTTATTGGAGAGAACGTT

QA 1 171 1 171
DS 



AS 1 2

CO CL5274Contig1 338 2 2 U
AGTTCACTTCCCTTGATAACAATGTTGGGGAAATCCAGCAAGTGGACCTCAAGGGGATCG
AGCATTCCTTTACGAGTAACAATAACTTGTTTTGGCTGTTCTTCAACAGGGAGAGACCTC
ACAAGAGCAGCTACCTCTTCAGCAGTTTTCCATTTCGCTAGCTGACCAAGACGCCTCTGA
CCAGCCCAAACGCTTGTGTGGATAACCTTCAGGAATAACTGTCCAGTTCTTGGATTGAAA
ATAAAATCGCACCATTGATTGGCTTTGTTGTTAAATTTCCTTCAAACGTCTTGTGAATTG
TTACACGATAGACATTGGTATCATCCACAAACCATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AN62TF C 1
AF RR2AN62JQ U 166
BS 1 165 RR2AN62TF
BS 166 338 RR2AN62JQ

RD RR2AN62TF 338 0 0
AGTTCACTTCCCTTGATAACAATGTTGGGGAAATCCAGCAAGTGGACCTCAAGGGGATCG
AGCATTCCTTTACGAGTAACAATAACTTGTTTTGGCTGTTCTTCAACAGGGAGAGACCTC
ACAAGAGCAGCTACCTCTTCAGCAGTTTTCCATTTCGCTAGCTGACCAAGACGCCTCTGA
CCAGCCCAAACGCTTGTGTGGATAACCTTCAGGAATAGCTGTCCAGTTCTTGGATTGAAA
ATAAAATCGCACCATTGATTGGCTTTGTTGTTAAATTTCCTTCAAACGTCTTGTGAATTG
TTACACGATAGACATTGGTATCATCCACAAACCATATC

QA 1 338 1 338
DS 

RD RR2AN62JQ 173 0 0
CCAAGACGCCTCTGACCAGCCCAAACGCTTGTGTGGATAACCTTCAGGAATAACTGTCCA
GTTCTTGGATTGAAAATAAAATCGCACCATTGATTGGCTTTGTTGTTAAATTTCCTTCAA
ACGTCTTGTGAATTGTTACACGATAGACATTGGTATCATCCACAAACCATATC

QA 1 173 1 173
DS 



AS 1 2

CO CL5275Contig1 842 2 2 U
TTTTTTTTTCTTCGTCTTGTGATTGTGTTGTAGAGAAGAAGAATGGCTTCAAGTGCTTCA
AAGTTCATCAAATGTGTAACTGTTGGTGATGGCGCCGTTGGTAAAACCTGTATGCTCATC
TGCTACACCAGCAACAAATTCCCTACTGACTATGTACCAACGGTTTTTGACAACTTCAGT
GCAAACGTTGTAGTTGAAGGCACCACTGTGAACTTAGGGCTATGGGATACTGCTGGGCAA
GAAGATTACAACAGACTAAGGCCTTTAAGTTACAGAGGAGCAGATGTTTTCGTCTTGTCT
TTCTCATTGGTCAGCAGAGCTAGCTATGAAAATGTTTTTAAAAAGTGGATCCCTGAGCTC
CAACACTTTGCTCCAGGAGTTCCATTAGTTCTTGTCGGTACCAAATTAGATCTCCGTGAG
GATAAGCATTATCTGGCTGACCATCCTGGACTATCCCCTGTAACTACTGCACAGGGAGAG
GAGTTGCGTAAGCTAATAGGCGCAACATATTACATTGAATGTAGCTCAAAAACTCAACAG
AATGTGAAAGCAGTTTTTGATTCCGCAATCAAGGAAGTGATCAAACCGGTGGTTAAACAA
AAGGACAAGACCAAGAAGAAGAAGAAGCAACAGTCGAACCACCACCACGGGTGTTTATCA
AACGTTCTGTGTGGGAGGATAGTGACTCGGCATTGATGATGATATGATGAACCTAAACTC
TCTGCCTTTATGTTCTGGAATTCCACTTTTGAGTTTGTATGATAAATGAGAAACACATTA
TATATATAGATTGAATCATGTAAGAGAGTTATTAGCCTCTACTTAATCAATAGATTACAT
AG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2FU18TF U 1
AF RR2FU18JQ C 2
BS 1 772 RR2FU18TF
BS 773 842 RR2FU18JQ

RD RR2FU18TF 772 0 0
TTTTTTTTTCTTCGTCTTGTGATTGTGTTGTAGAGAAGAAGAATGGCTTCAAGTGCTTCA
AAGTTCATCAAATGTGTAACTGTTGGTGATGGCGCCGTTGGTAAAACCTGTATGCTCATC
TGCTACACCAGCAACAAATTCCCTACTGACTATGTACCAACGGTTTTTGACAACTTCAGT
GCAAACGTTGTAGTTGAAGGCACCACTGTGAACTTAGGGCTATGGGATACTGCTGGGCAA
GAAGATTACAACAGACTAAGGCCTTTAAGTTACAGAGGAGCAGATGTTTTCGTCTTGTCT
TTCTCATTGGTCAGCAGAGCTAGCTATGAAAATGTTTTTAAAAAGTGGATCCCTGAGCTC
CAACACTTTGCTCCAGGAGTTCCATTAGTTCTTGTCGGTACCAAATTAGATCTCCGTGAG
GATAAGCATTATCTGGCTGACCATCCTGGACTATCCCCTGTAACTACTGCACAGGGAGAG
GAGTTGCGTAAGCTAATAGGCGCAACATATTACATTGAATGTAGCTCAAAAACTCAACAG
AATGTGAAAGCAGTTTTTGATTCCGCAATCAAGGAAGTGATCAAACCGGTGGTTAAACAA
AAGGACAAGACCAAGAAGAAGAAGAAGCAACAGTCGAACCACCACCACGGGTGTTTATCA
AACGTTCTGTGTGGGAGGATAGTGACTCGGCATTGATGATGATATGATGAACCTAAACTC
TCTGCCTTTATGTTCTGGAATTCCACTTTTGAGTTTGTATGATAAATGAGAA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2FU18JQ 841 0 0
TTTTTTTTCT*CGTCTTGTGATTGTGT*GTAGAGAAGAAGAATGGCTTCAAGTGCTTCAA
AGTTCATCAAATGTGTAACTGTTGGTGATGGCGCCGTTGGTAAAACCTGTATGCTCATCT
GCTACACCAGCAACAAATTCCCTACTGACTATGTACCAACGGTTTTTGACAACTTCAGTG
CAAACGTTGTAGTTGAAGGCACCACTGTGAACTTAGGGCTATGGGATACTGCTGGGCAAG
AAGATTACAACAGACTAAGGCCTTTAAGTTACAGAGGAGCAGATGTTTTCGTCTTGTCTT
TCTCATTGGTCAGCAGAGCTAGCTATGAAAATGTTTTTAAAAAGTGGATCCCTGAGCTCC
AACACTTTGCTCCAGGAGTTCCATTAGTTCTTGTCGGTACCAAATTAGATCTCCGTGAGG
ATAAGCATTATCTGGCTGACCATCCTGGACTATCCCCTGTAACTACTGCACAGGGAGAGG
AGTTGCGTAAGCTAATAGGCGCAACATATTACATTGAATGTAGCTCAAAAACTCAACAGA
ATGTGAAAGCAGTTTTTGATTCCGCAATCAAGGAAGTGATCAAACCGGTGGTTAAACAAA
AGGACAAGACCAAGAAGAAGAAGAAGCAACAGTCGAACCACCACCACGGGTGTTTATCAA
ACGTTCTGTGTGGGAGGATAGTGACTCGGCATTGATGATGATATGATGAACCTAAACTCT
CTGCCTTTATGTTCTGGAATTCCACTTTTGAGTTTGTATGATAAATGAGAAACACATTAT
ATATATAGATTGAATCATGTAAGAGAGTTATTAGCCTCTACTTAATCAATAGATTACATA
G

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 2

CO CL5276Contig1 1163 2 6 U
GAGCCACGCTGCTGGTGGACCTACGAGGATGGAGAATGCGAAGATCGCTGTGATTCAGTT
CCAGATCTCGCCTCCCAAGACTGATATCGAGCAGAGTATTGTTGTCTCTGATTATACTCA
GATGGATAGGATCTTGAAGGAAGAGAGGAACTACATCTTGGGGATGATTAAGAAGATCAA
GGCGACTGGTTGTAATGTGTTGTTGATCCAGAAGAGTATTTTGAGGGACGCTGTGACTGA
TCTGTCGCTTCACTATTTGGCTAAGGCTAAGATCATGGTGATTAAGGATGTGGAGAGGGA
TGAGATTTAGTTCGTGACTAAGACGTTGAACTGCTTGCCGATTTCTAACATTGAGCATTT
TAGGGCTGAGAAGCTTGGTTATGCTGATCTCGTTGAAGAAGCGTCGCTTGGAGATGGGAA
GATTTTGAAGATTACTGGGATTAAAGACATGGGGAGAACCACCTCTGTTCTCGTCCGTGG
CTCCAACCAGCTTGTTCTTGACGAAGCCGAGAGGAGTCTGCACGATGCGTTGTGTGTTGT
CAGGTGTCTGGTGAGCAAGAGGTTTTTGATTGCGGGAGGTGGTGCGCCGGAGATTGAGCT
CTCGAGGCAGCTAGGTGCTTGGGCTAAGGTGCTCCATGGGATGGAAAGTTACTGCGTGAA
GTCTTTCGCTGAAGCTCTGGAGGTTATTCCTTACACGCTGGCTGAGAATGCAGGTCTTAA
TCCTATTGCCATTGTGACTGAGCTCAGGAACAAGCATGCTCAAGGGGAAATCAACTCTGG
GATCAATGTGAGGAAAGGGCAGATCACTAATATCTTGGAGGAGAACGTGGTGCAGCCTCT
GCTTGTGAGCCCCAGCGCAATCACTCTCGCAACTGAATGCGTAAGGATGATTTTGAAGAT
TGATGACATCGTTACTGTGAGGTAGTGTGGTAGTTTCACTCTAAACGGGTCATCACAGTA
CACTTCTCTTGCTCTATCTATTTAAGCTTTGTTTCCTTTTTGGTGTTTTGATGTGTCTTT
TTTTTTTTGCAATGGTTGAACTTAGAACCTTAGTTGCTTTCAACATGTTCTATTGCATCT
TTTTTCTTTGTCAGCGTTCTATTGCCCTAGTGGTCTTCTTTTGGTTTGTGCTACTTTGTT
TCTTTCTAGTGACTTTAAATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES23TF U 1
AF RR2ES23JQ C 563
BS 1 684 RR2ES23TF
BS 685 685 RR2ES23JQ
BS 686 713 RR2ES23TF
BS 714 714 RR2ES23JQ
BS 715 745 RR2ES23TF
BS 746 1163 RR2ES23JQ

RD RR2ES23TF 745 0 0
GAGCCACGCTGCTGGTGGACCTACGAGGATGGAGAATGCGAAGATCGCTGTGATTCAGTT
CCAGATCTCGCCTCCCAAGACTGATATCGAGCAGAGTATTGTTGTCTCTGATTATACTCA
GATGGATAGGATCTTGAAGGAAGAGAGGAACTACATCTTGGGGATGATTAAGAAGATCAA
GGCGACTGGTTGTAATGTGTTGTTGATCCAGAAGAGTATTTTGAGGGACGCTGTGACTGA
TCTGTCGCTTCACTATTTGGCTAAGGCTAAGATCATGGTGATTAAGGATGTGGAGAGGGA
TGAGATTTAGTTCGTGACTAAGACGTTGAACTGCTTGCCGATTTCTAACATTGAGCATTT
TAGGGCTGAGAAGCTTGGTTATGCTGATCTCGTTGAAGAAGCGTCGCTTGGAGATGGGAA
GATTTTGAAGATTACTGGGATTAAAGACATGGGGAGAACCACCTCTGTTCTCGTCCGTGG
CTCCAACCAGCTTGTTCTTGACGAAGCCGAGAGGAGTCTGCACGATGCGTTGTGTGTTGT
CAGGTGTCTGGTGAGCAAGAGGTTTTTGATTGCGGGAGGTGGTGCGCCGGAGATTGAGCT
CTCGAGGCAGCTAGGTGCTTGGGCTAAGGTGCTCCATGGGATGGAAAGTTACTGCGTGAA
GTCTTTCGCTGAAGCTCTGGAGGT*ATTCCTTACACGCTGGCTGAGAATGCAG*TCTTAA
TCCTATTGCCATTGTGACTGAGCTC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2ES23JQ 601 0 0
TTTTTGATTGCGGGAGGTGGTGCGCCGGAGATTGAGCTCTCGAGGCAGCTAGGTGCTTGG
GCTAAGGTGCTCCATGGGATGGAAGGTTACTGCGTGAAGTCTTTCGCTGAAGCTCTGGAG
GTTATTCCTTACACGCTGGCTGAGAATGCAGGTCTTAATCCTATTGCCATTGTGACTGAG
CTCAGGAACAAGCATGCTCAAGGGGAAATCAACTCTGGGATCAATGTGAGGAAAGGGCAG
ATCACTAATATCTTGGAGGAGAACGTGGTGCAGCCTCTGCTTGTGAGCCCCAGCGCAATC
ACTCTCGCAACTGAATGCGTAAGGATGATTTTGAAGATTGATGACATCGTTACTGTGAGG
TAGTGTGGTAGTTTCACTCTAAACGGGTCATCACAGTACACTTCTCTTGCTCTATCTATT
TAAGCTTTGTTTCCTTTTTGGTGTTTTGATGTGTCTTTTTTTTTTTGCAATGGTTGAACT
TAGAACCTTAGTTGCTTTCAACATGTTCTATTGCATCTTTTTTCTTTGTCAGCGTTCTAT
TGCCCTAGTGGTCTTCTTTTGGTTTGTGCTACTTTGTTTCTTTCTAGTGACTTTAAATAT
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL5277Contig1 901 2 4 U
GGGACCTTTCTCTCTTTCTTTCTCGTCGTCCCCCAAATGAACGGAGCAAGGAGGAAGCTG
GTGGCTTCAGTCTCCACCCTTTTAACAAGACGATCATATTCTCCTTCTTCTTCTTCTACT
CTCGGGTGCAATCCACTCGCGAATAATTCACAAACTCACTTGATCCGCCAACCTCTGCAA
TCTTCTTCTTCTTCAGCTAATAAACCCCTGTGGCTCCAATTTCCCGGTAGAGGTTTTTGC
TCGGAGGGATCCTGCGGCGTGTGCTGGAACTGTGGCTCCTCGTCGTCGGAGAAAGCTGCG
TTTTTGTTCTGTGAATCGTGCCGCACCATTCAACCCGTCGATGATTCCGTCGATTACTTT
CAGATATTCGGCTTGGAGAAGAAGTATGAGTTAGATGCTGGGAGCCTTGAAGGCATTTAC
AAAGACTGGCAAAAAGAAACTTCATCCTGATTTAGTTCACAACAAATCTCAGAAAGAAAG
AGATTTCGCAGCGGACCAGTCTGCAAAGGTGACTGAAGCTTACCGGACATTAACCAAGCG
GCTCTCAAGAGCTATGTATATCATGAAGCTGAATGGCAAAAATGTCAATGAAGAAGAAAC
AATAACAGGTCCAACCTTGTTAATGGAGATTATGGAACTCAGAGAGGCCATTGCAGAAGC
AAATGATTCAAAAGAGTTAGACCAGATTCGATCCCAGGTACAAGAGAAACTGAAGCAATG
GTCTGACTCTTTTGTCCAAGCCTTTGAAAGCCACAGGTTTGATGAAGCTGTAAAATGTAT
CCAGAGAATGACTTATTACGAGCGAGCTTGTGAAGAAATTGTCAAGAAGCTATGATGAGG
GAAACTAGTCTCCTCCCTAATAGATAAACCATTTTTTTTGTTCGTTTTCTTTAAAGCCTT
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BX42TF U 1
AF RR2BX42JQ C 409
BS 1 434 RR2BX42TF
BS 435 435 RR2BX42JQ
BS 436 582 RR2BX42TF
BS 583 901 RR2BX42JQ

RD RR2BX42TF 582 0 0
GGGACCTTTCTCTCTTTCTTTCTCGTCGTCCCCCAAATGAACGGAGCAAGGAGGAAGCTG
GTGGCTTCAGTCTCCACCCTTTTAACAAGACGATCATATTCTCCTTCTTCTTCTTCTACT
CTCGGGTGCAATCCACTCGCGAATAATTCACAAACTCACTTGATCCGCCAACCTCTGCAA
TCTTCTTCTTCTTCAGCTAATAAACCCCTGTGGCTCCAATTTCCCGGTAGAGGTTTTTGC
TCGGAGGGATCCTGCGGCGTGTGCTGGAACTGTGGCTCCTCGTCGTCGGAGAAAGCTGCG
TTTTTGTTCTGTGAATCGTGCCGCACCATTCAACCCGTCGATGATTCCGTCGATTACTTT
CAGATATTCGGCTTGGAGAAGAAGTATGAGTTAGATGCTGGGAGCCTTGAAGGCATTTAC
AAAGACTGGCAAAA*GAAACTTCATCCTGATTTAGTTCACAACAAATCTCAGAAAGAAAG
AGATTTCGCAGCGGACCAGTCTGCAAAGGTGACTGAAGCTTACCGGACATTAACCAAGCG
GCTCTCAAGAGCTATGTATATCATGAAGCTGAATGGCAAAAA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2BX42JQ 493 0 0
GAAGGCATTTACAAAGACTGGCAAAAAGAAACTTCATCCTGATTTAGTTCACAACAAATC
TCAGAAAGAAAGAGATTTCGCAGCGGACCAGTCTGCAAAGGTGACTGAAGCTTACCGGAC
ATTAACCAAGCGGCTCTCAAGAGCTATGTATATCATGAAGCTGAATGGCAAAAATGTCAA
TGAAGAAGAAACAATAACAGGTCCAACCTTGTTAATGGAGATTATGGAACTCAGAGAGGC
CATTGCAGAAGCAAATGATTCAAAAGAGTTAGACCAGATTCGATCCCAGGTACAAGAGAA
ACTGAAGCAATGGTCTGACTCTTTTGTCCAAGCCTTTGAAAGCCACAGGTTTGATGAAGC
TGTAAAATGTATCCAGAGAATGACTTATTACGAGCGAGCTTGTGAAGAAATTGTCAAGAA
GCTATGATGAGGGAAACTAGTCTCCTCCCTAATAGATAAACCATTTTTTTTGTTCGTTTT
CTTTAAAGCCTTA

QA 1 493 1 493
DS 



AS 1 2

CO CL5278Contig1 805 2 6 U
GAAAACCCGCGTTAATTACGGTTGTCTCCCTACGCGCAACTCAAAGATTATATGGAGAAG
GTTGAGTTAGAGCTCACAAGTATATGCATTGACATAATGTCTGTGTTAGATGAGCATCTG
ATCCCATCTGCTTCCGAGGGTGAATCAACTGTCTTCTTCAACAAGATGAAAGGTGATTAT
TACCGCTATCTTGCTGAGTTTAAATCAGGAGATGAGAGGAAAGAGGCTGCTGATCAGTCT
TTGAAAGCCTATGAGATTGCTACTACTTCTGCTGAGGCTAAACTTCCTCCTACACATCCA
ATCAGATTGGGATTGGCTTTGAATTTCTCTGTCTTCTACTATGAGATCATGAACTCACCT
GAAAGGGCATGTGAGCTTGCTAAGCAGGCGTTTGATGGAGCAATCTCAGAACTTGACAGT
CTGAATGAGGAATCTTACAAAGATAGCACTTTGATTTTGCAACTCCTTAGGGACAATTTG
ACCTTGTGGACTTCTGACATCCCTGAAGAAGGAGATGATGCACATAAGACGAATGGTTCT
GCTAAACACGGTGCAGGTGAAGACGACGCAGAGTGATCTGATTATATGTGTGCACCCGCA
GCAGCAGCAGTAATGGACAAACATGTTTCAAGAACAACTGAATGTGCGGTGAACAATAGC
GAAAAACCTATAGTTCTTACTTCTTATTATGTTTCCTATATCATTATTGTCTATATATTG
TACTCTCTGGTTTGAGTGTATGCTTTGTCTCTCAAGACACTATTTTGTTATTTGTGATTT
GAATTCAGTACTGTCCTCTTCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G255TF U 1
AF RR2G115JQ C 594
BS 1 665 RR2G255TF
BS 666 666 RR2G115JQ
BS 667 754 RR2G255TF
BS 755 755 RR2G115JQ
BS 756 770 RR2G255TF
BS 771 805 RR2G115JQ

RD RR2G255TF 770 0 0
GAAAACCCGCGTTAATTACGGTTGTCTCCCTACGCGCAACTCAAAGATTATATGGAGAAG
GTTGAGTTAGAGCTCACAAGTATATGCATTGACATAATGTCTGTGTTAGATGAGCATCTG
ATCCCATCTGCTTCCGAGGGTGAATCAACTGTCTTCTTCAACAAGATGAAAGGTGATTAT
TACCGCTATCTTGCTGAGTTTAAATCAGGAGATGAGAGGAAAGAGGCTGCTGATCAGTCT
TTGAAAGCCTATGAGATTGCTACTACTTCTGCTGAGGCTAAACTTCCTCCTACACATCCA
ATCAGATTGGGATTGGCTTTGAATTTCTCTGTCTTCTACTATGAGATCATGAACTCACCT
GAAAGGGCATGTGAGCTTGCTAAGCAGGCGTTTGATGGAGCAATCTCAGAACTTGACAGT
CTGAATGAGGAATCTTACAAAGATAGCACTTTGATTTTGCAACTCCTTAGGGACAATTTG
ACCTTGTGGACTTCTGACATCCCTGAAGAAGGAGATGATGCACATAAGACGAATGGTTCT
GCTAAACACGGTGCAGGTGAAGACGACGCAGAGTGATCTGATTATATGTGTGCACCCGCA
GCAGCAGCAGTAATGGACAAACATGTTTCAAGAACAACTGAATGTGCGGTGAACAATAGC
GAAAA*CCTATAGTTCTTACTTCTTATTATGTTTCCTATATCATTATTGTCTATATATTG
TACTCTCTGGTTTGAGTGTATGCTTTGTCTCTCA*GACACTATTTTGTTA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2G115JQ 212 0 0
ACCCGCAGCAGCAGCAGTAATGGACAAACATGTTTCAAGAACAACTGAATGTGCGGTGAA
CAATAGCGAAAAACCTATAGTTCTTACTTCTTATTATGTTTCCTATATCATTATTGTCTA
TATATTGTACTCTCTGGTTTGAGTGTATGCTTTGTCTCTCAAGACACTATTTTGTTATTT
GTGATTTGAATTCAGTACTGTCCTCTTCACCC

QA 1 212 1 212
DS 



AS 1 2

CO CL5279Contig1 1269 2 2 U
GGAAGATCAGATAGAAAAACTTTTGAGAAACACACCTTTCTATCAAATAAGATTTTGTTT
TTGTTGCTGGATCAGATATTTGCTTTTCTTCTAGGGTTTAAAGGTTGCTTGGGTGATAAA
AAAAAAGATGGAAACTTTTGGTGGGTTTCACAAGGAAGATGATGAGCATATGGTTTTGCC
TCCTGGGTTTAGGTTTCATCCAACAGACGAAGAACTCATCACCCACTATCTTCACAACAA
GGTTCTCAACATTGATTTCTCATCTAAAGCTATTGGTGAAGTGGATTTGAACAAAGCTGA
GCCATGGGAGTTGCCATATAAAGCAAAAATGGGTGAGAAAGAATGGTACTTCTTCTGTGT
GAGGGATAGAAAGTATCCAACCGGTTTGAGGACTAACCGGGCAACTCAAGCCGGTTACTG
GAAGGCTACAGGGAAGGATAAGGAGATCTTCAGAGGCGAATCACTAGTTGGTATGAAGAA
AACACTTGTTTTCTACAGAGGAAGAGCTCCAAAAGGGCAGAAAACAAATTGGGTGATGCA
TGAGTATAGGCTTGATGGGAAGCTCTCTGCTCACAACATGCCCAAAACCGCCAAGAATGA
ATGGGTGATATGCAGAGTGTTTCATAAAACTGCTGGAGGCAAGAAGATCCCTATTTCGAC
TCTGATCCAAATTGGTTCTTATGGAGGTTCTAGCTTACCACCTTTAAATGATTCTTCACC
ATACAACAATGACAAAACTAAGACCGAACAGAGTTACGTGCCCTGCTTCTCCAACCAAAC
TGAAACCAGAGGAACACTACTCAATTACTTCAGCAACAACCCTGCCCTTTGCTCGATTCC
ACTATACCAACCTCAATCTCTCCATGTTTCTGATCCGGTTCTTACTCAAGAACAATCGGT
TTCTCAAGCCATGTTTGAGAATAACAGAAGGCAGAGCTTCAAAACGTTGAGTGTCTCGCA
GGAAACTGGAGTTTCTAATACCGATATATCATCATCAAATATTGAATTTGGGAGGAAAGG
ATTCGATCATCAAGAAGTTCCATCTTCCTCCACCGGTCCGGTCGATCTTGAACCATTCTG
GAGTTACTGAAGATTCAAAAACATCAAAAGTTCATTATCTTAGGTCACAAGTAAGAAGAA
CTTCGCAGAAGTTTTATCTTCTAAGCGTGGTGTGCCAAGTTTGTATAGATTATTATTATA
TCAATGCTTCCCACTCTTTAGTATGTTCTATTATTATTATATATTCAACTAATATTTGAT
ATTAGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF52TF U 1
AF RR2DF52JQ C 479
BS 1 646 RR2DF52TF
BS 647 1269 RR2DF52JQ

RD RR2DF52TF 646 0 0
GGAAGATCAGATAGAAAAACTTTTGAGAAACACACCTTTCTATCAAATAAGATTTTGTTT
TTGTTGCTGGATCAGATATTTGCTTTTCTTCTAGGGTTTAAAGGTTGCTTGGGTGATAAA
AAAAAAGATGGAAACTTTTGGTGGGTTTCACAAGGAAGATGATGAGCATATGGTTTTGCC
TCCTGGGTTTAGGTTTCATCCAACAGACGAAGAACTCATCACCCACTATCTTCACAACAA
GGTTCTCAACATTGATTTCTCATCTAAAGCTATTGGTGAAGTGGATTTGAACAAAGCTGA
GCCATGGGAGTTGCCATATAAAGCAAAAATGGGTGAGAAAGAATGGTACTTCTTCTGTGT
GAGGGATAGAAAGTATCCAACCGGTTTGAGGACTAACCGGGCAACTCAAGCCGGTTACTG
GAAGGCTACAGGGAAGGATAAGGAGATCTTCAGAGGCGAATCACTAGTTGGTATGAAGAA
AACACTTGTTTTCTACAGAGGAAGAGCTCCAAAAGGGCAGAAAACAAATTGGGTGATGCA
TGAGTATAGGCTTGATGGGAAGCTCTCTGCTCACAACATGCCCAAAACCGCCAAGAATGA
ATGGGTGATATGCAGAGTGTTTCATAAAACTGCTGGAGGCAAGAAG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2DF52JQ 791 0 0
AAAACACTTGTTTTCTACAGAGGAAGAGCTCCAAAAGGGCAGAAAACAAATTGGGTGATG
CATGAGTATAGGCTTGATGGGAAGCTCTCTGCTCACAACATGCCCAAAACCGCCAAGAAT
GAATGGGTGATATGCAGAGTGTTTCATAAAACTGCTGGAGGCAAGAAGATCCCTATTTCG
ACTCTGATCCAAATTGGTTCTTATGGAGGTTCTAGCTTACCACCTTTAAATGATTCTTCA
CCATACAACAATGACAAAACTAAGACCGAACAGAGTTACGTGCCCTGCTTCTCCAACCAA
ACTGAAACCAGAGGAACACTACTCAATTACTTCAGCAACAACCCTGCCCTTTGCTCGATT
CCACTATACCAACCTCAATCTCTCCATGTTTCTGATCCGGTTCTTACTCAAGAACAATCG
GTTTCTCAAGCCATGTTTGAGAATAACAGAAGGCAGAGCTTCAAAACGTTGAGTGTCTCG
CAGGAAACTGGAGTTTCTAATACCGATATATCATCATCAAATATTGAATTTGGGAGGAAA
GGATTCGATCATCAAGAAGTTCCATCTTCCTCCACCGGTCCGGTCGATCTTGAACCATTC
TGGAGTTACTGAAGATTCAAAAACATCAAAAGTTCATTATCTTAGGTCACAAGTAAGAAG
AACTTCGCAGAAGTTTTATCTTCTAAGCGTGGTGTGCCAAGTTTGTATAGATTATTATTA
TATCAATGCTTCCCACTCTTTAGTATGTTCTATTATTATTATATATTCAACTAATATTTG
ATATTAGAGAG

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL5280Contig1 1276 2 2 U
GGCTTCGTTCTTCAACTGCTCGACTTGGCATCAGTTTCTTGCTCAAGCCTCTTCACTTTT
GCACCTCAATCTCCACTGGTCTGTTTTTTCGCAGTCAAGTTCTCTCATCAATAACAAGTC
TTAGAAAGCTTACGCACTCGTGTTTGTTTTATTAATCTTACCTCTTGGAGTTTCCTCTGA
AAACCATGCTCAGTACTGGTTTTGTGCTCAGCAACCTCTGTTTCAGCCTCTTCCCTGGCT
TGCTTCAGTCTCGCCATTTTTGCTAAAAACCCAAAATATATACATACACAATGATCTAAT
GATAGTCAAACCAAAGACATTAGCTATATGTAACTCAATCAGATGCACGAACTTTATAGT
TTCAGACCGAAGGTACAGAACAGAGCTTGTGATTACCGGTCCTAGCGGCATTGACAATAT
GCTGAGCTTCGTGTTCAGCAGCAAGCAGTTGCTGGACACCCCCATGGTTGATGGTTACTT
GTGGATTCCATGTTTTCTTGAATAAGTTTAAGAATCTATTTATTTATTTTAAGAACAGCA
TAAATCATTTGATTAAGATCATATTAAGTTTGTGAATTTCATAAACTCTGCGAGAAATCG
AACGCGAGCGTCTAGGCATTGTCTAAACGAACTACACAAACATTGTTCTAAAGAGTCAAC
GCAGATCTGGTCAACCCGAGCATATCGGGACACTTTGATTATATATACCAAAATCTGGGG
GAGGGGGAGAAGAAATATATCTACCTGCTTTCAATGGCGAAATTTTAGAGAAGGAGAAGA
CTGAGAGAGATTTGATTAAGGAACGTTTTAGATCATATTTGTATATTTTCAATACAGAAG
TACAAGAAGAGAGCAGAGAAGACAAATGATTTCCCATAATAACATAAGTGTCATGAAACA
CATGCATTCTTTAAATGTCAGGCCATTTCAAATATTAATGGGCCATAAAGTATACACGCG
CCAGACCATTCACCTGAGTTTAAGTGATGCAAGCCACGAGCGTACATGTAAAGTGTTTTA
TTTATTTTTTCCTTTAAGCACTCTTTCATTTGTTTTTTAAATTCCAACTTTTAAACATTT
TTTTTTGTTTTATTAAAAGTATGGTCTTTAGATAGTCTCTCTCTAGTGTTTCAAAAAAAA
AAAAAGATAGTCTCTCTATGTCCGAAATCGGTAATGCACTAATACCAAAAACATAACGGA
AATTGCTTTCTCCACCAGATTTCGAATGAAGAGCACAACCACACCAACATATACAACTAA
ACCAACAGCTTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B446TF U 1
AF RR2B446JQ C 601
BS 1 769 RR2B446TF
BS 770 1276 RR2B446JQ

RD RR2B446TF 769 0 0
GGCTTCGTTCTTCAACTGCTCGACTTGGCATCAGTTTCTTGCTCAAGCCTCTTCACTTTT
GCACCTCAATCTCCACTGGTCTGTTTTTTCGCAGTCAAGTTCTCTCATCAATAACAAGTC
TTAGAAAGCTTACGCACTCGTGTTTGTTTTATTAATCTTACCTCTTGGAGTTTCCTCTGA
AAACCATGCTCAGTACTGGTTTTGTGCTCAGCAACCTCTGTTTCAGCCTCTTCCCTGGCT
TGCTTCAGTCTCGCCATTTTTGCTAAAAACCCAAAATATATACATACACAATGATCTAAT
GATAGTCAAACCAAAGACATTAGCTATATGTAACTCAATCAGATGCACGAACTTTATAGT
TTCAGACCGAAGGTACAGAACAGAGCTTGTGATTACCGGTCCTAGCGGCATTGACAATAT
GCTGAGCTTCGTGTTCAGCAGCAAGCAGTTGCTGGACACCCCCATGGTTGATGGTTACTT
GTGGATTCCATGTTTTCTTGAATAAGTTTAAGAATCTATTTATTTATTTTAAGAACAGCA
TAAATCATTTGATTAAGATCATATTAAGTTTGTGAATTTCATAAACTCTGCGAGAAATCG
AACGCGAGCGTCTAGGCATTGTCTAAACGAACTACACAAACATTGTTCTAAAGAGTCAAC
GCAGATCTGGTCAACCCGAGCATATCGGGACACTTTGATTATATATACCAAAATCTGGGG
GAGGGGGAGAAGAAATATATCTACCTGCTTTCAATGGCGAAATTTTAGA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2B446JQ 676 0 0
AACGCGAGCGTCTAGGCATTGTCTAAACGAACTACACAAACATTGTTCTAAAGAGTCAAC
GCAGATCTGGTCAACCCGAGCATATCGGGACACTTTGATTATATATACCAAAATCTGGGG
GAGGGGGAGAAGAAATATATCTACCTGCTTTCAATGGCGAAATTTTAGAGAAGGAGAAGA
CTGAGAGAGATTTGATTAAGGAACGTTTTAGATCATATTTGTATATTTTCAATACAGAAG
TACAAGAAGAGAGCAGAGAAGACAAATGATTTCCCATAATAACATAAGTGTCATGAAACA
CATGCATTCTTTAAATGTCAGGCCATTTCAAATATTAATGGGCCATAAAGTATACACGCG
CCAGACCATTCACCTGAGTTTAAGTGATGCAAGCCACGAGCGTACATGTAAAGTGTTTTA
TTTATTTTTTCCTTTAAGCACTCTTTCATTTGTTTTTTAAATTCCAACTTTTAAACATTT
TTTTTTGTTTTATTAAAAGTATGGTCTTTAGATAGTCTCTCTCTAGTGTTTCAAAAAAAA
AAAAAGATAGTCTCTCTATGTCCGAAATCGGTAATGCACTAATACCAAAAACATAACGGA
AATTGCTTTCTCCACCAGATTTCGAATGAAGAGCACAACCACACCAACATATACAACTAA
ACCAACAGCTTTTACC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL5281Contig1 1285 2 4 U
GGAAAGGAGAGAATAGAGAGGCGATTTCTCCCTCGTTCTCTTGCCCCGTCAGAAATTTTT
TTTTCCTCAGCCCTTCTCTACCATATTCTTCTGGTGGCCGGCGGTGAGTCTATTCCCGTC
GGTCCGCCATCCCAATTCTCCCCACTGATCCTATTCCTCTCCCTGTCAAGCTAAGGTCTC
TTCACTTCCTCCTTGCTCCTCCTTCTCTGGTTCTCACCGGATTGTGGCCAGATCCGGTGA
CCAAATTGACGATTGGGTGTGTATCCAGTGTCTCTGGAGAGAGGGCGAGGTCGTGGCAGT
CTGTATGCTTTCAGGAGGCGTCGCCGTTTTAGCAGATCTAGGGTTTGTCTTGTGCTGGTT
CTGGGTTAGTTCCTGCACGGAGGCTCACCGGAATGAAGAGCGTCGCTGCCCCCTCTCCTC
CGGTCTTTAGCCTCATCTGATTTCCCTGCCTCTTCCTTCGGCCGCAACTTTAGAGCTTCC
CCGTCTTATTCTCATGGTCTGAGACGAAGCGACGAGACTGAGGAGCTCGTTGGGGACCTC
TCACTTAGTTCAAGCGACAACAACCATGGCTTCCTTTGGTGATGTGTTCGTCTCCTCCTA
TTTGCTACCGATGTCGTCTGCGAGGGTTTGAGGACAACCCGATGTGGTGACTCACTTGTT
CATAGGCGGGGTTCTTTATCGCCTCTGGACTGCCTGTTTTCAAGGAGAGTTATGTCTCCT
TCTGTGCTTTATGCCCTTGTGGTCATTGCTCCGGCGAGTTGACTTAGTGTTTCTTCGGGT
CTATGCTGTATCCTTTGTGTCGCATGGGTGGTGTTGGAGCATGTTGTACCACCTATGCTT
GACCGTAACTCGAGCTTTTGTGTAAGCAGCGTGGATACGGCTGAACTTTTGTCTCTCCGT
CGAGATTGCTAGGTTTTGTTAGTCGAGGTCCTCCTCCAGCGGAGCTCCGGGGCGTAAGCG
AGGCGCTTCCGTCGATGCCTGCTCGGAGCCACTTCGGTGAGTTCTCGACCGAACTTTCTC
TGGCCATTCTCTTGTTTCTTCTGGTTAACTTCAGATTCAGCAAGAAGGCTTTGACTAGGG
TGATTATAGTGTTGTCCTGCTTGATCTTTTACCTATTAATCTCAAGTTCTGTGTTTCAAG
CTTGGAATTAATTTTATGTATCTTAGTGGTTTTTTAATTTTTTTTTGCGGTCACTAGGAT
CAAATCAGCAGCTGTTGCAAATTGTGGTTTCAATTAATTTTGTAAACCAAACTTTCATTT
TCATTAATGATATTTACCATTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF45TF U 1
AF RR2CF45JQ C 521
BS 1 665 RR2CF45TF
BS 666 666 RR2CF45JQ
BS 667 694 RR2CF45TF
BS 695 1285 RR2CF45JQ

RD RR2CF45TF 694 0 0
GGAAAGGAGAGAATAGAGAGGCGATTTCTCCCTCGTTCTCTTGCCCCGTCAGAAATTTTT
TTTTCCTCAGCCCTTCTCTACCATATTCTTCTGGTGGCCGGCGGTGAGTCTATTCCCGTC
GGTCCGCCATCCCAATTCTCCCCACTGATCCTATTCCTCTCCCTGTCAAGCTAAGGTCTC
TTCACTTCCTCCTTGCTCCTCCTTCTCTGGTTCTCACCGGATTGTGGCCAGATCCGGTGA
CCAAATTGACGATTGGGTGTGTATCCAGTGTCTCTGGAGAGAGGGCGAGGTCGTGGCAGT
CTGTATGCTTTCAGGAGGCGTCGCCGTTTTAGCAGATCTAGGGTTTGTCTTGTGCTGGTT
CTGGGTTAGTTCCTGCACGGAGGCTCACCGGAATGAAGAGCGTCGCTGCCCCCTCTCCTC
CGGTCTTTAGCCTCATCTGATTTCCCTGCCTCTTCCTTCGGCCGCAACTTTAGAGCTTCC
CCGTCTTATTCTCATGGTCTGAGACGAAGCGACGAGACTGAGGAGCTCGTTGGGGACCTC
TCACTTAGTTCAAGCGACAACAACCATGGCTTCCTTTGGTGATGTGTTCGTCTCCTCCTA
TTTGCTACCGATGTCGTCTGCGAGGGTTTGAGGACAACCCGATGTGGTGACTCACTTGTT
CATAG*CGGGGTTCTTTATCGCCTCTGGACTGCC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2CF45JQ 765 0 0
AGGAGCTCGTTGGGGACCTCTCACTTAGTTCAAGCGACAACAACCATGGCTTCCTTTGGT
GATGTGTTCGTCTCCTCCTATTTGCTACCGATGTCGTCTGCGAGGGTTTGAGGACAACCC
GATGTGGTGACTCACTTGTTCATAGGCGGGGTTCTTTATCGCCTCTGGACTGCCTGTTTT
CAAGGAGAGTTATGTCTCCTTCTGTGCTTTATGCCCTTGTGGTCATTGCTCCGGCGAGTT
GACTTAGTGTTTCTTCGGGTCTATGCTGTATCCTTTGTGTCGCATGGGTGGTGTTGGAGC
ATGTTGTACCACCTATGCTTGACCGTAACTCGAGCTTTTGTGTAAGCAGCGTGGATACGG
CTGAACTTTTGTCTCTCCGTCGAGATTGCTAGGTTTTGTTAGTCGAGGTCCTCCTCCAGC
GGAGCTCCGGGGCGTAAGCGAGGCGCTTCCGTCGATGCCTGCTCGGAGCCACTTCGGTGA
GTTCTCGACCGAACTTTCTCTGGCCATTCTCTTGTTTCTTCTGGTTAACTTCAGATTCAG
CAAGAAGGCTTTGACTAGGGTGATTATAGTGTTGTCCTGCTTGATCTTTTACCTATTAAT
CTCAAGTTCTGTGTTTCAAGCTTGGAATTAATTTTATGTATCTTAGTGGTTTTTTAATTT
TTTTTTGCGGTCACTAGGATCAAATCAGCAGCTGTTGCAAATTGTGGTTTCAATTAATTT
TGTAAACCAAACTTTCATTTTCATTAATGATATTTACCATTTAGC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5284Contig1 1276 2 2 U
GGACGAGAAGAGAGAGAAAAACAAAATCCTCCCCTCACTTCAAAAGACTTTCAAGCTTCT
TCTCGACTCTGAACAAGCTCCTAAGACCTCAGTCACTTCAAGTGTGACTGTTTTCTTGAT
AGAAAAACAAGGAACGACCTTTTTTAAAAAAATGGCGCATCTACTCTCAGCTTCATGCCC
TTTAGCTATCTCAGTAAGCAGCAGCAGCAGCACCAAGAACTCGGTTAAACCGTTTGGTTT
AAACCAAACCTTCTTCAACCCCCAACTCCCTTCACGCAGCACAACAACGTCATCGGGACT
CTCAACGTCCTCTTTGCTATCAAAGAGTTTCGAGAAGAGTGTCATCTCGTGAAACTGGGA
ACGATGGGGGAGTACGGGACTCCGAATATCGATATCGAGGAAGGTTATATAACGATAACG
CATAACGGTAGGACTGATACGCTGCCGTATCCGAAGCAGGCGAGCTCGTTTTATCATCTT
AGCAAAGTTCACGACTCCCACAACATTGCTTTCACTTGCAAGGCTTGGGGTATTAGAGCT
ACTGATCTTAACCAGGGAGTTGTTTATGGTGTGAAGACTGATGAGACTGAGATGCATGAG
GAGCTGCGTAACCGTTTGGATTATGATGTTGTGTTTGGTACTGCTCTTAACCGGTTCTGT
GTTCAAGCTGCTGTTGGTCACCCACTTACGGTTTATGGTAAAGGTGGTCAGACAAGAGGC
TACCTTGATATTAGAGACACGGTCCAATGTGTTGAGCTAGCTATAGCGAACCCTGCAAAG
GCTGGTGAGTTCAGGGTATTCAACCAATTTACAGAACAGTTCTCAGTCAACGAACTGGCG
TCGCTGGTGACTAAAGCGGGTTCGAAGCTGGGGCTAGACGTGACGAAGATGACGGTGCCT
AACCCGAGAGTGGAGGCGGAAGAGCATTACTACAACGCAAAGCACACTAAGCTGATGGAA
CTTGGACTTGAGCCTCACTATCTCTCTGAGTCACTTCTTGATTCGTTGCTCAACTTTGCT
GTTCAGTTTAAGGATCGTGTGGACACGAAGCAGATCATGCCTAGTGTTTCTTGGAAGAAG
ATTGGCGTCAAGACTAAGTCCATGAACCCCTAAACAGTCGCAGTTTATTATTAGTACTTG
TAAGGGAGATTATTAGATTATATGCGAGAGTTGTGTTTGTTTGTTATCCTTCAAAAATTC
AGTTGTGCTTTAAGGAGTTTGTACTTACGTACTGTGCAGGTTTTTTATTTATTTTAAACC
TCGATGAGCTTTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB73TF U 1
AF RR2EB73JQ C 523
BS 1 686 RR2EB73TF
BS 687 1276 RR2EB73JQ

RD RR2EB73TF 686 0 0
GGACGAGAAGAGAGAGAAAAACAAAATCCTCCCCTCACTTCAAAAGACTTTCAAGCTTCT
TCTCGACTCTGAACAAGCTCCTAAGACCTCAGTCACTTCAAGTGTGACTGTTTTCTTGAT
AGAAAAACAAGGAACGACCTTTTTTAAAAAAATGGCGCATCTACTCTCAGCTTCATGCCC
TTTAGCTATCTCAGTAAGCAGCAGCAGCAGCACCAAGAACTCGGTTAAACCGTTTGGTTT
AAACCAAACCTTCTTCAACCCCCAACTCCCTTCACGCAGCACAACAACGTCATCGGGACT
CTCAACGTCCTCTTTGCTATCAAAGAGTTTCGAGAAGAGTGTCATCTCGTGAAACTGGGA
ACGATGGGGGAGTACGGGACTCCGAATATCGATATCGAGGAAGGTTATATAACGATAACG
CATAACGGTAGGACTGATACGCTGCCGTATCCGAAGCAGGCGAGCTCGTTTTATCATCTT
AGCAAAGTTCACGACTCCCACAACATTGCTTTCACTTGCAAGGCTTGGGGTATTAGAGCT
ACTGATCTTAACCAGGGAGTTGTTTATGGTGTGAAGACTGATGAGACTGAGATGCATGAG
GAGCTGCGTAACCGTTTGGATTATGATGTTGTGTTTGGTACTGCTCTTAACCGGTTCTGT
GTTCAAGCTGCTGTTGGTCACCCACT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2EB73JQ 754 0 0
GCTTGGGGTATTAGAGCTACTGATCTTAACCAGGGAGTTGTTTATGGTGTGAAGACTGAT
GAGACTGAGATGCATGAGGAGCTGCGTAACCGTTTGGATTATGATGTTGTGTTTGGTACT
GCTCTTAACCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTGTTGGTCACCCACTTACGGTTTATGGTAAA
GGTGGTCAGACAAGAGGCTACCTTGATATTAGAGACACGGTCCAATGTGTTGAGCTAGCT
ATAGCGAACCCTGCAAAGGCTGGTGAGTTCAGGGTATTCAACCAATTTACAGAACAGTTC
TCAGTCAACGAACTGGCGTCGCTGGTGACTAAAGCGGGTTCGAAGCTGGGGCTAGACGTG
ACGAAGATGACGGTGCCTAACCCGAGAGTGGAGGCGGAAGAGCATTACTACAACGCAAAG
CACACTAAGCTGATGGAACTTGGACTTGAGCCTCACTATCTCTCTGAGTCACTTCTTGAT
TCGTTGCTCAACTTTGCTGTTCAGTTTAAGGATCGTGTGGACACGAAGCAGATCATGCCT
AGTGTTTCTTGGAAGAAGATTGGCGTCAAGACTAAGTCCATGAACCCCTAAACAGTCGCA
GTTTATTATTAGTACTTGTAAGGGAGATTATTAGATTATATGCGAGAGTTGTGTTTGTTT
GTTATCCTTCAAAAATTCAGTTGTGCTTTAAGGAGTTTGTACTTACGTACTGTGCAGGTT
TTTTATTTATTTTAAACCTCGATGAGCTTTCACC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL5285Contig1 705 2 1 U
GGAAGATCAAACAAAGCAGCGTCGGTTTCAGTTTCTCTCAGAGCTTCAATGGCGAATCCC
AAACCTCACCTCTTCTCTCTCTCCTTCTTCTCACTTCTCCTTCTTCACTTCCCCACCGTC
TCCCTCGCCCAGACGCTCTTCGTCTTCGGCGACGGTCTTTACGACGCCGGCAACAAACAG
TTCGTCTCTTCGAACCGTGTCGACGCTAGCTTTCCTCCCTATGGAATGACTGTCGGAGAA
GCTACTGGACGGTGGTCCGACGGTCGTATCGTTCCCGACTATCTTGCTAATTTCATGGGT
ATTCCTCACATCCCTCCGATTCTCAAGGGCACGGCGGACTTCTCTCACGGAGCTAACTTC
GCCATCGCCGACGCCACCGTCCTCGGCTCCCCTCCGGAGACGTTGACTTTCTCACAACAA
GTGATCAAGTTCTCGGACAGCAAGAACAAGTGGTCAGCTCAAGCACGTTCTGAAGCTGTC
TACTTGTTCTACATCGGCTCTGATGATTACTTGAACTTTGCCAAGAACAATCCCAATCCA
TCTGATGATCAGAAACAAGCTTTTGTAAATCGAGTCATCACTGCTATAGAAGCAGAACTA
AAGTGATTTACGGGTCTGGAGGTAGGAAGTTCGCGTTCCAGAACTTAGCACCATTAGTTG
CTTACCAGCCGTGAAACAAGCAACGGAAACGTTCAGAATTCGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL78TF U 366
AF RR2CO34TF U 1
BS 1 705 RR2CO34TF

RD RR2BL78TF 168 0 0
CGCCGACGCCACCGTCCTCGGCTCCCCTCCTGAGACGTTGACTTTCTCACAACAAGTGAT
CAAGTTCTCGGACAGCAAGAACAAGTGGTCAGCTCAAGCACGTTCTGAAGCTGTCTACTT
GTTCTACATCGGCTCTGATGATTACTTGAACTTTGCCAAGAACAATCC

QA 1 168 1 168
DS 

RD RR2CO34TF 705 0 0
GGAAGATCAAACAAAGCAGCGTCGGTTTCAGTTTCTCTCAGAGCTTCAATGGCGAATCCC
AAACCTCACCTCTTCTCTCTCTCCTTCTTCTCACTTCTCCTTCTTCACTTCCCCACCGTC
TCCCTCGCCCAGACGCTCTTCGTCTTCGGCGACGGTCTTTACGACGCCGGCAACAAACAG
TTCGTCTCTTCGAACCGTGTCGACGCTAGCTTTCCTCCCTATGGAATGACTGTCGGAGAA
GCTACTGGACGGTGGTCCGACGGTCGTATCGTTCCCGACTATCTTGCTAATTTCATGGGT
ATTCCTCACATCCCTCCGATTCTCAAGGGCACGGCGGACTTCTCTCACGGAGCTAACTTC
GCCATCGCCGACGCCACCGTCCTCGGCTCCCCTCCGGAGACGTTGACTTTCTCACAACAA
GTGATCAAGTTCTCGGACAGCAAGAACAAGTGGTCAGCTCAAGCACGTTCTGAAGCTGTC
TACTTGTTCTACATCGGCTCTGATGATTACTTGAACTTTGCCAAGAACAATCCCAATCCA
TCTGATGATCAGAAACAAGCTTTTGTAAATCGAGTCATCACTGCTATAGAAGCAGAACTA
AAGTGATTTACGGGTCTGGAGGTAGGAAGTTCGCGTTCCAGAACTTAGCACCATTAGTTG
CTTACCAGCCGTGAAACAAGCAACGGAAACGTTCAGAATTCGTGA

QA 1 705 1 705
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5287Contig1 629 2 1 U
GGACAGCAATAGGCAGAGAAGAGAAAAACTTTTAAAACAAAACACCAACAAGAGAGGAAA
ATGGGTGAGGGTTTATCCAAACGTGTCCTCACTTTTCTGATATTGATCTCGTTAGTGGCG
GTGGCAATGAACCTTCTGTCCACGGTAGAGGCACAGGATAAGAAGAAGCCGAGGAGAGAT
GTTCCTCTAGTGAAAGGTCTCTCATGGAGCTTTTACCAGAAAGCATGTCCAAAAGTGGAA
AGCATCATCAGGAAAGAGCTCAAGAAAATCTTCAAGAGAGATATTGGTTTAGCCGCAGCC
ATCCTTCGTATACATTTCCATGACTGCTTCGTTCAGGGATGTGAAGCATCCGTGCTGCTA
GATGGATCAGCGAGTGGACCAGGAGAGCAATCATCGATCCCGAATCTGACACTCCGTCAA
GCCGCCTTTGTCGTCATCAATAACCTTCGTGCCCTTGTCCACAAGCAATGTGGTCAAGTC
GTCTCTTGTTCTGACATCCTCGCTCTAGCCGCCCGTGACTCCGTCGTCCTATCAGGAGGG
CCAGACTATGCTGTGCCACTTGGCCGACGTGACTCACTAGCATTCGCGAGCCAGAACACG
ACTTTAAACAACTTACCACCACCTTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA18TF U 111
AF RR2FQ69TF U 1
BS 1 629 RR2FQ69TF

RD RR2CA18TF 162 0 0
GTTAGTGGCGGTGGCAATGAACCTTCTGTCCACGGTAGAGGCACAGGATAAGAAGAAGCC
GAGGAGAGATGTTCCTCTAGTGAAAGGTCTCTCATGGAGCTTTTACCAGAAAGCATGTCC
AAAAGTGGAAAGCATCATCAGGAAAGAGCTCAAGAAAATCTT

QA 1 162 1 162
DS 

RD RR2FQ69TF 629 0 0
GGACAGCAATAGGCAGAGAAGAGAAAAACTTTTAAAACAAAACACCAACAAGAGAGGAAA
ATGGGTGAGGGTTTATCCAAACGTGTCCTCACTTTTCTGATATTGATCTCGTTAGTGGCG
GTGGCAATGAACCTTCTGTCCACGGTAGAGGCACAGGATAAGAAGAAGCCGAGGAGAGAT
GTTCCTCTAGTGAAAGGTCTCTCATGGAGCTTTTACCAGAAAGCATGTCCAAAAGTGGAA
AGCATCATCAGGAAAGAGCTCAAGAAAATCTTCAAGAGAGATATTGGTTTAGCCGCAGCC
ATCCTTCGTATACATTTCCATGACTGCTTCGTTCAGGGATGTGAAGCATCCGTGCTGCTA
GATGGATCAGCGAGTGGACCAGGAGAGCAATCATCGATCCCGAATCTGACACTCCGTCAA
GCCGCCTTTGTCGTCATCAATAACCTTCGTGCCCTTGTCCACAAGCAATGTGGTCAAGTC
GTCTCTTGTTCTGACATCCTCGCTCTAGCCGCCCGTGACTCCGTCGTCCTATCAGGAGGG
CCAGACTATGCTGTGCCACTTGGCCGACGTGACTCACTAGCATTCGCGAGCCAGAACACG
ACTTTAAACAACTTACCACCACCTTTCGC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL5288Contig1 611 2 2 U
AAGTTCGTTGCGCCACAGAGACCTCGACCACAAAGGCCACAAGGGGTTTTGGTCTTTTCT
GTTATGACCTATTCTTCTTCCAGTGCTGCGTGGTGGGCCAGCTATGGATCAAGTCAGCGT
GTTATCCGGAGGGACAAGGGCACACCATGAATGCTAATACATCACAAAAGCTCATCTTTG
GCTTCTGATGGTGTACCAGTGAATGACATGGAAGAGACTCTTATCTTACTTGGATCTCTC
TTAAACGGGACTTACGCTGAGTCTTTCAACGGCTCAAAAGATCTCAAAAGAGGTGTTGAG
ATTGGGTGAGATGTGGGAGAAACACATACTTAAGATCTGTGACGATTGCTTCTTCTACGA
GCAAATTGAGGATTGTAATGAGCCGTTTATTGATTCCTTGAGGGAGTATGATGATGGGAA
GGATCTTTCTATGTATGACTTCAAGCAAGACGAGATTACTTCTCCTACTGATGAACTGGA
CAAGAGGAAACACGCTCTATAGGCATAGAGCCGTTGCGCGTAGATATGAAAAGAAGGTGT
GTCGATGTGGGAATGGTCTGGCTCAGTGTTTGATGAAGGAGAAGAGAAAAGGTTTTCAGA
TTATCTTGGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL66TF U 1
AF RR2AL66JQ C 238
BS 1 403 RR2AL66TF
BS 404 611 RR2AL66JQ

RD RR2AL66TF 408 0 0
AAGTTCGTTGCGCCACAGAGACCTCGACCACAAAGGCCACAAGGGGTTTTGGTCTTTTCT
GTTATGACCTATTCTTCTTCCAGTGCTGCGTGGTGGGCCAGCTATGGATCAAGTCAGCGT
GTTATCCGGAGGGACAAGGGCACACCATGAATGCTAATACATCACAAAAGCTCATCTTTG
GCTTCTGATGGTGTACCAGTGAATGACATGGAAGAGACTCTTATCTTACTTGGATCTCTC
TTAAACGGGACTTACGCTGAGTCTTTCAACGGCTCAAAAGATCTCAAAAGAGGTGTTGAG
ATTGGGTGAGATGTGGGAGAAACACATACTTAAGATCTGTGACGATTGCTTCTTCTACGA
GCAAATTGAGGATTGTAATGAGCCGTTTATTGATTCCTTGAGG
AGTAT

QA 1 403 1 403
DS 

RD RR2AL66JQ 374 0 0
CTCTTAAACGGGACTTACGCTGAGTCTTTCAACGGCTCAAAAGATCTCAAAAGAGGTGTT
GAGATTGG*TGAGATGTGGGAGAAACACATACTTAAGATCTGTGACGATTGCTTCTTCTA
CGAGCAAATTGAGGATTGTAATGAGCCGTTTATTGATTCCTTGAGGGAGTATGATGATGG
GAAGGATCTTTCTATGTATGACTTCAAGCAAGACGAGATTACTTCTCCTACTGATGAACT
GGACAAGAGGAAACACGCTCTATAGGCATAGAGCCGTTGCGCGTAGATATGAAAAGAAGG
TGTGTCGATGTGGGAATGGTCTGGCTCAGTGTTTGATGAAGGAGAAGAGAAAAGGTTTTC
AGATTATCTTGGAA

QA 1 374 1 374
DS 



AS 1 2

CO CL5289Contig1 973 2 2 U
GGGGCGAAGCACAACAACACATACGCCGCCGATAAAATGGCTAACGACAATTGTTAACAG
CTTTTGGAAACAACCAGAGACAAAGACAACTGCTCGATTAGGAAGATCGATCGTGATGAT
GAGTAGTCAGGGGACGGGTTTCTTCAACATCAGGGAGGAGGAGCACCACCACGACTGTAC
GGCGAGCCTCAAAGAAATCAGAGAACGGAAGCGTCGTCAATGGTGGGAACGCCTCAAAAC
CAAACTCACCTCCTTCTCAACCTCTCTCTAGTAGCGTTGAGAGAACAGTTAAGAAGCTTC
GGTTATCCAAAGCTCTCACCATCCCCGAAGATCTAAAGGGACGTGTGCATCGTTTTACTT
CTTCTGCTGAGAACCTGGAAGAGCTGATGGGTATTGTGATGCAAAGAATCGGTAGTGACA
TCAATGATGTGGAACAACGGCCTCAGATTATATATGAGGATGATGAAGGTGATAAGGTTT
TGATTACATCGGATAGTGATTTGGTTGGTGCTGTTACTCTTGCTAGGTCTGCAGGACAAA
AGGTATTGAGGCTGCATCTGGACTTTACAGAGACAGGAGGAACAAGGAGCTTGAGCTTGG
AAACGGGTCAACTCAAGAAAGCGAATACTACTACAGAGAGAGAAAGAGGTGGATGGGTTA
CATGGCGTGGTGGTGCGGTGGTTACAGGAGCTGTTGTGCTAACGAGCATAGCTGTTGTTG
TTTACTTGAAACGCTCAAAGATGTGATCAAAACTCTCTGGAAGGCATAAGTCTTTTCTAC
TTTCTGTTTTTGGTTAGTTTCATACATGTTGTCTCTTTTGCCATACGAAAAGAGAAACTT
TATTTCACTAAAGATATTTATTAAATTATTGGGGGGCCGACACCCCTATTCAGATGAGAA
TATTAGATTTGACAGAGTTAATGTAAAACCTCTGAAACCGAGAAAATAAAAGCAGATGAT
GTTGTTGCACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV86TF U 1
AF RR2DV86JQ C 369
BS 1 530 RR2DV86TF
BS 531 973 RR2DV86JQ

RD RR2DV86TF 530 0 0
GGGGCGAAGCACAACAACACATACGCCGCCGATAAAATGGCTAACGACAATTGTTAACAG
CTTTTGGAAACAACCAGAGACAAAGACAACTGCTCGATTAGGAAGATCGATCGTGATGAT
GAGTAGTCAGGGGACGGGTTTCTTCAACATCAGGGAGGAGGAGCACCACCACGACTGTAC
GGCGAGCCTCAAAGAAATCAGAGAACGGAAGCGTCGTCAATGGTGGGAACGCCTCAAAAC
CAAACTCACCTCCTTCTCAACCTCTCTCTAGTAGCGTTGAGAGAACAGTTAAGAAGCTTC
GGTTATCCAAAGCTCTCACCATCCCCGAAGATCTAAAGGGACGTGTGCATCGTTTTACTT
CTTCTGCTGAGAACCTGGAAGAGCTGATGGGTATTGTGATGCAAAGAATCGGTAGTGACA
TCAATGATGTGGAACAACGGCCTCAGATTATATATGAGGATGATGAAGGTGATAAGGTTT
TGATTACATCGGATAGTGATTTGGTTGGTGCTGTTACTCTTGCTAGGTCT

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2DV86JQ 605 0 0
GAGAACCTGGAAGAGCTGATGGGTATTGTGATGCAAAGAATCGGTAGTGACATCAATGAT
GTGGAACAACGGCCTCAGATTATATATGAGGATGATGAAGGTGATAAGGTTTTGATTACA
TCGGATAGTGATTTGGTTGGTGCTGTTACTCTTGCTAGGTCTGCAGGACAAAAGGTATTG
AGGCTGCATCTGGACTTTACAGAGACAGGAGGAACAAGGAGCTTGAGCTTGGAAACGGGT
CAACTCAAGAAAGCGAATACTACTACAGAGAGAGAAAGAGGTGGATGGGTTACATGGCGT
GGTGGTGCGGTGGTTACAGGAGCTGTTGTGCTAACGAGCATAGCTGTTGTTGTTTACTTG
AAACGCTCAAAGATGTGATCAAAACTCTCTGGAAGGCATAAGTCTTTTCTACTTTCTGTT
TTTGGTTAGTTTCATACATGTTGTCTCTTTTGCCATACGAAAAGAGAAACTTTATTTCAC
TAAAGATATTTATTAAATTATTGGGGGGCCGACACCCCTATTCAGATGAGAATATTAGAT
TTGACAGAGTTAATGTAAAACCTCTGAAACCGAGAAAATAAAAGCAGATGATGTTGTTGC
ACTAC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5292Contig1 1050 2 2 U
GGAGTTCGATACACTGTGTCACACACCTAACAAAGCTGATGGCTTCATCGGATCAAACGG
CGAAGATAATCGATGGGAAGGCGATTGCTCAAACCATCCGATCAGAGATCGCCGAGGAAG
TTCGCGATCTATCTGAGAAACACGGCAAGGTCCCAGGACTAGCGGTAGTTATAGTAGGGG
CACGGAAAGATTCACAGACTTATGTGACTATGAAGAGGAAAGCGTGTGCTGAGGTTGGGA
TCAAATCATTTGATGCGGACCTACCAGAGGATGTTTCTGAAGCTGATCTTATAACCAAAG
TTCATCTACTCAATTCAGATCCTGATGTCCATGGTATATTAGTTCAACTCCCATTGCCGA
AACATATTAATGAGGAGAATGTTTTAAGTGCAATCAGCATTGATAAAGATGTAGATGGCT
TCCACCCTCTGAATATTGGTAAGCTAGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCCGT
GCACCCCTAAGGGATGTTTGGAACTCTTAGTAAGAAGTGGCATAACGATAAAAGGGCAAC
GAGCTGTTGTAGTAGGTCGGAGCAACATTGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTCTACTGCTCA
AGGCTGATGCTACTGTTACCACCGTACATTCCCACACCAGAGATCCTGAGGCTATCATAC
GGGAAGCTGACATCGTTATTGCTGCAGCCGGACAAGCCTGCATGATTAAGGGGGACTGGA
TTAAACCAGGGGCTGCGGTGATCGATGTTGGAACCAATGCAGTCAGCGACCCGAGCAGGA
AATCAGGATACCGGTTGGTTGGAGATGTGGATTACGCAGAGGCTTGTAAAGTTGCAGGGT
TCATAACTCCGGTTCCTGGTGGTGTTGGTCCAATGACCGTGGCAATGCTGCTTAGGAACC
CCTTAGACGGCGCAAAGCGGGTCATTGGCCACTAAGATATCCATCCTACTGTATATTATA
AATGAAATTCAAAGTTTATCCATTATACAATTACGCTCTCGCTTTGATAACATAATTATT
CCTCTCAAATAAATTGAAGTTTGCCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK77TF U 1
AF RR2BK77JQ C 428
BS 1 596 RR2BK77TF
BS 597 1050 RR2BK77JQ

RD RR2BK77TF 596 0 0
GGAGTTCGATACACTGTGTCACACACCTAACAAAGCTGATGGCTTCATCGGATCAAACGG
CGAAGATAATCGATGGGAAGGCGATTGCTCAAACCATCCGATCAGAGATCGCCGAGGAAG
TTCGCGATCTATCTGAGAAACACGGCAAGGTCCCAGGACTAGCGGTAGTTATAGTAGGGG
CACGGAAAGATTCACAGACTTATGTGACTATGAAGAGGAAAGCGTGTGCTGAGGTTGGGA
TCAAATCATTTGATGCGGACCTACCAGAGGATGTTTCTGAAGCTGATCTTATAACCAAAG
TTCATCTACTCAATTCAGATCCTGATGTCCATGGTATATTAGTTCAACTCCCATTGCCGA
AACATATTAATGAGGAGAATGTTTTAAGTGCAATCAGCATTGATAAAGATGTAGATGGCT
TCCACCCTCTGAATATTGGTAAGCTAGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCCGT
GCACCCCTAAGGGATGTTTGGAACTCTTAGTAAGAAGTGGCATAACGATAAAAGGGCAAC
GAGCTGTTGTAGTAGGTCGGAGCAACATTGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTCTACTG

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2BK77JQ 623 0 0
TCTGAATATTGGTAAGCTAGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCCGTGCACCCC
TAAGGGATGTTTGGAACTCTTAGTAAGAAGTGGCATAACGATAAAAGGGCAACGAGCTGT
TGTAGTAGGTCGGAGCAACATTGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTTTACTGCTCAAGGCTGA
TGCTACTGTTACCACCGTACATTCCCACACCAGAGATCCTGAGGCTATCATACGGGAAGC
TGACATCGTTATTGCTGCAGCCGGACAAGCCTGCATGATTAAGGGGGACTGGATTAAACC
AGGGGCTGCGGTGATCGATGTTGGAACCAATGCAGTCAGCGACCCGAGCAGGAAATCAGG
ATACCGGTTGGTTGGAGATGTGGATTACGCAGAGGCTTGTAAAGTTGCAGGGTTCATAAC
TCCGGTTCCTGGTGGTGTTGGTCCAATGACCGTGGCAATGCTGCTTAGGAACCCCTTAGA
CGGCGCAAAGCGGGTCATTGGCCACTAAGATATCCATCCTACTGTATATTATAAATGAAA
TTCAAAGTTTATCCATTATACAATTACGCTCTCGCTTTGATAACATAATTATTCCTCTCA
AATAAATTGAAGTTTGCCTGTCC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL5293Contig1 1218 2 10 U
GTATCTCTCCTCTAATATGATTAGGCATTCGATGAAACTTCTTGGCCAACAAGCAAGGCG
GGTTCAGCCTTCCAACATTGCTCCTCCTAACTCCATTCGCCACGCCGGAACCCTAGTTTC
TCCTCTCCGTAACAACAACCCTTTGCTGCTTCGTATCGCTACAGCTCTAGATCAGAAGAC
ACCGGTCATTCAAGCCCTAGAGCAATGGAGAGAACAAGGTAATCAAGTCAAGCCTTCTGA
CCTAAGATGCATCATCGTGTCTATACTCTGTTTCCGGAAGATGTTGCATCTAGGGTTCTG
TTGATAGATACTGTTCTAGGTCTGAAAGAAGCAGAGAGGTTCTTCGAAACCATCCCTGAG
AACATGAAGGACTACACAGTCTACACAACTCTGTTAACCTTGTACGCAAGAAACAACAAC
ACTCTTGATAAAGCAGAAGCTGTTTTCGAGAAGATGAGAGAGCTAGGTTTCCTCTTGAAA
CCAACCCCATACAACCTATGCTATCTCTCTACAGTCCACTGAAACGCCACGATGATGTCA
ACAACCTCCTGAGCGAGATGGAAGACAACAACGTCGAGCCGGATGACCTCACAGCGAACC
ACGCACTCTTGGTCTACGCAGCTGTATCCGACATCAAGGCCATGGAGAAGTTTCTGCGCA
GCAACCAGAGAATCAAACTGGAGTGGGGAACGTGCATTGACATGGCAAAGGCTTACTTGA
AGTCAGGTTCAACCGAAAAGTGCTTAGCGATGCTGCATAGAACAGAGCTGTTGGTTGATT
GTGCGTCAAGGAAGCCGGCTTACGAGGCGCTGATGAGTGTGTATGGAGACGTGGGAGAGA
GAGAGGATGTGTATAGGATTTGGGAGCTTCACAAGAACGCGGGTTCGAGTAACGAAGGGT
ATAGAGCTGTGATAAGCGCGCTCTCGAGTATAGGAGACATGGAAGGTGCAGAGGTGATAT
ATAGAGAGTGGGAGCTTGGAGGTCTCCCGTTTCGATGCTAGCATCCCTAATACTTTGATC
TCTGGATATCATGCTTTGGGGATGGAGAGAAGACTAAGAAACTAATCAAACATTGATGAA
GTCCATTGTCTCGAGTGTGCAATGTTATGACTCTCATGTGAAGACCTCTTATGTAGTTTT
CCAAATTTTTTTTTAAGAAATCGTATAACCATTAGTTAAAGCTCTTTCAAGAAAAAAGTA
TCCATCTTTTGTCGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D059TF U 1
AF RR2D059JQ C 607
BS 1 638 RR2D059TF
BS 639 639 RR2D059JQ
BS 640 710 RR2D059TF
BS 711 711 RR2D059JQ
BS 712 726 RR2D059TF
BS 727 727 RR2D059JQ
BS 728 738 RR2D059TF
BS 739 739 RR2D059JQ
BS 740 789 RR2D059TF
BS 790 1218 RR2D059JQ

RD RR2D059TF 789 0 0
GTATCTCTCCTCTAATATGATTAGGCATTCGATGAAACTTCTTGGCCAACAAGCAAGGCG
GGTTCAGCCTTCCAACATTGCTCCTCCTAACTCCATTCGCCACGCCGGAACCCTAGTTTC
TCCTCTCCGTAACAACAACCCTTTGCTGCTTCGTATCGCTACAGCTCTAGATCAGAAGAC
ACCGGTCATTCAAGCCCTAGAGCAATGGAGAGAACAAGGTAATCAAGTCAAGCCTTCTGA
CCTAAGATGCATCATCGTGTCTATACTCTGTTTCCGGAAGATGTTGCATCTAGGGTTCTG
TTGATAGATACTGTTCTAGGTCTGAAAGAAGCAGAGAGGTTCTTCGAAACCATCCCTGAG
AACATGAAGGACTACACAGTCTACACAACTCTGTTAACCTTGTACGCAAGAAACAACAAC
ACTCTTGATAAAGCAGAAGCTGTTTTCGAGAAGATGAGAGAGCTAGGTTTCCTCTTGAAA
CCAACCCCATACAACCTATGCTATCTCTCTACAGTCCACTGAAACGCCACGATGATGTCA
ACAACCTCCTGAGCGAGATGGAAGACAACAACGTCGAGCCGGATGACCTCACAGCGAACC
ACGCACTCTTGGTCTACGCAGCTGTATCCGACATCAAG*CCATGGAGAAGTTTCTGCGCA
GCAACCAGAGAATCAAACTGGAGTGGGGAACGTGCATTGACATGGCAAAG*CTTACTTGA
AGTCAG*TTCAACCGAAA*GTGCTTAGCGATGCTGCATAGAACAGAGCTGTTGGTTGATT
GTGCGTCAA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2D059JQ 612 0 0
TCTTGGTCTACGCAGCTGTATCCGACATCAAGGCCATGGAGAAGTTTCTGCGCAGCAACC
AGAGAATCAAACTGGAGTGGGGAACGTGCATTGACATGGCAAAGGCTTACTTGAAGTCAG
GTTCAACCGAAAAGTGCTTAGCGATGCTGCATAGAACAGAGCTGTTGGTTGATTGTGCGT
CAAGGAAGCCGGCTTACGAGGCGCTGATGAGTGTGTATGGAGACGTGGGAGAGAGAGAGG
ATGTGTATAGGATTTGGGAGCTTCACAAGAACGCGGGTTCGAGTAACGAAGGGTATAGAG
CTGTGATAAGCGCGCTCTCGAGTATAGGAGACATGGAAGGTGCAGAGGTGATATATAGAG
AGTGGGAGCTTGGAGGTCTCCCGTTTCGATGCTAGCATCCCTAATACTTTGATCTCTGGA
TATCATGCTTTGGGGATGGAGAGAAGACTAAGAAACTAATCAAACATTGATGAAGTCCAT
TGTCTCGAGTGTGCAATGTTATGACTCTCATGTGAAGACCTCTTATGTAGTTTTCCAAAT
TTTTTTTTAAGAAATCGTATAACCATTAGTTAAAGCTCTTTCAAGAAAAAAGTATCCATC
TTTTGTCGTTCC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL5294Contig1 243 2 2 U
GGCCGACCAAACTTTCCGTCTTTAACTCTCAAGAGGGTAAAACATGGACGCAGCCGCGAC
CGCGAGTTTGATCCGATCTCCCGTCTTACCGCGTAAAACTCCCGACAACGGTGCTGGATC
TATGTTCCTCACAGCCAGTGGCCTTGGGTTCACGCGTTTTGGTCCGGGACGTCAACTTCG
TTTCAAGCAAAACGCGTTTGCTAGATTCTCAAGGTTGAGGACGTACGTGATGTCGTTTGA
TAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2E611TF U 1
AF RR2E611JQ C 1
BS 1 168 RR2E611TF
BS 169 243 RR2E611JQ

RD RR2E611TF 168 0 0
GGCCGACCAAACTTTCCGTCTTTAACTCTCAAGAGGGTAAAACATGGACGCAGCCGCGAC
CGCGAGTTTGATCCGATCTCCCGTCTTACCGCGTAAAACTCCCGACAACGGTGCTGGATC
TATGTTCCTCACAGCCAGTGGCCTTGGGTTCACGCGTTTTGGTCCGGG

QA 1 168 1 168
DS 

RD RR2E611JQ 243 0 0
GGCCGACCAAACTTTCCGTCTTTAACTCTCAAGAGGGTAAAACATGGACGCAGCCGCGAC
CGGGAGTTTGATCCGATCTCCCGTCTTACCGCGTAAAACTCCCGACAACGGTGCTGGATC
TATGTTCCTCACAGCCAGTGGCCTTGGGTTCACGCGTTTTGGTCCGGGACGTCAACTTCG
TTTCAAGCAAAACGCGTTTGCTAGATTCTCAAGGTTGAGGACGTACGTGATGTCGTTTGA
TAG

QA 1 243 1 243
DS 



AS 1 2

CO CL5295Contig1 1218 2 2 U
GGGAAGTGACCTTGGCGGAGAAATTAGGGTTTTGGTTACAGAAGTTTCTCCAATGTTTCT
CCGACGTTTCTTCAAAACTCCTCAGATCTCCTCCTCTGTGGAGAGGATCAGAACCATCTC
TAGCTCCCTTCACGCTACTCCTTCTGCTCCTTCGACCCCTGCTCTAAAACGGAAGCTTTT
TGCCAATCTTAAATCATCAGAGAAACCATGTGACGACGTTCTGAGAGATATGGAAGAGCA
AGGATTTCAGATATATCAAGCCGATCTGATTCGCTGGGCAGATCTACTGGAAAAGCAAGG
CCAAGAAAAAAAATATTTTGAGATCCATTCCTTTATGGAGTGGAAAGGTAGACTTATGGT
GAATAAGTCTGTTCTTCGTCCTGCTGGAAATCAATCTTCTGAGTTTGTTGGAAGAAGCAC
TTTCGGAAGGGTTGCTAAAACCATCGCTCCTTCTGTTGTCAATATTGATGGACCTAACGA
CGGTTATGGCTCTGGGATTTTGTTTGGGGGAGAAGGCAAAATAATAACTTGTGGTCATTT
CGTCCTCAACCCCCACAAGTTTAGAACGAGTCATGTCTATCGTTCCAAGCGAATGGAGGT
AAAGATCACATTGAACTGTGGTCAAACGTTTCGAGGAGTTGTTGCTGATTATGATGCAGA
TTATGATCTTGCACTAGTCAAGATTGAGGCACCAACGAAAGCATCATTCTCTCCTGCAAA
GTTTGGAGTCTCAAAGGATGTGTCTGTTGGGGATATGGTGCTGTCCATTGGCAATCCTCT
TGAGTTTGCAAACAGTTTCTCAGCAGGGATAATCAGTTGTGTTAAACGCACAAACAAGGA
AATTGGCTTAGAAGGCAAATGCCAATTCTATTTCCAAACTGATTGTGCTTTGAATGAGGG
TAACTCTGGAGGTCCGGTTGTTAACCTAGACGGTGAGGTCATTGCCGTGAATTGCGCATT
TGGGAGCGGAGTGGGTGTTGGGTTTGCAATACCCATAGACACAGTACTGAAGGTCATGAA
GGAGAGAAACTGGTAGCCCATAGACAGTGCTAAAGGTCATTAAGGAGAGAAACTGGTAGA
TTTTAGGATTTAAAACTCTTTATGTGGTACTTTGAATGCTCTTAATGTTTTGTTTCTATC
ACTGTCAACTTAATAACCTTCTTTAACACGAGTTGGAGACAACCGACTTTTTGCATGACT
ATATAAATTAAGTATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E694TF U 1
AF RR2E694JQ C 546
BS 1 669 RR2E694TF
BS 670 1218 RR2E694JQ

RD RR2E694TF 669 0 0
GGGAAGTGACCTTGGCGGAGAAATTAGGGTTTTGGTTACAGAAGTTTCTCCAATGTTTCT
CCGACGTTTCTTCAAAACTCCTCAGATCTCCTCCTCTGTGGAGAGGATCAGAACCATCTC
TAGCTCCCTTCACGCTACTCCTTCTGCTCCTTCGACCCCTGCTCTAAAACGGAAGCTTTT
TGCCAATCTTAAATCATCAGAGAAACCATGTGACGACGTTCTGAGAGATATGGAAGAGCA
AGGATTTCAGATATATCAAGCCGATCTGATTCGCTGGGCAGATCTACTGGAAAAGCAAGG
CCAAGAAAAAAAATATTTTGAGATCCATTCCTTTATGGAGTGGAAAGGTAGACTTATGGT
GAATAAGTCTGTTCTTCGTCCTGCTGGAAATCAATCTTCTGAGTTTGTTGGAAGAAGCAC
TTTCGGAAGGGTTGCTAAAACCATCGCTCCTTCTGTTGTCAATATTGATGGACCTAACGA
CGGTTATGGCTCTGGGATTTTGTTTGGGGGAGAAGGCAAAATAATAACTTGTGGTCATTT
CGTCCTCAACCCCCACAAGTTTAGAACGAGTCATGTCTATCGTTCCAAGCGAATGGAGGT
AAAGATCACATTGAACTGTGGTCAAACGTTTCGAGGAGTTGTTGCTGATTATGATGCAGA
TTATGATCT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2E694JQ 673 0 0
TCAACCCCCACAAGTTTAGAACGAGTCATGTCTATCGTTCCAAGCGAATGGAGGTAAAGA
TCACATTGAACTGTGGTCAAACGTTTCGAGGAGTTGTTGCTGATTATGATGCAGATTATG
ATCTTGCACTAGTCAAGATTGAGGCACCAACGAAAGCATCATTCTCTCCTGCAAAGTTTG
GAGTCTCAAAGGATGTGTCTGTTGGGGATATGGTGCTGTCCATTGGCAATCCTCTTGAGT
TTGCAAACAGTTTCTCAGCAGGGATAATCAGTTGTGTTAAACGCACAAACAAGGAAATTG
GCTTAGAAGGCAAATGCCAATTCTATTTCCAAACTGATTGTGCTTTGAATGAGGGTAACT
CTGGAGGTCCGGTTGTTAACCTAGACGGTGAGGTCATTGCCGTGAATTGCGCATTTGGGA
GCGGAGTGGGTGTTGGGTTTGCAATACCCATAGACACAGTACTGAAGGTCATGAAGGAGA
GAAACTGGTAGCCCATAGACAGTGCTAAAGGTCATTAAGGAGAGAAACTGGTAGATTTTA
GGATTTAAAACTCTTTATGTGGTACTTTGAATGCTCTTAATGTTTTGTTTCTATCACTGT
CAACTTAATAACCTTCTTTAACACGAGTTGGAGACAACCGACTTTTTGCATGACTATATA
AATTAAGTATATT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL5296Contig1 1185 2 4 U
GGATTCTAAACCAAACAACAGATTCACATAATCATCTCTCTATCTTTCCTCTTTAAGAAA
GGAACTAGATCAAAGCTTCCAAGTTATAACAAGATGGGTATTGTCGGCTTCTTCTTTATA
GTTATTGTCGGAGTAATGACGTCAAGCGTGAATGGCTATGATGGCGGTTGGGTGAACGCA
CACGCCACATTCTACGGCGGTGGTGATGCCTCCGGCACCATGGGTGGTGCTTGTGGGTAC
GGAAACCTTTATAGCCAAGGCTATGGAACCAACACAGCAGCACTGAGCACTGCTCTATTT
AACAACGGGCTGAGCTGTGGCGCTTGCTTCGAAATAAGATGTCAGAACGACGGGAAATGG
TGTCTCCCTGGTTCAATCGTCGTCACGGCGACTAACTTTTGCCCTCCAAACAACGCTTTA
CCTAACAACGCGGGAGGCTGGTGTAACCCTCCTCAGCAGCATTTCGATCTCTCCCAGCCT
GTATTTCAACGCATCGCTCAATACAAAGCTGGCATTGTCCCCGTCGCTTACAGAAGAGTG
CCATGCGTGAGAAGGGGAGGAATAAGGTTTACAATAAACGGACATTCTTACTTCAACCTT
GTTCTGATTACGAACGTAGGAGGAGCCGGAGATGTTCACTCCGCGTGGGTTAAAGGGTCA
AGAACCGGATGGCAAGCCATGTCTAGAAACTGGGGACAAAACTGGCAGAGCAACTCTTAC
CTAAACGGACAAGCTCTTTCTTTCAAAGTCACAACGAGCGATGGTCGCACCATCGTATCT
AACAACGTCGCTTCTGCAGGCTGGTCCTTCGGCCAGACCTTCAGCGGAGCACAGATATAA
GATTTGACTACGTGAAAACAAGCGGTTTTTGTGTGGTGTTTGCAGTAGTAGAAAGCTTAG
AGGGTCATATTAGTAATTTGGTACGTTATTTCAGTTTACACCTAAAAAGAAGGTGATGCT
TCGAGTGCTTGATTTTCCACAAGGCCTTGATGACGTCATCTTTTGGGACATGTGTTTCAT
TTGTTTGGTAAGGTTTGGTTTAAAGTTTTACTGATGCAGAGGTGGAGTTAAGTACCACCC
GCTAGTAGTAAAGTTGCGTTTGTTATCCCCCTCTTGAAGCAAGAGGGAGAGTTTCATGTT
TCAAGAATTGTTCGATTTGCATTCTTTCCTAGTCATCTATGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H176TF U 1
AF RR2H176JQ C 483
BS 1 635 RR2H176TF
BS 636 636 RR2H176JQ
BS 637 651 RR2H176TF
BS 652 1185 RR2H176JQ

RD RR2H176TF 651 0 0
GGATTCTAAACCAAACAACAGATTCACATAATCATCTCTCTATCTTTCCTCTTTAAGAAA
GGAACTAGATCAAAGCTTCCAAGTTATAACAAGATGGGTATTGTCGGCTTCTTCTTTATA
GTTATTGTCGGAGTAATGACGTCAAGCGTGAATGGCTATGATGGCGGTTGGGTGAACGCA
CACGCCACATTCTACGGCGGTGGTGATGCCTCCGGCACCATGGGTGGTGCTTGTGGGTAC
GGAAACCTTTATAGCCAAGGCTATGGAACCAACACAGCAGCACTGAGCACTGCTCTATTT
AACAACGGGCTGAGCTGTGGCGCTTGCTTCGAAATAAGATGTCAGAACGACGGGAAATGG
TGTCTCCCTGGTTCAATCGTCGTCACGGCGACTAACTTTTGCCCTCCAAACAACGCTTTA
CCTAACAACGCGGGAGGCTGGTGTAACCCTCCTCAGCAGCATTTCGATCTCTCCCAGCCT
GTATTTCAACGCATCGCTCAATACAAAGCTGGCATTGTCCCCGTCGCTTACAGAAGAGTG
CCATGCGTGAGAAGGGGAGGAATAAGGTTTACAATAAACGGACATTCTTACTTCAACCTT
GTTCTGATTACGAACGTAGGAGGAGCCGGAGATGT*CACTCCGCGTGGGTT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2H176JQ 703 0 0
ATTTCAACGCATCGCTCAATACAAAGCTGGCATTGTCCCCGTCGCTTACAGAAGAGTGCC
ATGCGTGAGAAGGGGAGGAATAAGGTTTACAATAAACGGACATTCTTACTTCAACCTTGT
TCTGATTACGAACGTAGGAGGAGCCGGAGATGTTCACTCCGCGTGGGTTAAAGGGTCAAG
AACCGGATGGCAAGCCATGTCTAGAAACTGGGGACAAAACTGGCAGAGCAACTCTTACCT
AAACGGACAAGCTCTTTCTTTCAAAGTCACAACGAGCGATGGTCGCACCATCGTATCTAA
CAACGTCGCTTCTGCAGGCTGGTCCTTCGGCCAGACCTTCAGCGGAGCACAGATATAAGA
TTTGACTACGTGAAAACAAGCGGTTTTTGTGTGGTGTTTGCAGTAGTAGAAAGCTTAGAG
GGTCATATTAGTAATTTGGTACGTTATTTCAGTTTACACCTAAAAAGAAGGTGATGCTTC
GAGTGCTTGATTTTCCACAAGGCCTTGATGACGTCATCTTTTGGGACATGTGTTTCATTT
GTTTGGTAAGGTTTGGTTTAAAGTTTTACTGATGCAGAGGTGGAGTTAAGTACCACCCGC
TAGTAGTAAAGTTGCGTTTGTTATCCCCCTCTTGAAGCAAGAGGGAGAGTTTCATGTTTC
AAGAATTGTTCGATTTGCATTCTTTCCTAGTCATCTATGTTGC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL5297Contig1 1479 2 4 U
GGACCCACCATATATCATTCTTAAATCTGTCCCTTAGCGGCTAAGCAAAAACACCGCACC
GTCGAAATCTCAGATCCCTCTCTCTCTCTTTTTTCCTGTTTGATAATTTTGCAGAAAGTT
TTAATATCTCAATCCCAATCTCTCTCTACCTATGGAGGATGTTACAATGAAGAACGCTGA
GCTACATGAAGAAATCTCCGACAAGTTTCTCTGCTGCGTCTGCCTGGAACTCCTTTACAA
ACCGATTGTGCTATCATGTGGTCACCTATCGTGTTTCTGGTGCGTACATAAGTCAATGAA
CGAGCTGCGCGAGTCTCATTGTCCAATTTGTAGAGACCCTTATGTTCACTTTCCTGCTGT
CTGCCAAAAGCTCCACTTCCTCCTCAAGAAGATTTACCCTCTTGCCCACCACAAGAGAGA
AGAACAAGTTCTAAAGGAGGGACAAGAACTAGAATGTTTTTCACCTCAGATTGATGAACC
AAAGGCTAATGAAGAGACTGTATCTAGTGGAGATGCAAAAGCTCTTCTTGGTGAGAATAA
TAATAAAGTCAGTAAGCAAATTTCGAAAGATGATTTGCTCTGTTCAGCATGTAAGGAGCT
GCTTGTGCGACCCGTTGTTCTCAACTGCGGACATGTGTATTGTGAAGTATGTGTAGTAGA
TATGTTCCAAGAAGGCGAAAAGATCAAATGCCAAGAGTGTCATATCTCTGACCCGAGAGG
GTTTCCGAAAGTTTGTTTGGTTCTTGAGCAGCTCTTGGAGGAGAACTTTCCCGAAGAGTA
CAATTCAAGGAGAAGTGGGATTCAGAAATCGATTCCCCAGACTAGCAAAGGAAACATTCA
AAGCTCTCACAAAGAAGGCCCATCCGTATCAGGCGAGAACAACAATGATCTTCCCTGGTG
GGCGAACCCTGCGTCTAATGTTCACATCGGAGCTGGTTGTGATTGTTGCGGAGTGTATCC
AATCATAGGGGAGCGATACAGATGCAAAGACTGCAAGGAAGAGATTGGTTATGACCTATG
CAAAGACTGTTACGAGACTCCTTCGAAAGTTCCAGGGAGATTCAACCAACAGCACACCCC
AGACCACAGGCTTGAGCTCGCTCAGGTTCCTCAGTTTCTGGTCAATATCGAGTCTATCGG
CTTCCTTCTAGGTCCGATGGTTAGTGAAGGCGTGAGTGGAGAAGAAGATAGTGATGATGA
TGATGATAGCGGGGAGGAAGATGTGCCTCCTCCTGATTCTAATGAGGTATCGTCAAGCGC
TGACTGAAACTGCAGTCTTGAGTATGTTGGAATCTTGAAGCATGGTCTGCGTTTGTGTTT
GCATATTTTCTTTTTAAAAGTATGGTTTTTAAACAAAGTTTGTTAATTTATAAACATAAA
ACGCAAACAAAAACAAAAACAAAGTCTTATGTTTTCATTTGGTTGCTTATGTATTTTGCA
ATAATATTTTATAAAAGAACTGAAAACTAATTTTTGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH46TF U 1
AF RR2DH46JQ C 605
BS 1 764 RR2DH46TF
BS 765 765 RR2DH46JQ
BS 766 782 RR2DH46TF
BS 783 1479 RR2DH46JQ

RD RR2DH46TF 782 0 0
GGACCCACCATATATCATTCTTAAATCTGTCCCTTAGCGGCTAAGCAAAAACACCGCACC
GTCGAAATCTCAGATCCCTCTCTCTCTCTTTTTTCCTGTTTGATAATTTTGCAGAAAGTT
TTAATATCTCAATCCCAATCTCTCTCTACCTATGGAGGATGTTACAATGAAGAACGCTGA
GCTACATGAAGAAATCTCCGACAAGTTTCTCTGCTGCGTCTGCCTGGAACTCCTTTACAA
ACCGATTGTGCTATCATGTGGTCACCTATCGTGTTTCTGGTGCGTACATAAGTCAATGAA
CGAGCTGCGCGAGTCTCATTGTCCAATTTGTAGAGACCCTTATGTTCACTTTCCTGCTGT
CTGCCAAAAGCTCCACTTCCTCCTCAAGAAGATTTACCCTCTTGCCCACCACAAGAGAGA
AGAACAAGTTCTAAAGGAGGGACAAGAACTAGAATGTTTTTCACCTCAGATTGATGAACC
AAAGGCTAATGAAGAGACTGTATCTAGTGGAGATGCAAAAGCTCTTCTTGGTGAGAATAA
TAATAAAGTCAGTAAGCAAATTTCGAAAGATGATTTGCTCTGTTCAGCATGTAAGGAGCT
GCTTGTGCGACCCGTTGTTCTCAACTGCGGACATGTGTATTGTGAAGTATGTGTAGTAGA
TATGTTCCAAGAAGGCGAAAAGATCAAATGCCAAGAGTGTCATATCTCTGACCCGAGAGG
GTTTCCGAAAGTTTGTTTGGTTCTTGAGCAGCTCTTGGAGGAGA*CTTTCCCGAAGAGTA
CA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2DH46JQ 875 0 0
GTGCGACCCGTT*TTCTCAACTGCGGACATGTGTAT*GTGAAGTATGTGTAGTAGATATG
TTCCAAGAAGGCGAAAAGATCAAATGCCAAGAGTGTCATATCTCTGACCCGAGAGGGTTT
CCGAAAGTTTGTTTGGTTCTTGAGCAGCTCTTGGAGGAGAACTTTCCCGAAGAGTACAAT
TCAAGGAGAAGTGGGATTCAGAAATCGATTCCCCAGACTAGCAAAGGAAACATTCAAAGC
TCTCACAAAGAAGGCCCATCCGTATCAGGCGAGAACAACAATGATCTTCCCTGGTGGGCG
AACCCTGCGTCTAATGTTCACATCGGAGCTGGTTGTGATTGTTGCGGAGTGTATCCAATC
ATAGGGGAGCGATACAGATGCAAAGACTGCAAGGAAGAGATTGGTTATGACCTATGCAAA
GACTGTTACGAGACTCCTTCGAAAGTTCCAGGGAGATTCAACCAACAGCACACCCCAGAC
CACAGGCTTGAGCTCGCTCAGGTTCCTCAGTTTCTGGTCAATATCGAGTCTATCGGCTTC
CTTCTAGGTCCGATGGTTAGTGAAGGCGTGAGTGGAGAAGAAGATAGTGATGATGATGAT
GATAGCGGGGAGGAAGATGTGCCTCCTCCTGATTCTAATGAGGTATCGTCAAGCGCTGAC
TGAAACTGCAGTCTTGAGTATGTTGGAATCTTGAAGCATGGTCTGCGTTTGTGTTTGCAT
ATTTTCTTTTTAAAAGTATGGTTTTTAAACAAAGTTTGTTAATTTATAAACATAAAACGC
AAACAAAAACAAAAACAAAGTCTTATGTTTTCATTTGGTTGCTTATGTATTTTGCAATAA
TATTTTATAAAAGAACTGAAAACTAATTTTTGGAT

QA 1 875 1 875
DS 



AS 1 2

CO CL5298Contig1 1552 2 4 U
GGGGATAATTGTTTACTGCAAACATGTGAGTGATCCAAGTACCCAGAGGATGGATTCGTA
AATTGATCGCTCTCCTTGATCTACACACTTCACTGGAAGATCCGTTCAATCAACCCATTT
ATCCGGAGCTTTCTTTGGTGATGTTATCTCAGAGGCATCCAATCTAATAAGATGATTGGT
AGGAAAAGTTACATACTCGGAGGCAGTGTATCACTTGCCTTAGTCATCCTCATCCTTTTC
ATGATGACCCTCCTTGTCTCCGAGGATAACCCGCTTCACACTTCTCTCTTTAATGTTAAA
CGTCAGTTCACTTCTTCTTCTTCAGTTTGTAACTTTGCAAAGGGGAAATGGGTTAAAGAC
GAGAACCGACCGTTGTATTCTGGTTTTGAATGCAAACAGTGGTTGTCAACCATGTGGTCT
TGTAGAGTAATGGGCAGACCAGATTTCTCTTTTGAGGGTTACCGTTGGCAACCACAAGGT
TGCAACATGCCACACTTTGATAGATTCACCTTCTTGAAACGAATGCAGAACAAGACGATA
GCATTTATAGGAGACTCGTTGGGACGGCAACAGTTTCAGTCTCTCATGTGTATGGTCACT
GGTGGCGAAGAGAGCCCGGAGGTTCAAAACGTTGGATGGGAGTACGGTCTTGTGAAACCC
AAAGGAGCCATTCGTCCTGATGGTTGGGCTTATCGGTTCCCCACCACAAACACAACCATC
TTATACTATTGGTCAGCTAGTTTATCAGATTTAGTACCCATGAACAACGACACTCATCTC
ACCGCAATGCATCTTGACCGTCCACCAGCTTTCATGAGAACTTACCTCCACCGTTTCGAT
GCGCTGGTTCTAAACACTGGTCACCACTGGAACAGAGGCAAGATCGAAGGAAACCATTGG
GTGATGCACGTGAACGGAACACAAGTCGAAGAAGAAGGGGAGTTTCTCAAGGATATCAAA
GACGCTAAGGATTACACAGTACGCAGCGTTGTGAAGTGGCTAGACGCACAGCTTCCGTTG
CATCCGCGTTTGAAAGCTTTCTTAGGACGATATTTCCGAGGCATTTTAGAAACGGAGATT
GGAACACGGGCGGGAACTGTAACAACACGGTTCCTTTGTCTAGAGGAAGCGAGATCACAG
GGGATGATGATGGATCGGTTGATGCAACGGTGGAGAGTGCTGTGAATGGGACAAGGATCA
AGATTCTTGACGTAACTGCACTCTTTGAGCTGAGAGATGAAGCTCATATCTCAGGGCCTA
AACTCAAACCCAAAAAGGCTGCGAGTAACGTGACCTCCACTCCTCCTCCTCCGATTGTCA
ACGATTGCTTGCACTGGTGCTTACCTGGGATCCCTGATACTTGGAATGAAATATTCATTG
CTCAGATTTAAAAGTACTCAACACCCATTCATTGTGCACAAAGTGCAGTTCAGTGTATTT
TGTATTCTTTTTACATTCTTTTGAGGAGAAAAACACAAAGGCTACCAGTTTGTGTTATAC
AAATAGCGTTACAGGCAGCGTTTGTTGCGGTTGAGAGTGAATCACGTTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG41TF U 1
AF RR2BG41JQ C 683
BS 1 819 RR2BG41TF
BS 820 820 RR2BG41JQ
BS 821 862 RR2BG41TF
BS 863 1552 RR2BG41JQ

RD RR2BG41TF 862 0 0
GGGGATAATTGTTTACTGCAAACATGTGAGTGATCCAAGTACCCAGAGGATGGATTCGTA
AATTGATCGCTCTCCTTGATCTACACACTTCACTGGAAGATCCGTTCAATCAACCCATTT
ATCCGGAGCTTTCTTTGGTGATGTTATCTCAGAGGCATCCAATCTAATAAGATGATTGGT
AGGAAAAGTTACATACTCGGAGGCAGTGTATCACTTGCCTTAGTCATCCTCATCCTTTTC
ATGATGACCCTCCTTGTCTCCGAGGATAACCCGCTTCACACTTCTCTCTTTAATGTTAAA
CGTCAGTTCACTTCTTCTTCTTCAGTTTGTAACTTTGCAAAGGGGAAATGGGTTAAAGAC
GAGAACCGACCGTTGTATTCTGGTTTTGAATGCAAACAGTGGTTGTCAACCATGTGGTCT
TGTAGAGTAATGGGCAGACCAGATTTCTCTTTTGAGGGTTACCGTTGGCAACCACAAGGT
TGCAACATGCCACACTTTGATAGATTCACCTTCTTGAAACGAATGCAGAACAAGACGATA
GCATTTATAGGAGACTCGTTGGGACGGCAACAGTTTCAGTCTCTCATGTGTATGGTCACT
GGTGGCGAAGAGAGCCCGGAGGTTCAAAACGTTGGATGGGAGTACGGTCTTGTGAAACCC
AAAGGAGCCATTCGTCCTGATGGTTGGGCTTATCGGTTCCCCACCACAAACACAACCATC
TTATACTATTGGTCAGCTAGTTTATCAGATTTAGTACCCATGAACAACGACACTCATCTC
ACCGCAATGCATCTTGACCGTCCACCAGCTTTCATGAGA*CTTACCTCCACCGTTTCGAT
GCGCTGGTTCTAAACACTGGTC

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR2BG41JQ 870 0 0
GTTGGGCTTATCGGTTCCCCACCACAAACACAACCATCTTATACTATTGGTCAGCTAGTT
TATCAGATTTAGTACCCATGAACAACGACACTCATCTCACCGCAATGCATCTTGACCGTC
CACCAGCTTTCATGAGAACTTACCTCCACCGTTTCGATGCGCTGGTTCTAAACACTGGTC
ACCACTGGAACAGAGGCAAGATCGAAGGAAACCATTGGGTGATGCACGTGAACGGAACAC
AAGTCGAAGAAGAAGGGGAGTTTCTCAAGGATATCAAAGACGCTAAGGATTACACAGTAC
GCAGCGTTGTGAAGTGGCTAGACGCACAGCTTCCGTTGCATCCGCGTTTGAAAGCTTTCT
TAGGACGATATTTCCGAGGCATTTTAGAAACGGAGATTGGAACACGGGCGGGAACTGTAA
CAACACGGTTCCTTTGTCTAGAGGAAGCGAGATCACAGGGGATGATGATGGATCGGTTGA
TGCAACGGTGGAGAGTGCTGTGAATGGGACAAGGATCAAGATTCTTGACGTAACTGCACT
CTTTGAGCTGAGAGATGAAGCTCATATCTCAGGGCCTAAACTCAAACCCAAAAAGGCTGC
GAGTAACGTGACCTCCACTCCTCCTCCTCCGATTGTCAACGATTGCTTGCACTGGTGCTT
ACCTGGGATCCCTGATACTTGGAATGAAATATTCATTGCTCAGATTTAAAAGTACTCAAC
ACCCATTCATTGTGCACAAAGTGCAGTTCAGTGTATTTTGTATTCTTTTTACATTCTTTT
GAGGAGAAAAACACAAAGGCTACCAGTTTGTGTTATACAAATAGCGTTACAGGCAGCGTT
TGTTGCGGTTGAGAGTGAATCACGTTTGGT

QA 1 870 1 870
DS 



AS 1 2

CO CL5299Contig1 1157 2 2 U
GGACTCTGCAAGAAACCAATCTCTCTCTACTCACTCTCGCTTTTTAAACCCTTACCGCTT
TCTCTCTCTCTGAAAAACCCTTTTATCCAAAAACTTTTGGGAGCTTACTCAGAAAAAGTT
TGCTCTTTTACTGCATTCGGACAATGGCCATTGAAGAACACGAGAACCCAAATCGAGAAA
TCAATCCTAAGAACAGAACAATCATGGGAGGTGGTGGAGAGGAGGAGAAGTGGTGGCCTT
CATGGTTGAAACCTTTACTCAAAGAACACTTCTTTGTTCAATGCAACTTCCATGGACACT
CACCGAAAAGCGAATGCAAGATGTATTGTTTGGACTGCACTAACGGCTCGCTCTGCTCTC
TCTGTCTTGCCCATCACAAGGATCATCGTACCATTCAGATAAGGAGATCGTCTTATCATG
ATGTGATAAGGGTAAGTGAGATTCAGAAGCATTTAGATATCTTCAGCGTTCAGACGTATG
TGATCAACAGCGCAAAGGTTGTGTTTTTGAATGAAAGGCCTCAGCCTCAGGCTCAGCCTA
GACCTGCTAAAGGAGTTACTAACGCCTGCACCGTCTGCTATCGTGGCCTTGTCGATGATT
GCTTCCGTTTCTGCTCCCTTGGCTGCAAGGTAGCAGGAACTTCTAGAAGCTTTGAGAAGA
GAGTGAAGAATATAGCAACGGAGTCAGAGAATTCAAGCAACAGCTCAGGAGTAGAGGATC
TCATCCCAAGTCCACAGAGTCTGACCCCATCAACGCCTCAACTTCCTACTTCTACTTCTT
TGCGAAAAAGACCAAGAGAGGGGATCCCTTACCAATTTCCGCTGCAATGAGGTTTGGTCG
CAAAGAAGTATTTAAAGCTCAATACAAGGTTACCAAAGAAGGGCCTTAGTTTTTGTGTGC
TATGAAGTAGTCAAATAACTAGTAAAAGTGTATATATATATGATCATCCTCTTGTATATT
CTTAAAGGTGATGCCATTGAGGATAGATAGGAGTGATACTATGGGGGTTTTTAGGGAGTT
GAATTGGGAATAAGACAAGATCATGAGGGCTTTTTTAAGTAGTTGGTTTTTTGACAAAAG
TTCTTGTGTGTAAATTTTAGTTTTGATGGATTATATAACATAACTTATATATTTTGTCTT
TGAAATGCTTATTAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F857TF U 1
AF RR2F857JQ C 458
BS 1 632 RR2F857TF
BS 633 1157 RR2F857JQ

RD RR2F857TF 632 0 0
GGACTCTGCAAGAAACCAATCTCTCTCTACTCACTCTCGCTTTTTAAACCCTTACCGCTT
TCTCTCTCTCTGAAAAACCCTTTTATCCAAAAACTTTTGGGAGCTTACTCAGAAAAAGTT
TGCTCTTTTACTGCATTCGGACAATGGCCATTGAAGAACACGAGAACCCAAATCGAGAAA
TCAATCCTAAGAACAGAACAATCATGGGAGGTGGTGGAGAGGAGGAGAAGTGGTGGCCTT
CATGGTTGAAACCTTTACTCAAAGAACACTTCTTTGTTCAATGCAACTTCCATGGACACT
CACCGAAAAGCGAATGCAAGATGTATTGTTTGGACTGCACTAACGGCTCGCTCTGCTCTC
TCTGTCTTGCCCATCACAAGGATCATCGTACCATTCAGATAAGGAGATCGTCTTATCATG
ATGTGATAAGGGTAAGTGAGATTCAGAAGCATTTAGATATCTTCAGCGTTCAGACGTATG
TGATCAACAGCGCAAAGGTTGTGTTTTTGAATGAAAGGCCTCAGCCTCAGGCTCAGCCTA
GACCTGCTAAAGGAGTTACTAACGCCTGCACCGTCTGCTATCGTGGCCTTGTCGATGATT
GCTTCCGTTTCTGCTCCCTTGGCTGCAAGGTA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2F857JQ 700 0 0
TATCTTCAGCGTTCAGACGTATGTGATCAACAGCGCAAAGGTTGTGTTTTTGAATGAAAG
GCCTCAGCCTCAGGCTCAGCCTAGACCTGCTAAAGGAGTTACTAACGCCTGCACCGTCTG
CTATCGTGGCCTTGTCGATGATTGCTTCCGTTTCTGCTCCCTTGGCTGCAAGGTAGCAGG
AACTTCTAGAAGCTTTGAGAAGAGAGTGAAGAATATAGCAACGGAGTCAGAGAATTCAAG
CAACAGCTCAGGAGTAGAGGATCTCATCCCAAGTCCACAGAGTCTGACCCCATCAACGCC
TCAACTTCCTACTTCTACTTCTTTGCGAAAAAGACCAAGAGAGGGGATCCCTTACCAATT
TCCGCTGCAATGAGGTTTGGTCGCAAAGAAGTATTTAAAGCTCAATACAAGGTTACCAAA
GAAGGGCCTTAGTTTTTGTGTGCTATGAAGTAGTCAAATAACTAGTAAAAGTGTATATAT
ATATGATCATCCTCTTGTATATTCTTAAAGGTGATGCCATTGAGGATAGATAGGAGTGAT
ACTATGGGGGTTTTTAGGGAGTTGAATTGGGAATAAGACAAGATCATGAGGGCTTTTTTA
AGTAGTTGGTTTTTTGACAAAAGTTCTTGTGTGTAAATTTTAGTTTTGATGGATTATATA
ACATAACTTATATATTTTGTCTTTGAAATGCTTATTAGAC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL5300Contig1 1231 2 2 U
AAGAAGCAGAAAAGATATGAACTCATCTCTTCTAACTCCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTCC
TCATCATCTCCAATCTCCTGCAACCTTCGACCACGATGACTTCCTCCAAAACTTCTTCTC
CTCCGCTCCTTGGCCTTCCTCCGTGCTCGAAGACGACGCGCCTCCCCCCACCTCCGACAC
CGCCGTGGCTAACTTTCACCATCACGACATTGATTCAAGAAACCAGATCACGATGATTCC
TTTGTCTCACCACAATCCAAACGACGCCGTTGATGTTAACGCCCTCTACAGTGGCTTCTC
CGCTGGATCGCTTCCTTTCCACTTCCCTCAGGGATCGGGGGCAGGAGTTATGAAACAAAG
TCACACGCAAACTCAGTCGCAGGCGACGGCGTCAACCACCACCGGTGGAACGGCGACGAC
TCCTCAGACTAAGCCTAAAGTCCGAGCTAGAAGAGGTCAAGCCACTGATCCTCACAGTAT
CGCCGAACGGTTACGAAGAGAGAGAATAGCGGAAAGGATGAAATCTCTTCAAGAACTTGT
CCCTAATGGCAACAAGACAGACAAAGCATCAATGCTCGATGAGATTATCGATTATGTCAA
GTTCTTACAGCTCCAAGTCAAGGTACTAAGCATGAGTAGACTGGGAGGTGCTGCTTCTGT
TTCTTCTCAAATCTCTGAGGATGCCGGTGGGTCCCCGGAAAACACTTCCGGCGAGAATCA
GACGGCGGCTAAAATGACGGAGCACCAAGTGGCCAAGCTAATGGAAGAGGACATGGGATC
GGCCATGCAATACCTACAAGGCAAAGGTCTATGCCTCATGCCCATATCCTTAGCCACCAC
CATCTCAACCGCTACTTGTCCTTCTCGTAATCCTCTGATCTCAGCCGTTAAAGAAGCCGG
CGTTCTTTTGTCTCCTAACACAGCTACTACACCAGTCGTTGACGTTAAAGGTGCCTCGGT
GGTTACCGTTAAAGACGCTTCATCAGTTTCCAAGCCGTGATAACGGCAGTTTGAATCTAA
CTTTCCTTTTTTCGGGAGTTAGGCTGAGTGGGAAACAGAGTCAATGAAAAGTGGGGTTGG
TGGTTATGGTCTAAGTCTAGAGAGAATAAGGGTTGCGTCTTGGAACACAACACCGTATTT
GCGTTCACTTTGTTTCTGTCTTTTACCTACTACAAACCACTATCAATGTTATTTTGTATT
AATCTAATATCTGCAACGGTTTTTGGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F892TF U 1
AF RR2F892JQ C 496
BS 1 670 RR2F892TF
BS 671 1231 RR2F892JQ

RD RR2F892TF 676 0 0
AAGAAGCAGAAAAGATATGAACTCATCTCTTCTAACTCCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTCC
TCATCATCTCCAATCTCCTGCAACCTTCGACCACGATGACTTCCTCCAAAACTTCTTCTC
CTCCGCTCCTTGGCCTTCCTCCGTGCTCGAAGACGACGCGCCTCCCCCCACCTCCGACAC
CGCCGTGGCTAACTTTCACCATCACGACATTGATTCAAGAAACCAGATCACGATGATTCC
TTTGTCTCACCACAATCCAAACGACGCCGTTGATGTTAACGCCCTCTACAGTGGCTTCTC
CGCTGGATCGCTTCCTTTCCACTTCCCTCAGGGATCGGGGGCAGGAGTTATGAAACAAAG
TCACACGCAAACTCAGTCGCAGGCGACGGCGTCAACCACCACCGGTGGAACGGCGACGAC
TCCTCAGACTAAGCCTAAAGTCCGAGCTAGAAGAGGTCAAGCCACTGATCCTCACAGTAT
CGCCGAACGGTTACGAAGAGAGAGAATAGCGGAAAGGATGAAATCTCTTCAAGAACTTGT
CCCTAATGGCAACAAGACAGACAAAGCATCAATGCTCGATGAGATTATCGATTATGTCAA
GTTCTTACAGCTCCAAGTCAAGGTACTAAGCATGAGTAGACTGGGAGGTGCTGCTTCTGT
TTCTTCTCAA
TCTCTG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2F892JQ 736 0 0
AAGAGAGAGAATAGCGGAAAGGATGAAATCTCTTCAAGAACTTGTCCCTAATGGCAACAA
GACAGACAAAGCATCAATGCTCGATGAGATTATCGATTATGTCAAGTTCTTACAGCTCCA
AGTCAAGGTACTAAGCATGAGTAGACTGGGAGGTGCTGCTTCTGTTTCTTCTCAAATCTC
TGAGGATGCCGGTGGGTCCCCGGAAAACACTTCCGGCGAGAATCAGACGGCGGCTAAAAT
GACGGAGCACCAAGTGGCCAAGCTAATGGAAGAGGACATGGGATCGGCCATGCAATACCT
ACAAGGCAAAGGTCTATGCCTCATGCCCATATCCTTAGCCACCACCATCTCAACCGCTAC
TTGTCCTTCTCGTAATCCTCTGATCTCAGCCGTTAAAGAAGCCGGCGTTCTTTTGTCTCC
TAACACAGCTACTACACCAGTCGTTGACGTTAAAGGTGCCTCGGTGGTTACCGTTAAAGA
CGCTTCATCAGTTTCCAAGCCGTGATAACGGCAGTTTGAATCTAACTTTCCTTTTTTCGG
GAGTTAGGCTGAGTGGGAAACAGAGTCAATGAAAAGTGGGGTTGGTGGTTATGGTCTAAG
TCTAGAGAGAATAAGGGTTGCGTCTTGGAACACAACACCGTATTTGCGTTCACTTTGTTT
CTGTCTTTTACCTACTACAAACCACTATCAATGTTATTTTGTATTAATCTAATATCTGCA
ACGGTTTTTGGTTTAC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5302Contig1 1307 2 2 U
GGACACTATCACATTGTCTCTTCTCTCCTCCCAATCACACTACACTACACATCATGGCTT
TCGCCACTAGAAGCTCTCTCTTGGTCTGCTTCACAACACTTGTTCTTCTCTCCACTCAAA
TCAATGCAAGAGAGAACTACTTCTTTGGCAAATTCCACCGAGAATCCTCCAAAGACCAAA
ACCCTAACAATGTCCTCCCTCTCGAGACCAGCGAGAAAACCACAGTAGAAGAATCCTTCC
CCAACAAGAAAGAGCAAGAACAAGATCCTACCTTCGTCCCCGAGTCCGAAAACGGCTATG
GCTTATATGGTCACGAGACCACCTACAACAACAACAAAGAAGAATTCAACAACAAGAACA
ACAAGTACGATGAAAAATTCAACGGTGAGACTTTCTCAACTCCAAGCCTGAGCGAGACCG
AAGAGTCTTACAACAACTACGAGGAGAACTACCCGAAGAAGACCGAGAGCTACGACAACA
ACCGTTACAACAACGAAGAGTTCAACAACAAGTACGATGAAAACGTCAAGGAAGAGTTCA
ACAACAACAACAAGTACGATGAAAACTTCAAGGAAGAGTTCAACAACAACGAGTACGACG
AAAACTTCAAGGAAGAGTCATTCTCTGAGAACAATGAAGACAAGAGAGGTATCTACAACT
CCAACGCCTACGGAACTGAGTTAGAGCGTGAAACGCCGTACAAAGGTTACAGCCACAACT
TGGAGAGACAAGGCATGAGTGACACAAGGTTCATGGAAAAGGGTAACTACTACTATGACC
TTTACAACGACAGAAACCACGGCCATTTCTACCGGAAGCCTCATCAGAAAAGCCCTGCCG
GCTACTATTCTTTTCAGGCGACCGAGAATAACTACGACCAGTCGTACAACAACTACAACA
ATGAGGAGGATAAGAGCTTCAAGGATCAGTACAATTCCAAGTGGGAGAAGAACATGATGA
ACAAACAGCCTGAAGAGTTTGTTGAGGAGCAAGGAGATCAGTTCAAGCCTTGATGAAGAT
TTGATGTTTGATTTCCTCTCAAGATCATTACAATCTTAAAAGTGTTTTCTTTTATTTCAA
CTAAGTTATTTTACTTCTGGTTGATTAGTCAAACTAAGTCGTTGTTATCATTGCAAGTGA
AAAAGGGAAAAGGGGAGGGGTCTGTGTTTTCTTTTAGTTGAAATGGGTTTGCTTTTTATG
GGATTTTGAACTTTGATGTTTGCGTTTGCATATAATATTCGAAGAAAAGATAGTAAAATA
TATGGTGTTACTTTATGTTATTTTCTTATGTTGATCACTTTTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D303TF U 1
AF RR2D303JQ C 489
BS 1 669 RR2D303TF
BS 670 1307 RR2D303JQ

RD RR2D303TF 669 0 0
GGACACTATCACATTGTCTCTTCTCTCCTCCCAATCACACTACACTACACATCATGGCTT
TCGCCACTAGAAGCTCTCTCTTGGTCTGCTTCACAACACTTGTTCTTCTCTCCACTCAAA
TCAATGCAAGAGAGAACTACTTCTTTGGCAAATTCCACCGAGAATCCTCCAAAGACCAAA
ACCCTAACAATGTCCTCCCTCTCGAGACCAGCGAGAAAACCACAGTAGAAGAATCCTTCC
CCAACAAGAAAGAGCAAGAACAAGATCCTACCTTCGTCCCCGAGTCCGAAAACGGCTATG
GCTTATATGGTCACGAGACCACCTACAACAACAACAAAGAAGAATTCAACAACAAGAACA
ACAAGTACGATGAAAAATTCAACGGTGAGACTTTCTCAACTCCAAGCCTGAGCGAGACCG
AAGAGTCTTACAACAACTACGAGGAGAACTACCCGAAGAAGACCGAGAGCTACGACAACA
ACCGTTACAACAACGAAGAGTTCAACAACAAGTACGATGAAAACGTCAAGGAAGAGTTCA
ACAACAACAACAAGTACGATGAAAACTTCAAGGAAGAGTTCAACAACAACGAGTACGACG
AAAACTTCAAGGAAGAGTCATTCTCTGAGAACAATGAAGACAAGAGAGGTATCTACAACT
CCAACGCCT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2D303JQ 819 0 0
C
ACAACGAAGAGTTCA*CAACAAGTACGATGAAAACGTCAAGGAAGAGTTCAACAACAACA
ACAAGTACGATGAAAACTTCAAGGAAGAGTTCAACAACAACGAGTACGACGAAAACTTCA
AGGAAGAGTCATTCTCTGAGAACAATGAAGACAAGAGAGGTATCTACAACTCCAACGCCT
ACGGAACTGAGTTAGAGCGTGAAACGCCGTACAAAGGTTACAGCCACAACTTGGAGAGAC
AAGGCATGAGTGACACAAGGTTCATGGAAAAGGGTAACTACTACTATGACCTTTACAACG
ACAGAAACCACGGCCATTTCTACCGGAAGCCTCATCAGAAAAGCCCTGCCGGCTACTATT
CTTTTCAGGCGACCGAGAATAACTACGACCAGTCGTACAACAACTACAACAATGAGGAGG
ATAAGAGCTTCAAGGATCAGTACAATTCCAAGTGGGAGAAGAACATGATGAACAAACAGC
CTGAAGAGTTTGTTGAGGAGCAAGGAGATCAGTTCAAGCCTTGATGAAGATTTGATGTTT
GATTTCCTCTCAAGATCATTACAATCTTAAAAGTGTTTTCTTTTATTTCAACTAAGTTAT
TTTACTTCTGGTTGATTAGTCAAACTAAGTCGTTGTTATCATTGCAAGTGAAAAAGGGAA
AAGGGGAGGGGTCTGTGTTTTCTTTTAGTTGAAATGGGTTTGCTTTTTATGGGATTTTGA
ACTTTGATGTTTGCGTTTGCATATAATATTCGAAGAAAAGATAGTAAAATATATGGTGTT
ACTTTATGTTATTTTCTTATGTTGATCACTTTTTGGTT

QA 2 819 2 819
DS 



AS 1 2

CO CL5303Contig1 1124 2 4 U
GGAGGATCAGAAGAAGTGTCTGCGAGAAAGAAAGAGGAACAAAGATTTTGATTTTGAGAA
AACGATGGAAGACGATGGAAGAGACGCTCATCAACTCGATTTGGAAAACGCCGATCGACA
TGTTTGGTTGATGAAGAGTCCTGTTGTTGTCTCCAAGGCCTGGGAGAAGCTCACTCCTCC
TTCTTCATCCTCGCTTTCTTCGTATTCTTCCCCTGGACTCACTAGTTTGGCCAAGGTTGT
TGAATCCGTGAATCCTTTACACCCCGAGCCGGAGTTCAACATGGAGATGGTGGGTGCTGA
GTATGGGAACATGCCAAAGAGCTACTCTTTGAACATGTTTAAAGACTTTGTTCCAATGTC
TGTCTTATCCGCTGTCGGTCTAGAAGAGAATCCAGCTGCTGAAGGAACGATAGAACAAAA
ATTCGATATGAAGCCACAGGGAGAAGACATTGAAGAGTATGCAAGGTTTTGTCGAGAGAG
AACAAGCAGATCCATGGTTAAGAACCGACAGATCCAGGTGTTTTGTTCTCCTTACTCTTG
GCCTCTCCTTTACCTGTTAGCTAATCAGATAAAGCTGCTTGTATTGTTGTAAACTAAAAG
GTTATCGATAATGACCGTGGAGTACATATGAGGTTTTTGCCTTTGCCTAATTTGCTTTCC
TCCAATTCAAGGGAAAAGAGGAAAGCTGTCCCAGTCAAGCAAACAGATGTGAAGAGGACG
AGGAGAGATCGTGGTGAGCTCGAAGGCATAATGTTCGACCTATTCGAAGGACAACCAAAC
TGGACCTTGAAGCAGCTAGTACAGAAGACTGACCAACCAGCGCAGTTTTTGAAAGAGATA
CTAAACGAGCTTTGCGTTTACAATAAGCGAGGATCGAACCAAGGGACTTATGAGCTTAAA
CCAGAATACAAGAAAGCTGGTGAAGATGATACAGGTGGACAGTAAAAAAAACAATCGCAT
GTGTAGCAAACATCTATGTACTACATGTGCCAAGTCATTTTAGCAGAGAGGATTTTATTT
TAATTTTTACTAGTTAAGCCAAAATAGTCAAATTATGAAATTTAGTGTTTCTTAGCACTT
GTTAATCATTCTGTTATAAAATCTTACTCCTTTTTTTTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF79TF U 1
AF RR2FF79JQ C 539
BS 1 702 RR2FF79TF
BS 703 703 RR2FF79JQ
BS 704 718 RR2FF79TF
BS 719 1124 RR2FF79JQ

RD RR2FF79TF 718 0 0
GGAGGATCAGAAGAAGTGTCTGCGAGAAAGAAAGAGGAACAAAGATTTTGATTTTGAGAA
AACGATGGAAGACGATGGAAGAGACGCTCATCAACTCGATTTGGAAAACGCCGATCGACA
TGTTTGGTTGATGAAGAGTCCTGTTGTTGTCTCCAAGGCCTGGGAGAAGCTCACTCCTCC
TTCTTCATCCTCGCTTTCTTCGTATTCTTCCCCTGGACTCACTAGTTTGGCCAAGGTTGT
TGAATCCGTGAATCCTTTACACCCCGAGCCGGAGTTCAACATGGAGATGGTGGGTGCTGA
GTATGGGAACATGCCAAAGAGCTACTCTTTGAACATGTTTAAAGACTTTGTTCCAATGTC
TGTCTTATCCGCTGTCGGTCTAGAAGAGAATCCAGCTGCTGAAGGAACGATAGAACAAAA
ATTCGATATGAAGCCACAGGGAGAAGACATTGAAGAGTATGCAAGGTTTTGTCGAGAGAG
AACAAGCAGATCCATGGTTAAGAACCGACAGATCCAGGTGTTTTGTTCTCCTTACTCTTG
GCCTCTCCTTTACCTGTTAGCTAATCAGATAAAGCTGCTTGTATTGTTGTAAACTAAAAG
GTTATCGATAATGACCGTGGAGTACATATGAGGTTTTTGCCTTTGCCTAATTTGCTTTCC
TCCAATTCAAGGGAAAAGAGGAAAGCTGTCCCAGTCAAGCAA*CAGATGTGAAGAGGA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2FF79JQ 586 0 0
TGGCCTCTCCTTTACCTGTTAGCTAATCAGATAAAGCTGCTTGTATTGTTGTAAACTAAA
AGGTTATCGATAATGACCGTGGAGTACATATGAGGTTTTTGCCTTTGCCTAATTTGCTTT
CCTCCAATTCAAGGGAAAAGAGGAAAGCTGTCCCAGTCAAGCAAACAGATGTGAAGAGGA
CGAGGAGAGATCGTGGTGAGCTCGAAGGCATAATGTTCGACCTATTCGAAGGACAACCAA
ACTGGACCTTGAAGCAGCTAGTACAGAAGACTGACCAACCAGCGCAGTTTTTGAAAGAGA
TACTAAACGAGCTTTGCGTTTACAATAAGCGAGGATCGAACCAAGGGACTTATGAGCTTA
AACCAGAATACAAGAAAGCTGGTGAAGATGATACAGGTGGACAGTAAAAAAAACAATCGC
ATGTGTAGCAAACATCTATGTACTACATGTGCCAAGTCATTTTAGCAGAGAGGATTTTAT
TTTAATTTTTACTAGTTAAGCCAAAATAGTCAAATTATGAAATTTAGTGTTTCTTAGCAC
TTGTTAATCATTCTGTTATAAAATCTTACTCCTTTTTTTTTTGACC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5305Contig1 1018 2 2 U
GGGGACAAAAAACAACTCAAGCCAGGTTCTGGTGGAGTATGTGTCCAATGATGCTAAGTT
TGTCAATGAAAGAGCTCGTAGTGACTTTGTTCTTCTTTCTCGGGGCTTTATGAGACTTGA
TGCGCGCGCACGTCAGGACGTTGCAATTATTGGGTCAGGGTTCCTTAAACTGGATGCTCG
GGCAAGAGAAGATACGGATAAAATAGATCGTGATGTCAAGAGAAAAGCCGAGCGCCTTCA
TCATATTGCTACTATATTAAAAAACACAGCCCAGTCTAAGTTGAAAAATGCTGCTGATAA
GCATTGGAGTGACGGTGCCTTAGAGGCTGATCTAAGGCGAGCGGACTTCCGCGCTAAACA
ACGGGCAATGGAAGATGCACTAATGGCTTTAGAGTTTATCAAGAACATTCATGATATGAT
GGTGCAAAAAATGGTTGATAGCTTGGTAACATCCGAAACTGGTACCAAGGACCGCATATC
GCTTGAGAAGAATGGAGAAGCTCTAGAGTTTTTCCTAGGGGAAGTTTCATCTGATAGCAT
ATCTGTTATTGAGGAAGCTTACAAGAGTATGGCATCAGCGCTCTCAGAAGCCGATGGAAT
TGACTATACTGATCCTGAAGAGCTTGAACTGTTAATAACTACTCTGATCGACCTCGATGC
AATGGATGGTAAAAGCAGTGCATCACTGTTAGCTGAATGCTCAAGCTCTCCAGACGTCAA
TACAAGGAAAGCGTTGGCTAATGCCTTAGCAGCTGCGCCGTCGATGTGGACGTTGGGAAA
TGCAGGCATGGGAGCATTACAGAGACTCGCGGAAGACAGTAACCCATCGATTGCAGCTGC
TGCTTCCAGAGCGATCATTGCGCTGAAGAAGCAATGGGAAGTTGAAGAAGGTGATGCACT
TAGGTTTATGATGAACTTGAAGAACCGAAAGGATGATGAAGAGGGAGACAGTGACCATGA
CGAAATCTGAAAATAGTTTTTTTTTTTCATGTAAAAGAATAGATAATTTAGAGATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E312TF U 1
AF RR2E312JQ C 535
BS 1 709 RR2E312TF
BS 710 1018 RR2E312JQ

RD RR2E312TF 709 0 0
GGGGACAAAAAACAACTCAAGCCAGGTTCTGGTGGAGTATGTGTCCAATGATGCTAAGTT
TGTCAATGAAAGAGCTCGTAGTGACTTTGTTCTTCTTTCTCGGGGCTTTATGAGACTTGA
TGCGCGCGCACGTCAGGACGTTGCAATTATTGGGTCAGGGTTCCTTAAACTGGATGCTCG
GGCAAGAGAAGATACGGATAAAATAGATCGTGATGTCAAGAGAAAAGCCGAGCGCCTTCA
TCATATTGCTACTATATTAAAAAACACAGCCCAGTCTAAGTTGAAAAATGCTGCTGATAA
GCATTGGAGTGACGGTGCCTTAGAGGCTGATCTAAGGCGAGCGGACTTCCGCGCTAAACA
ACGGGCAATGGAAGATGCACTAATGGCTTTAGAGTTTATCAAGAACATTCATGATATGAT
GGTGCAAAAAATGGTTGATAGCTTGGTAACATCCGAAACTGGTACCAAGGACCGCATATC
GCTTGAGAAGAATGGAGAAGCTCTAGAGTTTTTCCTAGGGGAAGTTTCATCTGATAGCAT
ATCTGTTATTGAGGAAGCTTACAAGAGTATGGCATCAGCGCTCTCAGAAGCCGATGGAAT
TGACTATACTGATCCTGAAGAGCTTGAACTGTTAATAACTACTCTGATCGACCTCGATGC
AATGGATGGTAAAAGCAGTGCATCACTGTTAGCTGAATGCTCAAGCTCT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2E312JQ 484 0 0
TAGCATATCTGTTATTGAGGAAGCTTACAAGAGTATGGCATCAGCGCTCTCAGAAGCCGA
TGGAATTGACTATACTGATCCTGAAGAGCTTGAACTGTTAATAACTACTCTGATCGACCT
CGATGCAATGGATGGTAAAAGCAGTGCATCACTGTTAGCTGAATGCTCAAGCTCTCCAGA
CGTCAATACAAGGAAAGCGTTGGCTAATGCCTTAGCAGCTGCGCCGTCGATGTGGACGTT
GGGAAATGCAGGCATGGGAGCATTACAGAGACTCGCGGAAGACAGTAACCCATCGATTGC
AGCTGCTGCTTCCAGAGCGATCATTGCGCTGAAGAAGCAATGGGAAGTTGAAGAAGGTGA
TGCACTTAGGTTTATGATGAACTTGAAGAACCGAAAGGATGATGAAGAGGGAGACAGTGA
CCATGACGAAATCTGAAAATAGTTTTTTTTTTTCATGTAAAAGAATAGATAATTTAGAGA
TAAA

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 2

CO CL5306Contig1 694 2 3 U
TTTAGCGGGAGTAACATATATTCTATGGATAACGAAACATTGTAACAACACATATAGGTA
CGAGATTATGAAGACAACTTAACACAATGTCAATAACATCAAAACGAAATCTTGATCAGG
ACATTCTCTTATTCGACCATTGTATTAAGGGACTGGAACACAGATGCCAACCGATGCTTT
TTAAAAAAGACAAAAAAAAAGATAGGCAATGAGTTTCCTTTTGACATATCAAGCAAGTGA
AGATCTTCATGCTTTTGATGGAAGCTTGGGGTCGGTCTCAACATGTTTCTGGTCTTCGAA
CTTGTCTATAGCCATTTGAAGCTCGTCCGTGCCACCAACGGCCTTCATCGTGTAGAAATA
TACCCCAAATACAAAAGCTGTCAAGCCTCCCGCTACAACCGCGTTCTTGCTTTTGGAGCC
TAGAAAACTCAAACCTGGAAATCCTGACATTTTTTCAAAAGTCTTTTTTATAACCTGGTG
CTGTGTACGTTTAAAGATGACTCGGAAGTTCTCGAAAGAGACACAAAGTTGGAATCTTTT
TTTTTTCACAGAGAAGTGTGCCCAAATGCTGCAGAAGCCTTAAAGGTTTCTTATTTAGGT
GACGAGACAACTGGTTCGTTGATGCCTGGTCTTGTCTATTGAAACCCTTAAAACCCAGAA
AAGAGGTATAGATGCAGACAACAAAGCCGTCTTC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB63JQ U 4
AF RR2EB63TF C 1
BS 1 3 RR2EB63TF
BS 4 182 RR2EB63JQ
BS 183 694 RR2EB63TF

RD RR2EB63JQ 179 0 0
AGCGGGAGTAACATATATTCTATGGATAACGAAACATTGTAACAACACATATAGGTACGA
GATTATGAAGACAACTTAACACAATGTCAATAACATCAAAACGAAATCTTGATCAGGACA
TTCTCTTATTCGACCATTGTATTAAGGGACTGGAACACAGATGCCAACCGATGCTTTTT

QA 1 179 1 179
DS 

RD RR2EB63TF 694 0 0
TTTAGCGGGAGTAACATATATTCTATGGATAACGAAACATTGTAACAACACATATAGGTA
CGAGATTATGAAGACAACTTAACACAATGTCAATAACATCAAAACGAAATCTTGATCAGG
ACATTCTCTTATTCGACCATTGTATTAAGGGACTGGAACACAGATGCCAACCGATGCTTT
TTAAAAAAGACAAAAAAAAAGATAGGCAATGAGTTTCCTTTTGACATATCAAGCAAGTGA
AGATCTTCATGCTTTTGATGGAAGCTTGGGGTCGGTCTCAACATGTTTCTGGTCTTCGAA
CTTGTCTATAGCCATTTGAAGCTCGTCCGTGCCACCAACGGCCTTCATCGTGTAGAAATA
TACCCCAAATACAAAAGCTGTCAAGCCTCCCGCTACAACCGCGTTCTTGCTTTTGGAGCC
TAGAAAACTCAAACCTGGAAATCCTGACATTTTTTCAAAAGTCTTTTTTATAACCTGGTG
CTGTGTACGTTTAAAGATGACTCGGAAGTTCTCGAAAGAGACACAAAGTTGGAATCTTTT
TTTTTTCACAGAGAAGTGTGCCCAAATGCTGCAGAAGCCTTAAAGGTTTCTTATTTAGGT
GACGAGACAACTGGTTCGTTGATGCCTGGTCTTGTCTATTGAAACCCTTAAAACCCAGAA
AAGAGGTATAGATGCAGACAACAAAGCCGTCTTC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5308Contig1 688 2 1 U
GAGAACCGGAGGAGAAAGAATGGCCGATCTTGAGAGCCAACATCTCCAGCCACAGCGGAG
ACTCGGAATCCGCCAAAACCGCCTTCGAGGAGATCATATCCAAGGACCCGCTTCGCGTCG
AGGCCTACCACGGCCTAGCCATGGCCTACTCCGACTCAGGCGACGGCCTAAAGGCCGTGG
AGGAGAGGATCCGCGAGGCGATGGCTAAGTGCAAGAAGGAGAGGAAGAATGGGAAGGATC
TCAGGGATTTCAAGCTGCTGGTGGCGCAGATTCGGGTGCTGGAAGGGAGGCACGAGGAAG
CGCTTAAGCTGTATCAGGAGCTAGTGAAGGAGGAGCCGAGGGATTTCAGGCCGTATCTCT
GTCAGGGGATTATATACACGCTTCTTAAGAAGGGAGGCGAGGCGGAGAAGCAGTTTGAGA
AGTTCAGGAGGCTTGTTCCCAGGAATCATCCGTATAGAGAGTATTTTATGGATAATATGG
TTGCGACGAAGCTCTTTGCGGAGAAGGCACAGAGAGAGATGGCTGGAACTAAGGGTTGAG
AGTCATGAGTTGGGGTTAAGTAATGATGGTTGTCTCACGAAGTGCTTTTCTTGATGGTTG
TTGTAGTAGGTGTGTGAACTTGAATTTGATATGATGTGCGTGTGTTGAATCTTCTTAATC
CATGGGAGTTAAAATCTTTTTTGCAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F211TF U 1
AF RR2F211JQ C 26
BS 1 688 RR2F211TF

RD RR2F211TF 688 0 0
GAGAACCGGAGGAGAAAGAATGGCCGATCTTGAGAGCCAACATCTCCAGCCACAGCGGAG
ACTCGGAATCCGCCAAAACCGCCTTCGAGGAGATCATATCCAAGGACCCGCTTCGCGTCG
AGGCCTACCACGGCCTAGCCATGGCCTACTCCGACTCAGGCGACGGCCTAAAGGCCGTGG
AGGAGAGGATCCGCGAGGCGATGGCTAAGTGCAAGAAGGAGAGGAAGAATGGGAAGGATC
TCAGGGATTTCAAGCTGCTGGTGGCGCAGATTCGGGTGCTGGAAGGGAGGCACGAGGAAG
CGCTTAAGCTGTATCAGGAGCTAGTGAAGGAGGAGCCGAGGGATTTCAGGCCGTATCTCT
GTCAGGGGATTATATACACGCTTCTTAAGAAGGGAGGCGAGGCGGAGAAGCAGTTTGAGA
AGTTCAGGAGGCTTGTTCCCAGGAATCATCCGTATAGAGAGTATTTTATGGATAATATGG
TTGCGACGAAGCTCTTTGCGGAGAAGGCACAGAGAGAGATGGCTGGAACTAAGGGTTGAG
AGTCATGAGTTGGGGTTAAGTAATGATGGTTGTCTCACGAAGTGCTTTTCTTGATGGTTG
TTGTAGTAGGTGTGTGAACTTGAATTTGATATGATGTGCGTGTGTTGAATCTTCTTAATC
CATGGGAGTTAAAATCTTTTTTGCAGTG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2F211JQ 663 0 0
GATCTTGAGAGCCAACATCTCCAGCCACAGCGGAGACTCGGAATCCGCCAAAACCGCCTT
CGAGGAGATCATATCCAAGGACCCGCTTCGCGTCGAGGCCTACCACGGCCTAGCCATGGC
CTACTCCGACTCAGGCGACGGCCTAAAGGCCGTGGAGGAGAGGATCCGCGAGGCGATGGC
TAAGTGCAAGAAGGAGAGGAAGAATGGGAAGGATCTCAGGGATTTCAAGCTGCTGGTGGC
GCAGATTCGGGTGCTGGAAGGGAGGCACGAGGAAGCGCTTAAGCTGTATCAGGAGCTAGT
GAAGGAGGAGCCGAGGGATTTCAGGCCGTATCTCTGTCAGGGGATTATATACACGCTTCT
TAAGAAGGGAGGCGAGGCGGAGAAGCAGTTTGAGAAGTTCAGGAGGCTTGTTCCCAGGAA
TCATCCGTATAGAGAGTATTTTATGGATAATATGGTTGCGACGAAGCTCTTTGCGGAGAA
GGCACAGAGAGAGATGGCTGGAACTAAGGGTTGAGAGTCATGAGTTGGGGTTAAGTAATG
ATGGTTGTCTCACGAAGTGCTTTTCTTGATGGTTGTTGTAGTAGGTGTGTGAACTTGAAT
TTGATATGATGTGCGTGTGTTGAATCTTCTTAATCCATGGGAGTTAAAATCTTTTTTGCA
GTG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL5309Contig1 697 2 3 U
AAAAATGAAGGAAACAATGTAAGTTGTCAACAAATCGAAGAAGAAAAAGTCTTCAAGTTT
CTCAATCTCACACAAAATCTCACACAAACAGAAACATCAAATCGGTTTTCACGAGGAAGG
GTATGACCTCAGCCCTGAAGCTTCATTCACCGCCGCAGCTTCCTCATCAGAGAACAAATT
ATCACTCCTTCTAACCGCCGCGTGGATCAGAACCAACACGACGGCGGTCAACAGCGACCC
GAGTATATTCCCCGTGGCGTGGGTGAACAAAAGAATGCCGATGGTCAACACCGATAGACA
GATCATGACCGTCCGATCGTCCACCTGGTGACCGAAGACGAGGAGAGGCTCGTCGCGGAG
GAAATAGAGGAAGATCCAGAAGACGACCAAGATGGCTAGGACGAGGAGGGAGGTCGGGTG
GTAGAGAAGGCTCATGAAGAGCATGAAGAGGACGGCGATGGCGTAGTTGGCTCTGAAGTA
GACGAGATTCGTCTTGGTTCTCGAGATCGCGTCGAAAAAACCGTGGGGTAGGGACATGGA
TTCGAGATCGAACATCGTTCGCCATGGGCGGCGCGTGGCTAGGCCTGATTTGATACGGTG
CTAGACGTGTGAGATGTACTCGAGATCCACCGGTGGAGATGGATGAGATGACGTCGGGAT
CGCACCGTAGTTTGTCATCGTTTCTCTAATTGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2CZ44TF C 1
AF RR2CZ44JQ U 511
BS 1 510 RR2CZ44TF
BS 511 693 RR2CZ44JQ
BS 694 697 RR2CZ44TF

RD RR2CZ44TF 697 0 0
AAAAATGAAGGAAACAATGTAAGTTGTCAACAAATCGAAGAAGAAAAAGTCTTCAAGTTT
CTCAATCTCACACAAAATCTCACACAAACAGAAACATCAAATCGGTTTTCACGAGGAAGG
GTATGACCTCAGCCCTGAAGCTTCATTCACCGCCGCAGCTTCCTCATCAGAGAACAAATT
ATCACTCCTTCTAACCGCCGCGTGGATCAGAACCAACACGACGGCGGTCAACAGCGACCC
GAGTATATTCCCCGTGGCGTGGGTGAACAAAAGAATGCCGATGGTCAACACCGATAGACA
GATCATGACCGTCCGATCGTCCACCTGGTGACCGAAGACGAGGAGAGGCTCGTCGCGGAG
GAAATAGAGGAAGATCCAGAAGACGACCAAGATGGCTAGGACGAGGAGGGAGGTCGGGTG
GTAGAGAAGGCTCATGAAGAGCATGAAGAGGACGGCGATGGCGTAGTTGGCTCTGAAGTA
GACGAGATTCGTCTTGGTTCTCGAGATCGCGTCGAAGAAACCGTGGGGTAGGGACATGGA
TTCGAGATCGAACATCGTTCGCCATGGGCGGCGCGTGGCTAGGCCTGATTTGATACGGTG
CTAGACGTGTGAGATGTACTCGAGATCCACCGGTGGAGATGGATGAGATGACGTCGGGAT
CGCACCGTAGTTTGTCATCGTTTCTCTAATTGGTTCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2CZ44JQ 183 0 0
GTCGAAAAAACCGTGGGGTAGGGACATGGATTCGAGATCGAACATCGTTCGCCATGGGCG
GCGCGTGGCTAGGCCTGATTTGATACGGTGCTAGACGTGTGAGATGTACTCGAGATCCAC
CGGTGGAGATGGATGAGATGACGTCGGGATCGCACCGTAGTTTGTCATCGTTTCTCTAAT
TGG

QA 1 183 1 183
DS 



AS 1 2

CO CL5310Contig1 1028 2 2 U
GGGGGATGATGAGGGAGTGGTGGCGGAGGATGATGATGTTGTGGTTTTGGGATCTATTGC
TCTGTCTATGGAGTTTGGGAAGAGGTTTTATGAGATGGGTTCTTCTCCTGATTGCCATCA
GGGGAATAGGAAAGTGATATTTGCGCTTCATAAAGAGTTTTTGCAGTTGGAGAAGGATAT
GTTGAGCTCTGGTGTTGTGGTTTCTATCACTGGAGCTTCTCGGGAGAAGGATGAAGTGCC
TGAGCTGGTTCCTATGACTGTTGAGGCAGTTGTTTCTGAGTCTAAGGAGGTTGTGCCAAT
GGGTCTTCTTCGAAGAAGAAGAAGAAGAGTTTGAAGAAGTGTTCAAGTTCTAAGAAGAAG
GGAGCTGATGTTGTTGTCAGTCATGGTGAGAAAGATGAGTCTGTTGACGAGACTATGATA
TCAGATCTCAGAGAGGAGTTTGAGAAGATTGCATCCGAAATGGGTCCACTGAAAGATGAG
GTTGCAAGTGTCTGTGAAGAAGCAGAAACTGTTCCAGTAGCCATAAAGAAGAACAAGAAG
AGGAAAAGAGAGAACAAAGAGGTTGTGGAGCAAGGTGCTACTGTTAACAGAGATGCAGCA
GAGAAGAGCTTACCTGGCCCGAGCAGTGAGAAGAGCTCAAAGAGAGTAAGATTTGCGATG
AAGAACAATTTGGTGTGGAAGCCTCATTGCCCTCTACCTCCACAGGACTTGAGGTTGCCT
CCGTCTGCTACACCGAGAGGAAGTGCTCTGAAGAAAGGAATCCCGGCTGGTCCAGTGAGG
GAGTCTCCGAGTAGGAAGACGAAGAAGAAAGTGAAACCGAACCGACGTAGAGGAGTGAAG
ACAATCAAGAATAAGAAAGTGTCTCCATGAGTAGTGGAATGTTGAGTTACTTTTGTTTGG
GTTGCTGCTTGCTTTTCTTTCAAATTTTGTTTTAGTTCCATCTATTTAATACAATTTCTA
GATTTCGTTTTACTGATTTGAGTATTAAGAGAAACATCTTTGCCATCAAAAAGGAAGATT
TTCTGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB19TF U 1
AF RR2GB19JQ C 319
BS 1 500 RR2GB19TF
BS 501 1028 RR2GB19JQ

RD RR2GB19TF 500 0 0
GGGGGATGATGAGGGAGTGGTGGCGGAGGATGATGATGTTGTGGTTTTGGGATCTATTGC
TCTGTCTATGGAGTTTGGGAAGAGGTTTTATGAGATGGGTTCTTCTCCTGATTGCCATCA
GGGGAATAGGAAAGTGATATTTGCGCTTCATAAAGAGTTTTTGCAGTTGGAGAAGGATAT
GTTGAGCTCTGGTGTTGTGGTTTCTATCACTGGAGCTTCTCGGGAGAAGGATGAAGTGCC
TGAGCTGGTTCCTATGACTGTTGAGGCAGTTGTTTCTGAGTCTAAGGAGGTTGTGCCAAT
GGGTCTTCTTCGAAGAAGAAGAAGAAGAGTTTGAAGAAGTGTTCAAGTTCTAAGAAGAAG
GGAGCTGATGTTGTTGTCAGTCATGGTGAGAAAGATGAGTCTGTTGACGAGACTATGATA
TCAGATCTCAGAGAGGAGTTTGAGAAGATTGCATCCGAAATGGGTCCACTGAAAGATGAG
GTTGCAAGTGTCTGTGAAGA

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2GB19JQ 710 0 0
AAGAAGAAGAGTT*GAAGAAGTGTTCAAGTTCTAAGAAGAAGGGAGCTGATGTTGTTGTC
AGTCATGGTGAGAAAGATGAGTCTGTTGACGAGACTATGATATCAGATCTCAGAGAGGAG
TTTGAGAAGATTGCATCCGAAATGGGTCCACTGAAAGATGAGGTTGCAAGTGTCTGTGAA
GAAGCAGAAACTGTTCCAGTAGCCATAAAGAAGAACAAGAAGAGGAAAAGAGAGAACAAA
GAGGTTGTGGAGCAAGGTGCTACTGTTAACAGAGATGCAGCAGAGAAGAGCTTACCTGGC
CCGAGCAGTGAGAAGAGCTCAAAGAGAGTAAGATTTGCGATGAAGAACAATTTGGTGTGG
AAGCCTCATTGCCCTCTACCTCCACAGGACTTGAGGTTGCCTCCGTCTGCTACACCGAGA
GGAAGTGCTCTGAAGAAAGGAATCCCGGCTGGTCCAGTGAGGGAGTCTCCGAGTAGGAAG
ACGAAGAAGAAAGTGAAACCGAACCGACGTAGAGGAGTGAAGACAATCAAGAATAAGAAA
GTGTCTCCATGAGTAGTGGAATGTTGAGTTACTTTTGTTTGGGTTGCTGCTTGCTTTTCT
TTCAAATTTTGTTTTAGTTCCATCTATTTAATACAATTTCTAGATTTCGTTTTACTGATT
TGAGTATTAAGAGAAACATCTTTGCCATCAAAAAGGAAGATTTTCTGCCG

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL5311Contig1 743 2 4 U
GCTCTACGCGGCGACAAAGAAAGCCGGTGAGGAAATCACCCACACTTATAATCATATTTA
CGGTCTTGCCATTACCGGTTTAAGATTCTTCACGGTTTACGGCCCCTGGGGTAGACCGGA
CATGGCTTACTTCTCATTCACGCGGAATATTCTCCAAGGTAAACCGATCACTATCTACCG
GGGTAAAAACCGTGTCGATTTGGCGAGGGATTTTACTTTCATCGACGACATAGTCAAAGG
ATGTTTAGGATCTCTTGACTCCTCGGGTAAAAGCACCGGGTCGGGTGGGAAGAAACGTGG
AGCCGCACCGTACCGGATCTTTAACCTAGGGAACACGTCTCCGGTTACGGTTCCCATCTT
GGTGGATATATTGGAGAAGCATCTCAAGGTGAAGGCGAAGAGGAACTTCGTGGAGATGCC
TGGAAACGGCGACGTTCCGTTCACGCACGCTAATATCAGCTCCGCCCGGAGAGAGTTCGG
GTATAAACCGACAACCGATTTGGAAACCGGTTTGAAGAAGTTCGTTAGATGGTATCTTTC
TTATTACGGGTACAATACTAAAGCCAAGCTTGGGCAATAACGGTGAAAATTTATTTTATA
TTATTTTTACACTCGGTTATTGTTGTTTATTTTCGTTTTGGGGGAGAGATGTTTATTACT
AGGATAATAGAAGAAAATCTAAATATTCTTTGCTCTTAAGACAAGCAAAGAAAAAAAGGA
CACCGAATCAAATCTATTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN30TF U 1
AF RR2DN30JQ C 95
BS 1 188 RR2DN30TF
BS 189 189 RR2DN30JQ
BS 190 271 RR2DN30TF
BS 272 743 RR2DN30JQ

RD RR2DN30TF 279 0 0
GCTCTACGCGGCGACAAAGAAAGCCGGTGAGGAAATCACCCACACTTATAATCATATTTA
CGGTCTTGCCATTACCGGTTTAAGATTCTTCACGGTTTACGGCCCCTGGGGTAGACCGGA
CATGGCTTACTTCTCATTCACGCGGAATATTCTCCAAGGTAAACCGATCACTATCTACCG
GGGTAAAA*CCGTGTCGATTTGGCGAGGGATTTTACTTTCATCGACGACATAGTCAAAGG
ATGTTTAGGATCTCTTGACTCCTCGGGTAAA
GCACCGGG

QA 1 271 1 271
DS 

RD RR2DN30JQ 649 0 0
GTTTACGGCCCCTGGGGTAGACCGGACATGGCTTACTTCTCATTCACGCGGAATATTCTC
CAAGGTAAACCGATCACTATCTACCGGGGTAAAAACCGTGTCGATTTGGCGAGGGATTTT
ACTTTCATCGACGACATAGTCAAAGGATGTTTAGGATCTCTTGACTCCTCGGGTAAAAGC
ACCGGGTCGGGTGGGAAGAAACGTGGAGCCGCACCGTACCGGATCTTTAACCTAGGGAAC
ACGTCTCCGGTTACGGTTCCCATCTTGGTGGATATATTGGAGAAGCATCTCAAGGTGAAG
GCGAAGAGGAACTTCGTGGAGATGCCTGGAAACGGCGACGTTCCGTTCACGCACGCTAAT
ATCAGCTCCGCCCGGAGAGAGTTCGGGTATAAACCGACAACCGATTTGGAAACCGGTTTG
AAGAAGTTCGTTAGATGGTATCTTTCTTATTACGGGTACAATACTAAAGCCAAGCTTGGG
CAATAACGGTGAAAATTTATTTTATATTATTTTTACACTCGGTTATTGTTGTTTATTTTC
GTTTTGGGGGAGAGATGTTTATTACTAGGATAATAGAAGAAAATCTAAATATTCTTTGCT
CTTAAGACAAGCAAAGAAAAAAAGGACACCGAATCAAATCTATTTTCTT

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL5312Contig1 744 2 3 U
GCTATCAAAGGATATTGTATTACAGCAACGCACCAATCTAATTCCTGGCGTTTTTAAAAC
ACAAAACATTCCAACATTTATGCTTCAGACAAGACTGTTTCTGGTCTTGAGACCGAACAG
ATTCTTGAGCAAATCTGCAGAGTTTGGAGGAATCTTGGCAGGTCGTGGAGCCATGAAGTT
GACAATCTTCTCATGCACATTATACCTGATCTTTCTGCTCTTAGAGGCACGCCGATCAAC
AACTTTCCTCTTCTTCGTTTGAAACTTCTTCATCGCATAAAAAGCCGCCTCTGAGGAAGC
TGGATCGATGGTCTCAAAGAACTCCTTTAGCAACTGCTGATAGAATTCTGCATCCTCCAC
TAGTTCAGGGTCTCCTTCAACTTGTTTTTCCTCTTTCTTGGGTTCCATGGTTTCCTCAGG
TACAGTTCCAAAAACAGCAACAGTTGACCTTGATTGTTGCATTTGTTTTATCATTCTACT
TGGATCCCTCATGTAAGAAGCAACCTGTTCACTAACGTTCTGGTTAAAGGCTTGGAGCTT
TCCTTTAATAGCAGCTGCACCAGTTGTGACTTGTGTTCTTCTCTGCCATTTGTCCACAGC
CTTGTTTCGGAACACACACATTCTTTTCTGCATGTCAGACACTCGGTGCCATTCATCGCT
ATCTTCCGCTTCTGATTTATTGGATTCGGTACCATTTGCTTGTTGGTCAACCGAGGGATT
CTTCTCAAACAAAGCCTCTTGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK66JQ U 490
AF RR2C151JQ U 1
BS 1 666 RR2C151JQ
BS 667 667 RR2AK66JQ
BS 668 744 RR2C151JQ

RD RR2AK66JQ 182 0 0
CATGTAAGAAGCAACCTGTTCACTAACGTTCTGGTTAAAGGCTTGGAGCTTTCCTTTAAT
AGCAGCTGCACCAGTTGTGACTTGTGTTCTTCTCTGCCATTTGTCCACAGCCTTGTTTCG
GAACACACACATTCTTTTCTGCATGTCAGACACTCGGTGCCATTCATCGCTATCTTCCGC
TT

QA 1 182 1 182
DS 

RD RR2C151JQ 744 0 0
GCTATCAAAGGATATTGTATTACAGCAACGCACCAATCTAATTCCTGGCGTTTTTAAAAC
ACAAAACATTCCAACATTTATGCTTCAGACAAGACTGTTTCTGGTCTTGAGACCGAACAG
ATTCTTGAGCAAATCTGCAGAGTTTGGAGGAATCTTGGCAGGTCGTGGAGCCATGAAGTT
GACAATCTTCTCATGCACATTATACCTGATCTTTCTGCTCTTAGAGGCACGCCGATCAAC
AACTTTCCTCTTCTTCGTTTGAAACTTCTTCATCGCATAAAAAGCCGCCTCTGAGGAAGC
TGGATCGATGGTCTCAAAGAACTCCTTTAGCAACTGCTGATAGAATTCTGCATCCTCCAC
TAGTTCAGGGTCTCCTTCAACTTGTTTTTCCTCTTTCTTGGGTTCCATGGTTTCCTCAGG
TACAGTTCCAAAAACAGCAACAGTTGACCTTGATTGTTGCATTTGTTTTATCATTCTACT
TGGATCCCTCATGTAAGAAGCAACCTGTTCACTAACGTTCTGGTTAAAGGCTTGGAGCTT
TCCTTTAATAGCAGCTGCACCAGTTGTGACTTGTGTTCTTCTCTGCCATTTGTCCACAGC
CTTGTTTCGGAACACACACATTCTTTTCTGCATGTCAGACACTCGGTGCCATTCATCGCT
ATCTTCTGCTTCTGATTTATTGGATTCGGTACCATTTGCTTGTTGGTCAACCGAGGGATT
CTTCTCAAACAAAGCCTCTTGCAC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL5313Contig1 1058 2 6 U
GATAGGAGAAGGCGGATCTGGCAACTTCGTTAAAATGGTTCATAATGGGATCGAGTACGG
GGATATGCAGCTCATCTCCGAGGCGTATGATGTTTTGAAGAACGTTGGGGGGGTTGAGTA
ATGATGAGCTGGCGGAGATTTTCATGGAGTGGAACCGAGGTGAGCTTGAAAGTTTCCTTG
TTGAGATTACTTCGGATATATTTAGGGTTAAGGATGAGTTTGGTGATGGGGAGTTGGTTG
ATAAGATTTTGGATAAGACTGGGATGAAAGGGACCGGGAAATGGACTGTTCAGCAGGCGG
CTGAGCTCTCCGTTGCGGCGCCGACTATCGCTGCGTCGTTGGATTGTAGGTACTTGAGTG
GGCTGAAGGAGGAGGGGGAGAATGCGGCGAAAGTCTTGGAGGAAGCTGGTTTGAAGGAGG
ATGTTGGGTCTGCATCGAGAGGAGTTGATAAGAAGAGGTTGATTGATGATGTGAGGCAAG
CTTTGTACGCTTCGAAGATATGTAGTTATGCTCAGGGGATGAATCTGCTTAGGGCGAAGA
GCGTGGAGAAAGAGTGGAACTTGAATCTTGGTGAGATGGCTCGGATCTGGAAAGGAGGGT
GTATTATCAGGGCGGTGTTCTTGAACAGGATCAAGAAAGCTTACCAGAGGAACCCGAACC
TTGCGAGCTTGGTGGTTGATCCTGATTTCGCTAAGGAGATGGTTCAGAGGCAGGCTGCGT
GGAGGAGAGTGGTGGGTTTGGCCATCTCTGCTGGGATAAGCACGCCTGGGATGTGCGCGA
GTCTTGCCTACTTTGATACTTACAGGCGTGCGAGACTGCCTGCGAATCTGGTTCAGGCGC
AGAGGGATCTCTTTGGAGCTCATACGTATGAGAGGACCGATCGTTCTGGTGCATACCACA
CGGAATGGACTAAGCTTGCTAGGAAGGGGAATTAGATTGTTGAGGTGATCCTCCTCTCTT
TCTCACGCTTTGTCTTGTGCTTAATTTGTGTTTGATTTTTCCCGAAAGCTTTTCATGTTA
TGTAGGGCTTTGTTTCCATGATTTCATCCTTTGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR58TF U 1
AF RR2DN58TF U 415
BS 1 472 RR2FR58TF
BS 473 473 RR2DN58TF
BS 474 594 RR2FR58TF
BS 595 595 RR2DN58TF
BS 596 606 RR2FR58TF
BS 607 1058 RR2DN58TF

RD RR2FR58TF 606 0 0
GATAGGAGAAGGCGGATCTGGCAACTTCGTTAAAATGGTTCATAATGGGATCGAGTACGG
GGATATGCAGCTCATCTCCGAGGCGTATGATGTTTTGAAGAACGTTGGGGGGGTTGAGTA
ATGATGAGCTGGCGGAGATTTTCATGGAGTGGAACCGAGGTGAGCTTGAAAGTTTCCTTG
TTGAGATTACTTCGGATATATTTAGGGTTAAGGATGAGTTTGGTGATGGGGAGTTGGTTG
ATAAGATTTTGGATAAGACTGGGATGAAAGGGACCGGGAAATGGACTGTTCAGCAGGCGG
CTGAGCTCTCCGTTGCGGCGCCGACTATCGCTGCGTCGTTGGATTGTAGGTACTTGAGTG
GGCTGAAGGAGGAGGGGGAGAATGCGGCGAAAGTCTTGGAGGAAGCTGGTTTGAAGGAGG
ATGTTGGGTCTGCATCGAGAGGAGTTGATAAGAAGAGGTTGATTGATGATGTTAGGCAAG
CTTTGTACGCTTCGAAGATATGTAGTTATGCTCAGGGGATGAATCTGCTTAGGGCGAAGA
GCGTGGAGAAAGAGTGGAACTTGAATCTTGGTGAGATGGCTCGGATCTGGAAAG*AGGGT
GTATTA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2DN58TF 644 0 0
G
GGAGGATGTTGGGTCTGCATCGAGAGGAGTTGATAAGAAGAGGTTGATTGATGATGTGAG
GCAAGCTTTGTACGCTTCGAAGATATGTAGTTATGCTCAGGGGATGAATCTGCTTAGGGC
GAAGAGCGTGGAGAAGGAGTGGAACTTGAATCTTGGTGAGATGGCTCGGATCTGGAAAGG
AGGGTGTATTATCAGGGCGGTGTTCTTGAACAGGATCAAGAAAGCTTACCAGAGGAACCC
GAACCTTGCGAGCTTGGTGGTTGATCCTGATTTCGCTAAGGAGATGGTTCAGAGGCAGGC
TGCGTGGAGGAGAGTGGTGGGTTTGGCCATCTCTGCTGGGATAAGCACGCCTGGGATGTG
CGCGAGTCTTGCCTACTTTGATACTTACAGGCGTGCGAGACTGCCTGCGAATCTGGTTCA
GGCGCAGAGGGATCTCTTTGGAGCTCATACGTATGAGAGGACCGATCGTTCTGGTGCATA
CCACACGGAATGGACTAAGCTTGCTAGGAAGGGGAATTAGATTGTTGAGGTGATCCTCCT
CTCTTTCTCACGCTTTGTCTTGTGCTTAATTTGTGTTTGATTTTTCCCGAAAGCTTTTCA
TGTTATGTAGGGCTTTGTTTCCATGATTTCATCCTTTGAAAAA

QA 2 644 2 644
DS 



AS 1 2

CO CL5314Contig1 577 2 8 U
GGAATATTGAAAATAAAGACAACAATTTCTACCCAAAAAAAAAGAAAATGGTGTCATTGT
TCTCTGTTGTTTTTACTGGTCTTGCTCTTATTCTCATCCCTGGGCTCTTCATCTCTTGGC
GTCTAAGTGTGCCTATCTCCTTCAAAAATATCCTCGGATTCATTAAGCTCATAACTTCTC
GGCACGATGATGAGGAAGAGAGGAACGAGAAACGTTACGAGGGAACTTATGTGAACGTGG
GAGAGGAGGGGACAACTTCAGGGCTTGTGAGAGAGCTGATGCCGAGACACGTGGCAGTGA
TAATGGACGGAAACAGGAGATGGGCCGAACGGGGCGGATTGCTGACGTTACAAGGCCACG
AGGCAGGAGCCAAACGGCTTTTAGAGTTCGCTGATCTCTGCTTCAAACTAGGGATAGAAA
CAGTGTCAGCTTTTGCTTTCTCCACTGAGAATTGGGGAAGACAAAAGGTCGAAGTTAATT
GCTTGATGTTTTTGTTCGAAAGATACCTCAACTCAAAGTTACAATATTTCAAAAGAGAGG
AGATCCGAGTTTCTGTTATTGGGAATCTTGAAAAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C060TF U 1
AF RR2F539TF U 26
BS 1 44 RR2C060TF
BS 45 45 RR2F539TF
BS 46 125 RR2C060TF
BS 126 126 RR2F539TF
BS 127 182 RR2C060TF
BS 183 183 RR2F539TF
BS 184 213 RR2C060TF
BS 214 577 RR2F539TF

RD RR2C060TF 213 0 0
GGAATATTGAAAATAAAGACAACAATTTCTACCCAAAAAAAAAGGAAATGGTGTCATTGT
TCTCTGTTGTTTTTACTGGTCTTGCTCTTATTCTCATCCCTGGGCTCTTCATCTCTTGGC
GTCTAGGTGTGCCTATCTCCTTCAAAAATATCCTCGGATTCATTAAGCTCATAACTTCTC
GGTACGATGATGAGGAAGAGAGGAACGAGAAAC

QA 1 213 1 213
DS 

RD RR2F539TF 552 0 0
TTTCTACCCTAAAAAAAAGAAAATGGTGTCATTGTTCTCTGTTGTTTTTACTGGTCTTGC
TCTTATTCTCATCCCTGGGCTCTTCATCTCTTGGCGTCTAAGTGTGCCTATCTCCTTCAA
AAATATCCTCGGATTCATTAAGCTCATAACTTCTCGGCACGATGATGAGGAAGAGAGGAA
CGAGAAACGTTACGAGGGAACTTATGTGAACGTGGGAGAGGAGGGGACAACTTCAGGGCT
TGTGAGAGAGCTGATGCCGAGACACGTGGCAGTGATAATGGACGGAAACAGGAGATGGGC
CGAACGGGGCGGATTGCTGACGTTACAAGGCCACGAGGCAGGAGCCAAACGGCTTTTAGA
GTTCGCTGATCTCTGCTTCAAACTAGGGATAGAAACAGTGTCAGCTTTTGCTTTCTCCAC
TGAGAATTGGGGAAGACAAAAGGTCGAAGTTAATTGCTTGATGTTTTTGTTCGAAAGATA
CCTCAACTCAAAGTTACAATATTTCAAAAGAGAGGAGATCCGAGTTTCTGTTATTGGGAA
TCTTGAAAAGAT

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL5315Contig1 933 2 4 U
GGGTCAACGGACACCATATCGGAAGGTACTGGAGTATCATTGCCCAAAAGGATGGATGTG
ACAGAACTTGTGATTACCGTGGAGCCTACCATTCAGATAAGTGCACAACAAATTGTGGAA
AGCCTACACAGACCGGGTACCATGTACCACGTTCTTGGTTGAAGCCTGACAGTAATCTAC
TAGTGCTCTTCGAAGAAACCGGGGGAGACCCGTTTAAAATCTCGGTTAAGACGGTTACCG
CTGGTGTTCTGTGCGGTCAAGTCTCGGAGTCGCATTATCCACCTCTGAGGAAATGGTCCA
CACCAGGTTTCATGAATGGAACAGTGTCGATAAACAGTGTGGCACCAGAGATGCATCTGC
GCTGTGAAGAAGGGCATGTAATATCCTCCATCGAGTTTGCTAGCTATGGAACTCCAAGAG
GTAGCTGCGAGAGGTTCTCTACCGGGAAATGCCACGCATCCAAATCGTTGTCAATCGTCT
CTGAGGCTTGTAGAGGACGTATCAGCTGCTTCATTGAAGTGTCGAATACTGCGTTTCAGA
GTGATCCATGTAGAGGAACTTTAAAGACATTAGCGGTTATGGCACGATGTTCGCCTTCTC
AGAACACGAGTTACCTCGGTTTTTCTTCGACAGCGTGAAACTGCTTCAGATTGATGAACA
ACTGTTTTTTTACATGACTATAATATCATGAAGAAGACCCAGTTGATCAACTAGTAAGAA
GAACATGCCTAATCACAAGGTTTTGGCTTTGATTTTTTGTTTTTTCAGAGAGTGAACAGT
TGGGGCTTGATTTAGTTTCATCGATGTGTCCATTTTCCACTTGAAACCAATAAACTCCGA
ACCATTTTGAATGTTTATGCATGTACAGTTTGTTGTTAATGTTTGGCAACACTCGGCTGT
TTGTAATGTTTTAGACTCGATTGTCATAAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU02TF U 1
AF RR2DU02JQ C 525
BS 1 694 RR2DU02TF
BS 695 695 RR2DU02JQ
BS 696 717 RR2DU02TF
BS 718 933 RR2DU02JQ

RD RR2DU02TF 717 0 0
GGGTCAACGGACACCATATCGGAAGGTACTGGAGTATCATTGCCCAAAAGGATGGATGTG
ACAGAACTTGTGATTACCGTGGAGCCTACCATTCAGATAAGTGCACAACAAATTGTGGAA
AGCCTACACAGACCGGGTACCATGTACCACGTTCTTGGTTGAAGCCTGACAGTAATCTAC
TAGTGCTCTTCGAAGAAACCGGGGGAGACCCGTTTAAAATCTCGGTTAAGACGGTTACCG
CTGGTGTTCTGTGCGGTCAAGTCTCGGAGTCGCATTATCCACCTCTGAGGAAATGGTCCA
CACCAGGTTTCATGAATGGAACAGTGTCGATAAACAGTGTGGCACCAGAGATGCATCTGC
GCTGTGAAGAAGGGCATGTAATATCCTCCATCGAGTTTGCTAGCTATGGAACTCCAAGAG
GTAGCTGCGAGAGGTTCTCTACCGGGAAATGCCACGCATCCAAATCGTTGTCAATCGTCT
CTGAGGCTTGTAGAGGACGTATCAGCTGCTTCATTGAAGTGTCGAATACTGCGTTTCAGA
GTGATCCATGTAGAGGAACTTTAAAGACATTAGCGGTTATGGCACGATGTTCGCCTTCTC
AGAACACGAGTTACCTCGGTTTTTCTTCGACAGCGTGAAACTGCTTCAGATTGATGAACA
ACTGTTTTTTTACATGACTATAATATCATGAAGA*GACCCAGTTGATCAACTAGTAA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2DU02JQ 409 0 0
AATACTGCGTTTCAGAGTGATCCATGTAGAGGAACTTTAAAGACATTAGCGGTTATGGCA
CGATGTTCGCCTTTTCAGAACACGAGTTACCTCGGTTTTTTTTTGACAGGGTGAAACTGC
TTCAGATTGATGAACAACTGTTTTTTTACATGACTATAATATCATGAAGAAGACCCAGTT
GATCAACTAGTAAGAAGAACATGCCTAATCACAAGGTTTTGGCTTTGATTTTTTGTTTTT
TCAGAGAGTGAACAGTTGGGGCTTGATTTAGTTTCATCGATGTGTCCATTTTCCACTTGA
AACCAATAAACTCCGAACCATTTTGAATGTTTATGCATGTACAGTTTGTTGTTAATGTTT
GGCAACACTCGGCTGTTTGTAATGTTTTAGACTCGATTGTCATAAATGC

QA 1 409 1 409
DS 



AS 1 2

CO CL5316Contig1 428 2 5 U
GAATAGTCCATCACTTGTGACTTGATAGTTGTCTTTATACTTTCAACATTTTGTCTCTAC
ACTTCAAATACAAAAACACAAAATGTTTAATACAAAGCTGAAAAAAAAAACTCTCATAGG
ATTGATTTTCAATAAACACAAACATCATCTCTTTGCTTCTTAGTTGATGTGCTATACTGG
ACATGTCCAATCAATCAAATTATCGCCACAACGGAACAACATTCGTGATGCGTCTTCATC
TCATCTCATGTAATAAGACACTTTGTCAGTTCAGAAACTATTCAGGAGAGAAGAGAGTTG
CTAAACCTTGATCAACTGTTATTTGAAGCTTCCCATAAGACATCAACGCCTTTTCATCAC
ATTTATACGATCTTCTTCCCCTTGCTAATACCTCTCCGTCTGAATCTATGATTCCTTCCT
TGTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G185JQ U 9
AF RR2G185TF C 1
BS 1 8 RR2G185TF
BS 9 12 RR2G185JQ
BS 13 13 RR2G185TF
BS 14 204 RR2G185JQ
BS 205 428 RR2G185TF

RD RR2G185JQ 197 0 0
CATCCCTTGTGACTTGATAGTTGTCTTTATACTTTCAACATTTTGTCTCTACACTTCAAA
TACAAAAACACAAAATGTTTAATACAAAGCTGAAAAAAAAAACTCTCATAGGATTGATTT
TCAATAAACACAAACATCATCTCTTTGCTTCTTAGTTGATGTGCTATACTGGACATGTCC
AATCAATCAAATTATC
C

QA 1 196 1 196
DS 

RD RR2G185TF 428 0 0
GAATAGTCCATCACTTGTGACTTGATAGTTGTCTTTATACTTTCAACATTTTGTCTCTAC
ACTTCAAATACAAAAACACAGAATGTTTAATACAAAGCTGAGAAAGAAAACTCTCATAGG
ATTGATTTTCAATAGACACAAACATCATCTCTTTGCTTCTTAGTTGATGTGCTATACTGT
ACATGTCCAATCAATCAAATTATCGCCACAACGGAACAACATTCGTGATGCGTCTTCATC
TCATCTCATGTAATAAGACACTTTGTCAGTTCAGAAACTATTCAGGAGAGAAGAGAGTTG
CTAAACCTTGATCAACTGTTATTTGAAGCTTCCCATAAGACATCAACGCCTTTTCATCAC
ATTTATACGATCTTCTTCCCCTTGCTAATACCTCTCCGTCTGAATCTATGATTCCTTCCT
TGTCTTCC

QA 1 428 1 428
DS 



AS 1 2

CO CL5317Contig1 1255 2 2 U
GGTTCTTACCAAACACAACAACAACAATGTCGGTTTATCATCACCTCCTCCTCTCGACCT
CTCCTTCGCTTGTTCTTCCTCCTCGCCGACCCAACTTCAGCTCAATCCACCGGATACCAC
CAGCTCACCCTTGTCTCACAAAATTCCCCACCTCGCCTTCTTCGTCTCTACCAGTAATTC
GGAAAATACTCGTACGCAGCACTCTCCGAGAAGACCCCGTCTCTCCGGACGCAGAGAGTC
CAACTCTGCTGATCGGAGAAGACTGCTGCTTTCGAATTAGGCAAACAGAAGCTTGTTTCC
TGGGTCTATTTCGGTGTTATCCTCGGAGTCGTCCTCTACATCCTCAACGTGGTCTGGATC
GATAACTCCACCGGTTTCGGTAAATCATACATCGACACCGTCTCCGCCGTCTCCGGCTCG
CCGGAGGTGGCGATGTTAATGCTTATACTCATATTCGCAACTGTGCACAGTGGATTAGCT
AGTCTCAGAGATGTAGGAGAGAAACTCATAGGTGAACGAGCGTTTCGTGTTCTGTTTGCT
GGAGTCTCTCTTCCTTTAGCTATGAGCACCATTGTTTTCTTTATAAACCATAGATACGAT
GGGTCACAGTTATGGCAGCTTAGGGTGTTCCGGGTCTCCATGAAGCTATCTGGTTCGCTA
ACTTTGTCTCCTTCTTCTTTCTCTATCCTTCTACCTTCAATCTTCTGGAGGTGGCTGCTG
TTGATAAACCCAAGATGCATCTCTGGGAGACTGGCATCATGAGAATCACTCGCCATCCTC
AGATGGTTGGACAAATAGTTTGGTGTTTGGCACACACTCTCTGGATTGGAAACTCAGTTG
CTGCGTCAGCTTCTCTTGGTTTGATTGCACACCATTTGTTTGGAGCGTGGAACGGAGACA
GGAGATTGGCTAAAAGATACGGAGATGCTTTCCAAGGCATCAAGAAGAGAACGAGTGTGA
TTCCTTTTGCTGCCATTATCGAAGGACGCCAAGTTTTGCCTGAGGATTACTACAAAGAGT
TTGTTCGGTTGCCTTATCTTGCAATCACGGCGTTAACAGTTGGGGCCTATTTTGCTCACC
CGCTAATGCAAGGTGCAAGCTTCAGGCTTCATTGGTAGATTCTTTTTATTATCTCATGGT
ATATTCAAAGAGGGAGTTCCTCGTAAAAACTTCTCAAGGAACAATGTATAATTATTTTCC
TACAAAAAAAAGAACTGTATAAATACAAAAAACTACTGCTTGTAATATTTTATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G887TF U 1
AF RR2G887JQ C 458
BS 1 629 RR2G887TF
BS 630 1255 RR2G887JQ

RD RR2G887TF 629 0 0
GGTTCTTACCAAACACAACAACAACAATGTCGGTTTATCATCACCTCCTCCTCTCGACCT
CTCCTTCGCTTGTTCTTCCTCCTCGCCGACCCAACTTCAGCTCAATCCACCGGATACCAC
CAGCTCACCCTTGTCTCACAAAATTCCCCACCTCGCCTTCTTCGTCTCTACCAGTAATTC
GGAAAATACTCGTACGCAGCACTCTCCGAGAAGACCCCGTCTCTCCGGACGCAGAGAGTC
CAACTCTGCTGATCGGAGAAGACTGCTGCTTTCGAATTAGGCAAACAGAAGCTTGTTTCC
TGGGTCTATTTCGGTGTTATCCTCGGAGTCGTCCTCTACATCCTCAACGTGGTCTGGATC
GATAACTCCACCGGTTTCGGTAAATCATACATCGACACCGTCTCCGCCGTCTCCGGCTCG
CCGGAGGTGGCGATGTTAATGCTTATACTCATATTCGCAACTGTGCACAGTGGATTAGCT
AGTCTCAGAGATGTAGGAGAGAAACTCATAGGTGAACGAGCGTTTCGTGTTCTGTTTGCT
GGAGTCTCTCTTCCTTTAGCTATGAGCACCATTGTTTTCTTTATAAACCATAGATACGAT
GGGTCACAGTTATGGCAGCTTAGGGTGTT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2G887JQ 798 0 0
CAACTGTGCACAGTGGATTAGCTAGTCTCAGAGATGTAGGAGAGAAACTCATAGGTGAAC
GAGCGTTTCGTGTTCTGTTTGCTGGAGTCTCTCTTCCTTTAGCTATGAGCACCATTGTTT
TCTTTATAAACCATAGATACGATGGGTCACAGTTATGGCAGCTTAGGGTGTTCCGGGTCT
CCATGAAGCTATCTGGTTCGCTAACTTTGTCTCCTTCTTCTTTCTCTATCCTTCTACCTT
CAATCTTCTGGAGGTGGCTGCTGTTGATAAACCCAAGATGCATCTCTGGGAGACTGGCAT
CATGAGAATCACTCGCCATCCTCAGATGGTTGGACAAATAGTTTGGTGTTTGGCACACAC
TCTCTGGATTGGAAACTCAGTTGCTGCGTCAGCTTCTCTTGGTTTGATTGCACACCATTT
GTTTGGAGCGTGGAACGGAGACAGGAGATTGGCTAAAAGATACGGAGATGCTTTCCAAGG
CATCAAGAAGAGAACGAGTGTGATTCCTTTTGCTGCCATTATCGAAGGACGCCAAGTTTT
GCCTGAGGATTACTACAAAGAGTTTGTTCGGTTGCCTTATCTTGCAATCACGGCGTTAAC
AGTTGGGGCCTATTTTGCTCACCCGCTAATGCAAGGTGCAAGCTTCAGGCTTCATTGGTA
GATTCTTTTTATTATCTCATGGTATATTCAAAGAGGGAGTTCCTCGTAAAAACTTCTCAA
GGAACAATGTATAATTATTTTCCTACAAAAAAAAGAACTGTATAAATACAAAAAACTACT
GCTTGTAATATTTTATCA

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

CO CL5318Contig1 1392 2 2 U
CGTAATAGCAAAGTGAAAAAGTGGCCCAGAGAATAAAAAATTCTATAATCATTCGTATGT
TTTGAATAATTTACCAAGACACAAATCATTTGATCCAAGAAGCGTTGACATTCCAAAGTT
TTCTCTGAAGCAAAATGGCGATTTGGTTTCAGAGAATCTTCCTGTTGCTTCTCGTTTCTA
GTTGCGCATCTTCAGATTTTCTTGAAAATTCAAACTTCGAATCTCTACCATTAAACCTAT
CTTCAAATGCAAGCTCTAGTGCCTTCCTGTTGCTGGATCAGAACACTACACTTCCTGGAT
GGACATTCCAAGGAACAGTACAATATGTTACTTCACCTGACCTTCCTGATTCTGGACACG
CGGTTCAGCTCGGTGAAGATGGCCAGATCAATCAAACATTCATTGCCAAAGGCGATGATT
TGAACTACGTCCTCACATTCGCTCTGATCCCCGGAGGCCAGAACTGTTCCGTCTCTGCTG
GTCTCAGTGTCTCGGGACCAGACAGCAGTTCTTTTTTTCTTACAGGCATAATTACAGCAA
GGTCTCATGGCAGAGCTACAGTCATAACTTGGGTAAATGGGGGGAATGGTGAGCCTATCA
ACCTCGTTCTTGAAAGCCAGGCAATAGATGCTGATACAAACTCCACATGTTGGCCTATTG
TTGATACATTACTCATCAAGACGGTTGGTGTAACACTGGGTCAAGACAGTGTTAATCTCT
TAACCAATGGTGGATTTGAATCTGGACCGGGTTTCTTACCCAACTCAACCGAGGGAGTTC
TGATTGGCGCAGTACCAAGTCTGATCCAGTCAGCATTAACGCAGTGGTCTATCATAGGAA
CAGTCAGATACATAGACTCGGACCACTTCCATGTCCCAGAAGGCAAAGCTGCGGTAGAAA
TTCTGGCTGACACAGCTCCATCAGGTATACAGACAGCAACAAGAGACACAAGTGAAGGTT
CGAGATACAACCTCACATTTACATTAGGAGATGCCAACGATGCATGCGTGGGACATTTTA
TTGTCGGTGTTCAAGCTGGATCCGCAGCTCAAAACTTCACACTGGAGAGCAATGGGACTG
GCTTTGGTGAGAAGTTTGGGTTAGTGTTTGAAGCAGACAAAGATGCAGCACAGATAAGTT
TCACCAGCTACTCGGTTACAATAACAAAAGAGGATGTTCTTTGTGGACCTGTGATTGATG
AAGTGAACGTACATCCTCTTGGTGGAAAAGCCTCGTTAAAACCTACATGGTTGCTTCTTA
TTTTCGCTCTGTTGTATGTTGCAGTTCTCTGATTGAATCTGTTTGGGAGAGAGATTATAA
ACACATCTTTTATGCAAGGAGATGTAAACACATTGATTTATATCGTTTGGTTCTCAAATG
CATTCTTCATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ33TF U 1
AF RR2AQ33JQ C 592
BS 1 762 RR2AQ33TF
BS 763 1392 RR2AQ33JQ

RD RR2AQ33TF 768 0 0
CGTAATAGCAAAGTGAAAAAGTGGCCCAGAGAATAAAAAATTCTATAATCATTCGTATGT
TTTGAATAATTTACCAAGACACAAATCATTTGATCCAAGAAGCGTTGACATTCCAAAGTT
TTCTCTGAAGCAAAATGGCGATTTGGTTTCAGAGAATCTTCCTGTTGCTTCTCGTTTCTA
GTTGCGCATCTTCAGATTTTCTTGAAAATTCAAACTTCGAATCTCTACCATTAAACCTAT
CTTCAAATGCAAGCTCTAGTGCCTTCCTGTTGCTGGATCAGAACACTACACTTCCTGGAT
GGACATTCCAAGGAACAGTACAATATGTTACTTCACCTGACCTTCCTGATTCTGGACACG
CGGTTCAGCTCGGTGAAGATGGCCAGATCAATCAAACATTCATTGCCAAAGGCGATGATT
TGAACTACGTCCTCACATTCGCTCTGATCCCCGGAGGCCAGAACTGTTCCGTCTCTGCTG
GTCTCAGTGTCTCGGGACCAGACAGCAGTTCTTTTTTTCTTACAGGCATAATTACAGCAA
GGTCTCATGGCAGAGCTACAGTCATAACTTGGGTAAATGGGGGGAATGGTGAGCCTATCA
ACCTCGTTCTTGAAAGCCAGGCAATAGATGCTGATACAAACTCCACATGTTGGCCTATTG
TTGATACATTACTCATCAAGACGGTTGGTGTAACACTGGGTCAAGACAGTGTTAATCTCT
TAACCAATGGTGGATTTGAATCTGGACCGGGTTTCTTACCCA
CTCACC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2AQ33JQ 801 0 0
AGCCTATCAACCTCGTTCTTGAAAGCCAGGCAATAGATGCTGATACAAACTCCACATGTT
GGCCTATTGTTGATACATTACTCATCAAGACGGTTGGTGTAACACTGGGTCAAGACAGTG
TTAATCTCTTAACCAATGGTGGATTTGAATCTGGACCGGGTTTCTTACCCAACTCAACCG
AGGGAGTTCTGATTGGCGCAGTACCAAGTCTGATCCAGTCAGCATTAACGCAGTGGTCTA
TCATAGGAACAGTCAGATACATAGACTCGGACCACTTCCATGTCCCAGAAGGCAAAGCTG
CGGTAGAAATTCTGGCTGACACAGCTCCATCAGGTATACAGACAGCAACAAGAGACACAA
GTGAAGGTTCGAGATACAACCTCACATTTACATTAGGAGATGCCAACGATGCATGCGTGG
GACATTTTATTGTCGGTGTTCAAGCTGGATCCGCAGCTCAAAACTTCACACTGGAGAGCA
ATGGGACTGGCTTTGGTGAGAAGTTTGGGTTAGTGTTTGAAGCAGACAAAGATGCAGCAC
AGATAAGTTTCACCAGCTACTCGGTTACAATAACAAAAGAGGATGTTCTTTGTGGACCTG
TGATTGATGAAGTGAACGTACATCCTCTTGGTGGAAAAGCCTCGTTAAAACCTACATGGT
TGCTTCTTATTTTCGCTCTGTTGTATGTTGCAGTTCTCTGATTGAATCTGTTTGGGAGAG
AGATTATAAACACATCTTTTATGCAAGGAGATGTAAACACATTGATTTATATCGTTTGGT
TCTCAAATGCATTCTTCATAG

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL5319Contig1 733 2 3 U
GGAATCAAACACACTCATTCATTCTCCATCGTCGTCGGATACAACGGTCTGTTCCAATGG
CGGATAACACTGATAACCGGAGAGCGATATGGGGAGTTCCGGAGAAGCTTCAGCTTCACA
TAGCCATGCTCACGTTACAATTCGGTTACGCTGGATTCCACGTGGTCTCGAGAGCTGCTC
TAAATATGGGAATCAGCAAACTCGTCTTTCCTGTTTATCGTAACATCATCGCCTTGCTTC
TTCTCCTTCCCTTTGCTTACTTCCTCGAAAAGAAGGAGAGACCAGCGATTACTCTAAACT
TTCTCATCCAGTTCTTCTTTTTGGCACTCATCGGAATAACAGCGAACCAAGGGTTTTACT
TACTGGGACTGGACAACACTTCACCAACATTTGCTTCTTCCATGCAAAACTCTGTCCCAG
CCATTACCTTTCTCATGGCTGCTCTTCTCAGGATTGAGAAAGTTAGAATAAACAGAAGAG
ACGGTATCTCCAAAGTCTTAGGAACAGCTCTTTGCGTAGCCGGAGCTTCCGTCATCACTC
TCTACAAGGGTCCAACCATCTACACTCCCACTAGCCACCTCCACGCCCACCTTCTCACCA
CCAACCCAGCCGTACTAGCGCCGCTTGGAGACGCCGCGCCGAAAACTGGACTCTTGGTTA
CCTCTACCTAATTGGTCACTGTCTCTCCTGGTCCGGTTGGCTCGTGTTTCAAGCTCCGTT
CTAAATCATACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT51TF U 274
AF RR2CG58TF U 1
BS 1 361 RR2CG58TF
BS 362 362 RR2BT51TF
BS 363 733 RR2CG58TF

RD RR2BT51TF 175 0 0
AGGAGAGACCAGCGATTACTCTAAACTTTCTCATCCAGTTCTTCTTTTTGGCACTCATCG
GAATAACAGCGAACCAAGGGTTTTACTTACTGGGACTGGACAACACTTCACCAACATTTG
CTTCTTCCATGCAAAACTCTGTCCCAGCCATTACCTTTCTCATGGCTGCTCTTCT

QA 1 175 1 175
DS 

RD RR2CG58TF 733 0 0
GGAATCAAACACACTCATTCATTCTCCATCGTCGTCGGATACAACGGTCTGTTCCAATGG
CGGATAACACTGATAACCGGAGAGCGATATGGGGAGTTCCGGAGAAGCTTCAGCTTCACA
TAGCCATGCTCACGTTACAATTCGGTTACGCTGGATTCCACGTGGTCTCGAGAGCTGCTC
TAAATATGGGAATCAGCAAACTCGTCTTTCCTGTTTATCGTAACATCATCGCCTTGCTTC
TTCTCCTTCCCTTTGCTTACTTCCTCGAAAAGAAGGAGAGACCAGCGATTACTCTAAACT
TTCTCATCCAGTTCTTCTTTTTGGCACTCATCGGAATAACAGCGAACCAAGGGTTTTACT
TGCTGGGACTGGACAACACTTCACCAACATTTGCTTCTTCCATGCAAAACTCTGTCCCAG
CCATTACCTTTCTCATGGCTGCTCTTCTCAGGATTGAGAAAGTTAGAATAAACAGAAGAG
ACGGTATCTCCAAAGTCTTAGGAACAGCTCTTTGCGTAGCCGGAGCTTCCGTCATCACTC
TCTACAAGGGTCCAACCATCTACACTCCCACTAGCCACCTCCACGCCCACCTTCTCACCA
CCAACCCAGCCGTACTAGCGCCGCTTGGAGACGCCGCGCCGAAAACTGGACTCTTGGTTA
CCTCTACCTAATTGGTCACTGTCTCTCCTGGTCCGGTTGGCTCGTGTTTCAAGCTCCGTT
CTAAATCATACCC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL5320Contig1 700 2 5 U
TTTTTTCACATTGTTTCTTTTACCTTCCCCGCGATTCAAACCAAGACCATGCGCTGGATC
CGTAGACTCGACCTCATCGATCCCTACTACTACACCTGTTCTCCTCCTCCTCTCGCCGTC
CGAGAAACCTCCATTGTCAAACCTTCATCCTCATTCTTTCCTTCCTCCATCCACCACGAC
GACGACGATGTCGAAGAAGATCTGGCTCTCCCTTTCGCACTCTCACCACCTGATCTGTTC
GAGGATCTGGTCCAGATCGAGAAATCTCCTTCCTCTTGCAAGTACCAGCTGATTCGCCGC
AGGGTGGAGGAGGAGTATCCTTTGCACTATCTCTGCCACCGAGTCTCCGAGCTGGAAACC
AAGTTCGACCGTTTGGTCGGAGGAGGACGCGGTGGCGGTTCCGACAGGAAGTATAAACTG
ACGAAGGAGATCAAGGGCTCTGGAGAGAGGAAGTACAAATGGGAGGCCGAGGTTCAAGAG
AGGAAGTACAAGTGGGAAGCGGAGTTTGATGGTCCTGCTGGGGACAGGAAGTACACGTGG
ACGACTGAGATTAAAGGCGGGAAGAAGAAGAAGAATGATGTAGCTGCTCTGAAGAAGGCC
AAAGCTGATGCTGAGGAGAAGAAGAAGAAGGAGATGGAGGCGAAGAAGAAGAAGAGTACA
TTGGACGACAGAGTTGAAGTCAGAGAGGAGAACGAGAGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY47TF U 1
AF RR2BT80TF U 1
BS 1 106 RR2BT80TF
BS 107 107 RR2DY47TF
BS 108 166 RR2BT80TF
BS 167 167 RR2DY47TF
BS 168 700 RR2BT80TF

RD RR2DY47TF 184 0 0
TTTTTTCACATTGTTTCTTTTACCTTCCCCGCGATTCAAACCAAGACCATGCGCTGGATC
CGTAGACTCGACCTCATCGATCCCTACTACTACACCTGTTCTCCTCCTCCTCTCGCCGTC
CGAGAAACCTCCATTGTCAAACCTTCATCCTCATTCTTTCCTTCCTCC*TCCACCACGAC
GACG

QA 1 184 1 184
DS 

RD RR2BT80TF 700 0 0
TTTTTTCACATTGTTTCTTTTACCTTCCCCGCGATTCAAACCAAGACCATGCGCTGGATC
CGTAGACTCGACCTCATCGATCCCTACTACTACACCTGTTCTCCTC*TCCTCTCGCCGTC
CGAGAAACCTCCATTGTCAAACCTTCATCCTCATTCTTTCCTTCCTTCATCCACCACGAC
GACGACGATGTCGAAGAAGATCTGGCTCTCCCTTTCGCACTCTCACCACCTGATCTGTTC
GAGGATCTGGTCCAGATCGAGAAATCTCCTTCCTCTTGCAAGTACCAGCTGATTCGCCGC
AGGGTGGAGGAGGAGTATCCTTTGCACTATCTCTGCCACCGAGTCTCCGAGCTGGAAACC
AAGTTCGACCGTTTGGTCGGAGGAGGACGCGGTGGCGGTTCCGACAGGAAGTATAAACTG
ACGAAGGAGATCAAGGGCTCTGGAGAGAGGAAGTACAAATGGGAGGCCGAGGTTCAAGAG
AGGAAGTACAAGTGGGAAGCGGAGTTTGATGGTCCTGCTGGGGACAGGAAGTACACGTGG
ACGACTGAGATTAAAGGCGGGAAGAAGAAGAAGAATGATGTAGCTGCTCTGAAGAAGGCC
AAAGCTGATGCTGAGGAGAAGAAGAAGAAGGAGATGGAGGCGAAGAAGAAGAAGAGTACA
TTGGACGACAGAGTTGAAGTCAGAGAGGAGAACGAGAGAT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL5321Contig1 1220 2 2 U
GTCTCTTTCAAACAATGGCTTTTCCTCGCTTTGAGATACTTGTGATCTGTGTCTTGTCTC
TCTTCTTTGTTCTTGCCCACTCCAAGACGTTGAAGCGTGATGTGAAAGCTTTGAATGAAA
TCAAAGCCTCTTTGGGATGGAGAGTGGTGTATTCATGGGTTGGTGATGACCCTTGTGGAG
ATGGAGATCTTCCTCCTTGGTCTGGTGTCACCTGTTCTACACAAGGTGACTATAGGGTTG
TCACAGAACTAGAAGTTTACGCGGTTTCTATTGTGGGACCGTTCCCCATTGCAGTAACAA
ACCTTTTGGATTTGACCAGACTGGATCTACATAACAACAAGCTGACTGGTCCAATCCCTC
CACAGGTTGGGAGACTGAAAAGGCTCAAAGTACTGAACCTGAGGTGGAATAAACTACAAG
ATGTGATTCCCCCTGAGATTGGGGAGCTGAAGAGGCTAACACATTTGTACTTGAGCTTCA
ATAGCTTCAAAGGAGAGATTCCAAAGGAGTTAGCTGCTCTCCCCGAGCTTCGGTATCTAT
ATCTTCAAGAAAACCGTCTCATTGGTAGAATACCTGCTGAGCTAGGGACACTTCAAAACC
TCCGCCACCTAGACGTTGGTAACAATCATTTGGTGGGAACTATACGGGAGCTCATTCGTT
TTGATGGTAGCTTCCCATCTCTTCGCAACCTGTACTTGAATAATAACTATTTGAGTGGAG
GAGTCCCTGCTCAGCTTTCTAATCTTTCCAGCTTAGAGATTGTGTACTTGTCTTACAACA
AGCTTATTGGAAACATTCCTTTTGCCATTTCTCATATTCCTAAGTTGACATTCCTGTATC
TTGATCACAACCAATTTACTGGGAGAATCCCAGATGCGTTCTACAAGCATCCATTCCTCA
AAGAAATGTACATTGAAGGCAACATGTTCAAACAAGGGACAAAACCAATTGGCACTCACA
TAGTTCTAGAAGTTTCTGATTCCGATTTTGTCGTGTGAAGGGGTAGGAGAGATACTAGTT
GGTTCCAAGAGAACAATGTCTCAGAACTACCTAGAGATGGTTCCACTTTAGCTTTCTTCA
TTACACTTCTTTGTATGGTCTTGAATTCTTGATCTTTCCTTTTGCAAATGGAAGAAAGCT
TAGACTACAAGTTTTTTTTTTATCTTCATATTGTATAGTTAAGACATATACTACTAATTT
TTATTGAACTTATCTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR23TF U 1
AF RR2CR23JQ C 524
BS 1 642 RR2CR23TF
BS 643 1220 RR2CR23JQ

RD RR2CR23TF 642 0 0
GTCTCTTTCAAACAATGGCTTTTCCTCGCTTTGAGATACTTGTGATCTGTGTCTTGTCTC
TCTTCTTTGTTCTTGCCCACTCCAAGACGTTGAAGCGTGATGTGAAAGCTTTGAATGAAA
TCAAAGCCTCTTTGGGATGGAGAGTGGTGTATTCATGGGTTGGTGATGACCCTTGTGGAG
ATGGAGATCTTCCTCCTTGGTCTGGTGTCACCTGTTCTACACAAGGTGACTATAGGGTTG
TCACAGAACTAGAAGTTTACGCGGTTTCTATTGTGGGACCGTTCCCCATTGCAGTAACAA
ACCTTTTGGATTTGACCAGACTGGATCTACATAACAACAAGCTGACTGGTCCAATCCCTC
CACAGGTTGGGAGACTGAAAAGGCTCAAAGTACTGAACCTGAGGTGGAATAAACTACAAG
ATGTGATTCCCCCTGAGATTGGGGAGCTGAAGAGGCTAACACATTTGTACTTGAGCTTCA
ATAGCTTCAAAGGAGAGATTCCAAAGGAGTTAGCTGCTCTCCCCGAGCTTCGGTATCTAT
ATCTTCAAGAAAACCGTCTCATTGGTAGAATACCTGCTGAGCTAGGGACACTTCAAAACC
TCCGCCACCTAGACGTTGGTAACAATCATTTGGTGGGAACTA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2CR23JQ 697 0 0
CGAGCTTCGGTATCTATATCTTCAAGAAAACCGTCTCATTGGTAGAATACCTGCTGAGCT
AGGGACACTTCAAAACCTCCGCCACCTAGACGTTGGTAACAATCATTTGGTGGGAACTAT
ACGGGAGCTCATTCGTTTTGATGGTAGCTTCCCATCTCTTCGCAACCTGTACTTGAATAA
TAACTATTTGAGTGGAGGAGTCCCTGCTCAGCTTTCTAATCTTTCCAGCTTAGAGATTGT
GTACTTGTCTTACAACAAGCTTATTGGAAACATTCCTTTTGCCATTTCTCATATTCCTAA
GTTGACATTCCTGTATCTTGATCACAACCAATTTACTGGGAGAATCCCAGATGCGTTCTA
CAAGCATCCATTCCTCAAAGAAATGTACATTGAAGGCAACATGTTCAAACAAGGGACAAA
ACCAATTGGCACTCACATAGTTCTAGAAGTTTCTGATTCCGATTTTGTCGTGTGAAGGGG
TAGGAGAGATACTAGTTGGTTCCAAGAGAACAATGTCTCAGAACTACCTAGAGATGGTTC
CACTTTAGCTTTCTTCATTACACTTCTTTGTATGGTCTTGAATTCTTGATCTTTCCTTTT
GCAAATGGAAGAAAGCTTAGACTACAAGTTTTTTTTTTATCTTCATATTGTATAGTTAAG
ACATATACTACTAATTTTTATTGAACTTATCTTTCAT

QA 1 697 1 697
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5324Contig1 1068 2 2 U
GGGAGACTGCACGACCTTTTGAGCTTGTGTTGCAAAAAGAAAAAAAAAGGACCTTTTGAG
CTTTGAGACCTTTTTGAAGCTGTACACCAACTGTTCGACGAATTGCTCCAGGGAGTTTCT
AAAACAGAAGGGCTTATGGAGGAAGAAAACTGGGAAGTATCCTCTTCAAGCGAGAACGAA
GATGCTGGTTTTGCGATTGATGACGACGAAGAGTTTCAATCAGGACCCAAGTTACAATTC
AGAGTTGGATCTTCAAAGGCTCGTTGGGTTACAGAGTTAGGAATGGCTGAAGTTGAGGTC
AAAAGAGGGAAGCTTTGGACAACAACTGGAATCATTCGTAGCGGAAAGACATACTGTTTC
ATAGAAGAGGCTTTGTATTTGAGGGAGATAGGAGAGTTGCAGATCTTGGGTAATGAAGAT
GATGATGATGTAGTGATCCCACTGAAGGGTTTGTATGAGATGATTGCAGAGGAAAAAAGT
GGATGCTGTTCGGAAAGCTATGAGGTTTATAGATACTTGAAGGGTCTAGGTTACATTCTA
GGCAGGCATGGAGTTCCTTGGACGTCAAAGGGTGCTGCTACCATGACACCAAGTGGTGGT
GAATGTCCTGAAGAGGATGATACTGTCACTAAACTGTTGGGAGATATGCAACTCTGTGAT
GCAAGAGCCGTGTTTGACGTGTATTTGCCAAACAGCCGGTTCAAGAAGTCTTCTCCTGGT
GAACCTAGCTTTGTGGCTTGCTTATCAGGGGACTCTACACCAAGCAAAGAAGATGTTAGA
GTCCTGCAAAGCCGCATAGCTGCACCGTTGAGGTTCTGTCATATCGCTCAGGGCCGTGTT
AGTCTCTTTTCATTCAGTTCCATAAACCTCCCTGTCTTACCATAAAATGTAACCAAAAAG
AAAAAAGAAAAACCAAAATGTTTTGTATTCTTTAGAATACTAGACAAAGTAACTGAGAGT
TTTACACACACTTTGAGTAATCTTGATGATGCTTATTCATGAGGGAATATGTACTACAAC
TTCTTATTTATTTTCTACAAGGCATTTAGTAAGAATCTTCCTTGGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G403TF U 1
AF RR2G403JQ C 530
BS 1 703 RR2G403TF
BS 704 1068 RR2G403JQ

RD RR2G403TF 706 0 0
GGGAGACTGCACGACCTTTTGAGCTTGTGTTGCAAAAAGAAAAAAAAAGGACCTTTTGAG
CTTTGAGACCTTTTTGAAGCTGTACACCAACTGTTCGACGAATTGCTCCAGGGAGTTTCT
AAAACAGAAGGGCTTATGGAGGAAGAAAACTGGGAAGTATCCTCTTCAAGCGAGAACGAA
GATGCTGGTTTTGCGATTGATGACGACGAAGAGTTTCAATCAGGACCCAAGTTACAATTC
AGAGTTGGATCTTCAAAGGCTCGTTGGGTTACAGAGTTAGGAATGGCTGAAGTTGAGGTC
AAAAGAGGGAAGCTTTGGACAACAACTGGAATCATTCGTAGCGGAAAGACATACTGTTTC
ATAGAAGAGGCTTTGTATTTGAGGGAGATAGGAGAGTTGCAGATCTTGGGTAATGAAGAT
GATGATGATGTAGTGATCCCACTGAAGGGTTTGTATGAGATGATTGCAGAGGAAAAAAGT
GGATGCTGTTCGGAAAGCTATGAGGTTTATAGATACTTGAAGGGTCTAGGTTACATTCTA
GGCAGGCATGGAGTTCCTTGGACGTCAAAGGGTGCTGCTACCATGACACCAAGTGGTGGT
GAATGTCCTGAAGAGGATGATACTGTCACTAAACTGTTGGGAGATATGCAACTCTGTGAT
GCAAGAGCCGTGTTTGACGTGTATTTGCCAAACAGCCGGTTCA
GAA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2G403JQ 539 0 0
GTTACATTCTAGGCAGGCATGGAGTTCCTTGGACGTCAAAGGGTGCTGCTACCATGACAC
CAAGTGGTGGTGAATGTCCTGAAGAGGATGATACTGTCACTAAACTGTTGGGAGATATGC
AACTCTGTGATGCAAGAGCCGTGTTTGACGTGTATTTGCCAAACAGCCGGTTCAAGAAGT
CTTCTCCTGGTGAACCTAGCTTTGTGGCTTGCTTATCAGGGGACTCTACACCAAGCAAAG
AAGATGTTAGAGTCCTGCAAAGCCGCATAGCTGCACCGTTGAGGTTCTGTCATATCGCTC
AGGGCCGTGTTAGTCTCTTTTCATTCAGTTCCATAAACCTCCCTGTCTTACCATAAAATG
TAACCAAAAAGAAAAAAGAAAAACCAAAATGTTTTGTATTCTTTAGAATACTAGACAAAG
TAACTGAGAGTTTTACACACACTTTGAGTAATCTTGATGATGCTTATTCATGAGGGAATA
TGTACTACAACTTCTTATTTATTTTCTACAAGGCATTTAGTAAGAATCTTCCTTGGGTG

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 2

CO CL5325Contig1 1065 2 8 U
GGGAAGATTCTTTCTTTCTTTCTCTTTCAAATAAAATATCTCCAAGTAACCACAGAAAAA
AAAAAACCTACTGTACTGTCTTGTTGGTTTCTAGCTCCTCACTTCACAGCCGCAGACCCT
TGGAAGGATTTTCCGGCTGTCCTTCCGTGACCGAGCTTCTGGCGCTCGTGTGCCTCGATG
ACCTCACTGACAAAGCTCTGTTCCTTCCCCATCCCGGTGGATCGGATCAGACCCCTCTGC
AGATTGTTAGCCTTAACGACCTGGTTGCTTCGGACGGGTCAAGTCACAATTACCGGGCCA
TGGATGTTCCTCCTCTTCCTAAGAATCGCCATGCCACATGCGGGAGACACAAAGAGGAGA
TGATCAGACAACTCCGTGAACTTTCAAGATCCGAGCCTAGCTGTATGAAATACGAGACCC
TAGATGCTGAACTCGACACCTCCGGATTCCTATTTCTAGAACCGGGAAACGATCTGTTTT
CTTCTACATTTGAATCTCAGGTGAGTGGACTGAAATGGTTAGAGGATCAACAAGAAGACT
ATTATCTGTATTCAGATGATAATAATGTGAACCGGGGAGGCTGCACTCAACAACAACAAG
AACAAGAGTCATCGCCGGTGATGGTTCCGGTTTCCACTAGTACTACAACAAGGTCGACAC
ATGAGATCAATAGTCTTGACAGAAACTCTGCTCTCTCTCGCTACAAAGCCAAGAAGAAAT
CTCGAAGGTACGAGAAGCACATCAGATATGAATCGCGGAAAGTTCGTGCAGAAAGCAGGA
CAAGGATCAGAGGACGTTTCGCTAAGTCAGATCCATAATATAGATAGTTGAGTATGATAG
CGAGTTTGTGGGAGTGGGTTTGCTCAGTTTCGTATCAGGTATTTGATTGTAAATGTCTCA
TACAGAAACCAATCATGGTCTTGTATAAATCGAAGCATTATAGTGAATATATATGTCTAC
TATGATTATAATTGAGTCAATTTTAACCTAGGAACCACGCATGTATCTCTCCTTCCACTG
TTTTGTTGTTGTTTCCTTTTGAATACACTATCTTCTGTTTCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE35TF U 1
AF RR2AE35JQ C 315
BS 1 725 RR2AE35TF
BS 726 726 RR2AE35JQ
BS 727 782 RR2AE35TF
BS 783 783 RR2AE35JQ
BS 784 817 RR2AE35TF
BS 818 818 RR2AE35JQ
BS 819 841 RR2AE35TF
BS 842 1065 RR2AE35JQ

RD RR2AE35TF 841 0 0
GGGAAGATTCTTTCTTTCTTTCTCTTTCAAATAAAATATCTCCAAGTAACCACAGAAAAA
AAAAAACCTACTGTACTGTCTTGTTGGTTTCTAGCTCCTCACTTCACAGCCGCAGACCCT
TGGAAGGATTTTCCGGCTGTCCTTCCGTGACCGAGCTTCTGGCGCTCGTGTGCCTCGATG
ACCTCACTGACAAAGCTCTGTTCCTTCCCCATCCCGGTGGATCGGATCAGACCCCTCTGC
AGATTGTTAGCCTTAACGACCTGGTTGCTTCGGACGGGTCAAGTCACAATTACCGGGCCA
TGGATGTTCCTCCTCTTCCTAAGAATCGCCATGCCACATGCGGGAGACACAAAGAGGAGA
TGATCAGACAACTCCGTGAACTTTCAAGATCCGAGCCTAGCTGTATGAAATACGAGACCC
TAGATGCTGAACTCGACACCTCCGGATTCCTATTTCTAGAACCGGGAAACGATCTGTTTT
CTTCTACATTTGAATCTCAGGTGAGTGGACTGAAATGGTTAGAGGATCAACAAGAAGACT
ATTATCTGTATTCAGATGATAATAATGTGAACCGGGGAGGCTGCACTCAACAACAACAAG
AACAAGAGTCATCGCCGGTGATGGTTCCGGTTTCCACTAGTACTACAACAAGGTCGACAC
ATGAGATCAATAGTCTTGACAGAAACTCTGCTCTCTCTCGCTACAAAGCCAAGAAGAAAT
CTCGA*GGTACGAGAAGCACATCAGATATGAATCGCGGAAAGTTCGTGCAGAAAGCAGGA
CA*GGATCAGAGGACGTTTCGCTAAGTCAGATCCATA*TATAGATAGTTGAGTATGATAG
C

QA 1 841 1 841
DS 

RD RR2AE35JQ 751 0 0
TCTT
CTAAGAATCGCCATGCCACATGCGGGAGACACAAAGAGGAGATGATCAGACAACTCCGTG
AACTTTCAAGATCCGAGCCTAGCTGTATGAAATACGAGACCCTAGATGCTGAACTCGACA
CCTCCGGATTCCTATTTCTAGAACCGGGAAACGATCTGTTTTCTTCTACATTTGAATCTC
AGGTGAGTGGACTGAAATGGTTAGAGGATCAACAAGAAGACTATTATCTGTATTCAGATG
ATAATAATGTGAACCGGGGAGGCTGCACTCAACAACAACAAGAACAAGAGTCATCGCCGG
TGATGGTTCCGGTTTCCACTAGTACTACAACAAGGTCGACACATGAGATCAATAGTCTTG
ACAGAAACTCTGCTCTCTCTCGCTACAAAGCCAAGAAGAAATCTCGAAGGTACGAGAAGC
ACATCAGATATGAATCGCGGAAAGTTCGTGCAGAAAGCAGGACAAGGATCAGAGGACGTT
TCGCTAAGTCAGATCCATAATATAGATAGTTGAGTATGATAGCGAGTTTGTGGGAGTGGG
TTTGCTCAGTTTCGTATCAGGTATTTGATTGTAAATGTCTCATACAGAAACCAATCATGG
TCTTGTATAAATCGAAGCATTATAGTGAATATATATGTCTACTATGATTATAATTGAGTC
AATTTTAACCTAGGAACCACGCATGTATCTCTCCTTCCACTGTTTTGTTGTTGTTTCCTT
TTGAATACACTATCTTCTGTTTCTACC

QA 5 751 5 751
DS 



AS 1 2

CO CL5326Contig1 1223 2 4 U
GGAACCTTTTGTGTCCCTCACAATCTCACAAAGATAAAACTAAATGGCGGGAGGAATAGG
GTTGGGTGACACGACGTACACAAAGGTGTTTGTAGGAGGGTTAGCTTGGGAGACGGACAA
GGATACGATGAAGAAGCACTTTGAGCAGTTTGGTGAGATCTTGGAAGCTGTAGTCATCAC
CGACAAGGCTTCCGGCAGATCCAAGGGATATGGATTCGTGACATTCAAGGAAGCAGAGGC
GGCGAGGAGGGCTTGTGTGGACGGTACTCCGGTGATCGACGGAAGAAGAGCTAATTGCAA
CCTTGCCTCTCTTGGTCTTCAACGATCCAAACCCTCCACTCCTAACCATGGAGGAGGAAG
GATTAATAACATGAGAGTGATGATGAGCACAATGCAGTCTGGTTTTGGACCACCACCCAC
TTTCACTCACCATCCCCACCTCCCTCTCAATCTCTTTGGGTACTCACCTTACTCGTCAGA
TTACTCCCCATTCCCTACGAACTTATACGGCGTGTACGGATGCAACTCAGGAGGACAATA
CGGACTGTATGGAAACGGAAACGGTGGAGGCGGTGGACTAACCGCAGCTGCTGCATCAGC
CGCTCCTTTTTATCCCTGCGGTGGAGGACAAGGTGGGGTCCAGTTCACACAACCACAGCC
ATTTTATCATCATTTCTCTGCTTATGACAACCCTCACCATTACTCTCCTGCCACCATTTC
TCTTCAACAAGGTGTAACAGGCTTTCCCCTTCAGCCACCTCTCATTCCTTACCTTTGATA
GCTATCAAAGCTATCACAATCGTCATCATCGAGTCACGAGTCATCTATGGTTTATTGGAT
ACTCTCTGGCTATCTCTCAACACTTCTGTTTCACTCTAAAAGCCACCCCATTTTATGGAA
TTTGAGGTGGCTTTTATTTGCGGATCCCCAATGGGATCTCCAATTTCATATGGTGGTTAT
GTCGTATTGTCATCTCTCACCTTCTTTGCAAACTGCATCTTCACGAGAGACAAGGGTTCT
CTCTAGATAGAGTGATGTTGCTAATGGAGCACAAAGCATCAAAATCACTCATGTGCTAAA
CTCAAAGCTGATGCATGTATCAGCTTATTTTGTTATGTTGTTTCAGCCTAGGGATGGCTA
ATCAACAAGACAAAAAAAAATGTCTGTTTAGGATTTAATGTAAGAAAACCAAGCACTAAA
AAACATGTGCTTTTTGAAAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ40TF U 1
AF RR2BZ40JQ C 500
BS 1 689 RR2BZ40TF
BS 690 690 RR2BZ40JQ
BS 691 724 RR2BZ40TF
BS 725 1223 RR2BZ40JQ

RD RR2BZ40TF 724 0 0
GGAACCTTTTGTGTCCCTCACAATCTCACAAAGATAAAACTAAATGGCGGGAGGAATAGG
GTTGGGTGACACGACGTACACAAAGGTGTTTGTAGGAGGGTTAGCTTGGGAGACGGACAA
GGATACGATGAAGAAGCACTTTGAGCAGTTTGGTGAGATCTTGGAAGCTGTAGTCATCAC
CGACAAGGCTTCCGGCAGATCCAAGGGATATGGATTCGTGACATTCAAGGAAGCAGAGGC
GGCGAGGAGGGCTTGTGTGGACGGTACTCCGGTGATCGACGGAAGAAGAGCTAATTGCAA
CCTTGCCTCTCTTGGTCTTCAACGATCCAAACCCTCCACTCCTAACCATGGAGGAGGAAG
GATTAATAACATGAGAGTGATGATGAGCACAATGCAGTCTGGTTTTGGACCACCACCCAC
TTTCACTCACCATCCCCACCTCCCTCTCAATCTCTTTGGGTACTCACCTTACTCGTCAGA
TTACTCCCCATTCCCTACGAACTTATACGGCGTGTACGGATGCAACTCAGGAGGACAATA
CGGACTGTATGGAAACGGAAACGGTGGAGGCGGTGGACTAACCGCAGCTGCTGCATCAGC
CGCTCCTTTTTATCCCTGCGGTGGAGGACAAGGTGGGGTCCAGTTCACACAACCACAGCC
ATTTTATCATCATTTCTCTGCTTATGACA*CCCTCACCATTACTCTCCTGCCACCATTTC
TCTT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2BZ40JQ 724 0 0
AACTTATACGGCGTGTACGGATGCAACTCAGGAGGACAATACGGACTGTATGGAAACGGA
AACGGTGGAGGCGGTGGACTAACCGCAGCTGCTGCATCAGCCGCTCCTTTTTATCCCTGC
GGTGGAGGACAAGGTGGGGTCCAGTTCACACAACCACAGCCATTTTATCATCATTTCTCT
GCTTATGACAACCCTCACCATTACTCTCCTGCCACCATTTTTCTTCAACAAGGTGTAACA
GGCTTTCCCCTTCAGCCACCTCTCATTCCTTACCTTTGATAGCTATCAAAGCTATCACAA
TCGTCATCATCGAGTCACGAGTCATCTATGGTTTATTGGATACTCTCTGGCTATCTCTCA
ACACTTCTGTTTCACTCTAAAAGCCACCCCATTTTATGGAATTTGAGGTGGCTTTTATTT
GCGGATCCCCAATGGGATCTCCAATTTCATATGGTGGTTATGTCGTATTGTCATCTCTCA
CCTTCTTTGCAAACTGCATCTTCACGAGAGACAAGGGTTCTCTCTAGATAGAGTGATGTT
GCTAATGGAGCACAAAGCATCAAAATCACTCATGTGCTAAACTCAAAGCTGATGCATGTA
TCAGCTTATTTTGTTATGTTGTTTCAGCCTAGGGATGGCTAATCAACAAGACAAAAAAAA
ATGTCTGTTTAGGATTTAATGTAAGAAAACCAAGCACTAAAAAACATGTGCTTTTTGAAA
GACC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL5327Contig1 1137 2 2 U
CATCTAAACAGATTTACTTGACTTTTCCAGCTGATAGCTCCTTCACTGATGAAGATGTCT
CCAATTACTTTGGCAATTTTGGAGCGATGCAAGATGTTAGGATTCCATACCAGCAGAAAC
GGATGTTTGGGTTTGTCACTTTTGTACACTCTGAAACTGTGAGAATCATATTAGCCAGAG
GAAACCCTCATTTCATCTGCGACTCACGTGTGCTTGTTAAACCCTACAAGGAGAAAGGGA
GAATCCTTGAAAATAGGAGGCAGCAGCAGCAACTGCTTCAGCAGATGGAGAGAGGGAACT
TTTCTCCTGGTTCAAGTCCATCTGGAATGGATGCAAGGGATCTCTTTGATTGCCACTTCG
GACCGAGGATGTTTTCTAGCACGCAGGAGATGATGATGAGGAGAAAAGCTGAGCAAGCTG
AGTTACAACAAGCATTAGAGTTCCAAAGGAGAAGACTTGTCAATCTGCAGTTGCCCGACT
TGGATAGCGAGTCGTTCCACCATCACCAGCGCAGTCTTTCTATTGGCTCCCCTGTTCATT
ACCCCTCCCGCGTCAATCAAAGCATGCTCTTTCGATCGGAAAACAACGCTGGTGAACAAG
TCTTAGAAGGTAATGGTGATTCAGGACATTTTCAGTCTGAAGCAAACCAAACGTTTCAGT
CTGATTCTGATAATAATAATAACAGCCACGAAGGTGGTTACGGTAACCATTTCCACAAAG
GGCAAGAGACAAGTCTGCCTGATTGCTTCTTTGATTCCCCATCAAAGACCGGTGAGACCC
AAGAACAGTCCGAGTCTGAGAATGACAACTGTGCTACTCTCTCTGTTACCGTGGAAAGCA
AGCAAGCCTCAACACTTGAATCAGCCTAGCTATATTGAAAAGTAGAGACTGATAAAAAGC
AGGAAGTAGAAGAACTTTGTCTATATGTATAAGAAGAAGCTAAAGTGGTGGGTTTTATAA
CATGCAACAGAAAGAAAGGGAGTTAGGATTTTTTTACATATCTCTGGCGGTTATGGAAAT
GCCAATCTGAAATAGAATTACAACTAAGTACTAACCTCAGACGGTGCATTGATAGGCAGA
GAACATTACAGTTACTCAAACCTTAAGTTTTAAAGTTTCTTCGTCTGTTCATTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ52TF U 1
AF RR2EZ52JQ C 449
BS 1 620 RR2EZ52TF
BS 621 1137 RR2EZ52JQ

RD RR2EZ52TF 620 0 0
CATCTAAACAGATTTACTTGACTTTTCCAGCTGATAGCTCCTTCACTGATGAAGATGTCT
CCAATTACTTTGGCAATTTTGGAGCGATGCAAGATGTTAGGATTCCATACCAGCAGAAAC
GGATGTTTGGGTTTGTCACTTTTGTACACTCTGAAACTGTGAGAATCATATTAGCCAGAG
GAAACCCTCATTTCATCTGCGACTCACGTGTGCTTGTTAAACCCTACAAGGAGAAAGGGA
GAATCCTTGAAAATAGGAGGCAGCAGCAGCAACTGCTTCAGCAGATGGAGAGAGGGAACT
TTTCTCCTGGTTCAAGTCCATCTGGAATGGATGCAAGGGATCTCTTTGATTGCCACTTCG
GACCGAGGATGTTTTCTAGCACGCAGGAGATGATGATGAGGAGAAAAGCTGAGCAAGCTG
AGTTACAACAAGCATTAGAGTTCCAAAGGAGAAGACTTGTCAATCTGCAGTTGCCCGACT
TGGATAGCGAGTCGTTCCACCATCACCAGCGCAGTCTTTCTATTGGCTCCCCTGTTCATT
ACCCCTCCCGCGTCAATCAAAGCATGCTCTTTCGATCGGAAAACAACGCTGGTGAACAAG
TCTTAGAAGGTAATGGTGAT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2EZ52JQ 689 0 0
GAGAAGACTTGTCAATCTGCAGTTGCCCGACTTGGATAGCGAGTCGTTCCACCATCACCA
GCGCAGTCTTTCTATTGGCTCCCCTGTTCATTACCCCTCCCGCGTCAATCAAAGCATGCT
CTTTCGATCGGAAAACAACGCTGGTGAACAAGTCTTAGAAGGTAATGGTGATTCAGGACA
TTTTCAGTCTGAAGCAAACCAAACGTTTCAGTCTGATTCTGATAATAATAATAACAGCCA
CGAAGGTGGTTACGGTAACCATTTCCACAAAGGGCAAGAGACAAGTCTGCCTGATTGCTT
CTTTGATTCCCCATCAAAGACCGGTGAGACCCAAGAACAGTCCGAGTCTGAGAATGACAA
CTGTGCTACTCTCTCTGTTACCGTGGAAAGCAAGCAAGCCTCAACACTTGAATCAGCCTA
GCTATATTGAAAAGTAGAGACTGATAAAAAGCAGGAAGTAGAAGAACTTTGTCTATATGT
ATAAGAAGAAGCTAAAGTGGTGGGTTTTATAACATGCAACAGAAAGAAAGGGAGTTAGGA
TTTTTTTACATATCTCTGGCGGTTATGGAAATGCCAATCTGAAATAGAATTACAACTAAG
TACTAACCTCAGACGGTGCATTGATAGGCAGAGAACATTACAGTTACTCAAACCTTAAGT
TTTAAAGTTTCTTCGTCTGTTCATTGATG

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL5328Contig1 1267 2 2 U
GGAGAAGTTATAATTATAGATCGAACGTTTTGCTCATGAGGGAAATCATTATTATATATT
CTTATCATTTGCTAGGAAGAAAATCGTGTTTATAAAAAAAATCGCGTTTATACATTAAAA
TACACAAATTTTAGTGATGGTAAGGTAAAAATCTTTTAATGATTGTAGTGTTCGAAATGT
TTCGGTGCTGAATTGTGATTTCTTGGTGGAATTATATTGGCAAATTTCTTACAAAATAAT
GGGACTAAATCCCAATATTGAAAAATGTTTCAATAGCAGCTTAGTATTTCGAATTGAGTT
AGACATAATGATCTTAATTGGTTGGATATATGTATTCAAGTTTTTTTTCTTTGTAAAATA
TACTCCTATCGTTTTCAAAAAAAAATCTAGATTTTTTTTTGTTTCACAAAAATAGATTTT
TATATTTTAAGATATTTTGCAAAATTCAATAAACATTAATTACAAATATTTGAATTGATT
AAATATAATTGGTTGATAATTATTGAAAATATATAATGAAATAAATAACAAATTTAATAT
AAATATTCAGTATTTCTAACATGTAAGAATACTCAAGATTTTTCAAGATTTAAGTGAGTA
TTGATTTAGAGAAGAATTCTTTAATTTTAGAAGTACACAAGACACACAAAAAGTAGAAAA
GAGAGGAACAATGATAATAAAAGTTTCCCCAAGAGAATGATGAAAGAATTGAACATTCTT
CAAAAGTAAACAAAGAAGATGAAATAAAGAGAAAACGATAACGATTGATGGGAGTGAGGC
CATTTCAATATATACGATATAATGCCACTACATTTTATTAACTTTTTTGTAGAAATACCA
CCGTTAGTGTTATTTTATTTGACATTTGTTATATCACACTTTTCGATTTTATTTTAGGTT
CATAATGAAACGTTTTTTCATAGTGTGAATATCAAGCCTCTCATTCCTTTTAAGTCTCTT
ATTACAAATCATATGATTAATGCATTAATGTACTATAAAATGACAATATAAAATCCATAT
GAGCGTTTTGTTCAAAATGAACTAACTATTTAAAACAACTTAGCTACGTACGTACGACAA
CGTCAACATGCATAAAATCCATATGCAAAAGGAACTACACTCACAATCTAATATATATTT
GTATTAAAATAAACAAATAAATATCTGTATCAATTTACTAGATGAACAATTATTTTATCC
GTAACTTCAGTTAGTTAATTTTGTATATACATTTTTCAAAGGATAAACAAACACTTTCGT
CAGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E003TF U 1
AF RR2E003JQ C 479
BS 1 651 RR2E003TF
BS 652 1267 RR2E003JQ

RD RR2E003TF 655 0 0
GGAGAAGTTATAATTATAGATCGAACGTTTTGCTCATGAGGGAAATCATTATTATATATT
CTTATCATTTGCTAGGAAGAAAATCGTGTTTATAAAAAAAATCGCGTTTATACATTAAAA
TACACAAATTTTAGTGATGGTAAGGTAAAAATCTTTTAATGATTGTAGTGTTCGAAATGT
TTCGGTGCTGAATTGTGATTTCTTGGTGGAATTATATTGGCAAATTTCTTACAAAATAAT
GGGACTAAATCCCAATATTGAAAAATGTTTCAATAGCAGCTTAGTATTTCGAATTGAGTT
AGACATAATGATCTTAATTGGTTGGATATATGTATTCAAGTTTTTTTTCTTTGTAAAATA
TACTCCTATCGTTTTCAAAAAAAAATCTAGATTTTTTTTTGTTTCACAAAAATAGATTTT
TATATTTTAAGATATTTTGCAAAATTCAATAAACATTAATTACAAATATTTGAATTGATT
AAATATAATTGGTTGATAATTATTGAAAATATATAATGAAATAAATAACAAATTTAATAT
AAATATTCAGTATTTCTAACATGTAAGAATACTCAAGATTTTTCAAGATTTAAGTGAGTA
TTGATTTAGAGAAGAATTCTTTAATTTTAGAAGTACACAAGACACACAAAA
GTAG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2E003JQ 789 0 0
TTAAATATAATTGGTTGATAATTATTGAAAATATATAATGAAATAAATAACAAATTTAAT
ATAAATATTCAGTATTTCTAACATGTAAGAATACTCAAGATTTTTCAAGATTTAAGTGAG
TATTGATTTAGAGAAGAATTCTTTAATTTTAGAAGTACACAAGACACACAAAAAGTAGAA
AAGAGAGGAACAATGATAATAAAAGTTTCCCCAAGAGAATGATGAAAGAATTGAACATTC
TTCAAAAGTAAACAAAGAAGATGAAATAAAGAGAAAACGATAACGATTGATGGGAGTGAG
GCCATTTCAATATATACGATATAATGCCACTACATTTTATTAACTTTTTTGTAGAAATAC
CACCGTTAGTGTTATTTTATTTGACATTTGTTATATCACACTTTTCGATTTTATTTTAGG
TTCATAATGAAACGTTTTTTCATAGTGTGAATATCAAGCCTCTCATTCCTTTTAAGTCTC
TTATTACAAATCATATGATTAATGCATTAATGTACTATAAAATGACAATATAAAATCCAT
ATGAGCGTTTTGTTCAAAATGAACTAACTATTTAAAACAACTTAGCTACGTACGTACGAC
AACGTCAACATGCATAAAATCCATATGCAAAAGGAACTACACTCACAATCTAATATATAT
TTGTATTAAAATAAACAAATAAATATCTGTATCAATTTACTAGATGAACAATTATTTTAT
CCGTAACTTCAGTTAGTTAATTTTGTATATACATTTTTCAAAGGATAAACAAACACTTTC
GTCAGTTAC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL5329Contig1 1218 2 4 U
GATTGTCTTAAAAGCTTAAGATCAGAGAGGAGATATCCAATCAAGAAAAGAAGATACTTT
GATGGTTACACAGCTTCACAATCAGAAGAAACACCTCGAAAGGCTTCAGCTTTTACGTCA
ACCATAGCTTGTCAGAAGCAGCCAGTTTTACAATCAAAAGATTCTCACGTGAAACTTGGA
ATCAAGTCGTTTAGAGTTCCTGAGATTTTCATTGATATTCCAGAGGCTGCTACCGTTGGT
TCGCTAAAGAGGACAGTCTTGGAAGCTGTGACCACCATACTCGAAGGTGGACTACGCATA
GGAGTTCTTGTTCATGGAAAAAAAGTTAGAGACGACAGTAAAATGCTTCTTCAGAGTGGA
ATCTCTCTAGACACTCTTTCAGATACCTTAGGCTTTTGTCTTGAGCCCAATCCTCCACAA
TCCACAAAACAGCTGTCTCCTGAAGATTCTGATTTTGGTCGTCCATGTAATAATGTACCT
CACACTCTAACAAGGTGTCTCCCATCACTAGGGAAACATGCTAAACCTAGTAACTCTGTA
GATAGTGACCTTGACTCCAAACCCTCTGCATCAAATAGGGGTAAACCCGTCTACTCCAGA
GCCTTGATTCCTGTTGCTCCTCTGCATGCTCAGGCTTTAAACGTAGTCCCACCTCGGAAA
CCTAAGCGGTTTGAGGTGGCTCAGCGCAGAATCCGTCGACCTTTCTCTGTTGCAGAAGTT
GAGGTCCTTGTTCAAGCTGTGGAGAAACTTGGGACCGGAAGGTGGCGTGATGTTAAGCTA
CGAGCTTTTGATAACGCAAAGCACCGGACTTATGTCGATTTGAAGGACAAATGGAAGACG
TTGGTGCACACAGCAAGAATATCGCCGCAACAAAGGAGAGGTGAGCCAGTTCCACAGGAG
CTCTTAGACCGGGTACTGATGGCTCATGCCTACTGGCCCCAGCAACAGGGGAAACAACAG
TTGCTAGAGGGACCTCATAAGCTCGAGACCAGTCTTGGTCTATAGACTGGGAACAAAATG
TTATTTCCGCGGCGTGAAAATGAACCTGATATTTTTTTCTTTCATATATACTTTTTTTGT
TTATTTGTTATGTTATGTATTTGAAAATATTCATTGTGTAAGGAAAAAAAGGAATGGAAT
GTGGTGAAGAAGTGAATAGAGATGAAGATATGTGAAGTCTAATGTAATTGTCACAGTGAT
TGGTTATAATAACATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E943TF U 1
AF RR2E943JQ C 476
BS 1 633 RR2E943TF
BS 634 634 RR2E943JQ
BS 635 653 RR2E943TF
BS 654 1218 RR2E943JQ

RD RR2E943TF 653 0 0
GATTGTCTTAAAAGCTTAAGATCAGAGAGGAGATATCCAATCAAGAAAAGAAGATACTTT
GATGGTTACACAGCTTCACAATCAGAAGAAACACCTCGAAAGGCTTCAGCTTTTACGTCA
ACCATAGCTTGTCAGAAGCAGCCAGTTTTACAATCAAAAGATTCTCACGTGAAACTTGGA
ATCAAGTCGTTTAGAGTTCCTGAGATTTTCATTGATATTCCAGAGGCTGCTACCGTTGGT
TCGCTAAAGAGGACAGTCTTGGAAGCTGTGACCACCATACTCGAAGGTGGACTACGCATA
GGAGTTCTTGTTCATGGAAAAAAAGTTAGAGACGACAGTAAAATGCTTCTTCAGAGTGGA
ATCTCTCTAGACACTCTTTCAGATACCTTAGGCTTTTGTCTTGAGCCCAATCCTCCACAA
TCCACAAAACAGCTGTCTCCTGAAGATTCTGATTTTGGTCGTCCATGTAATAATGTACCT
CACACTCTAACAAGGTGTCTCCCATCACTAGGGAAACATGCTAAACCTAGTAACTCTGTA
GATAGTGACCTTGACTCCAAACCCTCTGCATCAAATAGGGGTAAACCCGTCTACTCCAGA
GCCTTGATTCCTGTTGCTCCTCTGCATGCTCAG*CTTTAAACGTAGTCCCACC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2E943JQ 743 0 0
TACCTCACACTCTAACAAGGTGTCTCCCATCACTAGGGAAACATGCTAAACCTAGTAACT
CTGTAGATAGTGACCTTGACTCCAAACCCTCTGCATCAAATAGGGGTAAACCCGTCTACT
CCAGAGCCTTGATTCCTGTTGCTCCTCTGCATGCTCAGGCTTTAAACGTAGTCCCACCTC
GGAAACCTAAGCGGTTTGAGGTGGCTCAGCGCAGAATCCGTCGACCTTTCTCTGTTGCAG
AAGTTGAGGTCCTTGTTCAAGCTGTGGAGAAACTTGGGACCGGAAGGTGGCGTGATGTTA
AGCTACGAGCTTTTGATAACGCAAAGCACCGGACTTATGTCGATTTGAAGGACAAATGGA
AGACGTTGGTGCACACAGCAAGAATATCGCCGCAACAAAGGAGAGGTGAGCCAGTTCCAC
AGGAGCTCTTAGACCGGGTACTGATGGCTCATGCCTACTGGCCCCAGCAACAGGGGAAAC
AACAGTTGCTAGAGGGACCTCATAAGCTCGAGACCAGTCTTGGTCTATAGACTGGGAACA
AAATGTTATTTCCGCGGCGTGAAAATGAACCTGATATTTTTTTCTTTCATATATACTTTT
TTTGTTTATTTGTTATGTTATGTATTTGAAAATATTCATTGTGTAAGGAAAAAAAGGAAT
GGAATGTGGTGAAGAAGTGAATAGAGATGAAGATATGTGAAGTCTAATGTAATTGTCACA
GTGATTGGTTATAATAACATGTT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL5330Contig1 976 2 2 U
GGCCACGGCTTCCTCCTTCCGCCACCTTCCATGAATCCGACGATGACAAACCCGACGATC
CTCTTCCCACCTGGCACCGTCCAACCTCGAGTCTCTCAGCATTGCCATCTCAAGATCCTC
CACCACAGCATTGGCGTAATCATTCTCTTAATCTCTCCCCAATCCTGGACACACCTCAAC
GGTCTCTTCCTCCTCCGGATTCAATCCCTGAGCTAGAGACTTACGTTGTCCAGGTACCAA
GAGATCAAATCTATTGGACTCCTCCTCCGGAACACGCAAAGTACGTCGAGAAACTCCGTA
ATAACCCGGAGAAAAACAAAAAGAATGGGTGTGCTAAACGTCTTATGTGGTTCTTTATCA
TCTTGGTCGGCTTTGGATTCATCCTCGGTGCCATCACTCTCATCCTTCATCTCATTTTCA
ACCCTGCTGTTCCCGTTTTCGCGGTCGAGAGATTCACTGTAAAACCAAGTTACTTCGAGG
TCACGTTGAGAGCTGAGAATCCCACGTCTAACATGGGGGTAAACTATATGATGAAACCAA
ACGGTGTCGTTTCGTTAACGTACAAGAACAAGAGACTAGGACGCGGGAAGTTCCCAAAGA
TGTTCCAGGCCGCGTCTGGATCCGACAAGGTCAATGTGAAGCTGGATGGATCAACCAAAA
ACGCGGTTATGCCACCTCGGGGATCGAAACAACCGGTGGGTTTGGTGCTGAAGATGGAGC
TAAAGGCGGATTATGAAGCAGGTCCAGTGAAGAAGAACAAGGAAGTGGTGGTGACTTGTG
ATGTTAAGGTTAAAGGGTTAGATGCCAAGAAGGTGGAAATTGTGTCTGAGAATTGTGAGA
GTGAGTTTAAGGACTGACACTCTCTATATATTTTTTTGTTATATATATATGACGTGATTA
TGTCGTTAGATCTACAGTGTGCTTCAATAATTTATTACTTTCGATATAATGCTCAATTGT
TCTGTTTTTTTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ55TF U 1
AF RR2DQ55JQ C 269
BS 1 538 RR2DQ55TF
BS 539 976 RR2DQ55JQ

RD RR2DQ55TF 538 0 0
GGCCACGGCTTCCTCCTTCCGCCACCTTCCATGAATCCGACGATGACAAACCCGACGATC
CTCTTCCCACCTGGCACCGTCCAACCTCGAGTCTCTCAGCATTGCCATCTCAAGATCCTC
CACCACAGCATTGGCGTAATCATTCTCTTAATCTCTCCCCAATCCTGGACACACCTCAAC
GGTCTCTTCCTCCTCCGGATTCAATCCCTGAGCTAGAGACTTACGTTGTCCAGGTACCAA
GAGATCAAATCTATTGGACTCCTCCTCCGGAACACGCAAAGTACGTCGAGAAACTCCGTA
ATAACCCGGAGAAAAACAAAAAGAATGGGTGTGCTAAACGTCTTATGTGGTTCTTTATCA
TCTTGGTCGGCTTTGGATTCATCCTCGGTGCCATCACTCTCATCCTTCATCTCATTTTCA
ACCCTGCTGTTCCCGTTTTCGCGGTCGAGAGATTCACTGTAAAACCAAGTTACTTCGAGG
TCACGTTGAGAGCTGAGAATCCCACGTCTAACATGGGGGTAAACTATATGATGAAACC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2DQ55JQ 708 0 0
GGAACACGCAAAGTACGTCGAGAAACTCCGTAATAACCCGGAGAAAAACAAAAAGAATGG
GTGTGCTAAACGTCTTATGTGGTTCTTTATCATCTTGGTCGGCTTTGGATTCATCCTCGG
TGCCATCACTCTCATCCTTCATCTCATTTTCAACCCTGCTGTTCCCGTTTTCGCGGTCGA
GAGATTCACTGTAAAACCAAGTTACTTCGAGGTCACGTTGAGAGCTGAGAATCCCACGTC
TAACATGGGGGTAAACTATATGATGAAACCAAACGGTGTCGTTTCGTTAACGTACAAGAA
CAAGAGACTAGGACGCGGGAAGTTCCCAAAGATGTTCCAGGCCGCGTCTGGATCCGACAA
GGTCAATGTGAAGCTGGATGGATCAACCAAAAACGCGGTTATGCCACCTCGGGGATCGAA
ACAACCGGTGGGTTTGGTGCTGAAGATGGAGCTAAAGGCGGATTATGAAGCAGGTCCAGT
GAAGAAGAACAAGGAAGTGGTGGTGACTTGTGATGTTAAGGTTAAAGGGTTAGATGCCAA
GAAGGTGGAAATTGTGTCTGAGAATTGTGAGAGTGAGTTTAAGGACTGACACTCTCTATA
TATTTTTTTGTTATATATATATGACGTGATTATGTCGTTAGATCTACAGTGTGCTTCAAT
AATTTATTACTTTCGATATAATGCTCAATTGTTCTGTTTTTTTTCTTC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL5331Contig1 979 2 8 U
GCATACTGGAGTGTTTGCAAGCAAAATCACTCCAGCGAAAGATAGAAGACCAGTGATGAT
TGAGCTGATTGATGCCAAAACCAAGGCACCCAAAGATACTTTGGAGGTGGACACTGCTCT
TATTGCTACAGGAAGAGCCCCATTCACCAATGGTCTTGGCCTGGAAAACATCAATGTAGC
GACACAAAGAGGTTTCATACCAGTTGATGAGAGAATGCGTGTTATCGATGGAAATGGAAA
GCTGGTTCCACACTTGTACTGCATCGGTGATGCCAATGGGAAACTGATGCTTGCTCATGC
AGCCAGTGCCCAAGGAATTTCTGTGGTGGAGCAAGTCACAGGTAGAGATCATGTGCTGAA
TCATCTTAGCATCCCAGCCGCTTGTTTTACTCATCCTGAAATCAGCATGGTGGGATTCAC
AGAGCCTCAAGCGAGAGAGAAAGCTGAGAAAGAGGGGTTTAAAGTAAGTATTGCCAAGAC
AAGTTTCAAGGCAAACACAAAGGCTCTAGCCGAAAATGAGGGTGAAGGACTCGCTAAGAT
GATATACAGACCTGACAATGGTGAAATCCTAGGAGTTCATATCTTCGGGTTGCATGCAGC
TGATCTTATCCATAAGCATCCAACGCCATCGCATTGGGAACACGCATTCAGGACATAAAA
CTTGCAGTTCATGCACATCCAACTTTGTCTGAAGTTGTAGACGAACTGTTTAAAGCAGCT
AAAGTCGAAAGTCCAGCTTCAACAACGCCACAAAGTGTAAAAGCTGCTTTATAAACAGAA
TCTTGAGATCAACATCCTGTAACAAAAGTTTTGTGTTCCAAGACATTTGTGCTTTAGCGA
CATTCGCCATGACTTCACTTATGATCGTTCTCATGTTTTTCCTTCTTTTTCTTATTATAT
CTTAAGATTATTATGATAACAGAATAAAAAAGCAAATTGTGACAAGAGACACATACTTAA
AATAGAATTACCATATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN74TF U 1
AF RR2GN74JQ C 411
BS 1 651 RR2GN74TF
BS 652 652 RR2GN74JQ
BS 653 741 RR2GN74TF
BS 742 742 RR2GN74JQ
BS 743 761 RR2GN74TF
BS 762 762 RR2GN74JQ
BS 763 774 RR2GN74TF
BS 775 979 RR2GN74JQ

RD RR2GN74TF 774 0 0
GCATACTGGAGTGTTTGCAAGCAAAATCACTCCAGCGAAAGATAGAAGACCAGTGATGAT
TGAGCTGATTGATGCCAAAACCAAGGCACCCAAAGATACTTTGGAGGTGGACACTGCTCT
TATTGCTACAGGAAGAGCCCCATTCACCAATGGTCTTGGCCTGGAAAACATCAATGTAGC
GACACAAAGAGGTTTCATACCAGTTGATGAGAGAATGCGTGTTATCGATGGAAATGGAAA
GCTGGTTCCACACTTGTACTGCATCGGTGATGCCAATGGGAAACTGATGCTTGCTCATGC
AGCCAGTGCCCAAGGAATTTCTGTGGTGGAGCAAGTCACAGGTAGAGATCATGTGCTGAA
TCATCTTAGCATCCCAGCCGCTTGTTTTACTCATCCTGAAATCAGCATGGTGGGATTCAC
AGAGCCTCAAGCGAGAGAGAAAGCTGAGAAAGAGGGGTTTAAAGTAAGTATTGCCAAGAC
AAGTTTCAAGGCAAACACAAAGGCTCTAGCCGAAAATGAGGGTGAAGGACTCGCTAAGAT
GATATACAGACCTGACAATGGTGAAATCCTAGGAGTTCATATCTTCGGGTTGCATGCAGC
TGATCTTATCCATAAGCATCCAACGCCATCGCATTGGGAACACGCATTCAG*ACATAAAA
CTTGCAGTTCATGCACATCCAACTTTGTCTGAAGTTGTAGACGAACTGTTTAAAGCAGCT
AAAGTCGAAAGTCCAGCTTCA*CAACGCCACAAAGTGTAAA*GCTGCTTTATAA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2GN74JQ 569 0 0
TGGGATTCACAGAGCCTCAAGCGAGAGAGAAAGCTGAGAAAGAGGGGTTTAAAGTAAGTA
TTGCCAAGACAAGTTTCAAGGCAAACACAAAGGCTCTAGCCGAAAATGAGGGTGAAGGAC
TCGCTAAGATGATATACAGACCTGACAATGGTGAAATCCTAGGAGTTCATATCTTCGGGT
TGCATGCAGCTGATCTTATCCATAAGCATCCAACGCCATCGCATTGGGAACACGCATTCA
GGACATAAAACTTGCAGTTCATGCACATCCAACTTTGTCTGAAGTTGTAGACGAACTGTT
TAAAGCAGCTAAGGTCGAAAGTCCAGCTTCAACAACGCCACAAAGTGTAAAAGCTGCTTT
ATAAACAGAATCTTGAGATCAACATCCTGTAACAAAAGTTTTGTGTTCCAAGACATTTGT
GCTTTAGCGACATTCGCCATGACTTCACTTATGATCGTTCTCATGTTTTTCCTTCTTTTT
CTTATTATATCTTAAGATTATTATGATAACAGAATAAAAAAGCAAATTGTGACAAGAGAC
ACATACTTAAAATAGAATTACCATATGTC

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

CO CL5332Contig1 1088 2 4 U
AGGACTTTGAAGCTTTGCATTTGTTTGGAAGAGGCTTAATAAAATGGGGAGGATAATGGA
ATGGGCAGCAAGATCTGATCACTTGAGAGGAGTTCCAAGGAAAGCTGTGATAACAGCCGT
TGGTGCGTTTGCGAGAGCAGTAGCTAATCTTTGCAACAAGACCACATCTCACAATGCAGA
TACTCTTATGACTCTTGTCCGGTCAAGACCACCCGGTGTTCCTCTCATCACTGTTAGTAA
TCACATGTCTACTTTAGATGATCCAGTAATGTGGGGAGGGTTCAAGGGTCTTCTTTCCTT
TGATCCAGAGCTGGCTCGATGGGTTCTTGCTGCAGAGGACATATGTTTCAAGAACCCTGT
CTTCTCCTACATCTTCCGCACTGGCAAGTGTATACCTATAACTAGAGGTGGTGGAATCTA
TCAAGAACACATGAGTGAAGCTCTCGAGCGATTAAAAGATGGATGTTGGTTGCATACCTT
CCCAGAGGGCAAGGTGTTTCAAGAAGATGTGCCTATAAGACGTCTTAAATGGGGAACCGC
AAGCCTCATCGCCCGTTGCCCAGTTACCCCAATCGTCTTGCCAATCATTCACCGTGGTTT
TGACGAGATGATGCCGGAAAAGTACTTTTATGGAAGAAGACCACCGTTACCGCTTTGCAA
CAAAAACCTTAAAGTTGTGGTTGGTGAACCAATCGAGTTTGACTTTCCCATGATGGTTCA
GACCGCTTCCTCTGTTTTTGCCTCCTCCGATCATGTAACGGAAGCTACTCATCAAGAAGC
GAAATGGCCTGTGATCTCTTTTGCTGGCCAAAAGCTAGACGAAACAGCTCAAAGATACCT
CTACACAGCTCTCTCCCAAAAGATTCAATCCTCATTGGAATCGTTGAGGCTTTTAGCCAA
GCGGTTGTAATCTTAAGATCAGTACCGGGTTCACAATTTTGAAGTTACCGGTTTAGATCC
GACACGGTATTCAGTTATTTCATTTGGTTTAATTCTTTTTTTAAGCTGAGAAATACTCTA
GACATTGTAATAAGGATGAAATTTGTAACAACTTAAATTAAATTAACATTGGGGACAAAA
TCTCCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C356TF U 1
AF RR2C356JQ C 361
BS 1 583 RR2C356TF
BS 584 584 RR2C356JQ
BS 585 612 RR2C356TF
BS 613 1088 RR2C356JQ

RD RR2C356TF 612 0 0
AGGACTTTGAAGCTTTGCATTTGTTTGGAAGAGGCTTAATAAAATGGGGAGGATAATGGA
ATGGGCAGCAAGATCTGATCACTTGAGAGGAGTTCCAAGGAAAGCTGTGATAACAGCCGT
TGGTGCGTTTGCGAGAGCAGTAGCTAATCTTTGCAACAAGACCACATCTCACAATGCAGA
TACTCTTATGACTCTTGTCCGGTCAAGACCACCCGGTGTTCCTCTCATCACTGTTAGTAA
TCACATGTCTACTTTAGATGATCCAGTAATGTGGGGAGGGTTCAAGGGTCTTCTTTCCTT
TGATCCAGAGCTGGCTCGATGGGTTCTTGCTGCAGAGGACATATGTTTCAAGAACCCTGT
CTTCTCCTACATCTTCCGCACTGGCAAGTGTATACCTATAACTAGAGGTGGTGGAATCTA
TCAAGAACACATGAGTGAAGCTCTCGAGCGATTAAAAGATGGATGTTGGTTGCATACCTT
CCCAGAGGGCAAGGTGTTTCAAGAAGATGTGCCTATAAGACGTCTTAAATGGGGAACCGC
AAGCCTCATCGCCCGTTGCCCAGTTACCCCAATCGTCTTGCCA*TCATTCACCGTGGTTT
TGACGAGATGAT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2C356JQ 728 0 0
CTTCTCCTACATCTTCCGCACTGGCAAGTGTATACCTATAACTAGAGGTGGTGGAATCTA
TCAAGAACACATGAGTGAAGCTCTCGAGCGATTAAAAGATGGATGTTGGTTGCATACCTT
CCCAGAGGGCAAGGTGTTTCAAGAAGATGTGCCTATAAGACGTCTTAAATGGGGAACCGC
AAGCCTCATCGCCCGTTGCCCAGTTACCCCAATCGTCTTGCCAATCATTCACCGTGGTTT
TGACGAGATGATGCCGGAAAAGTACTTTTATGGAAGAAGACCACCGTTACCGCTTTGCAA
CAAAAACCTTAAAGTTGTGGTTGGTGAACCAATCGAGTTTGACTTTCCCATGATGGTTCA
GACCGCTTCCTCTGTTTTTGCCTCCTCCGATCATGTAACGGAAGCTACTCATCAAGAAGC
GAAATGGCCTGTGATCTCTTTTGCTGGCCAAAAGCTAGACGAAACAGCTCAAAGATACCT
CTACACAGCTCTCTCCCAAAAGATTCAATCCTCATTGGAATCGTTGAGGCTTTTAGCCAA
GCGGTTGTAATCTTAAGATCAGTACCGGGTTCACAATTTTGAAGTTACCGGTTTAGATCC
GACACGGTATTCAGTTATTTCATTTGGTTTAATTCTTTTTTTAAGCTGAGAAATACTCTA
GACATTGTAATAAGGATGAAATTTGTAACAACTTAAATTAAATTAACATTGGGGACAAAA
TCTCCATG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL5333Contig1 916 2 4 U
CATCCAGAGAAGGAGCGCTGAGTTTTACAACCCAGAACTGGTGGCCTGTTCAGTTGATGA
CACATCTAAGACAACAGTTCTGATTCCACATAGAGAAAGTGTAAAGATTCAGGAAATTCA
GCTCTTTCGGGATCATCTTGCAGTGTTCGAGCGTGAACAGGGACTGCAGAAGATAATAGT
TCATAGGCTTCCCGCTGAGGGACAGCCTCTGAACAAACTCCAAGCTGGTCGTAGTGTTAG
CTTTGTTGATCCGGTCTACTCAATTGACTCAACAGAGTCTGAATTTTTCGTCCAGTGTTT
TAAGGTTCCGCTACAGCTCAATGAAGACACCTCCTTCTGTGTATGACTATGACATGGATA
GTGGCACTTCTGTTTGCCAAGAAGATTGACACAGTGTTGGGAGGTTTTGATGCGTCGAAT
TATGTTACAGAAAGGAAATGGGTCACTGCAGCTGACGGAACTCAAATTCCAATGTCTATT
GTGTATAACAAAAACCTTGCAAAGCTCGATGGGTCTGATCCGTGTCTACTTTATGGATAT
GGTTCATATGAGATTTCTGTGGATCCATATTTCAAGGCATCAAGGTTATCCTTGTTAGAT
CGTGGTTTTATCTATGTGATTGCCCATGTTCGTGGTGGTGGCGAAATGGGGAGGAAGTGG
TACGAGAACGGAAAGTTTTTGAAGAAGAAAAACACGTTCACTGATTTTATAGCTTGTGCT
GAATCTTTAATAGAACTCAAGTACTGCTCAAAGGAAAAACTGTGTGTGGAAGGAAGAAGT
GCTGGTGGTCTGCTGATGGGTGCTGTTCTTAACATGAGGCCTGACTTGTTCAAGGTGGTT
ATCGCTGGAGTTCCTTTTGTAGACGTTTTGACAACAATGCTGGACCCAACTATTCCGCTT
ACGACATCAGAATGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL51TF U 1
AF RR2EC52TF U 274
BS 1 359 RR2AL51TF
BS 360 360 RR2EC52TF
BS 361 641 RR2AL51TF
BS 642 916 RR2EC52TF

RD RR2AL51TF 650 0 0
CATCCAGAGAAGGAGCGCTGAGTTTTACAACCCAGAACTGGTGGCCTGTTCAGTTGATGA
CACATCTAAGACAACAGTTCTGATTCCACATAGAGAAAGTGTAAAGATTCAGGAAATTCA
GCTCTTTCGGGATCATCTTGCAGTGTTCGAGCGTGAACAGGGACTGCAGAAGATAATAGT
TCATAGGCTTCCCGCTGAGGGACAGCCTCTGAACAAACTCCAAGCTGGTCGTAGTGTTAG
CTTTGTTGATCCGGTCTACTCAATTGACTCAACAGAGTCTGAATTTTTCGTCCAGTGTTT
TAAGGTTCCGCTACAGCTCAATGAAGACACCTCCTTCTGTGTATGACTATGACATGGATT
GTGGCACTTCTGTTTGCCAAGAAGATTGACACAGTGTTGGGAGGTTTTGATGCGTCGAAT
TATGTTACAGAAAGGAAATGGGTCACTGCAGCTGACGGAACTCAAATTCCAATGTCTATT
GTGTATAACAAAAACCTTGCAAAGCTCGATGGGTCTGATCCGTGTCTACTTTATGGATAT
GGTTCATATGAGATTTCTGTGGATCCATATTTCAAGGCATCAAGGTTATCCTTGTTAGAT
CGTGGTTTTATCTATGTGATTGCCCATGTTCGTGGTGGTGG
GCGAAATGG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2EC52TF 643 0 0
GAGAGTCCGAA
TTTTCGTCCAGTGTTTTAAGGTTCCGCTACAGCTCAATGAAGACACCTCCTTCTGTGTAT
GACTATGACATGGATAGTGGCACTTCTGTT*GCCAAGAAGATTGACACAGTGTTGGGAGG
TTTTGATGCGTCGAATTATGTTACAGAAAGGAAATGGGTCACTGCAGGTGACGGAACTCA
AATTCCAATGTCTATTGTGTATAACAAAAACCTTGCAAAGCTCGATGGGT*TGATCCGTG
TCTACTTTATGGATATGGTTCATATGAGATTTCTGTGGATCCATATTTCAAGGCATCAAG
GTTATCCTTGTTAGATCGTGGTTTTATCTATGTGATTGCCCATGTTCGTGGTGGTGGCGA
AATGGGGAGGAAGTGGTACGAGAACGGAAAGTTTTTGAAGAAGAAAAACACGTTCACTGA
TTTTATAGCTTGTGCTGAATCTTTAATAGAACTCAAGTACTGCTCAAAGGAAAAACTGTG
TGTGGAAGGAAGAAGTGCTGGTGGTCTGCTGATGGGTGCTGTTCTTAACATGAGGCCTGA
CTTGTTCAAGGTGGTTATCGCTGGAGTTCCTTTTGTAGACGTTTTGACAACAATGCTGGA
CCCAACTATTCCGCTTACGACATCAGAATGGG

QA 12 643 12 643
DS 



AS 1 2

CO CL5334Contig1 767 2 4 U
GGACTGCTTAAGGATAAGCCTCTCGCTTCACTCTCGGCTTCCCCATATCCTCATTTCAAT
GGCGACAACCTCAGCTCTCTCCTCTCTCTCTTCTCTCTCCCTCCACAACACAACCTCTCG
CATTACCACCACCTCCTCGAGAAGATCAGGGATGGGTTCGAGGAGAGGGTTGTGCAGGTG
AGGAGGGTGACTAAGGTTGTGAAAGGTGGGAAGCAGTTGAAGTTTAGGGCGATTGTTGTT
GTCGGAGATAAGCAGGGGAATGTCGGAGTTGGGTGCGCTAAGGCTAAGGAGGTTGTCGCT
GCTGTTCAGAAGAGTGCGATTGATGCGAGGAGGAATCTAGTTCAAGTGCCTATGACTAAG
TACCTTACGTTCCCTCACAGAGCAGAGGGAGACTACGGAGCAGCGAAGGTGATGCTTAGA
CCGGCTTCACCAGGAACAGGTGTGATTGCTGGAGGAGCGGTTAGGATCGTGCTAGAGATG
GCGGGAGTTGAGAACGCTTTGGGGAAACAGCTGGGAAGCAACAATGCTCTCAACAACGCG
AGAGCCACTCTTGCAGCGGTTCAACAGATGAGACAGTTCAAGGATGTTGCTCTCGAGCGT
GGAATCCCCATGGAAGAGCTCTGGAAGTGAAAGAAGAAACTCACTCATCTTCCCTTTTTT
CTATAACGTTTTCACCCTCTCCAATGTTGAAATGAGATTCTTGTGAAATCAAGGGGCGTG
TTTGTAATTTTCTGAGAAAACTGTGTTTATTTTGAAATATCAATCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C867TF U 1
AF RR2C867JQ C 22
BS 1 659 RR2C867TF
BS 660 660 RR2C867JQ
BS 661 691 RR2C867TF
BS 692 767 RR2C867JQ

RD RR2C867TF 695 0 0
GGACTGCTTAAGGATAAGCCTCTCGCTTCACTCTCGGCTTCCCCATATCCTCATTTCAAT
GGCGACAACCTCAGCTCTCTCCTCTCTCTCTTCTCTCTCCCTCCACAACACAACCTCTCG
CATTACCACCACCTCCTCGAGAAGATCAGGGATGGGTTCGAGGAGAGGGTTGTGCAGGTG
AGGAGGGTGACTAAGGTTGTGAAAGGTGGGAAGCAGTTGAAGTTTAGGGCGATTGTTGTT
GTCGGAGATAAGCAGGGGAATGTCGGAGTTGGGTGCGCTAAGGCTAAGGAGGTTGTCGCT
GCTGTTCAGAAGAGTGCGATTGATGCGAGGAGGAATCTAGTTCAAGTGCCTATGACTAAG
TACCTTACGTTCCCTCACAGAGCAGAGGGAGACTACGGAGCAGCGAAGGTGATGCTTAGA
CCGGCTTCACCAGGAACAGGTGTGATTGCTGGAGGAGCGGTTAGGATCGTGCTAGAGATG
GCGGGAGTTGAGAACGCTTTGGGGAAACAGCTGGGAAGCAACAATGCTCTCAACAACGCG
AGAGCCACTCTTGCAGCGGTTCAACAGATGAGACAGTTCAAGGATGTTGCTCTCGAGCGT
GGAATCCCCATGGAAGAGCTCTGGAAGTGAAAGAAGAAACTCACTCATCTTCCCTTTTT*
CTATAACGTTTTCACCCTCTCCAATGTTGAA
TGAG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2C867JQ 746 0 0
CTCGCTTCACTCTCGGCTTCCCCATATCCTCATTTCAATGGCGACAACCTCAGCTCTCTC
CTCTCTCTCTTCTCTCTCCCTCCACAACACAACCTCTCGCATTACCACCACCTCCTCGAG
AAGATCAGGGATGGGTTCGAGGAGAGGGTTGTGCAGGTGAGGAGGGTGACTAAGGTTGTG
AAAGGTGGGAAGCAGTTGAAGTTTAGGGCGATTGTTGTTGTCGGAGATAAGCAGGGGAAT
GTCGGAGTTGGGTGCGCTAAGGCTAAGGAGGTTGTCGCTGCTGTTCAGAAGAGTGCGATT
GATGCGAGGAGGAATCTAGTTCAAGTGCCTATGACTAAGTACCTTACGTTCCCTCACAGA
GCAGAGGGAGACTACGGAGCAGCGAAGGTGATGCTTAGACCGGCTTCACCAGGAACAGGT
GTGATTGCTGGAGGAGCGGTTAGGATCGTGCTAGAGATGGCGGGAGTTGAGAACGCTTTG
GGGAAACAGCTGGGAAGCAACAATGCTCTCAACAACGCGAGAGCCACTCTTGCAGCGGTT
CAACAGATGAGACAGTTCAAGGATGTTGCTCTCGAGCGTGGAATCCCCATGGAAGAGCTC
TGGAAGTGAAAGAAGAAACTCACTCATCTTCCCTTTTTTCTATAACGTTTTCACCCTCTC
CAATGTTGAAATGAGATTCTTGTGAAATCAAGGGGCGTGTTTGTAATTTTCTGAGAAAAC
TGTGTTTATTTTGAAATATCAATCGT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5338Contig1 522 2 3 U
GGAAGGAGAGATAGATCAATCAATCAGCAACCAAAGAACATTTCGAAACCCTAAATCTCC
AATAAAGAGTTCGGAACCTTAACGCCGCCATGGCTAAGAAGAGAAAGCTCGAAGCGCAAC
TCACCGCCGAGGCTTCTTCTGAGCCGTCGTCGCAGAAGAAGATTGCAACCAACACCAATC
AGCTTAGTCAGAAAGAGGTCGTATACGAGGAAGTAGAGGAAGAGCACGAGGAGGAAGTCG
AAGATGACGACAACGATAAGTAGCGACGAAGAGGAAGACTCCAGTGAAGAAGGTTGTGAA
GCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGCGAAGAGGGCTTCGAAGAGGGCGGTGAAGTGAAAAAT
AGGGTTTTAGGAATACATGCTTGTAGCTTTCTCTGTCGTGTAGGTGGTAGTGTTTGTATA
ATCCGATCTTTCATCTTGTTTGCTATGATGTTCTTGTAATCCATGGTTACTTGAGAACCA
TCCTTTGAATCATATATAATAGCTTAATCTCTTTTCAATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FE35TF U 1
AF RR2FE35JQ C 153
BS 1 358 RR2FE35TF
BS 359 359 RR2FE35JQ
BS 360 522 RR2FE35TF

RD RR2FE35TF 522 0 0
GGAAGGAGAGATAGATCAATCAATCAGCAACCAAAGAACATTTCGAAACCCTAAATCTCC
AATAAAGAGTTCGGAACCTTAACGCCGCCATGGCTAAGAAGAGAAAGCTCGAAGCGCAAC
TCACCGCCGAGGCTTCTTCTGAGCCGTCGTCGCAGAAGAAGATTGCAACCAACACCAATC
AGCTTAGTCAGAAAGAGGTCGTATACGAGGAAGTAGAGGAAGAGCACGAGGAGGAAGTCG
AAGATGACGACAACGATAAGTAGCGACGAAGAGGAAGACTCCAGTGAAGAAGGTTGTGAA
GCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGCGAAGAGGGCTTCGAAGAGGGCGGTGAAGTGAAAACT
AGGGTTTTAGGAATACATGCTTGTAGCTTTCTCTGTCGTGTAGGTGGTAGTGTTTGTATA
ATCCGATCTTTCATCTTGTTTGCTATGATGTTCTTGTAATCCATGGTTACTTGAGAACCA
TCCTTTGAATCATATATAATAGCTTAATCTCTTTTCAATGTT

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2FE35JQ 370 0 0
CAGAAGAAGATTGCAACCAACACCAATCAGCTTAGTCAGAAAGAGGTTGTATACGAGGAA
GTAGAGGAAGAGCACGAGGAGGAAGTCGAAGATGACGACAACGATAAGTAGCGACGAAGA
GGAAGACTCCAGTGAAGAAGGTTGTGAAGCCAAAGACGGTGAAGTTTCCAGCGAAGAGGG
CTTCGAAGAGGGCGGTGAAGTGAAAAATAGGGTTTTAGGAATACATGCTTGTAGCTTTTT
TTGTCGTGTAGGTGGTAGTGTTTGTATAATCCGATCTTTCATCTTGTTTGCTATGATGTT
CTTGTAATCCATGGTTACTTGAGAACCATCCTTTGAATCATATATAATAGCTTAATTTCT
TTTCAATGTT

QA 1 370 1 370
DS 



AS 1 2

CO CL5339Contig1 695 2 7 U
GACATCATCTCATTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTCGCTTTTAGCTATTATGGCTTTCTCT
ACACCATCACTTGCCAAACTCTCTCTTTTGGTCGCCATTTCGGCATCAGCACTCCTCTGC
TCAGCTCTTGCCCGTGATTTCTCCATCATTGGATACACACCTGAGCATCTGTCATCCACC
GATAACCTTCTAGAGCTCTTCGAGTCATGGATGTCAGAACACAGCAAGGCTTACCAAAGC
GTTGAGGAGAAGGTGCACAGGTTCGAGGTGTTCAGGGATAACCTGATGCATATAGACCAG
AGGAACAACGAGATCAGCAGTTACTGGCTCGGGTTAAACGAGTTTGCGGATCTGACCCAT
GAAGAGTTCAAGAGGAAGTATCTCGGACTTTCAAAGCCGCAGCAATTCTCTAGAAAGAAG
CAGCCCTCCTCTGCTAACTTCAGGTACAGAGACGTCACAGACTTGCCTAAATCCGTTGAC
TGGAGGAAGAAAGGCGCTGTGACTCCTGTCAAGAACCAGGGTTCATGTGGTAGTTGTTGG
GCGTTTTCGACAGTTGCAGCTGTTGAAGGGATCCACCAGATCACAACAGGGAACCTGAGT
TCGCTTTCGGAGCAAGAACTCATAGACTGTGACACAACTTACAACAACGGTTGCAATGGA
GTCTAATGGACTACGCATTCCAGTACATCATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2EW53TF U 1
AF RR2C265TF U 317
BS 1 387 RR2EW53TF
BS 388 388 RR2C265TF
BS 389 557 RR2EW53TF
BS 558 558 RR2C265TF
BS 559 582 RR2EW53TF
BS 583 583 RR2C265TF
BS 584 695 RR2EW53TF

RD RR2EW53TF 695 0 0
GACATCATCTCATTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTCGCTTTTAGCTATTATGGCTTTCTCT
ACACCATCACTTGCCAAACTCTCTCTTTTGGTCGCCATTTCGGCATCAGCACTCCTCTGC
TCAGCTCTTGCCCGTGATTTCTCCATCATTGGATACACACCTGAGCATCTGTCATCCACC
GATAACCTTCTAGAGCTCTTCGAGTCATGGATGTCAGAACACAGCAAGGCTTACCAAAGC
GTTGAGGAGAAGGTGCACAGGTTCGAGGTGTTCAGGGATAACCTGATGCATATAGACCAG
AGGAACAACGAGATCAGCAGTTACTGGCTCGGGTTAAACGAGTTTGCGGATCTGACCCAT
GAAGAGTTCAAGAGGAAGTATCTCGGA*TTTCAAAGCCGCAGCAATTCTCTAGAAAGAAG
CAGCCCTCCTCTGCTAACTTCAGGTACAGAGACGTCACAGACTTGCCTAAATCCGTTGAC
TGGAGGAAGAAAGGCGCTGTGACTCCTGTCAAGAACCAGGGTTCATGTGGTAGTTGTTGG
GCGTTTTCGACAGTTGCGGCTGTTGAAGGGATCCACCAGATCGCAACAGGGAACCTGAGT
TCGCTTTCGGAGCAAGAACTCATAGACTGTGACACAACTTACAACAACGGTTGCAATGGA
GTCTAATGGACTACGCATTCCAGTACATCATATCC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2C265TF 377 0 0
GCAGTTACTGGCTCGGGTTAAACGAGTTTGCGGATTTGACCCATGAAGAGTTCAAGAGGA
AGTATCTCGGACTTTCAAAGCCGCAGCAATTCTCTAGAAAGAAGCATCCCTCCTCTGCTA
ACTTCAGGTACAGAGACGTCACAGACTTGCCTAAATCCGTTGACTGGAGGAAGAAAGGCG
CTGTGACTCCTGTCAAGAACCAGGGTTCATGTGGTAGTTGTTGGGCGTTTTCGACAGTTG
CAGCTGTTGAAGGGATCCACCAGATCACAACAGGGAACCTGAGTTCGCTTTCGGAGCAAG
A*CTCATAGACTGTGACACAACTTACAACAACGGTTGCAATGGAGTCTA*TGGACTACGC
ATTCCAGTACATCATAT

QA 1 377 1 377
DS 



AS 1 2

CO CL5340Contig1 1092 2 2 U
GAGCAGATGTCTTTTACGTTGGCGGCAAACGAGAAGATGACTAAGAAAGCGATGAGAGAA
TCACGTGACCTGCGCGTGCAGAAGCGTCAGCTAGAAGAGCTTCTCATGAACTCTAAGGAT
GAACTCCGAGCGAATAAAGTAGAGTATGAAGCAAAGCTCAAGGAGATGGAGAGAATGTTG
GAAGGACTTGTGGAGAAATCCAGAAATCTAGAGAGCGAGAAGAGGAAACAAGAAGATGCC
AATGCAGATTTAACACAGGAGATCACAAGGCTTAAGGATGAGATTGAGATCTTGAGAGTT
GAGCTATCAAGCACGATTGCAGAGATGAAGAAAGGAACAGAGTGTTTGGCTGAGGAGGTG
CAGCTTATCAAAGATGAAAAAGAAGCAGTCGTTACCCTTTTAAAAGCAGAAGTAGAAACT
GCAAGAGGGAAATGTGATGATCTAAAGGAAAGAATAATACTGCTCGAGGAACACATCAGA
CTAAAGGAAAATGCTGTAGAAGACTCTTCAAAGATGTTTATCCAAAAGGAAAAGGAATTG
AATAGCCGAATCGAGGAATTGGAGACTGAACTCAACAAACTAAGTCTGAATAGTCTAGAG
ACTGGTGAATGTCTGCATGGTCCAGAAGCAGCTATTGCTTTGCAAAATAGAGAAGTACTG
TCATCGACCAAGAGTGATGATCTTAAAGACTTGGTAAATGAAGTAGCATCGCTAAAAGAG
CAAAATGAAGTGATGGAAATGGAGTTGAAGGAGATGCAAGAGAGGTATTCAGATATAAGT
GTAAGATTTGCAGAAGTTGAAGGTGAGAGACAACGACTTGTCATGACTGTACGTAATCTT
AAGAATGCCAAGAGGAGTTAGAAACCCATATTCTCACGACCATAAGAACATTGTACAAAT
TTCTTTCCTTTTCAATATATAAATTTACTTTTCCTGATTTTGTTTCATATTTATATATAG
TATAAATTTTGTTGTTTGAGTGAAAGAAAAATGAGTTTTGAATTTTGACTTCTTTTTCTT
TTGGTGTATTTATATAATGATGAACGCGTTGTATAATATTTCAAATGTATTCCAATTCCA
ATCCAAGGGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF57TF U 1
AF RR2CF57JQ C 274
BS 1 608 RR2CF57TF
BS 609 1092 RR2CF57JQ

RD RR2CF57TF 614 0 0
GAGCAGATGTCTTTTACGTTGGCGGCAAACGAGAAGATGACTAAGAAAGCGATGAGAGAA
TCACGTGACCTGCGCGTGCAGAAGCGTCAGCTAGAAGAGCTTCTCATGAACTCTAAGGAT
GAACTCCGAGCGAATAAAGTAGAGTATGAAGCAAAGCTCAAGGAGATGGAGAGAATGTTG
GAAGGACTTGTGGAGAAATCCAGAAATCTAGAGAGCGAGAAGAGGAAACAAGAAGATGCC
AATGCAGATTTAACACAGGAGATCACAAGGCTTAAGGATGAGATTGAGATCTTGAGAGTT
GAGCTATCAAGCACGATTGCAGAGATGAAGAAAGGAACAGAGTGTTTGGCTGAGGAGGTG
CAGCTTATCAAAGATGAAAAAGAAGCAGTCGTTACCCTTTTAAAAGCAGAAGTAGAAACT
GCAAGAGGGAAATGTGATGATCTAAAGGAAAGAATAATACTGCTCGAGGAACACATCAGA
CTAAAGGAAAATGCTGTAGAAGACTCTTCAAAGATGTTTATCCAAAAGGAAAAGGAATTG
AATAGCCGAATCGAGGAATTGGAGACTGAACTCAACAAACTAAGTCTGAATAGTCTAGAG
ACTGGTGA
TGTCTG

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2CF57JQ 819 0 0
AAGGATGAGATTGAGATCTTGAGAGT*GAGCTATCAAGCACGATTGCAGAGATGAAGAAA
GGAACAGAGTGTTTGGCTGAGGAGGTGCAGCTTATCAAAGATGAAAAAGAAGCAGTCGTT
ACCCTTTTAAAAGCAGAAGTAGAAACTGCAAGAGGGAAATGTGATGATCTAAAGGAAAGA
ATAATACTGCTCGAGGAACACATCAGACTAAAGGAAAATGCTGTAGAAGACTCTTCAAAG
ATGTTTATCCAAAAGGAAAAGGAATTGAATAGCCGAATCGAGGAATTGGAGACTGAACTC
AACAAACTAAGTCTGAATAGTCTAGAGACTGGTGAATGTCTGCATGGTCCAGAAGCAGCT
ATTGCTTTGCAAAATAGAGAAGTACTGTCATCGACCAAGAGTGATGATCTTAAAGACTTG
GTAAATGAAGTAGCATCGCTAAAAGAGCAAAATGAAGTGATGGAAATGGAGTTGAAGGAG
ATGCAAGAGAGGTATTCAGATATAAGTGTAAGATTTGCAGAAGTTGAAGGTGAGAGACAA
CGACTTGTCATGACTGTACGTAATCTTAAGAATGCCAAGAGGAGTTAGAAACCCATATTC
TCACGACCATAAGAACATTGTACAAATTTCTTTCCTTTTCAATATATAAATTTACTTTTC
CTGATTTTGTTTCATATTTATATATAGTATAAATTTTGTTGTTTGAGTGAAAGAAAAATG
AGTTTTGAATTTTGACTTCTTTTTCTTTTGGTGTATTTATATAATGATGAACGCGTTGTA
TAATATTTCAAATGTATTCCAATTCCAATCCAAGGGACT

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 2

CO CL5341Contig1 724 2 3 U
AGTATCAATCAAACATATCTAAACAGGCAAAGCGTTATGTTACATGTGAATCCTTAATTA
CTACTTCTCATCAAGGCCTCAACTGCTTTGTGTAAGGAACTAGTACGATTTGAGCCTTCT
GGACGTTTAAACAGTGAGTGAGGTCCGTTCCAGACAGAACTGTGGTTTTTGCTGTTAGGA
AAGATAGTCTCGCAAAAATTTAGCAGCTGAGGGTTTCTGAATTGGAACTTCTCATGCATC
TTAACTCTCCATTGTTTACGCTCTAACTCCTGCAGTTCCTTCTGCTCTCGGAATCGTTTT
GCCTTGTCTTCCTCATCATTCTGAGTTGATTTTGGACCTTCAACAACCAATTTCTCTGCA
GCACTGGTCAGGGGCTCGTCACCAGTCTCTTCTGTCGATCTATCAATCGATTGAGTCTTA
TCCTCGACAGTAGGTTTGGTTTTAGTTTCACTCTCCACCTCAATGGTTTCCACTTCCTCC
ACATTTTCACCAACTCTTTGTCGTTTTGCCACTGGACTATCATCTAGTTCCACGATTTCT
GGTTTTCCTGCTTGTCCAGTTTTGTTCAGTGGACTTTTTAGACTTGTTCCCTTTCTTATG
TCCTCCCTTACGCTTCATCCTCAAAGGACACCAAACAAACTTAATAGACACTCTCGAGAC
CGCGCTTTCCACTTTCGAGCCGTAAATTCTTCGGGCGTCGCTTTTTAGACCCGAGACGAG
ACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2GD52JQ U 166
AF RR2GD52TF C 1
BS 1 165 RR2GD52TF
BS 166 532 RR2GD52JQ
BS 533 724 RR2GD52TF

RD RR2GD52JQ 367 0 0
TTTTTGCTGTTAGGAAAGATAGTCTCGCAAAAATTTAGCAGCTGAGGGTTTCTGAATTGG
AACTTCTCATGCATCTTAACTCTCCATTGTTTACGCTCTAACTCCTGCAGTTCCTTCTGC
TCTCGGAATCGTTTTGCCTTGTCTTCCTCATCATTCTGAGTTGATTTTGGACCTTCAACA
ACCAATTTCTCTGCAGCACTGGTCAGGGGCTCGTCACCAGTCTCTTCTGTCGATCTATCA
ATCGATTGAGTCTTATCCTCGACAGTAGGTTTGGTTTTAGTTTCACTCTCCACCTCAATG
GTTTCCACTTCCTCCACATTTTCACCAACTCTTTGTCGTTTTGCCACTGGACTATCATCT
AGTTCCA

QA 1 367 1 367
DS 

RD RR2GD52TF 724 0 0
AGTATCAATCAAACATATCTAAACAGGCAAAGCGTTATGTTACATGTGAATCCTTAATTA
CTACTTCTCATCAAGGCCTCAACTGCTTTGTGTAAGGAACTAGTACGATTTGAGCCTTCT
GGACGTTTAAACAGTGAGTGAGGTCCGTTCCAGACAGAACTGTGGTTTTTGCTGTTAGGA
AAGATAGTCTCGCAGAGATTTAGCAGCTGAGGGTTTCTGAGTTGGAACTTCTCATGCATC
TTAGCTCTCCATTGTTTACGCTCTAACTCCTGCAGTTCCTTCTGCTCTCGGAGTCGTTTT
GCCTTGTCTTCCTCATCATTCTGAGTTGATTTTGGACCTTCAACAACCAATTTCTCTGCA
GCACTGGTCAGGGGCTCGTCACCAGTCTCTTCTGTCGATCTATCAATCGATTGAGTCTTA
TCCTCGACAGTAGGTTTGGTTTTAGTTTCACTCTCCACCTCAATGGTTTCCACTTCCTCC
ACATTTTCACCAACTCTTTGTCGTTTTGCCACTGGACTATCATCTAGTTCCACGATTTCT
GGTTTTCCTGCTTGTCCAGTTTTGTTCAGTGGACTTTTTAGACTTGTTCCCTTTCTTATG
TCCTCCCTTACGCTTCATCCTCAAAGGACACCAAACAAACTTAATAGACACTCTCGAGAC
CGCGCTTTCCACTTTCGAGCCGTAAATTCTTCGGGCGTCGCTTTTTAGACCCGAGACGAG
ACCC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5343Contig1 784 2 6 U
GGACACATCTTGTGTTCTTCTGATGAATCCAGATCATGGCAGCTTCACTCCCCCCCACTC
TAATCCTTTTGAGGATCCTAAAGTAAGATTTAAGCACCATAGCCTTTTGCAAGACTATCA
AGAACTGCATATGTATGCTGAAGCAATGAGAAAGAAGTTGCAGACTATGTAAGAGAGAAA
GGCAACACTAATGGCCGAAGTCCGGTTTCTGCGGCGGAGGTACAGACATTTGAAACAAGA
GTCTCAGCCTGTTATGCAGCCACCGGAGGTTAAGAAAGGGAGAGGAAGATCAAATGGTGG
GAAGAAGAGTAAGACACAGTTGATCCGAGTGGAAGTGTTTCCTACTAAGACAAGTGAAGC
AGAAATTAAACATGTTTCACTTCCTGACTTAAACCACTCGGGAGAGGTTCATCATGACGA
AACCGAAACCAAAAAAGTTCCATTGTTCGATCTAAACCAGATATCTGGAGAAGAAGAGGA
AGAGATGAACAACAATAGCGAAGAGAGAATGAGAGTGGAACAAAGTAAGAGAATGAGCAG
CAGCAGCATCGAGATGCTGTCTTGCAGGAATGGAGGAACCGGTTCACATAAGAGGAAAAT
CTCATGGCAAGATCCTGTTGCAGCTCTTAGAGTCTAATAAAAGACATCAATGTCAAAGTT
CTATCTTGTAACATATAGCTCTCACGTCAGTTTAGCTTTGCTGTATTTGTTTCTCTTCTC
CGTTGAAAGCATATCCTTTTTGTCCATTGTTGAAGTGGCGACTTTATACAAGTGACGTTT
GTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2CG62TF U 1
AF RR2CG62JQ C 49
BS 1 52 RR2CG62TF
BS 53 53 RR2CG62JQ
BS 54 656 RR2CG62TF
BS 657 657 RR2CG62JQ
BS 658 694 RR2CG62TF
BS 695 784 RR2CG62JQ

RD RR2CG62TF 694 0 0
GGACACATCTTGTGTTCTTCTGATGAATCCAGATCATGGCAGCTTCACTCCCTCCCACTC
TAATCCTTTTGAGGATCCTAAAGTAAGATTTAAGCACCATAGCCTTTTGCAAGACTATCA
AGAACTGCATATGTATGCTGAAGCAATGAGAAAGAAGTTGCAGACTATGTAAGAGAGAAA
GGCAACACTAATGGCCGAAGTCCGGTTTCTGCGGCGGAGGTACAGACATTTGAAACAAGA
GTCTCAGCCTGTTATGCAGCCACCGGAGGTTAAGAAAGGGAGAGGAAGATCAAATGGTGG
GAAGAAGAGTAAGACACAGTTGATCCGAGTGGAAGTGTTTCCTACTAAGACAAGTGAAGC
AGAAATTAAACATGTTTCACTTCCTGACTTAAACCACTCGGGAGAGGTTCATCATGACGA
AACCGAAACCAAAAAAGTTCCATTGTTCGATCTAAACCAGATATCTGGAGAAGAAGAGGA
AGAGATGAACAACAATAGCGAAGAGAGAATGAGAGTGGAACAAAGTAAGAGAATGAGCAG
CAGCAGCATCGAGATGCTGTCTTGCAGGAATGGAGGAACCGGTTCACATAAGAGGAAAAT
CTCATGGCAAGATCCTGTTGCAGCTCTTAGAGTCTAATAAAAGACATCAATGTCAA*GTT
CTATCTTGTAACATATAGCTCTCACGTCAGTTTA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2CG62JQ 736 0 0
TCCCCCCCACTCTAATCCTTTTGAGGATCCTAAAGTAAGATTTAAGCACCATAGCCTTTT
GCAAGACTATCAAGAACTGCATATGTATGCTGAAGCAATGAGAAAGAAGTTGCAGACTAT
GTAAGAGAGAAAGGCAACACTAATGGCCGAAGTCCGGTTTCTGCGGCGGAGGTACAGACA
TTTGAAACAAGAGTCTCAGCCTGTTATGCAGCCACCGGAGGTTAAGAAAGGGAGAGGAAG
ATCAAATGGTGGGAAGAAGAGTAAGACACAGTTGATCCGAGTGGAAGTGTTTCCTACTAA
GACAAGTGAAGCAGAAATTAAACATGTTTCACTTCCTGACTTAAACCACTCGGGAGAGGT
TCATCATGACGAAACCGAAACCAAAAAAGTTCCATTGTTCGATCTAAACCAGATATCTGG
AGAAGAAGAGGAAGAGATGAACAACAATAGCGAAGAGAGAATGAGAGTGGAACAAAGTAA
GAGAATGAGCAGCAGCAGCATCGAGATGCTGTCTTGCAGGAATGGAGGAACCGGTTCACA
TAAGAGGAAAATCTCATGGCAAGATCCTGTTGCAGCTCTTAGAGTCTAATAAAAGACATC
AATGTCAAAGTTCTATCTTGTAACATATAGCTCTCACGTCAGTTTAGCTTTGCTGTATTT
GTTTCTCTTCTCCGTTGAAAGCATATCCTTTTTGTCCATTGTTGAAGTGGCGACTTTATA
CAAGTGACGTTTGTAT

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL5344Contig1 456 2 3 U
GGCTACTCTAAGAATAAAGACGTTAAACCCAAGAAACAGAACTGTGAAGAGAGTATTTGC
ACACACAGCAAGCTTGCTGCTTTTATCATACATGGGACAGGAGAGACAGGAGAAGAGAGG
ACTTAAGTGAAACAGAAACACTTGTGGAAAAGAGTTGTGAAGAGAGAGGTGGGGGCTTGG
TCACACTTTCCATTGAGGAGGTCGGCGTGATCAGTGCTGCAGTAGAGATAGCTTTCCTTA
CCAGCTGAATTATTTGTCAGGACAGGATAAACCTGCGTACTTCTCCTTCTCCTGCGACCT
CTTTAGGCAGATGTTAGCCATGAATCTGAACATCTCTTTCTTCTGGTTAAAAGATTGGTT
GACATATTCCTCTATTGGCATCCACTTTGCATCCAATATCTCAGAGTCTTGTTTCTTGAT
TTCAAAATTGCTTGCCTCCAACTCACACAGGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK39JQ U 229
AF RR2FK39TF C 1
BS 1 228 RR2FK39TF
BS 229 337 RR2FK39JQ
BS 338 456 RR2FK39TF

RD RR2FK39JQ 109 0 0
TAGCTTTCCTTACCAGCTGAATTATTTGTCAGGACAGGATAAACCTGCGTACTTCTCCTT
CTCCTGCGACCTCTTTAGGCAGATGTTAGCCATGAATCTGAACATCTCT

QA 1 109 1 109
DS 

RD RR2FK39TF 456 0 0
GGCTACTCTAAGAATAAAGACGTTAAACCCAAGAAACAGAACTGTGAAGAGAGTATTTGC
ACACACAGCAAGCTTGCTGCTTTTATCATACATGGGACAGGAGAGACAGGAGAAGAGAGG
ACTTAAGTGAAACAGAAACACTTGTGGAAAAGAGTTGTGAAGAGAGAGGTGGGGGCTTGG
TCACACTTTCCATTGAGGAGGTCGGCGTGATCAGTGCTGCAGTAGAGATAGCTTTCCTTA
CCAGCTGAATTATTTGTCAGGACAGGATAAACCTGCGTACTTCTCCTTCTCCTGCGACCT
CTTTAGGCAGATGTTAGCCATGAATCTGAACATCTCTTTCTTCTGGTTAAAAGATTGGTT
GACATATTCCTCTATTGGCATCCACTTTGCATCCAATATCTCAGAGTCTTGTTTCTTGAT
TTCAAAATTGCTTGCCTCCAACTCACACAGGAAAAA

QA 1 456 1 456
DS 



AS 1 2

CO CL5345Contig1 1290 2 2 U
GGGACTCGTCTAACACATAGAGACGAGAGGGGAAGAGAGACATGAAGACTGCCTTTCTCA
CCAAGCACAACTCTCTTCAACTCTAAATCAGGTGGCAAAACAAAAACCAATGGCTATGGT
GGTGTCAGGTGGCACGATGCCGCTTCACTCCAATGCTCTTCCTCTGAGTATCATCAACAC
CAAAACAAGAGTCCGGCCTGCAGCATCCTCGTTTCCGCTATCCTCACCCGCTCCTCACAG
TCACACCCCTTCCACCTCCCTCTCCATCCGCTTCAAGCCCTTTCACCATGTTTCCCGGTC
TCTCCCTGTGGTATCTTCTCTTCTGTCAGAGGACAGAGCTACTGGAGGAGTTAGTGGCTC
CGGGACAGATGCACTCAAGCTCACATACTTTGAGGGAAATAGCTGGCTATGGGAAACGGG
TGGATTGAAAATCTTGGTTGATCCCATTCTCGTGGGTAATTTGGATTTTGGAATCCCATG
GCTCTATGATGCTGCCAAGAGATTTTTGAAAGTCTTCAAGCTTGATGATCTCCCTGAAGT
TGATTGCTTGCTCATCACTCAAAGCCTTGATGACCATTGCCATCTAAACACCCTTAGGCC
ACTTTCGGAGAAATCTCCAGACGTAAAGGTTATCGCAACTCCAAATGCAAAGCCTTTGCT
GGATCCTCTTTTCAGAAATGTAACTTATCTGGAACCTGGAGAGACCTACGAGCTAAATGC
AAGAAACGGTTCTAAGGTTCGAGTTAAGGCCACAGCAGGACCTGTCCTCGGTCCACCATG
GCAACGCCCTGAGAACGGGTATCTTCTTGTATCACCTGAAGATCGGTTATCTCTCTACTA
CGAACCGCATTGTGTATGCAACATGGAACTTCTGAAGAATGAAAGAGCCGACATTGTGAT
CACACCGGTCATCAAACAACTTCTTCCACAATTTACTCTGGTTTCTGGCCAAGAAGACGC
TGTCCAGCTAGCCAAAATCTTAAAAGCCAAGTTTGTTGTGCCGATGCAAAATGGTGATCT
TGATGCAAAGGGGATTTTAGCAAATATTATAAAGAAAGAAGGAACGATAGAATCATTTAA
GGAATTGTTATCAAGAGAGCTTCCAAAAGCTCAAGTGTTGGAGCCCATAGCAGGTGTGCC
ACTAGAGATCTTGCCTTCAACGTCAGACGTTTAGAATGTAACGGTATATGAACATGAATG
AGGATACACACATGTAAATATACTAGGCATTTTGTTGTTTTATTTTTCTGTAATGAACGA
TGATTATTGTTAGTACTGTGTTGATTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW24TF U 1
AF RR2EW24JQ C 658
BS 1 718 RR2EW24TF
BS 719 1290 RR2EW24JQ

RD RR2EW24TF 718 0 0
GGGACTCGTCTAACACATAGAGACGAGAGGGGAAGAGAGACATGAAGACTGCCTTTCTCA
CCAAGCACAACTCTCTTCAACTCTAAATCAGGTGGCAAAACAAAAACCAATGGCTATGGT
GGTGTCAGGTGGCACGATGCCGCTTCACTCCAATGCTCTTCCTCTGAGTATCATCAACAC
CAAAACAAGAGTCCGGCCTGCAGCATCCTCGTTTCCGCTATCCTCACCCGCTCCTCACAG
TCACACCCCTTCCACCTCCCTCTCCATCCGCTTCAAGCCCTTTCACCATGTTTCCCGGTC
TCTCCCTGTGGTATCTTCTCTTCTGTCAGAGGACAGAGCTACTGGAGGAGTTAGTGGCTC
CGGGACAGATGCACTCAAGCTCACATACTTTGAGGGAAATAGCTGGCTATGGGAAACGGG
TGGATTGAAAATCTTGGTTGATCCCATTCTCGTGGGTAATTTGGATTTTGGAATCCCATG
GCTCTATGATGCTGCCAAGAGATTTTTGAAAGTCTTCAAGCTTGATGATCTCCCTGAAGT
TGATTGCTTGCTCATCACTCAAAGCCTTGATGACCATTGCCATCTAAACACCCTTAGGCC
ACTTTCGGAGAAATCTCCAGACGTAAAGGTTATCGCAACTCCAAATGCAAAGCCTTTGCT
GGATCCTCTTTTCAGAAATGTAACTTATCTGGAACCTGGAGAGACCTACGAGCTAAAT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2EW24JQ 633 0 0
GCTGGATCCTCTTTTCAGAAATGTAACTTATCTGGAACCTGGAGAGACCTACGAGCTAAA
TGCAAGAAACGGTTCTAAGGTTCGAGTTAAGGCCACAGCAGGACCTGTCCTCGGTCCACC
ATGGCAACGCCCTGAGAACGGGTATCTTCTTGTATCACCTGAAGATCGGTTATCTCTCTA
CTACGAACCGCATTGTGTATGCAACATGGAACTTCTGAAGAATGAAAGAGCCGACATTGT
GATCACACCGGTCATCAAACAACTTCTTCCACAATTTACTCTGGTTTCTGGCCAAGAAGA
CGCTGTCCAGCTAGCCAAAATCTTAAAAGCCAAGTTTGTTGTGCCGATGCAAAATGGTGA
TCTTGATGCAAAGGGGATTTTAGCAAATATTATAAAGAAAGAAGGAACGATAGAATCATT
TAAGGAATTGTTATCAAGAGAGCTTCCAAAAGCTCAAGTGTTGGAGCCCATAGCAGGTGT
GCCACTAGAGATCTTGCCTTCAACGTCAGACGTTTAGAATGTAACGGTATATGAACATGA
ATGAGGATACACACATGTAAATATACTAGGCATTTTGTTGTTTTATTTTTCTGTAATGAA
CGATGATTATTGTTAGTACTGTGTTGATTATTT

QA 1 633 1 633
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5347Contig1 835 2 2 U
GGGAATTCGCAGCCACCGTCGTGTCGTGTGATGATCAAATATGCTTGGAGATAGTAGAAG
AAGAACCCTTCTCTCGATTTTGACGAGAAGACCAACTTTGTGCCTCCATTGTTTTCAATC
TCCCTTAAAGATTTTCGCAGGGAAAACCAAAGCCATAAAAGCTAGAGAACTAGTCAACTC
CACCGTTCTTCAGAGAAATGACACCCGCAAGGCAAATTAGTAAACTTTCGAGTTCAGCAA
GATCCTTTATTCTCAGTGGATCCAGATCAATTGCAGCTGCTGGGACTTCTCGTGCACACA
CCGACGATGAACCTTTTGTCTCCAGACGCCAGCAACAGCTTAGGAATCAAGCTGCACAGA
CTGGAAAAACACAGACCAATATTGTCCTCAATCCCTCGGTTGTTCCCAAGAAGGTTGATG
ATTTTGGTCGGCCATCTCTGTTGCCGCAACATGTTTCTTCTTCACATCCGGTTAGTTATG
CATCAGCAGTCATTAGGGAGGAGGAGAAAGCTACTTCAGCACCTATTGGGGATCAGATTT
TCAGAGCCGGTGTGAAAGCGGTTCAAAGGAAGCATGTCTATGACCTAAGGCAACTGCTTT
GGACGGGTGATAACGGAAGTTGCTCCCAGCATATTTACCAGTACATGCAAGCTGTTGTAG
ATGAAATTATCGTTGGAATTTCTGATCCGCAGAAGGTAAATTACGCTCTTGTCTAGTAAA
ACCTGTTAGATAAAGGTCATCGCTTTGCTCCTTTTCTCTAAAATAAATAAACCTAGTCAG
TTTTTCGTTTCTAATCCATAAAATATGTTTAATTATCTAATCATAATAATAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR51TF U 1
AF RR2DR51JQ C 156
BS 1 496 RR2DR51TF
BS 497 835 RR2DR51JQ

RD RR2DR51TF 496 0 0
GGGAATTCGCAGCCACCGTCGTGTCGTGTGATGATCAAATATGCTTGGAGATAGTAGAAG
AAGAACCCTTCTCTCGATTTTGACGAGAAGACCAACTTTGTGCCTCCATTGTTTTCAATC
TCCCTTAAAGATTTTCGCAGGGAAAACCAAAGCCATAAAAGCTAGAGAACTAGTCAACTC
CACCGTTCTTCAGAGAAATGACACCCGCAAGGCAAATTAGTAAACTTTCGAGTTCAGCAA
GATCCTTTATTCTCAGTGGATCCAGATCAATTGCAGCTGCTGGGACTTCTCGTGCACACA
CCGACGATGAACCTTTTGTCTCCAGACGCCAGCAACAGCTTAGGAATCAAGCTGCACAGA
CTGGAAAAACACAGACCAATATTGTCCTCAATCCCTCGGTTGTTCCCAAGAAGGTTGATG
ATTTTGGTCGGCCATCTCTGTTGCCGCAACATGTTTCTTCTTCACATCCGGTTAGTTATG
CATCAGCAGTCATTAG

QA 1 496 1 496
DS 

RD RR2DR51JQ 680 0 0
TAAAAGCTAGAGAACTAGTCAACTCCACCGTTCTTCAGAGAAATGACACCCGCAAGGCAA
ATTAGTAAACTTTCGAGTTCAGCAAGATCCTTTATTCTCAGTGGATCCAGATCAATTGCA
GCTGCTGGGACTTCTCGTGCACACACCGACGATGAACCTTTTGTCTCCAGACGCCAGCAA
CAGCTTAGGAATCAAGCTGCACAGACTGGAAAAACACAGACCAATATTGTCCTCAATCCC
TCGGTTGTTCCCAAGAAGGTTGATGATTTTGGTCGGCCATCTCTGTTGCCGCAACATGTT
TCTTCTTCACATCCGGTTAGTTATGCATCAGCAGTCATTAGGGAGGAGGAGAAAGCTACT
TCAGCACCTATTGGGGATCAGATTTTCAGAGCCGGTGTGAAAGCGGTTCAAAGGAAGCAT
GTCTATGACCTAAGGCAACTGCTTTGGACGGGTGATAACGGAAGTTGCTCCCAGCATATT
TACCAGTACATGCAAGCTGTTGTAGATGAAATTATCGTTGGAATTTCTGATCCGCAGAAG
GTAAATTACGCTCTTGTCTAGTAAAACCTGTTAGATAAAGGTCATCGCTTTGCTCCTTTT
CTCTAAAATAAATAAACCTAGTCAGTTTTTCGTTTCTAATCCATAAAATATGTTTAATTA
TCTAATCATAATAATAAAAG

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL5348Contig1 895 2 2 U
GGTTGTTTTCCTGGGAAAAAAAATTAATCAAATCGGATAAACGTACTTAGCAGCTTGAGG
AAATCATGAGCACCGAGTACGATTATCTGTTCAAGCTTTTGTTGATCGGTGACTCTTCCG
TTGGAAAATCATGCCTTCTTCTTCGATTCGCTGACGATGCTTACATTGACAGTTACATTA
GTACCATCGGTGTTGACTTCAAAATTAGAACCATTGAGCTGGATGGGAAGACCGTTAGGC
TGCAAATCTGGGATACTGCTGGGCAAGAACGTTTCAGGACCATCACTAGCAGCTACTACA
GAGGAGCTCATGGAATCATTATTGTGTACGACTGTACTGAGATGGAGAGCTTTAACAACG
TCAAGCAGTGGTTGAGTGAGATCGACAGATATGCTAATGACGGTGTATGCAAGCTTCTTA
TCGGTAACAAGAATGATATGGTTGAGAGTAAAGTTGTGTCCACCGAAACTGGAAAGGCCT
TAGCAGATGAGCTTGGAATTCCATTTCTTGAGACCAGTGCTAAGGATTCTATCAACGTCG
AACAAGCATTCTTAACTATTGCTGGCGAGATCAAGAAAAGAATGGGAAGCCAGACTACTG
CCAACAAGGCCTCAGGAAGTGGAACTGTTCAGATGAAAGGTCAGCCAATTTTACAGAACA
ATGGCGGTTGCTGCAGTAGTAGTTAAGCAAAGTGTTACCAAAAAAATTAAGTGAGACGTA
CTTTTTCTGTTCTTACTATGTGTTGTGAAAACCAAGGACTGTCTGAAACAACAACTGGAA
AACTTTAATAGTTCATGTCACTTGTATCCGAATAATCTATGGTGTTAGTTGCAATATTCC
TGTCTTTAGTGTAGTACATCTATGACATTTGATTACATAACTTTATGATTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL33TF U 1
AF RR2AL33JQ C 251
BS 1 607 RR2AL33TF
BS 608 895 RR2AL33JQ

RD RR2AL33TF 611 0 0
GGTTGTTTTCCTGGGAAAAAAAATTAATCAAATCGGATAAACGTACTTAGCAGCTTGAGG
AAATCATGAGCACCGAGTACGATTATCTGTTCAAGCTTTTGTTGATCGGTGACTCTTCCG
TTGGAAAATCATGCCTTCTTCTTCGATTCGCTGACGATGCTTACATTGACAGTTACATTA
GTACCATCGGTGTTGACTTCAAAATTAGAACCATTGAGCTGGATGGGAAGACCGTTAGGC
TGCAAATCTGGGATACTGCTGGGCAAGAACGTTTCAGGACCATCACTAGCAGCTACTACA
GAGGAGCTCATGGAATCATTATTGTGTACGACTGTACTGAGATGGAGAGCTTTAACAACG
TCAAGCAGTGGTTGAGTGAGATCGACAGATATGCTAATGACGGTGTATGCAAGCTTCTTA
TCGGTAACAAGAATGATATGGTTGAGAGTAAAGTTGTGTCCACCGAAACTGGAAAGGCCT
TAGCAGATGAGCTTGGAATTCCATTTCTTGAGACCAGTGCTAAGGATTCTATCAACGTCG
AACAAGCATTCTTAACTATTGCTGGCGAGATCAAGAAAAGAATGGGAAGCCAGACTACTG
CCAACAA
CGCC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2AL33JQ 645 0 0
GGATACTGCTGGGCAAGAACGTTTCAGGACCATCACTAGCAGCTACTACAGAGGAGCTCA
TGGAATCATTATTGTGTACGACTGTACTGAGATGGAGAGCTTTAACAACGTCAAGCAGTG
GTTGAGTGAGATCGACAGATATGCTAATGACGGTGTATGCAAGCTTTTTATCGGTAACAA
GAATGATATGGTTGAGAGTAAAGTTGTGTCCACCGAAACTGGAAAGGCCTTAGCAGATGA
GCTTGGAATTCCATTTCTTGAGACCAGTGTTAAGGATTCTATCAACGTCGAACAAGCATT
TTTAACTATTGCTGGGGAGATCAAGAAAAGAATGGGAAGCCAGACTACTGCCAACAAGGC
CTCAGGAAGTGGAACTGTTCAGATGAAAGGTCAGCCAATTTTACAGAACAATGGCGGTTG
CTGCAGTAGTAGTTAAGCAAAGTGTTACCAAAAAAATTAAGTGAGACGTACTTTTTCTGT
TCTTACTATGTGTTGTGAAAACCAAGGACTGTCTGAAACAACAACTGGAAAACTTTAATA
GTTCATGTCACTTGTATCCGAATAATCTATGGTGTTAGTTGCAATATTCCTGTCTTTAGT
GTAGTACATCTATGACATTTGATTACATAACTTTATGATTCTCTC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL5349Contig1 823 2 4 U
GTACTATCAAGACACCAATCAGATATAAAAACGCATAGGATAGCCTTGAGTCTTGACTTG
TTACAATAAGCGAACGAGTAAAACCAAGTCTGCATCGTGATCAAGATTTTTAAGAACTTT
TGTAAGAAACCCATCTAATGAGCATTAGCTTAAACCATAGGACATACAATCAAAATCAAC
ACTTAACGTTAACTAGGAAGTTTCGGTACAAAACCCAAAAAGGAAAAGACTAAGAGAACA
CAAAGCTTATAAACCATAACATACTAAATTGATGAAATCTCCACAAATCCTTGGTTGAAA
ATCCAAACTAAATATAATGTTTAAGTGTTTTAACTATATATTGTTTTGTGTTTTGTCATC
TGGACGATGACCGTCAATTTCCATAACTCTTTAGTAATAGTATTCTGTATTCATAATTTT
AGCATAATTCTTTACATAATACTTGAGAAATAAAATATCATTGTTATTTTTTTTTAGCGA
AATTGAGCAGTTACAAAAGTAAGACAAACATTATTTCACTGGTAACGTAGGAGATAATAT
TTTTTTTCACATCTACTGATAAGTTCCATATCGCCGACAAAAAAAAGTTCCATATCGCCC
AATTTTGATGAGTTGTTGTCCAAACGACACTAATATAAAGCGAAAATCTTACTATCAAGC
AAATTAATTAAAAAAAGATGAAAACAGTTGTCTTTTGGAAGATGGTTTTGAAATATCGAG
CAAAATAATTAAAAAAATGAAAAATGAAAACAGTTGTAATATTAGAAGAAAAAAATGAAA
ACAGTTGTCTTTGGAATATGAAACAAAGTCCAGAGTTTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ07TF U 1
AF RR2AJ07JQ C 125
BS 1 724 RR2AJ07TF
BS 725 725 RR2AJ07JQ
BS 726 766 RR2AJ07TF
BS 767 823 RR2AJ07JQ

RD RR2AJ07TF 767 0 0
GTACTATCAAGACACCAATCAGATATAAAAACGCATAGGATAGCCTTGAGTCTTGACTTG
TTACAATAAGCGAACGAGTAAAACCAAGTCTGCATCGTGATCAAGATTTTTAAGAACTTT
TGTAAGAAACCCATCTAATGAGCATTAGCTTAAACCATAGGACATACAATCAAAATCAAC
ACTTAACGTTAACTAGGAAGTTTCGGTACAAAACCCAAAAAGGAAAAGACTAAGAGAACA
CAAAGCTTATAAACCATAACATACTAAATTGATGAAATCTCCACAAATCCTTGGTTGAAA
ATCCAAACTAAATATAATGTTTAAGTGTTTTAACTATATATTGTTTTGTGTTTTGTCATC
TGGACGATGACCGTCAATTTCCATAACTCTTTAGTAATAGTATTCTGTATTCATAATTTT
AGCATAATTCTTTACATAATACTTGAGAAATAAAATATCATTGTTATTTTTTTTTAGCGA
AATTGAGCAGTTACAAAAGTAAGACAAACATTATTTCACTGGTAACGTAGGAGATAATAT
TTTTTTTCACATCTACTGATAAGTTCCATATCGCCGACAAAAAAAAGTTCCATATCGCCC
AATTTTGATGAGTTGTTGTCCAAACGACACTAATATAAAGCGAAAATCTTACTATCAAGC
AAATTAATTAAAAAAAGATGAAAACAGTTGTCTTTTGGAAGATGGTTTTGAAATATCGAG
CAAA*TAATTAAAAAAATGAAAAATGAAAACAGTTGTAATATTAGA
G

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2AJ07JQ 699 0 0
AGAAACCCATCTAATGAGCATTAGCTTAAACCATAGGACATACAATCAAAATCAACACTT
AACGTTAACTAGGAAGTTTCGGTACAAAACCCAAAAAGGAAAAGACTAAGAGAACACAAA
GCTTATAAACCATAACATACTAAATTGATGAAATCTCCACAAATCCTTGGTTGAAAATCC
AAACTAAATATAATGTTTAAGTGTTTTAACTATATATTGTTTTGTGTTTTGTCATCTGGA
CGATGACCGTCAATTTCCATAACTCTTTAGTAATAGTATTCTGTATTCATAATTTTAGCA
TAATTCTTTACATAATACTTGAGAAATAAAATATCATTGTTATTTTTTTTTAGCGAAATT
GAGCAGTTACAAAAGTAAGACAAACATTATTTCACTGGTAACGTAGGAGATAATATTTTT
TTTCACATCTACTGATAAGTTCCATATCGCCGACAAAAAAAAGTTCCATATCGCCCAATT
TTGATGAGTTGTTGTCCAAACGACACTAATATAAAGCGAAAATCTTACTATCAAGCAAAT
TAATTAAAAAAAGATGAAAACAGTTGTCTTTTGGAAGATGGTTTTGAAATATCGAGCAAA
ATAATTAAAAAAATGAAAAATGAAAACAGTTGTAATATTAGAAGAAAAAAATGAAAACAG
TTGTCTTTGGAATATGAAACAAAGTCCAGAGTTTTGTCC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL5350Contig1 770 2 4 U
GGACAGTTCTGTGCATTTCTTCTATCCGTCCATCTCTCACAAACACAAACACAAAAACGT
CTCATCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTGCCTCTCCTTTCCTCTCT
TCGCCGTGAATGGCGGCAACGCAAGGGATGGCTCAGCCTTCGACAAAGAAACGAAGCTTT
CTCCTCCGTGATTTCTTTAAACTTTTCCGAGCAATCTCAAGAGTCTTCCCTCGTGAAAAG
CCTAACCATACCCATAAGGCCAGTAAACACGAACGAAAGCCCCGCACCAAATCCAAACGG
CATGAAGAACAGATTTTCAACGTCCCTGATGATCCAAACGCCTTCCGTTTCCAGGAAGCG
AAGTCGTCGGTGGCTAACAAGGTGGAAGGTGCAAATTTTTGCAAGGTTCGTAGCTATAGA
TTGGACAACAGCGTGGGGACAAAGAAGGCGTCATCAGCTTTTTCAAGGAGTTGTAGCCAG
AACACGGCCACGACGAATCCGAATCTCACAATGCGGAGTTTATCTTTTATAGGGAGGAAC
AAGACGGATTCAAATGGATTCGTGCCGACACTTATGAGATCGACGACCACGGTTCCAAGG
AGCTTAGCAAACCCAATCTTGTACTCGAGCTCGTCCGCCAAAGTGGCTAAACCTCAAGCT
ACGGAGAAGAAACTAAGCTGCACGCTCGAGGAGCTATGCAACGGTTGCACTAAGAAGATT
AAGATCAAGAGAGATGTGATTACAACCTCAGGGTTTGCTTCTCTTTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU08TF U 1
AF RR2DU08JQ C 396
BS 1 721 RR2DU08TF
BS 722 722 RR2DU08JQ
BS 723 741 RR2DU08TF
BS 742 770 RR2DU08JQ

RD RR2DU08TF 741 0 0
GGACAGTTCTGTGCATTTCTTCTATCCGTCCATCTCTCACAAACACAAACACAAAAACGT
CTCATCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTGCCTCTCCTTTCCTCTCT
TCGCCGTGAATGGCGGCAACGCAAGGGATGGCTCAGCCTTCGACAAAGAAACGAAGCTTT
CTCCTCCGTGATTTCTTTAAACTTTTCCGAGCAATCTCAAGAGTCTTCCCTCGTGAAAAG
CCTAACCATACCCATAAGGCCAGTAAACACGAACGAAAGCCCCGCACCAAATCCAAACGG
CATGAAGAACAGATTTTCAACGTCCCTGATGATCCAAACGCCTTCCGTTTCCAGGAAGCG
AAGTCGTCGGTGGCTAACAAGGTGGAAGGTGCAAATTTTTGCAAGGTTCGTAGCTATAGA
TTGGACAACAGCGTGGGGACAAAGAAGGCGTCATCAGCTTTTTCAAGGAGTTGTAGCCAG
AACACGGCCACGACGAATCCGAATCTCACAATGCGGAGTTTATCTTTTATAGGGAGGAAC
AAGACGGATTCAAATGGATTCGTGCCGACACTTATGAGATCGACGACCACGGTTCCAAGG
AGCTTAGCAAACCCAATCTTGTACTCGAGCTCGTCCGCCAAAGTGGCTAAACCTCAAGCT
ACGGAGAAGAAACTAAGCTGCACGCTCGAGGAGCTATGCAACGGTTGCACTAAGAAGATT
A*GATCAAGAGAGATGTGATT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2DU08JQ 375 0 0
TTTTTGCAAGGTTCGTAGCTATAGATTGGACAACAGCGTGGGGACAAAGAAGGCGTCATC
AGCTTTTTCAAGGAGTTGTAGCCAGAACACGGCCACGACGAATCCGAATCTCACAATGCG
GAGTTTATCTTTTATAGGGAGGAACAAGACGGATTCAAATGGATTCGTGCCGACACTTAT
GAGATCGACGACCACGGTTCCAAGGAGCTTAGCAAACCCAATCTTGTACTCGAGCTCGTC
CGCCAAAGTGGCTAAACCTCAAGCTACGGAGAAGAAACTAAGCTGCACGCTCGAGGAGCT
ATGCAACGGTTGCACTAAGAAGATTAAGATCAAGAGAGATGTGATTACAACCTCAGGGTT
TGCTTCTCTTTCACC

QA 1 375 1 375
DS 



AS 1 2

CO CL5351Contig1 1034 2 4 U
TTTTTTTTACATGTAAAGATAGTAATGGAACCGAGCATTTTTCAAAATATAATCGTTCTA
ATAGATACCACTTCTTATGTACATACATATATATGTTAAAGAAATGATTATTGGTATTTT
ACATAAAATGATTATTGATAAAATATATTTATCATGATGTTGAAGATAAGTGGGTGTAGG
AAATGACATATACTCTTTGGAGGGGACAATGCATGCTATAATTTGATGTCAATTAACTTT
CTTCCCTACCAAAAAGTCATGCCCTTCTTTTCTTTACAACACATGCTTGTCATTATTAAC
AATTAATTATAAAGAAACCATTGTTAATATCTTTTCATTTATACGATCTCTTCGAATGAC
AGATCATTAAATTATCGGTTTAGAGTAGTGGTGCCCAGTTTTATTTAATTGGTGAACAAT
TGTTTTCGCATCTGGGGCGTATGACTAGGCTATTCCATGAAATTTACAATCATCGCCTAA
GATAATTTACTAAGCATAGGTTAAGCTCAGTCTACAGGCTTCAGTAGTGACACTAATTGT
TAGGTTAAGCTCAGTCTATCCAGACTTCAGTAGATAGCTTATAATTATTTGGTGAGTTTA
TTTGTTTTCAGAAAATAATAAGTAGGTAAAGAACAAAAAAGAAAGAAAGTTGGAACAAGC
CTTGATTTAGTTTAGAACATGTATCAGATTCAGACCATGGTATAGGGACATTACACGTAC
AAATTACAGATCGGGTGGTCTTGAGAGGGGACAACTGTATCTTATTTTAAAATTTTTGAA
TATAATATAGTAAAGTCAGATACAAAAACAATCGTTGTTATAAGATTTGCTCCCTTAAGA
TTCGAGCTTATAAAAATTATAAAACAAACTTAAAGAGATAAACTAAAGAATGTCAGTGGT
CTTAAAAAGAATTTGTTAAAAAACCATTAATCTTTAGCTGTTCCAAGCGTGTGTCTGTGT
ATGAGCTATAATGCTATGTTAAATATCAAATATTTATTTTGATAGGGTCAGATCAACAAG
GAACATCAGTAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H981TF U 1
AF RR2H981JQ C 357
BS 1 639 RR2H981TF
BS 640 640 RR2H981JQ
BS 641 701 RR2H981TF
BS 702 1034 RR2H981JQ

RD RR2H981TF 701 0 0
TTTTTTTTACATGTAAAGATAGTAATGGAACCGAGCATTTTTCAAAATATAATCGTTCTA
ATAGATACCACTTCTTATGTACATACATATATATGTTAAAGAAATGATTATTGGTATTTT
ACATAAAATGATTATTGATAAAATATATTTATCATGATGTTGAAGATAAGTGGGTGTAGG
AAATGACATATACTCTTTGGAGGGGACAATGCATGCTATAATTTGATGTCAATTAACTTT
CTTCCCTACCAAAAAGTCATGCCCTTCTTTTCTTTACAACACATGCTTGTCATTATTAAC
AATTAATTATAAAGAAACCATTGTTAATATCTTTTCATTTATACGATCTCTTCGAATGAC
AGATCATTAAATTATCGGTTTAGAGTAGTGGTGCCCAGTTTTATTTAATTGGTGAACAAT
TGTTTTCGCATCTGGGGCGTATGACTAGGCTATTCCATGAAATTTACAATCATCGCCTAA
GATAATTTACTAAGCATAGGTTAAGCTCAGTCTACAGGCTTCAGTAGTGACACTAATTGT
TAGGTTAAGCTCAGTCTATCCAGACTTCAGTAGATAGCTTATAATTATTTGGTGAGTTTA
TTTGTTTTCAGAAAATAATAAGTAGGTAAAGAACAAAAA*GAAAGAAAGTTGGAACAAGC
CTTGATTTAGTTTAGAACATGTATCAGATTCAGACCATGGT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2H981JQ 678 0 0
TGACAGATCATTAAATTATCGGTTTAGAGTAGTGGTGCCCAGTTTTATTTAATTGGTGAA
CAATTGTTTTCGCATCTGGGGCGTATGACTAGGCTATTCCATGAAATTTACAATCATCGC
CTAAGATAATTTACTAAGCATAGGTTAAGCTCAGTCTACAGGCTTCAGTAGTGACACTAA
TTGTTAGGTTAAGCTCAGTCTATCCAGACTTCAGTAGATAGCTTATAATTATTTGGTGAG
TTTATTTGTTTTCAGAAAATAATAAGTAGGTAAAGAACAAAAAAGAAAGAAAGTTGGAAC
AAGCCTTGATTTAGTTTAGAACATGTATCAGATTCAGACCATGGTATAGGGACATTACAC
GTACAAATTACAGATCGGGTGGTCTTGAGAGGGGACAACTGTATCTTATTTTAAAATTTT
TGAATATAATATAGTAAAGTCAGATACAAAAACAATCGTTGTTATAAGATTTGCTCCCTT
AAGATTCGAGCTTATAAAAATTATAAAACAAACTTAAAGAGATAAACTAAAGAATGTCAG
TGGTCTTAAAAAGAATTTGTTAAAAAACCATTAATCTTTAGCTGTTCCAAGCGTGTGTCT
GTGTATGAGCTATAATGCTATGTTAAATATCAAATATTTATTTTGATAGGGTCAGATCAA
CAAGGAACATCAGTAGAG

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL5352Contig1 642 2 2 U
GGATACTCAAACTCTCCACTACTGCTCACTCTTTTCCTCTCTCTCTAGATCTGTAGATTA
CATATACATTTATATACATTAAGAGGGAGTGTGATGAAGATAAGGTATTGGCGGAGGTCA
AGAGGATACGAAAGGCTAGATGTCTCGGCAAAGAAGTCGAACTCGGATCCGACCCGGAAG
ATACGGTTTTGGAGGAGGATCAAGATAGTGCCGAAGCTGAGGGTCTTGAAAAAGACTACG
TCCCCTAAGAAGCTTTTAACGCGGCTTCGAGATTCTTACGTCAACATGATGCTGCGCCTC
GCCAGTTCTGGGGCCATAGGGTCGTCCTACGGGTACGGTGAATATGGGTACGGGTCGGGT
TTAGCATCGAGGGAGTATGATGAGAAGAAGCTGGTGGAGATTTACAAATCCATGTTAATG
GCGCAGGGGACTTTCGTTCACCGCAATGTACCTAAACCTTGCTCTGGTTTTATTGTACTC
TCACCGCTTAGTTAATTACATATGTGGATCGTTGGTGCTAAGCGTTGTGATTGTAATCTG
TGTTAAAGTTACATTTCAGAAACTATAAAAACAATAAATTAATCAATCAAATATATATAG
TGGATCCAAACTTTTTTTTTAATAGAAAATATGGTTTGCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR26TF U 1
AF RR2BR26JQ C 241
BS 1 386 RR2BR26TF
BS 387 642 RR2BR26JQ

RD RR2BR26TF 386 0 0
GGATACTCAAACTCTCCACTACTGCTCACTCTTTTCCTCTCTCTCTAGATCTGTAGATTA
CATATACATTTATATACATTAAGAGGGAGTGTGATGAAGATAAGGTATTGGCGGAGGTCA
AGAGGATACGAAAGGCTAGATGTCTCGGCAAAGAAGTCGAACTCGGATCCGACCCGGAAG
ATACGGTTTTGGAGGAGGATCAAGATAGTGCCGAAGCTGAGGGTCTTGAAAAAGACTACG
TCCCCTAAGAAGCTTTTAACGCGGCTTCGAGATTCTTACGTCAACATGATGCTGCGCCTC
GCCAGTTCTGGGGCCATAGGGTCGTCCTACGGGTACGGTGAATATGGGTACGGGTCGGGT
TTAGCATCGAGGGAGTATGATGAGAA

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR2BR26JQ 402 0 0
TCCCCTAAGAAGCTTTTAACGCGGCTTCGAGATTTTTACGTCAACATGATGCTGCGCCTC
GCCAGTTTTGGGGCCATAGGGTCGTCCTACGGGTACGGTGAATATGGGTACGGGTCGGGT
TTAGCATCGAGGGAGTATGATGAGAAGAAGCTGGTGGAGATTTACAAATCCATGTTAATG
GCGCAGGGGACTTTCGTTCACCGCAATGTACCTAAACCTTGCTCTGGTTTTATTGTACTC
TCACCGCTTAGTTAATTACATATGTGGATCGTTGGTGCTAAGCGTTGTGATTGTAATCTG
TGTTAAAGTTACATTTCAGAAACTATAAAAACAATAAATTAATCAATCAAATATATATAG
TGGATCCAAACTTTTTTTTTAATAGAAAATATGGTTTGCATT

QA 1 402 1 402
DS 



AS 1 2

CO CL5353Contig1 804 2 4 U
GGGCGGACAGTGCCAATGGGCCAACGAGCTGCAACTCGGATAGTCATTTAGGAAGCTGAG
GGGGGGGACGGTTTACCCGAGAGAAGGGCGCCCCTTTCAGGATGGGCTGGACGGGTAAGG
AGACCCGTGAGCGGCTATAGGTCCATACGTCTAGGTTGATTGGTGTCGAGTCAGCCTACT
TGTTGAAGTCTAGTGAAGTGTAGTTGAGTATGTGTTCCTTGAGTTGATCATGTATTAGGT
TGTTAGAAATGGTGTTGTTATGAATTATCTTTTGTTGCATTGTTTGATTGTAGTGATTGG
TCAGTCATAGCTCCCGCATAGAGTAATGTTGAGTGTCTTGCGGGCATGCTGGACTAGAGC
CACTTCACTGAGTAATTCAATTGCTCACCCCTCCCATTTCCATCTCCCTGTGCAGGACTG
TAAGTAGAAGTAAATGGATACGGGTGGATTGGAATTTAAAAGAAAGCAATGCGTCCGTCA
ACTGTTGGGACCAGTAACGGACACGGCGGGTTGCCTTAAAGGGTATACGCGTGTCCATAA
CTCCCTTTCGTTAACTCCGGTCGGGCGCCAGGGGACAGGGATGTTACACTGAGCCTCCTT
CATCTTCTCTTTCACAAACTTGATCTTCTTTGTGGTCTCCTCCACAATCTCAGGACCAAT
CATGCTACGCTCCCCCACTTGGGTCCAGCATAATGGTGTCCTGCATGGCCGCCCATACAA
AGCCTCATATGGTGACATACCAATGCTTGTATGGAAGCTATTGTTGTAAGCAAACTCTAC
CAAAGGCAAGTGCTTCTCCCAGGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW41TFB U 1
AF RR2AW41JQ C 1
BS 1 66 RR2AW41TFB
BS 67 67 RR2AW41JQ
BS 68 671 RR2AW41TFB
BS 672 804 RR2AW41JQ

RD RR2AW41TFB 671 0 0
GGGCGGACAGTGCCAATGGGCCAACGAGCTGCAACTCGGATAGTCATTTAGGAAGCTGAG
GGGGGG*ACGGTTTACCCGAGAGAAGGGCGCCCCTTTCAGGATGGGCTGGACGGGTAAGG
AGACCCGTGAGCGGCTATAGGTCCATACGTCTAGGTTGATTGGTGTCGAGTCAGCCTACT
TGTTGAAGTCTAGTGAAGTGTAGTTGAGTATGTGTTCCTTGAGTTGATCATGTATTAGGT
TGTTAGAAATGGTGTTGTTATGAATTATCTTTTGTTGCATTGTTTGATTGTAGTGATTGG
TCAGTCATAGCTCCCGCATAGAGTAATGTTGAGTGTCTTGCGGGCATGCTGGACTAGAGC
CACTTCACTGAGTAATTCAATTGCTCACCCCTCCCATTTCCATCTCCCTGTGCAGGACTG
TAAGTAGAAGTAAATGGATACGGGTGGATTGGAATTTAAAAGAAAGCAATGCGTCCGTCA
ACTGTTGGGACCAGTAACGGACACGGCGGGTTGCCTTAAAGGGTATACGCGTGTCCATAA
CTCCCTTTCGTTAACTCCGGTCGGGCGCCAGGGGACAGGGATGTTACACTGAGCCTCCTT
CATCTTCTCTTTCACAAACTTGATCTTCTTTGTGGTCTCCTCCACAATCTCAGGACCAAT
CATGCTACGCT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2AW41JQ 804 0 0
GGGCGGACAGTGCCAATGGGCCAACGAGCTGCAACTCGGATAGTCATTTAGGAAGCTGAG
GGGGGGGACGGTTTACCCGAGAGAAGGGCGCCCCTTTCAGGATGGGCTGGACGGGTAAGG
AGACCCGTGAGCGGCTATAGGTCCATACGTCTAGGTTGATTGGTGTCGAGTCAGCCTACT
TGTTGAAGTCTAGTGAAGTGTAGTTGAGTATGTGTTCCTTGAGTTGATCATGTATTAGGT
TGTTAGAAATGGTGTTGTTATGAATTATCTTTTGTTGCATTGTTTGATTGTAGTGATTGG
TCAGTCATAGCTCCCGCATAGAGTAATGTTGAGTGTCTTGCGGGCATGCTGGACTAGAGC
CACTTCACTGAGTAATTCAATTGCTCACCCCTCCCATTTCCATCTCCCTGTGCAGGACTG
TAAGTAGAAGTAAATGGATACGGGTGGATTGGAATTTAAAAGAAAGCAATGCGTCCGTCA
ACTGTTGGGACCAGTAACGGACACGGCGGGTTGCCTTAAAGGGTATACGCGTGTCCATAA
CTCCCTTTCGTTAACTCCGGTCGGGCGCCAGGGGACAGGGATGTTACACTGAGCCTCCTT
CATCTTCTCTTTCACAAACTTGATCTTCTTTGTGGTCTCCTCCACAATCTCAGGACCAAT
CATGCTACGCTCCCCCACTTGGGTCCAGCATAATGGTGTCCTGCATGGCCGCCCATACAA
AGCCTCATATGGTGACATACCAATGCTTGTATGGAAGCTATTGTTGTAAGCAAACTCTAC
CAAAGGCAAGTGCTTCTCCCAGGG

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL5354Contig1 860 2 6 U
GGGACCCCCGGTCAGGCTGGAGATGGAGTTCAGACTCAAACGACACGAAGCAAGGCTCAT
CAAATCATAACGTTACGAACCCAGGCACATCAAATCATAACGTTACAAAGCCAGGCTCAT
CGAACCATAACCATACTACTAGCCCAGGCTCATCGAACCATAACCACCACCATAACGTTA
CAAAGCCAGGCTCATCGAACCATAACCACCACAACGTTACGAAGCCAGGCTCGTCGAACC
ACAACCATAACGTTACAAAGCCAGGCTCACCGAACCACAACCATAACGTTACAAGGCCAG
ACTCACCAAAACGTAATGATTCGAGGTCAGGCTCAAACGGTAATTCGGTATTTGCAGCAC
CAAGAGAGGTCGTAGTGGGAGGGTCACGTGGATGGAACTACGGGGTGGATCTTGAAGAAT
GGGCTTCCAAGATTACTTTCCATGTCGGCGATGTTCTTGTTTTCGAGTACAGCAATGTGA
CAAACCGAAGACATGACGTGTACTTGCAAACAAATCTATGGAGTTACAGGACCTGCAACA
TCGAAAGTAGAAATAAGATTGCTTCATCGGAGGATGAGAATGGATCTAAAGAGAACTTCA
AATCTACTCTTGCAATGTCACAGCCTTACTCTTTTGCATGCGGAGAGGATAACGGCTTTT
ATTGCCGTACCTATAACATGAAGTTCAGCGTTCTCCCTGACGCCTGATGAGTCCTCTCGT
CACTCAACCCTTTTGCCTCTTTTGTTTTTTTTTTTTCTTTCTATTTTCTTACTGCAATAT
TATTAGAGTAGTTGCTATGTTTTATTAGTTAAGGTTTTCTTATTACATAATGATTTGAGG
AATAAAACAGAGATGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ85TF U 1
AF RR2BZ85JQ C 81
BS 1 404 RR2BZ85TF
BS 405 405 RR2BZ85JQ
BS 406 418 RR2BZ85TF
BS 419 419 RR2BZ85JQ
BS 420 429 RR2BZ85TF
BS 430 860 RR2BZ85JQ

RD RR2BZ85TF 440 0 0
GGGACCCCCGGTCAGGCTGGAGATGGAGTTCAGACTCAAACGACACGAAGCAAGGCTCAT
CAAATCATAACGTTACGAACCCAGGCACATCAAATCATAACGTTACAAAGCCAGGCTCAT
CGAACCATAACCATACTACTAGCCCAGGCTCATCGAACCATAACCACCACCATAACGTTA
CAAAGCCAGGCTCATCGAACCATAACCACCACAACGTTACGAAGCCAGGCTCGTCGAACC
ACAACCATAACGTTACAAAGCCAGGCTCACCGAACCACAACCATAACGTTACAAGGCCAG
ACTCACCAAAACGTAATGATTCGAGGTCAGGCTCAAACGGTAATTCGGTATTTGCAGCAC
CAAGAGAGGTCGTAGTGGGAGGGTCACGTGGATGGAACTACGGG*TGGATCTTGAAGA*T
GGGCTTCCA
GATACTTCCAT

QA 1 429 1 429
DS 

RD RR2BZ85JQ 780 0 0
CCAGGCACATCAAATCATAACGTTACAAAGCCAGGCTCATCGAACCATAACCATACTACT
AGCCCAGGCTCATCGAACCATAACCACCACCATAACGTTACAAAGCCAGGCTCATCGAAC
CATAACCACCACAACGTTACGAAGCCAGGCTCGTCGAACCACAACCATAACGTTACAAAG
CCAGGCTCACCGAACCACAACCATAACGTTACAAGGCCAGACTCACCAAAACGTAATGAT
TCGAGGTCAGGCTCAAACGGTAATTCGGTATTTGCAGCACCAAGAGAGGTCGTAGTGGGA
GGGTCACGTGGATGGAACTACGGGGTGGATCTTGAAGAATGGGCTTCCAAGATTACTTTC
CATGTCGGCGATGTTCTTGTTTTCGAGTACAGCAATGTGACAAACCGAAGACATGACGTG
TACTTGCAAACAAATCTATGGAGTTACAGGACCTGCAACATCGAAAGTAGAAATAAGATT
GCTTCATCGGAGGATGAGAATGGATCTAAAGAGAACTTCAAATCTACTCTTGCAATGTCA
CAGCCTTACTCTTTTGCATGCGGAGAGGATAACGGCTTTTATTGCCGTACCTATAACATG
AAGTTCAGCGTTCTCCCTGACGCCTGATGAGTCCTCTCGTCACTCAACCCTTTTGCCTCT
TTTGTTTTTTTTTTTTCTTTCTATTTTCTTACTGCAATATTATTAGAGTAGTTGCTATGT
TTTATTAGTTAAGGTTTTCTTATTACATAATGATTTGAGGAATAAAACAGAGATGAATCC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL5355Contig1 699 2 1 U
TTTACTACAGATTCTCTTGGCAAATGGAGGGAGGTGTGATCCCAATGTCAGAGATGTTTG
GTACATTTGCTCTCTCTGTTGGTGCTGCTGTGGGGATGGAGTTTTGGGCAAGATGGGCTC
ATAGAGCTCTCTGGCACGCTTCTCTTTGGAACATGCATGAGTCACATCACAAACCAAGAG
AAGGGCCGTTTGAGCTGAACGATGTATTTGCAATTATAAACGCTGTTCCTGCGATCGGTC
TGCTCTCTTATGGTTTCTTCAATAAAGGACTCGTCCCTGGTCTCTGCTTTGGCGCCGGAC
TAGGAATAACGGTGTTTGGGATCGCCTACATGTTTGTCCACGATGGTTTGGTGCACAAGC
GTTTCCCTGTCGGTCCTATCGCTGACGTCCCTTATCTCCGGAAAGTCGCCGCCGCTCACC
AGCTACATCACACTGACAAGTTCGATGGTGTGCCATACGGGTTGTTTCTTGGACCGAAGG
AATTGGAAGAAGTTGGAGGAGATGAGGAGTTAGAGAAGGAGATTGGTCGGAGAATCAAAT
TATACAAAAAAGGTTCTGGTTCCGAGTCGAGCTCTTGACTAAACTAAAAACAAATTATTA
ATCTCTTCTTTTAGTTTTTGGTCTTTTGTCATGATCTGAAATACGGTCTTTGTTGATAAA
TCATATATGCCGATTTTGATTTTTAATTATTAAAAGTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DI23JQ C 1
AF RR2DI23TF U 1
BS 1 699 RR2DI23TF

RD RR2DI23JQ 699 0 0
TTTACTACAGATTCTCTTGGCAAATGGAGGGAGGTGTGATCCCAATGTCAGAGATGTTTG
GTACATTTGCTCTCTCTGTTGGTGCTGCTGTGGGGATGGAGTTTTGGGCAAGATGGGCTC
ATAGAGCTCTCTGGCACGCTTCTCTTTGGAACATGCATGAGTCACATCACAAACCAAGAG
AAGGGCCGTTTGAGCTGAACGATGTATTTGCAATTATAAACGCTGTTCCTGCGATCGGTC
TGCTCTCTTATGGTTTCTTCAATAAAGGACTCGTCCCTGGTCTCTGCTTTGGCGCCGGAC
TAGGAATAACGGTGTTTGGGATCGCCTACATGTTTGTCCACGATGGTTTGGTGCACAAGC
GTTTCCCTGTCGGTCCTATCGCTGACGTCCCTTATCTCCGGAAAGTCGCCGCCGCTCACC
AGCTACATCACACTGACAAGTTCGATGGTGTGCCATACGGGTTGTTTCTTGGACCGAAGG
AATTGGAAGAAGTTGGAGGAGATGAGGAGTTAGAGAAGGAGATTGGTCGGAGAATCAAAT
TATACAAAAAAGGTTCTGGTTCCGAGTCGAGCTCTTGACTAAACTAAAAACAAATTATTA
ATCTCTTCTTTTAGTTTTTGGTCTTTTGTCATGATCTGAAATACGGTCTTTGTTGATAAA
TCATATATGCCGATTTTGATTTTTAATTATTAAAAGTAG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2DI23TF 699 0 0
TTTACTACAGATTCTCTTGGCAAATGGAGGGAGGTGTGATCCCAATGTCAGAGATGTTTG
GTACATTTGCTCTCTCTGTTGGTGCTGCTGTGGGGATGGAGTTTTGGGCAAGATGGGCTC
ATAGAGCTCTCTGGCACGCTTCTCTTTGGAACATGCATGAGTCACATCACAAACCAAGAG
AAGGGCCGTTTGAGCTGAACGATGTATTTGCAATTATAAACGCTGTTCCTGCGATCGGTC
TGCTCTCTTATGGTTTCTTCAATAAAGGACTCGTCCCTGGTCTCTGCTTTGGCGCCGGAC
TAGGAATAACGGTGTTTGGGATCGCCTACATGTTTGTCCACGATGGTTTGGTGCACAAGC
GTTTCCCTGTCGGTCCTATCGCTGACGTCCCTTATCTCCGGAAAGTCGCCGCCGCTCACC
AGCTACATCACACTGACAAGTTCGATGGTGTGCCATACGGGTTGTTTCTTGGACCGAAGG
AATTGGAAGAAGTTGGAGGAGATGAGGAGTTAGAGAAGGAGATTGGTCGGAGAATCAAAT
TATACAAAAAAGGTTCTGGTTCCGAGTCGAGCTCTTGACTAAACTAAAAACAAATTATTA
ATCTCTTCTTTTAGTTTTTGGTCTTTTGTCATGATCTGAAATACGGTCTTTGTTGATAAA
TCATATATGCCGATTTTGATTTTTAATTATTAAAAGTAG

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL5356Contig1 1012 2 2 U
GGGATTAACGACAGTCGCCGAGTGAGAGAAGAGGGAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGATGACGCTGAACGATGAGCAAGAGCACGAGGTGTACGGGGGAGAGATCCCAGAGGAG
GAAGGAGAGATGGAGACGGACGAGTACGAGGAACACGTCGGTGAAGAAGAAGGCGCCGCA
GCCGGAGGAGACGAGGAGCTTGAGCCAGGCTCTAGCTCTAAGGATCTGGAGGATATGAAG
AAGCGAATCAATGAGATCGAGGAAGAAGCTGGAGCTTTGCGTGAAATGCAAGCCAAAGCT
GAGAAAGAAATGGGCGCTGATCAAGATCCGTCAGGTGCTATTAGTTCGGCTGAGAAGGAG
GAAGTTGATTCCCGTTCAATCTATGTTGGCAATGTGGACTATGCATGTACCCCAGAGGAA
GTCCAGCAACATTTCCAGTCCTGTGGGACTGTCAACAGGGTTACGATTCTGACAGATAAG
TTTGGACAACCCAAAGGTTTTGCCTACGTCGAATTTGTGGAAGAAGATGCTGTTCAGAAT
TCTCTTATCTTGAATGAGTCAGAGCTGCATGGTCGTCAGATAAAGGTATCAGCAAAGAGA
ACTAACGTCCCTGGAATGAGACAATTCCGAGGAAGACGTCCCTTTCGACCCATGAGAGGA
TTCATGCCTGGAATTCCATTTTATGCTCCATATGGTTATGGGAGAGTTCCCAGGTTCAGA
CGGCCAATGCGCTACAGACCATACTGATTAAAAAGCAAAATTGGGTGGTAAAAGTAGCAG
CTGCCTTTTGCTTTCAGTAAGGCTATTATCATCAATCCGTGTTTCATTAGGCCGCACACG
TTGCTTCGATTAAAGAGAGGTGGGCTGAAGAATCTTATGGCAGAAGAGAGAAAGAGGCAA
AGAATGAAAAAATATGTTTTAGATTTTATGTACAATGTTTGATATGAGAGAAGAGCAACA
ATTTGAATTCGTTTCTGTTTTATCTTTTGCAAAACTCATAAAGCTTTATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW23TF U 1
AF RR2GW23JQ C 246
BS 1 588 RR2GW23TF
BS 589 1012 RR2GW23JQ

RD RR2GW23TF 588 0 0
GGGATTAACGACAGTCGCCGAGTGAGAGAAGAGGGAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGATGACGCTGAACGATGAGCAAGAGCACGAGGTGTACGGGGGAGAGATCCCAGAGGAG
GAAGGAGAGATGGAGACGGACGAGTACGAGGAACACGTCGGTGAAGAAGAAGGCGCCGCA
GCCGGAGGAGACGAGGAGCTTGAGCCAGGCTCTAGCTCTAAGGATCTGGAGGATATGAAG
AAGCGAATCAATGAGATCGAGGAAGAAGCTGGAGCTTTGCGTGAAATGCAAGCCAAAGCT
GAGAAAGAAATGGGCGCTGATCAAGATCCGTCAGGTGCTATTAGTTCGGCTGAGAAGGAG
GAAGTTGATTCCCGTTCAATCTATGTTGGCAATGTGGACTATGCATGTACCCCAGAGGAA
GTCCAGCAACATTTCCAGTCCTGTGGGACTGTCAACAGGGTTACGATTCTGACAGATAAG
TTTGGACAACCCAAAGGTTTTGCCTACGTCGAATTTGTGGAAGAAGATGCTGTTCAGAAT
TCTCTTATCTTGAATGAGTCAGAGCTGCATGGTCGTCAGATAAAGGTA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2GW23JQ 767 0 0
AATCAATGAGATCGAGGAAGAAGCTGGAGCTTTGCGTGAAATGCAAGCCAAAGCTGAGAA
AGAAATGGGCGCTGATCAAGATCCGTCAGGTGCTATTAGTTCGGCTGAGAAGGAGGAAGT
TGATTCCCGTTCAATCTATGTTGGCAATGTGGACTATGCATGTACCCCAGAGGAAGTCCA
GCAACATTTCCAGTCCTGTGGGACTGTCAACAGGGTTACGATTCTGACAGATAAGTTTGG
ACAACCCAAAGGTTTTGCCTACGTCGAATTTGTGGAAGAAGATGCTGTTCAGAATTCTCT
TATCTTGAATGAGTCAGAGCTGCATGGTCGTCAGATAAAGGTATCAGCAAAGAGAACTAA
CGTCCCTGGAATGAGACAATTCCGAGGAAGACGTCCCTTTCGACCCATGAGAGGATTCAT
GCCTGGAATTCCATTTTATGCTCCATATGGTTATGGGAGAGTTCCCAGGTTCAGACGGCC
AATGCGCTACAGACCATACTGATTAAAAAGCAAAATTGGGTGGTAAAAGTAGCAGCTGCC
TTTTGCTTTCAGTAAGGCTATTATCATCAATCCGTGTTTCATTAGGCCGCACACGTTGCT
TCGATTAAAGAGAGGTGGGCTGAAGAATCTTATGGCAGAAGAGAGAAAGAGGCAAAGAAT
GAAAAAATATGTTTTAGATTTTATGTACAATGTTTGATATGAGAGAAGAGCAACAATTTG
AATTCGTTTCTGTTTTATCTTTTGCAAAACTCATAAAGCTTTATATT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL5357Contig1 1184 2 2 U
GGAATACTCTCTCGCTTGCCATTGAAGAAACCCATCTCTCTGTCGAGGATCATGGCGAAT
GGTAAAGGGCCAGCCAAAAAATCGAACCTTGATCGATTTCTTCATTGCACGACACCATTA
GTGCCACCCCAATCTCTCCCCAAGGGGGAGATTAGTAGAAGCCTGAATGGATTGTGGCAT
TCACCGCGGGAGAGAGAAAAAGTTGAGTTTTTCAGGTTGAGTGATCTTTGGGATTGCTAC
CATGAATGGAGCGCTTATGGTGCTACTGTTCCTATTCATTTAACCAATGGAGAATCTCTT
GTGCAATACTATGTTCCTTATCTCTCTGCCATCCAGATTTTCACCTCTCATTCCTCTTTG
ATCCGCCTAAGGGAAGAGTCTGAAGATGGGGAATCCGATGGTAGGTATCCCTTTAGCGAG
TCAAGTAGCGATGAGAGTGTCTCTGAGGAAGGACTTGAGAACAACAACCTCCTCAATGAT
CGTTTGGGTTACCTTTATCTCCAATTCTTTGAGATAACGTCTCCTTATACCAGAGTTCCT
CTCATGGACAAGATCAATGAGTTATCGCGGAGATGTCCTGGTTTGATGTCGTTGAGAAGC
GTGGATCTTTCACCAGCGAGCTGGATGTCTGTTGCTTGGTACCCTATTTATCATATACCG
ATGGGAAGAACCATTAAAGACTTGTCCACTTGTTTCCTCACTTACCACACCCTTTCTTCT
TCTTTCCAAGATATGGAACTGGAAGAGAACGGTGGTGATAGAGAGAGGATGCGAAAGGAA
GGAGAAGACATAACATTGCCCCCATTTGGGGTGGCTACTTACAAGATGCAGGGCAATGTT
TGGCTCTCGCATGACCACCAGGATGACCAAGAGAGATTGGTTTCGCTCTATAGCATTGCG
GATTCGTGGCTAAAACAGCTTAGGGTTCAACATCATGACTTCAACTACTTCTGCAGTATG
TCTTCTATGACTTATCGTGGCTAACTATGTTCGTTTCTTTCCTCATTATAAAGTCTAAAT
CCTTGCTTTGGTTTAGAATAGCGTTCTGACAAGTATATGTCCGTATATAGAGTTTGTTGC
CTTGTTCAAACAGAGTATGTCGTTTCTTGTAAGTTTTTATAACACTCTCTCTCTCGACAC
AGCGAGAAACATAACGTATTTACTTTAAGTTTTTATGACGTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA72TF U 1
AF RR2BA72JQ C 432
BS 1 774 RR2BA72TF
BS 775 1184 RR2BA72JQ

RD RR2BA72TF 774 0 0
GGAATACTCTCTCGCTTGCCATTGAAGAAACCCATCTCTCTGTCGAGGATCATGGCGAAT
GGTAAAGGGCCAGCCAAAAAATCGAACCTTGATCGATTTCTTCATTGCACGACACCATTA
GTGCCACCCCAATCTCTCCCCAAGGGGGAGATTAGTAGAAGCCTGAATGGATTGTGGCAT
TCACCGCGGGAGAGAGAAAAAGTTGAGTTTTTCAGGTTGAGTGATCTTTGGGATTGCTAC
CATGAATGGAGCGCTTATGGTGCTACTGTTCCTATTCATTTAACCAATGGAGAATCTCTT
GTGCAATACTATGTTCCTTATCTCTCTGCCATCCAGATTTTCACCTCTCATTCCTCTTTG
ATCCGCCTAAGGGAAGAGTCTGAAGATGGGGAATCCGATGGTAGGTATCCCTTTAGCGAG
TCAAGTAGCGATGAGAGTGTCTCTGAGGAAGGACTTGAGAACAACAACCTCCTCAATGAT
CGTTTGGGTTACCTTTATCTCCAATTCTTTGAGATAACGTCTCCTTATACCAGAGTTCCT
CTCATGGACAAGATCAATGAGTTATCGCGGAGATGTCCTGGTTTGATGTCGTTGAGAAGC
GTGGATCTTTCACCAGCGAGCTGGATGTCTGTTGCTTGGTACCCTATTTATCATATACCG
ATGGGAAGAACCATTAAAGACTTGTCCACTTGTTTCCTCACTTACCACACCCTTTCTTCT
TCTTTCCAAGATATGGAACTGGAAGAGAACGGTGGTGATAGAGAGAGGATGCGA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2BA72JQ 753 0 0
TGAGAGTGTCTCTGAGGAAGGACTTGAGAACAACAACCTCCTCAATGATCGTTTGGGTTA
CCTTTATCTCCAATTCTTTGAGATAACGTCTCCTTATACCAGAGTTCCTCTCATGGACAA
GATCAATGAGTTATCGCGGAGATGTCCTGGTTTGATGTCGTTGAGAAGCGTGGATCTTTC
ACCAGCGAGCTGGATGTCTGTTGCTTGGTACCCTATTTATCATATACCGATGGGAAGAAC
CATTAAAGACTTGTCCACTTGTTTCCTCACTTACCACACCCTTTCTTCTTCTTTCCAAGA
TATGGAACTGGAAGAGAACGGTGGTGATAGAGAGAGGATGCGAAAGGAAGGAGAAGACAT
AACATTGCCCCCATTTGGGGTGGCTACTTACAAGATGCAGGGCAATGTTTGGCTCTCGCA
TGACCACCAGGATGACCAAGAGAGATTGGTTTCGCTCTATAGCATTGCGGATTCGTGGCT
AAAACAGCTTAGGGTTCAACATCATGACTTCAACTACTTCTGCAGTATGTCTTCTATGAC
TTATCGTGGCTAACTATGTTCGTTTCTTTCCTCATTATAAAGTCTAAATCCTTGCTTTGG
TTTAGAATAGCGTTCTGACAAGTATATGTCCGTATATAGAGTTTGTTGCCTTGTTCAAAC
AGAGTATGTCGTTTCTTGTAAGTTTTTATAACACTCTCTCTCTCGACACAGCGAGAAACA
TAACGTATTTACTTTAAGTTTTTATGACGTCCT

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL5358Contig1 788 2 5 U
AGGAATACAAAACTATCAAACATAAGAAAACCATTGTCCATTGAGTTATATGCTCCGTTT
CCAAACTTCACCCCTATGTCACCAATTGTTATTCCTGGAAGAGGAGAATGATCATCCATA
TTGCGTAGTTGGACGATGAATCCATGGACACCGTGGTCTTTTCCATCGGTTATAAGACGA
GCATAAATCACAGCATGAGTAAAAACCTTTCCCAAACCACCAGGCCACCATTTGGATGAT
GTTTGAGATGGACTGTGAAGGATAAACTGGTCTGTCTGAGGATCAAAAGTAGCAGTTGTC
TCAAGGCCTTGAAAGTTAGAGCCATGACCAAGCTCAGTTTGAGCATAGCAACCGATTATC
TTCATCTTGTTGGCAAGAGGCAACCACTTTTGTTTCTGTTCCTCTGTCCCTTGTCCTTTG
ATTGCAGGCACAAACATTCTCCAATGAAGATCCAAGAAGCCAGGTTGATCCATGAAATGT
CTCAACATGAGTGACTCATCATCAGAGAGAGGAAGCTCGGTGATCAACTTCCAAGCATGA
ACGCTTTTCCTCAACGTGTTCTTGAACAACTCTTTCCTTGTCATTATAGCTCTGTTGCTT
TTCTCAAAGACCGGATCACTGGCGACAAGGCGGGACATCCGGTTTGAGACCTCGAAAGCG
TGGCGTGAACCGGCCCACACGATCTTCATGTCGTCGACGTTGAACTCTGCTTTGTTTCTT
TCATGGGCAAGGTGATCGCCTCCCTCCATAGGTTTCGCCGTTGTTAGATTCAGACTGTGG
AGAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE23JQ U 107
AF RR2CE23TF C 1
BS 1 106 RR2CE23TF
BS 107 117 RR2CE23JQ
BS 118 118 RR2CE23TF
BS 119 457 RR2CE23JQ
BS 458 788 RR2CE23TF

RD RR2CE23JQ 351 0 0
AATGATCATCCCTATTGCGTAGTTGGACGATGAATCCATGGACACCGTGGTCTTTTCCAT
CGGTTATAAGACGAGCATAAATCACAGCATGAGTAAAAACCTTTCCCAAACCACCAGGCC
ACCATTTGGATGATGTTTGAGATGGACTGTGAAGGATAAACTGGTCTGTCTGAGGATCAA
AAGTAGCAGTTGTCTCAAGGCCTTGAAAGTTAGAGCCATGACCAAGCTCAGTTTGAGCAT
AGCAACCGATTATCTTCATCTTGTTGGCAAGAGGCAACCACTTTTGTTTCTGTTCCTCTG
TCCCTTGTCCTTTGATTGCAGGCACAAACATTCTCCAATGAAGATCCAAGA

QA 1 351 1 351
DS 

RD RR2CE23TF 788 0 0
AGGAATACAAAACTATCAAACATAAGAAAACCATTGTCCATTGAGTTATATGCTCCGTTT
CCAAACTTCACCCCTATGTCACCAATTGTTATTCCTGGAAGAGGAGAATGATCATCCATA
TTGCGTAGTTGGACGATGAATCCATGGACACCGTGGTCTTTTCCATCGGTTATAAGACGA
GCATAAATCACAGCATGAGTAGAAACCTTTCCCAAACCACCAGGCCACCATTTGGATGAT
GTTTGAGATGGACTGTGAAGGATAAACTGGTCTGTCTGAGGATCAAAAGTAGCAGTTGTC
TCAAGGCCTTGAAAGTTAGAGCCATGACCAAGCTCAGTTTGAGCATAGCAACCGATTATC
TTCATCTTGTTGGCAAGAGGCAACCACTTTTGTTTCTGTTCCTCTGTCCCTTGTCCTTTG
ATTGCAGGCACAAACATTCTCCAATGAAGATCCAAGAAGCCAGGTTGATCCATGAAATGT
CTCAACATGAGTGACTCATCATCAGAGAGAGGAAGCTCGGTGATCAACTTCCAAGCATGA
ACGCTTTTCCTCAACGTGTTCTTGAACAACTCTTTCCTTGTCATTATAGCTCTGTTGCTT
TTCTCAAAGACCGGATCACTGGCGACAAGGCGGGACATCCGGTTTGAGACCTCGAAAGCG
TGGCGTGAACCGGCCCACACGATCTTCATGTCGTCGACGTTGAACTCTGCTTTGTTTCTT
TCATGGGCAAGGTGATCGCCTCCCTCCATAGGTTTCGCCGTTGTTAGATTCAGACTGTGG
AGAAATCC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL5359Contig1 1197 2 6 U
TTTTTCTTTTGGGGGGGTTATTAAGAGAGAAAAAAAAAGGGCAGAAGAGAAATCGGGAGA
GAACGGATAAGGAAGGAAGGCGATGGCGGCGGAAGAAGAAAACGAGTTCTACCTGAGGTA
CTATGTGGGACACAAGGGGAAATTCGGACACGAGTTCCTGGAGTTCGAGTTTAGACCGGA
CGGTAAACTCCGTTACGCAAATAACTCGAACTACAAGAACGATACGATGATCCGGAAGGA
GGTGTTTCTCACCCCCGCCGTTCTCAACGAATGCAAGCGTATCGTCTCCGAGAGCGAGGT
TCTTTCTTTCTTTCCTTTCTTAACTCCTCAGATTTGGTTCTAATTCCTCTCAGCTCGATT
AGGGTTTTGTTTTTGGAGTTCGATTTATCTATTACTATTAATGTAGATTTTTAGAACCGT
TTTGATTTCTCTCTTGGGCTTAGTTAGTGTTCTTAAGGTATGATGGAATCTATCATGCGC
GCTTTCGGTATTTTGTTGTACTTGACTCGTGCTGTTTTGTTTTGTTTGGTATAGATAATG
AAAGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCGTGTTGGAAGGCAAGAGCTTGAGATC
GTGATGGGAAATGAGCATATCTCCTTTGCTACATCTAAGATTGGTTCTCTCGTTGATGTC
CAGAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTTTTACTATCTTGTTCAGGTCACCTCT
CTCTCTCTCTCTTTTCCCTTGTTCAATTTTTATACCAACATAGCAAACTCATGCTTTAGG
ATATTCTTCTAAACTCTTTATAATCAATCTTGGGGGGATTCTTACCTGGGGTCGTATGTT
GGGGAGGCATATTCTGGTTTTGTTCTCTGTCAGCTGATTGACTATATGTTTCTCTCGTTA
TTCTTTTTGCATTAGCAAACATCTGTTATATATTCTTTGCTCTTGACATATTCCTTGTGG
TTGCAGGACTTGAAATGTCTTGTTTTTTCGCTCATCTCGCTGCACTTCAAGATCAAGCCT
ATTTAGGGAAGAAACCAGTTGAGCTACTGGGAGCATGGGCCTGAAGTTTGGTTGCTTTTA
TTTTTCTGGCTCATGCTTGTTTCTTGTGTTGTTAACTTGAAAACCCTGAGTGTTTCACTC
GTATGCTGTTTTTTTTTCTTGTTGTTGCAATGAATCTTAAATGAGCGTTGTTATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H918TF U 1
AF RR2H918JQ C 422
BS 1 711 RR2H918TF
BS 712 712 RR2H918JQ
BS 713 750 RR2H918TF
BS 751 751 RR2H918JQ
BS 752 773 RR2H918TF
BS 774 1197 RR2H918JQ

RD RR2H918TF 773 0 0
TTTTTCTTTTGGGGGGGTTATTAAGAGAGAAAAAAAAAGGGCAGAAGAGAAATCGGGAGA
GAACGGATAAGGAAGGAAGGCGATGGCGGCGGAAGAAGAAAACGAGTTCTACCTGAGGTA
CTATGTGGGACACAAGGGGAAATTCGGACACGAGTTCCTGGAGTTCGAGTTTAGACCGGA
CGGTAAACTCCGTTACGCAAATAACTCGAACTACAAGAACGATACGATGATCCGGAAGGA
GGTGTTTCTCACCCCCGCCGTTCTCAACGAATGCAAGCGTATCGTCTCCGAGAGCGAGGT
TCTTTCTTTCTTTCCTTTCTTAACTCCTCAGATTTGGTTCTAATTCCTCTCAGCTCGATT
AGGGTTTTGTTTTTGGAGTTCGATTTATCTATTACTATTAATGTAGATTTTTAGAACCGT
TTTGATTTCTCTCTTGGGCTTAGTTAGTGTTCTTAAGGTATGATGGAATCTATCATGCGC
GCTTTCGGTATTTTGTTGTACTTGACTCGTGCTGTTTTGTTTTGTTTGGTATAGATAATG
AAAGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCGTGTTGGAAGGCAAGAGCTTGAGATC
GTGATGGGAAATGAGCATATCTCCTTTGCTACATCTAAGATTGGTTCTCTCGTTGATGTC
CAGAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTTTTACTATCTTGTTCAG*TCACCTCT
CTCTCTCTCTCTTTTCCCTTGTTCAATTTT*ATACCAACATAGCAAACTCATG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2H918JQ 776 0 0
TTGATTTCTCTCTTGGGCTTAGTTAGTGTTCTTAAGGTATGATGGAATCTATCATGCGCG
CTTTCGGTATTTTGTTGTACTTGACTCGTGCTGTTTTGTTTTGTTTGGTATAGATAATGA
AAGAAGATGATTTTAAGTGGCCGGAACCTGACCGTGTTGGAAGGCAAGAGCTTGAGATCG
TGATGGGAAATGAGCATATCTCCTTTGCTACATCTAAGATTGGTTCTCTCGTTGATGTCC
AGAGCAGTGATGATCCTGAAGGTCTTCGCATCTTTTACTATCTTGTTCAGGTCACCTCTC
TCTCTCTCTCTTTTCCCTTGTTCAATTTTTATACCAACATAGCAAACTCATGCTTTAGGA
TATTCTTCTAAACTCTTTATAATCAATCTTGGGGGGATTCTTACCTGGGGTCGTATGTTG
GGGAGGCATATTCTGGTTTTGTTCTCTGTCAGCTGATTGACTATATGTTTCTCTCGTTAT
TCTTTTTGCATTAGCAAACATCTGTTATATATTCTTTGCTCTTGACATATTCCTTGTGGT
TGCAGGACTTGAAATGTCTTGTTTTTTCGCTCATCTCGCTGCACTTCAAGATCAAGCCTA
TTTAGGGAAGAAACCAGTTGAGCTACTGGGAGCATGGGCCTGAAGTTTGGTTGCTTTTAT
TTTTCTGGCTCATGCTTGTTTCTTGTGTTGTTAACTTGAAAACCCTGAGTGTTTCACTCG
TATGCTGTTTTTTTTTCTTGTTGTTGCAATGAATCTTAAATGAGCGTTGTTATTGG

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL5360Contig1 1028 2 2 U
GGAAGAGTTTTGGTCTTTAGGCATGCAGCAAGCAAACCAGGCTCTGCTTTCTGGATGCTC
AGCCGGAGGATTAGCTTCCATCTTGCACTGTGATCAGTTCAGAGAGCTCTTGCCTAGTTC
CACTAAAGTCAAGTGCTTAAGTGATGCTGGAATGTTTCTAGACGCAGTGGATGTCTCTGG
GGGCCACTCGCTCAGGAATATGTTCCAAGGTGTTGTTACTGTGCAGAACCTCCAGAAGGA
CTTGTCCAGCACTTGTACAAACCATTTGGATCCTACCTCGTGCTTCTTTCCTCAGAACTT
GGTTTCAGACATCAAAACCCCAATGTTTCTTCTCAACACAGCATATGACTCGCGGCAGAT
CCAAGAGAGCTTAACTCCTAAAACTGCTGACCCAGGCGGCATCTGGAAGGCATGCAAAGC
ATACCACTCGCAATGTAACTCATCACAGATCCAATTCTTCCAAGAATTCAGGAATCAAAT
GCTGTTCGCCGTAAATTCATTCTCCACATCAGACCAGAACGGTCTTTTCATAAACTCTTG
CTTCGCTCATTGTCAAACTGAAAGGCAAGACACTTGGTTTGCCCAAGATTCTCCCCAACT
CAACGGAAAGAGAGTCGCAGAGACTGTAGGTGACTGGTACTTCGACCGAGCCAAAAATAT
CAAAGCCATCGACTGTGCTTACCCATGTGACAAAACATGTCACAATCTGATTTTCGATGT
TCATCAAACAGGTGTAGATTGGGGTGTTGATCAAACAGCTCTAGAGATCTCAGCTTCTTC
TTCTTCTTCAAGATTTTGTTTTACTCTTTTTAGAGCCTCTTTGGTCTCTCTAGTGTTGAC
AACACTCATCCTCATATGCTTAGTTCAGTAGGTATAGGGAGACCTTATTCTTTCATACCT
CATAGTGTTTTTATAACCCTTTTGATTCAAATGTTGAATCTAAGTTAGTAATCAAATCTA
TGTATGCAGAAAAGAATATATCACAAAGAGAAAAAATAATAAGAAACAAAAACTCATGAT
TATACTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS61TF U 1
AF RR2FS61JQ C 387
BS 1 727 RR2FS61TF
BS 728 1028 RR2FS61JQ

RD RR2FS61TF 727 0 0
GGAAGAGTTTTGGTCTTTAGGCATGCAGCAAGCAAACCAGGCTCTGCTTTCTGGATGCTC
AGCCGGAGGATTAGCTTCCATCTTGCACTGTGATCAGTTCAGAGAGCTCTTGCCTAGTTC
CACTAAAGTCAAGTGCTTAAGTGATGCTGGAATGTTTCTAGACGCAGTGGATGTCTCTGG
GGGCCACTCGCTCAGGAATATGTTCCAAGGTGTTGTTACTGTGCAGAACCTCCAGAAGGA
CTTGTCCAGCACTTGTACAAACCATTTGGATCCTACCTCGTGCTTCTTTCCTCAGAACTT
GGTTTCAGACATCAAAACCCCAATGTTTCTTCTCAACACAGCATATGACTCGCGGCAGAT
CCAAGAGAGCTTAACTCCTAAAACTGCTGACCCAGGCGGCATCTGGAAGGCATGCAAAGC
ATACCACTCGCAATGTAACTCATCACAGATCCAATTCTTCCAAGAATTCAGGAATCAAAT
GCTGTTCGCCGTAAATTCATTCTCCACATCAGACCAGAACGGTCTTTTCATAAACTCTTG
CTTCGCTCATTGTCAAACTGAAAGGCAAGACACTTGGTTTGCCCAAGATTCTCCCCAACT
CAACGGAAAGAGAGTCGCAGAGACTGTAGGTGACTGGTACTTCGACCGAGCCAAAAATAT
CAAAGCCATCGACTGTGCTTACCCATGTGACAAAACATGTCACAATCTGATTTTCGATGT
TCATCAA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2FS61JQ 642 0 0
CTGACCCAGGCGGCATCTGGAAGGCATGCAAAGCATACCACTCGCAATGTAACTCATCAC
AGATCCAATTCTTCCAAGAATTCAGGAATCAAATGCTGTTCGCCGTAAATTCATTCTCCA
CATCAGACCAGAACGGTCTTTTCATAAACTCTTGCTTCGCTCATTGTCAAACTGAAAGGC
AAGACACTTGGTTTGCCCAAGATTCTCCCCAACTCAACGGAAAGAGAGTCGCAGAGACTG
TAGGTGACTGGTACTTCGACCGAGCCAAAAATATCAAAGCCATCGACTGTGCTTACCCAT
GTGACAAAACATGTCACAATCTGATTTTCGATGTTCATCAAACAGGTGTAGATTGGGGTG
TTGATCAAACAGCTCTAGAGATCTCAGCTTCTTCTTCTTCTTCAAGATTTTGTTTTACTC
TTTTTAGAGCCTCTTTGGTCTCTCTAGTGTTGACAACACTCATCCTCATATGCTTAGTTC
AGTAGGTATAGGGAGACCTTATTCTTTCATACCTCATAGTGTTTTTATAACCCTTTTGAT
TCAAATGTTGAATCTAAGTTAGTAATCAAATCTATGTATGCAGAAAAGAATATATCACAA
AGAGAAAAAATAATAAGAAACAAAAACTCATGATTATACTGT

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL5361Contig1 309 2 3 U
CCCCGCTCAAAGCGGTCTGGAGCGACCACCGCTAGCTCTACCGCATCGAAAAGCGTTTAT
GGGGATTGGGTACTCGTCTCTGAAAAAAGTCGAAGTTGTGTAAACACCCATATAAAACTG
TTGTCCTAAGTATTGCCTTGCCCAAAACTCGGACCTTAAATTCCACATCCCTACATTGTC
CAGTGCAATGTATATGGCCGTCCACGAACTGGGATACACCTGAACGGGGCAGCGAGCTAC
TGCATCACGTAGGTTTGTACTGGTTCCTACTGTCAGGAGTCCATTGCCCACCGTCCATTC
CAACAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C940JQ U 165
AF RR2AP09JQ U 1
BS 1 255 RR2AP09JQ
BS 256 256 RR2C940JQ
BS 257 309 RR2AP09JQ

RD RR2C940JQ 119 0 0
ACATCCCTACATTGTCCAGTGCAATGTATATGGCCGTCCACGAACTGGGATACACCTGAA
CGGTGCAGCGAGCTACTGCATCACGTAGGTTTGTACTGGTTCCTACTGTCAGGAGTCCA

QA 1 119 1 119
DS 

RD RR2AP09JQ 309 0 0
CCCCGCTCAAAGCGGTCTGGAGCGACCACCGCTAGCTCTACCGCATCGAAAAGCGTTTAT
GGGGATTGGGTACTCGTCTCTGAAAAAAGTCGAAGTTGTGTAAACACCCATATAAAACTG
TTGTCCTAAGTATTGCCTTGCCCAAAACTCGGACCTTAAATTCCACATCCCTACATTGTC
CAGTGCAATGTATATGGCCGTCCACGAACTGGGATACACCTGAACGGGGCAGCGAGCTAC
TGCATCACGTAGGTT*GTACTGGTTCCTACTGTCAGGAGTCCATTGCCCACCGTCCATTC
CAACAACCC

QA 1 309 1 309
DS 



AS 1 2

CO CL5362Contig1 983 2 2 U
GATTGAGAGATATGACCCCGATCCAGCGGCTAAAGCAGCAGCTGCAACTGTCCTGGCATC
CAAATTGGGTGCCGACTCTGGCTTAAAAGTAGTTTTAGGAGATGAATCCCAAGTCGATCC
GGCTTGGGGAAAGAGTAATGACATGGAGGTCAACCAATCACGAGGGCTGAGGAATCGAAG
GCATCCGAGTACTAGACCCCACGGTTCTGCAAGCAATTCAACACATCATTCTGATGACGA
GTCTCGCCCTTCTGGGGAAACCGAGAGATTACTAAGCACCGCAGAGCAAAGCCAGGAGAT
GCTGGTTGAGCATTACAGTCCTCAGGGATATGCGGCTCCCGATGGCAGTTGGATCTCACG
CATCGCGGCTCTCCTTGTGGGCGAAGATCCCACACAGTCATTCGCAATCATTTGTGAGAA
CTGTCATATGCATAACGGACTTGCTAGGAAAGAGGATTTTGAGTATATTACGTATTATTG
CCCTCACTGTAACGCCCTGAACAAACCGAAGCATTCAGAGGAGAATCCACTTCTTCCTCC
TGTTCCCGCTCTACTGGTCACAGACTCTCCCTCATTGATTGAAACCAGTGAAGTGGTTAA
TAGCAGCAGCTCGTCCAGTGAACGTGGGAATAGCCCCATTCCAGAAATAAACGAGGAAAC
TGCGACTACTGAGACTGGAACAACGAGCTGAGTAAGATCCAGTTACCTGAGGAAGAAGGC
TTTCGTGTGCTAGTATTCGTTCAGGTAATTTATAACTGTTCTTTATATATAGTAGTATAT
TCTTACAGGTTTGGTTATGGTGTGTTTTTAATACAACAAGACAACAGAGTTTTGGTGGGT
AAATATAACGATAATTGTTATACGTTTTTGGGTTTAAATCATTTTAATTTGGTTTACTTC
TACAGATTGTCTCTATATTTTGTTAATGTATTCACTTTTGAAAACGGATCATATTTGGTA
TTAATACTATGAGCTAACAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR91TF U 1
AF RR2DR91JQ C 253
BS 1 595 RR2DR91TF
BS 596 983 RR2DR91JQ

RD RR2DR91TF 595 0 0
GATTGAGAGATATGACCCCGATCCAGCGGCTAAAGCAGCAGCTGCAACTGTCCTGGCATC
CAAATTGGGTGCCGACTCTGGCTTAAAAGTAGTTTTAGGAGATGAATCCCAAGTCGATCC
GGCTTGGGGAAAGAGTAATGACATGGAGGTCAACCAATCACGAGGGCTGAGGAATCGAAG
GCATCCGAGTACTAGACCCCACGGTTCTGCAAGCAATTCAACACATCATTCTGATGACGA
GTCTCGCCCTTCTGGGGAAACCGAGAGATTACTAAGCACCGCAGAGCAAAGCCAGGAGAT
GCTGGTTGAGCATTACAGTCCTCAGGGATATGCGGCTCCCGATGGCAGTTGGATCTCACG
CATCGCGGCTCTCCTTGTGGGCGAAGATCCCACACAGTCATTCGCAATCATTTGTGAGAA
CTGTCATATGCATAACGGACTTGCTAGGAAAGAGGATTTTGAGTATATTACGTATTATTG
CCCTCACTGTAACGCCCTGAACAAACCGAAGCATTCAGAGGAGAATCCACTTCTTCCTCC
TGTTCCCGCTCTACTGGTCACAGACTCTCCCTCATTGATTGAAACCAGTGAAGTG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2DR91JQ 731 0 0
TGGGGAAACCGAGAGATTACTAAGCACCGCAGAGCAAAGCCAGGAGATGCTGGTTGAGCA
TTACAGTCCTCAGGGATATGCGGCTCCCGATGGCAGTTGGATCTCACGCATCGCGGCTCT
CCTTGTGGGCGAAGATCCCACACAGTCATTCGCAATCATTTGTGAGAACTGTCATATGCA
TAACGGACTTGCTAGGAAAGAGGATTTTGAGTATATTACGTATTATTGCCCTCACTGTAA
CGCCCTGAACAAACCGAAGCATTCAGAGGAGAATCCACTTCTTCCTCCTGTTCCCGCTCT
ACTGGTCACAGACTCTCCCTCATTGATTGAAACCAGTGAAGTGGTTAATAGCAGCAGCTC
GTCCAGTGAACGTGGGAATAGCCCCATTCCAGAAATAAACGAGGAAACTGCGACTACTGA
GACTGGAACAACGAGCTGAGTAAGATCCAGTTACCTGAGGAAGAAGGCTTTCGTGTGCTA
GTATTCGTTCAGGTAATTTATAACTGTTCTTTATATATAGTAGTATATTCTTACAGGTTT
GGTTATGGTGTGTTTTTAATACAACAAGACAACAGAGTTTTGGTGGGTAAATATAACGAT
AATTGTTATACGTTTTTGGGTTTAAATCATTTTAATTTGGTTTACTTCTACAGATTGTCT
CTATATTTTGTTAATGTATTCACTTTTGAAAACGGATCATATTTGGTATTAATACTATGA
GCTAACAGTTT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL5363Contig1 1088 2 4 U
GGGAACTCGAGATCAGCAAAAAAGAAAGAAAATGGAGAAGAAGCGTGAAGGAGTAATGGA
AAGAACGAGCCAGATCGTGTCAGATCCATACTACTTCCTCCACTTCATGGCCTTCTTCTC
ATACCTTCCGATCCGCACCTCCGTCGCACAGTACACTTCTCATCGACTCTTCGACAGAGA
AGTCCAAGCCTTTCTAGCCTTCCTCATGTTCTCAGCTATCAAGATGGTTAGGGAGGAAAC
ATGGGAGGCTTTTGTTGCTGATAGCTTTCTCTATGCTAAGATCTTTCTTATAGCGGTTTC
GTTGGTTATGGATTATCGAGTTGCGATCTGGTACTGTGTCATTTTTTCAGTGGTGTATCT
ATTAGCTCAACAACCAGCGTTTAGTAAGTTAGGAACAGCGAAGAAGCTAACACCTATGCA
GTTGGAGGATTTGCTATCAGATGGGACCACAACTAAATACTGGTTGGTAGAATTCTATGC
ATGTAGTTCAGCTAAGTGTGTTCGTTCAAGCCGCTGCTTTCCTGAGCTCTCCATCACGTA
CTCGAATAGTCTTTTGTCTTTTGGAACCATCGATCTTGGACTTTTCCCTAATGCTGCAGC
TAAGTTTGGAATCTCTCTTGCCGGTGGAATGTCTCAGCTTCCCACATACATATTGTTTGA
AAAGGGTGTAGAAGTTTCTCGTTTCCCAGACTTTTATGTTGACGCTGCACCGGCTTTACC
CGTAACCAAGAAACTTCTGTGTCAACATTTTGAGCTTGATCGTCTTCTGCTTGACTACAT
CAACGGATCATAGCCAGAGAAAAAACGATATGTAGATGGGCTTCTCGTAAAAGAGAATTA
TGCACACCATCGGGGGGGAAGGGGCTATAAGAGGCAAACATTTTGGGTCTATCGCATTCT
TTTTTTATCTTTGATCTTCTTAATGGGACTCTTTTTAGGGAGGCTCGCCTGAGGAAACTA
TAGATACTGTTTTTGTGTGTTATAGAGAGATGAGATAAGATTATGCTGAAAATTCTTGAA
TTTGATTTGATGTTAATGAAATCTTCTGAGCTTTTAGTACCTTTCGTTTTCAGTAATTTT
TTTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM58TF U 1
AF RR2CM58JQ C 348
BS 1 662 RR2CM58TF
BS 663 663 RR2CM58JQ
BS 664 707 RR2CM58TF
BS 708 1088 RR2CM58JQ

RD RR2CM58TF 707 0 0
GGGAACTCGAGATCAGCAAAAAAGAAAGAAAATGGAGAAGAAGCGTGAAGGAGTAATGGA
AAGAACGAGCCAGATCGTGTCAGATCCATACTACTTCCTCCACTTCATGGCCTTCTTCTC
ATACCTTCCGATCCGCACCTCCGTCGCACAGTACACTTCTCATCGACTCTTCGACAGAGA
AGTCCAAGCCTTTCTAGCCTTCCTCATGTTCTCAGCTATCAAGATGGTTAGGGAGGAAAC
ATGGGAGGCTTTTGTTGCTGATAGCTTTCTCTATGCTAAGATCTTTCTTATAGCGGTTTC
GTTGGTTATGGATTATCGAGTTGCGATCTGGTACTGTGTCATTTTTTCAGTGGTGTATCT
ATTAGCTCAACAACCAGCGTTTAGTAAGTTAGGAACAGCGAAGAAGCTAACACCTATGCA
GTTGGAGGATTTGCTATCAGATGGGACCACAACTAAATACTGGTTGGTAGAATTCTATGC
ATGTAGTTCAGCTAAGTGTGTTCGTTCAAGCCGCTGCTTTCCTGAGCTCTCCATCACGTA
CTCGAATAGTCTTTTGTCTTTTGGAACCATCGATCTTGGACTTTTCCCTAATGCTGCAGC
TAAGTTTGGAATCTCTCTTGCCGGTGGAATGTCTCAGCTTCCCACATACATATTGTTTGA
AA*GGGTGTAGAAGTTTCTCGTTTCCCAGACTTTTATGTTGACGCTG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2CM58JQ 741 0 0
CAGTGGTGTATCTATTAGCTCAACAACCAGCGTTTAGTAAGTTAGGAACAGCGAAGAAGC
TAACACCTATGCAGTTGGAGGATTTGCTATCAGATGGGACCACAACTAAATACTGGTTGG
TAGAATTCTATGCATGTAGTTCAGCTAAGTGTGTTCGTTCAAGCCGCTGCTTTCCTGAGC
TCTCCATCACGTACTCGAATAGTCTTTTGTCTTTTGGAACCATCGATCTTGGACTTTTCC
CTAATGCTGCAGCTAAGTTTGGAATCTCTCTTGCCGGTGGAATGTCTCAGCTTCCCACAT
ACATATTGTTTGAAAAGGGTGTAGAAGTTTCTCGTTTCCCAGACTTTTATGTTGACGCTG
CACCGGCTTTACCCGTAACCAAGAAACTTCTGTGTCAACATTTTGAGCTTGATCGTCTTC
TGCTTGACTACATCAACGGATCATAGCCAGAGAAAAAACGATATGTAGATGGGCTTCTCG
TAAAAGAGAATTATGCACACCATCGGGGGGGAAGGGGCTATAAGAGGCAAACATTTTGGG
TCTATCGCATTCTTTTTTTATCTTTGATCTTCTTAATGGGACTCTTTTTAGGGAGGCTCG
CCTGAGGAAACTATAGATACTGTTTTTGTGTGTTATAGAGAGATGAGATAAGATTATGCT
GAAAATTCTTGAATTTGATTTGATGTTAATGAAATCTTCTGAGCTTTTAGTACCTTTCGT
TTTCAGTAATTTTTTTTTACC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL5364Contig1 1263 2 6 U
CTCCTACAAAAAAAACAACTTTCTTCTTTCTCTTTGACATAAACAAAAAACTCTTTCTGT
ATCTCCCCTCTCTTCATCTTCAACACCCATGGATTACGAGGCGTCAAGAATTGGTGAGAT
CGTGGAAGATTCAGAGCAGTTTGATTTGCTACCTGGATTCAGATTTCACCCGACAGATGA
AGAACTCATAAGCCACTACTTGAGACCGAAGGTTCTAAACACCCTCTTCTCTGCTATAGC
CATTGGTGAAGTCGATCTCAACAAGGTCGAGCCTTGGGACTTGCCATGGAAGGCTAAGAT
TGGCGAAAAAGAGTGGTACTTCTTCTGCGTGAGAGATCGGAAATACCCAACCGGTTTAAG
AACGAACCGGGCTACTAAGGCCGGTTATTGGAAAGCTACAGGGAAAGACAAAGAGATATT
CAAAGAAAAATCTCTTGTCGGTATGAAGAAAACTTTGGTTTTCTACGAAGGAAGAGCTCC
TAAAGGAGCAAAAACTAACTGGGTCATGCACGAGTATCGCTTAGAAGGCGTGTATTCAAC
CGACAACCTTCCTAAAACCGCTAAGAACGAGTGGGTTATTAGTAGGATTTTTCAGAAAGG
TGCAGACGGTAAGAAGATGCATCTCTACCAGGGGCTCGGTTCAGGGATTAACCAAGTCGA
ACCGGCTGGTTTACCTCCGCTGATGGACTCTTCTTTCGCCAGATCGTTGCCTAACGTGGC
CTGCTTCTCCGACCAAACAACCTTTGAGGACAAGAGCCACATCTCCGAGTTAAAAGATGA
ATGCAACGTTACTATGCTCGGTTCATCGTCGGCTGACTTGATACCGAACATTGGTCTTCT
GCTATACTCTGATCCTCTTTTTATGCAAGATAATTCTTCGATAGTGAAGATGTTGCTTGA
CAGTGAAGAAACCAAGCTTAAGAAGAGTATCCAGGATTTCGGTACTGTTGAAAACGAATT
AACTTGGCACGGTCACCATCTTTCTGGTTCAACCGGTCCGGCTGAGGTCGATTGCTATTG
GAATTTCTGAATTTGGGGTCTGGAACGGATCGAAAATTGGGGGTACATATGGGTTAGAAC
AAACAATTAGGAGGTATTTTAGGGTTTGTATAAGTGTTATATGCGTTTGCTCAAGATTCT
AGACTCTAGGATATGCAAAGACATTGAAAGACTATTGCAACATTTTGTAAAAAGGGTGCC
GTTTGATGAAAAAAAAAACATTTTGTAAAAAAGGATCAACTTGTGAAAATCGATTCTCTT
ACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2B073TF U 1
AF RR2B073JQ C 484
BS 1 811 RR2B073TF
BS 812 812 RR2B073JQ
BS 813 837 RR2B073TF
BS 838 838 RR2B073JQ
BS 839 851 RR2B073TF
BS 852 1263 RR2B073JQ

RD RR2B073TF 851 0 0
CTCCTACAAAAAAAACAACTTTCTTCTTTCTCTTTGACATAAACAAAAAACTCTTTCTGT
ATCTCCCCTCTCTTCATCTTCAACACCCATGGATTACGAGGCGTCAAGAATTGGTGAGAT
CGTGGAAGATTCAGAGCAGTTTGATTTGCTACCTGGATTCAGATTTCACCCGACAGATGA
AGAACTCATAAGCCACTACTTGAGACCGAAGGTTCTAAACACCCTCTTCTCTGCTATAGC
CATTGGTGAAGTCGATCTCAACAAGGTCGAGCCTTGGGACTTGCCATGGAAGGCTAAGAT
TGGCGAAAAAGAGTGGTACTTCTTCTGCGTGAGAGATCGGAAATACCCAACCGGTTTAAG
AACGAACCGGGCTACTAAGGCCGGTTATTGGAAAGCTACAGGGAAAGACAAAGAGATATT
CAAAGAAAAATCTCTTGTCGGTATGAAGAAAACTTTGGTTTTCTACGAAGGAAGAGCTCC
TAAAGGAGCAAAAACTAACTGGGTCATGCACGAGTATCGCTTAGAAGGCGTGTATTCAAC
CGACAACCTTCCTAAAACCGCTAAGAACGAGTGGGTTATTAGTAGGATTTTTCAGAAAGG
TGCAGACGGTAAGAAGATGCATCTCTACCAGGGGCTCGGTTCAGGGATTAACCAAGTCGA
ACCGGCTGGTTTACCTCCGCTGATGGACTCTTCTTTCGCCAGATCGTTGCCTAACGTGGC
CTGCTTCTCCGACCAAACAACCTTTGAGGACAAGAGCCACATCTCCGAGTTAAAAGATGA
ATGCAACGTTACTATGCTCGGTTCATCGTCG*CTGACTTGATACCGAACATTGGTCT*CT
GCTATACTCTG

QA 1 851 1 851
DS 

RD RR2B073JQ 780 0 0
AGGAGCAAAAACTAACTGGGTCATGCACGAGTATCGCTTAGAAGGCGTGTATTCAACCGA
CAACCTTCCTAAAACCGCTAAGAACGAGTGGGTTATTAGTAGGATTTTTCAGAAAGGTGC
AGACGGTAAGAAGATGCATCTCTACCAGGGGCTCGGTTCAGGGATTAACCAAGTCGAACC
GGCTGGTTTACCTCCGCTGATGGACTCTTCTTTCGCCAGATCGTTGCCTAACGTGGCCTG
CTTCTCCGACCAAACAACCTTTGAGGACAAGAGCCACATCTCCGAGTTAAAAGATGAATG
CAACGTTACTATGCTCGGTTCATCGTCGGCTGACTTGATACCGAACATTGGTTTTCTGCT
ATACTCTGATCCTCTTTTTATGCAAGATAATTCTTCGATAGTGAAGATGTTGCTTGACAG
TGAAGAAACCAAGCTTAAGAAGAGTATCCAGGATTTCGGTACTGTTGAAAACGAATTAAC
TTGGCACGGTCACCATCTTTCTGGTTCAACCGGTCCGGCTGAGGTCGATTGCTATTGGAA
TTTCTGAATTTGGGGTCTGGAACGGATCGAAAATTGGGGGTACATATGGGTTAGAACAAA
CAATTAGGAGGTATTTTAGGGTTTGTATAAGTGTTATATGCGTTTGCTCAAGATTCTAGA
CTCTAGGATATGCAAAGACATTGAAAGACTATTGCAACATTTTGTAAAAAGGGTGCCGTT
TGATGAAAAAAAAAACATTTTGTAAAAAAGGATCAACTTGTGAAAATCGATTCTCTTACC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL5365Contig1 584 2 1 U
TCGTCTGCGACAGTCTCTGAGAGAGTGATACTGATACCTAAGCGAGAATTTTCGGTCAGC
CATGAACGCTCCCGACAGATACGAACGATTCGTCGTCCCAGAAGGCACCAAAAAGGTTTC
GTACGAGAGGGACACGAAGATCATCAACGCTGCTTCCTTCACGATTGAGAGAGAAGACCA
CACCATTGGCAACATCGTCCGCATGCAGCTTCACCGGGACGAGAATGTGTTGTTTGCTGG
ATATCAACTGCCTCATCCTCTCAAGTACAAAATCATAGTCAAGATTCACACCACAAGCCA
GTCTTCTCCTATGCAAGCATACAATCAGGCTATCAATGATCTTGACAAGGAGCTTGACTT
TCTCAAGTCCCAATTTGAGGCAGAGGTTGCCAAGTTCTCGAATCCGTACTAAGGAGGAGC
TCAGTGTTTTTCCTTATCTATGCACCAACTAGAAGACTTTTGTAATCAGCTTAGTTTTCG
TGTTCTGTTGTTTTAACTCTTTACGTTTTGGACACCAGTAATGCTTTGATTAACCTTTCC
TTTAGGAAAACCTTTTAATGGATGAAGTATTGTAAGCTCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GQ72TF U 1
AF RR2GQ72JQ C 226
BS 1 584 RR2GQ72TF

RD RR2GQ72TF 584 0 0
TCGTCTGCGACAGTCTCTGAGAGAGTGATACTGATACCTAAGCGAGAATTTTCGGTCAGC
CATGAACGCTCCCGACAGATACGAACGATTCGTCGTCCCAGAAGGCACCAAAAAGGTTTC
GTACGAGAGGGACACGAAGATCATCAACGCTGCTTCCTTCACGATTGAGAGAGAAGACCA
CACCATTGGCAACATCGTCCGCATGCAGCTTCACCGGGACGAGAATGTGTTGTTTGCTGG
ATATCAACTGCCTCATCCTCTCAAGTACAAAATCATAGTCAAGATTCACACCACAAGCCA
GTCTTCTCCTATGCAAGCATACAATCAGGCTATCAATGATCTTGACAAGGAGCTTGACTT
TCTCAAGTCCCAATTTGAGGCAGAGGTTGCCAAGTTCTCGAATCCGTACTAAGGAGGAGC
TCAGTGTTTTTCCTTATCTATGCACCAACTAGAAGACTTTTGTAATCAGCTTAGTTTTCG
TGTTCTGTTGTTTTAACTCTTTACGTTTTGGACACCAGTAATGCTTTGATTAACCTTTCC
TTTAGGAAAACCTTTTAATGGATGAAGTATTGTAAGCTCTTTTT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2GQ72JQ 359 0 0
TGTGTTGTTTGCTGGATATCAACTGCCTCATCCTCTCAAGTACAAAATCATAGTCAAGAT
TCACACCACAAGCCAGTCTTTTCCTATGCAAGCATACAATCAGGCTATCAATGATCTTGA
CAAGGAGCTTGACTTTCTCAAGTCCCAATTTGAGGCAGAGGTTGCCAAGTTCTCGAATCC
GTACTAAGGAGGAGCTCAGTGTTTTTCCTTATCTATGCACCAACTAGAAGACTTTTGTAA
TCAGCTTAGTTTTCGTGTTCTGTTGTTTTAACTCTTTACGTTTTGGACACCAGTAATGCT
TTGATTAACCTTTCCTTTAGGAAAACCTTTTAATGGATGAAGTATTGTAAGCTCTTTTT

QA 1 359 1 359
DS 



AS 1 2

CO CL5366Contig1 543 2 3 U
AGCAAAAAAATAGTTTTTTTTTAAATATACCTCTCGACTGACAAAACAGGCTAGTTTAGT
TAGGTGCTAGCATAATAACAACGTGAGAAATCACTAATAACATACAGTTACGTTACAACA
AAATAAAACAAATACAGATTTGAAGAAACAAAAATCTGAATCTGCTTTCTCATTTTGTTT
TTGTTTTTTGAATTTTAGACGACGGCTTTGAGTAGGGCGTCGAGTACAGCTTGTTTTGTA
GGAAGTGCAGGTACTGCACCTCTCTCCTTTACGGTCAAGGCACCACACGCATTCGCAAAC
ATTAGAGCCTCTCTCAGTCTTTCTTCGTCCTGAAGCAAAGAGAGATCACATGCTAGTTGA
GATAGTATTCCGGCAACAAACGCATCCCCAGCACCTGTCGTGTCCACTACTTCCACCCTC
AATCCATGTACTCTCCCGCTAAAATCCTTTGTGTAGTAGCGACAGCCTTCAGGACCTTCA
GTGACAAGGAGTAGTTTGAGCTTAGGATGGAACAGCTTCCTGACGACAGAATCATCATAA
GGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2GP85JQ U 74
AF RR2G647JQ U 1
BS 1 253 RR2G647JQ
BS 254 254 RR2GP85JQ
BS 255 543 RR2G647JQ

RD RR2GP85JQ 363 0 0
AATAACAACGTGAGAAATCACTAATAACATACAGTTACGTTACAACAAAATAAAACAAAT
ACAGATTTGAAGAAACAAAAATCTGAATCTGCTTTCTCATTTTGTTTTTGTTTTTTGAAT
TTTAGACGACGGCTTTGAGTAGGGCGTCGAGTACAGCTTGTTTTGTAGGAAGTGCAGGTA
CTGCACCTCTCTCCTTTACGGTCAAGGCACCACACGCATTCGCAAACATTAGAGCCTCTC
TCAGTCTTTCTTCGTCCTGAAGCAAAGAGAGATCACATGCTAGTTGAGATAGTATTCCGG
CAACAAACGCATCCCCAGCACCTGTCGTGTCCACTACTTCCACCTTCAATCCATGTACTC
TCC

QA 1 363 1 363
DS 

RD RR2G647JQ 543 0 0
AGCAAAAAAATAGTTTTTTTTTAAATATACCTCTCGACTGACAAAACAGGCTAGTTTAGT
TAGGTGCTAGCATAATAACAACGTGAGAAATCACTAATAACATACAGTTACGTTACAACA
AAATAAAACAAATACAGATTTGAAGAAACAAAAATCTGAATCTGCTTTCTCATTTTGTTT
TTGTTTTTTGAATTTTAGACGACGGCTTTGAGTAGGGCGTCGAGTACAGCTTGTTTTGTA
GGAAGTGCAGGTATTGCACCTCTCTCCTTTACGGTCAAGGCACCACACGCATTCGCAAAC
ATTAGAGCCTCTCTCAGTCTTTCTTCGTCCTGAAGCAAAGAGAGATCACATGCTAGTTGA
GATAGTATTCCGGCAACAAACGCATCCCCAGCACCTGTCGTGTCCACTACTTCCACCCTC
AATCCATGTACTCTCCCGCTAAAATCCTTTGTGTAGTAGCGACAGCCTTCAGGACCTTCA
GTGACAAGGAGTAGTTTGAGCTTAGGATGGAACAGCTTCCTGACGACAGAATCATCATAA
GGA

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL5367Contig1 895 2 2 U
GGGTGAACGTCAAGCTAGGGCTCTTGCTGTCTTCTTCAAATCTCAGGGTGTTCGGTTTAC
TTCGGTTTACTCTTCGCCTCTGGATCGAGCTAGATCCATGGCTCTTTCGGTTTGCCAGGA
AATGAGTTATCCAGAGGAGCACATACAATCCTCAGACGCAATTATAGAGATGAGTCTAGG
AGATTGGGAAGGTTGCAACCAATCAGAGATCTATAGTCCCGAGACTCTGAGCTTGATTGA
AAGATGCCTGCCTGATTTCTCAGCTCCTTCTGGAGAATCACTCAGACAAGTGGAGTTCCG
GATGGTTCAGTTTCTAAACGGGACAGTCTCAGGAGGACTCGCAGAGAAGCTCAGGTCAGA
TTTTTCATCCACCCCACATGAGCGTTGTGATGGTGGTTCGTTACTTCCCTCGACCAGCTG
GGACTTGCTTCACAAGCATCGTCCAAGTCTTACAAGGAAGAAACCTGGCAAAAGCAGGCT
TCAGGTGATGACCAATCACGAGCTTGAAGATGGAGTGTCCCCAAGGGAAGACGTTAATCA
AAATCTCATCGACATGGTGTCGAGTTGCGTTGGGGTTTTCACGCATTCGTCGCCTATAAA
GTGTGTTCTGACCGGAGTCCTCGGGTGCAGTCCTGTAATGACTCATAAGATCTGTGTGGA
GGACTCTTCGGTGACGGTGTTACAGCATTCTTGGAGAAATGGGTGGCAGATCAAACGAAT
GAATGATACCCTCATCTTAGATTGTTGTAGTTTGAAAAAAAAAAAAATTATTTATTACTG
GTTAAAAAAAGTTTTCATATGTATACAATGATGAATCGGTAAAGTTCAAGAACAAAGGTT
ATGCGGATGACTTGCCACGGCCTTTTCTTTGTAATGTTTGTTTGGAAACTAAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A087TF U 1
AF RR2A087JQ C 366
BS 1 754 RR2A087TF
BS 755 895 RR2A087JQ

RD RR2A087TF 754 0 0
GGGTGAACGTCAAGCTAGGGCTCTTGCTGTCTTCTTCAAATCTCAGGGTGTTCGGTTTAC
TTCGGTTTACTCTTCGCCTCTGGATCGAGCTAGATCCATGGCTCTTTCGGTTTGCCAGGA
AATGAGTTATCCAGAGGAGCACATACAATCCTCAGACGCAATTATAGAGATGAGTCTAGG
AGATTGGGAAGGTTGCAACCAATCAGAGATCTATAGTCCCGAGACTCTGAGCTTGATTGA
AAGATGCCTGCCTGATTTCTCAGCTCCTTCTGGAGAATCACTCAGACAAGTGGAGTTCCG
GATGGTTCAGTTTCTAAACGGGACAGTCTCAGGAGGACTCGCAGAGAAGCTCAGGTCAGA
TTTTTCATCCACCCCACATGAGCGTTGTGATGGTGGTTCGTTACTTCCCTCGACCAGCTG
GGACTTGCTTCACAAGCATCGTCCAAGTCTTACAAGGAAGAAACCTGGCAAAAGCAGGCT
TCAGGTGATGACCAATCACGAGCTTGAAGATGGAGTGTCCCCAAGGGAAGACGTTAATCA
AAATCTCATCGACATGGTGTCGAGTTGCGTTGGGGTTTTCACGCATTCGTCGCCTATAAA
GTGTGTTCTGACCGGAGTCCTCGGGTGCAGTCCTGTAATGACTCATAAGATCTGTGTGGA
GGACTCTTCGGTGACGGTGTTACAGCATTCTTGGAGAAATGGGTGGCAGATCAAACGAAT
GAATGATACCCTCATCTTAGATTGTTGTAGTTTG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2A087JQ 530 0 0
CATCCACCCCACATGAGCGTTGTGATGGTGGTTCGTTACTTCCCTCGACCAGCTGGGACT
TGCTTCACAAGCATTGTCCAAGTTTTACAAGGAAGAAACCTGGCAAAAGCAGGCTTCAGG
TGATGACCAATCACGAGCTTGAAGATGGAGTGTCCCCAAGGGAAGACGTTAATCAAAATT
TCATTGACATGGTGTCGAGTTGCGTTGGGGTTTTCACGCATTTGTCGCCTATAAAGTGTG
TTTTGACCGGAGTCCTCGGGTGCAGTCCTGTAATGACTCATAAGATCTGTGTGGAGGACT
TTTCGGTGACGGTGTTACAGCATTTTTGGAGAAATGGGTGGCAGATCAAACGAATGAATG
ATACCCTCATTTTAGATTGTTGTAGTTTGAAAAAAAAAAAAATTATTTATTACTGGTTAA
AAAAAGTTTTCATATGTATACAATGATGAATCGGTAAAGTTCAAGAACAAAGGTTATGCG
GATGACTTGCCACGGCCTTTTCTTTGTAATGTTTGTTTGGAAACTAAGGG

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 2

CO CL5368Contig1 657 2 2 U
GGGCACACTTTAACCTCTCTTCTCTCGATAGACGATCATCACCACATCCACAACAAGCGC
CGAAAAAAAAAAGATGGCGTCGAGAGAGCAAGTAAAGGCGTCGCACATTCTGATAAAGCA
CCAAGGATCTCGTAGGAAGGCGTCGTGGAAGGACCCCGAAGGAAAGATCATAATGACTAC
CACGAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTCAAATCGATCCGCGAAGACATCGTCTCTGGCAA
AGCTAACTTTGAGGACGTTGCCACTCGCGTCTCCGACTGTAGCCCCGCCAAACGCGGCGG
CGATCTAGGTCCGTTTGGGAGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAGGCAACATACGC
ACTCAAGGTTGGTGATATAAGCGAGATTGTGGATACAGACAGTGGAGTCCATATCATTAA
GAGAACTGCTTGATCTCTCCTCCATAGCCTCTATCTGTCATCATGTATCAAAAGTTACCA
GCTTTCTTTTTTCTTGACCAAAGATGAAGAAGAGAGAAGAATAATAAGAAAAAGCTTTGC
TATTGTGGTTTTAATTCTCCATGATTTTTGATACAAGCAAAAACATGTAATAAAACAAGA
TTTTGTAACTCTCATTCTTCTTTACAGCTTCATAATAAAACATTTCTGTTGCTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2E578TF U 1
AF RR2E578JQ C 309
BS 1 654 RR2E578TF
BS 655 657 RR2E578JQ

RD RR2E578TF 654 0 0
GGGCACACTTTAACCTCTCTTCTCTCGATAGACGATCATCACCACATCCACAACAAGCGC
CGAAAAAAAAAAGATGGCGTCGAGAGAGCAAGTAAAGGCGTCGCACATTCTGATAAAGCA
CCAAGGATCTCGTAGGAAGGCGTCGTGGAAGGACCCCGAAGGAAAGATCATAATGACTAC
CACGAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTCAAATCGATCCGCGAAGACATCGTCTCTGGCAA
AGCTAACTTTGAGGACGTTGCCACTCGCGTCTCCGACTGTAGCCCCGCCAAACGCGGCGG
CGATCTAGGTCCGTTTGGGAGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAGGCAACATACGC
ACTCAAGGTTGGTGATATAAGCGAGATTGTGGATACAGACAGTGGAGTCCATATCATTAA
GAGAACTGCTTGATCTCTCCTCCATAGCCTCTATCTGTCATCATGTATCAAAAGTTACCA
GCTTTCTTTTTTCTTGACCAAAGATGAAGAAGAGAGAAGAATAATAAGAAAAAGCTTTGC
TATTGTGGTTTTAATTCTCCATGATTTTTGATACAAGCAAAAACATGTAATAAAACAAGA
TTTTGTAACTCTCATTCTTCTTTACAGCTTCATAATAAAACATTTCTGTTGCTG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2E578JQ 349 0 0
GTCCGTTTGGGAGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAGGCAACATACGCACTCAAGG
TTGGTGATATAAGCGAGATTGTGGATACAGACAGTGGAGTCCATATCATTAAGAGAACTG
CTTGATCTCTCCTCCATAGCCTCTATCTGTCATCATGTATCAAAAGTTACCAGCTTTCTT
TTTTCTTGACCAAAGATGAAGAAGAGAGAAGAATAATAAGAAAAAGCTTTGCTATTGTGG
TTTTAATTCTCCATGATTTTTGATACAAGCAAAAACATGTAATAAAACAAGATTTTGTAA
CTCTCATTCTTCTTTACAGCTTCATAATAAAACATTTCTGTTGCTGACC

QA 1 349 1 349
DS 



AS 1 2

CO CL5369Contig1 831 2 1 U
ATCAGTCTCTAGATCATATACTAATCTTATTTTTGTCCAAGAAGGCTTGGAATCAAAAAC
AAAATGAACATACAGTATAGTCATATGGTTTTTGGTTTAGTATCTACACGTCCTTAAGAT
GTAATTTAGAGCTTTTGGTTTCTACCAAGCAAGAAAAGGGACTCAGAGATCAAAATCAAG
CTTGAGTAAGATGCCTCTCGAACCATTTCAGATTAGCGGAGTGAACTAGCTTAAATTGAT
GGATGCTTATGTTTAGGGTCATCTAGATTAGCATTGCAGAGGTTGTTAAAAGCATGCTTG
AGATGAGGGGTCACCACTTTGGCCTTGAAATCTTCAAGAGGACAGAAATCTTTTCCATCA
CAACCTGGAACTGCAATAGGATGCTCGTTGTGCAGAACCTGGACGAAGTACTTAGGCGAG
GAAGCTGCAGGACAACTGTAGAGGACAAGCATGTTGTTCGCACCAAAAGGAGCCATGGTG
CTGCCTTTAAAGTCCCTGGTTTTAGGAGGCTGAGGAGGGAGTTCCAATGGTTTCTCCTTC
TGTATTTTCTCAAACTCAGATGCATCAAGGAAAAGCCCGAGAAGACAAGAGAAGGGAACT
ATTGTTTCGGCATGAGCAAACCTAAGTCTTGCTTTCTCGTAACTTCCTGGTGGGAGATTT
TCTTCACGGGCCTTGATAGCTTCTTCCATCGAATGCAAAACATCTTCTAGCAATGGAACT
CCCATTTTGTAGTTCAAGGAGTTTCCATGACCTTTGAGAATAAACACTTCCAAGTCATCT
GCCCATTCCAACAAAGCAACCTCAGATGGCGTGAAAGTTCACAGCTTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK75JQ U 217
AF RR2EG16JQ U 1
BS 1 831 RR2EG16JQ

RD RR2AK75JQ 353 0 0
CGGAGTGAACTAGCTTAAATTGATGGATGCTTATGTTTAGGGTCATCTAGATTAGCATTG
CAGAGGTTGTTAAAAGCATGCTTGAGATGAGGGGTCACCACTTTGGCCTTGAAATCTTCA
AGAGGACAGAAATCTTTTCCATCACAACCTGGAACTGCAATAGGATGCTCGTTGTGCAGA
ACCTGGACGAAGTACTTAGGCGAGGAAGCTGCAGGACAACTGTAGAGGACAAGCATGTTG
TTCGCACCAAAAGGAGCCATGGTGCTGCCTTTAAAGTCCCTGGTTTTAGGAGGCTGAGGA
GGGAGTTCCAATGGTTTCTCCTTCTGTATTTTCTCAAACTCAGATGCATCAAG

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR2EG16JQ 831 0 0
ATCAGTCTCTAGATCATATACTAATCTTATTTTTGTCCAAGAAGGCTTGGAATCAAAAAC
AAAATGAACATACAGTATAGTCATATGGTTTTTGGTTTAGTATCTACACGTCCTTAAGAT
GTAATTTAGAGCTTTTGGTTTCTACCAAGCAAGAAAAGGGACTCAGAGATCAAAATCAAG
CTTGAGTAAGATGCCTCTCGAACCATTTCAGATTAGCGGAGTGAACTAGCTTAAATTGAT
GGATGCTTATGTTTAGGGTCATCTAGATTAGCATTGCAGAGGTTGTTAAAAGCATGCTTG
AGATGAGGGGTCACCACTTTGGCCTTGAAATCTTCAAGAGGACAGAAATCTTTTCCATCA
CAACCTGGAACTGCAATAGGATGCTCGTTGTGCAGAACCTGGACGAAGTACTTAGGCGAG
GAAGCTGCAGGACAACTGTAGAGGACAAGCATGTTGTTCGCACCAAAAGGAGCCATGGTG
CTGCCTTTAAAGTCCCTGGTTTTAGGAGGCTGAGGAGGGAGTTCCAATGGTTTCTCCTTC
TGTATTTTCTCAAACTCAGATGCATCAAGGAAAAGCCCGAGAAGACAAGAGAAGGGAACT
ATTGTTTCGGCATGAGCAAACCTAAGTCTTGCTTTCTCGTAACTTCCTGGTGGGAGATTT
TCTTCACGGGCCTTGATAGCTTCTTCCATCGAATGCAAAACATCTTCTAGCAATGGAACT
CCCATTTTGTAGTTCAAGGAGTTTCCATGACCTTTGAGAATAAACACTTCCAAGTCATCT
GCCCATTCCAACAAAGCAACCTCAGATGGCGTGAAAGTTCACAGCTTTGAT

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 2

CO CL5370Contig1 692 2 10 U
ATGCAAATTATAACATTCTATTGATGATATAGAAGCCAAAAACCACAAGAAATGTAACAA
AAGGGCACTAATTATCAGCCAAATATAACATATATTGAAGTCCCTATCCAAGCCCCCACA
TATTCTTCATCATCATCGTCATCTTCACTACTATCCTCATGAACAATGATGTCTCATCCG
CTTCTTTTCTTCCCCCTCAAAAAACCTTGCTTAGGTGATTAATATTAAAATAAAATAAAA
AGTAAAGAAAAAAGCAGACACAAAAGTCATAAAACACAACGGCACACCATTCTTGTTCCC
TTTTAAATGGGTAATGGCGTTTGTAATTATTATTAGCTGGAGAGACCCTGAACAAGTCAA
ACGTTGTCCGTTGACTTATGGAGCAGTGGAACTGTGATGGACGACTTGATGGAACCGCGA
GAAACGGGTACTCGCTCAATACCATGCTCCGCGATGGACTGGATCTCTGCCTTCTCAAGA
GCTGCAAATTTCCTCTCTTCACTCTTACCGTATAGAACAAAGTAAAGTCCCGCTATGATC
AGCACAGCACCAATAATCCCGCCCAAGTAAAATTCCTCGCCTAAAGCAATCGAAGCCATA
ATCGCAACGACCAAAGTCTGAACAGGTTGGTAAACAGCAACAAACACTGGACCCCCTCTG
TCAATACACCAAATCTGAACCGCAAACGCGAT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT51JQ U 1
AF RR2CG58JQ U 2
BS 1 287 RR2BT51JQ
BS 288 288 RR2CG58JQ
BS 289 413 RR2BT51JQ
BS 414 414 RR2CG58JQ
BS 415 437 RR2BT51JQ
BS 438 438 RR2CG58JQ
BS 439 515 RR2BT51JQ
BS 516 516 RR2CG58JQ
BS 517 663 RR2BT51JQ
BS 664 692 RR2CG58JQ

RD RR2BT51JQ 666 0 0
ATGCAAATTATAACATTCTATTGATGATATAGAAGCCAAAAACCACAAGAAATGTAACAA
AAGGGCACTAATTATCAGCCAAATATAACATATATTGAAGTCCCTATCCAAGCCCCCACA
TATTCTTCATCATCATCGTCATCTTCACTACTATCCTCATGAACAATGATGTCTCATCCG
CTTCTTTTCTTCCCCCTCAAAAAACCTTGCTTAGGTGATTAATATTAAAATAAAATAAAA
AGTAAAGAAAAAAGCAGACACAAAAGTCATAAAACACAACGGCACAC*ATTCTTGTTCCC
TTTTAAATGGGTAATGGCGTTTGTAATTATTATTAGCTGGAGAGACCCTGAACAAGTCAA
ACGTTGTCCGTTGACTTATGGAGCAGTGGAACTGTGATGGACGACTTGATGGAGCCGCGA
GAAACGGGTACTCGCTCGATACCATGCTCCGCGATGGACTGGATCTCTGCCTTCTCAAGA
GCTGCAAATTTCCTCTCTTCACTCTTACCGTATAGCACAAAGTAAAGTCCCGCTATGATC
AGCACAGCACCAATAATCCCGCCCAAGTAAAATTCCTCGCCTAAAGCAATCGAAGCCATA
ATCGCAACGACCAAAGTCTGAACAGGTTGGTAAACAGCAACAAACACTGGACCCCCTCTG
TCA
TAC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2CG58JQ 691 0 0
G
GCAAATTATAACATTCTATTGATGATATAGAAGCCAAAAACCACAAGAAATGTAACAAAA
GGGCACTAATTATCAGCCAAATATAACATATATTGAAGTCCCTATCCAAGCCCCCACATA
TTCTTCATCATCATCGTCATCTTCACTACTATCCTCATGAACAATGATGTCTCATCCGCT
TCTTTTCTTCCCCCTCAAAAAACCTTGCTTAGGTGATTAATATTAAAATAAAATAAAAAG
TAAAGAAAAAAGCAGACACAAAAGTCATAAAACACAACGGCACACCATTCTTGTTCCCTT
TTAAATGGGTAATGGCGTTTGTAATTATTATTAGCTGGAGAGACCCTGAACAAGTCAAAC
GTTGTCCGTTGACTTATGGAGCAGTGGAACTGTGATGGACGACTTGATGGAACCGCGAGA
AACGGGTACTCGCTCAATACCATGCTTCGCGATGGACTGGATCTCTGCCTTCTCAAGAGC
TGCAAATTTCCTCTCTTCACTCTTACCGTATAGAACAAAGTAAAGTCCCGCTATGATCAG
CACAGCACCAATAATCCCGCCCAAGTAAAATTCCTCGCCTAGAGCAATCGAAGCCATAAT
CGCAACGACCAAAGTCTGAACAGGTTGGTAAACAGCAACAAACACTGGACCCCCTCTGTC
AATACACCAAATCTGAACCGCAAACGCGAT

QA 2 691 2 691
DS 



AS 1 2

CO CL5371Contig1 1367 2 2 U
GGGGATCACAAGTCTTAACAATTAACAGAGAGATAGCAATGGGAGGCATCGATGCAACAG
AGTTGGGTTTAGAGAAGAAACCAAATCCGGGAAAGGCTACAATTCTTGCAATTGGAAAAG
CCTTTCCTCAGCAGCTAGTAATGCAAGAGTACTTGGTTGATGGCTACTTTAAAACTACTA
ATTGTGATGACCCTGAACTCAAACAGAAGCTTACCCGTCTCTGCAAGACAACGACTGTGA
GGACAAGGTATGTTGTCATGTCAGAGGAGATACTAACAAAGTATCCAGAACTAGCCATTG
AAGGAGGATCCACCGTGACGCAGCGTCTAGACATATGCAACGACGCTGTAACCGAAATGG
CAGTGGAGGCTTCTAGAGTCTGCATCAAGAACTGGGGCCGTTCTGTTTCCGACATAACTC
ACCTTGTCTATGTCTCTTCAAGCGAAGCTCGTCTCCCTGGTGGCGACCTCTACTTAGCCA
AAGGGCTTGGTCTAAGCCCCGAGACACACCGTGTCCTGCTCTACTTCGTGGGATGCTCTG
GTGGAGTTGCGGGTCTCCGTGTAGCCAAAGACATAGCCGAGAACAATCCGGGGAGTAGAG
TCTTGCTCGCCACGTCTGAGACGACTATCATTGGGTTCAAACCTCCGAGTGCTGATAGAC
CGTATGATCTTGTTGGGGTCGCATTGTTTGGTGATGGAGCCGGAGCTATGATCATCGGAT
CCGATCCAGATCCGATTCATGAGAAGCCTCTCTTTGAGCTCCACACAGCAATTCAGAACT
TCCTTCCTGACACGGAGAAGACGATAGATGGGAAGCTAACGGAACAAGGGATAAACTTCA
CGCTGTCTAGAGAGCTTCCACAGATAATAGAAGACAACGTGGAGAGTTTCTGCAAGAAGC
TAATAGCAAAAGCAGGACTGGCTTATGAAGACTATAACCAAATGTTCTGGGCGGTTCATC
CAGGTGGACCCGCCATTTTGAACAGGATGGAGAAGCGGCTTAACCTATCGCCAGAGAAGC
TGAGTCCAAGCAGGAGAGCTCTAATGGACTATGGCAACGCAAGTAGCAACTCGATCGTTT
ATGTGTTGGAGTATATGTTGGAGGAGAGCAGGAAAGCCAGGAACATGAATGAGGGTGGAA
ACGAGTGGGGTCTGATTCTTGCTTTTGGACCTGGTGTTACATTTGAAGGCATCGTTGCTC
GAAACCTTGACGTTTGAGCGAAAAAGTAATGGGGGTTTTGGTATTACCTTGAAGCTCAAG
AAATGGGGTTTGGTGATAACTAAGGGCTCAAGAAAAAACCGTCTTCTGTTATACAGTCAT
TACACCAGAGAGAAAATCATATAATAATAAGACTTGGAAGCTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C883TF U 1
AF RR2C883JQ C 573
BS 1 681 RR2C883TF
BS 682 1367 RR2C883JQ

RD RR2C883TF 681 0 0
GGGGATCACAAGTCTTAACAATTAACAGAGAGATAGCAATGGGAGGCATCGATGCAACAG
AGTTGGGTTTAGAGAAGAAACCAAATCCGGGAAAGGCTACAATTCTTGCAATTGGAAAAG
CCTTTCCTCAGCAGCTAGTAATGCAAGAGTACTTGGTTGATGGCTACTTTAAAACTACTA
ATTGTGATGACCCTGAACTCAAACAGAAGCTTACCCGTCTCTGCAAGACAACGACTGTGA
GGACAAGGTATGTTGTCATGTCAGAGGAGATACTAACAAAGTATCCAGAACTAGCCATTG
AAGGAGGATCCACCGTGACGCAGCGTCTAGACATATGCAACGACGCTGTAACCGAAATGG
CAGTGGAGGCTTCTAGAGTCTGCATCAAGAACTGGGGCCGTTCTGTTTCCGACATAACTC
ACCTTGTCTATGTCTCTTCAAGCGAAGCTCGTCTCCCTGGTGGCGACCTCTACTTAGCCA
AAGGGCTTGGTCTAAGCCCCGAGACACACCGTGTCCTGCTCTACTTCGTGGGATGCTCTG
GTGGAGTTGCGGGTCTCCGTGTAGCCAAAGACATAGCCGAGAACAATCCGGGGAGTAGAG
TCTTGCTCGCCACGTCTGAGACGACTATCATTGGGTTCAAACCTCCGAGTGCTGATAGAC
CGTATGATCTTGTTGGGGTCG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2C883JQ 795 0 0
ATAGCCGAGAACAATCCGGGGAGTAGAGTCTTGCTCGCCACGTCTGAGACGACTATCATT
GGGTTCAAACCTCCGAGTGCTGATAGACCGTATGATCTTGTTGGGGTCGCATTGTTTGGT
GATGGAGCCGGAGCTATGATCATCGGATCCGATCCAGATCCGATTCATGAGAAGCCTCTC
TTTGAGCTCCACACAGCAATTCAGAACTTCCTTCCTGACACGGAGAAGACGATAGATGGG
AAGCTAACGGAACAAGGGATAAACTTCACGCTGTCTAGAGAGCTTCCACAGATAATAGAA
GACAACGTGGAGAGTTTCTGCAAGAAGCTAATAGCAAAAGCAGGACTGGCTTATGAAGAC
TATAACCAAATGTTCTGGGCGGTTCATCCAGGTGGACCCGCCATTTTGAACAGGATGGAG
AAGCGGCTTAACCTATCGCCAGAGAAGCTGAGTCCAAGCAGGAGAGCTCTAATGGACTAT
GGCAACGCAAGTAGCAACTCGATCGTTTATGTGTTGGAGTATATGTTGGAGGAGAGCAGG
AAAGCCAGGAACATGAATGAGGGTGGAAACGAGTGGGGTCTGATTCTTGCTTTTGGACCT
GGTGTTACATTTGAAGGCATCGTTGCTCGAAACCTTGACGTTTGAGCGAAAAAGTAATGG
GGGTTTTGGTATTACCTTGAAGCTCAAGAAATGGGGTTTGGTGATAACTAAGGGCTCAAG
AAAAAACCGTCTTCTGTTATACAGTCATTACACCAGAGAGAAAATCATATAATAATAAGA
CTTGGAAGCTAAACC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

CO CL5372Contig1 1118 2 2 U
GGGAGGAGGCACAAGGTTATGGGATTCGTCGGTATTCAGACCGGATTCGGATCGGTTGGT
AGGAGACAAGCACTTCGAAAGACGTGGATGCCGTCAGATCCAGAAGGACTTCGACGCTTG
GAGGAATCTACGGGATTAGCCATTAGGTTTGTGATAGGAAAGACCAAGAATGAGCAAAAA
ATGGCTGAGCTAAGAAGGGAGATCGCAGAGTATGATGACTTTGTACTGCTTGATGTAGAA
GAGGAGTACAGTAAGCTCCCTTACAAAACTTTGGCTTTCTTCAAAGCTGCGTATGGGCTT
TACGATGCTGAGTTCTATGTCAAAGCTGATGATGATATTTACTTGAGGCCAGATCGACTC
TCTCTGCTGTTGGCTAAAGAGCGGAGTCACTCTCAAACATACCTAGGATGCTTGAAGAAG
GGTCCAGTTTTCACAGATCCTAAGCTCAAATGGTATGAACCATTGTCTCATCTGCTGGGA
AAAGAATATTTTCTTCATGCTTATGGCCCCATCTATGCTCTCTCTTCTGATGTCGTAGCA
AGTTTGGTTGCCCTCAAGAATAACAGTTTCAGGATGTTTAACAACGAGGACGTAACAATA
GGTGCGTGGATGCTAGCAATGAACGTCAACCACGAGAATCATCACATACTTTGCGAACCA
GAATGTTCTCCTTCCTCTGTTGCTGTTTGGGACATCCCCAAATGCTCAGGTCTTTGTAAT
CCAGAGAAGAGAATGTTGGAACTTCACAAGCAAGAAAGCTGTTCGAAAAGCCCAACTTTG
CCATCAGATGATGAGTGATCTTTTGCCACTTTTTCGACTCATACCCGCAGCAAGATTGCT
TCACAGAGATTGCTCTGTTCTTTGGTTTTGTCTCCAATCTTAGAAGAGCGAAAGTTTTGG
TTTTCTTTTGTTCATTGAGGAAAAAAAGGTGGAGGATTTTTTTGTCAGAGCCAGTATAAT
CTTAGTATATAGACTCATATACAATGTGTGTGATCGATTTTGTTTGTTTTTTCCTTTCGT
TAACATCAAAGACGAAATGATAATTAAACAGAGTAATAGTAGTAACTTCAAAAGACCCAA
TAAAATGAAAAGAAAAAAATTATACTCCCCAATTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B209TF U 1
AF RR2B209JQ C 471
BS 1 806 RR2B209TF
BS 807 1118 RR2B209JQ

RD RR2B209TF 806 0 0
GGGAGGAGGCACAAGGTTATGGGATTCGTCGGTATTCAGACCGGATTCGGATCGGTTGGT
AGGAGACAAGCACTTCGAAAGACGTGGATGCCGTCAGATCCAGAAGGACTTCGACGCTTG
GAGGAATCTACGGGATTAGCCATTAGGTTTGTGATAGGAAAGACCAAGAATGAGCAAAAA
ATGGCTGAGCTAAGAAGGGAGATCGCAGAGTATGATGACTTTGTACTGCTTGATGTAGAA
GAGGAGTACAGTAAGCTCCCTTACAAAACTTTGGCTTTCTTCAAAGCTGCGTATGGGCTT
TACGATGCTGAGTTCTATGTCAAAGCTGATGATGATATTTACTTGAGGCCAGATCGACTC
TCTCTGCTGTTGGCTAAAGAGCGGAGTCACTCTCAAACATACCTAGGATGCTTGAAGAAG
GGTCCAGTTTTCACAGATCCTAAGCTCAAATGGTATGAACCATTGTCTCATCTGCTGGGA
AAAGAATATTTTCTTCATGCTTATGGCCCCATCTATGCTCTCTCTTCTGATGTCGTAGCA
AGTTTGGTTGCCCTCAAGAATAACAGTTTCAGGATGTTTAACAACGAGGACGTAACAATA
GGTGCGTGGATGCTAGCAATGAACGTCAACCACGAGAATCATCACATACTTTGCGAACCA
GAATGTTCTCCTTCCTCTGTTGCTGTTTGGGACATCCCCAAATGCTCAGGTCTTTGTAAT
CCAGAGAAGAGAATGTTGGAACTTCACAAGCAAGAAAGCTGTTCGAAAAGCCCAACTTTG
CCATCAGATGATGAGTGATCTTTTGC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2B209JQ 648 0 0
TCTGCTGGGAAAAGAATATTTTCTTCATGCTTATGGCCCCATCTATGCTCTCTCTTCTGA
TGTCGTAGCAAGTTTGGTTGCCCTCAAGAATAACAGTTTCAGGATGTTTAACAACGAGGA
CGTAACAATAGGTGCGTGGATGCTAGCAATGAACGTCAACCACGAGAATCATCACATACT
TTGCGAACCAGAATGTTCTCCTTCCTCTGTTGCTGTTTGGGACATCCCCAAATGCTCAGG
TCTTTGTAATCCAGAGAAGAGAATGTTGGAACTTCACAAGCAAGAAAGCTGTTCGAAAAG
CCCAACTTTGCCATCAGATGATGAGTGATCTTTTGCCACTTTTTCGACTCATACCCGCAG
CAAGATTGCTTCACAGAGATTGCTCTGTTCTTTGGTTTTGTCTCCAATCTTAGAAGAGCG
AAAGTTTTGGTTTTCTTTTGTTCATTGAGGAAAAAAAGGTGGAGGATTTTTTTGTCAGAG
CCAGTATAATCTTAGTATATAGACTCATATACAATGTGTGTGATCGATTTTGTTTGTTTT
TTCCTTTCGTTAACATCAAAGACGAAATGATAATTAAACAGAGTAATAGTAGTAACTTCA
AAAGACCCAATAAAATGAAAAGAAAAAAATTATACTCCCCAATTTTAC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL5373Contig1 1065 2 2 U
GGATTCAAGACAAAGAGTCTCTCAAGACAAAGCGTTTTTGAGCTTTGGATCACTCACACT
ACTTTTATGGAGGGGGCTCTTCAATTTTCCAGCCGTTTCTCGGTGAATAATAGAATTCCG
TGTACTCAGAATAGGACGAGGAGTGGAGCAAGCAGGGCTACTACGCTTCGTTCTGCGTTC
ACCGGAACCAGCAATTCAGCTTCTCTCTCTTCTAAGGATACCTCCACGAGGGAGATATGG
AGTTGGGTGAAATCGAAGACAGTTGGGCATGGAAGATACAGGAGGAGTCAAGTGAGGGCG
GAGATGTTTGGTCAATTGACTAGTGGACTCGAGGCTGCTTGGACCAAACTCAAAGGAGAA
GATGTCATGACGAAGGAGAATATTGCTGAGCCAATGAGGGATATCAGAAGAGCTCTCCTT
GAAGCAGGTTAGTGAGGAGAAGACTGCAATAGATGAGAAAAAGGAATCCTCAACTGCTGA
TAAGGAATCTCAAACCACCGGTGATGCCAAGGTTGATGAGAATGGGTCAGTTGCTAAAAC
AGTTGGTGTGGTTGCAAATGGTTGCTAGGTTAGTCCGTGTAGCTCACGGCTTGAGCATTA
GAGGCAACAAGAGAGCAGAAGATAACATTCCCGTTTACATTTTCTCTTGAGAACAAAGTA
GTGCTGTGAGCTTTGAAGCATGGAGGGAAGGAGCTTTAGTACCTGAGATCCGCTTCTTTA
CCCTTTAGAAGTTCAAATCCATAGTTATTTTTTTCAATCTTTTCGTTTTCTCATTTTCCC
CTCGTCTTCACAGTTTTCAGATTTTTTTTACCTTTTTTCAATTTTCAGTTGATCCTCCTA
CCCTGTAAAAATGCTTATAGGACCTAGAGAAAAGGACACAACAGCAGGGTGGGATTTGTT
TTCATTTCTCTTGGATTTTAGGCAGTTTTTTTGTTTTTTTGTTCTTCTGTTTCTTGTTTT
TGGTTCAGAATTGACTCTGTTTTGAGTTTCTTTATTTGTTTGAGACTTGGCCTTTGCCTC
TTTTCACCTTTCTTGCTTTGGAAGTTAATTGAATCATTCCAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR33TF U 1
AF RR2AR33JQ C 321
BS 1 684 RR2AR33TF
BS 685 1065 RR2AR33JQ

RD RR2AR33TF 684 0 0
GGATTCAAGACAAAGAGTCTCTCAAGACAAAGCGTTTTTGAGCTTTGGATCACTCACACT
ACTTTTATGGAGGGGGCTCTTCAATTTTCCAGCCGTTTCTCGGTGAATAATAGAATTCCG
TGTACTCAGAATAGGACGAGGAGTGGAGCAAGCAGGGCTACTACGCTTCGTTCTGCGTTC
ACCGGAACCAGCAATTCAGCTTCTCTCTCTTCTAAGGATACCTCCACGAGGGAGATATGG
AGTTGGGTGAAATCGAAGACAGTTGGGCATGGAAGATACAGGAGGAGTCAAGTGAGGGCG
GAGATGTTTGGTCAATTGACTAGTGGACTCGAGGCTGCTTGGACCAAACTCAAAGGAGAA
GATGTCATGACGAAGGAGAATATTGCTGAGCCAATGAGGGATATCAGAAGAGCTCTCCTT
GAAGCAGGTTAGTGAGGAGAAGACTGCAATAGATGAGAAAAAGGAATCCTCAACTGCTGA
TAAGGAATCTCAAACCACCGGTGATGCCAAGGTTGATGAGAATGGGTCAGTTGCTAAAAC
AGTTGGTGTGGTTGCAAATGGTTGCTAGGTTAGTCCGTGTAGCTCACGGCTTGAGCATTA
GAGGCAACAAGAGAGCAGAAGATAACATTCCCGTTTACATTTTCTCTTGAGAACAAAGTA
GTGCTGTGAGCTTTGAAGCATGGA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2AR33JQ 745 0 0
TAGTGGACTCGAGGCTGCTTGGACCAAACTCAAAGGAGAAGATGTCATGACGAAGGAGAA
TATTGCTGAGCCAATGAGGGATATCAGAAGAGCTCTCCTTGAAGCAGGTTAGTGAGGAGA
AGACTGCAATAGATGAGAAAAAGGAATCCTCAACTGCTGATAAGGAATCTCAAACCACCG
GTGATGCCAAGGTTGATGAGAATGGGTCAGTTGCTAAAACAGTTGGTGTGGTTGCAAATG
GTTGCTAGGTTAGTCCGTGTAGCTCACGGCTTGAGCATTAGAGGCAACAAGAGAGCAGAA
GATAACATTCCCGTTTACATTTTTTCTTGAGAACAAGGTAGTGCTGTGAGCTTTGAAGCA
TGGAGGGAAGGAGCTTTAGTACCTGAGATCCGCTTCTTTACCCTTTAGAAGTTCAAATCC
ATAGTTATTTTTTTCAATCTTTTCGTTTTCTCATTTTCCCCTCGTCTTCACAGTTTTCAG
ATTTTTTTTACCTTTTTTCAATTTTCAGTTGATCCTCCTACCCTGTAAAAATGCTTATAG
GACCTAGAGAAAAGGACACAACAGCAGGGTGGGATTTGTTTTCATTTCTCTTGGATTTTA
GGCAGTTTTTTTGTTTTTTTGTTCTTCTGTTTCTTGTTTTTGGTTCAGAATTGACTCTGT
TTTGAGTTTCTTTATTTGTTTGAGACTTGGCCTTTGCCTCTTTTCACCTTTCTTGCTTTG
GAAGTTAATTGAATCATTCCAGTTT

QA 1 745 1 745
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5375Contig1 854 2 6 U
GTGGAAGATTCATACGGAACAGGATTTCCATCCATAAGAGGACTTCGAGGACAAAGCACC
CGTTATCTTCGAGATGTTTCCCGGTGGGCATATGACAAAGATGCAGAAATATTACGGCTT
GGCTATGTTAAGCCTGAAGTAGTTAGTTGGTCCCCTCGAATTATTGTGCTTCATAACTTT
CTTAGCTCAGAGGAATGTGAATACTTAAAAGCAATCGCTCGGCCTCGCCTTCAGGTCTCC
ACTGTTGTCGATATAAAAACTGGAAAGGGAGTTAAAAGTGATGTGAGGACAAGCTCTGGA
ATGTTTTTAACTCATGTAGAAAGAAGTTATCCAATGATACAGGCAATTGAAAAGCGAATT
GCAGTCTTCTCTCAAGTACCAGCGGAGAATGGAGACCTCATTCAAGTCCTAAGATATGAG
CCGGACCAATTTTACAGACCGCATCACGATTACTTTGGTGACACTTTCAATTTGAAGCGT
GGTTGTCAGCGCGTAGCAACAATGTTAATGTATTCAACAGATGACGTCGAAGGAGGAGAA
ACTTATTTCCCTTTGGCTGGTGACGGTGAATGCACTTGTGGTGGCAAAATCATGAAAGGC
ATCTCCGTGAAACCCACCAAAGGAAACGCAGTTCTCTTCTGGAGCATGGGACTTGGTGGA
CAGTCAGATCCTAATAGCATACATGGGGGATGTGAAGTCCTGTCTGGAGAGAAATGGTCA
GCTACCAAATGGATGAGACAAAAAGCTACTTCTCGAAGGACTCGAAAACTTATAAACCCA
AAGGAACCACATAGACTTATACTGAAAATGTTATAGAATTTTAGAGCTTTAGTATATTTT
TTTTTTGACCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G474TF U 1
AF RR2G474JQ C 367
BS 1 713 RR2G474TF
BS 714 714 RR2G474JQ
BS 715 743 RR2G474TF
BS 744 744 RR2G474JQ
BS 745 756 RR2G474TF
BS 757 854 RR2G474JQ

RD RR2G474TF 769 0 0
GTGGAAGATTCATACGGAACAGGATTTCCATCCATAAGAGGACTTCGAGGACAAAGCACC
CGTTATCTTCGAGATGTTTCCCGGTGGGCATATGACAAAGATGCAGAAATATTACGGCTT
GGCTATGTTAAGCCTGAAGTAGTTAGTTGGTCCCCTCGAATTATTGTGCTTCATAACTTT
CTTAGCTCAGAGGAATGTGAATACTTAAAAGCAATCGCTCGGCCTCGCCTTCAGGTCTCC
ACTGTTGTCGATATAAAAACTGGAAAGGGAGTTAAAAGTGATGTGAGGACAAGCTCTGGA
ATGTTTTTAACTCATGTAGAAAGAAGTTATCCAATGATACAGGCAATTGAAAAGCGAATT
GCAGTCTTCTCTCAAGTACCAGCGGAGAATGGAGACCTCATTCAAGTCCTAAGATATGAG
CCGGACCAATTTTACAGACCGCATCACGATTACTTTGGTGACACTTTCAATTTGAAGCGT
GGTTGTCAGCGCGTAGCAACAATGTTAATGTATTCAACAGATGACGTCGAAGGAGGAGAA
ACTTATTTCCCTTTGGCTGGTGACGGTGAATGCACTTGTGGTGGCAAAATCATGAAAGGC
ATCTCCGTGAAACCCACCAAAGGAAACGCAGTTCTCTTCTGGAGCATGGGACTTGGTGGA
CAGTCAGATCCTAATAGCATACATGGGGGATGTGAAGTCCTGTCTGGAGAGAA*TGGTCA
GCTACCAAATGGATGAGACAAAA*GCTACTTCTCGA
GACTCGAAACTTA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2G474JQ 488 0 0
TTCTTTCAAGTACCAGCGGAGAATGGAGACCTCATTCAAGTCCTAAGATATGAGCCGGAC
CAATTTTACAGACCGCATCACGATTACTTTGGTGACACTTTCAATTTGAAGGGTGGTTGT
CAGCGCGTAGCAACAATGTTAATGTATTCAACAGATGACGTCGAAGGAGGAGAAACTTAT
TTCCCTTTGGCTGGTGACGGTGAATGCACTTGTGGTGGCAAAATCATGAAAGGCATTTCC
GTGAAACCCACCAAAGGAAACGCAGTTTTTTTTTGGAGCATGGGACTTGGTGGACAGTCA
GATCCTAATAGCATACATGGGGGATGTGAAGTCCTGTTTGGAGAGAAATGGTCAGCTACC
AAATGGATGAGACAAAAAGCTACTTCTCGAAGGACTCGAAAACTTATAAACCCAAAGGAA
CCACATAGACTTATACTGAAAATGTTATAGAATTTTAGAGCTTTAGTATATTTTTTTTTT
GACCTTTG

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 2

CO CL5376Contig1 840 2 2 U
GGGAGAATCGTTCATCTTCATCATCTTCCTAATCCAAATCCCGAGTTAGTTTTCAATCCA
AGAAACTCGCCAAGAACTGGATACTCTGGCGGATTCAGAGACCAAGAACCGAGACGTGGT
TCTGAAGCTGTATGACGCCCTGAGATCTCGAGACGTCGAATCGGTTCACCGGATCCTAAC
CCCGGATCTCGACTACTGGTTCCACGGCCCTCCGCCGCACCAGTTTTTGATGCGCACGCT
CACCGGCGTCTCTCCTCCCTTCGAATTCGCGCCTCTCTCCGTCGTCTCCTTCGGATCCAC
CGTCATCGCCGAGGGCTGCGACGCCGCTAGCTCTGTCTCCTGGATCCACGCCTGGACCGT
GTCGCATGGGATAATCGCTCAGGTGAGGGAGTACTCGAACACTTCTCTCACCGTCACCCG
GATCGGTGGCGTCGTCGCCGGAAGGTCTGCCGAGATCGCGCGCTCGCACTGCCCCTCCGT
GTGGGAAAGCAAGTTCTCGGGTCGGGCGGGGAAATCCGTACCGGGTCTGGTTCTGGCGAT
TTGAGGATTTGTAAGGTAACAGCCACGTGGACTAATAACTAAATAAAGGCTGCTTACGTG
TCGGTATCTGGTTGGTTTTTCGTTTATGTGAGGATTTGTGCGGTTGAAGACGCGGCGTGT
GCTGCGTTTTGGCTGTCGCTAGTTCTTTATTTGTTTTTCTTTTTAATTTGCTTTATAATC
GTGCTTTTGTATTTTAGTGGCTACAGCGAGCATGGGGATACCCAAATTGGCTTGTGCCGT
TGTGTCTGATGTAACGTTTGGTTATGTTATAATTGAAATAAAAATGTGCGTTTGGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G249TF U 1
AF RR2G249JQ C 291
BS 1 645 RR2G249TF
BS 646 840 RR2G249JQ

RD RR2G249TF 645 0 0
GGGAGAATCGTTCATCTTCATCATCTTCCTAATCCAAATCCCGAGTTAGTTTTCAATCCA
AGAAACTCGCCAAGAACTGGATACTCTGGCGGATTCAGAGACCAAGAACCGAGACGTGGT
TCTGAAGCTGTATGACGCCCTGAGATCTCGAGACGTCGAATCGGTTCACCGGATCCTAAC
CCCGGATCTCGACTACTGGTTCCACGGCCCTCCGCCGCACCAGTTTTTGATGCGCACGCT
CACCGGCGTCTCTCCTCCCTTCGAATTCGCGCCTCTCTCCGTCGTCTCCTTCGGATCCAC
CGTCATCGCCGAGGGCTGCGACGCCGCTAGCTCTGTCTCCTGGATCCACGCCTGGACCGT
GTCGCATGGGATAATCGCTCAGGTGAGGGAGTACTCGAACACTTCTCTCACCGTCACCCG
GATCGGTGGCGTCGTCGCCGGAAGGTCTGCCGAGATCGCGCGCTCGCACTGCCCCTCCGT
GTGGGAAAGCAAGTTCTCGGGTCGGGCGGGGAAATCCGTACCGGGTCTGGTTCTGGCGAT
TTGAGGATTTGTAAGGTAACAGCCACGTGGACTAATAACTAAATAAAGGCTGCTTACGTG
TCGGTATCTGGTTGGTTTTTCGTTTATGTGAGGATTTGTGCGGTT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2G249JQ 550 0 0
TCGGATCCACCGTCATCGCCGAGGGCTGCGACGCCGCTAGCTCTGTCTCCTGGATCCACG
CCTGGACCGTGTCGCATGGGATAATCGCTCAGGTGAGGGAGTACTCGAACACTTCTCTCA
CCGTCACCCGGATCGGTGGCGTCGTCGCCGGAAGGTCTGCCGAGATCGCGCGCTCGCACT
GCCCCTCCGTGTGGGAAAGCAAGTTCTCGGGTCGGGCGGGGAAATCCGTACCGGGTCTGG
TTCTGGCGATTTGAGGATTTGTAAGGTAACAGCCACGTGGACTAATAACTAAATAAAGGC
TGCTTACGTGTCGGTATCTGGTTGGTTTTTCGTTTATGTGAGGATTTGTGCGGTTGAAGA
CGCGGCGTGTGCTGCGTTTTGGCTGTCGCTAGTTCTTTATTTGTTTTTCTTTTTAATTTG
CTTTATAATCGTGCTTTTGTATTTTAGTGGCTACAGCGAGCATGGGGATACCCAAATTGG
CTTGTGCCGTTGTGTCTGATGTAACGTTTGGTTATGTTATAATTGAAATAAAAATGTGCG
TTTGGGATCC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

CO CL5377Contig1 1410 2 2 U
GGGCCTCAAGCAAATAGAGCTTATCACACCAAACTTCTCTCATCAATCTAAAGAGAGTAA
AGCAGAGATCCTCTATACATAAACATAGATACATAATTGTTTTATATAACTACAGATATA
GTATCTATATAGAGAAGTAACAAATAATCAACAAACAAAGATGAAAGGTGGAGGAAGCAA
TTGTGGGAGCTTGGAGAAAATTAAACCGATATTAGCGATAATATCATTGCAATTTGGGTA
TGCAGGCATGTACATCATTACCATGGTGTCTTTCAAGCATGGCATGGACCATTGGGTCCT
AGCCACATACCGTCATATCGTCGCCACGTTGGTCATGGCTCCCTTTGCTCTGGTTTTTGA
GAGGAAAATTAGGCCGAAGATGACACTACCAATATTCTATAGGCTTCTTGCTCTTGGAAT
ACTAGAGCCCCTCATGGACCAGAACTTCTACTACATAGGATTAAAGTCCACGTCGGCATC
GTACACTTCTGCCTTTACGAATGCACTTCCCGCAGTCACGTTTATTCTCGCCCTCATTTT
CAGGCTTGAGACAGTGAACTTTAGAAAGATACATAGTGTTGCAAAAGTGGTAGGAACGGT
AATAACGTTGGCAGGAGCAATGGTGATGACTTTGTACAAAGGTCCAGCCATAGAGATCGT
GAAAGCTGCACATTCTTCCTTCCACGGTGGCTCCAATACGGCCACCGGCCAGCACTGGGT
CACCGGAACTTTAGCCATCATGGGAAGTATCTCCACTTGGGCTGCTTTCTTTATTTTACA
GTCGTTCACATTGAAAATTTATCCGGCTGAGTTATCCCTCGTGACGTTGATATGTGGGAT
TGGATCGATCCTAAACTTCGGCGTTTCGATGATATTTGTCCGCGACTTGAGCGCCTGGAA
AATCGGCATGGACTCTGGCACACTGGCCGCAGTTTACTCTGGAGTGGTTTGTTCGGGCAT
TGCTTATTACATACAAAGCATTGTGATTAAGCAACGTGGCCCCGTGTTTACGACGTCGTT
TAGTCCTATGTGTATGGTCATTACAGCTTTCCTCGGTGCCCTTGTTTTGGCTGAGAAAAT
CCACCTCGGAAGTATAATCGGGGCAATTTTCATCGTCATTGGACTATATAGTGTAGTATG
GGGAAAAAGTAAAGACGTGGTGAATCCATTGGATGAGAAAATCGTTGTAGCTCAAGAGCT
TCCGATCACTAACTCAGTCAAACAAACGAACGGTCATGATGCCTCGGGAGCACAAGTTAA
TGGCGTGGCTACAAGTATCTAATCAGTCCCGAAGAAAAAGAAAGATACAGAGACAAAGAT
GCATCTCCTTTGGGGTTGAAATTTTGATATCTTTCTTGTTGTTTTTGTGTTTTCTTCTTT
GTGTCTTTTTACGTTCTCTAATATTGCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A638TF U 1
AF RR2A638JQ C 588
BS 1 696 RR2A638TF
BS 697 1410 RR2A638JQ

RD RR2A638TF 696 0 0
GGGCCTCAAGCAAATAGAGCTTATCACACCAAACTTCTCTCATCAATCTAAAGAGAGTAA
AGCAGAGATCCTCTATACATAAACATAGATACATAATTGTTTTATATAACTACAGATATA
GTATCTATATAGAGAAGTAACAAATAATCAACAAACAAAGATGAAAGGTGGAGGAAGCAA
TTGTGGGAGCTTGGAGAAAATTAAACCGATATTAGCGATAATATCATTGCAATTTGGGTA
TGCAGGCATGTACATCATTACCATGGTGTCTTTCAAGCATGGCATGGACCATTGGGTCCT
AGCCACATACCGTCATATCGTCGCCACGTTGGTCATGGCTCCCTTTGCTCTGGTTTTTGA
GAGGAAAATTAGGCCGAAGATGACACTACCAATATTCTATAGGCTTCTTGCTCTTGGAAT
ACTAGAGCCCCTCATGGACCAGAACTTCTACTACATAGGATTAAAGTCCACGTCGGCATC
GTACACTTCTGCCTTTACGAATGCACTTCCCGCAGTCACGTTTATTCTCGCCCTCATTTT
CAGGCTTGAGACAGTGAACTTTAGAAAGATACATAGTGTTGCAAAAGTGGTAGGAACGGT
AATAACGTTGGCAGGAGCAATGGTGATGACTTTGTACAAAGGTCCAGCCATAGAGATCGT
GAAAGCTGCACATTCTTCCTTCCACGGTGGCTCCAA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2A638JQ 823 0 0
TGGTAGGAACGGTAATAACGTTGGCAGGAGCAATGGTGATGACTTTGTACAAAGGTCCAG
CCATAGAGATCGTGAAAGCTGCACATTCTTCCTTCCACGGTGGCTCCAATACGGCCACCG
GCCAGCACTGGGTCACCGGAACTTTAGCCATCATGGGAAGTATCTCCACTTGGGCTGCTT
TCTTTATTTTACAGTCGTTCACATTGAAAATTTATCCGGCTGAGTTATCCCTCGTGACGT
TGATATGTGGGATTGGATCGATCCTAAACTTCGGCGTTTCGATGATATTTGTCCGCGACT
TGAGCGCCTGGAAAATCGGCATGGACTCTGGCACACTGGCCGCAGTTTACTCTGGAGTGG
TTTGTTCGGGCATTGCTTATTACATACAAAGCATTGTGATTAAGCAACGTGGCCCCGTGT
TTACGACGTCGTTTAGTCCTATGTGTATGGTCATTACAGCTTTCCTCGGTGCCCTTGTTT
TGGCTGAGAAAATCCACCTCGGAAGTATAATCGGGGCAATTTTCATCGTCATTGGACTAT
ATAGTGTAGTATGGGGAAAAAGTAAAGACGTGGTGAATCCATTGGATGAGAAAATCGTTG
TAGCTCAAGAGCTTCCGATCACTAACTCAGTCAAACAAACGAACGGTCATGATGCCTCGG
GAGCACAAGTTAATGGCGTGGCTACAAGTATCTAATCAGTCCCGAAGAAAAAGAAAGATA
CAGAGACAAAGATGCATCTCCTTTGGGGTTGAAATTTTGATATCTTTCTTGTTGTTTTTG
TGTTTTCTTCTTTGTGTCTTTTTACGTTCTCTAATATTGCCCT

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL5378Contig1 880 2 6 U
GGATCACAGCTTACTCTTTTCTTTATTCATTACTTCCACAAAACCCAGAAAAAGAAAGTC
GTAAGATAGTCGTTTCACGGCGTGATCTGATCAGTTAGACTTTATTGATCAGCTAATAAA
GATCAAAACTTTCTTCCAACTCCACCTTGATCTCTCCGCAGCTATCTTTCTTCCTCGTTG
GCTCCGTTAAACCCTAAAATTGGAATCTCTCATCCTGCACGCTAAACACCTGCCCACTCT
TCTTATCCTTTTGTTTTCTTCAGACATTAAAGCTTGGAAACGAACTACTGATTCTTTTAA
GGTTAGAAGTTGACTGATTTTGTTTGGACAAGTTGATCACGCCCTGAAGGTGTTTGATAA
AATGGCTCAGTCAGTTGGTCCAAGACTCTACAGTTGCTGTAACTGCAGGAACCATGTGGG
ACTTCACGATGATATCATCTCTAAGGCTTTTCAGGGAAGAACCGGGAGAGCCTTCCTCTT
CTCCCACGCAATGAACATTGTGGTTGGGCCTAAAGAAGACCGGCACCTTCTAACGGGTCT
CCACACCGTGGCTGACATATCTTGTGCTGACTGCAATGAACCCTTGGGCTGGAAGTACGA
GCGAGCCTACGAGAGCTCACAAAAGTACAAGGAGGGCAAGTTCATATTCGAAAAGGCTAA
GATTGTCAAGGAAGAGGATTGGTAGTGAAAGCCAACATGTTGAATTCATTATTGGATTGA
CTCAAAACTGTACATAGACAAAAAAAACTTGGCTTTGTCGATTCCAATCTTTATGGATTT
CACAAGATTTCGTCATCATCCTCCATTTTCCTGTCTCTCTCTGCATGTTGTTAAATAATG
TCAGTGTCCTGTGTTTAAGTGAATGCTTGTATATTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW54TF U 1
AF RR2FW54JQ C 292
BS 1 631 RR2FW54TF
BS 632 632 RR2FW54JQ
BS 633 655 RR2FW54TF
BS 656 656 RR2FW54JQ
BS 657 666 RR2FW54TF
BS 667 880 RR2FW54JQ

RD RR2FW54TF 666 0 0
GGATCACAGCTTACTCTTTTCTTTATTCATTACTTCCACAAAACCCAGAAAAAGAAAGTC
GTAAGATAGTCGTTTCACGGCGTGATCTGATCAGTTAGACTTTATTGATCAGCTAATAAA
GATCAAAACTTTCTTCCAACTCCACCTTGATCTCTCCGCAGCTATCTTTCTTCCTCGTTG
GCTCCGTTAAACCCTAAAATTGGAATCTCTCATCCTGCACGCTAAACACCTGCCCACTCT
TCTTATCCTTTTGTTTTCTTCAGACATTAAAGCTTGGAAACGAACTACTGATTCTTTTAA
GGTTAGAAGTTGACTGATTTTGTTTGGACAAGTTGATCACGCCCTGAAGGTGTTTGATAA
AATGGCTCAGTCAGTTGGTCCAAGACTCTACAGTTGCTGTAACTGCAGGAACCATGTGGG
ACTTCACGATGATATCATCTCTAAGGCTTTTCAGGGAAGAACCGGGAGAGCCTTCCTCTT
CTCCCACGCAATGAACATTGTGGTTGGGCCTAAAGAAGACCGGCACCTTCTAACGGGTCT
CCACACCGTGGCTGACATATCTTGTGCTGACTGCAATGAACCCTTGGGCTGGAAGTACGA
GCGAGCCTACGAGAGCTCACAAAAGTACAAG*AGGGCAAGTTCATATTCGAAAAG*CTAA
GATTGT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2FW54JQ 589 0 0
TTCTTTTAAGGTTAGAAGTTGACTGATTTTGTTTGGACAAGTTGATCACGCCCTGAAGGT
GTTTGATAAAATGGCTCAGTCAGTTGGTCCAAGACTCTACAGTTGCTGTAACTGCAGGAA
CCATGTGGGACTTCACGATGATATCATCTTTAAGGCTTTTCAGGGAAGAACCGGGAGAGC
CTTCCTTTTTTCCCACGCAATGAACATTGTGGTTGGGCCTAAAGAAGACCGGCACCTTCT
AACGGGTCTCCACACCGTGGCTGACATATCTTGTGCTGACTGCAATGAACCCTTGGGCTG
GAAGTACGAGCGAGCCTACGAGAGCTCACAAAAGTACAAGGAGGGCAAGTTCATATTCGA
AAAGGCTAAGATTGTCAAGGAAGAGGATTGGTAGTGAAAGCCAACATGTTGAATTCATTA
TTGGATTGACTCAAAACTGTACATAGACAAAAAAAACTTGGCTTTGTCGATTCCAATCTT
TATGGATTTCACAAGATTTCGTCATCATCCTCCATTTTCCTGTCTCTCTCTGCATGTTGT
TAAATAATGTCAGTGTCCTGTGTTTAAGTGAATGCTTGTATATTTTACC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL5379Contig1 1287 2 6 U
GGAGGGTTCATCCGATTAGGTCAAATCGAATCGCGAGATTTCACCACATCTTGATCTGAA
TTTAGAAAGATGTCTCAGAACGGGAAGCTGGTCCCACCAAACATGGATCAGAACAGTACG
AGGCTCCTCAATCTCACAGTTCTCCAGCGAATCGATCCTTTCATAGAGGAGATCCTTATC
ACAGCAGCTCACGTCACCTTCTATGAATTCAACATTGAGATTAGTCAATGGAGTCGTAAG
GATGTTGAAGGGTCTTTGTTTGTTGTCAAAAGAAACAAACAACAACCTCGGTTTCAGTTT
ATTGTGATGAATCGTCGGAATACAGATAATCTGGTGGAAGATCTCCTGGGAGATTTTGAG
TACGAAGTCCAAGGTCCATATTTACTTTACCGTAACGCATCTCAAGAAGTAAATGGCATT
TGGTTCTACAATGAACGTGAATGTGAGGAGGTTGCACGTCTTTTCGACAGATTACTTAGC
GCCTATTCCAAGGCAAACCAGAAGCCAAATACCTCACCTTCGAAAAGCGAGTTTGAGAAA
TTGGAAGCTGTGCCTACAATGGCGGCTATGGATGGTCCTCTTGAACCATCTTTAACTGCT
AGAGATGCCCCTAATGATCCTGCTTTTGTCAACTTCTTTAGCTCAGCGTTGGCTCTTGCG
AACACTTCGAGTGGGACTTCAAGTGGACCACCATACCAATCATCAGCAACTCCTCACCAA
CCTCCACAGAAAATATCACCACAGCCTCTGCAATCATCCTCTCCTATTATGCCTCGCTTT
GAGAACAACCCTAATCTTATCAGTAAAAACTCCAACGTTCAGACCGATCTGGTGACGCCG
TCCTCGTTCTTTGCACCCCCACGGAAGATGACACAACCACACCTTATTCCTAGTTCATCT
ACCCCCACTGCGCCTCCTCTGAACTTTAATAATGCGACTCACCATCAGCGTCAGCATGGT
ACTCCGATGCTCCAGCCTTTCCCACCACCAAATCCACCACCCTCACTCGCTCCTCCTGCA
CACAGTGTCCCAGTTATCAACAGAGACAAAGTCAAACAAGCCCTTTTGACGCTGGTTCAG
GAGAATGAATTCATCGACATGGTGATCCGAGCCTTACAAAATGCACATCAACCATGAAGC
TTAGTAGGGTTGGGCGTGGGAACAGTGGCGGTTTGGTTTAGAATGTGTAGTTAAAACGTA
GTTTAGTTCTCTTTGATACCACCTTTGAACAAAGTCTTGTCAGAACCTCTAACAGGAAGT
TATAAAAGAGACTTGCATTGCTCCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB26TF U 1
AF RR2FB26JQ C 624
BS 1 717 RR2FB26TF
BS 718 718 RR2FB26JQ
BS 719 763 RR2FB26TF
BS 764 764 RR2FB26JQ
BS 765 779 RR2FB26TF
BS 780 1287 RR2FB26JQ

RD RR2FB26TF 779 0 0
GGAGGGTTCATCCGATTAGGTCAAATCGAATCGCGAGATTTCACCACATCTTGATCTGAA
TTTAGAAAGATGTCTCAGAACGGGAAGCTGGTCCCACCAAACATGGATCAGAACAGTACG
AGGCTCCTCAATCTCACAGTTCTCCAGCGAATCGATCCTTTCATAGAGGAGATCCTTATC
ACAGCAGCTCACGTCACCTTCTATGAATTCAACATTGAGATTAGTCAATGGAGTCGTAAG
GATGTTGAAGGGTCTTTGTTTGTTGTCAAAAGAAACAAACAACAACCTCGGTTTCAGTTT
ATTGTGATGAATCGTCGGAATACAGATAATCTGGTGGAAGATCTCCTGGGAGATTTTGAG
TACGAAGTCCAAGGTCCATATTTACTTTACCGTAACGCATCTCAAGAAGTAAATGGCATT
TGGTTCTACAATGAACGTGAATGTGAGGAGGTTGCACGTCTTTTCGACAGATTACTTAGC
GCCTATTCCAAGGCAAACCAGAAGCCAAATACCTCACCTTCGAAAAGCGAGTTTGAGAAA
TTGGAAGCTGTGCCTACAATGGCGGCTATGGATGGTCCTCTTGAACCATCTTTAACTGCT
AGAGATGCCCCTAATGATCCTGCTTTTGTCAACTTCTTTAGCTCAGCGTTGGCTCTTGCG
AACACTTCGAGTGGGACTTCAAGTGGACCACCATACCAATCATCAGCAACTCCTCAC*AA
CCTCCACAGAAAATATCACCACAGCCTCTGCAATCATCCTCTC*TATTATGCCTCGCTT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2FB26JQ 664 0 0
TTTTGTCAACTTCTTTAGCTCAGCGTTGGCTCTTGCGAACACTTCGAGTGGGACTTCAAG
TGGACCACCATACCAATCATCAGCAACTCCTCACCAACCTCCACAGAAAATATCACCACA
GCCTCTGCAATCATCCTCTCCTATTATGCCTCGCTTTGAGAACAACCCTAATCTTATCAG
TAAAAACTCCAACGTTCAGACCGATCTGGTGACGCCGTCCTCGTTCTTTGCACCCCCACG
GAAGATGACACAACCACACCTTATTCCTAGTTCATCTACCCCCACTGCGCCTCCTCTGAA
CTTTAATAATGCGACTCACCATCAGCGTCAGCATGGTACTCCGATGCTCCAGCCTTTCCC
ACCACCAAATCCACCACCCTCACTCGCTCCTCCTGCACACAGTGTCCCAGTTATCAACAG
AGACAAAGTCAAACAAGCCCTTTTGACGCTGGTTCAGGAGAATGAATTCATCGACATGGT
GATCCGAGCCTTACAAAATGCACATCAACCATGAAGCTTAGTAGGGTTGGGCGTGGGAAC
AGTGGCGGTTTGGTTTAGAATGTGTAGTTAAAACGTAGTTTAGTTCTCTTTGATACCACC
TTTGAACAAAGTCTTGTCAGAACCTCTAACAGGAAGTTATAAAAGAGACTTGCATTGCTC
CCTC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL5380Contig1 361 2 1 U
GGAAAACACTATCATTTCATTAGCAAAGATGAAAAACACGTTTAAACGTTTGCTTATTGG
TTTTGTTATGCTCACAATTCTTCTGTTCGGAGAAACGGTGATTGCTCAGAAAGGAAAACC
ATGTCATTCAGAATTGCCGGACAAAACATGTGAAACCAAGCGCTGCAAAGCTCACTGTGC
CAAAGAACATAAGAAAATACTGCTGAATCTTAGCGGGTGCCTTAAAAAAGTAAACGGAGA
AGTGTTTTGCCGATGTCAATATTTTTGCCCTCCCTAATTTTTTTATCTACACTAGAACTC
AAATAATATTTATAAGAATACTACAACTTTGTCAAAGAAATGAATAAAACTTTTAATAAT
T


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2H407JQB C 1
AF RR2H407TF U 1
BS 1 361 RR2H407TF

RD RR2H407JQB 361 0 0
GGAAAACACTATCATTTCATTAGCAAAGATGAAAAACACGTTTAAACGTTTGCTTATTGG
TTTTGTTATGCTCACAATTTTTCTGTTCGGAGAAACGGTGATTGCTCAGAAAGGAAAACC
ATGTCATTCAGAATTGCCGGACAAAACATGTGAAACCAAGCGCTGCAAAGCTCACTGTGC
CAAAGAACATAAGAAAATACTGCTGAATTTTAGCGGGTGCCTTAAAAAAGTAAACGGAGA
AGTGTTTTGCCGATGTCAATATTTTTGCCCTCCCTAATTTTTTTATTTACACTAGAACTC
AAATAATATTTATAAGAATACTACAACTTTGTCAAAGAAATGAATAAAACTTTTAATAAT
T

QA 1 361 1 361
DS 

RD RR2H407TF 361 0 0
GGAAAACACTATCATTTCATTAGCAAAGATGAAAAACACGTTTAAACGTTTGCTTATTGG
TTTTGTTATGCTCACAATTCTTCTGTTCGGAGAAACGGTGATTGCTCAGAAAGGAAAACC
ATGTCATTCAGAATTGCCGGACAAAACATGTGAAACCAAGCGCTGCAAAGCTCACTGTGC
CAAAGAACATAAGAAAATACTGCTGAATCTTAGCGGGTGCCTTAAAAAAGTAAACGGAGA
AGTGTTTTGCCGATGTCAATATTTTTGCCCTCCCTAATTTTTTTATCTACACTAGAACTC
AAATAATATTTATAAGAATACTACAACTTTGTCAAAGAAATGAATAAAACTTTTAATAAT
T

QA 1 361 1 361
DS 



AS 1 2

CO CL5381Contig1 724 2 3 U
GGGAAGCACGAGGGAGGCAACTGGGAGGGAGCTAACTCACGAAGTCTGCGTTGTCAAGAT
TCCGGAGGAAACACCTCAGCCCCAAACACATTGACTTTTTCTCATTTTCCAGATTAAAAC
CTTTGGAAGAAGAAGTCGTTTCGTTATCATTCGACAATGGCGGAGAACGTTGGGATTCTG
GCTATGGACATCTATTTTCCTCCTACCTGTGTTCAACAGGAAGCTTTGGAAGCTCATGAT
GGAGCAAGCAAAGGCAAATACACCATTGGTCTTGGCCAAGATTGTCTAGCTTTCTGCACT
GAGCTTGAAGATGTTATCTCAATGAGTTTCAATGCGGTGACATCTCTTCTAGAAAAGTAT
AAGATCGACCCCAAGCAAATTGGGCGACTTGAAGTAGGAAGTGAGACTGTCATTGACAAA
AGCAAGTCCATCAAAACCTTCTTGATGCAACTCTTTGAGAAATGTGGAAACACTGATGTG
GAAGGTGTTGACTCGACCAATGCTTGTTACGGTGGAAACAGCGGCGGTGGTGGTGGTGGC
TGGTGATCAAAGATGATTTGGTTGTCTGATTCTGCTATCTGTTTGGTTTAGATTTGGTTC
CGTATCCATGTTTCTCTGGTTTGGTTATGTTTCTGGTTTTTTGGTTCTACATGATGTAAC
AGATCGTTTAAATGTCATCTTTGCCTAAAACGAAATGTTAGATTCGCGTGTTGTGTTTCA
CTTG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2C064TF U 2
AF RR2C064JQ C 1
BS 1 4 RR2C064JQ
BS 5 362 RR2C064TF
BS 363 724 RR2C064JQ

RD RR2C064TF 361 0 0
GGG
AGCACGAGGGAGGCAACTGGGAGGGAGCTAACTCACGAAGTCTGCGTTGTCAAGATTCCG
GAGGAAACACCTCAGCCCCAAACACATTGACTTTTTCTCATTTTCCAGATTAAAACCTTT
GGAAGAAGAAGTCGTTTCGTTATCATTCGACAATGGCGGAGAACGTTGGGATTCTGGCTA
TGGACATCTATTTTCCTCCTACCTGTGTTCAACAGGAAGCTTTGGAAGCTCATGATGGAG
CAAGCAAAGGCAAATACACCATTGGTCTTGGCCAAGATTGTCTAGCTTTCTGCACTGAGC
TTGAAGATGTTATCTCAATGAGTTTCAATGCGGTGACATCTCTTCTAGAAAAGTATAA

QA 4 361 4 361
DS 

RD RR2C064JQ 724 0 0
GGGAAGCACGAGGGAGGCAACTGGGAGGGAGCTAACTCACGAAGTCTGCGTTGTCAAGAT
TCCGGAGGAAACACCTCAGCCCCAAACACATTGACTTTTTCTCATTTTCCAGATTAAAAC
CTTTGGAAGAAGAAGTCGTTTCGTTATCATTCGACAATGGCGGAGAACGTTGGGATTCTG
GCTATGGACATCTATTTTCCTCCTACCTGTGTTCAACAGGAAGCTTTGGAAGCTCATGAT
GGAGCAAGCAAAGGCAAATACACCATTGGTTTTGGCCAAGATTGTCTAGCTTTTTGCACT
GAGCTTGAAGATGTTATCTCAATGAGTTTCAATGCGGTGACATCTCTTCTAGAAAAGTAT
AAGATCGACCCCAAGCAAATTGGGCGACTTGAAGTAGGAAGTGAGACTGTCATTGACAAA
AGCAAGTCCATCAAAACCTTCTTGATGCAACTCTTTGAGAAATGTGGAAACACTGATGTG
GAAGGTGTTGACTCGACCAATGCTTGTTACGGTGGAAACAGCGGCGGTGGTGGTGGTGGC
TGGTGATCAAAGATGATTTGGTTGTCTGATTCTGCTATCTGTTTGGTTTAGATTTGGTTC
CGTATCCATGTTTCTCTGGTTTGGTTATGTTTCTGGTTTTTTGGTTCTACATGATGTAAC
AGATCGTTTAAATGTCATCTTTGCCTAAAACGAAATGTTAGATTCGCGTGTTGTGTTTCA
CTTG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL5382Contig1 1019 2 2 U
GGAGATCTTTGTTAAAGTATTACTCCAGATGTTGCTTAAGGCTTCTCCCGCGCTTTCTAT
CTTGAGCTCCGGCGGCGTTGGAGATCTCTTTCCTCCGTCGAGTGTTCTGTTTCCTTCGAC
CGCGTGCCGTGGATCAAGGTTGTCTGTTCGAGCGGCGAAAGGAACAAGCACCAAGTCGTT
GACCGGAGTTGTGTTCGAGCCTTTTGAGGAAGTGAAGAAAGATATGGATATGCTCGTTCC
CACAACTCCTCTGGTTTCTCTCGCCCGCCACAGATTCGCGGACGAATCTGAAGCTGCGAT
TAACGAACAGATCAATGTGGAGTATAATGTCTCCTGCATCTATCACGCTCTGTATGCCTA
CTTTGACAGAGATAATGTTGGTTTGAAAGGTTTCGTCAATTTCTTCAAAGATTCGTCTGT
TGAAGAACGAGGTCACGCTGAGAAGTTTATGGAGTACCAGAACAAGCGTGGTGGGAGAGT
GAAGCTCCAGTCTATTTTGATGCCGTTCTCTGAGTTTGATCACGAGGAGAAAGGAGATGC
ATTGTATGCTATGGAGCTTGCACTATCTTTGGGGAAACTTACAAATGAAAAGCTTCTCAA
GTTGCAAAGTGTGGGTGTTAAAAACAACGATGTTCAGCTGGTTGATTTTGTCGAATCTGA
GTTTCTAGGAGAGCAGGTCGAAGCTATCAAGAAAATCTCAGAGTATGTTGCCCAGCTAAG
AAGAATTGGAAAGGGTCATGGGGTGTGGCATTTTGACCAAGTGCTTCTGGATGACCAAGA
GGTTCTGCATTGAGGGTCAAAGGAAGGAAAGTTGCATGCAGCTCTTGATGATTCTGATTT
GGTGATAATGTTTTCCTTGTGCTAGACGGCACTGTTCTATCTTTTTAGAACGAGGTCTTA
TGGATAATAATAGTAGTTCTTTTCTTCTTTCTTTTCTATGTTGTGTTTAAAAGAATGTTC
GTGAGTGTTTTTGAATGTAAGTAGTACTCTGAGAATAAATGTAAAAGTCCACTGCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A612TF U 1
AF RR2A612JQ C 273
BS 1 622 RR2A612TF
BS 623 1019 RR2A612JQ

RD RR2A612TF 622 0 0
GGAGATCTTTGTTAAAGTATTACTCCAGATGTTGCTTAAGGCTTCTCCCGCGCTTTCTAT
CTTGAGCTCCGGCGGCGTTGGAGATCTCTTTCCTCCGTCGAGTGTTCTGTTTCCTTCGAC
CGCGTGCCGTGGATCAAGGTTGTCTGTTCGAGCGGCGAAAGGAACAAGCACCAAGTCGTT
GACCGGAGTTGTGTTCGAGCCTTTTGAGGAAGTGAAGAAAGATATGGATATGCTCGTTCC
CACAACTCCTCTGGTTTCTCTCGCCCGCCACAGATTCGCGGACGAATCTGAAGCTGCGAT
TAACGAACAGATCAATGTGGAGTATAATGTCTCCTGCATCTATCACGCTCTGTATGCCTA
CTTTGACAGAGATAATGTTGGTTTGAAAGGTTTCGTCAATTTCTTCAAAGATTCGTCTGT
TGAAGAACGAGGTCACGCTGAGAAGTTTATGGAGTACCAGAACAAGCGTGGTGGGAGAGT
GAAGCTCCAGTCTATTTTGATGCCGTTCTCTGAGTTTGATCACGAGGAGAAAGGAGATGC
ATTGTATGCTATGGAGCTTGCACTATCTTTGGGGAAACTTACAAATGAAAAGCTTCTCAA
GTTGCAAAGTGTGGGTGTTAAA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2A612JQ 747 0 0
GATTCGCGGACGAATCTGAAGCTGCGATTAACGAACAGATCAATGTGGAGTATAATGTCT
CCTGCATCTATCACGCTCTGTATGCCTACTTTGACAGAGATAATGTTGGTTTGAAAGGTT
TCGTCAATTTCTTCAAAGATTCGTCTGTTGAAGAACGAGGTCACGCTGAGAAGTTTATGG
AGTACCAGAACAAGCGTGGTGGGAGAGTGAAGCTCCAGTCTATTTTGATGCCGTTCTCTG
AGTTTGATCACGAGGAGAAAGGAGATGCATTGTATGCTATGGAGCTTGCACTATCTTTGG
GGAAACTTACAAATGAAAAGCTTCTCAAGTTGCAAAGTGTGGGTGTTAAAAACAACGATG
TTCAGCTGGTTGATTTTGTCGAATCTGAGTTTCTAGGAGAGCAGGTCGAAGCTATCAAGA
AAATCTCAGAGTATGTTGCCCAGCTAAGAAGAATTGGAAAGGGTCATGGGGTGTGGCATT
TTGACCAAGTGCTTCTGGATGACCAAGAGGTTCTGCATTGAGGGTCAAAGGAAGGAAAGT
TGCATGCAGCTCTTGATGATTCTGATTTGGTGATAATGTTTTCCTTGTGCTAGACGGCAC
TGTTCTATCTTTTTAGAACGAGGTCTTATGGATAATAATAGTAGTTCTTTTCTTCTTTCT
TTTCTATGTTGTGTTTAAAAGAATGTTCGTGAGTGTTTTTGAATGTAAGTAGTACTCTGA
GAATAAATGTAAAAGTCCACTGCTTTT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL5383Contig1 567 2 2 U
GGGGGAAGCAACCGCGCGAGCGGCGGTGGACGAAGCGGAAGCGAGAATGTCGGCTTGAGT
AACGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCGAAAACCCAAGGGTTCCTCCGCAAGGTTC
GTCCACGGAGGGTGAGTCAGGGCCTAAGATCAGGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGACAACA
GGTGAATATTCCTGTACTACCCCTTGTTTGGTCCCGAGGGACGGAGGAGGCTAGGTTAGC
CCGAAAGATGGTTATCGGTTCAAGAACGCAAGGTGTCCCTGTTTTTTCAGGGTAAGAAGG
GGTAGAGAAAATGCCCCGAGCCAATGTTCGAGTACCAGGCGCTACGGCGCTGAAGTAACC
CATGCTATACTCCCAGGAAAAGCTCGAACGACCTTCAACAAAAGGGTACCTGTACCCGAA
ACCGACACAGGTGGGTAGGTAGAGAATACCTAGGGGCGCGAGACAACTCTCTCTAAGGAA
CTCGGCAAAATAGCCCCGTAACTTCGGGAGAAGGGGTGCCTCCTCACAAAGGGGGTCGCA
GTGACCAGGCCCGGGCGACTGTTTACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV71TF U 1
AF RR2AV71JQ C 1
BS 1 252 RR2AV71TF
BS 253 567 RR2AV71JQ

RD RR2AV71TF 252 0 0
GGGGGAAGCAACCGCGCGAGCGGCGGTGGACGAAGCGGAAGCGAGAATGTCGGCTTGAGT
AACGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCGAAAACCCAAGGGTTCCTCCGCAAGGTTC
GTCCACGGAGGGTGAGTCAGGGCCTAAGATCAGGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGACAACA
GGTGAATATTCCTGTACTACCCCTTGTTTGGTCCCGAGGGACGGAGGAGGCTAGGTTAGC
CCGAAAGATGGT

QA 1 252 1 252
DS 

RD RR2AV71JQ 567 0 0
GGGGGAAGCAACCGCGCGAGCGGCGGTGGACGAAGCGGAAGCGAGAATGTCGGCTTGAGT
AACGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCGAAAACCCAAGGGTTCCTCCGCAAGGTTC
GTCCACGGAGGGTGAGTCAGGGCCTAAGATCAGGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGACAACA
GGTGAATATTCCTGTACTACCCCTTGTT*GGTCCCGAGGGACGGAGGAGGCTAGGTTAGC
C*GAAAGATGGTTATCGGTTCAAGAACGCAAGGTGTCCCTGTTTTTTCAGGGTAAGAAGG
GGTAGAGAAAATGCCCCGAGCCAATGTTCGAGTACCAGGCGCTACGGCGCTGAAGTAACC
CATGCTATACTCCCAGGAAAAGCTCGAACGACCTTCAACAAAAGGGTACCTGTACCCGAA
ACCGACACAGGTGGGTAGGTAGAGAATACCTAGGGGCGCGAGACAACTCTCTCTAAGGAA
CTCGGCAAAATAGCCCCGTAACTTCGGGAGAAGGGGTGCCTCCTCACAAAGGGGGTCGCA
GTGACCAGGCCCGGGCGACTGTTTACC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL5384Contig1 1016 2 10 U
GGGATCACGTCCTTTGTGTTTTCCTCTTTACATTTTTTTTCATTCTAGCGTTTCCTCATT
CACTTACATCGTTTAGTTTTTTTTGTTTGTTTGTGCCGGAGAGATGTTTAGTTGAATGTA
AATGATAGACGATTCGGAGGAATTGGATTCATATTGTGGGGTTGTTCCTCAGACGTAGAT
CTGAGGTTGCATTTTTTATTAGTTCTTTCGAAATACTTTTTTCTCTTTCGTTTTCTGTAT
TGTGTCTTCATAATCATCATCACGTTTGGGCTTCGGCAATGAGCGCGTCAAGGTTCATAA
AGTGCGTCACGGTTGGTGACGGAGCTGTCGGCAAAACATGTTTGCTCATTTCTTACACCA
GCAACACCTTTCCCACGGACTACGTCCCCACTGTTTTCGATAACTTTAGCGCCAATGTGG
TTGTTAATGGAGCCACGGTCAATCTTGGATTGTGGGATACTGCAGGGCAGGAAGACTATA
ACAGATTAAGACCTTTGAGTTACCGTGGTGCTGATGTTTTCATTCTAGCCTTCTCTCTTA
TTAGTAAGGCTAGTTACGAGAATGTCTCCAAGAAGTGGATCCCAGAGCTGAAGCACTATG
CTCCTGGTGTTCCTATCGTCCTTGTTGGAACCAAACTTGATCTTCGGGATGACAAACAGT
TTGTTATCGACCATCCTGGTGCCGTCCCTATTACAACTGCTCAGGGAGAGGAGCTCAAAA
AGCTAATAGAAGCACCTGCTTACATAGAATGCAGTTCAAAATCCCAAGAGAACGTGAAAG
GAGTCTTTGATGCAGCTATCAAAGTGGTCCTTCAACCTCCAAAGCAGAAGAAAAAGAAGA
ACAAAGCACAAAAGGCTTGCTCCATTTTGTAAGAAGCTCGATGACAGGGTCTTGAAAGAA
AGTGTGTGCGTTTTCATTTTTTTATGTTTTCTTCTTTTCAGTGTTCATTGTTGATTGCTC
TCTTAGTTCCTCTAAATACGAATTGTGTTGAGTTTAATTTAACGTATGTTTCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ17TF U 1
AF RR2BQ17JQ C 354
BS 1 631 RR2BQ17TF
BS 632 632 RR2BQ17JQ
BS 633 664 RR2BQ17TF
BS 665 665 RR2BQ17JQ
BS 666 691 RR2BQ17TF
BS 692 692 RR2BQ17JQ
BS 693 705 RR2BQ17TF
BS 706 706 RR2BQ17JQ
BS 707 720 RR2BQ17TF
BS 721 1016 RR2BQ17JQ

RD RR2BQ17TF 722 0 0
GGGATCACGTCCTTTGTGTTTTCCTCTTTACATTTTTTTTCATTCTAGCGTTTCCTCATT
CACTTACATCGTTTAGTTTTTTTTGTTTGTTTGTGCCGGAGAGATGTTTAGTTGAATGTA
AATGATAGACGATTCGGAGGAATTGGATTCATATTGTGGGGTTGTTCCTCAGACGTAGAT
CTGAGGTTGCATTTTTTATTAGTTCTTTCGAAATACTTTTTTCTCTTTCGTTTTCTGTAT
TGTGTCTTCATAATCATCATCACGTTTGGGCTTCGGCAATGAGCGCGTCAAGGTTCATAA
AGTGCGTCACGGTTGGTGACGGAGCTGTCGGCAAAACATGTTTGCTCATTTCTTACACCA
GCAACACCTTTCCCACGGACTACGTCCCCACTGTTTTCGATAACTTTAGCGCCAATGTGG
TTGTTAATGGAGCCACGGTCAATCTTGGATTGTGGGATACTGCAGGGCAGGAAGACTATA
ACAGATTAAGACCTTTGAGTTACCGTGGTGCTGATGTTTTCATTCTAGCCTTCTCTCTTA
TTAGTAAGGCTAGTTACGAGAATGTCTCCAAGAAGTGGATCCCAGAGCTGAAGCACTATG
CTCCTGGTGTTCCTATCGTCCTTGTTGGAAC*AAACTTGATCTTCGGGATGACAAACAGT
TTGT*ATCGACCATCCTGGTGCCGTCCCTAT*ACAACTGCTCAGG*AGAGGAGCTCAAAA
GC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2BQ17JQ 663 0 0
TACACCAGCAACACCTTTCCCACGGACTACGTCCCCACTGTTTTCGATAACTTTAGCGCC
AATGTGGTTGTTAATGGAGCCACGGTCAATCTTGGATTGTGGGATACTGCAGGGCAGGAA
GACTATAACAGATTAAGACCTTTGAGTTACCGTGGTGCTGATGTTTTCATTCTAGCCTTC
TCTCTTATTAGTAAGGCTAGTTACGAGAATGTCTCCAAGAAGTGGATCCCAGAGCTGAAG
CACTATGCTCCTGGTGTTCCTATCGTCCTTGTTGGAACCAAACTTGATCTTCGGGATGAC
AAACAGTTTGTTATCGACCATCCTGGTGCCGTCCCTATTACAACTGCTCAGGGAGAGGAG
CTCAAAAAGCTAATAGAAGCACCTGCTTACATAGAATGCAGTTCAAAATCCCAAGAGAAC
GTGAAAGGAGTCTTTGATGCAGCTATCAAAGTGGTCCTTCAACCTCCAAAGCAGAAGAAA
AAGAAGAACAAAGCACAAAAGGCTTGCTCCATTTTGTAAGAAGCTCGATGACAGGGTCTT
GAAAGAAAGTGTGTGCGTTTTCATTTTTTTATGTTTTCTTCTTTTCAGTGTTCATTGTTG
ATTGCTCTCTTAGTTCCTCTAAATACGAATTGTGTTGAGTTTAATTTAACGTATGTTTCA
ATT

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL5385Contig1 851 2 2 U
GGGCCTCATTTCTCTTGCTCTTCTCTTCCGAAAGGCGAACAACGTTTTACTTTTTTTTCT
TTTTTGCGACGCAGCGAAGAGGATCATCGATGGAGAATGAGTATGGTGTGAATATTTTTG
CTCTCGAGATGGATCATCGCGATGAATCTCAGTGCGAGTCGACTCTCTCTAACTCCCCCG
AGTCCGTTCTTACGGTCGAGAGCTCTCGTGGAGATGCCGAATCTAAGAAGCTGGATGAAT
GTGGTGGCTGGACGAATGAGAAACACAACTCGTATCTTGAATATTTAGAGGGCTCATTCG
TTACGCAGTTGTATTCCTTACTTGGAGGAGATGAGACTCGGAGACTCTCTAGAGCTCCTC
ATGTGCTGTCCAACTCTCACAAATCGACTGATCAGTTTACGGTTCTACAAAATGGTTGCC
GGCAGAAGGTTAACTTGGGCAAGAAACGACCTGGATCATCCATGAGAGCTTTGGGACATG
AGTATCCAGCTCAAAGCACTGCAGAGGCATCGGGGCAGAATTTCAGAGAGGAAGTAGGAG
AGAAGGGGTGTAACTCAAGGGTGTCCAGGAAACGGAGAAGAGAAGCTAACTTTGATGATA
GTTCATTGAAAGATCAGGTTGTGCCTTAAGGATGGTGGAGACATACAAACCGATAGGAAC
TAAAGTGTAGATGATTACTATGGATAGAGACTAAAAATAGGAAGTGTGAGTGGAGAATGA
ATGTGGATGGCTTTGTTTGTTGTATTATAGAACGAGGCTAAAGAGAGCCTTATTAAGGAA
TCGAGTGGGATGAAATTAGGGTTGTTTGTTAAATTTTGTCTTTGTTATATTATTAGTATG
ATCGCCATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF78TF U 1
AF RR2EF78JQ C 273
BS 1 617 RR2EF78TF
BS 618 851 RR2EF78JQ

RD RR2EF78TF 625 0 0
GGGCCTCATTTCTCTTGCTCTTCTCTTCCGAAAGGCGAACAACGTTTTACTTTTTTTTCT
TTTTTGCGACGCAGCGAAGAGGATCATCGATGGAGAATGAGTATGGTGTGAATATTTTTG
CTCTCGAGATGGATCATCGCGATGAATCTCAGTGCGAGTCGACTCTCTCTAACTCCCCCG
AGTCCGTTCTTACGGTCGAGAGCTCTCGTGGAGATGCCGAATCTAAGAAGCTGGATGAAT
GTGGTGGCTGGACGAATGAGAAACACAACTCGTATCTTGAATATTTAGAGGGCTCATTCG
TTACGCAGTTGTATTCCTTACTTGGAGGAGATGAGACTCGGAGACTCTCTAGAGCTCCTC
ATGTGCTGTCCAACTCTCACAAATCGACTGATCAGTTTACGGTTCTACAAAATGGTTGCC
GGCAGAAGGTTAACTTGGGCAAGAAACGACCTGGATCATCCATGAGAGCTTTGGGACATG
AGTATCCAGCTCAAAGCACTGCAGAGGCATCGGGGCAGAATTTCAGAGAGGAAGTAGGAG
AGAAGGGGTGTAACTCAAGGGTGTCCAGGAAACGGAGAAGAGAAGCTAACTTTGATGATA
GTTCATTGAAAGATCAG
TTGTGCCT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2EF78JQ 579 0 0
TATCTTGAATATTTAGAGGGCTCATTCGTTACGCAGTTGTATTCCTTACTTGGAGGAGAT
GAGACTCGGAGACTCTCTAGAGCTCCTCATGTGCTGTCCAACTCTCACAAATCGACTGAT
CAGTTTACGGTTCTACAAAATGGTTGCCGGCAGAAGGTTAACTTGGGCAAGAAACGACCT
GGATCATCCATGAGAGCTTTGGGACATGAGTATCCAGCTCAAAGCACTGCAGAGGCATCG
GGGCAGAATTTCAGAGAGGAAGTAGGAGAGAAGGGGTGTAACTCAAGGGTGTCCAGGAAA
CGGAGAAGAGAAGCTAACTTTGATGATAGTTCATTGAAAGATCAGGTTGTGCCTTAAGGA
TGGTGGAGACATACAAACCGATAGGAACTAAAGTGTAGATGATTACTATGGATAGAGACT
AAAAATAGGAAGTGTGAGTGGAGAATGAATGTGGATGGCTTTGTTTGTTGTATTATAGAA
CGAGGCTAAAGAGAGCCTTATTAAGGAATCGAGTGGGATGAAATTAGGGTTGTTTGTTAA
ATTTTGTCTTTGTTATATTATTAGTATGATCGCCATTTC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL5386Contig1 458 2 2 U
AACAAGATAAAATGAGCAGTGCTTCTTTTTATTAAAGAGAAGAGAATGAAGAGTTTCAAA
GGGTTCCTACAAAAATAACTAACAGAAGATTAACTAACTTAAGGCAAAAAAAAAACAGCC
CATAATCCATTGCATAATCACTGAAGTTTAGGCAAAGGAAAAGTCAACTCCTGGAAATTG
TGAAAACTTCCGGTGAAGTCAGTGAACAAACCATCAACACCAATCTTGTTGATCCAATAA
TCATACTACAAATACCCATCTTGATGAAACCCGGAATGCAAAAACTGGTTCTCGTTACGG
TATGTGTATGGATGCACCTGAAGGTTACGTGAATGAGCTCTTGCAACCAAATCCGTTGGT
GTAGTCAGACGGTTATCGCTAACAGGAACAATTGTGTCTTTCCATGGACCAATCCCAACC
ACATATGGTTTAATGTAATCTAAATATGCGTCTGACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BT15TF C 1
AF RR2BT15JQ U 90
BS 1 89 RR2BT15TF
BS 90 458 RR2BT15JQ

RD RR2BT15TF 458 0 0
AACAAGATAAAATGAGCAGTGCTTCTTTTTATTAAAGAGAAGAGAATGAAGAGTTTCAAA
GGGTTCCTACAAAAATAACTAACAGAAGATTAACTAACTTAAGGCAAAAGAAAAACAGCC
CATAATCCATTGCATAATCACTGAAGTTTAGGCAAAGGAGAAGTCAACTCCTGGAAATTG
TGAAGACTTCCGGTGAAGTCAGTGAACAAACCATCAACACCAATCTTGTTGATCCAATAA
TCATACTACAAATACGCATCTTGATGAAACCCGGAATGCAGAAACTGGTTCTCGTTACGG
TATGTGTATGGATGCACCTGAAGGTTACGTGAATGAGCTCTTGCAACCAAATCCGTTGGT
GTAGTCAGACGGTTATCGCTAACAGGAACAATTGTGTCTTTCCATGGACCAATCCCAACC
ACATATGGTTTAATGTAATCTAAATATGCGTCTGACGC

QA 1 458 1 458
DS 

RD RR2BT15JQ 369 0 0
TTAACTAACTTAAGGCAAAAAAAAAACAGCCCATAATCCATTGCATAATCACTGAAGTTT
AGGCAAAGGAAAAGTCAACTCCTGGAAATTGTGAAAACTTCCGGTGAAGTCAGTGAACAA
ACCATCAACACCAATCTTGTTGATCCAATAATCATACTACAAATACCCATCTTGATGAAA
CCCGGAATGCAAAAACTGGTTCTCGTTACGGTATGTGTATGGATGCACCTGAAGGTTACG
TGAATGAGCTCTTGCAACCAAATCCGTTGGTGTAGTCAGACGGTTATCGCTAACAGGAAC
AATTGTGTCTTTCCATGGACCAATCCCAACCACATATGGTTTAATGTAATCTAAATATGC
GTCTGACGC

QA 1 369 1 369
DS 



AS 1 2

CO CL5387Contig1 847 2 6 U
GCATCAATCTTTGTGAGGCTACAAGCGTCGATTTCTAAATCTGATTCCCCCTTTCGATCT
CTCTTTCTCTCGCGAGTCTCCAAGGGTTTTTGTTTACCGCCGCTTTTCTCCTGTGCATCA
AGGTTTCTCCGATCATAGAGACTGTCCTGAGTTGCCTTGGCCCTTGCTTTGTTCTCTTCT
TATCAGGGGCATAACGATTCATCAAAAGGCCAAGATAAATACCTAATTTTGGTGCAAGTC
TTTAAGTAGAAGAACCTCATTTCTAAGAGGCACCTTTTAACATGGCAAATCCATTACGGC
TATATTTAGCCTGCATAAAGAATACCCTCGAGGCAGCTATGTGCTTACAGAACTTTCCGT
GTCAAGAAGTTGAAAGGCATAATAAACCAGAGGTTGAACTAAAGACGAGCCCAGAACTCT
TGCTAAATCCTGTTTTGATATGCCGTAATGAGGCTGAAAAGTGTTTGATAGAAACATCTA
TAAATTCACTCCGGATAAGCCTCAAGGTCAAACAAGCGGATGAACTTGAAAACATACTAA
CCAAAAAGTTCCTTAGATTCTTGTCCATGAGGGCCGAAGCTTTTCAAGTACTGAGGAGGA
GGCCAGTGCAGGGATATGACATTAGCTTTCTTATAACAAACTATCACTGCGAAGAGATGC
AGAAACAGAAGCTAATCGATTTCATTATTCAGTTTATGGAGGATATAGAGAAAAAAATAA
GCGAGTTGAAGATATCAGTGACCACCAGGGGAAGACTCGTGGCTACAGAGTTTCTGAAAC
AGTTCATGTAAAGCAACTGCATTGTTATAATGTAACCACTCATTGTATTAACCACTCATT
ATTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK63TF U 1
AF RR2BK63JQ C 333
BS 1 612 RR2BK63TF
BS 613 613 RR2BK63JQ
BS 614 669 RR2BK63TF
BS 670 670 RR2BK63JQ
BS 671 705 RR2BK63TF
BS 706 847 RR2BK63JQ

RD RR2BK63TF 705 0 0
GCATCAATCTTTGTGAGGCTACAAGCGTCGATTTCTAAATCTGATTCCCCCTTTCGATCT
CTCTTTCTCTCGCGAGTCTCCAAGGGTTTTTGTTTACCGCCGCTTTTCTCCTGTGCATCA
AGGTTTCTCCGATCATAGAGACTGTCCTGAGTTGCCTTGGCCCTTGCTTTGTTCTCTTCT
TATCAGGGGCATAACGATTCATCAAAAGGCCAAGATAAATACCTAATTTTGGTGCAAGTC
TTTAAGTAGAAGAACCTCATTTCTAAGAGGCACCTTTTAACATGGCAAATCCATTACGGC
TATATTTAGCCTGCATAAAGAATACCCTCGAGGCAGCTATGTGCTTACAGAACTTTCCGT
GTCAAGAAGTTGAAAGGCATAATAAACCAGAGGTTGAACTAAAGACGAGCCCAGAACTCT
TGCTAAATCCTGTTTTGATATGCCGTAATGAGGCTGAAAAGTGTTTGATAGAAACATCTA
TAAATTCACTCCGGATAAGCCTCAAGGTCAAACAAGCGGATGAACTTGAAAACATACTAA
CCAAAAAGTTCCTTAGATTCTTGTCCATGAGGGCCGAAGCTTTTCAAGTACTGAGGAGGA
GGCCAGTGCAGG*ATATGACATTAGCTTTCTTATAACAAACTATCACTGCGAAGAGATGC
AGAAACAGA*GCTAATCGATTTCATTATTCAGTTTATGGAGGATA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2BK63JQ 515 0 0
GCAGCTATGTGCTTACAGAACTTTCCGTGTCAAGAAGTTGAAAGGCATAATAAACCAGAG
GTTGAACTAAAGACGAGCCCAGAACTCTTGCTAAATCCTGTTTTGATATGCCGTAATGAG
GCTGAAAAGTGTTTGATAGAAACATCTATAAATTCACTCCGGATAAGCCTCAAGGTCAAA
CAAGCGGATGAACTTGAAAACATACTAACCAAAAAGTTCCTTAGATTTTTGTCCATGAGG
GCCGAAGCTTTTCAAGTACTGAGGAGGAGGCCAGTGCAGGGATATGACATTAGCTTTCTT
ATAACAAACTATCACTGGGAAGAGATGCAGAAACAGAAGTTAATCGATTTCATTATTCAG
TTTATGGAGGATATAGAGAAAAAAATAAGCGAGTTGAAGATATCAGTGACCACCAGGGGA
AGACTCGTGGCTACAGAGTTTCTGAAACAGTTCATGTAAAGCAACTGCATTGTTATAATG
TAACCACTCATTGTATTAACCACTCATTATTTGGT

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

CO CL5388Contig1 738 2 3 U
TTAAAAGGGCTACAAGGAGAAAATGTAGACATAAGAGAGGAGATATTGAGGAAGAGAAGA
GCTGGGAAATACCAGGAGACACCACCTCTGTTCTCAAAGCTTGGTGGCAGTCTCACTCTA
AGTGGCCTTACCCTACTGGGAGTTCTCTCTTTCTACTTCTTCAACCACTCACATGACCAC
ACCCCTGACCCCTCAAGGCTCTCTTGTCCTGTTCCATATAGCTTAAACAGAATCACTTTC
TCCACTTCTTCATCTGCCCCCGGCCGTAAATAGGTACAAGCGTAAATCCGAAACATCAAA
TTTGCAAACCGGACATTTTGGGGACTCCTTCTTACCGTACTGATCGACGCGTCTTCTTGT
ATTGTTGGGGGAATAAGTCCACTTGTATATGCAGGGCCAACAAAACAAGTGGCCACATAG
TGTCACGACCGGGTCACGTACTTGATCCAAACATATGTTGCAGTCGAAGTCTCCTCCAGA
GTCACCCAATGCTGCTGAGTCTTCTACCTTCTCTATCTCCATGTTACCTTTGAAGAGGTT
ATAAGTATATGGATCTCTTCTGACTTGAGTGCTAATTAAGCCTTTGGAAACCTCCAGAGA
GTTTGATTGCTTTATGTGACAATGGCCTGAAGACGAGAGACGAGTTCAAAAAGAAAAGAG
AGATGAGAATTGTCTGGAAATAGAGAAAGCAGAATGGACAAGAAGAATAACAGATAGAGA
ATGGTGCAGAAGCACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA91JQ U 83
AF RR2EA91TF C 1
BS 1 84 RR2EA91TF
BS 85 476 RR2EA91JQ
BS 477 738 RR2EA91TF

RD RR2EA91JQ 394 0 0
CC
CCTCTGTTCTCAAAGCTTGGTGGCAGTCTCACTCTAAGTGGCCTTACCCTACTGGGAGTT
CTCTCTTTCTACTTCTTCAACCACTCACATGACCACACCCCTGACCCCTCAAGGCTCTCT
TGTCCTGTTCCATATAGCTTAAACAGAATCACTTTCTCCACTTCTTCATCTGCCCCCGGC
CGTAAATAGGTACAAGCGTAAATCCGAAACATCAAATTTGCAAACCGGACATTTTGGGGA
CTCCTTCTTACCGTACTGATCGACGCGTCTTCTTGTATTGTTGGGGGAATAAGTCCACTT
GTATATGCAGGGCCAACAAAACAAGTGGCCACATAGTGTCACGACCGGGTCACGTACTTG
ATCCAAACATATGTTGCAGTCGAAGTCTCCTC

QA 3 394 3 394
DS 

RD RR2EA91TF 738 0 0
TTAAAAGGGCTACAAGGAGAAAATGTAGACATAAGAGAGGAGATATTGAGGAAGAGAAGA
GCTGGGAAATACCAGGAGACACCACCTCTGTTCTCAAAGCTTGGTGGCAGTCTCACTCTA
AGTGGCCTTACCCTACTGTGAGTTCTCTCTTTCTACTTCTTCAACCACTCACATGACCAC
ACGCCTGACGCCTCAAGGCTCTCTTGTCCTGTTCCATATAGCTTAGACAGAATCACTTTC
TCCACTTCTTCATCTGCCCCCGGCCGTAGATAGGTACAAGCGTAGATCCGAGACATCAGA
TTTGCAGACCGGACATTTTGGGGACTCCTTCTTACCGTACTGATCGACGCGTCTTCTTGT
ATTGTTGGTGGAATAAGTCCACTTGTATATGCAGGGCCAACAAAACAAGTGGCCACATAG
TGTCACGACCGGGTCACGTACTTGATCCAAACATATGTTGCAGTCGAAGTCTCCTCCAGA
GTCACCCAATGCTGCTGAGTCTTCTACCTTCTCTATCTCCATGTTACCTTTGAAGAGGTT
ATAAGTATATGGATCTCTTCTGACTTGAGTGCTAATTAAGCCTTTGGAAACCTCCAGAGA
GTTTGATTGCTTTATGTGACAATGGCCTGAAGACGAGAGACGAGTTCAAAAAGAAAAGAG
AGATGAGAATTGTCTGGAAATAGAGAAAGCAGAATGGACAAGAAGAATAACAGATAGAGA
ATGGTGCAGAAGCACCCC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL5389Contig1 607 2 3 U
GGATATGAAAAAGGAACTCTCTCTCTCTCTAAAGAGAATCCCTCCACTGTCCTGATTTAT
GTGCATTTCTCTCTTGTTAACATAGAGACAAAGATCATCAAGTAGTAATCTTGAAGTAAA
CAAAGACTTTCGAGAGAACCTTATATTAAGTGTTTGTCTGATGATGAAGAGATTAAGAAG
TTCAGATCCAGTGGGTGGTCTGGTCTCTTTATGTCCTACATCTTCTACAGATGAGCAGAG
TCCAAGAAGATACGGGAGAGAATTTCAGTCGATGCTTGAAGGCTACGAGGAGGAGGATGA
AGAAGCGGTTTCTTCTCCGATGAGCAACCGCCGTTGATCACTGGACTTGAAGCCTTAAAC
GCCGGAAGAGGTTTTTCGATCGGATTAAAATGCTCTGTTTTTTTCTATGTGGGTTCGGAG
GAAAAGATGGGAAAAGGAGAGGGCACAGTGGGAATAATGGGAAAATAGAAGGGTGAATGG
GCAAATAAGGAAGGTTAGATATGGGCGGGAAATAATTGATTTGGGTGAATTTGTGATTAT
GTTTTCTCTGGCGTTTCGTGCACTTCTTGTAATTAAGGATTATGAGGGTTGAGAAAGGGT
AAAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ88TFB U 307
AF RR2AZ88JQ C 1
BS 1 306 RR2AZ88JQ
BS 307 415 RR2AZ88TFB
BS 416 607 RR2AZ88JQ

RD RR2AZ88TFB 109 0 0
GGTTTCTTCTCCGATGAGCAACCGCCGTTGATCACTGGACTTGAAGCCTTAAACGCCGGA
AGAGGTTTTTCGATCGGATTAAAATGCTCTGTTTTTTTCTATGTGGGTT

QA 1 109 1 109
DS 

RD RR2AZ88JQ 607 0 0
GGATATGAAAAAGGAACTCTCTCTCTCTCTAAAGAGAATCCCTCCACTGTCCTGATTTAT
GTGCATTTCTCTCTTGTTAACATAGAGACAAAGATCATCAAGTAGTAATCTTGAAGTAAA
CAAAGACTTTCGAGAGAACCTTATATTAAGTGTTTGTCTGATGATGAAGAGATTAAGAAG
TTCAGATCCAGTGGGTGGTCTGGTCTCTTTATGTCCTACATCTTCTACAGATGAGCAGAG
TCCAAGAAGATACGGGAGAGAATTTCAGTCGATGCTTGAAGGCTACGAGGAGGAGGATGA
AGAAGCGGTTTCTTCTCCGATGAGCAACCGCCGTTGATCACTGGACTTGAAGCCTTAAAC
GCCGGAAGAGGTTTTTCGATCGGATTAAAATGCTCTGTTTTTTTCTATGTGGGTTCGGAG
GAAAAGATGGGAAAAGGAGAGGGCACAGTGGGAATAATGGGAAAATAGAAGGGTGAATGG
GCAAATAAGGAAGGTTAGATATGGGCGGGAAATAATTGATTTGGGTGAATTTGTGATTAT
GTTTTCTCTGGCGTTTCGTGCACTTCTTGTAATTAAGGATTATGAGGGTTGAGAAAGGGT
AAAAGTC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL5390Contig1 671 2 1 U
GGCGGGTTAAGAAATGATCCGAAGAAGATTATGATCTCCAAAGTTATAAAGGGTGACATT
CAAGCGTTGGAAGATTTAACTTACGAGAGGAGAAAAGAGTTTTTGAAGAATCATCCGCTC
CCCAGAGAACTCCCCACGGTTTCATTCCGCACAGAAGCTAGCATTAGCCCAGCGGTTCTC
GCCACTTTATCACACGTGGCGCACGCCGAGCTTCCTCTGACGAACCAAGCCACGAAACTC
CCGGTGGTAATGCCGCTCGGTGCTGCAATGGCTGCTTGCGCGCAGCTGCTTCAGGTCAGA
TACGGAGAGAAGAGCGACGGGCTGGTGACTTGCTGCGACGCAGAGGTTCCTGGCTCCGTG
GTGGTTAGACCAAAGCGTAAACTAGACCATGCGTGGATGGTGTACTCGTCGTTGAACGAG
GTTCCTTTAGAAGCTGATGCTGCTCAAGTCTGTGAAGCTCTCTTGACTTTGCTTGTTCAA
GCTGAGGAAGAGAAGCAACGTAGAGCCTCTACGAAGAACGATTGATATGTAACGTTCTTC
TTCTACCACACTAAAAAAAAAACTTTACATTGTGTTCTATGTCATTGTATTTGTTTGATT
TTAATGTTGATTAATTTAAGTTCTACGATATGTTTTTGTGGTTTTTTCTATAGTATTACT
AGATTTTATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BD17JQ C 1
AF RR2BD17TF U 1
BS 1 671 RR2BD17TF

RD RR2BD17JQ 671 0 0
GGCGGGTTAAGAAATGATCCGAAGAAGATTATGATCTCCAAAGTTATAAAGGGTGACATT
CAAGCGTTGGAAGATTTAACTTACGAGAGGAGAAAAGAGTTTTTGAAGAATCATCCGCTC
CCCAGAGAACTCCCCACGGTTTCATTCCGCACAGAAGCTAGCATTAGCCCAGCGGTTCTC
GCCACTTTATCACACGTGGCGCACGCCGAGCTTCCTCTGACGAACCAAGCCACGAAACTC
CCGGTGGTAATGCCGCTCGGTGCTGCAATGGCTGCTTGCGCGCAGCTGCTTCAGGTCAGA
TACGGAGAGAAGAGCGACGGGCTGGTGACTTGCTGCGACGCAGAGGTTCCTGGCTCCGTG
GTGGTTAGACCAAAGCGTAAACTAGACCATGCGTGGATGGTGTACTCGTCGTTGAACGAG
GTTCCTTTAGAAGCTGATGCTGCTCAAGTCTGTGAAGCTCTCTTGACTTTGCTTGTTCAA
GCTGAGGAAGAGAAGCAACGTAGAGCCTCTACGAAGAACGATTGATATGTAACGTTCTTC
TTCTACCACACTAAAAAAAAAACTTTACATTGTGTTCTATGTCATTGTATTTGTTTGATT
TTAATGTTGATTAATTTAAGTTCTACGATATGTTTT*GTGGTTTTTTCTATAGTATTACT
AGATTTTATTT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2BD17TF 671 0 0
GGCGGGTTAAGAAATGATCCGAAGAAGATTATGATCTCCAAAGTTATAAAGGGTGACATT
CAAGCGTTGGAAGATTTAACTTACGAGAGGAGAAAAGAGTTTTTGAAGAATCATCCGCTC
CCCAGAGAACTCCCCACGGTTTCATTCCGCACAGAAGCTAGCATTAGCCCAGCGGTTCTC
GCCACTTTATCACACGTGGCGCACGCCGAGCTTCCTCTGACGAACCAAGCCACGAAACTC
CCGGTGGTAATGCCGCTCGGTGCTGCAATGGCTGCTTGCGCGCAGCTGCTTCAGGTCAGA
TACGGAGAGAAGAGCGACGGGCTGGTGACTTGCTGCGACGCAGAGGTTCCTGGCTCCGTG
GTGGTTAGACCAAAGCGTAAACTAGACCATGCGTGGATGGTGTACTCGTCGTTGAACGAG
GTTCCTTTAGAAGCTGATGCTGCTCAAGTCTGTGAAGCTCTCTTGACTTTGCTTGTTCAA
GCTGAGGAAGAGAAGCAACGTAGAGCCTCTACGAAGAACGATTGATATGTAACGTTCTTC
TTCTACCACACTAAAAAAAAAACTTTACATTGTGTTCTATGTCATTGTATTTGTTTGATT
TTAATGTTGATTAATTTAAGTTCTACGATATGTTTTTGTGGTTTTTTCTATAGTATTACT
AGATTTTATTT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL5391Contig1 624 2 1 U
GGACTACCCACAATAAGACTGAAGCAAACACAGAATATGTACCGATCCGCAAGCTGGAGC
CGTGTGACTGAGGATTACTCAGTACCTTGGTCCGCGCCAAAGGGATTATGGAAAGGCCTA
GATGAAGACGAGCCGACTACATACGATCCTACGAGCCAGGAGGTAACAAAGAAAGAGAAG
TCACGTGCCAAGTTTGCTGAAAATGCTGTTCACATAATCCCATTTGTTCTTCTCGCTTGT
GCTCTAGTCCTTTGGTTTTTCTCTAATCCAAATGTGGATGTTGGTGTAAAAGAGGAATCC
ATTGCGGCTAGGATCAAAGGATTGACGATTGAAGGAGACATTGACAACGACAGCGACGGA
ACTCAGACCGGATTCTTAGGCACTGCCGCAGAAGTGGGAGGCTCATACAAGTCGAAGCTA
AAACGCGACGTTAATAAGCGTCATCGGAGGATACAAACTTCAAGGAAAGTGGTGAAAGGG
TTTTATTAGTTTTTTTGGGTAAAAAAGGAGTTCCCTACATTAGTTAACACCTTAATCGAT
TTTTATTTCCTAGTTTCCCGTATTTTGATTGAGATGTGTTACTTTGGTTACGTTTTGCTT
TATGTTTTCTCAAATAATGTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY56TF U 19
AF RR2E735TF U 1
BS 1 624 RR2E735TF

RD RR2DY56TF 353 0 0
GG
GAAGCAAACACAGAATATGTACCGATCCGCAAGCTGGAGCCGTGTGACTGAGGATTACTC
AGTACCTTGGTCCGCGCCAAAGGGATTATGGAAAGGCCTAGATGAAGACGAGCCGACTAC
ATACGATCCTACGAGCCAGGAGGTAACAAAGAAAGAGAAGTCACGTGCCAAGTTTGCTGA
AAATGCTGTTCACATAATCCCATTTGTTCTTCTCGCTTGTGCTCTAGTCCTTTGGTTTTT
CTCTAATCCAAATGTGGATGTTGGTGTAAAAGAGGAATCCATTGCGGCTAGGATCAAAGG
ATTGACGATTGAAGGAGACATTGACAACGACAGCGACGGAACTCAGACCGG

QA 3 353 3 353
DS 

RD RR2E735TF 624 0 0
GGACTACCCACAATAAGACTGAAGCAAACACAGAATATGTACCGATCCGCAAGCTGGAGC
CGTGTGACTGAGGATTACTCAGTACCTTGGTCCGCGCCAAAGGGATTATGGAAAGGCCTA
GATGAAGACGAGCCGACTACATACGATCCTACGAGCCAGGAGGTAACAAAGAAAGAGAAG
TCACGTGCCAAGTTTGCTGAAAATGCTGTTCACATAATCCCATTTGTTCTTCTCGCTTGT
GCTCTAGTCCTTTGGTTTTTCTCTAATCCAAATGTGGATGTTGGTGTAAAAGAGGAATCC
ATTGCGGCTAGGATCAAAGGATTGACGATTGAAGGAGACATTGACAACGACAGCGACGGA
ACTCAGACCGGATTCTTAGGCACTGCCGCAGAAGTGGGAGGCTCATACAAGTCGAAGCTA
AAACGCGACGTTAATAAGCGTCATCGGAGGATACAAACTTCAAGGAAAGTGGTGAAAGGG
TTTTATTAGTTTTTTTGGGTAAAAAAGGAGTTCCCTACATTAGTTAACACCTTAATCGAT
TTTTATTTCCTAGTTTCCCGTATTTTGATTGAGATGTGTTACTTTGGTTACGTTTTGCTT
TATGTTTTCTCAAATAATGTTCAC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL5392Contig1 764 2 1 U
GGAAGACAACATTTGGCTTTGCGTTTCGTTATTTGACTTAACCTTCTGTTTGATGCAGCT
TCTCCCTCTATTAGCGTCTTCCCTTGAATTTGGTTCAGCTGTTGCCCCTGCATTAACTGC
TTTACTTAAGATGGGTTCATGGTTATCAACTGAAGATTTCAAACTCAAGGTGCTGCCAAC
AATAGTCAAGCTTTTTGCTTCCAATGATCGAGCTATTAGAGTTTCTCTTTTACAACATGT
TGATCAATTTGGAGAATCAATGTCAGGGCAAATTGTTGATGAACAAGTATACCCTCATGT
TGCTACTGGATTTGCGGACACATCTGCCTTTCTGCGAGAGCTGACTCTTAAGTCAATGCT
CGTTTTAGCTCCAAAGCTTTCTCAGCGTACACTTTCTGGATCCCTCTTGAAACATCTTTC
CAAATTACAGGTGGATGAAGAGCCTGCAATCAGAACAAATACCACTATATTACTCGGGAA
TATTGCCACCTACCTAAATGAAGGGACAAGGAAAAGAGTTTTGATAAATGCTTTTACAGT
GCGTGCCTTGCGGGATACATTTCCACCTGCTCGGGGTGCAGGTATTGTCGCACTATGTGC
CACCAGTACCACTTACGACGACACCGAAATAGCAACTAGGATTCTTCCAAATGTTGTTGT
GCTAACCATTGATCAAGACAGTGAGGTTCGGTCAAAGCATTTCAAGCTGTAGAACAGTTT
CTTCAGATACTGAAACAGAACTATGAGAAGACAACACTGGAGAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G824TF U 1
AF RR2G823TF U 1
BS 1 764 RR2G823TF

RD RR2G824TF 362 0 0
GGAAGACAACATTTGGCTTTGCGTTTCGTTATTTGACTTAACCTTCTGTTTGATGCAGCT
TCTCCCTCTATTAGCGTCTTCCCTTGAATTTGGTTCAGCTGTTGCCCCTGCATTAACTGC
TTTACTTAAGATGGGTTCATGGTTATCAACTGAAGATTTCCAACTCAAGGTGCTGCCAAC
AATAGTCAAGCTTTTTGCTTCCTATGATCGAGCTATTATAGTTTCTCTTTTACAACATGT
TGATCAATTTGGAGAATCAATGTCAGGGCAAATTGTTGATGAACAAGTATACCCTCATGT
TGCTACTGGATTTGCGGACACATCTGCCTTTCTGCGAGAGCTGACTCTTAAGTCAATGCT
CG

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR2G823TF 764 0 0
GGAAGACAACATTTGGCTTTGCGTTTCGTTATTTGACTTAACCTTCTGTTTGATGCAGCT
TCTCCCTCTATTAGCGTCTTCCCTTGAATTTGGTTCAGCTGTTGCCCCTGCATTAACTGC
TTTACTTAAGATGGGTTCATGGTTATCAACTGAAGATTTCAAACTCAAGGTGCTGCCAAC
AATAGTCAAGCTTTTTGCTTCCAATGATCGAGCTATTAGAGTTTCTCTTTTACAACATGT
TGATCAATTTGGAGAATCAATGTCAGGGCAAATTGTTGATGAACAAGTATACCCTCATGT
TGCTACTGGATTTGCGGACACATCTGCCTTTCTGCGAGAGCTGACTCTTAAGTCAATGCT
CGTTTTAGCTCCAAAGCTTTCTCAGCGTACACTTTCTGGATCCCTCTTGAAACATCTTTC
CAAATTACAGGTGGATGAAGAGCCTGCAATCAGAACAAATACCACTATATTACTCGGGAA
TATTGCCACCTACCTAAATGAAGGGACAAGGAAAAGAGTTTTGATAAATGCTTTTACAGT
GCGTGCCTTGCGGGATACATTTCCACCTGCTCGGGGTGCAGGTATTGTCGCACTATGTGC
CACCAGTACCACTTACGACGACACCGAAATAGCAACTAGGATTCTTCCAAATGTTGTTGT
GCTAACCATTGATCAAGACAGTGAGGTTCGGTCAAAGCATTTCAAGCTGTAGAACAGTTT
CTTCAGATACTGAAACAGAACTATGAGAAGACAACACTGGAGAG

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL5393Contig1 948 2 2 U
AGGGAAGCAAACCAAAACCATTCAGACAACGACGATGGCTTCGACTCCGCAGCTTACCCT
TCGTACCTTCTCTATACACGATGGCTTCAACAAGCAACCTAGAAACAGACTACGCTCCTC
CAAAGGACGGAGCTTTGGTCCTTCTCTGCTCGGAAACAAGTCGGGATTATTAAGAGCTTG
CGTGATTGAGCTTCGTCAGAGACGCCCAGCGATAGAAACTGGATTTCTAGCAAGGGAGAG
AGCTCTGAATCGTAAAGGAAGAGTCTTTAAGGTTAGCTGTAACAAAGGTTTAGGCTTTAA
CGGCGGCGGAGATAACAACGGGAACAACGGGAGGATCCTCGGGAACCTCGCTTTGGCTAT
TGGTTTGACTTATCTCTCTATGACTGGTCAGCTTGGTTGGGTTCTCGACGCAATTGTTTC
CGTCTGGCTGGTTGTGGTGATTGTCCCAATTTTGGGGTTGGGAGCTTTTCTTTGGTGGGC
ACAACGAGATATTGTCCAGAGCAGTTGTCCAAATTGCGGAAACGAGTTTCAGATATTCAA
GTCATCGTTGGACGATGAAGTACAGCTTTGCCCTTTCTGCACTCAGCCATTCTCAGTTGT
GGATGATAAGTTTGTTAAGGAACCAGTGAAATTTTCCAACCAAACTACTGCTTTCGGACA
AGACCTAAATGGGTTTTTTTTTCCACCTAAGAAAGGAAAGGGTTTTTCAACAGCGGTCGT
GGACATTGAAGCTGAAGTAACAGATGCAGACTGAAAATGCGACCCAACTTATTTTGCAGT
AAATCGAGCAAAGAAGATATTGTAGAGACAAAACAACAAACTTGTGCAAAGAGGTCGTTG
TTGGATGTAGAAGTGATATAGAAATACAGATGCATATGTACATATACATGTCCTTGACAC
TGTTATTACATTGTGATCTTTGTTGTTTTAGTGATCGTTTGAAGTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E813TF U 1
AF RR2E813JQ C 256
BS 1 615 RR2E813TF
BS 616 948 RR2E813JQ

RD RR2E813TF 615 0 0
AGGGAAGCAAACCAAAACCATTCAGACAACGACGATGGCTTCGACTCCGCAGCTTACCCT
TCGTACCTTCTCTATACACGATGGCTTCAACAAGCAACCTAGAAACAGACTACGCTCCTC
CAAAGGACGGAGCTTTGGTCCTTCTCTGCTCGGAAACAAGTCGGGATTATTAAGAGCTTG
CGTGATTGAGCTTCGTCAGAGACGCCCAGCGATAGAAACTGGATTTCTAGCAAGGGAGAG
AGCTCTGAATCGTAAAGGAAGAGTCTTTAAGGTTAGCTGTAACAAAGGTTTAGGCTTTAA
CGGCGGCGGAGATAACAACGGGAACAACGGGAGGATCCTCGGGAACCTCGCTTTGGCTAT
TGGTTTGACTTATCTCTCTATGACTGGTCAGCTTGGTTGGGTTCTCGACGCAATTGTTTC
CGTCTGGCTGGTTGTGGTGATTGTCCCAATTTTGGGGTTGGGAGCTTTTCTTTGGTGGGC
ACAACGAGATATTGTCCAGAGCAGTTGTCCAAATTGCGGAAACGAGTTTCAGATATTCAA
GTCATCGTTGGACGATGAAGTACAGCTTTGCCCTTTCTGCACTCAGCCATTCTCAGTTGT
GGATGATAAGTTTGT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2E813JQ 693 0 0
AGGAAGAGTCTTTAAGGTTAGCTGTAACAAAGGTTTAGGCTTTAACGGCGGCGGAGATAA
CAACGGGAACAACGGGAGGATCCTCGGGAACCTCGCTTTGGCTATTGGTTTGACTTATCT
CTCTATGACTGGTCAGCTTGGTTGGGTTCTCGACGCAATTGTTTCCGTCTGGCTGGTTGT
GGTGATTGTCCCAATTTTGGGGTTGGGAGCTTTTCTTTGGTGGGCACAACGAGATATTGT
CCAGAGCAGTTGTCCAAATTGCGGAAACGAGTTTCAGATATTCAAGTCATCGTTGGACGA
TGAAGTACAGCTTTGCCCTTTTTGCACTCAGCCATTTTCAGTTGTGGATGATAAGTTTGT
TAAGGAACCAGTGAAATTTTCCAACCAAACTACTGCTTTCGGACAAGACCTAAATGGGTT
TTTTTTTCCACCTAAGAAAGGAAAGGGTTTTTCAACAGCGGTCGTGGACATTGAAGCTGA
AGTAACAGATGCAGACTGAAAATGCGACCCAACTTATTTTGCAGTAAATCGAGCAAAGAA
GATATTGTAGAGACAAAACAACAAACTTGTGCAAAGAGGTCGTTGTTGGATGTAGAAGTG
ATATAGAAATACAGATGCATATGTACATATACATGTCCTTGACACTGTTATTACATTGTG
ATCTTTGTTGTTTTAGTGATCGTTTGAAGTATT

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL5394Contig1 933 2 2 U
GGATCACTCTCAACAAACGTACAAATCATGAGTGATCCCGAGAAAACAAAAGTGAATACT
GAGGAAAAAATTAATGAAAATAGTGATGAAAGTGATTACCTCTGGAGCGATGAGGAAGAA
GAAGGGGAGATACGCGAAATCGTTCTCGCCCTTCCCGCAATGAGTCTTGGTGATGTGGAT
GAAGCAACCCGCCAAAAAGCCGTCGCTGCGGCTGACTTGTTGATTGCTGCCGTTCAAGAA
GCGGCGGCGACTAAAGGCAACATGGAACAAGGGGTTGGTGGAAGTGTTGAAAAAGCTAAG
AAGAAAAGGGGTCGTCTTCCAAGGACGGTTATGTCGGACGACTTAGCAGATGTGGCCGGC
GCGTCCGATTCTAAAGCCACCGTGGTGGCTGGAGATGAAGAGCCGGCAAAGAAGCCCAGG
AAGAAAGGTTCTCCTAAGTTGATTAACCCACCTGAAGGTCCTCCTAAATGTAACGTTTGC
GGGAGAAGTTTTCTTTCTTGGAAAGCTGTCTTTGGCCACTTACGGGCTCATACAGATAGG
GGCTACTTTGGGTTCTTCCCTCCGCCCACACTTAGTGCGGCCGTGGAAGCATCTGGGGGT
GCTGTTGATGCTTCTTGCGGTGGAAGAGGGCTTGGTTTAGGCACTGGAGGGTTAGATTTT
GATTTGAATGCTGACCCGATTGATGAGGATAAGGAGGAAACTGGAACTGGATTTGCCCCA
AAGTTTGATCTCAACAGGTCGCCACCCCAAGATGAAGATGAGAATAAAGAAGATAAAGCT
GAGTGAAGGCATTGCGTGACCTAAAACATTTGAATTTACTATTTTTTTGCTTGATTTAAG
TTTTTTGCATGTGTGTGCATGCAATCAGTACGTACCTTTCCTTGTTTACATTGTTTTTTT
CGGTTTGTTTCTTTGAAGAAAATACAAAATAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET39TF U 1
AF RR2ET39JQ C 273
BS 1 635 RR2ET39TF
BS 636 933 RR2ET39JQ

RD RR2ET39TF 635 0 0
GGATCACTCTCAACAAACGTACAAATCATGAGTGATCCCGAGAAAACAAAAGTGAATACT
GAGGAAAAAATTAATGAAAATAGTGATGAAAGTGATTACCTCTGGAGCGATGAGGAAGAA
GAAGGGGAGATACGCGAAATCGTTCTCGCCCTTCCCGCAATGAGTCTTGGTGATGTGGAT
GAAGCAACCCGCCAAAAAGCCGTCGCTGCGGCTGACTTGTTGATTGCTGCCGTTCAAGAA
GCGGCGGCGACTAAAGGCAACATGGAACAAGGGGTTGGTGGAAGTGTTGAAAAAGCTAAG
AAGAAAAGGGGTCGTCTTCCAAGGACGGTTATGTCGGACGACTTAGCAGATGTGGCCGGC
GCGTCCGATTCTAAAGCCACCGTGGTGGCTGGAGATGAAGAGCCGGCAAAGAAGCCCAGG
AAGAAAGGTTCTCCTAAGTTGATTAACCCACCTGAAGGTCCTCCTAAATGTAACGTTTGC
GGGAGAAGTTTTCTTTCTTGGAAAGCTGTCTTTGGCCACTTACGGGCTCATACAGATAGG
GGCTACTTTGGGTTCTTCCCTCCGCCCACACTTAGTGCGGCCGTGGAAGCATCTGGGGGT
GCTGTTGATGCTTCTTGCGGTGGAAGAGGGCTTGG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2ET39JQ 661 0 0
GGTTGGTGGAAGTGTTGAAAAAGCTAAGAAGAAAAGGGGTCGTCTTCCAAGGACGGTTAT
GTCGGACGACTTAGCAGATGTGGCCGGCGCGTCCGATTCTAAAGCCACCGTGGTGGCTGG
AGATGAAGAGCCGGCAAAGAAGCCCAGGAAGAAAGGTTCTCCTAAGTTGATTAACCCACC
TGAAGGTCCTCCTAAATGTAACGTTTGCGGGAGAAGTTTTTTTTCTTGGAAAGCTGTCTT
TGGCCACTTACGGGCTCATACAGATAGGGGCTACTTTGGGTTTTTCCCTCCGCCCACACT
TAGTGCGGCCGTGGAAGCATTTGGGGGTGCTGTTGATGCTTCTTGCGGTGGAAGAGGGCT
TGGTTTAGGCACTGGAGGGTTAGATTTTGATTTGAATGCTGACCCGATTGATGAGGATAA
GGAGGAAACTGGAACTGGATTTGCCCCAAAGTTTGATCTCAACAGGTCGCCACCCCAAGA
TGAAGATGAGAATAAAGAAGATAAAGCTGAGTGAAGGCATTGCGTGACCTAAAACATTTG
AATTTACTATTTTTTTGCTTGATTTAAGTTTTTTGCATGTGTGTGCATGCAATCAGTACG
TACCTTTCCTTGTTTACATTGTTTTTTTCGGTTTGTTTCTTTGAAGAAAATACAAAATAA
T

QA 1 661 1 661
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5396Contig1 306 2 1 U
GGACGTCGTATCGTATTTCGGGAGAAGAGTGAAGCGCATCTGGGGTGGTGGCCAAAAAAG
CATATGTTATATAAAGTGTTGCGTAGGAGGGATGGATGATTAAGTTCTAAACTTCAAACT
AAAAGAAAAAAAAGAAAGAAAAAACTTTATTTCTTAGACTCGACGATTTGCTTTTGATCA
TTTCTCGTCTGCCTGCTGGGGGGAGGGAATGGATTCTGTTAGAAGCACCTACACGATGAT
GCGAGGTCGTCACATTGAGAAACGTGTTCCTTCAAAGAGTTCTCTCTGCTCTCGATAAAC
TGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA53TF U 100
AF RR2DL30TF U 1
BS 1 306 RR2DL30TF

RD RR2EA53TF 111 0 0
GG
AAGTTGTAAACTTCAAACTAAAAGAAAAAAAAGAAAGAAAAAACTTTATTTCTTAGACTC
GACGATTTGCTTTTGATCATTTCTCGTCTGCCTGCTGGGGGGGGGGA
GG

QA 3 109 3 109
DS 

RD RR2DL30TF 306 0 0
GGACGTCGTATCGTATTTCGGGAGAAGAGTGAAGCGCATCTGGGGTGGTGGCCAAAAAAG
CATATGTTATATAAAGTGTTGCGTAGGAGGGATGGATGATTAAGTTCTAAACTTCAAACT
AAAAGAAAAAAAAGAAAGAAAAAACTTTATTTCTTAGACTCGACGATTTGCTTTTGATCA
TTTCTCGTCTGCCTGCTGGGGGGAGGGAATGGATTCTGTTAGAAGCACCTACACGATGAT
GCGAGGTCGTCACATTGAGAAACGTGTTCCTTCAAAGAGTTCTCTCTGCTCTCGATAAAC
TGAACC

QA 1 306 1 306
DS 



AS 1 2

CO CL5397Contig1 1164 2 2 U
GGCCACTAACAACAACAAACAAACAGATCCACAAAACTTTTAAAGGCAACAGAGCAAATC
TAGAGAGAGAGATGGTGACGAAGACGGAGGAGAGAGAGCTAAACCAACTGGAGAACCAAG
TGGAGAACGGAGGCGGAGGCGTATGGGAGTATCTCTGCCTCGTTCGTAAGCTCAAGGTTC
GCCGATCAGAGATGGTGCTCAAGCACGGTCTCTCGATCCTGAACGATCCGGGGAAGCGAT
CCTCTCTTGGTCCAGATGAATGGACGCTATATGAGCAGGTAGCAATTGCAGCTATGGACT
GTCAATCTCTTGCTGTTGCACAGAATTGCATCAAGGTTCTCCAGAAGAAGTTTCCGGAGA
GCAAACGTGTGGGAAAGCTGGAAGCCTTGCTTATAGAAGCTAAAGGAATGTGGGAGGGGG
CTGAAAAGGCCTATTCAATCCTTTTGGAGGATAACCCACTCGACCAAGTGATACACAAAA
GAAAGGTGGCTATGGCCAAGGCACAGGGCAAACCTTCCCTAGCCATTGAACATCTTAACA
AATATCTTGAAGTATTCATGGCTGATCATGATGCGTGGAGAGAACTTGCAGAAATTTATG
TTTCCTTGCAAATGTACAAACAAGCAGCTTTCTGCTGCGAGGAGCTCATTTTATCTCAGC
CTACTCTTCCATTGTACCACTTAGCATACGCTGATGTTCTCTATACGATTGGTGGACTTG
AGAACCTCATCGCAGCAAGAAAGTACTATTCAGCAACCATAGACTTAACAGGTGGTAAAA
GCACAAGAGCCCTCCTCGGAATATGCTTGTGCGGATCAGCGATCGCACAGCTCTCAAGAG
GCAGGAACAAAGAGGACAAGGACATGGCTGCACCAGAGCTTCAGTCTCTAGCTGCAACTG
CATTGGAGAAAGAGTACAAGAAAAAATCTCCGGCCAAACTCAACCTCCTCACGTTTGCGT
TACGAAGCTTGAAAATGTCTTAAGTTCATCATAGACCACAGGATTAAAGTCAACGCAGGC
TCACATTTCTTGGTTTAAAGTTTTTGTTGTCTTTGTTCACTCTCAATCTAATGTTCTTCA
TTTTAGCTCTTGGTTTATTATATACACCGACTCACAGCTACACAGTTTACTAGAGGTGTT
CAATCAAAGCTAGTTACATTTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS47TF U 1
AF RR2BS47JQ C 386
BS 1 731 RR2BS47TF
BS 732 1164 RR2BS47JQ

RD RR2BS47TF 731 0 0
GGCCACTAACAACAACAAACAAACAGATCCACAAAACTTTTAAAGGCAACAGAGCAAATC
TAGAGAGAGAGATGGTGACGAAGACGGAGGAGAGAGAGCTAAACCAACTGGAGAACCAAG
TGGAGAACGGAGGCGGAGGCGTATGGGAGTATCTCTGCCTCGTTCGTAAGCTCAAGGTTC
GCCGATCAGAGATGGTGCTCAAGCACGGTCTCTCGATCCTGAACGATCCGGGGAAGCGAT
CCTCTCTTGGTCCAGATGAATGGACGCTATATGAGCAGGTAGCAATTGCAGCTATGGACT
GTCAATCTCTTGCTGTTGCACAGAATTGCATCAAGGTTCTCCAGAAGAAGTTTCCGGAGA
GCAAACGTGTGGGAAAGCTGGAAGCCTTGCTTATAGAAGCTAAAGGAATGTGGGAGGGGG
CTGAAAAGGCCTATTCAATCCTTTTGGAGGATAACCCACTCGACCAAGTGATACACAAAA
GAAAGGTGGCTATGGCCAAGGCACAGGGCAAACCTTCCCTAGCCATTGAACATCTTAACA
AATATCTTGAAGTATTCATGGCTGATCATGATGCGTGGAGAGAACTTGCAGAAATTTATG
TTTCCTTGCAAATGTACAAACAAGCAGCTTTCTGCTGCGAGGAGCTCATTTTATCTCAGC
CTACTCTTCCATTGTACCACTTAGCATACGCTGATGTTCTCTATACGATTGGTGGACTTG
AGAACCTCATC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2BS47JQ 779 0 0
CTTGCTTATAGAAGCTAAAGGAATGTGGGAGGGGGCTGAAAAGGCCTATTCAATCCTTTT
GGAGGATAACCCACTCGACCAAGTGATACACAAAAGAAAGGTGGCTATGGCCAAGGCACA
GGGCAAACCTTCCCTAGCCATTGAACATCTTAACAAATATCTTGAAGTATTCATGGCTGA
TCATGATGCGTGGAGAGAACTTGCAGAAATTTATGTTTCCTTGCAAATGTACAAACAAGC
AGCTTTCTGCTGCGAGGAGCTCATTTTATCTCAGCCTACTCTTCCATTGTACCACTTAGC
ATACGCTGATGTTCTCTATACGATTGGTGGACTTGAGAACCTCATCGCAGCAAGAAAGTA
CTATTCAGCAACCATAGACTTAACAGGTGGTAAAAGCACAAGAGCCCTCCTCGGAATATG
CTTGTGCGGATCAGCGATCGCACAGCTCTCAAGAGGCAGGAACAAAGAGGACAAGGACAT
GGCTGCACCAGAGCTTCAGTCTCTAGCTGCAACTGCATTGGAGAAAGAGTACAAGAAAAA
ATCTCCGGCCAAACTCAACCTCCTCACGTTTGCGTTACGAAGCTTGAAAATGTCTTAAGT
TCATCATAGACCACAGGATTAAAGTCAACGCAGGCTCACATTTCTTGGTTTAAAGTTTTT
GTTGTCTTTGTTCACTCTCAATCTAATGTTCTTCATTTTAGCTCTTGGTTTATTATATAC
ACCGACTCACAGCTACACAGTTTACTAGAGGTGTTCAATCAAAGCTAGTTACATTTTAG

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL5398Contig1 973 2 2 U
GGCTCACATTCCTCACCAAACACACGCACACACAAAGATGTCTTCTTTCAAAATATACTT
CTTCTCAGCTCTACTCGCGGCTGCGTTTTCAGCCTCGGCAGCTGACTTCAACAGCGACGT
CAACGTAGCATGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATACTCAACAACGGCCAGCTTCTTACTCT
CACCTTAGACAAGGCCTCTGGTTCTGGTTTTCAGTCCAAAGCAGAGTATTTGTTCGGAAA
GATCGATATGCAGATTAAGCTAGTTCCCGGTAACTCGGCAGGAACAGTAACAACTTTCTA
CCTGAAGTCAGAAGGATCAACTTGGGATGAGATTGATTTTGAGTTCTTGGGTAATATGAG
TGGAGATCCTTATACTTTACATACTAATGTTTACACTCAAGGTAAAGGTGACAAAGAACA
ACAGTTCCATCTCTGGTTTGACCCAACCGCAAACTTCCACACGTACTCAATCCTCTGGAA
CCCTCAAAGAATCATATGGACCGTCGATAATACACCGATTAGAGAGTTCAAGAACTCTGA
GCCGCTCGGTGTTTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGGATGTACGCGAGTTTGTGGAA
CGCAGATGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACAGATTGGTCCAAAGCTCCTTT
CGTGGCTTCTTACAGGAAAATTAAGTGCGACGGTTGTATTCATCCCAACGGAAGGCCGTC
TTGTAGCTCGACGATACCAACCTCTAATTGGTACACTCAACAAATGGATTCGACGAGCCA
AGCTAGGCTCAGGTGGGTCCAGAAGAATTACATGATCTACAATTATTGTACGGATAGTAA
GAGGTTCCCACAGGGAATCCCTCGAGAATGTGCAACAAGCGCGTAGACTTTAAAACTATT
CTATATATATATACATATATTCTCTATGTTCCTCTGCTTTCTTTTTCTTCTATGTGAATG
CTCTGTTACTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD79TF U 1
AF RR2DD79JQ C 287
BS 1 619 RR2DD79TF
BS 620 973 RR2DD79JQ

RD RR2DD79TF 619 0 0
GGCTCACATTCCTCACCAAACACACGCACACACAAAGATGTCTTCTTTCAAAATATACTT
CTTCTCAGCTCTACTCGCGGCTGCGTTTTCAGCCTCGGCAGCTGACTTCAACAGCGACGT
CAACGTAGCATGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATACTCAACAACGGCCAGCTTCTTACTCT
CACCTTAGACAAGGCCTCTGGTTCTGGTTTTCAGTCCAAAGCAGAGTATTTGTTCGGAAA
GATCGATATGCAGATTAAGCTAGTTCCCGGTAACTCGGCAGGAACAGTAACAACTTTCTA
CCTGAAGTCAGAAGGATCAACTTGGGATGAGATTGATTTTGAGTTCTTGGGTAATATGAG
TGGAGATCCTTATACTTTACATACTAATGTTTACACTCAAGGTAAAGGTGACAAAGAACA
ACAGTTCCATCTCTGGTTTGACCCAACCGCAAACTTCCACACGTACTCAATCCTCTGGAA
CCCTCAAAGAATCATATGGACCGTCGATAATACACCGATTAGAGAGTTCAAGAACTCTGA
GCCGCTCGGTGTTTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGGATGTACGCGAGTTTGTGGAA
CGCAGATGATTGGGCAACT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2DD79JQ 687 0 0
GTAACAACTTTCTACCTGAAGTCAGAAGGATCAACTTGGGATGAGATTGATTTTGAGTTC
TTGGGTAATATGAGTGGAGATCCTTATACTTTACATACTAATGTTTACACTCAAGGTAAA
GGTGACAAAGAACAACAGTTCCATCTCTGGTTTGACCCAACCGCAAACTTCCACACGTAC
TCAATCCTCTGGAACCCTCAAAGAATCATATGGACCGTCGATAATACACCGATTAGAGAG
TTCAAGAACTTTGAGCCGCTCGGTGTTTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGGATGTAC
GCGAGTTTGTGGAACGCAGATGATTGGGCAACTAGAGGCGGTCTGGTTAAAACAGATTGG
TCCAAAGCTCCTTTCGTGGCTTCTTACAGGAAAATTAAGTGCGACGGTTGTATTCATCCC
AACGGAAGGCCGTCTTGTAGCTCGACGATACCAACCTCTAATTGGTACACTCAACAAATG
GATTCGACGAGCCAAGCTAGGCTCAGGTGGGTCCAGAAGAATTACATGATCTACAATTAT
TGTACGGATAGTAAGAGGTTCCCACAGGGAATCCCTCGAGAATGTGCAACAAGCGCGTAG
ACTTTAAAACTATTCTATATATATATACATATATTCTCTATGTTCCTCTGCTTTCTTTTT
CTTCTATGTGAATGCTCTGTTACTTCT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL5399Contig1 723 2 11 U
GATATGTAATATGATTTGAACATCATAATAACTTATTTTTCATATTCTTAATTATTTTAC
GTTTCTTTGATTTTTATTTTGGTCTACATCTCCTAAACACAAAGGAAAGTTATAAAATTA
TGAGAGCATAATTACATATTAAATATTTTACACAACAAAGTAAATTATGAATGTGTTGGT
ATTTCTTAATCTACTTTGTATTTTAAAATCAAAAACAGGTATTAAATTATCAAAAAAACA
GTAAAACACATAAAATCCAAGTAATATATTTTTTTAAATTAAACAAAAAACTAAAGTTCG
ACGATAATTTAGAAGAAATTTTTTTTAAATGAATTGAGATAATGACAATATTTCATTGGT
TTACTTGATCAATACATACATTTACTTATCTTAATATTTCATAAGTTTACTTTGAATAAA
AGAAAAAATAGATAATGATAGTTTTATTATTTAAGTTAACTTATGGTTAATTATATAATG
ATAAATTTAATTATTCATTAAAATATAGCTATTTTAGCCATTTGAAAACTAAAACATTAA
ACACATGTTCATAACATGATTACATAAACAACTCTTTAAACTTAATATCAAAGCATATTT
TCTTATAGATTAAACAGTAGTAAGACATACACGTGAAATAACTACCGAAATAATTCAGAA
TACCTAATTCATAATTTCAAACTCCATGTAATAAAATTGATTTGTTCATAGTCTTTTAAA
CTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2C437TF U 98
AF RR2C437JQ C 1
BS 1 97 RR2C437JQ
BS 98 253 RR2C437TF
BS 254 254 RR2C437JQ
BS 255 275 RR2C437TF
BS 276 276 RR2C437JQ
BS 277 425 RR2C437TF
BS 426 426 RR2C437JQ
BS 427 433 RR2C437TF
BS 434 434 RR2C437JQ
BS 435 450 RR2C437TF
BS 451 723 RR2C437JQ

RD RR2C437TF 353 0 0
CACAAAGGAAAGTTATAAAATTATGAGAGCATAATTACATATTAAATATTTTACACAACA
AAGTAAATTATGAATGTGTTGGTATTTCTTAATCTACTTTGTATTTTAAAATCAAAAACA
GGTATTAAATTATCAAAAAAACAGTAAAACACATAAGATCCAAGTAATATATTTTTTTGA
ATTAAACAAAAAACTAAAGTTCGACGATAATTTAGAAGAAATTTTTTTTAAATGAATTGA
GATAATGACAATATTTCATTGGTTTACTTGATCAATACATACATTTACTTATCTTAATAT
TTCATAAGTTTACTTTGAATAAAAGAAAGAATAGATGATGATAGTTTTATTAT

QA 1 353 1 353
DS 

RD RR2C437JQ 723 0 0
GATATGTAATATGATTTGAACATCATAATAACTTATTTTTCATATTCTTAATTATTTTAC
GTTTCTTTGATTTTTATTTTGGTCTACATCTCCTAAACACAAAGGAAAGTTATAAAATTA
TGAGAGCATAATTACATATTAAATATTTTACACAACAAAGTAAATTATGAATGTGTTGGT
ATTTCTTAATCTACTTTGTATTTTAAAATCAAAAACATGTATTAAATTATCAAAAAAACA
GTAAAACACATAAAATCCAAGTAATATATTTTTTTAAATTAAACAAAAAACTAAAGTTCG
ACGATAATTTAGAAGAAATTTTTTTTAAATGAATTGAGATAATGACAATATTTCATTGGT
TTACTTGATCAATACATACATTTACTTATCTTAATATTTCATAAGTTTACTTTTAATAAA
AGAAAAAATAGATAATGATAGTTTTATTATTTAAGTTAACTTATGGTTAATTATATAATG
ATAAATTTAATTATTCATTAAAATATAGCTATTTTAGCCATTTGAAAACTAAAACATTAA
ACACATGTTCATAACATGATTACATAAACAACTCTTTAAACTTAATATCAAAGCATATTT
TCTTATAGATTAAACAGTAGTAAGACATACACGTGAAATAACTACCGAAATAATTCAGAA
TACCTAATTCATAATTTCAAACTCCATGTAATAAAATTGATTTGTTCATAGTCTTTTAAA
CTC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL5400Contig1 783 2 4 U
GAACATCATTTCCTCTGAGGATGTCACGCTTTGTGAGGTGGTGACTGTTACTGGGGAGGC
ATCACAGGACGAAGGATGGGTGGTGTGTCGTATTTTTAAGAAAAAGAATCTTCACAAAAC
CTTAAACAGTTCCGTCGGAGAAGCTTCCCTTAGTGGCGGCGGAGACATGCAAGGGCGACG
TCCTCATCTCAGATGTCCACCGATGATACTATCGAGCAATTCCTAGAACTTATGGGGCGA
TCTTGTAAAGAAGAGCTAAATCTAGACCCTTTCATGAAACTCCCAAACCTCGAGAGCCCT
GGCAGTCAAACAGTCAACAACAACCGCCACGTCAACTCTCCTGACACATATCATGACATA
TACGTCAACAACGTGGTCGACACTAGCTTCGTTACCAGCTGGGCCGCTTTGGACCGGCTT
GTGGCCTCGCAGCTAAACGGACCCATATCATACTCAATCGCAACCGTCGATGAGAGCCAC
GTGGAACAAGATCATCTTGCCCTGCCTAGCATAAACCGGTCTGGTTCGTACCACGCCGGT
TTAATTCAAGAATATACACCAGAGATGGAGCTATGGAGCACGACGTCCTCTCTACTATCA
TCATCTGACTCATTTCGCCACGTGTCTAACGGTAGTGGATAATGGAAATGGAAAGAAAGA
GAGGCACACAAAAGAAAGTCGATTTACATGTGTAGAAAGATATAATCATACCATATAGTT
GTTGAGGGAAAGTCATATTTGTGATAATTACAGTGGTTATGTGAAATATGGTAAAACAGA
ATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2E530TF U 1
AF RR2E530JQ C 389
BS 1 704 RR2E530TF
BS 705 705 RR2E530JQ
BS 706 721 RR2E530TF
BS 722 783 RR2E530JQ

RD RR2E530TF 721 0 0
GAACATCATTTCCTCTGAGGATGTCACGCTTTGTGAGGTGGTGACTGTTACTGGGGAGGC
ATCACAGGACGAAGGATGGGTGGTGTGTCGTATTTTTAAGAAAAAGAATCTTCACAAAAC
CTTAAACAGTTCCGTCGGAGAAGCTTCCCTTAGTGGCGGCGGAGACATGCAAGGGCGACG
TCCTCATCTCAGATGTCCACCGATGATACTATCGAGCAATTCCTAGAACTTATGGGGCGA
TCTTGTAAAGAAGAGCTAAATCTAGACCCTTTCATGAAACTCCCAAACCTCGAGAGCCCT
GGCAGTCAAACAGTCAACAACAACCGCCACGTCAACTCTCCTGACACATATCATGACATA
TACGTCAACAACGTGGTCGACACTAGCTTCGTTACCAGCTGGGCCGCTTTGGACCGGCTT
GTGGCCTCGCAGCTAAACGGACCCATATCATACTCAATCGCAACCGTCGATGAGAGCCAC
GTGGAACAAGATCATCTTGCCCTGCCTAGCATAAACCGGTCTGGTTCGTACCACGCCGGT
TTAATTCAAGAATATACACCAGAGATGGAGCTATGGAGCACGACGTCCTCTCTACTATCA
TCATCTGACTCATTTCGCCACGTGTCTAACGGTAGTGGATAATGGAAATGGAAAGAAAGA
GAGGCACACAAAAGAAAGTCGATTTACATGTGTAGAAAGATATA*TCATACCATATAGTT
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2E530JQ 395 0 0
TCGTTACCAGCTGGGCCGCTTTGGACCGGCTTGTGGCCTCGCAGCTAAACGGACCCATAT
CATACTCAATCGCAACCGTCGATGAGAGCCACGTGGAACAAGATCATCTTGCCCTGCCTA
GCATAAACCGGTCTGGTTCGTACCACGCCGGTTTAATTCAAGAATATACACCAGAGATGG
AGCTATGGAGCACGACGTCCTCTCTACTATCATCATCTGACTCATTTCGCCACGTGTCTA
ACGGTAGTGGATAATGGAAATGGAAAGAAAGAGAGGCACACAAAAGAAAGTCGATTTACA
TGTGTAGAAAGATATAATCATACCATATAGTTGTTGAGGGAAAGTCATATTTGTGATAAT
TACAGTGGTTATGTGAAATATGGTAAAACAGAATA

QA 1 395 1 395
DS 



AS 1 2

CO CL5401Contig1 1317 2 6 U
GGAGCTTCATTTCTTTATCTTCATCCTCACGCGCAGATTCCTTGTGGATATAACCCTCCT
TGATATTTTTTCTTGTTTCCACGATTTGAATCTAGGCTTTCACGGCTCGTTTGGAGAATC
CATCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCCGCATCAAAGTTTCTGAAAATCTCTGTTTTTTAA
TCTCCGAATCGAAATTAGAGAATTAGGGCTTTTACGTTGGGTTCTAGGGTTTCGAAGAGC
ATAAGATAATAATGCCTTCGGTGCCCACTAAGCTTCTGCTCCTTCTCCTTTTGGCTCCTT
CGTTGACTCCTTATCATTCCGGTCTGTCTTCGCATCGTCTTAAACCTCTTGAAAAGTCTG
ATTGGCGTGGTAATCTTAGTTAACGTCTCCACTCTCCATCTCCTTCTTCTTGACCCTTTT
CTTCTCTCCCCTTCCTCGTCTTGCCCGTGAAATTTTCCTAGCTCGATCTTTGGTGTTTTT
TCACTTTTTTTGTCGTTGCTTGATTCGCAAGTTACAACCCCACAAAGTTGGAATATGAGC
TCTGTTTGTGGGAAGTTGGATTTCAAAGATGCAGACTTTGACGTCTCCAATACGAGTCCT
CCCACGCAATGCTCTAATGGCTCTAAGCATTCCTCTCAAGCTGGATCTGATGAGTCTCAG
GAGTCTGATGGAGATGAAACTGGTTATATAAACCAAACTGAGAATGAAGGATCAGTTACC
AAGGATTTAGGCAAATCCACTTTAGGTTCTTTGCCTCCCATGTCCTCAGATGATGAAGAC
AAGGATGAGAATATTAATATTACACCAGTTGTTCTCATCCCAGCCATTAAAGGCAGCCGG
GAGAAGCACGGCTTGACACTGAAGAAGTCTAGTGTTTCATGGGCGGATGACGTGTACGAT
CCTCCTCCCTCCATAGCCTCGCACACACGAAACAAGAAGCAGCAGCAGCAGAAGTCCAAG
AGCAAAGACAACCACAAGAAGACCGGAAAGAAAGGTCAGAAGAACTCTTCCTCTCGTAGT
GGCAAGGACAAGAAGCAATCTGCTCGCAAACACAGCCGCGAGAAATTTGATTGGGTTACT
CAGCTGCCTATAGTTGCAGCATCTTCTTGAAGATAGCTCATTGGCTGGCTTATTACCAAA
GCACATCCATGAGCTTACCTCCCTCTTTTGTCTAATAAATAATCAAATCACGTTTGTGTG
TGTTTCAGTTTGACTTCAGCTTTTCCTTTGGGTAATGTTCAAATACTAAAACACTATTGT
GAAGATTTTGTTGAAGTTTGGTTCTTGTTTTTTTGTAATTTAAGTTTCATCTTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS38TF U 1
AF RR2AS38JQ C 492
BS 1 660 RR2AS38TF
BS 661 661 RR2AS38JQ
BS 662 783 RR2AS38TF
BS 784 784 RR2AS38JQ
BS 785 828 RR2AS38TF
BS 829 1317 RR2AS38JQ

RD RR2AS38TF 828 0 0
GGAGCTTCATTTCTTTATCTTCATCCTCACGCGCAGATTCCTTGTGGATATAACCCTCCT
TGATATTTTTTCTTGTTTCCACGATTTGAATCTAGGCTTTCACGGCTCGTTTGGAGAATC
CATCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCCGCATCAAAGTTTCTGAAAATCTCTGTTTTTTAA
TCTCCGAATCGAAATTAGAGAATTAGGGCTTTTACGTTGGGTTCTAGGGTTTCGAAGAGC
ATAAGATAATAATGCCTTCGGTGCCCACTAAGCTTCTGCTCCTTCTCCTTTTGGCTCCTT
CGTTGACTCCTTATCATTCCGGTCTGTCTTCGCATCGTCTTAAACCTCTTGAAAAGTCTG
ATTGGCGTGGTAATCTTAGTTAACGTCTCCACTCTCCATCTCCTTCTTCTTGACCCTTTT
CTTCTCTCCCCTTCCTCGTCTTGCCCGTGAAATTTTCCTAGCTCGATCTTTGGTGTTTTT
TCACTTTTTTTGTCGTTGCTTGATTCGCAAGTTACAACCCCACAAAGTTGGAATATGAGC
TCTGTTTGTGGGAAGTTGGATTTCAAAGATGCAGACTTTGACGTCTCCAATACGAGTCCT
CCCACGCAATGCTCTAATGGCTCTAAGCATTCCTCTCAAGCTGGATCTGATGAGTCTCAG
*AGTCTGATGGAGATGAAACTGGTTATATAAACCAAACTGAGAATGAAGGATCAGTTACC
AAGGATTTAGGCAAATCCACTTTAGGTTCTTTGCCTCCCATGTCCTCAGATGATGAAGAC
AAG*ATGAGAATATTAATATTACACCAGTTGTTCTCATCCCAGCCATT

QA 1 828 1 828
DS 

RD RR2AS38JQ 826 0 0
GTCGTTGCTTGATTCGCAAGTTACAACCCCACAAAGTTGGAATATGAGCTCTGTTTGTGG
GAAGTTGGATTTCAAAGATGCAGACTTTGACGTCTCCAATACGAGTCCTCCCACGCAATG
CTCTAATGGCTCTAAGCATTCCTCTCAAGCTGGATCTGATGAGTCTCAGGAGTCTGATGG
AGATGAAACTGGTTATATAAACCAAACTGAGAATGAAGGATCAGTTACCAAGGATTTAGG
CAAATCCACTTTAGGTTCTTTGCCTCCCATGTCCTCAGATGATGAAGACAAGGATGAGAA
TATTAATATTACACCAGTTGTTCTCATCCCAGCCATTAAAGGCAGCCGGGAGAAGCACGG
CTTGACACTGAAGAAGTCTAGTGTTTCATGGGCGGATGACGTGTACGATCCTCCTCCCTC
CATAGCCTCGCACACACGAAACAAGAAGCAGCAGCAGCAGAAGTCCAAGAGCAAAGACAA
CCACAAGAAGACCGGAAAGAAAGGTCAGAAGAACTCTTCCTCTCGTAGTGGCAAGGACAA
GAAGCAATCTGCTCGCAAACACAGCCGCGAGAAATTTGATTGGGTTACTCAGCTGCCTAT
AGTTGCAGCATCTTCTTGAAGATAGCTCATTGGCTGGCTTATTACCAAAGCACATCCATG
AGCTTACCTCCCTCTTTTGTCTAATAAATAATCAAATCACGTTTGTGTGTGTTTCAGTTT
GACTTCAGCTTTTCCTTTGGGTAATGTTCAAATACTAAAACACTATTGTGAAGATTTTGT
TGAAGTTTGGTTCTTGTTTTTTTGTAATTTAAGTTTCATCTTTGCG

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL5402Contig1 1236 2 2 U
GGACACACACAACAAACAAAGCTCAAATACTTTCTTATACGTTACTAAACAAAATACAAA
ATGGGTCGTGGTTATAACTTACTATTCATTCTAGTAACTTTTTTAGTATTGGTCGCAGCT
GTAACTGCACAAGGAAATCGTGGTCCGAGCCGTGGAGGTAGTGGTCGAAGACCACGTGTT
GGGTATTATGGCAATAGATGCCGAAACGTAGAGTCCATTGTGGCATCGGTGGTTCGAGCA
CATGTCCGGTCCAACCCGGCTAATGCACCCGGGATTTTGCGTATGCATTTTCACGATTGC
TTTGTTCGTGGCTGCGATGGGTCAGTTCTCATCGCTGGTAATAGCTCTGAGAGAACAGCG
GGTCCAAACCGTTCACTGAGAGGGTTTGAAGCTATTGAAGAAGCTAAGACTAGGCTTGAG
GCTGCTTGTCCTAGAACTGTTTCTTGTGCGGATATTCTCACCCTTGCTGCACGCGAAGCC
GTTGTTTTGACCGGTGGACAAGGGTGGCGAGTGCCATTGGGACGTCTGGATGGCCGAATC
TCGCAAGCCTCGGACGTGATCTTACCTGGACCATTCGACCCCGTCGACAAGCAGAAGCGA
GACTTTGCTGCTAAAACTCTCAACACATTAGACCTCGTAACTCTTGTTGGCGGACACACA
ATAGGAACAGCTGGTTGCGGTTTGGTGAGAGGCCGGTTCTTTAATTTCAACGGCACAGGA
CAACCAGACCCATCAATCGATCCGAGGTTCGTACCATTGGTTCAGGCTCGATGCCCTCAA
ACCGGAGACGCATCAGCCCGAGTCGACTTAGACGCTGGTAGTGTTGGGAGGTTTGATACA
TCGTTCCTAAGGAACGCGAGGTCAAGCCGTGTGGTTCTCCAATCTGACCTAGTCTTGTGG
AGGGACCCCGAGACACGAGCCATCATAGAACGGTTATTAGGCTTACGCCGACCATCATTT
AGGTTTGGAACAGAGTTCGGGAAGTCGATGGTGAAGATGAGTCTTATATACGTTAAGACA
GGATCAGATGGGGAGATTCGTACGGTTTGCTCTAGGATCAACTGATTAAGAATATGAAAG
CACATCAGTGTGGTTTGGTTTTAATCTGTGATGGTTAATCAATAATCATTTGTTTTATAC
GATAAGTTTGCTATATCTTCTTGTGGTTTGATTGCTACGTTATGAATATTCAAGTGTAAG
ATTGTAATTGTAACATGAATGTATTATACTATATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI69TF U 1
AF RR2BI69JQ C 531
BS 1 761 RR2BI69TF
BS 762 1236 RR2BI69JQ

RD RR2BI69TF 761 0 0
GGACACACACAACAAACAAAGCTCAAATACTTTCTTATACGTTACTAAACAAAATACAAA
ATGGGTCGTGGTTATAACTTACTATTCATTCTAGTAACTTTTTTAGTATTGGTCGCAGCT
GTAACTGCACAAGGAAATCGTGGTCCGAGCCGTGGAGGTAGTGGTCGAAGACCACGTGTT
GGGTATTATGGCAATAGATGCCGAAACGTAGAGTCCATTGTGGCATCGGTGGTTCGAGCA
CATGTCCGGTCCAACCCGGCTAATGCACCCGGGATTTTGCGTATGCATTTTCACGATTGC
TTTGTTCGTGGCTGCGATGGGTCAGTTCTCATCGCTGGTAATAGCTCTGAGAGAACAGCG
GGTCCAAACCGTTCACTGAGAGGGTTTGAAGCTATTGAAGAAGCTAAGACTAGGCTTGAG
GCTGCTTGTCCTAGAACTGTTTCTTGTGCGGATATTCTCACCCTTGCTGCACGCGAAGCC
GTTGTTTTGACCGGTGGACAAGGGTGGCGAGTGCCATTGGGACGTCTGGATGGCCGAATC
TCGCAAGCCTCGGACGTGATCTTACCTGGACCATTCGACCCCGTCGACAAGCAGAAGCGA
GACTTTGCTGCTAAAACTCTCAACACATTAGACCTCGTAACTCTTGTTGGCGGACACACA
ATAGGAACAGCTGGTTGCGGTTTGGTGAGAGGCCGGTTCTTTAATTTCAACGGCACAGGA
CAACCAGACCCATCAATCGATCCGAGGTTCGTACCATTGGT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2BI69JQ 706 0 0
TGGCCGAATCTCGCAAGCCTCGGACGTGATCTTACCTGGACCATTCGACCCCGTCGACAA
GCAGAAGCGAGACTTTGCTGCTAAAACTCTCAACACATTAGACCTCGTAACTCTTGTTGG
CGGACACACAATAGGAACAGCTGGTTGCGGTTTGGTGAGAGGCCGGTTCTTTAATTTCAA
CGGCACAGGACAACCAGACCCATCAATCGATCCGAGGTTCGTACCATTGGTTCAGGCTCG
ATGCCCTCAAACCGGAGACGCATCAGCCCGAGTCGACTTAGACGCTGGTAGTGTTGGGAG
GTTTGATACATCGTTCCTAAGGAACGCGAGGTCAAGCCGTGTGGTTCTCCAATCTGACCT
AGTCTTGTGGAGGGACCCCGAGACACGAGCCATCATAGAACGGTTATTAGGCTTACGCCG
ACCATCATTTAGGTTTGGAACAGAGTTCGGGAAGTCGATGGTGAAGATGAGTCTTATATA
CGTTAAGACAGGATCAGATGGGGAGATTCGTACGGTTTGCTCTAGGATCAACTGATTAAG
AATATGAAAGCACATCAGTGTGGTTTGGTTTTAATCTGTGATGGTTAATCAATAATCATT
TGTTTTATACGATAAGTTTGCTATATCTTCTTGTGGTTTGATTGCTACGTTATGAATATT
CAAGTGTAAGATTGTAATTGTAACATGAATGTATTATACTATATGA

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL5403Contig1 887 2 2 U
GGGTTCGTCTTCTTGCTACTGCAATGCGTTCTCTTCAGTACTTCCCCTCCGTCTCAATTT
CCTTCAGAACACAAAAAGACGTGAATACCCCTCTCCTTCCTCGCTTATCTCCCATTAGTA
GAACCCGTAATTATCCTCTACCCTTGAGGGCAGCGACGTCGACTGACGAAATCCCCCCTA
ACGCCGTTCGCCGGAAAACAGACAGCAACTGGAGAGGAGGGTTCAGTCTCGGCGTAGACT
TAGGGTTGTCGAAGACAGGAATCGCACTCAGTAAAGGCTACACCTTTCGTCCTCTCACGG
TTTTGAAATCGAGAGGGCAGAAGCTCGAGACTAGGCTGTTGGAAATTGCAGAAGAAGAGG
AGGTTGATGAGTTCATAATTGGGTTGCCGAGATCTTCTGACGGTAAAGAGACGGTCCAGT
CTAATAAAGTTCGATCTGTCGCTGGAAGGCTTGCGGTTCAAGCAGCCGAGAGGGGTTGGA
GGGTTTATGTATTGGATGAACATGGGACGTCAACAGAAGCTTCAGATAGAATGATTGTAA
TGGGAATTGGCAAGAGTGAAAGACAGAACAGAGAAGATGCGTACGCCGCTGTGATATTGT
TGGAGAGGTATTTCTCTACACAAGGTCTAGGAGCCGAGATTATACTTCCCAAGAGTTTAG
ACCTCCAAGAAAAGATCAAGAACAGTTCACAGAAAGACCCTGACTTTTTACCGGGAAAGC
TCGAAGAGTTTTACAGATTTTAATGTAGTTCCTCTACAAAATTATCAATATTTTTTTCTC
TGTTTTACAAGTCAGAACAGAGTAAAGTAAACTTGTGAACACAAGTGACATACGTGTACA
CATCTAAGCCCAATAAAAGTGGATAATGGAACTCTTTTACACGTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D156TF U 1
AF RR2D156JQ C 290
BS 1 618 RR2D156TF
BS 619 887 RR2D156JQ

RD RR2D156TF 618 0 0
GGGTTCGTCTTCTTGCTACTGCAATGCGTTCTCTTCAGTACTTCCCCTCCGTCTCAATTT
CCTTCAGAACACAAAAAGACGTGAATACCCCTCTCCTTCCTCGCTTATCTCCCATTAGTA
GAACCCGTAATTATCCTCTACCCTTGAGGGCAGCGACGTCGACTGACGAAATCCCCCCTA
ACGCCGTTCGCCGGAAAACAGACAGCAACTGGAGAGGAGGGTTCAGTCTCGGCGTAGACT
TAGGGTTGTCGAAGACAGGAATCGCACTCAGTAAAGGCTACACCTTTCGTCCTCTCACGG
TTTTGAAATCGAGAGGGCAGAAGCTCGAGACTAGGCTGTTGGAAATTGCAGAAGAAGAGG
AGGTTGATGAGTTCATAATTGGGTTGCCGAGATCTTCTGACGGTAAAGAGACGGTCCAGT
CTAATAAAGTTCGATCTGTCGCTGGAAGGCTTGCGGTTCAAGCAGCCGAGAGGGGTTGGA
GGGTTTATGTATTGGATGAACATGGGACGTCAACAGAAGCTTCAGATAGAATGATTGTAA
TGGGAATTGGCAAGAGTGAAAGACAGAACAGAGAAGATGCGTACGCCGCTGTGATATTGT
TGGAGAGGTATTTCTCTA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2D156JQ 598 0 0
TCCTCTCACGGTTTTGAAATCGAGAGGGCAGAAGCTCGAGACTAGGCTGTTGGAAATTGC
AGAAGAAGAGGAGGTTGATGAGTTCATAATTGGGTTGCCGAGATCTTCTGACGGTAAAGA
GACGGTCCAGTCTAATAAAGTTCGATCTGTCGCTGGAAGGCTTGCGGTTCAAGCAGCCGA
GAGGGGTTGGAGGGTTTATGTATTGGATGAACATGGGACGTCAACAGAAGCTTCAGATAG
AATGATTGTAATGGGAATTGGCAAGAGTGAAAGACAGAACAGAGAAGATGCGTACGCCGC
TGTGATATTGTTGGAGAGGTATTTCTCTACACAAGGTCTAGGAGCCGAGATTATACTTCC
CAAGAGTTTAGACCTCCAAGAAAAGATCAAGAACAGTTCACAGAAAGACCCTGACTTTTT
ACCGGGAAAGCTCGAAGAGTTTTACAGATTTTAATGTAGTTCCTCTACAAAATTATCAAT
ATTTTTTTCTCTGTTTTACAAGTCAGAACAGAGTAAAGTAAACTTGTGAACACAAGTGAC
ATACGTGTACACATCTAAGCCCAATAAAAGTGGATAATGGAACTCTTTTACACGTGCG

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL5404Contig1 1040 2 2 U
CAAAAATGCAAACTTTATCTCCACAATCGCTTCGATGTAAATCAAACCCACTGATTGTAT
CGGAAAGCCATGTCTTCAATCCCAAAGCACTCAACTTTCAAGTCTCTTCCCTGAGTTCTC
CTCCTCACCGCAGAACTCGAACCTGGAGAATCAGAACTTCATCGGAAGAGAACGCAGCAA
ACTCGAGCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGATTTGAAGAAGTCTCTGTCCGGTATTGTCGGAA
ACCAAGTCGAGGAGCTGCTGAGCAGAGAAGAGAACAAGAATCTGCTCGACGGTCTAGAAA
AAGCTTCGATGAGGGTGGAGGTTGCGAAGAGAGAGCTCGCTGAGATTGAGAGGCGAGAAC
TCGAGGCGAAGCTGTTGCAGGATTATGTTGATAAGCTCGAATCAAGAGCCGCTGAGATCG
CAGAATGCCAGCAGGATATTGTGGCAGCGAGGACAATGGTCGAGGAAGCAGAACGCACCT
TGTCCTTAGCAGAGACGGAGGCAACGACGGGAAGTTCAGAAAACGGATATTCGATTGATA
AAGACAAGGAGAGATTAGAATCAGCGAAAGCAGCAGCGATTGCAGCTGCGGTTGGGACCG
TTGCAGAAGTCCCGTTTGCTCTTTCTCAAGTCTCGAGCATTGAGCAGTTTGTTCTCCCCC
TGGGAGTAGCGTTTGCAAGCTGTGCGTTGTTTGGTGTCACATTCAGGTATGTAATCAGAA
GAGACTTGGATGATAGTCATCTCAAATCAGGAGCCGTTGCAGCCTTTGGATTTGTCAAAG
GACTTGGTATGTTAAGCAGAGGACCGCCACTCGAGCTGAGCTGGGAAAGCTTGTTTTCTC
ATGGAATAGACGGCGCCGTTTTAGTTTCTCAGAGCGTGTTGATATTCGCGTTTGCGTCTA
TAAGTTTGGACTTCTGTTTCAAAATTAAGCTCTTAAAACCATTTCCAAGCTCTGCTCAGA
TGTAGAAGCAGCAGTTAAAAAGGTAGAAACGCAAAAGAAAAAAAACATTGTATATTTTCT
TTGAAGATTTATGTATCAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH60TF U 1
AF RR2AH60JQ C 374
BS 1 703 RR2AH60TF
BS 704 1040 RR2AH60JQ

RD RR2AH60TF 703 0 0
CAAAAATGCAAACTTTATCTCCACAATCGCTTCGATGTAAATCAAACCCACTGATTGTAT
CGGAAAGCCATGTCTTCAATCCCAAAGCACTCAACTTTCAAGTCTCTTCCCTGAGTTCTC
CTCCTCACCGCAGAACTCGAACCTGGAGAATCAGAACTTCATCGGAAGAGAACGCAGCAA
ACTCGAGCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGATTTGAAGAAGTCTCTGTCCGGTATTGTCGGAA
ACCAAGTCGAGGAGCTGCTGAGCAGAGAAGAGAACAAGAATCTGCTCGACGGTCTAGAAA
AAGCTTCGATGAGGGTGGAGGTTGCGAAGAGAGAGCTCGCTGAGATTGAGAGGCGAGAAC
TCGAGGCGAAGCTGTTGCAGGATTATGTTGATAAGCTCGAATCAAGAGCCGCTGAGATCG
CAGAATGCCAGCAGGATATTGTGGCAGCGAGGACAATGGTCGAGGAAGCAGAACGCACCT
TGTCCTTAGCAGAGACGGAGGCAACGACGGGAAGTTCAGAAAACGGATATTCGATTGATA
AAGACAAGGAGAGATTAGAATCAGCGAAAGCAGCAGCGATTGCAGCTGCGGTTGGGACCG
TTGCAGAAGTCCCGTTTGCTCTTTCTCAAGTCTCGAGCATTGAGCAGTTTGTTCTCCCCC
TGGGAGTAGCGTTTGCAAGCTGTGCGTTGTTTGGTGTCACATT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2AH60JQ 667 0 0
GTTGCAGGATTATGTTGATAAGCTCGAATCAAGAGCCGCTGAGATCGCAGAATGCCAGCA
GGATATTGTGGCAGCGAGGACAATGGTCGAGGAAGCAGAACGCACCTTGTCCTTAGCAGA
GACGGAGGCAACGACGGGAAGTTCAGAAAACGGATATTCGATTGATAAAGACAAGGAGAG
ATTAGAATCAGCGAAAGCAGCAGCGATTGCAGCTGCGGTTGGGACCGTTGCAGAAGTCCC
GTTTGCTCTTTCTCAAGTCTCGAGCATTGAGCAGTTTGTTCTCCCCCTGGGAGTAGCGTT
TGCAAGCTGTGCGTTGTTTGGTGTCACATTCAGGTATGTAATCAGAAGAGACTTGGATGA
TAGTCATCTCAAATCAGGAGCCGTTGCAGCCTTTGGATTTGTCAAAGGACTTGGTATGTT
AAGCAGAGGACCGCCACTCGAGCTGAGCTGGGAAAGCTTGTTTTCTCATGGAATAGACGG
CGCCGTTTTAGTTTCTCAGAGCGTGTTGATATTCGCGTTTGCGTCTATAAGTTTGGACTT
CTGTTTCAAAATTAAGCTCTTAAAACCATTTCCAAGCTCTGCTCAGATGTAGAAGCAGCA
GTTAAAAAGGTAGAAACGCAAAAGAAAAAAAACATTGTATATTTTCTTTGAAGATTTATG
TATCAAT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL5405Contig1 709 2 2 U
GGGTCGGGGGAGAGGAACGGAACTCAGCAAAAAGAAGAATCCGGAGAAAAAACGTAAAAT
CGAAATGGGTATAGTAGCAGCGATGGGAGTGTTGTTGCCATTCCCTTTCTACTGGTGGCT
ATGGAGGAATCCTCAGTCATGGGTCAATCTCTGCGGCCAAGGAAGAGACCCTTCCACGGC
GATGGCGCGTGTCTCTCACGTCCTCAAGGCTGCTCAACTCCTCTCTCTCTTCTCCGTCGC
CTCTCTCTCCTGGCCTCCTCCGCTCTACTTCTGGCCCCTCATGGCCTTTGGCCAGTTTCT
CAACTTCAGGGTATATCAACTGTTAGGTGAAGCTGGAACATATTACGGTGTTCGGTTCGG
GAAGAGTATACCTTGGGTTACAGAGTTTCCATTTGGGGTCATCAGAGATCCACAGTATGT
TGGGAGCATCATGTCTTTGTTGGCTTGTCTCTCTTGGGTTCCGTTCCACTACATCCTCCT
CTGGTGTCTTGGCTATGTTTTCATGATGCTTGTCGAGTCAAAGGAGGATCCAAGTGCTCG
TGCCAAATCCGTCTCCTGATGTTCTTGGCATAAACCATTAGTTAATAGATAGCTTCACTC
CACTCCCATCTTTGTTGTTTTGACTGTTTCTGTTCTCAGCTTTGTACCCAAACTGGTTTT
ACAGTTTCGTGGAGACTTTATTCATTTTGTTAAATCAAAACTTTAGGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS75JQ C 1
AF RR2CS75TF U 1
BS 1 699 RR2CS75TF
BS 700 709 RR2CS75JQ

RD RR2CS75JQ 709 0 0
GGGTCGGGGGAGAGGAACGGAACTCAGCAAAAAGAAGAATCCGGAGAAAAAACGTAAAAT
CGAAATGGGTATAGTAGCAGCGATGGGAGTGTTGTTGCCATTCCCTTTCTACTGGTGGCT
ATGGAGGAATCCTCAGTCATGGGTCAATCTCTGCGGCCAAGGAAGAGACCCTTCCACGGC
GATGGCGCGTGTCTCTCACGTCCTCAAGGCTGCTCAACTCCTCTCTCTCTTCTCCGTCGC
CTCTCTCTCCTGGCCTCCTCCGCTCTACTTCTGGCCCCTCATGGCCTTTGGCCAGTTTCT
CAACTTCAGGGTATATCAACTGTTAGGTGAAGCTGGAACATATTACGGTGTTCGGTTCGG
GAAGAGTATACCTTGGGTTACAGAGTTTCCATTTGGGGTCATCAGAGATCCACAGTATGT
TGGGAGCATCATGTCTTTGTTGGCTTGTCTCTCTTGGGTTCCGTTCCACTACATCCTCCT
CTGGTGTCTTGGCTATGTTTTCATGATGCTTGTCGAGTCAAAGGAGGATCCAAGTGCTCG
TGCCAAATCCGTCTCCTGATGTTCTTGGCATAAACCATTAGTTAATAGATAGCTTCACTC
CACTCCCATCTTTGTTGTTTTGACTGTTTCTGTTCTCAGCTTTGTACCCAAACTGGTTTT
ACAGTTTCGTGGAGACTTTATTCATTTTGTTAAATCAAAACTTTAGGGC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2CS75TF 701 0 0
GGGTCGGGGGAGAGGAACGGAACTCAGCAAAAAGAAGAATCCGGAGAAAAAACGTAAAAT
CGAAATGGGTATAGTAGCAGCGATGGGAGTGTTGTTGCCATTCCCTTTCTACTGGTGGCT
ATGGAGGAATCCTCAGTCATGGGTCAATCTCTGCGGCCAAGGAAGAGACCCTTCCACGGC
GATGGCGCGTGTCTCTCACGTCCTCAAGGCTGCTCAACTCCTCTCTCTCTTCTCCGTCGC
CTCTCTCTCCTGGCCTCCTCCGCTCTACTTCTGGCCCCTCATGGCCTTTGGCCAGTTTCT
CAACTTCAGGGTATATCAACTGTTAGGTGAAGCTGGAACATATTACGGTGTTCGGTTCGG
GAAGAGTATACCTTGGGTTACAGAGTTTCCATTTGGGGTCATCAGAGATCCACAGTATGT
TGGGAGCATCATGTCTTTGTTGGCTTGTCTCTCTTGGGTTCCGTTCCACTACATCCTCCT
CTGGTGTCTTGGCTATGTTTTCATGATGCTTGTCGAGTCAAAGGAGGATCCAAGTGCTCG
TGCCAAATCCGTCTCCTGATGTTCTTGGCATAAACCATTAGTTAATAGATAGCTTCACTC
CACTCCCATCTTTGTTGTTTTGACTGTTTCTGTTCTCAGCTTTGTACCCAAACTGGTTTT
ACAGTTTCGTGGAGACTTTATTCATTTTGTTAAATCAAA
CT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL5406Contig1 897 2 2 U
CTCTCTCTCCGTCGTCTCCCGGAGAGGAAACGCCGTCGTCTCCACTGAGCACGGTTTATT
AGGATCAAGTTCAGACTTTGATTGTGTGATTCATGGATTAGGAAAGATAAAAGGGAGAAT
CTTTATCTTCTCCAGATTTGTTTTGGATTTGGGTAATACTTTCCATATCTCTGTTGTTGT
GATCTGTGTTATGGAAACGAGTCGTGGAGAGGCTAAAGAAGCCAATAGGTGTGAGAATCA
TAAGGCTATTATTGTCAGTGAAGTTGAGGATCAAGTCTGTGAGGAGGAGGAAGAAGAAGA
AGAAAGTGAGTCACAGTGTTTGTTGCCTCCTCCTAGGAAAGGAGGGATGATGTCTACAAG
TAGTGACAAGATTAAGAGGACTGTGCAGTGGACTGATAACAAAGGAGACAGTCTTGCTGA
GGTTTTAGTATACGAACCAAGTGAAGTAAGCGATTCAGATGACGATGATTCAGATTCGTG
CATCTGCGCCATTATGTAGTCTGCATTCAATCACTATTAACATGGAGTTTTTAACAAAGA
GCTCGTCCTTGTATCTGACTTCTTTTCAGCAACCAGTTATGTGCGGATAAACGAGCGGAC
ATCACACAATCACGCAAGTTTCAGATTTTTGTGCTCAGGTCTTCTGACAAGAAACCAAGT
CCAAACGTGGGATGTACGATCAGTACCCATTTGTCACATTTTAGTTACAGGAGTGAGAGA
GTATATAGAGGTATAGATTACGGCTGTATTATGCAATAGAGGCCTGATCTTCAGGCCGAA
GATCTCTGATTGCTGTTTGGGTCGAGAGCTTTTGATAGCAAACTAATGTATATCTTTCTG
CAACATACATATACAAGCTAATTAAACTGTAAGCAAATGCAGCAATTTTATACCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E849TF U 1
AF RR2E849JQ C 230
BS 1 565 RR2E849TF
BS 566 897 RR2E849JQ

RD RR2E849TF 565 0 0
CTCTCTCTCCGTCGTCTCCCGGAGAGGAAACGCCGTCGTCTCCACTGAGCACGGTTTATT
AGGATCAAGTTCAGACTTTGATTGTGTGATTCATGGATTAGGAAAGATAAAAGGGAGAAT
CTTTATCTTCTCCAGATTTGTTTTGGATTTGGGTAATACTTTCCATATCTCTGTTGTTGT
GATCTGTGTTATGGAAACGAGTCGTGGAGAGGCTAAAGAAGCCAATAGGTGTGAGAATCA
TAAGGCTATTATTGTCAGTGAAGTTGAGGATCAAGTCTGTGAGGAGGAGGAAGAAGAAGA
AGAAAGTGAGTCACAGTGTTTGTTGCCTCCTCCTAGGAAAGGAGGGATGATGTCTACAAG
TAGTGACAAGATTAAGAGGACTGTGCAGTGGACTGATAACAAAGGAGACAGTCTTGCTGA
GGTTTTAGTATACGAACCAAGTGAAGTAAGCGATTCAGATGACGATGATTCAGATTCGTG
CATCTGCGCCATTATGTAGTCTGCATTCAATCACTATTAACATGGAGTTTTTAACAAAGA
GCTCGTCCTTGTATCTGACTTCTTT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2E849JQ 668 0 0
TGTGAGAATCATAAGGCTATTATTGTCAGTGAAGTTGAGGATCAAGTCTGTGAGGAGGAG
GAAGAAGAAGAAGAAAGTGAGTCACAGTGTTTGTTGCCTCCTCCTAGGAAAGGAGGGATG
ATGTCTACAAGTAGTGACAAGATTAAGAGGACTGTGCAGTGGACTGATAACAAAGGAGAC
AGTCTTGCTGAGGTTTTAGTATACGAACCAAGTGAAGTAAGCGATTCAGATGACGATGAT
TCAGATTCTTGCATCTGCGCCATTATGTAGTCTGCATTCAATCACTATTAACATGGAGTT
TTTAACAAAGAGCTCGTCCTTGTATCTGACTTCTTTTCAGCAACCAGTTATGTGCGGATA
AACGAGCGGACATCACACAATCACGCAAGTTTCAGATTTTTGTGCTCAGGTCTTCTGACA
AGAAACCAAGTCCAAACGTGGGATGTACGATCAGTACCCATTTGTCACATTTTAGTTACA
GGAGTGAGAGAGTATATAGAGGTATAGATTACGGCTGTATTATGCAATAGAGGCCTGATC
TTCAGGCCGAAGATCTCTGATTGCTGTTTGGGTCGAGAGCTTTTGATAGCAAACTAATGT
ATATCTTTCTGCAACATACATATACAAGCTAATTAAACTGTAAGCAAATGCAGCAATTTT
ATACCTTC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL5407Contig1 637 2 1 U
GGCTTGCCGTTTCAAACAATGAAACCTCTCCACATATCTCTCTCTCTTTCGCCATTGCCA
TGAAAGTTTAAGCTCTCTCTCTCCGTCTCTCTCTCTCTCTCCGCCTATCTCTCTCTGCAT
CTCCCTATCCACGTCCGCCTATCTCTCTCTCTGCATCTCTCTGTCCGCATCTCTCTCTCT
TCGGATCTTTCTCGCCATGAAAGCTTGAGCTCTCTCTCTCCGTCTCTCTCTCTCTCTCGC
GTCTCTCTCTCTCAGATAATTGTTGCAATGACCTCTGTTCCTGGTACCGATGTAAGTACA
TTTTTTATATGGTAATGTTGGGGAAATAAAAACAGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGG
CAATTAGGGAGCTAATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCCGCCCACTCGAGCCAGC
AGATCTACACTCGTGCCACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCTTTGTCAATGTTTTG
GTTCCTCCAGTCTAATCTCTTTTGATGTATACGTTACTCATCAGAGCTCTCATAGTTCTT
TATGTTTGAACTCCTTCGTACTCGATAAACTCTTTAGAAGGCTGTTTTGAGATATTATGT
CTACTTAATATTCGGAATTGATTTTTATATTTGCTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C328JQ C 1
AF RR2C328TF U 1
BS 1 637 RR2C328TF

RD RR2C328JQ 637 0 0
GGCTTGCCGTTTCAAACAATGAAACCTCTCCACATATCTCTCTCTCTTTCGCCATTGCCA
TGAAAGTTTAAGCTCTCTCTCTCCGTCTCTCTCTCTCTCTCCGCCTATCTCTCTCTGCAT
CTCCCTATCCACGTCCGCCTATCTCTCTCTCTGCATCTCTCTGTCCGCATCTCTCTCTCT
TCGGATCTTTCTCGCCATGAAAGCTTGAGCTCTCTCTCTCCGTCTCTCTCTCTCTCTCGC
GTCTCTCTCTCTCAGATAATTGTTGCAATGACCTCTGTTCCTGGTACCGATGTAAGTACA
TTTTTTATATGGTAATGTTGGGGAAATAAAAACAGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGG
CAATTAGGGAGCTAATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCCGCCCACTCGAGCCAGC
AGATCTACACTCGTGCCACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCTTTGTCAATGTTTTG
GTTCCTCCAGTCTAATCTCTTTTGATGTATACGTTACTCATCAGAGCTCTCATAGTTCTT
TATGTTTGAACTCCTTCGTACTCGATAAACTCTTTAGAAGGCTGTTTTGAGATATTATGT
CTACTTAATATTCGGAATTGATTTTTATATTTGCTCC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2C328TF 637 0 0
GGCTTGCCGTTTCAAACAATGAAACCTCTCCACATATCTCTCTCTCTTTCGCCATTGCCA
TGAAAGTTTAAGCTCTCTCTCTCCGTCTCTCTCTCTCTCTCCGCCTATCTCTCTCTGCAT
CTCCCTATCCACGTCCGCCTATCTCTCTCTCTGCATCTCTCTGTCCGCATCTCTCTCTCT
TCGGATCTTTCTCGCCATGAAAGCTTGAGCTCTCTCTCTCCGTCTCTCTCTCTCTCTCGC
GTCTCTCTCTCTCAGATAATTGTTGCAATGACCTCTGTTCCTGGTACCGATGTAAGTACA
TTTTTTATATGGTAATGTTGGGGAAATAAAAACAGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGG
CAATTAGGGAGCTAATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCCGCCCACTCGAGCCAGC
AGATCTACACTCGTGCCACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCTTTGTCAATGTTTTG
GTTCCTCCAGTCTAATCTCTTTTGATGTATACGTTACTCATCAGAGCTCTCATAGTTCTT
TATGTTTGAACTCCTTCGTACTCGATAAACTCTTTAGAAGGCTGTTTTGAGATATTATGT
CTACTTAATATTCGGAATTGATTTTTATATTTGCTCC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL5408Contig1 637 2 1 U
GGATCGAAAGGAAGAGACCTAGTAGTCATCATCTTCGGCTATCTTACGAAGAAGAATGGC
GTCGAGACCAGGTTTTCTCACGGACTGGCCATGGGCACCTCTTGGAAGCTTTAAGTACTT
GGTGTTGGCGCCGCTTGTTATCGACAGCATCTACTCGTACGCGGCACTGCGATATCACGA
TAAACTTTTGGTCGTGGCGCTAATGTTGTGGCGTATTGTTCATAGCCAGGCTTGGATAAG
TTTCTCCCGTTACCGAACTGCTAAGGGGACCAAACAGATCGTGAACAAGTCCATAGAGTT
TGAGCAAGTCGACAGAGAACGAACTTGGGACGATCAGATCATCTTCAACACTCTTGTTGT
TTACTTAGTCAAAGCTTACGTCATAGGAAACACTCCCGTTCCCTTTTGGCGACTCGATGG
CGTGGTTCTAACCGTTCTCCTCCATACGGGTCCTGTTGAGTTCACCTACTACTGGTTTCA
CCGAGCCCTTCACCATCACTACCTCTATTCTCGATACCACTCACACCACCACTCCTCCAT
TGTCACCGAGCCGATAACTTGTACGTCCACATGTAAACTTATATATACTTCCTCCTAATA
CAAATAAAACAGTATTCAAGGGTCTATAACTTTTCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DA25JQ C 1
AF RR2DA25TF U 1
BS 1 637 RR2DA25TF

RD RR2DA25JQ 637 0 0
GGATCGAAAGGAAGAGACCTAGTAGTCATCATCTTCGGCTATCTTACGAAGAAGAATGGC
GTCGAGACCAGGTTTTCTCACGGACTGGCCATGGGCACCTCTTGGAAGCTTTAAGTACTT
GGTGTTGGCGCCGCTTGTTATCGACAGCATCTACTCGTACGCGGCACTGCGATATCACGA
TAAACTTTTGGTCGTGGCGCTAATGTTGTGGCGTATTGTTCATAGCCAGGCTTGGATAAG
TTTCTCCCGTTACCGAACTGCTAAGGGGACCAAACAGATCGTGAACAAGTCCATAGAGTT
TGAGCAAGTCGACAGAGAACGAACTTGGGACGATCAGATCATCTTCAACACTCTTGTTGT
TTACTTAGTCAAAGCTTACGTCATAGGAAACACTCCCGTTCCCTTTTGGCGACTCGATGG
CGTGGTTCTAACCGTTCTCCTCCATACGGGTCCTGTTGAGTTCACCTACTACTGGTTTCA
CCGAGCCCTTCACCATCACTACCTCTATTCTCGATACCACTCACACCACCACTCCTCCAT
TGTCACCGAGCCGATAACTTGTACGTCCACATGTAAACTTATATATACTTCCTCCTAATA
CAAATAAAACAGTATTCAAGGGTCTATAACTTTTCAC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2DA25TF 637 0 0
GGATCGAAAGGAAGAGACCTAGTAGTCATCATCTTCGGCTATCTTACGAAGAAGAATGGC
GTCGAGACCAGGTTTTCTCACGGACTGGCCATGGGCACCTCTTGGAAGCTTTAAGTACTT
GGTGTTGGCGCCGCTTGTTATCGACAGCATCTACTCGTACGCGGCACTGCGATATCACGA
TAAACTTTTGGTCGTGGCGCTAATGTTGTGGCGTATTGTTCATAGCCAGGCTTGGATAAG
TTTCTCCCGTTACCGAACTGCTAAGGGGACCAAACAGATCGTGAACAAGTCCATAGAGTT
TGAGCAAGTCGACAGAGAACGAACTTGGGACGATCAGATCATCTTCAACACTCTTGTTGT
TTACTTAGTCAAAGCTTACGTCATAGGAAACACTCCCGTTCCCTTTTGGCGACTCGATGG
CGTGGTTCTAACCGTTCTCCTCCATACGGGTCCTGTTGAGTTCACCTACTACTGGTTTCA
CCGAGCCCTTCACCATCACTACCTCTATTCTCGATACCACTCACACCACCACTCCTCCAT
TGTCACCGAGCCGATAACTTGTACGTCCACATGTAAACTTATATATACTTCCTCCTAATA
CAAATAAAACAGTATTCAAGGGTCTATAACTTTTCAC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL5409Contig1 935 2 4 U
GGATGCTCTCTTCTTCCTTCTTCATTCGCTCTCGCTCTGTAATATCTCGTTCATTAAGTG
CTACATTTAAGCATGGAGCTGTAGTGGTTGACTAAATTGAAGACTGATGACTGACAGGTT
TGCTCGAGTTGTCTCTCATATCTAGACCATTTGTGAGAAGGGGTTTTATAGGTGCACCTC
ACCAATCTCTAAATGACTAAATATACAATTAGTATTAGGCTCATATAAGGAAGTTAACTT
CTATACATAAAGTGCACTGATGACTTTTCCAGATGCTATATAGATACTTTTTAGAATTAG
GTCATGCCGAGTCTCCAACTCATATATAATCGTATACACTTTTGGACATACATTTTCCCT
AAGAGATGCCAAACTTCTGTCTGGAGTGGAGCTTTCTCGTGATAGCTCATAATTTGTAGC
TTGCACAACTTAAGCTACACTAGTTTACTTGATAAAAAAATTGAGTGGAGTGGGGGAGGT
GCTGGATTATTTCCCCTTCTCATCGATGGTCTAGATTTGCGAGGTGACTCTAATAGTGGT
AAAGAGAAACAGTGATCTCGGGAAGCATCCACAATAATGATATTCCTGAATAAGTTTTGT
GAGTTGTTTTGTCAGGTTGAGTAACATCATGCCATTATTCGAACTTAACGTGAACGATAG
CTGCAGAAGCAAGTAGCTATGACTTTGTTGCAATGTCCTTTGCGAGAACTAAAGAAGTCA
GAAAAATAAGGATTTATCGATGAAAGAGCAAAGTGGACGGGTGGTGTTACCTTTTGACTT
GTTGTCATCATTCTCTCATTCATTCATTTCATGCTGCAACAGAAAACCCCATGTATTAAG
ACATTTCTTGTAAATTGATACGGTACAATTACTCAGTAGATTTGTAACCACAAATGAAAA
ACTATGACCGTAATCTACTCCTTCATTTTCATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV53TF U 1
AF RR2AV53JQ C 24
BS 1 615 RR2AV53TF
BS 616 616 RR2AV53JQ
BS 617 721 RR2AV53TF
BS 722 935 RR2AV53JQ

RD RR2AV53TF 721 0 0
GGATGCTCTCTTCTTCCTTCTTCATTCGCTCTCGCTCTGTAATATCTCGTTCATTAAGTG
CTACATTTAAGCATGGAGCTGTAGTGGTTGACTAAATTGAAGACTGATGACTGACAGGTT
TGCTCGAGTTGTCTCTCATATCTAGACCATTTGTGAGAAGGGGTTTTATAGGTGCACCTC
ACCAATCTCTAAATGACTAAATATACAATTAGTATTAGGCTCATATAAGGAAGTTAACTT
CTATACATAAAGTGCACTGATGACTTTTCCAGATGCTATATAGATACTTTTTAGAATTAG
GTCATGCCGAGTCTCCAACTCATATATAATCGTATACACTTTTGGACATACATTTTCCCT
AAGAGATGCCAAACTTCTGTCTGGAGTGGAGCTTTCTCGTGATAGCTCATAATTTGTAGC
TTGCACAACTTAAGCTACACTAGTTTACTTGATAAAAAAATTGAGTGGAGTGGGGGAGGT
GCTGGATTATTTCCCCTTCTCATCGATGGTCTAGATTTGCGAGGTGACTCTAATAGTGGT
AAAGAGAAACAGTGATCTCGGGAAGCATCCACAATAATGATATTCCTGAATAAGTTTTGT
GAGTTGTTTTGTCAG*TTGAGTAACATCATGCCATTATTCGAACTTAACGTGAACGATAG
CTGCAGAAGCAAGTAGCTATGACTTTGTTGCAATGTCCTTTGCGAGAACTAAAGAAGTCA
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2AV53JQ 912 0 0
ATTCGCTCTCGCTCTGTAATATCTCGTTCATTAAGTGCTACATTTAAGCATGGAGCTGTA
GTGGTTGACTAAATTGAAGACTGATGACTGACAGGTTTGCTCGAGTTGTCTCTCATATCT
AGACCATTTGTGAGAAGGGGTTTTATAGGTGCACCTCACCAATCTCTAAATGACTAAATA
TACAATTAGTATTAGGCTCATATAAGGAAGTTAACTTCTATACATAAAGTGCACTGATGA
CTTTTCCAGATGCTATATAGATACTTTTTAGAATTAGGTCATGCCGAGTCTCCAACTCAT
ATATAATCGTATACACTTTTGGACATACATTTTCCCTAAGAGATGCCAAACTTCTGTCTG
GAGTGGAGCTTTCTCGTGATAGCTCATAATTTGTAGCTTGCACAACTTAAGCTACACTAG
TTTACTTGATAAAAAAATTGAGTGGAGTGGGGGAGGTGCTGGATTATTTCCCCTTCTCAT
CGATGGTCTAGATTTGCGAGGTGACTCTAATAGTGGTAAAGAGAAACAGTGATCTCGGGA
AGCATCCACAATAATGATATTCCTGAATAAGTTTTGTGAGTTGTTTTGTCAGGTTGAGTA
ACATCATGCCATTATTCGAACTTAACGTGAACGATAGCTGCAGAAGCAAGTAGCTATGAC
TTTGTTGCAATGTCCTTTGCGAGAACTAAAGAAGTCAGAAAAATAAGGATTTATCGATGA
AAGAGCAAAGTGGACGGGTGGTGTTACCTTTTGACTTGTTGTCATCATTCTCTCATTCAT
TCATTTCATGCTGCAACAGAAAACCCCATGTATTAAGACATTTCTTGTAAATTGATACGG
TACAATTACTCAGTAGATTTGTAACCACAAATGAAAAACTATGACCGTAATCTACTCCTT
CATTTTCATTTT

QA 1 912 1 912
DS 



AS 1 2

CO CL5410Contig1 670 2 2 U
GGAAAGCTAAAATCGTCAACAGAACATCCCTTGCTTTTCGGCTTCCCCTCTCTCCATCTA
TATAACCTTGATAAATTCATTCGAGCCCTACTATATCAACGCATACAGGCTTTTACAAGC
AAGCAATGGCTTACAAGAATTCGGAAGTGAAAGCGCATCTATCTTGCCTCTCGAGTTCAG
ATCTGAATCAAAGATTGGAAGAAAGGAATTTGATGACAAACCCTGTTGAGTTATCAGGAA
AAGGACAGCCACAAGTCTTCCACGACATTGCACTTGCCCTCAAGAAGATCAACACCTGCA
TCTTCTCGGCTGAGATTGGAAGACACTTGACGGGAGACAGAGAATGGGAGGTGTACAAAG
TGTTGATCAACGAAGAGGATAGCTTACCGGTCTCGAGAAGAAAGATAGAGGAACAAGTGT
GGAGTACTTTGATGGGCTGGGAGTGAAGCTTTAAGGAACTCAGGACCATTAGCTGACCTT
CAGACACATAGCAGAAGAGTATATGACTGTACGATTGTGAATTAATGATGCCAATGAGTG
AGTCTATGTAGATTAAGATGCTATGGTCGCTTCTTTCTTTTATACCAATAATGTTAAGTG
ATCTCTTCTTTTCGGTGATTCTGTGATCAACGAATCAAAGTTTGATTAATAAGATTTCTC
TCTGTTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL53TF U 1
AF RR2DL53JQ C 317
BS 1 649 RR2DL53TF
BS 650 670 RR2DL53JQ

RD RR2DL53TF 649 0 0
GGAAAGCTAAAATCGTCAACAGAACATCCCTTGCTTTTCGGCTTCCCCTCTCTCCATCTA
TATAACCTTGATAAATTCATTCGAGCCCTACTATATCAACGCATACAGGCTTTTACAAGC
AAGCAATGGCTTACAAGAATTCGGAAGTGAAAGCGCATCTATCTTGCCTCTCGAGTTCAG
ATCTGAATCAAAGATTGGAAGAAAGGAATTTGATGACAAACCCTGTTGAGTTATCAGGAA
AAGGACAGCCACAAGTCTTCCACGACATTGCACTTGCCCTCAAGAAGATCAACACCTGCA
TCTTCTCGGCTGAGATTGGAAGACACTTGACGGGAGACAGAGAATGGGAGGTGTACAAAG
TGTTGATCAACGAAGAGGATAGCTTACCGGTCTCGAGAAGAAAGATAGAGGAACAAGTGT
GGAGTACTTTGATGGGCTGGGAGTGAAGCTTTAAGGAACTCAGGACCATTAGCTGACCTT
CAGACACATAGCAGAAGAGTATATGACTGTACGATTGTGAATTAATGATGCCAATGAGTG
AGTCTATGTAGATTAAGATGCTATGGTCGCTTCTTTCTTTTATACCAATAATGTTAAGTG
ATCTCTTCTTTTCGGTGATTCTGTGATCAACGAATCAAAGTTTGATTAA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2DL53JQ 354 0 0
TGGAAGACACTTGACGGGAGACAGAGAATGGGAGGTGTACAAAGTGTTGATCAACGAAGA
GGATAGCTTACCGGTCTCGAGAAGAAAGATAGAGGAACAAGTGTGGAGTACTTTGATGGG
CTGGGAGTGAAGCTTTAAGGAACTCAGGACCATTAGCTGACCTTCAGACACATAGCAGAA
GAGTATATGACTGTACGATTGTGAATTAATGATGCCAATGAGTGAGTCTATGTAGATTAA
GATGCTATGGTCGCTTCTTTCTTTTATACCAATAATGTTAAGTGATCTTTTCTTTTCGGT
GATTCTGTGATCAACGAATCAAAGTTTGATTAATAAGATTTCTCTCTGTTGCTT

QA 1 354 1 354
DS 



AS 1 2

CO CL5411Contig1 763 2 24 U
GGGTGGGTAAATAGATCCCTTGAGATCATCGGAAAGTGATGACGGTCGCGGCGGGGATAG
GGTACGCGCTTCTTGCTCTAGGACCCTCTCTTTCACTCTTCGTCTCCGTCATCTCCAGAA
AGCCCTTCCTCATCCTCACTCTTCTCTCCAGTACGTTGGTGTGGCTAGTGAGTCTGATCG
TCTTGTCGGGACTGTGGAGGCCGTTCCTTCCTCTGAAAGCCAATGTGGTGTGGCCTTATG
CTTTACTTGTTCTCTCCTCTGTTTGCTTCCAGGAAGCTCTTCGCTTTCTTTTCTGGAAGC
TTTACATGAGGCTTGAAGATGTCTTGGATTCCTTTGCGGATCGGATCTCTAGGCCCCGCT
TGTTTCTCACTGATAAGCTCCAGATTGCTCTAGCTGGGGGTTTAGGTCATGGTGTGGCTC
ATGCTGTCTTCTTTTGTTTGAGCCTCTTAACTCCCGCATTTGGTCCAGCCACGTTCTATG
TCGACAGATGTTCGAAAGTCCCATTCTTTCTCATCTCTGCAATCATTGCTCTTGCATTTG
TCACAATCCACACATTCTCGATGGTCATTGCTTTCGAAGGGTATGCAAAAGGGAACAAAG
TAGATCAAGTCATAGTTCCAGTCATACACCTTTCTGCTGGAATGTTGACATTGGTGAATT
TTGCATCGGAAGGTGTGTGATTGGCGTTCCTCTTCTTTACCTTGTGGCATCACTGACTCT
TCTGCATTGTGGAAAGATGGTTTGGCAAAGGCTTATCGAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E894TF U 1
AF RR2CH36TF U 16
BS 1 32 RR2E894TF
BS 33 33 RR2CH36TF
BS 34 79 RR2E894TF
BS 80 80 RR2CH36TF
BS 81 85 RR2E894TF
BS 86 86 RR2CH36TF
BS 87 127 RR2E894TF
BS 128 128 RR2CH36TF
BS 129 166 RR2E894TF
BS 167 167 RR2CH36TF
BS 168 202 RR2E894TF
BS 203 203 RR2CH36TF
BS 204 220 RR2E894TF
BS 221 221 RR2CH36TF
BS 222 391 RR2E894TF
BS 392 392 RR2CH36TF
BS 393 397 RR2E894TF
BS 398 398 RR2CH36TF
BS 399 442 RR2E894TF
BS 443 443 RR2CH36TF
BS 444 711 RR2E894TF
BS 712 713 RR2CH36TF
BS 714 727 RR2E894TF
BS 728 763 RR2CH36TF

RD RR2E894TF 727 0 0
GGGTGGGTAAATAGATCCCTTGAGATCATCGGGAAGTGATGACGGTCGCGGCGGGGATAG
GGTACGCGCTTCTTGCTCTGGGACCGTCTCTTTCACTCTTCGTCTCCGTCATCTCCAGAA
AGCCCTTTCTCATCCTCACTCTTCTCTCCAGTACGTTGGTGTGGCTTGTGAGTCTGATCG
TCTTGTCGGGACTGTGGAGGCCTTTCCTTCCTCTGAAAGCGAATGTGGTGTGGCCTTATG
CTTTACTTGTTCTCTCCTCTGTTTGCTTCCAGGAAGCTCTTCGCTTTCTTTTCTGGAAGC
TTTACATGAGGCTTGAAGATGTCTTGGATTCCTTTGCGGATCGGATCTCTAGGCCCCGCT
TGTTTCTCACTGATAAGCTCCAGATTGCTCTCGCTGGTGGTTTAGGTCATGGTGTGGCTC
ATGCTGTCTTCTTTTGTTTGAGTCTCTTAACTCCCGCATTTGGTCCAGCCACGTTCTATG
TCGACAGATGTTCGAAAGTCCCATTCTTTCTCATCTCTGCAATCATTGCTCTTGCATTTG
TCACAATCCACACATTCTCGATGGTCATTGCTTTCGAAGGGTATGCAAAAGGGAACAAAG
TAGATCAAGTCATAGTTCCAGTCATACACCTTTCTGCTGGAATGTTGACATTGGTGAATT
TTGCATCGGAAGGTGTGTGATTGGCGTTCCTCTTCTTTACCTTGTGGCATCTTTGACTCT
TCTGCAT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2CH36TF 748 0 0
GGGATAA
AGATCATCGGAAAGTGATGACGGTCGCGGCGGGGATAGGGTACGCGCTTCTTGCTCTAGG
ACCCTCTCTTTCACTCTTCGTCTCCGTCATCTCCAGAAAGCCCTTCCTCATCCTCACTCT
TCTCTCCAGTACGTTGGTGTGGCTAGTGAGTCTGATCGTCTTGTCGGGACTGTGGAGGCC
GTTCCTTCCTCTGAAAGCCAATGTGGTGTGGCCTTATGCTTTGCTTGTTCTCTCCTCTGT
TTGCTTCCAGGAAGCTCTTCGCTTTCTTTTCTGGAAGCTTTACATGAGGCTTGAAGATGT
CTTGGATTCCTTTGCGGATCGGATCTCTAGGCCCCGCTTGTTTCTCACTGATAAGCTTCA
GATTGCTCTAGCTGGGGGTTTAGGTCATGGTGTGGCTCATGCTGTCTTCTTTTGTTTGAG
CCTCTTAACTCCCGCATTTGGTCCAGCCACGTTCTATGTCGACAGATGTTCGAAAGTCCC
ATTCTTTCTCATTTCTGCAATCATTGCTCTTGCATTTGTCACAATCCACACATTCTCGAT
GGTCATTGCTTTCGAAGGGTATGCAAAAGGGAACAAAGTAGATCAAGTCATAGTTCTAGT
CATACACCTTTCTGCTGGAATGTTGACATTGGTGAATTTTGCATCGGAAGTTGTGTGATT
GGCGTTCCTCTTCTTTACCTTGTGGCATCACTGACTCTTCTGCATTGTGGAAAGATGGTT
TGGCAAAGGCTTATCGAAAGC

QA 8 748 8 748
DS 



AS 1 2

CO CL5412Contig1 989 2 2 U
GGGAAGTCCAGGCGGAGAATACTCGACGAGACAAAACCCAGCATATCGAGAAGGGAAAGA
GAACAACTTTATACGCAAGACATGAATCTAGGTTTCGTAATCGGAGTTCTCGGCGTCCTG
ATTCTTTCCCACGCCGCCTATTCAACAATCCAATATAGAGGATTGTTGAAGATCACGGAG
GAAGAGTTCACCGGACCTCCGTTGAATGTTGTTCTGGAGCTGATCGTGGGACTAGCTCTC
TGTATGTGGGCTGCTTTGACTTTCCCTGGCAAGTTCCTCTCCATTCACCCCGACTCCGAT
GAAAACAGGTTTGTTGTGCATCATCACTCTGTTAATCAATCTTATAGTTTGGCTATTGGC
TGAGAATGTTTCTTAGATTCATGTTCATGGATTCGTTTTATAGTTACTATATTGGCTATT
GACTGAGAGAATGTTCTTAGATATATACACTGAACATGTTCACGCTTGTACCACTACGCT
CATGAGCAAGATCTGACCCTGAGCAGTCCTTACACACACTTCCTTTACTCTTTAGGTGTT
TTAGACACCCCTTTGGTGAAAAAAAAACTGAATTGTTCCTTCTATGTCGCCACCTATCTT
CTTATAACATTCTGATTCTTTGTTTGGTTTTGAGTTTTTTTTTTTTTTGATCAAAGTTTG
GTTTTGAGTTTATGAAGTGAATATTGACTTTTGGTTCCTTTCAAAACTTTTTTGCAGGGC
GGTGTCTTTACCAGATAACTCGGATTTCATGATATTCAATCACCGTGGCCGTCTGTTCCC
ACCGGAGATCACCATGAAGTTTTGATTTTTTTTTTCCGTTATCGCACTTTTTAGTCAAAC
ACTCATATGTCCACTGTAACGAGATGTTGTTTCCATTGATATTTTACTCAAAGTAACTAC
ACTCTGCTTTCCATCAGTTTGTTGTGGTTTGTGAAACCAACATTGTTTCGAAAATGAAAG
TCAACATAACGACAAAGTGTTTGCCGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E991TF U 1
AF RR2E991JQ C 367
BS 1 701 RR2E991TF
BS 702 989 RR2E991JQ

RD RR2E991TF 701 0 0
GGGAAGTCCAGGCGGAGAATACTCGACGAGACAAAACCCAGCATATCGAGAAGGGAAAGA
GAACAACTTTATACGCAAGACATGAATCTAGGTTTCGTAATCGGAGTTCTCGGCGTCCTG
ATTCTTTCCCACGCCGCCTATTCAACAATCCAATATAGAGGATTGTTGAAGATCACGGAG
GAAGAGTTCACCGGACCTCCGTTGAATGTTGTTCTGGAGCTGATCGTGGGACTAGCTCTC
TGTATGTGGGCTGCTTTGACTTTCCCTGGCAAGTTCCTCTCCATTCACCCCGACTCCGAT
GAAAACAGGTTTGTTGTGCATCATCACTCTGTTAATCAATCTTATAGTTTGGCTATTGGC
TGAGAATGTTTCTTAGATTCATGTTCATGGATTCGTTTTATAGTTACTATATTGGCTATT
GACTGAGAGAATGTTCTTAGATATATACACTGAACATGTTCACGCTTGTACCACTACGCT
CATGAGCAAGATCTGACCCTGAGCAGTCCTTACACACACTTCCTTTACTCTTTAGGTGTT
TTAGACACCCCTTTGGTGAAAAAAAAACTGAATTGTTCCTTCTATGTCGCCACCTATCTT
CTTATAACATTCTGATTCTTTGTTTGGTTTTGAGTTTTTTTTTTTTTTGATCAAAGTTTG
GTTTTGAGTTTATGAAGTGAATATTGACTTTTGGTTCCTTT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2E991JQ 623 0 0
TGTTTCTTAGATTCATGTTCATGGATTCGTTTTATAGTTACTATATTGGCTATTGACTGA
GAGAATGTTCTTAGATATATACACTGAACATGTTCACGCTTGTACCACTACGCTCATGAG
CAAGATTTGACCCTGAGCAGTCCTTACACACACTTCCTTTACTCTTTAGGTGTTTTAGAC
ACCCCTTTGGTGAAAAAAAAACTGAATTGTTCCTTTTATGTCGCCACCTATCTTCTTATA
ACATTTTGATTCTTTGTTTGGTTTTGAGTTTTTTTTTTTTTTGATCAAAGTTTGGTTTTG
AGTTTATGAAGTGAATATTGACTTTTGGTTCCTTTCAAAACTTTTTTGCAGGGCGGTGTC
TTTACCAGATAACTCGGATTTCATGATATTCAATCACCGTGGCCGTCTGTTCCCACCGGA
GATCACCATGAAGTTTTGATTTTTTTTTTCCGTTATCGCACTTTTTAGTCAAACACTCAT
ATGTCCACTGTAACGAGATGTTGTTTCCATTGATATTTTACTCAAAGTAACTACACTCTG
CTTTCCATCAGTTTGTTGTGGTTTGTGAAACCAACATTGTTTCGAAAATGAAAGTCAACA
TAACGACAAAGTGTTTGCCGAGT

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL5413Contig1 978 2 2 U
GGACATTCATCATCTCTCTTTTCTTGATTACCTATTAGCTCAACCAATAAAACCAATATT
AGTAACAATCACAAACTATCATTGTGATCCTGTGTTTCTCTATCAATAACACACACAAAA
TGTCAATTTCTGTTTGTCAACCTCAAGAAAAACTCATCACCAAAAGTTTCTCCCAAAAAG
GGGACATGGGTGGGTTGAGTTTCCTACAATCAATGTCCGATATCACTGCCATTGTCCGAA
ACAGAGAGGACAAAGCTTATGTGCACCCGACCGAGAAACGCTCTGTTTCTAAGCTGAACG
AGAAAAGCCTAGAGATGTGCACTGAGAGTCTCGGAGCCGAAACAGGAAGTGGGAGCGGTG
ACGAGTTGTCTTTACTTGCGCTTGAAGCAACCGCTATCTCTAGGGCTCATTCTCTTTCTC
CTAAGCCGAAACCACAAGAAGAAGAAAAGGACACTGACCTTCACGCCAAGAGATCAGCGA
TGAGTCGCAGCAAAAGTTTCCCGCCACCGATAAAGTTCTTTAAAGAATCAAGGTATAATC
GTATAGTGAGGTCGTTAGGAGAAGATGGTCGTGTCGTCGTTCAAGCAATCAGGTCTTCGT
CTCCGCCTCGTTGCTTTGTAGCGGAACGTGAGGAAGGAAGGCTCCGTCTCTGTTTATCGC
CGGAAAGTTCTTTACTTAGGCACAATCATGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAAACAGAGGAGG
GCATGGCCGAGGAGAATAGTGAGAATTTGGAGGGTAAAAATGGAATAAAAAGATTAGCAG
GCTAAGCAGCAGATGCAAGGAGAATGGCCGTGAGCCTAAACCAATGCTTACTTGGAAGCA
GCAGCAGTTTTGGGTCGCCACTTAAAAGACTTCATTAAGCTTCTAATCAAATAATTTAAG
GATTTAAAAATATGAGTTTCTAAATTTTATAACGTATGCTTTGTATTATTTCTCGAGGGT
ACTGGGAGTTGTTTTCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E972TF U 1
AF RR2E972JQ C 231
BS 1 555 RR2E972TF
BS 556 978 RR2E972JQ

RD RR2E972TF 555 0 0
GGACATTCATCATCTCTCTTTTCTTGATTACCTATTAGCTCAACCAATAAAACCAATATT
AGTAACAATCACAAACTATCATTGTGATCCTGTGTTTCTCTATCAATAACACACACAAAA
TGTCAATTTCTGTTTGTCAACCTCAAGAAAAACTCATCACCAAAAGTTTCTCCCAAAAAG
GGGACATGGGTGGGTTGAGTTTCCTACAATCAATGTCCGATATCACTGCCATTGTCCGAA
ACAGAGAGGACAAAGCTTATGTGCACCCGACCGAGAAACGCTCTGTTTCTAAGCTGAACG
AGAAAAGCCTAGAGATGTGCACTGAGAGTCTCGGAGCCGAAACAGGAAGTGGGAGCGGTG
ACGAGTTGTCTTTACTTGCGCTTGAAGCAACCGCTATCTCTAGGGCTCATTCTCTTTCTC
CTAAGCCGAAACCACAAGAAGAAGAAAAGGACACTGACCTTCACGCCAAGAGATCAGCGA
TGAGTCGCAGCAAAAGTTTCCCGCCACCGATAAAGTTCTTTAAAGAATCAAGGTATAATC
GTATAGTGAGGTCGT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2E972JQ 748 0 0
CA
TGTCCGAAACAGAGAGGACAAAGCTTATGTGCACCCGACCGAGAAACGCTCTGTTTCTAA
GCTGAACGAGAAAAGCCTAGAGATGTGCACTGAGAGTCTCGGAGCCGAAACAGGAAGTGG
GAGCGGTGACGAGTTGTCTTTACTTGCGCTTGAAGCAACCGCTATCTCTAGGGCTCATTC
TCTTTCTCCTAAGCCGAAACCACAAGAAGAAGAAAAGGACACTGACCTTCACGCCAAGAG
ATCAGCGATGAGTCGCAGCAAAAGTTTCCCGCCACCGATAAAGTTCTTTAAAGAATCAAG
GTATAATCGTATAGTGAGGTCGTTAGGAGAAGATGGTCGTGTCGTCGTTCAAGCAATCAG
GTCTTCGTCTCCGCCTCGTTGCTTTGTAGCGGAACGTGAGGAAGGAAGGCTCCGTCTCTG
TTTATCGCCGGAAAGTTCTTTACTTAGGCACAATCATGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAAAC
AGAGGAGGGCATGGCCGAGGAGAATAGTGAGAATTTGGAGGGTAAAAATGGAATAAAAAG
ATTAGCAGGCTAAGCAGCAGATGCAAGGAGAATGGCCGTGAGCCTAAACCAATGCTTACT
TGGAAGCAGCAGCAGTTTTGGGTCGCCACTTAAAAGACTTCATTAAGCTTCTAATCAAAT
AATTTAAGGATTTAAAAATATGAGTTTCTAAATTTTATAACGTATGCTTTGTATTATTTC
TCGAGGGTACTGGGAGTTGTTTTCCA

QA 3 748 3 748
DS 



AS 1 2

CO CL5414Contig1 949 2 2 U
GGCTGTTATCCCTTGTCATTCTTTCTCTCGATATATTCCCTCTCTCCTTCTCTTTCTAGA
CGCTCCGATTATATTCTCGACAAAAAAGAATTAAAATCCCTAAAATTTTTCTTTTTTCAC
TCCGAATATTTTGATTTTGCTGTTTAACAGCAGTCAAACTTTTTTTCTGTGTTGGGTGCT
GACGTGGCATGCATTCAATAGAGAAACACCATGAACACCAAAACGATGCGTTTACCCCCA
CGTCGTGTTCTAATGGCGGAAAAGCGCAAAGAAAGAGACGGCGTCATCTCCTCCGTCGTG
AAGTCACCGGAATCCGCCGTAACGAAGTTTCATCCGCCGCTGAATCTTGCTCCTCCGGCG
ATTAATTCCATTTCCAAGAAAGCTCTAACCGTAGCCGAACCGGTCGGCTCGAACCAGCTA
ATTTTAGCCGGTTACTTGAGTCACGAGTTTCTCAACAACGGCACACTGTTCGGGGAGCAA
TGGAATCCAGCTCGAGCCCAAGCCGGAGCCCAAGTCGGTCCACCCGAGCCAAAAAAGGTA
AAGCCGAACCATGCAGTTGAGCCGGTTGAGGAAAATGAGCCGAAACGAAAGAGGTATATG
GAAGTCGCTAATCTTCTCAAGGCAGATGGGACCCACATGCCCGGCATCGTCAATCCTGCC
CAGCTTGCCCGATTCCTGTGATCGGCGTAATCCGGTGTACACGTGGAGACAGATCACTGG
TCCGTCGCCCAGCAAGCAAGACAGCCCCAAAACCGGAAACCCGCCGCTCCTCTCTCTCTC
TTTTTTTTTCAAATGTTTCAAAATCCTCTCGTATGTAAAGCGCTGACTCTCGCTCTCTCT
CTTCATCGTCTTCTTCCTCGAAATCGATCGGGAAAGTTTAGGGTTTGTTGTGAGATAGAT
TGTTCATGTTCTTGTACATCAAAAAAATATCAATTAGCGAATTGATCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG66TF U 1
AF RR2EG66JQ C 312
BS 1 633 RR2EG66TF
BS 634 949 RR2EG66JQ

RD RR2EG66TF 638 0 0
GGCTGTTATCCCTTGTCATTCTTTCTCTCGATATATTCCCTCTCTCCTTCTCTTTCTAGA
CGCTCCGATTATATTCTCGACAAAAAAGAATTAAAATCCCTAAAATTTTTCTTTTTTCAC
TCCGAATATTTTGATTTTGCTGTTTAACAGCAGTCAAACTTTTTTTCTGTGTTGGGTGCT
GACGTGGCATGCATTCAATAGAGAAACACCATGAACACCAAAACGATGCGTTTACCCCCA
CGTCGTGTTCTAATGGCGGAAAAGCGCAAAGAAAGAGACGGCGTCATCTCCTCCGTCGTG
AAGTCACCGGAATCCGCCGTAACGAAGTTTCATCCGCCGCTGAATCTTGCTCCTCCGGCG
ATTAATTCCATTTCCAAGAAAGCTCTAACCGTAGCCGAACCGGTCGGCTCGAACCAGCTA
ATTTTAGCCGGTTACTTGAGTCACGAGTTTCTCAACAACGGCACACTGTTCGGGGAGCAA
TGGAATCCAGCTCGAGCCCAAGCCGGAGCCCAAGTCGGTCCACCCGAGCCAAAAAAGGTA
AAGCCGAACCATGCAGTTGAGCCGGTTGAGGAAAATGAGCCGAAACGAAAGAGGTATATG
GAAGTCGCTAATCTTCTCAAGGCAGATGGGACC
ACATG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2EG66JQ 638 0 0
ATCCGCCGTAACGAAGTTTCATCCGCCGCTGAATCTTGCTCCTCCGGCGATTAATTCCAT
TTCCAAGAAAGCTCTAACCGTAGCCGAACCGGTCGGCTCGAACCAGCTAATTTTAGCCGG
TTACTTGAGTCACGAGTTTCTCAACAACGGCACACTGTTCGGGGAGCAATGGAATCCAGC
TCGAGCCCAAGCCGGAGCCCAAGTCGGTCCACCCGAGCCAAAAAAGGTAAAGCCGAACCA
TGCAGTTGAGCCGGTTGAGGAAAATGAGCCGAAACGAAAGAGGTATATGGAAGTCGCTAA
TCTTCTCAAGGCAGATGGGACCCACATGCCCGGCATCGTCAATCCTGCCCAGCTTGCCCG
ATTCCTGTGATCGGCGTAATCCGGTGTACACGTGGAGACAGATCACTGGTCCGTCGCCCA
GCAAGCAAGACAGCCCCAAAACCGGAAACCCGCCGCTCCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTCA
AATGTTTCAAAATCCTCTCGTATGTAAAGCGCTGACTCTCGCTCTCTCTCTTCATCGTCT
TCTTCCTCGAAATCGATCGGGAAAGTTTAGGGTTTGTTGTGAGATAGATTGTTCATGTTC
TTGTACATCAAAAAAATATCAATTAGCGAATTGATCGC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL5415Contig1 1145 2 4 U
CTTTCTTTTGTGATTTTCTTAAGTTTCGTTTCTTCGTCAGGTGAAAAACAGAACAAAACT
TTAAACGTTTCGATCCGCGTCAAGCGATTTCCGCCATGTCGATGATGACAACTGTCAAAG
CGAGCAATGTTTCTCTAGGAGCAACCGATCGTGACCTCAAGGAGTTCTTTTCCTTCTCTG
GCGACATTCTCTACCTCGAGACCCTCAGCGAGACAGAACGGTCCAAATTGGCTTATGTCA
CTTTCAAGGATCTACAAGGAGCTGAAACTGCTGTTCTTCTCTCGGGAGCAACGATTGTTG
ATTCTTCAGTCATTGTCGCTATGGCTCCTGACTACCAACTCTCTCCTGAGGCTTTAGCTT
CCTTGGAGCCCAAGGAAAGCAGCAAGTCTCCCCGTGCAGGTGACTCCGTGTTGAGAAAAG
CCGAAGATGTTGTCAGCAGCATGCTCGCAAAGGGCTTCATTCTAGGCAAAGACGCAATCG
CCAAAGCCAAGAGCGTTGACGAGAAACACCAGGTTACATCCACTGCATCCGCCAAAGTCG
CATCTCTCGACAAGAAACTCGGTTTCACCGACAAGATCAACACCGGAACAGTCGTGGTGG
GGGATAAAGTCAGGGAAGTTGATCACAAGTACCAAGTCTCGGAGAAAACCAAATCAGCGA
TCGCTGCAGCTGAGCAGACGGTGAGCAACGCGGGGTCGGCTATAATGAAGAACCGGTATG
TTCTCACGGGTGCCACGTGGGTCACCGGAGCTTTCAACAAAGTGGCTAAGGCTGCAGAAG
AAGTTGGACAAAAGGCCAAAGAGAAAGTTGGTATGGCTGAGGAAGAAGAGAAGAGGAAAG
TGGTTGATGAGTTTGCTAGAGTTCACTTGTCTGAATCACCAAAAGCGCCATCATCTAAGG
ATGAAGACGTACATGAACCAAAACGCTCTGAATCTCCTGAATCAAAAGAATCTGAACATC
ACGAGCCCCAGCAGCCGCAGCCGCAGCAGCAACAGTCTCCTCCACCTGTGGCTCCGGCTC
AACCTTGAGATTTGCAGGCAAGTAAAGACTGAAGACATTTGTGATTCTTGTTGTGAACGG
TAATATTTTGAACTAATCTCTCCTGGATTATCGAAAATGAATATCGAACTTCTTTATTTA
GTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2AV84TF U 1
AF RR2AV84JQ C 399
BS 1 680 RR2AV84TF
BS 681 681 RR2AV84JQ
BS 682 726 RR2AV84TF
BS 727 1145 RR2AV84JQ

RD RR2AV84TF 726 0 0
CTTTCTTTTGTGATTTTCTTAAGTTTCGTTTCTTCGTCAGGTGAAAAACAGAACAAAACT
TTAAACGTTTCGATCCGCGTCAAGCGATTTCCGCCATGTCGATGATGACAACTGTCAAAG
CGAGCAATGTTTCTCTAGGAGCAACCGATCGTGACCTCAAGGAGTTCTTTTCCTTCTCTG
GCGACATTCTCTACCTCGAGACCCTCAGCGAGACAGAACGGTCCAAATTGGCTTATGTCA
CTTTCAAGGATCTACAAGGAGCTGAAACTGCTGTTCTTCTCTCGGGAGCAACGATTGTTG
ATTCTTCAGTCATTGTCGCTATGGCTCCTGACTACCAACTCTCTCCTGAGGCTTTAGCTT
CCTTGGAGCCCAAGGAAAGCAGCAAGTCTCCCCGTGCAGGTGACTCCGTGTTGAGAAAAG
CCGAAGATGTTGTCAGCAGCATGCTCGCAAAGGGCTTCATTCTAGGCAAAGACGCAATCG
CCAAAGCCAAGAGCGTTGACGAGAAACACCAGGTTACATCCACTGCATCCGCCAAAGTCG
CATCTCTCGACAAGAAACTCGGTTTCACCGACAAGATCAACACCGGAACAGTCGTGGTGG
GGGATAAAGTCAGGGAAGTTGATCACAAGTACCAAGTCTCGGAGAAAACCAAATCAGCGA
TCGCTGCAGCTGAGCAGACG*TGAGCAACGCGGGGTCGGCTATAATGAAGAACCGGTATG
TTCTCA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2AV84JQ 747 0 0
GGTGACTCCGTGTTGAGAAAAGCCGAAGATGTTGTCAGCAGCATGCTCGCAAAGGGCTTC
ATTCTAGGCAAAGACGCAATCGCCAAAGCCAAGAGCGTTGACGAGAAACACCAGGTTACA
TCCACTGCATCCGCCAAAGTCGCATCTCTCGACAAGAAACTCGGTTTCACCGACAAGATC
AACACCGGAACAGTCGTGGTGGGGGATAAAGTCAGGGAAGTTGATCACAAGTACCAAGTC
TCGGAGAAAACCAAATCAGCGATCGCTGCAGCTGAGCAGACGGTGAGCAACGCGGGGTCG
GCTATAATGAAGAACCGGTATGTTCTCACGGGTGCCACGTGGGTCACCGGAGCTTTCAAC
AAAGTGGCTAAGGCTGCAGAAGAAGTTGGACAAAAGGCCAAAGAGAAAGTTGGTATGGCT
GAGGAAGAAGAGAAGAGGAAAGTGGTTGATGAGTTTGCTAGAGTTCACTTGTCTGAATCA
CCAAAAGCGCCATCATCTAAGGATGAAGACGTACATGAACCAAAACGCTCTGAATCTCCT
GAATCAAAAGAATCTGAACATCACGAGCCCCAGCAGCCGCAGCCGCAGCAGCAACAGTCT
CCTCCACCTGTGGCTCCGGCTCAACCTTGAGATTTGCAGGCAAGTAAAGACTGAAGACAT
TTGTGATTCTTGTTGTGAACGGTAATATTTTGAACTAATCTCTCCTGGATTATCGAAAAT
GAATATCGAACTTCTTTATTTAGTACC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL5416Contig1 1131 2 2 U
GGAAGATACAACAAACCTAAGAAGAAGAAGAAAACATATAAAAACAGAGATATTCGACAA
AGATTCCTCAGTTTTTCTTCTTCTCTGTTTGTTATTGTTCACCATGACTATTGTTCTTCT
TCCTCTGTTTCATTTCTTGGTAGAAAAGGTCTCTGCGTCTCACTTCTTTTCTGAAACTAT
CACTTCTTTCTAGCGACCTTAAGTTACTAACTACACACATACAATCCCTTTGATACAAAA
AAAAAAGAACTTTCCTTGTTTTTTTTCTTTCTGTTTTGTAGTACTGAAAAAAATATCAAA
ATGGACTCGGTTCAGTTTCAACACTTAAAGATGATGAAACCGAGAGGAATCTTGAACTTC
CAAACAATAAGATCATTCAAAAGTTTATTCAGACTCATCGAACTGATTCTTCTTCTAATC
TTGATCTCCAAACTCTCTTTCCCTTCAGTGAAACTCTCCACTGACATTTTCAGGGGAGCA
GCAGAGTTTCTCGTTAGCCCGAGATTCGTTTTCTTCATCGGGAACGCAATTGTAATTACT
CTTTTTGCGATATCAAGACGATACAACTCAGCTCACGAGCCTGTCTCAAAGACAACAGAA
GCTGTAAGCAACGATCTTTACCAAGAGTTTCTTCACGAGAGTGAGAAGAAGAGGTCCGAA
GTTTATGAAAACACGAAAACAGAACAGCCTAAGAAGCCGAGTGGAGTGAAAAGGGTTAGT
TTCGAGAGAAGCCAAACGCAGAAAGCGTTTGAGGTGGTTCACCCGCTCGAGAGTACAAGT
GGTGGGAGAATCATGAAGAGGAATGCGTCGGAGAAGCATCTGAGGATTTGTGATTCGGAC
AAGAAAGTAGTGGTGAGAGCTAAGAAAGCAGAAGATAGAATGAGCAACGAACAGTTTAGG
ACAAAGATTGAAGCCTTCATCGCGAGGCAAAAGAGGATTCAGAAGGAGGAAGAACACTTG
ATAATCTAGCTCCTCTTTGATTCTGAATGCTTTCTTTCTTTTGGTTATAAACTTGGATAT
GCTCTGTTTCAAAACATTTCATAATCTTGTAGCTTTGCCTTAGTAAAACTATGTATCTTA
AGTCTTAACGCTTGTAAACCTTTAGCGTTATTTAAGTAAATAATACAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ80TF U 1
AF RR2GZ80JQ C 330
BS 1 651 RR2GZ80TF
BS 652 1131 RR2GZ80JQ

RD RR2GZ80TF 651 0 0
GGAAGATACAACAAACCTAAGAAGAAGAAGAAAACATATAAAAACAGAGATATTCGACAA
AGATTCCTCAGTTTTTCTTCTTCTCTGTTTGTTATTGTTCACCATGACTATTGTTCTTCT
TCCTCTGTTTCATTTCTTGGTAGAAAAGGTCTCTGCGTCTCACTTCTTTTCTGAAACTAT
CACTTCTTTCTAGCGACCTTAAGTTACTAACTACACACATACAATCCCTTTGATACAAAA
AAAAAAGAACTTTCCTTGTTTTTTTTCTTTCTGTTTTGTAGTACTGAAAAAAATATCAAA
ATGGACTCGGTTCAGTTTCAACACTTAAAGATGATGAAACCGAGAGGAATCTTGAACTTC
CAAACAATAAGATCATTCAAAAGTTTATTCAGACTCATCGAACTGATTCTTCTTCTAATC
TTGATCTCCAAACTCTCTTTCCCTTCAGTGAAACTCTCCACTGACATTTTCAGGGGAGCA
GCAGAGTTTCTCGTTAGCCCGAGATTCGTTTTCTTCATCGGGAACGCAATTGTAATTACT
CTTTTTGCGATATCAAGACGATACAACTCAGCTCACGAGCCTGTCTCAAAGACAACAGAA
GCTGTAAGCAACGATCTTTACCAAGAGTTTCTTCACGAGAGTGAGAAGAAG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2GZ80JQ 802 0 0
GATGATGAAACCGAGAGGAATCTTGAACTTCCAAACAATAAGATCATTCAAAAGTTTATT
CAGACTCATCGAACTGATTCTTCTTCTAATCTTGATCTCCAAACTCTCTTTCCCTTCAGT
GAAACTCTCCACTGACATTTTCAGGGGAGCAGCAGAGTTTCTCGTTAGCCCGAGATTCGT
TTTCTTCATCGGGAACGCAATTGTAATTACTCTTTTTGCGATATCAAGACGATACAACTC
AGCTCACGAGCCTGTCTCAAAGACAACAGAAGCTGTAAGCAACGATCTTTACCAAGAGTT
TCTTCACGAGAGTGAGAAGAAGAGGTCCGAAGTTTATGAAAACACGAAAACAGAACAGCC
TAAGAAGCCGAGTGGAGTGAAAAGGGTTAGTTTCGAGAGAAGCCAAACGCAGAAAGCGTT
TGAGGTGGTTCACCCGCTCGAGAGTACAAGTGGTGGGAGAATCATGAAGAGGAATGCGTC
GGAGAAGCATCTGAGGATTTGTGATTCGGACAAGAAAGTAGTGGTGAGAGCTAAGAAAGC
AGAAGATAGAATGAGCAACGAACAGTTTAGGACAAAGATTGAAGCCTTCATCGCGAGGCA
AAAGAGGATTCAGAAGGAGGAAGAACACTTGATAATCTAGCTCCTCTTTGATTCTGAATG
CTTTCTTTCTTTTGGTTATAAACTTGGATATGCTCTGTTTCAAAACATTTCATAATCTTG
TAGCTTTGCCTTAGTAAAACTATGTATCTTAAGTCTTAACGCTTGTAAACCTTTAGCGTT
ATTTAAGTAAATAATACAGTTG

QA 1 802 1 802
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5418Contig1 1050 2 2 U
GCATCGAATTGAGCATCCATCTCAAGGTTAATCTTATGGGGTACGATTACTCAGGGTATG
GACAATCTACTGGAAAGCCGAGTGAGCATCATACATATGCTGATATTGAAGCTGCTTACA
AATGTCTTGAAGAGACGTATGGAGCAAAACAGGAAGACGTGATCCTTTATGGCCAATCCG
TAGGAAGTGGACCTACGTTAGATCTCGCTGCAAGGTTACCTCAGTTAAGAGCTGTTGTTC
TCCATAGCCCTATTCTTTCAGGTCTTAGAGTAATGTATCCTGTTAAGAAGACATACTGGT
TCGACATCTACAAGAATATCGACAAGATCCCACTTGTGAATTTCCCTGTTCTTGTCATTC
ATGGAACTAGTGATGAGGTTGTTGACTGTTCCCACGGAAAACAGTTATGGGAACTCTCTA
AAGACAAGTACGAACCGCTTTGGCTCGAAGGTGGTAACCACTGTGATCTAGAACAGTACC
CTGAATACATCAAACACCTCAAGAAGTTCATCACAACCGTGGAGAGGTCTCTCTCCTCTA
GGAAGAGCACATGCTACCAATCGGAAAACCAGAGCAGCGATGTCGAGATGCCGAGGCAGA
GCGTTGATAGAAGAGAGAAGCCAAGACAGAGCGTTGATAGAAGGGAGAAAGAGAAACCTC
CAAAGGGTCAGTCCAAGAAGAGTAAGCTGAGAATCACTTTCGAGCAGCATTTGGACCGTT
CGAGGAGGAGCGTTGACCTTCATGACAAGGCGAGGAAGAGCGTTGACCACTATAGTCATC
ATCATCATCATCAGAATAATCATGAGATTGAGAGAGGAAGGAAGAGCGTTGATAGATTGG
ATAGAGTGCGGTCCGAATAAACACGGAGAAATCTGCAATACGTACATATTGTTGTTTACA
GAACAAGAACATTTGATCTTGATCTTTGATTGCAGTTCTAATGTTGATGTTTCTTTTTCT
TTTTTTTTCTTGTTTTGATTGTGAGTTATTCTGTAGTTTTTATATTTGGAGTGTGATATT
TCCTGAACTTGTGAAGCTTATGTATTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO36TF U 1
AF RR2FO36JQ C 541
BS 1 746 RR2FO36TF
BS 747 1050 RR2FO36JQ

RD RR2FO36TF 746 0 0
GCATCGAATTGAGCATCCATCTCAAGGTTAATCTTATGGGGTACGATTACTCAGGGTATG
GACAATCTACTGGAAAGCCGAGTGAGCATCATACATATGCTGATATTGAAGCTGCTTACA
AATGTCTTGAAGAGACGTATGGAGCAAAACAGGAAGACGTGATCCTTTATGGCCAATCCG
TAGGAAGTGGACCTACGTTAGATCTCGCTGCAAGGTTACCTCAGTTAAGAGCTGTTGTTC
TCCATAGCCCTATTCTTTCAGGTCTTAGAGTAATGTATCCTGTTAAGAAGACATACTGGT
TCGACATCTACAAGAATATCGACAAGATCCCACTTGTGAATTTCCCTGTTCTTGTCATTC
ATGGAACTAGTGATGAGGTTGTTGACTGTTCCCACGGAAAACAGTTATGGGAACTCTCTA
AAGACAAGTACGAACCGCTTTGGCTCGAAGGTGGTAACCACTGTGATCTAGAACAGTACC
CTGAATACATCAAACACCTCAAGAAGTTCATCACAACCGTGGAGAGGTCTCTCTCCTCTA
GGAAGAGCACATGCTACCAATCGGAAAACCAGAGCAGCGATGTCGAGATGCCGAGGCAGA
GCGTTGATAGAAGAGAGAAGCCAAGACAGAGCGTTGATAGAAGGGAGAAAGAGAAACCTC
CAAAGGGTCAGTCCAAGAAGAGTAAGCTGAGAATCACTTTCGAGCAGCATTTGGACCGTT
CGAGGAGGAGCGTTGACCTTCATGAC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2FO36JQ 510 0 0
GGAAGAGCACATGCTACCAATCGGAAAACCAGAGCAGCGATGTCGAGATGCCGAGGCAGA
GCGTTGATAGAAGAGAGAAGCCAAGACAGAGCGTTGATAGAAGGGAGAAAGAGAAACCTC
CAAAGGGTCAGTCCAAGAAGAGTAAGCTGAGAATCACTTTCGAGCAGCATTTGGACCGTT
CGAGGAGGAGCGTTGACCTTCATGACAAGGCGAGGAAGAGCGTTGACCACTATAGTCATC
ATCATCATCATCAGAATAATCATGAGATTGAGAGAGGAAGGAAGAGCGTTGATAGATTGG
ATAGAGTGCGGTCCGAATAAACACGGAGAAATCTGCAATACGTACATATTGTTGTTTACA
GAACAAGAACATTTGATCTTGATCTTTGATTGCAGTTCTAATGTTGATGTTTCTTTTTCT
TTTTTTTTCTTGTTTTGATTGTGAGTTATTCTGTAGTTTTTATATTTGGAGTGTGATATT
TCCTGAACTTGTGAAGCTTATGTATTAAGC

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL5419Contig1 826 2 2 U
GGAAATCAAATATCAAGAACAGTACGTTCTGTAAGTGAAATGGCCTCTCTAATGAGGAGC
AGCGTTCCGCTTTTTCAAGTTGCAATGGTTTCATTCTTCAGTAGTCTTAGTGAGGCCGGT
CTGCATGCTTCATCTATGTACTATTTAAAGGCCAAGTTTCACTTCAACAAAGACCAGTTT
GCAGACTTGATGATCATATCTGGTATTGCCGGGTCTGTTTCACAGTTGCTCTTCATGCCC
ATTTTAATTCCTACTTTAAAAGAGGGGAAACTGCTCTCAATTGGTCTTTTTTTTCGGCTG
TGCGCATATGTTCCTTCTCGGTATGACACGGTCCGCGTGGGTTCCATATATGGCTGCCAT
GTTTTCACTTGTCTCTATATTTCCTCAGTCATGTATGCGGAGCATTGTCTCCAAACAAGT
AACATCATATGAGCAGGGTAAGGCCCAAGGGATTATTTCAAGCATATGCTCTCTTGCAAA
CGTCATTTCTCCGCTTGCATTTTCACCTCTAACAGGCTGGTTTCTCTCTGAAAGAGCACC
ATTTGATTTCCCAGGGTTCAGTCTTATGTGCGCGGGGTTTACTATGACAGTAGCTTTTAC
CCAAAGTCTCATGATCAGAGCAACAACTCCAGTAGCAGATATGGGATCTCCATAATTCCA
GTCAGCTCAAAACCATGATTTTTATAGCGAACCATAATGCACAGGTTCTAGATACATAAG
TCTGTTTATTTTTGTTGTTGTTGTTTAATAGCATGTTTGGCTCATCATCAGCCGCTAGGA
CAGACACCATATATTTCAAGGTTAAGGTTGAAGACTGTTTCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM02TF U 1
AF RR2EM02JQ C 91
BS 1 727 RR2EM02TF
BS 728 826 RR2EM02JQ

RD RR2EM02TF 727 0 0
GGAAATCAAATATCAAGAACAGTACGTTCTGTAAGTGAAATGGCCTCTCTAATGAGGAGC
AGCGTTCCGCTTTTTCAAGTTGCAATGGTTTCATTCTTCAGTAGTCTTAGTGAGGCCGGT
CTGCATGCTTCATCTATGTACTATTTAAAGGCCAAGTTTCACTTCAACAAAGACCAGTTT
GCAGACTTGATGATCATATCTGGTATTGCCGGGTCTGTTTCACAGTTGCTCTTCATGCCC
ATTTTAATTCCTACTTTAAAAGAGGGGAAACTGCTCTCAATTGGTCTTTTTTTTCGGCTG
TGCGCATATGTTCCTTCTCGGTATGACACGGTCCGCGTGGGTTCCATATATGGCTGCCAT
GTTTTCACTTGTCTCTATATTTCCTCAGTCATGTATGCGGAGCATTGTCTCCAAACAAGT
AACATCATATGAGCAGGGTAAGGCCCAAGGGATTATTTCAAGCATATGCTCTCTTGCAAA
CGTCATTTCTCCGCTTGCATTTTCACCTCTAACAGGCTGGTTTCTCTCTGAAAGAGCACC
ATTTGATTTCCCAGGGTTCAGTCTTATGTGCGCGGGGTTTACTATGACAGTAGCTTTTAC
CCAAAGTCTCATGATCAGAGCAACAACTCCAGTAGCAGATATGGGATCTCCATAATTCCA
GTCAGCTCAAAACCATGATTTTTATAGCGAACCATAATGCACAGGTTCTAGATACATAAG
TCTGTTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2EM02JQ 736 0 0
TCATTCTTCAGTAGTCTTAGTGAGGCCGGTCTGCATGCTTCATCTATGTACTATTTAAAG
GCCAAGTTTCACTTCAACAAAGACCAGTTTGCAGACTTGATGATCATATCTGGTATTGCC
GGGTCTGTTTCACAGTTGCTCTTCATGCCCATTTTAATTCCTACTTTAAAAGAGGGGAAA
CTGCTCTCAATTGGTCTTTTTTTTCGGCTGTGCGCATATGTTCCTTCTCGGTATGACACG
GTCCGCGTGGGTTCCATATATGGCTGCCATGTTTTCACTTGTCTCTATATTTCCTCAGTC
ATGTATGCGGAGCATTGTCTCCAAACAAGTAACATCATATGAGCAGGGTAAGGCCCAAGG
GATTATTTCAAGCATATGCTCTCTTGCAAACGTCATTTCTCCGCTTGCATTTTCACCTCT
AACAGGCTGGTTTCTCTCTGAAAGAGCACCATTTGATTTCCCAGGGTTCAGTCTTATGTG
CGCGGGGTTTACTATGACAGTAGCTTTTACCCAAAGTCTCATGATCAGAGCAACAACTCC
AGTAGCAGATATGGGATCTCCATAATTCCAGTCAGCTCAAAACCATGATTTTTATAGCGA
ACCATAATGCACAGGTTCTAGATACATAAGTCTGTTTATTTTTGTTGTTGTTGTTTAATA
GCATGTTTGGCTCATCATCAGCCGCTAGGACAGACACCATATATTTCAAGGTTAAGGTTG
AAGACTGTTTCTGTCC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL5420Contig1 533 2 1 U
GGAGAAAGACCGACATACACCTTGGTAGGGGGTATCATCCTCGGGATATGAAGAGACTAC
AACTCCAGCGACAAGGGCCATTGACTCGCCAAGCACGGAAGAGATGATGAACTTCACGAC
TATTCCTGGATCGTGTCTTTGCTGTTACTACGGTGGTGGTTCAAATGTGTTCTTCAAAGA
CAGACTCTTGCCTTCTATGCCTTTACCGTTTTATTCTTTGTACAGGTTTCGCCAATTCTC
CACCAACATCTCACTCACGCACACTACCTAAGATTATCCTTGTTACAAGATGACCTGTAT
TTATTTATTCAAAACCAAAATTTTATGATTAATTGAGCCATAAATCATGTTTCGAGGACG
TTGGCTCTTCATCAGTCCATATTTTCTACAGTAATATATACTTATCAGTCACAAAAATTA
TAATTTATTGGAACCACATTATCCAAATCAATGTTTAGAATCAGGAAATAAATTTTGTAA
CACTTGTAGTTTTGTGACAAATAATAAGTTTTGACTTAGAGTGCACGTTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EK70TF U 1
AF RR2EK70JQ C 138
BS 1 533 RR2EK70TF

RD RR2EK70TF 533 0 0
GGAGAAAGACCGACATACACCTTGGTAGGGGGTATCATCCTCGGGATATGAAGAGACTAC
AACTCCAGCGACAAGGGCCATTGACTCGCCAAGCACGGAAGAGATGATGAACTTCACGAC
TATTCCTGGATCGTGTCTTTGCTGTTACTACGGTGGTGGTTCAAATGTGTTCTTCAAAGA
CAGACTCTTGCCTTCTATGCCTTTACCGTTTTATTCTTTGTACAGGTTTCGCCAATTCTC
CACCAACATCTCACTCACGCACACTACCTAAGATTATCCTTGTTACAAGATGACCTGTAT
TTATTTATTCAAAACCAAAATTTTATGATTAATTGAGCCATAAATCATGTTTCGAGGACG
TTGGCTCTTCATCAGTCCATATTTTCTACAGTAATATATACTTATCAGTCACAAAAATTA
TAATTTATTGGAACCACATTATCCAAATCAATGTTTAGAATCAGGAAATAAATTTTGTAA
CACTTGTAGTTTTGTGACAAATAATAAGTTTTGACTTAGAGTGCACGTTATGT

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2EK70JQ 396 0 0
TTTGCTGTTACTACGGTGGTGGTTCAAATGTGTTCTTCAAAGACAGACTCTTGCCTTTTA
TGCCTTTACCGTTTTATTCTTTGTACAGGTTTCGCCAATTTTCCACCAACATTTCACTCA
CGCACACTACCTAAGATTATCCTTGTTACAAGATGACCTGTATTTATTTATTCAAAACCA
AAATTTTATGATTAATTGAGCCATAAATCATGTTTCGAGGACGTTGGCTTTTCATCAGTC
CATATTTTTTACAGTAATATATACTTATCAGTCACAAAAATTATAATTTATTGGAACCAC
ATTATCCAAATCAATGTTTAGAATCAGGAAATAAATTTTGTAACACTTGTAGTTTTGTGA
CAAATAATAAGTTTTGACTTAGAGTGCACGTTATGT

QA 1 396 1 396
DS 



AS 1 2

CO CL5421Contig1 911 2 4 U
GGGTGCCAAGTACACAGATATGCATGCTGATTACACTGGCCAAGGATTTGATCAGCTCTT
AGATGTCATCAACAAGATAAAGAACAATCCGGACGATCGGCGGATTATAATGTCGGCTTG
GAATCCTTCTGACCTTAAGCTGATGGCGCTTCCTCCATGCCACAACAATTCTTCGCATTC
ACAACGAAAGATGGGAAGGTGTTCCATTTATCCTAAAGGCGGGAAAGGCGCTAAATTCGA
GGAAGGCGGAAATTCGAATTCAGTTCAAGGATGTTCCAGGCGACATATTCAGATGTCAGA
AACAAGGGAGGAACGAGTTTGTGATACGCCTGCAACCATCAGAGGCAATGTACATGAAAC
TAACTGTTAAGCAACCGGGTCTGGAGATGCAAACCGTACAAAGTGAACTAGACTTGTCAT
ACGGACAACGTTATCAAGGTGTCTCCATCCCTGAAGCATACGAGCGCTTAATTCTTGACA
CAATTAAAGGTGATCAACAGCATTTCGTTCGCAGAGACGAACTAAAGGTTGCGTGGGAGA
TCTTTACACCGTTGCTGCACAGGATTGACAAAGGAGAAGTGAAGTCAATCCCATACAAAC
CAGGAAGCCGAGGACCAAAAGAAGCTGATCAGTTACTGGAGAAAGCTGGTTACCTTCAAA
CTCATGGCTACATCTGGATCCCTCCTACATTATAAACACACAAATACATTTACACAGTAC
ATGCATCAATCCACATTTATATGTATGTATACGGTAATTAAACAACTAGACATCTCTTCC
CTGAATGATCTATCTCTGAGTTTGGTCATCGTATGTGAACCTATGTAACTTATGTTGTTC
ACTTTGAGATTTTGTCTTGTGTTTTGCTTTGTTGTATTAAACCATAATAAGAGATAGGCC
TGGGCATTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL20TF U 1
AF RR2DL20JQ C 212
BS 1 251 RR2DL20TF
BS 252 252 RR2DL20JQ
BS 253 275 RR2DL20TF
BS 276 911 RR2DL20JQ

RD RR2DL20TF 275 0 0
GGGTGCCAAGTACACAGATATGCATGCTGATTACACTGGCCAAGGATTTGATCAGCTCTT
AGATGTCATCAACAAGATAAAGAACAATCCGGACGATCGGCGGATTATAATGTCGGCTTG
GAATCCTTCTGACCTTAAGCTGATGGCGCTTCCTCCATGCCACAACAATTCTTCGCATTC
ACAACGAAAGATGGGAAGGTGTTCCATTTATCCTAAAGGCGGGAAAGGCGCTAAATTCGA
GGAAGGCGGAA*TTCGAATTCAGTTCAAGGATGTT

QA 1 275 1 275
DS 

RD RR2DL20JQ 700 0 0
CCTAAAGGCGGGAAAGGCGCTAAATTCGAGGAAGGCGGAAATTCGAATTCAGTTCAAGGA
TGTTCCAGGCGACATATTCAGATGTCAGAAACAAGGGAGGAACGAGTTTGTGATACGCCT
GCAACCATCAGAGGCAATGTACATGAAACTAACTGTTAAGCAACCGGGTCTGGAGATGCA
AACCGTACAAAGTGAACTAGACTTGTCATACGGACAACGTTATCAAGGTGTCTCCATCCC
TGAAGCATACGAGCGCTTAATTCTTGACACAATTAAAGGTGATCAACAGCATTTCGTTCG
CAGAGACGAACTAAAGGTTGCGTGGGAGATCTTTACACCGTTGCTGCACAGGATTGACAA
AGGAGAAGTGAAGTCAATCCCATACAAACCAGGAAGCCGAGGACCAAAAGAAGCTGATCA
GTTACTGGAGAAAGCTGGTTACCTTCAAACTCATGGCTACATCTGGATCCCTCCTACATT
ATAAACACACAAATACATTTACACAGTACATGCATCAATCCACATTTATATGTATGTATA
CGGTAATTAAACAACTAGACATCTCTTCCCTGAATGATCTATCTCTGAGTTTGGTCATCG
TATGTGAACCTATGTAACTTATGTTGTTCACTTTGAGATTTTGTCTTGTGTTTTGCTTTG
TTGTATTAAACCATAATAAGAGATAGGCCTGGGCATTCGG

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL5422Contig1 782 2 2 U
GGATAACTCAAAATATCTACGAACACAAGAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTA
CCGCACGAATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTT
TCAAGTGGAAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGA
ACTCAAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAGCAT
CTAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACA
AATATCTCGACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTA
ACGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGC
AGGTCTCGTCTCATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGTAAGTTTTTAAGTTTTGG
CGAAAACAAATATTATAAAACCATTTTTTGAGGCGTGTATATGAAACATTGCAGGGTTGT
GAGAGCGGGGAAAGATCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGG
GTTACAGACATTGCTGGAGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAG
TGAAAACAAAAAACATGAACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGT
TTCAACACAAGTGTTTGTGTATGTCAATGGCACTACCAAATGATATAAGTTTCATTTGGA
AC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2AI71TF U 1
AF RR2AI71JQ C 312
BS 1 648 RR2AI71TF
BS 649 782 RR2AI71JQ

RD RR2AI71TF 648 0 0
GGATAACTCAAAATATCTACGAACACAAGAAGAAAAAAATGGAATCTACTTTAAACACTA
CCGCACGAATCGGGAGCTGGTCATCGGTTATATCTCCACCTCTACAAGTGTGTGAATCTT
TCAAGTGGAAGCTACCAAAGGCAACAAGAAGAGTCGTCGTCAGTGTTGCAGATCGTCAGA
ACTCAAACTTCCGATGGAGGAAAGTAACAACAGGCAGAGCAAATGTTGCGGCGGAAGCAT
CTAGAGTTCCGACATCAGTACCGGTGAGAGTTGCGCGTGAGCTAGCTCAAGCAGGATACA
AATATCTCGACGTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGCTATTA
ACGTGCCTTACATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTCTAAGGC
AGGTCTCGTCTCATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGTAAGTTTTTAAGTTTTGG
CGAAAACAAATATTATAAAACCATTTTTTGAGGCGTGTATATGAAACATTGCAGGGTTGT
GAGAGCGGGGAAAGATCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGG
GTTACAGACATTGCTGGAGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2AI71JQ 471 0 0
GTGAGGACACCGGACGAGTTCAGCATCGGACATCCGTGTAGTGTTATTAACGTGCCTTAC
ATGTACAGAGTCGGATCAGGAATGGTTAAGAACCCGAGTTTTGTAAGGCAGGTCTGGTCT
CATTTCAGGAAACACGACGAGATCATCATCGTAAGTTTTTAAGTTTTGGCGAAAACAAAT
ATTATAAAACCATTTTTTGAGGCGTGTATATGAAACATTGCAGGGTTGTGAGAGCGGGGA
AAGATCTCTCATGGCTTCCACTGAACTTCTCACTGCTGGCTTCACCGGGGTTACAGACAT
TGCTGGAGGGTACGTTGCCTGGACAGAGAATGAACTACCAGTAGAAGAGTGAAAACAAAA
AACATGAACCTATCCGTTTGTAAATTTGCAAATAAATAATTGTATATGTTTCAACACAAG
TGTTTGTGTATGTCAATGGCACTACCAAATGATATAAGTTTCATTTGGAAC

QA 1 471 1 471
DS 



AS 1 2

CO CL5423Contig1 333 2 1 U
GGTACAACTCGATGATCCGCGGGTTGTGTATGGCGGGAGAGTTCAGAGAGGCGTGTTGGA
TGCTAAAGGAGATGGAGTCTAGAGGGTGTAAACCGAATTTTGTAGTGTATAGTACATTGG
TGAGCTATTTGAGAAAAGCAGGGAAGCTTGGAGAGGCTCGCAAGGTAATAAGAGACATGG
TGAAGAAGGGACATTATGTTCATTTAGTTCCAAAGATGATGAAATATAGGAGATGATGTT
AGATTTCTTTTTTGTTAATTTGAGGTTGTTGTTTCTCTCATTTACAGAGTTTTGTAACTT
ACATTCTTGTTCTTTTCTCAAAGAAAGTTTGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GT78JQB C 1
AF RR2GT78TF U 1
BS 1 333 RR2GT78TF

RD RR2GT78JQB 333 0 0
GGTACAACTCGATGATCCGCGGGTTGTGTATGGCGGGAGAGTTCAGAGAGGCGTGTTGGA
TGCTAAAGGAGATGGAGTCTAGAGGGTGTAAACCGAATTTTGTAGTGTATAGTACATTGG
TGAGCTATTTGAGAAAAGCAGGGAAGCTTGGAGAGGCTCGCAAGGTAATAAGAGACATGG
TGAAGAAGGGACATTATGTTCATTTAGTTCCAAAGATGATGAAATATAGGAGATGATGTT
AGATTTCTTTTTTGTTAATTTGAGGTTGTTGTTTCTTTCATTTACAGAGTTTTGTAACTT
ACATTCTTGTTCTTTTTTCAAAGAAAGTTTGAT

QA 1 333 1 333
DS 

RD RR2GT78TF 333 0 0
GGTACAACTCGATGATCCGCGGGTTGTGTATGGCGGGAGAGTTCAGAGAGGCGTGTTGGA
TGCTAAAGGAGATGGAGTCTAGAGGGTGTAAACCGAATTTTGTAGTGTATAGTACATTGG
TGAGCTATTTGAGAAAAGCAGGGAAGCTTGGAGAGGCTCGCAAGGTAATAAGAGACATGG
TGAAGAAGGGACATTATGTTCATTTAGTTCCAAAGATGATGAAATATAGGAGATGATGTT
AGATTTCTTTTTTGTTAATTTGAGGTTGTTGTTTCTCTCATTTACAGAGTTTTGTAACTT
ACATTCTTGTTCTTTTCTCAAAGAAAGTTTGAT

QA 1 333 1 333
DS 



AS 1 2

CO CL5424Contig1 1102 2 4 U
TATCTAGTGGAACCTCCCCCGCACAGATTCAAATCAGTCGCCTGCTCACCTGAATCATCT
TCTCAAGCTCAATTTTTGATTTTTGAAGGAAAGATGGTGAGGCCGTACGGGATTAAGGTG
AACAAGAGGAAGGAGAGAAAAGAGAGGTACGATAAGGAAGAAGATGAAGAAGATGAGCAG
CCTAAGTTTGAGCAGAAACAAAAAGGAGTGAAGAAAGCTAAGAGAGAAGAAGCCACCTCA
AATGCAGAGGAGGAAGATGATGAAGAGAATGAGATATCTGAGGAAGCAGCAGATGAGCTT
GATGTGGGAATACCTATTGTCGTGTCTGGTAATAAGAAGGACCAGACTGGTGTTATTTTT
GTGCTTGAGAAGGCCTCTCTCGAAGTTGCCAAAGTTGGAAAGACTTACCAGCTACTAAAC
TCTGATGATCATGCTAATTTCTTGAGGAAGAATGGCAGAGATCCTGCTCATTACAGGCCA
GACATCACTCATCAGGCTCTTTTGATGATTTTGGATAGTCCGGTAAACAAGGCTGGGAGG
TTGAAAGCGGTGTATGTTAGAACAGAGCAAGGTGTTCTTTTTGAAGTTAAGCCACATGTT
CGTATACCAAGAACTTTCAAGCGTTTCGCTGGAATCATGTTGCAATTGCTACAGAAGCTT
AGCATTAGTGCATCTGGGAAGCGTGAGAAACTTATGAGGGTGATCAAGGACCCTGTTACA
AGCCACCTTCCGCCTAACTGTAGAAAAATAGGGTTCTCGTATAGCTCTGAGAAGCTGGTC
AACATGCGGAAGCACCTATCTACTGTCTGTAATGAGACCGACACTGTTTTTGTGCTCGGT
GCGATGTCACACGGGAAAATAGAGTGCGACCATATCGATGATTTTGTGGCCATTTCAGGG
TATCCTCTTAGCGCAGCTTACTGTATCTCAAGAATCTGCGAGGCTTTATCGACAAATTGG
AATATTATATGAACATGTATTAACAAGAATGTCCCTTTTGTTTTACTCCCTACTGTTCTA
ATGATGGAACCACTTTAAGTTTGTGTTTATGCACATTGTACTATCTATCTATTATTGAAT
TTTTAGAAGTTTATTTTGGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F571TF U 1
AF RR2F571JQ C 417
BS 1 708 RR2F571TF
BS 709 709 RR2F571JQ
BS 710 745 RR2F571TF
BS 746 1102 RR2F571JQ

RD RR2F571TF 745 0 0
TATCTAGTGGAACCTCCCCCGCACAGATTCAAATCAGTCGCCTGCTCACCTGAATCATCT
TCTCAAGCTCAATTTTTGATTTTTGAAGGAAAGATGGTGAGGCCGTACGGGATTAAGGTG
AACAAGAGGAAGGAGAGAAAAGAGAGGTACGATAAGGAAGAAGATGAAGAAGATGAGCAG
CCTAAGTTTGAGCAGAAACAAAAAGGAGTGAAGAAAGCTAAGAGAGAAGAAGCCACCTCA
AATGCAGAGGAGGAAGATGATGAAGAGAATGAGATATCTGAGGAAGCAGCAGATGAGCTT
GATGTGGGAATACCTATTGTCGTGTCTGGTAATAAGAAGGACCAGACTGGTGTTATTTTT
GTGCTTGAGAAGGCCTCTCTCGAAGTTGCCAAAGTTGGAAAGACTTACCAGCTACTAAAC
TCTGATGATCATGCTAATTTCTTGAGGAAGAATGGCAGAGATCCTGCTCATTACAGGCCA
GACATCACTCATCAGGCTCTTTTGATGATTTTGGATAGTCCGGTAAACAAGGCTGGGAGG
TTGAAAGCGGTGTATGTTAGAACAGAGCAAGGTGTTCTTTTTGAAGTTAAGCCACATGTT
CGTATACCAAGAACTTTCAAGCGTTTCGCTGGAATCATGTTGCAATTGCTACAGAAGCTT
AGCATTAGTGCATCTGGGAAGCGTGAGAAACTTATGAGGGTGATCAAG*ACCCTGTTACA
AGCCACCTTCCGCCTAACTGTAGAA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2F571JQ 686 0 0
AAACTCTGATGATCATGCTAATTTCTTGAGGAAGAATGGCAGAGATCCTGCTCATTACAG
GCCAGACATCACTCATCAGGCTCTTTTGATGATTTTGGATAGTCCGGTAAACAAGGCTGG
GAGGTTGAAAGCGGTGTATGTTAGAACAGAGCAAGGTGTTCTTTTTGAAGTTAAGCCACA
TGTTCGTATACCAAGAACTTTCAAGCGTTTCGCTGGAATCATGTTGCAATTGCTACAGAA
GCTTAGCATTAGTGCATCTGGGAAGCGTGAGAAACTTATGAGGGTGATCAAGGACCCTGT
TACAAGCCACCTTCCGCCTAACTGTAGAAAAATAGGGTTCTCGTATAGCTCTGAGAAGCT
GGTCAACATGCGGAAGCACCTATCTACTGTCTGTAATGAGACCGACACTGTTTTTGTGCT
CGGTGCGATGTCACACGGGAAAATAGAGTGCGACCATATCGATGATTTTGTGGCCATTTC
AGGGTATCCTCTTAGCGCAGCTTACTGTATCTCAAGAATCTGCGAGGCTTTATCGACAAA
TTGGAATATTATATGAACATGTATTAACAAGAATGTCCCTTTTGTTTTACTCCCTACTGT
TCTAATGATGGAACCACTTTAAGTTTGTGTTTATGCACATTGTACTATCTATCTATTATT
GAATTTTTAGAAGTTTATTTTGGCAG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL5425Contig1 1259 2 2 U
GATAAACCGTTGGTTCATTCCGGTTTAGCTTTCGGAGCGAGACGTTGGGTGTCAACACTC
GAACGTCAGTGCGAGCGGCTCGCGAGTTCGATGGCCAGCAACATCCCTGCTAGTGATCTT
TCCGTGATAACAAGTCCTGAAGGGAGGAAGAGCATGTTGAAGTTAGCGGAAAGGATGGTT
ATGAGCTTTTGCAGCGGTGTTGGCGCGTCGACTGCACACGCGTGGACGACAATGTCGTCA
ACTGGATCCGATGATGTTCGCGTTATGACCCGAAAGAGCATGGATGATCCGGGAAGACCT
CCGGGTATTGTTCTTAGCGCTGCGACTTCGTTCTGGATCCCAGTGGCTCCCAAACGGGTT
TTTGATTTCCTCCGCGACGAAAACTCAAGAAGCGAGTGGGATATTCTCTCGAATGGAGGA
ATGGTTCAAGAAATGGCACATATAGCAAATGGTCGCGAACCTGGAAACTGCGTCTCCTTA
CTCCGTGTCAACAGCGGAAATTCGAGCCAAAGCAACATGCTGATACTACAAGAGAGCTGC
ACGGACGCATCTGGATCGTACGTGATATATGCGCCGGTGGATATAGTGGCGATGAACGTT
GTTCTAAGCGGAGGAGATCCTGATTACGTGGCGTTGCTCCCGTCTGGTTTCGCTATATTA
CCCGATGTTTCGGTCGGGGGAGGAGGAGATGGGAATCAAGAAGTGGTTTCTTCCTCTACT
GCATCTGAGAGTTGTGGTTCACTATTAACTGTTGCGTTTCAGATACTTGTTGACTCTGTT
CCTACAGCTAAACTCTCTCTTGGCTCGGTGGCTACGGTTAATAGTCTGATCAAATGTACG
GTGGAGGGGATTAAAGCCGCCGTTGCTTGTGACCGAGGTGGAGGAGGACCATAGTTCTTC
CAGAAGTAATAAGGAAGGAAAGGAGAAAAACACCGTTTATGCAATGGTTTATTTCTAGTT
TATGTATGTTTTAAAAATCCAAATGAAGTCAAGAACGCACCTTTAACGTTTAAAGCTTTA
TCTCAAGGATGATGAGAAAAGAAAGGGTAAAGAGGTTCGGGTATTGACTTCTGATGGAAA
CCCAAGGTCTAATTATTTACCTTTTCAAAGTTTGTCTGCTCTGTTTTGTAACAGTTTGTG
AACACTTTTGGGTGTCCTCTCTTTATGTGTTTTACCACCAAGTGTATGTTTCTTTATTGT
TTTGTAAGCTCTTTTTGTGGCAAGACCATATATTAGTAAGATTAGTTTCTGTTGAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW25TF U 1
AF RR2CW25JQ C 504
BS 1 668 RR2CW25TF
BS 669 1259 RR2CW25JQ

RD RR2CW25TF 668 0 0
GATAAACCGTTGGTTCATTCCGGTTTAGCTTTCGGAGCGAGACGTTGGGTGTCAACACTC
GAACGTCAGTGCGAGCGGCTCGCGAGTTCGATGGCCAGCAACATCCCTGCTAGTGATCTT
TCCGTGATAACAAGTCCTGAAGGGAGGAAGAGCATGTTGAAGTTAGCGGAAAGGATGGTT
ATGAGCTTTTGCAGCGGTGTTGGCGCGTCGACTGCACACGCGTGGACGACAATGTCGTCA
ACTGGATCCGATGATGTTCGCGTTATGACCCGAAAGAGCATGGATGATCCGGGAAGACCT
CCGGGTATTGTTCTTAGCGCTGCGACTTCGTTCTGGATCCCAGTGGCTCCCAAACGGGTT
TTTGATTTCCTCCGCGACGAAAACTCAAGAAGCGAGTGGGATATTCTCTCGAATGGAGGA
ATGGTTCAAGAAATGGCACATATAGCAAATGGTCGCGAACCTGGAAACTGCGTCTCCTTA
CTCCGTGTCAACAGCGGAAATTCGAGCCAAAGCAACATGCTGATACTACAAGAGAGCTGC
ACGGACGCATCTGGATCGTACGTGATATATGCGCCGGTGGATATAGTGGCGATGAACGTT
GTTCTAAGCGGAGGAGATCCTGATTACGTGGCGTTGCTCCCGTCTGGTTTCGCTATATTA
CCCGATGT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2CW25JQ 756 0 0
GAGCCAAAGCAACATGCTGATACTACAAGAGAGCTGCACGGACGCATCTGGATCGTACGT
GATATATGCGCCGGTGGATATAGTGGCGATGAACGTTGTTCTAAGCGGAGGAGATCCTGA
TTACGTGGCGTTGCTCCCGTCTGGTTTCGCTATATTACCCGATGTTTCGGTCGGGGGAGG
AGGAGATGGGAATCAAGAAGTGGTTTCTTCCTCTACTGCATCTGAGAGTTGTGGTTCACT
ATTAACTGTTGCGTTTCAGATACTTGTTGACTCTGTTCCTACAGCTAAACTCTCTCTTGG
CTCGGTGGCTACGGTTAATAGTCTGATCAAATGTACGGTGGAGGGGATTAAAGCCGCCGT
TGCTTGTGACCGAGGTGGAGGAGGACCATAGTTCTTCCAGAAGTAATAAGGAAGGAAAGG
AGAAAAACACCGTTTATGCAATGGTTTATTTCTAGTTTATGTATGTTTTAAAAATCCAAA
TGAAGTCAAGAACGCACCTTTAACGTTTAAAGCTTTATCTCAAGGATGATGAGAAAAGAA
AGGGTAAAGAGGTTCGGGTATTGACTTCTGATGGAAACCCAAGGTCTAATTATTTACCTT
TTCAAAGTTTGTCTGCTCTGTTTTGTAACAGTTTGTGAACACTTTTGGGTGTCCTCTCTT
TATGTGTTTTACCACCAAGTGTATGTTTCTTTATTGTTTTGTAAGCTCTTTTTGTGGCAA
GACCATATATTAGTAAGATTAGTTTCTGTTGAACTC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL5426Contig1 1124 2 2 U
CTTCTTCTTCGTTGTTTGGTTCAATCTAATCTCTTCATCCTCCATCTTCTTCAGTTTGGG
TTTTTTTTGTTCTTATTCATCCCAATCCAGTAAACGATGATGGCAAGGGAACCCTGATCT
CGTCTTTCCCAAACTCCTCCACTTTGCACTCTGTAAATCAATTATCGTCGCTCCACCAAA
CCCTGAACCTCGATCTATCCTTGAACGACGATTACGTCTCATAATCATCTCTGTAAGACC
TTGAAACCCCCTCAATTTCACTCCTTCATGCTTCTCCTCAGATCCCAACTCCTCTGATTC
GATAAAGGAGAGACAGATGGAGCAGAGACAGCAAGTAGCCAAGGCTGAACAGACAGAGAA
AGCTTTTCTTAAGCAACCCAAGGTCTTCCTAAGCTAGAAGAAATCTGGGAAGGAAAAAGA
CTAAGTTGAGACTTGTGATTTAAGGAACTTTTGTTCAGACTAACGAAGAGGTCGCAATTA
AGCTTGAAAGTGTGAAGAGCGCATCCCCAACTGTTATATGAGTCTGGATATATAGTGTTG
TTCAGAAAGAGTTTGGTTACTGCTGATCGAGAAGCACTGATAGATGAAGTCACGGAGAAT
CAGAGTGTTGGACCAGAATAGATGCTGTGTGAAGTGTCCACTCTGTGAGAGGTTTGTGTG
TGTTGACTGTGATGTTCCTTGGCATGATTCTGTGAGCTTTGAAGAGTTTCAGATTCTTCC
GGTTGATGAAAGATATCCAGATCATTGCATCGCTTGGTTAGGTGTGGGCATGAGCTTTTC
TACTGTTGTGGAGCAGAGTCAGAGAAGGACAACATAGTTGCACTTGTGACACATTTAACT
CGATGCCAATGGAAGAGTTGTTGATGGCAGAGAGATGACTGTTCAGTTTTGTGAAACCTT
TCTATGTATTTTTCTGTCTTAGATTTACAGACACCATACCGTTGACCAGAAAAAAAAAAG
ATTTACAGGCACCATAAGTATGTTCCAAGCCTTTGGTTTTTTCAGTTTCATCTGAGATGA
CTCTTGAGAATGAAGTTGTTTGAATTGTGTATAGGCCGGAGCAAGAGATGTATATTTTTT
TCAGTTTCATCTGAGATGATAATTGGAGTTTTATAAGTTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A504TF U 1
AF RR2A504JQ C 436
BS 1 760 RR2A504TF
BS 761 1124 RR2A504JQ

RD RR2A504TF 760 0 0
CTTCTTCTTCGTTGTTTGGTTCAATCTAATCTCTTCATCCTCCATCTTCTTCAGTTTGGG
TTTTTTTTGTTCTTATTCATCCCAATCCAGTAAACGATGATGGCAAGGGAACCCTGATCT
CGTCTTTCCCAAACTCCTCCACTTTGCACTCTGTAAATCAATTATCGTCGCTCCACCAAA
CCCTGAACCTCGATCTATCCTTGAACGACGATTACGTCTCATAATCATCTCTGTAAGACC
TTGAAACCCCCTCAATTTCACTCCTTCATGCTTCTCCTCAGATCCCAACTCCTCTGATTC
GATAAAGGAGAGACAGATGGAGCAGAGACAGCAAGTAGCCAAGGCTGAACAGACAGAGAA
AGCTTTTCTTAAGCAACCCAAGGTCTTCCTAAGCTAGAAGAAATCTGGGAAGGAAAAAGA
CTAAGTTGAGACTTGTGATTTAAGGAACTTTTGTTCAGACTAACGAAGAGGTCGCAATTA
AGCTTGAAAGTGTGAAGAGCGCATCCCCAACTGTTATATGAGTCTGGATATATAGTGTTG
TTCAGAAAGAGTTTGGTTACTGCTGATCGAGAAGCACTGATAGATGAAGTCACGGAGAAT
CAGAGTGTTGGACCAGAATAGATGCTGTGTGAAGTGTCCACTCTGTGAGAGGTTTGTGTG
TGTTGACTGTGATGTTCCTTGGCATGATTCTGTGAGCTTTGAAGAGTTTCAGATTCTTCC
GGTTGATGAAAGATATCCAGATCATTGCATCGCTTGGTTA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2A504JQ 689 0 0
TGATTTAAGGAACTTTTGTTCAGACTAACGAAGAGGTCGCAATTAAGCTTGAAAGTGTGA
AGAGCGCATCCCCAACTGTTATATGAGTCTGGATATATAGTGTTGTTCAGAAAGAGTTTG
GTTACTGCTGATCGAGAAGCACTGATAGATGAAGTCACGGAGAATCAGAGTGTTGGACCA
GAATAGATGCTGTGTGAAGTGTCCACTCTGTGAGAGGTTTGTGTGTGTTGACTGTGATGT
TCCTTGGCATGATTCTGTGAGCTTTGAAGAGTTTCAGATTCTTCCGGTTGATGAAAGATA
TCCAGATCATTGCATCGCTTGGTTAGGTGTGGGCATGAGCTTTTCTACTGTTGTGGAGCA
GAGTCAGAGAAGGACAACATAGTTGCACTTGTGACACATTTAACTCGATGCCAATGGAAG
AGTTGTTGATGGCAGAGAGATGACTGTTCAGTTTTGTGAAACCTTTCTATGTATTTTTCT
GTCTTAGATTTACAGACACCATACCGTTGACCAGAAAAAAAAAAGATTTACAGGCACCAT
AAGTATGTTCCAAGCCTTTGGTTTTTTCAGTTTCATCTGAGATGACTCTTGAGAATGAAG
TTGTTTGAATTGTGTATAGGCCGGAGCAAGAGATGTATATTTTTTTCAGTTTCATCTGAG
ATGATAATTGGAGTTTTATAAGTTTATAT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5429Contig1 754 2 6 U
AGTAACGATGAAAGTGAGCTTAGAAGGGAAGAGAGTGGTGTTGGTTCCCTACATGTCGGA
ACATGTCCCGAAGTACCACAGTTGGATGCAGGATCCTGCGCTTCTCGAAGCTACTGGATC
TGAGCCGTTGAGTCTGGAGCAGGAGTATGAGATGCAAATCTCTTGGACTCAAGATCCCAA
TAAGCGGACTTTCATTGTCTTGGACAAAGATTTCATAGAGGGAGACTTGGCTCATGGCGA
ACCTCATGTAGAAGCCATGACGGGTGATGTGAACATCTACATGAACGATGTGGATGATCC
CAAGGTTGCGGAGGTGGAAATAATGATAGCTGAGCCCACAAGTCGTGGTAAAGGAATAGG
AAAGGAATCTGTGTTGATGATGATGGCTTATGCTGTCAAGAATTTGGAGATTCACAAGTT
TACAGCCAAGATTGGGGACTCAAACACAGCTTCCCTCACCTTATTCCGCAAACTGGGTTA
CGAGGACACTTCTCACAGTGAAATCTTCAAAGAGGTTACACTAGAGTACACGGTGACAGA
TCTCCGTCGAGCAGAGCTTTTGAAGTTATTGGAGGATGATGTCATCACGCACACTAATTC
ATCTGACAGCCCATCAGATTCGCTGCTGACAGGGAAAGCTATTGCATAGAGCCTTTGTTC
AATGCTTATTATTGTTGAAAGAAAAAGATATATCATTTACCGTGTTTGAGCCTAAACAAA
AATGATGGTAGCACAATAATATATATGGACCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT53TF U 1
AF RR2GT53JQB C 307
BS 1 633 RR2GT53TF
BS 634 634 RR2GT53JQB
BS 635 661 RR2GT53TF
BS 662 662 RR2GT53JQB
BS 663 672 RR2GT53TF
BS 673 754 RR2GT53JQB

RD RR2GT53TF 683 0 0
AGTAACGATGAAAGTGAGCTTAGAAGGGAAGAGAGTGGTGTTGGTTCCCTACATGTCGGA
ACATGTCCCGAAGTACCACAGTTGGATGCAGGATCCTGCGCTTCTCGAAGCTACTGGATC
TGAGCCGTTGAGTCTGGAGCAGGAGTATGAGATGCAAATCTCTTGGACTCAAGATCCCAA
TAAGCGGACTTTCATTGTCTTGGACAAAGATTTCATAGAGGGAGACTTGGCTCATGGCGA
ACCTCATGTAGAAGCCATGACGGGTGATGTGAACATCTACATGAACGATGTGGATGATCC
CAAGGTTGCGGAGGTGGAAATAATGATAGCTGAGCCCACAAGTCGTGGTAAAGGAATAGG
AAAGGAATCTGTGTTGATGATGATGGCTTATGCTGTCAAGAATTTGGAGATTCACAAGTT
TACAGCCAAGATTGGGGACTCAAACACAGCTTCCCTCACCTTATTCCGCAAACTGGGTTA
CGAGGACACTTCTCACAGTGAAATCTTCAAAGAGGTTACACTAGAGTACACGGTGACAGA
TCTCCGTCGAGCAGAGCTTTTGAAGTTATTGGAGGATGATGTCATCACGCACACTAATTC
ATCTGACAGCCCATCAGATTCGCTGCTGACAGG*AAAGCTATTGCATAGAGCCTTTGTTC
A*TGCTTATTAT
GTGAAGAAAAG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2GT53JQB 448 0 0
TGCGGAGGTGGAAATAATGATAGCTGAGCCCACAAGTCGTGGTAAAGGAATAGGAAAGGA
ATTTGTGTTGATGATGATGGCTTATGCTGTCAAGAATTTGGAGATTCACAAGTTTACAGC
CAAGATTGGGGACTCAAACACAGCTTCCCTCACCTTATTCCGCAAACTGGGTTACGAGGA
CACTTTTCACAGTGAAATTTTCAAAGAGGTTACACTAGAGTACACGGTGACAGATTTCCG
TCGAGCAGAGCTTTTGAAGTTATTGGAGGATGATGTCATCACGCACACTAATTCATTTGA
CAGCCCATCAGATTCGCTGCTGACAGGGAAAGCTATTGCATAGAGCCTTTGTTCAATGCT
TATTATTGTTGAAAGAAAAAGATATATCATTTACCGTGTTTGAGCCTAAACAAAAATGAT
GGTAGCACAATAATATATATGGACCTTT

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 2

CO CL5430Contig1 652 2 17 U
CGTTCAAAGGATTGGCAGAACATAAATTATCCAAAACATTCAGTCGAACTTATGATAACT
TCAGTAAGTACCACACCACACAAGATACGTAGACATAAGAGTTTCATAGAGGAGTCTCTT
CATGGAGAAGTCTTAAAACATTTTATTTGGGCGATGAGAGTCATAATAGCTCATAGGAAG
ATAAGACAGAGAGCTGAACTGGGCTCATAGGAAGATAAGACAGAGAGCTGAACTGAATCA
GCAGTAAAACATAACTCGCTTCACGTTGTCTTTCAAAGGTGGGAGTGGTCTCACAGCAGC
GTTCACGTGAGGCCCACGCATGTTTCTACCACCCATACCACCTCCACGTGCCATGCTCCC
ACTAGCCATCGAACCACTGTCTGATGTCTCTGGCTCCATGTAAAACCGAGCCCTGAACGC
TGCTAAATGAGCATAGTACGCAGGCGGCACAATGGATACAGAACGAGTGCATCTAGCATA
CGTGTAACATAAGTTATTAGTCAAAAATTGGAGTCCATCAGCAGAAAAGTTGTTCTCATC
CCAAAAAACATGGTAATGAGCAGGTCGAGAAGTGCCCTGAATACCAGCATGGCTACAGAG
ATAGAAGTCGAACTCTGTGGGGTGACATATCTTTGAATCCACGACAGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H430JQB U 218
AF RR2AX37JQ U 1
BS 1 246 RR2AX37JQ
BS 247 247 RR2H430JQB
BS 248 360 RR2AX37JQ
BS 361 361 RR2H430JQB
BS 362 402 RR2AX37JQ
BS 403 403 RR2H430JQB
BS 404 425 RR2AX37JQ
BS 426 426 RR2H430JQB
BS 427 503 RR2AX37JQ
BS 504 504 RR2H430JQB
BS 505 505 RR2AX37JQ
BS 506 506 RR2H430JQB
BS 507 525 RR2AX37JQ
BS 526 526 RR2H430JQB
BS 527 545 RR2AX37JQ
BS 546 546 RR2H430JQB
BS 547 652 RR2AX37JQ

RD RR2H430JQB 378 0 0
AGATAA
AGAGCTGAACTGAATCAGCAGTAAAACATAACTCGCTTCACGTTGTCTTTCAAAGGTGGG
AGTGGTCTCACAGCAGCGTTCACGTGAGGCCCACGCATGTTTCTACCACCCATACCACCT
CCACGTGCCATGCTCCCACTAGCCATCGAACCACTGTCTGATGTCTCTGGCTCCATGTAA
AACCGAGCCCTGAACGCTGCTAAATGAGCATAGTACGCAGGCGGCACAATGGATACAGAA
CGAGTGCATCTAGCATACGTGTAACATAAGTTATTAGTCAAAAATTGGAGTCCATCAGCA
GAAAAGTTGTTCTCATCCCAAAAAACATGGTAATGAGCAGGTCGAGAAGTGCCCTGAATA
CCAGCATGGCT
G

QA 7 377 7 377
DS 

RD RR2AX37JQ 652 0 0
CGTTCAAAGGATTGGCAGAACATAAATTATCCAAAACATTCAGTCGAACTTATGATAACT
TCAGTAAGTACCACACCACACAAGATACGTAGACATAAGAGTTTCATAGAGGAGTCTCTT
CATGGAGAAGTCTTAAAACATTTTATTTGGGCGATGAGAGTCATAATAGCTCATAGGAAG
ATAAGACAGAGAGCTGAACTGGGCTCATAGGAAGATAAGACAGAGAGCTGAACTGAATCA
GCAGTAGAACATAACTCGCTTCACGTTGTCTTTCAAAGGTGGGAGTGGTCTCACAGCAGC
GTTCACGTGAGGCCCACGCATGTTTCTACCACCCATACCACCTCCACGTGCCATGCTCCC
GCTAGCCATCGAACCACTGTCTGATGTCTCTGGCTCCATGTAGAACCGAGCCCTGAACGC
TGCTAGATGAGCATAGTACGCAGGCGGCACAATGGATACAGAACGAGTGCATCTAGCATA
CGTGTAACATAAGTTATTAGTCAGAGATTGGAGTCCATCAGCAGAGAAGTTGTTCTCATC
CCAAAGAACATGGTAATGAGCAGGTCGAGAAGTGCCCTGAATACCAGCATGGCTACAGAG
ATAGAAGTCGAACTCTGTGGGGTGACATATCTTTGAATCCACGACAGTTCCC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL5431Contig1 785 2 2 U
GGCTTCAAGGTTTATAAAGTGTGTCACAGTCGCGACGGCGCTGTTGGAAAGACTTGTCTG
CTCATCTCCTACACTAGCAACACTTTCCCCACGGATTACGTGCCAACTGTGTTTGATAAT
TTCAGCGCCAATGTGATTGTGGATGGAAACACTATCAACTTGGGATTGTGGGATACTGCA
GGACAAGAAGACTACAATAGACTAAGACCTATGAGCTATCGAGGTGCAGATGTCTTCTTA
TTTGCCTTCTCTCTCGTCAGCAAAGCTAGCTATGAAAATGTTTCTAAAAAGTGGGTACCT
GAACTGAGACATTATGCTCCTGGTGTACCCATCATCCTCGTTGGAACCAAGCTTGATCTT
CGAGATGACAAGCAATTCTTGGTTGAGCACCCTGGTGCTGTGCCTATCTCTACTGCTCAG
GGTGAAGAACTGAAGAAGCTCATTGGGGCACCTGCTTATATTGAATGCAGTGCAAAAACA
CAACAGAATGTAAAAGCAGTGTTTGATGCGGCTATCAAGGTCGTTCTCCAACCACCCAAA
AACAAGAAGAGGAAGAAGAGAAAGTCTCAGAAAGGTTGTTCTATATTGTGATTCCACTAG
AGAACCAACCAGCAGGAGGATTGAAGTAGCTCTCACCACTTGTTTGTTTTCCTTAACAAA
GGAGGAACCTGTTGTTTGTAGTCTTTTTAAAAAAACAAAACAGAAGAAGTAGTAACCAAG
TATTTGTATTCTTGTTTGCATTTTGATTTGTATATATATTCCACGAATACTCTATTTCTT
TTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2H236TF U 1
AF RR2H236JQ C 252
BS 1 596 RR2H236TF
BS 597 785 RR2H236JQ

RD RR2H236TF 596 0 0
GGCTTCAAGGTTTATAAAGTGTGTCACAGTCGCGACGGCGCTGTTGGAAAGACTTGTCTG
CTCATCTCCTACACTAGCAACACTTTCCCCACGGATTACGTGCCAACTGTGTTTGATAAT
TTCAGCGCCAATGTGATTGTGGATGGAAACACTATCAACTTGGGATTGTGGGATACTGCA
GGACAAGAAGACTACAATAGACTAAGACCTATGAGCTATCGAGGTGCAGATGTCTTCTTA
TTTGCCTTCTCTCTCGTCAGCAAAGCTAGCTATGAAAATGTTTCTAAAAAGTGGGTACCT
GAACTGAGACATTATGCTCCTGGTGTACCCATCATCCTCGTTGGAACCAAGCTTGATCTT
CGAGATGACAAGCAATTCTTGGTTGAGCACCCTGGTGCTGTGCCTATCTCTACTGCTCAG
GGTGAAGAACTGAAGAAGCTCATTGGGGCACCTGCTTATATTGAATGCAGTGCAAAAACA
CAACAGAATGTAAAAGCAGTGTTTGATGCGGCTATCAAGGTCGTTCTCCAACCACCCAAA
AACAAGAAGAGGAAGAAGAGAAAGTCTCAGAAAGGTTGTTCTATATTGTGATTCCA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2H236JQ 534 0 0
TCTCGTCAGCAAAGCTAGCTATGAAAATGTTTCTAAAAAGTGGGTACCTGAACTGAGACA
TTATGCTCCTGGTGTACCCATCATCCTCGTTGGAACCAAGCTTGATCTTCGAGATGACAA
GCAATTCTTGGTTGAGCACCCTGGTGCTGTGCCTATCTTTACTGCTCAGGGTGAAGAACT
GAAGAAGCTCATTGGGGCACCTGCTTATATTGAATGCAGTGCAAAAACACAACAGAATGT
AAAAGCAGTGTTTGATGCGGCTATCAAGGTCGTTCTCCAACCACCCAAAAACAAGAAGAG
GAAGAAGAGAAAGTTTCAGAAAGGTTGTTCTATATTGTGATTCCACTAGAGAACCAACCA
GCAGGAGGATTGAAGTAGCTCTCACCACTTGTTTGTTTTCCTTAACAAAGGAGGAACCTG
TTGTTTGTAGTCTTTTTAAAAAAACAAAACAGAAGAAGTAGTAACCAAGTATTTGTATTC
TTGTTTGCATTTTGATTTGTATATATATTCCACGAATACTCTATTTCTTTTGCC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 2

CO CL5432Contig1 1032 2 4 U
GGGAACCACCACACCAGAAAAAAAACAAGAAGACAAAGATGTTCAGACCTATGAGTTTTG
ACAAGGAAGTTGAACTGTTTGGAGATTCGAAGCTGGTCAGTGACGGTTCTTCGATTCAGC
TGACAAACTCGGTGAGTGGAAGCGAGGGAAGAGTCGTTTACAAGGAACCCATCAATCTTT
TCCGAGGTGAACAGAATAGTCGTAACTCGTTATCTTTCTCGAGTCACTTCTCGTTTTCCA
TGCCTAACGAGACCGATGACGTCATGGCTTTTGTAATGGTTCCAACTAGTTTGGATCTTG
TTCTGTTCGGTAAGGAAAACAACGGTTCCTCTGCCTTAGGGTTTCTGGTCGAGCATGCAA
AGAACGAGACAGTTGTGGCTTTTGAGTTTGATATTTCCAGTAGAGGAAACCGTGCGAGAA
TCTTGATAGGTAAACCTGAATCTTCCGAAATTAGAAACATTTCGTTTGAGGGTGACTTGT
TGGTGGACGATGGAGGGACTTTGAGTTGTATGATTGAGTATGAGGCAAGTTTGAAGAGAA
TGATGGTTCGGTTCAGAAAACTAGGCACGAGAAAGATGTTGGATCCGTTCTTTGAGTTCT
ATGTAGACTTGGAGGAGATATTGGAAGGTGGTGAGTTCGTGGTGGGTTTAAGCTCTACGA
ACGGGAGCTCTTCCAATGCACATCTTCTCCATTCATGGAACTTTGACATAAGGCATCCAA
CGCCGGTGTGTGTGACTCCATTGCCACCTCGGGGTCCAGATGGAAGTGTGAGTATGTAGA
GAATGCTGGGTGGAGTATATTGAGGAATATGCTCTGGTGAGGGATGTGCTATGAGTATTG
TGGTGGTTGCTGTTGAAGAGGTACTGAGGAGTTTGGTGTGGTTTAAGGTTGTGGTGTGAA
TGCAGAGTCTTCTTCTGCTGTCTTTTGTGTTATTTTCTGTTGCTTTACTTAGTTTCTTGG
TTTCATATGTAAAATAGCTAATGAAAAGAAGCCGTGAGAATAATGATCTTGTGAAGTTGA
TGTTTCTTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL09TF U 1
AF RR2EL09JQ C 339
BS 1 627 RR2EL09TF
BS 628 628 RR2EL09JQ
BS 629 679 RR2EL09TF
BS 680 1032 RR2EL09JQ

RD RR2EL09TF 679 0 0
GGGAACCACCACACCAGAAAAAAAACAAGAAGACAAAGATGTTCAGACCTATGAGTTTTG
ACAAGGAAGTTGAACTGTTTGGAGATTCGAAGCTGGTCAGTGACGGTTCTTCGATTCAGC
TGACAAACTCGGTGAGTGGAAGCGAGGGAAGAGTCGTTTACAAGGAACCCATCAATCTTT
TCCGAGGTGAACAGAATAGTCGTAACTCGTTATCTTTCTCGAGTCACTTCTCGTTTTCCA
TGCCTAACGAGACCGATGACGTCATGGCTTTTGTAATGGTTCCAACTAGTTTGGATCTTG
TTCTGTTCGGTAAGGAAAACAACGGTTCCTCTGCCTTAGGGTTTCTGGTCGAGCATGCAA
AGAACGAGACAGTTGTGGCTTTTGAGTTTGATATTTCCAGTAGAGGAAACCGTGCGAGAA
TCTTGATAGGTAAACCTGAATCTTCCGAAATTAGAAACATTTCGTTTGAGGGTGACTTGT
TGGTGGACGATGGAGGGACTTTGAGTTGTATGATTGAGTATGAGGCAAGTTTGAAGAGAA
TGATGGTTCGGTTCAGAAAACTAGGCACGAGAAAGATGTTGGATCCGTTCTTTGAGTTCT
ATGTAGACTTGGAGGAGATATTGGAAG*TGGTGAGTTCGTGGTGGGTTTAAGCTCTACGA
ACGGGAGCTCTTCCAATGC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2EL09JQ 694 0 0
GGGTTTCTGGTCGAGCATGCAAAGAACGAGACAGTTGTGGCTTTTGAGTTTGATATTTCC
AGTAGAGGAAACCGTGCGAGAATCTTGATAGGTAAACCTGAATCTTCCGAAATTAGAAAC
ATTTCGTTTGAGGGTGACTTGTTGGTGGACGATGGAGGGACTTTGAGTTGTATGATTGAG
TATGAGGCAAGTTTGAAGAGAATGATGGTTCGGTTCAGAAAACTAGGCACGAGAAAGATG
TTGGATCCGTTCTTTGAGTTCTATGTAGACTTGGAGGAGATATTGGAAGGTGGTGAGTTC
GTGGTGGGTTTAAGCTCTACGAACGGGAGCTCTTCCAATGCACATCTTCTCCATTCATGG
AACTTTGACATAAGGCATCCAACGCCGGTGTGTGTGACTCCATTGCCACCTCGGGGTCCA
GATGGAAGTGTGAGTATGTAGAGAATGCTGGGTGGAGTATATTGAGGAATATGCTCTGGT
GAGGGATGTGCTATGAGTATTGTGGTGGTTGCTGTTGAAGAGGTACTGAGGAGTTTGGTG
TGGTTTAAGGTTGTGGTGTGAATGCAGAGTCTTCTTCTGCTGTCTTTTGTGTTATTTTCT
GTTGCTTTACTTAGTTTCTTGGTTTCATATGTAAAATAGCTAATGAAAAGAAGCCGTGAG
AATAATGATCTTGTGAAGTTGATGTTTCTTGGTC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL5433Contig1 1175 2 4 U
GGAAACACTGTCATTTTCAGCCCGTATCTTCTTCCTGTTTTGAGATCCGTTTGAGTGTGG
TTCATCTTCGGGCGAGTCGTTTTTGATTCTCGATCTCTTCGATTCCTCTACCGATCTAAA
CGGACGAAACTACTCATCTTCACCTAAAGCATTCTCCATCCTCCTATATGTATATAGAGG
TCCTGTCTCCTAGATTTTCTCCTCGGAAGAACTGCTCAGTCAGTTGTTGCTCGCCTTATC
CTTATCCGTTTCTGGGAAGATCTCAATGTCACTCATAAACTCTCTTTCTTCTCTCTCAGC
CACAGTATCACCGGAGATTACGCCGGAACGGCGAATGCGGCGTCGATTGGCGCGTAGTTC
AATATTCCGGAGTCGGGTCATTGAAATCATCACTCCCTCTCGACTCATGAGCAAGCACAC
ATGCAAATCATAGGCAAACCCATGATAAGATAAGAAGATTAACTGGAAGATGGACATGAG
GCGTAAGAGCAACACCAGCGTAGAAGATCTGAAGAAAGTTTCCATGGCCACCACTTCTGT
CATTTATGACTCAGCAACCTTCTCCACCTTATTTGTGACTCTTTACCTATCTTTACTTTT
TGCCTCCTTGGAGGTCGTTTCATCATAGTGGCTGCTCATTTGAACGCTACGGTTGACCGC
TGCGGCAATAGACACCGCGAGTAGTTCCCAGTAGCAAGAACTGAAGAAAGTTGCGGAGTA
TTCAGTGAAATATCTTTTGGGCGTAGGCTGCTGTCACAGACTAACAGATCACATAAGATT
CAATGTTACATATGGAAGCTTAGGAACGTTTCCGTGAGAACATCAAGATACAGTGGTCCT
TGCAATTAGAGATTGAAAACATTGGCGGTACCTACAAATGGTGTTTGAGAGTACAACAAA
AGTTACAAGAGAGACCCGGACCTCTTCCTCAATGACATCACCAAAGCAATGCAATGGCAC
ATTTGCGACATCCAAATTTGGTTTCAAGACACAAAATTTTGAACCAAACTGTATCTGCTG
TTGGTGTCCATGAAACTAAGTCCATTCAACTCTTTTTTTTCCAATTCGAGTACAATTAAG
GAAATGTTTTATTCTGGAAATGAACCTATGTATTTTAGATGTGTGTATACTTAGAAGCGA
TATTGAGCACAAAAGTTAAAATGTGTTAAAGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B405TF U 1
AF RR2B405JQ C 262
BS 1 746 RR2B405TF
BS 747 747 RR2B405JQ
BS 748 801 RR2B405TF
BS 802 1175 RR2B405JQ

RD RR2B405TF 801 0 0
GGAAACACTGTCATTTTCAGCCCGTATCTTCTTCCTGTTTTGAGATCCGTTTGAGTGTGG
TTCATCTTCGGGCGAGTCGTTTTTGATTCTCGATCTCTTCGATTCCTCTACCGATCTAAA
CGGACGAAACTACTCATCTTCACCTAAAGCATTCTCCATCCTCCTATATGTATATAGAGG
TCCTGTCTCCTAGATTTTCTCCTCGGAAGAACTGCTCAGTCAGTTGTTGCTCGCCTTATC
CTTATCCGTTTCTGGGAAGATCTCAATGTCACTCATAAACTCTCTTTCTTCTCTCTCAGC
CACAGTATCACCGGAGATTACGCCGGAACGGCGAATGCGGCGTCGATTGGCGCGTAGTTC
AATATTCCGGAGTCGGGTCATTGAAATCATCACTCCCTCTCGACTCATGAGCAAGCACAC
ATGCAAATCATAGGCAAACCCATGATAAGATAAGAAGATTAACTGGAAGATGGACATGAG
GCGTAAGAGCAACACCAGCGTAGAAGATCTGAAGAAAGTTTCCATGGCCACCACTTCTGT
CATTTATGACTCAGCAACCTTCTCCACCTTATTTGTGACTCTTTACCTATCTTTACTTTT
TGCCTCCTTGGAGGTCGTTTCATCATAGTGGCTGCTCATTTGAACGCTACGGTTGACCGC
TGCGGCAATAGACACCGCGAGTAGTTCCCAGTAGCAAGAACTGAAGAAAGTTGCGGAGTA
TTCAGTGAAATATCTTTTGGGCGTAG*CTGCTGTCACAGACTAACAGATCACATAAGATT
CAATGTTACATATGGAAGCTT

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2B405JQ 914 0 0
CTCAATGTCACTCATAAACTCTCTTTCT*CTCTCTCAGCCACAGTATCACCGGAGATTAC
GCCGGAACGGCGAATGCGGCGTCGATTGGCGCGTAGTTCAATATTCCGGAGTCGGGTCAT
TGAAATCATCACTCCCTCTCGACTCATGAGCAAGCACACATGCAAATCATAGGCAAACCC
ATGATAAGATAAGAAGATTAACTGGAAGATGGACATGAGGCGTAAGAGCAACACCAGCGT
AGAAGATCTGAAGAAAGTTTCCATGGCCACCACTTCTGTCATTTATGACTCAGCAACCTT
CTCCACCTTATTTGTGACTCTTTACCTATCTTTACTTTTTGCCTCCTTGGAGGTCGTTTC
ATCATAGTGGCTGCTCATTTGAACGCTACGGTTGACCGCTGCGGCAATAGACACCGCGAG
TAGTTCCCAGTAGCAAGAACTGAAGAAAGTTGCGGAGTATTCAGTGAAATATCTTTTGGG
CGTAGGCTGCTGTCACAGACTAACAGATCACATAAGATTCAATGTTACATATGGAAGCTT
AGGAACGTTTCCGTGAGAACATCAAGATACAGTGGTCCTTGCAATTAGAGATTGAAAACA
TTGGCGGTACCTACAAATGGTGTTTGAGAGTACAACAAAAGTTACAAGAGAGACCCGGAC
CTCTTCCTCAATGACATCACCAAAGCAATGCAATGGCACATTTGCGACATCCAAATTTGG
TTTCAAGACACAAAATTTTGAACCAAACTGTATCTGCTGTTGGTGTCCATGAAACTAAGT
CCATTCAACTCTTTTTTTTCCAATTCGAGTACAATTAAGGAAATGTTTTATTCTGGAAAT
GAACCTATGTATTTTAGATGTGTGTATACTTAGAAGCGATATTGAGCACAAAAGTTAAAA
TGTGTTAAAGTTCT

QA 1 914 1 914
DS 



AS 1 2

CO CL5434Contig1 626 2 3 U
CGAGTAAACTACTAAAATTGTCAACACAAACATTACAAGAATTTTAAGCTGTTTTTTTTC
CAAAAGGGGTTTTGCAAAAAGCAACATGAAGAAGGCACAAAAGCTCAAAACTGAGGTAAG
AAACTAGAGTTTATAGCAAGAGAAACGAAACGGCCTTTTGATGATAATTCATCTTTTAAG
CAGCTTGTTGGGCAGAAAGCCTCTTCCTGGCTTCCTCAATGATGGTCAGCTTGATACCTT
TACCCTTGGGAAGAGACACCCACGGCTTTGTCCCTTTCCCGAGAGTAAACACATTACCCA
ACCTCGTGGCAAACTCATGCCCCGTCGAGTCTTGAATGTGGATCGTCTCAAAGCTTCCCT
TGTGCTTCTCACGGTTCTTGATCACACCCACACGCCCTCTGTTTCTACCCCCAGTCACCA
TCACAACGTTGCCCACGTCGAACTTGATGAAGTCCACAACCTTGTTCTCCTCGAGGTCTA
GCTTGATGGTGTCGTTTGGTTTGATGAGCGGGTCAGGGTAACGGATGGTGCGACCATCGT
AAGTGTTGAGGTAAGGGATTCCCTTCTGCCCCAACTGGATAGTCCTAACCTTGCAAAGCT
TGAACTTTGCTTCCTCATCCCTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH52JQ U 144
AF RR2G609TF C 1
BS 1 143 RR2G609TF
BS 144 446 RR2AH52JQ
BS 447 626 RR2G609TF

RD RR2AH52JQ 303 0 0
AACGAAACGGCCTTTTGATGATAATTCATCTTTTAAGCAGCTTGTTGGGCAGAAAGCCTC
TTCCTGGCTTCCTCAATGATGGTCAGCTTGATACCTTTACCCTTGGGAAGAGACACCCAC
GGCTTTGTCCCTTTCCCGAGAGTAAACACATTACCCAACCTCGTGGCAAACTCATGCCCC
GTCGAGTCTTGAATGTGGATCGTCTCAAAGCTTCCCTTGTGCTTCTCACGGTTCTTGATC
ACACCCACACGCCCTCTGTTTCTACCCCCAGTCACCATCACAACGTTGCCCACGTCGAAC
TTG

QA 1 303 1 303
DS 

RD RR2G609TF 626 0 0
CGAGTAAACTACTAAAATTGTCAACACAAACATTACAAGAATTTTAAGCTGTTTTTTTTC
CAAAAGGGGTTTTGCAAAAAGCAACATGAAGAAGGCACAAAAGCTCAAAACTGAGGTAAG
AAACTAGAGTTTATAGCAAGAGAAACGAAACGGCCTTTTGATGATAATTCATCTTTTAAG
CAGCTTGTTGGGCAGAAAGCCTCTTCCTGGCTTCCTCAATGATGGTCAGCTTGATACCTT
TACCCTTGGGAAGAGACGCCCACGGCTTTGTCCCTTTCCCGAGAGTAAACACATTACCCA
ACCTCGTGGCAAACTCATGCCCCGTCGAGTCTTGAATGTGGATCGTCTCAAAGCTTCCCT
TGTGCTTCTCACGGTTCTTGATCACACCCACACGCCCTCTGTTTCTACCCCCAGTCACCA
TCACAACGTTGCCCACGTCGAACTTGATGAAGTCCACAACCTTGTTCTCCTCGAGGTCTA
GCTTGATGGTGTCGTTTGGTTTGATGAGCGGGTCAGGGTAACGGATGGTGCGACCATCGT
AAGTGTTGAGGTAAGGGATTCCCTTCTGCCCCAACTGGATAGTCCTAACCTTGCAAAGCT
TGAACTTTGCTTCCTCATCCCTGATC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL5435Contig1 651 2 3 U
TCATAGTGTTTATTTTATTCAATCTGAAACAGCTCGAGGCTGGAGTTGCATAGAGTCCAG
ATAAACAAACCCAATAAATCGTACAATGTTACAGTTTTAGACATAAACATTCATATGAAT
CGTTTTCTTCTTACATTTTACATATCATTCGCTTGTACTTCCCTTGAGGTTCAGCCTTGA
AACCATATTCTCCGTCCTCTGTTCGGAATGAGAAAGATACTTCCCGTCAAGTGTCACGAC
AACGTGGTTATTACCATCCACTCCTTTAACTTTGTCCACGGAGCAATAAAAGTCTATCGC
CGACATGATGCCATCGCCAAAATCTTCATTGATAATCTCTTTTATACTCTCACCGAAATG
CATCACTGCTTCATTCAACCTGTAAACGGTAGGTTCTTGGATAAGGTTTGGATCATATGA
TCTCCACGGAGGAGACATCATGGCGGCGATGAGTTCGTCGGTCAGAGCAGGTAAAGCTTC
ACGGAGCTTTGGGACTGTGTCGGGTTTGAGCTGGGCTTGGCGACGGAGAAGCTGAGCCAC
GTAGACGTTGGTGAGACCTGTCTCCTCCGCTAATTGGCTGTAAGTCTTGCCGGAGGCTGA
CTTCACGGTGAGAAGTCGGTTTGTAACGCTCAGCTTCGTCGCCGCTGCTTC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU71JQ U 2
AF RR2CU71TF C 1
BS 1 1 RR2CU71TF
BS 2 588 RR2CU71JQ
BS 589 651 RR2CU71TF

RD RR2CU71JQ 587 0 0
CATAGTGTTTATTTTATTCAATCTGAAACAGCTCGAGGCTGGAGTTGCATAGAGTCCAGA
TAAACAAACCCAATAAATCGTACAATGTTACAGTTTTAGACATAAACATTCATATGAATC
GTTTTCTTCTTACATTTTACATATCATTCGCTTGTACTTCCCTTGAGGTTCAGCCTTGAA
ACCATATTCTCCGTCCTCTGTTCGGAATGAGAAAGATACTTCCCGTCAAGTGTCACGACA
ACGTGGTTATTACCATCCACTCCTTTAACTTTGTCCACGGAGCAATAAAAGTCTATCGCC
GACATGATGCCATCGCCAAAATCTTCATTGATAATCTCTTTTATACTCTCACCGAAATGC
ATCACTGCTTCATTCAACCTGTAAACGGTAGGTTCTTGGATAAGGTTTGGATCATATGAT
CTCCACGGAGGAGACATCATGGCGGCGATGAGTTCGTCGGTCAGAGCAGGTAAAGCTTCA
CGGAGCTTTGGGACTGTGTCGGGTTTGAGCTGGGCTTGGCGACGGAGAAGCTGAGCCACG
TAGACGTTGGTGAGACCTGTCTCCTCCGCTAATTGGCTGTAAGTCTT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2CU71TF 651 0 0
TCATAGTGTTTATTT*ATTCAATCTGAAACAGCTCGAGGCTGGAGTTGCATAGAGTCCAG
ATAAACAAACCCAATAAATCGTACAATGTTACAGTTTTAGACATAAACATTCATATGAAT
CGTTTTCTTCTTACATTTTACATATCATTCGCTTGTACTTCCCTTGAGGTTCAGCCTTGA
GACCATATTCTCCGTCCTCTGTTCGGAATGAGAAAGATACTTCCCGTCAAGTGTCACGAC
AACGTGGTTATTACCATCCACTCCTTTAACTTTGTCCACGGAGCAATAGAAGTCTATCGC
CGACATGATGCCATCGCCAAAATCTTCATTGATAATCTCTTTTATACTCTCACCGAAATG
CATCACTGCTTCATTCAACCTGTAGACGGTAGGTTCTTGGATAAGGTTTGGATCATATGA
TCTCCACGGAGGAGACATCATGGCGGCGATGAGTTCGTCGGTCAGAGCAGGTAAAGCTTC
ACGGAGCTTTGGGACTGTGTCGGGTTTGAGCTGGGCTTGGCGACGGAGAAGCTGAGCCAC
GTAGACGTTGGTGAGACCTGTCTCCTCCGCTAATTGGCTGTAAGTCTTGCCGGAGGCTGA
CTTCACGGTGAGAAGTCGGTTTGTAACGCTCAGCTTCGTCGCCGCTGCTTC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL5436Contig1 914 2 2 U
TTTTTATGTTCTTCACAAGAATGCCTAAACATGGTTCTCGTTCTGTTGGGTATTCTAAAG
AAGAAGATAAACTTTTATGTCAAATTTATATGAAAGTTTCTCAAAATCCAATCACAGATT
TTTATCAAACAGCAGATCAATTCTGGGATTATGTGGTAGAAGCTTTCAAGAATGGTACAC
CCAAAACTTCGAGTGAACGTTCGAAAAAATCTCTTCAGTGTCGATTTCAAACGATCGAAA
GAGCAACAAAAAAACTACATGCATGCATCAAACAATGCGAAAACAGACATTCAAATGGTG
TTTCAAATGTTAATATTTGCAATCAAGCTAAACAAATGCTAATGGAAGATCCAAAATTCA
AATCTGGTTGGAAATTTGATCATGTGTGGAACATTATTAAGAATTCTGAAAAGTTTGAAG
ATGGTGTTACTTATGCTAAAAATGTATCAGATTCTTGCGGTTTCGAGACTACATATTCAG
AGAATCCAACAACTAATTCTGAGATACAAGCATTTCCAAGCGTACCTTCATTTTCTATTA
ACTTAGGTGGCAAAGATGATTCTATCGGTGGATCACTATCTCAACAACAAATTGGTGGAT
CCTTTTCTCAACGACCAATTGGAGTAAGAAAAGCTATACTAAAAAGAAGAAGCAATGATC
GAACATCGGCTGTAATCAAGATTTTAAAAGAAGGAAACAGACAACTTCTGAAACATTTAA
TGGAGACAAGTGCGCACATACAACACTATATGGAGATTCAAAGTAAGAATTATGCATTAA
AAAAAATTGAAGGAAGAAAATATTTTTTTACTTCAAGACTTGAATTCCATACAAGATTCA
AATATTCGTGCTTACGTTCAAAGTGAACAAAAAAGAATATTAAGAAATAGGGTTGATCAA
AAAGACCCTTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E423TF U 1
AF RR2E423JQ C 204
BS 1 543 RR2E423TF
BS 544 914 RR2E423JQ

RD RR2E423TF 543 0 0
TTTTTATGTTCTTCACAAGAATGCCTAAACATGGTTCTCGTTCTGTTGGGTATTCTAAAG
AAGAAGATAAACTTTTATGTCAAATTTATATGAAAGTTTCTCAAAATCCAATCACAGATT
TTTATCAAACAGCAGATCAATTCTGGGATTATGTGGTAGAAGCTTTCAAGAATGGTACAC
CCAAAACTTCGAGTGAACGTTCGAAAAAATCTCTTCAGTGTCGATTTCAAACGATCGAAA
GAGCAACAAAAAAACTACATGCATGCATCAAACAATGCGAAAACAGACATTCAAATGGTG
TTTCAAATGTTAATATTTGCAATCAAGCTAAACAAATGCTAATGGAAGATCCAAAATTCA
AATCTGGTTGGAAATTTGATCATGTGTGGAACATTATTAAGAATTCTGAAAAGTTTGAAG
ATGGTGTTACTTATGCTAAAAATGTATCAGATTCTTGCGGTTTCGAGACTACATATTCAG
AGAATCCAACAACTAATTCTGAGATACAAGCATTTCCAAGCGTACCTTCATTTTCTATTA
ACT

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2E423JQ 711 0 0
AAAAAATCTCTTCAGTGTCGATTTCAAACGATCGAAAGAGCAACAAAAAAACTACATGCA
TGCATCAAACAATGCGAAAACAGACATTCAAATGGTGTTTCAAATGTTAATATTTGCAAT
CAAGCTAAACAAATGCTAATGGAAGATCCAAAATTCAAATCTGGTTGGAAATTTGATCAT
GTGTGGAACATTATTAAGAATTCTGAAAAGTTTGAAGATGGTGTTACTTATGCTAAAAAT
GTATCAGATTCTTGCGGTTTCGAGACTACATATTCAGAGAATCCAACAACTAATTCTGAG
ATACAAGCATTTCCAAGCGTACCTTCATTTTCTATTAACTTAGGTGGCAAAGATGATTCT
ATCGGTGGATCACTATCTCAACAACAAATTGGTGGATCCTTTTCTCAACGACCAATTGGA
GTAAGAAAAGCTATACTAAAAAGAAGAAGCAATGATCGAACATCGGCTGTAATCAAGATT
TTAAAAGAAGGAAACAGACAACTTCTGAAACATTTAATGGAGACAAGTGCGCACATACAA
CACTATATGGAGATTCAAAGTAAGAATTATGCATTAAAAAAAATTGAAGGAAGAAAATAT
TTTTTTACTTCAAGACTTGAATTCCATACAAGATTCAAATATTCGTGCTTACGTTCAAAG
TGAACAAAAAAGAATATTAAGAAATAGGGTTGATCAAAAAGACCCTTCTGC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL5437Contig1 905 2 10 U
GAAAGAACCGCACGTGTAGAAGGCTGGCAGGGGCAACTTCCTGAGAATATTATTCAAAGC
GAATGGCAACGGTCGGAAGGTGATGAATTTTCTCAAAGGAGAAATGATGCTGAAGCAGAC
CTGAGTAGCCATCAAAGGGAGGATGCTACTAGCTGTTCATCTTCTTTTATTTTGGGAGGT
GGGAACAGACACGGCGGTCATTTGCAAGAAACTAGCGAGATATCTAATGAACAGTCTCTG
CAAAGTCCAGAAGAAATTGCCACTACTGGACCGACAGTAGATCTCCAGGAGCATCTGCCT
GAGAACATCGATCTAACTTTCACCCTAGAGGAACAGTCTGAAGAGGAGACTCTGGAAAAT
GAAGAAGCCGATTGGCAACTTATCAACGGTGAATGGAGAGATGATGCTGAAGAGGAGGCA
GATACTAACGTTTCCGAGAGTTTTCCAAATCAGTTGTCCCAGATATCATCCGTGGATGCA
GACGGAGAAGCCCATGGTCCACTACAACCCACAGAGATGCAGGCTGATGATTCTGATCTT
CAAAGCACAATACAAGACTGGTCTGAGGAACATTCTGATGAGGACACGGTCTCAATTGGA
AGGGCTGCCACATATTTTCCTCCGGACGATGATAATGAGAACATGGAACTCAGAGAACTC
TCGAGCAGGAGACGTGTTTCAAATCTTCTTCAAAGCGGGTTTAGGGAAAATCTTGACCAG
TTGATACAATCTTACGTGGACAGGCGAAGCCGAGATCCTGTCGACTGGGAAGAACACGAG
GACCCTTCATTAGTAGATGAACACACAGAACAGCAAGCTGATGCTCAGAGTGATGGTGGT
GGTGGTCAAGAAGTTGATGCTGTTGAATCTCCTCCTTTATCTCTACCCTCTCCAGTGATT
CCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2ET04TF U 1
AF RR2DT19TF U 419
BS 1 668 RR2ET04TF
BS 669 669 RR2DT19TF
BS 670 693 RR2ET04TF
BS 694 694 RR2DT19TF
BS 695 709 RR2ET04TF
BS 710 710 RR2DT19TF
BS 711 757 RR2ET04TF
BS 758 758 RR2DT19TF
BS 759 776 RR2ET04TF
BS 777 905 RR2DT19TF

RD RR2ET04TF 776 0 0
GAAAGAACCGCACGTGTAGAAGGCTGGCAGGGGCAACTTCCTGAGAATATTATTCAAAGC
GAATGGCAACGGTCGGAAGGTGATGAATTTTCTCAAAGGAGAAATGATGCTGAAGCAGAC
CTGAGTAGCCATCAAAGGGAGGATGCTACTAGCTGTTCATCTTCTTTTATTTTGGGAGGT
GGGAACAGACACGGCGGTCATTTGCAAGAAACTAGCGAGATATCTAATGAACAGTCTCTG
CAAAGTCCAGAAGAAATTGCCACTACTGGACCGACAGTAGATCTCCAGGAGCATCTGCCT
GAGAACATCGATCTAACTTTCACCCTAGAGGAACAGTCTGAAGAGGAGACTCTGGAAAAT
GAAGAAGCCGATTGGCAACTTATCAACGGTGAATGGAGAGATGATGCTGAAGAGGAGGCA
GATACTAACGTTTCCGAGAGTTTTCCAAATCAGTTGTCCCAGATATCATCCGTGGATGCA
GACGGAGAAGCCCATGGTCCACTACAACCCACAGAGATGCAGGCTGATGATTCTGATCTT
CAAAGCACAATACAAGACTGGTCTGAGGAACATTCTGATGAGGACACGGTCTCAATTGGA
AGGGCTGCCACATATTTTCCTCCGGACGATGATAATGAGAACATGGAACTCAGAGAACTC
TCGAGCAG*AGACGTGTTTCAAATCTTCTTCAA*GCGGGTTTAGGGAAA*TCTTGACCAG
TTGATACAATCTTACGTGGACAGGCGAAGCCGAGATC*TGTCGACTGGGAAGAACA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2DT19TF 487 0 0
CAGATACTAACGTTTCCGAGAGTTTTCCAAATCAGTTGTCCCAGATATCATCCGTGGATG
CAGACGGAGAAGCCCATGGTCCACTACAACCCACAGAGATGCAGGCTGATGATTCTGATC
TTCAAAGCACAATACAAGACTGGTCTGAGGAACATTCTGATGAGGACACGGTCTCAATTG
GAAGGGCTGCCACATATTTTCCTCCGGACGATGATAATGAGAACATGGAACTCAGAGAAC
TCTCGAGCAGGAGACGTGTTTCAAATCTTCTTCAAAGCGGGTTTAGGGAAAATCTTGACC
AGTTGATACAATCTTACGTGGACAGGCGAAGCCGAGATCCTGTCGACTGGGAAGAACACG
AGGACCCTTCATTAGTAGATGAACACACAGAACAGCAAGCTGATGCTCAGAGTGATGGTG
GTGGTGGTCAAGAAGTTGATGCTGTTGAATCTCCTCCTTTATCTCTACCCTCTCCAGTGA
TTCCTGT

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL5438Contig1 596 2 3 U
CACTGTTCAACTGCATGCAATACCATTGGCTGACACAGAACCTCTAGCAAAGGCAATTAG
CAATTTAAATCGCACCATATGTTCTTTCACTTGGTCTCTGCGTTGGTGCTTGAGTAGAAG
ACATGGAAGAACGGTCCCATGAAACTTCATTGGCAAAGGCATTGTTGATCTCTTCAGTTC
TTGAGTAGCTTTGCCCACTTCCACTCACAGTTTCAAGTAAGCCTGATAGAAGTGACATGC
CTGGCAATGCATCAATCCCACGCACGCGTTCTACTCTTGTTTTGTAGATAAATCCTCCAC
AGCATAAAAGTGTAAATGCAACGAGGGATACGCAGGAAAAGACTCCAAATATAGCCCATC
CTTTCGCTGATCCTCCTTCAGCACCTTGGCCGTATTCACAGTGTTTTGTGAGGAAAAACT
GAACAGGATCATAACCATCCACTGGGATAGTGACATTGACTTCATACGGAGTCTTACGAG
ATTTCTCACAATTCCAATCCAGTACTAAAGTTGAAGGTGATAAAGTTGTTGGATGATTCC
CAGTCAAGGAAGAACCAGATATCTTAACGTTAAGACCATTCTCCGGGGAAACCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD14JQ U 124
AF RR2AA01TF C 1
BS 1 123 RR2AA01TF
BS 124 475 RR2DD14JQ
BS 476 596 RR2AA01TF

RD RR2DD14JQ 352 0 0
TGGAAGAACGGTCCCATGAAACTTCATTGGCAAAGGCATTGTTGATCTCTTCAGTTCTTG
AGTAGCTTTGCCCACTTCCACTCACAGTTTCAAGTAAGCCTGATAGAAGTGACATGCCTG
GCAATGCATCAATCCCACGCACGCGTTCTACTCTTGTTTTGTAGATAAATCCTCCACAGC
ATAAAAGTGTAAATGCAACGAGGGATACGCAGGAAAAGACTCCAAATATAGCCCATCCTT
TCGCTGATCCTCCTTCAGCACCTTGGCCGTATTCACAGTGTTTTGTGAGGAAAAACTGAA
CAGGATCATAACCATCCACTGGGATAGTGACATTGACTTCATACGGAGTCTT

QA 1 352 1 352
DS 

RD RR2AA01TF 596 0 0
CACTGTTCAACTGCATGCAATACCATTGGCTGACACAGAACCTCTAGCAAAGGCAATTAG
CAATTTAAATCGCACCATATGTTCTTTCACTTGGTCTCTGCGTTGGTGCTTGAGTAGAAG
ACATGGAAGAGCGGTCCCATGAGACTTCATTGGCAAAGGCATTGTTGATCTCTTCAGTTC
TTGAGTAGCTTTGCCCACTTCCACTCACAGTTTCAAGTAAGCCTGATAGAAGTGACATGC
CTGGCAATGCATCAATCCCACGCACGCGTTCTACTCTTGTTTTGTAGATAAATCCTCCAC
AGCATAAAAGTGTAAATGCAACGAGGGATACGCAGGAGAAGACTCCAAATATAGCCCATC
CTTTCGCTGATCCTCCTTCAGCACCTTGGCCGTATTCACAGTGTTTTGTGAGGAAAAACT
GAACAGGATCATAACCATCCACTGGGATAGTGACATTGACTTCATACGGAGTCTTACGAG
ATTTCTCACAATTCCAATCCAGTACTAAAGTTGAAGGTGATAAAGTTGTTGGATGATTCC
CAGTCAAGGAAGAACCAGATATCTTAACGTTAAGACCATTCTCCGGGGAAACCTTC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5440Contig1 729 2 5 U
GTTTTTTCATAAATGAACAAAAAGTATTTATGGGACAGACATACGTACATTTCAATCTCA
TGCATATATACGAATAAACCATATAATTTTAAAAATCAATTTTGTAAAATTAAATTAATT
AAAAAGACCAAAAAAACCAAGAAAATTGATCCGTTGGGTAAACGTGGGGCAAAATGTCCC
TCTCAACGATCAAACCAACTGAAAAATCTAAACTCTTTTGTTATTGTTTTGTTAAAAGTA
AACTTAGGCTCCAGCGTAAGGGTTGGCAGGTTTAGGTGTGTTTTTGACGAAACCACATTG
GAGGCTTGTCTCAGGCATGTTGTACTCATCTCTAAGTGATTTCTCTGGCGACAAGACACT
CACGTAAAGCTGCTGTCCTAAGTAACGTCTCTCAGTGTTCTCAGATCGAATGTTCCACAT
TCCACAGTTATCAAATGTGAGCAAGATTGCTGCCCAGCACTTTGGGTAGACTTGGACTGT
GTGTCTGCTCACTGCGTCCAAGAGGTTGTAGTTCTTTCTCTTCTCTGGCGTCCAAGTCCC
AGGCTCCACAGCGACGGCGAAGAAAGAGTAACCATTCAAGTGCCAAGACTGAACACTCTT
CTCGTGGTTCTCAAACACCACCTCGATGAAGGTGCGGTGAGTGACGTTAATAACGTTTGG
CTCGATCTTGATGCTCTTTGTCTGTTCCGTGGTGGGGCTATCCGTGATGATATTGTACTT
AAAGACCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB30JQ U 1
AF RR2G993JQ U 1
BS 1 160 RR2G993JQ
BS 161 161 RR2GB30JQ
BS 162 178 RR2G993JQ
BS 179 179 RR2GB30JQ
BS 180 729 RR2G993JQ

RD RR2GB30JQ 558 0 0
GTTTTTTCATAAATGAACAAAAAGTATTTATGGGACAGACATACGTACATTTCAATCTCA
TGCATATATACGAATAAACCATATAATTTTAAAAATCAATTTTGTAAAATTAAATTAATT
AAAAAGACCAAAAAAACCAAGAAAATTGATCCGTTGGGTAAACGTGGGGCAAAATGTCCC
TCTCAACGATCAAACCAACTGAAAAATCTAAACTCTTTTGTTATTGTTTTGTTAAAAGTA
AACTTAGGCTCCAGCGTAAGGGTTGGCAGGTTTAGGTGTGTTTTTGACGAAACCACATTG
GAGGCTTGTCTCAGGCATGTTGTACTCATCTCTAAGTGATTTCTCTGGCGACAAGACACT
CACGTAAAGCTGCTGTCCTAAGTAACGTCTCTCAGTGTTCTCAGATCGAATGTTCCACAT
TCCACAGTTATCAAATGTGAGCAAGATTGCTGCCCAGCACTTTGGGTAGACTTGGACTGT
GTGTCTGCTCACTGCGTCCAAGAGGTTGTAGTTCTTTCTCTTCTCTGGCGTCCAAGTCCC
AGGCTCCACAGCGACGGC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2G993JQ 729 0 0
GTTTTTTCATAAATGAACAAAAAGTATTTATGGGACAGACATACGTACATTTCAATCTCA
TGCATATATACGAATAAACCATATAATTTTAAAAATCAATTTTGTAAAATTAAATTAATT
AAAAAGACCAAAAAAACCAAGAAAATTGATCCGTTGGGTAGACGTGGGGCAAAATGTCGC
TCTCAACGATCAAACCAACTGAAAAATCTAAACTCTTTTGTTATTGTTTTGTTAAAAGTA
AACTTAGGCTCCAGCGTAAGGGTTGGCAGGTTTAGGTGTGTTTTTGACGAAACCACATTG
GAGGCTTGTCTCAGGCATGTTGTACTCATCTCTAAGTGATTTCTCTGGCGACAAGACACT
CACGTAAAGCTGCTGTCCTAAGTAACGTCTCTCAGTGTTCTCAGATCGAATGTTCCACAT
TCCACAGTTATCAAATGTGAGCAAGATTGCTGCCCAGCACTTTGGGTAGACTTGGACTGT
GTGTCTGCTCACTGCGTCCAAGAGGTTGTAGTTCTTTCTCTTCTCTGGCGTCCAAGTCCC
AGGCTCCACAGCGACGGCGAAGAAAGAGTAACCATTCAAGTGCCAAGACTGAACACTCTT
CTCGTGGTTCTCAAACACCACCTCGATGAAGGTGCGGTGAGTGACGTTAATAACGTTTGG
CTCGATCTTGATGCTCTTTGTCTGTTCCGTGGTGGGGCTATCCGTGATGATATTGTACTT
AAAGACCTT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL5441Contig1 1199 2 4 U
GAGACTTACAACGAAGCAGCAGCTCTTCTCTCATCCGCTTACCCCAACCTCTTCTCTCCA
TCCTCCTCCTCAAAGAAGACTCACTCCAATCCTCAATTCTATGGGTTCGCCAAGTCCCCT
CTCCTCAGTGACAACGACGACGCTGCCTCCGAGCTTCTTCTTGAATCAGTCGAGGAGCCT
GACTTTCTCTTTCTCCCGACGATTCAAGCGAGATCGGAGTACTTCTCCGAGCTGAAGGAG
GTGAAAGTGAATCAATTCGAATTTTCAGACGAGTTCGACGCGGAGTCGATTCTTGATGAG
GAGGTTGAAGTAGGGATCGACAGTATAATGGGAATCGTCGAATCCACCAACTCGGGAGAG
AATCGTGGCCATCTAATTAACCGGTTAGAGCAGATGGTTATGATGAACCGAAGCACGAAG
GGATTTAAATTCGCCGGTAACTTCTTCCCGTTGGGACTTGGACTGAGAAGCGCTCTCAGA
GAACACAACGACGCGAGCTGGTGCAGGTTCCACACCGTCGATTTCGAACAGATCTCGCCG
TGGATCCGATCCACCGATGAGGAGAAAATAATCGAAAGCAAGAAGTTGATCGGAGAAAAG
AGCAAGAATAAGAAGAAAAACAAGAAAGTTGCAGAAGCGAAGAGATTGGATTCGAGTAAA
GAAGATGCGGAGGAGAGATCAGGGGAGCTGATGTTGAAGCTTGACTACGACGGCGTTTTG
GAAGCTTGGTCTGAGAAAGAGTCTCCCTTCTCCGATGACGTTCTGGGCTCGGAAGCTACT
ACCGGAGGAGCTGACGTCAATGCCAGATTAGCTCAGATAGATTTGTTCGGAGACAATGGA
GTACGAGAAGCAAGTGTTTTGAGGTACAAAGAGAAACGTCGAACTCGGCTCTTCTCCAAG
AAAATTCGATACCAAGTTCGCAAAGTTAATGCAGATCAACGTCCTCGAATGAAGGGACGG
TTCGTGAGAAGGCCCAATGCTAACCCTCCAAGTGGACAAAGATAGCGATGAAAGAAAGAG
CCAAGATTCACTTCTTTTATCCTTTTCATTCCTTTTTAGTTTTGTACTATATTATCTTTT
GCGGTTGTTATAGTTGAAATTTTGTTACCCTCATTTTTGTTCCTTAATTCATGGTCCTTT
TAGTTTATAATGTAATTTTTTTCTTTCATAAATAAGGATCAATAAAGAGATGTTAGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT03TF U 1
AF RR2FT03JQ C 440
BS 1 684 RR2FT03TF
BS 685 685 RR2FT03JQ
BS 686 783 RR2FT03TF
BS 784 1199 RR2FT03JQ

RD RR2FT03TF 783 0 0
GAGACTTACAACGAAGCAGCAGCTCTTCTCTCATCCGCTTACCCCAACCTCTTCTCTCCA
TCCTCCTCCTCAAAGAAGACTCACTCCAATCCTCAATTCTATGGGTTCGCCAAGTCCCCT
CTCCTCAGTGACAACGACGACGCTGCCTCCGAGCTTCTTCTTGAATCAGTCGAGGAGCCT
GACTTTCTCTTTCTCCCGACGATTCAAGCGAGATCGGAGTACTTCTCCGAGCTGAAGGAG
GTGAAAGTGAATCAATTCGAATTTTCAGACGAGTTCGACGCGGAGTCGATTCTTGATGAG
GAGGTTGAAGTAGGGATCGACAGTATAATGGGAATCGTCGAATCCACCAACTCGGGAGAG
AATCGTGGCCATCTAATTAACCGGTTAGAGCAGATGGTTATGATGAACCGAAGCACGAAG
GGATTTAAATTCGCCGGTAACTTCTTCCCGTTGGGACTTGGACTGAGAAGCGCTCTCAGA
GAACACAACGACGCGAGCTGGTGCAGGTTCCACACCGTCGATTTCGAACAGATCTCGCCG
TGGATCCGATCCACCGATGAGGAGAAAATAATCGAAAGCAAGAAGTTGATCGGAGAAAAG
AGCAAGAATAAGAAGAAAAACAAGAAAGTTGCAGAAGCGAAGAGATTGGATTCGAGTAAA
GAAGATGCGGAGGAGAGATCAGGG*AGCTGATGTTGAAGCTTGACTACGACGGCGTTTTG
GAAGCTTGGTCTGAGAAAGAGTCTCCCTTCTCCGATGACGTTCTGGGCTCGGAAGCTACT
ACC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2FT03JQ 760 0 0
ACTTCTTCCCGTTGGGACTTGGACTGAGAAGCGCTCTCAGAGAACACAACGACGCGAGCT
GGTGCAGGTTCCACACCGTCGATTTCGAACAGATCTCGCCGTGGATCCGATCCACCGATG
AGGAGAAAATAATCGAAAGCAAGAAGTTGATCGGAGAAAAGAGCAAGAATAAGAAGAAAA
ACAAGAAAGTTGCAGAAGCGAAGAGATTGGATTCGAGTAAAGAAGATGCGGAGGAGAGAT
CAGGGGAGCTGATGTTGAAGCTTGACTACGACGGCGTTTTGGAAGCTTGGTCTGAGAAAG
AGTCTCCCTTCTCCGATGACGTTCTGGGCTCGGAAGCTACTACCGGAGGAGCTGACGTCA
ATGCCAGATTAGCTCAGATAGATTTGTTCGGAGACAATGGAGTACGAGAAGCAAGTGTTT
TGAGGTACAAAGAGAAACGTCGAACTCGGCTCTTCTCCAAGAAAATTCGATACCAAGTTC
GCAAAGTTAATGCAGATCAACGTCCTCGAATGAAGGGACGGTTCGTGAGAAGGCCCAATG
CTAACCCTCCAAGTGGACAAAGATAGCGATGAAAGAAAGAGCCAAGATTCACTTCTTTTA
TCCTTTTCATTCCTTTTTAGTTTTGTACTATATTATCTTTTGCGGTTGTTATAGTTGAAA
TTTTGTTACCCTCATTTTTGTTCCTTAATTCATGGTCCTTTTAGTTTATAATGTAATTTT
TTTCTTTCATAAATAAGGATCAATAAAGAGATGTTAGATG

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL5442Contig1 340 2 1 U
GGGAGATCCATTACCTTGTTCTGTATTAATTCGCTTCTGGCCCCTGGAGATCTGATCCTT
TCCCATCGATTCCGATCCTCACGAAACGATGATCGATGACCAAGACTTGGGGTTTATAGT
CAACTCCCTTGGCATCTTCATCTTTGGGTTGGTAATTGCTTATCATTACGTAGCTGCTGA
TCCCAAGTTCGAATCCACTTGAGTGATGTACTTTTAGATGATGTAATGCGTCTTTTTTTT
AACTTTATAATAACTGTATTTTGCTAAGATGAATATGTTGTCAAGATGTTCGTAAGCCGT
TTCACATCTTCATTTCTTCGCTTTTATTTAGCAGAGATAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DE89JQ C 1
AF RR2DE89TF U 1
BS 1 340 RR2DE89TF

RD RR2DE89JQ 340 0 0
GGGAGATCCATTACCTTGTTCTGTATTAATTCGCTTCTGGCCCCTGGAGATCTGATCCTT
TCCCATCGATTCCGATCCTCACGAAACGATGATCGATGACCAAGACTTGGGGTTTATAGT
CAACTCCCTTGGCATCTTCATCTTTGGGTTGGTAATTGCTTATCATTACGTAGCTGCTGA
TCCCAAGTTCGAATCCACTTGAGTGATGTACTTTTAGATGATGTAATGCGTCTTTTTTTT
AACTTTATAATAACTGTATTTTGCTAAGATGAATATGTTGTCAAGATGTTCGTAAGCCGT
TTCACATCTTCATTTCTTCGCTTTTATTTAGCAGAGATAG

QA 1 340 1 340
DS 

RD RR2DE89TF 340 0 0
GGGAGATCCATTACCTTGTTCTGTATTAATTCGCTTCTGGCCCCTGGAGATCTGATCCTT
TCCCATCGATTCCGATCCTCACGAAACGATGATCGATGACCAAGACTTGGGGTTTATAGT
CAACTCCCTTGGCATCTTCATCTTTGGGTTGGTAATTGCTTATCATTACGTAGCTGCTGA
TCCCAAGTTCGAATCCACTTGAGTGATGTACTTTTAGATGATGTAATGCGTCTTTTTTTT
AACTTTATAATAACTGTATTTTGCTAAGATGAATATGTTGTCAAGATGTTCGTAAGCCGT
TTCACATCTTCATTTCTTCGCTTTTATTTAGCAGAGATAG

QA 1 340 1 340
DS 



AS 1 2

CO CL5443Contig1 427 2 2 U
GCTTCGGTTTAGGAAATGGCGAAGAGAACGAAGAAGGTCGGAATCGTCGGCAAGTACGGT
ACTCGTTATGGAGCGAGTATCAGGAAGCAAATTAAGAAGATGGAGGTGAGCCAACACAGC
AAGTACTTCTGTGAGTTCTGCGGCAAGTACGGAGTCAAGCGAAAGGCTGTTGGTATCTGG
GGATACAAGGACTGTGGCAAGGTCAAGGCCGGTGGTGCCTACACCATGAACACCGCCAGT
GCCGTCACCGTTAGAAGCACTATCAGGAGGTTGAGAGAGCAGATCGAGGGTTAAAAAAAA
ATCTACTTTTAATAACTTTTTGAGTTCTTTGTTTTTTGGATTTGTGTTTTGGAGTACTAT
GCTTGTGTCTTTGAAGACACAAAGACGTTGTTACATTTGGCCGTTAATCAATGGTTTATT
CGAGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AN58JQ C 1
AF RR2AN58TF U 85
BS 1 84 RR2AN58JQ
BS 85 427 RR2AN58TF

RD RR2AN58JQ 427 0 0
GCTTCGGTTTAGGAAATGGCGAAGAGAACGAAGAAGGTCGGAATCGTCGGCAAGTACGGT
ACTCGTTATGGAGCGAGTATCAGGAAGCAGATTAAGAAGATGGAGGTGAGCCAACACAGC
AAGTACTTCTGTGAGTTCTGCGGCAAGTACGGAGTCAAGCGAAAGGCTGTTGGTATCTGG
GGATACAAGGACTGTGGCAAGGTCAAGGCCGGTGGTGCCTACACCATGAACACCGCCAGT
GCCGTCACCGTTAGAAGCACTATCAGGAGGTTGAGAGAGCAGATCGAGGGTTAAAAAAAA
ATCTACTTTTAATAACTTTTTGAGTTCTTTGTTTTTTGGATTTGTGTTTTGGAGTACTAT
GCTTGTGTCTTTGAAGACACAAAGACGTTGTTACATTTGGCCGTTAATCAATGGTTTATT
CGAGTGT

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR2AN58TF 343 0 0
AAGCAAATTAAGAAGATGGAGGTGAGCCAACACAGCAAGTACTTCTGTGAGTTCTGCGGC
AAGTACGGAGTCAAGCGAAAGGCTGTTGGTATCTGGGGATACAAGGACTGTGGCAAGGTC
AAGGCCGGTGGTGCCTACACCATGAACACCGCCAGTGCCGTCACCGTTAGAAGCACTATC
AGGAGGTTGAGAGAGCAGATCGAGGGTTAAAAAAAAATCTACTTTTAATAACTTTTTGAG
TTCTTTGTTTTTTGGATTTGTGTTTTGGAGTACTATGCTTGTGTCTTTGAAGACACAAAG
ACGTTGTTACATTTGGCCGTTAATCAATGGTTTATTCGAGTGT

QA 1 343 1 343
DS 



AS 1 2

CO CL5444Contig1 1131 2 4 U
GGGTCTCGACTGAATCCAAAGGTTTAACCTTTGCTTGAAGCTCGTGAAACCCTTCACCAC
CGAGATGCCAATTTAGAGACTACATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAATGGTGAA
GGCAGCGGGAAAGCAGAGTTGCGGGCGGCTTGTGTTCGCTTCATTCCTCGCTCTTCTAGC
CTTTGTACTCATCGCCGACTTCCTCTGGGCTTCTTCTCATCGCTTCTCCTCCTCCCATTG
AGAAATATAATAGTAATAAGAAGAAGAAGAAGGACGATAATGGTAGAGAAAGGAAGCTTT
CTGCAACGTTTCAAGACCTGCCTGCTCCTCAGCTACATTGGGAGAAGATGTCAGCTGCAC
CTGTGCCTCGTCTTGACGGAGCTGCTATTCAGATCAGTAACTTTCTTTACGTCTTTGCTG
GTTACGCCAACATTAATCTCGTACGAAGAGATCTTATTAGATCAGTAGCATTCCTCTGTT
TCGGCGTCCAATGATGAGTTGATGATATGTTTCAATAATCTTCAAATACTCACGTCGTTT
GGAGGTGGTATTCAGTGATGTTTACATGCTGGATGAGGAAATGAAGTGGAAAGTTATGCC
ACCGATGCCTAAACCGGATTCACATATTGAATTTGCTTGGAAAGTAGTTAACAACTCCAT
TGTGATCGTTGGAGGGACAACAGAGAAGCACCCTGAAACCAAGAAGATGGTTCTCGTTGG
CGAAATCTTCCAGTTTAACCTGAATACAATGAAATGGTATGTGATTGGAAAGTTGCCGTA
CCGTGTGAAGACTACGCTGGTTGGTTATTGGGACGGGCAGTTATACTTCACATCAGGGCA
ACGAGACAAAGGCCCTGATGATCCTGGACCGCGCAAGGTAATTGCAGAGATGTGGAGAAC
CAAACTGATACTGAATCCATAATCATGTAAGAGAAAAAAAATATCTATCTCCCTCTTTAG
TAATGCAAAGTCCCAACAGATTTTGAAGTTCTTTGAGCCTAACTCATCCCACTCCACAAA
ACAATTGCTCTATATATATCTTCTATATTGATGGGGAATTTGTATATTGTAAACTAAATA
CACAAACTATGTAGAACGTTTCAATTTTTTCAACACATTTCTTTGTGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D465TF U 1
AF RR2D465JQ C 392
BS 1 704 RR2D465TF
BS 705 705 RR2D465JQ
BS 706 730 RR2D465TF
BS 731 1131 RR2D465JQ

RD RR2D465TF 730 0 0
GGGTCTCGACTGAATCCAAAGGTTTAACCTTTGCTTGAAGCTCGTGAAACCCTTCACCAC
CGAGATGCCAATTTAGAGACTACATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAATGGTGAA
GGCAGCGGGAAAGCAGAGTTGCGGGCGGCTTGTGTTCGCTTCATTCCTCGCTCTTCTAGC
CTTTGTACTCATCGCCGACTTCCTCTGGGCTTCTTCTCATCGCTTCTCCTCCTCCCATTG
AGAAATATAATAGTAATAAGAAGAAGAAGAAGGACGATAATGGTAGAGAAAGGAAGCTTT
CTGCAACGTTTCAAGACCTGCCTGCTCCTCAGCTACATTGGGAGAAGATGTCAGCTGCAC
CTGTGCCTCGTCTTGACGGAGCTGCTATTCAGATCAGTAACTTTCTTTACGTCTTTGCTG
GTTACGCCAACATTAATCTCGTACGAAGAGATCTTATTAGATCAGTAGCATTCCTCTGTT
TCGGCGTCCAATGATGAGTTGATGATATGTTTCAATAATCTTCAAATACTCACGTCGTTT
GGAGGTGGTATTCAGTGATGTTTACATGCTGGATGAGGAAATGAAGTGGAAAGTTATGCC
ACCGATGCCTAAACCGGATTCACATATTGAATTTGCTTGGAAAGTAGTTAACAACTCCAT
TGTGATCGTTGGAGGGACAACAGAGAAGCACCCTGAAACCAAGA*GATGGTTCTCGTTGG
CGAAATCTTC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2D465JQ 740 0 0
GATCAGTAACTTTCTTTACGTCTTTGCTGGTTACGCCAACATTAATCTCGTACGAAGAGA
TCTTATTAGATCAGTAGCATTCCTCTGTTTCGGCGTCCAATGATGAGTTGATGATATGTT
TCAATAATCTTCAAATACTCACGTCGTTTGGAGGTGGTATTCAGTGATGTTTACATGCTG
GATGAGGAAATGAAGTGGAAAGTTATGCCACCGATGCCTAAACCGGATTCACATATTGAA
TTTGCTTGGAAAGTAGTTAACAACTCCATTGTGATCGTTGGAGGGACAACAGAGAAGCAC
CCTGAAACCAAGAAGATGGTTCTCGTTGGCGAAATCTTCCAGTTTAACCTGAATACAATG
AAATGGTATGTGATTGGAAAGTTGCCGTACCGTGTGAAGACTACGCTGGTTGGTTATTGG
GACGGGCAGTTATACTTCACATCAGGGCAACGAGACAAAGGCCCTGATGATCCTGGACCG
CGCAAGGTAATTGCAGAGATGTGGAGAACCAAACTGATACTGAATCCATAATCATGTAAG
AGAAAAAAAATATCTATCTCCCTCTTTAGTAATGCAAAGTCCCAACAGATTTTGAAGTTC
TTTGAGCCTAACTCATCCCACTCCACAAAACAATTGCTCTATATATATCTTCTATATTGA
TGGGGAATTTGTATATTGTAAACTAAATACACAAACTATGTAGAACGTTTCAATTTTTTC
AACACATTTCTTTGTGTGCC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL5445Contig1 1051 2 6 U
GGTGGGAGGAGCAATGTCGTCTTCTTTGCTGCGGTTTGGAATCTCAAGGCCGATTTCTTC
TTCTTCGTATAAGAACTTAGTAAGCTCTCACTTCTTTGGGCTCGCTACGTCTTCTTTGTC
ATGGGCAAACAACACACCTCACCACATAAACACAAAGCTCAAGCAAAAGCAAAAGCTCTG
CGTTAAAGGTTCAGCACAAGAGATTCCACAGAAACTAGAGGAAGATTCAAAGTTTGTACC
TTTGGCTCCTGAAGATCCTCTGTTCGGCCCTCCTGTTTTGCTGTTGCTTGGATTTCAAGT
TCATGAAGCACAGAAGATACAAGAGCTTCTTAAGGAGCTCGATGGCGAATTCATGAAGAT
TATGTTCTGTACAGAAGATATGGTCCCGCGTTCGTTATGGGAAGCAGTTAACACAGGACA
GACTGACCTCAAGAGAGTGAAAATTGCGGAATCGCTGCCCCGGATCTGCTTCTTGTCTGG
TTTGACGGGAGAAGAGATGATGATGTTCATTGATGCATTTCCAGAAACCGGTACTTTCTT
CTTGTTTAAAATGCATTTAAGAAACAAAGAAAACATGAAGACTTTATAGCATGTCGTTTA
TAAAGCTGGAGGATCAAAAATGCAGGGCTAGAACCAGCTGTGTTTACAGCTATGGTTCCG
AACAGCGCTGATAAACCCATCTCGGAGTTGATGGAAGAAATCATGGGAGATCATGAGTTG
TTGGTTAGTAAACATCTCAAAATGTCGTCACTAGTTGCAGTTATGGTCTTGAATACCGAC
ACATAAAACAATCAAAACACTTCTTCCCTATGCAGAATGGGAGCGGTTCCAGCTGAAGGT
TTTTACTGATGAAGACAAGAGGACAGCTTTCGGGAATGGCTCTGTAAGTTGGCTTCTATT
AGTTTTGTTCCGCTATGCGAACTCACATGATCATATAAAGAGTGTTGTGTTACTTGTATT
TACAAAACAGAGAGAATTTAGTCATTTGATTAATCTTCGTGTACATTACAAAACACTACT
TACGTGAATAAATAGTCAGTATTTGTCTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG44TF U 1
AF RR2DG44JQ C 473
BS 1 741 RR2DG44TF
BS 742 742 RR2DG44JQ
BS 743 788 RR2DG44TF
BS 789 789 RR2DG44JQ
BS 790 823 RR2DG44TF
BS 824 1051 RR2DG44JQ

RD RR2DG44TF 823 0 0
GGTGGGAGGAGCAATGTCGTCTTCTTTGCTGCGGTTTGGAATCTCAAGGCCGATTTCTTC
TTCTTCGTATAAGAACTTAGTAAGCTCTCACTTCTTTGGGCTCGCTACGTCTTCTTTGTC
ATGGGCAAACAACACACCTCACCACATAAACACAAAGCTCAAGCAAAAGCAAAAGCTCTG
CGTTAAAGGTTCAGCACAAGAGATTCCACAGAAACTAGAGGAAGATTCAAAGTTTGTACC
TTTGGCTCCTGAAGATCCTCTGTTCGGCCCTCCTGTTTTGCTGTTGCTTGGATTTCAAGT
TCATGAAGCACAGAAGATACAAGAGCTTCTTAAGGAGCTCGATGGCGAATTCATGAAGAT
TATGTTCTGTACAGAAGATATGGTCCCGCGTTCGTTATGGGAAGCAGTTAACACAGGACA
GACTGACCTCAAGAGAGTGAAAATTGCGGAATCGCTGCCCCGGATCTGCTTCTTGTCTGG
TTTGACGGGAGAAGAGATGATGATGTTCATTGATGCATTTCCAGAAACCGGTACTTTCTT
CTTGTTTAAAATGCATTTAAGAAACAAAGAAAACATGAAGACTTTATAGCATGTCGTTTA
TAAAGCTGGAGGATCAAAAATGCAGGGCTAGAACCAGCTGTGTTTACAGCTATGGTTCCG
AACAGCGCTGATAAACCCATCTCGGAGTTGATGGAAGAAATCATGGGAGATCATGAGTTG
TTGGTTAGTAAACATCTCAAA*TGTCGTCACTAGTTGCAGTTATGGTCTTGAATACCGAC
ACATAAAA*AATCAAAACACTTCTTCCCTATGCAGAATGGGAG

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR2DG44JQ 579 0 0
TTGTCTGGTTTGACGGGAGAAGAGATGATGATGTTCATTGATGCATTTCCAGAAACCGGT
ACTTTCTTCTTGTTTAAAATGCATTTAAGAAACAAAGAAAACATGAAGACTTTATAGCAT
GTCGTTTATAAGGCTGGAGGATCAAAAATGCAGGGCTAGAACCAGCTGTGTTTACAGCTA
TGGTTCCGAACAGCGCTGATAAACCCATTTCGGAGTTGATGGAAGAAATCATGGGAGATC
ATGAGTTGTTGGTTAGTAAACATCTCAAAATGTCGTCACTAGTTGCAGTTATGGTCTTGA
ATACCGACACATAAAACAATCAAAACACTTCTTCCCTATGCAGAATGGGAGCGGTTCCAG
CTGAAGGTTTTTACTGATGAAGACAAGAGGACAGCTTTCGGGAATGGCTCTGTAAGTTGG
CTTCTATTAGTTTTGTTCCGCTATGCGAACTCACATGATCATATAAAGAGTGTTGTGTTA
CTTGTATTTACAAAACAGAGAGAATTTAGTCATTTGATTAATCTTCGTGTACATTACAAA
ACACTACTTACGTGAATAAATAGTCAGTATTTGTCTGAC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL5446Contig1 1119 2 4 U
GGCTTGATCTCCAACATCAACCACACTCCACATCCATACTCTAATCTCTAAAGCTTGCTC
CCCTTTAATGGCGAGCTTCATCGTTCTCCTCCTGGCTTTAGCCTCACTCTTCTCCAGAAT
CTCCATATCTGAAGCTACATCATCCTTCTCCTTCACAAGCTTCGATAAAAACGCGAGCTT
TGAGTCCGACGATATTGCCCTCTACGGCTACGCAAAGCTCGTAGACAACGGAACTTCGGT
TCAGCTGATTGACTCAGTAAATCCCATCGGCGGTGGAGTCGTTTACAAGAAACCCATCGC
GTCCAAAGACACTAAAGATGACTACTTCACGGGTTTCTCTACTGTCTTCTCTTTCTCCAT
TTCTCCCGGTCGTGGTGGCGGGAGTGTACGTTTTGTCGTGTTTCCTTCTAACGGAACACT
CGATCACTCTTTATTCGAGGTCAAGTTCGACATTTCTGATAATTTCACCAAATTTAAAGA
CTCTAATGTCACAGTTGGTGTATATGGTTCAACGGTTCCTGAGAAGAAAAGCAATCTTAC
GGTTGTAAACTCCAAGGACGCGGAGGAGGAGATGTTGTTGTACGTATGGATTAATTACGA
AGCGAATAGCAGGTACTTAGATGCTAGGTTAACCAAATCAAAGGGATATACATATCCAAA
GACTCGGTTCGGTTCTCGGATTGATTTGTTGAAAGACGAGGATGAGATCATGGTGGGTGT
TAAGTCGTATAACGGGAGCTTTAACCTCCATTCTTGGAGATTACAAGCGGGACTCGTCTC
TAGGGGTATACACTCGTATGCGGCGCTTCTTGAGTCAAAGCGTAGGTGGGTGGAGAAGAG
GAGAAGAGAGAAGATGTGGGGGACTGTCACTTGCTTCGTTATGACCTTTGGATCTATAGG
GCTTGTGTTCTTCGCCGTGATGCGTATCTGGGCAGCTTTCAAAAGAAACTATCTTGCGGT
GGTGGTGGAGCCTGAGGAATGTGGGCAGAAGACTAAGGAGTACGAGATGATTGAGAAAGT
TGAAGTTGTGATGAGTAAAGCTGAGGCGCAACAAGGAAAGTGAAGTAAAGTAAAAGTAAA
AGCTTGTGATGTTTGTGTGTTTAGAATATTTATGCAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG73TF U 1
AF RR2FG73JQ C 443
BS 1 761 RR2FG73TF
BS 762 762 RR2FG73JQ
BS 763 781 RR2FG73TF
BS 782 1119 RR2FG73JQ

RD RR2FG73TF 781 0 0
GGCTTGATCTCCAACATCAACCACACTCCACATCCATACTCTAATCTCTAAAGCTTGCTC
CCCTTTAATGGCGAGCTTCATCGTTCTCCTCCTGGCTTTAGCCTCACTCTTCTCCAGAAT
CTCCATATCTGAAGCTACATCATCCTTCTCCTTCACAAGCTTCGATAAAAACGCGAGCTT
TGAGTCCGACGATATTGCCCTCTACGGCTACGCAAAGCTCGTAGACAACGGAACTTCGGT
TCAGCTGATTGACTCAGTAAATCCCATCGGCGGTGGAGTCGTTTACAAGAAACCCATCGC
GTCCAAAGACACTAAAGATGACTACTTCACGGGTTTCTCTACTGTCTTCTCTTTCTCCAT
TTCTCCCGGTCGTGGTGGCGGGAGTGTACGTTTTGTCGTGTTTCCTTCTAACGGAACACT
CGATCACTCTTTATTCGAGGTCAAGTTCGACATTTCTGATAATTTCACCAAATTTAAAGA
CTCTAATGTCACAGTTGGTGTATATGGTTCAACGGTTCCTGAGAAGAAAAGCAATCTTAC
GGTTGTAAACTCCAAGGACGCGGAGGAGGAGATGTTGTTGTACGTATGGATTAATTACGA
AGCGAATAGCAGGTACTTAGATGCTAGGTTAACCAAATCAAAGGGATATACATATCCAAA
GACTCGGTTCGGTTCTCGGATTGATTTGTTGAAAGACGAGGATGAGATCATGGTGGGTGT
TAAGTCGTATAACGGGAGCTTTAACCTCCATTCTTGGAGAT*ACAAGCGGGACTCGTCTC
T

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2FG73JQ 677 0 0
AAGTTCGACATTTCTGATAATTTCACCAAATTTAAAGACTCTAATGTCACAGTTGGTGTA
TATGGTTCAACGGTTCCTGAGAAGAAAAGCAATCTTACGGTTGTAAACTCCAAGGACGCG
GAGGAGGAGATGTTGTTGTACGTATGGATTAATTACGAAGCGAATAGCAGGTACTTAGAT
GCTAGGTTAACCAAATCAAAGGGATATACATATCCAAAGACTCGGTTCGGTTCTCGGATT
GATTTGTTGAAAGACGAGGATGAGATCATGGTGGGTGTTAAGTCGTATAACGGGAGCTTT
AACCTCCATTCTTGGAGATTACAAGCGGGACTCGTCTCTAGGGGTATACACTCGTATGCG
GCGCTTCTTGAGTCAAAGCGTAGGTGGGTGGAGAAGAGGAGAAGAGAGAAGATGTGGGGG
ACTGTCACTTGCTTCGTTATGACCTTTGGATCTATAGGGCTTGTGTTCTTCGCCGTGATG
CGTATCTGGGCAGCTTTCAAAAGAAACTATCTTGCGGTGGTGGTGGAGCCTGAGGAATGT
GGGCAGAAGACTAAGGAGTACGAGATGATTGAGAAAGTTGAAGTTGTGATGAGTAAAGCT
GAGGCGCAACAAGGAAAGTGAAGTAAAGTAAAAGTAAAAGCTTGTGATGTTTGTGTGTTT
AGAATATTTATGCAATA

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL5447Contig1 605 2 1 U
GGATGGCGCATTAATCAAAACCCAATCACCTCTTCGCATGTGACATTGCTAATTACCACT
CTCTTCTTCTATTATTAATTTTCTTCTTCTTTCATCGCTTTCGTCTCCAAAATCGCCATG
GCAGCAGCTCCTTCTCTCACTCTCCTCATCACTCTCTCTCTTCTCTTCATTTCCCTCCCG
AGATCTGAACCTCTCCCTGAGAATCCATCCATGACTCTTATAGGCGACGGATTCGACTGG
CCGATCTCTCACGGCGACGCATTCGACATCATCGACGGAGGAGAAAGCTCTGAAGATGTC
GCAGATCGACGGTCGTTGTACTGGCAGAGGAAGAGATACTACATATCCTACGGTGCATTG
TCGGCGAACAGAGTACCGTGTCCTCCCAGATCTGGAAGATCTTACTACACTCACAACTGC
TTCAGAGCTAGAGGTCAGGTTCATCCATACACTCGAGGCTGCTCCTCCATCACTCGATGC
CGGAGATAGAATATTGCATTTTCCAATCACGGACTGTCTTTGTATTTGCTCGTTCCATTT
CGATGTTATTGTGTTGTGTGTAGTAGTAACCGTGATTAATTACTTTTGTTAAATTAATTA
AGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2DJ30TF U 1
AF RR2DJ30JQ C 268
BS 1 605 RR2DJ30TF

RD RR2DJ30TF 605 0 0
GGATGGCGCATTAATCAAAACCCAATCACCTCTTCGCATGTGACATTGCTAATTACCACT
CTCTTCTTCTATTATTAATTTTCTTCTTCTTTCATCGCTTTCGTCTCCAAAATCGCCATG
GCAGCAGCTCCTTCTCTCACTCTCCTCATCACTCTCTCTCTTCTCTTCATTTCCCTCCCG
AGATCTGAACCTCTCCCTGAGAATCCATCCATGACTCTTATAGGCGACGGATTCGACTGG
CCGATCTCTCACGGCGACGCATTCGACATCATCGACGGAGGAGAAAGCTCTGAAGATGTC
GCAGATCGACGGTCGTTGTACTGGCAGAGGAAGAGATACTACATATCCTACGGTGCATTG
TCGGCGAACAGAGTACCGTGTCCTCCCAGATCTGGAAGATCTTACTACACTCACAACTGC
TTCAGAGCTAGAGGTCAGGTTCATCCATACACTCGAGGCTGCTCCTCCATCACTCGATGC
CGGAGATAGAATATTGCATTTTCCAATCACGGACTGTCTTTGTATTTGCTCGTTCCATTT
CGATGTTATTGTGTTGTGTGTAGTAGTAACCGTGATTAATTACTTTTGTTAAATTAATTA
AGCCC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2DJ30JQ 338 0 0
ATCATCGACGGAGGAGAAAGCTCTGAAGATGTCGCAGATCGACGGTCGTTGTACTGGCAG
AGGAAGAGATACTACATATCCTACGGTGCATTGTCGGCGAACAGAGTACCGTGTCCTCCC
AGATCTGGAAGATCTTACTACACTCACAACTGCTTCAGAGCTAGAGGTCAGGTTCATCCA
TACACTCGAGGCTGCTCCTCCATCACTCGATGCCGGAGATAGAATATTGCATTTTCCAAT
CACGGACTGTCTTTGTATTTGCTCGTTCCATTTGGATGTTATTGTGTTGTGTGTAGTAGT
AACCGTGATTAATTACTTTTGTTAAATTAATTAAGCCC

QA 1 338 1 338
DS 



AS 1 2

CO CL5448Contig1 1053 2 4 U
TTTTTATTGTAGCTGTTCTACTTTTGGCTCTCTCCTCTTCCTATTTCACACGAGGCCAGA
GAATCATACAGATTCCACCGCCACGTCCATTATGCGTCTCTCAAAACCGGGAAAACAGAT
GCCAAGAGTGGTGGTGGCCTCTTAGGGTTTTTCAAAAATGTTAAAAGTGGAAAAGGAGAT
GAGAAGAAGGGAGGTGGCAAGAAAGAGGGTGAGAAGGTCAAATCTACCGGTGGTGGGGGA
GGAGGTGTCCACCATTATGATAGTGGGCCTAAAAAGGGAGGAGGTAAATCGAAAGGAGGA
GCTCATGGGGCCCATGGTATTGATGATCTAATGAAACACAACAAAGCAGGCGGAGGAGGT
AACAAGGGTAATCATAGCGCCAAGGGGATGGGTAACCACATGGGACAAGGTGGTCAGATG
GGGATGATGGGCCAAGGTGGTCCAATGGGTCCAGGTGGTCCTATGGGCATGATGAGTCAA
GGTTGTCATCCAATGGGCATGATGGGTCAAGGTGGTCAAATGGGACGCCAAGGCGGCTCC
TATCCGGCGGTACAAGGGTTGCCGATGAGTGGGAGGAGGATATTATCCACCACCAGCTCA
CGCAAATCACCAAATGAACCAACAACAGTATATGCAAATGATGATGCACCAGCAACAACA
GCAACAACAAGCTGCTGCAGCCCATGGAGGATATGGTGGTGGTCACGGTGGAGAAATGTA
CCATCCGATGATGTATGCACGGCAGTATCCAGCAGTGAATTATGCTCATCCGCCGCCAAT
GCCGCCTCCACACTCGGGTCCTTATACTGATATGTTCAGTGATGAGAATCCAGCTGGTTG
TAGTATCATGTGATCTTTGGTAATGTTTAATTAGACAAAACTGGTATGAATATGTTTATT
TTAGAAGTTTATATGTTTTATTTTAGAAGTTTTGTGTTATTTTTTTTTTTGGAACTGTTT
TTTACGTTTTTAACTTTGCCTAAGATATGAACTTTTTTTTGGGTGGCATGATGTTTATAA
TATCTCGAGTTTGGAAAATGATGGTTACAAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA21TF U 1
AF RR2EA21JQ C 358
BS 1 682 RR2EA21TF
BS 683 683 RR2EA21JQ
BS 684 698 RR2EA21TF
BS 699 1053 RR2EA21JQ

RD RR2EA21TF 698 0 0
TTTTTATTGTAGCTGTTCTACTTTTGGCTCTCTCCTCTTCCTATTTCACACGAGGCCAGA
GAATCATACAGATTCCACCGCCACGTCCATTATGCGTCTCTCAAAACCGGGAAAACAGAT
GCCAAGAGTGGTGGTGGCCTCTTAGGGTTTTTCAAAAATGTTAAAAGTGGAAAAGGAGAT
GAGAAGAAGGGAGGTGGCAAGAAAGAGGGTGAGAAGGTCAAATCTACCGGTGGTGGGGGA
GGAGGTGTCCACCATTATGATAGTGGGCCTAAAAAGGGAGGAGGTAAATCGAAAGGAGGA
GCTCATGGGGCCCATGGTATTGATGATCTAATGAAACACAACAAAGCAGGCGGAGGAGGT
AACAAGGGTAATCATAGCGCCAAGGGGATGGGTAACCACATGGGACAAGGTGGTCAGATG
GGGATGATGGGCCAAGGTGGTCCAATGGGTCCAGGTGGTCCTATGGGCATGATGAGTCAA
GGTTGTCATCCAATGGGCATGATGGGTCAAGGTGGTCAAATGGGACGCCAAGGCGGCTCC
TATCCGGCGGTACAAGGGTTGCCGATGAGTGGGAGGAGGATATTATCCACCACCAGCTCA
CGCAAATCACCAAATGAACCAACAACAGTATATGCAAATGATGATGCACCAGCAACAACA
GCAACAACAAGCTGCTGCAGCC*ATGGAGGATATGGTG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2EA21JQ 696 0 0
GGTAACAAGGGTAATCATAGCGCCAAGGGGATGGGTAACCACATGGGACAAGGTGGTCAG
ATGGGGATGATGGGCCAAGGTGGTCCAATGGGTCCAGGTGGTCCTATGGGCATGATGAGT
CAAGGTTGTCATCCAATGGGCATGATGGGTCAAGGTGGTCAAATGGGACGCCAAGGCGGC
TCCTATCCGGCGGTACAAGGGTTGCCGATGAGTGGGAGGAGGATATTATCCACCACCAGC
TCAGGCAAATCACCAAATGAACCAACAACAGTATATGCAAATGATGATGCACCAGCAACA
ACAGCAACAACAAGCTGCTGCAGCCCATGGAGGATATGGTGGTGGTCACGGTGGAGAAAT
GTACCATCCGATGATGTATGCACGGCAGTATCCAGCAGTGAATTATGCTCATCCGCCGCC
AATGCCGCCTCCACACTCGGGTCCTTATACTGATATGTTCAGTGATGAGAATCCAGCTGG
TTGTAGTATCATGTGATCTTTGGTAATGTTTAATTAGACAAAACTGGTATGAATATGTTT
ATTTTAGAAGTTTATATGTTTTATTTTAGAAGTTTTGTGTTATTTTTTTTTTTGGAACTG
TTTTTTACGTTTTTAACTTTGCCTAAGATATGAACTTTTTTTTGGGTGGCATGATGTTTA
TAATATCTCGAGTTTGGAAAATGATGGTTACAAAGT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL5449Contig1 941 2 2 U
GCGTACAAAGGAAACCCTTCAGAATATGTGCTTGGAGCTAGCAACCATGGGTGATCTCAA
GCTTGTTGAGCGTCCTCAAAACTATAGTCTGGCACCGGGAACGAGCATGCAGATAAAAGC
AAACATAAAGGTCTCGTCCACAGAGACCGGAGTCATATTCGGAAACATCGTCTATGAGAC
ATCAAACGTAATGGAGCGAAACGTCGTGGTTCTCAACGACATACACATTGATATCATGGA
CTATATCTCCCCTGCTGTTTGCTCAGAGGTTGCTTTCAGAACCATGTGGGCAGAGTTTGA
ATGGGAGAACAAGGTTGCTGTGAACACCACGATTCAGAACGAGAGAGAGTTCCTCGACCA
CATTATCAAATCCACAAACATGAAGTGTCTCACTGCCCCATCTGCAATAGAAGGAGAATG
CGGGTTCCTTGCAGCAAACTTATATGCAAAGAGTGTGTTTGGTGAGGATGCTCTTGTGAA
CGTGAGTATCGAGAAGCAAACTGATGGAGTATTGAGTGGGTACATAAGGATAAGGAGCAA
GACGCAAGGGATTGCTCTAAGTCTTGGGGACAAGATCACCCTCAAACAGAAGGGTAGTAG
CTGAGGCTTTGGATGGTGGCGCACAAGGTAACTTTCGTTTTTCTGTTGAGCAATTTTTAT
AGTTGGTCGAATCTGTTTACTATATGGAGTGAGGGAGGCGTTTTAAGTATATGTAAAGAC
CAAACTGTTATCATTCCTTAACCGGTTTATAGTTTCCGGTATGGTACCGATGGATTCTTC
CCCATACGGCTGTGTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTCCTTTTAATTAGTACCTGAAGATT
TTGTTTTTATTTGTAATGCTTTTTTTTCTTTCTATATTATCGTTTGTTGTGGAGATTATA
ACTGTAATGATTTCCGTAAAATGCATAATTAATACTAGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW23TF U 1
AF RR2FW23JQ C 278
BS 1 609 RR2FW23TF
BS 610 941 RR2FW23JQ

RD RR2FW23TF 609 0 0
GCGTACAAAGGAAACCCTTCAGAATATGTGCTTGGAGCTAGCAACCATGGGTGATCTCAA
GCTTGTTGAGCGTCCTCAAAACTATAGTCTGGCACCGGGAACGAGCATGCAGATAAAAGC
AAACATAAAGGTCTCGTCCACAGAGACCGGAGTCATATTCGGAAACATCGTCTATGAGAC
ATCAAACGTAATGGAGCGAAACGTCGTGGTTCTCAACGACATACACATTGATATCATGGA
CTATATCTCCCCTGCTGTTTGCTCAGAGGTTGCTTTCAGAACCATGTGGGCAGAGTTTGA
ATGGGAGAACAAGGTTGCTGTGAACACCACGATTCAGAACGAGAGAGAGTTCCTCGACCA
CATTATCAAATCCACAAACATGAAGTGTCTCACTGCCCCATCTGCAATAGAAGGAGAATG
CGGGTTCCTTGCAGCAAACTTATATGCAAAGAGTGTGTTTGGTGAGGATGCTCTTGTGAA
CGTGAGTATCGAGAAGCAAACTGATGGAGTATTGAGTGGGTACATAAGGATAAGGAGCAA
GACGCAAGGGATTGCTCTAAGTCTTGGGGACAAGATCACCCTCAAACAGAAGGGTAGTAG
CTGAGGCTT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2FW23JQ 664 0 0
AGAACCATGTGGGCAGAGTTTGAATGGGAGAACAAGGTTGCTGTGAACACCACGATTCAG
AACGAGAGAGAGTTCCTCGACCACATTATCAAATCCACAAACATGAAGTGTCTCACTGCC
CCATCTGCAATAGAAGGAGAATGCGGGTTCCTTGCAGCAAACTTATATGCAAAGAGTGTG
TTTGGTGAGGATGCTCTTGTGAACGTGAGTATCGAGAAGCAAACTGATGGAGTATTGAGT
GGGTACATAAGGATAAGGAGCAAGACGCAAGGGATTGCTCTAAGTCTTGGGGACAAGATC
ACCCTCAAACAGAAGGGTAGTAGCTGAGGCTTTGGATGGTGGCGCACAAGGTAACTTTCG
TTTTTCTGTTGAGCAATTTTTATAGTTGGTCGAATCTGTTTACTATATGGAGTGAGGGAG
GCGTTTTAAGTATATGTAAAGACCAAACTGTTATCATTCCTTAACCGGTTTATAGTTTCC
GGTATGGTACCGATGGATTCTTCCCCATACGGCTGTGTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTC
CTTTTAATTAGTACCTGAAGATTTTGTTTTTATTTGTAATGCTTTTTTTTCTTTCTATAT
TATCGTTTGTTGTGGAGATTATAACTGTAATGATTTCCGTAAAATGCATAATTAATACTA
GGTC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL5450Contig1 1125 2 2 U
GGATTATAAGCATTTTCTTAGCTGTGAATTCCCATTATCCCCCTCCTCTCTCGCCCCCTC
TTTCTCTATATCTCTCTCTCCTTCCACACTGCTTTACTCCTATATTGATTGTTGACGAAG
TCCTAAGTGATCTCTTAGATTTTGGATTATTTATTAAGTTATGCTTTGGAGCGAATTGGT
GAAGAAACATATAGCATAAGGTAAGTGTATGCGTCTTGAAGGGCTTCTATAAGCTTCTCT
AAGTGAGTTTTCTGGCATGAACTCAGAGCCTTAGAACATAATCAATGACCTTCTTTGGAG
AGAATCACAGCTTGGCCTCTCTTCTTTTCAGGTATGGGAACAAAGATCGTTGAGCGAATT
ACGACAAACTCATTTGGCTTAGAGGGTGTTGATTGTAGTGGATTCGGCAGATTTGGTGTT
GATGGTCAACGGAAATCTTCAAAGCAGAAATTGACTGACGAGAAAGAAGAGGAAAGAGTT
TTTTTTCTAAGGTCAATGGATAGGTTTCTTGAAAAGCAAAATGCTGAGTCCATCAGACGG
ACAATGCAAGCCCAAGAAGATCTTTTCAAGCAACAGGTACAAGAGCTGCATAGAGTATAT
AATATACAGAAGAAGATGATGGAGCAACTCAAACATAGAAGTCAAAACTGTACTACTAAC
AACCAAGACCAAACCGGTCCAAGAGAGAGAACCGGAGGCTGGTCAGGCATAGGCCTCGAA
AATGTGGCTAGAGCCACGAACACAGTAACGGATCATATTGAAGAGAGTGAGCTAGAACTG
ACACTGAGCATTGGAATGTCTTCTTCCTCTATGAACAAGGACATGGACTACTCGTCGACG
ACATCATTCAAATCATCATCGGATAATTGTAATAATCAGAGCAACACTATTAATTGTAAT
AACCAAGAAAGTAGCGGACCAACCACGCCTATGAGCAGCTCAAGTACGACGTCGTTGGAC
CGAGAGAAGAAGATACCTCATTGGCTCTTTCAGGGACTTAGTATTAACCGGACTTCATGA
ATTTTGTTAATTCACTGACTCTTTCTTTTTCCTTCTTCGTCTTATTCTTGATTTTCTTCT
TTTGTATCTTATCTGTTACTATTATTATCTACCAGATTTACTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES27TF U 1
AF RR2ES27JQ C 357
BS 1 690 RR2ES27TF
BS 691 1125 RR2ES27JQ

RD RR2ES27TF 690 0 0
GGATTATAAGCATTTTCTTAGCTGTGAATTCCCATTATCCCCCTCCTCTCTCGCCCCCTC
TTTCTCTATATCTCTCTCTCCTTCCACACTGCTTTACTCCTATATTGATTGTTGACGAAG
TCCTAAGTGATCTCTTAGATTTTGGATTATTTATTAAGTTATGCTTTGGAGCGAATTGGT
GAAGAAACATATAGCATAAGGTAAGTGTATGCGTCTTGAAGGGCTTCTATAAGCTTCTCT
AAGTGAGTTTTCTGGCATGAACTCAGAGCCTTAGAACATAATCAATGACCTTCTTTGGAG
AGAATCACAGCTTGGCCTCTCTTCTTTTCAGGTATGGGAACAAAGATCGTTGAGCGAATT
ACGACAAACTCATTTGGCTTAGAGGGTGTTGATTGTAGTGGATTCGGCAGATTTGGTGTT
GATGGTCAACGGAAATCTTCAAAGCAGAAATTGACTGACGAGAAAGAAGAGGAAAGAGTT
TTTTTTCTAAGGTCAATGGATAGGTTTCTTGAAAAGCAAAATGCTGAGTCCATCAGACGG
ACAATGCAAGCCCAAGAAGATCTTTTCAAGCAACAGGTACAAGAGCTGCATAGAGTATAT
AATATACAGAAGAAGATGATGGAGCAACTCAAACATAGAAGTCAAAACTGTACTACTAAC
AACCAAGACCAAACCGGTCCAAGAGAGAGA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2ES27JQ 769 0 0
AATTACGACAAACTCATTTGGCTTAGAGGGTGTTGATTGTAGTGGATTCGGCAGATTTGG
TGTTGATGGTCAACGGAAATCTTCAAAGCAGAAATTGACTGACGAGAAAGAAGAGGAAAG
AGTTTTTTTTCTAAGGTCAATGGATAGGTTTCTTGAAAAGCAAAATGCTGAGTCCATCAG
ACGGACAATGCAAGCCCAAGAAGATCTTTTCAAGCAACAGGTACAAGAGCTGCATAGAGT
ATATAATATACAGAAGAAGATGATGGAGCAACTCAAACATAGAAGTCAAAACTGTACTAC
TAACAACCAAGACCAAACCGGTCCAAGAGAGAGAACCGGAGGCTGGTCAGGCATAGGCCT
CGAAAATGTGGCTAGAGCCACGAACACAGTAACGGATCATATTGAAGAGAGTGAGCTAGA
ACTGACACTGAGCATTGGAATGTCTTCTTCCTCTATGAACAAGGACATGGACTACTCGTC
GACGACATCATTCAAATCATCATCGGATAATTGTAATAATCAGAGCAACACTATTAATTG
TAATAACCAAGAAAGTAGCGGACCAACCACGCCTATGAGCAGCTCAAGTACGACGTCGTT
GGACCGAGAGAAGAAGATACCTCATTGGCTCTTTCAGGGACTTAGTATTAACCGGACTTC
ATGAATTTTGTTAATTCACTGACTCTTTCTTTTTCCTTCTTCGTCTTATTCTTGATTTTC
TTCTTTTGTATCTTATCTGTTACTATTATTATCTACCAGATTTACTGAT

QA 1 769 1 769
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5453Contig1 700 2 2 U
GGCTATATGGACACCAGGCTAGACCGTTGATTCCATTCAACCAGCTAGAAGCAAATGCAT
ATGGCAAGAAGCAGGCAAAATGTGTGATGAGCCAACTTGTTTCTCTTGCAACAACATTAG
AGAGACGCAATCACAGACCGTTAGAGGGACCATCTTGGTGCCTTGTAGAACCGCAATGAG
AGGTAGTTTCCCGCTCAACGGAACATACTTCCAAGTTAATGAGGTGTTTGCGGATCATGA
GTCTAGTCTAACGCCAATTGATGTTCCAAGAGAATTGTTATGGAACCTTCCTAGAAGAAC
CGTCTACTTTGGCACATCTATCCCATCAATATTTAAAGGTTTATCTACTGAAACAATTCA
ACAATGTTTCTGGAGAGGGTATGTATGTGTGAGAGGATTTGATAGGAAGACAAGAGGACC
AAAGCCTTTGATCGCGAGGTTGCACTTTCCGAAAAGCAAAATGAAGTCACAGGTTAATCC
GGATGATGCATAGGTAGTAAGAAAGCAGACAGACTCGGCCTATGGTTTACCAAAACAAGC
CAATGTAAAATATTAGAGTTGTAACAGGTCTTTGAACTCCATGTTAGTGCGTGTCTTTGT
TTGTATTAATTAGGAAGTCACAAGAACGAAACCAGTAGCTAAGCTGAATCTCTCGTCTTT
CTTTATTTATTGTCCTCTCCCTAGTAGATGCCAACTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D983TF U 1
AF RR2D983JQ C 347
BS 1 685 RR2D983TF
BS 686 700 RR2D983JQ

RD RR2D983TF 685 0 0
GGCTATATGGACACCAGGCTAGACCGTTGATTCCATTCAACCAGCTAGAAGCAAATGCAT
ATGGCAAGAAGCAGGCAAAATGTGTGATGAGCCAACTTGTTTCTCTTGCAACAACATTAG
AGAGACGCAATCACAGACCGTTAGAGGGACCATCTTGGTGCCTTGTAGAACCGCAATGAG
AGGTAGTTTCCCGCTCAACGGAACATACTTCCAAGTTAATGAGGTGTTTGCGGATCATGA
GTCTAGTCTAACGCCAATTGATGTTCCAAGAGAATTGTTATGGAACCTTCCTAGAAGAAC
CGTCTACTTTGGCACATCTATCCCATCAATATTTAAAGGTTTATCTACTGAAACAATTCA
ACAATGTTTCTGGAGAGGGTATGTATGTGTGAGAGGATTTGATAGGAAGACAAGAGGACC
AAAGCCTTTGATCGCGAGGTTGCACTTTCCGAAAAGCAAAATGAAGTCACAGGTTAATCC
GGATGATGCATAGGTAGTAAGAAAGCAGACAGACTCGGCCTATGGTTTACCAAAACAAGC
CAATGTAAAATATTAGAGTTGTAACAGGTCTTTGAACTCCATGTTAGTGCGTGTCTTTGT
TTGTATTAATTAGGAAGTCACAAGAACGAAACCAGTAGCTAAGCTGAATCTCTCGTCTTT
CTTTATTTATTGTCCTCTCCCTAGT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2D983JQ 354 0 0
ACTGAAACAATTCAACAATGTTTCTGGAGAGGGTATGTATGTGTGAGAGGATTTGATAGG
AAGACAAGAGGACCAAAGCCTTTGATCGGGAGGTTGCACTTTCCGAAAAGCAAAATGAAG
TCACAGGTTAATCCGGATGATGCATAGGTAGTAAGAAAGCAGACAGACTCGGCCTATGGT
TTACCAAAACAAGCCAATGTAAAATATTAGAGTTGTAACAGGTCTTTGAACTCCATGTTA
GTGCGTGTCTTTGTTTGTATTAATTAGGAAGTCACAAGAACGAAACCAGTAGCTAAGCTG
AATCTCTCGTCTTTCTTTATTTATTGTCCTCTCCCTAGTAGATGCCAACTTTTT

QA 1 354 1 354
DS 



AS 1 2

CO CL5454Contig1 359 2 3 U
ACATAGTGCATGTGTGTTGTTGTATTTCTAGTATGACAATTATTTAACAAGATCTTCCCA
TTTGCAGTATTGGCCACCGGCCAATGCACGATAGTAACGGTCTCTACAATAAACCGGTCT
TCCATCAGCAGCCTCAGCTGCGGCCGCTGCTAAGTCATCATCTGTCACAACATCTGTGGG
CAACCGAAACAATTGTTCTTTTCTCATATTGAACTTGTTGTTGGTTCTTGAAATAAAAAC
CTCCGGGGGGTTACCATTTGATCTTAAAGTGGTTTTAAAAAAATCCTCAACAGGGGTTGC
AAAAACGAATAGGACGAATGCTGAAACGAGCAAAGCTCCTGTTCCAACTAATGTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G923JQ U 50
AF RR2G769JQ U 1
BS 1 188 RR2G769JQ
BS 189 189 RR2G923JQ
BS 190 359 RR2G769JQ

RD RR2G923JQ 234 0 0
AGATCTTCCCATTTGCAGTATTGGCCACCGGCCAATGCACGATAGTAACGGTCTCTACAA
TAAACCGGTCTTCCATCAGCAGCCTCAGCTGCGGCCGCTGCTAAGTCATCATCTGTCACA
ACATCTGTGGGCAACCGAAACAATTGTTCTTTTCTCATATTGAACTTGTTGTTGGTTCTT
GAAATAAAAACCTCCGGGGGGTTACCATTTGATCTTAAAGTGGTTTTAAAAAAA

QA 1 234 1 234
DS 

RD RR2G769JQ 359 0 0
ACATAGTGCATGTGTGTTGTTGTATTTCTAGTATGACAATTATTTAACAAGATCTTCCCA
TTTGCAGTATTGGCCACCGGCCAATGCACGATAGTAACGGTCTCTACAATAAACCGGTCT
TCCATCAGCAGCCTCAGCTGCGGCCGCTGCTAAGTCATCATCTGTCACAACATCTGTGGG
CAACCGAAGCAATTGTTCTTTTCTCATATTGAACTTGTTGTTGGTTCTTGAAATAAAAAC
CTCCGGGGGGTTACCATTTGATCTTAAAGTGGTTTTAAAAAAATCCTCAACAGGGGTTGC
AAAAACGAATAGGACGAATGCTGAAACGAGCAAAGCTCCTGTTCCAACTAATGTTTGTT

QA 1 359 1 359
DS 



AS 1 2

CO CL5455Contig1 673 2 2 U
CTAGCCATTGGCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGTCACGCTCCGAGATCACAAGATCCAT
CACCGCTGCATCCTCCAACACCATTGTGTTTCGTTTCGACTGAATCCAAAGGTTTAACCT
TTGCTTGAAGCTCGTGAAACCCTTCAGGGAGATGCCAATTTAGAGAAAGACAGAGAGAGA
GATATGGTGAAGCCAGCGGGAAAGCAGAGTTATGGGCGCCTTGTGTTCGCTTCATTCCTC
GCCCTTTTAGCCTTCGGCCTCATCACCGACTTCCTCTGGGCTTCATCTCATCGCTTCTCC
TCCGCCATGCTCTCTCTTCCCTCCTCCGTCACCACCGTGGTCGTAAAACTCCCTCCAAGT
TCCAATGATGAGAAGAAGCTAAGAGAGGAGCTATTTCAGCTATGCCCACCATGAGTGCCG
TTCAAGACCTTATCTCTTCTTCCTCTCGCTATCCGATTTGTTGGGGAGTGGTGTTGCAAA
CTGCAGAAAATTGCAGGTTTTTTTCATGTTTCTTTTGTGAAGTGTGTTGATGTTCACGTT
GTGGTTGAAATATGTTTTGGTTTTTGCGTAATTCTCCTGAGTCATATCATTATTAATTAC
AGTGTGTTGATGTTCATGTTGTGGTTGAGATATATATTTTCTCTGTTCTGCAAGTATATG
TCTCCATACGGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL87JQ C 1
AF RR2CL87TF U 1
BS 1 666 RR2CL87TF
BS 667 673 RR2CL87JQ

RD RR2CL87JQ 673 0 0
CTAGCCATTGGCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGTCACGCTCCGAGATCACAAGATCCAT
CACCGCTGCATCCTCCAACACCATTGTGTTTCGTTTCGACTGAATCCAAAGGTTTAACCT
TTGCTTGAAGCTCGTGAAACCCTTCAGGGAGATGCCAATTTAGAGAAAGACAGAGAGAGA
GATATGGTGAAGCCAGCGGGAAAGCAGAGTTATGGGCGCCTTGTGTTCGCTTCATTCCTC
GCCCTTTTAGCCTTCGGCCTCATCACCGACTTCCTCTGGGCTTCATCTCATCGCTTCTCC
TCCGCCATGCTCTCTCTTCCCTCCTCCGTCACCACCGTGGTCGTAAAACTCCCTCCAAGT
TCCAATGATGAGAAGAAGCTAAGAGAGGAGCTATTTCAGCTATGCCCACCATGAGTGCCG
TTCAAGACCTTATCTCTTCTTCCTCTCGCTATCCGATTTGTTGGGGAGTGGTGTTGCAAA
CTGCAGAAAATTGCAGGTTTTTTTCATGTTTCTTTTGTGAAGTGTGTTGATGTTCACGTT
GTGGTTGAAATATGTTTTGGTTTTTGCGTAATTCTCCTGAGTCATATCATTATTAATTAC
AGTGTGTTGATGTTCATGTTGTGGTTGAGATATATATTTTCTCTGTTCTGCAAGTATATG
TCTCCATACGGTC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2CL87TF 666 0 0
CTAGCCATTGGCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGTCACGCTCCGAGATCACAAGATCCAT
CACCGCTGCATCCTCCAACACCATTGTGTTTCGTTTCGACTGAATCCAAAGGTTTAACCT
TTGCTTGAAGCTCGTGAAACCCTTCAGGGAGATGCCAATTTAGAGAAAGACAGAGAGAGA
GATATGGTGAAGCCAGCGGGAAAGCAGAGTTATGGGCGCCTTGTGTTCGCTTCATTCCTC
GCCCTTTTAGCCTTCGGCCTCATCACCGACTTCCTCTGGGCTTCATCTCATCGCTTCTCC
TCCGCCATGCTCTCTCTTCCCTCCTCCGTCACCACCGTGGTCGTAAAACTCCCTCCAAGT
TCCAATGATGAGAAGAAGCTAAGAGAGGAGCTATTTCAGCTATGCCCACCATGAGTGCCG
TTCAAGACCTTATCTCTTCTTCCTCTCGCTATCCGATTTGTTGGGGAGTGGTGTTGCAAA
CTGCAGAAAATTGCAGGTTTTTTTCATGTTTCTTTTGTGAAGTGTGTTGATGTTCACGTT
GTGGTTGAAATATGTTTTGGTTTTTGCGTAATTCTCCTGAGTCATATCATTATTAATTAC
AGTGTGTTGATGTTCATGTTGTGGTTGAGATATATATTTTCTCTGTTCTGCAAGTATATG
TCTCCA

QA 1 666 1 666
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5457Contig1 835 2 2 U
GGAAGTACCATAAGGTAACATCATGAGTCAACAATACAAGACCGTGAACGAGAAAGACGA
GACGGTTAAGCATAAGAACATCGGTCATGGCGGTCCTAATAACTATAATCCTTACGTCCA
GACTACTACACCCACCTCGGCTTCTGATAAGAGGTCGAAAGATAAGATTCTTAAGGTGTT
GAATCGGTGCGGGAAGAAAGTGGAGCAGGTGACTCGTAAGGCTGAATCATTCGCCGACGG
TTTGAAAGACCACCTGAAGTTTAGTCCTAGCATAAGTGATGCAGCAAGGGCTAGGCTTGC
TCAAGGCACTAAAATATTGGTTGAAGGAGGACCATACAAGGTGTTTCAAAGAGAGTTCGG
TCTCTTAGCCGCAGAGAAACTCTTAGATTCGTTCGTTTGTTACATATCGACCACTTCAGG
ACCAGTGACCGGAGTGTTATACATTTCAAATAAAAGAATCACTTTTTGTAGTGACTATGC
GATCCGCAGTCCTTCCACCGGTGTTCCAGCTTATTATAAGGTGGTGATGGAATTGGAAAA
GATAAGGAGCATTAACTCATCATCGAACGTGTTGAAGCCAAGCGAGAGGTATGTGCATGT
GGTGACGCAAGATGGGTTTGATTTTTGGTTCATGGGCTTCGTCTCCTACATGGATGCTTT
CAATTTTCTCAACAAAGCTCTGTCTAACTATCATGCATCGTGATTGTGTAGTGTAAACCA
TCTTCTAATACCTTTTGTTATCACTAATAAGTCTATGTTGTCTACACGGCATATATAATT
TGTACGAATTTGGGTCTTGTGGTGTGTGTCTAGTAATCAAAGAATTGATTTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU89TF U 1
AF RR2DU89JQ C 386
BS 1 719 RR2DU89TF
BS 720 835 RR2DU89JQ

RD RR2DU89TF 719 0 0
GGAAGTACCATAAGGTAACATCATGAGTCAACAATACAAGACCGTGAACGAGAAAGACGA
GACGGTTAAGCATAAGAACATCGGTCATGGCGGTCCTAATAACTATAATCCTTACGTCCA
GACTACTACACCCACCTCGGCTTCTGATAAGAGGTCGAAAGATAAGATTCTTAAGGTGTT
GAATCGGTGCGGGAAGAAAGTGGAGCAGGTGACTCGTAAGGCTGAATCATTCGCCGACGG
TTTGAAAGACCACCTGAAGTTTAGTCCTAGCATAAGTGATGCAGCAAGGGCTAGGCTTGC
TCAAGGCACTAAAATATTGGTTGAAGGAGGACCATACAAGGTGTTTCAAAGAGAGTTCGG
TCTCTTAGCCGCAGAGAAACTCTTAGATTCGTTCGTTTGTTACATATCGACCACTTCAGG
ACCAGTGACCGGAGTGTTATACATTTCAAATAAAAGAATCACTTTTTGTAGTGACTATGC
GATCCGCAGTCCTTCCACCGGTGTTCCAGCTTATTATAAGGTGGTGATGGAATTGGAAAA
GATAAGGAGCATTAACTCATCATCGAACGTGTTGAAGCCAAGCGAGAGGTATGTGCATGT
GGTGACGCAAGATGGGTTTGATTTTTGGTTCATGGGCTTCGTCTCCTACATGGATGCTTT
CAATTTTCTCAACAAAGCTCTGTCTAACTATCATGCATCGTGATTGTGTAGTGTAAACC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2DU89JQ 450 0 0
GATTCGTTCGTTTGTTACATATCGACCACTTCAGGACCAGTGACCGGAGTGTTATACATT
TCAAATAAAAGAATCACTTTTTGTAGTGACTATGCGATCCGCAGTCCTTCCACCGGTGTT
CCAGCTTATTATAAGGTGGTGATGGAATTGGAAAAGATAAGGAGCATTAACTCATCATCG
AACGTGTTGAAGCCAAGCGAGAGGTATGTGCATGTGGTGACGCAAGATGGGTTTGATTTT
TGGTTCATGGGCTTCGTCTCCTACATGGATGCTTTCAATTTTCTCAACAAAGCTCTGTCT
AACTATCATGCATCGTGATTGTGTAGTGTAAACCATCTTCTAATACCTTTTGTTATCACT
AATAAGTCTATGTTGTCTACACGGCATATATAATTTGTACGAATTTGGGTCTTGTGGTGT
GTGTCTAGTAATCAAAGAATTGATTTACCC

QA 1 450 1 450
DS 



AS 1 2

CO CL5458Contig1 1105 2 4 U
GGACTCTCGAGAGAGAGACAAGAATGGCACCTTCGTCGTCGAGCGGTCTGACCTTCAAGC
TCCACCCTCTTGTAATCGTCAACATATCCGATCACTACACCAGGGTCAAGACTCAGCTCA
ACCCTCCGCCAGGTTCAGTCTGCTCAACCGAGAACAACGCATCCTCCTCCAACAACAACG
GCGGGGAAGCAATGTTGCAGCCGCCGAACCCTAGGGTTTACGGATGCGTGATCGGCGTCC
AGAGAGGCCGCACTGTCGAGATCTTCAACAGCTTCGAGCTTTTGTTCGATCCTTCCACTG
AAACTCTCGATAGATCCTTCCTCGAGAAGAAGCAAGAGCTCTACAAGAAAGTGTTCCCTG
ACTTTTACATTTTGGGATGGTACTCTACGGGGAGTGACGCTGAGGAGTCTGATATGCTTA
TCCACAAAGCTTTGATGGATATCAATGAGTCTCCTGTTTATGTGCTTCTTAACCCTGCAA
TCAATCACGCACAGAAGGATCTCCCAGTTACTATTTACGAAAGCGAGTTGCATGTCATTG
ATGGAATCCCACAGCTTATTTTTGCTCACACAAGCTACACAATCGAGACGGTTGAAGCTG
AACGGATATCAGTTGATCATGTTGCACATCTCAAACCGTCTGATGGTGGCTCAGCAGCAA
CCCAGTTGGCTGCTCATCTTACTGGGATACATAGTGCCATCAAAATGCTTAATAGCAGAA
TCAGAGTGCTGCACCAGTATCTTGCCGCAATGCAGAAAGGTGATATTCCTTATGAAAACT
CACTTTTGAGACAAGTATCAAGCCTGCTAAGAAGGTTGCCTGCCATGGAATCAGAGAGGT
TTCAAGATAACTTTTTGATGGAGTACAATGACAAATTACTAGTAACTTACTTAGCAATGA
TTACAAATTGTACCAGCACCATGAACGAGATGGTGGACAAATTCAATACTGCGTATGACA
GAAACGCTCGAAGAGGTGGAAGAACTGCGTTCATGTAAAGTTTCTTTCCAGCAGATTCAA
GCTTCTCTTCAGTTCCTGAAAACTTTTTTTGCATAATCTATAAATGAGTCTCTGTCTCCC
TCGTGATTGTTTCTATCTGTGTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA15TF U 1
AF RR2CA15JQ C 410
BS 1 704 RR2CA15TF
BS 705 705 RR2CA15JQ
BS 706 749 RR2CA15TF
BS 750 1105 RR2CA15JQ

RD RR2CA15TF 749 0 0
GGACTCTCGAGAGAGAGACAAGAATGGCACCTTCGTCGTCGAGCGGTCTGACCTTCAAGC
TCCACCCTCTTGTAATCGTCAACATATCCGATCACTACACCAGGGTCAAGACTCAGCTCA
ACCCTCCGCCAGGTTCAGTCTGCTCAACCGAGAACAACGCATCCTCCTCCAACAACAACG
GCGGGGAAGCAATGTTGCAGCCGCCGAACCCTAGGGTTTACGGATGCGTGATCGGCGTCC
AGAGAGGCCGCACTGTCGAGATCTTCAACAGCTTCGAGCTTTTGTTCGATCCTTCCACTG
AAACTCTCGATAGATCCTTCCTCGAGAAGAAGCAAGAGCTCTACAAGAAAGTGTTCCCTG
ACTTTTACATTTTGGGATGGTACTCTACGGGGAGTGACGCTGAGGAGTCTGATATGCTTA
TCCACAAAGCTTTGATGGATATCAATGAGTCTCCTGTTTATGTGCTTCTTAACCCTGCAA
TCAATCACGCACAGAAGGATCTCCCAGTTACTATTTACGAAAGCGAGTTGCATGTCATTG
ATGGAATCCCACAGCTTATTTTTGCTCACACAAGCTACACAATCGAGACGGTTGAAGCTG
AACGGATATCAGTTGATCATGTTGCACATCTCAAACCGTCTGATGGTGGCTCAGCAGCAA
CCCAGTTGGCTGCTCATCTTACTGGGATACATAGTGCCATCAAA*TGCTTAATAGCAGAA
TCAGAGTGCTGCACCAGTATCTTGCCGCA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2CA15JQ 696 0 0
TGATATGCTTATCCACAAAGCTTTGATGGATATCAATGAGTCTCCTGTTTATGTGCTTCT
TAACCCTGCAATCAATCACGCACAGAAGGATCTCCCAGTTACTATTTACGAAAGCGAGTT
GCATGTCATTGATGGAATCCCACAGCTTATTTTTGCTCACACAAGCTACACAATCGAGAC
GGTTGAAGCTGAACGGATATCAGTTGATCATGTTGCACATCTCAAACCGTCTGATGGTGG
CTCAGCAGCAACCCAGTTGGCTGCTCATCTTACTGGGATACATAGTGCCATCAAAATGCT
TAATAGCAGAATCAGAGTGCTGCACCAGTATCTTGCCGCAATGCAGAAAGGTGATATTCC
TTATGAAAACTCACTTTTGAGACAAGTATCAAGCCTGCTAAGAAGGTTGCCTGCCATGGA
ATCAGAGAGGTTTCAAGATAACTTTTTGATGGAGTACAATGACAAATTACTAGTAACTTA
CTTAGCAATGATTACAAATTGTACCAGCACCATGAACGAGATGGTGGACAAATTCAATAC
TGCGTATGACAGAAACGCTCGAAGAGGTGGAAGAACTGCGTTCATGTAAAGTTTCTTTCC
AGCAGATTCAAGCTTCTCTTCAGTTCCTGAAAACTTTTTTTGCATAATCTATAAATGAGT
CTCTGTCTCCCTCGTGATTGTTTCTATCTGTGTAAG

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL5459Contig1 485 2 2 U
GGGTGGAGCTGAAGAGCGGTGAGCTGTACAGAGGAAACCTCCTCGAGTGTGAGGATAACT
GGAACTGCCAGCTCGAGAACATCACCTATACCGCCAAGGATGGGAAGGTATCACAGCTTG
AGCATGTCTTCATCCGAGGCAGCAAAGTCAGGTTTATAGTGATACCAGACATGCTGAAGA
ATGCTCCGATGTTCAAGCGAGTAAATGATAAAATCAAGGGAAAGAGCTCAATAGGTCTAG
GCAGAGGTAGACCTTCAATGCGAGGCAGAGGTACTGGGCGTGGCACAGGAGGAAGGGGAG
GCTCACCACCTGTGAGGAGATAGATCTTCGGCTATGAGACAATTCTATTCAGCATCCAGG
AGAAGCCAGCCATCTTCAGCTTGTCGTTTATGCATCTTATGGTACTCATTAAAACTCTCC
TACAAGAAGAGAACCAGAGAGAGAAAGGAACTAGTTTTGTATTTGTGCGTTACTATTGAA
CACCA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2EU48TF U 1
AF RR2EU48JQ C 1
BS 1 334 RR2EU48TF
BS 335 485 RR2EU48JQ

RD RR2EU48TF 334 0 0
GGGTGGAGCTGAAGAGCGGTGAGCTGTACAGAGGAAACCTCCTCGAGTGTGAGGATAACT
GGAACTGCCAGCTCGAGAACATCACCTATACCGCCAAGGATGGGAAGGTATCACAGCTTG
AGCATGTCTTCATCCGAGGCAGCAAAGTCAGGTTTATAGTGATACCAGACATGCTGAAGA
ATGCTCCGATGTTCAAGCGAGTAAATGATAAAATCAAGGGAAAGAGCTCAATAGGTCTAG
GCAGAGGTAGACCTTCAATGCGAGGCAGAGGTACTGGGCGTGGCACAGGAGGAAGGGGAG
GCTCACCACCTGTGAGGAGATAGATCTTCGGCTA

QA 1 334 1 334
DS 

RD RR2EU48JQ 485 0 0
GGGTGGAGCTGAAGAGCGGTGAGCTGTACAGAGGAAACCTCCTCGAGTGTGAGGATAACT
GGAACTGCCAGCTCGAGAACATCACCTATACCGCCAAGGATGGGAAGGTATCACAGCTTG
AGCATGTCTTCATCCGAGGCAGCAAAGTCAGGTTTATAGTGATACCAGACATGCTGAAGA
ATGCTCCGATGTTCAAGCGAGTAAATGATAAAATCAAGGGAAAGAGCTCAATAGGTCTAG
GCAGAGGTAGACCTTCAATGCGAGGCAGAGGTACTGGGCGTGGCACAGGAGGAAGGGGAG
GCTCACCACCTGTGAGGAGATAGATCTTCGGCTATGAGACAATTCTATTCAGCATCCAGG
AGAAGCCAGCCATCTTCAGCTTGTCGTTTATGCATCTTATGGTACTCATTAAAACTCTCC
TACAAGAAGAGAACCAGAGAGAGAAAGGAACTAGTTTTGTATTTGTGCGTTACTATTGAA
CACCA

QA 1 485 1 485
DS 



AS 1 2

CO CL5460Contig1 1015 2 6 U
GGGCAACCAAACACAAACACACAAAAGAAAATCGAATCCGGTAATAAACTCCCCTCTTCC
CCAACAGAACCTCGCTGATCTCCGCCGGGAAGGTTCAGTGAAACGTAACCCACCGTCTTT
TGAGATGGTGTCGCCCGAAAACGCAAATTGGATATCGGAATTGATCGATGAAGACTATGG
GAGTTTCACAATCCAAGGTCCTGGCTTCTCCTGGCCTCTTCCCCAACCTATTCCCGCCGT
TTCCAGCCTTGGAGTTGATGCCTCAGCTGGTAATTCAGAAGCCACCAAGGAACCTGCCTC
TAAAAAGAGGACGAGATGTGAATCGTCCTCTGCCACTAGCTCCAAAGCCTGTAGAGAGAA
GCAGCGACGTGACAGGCTGAATGACAAGTTTATGGAGTTGGGTGCAATTTTGGAGCCTGG
GAATCCTCCCAAAACAGACAAGGCTGCAATCCTGGTCGATGCTGTCCGCTTGGTTACACA
ACTACGCGGCGAGGCACAGAAATTGAAGGACTCCAATTCAAGTCTTCAAGACAAAATCAA
AGAGTTGAAGACGGAGAAGAACGAGCTGCGAGATGAGAAGCAGAGGCTGAAGACAGAGAA
AGAGAAGCTGGAGCAACAGCTGAAAGCCATGAATGCTCCTCAACCAAGCTTCTTCCCAGC
CCCATCTATGATGCCAACTGCTTTTGCTTCTGCGCAAGGCCAAGCTCCAGGAAACAAGAT
GGTGCCGATCATCAGTTACCCAGGAGTTGCCATGTGGCAGTTCATGCCTCCTGCTTCAGT
CGATACTTCTCAGGATCACGTCCTTCGTCCACCAGTTGCTTAACTGAGAGGACCAAAAAA
AACAAAAACCTCAACAAAATCATCAACTGGTTTGCTTCTTGCTTCCTCTGAAAAAAAAAG
AAAAGTCAATTTGTTTTGCTCTCCTCTTTCTTAGTCTTATGGTTGCTTTGGTTTCATTGG
TGTTATCCTCTTATAACAATTATCTTTTGAACAATGATATGGCATTGTAAACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP28TF U 1
AF RR2BP28JQ C 308
BS 1 655 RR2BP28TF
BS 656 656 RR2BP28JQ
BS 657 676 RR2BP28TF
BS 677 677 RR2BP28JQ
BS 678 688 RR2BP28TF
BS 689 1015 RR2BP28JQ

RD RR2BP28TF 688 0 0
GGGCAACCAAACACAAACACACAAAAGAAAATCGAATCCGGTAATAAACTCCCCTCTTCC
CCAACAGAACCTCGCTGATCTCCGCCGGGAAGGTTCAGTGAAACGTAACCCACCGTCTTT
TGAGATGGTGTCGCCCGAAAACGCAAATTGGATATCGGAATTGATCGATGAAGACTATGG
GAGTTTCACAATCCAAGGTCCTGGCTTCTCCTGGCCTCTTCCCCAACCTATTCCCGCCGT
TTCCAGCCTTGGAGTTGATGCCTCAGCTGGTAATTCAGAAGCCACCAAGGAACCTGCCTC
TAAAAAGAGGACGAGATGTGAATCGTCCTCTGCCACTAGCTCCAAAGCCTGTAGAGAGAA
GCAGCGACGTGACAGGCTGAATGACAAGTTTATGGAGTTGGGTGCAATTTTGGAGCCTGG
GAATCCTCCCAAAACAGACAAGGCTGCAATCCTGGTCGATGCTGTCCGCTTGGTTACACA
ACTACGCGGCGAGGCACAGAAATTGAAGGACTCCAATTCAAGTCTTCAAGACAAAATCAA
AGAGTTGAAGACGGAGAAGAACGAGCTGCGAGATGAGAAGCAGAGGCTGAAGACAGAGAA
AGAGAAGCTGGAGCAACAGCTGAAAGCCATGAATGCTCCTCAACCAAGCTTCTTCTCAGC
CCCATCTATGATGCCA*CTGCTTTTGCT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2BP28JQ 708 0 0
AGGACGAGATGTGAATCGTCCTCTGCCACTAGCTCCAAAGCCTGTAGAGAGAAGCAGCGA
CGTGACAGGCTGAATGACAAGTTTATGGAGTTGGGTGCAATTTTGGAGCCTGGGAATCCT
CCCAAAACAGACAAGGCTGCAATCCTGGTCGATGCTGTCCGCTTGGTTACACAACTACGC
GGCGAGGCACAGAAATTGAAGGACTCCAATTCAAGTCTTCAAGACAAAATCAAAGAGTTG
AAGACGGAGAAGAACGAGCTGCGAGATGAGAAGCAGAGGCTGAAGACAGAGAAAGAGAAG
CTGGAGCAACAGCTGAAAGCCATGAATGCTCCTCAACCAAGCTTCTTCCCAGCCCCATCT
ATGATGCCAACTGCTTTTGCTTCTGCGCAAGGCCAAGCTCCAGGAAACAAGATGGTGCCG
ATCATCAGTTACCCAGGAGTTGCCATGTGGCAGTTCATGCCTCCTGCTTCAGTCGATACT
TCTCAGGATCACGTCCTTCGTCCACCAGTTGCTTAACTGAGAGGACCAAAAAAAACAAAA
ACCTCAACAAAATCATCAACTGGTTTGCTTCTTGCTTCCTCTGAAAAAAAAAGAAAAGTC
AATTTGTTTTGCTCTCCTCTTTCTTAGTCTTATGGTTGCTTTGGTTTCATTGGTGTTATC
CTCTTATAACAATTATCTTTTGAACAATGATATGGCATTGTAAACTCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL5461Contig1 416 2 3 U
GGGGGGAAAAAAGATAAAGAGAGAATGGGAGCAGAATATGGAGAGATTCGCCAAGGCAGC
GATCAAACTACGCAAGTCGCAATTTCGAGAGATCAGTTTCTCGCCTGGAAGCGCCAAAAG
GACGCTGAATTATCAGCTAAACAAGCTGAAGCAGCTAGGAAACGTGAACAAGACATAGCA
GCAGGCCGTGTCCCGATGAATGGCCGAGAGCTTTTCTTGCACCACCCCTGGGTTTTTGAC
GACACCCACCTTTAGTTTCTTCTTCTTACTCAGGTGATTCAGACAAAGATCAATTGGCGA
TCAGTGACCCAGCTCTGTTTTTTTTTTCATTCTGTTCTTGTACTTATTTTCCCATTGTCG
TTTCAATTAGGCTGTTATATTATTTGGAGATTTTGATCATATTTGCATTTATGGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D765JQ C 1
AF RR2D765TF U 1
BS 1 224 RR2D765TF
BS 225 225 RR2D765JQ
BS 226 416 RR2D765TF

RD RR2D765JQ 416 0 0
GGGGGGAAAAAAGATAAAGAGAGAATGGGAGCAGAATATGGAGAGATTCGCCAAGGCAGC
GATCAAACTACGCAAGTCGCAATTTCGAGAGATCAGTTTCTCGCCTGGAAGCGCCAAAAG
GACGCTGAATTTTCAGCTAAACAAGCTGAAGCAGCTAGGAAACGTGAACAAGACATAGCA
GCAGGCCGTGTCCCGATGAATGGCCGAGAGCTTTTTTTGCCCCACCCCTGGGTTTTTGAC
GACCCCCCCCTTTAGTTTTTTTTTTTTATTCAGGTGATTCAGACAAAGATCAATTGGCGA
TCAGTGACCCAGCTTTGTTTTTTTTTTCATTCTGTTCTTGTACTTATTTTCCCATTGTCG
TTTCAATTAGGCTGTTATATTATTTGGAGATTTTGATCATATTTGCATTTATGGTT

QA 1 416 1 416
DS 

RD RR2D765TF 416 0 0
GGGGGGAAAAAAGATAAAGAGAGAATGGGAGCAGAATATGGAGAGATTCGCCAAGGCAGC
GATCAAACTACGCAAGTCGCAATTTCGAGAGATCAGTTTCTCGCCTGGAAGCGCCAAAAG
GACGCTGAATTATCAGCTAAACAAGCTGAAGCAGCTAGGAAACGTGAACAAGACATAGCA
GCAGGCCGTGTCCCGATGAATGGCCGAGAGCTTTTCTTGCACCAGCCCTGGGTTTTTGAC
GACACCCACCTTTAGTTTCTTCTTCTTACTCAGGTGATTCAGACAAAGATCAATTGGCGA
TCAGTGACCCAGCTCTGTTTTTTTTTTCATTCTGTTCTTGTACTTATTTTCCCATTGTCG
TTTCAATTAGGCTGTTATATTATTTGGAGATTTTGATCATATTTGCATTTATGGTT

QA 1 416 1 416
DS 



AS 1 2

CO CL5462Contig1 982 2 2 U
GACCTCTCTCACACTCTCTCTCTATCTATTATCGTATTTTTCTCCTTCTAGAAGAAACTC
TCTGCACTCTGCTTCTTCTTCTTTTTTTGTGTGTTTAGTTATTATGGTGACTTCGGAGGG
GCAAGCATTAGCAAGCGTCGAACCTTGGTTGTTGCATCGACAAGGATTCAACGTGGATTC
TTGGTTGCTTCACGATGCCTTCTCTCACGACAGCGATTTGCTCGCCAAAGCTCTCCATAA
CACCGTCTCACCACCACCACCACCACCACATACTCTCTCTCCCTCCTCTGTTTTTTTCCA
CTCACCTCACGGTTCCTCAACTTACACCCTTTCCTCTAACGCATCCGGTGGATCCAATCA
AGAAGTCGTCGTGGGCGGAGGAGGAGCTAAAAGGAAGCGTAACTGCATCCTCACCGGCTC
ATCAGAAGGTAAAGCCACGAAGCAGCGCCGCTCTCGCGCTTCCAAGAAACCTCAGACCAC
GTTCATAACCACGGATCCGTCCAACTTCCGCCAGATGGTTCAGCAAGTGACCGGCGCCAA
GTACACCAACGACGATACTTCCTCGATGCCTTTCAAGCCGGAGCCGCATAGACTCGTTGA
CACGAGACTTTCTAGCGTTACCTCCTCAGAGAGATCCACCACAGCGGTTCCAACGCTAGA
TACATCAGCATTTTTGTCTAAACATCACCATGAGAATCTCCTTGCCGAAGATACATATTC
CGGTGGTAACGACGCCGTGGGATTACCGTCGGAGAAAGCTAATGCAAAGAGTGGTGGTGG
TTCAGCCGCGGAGTTTGATCCTTACCCAACGTTTCCAACGCTTGAGTCGTGGAAAGTTAT
GTGATTCCTTTCCTTCTTTAGTTGCTTTGTAATATTTTTTAACTCTATTTTAGATCTTTC
TTTTAACTACTACTGTGCATCTCATTATGAATTATCTTTGTTCATAGATTTTGGTTCTTA
ATCGGATAAGTTCTTTTATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK39TF U 1
AF RR2EK39JQ C 297
BS 1 668 RR2EK39TF
BS 669 982 RR2EK39JQ

RD RR2EK39TF 668 0 0
GACCTCTCTCACACTCTCTCTCTATCTATTATCGTATTTTTCTCCTTCTAGAAGAAACTC
TCTGCACTCTGCTTCTTCTTCTTTTTTTGTGTGTTTAGTTATTATGGTGACTTCGGAGGG
GCAAGCATTAGCAAGCGTCGAACCTTGGTTGTTGCATCGACAAGGATTCAACGTGGATTC
TTGGTTGCTTCACGATGCCTTCTCTCACGACAGCGATTTGCTCGCCAAAGCTCTCCATAA
CACCGTCTCACCACCACCACCACCACCACATACTCTCTCTCCCTCCTCTGTTTTTTTCCA
CTCACCTCACGGTTCCTCAACTTACACCCTTTCCTCTAACGCATCCGGTGGATCCAATCA
AGAAGTCGTCGTGGGCGGAGGAGGAGCTAAAAGGAAGCGTAACTGCATCCTCACCGGCTC
ATCAGAAGGTAAAGCCACGAAGCAGCGCCGCTCTCGCGCTTCCAAGAAACCTCAGACCAC
GTTCATAACCACGGATCCGTCCAACTTCCGCCAGATGGTTCAGCAAGTGACCGGCGCCAA
GTACACCAACGACGATACTTCCTCGATGCCTTTCAAGCCGGAGCCGCATAGACTCGTTGA
CACGAGACTTTCTAGCGTTACCTCCTCAGAGAGATCCACCACAGCGGTTCCAACGCTAGA
TACATCAG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2EK39JQ 686 0 0
TCCACTCACCTCACGGTTCCTCAACTTACACCCTTTCCTCTAACGCATCCGGTGGATCCA
ATCAAGAAGTCGTCGTGGGCGGAGGAGGAGCTAAAAGGAAGCGTAACTGCATCCTCACCG
GCTCATCAGAAGGTAAAGCCACGAAGCAGCGCCGCTCTCGCGCTTCCAAGAAACCTCAGA
CCACGTTCATAACCACGGATCCGTCCAACTTCCGCCAGATGGTTCAGCAAGTGACCGGCG
CCAAGTACACCAACGACGATACTTCCTCGATGCCTTTCAAGCCGGAGCCGCATAGACTCG
TTGACACGAGACTTTCTAGCGTTACCTCCTCAGAGAGATCCACCACAGCGGTTCCAACGC
TAGATACATCAGCATTTTTGTCTAAACATCACCATGAGAATCTCCTTGCCGAAGATACAT
ATTCCGGTGGTAACGACGCCGTGGGATTACCGTCGGAGAAAGCTAATGCAAAGAGTGGTG
GTGGTTCAGCCGCGGAGTTTGATCCTTACCCAACGTTTCCAACGCTTGAGTCGTGGAAAG
TTATGTGATTCCTTTCCTTCTTTAGTTGCTTTGTAATATTTTTTAACTCTATTTTAGATC
TTTCTTTTAACTACTACTGTGCATCTCATTATGAATTATCTTTGTTCATAGATTTTGGTT
CTTAATCGGATAAGTTCTTTTATCCC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL5463Contig1 663 2 4 U
GGATCGCAGTAGTTTATTCCTCTGGGATTTGCAGAAAGAAAATAAAAGAGAAGAGAGCGA
TGAAGGTTGTTGCGGCGTACCTCCTCGCGAAGCTCGGCGGCAATGAGAATCCAGCCGTTG
GTGATCTGAAGAAGATCTTGGAATCTGTTGGTGCAGAGATCGATCAAGTGAAGATAGATT
TGTTTTTCTCTCTGATCAAAGATCACGATCTGACCGAGCTTATCGCGGTTGGACGAGAGA
AGATGGCTGCTCTATCTTCCGGTGGTCCTCCGGTTGCGGTTGCTGCCGGTGGAGGCGGTG
CTGCTGCTCCTGCTGCTGAGCCTGCGGCGGCTGAGAAGAAGAAGGAAGAGGAGAAAGAAG
AATCAGAAGACGATGGTGTAATGATGAGTCTCTTCGATTAATCTTGATGGTAGAAGTTTC
GATCTGCGTATTATTTCTCCCTTTTTATGCCTTTTTCATAACTAGGGTTTCTAGATTCGT
GTGGTTTCCAAGATTTTTCATACCTTGAGTCTGGTGAGAGAATAAATGTTTTGAATAATG
AAGTTTTTATATGAAATATAAAGGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTAAATTTTATAAA
GGGATTTTGCTAGTGTTTAACACAGACTTCAGCATTATATAAATAAACGTATTCTGTTTG
AGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2E503TF U 1
AF RR2E503JQ C 219
BS 1 269 RR2E503TF
BS 270 270 RR2E503JQ
BS 271 594 RR2E503TF
BS 595 663 RR2E503JQ

RD RR2E503TF 594 0 0
GGATCGCAGTAGTTTATTCCTCTGGGATTTGCAGAAAGAAAATAAAAGAGAAGAGAGCGA
TGAAGGTTGTTGCGGCGTACCTCCTCGCGAAGCTCGGCGGCAATGAGAATCCAGCCGTTG
GTGATCTGAAGAAGATCTTGGAATCTGTTGGTGCAGAGATCGATCAAGTGAAGATAGATT
TGTTTTTCTCTCTGATCAAAGATCACGATCTGACCGAGCTTATCGCGGTTGGACGAGAGA
AGATGGCTGCTCTATCTTCCGGTGGTCCTGCGGTTGCGGTTGCTGCCGGTGGAGGCGGTG
CTGCTGCTCCTGCTGCTGAGCCTGCGGCGGCTGAGAAGAAGAAGGAAGAGGAGAAAGAAG
AATCAGAAGACGATGGTGTAATGATGAGTCTCTTCGATTAATCTTGATGGTAGAAGTTTC
GATCTGCGTATTATTTCTCCCTTTTTATGCCTTTTTCATAACTAGGGTTTCTAGATTCGT
GTGGTTTCCAAGATTTTTCATACCTTGAGTCTGGTGAGAGAATAAATGTTTTGAATAATG
AAGTTTTTATATGAAATATAAAGGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTAAATTT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2E503JQ 445 0 0
CTTATCGCGGTTGGACGAGAGAAGATGGCTGCTCTATCTTCCGGTGGTCCTCCGGTTGCG
GTTGCTGCCGGTGGAGGCGGTGCTGCTGCTCCTGCTGCTGAGCCTGCGGCGGCTGAGAAG
AAGAAGGAAGAGGAGAAAGAAGAATCAGAAGACGATGGTGTAATGATGAGTCTCTTCGAT
TAATCTTGATGGTAGAAGTTTCGATCTGCGTATTATTTCTCCCTTTTTATGCCTTTTTCA
TAACTAGGGTTTCTAGATTCGTGTGGTTTCCAAGATTTTTCATACCTTGAGTCTGGTGAG
AGAATAAATGTTTTGAATAATGAAGTTTTTATATGAAATATAAAGGGATTTTTTTTTTTT
TTTTTTTGCTAAATTTTATAAAGGGATTTTGCTAGTGTTTAACACAGACTTCAGCATTAT
ATAAATAAACGTATTCTGTTTGAGG

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 2

CO CL5464Contig1 1003 2 2 U
GGGCATTAGGAGAAGCCAAAATTTTCTTTGCGTCTCTGAGCTGTGTATTGAACTACATCT
CCTTCAATGGCTTCCCTATCAACCAGTTCTCTAAGCTTCAAAGCTACCTCCATACAATCT
ACCAGAATTTCTCAGGTGACATTCTCCTCTGTAAACTCAATATATAGTTTATACGTACAT
CTATTGTGACCAATATAATGTTTAAAAGCCATAACTAAATAACGCAATTACCCTTGAATA
CTGTTTAACCATTAGGTGTTAAGAAAACCCTTGAGTTTCCAGTCCATCTCCTTTGGACGT
TTTCAGTCTTCAAAGAAGCTTCGTCTTCAGATCACTTGTGCAGTAAGTAATTTATTTGAA
CCTAAAGTTGAATTATATGAGAAATGCAATAAGTTGGATTTTAACATGTTAGCTTTAATA
AGTACAGGCAAAACCAGAGACCGTGCAGAAAGTGAGTGACATTGTAAGGGAACAATTGGC
TTTGTCGGCCGACACTGCGCTCACTGCTGAGTCCAAGTTCTCTGCTCTCGGAGCTGATTC
TCTCGACACCGTATGTTATGCTCTCTATCTTTTCATGTTAACGTGATGTTTAAGCCAACC
ACTACAGTAGCCTTATCGGTTTGTAACCTAGTGGTTTGTTATTAGTTAATTGAGTACTCG
CTAAAATTTTTGCCGGGTGGGATATGGGTGTAGGTGGAGATAGTGATGGCTTTGGAGGAA
AAGTTTAACATAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACGATTCAAGAGGCG
GCTGATTTGATTGAGGATCTTGTTCAGAAGACACCTGCGGCCTAAGCTTTGTAAACTATC
CCGGTTTAACACCAACCGGCTGTTTTTTTTTTTCCTTCTTTTTGAGCTTTTTTGGTTTCA
GATCATTTTATTTTGGTTTTGTTAGACCAAGTTATTTTTTTTGTTTTTTTCTTTTGGAAG
TTAAGATTGGATGTTGATGATGAGAAAACTTTGGTACGTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO37TF U 1
AF RR2EO37JQ C 307
BS 1 689 RR2EO37TF
BS 690 1003 RR2EO37JQ

RD RR2EO37TF 689 0 0
GGGCATTAGGAGAAGCCAAAATTTTCTTTGCGTCTCTGAGCTGTGTATTGAACTACATCT
CCTTCAATGGCTTCCCTATCAACCAGTTCTCTAAGCTTCAAAGCTACCTCCATACAATCT
ACCAGAATTTCTCAGGTGACATTCTCCTCTGTAAACTCAATATATAGTTTATACGTACAT
CTATTGTGACCAATATAATGTTTAAAAGCCATAACTAAATAACGCAATTACCCTTGAATA
CTGTTTAACCATTAGGTGTTAAGAAAACCCTTGAGTTTCCAGTCCATCTCCTTTGGACGT
TTTCAGTCTTCAAAGAAGCTTCGTCTTCAGATCACTTGTGCAGTAAGTAATTTATTTGAA
CCTAAAGTTGAATTATATGAGAAATGCAATAAGTTGGATTTTAACATGTTAGCTTTAATA
AGTACAGGCAAAACCAGAGACCGTGCAGAAAGTGAGTGACATTGTAAGGGAACAATTGGC
TTTGTCGGCCGACACTGCGCTCACTGCTGAGTCCAAGTTCTCTGCTCTCGGAGCTGATTC
TCTCGACACCGTATGTTATGCTCTCTATCTTTTCATGTTAACGTGATGTTTAAGCCAACC
ACTACAGTAGCCTTATCGGTTTGTAACCTAGTGGTTTGTTATTAGTTAATTGAGTACTCG
CTAAAATTTTTGCCGGGTGGGATATGGGT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2EO37JQ 697 0 0
TCTTCAAAGAAGCTTCGTCTTCAGATCACTTGTGCAGTAAGTAATTTATTTGAACCTAAA
GTTGAATTATATGAGAAATGCAATAAGTTGGATTTTAACATGTTAGCTTTAATAAGTACA
GGCAAAACCAGAGACCGTGCAGAAAGTGAGTGACATTGTAAGGGAACAATTGGCTTTGTC
GGCCGACACTGCGCTCACTGCTGAGTCCAAGTTTTTTGCTTTCGGAGCTGATTCTCTCGA
CACCGTATGTTATGCTCTCTATCTTTTCATGTTAACGTGATGTTTAAGCCAACCACTACA
GTAGCCTTATCGGTTTGTAACCTAGTGGTTTGTTATTAGTTAATTGAGTACTCGCTAAAA
TTTTTGCCGGGTGGGATATGGGTGTAGGTGGAGATAGTGATGGCTTTGGAGGAAAAGTTT
AACATAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGAT
TTGATTGAGGATCTTGTTCAGAAGACACCTGCGGCCTAAGCTTTGTAAACTATCCCGGTT
TAACACCAACCGGCTGTTTTTTTTTTTCCTTCTTTTTGAGCTTTTTTGGTTTCAGATCAT
TTTATTTTGGTTTTGTTAGACCAAGTTATTTTTTTTGTTTTTTTCTTTTGGAAGTTAAGA
TTGGATGTTGATGATGAGAAAACTTTGGTACGTTGAG

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL5465Contig1 873 2 2 U
TTTTTGTGGAGAGCAGCAGCGGCGACCTTCGAGCTTAGTTCCGATGAAGACGGTGACGGG
AAGAGTAACGAGTGAGAGACCTATCAGTCTCTCAAAGGCGGCAACGCTTCTCTCAAGTTT
CGTTTCATCTGAGACAGAGGCCTCTCAGGACGTTGCAGCGTACCTCCGACGCGCCTCCGC
TGCCTTCACTGAGCTTAAGAGCTTCCACAGAGAGATTCGATCTACTACCAAACCCGAATC
CGAGGCAAAGGATGAGGTGAATCCGCGCGAGGATAAGAAGAAGAAGAAGAGCAGAGAAGA
AGATGTTGTTGAGGAGGAGAAGGAGAGTGTGAAGTTGGAAGAGGAGCCAGTGAAGAAAGA
GAGAAAGAAGAAGAAGAAGAGTAAAGGTGAAGATGATGTTGTGGTTGAAGAAAAAAATGG
ATGTGAAGTTAGAAGAAGAGCAGAGGAACGATGAGAGCAAGAAGAAAAAGAAGCACAAGA
AGAAGAGCAAAGGTGAAGAGAAGGTGGATGTGATGTTGGAAGAAGACCAAAGGAATGACG
AGAGGAAGAAAGGTGAAGATGTTGTTGAAGAAGAGAAAAAGAAGAAGAAGAAGCGGAAGA
GTGATGAAGAGATTGGTTCTGAGGAGAAGAAGAAGAAGAGCAAGAAGAAGAGGAATTCAA
AGGAGATTGATGCTTGAACTTGCTTTCTTTTGTCATCTTTTGGAGACCAAATTTGTAGGC
TTAAGATGTTCCTTATTGACAATTAAGATTTTGATAAAAAGATTTTGATTTTGTGGAACT
CTCTCTCTCTCTCTGTTATAAGTTAGAGTGTTGTTTTGGTATTGTGATTATGGCCTTCTT
TGCCGTTACTATATTTGGAAGACTCTTGAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD02TF U 1
AF RR2DD02JQ C 200
BS 1 568 RR2DD02TF
BS 569 873 RR2DD02JQ

RD RR2DD02TF 574 0 0
TTTTTGTGGAGAGCAGCAGCGGCGACCTTCGAGCTTAGTTCCGATGAAGACGGTGACGGG
AAGAGTAACGAGTGAGAGACCTATCAGTCTCTCAAAGGCGGCAACGCTTCTCTCAAGTTT
CGTTTCATCTGAGACAGAGGCCTCTCAGGACGTTGCAGCGTACCTCCGACGCGCCTCCGC
TGCCTTCACTGAGCTTAAGAGCTTCCACAGAGAGATTCGATCTACTACCAAACCCGAATC
CGAGGCAAAGGATGAGGTGAATCCGCGCGAGGATAAGAAGAAGAAGAAGAGCAGAGAAGA
AGATGTTGTTGAGGAGGAGAAGGAGAGTGTGAAGTTGGAAGAGGAGCCAGTGAAGAAAGA
GAGAAAGAAGAAGAAGAAGAGTAAAGGTGAAGATGATGTTGTGGTTGAAGAAAAAAATGG
ATGTGAAGTTAGAAGAAGAGCAGAGGAACGATGAGAGCAAGAAGAAAAAGAAGCACAAGA
AGAAGAGCAAAGGTGAAGAGAAGGTGGATGTGATGTTGGAAGAAGACCAAAGGAATGACG
AGAGGAAGAAAGGTGAAGATGTTGTTGA
GAAGAG

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2DD02JQ 674 0 0
AGCTTCCACAGAGAGATTCGATCTACTACCAAACCCGAATCCGAGGCAAAGGATGAGGTG
AATCCGCGCGAGGATAAGAAGAAGAAGAAGAGCAGAGAAGAAGATGTTGTTGAGGAGGAG
AAGGAGAGTGTGAAGTTGGAAGAGGAGCCAGTGAAGAAAGAGAGAAAGAAGAAGAAGAAG
AGTAAAGGTGAAGATGATGTTGTGGTTGAAGAAAAAAATGGATGTGAAGTTAGAAGAAGA
GCAGAGGAACGATGAGAGCAAGAAGAAAAAGAAGCACAAGAAGAAGAGCAAAGGTGAAGA
GAAGGTGGATGTGATGTTGGAAGAAGACCAAAGGAATGACGAGAGGAAGAAAGGTGAAGA
TGTTGTTGAAGAAGAGAAAAAGAAGAAGAAGAAGCGGAAGAGTGATGAAGAGATTGGTTC
TGAGGAGAAGAAGAAGAAGAGCAAGAAGAAGAGGAATTCAAAGGAGATTGATGCTTGAAC
TTGCTTTCTTTTGTCATCTTTTGGAGACCAAATTTGTAGGCTTAAGATGTTCCTTATTGA
CAATTAAGATTTTGATAAAAAGATTTTGATTTTGTGGAACTCTCTCTCTCTCTCTGTTAT
AAGTTAGAGTGTTGTTTTGGTATTGTGATTATGGCCTTCTTTGCCGTTACTATATTTGGA
AGACTCTTGAATGC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL5466Contig1 1098 2 6 U
GGAAACCTCAACGATTCGATTCGTCTTCACGGATTTGGTTATCAGAAAACAAAAGAGAGA
AGCGAGAAGAAGCAGCCAAAACAAACCCTAATACAAACGCCTCTCTTTCGCTAAAATATG
GCGGAGGATTTCGCGAGGGCGGTGGAGGACGGGCTTAAACTCGCGAAACGGATCTATTTC
GGGAACGACCGTGCCGTCGCGGCGCTGAGGCTAGCTTCCCCGATGGAGAGAGCGGCGTCG
CATTCTAACCTCCCTTCCGCGCCGATGGTCTACGCCGTCATACACGAGCCTGGGATCGTG
GATAACCCAGACCTGCCCAGCTACCAGCCTCACGTGCACGGCAGGTGCGACCCCCCGGCT
CTGATTCCTCTCCAGATGAACGCGATCGAGCTCGACGTAGACTGTTACCTCGACACGGCT
CTCGTCACCGTCACCGGATCGTGGCGTGTGCATTGCGTCATGGGAAGCAAGAGGTGTGAT
TGCCGCATCGCTATTCCCATGGGTGAACAGGGCTCAATACTAGGTGTTGAGGTTGAGATT
CCTAGAAAGTCTTACACAACACAGTCTTGCCGGTAATAGCCCTGGAAACTTGAACTACCC
TGCGATTTCAGCTTTGTTCCCAGAGAACACACGTGTTAAAGCTATGACACTCAAAAGAAC
CGTGACCAATGTTGGTCCTCACGTTTCAAGCTACAAGGTCTCTGTCTCTCCTTTCAAAGG
CGCAACCGTCACAGTCCAGCCAAAGACACTCAATTTCACTACGAAACACCAGAAGCTTTC
CTACACTGTTACTTTCAGGACGAAGCTGCGGATGAAGAGGCCTGAGTTTGGTGGTCTTTT
GTGGAAGAGTGCGACTCATAAGGTTCGTAGCCCGGTTATTATCACATGGTTGCCTCCTCT
GTAGAGAGGAACAAACCGTTATTGAAGAAACTTTAATGTTTTAGTTTCAACTTTCAACAA
ATAAGATTTCTTTATGTAAGGAGAGATGAGCTTTTCTCTAGAAGCAATGCTTTAAAAAAC
ATTTTCAGTAGTTTTAGTTCATGTTCTTGCATAAGCTACCTTTTTAAATAAAATACCGTG
TTTTCATCAAATTCGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU22TF U 1
AF RR2DU22JQ C 446
BS 1 697 RR2DU22TF
BS 698 698 RR2DU22JQ
BS 699 719 RR2DU22TF
BS 720 720 RR2DU22JQ
BS 721 757 RR2DU22TF
BS 758 1098 RR2DU22JQ

RD RR2DU22TF 757 0 0
GGAAACCTCAACGATTCGATTCGTCTTCACGGATTTGGTTATCAGAAAACAAAAGAGAGA
AGCGAGAAGAAGCAGCCAAAACAAACCCTAATACAAACGCCTCTCTTTCGCTAAAATATG
GCGGAGGATTTCGCGAGGGCGGTGGAGGACGGGCTTAAACTCGCGAAACGGATCTATTTC
GGGAACGACCGTGCCGTCGCGGCGCTGAGGCTAGCTTCCCCGATGGAGAGAGCGGCGTCG
CATTCTAACCTCCCTTCCGCGCCGATGGTCTACGCCGTCATACACGAGCCTGGGATCGTG
GATAACCCAGACCTGCCCAGCTACCAGCCTCACGTGCACGGCAGGTGCGACCCCCCGGCT
CTGATTCCTCTCCAGATGAACGCGATCGAGCTCGACGTAGACTGTTACCTCGACACGGCT
CTCGTCACCGTCACCGGATCGTGGCGTGTGCATTGCGTCATGGGAAGCAAGAGGTGTGAT
TGCCGCATCGCTATTCCCATGGGTGAACAGGGCTCAATACTAGGTGTTGAGGTTGAGATT
CCTAGAAAGTCTTACACAACACAGTCTTGCCGGTAATAGCCCTGGAAACTTGAACTACCC
TGCGATTTCAGCTTTGTTCCCAGAGAACACACGTGTTAAAGCTATGACACTCAAAAGAAC
CGTGACCAATGTTGGTCCTCACGTTTCAAGCTACAAG*TCTCTGTCTCTCCTTTCAAAG*
CGCAACCGTCACAGTCCAGCCAAAGACACTCAATTTC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2DU22JQ 653 0 0
GTGTGCATTGCGTCATGGGAAGCAAGAGGTGTGATTGCCGCATCGCTATTCCCATGGGTG
AACAGGGCTCAATACTAGGTGTTGAGGTTGAGATTCCTAGAAAGTCTTACACAACACAGT
CTTGCCGGTAATAGCCCTGGAAACTTGAACTACCCTGCGATTTCAGCTTTGTTCCCAGAG
AACACACGTGTTAAAGCTATGACACTCAAAAGAACCGTGACCAATGTTGGTCCTCACGTT
TCAAGCTACAAGGTTTCTGTCTCTCCTTTCAAAGGCGCAACCGTCACAGTCCAGCCAAAG
ACACTCAATTTCACTACGAAACACCAGAAGCTTTCCTACACTGTTACTTTCAGGACGAAG
CTGCGGATGAAGAGGCCTGAGTTTGGTGGTCTTTTGTGGAAGAGTGCGACTCATAAGGTT
CGTAGCCCGGTTATTATCACATGGTTGCCTCCTCTGTAGAGAGGAACAAACCGTTATTGA
AGAAACTTTAATGTTTTAGTTTCAACTTTCAACAAATAAGATTTCTTTATGTAAGGAGAG
ATGAGCTTTTCTCTAGAAGCAATGCTTTAAAAAACATTTTCAGTAGTTTTAGTTCATGTT
CTTGCATAAGCTACCTTTTTAAATAAAATACCGTGTTTTCATCAAATTCGCTC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5468Contig1 1140 2 2 U
GGTCACATCTACGATACTGACTGGCACTATTCATGTGGTACGAAGGAGTACAAGGTTCTG
ATGGACCAATTTCACCATGTTGCTGCAGCTTTTCTTGAACTTGAAAAAGGGTATCAAGAG
GCTATCGAGGAAATTACTAAAAGAATGGGAGCAGGAATGGCCAAGTTTATTTGCCAAGAG
GTAGAAACTGTTGATGACTACGATGAGTACTGCCACTATGTTGCTGGACTTGTGGGTTTA
GGTCTGTCGAAACTCTTCCTAGCTTCGGGAACAGAAGCTTTGTTGCCAGACTGGGAGCGG
ATTTCCAATTCAATGGGTTTATTTCTTCAGAAAACAAACATTATCAGAGATTATCTTGAG
GACATTAATGAAATACCAAAGTCTCGCATGTTTTGGCCTCGCGAGATTTGGGGCAAATAT
GCTGACAAGCTAGAGGACTTAAAATACGAGGAGAATTCAACTAAAGCAGTGCATTGCTTG
AATGAAATGGTCACCAATGCATTGACGCATATTGAAGATTGCCTGAAGTACATGGCTGTG
TTGCGTGATCCTTCTATATTTCGGTTCTGTGCTATCCCTCAGATCATGGCGATTGGAACA
CTTGCATTGTGCTATAACAATGTACAAGTATTTAGAGGCGTGGTGAAACTGAGGCGAGGT
CTAACTGCCAAAGTCATTGATCGCACAAAGACAATGGCTGATGTCTATGGAGCTTTCTAC
GATTTTGCTTGCATGCTAAAAACAAAGGTCGACAAGAACGATCCGAATTCCAGTATGACA
CTAAATCGACTTGAAGCCGTTCAGAAAATCTGCAGAGACACTGGAGTCCTTCATAACAGA
AAATCTTATATTAATGACAAAGGACAATCTGTCAATGTCTATATTGTAATGCTTGTGATT
CTACTGGCCATAGTCTTTGCATATCTCAGAGCAAACTGAGTGATCAATGATGGACACTGT
GATTCGTAGGGTTCGTTCTTATTCACGCCACTCTTTTTCTTAGAACTTAAGTCCTATTCA
AGATTGTTTCCACAGTTTTAAACTTCGCTTGATCTCTACCCATGTAGTTTGAATAATCAT
ATAACTTTCTTAAATGTATCTCTCTTGTTTATGATGACGTCTATATATATATTGCCAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL36TF U 1
AF RR2BL36JQ C 331
BS 1 708 RR2BL36TF
BS 709 1140 RR2BL36JQ

RD RR2BL36TF 708 0 0
GGTCACATCTACGATACTGACTGGCACTATTCATGTGGTACGAAGGAGTACAAGGTTCTG
ATGGACCAATTTCACCATGTTGCTGCAGCTTTTCTTGAACTTGAAAAAGGGTATCAAGAG
GCTATCGAGGAAATTACTAAAAGAATGGGAGCAGGAATGGCCAAGTTTATTTGCCAAGAG
GTAGAAACTGTTGATGACTACGATGAGTACTGCCACTATGTTGCTGGACTTGTGGGTTTA
GGTCTGTCGAAACTCTTCCTAGCTTCGGGAACAGAAGCTTTGTTGCCAGACTGGGAGCGG
ATTTCCAATTCAATGGGTTTATTTCTTCAGAAAACAAACATTATCAGAGATTATCTTGAG
GACATTAATGAAATACCAAAGTCTCGCATGTTTTGGCCTCGCGAGATTTGGGGCAAATAT
GCTGACAAGCTAGAGGACTTAAAATACGAGGAGAATTCAACTAAAGCAGTGCATTGCTTG
AATGAAATGGTCACCAATGCATTGACGCATATTGAAGATTGCCTGAAGTACATGGCTGTG
TTGCGTGATCCTTCTATATTTCGGTTCTGTGCTATCCCTCAGATCATGGCGATTGGAACA
CTTGCATTGTGCTATAACAATGTACAAGTATTTAGAGGCGTGGTGAAACTGAGGCGAGGT
CTAACTGCCAAAGTCATTGATCGCACAAAGACAATGGCTGATGTCTAT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2BL36JQ 810 0 0
AAAACAAACATTATCAGAGAT*ATCTTGAGGACATTAATGAAATACCAAAGTCTCGCATG
TTTTGGCCTCGCGAGATTTGGGGCAAATATGCTGACAAGCTAGAGGACTTAAAATACGAG
GAGAATTCAACTAAAGCAGTGCATTGCTTGAATGAAATGGTCACCAATGCATTGACGCAT
ATTGAAGATTGCCTGAAGTACATGGCTGTGTTGCGTGATCCTTCTATATTTCGGTTCTGT
GCTATCCCTCAGATCATGGCGATTGGAACACTTGCATTGTGCTATAACAATGTACAAGTA
TTTAGAGGCGTGGTGAAACTGAGGCGAGGTCTAACTGCCAAAGTCATTGATCGCACAAAG
ACAATGGCTGATGTCTATGGAGCTTTCTACGATTTTGCTTGCATGCTAAAAACAAAGGTC
GACAAGAACGATCCGAATTCCAGTATGACACTAAATCGACTTGAAGCCGTTCAGAAAATC
TGCAGAGACACTGGAGTCCTTCATAACAGAAAATCTTATATTAATGACAAAGGACAATCT
GTCAATGTCTATATTGTAATGCTTGTGATTCTACTGGCCATAGTCTTTGCATATCTCAGA
GCAAACTGAGTGATCAATGATGGACACTGTGATTCGTAGGGTTCGTTCTTATTCACGCCA
CTCTTTTTCTTAGAACTTAAGTCCTATTCAAGATTGTTTCCACAGTTTTAAACTTCGCTT
GATCTCTACCCATGTAGTTTGAATAATCATATAACTTTCTTAAATGTATCTCTCTTGTTT
ATGATGACGTCTATATATATATTGCCAATG

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

CO CL5469Contig1 1061 2 2 U
GGGATCTCTACGAAGACGAAGAGGAAGGATCATGGACTGGACAAACGTTTCCTCTAGATC
GAGCTCTCTTACAATTGGGGAGCAAATCTGCGCCGTCTTCGTACCATTCGTTGTCATCAT
TGATGTCATCTTCTCCACCTTCGGACAATGCTTCGATTGCCGCCGCCGCCGATCCTCTCA
GATATGTCAGCACCCGGATCTGACTCGTCTTGCCCATGAATCTCAATTTTCAGCCAATGA
AGTTGAAGCATTGTATGAGTTATTCAAGAAACTGAGCTGTTCAATTATTGATGACGGCTT
GATTCACAAGGAAGAGCTTCGGCTAGCGCTTGTCCAAACTCCAAACCTGTTTCTTGATAG
GGTTTTTGATTTGTTCGATGAGAAGAAGAATGGGGTTATCGAGTTTGAGGAGTTTATCCA
TGCCTTGAGTGTGTTTCATCCCTCTGCACCAATCGAGGAGAAGATCGACTTTGCATTTAG
GCTCTATGATCTTAGACAAACCGGATTTATAGAGCGAGAAGAGGTGCATCAAATGGTGGC
TGCTATTTTGAAAGAGTCTGATATGATGCTGTCTGATGAACTTCTGAACATGATTATTGA
TAAAACATTTGTTGATGCAGATTCCGATAGAGATGGCAAAATAAGCAAGGAGGAATGGAG
AGTGTATGTGCTTAAGCATCCCAGCTTGTTGAAGAATATGACTCTTCCTTACCTAAAGGA
TGTGACGACGGCATTCCCAAGTTTTATATTCAACACTGAGGTTGAAGACTGAGGCAACAA
CACCTACAATCTTTTTCTGCGTATGAAACCAGTTTCTTTGTTGTATTTTTTCCCCAAATT
AGTTGGTGATCATTGTTAGCTGTAAGTAAAAATGTATCTTTTGATGCATACATTTTGAGA
CTGTCCCATTGAAAGTGATAAATCATTTTTTCTACTTTATCTTGTGTTTTATGGCCATAT
GGACAAGTGGTTCAGACATTTATTGTGTGGAAAGATTGGAAGGGATAAACAAGAGTAAAT
GGAATTGAGGAATGACAATGATTGAAGATAAGATTGAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H090TF U 1
AF RR2H090JQ C 271
BS 1 642 RR2H090TF
BS 643 1061 RR2H090JQ

RD RR2H090TF 642 0 0
GGGATCTCTACGAAGACGAAGAGGAAGGATCATGGACTGGACAAACGTTTCCTCTAGATC
GAGCTCTCTTACAATTGGGGAGCAAATCTGCGCCGTCTTCGTACCATTCGTTGTCATCAT
TGATGTCATCTTCTCCACCTTCGGACAATGCTTCGATTGCCGCCGCCGCCGATCCTCTCA
GATATGTCAGCACCCGGATCTGACTCGTCTTGCCCATGAATCTCAATTTTCAGCCAATGA
AGTTGAAGCATTGTATGAGTTATTCAAGAAACTGAGCTGTTCAATTATTGATGACGGCTT
GATTCACAAGGAAGAGCTTCGGCTAGCGCTTGTCCAAACTCCAAACCTGTTTCTTGATAG
GGTTTTTGATTTGTTCGATGAGAAGAAGAATGGGGTTATCGAGTTTGAGGAGTTTATCCA
TGCCTTGAGTGTGTTTCATCCCTCTGCACCAATCGAGGAGAAGATCGACTTTGCATTTAG
GCTCTATGATCTTAGACAAACCGGATTTATAGAGCGAGAAGAGGTGCATCAAATGGTGGC
TGCTATTTTGAAAGAGTCTGATATGATGCTGTCTGATGAACTTCTGAACATGATTATTGA
TAAAACATTTGTTGATGCAGATTCCGATAGAGATGGCAAAAT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2H090JQ 791 0 0
ACTGAGCTGTTCAATTATTGATGACGGCTTGATTCACAAGGAAGAGCTTCGGCTAGCGCT
TGTCCAAACTCCAAACCTGTTTCTTGATAGGGTTTTTGATTTGTTCGATGAGAAGAAGAA
TGGGGTTATCGAGTTTGAGGAGTTTATCCATGCCTTGAGTGTGTTTCATCCCTCTGCACC
AATCGAGGAGAAGATCGACTTTGCATTTAGGCTCTATGATCTTAGACAAACCGGATTTAT
AGAGCGAGAAGAGGTGCATCAAATGGTGGCTGCTATTTTGAAAGAGTCTGATATGATGCT
GTCTGATGAACTTCTGAACATGATTATTGATAAAACATTTGTTGATGCAGATTCCGATAG
AGATGGCAAAATAAGCAAGGAGGAATGGAGAGTGTATGTGCTTAAGCATCCCAGCTTGTT
GAAGAATATGACTCTTCCTTACCTAAAGGATGTGACGACGGCATTCCCAAGTTTTATATT
CAACACTGAGGTTGAAGACTGAGGCAACAACACCTACAATCTTTTTCTGCGTATGAAACC
AGTTTCTTTGTTGTATTTTTTCCCCAAATTAGTTGGTGATCATTGTTAGCTGTAAGTAAA
AATGTATCTTTTGATGCATACATTTTGAGACTGTCCCATTGAAAGTGATAAATCATTTTT
TCTACTTTATCTTGTGTTTTATGGCCATATGGACAAGTGGTTCAGACATTTATTGTGTGG
AAAGATTGGAAGGGATAAACAAGAGTAAATGGAATTGAGGAATGACAATGATTGAAGATA
AGATTGAATTT

QA 1 791 1 791
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5471Contig1 1331 2 2 U
GGATCGGGGAGCAAAGACAGAGAGAGAGAGGATGAGTGTAGTAGTAACAATAACATCAAC
CATCAATTCCTCTCCATCATCATGGATGAACAGCGGAGACAATAATTCTACTTCACTGAG
GGAAACCTCTGCCTATTTCTCAAGGAGGAGCTCGAATATATCTCTTCTGAGGAAGAAGAC
GAAGAAGAAGGTGTGTTGCGGCGGTAAGAGCACAGATGATGACTACCACGCAACCCTCAA
ATCTCTCAATTCTCGAGGACGCTTTCCCAGAAAATCCCTTGGACAGCATTATATGCTGAA
TTCGGACATCAACGATCAGTTAGCGGCTGCGGCAAATGTGAAAGAAGGAGACTTTGTGTT
GGAGATTGGACCTGGGACTGGCTCTTTAACCAATGTTCTTCTCAACTTAGGTGCTTCAGT
TCTTGCCATCGACAAGGATCCTCATATGGTGGATTTGGTGCGAGAAAGATTCCAAGGTTC
CAACAAGTTCAAGGTTTTGCATGAGGATTTTGTCAAGTCTCACATCCGTTCTCACATGCT
CTCCTTTTTAGAGACTAGAAACTTATCTCATCCAGATTTTGCTCTTGCAAAGGTTGTGTC
CAACTTACCTTTTAATATAAGTACTGATGTTGTCAAGCTTCTTCTTCCTATGGGTGACAT
CTTCTCTCACGTTGTTCTCTTACTCCAGGATGAGGCAGCTCTGCGATTGGTTGAGCCAGC
ATTGCGAACATCTGAATACCGACCCATCAACATTTTGGTCAACTTCTATTCTGAACCGGA
ATACAATTTCAGAGTTGCTAGGGAAAACTTCTTCCCTCAGCCCAAGGTTGACGCAGCTGT
TGTAACATTCAAACTGAAGCATCCGAGGGACTATCCCGATGTTTCCTCCACCAAAAGTTT
CTTCTCTTTGGTGAATTCTGCATTCAATGGGAAGAGAAAAATGTTAAGAAAGTCACTCCA
GCACCTATCGTCATCTCCTGAGATCGAAAAAGCTCTTGGAGTAGCAGGTCTTCCAGTCAC
TTCGAGGCCAGAAGAGCTTACCTTGGGTGACTTTGTCAAGTTGCATAATGTAATAGGCAG
AGAATAGACGGTGGTTCATACTTATCGAAGTTTTCAGGAAGCCACCAGAGAACAAAGCAG
CATGAGGAGGGGGGAGGAGAAGGAGAAGGCCATTCAGATGCAGATGAATATGTCCATATA
CGCAGGAAGTAAGTAGAACGCAGATCCAGTCGCATGTTCTTGTGTAACCCTCTCTCTGTA
TTTTAGTCAAACTTACCTGTATGGTGTAAAATTATTATGGTGTAAAATTTTAATATCACA
ATTATTTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF03TF U 1
AF RR2AF03JQ C 445
BS 1 817 RR2AF03TF
BS 818 1331 RR2AF03JQ

RD RR2AF03TF 817 0 0
GGATCGGGGAGCAAAGACAGAGAGAGAGAGGATGAGTGTAGTAGTAACAATAACATCAAC
CATCAATTCCTCTCCATCATCATGGATGAACAGCGGAGACAATAATTCTACTTCACTGAG
GGAAACCTCTGCCTATTTCTCAAGGAGGAGCTCGAATATATCTCTTCTGAGGAAGAAGAC
GAAGAAGAAGGTGTGTTGCGGCGGTAAGAGCACAGATGATGACTACCACGCAACCCTCAA
ATCTCTCAATTCTCGAGGACGCTTTCCCAGAAAATCCCTTGGACAGCATTATATGCTGAA
TTCGGACATCAACGATCAGTTAGCGGCTGCGGCAAATGTGAAAGAAGGAGACTTTGTGTT
GGAGATTGGACCTGGGACTGGCTCTTTAACCAATGTTCTTCTCAACTTAGGTGCTTCAGT
TCTTGCCATCGACAAGGATCCTCATATGGTGGATTTGGTGCGAGAAAGATTCCAAGGTTC
CAACAAGTTCAAGGTTTTGCATGAGGATTTTGTCAAGTCTCACATCCGTTCTCACATGCT
CTCCTTTTTAGAGACTAGAAACTTATCTCATCCAGATTTTGCTCTTGCAAAGGTTGTGTC
CAACTTACCTTTTAATATAAGTACTGATGTTGTCAAGCTTCTTCTTCCTATGGGTGACAT
CTTCTCTCACGTTGTTCTCTTACTCCAGGATGAGGCAGCTCTGCGATTGGTTGAGCCAGC
ATTGCGAACATCTGAATACCGACCCATCAACATTTTGGTCAACTTCTATTCTGAACCGGA
ATACAATTTCAGAGTTGCTAGGGAAAACTTCTTCCCT

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2AF03JQ 887 0 0
TATGGTGGATTTGGTGCGAGAAAGATTCCAAGGTTCCAACAAGTTCAAGGTTTTGCATGA
GGATTTTGTCAAGTCTCACATCCGTTCTCACATGCTCTCCTTTTTAGAGACTAGAAACTT
ATCTCATCCAGATTTTGCTCTTGCAAAGGTTGTGTCCAACTTACCTTTTAATATAAGTAC
TGATGTTGTCAAGCTTCTTCTTCCTATGGGTGACATCTTCTCTCACGTTGTTCTCTTACT
CCAGGATGAGGCAGCTCTGCGATTGGTTGAGCCAGCATTGCGAACATCTGAATACCGACC
CATCAACATTTTGGTCAACTTCTATTCTGAACCGGAATACAATTTCAGAGTTGCTAGGGA
AAACTTCTTCCCTCAGCCCAAGGTTGACGCAGCTGTTGTAACATTCAAACTGAAGCATCC
GAGGGACTATCCCGATGTTTCCTCCACCAAAAGTTTCTTCTCTTTGGTGAATTCTGCATT
CAATGGGAAGAGAAAAATGTTAAGAAAGTCACTCCAGCACCTATCGTCATCTCCTGAGAT
CGAAAAAGCTCTTGGAGTAGCAGGTCTTCCAGTCACTTCGAGGCCAGAAGAGCTTACCTT
GGGTGACTTTGTCAAGTTGCATAATGTAATAGGCAGAGAATAGACGGTGGTTCATACTTA
TCGAAGTTTTCAGGAAGCCACCAGAGAACAAAGCAGCATGAGGAGGGGGGAGGAGAAGGA
GAAGGCCATTCAGATGCAGATGAATATGTCCATATACGCAGGAAGTAAGTAGAACGCAGA
TCCAGTCGCATGTTCTTGTGTAACCCTCTCTCTGTATTTTAGTCAAACTTACCTGTATGG
TGTAAAATTATTATGGTGTAAAATTTTAATATCACAATTATTTCACT

QA 1 887 1 887
DS 



AS 1 2

CO CL5472Contig1 844 2 12 U
GCCTCAGTCTCATCTTCATCATTGTTGCAATCGTGCTAGCAGTTAAAGATGGAGTGAAAA
CACATTCAAGAGACTACGAGATACAAGGATCACCGTTAAGTAAACTTTTCACCATCACAG
CTGCAGCAGCAAATCTTACTTTTGTATTCAACACAGGGATGCTTCCAGAAATTCAGGCCA
CGGTGAGAAAACCGGTGGTGAAAAACATGATGAAGGCTCTATACTTTCAGTTCACGATCG
GTGTTTTACCAATGTTGGCGGTTACATTCATCGGATATTGGGCTTACGGTTCCTCAACCT
CGACCTATCTGCTAAACAGTTTTACTGGTCCTCTTTGGGTCAAAGCCCTTGCTAACATCT
CTGCTTTCCTTCAATCAGTTATCTGTTTACACATATTTGCGAGTCCAACATATGAGTATA
TGGACACAAAGTTTGGGGTGACAGGCAGCACATTGGCGTTAAAGAACTTGACGTTTAGGA
TCATGGCAAGAGGAGGGTACCTCGCGGTTAGCACGCTTCTCTCAGCGCTTTTGCCGTTTC
TTGGGGACTTCATGAGCTTCACTGGTGCAGTGAGCACAATCCCTCTCACGTTCATTCTAG
CCAACCACATGTACTACAAAGCCAAGGACAATAAGCTGAATCCTATGCAAAAGCTGTGGC
ATTGGCTTAACGTTGTCTTCTTCAGTTTGATGGCTGTTGCTGCCGCGGTTGCAGCTCTCA
GGCTCATCTCCGTTGACTCCAAGAACTTTCACGTTTTTGCAGATTTGTAATTCATTCTAT
ATTGGCCATAAGCTTGTGTTCCTTGTTCTTATCAAACCATCTCTATAATATTATTTGAGA
AGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2G077TF U 1
AF RR2G077JQ C 365
BS 1 626 RR2G077TF
BS 627 627 RR2G077JQ
BS 628 651 RR2G077TF
BS 652 652 RR2G077JQ
BS 653 721 RR2G077TF
BS 722 722 RR2G077JQ
BS 723 741 RR2G077TF
BS 742 742 RR2G077JQ
BS 743 757 RR2G077TF
BS 758 758 RR2G077JQ
BS 759 767 RR2G077TF
BS 768 844 RR2G077JQ

RD RR2G077TF 767 0 0
GCCTCAGTCTCATCTTCATCATTGTTGCAATCGTGCTAGCAGTTAAAGATGGAGTGAAAA
CACATTCAAGAGACTACGAGATACAAGGATCACCGTTAAGTAAACTTTTCACCATCACAG
CTGCAGCAGCAAATCTTACTTTTGTATTCAACACAGGGATGCTTCCAGAAATTCAGGCCA
CGGTGAGAAAACCGGTGGTGAAAAACATGATGAAGGCTCTATACTTTCAGTTCACGATCG
GTGTTTTACCAATGTTGGCGGTTACATTCATCGGATATTGGGCTTACGGTTCCTCAACCT
CGACCTATCTGCTAAACAGTTTTACTGGTCCTCTTTGGGTCAAAGCCCTTGCTAACATCT
CTGCTTTCCTTCAATCAGTTATCTGTTTACACATATTTGCGAGTCCAACATATGAGTATA
TGGACACAAAGTTTGGGGTGACAGGCAGCACATTGGCGTTAAAGAACTTGACGTTTAGGA
TCATGGCAAGAGGAGGGTACCTCGCGGTTAGCACGCTTCTCTCAGCGCTTTTGCCGTTTC
TTGGGGACTTCATGAGCTTCACTGGTGCAGTGAGCACAATCCCTCTCACGTTCATTCTAG
CCAACCACATGTACTACAAAGCCAAG*ACAATAAGCTGAATCCTATGCAAA*GCTGTGGC
ATTGGCTTAACGTTGTCTTCTTCAGTTTGATGGCTGTTGCTGCCGCGGTTGCAGCTCTCA
G*CTCATCTCCGTTGACTCCA*GAACTTTCACGTTTT*GCAGATTTG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2G077JQ 480 0 0
TTTCCTTCAATCAGTTATCTGTTTACACATATTTGCGAGTCCAACATATGAGTATATGGA
CACAAAGTTTGGGGTGACAGGCAGCACATTGGCGTTAAAGAACTTGACGTTTAGGATCAT
GGCAAGAGGAGGGTACCTCGCGGTTAGCACGCTTCTTTCAGCGCTTTTGCCGTTTCTTGG
GGACTTCATGAGCTTCACTGGTGCAGTGAGCACAATCCCTCTCACGTTCATTCTAGCCAA
CCACATGTACTACAAAGCCAAGGACAATAAGCTGAATCCTATGCAAAAGCTGTGGCATTG
GCTTAACGTTGTCTTCTTCAGTTTGATGGCTGTTGCTGCCGCGGTTGCAGCTTTCAGGCT
CATCTCCGTTGACTCCAAGAACTTTCACGTTTTTGCAGATTTGTAATTCATTCTATATTG
GCCATAAGCTTGTGTTCCTTGTTCTTATCAAACCATCTCTATAATATTATTTGAGAAGCC

QA 1 480 1 480
DS 



AS 1 2

CO CL5473Contig1 625 2 6 U
GGGGGGGGTTGAAACTTCATTCTCCTCTTCCACCAAAGAGAACATCTCCCTCGCTGCTAA
TCTCCCAAGAAAAAAAAAGGATGGTGAAGATCTGTTGTATCGGAGCTGGATATGTTGGTG
GTCCAACGATGGCAGTGATTGCACTCAAATGTCCACACGTTGAAGTAGCGGTCGTTGACA
TCCCTGTTCCACGTATCAACGCATGGAACAGTGATCAGCTTCCCATCTACGAGCCCGGCC
TTGAAGACATCGTCAAGCAGTGCAGAGGCAAGAACCTCTTCTTCAGCACCGACGTTGAGA
AGCACGTCAGAGAAGCTGACATCGTGTTCGTCTCCGTCAACACCCCCACCAAAACCACTG
GTCTTGGAGCCGGCAAAGCCGCGGATCTCACCTACTGGGAGAGTGCTGCTCGTATGATTG
CTGATGTGTCGGTTTCCGACAAGATTGTTGTTGAGAAATCGACTGTGCCCGTGAAAACAG
CTGAAGCCATCGAGAAGATCTTGATGCATAACAGCAAAGGGATCAAGTTTCAGATCCTTT
CGAACCCTGAGTTTCTCGCGGAAGGAACTGCGATCGCTGATCTTTTCAACCCCGACCGTG
TTCTCATCGGAGGGCGGGAGACACC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F210TF U 1
AF RR2BZ36TF U 6
BS 1 182 RR2F210TF
BS 183 183 RR2BZ36TF
BS 184 370 RR2F210TF
BS 371 371 RR2BZ36TF
BS 372 457 RR2F210TF
BS 458 625 RR2BZ36TF

RD RR2F210TF 457 0 0
GGGGGGGGTTGAAACTTCATTCTCCTCTTCCACCAAAGAGAACATCTCCCTCGCTGCTAA
TCTCCCAAGAAAAAAAAAGGATGGTGAAGATCTGTTGTATCGGAGCTGGATATGTTGGTG
GTCCAACGATGGCAGTGATTGCACTCAAATGTCCACACGTTGAAGTAGCGGTCGTTGACA
TCTCTGTTCCACGTATCAACGCATGGAACAGTGATCAGCTTCCCATCTACGAGCCCGGCC
TTGAAGACATCGTCAAGCAGTGCAGAGGCAAGAACCTCTTCTTCAGCACCGACGTTGAGA
AGCACGTCAGAGAAGCTGACATCGTGTTCGTCTCCGTCAACACCCCCACCAAAACCACTG
GTCTTGGAGCTGGCAAAGCCGCGGATCTCACCTACTGGGAGAGTGCTGCTCGTATGATTG
CTGATGTGTCGGTTTCCGACAAGATTGTTGTTGAGAA

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR2BZ36TF 620 0 0
GGGTTGAAACTTCATTCTCCTCTTCCACCAAAGAGAACATCTCCCTCGCTGCTAATCTCC
CAAGAAAAAAAA*GGATGGTGAAGATCTGTTGTATCGGAGCTGGATATGTTGGTGGTCCA
ACGATGGCAGTGATTGCACTCAAATGTCCACACGTTGAAGTAGCGGTCGTTGACATCCCT
GTTCCACGTATCAACGCATGGAACAGTGATCAGCTTCCCATCTACGAGCCCGGCCTTGAA
GACATCGTCAAGCAGTGCGGAGGCAAGAACCTCTTCTTCAGCACCGACGTTGAGAAGCAC
GTCAGAGAAGCTGACATCGTGTTCGTCTCCGTCAACACCCCCACCAAAACCACTGGTCTT
GGAGCCGGCAAAGCCGCGGATCTCACCTACTGGGAGAGTGCTGCTCGTATGATTGCTGAT
GTGTCGGTTTCCGACAAGATTGTTGTTGAGAAATCGACTGTGCCCGTGAAAACAGCTGAA
GCCATCGAGAAGATCTTGATGCATAACAGCAAAGGGATCAAGTTTCAGATCCTTTCGAAC
CCTGAGTTTCTCGCGGAAGGAACTGCGATCGCTGATCTTTTCAACCCCGACCGTGTTCTC
ATCGGAGGGCGGGAGACACC

QA 1 620 1 620
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5476Contig1 876 2 8 U
GGGAGCAGCTCCATCTCCAGCTCAACTTCAGCTTCGTCGAGAGCTACTACCCTGATCTCC
TCCACTCTCGCCGTCAAAACTTTCCACACCGCCGCGTCAGGGTTACGGACCCAATCGTCT
TCGTCGTCTATTCTATCTTCTTCCCGAGTGATAACCACCACTGTCTCATCATCCATGGCG
GCTTCTGGAGCTGTTTTCAGTCTGTCCGATTCTAGCCTTCTCAAAATCCTTAAAGGCGAC
ATCACCAAATGGTCAGTCGATGCATCCTCCGATGCTATTGTGAATCCAGCAAATGAGAGA
ATGCTAGGTGGTGGGGGTGCAGATGGAGCAATACATAGAGCTGCTGGGCCACAGCTGAGA
GCAGCGTGCTATGAGGTCCCTGAAGCTCGTCCTGGTGTTCGTTGTCCGTTAGGTGAAGCA
AGAATCACTCCGGGTTTTAACTTGCCTGCGTCCCGTGTGATTCACACTGTTGGACCTATC
TATGACTCAGCTGTCAATCCTAAAGAATCCCTCACCAATTCTTACAGAAATAGTCTGAGA
GTGGCTAAGGAAAACAACATCAAGCACATTGCATTTCCTGCCATATCTTGTGGGATTTAC
GGATATCCTTTTGATGAAGCTGCTGTGATCGGTATATCAACGATCAAAGAGTTCGCCAAT
GACTTTAAAGAGGTGCATTTTGTTTTGTTCGCTGACGATATCTATAGCGTGTGGGTAAAC
AAAGCAAAGAAGGTACTACAAAAAGCTTAAGATAAGCATGAATAAAATAGTTTGCTATGT
GTGTTGTGTGAAGAGAGACTTGTGATGCTCCACACAAAGGAAACATTTGCTATTTGTGGT
TGTGTGGTGAGAGCCTTGTGATTGTCCGTAAATGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D594TF U 1
AF RR2D594JQ C 403
BS 1 730 RR2D594TF
BS 731 732 RR2D594JQ
BS 733 743 RR2D594TF
BS 744 744 RR2D594JQ
BS 745 754 RR2D594TF
BS 755 755 RR2D594JQ
BS 756 789 RR2D594TF
BS 790 876 RR2D594JQ

RD RR2D594TF 789 0 0
GGGAGCAGCTCCATCTCCAGCTCAACTTCAGCTTCGTCGAGAGCTACTACCCTGATCTCC
TCCACTCTCGCCGTCAAAACTTTCCACACCGCCGCGTCAGGGTTACGGACCCAATCGTCT
TCGTCGTCTATTCTATCTTCTTCCCGAGTGATAACCACCACTGTCTCATCATCCATGGCG
GCTTCTGGAGCTGTTTTCAGTCTGTCCGATTCTAGCCTTCTCAAAATCCTTAAAGGCGAC
ATCACCAAATGGTCAGTCGATGCATCCTCCGATGCTATTGTGAATCCAGCAAATGAGAGA
ATGCTAGGTGGTGGGGGTGCAGATGGAGCAATACATAGAGCTGCTGGGCCACAGCTGAGA
GCAGCGTGCTATGAGGTCCCTGAAGCTCGTCCTGGTGTTCGTTGTCCGTTAGGTGAAGCA
AGAATCACTCCGGGTTTTAACTTGCCTGCGTCCCGTGTGATTCACACTGTTGGACCTATC
TATGACTCAGCTGTCAATCCTAAAGAATCCCTCACCAATTCTTACAGAAATAGTCTGAGA
GTGGCTAAGGAAAACAACATCAAGCACATTGCATTTCCTGCCATATCTTGTGGGATTTAC
GGATATCCTTTTGATGAAGCTGCTGTGATCGGTATATCAACGATCAAAGAGTTCGCCAAT
GACTTTAAAGAGGTGCATTTTGTTTTGTTCGCTGACGATATCTATAGCGTGTGGGTAAAC
AAAGCAAAGA**GTACTACAAAA*GCTTAAGATA*GCATGAATAAAATAGTTTGCTATGT
GTGTTGTGT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2D594JQ 474 0 0
TGTCCGTTAGGTGAAGCAAGAATCACTCCGGGTTTTAACTTGCCTGCGTCCCGTGTGATT
CACACTGTTGGACCTATCTATGACTCAGCTGTCAATCCTAAAGAATCCCTCACCAATTCT
TACAGAAATAGTCTGAGAGTGGCTAAGGAAAACAACATCAAGCACATTGCATTTCCTGCC
ATATCTTGTGGGATTTACGGATATCCTTTTGATGAAGCTGCTGTGATCGGTATATCAACG
ATCAAAGAGTTCGCCAATGACTTTAAAGAGGTGCATTTTGTTTTGTTCGCTGACGATATC
TATAGCGTGTGGGTAAACAAAGCAAAGGAGGTACTACAAAAAGCTTAAGATAAGCATGAA
TAAAATAGTTTGCTATGTGTGTTGTGTGAAGAGAGACTTGTGATGCTCCACACAAAGGAA
ACATTTGCTATTTGTGGTTGTGTGGTGAGAGCCTTGTGATTGTCCGTAAATGGG

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 2

CO CL5477Contig1 888 2 2 U
GGTTCCCGGAAACAACGGTCTATGGAAAAACCTTCTGCGCTCGAAACCTCTGACGGCGCC
GTTAACTTGAAGGTAGACGATGACGAAGAAGAAACGTGTGAGCTTGTTAACAGAACAGAA
GTGTTAATTGACAGCGTCGAAGCTCACCTGTTAACGGCGGTAAAGAATAACAACGAAACT
GGATTGATTCTACTCTCTGATGTCTTCGGCTTCCAAGATTCCTCCACCCGCGACTTCGCT
TATCGCGTTGCTTGCAATGGCTACAATGTTCTTGTCCCGGATCTGTTCCGTGGAGATCCA
TGGCCGAAAAACCGACCAGAGCCTGAATACGAGGAATGGAGAAGAGGACATGACCTGAAC
CGGATCCGAAACGACATAAGGACCTTGACCGAATGGATGGTTGATGAGTTTGCAGCGGCT
GGGATATCCAAGAAGCTGGGAGTGATAGGATTCTGTTTTGGGGGTGGACGCGTAGTGGAC
ATTTTAGCCGCCGACAAGAACGGTTACTTCAGCACCGGAATTTCTTTCTATGGCACGAGA
ATAGACTCTGTGGTGGCCGGAGACGTGAACGTCCCGGTCTTGTTCATCGCCGGGGACACA
GACCCGCTTTGCCAACTGGAGGGTTTGAAGGAAATTAAAGAGAAGACTGGTGATGGGTCA
AAGGTTGTGGTGTTTGAAGGAAGAGGCCACGGCTTCGTTCACCGGCCGGAGACACCGGAA
GATGATAGAGACGCGGAGGAAGCTTTTTCTGTCATGAGGAATTGGTTACATCAACATTTG
CTGCGTGGGCACTAATGCTTTCTCTGCTTTATGTACATCCCATTAAAATGAACTTCGGAT
TCTTGTAGACCTCTATGTGTCCGGATTTAAGAAAAACTTAACTAATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H480TF U 1
AF RR2H480JQB C 287
BS 1 659 RR2H480TF
BS 660 888 RR2H480JQB

RD RR2H480TF 659 0 0
GGTTCCCGGAAACAACGGTCTATGGAAAAACCTTCTGCGCTCGAAACCTCTGACGGCGCC
GTTAACTTGAAGGTAGACGATGACGAAGAAGAAACGTGTGAGCTTGTTAACAGAACAGAA
GTGTTAATTGACAGCGTCGAAGCTCACCTGTTAACGGCGGTAAAGAATAACAACGAAACT
GGATTGATTCTACTCTCTGATGTCTTCGGCTTCCAAGATTCCTCCACCCGCGACTTCGCT
TATCGCGTTGCTTGCAATGGCTACAATGTTCTTGTCCCGGATCTGTTCCGTGGAGATCCA
TGGCCGAAAAACCGACCAGAGCCTGAATACGAGGAATGGAGAAGAGGACATGACCTGAAC
CGGATCCGAAACGACATAAGGACCTTGACCGAATGGATGGTTGATGAGTTTGCAGCGGCT
GGGATATCCAAGAAGCTGGGAGTGATAGGATTCTGTTTTGGGGGTGGACGCGTAGTGGAC
ATTTTAGCCGCCGACAAGAACGGTTACTTCAGCACCGGAATTTCTTTCTATGGCACGAGA
ATAGACTCTGTGGTGGCCGGAGACGTGAACGTCCCGGTCTTGTTCATCGCCGGGGACACA
GACCCGCTTTGCCAACTGGAGGGTTTGAAGGAAATTAAAGAGAAGACTGGTGATGGGTC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2H480JQB 602 0 0
TCCGTGGAGATCCATGGCCGAAAAACCGACCAGAGCCTGAATACGAGGAATGGAGAAGAG
GACATGACCTGAACCGGATCCGAAACGACATAAGGACCTTGACCGAATGGATGGTTGATG
AGTTTGCAGCGGCTGGGATATCCAAGAAGCTGGGAGTGATAGGATTCTGTTTTGGGGGTG
GACGCGTAGTGGACATTTTAGCCGCCGACAAGAACGGTTACTTCAGCACCGGAATTTCTT
TCTATGGCACGAGAATAGACTCTGTGGTGGCCGGAGACGTGAACGTCCCGGTCTTGTTCA
TCGCCGGGGACACAGACCCGCTTTGCCAACTGGAGGGTTTGAAGGAAATTAAGGAGAAGA
CTGGTGATGGGTCAAAGGTTGTGGTGTTTGAAGGAAGAGGCCACGGCTTCGTTCACCGGC
CGGAGACACCGGAAGATGATAGAGACGCGGAGGAAGCTTTTTCTGTCATGAGGAATTGGT
TACATCAACATTTGCTGCGTGGGCACTAATGCTTTCTCTGCTTTATGTACATCCCATTAA
AATGAACTTCGGATTCTTGTAGACCTCTATGTGTCCGGATTTAAGAAAAACTTAACTAAT
AA

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL5478Contig1 830 2 4 U
GTCCGGATGCGGTGACTGATTCTCAACGTGTAAAAACCCCAGACGTGCAGACTACTGGAA
ACCATTAGCAGAAGATATGGACCCATCAGCTGGAATAGAGGATGCGTACCATCATAAAAA
CAATAGAGTTTACTGCTGGAAAGGTCTTCGGTTTGCAGCTCGGCAAGACCTGGAAGGATT
CTCTAGGTTTACTGATCTGGGAATCGAAGGAGTTGTCCCTCTTGAACTATTGCCACCTGA
AGTCCGGTCCAAGTACCAAGCTAAACCGAACGAAAAAGCGAAGCGTGCTAAGAAGGATGA
AACCAAAGGTGGATCTCTGGAAGAAGAAACCAAAGGTGGGTCTCTGGTGTCAGCAGAGGG
AACCCTGGTTGGTGGTTCTACTAGTGAAGCTGACGGTGAAGTTGGAAGAGGCGAATCAGA
GGCGATGGAGAGTGATGCTATTGCAGACACTCCTACCCCTGAGGAACAACAAAGACTCGG
TGGTTCTGACACAGACAACGGTCAAGAAGCCGGCCAGATCGAAGACGCAGAGACAGAGGA
AGGTGGTTTGATGGAGACTGATCTTAATCATCCTCCCATGCCTATCTCTTGAGCAAAGCT
TTCTGTCTGAACCCTTTCTTTGTTGGTGATTCCTTTGGATATGAAGTTATAAATGTATTG
ATTTTTATCAAATTAATGATAAGTACGACTATTTTAAATATGTTGCACATGTATTAAATT
ATGTTGCTGTTTGCATAAAAAAATTGTTGGATGTAAAATTCGAAATGTCTTGCTGTTACT
CAAGAATCATGCTCATTCAGTTTCTCTAGTATATATCACTTTTCAACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU75TF U 1
AF RR2GU75JQB C 320
BS 1 671 RR2GU75TF
BS 672 672 RR2GU75JQB
BS 673 698 RR2GU75TF
BS 699 830 RR2GU75JQB

RD RR2GU75TF 698 0 0
GTCCGGATGCGGTGACTGATTCTCAACGTGTAAAAACCCCAGACGTGCAGACTACTGGAA
ACCATTAGCAGAAGATATGGACCCATCAGCTGGAATAGAGGATGCGTACCATCATAAAAA
CAATAGAGTTTACTGCTGGAAAGGTCTTCGGTTTGCAGCTCGGCAAGACCTGGAAGGATT
CTCTAGGTTTACTGATCTGGGAATCGAAGGAGTTGTCCCTCTTGAACTATTGCCACCTGA
AGTCCGGTCCAAGTACCAAGCTAAACCGAACGAAAAAGCGAAGCGTGCTAAGAAGGATGA
AACCAAAGGTGGATCTCTGGAAGAAGAAACCAAAGGTGGGTCTCTGGTGTCAGCAGAGGG
AACCCTGGTTGGTGGTTCTACTAGTGAAGCTGACGGTGAAGTTGGAAGAGGCGAATCAGA
GGCGATGGAGAGTGATGCTATTGCAGACACTCCTACCCCTGAGGAACAACAAAGACTCGG
TGGTTCTGACACAGACAACGGTCAAGAAGCCGGCCAGATCGAAGACGCAGAGACAGAGGA
AGGTGGTTTGATGGAGACTGATCTTAATCATCCTCCCATGCCTATCTCTTGAGCAAAGCT
TTCTGTCTGAACCCTTTCTTTGTTGGTGATTCCTTTGGATATGAAGTTATAAATGTATTG
ATTTTTATCAA*TTAATGATAAGTACGACTATTTTAAA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2GU75JQB 511 0 0
GAAGAAGAAACCAAAGGTGGGTCTCTGGTGTCAGCAGAGGGAACCCTGGTTGGTGGTTCT
ACTAGTGAAGCTGACGGTGAAGTTGGAAGAGGCGAATCAGAGGCGATGGAGAGTGATGCT
ATTGCAGACACTCCTACCCCTGAGGAACAACAAAGACTCGGTGGTTCTGACACAGACAAC
GGTCAAGAAGCCGGCCAGATCGAAGACGCAGAGACAGAGGAAGGTGGTTTGATGGAGACT
GATCTTAATCATCCTCCCATGCCTATTTCTTGAGCAAAGCTTTCTGTCTGAACCCTTTCT
TTGTTGGTGATTCCTTTGGATATGAAGTTATAAATGTATTGATTTTTATCAAATTAATGA
TAAGTACGACTATTTTAAATATGTTGCACATGTATTAAATTATGTTGCTGTTTGCATAAA
AAAATTGTTGGATGTAAAATTCGAAATGTCTTGCTGTTACTCAAGAATCATGCTCATTCA
GTTTCTCTAGTATATATCACTTTTCAACTCC

QA 1 511 1 511
DS 



AS 1 2

CO CL5479Contig1 370 2 1 U
AGGAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATCGCAGTCCTTCTTCC
TCCTCTTGGAGTCTGCCTAAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCTTGATATGCTTGGT
GTTGACTATCTTAGGCTACATCCCAGGGATAATCTATGCTATTTACGTGATCGTATTTCA
GAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAGCTTGAGACTATCT
GTCGGTCCATTCAATGTCTTTGAGACTGTTTTAATTATGTAACCACTAAATAAGTTGCTA
TGCAATTTCATCAGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTCCCAATTTCAAAGAATGAC
TTTTGAGACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FY17JQ C 1
AF RR2FY17TF U 1
BS 1 370 RR2FY17TF

RD RR2FY17JQ 370 0 0
AGGAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATCGCAGTCCTTCTTCC
TCCTCTTGGAGTCTGCCTAAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCTTGATATGCTTGGT
GTTGACTATCTTAGGCTACATCCCAGGGATAATCTATGCTATTTACGTGATCGTATTTCA
GAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAGCTTGAGACTATCT
GTCGGTCCATTCAATGTCTTTGAGACTGTTTTAATTATGTAACCACTAAATAAGTTGCTA
TGCAATTTCATCAGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTCCCAATTTCAAAGAATGAC
TTTTGAGACT

QA 1 370 1 370
DS 

RD RR2FY17TF 370 0 0
AGGAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATCGCAGTCCTTCTTCC
TCCTCTTGGAGTCTGCCTAAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCTTGATATGCTTGGT
GTTGACTATCTTAGGCTACATCCCAGGGATAATCTATGCTATTTACGTGATCGTATTTCA
GAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAGCTTGAGACTATCT
GTCGGTCCATTCAATGTCTTTGAGACTGTTTTAATTATGTAACCACTAAATAAGTTGCTA
TGCAATTTCATCAGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTCCCAATTTCAAAGAATGAC
TTTTGAGACT

QA 1 370 1 370
DS 



AS 1 2

CO CL5480Contig1 517 2 3 U
AGGATTGACTCTCATACCACGAATCACAATGTATGAGCATTTAGTCAGGAAAAGAGTAGT
GTCACGGCGAACCCTAACTTCCATTCGACCACCATTTGCTTAAATACATAATATTTTAAG
TTCAAAAACCATATTTGTACAAACATGATCACACAAACGCATTCCCCCTCCCAAATCCTC
CTTTCTTGACGTCTCACTTGGGTGTGAAAGCAGCGAAAATAGTAGCATGGCCAGGATAAG
CAAGATGTGCAAAAAGGTTATCAATAGGACCAGTCCCAGTGTAAATATGTTGGAACCAAG
GGAACCAGATTGGTCTCTCGGGATCCGCTGCAACGGCCCTCACAGACGCAGCTGATTTGG
AAACAGCTGGAACACTCAACTTCTTGTTCAGCCTTAGTTTCTTGCCTCCCAAGAAGCTAG
GAGAAGATATGGCGGCAATGGCAGAAGAAGCACAAAGAGAAGCCATTATTCTCGACGTTG
ATGATGATGACCTTTCTTCAAGACTCAAAAGTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN02JQ U 46
AF RR2GN02TF C 1
BS 1 45 RR2GN02TF
BS 46 421 RR2GN02JQ
BS 422 517 RR2GN02TF

RD RR2GN02JQ 376 0 0
CAGGAAAAGAGTAGTGTCACGGCGAACCCTAACTTCCATTCGACCACCATTTGCTTAAAT
ACATAATATTTTAAGTTCAAAAACCATATTTGTACAAACATGATCACACAAACGCATTCC
CCCTCCCAAATCCTCCTTTCTTGACGTCTCACTTGGGTGTGAAAGCAGCGAAAATAGTAG
CATGGCCAGGATAAGCAAGATGTGCAAAAAGGTTATCAATAGGACCAGTCCCAGTGTAAA
TATGTTGGAACCAAGGGAACCAGATTGGTCTCTCGGGATCCGCTGCAACGGCCCTCACAG
ACGCAGCTGATTTGGAAACAGCTGGAACACTCAACTTCTTGTTCAGCCTTAGTTTCTTGC
CTCCCAAGAAGCTAGG

QA 1 376 1 376
DS 

RD RR2GN02TF 517 0 0
AGGATTGACTCTCATACCACGAATCACAATGTATGAGCATTTAGTCAGGAAAAGAGTAGT
GTCACGGCGAACCCTAACTTCCATTCGACCACCATTTGCTTAAATACATAATATTTTAAG
TTCAAAAACCATATTTGTACAAACATGATCACACAAACGCATTCCCCCTCCCAAATCCTC
CTTTCTTGACGTCTCACTTGGGTGTGAAAGCAGCGAAGATAGTAGCATGGCCAGGATAAG
CAAGATGTGCAAAAAGGTTATCAATAGGACCAGTCCCAGTGTAGATATGTTGGAACCAAG
GGAACCAGATTGGTCTCTCGGGATCCGCTGCAACGGCCCTCACAGACGCAGCTGATTTGG
AAACAGCTGGAACACTCAACTTCTTGTTCAGCCTTAGTTTCTTGCCTCCCAAGAAGCTAG
GAGAAGATATGGCGGCAATGGCAGAAGAAGCACAAAGAGAAGCCATTATTCTCGACGTTG
ATGATGATGACCTTTCTTCAAGACTCAAAAGTGTTCC

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 2

CO CL5481Contig1 583 2 3 U
GTGACCAAGAAACCACTGGTTTCGCTTGGTGGGCCGGGAATGCCCGACTTATCAATTTAT
CTGGTAAACTATTGGGAGCTCATGTAGCCCATGCCGGATTAATCGTATTCTGGGCCGGAG
CAATGAACTTATTTGAAGTGGCTCATTTTGTACCTGAAAAGCCCATGTATGAACAAGGAT
TGATTTTACTTCCCCACCTAGCCACTTTAGGCTGGGGGGTAGGTCCTGGGGGAGAAGTTA
TAGACACCTTTCCATACTTTGTATCTGGAGTACTTCACTTAATTTCTTCTGCAGTTCTGG
GCTTTGGCGGTATTTATCATGCACTTCTGGGACCCGAAACTCTTGAAGAATCTTTTCCAT
TTTTCGGTTATGTATGGAAAGATAGAAATAAAATGACCACCATTTTGGGTATTCACTTAA
TTTTGTTAGGTGTAGGTGCTTTTCTTCTAGTATTCAAGGCTCTCTATTTTGGGGGCGTAT
ATGATACCTGGGCTCCAGGAGGGGGGGATGTAAGAAAAATTACAAACTTGACTCTTAGCC
CAAGTGTTATATTTGGTTATTTACTAAAATCTCCCTTTGGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ28TF U 46
AF RR2DX06TF U 1
BS 1 296 RR2DX06TF
BS 297 297 RR2GJ28TF
BS 298 583 RR2DX06TF

RD RR2GJ28TF 386 0 0
GC
CTTATCAATTTATCTGGTAAACTATTGGGAGCTCATGTAGCCCATGCCGGATTAATCGTA
TTCTGGGCCGGAGCAATGAACTTATTTGAAGTGGCTCATTTTGTACCTGAAAAGCCCATG
TATGAACAAGGATTGATTTTACTTCCCCACCTAGCCACTTTAGGCTGGGGGGTAGGTCCT
GGGGGATAAGTTATAGACACCTTTCCATACTTTGTATCTGGAGTACTTCACTTAATTTCT
TCTGCAGTTCTGGGCTTTGGCGGTATTTATCATGCACTTCTGGGACCCGAAACTCTTGAA
GAATCTTTTCCATTTTTCGGTTATGTATGGAAAGATAGAAATAAAATGACCACCATTTTG
GGTAT*CACTTAATTTTGT
AGGTG

QA 3 381 3 381
DS 

RD RR2DX06TF 583 0 0
GTGACCAAGAAACCACTGGTTTCGCTTGGTGGGCCGGGAATGCCCGACTTATCAATTTAT
CTGGTAAACTATTGGGAGCTCATGTAGCCCATGCCGGATTAATCGTATTCTGGGCCGGAG
CAATGAACTTATTTGAAGTGGCTCATTTTGTACCTGAAAAGCCCATGTATGAACAAGGAT
TGATTTTACTTCCCCACCTAGCCACTTTAGGCTGGGGGGTAGGTCCTGGGGGAGAAGTTA
TAGACACCTTTCCATACTTTGTATCTGGAGTACTTCACTTAATTTCTTCTGCAGTTTTGG
GCTTTGGCGGTATTTATCATGCACTTCTGGGACCCGAAACTCTTGAAGAATCTTTTCCAT
TTTTCGGTTATGTATGGAAAGATAGAAATAAAATGACCACCATTTTGGGTATTCACTTAA
TTTTGTTAGGTGTAGGTGCTTTTCTTCTAGTATTCAAGGCTCTCTATTTTGGGGGCGTAT
ATGATACCTGGGCTCCAGGAGGGGGGGATGTAAGAAAAATTACAAACTTGACTCTTAGCC
CAAGTGTTATATTTGGTTATTTACTAAAATCTCCCTTTGGGGG

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL5482Contig1 1178 2 2 U
GGAAGTTCGGGCTGCGATCTGGTGTTAGAAGCACTTGCATCTATGGTGGTGCTCCTAAAG
GACGTCAGATTCACGATCTCAGAAGAGGTGTTGAGATTGTGATTGCTACACCCGGTCGTT
GATCGATATGTTGGAGTGCCAACACACTGATTTGAAGAGGGTGACTTACCTTGTCTTGGA
TGAGGCTGACAGAATGTTAGACATGGGATTTGAACCCCAAATTAGAAAAATTGTATCTCA
GATCCGACCTGATAGACAAACACTGCTTTGGAGTGCAACATGGCCACGAGAAGTTGAAAC
TCTCGCCAGGCAGTTTCTACGAGATCCATATAAGGCCATTATTGGATCAGCAGATCTTAA
AGCTAACCAGTCTATTAACCAAGTAATCGAGATTGTACAGACGCCAGAGAAATACACCAG
GCTCCTTACACTGCTTAAGCAGTTGATGGATGGAAGCAAAATCTTAATATTTGTGGAGAC
AAAGAGAGGTTGTGATCAAGTGACTAGACAATTGAGAATGGACGGATGGCCAGCTCTTGC
CATACACGGTGACAAAAACCAAACGGAAAGAGATCGTGTCTTGTCAGAATTTAAGAGCGG
TAGAAGCCCGATAATGACTGCCACTGATGTAGCAGCAAGGGGACTTGATGTGAAGGACAT
AAAGTGTGTGGTTAACTATGATTTCCCAACTTCATTGGAGGACTACATCCACAGGATTGG
TCGAACCGGGCGTGCAGGAGCTAAAGGAATGGCCATGACATTCTTTACACATGACAATGC
TAAGTTTGCAAGAGAGCTTATCAAGATCCTTCAAGAAGCTGGTCAAGTTGTACCTCCCAG
ACTCTCCGCACTAGTCCGATCTTCTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGACGTAGTTTCCGGTC
AAGAGGAGGAGGACGTGGTGGTTTTGGTGATAAACGGCCAAGATCGACCTCCAACTTTGT
ACCTCATGGTGGAAAAAGGACTTGGTAGAGAGAGAGCTTGGTTTCTCTGGTCATGTTGAA
GCTCTCTGTTGTAGAGAAACGAATGTTTTATTTGATTAGTTGATTTATTTAATAAATCAA
ACTTGATTGATACTTCATAGCTAGTTGGAAACTTAAATTATTACTCCATCCCTTTTTATT
ATATAAAATATTTTAATGTTTAGAATTTTATTTGACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS09TF U 1
AF RR2AS09JQ C 438
BS 1 806 RR2AS09TF
BS 807 1178 RR2AS09JQ

RD RR2AS09TF 806 0 0
GGAAGTTCGGGCTGCGATCTGGTGTTAGAAGCACTTGCATCTATGGTGGTGCTCCTAAAG
GACGTCAGATTCACGATCTCAGAAGAGGTGTTGAGATTGTGATTGCTACACCCGGTCGTT
GATCGATATGTTGGAGTGCCAACACACTGATTTGAAGAGGGTGACTTACCTTGTCTTGGA
TGAGGCTGACAGAATGTTAGACATGGGATTTGAACCCCAAATTAGAAAAATTGTATCTCA
GATCCGACCTGATAGACAAACACTGCTTTGGAGTGCAACATGGCCACGAGAAGTTGAAAC
TCTCGCCAGGCAGTTTCTACGAGATCCATATAAGGCCATTATTGGATCAGCAGATCTTAA
AGCTAACCAGTCTATTAACCAAGTAATCGAGATTGTACAGACGCCAGAGAAATACACCAG
GCTCCTTACACTGCTTAAGCAGTTGATGGATGGAAGCAAAATCTTAATATTTGTGGAGAC
AAAGAGAGGTTGTGATCAAGTGACTAGACAATTGAGAATGGACGGATGGCCAGCTCTTGC
CATACACGGTGACAAAAACCAAACGGAAAGAGATCGTGTCTTGTCAGAATTTAAGAGCGG
TAGAAGCCCGATAATGACTGCCACTGATGTAGCAGCAAGGGGACTTGATGTGAAGGACAT
AAAGTGTGTGGTTAACTATGATTTCCCAACTTCATTGGAGGACTACATCCACAGGATTGG
TCGAACCGGGCGTGCAGGAGCTAAAGGAATGGCCATGACATTCTTTACACATGACAATGC
TAAGTTTGCAAGAGAGCTTATCAAGA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2AS09JQ 741 0 0
AGCAGTTGATGGATGGAAGCAAAATCTTAATATTTGTGGAGACAAAGAGAGGTTGTGATC
AAGTGACTAGACAATTGAGAATGGACGGATGGCCAGCTCTTGCCATACACGGTGACAAAA
ACCAAACGGAAAGAGATCGTGTCTTGTCAGAATTTAAGAGCGGTAGAAGCCCGATAATGA
CTGCCACTGATGTAGCAGCAAGGGGACTTGATGTGAAGGACATAAAGTGTGTGGTTAACT
ATGATTTCCCAACTTCATTGGAGGACTACATCCACAGGATTGGTCGAACCGGGCGTGCAG
GAGCTAAAGGAATGGCCATGACATTCTTTACACATGACAATGCTAAGTTTGCAAGAGAGC
TTATCAAGATCCTTCAAGAAGCTGGTCAAGTTGTACCTCCCAGACTCTCCGCACTAGTCC
GATCTTCTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGACGTAGTTTCCGGTCAAGAGGAGGAGGACGTG
GTGGTTTTGGTGATAAACGGCCAAGATCGACCTCCAACTTTGTACCTCATGGTGGAAAAA
GGACTTGGTAGAGAGAGAGCTTGGTTTCTCTGGTCATGTTGAAGCTCTCTGTTGTAGAGA
AACGAATGTTTTATTTGATTAGTTGATTTATTTAATAAATCAAACTTGATTGATACTTCA
TAGCTAGTTGGAAACTTAAATTATTACTCCATCCCTTTTTATTATATAAAATATTTTAAT
GTTTAGAATTTTATTTGACTT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL5483Contig1 754 2 9 U
GGATAACACATTAGAAAAAAGAGTCTATCTAGTCAAAATCAGAACGAAACTCCATTCACC
AACCAACACAAAAGAAATAAGCCAGAGTATGGCGATTACGGTGCCGAGACGTCAGCTCCT
CATCGGCGGTAAATGGACAGATCCCGTTCGCCGTCAAACACTCCCTGTTGTCAATCCCGC
CACCGAGGACATCATCGGTTATATTCCAGCCGCAACTTCTGAGGATGTGGAACTCGCGGT
GGTAGCTGCTAGGAAAGCACTTACTAGGAACAAAGGAAAAGATTGGTCTCGAGCATCCGG
GGCTGTTCGTGCCACATACTTACGTGCTATTGCAGCTAAGGTAACGGAGAGGAAGTCTGA
ACTAGCTAATCTCGAGGCTATTGATTGCGGTAAACCTCTAGATGAAGCAGCATGGGACAT
GGATGATGTTGCTGGATGTTTTGAGTATTATGCTGATTTAGCTGAAGGCTTAGATGCGAA
GCAGAAGGCTCCTCTTGATCTTCCGTTGGATACTTTTAAGGGCTACGTTCTCAAGGAACC
CCTTGGTGTAGTTGGGCTCATTACTCCATGGAATTATCCGCTACTGATGGCTGTCTGGAA
AGTCGCTCCTGCACTTGCTGCCGGGTGCACAGCAATACTGAAACCTTCAGAGTTGGCCTC
CGTGACATGTTTGGAGCTCGCTGATATTTGCCGCGAGGTGGGTTTGCCACCCGGCGTTCT
TATATTCTGACTGGTTTAGAACTGAAGCAGTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C535TF U 29
AF RR2D965TF U 1
BS 1 118 RR2D965TF
BS 119 119 RR2C535TF
BS 120 562 RR2D965TF
BS 563 563 RR2C535TF
BS 564 580 RR2D965TF
BS 581 581 RR2C535TF
BS 582 688 RR2D965TF
BS 689 689 RR2C535TF
BS 690 754 RR2D965TF

RD RR2C535TF 689 0 0
GG
AGTCAAAATCAGAACGAAACTCCATTCACCAACCAACACAAAAGAAATAAGCCAGAGTAT
GGCGATTACGGTGCCGAGACGTCAGCTCCTCATCGGCGGTAAATGGACAGATCCCGTTCG
CCGTCAAACACTCCCTGTTGTCAATCCCGCCACCGAGGACATCATCGGTTATATTCCAGC
CGCAACTTCTGAGGATGTGGAACTCGCGGTGGTAGCTGCTAGGGAAGCACTTACTAGGAA
CAAAGGAAAAGATTGGTCTCGAGCATCCGGGGCTGTTCGTGCCACATACTTACGTGCTAT
TGCAGCTAAGGTAACGGAGAGGAAGTCTGAACTAGCTAATCTCGAGGCTATTGATTGCGG
TAAACCTCTAGATGAAGCAGCATGGGACATGGATGATGTTGCTGGATGTTTTGAGTATTA
TGCTGATTTAGCTGAAGGCTTAGATGCGAAGCAGAAGGCTCCTCTTGATCTTCCGTTGGA
TACTTTTAAGGGCTACGTTCTCAAGGAACCCCTTGGTGTAGTTGGGCTCATTACTCCATG
GAATTATCCGCTACTGATGGCTGTCTGGAAAGTCGCTCCTGCACTTGCTGCCGGGTGCAC
AGCAATACTGAAACCTTCAGAGTTGGCCTCCGTGACATGTTTGGAGCTCGCTGATATTTG
CCGCGAGGTGGGTTTGCCACCCGGCGT

QA 3 689 3 689
DS 

RD RR2D965TF 754 0 0
GGATAACACATTAGAAAAAAGAGTCTATCTAGTCAAAATCAGAACGAAACTCCATTCACC
AACCAACACAAAAGAAATAAGCCAGAGTATGGCGATTACGGTGCCGAGACGTCAGCTCTT
CATCGGCGGTAAATGGACAGATCCCGTTCGCCGTCAAACACTCCCTGTTGTCAATCCCGC
CACCGAGGACATCATCGGTTATATTCCAGCCGCAACTTCTGAGGATGTGGAACTCGCGGT
GGTAGCTGCTAGGAAAGCACTTACTAGGAACAAAGGAAAAGATTGGTCTCGAGCATCCGG
GGCTGTTCGTGCCACATACTTACGTGCTATTGCAGCTAAGGTAACGGAGAGGAAGTCTGA
ACTAGCTAATCTCGAGGCTATTGATTGCGGTAAACCTCTAGATGAAGCAGCATGGGACAT
GGATGATGTTGCTGGATGTTTTGAGTATTATGCTGATTTAGCTGAAGGCTTAGATGCGAA
GCAGAAGGCTCCTCTTGATCTTCCGTTGGATACTTTTAAGGGCTACGTTCTCAAGGAACC
CCTTGGTGTAGTTGGGCTCATTGCTCCATGGAATTATCCGTTACTGATGGCTGTCTGGAA
AGTCGCTCCTGCACTTGCTGCCGGGTGCACAGCAATACTGAAACCTTCAGAGTTGGCCTC
CGTGACATGTTTGGAGCTCGCTGATATT*GCCGCGAGGTGGGTTTGCCACCCGGCGTTCT
TATATTCTGACTGGTTTAGAACTGAAGCAGTGCT

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL5484Contig1 1163 2 2 U
CCCGTCCCATATTGATCGAGTTGATTTTTGATGTAAACGTTGTGCTAAGTGCAGATGGAG
ACTACTACGAAGCGCCTCAATTTCTCCGATACTTGTCTGCAGAAGTCTCCCTCAGAAGAA
GTTTCGAGGAAGAAGAAGAATAAGAAGAAATCGGCTTCTCCTTTGATCAAACGGATATGG
AACGAGGACGATGAGCTCTCTATCTTAAAGGGATTAGTGGATTACAGAGTGAATACAAGG
CACGATCCGAGTTTCGATTGGGATGGTTTCTTCCGTTTCGTGCAAGCTTCCATCCATGTG
AAATTCTCCAAGGAGCAGCTTTTTAGTAAGGTCAGGAAGTTGAGAAGGAAGTTCGCTCTT
CACATGGAGAGAATCGATCGAGGGGAAGATCCGCTCTTCACTAGGCTTACTGACTCTCAA
GCCTTTGGATACTCCAACATGATCTGGGGCGTTTACCAACCTGAAGTTGTTGCTGCTAAC
GGAGGAGGCACTACTGAGAAAGCTCAACAAGAAGAGGCTCAAGGAGGAGGCATTGAGAAA
TCACCAGGAGAGACTGAGAATGGCTTTAGGGAGACTGGGCGAGTGACTAATGATGAACCT
GTAAAGGATGATGGGCGAGTGGGTACTAATGAACCTGTAAATGAAAACGGGGCGGAGAAA
GGTGCGTTTGTGTTTGATGGCAAATCGCTTCATGAAGTGGGTGTTGACAAAACAACCGAC
GGAAAGGAGAGTCATGATGATGATGCTGATGAGTTACGCGTTGTGGAAGATGCGTTTGAG
ACCACGATTTTGCAAGGTTTAAGTGTTTGGCAGAGGAAGTTACAGCTTAAGAAGCTGATG
ATGAACCTTGGAACGGAGAAAAGAAGAGAGTTGAGCAATGAGTGGAAAGCATTATGTTCC
GAGGAAACAAAATTGAAAATCAAGAAGCTTAGGTTTACTGCGAAGCTGGTAGAGGCAGCC
TATGACGGATGAAACTAGGCCATTGCATCACTTTTGCTGTAATGGTGTTGTTTAGTTAGA
AAGTTGGTAGTACGATTTACTATAAGTTTTAGTCAGTTTGCATGTGTTTCTTCTCTCCAG
ATTATTACAATATTGTTTTACTAAATACTCTTAACTGGAAATTGTTATTTTCTTGAAAGC
TGCAGTATTATATTTCTTCTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH25TF U 1
AF RR2BH25JQ C 325
BS 1 694 RR2BH25TF
BS 695 1163 RR2BH25JQ

RD RR2BH25TF 694 0 0
CCCGTCCCATATTGATCGAGTTGATTTTTGATGTAAACGTTGTGCTAAGTGCAGATGGAG
ACTACTACGAAGCGCCTCAATTTCTCCGATACTTGTCTGCAGAAGTCTCCCTCAGAAGAA
GTTTCGAGGAAGAAGAAGAATAAGAAGAAATCGGCTTCTCCTTTGATCAAACGGATATGG
AACGAGGACGATGAGCTCTCTATCTTAAAGGGATTAGTGGATTACAGAGTGAATACAAGG
CACGATCCGAGTTTCGATTGGGATGGTTTCTTCCGTTTCGTGCAAGCTTCCATCCATGTG
AAATTCTCCAAGGAGCAGCTTTTTAGTAAGGTCAGGAAGTTGAGAAGGAAGTTCGCTCTT
CACATGGAGAGAATCGATCGAGGGGAAGATCCGCTCTTCACTAGGCTTACTGACTCTCAA
GCCTTTGGATACTCCAACATGATCTGGGGCGTTTACCAACCTGAAGTTGTTGCTGCTAAC
GGAGGAGGCACTACTGAGAAAGCTCAACAAGAAGAGGCTCAAGGAGGAGGCATTGAGAAA
TCACCAGGAGAGACTGAGAATGGCTTTAGGGAGACTGGGCGAGTGACTAATGATGAACCT
GTAAAGGATGATGGGCGAGTGGGTACTAATGAACCTGTAAATGAAAACGGGGCGGAGAAA
GGTGCGTTTGTGTTTGATGGCAAATCGCTTCATG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2BH25JQ 839 0 0
AGTAAGGTCAGGAAGTTGAGAAGGAAGTTCGCTCTTCACATGGAGAGAATCGATCGAGGG
GAAGATCCGCTCTTCACTAGGCTTACTGACTCTCAAGCCTTTGGATACTCCAACATGATC
TGGGGCGTTTACCAACCTGAAGTTGTTGCTGCTAACGGAGGAGGCACTACTGAGAAAGCT
CAACAAGAAGAGGCTCAAGGAGGAGGCATTGAGAAATCACCAGGAGAGACTGAGAATGGC
TTTAGGGAGACTGGGCGAGTGACTAATGATGAACCTGTAAAGGATGATGGGCGAGTGGGT
ACTAATGAACCTGTAAATGAAAACGGGGCGGAGAAAGGTGCGTTTGTGTTTGATGGCAAA
TCGCTTCATGAAGTGGGTGTTGACAAAACAACCGACGGAAAGGAGAGTCATGATGATGAT
GCTGATGAGTTACGCGTTGTGGAAGATGCGTTTGAGACCACGATTTTGCAAGGTTTAAGT
GTTTGGCAGAGGAAGTTACAGCTTAAGAAGCTGATGATGAACCTTGGAACGGAGAAAAGA
AGAGAGTTGAGCAATGAGTGGAAAGCATTATGTTCCGAGGAAACAAAATTGAAAATCAAG
AAGCTTAGGTTTACTGCGAAGCTGGTAGAGGCAGCCTATGACGGATGAAACTAGGCCATT
GCATCACTTTTGCTGTAATGGTGTTGTTTAGTTAGAAAGTTGGTAGTACGATTTACTATA
AGTTTTAGTCAGTTTGCATGTGTTTCTTCTCTCCAGATTATTACAATATTGTTTTACTAA
ATACTCTTAACTGGAAATTGTTATTTTCTTGAAAGCTGCAGTATTATATTTCTTCTCTT

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

CO CL5485Contig1 606 2 3 U
TTTTTTTGACAAAGATAACATGTTCGGCTAATCGATAAGCCACAAAGAGTAACAAACAAT
GGTCTTTTCTTTGAATCAATGCCTAGACACAGACGAGTACAGACACTTAGCTATAGGATA
ATAAACCCCTGAGTAATCAAAACAATCATCGTTTCTTGAATCCATACTTCTTACGTTCAT
AGAACAGATCAGTCTTGGCACTCCCGAGATTGACAATCTTGGGACAACCATCCCTATCTT
TCTCCTGCTGTGTACACTCTTTGCAGTAGTAAGCATCTGAAATTCCAACCCCTCCGCATA
TGACGCACCGTCCTTGGAAAGAACCATAGATGCATTCATCGCAAATCCTGACCAGCGTAC
AGGGGCGCACGTAGGAATCGCAGACCACGCACTTGCCATCACATTTCTCGCACAATCTCC
CAATGGCGATGCCAGGTTGTTTCCGGCACATGATCAAATCAGGGTGATGCTTGGCCATGG
CTGCAGAAGCAAGGCTCTTGGTCTTCTCCTAAGATTTCGACCTGAACCCGGAGGAGAAGA
GGAGGAGTAGGAAGGTGTTACACGCGCAAGGAAACTATGCGATCTAGGAACTCCGAGCGA
CGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF55JQ U 8
AF RR2EF55TF C 1
BS 1 7 RR2EF55TF
BS 8 381 RR2EF55JQ
BS 382 606 RR2EF55TF

RD RR2EF55JQ 374 0 0
GACAAAGATAACATGTTCGGCTAATCGATAAGCCACAAAGAGTAACAAACAATGGTCTTT
TCTTTGAATCAATGCCTAGACACAGACGAGTACAGACACTTAGCTATAGGATAATAAACC
CCTGAGTAATCAAAACAATCATCGTTTCTTGAATCCATACTTCTTACGTTCATAGAACAG
ATCAGTCTTGGCACTCCCGAGATTGACAATCTTGGGACAACCATCCCTATCTTTCTCCTG
CTGTGTACACTCTTTGCAGTAGTAAGCATCTGAAATTCCAACCCCTCCGCATATGACGCA
CCGTCCTTGGAAAGAACCATAGATGCATTCATCGCAAATCCTGACCAGCGTACAGGGGCG
CACGTAGGAATCGC

QA 1 374 1 374
DS 

RD RR2EF55TF 606 0 0
TTTTTTTGACAAAGATAACATGTTCGGCTAATCGATAAGCCACAAAGAGTAACAAACAAT
GGTCTTTTCTTTGAATCAATGCCTAGACACAGACGAGTACAGACACTTAGCTATAGGATA
ATAAACCCCTGAGTAATCAAAACAATCATCGTTTCTTGAATCCATACTTCTTACGTTCAT
AGAACAGATCAGTCTTGGCACTCCCGAGATTGACAATCTTGGGACAACCATCCCTATCTT
TCTCCTGCTGTGTACACTCTTTGCAGTAGTAAGCATCTGAGATTCCAACCCCTCCGCATA
TGACGCACCGTCCTTGGAAAGAACCATAGATGCATTCATCGCAAATCCTGACCAGCGTAC
AGGGGCGCACGTAGGAATCGCAGACCACGCACTTGCCATCACATTTCTCGCACAATCTCC
CAATGGCGATGCCAGGTTGTTTCCGGCACATGATCAAATCAGGGTGATGCTTGGCCATGG
CTGCAGAAGCAAGGCTCTTGGTCTTCTCCTAAGATTTCGACCTGAACCCGGAGGAGAAGA
GGAGGAGTAGGAAGGTGTTACACGCGCAAGGAAACTATGCGATCTAGGAACTCCGAGCGA
CGATCC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL5486Contig1 792 2 3 U
CCATCTGTTCGAACGGAAGCGCCGCCGCAGACCACACGAACCGAGACGAACGCTACTCCG
AGCCACCGCAGACGGTTGAGAAAACAAGGAATCAGCTGAGCAAGACACCCGAGCACACAA
ACGCAACCACCACCAGTAGGGTTTGACCGGTGAAAATCAACGAAGGACCATGAGTGGAGA
GGCTCTCCGGGAGGGGCTTTGTGGCGAGAGAGAAAGACGTCTTAGCCGAGCCGGTGTGGA
GACCGTCGCCGTAATCAGCCGCTGCCGGGATCATTTTCACGCACTCACCATCGTCCTCAA
ATGGCAATCTTACTCATGGATCCCAGCAGTTCAAGCTCTTTCGCCTCCCCCTCGCCGCTA
CACCACCAACCAGATCACTGCCTCCCCCCTACGCCGACAATCTCCAATCTAACAACCACC
GGCGTTCACAAGCAGAAAGAAACAACCCGCAACTCTTGAGGAAGCACACCGGCACCTGTC
CTCAACGGAACCGGATATGCATGAGCGCTAAAATCACCACCACCGCTTGGACAGAGCAAA
GACGACAAGGAAGCTCGAGATCCGCCACATCTTCTACGCCGGCAAGATCCAAGACCGCAG
ATGAAGAGCAAAGAGAGAAAGAAAAAACCTAACCTAGTCGACCCCTCACGGCACCGGCGA
ACCGAGAACCGGAGGGGCGAAAGGGGGAGACGGAGGCGAAAACACTAGATTTAGAGAGAA
GGTGGAGAGAAAAAGGAGAGAGAGAAAATGGATCTTCCCCTCTTTGATAGCTTAATTTTG
TATACAGTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE16JQ U 231
AF RR2AE16TF C 1
BS 1 230 RR2AE16TF
BS 231 601 RR2AE16JQ
BS 602 792 RR2AE16TF

RD RR2AE16JQ 371 0 0
CCGGTGTGGAGACCGTCGCCGTAATCAGCCGCTGCCGGGATCATTTTCACGCACTCACCA
TCGTCCTCAAATGGCAATCTTACTCATGGATCCCAGCAGTTCAAGCTCTTTCGCCTCCCC
CTCGCCGCTACACCACCAACCAGATCACTGCCTCCCCCCTACGCCGACAATCTCCAATCT
AACAACCACCGGCGTTCACAAGCAGAAAGAAACAACCCGCAACTCTTGAGGAAGCACACC
GGCACCTGTCCTCAACGGAACCGGATATGCATGAGCGCTAAAATCACCACCACCGCTTGG
ACAGAGCAAAGACGACAAGGAAGCTCGAGATCCGCCACATCTTCTACGCCGGCAAGATCC
AAGACCGCAGA

QA 1 371 1 371
DS 

RD RR2AE16TF 792 0 0
CCATCTGTTCGAACGGAAGCGCCGCCGCAGACCACACGAACCGAGACGAACGCTACTCCG
AGCCACCGCAGACGGTTGAGAAAACAAGGAATCAGCTGAGCAAGACACCCGAGCACACAA
ACGCAACCACCACCAGTAGGGTTTGACCGGTGAAAATCAACGAAGGACCATGAGTGGAGA
GGCTCTCCGGGAGGGGCTTTGTGGCGAGAGAGAAAGACGTCTTAGCCGAGCCGGTGTGGA
GACCGTCGCCGTAATCAGCCGCTGCCGGGATCATTTTCACGCACTCACCATCGTCCTCAA
ATGGCAATCTTACTCATGGATCCCAGCAGTTCAAGCTCTTTCGCCTCCCCCTCGCCGCTA
CACCACCAACCAGATCACTGCCTCCCCCCTACGCCGACAATCTCCAATCTAACAACCACC
GGCGTTCACAAGCAGAAAGAAACAACCCGCAACTCTTGAGGAAGCACACCGGCACCTGTC
CTCAACGGAACCGGATATGCATGAGCGCTAAAATCACCACCACCGCTTGGACAGAGCAAA
GACGACAAGGAAGCTCGAGATCCGCCACATCTTCTACGCCGGCAAGATCCAAGACCGCAG
ATGAAGAGCAAAGAGAGAAAGAAAAAACCTAACCTAGTCGACCCCTCACGGCACCGGCGA
ACCGAGAACCGGAGGGGCGAAAGGGGGAGACGGAGGCGAAAACACTAGATTTAGAGAGAA
GGTGGAGAGAAAAAGGAGAGAGAGAAAATGGATCTTCCCCTCTTTGATAGCTTAATTTTG
TATACAGTACCC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL5487Contig1 1029 2 2 U
GGACAAGAAAACACCAAAATCCTTCTAAAAATGGCTCAACACTTATCTCTTCTCTTTTGC
CTCTTTCTCTCATTCTTCTCAATACTGTTTTCCGACCAAACCGAGGCTACCACAGTCGCG
CGTCTGGTGCCAAAATCGCTTTACGACTCAATGTTCATCCACAAGGAAAATACTGCTTGT
CCAGCAAATGGTTTCTACACTTACGAATCCTTTGTGAAGGCAACGAGGCGGTTTCCAAGA
TTTGGAAGCGTCGGATCCATGGAGACACGAAGACGCGAGGTGGCAGCGTTTTTGGCTCAG
ATTTCACACGAAACAACTGGAGGGTGGCCAACGGCACCGGACGGACCGTATGCTTGGGGG
TTGTGTTTTAAAGAAGAAATAAGTCCACAAAGCAATTATTGTGATTCTTCTAATACTGAA
TGGCCTTGTTTCTCTAACAAGACTTACCATGGAAGAGGTCCAATTCAACTCTCGTGGAAC
TATAACTACGGACCGGCCGGTCGAACTTTAGGATTCGACGGTCTAAGGAATCCCGAGATA
GTGGCGAATAATTCAGTGATAGCTTTCCAAACAGCACTTTGGTTTTGGATGACGGAGCAG
AGTCCCAAACCTTCGTGCCATGACGTTATGATCGGTAGATACAGACCTACAGAGGCAGAT
TTGGCAGCTAACCGGACCGGTGGATTCGGTTTAACCACGAACATTATAAACGGCGGTTTA
GAGTGCGGGATTGCCGGAGATGGGCGGGTCAATGACCGGATCGGGTTTTATCAGAGATAT
GCTGGGCTGTTAAATGTAGGAACTGGGCCTAACTTGGACTGTGAAAACCAGAAGCCCTTC
GCTTAAATAACAATTTGGTTGACCCAAGATTTTATTTACTTTGAATAAGCAAAAAGGTTA
AACATGTATGCACATGCATTGTGCCCACAGCCCACACATGGATGGATTTGATTGAATAAT
GTCTATTTCCTTTTTTTTTATTTTCTATGGATCATCTTTCAATTTAATGTGATTTGGTTT
TGATTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC62TF U 1
AF RR2CC62JQ C 298
BS 1 668 RR2CC62TF
BS 669 1029 RR2CC62JQ

RD RR2CC62TF 668 0 0
GGACAAGAAAACACCAAAATCCTTCTAAAAATGGCTCAACACTTATCTCTTCTCTTTTGC
CTCTTTCTCTCATTCTTCTCAATACTGTTTTCCGACCAAACCGAGGCTACCACAGTCGCG
CGTCTGGTGCCAAAATCGCTTTACGACTCAATGTTCATCCACAAGGAAAATACTGCTTGT
CCAGCAAATGGTTTCTACACTTACGAATCCTTTGTGAAGGCAACGAGGCGGTTTCCAAGA
TTTGGAAGCGTCGGATCCATGGAGACACGAAGACGCGAGGTGGCAGCGTTTTTGGCTCAG
ATTTCACACGAAACAACTGGAGGGTGGCCAACGGCACCGGACGGACCGTATGCTTGGGGG
TTGTGTTTTAAAGAAGAAATAAGTCCACAAAGCAATTATTGTGATTCTTCTAATACTGAA
TGGCCTTGTTTCTCTAACAAGACTTACCATGGAAGAGGTCCAATTCAACTCTCGTGGAAC
TATAACTACGGACCGGCCGGTCGAACTTTAGGATTCGACGGTCTAAGGAATCCCGAGATA
GTGGCGAATAATTCAGTGATAGCTTTCCAAACAGCACTTTGGTTTTGGATGACGGAGCAG
AGTCCCAAACCTTCGTGCCATGACGTTATGATCGGTAGATACAGACCTACAGAGGCAGAT
TTGGCAGC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2CC62JQ 732 0 0
CAGATTTCACACGAAACAACTGGAGGGTGGCCAACGGCACCGGACGGACCGTATGCTTGG
GGGTTGTGTTTTAAAGAAGAAATAAGTCCACAAAGCAATTATTGTGATTCTTCTAATACT
GAATGGCCTTGTTTCTCTAACAAGACTTACCATGGAAGAGGTCCAATTCAACTCTCGTGG
AACTATAACTACGGACCGGCCGGTCGAACTTTAGGATTCGACGGTCTAAGGAATCCCGAG
ATAGTGGCGAATAATTCAGTGATAGCTTTCCAAACAGCACTTTGGTTTTGGATGACGGAG
CAGAGTCCCAAACCTTCGTGCCATGACGTTATGATCGGTAGATACAGACCTACAGAGGCA
GATTTGGCAGCTAACCGGACCGGTGGATTCGGTTTAACCACGAACATTATAAACGGCGGT
TTAGAGTGCGGGATTGCCGGAGATGGGCGGGTCAATGACCGGATCGGGTTTTATCAGAGA
TATGCTGGGCTGTTAAATGTAGGAACTGGGCCTAACTTGGACTGTGAAAACCAGAAGCCC
TTCGCTTAAATAACAATTTGGTTGACCCAAGATTTTATTTACTTTGAATAAGCAAAAAGG
TTAAACATGTATGCACATGCATTGTGCCCACAGCCCACACATGGATGGATTTGATTGAAT
AATGTCTATTTCCTTTTTTTTTATTTTCTATGGATCATCTTTCAATTTAATGTGATTTGG
TTTTGATTGGCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL5488Contig1 1088 2 4 U
GGATATAACTAATATACATCTCAAAACACTAACACATTAGTCCTAGATGGGTGATACAAC
CAAGGAGGATGTCTCTGGCCCTAGCGGAAAAGTTGTGGGTAAGAAAAGAAGAGCGTATTT
CTTTAGGAAATGGACAAAGATCGACGTAATGAGAGCCTCCGCTGTTGGGATGGTGCATTT
GCTGTGTCTCTTTGCTCCTTTCAACTTTAAATGGGAAGCTCTCCTATTTGGTGTTATTCT
CGCTGTTGTGACTGCACTCAGCATTACGTTCTCTTACCATAGAAACTTAGCTCATCGAAG
CTCTAAGCTACCTAAATGGCTTGAATATTCATTTGCTTATTCTGCCCTTTTTGCGCTTCA
GGGTCATCCAATAGATTGGGTGAGCACACATAGGTTCCATCACCAGTTCACAGATTCGGA
CCGTGACCCACATAGCCCTATGGAAGGATTCTGGTTCAGTCATGTCTTCTGGATATTCGG
CACCAGTTACATGAGAGAAAAGTGTGGAGGACGTGACAACGTGATGGACTTGAAACAGCA
ATGGTTCTATAGGTTTCTACGAAACACAATTGGTTACCACATCATGACGTTTTGGACCCT
CGTCTACTTGGTGGGGTGGTCTTCCTTACCTAACTTGCGGCGTGGGTGTTGGAGGAGCAA
TCAGTTACAACGGGACTTGGCTCATAAACTCAGCTTGCCATATTTGGGGATCACGAGCCT
GGAACACCAAGGACACATCTCGTAACATTTGGTGGCTAGGACCATTCACAATGGGAGAAA
GCTGGCATAACAACCACCATGCCTTTGAGGCCTCAGCTAGGCACGGATTGGAATGGTACC
AGGTAGACTTGACTTGGTACCTCATCTCGTTCTTCCAGGCTCTCGGTTTAGCCACTGACG
TCAAATTGCCATCAGAAGCTCAGAAACGCAAGTTGGCTTTCGCTCGTTAATTTCAGCTCT
GATTCTATCTATTTCGCTTTCAACTTTGTGTCTCTTAATGATATGTACTCGTCACTTGTT
CTTTTGTTATTTATGTAAAACTGTTGATAACCATCAGTTGTCATGAATATGTAAAACTAG
TCTGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY76TF U 1
AF RR2GY76JQ C 366
BS 1 731 RR2GY76TF
BS 732 732 RR2GY76JQ
BS 733 744 RR2GY76TF
BS 745 1088 RR2GY76JQ

RD RR2GY76TF 744 0 0
GGATATAACTAATATACATCTCAAAACACTAACACATTAGTCCTAGATGGGTGATACAAC
CAAGGAGGATGTCTCTGGCCCTAGCGGAAAAGTTGTGGGTAAGAAAAGAAGAGCGTATTT
CTTTAGGAAATGGACAAAGATCGACGTAATGAGAGCCTCCGCTGTTGGGATGGTGCATTT
GCTGTGTCTCTTTGCTCCTTTCAACTTTAAATGGGAAGCTCTCCTATTTGGTGTTATTCT
CGCTGTTGTGACTGCACTCAGCATTACGTTCTCTTACCATAGAAACTTAGCTCATCGAAG
CTCTAAGCTACCTAAATGGCTTGAATATTCATTTGCTTATTCTGCCCTTTTTGCGCTTCA
GGGTCATCCAATAGATTGGGTGAGCACACATAGGTTCCATCACCAGTTCACAGATTCGGA
CCGTGACCCACATAGCCCTATGGAAGGATTCTGGTTCAGTCATGTCTTCTGGATATTCGG
CACCAGTTACATGAGAGAAAAGTGTGGAGGACGTGACAACGTGATGGACTTGAAACAGCA
ATGGTTCTATAGGTTTCTACGAAACACAATTGGTTACCACATCATGACGTTTTGGACCCT
CGTCTACTTGGTGGGGTGGTCTTCCTTACCTAACTTGCGGCGTGGGTGTTGGAGGAGCAA
TCAGTTACAACGGGACTTGGCTCATAAACTCAGCTTGCCATATTTGGGGATCACGAGCCT
GGAACACCAAG*ACACATCTCGTA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2GY76JQ 723 0 0
ATCCAATAGATTGGGTGAGCACACATAGGTTCCATCACCAGTTCACAGATTCGGACCGTG
ACCCACATAGCCCTATGGAAGGATTCTGGTTCAGTCATGTCTTCTGGATATTCGGCACCA
GTTACATGAGAGAAAAGTGTGGAGGACGTGACAACGTGATGGACTTGAAACAGCAATGGT
TCTATAGGTTTCTACGAAACACAATTGGTTACCACATCATGACGTTTTGGACCCTCGTCT
ACTTG*TGGGGTGGTCTTCCTTACCTAACTTGCGGCGTGGGTGTTGGAGGAGCAATCAGT
TACAACGGGACTTGGCTCATAAACTCAGCTTGCCATATTTGGGGATCACGAGCCTGGAAC
ACCAAGGACACATCTCGTAACATTTGGTGGCTAGGACCATTCACAATGGGAGAAAGCTGG
CATAACAACCACCATGCCTTTGAGGCCTCAGCTAGGCACGGATTGGAATGGTACCAGGTA
GACTTGACTTGGTACCTCATCTCGTTCTTCCAGGCTCTCGGTTTAGCCACTGACGTCAAA
TTGCCATCAGAAGCTCAGAAACGCAAGTTGGCTTTCGCTCGTTAATTTCAGCTCTGATTC
TATCTATTTCGCTTTCAACTTTGTGTCTCTTAATGATATGTACTCGTCACTTGTTCTTTT
GTTATTTATGTAAAACTGTTGATAACCATCAGTTGTCATGAATATGTAAAACTAGTCTGA
TTC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL5489Contig1 977 2 8 U
GGGGAGATTTGGTTGCGAAGAACAACGCGCTTAAGATTTTGGTTCCAGGTGCAGATTTGA
TCAGTGACTAATGGAGAGTGAAACGAAACCAACCTTCAGCAAATCAACAGGGCTTCCACG
CAAGCGATTCTACAGAGCAAGAGCTCGTAGCAACCCACTCAGCGACTCTCACTTCCCCAT
TCCCATCTCCCCGTCTCATGTCGACTTTTCACTTCATTTCCCCAAGTTCGTTGGAGCCAA
CAACGAAGAAGAAGTCTCCAAGAAAGTTGAGTTCGCTGATATCGGATGCGGCTTCGGTGG
TCTTCTCATCTCCCTCGCGACGCTCTTCCCTGATACATTGATGATCGGCATGGAGCTGAG
GGATAAAGTTACTGAATACGTCAAGGAACGGATCTTAGCCTTGAGGAAGACGAACTCTGG
GGGACAGTACGAGAACATCTCTGTTGTTAGGACTAACTCAATGAAGTACATTCCGAATTA
CTTTGAGAAAGGACAGCTTTCCAAGATGTTTTTCCTGTTTCCGGATCCACATTTCAAGGA
GAAGAATCACAGGAGGAGGGTGATTAGCATTGATTTGCTGGATGAGTATGCGTACGTTCT
TAGAGCTGGTGGGATTATATACACGATCACTGACGTTGAGGAGCTTGGTGAGTGGATGAG
GTCTTGCTTGGAGAAACATCCTATGTTTGAGTCTTTGACACAGGAAGAGCTTGATTCTGA
TCCTGTCGTTGAGCTTCTGTGCAGTGCTACTGAGGAAGGACAGAAAGTTGCTAGGAATGG
AGGTCAGACTTTCAGAGCCGTTTTCAGACGCATTGCATATGTTTCTTGAATTCAATCTCT
TTTTCTTTTTTTGTAGTGAACATCTTATTGTTGTTGTAACACCAGATTCTTTCTTCACTT
CAAATATTTTTTGGGATAGTATTTTTACAGAAATTTAGAAATTAATTCAAGACGAGAGAA
TGTGGAGTTACATTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM20TF U 1
AF RR2FM20JQ C 393
BS 1 703 RR2FM20TF
BS 704 704 RR2FM20JQ
BS 705 754 RR2FM20TF
BS 755 755 RR2FM20JQ
BS 756 765 RR2FM20TF
BS 766 766 RR2FM20JQ
BS 767 776 RR2FM20TF
BS 777 977 RR2FM20JQ

RD RR2FM20TF 777 0 0
GGGGAGATTTGGTTGCGAAGAACAACGCGCTTAAGATTTTGGTTCCAGGTGCAGATTTGA
TCAGTGACTAATGGAGAGTGAAACGAAACCAACCTTCAGCAAATCAACAGGGCTTCCACG
CAAGCGATTCTACAGAGCAAGAGCTCGTAGCAACCCACTCAGCGACTCTCACTTCCCCAT
TCCCATCTCCCCGTCTCATGTCGACTTTTCACTTCATTTCCCCAAGTTCGTTGGAGCCAA
CAACGAAGAAGAAGTCTCCAAGAAAGTTGAGTTCGCTGATATCGGATGCGGCTTCGGTGG
TCTTCTCATCTCCCTCGCGACGCTCTTCCCTGATACATTGATGATCGGCATGGAGCTGAG
GGATAAAGTTACTGAATACGTCAAGGAACGGATCTTAGCCTTGAGGAAGACGAACTCTGG
GGGACAGTACGAGAACATCTCTGTTGTTAGGACTAACTCAATGAAGTACATTCCGAATTA
CTTTGAGAAAGGACAGCTTTCCAAGATGTTTTTCCTGTTTCCGGATCCACATTTCAAGGA
GAAGAATCACAGGAGGAGGGTGATTAGCATTGATTTGCTGGATGAGTATGCGTACGTTCT
TAGAGCTGGTGGGATTATATACACGATCACTGACGTTGAGGAGCTTGGTGAGTGGATGAG
GTCTTGCTTGGAGAAACATCCTATGTTTGAGTCTTTGACACAG*AAGAGCTTGATTCTGA
TCCTGTCGTTGAGCTTCTGTGCAGTGCTACTGAG*AAGGACAGAA*GTTGCTAGGA
T

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2FM20JQ 585 0 0
TCTTAGCCTTGAGGAAGACGAACTCTGGGGGACAGTACGAGAACATCTCTGTTGTTAGGA
CTAACTCAATGAAGTACATTCCGAATTACTTTGAGAAAGGACAGCTTTCCAAGATGTTTT
TCCTGTTTCCGGATCCACATTTCAAGGAGAAGAATCACAGGAGGAGGGTGATTAGCATTG
ATTTGCTGGATGAGTATGCGTACGTTCTTAGAGCTGGTGGGATTATATACACGATCACTG
ACGTTGAGGAGCTTGGTGAGTGGATGAGGTCTTGCTTGGAGAAACATCCTATGTTTGAGT
CTTTGACACAGGAAGAGCTTGATTCTGATCCTGTCGTTGAGCTTCTGTGCAGTGCTACTG
AGGAAGGACAGAAAGTTGCTAGGAATGGAGGTCAGACTTTCAGAGCCGTTTTCAGACGCA
TTGCATATGTTTCTTGAATTCAATCTCTTTTTCTTTTTTTGTAGTGAACATCTTATTGTT
GTTGTAACACCAGATTCTTTCTTCACTTCAAATATTTTTTGGGATAGTATTTTTACAGAA
ATTTAGAAATTAATTCAAGACGAGAGAATGTGGAGTTACATTGAC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL5490Contig1 1036 2 2 U
GGATCTTTTCTTTATTTCGACGTTACATGGTTGTTGAATCTTCGTCAATGGCGACAAAGC
TTGGAAAAGACGAGGATGTTGAGGTCGAGCTTGAGCTATGTCTTTCTCTGGGAGGTCCTT
TAAAGAAAGCAACCAGAGCTCAGCCGATAGAATGTTGTCCGGACGGTAATTCTAACGCCG
TCATCAGATGGGCCAACGATATTGGCGTTGATCTTAATGTCGAGACGAGGAAGAAGCGGG
AAGCGAAGCAGCAGACAAGCGGAGGAGGAGGAGAGTGCAAGAGGATCAAAAGAGAAGTCA
CTAACGGCGTGGATTTGGGTTTGAGCTTCAGTGATTTGGGCAACGGGTACGGGTCGGGTC
AATATAAGGAAAACAGTAAAGACGTTACAATCGGGTCACCTATTGGCAGCACGTCGGACA
TTTACGATCCCTGCCAAGAAGGTGGAAGTTGCGAACTCGGGGTAAATTCTAACCGAAGAA
AACCGGTTAATTCTCCGGTTAATAATAACATTCTAACCCGTAAAGAGGAAAGAGCGTGGA
GCATGGACGGTCCAAATGATGCGGTGGTAGAGGAGACGCAAGAATTTTCCAATCCTATAG
CCAAAGAAGCTGGAAAGCCTCCAAAACCACGTCCCAACAGCAACGGGGTTAACGGCAGTT
TGCTTCCGTTTGCTAAGATGCCATGCGTGACTAGCACCGGTAACGGACCCGATGGGAAAA
CTGTAAATGGGTTTCTGTATCGGTACTTGCAATCAGATATTAGTATAATCTGCGTCTGTC
ACGGCACGTCGTTCTCGCCTGCTGAGTTCGTCATCCACGCCGGTGGGACCAATGTCTCAC
ATCCGTTAAGACATATAACTGTTGTTCCTTCAACGTTCTAAAACTTTTATTTTTCTCTTG
TTGTTGTTACCTTACGGTCTGTGTATATGTTTAGCTGATGGAGTTCTTGAGTTCGAAGGG
ATTCTTTATTGGTAATCTTTGTGTATGGCAACCGTTTTCAGTTCAATTCTTGTTATGGAG
AAGTCGATTTACTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F578TF U 1
AF RR2F578JQ C 178
BS 1 566 RR2F578TF
BS 567 1036 RR2F578JQ

RD RR2F578TF 566 0 0
GGATCTTTTCTTTATTTCGACGTTACATGGTTGTTGAATCTTCGTCAATGGCGACAAAGC
TTGGAAAAGACGAGGATGTTGAGGTCGAGCTTGAGCTATGTCTTTCTCTGGGAGGTCCTT
TAAAGAAAGCAACCAGAGCTCAGCCGATAGAATGTTGTCCGGACGGTAATTCTAACGCCG
TCATCAGATGGGCCAACGATATTGGCGTTGATCTTAATGTCGAGACGAGGAAGAAGCGGG
AAGCGAAGCAGCAGACAAGCGGAGGAGGAGGAGAGTGCAAGAGGATCAAAAGAGAAGTCA
CTAACGGCGTGGATTTGGGTTTGAGCTTCAGTGATTTGGGCAACGGGTACGGGTCGGGTC
AATATAAGGAAAACAGTAAAGACGTTACAATCGGGTCACCTATTGGCAGCACGTCGGACA
TTTACGATCCCTGCCAAGAAGGTGGAAGTTGCGAACTCGGGGTAAATTCTAACCGAAGAA
AACCGGTTAATTCTCCGGTTAATAATAACATTCTAACCCGTAAAGAGGAAAGAGCGTGGA
GCATGGACGGTCCAAATGATGCGGTG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2F578JQ 859 0 0
G
CGTCATCAGATGG*CCAACGATATTGGCGT*GATCTTAATGTCGAGACGAG*AAGAAGCG
G*AAGCGAAGCAGCAGACAAGCGGAGGAGGAGGAGAGTGCAAGAGGATCAAAAGAGAAGT
CACTAACGGCGTGGATTTGGGTTTGAGCTTCAGTGATTTGGGCAACGGGTACGGGTCGGG
TCAATATAAGGAAAACAGTAAAGACGTTACAATCGGGTCACCTATTGGCAGCACGTCGGA
CATTTACGATCCCTGCCAAGAAGGTGGAAGTTGCGAACTCGGGGTAAATTCTAACCGAAG
AAAACCGGTTAATTCTCCGGTTAATAATAACATTCTAACCCGTAAAGAGGAAAGAGCGTG
GAGCATGGACGGTCCAAATGATGCGGTGGTAGAGGAGACGCAAGAATTTTCCAATCCTAT
AGCCAAAGAAGCTGGAAAGCCTCCAAAACCACGTCCCAACAGCAACGGGGTTAACGGCAG
TTTGCTTCCGTTTGCTAAGATGCCATGCGTGACTAGCACCGGTAACGGACCCGATGGGAA
AACTGTAAATGGGTTTCTGTATCGGTACTTGCAATCAGATATTAGTATAATCTGCGTCTG
TCACGGCACGTCGTTCTCGCCTGCTGAGTTCGTCATCCACGCCGGTGGGACCAATGTCTC
ACATCCGTTAAGACATATAACTGTTGTTCCTTCAACGTTCTAAAACTTTTATTTTTCTCT
TGTTGTTGTTACCTTACGGTCTGTGTATATGTTTAGCTGATGGAGTTCTTGAGTTCGAAG
GGATTCTTTATTGGTAATCTTTGTGTATGGCAACCGTTTTCAGTTCAATTCTTGTTATGG
AGAAGTCGATTTACTGCG

QA 2 859 2 859
DS 



AS 1 2

CO CL5491Contig1 710 2 2 U
GTGGTTGTAGAGACGCCAGTTAACAATGTCGGTAGTGGTGGTGGTGGGTCGTCTTTAGAG
AGGAAAGTGTTGAGATCTAGATCTGTGGGGTGTGGGAGCAGAAGCTTCTCTGGTGATTTC
TTTGAGAGGATCTCTAATGGGTTTGGAGATTGCGCCTTGAAAAGGATTGAGTCACAGAGA
GAACACACAAAGGTCATTAGTAATGGTGGTGGTGGTGAAGCAACTGATGCCATGAGTCAA
ATGGTGAAATGTGGTGGTATCTTTGGTGGGTTTATGATTATGACATCATCATCATCAAAT
TCAGCATCATCAACAGTTGATCATCATCATCATAAGATGGGGAATAAAACCGCATGGGGA
AGGGCTTTTGCAAGTCCAATGAGACCCAAGACTACTCACAAAGGTGGTACTATTACAGAG
TCTTCAACTGATAAAAACACAACTCCAAACTTGGACTCAACTTCTTCCTTGGTTACTATG
AAAAGCTAAAAGAGATACATTATAGTACTTCTTATATCTATATCATATTTCATTCATGTG
ATTAGTTAGGCTGTTCGTTTGTTCTTTGGACATTGGTTTGATCTTTTGAGTACAACTAGT
AATGTAATGTCACACTATTTATCTTTTTTCTTTTCATTTATATGTTTGGCCTAATGGCTG
GATGTTGTTCATCATCATTCATTCATCATAAAAGTTGGTAAAGTTTAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H316TF U 1
AF RR2H316JQ C 8
BS 1 701 RR2H316TF
BS 702 710 RR2H316JQ

RD RR2H316TF 709 0 0
GTGGTTGTAGAGACGCCAGTTAACAATGTCGGTAGTGGTGGTGGTGGGTCGTCTTTAGAG
AGGAAAGTGTTGAGATCTAGATCTGTGGGGTGTGGGAGCAGAAGCTTCTCTGGTGATTTC
TTTGAGAGGATCTCTAATGGGTTTGGAGATTGCGCCTTGAAAAGGATTGAGTCACAGAGA
GAACACACAAAGGTCATTAGTAATGGTGGTGGTGGTGAAGCAACTGATGCCATGAGTCAA
ATGGTGAAATGTGGTGGTATCTTTGGTGGGTTTATGATTATGACATCATCATCATCAAAT
TCAGCATCATCAACAGTTGATCATCATCATCATAAGATGGGGAATAAAACCGCATGGGGA
AGGGCTTTTGCAAGTCCAATGAGACCCAAGACTACTCACAAAGGTGGTACTATTACAGAG
TCTTCAACTGATAAAAACACAACTCCAAACTTGGACTCAACTTCTTCCTTGGTTACTATG
AAAAGCTAAAAGAGATACATTATAGTACTTCTTATATCTATATCATATTTCATTCATGTG
ATTAGTTAGGCTGTTCGTTTGTTCTTTGGACATTGGTTTGATCTTTTGAGTACAACTAGT
AATGTAATGTCACACTATTTATCTTTTTTCTTTTCATTTATATGTTTGGCCTAATGGCTG
GATGTTGTTCATCATCATTCATTCATCATAAAAGTTGGTAA
GTTTAGAG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2H316JQ 703 0 0
TAGAGACGCCAGTTAACAATGTCGGTAGTGGTGGTGGTGGGTCGTCTTTAGAGAGGAAAG
TGTTGAGATCTAGATCTGTGGGGTGTGGGAGCAGAAGCTTCTCTGGTGATTTCTTTGAGA
GGATCTCTAATGGGTTTGGAGATTGCGCCTTGAAAAGGATTGAGTCACAGAGAGAACACA
CAAAGGTCATTAGTAATGGTGGTGGTGGTGAAGCAACTGATGCCATGAGTCAAATGGTGA
AATGTGGTGGTATCTTTGGTGGGTTTATGATTATGACATCATCATCATCAAATTCAGCAT
CATCAACAGTTGATCATCATCATCATAAGATGGGGAATAAAACCGCATGGGGAAGGGCTT
TTGCAAGTCCAATGAGACCCAAGACTACTCACAAAGGTGGTACTATTACAGAGTCTTCAA
CTGATAAAAACACAACTCCAAACTTGGACTCAACTTCTTCCTTGGTTACTATGAAAAGCT
AAAAGAGATACATTATAGTACTTCTTATATCTATATCATATTTCATTCATGTGATTAGTT
AGGCTGTTCGTTTGTTCTTTGGACATTGGTTTGATCTTTTGAGTACAACTAGTAATGTAA
TGTCACACTATTTATCTTTTTTCTTTTCATTTATATGTTTGGCCTAATGGCTGGATGTTG
TTCATCATCATTCATTCATCATAAAAGTTGGTAAAGTTTAGAG

QA 1 703 1 703
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5493Contig1 1035 2 4 U
GGGGTGCGTGCGTCTCTGGTGGTTGTCAAAATCTTGGAAAATGTTGGGTAGGCTAGCTGC
GAAGCGTCTTCTGGAGATCCGTCAAGTTTTCCGTCAACCACCGTCTCAGACACAGGTGTC
TCGTAGCTTTTCAACAGCCTTGAACTACCACCTGGATTCTCCTGATAACAAACCTGATCT
TCCATGGGAGTTTTCAGAGGCCAACAAATCTAAGGTTAAGGAGATACTCTCTTACTATCC
ATCAAACTGCAAGCAATCTGCAGTGATCCCTCTTCTAGATCTTGCACAACAACAGCGTGG
CGGCTGGCTCCCTGTTTCTGCTATGAATGCGGTTGCTAAAGTTATAGAAGTTGCTCCTAT
CCGTGTTTATGAGGTTGCAACACTCTACTCAATGTTCAACAGGGCAAAGGTCGGAAAGTA
CCACCTCCTAGTTTGTGGCACAACACCTTGCATGATCCGTGGTTCACGGGATATCGAATC
AGCTTTGCTAGACCATTTGGGAGTGAAACGCGGTGAAGTTACAAAGGATGGTTTGTTCTC
TGTTGGAGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTGAATGCGCCCATGATCACTGTGGCAGA
TTATTCCAACGGATCAGAAGGATATACATACAACTATTTCGAAGGTGTTACACCTGAGAA
AGTTGTAGAGATCGTTGAAAAGCTGAGAAAAGGAGAAAAGCCACCGCATGGAACTCAAAA
CTCAAAGAGGATCAAGTGTGGACCTGAAGGAGGAAACACTACACTGCTAGGGGAGCCAAA
GCCACCGCAGTTCCGTGATCTTGACGCTTGCTAAGCTCAGTTCTTTAAGCCCGGTGGGTT
AATGTGATTCAAATAACGCAAAAGGCTATAGTTATGTTTGAAGCCTATAGCATCAAACTG
AGCTTGCATACTCTCTGTAGTCTTCCTGATTTGAAATTTAGACTCCATTTTGAAACGAAT
GGCCAAAGGCATCTGTTTGTTATCATCTCACTTCCAAAACTTTTGTGAAATTGATGAAAT
AAAGACTTTTGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK92TF U 1
AF RR2CK92JQ C 254
BS 1 620 RR2CK92TF
BS 621 621 RR2CK92JQ
BS 622 638 RR2CK92TF
BS 639 1035 RR2CK92JQ

RD RR2CK92TF 638 0 0
GGGGTGCGTGCGTCTCTGGTGGTTGTCAAAATCTTGGAAAATGTTGGGTAGGCTAGCTGC
GAAGCGTCTTCTGGAGATCCGTCAAGTTTTCCGTCAACCACCGTCTCAGACACAGGTGTC
TCGTAGCTTTTCAACAGCCTTGAACTACCACCTGGATTCTCCTGATAACAAACCTGATCT
TCCATGGGAGTTTTCAGAGGCCAACAAATCTAAGGTTAAGGAGATACTCTCTTACTATCC
ATCAAACTGCAAGCAATCTGCAGTGATCCCTCTTCTAGATCTTGCACAACAACAGCGTGG
CGGCTGGCTCCCTGTTTCTGCTATGAATGCGGTTGCTAAAGTTATAGAAGTTGCTCCTAT
CCGTGTTTATGAGGTTGCAACACTCTACTCAATGTTCAACAGGGCAAAGGTCGGAAAGTA
CCACCTCCTAGTTTGTGGCACAACACCTTGCATGATCCGTGGTTCACGGGATATCGAATC
AGCTTTGCTAGACCATTTGGGAGTGAAACGCGGTGAAGTTACAAAGGATGGTTTGTTCTC
TGTTGGAGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTGAATGCGCCCATGATCACTGTGGCAGA
TTATTCCAACGGATCAGAAG*ATATACATACAACTATT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2CK92JQ 782 0 0
CAATCTGCAGTGATCCCTCTTCTAGATCTTGCACAACAACAGCGTGGCGGCTGGCTCCCT
GTTTCTGCTATGAATGCGGTTGCTAAAGTTATAGAAGTTGCTCCTATCCGTGTTTATGAG
GTTGCAACACTCTACTCAATGTTCAACAGGGCAAAGGTCGGAAAGTACCACCTCCTAGTT
TGTGGCACAACACCTTGCATGATCCGTGGTTCACGGGATATCGAATCAGCTTTGCTAGAC
CATTTGGGAGTGAAACGCGGTGAAGTTACAAAGGATGGTTTGTTTTCTGTTGGAGAGATG
GAATGCATGGGATGCTGTGTGAATGCGCCCATGATCACTGTGGCAGATTATTCCAACGGA
TCAGAAGGATATACATACAACTATTTCGAAGGTGTTACACCTGAGAAAGTTGTAGAGATC
GTTGAAAAGCTGAGAAAAGGAGAAAAGCCACCGCATGGAACTCAAAACTCAAAGAGGATC
AAGTGTGGACCTGAAGGAGGAAACACTACACTGCTAGGGGAGCCAAAGCCACCGCAGTTC
CGTGATCTTGACGCTTGCTAAGCTCAGTTCTTTAAGCCCGGTGGGTTAATGTGATTCAAA
TAACGCAAAAGGCTATAGTTATGTTTGAAGCCTATAGCATCAAACTGAGCTTGCATACTC
TCTGTAGTCTTCCTGATTTGAAATTTAGACTCCATTTTGAAACGAATGGCCAAAGGCATC
TGTTTGTTATCATCTCACTTCCAAAACTTTTGTGAAATTGATGAAATAAAGACTTTTGTT
AC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL5494Contig1 798 2 2 U
GGGTCACAAAGATTGTCAAAATTTTCACTGCCACGGGCGTTAGATCCGATCCGATCTGAA
ATCGATCATCCAGCGATGGACTTGGCTGAACTCTGGGCGATTTTCGGGCCGGGTTTCTCC
GGAGCTGTATTCGGTACCGGCTGGTGGTTTTGGGTGGACGCCGTTGTGTGCAGCTCCATC
CAAGTGCCCTTCCTCCACTATCTCCCCGGCATATTCGCATCTCTCGGAGCTTTGATGTTC
AATTGCGTCAGAAAAGAAGATATCGATTACTCTCCTTACGACGAAGGCGAATGGAGGTTG
AAGTTATGGCTTTTCATAGCGTATGTCGTGGCGTTTGTTTCCCTAGCTGCTTCTGTTGGT
CTGCTGATTCAAGATTCCGTCGTCAAAACTGGTCCTTCCACCTGGACTGGTGTCGCCGGT
GTCTTTCAATGTGTATTCGTATTGATAAGTGGGCTAATGTATTGGACATCACACTCGGAG
TAAGTAGACTTGCAGGGCACATACTCCAACGCAGATACTTGTGGTTACAACTTACAGATG
CCTCGTTTTCTTCTTCTCTGTAAATTCTTGTGTCTTTGTCTGGTCCAGCTTGGTGTTGTG
TGCTAGATTCCTCCATTGCCTTGGTGTGTTTGTTTTAAACTTTGTCGTTCTATGCTTGGG
TTATAAGTTGTTGCTTCTTATGTAGAGGATGGATAGATAATAATCTTCAACTTTATGTGG
ATGTTATGGGACGCCTTGCCCGTGTCTGCACAGTCTCTTAATTGCTTTGGAGTGAACGAT
TGGTAACATTTACCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G829TF U 1
AF RR2G829JQ C 236
BS 1 612 RR2G829TF
BS 613 798 RR2G829JQ

RD RR2G829TF 612 0 0
GGGTCACAAAGATTGTCAAAATTTTCACTGCCACGGGCGTTAGATCCGATCCGATCTGAA
ATCGATCATCCAGCGATGGACTTGGCTGAACTCTGGGCGATTTTCGGGCCGGGTTTCTCC
GGAGCTGTATTCGGTACCGGCTGGTGGTTTTGGGTGGACGCCGTTGTGTGCAGCTCCATC
CAAGTGCCCTTCCTCCACTATCTCCCCGGCATATTCGCATCTCTCGGAGCTTTGATGTTC
AATTGCGTCAGAAAAGAAGATATCGATTACTCTCCTTACGACGAAGGCGAATGGAGGTTG
AAGTTATGGCTTTTCATAGCGTATGTCGTGGCGTTTGTTTCCCTAGCTGCTTCTGTTGGT
CTGCTGATTCAAGATTCCGTCGTCAAAACTGGTCCTTCCACCTGGACTGGTGTCGCCGGT
GTCTTTCAATGTGTATTCGTATTGATAAGTGGGCTAATGTATTGGACATCACACTCGGAG
TAAGTAGACTTGCAGGGCACATACTCCAACGCAGATACTTGTGGTTACAACTTACAGATG
CCTCGTTTTCTTCTTCTCTGTAAATTCTTGTGTCTTTGTCTGGTCCAGCTTGGTGTTGTG
TGCTAGATTCCT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2G829JQ 563 0 0
TGTTCAATTGCGTCAGAAAAGAAGATATCGATTACTCTCCTTACGACGAAGGCGAATGGA
GGTTGAAGTTATGGCTTTTCATAGCGTATGTCGTGGCGTTTGTTTCCCTAGCTGCTTCTG
TTGGTCTGCTGATTCAAGATTCCGTCGTCAAAACTGGTCCTTCCACCTGGACTGGTGTCG
CCGGTGTCTTTCAATGTGTATTCGTATTGATAAGTGGGCTAATGTATTGGACATCACACT
CGGAGTAAGTAGACTTGCAGGGCACATACTCCAACGCAGATACTTGTGGTTACAACTTAC
AGATGCCTCGTTTTCTTCTTCTCTGTAAATTCTTGTGTCTTTGTCTGGTCCAGCTTGGTG
TTGTGTGCTAGATTCCTCCATTGCCTTGGTGTGTTTGTTTTAAACTTTGTCGTTCTATGC
TTGGGTTATAAGTTGTTGCTTCTTATGTAGAGGATGGATAGATAATAATCTTCAACTTTA
TGTGGATGTTATGGGACGCCTTGCCCGTGTCTGCACAGTCTCTTAATTGCTTTGGAGTGA
ACGATTGGTAACATTTACCTTTT

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 2

CO CL5495Contig1 720 2 8 U
GATCGGAGCGTCGTAGGAATCGAAAAATCGCCATGAGTGAAGAAGGTCCCAAGCTTTTCA
CCAACAAACCCAAAAAGAAGGATATCATCGCTCAGCTGAAGCACATCGAAGCCAACGGAA
CCGCCGCTGTTCCTCCGTCGAACCCCGCTGCAGCAGCGGCGGCTTCGTATACGATGGGCG
GTGGTTCTGCTCCTCCTCCTCTTCCGCCTCCAAAGGAATCATTCGCTCGAAGGTACAAAT
ATATGTGGCCGCTTCTCCTCACCGTCAATCTCGCCGTCGGAGGTTACCTTTTCTTTAGGA
CTAAGAAGAAGGACGTAGAGCCTGCAAGTGAAGAGATTGCTGCTAAATCAGATTCAGTCT
CGGCTCCCGTTACCATTGAAAAGCCTGTGTCTTCTGCAATGGTTGCTGTTGCTGAGCCAG
TGGTGGTCAAGGCACGTGAGCCAATACCGGAGAAGCAGCAACGTGAGCTCTTCAAATGGA
TGTTGGAGGAGAAAAGGAAAGTAAAACCGCAAAACGCTGAAGAGAAGAAGAGGATTGATG
AAGAAAAAGCGATTCTGAAACAATTCATAGCATCCAAAACCATTCCGACTCTCTGATTAA
ATTTCTGTTTCTGTTGATTTGGTTTTAGTTATTTTTGTGGATGTTTTGCTTTTTTTGGAG
GAAAAAAAATGATCAGTTTGAATATTTAAACCAGTAACTTTGGAATCTCATCCTTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H556TF U 1
AF RR2H556JQB C 259
BS 1 609 RR2H556TF
BS 610 610 RR2H556JQB
BS 611 625 RR2H556TF
BS 626 626 RR2H556JQB
BS 627 635 RR2H556TF
BS 636 636 RR2H556JQB
BS 637 646 RR2H556TF
BS 647 720 RR2H556JQB

RD RR2H556TF 652 0 0
GATCGGAGCGTCGTAGGAATCGAAAAATCGCCATGAGTGAAGAAGGTCCCAAGCTTTTCA
CCAACAAACCCAAAAAGAAGGATATCATCGCTCAGCTGAAGCACATCGAAGCCAACGGAA
CCGCCGCTGTTCCTCCGTCGAACCCCGCTGCAGCAGCGGCGGCTTCGTATACGATGGGCG
GTGGTTCTGCTCCTCCTCCTCTTCCGCCTCCAAAGGAATCATTCGCTCGAAGGTACAAAT
ATATGTGGCCGCTTCTCCTCACCGTCAATCTCGCCGTCGGAGGTTACCTTTTCTTTAGGA
CTAAGAAGAAGGACGTAGAGCCTGCAAGTGAAGAGATTGCTGCTAAATCAGATTCAGTCT
CGGCTCCCGTTACCATTGAAAAGCCTGTGTCTTCTGCAATGGTTGCTGTTGCTGAGCCAG
TGGTGGTCAAGGCACGTGAGCCAATACCGGAGAAGCAGCAACGTGAGCTCTTCAAATGGA
TGTTGGAGGAGAAAAGGAAAGTAAAACCGCAAAACGCTGAAGAGAAGAAGAGGATTGATG
AAGAAAAAGCGATTCTGAAACAATTCATAGCATCCAAAACCATTCCGACTCTCTGATTAA
ATTTCTGTT*CTGTTGATTTGGTTT*AGTTATTTT*GTGGATGTTT
GCTTTT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2H556JQB 462 0 0
TCACCGTCAATCTCGCCGTCGGAGGTTACCTTTTCTTTAGGACTAAGAAGAAGGACGTAG
AGCCTGCAAGTGAAGAGATTGCTGCTAAATCAGATTCAGTCTCGGCTCCCGTTACCATTG
AAAAGCCTGTGTCTTCTGCAATGGTTGCTGTTGCTGAGCCAGTGGTGGTCAAGGCACGTG
AGCCAATACCGGAGAAGCAGCAACGTGAGCTCTTCAAATGGATGTTGGAGGAGAAAAGGA
AAGTAAAACCGCAAAACGCTGAAGAGAAGAAGAGGATTGATGAAGAAAAAGCGATTCTGA
AACAATTCATAGCATCCAAAACCATTCCGACTCTCTGATTAAATTTCTGTTTCTGTTGAT
TTGGTTTTAGTTATTTTTGTGGATGTTTTGCTTTTTTTGGAGGAAAAAAAATGATCAGTT
TGAATATTTAAACCAGTAACTTTGGAATCTCATCCTTTTCAT

QA 1 462 1 462
DS 



AS 1 2

CO CL5496Contig1 750 2 4 U
TGCTTCCGACGATCAAAGTGTCTACCGTCGCCGTCGCTAACGGTGTCATTCATTTAACGG
TAGATTGCTCTTTCGGAATTTGAATTTCTCATATTCGTTAGACGCGTATCGGTGGAGATA
AAGATTGGTCAAACCCTAAACACCTGTGAAGAATCTGATGCCCTTTGTATTCAAGCAATC
TCGGATTGATTGATAAATCTGAGAAAACCCAAAAACAAATCTATCAGATCTTTATTGAAA
GTCGGTAGCTTTTTAAGGGAGGAGCAGCTGATTGGTTCTGAATCTGTGAATCAACAACGT
TGAACCTCGCCCCATAATTAGAGATTTCGAATATTCTCTTGCCCTTTGGGGGAGGTTTCT
ATAAAGAAAGAAAGAGATTTTTGAGTTTTTTGGATTCTCAGCGTTTTTGTAATCTTTGTG
GGGATCTCTGAGGAAGCCATGGAAGAGTCTTCCCAGGGGAGTTTTGTTACCACCATAAAC
GAAGAGTACGAAACAATTTGCTGGGGCTGTGGACTAAACCTTGTGCTTCCATCCTACGCA
CCTGTTTTCAAGTGCGGCTGGTGTGGAGCAATCACCAATCAGAATCCAGTCAGAGTTGAA
ACCAGAAACTTTGGGTTGAGACGGTTCCGCGACCGCTGTTTTGTTGTTATTCTTGCTGTC
TTTATGCTCTTTGTCATATGTAAGTTCCTCTTAAGTAGTCCAAAAGAAGAATGATATTCG
CCATTTTCTTGTTAAATGTACTGATTCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ28TF U 1
AF RR2FJ28JQ C 30
BS 1 671 RR2FJ28TF
BS 672 672 RR2FJ28JQ
BS 673 700 RR2FJ28TF
BS 701 750 RR2FJ28JQ

RD RR2FJ28TF 700 0 0
TGCTTCCGACGATCAAAGTGTCTACCGTCGCCGTCGCTAACGGTGTCATTCATTTAACGG
TAGATTGCTCTTTCGGAATTTGAATTTCTCATATTCGTTAGACGCGTATCGGTGGAGATA
AAGATTGGTCAAACCCTAAACACCTGTGAAGAATCTGATGCCCTTTGTATTCAAGCAATC
TCGGATTGATTGATAAATCTGAGAAAACCCAAAAACAAATCTATCAGATCTTTATTGAAA
GTCGGTAGCTTTTTAAGGGAGGAGCAGCTGATTGGTTCTGAATCTGTGAATCAACAACGT
TGAACCTCGCCCCATAATTAGAGATTTCGAATATTCTCTTGCCCTTTGGGGGAGGTTTCT
ATAAAGAAAGAAAGAGATTTTTGAGTTTTTTGGATTCTCAGCGTTTTTGTAATCTTTGTG
GGGATCTCTGAGGAAGCCATGGAAGAGTCTTCCCAGGGGAGTTTTGTTACCACCATAAAC
GAAGAGTACGAAACAATTTGCTGGGGCTGTGGACTAAACCTTGTGCTTCCATCCTACGCA
CCTGTTTTCAAGTGCGGCTGGTGTGGAGCAATCACCAATCAGAATCCAGTCAGAGTTGAA
ACCAGAAACTTTGGGTTGAGACGGTTCCGCGACCGCTGTTTTGTTGTTATTCTTGCTGTC
TTTATGCTCTT*GTCATATGTAAGTTCCTCTTAAGTAGTC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2FJ28JQ 721 0 0
GCCGTCGCTAACGGTGTCATTCATTTAACGGTAGATTGCTCTTTCGGAATTTGAATTTCT
CATATTCGTTAGACGCGTATCGGTGGAGATAAAGATTGGTCAAACCCTAAACACCTGTGA
AGAATCTGATGCCCTTTGTATTCAAGCAATCTCGGATTGATTGATAAATCTGAGAAAACC
CAAAAACAAATCTATCAGATCTTTATTGAAAGTCGGTAGCTTTTTAAGGGAGGAGCAGCT
GATTGGTTCTGAATCTGTGAATCAACAACGTTGAACCTCGCCCCATAATTAGAGATTTCG
AATATTCTCTTGCCCTTTGGGGGAGGTTTCTATAAAGAAAGAAAGAGATTTTTGAGTTTT
TTGGATTCTCAGCGTTTTTGTAATCTTTGTGGGGATCTCTGAGGAAGCCATGGAAGAGTC
TTCCCAGGGGAGTTTTGTTACCACCATAAACGAAGAGTACGAAACAATTTGCTGGGGCTG
TGGACTAAACCTTGTGCTTCCATCCTACGCACCTGTTTTCAAGTGCGGCTGGTGTGGAGC
AATCACCAATCAGAATCCAGTCAGAGTTGAAACCAGAAACTTTGGGTTGAGACGGTTCCG
CGACCGCTGTTTTGTTGTTATTCTTGCTGTCTTTATGCTCTTTGTCATATGTAAGTTCCT
CTTAAGTAGTCCAAAAGAAGAATGATATTCGCCATTTTCTTGTTAAATGTACTGATTCTG
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL5497Contig1 773 2 2 U
GGGAATTCTGAAACGACTTCCGTCTCCTTCCACCATTCTTCACTGATCAGTGTCAAACCA
GTCGACAGACAGGGATAGAGCTACATTCGCCTAGTTCCAGATCTGTGAAAAGAACATCTT
CAAAAACTTCATAATGAAGGCTGTAATTCTAGTAGGAGGATTTGGAACTCGATTGAGGCC
GCTTACATTCAGCATGCCAAAACCACTTGTTGATTTTGGTAACAAGCCCATGATTTTGCA
TCAGATTGAAGCACTAAAAGCTGCTGGAGTTACTGAAGTTGTATTAGCTATCAACCAACA
ACAACCAGAGGTGATGTTGAATTTTGTGAAAGAATACGAGAAGAAGCTGGAGATGAAGAT
CACCTTCTCCCAAGAAACCAAATCCCTCGGGACAGCAGGGCCTCTCGCTCTGGCTCGTGA
CAAGCTCATCGACGACGAATCAGGCGAACCCTTCTTCGTGCTGAACAGCGACGTCATCTG
CGAATATCCACTCCTCGAGATGAGAGGCGTGAGGATCAAGGAACATGCTTGTGTGTCTGA
TAGTATCGTGGGGTGGGACTCGACCATTGGAAGCTGGGCTCGTGTGGCTGACGTAACGGT
TCTAGGGAAAGATGTTCACGTTGCTGATGCGGAGGTTATACAAATGTCTGCGAAACCAGA
GATCGTCTAGAAAGTGTGATTCCATCCTATTTATTATTATAATGTTATTTGAAACCTCAT
TTTTTTTCTTTGATTAGCTCTTCTTGGAGTATGATTTTATATTAGGTTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT49TF U 1
AF RR2FT49JQ C 178
BS 1 560 RR2FT49TF
BS 561 773 RR2FT49JQ

RD RR2FT49TF 560 0 0
GGGAATTCTGAAACGACTTCCGTCTCCTTCCACCATTCTTCACTGATCAGTGTCAAACCA
GTCGACAGACAGGGATAGAGCTACATTCGCCTAGTTCCAGATCTGTGAAAAGAACATCTT
CAAAAACTTCATAATGAAGGCTGTAATTCTAGTAGGAGGATTTGGAACTCGATTGAGGCC
GCTTACATTCAGCATGCCAAAACCACTTGTTGATTTTGGTAACAAGCCCATGATTTTGCA
TCAGATTGAAGCACTAAAAGCTGCTGGAGTTACTGAAGTTGTATTAGCTATCAACCAACA
ACAACCAGAGGTGATGTTGAATTTTGTGAAAGAATACGAGAAGAAGCTGGAGATGAAGAT
CACCTTCTCCCAAGAAACCAAATCCCTCGGGACAGCAGGGCCTCTCGCTCTGGCTCGTGA
CAAGCTCATCGACGACGAATCAGGCGAACCCTTCTTCGTGCTGAACAGCGACGTCATCTG
CGAATATCCACTCCTCGAGATGAGAGGCGTGAGGATCAAGGAACATGCTTGTGTGTCTGA
TAGTATCGTGGGGTGGGACT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2FT49JQ 596 0 0
GCCGCTTACATTCAGCATGCCAAAACCACTTGTTGATTTTGGTAACAAGCCCATGATTTT
GCATCAGATTGAAGCACTAAAAGCTGCTGGAGTTACTGAAGTTGTATTAGCTATCAACCA
ACAACAACCAGAGGTGATGTTGAATTTTGTGAAAGAATACGAGAAGAAGCTGGAGATGAA
GATCACCTTCTCCCAAGAAACCAAATCCCTCGGGACAGCAGGGCCTCTCGCTCTGGCTCG
TGACAAGCTCATCGACGACGAATCAGGCGAACCCTTTTTCGTGCTGAACAGGGACGTCAT
CTGCGAATATCCACTCCTCGAGATGAGAGGCGTGAGGATCAAGGAACATGCTTGTGTGTC
TGATAGTATCGTGGGGTGGGACTCGACCATTGGAAGCTGGGCTCGTGTGGCTGACGTAAC
GGTTCTAGGGAAAGATGTTCACGTTGCTGATGCGGAGGTTATACAAATGTCTGCGAAACC
AGAGATCGTCTAGAAAGTGTGATTCCATCCTATTTATTATTATAATGTTATTTGAAACCT
CATTTTTTTTCTTTGATTAGCTCTTCTTGGAGTATGATTTTATATTAGGTTTGATC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL5498Contig1 821 2 4 U
TTTTTTTTTAAATTAAAACTCTCAATTTCACTATATTCCCTAAAAAAAAGAATTCATATT
TGCTTTTCTAGAACTCAAATTATTTTCAAGTTTTGATTATCGAGAAACATGACTATTGCT
TTAACGATCGGAGGAAGCGGGTTCTCTGGTCTACCCGGATCTTCGTTTTCCTCATCTTCT
TCATCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACAGGAAAGGA
GTCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCCGACCCGAC
TCATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGAT
GTTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCAGTTTCAGACAATCAATGAAGCTTACGATATT
GTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCATTCGATGTC
TATGAAGAGGGACTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGGATG
GGGTGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTGAATCCTTACGCGTGAAGA
CGACGGTGACCGACTTGGCAATGATTGTATGCAGATAAATAACAACAGAGAGAGAGAGAG
ACTGTAAGATCAATGTAAATAGTTGAAATTGTCTCTCTTGAATGGCTCTTAAATGTAAAT
AAAGTCATTTTTCCGTTATGTAAACCTCAAAACATTCACGGATAAGCTCAAAAGCTTTCC
TGAATTCGGATCTAATGATATAATAATTTGGATTCGAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ63TF U 1
AF RR2EQ63JQ C 165
BS 1 533 RR2EQ63TF
BS 534 534 RR2EQ63JQ
BS 535 543 RR2EQ63TF
BS 544 821 RR2EQ63JQ

RD RR2EQ63TF 554 0 0
TTTTTTTTTAAATTAAAACTCTCAATTTCACTATATTCCCTAAAAAAAAGAATTCATATT
TGCTTTTCTAGAACTCAAATTATTTTCAAGTTTTGATTATCGAGAAACATGACTATTGCT
TTAACGATCGGAGGAAGCGGGTTCTCTGGTCTACCCGGATCTTCGTTTTCCTCATCTTCT
TCATCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACAGGAAAGGA
GTCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCCGACCCGAC
TCATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGAT
GTTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCAGTTTCAGACAATCAATGAAGCTTACGATATT
GTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCATTCGATGTC
TATGAAGAGGGACTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGA*TGGATG
GGG
GTTGGGAAGGT

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2EQ63JQ 657 0 0
GTTTTCCTCATCTTCTTCATCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGAT
GCTGAACAGGAAAGGAGTCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCT
TAGGATCCGACCCGACTCATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAA
AAAGTATCATCCTGATGTTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCAGTTTCAGACAATCAA
TGAAGCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTT
TCAGCCATTCGATGTCTATGAAGAGGGACTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACAC
GTGGGAGGAATGGATGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTGAA
TCCTTACGCGTGAAGACGACGGTGACCGACTTGGCAATGATTGTATGCAGATAAATAACA
ACAGAGAGAGAGAGAGACTGTAAGATCAATGTAAATAGTTGAAATTGTCTCTCTTGAATG
GCTCTTAAATGTAAATAAAGTCATTTTTCCGTTATGTAAACCTCAAAACATTCACGGATA
AGCTCAAAAGCTTTCCTGAATTCGGATCTAATGATATAATAATTTGGATTCGAAGTT

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL5499Contig1 791 2 2 U
GGAATGAATTTCTGTTTCCGAAGAGTGTTGCTAGGGACAGGACAGCTGTGATTTCCTTTG
TTGACAGACGTGTAGCTATGGAGATGGCAGAAACAGCGAGAGACAGATGGAGAAGAAGAG
AGATTACAAACTTTGAATACTTGATGATTCTCAACACCCTTGCAGGCAGATCCTATAATG
ATTTGACTCAGTATCCTGTTTTCCCTTGGGTGGTGGCTGACTACTCATCTGAGACTCTTG
ATTTTAGTAAAGCATCTACCTTTCGTGATCTTTCTAAACCGGTTGGAGCTTTAGATTCAA
GAAGGTTTGAGGTTTTTGAGGACAGATACCAGCTTCTCTGATCCTGATATACCTAGTTTC
TATTACGGGTCCCATTATTCAAGTATGGGAAGTGTGTTGTATTACCTGTTGAGATTAGAG
CCATTTACATCTCTTCATCGTAGTCTACAGGGTGGTAAATTTGATCACGCAGATCGTCTT
TTTCAAAGTATTGAGGGGACATATCGAAATTGCCTGTCAAATACAAGCGATGTAAAAGAA
TTGATCCCTGAGTTCTTCTACATGCCTGAATTTCTGGTGAATTCCAACTCTTACCACCTT
GGAGTGAAACAAGACGGTGAACCTCTCGGAGATATTTGTCTACCTCCATGGGCTAAGAGG
TGTTTATTGCTCGTAATAGATAAGCCTTAGAGAGCGAGTATGTTAGCTCACATCTCATGA
ATGGATTGATTTGATATTTGGACATAACAGCGTGCAAACAGCTGTGGAGGCAGCAAGTAT
CTTTTTTACTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP95TF U 1
AF RR2H739TF U 1
BS 1 376 RR2GP95TF
BS 377 791 RR2H739TF

RD RR2GP95TF 376 0 0
GGAATGAATTTCTGTTTCCGAAGAGTGTTGCTAGGGACAGGACAGCTGTGATTTCCTTTG
TTGACAGACGTGTAGCTATGGAGATGGCAGAAACAGCGAGAGACAGATGGAGAAGAAGAG
AGATTACAAACTTTGAATACTTGATGATTCTCAACACCCTTGCAGGCAGATCCTATAATG
ATTTGACTCAGTATCCTGTTTTCCCTTGGGTGGTGGCTGACTACTCATCTGAGACTCTTG
ATTTTAGTAAAGCATCTACCTTTCGTGATCTTTCTAAACCGGTTGGAGCTTTAGATTCAA
GAAGGTTTGAGGTTTTTGAGGACAGATACCAGCTTCTCTGATCCTGATATACCTAGTTTC
TATTACGGGTCCCATT

QA 1 376 1 376
DS 

RD RR2H739TF 791 0 0
GGAATGAATTTCTGTTTCCGAAGAGTGTTGCTAGGGACAGGACAGCTGTGATTTCCTTTG
TTGACAGACGTGTAGCTATGGAGATGGCAGAAACAGCGAGAGACAGATGGAGAAGAAGAG
AGATTACAAACTTTGAATACTTGATGATTCTCAACACCCTTGCAGGCAGATCCTATAATG
ATTTGACTCAGTATCCTGTTTTCCCTTGGGTGGTGGCTGACTACTCATCTGAGACTCTTG
ATTTTAGTAAAGCATCTACCTTTCGTGATCTTTCTAAACCGGTTGGAGCTTTAGATTCAA
GAAGGTTTGAGGTTTTTGAGGACAGATACCAGCTTCTCTGATCCTGATATACCTAGTTTC
TATTACGGGTCCCATTATTCAAGTATGGGAAGTGTGTTGTATTACCTGTTGAGATTAGAG
CCATTTACATCTCTTCATCGTAGTCTACAGGGTGGTAAATTTGATCACGCAGATCGTCTT
TTTCAAAGTATTGAGGGGACATATCGAAATTGCCTGTCAAATACAAGCGATGTAAAAGAA
TTGATCCCTGAGTTCTTCTACATGCCTGAATTTCTGGTGAATTCCAACTCTTACCACCTT
GGAGTGAAACAAGACGGTGAACCTCTCGGAGATATTTGTCTACCTCCATGGGCTAAGAGG
TGTTTATTGCTCGTAATAGATAAGCCTTAGAGAGCGAGTATGTTAGCTCACATCTCATGA
ATGGATTGATTTGATATTTGGACATAACAGCGTGCAAACAGCTGTGGAGGCAGCAAGTAT
CTTTTTTACTT

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL5500Contig1 1349 2 2 U
GGACATGTTCTTCAGTTTCTCTTCTGGCATGATGATGAAAGTTTCAGACTCGTCTTCACC
TACTGGAGTTCTCGAAGAGTTCTTCAGAACAGAAGAATTCGAAAGCTCCCAGAGTACAAC
TACCAATAAGAACCCTTCCTCCTCTCGTTTCCGCAGGGTTGTTCAACTTCTAAGAAGCAC
GTCGAAAAAATCGCTAGAGAATCTGAAGGTCCCGTTTAAGTACAACAATGCCGTTACAAG
CTCTTTGAGAAGATGCAGTAGCTTGAGAGACACTCTCAGATTGGGCTCCTCCAGTGATTC
TCACGTTCTTGCACACTCTCCGCGAAGAATCTTTTCTTTTTCTGATCTCAAAACTGCCAC
CAACAATTTCGCTCCAGATAATCTAATTGGAGAAGGAGGTTATGCTGAAGTTTACAAGGG
GAAGTTTTCAAATGGCCAAGTGGTAGCCATAAAACGTCTGATGCGTGGAAACAACGAAGA
GATCATTGGAGATTTTCTATCAGAGATGGGAATAATGGCACATGTTAATCATCCAAACAT
AGCCAAGCTTTTAGGCTATGGTGTCGAAGGAGGAATGCACCTTGTTCTTGAGTTGTCACC
CCATGGGAGTTTAGCTTCTATGCTTTATAGCTCAAAGGAGAAGATGAAATGGAGCATCAC
GTACAAAATAGCTTTGGGAGTTGCAGAGGGTCTGGTGTATCTTCACAGAGGATGTCACAG
GAGAATAATTCACAGAGATATCAAAGCCGCAAACATTCTTCTCACGCATGATTTTTCGCC
TCAGATATGCGACTTTGGGCTTGCGGAGTGGCTACCTGAACACTGGACGAACCATATAGT
TTCCAAATTTGAGGGCACATTTGGATATCTTGCTCCTGAGTACTTAACACATGGGATAGT
AGATGAAAAGACCGATGTATTCTCCCTGGGTGTACTTTTACTAGAACTTGTTACTGGACG
ACGAGCTCTTGACTATTCCAAGCAAAGTCTTGCTCTATGGGCTAAACCATTGATGAAGAA
GAACAAAATTAGAGAGCTAATTGATCCATCTTTAGCGGGCGAATATGATTGGATGCAGAT
TAAACTTGTGCTTCTAGCTGCTTCGCTATCAATCCAAGAATCATCAATAGAGAGGCCTGG
GATGAGTCAGGTCGTTGAGATCCTTAAAGGCAACTTGAACGATCTCAAGTGCATCATGAA
ATGCAGAGTTCCCTTTTATCGAAAAGCTTTTAGAGATGAGAACATGTCAAAAAATATTCA
GAAAGTTAGATCTTGAAGAAAGGAAATGGATGAAAACCCACAAAGGGAAAAAAGATATTA
CATCATTTTTGAATAAAAATTCGTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT64TF U 1
AF RR2CT64JQ C 596
BS 1 706 RR2CT64TF
BS 707 1349 RR2CT64JQ

RD RR2CT64TF 706 0 0
GGACATGTTCTTCAGTTTCTCTTCTGGCATGATGATGAAAGTTTCAGACTCGTCTTCACC
TACTGGAGTTCTCGAAGAGTTCTTCAGAACAGAAGAATTCGAAAGCTCCCAGAGTACAAC
TACCAATAAGAACCCTTCCTCCTCTCGTTTCCGCAGGGTTGTTCAACTTCTAAGAAGCAC
GTCGAAAAAATCGCTAGAGAATCTGAAGGTCCCGTTTAAGTACAACAATGCCGTTACAAG
CTCTTTGAGAAGATGCAGTAGCTTGAGAGACACTCTCAGATTGGGCTCCTCCAGTGATTC
TCACGTTCTTGCACACTCTCCGCGAAGAATCTTTTCTTTTTCTGATCTCAAAACTGCCAC
CAACAATTTCGCTCCAGATAATCTAATTGGAGAAGGAGGTTATGCTGAAGTTTACAAGGG
GAAGTTTTCAAATGGCCAAGTGGTAGCCATAAAACGTCTGATGCGTGGAAACAACGAAGA
GATCATTGGAGATTTTCTATCAGAGATGGGAATAATGGCACATGTTAATCATCCAAACAT
AGCCAAGCTTTTAGGCTATGGTGTCGAAGGAGGAATGCACCTTGTTCTTGAGTTGTCACC
CCATGGGAGTTTAGCTTCTATGCTTTATAGCTCAAAGGAGAAGATGAAATGGAGCATCAC
GTACAAAATAGCTTTGGGAGTTGCAGAGGGTCTGGTGTATCTTCAC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2CT64JQ 754 0 0
TCACCCCATGGGAGTTTAGCTTCTATGCTTTATAGCTCAAAGGAGAAGATGAAATGGAGC
ATCAGGTACAAAATAGCTTTGGGAGTTGCAGAGGGTCTGGTGTATCTTCACAGAGGATGT
CACAGGAGAATAATTCACAGAGATATCAAAGCCGCAAACATTCTTCTCACGCATGATTTT
TCGCCTCAGATATGCGACTTTGGGCTTGCGGAGTGGCTACCTGAACACTGGACGAACCAT
ATAGTTTCCAAATTTGAGGGCACATTTGGATATCTTGCTCCTGAGTACTTAACACATGGG
ATAGTAGATGAAAAGACCGATGTATTCTCCCTGGGTGTACTTTTACTAGAACTTGTTACT
GGACGACGAGCTCTTGACTATTCCAAGCAAAGTCTTGCTCTATGGGCTAAACCATTGATG
AAGAAGAACAAAATTAGAGAGCTAATTGATCCATCTTTAGCGGGCGAATATGATTGGATG
CAGATTAAACTTGTGCTTCTAGCTGCTTCGCTATCAATCCAAGAATCATCAATAGAGAGG
CCTGGGATGAGTCAGGTCGTTGAGATCCTTAAAGGCAACTTGAACGATCTCAAGTGCATC
ATGAAATGCAGAGTTCCCTTTTATCGAAAAGCTTTTAGAGATGAGAACATGTCAAAAAAT
ATTCAGAAAGTTAGATCTTGAAGAAAGGAAATGGATGAAAACCCACAAAGGGAAAAAAGA
TATTACATCATTTTTGAATAAAAATTCGTTATGC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL5501Contig1 669 2 5 U
GATAAATAAGAAAAGTGTAGCTTACAATATCTTACTTATGAGCCAAAGACCAAGTGGTAA
AAACAAACAGAACAAAGGAACTTATTTTTTGGTGCAATCCCTAAACTCTAAAATCAAAAC
CACTTCACTTCATAAGAGAGGGTTTCAATAACAATTATAATATAGGATATGATATTAGAC
AGAGAGGAAACAAAAAGCCCATCCTCTCCTAAACTTTGACGCAAAAGTCTTTTAAGCTTG
GATGGGAATATCTTGATGAGTGTAAGCAATCCCATTGTCTCCATCCACAACTTGTCCTTT
TCCTCTCATTATCCATCTGGTTGTAAGTAATCCCTCGACTCCCACTGGACCACGGGCATG
GATCCTGCCTGTGCTTATCCCAACCTCAGCACCAAGTCCAAATCGAAAACCATCAAAAAA
TCTTGTGCTTGCATTGTGGAACACAGCAGCACTGTCTACTTGGCGAAGGAATAGCTCTGC
GACTTCAGGATCCTCTGTCACAATACAGTCTGTGTGTGCACTCCCATGTCTGTGAATGTG
ATCTATAGCACCATAAACGTCTTCTACAACTTCAACAGTGCACGCCTTGGAACAGTACTC
ATGATTGAAAGACCGTGCTTCTGGTAGGTTAAGTATTTTACTTGCCTTTGGTCCACCATA
CAAAGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK84JQ U 23
AF RR2AX03JQ U 1
BS 1 258 RR2AX03JQ
BS 259 259 RR2DK84JQ
BS 260 272 RR2AX03JQ
BS 273 273 RR2DK84JQ
BS 274 669 RR2AX03JQ

RD RR2DK84JQ 392 0 0
TACAATATCTTACTTATGAGCCAAAGACCAAGTGGTAAAAACAAACAGAACAAAGGAACT
TATTTTTTGGTGCAATCCCTAAACTCTAAAATCAAAACCACTTCACTTCATAAGAGAGGG
TTTCAATAACAATTATAATATAGGATATGATATTAGACAGAGAGGAAACAAAAAGCCCAT
CCTCTCCTAGACTTTGACGCAAAAGTCTTTTAAGCTTGGATGGGAATATCTTGATGAGTG
TAAGCAATCCCATTGTCTCCATCCACAACTTGTCCTTTTCCTCTCATTATCCATCTGGTT
GTAAGTAATCCCTCGACTCCCACTGGACCACGGGCATGGATCCTGCCTGTGCTTATCCCA
ACCTCAGCACCAAGTCCAAATCGAAAACCATC

QA 1 392 1 392
DS 

RD RR2AX03JQ 669 0 0
GATAAATAAGAAAAGTGTAGCTTACAATATCTTACTTATGAGCCAAAGACCAAGTGGTAA
AAACAAACAGAACAAAGGAACTTATTTTTTGGTGCAATCCCTAAACTCTAAAATCAAAAC
CACTTCACTTCATAAGAGAGGGTTTCAATAACAATTATAATATAGGATATGATATTAGAC
AGAGAGGAAACAAAAAGCCCATCCTCTCCTAAACTTTGACGCAAAAGTCTTTTAAGCTTG
GATGGGAATATCTTGATGGGTGTAAGCAATCCTATTGTCTCCATCCACAACTTGTCCTTT
TCCTCTCATTATCCATCTGGTTGTAAGTAATCCCTCGACTCCCACTGGACCACGGGCATG
GATCCTGCCTGTGCTTATCCCAACCTCAGCACCAAGTCCAAATCGAAAACCATCAAAAAA
TCTTGTGCTTGCATTGTGGAACACAGCAGCACTGTCTACTTGGCGAAGGAATAGCTCTGC
GACTTCAGGATCCTCTGTCACAATACAGTCTGTGTGTGCACTCCCATGTCTGTGAATGTG
ATCTATAGCACCATAAACGTCTTCTACAACTTCAACAGTGCACGCCTTGGAACAGTACTC
ATGATTGAAAGACCGTGCTTCTGGTAGGTTAAGTATTTTACTTGCCTTTGGTCCACCATA
CAAAGTGAC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL5502Contig1 437 2 2 U
AAAAAGACTCTCGAGAGTATTTATTGAGAGAGATACTACTCCAGTGTTCAGTTACATGAA
TTATAATATGGATAGTTGCTTATAACAAAATCATATTGAGAAAAAAAGAATGTTAACATT
TTCAAAAATAAGACGATGGCAAATACTACCATTTTAAAAAACTTTGGCAACATCCTTCAT
AAGTCCAGGATTGGCAGCTGCAAAATCAGTGAATTCTTGAAACGATATGTTTCCATCACC
ATCAGTATCGATTTTAGCCATCATACGAGTCACGTCATCAGGGGTCACCGAGCCAAGTTT
CTTAAGAGCTTCTTCAAGTTCGGCTGCTGATATTTTACCATCGCCGTCAGTATCAAATTT
CTTGAATATACGTTCGTGCTCAGCTTTATCCGCCATTATGTGTGTCTATGTGTTTTAAAG
ATCGTTTTCCTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CB34TF C 1
AF RR2CB34JQ U 49
BS 1 48 RR2CB34TF
BS 49 437 RR2CB34JQ

RD RR2CB34TF 437 0 0
AAAAAGACTCTCGAGAGTATTTATTGAGAGAGATACTACTCCAGTGTTCAGTTACATGAA
TTATAATATGGATAGTTGCTTATAACAAAATCATATTGAGAAGAAAAGAATGTTAACATT
TTCAAAAATAAGACGATGGCAAATACTACCATTTTAGAAAACTTTGGCAACATCCTTCAT
AAGTCCAGGATTGGCAGCTGCAAAATCAGTGAATTCTTGAAACGATATGTTTCCATCACC
ATCAGTATCGATTTTAGCCATCATACGAGTCACGTCATCAGGGGTCACCGAGCCAAGTTT
CTTAAGAGCTTCTTCAAGTTCGGCTGCTGATATTTTACCATCGCCGTCAGTATCAAATTT
CTTGAATATACGTTCGTGCTCAGCTTTATCCGCCATTATGTGTGTCTATGTGTTTTAAAG
ATCGTTTTCCTTTTTCC

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR2CB34JQ 389 0 0
CAGTTACATGAATTATAATATGGATAGTTGCTTATAACAAAATCATATTGAGAAAAAAAG
AATGTTAACATTTTCAAAAATAAGACGATGGCAAATACTACCATTTTAAAAAACTTTGGC
AACATCCTTCATAAGTCCAGGATTGGCAGCTGCAAAATCAGTGAATTCTTGAAACGATAT
GTTTCCATCACCATCAGTATCGATTTTAGCCATCATACGAGTCACGTCATCAGGGGTCAC
CGAGCCAAGTTTCTTAAGAGCTTCTTCAAGTTCGGCTGCTGATATTTTACCATCGCCGTC
AGTATCAAATTTCTTGAATATACGTTCGTGCTCAGCTTTATCCGCCATTATGTGTGTCTA
TGTGTTTTAAAGATCGTTTTCCTTTTTCC

QA 1 389 1 389
DS 



AS 1 2

CO CL5503Contig1 1241 2 2 U
GCGCTGTGGGGAGGTTTCAGACAGTTCGCTCACTGTTGAGAACAGCTAAATCAAGAGAAT
CTTCTTCATTTCCCTTCCGTAGTGGAAATGAGTTCCCTTGGACTCAAGTTGATGATGGTT
TCAGATTGGGGTGTGGGAGGAGCTTTCATTCTTCTCTTTTGTCACGTTCCTGATACTCAT
GGGAAAAGCGTGTATTCAAGCTTATATGAGAGCCACAACGCTGCCACCACACATTTGCTT
CGATCTACAATGATTGCAGAGGCTGTTCCGTTTAGCTGTGATAAAAGATATGCTACAACA
CAAGTTAAGGCTCCACCTCAGCTACAGAAAACGGGTGCGGTTAGAGTTTCGATGGTAAGC
CCTGGATTTGTTTACGAGCCCTACGCACTCCATGAGAACATCCCCCTGGTGGCGGAGATG
TTTCACAAGAAGCGGTTGGAAAAGAACCAAAGAGGATTTTGTTCGGGAGCTAAGAAGTGC
CTACGCTATCGCAAAGTTAAGGAAGACTGGGTACTCGAAGAATAAGTTCTACGTAGAAGC
ACTGGAGTTATACAAAGAGATTAACATTATGATGGCCAGTGGTGACAAGAAGACAATAAG
GAAAAACGTAACTGAGAGGATGTATTTTGCATTGAAGAACGAAATTAAGCAAAGAGAAGC
CAGGTGGGGTAGTGTTTACTGGGAATTGGTTGAGCCGGTCATCAAAATCAAAACTTTACA
AGCTCGACTGATTGGCATCGACAGGACAGACCTCAACAAAGCATTCATACAACTGACACT
TGAGTTTTTGACAAAGTAGAAATTTGAAGCATACGATACAAAAGGCAATGTAGTAGCTGG
AGACAAGAAGAAAGAGGTGCTTGTACGTGACATCTGGGTCTTTGAGAAGTTTTTGTTCCA
CACAGGAGCTTGCTGGGGTCTTTGTGGCCGTATTGAATTTCCTTCAAAGGATAAAATCCA
ACCTGCCGTTTGATAGTTCTTTGCTGAGTCAGTATTCTCTATACAATTTGCATTTTTTTA
GGCTCTGTTGCAACTAAAGCGTGAATGTTATCTGATTAGGCTCTAGATACATCCACTTTG
CGAGAACCATTAATAAGTGCAAAGACATCAGAAAGAAAACTTTTGGCTTGTAAGAACCCC
GTTGGAACCAGTTTTCATTTTCTTTTTTTCATTTTCTTTTGTAGTTCCATTTTAACAGAG
AATGGGTTTTGTTGCTTCTGTCGCTTACTTTGATATCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B859TF U 1
AF RR2B859JQ C 515
BS 1 596 RR2B859TF
BS 597 1241 RR2B859JQ

RD RR2B859TF 596 0 0
GCGCTGTGGGGAGGTTTCAGACAGTTCGCTCACTGTTGAGAACAGCTAAATCAAGAGAAT
CTTCTTCATTTCCCTTCCGTAGTGGAAATGAGTTCCCTTGGACTCAAGTTGATGATGGTT
TCAGATTGGGGTGTGGGAGGAGCTTTCATTCTTCTCTTTTGTCACGTTCCTGATACTCAT
GGGAAAAGCGTGTATTCAAGCTTATATGAGAGCCACAACGCTGCCACCACACATTTGCTT
CGATCTACAATGATTGCAGAGGCTGTTCCGTTTAGCTGTGATAAAAGATATGCTACAACA
CAAGTTAAGGCTCCACCTCAGCTACAGAAAACGGGTGCGGTTAGAGTTTCGATGGTAAGC
CCTGGATTTGTTTACGAGCCCTACGCACTCCATGAGAACATCCCCCTGGTGGCGGAGATG
TTTCACAAGAAGCGGTTGGAAAAGAACCAAAGAGGATTTTGTTCGGGAGCTAAGAAGTGC
CTACGCTATCGCAAAGTTAAGGAAGACTGGGTACTCGAAGAATAAGTTCTACGTAGAAGC
ACTGGAGTTATACAAAGAGATTAACATTATGATGGCCAGTGGTGACAAGAAGACAA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2B859JQ 727 0 0
TCGAAGAATAAGTTCTACGTAGAAGCACTGGAGTTATACAAAGAGATTAACATTATGATG
GCCAGTGGTGACAAGAAGACAATAAGGAAAAACGTAACTGAGAGGATGTATTTTGCATTG
AAGAACGAAATTAAGCAAAGAGAAGCCAGGTGGGGTAGTGTTTACTGGGAATTGGTTGAG
CCGGTCATCAAAATCAAAACTTTACAAGCTCGACTGATTGGCATCGACAGGACAGACCTC
AACAAAGCATTCATACAACTGACACTTGAGTTTTTGACAAAGTAGAAATTTGAAGCATAC
GATACAAAAGGCAATGTAGTAGCTGGAGACAAGAAGAAAGAGGTGCTTGTACGTGACATC
TGGGTCTTTGAGAAGTTTTTGTTCCACACAGGAGCTTGCTGGGGTCTTTGTGGCCGTATT
GAATTTCCTTCAAAGGATAAAATCCAACCTGCCGTTTGATAGTTCTTTGCTGAGTCAGTA
TTCTCTATACAATTTGCATTTTTTTAGGCTCTGTTGCAACTAAAGCGTGAATGTTATCTG
ATTAGGCTCTAGATACATCCACTTTGCGAGAACCATTAATAAGTGCAAAGACATCAGAAA
GAAAACTTTTGGCTTGTAAGAACCCCGTTGGAACCAGTTTTCATTTTCTTTTTTTCATTT
TCTTTTGTAGTTCCATTTTAACAGAGAATGGGTTTTGTTGCTTCTGTCGCTTACTTTGAT
ATCTTCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL5504Contig1 1113 2 2 U
GGATCCACAAACCAACGAACTCAAAACATCCAATCAAATCTAAAACTCAGATTCTCTCGA
AAAAATTCTGAGACATGGCTTACAATAGCTACAACAAGAACAACATTGTCGTTGTGTTCG
ACTTCGACAAGACAATCATCGACGTCGATAGCGACAATTGGGTGGTTGATGGACTTGGCT
TCACTGATTTGTTCAATCAACTTCTCCCCACCATGCCTTGGAACACACTCATGGACCGTA
TGATGAAGGAGCTTCATGATCAAGGCAAAACCATTGAAGAGATCAAAGAAGTTCTAAAAA
AAATCCCTATCCATCCACGAGTCGTCCCTGCGATCAAATCTGCACATGCTTTAGGGTGTG
AGCTTAGGATAGTAAGCGACGCCAACATGTTCTTCATCGAAACCATCGTTGAGCACCTTG
GGATTAGTGAATACTTCTCTGAGATCAACTCGAACCCAGGGTTTGTCGATGAGCATGACA
CGTTGCGAATTTCTCCTTACCATGATTTCACCAACTCATCTCATGGTTGCTCTCATCGCA
CGTGCCCTCCTAACATGTGCAAGGGACTGATTATTGAGAGGATTCAAGAATCACTAGCTA
AAGAAGGAAAGAAGAAGATGATCTACCTTGGAGATGGAGCTGGTGATTACTGTCCAACTT
TAAAACTAAAGTCTGAAGATTACGCGATGCCACGTAAGAATTTCCCGGTTTGGGATCTGA
TTAGTCAAAACCCGATGCTGGTTAAAGCAGCTATTAGAGAATGGACCGATGGTGAAAGCT
TGGAGAGGATCTTAATAGGAATCATCGAGGAGATTCTATTGGAGGAAGAGAACGAGAAGA
AGATGTTGACTAATGACTGCAAGATGCAGAACATCTCTGTCGGGATTAATGTTCATCATG
AGCCAATAATGCCCCGTGCTCTTCGAGTTTCTCAGTCCGGTTAATTAGATGGTTTGATAT
AACGGAGGAAGAGTAATATTATCTGTGGTGACTCTTTTCCTCGTCATAGTATACCAAAAT
ATTGAACTTTATCCTAAGTAAAGATATAAGATGCAACGATGAAGTTGTATGATTGCGATT
TTTGTTCTTTTAACAAGTACTTGTTTGGCTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW67TF U 1
AF RR2GW67JQ C 317
BS 1 702 RR2GW67TF
BS 703 1113 RR2GW67JQ

RD RR2GW67TF 702 0 0
GGATCCACAAACCAACGAACTCAAAACATCCAATCAAATCTAAAACTCAGATTCTCTCGA
AAAAATTCTGAGACATGGCTTACAATAGCTACAACAAGAACAACATTGTCGTTGTGTTCG
ACTTCGACAAGACAATCATCGACGTCGATAGCGACAATTGGGTGGTTGATGGACTTGGCT
TCACTGATTTGTTCAATCAACTTCTCCCCACCATGCCTTGGAACACACTCATGGACCGTA
TGATGAAGGAGCTTCATGATCAAGGCAAAACCATTGAAGAGATCAAAGAAGTTCTAAAAA
AAATCCCTATCCATCCACGAGTCGTCCCTGCGATCAAATCTGCACATGCTTTAGGGTGTG
AGCTTAGGATAGTAAGCGACGCCAACATGTTCTTCATCGAAACCATCGTTGAGCACCTTG
GGATTAGTGAATACTTCTCTGAGATCAACTCGAACCCAGGGTTTGTCGATGAGCATGACA
CGTTGCGAATTTCTCCTTACCATGATTTCACCAACTCATCTCATGGTTGCTCTCATCGCA
CGTGCCCTCCTAACATGTGCAAGGGACTGATTATTGAGAGGATTCAAGAATCACTAGCTA
AAGAAGGAAAGAAGAAGATGATCTACCTTGGAGATGGAGCTGGTGATTACTGTCCAACTT
TAAAACTAAAGTCTGAAGATTACGCGATGCCACGTAAGAATT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2GW67JQ 797 0 0
ACGAGTCGTCC*TGCGATCAAATCTGCACATGCTTTAGG*TGTGAGCTTAGGATAGTAAG
CGACGCCAACATGTTCTTCATCGAAACCATCGTTGAGCACCTTGGGATTAGTGAATACTT
CTCTGAGATCAACTCGAACCCAGGGTTTGTCGATGAGCATGACACGTTGCGAATTTCTCC
TTACCATGATTTCACCAACTCATCTCATGGTTGCTCTCATCGCACGTGCCCTCCTAACAT
GTGCAAGGGACTGATTATTGAGAGGATTCAAGAATCACTAGCTAAAGAAGGAAAGAAGAA
GATGATCTACCTTGGAGATGGAGCTGGTGATTACTGTCCAACTTTAAAACTAAAGTCTGA
AGATTACGCGATGCCACGTAAGAATTTCCCGGTTTGGGATCTGATTAGTCAAAACCCGAT
GCTGGTTAAAGCAGCTATTAGAGAATGGACCGATGGTGAAAGCTTGGAGAGGATCTTAAT
AGGAATCATCGAGGAGATTCTATTGGAGGAAGAGAACGAGAAGAAGATGTTGACTAATGA
CTGCAAGATGCAGAACATCTCTGTCGGGATTAATGTTCATCATGAGCCAATAATGCCCCG
TGCTCTTCGAGTTTCTCAGTCCGGTTAATTAGATGGTTTGATATAACGGAGGAAGAGTAA
TATTATCTGTGGTGACTCTTTTCCTCGTCATAGTATACCAAAATATTGAACTTTATCCTA
AGTAAAGATATAAGATGCAACGATGAAGTTGTATGATTGCGATTTTTGTTCTTTTAACAA
GTACTTGTTTGGCTGAG

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL5505Contig1 901 2 2 U
GGGCGATACAGGAGAGGGGTATAGCATTCAGGTGGGGGAATCTTGAAACTTCTTGTTGTG
ATGATAAAGTCTTTGGCTTCCCCTTGTAGTGGATTTGGATCTCAGAAACTTGACAGCTCT
TGTAAGAAACTGAAGCAGAGAGCAGTAAGAATGGAACTCACAATCACTCAACCTGATGAT
CGGCATCTCCATCTCCGTGACGGTGATCTTCTTCAGGCTGTTGTTCCCCACAGTGCGAGT
AATTTTAGGAGAGCGATTGTGATGCCAAACCTGAAACCGCCTGTTACAACCACTGCAGCT
GCCATTACTTACCGTGAATCTATCATGAAAGCTTTGCCACATGGGAGCAGCTTTGATCCA
TTAATGACTCTTTATTTGACTGACAAAACCCATCCTGATGAGATCAAGCTTGCCCGGGAA
AGTGGTGTGGTTTATGCGGTGAAGCTGTACCCTGCTGGAGCCACAACCAACTCTCAAGAT
GGTGTCACAGACCTCTTTGGAAAATGCTTACCAGTACTTGAAGAGATGGTCAAACAAAAC
ATGCCTTTACTGGTTCATGGAGAGGTCACAGATCCAAATATTGATGTGTTTGACCGCGAG
AAAATCTTCATTGAGACAGTTCTCCAGCCTCTAATCCAGCGCCTTCCACAGCTTAAAGTA
GTGATGGAACACATCACCACCATGGATGCTGTGAACTTTGTTGAATCTTGCAAAGGGTTT
GTGAGTAAGGAGGAGATTGCTGGATGCATTTCTGAGGTTATGGAAGGAGAGAAAGGGAAA
GTGATGAGGAAGAATGTTGAAAATTTTAAGGTATTGGCACGTGAGGCTATTTCAGAAGGA
GGTAGTTCCGACAGGAGCATTGATGAATTCGTTGCTATGATGACTTGAAAATCTGAAACC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2GU90TF U 1
AF RR2GU90JQB C 324
BS 1 704 RR2GU90TF
BS 705 901 RR2GU90JQB

RD RR2GU90TF 711 0 0
GGGCGATACAGGAGAGGGGTATAGCATTCAGGTGGGGGAATCTTGAAACTTCTTGTTGTG
ATGATAAAGTCTTTGGCTTCCCCTTGTAGTGGATTTGGATCTCAGAAACTTGACAGCTCT
TGTAAGAAACTGAAGCAGAGAGCAGTAAGAATGGAACTCACAATCACTCAACCTGATGAT
CGGCATCTCCATCTCCGTGACGGTGATCTTCTTCAGGCTGTTGTTCCCCACAGTGCGAGT
AATTTTAGGAGAGCGATTGTGATGCCAAACCTGAAACCGCCTGTTACAACCACTGCAGCT
GCCATTACTTACCGTGAATCTATCATGAAAGCTTTGCCACATGGGAGCAGCTTTGATCCA
TTAATGACTCTTTATTTGACTGACAAAACCCATCCTGATGAGATCAAGCTTGCCCGGGAA
AGTGGTGTGGTTTATGCGGTGAAGCTGTACCCTGCTGGAGCCACAACCAACTCTCAAGAT
GGTGTCACAGACCTCTTTGGAAAATGCTTACCAGTACTTGAAGAGATGGTCAAACAAAAC
ATGCCTTTACTGGTTCATGGAGAGGTCACAGATCCAAATATTGATGTGTTTGACCGCGAG
AAAATCTTCATTGAGACAGTTCTCCAGCCTCTAATCCAGCGCCTTCCACAGCTTAAAGTA
GTGATGGAACACATCACCACCATGGATGCTGTGAACTTTGTTGA
TCTGCAA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2GU90JQB 578 0 0
CATGAAAGCTTTGCCACATGGGAGCAGCTTTGATCCATTAATGACTCTTTATTTGACTGA
CAAAACCCATCCTGATGAGATCAAGCTTGCCCGGGAAAGTGGTGTGGTTTATGCGGTGAA
GCTGTACCCTGCTGGAGCCACAACCAACTCTCAAGATGGTGTCACAGACCTCTTTGGAAA
ATGCTTACCAGTACTTGAAGAGATGGTCAAACAAAACATGCCTTTACTGGTTCATGGAGA
GGTCACAGATCCAAATATTGATGTGTTTGACCGCGAGAAAATCTTCATTGAGACAGTTCT
CCAGCCTTTAATCCAGCGCCTTCCACAGCTTAAAGTAGTGATGGAACACATCACCACCAT
GGATGCTGTGAACTTTGTTGAATCTTGCAAAGGGTTTGTGAGTAAGGAGGAGATTGCTGG
ATGCATTTCTGAGGTTATGGAAGGAGAGAAAGGGAAAGTGATGAGGAAGAATGTTGAAAA
TTTTAAGGTATTGGCACGTGAGGCTATTTCAGAAGGAGGTAGTTCCGACAGGAGCATTGA
TGAATTCGTTGCTATGATGACTTGAAAATCTGAAACCC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL5506Contig1 1067 2 2 U
CCGGCGAGGCGTTTAAAATGGCGGCAGCCTTGCCTTTATCTCCGCATCAGTCATGTCGGG
GAAGCAACAGGTTCTGGTACAACGCTATGTCTCCCCGGTTCTGTGGGCCCAGTTTCTTGG
TTTCTTCTCCCTGTTGCATCGGCGTGAAAGGAATCGGCTTGTCCAGTCAGTTACGGGCTC
GCCACCCTCTGATCTCTTCAGCAGCTTCGACTGATTATCTATTGCATGACGTTGAAGCCA
CCGTGGCAGTTCTTGGTGGAGCCTACGCGCTAGTCTTACTCTTCGAGAGTCTCACGAAGC
GAGACGTGATTCCACAGAGATTGAGCAGAAAGCTTGTGCATATACTCTCAGGTCTGCTTT
TCGTGCTCTCGTGGCCAATCTTCAGCGCATCGATGGAGGCTAGATACTTTGCTGCTTTTG
TTCCGTTAGTGAATGGCTTAAGGCTTATTGTCAACGGGTTTTCCGTCTCCCCTAACTCCA
CGCTAATCAAATCAGTCACTAGGGAAGGAAGACCAGAAGAGTTGCTTAAAGGTCCATTGT
TCTACGTTCTAGCCCTTCTCGTTGCTGCGGTTTTCTTCTGGAGAGATTCTCCTACCGGTA
TGATCTCGTTGGCAATGATGTGTGGTGGCGACGGAATAGCTGATATCATGGGACGTAAGT
ATGGATCATACAAGATACCTTACAACCCAAGAAAGAGCTTGGCGGGAAGCATCTCAATGT
TCATATTCGGCTTTTTCATCTCCATCGGATTACTTTACTATTACTCGAGCCTTGGGTACC
TTCACATGAACTGGGAAACGACCTTTACTAGAGTCGCCATAGTCTCACTGGTTGCTACGT
TGGTGGAGTCACTACCCATCACCGATCAAATAGACGACAACATTTCGGTTCCTCTGGCTA
CTATTTTGGCTGCTTACCTAAGTTTGGGATATTAGATTCATCCCTCCTAAACTGTATAAG
CTGTATTTGTATGAATACGACCTGGGAATGCAGCTACAAATATGCTACCAGTTGTATATA
TTTTACTGTTACTGGTCAAAGATTCATAACTAATTTGATTTCGGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG78TF U 1
AF RR2GG78JQB C 246
BS 1 630 RR2GG78TF
BS 631 1067 RR2GG78JQB

RD RR2GG78TF 630 0 0
CCGGCGAGGCGTTTAAAATGGCGGCAGCCTTGCCTTTATCTCCGCATCAGTCATGTCGGG
GAAGCAACAGGTTCTGGTACAACGCTATGTCTCCCCGGTTCTGTGGGCCCAGTTTCTTGG
TTTCTTCTCCCTGTTGCATCGGCGTGAAAGGAATCGGCTTGTCCAGTCAGTTACGGGCTC
GCCACCCTCTGATCTCTTCAGCAGCTTCGACTGATTATCTATTGCATGACGTTGAAGCCA
CCGTGGCAGTTCTTGGTGGAGCCTACGCGCTAGTCTTACTCTTCGAGAGTCTCACGAAGC
GAGACGTGATTCCACAGAGATTGAGCAGAAAGCTTGTGCATATACTCTCAGGTCTGCTTT
TCGTGCTCTCGTGGCCAATCTTCAGCGCATCGATGGAGGCTAGATACTTTGCTGCTTTTG
TTCCGTTAGTGAATGGCTTAAGGCTTATTGTCAACGGGTTTTCCGTCTCCCCTAACTCCA
CGCTAATCAAATCAGTCACTAGGGAAGGAAGACCAGAAGAGTTGCTTAAAGGTCCATTGT
TCTACGTTCTAGCCCTTCTCGTTGCTGCGGTTTTCTTCTGGAGAGATTCTCCTACCGGTA
TGATCTCGTTGGCAATGATGTGTGGTGGCG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2GG78JQB 822 0 0
GCAGTTCTTGGTGGAGC*TACGCGCTAGTCTTACTCTTCGAGAGTCTCACGAAGCGAGAC
GTGATTCCACAGAGATTGAGCAGAAAGCTTGTGCATATACTCTCAGGTCTGCTTTTCGTG
CTCTCGTGGCCAATCTTCAGCGCATCGATGGAGGCTAGATACTTTGCTGCTTTTGTTCCG
TTAGTGAATGGCTTAAGGCTTATTGTCAACGGGTTTTCCGTCTCCCCTAACTCCACGCTA
ATCAAATCAGTCACTAGGGAAGGAAGACCAGAAGAGTTGCTTAAAGGTCCATTGTTCTAC
GTTCTAGCCCTTCTCGTTGCTGCGGTTTTCTTCTGGAGAGATTCTCCTACCGGTATGATC
TCGTTGGCAATGATGTGTGGTGGCGACGGAATAGCTGATATCATGGGACGTAAGTATGGA
TCATACAAGATACCTTACAACCCAAGAAAGAGCTTGGCGGGAAGCATCTCAATGTTCATA
TTCGGCTTTTTCATCTCCATCGGATTACTTTACTATTACTCGAGCCTTGGGTACCTTCAC
ATGAACTGGGAAACGACCTTTACTAGAGTCGCCATAGTCTCACTGGTTGCTACGTTGGTG
GAGTCACTACCCATCACCGATCAAATAGACGACAACATTTCGGTTCCTCTGGCTACTATT
TTGGCTGCTTACCTAAGTTTGGGATATTAGATTCATCCCTCCTAAACTGTATAAGCTGTA
TTTGTATGAATACGACCTGGGAATGCAGCTACAAATATGCTACCAGTTGTATATATTTTA
CTGTTACTGGTCAAAGATTCATAACTAATTTGATTTCGGGTT

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

CO CL5507Contig1 796 2 2 U
TTTTTATTCTCCTCCTCCCAATTAACACACAAGAGACCCAAGAACAACGAAAGAATGGAT
CATGATCACATGCACGCCATGCCTCCACCGTCATCATCCATGATGAACAATGGATCCATG
AACGGAGGAGGAGGAAGCCACGAGATGATGTTGATGCACATGACTTTCTTTTGGGGCAAG
AACACGGAGGTTCTCTTCTCCGGTTGGCCAGGAACAAGCTCCGGCATGTATGCTCTCTGT
ATCATCTTTGTCTTCTTCCTCGCCGTCCTCACCGAATGGCTTGCTCACTCCTCTCTCCTC
CGTGGCACCAGCGGAGATTCTGCTAATGCCGCCTCCGGACTCGTCCAAACCGCCGTGTAC
ACCCTCCGTACCGGCCTCTCTTATCTAGTCATGCTCGCCGTTATGTCATTCAACGCCGGC
GTGTTTATTGCCGCCCTCGCTGGTCATGCCATCGGTTTCATGTTGTTTGGAAGCCAAACT
TTCCGGAATCCCTCCGGTGACCGGGAAACGAAAGATCTTCTTCCTGCCTCAGGTTGTGCT
TGTTGATTATTATATATGTATTATTATTTTATCAACACTTGTCTTTTTAAATAAATATCT
AGGGTTTGTACTTTTTTTGGTTGTTTTTGGATTGTTCTTGAGGTTCACGGGTGTTAGTGT
GAGGAGGAGGAATAATTTCTATTTGTTTTGCTTTATAATTTTTGTATTCTTCTGGTTAAT
ATGATTAAATGGTGAAAGCTGAAGATATCAATTTACAAATGTAGCAAACCGATTTGTTTT
TTACCAGAGTTCATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV57TF U 1
AF RR2DV57JQ C 516
BS 1 574 RR2DV57TF
BS 575 796 RR2DV57JQ

RD RR2DV57TF 574 0 0
TTTTTATTCTCCTCCTCCCAATTAACACACAAGAGACCCAAGAACAACGAAAGAATGGAT
CATGATCACATGCACGCCATGCCTCCACCGTCATCATCCATGATGAACAATGGATCCATG
AACGGAGGAGGAGGAAGCCACGAGATGATGTTGATGCACATGACTTTCTTTTGGGGCAAG
AACACGGAGGTTCTCTTCTCCGGTTGGCCAGGAACAAGCTCCGGCATGTATGCTCTCTGT
ATCATCTTTGTCTTCTTCCTCGCCGTCCTCACCGAATGGCTTGCTCACTCCTCTCTCCTC
CGTGGCACCAGCGGAGATTCTGCTAATGCCGCCTCCGGACTCGTCCAAACCGCCGTGTAC
ACCCTCCGTACCGGCCTCTCTTATCTAGTCATGCTCGCCGTTATGTCATTCAACGCCGGC
GTGTTTATTGCCGCCCTCGCTGGTCATGCCATCGGTTTCATGTTGTTTGGAAGCCAAACT
TTCCGGAATCCCTCCGGTGACCGGGAAACGAAAGATCTTCTTCCTGCCTCAGGTTGTGCT
TGTTGATTATTATATATGTATTATTATTTTATCA

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2DV57JQ 281 0 0
TTTTT
TTCCTGCCTCAGGTTGTGCTTGTTGATTATTATATATGTATTATTATTTTATCAACACTT
GTCTTTTTAAATAAATATCTAGGGTTTGTACTTTTTTTGGTTGTTTTTGGATTGTTCTTG
AGGTTCACGGGTGTTAGTGTGAGGAGGAGGAATAATTTCTATTTGTTTTGCTTTATAATT
TTTGTATTCTTCTGGTTAATATGATTAAATGGTGAAAGCTGAAGATATCAATTTACAAAT
GTAGCAAACCGATTTGTTTTTTACCAGAGTTCATAT

QA 6 281 6 281
DS 



AS 1 2

CO CL5508Contig1 772 2 2 U
TTTTTATCGAAACCACTCGAGCTCAGCTGCAGATGATCTCAGCTGATCATTTCTTCTCTT
TGACGTTGCTCTTTGCATAAAATTCATCAGATCTAGTGGGATTAACTTCTTCTATTTGAT
CGGATCTGATAATCACAATCCTTAGAGAAAAACATGGCAGGGGCGGCCTCCGCTCTGTTT
CTGCTCGACATCAAGGGGCGTGTCCTCGTGTGGCGCGATTACCGTGGCGATGTCACCGCT
GCTCAAGCCGAGCGTTTCTTCACCAAACTCATCGAGAAAGAGGGGGATTCACAGTCTAAT
GATCCGGTTGCTTACGATAATGGCGTAACCTACATGTTTGTACAGCATAGTAACATTTAC
CTGATGATAGCCTCCAGGCAGAACTGTAATGCTGCCAGTCTTATCACCTTCTTGCACCGC
GTTGTCGATGTCTTCAAGCATTACTTTGAGGAGTTGGAGGAAGAATCATTGAGGGATAAC
TTTGTGGTTGTGTATGAGTTACTTGATGAGATGATGGACTTTGGTTACCCTCAGTATACT
GAAGCAAGGATCCTTAGTGAGTTCATCAAGACTGATGCTTATAGAATGGAGGTTACACAG
AGACCTCCAATGGCTGTCACTAATGCTGTTTCTTGGAGGAGTGAGGGTTTACAGTTTAAG
AAAAACGAAGTTTTCTTGGACGTAATAGAGAGTGTGAATATCCTTGTGAACAGTAATGGG
CAAATTGTGAGTCTGATGTCGTTGGAGCATTGAGATGCGACCTATTTGAGGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD33TF U 1
AF RR2GM51TF U 1
BS 1 697 RR2GD33TF
BS 698 772 RR2GM51TF

RD RR2GD33TF 705 0 0
TTTTTATCGAAACCACTCGAGCTCAGCTGCAGATGATCTCAGCTGATCATTTCTTCTCTT
TGACGTTGCTCTTTGCATAAAATTCATCAGATCTAGTGGGATTAACTTCTTCTATTTGAT
CGGATCTGATAATCACAATCCTTAGAGAAAAACATGGCAGGGGCGGCCTCCGCTCTGTTT
CTGCTCGACATCAAGGGGCGTGTCCTCGTGTGGCGCGATTACCGTGGCGATGTCACCGCT
GCTCAAGCCGAGCGTTTCTTCACCAAACTCATCGAGAAAGAGGGGGATTCACAGTCTAAT
GATCCGGTTGCTTACGATAATGGCGTAACCTACATGTTTGTACAGCATAGTAACATTTAC
CTGATGATAGCCTCCAGGCAGAACTGTAATGCTGCCAGTCTTATCACCTTCTTGCACCGC
GTTGTCGATGTCTTCAAGCATTACTTTGAGGAGTTGGAGGAAGAATCATTGAGGGATAAC
TTTGTGGTTGTGTATGAGTTACTTGATGAGATGATGGACTTTGGTTACCCTCAGTATACT
GAAGCAAGGATCCTTAGTGAGTTCATCAAGACTGATGCTTATAGAATGGAGGTTACACAG
AGACCTCCAATGGCTGTCACTAATGCTGTTTCTTGGAGGAGTGAGGGTTTACAGTTTAAG
AAAAACGAAGTTTTCTTGGACGTAATAGAGAGTGTGA
TATCCTTG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2GM51TF 772 0 0
TTTTTATCGAAACCACTCGAGCTCAGCTGCAGATGATCTCAGCTGATCATTTCTTCTCTT
TGACGTTGCTCTTTGCATAAAATTCATCAGATCTAGTGGGATTAACTTCTTCTATTTGAT
CGGATCTGATAATCACAATCCTTAGAGAAAAACATGGCAGGGGCGGCCTCCGCTCTGTTT
CTGCTCGACATCAAGGGGCGTGTCCTCGTGTGGCGCGATTACCGTGGCGATGTCACCGCT
GCTCAAGCCGAGCGTTTCTTCACCAAACTCATCGAGAAAGAGGGGGATTCACAGTCTAAT
GATCCGGTTGCTTACGATAATGGCGTAACCTACATGTTTGTACAGCATAGTAACATTTAC
CTGATGATAGCCTCCAGGCAGAACTGTAATGCTGCCAGTCTTATCACCTTCTTGCACCGC
GTTGTCGATGTCTTCAAGCATTACTTTGAGGAGTTGGAGGAAGAATCATTGAGGGATAAC
TTTGTGGTTGTGTATGAGTTACTTGATGAGATGATGGACTTTGGTTACCCTCAGTATACT
GAAGCAAGGATCCTTAGTGAGTTCATCAAGACTGATGCTTATAGAATGGAGGTTACACAG
AGACCTCCAATGGCTGTCACTAATGCTGTTTCTTGGAGGAGTGAGGGTTTACAGTTTAAG
AAAAACGAAGTTTTCTTGGACGTAATAGAGAGTGTGAATATCCTTGTGAACAGTAATGGG
CAAATTGTGAGTCTGATGTCGTTGGAGCATTGAGATGCGACCTATTTGAGGG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL5509Contig1 1259 2 2 U
GGACACAAATCTCCTCTTTCTCCCTCTTCTTAAAAACTTTTTCCGTACTGAAGAAAAAAA
TGGCTGCCAAAGTAATGCCAGCAATGGCGGTTATAGTGGTTGCTGCTCTGATGGCGACCA
CAGTGAACGCCAAAATCCCCGGAGTTTACACCGGAGGTCCCTGGATCAACGCTCACGCCA
CTTTCTACGGCGAAGCTGACGCTTCAGGGACTATGGGTGGTGCGTGCGGGTACGGAAACT
TATATAGCCAAGGTTACGGTGTGAACACGGCGGCTTTAAGCACGGCCTTGTTCAACAATG
GTCTGAGTTGTGGTGCTTGCTTTGAGCTCAAATGTGTTAATGATCCAGGCTGGTGTCTTC
CAGGAAACCCATCAATCCTTATCACCGCTACTAATTTCTGTCCGCCTAACTTTGCTCAAG
CTAGCGACAATGGTGGTTGGTGTAACCCTCCGCGTGAGCACTTTGATCTCGCTATGCCTA
TGTTCCTATCCATTGCCAAGTATAAGGCCGGTATCGTCCCCGTCTCTTACCGCAGGGTTC
CATGTAGGAAGAAAGGAGGTATGAGATTCACTATTAATGGATCCAAGTACTTCAACTTGG
TGCTAGTCACTAACGTAGCCGGAGCCGGAAACGTCCAGATGGTCAGTGTTAAAGGAAGCA
ACACAGGTTGGTTAGGTCTTAGCCGTAATTGGGGACAAAACTGGCAATCAAACGCAATTC
TGGTCGGCCAATCTCTTTCTTTCCGAGTCAAAACCTCCGATGGCCGAAGCTCCACCTCCA
ACAACATCGTTCCCAGTAACTGGCAATTTGGTCAGACTTTCTCCGGCAAGAACTTCCGCG
TCTGATTTCTAGAAGATAAAACAATAATCTGCTGAAGATATATTTGAAGATTTTTTTTTC
TTCCTAATATATATATTACGTACGTGTTTTAAAATTAATTAGATACCATTTGGAATTGGG
ATTCCTACCAATTCTCCCTTATTTTCTCAGGGGAAGTATTTGGGTTGCTTCGTTTGGAAG
TTAGGTTCTCTTTAAAAACATTTAGACTTTGTGTTTTGTTTTTGGTGTGTTATGTCTTGT
TTGGTTCTGTAGAGAGGTTGAAGCGGCTTCAAAAAGAAAGGGTCGGAATAAAGATAATTG
TAGCCCGCAGCTCTCTCTCTTTTACGCTCTGATCATTGTATTAAGTATATATCTATGATA
TTAAGAAACTTGGATTTTCCATTTATATAAATAAATGATTGGCTATTCATTTTGATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU79TF U 1
AF RR2FU79JQ C 554
BS 1 662 RR2FU79TF
BS 663 1259 RR2FU79JQ

RD RR2FU79TF 662 0 0
GGACACAAATCTCCTCTTTCTCCCTCTTCTTAAAAACTTTTTCCGTACTGAAGAAAAAAA
TGGCTGCCAAAGTAATGCCAGCAATGGCGGTTATAGTGGTTGCTGCTCTGATGGCGACCA
CAGTGAACGCCAAAATCCCCGGAGTTTACACCGGAGGTCCCTGGATCAACGCTCACGCCA
CTTTCTACGGCGAAGCTGACGCTTCAGGGACTATGGGTGGTGCGTGCGGGTACGGAAACT
TATATAGCCAAGGTTACGGTGTGAACACGGCGGCTTTAAGCACGGCCTTGTTCAACAATG
GTCTGAGTTGTGGTGCTTGCTTTGAGCTCAAATGTGTTAATGATCCAGGCTGGTGTCTTC
CAGGAAACCCATCAATCCTTATCACCGCTACTAATTTCTGTCCGCCTAACTTTGCTCAAG
CTAGCGACAATGGTGGTTGGTGTAACCCTCCGCGTGAGCACTTTGATCTCGCTATGCCTA
TGTTCCTATCCATTGCCAAGTATAAGGCCGGTATCGTCCCCGTCTCTTACCGCAGGGTTC
CATGTAGGAAGAAAGGAGGTATGAGATTCACTATTAATGGATCCAAGTACTTCAACTTGG
TGCTAGTCACTAACGTAGCCGGAGCCGGAAACGTCCAGATGGTCAGTGTTAAAGGAAGCA
AC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2FU79JQ 706 0 0
AGGAGGTATGAGATTCACTATTAATGGATCCAAGTACTTCAACTTGGTGCTAGTCACTAA
CGTAGCCGGAGCCGGAAACGTCCAGATGGTCAGTGTTAAAGGAAGCAACACAGGTTGGTT
AGGTCTTAGCCGTAATTGGGGACAAAACTGGCAATCAAACGCAATTCTGGTCGGCCAATC
TCTTTCTTTCCGAGTCAAAACCTCCGATGGCCGAAGCTCCACCTCCAACAACATCGTTCC
CAGTAACTGGCAATTTGGTCAGACTTTCTCCGGCAAGAACTTCCGCGTCTGATTTCTAGA
AGATAAAACAATAATCTGCTGAAGATATATTTGAAGATTTTTTTTTCTTCCTAATATATA
TATTACGTACGTGTTTTAAAATTAATTAGATACCATTTGGAATTGGGATTCCTACCAATT
CTCCCTTATTTTCTCAGGGGAAGTATTTGGGTTGCTTCGTTTGGAAGTTAGGTTCTCTTT
AAAAACATTTAGACTTTGTGTTTTGTTTTTGGTGTGTTATGTCTTGTTTGGTTCTGTAGA
GAGGTTGAAGCGGCTTCAAAAAGAAAGGGTCGGAATAAAGATAATTGTAGCCCGCAGCTC
TCTCTCTTTTACGCTCTGATCATTGTATTAAGTATATATCTATGATATTAAGAAACTTGG
ATTTTCCATTTATATAAATAAATGATTGGCTATTCATTTTGATCCC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL5510Contig1 771 2 4 U
GGGTATAAGCCCCCCTGATAATCCCCAGGTGAAGGAAATCCGTTGTGTTGTGATGGTGCC
ACAGCTGGGAAATCACCAGCAAGTTAACCTGCCGTTAGCTCTTCCTGAGCATGATTTCTT
AAATGATCTCGAGCCATTGGGATGGCTGCACACACAGCCTAACGAGCTCCCTCAATTGTC
ACCACAGGATGTGACTGCTCATTCCCGCATTCTGGAGAACAACAATCAATGGGATGGAGA
AAAATGCATCATCCTGACATGCAGTTTCACTCCGGGTCTTGCTCTTTGACATCACATAAG
CTGACCCAAGCCGGGTATGAATGGGGACGTCTCAACAAGGTCACAGGCAGCAATCCTCAT
GGCTACCTTCCCACCCATTATGAGAAGGTTCAAATGCTATTGAGTGACCGATTCCTCGGG
TTTTACATGGTTCCTGAGAACGGATCGTGGAACTACAACTTTATGGGAGTGAAGCACACG
GTGGGCATGAAATACAGCGTCAAACTTGGAACCCCAAAGGAGTTCTATCACGAGGAACAT
CGACCCACTCATTTCCTGGAGTTCAGCAACATGGAGGAGGCTGACTTCGCTGAGGGAGAT
CGTGAAGACACCTTTGCTTGACCATTTTGTACGTTTTGTAACTTCCTTGCTAGACTTGTA
GTATCGTATGTACTAGGCAAATGCGTGTCTGGGTTGGTTTTACTGCATTGTATGGGGTGG
TAATATTATAATGTCCCCAAGTCTATGATATCTTTTGACAGTAGAGCTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H674TF U 1
AF RR2H674JQB C 361
BS 1 676 RR2H674TF
BS 677 677 RR2H674JQB
BS 678 751 RR2H674TF
BS 752 771 RR2H674JQB

RD RR2H674TF 751 0 0
GGGTATAAGCCCCCCTGATAATCCCCAGGTGAAGGAAATCCGTTGTGTTGTGATGGTGCC
ACAGCTGGGAAATCACCAGCAAGTTAACCTGCCGTTAGCTCTTCCTGAGCATGATTTCTT
AAATGATCTCGAGCCATTGGGATGGCTGCACACACAGCCTAACGAGCTCCCTCAATTGTC
ACCACAGGATGTGACTGCTCATTCCCGCATTCTGGAGAACAACAATCAATGGGATGGAGA
AAAATGCATCATCCTGACATGCAGTTTCACTCCGGGTCTTGCTCTTTGACATCACATAAG
CTGACCCAAGCCGGGTATGAATGGGGACGTCTCAACAAGGTCACAGGCAGCAATCCTCAT
GGCTACCTTCCCACCCATTATGAGAAGGTTCAAATGCTATTGAGTGACCGATTCCTCGGG
TTTTACATGGTTCCTGAGAACGGATCGTGGAACTACAACTTTATGGGAGTGAAGCACACG
GTGGGCATGAAATACAGCGTCAAACTTGGAACCCCAAAGGAGTTCTATCACGAGGAACAT
CGACCCACTCATTTCCTGGAGTTCAGCAACATGGAGGAGGCTGACTTCGCTGAGGGAGAT
CGTGAAGACACCTTTGCTTGACCATTTTGTACGTTTTGTAACTTCCTTGCTAGACTTGTA
GTATCGTATGTACTAG*CAAATGCGTGTCTGGGTTGGTTTTACTGCATTGTATGGGGTGG
TAATATTATAATGTCCCCAAGTCTATGATAT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2H674JQB 411 0 0
GGCTACCTTCCCACCCATTATGAGAAGGTTCAAATGCTATTGAGTGACCGATTCCTCGGG
TTTTACATGGTTCCTGAGAACGGATCGTGGAACTACAACTTTATGGGAGTGAAGCACACG
GTGGGCATGAAATACAGCGTCAAACTTGGAACCCCAAAGGAGTTTTATCACGAGGAACAT
CGACCCACTCATTTCCTGGAGTTCAGCAACATGGAGGAGGCTGACTTCGGTGAGGGAGAT
CGTGAAGACACCTTTGCTTGACCATTTTGTACGTTTTGTAACTTCCTTGCTAGACTTGTA
GTATCGTATGTACTAGGCAAATGCGTGTTTGGGTTGGTTTTACTGCATTGTATGGGGTGG
TAATATTATAATGTCCCCAAGTCTATGATATCTTTTGACAGTAGAGCTAAA

QA 1 411 1 411
DS 



AS 1 2

CO CL5511Contig1 982 2 2 U
GGAATCACAGCCGGGACCTGAGAAGTAAGAGTATAGCCTTGTTCTGAACTCCTTCTCTCT
CTCTCTGTATATACACTTCTGCTTCTTTACATGCAACAACAAGTCTCTTGAGAACTACTT
CTCCGTGGGTTCACACGATTCTCTCTGCGATGGCTGCGACTACTTGTGGTGAAGGGGGGA
AGCAACAACTCCCAAGTGTTGCATACTTGAACGCCCCAGTCATCAAGTATCCAAGCTTCA
AAGCTCCTAAGCCTAGCTTCACTGATGTTGCCAAACATACCTCTATAGATGTGTTTCCTC
TTGTTAAGGAGTCTGCATTTCCTTTGAAACAAGACCGTTGCATCGATCATTCACTAATCC
AAGACGTGTGCACTATAGCAGTCTTACCTGATGAAGGAAACATAACCCCTCACCGGTTTA
CTCTCTTGAGCTTCGTCAAGGCTCTGCTTCCTTCTAAAAACCAGATGCTCTCGATGCCCA
ACTCAACTGCCAGAAAACTCAGAACCGCATCAATGTGCTACTTGGAGGCACTGATTCGTA
CCAATCATGCGTTGTTGACATCAACGTCGAGAAAGGGAACGGTGCTGAGTCAGAAGAAGA
AGTTGTTGCAAGTCTCAAATCCGAGAATCACATGCAAAAGATATTGCAGAGACAAGCAAG
CTTGAGCACTGATAAAGCTATCTCAGAGAGATGGCATGATGCACCAACGAACAGGTGGAG
AAGATACAAGCGTGCTGCTTCATTTGATTCTAGGAAAATCGTCATCTTATTCTCCATCTT
ATCAAGTGTGGGGACATTGATACTGATCTACCTGACATTGAGAGTGAGGCTAATAAACGG
AGACAACAGCTTCAATCATATGTAGTTGTCAAAAACTGTAAACATCTCTATTTGGTGCAT
TGTTTTTGAATCAATCTCTTTTCCCTAAACTCTTTTTGTTTTGTTACAATAATGTGTTGA
TAAAGCCAACAATTCCTCTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP63TF U 1
AF RR2CP63JQ C 314
BS 1 704 RR2CP63TF
BS 705 982 RR2CP63JQ

RD RR2CP63TF 709 0 0
GGAATCACAGCCGGGACCTGAGAAGTAAGAGTATAGCCTTGTTCTGAACTCCTTCTCTCT
CTCTCTGTATATACACTTCTGCTTCTTTACATGCAACAACAAGTCTCTTGAGAACTACTT
CTCCGTGGGTTCACACGATTCTCTCTGCGATGGCTGCGACTACTTGTGGTGAAGGGGGGA
AGCAACAACTCCCAAGTGTTGCATACTTGAACGCCCCAGTCATCAAGTATCCAAGCTTCA
AAGCTCCTAAGCCTAGCTTCACTGATGTTGCCAAACATACCTCTATAGATGTGTTTCCTC
TTGTTAAGGAGTCTGCATTTCCTTTGAAACAAGACCGTTGCATCGATCATTCACTAATCC
AAGACGTGTGCACTATAGCAGTCTTACCTGATGAAGGAAACATAACCCCTCACCGGTTTA
CTCTCTTGAGCTTCGTCAAGGCTCTGCTTCCTTCTAAAAACCAGATGCTCTCGATGCCCA
ACTCAACTGCCAGAAAACTCAGAACCGCATCAATGTGCTACTTGGAGGCACTGATTCGTA
CCAATCATGCGTTGTTGACATCAACGTCGAGAAAGGGAACGGTGCTGAGTCAGAAGAAGA
AGTTGTTGCAAGTCTCAAATCCGAGAATCACATGCAAAAGATATTGCAGAGACAAGCAAG
CTTGAGCACTGATAAAGCTATCTCAGAGAGATGGCATGATGCAC
AACGA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2CP63JQ 669 0 0
TGCATTTCCTTTGAAACAAGACCGTTGCATCGATCATTCACTAATCCAAGACGTGTGCAC
TATAGCAGTCTTACCTGATGAAGGAAACATAACCCCTCACCGGTTTACTCTCTTGAGCTT
CGTCAAGGCTTTGCTTCCTTCTAAAAACCAGATGCTCTCGATGCCCAACTCAACTGCCAG
AAAACTCAGAACCGCATCAATGTGCTACTTGGAGGCACTGATTCGTACCAATCATGCGTT
GTTGACATCAACGTCGAGAAAGGGAACGGTGCTGAGTCAGAAGAAGAAGTTGTTGCAAGT
CTCAAATCCGAGAATCACATGCAAAAGATATTGCAGAGACAAGCAAGCTTGAGCACTGAT
AAAGCTATTTCAGAGAGATGGCATGATGCACCAACGAACAGGTGGAGAAGATACAAGCGT
GCTGCTTCATTTGATTCTAGGAAAATCGTCATCTTATTCTCCATCTTATCAAGTGTGGGG
ACATTGATACTGATCTACCTGACATTGAGAGTGAGGCTAATAAACGGAGACAACAGCTTC
AATCATATGTAGTTGTCAAAAACTGTAAACATCTCTATTTGGTGCATTGTTTTTGAATCA
ATCTCTTTTCCCTAAACTCTTTTTGTTTTGTTACAATAATGTGTTGATAAAGCCAACAAT
TCCTCTGTG

QA 1 669 1 669
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5513Contig1 1034 2 2 U
GGATACTTTTCCCGGGCATTGCCTCTTGAATGATACCAGAAGAAGGCAGGTTAAAAGAGA
GAGAGAGAAAAAGCAAGAAAGCGTAGCGAGGTTATGGCTATTGAGGTTTCTTGGTCGGAG
GCTCCTGGTTCTGGAACCAGCCCAAGAAACTCTTTTTCCTACGATTTAGACTCGAGAGAC
GGTGAAGTGAGATTAGACTCAACACTTCTTGATTCAGGTTCGGAGTTTGATTTCTGCTTT
GGCTCGAGTTGTTCTATTCAAGAAGTGGCTCCGGCTGATGAACTCTTCTCCGATGGCAAG
ATCCTTCCCGTCCAGATCAAGAAAGTAACCTTTCAGGTTCAAAGATCAGCTTCGCTCTCA
TCATCATCTTCTACCTCTTCCTCCTCTTCTTCATCATCGTTCTACAACGAGAGATCAGCA
CCAGAAAAGAAGATCATGAGACTGAAAGAGCATCTGTTGGATCCTGACTCTGATTCTGAA
GACAAGCCAAAGGGACCGTTCTTGCAGTTCAAGAGAAGCATAAGTCTCAACTACGACAAG
AGCCGAAATAGCATCAGATCGCTTCATTTCCTGTCACGAAGCAACTCCACAGGCTGTGCT
CTAAACCCTAAACATAACTTGCTTCCCAAGGAATATCATCACCATCACAAGACCTACAAT
CTTCCCAAACAAACTTATCTTAGAAGATCATCTTCGCTCTCATCTTCACTCCCTTATAAG
AAACCACCCGCCAGAAACAGCTTCGGTAACGGAAACGGTGGCATTCGAGTTAGTCCGGTC
TTAAACTTCCCGCCACCGGCGTTCATCTCGAATGTTGCCGACGGATTTTTCAGCATTGGA
TCACTCTGTAATGGTAACATGAACAGAGAGACAACATTATGAAAATATCTTTTGTCTTTT
GTGGCCTGCGAGGAGAGAGAAATGTAAACAGAAAATCTCTATTTTTTTTTTTATATATTC
ACTGTTTATTGTATAATGGAATATCGACAGCGCATGTGAAGATTAGACATCATGTGAGTT
TTGCCTATATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP11TF U 1
AF RR2CP11JQ C 351
BS 1 699 RR2CP11TF
BS 700 1034 RR2CP11JQ

RD RR2CP11TF 699 0 0
GGATACTTTTCCCGGGCATTGCCTCTTGAATGATACCAGAAGAAGGCAGGTTAAAAGAGA
GAGAGAGAAAAAGCAAGAAAGCGTAGCGAGGTTATGGCTATTGAGGTTTCTTGGTCGGAG
GCTCCTGGTTCTGGAACCAGCCCAAGAAACTCTTTTTCCTACGATTTAGACTCGAGAGAC
GGTGAAGTGAGATTAGACTCAACACTTCTTGATTCAGGTTCGGAGTTTGATTTCTGCTTT
GGCTCGAGTTGTTCTATTCAAGAAGTGGCTCCGGCTGATGAACTCTTCTCCGATGGCAAG
ATCCTTCCCGTCCAGATCAAGAAAGTAACCTTTCAGGTTCAAAGATCAGCTTCGCTCTCA
TCATCATCTTCTACCTCTTCCTCCTCTTCTTCATCATCGTTCTACAACGAGAGATCAGCA
CCAGAAAAGAAGATCATGAGACTGAAAGAGCATCTGTTGGATCCTGACTCTGATTCTGAA
GACAAGCCAAAGGGACCGTTCTTGCAGTTCAAGAGAAGCATAAGTCTCAACTACGACAAG
AGCCGAAATAGCATCAGATCGCTTCATTTCCTGTCACGAAGCAACTCCACAGGCTGTGCT
CTAAACCCTAAACATAACTTGCTTCCCAAGGAATATCATCACCATCACAAGACCTACAAT
CTTCCCAAACAAACTTATCTTAGAAGATCATCTTCGCTC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2CP11JQ 684 0 0
TTCGCTCTCATCATCATCTTCTACCTCTTCCTCCTCTTCTTCATCATCGTTCTACAACGA
GAGATCAGCACCAGAAAAGAAGATCATGAGACTGAAAGAGCATCTGTTGGATCCTGACTC
TGATTCTGAAGACAAGCCAAAGGGACCGTTCTTGCAGTTCAAGAGAAGCATAAGTTTCAA
CTACGACAAGAGCCGAAATAGCATCAGATCGCTTCATTTCCTGTCACGAAGCAACTCCAC
AGGCTGTGCTCTAAACCCTAAACATAACTTGCTTCCCAAGGAATATCATCACCATCACAA
GACCTACAATCTTCCCAAACAAACTTATCTTAGAAGATCATCTTCGCTCTCATCTTCACT
CCCTTATAAGAAACCACCCGCCAGAAACAGCTTCGGTAACGGAAACGGTGGCATTCGAGT
TAGTCCGGTCTTAAACTTCCCGCCACCGGCGTTCATCTCGAATGTTGCCGACGGATTTTT
CAGCATTGGATCACTCTGTAATGGTAACATGAACAGAGAGACAACATTATGAAAATATCT
TTTGTCTTTTGTGGCCTGCGAGGAGAGAGAAATGTAAACAGAAAATCTCTATTTTTTTTT
TTATATATTCACTGTTTATTGTATAATGGAATATCGACAGCGCATGTGAAGATTAGACAT
CATGTGAGTTTTGCCTATATTTCC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL5514Contig1 767 2 2 U
GCGGAAGTGAGATGCACGCTTGAGATTGATGCTCCGGGGCTAGAGTATATGAGTCTAGGA
GAAGATCAGTTTGATAGCATCGTGGTAAAGAACCTGTCTTCTTTGTTAAAGGTTGAGCTT
GATATCAAGTTTGTTATCAACTTTGGCGAGTTTTTTGATCCGTGGGATGCATCAAAGAGA
ACTGAAATTCGTGATTTTCTCAAGGGGATATCGAGGGTAAGACATATGATCATCTTTGAG
AAAACAGTAAAGGCCCTTGATCTTTACTCAAAAGTAGGAATGATTCCTAAATTCAACAAC
TTATCCCATTTAGAAGCCGGGTTTCATACCAAGTCCTTGCAGTTTCTGCCAGCCTTTCTT
GAGTGTTGCCCAAATCTGAAACACCTAGTCTTGAAGGTTGTTCAATCAGAGGGGGTGGAG
GAAGGACTGGAACTCACAGATGTGCCACGGTGTGTCTCATCGACTCTTGAGTGTGCTGAG
ATTAAAGATAAGTTTGAATGGGAGGAAGGGAATATGAAGGTAGCCAGTTACTTTCTTGAG
AACTCAGCAGTACTGAAGAAACTCATTCTGAGCCCAACAGCTTATAATCAAAACATATAC
GAGAAAGTTAATCAACTCACAAAACGTTCTCCAGGATGTCAAATTATCCATGAATGAGTT
GATTATCAGTGTATGAGTTTTTTTTTGTTCTGGTTGGATTCCTTAGACCATTGTTGTTGA
ATCTTCCTTTCCTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTTCAAAGGTCACAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY87TF U 1
AF RR2EY87JQ C 305
BS 1 685 RR2EY87TF
BS 686 767 RR2EY87JQ

RD RR2EY87TF 687 0 0
GCGGAAGTGAGATGCACGCTTGAGATTGATGCTCCGGGGCTAGAGTATATGAGTCTAGGA
GAAGATCAGTTTGATAGCATCGTGGTAAAGAACCTGTCTTCTTTGTTAAAGGTTGAGCTT
GATATCAAGTTTGTTATCAACTTTGGCGAGTTTTTTGATCCGTGGGATGCATCAAAGAGA
ACTGAAATTCGTGATTTTCTCAAGGGGATATCGAGGGTAAGACATATGATCATCTTTGAG
AAAACAGTAAAGGCCCTTGATCTTTACTCAAAAGTAGGAATGATTCCTAAATTCAACAAC
TTATCCCATTTAGAAGCCGGGTTTCATACCAAGTCCTTGCAGTTTCTGCCAGCCTTTCTT
GAGTGTTGCCCAAATCTGAAACACCTAGTCTTGAAGGTTGTTCAATCAGAGGGGGTGGAG
GAAGGACTGGAACTCACAGATGTGCCACGGTGTGTCTCATCGACTCTTGAGTGTGCTGAG
ATTAAAGATAAGTTTGAATGGGAGGAAGGGAATATGAAGGTAGCCAGTTACTTTCTTGAG
AACTCAGCAGTACTGAAGAAACTCATTCTGAGCCCAACAGCTTATAATCAAAACATATAC
GAGAAAGTTAATCAACTCACAAAACGTTCTCCAGGATGTCAAATTATCCATGAATGAGTT
GATTATCAGTGTATGAGTTTTTTTT
GT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2EY87JQ 463 0 0
CCCATTTAGAAGCCGGGTTTCATACCAAGTCCTTGCAGTTTCTGCCAGCCTTTCTTGAGT
GTTGCCCAAATCTGAAACACCTAGTCTTGAAGGTTGTTCAATCAGAGGGGGTGGAGGAAG
GACTGGAACTCACAGATGTGCCACGGTGTGTTTCATCGACTCTTGAGTGTGCTGAGATTA
AAGATAAGTTTGAATGGGAGGAAGGGAATATGAAGGTAGCCAGTTACTTTCTTGAGAACT
CAGCAGTACTGAAGAAACTCATTTTGAGCCCAACAGCTTATAATCAAAACATATACGAGA
AAGTTAATCAACTCACAAAACGTTCTCCAGGATGTCAAATTATCCATGAATGAGTTGATT
ATCAGTGTATGAGTTTTTTTTTGTTCTGGTTGGATTCCTTAGACCATTGTTGTTGAATCT
TCCTTTCCTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTTCAAAGGTCACAAT

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 2

CO CL5515Contig1 621 2 6 U
GGGATTGACTCAGAACATGATCGATGGTTTGGGCATCACTGGATATGAGGGCATCTTCAT
GAGGGTATGTGAGATCACTCTCACAGTGTTGAGGACTCATAGGGAGACACTGATGAGCAT
CCTGGAGACCTTCATCCACGATCCTCTTGTGGAGTGGACAAAATCACACAAATCAAGCGG
TGTAGAAGTTCAGAACCCACATGCACAGCGGGCCATAAGCAGCATTGAAGCCAGGCTGCG
GGGGGTGGTTGTTGGTGGTGTTCCCCTACCAGTAGAAGGGCAAGCTCGCCGGTTAATTTC
CGATGCAGTCTCACATGAGAATCTTGGGAAGATGTATATCTGGTGGATGCCCTGGTTTTG
ATTTAAACCCTGGTTCCGATACAGTAATTGGTGTTTTCGGTGCAAATTTTATGAGCATAT
TACATAACAAACTGGCGCCTAGAACCATGCCATATATGTTCCAAGATCTGTTAACTAGTC
TAATACATGTTGTAGCTGTATTGATTATTACATGGCCCATGGGAAGGGAAGGAAGAAGTA
AATGCTAGTTTTGTTTTTTTAACTGTGTTAGTAGGTAATTGGGTATGAACTGGGAAAAGA
ATGATCAGTAGAGTTGTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D031TF U 1
AF RR2D031JQ C 150
BS 1 249 RR2D031TF
BS 250 250 RR2D031JQ
BS 251 307 RR2D031TF
BS 308 308 RR2D031JQ
BS 309 318 RR2D031TF
BS 319 621 RR2D031JQ

RD RR2D031TF 326 0 0
GGGATTGACTCAGAACATGATCGATGGTTTGGGCATCACTGGATATGAGGGCATCTTCAT
GAGGGTATGTGAGATCACTCTCACAGTGTTGAGGACTCATAGGGAGACACTGATGAGCAT
CCTGGAGACCTTCATCCACGATCCTCTTGTGGAGTGGACAAAATCACACAAATCAAGCGG
TGTAGAAGTTCAGAACCCACATGCACAGCGGGCCATAAGCAGCATTGAAGCCAGGCTGCG
GGGGGTGGT*GTTGGTGGTGTTCCCCTACCAGTAGAAGGGCAAGCTCGCCGGTTAATTTC
CGATGCA*TCTCACATGA
AATCTTGC

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR2D031JQ 472 0 0
TGGAGTGGACAAAATCACACAAATCAAGCGGTGTAGAAGTTCAGAACCCACATGCACAGC
GGGCCATAAGCAGCATTGAAGCCAGGCTGCGGGGGGTGGTTGTTGGTGGTGTTCCCCTAC
CAGTAGAAGGGCAAGCTCGCCGGTTAATTTCCGATGCAGTCTCACATGAGAATCTTGGGA
AGATGTATATCTGGTGGATGCCCTGGTTTTGATTTAAACCCTGGTTCCGATACAGTAATT
GGTGTTTTCGGTGCAAATTTTATGAGCATATTACATAACAAACTGGCGCCTAGAACCATG
CCATATATGTTCCAAGATCTGTTAACTAGTCTAATACATGTTGTAGCTGTATTGATTATT
ACATGGCCCATGGGAAGGGAAGGAAGAAGTAAATGCTAGTTTTGTTTTTTTAACTGTGTT
AGTAGGTAATTGGGTATGAACTGGGAAAAGAATGATCAGTAGAGTTGTTACC

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 2

CO CL5516Contig1 752 2 2 U
GGGTGGCTCTCATAAAAATCACACTTAACTACTTCCAATTCTCCATGGCTCTCCGATCGG
TCAAAACTCCGACCTTGACGACACCTCCCACCGGTGTCGTCATCTCATCCTCAATTATCA
TCAACAAGCCTCAGTCTCTCAGATTCGCCTCCAAACCGACGGCATCACTCCGCTCCAATC
TCAAACTCAAACCATCTTCCTCCGCCGCGAAATTCCGCTGCTCGGCGGCGTCGTCGTCGG
CGCTCACGCCGCAGCTCAGAGACACGCTGGAGAAGCTGGTGAACTCGGAGAAAGTGGTGC
TGTTCATGAAAGGGACGAGGGATTTCCCGATGTGCGGATTCTCTAACACGGTGGTGCAGA
TCCTAAAGACTCTCAACGTTCCTTTCGAAGACGTGAACATTCTCGAGAACGAGATGGTGA
GGCAAGGCCTTAAAGAGTACTCCAGCTGGCCGACGTTTCCTCAGCTTTACATCGGCGGCG
AGTTTTTCGGGGGATGTGATATCACTCTCGAGGCGTTCCAGAGTGGTGAGTTGCAGGAGG
TTGTGGAGAGAGCTATGTGCTCTTGAAGCTATTCTTTTGTCTCTAATGTCCTGAACGAAG
GTGTGTTGTTGATGTGTTAAAGAGTTTATGTCGTGTACCATTGAGACACATGTTGTATGA
TTGGAACTACACACTATGGTTATAGAATAACTATGTGTCTCAAAAAAAAAAATCTGTATC
TTACTGTCCTAGAGTCTCCTTATTGATTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK51TF U 1
AF RR2GK51JQ C 239
BS 1 532 RR2GK51TF
BS 533 752 RR2GK51JQ

RD RR2GK51TF 532 0 0
GGGTGGCTCTCATAAAAATCACACTTAACTACTTCCAATTCTCCATGGCTCTCCGATCGG
TCAAAACTCCGACCTTGACGACACCTCCCACCGGTGTCGTCATCTCATCCTCAATTATCA
TCAACAAGCCTCAGTCTCTCAGATTCGCCTCCAAACCGACGGCATCACTCCGCTCCAATC
TCAAACTCAAACCATCTTCCTCCGCCGCGAAATTCCGCTGCTCGGCGGCGTCGTCGTCGG
CGCTCACGCCGCAGCTCAGAGACACGCTGGAGAAGCTGGTGAACTCGGAGAAAGTGGTGC
TGTTCATGAAAGGGACGAGGGATTTCCCGATGTGCGGATTCTCTAACACGGTGGTGCAGA
TCCTAAAGACTCTCAACGTTCCTTTCGAAGACGTGAACATTCTCGAGAACGAGATGGTGA
GGCAAGGCCTTAAAGAGTACTCCAGCTGGCCGACGTTTCCTCAGCTTTACATCGGCGGCG
AGTTTTTCGGGGGATGTGATATCACTCTCGAGGCGTTCCAGAGTGGTGAGTT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2GK51JQ 514 0 0
GGCGCTCACGCCGCAGCTCAGAGACACGCTGGAGAAGCTGGTGAACTCGGAGAAAGTGGT
GCTGTTCATGAAAGGGACGAGGGATTTCCCGATGTGCGGATTCTCTAACACGGTGGTGCA
GATCCTAAAGACTCTCAACGTTCCTTTCGAAGACGTGAACATTCTCGAGAACGAGATGGT
GAGGCAAGGCCTTAAAGAGTACTCCAGCTGGCCGACGTTTCCTCAGCTTTACATCGGCGG
CGAGTTTTTCGGGGGATGTGATATCACTCTCGAGGCGTTCCAGAGTGGTGAGTTGCAGGA
GGTTGTGGAGAGAGCTATGTGCTCTTGAAGCTATTCTTTTGTCTCTAATGTCCTGAACGA
AGGTGTGTTGTTGATGTGTTAAAGAGTTTATGTCGTGTACCATTGAGACACATGTTGTAT
GATTGGAACTACACACTATGGTTATAGAATAACTATGTGTCTCAAAAAAAAAAATCTGTA
TCTTACTGTCCTAGAGTCTCCTTATTGATTTGAC

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL5517Contig1 1005 2 4 U
GGATGTGTTCTTATTCCAGAGAAAACAAAAAAAACAGAGTAAAGCTTTTGAAAAGCAGAG
CATAAAGAGCGCCTTTTTTTTGTCTGCTAAGTTCAAACGCAGAGACGAACGATCGGAGAG
ATGGGAGACGTGATAATATCCATAGAAGATACAGATATTAATTCGAGTTTGTCGCGCTGC
AGAATTTGTCACGAAGAAGAAGAAGAAGCAGAGAGCTACTTTGAAGCTCCTTGTTCTTGC
TCAGGCACCGTCAAGTTTGCTCACAGAGATTGCATACAACGATGGTGTGATGAGAAAGGA
AACACGATTTGTGAAATATGTCTCCAGGATTATAAACCTGGATACACCACAACTTCAAAA
CCATCTCGTTTAGTTGAAGCAGCAGTCACAATCAGGTATTTAAATTGTTCATACTATATA
TAAATATTTCTTCACAAGCAGCAAGATGTATTAATCTTTTATTGTTTCGGATATAAATAA
TTAACAACAATGATCGTAGGACGAGGAGACAATATGGAGGAAGAAGAAATAGAAGATTAG
TGAATAGAACTGAATCAGAATTTCCAGAATGCAACTCTGAAGTTGACAGAGGCGCTTCTT
GTTGTAGATACTTGGCTCTTATTCTATCGGTGGTTTTGTTGATAAAGCATGCGTTTGATG
TGGTTTACGGAACCGACGAATATCCCTTCACGATTTTGACGGTATTAACACTGAAGGCCA
TTGGTATACTATTGCCAATGCTCTTAATCATTCGGACTATCGCAGCTGTTCAGAGCAGTC
TCCGACGTCAGTTTATCGAATCTGAAGAAGATAGGTTGAGCTCTGAAGAAGAAGATGATG
ACTTGGAGGAGGAAGAGCAACAGCAACATTTGGCTTGATCTTTATTTTCTTCGTTAAACC
TTTGTCTTTTTTATGAAAGCATAAGACTCTCATATACAAATAGAAATCTGTAACCACTAT
CAACTGTAACGTATGTTAAATTAATAATCATAAGAGTTTTAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT62TF U 1
AF RR2DT62JQ C 286
BS 1 591 RR2DT62TF
BS 592 592 RR2DT62JQ
BS 593 665 RR2DT62TF
BS 666 1005 RR2DT62JQ

RD RR2DT62TF 665 0 0
GGATGTGTTCTTATTCCAGAGAAAACAAAAAAAACAGAGTAAAGCTTTTGAAAAGCAGAG
CATAAAGAGCGCCTTTTTTTTGTCTGCTAAGTTCAAACGCAGAGACGAACGATCGGAGAG
ATGGGAGACGTGATAATATCCATAGAAGATACAGATATTAATTCGAGTTTGTCGCGCTGC
AGAATTTGTCACGAAGAAGAAGAAGAAGCAGAGAGCTACTTTGAAGCTCCTTGTTCTTGC
TCAGGCACCGTCAAGTTTGCTCACAGAGATTGCATACAACGATGGTGTGATGAGAAAGGA
AACACGATTTGTGAAATATGTCTCCAGGATTATAAACCTGGATACACCACAACTTCAAAA
CCATCTCGTTTAGTTGAAGCAGCAGTCACAATCAGGTATTTAAATTGTTCATACTATATA
TAAATATTTCTTCACAAGCAGCAAGATGTATTAATCTTTTATTGTTTCGGATATAAATAA
TTAACAACAATGATCGTAGGACGAGGAGACAATATGGAGGAAGAAGAAATAGAAGATTAG
TGAATAGAACTGAATCAGAATTTCCAGAATGCAACTCTGAAGTTGACAGAG*CGCTTCTT
GTTGTAGATACTTGGCTCTTATTCTATCGGTGGTTTTGTTGATAAAGCATGCGTTTGATG
TGGTT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2DT62JQ 720 0 0
TGTGATGAGAAAGGAAACACGATTTGTGAAATATGTCTCCAGGATTATAAACCTGGATAC
ACCACAACTTCAAAACCATCTCGTTTAGTTGAAGCAGCAGTCACAATCAGGTATTTAAAT
TGTTCATACTATATATAAATATTTCTTCACAAGCAGCAAGATGTATTAATCTTTTATTGT
TTCGGATATAAATAATTAACAACAATGATCGTAGGACGAGGAGACAATATGGAGGAAGAA
GAAATAGAAGATTAGTGAATAGAACTGAATCAGAATTTCCAGAATGCAACTCTGAAGTTG
ACAGAGGCGCTTCTTGTTGTAGATACTTGGCTCTTATTCTATCGGTGGTTTTGTTGATAA
AGCATGCGTTTGATGTGGTTTACGGAACCGACGAATATCCCTTCACGATTTTGACGGTAT
TAACACTGAAGGCCATTGGTATACTATTGCCAATGCTCTTAATCATTCGGACTATCGCAG
CTGTTCAGAGCAGTCTCCGACGTCAGTTTATCGAATCTGAAGAAGATAGGTTGAGCTCTG
AAGAAGAAGATGATGACTTGGAGGAGGAAGAGCAACAGCAACATTTGGCTTGATCTTTAT
TTTCTTCGTTAAACCTTTGTCTTTTTTATGAAAGCATAAGACTCTCATATACAAATAGAA
ATCTGTAACCACTATCAACTGTAACGTATGTTAAATTAATAATCATAAGAGTTTTAAGTT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL5518Contig1 1155 2 2 U
GGGATGAAGTCGAGTTAGAGCGGGGAGTGACACTGACACGCCGTTGACAATTTAAGACGA
GAGCTAAGTGAGAGTTGATACACGATGGAGCTGAATCCACCTGAGAGTCCGACCAGATCA
ATTCGTTGCATCGTGAAACTTGGAGGTGCGGCGATTACACGGAAGAACGAGCTGGAGGAG
ATTCACGATGAGAATCTGGAAGCTGTGGCGTGTCAGTTACGTCAGGCCATGATGGAGGAG
GGTTCGGCTCAAAGCAAGGTTATTGGAATGGATTGGAGCAAGAGACCTGGAAGCTCTGAG
ATTGCTTGCGATGTTGATGACTTGAGAAACCTATTGTTAAAGCTGGTTTTGTTGCTACTC
GTATATCTGTCACAAATCTTAATCTTGAAATTGTACGAGCACTTGCCCGAGAGGGTATTC
CTACAATCGGTATGTCTCCATTTTCATGTGGTTGGACAACCTCCAAAAGAGATGTGGCTT
CTGCGGATCTATCAACAGTTGCTAAAACAATCGATTCAGGATTTGTCCCTGTTCTCCATG
GAGATGCAGTGCTAGACAATATACTGGGCTGCACCATACTGAGTGGTGATGTTATCATCC
GTCATCTTGCACATCATTTGAAGCCAGAATATGTTGTATTCCTCACAGACGTGTACGGTG
TTTACGATCGACCACCTTCAGAGAATGATGCTGTCCTCTTGAAAGAGATCGCTGTTGGAG
AAGATGGGAGCTGGAAGGTTGTGAATCCAGCCTTGGACCTCACAAACAAGAACGTTCAAA
CCTCTGTTGCTGCCCATGATACAACCGGTGGAATGGAAACAAAGATATCAGAAGCTGCTA
TGATTGCAAAACATGGAATCGATGTCTACATTGTCAAGGCTGCGACTACTCATTCACAGA
GAGCGCTCAATGGCGAATTGAGAGAGAGTGTACCTGAAGATTGGTTTGGTACTATCATCA
GATTCTCAAAGTAGAATGAACTGTTGTGACACAGCACACTAATTCAAGTTTTTTCAAATG
AGATAACATCCTCATGCTAATGCTGTGTGCTTTATTACCGAAGTTTGTGTGTGTTTGTAT
ATTACACATGTTTGGAAAAGATCGTGACTCGATCAATCATCTTATTCAGTAAAAATGCGA
AAGGCGTTACACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A443TF U 1
AF RR2A443JQ C 425
BS 1 733 RR2A443TF
BS 734 1155 RR2A443JQ

RD RR2A443TF 733 0 0
GGGATGAAGTCGAGTTAGAGCGGGGAGTGACACTGACACGCCGTTGACAATTTAAGACGA
GAGCTAAGTGAGAGTTGATACACGATGGAGCTGAATCCACCTGAGAGTCCGACCAGATCA
ATTCGTTGCATCGTGAAACTTGGAGGTGCGGCGATTACACGGAAGAACGAGCTGGAGGAG
ATTCACGATGAGAATCTGGAAGCTGTGGCGTGTCAGTTACGTCAGGCCATGATGGAGGAG
GGTTCGGCTCAAAGCAAGGTTATTGGAATGGATTGGAGCAAGAGACCTGGAAGCTCTGAG
ATTGCTTGCGATGTTGATGACTTGAGAAACCTATTGTTAAAGCTGGTTTTGTTGCTACTC
GTATATCTGTCACAAATCTTAATCTTGAAATTGTACGAGCACTTGCCCGAGAGGGTATTC
CTACAATCGGTATGTCTCCATTTTCATGTGGTTGGACAACCTCCAAAAGAGATGTGGCTT
CTGCGGATCTATCAACAGTTGCTAAAACAATCGATTCAGGATTTGTCCCTGTTCTCCATG
GAGATGCAGTGCTAGACAATATACTGGGCTGCACCATACTGAGTGGTGATGTTATCATCC
GTCATCTTGCACATCATTTGAAGCCAGAATATGTTGTATTCCTCACAGACGTGTACGGTG
TTTACGATCGACCACCTTCAGAGAATGATGCTGTCCTCTTGAAAGAGATCGCTGTTGGAG
AAGATGGGAGCTG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2A443JQ 731 0 0
AATCGGTATGTCTCCATTTTCATGTGGTTGGACAACCTCCAAAAGAGATGTGGCTTCTGC
GGATCTATCAACAGTTGCTAAAACAATCGATTCAGGATTTGTCCCTGTTCTCCATGGAGA
TGCAGTGCTAGACAATATACTGGGCTGCACCATACTGAGTGGTGATGTTATCATCCGTCA
TCTTGCACATCATTTGAAGCCAGAATATGTTGTATTCCTCACAGACGTGTACGGTGTTTA
CGATCGACCACCTTCAGAGAATGATGCTGTCCTCTTGAAAGAGATCGCTGTTGGAGAAGA
TGGGAGCTGGAAGGTTGTGAATCCAGCCTTGGACCTCACAAACAAGAACGTTCAAACCTC
TGTTGCTGCCCATGATACAACCGGTGGAATGGAAACAAAGATATCAGAAGCTGCTATGAT
TGCAAAACATGGAATCGATGTCTACATTGTCAAGGCTGCGACTACTCATTCACAGAGAGC
GCTCAATGGCGAATTGAGAGAGAGTGTACCTGAAGATTGGTTTGGTACTATCATCAGATT
CTCAAAGTAGAATGAACTGTTGTGACACAGCACACTAATTCAAGTTTTTTCAAATGAGAT
AACATCCTCATGCTAATGCTGTGTGCTTTATTACCGAAGTTTGTGTGTGTTTGTATATTA
CACATGTTTGGAAAAGATCGTGACTCGATCAATCATCTTATTCAGTAAAAATGCGAAAGG
CGTTACACATC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL5519Contig1 1347 2 2 U
GGGAATTGGAGAAGAAGATGGGAACGGCGGTGGGGCAGTGGCTAGAGGAAGCGTTGCTTG
ATCTCTGCGGTAAACCGGAGAACGGTTTAAATTTCGATCGTGATGTAATCTCCGGTCTAG
TCTCCTATTGCGATCTCGCTCAGCCTGTCGATGCCAAGGAGTATCTCGACAATATTATCG
GAAAAGAAGGCAAAAGCGTCATTGCAGAATATCTAGAGCGAAGAGGATACAAAGAACCAT
CCAGCCATGTGGCAAACACTTCAGGAGGTCCTGAACTGCAGATGTATGTTAAACCAAAAT
TTGATTATGTCGCTTCTAGTGGAACCAAGAAGCCGTTGAAAACAACACCAAAAGAGGGAA
CATCTTCTAATCAGCAACCTGGAACTACGAAAGCAGCAACAGCCCCGGCCCCTAAAGTTA
ACCCTAAGAAGAAAAAAGGCGGGAAAGTGATATCACTAGCTGAAGCAGCTAAAGGATCGA
TAGTGTTTCAGCAAGGCAAACCGTGTGCTTGCCAAGCTCGTAGGCACAGGTTAGTGAGCA
ACTGCTTGTCCTACGGGAAGATAGTGTGTGAACAAGAAGGAGAAGGGCCTTGCAGTTTCT
GCGGAGCGCTTGTGCTTAAAGAAGGAAGTACGTACGCTGGGCTAGAGGAAGGGTTTACTC
CCGTGTCTGATGCTGATGTGGCAGCTGAAGCTTATGCCAAAAGGCTTGTGGAGTATGATA
GAAACTCCGCCGCACGTACAACGGTTATTGATGACCAGAGTGATTACTACGAGAGTGAGG
GTAGTAAATGGGTTTCTCAAGAGGAGAAAGAGCTTTTGAGGAAGAAGCGTGAGGAGATTG
AAGAAGCTGAACGAGCCAAAAAGAGCAAAGTGGTTATGACATTTGATCTAGTCGGCCGTA
AGGTACTGTTAAACGAAGATGATATATCAGAACTAGAATCGGGGAACAGGATTCTTGGAC
CACCCGAGACTAGACCCGTGAACAGAATAAAACCGAACCCAACGGCGAAATTCGTTCCAA
TCTTCTTAGATCCTGGACCAACGGAGAAGAAGACAACAAACATGGGTAGCTCCTCCAAGA
GAGACAACAAGAAAAACCGGAACGGGTTGTGTTTGGAGATCACAGGAAGGGTACAACATG
ACAGGAGCGAACTTAAGTACTTACAAGCGGATCCATCATCAGTAATAGATGGGCTTCATG
TAGAAGATGGTGGTGAATGTTCCTTAGATTACGACTGATTCTTTTGTTTTCAGTTTTCTA
TAAACTGTACGAGTCCCGGTTTATTGTTTCCGGTTTACCGAACCGGATACTTTCTTCTTC
AGTTTTAAAAGTCGACAATATTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B751TF U 1
AF RR2B751JQ C 428
BS 1 807 RR2B751TF
BS 808 1347 RR2B751JQ

RD RR2B751TF 807 0 0
GGGAATTGGAGAAGAAGATGGGAACGGCGGTGGGGCAGTGGCTAGAGGAAGCGTTGCTTG
ATCTCTGCGGTAAACCGGAGAACGGTTTAAATTTCGATCGTGATGTAATCTCCGGTCTAG
TCTCCTATTGCGATCTCGCTCAGCCTGTCGATGCCAAGGAGTATCTCGACAATATTATCG
GAAAAGAAGGCAAAAGCGTCATTGCAGAATATCTAGAGCGAAGAGGATACAAAGAACCAT
CCAGCCATGTGGCAAACACTTCAGGAGGTCCTGAACTGCAGATGTATGTTAAACCAAAAT
TTGATTATGTCGCTTCTAGTGGAACCAAGAAGCCGTTGAAAACAACACCAAAAGAGGGAA
CATCTTCTAATCAGCAACCTGGAACTACGAAAGCAGCAACAGCCCCGGCCCCTAAAGTTA
ACCCTAAGAAGAAAAAAGGCGGGAAAGTGATATCACTAGCTGAAGCAGCTAAAGGATCGA
TAGTGTTTCAGCAAGGCAAACCGTGTGCTTGCCAAGCTCGTAGGCACAGGTTAGTGAGCA
ACTGCTTGTCCTACGGGAAGATAGTGTGTGAACAAGAAGGAGAAGGGCCTTGCAGTTTCT
GCGGAGCGCTTGTGCTTAAAGAAGGAAGTACGTACGCTGGGCTAGAGGAAGGGTTTACTC
CCGTGTCTGATGCTGATGTGGCAGCTGAAGCTTATGCCAAAAGGCTTGTGGAGTATGATA
GAAACTCCGCCGCACGTACAACGGTTATTGATGACCAGAGTGATTACTACGAGAGTGAGG
GTAGTAAATGGGTTTCTCAAGAGGAGA

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2B751JQ 920 0 0
GAAGAAAAAAGGCGGGAAAGTGATATCACTAGCTGAAGCAGCTAAAGGATCGATAGTGTT
*CAGCAAGGCAAACCGTGTGCTTGCCAAGCTCGTAGGCACAGGTTAGTGAGCAACTGCTT
GTCCTACGGGAAGATAGTGTGTGAACAAGAAGGAGAAGGGCCTTGCAGTTTCTGCGGAGC
GCTTGTGCTTAAAGAAGGAAGTACGTACGCTGGGCTAGAGGAAGGGTTTACTCCCGTGTC
TGATGCTGATGTGGCAGCTGAAGCTTATGCCAAAAGGCTTGTGGAGTATGATAGAAACTC
CGCCGCACGTACAACGGTTATTGATGACCAGAGTGATTACTACGAGAGTGAGGGTAGTAA
ATGGGTTTCTCAAGAGGAGAAAGAGCTTTTGAGGAAGAAGCGTGAGGAGATTGAAGAAGC
TGAACGAGCCAAAAAGAGCAAAGTGGTTATGACATTTGATCTAGTCGGCCGTAAGGTACT
GTTAAACGAAGATGATATATCAGAACTAGAATCGGGGAACAGGATTCTTGGACCACCCGA
GACTAGACCCGTGAACAGAATAAAACCGAACCCAACGGCGAAATTCGTTCCAATCTTCTT
AGATCCTGGACCAACGGAGAAGAAGACAACAAACATGGGTAGCTCCTCCAAGAGAGACAA
CAAGAAAAACCGGAACGGGTTGTGTTTGGAGATCACAGGAAGGGTACAACATGACAGGAG
CGAACTTAAGTACTTACAAGCGGATCCATCATCAGTAATAGATGGGCTTCATGTAGAAGA
TGGTGGTGAATGTTCCTTAGATTACGACTGATTCTTTTGTTTTCAGTTTTCTATAAACTG
TACGAGTCCCGGTTTATTGTTTCCGGTTTACCGAACCGGATACTTTCTTCTTCAGTTTTA
AAAGTCGACAATATTTTACC

QA 1 920 1 920
DS 



AS 1 2

CO CL5520Contig1 1528 2 2 U
GGATCCTCAGAAAAGTCTCAAAAACCATGGAATATCAAGTGTCTTTTCCACCATCCACCA
CCACATGTCTTTCCTTTAAGGTGCATCGCCGGCAGCCTGAGCTGGTCACTCCGGCTAAGC
CAACGCCACGAGAGCTCAAGCCTCTTTCCGACATAGACGACCAACAAGGATTAAGATTTC
AAATTCCTGTTATCTTCTTCTATAGACCTAACCTTACAAGTAATCTTGACCCCGTCCAAG
TGATCAGGAGAGCTCTCGCGCAGACGCTGGTTTACTATTACCCGTTCGCTGGTAGGCTCC
GGGAAGGTCCTAACCGAAAACTTTCGGTGGACTGTACCGGAGAAGGCGTTTTGTTCATTG
AAGCCGACGCTGACGTTACGTTTGCTGAGTTGGAGGAAGCTGATGCTCTTCTTCCTCCTT
TCCCTTGCTTAGAAGAGCTTCTCTTTGACGTAGAAGGGTCCAGTGAGTTACTTAACACTC
CGTTGCTTCTCGTTCAGGTCACGCGACTCAAGTGTGGTGGATTCATCTTTGCCCTCCGTT
TCAACCACACCATGACCGATGGAGCCGGTCTGTCCCTCTTTCTGAAATCACTATGCGAGT
TGGCATGTGGGTTACACGCGCCGTCGGTTCCACCAGTGTGGGAACGAGAGTCGCTGATTG
CGAGTGCCTCTGCGCTTGTGACACATACGCACCGCGAATATGACGATAAGGTGGAACCTG
AAGCGGTAGTCGTCGGAGACTTTTTAGTTAGTAGGTCTTTCTTTTTTGGTCCGGACGAGA
TCGCCGCTATAAGGAGACTCCTCCCGACCGATCTCCACAACACCACTTTTGAAGCGATGA
CATCGTTTTTGTGGCGTTGTCGGACGGTTGCACTGAGTCCCGACCCTAACACCGAGATGA
GAATGACATGCATCGTCAATTCACGTTCCAAACTTAGCAACCCGCCTATACCATCGGGTT
ACTACGGTAACGTTTTTGCCATCCCTGTGGCGATAGCTACCGCAAAAGATCTGATGGAGA
GGCCGCTTGAGTTTCCTCTGAGGTTGATACAAGAGGCGAAGAAGAGCGTGACAGAGGACT
ACATACGGTCGATGACGGCATTAATGGCAACCAGAGGGAGGCCTATGTTTGTGGCAGCTG
GGAACTATATAGTGTCGGATTTGAGACATTTTGATTTAGGAAAAGTTGATTTCGGGCCGT
GGGGTAAACCTGTGTACGGTGGTACCGCTAAGGCTGGTATCGCAGTGTTTCCAGGAGTGA
GCTTTTACGTGCCGTTTAAGAATAGAAAAGGTGTGAGCGGAACCGTTGTGGCAATTAGCT
TGCCGGTGCCAGCGATGGAGAAGTTTGTAGAAGAGCTTGACGGTGTGTTATACAAGTGTC
TTAACGGACGCTTGTAAAAAAAAAAAACATGCGTTCGAAATTAAGTAAATTATAGTTATG
TCTTCGCTCTTAGAGCTAATCATTTGATATACATTATCAGTTATGTATTTATTATCATGC
CATGCATATATAGTAAAATTGTCACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A727TF U 1
AF RR2A727JQ C 679
BS 1 750 RR2A727TF
BS 751 1528 RR2A727JQ

RD RR2A727TF 750 0 0
GGATCCTCAGAAAAGTCTCAAAAACCATGGAATATCAAGTGTCTTTTCCACCATCCACCA
CCACATGTCTTTCCTTTAAGGTGCATCGCCGGCAGCCTGAGCTGGTCACTCCGGCTAAGC
CAACGCCACGAGAGCTCAAGCCTCTTTCCGACATAGACGACCAACAAGGATTAAGATTTC
AAATTCCTGTTATCTTCTTCTATAGACCTAACCTTACAAGTAATCTTGACCCCGTCCAAG
TGATCAGGAGAGCTCTCGCGCAGACGCTGGTTTACTATTACCCGTTCGCTGGTAGGCTCC
GGGAAGGTCCTAACCGAAAACTTTCGGTGGACTGTACCGGAGAAGGCGTTTTGTTCATTG
AAGCCGACGCTGACGTTACGTTTGCTGAGTTGGAGGAAGCTGATGCTCTTCTTCCTCCTT
TCCCTTGCTTAGAAGAGCTTCTCTTTGACGTAGAAGGGTCCAGTGAGTTACTTAACACTC
CGTTGCTTCTCGTTCAGGTCACGCGACTCAAGTGTGGTGGATTCATCTTTGCCCTCCGTT
TCAACCACACCATGACCGATGGAGCCGGTCTGTCCCTCTTTCTGAAATCACTATGCGAGT
TGGCATGTGGGTTACACGCGCCGTCGGTTCCACCAGTGTGGGAACGAGAGTCGCTGATTG
CGAGTGCCTCTGCGCTTGTGACACATACGCACCGCGAATATGACGATAAGGTGGAACCTG
AAGCGGTAGTCGTCGGAGACTTTTTAGTTA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2A727JQ 850 0 0
TGACACATACGCACCGCGAATATGACGATAAGGTGGAACCTGAAGCGGTAGTCGTCGGAG
ACTTTTTAGTTAGTAGGTCTTTCTTTTTTGGTCCGGACGAGATCGCCGCTATAAGGAGAC
TCCTCCCGACCGATCTCCACAACACCACTTTTGAAGCGATGACATCGTTTTTGTGGCGTT
GTCGGACGGTTGCACTGAGTCCCGACCCTAACACCGAGATGAGAATGACATGCATCGTCA
ATTCACGTTCCAAACTTAGCAACCCGCCTATACCATCGGGTTACTACGGTAACGTTTTTG
CCATCCCTGTGGCGATAGCTACCGCAAAAGATCTGATGGAGAGGCCGCTTGAGTTTCCTC
TGAGGTTGATACAAGAGGCGAAGAAGAGCGTGACAGAGGACTACATACGGTCGATGACGG
CATTAATGGCAACCAGAGGGAGGCCTATGTTTGTGGCAGCTGGGAACTATATAGTGTCGG
ATTTGAGACATTTTGATTTAGGAAAAGTTGATTTCGGGCCGTGGGGTAAACCTGTGTACG
GTGGTACCGCTAAGGCTGGTATCGCAGTGTTTCCAGGAGTGAGCTTTTACGTGCCGTTTA
AGAATAGAAAAGGTGTGAGCGGAACCGTTGTGGCAATTAGCTTGCCGGTGCCAGCGATGG
AGAAGTTTGTAGAAGAGCTTGACGGTGTGTTATACAAGTGTCTTAACGGACGCTTGTAAA
AAAAAAAAACATGCGTTCGAAATTAAGTAAATTATAGTTATGTCTTCGCTCTTAGAGCTA
ATCATTTGATATACATTATCAGTTATGTATTTATTATCATGCCATGCATATATAGTAAAA
TTGTCACATC

QA 1 850 1 850
DS 



AS 1 2

CO CL5521Contig1 936 2 2 U
TCATACTCTCTTAAACCTTGCATATAGCAGCTGCACGTGCATGAAACCGCATGCGATATT
TCGTTTTTTCTCTTTTACTTGTTATCCTCATACTTACTTATTTCCCCTCCTCAACTAAGA
CCCCGCCATTTCAGGCAATTAAATTTCCCAACCCCATATCACTTGAGAAATATTTTCATA
AGTGCCCTAAAAATTTCAAAAGTTTCAAATTTGTCTTCAACAATACCACTGCTCATTATC
TGCAAACAACTTGCAAGCTTCCTCTCCACTAAACAAATCTTCATGCTTTTCCATTTTCAC
AAATTGGCCAAAACATCCCATCGTTGATATTTCAACCGCCGTAGCCGCGGCCGCTTCAGC
CGCCGTGGGACTATACTCTTCGTTCAGAATAGCGCTTGAGTCGCTACTATCAGCAGGATC
TTCTCTGAAGATCTTGGTACGTGGGAAAATGCTAAACATCTCGTATGCGAGCTCCGATGC
CGGAGCTTCCGTTTGAATATGTGGCAGCGGTTGAGAAGGAAGCTGGTTTAACTCTAAGAC
TTCGTTATTAGGCATCACGGTTTCATCCGCCTTTACAAAGATGTTTTCTTCTGTTGATGC
GTTACTATTGCTTCTGCTGATCCCTTCCACGTTAAGTTTCGCTCTTAGCTCTTTAATCTC
TGCACGGAGAGAATCGTTATCAAGTTGAAGCGAGTCGCGGCTGCGTTTGAGTGAGTCAAA
GTTTGACTTGAGAACGCCGTAATCACGTTCGAGCTGCTTTGTCTTCCACCGAGCACGGCG
GTTCTGAAACCATATCGCCACTTGTCGCGGTTGGAGCCCAAGCTCTTGAGCCAGCTTCAC
TTTTCTCTCGGGCTCTAACTTGTTATCAATCTCGAAATTCTTTTCTAATGCTTTTACTTG
CTCTACACTCAACCGCCGCTTTTTCTCCGTTGCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI85JQ U 1
AF RR2EE86JQ U 160
BS 1 540 RR2EI85JQ
BS 541 936 RR2EE86JQ

RD RR2EI85JQ 540 0 0
TCATACTCTCTTAAACCTTGCATATAGCAGCTGCACGTGCATGAAACCGCATGCGATATT
TCGTTTTTTCTCTTTTACTTGTTATCCTCATACTTACTTATTTCCCCTCCTCAACTAAGA
CCCCGCCATTTCAGGCAATTAAATTTCCCAACCCCATATCACTTGAGAAATATTTTCATA
AGTGCCCTAAAAATTTCAAAAGTTTCAAATTTGTCTTCAACAATACCACTGCTCATTATC
TGCAAACAACTTGCAAGCTTCCTCTCCACTAAACAAATCTTCATGCTTTTCCATTTTCAC
AAATTGGCCAAAACATCCCATCGTTGATATTTCAACCGCCGTAGCCGCGGCCGCTTCAGC
CGCCGTGGGACTATACTCTTCGTTCAGAATAGCGCTTGAGTCGCTACTATCAGCAGGATC
TTCTCTGAAGATCTTGGTACGTGGGAAAATGCTAAACATCTCGTATGCGAGCTCCGATGC
CGGAGCTTCCGTTTGAATATGTGGCAGCGGTTGAGAAGGAAGCTGGTTTAACTCTAAGAC

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2EE86JQ 777 0 0
CG
CTTGAGAAATATTTTCATAAGTGCCCTAAAAATTTCAAAAGTTTCAAATTTGTCTTCAAC
AATACCACTGCTCATTATCTGCAAACAACTTGCAAGCTTCCTCTCCACTAAACAAATCTT
CATGCTTTTCCATTTTCACAAATTGGCCAAAACATCCCATCGTTGATATTTCAACCGCCG
TAGCCGCGGCCGCTTCAGCCGCCGTGGGACTATACTCTTCGTTCAGAATAGCGCTTGAGT
CGCTACTATCAGCAGGATCTTCTCTGAAGATCTTGGTACGTGGGAAAATGCTAAACATCT
CGTATGCGAGCTCCGATGCCGGAGCTTCCGTTTGAATATGTGGCAGCGGTTGAGAAGGAA
GCTGGTTTAGCTCTAAGACTTCGTTATTAGGCATCACGGTTTCATCCGCCTTTACAAAGA
TGTTTTCTTCTGTTGATGCGTTACTATTGCTTCTGCTGATCCCTTCCACGTTAAGTTTCG
CTCTTAGCTCTTTAATCTCTGCACGGAGAGAATCGTTATCAAGTTGAAGCGAGTCGCGGC
TGCGTTTGAGTGAGTCAAAGTTTGACTTGAGAACGCCGTAATCACGTTCGAGCTGCTTTG
TCTTCCACCGAGCACGGCGGTTCTGAAACCATATCGCCACTTGTCGCGGTTGGAGCCCAA
GCTCTTGAGCCAGCTTCACTTTTCTCTCGGGCTCTAACTTGTTATCAATCTCGAAATTCT
TTTCTAATGCTTTTACTTGCTCTACACTCAACCGCCGCTTTTTCTCCGTTGCCGC

QA 3 777 3 777
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5523Contig1 379 2 1 U
GGAGATTTAGGGTTTCTCTCAGTTTCGGCTCGGTCCCAGAACCAAGATCGCAGGGCTTCA
AGATGCCGTCGCTCAAGTCATTCATGATCAAGAAGAAGCTTGCCAAGAAAATGAGGCAGA
ACAGGCCTATTCCTCACTGGATTCGTCTTCGCACCGACAATACCATCAGGTACAACGCAA
AGCGTAGACACTGGCGCAGAACCAAGCTTGGATTCTAAGCTGTCTTATCTTCACCTTTTT
GTGAAAGCTCTGTCCTTTCTAAGACATTGTGTTCCTTTGTTTGGTTCTTTAGCGTTTCGT
TTTTCTCAGTTTTGATTGTGACAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTAAGACAATCTTTTGA
TAAATTATGTTTCCAGACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H112JQ C 1
AF RR2H112TF U 1
BS 1 379 RR2H112TF

RD RR2H112JQ 379 0 0
GGAGATTTAGGGTTTCTCTCAGTTTCGGCTCGGTCCCAGAACCAAGATCGCAGGGCTTCA
AGATGCCGTCGCTCAAGTCATTCATGATCAAGAAGAAGCTTGCCAAGAAAATGAGGCAGA
ACAGGCCTATTCCTCACTGGATTCGTCTTCGCACCGACAATACCATCAGGTACAACGCAA
AGCGTAGACACTGGCGCAGAACCAAGCTTGGATTTTAAGCTGTCTTATCTTCACCTTTTT
GTGAAAGCTCTGTCCTTTCTAAGACATTGTGTTCCTTTGTTTGGTTCTTTAGCGTTTCGT
TTTTCTCAGTTTTGATTGTGACAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTAAGACAATCTTTTGA
TAAATTATGTTTCCAGACT

QA 1 379 1 379
DS 

RD RR2H112TF 379 0 0
GGAGATTTAGGGTTTCTCTCAGTTTCGGCTCGGTCCCAGAACCAAGATCGCAGGGCTTCA
AGATGCCGTCGCTCAAGTCATTCATGATCAAGAAGAAGCTTGCCAAGAAAATGAGGCAGA
ACAGGCCTATTCCTCACTGGATTCGTCTTCGCACCGACAATACCATCAGGTACAACGCAA
AGCGTAGACACTGGCGCAGAACCAAGCTTGGATTCTAAGCTGTCTTATCTTCACCTTTTT
GTGAAAGCTCTGTCCTTTCTAAGACATTGTGTTCCTTTGTTTGGTTCTTTAGCGTTTCGT
TTTTCTCAGTTTTGATTGTGACAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTAAGACAATCTTTTGA
TAAATTATGTTTCCAGACT

QA 1 379 1 379
DS 



AS 1 2

CO CL5524Contig1 1177 2 6 U
GAGGACCTCAAGGAAAAGCTGGATCATGCGGTTAAGGCTGTAAATGAGAGTAAAGACGAA
GTTGCTGACCTTACTGAGAAGTACGAGGACACAAAGAGAATGCTGGATATAGAAAATACT
AATGTAGAAAATTTGAAACATGAACTTGAAGGAACAAAGAAAGCACTCCAGGCATCTAGA
GATCGTGTCTCTGACCTGGAAACGCTGCTGGATGAGTCTAGAGCTTTGTGTTCAAAGTTT
GAATCAGAGCTTGATGTAGTTCACGCAGAGTTGGATAAAGCTAAAGTAAGATATGAAAGG
AACATTGCTGAGGAAAGACGAAACAATGAGATTTTGGCTAGCGAACTTGCAGCGGAGAAA
GATCAACTGAAGAAAGCTAGAGACGACGAGATTGAGGCACTGACCCGTGAAGTCGAAGAA
TTTTCTGTCAAGAACCAGAGTCTCCAGAAGGAACTGGCGGAGACTTACAAGAAAGCTGAA
ACCACTAACAAGGAATTAGAAGAGGAGAAGAAGACGGTTTTGGCGTTGGAGAAAGAAGTG
AAAGCAATGGAGAAGCAGATGTTGATGGAGAAGGAGTTGAGGAAGTCACTTGAAACAGAA
CTCGAAGAAGCAGTTAAGTCCTTGGATGAGATGAACAAAAACACATCGATACTCTCGAAA
GAGCTTGAGAAGGTGAACACACATGTCTCGAGTCTGGATGACGAGAAAGAAGTGCTTCAA
AGATCACTAGAAGAGGCGAAGAAGGCATCAAAAGAAGCTAAGGAGAACGTGGAAGACGCA
CACAACCTCGTGATAAGTCTAGGAAAAGAGAGGGAAGTGCTAGAGAAGAAAGTGAAGAAA
CTCGAGGAGGACTTGGGCTCTGCAAAGGGAGAGATACTGCGCATGAGAAGCCAACAACAG
ATTTCTGTAAAAGCTGTGAATAGTACAGATGATGAAGAGAAGAGTGATGGTGATAAGGTT
ACTGTGAAGAAAGTTGTCAGGAGGAGAAAGAGCAGTACCAGTTCTTGAACAGACAAGGTT
ATATAATGACCAGAGCTTGTATTAGATCTTTGTGTAAATTTTGACAAGAGGCAAGTGGCT
CCAGAGTTTCATCATTGAGATCATTTCATCAATGGGTGATACGAAATGTAGAGTGAGAAG
ATCAATGATTTGTATCAGATGTCTAAATTATGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF53TF U 1
AF RR2CF53JQ C 410
BS 1 672 RR2CF53TF
BS 673 673 RR2CF53JQ
BS 674 676 RR2CF53TF
BS 677 677 RR2CF53JQ
BS 678 695 RR2CF53TF
BS 696 1177 RR2CF53JQ

RD RR2CF53TF 695 0 0
GAGGACCTCAAGGAAAAGCTGGATCATGCGGTTAAGGCTGTAAATGAGAGTAAAGACGAA
GTTGCTGACCTTACTGAGAAGTACGAGGACACAAAGAGAATGCTGGATATAGAAAATACT
AATGTAGAAAATTTGAAACATGAACTTGAAGGAACAAAGAAAGCACTCCAGGCATCTAGA
GATCGTGTCTCTGACCTGGAAACGCTGCTGGATGAGTCTAGAGCTTTGTGTTCAAAGTTT
GAATCAGAGCTTGATGTAGTTCACGCAGAGTTGGATAAAGCTAAAGTAAGATATGAAAGG
AACATTGCTGAGGAAAGACGAAACAATGAGATTTTGGCTAGCGAACTTGCAGCGGAGAAA
GATCAACTGAAGAAAGCTAGAGACGACGAGATTGAGGCACTGACCCGTGAAGTCGAAGAA
TTTTCTGTCAAGAACCAGAGTCTCCAGAAGGAACTGGCGGAGACTTACAAGAAAGCTGAA
ACCACTAACAAGGAATTAGAAGAGGAGAAGAAGACGGTTTTGGCGTTGGAGAAAGAAGTG
AAAGCAATGGAGAAGCAGATGTTGATGGAGAAGGAGTTGAGGAAGTCACTTGAAACAGAA
CTCGAAGAAGCAGTTAAGTCCTTGGATGAGATGAACAAAAACACATCGATACTCTCGAAA
GAGCTTGAGAAG*TGA*CACACATGTCTCGAGTCT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2CF53JQ 768 0 0
AAGTCGAAGAATTTTCTGTCAAGAACCAGAGTCTCCAGAAGGAACTGGCGGAGACTTACA
AGAAAGCTGAAACCACTAACAAGGAATTAGAAGAGGAGAAGAAGACGGTTTTGGCGTTGG
AGAAAGAAGTGAAAGCAATGGAGAAGCAGATGTTGATGGAGAAGGAGTTGAGGAAGTCAC
TTGAAACAGAACTCGAAGAAGCAGTTAAGTCCTTGGATGAGATGAACAAAAACACATCGA
TACTCTCGAAAGAGCTTGAGAAGGTGAACACACATGTCTCGAGTCTGGATGACGAGAAAG
AAGTGCTTCAAAGATCACTAGAAGAGGCGAAGAAGGCATCAAAAGAAGCTAAGGAGAACG
TGGAAGACGCACACAACCTCGTGATAAGTCTAGGAAAAGAGAGGGAAGTGCTAGAGAAGA
AAGTGAAGAAACTCGAGGAGGACTTGGGCTCTGCAAAGGGAGAGATACTGCGCATGAGAA
GCCAACAACAGATTTCTGTAAAAGCTGTGAATAGTACAGATGATGAAGAGAAGAGTGATG
GTGATAAGGTTACTGTGAAGAAAGTTGTCAGGAGGAGAAAGAGCAGTACCAGTTCTTGAA
CAGACAAGGTTATATAATGACCAGAGCTTGTATTAGATCTTTGTGTAAATTTTGACAAGA
GGCAAGTGGCTCCAGAGTTTCATCATTGAGATCATTTCATCAATGGGTGATACGAAATGT
AGAGTGAGAAGATCAATGATTTGTATCAGATGTCTAAATTATGGTTCC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL5525Contig1 654 2 2 U
GGATAACATATAACGTAGAGAAAAGAAGATAGGAAAGGATGTCGTGGCAAACTTACGTTG
ATGAGCATTTGATGTGTGATGTTGGTGATGGTCAGGGTCATCACCTAACCGCTGCAGCAA
TCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCTCAGAGTGCCAACTTCCCTCAGTTCAAGGCAC
AAGAGTTCACTGGTATAATGAAGGATTTTGATGAACCGGGTCACCTAGCGCCCACAGGGT
TATTTCTAGCAGGAGCCAAGTACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGCGCTGTTATCCGTG
GAAAGAAGGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCATGTGTATTTGGGA
TCTATGAAGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTTGAGAGGCTAGGTGATT
ATCTCCTCGAACAGGATCTCTAAGCCCCATACTTCATCAAACCTTCTAGAATGTTCCACC
TGCTTCCACATTATTTTCTTATACAAACTAATATAATAGGATTTGGTTTCTGGATTCTCT
CTAAGAAGCTGAATCCTGATTGAGAGTTTGATTCTTTAAATTGGTTTTCTTCATTTCCAT
ACGTTTCATTTTGTTGTGTTTTTTCTTGTTAACCATGTTTAATTAATGTTCTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV05TF U 1
AF RR2GV05JQB C 154
BS 1 515 RR2GV05TF
BS 516 654 RR2GV05JQB

RD RR2GV05TF 515 0 0
GGATAACATATAACGTAGAGAAAAGAAGATAGGAAAGGATGTCGTGGCAAACTTACGTTG
ATGAGCATTTGATGTGTGATGTTGGTGATGGTCAGGGTCATCACCTAACCGCTGCAGCAA
TCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCTCAGAGTGCCAACTTCCCTCAGTTCAAGGCAC
AAGAGTTCACTGGTATAATGAAGGATTTTGATGAACCGGGTCACCTAGCGCCCACAGGGT
TATTTCTAGCAGGAGCCAAGTACATGGTGATCCAAGGCGAGCCTGGCGCTGTTATCCGTG
GAAAGAAGGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCATGTGTATTTGGGA
TCTATGAAGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTTGAGAGGCTAGGTGATT
ATCTCCTCGAACAGGATCTCTAAGCCCCATACTTCATCAAACCTTCTAGAATGTTCCACC
TGCTTCCACATTATTTTCTTATACAAACTAATATA

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2GV05JQB 501 0 0
GTGCCAACTTCCCTCAGTTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAGGATTTTGATG
AACCGGGTCACCTAGCGCCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAGTACATGGTGATCC
AAGGCGAGCCTGGCGCTGTTATCCGTGGAAAGAAGGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGA
AAACAGGACAATCATGTGTATTTGGGATCTATGAAGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCA
ACATGGTCGTTGAGAGGCTAGGTGATTATCTCCTCGAACAGGATCTTTAAGCCCCATACT
TCATCAAACCTTCTAGAATGTTCCACCTGCTTCCACATTATTTTTTTATACAAACTAATA
TAATAGGATTTGGTTTCTGGATTCTCTCTAAGAAGCTGAATCCTGATTGAGAGTTTGATT
CTTTAAATTGGTTTTCTTCATTTCCATACGTTTCATTTTGTTGTGTTTTTTCTTGTTAAC
CATGTTTAATTAATGTTCTTA

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL5526Contig1 718 2 2 U
AAGTGAGAGCTTCCTAACCATCAAAATAGAGTCGAAGGTCTAATGTTTTCTCTACATGAT
GGGACCATCTGTCCTAAAAAGAGGGATCATATAAAAGTCTATGGAGAATCGTTTCATGGT
TCCTTCAAACGGATCAAACAAGAAGATCAAACGCAAGCAAAACTTGAGAAGAACACTACT
TTGTCGAAGTCGGAGAACGCCAAGTTGTTAAAACCTGAAGTTCAGCTTTACCTAGATGCC
AAGGTCCATTCTGAGACATCTGAAGATCATAGAACATGCCTGGACCTCGAGTTAAACCTT
TGTTCCTCGTCAAGTTCCGTAGTAAAAAGAATCATGAAGAAAGAGGAATCTTCGAAAGGC
AAAACTTTGATCAGGAGCCCAAGTAAAAAGAGGAAATCTGGTGATAAAGGCGGGGTAAGT
CGATCCCCGTCTTGGCTAGCGTTTGAATGTGAGAATGATACTGATGAGCAGAAAAAGCAA
GAGATGGTAACAACGGTGTGCATGAAGTGTCACATGCTGGTTATGCTCTGCAAATCAACT
CTTGTGTGCCCCAACTGCAAGTTCACGCACCCTGATGATGATCACAGGCCTTTGAGTTTG
TTTTAAGCTTTTTATGCTAGGCTTTGCCTTTTCATATTCGTAGTTAATGGGTCCAAGAAT
TAATGTGAAACTAGGTGTATGTATATACAAGTACTTATAACACTATCATTCTATGCTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC49JQ C 1
AF RR2CC49TF U 1
BS 1 670 RR2CC49TF
BS 671 718 RR2CC49JQ

RD RR2CC49JQ 718 0 0
AAGTGAGAGCTTCCTAACCATCAAAATAGAGTCGAAGGTCTAATGTTTTCTCTACATGAT
GGGACCATCTGTCCTAAAAAGAGGGATCATATAAAAGTCTATGGAGAATCGTTTCATGGT
TCCTTCAAACGGATCAAACAAGAAGATCAAACGCAAGCAAAACTTGAGAAGAACACTACT
TTGTCGAAGTCGGAGAACGCCAAGTTGTTAAAACCTGAAGTTCAGCTTTACCTAGATGCC
AAGGTCCATTTTGAGACATCTGAAGATCATAGAACATGCCTGGACCTCGAGTTAAACCTT
TGTTCCTCGTCAAGTTCCGTAGTAAAAAGAATCATGAAGAAAGAGGAATCTTCGAAAGGC
AAAACTTTGATCAGGAGCCCAAGTAAAAAGAGGAAATCTGGTGATAAAGGCGGGGTAAGT
CGATCCCCGTCTTGGCTAGCGTTTGAATGTGAGAATGATACTGATGAGCAGAAAAAGCAA
GAGATGGTAACAACGGTGTGCATGAAGTGTCACATGCTGGTTATGCTCTGCAAATCAACT
CTTGTGTGCCCCAACTGCAAGTTCACGCACCCTGATGATGATCACAGGCCTTTGAGTTTG
TTTTAAGCTTTTTATGCTAGGCTTTGCCTTTTCATATTCGTAGTTAATGGGTCCAAGAAT
TAATGTGAAACTAGGTGTATGTATATACAAGTACTTATAACACTATCATTCTATGCTG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2CC49TF 670 0 0
AAGTGAGAGCTTCCTAACCATCAAAATAGAGTCGAAGGTCTAATGTTTTCTCTACATGAT
GGGACCATCTGTCCTAAAAAGAGGGATCATATAAAAGTCTATGGAGAATCGTTTCATGGT
TCCTTCAAACGGATCAAACAAGAAGATCAAACGCAAGCAAAACTTGAGAAGAACACTACT
TTGTCGAAGTCGGAGAACGCCAAGTTGTTAAAACCTGAAGTTCAGCTTTACCTAGATGCC
AAGGTCCATTCTGAGACATCTGAAGATCATAGAACATGCCTGGACCTCGAGTTAAACCTT
TGTTCCTCGTCAAGTTCCGTAGTAAAAAGAATCATGAAGAAAGAGGAATCTTCGAAAGGC
AAAACTTTGATCAGGAGCCCAAGTAAAAAGAGGAAATCTGGTGATAAAGGCGGGGTAAGT
CGATCCCCGTCTTGGCTAGCGTTTGAATGTGAGAATGATACTGATGAGCAGAAAAAGCAA
GAGATGGTAACAACGGTGTGCATGAAGTGTCACATGCTGGTTATGCTCTGCAAATCAACT
CTTGTGTGCCCCAACTGCAAGTTCACGCACCCTGATGATGATCACAGGCCTTTGAGTTTG
TTTTAAGCTTTTTATGCTAGGCTTTGCCTTTTCATATTCGTAGTTAATGGGTCCAAGAAT
TAATGTGAAA

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL5527Contig1 649 2 2 U
GGGAGAGCAATTAACTCGGCGACGTTCTTCAATCTCCGTCGTGCTCTCCACCGACTTTCG
GTCGTCTTAGGCGAAAAAACAAATGGCGGGAGAAGGTGAGGAAGATGTGCCAAGAGACGC
CAAGATTGTCAAGTCTCTGCTTAAGTCGATGGGGGTGGAGGACTACGAGCCTCGCGTGGT
GCACCAGTTTCTCGAATTATGGTACCGTTATGTGGTCGAAGTGTTGACAGATGCTCAGGT
TTACTCGGAGCATGCTAGCAAATCCACCATTGATTGTGACGATGTGAAGCTCGCTATTCA
ATCCAAAGTTAGTTTCGGCTTCTCTCAGCCTCCTCCAAGAGAGGTACTGCTAGAGCTTGC
TGCGAGCAGGAACAAGATTCCTTTGCCTAAATCGATAGCAGGACCAGGCATTCCTCTCCC
GCCTGAACAGGACACAGAACCTGAAGAGACAGAGGACGATGAAGAAATGACAGATCCTGC
ACAATCATCATCTCAAGAACAACAAACATCGGATCTTCCAAGCCAAACTCCTCAAAGGGT
GTCTTTTCCTCTCTCTAGACGACCCAAATAAGTAGAGAGAGACAACAGTAACAATTATGT
TATGTGTATCAAGATGTAGAAAATGTTTCGTGAATGACCAGATTATCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AY77JQ C 1
AF RR2AY77TFB U 288
BS 1 287 RR2AY77JQ
BS 288 649 RR2AY77TFB

RD RR2AY77JQ 649 0 0
GGGAGAGCAATTAACTCGGCGACGTTCTTCAATCTCCGTCGTGCTCTCCACCGACTTTCG
GTCGTCTTAGGCGAAAAAACAAATGGCGGGAGAAGGTGAGGAAGATGTGCCAAGAGACGC
CAAGATTGTCAAGTCTCTGCTTAAGTCGATGGGGGTGGAGGACTACGAGCCTCGCGTGGT
GCACCAGTTTCTCGAATTATGGTACCGTTATGTGGTCGAAGTGTTGACAGATGCTCAGGT
TTACTCGGAGCATGCTAGCAAATCCACCATTGATTGTGACGATGTGAAGCTCGCTATTCA
ATCCAAAGTTAGTTTCGGCTTCTCTCAGCCTCCTCCAAGAGAGGTACTGCTAGAGCTTGC
TGCGAGCAGGAACAAGATTCCTTTGCCTAAATCGATAGCAGGACCAGGCATTCCTCTCCC
GCCTGAACAGGACACAGAACCTGAAGAGACAGAGGACGATGAAGAAATGACAGATCCTGC
ACAATCATCATCTCAAGAACAACAAACATCGGATCTTCCAAGCCAAACTCCTCAAAGGGT
GTCTTTTCCTCTCTCTAGACGACCCAAATAAGTAGAGAGAGACAACAGTAACAATTATGT
TATGTGTATCAAGATGTAGAAAATGTTTCGTGAATGACCAGATTATCCG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2AY77TFB 362 0 0
AGCTCGCTATTCAATCCAAAGTTAGTTTCGGCTTCTCTCAGCCTCCTCCAAGAGAGGTAC
TGCTAGAGCTTGCTGCGAGCAGGAACAAGATTCCTTTGCCTAAATCGATAGCAGGACCAG
GCATTCCTCTCCCGCCTGAACAGGACACAGAACCTGAAGAGACAGAGGACGATGAAGAAA
TGACAGATCCTGCACAATCATCATCTCAAGAACAACAAACATCGGATCTTCCAAGCCAAA
CTCCTCAAAGGGTGTCTTTTCCTCTCTCTAGACGACCCAAATAAGTAGAGAGAGACAACA
GTAACAATTATGTTATGTGTATCAAGATGTAGAAAATGTTTCGTGAATGACCAGATTATC
CG

QA 1 362 1 362
DS 



AS 1 2

CO CL5528Contig1 228 2 1 U
GCGCCGCCGCCTGCTTTCCCTATTCCTCTCCCTCCAATCTTCCCTGGAATCCCTCCTGCT
TCATCTTCCTTCTCTAGTCACCATCAACCCTAGTTTTAAAAGTCCTTTCCCCACACATTT
CCAATTATGTAATCTATATGTATCAATCTTCGTTTCCTTTACTCGGCATTCTCACTTGTT
GGCTTGTTGTAATCTCAATCTCTATAATATTTACTAAGGAGTTTAATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DH43JQ C 1
AF RR2DH43TF U 1
BS 1 228 RR2DH43TF

RD RR2DH43JQ 228 0 0
GCGCCGCCGCCTGCTTTCCCTATTCCTCTCCCTCCAATCTTCCCTGGAATCCCTCCTGCT
TCATCTTCCTTCTCTAGTCACCATCAACCCTAGTTTTAAAAGTCCTTTCCCCACACATTT
CCAATTATGTAATCTATATGTATCAATCTTCGTTTCCTTTACTCGGCATTCTCACTTGTT
GGCTTGTTGTAATCTCAATCTCTATAATATTTACTAAGGAGTTTAATT

QA 1 228 1 228
DS 

RD RR2DH43TF 228 0 0
GCGCCGCCGCCTGCTTTCCCTATTCCTCTCCCTCCAATCTTCCCTGGAATCCCTCCTGCT
TCATCTTCCTTCTCTAGTCACCATCAACCCTAGTTTTAAAAGTCCTTTCCCCACACATTT
CCAATTATGTAATCTATATGTATCAATCTTCGTTTCCTTTACTCGGCATTCTCACTTGTT
GGCTTGTTGTAATCTCAATCTCTATAATATTTACTAAGGAGTTTAATT

QA 1 228 1 228
DS 



AS 1 2

CO CL5529Contig1 825 2 2 U
CAGAAGAATCTTCATACGGATTGACCAGACCGTGTAGTTAGTTGATGTAAGCATCGGACA
ACTTATGATTGATGAACCTCTTTCTTTCACTTTCCCTAATTGTCCGCCAATCGGACTCGT
CACCAGATCTTTTGTATCTCCCATGTTGGCTCTGATACCACGTGTTGTTTCAAACTCAAG
ATGATCGACACAAAAGATTATAAGAGCTCACTTATATTGCTTAAGAAAAATTCCTCAAAA
CTTAAGCACACAATACCAAACTCTAAAACTCTTAACTCTTGCCACAAGTCGGCATCTCAA
TATATAGGTCTAACAAATTCCTAAACTCATTAGGAGACCTATTTTATAAACTCAATACAA
ATAGGATTAGTAAGACTTGTGCCCTAAGTTAACTTCAAGTTTATCAACAACAATTTGTAC
CGTCTGCGCTTGACTAGTGTTTGCTCTTCATCTCTAGTGGTGGTCCATCGGGTTTACTCG
TGAGCTTCTCTACCGCGCAAGCTGTGGGTCTGTTTGTTCGGCGTCCTCCTCATGTGGTGT
CCCGGAGCTGTTGCCAGCCGCCTCCGTTGAAGTCACTTGAGCCACCTTCGGGTGAGTGTT
CGTCCGAACGACCCTCTTCAGTGTTTCTTTTGGTTTCCCTAGGTGATCGAAAAGGGGTTT
GTGTAGGGAGAAATTAGTTGTCATTTGGTCTTGTATTCTATTAAGTTAAGGATCACCATT
ATCGATTTGATCTTAGCTTATCTTGGTTTCTTATGGGTTTGTTAATTTTTTGCGGCCTTT
AAGAACCCACTGGCTTTAGAAGCAGATTCTGGTTCAACCATGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY50TF U 1
AF RR2CY50JQ C 265
BS 1 629 RR2CY50TF
BS 630 825 RR2CY50JQ

RD RR2CY50TF 629 0 0
CAGAAGAATCTTCATACGGATTGACCAGACCGTGTAGTTAGTTGATGTAAGCATCGGACA
ACTTATGATTGATGAACCTCTTTCTTTCACTTTCCCTAATTGTCCGCCAATCGGACTCGT
CACCAGATCTTTTGTATCTCCCATGTTGGCTCTGATACCACGTGTTGTTTCAAACTCAAG
ATGATCGACACAAAAGATTATAAGAGCTCACTTATATTGCTTAAGAAAAATTCCTCAAAA
CTTAAGCACACAATACCAAACTCTAAAACTCTTAACTCTTGCCACAAGTCGGCATCTCAA
TATATAGGTCTAACAAATTCCTAAACTCATTAGGAGACCTATTTTATAAACTCAATACAA
ATAGGATTAGTAAGACTTGTGCCCTAAGTTAACTTCAAGTTTATCAACAACAATTTGTAC
CGTCTGCGCTTGACTAGTGTTTGCTCTTCATCTCTAGTGGTGGTCCATCGGGTTTACTCG
TGAGCTTCTCTACCGCGCAAGCTGTGGGTCTGTTTGTTCGGCGTCCTCCTCATGTGGTGT
CCCGGAGCTGTTGCCAGCCGCCTCCGTTGAAGTCACTTGAGCCACCTTCGGGTGAGTGTT
CGTCCGAACGACCCTCTTCAGTGTTTCTT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2CY50JQ 561 0 0
AAAACTCTTAACTCTTGCCACAAGTCGGCATCTCAATATATAGGTCTAACAAATTCCTAA
ACTCATTAGGAGACCTATTTTATAAACTCAATACAAATAGGATTAGTAAGACTTGTGCCC
TAAGTTAACTTCAAGTTTATCAACAACAATTTGTACCGTCTGCGCTTGACTAGTGTTTGC
TCTTCATCTCTAGTGGTGGTCCATCGGGTTTACTCGTGAGCTTCTCTACCGCGCAAGCTG
TGGGTCTGTTTGTTGGGCGTCCTCCTCATGTGGTGTCCCGGAGCTGTTGCCAGCCGCCTC
CGTTGAAGTCACTTGAGCCACCTTCGGGTGAGTGTTCGTCCGAACGACCCTCTTCAGTGT
TTCTTTTGGTTTCCCTAGGTGATCGAAAAGGGGTTTGTGTAGGGAGAAATTAGTTGTCAT
TTGGTCTTGTATTCTATTAAGTTAAGGATCACCATTATCGATTTGATCTTAGCTTATCTT
GGTTTCTTATGGGTTTGTTAATTTTTTGCGGCCTTTAAGAACCCACTGGCTTTAGAAGCA
GATTCTGGTTCAACCATGTTG

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL5530Contig1 814 2 6 U
TTTTTTTAATAAAAAAAGATAAATATATCAAGAAATGTTTTACAAGTCACACATTTTTAT
GTAGCTTCATGTGTAAATGAGCAGAAGATAAATTTATTAACCAACCTCGAGAAATAAGAA
TAAGTCCAGATTATTAAGGAGAGATACCTAGTTTGGTTTGGTTTAGAGCCAAGCGGGGCT
CTTGATGGCAGTGACAACAGCCCTGACTTGCAAGTAATTATTGAGACTGTAGATACCTTT
CTCTATTCCAATGCCACTCATCTTATACCCTCCAAATGGAATTGTGGCATCAAACACATC
GAAACAGTTTATCCAAACGCTACCAACCCTGAGCGCTCTCATCAGCCGGTTCGCTGTGTC
CAGATTCTGAGTGAACACTCCTGCAGCTAAACCGTACCTAGAGTTGTTCGCCCTTGCAAT
CACCTCATCCAGATTCTTGAATTTCAGGATGGTTTGAACAGGTCCGAAAATCTCGTCCGT
TGCTATGAGCATGTCGTCTTTGACGTCTGAAAAGACAGTGGGTTGAATGTAGTAGCCCTT
GGAACCAAACCGGTCACCTCCAGCTTGTAAGGTGGCTCCATTCTCAACTCCATGTTTAAT
GAACTTCAAGATTTTCTTGAACTGCTCTGAGTCCACCTGGGGACCTTGCTCAATGCCTGA
CTTAAATGGATCTCCAACAGCGCGTTTGATTGCGCGAGCTTTAGCTTTCTCTACAAACTC
ATCATACACACGTTCATGCACAAATGTACGCGAGCCAGCACAGCAGCATTGTCCCTGGTT
AAAGAACAAAGCGAAATGAGCAAGCTCAACTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ92JQ U 1
AF RR2B443JQ U 2
BS 1 178 RR2DZ92JQ
BS 179 179 RR2B443JQ
BS 180 202 RR2DZ92JQ
BS 203 203 RR2B443JQ
BS 204 366 RR2DZ92JQ
BS 367 814 RR2B443JQ

RD RR2DZ92JQ 366 0 0
TTTTTTTAATAAAAAAAGATAAATATATCAAGAAATGTTTTACAAGTCACACATTTTTAT
GTAGCTTCATGTGTAAATGAGCAGAAGATAAATTTATTAACCAACCTCGAGAAATAAGAA
TAAGTCCAGATTATTAAGGAGAGATACCTAGTTTGGTTTGGTTTAGAGCCAAGCGGGGTT
CTTGATGGCAGTGACAACAGCCTTGACTTGCAAGTAATTATTGAGACTGTAGATACCTTT
CTCTATTCCAATGCCACTCATCTTATACCCTCCAAATGGAATTGTGGCATCAAACACATC
GAAACAGTTTATCCAAACGCTACCAACCCTGAGCGCTCTCATCAGCCGGTTCGCTGTGTC
CAGATT

QA 1 366 1 366
DS 

RD RR2B443JQ 813 0 0
CACAAG
AATAAAAAAAGATAAATATATCAAGAAATGTTTTACAAGTCACACATTTTTATGTAGCTT
CATGTGTAAATGAGCAGAAGATAAATTTATTAACCAACCTCGAGAAATAAGAATAAGTCC
AGATTATTAAGGAGAGATACCTAGTTTGGTTTGGTTTAGAGCCAAGCGGGGCTCTTGATG
GCAGTGACAACAGCCCTGACTTGCAAGTAATTATTGAGACTGTAGATACCTTTCTCTCTT
CCAATGCCACTCATCTTATACCCTCCAAATGGAATTGTGGCATCAAACACATCGAAACAG
TTTATCCAAACGCTACCAACCCTGAGCGCTCTCATCAGCCGGTTCGCTGTGTCCAGATTC
TGAGTGAACACTCCTGCAGCTAAACCGTACCTAGAGTTGTTCGCCCTTGCAATCACCTCA
TCCAGATTCTTGAATTTCAGGATGGTTTGAACAGGTCCGAAAATCTCGTCCGTTGCTATG
AGCATGTCGTCTTTGACGTCTGAAAAGACAGTGGGTTGAATGTAGTAGCCCTTGGAACCA
AACCGGTCACCTCCAGCTTGTAAGGTGGCTCCATTCTCAACTCCATGTTTAATGAACTTC
AAGATTTTCTTGAACTGCTCTGAGTCCACCTGGGGACCTTGCTCAATGCCTGACTTAAAT
GGATCTCCAACAGCGCGTTTGATTGCGCGAGCTTTAGCTTTCTCTACAAACTCATCATAC
ACACGTTCATGCACAAATGTACGCGAGCCAGCACAGCAGCATTGTCCCTGGTTAAAGAAC
AAAGCGAAATGAGCAAGCTCAACTGCC

QA 7 813 7 813
DS 



AS 1 2

CO CL5531Contig1 1369 2 8 U
GGAAATAATAAGAAAGAAAGAAAAAAAAATCTGTGAGGACGAAAACTCTCCTTCGTTCCG
GCAACTTTCTTTTGTTGATCGTCGAGTCTTGCCGTAATCCATAGGACTCCCCTAACCACT
TTAACGATTACCGGTTTTGGAAGTGTGACTTCGGTCTTAATAAAACAAAAATGGTGCAAA
GCCATTCGCTAAGCACGTTAACAATCTGTGGAAGTGTACAAGTTTACAGCTCATGGAGTA
GGAACCGTGTAAAGTTTGGGAACTCTTCAGGACTGATTGGTGATCGATGCGTGTCGTGTC
AATTCTTCCGTAGACCATTATCCCTAAGAAGCCAATGGAAGTCACTTAAGCTAAGAAACT
TCTCGAGGGTTGAAGCTAGATGGCCGTTTCAAGGAGGAGGTGAGCAAGGTCTAGACCCGA
ACTCTGAGCGAAGCGAGAGTGCCAATGAAGATATTTTGATCTTTTTCTTTCAGCTTGACT
TGGCTACTCGTGTTCAGTGTGCTTTGAATATGGAGCAGTATGATATTGCACAACAACTAA
GAGAGAAGCTAAATGAGGTTGAAGAGGAGGCGATAAGACTGCAAGAAGCTAAAAGAGGAT
CACCATCAAAAAGTGAAGCACAAGACAAGGGTATTAGCCTTATAACGCTACGTGCAGATC
TCCAGAATGCTATTGACGGTGAGGACTATGGTTTGGCAGCTAAGTTAAGAGACGAAATCT
CAAAGCTTGAGGCAGAGTCGTTAGCTGTGTCTGCCAAAGCCTTGGCTTTTGAGAATGCTG
AGTATGCGTTTCGTTTGGGACAGAAACTGAAACACAAAGCTTTTGGTTACAGGGCTGTAG
TTTGCGGGATGGATCCAGTTTGCTGTGAATCAAGCTCCTGGATGGAAGCTGCAGAAGTTG
AAAAGCTGCCTCGTGGTTCCAATCAGCCATTTTATCAGGTTCTTGTCGATGTTCGCACCC
ACCCTGATCTACTAGTGGCATACGTTCCTGAAGACAATCTATTAGCTCCTGAGAAACCGG
ACAAAGAAAGGTTTGATCATCCATACATTTCTTTCCTCTTCTATGGTGCGGATACAGCTG
GAGATTTCATCCCAATCCAACAACTGCGTGAGAAGTACAACAAACCTCGGCATGAAGCTC
CTTTTGATTCACAAGATGAGGATTAAGATGAAAGCAAGATTTTGAGCTTTAAGACCACAC
AACAAAGTAAGAATCGTAGCATCGCCCAGAGCTGTTAGTTCACTGTTGGTTATTTTATAT
ATATCCTCGTCGATGTAGTCAACACAACTGTTCTTGCTCTGTAGACTAAAAAAACAAATC
ATCGTTATCCAAGAATGCTTTTTGTGTATATATGATTCTTTGTTCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC73TF U 1
AF RR2AC73JQ C 491
BS 1 798 RR2AC73TF
BS 799 799 RR2AC73JQ
BS 800 805 RR2AC73TF
BS 806 806 RR2AC73JQ
BS 807 833 RR2AC73TF
BS 834 834 RR2AC73JQ
BS 835 869 RR2AC73TF
BS 870 1369 RR2AC73JQ

RD RR2AC73TF 869 0 0
GGAAATAATAAGAAAGAAAGAAAAAAAAATCTGTGAGGACGAAAACTCTCCTTCGTTCCG
GCAACTTTCTTTTGTTGATCGTCGAGTCTTGCCGTAATCCATAGGACTCCCCTAACCACT
TTAACGATTACCGGTTTTGGAAGTGTGACTTCGGTCTTAATAAAACAAAAATGGTGCAAA
GCCATTCGCTAAGCACGTTAACAATCTGTGGAAGTGTACAAGTTTACAGCTCATGGAGTA
GGAACCGTGTAAAGTTTGGGAACTCTTCAGGACTGATTGGTGATCGATGCGTGTCGTGTC
AATTCTTCCGTAGACCATTATCCCTAAGAAGCCAATGGAAGTCACTTAAGCTAAGAAACT
TCTCGAGGGTTGAAGCTAGATGGCCGTTTCAAGGAGGAGGTGAGCAAGGTCTAGACCCGA
ACTCTGAGCGAAGCGAGAGTGCCAATGAAGATATTTTGATCTTTTTCTTTCAGCTTGACT
TGGCTACTCGTGTTCAGTGTGCTTTGAATATGGAGCAGTATGATATTGCACAACAACTAA
GAGAGAAGCTAAATGAGGTTGAAGAGGAGGCGATAAGACTGCAAGAAGCTAAAAGAGGAT
CACCATCAAAAAGTGAAGCACAAGACAAGGGTATTAGCCTTATAACGCTACGTGCAGATC
TCCAGAATGCTATTGACGGTGAGGACTATGGTTTGGCAGCTAAGTTAAGAGACGAAATCT
CAAAGCTTGAGGCAGAGTCGTTAGCTGTGTCTGCCAAAGCCTTGGCTTTTGAGAATGCTG
AGTATGCGTTTCGTTTGG*ACAGAA*CTGAAACACAAAGCTTTTGGTTACAGG*CTGTAG
TTTGCGGGATGGATCCAGTTTGCTGTGAA

QA 1 869 1 869
DS 

RD RR2AC73JQ 879 0 0
TGTTCAGTGTGCTTTGAATATGGAGCAGTATGATATTGCACAACAACTAAGAGAGAAGCT
AAATGAGGTTGAAGAGGAGGCGATAAGACTGCAAGAAGCTAAAAGAGGATCACCATCAAA
AAGTGAAGCACAAGACAAGGGTATTAGCCTTATAAGGCTACGTGCAGATCTCCAGAATGC
TATTGACGGTGAGGACTATGGTTTGGCAGCTAAGTTAAGAGACGAAATCTCAAAGCTTGA
GGCAGAGTCGTTAGCTGTGTCTGCCAAAGCCTTGGCTTTTGAGAATGCTGAGTATGCGTT
TCGTTTGGGACAGAAACTGAAACACAAAGCTTTTGGTTACAGGGCTGTAGTTTGCGGGAT
GGATCCAGTTTGCTGTGAATCAAGCTCCTGGATGGAAGCTGCAGAAGTTGAAAAGCTGCC
TCGTGGTTCCAATCAGCCATTTTATCAGGTTCTTGTCGATGTTCGCACCCACCCTGATCT
ACTAGTGGCATACGTTCCTGAAGACAATCTATTAGCTCCTGAGAAACCGGACAAAGAAAG
GTTTGATCATCCATACATTTCTTTCCTCTTCTATGGTGCGGATACAGCTGGAGATTTCAT
CCCAATCCAACAACTGCGTGAGAAGTACAACAAACCTCGGCATGAAGCTCCTTTTGATTC
ACAAGATGAGGATTAAGATGAAAGCAAGATTTTGAGCTTTAAGACCACACAACAAAGTAA
GAATCGTAGCATCGCCCAGAGCTGTTAGTTCACTGTTGGTTATTTTATATATATCCTCGT
CGATGTAGTCAACACAACTGTTCTTGCTCTGTAGACTAAAAAAACAAATCATCGTTATCC
AAGAATGCTTTTTGTGTATATATGATTCTTTGTTCATCC

QA 1 879 1 879
DS 



AS 1 2

CO CL5532Contig1 894 2 2 U
GGAACACATATAAATTGATCCTTGCCTTTTCTTATACTATTTACACACAGAAAAAAAAAT
ACAAAGTAGTAGAATATGGTTGTGAAAGTATACGGACAGGTTACTGCAGCTTGTCCGCAA
AGAGTCTTGCTTTGTCTTCTTGAGAAAGAAATTGAATTTGAGATTGTTCACATCGATCTC
GATACATTAGAGCAGAAAAGACCAGAACATCTTCTTCGTCAGCCATTTGGTCAAGTTCCA
GCCATAGAAGATGGAGACTTCAAGCTTTTTGAATCTCGAGCCATTGCGAGATACTACGCG
ACCAAGTACGCGGACCAAGGCACGAACCTTTTGGGAAAGTCTCTAGAGCACCGAGCCATG
GTGGACCAGTGGGCTGATGTTGAGGTGGGTTACTTCAACGTGCTGGTACACCCTCTAGTG
ATGAACCTAGTCATCAAGCCGAGGTTAGGCGAAGAATGTGACGCCGTTTTGGTGGAGGAG
CTCAAGGTAAAGCTCGGGGTGGTCTTGGACATATACGACAACCAGCTTGCTTCGAACCGG
TTTCTGGCTGGTGATGAATTCACTATGGCTGATTTAACGCACATGCCGGCGATGAGGTAC
TTGATGGGTACCGGTCTAAACCGGATTGTTAAGGCTCGGGTTAATATGAACCGGTGGTGG
GAAGAGATTTCGGCTAGACCGGCCTGGAAGAAGCTTATGAATATTGCTGGTCTCTGAATT
ATAGCTCAAATTTATATGATGATGATATACGAACAAATTAATCTTCTTATTTTCTGTTTC
TTTTGTTTGTCTGAGTTAAATCAATTTACTTTTGAAGATTTTAATTTGCCAACTGGATCG
TATTTTTCATATACGAAATGTTCTATATTGATATAATAAAAGTATACTTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AI44TF U 1
AF RR2AI44JQ C 44
BS 1 684 RR2AI44TF
BS 685 894 RR2AI44JQ

RD RR2AI44TF 684 0 0
GGAACACATATAAATTGATCCTTGCCTTTTCTTATACTATTTACACACAGAAAAAAAAAT
ACAAAGTAGTAGAATATGGTTGTGAAAGTATACGGACAGGTTACTGCAGCTTGTCCGCAA
AGAGTCTTGCTTTGTCTTCTTGAGAAAGAAATTGAATTTGAGATTGTTCACATCGATCTC
GATACATTAGAGCAGAAAAGACCAGAACATCTTCTTCGTCAGCCATTTGGTCAAGTTCCA
GCCATAGAAGATGGAGACTTCAAGCTTTTTGAATCTCGAGCCATTGCGAGATACTACGCG
ACCAAGTACGCGGACCAAGGCACGAACCTTTTGGGAAAGTCTCTAGAGCACCGAGCCATG
GTGGACCAGTGGGCTGATGTTGAGGTGGGTTACTTCAACGTGCTGGTACACCCTCTAGTG
ATGAACCTAGTCATCAAGCCGAGGTTAGGCGAAGAATGTGACGCCGTTTTGGTGGAGGAG
CTCAAGGTAAAGCTCGGGGTGGTCTTGGACATATACGACAACCAGCTTGCTTCGAACCGG
TTTCTGGCTGGTGATGAATTCACTATGGCTGATTTAACGCACATGCCGGCGATGAGGTAC
TTGATGGGTACCGGTCTAAACCGGATTGTTAAGGCTCGGGTTAATATGAACCGGTGGTGG
GAAGAGATTTCGGCTAGACCGGCC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2AI44JQ 851 0 0
ACACAGA
AAAAAAAAATACAAAGTAGTAGAATATGGTTGTGAAAGTATACGGACAGGTTACTGCAGC
TTGTCCGCAAAGAGTCTTGCTTTGTCTTCTTGAGAAAGAAATTGAATTTGAGATTGTTCA
CATCGATCTCGATACATTAGAGCAGAAAAGACCAGAACATCTTCTTCGTCAGCCATTTGG
TCAAGTTCCAGCCATAGAAGATGGAGACTTCAAGCTTTTTGAATCTCGAGCCATTGCGAG
ATACTACGCGACCAAGTACGCGGACCAAGGCACGAACCTTTTGGGAAAGTCTCTAGAGCA
CCGAGCCATGGTGGACCAGTGGGCTGATGTTGAGGTGGGTTACTTCAACGTGCTGGTACA
CCCTCTAGTGATGAACCTAGTCATCAAGCCGAGGTTAGGCGAAGAATGTGACGCCGTTTT
GGTGGAGGAGCTCAAGGTAAAGCTCGGGGTGGTCTTGGACATATACGACAACCAGCTTGC
TTCGAACCGGTTTCTGGCTGGTGATGAATTCACTATGGCTGATTTAACGCACATGCCGGC
GATGAGGTACTTGATGGGTACCGGTCTAAACCGGATTGTTAAGGCTCGGGTTAATATGAA
CCGGTGGTGGGAAGAGATTTCGGCTAGACCGGCCTGGAAGAAGCTTATGAATATTGCTGG
TCTCTGAATTATAGCTCAAATTTATATGATGATGATATACGAACAAATTAATCTTCTTAT
TTTCTGTTTCTTTTGTTTGTCTGAGTTAAATCAATTTACTTTTGAAGATTTTAATTTGCC
AACTGGATCGTATTTTTCATATACGAAATGTTCTATATTGATATAATAAAAGTATACTTA
TTTT

QA 8 851 8 851
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5534Contig1 412 2 1 U
GGACCAAGAGAAGGAATGATGTCGGCCATGAGTATCAACGATCCTCCAACATTTGGTTTT
GGTTTCCCAAAGATTAATAGTGATCAAGCGCAAGTCCCTGTGTTCAACAGTGCTCCTGCT
TCTTCTATATTTTCATCCCCTGCTTCGAGTATCCCTCCTCAAGGGTTCACTTTTGGAGCT
GCTCCACCAAAGCCAACAACCGGCGATGATATTTCCATGGATGGCTCTTAAAACCAAATC
TGCAAGAACATTCCACAAAAAAAACATACCGGTTTCCTTTTTTTTTTCCTTTTTGTAAAT
GGATATTGGTGCACGCTTGAGAGAGTTTGGGTACGTGAGATGAATCTTTGTTGGTTTGGT
GTTTTGCATCTATCTCTGTTTGCTGAAAGGAAAGCATCTATTTTCTGGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G438TF U 1
AF RR2G438JQ C 35
BS 1 412 RR2G438TF

RD RR2G438TF 412 0 0
GGACCAAGAGAAGGAATGATGTCGGCCATGAGTATCAACGATCCTCCAACATTTGGTTTT
GGTTTCCCAAAGATTAATAGTGATCAAGCGCAAGTCCCTGTGTTCAACAGTGCTCCTGCT
TCTTCTATATTTTCATCCCCTGCTTCGAGTATCCCTCCTCAAGGGTTCACTTTTGGAGCT
GCTCCACCAAAGCCAACAACCGGCGATGATATTTCCATGGATGGCTCTTAAAACCAAATC
TGCAAGAACATTCCACAAAAAAAACATACCGGTTTCCTTTTTTTTTTCCTTTTTGTAAAT
GGATATTGGTGCACGCTTGAGAGAGTTTGGGTACGTGAGATGAATCTTTGTTGGTTTGGT
GTTTTGCATCTATCTCTGTTTGCTGAAAGGAAAGCATCTATTTTCTGGTTTG

QA 1 412 1 412
DS 

RD RR2G438JQ 378 0 0
TCAACGATCCTCCAACATTTGGTTTTGGTTTCCCAAAGATTAATAGTGATCAAGCGCAAG
TCCCTGTGTTCAACAGTGCTCCTGCTTTTTCTATATTTTCATCCCCTGCTTCGAGTATCC
CTCCTCAAGGGTTCACTTTTGGAGCTGCTCCACCAAAGCCAACAACCGGCGATGATATTT
CCATGGATGGCTTTTAAAACCAAATTTGCAAGAACATTCCACAAAAAAAACATACCGGTT
TCCTTTTTTTTTTCCTTTTTGTAAATGGATATTGGTGCACGCTTGAGAGAGTTTGGGTAC
GTGAGATGAATCTTTGTTGGTTTGGTGTTTTGCATCTATCTCTGTTTGCTGAAAGGAAAG
CATCTATTTTTTGGTTTG

QA 1 378 1 378
DS 



AS 1 2

CO CL5535Contig1 948 2 2 U
GGATAGAAAGGGGTTCTCTCTCTACTTTTAGAGAGAGAGATATTTTCTCTCGAATCATCC
TTCGTACTTCATCTCTATTCTTCAAAAGGATGATTCGAACCCCTATTTTTGTTTGTAAAA
TAATTTTCGATCTTTAGATCGATTATGTTTTTCCGGTTTGCGGATTTCTTTTTCGCTTTA
GGTGATCTTTTCTTCGTTCGGCGACTTCACTTCGCTAGGCGAATTTTGGTGTAAAATTCA
ACCAAAATCAGAGCAGTTCTTTATATCTATCTTTTCTCTGATATTGTGTTGAGCTAATAA
TAGTACCGATTCTAATCGGTTTTCCAGCTTTTCCCTTGTTTTAAATGTTTTATTCTGATT
GAATCTGAGGGCTTATCTTTGTCGTTTGGTCATCCTCAACTTTCTTTCTAAAAAAGAGTC
AATCTTTGCGTTGAAATATCATTAAGCAAAGTGTCTTTAACGGTTTGAAAAGTTGAGTTT
TTTTCGATCTCACTTCTGATTATTGTGCGGATTCAGCAGATTTGAAGCTTTCTTATATGA
AAGTGTTTCAAAATAGGATCTGTTACAAGGATTCAGAAGATTCGATGGGCTTCATATCCA
GCAACAAGGAGAAAGATCCTTCTAAATTCAACAGTGATTAGGGGGAGAAGCTTTCAAGTG
GATTCAAGTTTTCAGAGAGATGAGGTTCTATGCCTTTGCTTCACGAAGGTTGAAGAAACG
GTGGCAGCGGTTTCCGGCGAAACTCTCGGCGGAGACAGTCGGAGTCGGTGAGGCGGTGGC
TGGTTCTCTGCATTTTTGACGTGTGGCTTTACACGTGCAGGTTGATTTGAGAGAGAAGCT
GGCTGTTGCTCTCATTTGGGTTGTATCTTGGGCCTTGTTTTATTATAAACTTGTATCTGC
TTGTACTAAAATTGGCTTTAAAGCCTTTTAATGAAATTATCAGTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A786TF U 1
AF RR2A786JQ C 175
BS 1 537 RR2A786TF
BS 538 948 RR2A786JQ

RD RR2A786TF 537 0 0
GGATAGAAAGGGGTTCTCTCTCTACTTTTAGAGAGAGAGATATTTTCTCTCGAATCATCC
TTCGTACTTCATCTCTATTCTTCAAAAGGATGATTCGAACCCCTATTTTTGTTTGTAAAA
TAATTTTCGATCTTTAGATCGATTATGTTTTTCCGGTTTGCGGATTTCTTTTTCGCTTTA
GGTGATCTTTTCTTCGTTCGGCGACTTCACTTCGCTAGGCGAATTTTGGTGTAAAATTCA
ACCAAAATCAGAGCAGTTCTTTATATCTATCTTTTCTCTGATATTGTGTTGAGCTAATAA
TAGTACCGATTCTAATCGGTTTTCCAGCTTTTCCCTTGTTTTAAATGTTTTATTCTGATT
GAATCTGAGGGCTTATCTTTGTCGTTTGGTCATCCTCAACTTTCTTTCTAAAAAAGAGTC
AATCTTTGCGTTGAAATATCATTAAGCAAAGTGTCTTTAACGGTTTGAAAAGTTGAGTTT
TTTTCGATCTCACTTCTGATTATTGTGCGGATTCAGCAGATTTGAAGCTTTCTTATA

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2A786JQ 774 0 0
GCTTTAGGTGATCTTTTCTTCGTTCGGCGACTTCACTTCGCTAGGCGAATTTTGGTGTAA
AATTCAACCAAAATCAGAGCAGTTCTTTATATCTATCTTTTCTCTGATATTGTGTTGAGC
TAATAATAGTACCGATTCTAATCGGTTTTCCAGCTTTTCCCTTGTTTTAAATGTTTTATT
CTGATTGAATCTGAGGGCTTATCTTTGTCGTTTGGTCATCCTCAACTTTCTTTCTAAAAA
AGAGTCAATCTTTGCGTTGAAATATCATTAAGCAAAGTGTCTTTAACGGTTTGAAAAGTT
GAGTTTTTTTCGATCTCACTTCTGATTATTGTGCGGATTCAGCAGATTTGAAGCTTTCTT
ATATGAAAGTGTTTCAAAATAGGATCTGTTACAAGGATTCAGAAGATTCGATGGGCTTCA
TATCCAGCAACAAGGAGAAAGATCCTTCTAAATTCAACAGTGATTAGGGGGAGAAGCTTT
CAAGTGGATTCAAGTTTTCAGAGAGATGAGGTTCTATGCCTTTGCTTCACGAAGGTTGAA
GAAACGGTGGCAGCGGTTTCCGGCGAAACTCTCGGCGGAGACAGTCGGAGTCGGTGAGGC
GGTGGCTGGTTCTCTGCATTTTTGACGTGTGGCTTTACACGTGCAGGTTGATTTGAGAGA
GAAGCTGGCTGTTGCTCTCATTTGGGTTGTATCTTGGGCCTTGTTTTATTATAAACTTGT
ATCTGCTTGTACTAAAATTGGCTTTAAAGCCTTTTAATGAAATTATCAGTTGAC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL5536Contig1 772 2 2 U
GGAACCAACCCACCCACAGACCCTCTCTCTCCCTCTAGACCAGAAACATGGATGCTTCAT
CTAGAAAACCTTATTTCATCGAAGAGGACGATGATATGGCTTCCTCTTTATCAGAGATGG
AAGCTGGGTTTTCTGGTAGTAACTCACTAAACGGTGTCGTTTCGGGTCCTCTTTCTTACA
CTAGCATCAGGAACAGGAACTATTGTCACAGCACCTACACTCATGGTTATTACCACCATC
AGTACTCTGTTTCGTCTCCGAGATCTGTCGTTTCCCGAAGATTCCATGACTTCAGATTAG
ATAATCAACAGCCTCATTACTTGGATTCGTGTTTCCTCTGCAAGAAACCACTTCATAACA
GAGATATCTACATGTACAGAGGAGACACACCGTTTTGTAGTGAAGAGTGTAGACAAGAAC
AGGTAGAGAGAGATGAAGCAGAAGAGAAGAGAAAGAATCTGTCTTATTCGGTGAAATCAG
CAATGAGGAGAAAAGAGCAACGAAGCTCCTCTTCTTCTCCGACCAGATCTGGTGGTTATG
CTTTTCACAACGGACCTGTTGCTGCTGCTTGAAGTTCCGAATCTGATGTTGAGTTTGAAA
ACTATATAATAATAATAATAATTAGGTTTAAAGGGAAGAAGAAAAAAACAAGAGATTGTC
TCTGAACGTTTGGAAGTCTCTTTAGATCTTTTTTCAAATCTAAAAGATCAGTTTACTTTC
TCATTAAGTTTTCAGGGAATGGAGAAAGCTAAAGATCCTTTTTTTAACTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC55TF U 1
AF RR2CC55JQ C 286
BS 1 647 RR2CC55TF
BS 648 772 RR2CC55JQ

RD RR2CC55TF 647 0 0
GGAACCAACCCACCCACAGACCCTCTCTCTCCCTCTAGACCAGAAACATGGATGCTTCAT
CTAGAAAACCTTATTTCATCGAAGAGGACGATGATATGGCTTCCTCTTTATCAGAGATGG
AAGCTGGGTTTTCTGGTAGTAACTCACTAAACGGTGTCGTTTCGGGTCCTCTTTCTTACA
CTAGCATCAGGAACAGGAACTATTGTCACAGCACCTACACTCATGGTTATTACCACCATC
AGTACTCTGTTTCGTCTCCGAGATCTGTCGTTTCCCGAAGATTCCATGACTTCAGATTAG
ATAATCAACAGCCTCATTACTTGGATTCGTGTTTCCTCTGCAAGAAACCACTTCATAACA
GAGATATCTACATGTACAGAGGAGACACACCGTTTTGTAGTGAAGAGTGTAGACAAGAAC
AGGTAGAGAGAGATGAAGCAGAAGAGAAGAGAAAGAATCTGTCTTATTCGGTGAAATCAG
CAATGAGGAGAAAAGAGCAACGAAGCTCCTCTTCTTCTCCGACCAGATCTGGTGGTTATG
CTTTTCACAACGGACCTGTTGCTGCTGCTTGAAGTTCCGAATCTGATGTTGAGTTTGAAA
ACTATATAATAATAATAATAATTAGGTTTAAAGGGAAGAAGAAAAAA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2CC55JQ 487 0 0
ATGACTTCAGATTAGATAATCAACAGCCTCATTACTTGGATTCGTGTTTCCTCTGCAAGA
AACCACTTCATAACAGAGATATCTACATGTACAGAGGAGACACACCGTTTTGTAGTGAAG
AGTGTAGACAAGAACAGGTAGAGAGAGATGAAGCAGAAGAGAAGAGAAAGAATCTGTCTT
ATTCGGTGAAATCAGCAATGAGGAGAAAAGAGCAACGAAGCTCCTCTTCTTCTCCGACCA
GATCTGGTGGTTATGCTTTTCACAACGGACCTGTTGCTGCTGCTTGAAGTTCCGAATCTG
ATGTTGAGTTTGAAAACTATATAATAATAATAATAATTAGGTTTAAAGGGAAGAAGAAAA
AAACAAGAGATTGTCTCTGAACGTTTGGAAGTCTCTTTAGATCTTTTTTCAAATCTAAAA
GATCAGTTTACTTTCTCATTAAGTTTTCAGGGAATGGAGAAAGCTAAAGATCCTTTTTTT
AACTCAC

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL5537Contig1 1199 2 2 U
GGACTGTTTTCAGAGTGAAAAGAAAAACTGAATACGAACCGGTTTAACGAACCTGTTCCG
ATGGATAATCTACTGTGCGAGGAGTCATGGCTGTCGGGTCCTTCGACTCCGGGGCCTTTA
CCAAACTTCCGCTTGAATATTCGGGACGATCACGTGGAAATGTCTCCAGCCATGGATGCA
ACAACGGTAGAGGAAGCCATTTCTATGGATTTGGAGAAAGAATTGCGTTTCAGTAATCAC
GGAGACAAGTTTATTGAGTTTCTTGTTTTTAAGAAGTTGACCGATGCTAGGTTTCAAACA
TTTCAATGGCTCATTCAGACACGGAATCGTTTGAATCTATCATTTGAAACGATTTTCTCC
GCCGCAAGTTGTTTTGATCGGTTCGTCTATGCGACTAGCTGCAATGAATGGAGTAAGTGG
ATGGTGGAGTTAGTTGCAGTAACCTCATTGTCGATCGCATCAAAATTTAACGAAGTGTCT
TCCCCTTCACTTGAAGACTTTCAGACGGAAGGGCTAAATCATATGTTTCACCACAAGACC
GTTCTTGAGATGGAACTCATTGTATTGAAAGCTCTAGAGTGGCGTGTTAACTCGGTCACG
AGTTTCTCTTTTTCGCAAATTCTTGTCACTAAAATCCGGATGGGAGGAGGAGACATATTG
ATGAATCGAATCACAGATCATTTGCTAGATGATTTATGCGATTTGAAGATGCTTGCATAC
ACACCAAGTGTTGTGGCGGCTGCGGCTGTGTTGAATGTGTTAGAAGAGAAAGCAGTTCTA
GAAGAGAACCTTGGAAAAGTTATGAATCTCTTTGGAAAAGAACACAAGGAGAATATTGCA
AAATGTGCTACTGTTATGAAATCTCGAAACGTTCACGAAAAGGGTTGGAGAAGAGAAGTT
GGTGATGTGAAGAGTCTAGGGAGTATGTTGCAGAGAGGAGAGGTTATGAACATGAACATT
GTTTATTACGTGGGAGATCTCTCTGCCATTTTTCAAATTTTACGATCGGACGACAAGAAG
AAGAGAGAGAGAGATAATCACGAAGACGAGCATCGTCCTCCTGCAAAAAGAATGACATTT
GTTACGTCAAATTAATTATCACATTTATGAATAGAAAGTATACCACATTTTTTTGTGTTA
ACTGTAAACTGGCATGTACCATTTATTAATGTTTGACAATAAAAGTGAAATGTTGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G780TF U 1
AF RR2G780JQ C 368
BS 1 743 RR2G780TF
BS 744 1199 RR2G780JQ

RD RR2G780TF 743 0 0
GGACTGTTTTCAGAGTGAAAAGAAAAACTGAATACGAACCGGTTTAACGAACCTGTTCCG
ATGGATAATCTACTGTGCGAGGAGTCATGGCTGTCGGGTCCTTCGACTCCGGGGCCTTTA
CCAAACTTCCGCTTGAATATTCGGGACGATCACGTGGAAATGTCTCCAGCCATGGATGCA
ACAACGGTAGAGGAAGCCATTTCTATGGATTTGGAGAAAGAATTGCGTTTCAGTAATCAC
GGAGACAAGTTTATTGAGTTTCTTGTTTTTAAGAAGTTGACCGATGCTAGGTTTCAAACA
TTTCAATGGCTCATTCAGACACGGAATCGTTTGAATCTATCATTTGAAACGATTTTCTCC
GCCGCAAGTTGTTTTGATCGGTTCGTCTATGCGACTAGCTGCAATGAATGGAGTAAGTGG
ATGGTGGAGTTAGTTGCAGTAACCTCATTGTCGATCGCATCAAAATTTAACGAAGTGTCT
TCCCCTTCACTTGAAGACTTTCAGACGGAAGGGCTAAATCATATGTTTCACCACAAGACC
GTTCTTGAGATGGAACTCATTGTATTGAAAGCTCTAGAGTGGCGTGTTAACTCGGTCACG
AGTTTCTCTTTTTCGCAAATTCTTGTCACTAAAATCCGGATGGGAGGAGGAGACATATTG
ATGAATCGAATCACAGATCATTTGCTAGATGATTTATGCGATTTGAAGATGCTTGCATAC
ACACCAAGTGTTGTGGCGGCTGC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2G780JQ 832 0 0
AAGTG
TTTGATCGGTTCGTCTATGCGACTAGCTGCAATGAATGGAGTAAGTGGATGGTGGAGT*A
GTTGCAGTAACCTCATTGTCGATCGCATCAAAATTTAACGAAGTGTCTTCCC*TTCACTT
GAAGACTTTCAGACGGAAGGGCTAAATCATATGTTTCACCACAAGACCGTTCTTGAGATG
GAACTCATTGTATTGAAAGCTCTAGAGTGGCGTGTTAACTCGGTCACGAGTTTCTCTTTT
TCGCAAATTCTTGTCACTAAAATCCGGATGGGAGGAGGAGACATATTGATGAATCGAATC
ACAGATCATTTGCTAGATGATTTATGCGATTTGAAGATGCTTGCATACACACCAAGTGTT
GTGGCGGCTGCGGCTGTGTTGAATGTGTTAGAAGAGAAAGCAGTTCTAGAAGAGAACCTT
GGAAAAGTTATGAATCTCTTTGGAAAAGAACACAAGGAGAATATTGCAAAATGTGCTACT
GTTATGAAATCTCGAAACGTTCACGAAAAGGGTTGGAGAAGAGAAGTTGGTGATGTGAAG
AGTCTAGGGAGTATGTTGCAGAGAGGAGAGGTTATGAACATGAACATTGTTTATTACGTG
GGAGATCTCTCTGCCATTTTTCAAATTTTACGATCGGACGACAAGAAGAAGAGAGAGAGA
GATAATCACGAAGACGAGCATCGTCCTCCTGCAAAAAGAATGACATTTGTTACGTCAAAT
TAATTATCACATTTATGAATAGAAAGTATACCACATTTTTTTGTGTTAACTGTAAACTGG
CATGTACCATTTATTAATGTTTGACAATAAAAGTGAAATGTTGTTAT

QA 6 832 6 832
DS 



AS 1 2

CO CL5538Contig1 1076 2 2 U
GGGCGTCGGTGGCTCCTCTCCTCAACATTCATCATCCTTTTCCCGATCCAAAAAACAAAA
CGCAAATGACAATGACCAGCAACGGCGATTCGAAAACCAGCAACGGCTCGATCGCGAACA
CACCATTCAGGATCTTCGTCGGATACGATCCGCGCGAAGATCTCGCCTACCAAGTCTGCC
GCCACTCCATCACCAAGAGATCTTCAATCCCCGTCGAGATCACCCCCATAATCCAATCAG
ATCTCCGAGAGAAAGGCCTCTACTGGAGAGAACGCAACAACCTCGAGAGCACCGAGTTCT
CCTTCACCCGCTTCCTCACCCCACACCTCTCCGACTACCAAGGCTGGGCCATGTTCGTCG
ACTGCGACTTCCTCTACCTCTCCGACATCAAGGAGCTCGTCGATCTCATCGACGATAAAT
ACGCGATCATGTGCGTCCAGCACGACTACACTCCCAAGGAGACGACCAAGATGGACGGTG
CGGTTCAAACGGTTTACCCGAGGAAGAACTGGTCATCCATGGTGCTTTACAACTGTGGAC
ATCCTAAGAACAAGACGTTGAGCCCTGAAGCTGTGAATACTCAGACCGGTGCGTTCCTCC
ATAGGTTCCAGTGGCTGGAGGATGAGGAGATTGGGTCTGTTCCTTACGTTTGGAACTTTC
TTGAAGGGCATAACAGGGTGGTTGAGAAGGATCCCGCCACGCAGCCTAAGACCGTGCATT
TTACGCGTGGCAGGCCGTGGTTTGACGCTTGGAAGAATTGTGAATTCGCTGATCTCTGGC
TCGGTGAGATGGAAGAGTACAACAAGGAAGGAGCCCGTGTGACTGCGAATTAGAAAGGAA
GAGAAGGTATGTTACTTTACTTGCCAACACAAATATTATCACTACTCTTGTGAATTGGCT
TTGGATTTGTCATTTTTTTTTCATTGAAGTTCGTTTAATTATTCGCCACACTATTACCAT
TACTAAGAGATCTTATGGTAAAATTACATATTCGTTTTTTTTTGTGTTGGACTTGTACTT
TGTAATATGATATTTTATTTGTAATTTGAATGAAACAACTTATTTTTATTTGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ03TF U 1
AF RR2CJ03JQ C 306
BS 1 667 RR2CJ03TF
BS 668 1076 RR2CJ03JQ

RD RR2CJ03TF 671 0 0
GGGCGTCGGTGGCTCCTCTCCTCAACATTCATCATCCTTTTCCCGATCCAAAAAACAAAA
CGCAAATGACAATGACCAGCAACGGCGATTCGAAAACCAGCAACGGCTCGATCGCGAACA
CACCATTCAGGATCTTCGTCGGATACGATCCGCGCGAAGATCTCGCCTACCAAGTCTGCC
GCCACTCCATCACCAAGAGATCTTCAATCCCCGTCGAGATCACCCCCATAATCCAATCAG
ATCTCCGAGAGAAAGGCCTCTACTGGAGAGAACGCAACAACCTCGAGAGCACCGAGTTCT
CCTTCACCCGCTTCCTCACCCCACACCTCTCCGACTACCAAGGCTGGGCCATGTTCGTCG
ACTGCGACTTCCTCTACCTCTCCGACATCAAGGAGCTCGTCGATCTCATCGACGATAAAT
ACGCGATCATGTGCGTCCAGCACGACTACACTCCCAAGGAGACGACCAAGATGGACGGTG
CGGTTCAAACGGTTTACCCGAGGAAGAACTGGTCATCCATGGTGCTTTACAACTGTGGAC
ATCCTAAGAACAAGACGTTGAGCCCTGAAGCTGTGAATACTCAGACCGGTGCGTTCCTCC
ATAGGTTCCAGTGGCTGGAGGATGAGGAGATTGGGTCTGTTCCTTACGTTTGGAACTTTC
TTGAAGG
CATA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2CJ03JQ 771 0 0
ACCCGCTTCCTCACCCCACACCTCTCCGACTACCAAGGCTGGGCCATGTTCGTCGACTGC
GACTTCCTCTACCTCTCCGACATCAAGGAGCTCGTCGATCTCATCGACGATAAATACGCG
ATCATGTGCGTCCAGCACGACTACACTCCCAAGGAGACGACCAAGATGGACGGTGCGGTT
CAAACGGTTTACCCGAGGAAGAACTGGTCATCCATGGTGCTTTACAACTGTGGACATCCT
AAGAACAAGACGTTGAGCCCTGAAGCTGTGAATACTCAGACCGGTGCGTTCCTCCATAGG
TTCCAGTGGCTGGAGGATGAGGAGATTGGGTCTGTTCCTTACGTTTGGAACTTTCTTGAA
GGGCATAACAGGGTGGTTGAGAAGGATCCCGCCACGCAGCCTAAGACCGTGCATTTTACG
CGTGGCAGGCCGTGGTTTGACGCTTGGAAGAATTGTGAATTCGCTGATCTCTGGCTCGGT
GAGATGGAAGAGTACAACAAGGAAGGAGCCCGTGTGACTGCGAATTAGAAAGGAAGAGAA
GGTATGTTACTTTACTTGCCAACACAAATATTATCACTACTCTTGTGAATTGGCTTTGGA
TTTGTCATTTTTTTTTCATTGAAGTTCGTTTAATTATTCGCCACACTATTACCATTACTA
AGAGATCTTATGGTAAAATTACATATTCGTTTTTTTTTGTGTTGGACTTGTACTTTGTAA
TATGATATTTTATTTGTAATTTGAATGAAACAACTTATTTTTATTTGTGAC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL5539Contig1 606 2 2 U
AGTCTTCTCAAGTGATCATTACATTATTTATATAATCAACTGATATTGAAACAGCTTTTG
TTATATCAGGACTTCTCCAAAACCAATTAAAACATAACTACATCATTATTATTCTCTTCC
CATAAAGTAAGATTTGGCTCCTCAAATGTAAGTCCATAGTTAACATGAGAATAATAATCA
CTACCTTCAAGCCCAAGAACACTACTATCCATACCATCCATGTAAGAAAGTTCCATACAC
CAGTTCGTCATCTCATCATCATTCTGAGACGAAACCAGACCAATATCAAAGTCGTTAAGC
CACCCGAAATCATCTTCAAGACCGGGCTTTGTGATCTCTTGCAGATCCGTTTTTTGAGAT
TCTATGGTCGGAGAACTCATGTTGATCTCCACTTCTAACGATCTAATCACGCGGTTTAGT
TTCTCTTCTTCCTCTTCGCTAACGCTGATATGATTTTCAGCGGGCGATCCTTCTTCCAAG
AACGACATGATCATAAGCTCATCGTTGAAAGTCTCCATGCCCCGATCCAAACCATATTGC
ACAGAAGCCATTTGTGAGAAGAGAGAAAGAGTTAGTAATTAAATATACAACTTTTAGAGA
TTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX21TFB C 1
AF RR2AX21JQ U 40
BS 1 39 RR2AX21TFB
BS 40 606 RR2AX21JQ

RD RR2AX21TFB 196 0 0
AGTCTTCTCAAGTGATCATTACATTATTTATATAATCAACTGATATTGAAACAGCTTTTG
TTATATCAGGACTTCTCCAAAACCACTTAAAACATAACTACATCATTATTATTCTCTTCC
CATAAAGTAAGATTTGGCTCCTCAAATGTAAGTCCATAGTTAACATGAGAATAATAATCA
CTACCTTCAAGCCCAA

QA 1 196 1 196
DS 

RD RR2AX21JQ 567 0 0
CTGATATTGAAACAGCTTTTGTTATATCAGGACTTCTCCAAAACCAATTAAAACATAACT
ACATCATTATTATTCTCTTCCCATAAAGTAAGATTTGGCTCCTCAAATGTAAGTCCATAG
TTAACATGAGAATAATAATCACTACCTTCAAGCCCAAGAACACTACTATCCATACCATCC
ATGTAAGAAAGTTCCATACACCAGTTCGTCATCTCATCATCATTCTGAGACGAAACCAGA
CCAATATCAAAGTCGTTAAGCCACCCGAAATCATCTTCAAGACCGGGCTTTGTGATCTCT
TGCAGATCCGTTTTTTGAGATTCTATGGTCGGAGAACTCATGTTGATCTCCACTTCTAAC
GATCTAATCACGCGGTTTAGTTTCTCTTCTTCCTCTTCGCTAACGCTGATATGATTTTCA
GCGGGCGATCCTTCTTCCAAGAACGACATGATCATAAGCTCATCGTTGAAAGTCTCCATG
CCCCGATCCAAACCATATTGCACAGAAGCCATTTGTGAGAAGAGAGAAAGAGTTAGTAAT
TAAATATACAACTTTTAGAGATTATCC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL5540Contig1 853 2 6 U
GGGCCCAGAGAATTAAGGAGCCAATCACCCCGGCAACTTCCGTCGGTCTCGTCTGAGATA
CCGTTGGTCTCTGCTCTTTGTAAATGTATAGAAAGCGATCCTGAAGAAAAGATCAGGGAT
TCACGGTCTTGCCAGGATCGCAACTAGTAGATCGCATGAATATAGAGCAGGGGACACCAA
TCTGCCTGAGAACGATGAGCTTTTACAGCTGTTGAAAACTTAAGGACGCAAATGGTGGAA
AGGGGATACGTCTGCCAGACAAAACTTTCTCTGCACGATGTAGACGAAGAGAGTAAAGAG
AATGCACTTCTTGCTCATAGCGAGAGAATAGCTTTTGCTCGTGCTCTTCTCAACACTGCA
CCTCGTCATCAGTTCACGATCATGAAAAACCTTCGTGTGTGTATTGATTGTCATAACGCC
TTCAAGATTATGGCGGATATAGTCGGTAGGACAGTGATCATGCGAGATGCAAAGAGATTC
CACCATCTCAAAGATGGAACATGCAGCTGCAATGACTATTGGTGATTTTAACGAATAACC
TTGAGGTTTGTTCTATGGTGTCTGCCTGCGTTGAAATGCTTTTTCGCTCTCTTCTTTTTC
TTTATCAAATTCTTTAAAACACATTTCCGTAATGTTTTGCATCATAAGCAGCAACGTTCT
ATCATTAATGTTGTCATAGATCAATCTCAGTTTATGTTTGTGCTCAGGTTATCTGATCAG
CTATGTCTGGATAATATTATCGATATGTTTCTGGCTTTTCGTGTTGTCACTTGGCCATTT
AAAAATGTAAGAGAGATATATTGTTGGTTATGTTAATTCCTGGAATGATGTTTAGCTGTC
ATATTCAGACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BM95TF U 1
AF RR2BM95JQ C 347
BS 1 707 RR2BM95TF
BS 708 708 RR2BM95JQ
BS 709 733 RR2BM95TF
BS 734 734 RR2BM95JQ
BS 735 757 RR2BM95TF
BS 758 853 RR2BM95JQ

RD RR2BM95TF 757 0 0
GGGCCCAGAGAATTAAGGAGCCAATCACCCCGGCAACTTCCGTCGGTCTCGTCTGAGATA
CCGTTGGTCTCTGCTCTTTGTAAATGTATAGAAAGCGATCCTGAAGAAAAGATCAGGGAT
TCACGGTCTTGCCAGGATCGCAACTAGTAGATCGCATGAATATAGAGCAGGGGACACCAA
TCTGCCTGAGAACGATGAGCTTTTACAGCTGTTGAAAACTTAAGGACGCAAATGGTGGAA
AGGGGATACGTCTGCCAGACAAAACTTTCTCTGCACGATGTAGACGAAGAGAGTAAAGAG
AATGCACTTCTTGCTCATAGCGAGAGAATAGCTTTTGCTCGTGCTCTTCTCAACACTGCA
CCTCGTCATCAGTTCACGATCATGAAAAACCTTCGTGTGTGTATTGATTGTCATAACGCC
TTCAAGATTATGGCGGATATAGTCGGTAGGACAGTGATCATGCGAGATGCAAAGAGATTC
CACCATCTCAAAGATGGAACATGCAGCTGCAATGACTATTGGTGATTTTAACGAATAACC
TTGAGGTTTGTTCTATGGTGTCTGCCTGCGTTGAAATGCTTTTTCGCTCTCTTCTTTTTC
TTTATCAAATTCTTTAAAACACATTTCCGTAATGTTTTGCATCATAAGCAGCAACGTTCT
ATCATTAATGTTGTCATAGATCAATCTCAGTTTATGTTTGTGCTCAG*TTATCTGATCAG
CTATGTCTGGATA*TATTATCGATATGTTTCTGGCTT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2BM95JQ 507 0 0
TTCTCAACACTGCACCTCGTCATCAGTTCACGATCATGAAAAACCTTCGTGTGTGTATTG
ATTGTCATAACGCCTTCAAGATTATGGCGGATATAGTCGGTAGGACAGTGATCATGCGAG
ATGCAAAGAGATTCCCCCATTTCAAAGATGGAACATGCAGCTGCAATGACTATTGGTGAT
TTTAACGAATAACCTTGAGGTTTGTTTTATGGTGTCTGCCTGCGTTGAAATGCTTTTTCG
CTTTTTTTTTTTTTTTTATCAAATTCTTTAAAACACATTTCCGTAATGTTTTGCATCATA
AGCAGCAACGTTTTATCATTAATGTTGTCATAGATCAATTTCAGTTTATGTTTGTGCTCA
GGTTATCTGATCAGCTATGTCTGGATAATATTATCGATATGTTTTTGGCTTTTCGTGTTG
TCACTTGGCCATTTAAAAATGTAAGAGAGATATATTGTTGGTTATGTTAATTCCTGGAAT
GATGTTTAGCTGTCATATTCAGACATG

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 2

CO CL5541Contig1 1084 2 2 U
GGTGAGATGCGGAGGAAAGGACGAGAGCTCTTGCCCATTTGCAAGCTAGGGAAGAATGGT
GTGTATTGTGACCTTGTGAAAATTGTGAAGGAAGCATTTGAAGTTTGTGAATTGGTTCGG
ATCGATTGTCAAGGGATGAAAGGCAGTGATTTTAGGAAAATCGGTGCCAAGCTCAAGGAT
CTTGTTCCGTGTGTGCTCATTTCCTTTGAAAATGAGCAGATTCTTATATGGAGAGGAAGA
GAATGGAAATCATCTCTCACAGTTCCAGATAAAAAGGATGATATCCTCAGAGATATTGAA
GTTGATACTGTCTCTCCGGAAGAGGATAAAGAAGCATCAGAGTCACTTAATCAGACTCAA
ACTGTGAACCAGAACTCTTCTTCTGGTACTATGGAATTTCAAAACGATCCAGATGGTGAT
GATTTAAGCTCTTCAAATGCAGATCTCTCGTCAATGGAAGGCACGAGCTTGTCTACTGAA
GATGTTACTGAGCTAACTGCAGATAACTCTCTTGGTGATCATCAAGAACCTGAACAGGAG
GAGTCAGAAACATCGGAAGAGATTAACAGACAAAGCATAGAGAGAGTTTTAAACATGATG
AAACAAGCTGTAGAGAGCGGGGCTGCGTTGGTGTTAGACGCTGCTGATCTTGACGCAGAC
ACAGTGTTTGCTAAAGCCGCCGCCTTCTCGAGTGTAGCTGCACCGGGACCAGTTTTCCAG
CATGGCTTGAGGAAGCAACCAGCGGTTAAGAAAGAGGAGAAACGAGAATTCGGATACAAA
AACTTGGAGGGAAAGACAAGTAGTGATGTGTTTCCTGGGAGAAAAGAAGTTGCAGTGAGG
GTGGAGAGATATGAGAAGAAGGAGAAGGAAGGAATTGAAAAGAAAATTGATGAGTTTGAT
GAAGATTACAGAGAAGTGATACCTCATGGGACACTGAAAGTAGATGAACTAGCTAAACTA
CTTGCCTAATGTTGTTATCTGTATTTTATTTGTCCTTTGTTGAGTTAGTGTATAATGTAG
TCTAGTTATCATTATCAGAAATATGTGTAACTTTGATAAGAAATGTATTTTAGATATTTA
TAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2A625TF U 1
AF RR2A625JQ C 389
BS 1 748 RR2A625TF
BS 749 1084 RR2A625JQ

RD RR2A625TF 748 0 0
GGTGAGATGCGGAGGAAAGGACGAGAGCTCTTGCCCATTTGCAAGCTAGGGAAGAATGGT
GTGTATTGTGACCTTGTGAAAATTGTGAAGGAAGCATTTGAAGTTTGTGAATTGGTTCGG
ATCGATTGTCAAGGGATGAAAGGCAGTGATTTTAGGAAAATCGGTGCCAAGCTCAAGGAT
CTTGTTCCGTGTGTGCTCATTTCCTTTGAAAATGAGCAGATTCTTATATGGAGAGGAAGA
GAATGGAAATCATCTCTCACAGTTCCAGATAAAAAGGATGATATCCTCAGAGATATTGAA
GTTGATACTGTCTCTCCGGAAGAGGATAAAGAAGCATCAGAGTCACTTAATCAGACTCAA
ACTGTGAACCAGAACTCTTCTTCTGGTACTATGGAATTTCAAAACGATCCAGATGGTGAT
GATTTAAGCTCTTCAAATGCAGATCTCTCGTCAATGGAAGGCACGAGCTTGTCTACTGAA
GATGTTACTGAGCTAACTGCAGATAACTCTCTTGGTGATCATCAAGAACCTGAACAGGAG
GAGTCAGAAACATCGGAAGAGATTAACAGACAAAGCATAGAGAGAGTTTTAAACATGATG
AAACAAGCTGTAGAGAGCGGGGCTGCGTTGGTGTTAGACGCTGCTGATCTTGACGCAGAC
ACAGTGTTTGCTAAAGCCGCCGCCTTCTCGAGTGTAGCTGCACCGGGACCAGTTTTCCAG
CATGGCTTGAGGAAGCAACCAGCGGTTA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2A625JQ 696 0 0
CTATGGAATTTCAAAACGATCCAGATGGTGATGATTTAAGCTCTTCAAATGCAGATCTCT
CGTCAATGGAAGGCACGAGCTTGTCTACTGAAGATGTTACTGAGCTAACTGCAGATAACT
CTCTTGGTGATCATCAAGAACCTGAACAGGAGGAGTCAGAAACATCGGAAGAGATTAACA
GACAAAGCATAGAGAGAGTTTTAAACATGATGAAACAAGCTGTAGAGAGCGGGGCTGCGT
TGGTGTTAGACGCTGCTGATCTTGACGCAGACACAGTGTTTGCTAAAGCCGCCGCCTTCT
CGAGTGTAGCTGCACCGGGACCAGTTTTCCAGCATGGCTTGAGGAAGCAACCAGCGGTTA
AGAAAGAGGAGAAACGAGAATTCGGATACAAAAACTTGGAGGGAAAGACAAGTAGTGATG
TGTTTCCTGGGAGAAAAGAAGTTGCAGTGAGGGTGGAGAGATATGAGAAGAAGGAGAAGG
AAGGAATTGAAAAGAAAATTGATGAGTTTGATGAAGATTACAGAGAAGTGATACCTCATG
GGACACTGAAAGTAGATGAACTAGCTAAACTACTTGCCTAATGTTGTTATCTGTATTTTA
TTTGTCCTTTGTTGAGTTAGTGTATAATGTAGTCTAGTTATCATTATCAGAAATATGTGT
AACTTTGATAAGAAATGTATTTTAGATATTTATAAG

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL5542Contig1 407 2 1 U
TTTTTGCATCGCCGCTAAGCTTTCTCACCTCCGTCTCTCACCGAGCCGTCGTCTTCAGAA
TGGATTCTCAGATTAAGCACGCAGTGGTGGTCAAAGTGATGGGACGTACTGGATCCAGGG
GTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTGAAGTTCACTGACTCTGATCGTTACATTATGAGAAACG
TCAAGGGACCCGTGAGAGAAGGTGACATCCTCACTTTGCTCGAGTCTGAGAGAGAAGCTA
GGAGACTTCGTTGATTTGTCTTGTTGCTTTCTCCACTACAGAACTATGTCTGCTTATCTT
GCTCTTTTTTTTTTTGTTTTCTGTGACTGGATTAGTGATTATGCATTCGAACTGAATTTT
GTTTTTGCTGTAAGACATTTCATGGATTGATTTTTGTTCTGGTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GA05TF U 1
AF RR2GA05JQ C 49
BS 1 407 RR2GA05TF

RD RR2GA05TF 407 0 0
TTTTTGCATCGCCGCTAAGCTTTCTCACCTCCGTCTCTCACCGAGCCGTCGTCTTCAGAA
TGGATTCTCAGATTAAGCACGCAGTGGTGGTCAAAGTGATGGGACGTACTGGATCCAGGG
GTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTGAAGTTCACTGACTCTGATCGTTACATTATGAGAAACG
TCAAGGGACCCGTGAGAGAAGGTGACATCCTCACTTTGCTCGAGTCTGAGAGAGAAGCTA
GGAGACTTCGTTGATTTGTCTTGTTGCTTTCTCCACTACAGAACTATGTCTGCTTATCTT
GCTCTTTTTTTTTTTGTTTTCTGTGACTGGATTAGTGATTATGCATTCGAACTGAATTTT
GTTTTTGCTGTAAGACATTTCATGGATTGATTTTTGTTCTGGTCTCT

QA 1 407 1 407
DS 

RD RR2GA05JQ 359 0 0
TCGTCTTCAGAATGGATTCTCAGATTAAGCACGCAGTGGTGGTCAAAGTGATGGGACGTA
CTGGATCCAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTGAAGTTCACTGACTCTGATCGTTACA
TTATGAGAAACGTCAAGGGACCCGTGAGAGAAGGTGACATCCTCACTTTGCTCGAGTCTG
AGAGAGAAGCTAGGAGACTTCGTTGATTTGTCTTGTTGCTTTCTCCACTACAGAACTATG
TCTGCTTATCTTGCTCTTTTTTTTTTTGTTTTCTGTGACTGGATTAGTGATTATGCATTC
GAACTGAATTTTGTTTTTGCTGTAAGACATTTCATGGATTGATTTTTGTTCTGGTCTCT

QA 1 359 1 359
DS 



AS 1 2

CO CL5543Contig1 840 2 6 U
GATGCTAAGTACCGCCTCGAGCACATTGTCCGGACTCACAGGCTGCCGACGACCGCAGCT
TCAGGAGTGTGTACCAGGAAGAAGATGAACAAGGATTCAAGGGATTAAAGATAAGCAGAG
ACCTAATGGAAGTTGGAGGTGAAGCTCTCAAGACCAACATCACTACCTTAGGCCCTCTCG
TCCTACCTTTCTCCGAGCAGCTTCTCTTCTTTGCCGCTTTGCTCCGTAGAACTTTCTTAC
CCGCCGCCAAAACTACCCACCACCTCCTCCTCCTCCACCGCAGCTGCGAAAACCAACGGA
GCCAAGTCGTCTTCGTCCTCTGATCTATCCAAGCCGTACATCCCGGACTACAAGCTCGCC
TTCGAGCATTTCTGCTTCCACGCGGCAAGCAAAACAGCGCTTGAGGAGCTTCAGAAGAAC
CTAGGCTTGAGTGATGAGAACATGGAGGCTTCTAAGATGACTTTACACAGGTTTGGAAAC
ACTTCTAGCAGTGGGATCTGGTACGAGCTTGCTTACATGGAGGCCAAGGAGAGTGTCCGT
AGAGGCGATAGGGTTTGGCAGATTGCTTTTGGGTCAGGTTTTAAGTGTAGCAGTGTGGTT
TGGAAGGCAATGAGGAAGGTGAAGAAGCCAGCGAGGAACAATCCTTGGGTGGATTGCATT
GACCGTTACCCTGCCGCTCTCTGATCATTTATTTTTATAAATTATTATTTCTTCTAAAAT
TAAATCATCTAGTTATTCCAACCAAAGGAGAGACAATTTGGTTGGGCTCTCTTCCTTGTT
GTTTGCTGGCCATTCGTATCTAAGACTTCTATAAGGATGTTTCAAGTCCAATTCAGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB55TF U 1
AF RR2CB55JQ C 60
BS 1 257 RR2CB55TF
BS 258 258 RR2CB55JQ
BS 259 718 RR2CB55TF
BS 719 719 RR2CB55JQ
BS 720 738 RR2CB55TF
BS 739 840 RR2CB55JQ

RD RR2CB55TF 738 0 0
GATGCTAAGTACCGCCTCGAGCACATTGTCCGGACTCACAGGCTGCCGACGACCGCAGCT
TCAGGAGTGTGTACCAGGAAGAAGATGAACAAGGATTCAAGGGATTAAAGATAAGCAGAG
ACCTAATGGAAGTTGGAGGTGAAGCTCTCAAGACCAACATCACTACCTTAGGCCCTCTCG
TCCTACCTTTCTCCGAGCAGCTTCTCTTCTTTGCCGCTTTGCTCCGTAGAACTTTCTTAC
CCGCCGCCAAAACTACC*ACCACCTCCTCCTCCTCCACCGCAGCTGCGAAAACCAACGGA
GCCAAGTCGTCTTCGTCCTCTGATCTATCCAAGCCGTACATCCCGGACTACAAGCTCGCC
TTCGAGCATTTCTGCTTCCACGCGGCAAGCAAAACAGCGCTTGAGGAGCTTCAGAAGAAC
CTAGGCTTGAGTGATGAGAACATGGAGGCTTCTAAGATGACTTTACACAGGTTTGGAAAC
ACTTCTAGCAGTGGGATCTGGTACGAGCTTGCTTACATGGAGGCCAAGGAGAGTGTCCGT
AGAGGCGATAGGGTTTGGCAGATTGCTTTTGGGTCAGGTTTTAAGTGTAGCAGTGTGGTT
TGGAAGGCAATGAGGAAGGTGAAGAAGCCAGCGAGGAACAATCCTTGGGTGGATTGCATT
GACCGTTACCCTGCCGCTCTCTGATCATTTATTTTTATAAATTATTATTTCTTCTAAA*T
TAAATCATCTAGTTATTC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2CB55JQ 781 0 0
TTCAGGAGTGTGTACCAGGAAGAAGATGAACAAGGATTCAAGGGATTAAAGATAAGCAGA
GACCTAATGGAAGTTGGAGGTGAAGCTCTCAAGACCAACATCACTACCTTAGGCCCTCTC
GTCCTACCTTTCTCCGAGCAGCTTCTCTTCTTTGCCGCTTTGCTCCGTAGAACTTTCTTA
CCCGCCGCCAAAACTACCCACCACCTCCTCCTCCTCCACCGCAGCTGCGAAAACCAACGG
AGCCAAGTCGTCTTCGTCCTCTGATCTATCCAAGCCGTACATCCCGGACTACAAGCTCGC
CTTCGAGCATTTCTGCTTCCACGCGGCAAGCAAAACAGCGCTTGAGGAGCTTCAGAAGAA
CCTAGGCTTGAGTGATGAGAACATGGAGGCTTTTAAGATGACTTTACACAGGTTTGGAAA
CACTTCTAGCAGTGGGATCTGGTACGAGCTTGCTTACATGGAGGCCAAGGAGAGTGTCCG
TAGAGGCGATAGGGTTTGGCAGATTGCTTTTGGGTCAGGTTTTAAGTGTAGCAGTGTGGT
TTGGAAGGCAATGAGGAAGGTGAAGAAGCCAGCGAGGAACAATCCTTGGGTGGATTGCAT
TGACCGTTACCCTGCCGCTCTCTGATCATTTATTTTTATAAATTATTATTTCTTCTAAAA
TTAAATCATCTAGTTATTCCAACCAAAGGAGAGACAATTTGGTTGGGCTCTCTTCCTTGT
TGTTTGCTGGCCATTCGTATCTAAGACTTCTATAAGGATGTTTCAAGTCCAATTCAGGTT
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL5544Contig1 360 2 1 U
GAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAGAGAGGCTCCAGACATTGCCAAGAACCGCTGGTCC
TCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACTTCATCGTCAAGTCACGCCCTGAATA
AACTGCTTCCCTTCTCTCCCACCATTCCTTATGGATTTCATTTCCATATTATTTGCTCTT
TTGTTGGCCTTTGAGGATCGGCTAATTTCTCTACCTGGTTGTAGTAATAATTTGTGGGGA
TGATTGGATGGATGCACATTGTTCAGTCCAAAGCTTTCTCGAGATGCAATTTACTTTTTT
GTAACGTTTAATGATTTTAACGATAAAATAAAAATCAAGCCAATAAGACTTGGCAGCTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GT45JQB C 1
AF RR2GT45TF U 1
BS 1 360 RR2GT45TF

RD RR2GT45JQB 360 0 0
GAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAGAGAGGCTCCAGACATTGCCAAGAACCGCTGGTCC
TCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACTTCATCGTCAAGTCACGCCCTGAATA
AACTGCTTCCCTTCTCTCCCACCATTCCTTATGGATTTCATTTCCATATTATTTGCTCTT
TTGTTGGCCTTTGAGGATCGGCTAATTTCTCTACCTGGTTGTAGTAATAATTTGTGGGGA
TGATTGGATGGATGCACATTGTTCAGTCCAAAGCTTTCTCGAGATGCAATTTACTTTTTT
GTAACGTTTAATGATTTTAACGATAAAATAAAAATCAAGCCAATAAGACTTGGCAGCTAC

QA 1 360 1 360
DS 

RD RR2GT45TF 360 0 0
GAAGGCATGGGGTGTTGCGACTGAAGAGAGGCTCCAGACATTGCCAAGAACCGCTGGTCC
TCCCGTCGTCATGAACCCTATCAGTCGCCAGAACTTCATCGTCAAGTCACGCCCTGAATA
AACTGCTTCCCTTCTCTCCCACCATTCCTTATGGATTTCATTTCCATATTATTTGCTCTT
TTGTTGGCCTTTGAGGATCGGCTAATTTCTCTACCTGGTTGTAGTAATAATTTGTGGGGA
TGATTGGATGGATGCACATTGTTCAGTCCAAAGCTTTCTCGAGATGCAATTTACTTTTTT
GTAACGTTTAATGATTTTAACGATAAAATAAAAATCAAGCCAATAAGACTTGGCAGCTAC

QA 1 360 1 360
DS 



AS 1 2

CO CL5545Contig1 1003 2 2 U
TTTTTTCAGAGAGAGAGAGAGAGACTGAGATATCTCTTTGTGGATTTCATCATCGCGAAC
AGCCGATCGTCATGTCGAAGAAAAGGGGGCTTTCGTTGGAGGAGGAGCGCGAGAAGATGT
TTCAGATCTTTTACGACTCTCAAGACTTCTTCCTTCTAAAGGAACTTGAGAAGATGGGGC
CTAAGAAGGGTGTGATTAGCCAGTCTGTTAAAGATGTTATCCAGAGTCTTGTTGATGATG
ATCTTGTTGCCAAGGACAAGATTGGCATCTCTGTCTACTTTTGGAGCCTTCCCAGCTGTG
CCGGCAATCAGCTTAGGAGTGTTCGCCAGAAACTTGAATCTGATCTTCAGGGTAGCAATA
AAAGGCTTGCTGAACTTGTTGATCAGTGTGATGCTCTAAAGAAGGGAAGGGAAGAATCCG
AGGAACGAACAGAGGCTTTGGCGCAACTTAAAGAAATCGAAAAGAAACACAAAGAGCTCA
AGAACGAGATGGTACAATTTGCTGATAACGATCCAGCTACCTTGGAGGTAATGCGGGCTG
CAATTGAAGTTGCTCACCAATCGGCTAACAGATGGACAGATAACATCTTCACGTTGCGAC
AATGGTGTTCAAACAACTTCCCCCAAGCCAAGGAACAGCTGGAACATCTATACACGGAGG
CAGGAATCACCGAGGACTTTGACTACCTAGAGCTATCTTCATTCCCTTTGAGCTCATCCC
ATGATCCCGAAACTCCAAAGCAGCTGCTAGTAGAAGATCAAGCTTAGTTCTAGTACTCTC
CACCGTAACAAGTTGACGACACTCTAGTGTCTTTTATGCTTTCTTGTCCTAAAGGGTTGC
AACTGTCTTTTGTATATGACCCAGTTAAAATCTCATTTCACCAAAGTTTCGTGGTTAAAT
AAGATACTTTACTGCCTCTGATGCTTGTGTTCTATTTGTCGGCTATGTACAATGTTGGCT
TTGTCCTACCATTTTATTGGAGTTAATATAATATATCATGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC85TF U 1
AF RR2FC85JQ C 380
BS 1 735 RR2FC85TF
BS 736 1003 RR2FC85JQ

RD RR2FC85TF 735 0 0
TTTTTTCAGAGAGAGAGAGAGAGACTGAGATATCTCTTTGTGGATTTCATCATCGCGAAC
AGCCGATCGTCATGTCGAAGAAAAGGGGGCTTTCGTTGGAGGAGGAGCGCGAGAAGATGT
TTCAGATCTTTTACGACTCTCAAGACTTCTTCCTTCTAAAGGAACTTGAGAAGATGGGGC
CTAAGAAGGGTGTGATTAGCCAGTCTGTTAAAGATGTTATCCAGAGTCTTGTTGATGATG
ATCTTGTTGCCAAGGACAAGATTGGCATCTCTGTCTACTTTTGGAGCCTTCCCAGCTGTG
CCGGCAATCAGCTTAGGAGTGTTCGCCAGAAACTTGAATCTGATCTTCAGGGTAGCAATA
AAAGGCTTGCTGAACTTGTTGATCAGTGTGATGCTCTAAAGAAGGGAAGGGAAGAATCCG
AGGAACGAACAGAGGCTTTGGCGCAACTTAAAGAAATCGAAAAGAAACACAAAGAGCTCA
AGAACGAGATGGTACAATTTGCTGATAACGATCCAGCTACCTTGGAGGTAATGCGGGCTG
CAATTGAAGTTGCTCACCAATCGGCTAACAGATGGACAGATAACATCTTCACGTTGCGAC
AATGGTGTTCAAACAACTTCCCCCAAGCCAAGGAACAGCTGGAACATCTATACACGGAGG
CAGGAATCACCGAGGACTTTGACTACCTAGAGCTATCTTCATTCCCTTTGAGCTCATCCC
ATGATCCCGAAACTC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2FC85JQ 624 0 0
TGATCAGTGTGATGCTCTAAAGAAGGGAAGGGAAGAATCCGAGGAACGAACAGAGGCTTT
GGCGCAACTTAAAGAAATCGAAAAGAAACACAAAGAGCTCAAGAACGAGATGGTACAATT
TGCTGATAACGATCCAGCTACCTTGGAGGTAATGCGGGCTGCAATTGAAGTTGCTCACCA
ATCGGCTAACAGATGGACAGATAACATCTTCACGTTGCGACAATGGTGTTCAAACAACTT
CCCCCAAGCCAAGGAACAGCTGGAACATCTATACACGGAGGCAGGAATCACCGAGGACTT
TGACTACCTAGAGCTATCTTCATTCCCTTTGAGCTCATCCCATGATCCCGAAACTCCAAA
GCAGCTGCTAGTAGAAGATCAAGCTTAGTTCTAGTACTCTCCACCGTAACAAGTTGACGA
CACTCTAGTGTCTTTTATGCTTTCTTGTCCTAAAGGGTTGCAACTGTCTTTTGTATATGA
CCCAGTTAAAATCTCATTTCACCAAAGTTTCGTGGTTAAATAAGATACTTTACTGCCTCT
GATGCTTGTGTTCTATTTGTCGGCTATGTACAATGTTGGCTTTGTCCTACCATTTTATTG
GAGTTAATATAATATATCATGGTC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL5546Contig1 783 2 2 U
GGACCCATTTCTTGGCTCACAACAGCAACTAATAAACGTTTTTACTTTTACGCAACCGCA
ATGGCCGCCTCAACAATGGCTCTCTCATCCCCTGCTTTCGCCGGAAAGGCCGTCAAGATT
TCTCCGGCGGCATCAGAAGTCCTCGGAAGCGGCCGTGTGGCAATGAGGAAGACCGTAGCC
AAGCCAAAGGGCCCATCAGGCAGCCCATGGTACGGGTCCGAAAGAGTCAAGTACTTGGGT
CCATTCTCTGGCGAGCCACCAAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCAGGTGACTACGGATGG
GACACCGCTGGTCTTTCCGCCGATCCTGAGACATTTGCAAGGAACCGTGAGCTAGAAGTT
ATCCACTGCAGGTGGGCTATGCTTGGAGCCCTAGGCTGCGTCTTCCCGGAGTTGTTGGCC
AGGAACGGAGTCAAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAGC
GAAGGAGGACTTGATTACTTGGGAAACCCAAGCTTGGTTCACGCTCAGAGCATTTTGGCG
ATTTGGGCTACTCAAGTGATCTTGATGGGAGCCGTTGAAGGTTACAGAGTTGCAGGAGAT
GGGCCGCTGGGAGAGGCTGAGGACTTGCTTTACCCAGGAGGTAGTTTTGACCCATTGGGC
CTAGCTACAGACCCAGAGGCCTTTGCTGAGTTGAAGGTGAAGGAGATCAAGAACGGAAGA
TTGGCTATGTTTTCTATGTTTGGATTCTTCGTTCAAGCCATTGTCACTGGTAAGGGACCG
TTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2B488TF U 1
AF RR2B488JQ C 403
BS 1 770 RR2B488TF
BS 771 783 RR2B488JQ

RD RR2B488TF 770 0 0
GGACCCATTTCTTGGCTCACAACAGCAACTAATAAACGTTTTTACTTTTACGCAACCGCA
ATGGCCGCCTCAACAATGGCTCTCTCATCCCCTGCTTTCGCCGGAAAGGCCGTCAAGATT
TCTCCGGCGGCATCAGAAGTCCTCGGAAGCGGCCGTGTGGCAATGAGGAAGACCGTAGCC
AAGCCAAAGGGCCCATCAGGCAGCCCATGGTACGGGTCCGAAAGAGTCAAGTACTTGGGT
CCATTCTCTGGCGAGCCACCAAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCAGGTGACTACGGATGG
GACACCGCTGGTCTTTCCGCCGATCCTGAGACATTTGCAAGGAACCGTGAGCTAGAAGTT
ATCCACTGCAGGTGGGCTATGCTTGGAGCCCTAGGCTGCGTCTTCCCGGAGTTGTTGGCC
AGGAACGGAGTCAAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAGC
GAAGGAGGACTTGATTACTTGGGAAACCCAAGCTTGGTTCACGCTCAGAGCATTTTGGCG
ATTTGGGCTACTCAAGTGATCTTGATGGGAGCCGTTGAAGGTTACAGAGTTGCAGGAGAT
GGGCCGCTGGGAGAGGCTGAGGACTTGCTTTACCCAGGAGGTAGTTTTGACCCATTGGGC
CTAGCTACAGACCCAGAGGCCTTTGCTGAGTTGAAGGTGAAGGAGATCAAGAACGGAAGA
TTGGCTATGTTTTCTATGTTTGGATTCTTCGTTCAAGCCATTGTCACTGG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2B488JQ 381 0 0
TTCCCGGAGTTGTTGGCCAGGAACGGAGTCAAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGTTCAAGGCC
GGTTCACAGATCTTCAGCGAAGGAGGACTTGATTACTTGGGAAACCCAAGCTTGGTTCAC
GCTCAGAGCATTTTGGCGATTTGGGTTACTCAAGTGATCTTGATGGGAGCCGTTGAAGGT
TACAGAGTTGCAGGAGATGGGCCGCTGGGAGAGGCTGAGGACTTGCTTTACCCAGGAGGT
AGTTTTGACCCATTGGGCCTAGCTACAGACCCAGAGGCCTTTGCTGAGTTGAAGGTGAAG
GAGATCAAGAACGGAAGATTGGCTATGTTTTTTATGTTTGGATTTTTCGTTCAAGCCATT
GTCACTGGTAAGGGACCGTTG

QA 1 381 1 381
DS 



AS 1 2

CO CL5547Contig1 488 2 4 U
GATAAAGGTCATTAATGCTAGAAATATTGTTTTGATCTCATGAAAAGATAAAAGAGTCTC
GACTCAATATTCTCCATCGCGAATAAAGACACATACGATTTGTTCTGATGCGACAAGTCC
CCAAACTCTAGCAAACTAGCAAGTACCAACCAAAACTCCTACTGACAAATAGAAAATGAA
AAGAGTACAGGAAACAACATAGTGGTCATGGAATCCACTCATGGAAGCTTATTGTTACCA
GTGACCTCTTCCTTGTCCTCTCCCGCGACCACCTCCGCGTCTTCGGTTTCCTCCTCTACC
ACCACCGTGAGAAGATATTCCCTGAAAACCCTTGTTCACAAGCTGGTTTGACATACCACT
CGAACCTCGTCCCCTCTTTGCAGAGACATTGTTACCACTCCCAGTGTTGCTATTAGCAGG
TCGTTTTCCTCCGATTGTTGTTGTTGCAGAGGGTAACGGCTTTGTGGCTTCTTTCCAAGA
AAGGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW44TFB C 1
AF RR2AW44JQ U 56
BS 1 55 RR2AW44TFB
BS 56 328 RR2AW44JQ
BS 329 329 RR2AW44TFB
BS 330 488 RR2AW44JQ

RD RR2AW44TFB 418 0 0
GATAAAGGTCATTAATGCTAGAAATATTGTTTTGATCTCATGAAAAGATAAAAGAGTCTC
GACTCAATATTCTCCATCGCGAATAAAGACACATACGATTTGTTCTGATGCGACAAGTCC
CCAAACTCTAGCAAACTAGCAAGTACCAACCAAAACTCCTACTGACAAATAGAAAATGAA
AAGAGTACAGGAAACAACATAGTGGTCATGGAATCCACTCATGGAAGCTTATTGTTACCA
GTGACCTCTTCCTTGTCCTCTCCCGCGACCACCTCCGCGTCTTCGGTTTCCTCCTCTACC
ACCACCGTGAGAAGATATTCCCTGAAAACCCTTGTTCACAAGCTGGTTTGACATACCACT
CGAACCTCGTCCCCTCTTTGCAGAGACATTGTTACCACTCCCAGTGTTGCTATTAGCA

QA 1 418 1 418
DS 

RD RR2AW44JQ 433 0 0
GTCTCGACTCAATATTCTCCATCGCGAATAAAGACACATACGATTTGTTCTGATGCGACA
AGTCCCCAAACTCTAGCAAACTAGCAAGTACCAACCAAAACTCCTACTGACAAATAGAAA
ATGAAAAGAGTACAGGAAACAACATAGTGGTCATGGAATCCACTCATGGAAGCTTATTGT
TACCAGTGACCTCTTCCTTGTCCTCTCCCGCGACCACCTCCGCGTCTTCGGTTTCCTCCT
CTACCACCACCGTGAGAAGATATTCCCTGAAAAGCCTTGTTCACAAGCTGGTTTGACATA
CCACTCGAACCTCGTCCCCTCTTTGCAGAGACATTGTTACCACTCCCAGTGTTGCTATTA
GCAGGTCGTTTTCCTCCGATTGTTGTTGTTGCAGAGGGTAACGGCTTTGTGGCTTCTTTC
CAAGAAAGGTTGC

QA 1 433 1 433
DS 



AS 1 2

CO CL5548Contig1 363 2 1 U
GCTCAAAGATGAAAGCATGACGTTACCTGATAAAGCAGAAGAGTGGTCGTCTCCATCTCA
GTGGATGTCCTCAGAGGTTGCCCACGCGGTGGAGGCTTTCGAATTTAACCCTTTTCGCAC
ATCAAGCGACCTATCATGACCATATATACATCCTTCCCTATTCTTGTCATCACACATATG
TAGCTTCTTTAATTATATGTTTCCACCTAAAATCCGATAGTATACTAGCTACTGTTACGT
TTCCACATTATACATTTCTATCTACTTTTTTTTTTTTCGCTAAAATACATTTCTATCTAC
TTGAAGCTTTTGTTTAGTTAATTTTTAACCAGCTTCAATAACACGTGAATGAATGTTTGG
ACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2FB41JQ C 1
AF RR2FB41TF U 1
BS 1 363 RR2FB41TF

RD RR2FB41JQ 363 0 0
GCTCAAAGATGAAAGCATGACGTTACCTGATAAAGCAGAAGAGTGGTCGTCTCCATCTCA
GTGGATGTCCTCAGAGGTTGCCCACGCGGTGGAGGCTTTCGAATTTAACCCTTTTCGCAC
ATCAAGCGACCTATCATGACCATATATACATCCTTCCCTATTCTTGTCATCACACATATG
TAGCTTCTTTAATTATATGTTTCCACCTAAAATCCGATAGTATACTAGCTACTGTTACGT
TTCCACATTATACATTTCTATTTACTTTTTTTTTTTTCGCTAAAATACATTTCTATCTAC
TTGAAGCTTTTGTTTAGTTAATTTTTAACCAGCTTCAATAACACGTGAATGAATGTTTGG
ACT

QA 1 363 1 363
DS 

RD RR2FB41TF 363 0 0
GCTCAAAGATGAAAGCATGACGTTACCTGATAAAGCAGAAGAGTGGTCGTCTCCATCTCA
GTGGATGTCCTCAGAGGTTGCCCACGCGGTGGAGGCTTTCGAATTTAACCCTTTTCGCAC
ATCAAGCGACCTATCATGACCATATATACATCCTTCCCTATTCTTGTCATCACACATATG
TAGCTTCTTTAATTATATGTTTCCACCTAAAATCCGATAGTATACTAGCTACTGTTACGT
TTCCACATTATACATTTCTATCTACTTTTTTTTTTTTCGCTAAAATACATTTCTATCTAC
TTGAAGCTTTTGTTTAGTTAATTTTTAACCAGCTTCAATAACACGTGAATGAATGTTTGG
ACT

QA 1 363 1 363
DS 



AS 1 2

CO CL5549Contig1 1056 2 2 U
GATACACACACACACACACATTCACACACCATCTTCAACCTCTCTCTTAATCTCAAAAAT
GGACTTTTTCCAGAAAGCCAAAGCCGTCCGTTTACGTAGCCACCACGACAAGTTCCTAAT
CGCCGACGAAGACGAAGAGTCCGTCACCCAAGAACGCAACGGCTCAGCAGGCGCAGCCAA
GTGGACCATCGAGCCGGTCCCGGGCTCATCCAACCTCATCCGCCTGAAAAGCGCTTACGG
CAAATACTTGACGGGGTCGAACAAACCGTTCCTCCTCGGAGCCACCGGAAGAAAAGTCCT
CCAGACCAATCCTAGCCGCCTCGACTCGTCTCTCGCTTGGGAGCCGATCAGAGACGGCGC
TCTTGTCAAGCTCAAGACACGTTACGGCCACTTCCTTCGCGGTAATGGTGGTTTGCCTCC
GTGGAGAAACTCCGTCACTCACGATATTCCTCACAGATCGGCCACTCAGGATTGGGTTCT
TTGGCACGTCGATGTCGTCGAGATTCTCTCCGATCAACACAAGCAGCAGCAGCCTCCGTC
TCCTCTTCATCATTCTGATTCCTAGATTTCGAACCTGGATCTCCTTCTAGATCTAACCGG
TTTTTCAGACAAGAGTCAACGGATTCAGTAGCGGTGGGATCGCCGCCGAAGTCGGAAGGG
ATAGTGATTTATTACCACGTGGCGGACGATGAGGGTGAAGAGGAAGATGATTCCGTTGAG
GCGAAGTCGTTTACTTTCAAAGGCAATGGCGTTGAGGAGCTGACTAAGAGGTTGAAAGAA
GAGAGCAATGTGGAAGATGTTATCGTTTGTACTCGTAGTCCTTTGAACGGCAAGCTTTTC
CCTTTGCGTCTTCAGCTCCCGCCCAATAATGCCGACATGACTGTTGTTTTAGTACCAACC
TCGTCCAAAACAGAAGGGTTCATCAAGTGAGAGATGTTTATGTTTGAAGCTTGAGCCGTG
AAAGTGAAGGCTATAGCTGGAAAATGATTTGTTGTTAATTCAGTGGATTTGCCTTAGAGA
TATGCTGTTTGATTATTAAACATTATGAATTATACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB70TF U 1
AF RR2FB70JQ C 290
BS 1 650 RR2FB70TF
BS 651 1056 RR2FB70JQ

RD RR2FB70TF 650 0 0
GATACACACACACACACACATTCACACACCATCTTCAACCTCTCTCTTAATCTCAAAAAT
GGACTTTTTCCAGAAAGCCAAAGCCGTCCGTTTACGTAGCCACCACGACAAGTTCCTAAT
CGCCGACGAAGACGAAGAGTCCGTCACCCAAGAACGCAACGGCTCAGCAGGCGCAGCCAA
GTGGACCATCGAGCCGGTCCCGGGCTCATCCAACCTCATCCGCCTGAAAAGCGCTTACGG
CAAATACTTGACGGGGTCGAACAAACCGTTCCTCCTCGGAGCCACCGGAAGAAAAGTCCT
CCAGACCAATCCTAGCCGCCTCGACTCGTCTCTCGCTTGGGAGCCGATCAGAGACGGCGC
TCTTGTCAAGCTCAAGACACGTTACGGCCACTTCCTTCGCGGTAATGGTGGTTTGCCTCC
GTGGAGAAACTCCGTCACTCACGATATTCCTCACAGATCGGCCACTCAGGATTGGGTTCT
TTGGCACGTCGATGTCGTCGAGATTCTCTCCGATCAACACAAGCAGCAGCAGCCTCCGTC
TCCTCTTCATCATTCTGATTCCTAGATTTCGAACCTGGATCTCCTTCTAGATCTAACCGG
TTTTTCAGACAAGAGTCAACGGATTCAGTAGCGGTGGGATCGCCGCCGAA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2FB70JQ 767 0 0
AGAAAAGTCCTCCAGACCAATCCTAGCCGCCTCGACTCGTCTCTCGCTTGGGAGCCGATC
AGAGACGGCGCTCTTGTCAAGCTCAAGACACGTTACGGCCACTTCCTTCGCGGTAATGGT
GGTTTGCCTCCGTGGAGAAACTCCGTCACTCACGATATTCCTCACAGATCGGCCACTCAG
GATTGGGTTCTTTGGCACGTCGATGTCGTCGAGATTCTCTCCGATCAACACAAGCAGCAG
CAGCCTCCGTCTCCTCTTCATCATTCTGATTCCTAGATTTCGAACCTGGATCTCCTTCTA
GATCTAACCGGTTTTTCAGACAAGAGTCAACGGATTCAGTAGCGGTGGGATCGCCGCCGA
AGTCGGAAGGGATAGTGATTTATTACCACGTGGCGGACGATGAGGGTGAAGAGGAAGATG
ATTCCGTTGAGGCGAAGTCGTTTACTTTCAAAGGCAATGGCGTTGAGGAGCTGACTAAGA
GGTTGAAAGAAGAGAGCAATGTGGAAGATGTTATCGTTTGTACTCGTAGTCCTTTGAACG
GCAAGCTTTTCCCTTTGCGTCTTCAGCTCCCGCCCAATAATGCCGACATGACTGTTGTTT
TAGTACCAACCTCGTCCAAAACAGAAGGGTTCATCAAGTGAGAGATGTTTATGTTTGAAG
CTTGAGCCGTGAAAGTGAAGGCTATAGCTGGAAAATGATTTGTTGTTAATTCAGTGGATT
TGCCTTAGAGATATGCTGTTTGATTATTAAACATTATGAATTATACG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL5550Contig1 1045 2 4 U
GGAATGTAGCTTACCCAAATACAAGAAGATAAACCAATGTCTTCCATGTGAATCCTTCCT
TCCTCGATTCTCATCTTCTGGCTTCTTTGGTGTTAAGAAAAGGAATCTTCCAAAAACGAT
GTCGCTTTTGTCGAAGCTACGGTGTATCACAGTAGATGTAACTGGCACGCTCATAGCTTA
CAAAGGGGAGCTTGGTGATTACTATTGTATGGCTGCTAAAGCCGTTGGCTTGCCTTGTCC
TGATTACACACGAGTCCATGAAGGTTTCAAAATTGCTTACACAGACATGGCTCAGAAGTA
TCCTTGTTTCGGTTTCTCCAAAATGTCAAACATTGTTTGGTGGAAAACCTGCGTGAGAGA
TTCATTTGTCAAGGCAGGGTATGACTATGACGAGGAGACGTTTGAGAAAGTGTTTAGAAG
AATCTATTCGACGTTTGGTTCTGCTGCACCTTACTCTATCTTTCAAGACTCTCGACCTTT
CTTGAGATGGGCACGCGAGAAAGGGCTCATCGTTGGACTCGTTAGCAACGCCGAGTATCG
TTATCAAGAAGTTATTTTACCTGCCTTAGGTTTGAACAAGGTAAGTGAACAAAGTCTCTT
AAAAAAGAGAGAGGTCTTATTCAGAAGTTGACTTAAGTTTTTTTTTCAGGGAGAGTGGGA
CTTCGGTGTGTTCTCTGGTATGGAAGGGATAGAGAAGCCGGATCCGAGGATATACAAGCT
GGCGTTAGAGAGAGCGGGGAACAACATTGCGCCTGGAGAGGTTCTGCATATTGGAGATAG
TATGCGTAAAGATTATGTTCCGGCAAAGAGTATTGGGATGCATTCCTTGTTGCTTGATAG
GTTTAAGACAGAAGCTGCTAAAGACTGGAGAGAAGCTGGAGCTGTTGTGCTTCCTGATTT
AGTTGCTGTTCAACAGCTTTTGGAGTCTGACAAGTTGAAATGTTAATGAAGAGACCTCTC
TCTAATGTATTGTAGTATTGCACATTTTGGCTCTTTCTTCTTATGAGTAAAAAGAGTTTC
AAAGGCCTATGATTTAATCTAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C472TF U 1
AF RR2C472JQ C 316
BS 1 605 RR2C472TF
BS 606 606 RR2C472JQ
BS 607 644 RR2C472TF
BS 645 1045 RR2C472JQ

RD RR2C472TF 644 0 0
GGAATGTAGCTTACCCAAATACAAGAAGATAAACCAATGTCTTCCATGTGAATCCTTCCT
TCCTCGATTCTCATCTTCTGGCTTCTTTGGTGTTAAGAAAAGGAATCTTCCAAAAACGAT
GTCGCTTTTGTCGAAGCTACGGTGTATCACAGTAGATGTAACTGGCACGCTCATAGCTTA
CAAAGGGGAGCTTGGTGATTACTATTGTATGGCTGCTAAAGCCGTTGGCTTGCCTTGTCC
TGATTACACACGAGTCCATGAAGGTTTCAAAATTGCTTACACAGACATGGCTCAGAAGTA
TCCTTGTTTCGGTTTCTCCAAAATGTCAAACATTGTTTGGTGGAAAACCTGCGTGAGAGA
TTCATTTGTCAAGGCAGGGTATGACTATGACGAGGAGACGTTTGAGAAAGTGTTTAGAAG
AATCTATTCGACGTTTGGTTCTGCTGCACCTTACTCTATCTTTCAAGACTCTCGACCTTT
CTTGAGATGGGCACGCGAGAAAGGGCTCATCGTTGGACTCGTTAGCAACGCCGAGTATCG
TTATCAAGAAGTTATTTTACCTGCCTTAGGTTTGAACAAGGTAAGTGAACAAAGTCTCTT
AAAAA*GAGAGAGGTCTTATTCAGAAGTTGACTTAAGTTTTTTT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2C472JQ 730 0 0
CTCCAAAATGTCAAACATTGTTTGGTGGAAAACCTGCGTGAGAGATTCATTTGTCAAGGC
AGGGTATGACTATGACGAGGAGACGTTTGAGAAAGTGTTTAGAAGAATCTATTCGACGTT
TGGTTCTGCTGCACCTTACTCTATCTTTCAAGACTCTCGACCTTTCTTGAGATGGGCACG
CGAGAAAGGGCTCATCGTTGGACTCGTTAGCAACGCCGAGTATCGTTATCAAGAAGTTAT
TTTACCTGCCTTAGGTTTGAACAAGGTAAGTGAACAAAGTCTCTTAAAAAAGAGAGAGGT
CTTATTCAGAAGTTGACTTAAGTTTTTTTTTCAGGGAGAGTGGGACTTCGGTGTGTTCTC
TGGTATGGAAGGGATAGAGAAGCCGGATCCGAGGATATACAAGCTGGCGTTAGAGAGAGC
GGGGAACAACATTGCGCCTGGAGAGGTTCTGCATATTGGAGATAGTATGCGTAAAGATTA
TGTTCCGGCAAAGAGTATTGGGATGCATTCCTTGTTGCTTGATAGGTTTAAGACAGAAGC
TGCTAAAGACTGGAGAGAAGCTGGAGCTGTTGTGCTTCCTGATTTAGTTGCTGTTCAACA
GCTTTTGGAGTCTGACAAGTTGAAATGTTAATGAAGAGACCTCTCTCTAATGTATTGTAG
TATTGCACATTTTGGCTCTTTCTTCTTATGAGTAAAAAGAGTTTCAAAGGCCTATGATTT
AATCTAAGTC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL5551Contig1 661 2 2 U
TGGCGATGAGAGCTGCGAGGGAGAAACTCAGTCCCGAGTTAAGCGACACAGGAATCTCCG
GGATCATCCTGGTCCATCCTTACTTCTGGTCGAAAACACCAGTCGACGACAAGGAGACGA
GAGATGAAACGTTGAGGTCGAAGATCGAGGCGTTTTGGATGATGGCTACTCCAAACAACA
AAGACGGAGTGGATGATCCGTTGATCAACGTGGTTCAGTCAGAGTCGGTGGATATCTCCG
GGTTGGGTTGCGGGAAAGTGTTGGTGATGGTGGCTGAGAAAGACGCGTTGGCGAGACAAG
GCTGGGGGTACGCGGCGAAGCTTGAGAAGAGTGGGTGGAAAGGGAAAGTGGAGTTGGTGG
AGAGTGAAGGAGAAGACCATGTTTTTCATTTGATGAGACCTGATTGTGAGAAAGCTCTTG
AGGCCATGAAGATATTCGCAGGCTTTCTTAAGGGAGAGATGTAGTACCTGTGCCTGCATG
TGTGGTCCATCCGGAGAGATGAAGATATAGTTTGGTCTCTCTCAGTCTCTGTAATGTTTT
TATTGATTTTATCTTATTAGCATGAATAACACGAGAGATGAATAATACCATATGCACATG
ACAAGAGCACCAGTGAGATTACCATTGTATTGTTTTAAACATAGTTTATGTTTTTCTGGG
T


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2GZ84TF U 1
AF RR2H667TF U 1
BS 1 636 RR2GZ84TF
BS 637 661 RR2H667TF

RD RR2GZ84TF 636 0 0
TGGCGATGAGAGCTGCGAGGGAGAAACTCAGTCCCGAGTTAAGCGACACAGGAATCTCCG
GGATCATCCTGGTCCATCCTTACTTCTGGTCGAAAACACCAGTCGACGACAAGGAGACGA
GAGATGAAACGTTGAGGTCGAAGATCGAGGCGTTTTGGATGATGGCTACTCCAAACAACA
AAGACGGAGTGGATGATCCGTTGATCAACGTGGTTCAGTCAGAGTCGGTGGATATCTCCG
GGTTGGGTTGCGGGAAAGTGTTGGTGATGGTGGCTGAGAAAGACGCGTTGGCGAGACAAG
GCTGGGGGTACGCGGCGAAGCTTGAGAAGAGTGGGTGGAAAGGGAAAGTGGAGTTGGTGG
AGAGTGAAGGAGAAGACCATGTTTTTCATTTGATGAGACCTGATTGTGAGAAAGCTCTTG
AGGCCATGAAGATATTCGCAGGCTTTCTTAAGGGAGAGATGTAGTACCTGTGCCTGCATG
TGTGGTCCATCCGGAGAGATGAAGATATAGTTTGGTCTCTCTCAGTCTCTGTAATGTTTT
TATTGATTTTATCTTATTAGCATGAATAACACGAGAGATGAATAATACCATATGCACATG
ACAAGAGCACCAGTGAGATTACCATTGTATTGTTTT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2H667TF 661 0 0
TGGCGATGAGAGCTGCGAGGGAGAAACTCAGTCCCGAGTTAAGCGACACAGGAATCTCCG
GGATCATCCTGGTCCATCCTTACTTCTGGTCGAAAACACCAGTCGACGACAAGGAGACGA
GAGATGAAACGTTGAGGTCGAAGATCGAGGCGTTTTGGATGATGGCTACTCCAAACAACA
AAGACGGAGTGGATGATCCGTTGATCAACGTGGTTCAGTCAGAGTCGGTGGATATCTCCG
GGTTGGGTTGCGGGAAAGTGTTGGTGATGGTGGCTGAGAAAGACGCGTTGGCGAGACAAG
GCTGGGGGTACGCGGCGAAGCTTGAGAAGAGTGGGTGGAAAGGGAAAGTGGAGTTGGTGG
AGAGTGAAGGAGAAGACCATGTTTTTCATTTGATGAGACCTGATTGTGAGAAAGCTCTTG
AGGCCATGAAGATATTCGCAGGCTTTCTTAAGGGAGAGATGTAGTACCTGTGCCTGCATG
TGTGGTCCATCCGGAGAGATGAAGATATAGTTTGGTCTCTCTCAGTCTCTGTAATGTTTT
TATTGATTTTATCTTATTAGCATGAATAACACGAGAGATGAATAATACCATATGCACATG
ACAAGAGCACCAGTGAGATTACCATTGTATTGTTTTAAACATAGTTTATGTTTTTCTGGG
T

QA 1 661 1 661
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5553Contig1 695 2 2 U
GGGGGGAAAGAAAATTCAGAGCTCAGAGCTTCCAGGAAGTAATATCAATGGGTGGTGAAG
ATGAATCGATAGAGCAGAAGTCAGCTGCTCGCAAAGAGGCGCTTAGAGCTTTAAGGGCAG
CTCGGGAACTTACTGAGAGCAAAGAAGAGGGAGAAGGTGATGCTGCTGCTGCTGCTGTTG
AAGAAGATGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAATTATGTTCCCCAAGCTGAGGAGCTTCAGA
ACAGTAAAGTTGCACCACCAGAGCTGCCCAAACTCGAAGATCCAATCGCTGCACTTCCAC
CTGCTGTGGAGAAGAAAGAGGACCCATTTGTCAACATTGCTCCAAAGAAACCGAACTGGG
ACCTCCGAAGAGATGTCCAGAAGAAGCTTGACAAGCTCGAAAGGCGGACCCAAAAGGCAA
TGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTGAGACGGCCGAAGCTGATGAAAACG
CAATAGAAAGTTAAAGACGACGATGATATGACTTGAAAGAAGCCACGTGACGCTCTACTC
AGTTTTTTTTGTACGACTGCTCTGTCCGAAGAGAGTAGCTCTTAGTGCCTTATTTCTACT
CATTCTTCGGAACAAACCTTGCCAAACATGGTTTGATTGAACTTCAGTTTATAATCGGTT
TGATCGTAAAACGTAATGCAATTTCAGTTCCGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G973TF U 1
AF RR2G973JQ C 220
BS 1 579 RR2G973TF
BS 580 695 RR2G973JQ

RD RR2G973TF 579 0 0
GGGGGGAAAGAAAATTCAGAGCTCAGAGCTTCCAGGAAGTAATATCAATGGGTGGTGAAG
ATGAATCGATAGAGCAGAAGTCAGCTGCTCGCAAAGAGGCGCTTAGAGCTTTAAGGGCAG
CTCGGGAACTTACTGAGAGCAAAGAAGAGGGAGAAGGTGATGCTGCTGCTGCTGCTGTTG
AAGAAGATGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAATTATGTTCCCCAAGCTGAGGAGCTTCAGA
ACAGTAAAGTTGCACCACCAGAGCTGCCCAAACTCGAAGATCCAATCGCTGCACTTCCAC
CTGCTGTGGAGAAGAAAGAGGACCCATTTGTCAACATTGCTCCAAAGAAACCGAACTGGG
ACCTCCGAAGAGATGTCCAGAAGAAGCTTGACAAGCTCGAAAGGCGGACCCAAAAGGCAA
TGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTGAGACGGCCGAAGCTGATGAAAACG
CAATAGAAAGTTAAAGACGACGATGATATGACTTGAAAGAAGCCACGTGACGCTCTACTC
AGTTTTTTTTGTACGACTGCTCTGTCCGAAGAGAGTAGC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2G973JQ 476 0 0
CCCAAGCTGAGGAGCTTCAGAACAGTAAAGTTGCACCACCAGAGCTGCCCAAACTCGAAG
ATCCAATCGCTGCACTTCCACCTGCTGTGGAGAAGAAAGAGGACCCATTTGTCAACATTG
CTCCAAAGAAACCGAACTGGGACCTCCGAAGAGATGTCCAGAAGAAGCTTGACAAGCTCG
AAAGGCGGACCCAAAAGGCAATGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTGAGA
CGGCCGAAGCTGATGAAAACGCAATAGAAAGTTAAAGACGACGATGATATGACTTGAAAG
AAGCCACGTGACGCTCTACTCAGTTTTTTTTGTACGACTGCTCTGTCCGAAGAGAGTAGC
TCTTAGTGCCTTATTTCTACTCATTCTTCGGAACAAACCTTGCCAAACATGGTTTGATTG
AACTTCAGTTTATAATCGGTTTGATCGTAAAACGTAATGCAATTTCAGTTCCGAGC

QA 1 476 1 476
DS 



AS 1 2

CO CL5554Contig1 1012 2 2 U
GGCCAATCCAAAACCCTAAATTCTCGTCGATCTCGTAACTCACTCACCATCAACATCCCG
CAGAAAATCCCAGGCTTCAATTGAGTGAAGTTGCTACAATGGACGGCGATTTTAGCGGAG
ACCATTACGCTTCAAATGAAACTAGGGTTTCAGGAAACAAAAGAAGATTTGGTGACCATG
AACATGATATCTCCGTCCCAAAGAAGAGTTGTACTGAATGTGTTGCAATCGTTTCATCAA
CCATCAAGAGTCTTGTGGTTTTTAAAGACGAGCTTGCTTCAATTCGAACATTGCTCTCTG
GCAGTTTTGATAAACTTAAAGACGAGCTTGCTTCATTGTTCGTTGACAGTTTCCAGAGTG
TTAAAGACGAGTTTGCTTCATGTCAAAATGAGCTTGATAAGTGGAAGTCAGCGTTTAAGA
AGGAGTCCTTTGTACCCGCTAGAAAATCTCCTGAACCTCAACATGTGATTGACTACATCC
AAACTCTAAGATCTTCCGACAAGTCTTTGAAAGAAGAGTTGGAAATTGCACAAATGAAAT
TAGCTATCCGTGATCTGAAAGCTCAACTCAAGCCAGAGTCAGACAAGCCAACAGATGGGG
ATACAGAAGTCTACGACGAGCAGCAGCTGCAAGGATCGACTCCTGGTCCATCACGCAACG
TGGCATATCTTGAGGAAGAGTTGAGGGCAGCAAATGCGAGGATCGCAGAGTTGAATGAGT
ATCAGGAAGTGGAGTTGAAGGAGATGGTGAAGCAGTTGGAGTATTATCGCAACTTGGGCA
AGGTGATACTTGAAAAAATCCCAGACTTGGTTCCTCCACAACCTGCACCAGAGGATAGCA
ATGATCAGAAATAAATCTATATTATCTGTTATATAGGTTTGTTGGAAACTAAAGAATCCA
TCTATGTAGAAAAACGTTAGAATCATTTCAATTGTTTTTCTGGTAGTCGCCTTATTAATA
TCCCTAACTTCTGTAATATTTTCAGATTAATTAAGTGTAGTAGTTTCTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F284TF U 1
AF RR2F284JQ C 265
BS 1 628 RR2F284TF
BS 629 1012 RR2F284JQ

RD RR2F284TF 628 0 0
GGCCAATCCAAAACCCTAAATTCTCGTCGATCTCGTAACTCACTCACCATCAACATCCCG
CAGAAAATCCCAGGCTTCAATTGAGTGAAGTTGCTACAATGGACGGCGATTTTAGCGGAG
ACCATTACGCTTCAAATGAAACTAGGGTTTCAGGAAACAAAAGAAGATTTGGTGACCATG
AACATGATATCTCCGTCCCAAAGAAGAGTTGTACTGAATGTGTTGCAATCGTTTCATCAA
CCATCAAGAGTCTTGTGGTTTTTAAAGACGAGCTTGCTTCAATTCGAACATTGCTCTCTG
GCAGTTTTGATAAACTTAAAGACGAGCTTGCTTCATTGTTCGTTGACAGTTTCCAGAGTG
TTAAAGACGAGTTTGCTTCATGTCAAAATGAGCTTGATAAGTGGAAGTCAGCGTTTAAGA
AGGAGTCCTTTGTACCCGCTAGAAAATCTCCTGAACCTCAACATGTGATTGACTACATCC
AAACTCTAAGATCTTCCGACAAGTCTTTGAAAGAAGAGTTGGAAATTGCACAAATGAAAT
TAGCTATCCGTGATCTGAAAGCTCAACTCAAGCCAGAGTCAGACAAGCCAACAGATGGGG
ATACAGAAGTCTACGACGAGCAGCAGCT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2F284JQ 748 0 0
AAGACGAGCTTGCTTCAATTCGAACATTGCTCTCTGGCAGTTTTGATAAACTTAAAGACG
AGCTTGCTTCATTGTTCGTTGACAGTTTCCAGAGTGTTAAAGACGAGTTTGCTTCATGTC
AAAATGAGCTTGATAAGTGGAAGTCAGCGTTTAAGAAGGAGTCCTTTGTACCCGCTAGAA
AATCTCCTGAACCTCAACATGTGATTGACTACATCCAAACTCTAAGATCTTCCGACAAGT
CTTTGAAAGAAGAGTTGGAAATTGCACAAATGAAATTAGCTATCCGTGATCTGAAAGCTC
AACTCAAGCCAGAGTCAGACAAGCCAACAGATGGGGATACAGAAGTTTACGACGAGCAGC
AGCTGCAAGGATCGACTCCTGGTCCATCACGCAACGTGGCATATCTTGAGGAAGAGTTGA
GGGCAGCAAATGCGAGGATCGCAGAGTTGAATGAGTATCAGGAAGTGGAGTTGAAGGAGA
TGGTGAAGCAGTTGGAGTATTATCGCAACTTGGGCAAGGTGATACTTGAAAAAATCCCAG
ACTTGGTTCCTCCACAACCTGCACCAGAGGATAGCAATGATCAGAAATAAATCTATATTA
TCTGTTATATAGGTTTGTTGGAAACTAAAGAATCCATCTATGTAGAAAAACGTTAGAATC
ATTTCAATTGTTTTTCTGGTAGTCGCCTTATTAATATCCCTAACTTCTGTAATATTTTCA
GATTAATTAAGTGTAGTAGTTTCTTTTC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL5555Contig1 1102 2 2 U
CGGAACTAAGCTGTGGCTTCTCCCTAGTGGGATGTTGAAGAGGGATAAGAACCAGACTCG
TTACGATAACCGGAGAAAGTGCATTCATTGGACAGTTGAGTGGCGGTTTCACTCTACAGA
TGTGGTTCTTGTTGATCATGGTGTTGGTGAAGATACAAGCCTCTGCTCTGTGATAGAGAA
TCATCTTAAGCCAGGCCCTTGGATTCACAAGCTCAAGCCTTTTTGTGACGTGGATCTTGA
TTCTCTCAAGCTTTTTATCCGCAAGTACCCAAAGGGTGCAAAGGTTCCTTACAAGGAGCT
GGACATCAAGGCTTCTTTGAGGCAACAGCTTGCTCAGGTAACTATCTTAGAGTACCCGGT
GATTCATGTTTATCTTCCTTCGCACACCTATGACTTTGAAGTTATCAGAGACTTTGACCG
TGAGAAAACGACACCGGAGCCTAAGTACTATAGCCAGGCAGAAGGTGCAACCACACGAGA
AGAAGAAATAGAAGAAGAAGACGGCATTGACTCCTTTGAGCCAGAGGTTCTTGATCTCAT
CAAACAAATAAACTATAACCGCTCAGAGGGCAGCAAGGGTGAGGGTGGGGTTAGCAAAAA
TGCACATCCTGACGATGACATGGAGCTGGAGTTTGAGCAAGGGTTAATAGACACATACTC
TGATCTTTTCCCGGAGTTGAACCCTGGTGATTACTTCAACTTTGAATGTGAGTTTGCAGA
GGGGTTTGATTCTGATGATAACTGCAATCTCCAAAGTCTAGCTACTACTACTGATTTGAA
CACTGATGGACTAGAGGAAGGGGAGATCGTTGAATGAGGGTCATTCTCTTTCCATTGCGA
CATTCTTGGTCATGCCTGAAGTGAACCTCCCTTGTTGAAGCACGTTGGCTAGTGTTTGTA
TCATCCAAAGCTTTTACAGAACTAGATAGCCAATCTATTTGATTGCAGAACTAGTGGGTC
ATAAACGTTTTGGTTTGAGATCGGATCAATAGGTCTTCCTGTAGTCTAGGTGTTTAATTA
TTTATCACATTCAATATTATTTAGTTGATGTAAGAGAACGCCTTCCAAACTTTTTGTTAA
TTCTCTTGTCCTCTTTCTATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY21TFB U 1
AF RR2AY21JQ C 309
BS 1 669 RR2AY21TFB
BS 670 1102 RR2AY21JQ

RD RR2AY21TFB 669 0 0
CGGAACTAAGCTGTGGCTTCTCCCTAGTGGGATGTTGAAGAGGGATAAGAACCAGACTCG
TTACGATAACCGGAGAAAGTGCATTCATTGGACAGTTGAGTGGCGGTTTCACTCTACAGA
TGTGGTTCTTGTTGATCATGGTGTTGGTGAAGATACAAGCCTCTGCTCTGTGATAGAGAA
TCATCTTAAGCCAGGCCCTTGGATTCACAAGCTCAAGCCTTTTTGTGACGTGGATCTTGA
TTCTCTCAAGCTTTTTATCCGCAAGTACCCAAAGGGTGCAAAGGTTCCTTACAAGGAGCT
GGACATCAAGGCTTCTTTGAGGCAACAGCTTGCTCAGGTAACTATCTTAGAGTACCCGGT
GATTCATGTTTATCTTCCTTCGCACACCTATGACTTTGAAGTTATCAGAGACTTTGACCG
TGAGAAAACGACACCGGAGCCTAAGTACTATAGCCAGGCAGAAGGTGCAACCACACGAGA
AGAAGAAATAGAAGAAGAAGACGGCATTGACTCCTTTGAGCCAGAGGTTCTTGATCTCAT
CAAACAAATAAACTATAACCGCTCAGAGGGCAGCAAGGGTGAGGGTGGGGTTAGCAAAAA
TGCACATCCTGACGATGACATGGAGCTGGAGTTTGAGCAAGGGTTAATAGACACATACTC
TGATCTTTT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2AY21JQ 794 0 0
AGGCTTCTTTGAGGCAACAGCTTGCTCAGGTAACTATCTTAGAGTACCCGGTGATTCATG
TTTATCTTCCTTCGCACACCTATGACTTTGAAGTTATCAGAGACTTTGACCGTGAGAAAA
CGACACCGGAGCCTAAGTACTATAGCCAGGCAGAAGGTGCAACCACACGAGAAGAAGAAA
TAGAAGAAGAAGACGGCATTGACTCCTTTGAGCCAGAGGTTCTTGATCTCATCAAACAAA
TAAACTATAACCGCTCAGAGGGCAGCAAGGGTGAGGGTGGGGTTAGCAAAAATGCACATC
CTGACGATGACATGGAGCTGGAGTTTGAGCAAGGGTTAATAGACACATACTCTGATCTTT
TCCCGGAGTTGAACCCTGGTGATTACTTCAACTTTGAATGTGAGTTTGCAGAGGGGTTTG
ATTCTGATGATAACTGCAATCTCCAAAGTCTAGCTACTACTACTGATTTGAACACTGATG
GACTAGAGGAAGGGGAGATCGTTGAATGAGGGTCATTCTCTTTCCATTGCGACATTCTTG
GTCATGCCTGAAGTGAACCTCCCTTGTTGAAGCACGTTGGCTAGTGTTTGTATCATCCAA
AGCTTTTACAGAACTAGATAGCCAATCTATTTGATTGCAGAACTAGTGGGTCATAAACGT
TTTGGTTTGAGATCGGATCAATAGGTCTTCCTGTAGTCTAGGTGTTTAATTATTTATCAC
ATTCAATATTATTTAGTTGATGTAAGAGAACGCCTTCCAAACTTTTTGTTAATTCTCTTG
TCCTCTTTCTATCT

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL5556Contig1 815 2 2 U
GTTGTGGACTAAATGTTTTCTTCATCGTCATGACTATGATCCTTGCCTTTGTTTTCGCCA
TTGTTGCCTTACATCCTGCGGTCAATGGCAGCCTGTTACCAGCATCTGTTATATCTGTTT
ACTGTGCGTATGTCTGTTACACGGGTCTCTCTAGCGAACCACACGACTACGTGTGCAATG
GGCTTAATAGATCAAAGGCAGTGACCGCTAGTACTCTAACGCTCGGAATGCTCACAACAG
TTCTCTCTGTTCTCTACTCCGCCCTCCGAGCTGGCTCTTCCACCACATTCCTCTCACCAC
CATCCTCTCCCAGAGCAGGTGGGAAGGAGGCATTGTTAGAAGACCCTGAAGATGGGAAGA
AAGGTGGTGAAGCAGAGGCACGGCCTGTGAGTTACTCATACTCTTTCTTCCATATAATCT
TTGCGCTGGCGAGCATGTACGCTGCGATGCTTCTCTCGGGATGGACTGACTCCTCAGAGA
GTGCGTCTCTGATCGACGTGGGATGGACCTCTGTCTGGGTCAAGATTTGCACCGGTTGGG
TCACAGCTGCACTCTACATCTGGACACTCATCGCACCGCTCATCCTTCCGGATCGCGAGT
TCTACTGAATGGCAATATCCGCTCAGGAGAGAAGGCAACACTTTTTTTTTAATTGAAAAT
GGCAACACTTATATGTTCCGGTGAATGTAAGTATTATGTTTATATATAAAATGGGTATGG
TCATGTAATGGTAATGAATGTAGCTCTTATCGTATTCTATATACTTGTAATTAAAACATG
AACTAAAAGACTTTGAATGTTGGGAGTGTTCTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG94TF U 1
AF RR2CG94JQ C 255
BS 1 622 RR2CG94TF
BS 623 815 RR2CG94JQ

RD RR2CG94TF 622 0 0
GTTGTGGACTAAATGTTTTCTTCATCGTCATGACTATGATCCTTGCCTTTGTTTTCGCCA
TTGTTGCCTTACATCCTGCGGTCAATGGCAGCCTGTTACCAGCATCTGTTATATCTGTTT
ACTGTGCGTATGTCTGTTACACGGGTCTCTCTAGCGAACCACACGACTACGTGTGCAATG
GGCTTAATAGATCAAAGGCAGTGACCGCTAGTACTCTAACGCTCGGAATGCTCACAACAG
TTCTCTCTGTTCTCTACTCCGCCCTCCGAGCTGGCTCTTCCACCACATTCCTCTCACCAC
CATCCTCTCCCAGAGCAGGTGGGAAGGAGGCATTGTTAGAAGACCCTGAAGATGGGAAGA
AAGGTGGTGAAGCAGAGGCACGGCCTGTGAGTTACTCATACTCTTTCTTCCATATAATCT
TTGCGCTGGCGAGCATGTACGCTGCGATGCTTCTCTCGGGATGGACTGACTCCTCAGAGA
GTGCGTCTCTGATCGACGTGGGATGGACCTCTGTCTGGGTCAAGATTTGCACCGGTTGGG
TCACAGCTGCACTCTACATCTGGACACTCATCGCACCGCTCATCCTTCCGGATCGCGAGT
TCTACTGAATGGCAATATCCGC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2CG94JQ 561 0 0
TACTCCGCCCTCCGAGCTGGCTCTTCCACCACATTCCTCTCACCACCATCCTCTCCCAGA
GCAGGTGGGAAGGAGGCATTGTTAGAAGACCCTGAAGATGGGAAGAAAGGTGGTGAAGCA
GAGGCACGGCCTGTGAGTTACTCATACTCTTTCTTCCATATAATCTTTGCGCTGGCGAGC
ATGTACGCTGCGATGCTTCTCTCGGGATGGACTGACTCCTCAGAGAGTGCGTCTCTGATC
GACGTGGGATGGACCTCTGTTTGGGTCAAGATTTGCACCGGTTGGGTCACAGCTGCACTC
TACATCTGGACACTCATCGCACCGCTCATCCTTCCGGATCGCGAGTTTTACTGAATGGCA
ATATCCGCTCAGGAGAGAAGGCAACACTTTTTTTTTAATTGAAAATGGCAACACTTATAT
GTTCCGGTGAATGTAAGTATTATGTTTATATATAAAATGGGTATGGTCATGTAATGGTAA
TGAATGTAGCTCTTATCGTATTCTATATACTTGTAATTAAAACATGAACTAAAAGACTTT
GAATGTTGGGAGTGTTCTTAG

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL5557Contig1 782 2 4 U
GGAAACATGTCGAGAAACAATATTAAGCTGCTGCAATGCGTGTCGTCTTTTTTATTCGCC
GTCGTCGCCGTCAATTCCTCAACCACTCCCCTCGTCGGAGTTCATCCATTAGATGAGAAA
TACTTGGAGTCAGATATAATCAGATGCAAAGATGGCTCCAAATCATTCCCTAGAGAACGT
CTCAATGACAACTTCTGCGACTGTCTCGACGGTACCGATGAGCCTGGAACTTCGGCTTGT
CCGAACGGCAAATTCTACTGTCGGAATACAGGAAGTTCTCCAAAGTTTGTTTACTTTTCT
CGTGTGAACGATCGAATCTGTGATTGTTGCGATGGAAGTGACGAGTACGAGAGTAGCATT
ACTTGTCCCAACACGTGTATAATGGGCGGTAACGTTAACTACGTCTACAAACCTAGAACC
GACCGTAAATCTATCGACAGGGAACTCGGTTCTGCAACAACCGATCCAAATAGATCGGTA
ACCATAGCGAATCTTCAAGACATTGTCAAGAATCTCCAAGGTATGAAGCTTGTCTTCGCA
GTTCAGATGGTTTTGATCGGTTTCTTGGTGATCTTATGGATGCTTAGGCGTCGTGCTCGG
TCTTCTAAGAGAAGACGGCATCTGCTGAAGAGTGTTCATCCCAATAGATCAGGCTAACTA
ACTCTAGGGAACTCTTCGATTCATATATGGTCGGTTTCTTGAGTCTTTTACGCAAATTTT
AATCACTGCTTTCATGTGTTGTTCGGACAAGATAATATATGTTTAAAATTAGAATTGGAG
CG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2FG63TF U 1
AF RR2FG63JQ C 49
BS 1 652 RR2FG63TF
BS 653 653 RR2FG63JQ
BS 654 689 RR2FG63TF
BS 690 782 RR2FG63JQ

RD RR2FG63TF 689 0 0
GGAAACATGTCGAGAAACAATATTAAGCTGCTGCAATGCGTGTCGTCTTTTTTATTCGCC
GTCGTCGCCGTCAATTCCTCAACCACTCCCCTCGTCGGAGTTCATCCATTAGATGAGAAA
TACTTGGAGTCAGATATAATCAGATGCAAAGATGGCTCCAAATCATTCCCTAGAGAACGT
CTCAATGACAACTTCTGCGACTGTCTCGACGGTACCGATGAGCCTGGAACTTCGGCTTGT
CCGAACGGCAAATTCTACTGTCGGAATACAGGAAGTTCTCCAAAGTTTGTTTACTTTTCT
CGTGTGAACGATCGAATCTGTGATTGTTGCGATGGAAGTGACGAGTACGAGAGTAGCATT
ACTTGTCCCAACACGTGTATAATGGGCGGTAACGTTAACTACGTCTACAAACCTAGAACC
GACCGTAAATCTATCGACAGGGAACTCGGTTCTGCAACAACCGATCCAAATAGATCGGTA
ACCATAGCGAATCTTCAAGACATTGTCAAGAATCTCCAAGGTATGAAGCTTGTCTTCGCA
GTTCAGATGGTTTTGATCGGTTTCTTGGTGATCTTATGGATGCTTAGGCGTCGTGCTCGG
TCTTCTAAGAGAAGACGGCATCTGCTGAAGAGTGTTCATCCCAATAGATCAG*CTAACTA
ACTCTAGGGAACTCTTCGATTCATATATG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2FG63JQ 734 0 0
TTTTTATTCGCCGTCGTCGCCGTCAATTCCTCAACCACTCCCCTCGTCGGAGTTCATCCA
TTAGATGAGAAATACTTGGAGTCAGATATAATCAGATGCAAAGATGGCTCCAAATCATTC
CCTAGAGAACGTCTCAATGACAACTTCTGCGACTGTCTCGACGGTACCGATGAGCCTGGA
ACTTCGGCTTGTCCGAACGGCAAATTCTACTGTCGGAATACAGGAAGTTCTCCAAAGTTT
GTTTACTTTTCTCGTGTGAACGATCGAATCTGTGATTGTTGCGATGGAAGTGACGAGTAC
GAGAGTAGCATTACTTGTCCCAACACGTGTATAATGGGCGGTAACGTTAACTACGTCTAC
AAACCTAGAACCGACCGTAAATCTATCGACAGGGAACTCGGTTCTGCAACAACCGATCCA
AATAGATCGGTAACCATAGCGAATCTTCAAGACATTGTCAAGAATCTCCAAGGTATGAAG
CTTGTCTTCGCAGTTCAGATGGTTTTGATCGGTTTCTTGGTGATCTTATGGATGCTTAGG
CGTCGTGCTCGGTCTTCTAAGAGAAGACGGCATCTGCTGAAGAGTGTTCATCCCAATAGA
TCAGGCTAACTAACTCTAGGGAACTCTTCGATTCATATATGGTCGGTTTCTTGAGTCTTT
TACGCAAATTTTAATCACTGCTTTCATGTGTTGTTCGGACAAGATAATATATGTTTAAAA
TTAGAATTGGAGCG

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL5558Contig1 1302 2 4 U
GGACGAATCGTGTCTCTTCTTCACCTACTAACTCTCTCTCCGTCAACAATAGACTCTCAG
GATTCGATTTCTATTTTGTTGGTGTGAGAGAGAGAAAAGGGGTTTAGGGTTTTCGGGTTG
TTGCTAACGATGGACGAGACTTTACTGGACGACATAATAAGGAGGCTACTGGAAACGAAT
AACGGGAAGGCGGCGAAGCAGCAGGTAAAGCTACTTGAGGCGGAGATACGTCAGCTCTGC
TATGCTTCCAAAGAGGTGTTTCTCAGCCAACCTAATCTCCTCGAGCTCGAAGCTCCTATC
AAGATTTGCGGAGATGTTCACGGTCAGTTCCCAGACCTTTTGAGGTTGTTTGAGTACGGT
GGCTATCCTCCAGCTGCCAACTACTTGTTCCTTGGGGACTATGTTGATCGTGGTAAGCAG
AGCATTGAGACCATATGCCTTCTCCTTGCCTACAAGCTCAAATACAAGCTCAACTTCTTT
CTTCTCAGAGGCAACCACGAGTCCGCTTCTATCAACCGTGTCTACGGATTCTACGACGAA
TGCAAAAGAAAATACAACGTGCGTCTATGAAAGAGTTTCACCGACTGCTTCAACTGTCTC
CCTGTTGCTGCGCTCATTGATGACAAGATCCTCTGTATGCACGGTGGACTTTCCCCTGAT
CTCAAGAGCTTGGATGATATCAGGCGGATTCCTCGTCCTATTGATGTTCCTGATCAGGGT
GTTCTCTGTGATTTGTTGTGGGTTGATCCTGAGAAAGGAGTCAAAGGCTGGGGGGAGAAT
GAGAGAGGTGTCTCATATACTTTTGTCGCCGACATAGTGGCTGAGTTCCTTCAAACTCAT
GACCTTGATCTTGTTTGCCGAGCTCATCAGGTTGTGGAAGATGGATATGAGTTCTTTGCA
AATAGACAACTGGTGACAATATTCTCTGCGCCTAATTACTGTGGTGAGTTTGATAATGCT
GGCGCAATGATGAGTGTTGATGATAGCTTGACGTGTTCGTTCCAAATCATCAAGTCAACT
GAGAAGAAAATAAGATTTGGATTCAACAACGTTTCTAGACCAGGAACCCCACCACATAAG
GGAGGAAGAGGTGGTTAAGACCTTTGTATCATTGGATGAATCAAGACAAGAATGAAGCTG
ATGGGTTCGATTCTTTTTAAGCTGTAGGTGATTTGAGGCTGCAGTTTGGTTTTGCTAATT
TGTTTTTTTTCTTTTGTTTGATTGAAGCTAAGTTTTGTTATGTTTGATTGTTATGACATT
TTTTCCAACTGAGAAAAGTCGGCTCTATACCCCTAATTTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C694TF U 1
AF RR2C694JQ C 539
BS 1 569 RR2C694TF
BS 570 570 RR2C694JQ
BS 571 681 RR2C694TF
BS 682 1302 RR2C694JQ

RD RR2C694TF 681 0 0
GGACGAATCGTGTCTCTTCTTCACCTACTAACTCTCTCTCCGTCAACAATAGACTCTCAG
GATTCGATTTCTATTTTGTTGGTGTGAGAGAGAGAAAAGGGGTTTAGGGTTTTCGGGTTG
TTGCTAACGATGGACGAGACTTTACTGGACGACATAATAAGGAGGCTACTGGAAACGAAT
AACGGGAAGGCGGCGAAGCAGCAGGTAAAGCTACTTGAGGCGGAGATACGTCAGCTCTGC
TATGCTTCCAAAGAGGTGTTTCTCAGCCAACCTAATCTCCTCGAGCTCGAAGCTCCTATC
AAGATTTGCGGAGATGTTCACGGTCAGTTCCCAGACCTTTTGAGGTTGTTTGAGTACGGT
GGCTATCCTCCAGCTGCCAACTACTTGTTCCTTGGGGACTATGTTGATCGTGGTAAGCAG
AGCATTGAGACCATATGCCTTCTCCTTGCCTACAAGCTCAAATACAAGCTCAACTTCTTT
CTTCTCAGAGGCAACCACGAGTCCGCTTCTATCAACCGTGTCTACGGATTCTACGACGAA
TGCAAAAGAAAATACAACGTGCGTCTATGGAAGAGTTTCACCGACTGCTTCAACTGTCTC
CCTGTTGCTGCGCTCATTGATGACAAGATCCTCTGTATGCACGGTGGACTTTCCCCTGAT
CTCAAGAGCTTGGATGATATC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2C694JQ 764 0 0
AATGCAAAAGAAAATACAACGTGCGTCTATGAAAGAGTTTCACCGACTGCTTCAACTGTC
TCCCTGTTGCTGCGCTCATTGATGACAAGATCCTCTGTATGCACGGTGGACTTTCCCCTG
ATCTCAAGAGCTTGGATGATATCAGGCGGATTCCTCGTCCTATTGATGTTCCTGATCAGG
GTGTTCTCTGTGATTTGTTGTGGGTTGATCCTGAGAAAGGAGTCAAAGGCTGGGGGGAGA
ATGAGAGAGGTGTCTCATATACTTTTGTCGCCGACATAGTGGCTGAGTTCCTTCAAACTC
ATGACCTTGATCTTGTTTGCCGAGCTCATCAGGTTGTGGAAGATGGATATGAGTTCTTTG
CAAATAGACAACTGGTGACAATATTCTCTGCGCCTAATTACTGTGGTGAGTTTGATAATG
CTGGCGCAATGATGAGTGTTGATGATAGCTTGACGTGTTCGTTCCAAATCATCAAGTCAA
CTGAGAAGAAAATAAGATTTGGATTCAACAACGTTTCTAGACCAGGAACCCCACCACATA
AGGGAGGAAGAGGTGGTTAAGACCTTTGTATCATTGGATGAATCAAGACAAGAATGAAGC
TGATGGGTTCGATTCTTTTTAAGCTGTAGGTGATTTGAGGCTGCAGTTTGGTTTTGCTAA
TTTGTTTTTTTTCTTTTGTTTGATTGAAGCTAAGTTTTGTTATGTTTGATTGTTATGACA
TTTTTTCCAACTGAGAAAAGTCGGCTCTATACCCCTAATTTAAG

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL5559Contig1 474 2 2 U
GGCCTTATTCTCTCTTCTTCTGTATGATTTATAGTTGTGGGGAGGTAGAGGGAGAGCAAG
ATTCACCAACACAATAAAGAAGATAATGGTGCTCTCTGACTTCACTGGAGTCGGTGTTGG
ATTCGGGTTCGGCGTCGGCTGTGGATTTGGTGTTGGGTGGGGTTTTGGAGGAATGCCTGT
GAATGTTTTAGGCGTTGGTGTAGGTGGAGGTTGCGGAGTGGGACTGGGACTCGGGTGGGG
TTTCGGGACTGCCTTTGGTAGTCACTACCGATCATCTAGGCTTACTTTTCAAGGCGTCCA
GCTAGAGAAGGAGGGTAAAGTGGAAAACATGTCCAAAAACGCTTAGCAGCCTGTGGACTT
TCCCATCCCAAATCACTTGAGAAAAAAAAACTCTGCTCGGATTTTATTGTATAATAAGAA
AACAATGTTTGACGTTTTTCTTATTTCTCAGTAAGAATCATAATTCAAATAATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS73TF U 1
AF RR2BS73JQ C 1
BS 1 281 RR2BS73TF
BS 282 474 RR2BS73JQ

RD RR2BS73TF 281 0 0
GGCCTTATTCTCTCTTCTTCTGTATGATTTATAGTTGTGGGGAGGTAGAGGGAGAGCAAG
ATTCACCAACACAATAAAGAAGATAATGGTGCTCTCTGACTTCACTGGAGTCGGTGTTGG
ATTCGGGTTCGGCGTCGGCTGTGGATTTGGTGTTGGGTGGGGTTTTGGAGGAATGCCTGT
GAATGTTTTAGGCGTTGGTGTAGGTGGAGGTTGCGGAGTGGGACTGGGACTCGGGTGGGG
TTTCGGGACTGCCTTTGGTAGTCACTACCGATCATCTAGGC

QA 1 281 1 281
DS 

RD RR2BS73JQ 474 0 0
GGCCTTATTCTCTCTTCTTCTGTATGATTTATAGTTGTGGGGAGGTAGAGGGAGAGCAAG
ATTCACCAACACAATAAAGAAGATAATGGTGCTCTCTGACTTCACTGGAGTCGGTGTTGG
ATTCGGGTTCGGCGTCGGCTGTGGATTTGGTGTTGGGTGGGGTTTTGGAGGAATGCCTGT
GAATGTTTTAGGCGTTGGTGTAGGTGGAGGTTGCGGAGTGGGACTGGGACTCGGGTGGGG
TTTCGGGACTGCCTTTGGTAGTCACTACCGATCATCTAGGCTTACTTTTCAAGGCGTCCA
GCTAGAGAAGGAGGGTAAAGTGGAAAACATGTCCAAAAACGCTTAGCAGCCTGTGGACTT
TCCCATCCCAAATCACTTGAGAAAAAAAAACTCTGCTCGGATTTTATTGTATAATAAGAA
AACAATGTTTGACGTTTTTCTTATTTCTCAGTAAGAATCATAATTCAAATAATC

QA 1 474 1 474
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5561Contig1 1096 2 4 U
GCACCAGTGGATGAAGCAGGAAAGTCTGTGTTTCTCTACGTTGGTTCTCCTCCTTCACAG
CTAGAGCCAGCTTTGGAAGACATGAGCTTGTGGTATCAGGTGCAGAGACAAACTAAAATA
CTAAGTATAATGAAACAGAGAGGGCTTTCTAGCAAGTACTTGCCGCAGCTCCACGGTTCT
GGTCGGATCATTCACCCAGGCCAGTGTCAAAAACCAAGCTCAGGTGGACGGTGTGATCAT
CCTTGGTGCGGAACTCCCATTCTTGTCACCACTCCCGTTGGGGAGACAGTATCTGATTTG
GTAAACGAGGGTCGGTTTGGTCCTGAAGAAGCTATTAGATGTTGCCATGATTGCTTATCA
GCACTCTCAACCTCCTCTTCAGCTGGAATACGCCATGGTGACATCCGTCCAGAAAACGTA
GTCTATGTCACTTCAGGTGTGAGACAACCATACTTTGTACTAGTAGGTTGGGGTCATGCG
GTGCTTGAGGATAGAGATAGACCTGCAATGAACCTTCACTTCTCCTCTACTTACGCACTT
CAGGAAGGGAAACTTTGTGCTGCCTCGGATGCGGAGAGCTTGATATACATGCTTTATTTC
TGTTTCGGAGACTTGCCTGATTTGGATTCAGTTGAAGGAGCTCTTCAGTGGAGAGAGACC
TCTTGGTCGAGAAGATTGATTCAGCAGAAGCTAGGTGATGTCTCAACTATTTTGAAAGCG
TTTTCTGACTACGTTGATAGTCTATGTGGGACACCGTATCCTCTGGATTATGGGATATGG
TTGAGAAGATTGAAGAGGAATCTTTCAGAAGATCACGGAAAAGAAATTGAAACCTCAGGC
TAATGGGGATGTATAAAACATTCGATTCCTTTTGAACATTCTTTCAGGTGCTCTCTGCTT
TAACCTGTCCGAGACTGGAAAGCTTCACGATGAGACACGTATGCTTGCGTTTTGCCAAGT
TTGAGTAGTTTGGACCTTTTTCTGTTCTTCTTGTACATGATCTCCTAAATGGATTAGATT
CTGTGTTTACCTTCTCTGTCAATCTTTTGTTCCTTTTCGTCATTATTATTATTATCTCCA
AGAGTGGTTCTCTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ70TF U 1
AF RR2GZ70JQ C 309
BS 1 637 RR2GZ70TF
BS 638 638 RR2GZ70JQ
BS 639 686 RR2GZ70TF
BS 687 1096 RR2GZ70JQ

RD RR2GZ70TF 686 0 0
GCACCAGTGGATGAAGCAGGAAAGTCTGTGTTTCTCTACGTTGGTTCTCCTCCTTCACAG
CTAGAGCCAGCTTTGGAAGACATGAGCTTGTGGTATCAGGTGCAGAGACAAACTAAAATA
CTAAGTATAATGAAACAGAGAGGGCTTTCTAGCAAGTACTTGCCGCAGCTCCACGGTTCT
GGTCGGATCATTCACCCAGGCCAGTGTCAAAAACCAAGCTCAGGTGGACGGTGTGATCAT
CCTTGGTGCGGAACTCCCATTCTTGTCACCACTCCCGTTGGGGAGACAGTATCTGATTTG
GTAAACGAGGGTCGGTTTGGTCCTGAAGAAGCTATTAGATGTTGCCATGATTGCTTATCA
GCACTCTCAACCTCCTCTTCAGCTGGAATACGCCATGGTGACATCCGTCCAGAAAACGTA
GTCTATGTCACTTCAGGTGTGAGACAACCATACTTTGTACTAGTAGGTTGGGGTCATGCG
GTGCTTGAGGATAGAGATAGACCTGCAATGAACCTTCACTTCTCCTCTACTTACGCACTT
CAGGAAGGGAAACTTTGTGCTGCCTCGGATGCGGAGAGCTTGATATACATGCTTTATTTC
TGTTTCGGAGACTTGCCTGATTTGGATTCAGTTGAAG*AGCTCTTCAGTGGAGAGAGACC
TCTTGGTCGAGAAGATTGATTCAGCA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2GZ70JQ 788 0 0
GGGTCGGTTTGGTC*TGAAGAAGCTAT*AGATGTTGCCATGATTGCTTATCAGCACTCTC
AACCTCCTCTTCAGCTGGAATACGCCATGGTGACATCCGTCCAGAAAACGTAGTCTATGT
CACTTCAGGTGTGAGACAACCATACTTTGTACTAGTAGGTTGGGGTCATGCGGTGCTTGA
GGATAGAGATAGACCTGCAATGAACCTTCACTTCTCCTCTACTTACGCACTTCAGGAAGG
GAAACTTTGTGCTGCCTCGGATGCGGAGAGCTTGATATACATGCTTTATTTCTGTTTCGG
AGACTTGCCTGATTTGGATTCAGTTGAAGGAGCTCTTCAGTGGAGAGAGACCTCTTGGTC
GAGAAGATTGATTCAGCAGAAGCTAGGTGATGTCTCAACTATTTTGAAAGCGTTTTCTGA
CTACGTTGATAGTCTATGTGGGACACCGTATCCTCTGGATTATGGGATATGGTTGAGAAG
ATTGAAGAGGAATCTTTCAGAAGATCACGGAAAAGAAATTGAAACCTCAGGCTAATGGGG
ATGTATAAAACATTCGATTCCTTTTGAACATTCTTTCAGGTGCTCTCTGCTTTAACCTGT
CCGAGACTGGAAAGCTTCACGATGAGACACGTATGCTTGCGTTTTGCCAAGTTTGAGTAG
TTTGGACCTTTTTCTGTTCTTCTTGTACATGATCTCCTAAATGGATTAGATTCTGTGTTT
ACCTTCTCTGTCAATCTTTTGTTCCTTTTCGTCATTATTATTATTATCTCCAAGAGTGGT
TCTCTATT

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL5562Contig1 1057 2 6 U
ATTAATGGATGCCCTAGAGAGAAACTTTCTCAAGCTCGCATCCCAAGGTGCTGCTCCGAT
GGATCTCCCCAGCTCCAACCACACAGCTCCTCCCTCCTCTCTTTGAAGCTCTGTTTCTTA
CCACAGCCATGAACATGTCTACTCCTCCGTCGTGTCTCCGTCCCCCTCCAGATCCGCCAC
CGCCGCCGTCCTTTGGCTTGATGCAGCACTGCTCTTCCTCCTTGAAGATGATGGTGACAG
CTCTTCCTCTTTCTGCACAGCCCGGTCCTCTTCCGGATCCGCCGCCGAACAAGCACTTTC
CGGTTGAAACACTCTCTCCTGTCAAGCCACCAGAACCTCCAGACCCACCAGATGTTTCCG
TCAGCTTCATGCTACTCCGAATCTTCATTACTTTTTCCAGATCATCTCCAAAAAATACTC
AAATCCTAGATCTGATGTTGAATCTTTCAAGGGTATCAAGTCACATCCCTGTCAATGTTT
TTTTCCTGTGGTATACAGGTTGTATCTTTGTTTGCTACAGAATGGCGTGGTCTTCTCATA
GTTCTTGTTCAAGCCTTCCTTGTAACCAAGCGGTTATAGACGTCCAGATCTGTCCAACTT
CCTCTAGAGTGGAGTACTTAATGGTAAATTGCAGATGTTTAGCTAGATTGGAAGATTGCT
CAAGAGATGATTCGCTCTCTGTACTATTCAAAGGCTCAGCATTCTGGTGTCACATAGCCC
CTGCTATCCTTAGTGTTGTCGAGATAAGAGGACGTCTCTGCAATGTGGATGCAGCTTGGG
ATGCCAAGTCTAGGCACTGCGACATCGGAGGCATCTTCTCGGGTGAGAATACCATCACCC
TACCAAACCTTTGCGAGTCTCGCAATCATGTATCATCAGCACTCATGGCTGAAGCCATTG
CTGTCTGACCGTCTACTCAAACATCCGATCCTTGGGAGTTCTCTCTGATTCTCTATCACT
CATCAAGCTATTGAAGAATGGTGGATTTCAGCCGAAACTTTTCGGTGTCATGTTTGATAT
CTATAACTACTTGTCTTATTTTGATGTTATATCTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG02TF U 1
AF RR2EG02JQ C 323
BS 1 652 RR2EG02TF
BS 653 653 RR2EG02JQ
BS 654 662 RR2EG02TF
BS 663 663 RR2EG02JQ
BS 664 693 RR2EG02TF
BS 694 1057 RR2EG02JQ

RD RR2EG02TF 699 0 0
ATTAATGGATGCCCTAGAGAGAAACTTTCTCAAGCTCGCATCCCAAGGTGCTGCTCCGAT
GGATCTCCCCAGCTCCAACCACACAGCTCCTCCCTCCTCTCTTTGAAGCTCTGTTTCTTA
CCACAGCCATGAACATGTCTACTCCTCCGTCGTGTCTCCGTCCCCCTCCAGATCCGCCAC
CGCCGCCGTCCTTTGGCTTGATGCAGCACTGCTCTTCCTCCTTGAAGATGATGGTGACAG
CTCTTCCTCTTTCTGCACAGCCCGGTCCTCTTCCGGATCCGCCGCCGAACAAGCACTTTC
CGGTTGAAACACTCTCTCCTGTCAAGCCACCAGAACCTCCAGACCCACCAGATGTTTCCG
TCAGCTTCATGCTACTCCGAATCTTCATTACTTTTTCCAGATCATCTCCAAAAAATACTC
AAATCCTAGATCTGATGTTGAATCTTTCAAGGGTATCAAGTCACATCCCTGTCAATGTTT
TTTTCCTGTGGTATACAGGTTGTATCTTTGTTTGCTACAGAATGGCGTGGTCTTCTCATA
GTTCTTGTTCAAGCCTTCCTTGTAACCAAGCGGTTATAGACGTCCAGATCTGTCCAACTT
CCTCTAGAGTGGAGTACTTAATGGTAAATTGCAGATGTTTAGCTAGATTGGA*GATTGCT
CA*GAGATGATTCGCTCTCTGTACTATTCAAAG
CTCAGC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2EG02JQ 735 0 0
CAAGCCACCAGAACCTCCAGACCCACCAGATGTTTCCGTCAGCTTCATGCTACTCCGAAT
CTTCATTACTTTTTCCAGATCATCTCCAAAAAATACTCAAATCCTAGATCTGATGTTGAA
TCTTTCAAGGGTATCAAGTCACATCCCTGTCAATGTTTTTTTCCTGTGGTATACAGGTTG
TATCTTTGTTTGCTACAGAATGGCGTGGTCTTCTCATAGTTCTTGTTCAAGCCTTCCTTG
TAACCAAGCGGTTATAGACGTCCAGATCTGTCCAACTTCCTCTAGAGTGGAGTACTTAAT
GGTAAATTGCAGATGTTTAGCTAGATTGGAAGATTGCTCAAGAGATGATTCGCTCTCTGT
ACTATTCAAAGGCTCAGCATTCTGGTGTCACATAGCCCCTGCTATCCTTAGTGTTGTCGA
GATAAGAGGACGTCTCTGCAATGTGGATGCAGCTTGGGATGCCAAGTCTAGGCACTGCGA
CATCGGAGGCATCTTCTCGGGTGAGAATACCATCACCCTACCAAACCTTTGCGAGTCTCG
CAATCATGTATCATCAGCACTCATGGCTGAAGCCATTGCTGTCTGACCGTCTACTCAAAC
ATCCGATCCTTGGGAGTTCTCTCTGATTCTCTATCACTCATCAAGCTATTGAAGAATGGT
GGATTTCAGCCGAAACTTTTCGGTGTCATGTTTGATATCTATAACTACTTGTCTTATTTT
GATGTTATATCTTCT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL5563Contig1 1098 2 2 U
TTTTAGATAGATATCTCAGTATACAAATTGTTTTTTTAATGGTTAGTACATACCATTATT
TTGAATTGTACATTTTAGATAGAAAACAATTCATTTGCAATTAATAAACCGGTTTGATCA
TTGATAAGGTGTAGAGTAGCAATTGCTAAACCAATTACTCTGTAAGCCATCAACTGATAC
TATACTCCATAGGCAACGTTTAACAAACAATGCTAAACCGTTTAATAGATTGTTGCAATT
ACGAAAATGAATTTTATAGAAAAATTAAACTAATTAATCTGCATTCTACAAAATGGATAC
TATAATCCCAGGCCTTGGATTTATTTTGAAAAACGTCATAATGCGTTATATATGATATGA
GCACTTATCAATAATCAAAATTTCAGAGTTAGACCACGTGTGTAATTGTTACATTCATAG
TTTCTATAAATAAGGACCAAGTCCAACGAATGACATGGTTAGCATAGAAAAAAATAGTAA
GAAATTAATGGGTTAGAAAAGATGTAAAACTACTGTGTTTTGATTAGTGTTTTGATTAGT
GGCATTTAGTTGTAATTTTTGTGCAAAACCAAAGGGACATATCTAAATGTACTTCAGTTT
TAATAGTTTAGATTAGTCTGACTCATTATATTTACTTAATTATGACATTAAGTTAAATAA
CAGAAATATACATATAATCATCCGAGGAATAATGACTAATAAGCCTCCATGCAGTTTGAT
GATCCTGCTAATTAATGATACGTGCTAATATTTAATATAATATTAGCAGACGATTTATTG
CTTTTTTGTATGTATATGCTGTCTCTAAATCTAACTTCCTTCTCCATTTATCAGACTAGA
AAGAGATTTTTCAAGGAAGAGGAGAGAGACTAAGAAACTGAGAGTGAAAGAGGAAGTATA
TAAGTTTGTATAAGATGCAAGTACATAATTATTTATACAGTAATACATATTTAATCATAT
GATCATCGATGTCATCATGTCCGGTATTTTCTTCATGTACCGTTCTATCTTTTTTTTTGG
GGCTGAATCTCTTGGAAGAAAACTCAAATTAATTCGGGTAATGTGTCGCCATATCAATAT
CAGTGTCGTTCTCAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AG67TF U 1
AF RR2AG67JQ C 318
BS 1 682 RR2AG67TF
BS 683 1098 RR2AG67JQ

RD RR2AG67TF 682 0 0
TTTTAGATAGATATCTCAGTATACAAATTGTTTTTTTAATGGTTAGTACATACCATTATT
TTGAATTGTACATTTTAGATAGAAAACAATTCATTTGCAATTAATAAACCGGTTTGATCA
TTGATAAGGTGTAGAGTAGCAATTGCTAAACCAATTACTCTGTAAGCCATCAACTGATAC
TATACTCCATAGGCAACGTTTAACAAACAATGCTAAACCGTTTAATAGATTGTTGCAATT
ACGAAAATGAATTTTATAGAAAAATTAAACTAATTAATCTGCATTCTACAAAATGGATAC
TATAATCCCAGGCCTTGGATTTATTTTGAAAAACGTCATAATGCGTTATATATGATATGA
GCACTTATCAATAATCAAAATTTCAGAGTTAGACCACGTGTGTAATTGTTACATTCATAG
TTTCTATAAATAAGGACCAAGTCCAACGAATGACATGGTTAGCATAGAAAAAAATAGTAA
GAAATTAATGGGTTAGAAAAGATGTAAAACTACTGTGTTTTGATTAGTGTTTTGATTAGT
GGCATTTAGTTGTAATTTTTGTGCAAAACCAAAGGGACATATCTAAATGTACTTCAGTTT
TAATAGTTTAGATTAGTCTGACTCATTATATTTACTTAATTATGACATTAAGTTAAATAA
CAGAAATATACATATAATCATC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2AG67JQ 781 0 0
GATTTATTTTGAAAAACGTCATAATGCGTTATATATGATATGAGCACTTATCAATAATCA
AAATTTCAGAGTTAGACCACGTGTGTAATTGTTACATTCATAGTTTCTATAAATAAGGAC
CAAGTCCAACGAATGACATGGTTAGCATAGAAAAAAATAGTAAGAAATTAATGGGTTAGA
AAAGATGTAAAACTACTGTGTTTTGATTAGTGTTTTGATTAGTGGCATTTAGTTGTAATT
TTTGTGCAAAACCAAAGGGACATATCTAAATGTACTTCAGTTTTAATAGTTTAGATTAGT
CTGACTCATTATATTTACTTAATTATGACATTAAGTTAAATAACAGAAATATACATATAA
TCATCCGAGGAATAATGACTAATAAGCCTCCATGCAGTTTGATGATCCTGCTAATTAATG
ATACGTGCTAATATTTAATATAATATTAGCAGACGATTTATTGCTTTTTTGTATGTATAT
GCTGTCTCTAAATCTAACTTCCTTCTCCATTTATCAGACTAGAAAGAGATTTTTCAAGGA
AGAGGAGAGAGACTAAGAAACTGAGAGTGAAAGAGGAAGTATATAAGTTTGTATAAGATG
CAAGTACATAATTATTTATACAGTAATACATATTTAATCATATGATCATCGATGTCATCA
TGTCCGGTATTTTCTTCATGTACCGTTCTATCTTTTTTTTTGGGGCTGAATCTCTTGGAA
GAAAACTCAAATTAATTCGGGTAATGTGTCGCCATATCAATATCAGTGTCGTTCTCAGAT
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL5564Contig1 982 2 2 U
GAACAGAAGACGGAACTCGACGGGAAAGTAACTGACTCGAGCAGTTACGGCGGTTGAGAG
TTCTTCACTACCAACGATTATGGCGGAAGAGGAGAATCTCGATCCTAACACCACGAGCCT
TATCCGTTTAGAGAAGCATGTTCCGGCGATTAAGGCTATCTGCGGCGGCGGTGAAGGTCC
GTCGAAGGAGAAAGGGATCAAGAAATCGAGATCAACCAGCGCAATCGAGCCTTCGCACTC
CTTCCAGAACTCGTGGACATTCTGGTTCGATAATCCATCGTCTAAATCGAATCAAGCCAC
ATGGGGAAGTTCTTTGAGATCCTTGTACACTTTCGCTACTATCGAGGAGTTCTGGAGTCT
TTACAATAACATGCATCCACCAACCAAGTGTGTTCATGGGGGAGATACCTACTGCTTCAA
AGATAAGATTGATCCCAAATGGGAAGATCCTGTTTGTGCTAATGGAGGAAAGTGGACTAT
GATGTTCCCTAAGGCTACACTCGAATCTAGCTGGCTTAACACGTTACTTGCGTTAGTTGG
GGAGCAATTTGAGCAAGGAGATGAGATTTGCGGGGCAGTACTGAATTTCAGAACGAGAGG
GGACAAGATCTCTTTATGGACAAAGAACGCTGCAAACAAGGAGGCTCAGCTAAGCATTGG
GAAGCAGTGGAAGGAACTTCTTGGTTACACAGAAACAATCGGCTTCATATTTCATGAGGA
TGCAAAGACTCTTGATCGTAATGCTAAACCTCAGTATACTGTATGAGTTCAAGTTCTACT
TTTCTCAGCTTCCCGTAAAGAAAAAGAAGACTCAAAAATGTAAGTAATATGAGAAAGTAT
ATTACCTGTAATTGCTTCTGATTTTATCTTTCACTGTAAAAAGATGCACATTTTGGGTTT
GAAGTCATCAGCGCTCTCTCACTTTCAAACTGGTGAAATGGGTTCTAATCAAATGTACAT
GACTTTTGCTTTTTCATAAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX32TF U 1
AF RR2BX32JQ C 270
BS 1 634 RR2BX32TF
BS 635 982 RR2BX32JQ

RD RR2BX32TF 634 0 0
GAACAGAAGACGGAACTCGACGGGAAAGTAACTGACTCGAGCAGTTACGGCGGTTGAGAG
TTCTTCACTACCAACGATTATGGCGGAAGAGGAGAATCTCGATCCTAACACCACGAGCCT
TATCCGTTTAGAGAAGCATGTTCCGGCGATTAAGGCTATCTGCGGCGGCGGTGAAGGTCC
GTCGAAGGAGAAAGGGATCAAGAAATCGAGATCAACCAGCGCAATCGAGCCTTCGCACTC
CTTCCAGAACTCGTGGACATTCTGGTTCGATAATCCATCGTCTAAATCGAATCAAGCCAC
ATGGGGAAGTTCTTTGAGATCCTTGTACACTTTCGCTACTATCGAGGAGTTCTGGAGTCT
TTACAATAACATGCATCCACCAACCAAGTGTGTTCATGGGGGAGATACCTACTGCTTCAA
AGATAAGATTGATCCCAAATGGGAAGATCCTGTTTGTGCTAATGGAGGAAAGTGGACTAT
GATGTTCCCTAAGGCTACACTCGAATCTAGCTGGCTTAACACGTTACTTGCGTTAGTTGG
GGAGCAATTTGAGCAAGGAGATGAGATTTGCGGGGCAGTACTGAATTTCAGAACGAGAGG
GGACAAGATCTCTTTATGGACAAAGAACGCTGCA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2BX32JQ 713 0 0
ATAATCCATCGTCTAAATCGAATCAAGCCACATGGGGAAGTTCTTTGAGATCCTTGTACA
CTTTCGCTACTATCGAGGAGTTCTGGAGTCTTTACAATAACATGCATCCACCAACCAAGT
GTGTTCATGGGGGAGATACCTACTGCTTCAAAGATAAGATTGATCCCAAATGGGAAGATC
CTGTTTGTGCTAATGGAGGAAAGTGGACTATGATGTTCCCTAAGGCTACACTCGAATCTA
GCTGGCTTAACACGTTACTTGCGTTAGTTGGGGAGCAATTTGAGCAAGGAGATGAGATTT
GCGGGGCAGTACTGAATTTCAGAACGAGAGGGGACAAGATCTCTTTATGGACAAAGAACG
CTGCAAACAAGGAGGCTCAGCTAAGCATTGGGAAGCAGTGGAAGGAACTTCTTGGTTACA
CAGAAACAATCGGCTTCATATTTCATGAGGATGCAAAGACTCTTGATCGTAATGCTAAAC
CTCAGTATACTGTATGAGTTCAAGTTCTACTTTTCTCAGCTTCCCGTAAAGAAAAAGAAG
ACTCAAAAATGTAAGTAATATGAGAAAGTATATTACCTGTAATTGCTTCTGATTTTATCT
TTCACTGTAAAAAGATGCACATTTTGGGTTTGAAGTCATCAGCGCTCTCTCACTTTCAAA
CTGGTGAAATGGGTTCTAATCAAATGTACATGACTTTTGCTTTTTCATAAAGA

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL5565Contig1 921 2 6 U
GATACTTCTGGAGGTACTGTTAAAGATTTGGATCCTTTAGAAGTTACCGATCCAGATTTT
TGTGACTTCAACAAGGATCGGACTGAAAGGTCATTTAGTGATAACCAGATATGGGCTTGT
TACGACTCTTTAGATGGGATGCCTCGAGGTTATGTCATGATAGACAAGGTTATCTCCGTG
GATCCGTTTAAAGTGTGTGTCGTTCAGATTACTTCAGACACAAACAGTGAGCTTAGGACA
ACAAAGTGGCTTGGCTTTGGTGTTTCAAAAGCTTGTGGAGATTTCAGAGCTGGTAAAACC
CAAATCTGCAGGTCACCTTACATTTTCTCACACAAAGTGGAGCTGGTCAAAGGCAATCAC
GGGGAGTTTCTTATATATCCTAGAAGAGGCGATGTATGGGCTCTGTATAGGAACTGGTCT
CATGAGTGGAACTATCTTACAGGAGGGGAAGCAATAGAGTATGATGTGGTCGAAGTAGTT
GAAGGGTATACAGAGGAGTATGGTGTTTCAGTGGTTCCTTTGATGAAAGTTGCCGGTTTC
AAATCAGTTTTTCACCATCATTTGGATCCCAAAGATGTCAGGAGGATCTCGAGGGATGAG
TTATCAAGATTCTCTCATCGGATACCATCGTACTTGCTCACAGGTCGAGAAGCGCCCGGT
GCACCCAGAGGTTGCATACAACTCGACCCGGCAGCAACACCATCACAGCTTCTTCAAGTT
ATAGATATGTGATTGTATGACTTAATTGTATCCTTTGGTAATGTAGTTTACCTATAACGA
ACCGTTATGATGTTTTGTTTCTAATTTATCGGTAACAGAGTGCTGGTCCGGATGACATAC
CTATGAGACGCTGGGGTGGGAATGTGGGTATCCCACTTTTATGTGGCCCATAATTTTTTA
AATATTAAAAGTATTACACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO49TF U 1
AF RR2CO49JQ C 151
BS 1 670 RR2CO49TF
BS 671 671 RR2CO49JQ
BS 672 716 RR2CO49TF
BS 717 717 RR2CO49JQ
BS 718 750 RR2CO49TF
BS 751 921 RR2CO49JQ

RD RR2CO49TF 750 0 0
GATACTTCTGGAGGTACTGTTAAAGATTTGGATCCTTTAGAAGTTACCGATCCAGATTTT
TGTGACTTCAACAAGGATCGGACTGAAAGGTCATTTAGTGATAACCAGATATGGGCTTGT
TACGACTCTTTAGATGGGATGCCTCGAGGTTATGTCATGATAGACAAGGTTATCTCCGTG
GATCCGTTTAAAGTGTGTGTCGTTCAGATTACTTCAGACACAAACAGTGAGCTTAGGACA
ACAAAGTGGCTTGGCTTTGGTGTTTCAAAAGCTTGTGGAGATTTCAGAGCTGGTAAAACC
CAAATCTGCAGGTCACCTTACATTTTCTCACACAAAGTGGAGCTGGTCAAAGGCAATCAC
GGGGAGTTTCTTATATATCCTAGAAGAGGCGATGTATGGGCTCTGTATAGGAACTGGTCT
CATGAGTGGAACTATCTTACAGGAGGGGAAGCAATAGAGTATGATGTGGTCGAAGTAGTT
GAAGGGTATACAGAGGAGTATGGTGTTTCAGTGGTTCCTTTGATGAAAGTTGCCGGTTTC
AAATCAGTTTTTCACCATCATTTGGATCCCAAAGATGTCAGGAGGATCTCGAGGGATGAG
TTATCAAGATTCTCTCATCGGATACCATCGTACTTGCTCACAGGTCGAGAAGCGCCCGGT
GCACCCAGAG*TTGCATACAACTCGACCCGGCAGCAACACCATCACAGCTTCTTCA*GTT
ATAGATATGTGATTGTATGACTTAATTGTA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2CO49JQ 771 0 0
TATGTCATGATAGACAAGGTTATCTCCGTGGATCCGTTTAAAGTGTGTGTCGTTCAGATT
ACTTCAGACACAAACAGTGAGCTTAGGACAACAAAGTGGCTTGGCTTTGGTGTTTCAAAA
GCTTGTGGAGATTTCAGAGCTGGTAAAACCCAAATCTGCAGGTCACCTTACATTTTCTCA
CACAAAGTGGAGCTGGTCAAAGGCAATCACGGGGAGTTTCTTATATATCCTAGAAGAGGC
GATGTATGGGCTCTGTATAGGAACTGGTCTCATGAGTGGAACTATCTTACAGGAGGGGAA
GCAATAGAGTATGATGTGGTCGAAGTAGTTGAAGGGTATACAGAGGAGTATGGTGTTTCA
GTGGTTCCTTTGATGAAAGTTGCCGGTTTCAAATCAGTTTTTCACCATCATTTGGATCCC
AAAGATGTCAGGAGGATCTCGAGGGATGAGTTATCAAGATTCTCTCATCGGATACCATCG
TACTTGCTCACAGGTCGAGAAGCGCCCGGTGCACCCAGAGGTTGCATACAACTCGACCCG
GCAGCAACACCATCACAGCTTCTTCAAGTTATAGATATGTGATTGTATGACTTAATTGTA
TCCTTTGGTAATGTAGTTTACCTATAACGAACCGTTATGATGTTTTGTTTCTAATTTATC
GGTAACAGAGTGCTGGTCCGGATGACATACCTATGAGACGCTGGGGTGGGAATGTGGGTA
TCCCACTTTTATGTGGCCCATAATTTTTTAAATATTAAAAGTATTACACCG

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL5566Contig1 839 2 2 U
GCTTGCATGACCAGATATACTTTGTGGTCCGAACGGCATCTGGTCCTAGTCTTAACTTTA
TGTACTTGGACGAGAACAAATCGTTGATTCTGAAGATAGTTGAATCTCAAAACTCGGGAA
AGCTCAGCGAGTGTGCCGAGAACCAGGCAAGGCTTCAACGCAACCTAATGTACTTAGCTG
CAATTGCAGATTCTCAGCCTCAACCTCCCAGCATGCATAGCCAGTATGGATCTGGTGGTG
GTGGGTTGGTTCAGGGAGAAGGAGGGTCACACTATTTGCAGCAGCAACAGGCAACTCAAC
ATCAGCAGCAGATGACTCAACAGTCTCTAATGGCGGCTCGTACTTCTTCAATGATGTATG
CTCAGCAGCAGCAGCAACAGCCTTATGCAACACTTCAGCATCAGCAATTGCACCATAGCC
AGCTAGGGATGAGCTCAACCAGCGGAGGAGGAAGCAGCGGTCTCCATTTCCTTCAGGGAG
AGGCTGGTGGGTTTCATGAGTTTGGTCGTGGGAAGTTGGAAATGGGAAGTGGTGAAGGCA
GAGGAGGAAGCTCAGGAGATGGTGGAGAAACCCTTTACTTGAAATCATCAGATGATGGGA
ACTGAAAAGAGTGTATCACAAGGAATCAAAATGATGAAGTTAGTAACAGTAAGAGTTGAA
GCTATTGTGTTTTGTTTAAGTTGCTTGTTGAAGAAGAAAAGTACTCTTATTTACATGTTT
GTGGTTTTTTGTATTTTCTTTATGTTTGTTCCCTAAAAAAGTGAACTCTTTCGTGGTAGT
GTACCATGTAAATCTGCTCGCTCTATGTTGTGTCGTATAATCTTAGTATGTTATTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE87TF U 1
AF RR2BE87JQ C 324
BS 1 691 RR2BE87TF
BS 692 839 RR2BE87JQ

RD RR2BE87TF 691 0 0
GCTTGCATGACCAGATATACTTTGTGGTCCGAACGGCATCTGGTCCTAGTCTTAACTTTA
TGTACTTGGACGAGAACAAATCGTTGATTCTGAAGATAGTTGAATCTCAAAACTCGGGAA
AGCTCAGCGAGTGTGCCGAGAACCAGGCAAGGCTTCAACGCAACCTAATGTACTTAGCTG
CAATTGCAGATTCTCAGCCTCAACCTCCCAGCATGCATAGCCAGTATGGATCTGGTGGTG
GTGGGTTGGTTCAGGGAGAAGGAGGGTCACACTATTTGCAGCAGCAACAGGCAACTCAAC
ATCAGCAGCAGATGACTCAACAGTCTCTAATGGCGGCTCGTACTTCTTCAATGATGTATG
CTCAGCAGCAGCAGCAACAGCCTTATGCAACACTTCAGCATCAGCAATTGCACCATAGCC
AGCTAGGGATGAGCTCAACCAGCGGAGGAGGAAGCAGCGGTCTCCATTTCCTTCAGGGAG
AGGCTGGTGGGTTTCATGAGTTTGGTCGTGGGAAGTTGGAAATGGGAAGTGGTGAAGGCA
GAGGAGGAAGCTCAGGAGATGGTGGAGAAACCCTTTACTTGAAATCATCAGATGATGGGA
ACTGAAAAGAGTGTATCACAAGGAATCAAAATGATGAAGTTAGTAACAGTAAGAGTTGAA
GCTATTGTGTTTTGTTTAAGTTGCTTGTTGA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2BE87JQ 516 0 0
TCTCTAATGGCGGCTCGTACTTCTTCAATGATGTATGCTCAGCAGCAGCAGCAACAGCCT
TATGCAACACTTCAGCATCAGCAATTGCACCATAGCCAGCTAGGGATGAGCTCAACCAGC
GGAGGAGGAAGCAGCGGTCTCCATTTCCTTCAGGGAGAGGCTGGTGGGTTTCATGAGTTT
GGTCGTGGGAAGTTGGAAATGGGAAGTGGTGAAGGCAGAGGAGGAAGCTCAGGAGATGGT
GGAGAAACCCTTTACTTGAAATCATCAGATGATGGGAACTGAAAAGAGTGTATCACAAGG
AATCAAAATGATGAAGTTAGTAACAGTAAGAGTTGAAGCTATTGTGTTTTGTTTAAGTTG
CTTGTTGAAGAAGAAAAGTACTCTTATTTACATGTTTGTGGTTTTTTGTATTTTCTTTAT
GTTTGTTCCCTAAAAAAGTGAACTCTTTCGTGGTAGTGTACCATGTAAATCTGCTCGCTC
TATGTTGTGTCGTATAATCTTAGTATGTTATTTCCC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL5567Contig1 852 2 15 U
ATCTCGACACTTCAAAGACCTTACAACAGAGAATGTCATCAACTTTACATGAAGCATTCA
CTCGAAGGGGATGCACCATTTTACCAGTAACATAAAAATACAAACAAACAAACAGTAGAT
ATCATAGTACAGCTCCACATATCAGTGTTACTACTTTGTCCGGGTTCGATACATTCGTCC
CATATCACAAGTCGCTACAACAAATCACCAGATAAATGAAGTCGAGGTGTCTGATCTTCG
AACTAAACCCACCTCAAGCAAAAGCCATATGCTGGAAAAAAACACAGGAAACGGAAAAGG
TGATGATGACCTGCTCTTGCTGAAACGCCAGGCCCTTAAATAAAATCTAATGAAACCAGT
GGGTGATAGAGAGATTCATTGACTAAAAGTGAAATTGACTCGTCACTGATACAGAGTCGC
GGCTAGAGTTGGAATCCTTGCTCTTTAAGGAAAGACTCGAGAACTGAAAGTCAAGATCTT
TGCTACTGGCACGTTTGTGAGTTGCTGATAGTTGTTGAGTTTGTTTCTGTTGCTGCTGCT
GATACAGAGCTCGTAGTCTTCCAATCTCCTTTTCCAACAACTCCTGTTCCAATTGTTTGA
TCAGCTTCTCCTGAGCAATACTTTCTAGACGCTGCTTAAGAGCTTTATTTTCCATACTCA
GAATAAGATTCCTCTGATTGAGAAAGTCAAGATCAGCTGAAACCTTTGAGCCTTCTGCCT
GCAATGCTTGCACAGTCCTTTCTAATTCAGATATGTACTGAAGCTTACGGACCCGCGATC
GTTGTGCAAATTGCTGTTTGGCACGTCTTGTATTGTCAGCATCACTAGTCCCAGGCTGAG
TATTGGAGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT80JQ U 141
AF RR2G370JQ U 1
BS 1 343 RR2G370JQ
BS 344 344 RR2FT80JQ
BS 345 354 RR2G370JQ
BS 355 355 RR2FT80JQ
BS 356 365 RR2G370JQ
BS 366 366 RR2FT80JQ
BS 367 442 RR2G370JQ
BS 443 443 RR2FT80JQ
BS 444 466 RR2G370JQ
BS 467 468 RR2FT80JQ
BS 469 509 RR2G370JQ
BS 510 510 RR2FT80JQ
BS 511 524 RR2G370JQ
BS 525 527 RR2FT80JQ
BS 528 852 RR2G370JQ

RD RR2FT80JQ 414 0 0
ATCAGTGTTACTACTTTGTCCGGGTTCGATACATTCGTCCCATATCACAAGTCGCTACAA
CAAATCACCAGATAAATGAAGTCGAGGTGTCTGATCTTCGAACTAAACCCACCTCAAGCA
AAAGCCATATGCTGGAAAAAAACACAGGAAACGGAAAAGGTGATGATGACCTGCTCTTGC
TGAAACGCCAGGCCCTTAAATAAAATCTAATGAAACCAGTGGGTGATAGAGAGATTCATT
GACTAAAAGTGAAATTGACTCGTCACTGATACAGAGTCGCGGCTAGAGTTGGAATCCTTG
CTCTTTAAGGAAAGACTCGAGAACTGAAAGTCAAGATCTTTGCTACTGGCACGTTTGTGA
GTTGCTGATAGTTGTTGAGTTTGTTTCTGTTGCTGCTGCTGATACAGAGC
ACGT

QA 1 410 1 410
DS 

RD RR2G370JQ 852 0 0
ATCTCGACACTTCAAAGACCTTACAACAGAGAATGTCATCAACTTTACATGAAGCATTCA
CTCGAAGGGGATGCACCATTTTACCAGTAACATAAAAATACAAACAAACAAACAGTAGAT
ATCATAGTACAGCTCCACATATCAGTGTTACTACTTTGTCCGGGTTCGATACATTCGTCC
CATATCACAAGTCGCTACAACAAATCACCAGATAAATGAAGTCGAGGTGTCTGATCTTCG
AACTAAACCCACCTCAAGCAAAAGCCATATGCTGGAAAAAAACACAGGAAACGGAAAAGG
TGATGATGACCTGCTCTTGCTGAAACGCCAGGCCCTTAAATAAGATCTAATGAA*CCAGT
GGGTGGTAGAGAGATTCATTGACTAAAAGTGAAATTGACTCGTCACTGATACAGAGTCGC
GGCTAGAGTTGGAATCCTTGCTGTTTAAGGAAAGACTCGAGAACTGGGAGTCAAGATCTT
TGCTACTGGCACGTTTGTGAGTTGCTGATGGTTGTTGAGTTTGT***TGTTGCTGCTGCT
GATACAGAGCTCGTAGTCTTCCAATCTCCTTTTCCAACAACTCCTGTTCCAATTGTTTGA
TCAGCTTCTCCTGAGCAATACTTTCTAGACGCTGCTTAAGAGCTTTATTTTCCATACTCA
GAATAAGATTCCTCTGATTGAGAAAGTCAAGATCAGCTGAAACCTTTGAGCCTTCTGCCT
GCAATGCTTGCACAGTCCTTTCTAATTCAGATATGTACTGAAGCTTACGGACCCGCGATC
GTTGTGCAAATTGCTGTTTGGCACGTCTTGTATTGTCAGCATCACTAGTCCCAGGCTGAG
TATTGGAGTTTT

QA 1 852 1 852
DS 



AS 1 2

CO CL5568Contig1 1096 2 8 U
GGACCCGCGAAGATCAATACACAAATCTAACTCAAGAAATTTTTTTAAAAAATTCGAAGT
ATTCTCTCCGATGAATAACGATTCTCTAGGAGTGTTTCTATATTAAACTCCGTCTTTCAT
TTTGATCTTGTTTTTAAGTATTTAAGTTCTTAATTTCCTGTTTCTTGATCTGTTTTTTTT
TTTTTCAAAACGATGGGACTTTGCCTCTGTTTGTTAGCAACTCCGGCGACATTGTTGTGG
ACAACGAGTTTCTTCCGCCACAAATTCTTGATTTTCTAACGCATTGTTTCGTCACATAAT
CCACTTAGATTCACATTTTAGGTTTTTCATTTCTTCTTGTATTTTACTTTAAAGTTTAAA
CATCTCAATGTATCCAAAACACGATCAAGAATCAAGATCAAGATCGGCTCCAACAGGTGC
AATCAATAATCAACGGGCTGAGAAAAAGCGTCGTCTAACGTTTGAACAAGTGAATATGTT
GGAGAAGAGTTTTGAAGAAGACAACAAACTGGAACCAGAGAGAAAGACTGAGCTAGCTAA
AGTGCTTGGATTGCCTAAACGACAAGTTGCTGTTTGGTTTCAGAATCGAAAAGCTCGGTG
CAAGGTCAAGCAGATCGAAAGAGATTATGATGTTCTCAAGGCTTGTTATGATTCCCTACT
GGCTAAACATGAATTAGTCATCTCAGTGAATGAGAAACTCATATCTAAAGTCTTAACTTT
GACTAAGATGCTTCCTCCTGCAACAAACCAAACCCAAAGAAACTTCCAAGTCAAGCTTAA
CTCTAAAGGCGATGATGAAAGTATGAGCTCTTCCGCTGCTTTAGTTCCATTGGCAAATGA
CCATTACTTTACCAACGTTGATGAAACATTCGGCTGGTGGGTTTGGCCATCGAATCTTAT
GTAAAAATCTGATGATCCAGGACCGATTTAAAGCGCAAGAGAGAGAGAGAGAGACTTAGT
ATTCCAAGCTTCTGTTCTAAACATGGGCAAATGTTGAATAGACTACAAAACATAGTGTTC
ATTAGAGAAATAAGAATGTTTCAAAAGCTACTACAATCACTATTTTAAATAAATATATCA
TATGGAAGTTTCTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H280TF U 1
AF RR2H280JQ C 348
BS 1 674 RR2H280TF
BS 675 675 RR2H280JQ
BS 676 708 RR2H280TF
BS 709 709 RR2H280JQ
BS 710 715 RR2H280TF
BS 716 716 RR2H280JQ
BS 717 729 RR2H280TF
BS 730 1096 RR2H280JQ

RD RR2H280TF 729 0 0
GGACCCGCGAAGATCAATACACAAATCTAACTCAAGAAATTTTTTTAAAAAATTCGAAGT
ATTCTCTCCGATGAATAACGATTCTCTAGGAGTGTTTCTATATTAAACTCCGTCTTTCAT
TTTGATCTTGTTTTTAAGTATTTAAGTTCTTAATTTCCTGTTTCTTGATCTGTTTTTTTT
TTTTTCAAAACGATGGGACTTTGCCTCTGTTTGTTAGCAACTCCGGCGACATTGTTGTGG
ACAACGAGTTTCTTCCGCCACAAATTCTTGATTTTCTAACGCATTGTTTCGTCACATAAT
CCACTTAGATTCACATTTTAGGTTTTTCATTTCTTCTTGTATTTTACTTTAAAGTTTAAA
CATCTCAATGTATCCAAAACACGATCAAGAATCAAGATCAAGATCGGCTCCAACAGGTGC
AATCAATAATCAACGGGCTGAGAAAAAGCGTCGTCTAACGTTTGAACAAGTGAATATGTT
GGAGAAGAGTTTTGAAGAAGACAACAAACTGGAACCAGAGAGAAAGACTGAGCTAGCTAA
AGTGCTTGGATTGCCTAAACGACAAGTTGCTGTTTGGTTTCAGAATCGAAAAGCTCGGTG
CAAGGTCAAGCAGATCGAAAGAGATTATGATGTTCTCAAGGCTTGTTATGATTCCCTACT
GGCTAAACATGAAT*AGTCATCTCAGTGAATGAGAAACTCATATCTAA*GTCTTA*CTTT
GACTAAGAT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2H280JQ 749 0 0
TTTAAAGTTTAAACATCTCAATGTATCCAAAACACGATCAAGAATCAAGATCAAGATCGG
CTCCAACAGGTGCAATCAATAATCAACGGGCTGAGAAAAAGCGTCGTCTAACGTTTGAAC
AAGTGAATATGTTGGAGAAGAGTTTTGAAGAAGACAACAAACTGGAACCAGAGAGAAAGA
CTGAGCTAGCTAAAGTGCTTGGATTGCCTAAACGACAAGTTGCTGTTTGGTTTCAGAATC
GAAAAGCTCGGTGCAAGGTCAAGCAGATCGAAAGAGATTATGATGTTCTCAAGGCTTGTT
ATGATTCCCTACTGGCTAAACATGAATTAGTCATCTCAGTGAATGAGAAACTCATATCTA
AAGTCTTAACTTTGACTAAGATGCTTCCTCCTGCAACAAACCAAACCCAAAGAAACTTCC
AAGTCAAGCTTAACTCTAAAGGCGATGATGAAAGTATGAGCTCTTCCGCTGCTTTAGTTC
CATTGGCAAATGACCATTACTTTACCAACGTTGATGAAACATTCGGCTGGTGGGTTTGGC
CATCGAATCTTATGTAAAAATCTGATGATCCAGGACCGATTTAAAGCGCAAGAGAGAGAG
AGAGAGACTTAGTATTCCAAGCTTCTGTTCTAAACATGGGCAAATGTTGAATAGACTACA
AAACATAGTGTTCATTAGAGAAATAAGAATGTTTCAAAAGCTACTACAATCACTATTTTA
AATAAATATATCATATGGAAGTTTCTACT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL5569Contig1 1013 2 4 U
GGGACGATACCCCTCGGAGCAGCTCTACATGTCCCAGCAAATCTCTTGTCGAGCTGCAAC
AAAACTTGATACAACCTGGACATGGCTTATCTCGGAAGAGAATCAATGGTGGAATAAACG
TAGGCCTCATCAACGAGATTTCAATAGAATCTCTGGAGTACAGGAGGGACTTGCTTTTTC
CGTTTTCACTTTTATTAAACAATACCCGACCCGTTGGTCGTCAGGATACTCTTCTACGTT
TGATATCCATCCTTCTTCTTGCGGATCTTTCAGTTACGCTCCTTGCGTTGCTTCAATTCT
ATTGGCTTGCCCTTGCAGCCTTTCTAGCTATCCTCCTGATTCTCCCCCTCGCTCTGCTTT
GCCCATTCCCGGCTGGCCTTAACGCTTTATTAAGTAGAGAAATGAGAAGAGCCTCACTTA
CTCGTATCTACGCCCTTTGGAACGCGACATCTCTAACAAACGTCATTGTGGCTTTCATTT
GCGGTGTCATTCATTCTGGTTTTTTCTCTGACCAACTAAGTGAGATGACAAACATCTGGG
ACGCTATTAGAGATGATGATAAGTGGGTGGGTGTTACCAACAGTCCTCTTGTTACTCAAG
TCGATTCAAGCTCGATTCCTTGACTGGCACGTCGCAAATCTGGAAGTACCAGACTTTTCT
CTTCTTTGTCCCGATCCAGATACTTTCTGGGCATATGAATCTGGAGCTTGACGATCCAAA
GACAAAAAAAAAGAAGAGTTGGGTATATCTTATTTTTCATGTAAATCTGGTTAAAAAAAG
CACAACTTGTCAGTGTTAGGTGTTATCTGGTTTTTATTTCTGGAGTAAACTTAGGGTTTT
TGCAAGAAGAAAATGGTAGTTTAAGAAACTAAAGAGAGCGAGAGAATGCGAGTTATGTGA
TTGCTTAGAGTTTTGCAACAACGTAAATGTTTTAGATGGATCTACCTGTGTTACATTCAG
TTTTCTTTGGGTAACTATTTTTTTCTGAACAGAACAATGAAAAAACATCGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK47TF U 1
AF RR2BK47JQ C 278
BS 1 637 RR2BK47TF
BS 638 638 RR2BK47JQ
BS 639 662 RR2BK47TF
BS 663 1013 RR2BK47JQ

RD RR2BK47TF 662 0 0
GGGACGATACCCCTCGGAGCAGCTCTACATGTCCCAGCAAATCTCTTGTCGAGCTGCAAC
AAAACTTGATACAACCTGGACATGGCTTATCTCGGAAGAGAATCAATGGTGGAATAAACG
TAGGCCTCATCAACGAGATTTCAATAGAATCTCTGGAGTACAGGAGGGACTTGCTTTTTC
CGTTTTCACTTTTATTAAACAATACCCGACCCGTTGGTCGTCAGGATACTCTTCTACGTT
TGATATCCATCCTTCTTCTTGCGGATCTTTCAGTTACGCTCCTTGCGTTGCTTCAATTCT
ATTGGCTTGCCCTTGCAGCCTTTCTAGCTATCCTCCTGATTCTCCCCCTCGCTCTGCTTT
GCCCATTCCCGGCTGGCCTTAACGCTTTATTAAGTAGAGAAATGAGAAGAGCCTCACTTA
CTCGTATCTACGCCCTTTGGAACGCGACATCTCTAACAAACGTCATTGTGGCTTTCATTT
GCGGTGTCATTCATTCTGGTTTTTTCTCTGACCAACTAAGTGAGATGACAAACATCTGGG
ACGCTATTAGAGATGATGATAAGTGGGTGGGTGTTACCAACAGTCCTCTTGTTACTCAAG
TCGATTCAAGCTCGATTCCTTGACTGGCACGTCGCAA*TCTGGAAGTACCAGACTTTTCT
CT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2BK47JQ 736 0 0
GCTCCTTGCGT*GCTTCAATTCTATTGGCTTGCCCTTGCAGCCTTTCTAGCTATCCTCCT
GATTCTCCCCCTCGCTCTGCTTTGCCCATTCCCGGCTGGCCTTAACGCTTTATTAAGTAG
AGAAATGAGAAGAGCCTCACTTACTCGTATTTACGCCCTTTGGAACGCGACATCTCTAAC
AAACGTCATTGTGGCTTTCATTTGCGGTGTCATTCATTCTGGTTTTTTCTCTGACCAACT
AAGTGAGATGACAAACATCTGGGACGCTATTAGAGATGATGATAAGTGG*TGGGTGTTAC
CAACAGTCCTCTTGTTACTCAAGTCGATTCAAGCTCGATTCCTTGACTGGCACGTCGCAA
ATCTGGAAGTACCAGACTTTTCTCTTCTTTGTCCCGATCCAGATACTTTCTGGGCATATG
AATCTGGAGCTTGACGATCCAAAGACAAAAAAAAAGAAGAGTTGGGTATATCTTATTTTT
CATGTAAATCTGGTTAAAAAAAGCACAACTTGTCAGTGTTAGGTGTTATCTGGTTTTTAT
TTCTGGAGTAAACTTAGGGTTTTTGCAAGAAGAAAATGGTAGTTTAAGAAACTAAAGAGA
GCGAGAGAATGCGAGTTATGTGATTGCTTAGAGTTTTGCAACAACGTAAATGTTTTAGAT
GGATCTACCTGTGTTACATTCAGTTTTCTTTGGGTAACTATTTTTTTCTGAACAGAACAA
TGAAAAAACATCGATC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL5570Contig1 1171 2 6 U
GAAAACAAAAAGTTAGATTCATAATCTTTCGCCAGAAGCCCTAGCCGTCTCGTTCAACTT
TTCAGATCTTCCACCTTCCTCGGTGGTTTGGCTTCGCCACCGCCGAGGGAGGATCTTTAT
CCTTTTTCCACCTTTTTTTTAAGGCTTTTCCTGATATCTACGATCTATCAAAGGTGTGGC
AATGTTGGGGTAGTCGTCGGTGGTCTTGGTATGGATTTCCGATGCTCAGAGTAGAAACCA
TTCCTCACGAGATGCGTATGGCGCCGTATTGCTCTCCTTTGTTGATCTATGGTTGTTTCT
TCAACCTTGTTTTCGTTTTTTATGGATGCTTTGAGTGGTGTTTACTCTACGAAAGTTTGG
CATCATCTAGAATATTGTAGCGTGTTGTTGGTGCTCGTGAGCACGGGCCTCATAGCTGAA
TCTTCCAGCTTTGCTGTGATGCCACAAACTGTGATGTGGAATATGCGATACCTCTCTCCA
TGTCTGGCCTCTGTGTTTGAGGTTGTGCGCCCTTGCCTCGGTTTCACCTGCTCGGGTCTG
TATGTGCTTTGTTTTTTATATTTTATCTAGTGGTTCTTGGTTGATTAAGCTAGTTGTGGT
TCTGCTTCATGGTGTTTTTGGAAGTTTCTAATGGTGGGGAAAGAGAAGACTATCTTCACA
GAATTAAGACATGTTTCTGTCGACAGAATTTTCTTCACGTCAAGCTGAGCTCTACTCAAG
CTGCTAGTGTAGATAAAAGCAGGGCATCTAGTTGTGAAGTAAAATGAACTTTGGACAGTG
CAGTCTAATTGTATTTCAAGAAATTTTTGTTTGGGATAGTTTGTATGCTTGGTCCCTGGA
GTATGCTCAAGCAAGTAGGAATGTGATAGCTTTGAAATTGCAGTGTTACCATTGACCAAA
GGTACCAATCGTACGCCAACAATGGTCCTCACTGGCTCCTCCCTCTAATCTCTGCAGAAG
CTGTATCACTGCATACATGATCTGGAAAAGGTACCCCCCCGAATTCCACCTATATTGAGG
GTGTGAATGGGTTTGTCTTCGTGTACTATTTCTTGGAGTAATAGCCTTCATATATATTGG
CTATTTTCTTTTCATGCCTATTGGTGTGTATTAATTTTTTGTAGCAACATTATGCAAGTT
TTGCCTTGATCGCTTTATAACATTCAGCGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC81TF U 1
AF RR2BC81JQ C 446
BS 1 743 RR2BC81TF
BS 744 744 RR2BC81JQ
BS 745 798 RR2BC81TF
BS 799 799 RR2BC81JQ
BS 800 821 RR2BC81TF
BS 822 1171 RR2BC81JQ

RD RR2BC81TF 821 0 0
GAAAACAAAAAGTTAGATTCATAATCTTTCGCCAGAAGCCCTAGCCGTCTCGTTCAACTT
TTCAGATCTTCCACCTTCCTCGGTGGTTTGGCTTCGCCACCGCCGAGGGAGGATCTTTAT
CCTTTTTCCACCTTTTTTTTAAGGCTTTTCCTGATATCTACGATCTATCAAAGGTGTGGC
AATGTTGGGGTAGTCGTCGGTGGTCTTGGTATGGATTTCCGATGCTCAGAGTAGAAACCA
TTCCTCACGAGATGCGTATGGCGCCGTATTGCTCTCCTTTGTTGATCTATGGTTGTTTCT
TCAACCTTGTTTTCGTTTTTTATGGATGCTTTGAGTGGTGTTTACTCTACGAAAGTTTGG
CATCATCTAGAATATTGTAGCGTGTTGTTGGTGCTCGTGAGCACGGGCCTCATAGCTGAA
TCTTCCAGCTTTGCTGTGATGCCACAAACTGTGATGTGGAATATGCGATACCTCTCTCCA
TGTCTGGCCTCTGTGTTTGAGGTTGTGCGCCCTTGCCTCGGTTTCACCTGCTCGGGTCTG
TATGTGCTTTGTTTTTTATATTTTATCTAGTGGTTCTTGGTTGATTAAGCTAGTTGTGGT
TCTGCTTCATGGTGTTTTTGGAAGTTTCTAATGGTGGGGAAAGAGAAGACTATCTTCACA
GAATTAAGACATGTTTCTGTCGACAGAATTTTCTTCACGTCAAGCTGAGCTCTACTCAAG
CTGCTAGTGTAGATAAAAGCAGG*CATCTAGTTGTGAAGTAAAATGAACTTTGGACAGTG
CAGTCTAATTGTATTTCA*GAAATTTTTGTTTGGGATAGTT

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR2BC81JQ 726 0 0
AAACTGTGATGTGGAATATGCGATACCTCTCTCCATGTCTGGCCTCTGTGTTTGAGGTTG
TGCGCCCTTGCCTCGGTTTCACCTGCTCGGGTCTGTATGTGCTTTGTTTTTTATATTTTA
TCTAGTGGTTCTTGGTTGATTAAGCTAGTTGTGGTTCTGCTTCATGGTGTTTTTGGAAGT
TTCTAATGGTGGGGAAAGAGAAGACTATCTTCACAGAATTAAGACATGTTTCTGTCGACA
GAATTTTCTTCACGTCAAGCTGAGCTCTACTCAAGCTGCTAGTGTAGATAAAAGCAGGGC
ATCTAGTTGTGAAGTAAAATGAACTTTGGACAGTGCAGTCTAATTGTATTTCAAGAAATT
TTTGTTTGGGATAGTTTGTATGCTTGGTCCCTGGAGTATGCTCAAGCAAGTAGGAATGTG
ATAGCTTTGAAATTGCAGTGTTACCATTGACCAAAGGTACCAATCGTACGCCAACAATGG
TCCTCACTGGCTCCTCCCTCTAATCTCTGCAGAAGCTGTATCACTGCATACATGATCTGG
AAAAGGTACCCCCCCGAATTCCACCTATATTGAGGGTGTGAATGGGTTTGTCTTCGTGTA
CTATTTCTTGGAGTAATAGCCTTCATATATATTGGCTATTTTCTTTTCATGCCTATTGGT
GTGTATTAATTTTTTGTAGCAACATTATGCAAGTTTTGCCTTGATCGCTTTATAACATTC
AGCGTT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL5571Contig1 983 2 4 U
GGGCACACACAAGATCCAATATGGAAGAAGTAAGCACCACGATCATCATGACGTCACTCT
CTACTCTTTCTCCTTCACACCTCACGAGTCTTACTCACACCATTCTTTCTCTCTCCCACC
ACCATCGCCGTCGTCTCACCTCCGTCCTCTCCTCTCCGACGCTTTTCTCCCTCACTCTCC
GCCACCTCCTTTCTCTCTCCCTTCCTCAAAAGACCCTCCTCATCGCTACTCACCTCCTTT
CTCTTCTCCACCCTCTCCTACTCAACCGCAACCACCACCACTCTCTCCCCTCCTCTGCCG
CCTTTATGAAGCTCCGGGACCTCGACGCGGTGGTGCTTCTCCTCTTTCTCTGCGAAACGC
ACCAGCTAGATCCAGATGTTCTAGAAGCTTCAGCTGATAACTGGCGGGAAATCCTCGGTG
CTATGTGTTCTGATTCTATGTTAAACAGTGTCTCCGGTCTATGGACATGCGACGCAGGAA
TCTTGATGCCTTACATAGAATCCCTAGTTCGATGCAAAAGATTCGTCGACATAATGGGAG
GCTACAACACCACCGTCGTCTAAGAGGAGAGAAAGAAGGATATGAGGTCCCAGCGGCTAG
AGCGGCTGTGGTGGCGCTACTTGCTGTTGAGGTGTCTAATGCAACCGGTTTGAACTCCGG
AGAAGTAGAATGCGTGATATGCAAGGAAGAGATTAGTGAAGGAAGAGATGTTTGTGAAAT
GCCATGTCAGCATTTGTTCCATTGGAAGTGTATCTTGCCATGGCTTAGCAAGAGGAACAC
GTGTCCTTTCTGTAGGTTTCAGCTTCCCACCGACGATGTTTTCTCCGAGATCCAACGGCT
GTGGGAGATCCTCGTCAAGACCACTGAGTTACACGTGGCGTGATTAATACACGTGCATAT
TGTTATTTATACTAGATGTGTCAAGTACTATAATCAAATAGGAATGTTTGGACCGTTTCG
ATCTATAGAATTTATGTTAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E002TF U 1
AF RR2E002JQ C 526
BS 1 631 RR2E002TF
BS 632 632 RR2E002JQ
BS 633 685 RR2E002TF
BS 686 983 RR2E002JQ

RD RR2E002TF 688 0 0
GGGCACACACAAGATCCAATATGGAAGAAGTAAGCACCACGATCATCATGACGTCACTCT
CTACTCTTTCTCCTTCACACCTCACGAGTCTTACTCACACCATTCTTTCTCTCTCCCACC
ACCATCGCCGTCGTCTCACCTCCGTCCTCTCCTCTCCGACGCTTTTCTCCCTCACTCTCC
GCCACCTCCTTTCTCTCTCCCTTCCTCAAAAGACCCTCCTCATCGCTACTCACCTCCTTT
CTCTTCTCCACCCTCTCCTACTCAACCGCAACCACCACCACTCTCTCCCCTCCTCTGCCG
CCTTTATGAAGCTCCGGGACCTCGACGCGGTGGTGCTTCTCCTCTTTCTCTGCGAAACGC
ACCAGCTAGATCCAGATGTTCTAGAAGCTTCAGCTGATAACTGGCGGGAAATCCTCGGTG
CTATGTGTTCTGATTCTATGTTAAACAGTGTCTCCGGTCTATGGACATGCGACGCAGGAA
TCTTGATGCCTTACATAGAATCCCTAGTTCGATGCAAAAGATTCGTCGACATAATGGGAG
GCTACAACACCACCGTCGTCTAAGAGGAGAGAAAGAAGGATATGAGGTCCCAGCGGCTAG
AGCGGCTGTGGTGGCGCTACTTGCTGTTGAG*TGTCTAATGCAACCGGTTTGAACTCCGG
AGAAGTAGAATGCGTGATATGCAAG
AAG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2E002JQ 458 0 0
TCGACATAATGGGAGGCTACAACACCACCGTCGTCTAAGAGGAGAGAAAGAAGGATATGA
GGTCCCAGCGGCTAGAGCGGCTGTGGTGGCGCTACTTGCTGTTGAGGTGTTTAATGCAAC
CGGTTTGAACTCCGGAGAAGTAGAATGCGTGATATGCAAGGAAGAGATTAGTGAAGGAAG
AGATGTTTGTGAAATGCCATGTCAGCATTTGTTCCATTGGAAGTGTATCTTGCCATGGCT
TAGCAAGAGGAACACGTGTCCTTTCTGTAGGTTTCAGCTTCCCACCGACGATGTTTTCTC
CGAGATCCAACGGCTGTGGGAGATCCTCGTCAAGACCACTGAGTTACACGTGGCGTGATT
AATACACGTGCATATTGTTATTTATACTAGATGTGTCAAGTACTATAATCAAATAGGAAT
GTTTGGACCGTTTCGATCTATAGAATTTATGTTAGTTT

QA 1 458 1 458
DS 



AS 1 2

CO CL5572Contig1 785 2 5 U
GGGGAAGAAGGAAACGGAGGGAGTGAAAAAAATGGCGGACGATGAAAAACCACCGATGGC
TGTTCAAATCCAACCAGATATTTCCGTCGTTAACACAACCCTCTCTCTAGAGGAATCAAT
CGATGCTGTTGGTGTCACTGTCATCACTGGTTATCTCGGCGCCGGAAAGTCCACCCTTGT
GAATTATGTTCTGAACGGGAAACACGGGAAGAAAATCGCCGTGATTTTGAACGAGTTTGG
GGAATAGATTGGAGTAGAGAGGGCTATGATCAACGAAGGCGAAGGAGGTGCTCTTGTCGA
GGAATGGGTCGAGCTTGCTAATGGCTGTATTTGCTGCACTGTCAAACACAGTCTTGTTCA
AGCTCTCGAGCAGCTTGTCCAGAGGAAAGACAGGCTTGATCATATACTACTGGAGACAAC
AGGTTTAGCGAATCCGGCTCCTCTTGCTTCTATTCTTTGGTTGGATGACCAGTTAGAATC
AGAAGTCAAGCTTGATTGCATCGTTACTGTTGTGGATGCAAAGAACCTTCGCTTTCAGCT
CAATGAGCGCCGTGACTCATCCTCCTTTCCCGAGGCTTTTAATCAAATAGCATTTGCAGA
CACAGTGATAATGAACAAGGTTGACTTGATTTCTCAAGAGGAATCTTATGAACTGGAGAA
AGAGATTCACTCCATCAACTCCCTCGCCAATGTCATCCGTTCTGTCAGTGTCAAGTTGAT
TTATCCAACATATTAGAATGCCAAGCATATGATTCAACCCATGCTAGTCGTCTTGAATCC
CTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2AJ82TF U 19
AF RR2AD54TF U 1
BS 1 46 RR2AD54TF
BS 47 47 RR2AJ82TF
BS 48 93 RR2AD54TF
BS 94 94 RR2AJ82TF
BS 95 785 RR2AD54TF

RD RR2AJ82TF 116 0 0
GGGAGTGAAAAAAATGGCGGACGATGAAAAACCACCGATGGCTGTTCAAATCCAACCAGA
TATTTCCGTCGTTAACACAACCCTCTCTCTAGAGGAATCAATCGATGCTGTTGGTG

QA 1 116 1 116
DS 

RD RR2AD54TF 785 0 0
GGGGAAGAAGGAAACGGAGGGAGTGAAAAAAATGGCGGACGATGAAGAACCACCGATGGC
TGTTCAAATCCAACCAGATATTTCCGTCGTTAAGACAACCCTCTCTCTAGAGGAATCAAT
CGATGCTGTTGGTGTCACTGTCATCACTGGTTATCTCGGCGCCGGAAAGTCCACCCTTGT
GAATTATGTTCTGAACGGGAAACACGGGAAGAAAATCGCCGTGATTTTGAACGAGTTTGG
GGAATAGATTGGAGTAGAGAGGGCTATGATCAACGAAGGCGAAGGAGGTGCTCTTGTCGA
GGAATGGGTCGAGCTTGCTAATGGCTGTATTTGCTGCACTGTCAAACACAGTCTTGTTCA
AGCTCTCGAGCAGCTTGTCCAGAGGAAAGACAGGCTTGATCATATACTACTGGAGACAAC
AGGTTTAGCGAATCCGGCTCCTCTTGCTTCTATTCTTTGGTTGGATGACCAGTTAGAATC
AGAAGTCAAGCTTGATTGCATCGTTACTGTTGTGGATGCAAAGAACCTTCGCTTTCAGCT
CAATGAGCGCCGTGACTCATCCTCCTTTCCCGAGGCTTTTAATCAAATAGCATTTGCAGA
CACAGTGATAATGAACAAGGTTGACTTGATTTCTCAAGAGGAATCTTATGAACTGGAGAA
AGAGATTCACTCCATCAACTCCCTCGCCAATGTCATCCGTTCTGTCAGTGTCAAGTTGAT
TTATCCAACATATTAGAATGCCAAGCATATGATTCAACCCATGCTAGTCGTCTTGAATCC
CTGCT

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL5573Contig1 822 2 2 U
GGGAATCTGCTGTCTTTATAATTTATCAGAATCGCCGATCGATAGAGAGAACAACGACCA
TCCGTTAAATCGCCGACGGAGAAATCGTGGCCGTCTAAATTAGGCGACTATAGAAGATCC
GATTCCGATTTGTAGAAGAATCTTTAAGAGATGGGGAAGAAGAGAAAAGCTACAGCGACG
AGCCTCGATGAGGTAGATCGGACTGTTTACGCCTCGTTTCGAACCGCCGCGAACTCGTTA
TCTCAGCTTTATACTCAGTCCATGAACCACCAGAAATTATCTTTCCAAGCCGGTGAACGC
CATGGTCTCGAAAAATTGTACCAATGGATTTGGAGACAACAAGAAGGAGGGTCAAGAGTG
ACGTCTATGGATATAATCAATTACATTCAGAACGAGCTAGAGTGCTGCACAGAGGAGCCC
CCAATTTCCCCAAGAGCGCCGCCAACACAACCAGCAATGAATGCCGGGCTCATTGCCTCT
TCAGGCACGTCTTGCCCAACAGCTGTTCCAGTGGTTCGGTCTGAGCAATGCGAAAACCAG
GCGAAGAACTCGGTTTTCTCAAACGCGCTTTCTAGCCCCATACGCCGTAGCCTTCAAAAC
TACCAAATTCCCCAGGGAGGCTACATATCTGGCGCAACCAGAAGCAGTGAACTGAACAGG
GGATCCAACTCTCCAGGCTCTTTTGATTCCTCAATGGACATGCATGCAGACTAATAACTA
TGATGTAATACACTCTCGTTTGATGATGTTTGCTTTATACAAAACTGGTTTTATTTTTCA
TAATGTGTCAATTGGTTCTTATCTGATGGTTTGCTGGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F995TF U 1
AF RR2F995JQ C 254
BS 1 616 RR2F995TF
BS 617 822 RR2F995JQ

RD RR2F995TF 616 0 0
GGGAATCTGCTGTCTTTATAATTTATCAGAATCGCCGATCGATAGAGAGAACAACGACCA
TCCGTTAAATCGCCGACGGAGAAATCGTGGCCGTCTAAATTAGGCGACTATAGAAGATCC
GATTCCGATTTGTAGAAGAATCTTTAAGAGATGGGGAAGAAGAGAAAAGCTACAGCGACG
AGCCTCGATGAGGTAGATCGGACTGTTTACGCCTCGTTTCGAACCGCCGCGAACTCGTTA
TCTCAGCTTTATACTCAGTCCATGAACCACCAGAAATTATCTTTCCAAGCCGGTGAACGC
CATGGTCTCGAAAAATTGTACCAATGGATTTGGAGACAACAAGAAGGAGGGTCAAGAGTG
ACGTCTATGGATATAATCAATTACATTCAGAACGAGCTAGAGTGCTGCACAGAGGAGCCC
CCAATTTCCCCAAGAGCGCCGCCAACACAACCAGCAATGAATGCCGGGCTCATTGCCTCT
TCAGGCACGTCTTGCCCAACAGCTGTTCCAGTGGTTCGGTCTGAGCAATGCGAAAACCAG
GCGAAGAACTCGGTTTTCTCAAACGCGCTTTCTAGCCCCATACGCCGTAGCCTTCAAAAC
TACCAAATTCCCCAGG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2F995JQ 569 0 0
CTCAGTCCATGAACCACCAGAAATTATCTTTCCAAGCCGGTGAACGCCATGGTCTCGAAA
AATTGTACCAATGGATTTGGAGACAACAAGAAGGAGGGTCAAGAGTGACGTCTATGGATA
TAATCAATTACATTCAGAACGAGCTAGAGTGCTGCACAGAGGAGCCCCCAATTTCCCCAA
GAGCGCCGCCAACACAACCAGCAATGAATGCCGGGCTCATTGCCTCTTCAGGCACGTCTT
GCCCAACAGCTGTTCCAGTGGTTCGGTCTGAGCAATGCGAAAACCAGGCGAAGAACTCGG
TTTTCTCAAACGCGCTTTCTAGCCCCATACGCCGTAGCCTTCAAAACTACCAAATTCCCC
AGGGAGGCTACATATCTGGCGCAACCAGAAGCAGTGAACTGAACAGGGGATCCAACTCTC
CAGGCTCTTTTGATTCCTCAATGGACATGCATGCAGACTAATAACTATGATGTAATACAC
TCTCGTTTGATGATGTTTGCTTTATACAAAACTGGTTTTATTTTTCATAATGTGTCAATT
GGTTCTTATCTGATGGTTTGCTGGTGTTT

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

CO CL5574Contig1 869 2 2 U
GGACTCTCTCTCTGTGGAATCGATCGCTTTTGTTGTACAACGTTCTGGTGTGAGCTTTGA
TTTGGATCACTCTTGTGTTTGTTGGAAAGCTAAAATCGAGAGATGGCGGGAGATGAAGAG
ATTGAGATTTACGAAGAAGGAGAGGAGGAATACATTGAAGCGAAAACAGAGGGAGGAGAT
GATGAGAAGGTGTTGCAGTTTTTAGATTCGTTGGATGTGTATCTAACGCTTATGGATTCT
CTCAATTCAAAGCTACGAGAGGGATGGTTTGATCTAGCAAGTGCTCGACACTCTATGGGA
ACTTTACGTATCACCAGCACTCTCTTAGACCTCAAGGATCATTCCGCTTCTTCCACATTG
CAAGTCTCTGACCAAGAGGTTGAATCTTTGGGACCAGTACCTCATTTTGCTTTGTCCAAG
TGGGCTTCTAAGGGCGGTAGTGGGAAAGGCAAAGACTTCTCTACTGATGCAGATTCGGAG
ATGGGCTCTCCTCGTTCCCCACAGCTACGGCATCGAGGCATTTCCGAGAAACCATCAGCC
ATGGGTGAGACCGTGTTAGCAGCTGATGAGGAGGTTAAGAAAGAACGGGCCAAGTCTCTG
TCGGTATTCGGAGGTCTAGTCTCCCCTAAGCTGCGTGGTGCTCAACTTTCATTTGAGACA
GCTCTTGAAACTCTTGTGGAAATAGCCAACACACGATCATCCATGTTAGCTGCTTTTGCG
CGGATCACAAAGAAGTAAAGACAGAGTGTGCCAATGCGTTAGCTCAAGTTTTTTCAGTTT
GTAACTACCACATTCTGTGTAATACACACAGTATCTATTTTGATCAGAATTGCTTTACAG
TACCAAATAATATACAACATTTTGAAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL23TF U 1
AF RR2GL23JQ C 291
BS 1 642 RR2GL23TF
BS 643 869 RR2GL23JQ

RD RR2GL23TF 642 0 0
GGACTCTCTCTCTGTGGAATCGATCGCTTTTGTTGTACAACGTTCTGGTGTGAGCTTTGA
TTTGGATCACTCTTGTGTTTGTTGGAAAGCTAAAATCGAGAGATGGCGGGAGATGAAGAG
ATTGAGATTTACGAAGAAGGAGAGGAGGAATACATTGAAGCGAAAACAGAGGGAGGAGAT
GATGAGAAGGTGTTGCAGTTTTTAGATTCGTTGGATGTGTATCTAACGCTTATGGATTCT
CTCAATTCAAAGCTACGAGAGGGATGGTTTGATCTAGCAAGTGCTCGACACTCTATGGGA
ACTTTACGTATCACCAGCACTCTCTTAGACCTCAAGGATCATTCCGCTTCTTCCACATTG
CAAGTCTCTGACCAAGAGGTTGAATCTTTGGGACCAGTACCTCATTTTGCTTTGTCCAAG
TGGGCTTCTAAGGGCGGTAGTGGGAAAGGCAAAGACTTCTCTACTGATGCAGATTCGGAG
ATGGGCTCTCCTCGTTCCCCACAGCTACGGCATCGAGGCATTTCCGAGAAACCATCAGCC
ATGGGTGAGACCGTGTTAGCAGCTGATGAGGAGGTTAAGAAAGAACGGGCCAAGTCTCTG
TCGGTATTCGGAGGTCTAGTCTCCCCTAAGCTGCGTGGTGCT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2GL23JQ 579 0 0
CTCTATGGGAACTTTACGTATCACCAGCACTCTCTTAGACCTCAAGGATCATTCCGCTTC
TTCCACATTGCAAGTCTCTGACCAAGAGGTTGAATCTTTGGGACCAGTACCTCATTTTGC
TTTGTCCAAGTGGGCTTCTAAGGGCGGTAGTGGGAAAGGCAAAGACTTCTCTACTGATGC
AGATTCGGAGATGGGCTCTCCTCGTTCCCCACAGCTACGGCATCGAGGCATTTCCGAGAA
ACCATCAGCCATGGGTGAGACCGTGTTAGCAGCTGATGAGGAGGTTAAGAAAGAACGGGC
CAAGTCTCTGTCGGTATTCGGAGGTCTAGTCTCCCCTAAGCTGCGTGGTGCTCAACTTTC
ATTTGAGACAGCTCTTGAAACTCTTGTGGAAATAGCCAACACACGATCATCCATGTTAGC
TGCTTTTGCGCGGATCACAAAGAAGTAAAGACAGAGTGTGCCAATGCGTTAGCTCAAGTT
TTTTCAGTTTGTAACTACCACATTCTGTGTAATACACACAGTATCTATTTTGATCAGAAT
TGCTTTACAGTACCAAATAATATACAACATTTTGAAGCG

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL5575Contig1 1042 2 4 U
GGGCTGTTCGGCGTCTTCTTCTTTCCTGCAAACAAGGTGCGAATCAGGCGGCCAGTTTTC
TCCGAGGGTCATCTAGAAGAACTCAGTCATTCAATTACAGCCAATCGACAAGACAGGGGG
GGACACATGGAAGGACAGATCTTAAACCTCAGTTGCCTCTCGGAACTGCTCAGACTTACT
CTCGCTCGCGTGCTCGTTATGCCGCTCCAACACTAGCGGTTGGGTTTACTGGATTCTTAG
CCTTTCTTCATTACAACGACGAAAGGAGAGCTGTTCCTAAAGGTCAACCAAGCAGAAGCA
ATAGTAGCGGTTGTGGCTGTGGTTCTAATACAACAGTCAGGGGTCCTATTATTGGAGGTC
CATTCACGCTTATGAGCACACAGAACAAGATTGTCACTGAGAAAGACTTGCGTGATAAAT
GGGTTCTCCTCTACTTTGGTTACTCGTTTTCCCCTGATGTTGGACCTGACCAGCTTAAGA
TGATCTCCAGAGCTGTTCACAAACTAGAGTCTAATCATGACAAGAAGATTCTGCCTGTCT
TTGTTACTCTTGACCCTGTACGAGATACGCCTTCTCATCTCCACGCCTACTTGAAAGAAT
TTGACGATAGAATACCTGGATTGACTGGATCTGCAAGTGCAATGAGGCAAATGGCACAGG
AGTATCGTGTTTATTTCAAGAAGGTTCAAGAAGATGGAGATGATTACCTCGTTGATACTT
CTCATAACATGTACTTGTTGAATCCGAAGATGGAGGTAGTGAGATGCTTTGGAGTTGAGT
ACAATCCAGATGACCTCGCACAAGAAGTTCTTAAAGAAGTTACTTCCCTTTCACAGTGAC
CAAACACTAATGAGAGATGTTCACAGAATGAAACTACTAAGTTCCTTTTTTTCCTCCATT
GGTCAAATTTCATTTAGACGATTTTGCTTATCCTTTGGTCAATGCTGATCTGATAGTTTC
AATTTGATTCATCTTCCCTCTTTCAGTGTGGGCTGAAGCAAATAGGCTTTTTCCTTCTTA
AGGTTCTTTATTGGTTTATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D221TF U 1
AF RR2D221JQ C 246
BS 1 683 RR2D221TF
BS 684 684 RR2D221JQ
BS 685 716 RR2D221TF
BS 717 1042 RR2D221JQ

RD RR2D221TF 716 0 0
GGGCTGTTCGGCGTCTTCTTCTTTCCTGCAAACAAGGTGCGAATCAGGCGGCCAGTTTTC
TCCGAGGGTCATCTAGAAGAACTCAGTCATTCAATTACAGCCAATCGACAAGACAGGGGG
GGACACATGGAAGGACAGATCTTAAACCTCAGTTGCCTCTCGGAACTGCTCAGACTTACT
CTCGCTCGCGTGCTCGTTATGCCGCTCCAACACTAGCGGTTGGGTTTACTGGATTCTTAG
CCTTTCTTCATTACAACGACGAAAGGAGAGCTGTTCCTAAAGGTCAACCAAGCAGAAGCA
ATAGTAGCGGTTGTGGCTGTGGTTCTAATACAACAGTCAGGGGTCCTATTATTGGAGGTC
CATTCACGCTTATGAGCACACAGAACAAGATTGTCACTGAGAAAGACTTGCGTGATAAAT
GGGTTCTCCTCTACTTTGGTTACTCGTTTTCCCCTGATGTTGGACCTGACCAGCTTAAGA
TGATCTCCAGAGCTGTTCACAAACTAGAGTCTAATCATGACAAGAAGATTCTGCCTGTCT
TTGTTACTCTTGACCCTGTACGAGATACGCCTTCTCATCTCCACGCCTACTTGAAAGAAT
TTGACGATAGAATACCTGGATTGACTGGATCTGCAAGTGCAATGAGGCAAATGGCACAGG
AGTATCGTGTTTATTTCAAGAAG*TTCAAGAAGATGGAGATGATTACCTCGTTGAT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2D221JQ 797 0 0
CTTCATTACAACGACGAAAGGAGAGCTGTTCCTAAAGGTCAACCAAGCAGAAGCAATAGT
AGCGGTTGTGGCTGTGGTTCTAATACAACAGTCAGGGGTCCTATTATTGGAGGTCCATTC
ACGCTTATGAGCACACAGAACAAGATTGTCACTGAGAAAGACTTGCGTGATAAATGGGTT
CTCCTCTACTTTGGTTACTCGTTTTCCCCTGATGTTGGACCTGACCAGCTTAAGATGATC
TCCAGAGCTGTTCACAAACTAGAGTCTAATCATGACAAGAAGATTCTGCCTGTCTTTGTT
ACTCTTGACCCTGTACGAGATACGCCTTCTCATCTCCACGCCTACTTGAAAGAATTTGAC
GATAGAATACCTGGATTGACTGGATCTGCAAGTGCAATGAGGCAAATGGCACAGGAGTAT
CGTGTTTATTTCAAGAAGGTTCAAGAAGATGGAGATGATTACCTCGTTGATACTTCTCAT
AACATGTACTTGTTGAATCCGAAGATGGAGGTAGTGAGATGCTTTGGAGTTGAGTACAAT
CCAGATGACCTCGCACAAGAAGTTCTTAAAGAAGTTACTTCCCTTTCACAGTGACCAAAC
ACTAATGAGAGATGTTCACAGAATGAAACTACTAAGTTCCTTTTTTTCCTCCATTGGTCA
AATTTCATTTAGACGATTTTGCTTATCCTTTGGTCAATGCTGATCTGATAGTTTCAATTT
GATTCATCTTCCCTCTTTCAGTGTGGGCTGAAGCAAATAGGCTTTTTCCTTCTTAAGGTT
CTTTATTGGTTTATGCT

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL5576Contig1 770 2 8 U
GGGCGAAGAAAACAATGTTACACAAAACATGTGGATTTGATTTGATCGCACAAACAAAAT
TTATTTATTTTTAACAGAAGAAATCGATTTCACAGTCTCCCTTCGATTTCTCCGCCTCGT
CACTCTCTCCCTCCCTGGAAAAGAAAAGAAATGGCAGCGAGAATCCATGGAGGAGCTGGA
GCTGGAGCTGCTACGGCCTTGTCGACCTTTAATCCAAAGAAACTCGTTGCTCCTCCTTCT
TGCACCAATCTCCCAGCGAGGAGCAGCAAGAGATGCATTGTGGCTGCTGGATCTGATGGG
AGTAAGAAGAGCCTCCTCAGAGTTCGTCACTCTCAGAAACTGATTGCGAATGCTGCTGTT
GCTACCAAGGCGGAGGAGTCATCTACCACCACTGGCACTGGACATTAACTACTGCTTTTC
GAGGCTCTTCAGGAAGGTCTGGAAGAAGAGATGGACAGAGATCCACATGTATGTGTTATG
GGTGAAGACGTGGGCCACTACGGTGGCTCCTACAAAGTTACCAAAGGCCTTGCTGATAAG
TTCGGCGACCTCAGGGTTCTCGACACTCCTATTTGTGAAAAGTCGTATTTTATCCGGTGA
GCCATTATTTACCATTTACCTCTCAATTTACTTTCTCTTTAGCTTAGTTCGCAAGAACTT
GTCTGTTTGATTTTCTTAACGTTTTGTTGTCTCTTTTCTTGTGTTTTGGAATATGGTTTT
GAAACTCATACTGTTTCGTTTGTTAATCTATCTCTCACATTTTTATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ82TF U 1
AF RR2FJ82JQ C 19
BS 1 706 RR2FJ82TF
BS 707 707 RR2FJ82JQ
BS 708 719 RR2FJ82TF
BS 720 720 RR2FJ82JQ
BS 721 743 RR2FJ82TF
BS 744 744 RR2FJ82JQ
BS 745 763 RR2FJ82TF
BS 764 770 RR2FJ82JQ

RD RR2FJ82TF 768 0 0
GGGCGAAGAAAACAATGTTACACAAAACATGTGGATTTGATTTGATCGCACAAACAAAAT
TTATTTATTTTTAACAGAAGAAATCGATTTCACAGTCTCCCTTCGATTTCTCCGCCTCGT
CACTCTCTCCCTCCCTGGAAAAGAAAAGAAATGGCAGCGAGAATCCATGGAGGAGCTGGA
GCTGGAGCTGCTACGGCCTTGTCGACCTTTAATCCAAAGAAACTCGTTGCTCCTCCTTCT
TGCACCAATCTCCCAGCGAGGAGCAGCAAGAGATGCATTGTGGCTGCTGGATCTGATGGG
AGTAAGAAGAGCCTCCTCAGAGTTCGTCACTCTCAGAAACTGATTGCGAATGCTGCTGTT
GCTACCAAGGCGGAGGAGTCATCTACCACCACTGGCACTGGACATTAACTACTGCTTTTC
GAGGCTCTTCAGGAAGGTCTGGAAGAAGAGATGGACAGAGATCCACATGTATGTGTTATG
GGTGAAGACGTGGGCCACTACGGTGGCTCCTACAAAGTTACCAAAGGCCTTGCTGATAAG
TTCGGCGACCTCAGGGTTCTCGACACTCCTATTTGTGAAAAGTCGTATTTTATCCGGTGA
GCCATTATTTACCATTTACCTCTCAATTTACTTTCTCTTTAGCTTAGTTCGCAAGAACTT
GTCTGTTTGATTTTCTTAACGTTTTGTTGTCTCTTTTCTTGTGTTT*GGAATATGGTTT*
GAAACTCATACTGTTTCGTTTGT*AATCTATCTCTCACATTTT
ATTTT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2FJ82JQ 752 0 0
TACACAAAACATGTGGATTTGATTTGATCGCACAAACAAAATTTATTTATTTTTAACAGA
AGAAATCGATTTCACAGTCTCCCTTCGATTTCTCCGCCTCGTCACTCTCTCCCTCCCTGG
AAAAGAAAAGAAATGGCAGCGAGAATCCATGGAGGAGCTGGAGCTGGAGCTGCTACGGCC
TTGTCGACCTTTAATCCAAAGAAACTCGTTGCTCCTCCTTCTTGCACCAATCTCCCAGCG
AGGAGCAGCAAGAGATGCATTGTGGCTGCTGGATCTGATGGGAGTAAGAAGAGCCTCCTC
AGAGTTCGTCACTCTCAGAAACTGATTGCGAATGCTGCTGTTGCTACCAAGGCGGAGGAG
TCATCTACCACCACTGGCACTGGACATTAACTACTGCTTTTCGAGGCTCTTCAGGAAGGT
CTGGAAGAAGAGATGGACAGAGATCCACATGTATGTGTTATGGGTGAAGACGTGGGCCAC
TACGGTGGCTCCTACAAAGTTACCAAAGGCCTTGCTGATAAGTTCGGCGACCTCAGGGTT
CTCGACACTCCTATTTGTGAAAAGTCGTATTTTATCCGGTGAGCCATTATTTACCATTTA
CCTCTCAATTTACTTTCTCTTTAGCTTAGTTCGCAAGAACTTGTCTGTTTGATTTTCTTA
ACGTTTTGTTGTCTCTTTTCTTGTGTTTTGGAATATGGTTTTGAAACTCATACTGTTTCG
TTTGTTAATCTATCTCTCACATTTTTATTTTT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL5577Contig1 692 2 1 U
GGAAACCATCAGAAAATATGAAAAACAAATCCCAAATCGAAGCAGCTCCGGCTCAGCAGC
AGGGAAGTATGTTTTCTTTTTTCAATTTGTTCCCTTTTCTCCTCCCGACATTTGAGGTTA
TCAAGATGGTTGTTGCTTCCGTTGCCTCAGCAGTCTATTTAGGCTTCGCCGGTGTAACAC
TCAGTGGTTCAGCCGTGGCATTAGCCGTATCTACCCCCCTTTTCATCATATACAGTCCGA
TTCTCTTACCTGCCATTGCAGCCACTACTGTCCTAGCCGCTGGGCTCGGCGGTAAAAAAG
CGAATCAGCAGGCTCCGGCAGGTTCACCGTCCCTATCTCTGTTGGGCATACCAGAGGCTA
TTAAACCAAGTAATATTATACCAGAGGCTGTTAAACCAAGTAATATTATACCAGAGGCTG
TTAAACCAAGTAATATTATACCAGAGGCTGTTAAACCAAGTAATATTAAGGACAAAATCA
AGGAAACGATAGGCAAAGTCAAGAATAAGATCGAAGAGAAAAAGGAAGAAAAATCTAAAG
AAAAAGGTAAATCTGGAGGTGGAGGTTCTCCTAAGGGTGAAGATTCGTCTTCTTCGGATG
AGAGTAAACACAAGAGTGAAGGTAAACACGGAAAGGGTGAGAGTAAACACGAAGGCGGAG
TAAACATGGAGGTGGAGGTTCGTCAATGGATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A989TF U 7
AF RR2GH36TF U 1
BS 1 692 RR2GH36TF

RD RR2A989TF 388 0 0
G
ATCAGAAAATATGAAAAACAAATCCCAAATCGAAGCAGCTCCGGCTCAGCAGCAGGGAAG
TATGTTTTCTTTTTTCAATTTGTTCCCTTTTCTCCTCCCGACATTTGAGGTTATCAAGAT
GGTTGTTGCTTCCGTTGCCTCAGCAGTCTATTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCAGTGG
TTCAGCCGTGGCATTAGCCGTATCTACCCCCCTTTTCATCATATTCAGTCCGATTCTCTT
ACCTGCCATTGCAGCCACTACTGTCCTAGCCGCTGGGCTCGGCGGTAAAAAAGCGAATCA
GCAGGCTCCGGCAGGTTCGCCGTCCCTATCTCTGTTGGGCATACTAGAGGCTATTAAACC
AAGTAATATTATACC
CACTCTTCAAAT

QA 2 376 2 376
DS 

RD RR2GH36TF 692 0 0
GGAAACCATCAGAAAATATGAAAAACAAATCCCAAATCGAAGCAGCTCCGGCTCAGCAGC
AGGGAAGTATGTTTTCTTTTTTCAATTTGTTCCCTTTTCTCCTCCCGACATTTGAGGTTA
TCAAGATGGTTGTTGCTTCCGTTGCCTCAGCAGTCTATTTAGGCTTCGCCGGTGTAACAC
TCAGTGGTTCAGCCGTGGCATTAGCCGTATCTACCCCCCTTTTCATCATATACAGTCCGA
TTCTCTTACCTGCCATTGCAGCCACTACTGTCCTAGCCGCTGGGCTCGGCGGTAAAAAAG
CGAATCAGCAGGCTCCGGCAGGTTCACCGTCCCTATCTCTGTTGGGCATACCAGAGGCTA
TTAAACCAAGTAATATTATACCAGAGGCTGTTAAACCAAGTAATATTATACCAGAGGCTG
TTAAACCAAGTAATATTATACCAGAGGCTGTTAAACCAAGTAATATTAAGGACAAAATCA
AGGAAACGATAGGCAAAGTCAAGAATAAGATCGAAGAGAAAAAGGAAGAAAAATCTAAAG
AAAAAGGTAAATCTGGAGGTGGAGGTTCTCCTAAGGGTGAAGATTCGTCTTCTTCGGATG
AGAGTAAACACAAGAGTGAAGGTAAACACGGAAAGGGTGAGAGTAAACACGAAGGCGGAG
TAAACATGGAGGTGGAGGTTCGTCAATGGATA

QA 1 692 1 692
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5579Contig1 762 2 2 U
GGACGACCTTAAAAATCAGAGATTCCAGTTTTCATACTCTTCTCTCTCTCTCCTAATACG
ATTCTGATTCTATTTTTTCACCAACCATTCTCCAATTTTCTCAGCCATGGGACACGGAAC
AATGGCGACACCACCAACCACCACCACCATCCCCGGCAAGACGACGCTCATCTTCACGTA
CGGAACCCTGAAGAGAGGATTCTCGAACCACGTCCTGATGCAAGATCTGATCCGATCAGG
CGACTCATCTTTCAAAGGAGTCTACCAAACCCTAGACAAATACCCCCTCGTCTGCGGACC
GTACCGAGTCCCTTTCCTCCTCAACAAGCCTGGATCAGGCCACCGCGTCACGGGAGAGCT
TTACGCCGTTTCTCCTCGCGGTCTCTCGCGTCTCGACGAGTTGGAAGGGATCACTCTAGG
CCATTACGTGAGGCAGCCAATCCGCCTCGCTGCTGAGAAACAAGGAGGAGGAGATCTGGA
ATCGTGCGTGGTTGAGGCGTATTATGCGCACAAGAGCTACGATGAGAAGCTGTGGGAGAG
GAGTAGTGGGAGGTCGTTCGGCGCGTACACGGAGAACGAAGCGCGTGGATACGTGAAGCG
TAAGGATCGACCGCAGCATCTTACCTTCTTGGACCATATCCGTATTTTTGTTTCTTCTCC
ATGTGATTGATTTTTTTAATTTTCCTTGTGTGTGTCTCTCTCTATCTCTCACCGCCTTTT
TTAAACCTTTTCTCGGGAAATGAAATAAGAAAGTACAAACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA44TF U 1
AF RR2HA44JQ C 146
BS 1 715 RR2HA44TF
BS 716 762 RR2HA44JQ

RD RR2HA44TF 715 0 0
GGACGACCTTAAAAATCAGAGATTCCAGTTTTCATACTCTTCTCTCTCTCTCCTAATACG
ATTCTGATTCTATTTTTTCACCAACCATTCTCCAATTTTCTCAGCCATGGGACACGGAAC
AATGGCGACACCACCAACCACCACCACCATCCCCGGCAAGACGACGCTCATCTTCACGTA
CGGAACCCTGAAGAGAGGATTCTCGAACCACGTCCTGATGCAAGATCTGATCCGATCAGG
CGACTCATCTTTCAAAGGAGTCTACCAAACCCTAGACAAATACCCCCTCGTCTGCGGACC
GTACCGAGTCCCTTTCCTCCTCAACAAGCCTGGATCAGGCCACCGCGTCACGGGAGAGCT
TTACGCCGTTTCTCCTCGCGGTCTCTCGCGTCTCGACGAGTTGGAAGGGATCACTCTAGG
CCATTACGTGAGGCAGCCAATCCGCCTCGCTGCTGAGAAACAAGGAGGAGGAGATCTGGA
ATCGTGCGTGGTTGAGGCGTATTATGCGCACAAGAGCTACGATGAGAAGCTGTGGGAGAG
GAGTAGTGGGAGGTCGTTCGGCGCGTACACGGAGAACGAAGCGCGTGGATACGTGAAGCG
TAAGGATCGACCGCAGCATCTTACCTTCTTGGACCATATCCGTATTTTTGTTTCTTCTCC
ATGTGATTGATTTTTTTAATTTTCCTTGTGTGTGTCTCTCTCTATCTCTCACCGC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2HA44JQ 617 0 0
ACCATCCCCGGCAAGACGACGCTCATCTTCACGTACGGAACCCTGAAGAGAGGATTCTCG
AACCACGTCCTGATGCAAGATCTGATCCGATCAGGCGACTCATCTTTCAAAGGAGTCTAC
CAAACCCTAGACAAATACCCCCTCGTCTGCGGACCGTACCGAGTCCCTTTCCTCCTCAAC
AAGCCTGGATCAGGCCACCGCGTCACGGGAGAGCTTTACGCCGTTTCTCCTCGCGGTCTC
TCGCGTCTCGACGAGTTGGAAGGGATCACTCTAGGCCATTACGTGAGGCAGCCAATCCGC
CTCGCTGCTGAGAAACAAGGAGGAGGAGATCTGGAATCGTGCGTGGTTGAGGCGTATTAT
GCGCACAAGAGCTACGATGAGAAGCTGTGGGAGAGGAGTAGTGGGAGGTCGTTCGGCGCG
TACACGGAGAACGAAGCGCGTGGATACGTGAAGCGTAAGGATCGACCGCAGCATCTTACC
TTCTTGGACCATATCCGTATTTTTGTTTCTTCTCCATGTGATTGATTTTTTTAATTTTCC
TTGTGTGTGTCTCTCTCTATCTCTCACCGCCTTTTTTAAACCTTTTCTCGGGAAATGAAA
TAAGAAAGTACAAACGC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL5580Contig1 354 2 1 U
GTACTCGAGGAGTTTGAACGATTCCAAGTTTACGGGAGTGGGTATTGGTAAAGAAAATGA
TTGGATCGTTGTGGTTCTTACTACCAATACACCAGGAGGAAGCTATTCAACAGATACAGA
TACAAAAGATCATGACGATCATGATGATGATGATTCTAGTGGCTTCACCTTTAGTATTGG
CCTCGTTAATTATTTGCTGGTTTTCATCTTGTCCTTTTGTTTCTTCATCTGGTGAGATAT
CGACTATCACATGCTTTGAGTTTTTTTTGTCACAACTCTCTCTTAGACTACGAATAATTT
ATGAATATGATATTTTACTCTTTTTTTTGAATAAAAACAAATATATTTTCTCAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FC91JQ C 1
AF RR2FC91TF U 1
BS 1 354 RR2FC91TF

RD RR2FC91JQ 354 0 0
GTACTCGAGGAGTTTGAACGATTCCAAGTTTACGGGAGTGGGTATTGGTAAAGAAAATGA
TTGGATCGTTGTGGTTCTTACTACCAATACACCAGGAGGAAGCTATTCAACAGATACAGA
TACAAAAGATCATGACGATCATGATGATGATGATTCTAGTGGCTTCACCTTTAGTATTGG
CCTCGTTAATTATTTGCTGGTTTTCATCTTGTCCTTTTGTTTCTTCATCTGGTGAGATAT
CGACTATCACATGCTTTGAGTTTTTTTTGTCACAACTCTCTCTTAGACTACGAATAATTT
ATGAATATGATATTTTACTCTTTTTTTTGAATAAAAACAAATATATTTTCTCAT

QA 1 354 1 354
DS 

RD RR2FC91TF 354 0 0
GTACTCGAGGAGTTTGAACGATTCCAAGTTTACGGGAGTGGGTATTGGTAAAGAAAATGA
TTGGATCGTTGTGGTTCTTACTACCAATACACCAGGAGGAAGCTATTCAACAGATACAGA
TACAAAAGATCATGACGATCATGATGATGATGATTCTAGTGGCTTCACCTTTAGTATTGG
CCTCGTTAATTATTTGCTGGTTTTCATCTTGTCCTTTTGTTTCTTCATCTGGTGAGATAT
CGACTATCACATGCTTTGAGTTTTTTTTGTCACAACTCTCTCTTAGACTACGAATAATTT
ATGAATATGATATTTTACTCTTTTTTTTGAATAAAAACAAATATATTTTCTCAT

QA 1 354 1 354
DS 



AS 1 2

CO CL5581Contig1 1073 2 2 U
GGGGACCTGCTTGTGTTTGGTAAAATCCGTGCTGTCTTGGGAGGTCAACTCCGTTACTTG
CTCTCTGGAGGAGCCCCTCTTTCTGGTGACACTCAGAGATTCATTAACATATGCGTTGGG
GCTCCAATCGGTCAGGGATATGGACTAACAGAGACTTGTGCTGGGGGAACCTTCTCGGAG
TTTGATGATACGCCTGTTGGGCGTGTGGGTGCTCCACTTCCTTGCTCCTTTGTTAAGCTA
ATAGACTGGCCGGAAGGCGGGTACTTAATCAGTGATAAGCCAATGCCCCGTGGTGAAATT
GTAATTGGTGGCTCTAATATTACACTTGGGTATTTCAAGAATGAAGAGAAGACTAAAGAA
GTTTACAAGGTTGATGAAAAGGGGATGAGGTGGTTCTACACAGGAGACATAGGACAGTTT
CACCCTGATGGTTGCCTTGAGATTATAGACAGAAAGAAGGATATTGTTAAACTTCAGCAT
GGGGAATATGTCTCCTTGGGCAAAGTGGAAGCTGCTCTCAGTATAAGCCCATACGTTGAA
AACATAATGGTTCATGCTGATCCGTTTTACTCTTACTGTGTGGCTCTTGTGGTTGCTGCG
CAACAAACGCTTGAAGGTTCGGCGTCAAAGCAAGGAATAGAGTTCACCAACTTCGAAGAG
CTGTGTGCTAAAGAACAAACCGTGAAAGAAGTGTATGCGTCTCTTGTTAAGGCGGCTAAA
CAGTCGCGGTTGGAGAAGTTTGAGATACCATCAAAGATCAAGTTGTTGGCGGCTCCATGG
ACGCCAGAGTCAGGGTTAGTGACAGCAGCACTAAAGCTTAAAAGAGATGTAATTAGGAAG
GAGTTCTCTGAAGATCTCACCAAGCTATATGCTTCCTAAATCACTTCTTCTTTCGTCTTC
TACTATCTTTTTTTTTCAACTTTCTATAAACACACAACTTGTCTGTCTTGCTCTTTAGTT
GGTTTGCTTGAGAGTAGAAAAAAAGAGTGTTGACACAAAAACTTGCATTGGACTCCAACA
ATCTACATGCTATTGACTCAAAAGCCAATACAACTTCATGGACCATTATCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ25TF U 1
AF RR2CQ25JQ C 358
BS 1 706 RR2CQ25TF
BS 707 1073 RR2CQ25JQ

RD RR2CQ25TF 706 0 0
GGGGACCTGCTTGTGTTTGGTAAAATCCGTGCTGTCTTGGGAGGTCAACTCCGTTACTTG
CTCTCTGGAGGAGCCCCTCTTTCTGGTGACACTCAGAGATTCATTAACATATGCGTTGGG
GCTCCAATCGGTCAGGGATATGGACTAACAGAGACTTGTGCTGGGGGAACCTTCTCGGAG
TTTGATGATACGCCTGTTGGGCGTGTGGGTGCTCCACTTCCTTGCTCCTTTGTTAAGCTA
ATAGACTGGCCGGAAGGCGGGTACTTAATCAGTGATAAGCCAATGCCCCGTGGTGAAATT
GTAATTGGTGGCTCTAATATTACACTTGGGTATTTCAAGAATGAAGAGAAGACTAAAGAA
GTTTACAAGGTTGATGAAAAGGGGATGAGGTGGTTCTACACAGGAGACATAGGACAGTTT
CACCCTGATGGTTGCCTTGAGATTATAGACAGAAAGAAGGATATTGTTAAACTTCAGCAT
GGGGAATATGTCTCCTTGGGCAAAGTGGAAGCTGCTCTCAGTATAAGCCCATACGTTGAA
AACATAATGGTTCATGCTGATCCGTTTTACTCTTACTGTGTGGCTCTTGTGGTTGCTGCG
CAACAAACGCTTGAAGGTTCGGCGTCAAAGCAAGGAATAGAGTTCACCAACTTCGAAGAG
CTGTGTGCTAAAGAACAAACCGTGAAAGAAGTGTATGCGTCTCTTG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2CQ25JQ 716 0 0
GAAGTTTACAAGGTTGATGAAAAGGGGATGAGGTGGTTCTACACAGGAGACATAGGACAG
TTTCACCCTGATGGTTGCCTTGAGATTATAGACAGAAAGAAGGATATTGTTAAACTTCAG
CATGGGGAATATGTCTCCTTGGGCAAAGTGGAAGCTGCTCTCAGTATAAGCCCATACGTT
GAAAACATAATGGTTCATGCTGATCCGTTTTACTCTTACTGTGTGGCTCTTGTGGTTGCT
GCGCACCAAACGCTTGAAGGTTCGGCGTCAAAGCAAGGAATAGAGTTCACCAACTTCGAA
GAGCTGTGTGCTAAAGAACAAACCGTGAAAGAAGTGTATGCGTCTCTTGTTAAGGCGGCT
AAACAGTCGCGGTTGGAGAAGTTTGAGATACCATCAAAGATCAAGTTGTTGGCGGCTCCA
TGGACGCCAGAGTCAGGGTTAGTGACAGCAGCACTAAAGCTTAAAAGAGATGTAATTAGG
AAGGAGTTCTCTGAAGATCTCACCAAGCTATATGCTTCCTAAATCACTTCTTCTTTCGTC
TTCTACTATCTTTTTTTTTCAACTTTCTATAAACACACAACTTGTCTGTCTTGCTCTTTA
GTTGGTTTGCTTGAGAGTAGAAAAAAAGAGTGTTGACACAAAAACTTGCATTGGACTCCA
ACAATCTACATGCTATTGACTCAAAAGCCAATACAACTTCATGGACCATTATCATC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5583Contig1 1357 2 2 U
GGGATCCATACCCCAACAACTAAAAGGTATGATGAGTTTGTTTGAGGTTAATTTCTCAAA
TAACCTCTTGAGTGGTCCAGTTCCAGTCTTTGTCCCCTTTCAAAAATCTCCAAACTCGAG
CTTTTCCGGAAACAAAGAGCTTTGTGGAGCGCCGTTGAGCTCTTCCTGTGGATACTCAGA
TGATCTTGAACATATGAGGTACAACCACAGAGTCTCCTACAGGATTGTGCTTGCAGTGAT
TGGTTCAGGTGTTGCCGTCTTTGTCTCAGTCACTGTGGTGGTTCTTCTCTTCATGATGAG
GGAGAAACAAGAGAAAGCAGCGGCTAAAAACGTCGACGTTGAAGAAAACATCGAGGATGA
GCAACCGGAGATTATAGCTGGAAATGTCTTCCTTGAGAGTCTTAAACAAGGGATTGATCT
TGATGCAGTTGTGAAAGCAACTATGAAAGAGACAAACAAACTCAGCACAGGAACTTTCAG
TTCGGTTTACAAAGCCGTTATGCCTTCAGGGATGGTTGTCTCGGTGAAGAAACTCAAGTC
TATGGACAGAGCTATAACTAATCATCAGAACAAGATGATCGGAGAACTTGAGAGACTCAG
CAAACTTTGCCATGACCATTTGGTTACACCGATTGGGTTTGTTATATATGAAGATGTTGC
TCTCTTGTTGCATCAGCATTTACCTAATGGTAACTTAGCTCAGCTGATTCATGAGTCTGC
TAAGAAACCAGAGTACCAACCTGACTGGCCAATGAGACTGTCGATAGCCGTTGGTGTAGC
AGAAGGCTTGGCGTTTCTCCACCATGTCGCCATTATTCACCTTGATGTTTCCTCTAGTAA
TGTGTTGCTAGACTCTGGTTACAAACCTGTGCTTGGGGAAATCGAGATATCGAAACTTTT
GGATCCATCCAGAGGCACTGCAAGTATTAGCTCAGTTGCTGGCTCCTTTGGCTACATTCC
TCCAGAGTATGCATACACAATGCAAGTGACTGCACCAGGGAATGTATACAGCTACGGAGT
GGTGTTGCTTGAGATTCTAACCTCAAGAGCACCAGTGGAGGAAGAGTTTGGGGAAGGAGT
AGATTTGGTGAAATGGGTGCATGGAGCTTCAGGGAGAGGAGAAACACCGGAACAGATACT
TGATGCCAAGCTTAGCACAGTGTCCTTTGCTTGGAGGAGAGAGATGCTTGCAGCTCTGAA
AGTTGCATTGCTTTGCACAGACATCACACCTGCAAAAAGGCCGAAGATGAAGAAAGTAGT
TGAGATGCTTCAAGAGGTTAAGCAGAGCAAATGAGAGAGTGAATATGATGATGATACATA
GTTCCCTTTGTGATACTCATATAAGTGAGTTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV03TF U 1
AF RR2AV03JQ C 521
BS 1 727 RR2AV03TF
BS 728 1357 RR2AV03JQ

RD RR2AV03TF 727 0 0
GGGATCCATACCCCAACAACTAAAAGGTATGATGAGTTTGTTTGAGGTTAATTTCTCAAA
TAACCTCTTGAGTGGTCCAGTTCCAGTCTTTGTCCCCTTTCAAAAATCTCCAAACTCGAG
CTTTTCCGGAAACAAAGAGCTTTGTGGAGCGCCGTTGAGCTCTTCCTGTGGATACTCAGA
TGATCTTGAACATATGAGGTACAACCACAGAGTCTCCTACAGGATTGTGCTTGCAGTGAT
TGGTTCAGGTGTTGCCGTCTTTGTCTCAGTCACTGTGGTGGTTCTTCTCTTCATGATGAG
GGAGAAACAAGAGAAAGCAGCGGCTAAAAACGTCGACGTTGAAGAAAACATCGAGGATGA
GCAACCGGAGATTATAGCTGGAAATGTCTTCCTTGAGAGTCTTAAACAAGGGATTGATCT
TGATGCAGTTGTGAAAGCAACTATGAAAGAGACAAACAAACTCAGCACAGGAACTTTCAG
TTCGGTTTACAAAGCCGTTATGCCTTCAGGGATGGTTGTCTCGGTGAAGAAACTCAAGTC
TATGGACAGAGCTATAACTAATCATCAGAACAAGATGATCGGAGAACTTGAGAGACTCAG
CAAACTTTGCCATGACCATTTGGTTACACCGATTGGGTTTGTTATATATGAAGATGTTGC
TCTCTTGTTGCATCAGCATTTACCTAATGGTAACTTAGCTCAGCTGATTCATGAGTCTGC
TAAGAAA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2AV03JQ 837 0 0
TCGGTGAAGAAACTCAAGTCTATGGACAGAGCTATAACTAATCATCAGAACAAGATGATC
GGAGAACTTGAGAGACTCAGCAAACTTTGCCATGACCATTTGGTTACACCGATTGGGTTT
GTTATATATGAAGATGTTGCTCTCTTGTTGCATCAGCATTTACCTAATGGTAACTTAGCT
CAGCTGATTCATGAGTCTGCTAAGAAACCAGAGTACCAACCTGACTGGCCAATGAGACTG
TCGATAGCCGTTGGTGTAGCAGAAGGCTTGGCGTTTCTCCACCATGTCGCCATTATTCAC
CTTGATGTTTCCTCTAGTAATGTGTTGCTAGACTCTGGTTACAAACCTGTGCTTGGGGAA
ATCGAGATATCGAAACTTTTGGATCCATCCAGAGGCACTGCAAGTATTAGCTCAGTTGCT
GGCTCCTTTGGCTACATTCCTCCAGAGTATGCATACACAATGCAAGTGACTGCACCAGGG
AATGTATACAGCTACGGAGTGGTGTTGCTTGAGATTCTAACCTCAAGAGCACCAGTGGAG
GAAGAGTTTGGGGAAGGAGTAGATTTGGTGAAATGGGTGCATGGAGCTTCAGGGAGAGGA
GAAACACCGGAACAGATACTTGATGCCAAGCTTAGCACAGTGTCCTTTGCTTGGAGGAGA
GAGATGCTTGCAGCTCTGAAAGTTGCATTGCTTTGCACAGACATCACACCTGCAAAAAGG
CCGAAGATGAAGAAAGTAGTTGAGATGCTTCAAGAGGTTAAGCAGAGCAAATGAGAGAGT
GAATATGATGATGATACATAGTTCCCTTTGTGATACTCATATAAGTGAGTTTCTCCC

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 2

CO CL5584Contig1 740 2 1 U
GATCAAGGAACAGTCGTAGGAGGAGTTCGCGATATTGATCCAAATGCAAATGATCTCCAA
GTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAAGGAGGTGCGTTTCGTT
TCTATTACTATGTTTGCTTGATCGATGTTGTCTCGTAGCAGATCGATGAGTTTCTCGATC
GATCTTATGGCTAAATTGGAAATCGCCTGGGGATTGCGTAAATTTGATTAATGTAGTGTT
ATTGACCAGTTTTCATCTATAATAATCCAATTGATTCTGATCCTCATGTAGATTTGATTG
ATTGATTGGAGGATGATGATTCTTGTTTTGTGTACGCGCAGAACGTGACACTGGAGTACA
AGAGGCTCCTTGGTGCGAAAACGCAGGTTGTGGCGGGAACGATGCATCATCTTACCGTGG
AGGTGGCCGATGGTGAGACCAATAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGGG
AGAATCTCAAGCAGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAATTCCCAATATCTG
AGCTTGTCTGTCTATGCGGGAGGCTACGTGATAAGAGTCCCTGTTTAACCAAGTATATTT
TAAATAAGTGAATTTGAATCCAGTCCATGTGTTTGATTTGATGGGGTGTGTACGGAACTG
GTGATTTGTGTATCTCTTTGACTTTCGTTTGTGTATTATTGCAAGTTGTCACTTTATTAT
ATCTATCTACCATATGAATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A957JQ C 1
AF RR2A957TF U 1
BS 1 740 RR2A957TF

RD RR2A957JQ 740 0 0
GATCAAGGAACAGTCGTAGGAGGAGTTCGCGATATTGATCCAAATGCAAATGATCTCCAA
GTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAAGGAGGTGCGTTTCGTT
TCTATTACTATGTTTGCTTGATCGATGTTGTCTCGTAGCAGATCGATGAGTTTCTCGATC
GATCTTATGGCTAAATTGGAAATCGCCTGGGGATTGCGTAAATTTGATTAATGTAGTGTT
ATTGACCAGTTTTCATCTATAATAATCCAATTGATTCTGATCCTCATGTAGATTTGATTG
ATTGATTGGAGGATGATGATTCTTGTTTTGTGTACGCGCAGAACGTGACACTGGAGTACA
AGAGGCTCCTTGGTGCGAAAACGCAGGTTGTGGCGGGAACGATGCATCATCTTACCGTGG
AGGTGGCCGATGGTGAGACCAATAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGGG
AGAATCTCAAGCAGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAATTCCCAATATCTG
AGCTTGTCTGTCTATGCGGGAGGCTACGTGATAAGAGTCCCTGTTTAACCAAGTATATTT
TAAATAAGTGAATTTGAATCCAGTCCATGTGTTTGATTTGATGGGGTGTGTACGGAACTG
GTGATTTGTGTATCTCTTTGACTTTCGTTTGTGTATTATTGCAAGTTGTCACTTTATTAT
ATCTATCTACCATATGAATC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2A957TF 740 0 0
GATCAAGGAACAGTCGTAGGAGGAGTTCGCGATATTGATCCAAATGCAAATGATCTCCAA
GTCGAGAGTCTCGCTCGTTTCGCTGTCGATGAGCACAACAAGAAGGAGGTGCGTTTCGTT
TCTATTACTATGTTTGCTTGATCGATGTTGTCTCGTAGCAGATCGATGAGTTTCTCGATC
GATCTTATGGCTAAATTGGAAATCGCCTGGGGATTGCGTAAATTTGATTAATGTAGTGTT
ATTGACCAGTTTTCATCTATAATAATCCAATTGATTCTGATCCTCATGTAGATTTGATTG
ATTGATTGGAGGATGATGATTCTTGTTTTGTGTACGCGCAGAACGTGACACTGGAGTACA
AGAGGCTCCTTGGTGCGAAAACGCAGGTTGTGGCGGGAACGATGCATCATCTTACCGTGG
AGGTGGCCGATGGTGAGACCAATAAGGTCTACGAGGCCAAGGTTTTGGAGAAAGCCTGGG
AGAATCTCAAGCAGTTGGAGCACTTCAACCACGTTCGCGATGTTTAATTCCCAATATCTG
AGCTTGTCTGTCTATGCGGGAGGCTACGTGATAAGAGTCCCTGTTTAACCAAGTATATTT
TAAATAAGTGAATTTGAATCCAGTCCATGTGTTTGATTTGATGGGGTGTGTACGGAACTG
GTGATTTGTGTATCTCTTTGACTTTCGTTTGTGTATTATTGCAAGTTGTCACTTTATTAT
ATCTATCTACCATATGAATC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL5585Contig1 601 2 1 U
GAAAAAGCAAAAAAAAAAACAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAATAAGTGATTTTTGTCTTT
GCTAGTTTTTACTTTCTAGTGTGGAAAGACCATTAGTTTCTCAGTATCGTTCTTTCTTAT
TCTCTGATGTAATATGTCTCAAATCAGTTCTAATAAAACAAAGCGTTAAAAAAAAAGAAG
AATTAAAAAACGTCATGGCTAAGTTAGTTTCCATCATCACCCTCCTCTTCGCTGCTCTTG
TTTTATTCGCTGCTTTTGAAGCACCGACGATGGTGGAAGGACAACAACCAAAGTTCTGCA
AGAAGCAGAGTAAGACATGGTCAGGTTTATGTATAAAGAGTGGTTCGTGCAAGAACCAGT
GCATCCGCAACGAGAAGGCAGCTCATGGTTCTTGCAATTATATCTTTCCAATTCACAAGT
GTATCTGCTACTACCCATGTTAATCTACCAAAATCTTGGGTATGATGTTGTTGCGTTTAT
TTATATATTGTGGTGTTTATTTACATTTCAATTAGTCTGTGTCACTCTTTTAGTGACTTT
TATGGCATGTGCAATGTATGCTTATGTTGGTTTTCAATAGTACAAACTGTTATGCACGAC
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2GF38TF U 1
AF RR2GF38JQ C 230
BS 1 601 RR2GF38TF

RD RR2GF38TF 601 0 0
GAAAAAGCAAAAAAAAAAACAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAATAAGTGATTTTTGTCTTT
GCTAGTTTTTACTTTCTAGTGTGGAAAGACCATTAGTTTCTCAGTATCGTTCTTTCTTAT
TCTCTGATGTAATATGTCTCAAATCAGTTCTAATAAAACAAAGCGTTAAAAAAAAAGAAG
AATTAAAAAACGTCATGGCTAAGTTAGTTTCCATCATCACCCTCCTCTTCGCTGCTCTTG
TTTTATTCGCTGCTTTTGAAGCACCGACGATGGTGGAAGGACAACAACCAAAGTTCTGCA
AGAAGCAGAGTAAGACATGGTCAGGTTTATGTATAAAGAGTGGTTCGTGCAAGAACCAGT
GCATCCGCAACGAGAAGGCAGCTCATGGTTCTTGCAATTATATCTTTCCAATTCACAAGT
GTATCTGCTACTACCCATGTTAATCTACCAAAATCTTGGGTATGATGTTGTTGCGTTTAT
TTATATATTGTGGTGTTTATTTACATTTCAATTAGTCTGTGTCACTCTTTTAGTGACTTT
TATGGCATGTGCAATGTATGCTTATGTTGGTTTTCAATAGTACAAACTGTTATGCACGAC
G

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2GF38JQ 372 0 0
CGCTGCTCTTGTTTTATTCGCTGCTTTTGAAGCACCGACGATGGTGGAAGGACAACAACC
AAAGTTTTGCAAGAAGCAGAGTAAGACATGGTCAGGTTTATGTATAAAGAGTGGTTCGTG
CAAGAACCAGTGCATCCGCAACGAGAAGGCAGCTCATGGTTCTTGCAATTATATCTTTCC
AATTCACAAGTGTATTTGCTACTACCCATGTTAATCTACCAAAATCTTGGGTATGATGTT
GTTGCGTTTATTTATATATTGTGGTGTTTATTTACATTTCAATTAGTCTGTGTCACTCTT
TTAGTGACTTTTATGGCATGTGCAATGTATGCTTATGTTGGTTTTCAATAGTACAAACTG
TTATGCACGACG

QA 1 372 1 372
DS 



AS 1 2

CO CL5586Contig1 368 2 1 U
GGATCTGCCTCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAAAT
GACTTTCTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGTGCGGTTTCTCAGACCGGTAA
TGTTCCAGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTCTCCGCTACATGTCGACCAAGCTTTTTGTCGG
TGGTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGGAAGTGCGTTCATATCAGCAACCAGCGATTAA
GAATGAATATGATTTGTGGTTGTAGTACCGATAATACTCTAGTTTCCGAAGTTATTCGTT
TTGTTTTTGTTGTAACAGTTGAAAACAAGATCCTTGTCTGGTTTCGTTTTGTTTGGACAA
TTGTTTTA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BO43JQ C 1
AF RR2BO43TF U 1
BS 1 368 RR2BO43TF

RD RR2BO43JQ 368 0 0
GGATCTGCCTCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAAAT
GACTTTCTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGTGCGGTTTCTCAGACCGGTAA
TGTTCCAGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTTTCCGCTACATGTCGACCAAGCTTTTTGTCGG
TGGTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGGAAGTGCGTTCATATCAGCAACCAGCGATTAA
GAATGAATATGATTTGTGGTTGTAGTACCGATAATACTCTAGTTTCCGAAGTTATTCGTT
TTGTTTTTGTTGTAACAGTTGAAAACAAGATCCTTGTCTGGTTTCGTTTTGTTTGGACAA
TTGTTTTA

QA 1 368 1 368
DS 

RD RR2BO43TF 368 0 0
GGATCTGCCTCTCTCTCAGTTTACCAGAACCCTAGTTTCGAAGCTTTACTCCCCAGAAAT
GACTTTCTGCAAAAGTCTCGGTGGTCTATTGAGGCAAGGTGCGGTTTCTCAGACCGGTAA
TGTTCCAGTTCAGTCTATGCTCGGTTCTCTCCGCTACATGTCGACCAAGCTTTTTGTCGG
TGGTCTCTCATGGGGTACTGACGACCAGGAAGTGCGTTCATATCAGCAACCAGCGATTAA
GAATGAATATGATTTGTGGTTGTAGTACCGATAATACTCTAGTTTCCGAAGTTATTCGTT
TTGTTTTTGTTGTAACAGTTGAAAACAAGATCCTTGTCTGGTTTCGTTTTGTTTGGACAA
TTGTTTTA

QA 1 368 1 368
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5588Contig1 918 2 6 U
GGACCCCTTCTGTATCAATATTATCGGAGACTCAGATCGAGCCTAGACCTGCAAATTAAA
GCTGTTGTTCAATTTCACGGAAGAAGAAGACTCAGAATGGATACTTTCAGCGCGGAGGAC
CTGTCGACAATCGGGGGAATCGCGACAGTATCTCTCCTTCATTCATTCATTCCCACGCAT
TGGTTACCTTTCTCCCATCGTTGGTCGCGCTCAGAAATGGACTCTTTCCCAGAACCCTCT
TCGTCACTGCGTTTGGAGCAGTCCTGCATGTCATATCCACTGCCCTCCTTGGTATAACAG
CCATCACAATGGCCAACACCATCGCCGGTGAAGAGACTGTTCACAAGCTTGCTTCCCTTT
TGCTTGTGTTTCTCGGCGGAAGCTATATCTTGCTGTTTTTGGCTGGTAAAGGAGGTCACA
CTCATTCTCATAACCAACCCATGGAGAAAATGGCTGTTGCTGGGCTTGTCCTTGTTCCCG
CGTTATCTCCTTGTGCAACCACTCTCCCTGTTTTCCTCGCTGTTGGAAACTCAAAGCCCA
TGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTGCTGATTAGCACCATTTTGGTGATGACGTCGCTGG
TAGCTCTATCGTTTTATGGTGCAAGCCAGCTGAAGTTTCACTGGGTGGAAAGATACGACA
AACTACTGGTTGGTTCTGTCCTGTGTCTGGTAGGTGTCTTAACCCTTCTCTTCCATGATC
ACGACCACCATGGTGGTCATGAAGCACATCAACTACACAGGAAAATCATTATTCTCTAGA
GACCGCTTCTGTTTTGCGTGTTTTTGTCTTTGTTGTAGAGCGGCCTTAATGTCTTCTCAC
CTTGTATGTCTATAACTAGTTGTAACGCACTCTGTTGCACGTTAAGAATTCATATAGCAC
TGGCAGTGTTAAATTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC52TF U 1
AF RR2BC52JQ C 53
BS 1 195 RR2BC52TF
BS 196 196 RR2BC52JQ
BS 197 229 RR2BC52TF
BS 230 230 RR2BC52JQ
BS 231 834 RR2BC52TF
BS 835 918 RR2BC52JQ

RD RR2BC52TF 834 0 0
GGACCCCTTCTGTATCAATATTATCGGAGACTCAGATCGAGCCTAGACCTGCAAATTAAA
GCTGTTGTTCAATTTCACGGAAGAAGAAGACTCAGAATGGATACTTTCAGCGCGGAGGAC
CTGTCGACAATCGGGGGAATCGCGACAGTATCTCTCCTTCATTCATTCATTCCCACGCAT
TGGTTACCTTTCTCC*ATCGTTGGTCGCGCTCAGAAATGGACTCTTTCC*AGAACCCTCT
TCGTCACTGCGTTTGGAGCAGTCCTGCATGTCATATCCACTGCCCTCCTTGGTATAACAG
CCATCACAATGGCCAACACCATCGCCGGTGAAGAGACTGTTCACAAGCTTGCTTCCCTTT
TGCTTGTGTTTCTCGGCGGAAGCTATATCTTGCTGTTTTTGGCTGGTAAAGGAGGTCACA
CTCATTCTCATAACCAACCCATGGAGAAAATGGCTGTTGCTGGGCTTGTCCTTGTTCCCG
CGTTATCTCCTTGTGCAACCACTCTCCCTGTTTTCCTCGCTGTTGGAAACTCAAAGCCCA
TGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTGCTGATTAGCACCATTTTGGTGATGACGTCGCTGG
TAGCTCTATCGTTTTATGGTGCAAGCCAGCTGAAGTTTCACTGGGTGGAAAGATACGACA
AACTACTGGTTGGTTCTGTCCTGTGTCTGGTAGGTGTCTTAACCCTTCTCTTCCATGATC
ACGACCACCATGGTGGTCATGAAGCACATCAACTACACAGGAAAATCATTATTCTCTAGA
GACCGCTTCTGTTTTGCGTGTTTTTGTCTTTGTTGTAGAGCGGCCTTAATGTCT

QA 1 834 1 834
DS 

RD RR2BC52JQ 866 0 0
AAATTAAAGCTGTTGTTCAATTTCACGGAAGAAGAAGACTCAGAATGGATACTTTCAGCG
CGGAGGACCTGTCGACAATCGGGGGAATCGCGACAGTATCTCTCCTTCATTCATTCATTC
CCACGCATTGGTTACCTTTCTCCCATCGTTGGTCGCGCTCAGAAATGGACTCTTTCCCAG
AACCCTCTTCGTCACTGCGTTTGGAGCAGTCCTGCATGTCATATCCACTGCCCTCCTTGG
TATAACAGCCATCACAATGGCCAACACCATCGCCGGTGAAGAGACTGTTCACAAGCTTGC
TTCCCTTTTGCTTGTGTTTCTCGGCGGAAGCTATATCTTGCTGTTTTTGGCTGGTAAAGG
AGGTCACACTCATTCTCATAACCAACCCATGGAGAAAATGGCTGTTGCTGGGCTTGTCCT
TGTTCCCGCGTTATCTCCTTGTGCAACCACTCTCCCTGTTTTCCTCGCTGTTGGAAACTC
AAAGCCCATGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTGCTGATTAGCACCATTTTGGTGATGAC
GTCGCTGGTAGCTCTATCGTTTTATGGTGCAAGCCAGCTGAAGTTTCACTGGGTGGAAAG
ATACGACAAACTACTGGTTGGTTCTGTCCTGTGTCTGGTAGGTGTCTTAACCCTTTTCTT
CCATGATCACGACCACCATGGTGGTCATGAAGCACATCAACTACACAGGAAAATCATTAT
TCTCTAGAGACCGCTTCTGTTTTGCGTGTTTTTGTCTTTGTTGTAGAGCGGCCTTAATGT
CTTCTCACCTTGTATGTCTATAACTAGTTGTAACGCACTCTGTTGCACGTTAAGAATTCA
TATAGCACTGGCAGTGTTAAATTCCG

QA 1 866 1 866
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5590Contig1 1107 2 6 U
GTAGGAGGGACATCCAAGAAGGAGCAAGCGAAAACGCATTTGTGGGGAAATGTAAAAACG
AAGACAGACAAGAAGTTACTATTGTATATGTTGTCTGCAACAAGTTCAACCGTATCACCA
TTGTTAAAGGAGTTGGAACTTTTTGGTCAAAAGAAATTTACTGCCAGTGCCTAACTCCTT
TCATATTTTTAGTGACGACTGTAATCACAAAACTACTTGGTGGTGATTACATGAAGCAGA
GGTCCGCCAAAGTAGATTCACAGCTGTAGATAAACCACTGAAAACGACCTGCTGACCATC
GGTTGTAAAATAAAGGCCAACAGAGGCTCTAATTCGTTAATGTGTCCAAAATTTGGCAAG
GGTTGCGTTGCCGGAGTTGCCAAGTACAGTTCTCCAACCTCGAGAAATCCCTTATGCACT
AGGCTATGTTTCAGAGCATGATATATCGAATACATTGATATTGATATAAGTTCCCTTTGG
TAAAGTTGTGAGATGTCTGAGCTGTTTGGTTGGCTTTACTGTTGCACAAACCCAACAAGG
AGTTCAGATACGTTCCTCCGTGGGACAAAGGGCTAAGCCTAATCCAGATAAAGAAGAACA
AAGTCACTTCTTCCATGCACTCTTTAGTGGTACAAAATTCTTCGGATACAGCACAAGCGT
ACCAGTTTGGCGCTGAGACAGCTGACCTCCCTGTGCAAGAAGAAGAAAGGTGACAATTTG
ATTTGATGTTCAATAACATGTTTACAGAGAAGTGGGACCTTTTAAGTTTACTCCCAAACA
GAACAAACAAGAAAGCATTTCTCAACTGATAGAGCAGATCATGGAACTCGAAAACCTTGA
AGAGAAATGTAAACTTCAGGCTGAAGCAAAAGATGAGTCAGAGAGAATTCTCAGCTCTCA
ACCTTAAACCTCTAAATCAACAGAAAAAACTGGTGAGGAAACCATTATCATCAATCATCA
CAACATAGCTCATCCTCATGGTAAGCAAATCATCTTACGGCGACATATGTATGGCCTTAA
TAATGTCTGCTGCGGAACTGAAACCTAGATTCTTCAATCTTCAGTGACATAAACCTGTGG
AATGTTGAGTTTATGATGATATACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ68TF U 1
AF RR2DD36TF U 375
BS 1 420 RR2EJ68TF
BS 421 421 RR2DD36TF
BS 422 468 RR2EJ68TF
BS 469 469 RR2DD36TF
BS 470 677 RR2EJ68TF
BS 678 1107 RR2DD36TF

RD RR2EJ68TF 677 0 0
GTAGGAGGGACATCCAAGAAGGAGCAAGCGAAAACGCATTTGTGGGGAAATGTAAAAACG
AAGACAGACAAGAAGTTACTATTGTATATGTTGTCTGCAACAAGTTCAACCGTATCACCA
TTGTTAAAGGAGTTGGAACTTTTTGGTCAAAAGAAATTTACTGCCAGTGCCTAACTCCTT
TCATATTTTTAGTGACGACTGTAATCACAAAACTACTTGGTGGTGATTACATGAAGCAGA
GGTCCGCCAAAGTAGATTCACAGCTGTAGATAAACCACTGAAAACGACCTGCTGACCATC
GGTTGTAAAATAAAGGCCAACAGAGGCTCTAATTCGTTAATGTGTCCAAAATTTGGCAAG
GGTTGCGTTGCCGGAGTTGCCAAGTACAGTTCTCCAACCTCGAGAAATCCCTTATGCACT
GGGCTATGTTTCAGAGCATGATATATCGAATACATTGATATTGATATAGGTTCCCTTTGG
TAAAGTTGTGAGATGTCTGAGCTGTTTGGTTGGCTTTACTGTTGCACAAACCCAACAAGG
AGTTCAGATACGTTCCTCCGTGGGACAAAGGGCTAAGCCTAATCCAGATAAAGAAGAACA
AAGTCACTTCTTCCATGCACTCTTTAGTGGTACAAAATTCTTCGGATACAGCACAAGCGT
ACCAGTTTGGCGCTGAG

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2DD36TF 733 0 0
G
GTTGCCAAGTACAGTTCTCCAACCTCGAGAAATCCCTTATGCACTAGGCTATGTTTCAGA
GCATGATATATCGAATACATTGATATTGATATAAGTTCCCTTTGGTAAAGTTGTGAGATG
TCTGAGCTGTTTGGTTGGCTTTACTGTTGCACAAACCCAACAAGGAGTTCAGATACGTTC
CTCCGTGGGACAAAGGGCTAAGCCTAATCCAGATAAAGAAGAACAAAGTCACTTCTTCCG
TGCACTCTTTAGTGGTACAAAATTCTTCGGATACAGCACAAGCGTACCAGTTTGGCGCTG
AGACAGCTGACCTCCCTGTGCAAGAAGAAGAAAGGTGACAATTTGATTTGATGTTCAATA
ACATGTTTACAGAGAAGTGGGACCTTTTAAGTTTACTCCCAAACAGAACAAACAAGAAAG
CATTTCTCAACTGATAGAGCAGATCATGGAACTCGAAAACCTTGAAGAGAAATGTAAACT
TCAGGCTGAAGCAAAAGATGAGTCAGAGAGAATTCTCAGCTCTCAACCTTAAACCTCTAA
ATCAACAGAAAAAACTGGTGAGGAAACCATTATCATCAATCATCACAACATAGCTCATCC
TCATGGTAAGCAAATCATCTTACGGCGACATATGTATGGCCTTAATAATGTCTGCTGCGG
AACTGAAACCTAGATTCTTCAATCTTCAGTGACATAAACCTGTGGAATGTTGAGTTTATG
ATGATATACATG

QA 2 733 2 733
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5592Contig1 883 2 2 U
AAGATGATTTGAACGGTAGACCCGATTAGAGAGAGAGAGATTAAAAAGAAAGATTTTACC
ACACGCAAAGGGTTCCTCATATGGATTTAAGTCACCTTCTTCCTCTAGCAGAGCTCTCTC
GTGATTGATTTGAAGCTCTACCTGATGAGATCCATCGATCATCGTCTAATGGAGGAATCG
TCTTCCTCTTCTTCCCACTATTTCTCAATTTTCACGAACTATCCTCTGCTTTCCTCCGTC
TTAGCTTTCACCATCGCACAATTCATCAAGTTCTTCACCACCTGGTATAAAGAAAAGAGA
CGTGATCTGAAACGGCTTGTTGGGTCTGGAGGAATGCCTTCTTCACATTCAGCAACCGTT
ACAGCTCTTGCTATGGCCGTTGGTTTACAAGAAGGCTTTGGTGGATCTCTTTTTGCCATC
GCTTCCATTCTCACTTCCATTGTTATGTATGATGCAACTGGTGTAAGATTACATGCTGGA
CGCCAAGCTGAGGTTCTCAATCAGATTGTCTATGAACTTCCTTCAGAGCATCCCCTTGCT
GAAAGCAGACCCTTGCGTGAACTTCTAGGTCATACCCCTCCACAGGTCATTGCGGGTGGG
ATCCTTGGAACTGCTACAGCTGTTGTTGGCTACTTAGTCACCTTGACAGACAAGTAGCCT
AAGGTGCAGCAAGACCTCACCTCTTCTGCTCCACCGTGTGTGAAAGCCCCACTTGTATGT
AACTGAAAGAGCAAATGGACTCTTGAAACTAGGTTCACTGACCCCAGTTTCTTTTTCGCT
GCTTAGCTCTTATCACTGATAACATAGTATAGGTTTGGGTCTTGCAAAGAAAACATGAAA
AAGTCATTACACGGATCTATGATGTGGTAACGGAGAAGCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK90TF U 1
AF RR2FK90JQ C 228
BS 1 522 RR2FK90TF
BS 523 883 RR2FK90JQ

RD RR2FK90TF 522 0 0
AAGATGATTTGAACGGTAGACCCGATTAGAGAGAGAGAGATTAAAAAGAAAGATTTTACC
ACACGCAAAGGGTTCCTCATATGGATTTAAGTCACCTTCTTCCTCTAGCAGAGCTCTCTC
GTGATTGATTTGAAGCTCTACCTGATGAGATCCATCGATCATCGTCTAATGGAGGAATCG
TCTTCCTCTTCTTCCCACTATTTCTCAATTTTCACGAACTATCCTCTGCTTTCCTCCGTC
TTAGCTTTCACCATCGCACAATTCATCAAGTTCTTCACCACCTGGTATAAAGAAAAGAGA
CGTGATCTGAAACGGCTTGTTGGGTCTGGAGGAATGCCTTCTTCACATTCAGCAACCGTT
ACAGCTCTTGCTATGGCCGTTGGTTTACAAGAAGGCTTTGGTGGATCTCTTTTTGCCATC
GCTTCCATTCTCACTTCCATTGTTATGTATGATGCAACTGGTGTAAGATTACATGCTGGA
CGCCAAGCTGAGGTTCTCAATCAGATTGTCTATGAACTTCCT

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2FK90JQ 656 0 0
GCTTTCCTCCGTCTTAGCTTTCACCATCGCACAATTCATCAAGTTCTTCACCAC*TGGTA
TAAAGAAAAGAGACGTGATCTGAAACGGCTTGTTGGGTCTGGAGGAATGCCTTCTTCACA
TTCAGCAACCGTTACAGCTCTTGCTATGGCCGTTGGTTTACAAGAAGGCTTTGGTGGATC
TCTTTTTGCCATCGCTTCCATTCTCACTTCCATTGTTATGTATGATGCAACTGGTGTAAG
ATTACATGCTGGACGCCAAGCTGAGGTTCTCAATCAGATTGTCTATGAACTTCCTTCAGA
GCATCCCCTTGCTGAAAGCAGACCCTTGCGTGAACTTCTAGGTCATACCCCTCCACAGGT
CATTGCGGGTGGGATCCTTGGAACTGCTACAGCTGTTGTTGGCTACTTAGTCACCTTGAC
AGACAAGTAGCCTAAGGTGCAGCAAGACCTCACCTCTTCTGCTCCACCGTGTGTGAAAGC
CCCACTTGTATGTAACTGAAAGAGCAAATGGACTCTTGAAACTAGGTTCACTGACCCCAG
TTTCTTTTTCGCTGCTTAGCTCTTATCACTGATAACATAGTATAGGTTTGGGTCTTGCAA
AGAAAACATGAAAAAGTCATTACACGGATCTATGATGTGGTAACGGAGAAGCTTAT

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL5593Contig1 1065 2 2 U
GGGTGTCAACTCTCCTCCCCTCTAAGTTAGCCGTCTCAGAAAATGTCTCGCAACTGCCAT
CCAGATTGCCAAAGAGCAGCCGCTGCCAAAGAAGAAGATGATTCTGCTGAGAGAGCCGCT
ACGGTAGCAGCTAACCTGATCAGCACTGCGCGTCTGATCCTCAAGCTGGACCGTGAGTTT
ACAGAGTACTCAGCTCAGTTCCTGGTGGACAACTCCCTCGTCGAGAAGGAGCCAGCGCAG
GAAGGTCCACAGCCCTCCACGCTTAAGATCGAGGACTGCATTGAGTATCTGGTGAACATG
GCTTCTCCCAAGACCGAGGCCGAGCTGGAAGAGATGGAGAAAGAAAGACAGCGACGCGCC
AAGATAACTGTAAAGGACTGCCTCGAGTGTGCCTTCAAGGAAGGGATACCGAGATACGAA
CACTGGGGGCACTTGGGTTGTGTTTCCAAGGTTCCCCCGTTTGCTGCTCTGATGCCTCGC
GTTCCCGTGAAAGGAGAAGTGGTCGAGGCTAAGGAGCTGAAAGACGCGTTTAAGCTGTTG
CAGGATGGACCGGTGGGAGCAAAGCTGCATGTCTTCAGTCCTGAGATTGATCTTGTCGGA
GAACATGGAGTTTACGATGTGGCAGGTGGTGGATCAAGCTACGTTGGGCTTAGGGACGTG
ATCCTGGTAGCAGTGGACGAGATCAATGGAGAAGCAGTTGGGACAGTGAAGATTCGCTAC
AAGAAGAAGACTCGGTTCATCAATGTGTCTTTGCGCCGTATGTTCACCTCACTAGCGCTC
AATAGCGACGAGTCTCAGGCCATTGCGCCGACGGGTCTTCTCGTTGACTTCATCGTCCCT
CGCTTGTCCAAGTGAGAAAACAAGATCTTCAATGATCTTGTGGTAAGTATCTAAGTAAAC
CAGATCCTAGGATCTTTGGTTAGTATCTAGAGAGAACAATATGGTATGTAATAAGTGAAG
TATTGTGAAAACCTTATGCTGTTTGTTTGACTTTTGTTTATCGTTTGATGTTTGTCTGTT
TCTAGGAGACTCTTATCTATCTATCAGTAAAGAAGTTATGATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E624TF U 1
AF RR2E624JQ C 332
BS 1 621 RR2E624TF
BS 622 1065 RR2E624JQ

RD RR2E624TF 621 0 0
GGGTGTCAACTCTCCTCCCCTCTAAGTTAGCCGTCTCAGAAAATGTCTCGCAACTGCCAT
CCAGATTGCCAAAGAGCAGCCGCTGCCAAAGAAGAAGATGATTCTGCTGAGAGAGCCGCT
ACGGTAGCAGCTAACCTGATCAGCACTGCGCGTCTGATCCTCAAGCTGGACCGTGAGTTT
ACAGAGTACTCAGCTCAGTTCCTGGTGGACAACTCCCTCGTCGAGAAGGAGCCAGCGCAG
GAAGGTCCACAGCCCTCCACGCTTAAGATCGAGGACTGCATTGAGTATCTGGTGAACATG
GCTTCTCCCAAGACCGAGGCCGAGCTGGAAGAGATGGAGAAAGAAAGACAGCGACGCGCC
AAGATAACTGTAAAGGACTGCCTCGAGTGTGCCTTCAAGGAAGGGATACCGAGATACGAA
CACTGGGGGCACTTGGGTTGTGTTTCCAAGGTTCCCCCGTTTGCTGCTCTGATGCCTCGC
GTTCCCGTGAAAGGAGAAGTGGTCGAGGCTAAGGAGCTGAAAGACGCGTTTAAGCTGTTG
CAGGATGGACCGGTGGGAGCAAAGCTGCATGTCTTCAGTCCTGAGATTGATCTTGTCGGA
GAACATGGAGTTTACGATGTG

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2E624JQ 734 0 0
AGATGGAGAAAGAAAGACAGCGACGCGCCAAGATAACTGTAAAGGACTGCCTCGAGTGTG
CCTTCAAGGAAGGGATACCGAGATACGAACACTGGGGGCACTTGGGTTGTGTTTCCAAGG
TTCCCCCGTTTGCTGCTCTGATGCCTCGCGTTCCCGTGAAAGGAGAAGTGGTCGAGGCTA
AGGAGCTGAAAGACGCGTTTAAGCTGTTGCAGGATGGACCGGTGGGAGCAAAGCTGCATG
TCTTCAGTCCTGAGATTGATCTTGTCGGAGAACATGGAGTTTACGATGTGGCAGGTGGTG
GATCAAGCTACGTTGGGCTTAGGGACGTGATCCTGGTAGCAGTGGACGAGATCAATGGAG
AAGCAGTTGGGACAGTGAAGATTCGCTACAAGAAGAAGACTCGGTTCATCAATGTGTCTT
TGCGCCGTATGTTCACCTCACTAGCGCTCAATAGCGACGAGTCTCAGGCCATTGCGCCGA
CGGGTCTTCTCGTTGACTTCATCGTCCCTCGCTTGTCCAAGTGAGAAAACAAGATCTTCA
ATGATCTTGTGGTAAGTATCTAAGTAAACCAGATCCTAGGATCTTTGGTTAGTATCTAGA
GAGAACAATATGGTATGTAATAAGTGAAGTATTGTGAAAACCTTATGCTGTTTGTTTGAC
TTTTGTTTATCGTTTGATGTTTGTCTGTTTCTAGGAGACTCTTATCTATCTATCAGTAAA
GAAGTTATGATGAC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL5594Contig1 1273 2 12 U
GGGCTCGTGAGAAGAACACAATTGGATCTGAGCTCTCTCTCTAACTCGAAATCAAACGAC
GAAACCCTATCCTACCTCTCCAATGGATCTCTCACCTCGTCTCTCATCGATCCTCCTCAT
CCTCCTCCTCCTCACCATCATCACCACATCCTCCAACCGTCTTCACCGAGAACGACGCCG
ATCAGTACTCCCTCGTCTTCGCCAACTGCCTCCAGAACGTCAAAGTCACCATGGACGTCA
GATCCGCCATGTACAACCTCGAAGGGAAGAGCGGAGGACGAGATTACCTCTCCGCCGGGA
GAACCGTCCTCCCGAAAGTCTACTTCCTCTTCTCAATCATCTACTTCTCCCTCGCCGCCA
CGTGGATCTACGTCCTCTTCAAGAAACGACGCACCGTCTTCGCGACCCACTTCTTCATGC
TCGGCGTCGTCGTTTTGAAAGCTCTCAATCTCCTCTGCGAGGCGGAGGATAAGTCGTACA
TCAAGGAAACAGGATCCGGCCATGGATGGGATGTGCTGTTCTACATCTTCAGTTTCCTCA
AAGGAATCACTCTCTTCACTCTCATCGTCTTGATCGGGACGGGTTGGTCTTTCTTGAAGC
CTTACTTGCAGGACAAGGAGAAGAAAGTGTTGATGATAGTCATCCCTCTCCAGGTTGTTG
CTAATTTCGCGCAGGTGGTTATCGACGAGACGGGGCCTTATGGCCAAGACTGGGTCACGT
GGAAACAGATCTTTTTACTCGTTGACGTGGTGTGTTGCTGTGCTGTTTTGTTTCCCATTG
TTTGGTCTATCAAGAACTTGCGCGAGGCGGCGAAGACTGATGGGAAGGCTGCTGTGAATT
TGGTTAAGCTGACTCTGTTTAGGCATTACTATATTGTGGTAATCTGTTATATCTACTTTA
CTCGCGTTGTTGTCTATGCGTTGGAGACTATTACCTCGTACAAGTATATGTGGACTAGCG
TTGTGGCTAGCGAGTTCTACTTTGGCGTTCTATCTGTTTACTGGTTACAAGTTCAGGCCG
GAGGTGCATAACCCGTACTTTGTTGTTGATGATGATGAGGAAGAGGCTGCAGCTGAAGCC
TTGAAGCTTGAAGACGAGTTTGAATTGTAATTCATGATTTAGAGTACATGGGATCATTAT
CAGGACTTATCTGGTAAACCAGCATCTCTTACATGGTTTTTTTTTCTTCTTAATTTTTTT
TTCTTTTTATAATGTAATCCATGTTTTGTTTGATTGAGTTGTTAGGACATGACTCCTATA
TCGTGTCTTATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO20TF U 1
AF RR2FO20JQ C 457
BS 1 674 RR2FO20TF
BS 675 675 RR2FO20JQ
BS 676 694 RR2FO20TF
BS 695 695 RR2FO20JQ
BS 696 706 RR2FO20TF
BS 707 707 RR2FO20JQ
BS 708 735 RR2FO20TF
BS 736 736 RR2FO20JQ
BS 737 755 RR2FO20TF
BS 756 756 RR2FO20JQ
BS 757 767 RR2FO20TF
BS 768 1273 RR2FO20JQ

RD RR2FO20TF 767 0 0
GGGCTCGTGAGAAGAACACAATTGGATCTGAGCTCTCTCTCTAACTCGAAATCAAACGAC
GAAACCCTATCCTACCTCTCCAATGGATCTCTCACCTCGTCTCTCATCGATCCTCCTCAT
CCTCCTCCTCCTCACCATCATCACCACATCCTCCAACCGTCTTCACCGAGAACGACGCCG
ATCAGTACTCCCTCGTCTTCGCCAACTGCCTCCAGAACGTCAAAGTCACCATGGACGTCA
GATCCGCCATGTACAACCTCGAAGGGAAGAGCGGAGGACGAGATTACCTCTCCGCCGGGA
GAACCGTCCTCCCGAAAGTCTACTTCCTCTTCTCAATCATCTACTTCTCCCTCGCCGCCA
CGTGGATCTACGTCCTCTTCAAGAAACGACGCACCGTCTTCGCGACCCACTTCTTCATGC
TCGGCGTCGTCGTTTTGAAAGCTCTCAATCTCCTCTGCGAGGCGGAGGATAAGTCGTACA
TCAAGGAAACAGGATCCGGCCATGGATGGGATGTGCTGTTCTACATCTTCAGTTTCCTCA
AAGGAATCACTCTCTTCACTCTCATCGTCTTGATCGGGACGGGTTGGTCTTTCTTGAAGC
CTTACTTGCAGGACAAGGAGAAGAAAGTGTTGATGATAGTCATCCCTCTCCAGGTTGTTG
CTAATTTCGCGCAG*TGGTTATCGACGAGACGGG*CCTTATGGCCA*GACTGGGTCACGT
GGAAACAGATCTTTT*ACTCGTTGACGTGGTGTGT*GCTGTGCTGTT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2FO20JQ 817 0 0
GCGAGGCGGAGGATAAGTCGTACATCAAGGAAACAGGATCCGGCCATGGATGGGATGTGC
TGTTCTACATCTTCAGTTTCCTCAAAGGAATCACTCTCTTCACTCTCATCGTCTTGATCG
GGACGGGTTGGTCTTTCTTGAAGCCTTACTTGCAGGACAAGGAGAAGAAAGTGTTGATGA
TAGTCATCCCTCTCCAGGTTGTTGCTAATTTCGCGCAGGTGGTTATCGACGAGACGGGGC
CTTATGGCCAAGACTGGGTCACGTGGAAACAGATCTTTTTACTCGTTGACGTGGTGTGTT
GCTGTGCTGTTTTGTTTCCCATTGTTTGGTCTATCAAGAACTTGCGCGAGGCGGCGAAGA
CTGATGGGAAGGCTGCTGTGAATTTGGTTAAGCTGACTCTGTTTAGGCATTACTATATTG
TGGTAATCTGTTATATCTACTTTACTCGCGTTGTTGTCTATGCGTTGGAGACTATTACCT
CGTACAAGTATATGTGGACTAGCGTTGTGGCTAGCGAGTTCTACTTTGGCGTTCTATCTG
TTTACTGGTTACAAGTTCAGGCCGGAGGTGCATAACCCGTACTTTGTTGTTGATGATGAT
GAGGAAGAGGCTGCAGCTGAAGCCTTGAAGCTTGAAGACGAGTTTGAATTGTAATTCATG
ATTTAGAGTACATGGGATCATTATCAGGACTTATCTGGTAAACCAGCATCTCTTACATGG
TTTTTTTTTCTTCTTAATTTTTTTTTCTTTTTATAATGTAATCCATGTTTTGTTTGATTG
AGTTGTTAGGACATGACTCCTATATCGTGTCTTATCT

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

CO CL5595Contig1 632 2 3 U
AAGAATTGTGTGAAGAACCCTTACCGTTTAACTGCACGGGATTCTCTTGCAGAACCTGTG
TTTTGGATGCCTGTTTCAGAAGTTAGGTTCTACCAAATTGCTCATACACTCCTCGACAAC
TCGACTTGGCCTGATCCTCAAAGTGTAGCGTCTTCACTCTCTCGTGCTGATGCTACGGTT
CTGAATCAGCAGCCAAATTGGTATTTGAGTCTAACACCAGAATACCGGCGGTGCGTAGAG
CCTGATTGGGTAGGCCATCCTAACCGCCTTACCTTCAAGATTAGGTATCTGATAAAGTTC
GTGAGAAACCGCACTGTTCACTATTGTCCAAATCAAGAGACCGAGGCTGATGTTCTTGAG
TACTTCAATCACACCTTCCCCCAGCTGCTATACCAGACCTATTACCTGATCAGCAAGGAA
TTTGGCACAGATCCATCTTTTGTTGATTTTGCACGTAACATAAAAAGGATATGATTTTAT
CTAGTTTATCGCACTTGCAAACAATTTTATCTTTAGAAACATGCAAGGCGATAAGAAGAA
GAGAACTGACTCTGAGGTTTTTAGAATGAATGTTATGACTTGGGGTATTATTACTCTCTG
CGTCACATCCTATATTTCGGATATTTAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D860TF U 197
AF RR2D860JQ C 1
BS 1 196 RR2D860JQ
BS 197 484 RR2D860TF
BS 485 632 RR2D860JQ

RD RR2D860TF 288 0 0
ATTGGTATTTGAGTCTAACACCAGAATACCGGCGGTGCGTAGAGCCTGATTGGGTAGGCC
ATCCTAACCGCCTTACCTTCAAGATTAGGTATCTGATAAAGTTCGTGAGAAACCGCACTG
TTCACTATTGTCCAAATCAAGAGACCGAGGCTGATGTTCTTGAGTACTTCAATCACACCT
TCCCCCAGCTGCTATACCAGACCTATTACCTGATCAGCAAGGAATTTGGCACAGATCCAT
CTTTTGTTGATTTTGCACGTAACATAAAAAGGATATGATTTTATCTAG

QA 1 288 1 288
DS 

RD RR2D860JQ 632 0 0
AAGAATTGTGTGAAGAACCCTTACCGTTTAACTGCACGGGATTCTCTTGCAGAACCTGTG
TTTTGGATGCCTGTTTCAGAAGTTAGGTTCTACCAAATTGCTCATACACTCCTCGACAAC
TCGACTTGGCCTGATCCTCAAAGTGTAGCGTCTTCACTCTCTCGTGCTGATGCTACGGTT
CTGAATCAGCAGCCAAATTGGTATTTGAGTCTAACACCAGAATACCGGCGGTGCGTAGAG
CCTGATTGGGTAGGCCATCCTAACCGCCTTACCTTCAAGATTAGGTATCTGATAAAGTTC
GTGAGAAACCGCACTGTTCACTATTGTCCAAATCAAGAGACCGAGGCTGATGTTCTTGAG
TACTTCAATCACACCTTCCCCCAGCTGCTATACCAGACCTATTACCTGATCAGCAAGGAA
TTTGGCACAGATCCATCTTTTGTTGATTTTGCACGTAACATAAAAAGGATATGATTTTAT
CTAGTTTATCGCACTTGCAAACAATTTTATCTTTAGAAACATGCAAGGCGATAAGAAGAA
GAGAACTGACTCTGAGGTTTTTAGAATGAATGTTATGACTTGGGGTATTATTACTCTCTG
CGTCACATCCTATATTTCGGATATTTAGTTCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL5596Contig1 707 2 1 U
GGGGTCACTTCACAATTCCCTCATGGCATATTCTATCACCTCGCAGAAAAATTCAAACTC
AAACAACAATGGCGACGAGCAACGGACCAGAGTTTGCAACGGCGGTGGCGGTTGCTACAA
AGCAAAGAACGTTCAAGAAGTTCTCATTCAGAGGATTCAACGTCGAAGCTCTTCCAAAAT
GTCCACATATAATCTCTCTAAGCTGTTCAACGCTCGTGTTCGAAGGAGATTCTATAGAGG
GCTAAAGAAGAAGCCTCTGATTCTGATCAAGAAGCTACGCAAGGCGAAGAAAGAAGCAAA
AGATGGGGACAAGAAGAAGCCTGAAGTGGTGAAAACGCATCTGAGGAACATGATCATTGT
CCCTGAGATGATTGGAAGTGTTGTCGGAGTGCATAACGGTAAGAAGTTTAACGAGGTCGT
GATTAAACCTGAGATGATTGGTCACTATCTTGCGGAGTTTTCGATGACTTGCAAGAAAGT
TGATCACTATAGACCACGTATACGTGGTTGTGGTTGTTACCGTAATTCCACCAGGTTTAT
TCCTCTGAGGTGATTTATATTATGCTCAATTTATTTTCTTGTTATGTTTTGTGTTTTCTC
TTCTTTAGAATGTTCTTTCACCTCTAATATAATTTGAAACTGCAACATAAAGTTATGTTG
TAGCAGATTTCAAAACGTACTATGAATCTAACTTTTGTTACAAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FA05TF U 1
AF RR2FA05JQ C 47
BS 1 707 RR2FA05TF

RD RR2FA05TF 707 0 0
GGGGTCACTTCACAATTCCCTCATGGCATATTCTATCACCTCGCAGAAAAATTCAAACTC
AAACAACAATGGCGACGAGCAACGGACCAGAGTTTGCAACGGCGGTGGCGGTTGCTACAA
AGCAAAGAACGTTCAAGAAGTTCTCATTCAGAGGATTCAACGTCGAAGCTCTTCCAAAAT
GTCCACATATAATCTCTCTAAGCTGTTCAACGCTCGTGTTCGAAGGAGATTCTATAGAGG
GCTAAAGAAGAAGCCTCTGATTCTGATCAAGAAGCTACGCAAGGCGAAGAAAGAAGCAAA
AGATGGGGACAAGAAGAAGCCTGAAGTGGTGAAAACGCATCTGAGGAACATGATCATTGT
CCCTGAGATGATTGGAAGTGTTGTCGGAGTGCATAACGGTAAGAAGTTTAACGAGGTCGT
GATTAAACCTGAGATGATTGGTCACTATCTTGCGGAGTTTTCGATGACTTGCAAGAAAGT
TGATCACTATAGACCACGTATACGTGGTTGTGGTTGTTACCGTAATTCCACCAGGTTTAT
TCCTCTGAGGTGATTTATATTATGCTCAATTTATTTTCTTGTTATGTTTTGTGTTTTCTC
TTCTTTAGAATGTTCTTTCACCTCTAATATAATTTGAAACTGCAACATAAAGTTATGTTG
TAGCAGATTTCAAAACGTACTATGAATCTAACTTTTGTTACAAGAGC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2FA05JQ 661 0 0
AAAAATTCAAACTCAAACAACAATGGCGACGAGCAACGGACCAGAGTTTGCAACGGCGGT
GGCGGTTGCTACAAAGCAAAGAACGTTCAAGAAGTTCTCATTCAGAGGATTCAACGTCGA
AGCTCTTCCAAAATGTCCACATATAATCTCTCTAAGCTGTTCAACGCTCGTGTTCGAAGG
AGATTCTATAGAGGGCTAAAGAAGAAGCCTCTGATTCTGATCAAGAAGCTACGCAAGGCG
AAGAAAGAAGCAAAAGATGGGGACAAGAAGAAGCCTGAAGTGGTGAAAACGCATCTGAGG
AACATGATCATTGTCCCTGAGATGATTGGAAGTGTTGTCGGAGTGCATAACGGTAAGAAG
TTTAACGAGGTCGTGATTAAACCTGAGATGATTGGTCACTATCTTGCGGAGTTTTCGATG
ACTTGCAAGAAAGTTGATCACTATAGACCACGTATACGTGGTTGTGGTTGTTACCGTAAT
TCCACCAGGTTTATTCCTCTGAGGTGATTTATATTATGCTCAATTTATTTTCTTGTTATG
TTTTGTGTTTTCTCTTCTTTAGAATGTTCTTTCACCTCTAATATAATTTGAAACTGCAAC
ATAAAGTTATGTTGTAGCAGATTTCAAAACGTACTATGAATCTAACTTTTGTTACAAGAG
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL5597Contig1 819 2 2 U
TTTTTTGTTTCCACGAGGAGCTTCGGAGAAGCAGGAACATGTTCAAGAACACGTTTCAGT
CTGGGTTTCTGTCTATTTTGTACAGTCTAGGAAGTAAGCCTCTTCAGATATGGGACAAAG
AAGTTGAGGATGGACATGTGAAGCGTTGCCATGATGATGACATACAATCCAATGTACTTG
AAGTAGTTGGATCAAACATACAGTCTACATACATTACATGCCCCGCTGATCTCTCCGCAA
CTCTTGGTATCAAACTACCCTTTTTGGTATTGGTTGTGAAGAACATGAAGAAGTATTTCT
CATTCGAGATTCAGATTCTTGATGACAAGAACGTGCGCCGGCGTTTCCGAGCTTCTAACT
TTCAATCTGTGACTAGAGTAAAGCCATATATATGCACAATGCCATTGAAGATGGATGAGG
GATGGAATCAGATCCAGCTGAACTTGACTGATCTTACTAGGAGAGCTTATGGGACTAATT
ACGCTGAGACTTTGCGAGTTCAGGTTCATGCTAACTGCCGTCTCAGAAGGATATATTTTG
CCGACCGTCTCTACTCGGATGAAGACCTTCCTCCAGAGTTAAAACTCTATCTCCCAGTGC
AGAAAGCATGAGCGTATTTCTGCCCCCTTGTCGTGGAAACTACTTTAGATAAGAACTAGA
GCGTCTTAGGTGAGAGTTTCAGGATGGCTTGTAGCATCCATAGTATTTGGAATTTGCCGT
ACCTTGAGCAGCGTGACTTTGATAACTTATGTTTGTTGTGTCTTTATGAAATGAGATTAT
ATACTCTTAAGATTTTCAATGAATATTGTACATGTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX96TF U 1
AF RR2EX96JQ C 325
BS 1 569 RR2EX96TF
BS 570 819 RR2EX96JQ

RD RR2EX96TF 569 0 0
TTTTTTGTTTCCACGAGGAGCTTCGGAGAAGCAGGAACATGTTCAAGAACACGTTTCAGT
CTGGGTTTCTGTCTATTTTGTACAGTCTAGGAAGTAAGCCTCTTCAGATATGGGACAAAG
AAGTTGAGGATGGACATGTGAAGCGTTGCCATGATGATGACATACAATCCAATGTACTTG
AAGTAGTTGGATCAAACATACAGTCTACATACATTACATGCCCCGCTGATCTCTCCGCAA
CTCTTGGTATCAAACTACCCTTTTTGGTATTGGTTGTGAAGAACATGAAGAAGTATTTCT
CATTCGAGATTCAGATTCTTGATGACAAGAACGTGCGCCGGCGTTTCCGAGCTTCTAACT
TTCAATCTGTGACTAGAGTAAAGCCATATATATGCACAATGCCATTGAAGATGGATGAGG
GATGGAATCAGATCCAGCTGAACTTGACTGATCTTACTAGGAGAGCTTATGGGACTAATT
ACGCTGAGACTTTGCGAGTTCAGGTTCATGCTAACTGCCGTCTCAGAAGGATATATTTTG
CCGACCGTCTCTACTCGGATGAAGACCTT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2EX96JQ 495 0 0
ACAAGAACGTGCGCCGGCGTTTCCGAGCTTCTAACTTTCAATCTGTGACTAGAGTAAAGC
CATATATATGCACAATGCCATTGAAGATGGATGAGGGATGGAATCAGATCCAGCTGAACT
TGACTGATCTTACTAGGAGAGCTTATGGGACTAATTACGCTGAGACTTTGCGAGTTCAGG
TTCATGCTAACTGCCGTCTCAGAAGGATATATTTTGCCGACCGTCTCTACTCGGATGAAG
ACCTTCCTCCAGAGTTAAAACTCTATCTCCCAGTGCAGAAAGCATGAGCGTATTTCTGCC
CCCTTGTCGTGGAAACTACTTTAGATAAGAACTAGAGCGTCTTAGGTGAGAGTTTCAGGA
TGGCTTGTAGCATCCATAGTATTTGGAATTTGCCGTACCTTGAGCAGCGTGACTTTGATA
ACTTATGTTTGTTGTGTCTTTATGAAATGAGATTATATACTCTTAAGATTTTCAATGAAT
ATTGTACATGTTCTC

QA 1 495 1 495
DS 



AS 1 2

CO CL5598Contig1 823 2 4 U
TATATTAATAACACAAAAAATCTAAGGTTAAAACATCACATAGCTGAAGTAACAACATTT
GAAATAAGATTCTGTTGATAAAGAAAATAATTCATAGTTCAAAGGCCGAAATTGCAAGCC
TGAACAAACTCCAAGTCGTAGTCGACATGCTTTGTCCAAAGCGGTCGGAACTGGTTCATA
GCAATGTCTAGCCACGGTTTCATATTACCGTTGAAGTGTACCACCGCAGCGTTACGGATC
TCGTCCATACTAATACTCGGATTGTAACCCAGCCCAAGCACATGCCATGTTTTGTCCAGC
GGTTTTGTGGTCGAGTAAAACGTGATCAGTCCCGGTGGCAACGTTCCAAGTTTCCACAGA
GTCCTGTTCTCATTCAGATTTTGCCAGTAGTGATATTCTTCAGTACACTTCTCTCTTCTC
CAAGCATCAAGATCAAAGAAGTTCATCCCATAAGCCCACGCGCATGCTTTCGGATTAAAC
TTCTCTTTGATCAAAGGATGCGAGAAGTTCATGTACTGAGCATACCGATGGAACGAACCA
AAACAAGTCTCCACAGCTCCATTCACTTTCCCGTCCATATCAATCTCCCAAAGCCCCGTC
AAATCCTTCTGCACAACCACGTCATCGTCCAGAAACAGTATCTATGCAGCTTCGGGTACA
TCTCAGGCAAATAGAATCTCAAGTGATTCAATATAGACAAATACTTTGGGTTCCTAAACT
TCATATTAGTCGTATCTTTGGTCGCATTCTCAAGCTTATTCTCGAAATAAAACTTCTGAA
GATTCGCAGACTCGAGCTGCTTCACACAGGCACATACGAAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM39JQ U 1
AF RR2EO31JQ U 19
BS 1 71 RR2DM39JQ
BS 72 73 RR2EO31JQ
BS 74 326 RR2DM39JQ
BS 327 823 RR2EO31JQ

RD RR2DM39JQ 326 0 0
TATATTAATAACACAAAAAATCTAAGGTTAAAACATCACATAGCTGAAGTAACAACATTT
GAAATAAGATT**GTTGATAAAGAAAATAATTCATAGTTCAAAGGCCGAAATTGCAAGCC
TGAACAAACTCCAAGTCGTAGTCGACATGCTTTGTCCAAAGCGGTCGGAACTGGTTCATA
GCAATGTCTAGCCACGGTTTCATATTACCGTTGAAGTGTACCACCGCAGCGTTACGGATC
TCGTCCATACTAATACTCGGATTGTAACCCAGCCCAAGCACATGCCATGTTTTGTCCAGC
GGTTTTGTGGTCGAGTAAAACGTGAT

QA 1 326 1 326
DS 

RD RR2EO31JQ 805 0 0
AG
TCTAAGGTTAAAACATCACATAGCTGAAGTAACAACATTTGAAATAAGATTCTGTTGATA
AAGAAAATAATTCATAGTTCAGAGGCCGAAATTGCAAGCCTGAACAAACTCCAAGTCGTA
GTCGACATGCTTTGTCCAAAGCGGTCGGAACTGGTTCATAGCAATGTCTAGCCACGGTTT
CATATTACCGTTGAAGTGTACCACCGCAGCGTTACGGATCTCGTCCATACTAATACTCGG
ATTGTAACCCAGCCCAAGCACATGCCATGTTTTGTCCAGCGGTTTTGTGGTCGAGTAAAA
CGTGATCAGTCCCGGTGGCAACGTTCCAAGTTTCCACAGAGTCCTGTTCTCATTCAGATT
TTGCCAGTAGTGATATTCTTCAGTACACTTCTCTCTTCTCCAAGCATCAAGATCAAAGAA
GTTCATCCCATAAGCCCACGCGCATGCTTTCGGATTAAACTTCTCTTTGATCAAAGGATG
CGAGAAGTTCATGTACTGAGCATACCGATGGAACGAACCAAAACAAGTCTCCACAGCTCC
ATTCACTTTCCCGTCCATATCAATCTCCCAAAGCCCCGTCAAATCCTTCTGCACAACCAC
GTCATCGTCCAGAAACAGTATCTATGCAGCTTCGGGTACATCTCAGGCAAATAGAATCTC
AAGTGATTCAATATAGACAAATACTTTGGGTTCCTAAACTTCATATTAGTCGTATCTTTG
GTCGCATTCTCAAGCTTATTCTCGAAATAAAACTTCTGAAGATTCGCAGACTCGAGCTGC
TTCACACAGGCACATACGAAGAG

QA 3 805 3 805
DS 



AS 1 2

CO CL5599Contig1 639 2 2 U
CGCCGAAAATCTTTGGAAAACAAATTGCTGATAAAACCAACTAGTGTACAAAAACCATAC
TACATATCTGAAGTCTTGATAAGGAAACAAGTGTTTGGAGTCTTTTTCCACCCAAAGATG
CTAATAAACTCAACGAAAATCCTGAAAAGTTTCACGGAAAAGCAAATGATGTTCAAGGTC
TCAGTGCGGCTTTGTGAACCATGGTTTCCTTGTGAATTTGGTGGCAACTCTTTTCAACAA
GATCTAAAAGCTTCTCCAGATTCACTGCCCACGAGTTGAGAATCTCGTTGCTGTCCTTTG
AGACCTGGAAGCACACAATCCCTGATGGTCTGTCTATTTTTGCAATCAGTGCTTTCGACA
CGACCATCTCCGAAAGATGCTTCTCCGCCTCCTCAATACTTAGGCATAAAAGCTCTGCAA
GTCTCTTTAAGGTTATCCTCGAGTAGTACTTTGAGACGACGAAAATATTGGGTTCAATGA
TTCTCAGTTTCAAATCTTCACCAGCTTTGTCACCCAACGAACCTCCAACCATGCTTTTTT
CTTTCTCAAACTCATCCTTGTATTTGTTCCAAAAAGATGTCCATTGAATAACCTCCATTG
TCACTACCTGTTTTAAAAGCATCTTGAAATCAGGAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC34JQ U 1
AF RR2AG59JQ U 169
BS 1 460 RR2FC34JQ
BS 461 639 RR2AG59JQ

RD RR2FC34JQ 460 0 0
CGCCGAAAATCTTTGGAAAACAAATTGCTGATAAAACCAACTAGTGTACAAAAACCATAC
TACATATCTGAAGTCTTGATAAGGAAACAAGTGTTTGGAGTCTTTTTCCACCCAAAGATG
CTAATAAACTCAACGAAAATCCTGAAAAGTTTCACGGAAAAGCAAATGATGTTCAAGGTC
TCAGTGCGGCTTTGTGAACCATGGTTTCCTTGTGAATTTGGTGGCAACTCTTTTCAACAA
GATCTAAAAGCTTCTCCAGATTCACTGCCCACGAGTTGAGAATCTCGTTGCTGTCCTTTG
AGACCTGGAAGCACACAATCCCTGATGGTCTGTCTATTTTTGCAATCAGTGCTTTCGACA
CGACCATCTCCGAAAGATGCTTCTCCGCCTCCTCAATACTTAGGCATAAAAGCTCTGCAA
GTCTCTTTAAGGTTATCCTCGAGTAGTACTTTGAGACGAC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RR2AG59JQ 471 0 0
ATGTTCAAGGTCTCAGTGCGGCTTTGTGAACCATGGTTTCCTTGTGAATTTGGTGGCAAC
TCTTTTCAACAAGATCTAAAAGCTTCTCCAGATTCACTGCCCACGAGTTGAGAATCTCGT
TGCTGTCCTTTGAGACCTGGAAGCACACAATCCCTGATGGTCTGTCTATTTTTGCAATCA
GTGCTTTCGACACGACCATCTCCGAAAGATGCTTCTCCGCCTCCTCAATACTTAGGCATA
AAAGCTCTGCAAGTCTCTTTAAGGTTATCCTCGAGTAGTACTTTGAGACGACGAAAATAT
TGGGTTCAATGATTCTCAGTTTCAAATCTTCACCAGCTTTGTCACCCAACGAACCTCCAA
CCATGCTTTTTTCTTTCTCAAACTCATCCTTGTATTTGTTCCAAAAAGATGTCCATTGAA
TAACCTCCATTGTCACTACCTGTTTTAAAAGCATCTTGAAATCAGGAATTT

QA 1 471 1 471
DS 



AS 1 2

CO CL5600Contig1 646 2 2 U
CATGGCGGCCAACGGCGTGAGAAGGGCCCTCAATAAGCTATCTTCGTCATCGACGACGAC
AGGGAGAACACTCTTCGGTCGTTCTTCTTCAGCTGCGTCTACTTCTGGTCCGAATGTCGG
AAAATCAGCTGGATTCGCTTTCGCGAACGGATCATCTTCACCTCGCGCATCACTTCGTAG
GCTCACATCCTCCTCCAGGGTCCCAGTGGAGCTGAGTGCAGGGATGTCGCTTATACCGTT
ACATAGTGTTACTGCTTCAGCTTTACTCACTTCGTTGCTGTCTCTTAGCAATCAGAGCTG
GGGTTGCTTATCTGAAGGATTTGGAACGACCCTATAACATGGACTGCGAGTTTTTGACTC
CTCCAGGTTTACTTGTCAGATTCCAAGAAACTTTTTTCATAATTTCATCATCGGTGGTCT
GCACTTTTTTTTTCCCCAAAAGGTTTCAGATAAAATTACTCTTTGATTTACCCAAAAAAA
AAACATTACTCTTTGATTTGCCCAAAAAAAAAAACATTACTCTTTGAAGAGCTCTCCTTT
GTTGTGTTTGTTGTGTTTGTTGTGTCATCTTTAGTTGGATGATTTCATTACTTCAACAAT
TCTGCTGAGGGAAATAAACCACTCATTTTTGCTAGAGTTTTTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL38TF U 1
AF RR2BL38JQ C 316
BS 1 605 RR2BL38TF
BS 606 646 RR2BL38JQ

RD RR2BL38TF 605 0 0
CATGGCGGCCAACGGCGTGAGAAGGGCCCTCAATAAGCTATCTTCGTCATCGACGACGAC
AGGGAGAACACTCTTCGGTCGTTCTTCTTCAGCTGCGTCTACTTCTGGTCCGAATGTCGG
AAAATCAGCTGGATTCGCTTTCGCGAACGGATCATCTTCACCTCGCGCATCACTTCGTAG
GCTCACATCCTCCTCCAGGGTCCCAGTGGAGCTGAGTGCAGGGATGTCGCTTATACCGTT
ACATAGTGTTACTGCTTCAGCTTTACTCACTTCGTTGCTGTCTCTTAGCAATCAGAGCTG
GGGTTGCTTATCTGAAGGATTTGGAACGACCCTATAACATGGACTGCGAGTTTTTGACTC
CTCCAGGTTTACTTGTCAGATTCCAAGAAACTTTTTTCATAATTTCATCATCGGTGGTCT
GCACTTTTTTTTTCCCCAAAAGGTTTCAGATAAAATTACTCTTTGATTTACCCAAAAAAA
AAACATTACTCTTTGATTTGCCCAAAAAAAAAAACATTACTCTTTGAAGAGCTCTCCTTT
GTTGTGTTTGTTGTGTTTGTTGTGTCATCTTTAGTTGGATGATTTCATTACTTCAACAAT
TCTGC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2BL38JQ 331 0 0
AGGATTTGGAACGACCCTATAACATGGACTGCGAGTTTTTGACTCCTCCAGGTTTACTTG
TCAGATTCCAAGAAACTTTTTTCATAATTTCATCATCGGTGGTCTGCACTTTTTTTTTCC
CCAAAAGGTTTCAGATAAAATTACTTTTTGATTTACCCAAAAAAAAAACATTACTCTTTG
ATTTGCCCAAAAAAAAAAACATTACTCTTTGAAGAGCTCTCCTTTGTTGTGTTTGTTGTG
TTTGTTGTGTCATCTTTAGTTGGATGATTTCATTACTTCAACAATTCTGCTGAGGGAAAT
AAACCACTCATTTTTGCTAGAGTTTTTACCC

QA 1 331 1 331
DS 



AS 1 2

CO CL5601Contig1 1003 2 4 U
GGACTGTTTCACTACGTAATCTCTCTCTCATCTTCTCCGTCCCGACAAGAACCAAGTCCC
GTCCGAACACATCTCATTCTTTCTTCAATCGCAAGTTGCAATCTTTAGTTTTTGTTTTTC
CCCTAAATCGGCTTGGATCTGTCGGGGGCTATTTGGAAAGTTGGCGATTTTTCGAGGGAC
GATGGAAAGCGAATTGATCGAATTGTTCGAGGCGGCGAAGAAGGCAGCCGATGCGGCGGC
GATCGACGGTGTAGCCTCCTCAGGTCCGGAGGTTTCTCGATCTCTCGATGCCCTTAAACA
GCTCAAGAAGTTTCCCATCACATACGACATGCTCGTCGCCACTCAGGTGGGAAAGAAGCT
GAGGTCTCTTTCAAAACATCCTATCGACGAAATCAAAACCGTTGCTACTGATCTTCTCGA
TATATGGAAGAAGCTTGTCATCGAAGAGACGTCCAAGTCTAAGAAGGATGCAAATCCCGC
GCCTGTGAAAGTCCAGAAGCTTCAGAGAGGTGATTCAGCTAAGAGCATCAAGGTAGAGAG
AGAAGAACCAGTCAACAACGGAGTTAAGATAGAGCATCGTGGTCAGACTGGTGTCAAAGA
CGAGAATCAATCTAGTACGAAAGCGAGTACGGATCAGTTCAAGTGTGGGAGGTGTGGTCA
GCAAATGCACTTACTATCAGATGCAGACGAGGAGTGCTGATGAGCCGATGACGACTTATG
TTACGTGTGTTAACTGCGACAACCACTGGAAGTTCTGTTGAGGTGAGACATAAGAGGCTC
TGGTTGATTTATCATCAATCCATTTGCCGAACACATTCTTAGAATGTTTGTGGCTCTGAT
GTTTGTGTAAGGTTATCAGTTTCATTGTCTTGAGAGATTAGTAAGTAGAGGAGTCTATTA
ATGTAGGTGTCTATAACTCTTTATTTCTTCTTTCTTCTTTTATTTCAAACTTGTCAAACT
TGTCAACCCTCTTGCAATTTTTATCAAAGTTTTGAAGTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU57TF U 1
AF RR2DU57JQ C 446
BS 1 651 RR2DU57TF
BS 652 652 RR2DU57JQ
BS 653 687 RR2DU57TF
BS 688 1003 RR2DU57JQ

RD RR2DU57TF 687 0 0
GGACTGTTTCACTACGTAATCTCTCTCTCATCTTCTCCGTCCCGACAAGAACCAAGTCCC
GTCCGAACACATCTCATTCTTTCTTCAATCGCAAGTTGCAATCTTTAGTTTTTGTTTTTC
CCCTAAATCGGCTTGGATCTGTCGGGGGCTATTTGGAAAGTTGGCGATTTTTCGAGGGAC
GATGGAAAGCGAATTGATCGAATTGTTCGAGGCGGCGAAGAAGGCAGCCGATGCGGCGGC
GATCGACGGTGTAGCCTCCTCAGGTCCGGAGGTTTCTCGATCTCTCGATGCCCTTAAACA
GCTCAAGAAGTTTCCCATCACATACGACATGCTCGTCGCCACTCAGGTGGGAAAGAAGCT
GAGGTCTCTTTCAAAACATCCTATCGACGAAATCAAAACCGTTGCTACTGATCTTCTCGA
TATATGGAAGAAGCTTGTCATCGAAGAGACGTCCAAGTCTAAGAAGGATGCAAATCCCGC
GCCTGTGAAAGTCCAGAAGCTTCAGAGAGGTGATTCAGCTAAGAGCATCAAGGTAGAGAG
AGAAGAACCAGTCAACAACGGAGTTAAGATAGAGCATCGTGGTCAGACTGGTGTCAAAGA
CGAGAATCAATCTAGTACGAAAGCGAGTACGGATCAGTTCAAGTGTGGGAG*TGTGGTCA
GCAAATGCACTTACTATCAGATGCAGA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2DU57JQ 558 0 0
GAGACGTCCAAGTCTAAGAAGGATGCAAATCCCGCGCCTGTGAAAGTCCAGAAGCTTCAG
AGAGGTGATTCAGCTAAGAGCATCAAGGTAGAGAGAGAAGAACCAGTCAACAACGGAGTT
AAGATAGAGCATCGTGGTCAGACTGGTGTCAAAGACGAGAATCAATCTAGTACGAAAGCG
AGTACGGATCAGTTCAAGTGTGGGAGGTGTGGTCAGCAAATGCACTTACTATCAGATGCA
GACGAGGAGTGCTGATGAGCCGATGACGACTTATGTTACGTGTGTTAACTGCGACAACCA
CTGGAAGTTCTGTTGAGGTGAGACATAAGAGGCTCTGGTTGATTTATCATCAATCCATTT
GCCGAACACATTCTTAGAATGTTTGTGGCTCTGATGTTTGTGTAAGGTTATCAGTTTCAT
TGTCTTGAGAGATTAGTAAGTAGAGGAGTCTATTAATGTAGGTGTCTATAACTCTTTATT
TCTTCTTTCTTCTTTTATTTCAAACTTGTCAAACTTGTCAACCCTCTTGCAATTTTTATC
AAAGTTTTGAAGTTTATC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL5602Contig1 820 2 8 U
TCCCTCCTTTCTCCACATGATGGATACATTCTCTTGTAATTCCTATGAACAAAATCACGC
CCCTTTCCACCGCCACGATAATGATATTGATATTGATGATTCCAATCATGATCATCATGA
TGATGTTCAGCAAGAGGAGAGTGGATGGACAACTTATCTTGAAGATTTCTCAAATCAATA
CAGAACTTATCCTGAAGATAACGATCATCAAGATAAGAGTTCGTGTTCGATTCTGGACGC
CTCTCCTTCTCTGGTTTCCGACGCCAAGAACCAAAAAGATTTGTGAGGATGATTCTTTTG
AGGATACGGCCAGCTCTCCGGTTAATAGCCCTAAGATCAGTCAGATGGAGCATATTCAGA
CGCTTCCTAGAAAACATGAGGACTATGTCTCTTCTAGTTTCGTTATGGGAAATATGAGAG
GCGTGGGGGATCATCAAATCCAAATCCAAGAAGGAGATGAACAAAAGATGACGATGATGA
GGAATCTCAGAGAAAGAAACAACAATAGCAACACCAATAATATGGACTTGAGGAGTAGAG
GATTATGCGTCGTCCCTATTTCCATGTTGGGTAATTTCAATGGCCGCTTCTGAATGATGA
GAAATACTAGTAAACCCTTGTCACTTTCGGTGGTGTTTATGTATGTACCCATCTTGCATA
TATTCACACGATGTGTGTATGTGTATGTGCTTAAATAGATATGTAGTTTGTGTACGTTTG
TATAAGTGCATATCGGTGGGATATTTGTGAAGTACACAGCGTATATGTTTGTAAACATAT
CTAAGAGCTACTATCTCATAAAGATTACGATAGGTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL80TF U 1
AF RR2EL80JQ C 41
BS 1 629 RR2EL80TF
BS 630 630 RR2EL80JQ
BS 631 663 RR2EL80TF
BS 664 664 RR2EL80JQ
BS 665 691 RR2EL80TF
BS 692 694 RR2EL80JQ
BS 695 724 RR2EL80TF
BS 725 820 RR2EL80JQ

RD RR2EL80TF 731 0 0
TCCCTCCTTTCTCCACATGATGGATACATTCTCTTGTAATTCCTATGAACAAAATCACGC
CCCTTTCCACCGCCACGATAATGATATTGATATTGATGATTCCAATCATGATCATCATGA
TGATGTTCAGCAAGAGGAGAGTGGATGGACAACTTATCTTGAAGATTTCTCAAATCAATA
CAGAACTTATCCTGAAGATAACGATCATCAAGATAAGAGTTCGTGTTCGATTCTGGACGC
CTCTCCTTCTCTGGTTTCCGACGCCAAGAACCAAAAAGATTTGTGAGGATGATTCTTTTG
AGGATACGGCCAGCTCTCCGGTTAATAGCCCTAAGATCAGTCAGATGGAGCATATTCAGA
CGCTTCCTAGAAAACATGAGGACTATGTCTCTTCTAGTTTCGTTATGGGAAATATGAGAG
GCGTGGGGGATCATCAAATCCAAATCCAAGAAGGAGATGAACAAAAGATGACGATGATGA
GGAATCTCAGAGAAAGAAACAACAATAGCAACACCAATAATATGGACTTGAGGAGTAGAG
GATTATGCGTCGTCCCTATTTCCATGTTGGGTAATTTCAATGGCCGCTTCTGAATGATGA
GAAATACTAGTAAACCCTTGTCACTTTCG*TGGTGTTTATGTATGTACCCATCTTGCATA
TAT*CACACGATGTGTGTATGTGTATGTGCT***ATAGATATGTAGTTTGTGTACGTTTG
TATA
GTGCATA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2EL80JQ 780 0 0
TCCTATGAACAAAATCACGCCCCTTTCCACCGCCACGATAATGATATTGATATTGATGAT
TCCAATCATGATCATCATGATGATGTTCAGCAAGAGGAGAGTGGATGGACAACTTATCTT
GAAGATTTCTCAAATCAATACAGAACTTATCCTGAAGATAACGATCATCAAGATAAGAGT
TCGTGTTCGATTCTGGACGCCTCTCCTTCTCTGGTTTCCGACGCCAAGAACCAAAAAGAT
TTGTGAGGATGATTCTTTTGAGGATACGGCCAGCTCTCCGGTTAATAGCCCTAAGATCAG
TCAGATGGAGCATATTCAGACGCTTCCTAGAAAACATGAGGACTATGTCTCTTCTAGTTT
CGTTATGGGAAATATGAGAGGCGTGGGGGATCATCAAATCCAAATCCAAGAAGGAGATGA
ACAAAAGATGACGATGATGAGGAATCTCAGAGAAGGAAACAACAATAGCAACACCAATAA
TATGGACTTGAGGAGTAGAGGATTATGCGTCGTCCCTATTTCCATGTTGGGTAATTTCAA
TGGCCGCTTCTGAATGATGAGAAATACTAGTAAACCCTTGTCACTTTCGGTGGTGTTTAT
GTATGTACCCATCTTGCATATATTCACACGATGTGTGTATGTGTATGTGCTTAATTAGAT
ATGTAGTTTGTGTACGTTTGTATAAGTGCATATCGGTGGGATATTTGTGAAGTACACAGC
GTATATGTTTGTAAACATATCTAAGAGCTACTATCTCATAAAGATTACGATAGGTTTTAC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL5603Contig1 1071 2 2 U
ATCACCCGTGCATACTCGCAGTTCACTTTCTTTGCTTTAATCGGCACTGGAGCTGTGCCA
CCGGGATGATCAAGAGCTAAATGCAAGTTCATCATCAAAAGTTGAGGAGAAGTCGTGGAA
AGAGTGATTTGAGTTTTTTTTTAAGTGGAGAGTTTCAATGGTAATAATAGATCTGTACTT
AGCCCGGTTCTTACTCTATATTTTGTTGAATGTTTACCTCGGTTATCTTAGAGTGGATTG
ATTAATGCTTTTGATGTCTTATCCTAATCGCTTACTAAGGATAGCTAATTAGAATAACCA
AAGTTAGACACTTTGGGAAAGATCTATGATCCGTTCCTTAAAAATTTGAGAAGACAAGCA
TCTTCCAGCGCCACCCCTCTTCCCTGCTTCCTCCTTTCCATCCTCCATGTCTGGCCTCCT
CCACCCTTCAAATCGTTTAAGCTCCGTTTAAAACGACCGTCTGAAGATTTATACCACCAA
CCACCGCAAACATACCTTCTATCACAACGGTTTGTGAATCTGGTGTCCGATGTAGGTGGG
AATCCACTCCGGCATTTAGTTTTGAGCCATCTGTTTATGAATCTGGCGTCCGATGTAGGT
GGGAATCCACTCCGGCGTCCAGCTTTGATACAACAAAAGCTAGTAAGTTCAGTTTGTCGG
CGTGCTACTCTCACTTCCTCTTCTATTATGAAGGGTACTTCACTACCATGTCTCCTTTCT
ATGAATGGAGAAAATATTTCGGATTCTTTTCTGAGTTTTCGTTTCAGTTCACTCACCGGT
TTGTTACCTTGTGGAGCGGTCCGTACGGGGCCTGAAGGCGCAATCGAGACTACTTCGGTT
TTTCTCGTTGGTGAGGACTGTCACTCAACGTCACTTGTGACTATCTCTCAGCTGTCCGAC
TATATGGTGGAAGCTTTATCGACGCATTCAAACTTGGTTTTGAATTCGCTGTCAACTTCA
TATGAAGATCTATCATGCTTGTTTCTATTTGCTATTGTAGTTCATGAATTGTTTACAAGA
GGATGTTTAATTCCCTCTTGGCTTTGTAGCTCTTGCATTTGGGTTTTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP58TF U 1
AF RR2GP58JQ C 388
BS 1 677 RR2GP58TF
BS 678 1071 RR2GP58JQ

RD RR2GP58TF 677 0 0
ATCACCCGTGCATACTCGCAGTTCACTTTCTTTGCTTTAATCGGCACTGGAGCTGTGCCA
CCGGGATGATCAAGAGCTAAATGCAAGTTCATCATCAAAAGTTGAGGAGAAGTCGTGGAA
AGAGTGATTTGAGTTTTTTTTTAAGTGGAGAGTTTCAATGGTAATAATAGATCTGTACTT
AGCCCGGTTCTTACTCTATATTTTGTTGAATGTTTACCTCGGTTATCTTAGAGTGGATTG
ATTAATGCTTTTGATGTCTTATCCTAATCGCTTACTAAGGATAGCTAATTAGAATAACCA
AAGTTAGACACTTTGGGAAAGATCTATGATCCGTTCCTTAAAAATTTGAGAAGACAAGCA
TCTTCCAGCGCCACCCCTCTTCCCTGCTTCCTCCTTTCCATCCTCCATGTCTGGCCTCCT
CCACCCTTCAAATCGTTTAAGCTCCGTTTAAAACGACCGTCTGAAGATTTATACCACCAA
CCACCGCAAACATACCTTCTATCACAACGGTTTGTGAATCTGGTGTCCGATGTAGGTGGG
AATCCACTCCGGCATTTAGTTTTGAGCCATCTGTTTATGAATCTGGCGTCCGATGTAGGT
GGGAATCCACTCCGGCGTCCAGCTTTGATACAACAAAAGCTAGTAAGTTCAGTTTGTCGG
CGTGCTACTCTCACTTC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2GP58JQ 684 0 0
TTCCTCCTTTCCATCCTCCATGTCTGGCCTCCTCCACCCTTCAAATCGTTTAAGCTCCGT
TTAAAACGACCGTCTGAAGATTTATACCACCAACCACCGCAAACATACCTTCTATCACAA
CGGTTTGTGAATCTGGTGTCCGATGTAGGTGGGAATCCACTCCGGCATTTAGTTTTGAGC
CATCTGTTTATGAATCTGGCGTCCGATGTAGGTGGGAATCCACTCCGGCGTCCAGCTTTG
ATACAACAAAAGCTAGTAAGTTCAGTTTGTCGGCGTGCTACTCTCACTTCCTCTTCTATT
ATGAAGGGTACTTCACTACCATGTCTCCTTTCTATGAATGGAGAAAATATTTCGGATTCT
TTTCTGAGTTTTCGTTTCAGTTCACTCACCGGTTTGTTACCTTGTGGAGCGGTCCGTACG
GGGCCTGAAGGCGCAATCGAGACTACTTCGGTTTTTCTCGTTGGTGAGGACTGTCACTCA
ACGTCACTTGTGACTATCTCTCAGCTGTCCGACTATATGGTGGAAGCTTTATCGACGCAT
TCAAACTTGGTTTTGAATTCGCTGTCAACTTCATATGAAGATCTATCATGCTTGTTTCTA
TTTGCTATTGTAGTTCATGAATTGTTTACAAGAGGATGTTTAATTCCCTCTTGGCTTTGT
AGCTCTTGCATTTGGGTTTTAATG

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL5604Contig1 958 2 2 U
GGGTCACAAGGCTTGGGAAATGCGACGTGGAGGCTGTGAGAAAGGAGATGAGAGACAAGG
ATGTTCCTGTGTCCTATTCGGGGAGCGGAGGGCCGACCAAGTCAGTTCGGAAACCCAATG
TAGAGGAGATCCTCAGACGTCTCCTTACTTCCTTGAAGCCTGAGGCTTTTCAAGGAGCTA
TTAAGGCCATTAACGAGAGGATCCTCTCGGTTCTTGATGACACAGGGTCTGGAAGAGTCG
ACATGGGCATGTTCTACGCAGTGATTTCTCCTTTATGCAGTAGACATTCAGATAAACGCA
AGAGAGTTGCCTTCGAGGCGCTTATGTGGAGACCAGTGAACGAAGGAAGCTCTCAGATTA
CAAAAGCGGATGCTGACAAGTACATGAAGCTCTTGAGAGCTATCTACATTCCATCGCAGG
GGATGAGTGAGATGTTAGAAGTTCACGGTGAAGAAGAAGGAGAAGCTGGTTCCTCCGGGA
CAGTAACGTTTAATCAGTTTCTAGACATGTTGGATGATCCTGATTGGGGGTTTGGTATCA
TGTCTACGGTTACTAAACTGGAGAGTAACGATAGAAACCGGCATGGGAACCAAGTGTGTT
CGGTTTGTCGGTATCCGATTATTGGATCTCGGTTTAAGGAAGTGAAGGCTCGGTTTAGTT
TGTGTAGTCAGTGTTATAGTGGAGGGAAGGTTCCTCCTTCGTTTAGACAGGAGGAATACA
GGTTCAGAGAGTATGTGAGTGAAGCTGAAGCGATGAAAGCTAAGTGTGTTTGTTTCTCAG
TGCAGTCTCATAAGAAACCTATTGCCACTTGAAAGAAACAATGAAACTAACTCATCAAGT
TTTTTATTTGAATCTTTACTTCTAATCTGCAAGTTGTAACGTTTTTTATATTAACTTGTG
TGCATAGTTTCAGTGAAATGTATTGTTGAGAGTGTAATGAATGATGTTCTTGCATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ12TF U 1
AF RR2GZ12JQ C 353
BS 1 644 RR2GZ12TF
BS 645 958 RR2GZ12JQ

RD RR2GZ12TF 644 0 0
GGGTCACAAGGCTTGGGAAATGCGACGTGGAGGCTGTGAGAAAGGAGATGAGAGACAAGG
ATGTTCCTGTGTCCTATTCGGGGAGCGGAGGGCCGACCAAGTCAGTTCGGAAACCCAATG
TAGAGGAGATCCTCAGACGTCTCCTTACTTCCTTGAAGCCTGAGGCTTTTCAAGGAGCTA
TTAAGGCCATTAACGAGAGGATCCTCTCGGTTCTTGATGACACAGGGTCTGGAAGAGTCG
ACATGGGCATGTTCTACGCAGTGATTTCTCCTTTATGCAGTAGACATTCAGATAAACGCA
AGAGAGTTGCCTTCGAGGCGCTTATGTGGAGACCAGTGAACGAAGGAAGCTCTCAGATTA
CAAAAGCGGATGCTGACAAGTACATGAAGCTCTTGAGAGCTATCTACATTCCATCGCAGG
GGATGAGTGAGATGTTAGAAGTTCACGGTGAAGAAGAAGGAGAAGCTGGTTCCTCCGGGA
CAGTAACGTTTAATCAGTTTCTAGACATGTTGGATGATCCTGATTGGGGGTTTGGTATCA
TGTCTACGGTTACTAAACTGGAGAGTAACGATAGAAACCGGCATGGGAACCAAGTGTGTT
CGGTTTGTCGGTATCCGATTATTGGATCTCGGTTTAAGGAAGTG

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2GZ12JQ 606 0 0
TCAGATTACAAAAGCGGATGCTGACAAGTACATGAAGCTCTTGAGAGCTATCTACATTCC
ATCGCAGGGGATGAGTGAGATGTTAGAAGTTCACGGTGAAGAAGAAGGAGAAGCTGGTTC
CTCCGGGACAGTAACGTTTAATCAGTTTCTAGACATGTTGGATGATCCTGATTGGGGGTT
TGGTATCATGTCTACGGTTACTAAACTGGAGAGTAACGATAGAAACCGGCATGGGAACCA
AGTGTGTTCGGTTTGTCGGTATCCGATTATTGGATCTCGGTTTAAGGAAGTGAAGGCTCG
GTTTAGTTTGTGTAGTCAGTGTTATAGTGGAGGGAAGGTTCCTCCTTCGTTTAGACAGGA
GGAATACAGGTTCAGAGAGTATGTGAGTGAAGCTGAAGCGATGAAAGCTAAGTGTGTTTG
TTTCTCAGTGCAGTCTCATAAGAAACCTATTGCCACTTGAAAGAAACAATGAAACTAACT
CATCAAGTTTTTTATTTGAATCTTTACTTCTAATCTGCAAGTTGTAACGTTTTTTATATT
AACTTGTGTGCATAGTTTCAGTGAAATGTATTGTTGAGAGTGTAATGAATGATGTTCTTG
CATATC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL5605Contig1 982 2 4 U
CTCAGGGTTTCCTTCCTTCTTCCAGATCCTTTGTCGTCTGAATCGATTCATCTTCAGGAC
CAGCCATTTATTAAACGCCTCCTCTTCCTGTAACGTCTTCTCGAACATCATATAGATAGA
AGTCCTCTTTTGCCTCTTAACTTTTCTCCCACAACTTTTCCTTCGTGTATCTCAGCAACC
GCCGTTACAAAAATGACTTCCTCAGATGGAAGAAAAAATCTAGGAGGTTGTTGAGATCAA
GCAACGAAATCTGGCTGAGGAAAATCATAAAACGCTGGAGCTTTTAAAGGATAGGGAGCA
AGCTTTACAAGATCAGTTAAGGCAAGCAAAAGACAGTGTCTCCACTATGCAAAAATTGCA
TGAGCTAGCACATAGCCAACTCTTTGAACTTCGTGCTCAATCAGGTTAGTCACTCTGAGA
ATTTCAAGAGCTTCACTTGGAAGAACGTCGAAAACTGCTCCGGGAGGTTGTTGGTTTGTC
TAAGAGGTATGTTAATAGACATCGAGGTGGTGTTAGAAATGATACATTTTCTGTAAGTAA
GAGTCACTTGCCAAACAGAAGGCGGGACTGTAAGCTTGGATCAATCTTAAACTTTCCAAA
GGACTAGAGCTGCTATTTTTCGCTCGCCTTACTACAAAGAAGGCTTATGGGTTCTTCTAC
CGGCTTATGGGTTTCAGAAGGTTAGCTCCATGGATGAATCTGAAGCTATACTCACTTCTT
CAAGTGCTATTAGTTGGACAATGAAAAGTTTAGGAGCCAGGTTGAGGCAAAGAACAAAGA
AGTTAGAGAAGGTTAAAAGCCTATCAAGATTGGTAATGGGGAAATGCTTAAAACCTGCAG
AAGGTATTTAATTTGACTTGCTTATGAGTTCTGCCTAAGAGATGCTTGGATCAGTTGTGA
TGCAAATTTACCTGTAACTGTTATTTGTTCTTCTTTAACTGTAGATTCTGCCTCCAAAAT
TTACACAGTGATACACGTCAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV14TF U 1
AF RR2CV14JQ C 288
BS 1 642 RR2CV14TF
BS 643 643 RR2CV14JQ
BS 644 676 RR2CV14TF
BS 677 982 RR2CV14JQ

RD RR2CV14TF 676 0 0
CTCAGGGTTTCCTTCCTTCTTCCAGATCCTTTGTCGTCTGAATCGATTCATCTTCAGGAC
CAGCCATTTATTAAACGCCTCCTCTTCCTGTAACGTCTTCTCGAACATCATATAGATAGA
AGTCCTCTTTTGCCTCTTAACTTTTCTCCCACAACTTTTCCTTCGTGTATCTCAGCAACC
GCCGTTACAAAAATGACTTCCTCAGATGGAAGAAAAAATCTAGGAGGTTGTTGAGATCAA
GCAACGAAATCTGGCTGAGGAAAATCATAAAACGCTGGAGCTTTTAAAGGATAGGGAGCA
AGCTTTACAAGATCAGTTAAGGCAAGCAAAAGACAGTGTCTCCACTATGCAAAAATTGCA
TGAGCTAGCACATAGCCAACTCTTTGAACTTCGTGCTCAATCAGGTTAGTCACTCTGAGA
ATTTCAAGAGCTTCACTTGGAAGAACGTCGAAAACTGCTCCGGGAGGTTGTTGGTTTGTC
TAAGAGGTATGTTAATAGACATCGAGGTGGTGTTAGAAATGATACATTTTCTGTAAGTAA
GAGTCACTTGCCAAACAGAAGGCGGGACTGTAAGCTTGGATCAATCTTAAACTTTCCAAA
GGACTAGAGCTGCTATTTTTCGCTCGCCTTACTACAAAGAAG*CTTATGGGTTCTTCTAC
CGGCTTATGGGTTTCA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2CV14JQ 695 0 0
AGGATAGGGAGCAAGCTTTACAAGATCAGTTAAGGCAAGCAAAAGACAGTGTCTCCACTA
TGCAAAAATTGCATGAGCTAGCACATAGCCAACTCTTTGAACTTCGTGCTCAATCAGGTT
AGTCACTCTGAGAATTTCAAGAGCTTCACTTGGAAGAACGTCGAAAACTGCTCCGGGAGG
TTGTTGGTTTGTCTAAGAGGTATGTTAATAGACATCGAGGTGGTGTTAGAAATGATACAT
TTTCTGTAAGTAAGAGTCACTTGCCAAACAGAAGGCGGGACTGTAAGCTTGGATCAATCT
TAAACTTTCCAAAGGACTAGAGCTGCTATTTTTCGCTCGCCTTACTACAAAGAAGGCTTA
TGGGTTCTTCTACCGGCTTATGGGTTTCAGAAGGTTAGCTCCATGGATGAATCTGAAGCT
ATACTCACTTCTTCAAGTGCTATTAGTTGGACAATGAAAAGTTTAGGAGCCAGGTTGAGG
CAAAGAACAAAGAAGTTAGAGAAGGTTAAAAGCCTATCAAGATTGGTAATGGGGAAATGC
TTAAAACCTGCAGAAGGTATTTAATTTGACTTGCTTATGAGTTCTGCCTAAGAGATGCTT
GGATCAGTTGTGATGCAAATTTACCTGTAACTGTTATTTGTTCTTCTTTAACTGTAGATT
CTGCCTCCAAAATTTACACAGTGATACACGTCAAA

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL5606Contig1 1002 2 2 U
TTTTTGGAGTATCAGCAAAGTCGATGCAATGCTCTTACGACAACAGAGGAAATAGCGTTC
CAACGATCCTTCTCAGGATGCAGAAACGTCTTTATACCGAAGGAGGTCTTAAGGCAGTAG
GAATATTCCGAATAAATCCAGACAATAGCAAAGAAGAGCATGTCCGAAAGCAGCTGAACC
GTGGTGTAATACCACGTGGAATCGATGTTCATTGCTTGGCAGGTTTAATAAAGGCCTGGT
TTAGGGAGCTACCTACAGGAGTTCTTGATGTGTTGACACCAGAGCAAGTGATGAAATGCA
ACACAGAACAAGATTGTAACAAGCTCGTGACTCTTCTTCCTCCAGTTGAATCTGCGCTTC
TTGATTGGGCCATCGGTTTAATGGCTGACGTGGTGGAGCATGAACAGTTTAACAAAATGA
ATGCTCGCAATGTAGCTATGGTTTTCGCTCCAAACATGACCCAAATGGCAGATCCTTTAA
CCGCATTGATCCACGCGGTACAAGTGATGAACTTTCTCAAGACTTTGATTTTAATGAACC
TCAAAGAGAGGGAAAACGCAGATGCCAAAACAAGGTGGATCGAGAAACAAACCTCAGATC
CTTCAGAAGAATGGGAATTACAACACTTTAAGATAGTCCCTGAGAAACCCAACAATAACC
CTAAGTTCTTGAGAGTGGCTACTCTTTGTAGGCTAGAAGCTGACAATGAAGAAAAGGTTT
GGAACATTGAGAAGAGAAACGATCATAAAGATACAACTGAAAATACTGGAACTGTTCAGA
GGCGGTGTAAGCATCCATTGTTCAAGTCAAGCAGATCGACAAAGAAACCTCTTGTAAGTA
ATCAAGATGAAGGAAGAAGAGGACGAGATGCTTGGGGTTCACGTCTTTCTTCTTTGCCTT
GGTAAATTTTAATTACTACATACCTCCATTTCGTTCCTTTTTTGCTTTTGAGAGTGTAAA
GATGTATTGTGAAGTATTGATTGATTATAGGTGTTAGTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ29TF U 1
AF RR2CZ29JQ C 355
BS 1 469 RR2CZ29TF
BS 470 1002 RR2CZ29JQ

RD RR2CZ29TF 469 0 0
TTTTTGGAGTATCAGCAAAGTCGATGCAATGCTCTTACGACAACAGAGGAAATAGCGTTC
CAACGATCCTTCTCAGGATGCAGAAACGTCTTTATACCGAAGGAGGTCTTAAGGCAGTAG
GAATATTCCGAATAAATCCAGACAATAGCAAAGAAGAGCATGTCCGAAAGCAGCTGAACC
GTGGTGTAATACCACGTGGAATCGATGTTCATTGCTTGGCAGGTTTAATAAAGGCCTGGT
TTAGGGAGCTACCTACAGGAGTTCTTGATGTGTTGACACCAGAGCAAGTGATGAAATGCA
ACACAGAACAAGATTGTAACAAGCTCGTGACTCTTCTTCCTCCAGTTGAATCTGCGCTTC
TTGATTGGGCCATCGGTTTAATGGCTGACGTGGTGGAGCATGAACAGTTTAACAAAATGA
ATGCTCGCAATGTAGCTATGGTTTTCGCTCCAAACATGACCCAAATGGC

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR2CZ29JQ 648 0 0
CGCTTCTTGATTGGGCCATCGGTTTAATGGCTGACGTGGTGGAGCATGAACAGTTTAACA
AAATGAATGCTCGCAATGTAGCTATGGTTTTCGCTCCAAACATGACCCAAATGGCAGATC
CTTTAACCGCATTGATCCACGCGGTACAAGTGATGAACTTTCTCAAGACTTTGATTTTAA
TGAACCTCAAAGAGAGGGAAAACGCAGATGCCAAAACAAGGTGGATCGAGAAACAAACCT
CAGATCCTTCAGAAGAATGGGAATTACAACACTTTAAGATAGTCCCTGAGAAACCCAACA
ATAACCCTAAGTTCTTGAGAGTGGCTACTCTTTGTAGGCTAGAAGCTGACAATGAAGAAA
AGGTTTGGAACATTGAGAAGAGAAACGATCATAAAGATACAACTGAAAATACTGGAACTG
TTCAGAGGCGGTGTAAGCATCCATTGTTCAAGTCAAGCAGATCGACAAAGAAACCTCTTG
TAAGTAATCAAGATGAAGGAAGAAGAGGACGAGATGCTTGGGGTTCACGTCTTTCTTCTT
TGCCTTGGTAAATTTTAATTACTACATACCTCCATTTCGTTCCTTTTTTGCTTTTGAGAG
TGTAAAGATGTATTGTGAAGTATTGATTGATTATAGGTGTTAGTTGTT

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL5607Contig1 1350 2 4 U
GCGAGCTGCTCAACTTTACTCTGCAGGGTCCTTATTCATATGTTAACTTGAGCAGTGAGA
GGAAAGGAGTGAGCTGGGGACGTTTGGCAGCAATAACTGCAGGGGCTGTGGTGACTGCTG
TTGCAATCTCCGCCATGGTTGCCGTCTTGTTGCTTAGAAGATACAGCAAGCACGAGCGTG
AGATATCTAGAAGACGGTCTTCCTCGAAAGCTTCGTTGATGAGTTCTGGGATAAGAGGCT
TCAGGTTCAAAGAACTAGCAGAGGCCACAGACGATTTTAGCAGCTCAGCTTTGGTTGGAC
GAGGAGGCTACGGAAAGGTTTATAGAGGAGTGTTATCTGACAAAACGGTTGCTCCATAAA
GCGAGCTGATGAAGGGTCTTTGCAAGGTGAGAAGGAGTTCTTGAATGAAATAGAGTTGCT
CTCCAGGTTGCATCATCGGAATCTAGTGTCCCTTATCGGTTATTGCGACGAAGAAGGGGA
GCAGATGCTGGTGTACGAATTCATGCCAAATGGCACCCTGCGCGACTGGCTCTCTGCTAA
AGGGAAGGAGACATTGAGCTTTGGGATGAGGGTTCGGGTTGCTTTGGGAGCAGCGAGGGG
TATTCTCTACCTTCACACAGAAGCCAACCCACCCAGTGTTCCACCGAGACATCAAAGCCA
GTAACATCCTCCTCGACCTCAACTTCAATGCCAAAGTTGCAGATTTTGGACTGTCCCGTC
TTGCTCCTGCTTTGGAGGAGGAAGAGGATGTGCCTAAACACGTATCCACGGTTGTTCGAG
GGACTCCAGGGTACCTGGATCCAGAGTACTTCCTGACGCACAAGCTGACGGACAAGAGCG
ACGTATACAGCATTGGGGTTGTGTTCTTGGAGCTGCTGACTGGTATGCACGCCATATCCC
ATGGCAAAAACATTGTGCGAGAGGTGAAGACCGGGGATACCATGGTGTCGCTGATAGACA
AGAGAATGGAGCCGTGGTCGATGGAAACAGCTGAAAGGTTTTTCTCATTGGCACTGAGGT
GTAGCCACGACTCGCCTGATATGAGGCCTGCCATGGCTGAGGTGGTGAAAGAACTGGAGG
CACTGGTTGTCAAGGAAGGAAAAATGGAGACCAAGTCCTCCTCCTCGGTGCTGTCAACAT
CATCTTCGAATGTTACAAGAGACCTTTACGAGTCGGCGAGCCTTTTAGGAAGCGATCTCA
GCAGCGGCGTTGTTCCCAGCATTGCTCCTCGCTGACTCGTACCATACCCAAACAAAACAC
CTGAGCTTCTTTTGGTTTGCTGTTATCTTCCACTTCAACACTGTATAAATCTGTAACATA
TATTCCCTTGAAAAAAAGAAAAGTCTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA80TF U 1
AF RR2BA80JQ C 471
BS 1 633 RR2BA80TF
BS 634 634 RR2BA80JQ
BS 635 766 RR2BA80TF
BS 767 1350 RR2BA80JQ

RD RR2BA80TF 766 0 0
GCGAGCTGCTCAACTTTACTCTGCAGGGTCCTTATTCATATGTTAACTTGAGCAGTGAGA
GGAAAGGAGTGAGCTGGGGACGTTTGGCAGCAATAACTGCAGGGGCTGTGGTGACTGCTG
TTGCAATCTCCGCCATGGTTGCCGTCTTGTTGCTTAGAAGATACAGCAAGCACGAGCGTG
AGATATCTAGAAGACGGTCTTCCTCGAAAGCTTCGTTGATGAGTTCTGGGATAAGAGGCT
TCAGGTTCAAAGAACTAGCAGAGGCCACAGACGATTTTAGCAGCTCAGCTTTGGTTGGAC
GAGGAGGCTACGGAAAGGTTTATAGAGGAGTGTTATCTGACAAAACGGTTGCTCCATAAA
GCGAGCTGATGAAGGGTCTTTGCAAGGTGAGAAGGAGTTCTTGAATGAAATAGAGTTGCT
CTCCAGGTTGCATCATCGGAATCTAGTGTCCCTTATCGGTTATTGCGACGAAGAAGGGGA
GCAGATGCTGGTGTACGAATTCATGCCAAATGGCACCCTGCGCGACTGGCTCTCTGCTAA
AGGGAAGGAGACATTGAGCTTTGGGATGAGGGTTCGGGTTGCTTTGGGAGCAGCGAGGGG
TATTCTCTACCTTCACACAGAAGCCAACCCACC*AGTGTTCCACCGAGACATCAAAGCCA
GTAACATCCTCCTCGACCTCAACTTCAATGCCAAAGTTGCAGATTTTGGACTGTCCCGTC
TTGCTCCTGCTTTGGAGGAGGAAGAGGATGTGCCTAAACACGTATC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2BA80JQ 880 0 0
AAGAAGGGGAGCAGATGCTGGTGTACGAATTCATGCCAAATGGCACC*TGCGCGACTGGC
TCTCTGCTAAAGGGAAGGAGACATTGAGCTTTGGGATGAGGGTTCGGGTTGCTTTGGGAG
CAGCGAGGGGTATTCTCTACCTTCACACAGAAGCCAACCCACCCAGTGTTCCACCGAGAC
ATCAAAGCCAGTAACATCCTCCTCGACCTCAACTTCAATGCCAAAGTTGCAGATTTTGGA
CTGTCCCGTCTTGCTCCTGCTTTGGAGGAGGAAGAGGATGTGCCTAAACACGTATCCACG
GTTGTTCGAGGGACTCCAGGGTACCTGGATCCAGAGTACTTCCTGACGCACAAGCTGACG
GACAAGAGCGACGTATACAGCATTGGGGTTGTGTTCTTGGAGCTGCTGACTGGTATGCAC
GCCATATCCCATGGCAAAAACATTGTGCGAGAGGTGAAGACCGGGGATACCATGGTGTCG
CTGATAGACAAGAGAATGGAGCCGTGGTCGATGGAAACAGCTGAAAGGTTTTTCTCATTG
GCACTGAGGTGTAGCCACGACTCGCCTGATATGAGGCCTGCCATGGCTGAGGTGGTGAAA
GAACTGGAGGCACTGGTTGTCAAGGAAGGAAAAATGGAGACCAAGTCCTCCTCCTCGGTG
CTGTCAACATCATCTTCGAATGTTACAAGAGACCTTTACGAGTCGGCGAGCCTTTTAGGA
AGCGATCTCAGCAGCGGCGTTGTTCCCAGCATTGCTCCTCGCTGACTCGTACCATACCCA
AACAAAACACCTGAGCTTCTTTTGGTTTGCTGTTATCTTCCACTTCAACACTGTATAAAT
CTGTAACATATATTCCCTTGAAAAAAAGAAAAGTCTCACT

QA 1 880 1 880
DS 



AS 1 2

CO CL5608Contig1 1140 2 2 U
GGCATTCTCTGTTGTTTTGGGATCTGTGTGAGTGAAGATCTAGAGGAGGAAGAAGCAAGC
AAGCAAGCAAGCAATGGCAGGCATGGGAGGAGCAGGACCAGATCACCTCTTCAACCTCCG
AAACACGTTCTATCTCGGAGCTTACCAAACGGCGATCAACAATAGCGAGATCCCCAACCT
CTCACCTGAAGACGCAGTGGAACGCGACTGCCTCGTCTTCCGCTCGTACATCGCCCTCGG
TAGCTATCAGCTCGTCATCAGTGAGATCGATGAAGCCGCCTCGACTCCGTTGCAGGCAGT
CAAGCTCCTCGCTATGTATCTATCGAGTCCTGATAATAAGGAATCAACCATTTCAAGCTT
GAAGGAATGGCTGGCCGATTCAACTATAGGAAACAATGCTATCTTGAGGTTGATTGCTGG
TACTATTTTCATGCACGAGGAAGATTATAATGAAGCTTTGAAACACACTCATGCGGGAGG
AACAATGGATCTGCATGCTTTGAATGTCCAGATATTCATTAAGATGCACAGATCAGATTA
CGCTGAGAAGCAGCTTAGAGTGATGCAACAGTATGACGAAGACCACACTCTCACCCAACT
TGCTACCGCATGGTTGAACCTGGCAGTGGTGGCTCGAAGATACAAGAAGCTCATCTCATT
TTCCAGGATTTTTTTGAGAGGTACCCGATGACATGCTTGATTTTGAATAGCAAAGCAGTT
TGCTGTATGCAAATGGGTAACTTTGATGAAGCTGAATCGCTACTACTAGAAGCACTCAAC
AAGGATGCTAAAGACCCAGAAACTCTTGCAAACCTTGTCGTCTGCAGTCTCCATGTTGGC
AAATCATCTTCACGTTACTTAAGCCAGCTGAAACTATCACACCCTGAACATGTGCTTGTG
AAGCGTGTATCATCAGCCGAAGATAACTTCGAGAGAGCACTTCAATCTATCGCTTGAAGA
CTTTTCCATGGTTTCAAGCTTTGCAGGATCATTTTGCTTTACCACATATTTTCCCGGGTT
GGTAAATCCACCAGAACAACCAAACCGTTTTTTCTTTTTGGAATCAGTCTATGAATCAGA
TTTTGCCTTTGAGTATGTTACGTTTACCATCTCGTTGCTTTTAAATATAAAGCTCCACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ51TF U 1
AF RR2BZ51JQ C 382
BS 1 666 RR2BZ51TF
BS 667 1140 RR2BZ51JQ

RD RR2BZ51TF 666 0 0
GGCATTCTCTGTTGTTTTGGGATCTGTGTGAGTGAAGATCTAGAGGAGGAAGAAGCAAGC
AAGCAAGCAAGCAATGGCAGGCATGGGAGGAGCAGGACCAGATCACCTCTTCAACCTCCG
AAACACGTTCTATCTCGGAGCTTACCAAACGGCGATCAACAATAGCGAGATCCCCAACCT
CTCACCTGAAGACGCAGTGGAACGCGACTGCCTCGTCTTCCGCTCGTACATCGCCCTCGG
TAGCTATCAGCTCGTCATCAGTGAGATCGATGAAGCCGCCTCGACTCCGTTGCAGGCAGT
CAAGCTCCTCGCTATGTATCTATCGAGTCCTGATAATAAGGAATCAACCATTTCAAGCTT
GAAGGAATGGCTGGCCGATTCAACTATAGGAAACAATGCTATCTTGAGGTTGATTGCTGG
TACTATTTTCATGCACGAGGAAGATTATAATGAAGCTTTGAAACACACTCATGCGGGAGG
AACAATGGATCTGCATGCTTTGAATGTCCAGATATTCATTAAGATGCACAGATCAGATTA
CGCTGAGAAGCAGCTTAGAGTGATGCAACAGTATGACGAAGACCACACTCTCACCCAACT
TGCTACCGCATGGTTGAACCTGGCAGTGGTGGCTCGAAGATACAAGAAGCTCATCTCATT
TTCCAG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2BZ51JQ 759 0 0
AACTATAGGAAACAATGCTATCTTGAGGTTGATTGCTGGTACTATTT*CATGCACGAGGA
AGATTATAATGAAGCTTTGAAACACACTCATGCGGGAGGAACAATGGATCTGCATGCTTT
GAATGTCCAGATATTCATTAAGATGCACAGATCAGATTACGCTGAGAAGCAGCTTAGAGT
GATGCAACAGTATGACGAAGACCACACTCTCACCCAACTTGCTACCGCATGGTTGAACCT
GGCAGTGGTGGCTCGAAGATACAAGAAGCTCATCTCATTTTCCAGGATTTTTTTGAGAGG
TACCCGATGACATGCTTGATTTTGAATAGCAAAGCAGTTTGCTGTATGCAAATGGGTAAC
TTTGATGAAGCTGAATCGCTACTACTAGAAGCACTCAACAAGGATGCTAAAGACCCAGAA
ACTCTTGCAAACCTTGTCGTCTGCAGTCTCCATGTTGGCAAATCATCTTCACGTTACTTA
AGCCAGCTGAAACTATCACACCCTGAACATGTGCTTGTGAAGCGTGTATCATCAGCCGAA
GATAACTTCGAGAGAGCACTTCAATCTATCGCTTGAAGACTTTTCCATGGTTTCAAGCTT
TGCAGGATCATTTTGCTTTACCACATATTTTCCCGGGTTGGTAAATCCACCAGAACAACC
AAACCGTTTTTTCTTTTTGGAATCAGTCTATGAATCAGATTTTGCCTTTGAGTATGTTAC
GTTTACCATCTCGTTGCTTTTAAATATAAAGCTCCACAT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL5609Contig1 1076 2 2 U
GGCCGCTCAGAAAAAAAAACAAATATGGAGAGAACCACTCCAGTGAGAAAGCCGCACACA
TCAACCGCAGATCTACTCACTTGGTCGGAAGCTCCACCGTCGGATTCTCCTTCCTCCGCT
TCTCGCTCCTCCGCCGTTCGATCTCACCAGCCATCTGATGGGGTTAGCAGAGTTGTCTTT
GGTGGTCAAGTCACTGATGAAGAAGTTGAGAGCTTGAACAAAAGGAAGCCTTGCTCAGAA
CATAAGATGAAGGAGATAACAGGGAGTGGGATCTTCACTCGTAATCAAGAAGATGCATCA
GAGCTCTCTAGTGCCCCAAGGGTATATCAGCAAGCACTTAGTGGTATAAGCCATATATCA
TTCGGTGAAGAGGAGGACTTGTCTCCCAAGAAGCCTATCACTCTACCCGAAGTTGCTAAA
CAGCGAGAGCTAAGCGGGACGATGGAGAGCGATTCAGCTTCTAATCTGAAGAAGCAGCTC
TCTGACGCTAAGTACAAGGAGATCAGCGGACAGAACATCTTCGCACCGCCGCCTGAGATC
AAACCTCGGTCCGGAGCAACTCGTGCTTTGGCTCTAAAGGACAACTTCAACCTCGGAGCT
GAATCTCAAACCTCTGGTGAAGAAGACTCATCTGTGAAGACGGCGAAGAAGATTTACGAC
AAGAAGTTTGCAGAGCTTTCAGGGAATGATATATTCAAGGGAGATGGTGCTGCTGCTGGG
GCGACTTCGTCTTGCGGCGAGAAGCAGCTGAGTGAAGCGAAGCTGAAGGAGATAGGAGGG
AACAACATATTCGCTGATGGGAAGGTAGAGTCCAGAGACTATTTAGGAGGTGTCCGTAAA
CCACCGGGTGGTGAGACAAGCATTGCTCTCGTTTAGAATCAATCCTCTCTATTTTTACAG
TAACGTTTAACTCTCTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAACTGCGATTTATTGGTGTGTGTTC
TTTGTTGGTATCTATCTCTCAAATACGCTTTTCAGCTCTCAAAAAGTGTGATTTGTATTA
TGATGCAGTTTCGTTGGTTTATTTGGTTATGGTGATATAATAACTAGTATTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC32TF U 1
AF RR2FC32JQ C 469
BS 1 755 RR2FC32TF
BS 756 1076 RR2FC32JQ

RD RR2FC32TF 760 0 0
GGCCGCTCAGAAAAAAAAACAAATATGGAGAGAACCACTCCAGTGAGAAAGCCGCACACA
TCAACCGCAGATCTACTCACTTGGTCGGAAGCTCCACCGTCGGATTCTCCTTCCTCCGCT
TCTCGCTCCTCCGCCGTTCGATCTCACCAGCCATCTGATGGGGTTAGCAGAGTTGTCTTT
GGTGGTCAAGTCACTGATGAAGAAGTTGAGAGCTTGAACAAAAGGAAGCCTTGCTCAGAA
CATAAGATGAAGGAGATAACAGGGAGTGGGATCTTCACTCGTAATCAAGAAGATGCATCA
GAGCTCTCTAGTGCCCCAAGGGTATATCAGCAAGCACTTAGTGGTATAAGCCATATATCA
TTCGGTGAAGAGGAGGACTTGTCTCCCAAGAAGCCTATCACTCTACCCGAAGTTGCTAAA
CAGCGAGAGCTAAGCGGGACGATGGAGAGCGATTCAGCTTCTAATCTGAAGAAGCAGCTC
TCTGACGCTAAGTACAAGGAGATCAGCGGACAGAACATCTTCGCACCGCCGCCTGAGATC
AAACCTCGGTCCGGAGCAACTCGTGCTTTGGCTCTAAAGGACAACTTCAACCTCGGAGCT
GAATCTCAAACCTCTGGTGAAGAAGACTCATCTGTGAAGACGGCGAAGAAGATTTACGAC
AAGAAGTTTGCAGAGCTTTCAGGGAATGATATATTCAAGGGAGATGGTGCTGCTGCTGGG
GCGACTTCGTCTTGCGGCGAGAAGCAGCTGAGTGA
GCGAG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2FC32JQ 608 0 0
AAGAAGCAGCTCTCTGACGCTAAGTACAAGGAGATCAGCGGACAGAACATCTTCGCACCG
CCGCCTGAGATCAAACCTCGGTCCGGAGCAACTCGTGCTTTGGCTCTAAAGGACAACTTC
AACCTCGGAGCTGAATCTCAAACCTCTGGTGAAGAAGACTCATCTGTGAAGACGGCGAAG
AAGATTTACGACAAGAAGTTTGCAGAGCTTTCAGGGAATGATATATTCAAGGGAGATGGT
GCTGCTGCTGGGGCGACTTCGTCTTGCGGCGAGAAGCAGCTGAGTGAAGCGAAGCTGAAG
GAGATAGGAGGGAACAACATATTCGCTGATGGGAAGGTAGAGTCCAGAGACTATTTAGGA
GGTGTCCGTAAACCACCGGGTGGTGAGACAAGCATTGCTCTCGTTTAGAATCAATCCTCT
CTATTTTTACAGTAACGTTTAACTCTCTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAACTGCGATTTAT
TGGTGTGTGTTCTTTGTTGGTATCTATCTCTCAAATACGCTTTTCAGCTCTCAAAAAGTG
TGATTTGTATTATGATGCAGTTTCGTTGGTTTATTTGGTTATGGTGATATAATAACTAGT
ATTTTATT

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL5610Contig1 1131 2 2 U
GGACACCACCATCTTTCTTCAAAACAAAAACCAAAAACAAAATATAAATCAAGAAACCAA
AAAGAAAACATTCCAATAATTGAATCGGAGATACGCAATCTCCGACACTTTATTCCTTCA
ATGCCGATAACGAAACCGCTCGGATCAAACACAACTCTTCGATCTCAGCCACCACATCAG
TACAGCCAACCGCCACTCTTCATAATCCTAACTGTGATCCTCCCCGTCGTCTTTTTCATC
GGTTTCTGCGCTCTCTATTTCTTCAGGTGTTTCTTCCACACTCTCTCACAGGCCTGGGAT
CGCCATTACCACAACAGATCACCCGAAGATCAAATCCAATCACAACAAGAAAACGCCGGT
CAACCACCGGTTAACCCCGGTTTAGAGCCACATATCATCCAATCCTTCCCATTATTCCCA
TTCTCCTCGGTAAAAGATCTTAGAGAAGATAACCAAGGACTCGAATGCGCGATCTGTCTT
CTAGAATTCGAAGAAGAACAAATCCTCCTTCGGCTTCTGACAACATGCTACCATGTTTTT
CATCAAGAATGCATCGATAGATGGCTCGAATCTAACAAAACATGCCCTGTTTGTCGTCGA
AACTTAGATCCAAATGCGCCAGAAAACATCAAAGAGTTAATCATAGAAGTCATACACGAA
AACAGCAACGGAAACCACGAGCAACCTTCAACGTCAAACGAGGTTTCGTTGTCGAGAGAG
AGCAGTAGTAGTGGTAAGACCGAGCCTTTACCGGATAAATTCTCGAGATCGAAGACGACG
GGTCATTCTATTGAGGAATAAACCGGAGGAAGAAGATCGGTATACGTTGAGATTACCGGA
TCATGTTAAGATTAAAGTTACGAGGAGGCATAATAATAACCAAACAGAGAGTTGTATTTC
TTTTGGTGAGCTTATGAGAAACAGAGAAGGCCGGTTTGGTGAACTCTCTGGTCAATCACT
TGTACCGGAATCCCAACATTAAAGAAGATTTACAATTATTTTTTGTTTACTTTACATTAA
ATTGGTTCGTTACATGTCTTTTTGTATTTTGTTAGTAGGATACTGAAGAGATTTTTTCTA
ATGATGACTGGACAATGAAACTACGTCGTTTAGTGATTTTTTTCCCTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL20TF U 1
AF RR2GL20JQ C 536
BS 1 698 RR2GL20TF
BS 699 1131 RR2GL20JQ

RD RR2GL20TF 698 0 0
GGACACCACCATCTTTCTTCAAAACAAAAACCAAAAACAAAATATAAATCAAGAAACCAA
AAAGAAAACATTCCAATAATTGAATCGGAGATACGCAATCTCCGACACTTTATTCCTTCA
ATGCCGATAACGAAACCGCTCGGATCAAACACAACTCTTCGATCTCAGCCACCACATCAG
TACAGCCAACCGCCACTCTTCATAATCCTAACTGTGATCCTCCCCGTCGTCTTTTTCATC
GGTTTCTGCGCTCTCTATTTCTTCAGGTGTTTCTTCCACACTCTCTCACAGGCCTGGGAT
CGCCATTACCACAACAGATCACCCGAAGATCAAATCCAATCACAACAAGAAAACGCCGGT
CAACCACCGGTTAACCCCGGTTTAGAGCCACATATCATCCAATCCTTCCCATTATTCCCA
TTCTCCTCGGTAAAAGATCTTAGAGAAGATAACCAAGGACTCGAATGCGCGATCTGTCTT
CTAGAATTCGAAGAAGAACAAATCCTCCTTCGGCTTCTGACAACATGCTACCATGTTTTT
CATCAAGAATGCATCGATAGATGGCTCGAATCTAACAAAACATGCCCTGTTTGTCGTCGA
AACTTAGATCCAAATGCGCCAGAAAACATCAAAGAGTTAATCATAGAAGTCATACACGAA
AACAGCAACGGAAACCACGAGCAACCTTCAACGTCAAA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2GL20JQ 596 0 0
TTTTTCATCAAGAATGCATCGATAGATGGCTCGAATCTAACAAAACATGCCCTGTTTGTC
GTCGAAACTTAGATCCAAATGCGCCAGAAAACATCAAAGAGTTAATCATAGAAGTCATAC
ACGAAAACAGCAACGGAAACCACGAGCAACCTTCAACGTCAAACGAGGTTTCGTTGTCGA
GAGAGAGCAGTAGTAGTGGTAAGACCGAGCCTTTACCGGATAAATTCTCGAGATCGAAGA
CGACGGGTCATTCTATTGAGGAATAAACCGGAGGAAGAAGATCGGTATACGTTGAGATTA
CCGGATCATGTTAAGATTAAAGTTACGAGGAGGCATAATAATAACCAAACAGAGAGTTGT
ATTTCTTTTGGTGAGCTTATGAGAAACAGAGAAGGCCGGTTTGGTGAACTCTCTGGTCAA
TCACTTGTACCGGAATCCCAACATTAAAGAAGATTTACAATTATTTTTTGTTTACTTTAC
ATTAAATTGGTTCGTTACATGTCTTTTTGTATTTTGTTAGTAGGATACTGAAGAGATTTT
TTCTAATGATGACTGGACAATGAAACTACGTCGTTTAGTGATTTTTTTCCCTATCC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5612Contig1 752 2 3 U
GAAAGATAGTAAAAACGTTTTCATGTATCTTTGATACTTTTATTACACTTCCAAACTCCA
AATTCTCAAATAAAAATTGCAAAAAAGTTTAGGAAACTCATACCTCAAGCTTAAAAAATT
TAGTGATGACTCCCATCATTTCACCACCATGGAAACGACCAAGACACCCTCTCGCAGCTG
CAATCTCACTCAACTCCGCAACTGAATCACCACCAATAGCTCGAGGAGTCTCCTTTCTCC
CACCTTCTCTTCCGGTGACATATTCATCAGACTCCACCACCTTTGGAAGTGGAAAAGGCT
CCAAAGACGTCTCCAACAGTGCTGATTCTCCTCCAACAGCACTCACAAACTCTCTTAACC
TGCACATAGTGAATGGAACCGGCTCGAAGCTGTGGTCTCCATACTCAACCGGAGTAGAGT
GATCACCAGTCACACACAAGAAATACTGGTAGTTACTACAAGACTCAGCTTGCCACAAAA
GCTTAGCTAGCTGGCGTATCGCCTTGTCAACAGCCTCCAAGCCTTTGACTTTGAACATCG
TCGCCTTATCGTGACCAGCATCATCTATAGCCTTTATGTGAAGGAACCCAAAGTCATAAC
CCTCTGACCTTCCCGGTTTATGCCCGTCCTCTCCCGGGACAAAGACATTGGGACAAGGGT
TCAAAGGAGCTGAGAGGGCGTTGGCTATAGCAACTGCCTTGGACGTGAGAAGCGTCCTGT
AATCTCCAGTGGCTCCCGGAGCTTCTAGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G777JQ U 14
AF RR2G777TF C 1
BS 1 29 RR2G777TF
BS 30 158 RR2G777JQ
BS 159 752 RR2G777TF

RD RR2G777JQ 145 0 0
TTTTTCATTGTAATCT
TTTGATACTTTTATTACACTTCCAAACTCCAAATTCTCAAATAAAAATTGCAAAAAAGTT
TAGGAAACTCATACCTCAAGCTTAAAAAATTTAGTGATGACTCCCATCATTTCACCACCA
TGGAAACGA

QA 17 145 17 145
DS 

RD RR2G777TF 752 0 0
GAAAGATAGTAAAAACGTTTTCATGTATCTTTGATACTTTTATTACACTTCCAAACTCCA
AATTCTCAAATAAAA*TTGCAAAAAAGTTTAGGAAACTCATAC*TCAAGCTTAAGAAATT
TAGTGATGACTCCCATCATTTCACCACCATGGAAACGACCAAGACACCCTCTCGCAGCTG
CAATCTCACTCAACTCCGCAACTGAATCACCACCAATAGCTCGAGGAGTCTCCTTTCTCC
CACCTTCTCTTCCGGTGACATATTCATCAGACTCCACCACCTTTGGAAGTGGAAAAGGCT
CCAAAGACGTCTCCAACAGTGCTGATTCTCCTCCAACAGCACTCACAAACTCTCTTAACC
TGCACATAGTGAATGGAACCGGCTCGAAGCTGTGGTCTCCATACTCAACCGGAGTAGAGT
GATCACCAGTCACACACAAGAAATACTGGTAGTTACTACAAGACTCAGCTTGCCACAAAA
GCTTAGCTAGCTGGCGTATCGCCTTGTCAACAGCCTCCAAGCCTTTGACTTTGAACATCG
TCGCCTTATCGTGACCAGCATCATCTATAGCCTTTATGTGAAGGAACCCAAAGTCATAAC
CCTCTGACCTTCCCGGTTTATGCCCGTCCTCTCCCGGGACAAAGACATTGGGACAAGGGT
TCAAAGGAGCTGAGAGGGCGTTGGCTATAGCAACTGCCTTGGACGTGAGAAGCGTCCTGT
AATCTCCAGTGGCTCCCGGAGCTTCTAGAATC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL5613Contig1 700 2 1 U
GGAAGCAACCATATACTCCATCCTCTCGGCCATATTAATGAATGCATCCGAAAAAAGCAT
CCAGTTTAACAGACTTTAATTGACTGCATCAGAACTTCTACGACATAAGTGGCTCGCCTG
AGCGGCTGAGCTTCCTCTCGACGTGACCATCGCCTCCGGTCCACTGTTGACCTGATTACG
GTTCCTCAACTTGACGACTCTCGGTAGGGGCAGACAAAATGTAAAATAAGGTTTCTACAC
GTCTAAAACTAAAAGAGAAAAACAAGAGTAAATGTGAGTGAATCATGTACCTCTTGTCTC
CCAACAACATACCCATATAATTGCAGAATCCTTCGAGGGCATCTTTCCACTCCGTCATCC
GAAAATTGGAATAACAATGAGCTTTTTCTTGTCCGCAAGTGTCTTCATTTTTACTAACTC
GTCCATGCACCACATCGACTCTGGATACCTACAAGCCGATGAGGAAATTGTAACATGCAA
GGATAAGATATTGACTATAACTTTTGTCACGCAACAAAAACCAGAAGCTTACTTAACATG
GATCACAAGTTAAATTCGTTCTATTAAAATAGAAATAACAATGTTTTAATTTGGACTTAT
CCTATAAAATCAGTTATCATTTATTCATTAATAATAATATGTCTTAGTATATCACTCCAG
ATATTCTCACCTAATACATAATAATAAAGTTCGGTTAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BA77JQ C 1
AF RR2BA77TF U 1
BS 1 700 RR2BA77TF

RD RR2BA77JQ 700 0 0
GGAAGCAACCATATACTCCATCCTCTCGGCCATATTAATGAATGCATCCGAAAAAAGCAT
CCAGTTTAACAGACTTTAATTGACTGCATCAGAACTTCTACGACATAAGTGGCTCGCCTG
AGCGGCTGAGCTTCCTCTCGACGTGACCATCGCCTCCGGTCCACTGTTGACCTGATTACG
GTTCCTCAACTTGACGACTCTCGGTAGGGGCAGACAAAATGTAAAATAAGGTTTCTACAC
GTCTAAAACTAAAAGAGAAAAACAAGAGTAAATGTGAGTGAATCATGTACCTCTTGTCTC
CCAACAACATACCCATATAATTGCAGAATCCTTCGAGGGCATCTTTCCACTCCGTCATCC
GAAAATTGGAATAACAATGAGCTTTTTCTTGTCCGCAAGTGTCTTCATTTTTACTAACTC
GTCCATGCACCACATCGACTCTGGATACCTACAAGCCGATGAGGAAATTGTAACATGCAA
GGATAAGATATTGACTATAACTTTTGTCACGCAACAAAAACCAGAAGCTTACTTAACATG
GATCACAAGTTAAATTCGTTCTATTAAAATAGAAATAACAATGTTTTAATTTGGACTTAT
CCTATAAAATCAGTTATCATTTATTCATTAATAATAATATGTCTTAGTATATCACTCCAG
ATATTCTCACCTAATACATAATAATAAAGTTCGGTTAACC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2BA77TF 700 0 0
GGAAGCAACCATATACTCCATCCTCTCGGCCATATTAATGAATGCATCCGAAAAAAGCAT
CCAGTTTAACAGACTTTAATTGACTGCATCAGAACTTCTACGACATAAGTGGCTCGCCTG
AGCGGCTGAGCTTCCTCTCGACGTGACCATCGCCTCCGGTCCACTGTTGACCTGATTACG
GTTCCTCAACTTGACGACTCTCGGTAGGGGCAGACAAAATGTAAAATAAGGTTTCTACAC
GTCTAAAACTAAAAGAGAAAAACAAGAGTAAATGTGAGTGAATCATGTACCTCTTGTCTC
CCAACAACATACCCATATAATTGCAGAATCCTTCGAGGGCATCTTTCCACTCCGTCATCC
GAAAATTGGAATAACAATGAGCTTTTTCTTGTCCGCAAGTGTCTTCATTTTTACTAACTC
GTCCATGCACCACATCGACTCTGGATACCTACAAGCCGATGAGGAAATTGTAACATGCAA
GGATAAGATATTGACTATAACTTTTGTCACGCAACAAAAACCAGAAGCTTACTTAACATG
GATCACAAGTTAAATTCGTTCTATTAAAATAGAAATAACAATGTTTTAATTTGGACTTAT
CCTATAAAATCAGTTATCATTTATTCATTAATAATAATATGTCTTAGTATATCACTCCAG
ATATTCTCACCTAATACATAATAATAAAGTTCGGTTAACC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL5614Contig1 815 2 7 U
AGTATATTTCTGAAGGATTGGGTCTTTACATTAGAGAAAGGTAAGCAAATAAGTTCATAG
CATGTGGGTTGAGACCAAAGATAACATCATAGTAATATCGTTTTGATTCATTGAGACTGT
GGATAGAAAAATATCAAGTTCTTGTTTCTTGTTCTTTTTGCATTCTGACCAACTTAAGCT
CATCCATCAACCTGTTAAGCTCAACATCTGATGATCCTCCTTCTCTTGCTGCATCTTTAG
CCATAACAGCTAACTGATTCGCCCGTTTCCTCCTCTCTTCTCCAACCATAACTTCCCTTA
CCGCAATCTCCACTTTCTCTCTACTAATGAAATCTCCAGAACCTTTCATCATCTTCTCTA
CTCCAACACTCACTCCTGTCTTCAACACTTGTGTCGCCAACTTCTCATTGTAGAACTGCT
CAGCTCCAATGGGCCATGTCACCATTGGCAGGCCTGATGCAGCACCTTCTAGAAGCGAGT
TCCATCCACAATGAGTCAAAAACCCTCCAATGGCTTGGTGGTCTAGTATAAGCACTTGAG
GCGCCCATCCACGTATTATCAGTCCTTGTCCTTTTGTTCTCTCTTCGAACCCTTCTGGTA
ACCACTCTACCTTCTCCCCTGTTCACACCCACCACAGAGGTTTATGTTTAGTCAATTTGT
TGCAAATAATAGCTACAAACATAGTATTCCCTTCATTTCTTTAAAAATATCAATTTGACA
TTTTTCAAACTGTTAAAGAAATGATTAATATATATCCATATTCTTATTAATTATACTAAT
AATATTTGAAATAAACAAAATTATTAATAAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ52JQ U 39
AF RR2DJ52TF C 1
BS 1 42 RR2DJ52TF
BS 43 52 RR2DJ52JQ
BS 53 53 RR2DJ52TF
BS 54 347 RR2DJ52JQ
BS 348 348 RR2DJ52TF
BS 349 361 RR2DJ52JQ
BS 362 815 RR2DJ52TF

RD RR2DJ52JQ 323 0 0
AAGG
AAGCAAATAA*TTCATAGCATGTGGGTTGAGACCAAAGATAACATCATAGTAATATCGTT
TTGATTCATTGAGACTGTGGATAGAAAAATATCAAGTTCTTGTTTCTTGTTCTTTTTGCA
TTCTGACCAACTTAAGCTCATCCATCAACCTGTTAAGCTCAACATCTGATGATCCTCCTT
CTCTTGCTGCATCTTTAGCCATAACAGCTAACTGATTCGCCCGTTTCCTCCTCTCTTCTC
CAACCATAACTTCCCTTACCGCAATCTCCACTTTCTCTCTACTAATGAAATCTCCAGAAC
CTTTC*TCATCTTCTCTAC

QA 5 323 5 323
DS 

RD RR2DJ52TF 815 0 0
AGTATATTTCTGAAGGATTGGGTCTTTACATTAGAGAAAGGTAAGCAAATAAGTTCATAG
CATGTGGGTTGAGACCAAAGATAACATCATAGTAATATCGTTTTGATTCAT*GAGACTGT
G*ATAGAAAA*TATCAAGTTCTTGTTTCTTGTTCTTTT*GCATTCTGACCAACTTAAGCT
CATCCATCAAC*TGTTAAGCTCAACATCTGATGATCCTCCTTCTCTTGCTGCATCTTTAG
CCATAACAGCTAACTGATTCGCCCGTTTCCTCCTCTCTTCTCCAACCATAACTTCCCTTA
CCGCAATCTCCACTTTCTCTCTACTAATGAAATCTCCAGAACCTTTCATCATCTTCTCTA
CTCCAACACTCACTCCTGTCTTCAACACTTGTGTCGCCAACTTCTCATTGTAGAACTGCT
CAGCTCCAATGGGCCATGTCACCATTGGCAGGCCTGATGCAGCACCTTCTAGAAGCGAGT
TCCATCCACAATGAGTCAAAAACCCTCCAATGGCTTGGTGGTCTAGTATAAGCACTTGAG
GCGCCCATCCACGTATTATCAGTCCTTGTCCTTTTGTTCTCTCTTCGAACCCTTCTGGTA
ACCACTCTACCTTCTCCCCTGTTCACACCCACCACAGAGGTTTATGTTTAGTCAATTTGT
TGCAAATAATAGCTACAAACATAGTATTCCCTTCATTTCTTTAAAAATATCAATTTGACA
TTTTTCAAACTGTTAAAGAAATGATTAATATATATCCATATTCTTATTAATTATACTAAT
AATATTTGAAATAAACAAAATTATTAATAAGATCC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL5615Contig1 1153 2 2 U
GGGAAGTTGCTAAACGCTAATGACAATAACACCCTCGATGCTCTCACATTATTTCAGCTT
TTCGCCCATTGTTGAGAGACGACCGAACTTTTCCCACCTTTTTACCATCTCTCTCTCTCC
GCATCAATCGTAAAACTCACTCTCTCTCTCATCCTTTCTCCCCATCTCTCTCTTCATTAT
CTCTCAAACGCGATGAACGGAGAGAAAGATCTGGCCGGAGACGGAGAGTGCTCACGAACC
AAAACCTCAAAGCCTCGATTCGCTCATCTAAACACCGACAAAACCAACCAGTTTCATCAC
AAAGGCGTTGGCGTCAACGACGACTTTCTCAGCGTCCGATCCAGCAACAACAACAACAAC
AACGTCGACGCCTTCTCCTCGAAATCATCTCCCAGATCCGGAAACGAGCTCACCCTCAGC
TACCTCTGCGAGAACCGCGACCTCTCCGAGAAAATCGCCGAGAGCCAAAAAGGTAAAGAG
GTCGTTACCTTCTCCTACTGATGCATCTAACTTCATCATCCAGTTTTTCAACTATGCAGA
GTCAGTATCAGAGTTTCCGGAACCACCGAAGGAGCAAACAGTTGTAACAGAAACAAGCCA
CAGAAAAGACGAAGCATCTGTGACGGCTTCAACGTCCAAGGATCAGATGAAGAAGAGCTT
TGCGTTGACCGATGCAATGATGAACAGTTTCGATAGTTTAGAGAGCATGGTGAGAATCAA
GGAGGCGGAAACGAGAATGTTTCAGAAGAAAGCCGACGAGGCGAGGATAGAGGCGGAGAG
TTTCAGGAGGATGATAGAGATGAAGACTGAGAAGATGGAGGAGGAGTACACAGAGAAGCT
GGCGCGGCTGTGTTTGCAGGAGACGGAGGAGAGGAGGAGGAATAAGCTCGAGGAGTTGAA
GAAGCTTGAGAACTCTCACTGTGATTACAGGAACATGAAGATGAGAATGGAGGCTGAGAT
TGCTGGATTGTTGAAGAGAATGGAAAGTACAAGACAGCAATTAGTATGAAATGAATCTGA
ACTAACAGAGCTTTTTTTAATTATCCGTTTCTTTGCTTCTTGTTGTCTTTTGTGATATAT
CAGTGATAACTGCTTTATTTGTTTTTCTCAGTTTTAAGTTTTTTTTTAATCTAAAACTTC
AGATTTTTTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV57TF U 1
AF RR2BV57JQ C 428
BS 1 715 RR2BV57TF
BS 716 1153 RR2BV57JQ

RD RR2BV57TF 715 0 0
GGGAAGTTGCTAAACGCTAATGACAATAACACCCTCGATGCTCTCACATTATTTCAGCTT
TTCGCCCATTGTTGAGAGACGACCGAACTTTTCCCACCTTTTTACCATCTCTCTCTCTCC
GCATCAATCGTAAAACTCACTCTCTCTCTCATCCTTTCTCCCCATCTCTCTCTTCATTAT
CTCTCAAACGCGATGAACGGAGAGAAAGATCTGGCCGGAGACGGAGAGTGCTCACGAACC
AAAACCTCAAAGCCTCGATTCGCTCATCTAAACACCGACAAAACCAACCAGTTTCATCAC
AAAGGCGTTGGCGTCAACGACGACTTTCTCAGCGTCCGATCCAGCAACAACAACAACAAC
AACGTCGACGCCTTCTCCTCGAAATCATCTCCCAGATCCGGAAACGAGCTCACCCTCAGC
TACCTCTGCGAGAACCGCGACCTCTCCGAGAAAATCGCCGAGAGCCAAAAAGGTAAAGAG
GTCGTTACCTTCTCCTACTGATGCATCTAACTTCATCATCCAGTTTTTCAACTATGCAGA
GTCAGTATCAGAGTTTCCGGAACCACCGAAGGAGCAAACAGTTGTAACAGAAACAAGCCA
CAGAAAAGACGAAGCATCTGTGACGGCTTCAACGTCCAAGGATCAGATGAAGAAGAGCTT
TGCGTTGACCGATGCAATGATGAACAGTTTCGATAGTTTAGAGAGCATGGTGAGA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2BV57JQ 726 0 0
GCGAGAACCGCGACCTCTCCGAGAAAATCGCCGAGAGCCAAAAAGGTAAAGAGGTCGTTA
CCTTCTCCTACTGATGCATCTAACTTCATCATCCAGTTTTTCAACTATGCAGAGTCAGTA
TCAGAGTTTCCGGAACCACCGAAGGAGCAAACAGTTGTAACAGAAACAAGCCACAGAAAA
GACGAAGCATCTGTGACGGCTTCAACGTCCAAGGATCAGATGAAGAAGAGCTTTGCGTTG
ACCGATGCAATGATGAACAGTTTCGATAGTTTAGAGAGCATGGTGAGAATCAAGGAGGCG
GAAACGAGAATGTTTCAGAAGAAAGCCGACGAGGCGAGGATAGAGGCGGAGAGTTTCAGG
AGGATGATAGAGATGAAGACTGAGAAGATGGAGGAGGAGTACACAGAGAAGCTGGCGCGG
CTGTGTTTGCAGGAGACGGAGGAGAGGAGGAGGAATAAGCTCGAGGAGTTGAAGAAGCTT
GAGAACTCTCACTGTGATTACAGGAACATGAAGATGAGAATGGAGGCTGAGATTGCTGGA
TTGTTGAAGAGAATGGAAAGTACAAGACAGCAATTAGTATGAAATGAATCTGAACTAACA
GAGCTTTTTTTAATTATCCGTTTCTTTGCTTCTTGTTGTCTTTTGTGATATATCAGTGAT
AACTGCTTTATTTGTTTTTCTCAGTTTTAAGTTTTTTTTTAATCTAAAACTTCAGATTTT
TTTGCT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL5616Contig1 752 2 2 U
GCTTGCACCGAGGGACCGAGAGAGACAGGAATACCGACCGTATAGAGATAGAAGACGTGG
AGGCTCCAATTTTTAAGGATGTTCTGTTCACGAATGTACCATCCGGGATCTTCTCCTGGG
GCGCTACTCCTGTTGTCTGAGTTTACTCACCCGGGATAAGGTTTTGCTTCATTTTATCTA
CTGGGACGAATTGCCTGATATGCGAGAGTTAATAGGCACAGATTCTAAATCAGCTTCTAC
TCTTGTGGCTCAGCATCTGCTTGCAGCGGCAGACCGTTATGCTCTTGAGCGGCTTAAAGC
TATCTGCGAGTCAAAGCTTTGTGAAGGAATCACCATAAACACGGTTGCAACCACCTTGGC
ACTAGCGGAGCAGCACCACTGTTTCCAGCTAAAAGCAGTCTGTCTCAAATTCGTCGCCAT
GCCTGAGAACTTGAAAGCTGTGATGCAAACAGATGGGTTTGATTATCTGAAAAGGAGCTG
TCCATCTCTACTCACTGAGCTATTGAAGTATTTGGCGAGGCTTAGGGAACACTCTGGAAC
TACTGCACCAGGACATCCAAAAGATATATTTGCTGATGGTTGTGATGCCAATGGAAGAAG
AGTGAAGCAACGGCTGCGCTGAACAGAATTGTGCATTGTATAATCTCTATTAAAAGATAA
TGGCTTATCTGAATCTTTTTCAATTCTTTGTTTTAAGATCAAAGATCCAATGGAATTTGG
TTACTAGTCTTGGTGTTTCTCTCTCTGTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G203TF U 1
AF RR2G203JQ C 382
BS 1 672 RR2G203TF
BS 673 752 RR2G203JQ

RD RR2G203TF 673 0 0
GCTTGCACCGAGGGACCGAGAGAGACAGGAATACCGACCGTATAGAGATAGAAGACGTGG
AGGCTCCAATTTTTAAGGATGTTCTGTTCACGAATGTACCATCCGGGATCTTCTCCTGGG
GCGCTACTCCTGTTGTCTGAGTTTACTCACCCGGGATAAGGTTTTGCTTCATTTTATCTA
CTGGGACGAATTGCCTGATATGCGAGAGTTAATAGGCACAGATTCTAAATCAGCTTCTAC
TCTTGTGGCTCAGCATCTGCTTGCAGCGGCAGACCGTTATGCTCTTGAGCGGCTTAAAGC
TATCTGCGAGTCAAAGCTTTGTGAAGGAATCACCATAAACACGGTTGCAACCACCTTGGC
ACTAGCGGAGCAGCACCACTGTTTCCAGCTAAAAGCAGTCTGTCTCAAATTCGTCGCCAT
GCCTGAGAACTTGAAAGCTGTGATGCAAACAGATGGGTTTGATTATCTGAAAAGGAGCTG
TCCATCTCTACTCACTGAGCTATTGAAGTATTTGGCGAGGCTTAGGGAACACTCTGGAAC
TACTGCACCAGGACATCCAAAAGATATATTTGCTGATGGTTGTGATGCCAATGGAAGAAG
AGTGAAGCAACGGCTGCGCTGAACAGAATTGTGCATTGTATAATCTCTATTAAAAGATAA
TGGCTTATCTGA
T

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2G203JQ 371 0 0
TTC
CCAGCTAAAAGCAGTCTGTCTCAAATTCGTCGCCATGCCTGAGAACTTGAAAGCTGTGAT
GCAAACAGATGGGTTTGATTATCTGAAAAGGAGCTGTCCATCTCTACTCACTGAGCTATT
GAAGTATTTGGCGAGGCTTAGGGAACACTCTGGAACTACTGCACCAGGACATCCAAAAGA
TATATTTGCTGATGGTTGTGATGCCAATGGAAGAAGAGTGAAGCAACGGCTGCGCTGAAC
AGAATTGTGCATTGTATAATCTCTATTAAAAGATAATGGCTTATCTGAATCTTTTTCAAT
TCTTTGTTTTAAGATCAAAGATCCAATGGAATTTGGTTACTAGTCTTGGTGTTTCTCTCT
CTGTCATC

QA 4 371 4 371
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5618Contig1 956 2 2 U
GGAGCAGCTTCCAAAAAGTCTGTTCTAAAAAAACCATACAAGGTTCCTTCACCATGGCCC
CTCCAGCTCTGACAGACGCAGAGACACTCAGGCATCTACAAGACATGATACAAGACATAA
TCCAGCAGCAGTTGACAACGGTTGTGTCAGCTCTCACCCAGCCACAAGAAAAACCCGACA
AGAATGAAGAAGAAAATCCTGTGTCAGTGAGCCCTGACGTAATTGAACTTCTTCCAGAAT
TTTCTGGCGAACAATCAGCCGAGGAGTTTCTAGACTGGATCGTCACCGTCGAGGAGACTC
TCGACTTCAAACGCGTGTCTCTGGAACGATGTGTTCCCATGATCGCCATGCTGTTCCTTG
GCTCAGCAGCAGCTTGGTGGTCGCAACAGAAGTCGTCACGTGCACGTGAGGGAAAACCTA
GAATCTTGTCGTGGGATAAGTTGAAGAAGAAGATGCGTAAGGCGTTTTTACCATTCAACT
ACGACCAAGTCATGTTCCAACGCTTTCACGGTTTGCAACAAGAAAGGCGATCAGTGGAAG
AATACTCCACCGAGTTTATTTCGCTTCTGAGGCGTGTTGATGTGCAGTATACGGACCAAC
AAATTGTAGGGTTTTTCGTACGTGGCTTGCGGCAGAAGGAGATGAAAGACGTTCTTAGCT
TATTGAACCCTCTCACTCTAGCCGAAGCACATCAAAAGGCACTCATCCTGGAAGCTCATC
TTGAGAAGGAGAACTTGGGGGCCAAGATGGAGAACTTGGGCAAGTCCTTGTCGCATATAG
GGTATTGGAGTCTCTTTACGCTCTCGTTTATAATCTTTGCATCTAGATGTTGAGAATTGA
GATTGTGGCTTACTGTTTTTTTTTTTTCTACTTTTGTCTCAAAAGTATATCCCTCTGGTT
TTGCGCTTTCTTTTAGTTCGATTTAGAGCATACTTAATTATAGTTTTTGTTTCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU12TF U 1
AF RR2FU12JQ C 364
BS 1 663 RR2FU12TF
BS 664 956 RR2FU12JQ

RD RR2FU12TF 663 0 0
GGAGCAGCTTCCAAAAAGTCTGTTCTAAAAAAACCATACAAGGTTCCTTCACCATGGCCC
CTCCAGCTCTGACAGACGCAGAGACACTCAGGCATCTACAAGACATGATACAAGACATAA
TCCAGCAGCAGTTGACAACGGTTGTGTCAGCTCTCACCCAGCCACAAGAAAAACCCGACA
AGAATGAAGAAGAAAATCCTGTGTCAGTGAGCCCTGACGTAATTGAACTTCTTCCAGAAT
TTTCTGGCGAACAATCAGCCGAGGAGTTTCTAGACTGGATCGTCACCGTCGAGGAGACTC
TCGACTTCAAACGCGTGTCTCTGGAACGATGTGTTCCCATGATCGCCATGCTGTTCCTTG
GCTCAGCAGCAGCTTGGTGGTCGCAACAGAAGTCGTCACGTGCACGTGAGGGAAAACCTA
GAATCTTGTCGTGGGATAAGTTGAAGAAGAAGATGCGTAAGGCGTTTTTACCATTCAACT
ACGACCAAGTCATGTTCCAACGCTTTCACGGTTTGCAACAAGAAAGGCGATCAGTGGAAG
AATACTCCACCGAGTTTATTTCGCTTCTGAGGCGTGTTGATGTGCAGTATACGGACCAAC
AAATTGTAGGGTTTTTCGTACGTGGCTTGCGGCAGAAGGAGATGAAAGACGTTCTTAGCT
TAT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2FU12JQ 593 0 0
CAGCAGCAGCTTGGTGGTCGCAACAGAAGTCGTCACGTGCACGTGAGGGAAAACCTAGAA
TCTTGTCGTGGGATAAGTTGAAGAAGAAGATGCGTAAGGCGTTTTTACCATTCAATTACG
ACCAAGTCATGTTCCAACGCTTTCACGGTTTGCAACAAGAAAGGCGATCAGTGGAAGAAT
ACTCCACCGAGTTTATTTCGCTTTTGAGGCGTGTTGATGTGCAGTATACGGACCAACAAA
TTGTAGGGTTTTTCGTACGTGGCTTGCGGCAGAAGGAGATGAAAGACGTTTTTAGCTTAT
TGAACCCTCTCACTCTAGCCGAAGCACATCAAAAGGCACTCATCCTGGAAGCTCATCTTG
AGAAGGAGAACTTGGGGGCCAAGATGGAGAACTTGGGCAAGTCCTTGTCGCATATAGGGT
ATTGGAGTCTCTTTACGCTCTCGTTTATAATCTTTGCATCTAGATGTTGAGAATTGAGAT
TGTGGCTTACTGTTTTTTTTTTTTCTACTTTTGTCTCAAAAGTATATCCCTCTGGTTTTG
CGCTTTCTTTTAGTTCGATTTAGAGCATACTTAATTATAGTTTTTGTTTCGTC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

CO CL5619Contig1 619 2 1 U
GATTCGTGAGGGGGCTTGTGAACCCTGGATATTTTGGGATGAAATCGGTTTCGGATGTTC
CAGCTTTGGTGGGAACTCTTGAGGATCCTCTAATTCCATTCTCGTCCATCTCGATACTTA
GGAAGTATAGTGAAACAGATATGACATACAAGATATTTACACGACAAGCAGCATCAGATT
CATTGCTTGATGAGCTCTTCAGTGCAAGAACAGAAACTGTTCGCATAGACTGGGGTGCAT
ATCCAAAGTACCACGCTCCTGAAGTTTTTGCACCGTTCATATTAGATGACCATCATTTGT
ACTATGTGAATGCTTTTGAAAACGCGGCTAGCACGATGGAGACAAGTGCAGTGGCTGGTG
AGAATATGGCGAGGCTCATAATTTCCAGATTCAGGACAAAAGAATCATCATCACCACCTT
CGTCCGACTCAAGAAGCTGTGGTTCTGGTCTTCACTCAGACTTGTGAACAAACTTATCAG
CTACGCGTGAACAAGGTTTTTTTGACTGTGCTCTTTGAAGAATAATATGCTTTGATGTAT
ATATAAAGAAACTATAAAGCTGTAAAAACTGTAAACTATGAGTTGTTTGTTTTCAGTTAT
TGATTGAGACCATTATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DV68TF U 1
AF RR2DV68JQ C 332
BS 1 619 RR2DV68TF

RD RR2DV68TF 619 0 0
GATTCGTGAGGGGGCTTGTGAACCCTGGATATTTTGGGATGAAATCGGTTTCGGATGTTC
CAGCTTTGGTGGGAACTCTTGAGGATCCTCTAATTCCATTCTCGTCCATCTCGATACTTA
GGAAGTATAGTGAAACAGATATGACATACAAGATATTTACACGACAAGCAGCATCAGATT
CATTGCTTGATGAGCTCTTCAGTGCAAGAACAGAAACTGTTCGCATAGACTGGGGTGCAT
ATCCAAAGTACCACGCTCCTGAAGTTTTTGCACCGTTCATATTAGATGACCATCATTTGT
ACTATGTGAATGCTTTTGAAAACGCGGCTAGCACGATGGAGACAAGTGCAGTGGCTGGTG
AGAATATGGCGAGGCTCATAATTTCCAGATTCAGGACAAAAGAATCATCATCACCACCTT
CGTCCGACTCAAGAAGCTGTGGTTCTGGTCTTCACTCAGACTTGTGAACAAACTTATCAG
CTACGCGTGAACAAGGTTTTTTTGACTGTGCTCTTTGAAGAATAATATGCTTTGATGTAT
ATATAAAGAAACTATAAAGCTGTAAAAACTGTAAACTATGAGTTGTTTGTTTTCAGTTAT
TGATTGAGACCATTATCAT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2DV68JQ 288 0 0
CACGATGGAGACAAGTGCAGTGGCTGGTGAGAATATGGCGAGGCTCATAATTTCCAGATT
CAGGACAAAAGAATCATCATCACCACCTTCGTCCGACTCAAGAAGCTGTGGTTCTGGTCT
TCACTCAGACTTGTGAACAAACTTATCAGCTACGCGTGAACAAGGTTTTTTTGACTGTGC
TCTTTGAAGAATAATATGCTTTGATGTATATATAAAGAAACTATAAAGCTGTAAAAACTG
TAAACTATGAGTTGTTTGTTTTCAGTTATTGATTGAGACCATTATCAT

QA 1 288 1 288
DS 



AS 1 2

CO CL5620Contig1 1143 2 2 U
GGACTTCTAACCTTCTCTTCTTCCACACACTTAAATACACACACGCTTTAGATAATATAG
AAGAAGAACAAGGACAAGAAAATAATGGATCAAGAAAAGTCTCCCTCTTGCTGCTGCGTT
CTTGATGCTTCTACTTATGTAGGTTTCTGGATTCTCAAGAAGTTGCTTAGCAGAGGATAC
TCTGTTCACGCAGCTATTCGTAGAAACGGGGAGAGTGAAATTGAAGAGACAATCAGAGAG
ATGGAAGCAACGGAGGAGAGATTAGTGGTGTACGATGTTGATGTCTTGGACTATCAAAGC
ATACTTGTCTCTCTCAAGACATGTAACGCTGTCTTCTGCTGCTTAGATAGCCCTGAAGGA
TACGATGAGAAGGAGGTTGATTTGGAGGTGAGAGGAGCTATCAATGTGGTGGAGGCATGT
GGAAGAACAGAGAGCATAGAGAAGATTGTCTTCTCTTCTTCTTTAACAGCTTCTATTTGG
AGAGACAACATTGGAACTCAGAAGGATGTTGATGAGAAGTGTTGGAGTGATCAAGACTTC
TGTCGCAGCAAGAAGCTGTGGCACGCATTGGCAAAGATGTTGTCCGAGAAAGCAGCTTGG
GCACTAGCCATGGACCGTAGGCTCAACATGGTTTCTATCAATCCTGGTCTTATCGTCGGA
CCGTCGGTTGCACAACATAACCCTAGGCCCACCATGTCCTACCCCAAAGGAGCTGCACAA
ATGTATGAGAATGGAGTGTTGGCATATGTAGATGTGAAATTCTTAGCGGATGTTCATATT
AGAGCATTCGAGGATGTTTCAGCATGTGGTCGATATTTCTGCTTCAACCAAATCGTCAAC
ACAGAAGAAGAAGCTCTCAAGCTTGTCCAGAGTTTGTCTCCTTTGATACCTATGCCACCG
AGGTATGAGAGTGTAATGCAAGGAAGCGAAGTTTACGAAGAAAGATTGAGGAACAATAAA
TTGAGCAAGCTGGTGGAAGCTGGCTCTGCTTGTTAAACAAATATTTAAATTATTAAGATT
GAAAATGAGGAGCTTATACAAGAAAGGGTTATAGTTTGTATATTAAGCTTCTCTAAATTC
ATACTTCATGGTAGCATGTGTTCTCGTGAACTATTTATTTATAAAAAATCATATTTTCAT
GTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2F090TF U 1
AF RR2F090JQ C 392
BS 1 679 RR2F090TF
BS 680 1143 RR2F090JQ

RD RR2F090TF 679 0 0
GGACTTCTAACCTTCTCTTCTTCCACACACTTAAATACACACACGCTTTAGATAATATAG
AAGAAGAACAAGGACAAGAAAATAATGGATCAAGAAAAGTCTCCCTCTTGCTGCTGCGTT
CTTGATGCTTCTACTTATGTAGGTTTCTGGATTCTCAAGAAGTTGCTTAGCAGAGGATAC
TCTGTTCACGCAGCTATTCGTAGAAACGGGGAGAGTGAAATTGAAGAGACAATCAGAGAG
ATGGAAGCAACGGAGGAGAGATTAGTGGTGTACGATGTTGATGTCTTGGACTATCAAAGC
ATACTTGTCTCTCTCAAGACATGTAACGCTGTCTTCTGCTGCTTAGATAGCCCTGAAGGA
TACGATGAGAAGGAGGTTGATTTGGAGGTGAGAGGAGCTATCAATGTGGTGGAGGCATGT
GGAAGAACAGAGAGCATAGAGAAGATTGTCTTCTCTTCTTCTTTAACAGCTTCTATTTGG
AGAGACAACATTGGAACTCAGAAGGATGTTGATGAGAAGTGTTGGAGTGATCAAGACTTC
TGTCGCAGCAAGAAGCTGTGGCACGCATTGGCAAAGATGTTGTCCGAGAAAGCAGCTTGG
GCACTAGCCATGGACCGTAGGCTCAACATGGTTTCTATCAATCCTGGTCTTATCGTCGGA
CCGTCGGTTGCACAACATA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2F090JQ 752 0 0
GAGGAGCTATCAATGTGGTGGAGGCATGTGGAAGAACAGAGAGCATAGAGAAGATTGTCT
TCTCTTCTTCTTTAACAGCTTCTATTTGGAGAGACAACATTGGAACTCAGAAGGATGTTG
ATGAGAAGTGTTGGAGTGATCAAGACTTCTGTCGCAGCAAGAAGCTGTGGCACGCATTGG
CAAAGATGTTGTCCGAGAAAGCAGCTTGGGCACTAGCCATGGACCGTAGGCTCAACATGG
TTTCTATCAATCCTGGTCTTATCGTCGGACCGTCGGTTGCACAACATAACCCTAGGCCCA
CCATGTCCTACCCCAAAGGAGCTGCACAAATGTATGAGAATGGAGTGTTGGCATATGTAG
ATGTGAAATTCTTAGCGGATGTTCATATTAGAGCATTCGAGGATGTTTCAGCATGTGGTC
GATATTTCTGCTTCAACCAAATCGTCAACACAGAAGAAGAAGCTCTCAAGCTTGTCCAGA
GTTTGTCTCCTTTGATACCTATGCCACCGAGGTATGAGAGTGTAATGCAAGGAAGCGAAG
TTTACGAAGAAAGATTGAGGAACAATAAATTGAGCAAGCTGGTGGAAGCTGGCTCTGCTT
GTTAAACAAATATTTAAATTATTAAGATTGAAAATGAGGAGCTTATACAAGAAAGGGTTA
TAGTTTGTATATTAAGCTTCTCTAAATTCATACTTCATGGTAGCATGTGTTCTCGTGAAC
TATTTATTTATAAAAAATCATATTTTCATGTG

QA 1 752 1 752
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5622Contig1 1298 2 2 U
GAGTGTTTCTCTTAGAGAAAAGAAAAAATTGGACTTCACCCTTAAGGTTGTTGGAGGCGA
CATTTCATCAATTCCTGGACTTTCTGATGCTATTGAGGAAACAATACGGGATGCCGTGGA
AGATTCAATCACATGGCCTGTTCGGAAGGTCATCCCCATTTTGCCTGGTGATTATAGTGA
TCTGGAGCTTAAGCCTGTTGGAATGTTGGAGGTGAAGCTTGTGCAAGCGAAGAACTTGAC
CAACAAAGATCTAGTGGGAAAATCTGACCCCTTTGCTAAAATGTTTATACGCCCTTTGCG
TGAAAAGACTCAAAGAAGCAAGACAATTAACAATGATCTGAATCCCATCTGGAATGAGCA
TTTTGAATTTGTTGTTGAAGACGCGTCAACTCAACATTTAGTGGTTAAAATATATGACGA
CGAGGGTGTGCAGGCATCTGAGCTTATTGGCTGTGCACAGATCCGGCTTTGTGAACTTGA
ACCTGGTAAAGTGAAAGACGTCTGGTTGAAGTTGGTCAAGGATCTAGAGATCCAGAGAGA
TAACAAGAACCGTCGAGAGGTTCACCTTGAGCTACTATATGTTCCTTTCGGTGCGGGAAG
CAACGGCATCGTAGATCCCTTTGCCTCTTCATCGATGACTTCGTTAGAAAGAGTGCTCAA
GAATGATACGACAGACGAAGAGAATGCAACATCGCGTAAAAGAAAAGATGTCATCGTGAG
AGGAGTGCTTTCTGTGACGGTGATATCTGCAGAAGAGATACCGATACAAGATATGATGGG
GAAAGCTGATCCATATGTCGTTCTCTCCATGAAGAAATCAGGTGCCAAGAGCAAAACTCG
GGTTGTCAATGACAGCCTAAACCCGGTTTGGAACCAGACTTTTGATTTTGTGGTGGAAGA
CGGTTTACACGATATGCTAGTCCTTGAAGTTTGGGACCATGACACCTTTGGAAAGGATTA
CATTGGGAGATGCATCTTGACGCTGACGAGGGTTATAATGGAAGAGGAATACAAGGACTG
GTTTCCATTAGACGAATCCAAATCAGGCAAGCTTCAGTTGCATCTCAAGTGGATGGCTCA
GTCGATTTATCGTGATTCCTATGTCTTTGTCTAAAGTTTACTTAAGAGAGAGAGAATACA
CAAGAGAAAGGATCGAGCTTGGCTTTTGTTAATTATGTGTATTTAAGCTGTAGGCACTTG
AAATAGAGTTAGATGGCGTCTCAAGGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTCTTCACGACTCCTAA
CTTAAGTCTTCTTTATATTCGAGAGCTTGGCCCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B382TF U 1
AF RR2B382JQ C 488
BS 1 783 RR2B382TF
BS 784 1298 RR2B382JQ

RD RR2B382TF 783 0 0
GAGTGTTTCTCTTAGAGAAAAGAAAAAATTGGACTTCACCCTTAAGGTTGTTGGAGGCGA
CATTTCATCAATTCCTGGACTTTCTGATGCTATTGAGGAAACAATACGGGATGCCGTGGA
AGATTCAATCACATGGCCTGTTCGGAAGGTCATCCCCATTTTGCCTGGTGATTATAGTGA
TCTGGAGCTTAAGCCTGTTGGAATGTTGGAGGTGAAGCTTGTGCAAGCGAAGAACTTGAC
CAACAAAGATCTAGTGGGAAAATCTGACCCCTTTGCTAAAATGTTTATACGCCCTTTGCG
TGAAAAGACTCAAAGAAGCAAGACAATTAACAATGATCTGAATCCCATCTGGAATGAGCA
TTTTGAATTTGTTGTTGAAGACGCGTCAACTCAACATTTAGTGGTTAAAATATATGACGA
CGAGGGTGTGCAGGCATCTGAGCTTATTGGCTGTGCACAGATCCGGCTTTGTGAACTTGA
ACCTGGTAAAGTGAAAGACGTCTGGTTGAAGTTGGTCAAGGATCTAGAGATCCAGAGAGA
TAACAAGAACCGTCGAGAGGTTCACCTTGAGCTACTATATGTTCCTTTCGGTGCGGGAAG
CAACGGCATCGTAGATCCCTTTGCCTCTTCATCGATGACTTCGTTAGAAAGAGTGCTCAA
GAATGATACGACAGACGAAGAGAATGCAACATCGCGTAAAAGAAAAGATGTCATCGTGAG
AGGAGTGCTTTCTGTGACGGTGATATCTGCAGAAGAGATACCGATACAAGATATGATGGG
GAA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2B382JQ 811 0 0
AAAGTGAAAGACGTCTGGTTGAAGTTGGTCAAGGATCTAGAGATCCAGAGAGATAACAAG
AACCGTCGAGAGGTTCACCTTGAGCTACTATATGTTCCTTTCGGTGCGGGAAGCAACGGC
ATCGTAGATCCCTTTGCCTCTTCATCGATGACTTCGTTAGAAAGAGTGCTCAAGAATGAT
ACGACAGACGAAGAGAATGCAACATCGCGTAAAAGAAAAGATGTCATCGTGAGAGGAGTG
CTTTCTGTGACGGTGATATCTGCAGAAGAGATACCGATACAAGATATGATGGGGAAAGCT
GATCCATATGTCGTTCTCTCCATGAAGAAATCAGGTGCCAAGAGCAAAACTCGGGTTGTC
AATGACAGCCTAAACCCGGTTTGGAACCAGACTTTTGATTTTGTGGTGGAAGACGGTTTA
CACGATATGCTAGTCCTTGAAGTTTGGGACCATGACACCTTTGGAAAGGATTACATTGGG
AGATGCATCTTGACGCTGACGAGGGTTATAATGGAAGAGGAATACAAGGACTGGTTTCCA
TTAGACGAATCCAAATCAGGCAAGCTTCAGTTGCATCTCAAGTGGATGGCTCAGTCGATT
TATCGTGATTCCTATGTCTTTGTCTAAAGTTTACTTAAGAGAGAGAGAATACACAAGAGA
AAGGATCGAGCTTGGCTTTTGTTAATTATGTGTATTTAAGCTGTAGGCACTTGAAATAGA
GTTAGATGGCGTCTCAAGGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTCTTCACGACTCCTAACTTAAGT
CTTCTTTATATTCGAGAGCTTGGCCCTGTCC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL5623Contig1 1247 2 2 U
GTGTAGTGTGCTCTTTAAGCTCTCTTCCCTTGGAACTCTCCCATAATCCACCAAACACAG
ATTGGTTTGGATTTTCAGACGAAACTAAACCCCAGGCACATACCATGAGAGCACCCACAG
ATCTAACGCTCACCTCAGTTGTTAGACAAGTTAGAGCTTCTCTGATGATTTGAATCCTCT
CCTCAAGTGTTTCAACATGATTCCAGGCATCGAGATTGATAACCTTCCTGTCCTTCAGCA
TCTCATTTGTCCAAACCACTTTATTAGTGTTCATCTTGTGTCTGAAAGATGATAGAGCTT
CCCATTTTTTGGCAAGATGTGGGTTGAACATAGTACTAGCCGAAACAGTGTCATCTGGTT
CATTTGGAGGTGTTGCCATTGATCACTTGTCTTTTGAAGTCGGAGGTATTAAAAAAAGGA
AACAAGCCGTCAGAGGAACTTGTTTATTTGTACAACTCTACTTTGAAAAAAAAGTTTTAA
CCTAGCTGTTGGAGAAGAGAAACCTAATGGACCTGGACCTTTACAATTCTGATATGGACA
TACATGGAAATTGTTAATAACGGATGAGGCTAAATAATAGAAACAGATGGATAAAAATTA
TATTTACAAGAGGTTCAGGATTGGTTATGTCCGCACACACGCGCAAAATTATTGATGAGG
ACTGGAAGTATATTTTTGGATATAGTACAATTAAACATCATATATAAAGTATCTATATTT
TAGAACCAATGGAGAAATGTATAATATTCGTTTATCCAAAGTTGAAAATGAAAGGAACAT
ATGTTTGAGTAACAGATTAACAATGTTCCGTTGTAATATCCGAAGAGTATATGAGAACCG
AGGTGTGTGGTATTGTCACCAAAGAATTGTGATTGTGCTGACTTTGAAAAATGAAAAGCC
TCTCGATGAAACCGAACAAGACATATCTATTTTTAATTTTATGTTATGACTTGGTTGCCA
TCTCTTTTGGCAGTCTAAATATGTGTGTGTTCTTTAGTGGTTATTTAGCAAAATGGTTGC
CGAGTTTTCTTCAATATGTATTTATGAGAAACATAGTTTTTGAGCTAATTATGTCTTCTT
AATAGCTTTGTTAACCGGGTAGTTCTTACAAAAATAACAAAGGGCTTTTGTATATGCAAA
TAGAGACTCAAAAATAAACCATTCATTTTTTTTTCCTTTTTCTTCTGATCACCCACCACC
CCTAATATTTATCTTTCTTTTTGCTTGAATTCTCTCTTCGTAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B328TF U 1
AF RR2B328JQ C 466
BS 1 761 RR2B328TF
BS 762 1247 RR2B328JQ

RD RR2B328TF 761 0 0
GTGTAGTGTGCTCTTTAAGCTCTCTTCCCTTGGAACTCTCCCATAATCCACCAAACACAG
ATTGGTTTGGATTTTCAGACGAAACTAAACCCCAGGCACATACCATGAGAGCACCCACAG
ATCTAACGCTCACCTCAGTTGTTAGACAAGTTAGAGCTTCTCTGATGATTTGAATCCTCT
CCTCAAGTGTTTCAACATGATTCCAGGCATCGAGATTGATAACCTTCCTGTCCTTCAGCA
TCTCATTTGTCCAAACCACTTTATTAGTGTTCATCTTGTGTCTGAAAGATGATAGAGCTT
CCCATTTTTTGGCAAGATGTGGGTTGAACATAGTACTAGCCGAAACAGTGTCATCTGGTT
CATTTGGAGGTGTTGCCATTGATCACTTGTCTTTTGAAGTCGGAGGTATTAAAAAAAGGA
AACAAGCCGTCAGAGGAACTTGTTTATTTGTACAACTCTACTTTGAAAAAAAAGTTTTAA
CCTAGCTGTTGGAGAAGAGAAACCTAATGGACCTGGACCTTTACAATTCTGATATGGACA
TACATGGAAATTGTTAATAACGGATGAGGCTAAATAATAGAAACAGATGGATAAAAATTA
TATTTACAAGAGGTTCAGGATTGGTTATGTCCGCACACACGCGCAAAATTATTGATGAGG
ACTGGAAGTATATTTTTGGATATAGTACAATTAAACATCATATATAAAGTATCTATATTT
TAGAACCAATGGAGAAATGTATAATATTCGTTTATCCAAAG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2B328JQ 782 0 0
AAAAAAAAGTTTTAACCTAGCTGTTGGAGAAGAGAAACCTAATGGACCTGGACCTTTACA
ATTCTGATATGGACATACATGGAAATTGTTAATAACGGATGAGGCTAAATAATAGAAACA
GATGGATAAAAATTATATTTACAAGAGGTTCAGGATTGGTTATGTCCGCACACACGCGCA
AAATTATTGATGAGGACTGGAAGTATATTTTTGGATATAGTACAATTAAACATCATATAT
AAAGTATCTATATTTTAGAACCAATGGAGAAATGTATAATATTCGTTTATCCAAAGTTGA
AAATGAAAGGAACATATGTTTGAGTAACAGATTAACAATGTTCCGTTGTAATATCCGAAG
AGTATATGAGAACCGAGGTGTGTGGTATTGTCACCAAAGAATTGTGATTGTGCTGACTTT
GAAAAATGAAAAGCCTCTCGATGAAACCGAACAAGACATATCTATTTTTAATTTTATGTT
ATGACTTGGTTGCCATCTCTTTTGGCAGTCTAAATATGTGTGTGTTCTTTAGTGGTTATT
TAGCAAAATGGTTGCCGAGTTTTCTTCAATATGTATTTATGAGAAACATAGTTTTTGAGC
TAATTATGTCTTCTTAATAGCTTTGTTAACCGGGTAGTTCTTACAAAAATAACAAAGGGC
TTTTGTATATGCAAATAGAGACTCAAAAATAAACCATTCATTTTTTTTTCCTTTTTCTTC
TGATCACCCACCACCCCTAATATTTATCTTTCTTTTTGCTTGAATTCTCTCTTCGTAATT
CC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL5624Contig1 1155 2 2 U
CTTAACAAGAAGTTGACTCAGGTTAACAAAATATTCTCAGAGAATGCATTTGACGCTGTG
ATGCATTTCGCAGCTGTTGCTTATGTTGGAGAAAGCACACAGTTCCCTCTAAAGTATTAC
CACAACATTACATCAAACACATTAGTAGTTCTAGAGACAATGGCTGCTCATGGTGTGAAG
ACTTTGATATATTCGAGCACATGTGCTACCTATGGAGAGCCTGAGAAGATGCCAATTACA
GAGGAAACTCCTCAGGTTCCTATCAATCCATATGGAAAGGCTAAGAAGATGGCTGAAGAT
ATCATCTTGGACTTCTCCAAAAACTCCAACATGGCGGTTATGATCCTTAGATGTTTCAAT
GTGATTGGGTCTGATCCTGAGGGAAGACTGGGTGAAGCTCCAAGACCAGAACTCAGAGAG
CATGGAAGGATCTCTGGTGCTTGCTTTGATGCTGCACGTGGCATCATCCCCGGTCTACAG
ATTAAAGGAACAGACTACAAGACCCCTGATGGGACTTGCGTACGTGACTACATAGATGTC
ACAGACCTTGTTGATGCTCATGTTAAAGCTCTTGAAAAGGCCAAACCTAGCAGACTTGGA
ATCTTCAATGTTGGTACCGGGAAAGGTAGCTCGGTGAAAGAGTTTGTGGAGGCCTGCAAG
AAAGCGACAGGGGTTGATATAAAGGTCGATTACTTGGAGAGACGGGCAGGAGATTACGCA
GAAGTTTACAGCGATCCAAGAAAGATTAGAGAGGAGCTGAATTGGACAGCTAAGCACACA
AATCTTAAGGAGAGTTTGAAGACTGCATGGAGATGGCAAAAGCTTCATCGCAATGGCTAT
GAATCTTCTTCTTTTTCTTCATTGTTCTCTGCATACTGACCCTTTTTTCTCTGTATTGAT
CCGTGATGATTGATCTTCTAGGACTCCTTTCACTGTTTGATGATTGGTAGCTAGAGATTA
GAGTCTAGATGGTTGTGGAGGGAGTAGGAGATGCTGAATGTGTTCTTACTTATCGGTATC
CATATATAGAAATATGGATTGTTTAATAAAATGTTTTAGGTTAATTCTAGGAGCAGCTAT
TCATTCAACGTTTTGCACCTGTTTGTAAAAGGGTTACCTCTCAAATATATTATTGTGATT
GAGGTTGATCGAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE21TF U 1
AF RR2AE21JQ C 380
BS 1 680 RR2AE21TF
BS 681 1155 RR2AE21JQ

RD RR2AE21TF 680 0 0
CTTAACAAGAAGTTGACTCAGGTTAACAAAATATTCTCAGAGAATGCATTTGACGCTGTG
ATGCATTTCGCAGCTGTTGCTTATGTTGGAGAAAGCACACAGTTCCCTCTAAAGTATTAC
CACAACATTACATCAAACACATTAGTAGTTCTAGAGACAATGGCTGCTCATGGTGTGAAG
ACTTTGATATATTCGAGCACATGTGCTACCTATGGAGAGCCTGAGAAGATGCCAATTACA
GAGGAAACTCCTCAGGTTCCTATCAATCCATATGGAAAGGCTAAGAAGATGGCTGAAGAT
ATCATCTTGGACTTCTCCAAAAACTCCAACATGGCGGTTATGATCCTTAGATGTTTCAAT
GTGATTGGGTCTGATCCTGAGGGAAGACTGGGTGAAGCTCCAAGACCAGAACTCAGAGAG
CATGGAAGGATCTCTGGTGCTTGCTTTGATGCTGCACGTGGCATCATCCCCGGTCTACAG
ATTAAAGGAACAGACTACAAGACCCCTGATGGGACTTGCGTACGTGACTACATAGATGTC
ACAGACCTTGTTGATGCTCATGTTAAAGCTCTTGAAAAGGCCAAACCTAGCAGACTTGGA
ATCTTCAATGTTGGTACCGGGAAAGGTAGCTCGGTGAAAGAGTTTGTGGAGGCCTGCAAG
AAAGCGACAGGGGTTGATAT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2AE21JQ 776 0 0
AGGGAAGACTGGGTGAAGCTCCAAGACCAGAACTCAGAGAGCATGGAAGGATCTCTGGTG
CTTGCTTTGATGCTGCACGTGGCATCATCCCCGGTCTACAGATTAAAGGAACAGACTACA
AGACCCCTGATGGGACTTGCGTACGTGACTACATAGATGTCACAGACCTTGTTGATGCTC
ATGTTAAAGCTCTTGAAAAGGCCAAACCTAGCAGACTTGGAATCTTCAATGTTGGTACCG
GGAAAGGTAGCTCGGTGAAGGAGTTTGTGGAGGCCTGCAAGAAAGCGACAGGGGTTGATA
TAAAGGTCGATTACTTGGAGAGACGGGCAGGAGATTACGCAGAAGTTTACAGCGATCCAA
GAAAGATTAGAGAGGAGCTGAATTGGACAGCTAAGCACACAAATCTTAAGGAGAGTTTGA
AGACTGCATGGAGATGGCAAAAGCTTCATCGCAATGGCTATGAATCTTCTTCTTTTTCTT
CATTGTTCTCTGCATACTGACCCTTTTTTCTCTGTATTGATCCGTGATGATTGATCTTCT
AGGACTCCTTTCACTGTTTGATGATTGGTAGCTAGAGATTAGAGTCTAGATGGTTGTGGA
GGGAGTAGGAGATGCTGAATGTGTTCTTACTTATCGGTATCCATATATAGAAATATGGAT
TGTTTAATAAAATGTTTTAGGTTAATTCTAGGAGCAGCTATTCATTCAACGTTTTGCACC
TGTTTGTAAAAGGGTTACCTCTCAAATATATTATTGTGATTGAGGTTGATCGAGTT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL5625Contig1 821 2 2 U
GGAAAGTAATTGAGAGATTTCCATGGCGGTGACAAATCTTGCGAGATTAAGGAAGCGGGA
TGAATTTTGGATGAAAGTGGGAGAATGTGGTGGATTTGATATCGAACACTTGATGGAAAA
AAAACCACCCTCTTGTAATATCATAGCTCGGAAGTTTACAAAAGATCTTTGCCCCCGAAA
CAACATCATCGTATATGCTAAGTTAGGGATCCATAAGTACAATATGACACAGGGTACTAA
CTTGCAGCTGAGTTCCATAGAGAAATACAATGTGCGACCAAAAGTAGCTTATACCACTTA
CTATGTAACAGCGGTTGCAAAAGATCCAGCTGTTGATGAGGACCAAGCTTACAACCGATC
TAGCGAATGTGGACCTATAGACAGAGGTAGTTTGCCTGAATGGCCGGCAGATAATGCTTT
CGATGATAAAACGCGATATTACGTGGTGAAAAAATCAGAGCTTCGAAAAAATGACTGGAT
TCGTCTATACTTGGAGCTTGCATTCCTCAATGCAAATTTAAGCCTTCCAAATCTTTCTTC
TTCTGCAGATTAATCTGTCAAAGCTGGTCATAATGAAAGTAGCGGTGGAGAGTAGAGAAA
ACATAGATTCTCCAAAGGGAGACTCAATGCCAGATATGCAACCTTCTACATAAAGTACAA
GTACTGCCCAAATAAAAGTCGCCGCGCTTGTAAGGTTGATGGTTGCAGGGCTACACGTGA
ACGCATAGCTATAGTAAGAAGAAGCCTGGACAAGATTTCAGGACTCCTCACTCTCTCGTT
CCATGGTCATTGGAAACACACTTTTCTTTAGAGTATCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C173TF U 1
AF RR2C173JQ C 399
BS 1 696 RR2C173TF
BS 697 821 RR2C173JQ

RD RR2C173TF 703 0 0
GGAAAGTAATTGAGAGATTTCCATGGCGGTGACAAATCTTGCGAGATTAAGGAAGCGGGA
TGAATTTTGGATGAAAGTGGGAGAATGTGGTGGATTTGATATCGAACACTTGATGGAAAA
AAAACCACCCTCTTGTAATATCATAGCTCGGAAGTTTACAAAAGATCTTTGCCCCCGAAA
CAACATCATCGTATATGCTAAGTTAGGGATCCATAAGTACAATATGACACAGGGTACTAA
CTTGCAGCTGAGTTCCATAGAGAAATACAATGTGCGACCAAAAGTAGCTTATACCACTTA
CTATGTAACAGCGGTTGCAAAAGATCCAGCTGTTGATGAGGACCAAGCTTACAACCGATC
TAGCGAATGTGGACCTATAGACAGAGGTAGTTTGCCTGAATGGCCGGCAGATAATGCTTT
CGATGATAAAACGCGATATTACGTGGTGAAAAAATCAGAGCTTCGAAAAAATGACTGGAT
TCGTCTATACTTGGAGCTTGCATTCCTCAATGCAAATTTAAGCCTTCCAAATCTTTCTTC
TTCTGCAGATTAATCTGTCAAAGCTGGTCATAATGAAAGTAGCGGTGGAGAGTAGAGAAA
ACATAGATTCTCCAAAGGGAGACTCAATGCCAGATATGCAACCTTCTACATAAAGTACAA
GTACTGCCCAAATAAAAGTCGCCGCGCTTGTAAGGT
GATGGTT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2C173JQ 423 0 0
AATGGCCGGCAGATAATGCTTTCGATGATAAAACGCGATATTACGTGGTGAAAAAATCAG
AGCTTCGAAAAAATGACTGGATTCGTCTATACTTGGAGCTTGCATTCCTCAATGCAAATT
TAAGCCTTCCAAATCTTTCTTCTTCTGCAGATTAATCTGTCAAAGCTGGTCATAATGAAA
GTAGCGGTGGAGAGTAGAGAAAACATAGATTCTCCAAAGGGAGACTCAATGCCAGATATG
CAACCTTTTACATAAAGTACAAGTACTGCCCAAATAAAAGTCGCCGCGCTTGTAAGGTTG
ATGGTTGCAGGGCTACACGTGAACGCATAGCTATAGTAAGAAGAAGCCTGGACAAGATTT
CAGGACTCCTCACTCTCTCGTTCCATGGTCATTGGAAACACACTTTTCTTTAGAGTATCT
TTC

QA 1 423 1 423
DS 



AS 1 2

CO CL5626Contig1 1208 2 4 U
GGACTCTCAGCCAGTGCTTGTGTTCACTGGTGATAAGGCGCTTCGTTGTTACCAACTACC
CGATCTGATAAGCATTGTAGGCTTACGTCATCAATGGCTTCTTTCATGCTTAACGGTGCC
ATCACCTTCCCCAAGGGATTAGGTTTCACCGGTTCCAAACTCCAAGCGAGATCAATTCCT
CCGCTGAGCTTGGTCCCAAACACATCCGCCGCCACGACGCGGAGACTCTCAGTGGCAACC
AGATGCACCAGCAGCAGCAGCAGCGTGTCGGCGCCAAGGCCATCTGCGCAGCCCAGGTTC
ATTCAGCACAAGAAGGAGGCCTACTGGTTCTACGGGTTCCTGTCCATCGTGTACGACCAC
ATCATCAATCCCGGCCACTGGACGGAGGATATGAGGGACGACGCTCTCGAGCCGGCGGAT
CTGAACAATCCTAACTTGCGCGTCGTCGACGTCGGAGGCGGGACTGGTTTCACCACGCTG
GGCATCGTCAAGACGGTGAAAGCTAAGAACGCGACGATTCTGGACCAGTCGCCACATCAG
CTTGCCAAGGCGAAGCAGAAGGAGCCTTTGAAGGAGTGCACGATCGTGGAAGGAGATGCA
GAGGATCTCCCTTTTCGTACTGATTATGCCGACAGATACGTCTCTGCTGGAAGCATTGAG
TACTGGCCTGACCCGCAGAGGGGAATAAGGGAAGCCTACAGAGTTCTCAAGATTGGTGGG
AAAGCATGTCTCATTGGCCCTGTCCACCCAACCTTCTGGCTTTCTCGCTTCTTTGCAGAT
GTCTGGATGCTTTTCCCCAAGGAGGAAGAGTACATTGAGTGGTTCACCAAAGCTGGTTTC
AAGGACGTTCAGCTTAAGAGGATTGGCCCCAAGTGGTACCGTGGTGTTCGCAGGCACGGT
CTTATCATGGGATGCTCTGTCACCGGTGTCAAACCTGCCTCTGGTGACTCTCCTCTCCAG
CTTGGACCAAAGGAAGAGGACGTAGAGAAGCCTGTAAACAATCCTTTCTCCTTCTTGGGA
CGCTTCCTCTTGGGTACCCTAGCGGCTGCCTGGTTTGTGTTAATCCCGATCTACATGTGG
ATCAAGGATCAAATCGTTCCCAAAGACCAACCCATCTGATAAAACAACCTTATGTGTGAT
TTGTAATACACTCCTCCTATGTTAGACACACTTTTTTTGGTCCTCTGTGATTATAATGAA
CCCTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU90TF U 1
AF RR2EU90JQ C 435
BS 1 692 RR2EU90TF
BS 693 693 RR2EU90JQ
BS 694 734 RR2EU90TF
BS 735 1208 RR2EU90JQ

RD RR2EU90TF 734 0 0
GGACTCTCAGCCAGTGCTTGTGTTCACTGGTGATAAGGCGCTTCGTTGTTACCAACTACC
CGATCTGATAAGCATTGTAGGCTTACGTCATCAATGGCTTCTTTCATGCTTAACGGTGCC
ATCACCTTCCCCAAGGGATTAGGTTTCACCGGTTCCAAACTCCAAGCGAGATCAATTCCT
CCGCTGAGCTTGGTCCCAAACACATCCGCCGCCACGACGCGGAGACTCTCAGTGGCAACC
AGATGCACCAGCAGCAGCAGCAGCGTGTCGGCGCCAAGGCCATCTGCGCAGCCCAGGTTC
ATTCAGCACAAGAAGGAGGCCTACTGGTTCTACGGGTTCCTGTCCATCGTGTACGACCAC
ATCATCAATCCCGGCCACTGGACGGAGGATATGAGGGACGACGCTCTCGAGCCGGCGGAT
CTGAACAATCCTAACTTGCGCGTCGTCGACGTCGGAGGCGGGACTGGTTTCACCACGCTG
GGCATCGTCAAGACGGTGAAAGCTAAGAACGCGACGATTCTGGACCAGTCGCCACATCAG
CTTGCCAAGGCGAAGCAGAAGGAGCCTTTGAAGGAGTGCACGATCGTGGAAGGAGATGCA
GAGGATCTCCCTTTTCGTACTGATTATGCCGACAGATACGTCTCTGCTGGAAGCATTGAG
TACTGGCCTGACCCGCAGAGGGGAATAAGGGA*GCCTACAGAGTTCTCAAGATTGGTGGG
AAAGCATGTCTCAT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2EU90JQ 774 0 0
CTTGCGCGTCGTCGACGTCGGAGGCGGGACTGGTTTCACCACGCTGGGCATCGTCAAGAC
GGTGAAAGCTAAGAACGCGACGATTCTGGACCAGTCGCCACATCAGCTTGCCAAGGCGAA
GCAGAAGGAGCCTTTGAAGGAGTGCACGATCGTGGAAGGAGATGCAGAGGATCTCCCTTT
TCGTACTGATTATGCCGACAGATACGTCTCTGCTGGAAGCATTGAGTACTGGCCTGACCC
GCAGAGGGGAATAAGGGAAGCCTACAGAGTTCTCAAGATTGGTGGGAAAGCATGTCTCAT
TGGCCCTGTCCACCCAACCTTCTGGCTTTCTCGCTTCTTTGCAGATGTCTGGATGCTTTT
CCCCAAGGAGGAAGAGTACATTGAGTGGTTCACCAAAGCTGGTTTCAAGGACGTTCAGCT
TAAGAGGATTGGCCCCAAGTGGTACCGTGGTGTTCGCAGGCACGGTCTTATCATGGGATG
CTCTGTCACCGGTGTCAAACCTGCCTCTGGTGACTCTCCTCTCCAGCTTGGACCAAAGGA
AGAGGACGTAGAGAAGCCTGTAAACAATCCTTTCTCCTTCTTGGGACGCTTCCTCTTGGG
TACCCTAGCGGCTGCCTGGTTTGTGTTAATCCCGATCTACATGTGGATCAAGGATCAAAT
CGTTCCCAAAGACCAACCCATCTGATAAAACAACCTTATGTGTGATTTGTAATACACTCC
TCCTATGTTAGACACACTTTTTTTGGTCCTCTGTGATTATAATGAACCCTTTTC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL5627Contig1 727 2 2 U
GGAGGGCGAATCGACGCGGGAAAATGCAGGAGGAGGAAGCCAAGATCTTGCTGGGCTTTC
CTCCCAATTCTCGTCCCGATCCTTCTCAGGTTAAAGCAGCGTGCCGCAAGAAAGTATGGG
AATCACACCCTGACCTGTTCCCTGATGATCAGAAGCTCCGTGCCGAGTCTAAGTTCAAAT
CTATATCCGAAGCTTACTCTTGCCTTGAGTTTGGTGATGTTAAAGGCCAACACTATTCCA
GATCAGGTGTGTATTCAAGGGTGGTCAGGACGGGAGTCCCACGGACATATGCATATGCCA
AAAGAGGTAATGCGTGGTTGATCGGTGCACCTTTCCTTTTGATCGTCCTTGGAACCATCG
GTCTTGGTGGAATCAAAGCTAATAGGGCATACAATATGCAAAAACAGACGTTCCCCTCTC
ATAATCCTTTCCTTCCTTGATTCCCAGTGCCCCTCTCTTTCAACATAACATTTTGAATGA
GAGAGAGCTGCCAACAGTCTTCCTCCTTGTTAAATTCGAAAGGGATGTAAGGTTAGAGTA
ACTATTTTAAGACTTGAAGTCCTAGGAATGTGGGGGTTATCTGCTTGGTGACTCCTCTAC
TTGTTGTAATTTGAATAGCAATACGTACACAAGGACTCAGCTTCTGTCCTTTGTATTTGT
ATTATAATACTTGTGATTCAGTGAAAGATGGTGTGAGCGTAGAACAATAATAAGTTAAAT
AACTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E772TF U 1
AF RR2E772JQ C 14
BS 1 667 RR2E772TF
BS 668 727 RR2E772JQ

RD RR2E772TF 667 0 0
GGAGGGCGAATCGACGCGGGAAAATGCAGGAGGAGGAAGCCAAGATCTTGCTGGGCTTTC
CTCCCAATTCTCGTCCCGATCCTTCTCAGGTTAAAGCAGCGTGCCGCAAGAAAGTATGGG
AATCACACCCTGACCTGTTCCCTGATGATCAGAAGCTCCGTGCCGAGTCTAAGTTCAAAT
CTATATCCGAAGCTTACTCTTGCCTTGAGTTTGGTGATGTTAAAGGCCAACACTATTCCA
GATCAGGTGTGTATTCAAGGGTGGTCAGGACGGGAGTCCCACGGACATATGCATATGCCA
AAAGAGGTAATGCGTGGTTGATCGGTGCACCTTTCCTTTTGATCGTCCTTGGAACCATCG
GTCTTGGTGGAATCAAAGCTAATAGGGCATACAATATGCAAAAACAGACGTTCCCCTCTC
ATAATCCTTTCCTTCCTTGATTCCCAGTGCCCCTCTCTTTCAACATAACATTTTGAATGA
GAGAGAGCTGCCAACAGTCTTCCTCCTTGTTAAATTCGAAAGGGATGTAAGGTTAGAGTA
ACTATTTTAAGACTTGAAGTCCTAGGAATGTGGGGGTTATCTGCTTGGTGACTCCTCTAC
TTGTTGTAATTTGAATAGCAATACGTACACAAGGACTCAGCTTCTGTCCTTTGTATTTGT
ATTATAA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2E772JQ 714 0 0
ACGCGGGAAAATGCAGGAGGAGGAAGCCAAGATCTTGCTGGGCTTTCCTCCCAATTCTCG
TCCCGATCCTTCTCAGGTTAAAGCAGCGTGCCGCAAGAAAGTATGGGAATCACACCCTGA
CCTGTTCCCTGATGATCAGAAGCTCCGTGCCGAGTCTAAGTTCAAATCTATATCCGAAGC
TTACTCTTGCCTTGAGTTTGGTGATGTTAAAGGCCAACACTATTCCAGATCAGGTGTGTA
TTCAAGGGTGGTCAGGACGGGAGTCCCACGGACATATGCATATGCCAAAAGAGGTAATGC
GTGGTTGATCGGTGCACCTTTCCTTTTGATCGTCCTTGGAACCATCGGTCTTGGTGGAAT
CAAAGCTAATAGGGCATACAATATGCAAAAACAGACGTTCCCCTCTCATAATCCTTTCCT
TCCTTGATTCCCAGTGCCCCTCTCTTTCAACATAACATTTTGAATGAGAGAGAGCTGCCA
ACAGTCTTCCTCCTTGTTAAATTCGAAAGGGATGTAAGGTTAGAGTAACTATTTTAAGAC
TTGAAGTCCTAGGAATGTGGGGGTTATCTGCTTGGTGACTCCTCTACTTGTTGTAATTTG
AATAGCAATACGTACACAAGGACTCAGCTTCTGTCCTTTGTATTTGTATTATAATACTTG
TGATTCAGTGAAAGATGGTGTGAGCGTAGAACAATAATAAGTTAAATAACTGGC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5629Contig1 962 2 2 U
GGATGGCTGTATCGAAGCGTCCTCTTCCATGCCCTCATTAACAGTACCAGCCCACTCCTC
TCACAGTCTCTCATACAATGAATATCCCATTACATCGATTGAGTGAGTCTTTGACTATAA
ATATAGACAAAAATGGCTACCTAAGCTATCTTCTTCGCTGATTTGAAGACATAATTTGTC
TGATTCTTAGATGGCTTTAACTTCTTCTTAATCAGAACGATGCTTGAAGATAAGATTTAA
GGAGAGGAAGCTTCAGAAACTTCTCTTTCTGGAAAGAGAAGAAAAGAAACTGAAAGACCA
AGCTCTGCTCCTCCTCCAAACCCAAGGAATTGAAGTAGCATGGCTGTGAAGGGAAAGTTC
ATGGGTGCTTTCAAGGAAGAGATGTAGATAACCAAGAAGCTGGAGAAAATACAGAAGGCT
ATTGAAGGGTCTGTTGATGATGGTTTGGATCTTACGGGGAGGTTCTTAGACGAGTTTGAT
ATGTTGCAGAGACTATCTCAAGCTTTGAACTTAGACATGGTCTATGTTAAAGTAGTAAGC
TGATACCGGGGTTAGGGTTTGTACCAGAGGATGCTGATAGGCTTGTGGCTTTGTTTAGCG
GTGGATGAAAAATGAGAATGTCATTCAGAAATATTCAGCTTCAGGATCCAGAATTGCTGC
TGCTACTTGATGAGCCTACAAACCATTTGGATCTTGATACTATTGAATGACTTGAAGATT
ATAATCTCACAGGACAGAGCCTTACTTGATCAGTTGTGTACCAAAATTGTGGAAGCCGAG
ACAATGATGGAAGTCGAGTTGCAGTCGTTGCTGAAAGAAACAAGTGATGGTATTTGGTTG
TTATGTCTTTTATCTATATATGTTTCCTTCTAAGTCTGTGAACAATATCCGACAATCACA
GTAATAACTAATACATGGTTCTGTCTTTAATCTTTATATATATATGCTTCTGTTTTTAGA
TG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2FO22TF U 1
AF RR2FO22JQ C 309
BS 1 612 RR2FO22TF
BS 613 962 RR2FO22JQ

RD RR2FO22TF 612 0 0
GGATGGCTGTATCGAAGCGTCCTCTTCCATGCCCTCATTAACAGTACCAGCCCACTCCTC
TCACAGTCTCTCATACAATGAATATCCCATTACATCGATTGAGTGAGTCTTTGACTATAA
ATATAGACAAAAATGGCTACCTAAGCTATCTTCTTCGCTGATTTGAAGACATAATTTGTC
TGATTCTTAGATGGCTTTAACTTCTTCTTAATCAGAACGATGCTTGAAGATAAGATTTAA
GGAGAGGAAGCTTCAGAAACTTCTCTTTCTGGAAAGAGAAGAAAAGAAACTGAAAGACCA
AGCTCTGCTCCTCCTCCAAACCCAAGGAATTGAAGTAGCATGGCTGTGAAGGGAAAGTTC
ATGGGTGCTTTCAAGGAAGAGATGTAGATAACCAAGAAGCTGGAGAAAATACAGAAGGCT
ATTGAAGGGTCTGTTGATGATGGTTTGGATCTTACGGGGAGGTTCTTAGACGAGTTTGAT
ATGTTGCAGAGACTATCTCAAGCTTTGAACTTAGACATGGTCTATGTTAAAGTAGTAAGC
TGATACCGGGGTTAGGGTTTGTACCAGAGGATGCTGATAGGCTTGTGGCTTTGTTTAGCG
GTGGATGAAAAA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2FO22JQ 654 0 0
TCCTCCTCCAAACCCAAGGAATTGAAGTAGCATGGCTGTGAAGGGAAAGTTCATGGGTGC
TTTCAAGGAAGAGATGTAGATAACCAAGAAGCTGGAGAAAATACAGAAGGCTATTGAAGG
GTCTGTTGATGATGGTTTGGATCTTACGGGGAGGTTTTTAGACGAGTTTGATATGTTGCA
GAGACTATCTCAAGCTTTGAACTTAGACATGGTTTATGTTAAAGTAGTAAGCTGATACCG
GGGTTAGGGTTTGTACCAGAGGATGCTGATAGGCTTGTGGCTTTGTTTAGCGGTGGATGA
AAAATGAGAATGTCATTCAGAAATATTCAGCTTCAGGATCCAGAATTGCTGCTGCTACTT
GATGAGCCTACAAACCATTTGGATCTTGATACTATTGAATGACTTGAAGATTATAATCTC
ACAGGACAGAGCCTTACTTGATCAGTTGTGTACCAAAATTGTGGAAGCCGAGACAATGAT
GGAAGTCGAGTTGCAGTCGTTGCTGAAAGAAACAAGTGATGGTATTTGGTTGTTATGTCT
TTTATCTATATATGTTTCCTTCTAAGTCTGTGAACAATATCCGACAATCACAGTAATAAC
TAATACATGGTTCTGTCTTTAATCTTTATATATATATGCTTCTGTTTTTAGATG

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL5630Contig1 860 2 4 U
GGCCACAACACAATCAAAACCACAAACCAACGAACTCCAAAGTTTCATTTATGACTTCTT
CACAAGACCAATCAGCTTTGGACCTCATAACTCAACACCTCCTTACCGATTTCCCTTCCT
TAGAGACTTTCGTTTCTAGCATCCATCAGAGCACCACCTCCACTCTTAGCCAACGCAAGC
CATCTCTTGCCACCATTTCAGTTCCTACTACTGCAGCGGTGGTTCAAGAGGATGATCATA
GGCATTACAGAGGCGTGAGGCGTAGACCGTGGGGTAAGTACGCGGCTGAGATCAGAGACC
CAAACAAGAAAGGTGTTCGTGTCTGGCTAGGTACTTTTGACACGGCCGTGGAAGCTGCAA
GAGGTTACGACAGAGCTGCTTTTAAACTAAGAGGAAGCAAGGCCATTCTTAACTTCCCAC
TCGAAGCAGGTAAGCACGAGGACTCTGGAGATGACGACAACAACAAGAAGACTCTGGCTT
TGAAAGCTAAGAGGAAGAGACCAGAAACAGAGGATGAAAACCGTGGGGTAAACCTGATCA
GCCATAAAGCTGTGAAAAGGGAAGAGACAGAAGCTCAGGGTGAAGCTTGTCCGTTGACAC
CGTCAAGTTGGATGGGGTTTTGGGACGGAGTAGACGGTATAGGGATGGGACTGTTTTCTG
TGCCTCCGTTATCTCCTTATCCATCTTTAGGACATTCTCAACTCGGGGTTAAGTAAACAC
ACAAATGAGACAGTAGTTATATACTTAAGGATTGTACTCAAGATTCCTCATGGAGTGAAT
TAGTTTTTTTAGATTAATTGATTGTAAATGCTTTGTTATATTCATTCGTTCTTCTCAATG
CAATTATCACAACTCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G175TF U 1
AF RR2G175JQ C 325
BS 1 579 RR2G175TF
BS 580 580 RR2G175JQ
BS 581 632 RR2G175TF
BS 633 860 RR2G175JQ

RD RR2G175TF 632 0 0
GGCCACAACACAATCAAAACCACAAACCAACGAACTCCAAAGTTTCATTTATGACTTCTT
CACAAGACCAATCAGCTTTGGACCTCATAACTCAACACCTCCTTACCGATTTCCCTTCCT
TAGAGACTTTCGTTTCTAGCATCCATCAGAGCACCACCTCCACTCTTAGCCAACGCAAGC
CATCTCTTGCCACCATTTCAGTTCCTACTACTGCAGCGGTGGTTCAAGAGGATGATCATA
GGCATTACAGAGGCGTGAGGCGTAGACCGTGGGGTAAGTACGCGGCTGAGATCAGAGACC
CAAACAAGAAAGGTGTTCGTGTCTGGCTAGGTACTTTTGACACGGCCGTGGAAGCTGCAA
GAGGTTACGACAGAGCTGCTTTTAAACTAAGAGGAAGCAAGGCCATTCTTAACTTCCCAC
TCGAAGCAGGTAAGCACGAGGACTCTGGAGATGACGACAACAACAAGAAGACTCTGGCTT
TGAAAGCTAAGAGGAAGAGACCAGAAACAGAGGATGAAAACCGTGGGGTAAACCTGATCA
GCCATAAAGCTGTGAAAAGGGAAGAGACAGAAGCTCAGG*TGAAGCTTGTCCGTTGACAC
CGTCAAGTTGGATGGGGTTTTGGGACGGAGTA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2G175JQ 536 0 0
GGCTAGGTACTTTTGACACGGCCGTGGAAGCTGCAAGAGGTTACGACAGAGCTGCTTTTA
AACTAAGAGGAAGCAAGGCCATTTTTAACTTCCCACTCGAAGCAGGTAAGCACGAGGACT
CTGGAGATGACGACAACAACAAGAAGACTCTGGCTTTGAAAGCTAAGAGGAAGAGACCAG
AAACAGAGGATGAAAACCGTGGGGTAAACCTGATCAGCCATAAAGCTGTGAAAAGGGAAG
AGACAGAAGCTCAGGGTGAAGCTTGTCCGTTGACACCGTCAAGTTGGATGGGGTTTTGGG
ACGGAGTAGACGGTATAGGGATGGGACTGTTTTCTGTGCCTCCGTTATCTCCTTATCCAT
CTTTAGGACATTCTCAACTCGGGGTTAAGTAAACACACAAATGAGACAGTAGTTATATAC
TTAAGGATTGTACTCAAGATTCCTCATGGAGTGAATTAGTTTTTTTAGATTAATTGATTG
TAAATGCTTTGTTATATTCATTCGTTCTTCTCAATGCAATTATCACAACTCTTCCC

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 2

CO CL5631Contig1 1286 2 2 U
GAGAGTAGTACTCTTGGATCATCCAAGGGGAAGAGTAAGAAGAGTGAGACTAAGACTAAG
AAGGTCGCTAGTATTAGCTTTTTGGGTCTTCTGTTTTGTCTGTTTTTGTTTGGTGCTTTG
GCTCCGGTTATGAACGTTAGTTATGGAGGAATTAGTGGTGCTTTTTATGGGAACTATAGG
TCTAATTATGTTACTGACCAGATTTATAGCCAGCGTAGGAGTAGGGTTTTGGATACATCT
GGTTCTGGGGTTTCTAATGGTAATGGGATGCATTGCGGGAGAGATTCTAATAATATATCT
GCAACAGAGAGCTCTGTACCTCCTGGGAATGGTAGCGAGCCTCTGGTTGCATCGCTCTTT
GTTCCGAGGAATGATAAGCTTGTGAAGATTGATGGGAATTTGATTATTAATTCTATATTG
GCGAGTGAGAAAGCGGTGGCGGCTTCACGAAAGGCTTCTGAATCAAATGAGAGGAAAGCT
GACCCGGTGATTAGTAAAGATTATCCTCCTGCTTTGCCTCTACCTGGTGTGGGGAAGATC
GAGGATATGGCTAAGCATCTCTATAGATCAAAGGCTGAAAAACAGAGAGCCTTGTCATCT
GGCTCTGATGATACTCTGAAAGAGAAAATCAAAACAAAAGCAGCCAATGGTGAAATGCAG
CAATGGTTTCGTGAAGGTGTTGCAGGGCCAATGTTTAGCTCAGGGATGTGCACTGAAGTG
TTTCAGTTCGATGTCTCATCAACCTCTGGAGCCATTATTCCTGCATCTCCAACAGCCAAC
GTCTCTTCTGAACACAGTAAAAACGCCACAGACACACACAGGCGAAAGAACAGAAGAACC
CTTCGTGGTCTGGCCATTCCACTGCCAGGATCAGATTTTAACTTCACCAAAGAGCACCAA
AGAAACAGCTCTAGCAAAGAAATCAAGCCCGCGTCATCAATGGTAGTGTCCGTGCTTGTT
GATCCCAGAGAAGGTGGTGATGGAGGAGACATCGATGGGATGATTGGTGGACCAAAATCA
CTGTCCAGAGTTTTTGTTGTCGTGCTCGTGGACAGTGCAAAGTATGTAACATACTCTTGT
GTCCTACCTCGATCAGGAGCTCCTCATCTTGTGACCACTTAAAAGGACTTTTCAGCAGTC
TCTATCCTTCAGCTATGTATGTAGAAGAATAAAAAGCTGCCTGTGCCTGCTTTATGGAAT
CAAGTAGTATCCTTAGCTATTACCGGTTTTGTTTACAGATGTAGAATCCAAACACTGTAA
CTTTTTTTTATATATATACTTTACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A540TF U 1
AF RR2A540JQ C 500
BS 1 798 RR2A540TF
BS 799 1286 RR2A540JQ

RD RR2A540TF 798 0 0
GAGAGTAGTACTCTTGGATCATCCAAGGGGAAGAGTAAGAAGAGTGAGACTAAGACTAAG
AAGGTCGCTAGTATTAGCTTTTTGGGTCTTCTGTTTTGTCTGTTTTTGTTTGGTGCTTTG
GCTCCGGTTATGAACGTTAGTTATGGAGGAATTAGTGGTGCTTTTTATGGGAACTATAGG
TCTAATTATGTTACTGACCAGATTTATAGCCAGCGTAGGAGTAGGGTTTTGGATACATCT
GGTTCTGGGGTTTCTAATGGTAATGGGATGCATTGCGGGAGAGATTCTAATAATATATCT
GCAACAGAGAGCTCTGTACCTCCTGGGAATGGTAGCGAGCCTCTGGTTGCATCGCTCTTT
GTTCCGAGGAATGATAAGCTTGTGAAGATTGATGGGAATTTGATTATTAATTCTATATTG
GCGAGTGAGAAAGCGGTGGCGGCTTCACGAAAGGCTTCTGAATCAAATGAGAGGAAAGCT
GACCCGGTGATTAGTAAAGATTATCCTCCTGCTTTGCCTCTACCTGGTGTGGGGAAGATC
GAGGATATGGCTAAGCATCTCTATAGATCAAAGGCTGAAAAACAGAGAGCCTTGTCATCT
GGCTCTGATGATACTCTGAAAGAGAAAATCAAAACAAAAGCAGCCAATGGTGAAATGCAG
CAATGGTTTCGTGAAGGTGTTGCAGGGCCAATGTTTAGCTCAGGGATGTGCACTGAAGTG
TTTCAGTTCGATGTCTCATCAACCTCTGGAGCCATTATTCCTGCATCTCCAACAGCCAAC
GTCTCTTCTGAACACAGT

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2A540JQ 787 0 0
ATTATCCTCCTGCTTTGCCTCTACCTGGTGTGGGGAAGATCGAGGATATGGCTAAGCATC
TCTATAGATCAAAGGCTGAAAAACAGAGAGCCTTGTCATCTGGCTCTGATGATACTCTGA
AAGAGAAAATCAAAACAAAAGCAGCCAATGGTGAAATGCAGCAATGGTTTCGTGAAGGTG
TTGCAGGGCCAATGTTTAGCTCAGGGATGTGCACTGAAGTGTTTCAGTTCGATGTCTCAT
CAACCTCTGGAGCCATTATTCCTGCATCTCCAACAGCCAACGTCTCTTCTGAACACAGTA
AAAACGCCACAGACACACACAGGCGAAAGAACAGAAGAACCCTTCGTGGTCTGGCCATTC
CACTGCCAGGATCAGATTTTAACTTCACCAAAGAGCACCAAAGAAACAGCTCTAGCAAAG
AAATCAAGCCCGCGTCATCAATGGTAGTGTCCGTGCTTGTTGATCCCAGAGAAGGTGGTG
ATGGAGGAGACATCGATGGGATGATTGGTGGACCAAAATCACTGTCCAGAGTTTTTGTTG
TCGTGCTCGTGGACAGTGCAAAGTATGTAACATACTCTTGTGTCCTACCTCGATCAGGAG
CTCCTCATCTTGTGACCACTTAAAAGGACTTTTCAGCAGTCTCTATCCTTCAGCTATGTA
TGTAGAAGAATAAAAAGCTGCCTGTGCCTGCTTTATGGAATCAAGTAGTATCCTTAGCTA
TTACCGGTTTTGTTTACAGATGTAGAATCCAAACACTGTAACTTTTTTTTATATATATAC
TTTACAC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL5632Contig1 1132 2 4 U
GGATCCTATCTCTCATTGAACAAATACGAGAACATGGAGAGGCAACAGCAAGGGAAAGGG
AAGGAGAAAGCGTGGGTGATATGGAATATCAGCATGTGCCCGATTCCGGATGGTGTTGAT
CCTCGTGTGATGGGTACGACAATACAAAAGGCGTTGGAAAGTGCAGGCCACGTCCGCCGC
TATGATCAGATCTCCATCACCGCCTTTGGCAACAACCTGATACAAAAGCAAGACGTCACG
AGGAAGCTCTATTCTACTGGAAAATCTCTCTTATGCATGGCACCGAATATCGAACGCAAC
TCTTAATTTGGTCCCAAAGAAATCGTCCTCCGGCTACTGTGATGATCGTAGACAGTCATG
AGCGACTGGGAGTGGGATGGTTAGCTTCTACACTTTCGAACCTTAAAGATGAGGGATACA
CAATTCTTCTTGCATATCCTCAATGTGACGGCATTGCCAAACCCTTGCCACGTTCCTATT
CTAAACAGTGGTATTGGCAAGACTTAGTGTCTGATGAACAAAAGACAATAACAAGCCTTG
ATCTTAAGGAAGATTGTTATGAAAGGAATATTGTATTTTGCTCATTATGCTATTTTGAAT
CCCAAATCTTTGAAGATTTACTCACCCATCTCAAGACTGAAGGACATGCATATTCTGAGT
GGAACCACTCTTGTGATGATAGTGTGGACTGGCTGAACCTTGCTAACTTGCACCTTGGTC
GATCAGAGGGGTGGGACTTTAGGGCGGCTGAAGATTTCTTTACCCGTTTATTGTTCAAGT
ACGGGGACCACCCCGACCCTGTTGATCTGATTAATCAGAATAAGGAGTTGGACATTCTGG
CGGCTCGAAAATTGCTTACCCATTTAAGGGAAAAGTACGGCGTCAATCCCGGCTACCTTG
TGACCTGCTGGTTTGAAGACTTATCTGAATCTGAAGAAGAATAAGCTTGGCGAAGAAGCG
GCGAGGAGGGTGTTGCAGTTTTCATATGGTTTATTTACTGGTTTTATGCAATTAATCAAA
TTTAATTACTACTATGTTATCTTTTGGGGGTGGGGGTAATGTGTTTCTTTAAGGTGAAAA
AATTAGAATGTCTAAAATCGTTTTTACTTTAAAATATATAACTAAGTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO54TF U 1
AF RR2DO54JQ C 408
BS 1 642 RR2DO54TF
BS 643 643 RR2DO54JQ
BS 644 712 RR2DO54TF
BS 713 1132 RR2DO54JQ

RD RR2DO54TF 712 0 0
GGATCCTATCTCTCATTGAACAAATACGAGAACATGGAGAGGCAACAGCAAGGGAAAGGG
AAGGAGAAAGCGTGGGTGATATGGAATATCAGCATGTGCCCGATTCCGGATGGTGTTGAT
CCTCGTGTGATGGGTACGACAATACAAAAGGCGTTGGAAAGTGCAGGCCACGTCCGCCGC
TATGATCAGATCTCCATCACCGCCTTTGGCAACAACCTGATACAAAAGCAAGACGTCACG
AGGAAGCTCTATTCTACTGGAAAATCTCTCTTATGCATGGCACCGAATATCGAACGCAAC
TCTTAATTTGGTCCCAAAGAAATCGTCCTCCGGCTACTGTGATGATCGTAGACAGTCATG
AGCGACTGGGAGTGGGATGGTTAGCTTCTACACTTTCGAACCTTAAAGATGAGGGATACA
CAATTCTTCTTGCATATCCTCAATGTGACGGCATTGCCAAACCCTTGCCACGTTCCTATT
CTAAACAGTGGTATTGGCAAGACTTAGTGTCTGATGAACAAAAGACAATAACAAGCCTTG
ATCTTAAGGAAGATTGTTATGAAAGGAATATTGTATTTTGCTCATTATGCTATTTTGAAT
CCCAAATCTTTGAAGATTTACTCACCCATCTCAAGACTGAAG*ACATGCATATTCTGAGT
GGAACCACTCTTGTGATGATAGTGTGGACTGGCTGAACCTTGCTAACTTGCA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2DO54JQ 725 0 0
GATGAGGGATACACAATTCTTCTTGCATATCCTCAATGTGACGGCATTGCCAAACCCTTG
CCACGTTCCTATTCTAAACAGTGGTATTGGCAAGACTTAGTGTCTGATGAACAAAAGACA
ATAACAAGCCTTGATCTTAAGGAAGATTGTTATGAAAGGAATATTGTATTTTGCTCATTA
TGCTATTTTGAATCCCAAATCTTTGAAGATTTACTCACCCATCTCAAGACTGAAGGACAT
GCATATTCTGAGTGGAACCACTCTTGTGATGATAGTGTGGACTGGCTGAACCTTGCTAAC
TTGCACCTTGGTCGATCAGAGGGGTGGGACTTTAGGGCGGCTGAAGATTTCTTTACCCGT
TTATTGTTCAAGTACGGGGACCACCCCGACCCTGTTGATCTGATTAATCAGAATAAGGAG
TTGGACATTCTGGCGGCTCGAAAATTGCTTACCCATTTAAGGGAAAAGTACGGCGTCAAT
CCCGGCTACCTTGTGACCTGCTGGTTTGAAGACTTATCTGAATCTGAAGAAGAATAAGCT
TGGCGAAGAAGCGGCGAGGAGGGTGTTGCAGTTTTCATATGGTTTATTTACTGGTTTTAT
GCAATTAATCAAATTTAATTACTACTATGTTATCTTTTGGGGGTGGGGGTAATGTGTTTC
TTTAAGGTGAAAAAATTAGAATGTCTAAAATCGTTTTTACTTTAAAATATATAACTAAGT
TTACC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL5633Contig1 1240 2 2 U
GCATCCCGTTGGGATCACTGATATTCCTGCAGACACCGCAGATAGAGATGAGATACTTGA
AAGCGAGTTTTTCGATACGAGGCAAGCATTTCTGAGTCTTTGCCAAGGAAACCTTTATCA
GTATGATACACTGAGGCGGGCGAAACATTCTTCCATGATGGTGCTTTATCACCTGCACAA
TCCAACTGCTCCTGCCTTTGTCACAACATGTAACGCATGTCACCTCGATATTGAAAGTGG
TCAAGGCTGGCGCTGCGAAGTCTGCCCGGACTACGATGTATGCAATGCTTGTTACAGTAA
AGAGAGCGGTGTTAATCATCCTCACAAGTTGACAAATCATCCATCACTAGCTGATCAAGA
TGCTCAGAACAAAGAAGCTAGGCAATTGCGAGTCTTGCAGCTAAGGAAAATGCTTGATCT
TCTGGTGCATGCGGCGCTATGCCGTGCCATGTATTGTCAATATCCAAACTGCCGCAAAGT
GAAGGGGCTGTTCAGACATGGTATCCGTTGCACAACACGTGCTGCAGGTGGTTGTGTTCT
TTGCAAGAAAATGTGGTATCTCTTGCAAATCCACGCTCGAGCCTGCAAGGAATCAAACTG
CAATGTACCTCGATGCGGGGACCTAAAGGAACATCTGAGAAGGTTAGCGCAGCAATCAGA
ATCACGGCGCAGAGCAGCAGTAATGGAGATGATGAGACAGAGAGCTGCAGAAGTCGCTGG
GACCTCCAGTTGATTAATTTGTATATACTTATTTCATTTAGGATATAAGTAGAACTGGAA
AGCTAATCTTCTTTCCGAAGGTTAAAGAAGACGGAAGAAGCTGGTGTCTCTGAGCTCCAC
TCGAAGCAAGTTATATGGTAAGGCAGCAGAAATAGAGTGTATATATATAATCAATGGATC
ACCAACCAATCAAAAGCTATAGAGTCTGAAATCTGAAATTTGATTTCTTCCTTCTTGCGA
CCTGACCAGAGAGCATAAAGTTAAGCATCTATGAAGATTCTTCTACATCAGTGGCACTTA
GGCTGAGAAAACTATTCAAGTCACTGTGACTTGCTCTTCTTTTTGTAGCCTGGTGTATTC
ATAAAACGCCTTAGCAACAATCCGCTGACTATTTATAAGTAGTTTCTTAACTTTCTAGGC
AAGTAAGATGAAGGGAGTGTCTTCGGATACGTCTCTTAACATTTTTGATGCTCTGTACTA
ATAACATTTTTCATATCTTTAATTCAAATAGGGTTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E528TF U 1
AF RR2E528JQ C 409
BS 1 625 RR2E528TF
BS 626 1240 RR2E528JQ

RD RR2E528TF 625 0 0
GCATCCCGTTGGGATCACTGATATTCCTGCAGACACCGCAGATAGAGATGAGATACTTGA
AAGCGAGTTTTTCGATACGAGGCAAGCATTTCTGAGTCTTTGCCAAGGAAACCTTTATCA
GTATGATACACTGAGGCGGGCGAAACATTCTTCCATGATGGTGCTTTATCACCTGCACAA
TCCAACTGCTCCTGCCTTTGTCACAACATGTAACGCATGTCACCTCGATATTGAAAGTGG
TCAAGGCTGGCGCTGCGAAGTCTGCCCGGACTACGATGTATGCAATGCTTGTTACAGTAA
AGAGAGCGGTGTTAATCATCCTCACAAGTTGACAAATCATCCATCACTAGCTGATCAAGA
TGCTCAGAACAAAGAAGCTAGGCAATTGCGAGTCTTGCAGCTAAGGAAAATGCTTGATCT
TCTGGTGCATGCGGCGCTATGCCGTGCCATGTATTGTCAATATCCAAACTGCCGCAAAGT
GAAGGGGCTGTTCAGACATGGTATCCGTTGCACAACACGTGCTGCAGGTGGTTGTGTTCT
TTGCAAGAAAATGTGGTATCTCTTGCAAATCCACGCTCGAGCCTGCAAGGAATCAAACTG
CAATGTACCTCGATGCGGGGACCTA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2E528JQ 832 0 0
AATGCTTGATCTTCTGGTGCATGCGGCGCTATGCCGTGCCATGTATTGTCAATATCCAAA
CTGCCGCAAAGTGAAGGGGCTGTTCAGACATGGTATCCGTTGCACAACACGTGCTGCAGG
TGGTTGTGTTCTTTGCAAGAAAATGTGGTATCTCTTGCAAATCCACGCTCGAGCCTGCAA
GGAATCAAACTGCAATGTACCTCGATGCGGGGACCTAAAGGAACATCTGAGAAGGTTAGC
GCAGCAATCAGAATCACGGCGCAGAGCAGCAGTAATGGAGATGATGAGACAGAGAGCTGC
AGAAGTCGCTGGGACCTCCAGTTGATTAATTTGTATATACTTATTTCATTTAGGATATAA
GTAGAACTGGAAAGCTAATCTTCTTTCCGAAGGTTAAAGAAGACGGAAGAAGCTGGTGTC
TCTGAGCTCCACTCGAAGCAAGTTATATGGTAAGGCAGCAGAAATAGAGTGTATATATAT
AATCAATGGATCACCAACCAATCAAAAGCTATAGAGTCTGAAATCTGAAATTTGATTTCT
TCCTTCTTGCGACCTGACCAGAGAGCATAAAGTTAAGCATCTATGAAGATTCTTCTACAT
CAGTGGCACTTAGGCTGAGAAAACTATTCAAGTCACTGTGACTTGCTCTTCTTTTTGTAG
CCTGGTGTATTCATAAAACGCCTTAGCAACAATCCGCTGACTATTTATAAGTAGTTTCTT
AACTTTCTAGGCAAGTAAGATGAAGGGAGTGTCTTCGGATACGTCTCTTAACATTTTTGA
TGCTCTGTACTAATAACATTTTTCATATCTTTAATTCAAATAGGGTTTTGGC

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 2

CO CL5634Contig1 305 2 1 U
GGAATAAAAATAATAAAGCAAATAAAAACCCTAAAATTGGAGAAAGAATTGTTGAGATCG
CCGTTTGGATCGGGTTTCTGTGAACCCATCGGAAAACCAAAAAAAAGAGAGAGAGATAGA
ACCAAACTGAGAGTTTCTCTCCTGTTTTTTGACGCTTCCAACCTTTTACCTTTGTCCGAA
TGAAATCATCAGTTACGCACAAGGAATGACGAGTAGCTCGTCATCTAAGAAACAAGCTCA
AGATCCGCCTGAATCCTCCGAGCCCACTTTGAAATCCCTCAGAACCAAGATGACCAAATC
CGACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2G738JQ C 1
AF RR2G738TF U 1
BS 1 305 RR2G738TF

RD RR2G738JQ 305 0 0
GGAATAAAAATAATAAAGCAAATAAAAACCCTAAAATTGGAGAAAGAATTGTTGAGATCG
CCGTTTGGATCGGGTTTCTGTGAACCCATCGGAAAACCAAAAAAAAGAGAGAGAGATAGA
ACCAAACTGAGAGTTTCTTTCCTGTTTTTTGACGCTTCCAACCTTTTACCTTTGTCCGAA
TGAAATCATCAGTTACGCACAAGGAATGACGAGTAGCTCGTCATTTAAGAAACAAGCTCA
AGATCCGCCTGAATCCTCCGAGCCCACTTTGAAATCCCTCAGAACCAAGATGACCAAATC
CGACG

QA 1 305 1 305
DS 

RD RR2G738TF 305 0 0
GGAATAAAAATAATAAAGCAAATAAAAACCCTAAAATTGGAGAAAGAATTGTTGAGATCG
CCGTTTGGATCGGGTTTCTGTGAACCCATCGGAAAACCAAAAAAAAGAGAGAGAGATAGA
ACCAAACTGAGAGTTTCTCTCCTGTTTTTTGACGCTTCCAACCTTTTACCTTTGTCCGAA
TGAAATCATCAGTTACGCACAAGGAATGACGAGTAGCTCGTCATCTAAGAAACAAGCTCA
AGATCCGCCTGAATCCTCCGAGCCCACTTTGAAATCCCTCAGAACCAAGATGACCAAATC
CGACG

QA 1 305 1 305
DS 



AS 1 2

CO CL5635Contig1 1039 2 2 U
TTTTTGTATATGGTCTTAAACTTGGAGTCATAGGGACCGTGGCTACTGTTAATCTGTCAT
GGTGGCTCATTGTCTTAATCTTGTTTACATACGCCACTTGCGGTGGTTGTCCACTCACTT
GGAATGGTTTCTCCATCGAAGCTTTCACCGGACTTTGGGAATTTGCTAAGCTCTCTGCCT
CCTCCGGAATCATGCTTTGCTTGGAGAATTGGTATTATAAGATTTTAGTTCTGATGACTG
GAAATCTGAAAGATGCAAAAATTGCTGTCGACTCTCTGGCTATATGCATGGCGATAAATG
GACTGGAGATGATGATTCCACTTGCTTTCCTCGCAGGGACCGGCGTACGAGTGGCGAATG
AATTGGGGGCGGGTAATGGAAGAGGAGCACGATTTGCAATGATCGTATCAGTGACAGAAT
CGTTATTCATCGGAATAATATTTTCGATTCTCGTAGTATTTCTTCATGATCAAATTGGTT
GGATTTTCTCTTCAAGTGAAACCGTCGTAAAAGCAGTCACTGATCTCTCTGTTCTTTTAG
CTTTTACGATTCTTCTCAACAGTGTCCAGCCGGTTCTCTCCGGTGTTGCAATTGGTTCGG
GTTGGCAATCATTTGCGGCATACATAAATTTGGGATGCTATTATTTCATTGGTCTTCCAC
TTGGATTCGTCATGGGATGGATTTTCAAGACTGGAGTTAAGGGCATTTGGGCTGGTATGA
TATTCGGAGGAACCGCTATTCAGACATTTATATTGATTTTGATTGTTATGAGATGTGACT
GGGAAAAAGAGGCACAAAAAGCAAGCGTGCGCGTTAAAAAGTGGTCGATCTCAGATTCAT
AAGCAAGGCAATGAAGATTGTATGATTTGTATACAATTGTAAAAAGTAAATATATATTTG
GATTTTGGACATATATATTCCATAAAGCTAGGCCGTGGTAAGCTAGTAAAGCACATTTGG
TATCATTTCATCACACGGTATGACAAGACAAAAAAATGACATCTTTCTCATATATATTCA
ATCATATATGCTTATATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F310TF U 1
AF RR2F310JQ C 334
BS 1 630 RR2F310TF
BS 631 1039 RR2F310JQ

RD RR2F310TF 630 0 0
TTTTTGTATATGGTCTTAAACTTGGAGTCATAGGGACCGTGGCTACTGTTAATCTGTCAT
GGTGGCTCATTGTCTTAATCTTGTTTACATACGCCACTTGCGGTGGTTGTCCACTCACTT
GGAATGGTTTCTCCATCGAAGCTTTCACCGGACTTTGGGAATTTGCTAAGCTCTCTGCCT
CCTCCGGAATCATGCTTTGCTTGGAGAATTGGTATTATAAGATTTTAGTTCTGATGACTG
GAAATCTGAAAGATGCAAAAATTGCTGTCGACTCTCTGGCTATATGCATGGCGATAAATG
GACTGGAGATGATGATTCCACTTGCTTTCCTCGCAGGGACCGGCGTACGAGTGGCGAATG
AATTGGGGGCGGGTAATGGAAGAGGAGCACGATTTGCAATGATCGTATCAGTGACAGAAT
CGTTATTCATCGGAATAATATTTTCGATTCTCGTAGTATTTCTTCATGATCAAATTGGTT
GGATTTTCTCTTCAAGTGAAACCGTCGTAAAAGCAGTCACTGATCTCTCTGTTCTTTTAG
CTTTTACGATTCTTCTCAACAGTGTCCAGCCGGTTCTCTCCGGTGTTGCAATTGGTTCGG
GTTGGCAATCATTTGCGGCATACATAAATT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2F310JQ 706 0 0
CAGGGACCGGCGTACGAGTGGCGAATGAATTGGGGGCGGGTAATGGAAGAGGAGCACGAT
TTGCAATGATCGTATCAGTGACAGAATCGTTATTCATCGGAATAATATTTTCGATTCTCG
TAGTATTTCTTCATGATCAAATTGGTTGGATTTTCTCTTCAAGTGAAACCGTCGTAAAAG
CAGTCACTGATCTCTCTGTTCTTTTAGCTTTTACGATTCTTCTCAACAGTGTCCAGCCGG
TTCTCTCCGGTGTTGCAATTGGTTCGGGTTGGCAATCATTTGCGGCATACATAAATTTGG
GATGCTATTATTTCATTGGTCTTCCACTTGGATTCGTCATGGGATGGATTTTCAAGACTG
GAGTTAAGGGCATTTGGGCTGGTATGATATTCGGAGGAACCGCTATTCAGACATTTATAT
TGATTTTGATTGTTATGAGATGTGACTGGGAAAAAGAGGCACAAAAAGCAAGCGTGCGCG
TTAAAAAGTGGTCGATCTCAGATTCATAAGCAAGGCAATGAAGATTGTATGATTTGTATA
CAATTGTAAAAAGTAAATATATATTTGGATTTTGGACATATATATTCCATAAAGCTAGGC
CGTGGTAAGCTAGTAAAGCACATTTGGTATCATTTCATCACACGGTATGACAAGACAAAA
AAATGACATCTTTCTCATATATATTCAATCATATATGCTTATATGG

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL5636Contig1 899 2 2 U
GGGGGTCTTAAAGAGCTGAGAGAATCAACAATACAAGCGACGACATTCACAGGAAATCTA
GATGCTCCAGTTGATGAAACTCTCTTTGATATAGAGAAAGAAATAGATGACTTATTGCCC
ATTGAAGTCAAAGAACAGAGAGTAAGCAACTTGCTTCAAGCAGTGATGGTCGGAGGATGT
GTTGCAGCTATGCCTATACTAAAAATGATCCCTACATCAGTTCTTTGGGGATACTTCGCC
TTCATGGCCATCGAGAGCTTACCAGGAAATCAGTTTTGGGAAAGAATCTTACTTCTCTTC
ACTGCACCAAGTCGAAGATTCAAGGTTCTTGAAGACAACCATGCTACATTCGTGGAAACT
GTTCCATTCAAAACGATTGCAATGTTCACAATCTTCCAAACAACTTACCTTCTAATCTGT
TTTGGCCTCACATGGATCCCAATAGCTGGAGTTATGTTCCCTCTAATGATCATGTTTCTA
ATACCGGTAAGGCAATACATACTTCCAAGATTCTTCAAAGGTGCTCATCTTCAGGACTTA
GACGCAGCAGAGTATGAAGAAGCACCCGCTTTACCATTCAATCTCGCAGTATCGGAAGAT
GAAATGGGATCAACAGCTTCATATCCATGCGACTCTGAGATTCTTGATGAGGTTATTACA
AGAAGTAGAGGAGAGTTTAGACACACGTGCAGTCCTAAAGTTACTAGTTCGACTTCCACG
CCGGTTTATCATAGGAACCTGTCCCAAGTGTTTAGTCCTCGAGTTAATGAACTAAGGGGT
GGCATGGTGAGTCCTAGTCTCACCGGAAAAGGGCATAATAGTCCAAAGCCAAGTCCTATG
AACCCATCTTCCTCGTCACAGTCGAAGTGAGAATAATTGTCATGGAGGCTAAATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT60TF U 1
AF RR2FT60JQ C 415
BS 1 712 RR2FT60TF
BS 713 899 RR2FT60JQ

RD RR2FT60TF 712 0 0
GGGGGTCTTAAAGAGCTGAGAGAATCAACAATACAAGCGACGACATTCACAGGAAATCTA
GATGCTCCAGTTGATGAAACTCTCTTTGATATAGAGAAAGAAATAGATGACTTATTGCCC
ATTGAAGTCAAAGAACAGAGAGTAAGCAACTTGCTTCAAGCAGTGATGGTCGGAGGATGT
GTTGCAGCTATGCCTATACTAAAAATGATCCCTACATCAGTTCTTTGGGGATACTTCGCC
TTCATGGCCATCGAGAGCTTACCAGGAAATCAGTTTTGGGAAAGAATCTTACTTCTCTTC
ACTGCACCAAGTCGAAGATTCAAGGTTCTTGAAGACAACCATGCTACATTCGTGGAAACT
GTTCCATTCAAAACGATTGCAATGTTCACAATCTTCCAAACAACTTACCTTCTAATCTGT
TTTGGCCTCACATGGATCCCAATAGCTGGAGTTATGTTCCCTCTAATGATCATGTTTCTA
ATACCGGTAAGGCAATACATACTTCCAAGATTCTTCAAAGGTGCTCATCTTCAGGACTTA
GACGCAGCAGAGTATGAAGAAGCACCCGCTTTACCATTCAATCTCGCAGTATCGGAAGAT
GAAATGGGATCAACAGCTTCATATCCATGCGACTCTGAGATTCTTGATGAGGTTATTACA
AGAAGTAGAGGAGAGTTTAGACACACGTGCAGTCCTAAAGTTACTAGTTCGA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2FT60JQ 485 0 0
ATCTGTTTTGGCCTCACATGGATCCCAATAGCTGGAGTTATGTTCCCTCTAATGATCATG
TTTCTAATACCGGTAAGGCAATACATACTTCCAAGATTCTTCAAAGGTGCTCATCTTCAG
GACTTAGACGCAGCAGAGTATGAAGAAGCACCCGCTTTACCATTCAATCTCGCAGTATCG
GAAGATGAAATGGGATCAACAGCTTCATATCCATGCGACTCTGAGATTCTTGATGAGGTT
ATTACAAGAAGTAGAGGAGAGTTTAGACACACGTGCAGTCCTAAAGTTACTAGTTCGACT
TCCACGCCGGTTTATCATAGGAACCTGTCCCAAGTGTTTAGTCCTCGAGTTAATGAACTA
AGGGGTGGCATGGTGAGTCCTAGTCTCACCGGAAAAGGGCATAATAGTCCAAAGCCAAGT
CCTATGAACCCATCTTCCTCGTCACAGTCGAAGTGAGAATAATTGTCATGGAGGCTAAAT
AAAAA

QA 1 485 1 485
DS 



AS 1 2

CO CL5637Contig1 1113 2 6 U
GGGGCATAAGGGTCTTTATGACACAATCAATAATTCGATTCATTTTCAATTAGGCCTTGC
TCTAGCCTCCTTAGGAGTTATTACTTCCTTGGTAGCTCAACACATGTACTCTTTACCTGC
TTATGCGTTCATAGCGCAAGATTTTACGACTCAAGCTGCGTTATATACCCATCACCAATA
CATTGCAGGATTCATCATGACAGGAGCTTTTGCTCATGGCGCTATATTTTTTATTAGAGA
TTACAATCCAGAACAGAATGAGGATAACGTATTGGCAAGAATGTTAGACCATAAAGAAGC
TATCATATCCCATTTAAGTTGGGCCAGCCTCTTTCTAGGGTTCCATACTTTGGGACTTTA
TGTTCATAATGACGTCATGCTTGCTTTTGGTACTCCCGAAAAACAAATCTTGATCGAACC
CATATTTGCCCAATGGATACAATCCGCTCATGGGAAAACTTCATATGGATTTGATGTACT
TTTATCTTCGACAAATGGCCCAGCATTTAATGCGGGTCGAAGCATATGGTTGCCCGGCTG
GTTAAATGCTATTAATGAGAATAGTAATTCATTATTCTTAACAATAGGTCCTGGAGATTT
CTTGGTTCATCATGCTATTGCTTTAGGTTTACATACAACTACATTGATCTTAGTAAAAGG
TGCTTTAGATGCACGTGGTTCCAAGTTAATGCCAGATAAAAAGGATTTCGGGTATAGTTT
TCCTTGCGATGGTCCGGGACGAGGTGGTACTTGTGATATTTCGGCTTGGGACGCATTTTA
TTTGGCAGTTTTTTGGATGTTAAATACTATTGGATGGGTTACTTTTTATTGGCATTGGAA
ACACATCACATTATGGCAAGGTAACGTTTCACAGTTTAATGAATCTTCCACTTATTTGAT
GGGATGGTTAAGAGATTATCTATGGTTAAACTCTTCACAACTTATCAATGGATATAACCC
TTTTGGTATGAATAGTTTATCAGTCTGGGCATGGATGTTCTTATTTGGGCATCTTGTTTG
GGCTACTGGATTTATGTTCTTAATTTCCTGGCGTGGTTATTGGCAGGAATTGATTGAAAC
TTTAGCATGGGCTCATGAACGTACACCTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ69TF U 1
AF RR2CJ69JQ C 354
BS 1 626 RR2CJ69TF
BS 627 627 RR2CJ69JQ
BS 628 659 RR2CJ69TF
BS 660 660 RR2CJ69JQ
BS 661 692 RR2CJ69TF
BS 693 1113 RR2CJ69JQ

RD RR2CJ69TF 698 0 0
GGGGCATAAGGGTCTTTATGACACAATCAATAATTCGATTCATTTTCAATTAGGCCTTGC
TCTAGCCTCCTTAGGAGTTATTACTTCCTTGGTAGCTCAACACATGTACTCTTTACCTGC
TTATGCGTTCATAGCGCAAGATTTTACGACTCAAGCTGCGTTATATACCCATCACCAATA
CATTGCAGGATTCATCATGACAGGAGCTTTTGCTCATGGCGCTATATTTTTTATTAGAGA
TTACAATCCAGAACAGAATGAGGATAACGTATTGGCAAGAATGTTAGACCATAAAGAAGC
TATCATATCCCATTTAAGTTGGGCCAGCCTCTTTCTAGGGTTCCATACTTTGGGACTTTA
TGTTCATAATGACGTCATGCTTGCTTTTGGTACTCCCGAAAAACAAATCTTGATCGAACC
CATATTTGCCCAATGGATACAATCCGCTCATGGGAAAACTTCATATGGATTTGATGTACT
TTTATCTTCGACAAATGGCCCAGCATTTAATGCGGGTCGAAGCATATGGTTGCCCGGCTG
GTTAAATGCTATTAATGAGAATAGTAATTCATTATTCTTAACAATAGGTCCTGGAGATTT
CTTGGTTCATCATGCTATTGCTTTAG*TTTACATACAACTACATTGATCTTAGTAAAAG*
TGCTTTAGATGCACGTGGTTCCAAGTTAATGC
AGATAA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2CJ69JQ 760 0 0
GACTTTATGTTCATAATGACGTCATGCTTGCTTTTGGTACTCCCGAAAAACAAATCTTGA
TCGAACCCATATTTGCCCAATGGATACAATCCGCTCATGGGAAAACTTCATATGGATTTG
ATGTACTTTTATCTTCGACAAATGGCCCAGCATTTAATGCGGGTCGAAGCATATGGTTGC
CCGGCTGGTTAAATGCTATTAATGAGAATAGTAATTCATTATTCTTAACAATAGGTCCTG
GAGATTTCTTGGTTCATCATGCTATTGCTTTAGGTTTACATACAACTACATTGATCTTAG
TAAAAGGTGCTTTAGATGCACGTGGTTCCAAGTTAATGCCAGATAAAAAGGATTTCGGGT
ATAGTTTTCCTTGCGATGGTCCGGGACGAGGTGGTACTTGTGATATTTCGGCTTGGGACG
CATTTTATTTGGCAGTTTTTTGGATGTTAAATACTATTGGATGGGTTACTTTTTATTGGC
ATTGGAAACACATCACATTATGGCAAGGTAACGTTTCACAGTTTAATGAATCTTCCACTT
ATTTGATGGGATGGTTAAGAGATTATCTATGGTTAAACTCTTCACAACTTATCAATGGAT
ATAACCCTTTTGGTATGAATAGTTTATCAGTCTGGGCATGGATGTTCTTATTTGGGCATC
TTGTTTGGGCTACTGGATTTATGTTCTTAATTTCCTGGCGTGGTTATTGGCAGGAATTGA
TTGAAACTTTAGCATGGGCTCATGAACGTACACCTTTGGC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL5638Contig1 874 2 2 U
GGCAGTTGTTATTTATTTATTTATTTCAGATAAACAAACGAACAAACTGAGTTAAAAACA
AACTCCATAATACTTTAAAGAAAGTAAATCTGAAAACTCCATTAGCATCGCTGTAATACA
GCCCAGGTTGTCGATCATAACATTCATACTCAAGAAGCTCTCTCACACTTAAAATCAGTT
ATTTGTTTGTAATCTTTTGACTTCTAGGAGGACTTCACTTTCCTCACTTTCGGTGATGCA
TCTTCTCGAAACGCATGTAAAAGAGTCCTTCCGATCCCCGCTGCTGTTATCCTTCCATGT
TTCCTGCCTTGAATACTTATCATGCTCAGCAGAGACATCTGTCGATCTGATAATCATAAA
GACCCGTTCATTAAGACATAGCTCATTTTCAAACACATTACCAATGCAGAAAGAAAGGCA
CGGTTCGGTGGATGTCTTTGGGACGATTATAGAGACGGAGGCGTCGGGCTTCCAGCTCGC
CAGTTTCATTCATTCACCGTGTTAGACTAAGATCCGTACGTATCTCAGAATAAAACCTGG
AATCTGAACGAAGTGGCTTAAATTCAAATACAGGAGGTTATTTAACGGTGAGACTCATCC
ACTCACAGTGGGTTTGTTCTCCAGCGACCCAATATCAAAGAAAACCGAGAGGAACAGATT
CAACCGGTACGTTCGTTAACGCTGGAAGCCAGCTTGTATGTACACTGCGTAAAGAACTAA
AGATCCCTGCGTTTACATCAAAATATTACATTGTTTGTTGCCACTAAGGTAACAAAGTAA
ACATGTAAAATACTTTGGTGTTTGGATAAACCAACTTACATGGAGTCCTTATTTGCATTG
ATGGAAGCTTGAGCTGGGAGGAACCTTCACGTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H467JQB U 1
AF RR2D513JQ U 33
BS 1 327 RR2H467JQB
BS 328 874 RR2D513JQ

RD RR2H467JQB 327 0 0
GGCAGTTGTTATTTATTTATTTATTTCAGATAAACAAACGAACAAACTGAGTTAAAAACA
AACTCCATAATACTTTAAAGAAAGTAAATCTGAAAACTCCATTAGCATCGCTGTAATACA
GCCCAGGTTGTCGATCATAACATTCATACTCAAGAAGCTCTCTCACACTTAAAATCAGTT
ATTTGTTTGTAATCTTTTGACTTCTAGGAGGACTTCACTTTCCTCACTTTCGGTGATGCA
TCTTCTCGAAACGCATGTAAAAGAGTCCTTCCGATCCCCGCTGCTGTTATCCTTCCATGT
TTCCTGCCTTGAATACTTATCATGCTC

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR2D513JQ 842 0 0
G
ACAAACGAACAAACTGAGTTAAAAACAAACTCCATAATACTTTAAAGAAAGTAAATCTGA
AAACTCCATTAGCATCGCTGTAATACAGCCCAGGTTGTCGATCATAACATTCATACTCAA
GAAGCTCTCTCACACTTAAAATCAGTTATTTGTTTGTAATCTTTTGACTTCTAGGAGGAC
TTCACTTTCCTCACTTTCGGTGATGCATCTTCTCGAAACGCATGTAAAAGAGTCCTTCCG
ATCCCCGCTGCTGTTATCCTTCCATGTTTCCTGCCTTGAATACTTATCATGCTCAGCAGA
GACATCTGTCGATCTGATAATCATAAAGACCCGTTCATTAAGACATAGCTCATTTTCAAA
CACATTACCAATGCAGAAAGAAAGGCACGGTTCGGTGGATGTCTTTGGGACGATTATAGA
GACGGAGGCGTCGGGCTTCCAGCTCGCCAGTTTCATTCATTCACCGTGTTAGACTAAGAT
CCGTACGTATCTCAGAATAAAACCTGGAATCTGAACGAAGTGGCTTAAATTCAAATACAG
GAGGTTATTTAACGGTGAGACTCATCCACTCACAGTGGGTTTGTTCTCCAGCGACCCAAT
ATCAAAGAAAACCGAGAGGAACAGATTCAACCGGTACGTTCGTTAACGCTGGAAGCCAGC
TTGTATGTACACTGCGTAAAGAACTAAAGATCCCTGCGTTTACATCAAAATATTACATTG
TTTGTTGCCACTAAGGTAACAAAGTAAACATGTAAAATACTTTGGTGTTTGGATAAACCA
ACTTACATGGAGTCCTTATTTGCATTGATGGAAGCTTGAGCTGGGAGGAACCTTCACGTC
A

QA 2 842 2 842
DS 



AS 1 2

CO CL5639Contig1 1083 2 2 U
GCGGATCAGGGGTTCATGAAAAAGTTGAAAGAATTTGATGGACTTGCAATGTCTATAAGC
AATAACAAAGCTGGGAGTGCTGAACACAGCAGTGGACCTAGGAATTCTCAGAGCTCCGAG
AATGATGATTCCAGCAATGGTAGTGATGGGAATACAACTGGGGGAGAACAGTCTAGGAAG
AAAAGAAGCCGGGAAGGATCACCGAACAATGATGGGAAACCTTCATCTCAAATTGTTCCT
CTTCTTAGAGATGAAAATGAGAAACCTGCAGTGACTATGGGGACTCCTGTTATGCCGACA
ACTATGGATTTCCCACAGCCATGCCATGGTGCGCCTCATGAAGTCTGGAATGAAAAAGAG
GTTAAAAGAGAGAAGAGAAAACAGTCAAACCGAGAATCTGCTAGAAGGTCAAGACTAAGG
AAGCAGGCTGAAACTGAAGAACTCTCTGTCAAGGTTGACGCACTAGTTGCTGAGAACATG
ACTCTGAGGTCAAAACTAGGCCAACTAAACGATGAGTCTGAGAAACTACGGCTGGAGAAC
GAAGCTTTATTGGCCCAACTGAAAGCGACGCAAACGCAAGCAACTGGGAAAACAGAGAAC
CTTATATCTCGAGTTGATAACAACAACAACAACTCTGTATCAGGTAGTAGTAAGAATGTG
GAACAACAACTCTTAAACGTAAGTCTAAGAACCGATTCTGTGGCGGCTAGCTAAGTTGAC
TGTGGCACAGAAGTGAAAGAAACCATTTCATTTCTTCTAATGGGTTCTGATTGTAACTTA
AAAAAAAAAAGTTTTTTCTTAGATTTATAGCTCTCTCATCTCTGCATGGTGAGCAGAAAC
TGATATAATATCCTTAAGCAGAAGAGATTCAGTGTGGTCTTGATTGATTAGTTTTAGTGA
TATCATACTATACAAGCGAATGGATTCGAGAAAAGGGGAGACCTATTTTGATGGTCTCTC
TTCTTCATGGTCGTTTGTGCATTCTTCTTTTATGAAAACACTCTCTCTTGTGTGTGTGTG
TGTGTTTTTGTATTAGATTAACGTGTTGTAAAACTTGTCAATGTAAGACTTATCAATTAT
TCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2EZ03TF U 1
AF RR2EZ03JQ C 425
BS 1 640 RR2EZ03TF
BS 641 1083 RR2EZ03JQ

RD RR2EZ03TF 640 0 0
GCGGATCAGGGGTTCATGAAAAAGTTGAAAGAATTTGATGGACTTGCAATGTCTATAAGC
AATAACAAAGCTGGGAGTGCTGAACACAGCAGTGGACCTAGGAATTCTCAGAGCTCCGAG
AATGATGATTCCAGCAATGGTAGTGATGGGAATACAACTGGGGGAGAACAGTCTAGGAAG
AAAAGAAGCCGGGAAGGATCACCGAACAATGATGGGAAACCTTCATCTCAAATTGTTCCT
CTTCTTAGAGATGAAAATGAGAAACCTGCAGTGACTATGGGGACTCCTGTTATGCCGACA
ACTATGGATTTCCCACAGCCATGCCATGGTGCGCCTCATGAAGTCTGGAATGAAAAAGAG
GTTAAAAGAGAGAAGAGAAAACAGTCAAACCGAGAATCTGCTAGAAGGTCAAGACTAAGG
AAGCAGGCTGAAACTGAAGAACTCTCTGTCAAGGTTGACGCACTAGTTGCTGAGAACATG
ACTCTGAGGTCAAAACTAGGCCAACTAAACGATGAGTCTGAGAAACTACGGCTGGAGAAC
GAAGCTTTATTGGCCCAACTGAAAGCGACGCAAACGCAAGCAACTGGGAAAACAGAGAAC
CTTATATCTCGAGTTGATAACAACAACAACAACTCTGTAT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2EZ03JQ 659 0 0
AGGCTGAAACTGAAGAACTCTCTGTCAAGGTTGACGCACTAGTTGCTGAGAACATGACTC
TGAGGTCAAAACTAGGCCAACTAAACGATGAGTCTGAGAAACTACGGCTGGAGAACGAAG
CTTTATTGGCCCAACTGAAAGCGACGCAAACGCAAGCAACTGGGAAAACAGAGAACCTTA
TATCTCGAGTTGATAACAACAACAACAACTCTGTATCAGGTAGTAGTAAGAATGTGGAAC
AACAACTCTTAAACGTAAGTCTAAGAACCGATTCTGTGGCGGCTAGCTAAGTTGACTGTG
GCACAGAAGTGAAAGAAACCATTTCATTTCTTCTAATGGGTTCTGATTGTAACTTAAAAA
AAAAAAGTTTTTTCTTAGATTTATAGCTCTCTCATCTCTGCATGGTGAGCAGAAACTGAT
ATAATATCCTTAAGCAGAAGAGATTCAGTGTGGTCTTGATTGATTAGTTTTAGTGATATC
ATACTATACAAGCGAATGGATTCGAGAAAAGGGGAGACCTATTTTGATGGTCTCTCTTCT
TCATGGTCGTTTGTGCATTCTTCTTTTATGAAAACACTCTCTCTTGTGTGTGTGTGTGTG
TTTTTGTATTAGATTAACGTGTTGTAAAACTTGTCAATGTAAGACTTATCAATTATTCT

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL5640Contig1 1013 2 2 U
GGTGATAAAAAAGTGGGATAAATGAGGTTACATAAAAGTCATGATGATAATCCTCAGAAT
TCTAATGAAACCGCGTTGCAGCATGTTGAATTTATATTCAAACACAAGTATGGCGAGGTG
ATGCCGGAACTATTGTCCAAGTTCATTGCATTGCTGGACATGGAGAAGGAAGAATGGGGT
GGAGTGAAAGTGATGATAGAGTGTGTGCAAGAGTTCCGTGAGTGGAAAAAGAAATCTCAA
ACGCTAAATGATAAAGGCGACACCTGTGAAGACTTCGAAGAATTTTTGTTTTCCCCCGAT
CGTAACGTGATCGTTATCCAAGGGGGCGAAGGTACAATGACTAGCAAGGCAGTTATTCAA
GGTGTCGCTGATCCACAAGCAAATCGAGAAATATGCAAGGAGCCTGACCATCCAAGTTCT
AGCAAAAATGTTAATCAAGATCTGCCAAAGGCTCCAAATATTTTAAAGGAGCCTGGCGGT
CCAGGTTCTAGCAAAAATGTTAATCAAGATCTCCCAAAGGCTCCAAATACTTTAAAGGTC
AAAATCTATATGGGAATTGGGTGGGACAAAGACTTTCCAAAGAGTAATAGAGGTTCCTTT
CCGGATCTCATTGTGAATCTCGCTATATATTGTGGCAAGATCCAGAAGACTAAAGTCCAC
AAAAGCAGTTGGACACCCTGTTGTGGAGAGGAAAGTTCGTTTTCGATATCTAGTTGGGAA
AATGACGTGCTTGTTGCTGAAGTATATGACCATACGCTAAACGAGAAATTTGCTGGTACG
TTCCGTCTCTTGGTGTTTAAGCTGAAACCAGGTATACAAGTAATTCCTCTATCAGATGAA
GTGAGGAAACCATGCAGCACGGCACGGCTGCTCATGGGTTTTATGTTTGCTTGAAATGGA
TCAGGCCTATATGGTACTCTTACTTTATGGTTGTGTTTTTGATGTGTGTGGTATAGTACT
GGTTGAGTTGTTCAATTTGTAACCATCAATACATGGTAAGTATTCTTGTCGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ74TF U 1
AF RR2FZ74JQ C 283
BS 1 576 RR2FZ74TF
BS 577 1013 RR2FZ74JQ

RD RR2FZ74TF 576 0 0
GGTGATAAAAAAGTGGGATAAATGAGGTTACATAAAAGTCATGATGATAATCCTCAGAAT
TCTAATGAAACCGCGTTGCAGCATGTTGAATTTATATTCAAACACAAGTATGGCGAGGTG
ATGCCGGAACTATTGTCCAAGTTCATTGCATTGCTGGACATGGAGAAGGAAGAATGGGGT
GGAGTGAAAGTGATGATAGAGTGTGTGCAAGAGTTCCGTGAGTGGAAAAAGAAATCTCAA
ACGCTAAATGATAAAGGCGACACCTGTGAAGACTTCGAAGAATTTTTGTTTTCCCCCGAT
CGTAACGTGATCGTTATCCAAGGGGGCGAAGGTACAATGACTAGCAAGGCAGTTATTCAA
GGTGTCGCTGATCCACAAGCAAATCGAGAAATATGCAAGGAGCCTGACCATCCAAGTTCT
AGCAAAAATGTTAATCAAGATCTGCCAAAGGCTCCAAATATTTTAAAGGAGCCTGGCGGT
CCAGGTTCTAGCAAAAATGTTAATCAAGATCTCCCAAAGGCTCCAAATACTTTAAAGGTC
AAAATCTATATGGGAATTGGGTGGGACAAAGACTTT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2FZ74JQ 731 0 0
TTTTTGTTTTCCCCCGATCGTAACGTGATCGTTATCCAAGGGGGCGAAGGTACAATGACT
AGCAAGGCAGTTATTCAAGGTGTCGCTGATCCACAAGCAAATCGAGAAATATGCAAGGAG
CCTGACCATCCAAGTTCTAGCAAAAATGTTAATCAAGATCTGCCAAAGGCTCCAAATATT
TTAAAGGAGCCTGGCGGTCCAGGTTCTAGCAAAAATGTTAATCAAGATCTCCCAAAGGCT
CCAAATACTTTAAAGGTCAAAATCTATATGGGAATTGGGTGGGACAAAGACTTTCCAAAG
AGTAATAGAGGTTCCTTTCCGGATCTCATTGTGAATCTCGCTATATATTGTGGCAAGATC
CAGAAGACTAAAGTCCACAAAAGCAGTTGGACACCCTGTTGTGGAGAGGAAAGTTCGTTT
TCGATATCTAGTTGGGAAAATGACGTGCTTGTTGCTGAAGTATATGACCATACGCTAAAC
GAGAAATTTGCTGGTACGTTCCGTCTCTTGGTGTTTAAGCTGAAACCAGGTATACAAGTA
ATTCCTCTATCAGATGAAGTGAGGAAACCATGCAGCACGGCACGGCTGCTCATGGGTTTT
ATGTTTGCTTGAAATGGATCAGGCCTATATGGTACTCTTACTTTATGGTTGTGTTTTTGA
TGTGTGTGGTATAGTACTGGTTGAGTTGTTCAATTTGTAACCATCAATACATGGTAAGTA
TTCTTGTCGTG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL5641Contig1 1149 2 2 U
GCAAACCAGCCCATTCGAGAAACAGTGAACTATCATTCAAGTAATCAAACTGGAGAAACT
GCTGTAGACTCTTCTAAGGATCGAACCGCATCCAATGCTGTTGGATGGAACGATGGCTGG
TATATGACTCCTGAAACGCATCACTCTGCTGCTGCTGCTGCTGTGGAATTGGAAGCAAGT
GCTCCTCGAACCAACACTGTTGGAAAAGATCACGGTAAGCAGCAGGGTTACAGAAGTAAC
TATGGTGACTCTAAAAAGGCGAATACAAGAGATTCCAGTAAAGCTCATATGCAGCAGTCT
GGCCATGGGTCAGGTCAACAAGATCTGCATGTTGGTTCGAATGAAATTCGTGGTCAGTCT
GGTGGTGGTCGTCAATATTCGAGGGACAGAACTTATGCATCTCAGAAAAGGGATGGTGGA
TACGAGCAGCAGGGGTTTACTCCAGAACAGAAAATGAACTCAGCTGATACACCAAACCAT
TCTCAAAACCGATCTGCCAGTCAGGAGGTCCAGGGTGGGCATAATCCGAATAGTATGTTC
CAAACGAACACAGGCCAGAATCGACGGTTTGGAAGAGGACAGGAGCCACACGGAGGTTGG
GGTTCGTCGATGCAAGAGAACATGCACCATCACCATCAGAGGCCACTTTCAAACAGAGGT
AGACAGAAGCCAAATCTGCATTACGAGTACAAGCCTGTTGGGTCACATGCTTATGAAGGA
GAACATAGTCGAGAACAATTGAAAGAGAGTTCAGAAGGTCCAAGATTCAGGGAGAAGGGG
CAGGGAAACCAGAGGCATGATGGACAAAAGTCGTACCAACAGCAAAGGGGTTAGTGCTGG
GAGAAACACCGGTCGATAAGAGAAACTGAGATTGTCCTGTTTGTGATTAGGTAGTTGAGC
TGTGTTGGCGAGGCTTTGCCAAAGGAGTAGCATCTGATGAGGACGTATTTGGCAACAAAG
CCTTTGCTCTGGAAGGGTTTTTATGTATTTCAGTGGATTATTTGATTATGGATCTTAACT
TTAGCATTTTGTATTACATTTGGTGGCAGGTTGGACTTTACCTGTTCTGTCAAGCCTTTG
CTCTGTTGCTTGTTTTTTTCTTTGTTTTCGGAGTGTGGGAATTATCTTATCTAACATGAA
CTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH09TF U 1
AF RR2GH09JQB C 468
BS 1 636 RR2GH09TF
BS 637 1149 RR2GH09JQB

RD RR2GH09TF 636 0 0
GCAAACCAGCCCATTCGAGAAACAGTGAACTATCATTCAAGTAATCAAACTGGAGAAACT
GCTGTAGACTCTTCTAAGGATCGAACCGCATCCAATGCTGTTGGATGGAACGATGGCTGG
TATATGACTCCTGAAACGCATCACTCTGCTGCTGCTGCTGCTGTGGAATTGGAAGCAAGT
GCTCCTCGAACCAACACTGTTGGAAAAGATCACGGTAAGCAGCAGGGTTACAGAAGTAAC
TATGGTGACTCTAAAAAGGCGAATACAAGAGATTCCAGTAAAGCTCATATGCAGCAGTCT
GGCCATGGGTCAGGTCAACAAGATCTGCATGTTGGTTCGAATGAAATTCGTGGTCAGTCT
GGTGGTGGTCGTCAATATTCGAGGGACAGAACTTATGCATCTCAGAAAAGGGATGGTGGA
TACGAGCAGCAGGGGTTTACTCCAGAACAGAAAATGAACTCAGCTGATACACCAAACCAT
TCTCAAAACCGATCTGCCAGTCAGGAGGTCCAGGGTGGGCATAATCCGAATAGTATGTTC
CAAACGAACACAGGCCAGAATCGACGGTTTGGAAGAGGACAGGAGCCACACGGAGGTTGG
GGTTCGTCGATGCAAGAGAACATGCACCATCACCAT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2GH09JQB 682 0 0
TACACCAAACCATTCTCAAAACCGATCTGCCAGTCAGGAGGTCCAGGGTGGGCATAATCC
GAATAGTATGTTCCAAACGAACACAGGCCAGAATCGACGGTTTGGAAGAGGACAGGAGCC
ACACGGAGGTTGGGGTTCGTCGATGCAAGAGAACATGCACCATCACCATCAGAGGCCACT
TTCAAACAGAGGTAGACAGAAGCCAAATCTGCATTACGAGTACAAGCCTGTTGGGTCACA
TGCTTATGAAGGAGAACATAGTCGAGAACAATTGAAAGAGAGTTCAGAAGGTCCAAGATT
CAGGGAGAAGGGGCAGGGAAACCAGAGGCATGATGGACAAAAGTCGTACCAACAGCAAAG
GGGTTAGTGCTGGGAGAAACACCGGTCGATAAGAGAAACTGAGATTGTCCTGTTTGTGAT
TAGGTAGTTGAGCTGTGTTGGCGAGGCTTTGCCAAAGGAGTAGCATCTGATGAGGACGTA
TTTGGCAACAAAGCCTTTGCTCTGGAAGGGTTTTTATGTATTTCAGTGGATTATTTGATT
ATGGATCTTAACTTTAGCATTTTGTATTACATTTGGTGGCAGGTTGGACTTTACCTGTTC
TGTCAAGCCTTTGCTCTGTTGCTTGTTTTTTTCTTTGTTTTCGGAGTGTGGGAATTATCT
TATCTAACATGAACTTTTTTTT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL5642Contig1 795 2 12 U
GATCTCAAGTTTTATACATCCTCCAATGTAATAGTTTGTGACACAGAATGAGGTTTATTA
ACGTAGTAGTAAAGATATAATGCATATGCTAAACATAGAGCTTGGCATCATAAATAGAAT
AAAAGACACTCTAATAATTAATTATAGGGTATTTTAGGTTTGAGAAACTGGGATTCAATT
GGTGAAGAAAGAAGCGCTAAAATTTGGGTAGCTGAATCAAAAGGCAGGTGCAGCGAAATC
CTCTTCCTCCTTGTTCTCTTGGCATCTTTTTAGCAGCTGAAGTTGGCGTCGAAAATGCAA
TACCTCTTCTTGAAGCATAGTTGGGAGGGAAGCCATGGAAATGAGCTGCTTCATTTCTTG
CATAAGAGCTTGGTCTTTAACCCCTGACCATGTCTGTGGAGGTAATGCCAACAGAAGTAC
AGTGAACACATCGTTTCCTGCAGGATAATTTGCTTCTGGACCACATTCACAGTCAGTTTG
GGTTGATGGCACCAGCAGATCAACATTTTGTTCGCTCCCGTCACGCACCACAACTCCAGT
CACCACGGTGCCTGCTGCCTCGCCAGGACCTTTGACACAAGTGACACAAGTTTCCCGACA
ACAAAACTCTTTTGATGAGCATCCGGTCAAGATTTCAGCACCTTGGCAACAAGCCTTTGC
AGCCGCATATGTCAGACTGTCTTCGTAACCCACTGTGGATAAGAACTTACTGATGTGTTT
AAACAGTTCAGTTTCATGCACTTCTTTCAGCACCACTTGCTTTAAGTTGAGCCTTGATTT
CTCCCCAGCGCTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC11JQ U 1
AF RR2C858JQ U 41
BS 1 102 RR2BC11JQ
BS 103 103 RR2C858JQ
BS 104 129 RR2BC11JQ
BS 130 131 RR2C858JQ
BS 132 188 RR2BC11JQ
BS 189 189 RR2C858JQ
BS 190 200 RR2BC11JQ
BS 201 201 RR2C858JQ
BS 202 338 RR2BC11JQ
BS 339 339 RR2C858JQ
BS 340 362 RR2BC11JQ
BS 363 795 RR2C858JQ

RD RR2BC11JQ 362 0 0
GATCTCAAGTTTTATACATCCTCCAATGTAATAGTTTGTGACACAGAATGAGGTTTATTA
ACGTAGTAGTAAAGATATAATGCATATGCTAAACATAGAGCT*GGCATCATAAATAGAAT
AAAAGACAC**TAATAATTAATTATAGGGTATTTTAGGTTTGAGAAACTGGGATTCAATT
GGTGAAGAGAGAAGCGCTAAGATTTGGGTAGCTGAATCAAAAGGCAGGTGCAGCGAAATC
CTCTTCCTCCTTGTTCTCTTGGCATCTTTTTAGCAGCTGAAGTTGGCGTCGAAAATGCAA
TACCTCTTCTTGAAGCATAGTTGGGAGGGAAGCCATGGTAATGAGCTGCTTCATTTCTTG
CA

QA 1 362 1 362
DS 

RD RR2C858JQ 755 0 0
ACACAGAATGAGGTTTATTAACGTAGTAGTAAAGATATAATGCATATGCTAAACATAGAG
CTTGGCATCATAAATAGAATAAAAGACACTCTAATAATTAATTATATGGTATTTTAGGTT
TGAGAAACTGGGATTCAATTGGTGAAGAAAGAGGCGCTGAAATTTGGGTAGCTGAATCAA
AAGGCAGGTGCAGCGAAATCCTCTTCCTCCTTGTTCTCTTGGCATCTTTTTAGCAGCTGA
AGTTGGCGTCTAAGATGCAATACCTCTTCTTGAAGCATAGTTGGGAGGGAAGCCATGGAA
ATGAGCTGCTTCATTTCTTGCATAAGAGCTTGGTCTTTAACCCCTGACCATGTCTGTGGA
GGTAATGCCAACAGAAGTACAGTGAACACATCGTTTCCTGCAGGATAATTTGCTTCTGGA
CCACATTCACAGTCAGTTTGGGTTGATGGCACCAGCAGATCAACATTTTGTTCGCTCCCG
TCACGCACCACAACTCCAGTCACCACGGTGCCTGCTGCCTCGCCAGGACCTTTGACACAA
GTGACACAAGTTTCCCGACAACAAAACTCTTTTGATGAGCATCCGGTCAAGATTTCAGCA
CCTTGGCAACAAGCCTTTGCAGCCGCATATGTCAGACTGTCTTCGTAACCCACTGTGGAT
AAGAACTTACTGATGTGTTTAAACAGTTCAGTTTCATGCACTTCTTTCAGCACCACTTGC
TTTAAGTTGAGCCTTGATTTCTCCCCAGCGCTGAG

QA 1 755 1 755
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5644Contig1 1207 2 2 U
GGACTCTCTGCAGAGCTAATGTTTCTCCTCTTATCTCTTTACCTTCCCCTGAATTGGGCC
ATCTCAGTCTCCCCTCTCACTGTATTATAACCTGTTACTGGCTCAATCCCTGCAATCAAT
ATCATGTCCGTTTTCAATTACCTCTTTTATCTCCCATTCACTCTCTTTCTCAACTTATCT
CCTCACATCAAAATCTCAACATTTTTTAAACCTAAATGGACTTTCTATAGATAGTATAGG
CCGCAGTCGTGAAGCCAATATTTCACATGCTCATTCTGAGTATCCCCTCCGCAAAAACTT
TTTTCAAGCAGCACGAAAATCTCTACTTCTGATAATATCTCTATCGAAGCCGCTGTCCCA
CTCCACCTTCGACGATCTCTGTCCTGGCCGCTCTGCGCATATGATTGTTGGCCGCCTCCT
CCCCTTCTTGGATTCACAGAGCATCAGGAAAGATGGTGAGTTCATTGGTATCATCTTTCT
GCTACAAAATGAGACGGTACAATGTCTACCAAACATTCCCTCTTGACTCCATCAAACAGA
CGTCTCCGAAAGCTCTTACAAAAGATTACATGTGTTTCCCAGTCGTTATTCAATTCAGAA
AACCCTAGCTTTCTCACTCGGCCTAGATCTTTCAATCCCTTTTGGAGATGTTGTTGAAGC
TGTTGTGCCTCACATGGTTGAATCAATCAACGATGGAACAAATTGAAACTGCCAAGTTTT
TATAAATTAGGTTTGATTCTTCTACGTGCTTTAGGCGACGATAGATATTGCTAGCCTTCT
CCAACTGCTGAATAACCCAAGGTTGAAAGTAATAAATTTGCGGAGTAACCCAAGGCATCA
TCAGCGCCACCACCGACGACTAAACAGTCAACGAAAGTTTTAAAGAGAACACTTGGACTA
TGGGAAAAAACTTCGGATGCCCGGATGGAGTCCTCCTCAGTGGAAAGGGTCCTTACAAGT
ACAACAGACAACAGTAGTGTACCTGATGGAATTGATTACTTGACCGCTCATGTTGAACTT
GGTACTAAGAGTTTTTCTGTCACTTTTCTCATGAGACGGAAGACTTTTTTCATGCAACTT
TTCCTTTGTGGGGAAAAACATTCAAAACTTGAAGCTCGCGTTGTTTGGTTTCTCTACAAT
AGCTTTTAGTAAAAGTTTATTATAACAATAATTTTGTTCGATCAGATTCATATAAATTAC
TTTATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA06TF U 1
AF RR2EA06JQ C 433
BS 1 725 RR2EA06TF
BS 726 1207 RR2EA06JQ

RD RR2EA06TF 725 0 0
GGACTCTCTGCAGAGCTAATGTTTCTCCTCTTATCTCTTTACCTTCCCCTGAATTGGGCC
ATCTCAGTCTCCCCTCTCACTGTATTATAACCTGTTACTGGCTCAATCCCTGCAATCAAT
ATCATGTCCGTTTTCAATTACCTCTTTTATCTCCCATTCACTCTCTTTCTCAACTTATCT
CCTCACATCAAAATCTCAACATTTTTTAAACCTAAATGGACTTTCTATAGATAGTATAGG
CCGCAGTCGTGAAGCCAATATTTCACATGCTCATTCTGAGTATCCCCTCCGCAAAAACTT
TTTTCAAGCAGCACGAAAATCTCTACTTCTGATAATATCTCTATCGAAGCCGCTGTCCCA
CTCCACCTTCGACGATCTCTGTCCTGGCCGCTCTGCGCATATGATTGTTGGCCGCCTCCT
CCCCTTCTTGGATTCACAGAGCATCAGGAAAGATGGTGAGTTCATTGGTATCATCTTTCT
GCTACAAAATGAGACGGTACAATGTCTACCAAACATTCCCTCTTGACTCCATCAAACAGA
CGTCTCCGAAAGCTCTTACAAAAGATTACATGTGTTTCCCAGTCGTTATTCAATTCAGAA
AACCCTAGCTTTCTCACTCGGCCTAGATCTTTCAATCCCTTTTGGAGATGTTGTTGAAGC
TGTTGTGCCTCACATGGTTGAATCAATCAACGATGGAACAAATTGAAACTGCCAAGTTTT
TATAA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2EA06JQ 775 0 0
TTCACAGAGCATCAGGAAAGATGGTGAGTTCATTGGTATCATCTTTCTGCTACAAAATGA
GACGGTACAATGTCTACCAAACATTCCCTCTTGACTCCATCAAACAGACGTCTCCGAAAG
CTCTTACAAAAGATTACATGTGTTTCCCAGTCGTTATTCAATTCAGAAAACCCTAGCTTT
CTCACTCGGCCTAGATCTTTCAATCCCTTTTGGAGATGTTGTTGAAGCTGTTGTGCCTCA
CATGGTTGAATCAATCAACGATGGAACAAATTGAAACTGCCAAGTTTTTATAAATTAGGT
TTGATTCTTCTACGTGCTTTAGGCGACGATAGATATTGCTAGCCTTCTCCAACTGCTGAA
TAACCCAAGGTTGAAAGTAATAAATTTGCGGAGTAACCCAAGGCATCATCAGCGCCACCA
CCGACGACTAAACAGTCAACGAAAGTTTTAAAGAGAACACTTGGACTATGGGAAAAAACT
TCGGATGCCCGGATGGAGTCCTCCTCAGTGGAAAGGGTCCTTACAAGTACAACAGACAAC
AGTAGTGTACCTGATGGAATTGATTACTTGACCGCTCATGTTGAACTTGGTACTAAGAGT
TTTTCTGTCACTTTTCTCATGAGACGGAAGACTTTTTTCATGCAACTTTTCCTTTGTGGG
GAAAAACATTCAAAACTTGAAGCTCGCGTTGTTTGGTTTCTCTACAATAGCTTTTAGTAA
AAGTTTATTATAACAATAATTTTGTTCGATCAGATTCATATAAATTACTTTATGG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5647Contig1 848 2 10 U
GTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTG
TAAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTT
GTTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAA
ACCCCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGT
TGCTCTGATGATTCATGATAACTCGACAGATGGTACGGGCTGCGACCAAGAAAAATCCAA
AAATAAGATCGTTACAATTACAGGATACCAAAAGGTAACACCGAATGAGGCGAGCCTAGA
AGTCGCTGCTGCTCAGCAACCAGTGTCAGTTGGAATCGATGCTGACGGGTTTATCTTTCA
GTTCTACTCTTCTGGTATTTTCACAGGTTACTGTGGGTCGAGTCTCAACCATGCAGTGAC
TGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGACGGTCAAAAGTACTGGATCGTGAAGAATACATGGGG
AACTGGTTGGGGGTGAAGAAGGCTACATACGGATGGAACGTGGTTATCGTAAAGACAGGG
GTAAATGTGGTATTACTATGCTGGCGAGCTATCCCTTGCAGTGAATCCACGAAACTCCAA
AAGATTAAGAGAGCCTTTTCTTTCTCATTAATATGAAAATTATCTCTGTATGACAATCTG
CAATAGCGCAGCTAAAATAATTACGACTGTGAAATAAATTACTAGAGATAATTGAGAACC
AGGTGCTGTTTACAGGATTACAAAGATAAGATGCGGTTATAAATAGAAACATGTTTCAGT
CTGGATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN55TF U 1
AF RR2BN55JQ C 428
BS 1 661 RR2BN55TF
BS 662 662 RR2BN55JQ
BS 663 698 RR2BN55TF
BS 699 699 RR2BN55JQ
BS 700 722 RR2BN55TF
BS 723 723 RR2BN55JQ
BS 724 736 RR2BN55TF
BS 737 737 RR2BN55JQ
BS 738 754 RR2BN55TF
BS 755 848 RR2BN55JQ

RD RR2BN55TF 757 0 0
GTACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTG
TAAGTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTT
GTTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAA
ACCCCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCTGCCCGT
TGCTCTGATGATTCATGATAACTCGACAGATGGTACGGGCTGCGACCAAGAAAAATCCAA
AAATAAGATCGTTACAATTACAGGATACCAAAAGGTAACACCGAATGAGGCGAGCCTAGA
AGTCGCTGCTGCTCAGCAACCAGTGTCAGTTGGAATCGATGCTGACGGGTTTATCTTTCA
GTTCTACTCTTCTGGTATTTTCACAGGTTACTGTGGGTCGAGTCTCAACCATGCAGTGAC
TGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGACGGTCAAAAGTACTGGATCGTGAAGAATACATGGGG
AACTGGTTGGGGGTGAAGAAGGCTACATACGGATGGAACGTGGTTATCGTAAAGACAGGG
GTAAATGTGGTATTACTATGCTGGCGAGCTATCCCTTGCAGTGAATCCACGAAACTCCAA
A*GATTAAGAGAGCCTTTTCTTTCTCATTAATATGAAA*TTATCTCTGTATGACAATCTG
CA*TAGCGCAGCTAAA*TAATTACGACTGTGAAA
AAA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2BN55JQ 421 0 0
TTTTT
TGGTATTTTCACAGGTTACTGTGGGTCGAGTTTCAACCATGCAGTGACTGTTGTTGGATA
TGGAGAAGAAGACGGTCAAAAGTACTGGATCGTGAAGAATACATGGGGAACTGGTTGGGG
*TGAAGAAGGCTACATACGGATGGAACGTGGTTATCGTAAAGACAGGGGTAAATGTGGTA
TTACTATGCTGGCGAGCTATCCCTTGCAGTGAATCCACGAAACTCCAAAAGATTAAGAGA
GCCTTTTCTTTCTCATTAATATGAAAATTATCTCTGTATGACAATCTGCAATAGCGCAGC
TAAAATAATTACGACTGTGAAATAAATTACTAGAGATAATTGAGAACCAGGTGCTGTTTA
CAGGATTACAAAGATAAGATGCGGTTATAAATAGAAACATGTTTCAGTCTGGATAT

QA 6 421 6 421
DS 



AS 1 2

CO CL5648Contig1 524 2 7 U
ATTAAAGGAGCTTTTGGTGTCAGTTGGTTCACTTCAATTCCCTTCTGGAAAAGCTGAGAT
TATAGATGTTAGCAGATGTGTTGGAGATGCTTTCTTGGTCACTGTTCGGAACAAGAAAAG
AGTTGGCTATACTTACGAGCTTTCCCTCAAAGTCCAAGGAGAGTGGTCTGTTGACGAGGA
CGCAAAAAAGGTGAAGGGGAGTCTCGACATTCCCGAGTTCTCATTCGGCGAGCTTGATGA
TCTTGAGGTGAATGTGAAGCTCAGTGAAGACAAAGAGCTTTCCCAGCAGCTGAAGCAGCA
AGTTCGGTTGGATACGAAGCAGTTCTTGGAGCCTATACGCCTTAAACTTGCCCAGTTCGA
GCAGGAGCTCAAAGATCGATAGTTATTGTTTCTTTTCATTTCATATCAGCAATTTTCTGT
TAGCATCGAGAACTTGGTTAAAGCATAACACTACAGCTTTTCTTGTATCCATGCTTCATC
TGTTCACCAACATTTCCACATTTATTGTCTAAGTTCAGTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G318JQ C 1
AF RR2G318TF U 192
BS 1 191 RR2G318JQ
BS 192 364 RR2G318TF
BS 365 365 RR2G318JQ
BS 366 420 RR2G318TF
BS 421 421 RR2G318JQ
BS 422 495 RR2G318TF
BS 496 524 RR2G318JQ

RD RR2G318JQ 524 0 0
ATTAAAGGAGCTTTTGGTGTCAGTTGGTTCACTTCAATTCCCTTCTGGAAAAGCTGAGAT
TATAGATGTTAGCAGATGTGTTGGAGATGCTTTCTTGGTCACTGTTCGGAACAAGAAAAG
AGTTGGCTATACTTACGAGCTTTCCCTCAAAGTCCAAGGAGAGTGGTCTGTTGACGAGGA
CGCAAAAAAGGTGAAGGGGAGTCTCGACATTCCCGAGTTCTCATTCGGCGAGCTTGATGA
TCTTGAGGTGAATGTGAAGCTCAGTGAAGACAAAGAGCTTTCCCAGCAGCTGAAGCAGCA
AGTTCGGTTGGATACGAAGCAGTTCTTGGAGCCTATACGCCTTAAACTTGCCCAGTTCGA
GCAGGAGCTCAAAGATCGATAGTTATTGTTTCTTTTCATTTCATATCAGCAATTTTCTGT
TAGCATCGAGAACTTGGTTAAAGCATAACACTACAGCTTTTCTTGTATCCATGCTTCATC
TGTTCACCAACATTTCCACATTTATTGTCTAAGTTCAGTTCTCC

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2G318TF 304 0 0
TGAAGGGGAGTCTCGACATTCCCGAGTTCTCATTCGGCGAGCTTGATGATCTTGAGGTGA
ATGTGAAGCTCAGTGAAGACAAAGAGCTTTCCCAGCAGCTGAAGCAGCAAGTTCGGTTGG
ATACGAAGCAGTTCTTGGAGCCTATACGCCTTAAACTTGCCCAGTTCGAGCAG*AGCTCA
AAGATCGATAGTTATTGTTTCTTTTCATTTCATATCAGCAATTTTCTGT*AGCATCGAGA
ACTTGGTTAAAGCATAACACTACAGCTTTTCTTGTATCCATGCTTCATCTGTTCACCAAC
ATTT

QA 1 304 1 304
DS 



AS 1 2

CO CL5649Contig1 949 2 10 U
TCTTTGAAGGTGTATTGTATATTATATGATCTTGATAATATGATCTTGTGAGTTGTTTCT
CCCATAGACGATCACAATCATCTTCCTCCAATCGTTTCCAGCCAAAAAAAAAAACCTCCA
ATGGCCGAGTCTGCAAGCAGAAACTTTTCAAAAAAGCTCATCGAAATTGATATAAGCTCG
GATACGGTGTGCCCATGGTGCTTTGTGGGGAAGAAGAATCTTGACAAAGCCATTGATGCA
TCTAAAGGTCAATACAACTTTGAGATTCGATGGCATCCTTTTTTCCTCGATGCATCTGCA
CCCAAAGAAGGTGTGAACAAGAAAGAGTTTTATAGACAAAGGTTTGGAAGCAGAGTTGAA
GCAATGTTCAGAAGAATGTCTGAGATCTTCAAAGGTATTGGGTTAGAGTATGACACATCC
GGTCTCACAGGCAACACTCTGGATAGTCATAGACTCATACATTATGCGGGGAAACAAGCT
CCGGATAAACAACATAGCCTTGTTGAAGAGTTGTGTCTTGGTTACTTCACCCAGGGAAAG
TACATAGGGGACAGGGAGTTTCTGGCTGAGACGGCTAAGAAGCTTGGCACAGACGGAGCA
GAAGTATTCCTCTCAGAGCCCAACAATGGAACCACAGAGGTAAAAGAAGAGCTGGAGAAG
TATTCGCAGAATATCACTGGGGTTCCACATTACACTATCAACGGGAAGGTGAAAATGAGC
GGTGCACAACCGCCTGAGACATTCCAGAGTGCGTTTGAAGCAGCTTTTTTTTAAAACACA
AAACAGTGAACTTAAGTAAAGATTTATGTATGCTCTGTTTGTAGTTTGAACTGCTGAGTT
CCAACTTTTCAAGAACTTAATGTAATAATGAATACAGGTTTGGTTTTTGATGGTTTTGCC
TGAACAACATTTAAAGTTACTTTTAAATACTATTTTACATCTTGCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET34TF U 1
AF RR2ET34JQ C 430
BS 1 644 RR2ET34TF
BS 645 645 RR2ET34JQ
BS 646 670 RR2ET34TF
BS 671 671 RR2ET34JQ
BS 672 708 RR2ET34TF
BS 709 709 RR2ET34JQ
BS 710 714 RR2ET34TF
BS 715 715 RR2ET34JQ
BS 716 762 RR2ET34TF
BS 763 949 RR2ET34JQ

RD RR2ET34TF 762 0 0
TCTTTGAAGGTGTATTGTATATTATATGATCTTGATAATATGATCTTGTGAGTTGTTTCT
CCCATAGACGATCACAATCATCTTCCTCCAATCGTTTCCAGCCAAAAAAAAAAACCTCCA
ATGGCCGAGTCTGCAAGCAGAAACTTTTCAAAAAAGCTCATCGAAATTGATATAAGCTCG
GATACGGTGTGCCCATGGTGCTTTGTGGGGAAGAAGAATCTTGACAAAGCCATTGATGCA
TCTAAAGGTCAATACAACTTTGAGATTCGATGGCATCCTTTTTTCCTCGATGCATCTGCA
CCCAAAGAAGGTGTGAACAAGAAAGAGTTTTATAGACAAAGGTTTGGAAGCAGAGTTGAA
GCAATGTTCAGAAGAATGTCTGAGATCTTCAAAGGTATTGGGTTAGAGTATGACACATCC
GGTCTCACAGGCAACACTCTGGATAGTCATAGACTCATACATTATGCGGGGAAACAAGCT
CCGGATAAACAACATAGCCTTGTTGAAGAGTTGTGTCTTGGTTACTTCACCCAGGGAAAG
TACATAGGGGACAGGGAGTTTCTGGCTGAGACGGCTAAGAAGCTTGGCACAGACGGAGCA
GAAGTATTCCTCTCAGAGCCCAACAATGGAACCACAGAGGTAAA*GAAGAGCTGGAGAAG
TATTCGCAGA*TATCACTGGGGTTCCACATTACACTATCAACGGGAAG*TGAAACTGAGC
GGTGCACAACCGCCTGAGACATTCCAGAGTGCGTTTGAAGCA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2ET34JQ 520 0 0
GGCAACACTCTGGATAGTCATAGACTCATACATTATGGGGGGAAACAAGCTCCGGATAAA
CAACATAGCCTTGTTGAAGAGTTGTGTTTTGGTTACTTCACCCAGGGAAAGTACATAGGG
GACAGGGAGTTTTTGGCTGAGACGGCTAAGAAGCTTGGCACAGACGGAGCAGAAGTATTC
CTTTCAGAGCCCAACAATGGAACCACAGAGGTAAAAGAAGAGCTGGAGAAGTATTCGCAG
AATATCACTGGGGTTCCACATTACACTATCAACGGGAAGGTGAAAATGAGCGGTGCACAA
CCGCCTGAGACATTCCAGAGTGGGTTTGAAGCAGCTTTTTTTTAAAACACAAAACAGTGA
ACTTAAGTAAAGATTTATGTATGCTCTGTTTGTAGTTTGAACTGCTGAGTTCCAACTTTT
CAAGAACTTAATGTAATAATGAATACAGGTTTGGTTTTTGATGGTTTTGCCTGAACAACA
TTTAAAGTTACTTTTAAATACTATTTTACATCTTGCTTTG

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 2

CO CL5650Contig1 327 2 4 U
GAAAACACCTTTGTCATTCATTAGCTACTCTTAAAGATTACATTACAGACTCTCTGACTC
ATCTAAAGACCCATGATCCCTGGTTCATCAGCTTACAAAAAGAGTTCATTTGATTCCTTC
TCCCGGAAATTTTTACTTAGATAGAAGAAGCCGAAGACCAGAACAATAGCTCAGATAAGA
AGCCAGCAAACCACCCATGAACTAAGACAGCAAAGCGGGAGGAGACACAGCTATGATTGT
CCCCAAGCCCCGATACTGAACACGCTCATAGGATCCAAAAGCTGCTGCGACTGTTGTTGT
TGCTGCTGCTGCTGATGCTCTTGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E958TF C 1
AF RR2E958JQ U 26
BS 1 25 RR2E958TF
BS 26 41 RR2E958JQ
BS 42 42 RR2E958TF
BS 43 327 RR2E958JQ

RD RR2E958TF 327 0 0
GAAAACACCTTTGTCATTCATTAGCTACTCTTAAAGATTACATTACAGACTCTCTGACTC
ATCTAAAGACCCATGATCCCTGGTTCATCAGCTTACAAAAAGAGTTCATTTGATTCCTTC
TCCCGGAAATTTTTACTTAGATAGAAGAAGCCGAAGACCAGAACAATAGCTCAGATAAGA
AGCCAGCAAACCACCCATGAACTAAGACAGCAAAGCGGGAGGAGACACAGCTATGATTGT
CCCCAAGCCCCGATACTGAACACGCTCATAGGATCCAGAAGCTGCTGCGACTGTTGTTGT
TGCTGCTGCTGCTGATGCTCTTGTTGC

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR2E958JQ 302 0 0
TACTCTTAAAGATTACGTTACAGACTCTCTGACTCATCTAAAGACCCATGATCCCTGGTT
CATCAGCTTACAAAAAGAGTTCATTTGATTCCTTCTCCCGGAAATTTTTACTTAGATAGA
AGAAGCCGAAGACCAGAACAATAGCTCAGATAAGAAGCCAGCAAACCACCCATGAACTAA
GACAGCAAAGCGGGAGGAGACACAGCTATGATTGTCCCCAAGCCCCGATACTGAACACGC
TCATAGGATCCAAAAGCTGCTGCGACTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGATGCTCTTGTT
GC

QA 1 302 1 302
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5652Contig1 774 2 2 U
GGGACCACCACCCAGATTCATCATCATCGTCATCCCCCAACTCGGTCTTGATCTTAAAGA
TTCGATAAATTTCTCATTTTTAAAAAAGGAAAGTTTACGACTTTGATTGGCTTCGATGAA
GGGTTTTGTCTGAATCATCATTTGTGGTCTCTCTGTTTCCGTACTTGAACGATTGAAAGA
AGAAGGAAGAACAGAGATGGGTTGTGCTGGATCGACGCAGTCTCAAGCAGAAGGGCCAGT
GAAGAAAATTAGGAAGCCGAAACTGTGGAAGCATACTCAACCGATCAGTAAAGCTGAGCT
TATGAAACTGAGAGAGGAGTTTTGGGACACTGCTCCTCACTATGGTGGTACCAAAGAGAT
ATGGGATGCACCTCGTGCTGCCGCTGAAGCTGACATATCTCTAGCGCAAGCAATCGTGGA
CAGTGCAGGAGTCATTGTTCAGAACAATGATCTCACTGTCTGCTATGACGAAAGAGGTGC
TAAGTATGAGCTGCCTAAGTATGTTCTAAGCGAGCCTACCAACTTGGTGGAAGAAAGTTG
ATTAAGGATCAATACCATTTCGAAAAGACAAAACAAAATGTAAATCTTGTGTGTAAGTAG
TTGCATTAGGATCCTCTGCTTTTGTCTATTTAACACTTTGAAAAAAAGGTTCCCACTGTT
CTCTCTCTGACCTTTACCTAAAGAGCTCAAATTGTTACTGTAATTCTAAAGACAATTGTT
ATATGTTTACATTAATGCGTTGACGAGGTAGTTTGGTCAGTAATGGTCATGGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AF17JQ C 1
AF RR2AF17TF U 1
BS 1 772 RR2AF17TF
BS 773 774 RR2AF17JQ

RD RR2AF17JQ 774 0 0
GGGACCACCACCCAGATTCATCATCATCGTCATCCCCCAACTCGGTCTTGATCTTAAAGA
TTCGATAAATTTCTCATTTTTAAAAAAGGAAAGTTTACGACTTTGATTGGCTTCGATGAA
GGGTTTTGTCTGAATCATCATTTGTGGTCTCTCTGTTTCCGTACTTGAACGATTGAAAGA
AGAAGGAAGAACAGAGATGGGTTGTGCTGGATCGACGCAGTCTCAAGCAGAAGGGCCAGT
GAAGAAAATTAGGAAGCCGAAACTGTGGAAGCATACTCAACCGATCAGTAAAGCTGAGCT
TATGAAACTGAGAGAGGAGTTTTGGGACACTGCTCCTCACTATGGTGGTACCAAAGAGAT
ATGGGATGCACCTCGTGCTGCCGCTGAAGCTGACATATCTCTAGCGCAAGCAATCGTGGA
CAGTGCAGGAGTCATTGTTCAGAACAATGATCTCACTGTCTGCTATGACGAAAGAGGTGC
TAAGTATGAGCTGCCTAAGTATGTTTTAAGCGAGCCTACCAACTTGGTGGAAGAAAGTTG
ATTAAGGATCAATACCATTTCGAAAAGACAAAACAAAATGTAAATCTTGTGTGTAAGTAG
TTGCATTAGGATCCTCTGCTTTTGTCTATTTAACACTTTGAAAAAAAGGTTCCCACTGTT
CTCTCTCTGACCTTTACCTAAAGAGCTCAAATTGTTACTGTAATTCTAAAGACAATTGTT
ATATGTTTACATTAATGCGTTGACGAGGTAGTTTGGTCAGTAATGGTCATGGTC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2AF17TF 772 0 0
GGGACCACCACCCAGATTCATCATCATCGTCATCCCCCAACTCGGTCTTGATCTTAAAGA
TTCGATAAATTTCTCATTTTTAAAAAAGGAAAGTTTACGACTTTGATTGGCTTCGATGAA
GGGTTTTGTCTGAATCATCATTTGTGGTCTCTCTGTTTCCGTACTTGAACGATTGAAAGA
AGAAGGAAGAACAGAGATGGGTTGTGCTGGATCGACGCAGTCTCAAGCAGAAGGGCCAGT
GAAGAAAATTAGGAAGCCGAAACTGTGGAAGCATACTCAACCGATCAGTAAAGCTGAGCT
TATGAAACTGAGAGAGGAGTTTTGGGACACTGCTCCTCACTATGGTGGTACCAAAGAGAT
ATGGGATGCACCTCGTGCTGCCGCTGAAGCTGACATATCTCTAGCGCAAGCAATCGTGGA
CAGTGCAGGAGTCATTGTTCAGAACAATGATCTCACTGTCTGCTATGACGAAAGAGGTGC
TAAGTATGAGCTGCCTAAGTATGTTCTAAGCGAGCCTACCAACTTGGTGGAAGAAAGTTG
ATTAAGGATCAATACCATTTCGAAAAGACAAAACAAAATGTAAATCTTGTGTGTAAGTAG
TTGCATTAGGATCCTCTGCTTTTGTCTATTTAACACTTTGAAAAAAAGGTTCCCACTGTT
CTCTCTCTGACCTTTACCTAAAGAGCTCAAATTGTTACTGTAATTCTAAAGACAATTGTT
ATATGTTTACATTAATGCGTTGACGAGGTAGTTTGGTCAGTAATGGTCATGG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL5653Contig1 1058 2 4 U
GCTTCAGACTCGCTATGGAAGCACACAGTGTGGCTACGAAGAAGAACAAAGAATGGCAGG
AGAAGCTTCCTGTTGTTGTCTTGAAAGCCGAGGAAATCATGTACTCTAAAGCCAGCTCCG
AGGAAGAGTATACAGATGTTGATACTGTGGAATAGAGTCAATGATGCTATTGACACAATT
ATTAGAAGAGATGAAAGCACTGAGACTGGCCCTCTTTTGCCTCCTTGTGTTGAAGCTGCT
CTTAACCTTGGGTGCATTGCTGTAAGAGCTTCAAGAAGCCAACGACATAGAAACGTCAGG
ACTTACCTCTCTCCAAAATACCAACAACCTGTTTCTGCATCTGCTAATGAGCCGCAAAAG
ACTAACAAGCCAATCCATACCGCTCAACCTGCAACCCCAGTGGAGGTTCTTGAGGACAGC
AACAACCGAGGAGTAACGTTTCTACATGAAAAGCCATTGGCTAGAAAACTAGGGACTGTC
ACTGCTGCTCCAGGTACAGCACCAGCGCCAACCAACTTGGGTTCGGTGTATCCTTTGTAT
TACGGAGGTATTAATCAGACTCGGCAAGTGGACATGACTTCAAGAGTCCCTGAGACGCCT
ATAATCATTGGCATGCCTGTTAGTATAAAGGCTCCGGAAGAAAGAACAGAGAGGTTCTGT
GATTTGTCTTTGAGGCTTGGTGTATCTTCAGATCATCCACCCTCCACAAAAATAGATGTT
GGGTCTAGCCGAGCTTACCAAGGAAGAAACCAACAAGAGTTATGTTTGTTCTCTGAGGTG
AAGAAGAAACATGATTCGTTTTCAAATTACCAAGGCCAGCATTCAGATAAAAAACACAAA
ACATTTTGTGGAGACTTCCTCTAGGGATTTTTGCTCAAAACCTGTAAAACTTTCAGGTTT
ATTGGTTGATATATGATCGACTCTCTAGAACGATTATCAAATCTACTCTGTTTACATCAA
ATAGGCAATACGGATGAGAAAATTTCTTCACCAGTTTTGCTTTTGTTAGTGCAAATCTCT
TTAACACATATATCACGAATTCAAAGTCATTTTTAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT33TF U 1
AF RR2BT33JQ C 410
BS 1 674 RR2BT33TF
BS 675 675 RR2BT33JQ
BS 676 704 RR2BT33TF
BS 705 1058 RR2BT33JQ

RD RR2BT33TF 711 0 0
GCTTCAGACTCGCTATGGAAGCACACAGTGTGGCTACGAAGAAGAACAAAGAATGGCAGG
AGAAGCTTCCTGTTGTTGTCTTGAAAGCCGAGGAAATCATGTACTCTAAAGCCAGCTCCG
AGGAAGAGTATACAGATGTTGATACTGTGGAATAGAGTCAATGATGCTATTGACACAATT
ATTAGAAGAGATGAAAGCACTGAGACTGGCCCTCTTTTGCCTCCTTGTGTTGAAGCTGCT
CTTAACCTTGGGTGCATTGCTGTAAGAGCTTCAAGAAGCCAACGACATAGAAACGTCAGG
ACTTACCTCTCTCCAAAATACCAACAACCTGTTTCTGCATCTGCTAATGAGCCGCAAAAG
ACTAACAAGCCAATCCATACCGCTCAACCTGCAACCCCAGTGGAGGTTCTTGAGGACAGC
AACAACCGAGGAGTAACGTTTCTACATGAAAAGCCATTGGCTAGAAAACTAGGGACTGTC
ACTGCTGCTCCAGGTACAGCACCAGCGCCAACCAACTTGGGTTCGGTGTATCCTTTGTAT
TACGGAGGTATTAATCAGACTCGGCAAGTGGACATGACTTCAAGAGTCCCTGAGACGCCT
ATAATCATTGGCATGCCTGTTAGTATAAAGGCTCCGGAAGAAAGAACAGAGAGGTTCTGT
GATTTGTCTTTGAG*CTTGGTGTATCTTCAGATCATCCACCCTC
ACAAAAA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2BT33JQ 649 0 0
TTGAGGACAGCAACAACCGAGGAGTAACGTTTCTACATGAAAAGCCATTGGCTAGAAAAC
TAGGGACTGTCACTGCTGCTCCAGGTACAGCACCAGCGCCAACCAACTTGGGTTCGGTGT
ATCCTTTGTATTACGGAGGTATTAATCAGACTCGGCAAGTGGACATGACTTCAAGAGTCC
CTGAGACGCCTATAATCATTGGCATGCCTGTTAGTATAAAGGCTCCGGAAGAAAGAACAG
AGAGGTTCTGTGATTTGTCTTTGAGGCTTGGTGTATCTTCAGATCATCCACCCTCCACAA
AAATAGATGTTGGGTCTAGCCGAGCTTACCAAGGAAGAAACCAACAAGAGTTATGTTTGT
TCTCTGAGGTGAAGAAGAAACATGATTCGTTTTCAAATTACCAAGGCCAGCATTCAGATA
AAAAACACAAAACATTTTGTGGAGACTTCCTCTAGGGATTTTTGCTCAAAACCTGTAAAA
CTTTCAGGTTTATTGGTTGATATATGATCGACTCTCTAGAACGATTATCAAATCTACTCT
GTTTACATCAAATAGGCAATACGGATGAGAAAATTTCTTCACCAGTTTTGCTTTTGTTAG
TGCAAATCTCTTTAACACATATATCACGAATTCAAAGTCATTTTTAGTG

QA 1 649 1 649
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5655Contig1 790 2 4 U
GGACACACGTCTTTCTCCATAACTCTCGTCTTCTCATCAGAGGTCGCAGAGATTTTCATC
TCCGAGAATTGAATCCAATGTCGTTCGAGGAGCAACAAGGCGAGGTGGAGGAGGAGACAT
TCGAGCACACACTCCTCGTGGTGCGCGAGGTCTCCGTCTACAAGATCCCGCCGCGAACCA
CGTCCGGCGGGTACAAGTGCGGCGAATGGCTCCAGTCCGATAAGATCTGGTCCGGCAGGC
TCCGCGTCGTGTCCTGCAAGGACCGATGCGAGATCCGGCTCGAGGACTCGAGCTCCGGCG
ACCTGTTCGCGGCTTGTTTCGTGGATCCGGAGAGGAGAGAGAACTCCGTGGAGCCGTCGC
TCGACTCGTCGAGGTATTTCGTGCTCAGGATCGGCGACGGGCGAGGGAAGCACGCGTTCA
TCGGGCTGGGGTTCGCGGAGAGGAACGAGGCGTTCGATTTCAACGTGGCGCTGTCGGATC
ACGAGAAGTATGTGAGGAGGGAGAAGGAGAAGGAGAGTGGGGAGTCGAGTGAGAGCGACG
ATCACATTGATATCCATCCCGCCGTTAATCACAGATTGAAGTGATTCGTTCAGATGCTTC
AAGTAGATCTGCTCTTGTTCGTATCATCTTTGGAGTTGTTCGATGCATCGTTGGCAATGA
GATTGATCACAGAGAGAATTTGATTATTAGTGTAATTGGTGTTTAGATTGCCTGTAATGT
TATGGTTCGTGCAGATATTATAATGAGTAATCTTGTCACCGTGTGTGTTGGTGATTTCTG
ATCTCTGAGT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY63TF U 1
AF RR2FV19TF U 2
BS 1 253 RR2DY63TF
BS 254 254 RR2FV19TF
BS 255 284 RR2DY63TF
BS 285 790 RR2FV19TF

RD RR2DY63TF 284 0 0
GGACACACGTCTTTCTCCATAACTCTCGTCTTCTCATCAGAGGTCGCAGAGATTTTCATC
TCCGAGAATTGAATCCAATGTCGTTCGAGGAGCAACAAGGCGAGGTGGAGGAGGAGACAT
TCGAGCACACACTCCTCGTGGTGCGCGAGGTCTCCGTCTACAAGATCCCGCCGCGAACCA
CGTCCGGCGGGTACAAGTGCGGCGAATGGCTCCAGTCCGATAAGATCTGGTCCGGCAGGC
TCCGCGTCGTGTCTTGCAAGGACCGATGCGAGATCCGGCTCGAG

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2FV19TF 789 0 0
GACACACGTCTTTCTCCATAACTCTCGTCTTCTCATCAGAGGTCGCAGAGATTTTCATCT
CCGAGAATTGAATCCAATGTCGTTCGAGGAGCAACAAGGCGAGGTGGAGGAGGAGACATT
CGAGCACACACTCCTCGTGGTGCGCGAGGTCTCCGTCTACAAGATCCCGCCGCGAACCAC
GTCCGGCGGGTACAAGTGCGGCGAATGGCTCCAGTCCGATAAGGTCTGGTCCGGCAGGCT
CCGCGTCGTGTCCTGCAAGGACCGATGCGAGATCCGGCTCGAGGACTCGAGCTCCGGCGA
CCTGTTCGCGGCTTGTTTCGTGGATCCGGAGAGGAGAGAGAACTCCGTGGAGCCGTCGCT
CGACTCGTCGAGGTATTTCGTGCTCAGGATCGGCGACGGGCGAGGGAAGCACGCGTTCAT
CGGGCTGGGGTTCGCGGAGAGGAACGAGGCGTTCGATTTCAACGTGGCGCTGTCGGATCA
CGAGAAGTATGTGAGGAGGGAGAAGGAGAAGGAGAGTGGGGAGTCGAGTGAGAGCGACGA
TCACATTGATATCCATCCCGCCGTTAATCACAGATTGAAGTGATTCGTTCAGATGCTTCA
AGTAGATCTGCTCTTGTTCGTATCATCTTTGGAGTTGTTCGATGCATCGTTGGCAATGAG
ATTGATCACAGAGAGAATTTGATTATTAGTGTAATTGGTGTTTAGATTGCCTGTAATGTT
ATGGTTCGTGCAGATATTATAATGAGTAATCTTGTCACCGTGTGTGTTGGTGATTTCTGA
TCTCTGAGT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL5656Contig1 342 2 2 U
CGAACAGGGGAAAACAATTACAGGTAGTAGCAGTTGTGTTGTTGTATATTACACCCACTC
AAATTCTAATCTAAAGAGAAAAAAACAGTTCACTTACCAAATTGGGAATAAAATAAGACT
GACAAAAAGCCCCCATCGAAGGATGATACATGTATATATTCTCCCTCTCTACTGCTTTTT
TATATAGAGATGTATGTCCATCATAACTGGATGTTTTTTTTCCTCTTTATTGATAATTCC
TCTAGTCGCATTTGATGTTTCTGTAGATTCTCCTCACAAACAGGTTTGATCCCAAGAATC
CAACAGCTCCGCAAAGGATTCCAAGGCCAAGACAGAACATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C847TF C 1
AF RR2C847JQ U 68
BS 1 67 RR2C847TF
BS 68 342 RR2C847JQ

RD RR2C847TF 342 0 0
CGAACAGGGGAAAACAATTACAGGTAGTAGCAGTTGTGTTGTTGTATATTACACCCACTC
AAATTCTAATCTAAAGAGAAAAAAACAGTTCACTTACCAAATTGGGAATAAAATAAGACT
GACAAAAAGCCCCCATCGAAGGATGATACATGTATATATTCTCCCTCTCTACTGCTTTTT
TATATAGAGATGTATGTCCATCATAACTGGATGTTTTTTTTCCTCTTTATTGATAATTCC
TCTAGTCGCATTTGATGTTTCTGTAGATTCTCCTCACAAACAGGTTTGATCCCAAGAATC
CAACAGCTCCGCAAAGGATTCCAAGGCCAAGACAGAACATCC

QA 1 342 1 342
DS 

RD RR2C847JQ 275 0 0
AATCTAAAGAGAAAAAAACAGTTCACTTACCAAATTGGGAATAAAATAAGACTGACAAAA
AGCCCCCATCGAAGGATGATACATGTATATATTCTCCCTCTCTACTGCTTTTTTATATAG
AGATGTATGTCCATCATAACTGGATGTTTTTTTTCCTCTTTATTGATAATTCCTCTAGTC
GCATTTGATGTTTCTGTAGATTCTCCTCACAAACAGGTTTGATCCCAAGAATCCAACAGC
TCCGCAAAGGATTCCAAGGCCAAGACAGAACATCC

QA 1 275 1 275
DS 



AS 1 2

CO CL5657Contig1 717 2 5 U
GGAACACTTTCTTCATCAATTACATTTACACTCTCATTGTTATCTTTCACATTTTCATAG
ACAAAAATATGGTGCGCCAAATGAAATCATTTCTCTTCCTATTTATTGTCCTTGTTCTAT
CAGAAACTGTCATATCAGCTCGAAAACCATCCAAAACTCAATCAAAACCTTGCAAAAACT
TCGTCCTCTACTATCATGACATAATGTTTGGGGTCGATGACGTGCAAAACGCGACATCTG
CTGCCGTTACAAACCCTCCGGGACTCGGAAATTTCAAATTCGGAAAGCTCGTGATCTTCG
ACGATCCAGTGACCATAGACAAAAACTATCAATCCGAACCTGTTGCACGTGCTCAGGGGT
TCTATTTCTACGACATGAAGAATGATTACAATGCGTGGTTCTCATACACACTTGTGTTTA
ACTCGACTCAACACAAAGGGACGTTGAACATAATGGGAGCAGATCTTATGATGGAGAAGA
CACGAGATTTGTCTGTGGTCGGAGGGACAGGTGATTTCTTCATGTCCCGAGGGATTGTTA
CGTTTGAAACTGACACCTTTGAAGGCGCGAAGTATTTTAGAGTCAAGATGGATATCAAAC
TCTATGACTGTTATTAAAAAAATGAAAAAAAAATGGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGA
TTACTCTGGCCTTGTGATGATTGAATAAGCTTAAGCTATGTAACAATCTTATTTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DK91TF U 1
AF RR2DK91JQ C 43
BS 1 621 RR2DK91TF
BS 622 622 RR2DK91JQ
BS 623 632 RR2DK91TF
BS 633 633 RR2DK91JQ
BS 634 717 RR2DK91TF

RD RR2DK91TF 717 0 0
GGAACACTTTCTTCATCAATTACATTTACACTCTCATTGTTATCTTTCACATTTTCATAG
ACAAAAATATGGTGCGCCAAATGAAATCATTTCTCTTCCTATTTATTGTCCTTGTTCTAT
CAGAAACTGTCATATCAGCTCGAAAACCATCCAAAACTCAATCAAAACCTTGCAAAAACT
TCGTCCTCTACTATCATGACATAATGTTTGGGGTCGATGACGTGCAAAACGCGACATCTG
CTGCCGTTACAAACCCTCCGGGACTCGGAAATTTCAAATTCGGAAAGCTCGTGATCTTCG
ACGATCCAGTGACCATAGACAAAAACTATCAATCCGAACCTGTTGCACGTGCTCAGGGGT
TCTATTTCTACGACATGAAGAATGATTACAATGCGTGGTTCTCATACACACTTGTGTTTA
ACTCGACTCAACACAAAGGGACGTTGAACATAATGGGAGCAGATCTTATGATGGAGAAGA
CACGAGATTTGTCTGTGGTCGGAGGGACAGGTGATTTCTTCATGTCCCGAGGGATTGTTA
CGTTTGAAACTGACACCTTTGAAGGCGCGAAGTATTTTAGAGTCAAGATGGATATCAAAC
TCTATGACTGTTATTAAAAAA*TGAAAAAAAA*TGGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGA
TTACTCTGGCCTTGTGATGATTGAATAAGCTTAAGCTATGTAACAATCTTATTTGGG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2DK91JQ 675 0 0
TCTTTCACATTTTCATAGACAAAAATATGGTGCGCCAAATGAAATCATTTCTCTTCCTAT
TTATTGTCCTTGTTCTATCAGAAACTGTCATATCAGCTCGAAAACCATCCAAAACTCAAT
CAAAACCTTGCAAAAACTTCGTCCTCTACTATCATGACATAATGTTTGGGGTCGATGACG
TGCAAAACGCGACATCTGCTGCCGTTACAAACCCTCCGGGACTCGGAAATTTCAAATTCG
GAAAGCTCGTGATTTTCGACGATCCAGTGACCATAGACAAAAACTATCAATCCGAACCTG
TTGCACGTGCTCAGGGGTTCTATTTTTACGACATGAAGAATGATTACAATGCGTGGTTTT
CATACACACTTGTGTTTAACTCGACTCAACACAAAGGGACGTTGAACATAATGGGAGCAG
ATCTTATGATGGAGAAGACACGAGATTTGTCTGTGGTCGGAGGGACAGGTGATTTCTTCA
TGTCCCGAGGGATTGTTACGTTTGAAACTGACACCTTTGAAGGCGCGAAGTATTTTAGAG
TCAAGATGGATATCAAACTCTATGACTGTTATTAAAAAAATGAAAAAAAAATGGGAGTGT
GTGTGTGTGTGTGTTTGATTACTCTGGCCTTGTGATGATTGAATAAGCTTAAGCTATGTA
ACAATCTTATTTGGG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL5658Contig1 504 2 1 U
GGAGGCAGGGGAAGACGAAACAACCCTAGAGAAAGATGGGGGCGATGCGGAGTGTACGAT
CCTCTGTTGCCAATTTGAAGGGTAGGATTGGTCAATTCATGAAACGTGTGTGGGTACAAG
GGGTCGAGCAGAAACCAGGCCAAGCTTTCCTAGTAGTAGCCGGTACAATGGGGTACGCTT
TCCATGACCAGTATGATAGGGTGCGCAAGATAAGAAAGAAACTTCTTGAACAAGAAGCGG
AATGTGAGATCATGAGGAAACGGGTTCTTGAGAGAAATGCAAATTATCATGCTAAAAAGG
ATGATTTGTTGATGCAGATGGCTGTCGACTTTTTCTCGATAAAGAAGAAGTGAGGTTGCG
GACAAGTCAAGTAATCAAAACAATCATATATGCTCTGGCTTATGTAATAATACTTGTGGC
AAACACCTATTTCAGAAGGTGGATTTGTTTATGTGTGGAAAAGATGATCCTTGAACATAA
CAAAGACCAGGCTTATTCTTGGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DA50JQ C 1
AF RR2DA50TF U 1
BS 1 504 RR2DA50TF

RD RR2DA50JQ 504 0 0
GGAGGCAGGGGAAGACGAAACAACCCTAGAGAAAGATGGGGGCGATGCGGAGTGTACGAT
CCTCTGTTGCCAATTTGAAGGGTAGGATTGGTCAATTCATGAAACGTGTGTGGGTACAAG
GGGTCGAGCAGAAACCAGGCCAAGCTTTCCTAGTAGTAGCCGGTACAATGGGGTACGCTT
TCCATGACCAGTATGATAGGGTGCGCAAGATAAGAAAGAAACTTCTTGAACAAGAAGCGG
AATGTGAGATCATGAGGAAACGGGTTCTTGAGAGAAATGCAAATTATCATGCTAAAAAGG
ATGATTTGTTGATGCAGATGGCTGTCGACTTTTTCTCGATAAAGAAGAAGTGAGGTTGCG
GACAAGTCAAGTAATCAAAACAATCATATATGCTCTGGCTTATGTAATAATACTTGTGGC
AAACACCTATTTCAGAAGGTGGATTTGTTTATGTGTGGAAAAGATGATCCTTGAACATAA
CAAAGACCAGGCTTATTCTTGGCC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2DA50TF 504 0 0
GGAGGCAGGGGAAGACGAAACAACCCTAGAGAAAGATGGGGGCGATGCGGAGTGTACGAT
CCTCTGTTGCCAATTTGAAGGGTAGGATTGGTCAATTCATGAAACGTGTGTGGGTACAAG
GGGTCGAGCAGAAACCAGGCCAAGCTTTCCTAGTAGTAGCCGGTACAATGGGGTACGCTT
TCCATGACCAGTATGATAGGGTGCGCAAGATAAGAAAGAAACTTCTTGAACAAGAAGCGG
AATGTGAGATCATGAGGAAACGGGTTCTTGAGAGAAATGCAAATTATCATGCTAAAAAGG
ATGATTTGTTGATGCAGATGGCTGTCGACTTTTTCTCGATAAAGAAGAAGTGAGGTTGCG
GACAAGTCAAGTAATCAAAACAATCATATATGCTCTGGCTTATGTAATAATACTTGTGGC
AAACACCTATTTCAGAAGGTGGATTTGTTTATGTGTGGAAAAGATGATCCTTGAACATAA
CAAAGACCAGGCTTATTCTTGGCC

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL5659Contig1 456 2 2 U
GGAACGTAGCAACCAGCACAGAGATAGGAGCCAATCGCAAATCCTTCCTCCCTGATTTTG
GTGGGCGTTGAGGAGACATCATCAGAAATGTCAAGCGTAGAGGATGTGAAAGAGCAAGGG
AACCTCACCAATGACGCAGATAATTCAATGCCATCATCACAGCAAGAGGAGGCTGCTGTA
AAGAACAAGTATGGAGGACTTATGCCAAAGAAACCACCTCTCATTTCCAAGGATCATGAA
CGAGCATACTTTGACTCAGCTGATTGGGCTCTTGGAAAGCAAGGTGTTGCTAAGCCAAAA
GGACCCTTAGAAGCTCTTCGTCCCAAGTTACAGCCAACGCAGCAGCAGACGCGTTACAGG
AAGTCTCCATGTGCTCCATCCGGTGAAGATGGAGGAGCTGCTCAGGGCGAATGAGTTTCC
GAGAACGAGGAGTAGAGACCAGAGAGAGAGAGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC05TF U 1
AF RR2GC05JQ C 64
BS 1 329 RR2GC05TF
BS 330 456 RR2GC05JQ

RD RR2GC05TF 329 0 0
GGAACGTAGCAACCAGCACAGAGATAGGAGCCAATCGCAAATCCTTCCTCCCTGATTTTG
GTGGGCGTTGAGGAGACATCATCAGAAATGTCAAGCGTAGAGGATGTGAAAGAGCAAGGG
AACCTCACCAATGACGCAGATAATTCAATGCCATCATCACAGCAAGAGGAGGCTGCTGTA
AAGAACAAGTATGGAGGACTTATGCCAAAGAAACCACCTCTCATTTCCAAGGATCATGAA
CGAGCATACTTTGACTCAGCTGATTGGGCTCTTGGAAAGCAAGGTGTTGCTAAGCCAAAA
GGACCCTTAGAAGCTCTTCGTCCCAAGTT

QA 1 329 1 329
DS 

RD RR2GC05JQ 393 0 0
GGCGTTGAGGAGACATCATCAGAAATGTCAAGCGTAGAGGATGTGAAAGAGCAAGGGAAC
CTCACCAATGACGCAGATAATTCAATGCCATCATCACAGCAAGAGGAGGCTGCTGTAAAG
AACAAGTATGGAGGACTTATGCCAAAGAAACCACCTCTCATTTCCAAGGATCATGAACGA
GCATACTTTGACTCAGCTGATTGGGCTCTTGGAAAGCAAGGTGTTGCTAAGCCAAAAGGA
CCCTTAGAAGCTTTTCGTCCCAAGTTACAGCCAACGCAGCAGCAGACGCGTTACAGGAAG
TCTCCATGTGCTCCATCCGGTGAAGATGGAGGAGCTGCTCAGGGCGAATGAGTTTCCGAG
AACGAGGAGTAGAGACCAGAGAGAGAGAGAGAG

QA 1 393 1 393
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5661Contig1 876 2 2 U
GCATCGACACTGATTTCGACGGCTGTATGAAGCTGATCAGAGAGATAACCGCTGAGTTAC
CTATCTACTTGGCGAACTCGTTGAATAGTTTGAGGCTAGAAGGGCAGAAGACTGCGGCGA
TTGAGATTCTTCAGCAGTTTGATTGGCAAGTTCCTGATTGGGTGATTGTTCCCGGCGGCA
ATCTCGGTAACATCTACGCTTTCTACAAAGGTTTCAAGATGTGTCAAGAGCTTGGACTCG
TCGACAGGATCCCGAGGATGGTTTGTGCTCAGGCGGCTAATGCGAATCCTCTTTACTTGC
ATTACAAGTCTGGTTGGAAGGACTTCAAGCCCATGACCGCGAGTACCACTTTCGCCTCTG
CGATTCAGATCGGTGACCCTGTGTCCATCGATAGAGCCGTGTACGCTCTAAAAAAGTGTG
ACGGGATTGTGGAGGAAGCGACGGAGGAGGAGCTGATGGATGCGATGGCTCAGGCGGATT
CTACTGGGATGTTTATCTGTCCTCATACGGGTGTGGCTTTGACCGCTTTGTTTAAGCTGA
GGAACAGAGGAGTGATTGCGCCGACTGATAGGACTGTGGTTGTGAGTACTGCTCATGGGT
TGAAGTTTACTCAGTCGAAGATTGATTATCACTCCAAAGCCATCCCTGACATGGCGTGCA
GATTCTCTAATCCTCCTGTTGAAGTGAAAGCTGATTTTGGAGCTGTTATGGATGTTCTCA
AGAGTTACTTAGGAAGCCAGACACTTAGGCCATAAGAAACAGACCAATCTTGTTTCGTTT
TGTTTTGTTTTTTGAAAACTGTTAGTTGTTGTTTGTGTACTCATAAACTGCTCGTTATCT
CAGTTTTATAATAAGCTCTCAAGCAAAGTTTGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A724TF U 1
AF RR2A724JQ C 110
BS 1 384 RR2A724TF
BS 385 876 RR2A724JQ

RD RR2A724TF 384 0 0
GCATCGACACTGATTTCGACGGCTGTATGAAGCTGATCAGAGAGATAACCGCTGAGTTAC
CTATCTACTTGGCGAACTCGTTGAATAGTTTGAGGCTAGAAGGGCAGAAGACTGCGGCGA
TTGAGATTCTTCAGCAGTTTGATTGGCAAGTTCCTGATTGGGTGATTGTTCCCGGCGGCA
ATCTCGGTAACATCTACGCTTTCTACAAAGGTTTCAAGATGTGTCAAGAGCTTGGACTCG
TCGACAGGATCCCGAGGATGGTTTGTGCTCAGGCGGCTAATGCGAATCCTCTTTACTTGC
ATTACAAGTCTGGTTGGAAGGACTTCAAGCCCATGACCGCGAGTACCACTTTCGCCTCTG
CGATTCAGATCGGTGACCCTGTGT

QA 1 384 1 384
DS 

RD RR2A724JQ 767 0 0
GACTGCGGCGATTGAGATTCTTCAGCAGTTTGATTGGCAAGTTCCTGATTGGGTGATTGT
TCCCGGCGGCAATCTCGGTAACATCTACGCTTTCTACAAAGGTTTCAAGATGTGTCAAGA
GCTTGGACTCGTCGACAGGATCCCGAGGATGGTTTGTGCTCAGGCGGCTAATGCGAATCC
TCTTTACTTGCATTACAAGTCTGGTTGGAAGGACTTCAAGCCCATGACCGCGAGTACCAC
TTTCGCCTCTGCGATTCAGATCGGTGACCCTGTGTCCATCGATAGAGCCGTGTACGCTCT
AAAAAAGTGTGACGGGATTGTGGAGGAAGCGACGGAGGAGGAGCTGATGGATGCGATGGC
TCAGGCGGATTCTACTGGGATGTTTATCTGTCCTCATACGGGTGTGGCTTTGACCGCTTT
GTTTAAGCTGAGGAACAGAGGAGTGATTGCGCCGACTGATAGGACTGTGGTTGTGAGTAC
TGCTCATGGGTTGAAGTTTACTCAGTCGAAGATTGATTATCACTCCAAAGCCATCCCTGA
CATGGCGTGCAGATTCTCTAATCCTCCTGTTGAAGTGAAAGCTGATTTTGGAGCTGTTAT
GGATGTTCTCAAGAGTTACTTAGGAAGCCAGACACTTAGGCCATAAGAAACAGACCAATC
TTGTTTCGTTTTGTTTTGTTTTTTGAAAACTGTTAGTTGTTGTTTGTGTACTCATAAACT
GCTCGTTATCTCAGTTTTATAATAAGCTCTCAAGCAAAGTTTGAACC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL5662Contig1 626 2 1 U
GGAAACCTAATAGAGAAAAAAAAAACACGGATCTCCGTAAGAAAAAGAGAGAGAAGAAAT
GGTGCGTTTCTCAACTGCAACGATGATCTTTGCCGCGGCCATGACGGCGATGGTTTTGGT
TTCGTTGCCGGAGGTGGAAGCGCAAACGACTACTACTTGCGTGAACAAGCTAGTCCCCTG
CTTCAGTGCTCTGACGACGACGACGAGGCCACCAAAGGAATGCTGTGACTCGATCAAGGA
AGCGGTGAAAAATGAGCTTCAATGTCTCTGCACCGTCTATAACACTCCTGGTTTGCTCTC
TGGGTTCAACGTCTCTACTGACCAAGCTCTCAATCTCAGCCGTCGATGTGACGTCACCAC
CGATCTCTCCGCTTGTTCCGGTACTGGAGCTTCATCGCCAAAGGCCTCTTTACCTCCTCC
AGGAAACAAAGGAAAAGACACCGCAGCTGGGAACAAGCTCGCTGGTTATGGAGTCACCAC
CGTGATCTTCTCTTTGTTTTTCACCAATTTCTTTTGAAAAAAAAACCTGGAATTACCTGG
TTTTCCGATTGTTAACCGGATTTATTATTAGCTCATATTTGACCTTATATTAAGGGTAAA
ATAAAGTTTTCTTTTGTTCACGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GF70TF U 1
AF RR2GF70JQ C 10
BS 1 626 RR2GF70TF

RD RR2GF70TF 626 0 0
GGAAACCTAATAGAGAAAAAAAAAACACGGATCTCCGTAAGAAAAAGAGAGAGAAGAAAT
GGTGCGTTTCTCAACTGCAACGATGATCTTTGCCGCGGCCATGACGGCGATGGTTTTGGT
TTCGTTGCCGGAGGTGGAAGCGCAAACGACTACTACTTGCGTGAACAAGCTAGTCCCCTG
CTTCAGTGCTCTGACGACGACGACGAGGCCACCAAAGGAATGCTGTGACTCGATCAAGGA
AGCGGTGAAAAATGAGCTTCAATGTCTCTGCACCGTCTATAACACTCCTGGTTTGCTCTC
TGGGTTCAACGTCTCTACTGACCAAGCTCTCAATCTCAGCCGTCGATGTGACGTCACCAC
CGATCTCTCCGCTTGTTCCGGTACTGGAGCTTCATCGCCAAAGGCCTCTTTACCTCCTCC
AGGAAACAAAGGAAAAGACACCGCAGCTGGGAACAAGCTCGCTGGTTATGGAGTCACCAC
CGTGATCTTCTCTTTGTTTTTCACCAATTTCTTTTGAAAAAAAAACCTGGAATTACCTGG
TTTTCCGATTGTTAACCGGATTTATTATTAGCTCATATTTGACCTTATATTAAGGGTAAA
ATAAAGTTTTCTTTTGTTCACGTGCC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2GF70JQ 617 0 0
TAGAGA
AAAAAAAAAACACGGATCTCCGTAAGAAAAAGAGAGAGAAGAAATGGTGCGTTTCTCAAC
TGCAACGATGATCTTTGCCGCGGCCATGACGGCGATGGTTTTGGTTTCGTTGCCGGAGGT
GGAAGCGCAAACGACTACTACTTGCGTGAACAAGCTAGTCCCCTGCTTCAGTGCTCTGAC
GACGACGACGAGGCCACCAAAGGAATGCTGTGACTCGATCAAGGAAGCGGTGAAAAATGA
GCTTCAATGTCTCTGCACCGTCTATAACACTCCTGGTTTGCTCTCTGGGTTCAACGTCTC
TACTGACCAAGCTCTCAATTTCAGCCGTCGATGTGACGTCCCCACCGATCTCTCCGCTTG
TTCCGGTACTGGAGCTTCATCGCCAAAGGCCTCTTTACCTCCTCCAGGAAACAAAGGAAA
AGACACCGCAGCTGGGAACAAGCTCGCTGGTTATGGAGTCACCCCCGTGATCTTCTCTTT
GTTTTTCACCAATTTCTTTTGAAAAAAAAACCTGGAATTACCTGGTTTTCCGATTGTTAA
CCGGATTTATTATTAGCTCATATTTGACCTTATATTAAGGGTAAAATAAAGTTTTCTTTT
GTTCACGTGCC

QA 7 617 7 617
DS 



AS 1 2

CO CL5663Contig1 1137 2 4 U
GGGAGAAGGGAAAAAACAATGGAGAAGAAGACGAAAGTGGTGATTGTGGGAGGTACGGGC
TACTTGGGTCAGCATCTTCTTCAAGCTTTCGCCGGAGATCGTTACGACGTCGCTTTCACT
CATCACTCTTGTCCCCTTCCGCGCCTCTTGCTCGACGCTTTCCCACATTTCTCATCTTTT
CATGTCGATCTCAAAACCGGTCTTGGTTTCAATTCCATCTCCCACCACTTCGGCCAGCCG
GACGTGGTCGTGAATTGTGCAGCTCTCTCTGTTCCTCGAGTTTGTGAGCAAGATCCAGAT
TCCGCCACCTCCATCAACGTCCCTTCTTCCCTTGTTAACTGGCTGTCATCATCTTTTCAG
ACAAAAAACAAAACCTTGTTGATTCATCTCTCTACTGATCAAGTTTATGAAGGTGTCAAG
TCTTTCTACAAGGAAGAAGACGAGACTCTTGCTGTAAACGTATACGGTAAATCTAAAGTT
GCAGCAGAGCTTCTCATCAGAGATAAATTTCAAAACTTTGCTATATTGAGGAGTAGTATC
ATCTTTGGTCCTCAGACTCTATCACCACTCCCTAAGAATCTCCCCGTTCAGTGGATGGAT
AGCGTCTTACAGAAGAGAGACACGGTAGATTTCTTCCACGATGAGTATCGCTGTCCCATT
TACGTTAAGGATCTCGTGAGCATCATCTTGATGTTGATTGACAGATGGGTTCTCTCAGAT
GATAAACAGATGCGGCTAGTTTTGAATGCTGGTGGACCGGACAGACTCTCTCGTGTTCAA
ATGGCGGAAGCGGTTGCACAAGTCAAAGGACATGATCTTTCCTTGATTAAACATGTTTCT
GCTTCATCGGTTGATCGAGGAGTGGTGTCACCAGCAGATATATCATGGACATAACCAAAC
TGAATCAGACACTTGACATCTCCCCAACTTCTTTTAAAGATGGTGTTAGGTTAACGCTTC
AGTCTGAATCTCGTTCCCATATCCTGTCGTAACATTGTTTTCTTCTGTCATCCTTACCCA
CCACACTGCTTCTTTCTACCACATAAATGTTGGTTATGATACAACCAAATCTATTATGAA
TAAGGATTGAAACGGTTCTGGTTTTATTATTTAGTTTTGTTTTACTGTTTTACAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE19TF U 1
AF RR2GE19JQ C 410
BS 1 669 RR2GE19TF
BS 670 670 RR2GE19JQ
BS 671 694 RR2GE19TF
BS 695 1137 RR2GE19JQ

RD RR2GE19TF 699 0 0
GGGAGAAGGGAAAAAACAATGGAGAAGAAGACGAAAGTGGTGATTGTGGGAGGTACGGGC
TACTTGGGTCAGCATCTTCTTCAAGCTTTCGCCGGAGATCGTTACGACGTCGCTTTCACT
CATCACTCTTGTCCCCTTCCGCGCCTCTTGCTCGACGCTTTCCCACATTTCTCATCTTTT
CATGTCGATCTCAAAACCGGTCTTGGTTTCAATTCCATCTCCCACCACTTCGGCCAGCCG
GACGTGGTCGTGAATTGTGCAGCTCTCTCTGTTCCTCGAGTTTGTGAGCAAGATCCAGAT
TCCGCCACCTCCATCAACGTCCCTTCTTCCCTTGTTAACTGGCTGTCATCATCTTTTCAG
ACAAAAAACAAAACCTTGTTGATTCATCTCTCTACTGATCAAGTTTATGAAGGTGTCAAG
TCTTTCTACAAGGAAGAAGACGAGACTCTTGCTGTAAACGTATACGGTAAATCTAAAGTT
GCAGCAGAGCTTCTCATCAGAGATAAATTTCAAAACTTTGCTATATTGAGGAGTAGTATC
ATCTTTGGTCCTCAGACTCTATCACCACTCCCTAAGAATCTCCCCGTTCAGTGGATGGAT
AGCGTCTTACAGAAGAGAGACACGGTAGATTTCTTCCACGATGAGTATCGCTGTCCCATT
TACGTTAAG*ATCTCGTGAGCATCATCTTGATGT
GATGA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2GE19JQ 728 0 0
AAGGTGTCAAGTCTTTCTACAAGGAAGAAGACGAGACTCTTGCTGTAAACGTATACGGTA
AATCTAAAGTTGCAGCAGAGCTTCTCATCAGAGATAAATTTCAAAACTTTGCTATATTGA
GGAGTAGTATCATCTTTGGTCCTCAGACTCTATCACCACTCCCTAAGAATCTCCCCGTTC
AGTGGATGGATAGCGTCTTACAGAAGAGAGACACGGTAGATTTCTTCCACGATGAGTATC
GCTGTCCCATTTACGTTAAGGATCTCGTGAGCATCATCTTGATGTTGATTGACAGATGGG
TTCTCTCAGATGATAAACAGATGCGGCTAGTTTTGAATGCTGGTGGACCGGACAGACTCT
CTCGTGTTCAAATGGCGGAAGCGGTTGCACAAGTCAAAGGACATGATCTTTCCTTGATTA
AACATGTTTCTGCTTCATCGGTTGATCGAGGAGTGGTGTCACCAGCAGATATATCATGGA
CATAACCAAACTGAATCAGACACTTGACATCTCCCCAACTTCTTTTAAAGATGGTGTTAG
GTTAACGCTTCAGTCTGAATCTCGTTCCCATATCCTGTCGTAACATTGTTTTCTTCTGTC
ATCCTTACCCACCACACTGCTTCTTTCTACCACATAAATGTTGGTTATGATACAACCAAA
TCTATTATGAATAAGGATTGAAACGGTTCTGGTTTTATTATTTAGTTTTGTTTTACTGTT
TTACAACC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL5664Contig1 1033 2 2 U
GGAGATCTCAATTTTCCCGAGAAAAAGTCTTTTGAGTTTTCGTTTTTTTCTCTCCGTCGT
CTCCCGGAGAGAAAACGCTTCCGCCGCCACTGACCACGTAAATAATGCCAATCTCGATCT
CAATTTCAATCTGGGTTTTTACCTTTTGATCGTCGACTTATTCCTTTTTCTGTAATTAGG
GTTTATTAGGATTAAGCTCAAACCTTGAAATCAAGCCATTAAGATCCAAATCGTGCTGCT
TGATTGTGTTTGACATGGATTAGGAAAGATAAAAGGAAGAATCTTTATCTTCTCCAGATT
GTTTTGGATTTGGGTAATATTTTCCATATCTCTGTTGTGGTGATTTGTGTTATGGAAACG
AGTCGTGGAGAGGCTAAAGAAGCCAATGGATGTGAGAATCATAAGGCTATTATTGTTGGC
TTAAGAAGCAGTGAAGTTGAGGATCAAGTCTGTGAGGAGGAGGTAGAAGAAGAAGAAAGT
GAGTCACAGTGTTTGTTGCCTCCTCCTAGGAAAGGAGGGATGATGTCTACAAGTAGTGAC
AAGATTAAGAGGACTGTGCAGTGGACTGATAACAAAGGAGACAGTCTTACTGAGGTTTTA
GTATACGAACCAAGTGAAGTAAGCGATTCAGATGACGATGATTTAGATTCTTGCATCTGC
ACCATTATGTAGTCTGCATTCAGTCACTATTAACATGGAGTTTTAACGAAGACTCGTCCT
TGTATGATTGTATCTGACTTCTTTTCAGCAACCAGTTATGTGCGGATAAACGAGTGGACA
TCACACAATCACGCAAGTTTCAGATTTTGTGCTCAGGTCTTGTGACAAGTAACCAAGTCC
AAACGTGGGATGCACGATCAGTACGCATTTGTCACATTTTAGTTACAGGAGTGAGAGAGT
ATATAGAGGTATAGATTACTGCTCTATTATGCAACAGAGGCCTGATCTTCAGGCCAAAGA
TCTCTGATTGCTGTTTGGGTTCAAACTAATGTATATCTTTCTGCAACATACATATACAAG
CTAATTAAACTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F332TF U 1
AF RR2F332JQ C 281
BS 1 799 RR2F332TF
BS 800 1033 RR2F332JQ

RD RR2F332TF 799 0 0
GGAGATCTCAATTTTCCCGAGAAAAAGTCTTTTGAGTTTTCGTTTTTTTCTCTCCGTCGT
CTCCCGGAGAGAAAACGCTTCCGCCGCCACTGACCACGTAAATAATGCCAATCTCGATCT
CAATTTCAATCTGGGTTTTTACCTTTTGATCGTCGACTTATTCCTTTTTCTGTAATTAGG
GTTTATTAGGATTAAGCTCAAACCTTGAAATCAAGCCATTAAGATCCAAATCGTGCTGCT
TGATTGTGTTTGACATGGATTAGGAAAGATAAAAGGAAGAATCTTTATCTTCTCCAGATT
GTTTTGGATTTGGGTAATATTTTCCATATCTCTGTTGTGGTGATTTGTGTTATGGAAACG
AGTCGTGGAGAGGCTAAAGAAGCCAATGGATGTGAGAATCATAAGGCTATTATTGTTGGC
TTAAGAAGCAGTGAAGTTGAGGATCAAGTCTGTGAGGAGGAGGTAGAAGAAGAAGAAAGT
GAGTCACAGTGTTTGTTGCCTCCTCCTAGGAAAGGAGGGATGATGTCTACAAGTAGTGAC
AAGATTAAGAGGACTGTGCAGTGGACTGATAACAAAGGAGACAGTCTTACTGAGGTTTTA
GTATACGAACCAAGTGAAGTAAGCGATTCAGATGACGATGATTTAGATTCTTGCATCTGC
ACCATTATGTAGTCTGCATTCAGTCACTATTAACATGGAGTTTTAACGAAGACTCGTCCT
TGTATGATTGTATCTGACTTCTTTTCAGCAACCAGTTATGTGCGGATAAACGAGTGGACA
TCACACAATCACGCAAGTT

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2F332JQ 753 0 0
ATCTTTATCTTCTCCAGATTGTTTTGGATTTGGGTAATATTTTCCATATCTCTGTTGTGG
TGATTTGTGTTATGGAAACGAGTCGTGGAGAGGCTAAAGAAGCCAATGGATGTGAGAATC
ATAAGGCTATTATTGTTGGCTTAAGAAGCAGTGAAGTTGAGGATCAAGTCTGTGAGGAGG
AGGTAGAAGAAGAAGAAAGTGAGTCACAGTGTTTGTTGCCTCCTCCTAGGAAAGGAGGGA
TGATGTCTACAAGTAGTGACAAGATTAAGAGGACTGTGCAGTGGACTGATAACAAAGGAG
ACAGTCTTACTGAGGTTTTAGTATACGAACCAAGTGAAGTAAGCGATTCAGATGACGATG
ATTTAGATTCTTGCATCTGCACCATTATGTAGTCTGCATTCAGTCACTATTAACATGGAG
TTTTAACGAAGACTCGTCCTTGTATGATTGTATCTGACTTCTTTTCAGCAACCAGTTATG
TGCGGATAAACGAGTGGACATCACACAATCACGCAAGTTTCAGATTTTGTGCTCAGGTCT
TGTGACAAGTAACCAAGTCCAAACGTGGGATGCACGATCAGTACGCATTTGTCACATTTT
AGTTACAGGAGTGAGAGAGTATATAGAGGTATAGATTACTGCTCTATTATGCAACAGAGG
CCTGATCTTCAGGCCAAAGATCTCTGATTGCTGTTTGGGTTCAAACTAATGTATATCTTT
CTGCAACATACATATACAAGCTAATTAAACTGC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL5665Contig1 720 2 2 U
GGGCAACTCTCTTCTCCATTGACGCCGTTGCCTTATCTTCTCCATCTCTCTCGATCTCAG
ACACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGAACCCAGCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCGAACTAAGCTCTCTCTGTCTCTCTCGTTCTCTCGATCTCTTGAAGCTCTCTCTG
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGAACTCAGCTCTCTCTGTCACTCTCTCGTCTTGA
GTTCTGAAGTTACTGATTTTGATGTTCTTCTCTATGCTCCTTGGTGCTACTGGAGTAAAC
GTTTGGTAAAAGACTCTCTGAGCTCATCTCATCTCAACCAAACCCATCTCTTCCTTTTGT
AAGCACGGCTGTGACTGTGTGTCTCAAGCTCTCTTCTCCAAACCACTTGCAGAGCTCAGA
CTGCCATGCAGAGACATGGTGATTTCAAGCTTCCTCAGTTCTTCAACTATCCTCCATACT
TCTGAATTATCTGATAAATGATCAGAACAACAACTGAGTTAAACACAGCATGATAGGACG
ATTCTAATGAAGGCCTTGAAGCTGCTAGAGAACAAGGGCAAGCTTGCATTGTTCAAAGGA
ACATCGGCTGATGATGACGGCTTCAAGTTCTCTTTCTGAATGCTACTCTCTGTATAAACG
TTTTGGAAGTGTGAAATATCAGATAAACAACCTTTTTAATAATAACATTCTTTTCTAGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR62TF U 1
AF RR2BR62JQ C 1
BS 1 284 RR2BR62TF
BS 285 720 RR2BR62JQ

RD RR2BR62TF 284 0 0
GGGCAACTCTCTTCTCCATTGACGCCGTTGCCTTATCTTCTCCATCTCTCTCGATCTCAG
ACACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGAACCCAGCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCGAACTAAGCTCTCTCTGTCTCTCTCGTTCTCTCGATCTCTTGAAGCTCTCTCTG
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGAACTCAGCTCTCTCTGTCACTCTCTCGTCTTGA
GTTCTGAAGTTACTGATTTTGATGTTCTTCTCTATGCTCCTTGG

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2BR62JQ 720 0 0
GGGCAACTCTCTTCTCCATTGACGCCGTTGCCTTATCTTCTCCATCTCTCTCGATCTCAG
ACACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGAACCCAGCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCGAACTCAGCTCTCTCTGTCTCTCTCGTTCTCTCGATCTCTTGAAGCTCTCTCTG
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGAACTCAGCTCTCTCTGTCACTCTCTCGTCTTGA
GTTCTGAAGTTACTGATTTTGATGTTCTTCTCTATGCTCCTTGGTGCTACTGGAGTAAAC
GTTTGGTAAAAGACTCTCTGAGCTCATCTCATCTCAACCAAACCCATCTCTTCCTTTTGT
AAGCACGGCTGTGACTGTGTGTCTCAAGCTCTCTTCTCCAAACCACTTGCAGAGCTCAGA
CTGCCATGCAGAGACATGGTGATTTCAAGCTTCCTCAGTTCTTCAACTATCCTCCATACT
TCTGAATTATCTGATAAATGATCAGAACAACAACTGAGTTAAACACAGCATGATAGGACG
ATTCTAATGAAGGCCTTGAAGCTGCTAGAGAACAAGGGCAAGCTTGCATTGTTCAAAGGA
ACATCGGCTGATGATGACGGCTTCAAGTTCTCTTTCTGAATGCTACTCTCTGTATAAACG
TTTTGGAAGTGTGAAATATCAGATAAACAACCTTTTTAATAATAACATTCTTTTCTAGTC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL5666Contig1 916 2 2 U
GGACATCTCCAGTAACTTTTCGATCTGATAAACATAAGCATACTTAAATTCTGTAGAGAA
ACCATTCATCTAGATTTTCTGGCTACATTAGTTATCAAGTGATCTCCCTTCCTATAAACA
CAAGCGGTCATCCATCTCCCTTGCTATTCATGATGTCTTCATTTTAATCTTTAAATCAGT
TCATCATGATTGCATCAGAACATCAAAGCCTAAGCAGCAAGCAGCAAACAGCAAACTGAG
GATGAGAAGGCTGACGTGTAGTTTCTTGAGTCAGTATCTGAAAGAGAACGTAGCTTTGGA
GATCTGAGCTTTGGTATGGAAGGCAAGCCTGAGGTCATCGGTTTGAATTCTTGACATGAG
GCTTCTCTTTTTTTTACACCAAAGCAAATAAGTGTTGTGGATTCTTACAAGAAGCTTATT
TTTGTGGTTCCATCTGCTTCTCCATCCTGACTCTAATGACTCCGCTTAGCTATCCCGGGT
TATAAAATGTTCTCCGTCTTCCAGTGTCACAAATTCACTAGTTGGTGGCTTGAACTCGTA
ATCCAACTGAATAATATTCATAAGGTTACACCACTAGAAAGCAGAAAAACAAGGTACAAT
TAAATGTGTGAGAGGAGACTCACAATGGAAACAAGTATTCTTTGAGTCAGGTACGTATAT
GAAAGTAGCCCTATACTTTGTGACCATGTTCTGGTCACATGGAAAAGAAAACAATCAGCA
GAGGGAACAAGAAGGGGAAAACGATCAAACATACACTCATATTTACTATTTCAATAATCA
CCCAAAAGATTAGGTTGGACAAAGATAAATAATTGGACACAAAATGTTAGAACATCAGCG
CATAGTCTTTTGCTTTTGGTTACCACACATATTTGTATTATGCACACGTACATATAAAGA
ATCACCGCATTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP61TF U 1
AF RR2FP61JQ C 419
BS 1 710 RR2FP61TF
BS 711 916 RR2FP61JQ

RD RR2FP61TF 718 0 0
GGACATCTCCAGTAACTTTTCGATCTGATAAACATAAGCATACTTAAATTCTGTAGAGAA
ACCATTCATCTAGATTTTCTGGCTACATTAGTTATCAAGTGATCTCCCTTCCTATAAACA
CAAGCGGTCATCCATCTCCCTTGCTATTCATGATGTCTTCATTTTAATCTTTAAATCAGT
TCATCATGATTGCATCAGAACATCAAAGCCTAAGCAGCAAGCAGCAAACAGCAAACTGAG
GATGAGAAGGCTGACGTGTAGTTTCTTGAGTCAGTATCTGAAAGAGAACGTAGCTTTGGA
GATCTGAGCTTTGGTATGGAAGGCAAGCCTGAGGTCATCGGTTTGAATTCTTGACATGAG
GCTTCTCTTTTTTTTACACCAAAGCAAATAAGTGTTGTGGATTCTTACAAGAAGCTTATT
TTTGTGGTTCCATCTGCTTCTCCATCCTGACTCTAATGACTCCGCTTAGCTATCCCGGGT
TATAAAATGTTCTCCGTCTTCCAGTGTCACAAATTCACTAGTTGGTGGCTTGAACTCGTA
ATCCAACTGAATAATATTCATAAGGTTACACCACTAGAAAGCAGAAAAACAAGGTACAAT
TAAATGTGTGAGAGGAGACTCACAATGGAAACAAGTATTCTTTGAGTCAGGTACGTATAT
GAAAGTAGCCCTATACTTTGTGACCATGTTCTGGTCACATGGAAAAGAAA
CAATCAGC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2FP61JQ 498 0 0
TTTTTGTGGTTCCATTTGCTTCTCCATCCTGACTTTAATGACTCCGCTTAGCTATCCCGG
GTTATAAAATGTTTTCCGTTTTCCAGTGTCACAAATTCACTAGTTGGTGGCTTGAACTCG
TAATCCAACTGAATAATATTCATAAGGTTACACCACTAGAAAGCAGAAAAACAAGGTACA
ATTAAATGTGTGAGAGGAGACTCACAATGGAAACAAGTATTCTTTGAGTCAGGTACGTAT
ATGAAAGTAGCCCTATACTTTGTGACCATGTTCTGGTCACATGGAAAAGAAAACAATCAG
CAGAGGGAACAAGAAGGGGAAAACGATCAAACATACACTCATATTTACTATTTCAATAAT
CACCCAAAAGATTAGGTTGGACAAAGATAAATAATTGGACACAAAATGTTAGAACATCAG
CGCATAGTCTTTTGCTTTTGGTTACCACACATATTTGTATTATGCACACGTACATATAAA
GAATCACCGCATTTTGTT

QA 1 498 1 498
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5670Contig1 1196 2 2 U
GGATTAGTAACTCAATAAATATCTAAACAATGGATTTGTTTCTTTCACTGCCTAAAATTT
AGCTGAAGAGTCTTATCGAATAAGAAACACAAAAGAGGCATTTGTAGTGACGAGCATCCG
TTTCCGGCAAAAGGGTTTAGATTCAATTGTCTGATTTATTTACTGAAAGCTGAAAAAAAA
CGACACTTTGTTGAGATTTTGTTGTTCTCAGCCATAAAGTTCGTAGCTTTCCTCTCACTT
GTCATTCAACTGCATCTTGATTCTGGAACTTGGGAGTTCTTGAACTAAAACCGCTCCTCG
TTTGTTTTTGGTGTGTAATATGAATGAAATGGACACGAAAAGCTGTTCAAAATCGATTGG
ATCTGTGTCTGAGGCTGTGATTGTAGTCTCTGATGTGAAGGGTGAGACCAGTAACTCTAT
CTCAAACCAAAAAGAGAATGATTCAAGAATGGGGGAAGATGGTGTTGGATGCAGTAACGT
TTCAGCTCAAGCTGTTCACGAGGAAGTTGCAAATACCGTTACTGCGGTAAGCTGTCACGA
GAGCGATGCATCAACAAAAGCAAAAGACAAGGAGTTTCACGTGGTTGATCTGAGCGGTGG
AGGAGAAAGTGATAGCGGGCAAAGAATCTGCAGAATCTGTCACTTTGGTTCTGATCAAAC
GCCAGATAGAGTTTCTGGCAAGTCTGTAAGTGTAGAGTTGATTCAGATTGGTTGCAAATG
CAAAAACGAGCTTGGCCTTGCGCATTTTCATTGTGCTGAAGCTTGGTTCAAGCTAAGAGG
AAACAGTGTATGTGAAATCTGTGGTTCTTCAGCATTGAATGTTCCAGTAAGGTTAACGGA
GGAGGAGTGGAGCGAAATAAGGGATACTACAATGGATGAAGGAAGAAGACGTGGAACTGG
ACAGTCTTGCTGCATCTTCATGGTTTTCCTGGTCACTATCATTCTGCTTCATTGGTTTTT
CAAGAAGATGAGTACTTACTACCAAAACCCATCTATTTAATTTGTTAGTTTATAAGCATA
TATGTTGGTAACTTTTCTTTTTTTTGAGACGTATATGTTGGTAACTTGTAAATTCTATTC
TGACTCTAAGACTATATGGAAACAAAAGAAGATAGAATATAGTACAAGTTCTTTAGATCA
AACTCTGATTAAGAATCTAATAAATGGCCAAATCAGAGTTTTTTTACTAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA08TF U 1
AF RR2CA08JQ C 370
BS 1 647 RR2CA08TF
BS 648 1196 RR2CA08JQ

RD RR2CA08TF 647 0 0
GGATTAGTAACTCAATAAATATCTAAACAATGGATTTGTTTCTTTCACTGCCTAAAATTT
AGCTGAAGAGTCTTATCGAATAAGAAACACAAAAGAGGCATTTGTAGTGACGAGCATCCG
TTTCCGGCAAAAGGGTTTAGATTCAATTGTCTGATTTATTTACTGAAAGCTGAAAAAAAA
CGACACTTTGTTGAGATTTTGTTGTTCTCAGCCATAAAGTTCGTAGCTTTCCTCTCACTT
GTCATTCAACTGCATCTTGATTCTGGAACTTGGGAGTTCTTGAACTAAAACCGCTCCTCG
TTTGTTTTTGGTGTGTAATATGAATGAAATGGACACGAAAAGCTGTTCAAAATCGATTGG
ATCTGTGTCTGAGGCTGTGATTGTAGTCTCTGATGTGAAGGGTGAGACCAGTAACTCTAT
CTCAAACCAAAAAGAGAATGATTCAAGAATGGGGGAAGATGGTGTTGGATGCAGTAACGT
TTCAGCTCAAGCTGTTCACGAGGAAGTTGCAAATACCGTTACTGCGGTAAGCTGTCACGA
GAGCGATGCATCAACAAAAGCAAAAGACAAGGAGTTTCACGTGGTTGATCTGAGCGGTGG
AGGAGAAAGTGATAGCGGGCAAAGAATCTGCAGAATCTGTCACTTTG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2CA08JQ 827 0 0
TGAGGCTGTGATTGTAGTCTCTGATGTGAAGGGTGAGACCAGTAACTCTATCTCAAACCA
AAAAGAGAATGATTCAAGAATGGGGGAAGATGGTGTTGGATGCAGTAACGTTTCAGCTCA
AGCTGTTCACGAGGAAGTTGCAAATACCGTTACTGCGGTAAGCTGTCACGAGAGCGATGC
ATCAACAAAAGCAAAAGACAAGGAGTTTCACGTGGTTGATCTGAGCGGTGGAGGAGAAAG
TGATAGCGGGCAAAGAATCTGCAGAATCTGTCACTTTGGTTCTGATCAAACGCCAGATAG
AGTTTCTGGCAAGTCTGTAAGTGTAGAGTTGATTCAGATTGGTTGCAAATGCAAAAACGA
GCTTGGCCTTGCGCATTTTCATTGTGCTGAAGCTTGGTTCAAGCTAAGAGGAAACAGTGT
ATGTGAAATCTGTGGTTCTTCAGCATTGAATGTTCCAGTAAGGTTAACGGAGGAGGAGTG
GAGCGAAATAAGGGATACTACAATGGATGAAGGAAGAAGACGTGGAACTGGACAGTCTTG
CTGCATCTTCATGGTTTTCCTGGTCACTATCATTCTGCTTCATTGGTTTTTCAAGAAGAT
GAGTACTTACTACCAAAACCCATCTATTTAATTTGTTAGTTTATAAGCATATATGTTGGT
AACTTTTCTTTTTTTTGAGACGTATATGTTGGTAACTTGTAAATTCTATTCTGACTCTAA
GACTATATGGAAACAAAAGAAGATAGAATATAGTACAAGTTCTTTAGATCAAACTCTGAT
TAAGAATCTAATAAATGGCCAAATCAGAGTTTTTTTACTAAAAAAAA

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 2

CO CL5671Contig1 744 2 4 U
GGACTGAACAGCAAAACCCAAAAGGATCATAAGCTATAGTTTGGTTACATCTTTGAATTT
CACTTAAAAGTTGGAAGAAAATGCAGTCGATGAAGGAAACAGCTTCGAACATCGCAGCTT
CTGCGAAGTCTGGCATGGACAAGACCAAAGCCACCATGCAGGAAAAGGCTGAGAAGATGA
CAACACGAGACCCTCTTCAGAAAGAGATGGCTACACAGAAGAAAGAAGAGAGGATCAATG
AAGCTGAGATGCAGAAGAGAGAAGCGCGTGAGCACAACGCTGCAATGAAAGAAGCCTCTG
GAGCTGGGACAGGAACTGGTTTGGGACTGGGGTCGGCCACTCACTCGACCACTGGACAAG
TCGGACACGGAACTGGGACCCACCAGATGTCGGCTTTACCTGGTCACGGCACGGGACAAC
CAACGGGGCACGTTGTGGATGGTACAGCCGCCACAGAACCGATAGGAACGAACACTGGAA
CTGGTAGGACCACCGCTCATAACACCCGCGTGGGCGGTGGCACCACTGGGTACGGAACCG
GTGGAGGATATACTGGATAAGACGTTTTGTCATTTGTTTATATGTTCTTGTCAACTTGTC
CTTTGTGTGTGTTCATGTTTTCTTTTTCTTTTTTTGGTCCTACCTTTGTTTTTCTCATAA
CTGTAGGACTTTGCTTTTGTGTGGTGTGTCTTTGATCTGGTGACAGACTTGACAGTTGTG
GTTTTTGAATAAAAGTGTTGTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF59TF U 1
AF RR2GF59JQ C 402
BS 1 634 RR2GF59TF
BS 635 635 RR2GF59JQ
BS 636 661 RR2GF59TF
BS 662 744 RR2GF59JQ

RD RR2GF59TF 661 0 0
GGACTGAACAGCAAAACCCAAAAGGATCATAAGCTATAGTTTGGTTACATCTTTGAATTT
CACTTAAAAGTTGGAAGAAAATGCAGTCGATGAAGGAAACAGCTTCGAACATCGCAGCTT
CTGCGAAGTCTGGCATGGACAAGACCAAAGCCACCATGCAGGAAAAGGCTGAGAAGATGA
CAACACGAGACCCTCTTCAGAAAGAGATGGCTACACAGAAGAAAGAAGAGAGGATCAATG
AAGCTGAGATGCAGAAGAGAGAAGCGCGTGAGCACAACGCTGCAATGAAAGAAGCCTCTG
GAGCTGGGACAGGAACTGGTTTGGGACTGGGGTCGGCCACTCACTCGACCACTGGACAAG
TCGGACACGGAACTGGGACCCACCAGATGTCGGCTTTACCTGGTCACGGCACGGGACAAC
CAACGGGGCACGTTGTGGATGGTACAGCCGCCACAGAACCGATAGGAACGAACACTGGAA
CTGGTAGGACCACCGCTCATAACACCCGCGTGGGCGGTGGCACCACTGGGTACGGAACCG
GTGGAGGATATACTGGATAAGACGTTTTGTCATTTGTTTATATGTTCTTGTCAACTTGTC
CTTTGTGTGTGTTCATGTTTTCTTTTTCTTTTTT*GGTCCTACCTTTGTTTTTCTCATAA
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2GF59JQ 343 0 0
GGTCACGGCACGGGACAACCAACGGGGCACGTTGTGGATGGTACAGCCGCCACAGAACCG
ATAGGAACGAACACTGGAACTGGTAGGACCACCGCTCATAACACCCGCGTGGGCGGTGGC
ACCACTGGGTACGGAACCGGTGGAGGATATACTGGATAAGACGTTTTGTCATTTGTTTAT
ATGTTCTTGTCAACTTGTCCTTTGTGTGTGTTCATGTTTTCTTTTTCTTTTTTTGGTCCT
ACCTTTGTTTTTCTCATAACTGTAGGACTTTGCTTTTGTGTGGTGTGTCTTTGATCTGGT
GACAGACTTGACAGTTGTGGTTTTTGAATAAAAGTGTTGTGTC

QA 1 343 1 343
DS 



AS 1 2

CO CL5672Contig1 1458 2 2 U
GGGCGGTCGCCACATCTCTCTCAGTGCTCGGGGGGTAAGACAACAGCAGCAGCAATGTTC
GTTTCCGACAAGCCTCGTCCTATCGATTTCTACAAAGACGATAACAATAACAACACCAAT
CCCTCCACCACCGCCCGAGACAACATGATCATCGACGTCACCACCAACAACACACCAGGA
GGTCTACATCCCCACCACCACAACCATCATAACCATCATCTCCAGCCGCAACAGATTCTC
CTCGGAGAAAGCAGCGGCGAGGACCACGAAGTGAAAGCTCCCAAGAAACGAGCGGAGACG
TGGGTCCAAGACGAGACACGCTCCCTGATCATGTTCCGCCGAGGCATGGACGGTCTCTTC
AACACCTCCAAGTCCAACAAGCATCTCTGGGAGCAGATCTCCGCCAAGATGAGGGAGAAA
GGGTTCGATCGGTCTCCGACCATGTGTACCGACAAGTGGAGGAATCTTTTGAAGGAGTTT
AAGAAGGCCAAGCACCACGACAGAGGGAATAGATCGGCTAAGATGTCGTATTACAAGGAG
ATTGAGGAGATTCTTAGGGATAGGAGCAAGAAAGTGACGGCGACGGGACAGTATAGCAAG
AGCCCTAATACACCGCCCACTTCTAAAGTTGATTCCTTTATGCAATTTACTGATAAAGGT
TTTGATGATCCGAGCATTTCTTTTGGATCTGTTGAAGGTAATGGAAGGCCAGCGTTAAAC
CTTGAAAGGCGTCTTGACCATGATGGTCATCCTCTTGCCATCACTACAGTTGATGCTGTT
GCAGCAAATGGAGTTCCTCCTTGGAATTGGAGAGAGACTCCTGGAAACGGTGGTGATTCT
CATGGTCAGCCTTTTGGTGGGAGGATCATAACTGTGAAATTTGGCGACTATACAAGAAGA
ATCGGCGTTGATGGCAGCACTGAAGCAATCAAAGACACAATCAGATCAGCTTTCGGGTTA
AGAACTCGACGGGCTTTTTGGTTAGAAGATGAAGATCAGGTTGTCCGCTGTCTTGACCGA
GACATGCCTTTAGGGAACTATCTACTCCATGTCGATGATGGACTAGCCATTAGGGTTTGC
CATTATGATGAATCCAACCAGTTACCAGTCCATACAGAAGAGAAAATCTTCTACACAGAA
GAAGATTACCGTGATTTTCTAGCTAGACGGGGATGGACATGTCTGCAAGTTGATGGTTTT
AGGAACATAGACAACATGGATGATCTTCAACCTGGTGCTGTGTACAGAGGAGTTAGATGA
GATAATCTAATCATAAAAGCTGTCCTCTGTAAATAAATGTTTTCTCATTTTGTACATTTA
CAGCTCTTTTGTTTCCTACCCACTGAGAAGAACAAAGAATGTACTTGCTCAAATGTGATA
TATCAACTTGGATTCACCTTGCCGGTCAAGAAGACCTGCAATTGTATTTTTGTATGGTAA
CACTTTGGAAGGATCAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B851TF U 1
AF RR2B851JQ C 548
BS 1 823 RR2B851TF
BS 824 1458 RR2B851JQ

RD RR2B851TF 823 0 0
GGGCGGTCGCCACATCTCTCTCAGTGCTCGGGGGGTAAGACAACAGCAGCAGCAATGTTC
GTTTCCGACAAGCCTCGTCCTATCGATTTCTACAAAGACGATAACAATAACAACACCAAT
CCCTCCACCACCGCCCGAGACAACATGATCATCGACGTCACCACCAACAACACACCAGGA
GGTCTACATCCCCACCACCACAACCATCATAACCATCATCTCCAGCCGCAACAGATTCTC
CTCGGAGAAAGCAGCGGCGAGGACCACGAAGTGAAAGCTCCCAAGAAACGAGCGGAGACG
TGGGTCCAAGACGAGACACGCTCCCTGATCATGTTCCGCCGAGGCATGGACGGTCTCTTC
AACACCTCCAAGTCCAACAAGCATCTCTGGGAGCAGATCTCCGCCAAGATGAGGGAGAAA
GGGTTCGATCGGTCTCCGACCATGTGTACCGACAAGTGGAGGAATCTTTTGAAGGAGTTT
AAGAAGGCCAAGCACCACGACAGAGGGAATAGATCGGCTAAGATGTCGTATTACAAGGAG
ATTGAGGAGATTCTTAGGGATAGGAGCAAGAAAGTGACGGCGACGGGACAGTATAGCAAG
AGCCCTAATACACCGCCCACTTCTAAAGTTGATTCCTTTATGCAATTTACTGATAAAGGT
TTTGATGATCCGAGCATTTCTTTTGGATCTGTTGAAGGTAATGGAAGGCCAGCGTTAAAC
CTTGAAAGGCGTCTTGACCATGATGGTCATCCTCTTGCCATCACTACAGTTGATGCTGTT
GCAGCAAATGGAGTTCCTCCTTGGAATTGGAGAGAGACTCCTG

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR2B851JQ 911 0 0
GAGATT
TTAGGGATAGGAGCAAGAAAGTGACGGCGACGGGACAGTATAGCAAGAGCCCTAATACAC
CGCCCACTTCTAAAGTTGATTCCTTTATGCAATTTACTGATAAAGGTTTTGATGATCCGA
GCATTTCTTTTGGATCTGTTGAAGGTAATGGAAGGCCAGCGTTAAACCTTGAAAGGCGTC
TTGACCATGATGGTCATCCTCTTGCCATCACTACAGTTGATGCTGTTGCAGCAAATGGAG
TTCCTCCTTGGAATTGGAGAGAGACTCCTGGAAACGGTGGTGATTCTCATGGTCAGCCTT
TTGGTGGGAGGATCATAACTGTGAAATTTGGCGACTATACAAGAAGAATCGGCGTTGATG
GCAGCACTGAAGCAATCAAAGACACAATCAGATCAGCTTTCGGGTTAAGAACTCGACGGG
CTTTTTGGTTAGAAGATGAAGATCAGGTTGTCCGCTGTCTTGACCGAGACATGCCTTTAG
GGAACTATCTACTCCATGTCGATGATGGACTAGCCATTAGGGTTTGCCATTATGATGAAT
CCAACCAGTTACCAGTCCATACAGAAGAGAAAATCTTCTACACAGAAGAAGATTACCGTG
ATTTTCTAGCTAGACGGGGATGGACATGTCTGCAAGTTGATGGTTTTAGGAACATAGACA
ACATGGATGATCTTCAACCTGGTGCTGTGTACAGAGGAGTTAGATGAGATAATCTAATCA
TAAAAGCTGTCCTCTGTAAATAAATGTTTTCTCATTTTGTACATTTACAGCTCTTTTGTT
TCCTACCCACTGAGAAGAACAAAGAATGTACTTGCTCAAATGTGATATATCAACTTGGAT
TCACCTTGCCGGTCAAGAAGACCTGCAATTGTATTTTTGTATGGTAACACTTTGGAAGGA
TCAAG

QA 7 911 7 911
DS 



AS 1 2

CO CL5673Contig1 1166 2 12 U
GGTGATGATCGTGGCACGCGTTCCAAGGTCGTACTATCGGACTCTATCACTAGTCTCCAA
GAGCTTTCGATCTATGGTGGTTGCACCTGAGCTTTACAAGGTTAGGTCACTCTTGGGCCT
CACGGAGACTTGTCTATATGTGTGCTTGAGGTTCGGGTTGACTTGTTATAAGTGGTACAC
CCTCTCCAAGACTAGTACTAGTAGTAGTGGCTATGTTTTGGGTAGAGTCTCAATGCGCGA
TGTTGATGATGCTTCTCCTCGTGTGGTGGGTTTGTTATATTCAGATCTTGTGGCTGTTGG
TTCTGAAATCTACAACGTTGGCGTAGCAGATAAAGGAACCATGCCCACCTCTGGGGTCTC
AATTCTTGATTGCAAGACTCACAGGTGGCGTAAGGCTCCACGCATGCCAGTGGAGCTAAC
TGAACTTTCTACCACATTCCTTGATCAAAAGATATATGTACTTGGACGCTTCCATCAAGA
TGGTTCCTGGAAGAGCTACTTCGAGGTATTCAACACAAATACTCAAACTTGGCATCTCCC
TTGCTGTGGTGGATGTGATACCCCCAGAATCACTTTTATTGTTGACGGCAAGCTCCACGT
GGTGACTTTCTTTGATGGCGTGTTTGCTTTCAATTCAAAGCAATGTAGATGGGACCTGGT
TGATGAACAATATCCAAGCACGGGCACTATGTTTTTAGATTCTTACTGCGAGGTTGATAA
TATTCTCTACTCTGTTTCTGACCACGGAGCTCTGAGATGGTATGACTCCGACAAGACTAG
GTGGAGAGATTTGAAGGGTTTGGTTGGGCTACTACCTAAGTTGCCTAGTCCTCTTGCTGG
TTATGGTTCTTATGTTAAACTGACGGGTTTTGGTGGCGGAAAGATTATGGTTTTCTGGAA
TGCCAATTTCAGTTGTCACTTGACTCGAAGGGAGACCATATGTTGTGCGGAGATATCGCT
TGAAAGACGCGATGGAGACTGTTGGGGCAAACTTGAGTGGTCTGATAGTGTGCTTTCAGT
CCCTGTGGGAACTGAGTTCGTTAAAGTTCTTGCTGTAACACTTTGAATTAATGAATGTTG
TGTCTTTCTTTAACTTTTATTTTTTTGTTTTGTAATAATGGCTTTTTCAATTTCTCTGAT
GATTAAGTTAAAAACTTTCTTTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW66TF U 1
AF RR2FW66JQ C 444
BS 1 632 RR2FW66TF
BS 633 633 RR2FW66JQ
BS 634 695 RR2FW66TF
BS 696 696 RR2FW66JQ
BS 697 700 RR2FW66TF
BS 701 701 RR2FW66JQ
BS 702 712 RR2FW66TF
BS 713 713 RR2FW66JQ
BS 714 719 RR2FW66TF
BS 720 720 RR2FW66JQ
BS 721 742 RR2FW66TF
BS 743 1166 RR2FW66JQ

RD RR2FW66TF 742 0 0
GGTGATGATCGTGGCACGCGTTCCAAGGTCGTACTATCGGACTCTATCACTAGTCTCCAA
GAGCTTTCGATCTATGGTGGTTGCACCTGAGCTTTACAAGGTTAGGTCACTCTTGGGCCT
CACGGAGACTTGTCTATATGTGTGCTTGAGGTTCGGGTTGACTTGTTATAAGTGGTACAC
CCTCTCCAAGACTAGTACTAGTAGTAGTGGCTATGTTTTGGGTAGAGTCTCAATGCGCGA
TGTTGATGATGCTTCTCCTCGTGTGGTGGGTTTGTTATATTCAGATCTTGTGGCTGTTGG
TTCTGAAATCTACAACGTTGGCGTAGCAGATAAAGGAACCATGCCCACCTCTGGGGTCTC
AATTCTTGATTGCAAGACTCACAGGTGGCGTAAGGCTCCACGCATGCCAGTGGAGCTAAC
TGAACTTTCTACCACATTCCTTGATCAAAAGATATATGTACTTGGACGCTTCCATCAAGA
TGGTTCCTGGAAGAGCTACTTCGAGGTATTCAACACAAATACTCAAACTTGGCATCTCCC
TTGCTGTGGTGGATGTGATACCCCCAGAATCACTTTTATTGTTGACGGCAAGCTCCACGT
GGTGACTTTCTTTGATGGCGTGTTTGCTTTCA*TTCAAAGCAATGTAGATGGGACCTGGT
TGATGAACAATATCCAAGCACGGGCACTATGTTTT*AGAT*CTTACTGCGAG*TTGATA*
TATTCTCTACTCTGTTTCTGAC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2FW66JQ 723 0 0
ATCAAAAGATATATGTACTTGGACGCTTCCATCAAGATGGTTCCTGGAAGAGCTACTTCG
AGGTATTCAACACAAATACTCAAACTTGGCATCTCCCTTGCTGTGGTGGATGTGATACCC
CCAGAATCACTTTTATTGTTGACGGCAAGCTCCACGTGGTGACTTTCTTTGATGGCGTGT
TTGCTTTCAATTCAAAGCAATGTAGATGGGACCTGGTTGATGAACAATATCCAAGCACGG
GCACTATGTTTTTAGATTCTTACTGCGAGGTTGATAATATTCTTTACTCTGTTTCTGACC
ACGGAGCTCTGAGATGGTATGACTCCGACAAGACTAGGTGGAGAGATTTGAAGGGTTTGG
TTGGGCTACTACCTAAGTTGCCTAGTCCTCTTGCTGGTTATGGTTCTTATGTTAAACTGA
CGGGTTTTGGTGGCGGAAAGATTATGGTTTTCTGGAATGCCAATTTCAGTTGTCACTTGA
CTCGAAGGGAGACCATATGTTGTGCGGAGATATCGCTTGAAAGACGCGATGGAGACTGTT
GGGGCAAACTTGAGTGGTCTGATAGTGTGCTTTCAGTCCCTGTGGGAACTGAGTTCGTTA
AAGTTCTTGCTGTAACACTTTGAATTAATGAATGTTGTGTCTTTCTTTAACTTTTATTTT
TTTGTTTTGTAATAATGGCTTTTTCAATTTCTCTGATGATTAAGTTAAAAACTTTCTTTG
GTC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5675Contig1 997 2 2 U
GGGAAGAGAAGCTTCCAGAACGCCTGGTGGACCTTCAAGCGCTCACGCCACCCCTCGTTC
ACTCGACAACAACGACGAATCATCATCGAGACCCGATCGGAGTAGTAGTCCAATGAATTT
TGATTCTAGGGTTGCGAATGGTGAGGATACGTCAGGGGAAAGTACTGATACGTTATTGGA
TCAGTTCCTTCCTCCGCGACCCAAAGACAAGTGCTCCGAGGAGCTGCAAAGGAAAATAGA
TAAGTTTCTGAGCTTGAAGAAGATGGGGAAGAGTTTCAATAACGAAGTTCGGAATAGAAA
GGAATACAGGAATCCTGACTTCTTGTTGCATGCTGTGAGTTATCAAGATATTGACCAGAC
TGGTTCTTGCTTCAGTAAAGACGTGTTTGACCCCAATGGATATGACCCTAGTGACTTCTG
TGATGCAATAGAACTTGACATGAAGCATGAGAGGGAAAGAAAGGAACTGGAAAGCAAGAA
AAACCAAAGGCTCGACTTTGTTTCCGTTGGCACTCAACCTGTGGCTGCGGTATTCGCTCC
CCAAAAGCCTAACATCCCTATCCCAGGTGTTCCAGCTTTAGCTACTACTGGATTACCCTC
TGCACCAACTGACATTGCTGCTCGTGATGGCAGGCCAAACAAGAAATCCAAATGGGATAA
GGTTGATGGAGATGTGAAGAATCTACCACTAGCAGCTGGGAGTAATGCAGCTCCTGTATT
TGGTGCAAGTGCTGGTTCTGGATACTCAGCTTTCGCGCAACAACGGAGACGAGACTCGGA
AGGAAGAAGATCCTCAGAGCGGAAACTGGAGAGAAGAAGTTAAGACCATAGTACTGAGAT
TCTCAAGAGGTTCTAGCCCAACATCTTTTCAATGTTTCATAGTGATTACAAACCTAGAAT
CAATGATATACAATGTCTTTATTCTGTTTTGTTTACTAACGAGACATCAAAATTTTCAGA
ACAGTAATGTTTTACGTTCCAAGAATCAAAATTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM10TF U 1
AF RR2AM10JQ C 355
BS 1 629 RR2AM10TF
BS 630 997 RR2AM10JQ

RD RR2AM10TF 629 0 0
GGGAAGAGAAGCTTCCAGAACGCCTGGTGGACCTTCAAGCGCTCACGCCACCCCTCGTTC
ACTCGACAACAACGACGAATCATCATCGAGACCCGATCGGAGTAGTAGTCCAATGAATTT
TGATTCTAGGGTTGCGAATGGTGAGGATACGTCAGGGGAAAGTACTGATACGTTATTGGA
TCAGTTCCTTCCTCCGCGACCCAAAGACAAGTGCTCCGAGGAGCTGCAAAGGAAAATAGA
TAAGTTTCTGAGCTTGAAGAAGATGGGGAAGAGTTTCAATAACGAAGTTCGGAATAGAAA
GGAATACAGGAATCCTGACTTCTTGTTGCATGCTGTGAGTTATCAAGATATTGACCAGAC
TGGTTCTTGCTTCAGTAAAGACGTGTTTGACCCCAATGGATATGACCCTAGTGACTTCTG
TGATGCAATAGAACTTGACATGAAGCATGAGAGGGAAAGAAAGGAACTGGAAAGCAAGAA
AAACCAAAGGCTCGACTTTGTTTCCGTTGGCACTCAACCTGTGGCTGCGGTATTCGCTCC
CCAAAAGCCTAACATCCCTATCCCAGGTGTTCCAGCTTTAGCTACTACTGGATTACCCTC
TGCACCAACTGACATTGCTGCTCGTGATG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2AM10JQ 643 0 0
CCAGACTGGTTCTTGCTTCAGTAAAGACGTGTTTGACCCCAATGGATATGACCCTAGTGA
CTTCTGTGATGCAATAGAACTTGACATGAAGCATGAGAGGGAAAGAAAGGAACTGGAAAG
CAAGAAAAACCAAAGGCTCGACTTTGTTTCCGTTGGCACTCAACCTGTGGCTGCGGTATT
CGCTCCCCAAAAGCCTAACATCCCTATCCCAGGTGTTCCAGCTTTAGCTACTACTGGATT
ACCCTTTGCACCAACTGACATTGCTGCTCGTGATGGCAGGCCAAACAAGAAATCCAAATG
GGATAAGGTTGATGGAGATGTGAAGAATCTACCACTAGCAGCTGGGAGTAATGCAGCTCC
TGTATTTGGTGCAAGTGCTGGTTCTGGATACTCAGCTTTCGCGCAACAACGGAGACGAGA
CTCGGAAGGAAGAAGATCCTCAGAGCGGAAACTGGAGAGAAGAAGTTAAGACCATAGTAC
TGAGATTCTCAAGAGGTTCTAGCCCAACATCTTTTCAATGTTTCATAGTGATTACAAACC
TAGAATCAATGATATACAATGTCTTTATTCTGTTTTGTTTACTAACGAGACATCAAAATT
TTCAGAACAGTAATGTTTTACGTTCCAAGAATCAAAATTTACG

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL5676Contig1 1087 2 2 U
GGAGACATTTATCTTCTTGTAAGTTGTAGTCTTGATTTATAACGTGTGCAACCCATACAA
GAACTAGAATCTTGTGTTGCAGTCTCGTCATAGTATGTCGACCGGACAAGCGTCGGAGAA
GTCCAACTTTAACCGGAGATGTAGGTTGCTCAGTCGGTACCTGAAGGAGAAGGGATTTTT
GGGAATATAGATATAGGCCTGACTCGAAACTCCGATCTTGAGTTAGCCGGAAAATCTGAT
CTTAGAGCTCAACAAAATGCAATAAAGAAGGCAAACATTTCTGAAACTAGACCCTTCAAG
TTGACTCAGAAGCAGCTTTCAGTTGGTGAAACCTCTATTTCTTCCAGAGGCAAAGCCATA
GATGTCGTCGATCTAAGTGAACCGAGAAACGTACCGGAGCCTAAAACTTCCCAGTTGACC
ATATTTTTCGGCAGCAAAGTTATAGTTTACAACGAGTTTCCTGAAGACAAAGCAAAGGAG
ATAATAGAAGCAGCCAAAGAAGCGAATCCAGTTGCTGTTGAGTCAAAGAACATTCAGAAC
CACATGAATCTTGATGTGAACATTAACAACAAAAGCAACGTTGTGATTCCTGACCTGAAT
GAACCAACGAGTTCCGGTAACAACGATGATCATCAAACAAAAGAGCAACATCAAGTCGTG
GAACGCATTGCAAGAAGAGCCTCTCTTCATCGGTTCTTTTCCAAACGAAAAGACAGGGCT
GTAGCTAGAGCTCCGTATCAAGTGAACCAAAACGGTGGTCATCTTCCTCCCAAGCCACAA
ATGGTCGGTCCATCGGTAGAGCCAGGACAATCCTCGCGACAGCCTGCGACTCCCTCAAAA
CCAAAGAGACATGATGATATGTCGATGGCAGTGGAGGAAGAAGAAGGACTGTGTTCAAAA
GATCTTGAACTCAAGCTTTAGGACATAAAAATTCAGCAGTTCACATTTGCAGTTTAACTT
ATTCAGGATTTGAAGCCAAATATTAGTGACTTTTATATTATTATCATTTTTTGGTCAAAA
TATGTAATTCCTATCTGGTTTAGATTGTTTGAAAGTTGCACTTCTATAATATATTCACAC
TCGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU80TF U 1
AF RR2GU80JQB C 431
BS 1 699 RR2GU80TF
BS 700 1087 RR2GU80JQB

RD RR2GU80TF 709 0 0
GGAGACATTTATCTTCTTGTAAGTTGTAGTCTTGATTTATAACGTGTGCAACCCATACAA
GAACTAGAATCTTGTGTTGCAGTCTCGTCATAGTATGTCGACCGGACAAGCGTCGGAGAA
GTCCAACTTTAACCGGAGATGTAGGTTGCTCAGTCGGTACCTGAAGGAGAAGGGATTTTT
GGGAATATAGATATAGGCCTGACTCGAAACTCCGATCTTGAGTTAGCCGGAAAATCTGAT
CTTAGAGCTCAACAAAATGCAATAAAGAAGGCAAACATTTCTGAAACTAGACCCTTCAAG
TTGACTCAGAAGCAGCTTTCAGTTGGTGAAACCTCTATTTCTTCCAGAGGCAAAGCCATA
GATGTCGTCGATCTAAGTGAACCGAGAAACGTACCGGAGCCTAAAACTTCCCAGTTGACC
ATATTTTTCGGCAGCAAAGTTATAGTTTACAACGAGTTTCCTGAAGACAAAGCAAAGGAG
ATAATAGAAGCAGCCAAAGAAGCGAATCCAGTTGCTGTTGAGTCAAAGAACATTCAGAAC
CACATGAATCTTGATGTGAACATTAACAACAAAAGCAACGTTGTGATTCCTGACCTGAAT
GAACCAACGAGTTCCGGTAACAACGATGATCATCAAACAAAAGAGCAACATCAAGTCGTG
GAACGCATTGCAAGAAGAGCCTCTCTTCATCGGTTCTTT
CCAACGAAAG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2GU80JQB 657 0 0
GCAGCAAAGTTATAGTTTACAACGAGTTTCCTGAAGACAAAGCAAAGGAGATAATAGAAG
CAGCCAAAGAAGCGAATCCAGTTGCTGTTGAGTCAAAGAACATTCAGAACCACATGAATC
TTGATGTGAACATTAACAACAAAAGCAACGTTGTGATTCCTGACCTGAATGAACCAACGA
GTTCCGGTAACAACGATGATCATCAAACAAAAGAGCAACATCAAGTCGTGGAACGCATTG
CAAGAAGAGCCTCTCTTCATCGGTTCTTTTCCAAACGAAAAGACAGGGCTGTAGCTAGAG
CTCCGTATCAAGTGAACCAAAACGGTGGTCATCTTCCTCCCAAGCCACAAATGGTCGGTC
CATCGGTAGAGCCAGGACAATCCTCGCGACAGCCTGCGACTCCCTCAAAACCAAAGAGAC
ATGATGATATGTCGATGGCAGTGGAGGAAGAAGAAGGACTGTGTTCAAAAGATCTTGAAC
TCAAGCTTTAGGACATAAAAATTCAGCAGTTCACATTTGCAGTTTAACTTATTCAGGATT
TGAAGCCAAATATTAGTGACTTTTATATTATTATCATTTTTTGGTCAAAATATGTAATTC
CTATCTGGTTTAGATTGTTTGAAAGTTGCACTTCTATAATATATTCACACTCGTTCC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL5677Contig1 1149 2 2 U
GGCGGAGATGGTGAAGTCAGACACGCACATGGAGAAGGTGAAGTCTAAGCTTCTGTACGA
GAAGAAACAGATGGAGGAGGCTGAAGAGAGGAGGAAAGCTAGGGACAACAAGAAGATGGC
TAAGGAAGTACAGTCTCAGAAGATGAAGGAGCGCGCTAAGCAGAAGAAGGATGAGATTGA
GTCTGTCAAGAAGTGGAGGAAACAGAGGCAGCAGAGTGGGTTCAGCGAGAAAGGAGCTGG
AGAGCTTGATCTTGAGTTTGGAAACGGGAAGAGTTTTCAGAGAGGTGGTGGTGGTAAGAA
GAGACCTGGTGTGTCTCCCGGTGATAGGTCAGGAGGTAAAGGGAAGACTGCTTCGAGGAT
GAACAATAAGAAGAGGGAGTTTAGGGACTCCAAGTTTGGTCATGGTGGAAGGAAAGGGTT
GAGCAAGCAGAACACTGCAGAGACCACGAATGACTTCAAAGGTGGGTTTCGTGGAGGCAA
AGCTGGTGGAAACAAGAGACAGAAGAGATAAACGAAGTTTGGTTATTTAAACCTATCTAC
AGTTTCAAAACACTATAAACTATTATGTCATCCTGGATTATGTTTTTGAGAGAATGTTTC
TTTAGTTACAATGTTGTAGTAATGATTACTTTGATTAAAAAAGGTCCATGTGTTTCAAAG
AAGTTAGGTGGGAAGATGTTTCTTCTTTGAATCAATCTCTTAAAGAAGCTTAGAAGTCTA
ATTAAGACTTAGGACAATGCAAAGCTACGTAAAACATGTTGAAACAACACAACAAACCTC
CAGAATTATCTATTAATGATTTTGGAACCAAACATAATAATACGAGTGCCTGGCACCACA
AACCTAACAAAAACTTTTGGGCTATTGAGGTCAGTTAAATTGATCACATAGGGGCAGGAG
GAGGAAGAAACCTCCAGGATTCTCTATTAATGGCAGTGTCAGTGGTGTGGCTACTGAAAC
TGGATGGGCTATGTATGAATATCAAATAGTAAATCTTGCATCAAGAAAGTAAAGGCAGGC
CGGTATAATGGGCCTTATAAGAAACCCATATCATAATGCCCAAGACGATTGAATAAACCC
CAATCACCTTTCTTTAAAGAAATCTTGTTCACCAAGACGCTTTCTTAAACCATCTACGAG
ACTAGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ70TF U 1
AF RR2AJ70JQ C 356
BS 1 626 RR2AJ70TF
BS 627 1149 RR2AJ70JQ

RD RR2AJ70TF 626 0 0
GGCGGAGATGGTGAAGTCAGACACGCACATGGAGAAGGTGAAGTCTAAGCTTCTGTACGA
GAAGAAACAGATGGAGGAGGCTGAAGAGAGGAGGAAAGCTAGGGACAACAAGAAGATGGC
TAAGGAAGTACAGTCTCAGAAGATGAAGGAGCGCGCTAAGCAGAAGAAGGATGAGATTGA
GTCTGTCAAGAAGTGGAGGAAACAGAGGCAGCAGAGTGGGTTCAGCGAGAAAGGAGCTGG
AGAGCTTGATCTTGAGTTTGGAAACGGGAAGAGTTTTCAGAGAGGTGGTGGTGGTAAGAA
GAGACCTGGTGTGTCTCCCGGTGATAGGTCAGGAGGTAAAGGGAAGACTGCTTCGAGGAT
GAACAATAAGAAGAGGGAGTTTAGGGACTCCAAGTTTGGTCATGGTGGAAGGAAAGGGTT
GAGCAAGCAGAACACTGCAGAGACCACGAATGACTTCAAAGGTGGGTTTCGTGGAGGCAA
AGCTGGTGGAAACAAGAGACAGAAGAGATAAACGAAGTTTGGTTATTTAAACCTATCTAC
AGTTTCAAAACACTATAAACTATTATGTCATCCTGGATTATGTTTTTGAGAGAATGTTTC
TTTAGTTACAATGTTGTAGTAATGAT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2AJ70JQ 794 0 0
AGGATGAACAATAAGAAGAGGGAGTTTAGGGACTCCAAGTTTGGTCATGGTGGAAGGAAA
GGGTTGAGCAAGCAGAACACTGCAGAGACCACGAATGACTTCAAAGGTGGGTTTCGTGGA
GGCAAAGCTGGTGGAAACAAGAGACAGAAGAGATAAACGAAGTTTGGTTATTTAAACCTA
TCTACAGTTTCAAAACACTATAAACTATTATGTCATCCTGGATTATGTTTTTGAGAGAAT
GTTTCTTTAGTTACAATGTTGTAGTAATGATTACTTTGATTAAAAAAGGTCCATGTGTTT
CAAAGAAGTTAGGTGGGAAGATGTTTCTTCTTTGAATCAATCTCTTAAAGAAGCTTAGAA
GTCTAATTAAGACTTAGGACAATGCAAAGCTACGTAAAACATGTTGAAACAACACAACAA
ACCTCCAGAATTATCTATTAATGATTTTGGAACCAAACATAATAATACGAGTGCCTGGCA
CCACAAACCTAACAAAAACTTTTGGGCTATTGAGGTCAGTTAAATTGATCACATAGGGGC
AGGAGGAGGAAGAAACCTCCAGGATTCTCTATTAATGGCAGTGTCAGTGGTGTGGCTACT
GAAACTGGATGGGCTATGTATGAATATCAAATAGTAAATCTTGCATCAAGAAAGTAAAGG
CAGGCCGGTATAATGGGCCTTATAAGAAACCCATATCATAATGCCCAAGACGATTGAATA
AACCCCAATCACCTTTCTTTAAAGAAATCTTGTTCACCAAGACGCTTTCTTAAACCATCT
ACGAGACTAGAGAG

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL5678Contig1 1449 2 2 U
GGATAGAACGTAGAACAACATCGTCGAGATCCAGTCCAAGATTCCTCTTTTTATATTTAT
TGCGCTTAATAAGGTTGGATCCGAATCCGAAACCTGGCTCCGACACACTCAATCTGAACG
CTTTTTGAGCTTATAAGGCAAACCACACTTTCACTGGAGAAAAAAATGGAGACGGAATCG
AATCCCATTCTGCGAAAATCAGAGCTCAAATCATACACTCACAAGCACTTCCACTCTACC
AACGCGTTAGAGATCTTACGAGAGTCCGTTAGAATCCTCCGGTACAATCTCGGCGCTTTT
ATGCTAACCGCCGCCGTTTTGATCTGTCCCGTCTCCGCCGTCCTCTTACCGAACTTCCTA
GTCGACCACTCGCTGGTGAACAAGCTCGCGCTGAAGCTCCTCTTAGTAGCCAAGTCCAGC
GGTCTCCCTCTCCAGCCTCTCGTCAAACACTCCTGTCAGAAATTCGCCGAGACCGCTGTT
TCCTCCGCGGTGTGTTTCCCTCTGTTCGCCACCGTGTCGCTCTTGTCCAAAACGGCGGTG
GTTTACTCGGTGGAGGCGACTTACTCGAGGGAGAAGGTGGAGATGAGCAAGTTCTTGGTT
GCGTTGAAGAAGCTCTGGAAGCGAGTCGTGTACACTTACATTTGCGTTTGCGTTCTGATC
GTTGGCCGTTTCACTTTCTTTTGCGTTCTCCTCGTGGCGATCTGCAGCTCCTTCTCCGTC
CTCGGCTCCTCTCCTGATTTCAATGTCTACGGAGCCGTCTTAGTAGGTTTAACGTTCTCC
GTCGTATTCGCAAACGCCATCATAGTCTGTAACACCGCGGTGGTGATCTCGGTTCTTGAA
GATGTTTCGGGGGCGGGAGCGTTGGTGAGAGCTGGTGATCTGATCAAAGGCCAGGTTCAG
GTGGGGCTGTTGATATTCCTCGGGTCGACTTTGGGGTTAGCGTTCGTGGAAGGGCTGTTT
GATCACAGAGTGAAGAAGGTGAGTTATGGAGATGGGTCTTCGAGGCTGTGGGAAGGGCCT
CTGCTCGTGGTGATGTATTCGTTTGTGACGCTTATAGATTCGATGATGAGTGCAGTGTTC
TATTTCAGCTGCAGAGTTTATTATAGTATTGAAGCTTCTTCTTCTGTAGGTGAAACGCAG
CCAATAATGGATACTGTTGCTGTTGTGGATACTTAAAGCAATTGGTTTTGGATCAGACTC
ATGTGAATGGGACATTGAAGCGTATTATTAGTTGAAGATGTATGAAAGTATACATCAGTA
ATAATATGCTGTGAAACTTTTTGTTTGGCAAGATTTGTTGGATTCAACTAAAGACTCAGG
CGTATGGACATGGAAGCGTATTAGTTGAAGAGTTCAAACATTTTTGTTTCACTTGAAAAA
AAAAACATAATGCATTTTGTAAGGTTTTTGTTTTATCTACTATACTAAGAGGGGAATACC
CTTTCAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B742TF U 1
AF RR2B742JQ C 624
BS 1 762 RR2B742TF
BS 763 1449 RR2B742JQ

RD RR2B742TF 762 0 0
GGATAGAACGTAGAACAACATCGTCGAGATCCAGTCCAAGATTCCTCTTTTTATATTTAT
TGCGCTTAATAAGGTTGGATCCGAATCCGAAACCTGGCTCCGACACACTCAATCTGAACG
CTTTTTGAGCTTATAAGGCAAACCACACTTTCACTGGAGAAAAAAATGGAGACGGAATCG
AATCCCATTCTGCGAAAATCAGAGCTCAAATCATACACTCACAAGCACTTCCACTCTACC
AACGCGTTAGAGATCTTACGAGAGTCCGTTAGAATCCTCCGGTACAATCTCGGCGCTTTT
ATGCTAACCGCCGCCGTTTTGATCTGTCCCGTCTCCGCCGTCCTCTTACCGAACTTCCTA
GTCGACCACTCGCTGGTGAACAAGCTCGCGCTGAAGCTCCTCTTAGTAGCCAAGTCCAGC
GGTCTCCCTCTCCAGCCTCTCGTCAAACACTCCTGTCAGAAATTCGCCGAGACCGCTGTT
TCCTCCGCGGTGTGTTTCCCTCTGTTCGCCACCGTGTCGCTCTTGTCCAAAACGGCGGTG
GTTTACTCGGTGGAGGCGACTTACTCGAGGGAGAAGGTGGAGATGAGCAAGTTCTTGGTT
GCGTTGAAGAAGCTCTGGAAGCGAGTCGTGTACACTTACATTTGCGTTTGCGTTCTGATC
GTTGGCCGTTTCACTTTCTTTTGCGTTCTCCTCGTGGCGATCTGCAGCTCCTTCTCCGTC
CTCGGCTCCTCTCCTGATTTCAATGTCTACGGAGCCGTCTTA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2B742JQ 826 0 0
AGTCGTGTACACTTACATTTGCGTTTGCGTTCTGATCGTTGGCCGTTTCACTTTCTTTTG
CGTTCTCCTCGTGGCGATCTGCAGCTCCTTCTCCGTCCTCGGCTCCTCTCCTGATTTCAA
TGTCTACGGAGCCGTCTTAGTAGGTTTAACGTTCTCCGTCGTATTCGCAAACGCCATCAT
AGTCTGTAACACCGCGGTGGTGATCTCGGTTCTTGAAGATGTTTCGGGGGCGGGAGCGTT
GGTGAGAGCTGGTGATCTGATCAAAGGCCAGGTTCAGGTGGGGCTGTTGATATTCCTCGG
GTCGACTTTGGGGTTAGCGTTCGTGGAAGGGCTGTTTGATCACAGAGTGAAGAAGGTGAG
TTATGGAGATGGGTCTTCGAGGCTGTGGGAAGGGCCTCTGCTCGTGGTGATGTATTCGTT
TGTGACGCTTATAGATTCGATGATGAGTGCAGTGTTCTATTTCAGCTGCAGAGTTTATTA
TAGTATTGAAGCTTCTTCTTCTGTAGGTGAAACGCAGCCAATAATGGATACTGTTGCTGT
TGTGGATACTTAAAGCAATTGGTTTTGGATCAGACTCATGTGAATGGGACATTGAAGCGT
ATTATTAGTTGAAGATGTATGAAAGTATACATCAGTAATAATATGCTGTGAAACTTTTTG
TTTGGCAAGATTTGTTGGATTCAACTAAAGACTCAGGCGTATGGACATGGAAGCGTATTA
GTTGAAGAGTTCAAACATTTTTGTTTCACTTGAAAAAAAAAACATAATGCATTTTGTAAG
GTTTTTGTTTTATCTACTATACTAAGAGGGGAATACCCTTTCAGGT

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL5679Contig1 1040 2 2 U
GGCGCAGAGAAGAGTCTGATCGTGAAACTGAAGACGGAATGTGGCTATCAGTTCACTTCG
AAATTGGAAGGCATGTTTACTGACATGAAGACTTCAGAGGACACAATGAGAGGGTTTTAC
GGTAGTCACCCCGAGCTTTCAGAAGGACCAACACTTATCGTTCAGGTTCTCACAACTGGT
TCATGGCCCACGCAGCCTGCAGTACCTTGTAATCTCCCAGCTGAAGTTTCGGTTCTCTGC
GAGAAGTTCCGGTCTTATTACCTTGGAACCCACACCGGTAGAAGACTGTCATGGCAAACT
AACATGGGCACAGCGGATATCAAAGCCATCTTTGGAAAGTGTCGAAACATGAACTGAACG
TGTCGACTTTCCAGATGTGCGTCCTCATGCTGTTCAACAACTCTGATCGTCTCAGCTACA
AAGAGATCGAATAGGCCACTGAAATCCCAGCACCCGATCTGAAACGTTGCTTGCAGTCGC
TTGCGTGTGTGAAAGGCAAAAACGTGATAAAGAAAGAACCCATGAGCAAAGACATAGGAG
AGGAGGATTTGTTTTCAGTGAACGACAAGTTCACAAGCAAGTTTTACAAAGTGAAGATTG
GAACGGTGGTGGCACAAAAGGAGACGGAACCGGAGAAGCAAGAGACGAGACAGAGAGTAG
AGGAAGACAGGAAACCGCAGATTGAAGCAGCGATTGTGAGGATAATGAAGTCGAGAAAGA
TACTTGACCACAACAATATAATCGCGGAGGTGACGAAACAGTTGCAGCCACGGTTTTTGG
CTAACCCAACGGAGATAAAGAAGAGAATTGAGTCGCTCACTGAACGTGATTTTTTGGAAA
GGGATAACACGGACCGGAAACTTTACCGCTATTTAGCCTAATAAGTTGATTACCTCGACA
ACAAAAGGCCCTTTGTTTTTTCTGTTAATTTGCTTTGTTTCTTTGTTTTTGGTGTAAAAG
CTTATGAACGGTACGGTAGTTGCTAGAATCAAACAATCACTGTATTGCTGCCGTTGGTCG
AATATTTCATTTGCTCCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS23TF U 1
AF RR2FS23JQ C 463
BS 1 735 RR2FS23TF
BS 736 1040 RR2FS23JQ

RD RR2FS23TF 735 0 0
GGCGCAGAGAAGAGTCTGATCGTGAAACTGAAGACGGAATGTGGCTATCAGTTCACTTCG
AAATTGGAAGGCATGTTTACTGACATGAAGACTTCAGAGGACACAATGAGAGGGTTTTAC
GGTAGTCACCCCGAGCTTTCAGAAGGACCAACACTTATCGTTCAGGTTCTCACAACTGGT
TCATGGCCCACGCAGCCTGCAGTACCTTGTAATCTCCCAGCTGAAGTTTCGGTTCTCTGC
GAGAAGTTCCGGTCTTATTACCTTGGAACCCACACCGGTAGAAGACTGTCATGGCAAACT
AACATGGGCACAGCGGATATCAAAGCCATCTTTGGAAAGTGTCGAAACATGAACTGAACG
TGTCGACTTTCCAGATGTGCGTCCTCATGCTGTTCAACAACTCTGATCGTCTCAGCTACA
AAGAGATCGAATAGGCCACTGAAATCCCAGCACCCGATCTGAAACGTTGCTTGCAGTCGC
TTGCGTGTGTGAAAGGCAAAAACGTGATAAAGAAAGAACCCATGAGCAAAGACATAGGAG
AGGAGGATTTGTTTTCAGTGAACGACAAGTTCACAAGCAAGTTTTACAAAGTGAAGATTG
GAACGGTGGTGGCACAAAAGGAGACGGAACCGGAGAAGCAAGAGACGAGACAGAGAGTAG
AGGAAGACAGGAAACCGCAGATTGAAGCAGCGATTGTGAGGATAATGAAGTCGAGAAAGA
TACTTGACCACAACA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2FS23JQ 578 0 0
AACGTTGCTTGCAGTCGCTTGCGTGTGTGAAAGGCAAAAACGTGATAAAGAAAGAACCCA
TGAGCAAAGACATAGGAGAGGAGGATTTGTTTTCAGTGAACGACAAGTTCACAAGCAAGT
TTTACAAAGTGAAGATTGGAACGGTGGTGGCACAAAAGGAGACGGAACCGGAGAAGCAAG
AGACGAGACAGAGAGTAGAGGAAGACAGGAAACCGCAGATTGAAGCAGCGATTGTGAGGA
TAATGAAGTCGAGAAAGATACTTGACCACAACAATATAATCGCGGAGGTGACGAAACAGT
TGCAGCCACGGTTTTTGGCTAACCCAACGGAGATAAAGAAGAGAATTGAGTCGCTCACTG
AACGTGATTTTTTGGAAAGGGATAACACGGACCGGAAACTTTACCGCTATTTAGCCTAAT
AAGTTGATTACCTCGACAACAAAAGGCCCTTTGTTTTTTCTGTTAATTTGCTTTGTTTCT
TTGTTTTTGGTGTAAAAGCTTATGAACGGTACGGTAGTTGCTAGAATCAAACAATCACTG
TATTGCTGCCGTTGGTCGAATATTTCATTTGCTCCCTT

QA 1 578 1 578
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5681Contig1 1188 2 8 U
GGAAAGAAAAGACAGTAATGGAGGAGGACCGTGTGAGACTCATATGCAAACGAACCGTAG
TGAGCACGAAACCGGTTGAACAAGGGCGATTGTACCGGTTCTCAGTATTCGACCACGTCA
TGGAACCTAATCACATCCGTCTAGTATACTATTACCGGACTTCCAAGACTAGAGAACCGG
GAGAAATCACCAAAAAACTAAGGGAATCATTAGCATACACTCTCAATTGTTATCCTATCG
TAACCGGGAGATTGGTTAAGGAAACTGATGGTTCAGAAGAGAACCGGTGGAAGGTGAAGA
GCAACGACGCCGGGGTGAGAATGGTGGAGGCCAGAGCTACCGGGACGGTTGAGGAATGGC
GTAGGAGTTTGAATAGAGAGGAAGAGCTTAAGCTTGTTCATTGGGAGGACATGTATCACC
TTCCTTACTATTGGTCTACCTTTTATGTTCAGGTGACTGAGTTTGAGAGCGGTGGGTTAG
CTATTGGGTTAAGTTGTACTCATCTGTTAGCTGATCCAGTTTGTGCAATGATGTTTATTA
GAACATGGGCAGATTTAACTCTGACTCGAAACATGATGACGCCACCACTCTTCCACTCAC
TCCCGCCTCGCAGGTTCACCAGCCATAAGCTCTCTAACAACCAGCTTCTTAGCCATTACA
TCAAATCTTGCTCCCTTACAGCTCCACCTTCAAACGTAACCGAGGATAGTATGGTCACTA
TAACCCTTCTGTTCCCGGATCCGATGGTCAAAGCGGGAGAGACCGAGCCAGGGCTTTCAG
CATTTGAGATATTGTCTGGACTCTTCTGTGTCTGTGTGAGTCGAGCCAAAGGGAAGAGGA
ACGAGCTCACTGACATGTCCTTGTGCCTAGACGTTAGGAAGCTATTGCGTTTAGACCAAA
GTTACTTTGGTAATTGCATGGTCTATCACAAGGTTCACTATTCCAAACCAGTTAACACCA
AAGACAGGTTATTATTATTTTCTTACCTTGTTAAAGAGATTCATAACGTGACCAAGGACT
AGACTACGACACGGTCATGGACTTGGTCGAGTGGCTCAGTAGCAACAAAAACAATCCCAT
ATCCAACGGTTCGGATCTCGTATGTACTAATCTAGAGAACATGGCGAATTCGCGTACATG
ATGTTCGAGGAAGATTTGATGTTAGCCACATATCTGCTACGTTGAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR68TF U 1
AF RR2E221TF U 399
BS 1 408 RR2GR68TF
BS 409 409 RR2E221TF
BS 410 419 RR2GR68TF
BS 420 420 RR2E221TF
BS 421 458 RR2GR68TF
BS 459 459 RR2E221TF
BS 460 684 RR2GR68TF
BS 685 1188 RR2E221TF

RD RR2GR68TF 684 0 0
GGAAAGAAAAGACAGTAATGGAGGAGGACCGTGTGAGACTCATATGCAAACGAACCGTAG
TGAGCACGAAACCGGTTGAACAAGGGCGATTGTACCGGTTCTCAGTATTCGACCACGTCA
TGGAACCTAATCACATCCGTCTAGTATACTATTACCGGACTTCCAAGACTAGAGAACCGG
GAGAAATCACCAAAAAACTAAGGGAATCATTAGCATACACTCTCAATTGTTATCCTATCG
TAACCGGGAGATTGGTTAAGGAAACTGATGGTTCAGAAGAGAACCGGTGGAAGGTGAAGA
GCAACGACGCCGGGGTGAGAATGGTGGAGGCCAGAGCTACCGGGACGGTTGAGGAATGGC
GTAGGAGTTTGAATAGAGAGGAAGAGCTTAAGCTTGTTCATTGGGAGGGCATGTATCACT
TTCCTTACTATTGGTCTACCTTTTATGTTCAGGTGACTTAGTTTGAGAGCGGTGGGTTAG
CTATTGGGTTAAGTTGTACTCATCTGTTAGCTGATCCAGTTTGTGCAATGATGTTTATTA
GAACATGGGCAGATTTAACTCTGACTCGAAACATGATGACGCCACCACTCTTCCACTCAC
TCCCGCCTCGCAGGTTCACCAGCCATAAGCTCTCTAACAACCAGCTTCTTAGCCATTACA
TCAAATCTTGCTCCCTTACAGCTC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2E221TF 790 0 0
G
ATTGGGAGGACATGTATCACCTTCCTTACTATTGGTCTACCTTTTATGTTCAGGTGACTG
AGTTTGAGAGCGGTGGGTTAGCTATTGGGTTAAGTTGTACTCATCTGTTAGCTGATCCAG
TTTGTGCAATGATGTTTATTAGAACATGGGCAGATTTAACTCTGACTCGAAACATGATGA
CGCCACCACTCTTCCACTCACTCCCGCCTCGCAGGTTCACCAGCCATAAGCTCTCTAACA
ACCAGCTTCTTAGCCATTACATCAAATCTTGCTCCCTTACAGCTCCACCTTCAAACGTAA
CCGAGGATAGTATGGTCACTATAACCCTTCTGTTCCCGGATCCGATGGTCAAAGCGGGAG
AGACCGAGCCAGGGCTTTCAGCATTTGAGATATTGTCTGGACTCTTCTGTGTCTGTGTGA
GTCGAGCCAAAGGGAAGAGGAACGAGCTCACTGACATGTCCTTGTGCCTAGACGTTAGGA
AGCTATTGCGTTTAGACCAAAGTTACTTTGGTAATTGCATGGTCTATCACAAGGTTCACT
ATTCCAAACCAGTTAACACCAAAGACAGGTTATTATTATTTTCTTACCTTGTTAAAGAGA
TTCATAACGTGACCAAGGACTAGACTACGACACGGTCATGGACTTGGTCGAGTGGCTCAG
TAGCAACAAAAACAATCCCATATCCAACGGTTCGGATCTCGTATGTACTAATCTAGAGAA
CATGGCGAATTCGCGTACATGATGTTCGAGGAAGATTTGATGTTAGCCACATATCTGCTA
CGTTGAGGG

QA 2 790 2 790
DS 



AS 1 2

CO CL5682Contig1 773 2 2 U
GGAATTCGTCAGCTTCCCCTATGAATGAGAGTGATACCGTTGAGGTTGATCTCCCTGAAG
GAGACGAGGATGACAGGATTCCTGCGGAGTTTGCTTCTGAGTCTAACAGAGATGAAAGCT
ACCTTCGAGCAGATGATGACGCCCACGATCTTCTTATGAGTGCTCATAGCGCACTTAGCA
GAAACAGCCGTGGGACTCATACAAGCTCAACCAGGAGTGCCATGACCAACAAGTTCGACG
TGGAAGAGCTTGAAATGCTTTTGGAAGCATATTTCGTGCAGATTGATGGTACACTGAACA
AACTTTCAACACTAAGGGAGTACGTGGATGACACAGAGGACTACATCAACATAATGCTAG
ATGACAAACAGAATCATCTGTTGCAAATGGGTGTGATGCTAACGACAGCGACTCTGGTGA
TGAGTGCATTTATCGCTGTAGCTGGAGTGTTCGGGATGAACATTAACATAGAGCTGTTCA
ATGATGATAAAGCTGGTCCGATGAGATTCGCGTGGACTGTAATTGGAGGTTTTATCGGGA
GTATAGTCCTTTATGTTGGTGCCATTGGGTGGTGGAAGCAGAAGCGCTTGCTTGAATGAG
TCAACCGAACATTGGGAAGAATGATGTCTCTTGCTAAAATATTTGTACACTAATAAGATT
TTTATGGGGGTTTTAATTTTTTGTTATTGAGAATAACGTCCCTCCCTTTGCATAGTTAAA
TTGTAAAAGAGAGCAAATCGAAATTACATGATTTACATATTTGCAAGATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE11TF U 1
AF RR2EE11JQ C 254
BS 1 526 RR2EE11TF
BS 527 773 RR2EE11JQ

RD RR2EE11TF 526 0 0
GGAATTCGTCAGCTTCCCCTATGAATGAGAGTGATACCGTTGAGGTTGATCTCCCTGAAG
GAGACGAGGATGACAGGATTCCTGCGGAGTTTGCTTCTGAGTCTAACAGAGATGAAAGCT
ACCTTCGAGCAGATGATGACGCCCACGATCTTCTTATGAGTGCTCATAGCGCACTTAGCA
GAAACAGCCGTGGGACTCATACAAGCTCAACCAGGAGTGCCATGACCAACAAGTTCGACG
TGGAAGAGCTTGAAATGCTTTTGGAAGCATATTTCGTGCAGATTGATGGTACACTGAACA
AACTTTCAACACTAAGGGAGTACGTGGATGACACAGAGGACTACATCAACATAATGCTAG
ATGACAAACAGAATCATCTGTTGCAAATGGGTGTGATGCTAACGACAGCGACTCTGGTGA
TGAGTGCATTTATCGCTGTAGCTGGAGTGTTCGGGATGAACATTAACATAGAGCTGTTCA
ATGATGATAAAGCTGGTCCGATGAGATTCGCGTGGACTGTAATTGG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2EE11JQ 520 0 0
AATGCTTTTGGAAGCATATTTCGTGCAGATTGATGGTACACTGAACAAACTTTCAACACT
AAGGGAGTACGTGGATGACACAGAGGACTACATCAACATAATGCTAGATGACAAACAGAA
TCATCTGTTGCAAATGGGTGTGATGCTAACGACAGCGACTCTGGTGATGAGTGCATTTAT
CGCTGTAGCTGGAGTGTTCGGGATGAACATTAACATAGAGCTGTTCAATGATGATAAAGC
TGGTCCGATGAGATTCGCGTGGACTGTAATTGGAGGTTTTATCGGGAGTATAGTCCTTTA
TGTTGGTGCCATTGGGTGGTGGAAGCAGAAGCGCTTGCTTGAATGAGTCAACCGAACATT
GGGAAGAATGATGTCTCTTGCTAAAATATTTGTACACTAATAAGATTTTTATGGGGGTTT
TAATTTTTTGTTATTGAGAATAACGTCCCTCCCTTTGCATAGTTAAATTGTAAAAGAGAG
CAAATCGAAATTACATGATTTACATATTTGCAAGATTTTG

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 2

CO CL5683Contig1 764 2 3 U
TTTTTGGTTCCGTATCGTCGTCGTCACAAATCGAGAGATTTTCACAGAGAGAGAAATCTT
CTTCGTCTTCCGTCTTCCTTCTTCCTTCTTTAGTGTTTGAAATGTCGTATGATGAGATGC
TTGCTGCTGCGAAGAAAGCCGCCTCTCTCGCTGCTCGTCTCAGTAACGAAGTGAGGAAAT
CTCTGTTGGTCTCTGACGTTTGGAACAAATCGGATGATAGTCCTGTCACTGTTGCTGATT
ATGGGTCTCAGGCGGTGGTTAGCCTTGTTCTGGAAAGGGAACTCAAGAATGAACCTGTCT
CCTTAGTTGCTGAAGAGGATTCTGCTGAGCTGAGGAAAGTTGCTGCTGAGACGGTTCTGG
CGCGTATTACAGAGCTTGTTAAAGATACTCTCGCTACTGATGAATCCTATGCTTCTTCTC
CTTTGTCTTCCGATGATGTCCTCAACGCTATTGACTCTGGCATCAGAAGGAGGTCCTAAA
GGTCGCCATTGGGTCTTGGATCCTATTGGTGGCACCAGAGGATTTATAAGAGGAGAACAG
TATGTAATAGGACTAGCATTGCTTGTGGAAGGAAAAGTAGTGCTTGGTGTAATGGCTTGT
CCCAAGCTTCCTTTGGCTTCCACTGCTGGCAGCAACACACACAACAAGTCCTCACCTGAA
AAAGTGGGTTGCCTTTTCTTCGGCGCGGTTGGCACTGGAGCTTATGTCCAGTCACTCAAT
GCTCTCGACTCTCCTCCTGTCAAGGTGGAGGTAAGCAGCAATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E641TF U 2
AF RR2F393TF U 1
BS 1 141 RR2F393TF
BS 142 142 RR2E641TF
BS 143 764 RR2F393TF

RD RR2E641TF 302 0 0
TTTTTGG
TCCGTATCGTCGTCGTCACAAATCGAGAGATTTTCACAGAGAGAGAAATCTTCTTCGTCT
TCCGTCTTCCTTCTTCCTTCTTTA*TGTTTGAAATGTCGTATGATGAGATGCTTGCTGCT
GCGAAGAAAGCCGCCTCTCTCGCTGCTCGTCTCA*TAACGAAGTGAGGAAATCTCTGTTG
GTCTCTGACGTTTGGAACAAATCGGATGATA*TCCTGTCACTGTTGCTGATTATGG*TCT
CAGGCGGTGGT*AGCCTTGTTCTGGAAAGGGAACTCAAGAATGAACCTGTCTCCT

QA 8 302 8 302
DS 

RD RR2F393TF 764 0 0
TTTTTGGTTCCGTATCGTCGTCGTCACAAATCGAGAGATTTTCACAGAGAGAGAAATCTT
CTTCGTCTTCCGTCTTCCTTCTTCCTTCTTTAGTGTTTGAAATGTCGTATGATGAGATGC
TTGCTGCTGCGAAGAAAGCCGTCTCTCTCGCTGCTCGTCTCAGTAACGAAGTGAGGAAAT
CTCTGTTGGTCTCTGACGTTTGGAACAAATCGGATGATAGTCCTGTCACTGTTGCTGATT
ATGGGTCTCAGGCGGTGGTTAGCCTTGTTCTGGAAAGGGAACTCAAGAATGAACCTGTCT
CCTTAGTTGCTGAAGAGGATTCTGCTGAGCTGAGGAAAGTTGCTGCTGAGACGGTTCTGG
CGCGTATTACAGAGCTTGTTAAAGATACTCTCGCTACTGATGAATCCTATGCTTCTTCTC
CTTTGTCTTCCGATGATGTCCTCAACGCTATTGACTCTGGCATCAGAAGGAGGTCCTAAA
GGTCGCCATTGGGTCTTGGATCCTATTGGTGGCACCAGAGGATTTATAAGAGGAGAACAG
TATGTAATAGGACTAGCATTGCTTGTGGAAGGAAAAGTAGTGCTTGGTGTAATGGCTTGT
CCCAAGCTTCCTTTGGCTTCCACTGCTGGCAGCAACACACACAACAAGTCCTCACCTGAA
AAAGTGGGTTGCCTTTTCTTCGGCGCGGTTGGCACTGGAGCTTATGTCCAGTCACTCAAT
GCTCTCGACTCTCCTCCTGTCAAGGTGGAGGTAAGCAGCAATGA

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL5684Contig1 1371 2 2 U
GGAGAAGAAAATGAACCGGTGAAATATGCAGAGGCAACAATAATGAAACTTTCTTTGTAT
CTTTGTAACTCCCTAGAAAACTTTTGGGTTTGTTTAAGTGATCTGAAATGGTGAAGAAGG
CGTCACTCTTCTCTCCGGAAACCCCACACTTCTTCCAGCCGTTTCTTCTCGGGTCCAAGA
GTCATCTGAATATTCCTGTGAAGTTCTTCTCGAACACATTGAAGGAAAACACGAGGGCAA
GACAGTAACGTTGAGATCTGATGCATTGGAGGAAACATGGAAAGTGAAGATGGAAGGCCA
AAGACTCACTCATGGTTGGAAGGAGTTCGTTGAGGCACATGTTCTTGGAGTTGGTGACTT
TGTCGTCTTCAGACACGAACGAGACATGTTGTTCCATGTCACTGCTTTAGGATCCGATTG
CTGTGAGATCCAATACACACCGTCTGGTAGTCGCCGCCAAGAAGACGAAGAAGAGAGTGT
TGAAGTAGAAAGATCTGCTAAGGAAGTTGAGAAGAATCTCACAAAGTTTGTCAAGTTAAC
TCCTACATCAACCAGCTTTGAGACCGGTAGACAGCATTTACCAGCAAGGTTCACGAGAGT
GAACGGACTCATCAAGCCAGGGAAGATCATTCTTGTGGATAAAAAGGGAGCTGAGTGGGC
GATGGAGCTTAAGGTTGAAAAAACAAATGGATCTATTATGTACATGTACATTATGAGTCG
CAATGGCTGGAGTATATTCTGTCGCGTGAATGAAGTAAGAGCAGGGGAGTCTCTAACTTT
GGAGTTGATCAAAGGAGGCGCAAGTCCTATGCTCAAGTTCTGTTCCAAGATGGAGCAACC
ACCGTTTGAAGCAGAGGCTAGTGCTCACAAGCGAGCTAAATGGAGTCAGGAAATAAAAGA
GAAAACAGCTGAAGAAGGAGAACCCTCTCATCGCACTATGGCATCTAAGGAAACCAATGC
ATATCACGAAAACTTACAGGACAAGCAACCTTGCTCTGACTCAGATCTGATGGCTAAGGT
GAAACATAGCGTTGTAAGTACTTTAACTAGTATCAGACTGTTTCGTGAAGAGCTCGAGAC
AAAGGAACAAGAACTGGAAGATACATTGCAGGAAATCAAAAACTTAGAGAGGAGAAGACA
AAGGGAATAAAACAACATCCTCAAATAATAACTAAGTTTTAATGTGGAGCTGAAGATCAT
TCACAGACTTCTGTAAACTCTGTTTTATTTGAAGTCTTTGTTTCAAGATTGTTTCAGACA
TTTAGTGCTGGAGAATTAGATTGTAGTAGTTCCTAGTCCATTACTTTAGGGCTTATTCCC
ACCGTTTTAGTTCCACTTGTTATGTTATTTATAAAAAAAATCAAGACTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D753TF U 1
AF RR2D753JQ C 556
BS 1 673 RR2D753TF
BS 674 1371 RR2D753JQ

RD RR2D753TF 676 0 0
GGAGAAGAAAATGAACCGGTGAAATATGCAGAGGCAACAATAATGAAACTTTCTTTGTAT
CTTTGTAACTCCCTAGAAAACTTTTGGGTTTGTTTAAGTGATCTGAAATGGTGAAGAAGG
CGTCACTCTTCTCTCCGGAAACCCCACACTTCTTCCAGCCGTTTCTTCTCGGGTCCAAGA
GTCATCTGAATATTCCTGTGAAGTTCTTCTCGAACACATTGAAGGAAAACACGAGGGCAA
GACAGTAACGTTGAGATCTGATGCATTGGAGGAAACATGGAAAGTGAAGATGGAAGGCCA
AAGACTCACTCATGGTTGGAAGGAGTTCGTTGAGGCACATGTTCTTGGAGTTGGTGACTT
TGTCGTCTTCAGACACGAACGAGACATGTTGTTCCATGTCACTGCTTTAGGATCCGATTG
CTGTGAGATCCAATACACACCGTCTGGTAGTCGCCGCCAAGAAGACGAAGAAGAGAGTGT
TGAAGTAGAAAGATCTGCTAAGGAAGTTGAGAAGAATCTCACAAAGTTTGTCAAGTTAAC
TCCTACATCAACCAGCTTTGAGACCGGTAGACAGCATTTACCAGCAAGGTTCACGAGAGT
GAACGGACTCATCAAGCCAGGGAAGATCATTCTTGTGGATAAAAAGGGAGCTGAGTGGGC
GATGGAGCTTAAG
TTG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2D753JQ 816 0 0
CTTTGAGACCGGTAGACAGCATTTACCAGCAAGGTTCACGAGAGTGAACGGACTCATCAA
GCCAGGGAAGATCATTCTTGTGGATAAAAAGGGAGCTGAGTGGGCGATGGAGCTTAAGGT
TGAAAAAACAAATGGATCTATTATGTACATGTACATTATGAGTCGCAATGGCTGGAGTAT
ATTCTGTCGCGTGAATGAAGTAAGAGCAGGGGAGTCTCTAACTTTGGAGTTGATCAAAGG
AGGCGCAAGTCCTATGCTCAAGTTCTGTTCCAAGATGGAGCAACCACCGTTTGAAGCAGA
GGCTAGTGCTCACAAGCGAGCTAAATGGAGTCAGGAAATAAAAGAGAAAACAGCTGAAGA
AGGAGAACCCTCTCATCGCACTATGGCATCTAAGGAAACCAATGCATATCACGAAAACTT
ACAGGACAAGCAACCTTGCTCTGACTCAGATCTGATGGCTAAGGTGAAACATAGCGTTGT
AAGTACTTTAACTAGTATCAGACTGTTTCGTGAAGAGCTCGAGACAAAGGAACAAGAACT
GGAAGATACATTGCAGGAAATCAAAAACTTAGAGAGGAGAAGACAAAGGGAATAAAACAA
CATCCTCAAATAATAACTAAGTTTTAATGTGGAGCTGAAGATCATTCACAGACTTCTGTA
AACTCTGTTTTATTTGAAGTCTTTGTTTCAAGATTGTTTCAGACATTTAGTGCTGGAGAA
TTAGATTGTAGTAGTTCCTAGTCCATTACTTTAGGGCTTATTCCCACCGTTTTAGTTCCA
CTTGTTATGTTATTTATAAAAAAAATCAAGACTATT

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

CO CL5685Contig1 1044 2 2 U
GGGTACTTCCTATCATCGATATCTCTTCGCCGGACAAGATATCCACATCCACCGCACAGT
TGATCCGTAAGGCATGTCTTGAACATGGGTTCTTCTATGTCAAGAACCATGGCATCTCTG
AAGAATTGATGGAAGAGGTTTTGAGAGAGTAAAAGCTTCTTTAATCTCCCACTAGATGAG
AAGATGTCTTTACTCCGCCGCGATCTTCTCGGTTATACTCCACTCCATGCTGAGAAACTC
GACCCCTCCTTGACCTCCTCCACAGGTGATTCTAAGGAAAGCTTTTACTTTGGCTCTTTG
GAAGGAGCTCTGGCAGCGTTATCCAAATCAATGGCCTCCTGAAGATCTCTTACCATCATG
GAGGCAAGCCATGGAATGTTACTACAAGAATGTCCTGTCCGTTGGTCGAAAGTTGCTCGG
CTTGATTGCCTTGGCATTGGATTTAGATGAGGTTTTCTACGAACAAATCGGAGCCTTGAA
TGATCCTACAGCAGTTGTTCGCCTCTTACGCTATCCGGGTGAAGTGATTTCGTCGGATGT
TGAAACATATGGTGCCTCAGCTCACTCGGATTACGGGATGGTCACTCTTCTTTTAACTGA
TGGAGTCCCAGGACTTCAGGTTTGTAGAGACAAGTCAAGACAACCACGTGTTTGGGAAGA
TGTACCTGGAATTAGAGGGGCGTTCATTGTCAACATTGGTGATATGATGGAGAGATGGAC
AAATGGATTGTTCCGGTCTACCCTGCACAGAGTGATGCTTGTTGGAAAAGAACGTTACTC
GGTGGTTTTCTTCTTAGATCCCAATCCAGATTGTCACGTGGAATGTTTGGAGAGTTGTTG
CAGCGAAACTTGTCCTCCAAGATTCCCTCCTATCCTCGCCGGTGACTATATTAAGGAGCG
TTTCAGGCTAACCTACGAGTCTTAGGAGGTGTTATTGAATTAATGAATTCAATGGAATTC
AATGTAACTGCAATTAGGAATGTTTCAGTGGATTGGATTGGATTCTTTACAAGATATGAT
GGATTTTAGTGTTCATTGTAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL29TF U 1
AF RR2EL29JQ C 343
BS 1 615 RR2EL29TF
BS 616 1044 RR2EL29JQ

RD RR2EL29TF 615 0 0
GGGTACTTCCTATCATCGATATCTCTTCGCCGGACAAGATATCCACATCCACCGCACAGT
TGATCCGTAAGGCATGTCTTGAACATGGGTTCTTCTATGTCAAGAACCATGGCATCTCTG
AAGAATTGATGGAAGAGGTTTTGAGAGAGTAAAAGCTTCTTTAATCTCCCACTAGATGAG
AAGATGTCTTTACTCCGCCGCGATCTTCTCGGTTATACTCCACTCCATGCTGAGAAACTC
GACCCCTCCTTGACCTCCTCCACAGGTGATTCTAAGGAAAGCTTTTACTTTGGCTCTTTG
GAAGGAGCTCTGGCAGCGTTATCCAAATCAATGGCCTCCTGAAGATCTCTTACCATCATG
GAGGCAAGCCATGGAATGTTACTACAAGAATGTCCTGTCCGTTGGTCGAAAGTTGCTCGG
CTTGATTGCCTTGGCATTGGATTTAGATGAGGTTTTCTACGAACAAATCGGAGCCTTGAA
TGATCCTACAGCAGTTGTTCGCCTCTTACGCTATCCGGGTGAAGTGATTTCGTCGGATGT
TGAAACATATGGTGCCTCAGCTCACTCGGATTACGGGATGGTCACTCTTCTTTTAACTGA
TGGAGTCCCAGGACT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2EL29JQ 702 0 0
AGATCTCTTACCATCATGGAGGCAAGCCATGGAATGTTACTACAAGAATGTCCTGTCCGT
TGGTCGAAAGTTGCTCGGCTTGATTGCCTTGGCATTGGATTTAGATGAGGTTTTCTACGA
ACAAATCGGAGCCTTGAATGATCCTACAGCAGTTGTTCGCCTCTTACGCTATCCGGGTGA
AGTGATTTCGTCGGATGTTGAAACATATGGTGCCTCAGCTCACTCGGATTACGGGATGGT
CACTCTTCTTTTAACTGATGGAGTCCCAGGACTTCAGGTTTGTAGAGACAAGTCAAGACA
ACCACGTGTTTGGGAAGATGTACCTGGAATTAGAGGGGCGTTCATTGTCAACATTGGTGA
TATGATGGAGAGATGGACAAATGGATTGTTCCGGTCTACCCTGCACAGAGTGATGCTTGT
TGGAAAAGAACGTTACTCGGTGGTTTTCTTCTTAGATCCCAATCCAGATTGTCACGTGGA
ATGTTTGGAGAGTTGTTGCAGCGAAACTTGTCCTCCAAGATTCCCTCCTATCCTCGCCGG
TGACTATATTAAGGAGCGTTTCAGGCTAACCTACGAGTCTTAGGAGGTGTTATTGAATTA
ATGAATTCAATGGAATTCAATGTAACTGCAATTAGGAATGTTTCAGTGGATTGGATTGGA
TTCTTTACAAGATATGATGGATTTTAGTGTTCATTGTAATTC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL5686Contig1 922 2 3 U
TCAAAACGACGCTGAGAGCTCGATCGGAGAGTGAACATGAGAGGTCACGAAGGCACAAGA
AGCATGACAAGCCAAAGAGGGCAAAGGAAAAGGAGTGAAGCAGCAAGAGTCATCGTCATA
AACGTCGTAAGAACAGAGACAAAAAGATGCTCTTTTTTGGCATCTAACTCATTTTGCAAA
AACGATATAGTGTTTGTCTTTTCATCTCTTTGTTTGACTGTGTGTGTTGTAGGGATTGAA
TATGAGTACATAGGAGTGAATCCGCTCAAGAGAGATGAGTTCTTGAAGGTGAATCCAATG
GGTGCTGTACCAGCTCTGGTTGATGGAGACGTTGTGGTTTCTGATTCCTTTGCTATCATA
ATGTATCTAGATGAGAAGTATCCTGACCCACCTCTCTTACCTCCTGACCTCCACAAACGT
GCTGTGAACTACCAGGCAGCGAGTATTGTCTTGTCTGGCATACAGCCTTATCAAAATACG
CCTGTTGCTATGTATATTGAGGAGAAGACCAACTCTGAGGAGAAGACTGCTTGGGTCAAT
AACTCTCTATCTATGGGAAAAAGATTATGCTGAAGGTTGATAAGTCCAAAGTGGACAAAG
CTGCAGAGAGCAAGAGAAATGAATTGCTTAAGTTCTTGAATGCAAGCTTCGACTAGTTTT
ATTCCAAACACCAAAAATGTATCAGACCCTCTTTGACAACGAGTCTCTGTTCAGGATGTT
GGTCTGATGATTATTATAGCAGGTTTTGAGACTTTTTAGTGATCAGTACCAGTTTATACT
TTTCATTTTCTCTGAGATATTATATGCTTCATTGATTCTAGGTGGGTTCTATGTGCTTTG
GGATATCTGTCCATTGTGTTAAATGTTGACTTGGACATATATAATAAGATTATTATGGCT
TATAGCTATGATGTTTACTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH09TF U 159
AF RR2AH09JQ C 1
BS 1 158 RR2AH09JQ
BS 159 431 RR2AH09TF
BS 432 922 RR2AH09JQ

RD RR2AH09TF 273 0 0
GGCATCTAACTCATTTTGCAAAAACGATATAGTGTTTGTCTTTTCATCTCTTTGTTTGAC
TGTGTGTGTTGTAGGGATTGAATATGAGTACATAGGAGTGAATCCGCTCAAGAGAGATGA
GTTCTTGAAGGTGAATCCAATGGGTGCTGTACCAGCTCTGGTTGATGGAGACGTTGTGGT
TTCTGATTCCTTTGCTATCATAATGTATCTAGATGAGAAGTATCCTGACCCACCTCTCTT
ACCTCCTGACCTCCACAAACGTGCTGTGAACTA

QA 1 273 1 273
DS 

RD RR2AH09JQ 922 0 0
TCAAAACGACGCTGAGAGCTCGATCGGAGAGTGAACATGAGAGGTCACGAAGGCACAAGA
AGCATGACAAGCCAAAGAGGGCAAAGGAAAAGGAGTGAAGCAGCAAGAGTCATCGTCATA
AACGTCGTAAGAACAGAGACAAAAAGATGCTCTTTTTTGGCATCTAACTCATTTTGCAAA
AACGATATAGTGTTTGTCTTTTCATCTCTTTGTTTGACTGTGTGTGTTGTAGGGATTGAA
TATGAGTACATAGGAGTGAATCCGCTCAAGAGAGATGAGTTCTTGAAGGTGAATCCAATG
GGTGCTGTACCAGCTCTGGTTGATGGAGACGTTGTGGTTTCTGATTCCTTTGCTATCATA
ATGTATCTAGATGAGAAGTATCCTGACCCACCTCTCTTACCTCCTGACCTCCACAAACGT
GCTGTGAACTACCAGGCAGCGAGTATTGTCTTGTCTGGCATACAGCCTTATCAAAATACG
CCTGTTGCTATGTATATTGAGGAGAAGACCAACTCTGAGGAGAAGACTGCTTGGGTCAAT
AACTCTCTATCTATGGGAAAAAGATTATGCTGAAGGTTGATAAGTCCAAAGTGGACAAAG
CTGCAGAGAGCAAGAGAAATGAATTGCTTAAGTTCTTGAATGCAAGCTTCGACTAGTTTT
ATTCCAAACACCAAAAATGTATCAGACCCTCTTTGACAACGAGTCTCTGTTCAGGATGTT
GGTCTGATGATTATTATAGCAGGTTTTGAGACTTTTTAGTGATCAGTACCAGTTTATACT
TTTCATTTTCTCTGAGATATTATATGCTTCATTGATTCTAGGTGGGTTCTATGTGCTTTG
GGATATCTGTCCATTGTGTTAAATGTTGACTTGGACATATATAATAAGATTATTATGGCT
TATAGCTATGATGTTTACTCTT

QA 1 922 1 922
DS 



AS 1 2

CO CL5687Contig1 1503 2 2 U
CTCAGATTTCACCGATCCACTTTCTCGAGTCCATTTTCGATAGTGAATCTCGTGAGTGAT
GGGAGGACTAGCGATGGAGGAGATGCCATTATCGGCGTTGTTCGAGGAAGCAAGGAAGAT
TCATCTCGCGGCTTCAGACTCTCGCGCCGATCAGAATGATGTGAAGAAAGGATGTGAGAT
GTTAGACAAGTGCGAAGACATGGTGGGGAAGCTGGGGCTCTTCTCTTCTAACGAGACTAA
AGAAGATATCAGCACCAACAATCCCAAGTATCTTTTGGTACCTTTCTATCTTGCGGAGTT
GACAGAGAAAATCAAACAGGAAGATCGGATTCCGATTGTCAAAGCTTCTTATGCTAAGTT
GAAGGAGTTCTTTTCGTTTTGTGAGGCAATGGAACTTGTTCCGGAAGAGGAGTTGGAGGC
TTCTTCACGAGGTGGTTCTGCTCCACCTGCTGATCGAAGAGCTCTCAAGATAGCTCGGTT
CAAACGTCAAAAGGCTGCAGAGGCGAAGCTCCTTGAGATTAAAGAGAGGAAGGAGCGACG
CGGACGTTCAAAAAGGGCTGCTGCCTTGTCTACTCCCGTTGAATCTGGAGAAGATGACAT
CCCAGATGATGACAGCGAAGAAGAAAGAGATGTACCTCCACAGTTTTATTGCTGGCTCTG
TGTTTCTTTTGTAAATCAGAGTCCTGCTAACCTTTTTATTCTATGGATTTTCTTTTGCAG
GCGTGGCTCGCCACAATTAACTTGGCTATTTGTAAGGCTATTGATCTGTTGGAAATGCTA
AAGAGAAAAGAGGAAATGCTCTCTGCAATCAAGGAGAAACAGTTGAAGGATGGAGAGGAT
GTGTTTTCTCGGGATGCTCTAGATGATCGCACAAAGAAAGCTGAAACATGGCACAGAGAT
GCTGCTGCGAGGGTACAGTACTCTAGACCGGCACAACCAATCACTTGTGCCACATTTGCA
CAAGATGTGTTAGAAGGTAGAGCTTCAGTATCACAGGGTCACGAACACAAGCATCAACCT
CTTATCTTCGGTCCAGCAAGCATCGTGAATGGAGGTCTTTTTACGGAGAGAGAGAGAATG
ATAGCTCAGGTTTTCCAACCAAGTCACAGGATGCCGACGATGAGCATAGAGGATGCAGGG
TTAACAGAGATGAATATAATGAATGATTGGCAAGAGCAGACGAAAAAAGCAATTGAAGAA
GCAACCACCTCATGGCACAATGACAAACCTCTGAGAAGAAAGGAAAAGGACGAAGAAGAT
GATGATGAAGACGAAGAAGCTGTGATGAAAGCTAGAGCTTTCGATGATTGGAAGGACGAT
AATCCTCGTGGTGCAGGTAACAAGAAACTCACTCCTTGTGGCTGAACCTTTGATTGTGAC
GATACAAGTTTTAAACACTTTCTCTCCCTCTTTTGTTACTTATATCCGGACCCTTCTTTT
TTTCAATTATGTCTTGTAATGTAATCGTTAGACTGAGTTAAGTACTATTCGAATATTATT
TTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2AL82TF U 1
AF RR2AL82JQ C 698
BS 1 813 RR2AL82TF
BS 814 1503 RR2AL82JQ

RD RR2AL82TF 822 0 0
CTCAGATTTCACCGATCCACTTTCTCGAGTCCATTTTCGATAGTGAATCTCGTGAGTGAT
GGGAGGACTAGCGATGGAGGAGATGCCATTATCGGCGTTGTTCGAGGAAGCAAGGAAGAT
TCATCTCGCGGCTTCAGACTCTCGCGCCGATCAGAATGATGTGAAGAAAGGATGTGAGAT
GTTAGACAAGTGCGAAGACATGGTGGGGAAGCTGGGGCTCTTCTCTTCTAACGAGACTAA
AGAAGATATCAGCACCAACAATCCCAAGTATCTTTTGGTACCTTTCTATCTTGCGGAGTT
GACAGAGAAAATCAAACAGGAAGATCGGATTCCGATTGTCAAAGCTTCTTATGCTAAGTT
GAAGGAGTTCTTTTCGTTTTGTGAGGCAATGGAACTTGTTCCGGAAGAGGAGTTGGAGGC
TTCTTCACGAGGTGGTTCTGCTCCACCTGCTGATCGAAGAGCTCTCAAGATAGCTCGGTT
CAAACGTCAAAAGGCTGCAGAGGCGAAGCTCCTTGAGATTAAAGAGAGGAAGGAGCGACG
CGGACGTTCAAAAAGGGCTGCTGCCTTGTCTACTCCCGTTGAATCTGGAGAAGATGACAT
CCCAGATGATGACAGCGAAGAAGAAAGAGATGTACCTCCACAGTTTTATTGCTGGCTCTG
TGTTTCTTTTGTAAATCAGAGTCCTGCTAACCTTTTTATTCTATGGATTTTCTTTTGCAG
GCGTGGCTCGCCACAATTAACTTGGCTATTTGTAAGGCTATTGATCTGTTGGAAATGCTA
AAGAGAAAAGAGGAAATGCTCTCTGCAATCAAG
AGAACAGTT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2AL82JQ 806 0 0
ATTCTATGGATTTTCTTTTGCAGGCGTGGCTCGCCACAATTAACTTGGCTATTTGTAAGG
CTATTGATCTGTTGGAAATGCTAAAGAGAAAAGAGGAAATGCTCTCTGCAATCAAGGAGA
AACAGTTGAAGGATGGAGAGGATGTGTTTTCTCGGGATGCTCTAGATGATCGCACAAAGA
AAGCTGAAACATGGCACAGAGATGCTGCTGCGAGGGTACAGTACTCTAGACCGGCACAAC
CAATCACTTGTGCCACATTTGCACAAGATGTGTTAGAAGGTAGAGCTTCAGTATCACAGG
GTCACGAACACAAGCATCAACCTCTTATCTTCGGTCCAGCAAGCATCGTGAATGGAGGTC
TTTTTACGGAGAGAGAGAGAATGATAGCTCAGGTTTTCCAACCAAGTCACAGGATGCCGA
CGATGAGCATAGAGGATGCAGGGTTAACAGAGATGAATATAATGAATGATTGGCAAGAGC
AGACGAAAAAAGCAATTGAAGAAGCAACCACCTCATGGCACAATGACAAACCTCTGAGAA
GAAAGGAAAAGGACGAAGAAGATGATGATGAAGACGAAGAAGCTGTGATGAAAGCTAGAG
CTTTCGATGATTGGAAGGACGATAATCCTCGTGGTGCAGGTAACAAGAAACTCACTCCTT
GTGGCTGAACCTTTGATTGTGACGATACAAGTTTTAAACACTTTCTCTCCCTCTTTTGTT
ACTTATATCCGGACCCTTCTTTTTTTCAATTATGTCTTGTAATGTAATCGTTAGACTGAG
TTAAGTACTATTCGAATATTATTTTT

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL5688Contig1 284 2 1 U
GGATACCGAGAAAGTTAACTCCCAAATCTAGTCGTTCAAATATCTTAGTTTCCCTCTGAT
TATAAGATGAGATTTAGCGAGATGCACAAAGTGAAGAACTAAAAAAGAAGATGTTACAAA
TGGGTACTCTTTGTATTTGCGCTTTAGGTTTAAAGTGTCAAGTCTCTAGTGTGTATACTC
AGATTGTTGTTGTTGTAAATATGGCAACACAATTGAGGATGTGAATCAACAACTACATAA
TTAGACAAATTACAAACTCCGATGGAAACTACTTTTGACAGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BN32JQ C 1
AF RR2BN32TF U 1
BS 1 284 RR2BN32TF

RD RR2BN32JQ 284 0 0
GGATACCGAGAAAGTTAACTCCCAAATCTAGTCGTTCAAATATCTTAGTTTCCCTCTGAT
TATAAGATGAGATTTAGCGAGATGCACAAAGTGAAGAACTAAAAAAGAAGATGTTACAAA
TGGGTACTCTTTGTATTTGCGCTTTAGGTTTAAAGTGTCAAGTCTCTAGTGTGTATACTC
AGATTGTTGTTGTTGTAAATATGGCAACACAATTGAGGATGTGAATCAACAACTACATAA
TTAGACAAATTACAAACTCCGATGGAAACTACTTTTGACAGATT

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2BN32TF 284 0 0
GGATACCGAGAAAGTTAACTCCCAAATCTAGTCGTTCAAATATCTTAGTTTCCCTCTGAT
TATAAGATGAGATTTAGCGAGATGCACAAAGTGAAGAACTAAAAAAGAAGATGTTACAAA
TGGGTACTCTTTGTATTTGCGCTTTAGGTTTAAAGTGTCAAGTCTCTAGTGTGTATACTC
AGATTGTTGTTGTTGTAAATATGGCAACACAATTGAGGATGTGAATCAACAACTACATAA
TTAGACAAATTACAAACTCCGATGGAAACTACTTTTGACAGATT

QA 1 284 1 284
DS 



AS 1 2

CO CL5689Contig1 645 2 4 U
GGCAAAAATTATATCCCACAAAAAATATCCCAAAAAAATATGAATAAATTCATAGTGTTT
CTGTTTGCTATTAAAATATGTTTTGTATTGAGTGAAGCTTGCGCAGAAAGTCGTATAGAC
CTCAAGAACGAACTCGGCGCAGGTGTGATGCTCGAAATCCATTGTAAATCTGACGATCCA
ACCAGAGACTTGGGGAGAGTCTCTATAAAATTCAATGACAAAATGGGTTATGGATTCTGG
CCTCTTGTTGAACGAAGACGCAGAACTATATATAGATGTGATCTATGGCATACGATTCCG
AAAAGTCCGGCACATCCTCGCGGCGGAATGAATAGTGTTGATAAGCTTGAAGCATTTGCC
GGGGGCTCGAATAGTAGATGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGGATT
TACTTCAGAAGAAATGCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAAAGACTATCAATGGTTTACA
CTAAGATTTTAAATAAGTTTTTTCTCATATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTCGA
TTATTTGTATTTGTAAATAACTAATCCCTAAGTTGTATTAATAATGTGCTACAAATATGT
AGCAAAAAATGTAATAAAATGTGATATTAATAAATGATTATAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV77TF U 1
AF RR2G171TF U 308
BS 1 494 RR2GV77TF
BS 495 497 RR2G171TF
BS 498 609 RR2GV77TF
BS 610 645 RR2G171TF

RD RR2GV77TF 609 0 0
GGCAAAAATTATATCCCACAAAAAATATCCCAAAAAAATATGAATAAATTCATAGTGTTT
CTGTTTGCTATTAAAATATGTTTTGTATTGAGTGAAGCTTGCGCAGAAAGTCGTATAGAC
CTCAAGAACGAACTCGGCGCAGGTGTGATGCTCGAAATCCATTGTAAATCTGACGATCCA
ACCAGAGACTTGGGGAGAGTCTCTATAAAATTCAATGACAAAATGGGTTATGGATTCTGG
CCTCTTGTTGAACGAAGACGCAGAACTATATATAGATGTGATCTATGGCATACGATTCCG
AAAAGTCCGGCACATCCTCGCGGCGGAATGAATAGTGTTGATAAGCTTGAAGCATTTGCC
GGGGGCTCGAATAGTAGATGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGGATT
TACTTCAGAAGAAATGCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAAAGACTATCAATGGTTTACA
CTAAGATTTTAAATT**TTTTTTCTCATATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTCGA
TTATTTGTATTTGTAAATAACTAATCCCTAAGTTGTATTAATAATGTGCTACAAATATGT
AGCAAAAAA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2G171TF 338 0 0
G
GGCACATCCTCGCGGCGGAATGAATAGTGTTGATAAGCTTGAAGCATTTGCCGGGGGCTC
GAATAGTAGATGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGGATTTACTTCAG
AAGAAATGCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAAAGACTATCAATGGTTTACACTAAGATT
TTAAATAAGTTTTTTCTCATATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTTGATTATTTGT
ATTTGTAAATAACTAATCCCTAAGTTGTATTAATAATGTGCTACAAATATGTAGCAAAAA
ATGTAATAAAATGTGATATTAATAAATGATTATAGAT

QA 2 338 2 338
DS 



AS 1 2

CO CL5690Contig1 814 2 3 U
GTGGAGCCATGATTTTCTACAGAAAAGGTGTTAAGGAAGTTAACAAACAAGGGAAAGAGG
TTTTGTATGATTTTGAAGACAAGATCAACCAAGCTGTCTTCCCTGGTCTTCAAGGTGGTC
CACACAACCACACTATTACAGGACTAGCTGTTGCTTTAAAACAGGCAACTACTTCAGAGT
ACAAAGCATACCAAGAGCAAGTCTTGAGTAACTCTGCAAAGTTTGCTCAGACTCTGATGG
AGAAAGGGTATGAGCTTGTTTCTGGTGGAACTGACAACCATCTGGTTCTAGTGAATCTGA
AGCCCAAGGGAATTGATGGATCTAGAGTTGAGAAAGTGTTGGAAGCTGTTCACATTGCAT
CAAACAAAAACACTGTTCCTGGAGATGTTTCTGCCATGGTTCCTGGTGGAATCAGAATGG
GTACACCTGCACTCACTTCCAGAGGCTTTGTTGAGGAAGACTTTGCTAAAGTTGCTGAAT
ACTTCGACAAAGCTGTAAAGTTGGCTCTCAAAGTCAAATCTGAAGCTCAAGGAACCAAGC
TGAAAGACTTTGTGTCAGCAATGGAAGCTTCTTCAACCATTCAATCAGAGATTACCAAGC
TGCGCCATGAAGTTGAGGAATTTGCCAAACAGTTCCCAACAATTGGGTTCGAGAAAGAAA
CCATGAAGTACAAGAACTAATAAATGTCTTCTCATGCAAGTCTTTTACTATGCTTTGAAC
TTCCATGGAATGTATAGATGATATGATACATGTGCTCTATCTTATGCTACGAGAAAAAAA
TAATGAACGTTCTATGCAAATCCTTTTCTTAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK77TF U 591
AF RR2BG28JQ C 1
BS 1 590 RR2BG28JQ
BS 591 766 RR2DK77TF
BS 767 814 RR2BG28JQ

RD RR2DK77TF 176 0 0
ATTACCAAGCTGCGCCATGAAGTTGAGGAATTTGCCAAACAGTTCCCAACAATTGGGTTC
GAGAAAGAAACCATGAAGTACAAGAACTAATAAATGTCTTCTCATGCAAGTCTTTTACTA
TGCTTTGAACTTCCATGGAATGTATAGATGATATGATACATGTGCTCTATCTTATG

QA 1 176 1 176
DS 

RD RR2BG28JQ 814 0 0
GTGGAGCCATGATTTTCTACAGAAAAGGTGTTAAGGAAGTTAACAAACAAGGGAAAGAGG
TTTTGTATGATTTTGAAGACAAGATCAACCAAGCTGTCTTCCCTGGTCTTCAAGGTGGTC
CACACAACCACACTATTACAGGACTAGCTGTTGCTTTAAAACAGGCAACTACTTCAGAGT
ACAAAGCATACCAAGAGCAAGTCTTGAGTAACTCTGCAAAGTTTGCTCAGACTCTGATGG
AGAAAGGGTATGAGCTTGTTTCTGGTGGAACTGACAACCATCTGGTTCTAGTGAATCTGA
AGCCCAAGGGAATTGATGGATCTAGAGTTGAGAAAGTGTTGGAAGCTGTTCACATTGCAT
CAAACAAAAACACTGTTCCTGGAGATGTTTCTGCCATGGTTCCTGGTGGAATCAGAATGG
GTACACCTGCACTCACTTCCAGAGGCTTTGTTGAGGAAGACTTTGCTAAAGTTGCTGAAT
ACTTCGACAAAGCTGTAAAGTTGGCTCTCAAAGTCAAATCTGAAGCTCAAGGAACCAAGC
TGAAAGACTTTGTGTCAGCAATGGAAGCTTCTTCAACCATTCAATCAGAGATTACCAAGC
TGCGCCATGAAGTTGAGGAATTTGCTAAACAGTTCCCAACAATTGGGTTCGAGAAAGAAA
CCATGAAGTACAAGAACTAATAAATGTCTTCTCATGCAAGTCTTTTACTATGCTTTGAAC
TTCCATGGAATGTATAGATGATATGATACATGTGCTCTATCTTATGCTACGAGAAAAAAA
TAATGAACGTTCTATGCAAATCCTTTTCTTAGAT

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL5691Contig1 864 2 4 U
GGAAGTCTTTGAACCCTCACCTCTTCGATTAATAGAAAGTATGAGTTCCTCTGTCACTGT
GATCTGGGACTTTCAATATGCTTGGATCCCTGAGGGTTACGATCTCCGCACCCTCAAAAC
GAGCATCGAAACTGCCCTGAAAAGATGCAATCCAGATTTCTTCGTAGAAGGGAAACTGCT
TGCTGTTGGACATGCCACCGGAGATAAACATCAAGCCATTTCCATGCTCCCTGATGACAT
CAAATTCTCCCCCGTCCGACCCGATAACATCCGTACTCCAGACCCTGAAGATCAAACTGC
TTTGGAACTGGTTATGAAGCTCACCATGAAAGTACTTGCCAAAGCGACTAACATTTTGGT
CATTTCTGGAAACTATGATCTGATGGGTGCGATTAATGGATGGAGACAAAGGAATATCTT
TATGATGTTGGCCCCTCCTGAAAGCTCCTCCTCCTCACCAAGCATCTACCATTGTGCCAA
CTTGACTTGGCTTTGGGCTTCTGAAGATCCTGAGAGTGCTGCTGCTACCATGGTTAATGG
AGGTGGACCCATCCTTCCTGTCCCCGTGTAAGAGGATGAGCTTATCAGTATGGTGGTAGA
TAAAATAACATGAACTCTTAGTAATATCAGACTCTCTCTTATGCTGCGCTGTTTTAGTCT
CAGACTCTCTCTCTCTCTTTAGCTGCGCTGTTGTTTTGGAGCATGTGAGTATGTATGATC
ATTTTAACTAATATGACTTTTGAGTAATATTGTAGTACTCCTTTTTAAGCTTGTGGTGGG
TTTGTCTGATATGCAGCAAACCCTTTGTTCTTCATGTTCTTCTGTTTTAGAGGAACATTG
TTGTTCTCATTATCTTCCACTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY03TF U 1
AF RR2BY03JQ C 96
BS 1 746 RR2BY03TF
BS 747 747 RR2BY03JQ
BS 748 765 RR2BY03TF
BS 766 864 RR2BY03JQ

RD RR2BY03TF 765 0 0
GGAAGTCTTTGAACCCTCACCTCTTCGATTAATAGAAAGTATGAGTTCCTCTGTCACTGT
GATCTGGGACTTTCAATATGCTTGGATCCCTGAGGGTTACGATCTCCGCACCCTCAAAAC
GAGCATCGAAACTGCCCTGAAAAGATGCAATCCAGATTTCTTCGTAGAAGGGAAACTGCT
TGCTGTTGGACATGCCACCGGAGATAAACATCAAGCCATTTCCATGCTCCCTGATGACAT
CAAATTCTCCCCCGTCCGACCCGATAACATCCGTACTCCAGACCCTGAAGATCAAACTGC
TTTGGAACTGGTTATGAAGCTCACCATGAAAGTACTTGCCAAAGCGACTAACATTTTGGT
CATTTCTGGAAACTATGATCTGATGGGTGCGATTAATGGATGGAGACAAAGGAATATCTT
TATGATGTTGGCCCCTCCTGAAAGCTCCTCCTCCTCACCAAGCATCTACCATTGTGCCAA
CTTGACTTGGCTTTGGGCTTCTGAAGATCCTGAGAGTGCTGCTGCTACCATGGTTAATGG
AGGTGGACCCATCCTTCCTGTCCCCGTGTAAGAGGATGAGCTTATCAGTATGGTGGTAGA
TAAAATAACATGAACTCTTAGTAATATCAGACTCTCTCTTATGCTGCGCTGTTTTAGTCT
CAGACTCTCTCTCTCTCTTTAGCTGCGCTGTTGTTTTGGAGCATGTGAGTATGTATGATC
ATTTTAACTAATATGACTTTTGAGTA*TATTGTAGTACTCCTTTT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2BY03JQ 769 0 0
GTTACGATCTCCGCACCCTCAAAACGAGCATCGAAACTGCC*TGAAAAGATGCAATCCAG
ATTTCTTCGTAGAAGGGAAACTGCTTGCTGTTGGACATGCCACCGGAGATAAACATCAAG
CCATTTCCATGCTCCCTGATGACATCAAATTCTCCCCCGTCCGACCCGATAACATCCGTA
CTCCAGACCCTGAAGATCAAACTGCTTTGGAACTGGTTATGAAGCTCACCATGAAAGTAC
TTGCCAAAGCGACTAACATTTTGGTCATTTCTGGAAACTATGATCTGATGGGTGCGATTA
ATGGATGGAGACAAAGGAATATCTTTATGATGTTGGCCCCTCCTGAAAGCTCCTCCTCCT
CACCAAGCATCTACCATTGTGCCAACTTGACTTGGCTTTGGGCTTCTGAAGATCCTGAGA
GTGCTGCTGCTACCATGGTTAATGGAGGTGGACCCATCCTTCCTGTCCCCGTGTAAGAGG
ATGAGCTTATCAGTATGGTGGTAGATAAAATAACATGAACTCTTAGTAATATCAGACTCT
CTCTTATGCTGCGCTGTTTTAGTCTCAGACTCTCTCTCTCTCTTTAGCTGCGCTGTTGTT
TTGGAGCATGTGAGTATGTATGATCATTTTAACTAATATGACTTTTGAGTAATATTGTAG
TACTCCTTTTTAAGCTTGTGGTGGGTTTGTCTGATATGCAGCAAACCCTTTGTTCTTCAT
GTTCTTCTGTTTTAGAGGAACATTGTTGTTCTCATTATCTTCCACTCTT

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL5692Contig1 821 2 2 U
CGAGAGCGGAAGAGATACGGCGGTGGTGAAGGAAATTCAAACGCACATGATAATCCCCGG
GGGAGACGTTAACGAGGACGAGTACACTCCTGAAGAAATCATGCAGCTCGTTGAGTCTTC
TTCTTCGCCGACGACGATGAACGTCGGCGGAACTAACTTTTCCGGTGAGGGGAGTTTCCG
AGTGAGGTTTATCGATGATCCTTACGCGGTTCCGGTGGTTGTTAAGTCATCTACGGGTTA
CATCACGATCAACGTCAACGAGGAGAGCTGTGGTCCTTCGTTTTCAGACAGCAACGCTTC
CGCCATGGCAAGCGTCGACGCAACCGGTCTGTTCGGTTGCTGCCTCGGTTTGAACGGCGC
GTGGAGTATAGACGAGATGAGAGCGAGTGAGAGTGGGAGTGAGTGCGAGTGGGACGACGA
ATTGCTGGCGAGGTTTATTGGCGAAGACAGTGACTTTTGACCAATGCGTCGTCTTGCGGA
GAGAGCTAAAATGTTTTGGGGGTACTTTGGTCAATTTAAGGACTGTCATTAAGTGAAAAT
TGATTTACATGTTGTTAGTAATAGGAAGGACGCAAGAAAATAGAAAATAGTTAATGGTAG
TAAGACTAGTCTACTTAGCTGACAAAGAAAAAACTAGTCTAGTTAGCATCTACATAGTCT
AATGTGACCATTTTGGTAAATTATGTCACATGATGGTATTTTGTAAGTTTTGTTAGATTT
AATATATTTTTAAAAGTATTTAATGCCCCCATGGAAAAAAGTGTAATTGTATGCTTTATG
TATGAATGAATCTCTATATTTACTTGATATTAGAGTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A015TF U 1
AF RR2A015JQ C 88
BS 1 205 RR2A015TF
BS 206 821 RR2A015JQ

RD RR2A015TF 205 0 0
CGAGAGCGGAAGAGATACGGCGGTGGTGAAGGAAATTCAAACGCACATGATAATCCCCGG
GGGAGACGTTAACGAGGACGAGTACACTCCTGAAGAAATCATGCAGCTCGTTGAGTCTTC
TTCTTCGCCGACGACGATGAACGTCGGCGGAACTAACTTTTCCGGTGAGGGGAGTTTCCG
AGTGAGGTTTATCGATGATCCTTAC

QA 1 205 1 205
DS 

RD RR2A015JQ 734 0 0
TCCTGAAGAAATCATGCAGCTCGTTGAGTCTTCTTCTTCGCCGACGACGATGAACGTCGG
CGGAACTAACTTTTCCGGTGAGGGGAGTTTCCGAGTGAGGTTTATCGATGATCCTTACGC
GGTTCCGGTGGTTGTTAAGTCATCTACGGGTTACATCACGATCAACGTCAACGAGGAGAG
CTGTGGTCCTTCGTTTTCAGACAGCAACGCTTCCGCCATGGCAAGCGTCGACGCAACCGG
TCTGTTCGGTTGCTGCCTCGGTTTGAACGGCGCGTGGAGTATAGACGAGATGAGAGCGAG
TGAGAGTGGGAGTGAGTGCGAGTGGGACGACGAATTGCTGGCGAGGTTTATTGGCGAAGA
CAGTGACTTTTGACCAATGCGTCGTCTTGCGGAGAGAGCTAAAATGTTTTGGGGGTACTT
TGGTCAATTTAAGGACTGTCATTAAGTGAAAATTGATTTACATGTTGTTAGTAATAGGAA
GGACGCAAGAAAATAGAAAATAGTTAATGGTAGTAAGACTAGTCTACTTAGCTGACAAAG
AAAAAACTAGTCTAGTTAGCATCTACATAGTCTAATGTGACCATTTTGGTAAATTATGTC
ACATGATGGTATTTTGTAAGTTTTGTTAGATTTAATATATTTTTAAAAGTATTTAATGCC
CCCATGGAAAAAAGTGTAATTGTATGCTTTATGTATGAATGAATCTCTATATTTACTTGA
TATTAGAGTATTTT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL5693Contig1 1221 2 8 U
GAAGAGCGACGTTTGCGATGATGGTGATTACAGGCGACGATGGCCTCAATCGATTAGATC
CTTCGTCAAGGGTCTTCAATCTTCCATTCCGCCTCACCCCTCGAAGAGATTCGAACTCAG
CTCCTCTGTTTCTCAGTCTCGTAATCCCACCGCCGACACTTCCTTGGCGACGTCTCTAAT
CTCCGATCCTTGTTCCATATGAAAGAAGATCGCGACTTCTTCTTCCTCTAGAGAAAATTG
TTCTCTTGAACCGTCGGAGATTTGAGAAGCTTCACCGGAAACTTGACGTCACACTTTCCG
CTTCTCGGTCGCAACCGTATGCGTCTCCTCCGCTGTATTAACGACCCATGTCTCCCTTCA
GCTTCGTCCTTGGCTGTTTAAGACATCTCCTGTGTCGTTTGTCTTATCCCTCGATCAATT
TGAGCCTCCTTTTTACCGCTTGAGCTTACTCCACCTTGAGCTGAGACCTCCTTGTCTTAG
CACTCCTCGCCTCGCATCTTTCCTAGCAGGTAACTTCCGTGTAACCAATTAGCTTCCTTG
TTATCGATAAGAAGTAACTTGTTTGCTCTAACCTTATTACTTCTTCTTGTGCGAGGTGAA
TCAATAACGAAGTTACCTGCCGTGCCGTTCTCTTAGGCTATCTTGACGAGTTCACAACAG
AGATCAAACTTTTGCCCTGGTAAATACGATTCGGCAAGGACGTCTCCGTGTACAGCTTGT
TGAGGGCTGACCACATCGCAGCAGCAGTTTCACAGTGGCTGATCTTCCTTAGGACTTGGT
TTCCTACATTTATAACAATGAGATCTTTTGCTTTCTCTGATTTCCCGAGTTTAACGGGAT
CAATGGTCGGGACCTCTTCCGCTTCTTTCTTCTCCGTGTCCTTTAAGGTTTCAGGAATTG
GGCCAAGGAGTAAAAGACATTTGAGGCCCATAAGTCTACATTGCGGTTCTTAAAAGTGCT
GAAGGTAAACCGCAAAAGTGAAGTAAATCAACAAAAAGGAAAAAAGGAAAATTATATATT
TGCTTAACTACGAAAACAACAGTAACGGTGAAAGACTTCAGTGAGAGCCCCCACTAAAGA
TGCTCTTACACTATGGCTTCAGTATTTCTTTTAGTTCACTCCATAATGTGTCTGACACAT
ATTTCCAATTCAAAGAAACTTTTTAACTTCTGTAGAATACAAACAGAACACACAAAAGCC
CAAAGATTGGGAACATTAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL31TF U 1
AF RR2CL31JQ C 459
BS 1 599 RR2CL31TF
BS 600 600 RR2CL31JQ
BS 601 636 RR2CL31TF
BS 637 637 RR2CL31JQ
BS 638 651 RR2CL31TF
BS 652 652 RR2CL31JQ
BS 653 683 RR2CL31TF
BS 684 1221 RR2CL31JQ

RD RR2CL31TF 687 0 0
GAAGAGCGACGTTTGCGATGATGGTGATTACAGGCGACGATGGCCTCAATCGATTAGATC
CTTCGTCAAGGGTCTTCAATCTTCCATTCCGCCTCACCCCTCGAAGAGATTCGAACTCAG
CTCCTCTGTTTCTCAGTCTCGTAATCCCACCGCCGACACTTCCTTGGCGACGTCTCTAAT
CTCCGATCCTTGTTCCATATGAAAGAAGATCGCGACTTCTTCTTCCTCTAGAGAAAATTG
TTCTCTTGAACCGTCGGAGATTTGAGAAGCTTCACCGGAAACTTGACGTCACACTTTCCG
CTTCTCGGTCGCAACCGTATGCGTCTCCTCCGCTGTATTAACGACCCATGTCTCCCTTCA
GCTTCGTCCTTGGCTGTTTAAGACATCTCCTGTGTCGTTTGTCTTATCCCTCGATCAATT
TGAGCCTCCTTTTTACCGCTTGAGCTTACTCCACCTTGAGCTGAGACCTCCTTGTCTTAG
CACTCCTCGCCTCGCATCTTTCCTAGCAGGTAACTTCCGTGTAACCAATTAGCTTCCTTG
TTATCGATAAGAAGTAACTTGTTTGCTCTAACCTTATTACTTCTTCTTGTGCGAGGTGA*
TCAATAACGAAGTTACCTGCCGTGCCGTTCTCTTAG*CTATCTTGACGAGT*CACAACAG
AGATCAAACTTTTGCCCTGGTAA
TACG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2CL31JQ 763 0 0
AGCTGAGACCTCCTTGTCTTAGCACTCCTCGCCTCGCATCTTTCCTAGCAGGTAACTTCC
GTGTAACCAATTAGCTTCCTTGTTATCGATAAGAAGTAACTTGTTTGCTCTAACCTTATT
ACTTCTTCTTGTGCGAGGTGAATCAATAACGAAGTTACCTGCCGTGCCGTTCTCTTAGGC
TATCTTGACGAGTTCACAACAGAGATCAAACTTTTGCCCTGGTAAATACGATTCGGCAAG
GACGTCTCCGTGTACAGCTTGTTGAGGGCTGACCACATCGCAGCAGCAGTTTCACAGTGG
CTGATCTTCCTTAGGACTTGGTTTCCTACATTTATAACAATGAGATCTTTTGCTTTCTCT
GATTTCCCGAGTTTAACGGGATCAATGGTCGGGACCTCTTCCGCTTCTTTCTTCTCCGTG
TCCTTTAAGGTTTCAGGAATTGGGCCAAGGAGTAAAAGACATTTGAGGCCCATAAGTCTA
CATTGCGGTTCTTAAAAGTGCTGAAGGTAAACCGCAAAAGTGAAGTAAATCAACAAAAAG
GAAAAAAGGAAAATTATATATTTGCTTAACTACGAAAACAACAGTAACGGTGAAAGACTT
CAGTGAGAGCCCCCACTAAAGATGCTCTTACACTATGGCTTCAGTATTTCTTTTAGTTCA
CTCCATAATGTGTCTGACACATATTTCCAATTCAAAGAAACTTTTTAACTTCTGTAGAAT
ACAAACAGAACACACAAAAGCCCAAAGATTGGGAACATTAGAC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL5694Contig1 958 2 2 U
GGGATTATATTAAAGCAAAGAAAATAGGTTCTCTCTTTCTTTTTTAAAGAGAGAAAACTC
TCTCAACCTCCCTCTTAACACTTACCAAATCTTTCAGAGGGATTGAGAAGAGTTGAGAGC
TTTTTTCTTGTTTTGTGTAATATATTCGGTCTTATGATCGATTTCTATCCTTCCGGTTGC
GGAATTTTTTTTCGCTAGGCGAATTTTTTTTGTTGTTGTGCTTTTCAAACAAAATCTGAT
CTTGTTCATCAACTTTACATTTTCTCAGATTTAGTTTGAAACAAATAAAGTTTCCGATTT
TAAATCGGATTTCATGAAGTCTGATTCTGATGATCGGATCTGATAGCAGCTTTCGGTGAT
TTTCACTTCCATCCCATCTGATTTCTTTTAAATTGATGAATCTTCTTGTGTTATGGAGGT
AACTTCATGCTAGCTTCATCAGTCAATCCTTAGTGGGGCTGTTTCAAATGCCTCCGTGCT
TGGTTCATCGGAGACGGCGGCATGTTCTCCATCATTAGAAGAAGAAGATTGAATAAGGAT
GAAGAAAGCGACAAACGAGAAGCTGCTAGAGTTGTGGTCAGAGAACTACGCCTTGAAGAA
GATCGCTTTAGCTTAATCGTAATCCTTAGTGGACGATTAAGATATCATAGAGGACGATTC
AATTGAGGCGGAGAAGTAAGGGTTGAATCAATTTGAGTTTCACGGCGGAAAAGCTCTCTG
GTGATCGGCGGAGGAGCGTCGCGGAAAAAAGTTTGGATCCTTGCATGATGGACGCATATC
ACAAAACGTGGCAACCGATCTCACAAACAGAGCACGTGCATTCAAGTCGGTGGATAGAAA
AGCAATTATAATTTTGTTTTTTCTTGTTAACCTTTGCTGGGCTTAAAATTCAAACAATCT
GGCCCAACTTGTAATGGTCTTTTGACCCTTTTCATTTCTATGAAATGAAGAAGTAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC93TF U 1
AF RR2FC93JQ C 395
BS 1 677 RR2FC93TF
BS 678 958 RR2FC93JQ

RD RR2FC93TF 677 0 0
GGGATTATATTAAAGCAAAGAAAATAGGTTCTCTCTTTCTTTTTTAAAGAGAGAAAACTC
TCTCAACCTCCCTCTTAACACTTACCAAATCTTTCAGAGGGATTGAGAAGAGTTGAGAGC
TTTTTTCTTGTTTTGTGTAATATATTCGGTCTTATGATCGATTTCTATCCTTCCGGTTGC
GGAATTTTTTTTCGCTAGGCGAATTTTTTTTGTTGTTGTGCTTTTCAAACAAAATCTGAT
CTTGTTCATCAACTTTACATTTTCTCAGATTTAGTTTGAAACAAATAAAGTTTCCGATTT
TAAATCGGATTTCATGAAGTCTGATTCTGATGATCGGATCTGATAGCAGCTTTCGGTGAT
TTTCACTTCCATCCCATCTGATTTCTTTTAAATTGATGAATCTTCTTGTGTTATGGAGGT
AACTTCATGCTAGCTTCATCAGTCAATCCTTAGTGGGGCTGTTTCAAATGCCTCCGTGCT
TGGTTCATCGGAGACGGCGGCATGTTCTCCATCATTAGAAGAAGAAGATTGAATAAGGAT
GAAGAAAGCGACAAACGAGAAGCTGCTAGAGTTGTGGTCAGAGAACTACGCCTTGAAGAA
GATCGCTTTAGCTTAATCGTAATCCTTAGTGGACGATTAAGATATCATAGAGGACGATTC
AATTGAGGCGGAGAAGT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2FC93JQ 564 0 0
GATGAATCTTCTTGTGTTATGGAGGTAACTTCATGCTAGCTTCATCAGTCAATCCTTAGT
GGGGCTGTTTCAAATGCCTCCGTGCTTGGTTCATCGGAGACGGCGGCATGTTCTCCATCA
TTAGAAGAAGAAGATTGAATAAGGATGAAGAAAGCGACAAACGAGAAGCTGCTAGAGTTG
TGGTCAGAGAACTACGCCTTGAAGAAGATCGCTTTAGCTTAATCGTAATCCTTAGTGGAC
GATTAAGATATCATAGAGGACGATTCAATTGAGGCGGAGAAGTAAGGGTTGAATCAATTT
GAGTTTCACGGCGGAAAAGCTCTCTGGTGATCGGCGGAGGAGCGTCGCGGAAAAAAGTTT
GGATCCTTGCATGATGGACGCATATCACAAAACGTGGCAACCGATCTCACAAACAGAGCA
CGTGCATTCAAGTCGGTGGATAGAAAAGCAATTATAATTTTGTTTTTTCTTGTTAACCTT
TGCTGGGCTTAAAATTCAAACAATCTGGCCCAACTTGTAATGGTCTTTTGACCCTTTTCA
TTTCTATGAAATGAAGAAGTAGAC

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

CO CL5695Contig1 1135 2 4 U
GTCTAAGTCAATGGATTTGATTGATTACTACAATGTCACCACGTCAAGAGACTGGACGGG
AAGAGTGAAGGAGTTTAAAGCTGAAGGAAGCATCGGAGATGGTTTGGAACCTATTCTTCA
CAAATCCGCACCTGAAGTGGCTCTGTTCTCAGCTCGAGGACCCAACACTAAAGACTTTAG
CTTTCAGGATGCTGATCTCCTCAAACCAGATATACTTGCTCCGGGTTCTCTGATATGGTC
TGCTTGGTCTGAGAATGGAACTGACGAGGCTAACTATGTCGGTGAAGGATTTGCATTGAT
TTCTGGTACGAGCATGGCTGCACCACACATTGCTGGTATAGCTGCTCTGGTGAAACAGAA
GCATCCTCAGTGGAGTCCAGCTGCTATCAAATCGGCTTTGATGACAACTTCAACAGTCAT
GGACCGAGCAGGAAGGCCTCTCCAAGCACAGCAGTACTCTGATACAGAGACGGTGACGCT
TGTTAAAGCAACTCCGTTTGATTATGGAAGTGGTCATGTCAGTCCAAGCTCTGCTCTAGA
CCCTGGTCTCGTCTTTGATGCAGGTTATGAGGATTACTTAGGTTTCTTGTGCACCACGCC
TGGTATCGATGCCCACGAGATAAGGAACTTCACAAACACTCCCTGCAATTACAAAATGAA
ACATCCTTCGAACTTCAACTCGCCATCCATAGCCATTTCCCATCTTGTGAGAACACAAAC
CGTAACAAGAAGAGTGACGAATGTTGCGGAAGAGGAAGAAACATACACGATCACATCGAG
AATGGAGCCATCCATCGCCATTGAAGTGAGTCCTCCTGCAATGACACTTAGAGCCGGAGC
TTCGAGAAGCTTTTTGGTGACTCTAACAGTGAGATCTGTGACCGGAGCTTATAGCTTCGG
AGAGGTTACTTTGAAAGGAAGCCGAGGGCATAAAGTGAGTATCCCAGTGGTTGTCTTGGG
ACACAAGCGATGAAGACAATATATGAGATATTGTAATATTATTATTATTGTTATTTTTAT
AATACGCAGTAGCAATAAAAAGGTAGTTTTGTATGAGTAAAAATGAATAATACTGTTTGT
ATAATTAGTTATTTTTATTTTTTTAATTAATTTGAAGAAATAATAGTGACATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD08TF U 1
AF RR2AD08JQ C 461
BS 1 613 RR2AD08TF
BS 614 614 RR2AD08JQ
BS 615 750 RR2AD08TF
BS 751 1135 RR2AD08JQ

RD RR2AD08TF 750 0 0
GTCTAAGTCAATGGATTTGATTGATTACTACAATGTCACCACGTCAAGAGACTGGACGGG
AAGAGTGAAGGAGTTTAAAGCTGAAGGAAGCATCGGAGATGGTTTGGAACCTATTCTTCA
CAAATCCGCACCTGAAGTGGCTCTGTTCTCAGCTCGAGGACCCAACACTAAAGACTTTAG
CTTTCAGGATGCTGATCTCCTCAAACCAGATATACTTGCTCCGGGTTCTCTGATATGGTC
TGCTTGGTCTGAGAATGGAACTGACGAGGCTAACTATGTCGGTGAAGGATTTGCATTGAT
TTCTGGTACGAGCATGGCTGCACCACACATTGCTGGTATAGCTGCTCTGGTGAAACAGAA
GCATCCTCAGTGGAGTCCAGCTGCTATCAAATCGGCTTTGATGACAACTTCAACAGTCAT
GGACCGAGCAGGAAGGCCTCTCCAAGCACAGCAGTACTCTGATACAGAGACGGTGACGCT
TGTTAAAGCAACTCCGTTTGATTATGGAAGTGGTCATGTCAGTCCAAGCTCTGCTCTAGA
CCCTGGTCTCGTCTTTGATGCAGGTTATGAGGATTACTTAGGTTTCTTGTGCACCACGCC
TGGTATCGATGCC*ACGAGATAAGGAACTTCACAAACACTCCCTGCAATTACAAAATGAA
ACATCCTTCGAACTTCAACTCGCCATCCATAGCCATTTCCCATCTTGTGAGAACACAAAC
CGTAACAAGAAGAGTGACGAATGTTGCGGA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2AD08JQ 675 0 0
GATACAGAGACGGTGACGCTTGTTAAAGCAACTCCGTTTGATTATGGAAGTGGTCATGTC
AGTCCAAGCTCTGCTCTAGACCCTGGTCTCGTCTTTGATGCAGGTTATGAGGATTACTTA
GGTTTCTTGTGCACCACGCCTGGTATCGATGCCCACGAGATAAGGAACTTCACAAACACT
CCCTGCAATTACAAAATGAAACATCCTTCGAACTTCAACTCGCCATCCATAGCCATTTCC
CATCTTGTGAGAACACAAACCGTAACAAGAAGAGTGACGAATGTTGCGGAAGAGGAAGAA
ACATACACGATCACATCGAGAATGGAGCCATCCATCGCCATTGAAGTGAGTCCTCCTGCA
ATGACACTTAGAGCCGGAGCTTCGAGAAGCTTTTTGGTGACTCTAACAGTGAGATCTGTG
ACCGGAGCTTATAGCTTCGGAGAGGTTACTTTGAAAGGAAGCCGAGGGCATAAAGTGAGT
ATCCCAGTGGTTGTCTTGGGACACAAGCGATGAAGACAATATATGAGATATTGTAATATT
ATTATTATTGTTATTTTTATAATACGCAGTAGCAATAAAAAGGTAGTTTTGTATGAGTAA
AAATGAATAATACTGTTTGTATAATTAGTTATTTTTATTTTTTTAATTAATTTGAAGAAA
TAATAGTGACATGTT

QA 1 675 1 675
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5697Contig1 841 2 2 U
GGGCCCCAAAAAGATGATGATTCGGTGCTTCGTGCGTGCACCCTTCATCACCACCGTCCA
TTTCGCATCTCCACCATCCATCACCATCTCCGCATCTCATTCTCCATCGTCGTCAGTAGC
AGCATCCAGAAGAGAAATATCTCTATCCATTATAGCCGTCGCGTCTTCCATCATCTCCTC
CTGTTACTTCTCTTCTCCGGCCTCCGCTGAGTTCTCCGAAATCCCCGACTCCGGCGGAGT
TAAGAGTCTCGACCTCCGTGTCGGCGACGGTGAAGTACCCATTGAAGGAGATCAGGTTGC
AATACATTACTATGGGAGGTTGGCTGCGAAGCAAGGATGGAGATTTGATTCAACGTATGA
TCATAAAGACAGTAGTGGAGACTCTGTTCCTTTTACTATCATCCTTGGTTCTGCCAATGT
TATTCCGGGGATCGAAACAGCCGTGAGGTCGATGAAAGTAGGTGGGATTCGTCGGGTGGT
TATACCTCCGTCTCAAGGCTACCAGAATACATCACAAGAACCTCTCCCACCAAATTTCTT
TGACAGACAAAGACTCTTCACGACTATCTTTAACCCAACACGTCTTGCCAATGGAGAAGG
TTCTACTCTTGGAACTCTCGTTTTCGATATTGAACTTGTCAGTACCAGACGCCCTAACCG
ATGATTCATACAGCCAGCCATTCATACTCTTCGGTTGTTTCTTGCTGGACGAGATATCAC
AAAATAAACAATTATAATTACACAAAGTCTTTAGTAAGCATTTGGATATGGTTAGTTGAA
TCTCGATGTGCACCTCACCCCAATCTATGATATAGTATATCACTTGAACATAGTGTTGAT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2AG34TF U 1
AF RR2BN52TF U 70
BS 1 774 RR2AG34TF
BS 775 841 RR2BN52TF

RD RR2AG34TF 774 0 0
GGGCCCCAAAAAGATGATGATTCGGTGCTTCGTGCGTGCACCCTTCATCACCACCGTCCA
TTTCGCATCTCCACCATCCATCACCATCTCCGCATCTCATTCTCCATCGTCGTCAGTAGC
AGCATCCAGAAGAGAAATATCTCTATCCATTATAGCCGTCGCGTCTTCCATCATCTCCTC
CTGTTACTTCTCTTCTCCGGCCTCCGCTGAGTTCTCCGAAATCCCCGACTCCGGCGGAGT
TAAGAGTCTCGACCTCCGTGTCGGCGACGGTGAAGTACCCATTGAAGGAGATCAGGTTGC
AATACATTACTATGGGAGGTTGGCTGCGAAGCAAGGATGGAGATTTGATTCAACGTATGA
TCATAAAGACAGTAGTGGAGACTCTGTTCCTTTTACTATCATCCTTGGTTCTGCCAATGT
TATTCCGGGGATCGAAACAGCCGTGAGGTCGATGAAAGTAGGTGGGATTCGTCGGGTGGT
TATACCTCCGTCTCAAGGCTACCAGAATACATCACAAGAACCTCTCCCACCAAATTTCTT
TGACAGACAAAGACTCTTCACGACTATCTTTAACCCAACACGTCTTGCCAATGGAGAAGG
TTCTACTCTTGGAACTCTCGTTTTCGATATTGAACTTGTCAGTACCAGACGCCCTAACCG
ATGATTCATACAGCCAGCCATTCATACTCTTCGGTTGTTTCTTGCTGGACGAGATATCAC
AAAATAAACAATTATAATTACACAAAGTCTTTAGTAAGCATTTGGATATGGTTA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2BN52TF 772 0 0
G
CCACCATCCATCACCATCTCCGCATCTCATTCTCCATCGTCGTCAGTAGCAGCATCCAGA
AGAGAAATATCTCTATCCATTATAGCCGTCGCGTCTTCCATCATCTCCTCCTGTTACTTC
TCTTCTCCGGCCTCCGCTGAGTTCTCCGAAATCCCCGACTCCGGCGGAGTTAAGAGTCTC
GACCTCCGTGTCGGCGACGGTGAAGTACCCATTGAAGGAGATCAGGTTGCAATACATTAC
TATGGGAGGTTGGCTGCGAAGCAAGGATGGAGATTTGATTCAACGTATGATCATAAAGAC
AGTAGTGGAGACTCTGTTCCTTTTACTTTCATCCTTGGTTCTGCCAATGTTATTCCGGGG
ATCGAAACAGCCGTGAGGTCGATGAAAGTAGGTGGGATTCGTCGGGTGGTTATACCTCCG
TCTCAAGGCTACCAGAATACATCACAAGAACCTCTCCCACCAAATTTCTTTGACAGACAA
AGACTCTTCACGACTATCTTTAACCCAACACGTCTTGCCAATGGAGAAGGTTCTACTCTT
GGAACTCTCGTTTTCGATATTGAACTTGTCAGTACCAGACGCCCTAACCGATGATTCATA
CAGCCAGCCATTCATACTCTTCGGTTGTTTCTTGCTGGACGAGATATCACAAAATAAACA
ATTATAATTACACAAAGTCTTTAGTAAGCATTTGGATATGGTTAGTTGAATCTCGATGTG
CACCTCACCCCAATCTATGATATAGTATATCACTTGAACATAGTGTTGATT

QA 2 772 2 772
DS 



AS 1 2

CO CL5698Contig1 1076 2 2 U
GGTGGAAACCGACCGAGAAAAAAAAAGGAAGTGCCAAACAACATTTGCCGGCGATTAAGA
TGGAGACGGAGGTCGATAAGGAGATTCTCAAATCTGTCGGAGCTGAGCTTCTTCCCGACG
GACGTCAAGGTTTACGCATCCATGACTGGGAGATCGAAACCATCCGCGGCACGATTCTCA
CTTCTCTCGCTCACGAACAGTGGGAAGAGAAGCTTAAGACCTCTCACTTACCTGAAATGG
TGTTTGGAGAGAATGCGTTGGTTCTTAAACACTTGAGGAGCAACACTAAGATTCATTTCA
ACGCGTTTGATGCACTTGCTGGTTGGAAGCAAGAGGGGCTTCCACCTGTTGAAGTTCCTG
CTGCAGCACAATGGAAGTTCAGGAGCAAGCCGTCCCAGCAGGTGATACTGGATTATGATT
ATACTTTTACTACGCCGTACTGTGGAAGTGGAGTTGTTCAGAAAGACCAAGAAACGGTTG
AGCAAAAGCAAGTCCTGAGGGGGATGCTAGTCTTAAGTGGGAGAACTGTGAAGAGCAGAT
TGATTTGGGTGCTCTCTCACTTAAAGAACCTATTCTCTTCTATGATGAGGTAGTTTTGTA
TGAAGATGAACTGGCTGACAATGGAGTGTCACTTCTGACTGTGAAAGTGAGAGTCATGCC
AAGTTCATGGTTTCTCCTCTTACGATTTTGGCTTAGAGTTGATGGTGTACTTATGAGGTT
GAGAGAGACAAGAATGCATTATGTCTTTGGCAAAGGGGAGACCCCCACAGTTCTTCGTGG
AAGCTGTTGGAGAGAAACAACATTTAAGTCTCTATCTGCGAAAGGGTATCCAGTTGATTT
AGCATTCTATAGTGACCCAGGTCCCATCAGTCAGAGGCTTCCGGTGATTAAACAGATAAC
ACAGAAACTGAAGATTCCTCATTAAGTGTAAGCTGTTTATAAAGTTGCAAGTTAAACGAA
ATACTTTCTCAATTATTACTATCGAGTTTGTCGTTGTAAGGAGTTACTCAGCTGATTCAT
GGATTTCATTTTCAAGTGAGCACTCAAACCCTTTCATGTTATACTATCTTTAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB53TF U 1
AF RR2GB53JQ C 408
BS 1 692 RR2GB53TF
BS 693 1076 RR2GB53JQ

RD RR2GB53TF 692 0 0
GGTGGAAACCGACCGAGAAAAAAAAAGGAAGTGCCAAACAACATTTGCCGGCGATTAAGA
TGGAGACGGAGGTCGATAAGGAGATTCTCAAATCTGTCGGAGCTGAGCTTCTTCCCGACG
GACGTCAAGGTTTACGCATCCATGACTGGGAGATCGAAACCATCCGCGGCACGATTCTCA
CTTCTCTCGCTCACGAACAGTGGGAAGAGAAGCTTAAGACCTCTCACTTACCTGAAATGG
TGTTTGGAGAGAATGCGTTGGTTCTTAAACACTTGAGGAGCAACACTAAGATTCATTTCA
ACGCGTTTGATGCACTTGCTGGTTGGAAGCAAGAGGGGCTTCCACCTGTTGAAGTTCCTG
CTGCAGCACAATGGAAGTTCAGGAGCAAGCCGTCCCAGCAGGTGATACTGGATTATGATT
ATACTTTTACTACGCCGTACTGTGGAAGTGGAGTTGTTCAGAAAGACCAAGAAACGGTTG
AGCAAAAGCAAGTCCTGAGGGGGATGCTAGTCTTAAGTGGGAGAACTGTGAAGAGCAGAT
TGATTTGGGTGCTCTCTCACTTAAAGAACCTATTCTCTTCTATGATGAGGTAGTTTTGTA
TGAAGATGAACTGGCTGACAATGGAGTGTCACTTCTGACTGTGAAAGTGAGAGTCATGCC
AAGTTCATGGTTTCTCCTCTTACGATTTTGGC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2GB53JQ 669 0 0
CTGGATTATGATTATACTTTTACTACGCCGTACTGTGGAAGTGGAGTTGTTCAGAAAGAC
CAAGAAACGGTTGAGCAAAAGCAAGTCCTGAGGGGGATGCTAGTCTTAAGTGGGAGAACT
GTGAAGAGCAGATTGATTTGGGTGCTCTCTCACTTAAAGAACCTATTCTCTTCTATGATG
AGGTAGTTTTGTATGAAGATGAACTGGCTGACAATGGAGTGTCACTTCTGACTGTGAAAG
TGAGAGTCATGCCAAGTTCATGGTTTCTCCTCTTACGATTTTGGCTTAGAGTTGATGGTG
TACTTATGAGGTTGAGAGAGACAAGAATGCATTATGTCTTTGGCAAAGGGGAGACCCCCA
CAGTTCTTCGTGGAAGCTGTTGGAGAGAAACAACATTTAAGTCTCTATCTGCGAAAGGGT
ATCCAGTTGATTTAGCATTCTATAGTGACCCAGGTCCCATCAGTCAGAGGCTTCCGGTGA
TTAAACAGATAACACAGAAACTGAAGATTCCTCATTAAGTGTAAGCTGTTTATAAAGTTG
CAAGTTAAACGAAATACTTTCTCAATTATTACTATCGAGTTTGTCGTTGTAAGGAGTTAC
TCAGCTGATTCATGGATTTCATTTTCAAGTGAGCACTCAAACCCTTTCATGTTATACTAT
CTTTAACCC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL5699Contig1 906 2 8 U
GGGTCGTTCAGAGACGTTTCATCTTTGTCTGAATCATTTGTGGCATCGAAACGCGCTTCT
TCGTGATTAATGTTCATTACTTCAGTCACCACGATGTAGCCTTGAATGCATGATTTGATT
AGGAGTCGGTGAACCTGAGCGTATAAATATTAGATCTATTAAAAGCTAAGAAGATCAAGA
ACAATCCTACCAAACTTGGCCATGGTCATTACAACGATCATGATGCGTACGAAGAAAAAT
ATGGCAAGCAAGAATCAGAGTGGCACGGTGAGCCAGATTTGTTATTTACCTTTGAAAAAG
ACTTGCGCGTTATGTTTTTGCGACATTAACGGGTTCTCTGTTTTATGTTGGAATAGCACA
ATGTATACTCATGGGTCATGGCGGTGTATCTGTTGAAGCTGTGTCACTGTGTCATCCCGG
GGAAGCTAATTTCCAGGCACCGCCGAAGATCGTTCCATCAGGGACAAAAGTTTCCCATTG
GTGTTTTCGGATACTTATTATGGACACGAGAGGATATATACTCTGGAGAGGGACGTGAGA
AGAGAGGCACCGTCTCATCCTCCTAAACTGCATGACATGTTGTAGAGAGAATAAATGATC
GAGGCTCATCAGATGGCAATAAAACACGCATGTGTCTTTGTTATCCGCGACAAAGATGTA
ATGAGGACGTGATGTTTTTTTAAATATTGGTTGAAGTTGCAGGAAAACCTATGTCAAAAG
TTTAAAGCCATCTGTGAATTGGCTTGAAGAGGCTGAGGAACAAAAAATTACGGTGTTTCT
TTTTCATTTTGCTTTGTAATTATCTTTTCTTATAAACATATATAATTTTAGAGTGTATAT
GTCTTTTAACTCTTTTGATTTCCGATATTCTTTTGCTGCATTTGACCTTTTAGTGGCAAG
AAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2H515TF U 1
AF RR2H515JQB C 394
BS 1 603 RR2H515TF
BS 604 604 RR2H515JQB
BS 605 653 RR2H515TF
BS 654 654 RR2H515JQB
BS 655 680 RR2H515TF
BS 681 681 RR2H515JQB
BS 682 699 RR2H515TF
BS 700 906 RR2H515JQB

RD RR2H515TF 699 0 0
GGGTCGTTCAGAGACGTTTCATCTTTGTCTGAATCATTTGTGGCATCGAAACGCGCTTCT
TCGTGATTAATGTTCATTACTTCAGTCACCACGATGTAGCCTTGAATGCATGATTTGATT
AGGAGTCGGTGAACCTGAGCGTATAAATATTAGATCTATTAAAAGCTAAGAAGATCAAGA
ACAATCCTACCAAACTTGGCCATGGTCATTACAACGATCATGATGCGTACGAAGAAAAAT
ATGGCAAGCAAGAATCAGAGTGGCACGGTGAGCCAGATTTGTTATTTACCTTTGAAAAAG
ACTTGCGCGTTATGTTTTTGCGACATTAACGGGTTCTCTGTTTTATGTTGGAATAGCACA
ATGTATACTCATGGGTCATGGCGGTGTATCTGTTGAAGCTGTGTCACTGTGTCATCCCGG
GGAAGCTAATTTCCAGGCACCGCCGAAGATCGTTCCATCAGGGACAAAAGTTTCCCATTG
GTGTTTTCGGATACTTATTATGGACACGAGAGGATATATACTCTGGAGAGGGACGTGAGA
AGAGAGGCACCGTCTCATCCTCCTAAACTGCATGACATGTTGTAGAGAGAATAAATGATC
GAG*CTCATCAGATGGCAATAAAACACGCATGTGTCTTTGTTATCCGCGACAA*GATGTA
ATGAGGACGTGATGTTTTTT*AAATATTGGTTGAAGTTG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2H515JQB 513 0 0
TGAAGCTGTGTCACTGTGTCATCCCGGGGAAGCTAATTTCCAGGCACCGCCGAAGATCGT
TCCATCAGGGACAAAAGTTTCCCATTGGTGTTTTCGGATACTTATTATGGACACGAGAGG
ATATATACTCTGGAGAGGGACGTGAGAAGAGAGGCCCCGTCTCATCCTCCTAAACTGCAT
GACATGTTGTAGAGAGAATAAATGATCGAGGCTCATCAGATGGCAATAAAACACGCATGT
GTTTTTGTTATCCGCGACAAAGATGTAATGAGGACGTGATGTTTTTTTAAATATTGGTTG
AAGTTGCAGGAAAACCTATGTCAAAAGTTTAAAGCCATCTGTGAATTGGCTTGAAGAGGC
TGAGGAACAAAAAATTACGGTGTTTCTTTTTCATTTTGCTTTGTAATTATCTTTTCTTAT
AAACATATATAATTTTAGAGTGTATATGTCTTTTAACTCTTTTGATTTCCGATATTCTTT
TGCTGCATTTGACCTTTTAGTGGCAAGAAGCTT

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 2

CO CL5700Contig1 1189 2 12 U
GGATATCAAAACCTCCTGATTTCATTCCCTACTTGTATTTGTTTCTTTAAAAAGATAGTT
TTCGTTAGAAAATAAAAGGACATGGTTTTGCTTTCTTCAACACCGTCCCTGAACACCGGA
ATGCAAGCGAAAGCCTCGCCCGAATGTAACTTTCCGGTGATTGATTTCTCTTCACACGAC
CGGTCAAAACTATCGGAGAAAATCGTGAAAGCCTGCGACGTTAATGGGTTCTTCAAGGTG
ATAAACCATGGAGTTAAACCGGAGATCATTTGGAGATTTGAGCGTGAGGGCGAAGAGTTC
TTTAATAAACCGGGACCGGAGAAGCAACGAGCCGGTCCGGCGAGCCCATTCGGTTACGGA
TGCAAGAACATCGGGTTTAATGGAGATTTGGGTGAGCTTGAGTATTTTCTTCTCCATGCA
AACCCAACTTCTGTAGCTGATAAATCTGAAACTATCTCACGTGATGACCCCTTCAAGTTC
AGCTCGGTCACTAACGAATACATACGCGCCGTTAAAGATCTGGCATGTGAGATTATTGAT
CTTACGGCCGAGAATATATGGGGCCAGAGATCTAGCAAGGTGAGCGAGCTAATCAGAGAT
GTACGTAGCGACTCGATCCTGCGGCTGAATCACTATCCACCCGCACCGTACGCGCTGAGA
GGCGTTAGCCAATTAGGTTTCGGGGAGCATTCTGACCCTCAGATCTTGACGGTGTTAAGA
TCCAACGACGTAGATGGCTTTGAGGTTTGCTCACGTGACGGCTTGTGGATTCCTGTACCA
TCTGACCCTACATGCTTTTACGCATTGGTCGGTGACTGCTTTCAGGCATTGACGAATGTG
AGATTCACAAGCGTGAGGCACAGGGTATTAGCGAACACGGCAGGGAAGCCTCGGATGTCG
GCGATGTATTTTGCGGCACCACCGTTGGAGGCAAAAATATCACCGTTACCGGAAATGGTA
TCGCCGGAAAATCCACGAAGGTATAAATCATTCACATGGGGTGACTACAAAACAGCTACC
TACTCCCTCCGTTTAGATGTTCCTCGTCTCGAGTTTTTCAAAACTTCATAAGTATAAATA
TACGTACACCAGCTAAAACTTAGATTTTTTTTTCTTTTGCAGAAATTTTTATGATTGTTG
GTTTGTTCAAAATACGTACTACACCATGTGAATGTACACGATGAATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG59TF U 1
AF RR2GG59JQB C 491
BS 1 676 RR2GG59TF
BS 677 677 RR2GG59JQB
BS 678 711 RR2GG59TF
BS 712 712 RR2GG59JQB
BS 713 744 RR2GG59TF
BS 745 745 RR2GG59JQB
BS 746 770 RR2GG59TF
BS 771 771 RR2GG59JQB
BS 772 778 RR2GG59TF
BS 779 779 RR2GG59JQB
BS 780 797 RR2GG59TF
BS 798 1189 RR2GG59JQB

RD RR2GG59TF 798 0 0
GGATATCAAAACCTCCTGATTTCATTCCCTACTTGTATTTGTTTCTTTAAAAAGATAGTT
TTCGTTAGAAAATAAAAGGACATGGTTTTGCTTTCTTCAACACCGTCCCTGAACACCGGA
ATGCAAGCGAAAGCCTCGCCCGAATGTAACTTTCCGGTGATTGATTTCTCTTCACACGAC
CGGTCAAAACTATCGGAGAAAATCGTGAAAGCCTGCGACGTTAATGGGTTCTTCAAGGTG
ATAAACCATGGAGTTAAACCGGAGATCATTTGGAGATTTGAGCGTGAGGGCGAAGAGTTC
TTTAATAAACCGGGACCGGAGAAGCAACGAGCCGGTCCGGCGAGCCCATTCGGTTACGGA
TGCAAGAACATCGGGTTTAATGGAGATTTGGGTGAGCTTGAGTATTTTCTTCTCCATGCA
AACCCAACTTCTGTAGCTGATAAATCTGAAACTATCTCACGTGATGACCCCTTCAAGTTC
AGCTCGGTCACTAACGAATACATACGCGCCGTTAAAGATCTGGCATGTGAGATTATTGAT
CTTACGGCCGAGAATATATGGGGCCAGAGATCTAGCAAGGTGAGCGAGCTAATCAGAGAT
GTACGTAGCGACTCGATCCTGCGGCTGAATCACTATCCACCCGCACCGTACGCGCTGAGA
GGCGTTAGCCAATTAG*TTTCGGGGAGCATTCTGACCCTCAGATCTTGACG*TGTTAAGA
TCCAACGACGTAGATGGCTTTGAG*TTTGCTCACGTGACGGCTTGTGGAT*CCTGTAC*A
TCTGACCCTACATGCTT
C

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2GG59JQB 699 0 0
CTAACGAATACATACGCGCCGTTAAAGATCTGGCATGTGAGATTATTGATCTTACGGCCG
AGAATATATGGGGCCAGAGATCTAGCAAGGTGAGCGAGCTAATCAGAGATGTACGTAGCG
ACTCGATCCTGCGGCTGAATCACTATCCACCCGCACCGTACGCGCTGAGAGGCGTTAGCC
AATTAGGTTTCGGGGAGCATTCTGACCCTCAGATCTTGACGGTGTTAAGATCCAACGACG
TAGATGGCTTTGAGGTTTGCTCACGTGACGGCTTGTGGATTCCTGTACCATCTGACCCTA
CATGCTTTTACGCATTGGTCGGTGACTGCTTTCAGGCATTGACGAATGTGAGATTCACAA
GCGTGAGGCACAGGGTATTAGCGAACACGGCAGGGAAGCCTCGGATGTCGGCGATGTATT
TTGCGGCACCACCGTTGGAGGCAAAAATATCACCGTTACCGGAAATGGTATCGCCGGAAA
ATCCACGAAGGTATAAATCATTCACATGGGGTGACTACAAAACAGCTACCTACTCCCTCC
GTTTAGATGTTCCTCGTCTCGAGTTTTTCAAAACTTCATAAGTATAAATATACGTACACC
AGCTAAAACTTAGATTTTTTTTTCTTTTGCAGAAATTTTTATGATTGTTGGTTTGTTCAA
AATACGTACTACACCATGTGAATGTACACGATGAATTAG

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL5701Contig1 1073 2 2 U
GGAGTCTGGAGATGGTGGAGTTGGATCCTCTTTGCCTTCTTCTTCTCTAAGTAAACTGAC
TGAGACAGAGGATAATCAGGTGATGCAGATATTTGGGAAGTTAACGGTCGAGAGTAGTAA
CAGAGGGAAGAAAGATTGTGAGGAGGAGGGTATGCATGAGCTCTCTTCTATATTGGAGGT
TATCCGCAAGATGCATCAGCTGGAAATAAAACCGAATGTTGTTACCTTCTCTGCCATTCT
GAATGCTTGCAGTCGGTGCAACTCATTTGAAGATGCATCGGTGCTGCTAGAGGAGCTCAG
GCTGTTTGATAATCAGGTGTATGGGGTTGTTCATGGACTTCTCAAGGGCCACAGAGAGAA
TGTGTGGCTCCAGGCTCAGAGTTTATTCGACAAAGTAAACGAAATGGATGGTTCCACTGC
TGCTGCCTTCTACAATGCTCTTACAGACATGCTCTGGCACTTTGGTCAGAAACGAGGAGC
GCAACTGGTGGCGCTTGAGGGAAGATCTAGGCAAGTTTGGGAGAATGTTTGGTCCGAGTC
TTGCTTGGACTTGCACCTTATGTCTTCTGGCGCTGCACGTGCGATGGTCCATGCTTGGTT
GCTAAACATACGCTCCATTGTCTATGAAGGTCATGAGTTACCTAAACTTTTGAGCATATT
GACTGGTTGGGGGAAACACAGCAAAGTAGTTGGAGATGCAGCACTAAGGCCAGCTGTTGA
AGCGCTTTTGAGGGGAATGGACGCACCGTTCTACCTCCCAAAATGCAACATGGGACGGTT
CACATCAAGCGGTTCGGTGGTAGCAACTTGGCTGCGTGAATCAGCCACACTCAAGCTCTT
GATAGTCCATGACCACATAACCACCAAAGCTAGCACAGCAAGAGGGGAAACAGAACAACA
TGAACAAACCTCTCTCACTTTGCAGCCTCTTCTTCTGTAGTAGTTGTACTCTGTTTTATG
TATACAATTTTATGACCGCCAAGTATGTGTTTGTAACTTGTAACAATGGTGGTGTTTTCT
GCGGTGTGATGATATTTTGTAACAAAGTAAGACCCAAATTGTAATTTTGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU92TF U 1
AF RR2EU92JQ C 396
BS 1 675 RR2EU92TF
BS 676 1073 RR2EU92JQ

RD RR2EU92TF 683 0 0
GGAGTCTGGAGATGGTGGAGTTGGATCCTCTTTGCCTTCTTCTTCTCTAAGTAAACTGAC
TGAGACAGAGGATAATCAGGTGATGCAGATATTTGGGAAGTTAACGGTCGAGAGTAGTAA
CAGAGGGAAGAAAGATTGTGAGGAGGAGGGTATGCATGAGCTCTCTTCTATATTGGAGGT
TATCCGCAAGATGCATCAGCTGGAAATAAAACCGAATGTTGTTACCTTCTCTGCCATTCT
GAATGCTTGCAGTCGGTGCAACTCATTTGAAGATGCATCGGTGCTGCTAGAGGAGCTCAG
GCTGTTTGATAATCAGGTGTATGGGGTTGTTCATGGACTTCTCAAGGGCCACAGAGAGAA
TGTGTGGCTCCAGGCTCAGAGTTTATTCGACAAAGTAAACGAAATGGATGGTTCCACTGC
TGCTGCCTTCTACAATGCTCTTACAGACATGCTCTGGCACTTTGGTCAGAAACGAGGAGC
GCAACTGGTGGCGCTTGAGGGAAGATCTAGGCAAGTTTGGGAGAATGTTTGGTCCGAGTC
TTGCTTGGACTTGCACCTTATGTCTTCTGGCGCTGCACGTGCGATGGTCCATGCTTGGTT
GCTAAACATACGCTCCATTGTCTATGAAGGTCATGAGTTACCTAAACTTTTGAGCATATT
GACTGGTTGGGGGAA
CACAGCAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2EU92JQ 678 0 0
TAAACGAAATGGATGGTTCCACTGCTGCTGCCTTCTACAATGCTCTTACAGACATGCTCT
GGCACTTTGGTCAGAAACGAGGAGCGCAACTGGTGGCGCTTGAGGGAAGATCTAGGCAAG
TTTGGGAGAATGTTTGGTCCGAGTCTTGCTTGGACTTGCACCTTATGTCTTCTGGCGCTG
CACGTGCGATGGTCCATGCTTGGTTGCTAAACATACGCTCCATTGTCTATGAAGGTCATG
AGTTACCTAAACTTTTGAGCATATTGACTGGTTGGGGGAAACACAGCAAAGTAGTTGGAG
ATGCAGCACTAAGGCCAGCTGTTGAAGCGCTTTTGAGGGGAATGGACGCACCGTTCTACC
TCCCAAAATGCAACATGGGACGGTTCACATCAAGCGGTTCGGTGGTAGCAACTTGGCTGC
GTGAATCAGCCACACTCAAGCTCTTGATAGTCCATGACCACATAACCACCAAAGCTAGCA
CAGCAAGAGGGGAAACAGAACAACATGAACAAACCTCTCTCACTTTGCAGCCTCTTCTTC
TGTAGTAGTTGTACTCTGTTTTATGTATACAATTTTATGACCGCCAAGTATGTGTTTGTA
ACTTGTAACAATGGTGGTGTTTTCTGCGGTGTGATGATATTTTGTAACAAAGTAAGACCC
AAATTGTAATTTTGAGCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL5702Contig1 723 2 3 U
TTATAAAGACAAACATAATACACTTTAACAAACAGAAAGTAGAATACATGCATGTATAAT
ACAGCACTTCAATTTCACATGCCACTCATATATACTATGCACTCATTATTTATTGAACTT
TTTAATACTGAAATCAGCAGGCTTCGGCCATGCACACAAGTACTGATAGGAAAGTCACAC
CAGGAGTACTCTCCTCTATTCCTCAGACAAGAGATGTTCGTCGATCTCTTTGGAGACTTC
AACACAGAACTGGAGGAAAGTCTCAGGATGAGCAACCTCGTCGCTAATCTTCTCATACTC
AAAGTGCCAGTGCACAATACTCCCTGGCCCTCCATGCTTAGGGGTCACCTGGATCGTGGT
CAAGAAGCTTTTGTACTCTTTCATCAAATCACCTTCTATAACCCTGAAAGTGATCAAGTT
CTTTTCTGGCTCCACTGCCTCGATCCTCTCCTTGGTCAACTTTGCCTCCCCATCAATAAC
GAAGTTCCAGTAGACGATAGAGCCGACCTTTCCCCAGTCACCTTCGTGCAGATCACAACC
TTTAATCTTGCCTGGAGATGCTTTGGAGACATGGTGTGGTCTCCCGGCGACCATGTGATG
AAACTGTCCAGCCGAAGCTTTGATCTCCACGTCTATCTCAAGCGTACCAACCAAAGTAGA
CCCCTTGGTCGTTGCCGCTTCAGCCATTTTTCTACCTCTGATAATGCTTATCTTGAGTAA
AAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2G189JQ U 210
AF RR2G189TF C 1
BS 1 209 RR2G189TF
BS 210 497 RR2G189JQ
BS 498 723 RR2G189TF

RD RR2G189JQ 288 0 0
AGAGATGTTCGTCGATCTCTTTGGAGACTTCAACACAGAACTGGAGGAAAGTCTCAGGAT
GAGCAACCTCGTCGCTAATCTTCTCATACTCAAAGTGCCAGTGCACAATACTCCCTGGCC
CTCCATGCTTAGGGGTCACCTGGATCGTGGTCAAGAAGCTTTTGTACTCTTTCATCAAAT
CACCTTCTATAACCCTGAAAGTGATCAAGTTCTTTTCTGGCTCCACTGCCTCGATCCTCT
CCTTGGTCAACTTTGCCTCCCCATCAATAACGAAGTTCCAGTAGACGA

QA 1 288 1 288
DS 

RD RR2G189TF 723 0 0
TTATAAAGACAAACATAATACACTTTAACAAACAGAAAGTAGAATACATGCATGTATAAT
ACAGCACTTCAATTTCACATGCCACTCATATATACTATGCACTCATTATTTATTGAACTT
TTTAATACTGAAATCAGCAGGCTTCGGCCATGCACACAAGTACTGATAGGAAAGTCACAC
CAGGAGTACTCTCCTCTATTCCTCAGACAAGAGATGTTCGTCGATCTCTTTGGAGACTTC
AACACAGAACTGGAGGAAAGTCTCAGGATGAGCAACCTCGTCGCTAATCTTCTCATACTC
AAAGTGCCAGTGCACAATACTCCCTGGCCCTCCATGCTTAGGGGTCACCTGGATCGTGGT
CAAGAAGCTTTTGTACTCTTTCATCAGATCACCTTCTATAACCCTGAAAGTGATCAAGTT
CTTTTCTGGCTCCACTGCCTCGATCCTCTCCTTGGTCAACTTTGCCTCCCCATCAATAAC
GAAGTTCCAGTAGACGATAGAGCCGACCTTTCCCCAGTCACCTTCGTGCAGATCACAACC
TTTAATCTTGCCTGGAGATGCTTTGGAGACATGGTGTGGTCTCCCGGCGACCATGTGATG
AAACTGTCCAGCCGAAGCTTTGATCTCCACGTCTATCTCAAGCGTACCAACCAAAGTAGA
CCCCTTGGTCGTTGCCGCTTCAGCCATTTTTCTACCTCTGATAATGCTTATCTTGAGTAA
AAA

QA 1 723 1 723
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5705Contig1 821 2 4 U
GCGCAGGCTGTTGTGTAAGATGCTGGACCCAAACCCTGAAACTAGAATCACTATGGCGAA
AATCAGGGAGAGTACTTGGTTCAGAAAAGGTTTACACATGAAACAGAGAAAGATGGAGAA
ACGAGTCAGAGAGACGAACTCCGTGGAAGCTAGTGCTGCAGGTCCAAGCGAGAACGGAGG
CAGGATCACAGAGGAAAACAATACAGACCAGCCTACAAGTATAAATGCTTTTGATATAAT
TGCATCGTCTGCTGGGTTTGATCTGACGGGACTGTTTGGAGATGTTTACGACAAGAGAGA
ATCTAGATTCACATCCCAGAAACCTGCTTCGGTGATCATATCTAAGCTGGAGGAGGTGGC
GCAGCGACTGAAACTGAGCATAAGGAAACGAGAAGCAGGTCTGTTCAAACTAGAAACATC
AAAGGAGGGAAGAAAAGGAAAACTGTCGATGGATGCGGAGATATTCCAAGTGACGCCAAC
GTTTCATATGGTGGAAGTGAAGAAGTCTAATGGAGATACTCTGGAGTATCAGAAATTAGT
GAAAGAGGATCTTAGGCCTGCTCTTGCAGACATTGTATGGGTTTGGCAGAGCGACAGAGA
TGAGCAGATAATGCCTGCTTCACAGCAAGAGACAGAGCAACAACAACAGCAGCAGCAGGA
AGAAGAAGAACCATTGTAGCTTGAGAATCTTTTGTTATCAGTTCAAAGTTTTGAATTTTT
TGAACTTTGATGTTAAACGTGTAGTACATGAGTTTCTTACATTGTCGTTTGTGAAAAAAG
AAAGGAAGAATCCTGCATATAATAAAGTCCTTTACACAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E163TF U 1
AF RR2E163JQ C 367
BS 1 534 RR2E163TF
BS 535 535 RR2E163JQ
BS 536 664 RR2E163TF
BS 665 821 RR2E163JQ

RD RR2E163TF 664 0 0
GCGCAGGCTGTTGTGTAAGATGCTGGACCCAAACCCTGAAACTAGAATCACTATGGCGAA
AATCAGGGAGAGTACTTGGTTCAGAAAAGGTTTACACATGAAACAGAGAAAGATGGAGAA
ACGAGTCAGAGAGACGAACTCCGTGGAAGCTAGTGCTGCAGGTCCAAGCGAGAACGGAGG
CAGGATCACAGAGGAAAACAATACAGACCAGCCTACAAGTATAAATGCTTTTGATATAAT
TGCATCGTCTGCTGGGTTTGATCTGACGGGACTGTTTGGAGATGTTTACGACAAGAGAGA
ATCTAGATTCACATCCCAGAAACCTGCTTCGGTGATCATATCTAAGCTGGAGGAGGTGGC
GCAGCGACTGAAACTGAGCATAAGGAAACGAGAAGCAGGTCTGTTCAAACTAGAAACATC
AAAGGAGGGAAGAAAAGGAAAACTGTCGATGGATGCGGAGATATTCCAAGTGACGCCAAC
GTTTCATATGGTGGAAGTGAAGAAGTCTAATGGAGATACTCTGGAGTATCAGAA*TTAGT
GAAAGAGGATCTTAGGCCTGCTCTTGCAGACATTGTATGGGTTTGGCAGAGCGACAGAGA
TGAGCAGATAATGCCTGCTTCACAGCAAGAGACAGAGCAACAACAACAGCAGCAGCAGGA
AGAA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2E163JQ 455 0 0
ACTGAAACTGAGCATAAGGAAACGAGAAGCAGGTCTGTTCAAACTAGAAACATCAAAGGA
GGGAAGAAAAGGAAAACTGTCGATGGATGCGGAGATATTCCAAGTGACGCCAACGTTTCA
TATGGTGGAAGTGAAGAAGTTTAATGGAGATACTCTGGAGTATCAGAAATTAGTGAAAGA
GGATTTTAGGCCTGTTCTTGCAGACATTGTATGGGTTTGGCAGAGCGACAGAGATGAGCA
GATAATGCCTGCTTCACAGCAAGAGACAGAGCAACAACAACAGCAGCAGCAGGAAGAAGA
AGAACCATTGTAGCTTGAGAATCTTTTGTTATCAGTTCAAAGTTTTGAATTTTTTGAACT
TTGATGTTAAACGTGTAGTACATGAGTTTCTTACATTGTCGTTTGTGAAAAAAGAAAGGA
AGAATCCTGCATATAATAAAGTCCTTTACACAACT

QA 1 455 1 455
DS 



AS 1 2

CO CL5706Contig1 586 2 2 U
GTTTTCTTGAATATGATTTTGATTCTCATAACCCTTTATTGTATACAAACACTTGTGTTC
AACTTCTGAAACCCAAATCAAACGTGTGGGCCAAGCTACTTAACAATCTGAGGATGAATA
CAGATTGATCCGAGAATCCAGTCAAACATACGTTTCAAGAACTCTATTCCGGCGGAGAAG
TGGAGCCACACGCCTCGGAGGAACCGAGACCACCCAGGCGAGTCTTCCGATGAAGCTAAC
GCCGTTGGCTGGAGATAAGACCAAGCGGCTTGCTTCACTAAGGGGTTGTGTATCGAGATA
TCACCAACGGTGGATAAGACCGGAGAGCTGCTACCGTTAACCGACGGTAAGTTGACGGAG
GAGTTACTCGGAGATGAGATGATATCTCTGAAAGATGTGTAAGAGGGTGGTTTCAGCGAG
ATGAGCTCGAAATGGAACGACGTCGGCGTAGTGGACGATTCGATCGCGAAAGGAATATCG
GAGGTGATCGCAGGCGTTATCGTGGATATGGAGTTTCTACGGCGGAGAGGTGTTGACGAC
GGTGGAGTCTCCATAGTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AK51TF C 1
AF RR2AK51JQ U 375
BS 1 374 RR2AK51TF
BS 375 586 RR2AK51JQ

RD RR2AK51TF 586 0 0
GTTTTCTTGAATATGATTTTGATTCTCATAACCCTTTATTGTATACAAACACTTGTGTTC
AACTTCTGAAACCCAAATCAAACGTGTGGGCCAAGCTACTTAACAATCTGAGGATGAATA
CAGATTGATCCGAGAATCCAGTCAAACATACGTTTCAAGAACTCTATTCCGGCGGAGAAG
TGGAGCCACACGCCTCGGAGGAACCGAGACCACCCAGGCGAGTCTTCCGATGAAGCTAAC
GCCGTTGGCTGGAGATAAGACCAAGCGGCTTGCTTCACTAAGGGGTTGTGTATCGAGATA
TCACCAACGGTGGATAAGACCGGAGAGCTGCTACCGTTAACCGACGGTAAGTTGACGGAG
GAGTTACTCGGAGATGAGATGATATCTCTGAGAGATGTGTAAGAGGGTGGTTTCAGCGAG
ATGAGCTCGAAATGGAACGACGTCGGCGTAGTGGACGATTCGATCGCGAAAGGAATATCG
GAGGTGATCGCAGGCGTTATCGTGGATATGGAGTTTCTACGGCGGAGAGGTGTTGACGAC
GGTGGAGTCTCCATAGTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCTCTTTCC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2AK51JQ 212 0 0
TGAGATGATATCTCTGAAAGATGTGTAAGAGGGTGGTTTCAGCGAGATGAGCTCGAAATG
GAACGACGTCGGCGTAGTGGACGATTCGATCGCGAAAGGAATATCGGAGGTGATCGCAGG
CGTTATCGTGGATATGGAGTTTCTACGGCGGAGAGGTGTTGACGACGGTGGAGTCTCCAT
AGTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCTCTTTCC

QA 1 212 1 212
DS 



AS 1 2

CO CL5707Contig1 860 2 2 U
GGGAAGCCTCAACAGCCATATGTTCAAGCATGGACCATGAAAAACTCAGCGGCAGAGAAA
TCGACCGCCACAATCCGATCATTGAAGATGGCAAGAGATCCTCCGTCGACGACTATATCA
GAATACCCGCTTCCCCCGGAGAGATCAGTAACAAAACACTAGAGATCTACAAGGGCAGGA
GGAGCGTCACTGCCCGAAAAAGCACCGGTGGTGGAGCCGCGGCGTTGTTGAAGCTCATCA
CAAATGACCTCAGCTTGGCGAGGAGGAGTTTCAGCTGTGTAGCTAGACCCGCAAGTGACT
TTGTCAAAACCCCTGCTGGTTCTACAAGGTATCTTTTGGGATCCGACCCGGGTTCTCTTA
CCGGGTCTGCGGGTCAGGATACAGTAGCTCCTAAATCTACTGATGTTGAAGAGATAAAGC
CGTCAATGGAGGAGGAGAAGACTAGTGGTGGAGGAGGTGGTGGTTCAGACCAGGTCGTTG
TTCTCAAAGTGTCTCTCCACTGTAGAGGCTGTGAAGCAAAAGTTAGGAAACATCTGTCCA
GAATGCAAGGTGTGACATCGTTCAACATAGATTTTGCTGCAAAGAAAGTGACTGTGACTG
GAGACATCACTCCCTTGGGAATATTGGATAGCATCTCAAAGGTTAAAAATGCTCAATTCT
GGACAGCTCCAACACTCCCAGCTCCAACGCTCCCAATGCCAAATCTGGAAACTCCAAATC
CCTAGTTTACTTTTTTCACTGTCTTATCTGTCTCACTTGTTGTAAAGCCAACAGTAAAGT
TTCAAACTTTACTGCACCACCTACTTTTCGTTGGAACTAGATCATGAGGCTACACCTCTT
CTCTTTATGCAGTGATACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H469TF U 1
AF RR2H469JQB C 358
BS 1 637 RR2H469TF
BS 638 860 RR2H469JQB

RD RR2H469TF 637 0 0
GGGAAGCCTCAACAGCCATATGTTCAAGCATGGACCATGAAAAACTCAGCGGCAGAGAAA
TCGACCGCCACAATCCGATCATTGAAGATGGCAAGAGATCCTCCGTCGACGACTATATCA
GAATACCCGCTTCCCCCGGAGAGATCAGTAACAAAACACTAGAGATCTACAAGGGCAGGA
GGAGCGTCACTGCCCGAAAAAGCACCGGTGGTGGAGCCGCGGCGTTGTTGAAGCTCATCA
CAAATGACCTCAGCTTGGCGAGGAGGAGTTTCAGCTGTGTAGCTAGACCCGCAAGTGACT
TTGTCAAAACCCCTGCTGGTTCTACAAGGTATCTTTTGGGATCCGACCCGGGTTCTCTTA
CCGGGTCTGCGGGTCAGGATACAGTAGCTCCTAAATCTACTGATGTTGAAGAGATAAAGC
CGTCAATGGAGGAGGAGAAGACTAGTGGTGGAGGAGGTGGTGGTTCAGACCAGGTCGTTG
TTCTCAAAGTGTCTCTCCACTGTAGAGGCTGTGAAGCAAAAGTTAGGAAACATCTGTCCA
GAATGCAAGGTGTGACATCGTTCAACATAGATTTTGCTGCAAAGAAAGTGACTGTGACTG
GAGACATCACTCCCTTGGGAATATTGGATAGCATCTC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2H469JQB 503 0 0
TTACCGGGTCTGCGGGTCAGGATACAGTAGCTCCTAAATCTACTGATGTTGAAGAGATAA
AGCCGTCAATGGAGGAGGAGAAGACTAGTGGTGGAGGAGGTGGTGGTTCAGACCAGGTCG
TTGTTCTCAAAGTGTCTCTCCACTGTAGAGGCTGTGAAGCAAAAGTTAGGAAACATCTGT
CCAGAATGCAAGGTGTGACATCGTTCAACATAGATTTTGCTGCAAAGAAAGTGACTGTGA
CTGGAGACATCACTCCCTTGGGAATATTGGATAGCATCTCAAAGGTTAAAAATGCTCAAT
TCTGGACAGCTCCAACACTCCCAGCTCCAACGCTCCCAATGCCAAATCTGGAAACTCCAA
ATCCCTAGTTTACTTTTTTCACTGTCTTATCTGTCTCACTTGTTGTAAAGCCAACAGTAA
AGTTTCAAACTTTACTGCACCACCTACTTTTCGTTGGAACTAGATCATGAGGCTACACCT
CTTCTCTTTATGCAGTGATACTT

QA 1 503 1 503
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5709Contig1 924 2 2 U
GGATCACCTTCCTTTCTTCTTCATCTCTACACTTAAAGTTTTTCCCAAGGAAACAGAAAT
TAAGAAGAAGAAACATGAAGTTCGGTAAGAGTCTGAGCAACCAGATCGAGCAGACACTGC
CTGAATGGCGTGACAAGTTCTTGTCTTACAAAGACCTCAAGAAACGACTCAAGCTCATCA
CCTCCACAACACAAGACCGTCCCACCAAACGTCTCCGAGTAGACGCTGAGTGCTCCCTAG
GAATGTCTAAAGAAGAGATCAGTTTCATACAACTGCTGGAGGGCGAGTTGGAGAAGTTCA
ACAACTTCTTCGTTGAGAAGGAGGAAGAGTACATCATCAGATTAAAGGAGTTGAGAGACA
GGATTGTAAAAGCTAAGGACTCAAAGGAGAAGATGATGAGCATGAGGAAGGAGATTGTTG
ATTTCCATGGAGAGATGGTACTCCTCGAGAACTACAGTGCCCTAAACTACACTGGATTGG
TAAAGATACTGAAGAAGTATGACAAAAGAACTGGTGATCTCATGCGTTTACCTTACATCC
AAAAAGTTCTCCAGCAACCCTTTTACACGACTGACTTGTTGTACAAGCTCAAAGAATCCG
AGGCAATTCTTGATCGGTTCTTTCCAGCTACGCATGAATCTGAGGATCCTACTGATGCAG
TAGAGTCTGAGAATATCCAAGCAGAGCTCTCAGAGCACAAGTTCATGGAGAGCCTCCACA
TGAAAAGTACAATCGCTGCTCTGCGTGTGCTGCAAGAAATCAGGAGTAAAAGCTCTACCG
TGAGTCTCTTTTCGCTGCCGCCACTCCAATTAAACGGGTTAGATGAGACATGGAAGAAGA
TTCCGTTGTTGGAGCAAGAAGCCAAATAGAGTGAGAGATGGATCCACTTAGGAGCTAACA
GTTTATAAAACCGGTCACATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW17TF U 1
AF RR2FW17JQ C 313
BS 1 600 RR2FW17TF
BS 601 924 RR2FW17JQ

RD RR2FW17TF 600 0 0
GGATCACCTTCCTTTCTTCTTCATCTCTACACTTAAAGTTTTTCCCAAGGAAACAGAAAT
TAAGAAGAAGAAACATGAAGTTCGGTAAGAGTCTGAGCAACCAGATCGAGCAGACACTGC
CTGAATGGCGTGACAAGTTCTTGTCTTACAAAGACCTCAAGAAACGACTCAAGCTCATCA
CCTCCACAACACAAGACCGTCCCACCAAACGTCTCCGAGTAGACGCTGAGTGCTCCCTAG
GAATGTCTAAAGAAGAGATCAGTTTCATACAACTGCTGGAGGGCGAGTTGGAGAAGTTCA
ACAACTTCTTCGTTGAGAAGGAGGAAGAGTACATCATCAGATTAAAGGAGTTGAGAGACA
GGATTGTAAAAGCTAAGGACTCAAAGGAGAAGATGATGAGCATGAGGAAGGAGATTGTTG
ATTTCCATGGAGAGATGGTACTCCTCGAGAACTACAGTGCCCTAAACTACACTGGATTGG
TAAAGATACTGAAGAAGTATGACAAAAGAACTGGTGATCTCATGCGTTTACCTTACATCC
AAAAAGTTCTCCAGCAACCCTTTTACACGACTGACTTGTTGTACAAGCTCAAAGAATCCG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2FW17JQ 612 0 0
TTGAGAAGGAGGAAGAGTACATCATCAGATTAAAGGAGTTGAGAGACAGGATTGTAAAAG
CTAAGGACTCAAAGGAGAAGATGATGAGCATGAGGAAGGAGATTGTTGATTTCCATGGAG
AGATGGTACTCCTCGAGAACTACAGTGCCCTAAACTACACTGGATTGGTAAAGATACTGA
AGAAGTATGACAAAAGAACTGGTGATTTCATGCGTTTCCCTTACATCCAAAAAGTTCTCC
AGCAACCCTTTTACACGACTGACTTGTTGTACAAGCTCAAAGAATCCGAGGCAATTCTTG
ATCGGTTCTTTCCAGCTACGCATGAATCTGAGGATCCTACTGATGCAGTAGAGTCTGAGA
ATATCCAAGCAGAGCTCTCAGAGCACAAGTTCATGGAGAGCCTCCACATGAAAAGTACAA
TCGCTGCTCTGCGTGTGCTGCAAGAAATCAGGAGTAAAAGCTCTACCGTGAGTCTCTTTT
CGCTGCCGCCACTCCAATTAAACGGGTTAGATGAGACATGGAAGAAGATTCCGTTGTTGG
AGCAAGAAGCCAAATAGAGTGAGAGATGGATCCACTTAGGAGCTAACAGTTTATAAAACC
GGTCACATTATC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL5710Contig1 1118 2 2 U
GCTACTTTGTAAACTCTGGCTCGGAAGCTAATGAGCTAGCAATGATGATGGCTAGGCTCT
ACACTAATAGCCTTGAGATGATTTCTTTGAGAAATGCTTATCATGGTGGAAGTTCTAACA
CTATTGGACTCACTGCTCTTAACACTTGGAAGTACCCGTTACCACAGGGAGAAATCCATC
ACGTCGTAAATCCAGATCCATACCGTGGAGTATTTGGTTCTGATGGCTCTATGTATGCTA
AAGATGTTCAAGACCATATCGACTATGGTACTTCTGGAAAAGTCGCTGGATTTATCGCTG
AGACCATCCAGGGCGTGGGAGGAGCTGTAGAATTGGCTCCTGGTTACTTAAAGTCGGTTT
ATGACACTGTACGCAAAGCTGGTGGTGTATGCATCGCCGATGAGGTCCAAACTGGATTTG
GCCGCACAGGAAGTCATTATTGGGGTTTCCAGACCCAAGATGTAGTACCCGACATAGTCA
CAATGGCAAAGGGAATTGGAAATGGATTGCCATTAGGAGCTGTGGTGACTACACCAGAAA
TCGCTAGCGTATTAGCTACAAAGATTCAGTTCAACACTTTTGGTGGGAACCCGGTCTGTT
CAGCTGGTGGACATGCTGTTCTAAAGGTTATTGATAAGGAGAGACGCCAAACACACTGCG
CTGAAGTTGGTTCCCACCTTATTCAACGTTTGAAAGATCTCCAGAAAAGACATGATATCA
TTGGAGATGTGAGAGGAAGAGGATTAATGGTTGGGATAGAGCTTGTGTCTGACAGGAAGG
ACAAGACACCAGCCAAGGCTGAAACAGCTGTCTTGTTTGAGCAACTTAGAGAATTGGGCA
TTCTCGTTGGAAAAGGAGGACTTCATGGGAATGTTTTCAGGATAAAGCCGCCAATGTGTT
TCGCCAAAGACGACGCAGATTTCTTGGTAGATGCATTGGACTATTCAGTCTCCAGGTTGT
GAAGAAGGACGAAAGAAAGCGAATGAGAGTTTTAACCTTATGTCCTGGTTTAATGTTTTT
TTTAATGTTCCAATCCAACTCTCTCACTCTTCCTTGTTCCTTTTGTAATAACACTCTCTT
CATGTGATCTGAAAATTAAATAAATTAAGTATTCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA64TF U 1
AF RR2C676TF U 515
BS 1 633 RR2GA64TF
BS 634 1118 RR2C676TF

RD RR2GA64TF 633 0 0
GCTACTTTGTAAACTCTGGCTCGGAAGCTAATGAGCTAGCAATGATGATGGCTAGGCTCT
ACACTAATAGCCTTGAGATGATTTCTTTGAGAAATGCTTATCATGGTGGAAGTTCTAACA
CTATTGGACTCACTGCTCTTAACACTTGGAAGTACCCGTTACCACAGGGAGAAATCCATC
ACGTCGTAAATCCAGATCCATACCGTGGAGTATTTGGTTCTGATGGCTCTATGTATGCTA
AAGATGTTCAAGACCATATCGACTATGGTACTTCTGGAAAAGTCGCTGGATTTATCGCTG
AGACCATCCAGGGCGTGGGAGGAGCTGTAGAATTGGCTCCTGGTTACTTAAAGTCGGTTT
ATGACACTGTACGCAAAGCTGGTGGTGTATGCATCGCCGATGAGGTCCAAACTGGATTTG
GCCGCACAGGAAGTCATTATTGGGGTTTCCAGACCCAAGATGTAGTACCCGACATAGTCA
CAATGGCAAAGGGAATTGGAAATGGATTGCCATTAGGAGCTGTGGTGACTACACCAGAAA
TCGCTAGCGTATTAGCTACAAAGATTCAGTTCAACACTTTTGGTGGGAACCCGGTCTGTT
CAGCTGGTGGACATGCTGTTCTAAAGGTTATTG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2C676TF 604 0 0
G
GGAGCTGTGGTGACTACACCAGAAATCGCTAGCGTATTAGCTACAAAGATTCAGTTCAAC
ACTTTTGGTGGGAACCCGGTCTGTTCAGCTGGTGGACATGCTGTTCTAAAGGTTATTGAT
AAGGAGAGACGCCAAACACACTGCGCTGAAGTTGGTTCCCACCTTATTCAACGTTTGAAA
GATCTCCAGAAAAGACATGATATCATTGGAGATGTGAGAGGAAGAGGATTAATGGTTGGG
ATAGAGCTTGTGTCTGACAGGAAGGACAAGACACCAGCCAAGGCTGAAACAGCTGTCTTG
TTTGAGCAACTTAGAGAATTGGGCATTCTCGTTGGAAAAGGAGGACTTCATGGGAATGTT
TTCAGGATAAAGCCGCCAATGTGTTTCGCCAAAGACGACGCAGATTTCTTGGTAGATGCA
TTGGACTATTCAGTCTCCAGGTTGTGAAGAAGGACGAAAGAAAGCGAATGAGAGTTTTAA
CCTTATGTCCTGGTTTAATGTTTTTTTTAATGTTCCAATCCAACTCTCTCACTCTTCCTT
GTTCCTTTTGTAATAACACTCTCTTCATGTGATCTGAAAATTAAATAAATTAAGTATTCA
AGC

QA 2 604 2 604
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5712Contig1 445 2 2 U
AGATTGTTGTTTAACAAAAGTTACATAATGCATTACAGAAACTGCCAGTCTTCCAAATAT
ATGACAAGACGCCTCTAAGAAAATCTCCCAGCTCCAGGATTTGATCTTACCCCGTTCAAA
CTTTTTCTGAAAACAGCTTCGAGAAGGTCGAAACTGCCCCTTGTCATTTACAGAAATTTT
ACTTGTAACAGTTCCACAACACTTATCTTTACTATCACACATTCAGCTCTCCATAACCAT
GTGATCAAGCTCTTGCATCCCATCATATTCCAGCTGAACTTCTTCATGAGCCAGTTTCAT
CCTTCTGTAATCTTGCTGAACCTTCTTGGACCTGAACATGGCCTGGACTCCAACCACTGA
TCTCTCTAGCCTATCCTCTGCTTGTTTCTGGCTTGTCTTGTAAAAATCCTCCACCACGTC
AGTCCCTTCCATCGTCTCAGGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2HA50TF C 1
AF RR2HA50JQ U 142
BS 1 143 RR2HA50TF
BS 144 445 RR2HA50JQ

RD RR2HA50TF 445 0 0
AGATTGTTGTTTAACAAAAGTTACATAATGCATTACAGAAACTGCCAGTCTTCCAAATAT
ATGACAAGACGCCTCTAAGAAAATCTCCCAGCTCCAGGATTTGATCTTACCCCGTTCAAA
CTTTTTCTGAAAACAGCTTCGAGAAGGTCGAAACTGCCCCTTGTCATTTACAGAAATTTT
ACTTGTAACAGTTCCACAACACTTATCTTTACTATCACACATTCAGCTCTCCATAGCCAT
GTGATCAAGCTCTTGCATCCCATCATATTCCAGCTGAGCTTCTTCATGAGCCAGTTTCAT
CCTTCTGTAATCTTGCTGAGCCTTCTTGGACCTGAACATGGCCTGGACTCGAACCACTGA
TCTCTCTAGCCTATCCTCTGCTTGTTTCTGGCTTGTCTTGTAGAAATCCTCCACCACGTC
AGTCCCTTCCATCGTCTCAGGTTGC

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR2HA50JQ 304 0 0
AA
AAGGTCGAAACTGCCCCTTGTCATTTACAGAAATTTTACTTGTAACAGTTCCACAACACT
TATCTTTACTATCACACATTCAGCTCTCCATAACCATGTGATCAAGCTCTTGCATCCCAT
CATATTCCAGCTGAACTTCTTCATGAGCCAGTTTCATCCTTCTGTAATCTTGCTGAACCT
TCTTGGACCTGAACATGGCCTGGACTCCAACCACTGATCTCTCTAGCCTATCCTCTGCTT
GTTTCTGGCTTGTCTTGTAAAAATCCTCCACCACGTCAGTCCCTTCCATCGTCTCAGGTT
GC

QA 3 304 3 304
DS 



AS 1 2

CO CL5713Contig1 714 2 3 U
GGAGCTTCGGAATCCTTCCTTCCTTGCAGTTGCAATCAAGAGTATCGATGGCGGAGAATT
GCATAGTTTCCGTGAACCCTAAACCCTCGAAGGGATTCTCCTCTAAGCTTCTCGATCTTG
TGGAGAGAGTTATAGTGAAGCTGATGCACGATGCTTCTCTCCCTCTCCACTACCTCTCCG
GCAACTTCGCTCCTGTCCGCGAGGAGACTCCTCCGGTCAAGGATCTCCCCGTCGTCCATG
GATTTCTTCCAGAATGCTTGAATGGTGAATTTGTGAGGGTTGGTCCAAATCCCAAGTTTG
ATCCCGTCGCTGGATATCACTGGTTTGATGGAGATGGAATGATACATGGTGTCCGCATCA
AAGATGGGAAAGCAACTTATGTTTCTCGATATGTTAAGACATCACGCCTCAAGCAGGAAG
AGTTTTTCGGAGCTGCCAAATTCATGAAGATTGGAGACCTGCAAACTCTTGGCATGATGG
ATTATGACAAGAGATTGACCCACTCCTTCACTGCACACCCTAAAGTTGGCCCAGCTACCG
GTGAAATGTTTACATTTGGCTATTCGCAAACGCCACCTTATCTCACATACAGAGTGATCT
CCGAAGATGGCATTATGCATGACCCTGTCCCAATTACTATATCAGAGCCAGTCATGATGC
ACGATTTCGCTATTACCGAGTCTTACGCAATCTTCATGGATCTTCCTATGCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO56TF U 166
AF RR2F383TF U 1
BS 1 202 RR2F383TF
BS 203 203 RR2GO56TF
BS 204 714 RR2F383TF

RD RR2GO56TF 302 0 0
TCCACTACCTCTCCGGCAACTTCGCTCCTGTCCGCGAGGAGACTCCTCTGGTCAAGGATC
TCCCCGTCGTCCATGGATTTCTTCCAGAATGCTTGAATGGTGAATTTGTGAGGGTTGGTC
CAAATCCCAAGTTTGATCCCGTCGCTGGATATCACTGGTTTGATGGAGATGGAATGATAC
ATGGTGTCCGCATCAAAGATGGGAAAGCAACTTATGTTTCTCGATATGTTAAGACATCAC
GCCTCAAGCAGGAAGAGTTTTTCGGAGCTGCCAAATTCATGAAGATTGGGGACCT
TAAGAGG

QA 1 295 1 295
DS 

RD RR2F383TF 714 0 0
GGAGCTTCGGAATCCTTCCTTCCTTGCAGTTGCAATCAAGAGTATCGATGGCGGAGAATT
GCATAGTTTCCGTGAACCCTAAACCCTCGAAGGGATTCTCCTCTAAGCTTCTCGATCTTG
TGGAGAGAGTTATAGTGAAGCTGATGCACGATGCTTCTCTCCCTCTCCACTACCTCTCCG
GCAACTTCGCTCCTGTCCGCGATGAGACTCCTCCGGTCAAGGATCTCCCCGTCGTCCATG
GATTTCTTCCAGAATGCTTGAATGGTGAATTTGTGAGGGTTGGTCCAAATCCCAAGTTTG
ATCCCGTCGCTGGATATCACTGGTTTGATGGAGATGGAATGATACATGGTGTCCGCATCA
AAGATGGGAAAGCAACTTATGTTTCTCGATATGTTAAGACATCACGCCTCAAGCAGGAAG
AGTTTTTCGGAGCTGCCAAATTCATGAAGATTGGAGACCTGCAAACTCTTGGCATGATGG
ATTATGACAAGAGATTGACCCACTCCTTCACTGCACACCCTAAAGTTGGCCCAGCTACCG
GTGAAATGTTTACATTTGGCTATTCGCAAACGCCACCTTATCTCACATACAGAGTGATCT
CCGAAGATGGCATTATGCATGACCCTGTCCCAATTACTATATCAGAGCCAGTCATGATGC
ACGATTTCGCTATTACCGAGTCTTACGCAATCTTCATGGATCTTCCTATGCACT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL5714Contig1 1019 2 2 U
GTGTGTAATAAGAAGACCAAAGATGGTGACGGCGACGACGTGCGTCGTCGGAGCTCCGTT
GGTAGTTACTCGAGACTCTAGACGGATTCCGAAGACCTTAAAGTGCTTCGCTTCCACCGC
CAATTCTGAGCTTCTCCGTTCCCAGCTCGATCGTCTCCACGCGGAGGCAGAGTTCACTCG
TGCTAAAGCAAGTAGTAATAGGTTGAGACTTTTGAGATTATCCGAAGCTGCAGAGAATCT
ACGGAGACAAGCATCTGTTCATGTTCAGACAGGGAAAGAGAATGATGCAAGAGAGTTGCT
TCTCCAGAAGAAGAAAGTCATGCAAGCTTTGGACAAGGCCAAATCTCGTATCGAGTTGCT
CGATACCCTTTCTTCCAAACTTAACGAGGCAATATCTGTCAAGGAAACTCAGCTGATTGG
GAACATATCTTTAGATCTCCAAGTAGATACTGACAATAATACTTCAGATGGAGGAGTTCA
CATTGTATCTCCAAAGCCTGAGTCTACTCAAGAGAATGACACAACTGACTTGGATTCTCA
GGAAAGTCAACTTACTGAAAACAACTTTGAGGATCACCAAGAAACTAATCATGTACTGGT
GGAAGAGGCTTTAACTGGCAGCATCTTCAAAGAAGTGTCTTCTTATGACTCTTTCCTGGA
AAATCTAGACCAGAAACTTGGCAGAATCGAGGATGAACTCGTCACTGTTGTGAATGTTGC
GTCCTTGGTGCTTAGTCATGAAGATAAACCCAATAATCTAAAGGTTCAGCAAACATCAGA
AATTCTTGAAGAGATTCGTTCTGTGAGGGAAAGGATTGCAAATATCATTTCCAAAGAAGC
TAACATCAGTTAGTGCCTCAAGCTCCTTCTTTGGTATGAACAGTTTAAGACTCATTCAGG
TCTATGGCTCTTCTTTGATGTGATGTGATGTGATATGATGTGAATATTAAATTTCTTGTT
AAGTTGGGTACATTAAATTTTGATGAGATATATATATGTACAAACTTAGGTGTTAGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ23TF U 1
AF RR2EJ23JQ C 402
BS 1 684 RR2EJ23TF
BS 685 1019 RR2EJ23JQ

RD RR2EJ23TF 684 0 0
GTGTGTAATAAGAAGACCAAAGATGGTGACGGCGACGACGTGCGTCGTCGGAGCTCCGTT
GGTAGTTACTCGAGACTCTAGACGGATTCCGAAGACCTTAAAGTGCTTCGCTTCCACCGC
CAATTCTGAGCTTCTCCGTTCCCAGCTCGATCGTCTCCACGCGGAGGCAGAGTTCACTCG
TGCTAAAGCAAGTAGTAATAGGTTGAGACTTTTGAGATTATCCGAAGCTGCAGAGAATCT
ACGGAGACAAGCATCTGTTCATGTTCAGACAGGGAAAGAGAATGATGCAAGAGAGTTGCT
TCTCCAGAAGAAGAAAGTCATGCAAGCTTTGGACAAGGCCAAATCTCGTATCGAGTTGCT
CGATACCCTTTCTTCCAAACTTAACGAGGCAATATCTGTCAAGGAAACTCAGCTGATTGG
GAACATATCTTTAGATCTCCAAGTAGATACTGACAATAATACTTCAGATGGAGGAGTTCA
CATTGTATCTCCAAAGCCTGAGTCTACTCAAGAGAATGACACAACTGACTTGGATTCTCA
GGAAAGTCAACTTACTGAAAACAACTTTGAGGATCACCAAGAAACTAATCATGTACTGGT
GGAAGAGGCTTTAACTGGCAGCATCTTCAAAGAAGTGTCTTCTTATGACTCTTTCCTGGA
AAATCTAGACCAGAAACTTGGCAG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2EJ23JQ 618 0 0
AGGAAACTCAGCTGATTGGGAACATATCTTTAGATCTCCAAGTAGATACTGACAATAATA
CTTCAGATGGAGGAGTTCACATTGTATCTCCAAAGCCTGAGTCTACTCAAGAGAATGACA
CAACTGACTTGGATTCTCAGGAAAGTCAACTTACTGAAAACAACTTTGAGGATCACCAAG
AAACTAATCATGTACTGGTGGAAGAGGCTTTAACTGGCAGCATCTTCAAAGAAGTGTCTT
CTTATGACTCTTTCCTGGAAAATCTAGACCAGAAACTTGGCAGAATCGAGGATGAACTCG
TCACTGTTGTGAATGTTGCGTCCTTGGTGCTTAGTCATGAAGATAAACCCAATAATCTAA
AGGTTCAGCAAACATCAGAAATTCTTGAAGAGATTCGTTCTGTGAGGGAAAGGATTGCAA
ATATCATTTCCAAAGAAGCTAACATCAGTTAGTGCCTCAAGCTCCTTCTTTGGTATGAAC
AGTTTAAGACTCATTCAGGTCTATGGCTCTTCTTTGATGTGATGTGATGTGATATGATGT
GAATATTAAATTTCTTGTTAAGTTGGGTACATTAAATTTTGATGAGATATATATATGTAC
AAACTTAGGTGTTAGGAG

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL5715Contig1 749 2 8 U
GGGGACGTCGACTCGAGGATCCTCTCCTCCGCCAGAATATTCCAGATTCGTACAGAAACA
ATACATATAATCTCCGATGATGGAAGACGGTTCGATCCCGACTGAGAACGGCTCCGATCG
AGACGGATTGGCTCTGATATTCCTCGGAACGGGATGCTCGAGCGCAGTCCCTAACGCAAT
GTGTCTGATCCAGAAATCGGACTCCCCCTGTCACGTATGCTCTCAGTCTCTCTCGATCGA
AACCCTAACTACAGGTCGTATGCTTCTCAGTGTAAGATCGAACAGTCAGAGTCATTCGTC
TCTGCAAAGTGGGAAGCACTTGCTCTGTTGCTGATAGGGAGCTGCGCTCTCTTCCTGAAG
GTGCTACTACTATGGCTGTTCCAGTTACTAGTTGGCTGTGTTAAAAGCCTTGCTGTGAAG
TTCCCGTATTTGGTTCAGAAGAAACTTAAAGAAGGGCAAGAAGTTAGGCGAGTAGCACAG
CTGGATTGGAGAGTGATCGAGGAAGATTGTGAGAAGCCCTTTGTAGCTTCAGGCTTATCA
TTCACTCTACTTCCAGTAAGTTATTCGGTAGAAATAGTGAATCATGTATTCCTGCTGATC
TTGTGTGGAGACTTGAATCTTTGTTCCAAGCACTAAGTATGGTAGGTGTAACACTTTTGC
TTAGCGTGTGTGTGTGTGTTTGTAGAATGGTCTAAAAGGTAGCAAACTGTAGACAATTCT
CAATTGCATCATCATCTATCTGAAATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2H241TF U 1
AF RR2H241JQ C 133
BS 1 645 RR2H241TF
BS 646 646 RR2H241JQ
BS 647 698 RR2H241TF
BS 699 699 RR2H241JQ
BS 700 717 RR2H241TF
BS 718 718 RR2H241JQ
BS 719 748 RR2H241TF
BS 749 749 RR2H241JQ

RD RR2H241TF 748 0 0
GGGGACGTCGACTCGAGGATCCTCTCCTCCGCCAGAATATTCCAGATTCGTACAGAAACA
ATACATATAATCTCCGATGATGGAAGACGGTTCGATCCCGACTGAGAACGGCTCCGATCG
AGACGGATTGGCTCTGATATTCCTCGGAACGGGATGCTCGAGCGCAGTCCCTAACGCAAT
GTGTCTGATCCAGAAATCGGACTCCCCCTGTCACGTATGCTCTCAGTCTCTCTCGATCGA
AACCCTAACTACAGGTCGTATGCTTCTCAGTGTAAGATCGAACAGTCAGAGTCATTCGTC
TCTGCAAAGTGGGAAGCACTTGCTCTGTTGCTGATAGGGAGCTGCGCTCTCTTCCTGAAG
GTGCTACTACTATGGCTGTTCCAGTTACTAGTTGGCTGTGTTAAAAGCCTTGCTGTGAAG
TTCCCGTATTTGGTTCAGAAGAAACTTAAAGAAGGGCAAGAAGTTAGGCGAGTAGCACAG
CTGGATTGGAGAGTGATCGAGGAAGATTGTGAGAAGCCCTTTGTAGCTTCAGGCTTATCA
TTCACTCTACTTCCAGTAAGTTATTCGGTAGAAATAGTGAATCATGTATTCCTGCTGATC
TTGTGTGGAGACTTGAATCTTTGTTCCAAGCACTAAGTATGGTAG*TGTAACACTTTTGC
TTAGCGTGTGTGTGTGTGTTTGTAGAATGGTCTAAAAG*TAGCAAACTGTAGACAAT*CT
CAATTGCATCATCATCTATCTGAAATTT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2H241JQ 617 0 0
TCTGATATTCCTCGGAACGGGATGCTCGAGCGCAGTCCCTAACGCAATGTGTCTGATCCA
GAAATCGGACTCCCCCTGTCACGTATGCTCTCAGTCTCTCTCGATCGAAACCCTAACTAC
AGGTCGTATGCTTCTCAGTGTAAGATCGAACAGTCAGAGTCATTCGTCTCTGCAAAGTGG
GAAGCACTTGCTCTGTTGCTGATAGGGAGCTGCGCTCTCTTCCTGAAGGTGCTACTACTA
TGGCTGTTCCAGTTACTAGTTGGCTGTGTTAAAAGCCTTGCTGTGAAGTTCCCGTATTTG
GTTCAGAAGAAACTTAAAGAAGGGCAAGAAGTTAGGCGAGTAGCACAGCTGGATTGGAGA
GTGATCGAGGAAGATTGTGAGAAGCCCTTTGTAGCTTCAGGCTTATCATTCACTCTACTT
CCAGTAAGTTATTCGGTAGAAATAGTGAATCATGTATTCCTGCTGATCTTGTGTGGAGAC
TTGAATCTTTGTTCCAAGCACTAAGTATGGTAGGTGTAACACTTTTGCTTAGCGTGTGTG
TGTGTGTTTGTAGAATGGTCTAAAAGGTAGCAAACTGTAGACAATTCTCAATTGCATCAT
CATCTATCTGAAATTTT

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL5716Contig1 917 2 2 U
CCAACTTGCTGATCCGTTTAGCAAAACCAATCAGACTGCTACTAAGGATGATGTTGTCTT
TCTCCGTATAGCGACTCTTCCAAAGGGGAAGAAAATGCTTACGAAGTATATACAGCTTCT
AGTTCCAGGTACCGAGATTGCTCGAGTTGTCTGCATGGCTATATTCCGACACTTGAGATT
CCTATTCGGCGGTTTGCCTTCAGATGCTTTAGCAGCAGAGACGATTGTGAATCTCGCCAA
AGCAGTCACTATCTGCGTTCAAGCCATGGACCTCCGAGCGCTGAGTGCTTGCCTTGCAGC
TGTAGTGTGTTCCTCAGAGCAGCCACCTCTGCGTCCTATAGGAAGCTCTGCTGGAGATGG
TGCTTCTGTTGTTTTGATATCTCTTCTAGAGAGAGCTGCTGAAGTAGTGGCGGTTCCTCG
AGTCGTCCATGATGGTCTATGGAGAGCCTCGTTCGATGGGTTCTTCAACCTTCTTACCAA
ATACTGCAGGAGCAAGTATGAGACGATCCGCAGCCAGAACCAAGGGAGTGCAGCGGATGT
TTTGGAGGTGGCGATAAAGAGGGAAATGCCTGCTGAGCTGTTACGAGCGAGCATCCGTCA
CACCAGTGACGACCAGAGGAACTATCTGTTGAACTTTGGCCGTAAACCGTCTGCTATAAT
TAGCGAGTCGGCGTCGCATGCAAGGGGTGCTCAGATCAAGTCTGAGTCTGTGAGGGTTTT
ATCAAAAAGTGAGAGAGAAGTGATAACCAATGGGGCTTAGAAGATTACCAGTTCGTGGGT
TTTGTGGGCCGTGAAGGAAACAAACTGTCAAGGGGTGTGTGTGTGTAGACTCAGGAGCCA
AACTTGTAAGTAACCTGGTGGTGTAGGACTCTTTTCACAAGGATTTCAGATGATAAATGC
TTTTAGAGTTTGCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM35TF U 1
AF RR2GM35JQ C 383
BS 1 663 RR2GM35TF
BS 664 917 RR2GM35JQ

RD RR2GM35TF 663 0 0
CCAACTTGCTGATCCGTTTAGCAAAACCAATCAGACTGCTACTAAGGATGATGTTGTCTT
TCTCCGTATAGCGACTCTTCCAAAGGGGAAGAAAATGCTTACGAAGTATATACAGCTTCT
AGTTCCAGGTACCGAGATTGCTCGAGTTGTCTGCATGGCTATATTCCGACACTTGAGATT
CCTATTCGGCGGTTTGCCTTCAGATGCTTTAGCAGCAGAGACGATTGTGAATCTCGCCAA
AGCAGTCACTATCTGCGTTCAAGCCATGGACCTCCGAGCGCTGAGTGCTTGCCTTGCAGC
TGTAGTGTGTTCCTCAGAGCAGCCACCTCTGCGTCCTATAGGAAGCTCTGCTGGAGATGG
TGCTTCTGTTGTTTTGATATCTCTTCTAGAGAGAGCTGCTGAAGTAGTGGCGGTTCCTCG
AGTCGTCCATGATGGTCTATGGAGAGCCTCGTTCGATGGGTTCTTCAACCTTCTTACCAA
ATACTGCAGGAGCAAGTATGAGACGATCCGCAGCCAGAACCAAGGGAGTGCAGCGGATGT
TTTGGAGGTGGCGATAAAGAGGGAAATGCCTGCTGAGCTGTTACGAGCGAGCATCCGTCA
CACCAGTGACGACCAGAGGAACTATCTGTTGAACTTTGGCCGTAAACCGTCTGCTATAAT
TAG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2GM35JQ 535 0 0
CTTCTAGAGAGAGCTGCTGAAGTAGTGGCGGTTCCTCGAGTCGTCCATGATGGTCTATGG
AGAGCCTCGTTCGATGGGTTCTTCAACCTTCTTACCAAATACTGCAGGAGCAAGTATGAG
ACGATCCGCAGCCAGAACCAAGGGAGTGCAGCGGATGTTTTGGAGGTGGCGATAAAGAGG
GAAATGCCTGCTGAGCTGTTACGAGCGAGCATCCGTCACACCAGTGACGACCAGAGGAAC
TATCTGTTGAACTTTGGCCGTAAACCGTCTGCTATAATTAGCGAGTCGGCGTCGCATGCA
AGGGGTGCTCAGATCAAGTCTGAGTCTGTGAGGGTTTTATCAAAAAGTGAGAGAGAAGTG
ATAACCAATGGGGCTTAGAAGATTACCAGTTCGTGGGTTTTGTGGGCCGTGAAGGAAACA
AACTGTCAAGGGGTGTGTGTGTGTAGACTCAGGAGCCAAACTTGTAAGTAACCTGGTGGT
GTAGGACTCTTTTCACAAGGATTTCAGATGATAAATGCTTTTAGAGTTTGCTCTC

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 2

CO CL5717Contig1 1120 2 2 U
GGGGACGCTTACAGTTGAAGAGATGAGGCAACAGCTTCGAGACTGGATGGATTTGTCACT
TAATCACTCTGTCCCCTCGTCGTTACTGATCCTCTCTAGGGCATTCACGGTTGCAGGAAG
AGTTGCGGCAGATGCTGTCCGGGCAACTCTTTCTTCTCTTCCTGATGAGGTCGTGGATAC
TGTTGGTGTTACTTCTCTGCCATCTGAAGACCCTGTCTCTGAGAGGCTAAGGAAGTTAGA
GTACCTTGAGATGCAAGACGAACTTATCAAGAAAGAGGAAGAGAAAGAAGAAGAAGAGCT
TACAAGAATTAAGGATGTTAAAGGTGGTGAAGAGGATAAGGCGCTGCAAGAGATGACCAT
ACCAACTGCCAGAGAAGCACAAGAACAGGCCAGAGCTAGAGTTCTTGAACAGCAAGACGA
TCTTTGCAAGCTTAGCCGTGCACTGGGCATTTTGGCTTCCGCTTCTTCGGTATGTAGAGA
GCGTGAAGAATTCCTCCGTCTAGTCAAGAAAGAGGTGGAGTTCTATGACACAATGGTCGA
GAGAGAAGATGTTGATGGTGAAAAGGCTGCAATGAAAGCATACAAAGCAGCTAGAGAAGA
TAGTCATGACCAAGGTGATGAAGTTGCTGAGGCAGACGAGGTTTCCTCAGCGCTAATGGA
AAAGGTTGATGGTTTGATCCAAAACCTCGAGAAGGAGATTGATGATGTGGATATCAAAAT
TGGCAAAGGCTGGCAGCTTCTTGACAGGGATCGAGATGGAAAGGTCACAGCTGATGAAGT
TGCAGCAGCTGCGATGTACTTGAAAGACACACTTGCTAATGAAGGTCTTCAACAACTAAT
CAGTAGCCTCTCCAAAGATAAAGAGGGAAGAATTATGGTGGAAGACATTGTAAGGTTGGG
GAGGTTGGGAAGTAAGCCAGAAGAAAATGCAACAGAAGAAGAAGAATCAACTTAAGAGAA
AGAGTAACTCTAAATAATTTTTTTTTGGAGAACCAGACGAGAAACTACTACTCTTGTAAT
GAAGTTGGCTTCTTTTTTTTTTAAACTGAGAGAAACTCAACTTCAGGTTTTGCTGCTTAG
ACATAAGCAAGTTACATAATAGAAGGCGGCTAAGATTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO50TF U 1
AF RR2FO50JQ C 327
BS 1 608 RR2FO50TF
BS 609 1120 RR2FO50JQ

RD RR2FO50TF 608 0 0
GGGGACGCTTACAGTTGAAGAGATGAGGCAACAGCTTCGAGACTGGATGGATTTGTCACT
TAATCACTCTGTCCCCTCGTCGTTACTGATCCTCTCTAGGGCATTCACGGTTGCAGGAAG
AGTTGCGGCAGATGCTGTCCGGGCAACTCTTTCTTCTCTTCCTGATGAGGTCGTGGATAC
TGTTGGTGTTACTTCTCTGCCATCTGAAGACCCTGTCTCTGAGAGGCTAAGGAAGTTAGA
GTACCTTGAGATGCAAGACGAACTTATCAAGAAAGAGGAAGAGAAAGAAGAAGAAGAGCT
TACAAGAATTAAGGATGTTAAAGGTGGTGAAGAGGATAAGGCGCTGCAAGAGATGACCAT
ACCAACTGCCAGAGAAGCACAAGAACAGGCCAGAGCTAGAGTTCTTGAACAGCAAGACGA
TCTTTGCAAGCTTAGCCGTGCACTGGGCATTTTGGCTTCCGCTTCTTCGGTATGTAGAGA
GCGTGAAGAATTCCTCCGTCTAGTCAAGAAAGAGGTGGAGTTCTATGACACAATGGTCGA
GAGAGAAGATGTTGATGGTGAAAAGGCTGCAATGAAAGCATACAAAGCAGCTAGAGAAGA
TAGTCATG

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2FO50JQ 794 0 0
GTGAAGAGGATAAGGCGCTGCAAGAGATGACCATACCAACTGCCAGAGAAGCACAAGAAC
AGGCCAGAGCTAGAGTTCTTGAACAGCAAGACGATCTTTGCAAGCTTAGCCGTGCACTGG
GCATTTTGGCTTCCGCTTCTTCGGTATGTAGAGAGCGTGAAGAATTCCTCCGTCTAGTCA
AGAAAGAGGTGGAGTTCTATGACACAATGGTCGAGAGAGAAGATGTTGATGGTGAAAAGG
CTGCAATGAAAGCATACAAAGCAGCTAGAGAAGATAGTCATGACCAAGGTGATGAAGTTG
CTGAGGCAGACGAGGTTTCCTCAGCGCTAATGGAAAAGGTTGATGGTTTGATCCAAAACC
TCGAGAAGGAGATTGATGATGTGGATATCAAAATTGGCAAAGGCTGGCAGCTTCTTGACA
GGGATCGAGATGGAAAGGTCACAGCTGATGAAGTTGCAGCAGCTGCGATGTACTTGAAAG
ACACACTTGCTAATGAAGGTCTTCAACAACTAATCAGTAGCCTCTCCAAAGATAAAGAGG
GAAGAATTATGGTGGAAGACATTGTAAGGTTGGGGAGGTTGGGAAGTAAGCCAGAAGAAA
ATGCAACAGAAGAAGAAGAATCAACTTAAGAGAAAGAGTAACTCTAAATAATTTTTTTTT
GGAGAACCAGACGAGAAACTACTACTCTTGTAATGAAGTTGGCTTCTTTTTTTTTTAAAC
TGAGAGAAACTCAACTTCAGGTTTTGCTGCTTAGACATAAGCAAGTTACATAATAGAAGG
CGGCTAAGATTGAG

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL5718Contig1 676 2 14 U
GGAAAATAACAAATCGGAACACAGAAAAAAAAGAAGAAGAAGAGAGAATGGCATCAGCAG
AGCAAAAGGAGGTAGAAGAAACTGGGTCGATGATTTCAGGCTTGTTGGACAAAGCCAAAG
GTTTCTTTGCGGAGAAGCTAGCTAGTGTTCCGACACCGGAAGCCGCCGTGGACAACGTAG
ACTTTAAGGGAGTGACACGTCAAGGTGTAGACTATCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATC
CTTACTCTCAGACGATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACGTCCTCAAGAGTGCCACAAGGA
CGATAGCGTCGGGGACAATACCGGACCCGGGTTCGTTGGTTGGCAACAAGACAACGGTTT
TAGACGTACCGGTTAAGGTGGCTTATAGCATAGCGGTTAGTCTGATGAAGGACATTGGCT
CGGACTGGGGACATTTGACTATCAACTTGACATTTGGACTAACTTTCGACATTTCCTGTT
TGTTGGTGACATTACCATTCCTGTCTCTACTCAGGGAGAGATCAAGCTCCCCTTCCCTTC
GCGACTTCTTTTAATTTAGACTATGGTATGTCTTAATTATAATCTAATTTTCAATAACGT
ACGATCCACAAACATAGGCGATCGGAGATTATCAATTCTGCATTTCTTTTAAATCCCTTT
TCTTTTAATTTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2G062TF U 1
AF RR2G024TF U 381
BS 1 429 RR2G062TF
BS 430 430 RR2G024TF
BS 431 435 RR2G062TF
BS 436 436 RR2G024TF
BS 437 454 RR2G062TF
BS 455 455 RR2G024TF
BS 456 473 RR2G062TF
BS 474 474 RR2G024TF
BS 475 480 RR2G062TF
BS 481 481 RR2G024TF
BS 482 531 RR2G062TF
BS 532 532 RR2G024TF
BS 533 672 RR2G062TF
BS 673 676 RR2G024TF

RD RR2G062TF 676 0 0
GGAAAATAACAAATCGGAACACAGAAAAAAAAGAAGAAGAAGAGAGAATGGCATCAGCAG
AGCAAAAGGAGGTAGAAGAAACTGGGTCGATGATTTCAGGCTTGTTGGACAAAGCCAAAG
GTTTCTTTGCGGAGAAGCTAGCTAGTGTTCCGACACCGGAAGCCGCCGTGGACAACGTAG
ACTTTAAGGGAGTGACACGTCAAGGTGTAGACTATCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATC
CTTACTCTCAGACGATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACGTCCTCAAGAGTGCCACAAGGA
CGATAGCGTCGGGGACAATACCGGACCCGGGTTCGTTGGTTGGCAACAAGACAACGGTTT
TAGACGTACCGGTTAAGGTGGCTTATAGCATAGCGGTTAGTCTGATGAAGGACATTGGCT
CGGACTGGG*ACATT*GACTATCAACTTGACATT*GGACTAACTTTCGACATT*CCTGTT
*GTTGGTGACATTACCATTCCTGTCTCTACTCAGGGAGAGATCAAGCTCCC*TTCCCTTC
GCGACTTCTTTTAATTTAGACTATGGTATGTCTTAATTATAATCTAATTTTCAATAACGT
ACGATCCACAAACATAGGCGATCGGAGATTATCAATTCTGCATTTCTTTTAAATCCCTTT
TCTTTTAATTTT
GTTA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2G024TF 296 0 0
GCTTATAGCATAGCGGTTAGTCTGATGAAGGACATTGGCTCGGACTGGGGACATTTGACT
ATCAACTTGACATTTGGACTAACTTTCGACATTTCCTGTTTGTTGGTGACATTACCATTC
CTGTCTCTACTCAGGGAGAGATCAAGCTCCCCTTCCCTTCGCGACTTCTTTTAATTTAGA
CTATGGTATGTCTTAATTATAATCTAATTTTCAATAACGTACGATCCACAAACATAGGCG
ATCGGAGATTATCAATTCTGCATTTCTTTTAA*TCCCTTTTCTTTTAATTTTTGTT

QA 1 296 1 296
DS 



AS 1 2

CO CL5719Contig1 779 2 2 U
GGTCCTCATAAATAAACATCCCCAAACTATTCACGGGTTTCACTTGAATCGTTTGATTTT
CCCATTTTCCCAAAACTACCAAAACAATGGCCAAAGCGCCACCGTCAATCTCTCTCCTCC
TCCTCCTCTCCGCCGCCGTACTTCTCACCCTCCCCGCCGCTATCTCCTCCATAGGCGTCA
ACTACGGAACTCTCGGAAACCTCCCACCTCCGACTCAGGTGGCGAACTTCCTCAAGACTC
AGACTACCATAGACAGCGTCAAGATCTTCAACGTGAATCCAGATATCATCCGTGCCTTTG
CCGGAACTGGAATATCTGTGGTCGTCACCGTCCCTAACGGTGATATTCCGGCGTTAGCTA
ACGGGATAGAAGCTCGTCGGTGGGTTTCTGCTAATATTCAACCCGTTCATCCTCAGACAA
AGATCAAGTACATCTCTGTCGGAAATGAGATTCTTCTCTCCGGAGATGATAACATGATCA
AGAATCTTTTACCGGCGATGAAGAATCTTAACGCTGCTTTGGTTCGTGCTGGTGTCAAAG
ATGTTAAGGTCAGTTTTTCTCTTCATTAATCTCCACACTTTTTTTTCCTGTTTTTGGTGA
TTCAATAATTAATAATATATTTCGATGTCATTTATGCGTCATTATTAAATGATAATTGAT
AATTGGCGTGATAATGCAATTTGTTAATTTTTACGTTAAGAAAATAACTGAACCAATGCG
TTGATTGCGCATTATAAAGTTGGAACAATCTAAAGGTAAAAATATCGCAAGTAAAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC12TF U 1
AF RR2CC12JQ C 268
BS 1 586 RR2CC12TF
BS 587 779 RR2CC12JQ

RD RR2CC12TF 586 0 0
GGTCCTCATAAATAAACATCCCCAAACTATTCACGGGTTTCACTTGAATCGTTTGATTTT
CCCATTTTCCCAAAACTACCAAAACAATGGCCAAAGCGCCACCGTCAATCTCTCTCCTCC
TCCTCCTCTCCGCCGCCGTACTTCTCACCCTCCCCGCCGCTATCTCCTCCATAGGCGTCA
ACTACGGAACTCTCGGAAACCTCCCACCTCCGACTCAGGTGGCGAACTTCCTCAAGACTC
AGACTACCATAGACAGCGTCAAGATCTTCAACGTGAATCCAGATATCATCCGTGCCTTTG
CCGGAACTGGAATATCTGTGGTCGTCACCGTCCCTAACGGTGATATTCCGGCGTTAGCTA
ACGGGATAGAAGCTCGTCGGTGGGTTTCTGCTAATATTCAACCCGTTCATCCTCAGACAA
AGATCAAGTACATCTCTGTCGGAAATGAGATTCTTCTCTCCGGAGATGATAACATGATCA
AGAATCTTTTACCGGCGATGAAGAATCTTAACGCTGCTTTGGTTCGTGCTGGTGTCAAAG
ATGTTAAGGTCAGTTTTTCTCTTCATTAATCTCCACACTTTTTTTT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2CC12JQ 512 0 0
TCAACGTGAATCCAGATATCATCCGTGCCTTTGCCGGAACTGGAATATCTGTGGTCGTCA
CCGTCCCTAACGGTGATATTCCGGCGTTAGCTAACGGGATAGAAGCTCGTCGGTGGGTTT
CTGCTAATATTCAACCCTTTCATCCTCAGACAAAGATCAAGTACATCTCTGTCGGAAATG
AGATTCTTCTCTCCGGAGATGATAACATGATCAAGAATCTTTTACCGGCGATGAAGAATC
TTAACGCTGCTTTGGTTCGTGCTGGTGTCAAAGATGTTAAGGTCAGTTTTTCTCTTCATT
AATCTCCACACTTTTTTTTCCTGTTTTTGGTGATTCAATAATTAATAATATATTTCGATG
TCATTTATGCGTCATTATTAAATGATAATTGATAATTGGCGTGATAATGCAATTTGTTAA
TTTTTACGTTAAGAAAATAACTGAACCAATGCGTTGATTGCGCATTATAAAGTTGGAACA
ATCTAAAGGTAAAAATATCGCAAGTAAAATTC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL5720Contig1 626 2 5 U
TAGAACACAGATACTCTAGCAGAAGAGTTTACTAAGAAAAAGAAACACAGCAAAAAAGAA
ACAGAATACAGGGTCCATTATGTTGTGGATCATCCCCTCCCTATTCGTCGTCATCCTCAC
TCTTTGACTTCTTCTTCTTCTTCCATTTCTTCTTGCTCTGACCACCATCATCAGTCTCTT
CCTCTCCACCAGACTTGCTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTCTGATTTCTCATTCTCCTCTT
CTGGCTCCTCCATCTTCCTCTTCTCTTTCTTCTTCTTTTTCTCTGACTTCTCCTCTTCCA
CTGCCTCTTTCCCTTCCTCATCTTTGTTTTGCAGATTCTCTATCACCTCCTTCATTACAT
CTACGTTCTTGCGTGGAGCAACACCTTTGTCGTAAAAGTCTAGCCTTTCCTTTACTTGTT
CACGAAGCTTCTCCCCAAATGCCGTTGTTGCTCCATCAGCGAAACAATCAATACGGGAAG
CTATAGAGCACTTGTTTGCAAGATAACGCGCGATACGGCCCTTGTTCTTAGCAGATGCTC
GGCCAATGAAGGAAGAATGGAAGATCAACCCATACTTGGGTGTGTTTCCACGTGTTTTAA
GAGCCCTGAAAAGCGCCTTCTCAGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW96JQ U 1
AF RR2CT82JQ U 1
BS 1 143 RR2CT82JQ
BS 144 144 RR2EW96JQ
BS 145 243 RR2CT82JQ
BS 244 244 RR2EW96JQ
BS 245 626 RR2CT82JQ

RD RR2EW96JQ 327 0 0
TAGAACACAGATACTCTAGCAGAAGAGTTTACTAAGAAAAAGAAACACAGCAAAAAAGAA
ACAGAATACAGGGTCCATTATGTTGTGGATCATCCCCTCCCTATTCGTCGTCATCCTCAC
TCTTTGACTTCTTCTTCTTCTTCCATTTCTTCTTGCTCTGACCACCATCATCAGTCTCTT
CCTCTCCTCCAGACTTGCTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTCTGATTTCTCATTCTCCTCTT
CTGGCTCCTCCATCTTCCTCTTCTCTTTCTTCTTCTTTTTCTCTGACTTCTCCTCTTCCA
CTGCCTCTTTCCCTTCCTCATCTTTGT

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR2CT82JQ 626 0 0
TAGAACACAGATACTCTAGCAGAAGAGTTTACTAAGAAAAAGAAACACAGCAAAAAAGAA
ACAGAATACAGGGTCCATTATGTTGTGGATCATCCCCTCCCTATTCGTCGTCATCCTCAC
TCTTTGACTTCTTCTTCTTCTTCGATTTCTTCTTGCTCTGACCACCATCATCAGTCTCTT
CCTCTCCACCAGACTTGCTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTCTGATTTCTCATTCTCCTCTT
CTGTCTCCTCCATCTTCCTCTTCTCTTTCTTCTTCTTTTTCTCTGACTTCTCCTCTTCCA
CTGCCTCTTTCCCTTCCTCATCTTTGTTTTGCAGATTCTCTATCACCTCCTTCATTACAT
CTACGTTCTTGCGTGGAGCAACACCTTTGTCGTAAAAGTCTAGCCTTTCCTTTACTTGTT
CACGAAGCTTCTCCCCAAATGCCGTTGTTGCTCCATCAGCGAAACAATCAATACGGGAAG
CTATAGAGCACTTGTTTGCAAGATAACGCGCGATACGGCCCTTGTTCTTAGCAGATGCTC
GGCCAATGAAGGAAGAATGGAAGATCAACCCATACTTGGGTGTGTTTCCACGTGTTTTAA
GAGCCCTGAAAAGCGCCTTCTCAGCT

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL5721Contig1 1211 2 4 U
GGATTCAAACCAATTCACATCTTCCCAAGACCCAACTACTACAACTTGTAGCAAGAAAAA
TAAACTAAAGCTTTGTCTTGTTTCCTCAGATTCTTTGTTCAATATAACACATCTGGGTTC
TCGTCAAAATTCACAACCTCCTCATTACTAGTTCCATGGATGAAGAGATCGAGATTCCTC
CTTTCTTTCTTTGCCCAATCTCTCTAGAGATCATGAAAGATCCGGTGATAGTTTCTACGG
GAATAACCTACGACAGAGACAGCATCGAGAAGTGGCTCTTTTCAGGCAAGAAGAACTCGT
GTCCGGTCACCAAACAAGACATAACCGACGCAGATCTAACCCCTACGCAACTTTGCTTCT
CAAGAACATTCTTGAAGTAGCGGAACCAATGCAGATTATGAATTTGAAGCCATTGGTTTT
CACCGAGGTCGTCCAGATCTTGGACGACAGGATCTCACACAAGGCGACAAAAGCTGCTTT
GCATATATTGGTGAACATATGTCCATGGGGAAGGAACAGACACAAGGCCGTGGAAGCTGG
AGCGATATCTGCGATGATTGAGCTTCTCATGGACGAGAGCTTCTCATCAGAAAAGAGGGG
TCAAGAGATGGCGATGGTGGTTCTTGATCTGCTGTGTCAGTGTGCGGAGGGACGAGCCGA
GTTCTTGAACCACGGAGCAGCTATAGCAGTGGTGTGCAAGAAGATATTGAGGATTTCGCA
AACGGCAAGCGATAGAGCTGTTAGGGTTTTGTTATCGGTGGGAAGGTTCTGCGCGACGCC
GAGTTTGCTGCACGAGATGTTACAGTTGGGGGTCGTAGCGAAGCTGTGTCTTGTGCTTCA
GGTTAACTGCGGAAGCAAGACTAAAGAGAAGGCAAAGGAGTTGCTTAAGTTGCATGCTAG
AGTTTGGAAAGACTCGCCTTGTCTCCCAAGAAACATGATTCTTGCATATCCCTCGTGATG
AAAACCAAGAAAACAACGTACAGTCACTGAAGCGAGACGGATTCTCAATAAGCCCAAACG
CGTATATGAGAGTTGCTCTTCGTAATTTGTTGAAAAGACTTCTGGTTTAATTTGTTCCTA
TAGTTATCCAATCATTTTAGTTTTCTATACGTTTGATGTTCAAGATGTAGATAATAGGGG
AGCTTGCTTATCAAATTATTTTTCTCAGAAAGAAAACTGCAAGATATGAAATGAATCACA
TTTTACATGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D858TF U 1
AF RR2D858JQ C 475
BS 1 593 RR2D858TF
BS 594 594 RR2D858JQ
BS 595 698 RR2D858TF
BS 699 1211 RR2D858JQ

RD RR2D858TF 705 0 0
GGATTCAAACCAATTCACATCTTCCCAAGACCCAACTACTACAACTTGTAGCAAGAAAAA
TAAACTAAAGCTTTGTCTTGTTTCCTCAGATTCTTTGTTCAATATAACACATCTGGGTTC
TCGTCAAAATTCACAACCTCCTCATTACTAGTTCCATGGATGAAGAGATCGAGATTCCTC
CTTTCTTTCTTTGCCCAATCTCTCTAGAGATCATGAAAGATCCGGTGATAGTTTCTACGG
GAATAACCTACGACAGAGACAGCATCGAGAAGTGGCTCTTTTCAGGCAAGAAGAACTCGT
GTCCGGTCACCAAACAAGACATAACCGACGCAGATCTAACCCCTACGCAACTTTGCTTCT
CAAGAACATTCTTGAAGTAGCGGAACCAATGCAGATTATGAATTTGAAGCCATTGGTTTT
CACCGAGGTCGTCCAGATCTTGGACGACAGGATCTCACACAAGGCGACAAAAGCTGCTTT
GCATATATTGGTGAACATATGTCCATGGGGAAGGAACAGACACAAGGCCGTGGAAGCTGG
AGCGATATCTGCGATGATTGAGCTTCTCATGGACGAGAGCTTCTCATCAGAAA*GAGGGG
TCAAGAGATGGCGATGGTGGTTCTTGATCTGCTGTGTCAGTGTGCGGAGGGACGAGCCGA
GTTCTTGAACCACGGAGCAGCTATAGCAGTGGTGTGCA
GAGATAT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2D858JQ 737 0 0
TGCTTTGCATATATTGGTGAACATATGTCCATGGGGAAGGAACAGACACAAGGCCGTGGA
AGCTGGAGCGATATCTGCGATGATTGAGCTTCTCATGGACGAGAGCTTCTCATCAGAAAA
GAGGGGTCAAGAGATGGCGATGGTGGTTCTTGATCTGCTGTGTCAGTGTGCGGAGGGACG
AGCCGAGTTCTTGAACCACGGAGCAGCTATAGCAGTGGTGTGCAAGAAGATATTGAGGAT
TTCGCAAACGGCAAGCGATAGAGCTGTTAGGGTTTTGTTATCGGTGGGAAGGTTCTGCGC
GACGCCGAGTTTGCTGCACGAGATGTTACAGTTGGGGGTCGTAGCGAAGCTGTGTCTTGT
GCTTCAGGTTAACTGCGGAAGCAAGACTAAAGAGAAGGCAAAGGAGTTGCTTAAGTTGCA
TGCTAGAGTTTGGAAAGACTCGCCTTGTCTCCCAAGAAACATGATTCTTGCATATCCCTC
GTGATGAAAACCAAGAAAACAACGTACAGTCACTGAAGCGAGACGGATTCTCAATAAGCC
CAAACGCGTATATGAGAGTTGCTCTTCGTAATTTGTTGAAAAGACTTCTGGTTTAATTTG
TTCCTATAGTTATCCAATCATTTTAGTTTTCTATACGTTTGATGTTCAAGATGTAGATAA
TAGGGGAGCTTGCTTATCAAATTATTTTTCTCAGAAAGAAAACTGCAAGATATGAAATGA
ATCACATTTTACATGGT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL5722Contig1 841 2 8 U
GGGCATCGAGTAGAAACACTACTCTCTGGTCTCCATCACCACCCTCGTACAAACACCAAT
AGAAACAGGGTTCCCAGATCTGTCGAGATCTTAAACACGGCCAATCATGTAAATCCAAGA
AAGTGTCAATGTTTCGATCTCTACGACCAATTGGTTCCATACAAGAAAGCTTGGACATGG
CAGAAAGCCCTCGTCGAGGAGAAAAAAACACTGATCGATAGAAGAAACCAAGACTGTCCA
GACACTGTGATTCTATTACAGCACTCCCCTGTTTACACAATGGGAACTGGTAGCTCAGAG
GAGTATCTCAACTTCGACGTAAAGGACGCTCCTTTCGATGTGTATCGAACCGAGCGTGGT
GGTGAAGTCACTTACCATGGCCCTGGTCAGCTAGTTATGTATCCTATAATCAACCTTAGG
AACCACGAGATGGATCTTCATTGGTACCTCAGGACGCTTGAAGAGGTTGTCATCCGTGTT
CTTTCCTCAGCTTTCTCCATCAGAGCTTCACGTCTTGATGGTTTAACTGGTGTTTGGGTC
GGCAACCAAAAGGTGGCGGCCATAGGTATTCGTGTTTCGAGATGGATAACGTATCATGGT
CTGGCTCTTAATGTCACAACGGATTTAGCACCGTTTGAGTCGATAGTTCCATGTGGGATT
AGAGACAGGCGAGTTGGGAGTGTAAAAGGTTTGCTTGCAGTTGCAGATGGAGAACATGGA
AAGGTTGGTGATTTGAGGTTGATAGATGTAGCTCATGAGTCTTTGCTTATGGAGTTTTTT
GAAGTTTTCCAGCTTCAAATCGAGAAGCAAACAGTTTTGGAGTGATCAAAGTTTTTTGCA
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2D708TF U 1
AF RR2D708JQ C 438
BS 1 688 RR2D708TF
BS 689 689 RR2D708JQ
BS 690 725 RR2D708TF
BS 726 726 RR2D708JQ
BS 727 739 RR2D708TF
BS 740 740 RR2D708JQ
BS 741 775 RR2D708TF
BS 776 841 RR2D708JQ

RD RR2D708TF 785 0 0
GGGCATCGAGTAGAAACACTACTCTCTGGTCTCCATCACCACCCTCGTACAAACACCAAT
AGAAACAGGGTTCCCAGATCTGTCGAGATCTTAAACACGGCCAATCATGTAAATCCAAGA
AAGTGTCAATGTTTCGATCTCTACGACCAATTGGTTCCATACAAGAAAGCTTGGACATGG
CAGAAAGCCCTCGTCGAGGAGAAAAAAACACTGATCGATAGAAGAAACCAAGACTGTCCA
GACACTGTGATTCTATTACAGCACTCCCCTGTTTACACAATGGGAACTGGTAGCTCAGAG
GAGTATCTCAACTTCGACGTAAAGGACGCTCCTTTCGATGTGTATCGAACCGAGCGTGGT
GGTGAAGTCACTTACCATGGCCCTGGTCAGCTAGTTATGTATCCTATAATCAACCTTAGG
AACCACGAGATGGATCTTCATTGGTACCTCAGGACGCTTGAAGAGGTTGTCATCCGTGTT
CTTTCCTCAGCTTTCTCCATCAGAGCTTCACGTCTTGATGGTTTAACTGGTGTTTGGGTC
GGCAACCAAAAGGTGGCGGCCATAGGTATTCGTGTTTCGAGATGGATAACGTATCATGGT
CTGGCTCTTAATGTCACAACGGATTTAGCACCGTTTGAGTCGATAGTTCCATGTGGGATT
AGAGACAGGCGAGTTGGGAGTGTAAAAG*TTTGCTTGCAGTTGCAGATGGAGAACATGGA
AAGGT*GGTGATTTGAGGT*GATAGATGTAGCTCATGAGTCTTTGCTTATGGAGT
CTCTGAAGTT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2D708JQ 404 0 0
TCATTGGTACCTCAGGACGCTTGAAGAGGTTGTCATCCGTGTTCTTTCCTCAGCTTTCTC
CATCAGAGCTTCACGTCTTGATGGTTTAACTGGTGTTTGGGTCGGCAACCAAAAGGTGGC
GGCCATAGGTATTCGTGTTTCGAGATGGATAACGTATCATGGTCTGGCTTTTAATGTCAC
AACGGATTTAGCACCGTTTGAGTCGATAGTTCCATGTGGGATTAGAGACAGGGGAGTTGG
GAGTGTAAAAGGTTTGCTTGCAGTTGCAGATGGAGAACATGGAAAGGTTGGTGATTTGAG
GTTGATAGATGTAGCTCATGAGTCTTTGCTTATGGAGTTTTTTGAAGTTTTCCAGCTTCA
AATCGAGAAGCAAACAGTTTTGGAGTGATCAAAGTTTTTTGCAA

QA 1 404 1 404
DS 



AS 1 2

CO CL5723Contig1 1306 2 2 U
GGAAAGAGAAAATCAGGCAATCGCCAACTAATCTCTACTCTCTCTCTCTCCCCATCAATT
TTCTACAGCTACAAGTAGTCTACAAGGATTGCATTTCTGGAGAATCTTATTTTGTCTTTC
GTGCGCGATCCTCCCTGTCTCAATCTCTCTCTCCCCCTAATGATTGCCTGAGAGAGAGAG
AGTCAACCATGGGCGTGTGCTGTCCTATTCTCCGACCCTGGGATCGAACCCGAGACAGCT
ATCTCGATAACATCCCTTGCCTCTCTGATCCTGTGAAAAGATCTTCTCTGTTAATGAAAC
TGGGACTAGTAGCTATACACCTCGTCTTCATTGGCTTCCTCTTCGTTTGCGATGCTGACT
TCATCGACAAAACTAAGCGAGATCCATGGTACACAGCTTCTTACTTGTTGTTGTTTTCTC
TCACGCTTCTTCAGTATTTTGTGACTTCTGGCTCTTCACCTGGGTATGTTATTGATGCAA
TGAGGGAGGTTTGCGGGAATGATGCAATTTACAGAAGCGCACCTACCCCCTCAATAAAAA
ATGGGAGCTTTGTTATTAATGTGGAGGGAGAATCGGCTTCAGGTGGTGGTAGTAGTAGAA
AGACTCCAACTTCCTCCTGGGGCAAGATGGTTCTTGACTTGTACCCTCCAGGGACATCCT
TAAGAAATTTGACTTGCGGCTATTGTCATGTGGAGCAGCCTCCGCGAGCCAAGCATTGTC
ATGATTGTGATAGATGTGTTCTTCAGTTTGATCATCACTGTGTTTGGCTGGGAACATGTG
TAGGCCAGAAAAACCATTGTAAATTCTGGTGGTACATATGTGAAGAGAGTGCTCTATGCA
TCTGGACACTCATCATGTACATTGACTACCTCAGTAACGTAGCCAAGCCTTGGTGGAAGA
ATGCAATTACCATACTACTGCTTCTCGTCTTGGTGATCTCCATGATATTTGTGCTGCTTC
TATTGCTTTTTCACAGCTACCTCATTCTAACGAATCAGAGCACTTATGAACTTGTAAGAC
GAAAACGTATTCCCTACATGAGGAATATTCCGGAACGAGTGCATCCATTTAGCAGAGGCA
TAAAGAGGAATCTACACAACGTCTGTTGCGGCAACGATACTCTAGACTCACTGCCCACCG
CATTCGAACTCGAGGATAAAGCAAGACCCTACACTTGCTTAGATATGTTGAAATGTCGTT
GTTGCTAAATTTTTTTTTTTCTTTTTTTTGGTTTGTTTAGTTAGACAGCTACCATTGTTT
TAATCTATGAAACATGTTAAAAAAATATAAGTGAATTTGTATACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB28TF U 1
AF RR2AB28JQ C 528
BS 1 842 RR2AB28TF
BS 843 1306 RR2AB28JQ

RD RR2AB28TF 842 0 0
GGAAAGAGAAAATCAGGCAATCGCCAACTAATCTCTACTCTCTCTCTCTCCCCATCAATT
TTCTACAGCTACAAGTAGTCTACAAGGATTGCATTTCTGGAGAATCTTATTTTGTCTTTC
GTGCGCGATCCTCCCTGTCTCAATCTCTCTCTCCCCCTAATGATTGCCTGAGAGAGAGAG
AGTCAACCATGGGCGTGTGCTGTCCTATTCTCCGACCCTGGGATCGAACCCGAGACAGCT
ATCTCGATAACATCCCTTGCCTCTCTGATCCTGTGAAAAGATCTTCTCTGTTAATGAAAC
TGGGACTAGTAGCTATACACCTCGTCTTCATTGGCTTCCTCTTCGTTTGCGATGCTGACT
TCATCGACAAAACTAAGCGAGATCCATGGTACACAGCTTCTTACTTGTTGTTGTTTTCTC
TCACGCTTCTTCAGTATTTTGTGACTTCTGGCTCTTCACCTGGGTATGTTATTGATGCAA
TGAGGGAGGTTTGCGGGAATGATGCAATTTACAGAAGCGCACCTACCCCCTCAATAAAAA
ATGGGAGCTTTGTTATTAATGTGGAGGGAGAATCGGCTTCAGGTGGTGGTAGTAGTAGAA
AGACTCCAACTTCCTCCTGGGGCAAGATGGTTCTTGACTTGTACCCTCCAGGGACATCCT
TAAGAAATTTGACTTGCGGCTATTGTCATGTGGAGCAGCCTCCGCGAGCCAAGCATTGTC
ATGATTGTGATAGATGTGTTCTTCAGTTTGATCATCACTGTGTTTGGCTGGGAACATGTG
TAGGCCAGAAAAACCATTGTAAATTCTGGTGGTACATATGTGAAGAGAGTGCTCTATGCA
TC

QA 1 842 1 842
DS 

RD RR2AB28JQ 779 0 0
CCCTCAATAAAAAATGGGAGCTTTGTTATTAATGTGGAGGGAGAATCGGCTTCAGGTGGT
GGTAGTAGTAGAAAGACTCCAACTTCCTCCTGGGGCAAGATGGTTCTTGACTTGTACCCT
CCAGGGACATCCTTAAGAAATTTGACTTGCGGCTATTGTCATGTGGAGCAGCCTCCGCGA
GCCAAGCATTGTCATGATTGTGATAGATGTGTTCTTCAGTTTGATCATCACTGTGTTTGG
CTGGGAACATGTGTAGGCCAGAAAAACCATTGTAAATTCTGGTGGTACATATGTGAAGAG
AGTGCTCTATGCATCTGGACACTCATCATGTACATTGACTACCTCAGTAACGTAGCCAAG
CCTTGGTGGAAGAATGCAATTACCATACTACTGCTTCTCGTCTTGGTGATCTCCATGATA
TTTGTGCTGCTTCTATTGCTTTTTCACAGCTACCTCATTCTAACGAATCAGAGCACTTAT
GAACTTGTAAGACGAAAACGTATTCCCTACATGAGGAATATTCCGGAACGAGTGCATCCA
TTTAGCAGAGGCATAAAGAGGAATCTACACAACGTCTGTTGCGGCAACGATACTCTAGAC
TCACTGCCCACCGCATTCGAACTCGAGGATAAAGCAAGACCCTACACTTGCTTAGATATG
TTGAAATGTCGTTGTTGCTAAATTTTTTTTTTTCTTTTTTTTGGTTTGTTTAGTTAGACA
GCTACCATTGTTTTAATCTATGAAACATGTTAAAAAAATATAAGTGAATTTGTATACAT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL5724Contig1 1165 2 2 U
GGGGAACTAGAACGAGCTTCGAGTAGTGCGGAGGAGATGGGTGTGAAATCGGTTTCTCGA
GAATCTTCAGATAGGAAAAGCTGGGACTATATTTTCAAGAGTTTGGTCAAAATTCTACAG
ACGAAACAGGACCGCATCGAATCGCTTCTAAAAGACAGGAAGACTCTCGAAGATAAGGTC
AAGACTAAACACGAAAACTGGATCTCTGATGTTCGTAACTACGACCAACAACTCTCTCTC
ATGAAGAGAGAAATTGAAACGATGGAGATGATGCAGTTCCTTGAGACCTCTAAATTCAAT
CTCTTGTCTGTATTAAAGGAAAGAGATCGTTCTATATGCAATTTGAAATCTGATGAGACG
GTGGCGGAGTTAAAATACTTCAAGGCTTGGTTTGATATCCTCACTCTGAACACAAGTAAA
GAGAATGGAGACTCTGAAGCTGCAGAATCATTGGAAGCAAAGATCAGAAAGCTGAAGCTT
GAGTATGAGAAGCTTGCTTCTGAAAAGAAATGTGAAATATCTGATCTTTTACGAGAAAAC
GGGTTTGCTAGGAGCGAGTTCAAGTGTATCGAAAGTGGTTTTACTGATAAGTTAAAGAGG
AAAGATGACGAGATTGCTCAAGCGAACGCGAAGATTTCGAGTCTTGTGTCTTATCAAGAG
CAGCTTCTGTCATCTAACCATGAGAAAGATGAGATTATCTCGAGTCTGAAGGCCAAGGTT
GCTTAAATGGAGGGTGGATTTGCCAAGAAAGGTGAGGACGGGGTCTCGAAGCTCTCAAGG
GATGTAGAGTCTTTGAAGAAGTCTTGTAGCTTAACAAGATGCACAACACGTGACAAAGGT
AGCAACGGTAATACTGTGGGATCTCAGGTAACAAGAAAGAAGAACAAGTCTGCATCACCA
CCAAATGATAAGGAAATTAGAAGGTCGAAGAGGCGAAAAGTGAACAAGACATCAGTCACA
GTTTCAGAAACTCCAAAGCTCTTCACTTCAACATTTAGACTTCCAAAGTTAAAGTCTCGT
CCATCTTCTGGAGGAGCTAAATAGGATTTTTATCTTTGTGTCTGCTTCTATTAGATTGGT
TTAGAGAAATAATCTGCTTGTAATCTAATCTCTGTAGTTATGATCATCCCTCTGATGTAT
ATTAGTTCTCGAGTATTTTCCACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A516TF U 1
AF RR2A516JQ C 392
BS 1 706 RR2A516TF
BS 707 1165 RR2A516JQ

RD RR2A516TF 706 0 0
GGGGAACTAGAACGAGCTTCGAGTAGTGCGGAGGAGATGGGTGTGAAATCGGTTTCTCGA
GAATCTTCAGATAGGAAAAGCTGGGACTATATTTTCAAGAGTTTGGTCAAAATTCTACAG
ACGAAACAGGACCGCATCGAATCGCTTCTAAAAGACAGGAAGACTCTCGAAGATAAGGTC
AAGACTAAACACGAAAACTGGATCTCTGATGTTCGTAACTACGACCAACAACTCTCTCTC
ATGAAGAGAGAAATTGAAACGATGGAGATGATGCAGTTCCTTGAGACCTCTAAATTCAAT
CTCTTGTCTGTATTAAAGGAAAGAGATCGTTCTATATGCAATTTGAAATCTGATGAGACG
GTGGCGGAGTTAAAATACTTCAAGGCTTGGTTTGATATCCTCACTCTGAACACAAGTAAA
GAGAATGGAGACTCTGAAGCTGCAGAATCATTGGAAGCAAAGATCAGAAAGCTGAAGCTT
GAGTATGAGAAGCTTGCTTCTGAAAAGAAATGTGAAATATCTGATCTTTTACGAGAAAAC
GGGTTTGCTAGGAGCGAGTTCAAGTGTATCGAAAGTGGTTTTACTGATAAGTTAAAGAGG
AAAGATGACGAGATTGCTCAAGCGAACGCGAAGATTTCGAGTCTTGTGTCTTATCAAGAG
CAGCTTCTGTCATCTAACCATGAGAAAGATGAGATTATCTCGAGTC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2A516JQ 774 0 0
TTGATATCCTCACTCTGAACACAAGTAAAGAGAATGGAGACTCTGAAGCTGCAGAATCAT
TGGAAGCAAAGATCAGAAAGCTGAAGCTTGAGTATGAGAAGCTTGCTTCTGAAAAGAAAT
GTGAAATATCTGATCTTTTACGAGAAAACGGGTTTGCTAGGAGCGAGTTCAAGTGTATCG
AAAGTGGTTTTACTGATAAGTTAAAGAGGAAAGATGACGAGATTGCTCAAGCGAACGCGA
AGATTTCGAGTCTTGTGTCTTATCAAGAGCAGCTTCTGTCATCTAACCATGAGAAAGATG
AGATTATCTCGAGTCTGAAGGCCAAGGTTGCTTAAATGGAGGGTGGATTTGCCAAGAAAG
GTGAGGACGGGGTCTCGAAGCTCTCAAGGGATGTAGAGTCTTTGAAGAAGTCTTGTAGCT
TAACAAGATGCACAACACGTGACAAAGGTAGCAACGGTAATACTGTGGGATCTCAGGTAA
CAAGAAAGAAGAACAAGTCTGCATCACCACCAAATGATAAGGAAATTAGAAGGTCGAAGA
GGCGAAAAGTGAACAAGACATCAGTCACAGTTTCAGAAACTCCAAAGCTCTTCACTTCAA
CATTTAGACTTCCAAAGTTAAAGTCTCGTCCATCTTCTGGAGGAGCTAAATAGGATTTTT
ATCTTTGTGTCTGCTTCTATTAGATTGGTTTAGAGAAATAATCTGCTTGTAATCTAATCT
CTGTAGTTATGATCATCCCTCTGATGTATATTAGTTCTCGAGTATTTTCCACTC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL5725Contig1 804 2 4 U
GGAAGCAAGAACCAGTGAGAATAAAAAAGATGATGGACGCTACGTCTGAATCAGAAAGAA
CAAGCCTGGACCTATCAATCTCATCACCAAAACAAGCTTACTACGTTGAGAGCCCATCAA
GCGTGTCCCAAGTATACGATGGTGACAAATCCTCTTCCGCTGCTTCACTCATTCAGGTTC
AGACCCCAAACTACACCATCCTCACAGAGTCACGTCTCTCTTCTTCAAGCCGCACCTCCA
ATGGGACAAGCGGTGTGGGTTTCCGGTGGAAAGGGAGCTCCCGGAGGAGAGACATGTATT
GGCTGGAGAGGCATTACACGATCGACGAAGAGGAAGTGTATGAAGACAACAGAGGACTAT
CGGTTGGACAATGCAGAGCGGTTATGGTAATACTGGGGATTGTGGTTGTGTTCTCTGTTT
TCTGCTCTGTTTTGTGGGGAGCTTCTCATCCTTTCTCTCCTATTGTATCTGTCAAGAGCT
TTAGCCTCCACAGCTTTTACTACGGAGAGGGAATAGACAGAACAGGTGTTGCGACCAAGA
TTCTGAGCTTTAACAGCTCTGTGAAAGTGACAATAGACAGTCCTGCTCCTTACTTTGGCA
TCCATGTCTCTTCTTCTTCTACCTTCAATCTCACCTTCTCTACTCTCACTCTCGCCACTG
GTCAGTACTCTTTTCTTTCAGATTTCACGCATTGCTCCTATGTCATCGTATGCTGATCTT
TACGTTTTGGCTATGAAGCTTAAGAGTTATTACCAACCAAAAAGAGCAAGCACACAGCCA
TTGTGAAGCTCATTGGCTCGAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E868TF U 1
AF RR2EY21TF U 6
BS 1 202 RR2E868TF
BS 203 203 RR2EY21TF
BS 204 326 RR2E868TF
BS 327 804 RR2EY21TF

RD RR2E868TF 326 0 0
GGAAGCAAGAACCAGTGAGAATAAAAAAGATGATGGACGCTACGTCTGAATCAGAAAGAA
CAAGCCTGGACCTATCAATCTCATCACCAAAACAAGCTTACTACGTTGAGAGCCCATCAA
GCGTGTCCCAAGTATACGATGGTGACAAATCCTCTTCCGCTGCTTCACTCATTCAGGTTC
AGACCCCAAACTACACCATCCTTACAGAGTCACGTCTCTCTTCTTCAAGCCGCACCTCCA
ATGGGACAAGCGGTGTGGGTTTCCGGTGGAAAGGGAGCTCCCGGAGGAGAGACATGTATT
GGCTGGAGAGGCATTACACGATCGAC

QA 1 326 1 326
DS 

RD RR2EY21TF 799 0 0
GG
AGAACCAGTGAGAATAAAAAAGATGATGGACGCTACGTCTGAATCAGAAAGAACAAGCCT
GGACCTATCAATCTCATCACCAAAACAAGCTTACTACGTTGAGAGCCCATCAAGCGTGTC
CCAAGTATACGATGGTGACAAATCCTCTTCCGCTGCTTCACTCATTCAGGTTCAGACCCC
AAACTACACCATCCTCACAGAGTCACGTCTCTCTTCTTCAAGCCGCACCTCCAATGGGAC
AAGCGGTGTGGGTTTCCGGTGGAAAGGGAGCTCCCGGAGGAGAGACATGTATTGGCTGGA
GAGGCATTACACGATCGACGAAGAGGAAGTGTATGAAGACAACAGAGGACTATCGGTTGG
ACAATGCAGAGCGGTTATGGTAATACTGGGGATTGTGGTTGTGTTCTCTGTTTTCTGCTC
TGTTTTGTGGGGAGCTTCTCATCCTTTCTCTCCTATTGTATCTGTCAAGAGCTTTAGCCT
CCACAGCTTTTACTACGGAGAGGGAATAGACAGAACAGGTGTTGCGACCAAGATTCTGAG
CTTTAACAGCTCTGTGAAAGTGACAATAGACAGTCCTGCTCCTTACTTTGGCATCCATGT
CTCTTCTTCTTCTACCTTCAATCTCACCTTCTCTACTCTCACTCTCGCCACTGGTCAGTA
CTCTTTTCTTTCAGATTTCACGCATTGCTCCTATGTCATCGTATGCTGATCTTTACGTTT
TGGCTATGAAGCTTAAGAGTTATTACCAACCAAAAAGAGCAAGCACACAGCCATTGTGAA
GCTCATTGGCTCGAGGT

QA 3 799 3 799
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5728Contig1 898 2 2 U
AGGGAGATTCGGGGACTGAAGATCCAACCGGGAAGACGCTGAAACGACCGCGTTTAGTGT
GGACGCCGCAGCTGCACAAGAGATTCGTCGACGTCGTGGCTCACTTGGGGGTCAAGAACG
CGGTGCCGAAGATGATTATGCAGCTGATGAACGTGGAAGGGTTGACCCGAGAGAACGTCG
CGTCTCACCTCCAGAAGTACAGGCTGTGCCTCCACAGAGCTTCCAAGAACTCGGAGGAGG
CGGTAACGGTAACGGTAACGGCCAAGGGAATGTAACGGCGGGTGTGCCGTACGGAGCAGC
GCCCCAGCCGCCGATGATGCAGATGCCTGTGTATGCGCATCATATGGGTATGCAAGGGTA
TCATCATCACCAGAGTCACGGTCATGATCCTTATCATCAGAACCGTCAGCATCATCATGA
AGCGAATCCATATATGATGCAGCAGAACAAGTTCGGATCCATGGCATCTTATCCTTCTGT
TGGGGGTAGAAGTGCGAATGAGAATTAAAATGAATCGAATTGGTTCTTGACTTGTGTCCG
CATCAATATGTCTTTATCTTTTGCCGAGTTTTCTTAACCATAGGAGAGATCATACAACAT
ATCATGTCGAAGCTAGACCAATGAGTATTCTTGGAAGACAATGCATACATACTTGGGAAC
TTCTGTCAAGTTTCGTGTACTCATTTTCTAGATTGTGAGGTAAGTCGCTCATGTCTTGTT
TCTTTGCTTTGTTAAGGGTTTGTTTCTTTAAGATGGCGTCAGACACAATCTTCATCTTTA
TTTACTTTTCAATATACGAATCAGTTTTAATCTTTTAATAGGAGAGCTTATTTGTGTCCA
ATCAAATTGTCTCTCATATGACGACCTTTTCTTTTCTGTAAGTAATTATAACCTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E392TF U 1
AF RR2E392JQ C 373
BS 1 696 RR2E392TF
BS 697 898 RR2E392JQ

RD RR2E392TF 696 0 0
AGGGAGATTCGGGGACTGAAGATCCAACCGGGAAGACGCTGAAACGACCGCGTTTAGTGT
GGACGCCGCAGCTGCACAAGAGATTCGTCGACGTCGTGGCTCACTTGGGGGTCAAGAACG
CGGTGCCGAAGATGATTATGCAGCTGATGAACGTGGAAGGGTTGACCCGAGAGAACGTCG
CGTCTCACCTCCAGAAGTACAGGCTGTGCCTCCACAGAGCTTCCAAGAACTCGGAGGAGG
CGGTAACGGTAACGGTAACGGCCAAGGGAATGTAACGGCGGGTGTGCCGTACGGAGCAGC
GCCCCAGCCGCCGATGATGCAGATGCCTGTGTATGCGCATCATATGGGTATGCAAGGGTA
TCATCATCACCAGAGTCACGGTCATGATCCTTATCATCAGAACCGTCAGCATCATCATGA
AGCGAATCCATATATGATGCAGCAGAACAAGTTCGGATCCATGGCATCTTATCCTTCTGT
TGGGGGTAGAAGTGCGAATGAGAATTAAAATGAATCGAATTGGTTCTTGACTTGTGTCCG
CATCAATATGTCTTTATCTTTTGCCGAGTTTTCTTAACCATAGGAGAGATCATACAACAT
ATCATGTCGAAGCTAGACCAATGAGTATTCTTGGAAGACAATGCATACATACTTGGGAAC
TTCTGTCAAGTTTCGTGTACTCATTTTCTAGATTGT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2E392JQ 526 0 0
GAGTCACGGTCATGATCCTTATCATCAGAACCGTCAGCATCATCATGAAGCGAATCCATA
TATGATGCAGCAGAACAAGTTCGGATCCATGGCATTTTATCCTTCTGTTGGGGGTAGAAG
TGCGAATGAGAATTAAAATGAATCGAATTGGTTCTTGACTTGTGTCCGCATCAATATGTC
TTTATCTTTTGCCGAGTTTTTTTAACCATAGGAGAGATCATACAACATATCATGTCGAAG
CTAGACCAATGAGTATTCTTGGAAGACAATGCATACATACTTGGGAACTTCTGTCAAGTT
TCGTGTACTCATTTTCTAGATTGTGAGGTAAGTCGCTCATGTCTTGTTTCTTTGCTTTGT
TAAGGGTTTGTTTCTTTAAGATGGCGTCAGACACAATCTTCATCTTTATTTACTTTTCAA
TATACGAATCAGTTTTAATCTTTTAATAGGAGAGCTTATTTGTGTCCAATCAAATTGTCT
CTCATATGACGACCTTTTCTTTTCTGTAAGTAATTATAACCTTTCG

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 2

CO CL5729Contig1 678 2 2 U
GGAATTGTAGTAAGCCTCAAGGAAGCTTTCCCTCTCTGGGTACTTTAGAACAAAGCAATG
GAGGTTCAAGAACAAGATAGCCGGAAAAAGCGACCCGACTTCTCTCCCATTTTCATATTC
ATAGTTTTTCTTGGTCTCGCCGCGTTTTTCCTTTGTCTCGCGTCTGAGTTTCAGAAGGCT
AAGGGGAAAGATCTGAAATGGGATGGAGAATCATGTTATCTACCCGAAAGTCATGCGTTC
AGGTTTGGAACCGCGGCTCTGGTCTGTGTTTCGGTAGCTCAGATCATCGGAAATGTTGTG
ATTTGTAAAGGTTTCTTGAAAACAAACAAAAAGGAAACGACGCCGTTTCTTGCATTTCTT
CTGTTGTTTTCTTGGGTTAATTTTGCGGTTGTGGCTATGTTGATAATCGTTGGTGTAAGC
GTGAACAATGAGCAGAAATACGGCAAAGGGTGGCTAAACGGTGAGTGTTACCTTGTGAAA
GACGGTCTGTTCGCATCATCCGGCGTTCTGTGCGTTACAGCACTGGGTGCAGTTCTCGGA
ACGTTTGCGTCCAACGTCAAACCATCGTTACAGGTTGACACTCAAAACAAAATTCATACC
CACAATGTCTAGCAATTCTCTTTTTTTTTTACCCGTATAATTCTTGAGACTTAACTTGAA
AACAAAGATATTCGATCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ71TF U 1
AF RR2EJ71JQ C 1
BS 1 321 RR2EJ71TF
BS 322 678 RR2EJ71JQ

RD RR2EJ71TF 321 0 0
GGAATTGTAGTAAGCCTCAAGGAAGCTTTCCCTCTCTGGGTACTTTAGAACAAAGCAATG
GAGGTTCAAGAACAAGATAGCCGGAAAAAGCGACCCGACTTCTCTCCCATTTTCATATTC
ATAGTTTTTCTTGGTCTCGCCGCGTTTTTCCTTTGTCTCGCGTCTGAGTTTCAGAAGGCT
AAGGGGAAAGATCTGAAATGGGATGGAGAATCATGTTATCTACCCGAAAGTCATGCGTTC
AGGTTTGGAACCGCGGCTCTGGTCTGTGTTTCGGTAGCTCAGATCATCGGAAATGTTGTG
ATTTGTAAAGGTTTCTTGAAA

QA 1 321 1 321
DS 

RD RR2EJ71JQ 678 0 0
GGAATTGTAGTAAGCCTCAAGGAAGCTTTCCCTCTCTGGGTACTTTAGAACAAAGCAATG
GAGGTTCAAGAACAAGATAGCCGGAAAAAGCGACCCGACTTCTCTCCCATTTTCATATTC
ATAGTTTTTCTTGGTCTCGCCGCGTTTTTCCTTTGTCTCGCGTCTGAGTTTCAGAAGGCT
AAGGGGAAAGATTTGAAATGGGATGGAGAATCATGTTATCTACCCGAAAGTCATGCGTTC
AGGTTTGGAACCGCGGCTCTGGTCTGTGTTTCGGTAGCTCAGATCATCGGAAATGTTGTG
ATTTGTAAAGGTTTCTTGAAAACAAACAAAAAGGAAACGACGCCGTTTCTTGCATTTCTT
CTGTTGTTTTCTTGGGTTAATTTTGCGGTTGTGGCTATGTTGATAATCGTTGGTGTAAGC
GTGAACAATGAGCAGAAATACGGCAAAGGGTGGCTAAACGGTGAGTGTTACCTTGTGAAA
GACGGTCTGTTCGCATCATCCGGCGTTCTGTGCGTTACAGCACTGGGTGCAGTTCTCGGA
ACGTTTGCGTCCAACGTCAAACCATCGTTACAGGTTGACACTCAAAACAAAATTCATACC
CACAATGTCTAGCAATTCTCTTTTTTTTTTACCCGTATAATTCTTGAGACTTAACTTGAA
AACAAAGATATTCGATCG

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL5730Contig1 1087 2 4 U
GGGACTTTGAATCAGAAGAAGGGCATATATCGGTCTCCAGCCTTCAAAATTGACGCCAAA
ACTGTCTCTCTCGACGACGACGACGAGCACCACTCTATCTCTCTCTACCGGAAAACGATT
GAACAGCGGGCGATCTTATCAGAATGAGTAACGCGCTTCTCGACATCGATCCTATCGACC
TTCAATTCCCTTTTGAATTGAAGAAACAGATCTCTTGCTCTCTCTATTTGGCTAACAAGA
CCGACAATTATGTAGCCTTCAAGGTTAAAACGACGAATCCAAAGAAGTACTGTGTGAGGC
CTAACACTGGCGTTGTTCTTCCCAGATCCTCTTCCGAAGTTCTTGTGACCATGCAAGCGC
AGAAGGAAGCTCCTGCTGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTCTTGCTTCAATGTGTTGTGG
CTTCTCCCGGTGTCACTCCCAAAGACGTTACTCCCGAGATGTTTAGCAAAGAGGCGGGGA
ATCGAGTTGAGGAGACGAAACTGAGAGTTGTTTATGTTGATCCACCGCAACCACCTTCAC
CGGTTCGTGAAGGATCAGAAGAGGGCTCTTCACCAAGAGCTTCTGTCTCTGACAATGGGA
ACAACAACGCTCCTGACTTTACTGCTGCTCCAAGATTTAGCGTGGACAAGCTTGAACCTC
AGGATAACCCATCTGAGGCGAGAGCGCTCATCACAAGGCTCACCGAGGAAAAGAACTCTG
CGGTTCAACTGAACAATAGACTTCAACAAGAATTGGAGCAGTTGAAGCGTGGAAGCAATA
GAAGTCAGAGTGGTGGTGGAATCCCGTTCATGTACGTTCTTCTGGTAGGACTAATAGGTC
TAATCTTGGGATACATTTTGAAGAGGACATGATCACGTTGGAAAAACTATAATACCACAC
CCACATCAAAAGTGGCTTCGGCAAAAAAAAACCAAAAGACATGGAAAAGAAAAATCAAAA
CTGTGTCAGAATGACATTCAGTCCTTGTCTTTATCGTCTATCATTTCACCTTTGGTTGAA
TCTTAAACCTAGTTGCCTTAGAGTATTGATTGTGTTACGGTTTTCATAATACTTACAATT
TTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G654TF U 1
AF RR2G654JQ C 379
BS 1 662 RR2G654TF
BS 663 663 RR2G654JQ
BS 664 697 RR2G654TF
BS 698 1087 RR2G654JQ

RD RR2G654TF 703 0 0
GGGACTTTGAATCAGAAGAAGGGCATATATCGGTCTCCAGCCTTCAAAATTGACGCCAAA
ACTGTCTCTCTCGACGACGACGACGAGCACCACTCTATCTCTCTCTACCGGAAAACGATT
GAACAGCGGGCGATCTTATCAGAATGAGTAACGCGCTTCTCGACATCGATCCTATCGACC
TTCAATTCCCTTTTGAATTGAAGAAACAGATCTCTTGCTCTCTCTATTTGGCTAACAAGA
CCGACAATTATGTAGCCTTCAAGGTTAAAACGACGAATCCAAAGAAGTACTGTGTGAGGC
CTAACACTGGCGTTGTTCTTCCCAGATCCTCTTCCGAAGTTCTTGTGACCATGCAAGCGC
AGAAGGAAGCTCCTGCTGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTCTTGCTTCAATGTGTTGTGG
CTTCTCCCGGTGTCACTCCCAAAGACGTTACTCCCGAGATGTTTAGCAAAGAGGCGGGGA
ATCGAGTTGAGGAGACGAAACTGAGAGTTGTTTATGTTGATCCACCGCAACCACCTTCAC
CGGTTCGTGAAGGATCAGAAGAGGGCTCTTCACCAAGAGCTTCTGTCTCTGACAATGGGA
ACAACAACGCTCCTGACTTTACTGCTGCTCCAAGATTTAGCGTGGACAAGCTTGAACCTC
AG*ATAACCCATCTGAGGCGAGAGCGCTCATCACAAG
CTCACC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2G654JQ 709 0 0
ATATGCAGTGCAAGGACAAGTTCTTGCTTCAATGTGTTGTGGCTTCTCCCGGTGTCACTC
CCAAAGACGTTACTCCCGAGATGTTTAGCAAAGAGGCGGGGAATCGAGTTGAGGAGACGA
AACTGAGAGTTGTTTATGTTGATCCACCGCAACCACCTTCACCGGTTCGTGAAGGATCAG
AAGAGGGCTCTTCACCAAGAGCTTCTGTCTCTGACAATGGGAACAACAACGCTCCTGACT
TTACTGCTGCTCCAAGATTTAGCGTGGACAAGCTTGAACCTCAGGATAACCCATCTGAGG
CGAGAGCGCTCATCACAAGGCTCACCGAGGAAAAGAACTCTGCGGTTCAACTGAACAATA
GACTTCAACAAGAATTGGAGCAGTTGAAGCGTGGAAGCAATAGAAGTCAGAGTGGTGGTG
GAATCCCGTTCATGTACGTTCTTCTGGTAGGACTAATAGGTCTAATCTTGGGATACATTT
TGAAGAGGACATGATCACGTTGGAAAAACTATAATACCACACCCACATCAAAAGTGGCTT
CGGCAAAAAAAAACCAAAAGACATGGAAAAGAAAAATCAAAACTGTGTCAGAATGACATT
CAGTCCTTGTCTTTATCGTCTATCATTTCACCTTTGGTTGAATCTTAAACCTAGTTGCCT
TAGAGTATTGATTGTGTTACGGTTTTCATAATACTTACAATTTTCCTCC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL5731Contig1 776 2 4 U
GCTGCAAAAGCTCTCTCCACTCCCAAGCTTTCAACCACCAAGGGAAGACCCCTGGGAAGG
AGATCTTAGGAGGGACAATGTACACATGCATCGTCTGGGTTGTGAACTTGCAGATGGCAT
TAGCCATCAGCTACTTCACAATGATCCAGCACATCGTCATCTGGGGCTCCATCATCGTCT
GGTACCTCTTCATGGCCGTGTACGGAGAGTTTCCAGCGAGTGTATCAACCAGTGCGTATA
GAGTCTTCGTTGAAGCTCTGGCTCCATCGCTCTCTTACTGGGTCATCACTCTCTTTGTGG
TTGTCTCAACTCTTCTGCCGTACTTCATCTACTCTGCGGTTCAGATGAGGTTCTTCCCAA
TGTACCATGGGATGATACAGTGGCTGAGGTACGAGGGTCAGTGTAATGACCCTGAGTACT
GTGATATGGTGAGGCAGAGATCAATAAGGCCTACAACTGTTGGATTCACCGCGAGATTAG
AAGCTAAGAAGAGATCAGTGAGGAGATCAGAGCCTGAATCATGATGATACATAACCATTT
TCAAACTGACTTGCAAGGACGTTACGTACATATATATAGCTTCTTGCTTCAGACCTTGCT
GTTTGTACATTCTGATTCTTGCTGCCTTGAACTGATTAACAAAGTAGATTCTTACAGAGA
ACTTTGAAGATTATTCACCGGTAGAGAGATCTTGTGTGATCCTCTTAAAGACATCTTGTA
TGATCAATGATAGGAATGATCATTTTACTCCTTCTATTTCATATTGTGAGTTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C287TF U 1
AF RR2C287JQ C 406
BS 1 671 RR2C287TF
BS 672 672 RR2C287JQ
BS 673 726 RR2C287TF
BS 727 776 RR2C287JQ

RD RR2C287TF 728 0 0
GCTGCAAAAGCTCTCTCCACTCCCAAGCTTTCAACCACCAAGGGAAGACCCCTGGGAAGG
AGATCTTAGGAGGGACAATGTACACATGCATCGTCTGGGTTGTGAACTTGCAGATGGCAT
TAGCCATCAGCTACTTCACAATGATCCAGCACATCGTCATCTGGGGCTCCATCATCGTCT
GGTACCTCTTCATGGCCGTGTACGGAGAGTTTCCAGCGAGTGTATCAACCAGTGCGTATA
GAGTCTTCGTTGAAGCTCTGGCTCCATCGCTCTCTTACTGGGTCATCACTCTCTTTGTGG
TTGTCTCAACTCTTCTGCCGTACTTCATCTACTCTGCGGTTCAGATGAGGTTCTTCCCAA
TGTACCATGGGATGATACAGTGGCTGAGGTACGAGGGTCAGTGTAATGACCCTGAGTACT
GTGATATGGTGAGGCAGAGATCAATAAGGCCTACAACTGTTGGATTCACCGCGAGATTAG
AAGCTAAGAAGAGATCAGTGAGGAGATCAGAGCCTGAATCATGATGATACATAACCATTT
TCAAACTGACTTGCAAGGACGTTACGTACATATATATAGCTTCTTGCTTCAGACCTTGCT
GTTTGTACATTCTGATTCTTGCTGCCTTGAACTGATTAACAAAGTAGATTCTTACAGAGA
ACTTTGAAGAT*ATTCACCGGTAGAGAGATCTTGTGTGATCCTCTTAAAGACATCTTGTA
TGATCA
TG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2C287JQ 371 0 0
ATGACCCTGAGTACTGTGATATGGTGAGGCAGAGATCAATAAGGCCTACAACTGTTGGAT
TCACCGCGAGATTAGAAGCTAAGAAGAGATCAGTGAGGAGATCAGAGCCTGAATCATGAT
GATACATAACCATTTTCAAACTGACTTGCAAGGACGTTACGTACATATATATAGCTTCTT
GCTTCAGACCTTGCTGTTTGTACATTCTGATTCTTGCTGCCTTGAACTGATTAACAAAGT
AGATTCTTACAGAGAACTTTGAAGATTATTCACCGGTAGAGAGATCTTGTGTGATCCTCT
TAAAGACATCTTGTATGATCAATGATAGGAATGATCATTTTACTCCTTCTATTTCATATT
GTGAGTTTCCG

QA 1 371 1 371
DS 



AS 1 2

CO CL5732Contig1 1535 2 4 U
GGATTCTCAGGCGTCGTTTCTCAAAAAAAAACAAAACCTTTTCGCAGTGGCGCCGCCGAG
CACCGCCCGTCTTGTTGTAGAAAAGTCTCATTCTTCTTCGCGTCTTCTTTCTTTCCTCGG
ACGGGTCGAGCATTATAAGAGCTTCTCTCGCTTTCAAAGGTAGTCATAGCAAATAATGGA
GGGGAGATTGGCTAATATGTGGAGGTTAACAGTGAACGAAAGTAAGTTCGTGGAAACTGC
GTTGCAATCTGAGCTCAGAGTCGATGGTCGTGGTCTTTATGATTACCGCAAGCTTACTAT
TAAGTTTGGAAAAGAGTATGGTAGCTCAGAAGTTCAGCTTGGTCAGACTCATGTGATGGG
TATTGTGACTGCTCAGTTGGTACAACCTTACAAAGACAGACCTAACGAAGGATCTCTCTC
TATCTTCACTGAGTTTTCTCCTATGGCTGATCCATCGTTTGAGCCTGGTCGCCCTGGAGA
ATCTGCAGTGGAGCTGGGACGTATTATAGACCGTGGTCTAAGAGAAAGCCGTGCGGTAGA
TACAGAGTCACTCTGCGTTCTAGCTGGAAAGAAGGTCTGGTCTGTTCGCATTGATCTTCA
CATTTTGGACAATGGAGGGAACTTGGTTGATGCTGCAAATATTGCTGCGTTAGCAGCGCT
CATGACGTTTAGGAGACCAGACTGCACTGTAGGAGGGGAGAACAGTCAAGAAGTTATCAT
ACATTCTCTAGAGGAACGGGAGCCACTCCCCACTGATAATACATCATCTCCCCATAGCCT
TTACGTTTGGATTTTTTAATAAAGGCAACATTGTGGTAATGGACCCAACTTACGTTGAAG
AAGAGGTTATGTGTGGGAGAATGACTGTGACAGTCAATGCTAATGGTGATATATGTGCAA
TCCAAAAACCAGGAGAAGAAGGCGTGAACCAGAGTGTAATCCTTCATTGCTTACGTCTTG
CTTCTTCAAGAGCAGCTGCAACAACAAAGATTATTAGAGAAGAGGTTGAAGCATATAACC
GCGAGAAGAACTTACAGAAGGTGAAGCGACATCCTACTTTGGCTAAATCTGAAGTTTGTG
GACCTATTGTGGTTGTGAAGGAGGGACATAAGAAGTCTTCAGATGAGGATAAATCTGCAG
AGATATTTCAGAAACATGTTGAACTAAATAACAGCAAGGGACAAGAAGCTGTTGCCTCTC
TTGCCACTTTCAAAGGAACTGAAACTTGTTCTGTATCTTCTGATCCAGCGATCAAGGGAA
AGGCGAACGACTCTGGAGATGCGCAGAAAGAAGTAACCGGAGATGTAGAGATGAAAGATA
CACCTGAGGTTACAAAACACAAGGATGGAGAGAAGACACTCAAAGATGCTGTCAAGCCTA
AGAAGAAGAAGCGGAAAAACAAAAGCACTTGAAAGAAGTTTGATGTTAGCATTTAACTAC
ATAAGAAAAAGCACAAAGTGATTTGTTGTTTAGCACTTAATTATATTGTTATTTGTTTCT
TATTTTTGAATTATATACATCACCCTCAGTTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B006TF U 1
AF RR2B006JQ C 717
BS 1 750 RR2B006TF
BS 751 751 RR2B006JQ
BS 752 833 RR2B006TF
BS 834 1535 RR2B006JQ

RD RR2B006TF 833 0 0
GGATTCTCAGGCGTCGTTTCTCAAAAAAAAACAAAACCTTTTCGCAGTGGCGCCGCCGAG
CACCGCCCGTCTTGTTGTAGAAAAGTCTCATTCTTCTTCGCGTCTTCTTTCTTTCCTCGG
ACGGGTCGAGCATTATAAGAGCTTCTCTCGCTTTCAAAGGTAGTCATAGCAAATAATGGA
GGGGAGATTGGCTAATATGTGGAGGTTAACAGTGAACGAAAGTAAGTTCGTGGAAACTGC
GTTGCAATCTGAGCTCAGAGTCGATGGTCGTGGTCTTTATGATTACCGCAAGCTTACTAT
TAAGTTTGGAAAAGAGTATGGTAGCTCAGAAGTTCAGCTTGGTCAGACTCATGTGATGGG
TATTGTGACTGCTCAGTTGGTACAACCTTACAAAGACAGACCTAACGAAGGATCTCTCTC
TATCTTCACTGAGTTTTCTCCTATGGCTGATCCATCGTTTGAGCCTGGTCGCCCTGGAGA
ATCTGCAGTGGAGCTGGGACGTATTATAGACCGTGGTCTAAGAGAAAGCCGTGCGGTAGA
TACAGAGTCACTCTGCGTTCTAGCTGGAAAGAAGGTCTGGTCTGTTCGCATTGATCTTCA
CATTTTGGACAATGGAGGGAACTTGGTTGATGCTGCAAATATTGCTGCGTTAGCAGCGCT
CATGACGTTTAGGAGACCAGACTGCACTGTAGGAGGGGAGAACAGTCAAGAAGTTATCAT
ACATTCTCTAGAGGAACGGGAGCCACTCCC*ACTGATAATACATCATCTCCCCATAGCCT
TTACGTTTGGATTTTTTAATAAAGGCAACATTGTGGTAATGGACCCAACTTAC

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2B006JQ 819 0 0
TCATACATTCTCTAGAGGAACGGGAGCCACTCCCCACTGATAATACATCATCTCCCCATA
GCCTTTACGTTTGGATTTTTTAATAAAGGCAACATTGTGGTAATGGACCCAACTTACGTT
GAAGAAGAGGTTATGTGTGGGAGAATGACTGTGACAGTCAATGCTAATGGTGATATATGT
GCAATCCAAAAACCAGGAGAAGAAGGCGTGAACCAGAGTGTAATCCTTCATTGCTTACGT
CTTGCTTCTTCAAGAGCAGCTGCAACAACAAAGATTATTAGAGAAGAGGTTGAAGCATAT
AACCGCGAGAAGAACTTACAGAAGGTGAAGCGACATCCTACTTTGGCTAAATCTGAAGTT
TGTGGACCTATTGTGGTTGTGAAGGAGGGACATAAGAAGTCTTCAGATGAGGATAAATCT
GCAGAGATATTTCAGAAACATGTTGAACTAAATAACAGCAAGGGACAAGAAGCTGTTGCC
TCTCTTGCCACTTTCAAAGGAACTGAAACTTGTTCTGTATCTTCTGATCCAGCGATCAAG
GGAAAGGCGAACGACTCTGGAGATGCGCAGAAAGAAGTAACCGGAGATGTAGAGATGAAA
GATACACCTGAGGTTACAAAACACAAGGATGGAGAGAAGACACTCAAAGATGCTGTCAAG
CCTAAGAAGAAGAAGCGGAAAAACAAAAGCACTTGAAAGAAGTTTGATGTTAGCATTTAA
CTACATAAGAAAAAGCACAAAGTGATTTGTTGTTTAGCACTTAATTATATTGTTATTTGT
TTCTTATTTTTGAATTATATACATCACCCTCAGTTACCC

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 2

CO CL5733Contig1 370 2 2 U
ACCAAAAAAAAAAAATTCAAGCAGTGTATATACACGTAGATATGATTAAGATAGAAGAAG
CCATGCACTAGCTGACAAAACAATAATCGTCGCCTTGCGTGCATGGGAAAGCTATTTGGT
TTTCACATCTTTGTTGACCAAATCTACTGTTATTACTGGACTTTTTTTTGTTAAATATAG
TTATTACTTAACTACTTAATAAGTTCAACTTGGTTTTACCTATACCAACTCGATTTGATA
GTCCATAAATACTTAATTCTGTTTGTAATTTGGGAATATTTAATTTTGTTAGATTACTTA
ACTTAAGTTAGTTTTTTTCGTCTATTTAAAGACAAGAACAAACTTCCATGAACAAGAAGT
TTCTTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BQ40TF C 1
AF RR2BQ40JQ U 55
BS 1 54 RR2BQ40TF
BS 55 370 RR2BQ40JQ

RD RR2BQ40TF 370 0 0
ACCAAAAAAAAAAAATTCAAGCAGTGTATATACACGTAGATATGATTAAGATAGAAGAAG
CCATGCACTAGCTGACAAAACAATAATCGTCGCCTTGCGTGCATGGGAAAGCTATTTGGT
TTTCACATCTTTGTTGACCAAATCTACTGTTATTACTGGACTTTTTTTTGTTAAATATAG
TTATTACTTAACTACTTAATAAGTTCAACTTGGTTTTACCTATACCAACTCGATTTGATA
GTCCATAAATACTTAATTCTGTTTGTAATTTGGGAATATTTAATTTTGTTAGATTACTTA
ACTTAAGTTAGTTTTTTTCGTCTATTTAAAGACAAGAACAAACTTCCATGAACAAGAAGT
TTCTTTAATC

QA 1 370 1 370
DS 

RD RR2BQ40JQ 316 0 0
AAGAAGCCATGCACTAGCTGACAAAACAATAATCGTCGCCTTGCGTGCATGGGAAAGCTA
TTTGGTTTTCACATCTTTGTTGACCAAATCTACTGTTATTACTGGACTTTTTTTTGTTAA
ATATAGTTATTACTTAACTACTTAATAAGTTCAACTTGGTTTTACCTATACCAACTCGAT
TTGATAGTCCATAAATACTTAATTCTGTTTGTAATTTGGGAATATTTAATTTTGTTAGAT
TACTTAACTTAAGTTAGTTTTTTTCGTCTATTTAAAGACAAGAACAAACTTCCATGAACA
AGAAGTTTCTTTAATC

QA 1 316 1 316
DS 



AS 1 2

CO CL5734Contig1 962 2 12 U
GCAAAGAATATTTGCGGTTCAACTATTTGAGTTGCACAGACTTATTAAGGTTCAAAAACT
TATTGCTTCATCATCGGATGTCTTGCTCGATGAGATCAGTTATCTCGGAAAAGTTGCTGC
TAAAGGCTATCCATTGAAGAAGCTTCTTCCCTCAGAATCTATAGTAAAGCCTCCTCCTTC
TCTTCCCTCTGGAGGAAATCAGCAATGGTTGATCCCTGTAATGTCTCCTTCCGAAGGGCT
AATATACAAGCCTCACCCAGGTCCAGGAGGACACCACACAGAGGCCCCCGTCTGTGGAGG
CTATTATGGTCATTTCATGCCTGCACCGATGATAATGAGTAGCTTCATGGGCGGTGGTAA
TGGCTACTTCCCTCCTTATGGTATAATGCCCACTATGATGAACCCTTACGGTTCAGGCCA
ACAACAACAACAGCCGCCCAATGAGCAAATGAATCAGTTTGTGCATCCTGGAAACCTTCA
GTACGCATCGGCTGTGAACACTCAACAACAGAGCTCAATGAATGAAGAGGTCTCACAACA
ACAGCCAACAAAATCTTATCCTCGGGCTAGAAAGAGCAGGCAAAGGAGCACAGGAAGCAG
TAGTAGTCCAAGTGGTACGAACTCCTTTCGGCCATTGTCAGTGGTTGATGATGATGACAA
CAATGAGCAAATGTTGACGACAACCACAACAACAACGAGAACAACTGTTACGCAGACAAC
AAGAGATGGAGGTGGTGGGGTGGCGAGAGTGATAAAGGTGGTTCCGCACAACGCCAAGCT
GGCTAGTGAGAATGCTGCAAGGATTTTCCGGTCGATACAGGAAGAACGTAAACACTACGA
CTCCTTTTCTAACCACTCTTAAGCTTTTGTCTTTTTCTTTCTTGTTCGTTTTCGTAATTT
GTGTTTGCGACTGACTATATGTATCTTTAAAAGGTAGAAAATTGTGATACATGTTATGCT
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2D502TF U 1
AF RR2D502JQ C 271
BS 1 684 RR2D502TF
BS 685 685 RR2D502JQ
BS 686 718 RR2D502TF
BS 719 721 RR2D502JQ
BS 722 757 RR2D502TF
BS 758 758 RR2D502JQ
BS 759 762 RR2D502TF
BS 763 763 RR2D502JQ
BS 764 791 RR2D502TF
BS 792 792 RR2D502JQ
BS 793 806 RR2D502TF
BS 807 962 RR2D502JQ

RD RR2D502TF 813 0 0
GCAAAGAATATTTGCGGTTCAACTATTTGAGTTGCACAGACTTATTAAGGTTCAAAAACT
TATTGCTTCATCATCGGATGTCTTGCTCGATGAGATCAGTTATCTCGGAAAAGTTGCTGC
TAAAGGCTATCCATTGAAGAAGCTTCTTCCCTCAGAATCTATAGTAAAGCCTCCTCCTTC
TCTTCCCTCTGGAGGAAATCAGCAATGGTTGATCCCTGTAATGTCTCCTTCCGAAGGGCT
AATATACAAGCCTCACCCAGGTCCAGGAGGACACCACACAGAGGCCCCCGTCTGTGGAGG
CTATTATGGTCATTTCATGCCTGCACCGATGATAATGAGTAGCTTCATGGGCGGTGGTAA
TGGCTACTTCCCTCCTTATGGTATAATGCCCACTATGATGAACCCTTACGGTTCAGGCCA
ACAACAACAACAGCCGCCCAATGAGCAAATGAATCAGTTTGTGCATCCTGGAAACCTTCA
GTACGCATCGGCTGTGAACACTCAACAACAGAGCTCAATGAATGAAGAGGTCTCACAACA
ACAGCCAACAAAATCTTATCCTCGGGCTAGAAAGAGCAGGCAAAGGAGCACAGGAAGCAG
TAGTAGTCCAAGTGGTACGAACTCCTTTCGGCCATTGTCAGTGGTTGATGATGATGACAA
CAATGAGCAAATGTTGACGACAAC*ACAACAACAACGAGAACAACTGTTACGCAGACA**
CAGAGATGGAGGTGGTGGGGTGGCGAGAGTGATAAAG*TGGT*CCGCACAACGCCAAGCT
GGCTAGTGAGA*TGCTGCAAGGATTT
CCGTCGA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2D502JQ 692 0 0
ACACCACACAGAGGCCCCCGTCTGTGGAGGCTATTATGGTCATTTCATGCCTGCACCGAT
GATAATGAGTAGCTTCATGGGCGGTGGTAATGGCTACTTCCCTCCTTATGGTATAATGCC
CACTATGATGAACCCTTACGGTTCAGGCCAACAACAACAACAGCCGCCCAATGAGCAAAT
GAATCAGTTTGTGCATCCTGGAAACCTTCAGTACGCATCGGCTGTGAACACTCAACAACA
GAGCTCAATGAATGAAGAGGTCTCACAACAACAGCCAACAAAATCTTATCCTCGGGCTAG
AAAGAGCAGGCAAAGGAGCACAGGAAGCAGTAGTAGTCCAAGTGGTACGAACTCCTTTCG
GCCATTGTCAGTGGTTGATGATGATGACAACAATGAGCAAATGTTGACGACAACCACAAC
AACAACGAGAACAACTGTTACGCAGACAACAAGAGATGGAGGTGGTGGGGTGGCGAGAGT
GATAAAGGTGGTTCCGCACAACGCCAAGCTGGCTAGTGAGAATGCTGCAAGGATTTTCCG
GTCGATACAGGAAGAACGTAAACACTACGACTCCTTTTCTAACCACTCTTAAGCTTTTGT
CTTTTTCTTTCTTGTTCGTTTTCGTAATTTGTGTTTGCGACTGACTATATGTATCTTTAA
AAGGTAGAAAATTGTGATACATGTTATGCTCC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL5735Contig1 318 2 1 U
GGATCGTCACCAATTCATCTCGCCTACAATCCCTCTACCCAGTTTTTTTCTCTTATCTCG
CCGTCGCAGGCTTCGCCGCCGGCAAGCTCCTACCCTTTTCATCTTCCCTCTCCTCTAATA
ATCCCCAAAAAGAGAAAAAAAAAACAGAAAAAAAGTAAAACGATCAGAAAAAAAAAAATC
GAATCTTTTGTTGTTGTGTTATTACTTTCCGCTTCATTCCTCCTTCGTTCAATCCGATTC
AGTCTAAATAACGAAGAGGGGAGGGAAGAGTAATTGAAAACCCCAAAAAAAAATTCAAAA
AGAAAGTTTGAAAAATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BO80JQ C 1
AF RR2BO80TF U 1
BS 1 318 RR2BO80TF

RD RR2BO80JQ 318 0 0
GGATCGTCACCAATTCATTTCGCCTACAATCCCTCTACCCAGTTTTTTTCTCTTATCTCG
CCGTCGCAGGCTTCGCCGCCGGCAAGCTCCTACCCTTTTCATCTTCCCTCTCCTCTAATA
ATCCCCAAAAAGAGAAAAAAAAAACAGAAAAAAAGTAAAACGATCAGAAAAAAAAAAATC
GAATCTTTTGTTGTTGTGTTATTACTTTCCGCTTCATTCCTCCTTCGTTCAATCCGATTC
AGTCTAAATAACGAAGAGGGGAGGGAAGAGTAATTGAAAACCCCAAAAAAAAATTCAAAA
AGAAAGTTTGAAAAATCC

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR2BO80TF 318 0 0
GGATCGTCACCAATTCATCTCGCCTACAATCCCTCTACCCAGTTTTTTTCTCTTATCTCG
CCGTCGCAGGCTTCGCCGCCGGCAAGCTCCTACCCTTTTCATCTTCCCTCTCCTCTAATA
ATCCCCAAAAAGAGAAAAAAAAAACAGAAAAAAAGTAAAACGATCAGAAAAAAAAAAATC
GAATCTTTTGTTGTTGTGTTATTACTTTCCGCTTCATTCCTCCTTCGTTCAATCCGATTC
AGTCTAAATAACGAAGAGGGGAGGGAAGAGTAATTGAAAACCCCAAAAAAAAATTCAAAA
AGAAAGTTTGAAAAATCC

QA 1 318 1 318
DS 



AS 1 2

CO CL5736Contig1 1008 2 2 U
GGCAGCGTGAGAGATTCCTGATGTCTGTGGGTTTTGGAAAAAGAAAACGCATAGAATGAA
ATGAATGAATGTAATCAAATCATGAATGAGATTCCGTTTTTCATGGCCGAAATCAATCTA
TCTCACTTTCTCAAAGTTGTCTTTCTTTTTTTTTCTTTTTTACAACTAATTATTGTATTC
TTTATGGACTGAATATTTCTTTATTATTTTTGTCCAATACAATAATGATCTGTAAGAATC
TCCTTTTATTGGGATTAGCGTTTCAACTCCAAAAATTCAGAGAAAACTTCTCATTTTGTT
TTCCTTCTTCTCTCTGCTTCATCGTCACAAGTAACCAACCATCATGGACACACTCGTCGC
TCAGTTGCAGAGACAGTTTCGTGATTACACCATCTCTCTCTATCAGCAGGGGTTTCTGGA
TGATCAGTTCACTGAATTGAAAAAGCTGCAAGATGAATGTAGCCCTGATTTTGTGGCTGA
GGTTGTTTCTCTCTTCTTTGAAGACTGTGAGAAGCTTATCGGTAACATGGCTAGAGCTCT
AGATCAGACAGGAAACGTAGATTTCAGTCTGGTAGGTTCTAGTGTTCATCAACTCAAAGG
TAGTAGCTCAAGTGTTGGTGCCAAGAGGGTCAAAGGTCTTTGTATTACCTTCATGGAGTG
TTGTGACTCTCAGAACTTTGAAGGGTGTGTGAGATGTTTGCAGCAGGTGGATATTGAGTA
CAAGTCATTAAAGGCAAAGCTTCAAGATTTGTTCAGTCTTGAGCAGCAGATCGTCCAAGC
TGGTGGTAGAATCCCTCAGGTTGATATATAAACTACTTGTGGACGAACAGATCGATGATA
ATGATGATGATGATTGGCATCCCCAGGATTTTATTGTTTAGTTAAAACTTTTTACAAATG
TGTGGGAAAAGACTGGTGATTGTTGTTGTTAGATCAGTACCGTGTAACTTTATCAATCGC
TTTGGTTTGATGAACCTTGATCCTAATATATAATCTGAACCTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK93TF U 1
AF RR2DK93JQ C 319
BS 1 631 RR2DK93TF
BS 632 1008 RR2DK93JQ

RD RR2DK93TF 631 0 0
GGCAGCGTGAGAGATTCCTGATGTCTGTGGGTTTTGGAAAAAGAAAACGCATAGAATGAA
ATGAATGAATGTAATCAAATCATGAATGAGATTCCGTTTTTCATGGCCGAAATCAATCTA
TCTCACTTTCTCAAAGTTGTCTTTCTTTTTTTTTCTTTTTTACAACTAATTATTGTATTC
TTTATGGACTGAATATTTCTTTATTATTTTTGTCCAATACAATAATGATCTGTAAGAATC
TCCTTTTATTGGGATTAGCGTTTCAACTCCAAAAATTCAGAGAAAACTTCTCATTTTGTT
TTCCTTCTTCTCTCTGCTTCATCGTCACAAGTAACCAACCATCATGGACACACTCGTCGC
TCAGTTGCAGAGACAGTTTCGTGATTACACCATCTCTCTCTATCAGCAGGGGTTTCTGGA
TGATCAGTTCACTGAATTGAAAAAGCTGCAAGATGAATGTAGCCCTGATTTTGTGGCTGA
GGTTGTTTCTCTCTTCTTTGAAGACTGTGAGAAGCTTATCGGTAACATGGCTAGAGCTCT
AGATCAGACAGGAAACGTAGATTTCAGTCTGGTAGGTTCTAGTGTTCATCAACTCAAAGG
TAGTAGCTCAAGTGTTGGTGCCAAGAGGGTC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2DK93JQ 690 0 0
TCATCGTCACAAGTAACCAACCATCATGGACACACTCGTCGCTCAGTTGCAGAGACAGTT
TCGTGATTACACCATCTCTCTCTATCAGCAGGGGTTTCTGGATGATCAGTTCACTGAATT
GAAAAAGCTGCAAGATGAATGTAGCCCTGATTTTGTGGCTGAGGTTGTTTCTCTCTTCTT
TGAAGACTGTGAGAAGCTTATCGGTAACATGGCTAGAGCTCTAGATCAGACAGGAAACGT
AGATTTCAGTCTGGTAGGTTCTAGTGTTCATCAACTCAAAGGTAGTAGCTCAAGTGTTGG
TGCCAAGAGGGTCAAAGGTCTTTGTATTACCTTCATGGAGTGTTGTGACTCTCAGAACTT
TGAAGGGTGTGTGAGATGTTTGCAGCAGGTGGATATTGAGTACAAGTCATTAAAGGCAAA
GCTTCAAGATTTGTTCAGTCTTGAGCAGCAGATCGTCCAAGCTGGTGGTAGAATCCCTCA
GGTTGATATATAAACTACTTGTGGACGAACAGATCGATGATAATGATGATGATGATTGGC
ATCCCCAGGATTTTATTGTTTAGTTAAAACTTTTTACAAATGTGTGGGAAAAGACTGGTG
ATTGTTGTTGTTAGATCAGTACCGTGTAACTTTATCAATCGCTTTGGTTTGATGAACCTT
GATCCTAATATATAATCTGAACCTTGATCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL5737Contig1 1054 2 4 U
TGATGTGCAAGATCTTTATACGGATGTAATGAGGAGATCAAGCAGAGAAGGAATGCCTAG
AGCCTCCAGTTTATCAAGTATTGACTCAATAATGACCCCAAGCGTAGGCGAGCTAGACAC
ATGTAGCAGCACACATGCCAGCGCCGAGCCATCTGAATATGTTCGTGGAATAGATCCACC
TCCTTCAACTCGATGTTCAACTCGATGCTCATGACAGAGAAGATATTTCATCTACTGTAT
CCGACCCGGGTCCAATCTGGGATTCAGGACCCAAATGGGACAGTTAACCGTCTGCTTGGG
ATGTAGAAAACCCGATCGAGCTGCCAGGTCCTCCTGAGGATATAGAACAGGACTGAGGAG
GCAAACCATCACGCCAATATATGAAGATAAATGGGTTTCTAGAAAGGGACATTTCCTCGG
CATCATGGTCTGTAACCACGCTTGTCGGACGGTTCAGAGCTCTCAAGTGGTAGCTCCCAA
TTCAGAGCATGACGATGGTACAATGGACATGATCTTGATTCATGGGTGTGGAAGACTAAG
ATTGCTGAGGTTCTTTATCCTTCTGCAAACCGGTCGACACCTTTCTCTTCCGTATGTCGA
GTGTGTAAAGGTGAAGTCGGTGAAAGTAAAGTCGGGGAAACAGACGCATGACAGTTGTGG
TATAGACGGAGAGCTGTTTGCATTGAATGGAGAGGTGATATCGACTATGCTACCGGAACA
ATGCAGATTGATCGGTAATGCTCCAGAACGACATTCATAGTTGAATTAAATCTCATCAAA
GTTATGTGGATGGAGGGAGAGAACGAGAAAGAGTCTGGGTGTTTATATATATATATGGAA
TTATTATTTTTGGGGGATTTTGTTCTGGTTCGGCGTCGGTAGCTATGCGGTAAGAGAAAT
AAAGACATGAGAGAATGACACTGTTGTGATCACAATCCTTTTTCCATCCATAAGTTCCCT
AAAAGACTGAACTCTTTGTATATTCTTTTGCTCTTTTGTTTGTTTTGTGTGTTTAGAGCT
ATATATGTGTACTATATATAATGTGTTTTCCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D401TF U 1
AF RR2D401JQ C 338
BS 1 636 RR2D401TF
BS 637 637 RR2D401JQ
BS 638 664 RR2D401TF
BS 665 1054 RR2D401JQ

RD RR2D401TF 664 0 0
TGATGTGCAAGATCTTTATACGGATGTAATGAGGAGATCAAGCAGAGAAGGAATGCCTAG
AGCCTCCAGTTTATCAAGTATTGACTCAATAATGACCCCAAGCGTAGGCGAGCTAGACAC
ATGTAGCAGCACACATGCCAGCGCCGAGCCATCTGAATATGTTCGTGGAATAGATCCACC
TCCTTCAACTCGATGTTCAACTCGATGCTCATGACAGAGAAGATATTTCATCTACTGTAT
CCGACCCGGGTCCAATCTGGGATTCAGGACCCAAATGGGACAGTTAACCGTCTGCTTGGG
ATGTAGAAAACCCGATCGAGCTGCCAGGTCCTCCTGAGGATATAGAACAGGACTGAGGAG
GCAAACCATCACGCCAATATATGAAGATAAATGGGTTTCTAGAAAGGGACATTTCCTCGG
CATCATGGTCTGTAACCACGCTTGTCGGACGGTTCAGAGCTCTCAAGTGGTAGCTCCCAA
TTCAGAGCATGACGATGGTACAATGGACATGATCTTGATTCATGGGTGTGGAAGACTAAG
ATTGCTGAGGTTCTTTATCCTTCTGCAAACCGGTCGACACCTTTCTCTTCCGTATGTCGA
GTGTGTAAAGGTGAAGTCGGTGAAAGTAAAGTCGGG*AAACAGACGCATGACAGTTGTGG
TATA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2D401JQ 717 0 0
GGATATAGAACAGGACTGAGGAGGCAAACCATCACGCCAATATATGAAGATAAATGGGTT
TCTAGAAAGGGACATTTCCTCGGCATCATGGTCTGTAACCACGCTTGTCGGACGGTTCAG
AGCTCTCAAGTGGTAGCTCCCAATTCAGAGCATGACGATGGTACAATGGACATGATCTTG
ATTCATGGGTGTGGAAGACTAAGATTGCTGAGGTTCTTTATCCTTCTGCAAACCGGTTGA
CACCTTTCTCTTCCGTATGTCGAGTGTGTAAAGGTGAAGTCGGTGAAGGTAAAGTCGGGG
AAACAGACGCATGACAGTTGTGGTATAGACGGAGAGCTGTTTGCATTGAATGGAGAGGTG
ATATCGACTATGCTACCGGAACAATGCAGATTGATCGGTAATGCTCCAGAACGACATTCA
TAGTTGAATTAAATCTCATCAAAGTTATGTGGATGGAGGGAGAGAACGAGAAAGAGTCTG
GGTGTTTATATATATATATGGAATTATTATTTTTGGGGGATTTTGTTCTGGTTCGGCGTC
GGTAGCTATGCGGTAAGAGAAATAAAGACATGAGAGAATGACACTGTTGTGATCACAATC
CTTTTTCCATCCATAAGTTCCCTAAAAGACTGAACTCTTTGTATATTCTTTTGCTCTTTT
GTTTGTTTTGTGTGTTTAGAGCTATATATGTGTACTATATATAATGTGTTTTCCGAC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL5738Contig1 1215 2 6 U
GATTCCCTGCTAGAAAATATATGTTTCATGTTTAAAATACCATTGAGTTGCCCTCCAAGT
TTACAGAAGATGTAAAACCTCCTAAGCTAGTCTTGAATGCGTTAATCTTGATGTCGACAA
TATTCCCGAAAACAAAGCTCTTTCCAAAGAAAGACATTCGTCCGCTGTTCTACAGAGAAC
CAAGTAAAAGAAAACTGTCCTACTTTGATGTGATTAGCTACGATGATCAAACACGTCTGA
AAACCGCTGTTGAACTTCTAAATGCGGCAAATGACATTGAGATGCAAATTAATAAGGTCA
GTTGAACAGCCAAATAAATATGTATAAAACTTCTTTAGCGTATCATAGACAGGAGAAACT
TATTGCAGGTCTCATCGCCAATGTTGATTCTACATGGAGACGCGGATATAGTCACAGATC
CCACTGTGAGCAAGTTCCTTTACGAGCAAGCAACCAGCCAAGACAAAACCCTAAAACTCT
ATCCAGGTGGCTACCATTGCCTTCTAGAAGGTGACACAGACGAAAACATTTTCACCGCAA
TCAACGACATCGTTGCTTGGCTTGATGCCCACACCACTCCCAAGTAAATTGAGAGTATAT
CCAAAACCCTATGTTTATTATCGTCTTTCATAACTCTGAGAATCTCTGCAGTTAATTACA
TAAAGAATAAAACAAAAACTGTATATGGCTTGCAATGAAATCACATCATGTATTGGGCCT
TATGCCACCTTAACGGGGTTTCCTGAGAGTTTCTAAAGCAAAAAGTAAGAGAGAAAGTGA
TCAAATGTGGAAAATAGTACCTTGGAGAGATACCCTAAAAAAAGTTTAACATACTCATCA
AACCTGTGACATATGATTAGTGGATAATCTAATTACAATGTTTAAATCTTAATACTTTTT
TGTCTTTGAAGAACTTAGATAATATCTACCTTTTTTGTCTTGTTGATGCTCGATGCTCCT
AGCTTTCCTCCTCGACTAATATGAGCTACAGTCCAAATTCCAAAATAGCAATACCATGGT
CCTTTACGATATTCGATTTTTGAATAAATTTATTTTAAATTTGATTTATAGTATATTAAG
AATTTTTTGTAATACAAAATTGGATAAAATTCCATTCGTGAATTTTGTAATTCAACAAAG
CGGAAATAATGGAGCTTTGTTGAAGTAAAAAATAAGAAATAAATTGTGTAAGAGAAAACT
ATGAATTATTTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D678TF U 1
AF RR2D678JQ C 400
BS 1 694 RR2D678TF
BS 695 695 RR2D678JQ
BS 696 716 RR2D678TF
BS 717 717 RR2D678JQ
BS 718 731 RR2D678TF
BS 732 1215 RR2D678JQ

RD RR2D678TF 731 0 0
GATTCCCTGCTAGAAAATATATGTTTCATGTTTAAAATACCATTGAGTTGCCCTCCAAGT
TTACAGAAGATGTAAAACCTCCTAAGCTAGTCTTGAATGCGTTAATCTTGATGTCGACAA
TATTCCCGAAAACAAAGCTCTTTCCAAAGAAAGACATTCGTCCGCTGTTCTACAGAGAAC
CAAGTAAAAGAAAACTGTCCTACTTTGATGTGATTAGCTACGATGATCAAACACGTCTGA
AAACCGCTGTTGAACTTCTAAATGCGGCAAATGACATTGAGATGCAAATTAATAAGGTCA
GTTGAACAGCCAAATAAATATGTATAAAACTTCTTTAGCGTATCATAGACAGGAGAAACT
TATTGCAGGTCTCATCGCCAATGTTGATTCTACATGGAGACGCGGATATAGTCACAGATC
CCACTGTGAGCAAGTTCCTTTACGAGCAAGCAACCAGCCAAGACAAAACCCTAAAACTCT
ATCCAGGTGGCTACCATTGCCTTCTAGAAGGTGACACAGACGAAAACATTTTCACCGCAA
TCAACGACATCGTTGCTTGGCTTGATGCCCACACCACTCCCAAGTAAATTGAGAGTATAT
CCAAAACCCTATGTTTATTATCGTCTTTCATAACTCTGAGAATCTCTGCAGTTAATTACA
TAAAGAATAAAACAAAAACTGTATATGGCTTGCA*TGAAATCACATCATGTATTGG*CCT
TATGCCACCTT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2D678JQ 816 0 0
ACGCGGATATAGTCACAGATCCCACTGTGAGCAAGT*CCTTTACGAGCAAGCAACCAGCC
AAGACAAAACCCTAAAACTCTATCCAGGTGGCTACCATTGCCTTCTAGAAGGTGACACAG
ACGAAAACATTTTCACCGCAATCAACGACATCGTTGCTTGGCTTGATGCCCACACCACTC
CCAAGTAAATTGAGAGTATATCCAAAACCCTATGTTTATTATCGTCTTTCATAACTCTGA
GAATCTCTGCAGTTAATTACATAAGGAATAAAACAAAAACTGTATATGGCTTGCAATGAA
ATCACATCATGTATTGGGCCTTATGCCACCTTAACGGGGTTTCCTGAGAGTTTCTAAAGC
AAAAAGTAAGAGAGAAAGTGATCAAATGTGGAAAATAGTACCTTGGAGAGATACCCTAAA
AAAAGTTTAACATACTCATCAAACCTGTGACATATGATTAGTGGATAATCTAATTACAAT
GTTTAAATCTTAATACTTTTTTGTCTTTGAAGAACTTAGATAATATCTACCTTTTTTGTC
TTGTTGATGCTCGATGCTCCTAGCTTTCCTCCTCGACTAATATGAGCTACAGTCCAAATT
CCAAAATAGCAATACCATGGTCCTTTACGATATTCGATTTTTGAATAAATTTATTTTAAA
TTTGATTTATAGTATATTAAGAATTTTTTGTAATACAAAATTGGATAAAATTCCATTCGT
GAATTTTGTAATTCAACAAAGCGGAAATAATGGAGCTTTGTTGAAGTAAAAAATAAGAAA
TAAATTGTGTAAGAGAAAACTATGAATTATTTATTG

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

CO CL5739Contig1 1214 2 4 U
GCTAGCTACAGACAACGTTTTGGCTGCATCGGTTGTGGTCTCATCCGCTGTTCAGTCGTC
TTCGAAACCTGAGAAGATTGTCTTTCATGTTATCACTGACAAGAAAACCTATGCGGGCAT
GCATTCTTGGTTTGCGCTCAACTCCGTTGCTCCTGCCATCGTTGAAGTCAAAAGCGTTCA
TCAGTTCGACTGGCTAACAAGAGAGAATGTTCCTGTTCTCGAAGCTGTGGAAACCCATCA
CGGTATCAGAAACTATTACCATGGGAATCATATTGCTGGTGCAAACCTCAGTGAAACAAC
TCCAAGAAAATTCGCTTCCAAGTTGCAATCGAGAAGTCCCAAATACATATCTTTGCTCAA
CCATCTTAGAATATATCTACCAGAGCTGTTTCCAAACTTGGACAAGGTGGTTTTCTTAGA
TGATGATATAGTGATTCAGAGAGATCTATCTCCTCTTTGGGATATTGATCTTCACGGGAA
GGTAAATGGAGCTGTGGAGACTTGTAGAGGAGAAGACGAATGGGTTATGTCAAAGCGTCT
CAGGAACTACTTCAACTTCTCTCACCCTCTCATAGCAAAGCATTTGGATCCGGAAGAATG
TGCTTGGGCTTATGGAATGAATATCTTTGATCTACGGACTTGGAGGAAGACAGATATCAG
AGAAACGTATCATTCTTGGCTAAAAGCGAATCTGAAGTCGAATCTAACTATGTGGAAACT
GGGGACATTGCCTCCAGCTCTGATTGCGTTTAAAGGTCATGTTCAGGCAATAGATTCGTC
TTGGCATATGCTTGGATTAGGATACCAGAGCAATACCAACATAGAAAATGTGAAGAAAGC
TGCAGTGATCCACTACAATGGCCAATCAAAGCCGTGGCTGGAGATAGGTTTTGAGCATCT
GAGGCCGTTCTGGACAAAATATGTGAACTACTCCAATGATTTCATTAGGAATTGTCATAT
CTTGGAATGGCAAACGGGAAGCTTTCAGGTAATCTTGAAGAAGAGAAGTGGAGATTTGGC
AGGGGGGGTTTCTGGAGATATACATTGGACTTTTTGCTGGAAGATGAAACTAGTTACAGA
GCTCTGCAGCAGAAAAGATTGATTCTTCTGTAGAGATAGAAGAGGTACCCTTTTGTTGAG
ATTCTTTTGACACAGCAGAAGAAATTGGATTTTTTTTTTGGTCATGATCAGACAACAACA
CCAAACTCTGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW90TF U 1
AF RR2FW90JQ C 428
BS 1 701 RR2FW90TF
BS 702 702 RR2FW90JQ
BS 703 745 RR2FW90TF
BS 746 1214 RR2FW90JQ

RD RR2FW90TF 745 0 0
GCTAGCTACAGACAACGTTTTGGCTGCATCGGTTGTGGTCTCATCCGCTGTTCAGTCGTC
TTCGAAACCTGAGAAGATTGTCTTTCATGTTATCACTGACAAGAAAACCTATGCGGGCAT
GCATTCTTGGTTTGCGCTCAACTCCGTTGCTCCTGCCATCGTTGAAGTCAAAAGCGTTCA
TCAGTTCGACTGGCTAACAAGAGAGAATGTTCCTGTTCTCGAAGCTGTGGAAACCCATCA
CGGTATCAGAAACTATTACCATGGGAATCATATTGCTGGTGCAAACCTCAGTGAAACAAC
TCCAAGAAAATTCGCTTCCAAGTTGCAATCGAGAAGTCCCAAATACATATCTTTGCTCAA
CCATCTTAGAATATATCTACCAGAGCTGTTTCCAAACTTGGACAAGGTGGTTTTCTTAGA
TGATGATATAGTGATTCAGAGAGATCTATCTCCTCTTTGGGATATTGATCTTCACGGGAA
GGTAAATGGAGCTGTGGAGACTTGTAGAGGAGAAGACGAATGGGTTATGTCAAAGCGTCT
CAGGAACTACTTCAACTTCTCTCACCCTCTCATAGCAAAGCATTTGGATCCGGAAGAATG
TGCTTGGGCTTATGGAATGAATATCTTTGATCTACGGACTTGGAGGAAGACAGATATCAG
AGAAACGTATCATTCTTGGCTAAAAGCGAATCTGAAGTCGA*TCTAACTATGTGGAAACT
GGGGACATTGCCTCCAGCTCTGATT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2FW90JQ 787 0 0
ATAGTGATTCAGAGAGATCTATCTCCTCTTTGGGATATTGATCTTCACGGGAAGGTAAAT
GGAGCTGTGGAGACTTGTAGAGGAGAAGACGAATGGGTTATGTCAAAGCGTCTCAGGAAC
TACTTCAACTTCTCTCACCCTCTCATAGCAAAGCATTTGGATCCGGAAGAATGTGCTTGG
GCTTATGGAATGAATATCTTTGATCTACGGACTTGGAGGAAGACAGATATCAGAGAAACG
TATCATTCTTGGCTAAAAGCGAATCTGAAGTCGAATCTAACTATGTGGAAACTGGGGACA
TTGCCTCCAGCTCTGATTGCGTTTAAAGGTCATGTTCAGGCAATAGATTCGTCTTGGCAT
ATGCTTGGATTAGGATACCAGAGCAATACCAACATAGAAAATGTGAAGAAAGCTGCAGTG
ATCCACTACAATGGCCAATCAAAGCCGTGGCTGGAGATAGGTTTTGAGCATCTGAGGCCG
TTCTGGACAAAATATGTGAACTACTCCAATGATTTCATTAGGAATTGTCATATCTTGGAA
TGGCAAACGGGAAGCTTTCAGGTAATCTTGAAGAAGAGAAGTGGAGATTTGGCAGGGGGG
GTTTCTGGAGATATACATTGGACTTTTTGCTGGAAGATGAAACTAGTTACAGAGCTCTGC
AGCAGAAAAGATTGATTCTTCTGTAGAGATAGAAGAGGTACCCTTTTGTTGAGATTCTTT
TGACACAGCAGAAGAAATTGGATTTTTTTTTTGGTCATGATCAGACAACAACACCAAACT
CTGTTAC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL5740Contig1 821 2 4 U
GGAACACTAGATCGGAATTTCACGCAGAGAAACACATTCTCTCTCGGTTCGGAAACGCAT
CCCATCTCTCTCTCTCCGGTTGTATTCCAGCTGCATCGACCAAATCTCATAAACTTACCA
AAGAGATAACCTCTCATCATCCAACATGTTCAAGAAGTTTTCAATGGAGGAGGTTTCATC
GCAAAACCAAGTAAAGGCTTCTGTCCAACGTAGGATTCGCCAGAGTATTCAAGAAGAGTA
CCCGGGACTTGAAACGGTGTTGGAGGATCTACTTCCCAAAAAGTCTCCTCTCATTGTAGT
CAAGTGCCCAAACCATCTGACACTAGTTGCTGTCAACAATGTCCCTCTCTTCTTCTGTAT
CCGTGATGGGCCATACATGCCAACTCTGCGTCTTCTTCATCAGTACCCAAATATAATGAA
GAGGTTTCAAGTTGATAGAGGTGCCATAAAGTTTGTTTTCTCTGGTGCAAACATAATGTG
TCCTGGTCTCACATCCCCTGGAGGCGTTCTGGATGAAGAAGTTGAGGCAGAAAGGCCTGT
GGCTATATATGCAGAAGGAAAGCAGCATGCCTTAGCAATAGGCTTCACCAAAATGTCAGC
CAAGGACATTAAGAGCATCAACAAAGGAATCGGAGTGGACAACATGCATTACCTCAACGA
TGGTCTCTGGAAGATGGAACGACTAGATTGAGGAACGAAGTCCAATGTCGTGTGAATCAC
TCTGGAGGAGATCTCCTTTTTTATGTGTCTCTAAACTTGTGGAGCTTTTGTCCGGATCTC
AATCGTGGCTTCTGTTTTTTCAAAATATTTGATGTTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV80TF U 1
AF RR2GU01TF U 300
BS 1 468 RR2DV80TF
BS 469 469 RR2GU01TF
BS 470 560 RR2DV80TF
BS 561 821 RR2GU01TF

RD RR2DV80TF 560 0 0
GGAACACTAGATCGGAATTTCACGCAGAGAAACACATTCTCTCTCGGTTCGGAAACGCAT
CCCATCTCTCTCTCTCCGGTTGTATTCCAGCTGCATCGACCAAATCTCATAAACTTACCA
AAGAGATAACCTCTCATCATCCAACATGTTCAAGAAGTTTTCAATGGAGGAGGTTTCATC
GCAAAACCAAGTAAAGGCTTCTGTCCAACGTAGGATTCGCCAGAGTATTCAAGAAGAGTA
CCCGGGACTTGAAACGGTGTTGGAGGATCTACTTCCCAAAAAGTCTCCTCTCATTGTAGT
CAAGTGCCCAAACCATCTGACACTAGTTGCTGTCAACAATGTCCCTCTCTTCTTCTGTAT
CCGTGATGGGCCATACATGCCAACTCTGCGTCTTCTTCATCAGTACCCAAATATAATGAA
GAGGTTTCAAGTTGATAGAGGTGCCATAAAGTTTGTTTTCTCTGGTGCCAACATAATGTG
TCCTGGTCTCACATCCCCTGGAGGCGTTCTGGATGAAGAAGTTGAGGCAGAAAGGCCTGT
GGCTATATATGCAGAAGGAA

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2GU01TF 522 0 0
G
CAAGTGCCCAAACCATCTGACGCTAGTTGTTGTCAACAATGTCCCTCTCTTCTTCTGTAT
CCGTGATGGGCCATACATGCCAACTCTGCGTCTTCTTCATCAGTACCCAAATATAATGAA
GAGGTTTCAAGTTGATAGAGGTGCCATAAAGTTTGTTTTCTCTGGTGCAAACATAATGTG
TCCTGGTCTCACATCCCCTGGAGGTGTTCTGGATGAAGAAGTTGAGGCAGAAAGGCCTGT
GGCTATATATGCAGAAGGAAAGCAGCATGCCTTAGCAATAGGCTTCACCAAAATGTCAGC
CAAGGACATTAAGAGCATCAACAAAGGAATCGGAGTGGACAACATGCATTACCTCAACGA
TGGTCTCTGGAAGATGGAACGACTAGATTGAGGAACGAAGTCCAATGTCGTGTGAATCAC
TCTGGAGGAGATCTCCTTTTTTATGTGTCTCTAAACTTGTGGAGCTTTTGTCCGGATCTC
AATCGTGGCTTCTGTTTTTTCAAAATATTTGATGTTTTGTT

QA 2 522 2 522
DS 



AS 1 2

CO CL5741Contig1 730 2 2 U
GGCAAGAAGCCGAGAAAGATCCTTTGGAACATAAAAAAAATGTACTTCGCATCTACGGGT
TCTTCACGACAATATCTTTTACCAAACTTTTTTAGTTTTGGGCACAGTTTCAGACCCAGA
CACAATATTAACTTCATTCGTCCGAACTCAATCTGTTGCAAAGCTCCACACCACGACGAG
GAAGCTGATTCTTCCCGGAAAAATGAGAATAAGCTGGCGAAATTGGCAATCGCGACGTTA
GCGGTTAGCGTTTTGGCTTTGGGATCCGTTGGAGATGCATCTGCTGCTAAGGGCGGTGGA
AGGATCGGCGGTCAAGCGTTTCGATCTTCAGCTCCTCGGCCTCCACCTAGAGTTAACAGC
CGATCGAGGACCAACATCTACGTGAATCCTCCCGTTGCACCACCTTTGATCGGTGGCTAT
GGATATGGATACGGCGGTTGGGGATGGTCACCGTTTTCCTTCTTTGCCCCTGGTCCTGCG
GTGGCAGTTGGTGTGGGAGGTGGCTTCGATCTCCTCGTTCTCTTCATTTTCTTGGAGCTG
CTTCAGCCGTCGCTAGAAACTTTTTTCGATCAAGAAATGAAGAAGACTACGAAGATTACT
ATTAGGGTCGGAAAGAATAAAAACAAAGTTGCTTGTGTATATGTTGTGTTATTATAACAT
AGTCAAATATATATATATTGTGTCACGAAAATTACGATGGAAGAAGACTCAAATAAATAC
TTGATGGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU12TF U 1
AF RR2DU12JQ C 289
BS 1 601 RR2DU12TF
BS 602 730 RR2DU12JQ

RD RR2DU12TF 601 0 0
GGCAAGAAGCCGAGAAAGATCCTTTGGAACATAAAAAAAATGTACTTCGCATCTACGGGT
TCTTCACGACAATATCTTTTACCAAACTTTTTTAGTTTTGGGCACAGTTTCAGACCCAGA
CACAATATTAACTTCATTCGTCCGAACTCAATCTGTTGCAAAGCTCCACACCACGACGAG
GAAGCTGATTCTTCCCGGAAAAATGAGAATAAGCTGGCGAAATTGGCAATCGCGACGTTA
GCGGTTAGCGTTTTGGCTTTGGGATCCGTTGGAGATGCATCTGCTGCTAAGGGCGGTGGA
AGGATCGGCGGTCAAGCGTTTCGATCTTCAGCTCCTCGGCCTCCACCTAGAGTTAACAGC
CGATCGAGGACCAACATCTACGTGAATCCTCCCGTTGCACCACCTTTGATCGGTGGCTAT
GGATATGGATACGGCGGTTGGGGATGGTCACCGTTTTCCTTCTTTGCCCCTGGTCCTGCG
GTGGCAGTTGGTGTGGGAGGTGGCTTCGATCTCCTCGTTCTCTTCATTTTCTTGGAGCTG
CTTCAGCCGTCGCTAGAAACTTTTTTCGATCAAGAAATGAAGAAGACTACGAAGATTACT
A

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2DU12JQ 442 0 0
AAGGGCGGTGGAAGGATCGGCGGTCAAGCGTTTCGATCTTCAGCTCCTCGGCCTCCACCT
AGAGTTAACAGCCGATCGAGGACCAACATCTACGTGAATCCTCCCGTTGCACCACCTTTG
ATCGGTGGCTATGGATATGGATACGGCGGTTGGGGATGGTCACCGTTTTCCTTCTTTGCC
CCTGGTCCTGCGGTGGCAGTTGGTGTGGGAGGTGGCTTCGATCTCCTCGTTCTCTTCATT
TTCTTGGAGCTGCTTCAGCCGTCGCTAGAAACTTTTTTCGATCAAGAAATGAAGAAGACT
ACGAAGATTACTATTAGGGTCGGAAAGAATAAAAACAAAGTTGCTTGTGTATATGTTGTG
TTATTATAACATAGTCAAATATATATATATTGTGTCACGAAAATTACGATGGAAGAAGAC
TCAAATAAATACTTGATGGTCT

QA 1 442 1 442
DS 



AS 1 2

CO CL5742Contig1 903 2 2 U
TTTTTTCCTTCTGAGACTCTTTCTTCCGAAAATGGCAGAGCCAAGTTTCTATATCGGAGT
CATAGGAAATGTAATCTCCGTTCTCGTCTTCCTCTCACCAGTGGAGACGTTTTGGAAAAT
AGTGAAGCGAAAATCGACCGAAGAGTACAACGCTTGCCGTACATTTGCACGTTGTTAGGA
TCGACGTTATGGACATACTACGGCATCGTCACTCCCGGAGAATATCTTGTCTCCACCGTT
AATGGCTTTGGTTCTCTTGTTGAAATCATCTATGTCTTGCTTTTTCTCATTTATGCCCCT
CGACATCTAAAGTTAAATACAATCGTAGTGGTTGCGTTGTTGAACGTCTTTTTCCCAGTA
GTAGCGATTGCTGCCACGAGAAGTGCGTTTCAGGATGAGAAAATGCGTTCTCAATCGATG
GGGTTCATCTGTGCTGGCCTCAACATTGTAATGTATGGTTCTCCTCTTTCTGCTATGAAA
ACGGTAGTGACGACAAAGAGCGTGAAATACATGCCGTTTTGGTTGTCGTTTTTCCTCTTC
TTAAACGGCGCGATCTGGGCAGTGTATGCTTCACTCCAACACGACGTTTTTCTACTTGTG
CCAAATGGAGTGGGGTTTGTGTTTGGGACAATACAACTCATACTTTATGGAATTTACAGA
AACGCCAAACCGGCCGGTTTAAGCTCAAGTAAGATTGCTGCAGATGAAGAGGAAGGCCTC
ACGTCACGTGCCCCTCTCCTTTCTTAAACCTATTTTATAAAAATATTATAACGTATTTTC
TTTTAGTTTATTGGGGAGTGTTTGTGTTGATTTTTTTTATAAATAAAATCTTTTATCATT
TCTTTGCCATTATTGTGGTGTACGATTTTTTGTGTCCCTTGTTTTTTTGAAGCAAATTAG
ATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2BZ72TF U 1
AF RR2BZ72JQ C 117
BS 1 642 RR2BZ72TF
BS 643 903 RR2BZ72JQ

RD RR2BZ72TF 642 0 0
TTTTTTCCTTCTGAGACTCTTTCTTCCGAAAATGGCAGAGCCAAGTTTCTATATCGGAGT
CATAGGAAATGTAATCTCCGTTCTCGTCTTCCTCTCACCAGTGGAGACGTTTTGGAAAAT
AGTGAAGCGAAAATCGACCGAAGAGTACAACGCTTGCCGTACATTTGCACGTTGTTAGGA
TCGACGTTATGGACATACTACGGCATCGTCACTCCCGGAGAATATCTTGTCTCCACCGTT
AATGGCTTTGGTTCTCTTGTTGAAATCATCTATGTCTTGCTTTTTCTCATTTATGCCCCT
CGACATCTAAAGTTAAATACAATCGTAGTGGTTGCGTTGTTGAACGTCTTTTTCCCAGTA
GTAGCGATTGCTGCCACGAGAAGTGCGTTTCAGGATGAGAAAATGCGTTCTCAATCGATG
GGGTTCATCTGTGCTGGCCTCAACATTGTAATGTATGGTTCTCCTCTTTCTGCTATGAAA
ACGGTAGTGACGACAAAGAGCGTGAAATACATGCCGTTTTGGTTGTCGTTTTTCCTCTTC
TTAAACGGCGCGATCTGGGCAGTGTATGCTTCACTCCAACACGACGTTTTTCTACTTGTG
CCAAATGGAGTGGGGTTTGTGTTTGGGACAATACAACTCATA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2BZ72JQ 787 0 0
AAATAGTGAAGCGAAAATCGACCGAAGAGTACAACGCTTGCCGTACATTTGCACGTTGTT
AGGATCGACGTTATGGACATACTACGGCATCGTCACTCCCGGAGAATATCTTGTCTCCAC
CGTTAATGGCTTTGGTTCTCTTGTTGAAATCATCTATGTCTTGCTTTTTCTCATTTATGC
CCCTCGACATCTAAAGTTAAATACAATCGTAGTGGTTGCGTTGTTGAACGTCTTTTTCCC
AGTAGTAGCGATTGCTGCCACGAGAAGTGCGTTTCAGGATGAGAAAATGCGTTCTCAATC
GATGGGGTTCATCTGTGCTGGCCTCAACATTGTAATGTATGGTTCTCCTCTTTCTGCTAT
GAAAACGGTAGTGACGACAAAGAGCGTGAAATACATGCCGTTTTGGTTGTCGTTTTTCCT
CTTCTTAAACGGCGCGATCTGGGCAGTGTATGCTTCACTCCAACACGACGTTTTTCTACT
TGTGCCAAATGGAGTGGGGTTTGTGTTTGGGACAATACAACTCATACTTTATGGAATTTA
CAGAAACGCCAAACCGGCCGGTTTAAGCTCAAGTAAGATTGCTGCAGATGAAGAGGAAGG
CCTCACGTCACGTGCCCCTCTCCTTTCTTAAACCTATTTTATAAAAATATTATAACGTAT
TTTCTTTTAGTTTATTGGGGAGTGTTTGTGTTGATTTTTTTTATAAATAAAATCTTTTAT
CATTTCTTTGCCATTATTGTGGTGTACGATTTTTTGTGTCCCTTGTTTTTTTGAAGCAAA
TTAGATC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL5743Contig1 666 2 2 U
GGGTAGAGGTTCTATATTTCTACCTGCCTTTGTTGTTAACCTAAGAGCCATTACACTTTT
CTCGATCTCTCCGTTGGCAAGTCAGTCACCAGATGGAGCTATTCTTCACAGGGTCACCGC
CGAGTAGAGTTTCTAACCCTTTAACCAAAGATTCACTCTTCCGGGACGAGCTTCTCGTAG
TGGCTCCACCTCCTCCGCCGGCTCCACGAGCAACCAAGCTGCCACCACCGGCTTCTCCAA
GGAACGGTGGCGGTTGCGTTAGGGCGACGACTAACTTCGGGAACAATCCTGCGGTTCGTG
TCGTGGGATTTAATTGCCTTGACATGGACAGACGCAACAGTGTTCCGACTCTTGCATAAG
AGTCCCAATAACATGCATATATAAAACAGAGAAGGCTAAAAGACCATTCGAAAGGTTTAG
GAGTTGATGATAATGGATTATGTGGGTTTTTTTGTGGAAAATTTGTAAATATGTGGAAAA
GGGGTAATCAAAAAGATATGTTATATATAAAATTACGATTTGAAGTCCAATTTGGGAGTT
TTGTAAAAGTAAAAAAAGGGGAGAGAGAAGGGTTTGTGAGTGTTAGTGGAAGTAAGAGCA
TCAGTGTTTCTTCCTTATTGTAAAAAAAGGGATGAGTTTTGAAATGGGAAGATATCATTT
TTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR78TF U 1
AF RR2BR78JQ C 305
BS 1 623 RR2BR78TF
BS 624 666 RR2BR78JQ

RD RR2BR78TF 625 0 0
GGGTAGAGGTTCTATATTTCTACCTGCCTTTGTTGTTAACCTAAGAGCCATTACACTTTT
CTCGATCTCTCCGTTGGCAAGTCAGTCACCAGATGGAGCTATTCTTCACAGGGTCACCGC
CGAGTAGAGTTTCTAACCCTTTAACCAAAGATTCACTCTTCCGGGACGAGCTTCTCGTAG
TGGCTCCACCTCCTCCGCCGGCTCCACGAGCAACCAAGCTGCCACCACCGGCTTCTCCAA
GGAACGGTGGCGGTTGCGTTAGGGCGACGACTAACTTCGGGAACAATCCTGCGGTTCGTG
TCGTGGGATTTAATTGCCTTGACATGGACAGACGCAACAGTGTTCCGACTCTTGCATAAG
AGTCCCAATAACATGCATATATAAAACAGAGAAGGCTAAAAGACCATTCGAAAGGTTTAG
GAGTTGATGATAATGGATTATGTGGGTTTTTTTGTGGAAAATTTGTAAATATGTGGAAAA
GGGGTAATCAAAAAGATATGTTATATATAAAATTACGATTTGAAGTCCAATTTGGGAGTT
TTGTAAAAGTAAAAAAAGGGGAGAGAGAAGGGTTTGTGAGTGTTAGTGGAAGTAAGAGCA
TCAGTGTTTCTTCCTTATTGTAA
CA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2BR78JQ 362 0 0
GGGATTTAATTGCCTTGACATGGACAGACGCAACAGTGTTCCGACTCTTGCATAAGAGTC
CCAATAACATGCATATATAAAACAGAGAAGGCTAAAAGACCATTCGAAAGGTTTAGGAGT
TGATGATAATGGATTATGTGGGTTTTTTTGTGGAAAATTTGTAAATATGTGGAAAAGGGG
TAATCAAAAAGATATGTTATATATAAAATTACGATTTGAAGTCCAATTTGGGAGTTTTGT
AAAAGTAAAAAAAGGGGAGAGAGAAGGGTTTGTGAGTGTTAGTGGAAGTAAGAGCATCAG
TGTTTTTTCCTTATTGTAAAAAAAGGGATGAGTTTTGAAATGGGAAGATATCATTTTTAC
TC

QA 1 362 1 362
DS 



AS 1 2

CO CL5744Contig1 1183 2 4 U
GTTTCGAGGTTTTGCCAAGTTTTGGTGGCTGCAACTAAGAAATCATCTATGGAGGCGCCG
TCTAGAGGGAGAGAGGAGATGTATGATGAATATAGACAAGGCAAGAATGCTTCAGGAGAT
ACAGGGAGGAGGATTGTGCACACAGATGAATTCAAGTTCTTGGACAGGGCAGCGTACATC
ACAGCGAGAGATCTTGATGACAAGAAACAAGGCGGAGTGAATCCGTGGAGGCTTTGTCCA
GTGACACAAGTTGAGGAAGTCAAGTGTATTCTTAGACTGATGCCGATTTGGCTCTGCACT
ATCATCTACTCGGTGGTCTTCACTCAGATGGCCTCTCTGTTTGTGGAGCAAGGCGCAGCG
ATGAAGACCACTGTCTCGGATTTCAAAATCCCTCCGGCAAGTATGTCCAGCTTCGACATC
CTTAGCGTCGCCTTGTTCATATTCATATACCGCAGAGTGCTGGAGCCACTAGCCAACAGA
TTCAAGAAGAAGGATGGAACAAAGGGAATCACCGAGCTTCACAGGATGGGCATCGGTCTT
GTGATTGCTATCTTAGCTATGGTTGCAGCTGGGGTTGTTGAATGCTTTAGACTTAAATAC
GCAGACAAGAGTTGCACTCACTGTGATGGCTCGAGCTCACTAAGCATCTTCTGGCAGGTT
CCACAATACTCGCTCATTGGAGCATCAGAAGTGTTCATGTACGTTGGTCAGCTTGAGTTC
TTCAACGCGCAGACACCAGACGGACTAAAGAGCTTCGGGAGCGCTCTGTGCATGATGTCA
ATGTCGATGGGGAACTTTGTGAGTAGCTTGTTGGTGACAATGGTGGTGAAGATCTCTACG
GAGGATCACATGCCTGGTTGGATTCCAAGGAACCTCAACAAAGGTCACTTGGACAGATTC
TATTTCTTGCTAGCTGCATTGACCAGCATTGACCTGGTGGTGTACATTGCATGTGCAAGG
TGGTACAAATGTATAAAACTAGAAGCCAAAGATGAGATGCAAGACATGATGAGTGATGAT
GAAAATGATACCGACAGTGATGACTACGAGGAGCCGATGAAGGATTCTAGAGTCTAACTA
CATGTGTGTTTGGTTTTCGTTTTTTTTTGGTTTTCGGGTGATGTAACAAAACAAAAACTG
ATTGATAAATAAAAAGGCTGAATCGGATTGGTCTTTTTCATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ28TF U 1
AF RR2GZ28JQ C 400
BS 1 657 RR2GZ28TF
BS 658 658 RR2GZ28JQ
BS 659 724 RR2GZ28TF
BS 725 1183 RR2GZ28JQ

RD RR2GZ28TF 730 0 0
GTTTCGAGGTTTTGCCAAGTTTTGGTGGCTGCAACTAAGAAATCATCTATGGAGGCGCCG
TCTAGAGGGAGAGAGGAGATGTATGATGAATATAGACAAGGCAAGAATGCTTCAGGAGAT
ACAGGGAGGAGGATTGTGCACACAGATGAATTCAAGTTCTTGGACAGGGCAGCGTACATC
ACAGCGAGAGATCTTGATGACAAGAAACAAGGCGGAGTGAATCCGTGGAGGCTTTGTCCA
GTGACACAAGTTGAGGAAGTCAAGTGTATTCTTAGACTGATGCCGATTTGGCTCTGCACT
ATCATCTACTCGGTGGTCTTCACTCAGATGGCCTCTCTGTTTGTGGAGCAAGGCGCAGCG
ATGAAGACCACTGTCTCGGATTTCAAAATCCCTCCGGCAAGTATGTCCAGCTTCGACATC
CTTAGCGTCGCCTTGTTCATATTCATATACCGCAGAGTGCTGGAGCCACTAGCCAACAGA
TTCAAGAAGAAGGATGGAACAAAGGGAATCACCGAGCTTCACAGGATGGGCATCGGTCTT
GTGATTGCTATCTTAGCTATGGTTGCAGCTGGGGTTGTTGAATGCTTTAGACTTAAATAC
GCAGACAAGAGTTGCACTCACTGTGATGGCTCGAGCTCACTAAGCATCTTCTGGCAG*TT
CCACAATACTCGCTCATTGGAGCATCAGAAGTGTTCATGTACGTTGGTCAGCTTGAGTTC
TTCA
CGCGCA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2GZ28JQ 784 0 0
AGTATGTCCAGCTTCGACATC*TTAGCGTCGC*TTGTTCATATTCATATACCGCAGAGTG
CTGGAGCCACTAGCCAACAGATTCAAGAAGAAGGATGGAACAAAGGGAATCACCGAGCTT
CACAGGATGGGCATCGGTCTTGTGATTGCTATCTTAGCTATGGTTGCAGCTGGGGTTGTT
GAATGCTTTAGACTTAAATACGCAGACAAGAGTTGCACTCACTGTGATGGCTCGAGCTCA
CTAAGCATCTTCTGGCAGGTTCCACAATACTCGCTCATTGGAGCATCAGAAGTGTTCATG
TACGTTGGTCAGCTTGAGTTCTTCAACGCGCAGACACCAGACGGACTAAAGAGCTTCGGG
AGCGCTCTGTGCATGATGTCAATGTCGATGGGGAACTTTGTGAGTAGCTTGTTGGTGACA
ATGGTGGTGAAGATCTCTACGGAGGATCACATGCCTGGTTGGATTCCAAGGAACCTCAAC
AAAGGTCACTTGGACAGATTCTATTTCTTGCTAGCTGCATTGACCAGCATTGACCTGGTG
GTGTACATTGCATGTGCAAGGTGGTACAAATGTATAAAACTAGAAGCCAAAGATGAGATG
CAAGACATGATGAGTGATGATGAAAATGATACCGACAGTGATGACTACGAGGAGCCGATG
AAGGATTCTAGAGTCTAACTACATGTGTGTTTGGTTTTCGTTTTTTTTTGGTTTTCGGGT
GATGTAACAAAACAAAAACTGATTGATAAATAAAAAGGCTGAATCGGATTGGTCTTTTTC
ATCG

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL5745Contig1 737 2 1 U
GAAACTCTGTATTACCGGTGAATACAGAATCAACCATTGATGCAGATGAAGTTGCTGCAA
TTCGAAGGCAACGACTTAGTGAGATATCTTCATGGTTTGGCCCTCATTCCCTTAACAATC
ACAACAACAGTAGCTCTGTTGCGGCTTCTCAGGCTACGCCAGAACAATCTTTAGGTGTTG
TGAGCTTTGGGGTGTTGCCTACGGAAAACCGTGCAACTAAATGGGCTGTGGAAGGTACTG
GGATTCTACTTGCTACTGGTTTACTCACTGTTACTTTGGTATGGCTCATTGCTCCTCGTG
TTGGAAAGAAAACTGCTAGGAGCGGACTTCATATCCTGCTTGGTGGTCTATGTGCTCTAA
CGATAGTCATCTTCTTCAGATTCGTGGTGCTGACAAGAATCAAGTATGGTCCTGCACGCT
ACTGGGCAATCTTATTCATCTTCTGGTTTCTTGTGTTTGGTATTTGGGCTTCTCGTTCTT
CTCACGGTGACTCTTGACCCATCTTCACCATCCCTCTGCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCT
CCCCTCTAGAGCTCTCCTCTATGCTCACTCTTGTAATCTTCTTTTGGAGAAAAAATGTAC
ATTGTGTCATCATAAAAGAAAAATAAGCTTATGCTCATTGATTATGATGACTATATATAT
ATGATTTATAATGGTCACTGTTGCTTCTACAGTTACTCTGTTGTATCTACTTCGATATCT
TTAGACATTTATTAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F927TF U 1
AF RR2F927JQ C 101
BS 1 737 RR2F927TF

RD RR2F927TF 737 0 0
GAAACTCTGTATTACCGGTGAATACAGAATCAACCATTGATGCAGATGAAGTTGCTGCAA
TTCGAAGGCAACGACTTAGTGAGATATCTTCATGGTTTGGCCCTCATTCCCTTAACAATC
ACAACAACAGTAGCTCTGTTGCGGCTTCTCAGGCTACGCCAGAACAATCTTTAGGTGTTG
TGAGCTTTGGGGTGTTGCCTACGGAAAACCGTGCAACTAAATGGGCTGTGGAAGGTACTG
GGATTCTACTTGCTACTGGTTTACTCACTGTTACTTTGGTATGGCTCATTGCTCCTCGTG
TTGGAAAGAAAACTGCTAGGAGCGGACTTCATATCCTGCTTGGTGGTCTATGTGCTCTAA
CGATAGTCATCTTCTTCAGATTCGTGGTGCTGACAAGAATCAAGTATGGTCCTGCACGCT
ACTGGGCAATCTTATTCATCTTCTGGTTTCTTGTGTTTGGTATTTGGGCTTCTCGTTCTT
CTCACGGTGACTCTTGACCCATCTTCACCATCCCTCTGCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCT
CCCCTCTAGAGCTCTCCTCTATGCTCACTCTTGTAATCTTCTTTTGGAGAAAAAATGTAC
ATTGTGTCATCATAAAAGAAAAATAAGCTTATGCTCATTGATTATGATGACTATATATAT
ATGATTTATAATGGTCACTGTTGCTTCTACAGTTACTCTGTTGTATCTACTTCGATATCT
TTAGACATTTATTAACG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2F927JQ 637 0 0
CCCTCATTCCCTTAACAATCACAACAACAGTAGCTCTGTTGCGGCTTCTCAGGCTACGCC
AGAACAATCTTTAGGTGTTGTGAGCTTTGGGGTGTTGCCTACGGAAAACCGTGCAACTAA
ATGGGCTGTGGAAGGTACTGGGATTCTACTTGCTACTGGTTTACTCACTGTTACTTTGGT
ATGGCTCATTGCTCCTCGTGTTGGAAAGAAAACTGCTAGGAGCGGACTTCATATCCTGCT
TGGTGGTCTATGTGCTCTAACGATAGTCATCTTCTTCAGATTCGTGGTGCTGACAAGAAT
CAAGTATGGTCCTGCACGCTACTGGGCAATCTTATTCATCTTCTGGTTTCTTGTGTTTGG
TATTTGGGCTTCTCGTTCTTCTCACGGTGACTCTTGACCCATCTTCACCATCCCTCTGCT
CTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCCCCTCTAGAGCTCTCCTCTATGCTCACTCTTGTAATCTT
CTTTTGGAGAAAAAATGTACATTGTGTCATCATAAAAGAAAAATAAGCTTATGCTCATTG
ATTATGATGACTATATATATATGATTTATAATGGTCACTGTTGCTTCTACAGTTACTCTG
TTGTATCTACTTCGATATCTTTAGACATTTATTAACG

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL5746Contig1 728 2 2 U
GGAGACAGAAGCTGTCTTTTATCCGAAGAATATAGGGTTTTCATTTCTCGTATAATCCAA
ATCGTCGAAACCCTAATACATCTACATCAGGCTTTAGCATCCTTGTCGAGTTTGCTTCCC
TTGTTTCAACCACGGTTCATGTCAGATTTTGGAGTTCAAGTCCCCACTGCCTTTGATCCG
TTTGCTGATGCAAATGCTGAGGACGCTGGAGCTGGAGCTGGAACAAAGGAATACGTGCAC
ATACGTGTTCAGCAGCGTAATGGTAGAAAAAGCCTGACCACTGTCCAGGGCCTTAAGAAA
GAGTATAGCTATACTAAGATCCTTAAAGACCTTAAGAAAGAGTTCTGCTGCAATGGCACT
GTCGTCCAGGACTCTGAACTAGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGTGATCAGAGGAAGAAT
GTCTCTACTTTCCTTGTTCAGGCTGGTCTTGTGAAGAAGGATAACATCAAGATCCATGGT
TTTTGAGCAAACTCTATATACTTGTTGTTGTTGTTCATCTTTGCACAACGAGTTGAATTT
GCGGAATCAATCATCCCTTCTCAAAGGCAGCACTATAAACAATCACTTATGTATTATTAA
TGCTTTTCTTCTATATATATTGTGTCAGAAAAATTAAATGGTTTGCTTATGAGCGGATAT
AACAAATGTATGAACTTTTCATTTGCGTTTCTAGTGTGAGATCATCAATAAAACTGTGCA
TTGAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E015TF U 1
AF RR2E015JQ C 238
BS 1 552 RR2E015TF
BS 553 728 RR2E015JQ

RD RR2E015TF 552 0 0
GGAGACAGAAGCTGTCTTTTATCCGAAGAATATAGGGTTTTCATTTCTCGTATAATCCAA
ATCGTCGAAACCCTAATACATCTACATCAGGCTTTAGCATCCTTGTCGAGTTTGCTTCCC
TTGTTTCAACCACGGTTCATGTCAGATTTTGGAGTTCAAGTCCCCACTGCCTTTGATCCG
TTTGCTGATGCAAATGCTGAGGACGCTGGAGCTGGAGCTGGAACAAAGGAATACGTGCAC
ATACGTGTTCAGCAGCGTAATGGTAGAAAAAGCCTGACCACTGTCCAGGGCCTTAAGAAA
GAGTATAGCTATACTAAGATCCTTAAAGACCTTAAGAAAGAGTTCTGCTGCAATGGCACT
GTCGTCCAGGACTCTGAACTAGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGTGATCAGAGGAAGAAT
GTCTCTACTTTCCTTGTTCAGGCTGGTCTTGTGAAGAAGGATAACATCAAGATCCATGGT
TTTTGAGCAAACTCTATATACTTGTTGTTGTTGTTCATCTTTGCACAACGAGTTGAATTT
GCGGAATCAATC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2E015JQ 491 0 0
CACATACGTGTTCAGCAGCGTAATGGTAGAAAAAGCCTGACCACTGTCCAGGGCCTTAAG
AAAGAGTATAGCTATACTAAGATCCTTAAAGACCTTAAGAAAGAGTTCTGCTGCAATGGC
ACTGTCGTCCAGGACTCTGAACTAGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGTGATCAGAGGAAG
AATGTCTCTACTTTCCTTGTTCAGGCTGGTCTTGTGAAGAAGGATAACATCAAGATCCAT
GGTTTTTGAGCAAACTCTATATACTTGTTGTTGTTGTTCATCTTTGCACAACGAGTTGAA
TTTGCGGAATCAATCATCCCTTCTCAAAGGCAGCACTATAAACAATCACTTATGTATTAT
TAATGCTTTTCTTCTATATATATTGTGTCAGAAAAATTAAATGGTTTGCTTATGAGCGGA
TATAACAAATGTATGAACTTTTCATTTGCGTTTCTAGTGTGAGATCATCAATAAAACTGT
GCATTGAGTGC

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 2

CO CL5747Contig1 1279 2 6 U
GGATCCCCATTCCAAAAAGAAGACTAAAAACCCCAAAAGATAAAGATGGATCATCGATCA
GGAATGATCCTTTTCCTAGCCCTGGTTGCAATGTCCGTATGGGGTTCGGACGCATCGGCA
CTGGAAAGTATGAAGTTTGACGCGCCGCTTCTAACTGAAAAAATTGCAACAAATAGATCT
ATAATCGTCGATATTGAAGGGAAGGGAGACTACACTTCGGTTCAAAAAGCCATTGATGCT
GTCCCTGCTGGTAACTCTAATTGGATTATCGTCCATGTCCGTAAAGGGATCTACAAGGAG
AGAGTGCACATTCCAGAGAACAGGCCTTTCATATTCATGAGAGGTAACGGAAGAGGAAAG
ACAGTCATCGAATCATCGCAAAGTTCGATCGACAATGTTGCTTCAGCCACTTTCAAAGTC
GAAGCTAATCACTTCGTTGCTTTTGGTATCAGCATCAGGAATGATGCACCGGTCGGACAG
GCGTTCACGTCTGACAATCAATCGGTGGCAGCGTTTGTGGCAGCTGATAAAGTTGCGTTT
TACCATTGTGCGTTCTACAGCTTGCACAACACTTTGTTTGATAACAAAGGTAGACATTAC
TACCACGAGACTTACATCCAAGGCTCCATCGACTTCATCTTCGGTCGTGCAACTTCCATT
TTCAACAATTGTGAGATATTTGTGATATCGGACAAGAGGGTGAAACCGTATGGGTCAATC
ACAGCACACCACAGGGAACACCCAGAGGAAAGCACGGGTTATGTGTTCATAAGAGGCAAA
GTGTACGGAATCGATGAGGTTTACCTAGGCAGAGCCAAAGGACCTTATTCTCGGGTCATC
TTTGCCAAGACTTACTTTTCCAAGACCGTTGTCCCTAGCGGTTGGACCAACTGGAGCTAC
GACGGCTCGACCAAGGATTTATACCATGCGGAGTATAAGTGTCATGGACCAGGCGCTGAG
AGAAAAGGTAGATCAGATTGGGCGAAAGAACTTACCAAACAAGAAGTTGAATCTTTCTTG
TCCATTGATTTCATTGATGGAACTTCTTGGCTCCCTGTTTGGCTTCAGCAAAAGTCTTAG
AGCTCCTTCATCTGTGCGTGTCGTGTTTCCCGTTTGGCTTGGAAAAAGAAAACATATGAA
GAAAGAAGGACCCATTCTTTTTCTTCACTATACATAATAGTTTTCTCTCTCTTTTTGTTC
TACTCTAAAATGATTGTAGACTGATTGGAATATTCTTATGTCGTTTGCACACATTATATA
AGATAATTTCCATTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D538TF U 1
AF RR2D538JQ C 442
BS 1 735 RR2D538TF
BS 736 736 RR2D538JQ
BS 737 747 RR2D538TF
BS 748 748 RR2D538JQ
BS 749 759 RR2D538TF
BS 760 1279 RR2D538JQ

RD RR2D538TF 771 0 0
GGATCCCCATTCCAAAAAGAAGACTAAAAACCCCAAAAGATAAAGATGGATCATCGATCA
GGAATGATCCTTTTCCTAGCCCTGGTTGCAATGTCCGTATGGGGTTCGGACGCATCGGCA
CTGGAAAGTATGAAGTTTGACGCGCCGCTTCTAACTGAAAAAATTGCAACAAATAGATCT
ATAATCGTCGATATTGAAGGGAAGGGAGACTACACTTCGGTTCAAAAAGCCATTGATGCT
GTCCCTGCTGGTAACTCTAATTGGATTATCGTCCATGTCCGTAAAGGGATCTACAAGGAG
AGAGTGCACATTCCAGAGAACAGGCCTTTCATATTCATGAGAGGTAACGGAAGAGGAAAG
ACAGTCATCGAATCATCGCAAAGTTCGATCGACAATGTTGCTTCAGCCACTTTCAAAGTC
GAAGCTAATCACTTCGTTGCTTTTGGTATCAGCATCAGGAATGATGCACCGGTCGGACAG
GCGTTCACGTCTGACAATCAATCGGTGGCAGCGTTTGTGGCAGCTGATAAAGTTGCGTTT
TACCATTGTGCGTTCTACAGCTTGCACAACACTTTGTTTGATAACAAAGGTAGACATTAC
TACCACGAGACTTACATCCAAGGCTCCATCGACTTCATCTTCGGTCGTGCAACTTCCATT
TTCAACAATTGTGAGATATTTGTGATATCGGACAAGAGGGTGAAACCGTATGGGTCAATC
ACAGCACACCACAGG*AACACCCAGAG*AAAGCACGGGT
ATGTGTCATAAG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2D538JQ 838 0 0
TTTGGTATCAGCATCAGGAATGATGCACCGGTCGGACAGGCGTTCACGTCTGACAATCAA
TCGGTGGCAGCGTTTGTGGCAGCTGATAAAGTTGCGTTTTACCATTGTGCGTTCTACAGC
TTGCACAACACTTTGTTTGATAACAAAGGTAGACATTACTACCACGAGACTTACATCCAA
GGCTCCATCGACTTCATCTTCGGTCGTGCAACTTCCATTTTCAACAATTGTGAGATATTT
GTGATATCGGACAAGAGGGTGAAACCGTATGGGTCAATCACAGCACACCACAGGGAACAC
CCAGAGGAAAGCACGGGTTATGTGTTCATAAGAGGCAAAGTGTACGGAATCGATGAGGTT
TACCTAGGCAGAGCCAAAGGACCTTATTCTCGGGTCATCTTTGCCAAGACTTACTTTTCC
AAGACCGTTGTCCCTAGCGGTTGGACCAACTGGAGCTACGACGGCTCGACCAAGGATTTA
TACCATGCGGAGTATAAGTGTCATGGACCAGGCGCTGAGAGAAAAGGTAGATCAGATTGG
GCGAAAGAACTTACCAAACAAGAAGTTGAATCTTTCTTGTCCATTGATTTCATTGATGGA
ACTTCTTGGCTCCCTGTTTGGCTTCAGCAAAAGTCTTAGAGCTCCTTCATCTGTGCGTGT
CGTGTTTCCCGTTTGGCTTGGAAAAAGAAAACATATGAAGAAAGAAGGACCCATTCTTTT
TCTTCACTATACATAATAGTTTTCTCTCTCTTTTTGTTCTACTCTAAAATGATTGTAGAC
TGATTGGAATATTCTTATGTCGTTTGCACACATTATATAAGATAATTTCCATTTTTAT

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 2

CO CL5748Contig1 694 2 2 U
GATCAAATGGAAGCTCTTCAAAGCTTGGAAAAGACTCCACCTCCATTGGTGTTGTCCTCA
AGAACCAAAAGTGTGATAATGATAGCGGCCGAGTGAAGACAATGGAACCAAAGAGGCGAG
GAGGCTTGTTCGTGAAGATCAACATGTATGGTGTTCCCATTGGTCGTAAAGTCGATCTCA
GTGCGCATAATAGCTATGAGCAGTTATCTCTCACGGTTGACAAGCTCTTTAGGGGTCTTC
TTGTAGCTCAAAGAGAATCATTATCATTTGGAGAAGAAGAGAAACCAATCACTGGATTAT
TGGATGGGAATGGAGAATATACTCTTACTTATGAGGACAATGAAGGAGACAAGATGCTTG
TAGGAGATGTCCCATGGCAGATGTTTGTATCTTCGGTGAAGAGGCTGCGTGTGATCAATA
CCTCTGAGATTTCTTCAGCATTAACATATGGAAGATGAGAAGCTGAAGAATGGAACTTTT
ACAGCTTAAAGAAGGAGAGATGTTATTGTTTTGCTTTTGCCTTTTTAACTCTGATGTTCT
TTGAAAAGTGTTTCTAATTCAAGTCTTATGTACATTCTGGTTTGGTACATGTTCTTTTGA
CTTGTGAAAATGTTATAGATGAGTTTAATGGAACTCAAGATCTGACAGTGAAAAAGATGA
ATTTTTGATCTTGGAATATATTACATATTCATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE84TF U 1
AF RR2GE84JQ C 1
BS 1 314 RR2GE84TF
BS 315 694 RR2GE84JQ

RD RR2GE84TF 314 0 0
GATCAAATGGAAGCTCTTCAAAGCTTGGAAAAGACTCCACCTCCATTGGTGTTGTCCTCA
AGAACCAAAAGTGTGATAATGATAGCGGCCGAGTGAAGACAATGGAACCAAAGAGGCGAG
GAGGCTTGTTCGTGAAGATCAACATGTATGGTGTTCCCATTGGTCGTAAAGTCGATCTCA
GTGCGCATAATAGCTATGAGCAGTTATCTCTCACGGTTGACAAGCTCTTTAGGGGTCTTC
TTGTAGCTCAAAGAGAATCATTATCATTTGGAGAAGAAGAGAAACCAATCACTGGATTAT
TGGATGGGAATGGA

QA 1 314 1 314
DS 

RD RR2GE84JQ 694 0 0
GATCAAATGGAAGCTCTTCAAAGCTTGGAAAAGACTCCACCTCCATTGGTGTTGTCCTCA
AGAACCAAAAGTGTGATAATGATAGCGGCCGAGTGAAGACAATGGAACCAAAGAGGCGAG
GAGGCTTGTTCGTGAAGATCAACATGTATGGTGTTCCCATTGGTCGTAAAGTCGATCTCA
GTGCGCATAATAGCTATGAGCAGTTATCTCTCACGGTTGACAAGCTCTTTAGGGGTCTTC
TTGTAGCTCAAAGAGAATCATTATCATTTGGAGAAGAAGAGAAACCAATCACTGGATTAT
TGGATGGGAATGGAGAATATACTCTTACTTATGAGGACAATGAAGGAGACAAGATGCTTG
TAGGAGATGTCCCATGGCAGATGTTTGTATCTTCGGTGAAGAGGCTGCGTGTGATCAATA
CCTCTGAGATTTCTTCAGCATTAACATATGGAAGATGAGAAGCTGAAGAATGGAACTTTT
ACAGCTTAAAGAAGGAGAGATGTTATTGTTTTGCTTTTGCCTTTTTAACTCTGATGTTCT
TTGAAAAGTGTTTCTAATTCAAGTCTTATGTACATTCTGGTTTGGTACATGTTCTTTTGA
CTTGTGAAAATGTTATAGATGAGTTTAATGGAACTCAAGATCTGACAGTGAAAAAGATGA
ATTTTTGATCTTGGAATATATTACATATTCATTT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL5749Contig1 1015 2 2 U
GGCACGTCATCATCCACAACGTCCACATCTACGACTGCAAACCCTCCGGCGGCGCCGTCA
TCGCCGCGACTCCGACTAAGTCCGGTCGGCGAGGCAGGTCCGACGGCGACGGGATCTCCA
TCTTCGGGTCCCAGAAGATCTGGATCGACCACTGCTCCATGAGCCACTGCACCGACGGGC
TCATCGACGCGGTGATGGGGTCCACCGCGATCACGATATCGAACAACTACTTCGCGCACC
ACGACGAGGTGATGCTGTTGGGTCATGACGACAGTTACGGTCCGGACACGGGGATGCAGG
TGACGATCGCGTTTAATCATTTCGGACAGGGGCTTGTTCAGAGGATGCCGAGGTGTCGGA
GAGGGTATATACACGTGGTGAATAATGATTTTACTTCGTGGAAGATGTATGCGATTGGTG
GTAGTGGTAATCCCACGATTAATAGTCAAGGGAATCGTTACATTGCTCCTTCTGATCCTA
GCGCCAAAGAGGTGACGAAGCGGGTGGATTCAAAGGACGATGGAGAGTGGTCGAATTGGA
ATTGGAGAACGGAAGGAGATCTGATGGAGAACGGAGCTTTCTTTGTGGCGTCTGGTGGAG
GAGTGAGCGCATTGTACTCTAAAGCTTCCAGTGTGGAGCCTAAAGCTTCCGCTCTTGTAG
ACCAACTCACTCGAAACGCTGGCGTTTTTGGCGGTCCCAGGGATGATCAAGGTCAGAGTG
GCGATTCTTATTCTGGTTATGGAGGTGGAGGTGGTGGTGTTGGTGGTGGTGGTGGTGAAG
GCGGAAGCAGCGGCAGCAATGGAGGAACCAGTGCTATTGGCGGAACAACGAGAGGATGTA
GTACCGGCAGCAGCGATGACAACAATGTCTTCGGGATGATCTTCGGAAGCAATGCACCGC
CTCGACCACGTTTAACGTGTGTGTTTTCTTTGATAATGATTTGTGTTTTGTCATTATCAA
CTCTATTATTGTTGTAGTCCGCAAGGATAACTAATAGGATTTGGACCCTTCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E964TF U 1
AF RR2E964JQ C 283
BS 1 596 RR2E964TF
BS 597 1015 RR2E964JQ

RD RR2E964TF 596 0 0
GGCACGTCATCATCCACAACGTCCACATCTACGACTGCAAACCCTCCGGCGGCGCCGTCA
TCGCCGCGACTCCGACTAAGTCCGGTCGGCGAGGCAGGTCCGACGGCGACGGGATCTCCA
TCTTCGGGTCCCAGAAGATCTGGATCGACCACTGCTCCATGAGCCACTGCACCGACGGGC
TCATCGACGCGGTGATGGGGTCCACCGCGATCACGATATCGAACAACTACTTCGCGCACC
ACGACGAGGTGATGCTGTTGGGTCATGACGACAGTTACGGTCCGGACACGGGGATGCAGG
TGACGATCGCGTTTAATCATTTCGGACAGGGGCTTGTTCAGAGGATGCCGAGGTGTCGGA
GAGGGTATATACACGTGGTGAATAATGATTTTACTTCGTGGAAGATGTATGCGATTGGTG
GTAGTGGTAATCCCACGATTAATAGTCAAGGGAATCGTTACATTGCTCCTTCTGATCCTA
GCGCCAAAGAGGTGACGAAGCGGGTGGATTCAAAGGACGATGGAGAGTGGTCGAATTGGA
ATTGGAGAACGGAAGGAGATCTGATGGAGAACGGAGCTTTCTTTGTGGCGTCTGGT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2E964JQ 733 0 0
CGGACACGGGGATGCAGGTGACGATCGCGTTTAATCATTTCGGACAGGGGCTTGTTCAGA
GGATGCCGAGGTGTCGGAGAGGGTATATACACGTGGTGAATAATGATTTTACTTCGTGGA
AGATGTATGCGATTGGTGGTAGTGGTAATCCCACGATTAATAGTCAAGGGAATCGTTACA
TTGCTCCTTCTGATCCTAGCGCCAAAGAGGTGACGAAGCGGGTGGATTCAAAGGACGATG
GAGAGTGGTCGAATTGGAATTGGAGAACGGAAGGAGATCTGATGGAGAACGGAGCTTTCT
TTGTGGCGTCTGGTGGAGGAGTGAGCGCATTGTACTCTAAAGCTTCCAGTGTGGAGCCTA
AAGCTTCCGCTCTTGTAGACCAACTCACTCGAAACGCTGGCGTTTTTGGCGGTCCCAGGG
ATGATCAAGGTCAGAGTGGCGATTCTTATTCTGGTTATGGAGGTGGAGGTGGTGGTGTTG
GTGGTGGTGGTGGTGAAGGCGGAAGCAGCGGCAGCAATGGAGGAACCAGTGCTATTGGCG
GAACAACGAGAGGATGTAGTACCGGCAGCAGCGATGACAACAATGTCTTCGGGATGATCT
TCGGAAGCAATGCACCGCCTCGACCACGTTTAACGTGTGTGTTTTCTTTGATAATGATTT
GTGTTTTGTCATTATCAACTCTATTATTGTTGTAGTCCGCAAGGATAACTAATAGGATTT
GGACCCTTCAATT

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL5750Contig1 773 2 4 U
GGACACATTCACTTTTAAAGCCCAAAAGCCTAAGAGACAATTTGCAAATTAGCGGAAGAT
TCAAAAATGGCCAGGATCCTTGAGAAAACCGTGGAGCTAAAATCTTCGCCCGAGAAGTTC
TTTGACATGATTGTCGGGAAACAACACCAAGTCTCTAGTGTATGTCCGTCCCTCATTCAA
GGCTTTGAGCTGCGCGAAGGCGAAATGGGCAAAGCTGGTTCTATCGTACTCTGGAGATAC
GTTCAGGATGGGGAGGAAAAAATGATGATGGAGATGGTGGACTCAGTAGATCTGGAGAAC
AACAAGGTCACGATGAAGGTGTTAGATGGTGATTTAATGAAAGAGTACACTCATTTCTTG
ATCACCTTACAAGTGACCTCAAAGGAGGGACATCAAGTGATCTCAAAGGAGGGACATGTT
GGAAGTGTTGCACATTGGCACTTTAAATACGTGAAAATTAACAAGAAGGTGGCTGACCCC
GAGTCTCTCCTCCAATTTGCCGTCGAGGTATCCAAAATGATCGATGAACATCTCTTTTCC
AGGGAATAGAGGAAATATCTCTTGTATCAATCATACTTTATATCGATGTTCATATTTGTG
TGTTTGCCTTAAGTTCAGTCTTTAATAAAAGTGCTGTAAGATAAGGACTAAGGAGCCGCC
TTGTCCGAGTTTCTGAAAGCGTTGTGTGTTATGATTGTGTGGAAGTTATTACTTAGGCTA
CTCGATACTTATGTATGAAATGTTTGATAATAATAAAAGCCTATGTTTATACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ16TF U 1
AF RR2DQ16JQ C 35
BS 1 276 RR2DQ16TF
BS 277 277 RR2DQ16JQ
BS 278 317 RR2DQ16TF
BS 318 773 RR2DQ16JQ

RD RR2DQ16TF 317 0 0
GGACACATTCACTTTTAAAGCCCAAAAGCCTAAGAGACAATTTGCAAATTAGCGGAAGAT
TCAAAAATGGCCAGGATCCTTGAGAAAACCGTGGAGCTAAAATCTTCGCCCGAGAAGTTC
TTTGACATGATTGTCGGGAAACAACACCAAGTCTCTAGTGTATGTCCGTCCCTCATTCAA
GGCTTTGAGCTGCGCGAAGGCGAAATGGGCAAAGCTGGTTCTATCGTACTCTGGAGATAC
GTTCAGGATGGGGAGGAAAAAATGATGATGGAGATG*TGGACTCAGTAGATCTGGAGAAC
AACAAGGTCACGATGAA

QA 1 317 1 317
DS 

RD RR2DQ16JQ 739 0 0
AGACAATTTGCAAATTAGCGGAAGATTCAAAAATGGCCAGGATCCTTGAGAAAACCGTGG
AGCTAAAATCTTCGCCCGAGAAGTTCTTTGACATGATTGTCGGGAAACAACACCAAGTCT
CTAGTGTATGTCCGTCCCTCATTCAAGGCTTTGAGCTGCGCGAAGGCGAAATGGGCAAAG
CTGGTTCTATCGTACTCTGGAGATACGTTCAGGATGGGGAGGAAAAAATGATGATGGAGA
TGGTGGACTCAGTAGATCTGGAGAACAACAAGGTCACGATGAAGGTGTTAGATGGTGATT
TAATGAAAGAGTACACTCATTTCTTGATCACCTTACAAGTGACCTCAAAGGAGGGACATC
AAGTGATCTCAAAGGAGGGACATGTTGGAAGTGTTGCACATTGGCACTTTAAATACGTGA
AAATTAACAAGAAGGTGGCTGACCCCGAGTCTCTCCTCCAATTTGCCGTCGAGGTATCCA
AAATGATCGATGAACATCTCTTTTCCAGGGAATAGAGGAAATATCTCTTGTATCAATCAT
ACTTTATATCGATGTTCATATTTGTGTGTTTGCCTTAAGTTCAGTCTTTAATAAAAGTGC
TGTAAGATAAGGACTAAGGAGCCGCCTTGTCCGAGTTTCTGAAAGCGTTGTGTGTTATGA
TTGTGTGGAAGTTATTACTTAGGCTACTCGATACTTATGTATGAAATGTTTGATAATAAT
AAAAGCCTATGTTTATACG

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL5751Contig1 753 2 2 U
GAGACTGTGTGACTTAAGTGTGGGGGAGGTACCAAGTTGCTGATCTTTTATATGTTTTGG
TGTTTTTAATCGAGTCTTGCATTTAGCATTAAAAAAAAAAAACATTTGAAAAATTTGAAA
AAAAAAAAAAAATCATTTAGTTTGCATCATTTGCACTTTTAGGAGAGTCTAGAGCATATA
GGTTGCATTCATTTGCATTGGGAGCAATGATTTAATCGCCTTGTAGAGAGCACTGTCTAG
CCTCGTATAGTTCATGCACCTCTCTTGAAAACCTTGTAAGCTTCGTGCCTTGAAAGCTCT
CCCTGAAACTCAATCTCTTAACCCAACTACAACCTTAAATGAACTGAATGAACTTAATTT
CTTGCTCATAGTCCCTTGTGTGCTAAGTCATGGATATACACACTAGAGTTGTCGCGCCTT
TTATGCCGATCTTTTTGACAATCTCTAGTGGCAGTCCTCTCCCTAAAACCCTCTCCTCCT
TTTAAGCCTTCATTGATTGTTGAGTGAGGCCTTTTTCGGAAAGTTTTACATGTGCATAAT
CTTGAGAGTATTGGGAACGACAATGCTCAGTTTTCATTCTTGTTAGATTGGATACACTAT
TGTCTAGCTATAGGTGGGGGGGGGGGGGTGAGTGTTGTGAAGTTTGACTTGGGAATTTGA
AGGTTGAAAGAAAATGATTGAACTCTTGTGCTTAATTGTCTCTTTGGAAATTGTATAAAA
CCTCTAGCTCAAATTGTGAAAGTCTTGGCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV96TF U 1
AF RR2AV96JQ C 119
BS 1 453 RR2AV96TF
BS 454 753 RR2AV96JQ

RD RR2AV96TF 453 0 0
GAGACTGTGTGACTTAAGTGTGGGGGAGGTACCAAGTTGCTGATCTTTTATATGTTTTGG
TGTTTTTAATCGAGTCTTGCATTTAGCATTAAAAAAAAAAAACATTTGAAAAATTTGAAA
AAAAAAAAAAAATCATTTAGTTTGCATCATTTGCACTTTTAGGAGAGTCTAGAGCATATA
GGTTGCATTCATTTGCATTGGGAGCAATGATTTAATCGCCTTGTAGAGAGCACTGTCTAG
CCTCGTATAGTTCATGCACCTCTCTTGAAAACCTTGTAAGCTTCGTGCCTTGAAAGCTCT
CCCTGAAACTCAATCTCTTAACCCAACTACAACCTTAAATGAACTGAATGAACTTAATTT
CTTGCTCATAGTCCCTTGTGTGCTAAGTCATGGATATACACACTAGAGTTGTCGCGCCTT
TTATGCCGATCTTTTTGACAATCTCTAGTGGCA

QA 1 453 1 453
DS 

RD RR2AV96JQ 635 0 0
AAAAAAAAAAAAAATCATTTAGTTTGCATCATTTGCACTTTTAGGAGAGTCTAGAGCATA
TAGGTTGCATTCATTTGCATTGGGAGCAATGATTTAATCGCCTTGTAGAGAGCACTGTCT
AGCCTCGTATAGTTCATGCACCTCTCTTGAAAACCTTGTAAGCTTCGTGCCTTGAAAGCT
CTCCCTGAAACTCAATTTCTTAACCCAACTACAACCTTAAATGAACTGAATGAACTTAAT
TTTTTGCTCATAGTCCCTTGTGTGCTAAGTCATGGATATACACACTAGAGTTGTCGCGCC
TTTTATGCCGATCTTTTTGACAATTTTTAGTGGCAGTCCTCTCCCTAAAACCCTCTCCTC
CTTTTAAGCCTTCATTGATTGTTGAGTGAGGCCTTTTTCGGAAAGTTTTACATGTGCATA
ATCTTGAGAGTATTGGGAACGACAATGCTCAGTTTTCATTCTTGTTAGATTGGATACACT
ATTGTCTAGCTATAGGTGGGGGGGGGGGGGTGAGTGTTGTGAAGTTTGACTTGGGAATTT
GAAGGTTGAAAGAAAATGATTGAACTCTTGTGCTTAATTGTCTCTTTGGAAATTGTATAA
AACCTCTAGCTCAAATTGTGAAAGTCTTGGCCCCC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL5752Contig1 925 2 6 U
GGATCTTCTTCATTAAGTTTAAAATACCCTTCAACGTCTTTTCATTCTTCATCTAAAACA
ATGGCAGGAGTTGCCTTTGGTTCTTTTGATGATTCTTTCAGCTTGGCTTCTCTACGAGCT
TACCTTGCTGAGTTCATCTCCACTTTACTATTTGTCTTCGCTGGTATCGGCTCAGCCATT
GCCTACGCGAAACTAACGTCTGATGCGGCTCTTGATACGCCGGGACTTGTCGCCATCGCT
GTGTGCCATGGTTTCGCCCTCTTCGTGGCGGTTGCAATCGGAGCCAATATCTCCGGTGGC
CATGTGAACCCAGCCGTTACTTTTGGCCTTGCTCTCGGAGGTCAAATCACACTCATCACC
GGAATTTTCTACTGGATCGCTCAGCTTCTCGGCTCCACCGCCGCTTGCTTCCTTCTTAAG
TTCGTCACCGGTGGCTTGGCGGTTCCAACACACAGCGTTGCGGCTGGAGTAGGAGCCATT
GAAGGAGTAGTGATGGAGATCATCATCACCTTCGCTTTGGTCTACACAGTCTATGCCACC
GCCGCTGATCCCAAGAAAGGTTCGCTTGGAACCATCGCTCCTCTCGCCATTGGTCTCATC
GTTGGTGCCAACATCCTCGCCGCTGGTCCATTCTCAGGTGGATCCATGAACCCAGCACGT
TCCTTTGGACCAGCTGTTGCAGCTGGAGACTTCTCTGGTCACTGGGTCTACTGGGTGGGA
CCACTTATCGGGGGTGGACTCGCTGGACTTGTCTACGGAAATGTCTTCATGCCTTCTTCC
GAACATGTTCCTCTTGTCTCTGAATTCTAAGCAGAAATGTAATGATTCTTGTTTGTTTTC
TTTGTCTCTCCATATGTTACTTTGTTTGGTGTTTGGTTTGGTTTCGTTGTATGAATATCA
TTTAATGAAAGCCTGTTTCATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC69TF U 1
AF RR2EC69JQ C 394
BS 1 637 RR2EC69TF
BS 638 638 RR2EC69JQ
BS 639 670 RR2EC69TF
BS 671 671 RR2EC69JQ
BS 672 721 RR2EC69TF
BS 722 925 RR2EC69JQ

RD RR2EC69TF 722 0 0
GGATCTTCTTCATTAAGTTTAAAATACCCTTCAACGTCTTTTCATTCTTCATCTAAAACA
ATGGCAGGAGTTGCCTTTGGTTCTTTTGATGATTCTTTCAGCTTGGCTTCTCTACGAGCT
TACCTTGCTGAGTTCATCTCCACTTTACTATTTGTCTTCGCTGGTATCGGCTCAGCCATT
GCCTACGCGAAACTAACGTCTGATGCGGCTCTTGATACGCCGGGACTTGTCGCCATCGCT
GTGTGCCATGGTTTCGCCCTCTTCGTGGCGGTTGCAATCGGAGCCAATATCTCCGGTGGC
CATGTGAACCCAGCCGTTACTTTTGGCCTTGCTCTCGGAGGTCAAATCACACTCATCACC
GGAATTTTCTACTGGATCGCTCAGCTTCTCGGCTCCACCGCCGCTTGCTTCCTTCTTAAG
TTCGTCACCGGTGGCTTGGCGGTTCCAACACACAGCGTTGCGGCTGGAGTAGGAGCCATT
GAAGGAGTAGTGATGGAGATCATCATCACCTTCGCTTTGGTCTACACAGTCTATGCCACC
GCCGCTGATCCCAAGAAAGGTTCGCTTGGAACCATCGCTCCTCTCGCCATTGGTCTCATC
GTTGGTGCCAACATCCTCGCCGCTGGTCCATTCTCAG*TGGATCCATGAACCCAGCACGT
TCCTTTGGAC*AGCTGTTGCAGCTGGAGACTTCTCTGGTCACTGGGTCTACTGGGTGGGA
C
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2EC69JQ 532 0 0
TCCACCGCCGCTTGCTTCCTTCTTAAGTTCGTCACCGGTGGCTTGGCGGTTCCAACACAC
AGCGTTGCGGCTGGAGTAGGAGCCATTGAAGGAGTAGTGATGGAGATCATCATCACCTTC
GCTTTGGTCTACACAGTCTATGCCACCGCCGCTGATCCCAAGAAAGGTTCGCTTGGAACC
ATCGCTCCTCTCGCCATTGGTCTCATCGTTGGTGCCAACATCCTCGCCGCTGGTCCATTC
TCAGGTGGATCCATGAACCCAGCACGTTCCTTTGGACCAGCTGTTGCAGCTGGAGACTTC
TCTGGTCACTGGGTCTACTGGGTGGGACCACTTATCGGGGGTGGACTCGCTGGACTTGTC
TACGGAAATGTCTTCATGCCTTCTTCCGAACATGTTCCTCTTGTCTCTGAATTCTAAGCA
GAAATGTAATGATTCTTGTTTGTTTTCTTTGTCTCTCCATATGTTACTTTGTTTGGTGTT
TGGTTTGGTTTCGTTGTATGAATATCATTTAATGAAAGCCTGTTTCATTATC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL5753Contig1 1152 2 2 U
GGACACACAAAATAAAATGGCAAGAATCATAATTACACTCTCTACTCCTCTGTTTTTCTT
CTTCCTCTTTCTCTTCTCTCTGCTCTCTCACCAAACCATGTCTCAACCTGAACACTTGAC
TACTTTCTGCAACCCTTCCGACAACTTCACTCAAACCAGTTCATACGAAGCAAACCGAGA
CCTTCTACTCTCCTCTCTCCGCGTCAGTTCCTCCCTCGGAACCTATTCAAACGCCACAGT
CGGTCGTAGTACCAACACAGTCCACGGCATGTTCCTCTGCAGAGGAGACACCACCGCGAC
GTCTTGCTCAGACTGCGTCCAGACCGCTACAATCGAGATCGCTACAAACTGTACTCTTAA
CAAAGAAGCGGTCATATACTACGAAGAGTGCATGGTTCGGTACTCTAATGTATCCTTCTT
CTCTGTTCTTGAGGTCAGACCGAGCATCGTCCTTTACTCTCTTCGCTCTGCTCCAAACTC
GAATACGTTCAATGAAACGTTAGCTGATAAATTCAACCAACTGATTCTCAACGTATCTTC
GTCCTCTTTGGTTCCGTATTTCGTGGAAGATCAAGAACTTGTGACTCAAGAAGAGGGTTC
TTATCAGTTTGAGTCAATGGCTCAGTGTAGTCCTGGTCTTGACCGGTTTAACTGTACCGT
TTGTCTCAGATTTGCGCTCTTAAGAGTTTCAACTTGTTGCGGTTCACCAAGCTCGGCTCT
GATCTTTACTCCTAAATGTCTTTTGAGGTATCAAACCTCTGTTCTGTCGTCGCCGCCACC
GTTGCCTCCATCCTCTCCACCTCCTCTATCGTTGCCGCCGCCTCCACCGTCACCGGCTCT
ATTTTTACCGCCTCCTGGTTTATCGCAACCGCCACCACCGCCGCTGGTTTTCACGCGGCC
ACAGAGCAGCGGGTCGTTTTCTAACGTTATTAAAGGAAACCAAATATTTGGGAGAATTGC
TATGACGATGGCAGTTTTGGTGTTTGCACTTGTGAATTTGTGAACACATTTGATGATTTT
GGATTGAAATAATTTGTATTTCCTTTTATATTTGTCATGTGTTGTCAAGATCAAAAGCCA
CAAAGGATGTGAATAATTCAAACAGTGTTTCTCTTTTGAACATTTAACCATGTTGATTTT
GAACAAGAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E938TF U 1
AF RR2E938JQ C 418
BS 1 737 RR2E938TF
BS 738 1152 RR2E938JQ

RD RR2E938TF 737 0 0
GGACACACAAAATAAAATGGCAAGAATCATAATTACACTCTCTACTCCTCTGTTTTTCTT
CTTCCTCTTTCTCTTCTCTCTGCTCTCTCACCAAACCATGTCTCAACCTGAACACTTGAC
TACTTTCTGCAACCCTTCCGACAACTTCACTCAAACCAGTTCATACGAAGCAAACCGAGA
CCTTCTACTCTCCTCTCTCCGCGTCAGTTCCTCCCTCGGAACCTATTCAAACGCCACAGT
CGGTCGTAGTACCAACACAGTCCACGGCATGTTCCTCTGCAGAGGAGACACCACCGCGAC
GTCTTGCTCAGACTGCGTCCAGACCGCTACAATCGAGATCGCTACAAACTGTACTCTTAA
CAAAGAAGCGGTCATATACTACGAAGAGTGCATGGTTCGGTACTCTAATGTATCCTTCTT
CTCTGTTCTTGAGGTCAGACCGAGCATCGTCCTTTACTCTCTTCGCTCTGCTCCAAACTC
GAATACGTTCAATGAAACGTTAGCTGATAAATTCAACCAACTGATTCTCAACGTATCTTC
GTCCTCTTTGGTTCCGTATTTCGTGGAAGATCAAGAACTTGTGACTCAAGAAGAGGGTTC
TTATCAGTTTGAGTCAATGGCTCAGTGTAGTCCTGGTCTTGACCGGTTTAACTGTACCGT
TTGTCTCAGATTTGCGCTCTTAAGAGTTTCAACTTGTTGCGGTTCACCAAGCTCGGCTCT
GATCTTTACTCCTAAAT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2E938JQ 735 0 0
CTTCTCTGTTCTTGAGGTCAGACCGAGCATCGTCCTTTACTCTCTTCGCTCTGCTCCAAA
CTCGAATACGTTCAATGAAACGTTAGCTGATAAATTCAACCAACTGATTCTCAACGTATC
TTCGTCCTCTTTGGTTCCGTATTTCGTGGAAGATCAAGAACTTGTGACTCAAGAAGAGGG
TTCTTATCAGTTTGAGTCAATGGCTCAGTGTAGTCCTGGTCTTGACCGGTTTAACTGTAC
CGTTTGTCTCAGATTTGCGCTCTTAAGAGTTTCAACTTGTTGCGGTTCACCAAGCTCGGC
TCTGATCTTTACTCCTAAATGTCTTTTGAGGTATCAAACCTCTGTTCTGTCGTCGCCGCC
ACCGTTGCCTCCATCCTCTCCACCTCCTCTATCGTTGCCGCCGCCTCCACCGTCACCGGC
TCTATTTTTACCGCCTCCTGGTTTATCGCAACCGCCACCACCGCCGCTGGTTTTCACGCG
GCCACAGAGCAGCGGGTCGTTTTCTAACGTTATTAAAGGAAACCAAATATTTGGGAGAAT
TGCTATGACGATGGCAGTTTTGGTGTTTGCACTTGTGAATTTGTGAACACATTTGATGAT
TTTGGATTGAAATAATTTGTATTTCCTTTTATATTTGTCATGTGTTGTCAAGATCAAAAG
CCACAAAGGATGTGAATAATTCAAACAGTGTTTCTCTTTTGAACATTTAACCATGTTGAT
TTTGAACAAGAAAGC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL5754Contig1 822 2 6 U
GACTCAAAGCTGTGCATCCTGACTGGTCTCCTGCCATGCTTAAATCAGCTCTCATCACTA
CAGCTTCCACAACGGATCCCCATGGCGAACCAATCTTCTCAGAAGGATTATCACGGAAAC
TAGCTGACCCTTTTGATTTCGGGGGAGGACTAATGAGCCCAGACAAAGCAGCAAACCCTG
GTCTTGTCTATGATGCAGAACCAGAAGACTATAGGCGTTTTATGTGCGCTTCTAATTATG
AGGAGAAGTACACTACCACAATGTCACAGCAAAACGTGCTATATAAATGTCCGAGTCCAA
AGCCATCTATGCTCGATCTCAATTTGCCGTCTATCACCATTCCATTCCTCAAGGAAGATG
TGACTCTCACAAGAACCGTAACCAACGTTGGACCAGTCTACTCCGTATATAGAGTCATCG
TTCAGCCTCCTATGGGTGTCAAAATCTCCGTCACGCCCAAGAGATTGGTCTTTAACTCCA
GAGTTAAGAAACTCAGCTACCAAGTCACTGTCTCCACAACTCACAAAGCCAATTCTATTT
ACTTTTTCGGGAGTTTGACTTGGACTGATGGCATTCACAACGTCGTCATCCCATTATCTA
TCAGGACACAAATGTTGAAGTACTTTGACCAATAAGTTCACTTCACATTTGTTTTCATTA
TCATATAACTCATAATAACATCGAATCAATGCAACTTTGTAAGAACAAGTGCATCAAGTC
CCTTCAGCAAAAAGTGTTGATGTTTTCTCCCACTCTGCTTTAAACAAGTGCATGTTTCTT
GTTGTATTGTTCATTCTGCTTCTACTGTCCAAACGAGTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H738TF U 1
AF RR2H738JQB C 449
BS 1 729 RR2H738TF
BS 730 730 RR2H738JQB
BS 731 764 RR2H738TF
BS 765 766 RR2H738JQB
BS 767 785 RR2H738TF
BS 786 822 RR2H738JQB

RD RR2H738TF 785 0 0
GACTCAAAGCTGTGCATCCTGACTGGTCTCCTGCCATGCTTAAATCAGCTCTCATCACTA
CAGCTTCCACAACGGATCCCCATGGCGAACCAATCTTCTCAGAAGGATTATCACGGAAAC
TAGCTGACCCTTTTGATTTCGGGGGAGGACTAATGAGCCCAGACAAAGCAGCAAACCCTG
GTCTTGTCTATGATGCAGAACCAGAAGACTATAGGCGTTTTATGTGCGCTTCTAATTATG
AGGAGAAGTACACTACCACAATGTCACAGCAAAACGTGCTATATAAATGTCCGAGTCCAA
AGCCATCTATGCTCGATCTCAATTTGCCGTCTATCACCATTCCATTCCTCAAGGAAGATG
TGACTCTCACAAGAACCGTAACCAACGTTGGACCAGTCTACTCCGTATATAGAGTCATCG
TTCAGCCTCCTATGGGTGTCAAAATCTCCGTCACGCCCAAGAGATTGGTCTTTAACTCCA
GAGTTAAGAAACTCAGCTACCAAGTCACTGTCTCCACAACTCACAAAGCCAATTCTATTT
ACTTTTTCGGGAGTTTGACTTGGACTGATGGCATTCACAACGTCGTCATCCCATTATCTA
TCAGGACACAAATGTTGAAGTACTTTGACCAATAAGTTCACTTCACATTTGTTTTCATTA
TCATATAACTCATAATAACATCGAATCAATGCAACTTTGTAAGAACAAGTGCATCAAGTC
CCTTCAGCATAAAGTGTTGATGTTTTCTCCCACTCTGCTTTAAA**AGTGCATGTTTCTT
GTTGT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2H738JQB 374 0 0
CGTCACGCCCAAGAGATTGGTCTTTAACTCCAGAGTTAAGAAACTCAGCTACCAAGTCAC
TGTCTCCACAACTCACAAAGCCAATTCTATTTACTTTTTCGGGAGTTTGACTTGGACTGA
TGGCATTCACAACGTCGTCATCCCATTATCTATCAGGACACAAATGTTGAAGTACTTTGA
CCAATAAGTTCACTTCACATTTGTTTTCATTATCATATAACTCATAATAACATCGAATCA
ATGCAACTTTGTAAGAACAAGTGCATCAAGTCCCTTCAGCAATAAGTGTTGATGTTTTCT
CCCACTCTGCTTTTAACAAGTGCATGTTTCTTGTTGTATTGTTCATTCTGCTTCTACTGT
CCAAACGAGTTTGG

QA 1 374 1 374
DS 



AS 1 2

CO CL5755Contig1 479 2 7 U
GGGCAGCTGCTGAAATCGTCTTCAGTGGAAAAGCTCAGCCTGGGCTCACAGCTACAAATG
TCAACGTAGACGAGGTGAGGATGGTGGTGGACGAGGGTTCTCAAGGATTTGGTTTCTCGA
GGAAGAACGAAGTGATAAATGGCAAAGCAGCAGTGATAGGGTTCTTACTGCTCTTAGATT
TTGAGCTATTGACAAGTAAAGGTCTATTGAAGGGGACAGGGTTCTTGGACTTCCTTTACT
CTGCTTCTGATGCTTTCAAGTAAAGATCAATATACATCTCTTTGGTCTGGTTTTTTGCCT
TACCTCCCTTGTGCAATTTGTGGAAGCGTTATTCAGTAAATGGAGAAACAAACAACATAC
TTTAAGTAACAAAATTCACACCATGTCTTAGTATATGAATCACATTTTATAGAGATGTCT
TGCCTTTGCTTTGTTTGTGTGTTTACCTCTTAATATAAGATATTCTTCGTCTTTCCCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C453TF U 1
AF RR2D064TF U 133
BS 1 194 RR2C453TF
BS 195 195 RR2D064TF
BS 196 348 RR2C453TF
BS 349 349 RR2D064TF
BS 350 354 RR2C453TF
BS 355 355 RR2D064TF
BS 356 479 RR2C453TF

RD RR2C453TF 479 0 0
GGGCAGCTGCTGAAATCGTCTTCAGTGGAAAAGCTCAGCCTGGGCTCACAGCTACAAATG
TCAACGTAGACGAGGTGAGGATGGTGGTGGACGAGGGTTCTCAAGGATTTGGTTTCTCGA
GGAAGAACGAAGTGATAAATGGCAAAGCAGCAGTGATAGGGTTCTTACTGCTCTTAGATT
TTGAGCTATTGACAGGTAAAGGTCTATTGAAGGGGACAGGGTTCTTGGACTTCCTTTACT
CTGCTTCTGATGCTTTCAAGTAAAGATCAATATACATCTCTTTGGTCTGGTTTTTTGCCT
TACCTCCCTTGTGCAATTTGTGGAAGCGTTATTCAGTAAATGGAGAAATAAACAGCATAC
TTTAAGTAACAAAATTCACACCATGTCTTAGTATATGAATCACATTTTATAGAGATGTCT
TGCCTTTGCTTTGTTTGTGTGTTTACCTCTTAATATAAGATATTCTTCGTCTTTCCCGT

QA 1 479 1 479
DS 

RD RR2D064TF 340 0 0
G
GATAAATGGCAAAGCAGCAGTGATAGGGTTCTTACTGTTCTTAGATTTTGAGCTATTGAC
AAGTAAAGGTCTATTGAAGGGGACAGGGTTCTTGGACTTCCTTTACTCTGCTTCTGATGC
TTTCAAGTAAAGATCAATATACATCTCTTTGGTCTGGTTTTTTGCTTTACCTCCCTTGTG
CAATTTGTGGAAGCGTTATTCAGTAAATGGAGAAACAAACAACATACTTTAAGTAACAAA
ATTCACACCATGTCTTAGTATATGAATCACATTTTATAGAGATGTCTTGCCTTTGCTTTG
TTTGTGTGTTTACCTCTTAATATAAGATATTCTTCGTCT

QA 2 340 2 340
DS 



AS 1 2

CO CL5756Contig1 1026 2 14 U
GGGACCCGTCTTCCCTTTGTCTCGCTCGCCTAACACTTACCCCACACGCTCTCTCACACC
TCTCATCATCCCTTTTATTAATTTCTTTCTCTTCTCTCCATGTTCCAGCTCTTATCCCCC
TCCCCATAGGCTCTCTCTGTACAGTTAAACCTTAAGTTTTTTTGTTTGATCGGAAGAAGA
AAACGATGAATCATCGGTGGGCGATTCAGCCGAACGCGCTCTCTGCGGGAGGAGGAGGAG
AACAGAGTGTTGTAGTTTGCCCTAAACCACGTCGTATTGGTCTCCATAACTACGAACATC
TCCACCATCCCTCTCGCTCTTTGCGATGTTACTTCAGCCAGCAAGTTGAATCCAAGGCAG
AGAACGATATCTTAGATATCATCCTCACCAAGGATGGTTATGGTTCGGAACAAGTTCGTC
ATACGCAGGTGTTAGACTCGCCGTCCCCGTTTTTATGTGGGTCGCCGCCGAGCAGAGTCG
CTAACCCATTAACCCAGGATGCACGTTTCAGAGATGAGATCAAACTGGTCTCTTCTTCCC
CGACCACGGCTCCTCCGCTGGGCCAACCTCCATCCTCGCCTTCTTCCTCAGGGAGGAAAG
GAGGATGTGTTAGAGGCAATTTTGGTAACAGCCCAGCGGTTAGGATCGAAGGGTTTGATT
GCCTTGACAGGGACCGTAGAAACTGCAGCATCCCTGCCTTGGCTTAGAAACCAAACCAAC
CTCAAAAAATTCCACATAACTCTATTGAATTAACTCACAGATCCAGTTTAGTGCGTCGTA
CATAAATGGGTTTAAGGATATGGAGAGATGTGTGGATATAAATCTTTGAGGGAAGTAAGA
GCATGAGATCGATCTTTTGGAGTTTGTCTGTTTTGTTTTTAAGAGTGTAAATAGGTAACG
GAGTAAAAGCAGTTTTATGGGTTAAAGTTTGTAGTATTTGTGGTCATTTTGTAAGTAACG
TATTAAAGCTAAAAATGAGTCGTCGAGGAGAATGGGAAAATAATATGGAAAGTCATGTTT
TCTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD25TF U 1
AF RR2FD25JQ C 461
BS 1 543 RR2FD25TF
BS 544 544 RR2FD25JQ
BS 545 709 RR2FD25TF
BS 710 710 RR2FD25JQ
BS 711 728 RR2FD25TF
BS 729 729 RR2FD25JQ
BS 730 750 RR2FD25TF
BS 751 751 RR2FD25JQ
BS 752 785 RR2FD25TF
BS 786 786 RR2FD25JQ
BS 787 794 RR2FD25TF
BS 795 796 RR2FD25JQ
BS 797 814 RR2FD25TF
BS 815 1026 RR2FD25JQ

RD RR2FD25TF 814 0 0
GGGACCCGTCTTCCCTTTGTCTCGCTCGCCTAACACTTACCCCACACGCTCTCTCACACC
TCTCATCATCCCTTTTATTAATTTCTTTCTCTTCTCTCCATGTTCCAGCTCTTATCCCCC
TCCCCATAGGCTCTCTCTGTACAGTTAAACCTTAAGTTTTTTTGTTTGATCGGAAGAAGA
AAACGATGAATCATCGGTGGGCGATTCAGCCGAACGCGCTCTCTGCGGGAGGAGGAGGAG
AACAGAGTGTTGTAGTTTGCCCTAAACCACGTCGTATTGGTCTCCATAACTACGAACATC
TCCACCATCCCTCTCGCTCTTTGCGATGTTACTTCAGCCAGCAAGTTGAATCCAAGGCAG
AGAACGATATCTTAGATATCATCCTCACCAAGGATGGTTATGGTTCGGAACAAGTTCGTC
ATACGCAGGTGTTAGACTCGCCGTCCCCGTTTTTATGTGGGTCGCCGCCGAGCAGAGTCG
CTAACCCATTAACCCAGGATGCACGTTTCAGAGATGAGATCAAACTGGTCTCTTCTTCCC
CGATCACGGCTCCTCCGCTGGGCCAACCTCCATCCTCGCCTTCTTCCTCAGGGAGGAAAG
GAGGATGTGTTAGAGGCAATTTTGGTAACAGCCCAGCGGTTAGGATCGAAGGGTTTGATT
GCCTTGACAGGGACCGTAGAAACTGCAGCATCCCTGCCTTGGCTTAGAA*CCAAACCAAC
CTCAAAAA*TTCCACATAACTCTATTGAAT*AACTCACAGATCCAGTTTAGTGCGTCGTA
CATAA*TGGGTTTA**GATATGGAGAGATGTGTG

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR2FD25JQ 566 0 0
GTCGCCGCCGAGCAGAGTCGCTAACCCATTAACCCCGGATGCACGTTTCAGAGATGAGAT
CAAACTGGTCTCTTCTTCCCCGACCACGGCTCCTCCGCTGGGCCAACCTCCATCCTCGCC
TTCTTCCTCAGGGAGGAAAGGAGGATGTGTTAGAGGCAATTTTGGTAACAGCCCAGCGGT
TAGGATCGAAGGGTTTGATTGCCTTGACAGGGACCGTAGAAACTGCAGCATCCCTGCCTT
GGCTTAGAAACCAAACCAACCTCAAAAAATTCCACATAACTCTATTGAATTAACTCACAG
ATCCAGTTTAGTGCGTCGTACATAAATGGGTTTAAGGATATGGAGAGATGTGTGGATATA
AATCTTTGAGGGAAGTAAGAGCATGAGATCGATCTTTTGGAGTTTGTCTGTTTTGTTTTT
AAGAGTGTAAATAGGTAACGGAGTAAAAGCAGTTTTATGGGTTAAAGTTTGTAGTATTTG
TGGTCATTTTGTAAGTAACGTATTAAAGCTAAAAATGAGTCGTCGAGGAGAATGGGAAAA
TAATATGGAAAGTCATGTTTTCTTCT

QA 1 566 1 566
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5758Contig1 824 2 2 U
AATCGTGAAACGTAGGAAGGGGGAGGAGGAGCATCTAGGCATCAGATCTCGTGCGGCGTT
GTTTCTTCGAAAAAAAGAAAGGAAGGGAGAGATGGGGGTATCATTTGGAAAGCTGTTCAG
TAAGCCGTTTGCGAAGAAGGAGATGAGGATCCTTATGGTTGGTCTCGATGCTGCTGGTAA
GACTACCATCCTCTACAAGCTCAAGCTTGGTGAGATCGTCACCACCATTCCCACCATTGG
TTTCAATGTTGAAACTGTGGAATACAAGAACATTAGCTTCACCGTCTGGGATGTCGGGGG
TCAGGACAAGATCCGTCCTTTGTGGAGACACTACTTCCAGAACACACAGGGACTTATCTT
TGTTGTGGACAGCAACGATCGTGACCGTGTTGTTGAAGCCAGTGACGAGCTTCACAGGAT
GCTCAACGAGGATGAATTGAGGGATGCAGTTTTGCTTGTTTTTGCTAACAAACAAGATCT
CCCCAACGCAATGAACGCCGCTGAGATTACTGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTCCGCCA
ACGTCACTGGTACATTCAGAGCACATGTGCCACCTCTGGAGAAGGACTTTACGAGGGACT
TGACTGGCTCTCCAACAACATTGCTAACAAGGCATAGAAAGGAGGTTGCAAGATTCCTCC
TTGCTTGTTAATCAAGGAAGGGGTCCCTTTCGCTAGTACTATAAAAAACGAAACCAAGAT
TTTATTATCATATATGTTCTTCTTCTTCTATGTCTCGCATCTGAAACTCAAAATCATATC
ACGTTTTGTACTTTCCTTTAATAACTCAGATCTTTTACTTTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI91TF U 1
AF RR2BI91JQ C 70
BS 1 672 RR2BI91TF
BS 673 824 RR2BI91JQ

RD RR2BI91TF 672 0 0
AATCGTGAAACGTAGGAAGGGGGAGGAGGAGCATCTAGGCATCAGATCTCGTGCGGCGTT
GTTTCTTCGAAAAAAAGAAAGGAAGGGAGAGATGGGGGTATCATTTGGAAAGCTGTTCAG
TAAGCCGTTTGCGAAGAAGGAGATGAGGATCCTTATGGTTGGTCTCGATGCTGCTGGTAA
GACTACCATCCTCTACAAGCTCAAGCTTGGTGAGATCGTCACCACCATTCCCACCATTGG
TTTCAATGTTGAAACTGTGGAATACAAGAACATTAGCTTCACCGTCTGGGATGTCGGGGG
TCAGGACAAGATCCGTCCTTTGTGGAGACACTACTTCCAGAACACACAGGGACTTATCTT
TGTTGTGGACAGCAACGATCGTGACCGTGTTGTTGAAGCCAGTGACGAGCTTCACAGGAT
GCTCAACGAGGATGAATTGAGGGATGCAGTTTTGCTTGTTTTTGCTAACAAACAAGATCT
CCCCAACGCAATGAACGCCGCTGAGATTACTGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTCCGCCA
ACGTCACTGGTACATTCAGAGCACATGTGCCACCTCTGGAGAAGGACTTTACGAGGGACT
TGACTGGCTCTCCAACAACATTGCTAACAAGGCATAGAAAGGAGGTTGCAAGATTCCTCC
TTGCTTGTTAAT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2BI91JQ 755 0 0
AAAAAAAGAAAGGAAGGGAGAGATGGGGGTATCATTTGGAAAGCTGTTCAGTAAGCCGTT
TGCGAAGAAGGAGATGAGGATCCTTATGGTTGGTCTCGATGCTGCTGGTAAGACTACCAT
CCTCTACAAGCTCAAGCTTGGTGAGATCGTCACCACCATTCCCACCATTGGTTTCAATGT
TGAAACTGTGGAATACAAGAACATTAGCTTCACCGTCTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAA
GATCCGTCCTTTGTGGAGACACTACTTCCAGAACACACAGGGACTTATCTTTGTTGTGGA
CAGCAACGATCGTGACCGTGTTGTTGAAGCCAGTGACGAGCTTCACAGGATGCTCAACGA
GGATGAATTGAGGGATGCAGTTTTGCTTGTTTTTGCTAACAAACAAGATCTCCCCAACGC
AATGAACGCCGCTGAGATTACTGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTCCGCCAACGTCACTG
GTACATTCAGAGCACATGTGCCACCTCTGGAGAAGGACTTTACGAGGGACTTGACTGGCT
CTCCAACAACATTGCTAACAAGGCATAGAAAGGAGGTTGCAAGATTCCTCCTTGCTTGTT
AATCAAGGAAGGGGTCCCTTTCGCTAGTACTATAAAAAACGAAACCAAGATTTTATTATC
ATATATGTTCTTCTTCTTCTATGTCTCGCATCTGAAACTCAAAATCATATCACGTTTTGT
ACTTTCCTTTAATAACTCAGATCTTTTACTTTTAG

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL5759Contig1 989 2 2 U
GGAGAAGAGGTTAAGAAAAGGGAGTTGAAGTCACAAGAACCAAAAATGGAGAAATCTGAA
ATTCCTCCTGTGGAAAAGAAGAACCTACCTTTAAAACCAGCTGGTGCTGATGAGAACAGA
GAGAAAGAGGTGGCAAAAGATGTAGAGGACTCGAACAGTAAGCCTGAAGTTGAAACGACA
GCAAGTGAAACAGCTGAAGAGAAAAAGACCACTGTGTTTGTTCCAACAAAACCCCAATGG
CTCGGTTCCTCTGCAAACAAAGACACAGTTGAAGAGAAGAAACCTGAGATTGCAGCAGCT
GCTGCTGCTACTACTGGTAGCACAGATGATGGTGATGGGTTTGTTGACTATAAGGATAGA
AAGACAATGATCGAAGCTGCAACAGGATTGATAATAAGAAAACGGAAGCAAGAAGACAAG
AGCAAAGAAGAGGATGAAAAGTCAAAGGAAAAGGAAATGGAAAAGGAAAAGCAAGCACAG
GTCATGGCACAAGACGCAGTTGCTCTCTTGTTGAAACATTCTGTAGGACATGGTATAAAC
GAAGAAGACGAAGGAATCAGTAAAAAGGAAGAAAGTAAGCAAGGAAGTGGCCGTAGTAGA
AAGAAAAAGAAGACGGATAAAAAAGTAGTACTTGGTCCTGATAAACCAGAATATCTGGAT
GAAACCACAGATTATGATTCATCATGGGTACCTCCCAAAGGACAATCTGGTGATGGACGG
ACGTCTCTGAATGATCGTTTGGGATATTGATCGGCCGGTTAGTCGCCTCCAAGAGCAAAC
CATGGGATCAAGGGAGGGTCATAACTGTGGCTTTAAAGATGTCAAGTTTGCACTTTTATT
GGTCACATTCGCTGTGTTTCATGCTATAAGTTGAAAGTGTGAAGTGCTTCTTTGGTGGCT
TTCTTCCCTTAGCTAAATTAAGCTTCAACTAAAAGCGTAGCCCACTTCTCTACCAAAAGA
AACAACATACTATTTCAGTGCATAATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV47TF U 1
AF RR2DV47JQ C 430
BS 1 750 RR2DV47TF
BS 751 989 RR2DV47JQ

RD RR2DV47TF 750 0 0
GGAGAAGAGGTTAAGAAAAGGGAGTTGAAGTCACAAGAACCAAAAATGGAGAAATCTGAA
ATTCCTCCTGTGGAAAAGAAGAACCTACCTTTAAAACCAGCTGGTGCTGATGAGAACAGA
GAGAAAGAGGTGGCAAAAGATGTAGAGGACTCGAACAGTAAGCCTGAAGTTGAAACGACA
GCAAGTGAAACAGCTGAAGAGAAAAAGACCACTGTGTTTGTTCCAACAAAACCCCAATGG
CTCGGTTCCTCTGCAAACAAAGACACAGTTGAAGAGAAGAAACCTGAGATTGCAGCAGCT
GCTGCTGCTACTACTGGTAGCACAGATGATGGTGATGGGTTTGTTGACTATAAGGATAGA
AAGACAATGATCGAAGCTGCAACAGGATTGATAATAAGAAAACGGAAGCAAGAAGACAAG
AGCAAAGAAGAGGATGAAAAGTCAAAGGAAAAGGAAATGGAAAAGGAAAAGCAAGCACAG
GTCATGGCACAAGACGCAGTTGCTCTCTTGTTGAAACATTCTGTAGGACATGGTATAAAC
GAAGAAGACGAAGGAATCAGTAAAAAGGAAGAAAGTAAGCAAGGAAGTGGCCGTAGTAGA
AAGAAAAAGAAGACGGATAAAAAAGTAGTACTTGGTCCTGATAAACCAGAATATCTGGAT
GAAACCACAGATTATGATTCATCATGGGTACCTCCCAAAGGACAATCTGGTGATGGACGG
ACGTCTCTGAATGATCGTTTGGGATATTGA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2DV47JQ 560 0 0
GAGGATGAAAAGTCAAAGGAAAAGGAAATGGAAAAGGAAAAGCAAGCACAGGTCATGGCA
CAAGACGCAGTTGCTCTCTTGTTGAAACATTCTGTAGGACATGGTATAAACGAAGAAGAC
GAAGGAATCAGTAAAAAGGAAGAAAGTAAGCAAGGAAGTGGCCGTAGTAGAAAGAAAAAG
AAGACGGATAAAAAAGTAGTACTTGGTCCTGATAAACCAGAATATCTGGATGAAACCACA
GATTATGATTCATCATGGGTACCTCCCAAAGGACAATCTGGTGATGGACGGACGTCTCTG
AATGATCGTTTGGGATATTGATCGGCCGGTTAGTCGCCTCCAAGAGCAAACCATGGGATC
AAGGGAGGGTCATAACTGTGGCTTTAAAGATGTCAAGTTTGCACTTTTATTGGTCACATT
CGCTGTGTTTCATGCTATAAGTTGAAAGTGTGAAGTGCTTCTTTGGTGGCTTTCTTCCCT
TAGCTAAATTAAGCTTCAACTAAAAGCGTAGCCCACTTCTCTACCAAAAGAAACAACATA
CTATTTCAGTGCATAATGTT

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

CO CL5760Contig1 1112 2 16 U
GGAACCTAAGTGTTTTCCAATTCTCCATTCCTATAACCATATAAGCCGAGATGAGTACCC
GAGAAGAAGTAGGTGAAGTCTCTAAACTCTTCAATGGTTTCATGACTCTAATGAGAAGAT
TCATATTCAAAGTTCTTTGCGTCGGTCCAATACCTTATCACATCTCATTCATCATGGATG
GAAACCGCAGATTCGCCAAGAAACACAATCTTCAAGGCCTAGATGCAGGACACAGAGCCG
GTTTCGTGTCCGTAACATATGTTCTTCAGTACTGCCAAGAGATTGGTGTACCGTACGTCA
CGCTCTACGCCTTTGGTATCGATAATTTCAAGAGAGAACCTGAAGAAGTCAAGTGTATGA
TGGATCTAATGCCGGAGAAAATCGAGTTCACTATCGGTCAAGCCATCTCCGGGAATCTAA
AAGATTTGAAAGTGATATTTGCTGGTGATTTGAATCTGGTAAACGAGCGTCTTAAAGCCG
CAGCTCAGAGACTGATGGAGCTTACCGAGGAGAACATGGGGTTAGTGGTTGTGGTTATCG
TTGCGTACAGTACAAGTCACGAGATTGTTCAGGCTATTAGAGAATCTTGTGTGAGGAAGT
GTGAGGGTGGAGATAGTCCTCAGGTTTTGGAGGTGAGTGATGTTGAAGAGTGTATGTATA
CATCAATTGTTCCTGATCCGGATCTTGTGATAAGATCAGGAGGAATAGATCGGCTGAGTG
ATTTCATGACTTGGCAGAGTTCAAGGTTTTTTTTTCATACCACTGCAGCTCTCTGGCCGG
AGTTAGGTCTTTGGCATTTGGTTTGGGCCATTTTTAAACTCCAGAGGATCCACGATTACT
TGCAGAGGAAGCAAAAGCTCGACTAAATAGGTTTAAGTTAAACCCTATCAGAACTGACTT
GAGAAATAAATTGTTTTTACTAAGTAGATGCATAAAACACATGTATACTAGTTTTTAGAA
ATTTAGGAATTAAGACGAATGTTTCATTAGGTTTAGAGCACCGGTCCCCAGCCGCAGCAT
GTACTCTTACCATCTATGTTGGAGTTACATGTTTCTTGTGGCACAAGAAACTATAAATAT
GAACAAGAAAACATAAGAAAATCATTCTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW54TF U 1
AF RR2BW54JQ C 377
BS 1 623 RR2BW54TF
BS 624 624 RR2BW54JQ
BS 625 636 RR2BW54TF
BS 637 637 RR2BW54JQ
BS 638 665 RR2BW54TF
BS 666 666 RR2BW54JQ
BS 667 670 RR2BW54TF
BS 671 671 RR2BW54JQ
BS 672 692 RR2BW54TF
BS 693 693 RR2BW54JQ
BS 694 699 RR2BW54TF
BS 700 700 RR2BW54JQ
BS 701 704 RR2BW54TF
BS 705 705 RR2BW54JQ
BS 706 723 RR2BW54TF
BS 724 1112 RR2BW54JQ

RD RR2BW54TF 736 0 0
GGAACCTAAGTGTTTTCCAATTCTCCATTCCTATAACCATATAAGCCGAGATGAGTACCC
GAGAAGAAGTAGGTGAAGTCTCTAAACTCTTCAATGGTTTCATGACTCTAATGAGAAGAT
TCATATTCAAAGTTCTTTGCGTCGGTCCAATACCTTATCACATCTCATTCATCATGGATG
GAAACCGCAGATTCGCCAAGAAACACAATCTTCAAGGCCTAGATGCAGGACACAGAGCCG
GTTTCGTGTCCGTAACATATGTTCTTCAGTACTGCCAAGAGATTGGTGTACCGTACGTCA
CGCTCTACGCCTTTGGTATCGATAATTTCAAGAGAGAACCTGAAGAAGTCAAGTGTATGA
TGGATCTAATGCCGGAGAAAATCGAGTTCACTATCGGTCAAGCCATCTCCGGGAATCTAA
AAGATTTGAAAGTGATATTTGCTGGTGATTTGAATCTGGTAAACGAGCGTCTTAAAGCCG
CAGCTCAGAGACTGATGGAGCTTACCGAGGAGAACATGGGGTTAGTGGTTGTGGTTATCG
TTGCGTACAGTACAAGTCACGAGATTGTTCAGGCTATTAGAGAATCTTGTGTGAGGAAGT
GTGAGGGTGGAGATAGTCCTCAG*TTTTGGAGGTGA*TGATGTTGAAGAGTGTATGTATA
CATCA*TTGT*CCTGATCCGGATCTTGTGATA*GATCAG*AGGA*TAGATCGGCTGAGTG
ATT
CATGACTGGCAGA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2BW54JQ 736 0 0
GAAAATCGAGTTCACTATCGGTCAAGCCATCTCCGGGAATCTAAAAGATTTGAAAGTGAT
ATTTGCTGGTGATTTGAATCTGGTAAACGAGCGTCTTAAAGCCGCAGCTCAGAGACTGAT
GGAGCTTACCGAGGAGAACATGGGGTTAGTGGTTGTGGTTATCGTTGCGTACAGTACAAG
TCACGAGATTGTTCAGGCTATTAGAGAATCTTGTGTGAGGAAGTGTGAGGGTGGAGATAG
TCCTCAGGTTTTGGAGGTGAGTGATGTTGAAGAGTGTATGTATACATCAATTGTTCCTGA
TCCGGATCTTGTGATAAGATCAGGAGGAATAGATCGGCTGAGTGATTTCATGACTTGGCA
GAGTTCAAGGTTTTTTTTTCATACCACTGCAGCTCTCTGGCCGGAGTTAGGTCTTTGGCA
TTTGGTTTGGGCCATTTTTAAACTCCAGAGGATCCACGATTACTTGCAGAGGAAGCAAAA
GCTCGACTAAATAGGTTTAAGTTAAACCCTATCAGAACTGACTTGAGAAATAAATTGTTT
TTACTAAGTAGATGCATAAAACACATGTATACTAGTTTTTAGAAATTTAGGAATTAAGAC
GAATGTTTCATTAGGTTTAGAGCACCGGTCCCCAGCCGCAGCATGTACTCTTACCATCTA
TGTTGGAGTTACATGTTTCTTGTGGCACAAGAAACTATAAATATGAACAAGAAAACATAA
GAAAATCATTCTTATT

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL5761Contig1 804 2 2 U
GTCCAATTAACCAGGTCACTCCAGAAACTGAACATGAAAAAATGCTCTGGAAAGAAGCAG
AAGAGAGGAACAAACTACGGAAACAAAAGAGAGCACAAGGTAAAGAAGAGCAAGAGAAGT
TGAAGGACTTAGAGAGGCTAAATGATTTATTGGCGGAAGGACGAGTATTCCTGGACATGC
CAGCTCTTGCAGACAGGAACAGCATCCTAATCAAGGATACTTACCATGAGAACTCGTTGA
TTTGTCAGCCACAACAACGGAATATTCATGGTAGGATATTTGGAGGCTTCTTGATGCGCA
AGGCTTTTGAGCTGGCTTTCTCCAATGCTTACACCTTCGCTGGGGTCTCGCCACGTTTCC
TTGAAGTCGACCGTGTCGATTTTATCAAACCTGTGGATGTTGGAAACTTCCTTCGTTTCA
AATCACGGATACTGTACACGGAAGCTAACAGTTCAGCAGAACCGCTAATAAACATCGAGG
TTATAGCTCATGTGACAAGTCCAGAGCTCAGGTCTAGCGAAGTATCGAACAGATTCTACT
TCACATTCAGTGTGAGACCTGAAGCGATGAAAGATGGATGGAAGATAAGGAATGTGGTTC
CAGGAACGGAAGAAGAAGCAAGAAGGGTGATTGAGCGAATGGACGCAGCGAGACCCATCT
CATAGAGAGAGAGCCTTGAGCTCCTCCCCTCATTGATCTGAATAAGAAGTTTATCTCCTT
ATCTTTTTTGCAGAGTAGATTCATGTGATCACTATTTTTCCTTTGCTTTCAACTTTACTT
GGTCTATGAAAAAGATTAATTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX27TF U 1
AF RR2EX27JQ C 370
BS 1 707 RR2EX27TF
BS 708 804 RR2EX27JQ

RD RR2EX27TF 707 0 0
GTCCAATTAACCAGGTCACTCCAGAAACTGAACATGAAAAAATGCTCTGGAAAGAAGCAG
AAGAGAGGAACAAACTACGGAAACAAAAGAGAGCACAAGGTAAAGAAGAGCAAGAGAAGT
TGAAGGACTTAGAGAGGCTAAATGATTTATTGGCGGAAGGACGAGTATTCCTGGACATGC
CAGCTCTTGCAGACAGGAACAGCATCCTAATCAAGGATACTTACCATGAGAACTCGTTGA
TTTGTCAGCCACAACAACGGAATATTCATGGTAGGATATTTGGAGGCTTCTTGATGCGCA
AGGCTTTTGAGCTGGCTTTCTCCAATGCTTACACCTTCGCTGGGGTCTCGCCACGTTTCC
TTGAAGTCGACCGTGTCGATTTTATCAAACCTGTGGATGTTGGAAACTTCCTTCGTTTCA
AATCACGGATACTGTACACGGAAGCTAACAGTTCAGCAGAACCGCTAATAAACATCGAGG
TTATAGCTCATGTGACAAGTCCAGAGCTCAGGTCTAGCGAAGTATCGAACAGATTCTACT
TCACATTCAGTGTGAGACCTGAAGCGATGAAAGATGGATGGAAGATAAGGAATGTGGTTC
CAGGAACGGAAGAAGAAGCAAGAAGGGTGATTGAGCGAATGGACGCAGCGAGACCCATCT
CATAGAGAGAGAGCCTTGAGCTCCTCCCCTCATTGATCTGAATAAGA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2EX27JQ 435 0 0
ACCGTGTCGATTTTATCAAACCTGTGGATGTTGGAAACTTCCTTCGTTTCAAATCACGGA
TACTGTACACGGAAGCTAACAGTTCAGCAGAACCGCTAATAAACATCGAGGTTATAGCTC
ATGTGACAAGTCCAGAGCTCAGGTCTAGGGAAGTATCGAACAGATTTTACTTCACATTCA
GTGTGAGACCTGAAGCGATGAAAGATGGATGGAAGATAAGGAATGTGGTTCCAGGAACGG
AAGAAGAAGCAAGAAGGGTGATTGAGCGAATGGACGCAGCGAGACCCATTTCATAGAGAG
AGAGCCTTGAGCTCCTCCCCTCATTGATTTGAATAAGAAGTTTATCTCCTTATCTTTTTT
GCAGAGTAGATTCATGTGATCACTATTTTTCCTTTGCTTTCAACTTTACTTGGTCTATGA
AAAAGATTAATTGGG

QA 1 435 1 435
DS 



AS 1 2

CO CL5762Contig1 886 2 4 U
GGGATGGCAGAAGACTTTTCGGTGGTAGTCTTAGCTTCCGATCTAGGTATCGACGCTAGA
CCGTTCTTAACGAGAAGCGATGAGATCGATGAGCAAGAGAACTGGCACGACTGTCCTCAA
TACCTCGGCGACGAAGACTTCTCCGATCTCGACCTCCTCCACTTCTTCACCCTCCAAGGC
TCCGATAAGTCCGGTAACCGGATCTTCCGCGTCGTCGGAAAGTACTTTCCCGCTCGTGTG
GTGAGTGCAGAGAGGCTGAAGAAGTATATATTCCAGAAGATTAGCAACGAATGTCCCGAG
GGACCTTTCTGCTTGGTTTACATGCATAGCACGGTTCAAAAGGACGATAACTCACCGGGG
ATTACCATCTTGAGATGGATCTACGAGGATCTTCCTTCCGAGATCAAAGACAGACTCCAA
GTTGTTTACTTTATACACCCTGGTCTTCGTTCTAGACTTGTCATTGCTACTCTCGGTCCC
CTTCTTCTAACTGGAGGGCTGTACTGGAAGATTAAGTATGTGAGCAGGTTGCAGTATCTG
TGGGAGGAGATAAAGAAAGGGGAGGTGGAAGTTCCTGACTTTGTGAACAACCATGACAAT
GTGCTTGAGCATAGACCGTTAACTGACTATGGAATCGAACCGGATCCTTTTCATTTAACC
GAGGTTCAGTTTTTTTCGTTCTCACTCAACAGAGAACTCAACCAGTACGAGAATAGATGG
GTCTCATAGTGTATTTTCTCCTCTTCTGTAATGCCAAAACCTCTATGTGTTATGTTTCTT
GTATAGAGTATAATTTGAGTGTCCTAAAAAAAAACTCTTCAGTGTCGATGTGGTTTTGAT
TGATTTTGGACAGAACCAGTAACTAATTATTGTCGTTGGTAAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB20TF U 1
AF RR2HB20JQ C 218
BS 1 478 RR2HB20TF
BS 479 479 RR2HB20JQ
BS 480 558 RR2HB20TF
BS 559 886 RR2HB20JQ

RD RR2HB20TF 558 0 0
GGGATGGCAGAAGACTTTTCGGTGGTAGTCTTAGCTTCCGATCTAGGTATCGACGCTAGA
CCGTTCTTAACGAGAAGCGATGAGATCGATGAGCAAGAGAACTGGCACGACTGTCCTCAA
TACCTCGGCGACGAAGACTTCTCCGATCTCGACCTCCTCCACTTCTTCACCCTCCAAGGC
TCCGATAAGTCCGGTAACCGGATCTTCCGCGTCGTCGGAAAGTACTTTCCCGCTCGTGTG
GTGAGTGCAGAGAGGCTGAAGAAGTATATATTCCAGAAGATTAGCAACGAATGTCCCGAG
GGACCTTTCTGCTTGGTTTACATGCATAGCACGGTTCAAAAGGACGATAACTCACCGGGG
ATTACCATCTTGAGATGGATCTACGAGGATCTTCCTTCCGAGATCAAAGACAGACTCCAA
GTTGTTTACTTTATACACCCTGGTCTTCGTTCTAGACTTGTCATTGCTACTCTCGGTCGC
CTTCTTCTAACTGGAGGGCTGTACTGGAAGATTAAGTATGTGAGCAGGTTGCAGTATCTG
TGGGAGGAGATAAAGAAA

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2HB20JQ 669 0 0
GAAAGTACTTTCCCGCTCGTGTGGTGAGTGCAGAGAGGCTGAAGAAGTATATATTCCAGA
AGATTAGCAACGAATGTCCCGAGGGACCTTTCTGCTTGGTTTACATGCATAGCACGGTTC
AAAAGGACGATAACTCACCGGGGATTACCATCTTGAGATGGATTTACGAGGATCTTCCTT
CCGAGATCAAAGACAGACTCCAAGTTGTTTACTTTATACCCCCTGGTCTTCGTTCTAGAC
TTGTCATTGCTACTTTCGGTCCCCTTTTTCTAACTGGAGGGCTGTACTGGAAGATTAAGT
ATGTGAGCAGGTTGCAGTATCTGTGGGAGGAGATAAAGAAAGGGGAGGTGGAAGTTCCTG
ACTTTGTGAACAACCATGACAATGTGCTTGAGCATAGACCGTTAACTGACTATGGAATCG
AACCGGATCCTTTTCATTTAACCGAGGTTCAGTTTTTTTCGTTCTCACTCAACAGAGAAC
TCAACCAGTACGAGAATAGATGGGTCTCATAGTGTATTTTCTCCTCTTCTGTAATGCCAA
AACCTCTATGTGTTATGTTTCTTGTATAGAGTATAATTTGAGTGTCCTAAAAAAAAACTC
TTCAGTGTCGATGTGGTTTTGATTGATTTTGGACAGAACCAGTAACTAATTATTGTCGTT
GGTAAGTTC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL5763Contig1 1009 2 2 U
TTTTTTCTCATCGCAAGTACGGAGGAGTGTAGTGTACGGAGATCAACCAAGGAATAGGCT
GGATCTGTACTTACCATGCAACAATGATGGTATGAAGCCGGTTGTTGTTTTTGTGACGGG
TGGAGCTTGGATTATTGGGTACAAAGCCTGGGGCTCGCTCCTGGGAATGCAGCTGGCAGA
AAGGGATATCATTGTAGCATGCGTTGACTACAGAAACTTTCCTCAGGGAACAATTAGTGA
TATGGTGACGGATGCTTCTCGAGGAATCTCATTTATCTGCAATAACATCTCTGCCTTTGG
AGGTGACCCCAACAGGATATACCTGATGGGACAATCAGCTGGTGCACATATAGCCGCTTG
TGCTCTATTGGAACAAGCTACCAAAGAATCAAAAGGAGAGAGCATCTCCTGGAGAGTTTC
CCAGATAAAAGCCTATTTCGGACTATCTGGAGGATACAATCTTTACAATTTGGTTGATCA
CTTCCACAACCGTGGCCTGTATCGCTCGATTTTCCTGAGCATAATGGAAGGAGAAGAGTC
CTTTGAAAGATTCTCTCCGGAAGTAAGATTGAAAGACCCAATTGTTGGAAAAGCTGCGTC
TATGTTGCCTCCAATTATGCTTTTCCATGGATCCTCAGATTATTCAATACCATGCGATGC
AAGCAAAACTTTTGCAGACGCTCTCCAAGCTGTTGGAGCCAAAGTGGAGCTTATTTTATA
CAGCGGCAAAACACATACAGATTTGTTTCTTCAGGATCCCTTAAGAGGCGGCAAAGATGA
ACTCTTTGACGACATAGTCTCTGTGATACACGCGGAGGATGATGACGCGCTGGCCAAAGA
CTCATTTGCTCCTCCTAGAAAACGTCTTGTCCCAGAGTTGTTGCTGAAACTAGCTCGCGA
GGTTAGCCCCTTCTGATAGAAGCTTGTTAGTTACTTGCTCTGTATTTTCATTTTTTTTCC
TATTATTCGATTTGTATCTTAAAATATAAATATTATGTCCTTGAAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE62TF U 1
AF RR2CE62JQ C 285
BS 1 609 RR2CE62TF
BS 610 1009 RR2CE62JQ

RD RR2CE62TF 609 0 0
TTTTTTCTCATCGCAAGTACGGAGGAGTGTAGTGTACGGAGATCAACCAAGGAATAGGCT
GGATCTGTACTTACCATGCAACAATGATGGTATGAAGCCGGTTGTTGTTTTTGTGACGGG
TGGAGCTTGGATTATTGGGTACAAAGCCTGGGGCTCGCTCCTGGGAATGCAGCTGGCAGA
AAGGGATATCATTGTAGCATGCGTTGACTACAGAAACTTTCCTCAGGGAACAATTAGTGA
TATGGTGACGGATGCTTCTCGAGGAATCTCATTTATCTGCAATAACATCTCTGCCTTTGG
AGGTGACCCCAACAGGATATACCTGATGGGACAATCAGCTGGTGCACATATAGCCGCTTG
TGCTCTATTGGAACAAGCTACCAAAGAATCAAAAGGAGAGAGCATCTCCTGGAGAGTTTC
CCAGATAAAAGCCTATTTCGGACTATCTGGAGGATACAATCTTTACAATTTGGTTGATCA
CTTCCACAACCGTGGCCTGTATCGCTCGATTTTCCTGAGCATAATGGAAGGAGAAGAGTC
CTTTGAAAGATTCTCTCCGGAAGTAAGATTGAAAGACCCAATTGTTGGAAAAGCTGCGTC
TATGTTGCC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2CE62JQ 725 0 0
ACATCTCTGCCTTTGGAGGTGACCCCAACAGGATATACCTGATGGGACAATCAGCTGGTG
CACATATAGCCGCTTGTGCTCTATTGGAACAAGCTACCAAAGAATCAAAAGGAGAGAGCA
TCTCCTGGAGAGTTTCCCAGATAAAAGCCTATTTCGGACTATCTGGAGGATACAATCTTT
ACAATTTGGTTGATCACTTCCACAACCGTGGCCTGTATCGCTCGATTTTCCTGAGCATAA
TGGAAGGAGAAGAGTCCTTTGAAAGATTCTTTCCGGAAGTAAGATTGAAAGACCCAATTG
TTGGAAAAGCTGCGTCTATGTTGCCTCCAATTATGCTTTTCCATGGATCCTCAGATTATT
CAATACCATGCGATGCAAGCAAAACTTTTGCAGACGCTCTCCAAGCTGTTGGAGCCAAAG
TGGAGCTTATTTTATACAGCGGCAAAACACATACAGATTTGTTTCTTCAGGATCCCTTAA
GAGGCGGCAAAGATGAACTCTTTGACGACATAGTCTCTGTGATACACGCGGAGGATGATG
ACGCGCTGGCCAAAGACTCATTTGCTCCTCCTAGAAAACGTCTTGTCCCAGAGTTGTTGC
TGAAACTAGCTCGCGAGGTTAGCCCCTTCTGATAGAAGCTTGTTAGTTACTTGCTCTGTA
TTTTCATTTTTTTTCCTATTATTCGATTTGTATCTTAAAATATAAATATTATGTCCTTGA
AGCTT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL5764Contig1 636 2 3 U
GAGATACTAATCAGTTCTTCAAATTATGTTTGTTACTACTCACTCACTCAAAAAGAGACT
GAGATGATTTGATGATCTGATGAAGATCAGTATCCATAAGCTCATAAACCAAGTACACGT
CTTTGAAACTCGATTTATTCGTAGGCAACATAACATCTTTAAGCGCGATCACGTTCTCGT
GCCTCACGTGCCTAAAAAGCTTGAGCTCTCTCAACGTCCTCAAAGAGTCAACTCGATTCT
CGAAGACGTTGTGAATCTTTTTGATGGCGACCTTCTCGTTGGTCTCACGGTTGATGGAAG
AGCATACCACACCGTAAGCTCCTCTTCCGATGGGTTTAATGGGGACATACTTGGTGTCGA
TTTCGAACAGTGTTTGCCACATGGAGTAGTAATGTTTCCCTTGCTGTTTGATCCCATTTG
GTGGCTCAACTAACATCGCCATGCTTCTTGTTCCCAGGTTGTAATTAAGAAGCTCTGAAT
CGTTGCTGTTGATTGTGTGCTTTGTTTGGTTGGTGATCAGAGAAAGAAGAGAAGGGTATG
ATTGGATCTGAATTGAGATGGTTTCTTCATACTTATCTAGAAGATATAAGAGAGAGAAGT
TAAGAAGTGGTGAGACCCATACCGGGGAATGTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR10JQ U 24
AF RR2DR10TF C 1
BS 1 26 RR2DR10TF
BS 27 355 RR2DR10JQ
BS 356 636 RR2DR10TF

RD RR2DR10JQ 332 0 0
TTG
TGTTTGTTACTACTCACTCACTCAAAAAGAGACTGAGATGATTTGATGATCTGATGAAGA
TCAGTATCCATAAGCTCATAAACCAAGTACACGTCTTTGAAACTCGATTTATTCGTAGGC
AACATAACATCTTTAAGCGCGATCACGTTCTCGTGCCTCACGTGCCTAAAAAGCTTGAGC
TCTCTCAACGTCCTCAAAGAGTCAACTCGATTCTCGAAGACGTTGTGAATCTTTTTGATG
GCGACCTTCTCGTTGGTCTCACGGTTGATGGAAGAGCATACCACACCGTAAGCTCCTCTT
CCGATGGGTTTAATGGGGACATACTTGGT

QA 4 332 4 332
DS 

RD RR2DR10TF 636 0 0
GAGATACTAATCAGTTCTTCAAATTATGTTTGTTACTACTCACTCACTCAGAAAGAGACT
GAGATGATTTGATGATCTGATGAAGATCAGTATCCATAAGCTCATAAACCAAGTACACGT
CTTTGAAACTCGATTTATTCGTAGGCAACATAACATCTTTAAGCGCGATCACGTTCTCGT
GCCTCACGTGCCTAAGAAGCTTGAGCTCTCTCAACGTCCTCAAAGAGTCAACTCGATTCT
CGAAGACGTTGTGAATCTTTTTGATGGCGACCTTCTCGTTGGTCTCACGGTTGATGGAAG
AGCATACCACACCGTAAGCTCCTCTTCCGATGGGTTTAATGGGGACATACTTGGTGTCGA
TTTCGAACAGTGTTTGCCACATGGAGTAGTAATGTTTCCCTTGCTGTTTGATCCCATTTG
GTGGCTCAACTAACATCGCCATGCTTCTTGTTCCCAGGTTGTAATTAAGAAGCTCTGAAT
CGTTGCTGTTGATTGTGTGCTTTGTTTGGTTGGTGATCAGAGAAAGAAGAGAAGGGTATG
ATTGGATCTGAATTGAGATGGTTTCTTCATACTTATCTAGAAGATATAAGAGAGAGAAGT
TAAGAAGTGGTGAGACCCATACCGGGGAATGTTACC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL5765Contig1 680 2 14 U
GGACCGAATTCAGGTATCTCTCTCTCTCGCTGGGAAGAGCAGAAGAGCAATGGCTTCGAC
GGCGACGACAACTGACTTCTTCAAGCCTTTCCTCTCTCCTTTCTCCAATGGGAACGTGGC
GCAACGAGGAGGTAGTAGACAGAACAACAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAA
CAGGTCTCTTCGTGTTAATGGATTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGG
CCAATCAAAGGCAGGGATACTTGGTAATATGCAGAATCTGTATGAGACTGTGAAGAAAGC
TCAGATGGTCGTCCAAATTGAGGCTGTTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCTGAGTT
TGATGGTTATTGTGAAGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACCAAT
CCGCACTGATATCACTGATGCAGCGATGGAATTAGGTTCCGAAAAACTATCACTACTGGT
TACAGAAGCATACAAGGACGCACATGCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAG
TGATCTTGCCCAGAGCTTAGGCATGCCACCAGGTCTAAGTGATGGATTAAAGTAACAGAA
CCAGATCTTTTCTTTTTTTGTCTTTATACTCGAACTTCTTCAGGTATGAGAAGTCCAGTT
TGTTTTGTCTTTATACCGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ20TF U 1
AF RR2BJ12TF U 9
BS 1 41 RR2FZ20TF
BS 42 42 RR2BJ12TF
BS 43 57 RR2FZ20TF
BS 58 58 RR2BJ12TF
BS 59 95 RR2FZ20TF
BS 96 96 RR2BJ12TF
BS 97 141 RR2FZ20TF
BS 142 142 RR2BJ12TF
BS 143 187 RR2FZ20TF
BS 188 188 RR2BJ12TF
BS 189 209 RR2FZ20TF
BS 210 210 RR2BJ12TF
BS 211 303 RR2FZ20TF
BS 304 680 RR2BJ12TF

RD RR2FZ20TF 306 0 0
GGACCGAATTCAGGTATCTCTCTCTCTCGCTGGGAAGAGCA*AAGAGCAATGGCTTC*AC
GGCGACGACAACTGACTTCTTCAAGCCTTTCCTCTTTCCTTTCTCCAATGGGAACGTGGC
GCAACGAGGAGGTAGTAGACATAACAACAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAACCCTAA
CAGGTCTGTTCGTGTTAATGGATTGTTCG*AGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGG
CCAATCAAAGGCAGGGATACTTGGTAATATGCAGAATCTGTATGAGACTGTGAAGAAAGC
TCA
ATG

QA 1 303 1 303
DS 

RD RR2BJ12TF 672 0 0
GGG
AGGTATCTCTCTCTCTCGCTGGGAAGAGCAGAAGAGCAATGGCTTCGACGGCGACGACAA
CTGACTTCTTCAAGCCTTTCCTCTCTCCTTTCTCCAATGGGAACGTGGCGCAACGAGGAG
GTAGTAGACAGAACAACAACGTGGTATGGTTGAATCGGAAGAGCCCTAGCAGGTCTCTTC
GTGTTAATGGATTGTTCGGAGGTGGAAAGAAGGACAATAACGATGATGGCCAATCAAAGG
CAGGGATACTTGGTAATATGCAGAATCTGTATGAGACTGTGAAGAAAGCTCAGATGGTCG
TCCAAATTGAGGCTGTTCGTGTCCAGAAGGAGTTAGCTGTTGCTGAGTTTGATGGTTATT
GTGAAGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTATCGGGTAACCAGCAACCAATCCGCACTGATA
TCACTGATGCAGCGATGGAATTAGGTTCCGAAAAACTATCACTACTGGTTACAGAAGCAT
ACAAGGACGCACATGCAAAGAGTGTTCTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGATCTTGCCC
AGAGCTTAGGCATGCCACCAGGTCTAAGTGATGGATTAAAGTAACAGAACCAGATCTTTT
CTTTTTTTGTCTTTATACTCGAACTTCTTCAGGTATGAGAAGTCCAGTTTGTTTTGTCTT
TATACCGGC

QA 4 672 4 672
DS 



AS 1 2

CO CL5766Contig1 905 2 6 U
GGGGGCTTTTCACTAGAACACACAAGATGGGTCTCAATGCCTCCCTTTATCTATTCTCCC
TCACCTTCTTACTCATATTTTTCTCTACAGCCATTACAGCAGACAACATCACACAAGCGT
TTGAGAAGTACTCCAACTTCAGCACCATGAATGATCTCTTGATCAAAACCAAGCTCAATA
TACCCATAAGCAAATACCTGACCATAACCTTACTTGCTGTTAGCAACGAAGCCATCAGCC
CTATCGTTAACAGATCCGACGTTGAGGTCAAGAACATCCTCATGAATCATGTCATTCTCG
ATTACTACGATGAGATCAAGTTTAAAGGGATGAAGGAGAAGAGCATAATGCTCACTACCT
TATACCAAACAACCGGTTTAGGTGAAGAGATGAATGGTTTTCTCAACTGTACCAAATCCA
AAGGCAGAGTTTACTTTGGTTCGGGGGTGAAGGGTTCACCTCTAGTCGCTGAGTATGTCA
AGGCTCTGTACGACAATCCATATAACTTGTCTATAGTCCAGATTAGTATGCCCATTGTGG
CTCCTGGACTCAGCCTTGTTATTTATCCACCTCCACCACCACCTGCTCCTCCGGCTCCAC
CTCCTACAGATGCTGCAATGGCTCCAGGTCCTGGACCAGCTGATGATGACAATGCCTCAG
ATACAGCTGTTCCAAAACATAAACCTGCAACAGAAACAACGGAGGTTGATTCTCCAGCTC
CTACTCCAAGCGCAGACAATGAGAAGATCGAAGCTGCTGATAAGGCTGGGTCATCCTCTT
CTGCTTGTAAGGCAGGTTTAAGCTTTGTTGTTGTTCTCTTGCTACTATTGTTTGCTAGCT
TTGCTGGTTTCTAAGTTTTGGAATTAGGTGATATGGTTTGATGACGATAATGGTAGATGA
GATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2DU67TF U 1
AF RR2DU67JQ C 420
BS 1 704 RR2DU67TF
BS 705 705 RR2DU67JQ
BS 706 728 RR2DU67TF
BS 729 729 RR2DU67JQ
BS 730 744 RR2DU67TF
BS 745 905 RR2DU67JQ

RD RR2DU67TF 756 0 0
GGGGGCTTTTCACTAGAACACACAAGATGGGTCTCAATGCCTCCCTTTATCTATTCTCCC
TCACCTTCTTACTCATATTTTTCTCTACAGCCATTACAGCAGACAACATCACACAAGCGT
TTGAGAAGTACTCCAACTTCAGCACCATGAATGATCTCTTGATCAAAACCAAGCTCAATA
TACCCATAAGCAAATACCTGACCATAACCTTACTTGCTGTTAGCAACGAAGCCATCAGCC
CTATCGTTAACAGATCCGACGTTGAGGTCAAGAACATCCTCATGAATCATGTCATTCTCG
ATTACTACGATGAGATCAAGTTTAAAGGGATGAAGGAGAAGAGCATAATGCTCACTACCT
TATACCAAACAACCGGTTTAGGTGAAGAGATGAATGGTTTTCTCAACTGTACCAAATCCA
AAGGCAGAGTTTACTTTGGTTCGGGGGTGAAGGGTTCACCTCTAGTCGCTGAGTATGTCA
AGGCTCTGTACGACAATCCATATAACTTGTCTATAGTCCAGATTAGTATGCCCATTGTGG
CTCCTGGACTCAGCCTTGTTATTTATCCACCTCCACCACCACCTGCTCCTCCGGCTCCAC
CTCCTACAGATGCTGCAATGGCTCCAGGTCCTGGACCAGCTGATGATGACAATGCCTCAG
ATACAGCTGTTCCAAAACATAAACCTGCAACAGAAACAACGGAG*TTGATTCTCCAGCTC
CTACTCCA*GCGCAGACAATGAGA
GATCGAGCTGCT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2DU67JQ 486 0 0
AAAGGCAGAGTTTACTTTGGTTCGGGGGTGAAGGGTTCACCTCTAGTCGCTGAGTATGTC
AAGGCTCTGTACGACAATCCATATAACTTGTCTATAGTCCAGATTAGTATGCCCATTGTG
GCTCCTGGACTCAGCCTTGTTATTTATCCACCTCCACCACCACCTGCTCCTCCGGCTCCA
CCTCCTACAGATGCTGCAATGGCTCCAGGTCCTGGACCAGCTGATGATGACAATGCCTCA
GATACAGCTGTTCCAAAACATAAACCTGCAACAGAAACAACGGAGGTTGATTCTCCAGCT
CCTACTCCAAGCGCAGACAATGAGAAGATCGAAGCTGCTGATAAGGCTGGGTCATCCTCT
TCTGCTTGTAAGGCAGGTTTAAGCTTTGTTGTTGTTCTCTTGCTACTATTGTTTGCTAGC
TTTGCTGGTTTCTAAGTTTTGGAATTAGGTGATATGGTTTGATGACGATAATGGTAGATG
AGATTC

QA 1 486 1 486
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5768Contig1 605 2 2 U
TTTTTAAACTTAATAGACTTGTCTACTTAAAAAAACAAAAGAAAAGAAAGAGAGAAAAAC
ATAAACTGTGATGATGGTTGCAGAAACCATGGTATCAAAACGAGATTTAAAAAAAAACAA
ATAGGATGCGGATACATGTTGTTGATATGAATGAGAATCTAAGGTAGAGGAGCAAGTTGT
TTATATGAATGAGATGAAAGCGCTTCCTCCTTTTCCAGAGAACCTCCACCTCCACCTCAA
CCCAACCCAGTGCCGAAACCGCAAGTAAGTGATGATCTATGACGTCATGCTGATGTCAGC
AAGGAGGAATGAGAGGTCAAGCTAGTTTGGCAAAGATGAGTCCGTGACAAGTGCCAATGC
TGAGCTGGACCAATCATGAAGCAAGGATGATGTGGAGATGGAGTAACGACTTTACGCGGA
AAAAGTTGAGTCGTTAGACGGTTAGGCTATTAGGCCGAGCTTGTTGGGCAATTGGGCTTA
GGCCTAGTATAAATAGAAAGGAATGAGAGAATAAACGTAGGCCATAATTGTCTTGTAGTG
GGGAAGTCTATAGCTTATTGCTTTAGTCTTTGGGCTCACTTAATGGAATACCGTATTGGG
ATTGG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2C884JQ C 1
AF RR2C884TF U 6
BS 1 5 RR2C884JQ
BS 6 605 RR2C884TF

RD RR2C884JQ 605 0 0
TTTTTAAACTTAATAGACTTGTCTACTTAAAAAAACAAAAGAAAAGAAAGAGAGAAAAAC
ATAAACTGTGATGATGGTTGCAGAAACCATGGTATCAAAACGAGATTTAAAAAAAAACAA
ATAGGATGCGGATACATGTTGTTGATATGAATGAGAATCTAAGGTAGAGGAGCAAGTTGT
TTATATGAATGAGATGAAAGCGCTTCCTCCTTTTCCAGAGAACCTCCACCTCCACCTCAA
CCCAACCCAGTGCCGAAACCGCAAGTAAGTGATGATCTATGACGTCATGCTGATGTCAGC
AAGGAGGAATGAGAGGTCAAGCTAGTTTGGCAAAGATGAGTCCGTGACAAGTGCCAATGC
TGAGCTGGACCAATCATGAAGCAAGGATGATGTGGAGATGGAGTAACGACTTTACGCGGA
AAAAGTTGAGTCGTTAGACGGTTAGGCTATTAGGCCGAGCTTGTTGGGCAATTGGGCTTA
GGCCTAGTATAAATAGAAAGGAATGAGAGAATAAACGTAGGCCATAATTGTCTTGTAGTG
GGGAAGTCTATAGCTTATTGCTTTAGTCTTTGGGCTCACTTAATGGAATACCGTATTGGG
ATTGG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2C884TF 600 0 0
AAACTTAATAGACTTGTCTACTTAAAAAAACAAAAGAAAAGAAAGAGAGAAAAACATAAA
CTGTGATGATGGTTGCAGAAACCATGGTATCAAAACGAGATTTAAAAAAAAACAAATAGG
ATGCGGATACATGTTGTTGATATGAATGAGAATCTAAGGTAGAGGAGCAAGTTGTTTATA
TGAATGAGATGAAAGCGCTTCCTCCTTTTCCAGAGAACCTCCACCTCCACCTCAACCCAA
CCCAGTGCCGAAACCGCAAGTAAGTGATGATCTATGACGTCATGCTGATGTCAGCAAGGA
GGAATGAGAGGTCAAGCTAGTTTGGCAAAGATGAGTCCGTGACAAGTGCCAATGCTGAGC
TGGACCAATCATGAAGCAAGGATGATGTGGAGATGGAGTAACGACTTTACGCGGAAAAAG
TTGAGTCGTTAGACGGTTAGGCTATTAGGCCGAGCTTGTTGGGCAATTGGGCTTAGGCCT
AGTATAAATAGAAAGGAATGAGAGAATAAACGTAGGCCATAATTGTCTTGTAGTGGGGAA
GTCTATAGCTTATTGCTTTAGTCTTTGGGCTCACTTAATGGAATACCGTATTGGGATTGG

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

CO CL5769Contig1 757 2 3 U
GGCAACAAATTATTAGTATTTTTTTAGCAGAGCACAACTACAGTTTGTAACGTTTATATG
CTAAAAAAAAGACAGAAAAGGTTTTTAAAAGGAAAGAAAAAAAACAAGTTAGGCAAGTAA
AATAGGTTGGAACTTTACAAAAGCGACATGATGAGGATTTACATGATTCTACATTTGCTA
TCTTTATCTTTAGGGGATTTGCCTTCCTGTCTTGACGCTGTAGCTGATGATGGCCTGTGG
CTGCTCCTTGGTACCTGAGGACCAGTGATCAGTCGTGAAGCACCAACAATTGTTGGTGGT
TGTGGAGTTGGGTTACTCCGTGGGCTCTGGTCCTCAAACTCTTGTTGTTGCAAAGCTATC
GCCAGTTGTAGATCAGAGTTGACTTCTACGCCTGTGTCTGGAATGCTCGCAAGATAATCA
GCAGTATTTGTGACTGCGTTTTGTTCATCCCACGTGCCACTCGCACCAGTTGTGCTGCTG
TCTATCTTGAACTCCTTGAAAGTAGCAGTCATGAACGCAGTGTCACCATTAACCTCATTA
AGCTTTTCCCATACTAAATCAGGCTGATTCAGGTAACCTTGATCTGTAGCCAAAAGATAA
AGTTCACCTTCGTACTTGAACATGGTGCAGAAATGATTGTTGCGGAAAAAGACACAGAGT
TCACGTTCTTTAAGACCTTCTTGCAAGCGAAAGAGTCCACAAAAGGTTAATTGACTGGCA
CTATTCTTCAGGAAGTTCCTGATTACTTCACCTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B936JQ U 39
AF RR2B936TF C 1
BS 1 38 RR2B936TF
BS 39 356 RR2B936JQ
BS 357 757 RR2B936TF

RD RR2B936JQ 318 0 0
TACAGTTTGTAACGTTTATATGCTAAAAAAAAGACAGAAAAGGTTTTTAAAAGGAAAGAA
AAAAAACAAGTTAGGCAAGTAAAATAGGTTGGAACTTTACAAAAGCGACATGATGAGGAT
TTACATGATTCTACATTTGCTATCTTTATCTTTAGGGGATTTGCCTTCCTGTCTTGACGC
TGTAGCTGATGATGGCCTGTGGCTGCTCCTTGGTACCTGAGGACCAGTGATCAGTCGTGA
AGCACCAACAATTGTTGGTGGTTGTGGAGTTGGGTTACTCCGTGGGCTCTGGTCCTCAAA
CTCTTGTTGTTGCAAAGC

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR2B936TF 757 0 0
GGCAACAAATTATTAGTATTTTTTTAGCAGAGCACAACTACAGTTTGTAACGTTTATATG
CTAAAAAAAAGACAGAAAAGGTTTTTAAAAGGAAAGAAAAAAAACAAGTTAGGCAAGTAA
AATAGGTTGGAACTTTACAAAAGCGACATGATGAGGATTTACATGATTCTACATTTGCTA
TCTTTATCTTTAGGGGATTTGCCTTCCTGTCTTGACGCTGTAGCTGATGATGGCCTGTGG
CTGCTCCTTGGTACCTGAGGACCAGTGATCAGTCGTGAAGCACCAACAATTGTTGGTGGT
TGTGGAGTTGGGTTACTCCGTGGGCTCTGGTCCTCAAACTCTTGTTGTTGCAAAGCTATC
GCCAGTTGTAGATCAGAGTTGACTTCTACGCCTGTGTCTGGAATGCTCGCAAGATAATCA
GCAGTATTTGTGACTGCGTTTTGTTCATCCCACGTGCCACTCGCACCAGTTGTGCTGCTG
TCTATCTTGAACTCCTTGAAAGTAGCAGTCATGAACGCAGTGTCACCATTAACCTCATTA
AGCTTTTCCCATACTAAATCAGGCTGATTCAGGTAACCTTGATCTGTAGCCAAAAGATAA
AGTTCACCTTCGTACTTGAACATGGTGCAGAAATGATTGTTGCGGAAAAAGACACAGAGT
TCACGTTCTTTAAGACCTTCTTGCAAGCGAAAGAGTCCACAAAAGGTTAATTGACTGGCA
CTATTCTTCAGGAAGTTCCTGATTACTTCACCTTCTC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL5770Contig1 1259 2 2 U
GGGTTACCTAAAACATCTGTCTCTCGCTTCATCTCGCCTCTTTTAAAATAAAAAAAAAAA
CATATGAGGTCGTTGAAGATGGGTGGAGACATGATGGAAGATGATTGGGAGTTTGCTTCA
TCCTCAAACCCTAACCGAACCCTAGTTCTTGTCGGCCGTACTGGAAACGGAAAGAGCGCA
ACAGGTAACAGCCTCCTTGGAAAGAAAGCGTTCAAGTCAAAAGCAAGCTCTAGAGGAGTG
ACTAGCACATCAGAGTCACAGAGAGTTGTCAAAGAAGATGGACAGATCATCAACGTTATC
GACACTCCTGGTCTGTTTGATTTGTCAACGGCAGCAGAGTTTATAGGGAAAGAGATAGTG
AGATGCGTAACTCTTGCTGAAGGTGGAATCCATGCTGTTCTGTTGGTGTTCACTGTGAGG
GGTCGTCCTACAGATGAGGAGCAGTCTGTTCTCTATCACTTGCAGACGCTTTTCGGCAGT
AAGATCTCTGACTATATGATCATTGTCTTTACCGGTGGAGATGATCTGGAAGACAATGAT
GAGACGTTGGAGGACTATTTGGGTCAGGAGTGCCCTGAGTTTCTGAAAGAGATTCTTGAA
CTATGTGACAATAGAATGGTACTGTTTGATAACAAGACTACCAATAAGCGGAAGAAAGCA
GAGCAAGTTCAGAAGCTTCTCTCACTTGTTGACTCTGTTGCTAGAAAGAACAATGGAAAA
CCGTTTACAGATGAGTTGTTCCATGAACTACAGGAGGAGGCTATCAAGCTACGTGATCAG
AAAAAGGAGGTTGAATCGCTCAAGGGTTATTCAAAGAGTGAGATATTTGAGTTCAAGAAG
CAGATAGAGATATCCTATGACAGACAGCTTAGCCGTATCACAGAGATGGTGGAGACAAAG
CTGAAAGAAACGGCAAAGAGGCTGGAGAAGCAGCTAGGTGAAGAGCAAGCGGCAAGACTT
GAAGCCGAAGAGTGGGCAAACGAAGTTCAGAAACGGTCAAGTGATGAGATTAAGAAGCTG
AGAGAGAATCTGGAGAGGGCGGAGAACGAGACAAAGGAGCTCCAGAAAAAACTCGGAAAG
TGCATCAATCCTTGATTGAGATCCAAGCTTCTTTCAAGTCTCTGATAAGGGCTTTCATTT
ATTCAAAATATATTGTGGTTTTATTATCATTAAAAGACAAAAAGGTGTTTTATAAGTCTA
AATAATGACGGATGCACGTGAATATTATTTTTTCTCTCTTCTGAATTTGATGCTGGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO89TF U 1
AF RR2AO89JQ C 432
BS 1 749 RR2AO89TF
BS 750 1259 RR2AO89JQ

RD RR2AO89TF 749 0 0
GGGTTACCTAAAACATCTGTCTCTCGCTTCATCTCGCCTCTTTTAAAATAAAAAAAAAAA
CATATGAGGTCGTTGAAGATGGGTGGAGACATGATGGAAGATGATTGGGAGTTTGCTTCA
TCCTCAAACCCTAACCGAACCCTAGTTCTTGTCGGCCGTACTGGAAACGGAAAGAGCGCA
ACAGGTAACAGCCTCCTTGGAAAGAAAGCGTTCAAGTCAAAAGCAAGCTCTAGAGGAGTG
ACTAGCACATCAGAGTCACAGAGAGTTGTCAAAGAAGATGGACAGATCATCAACGTTATC
GACACTCCTGGTCTGTTTGATTTGTCAACGGCAGCAGAGTTTATAGGGAAAGAGATAGTG
AGATGCGTAACTCTTGCTGAAGGTGGAATCCATGCTGTTCTGTTGGTGTTCACTGTGAGG
GGTCGTCCTACAGATGAGGAGCAGTCTGTTCTCTATCACTTGCAGACGCTTTTCGGCAGT
AAGATCTCTGACTATATGATCATTGTCTTTACCGGTGGAGATGATCTGGAAGACAATGAT
GAGACGTTGGAGGACTATTTGGGTCAGGAGTGCCCTGAGTTTCTGAAAGAGATTCTTGAA
CTATGTGACAATAGAATGGTACTGTTTGATAACAAGACTACCAATAAGCGGAAGAAAGCA
GAGCAAGTTCAGAAGCTTCTCTCACTTGTTGACTCTGTTGCTAGAAAGAACAATGGAAAA
CCGTTTACAGATGAGTTGTTCCATGAACT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2AO89JQ 828 0 0
AGATGAGGAGCAGTCTGTTCTCTATCACTTGCAGACGCTTTTCGGCAGTAAGATCTCTGA
CTATATGATCATTGTCTTTACCGGTGGAGATGATCTGGAAGACAATGATGAGACGTTGGA
GGACTATTTGGGTCAGGAGTGCCCTGAGTTTCTGAAAGAGATTCTTGAACTATGTGACAA
TAGAATGGTACTGTTTGATAACAAGACTACCAATAAGCGGAAGAAAGCAGAGCAAGTTCA
GAAGCTTCTCTCACTTGTTGACTCTGTTGCTAGAAAGAACAATGGAAAACCGTTTACAGA
TGAGTTGTTCCATGAACTACAGGAGGAGGCTATCAAGCTACGTGATCAGAAAAAGGAGGT
TGAATCGCTCAAGGGTTATTCAAAGAGTGAGATATTTGAGTTCAAGAAGCAGATAGAGAT
ATCCTATGACAGACAGCTTAGCCGTATCACAGAGATGGTGGAGACAAAGCTGAAAGAAAC
GGCAAAGAGGCTGGAGAAGCAGCTAGGTGAAGAGCAAGCGGCAAGACTTGAAGCCGAAGA
GTGGGCAAACGAAGTTCAGAAACGGTCAAGTGATGAGATTAAGAAGCTGAGAGAGAATCT
GGAGAGGGCGGAGAACGAGACAAAGGAGCTCCAGAAAAAACTCGGAAAGTGCATCAATCC
TTGATTGAGATCCAAGCTTCTTTCAAGTCTCTGATAAGGGCTTTCATTTATTCAAAATAT
ATTGTGGTTTTATTATCATTAAAAGACAAAAAGGTGTTTTATAAGTCTAAATAATGACGG
ATGCACGTGAATATTATTTTTTCTCTCTTCTGAATTTGATGCTGGACG

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 2

CO CL5771Contig1 618 2 2 U
GGAAGCACATGAAGGAAGATATTCAGATTTCGAAAATGAAGCAACTGAAAATGAGTACCG
AACTAAACCGGACCTGATCGTAACAATTCATCTTCGAGGCGGCCTTCTCAATCTCAAGCT
GGATCGATACTCTATCACGTAACTACCAACCTCCCCTTGATGCTCACTTGGTAATTTCTG
TCATGTCTATGCGACTCGTGTACAACCTGCATATGCTGTTAATATGTGGAACGAGGCAGT
CAATAAACTACGGCTCGGTACAGAGCAACTGGATTTGTATGGGATTCTTGAAGAAACAAT
GAGGCGTGAAATGTCATTTGATGAGATAGTCGCCATCCCCAAACAGGACGAGTGACAACA
TGTGTTGCTTTTATCCTTGCAATGTACAAAGCCGCTGGTGCATTCGGCCCTCTGACTGAT
CACATTCAAGGCCCTCTAAGTGTTAGGAAAAAATATTCAACCTGTTTGTCTCTGTAACTC
TGTGTTTTATCTACTTTATGTTTATTTATTTAGCAAGCTTTAGCTTTTTAGTTATAAGTT
ATAAGCGAAGAAAACCACACATGACAATTATATGTGATTATGTGATGATATTTTATTAAA
TATAAGTTGGTTCGAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC42TF U 1
AF RR2EC42JQ C 1
BS 1 313 RR2EC42TF
BS 314 618 RR2EC42JQ

RD RR2EC42TF 321 0 0
GGAAGCACATGAAGGAAGATATTCAGATTTCGAAAATGAAGCAACTGAAAATGAGTACCG
AACTAAACCGGACCTGATCGTAACAATTCATCTTCGAGGCGGCCTTCTCAATCTCAAGCT
GGATCGATACTCTATCACGTAACTACCAACCTCCCCTTGATGCTCACTTGGTAATTTCTG
TCATGTCTATGCGACTCGTGTACAACCTGCATATGCTGTTAATATGTGGAACGAGGCAGT
CAATAAACTACGGCTCGGTACAGAGCAACTGGATTTGTATGGGATTCTTGAAGAAACAAT
GAGGCGTGAAATG
CATTTGAT

QA 1 313 1 313
DS 

RD RR2EC42JQ 618 0 0
GGAAGCACATGAAGGAAGATATTCAGATTTCGAAAATGAAGCAACTGAAAATGAGTACCG
AACTAAACCGGACCTGATCGTAACAATTCATCTTCGAGGCGGCCTTCTCAATCTCAAGCT
GGATCGATACTCTATCACGTAACTACCAACCTCCCCTTGATGCTCACTTGGTAATTTCTG
TCATGTCTATGCGACTCGTGTACAACCTGCATATGCTGTTAATATGTGGAACGAGGCAGT
CAATAAACTACGGCTCGGTACAGAGCAACTGGATTTGTATGGGATTCTTGAAGAAACAAT
GAGGCGTGAAATGTCATTTGATGAGATAGTCGCCATCCCCAAACAGGACGAGTGACAACA
TGTGTTGCTTTTATCCTTGCAATGTACAAAGCCGCTGGTGCATTCGGCCCTCTGACTGAT
CACATTCAAGGCCCTCTAAGTGTTAGGAAAAAATATTCAACCTGTTTGTCTCTGTAACTC
TGTGTTTTATCTACTTTATGTTTATTTATTTAGCAAGCTTTAGCTTTTTAGTTATAAGTT
ATAAGCGAAGAAAACCACACATGACAATTATATGTGATTATGTGATGATATTTTATTAAA
TATAAGTTGGTTCGAACT

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL5772Contig1 831 2 7 U
GTGAAATTATGCAAATACAATTGTATCCTTGTGAGTAATTCATCAAAAGATAAGTAACAA
TTTCTTCCATAACTCGATGGGAGTCTCCCAGTACAACAATGCCTGTCAAACACAATCAAA
ATAACAAAAGGTTCCTTGACAAAATGTTTAGCTGATCATAGTTTTAAGCTTAGCTTATTC
ATCTAGCCTTCTATTTCAAATAGGATGAAGAAGAAGCTAAAAAGGGTAAAAATATAACTT
AATAGTTCTTATTGTAATCTTCTTGAGACCAAAACTCAGCTTACGTTATGGTACGAGTCG
ATGATGGCATCAGCAAGGTACTCGCATTTAGCCATAGACAATCCAGCCAACGATATCCTC
CCATCTTTAGTCATGTACACGTGCCACTTGTTCGTCATATTATCACTCTGAGCCTTGTTG
AGTCCGGTGAACGAGAACATGCCAATCTGCTTCAGAATAAACGACCAGTCCTTGCCGCTC
TTGTCTTTGGAAACGAGGCTGTCGTACAACTTCTGTCTCACCGTCTTGATCCTTCCCGCC
ATCATTTCCATCTCTGCTTTCCACTCGTTGAACATGGCTGAATCGCCCACGACGTTAGCC
ACGATCCTCGCACCGTGAACCGGTGGGTTCGAGTACATAGGCCGAGCTATCCTCTTCAAC
TGGCTCTTAACCCTTGTAGCAGCATCGGCTGATGAGCAGACGACGTTGATCGCACCAATC
CTTTCAGCGTAAAGGCCCAAGTTTTTACTATATGACTGAGCGACGAAAAACTCCATTCCA
CGCTCAGCAAATAGTCTCACAGAAGATGCATCTTCATCAAGGCTTCCACTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI54JQ U 23
AF RR2B628JQ U 1
BS 1 67 RR2B628JQ
BS 68 68 RR2BI54JQ
BS 69 192 RR2B628JQ
BS 193 193 RR2BI54JQ
BS 194 349 RR2B628JQ
BS 350 350 RR2BI54JQ
BS 351 831 RR2B628JQ

RD RR2BI54JQ 623 0 0
GTATCCTTGTGAGTAATTCATCAAAAGATAAGTAACAATTTCTTCCATAACTCGATGGGA
GTCTCCCAGTACAACAATGCCTGTCGAACACAATCAAAATAACAAAAGGTTCCTTGACAA
AATGTTTAGCTGATCATAGTTTTAAGCTTAGCTTATTCATCTAGCCTTCTATTTCAAATA
GGATGAAGAAGAAGCTAAAAAGGGTAAAAATATAACTTAATAGTTCTTATTGTAATCTTC
TTGAGACCAAAACTCAGCTTACGTTATGGTACGAGTCGATGATGGCATCAGCAAGGTACT
CGCATTTAGCCATTGACAATCCAGCCAACGATATCCTCCCATCTTTAGTCATGTACACGT
GCCACTTGTTCGTCATATTATCACTCTGAGCCTTGTTGAGTCCGGTGAACGAGAACATGC
CGATCTGCTTCAGAATAAACGACCAGTCCTTGCCGCTCTTGTCTTTGGAAACGAGGCTGT
CGTACAACTTCTGTCTCACCGTCTTGATCCTTCCCGCCATCATTTCCATCTCTGCTTTCC
ACTCGTTGAACATGGCTGCATCGCCCACGACGTTAGCCACGATCCTCGCACCGTGAACCG
GTGGGTTCGAGTACATAGGCCGA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2B628JQ 831 0 0
GTGAAATTATGCAAATACAATTGTATCCTTGTGAGTAATTCATCAAAAGATAAGTAACAA
TTTCTTCTATAACTCGATGGGAGTCTCCCAGTACAACAATGCCTGTCAAACACAATCAAA
ATAACAAAAGGTTCCTTGACAAAATGTTTAGCTGATCATAGTTTTAAGCTTAGCTTATTC
ATCTAGCCTTCTCTTTCAAATAGGATGAAGAAGAAGCTAAAAAGGGTAAAAATATAACTT
AATAGTTCTTATTGTAATCTTCTTGAGACCAAAACTCAGCTTACGTTATGGTACGAGTCG
ATGATGGCATCAGCAAGGTACTCGCATTTAGCCATAGACAATCCAGCCAGCGATATCCTC
CCATCTTTAGTCATGTACACGTGCCACTTGTTCGTCATATTATCACTCTGAGCCTTGTTG
AGTCCGGTGAACGAGAACATGCCAATCTGCTTCAGAATAAACGACCAGTCCTTGCCGCTC
TTGTCTTTGGAAACGAGGCTGTCGTACAACTTCTGTCTCACCGTCTTGATCCTTCCCGCC
ATCATTTCCATCTCTGCTTTCCACTCGTTGAACATGGCTGAATCGCCCACGACGTTAGCC
ACGATCCTCGCACCGTGAACCGGTGGGTTCGAGTACATAGGCCGAGCTATCCTCTTCAAC
TGGCTCTTAACCCTTGTAGCAGCATCGGCTGATGAGCAGACGACGTTGATCGCACCAATC
CTTTCAGCGTAAAGGCCCAAGTTTTTACTATATGACTGAGCGACGAAAAACTCCATTCCA
CGCTCAGCAAATAGTCTCACAGAAGATGCATCTTCATCAAGGCTTCCACTA

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 2

CO CL5773Contig1 872 2 2 U
GGAATATGAATAATGGAGAGCTTCTCTCTCTTCCTCTAGAGAGAGAAATTTCTCTCGAGA
CTCCCTTCTTATCAATCACATATCTTTCAGAAGGGAGGACTCGATTTTGTTTTGTTATGT
GATATATTCGATCAATAGATCGACTTTTGTTTTCGTTCTGGCGATTTAGTCTTCGCACGG
CGATTTCGGTTCCGCTTGTCGGAAATTTTCTTCGCTTGGCGATTTTTTTGTTGTGTTTTT
CTTCAAGCCAATCAGAGCTTTTCTTAACGTTTTCATCTTTTATCTCTGATTTGCTTGATT
CTCTTTTCCCCCGTGCAAGATTTAATTTTTTTTTATTCCGGTTCTTTGATTTGCTCTCTT
TGTGATCTTCGAGTGCTAGATCTCCTCCATGGGAGAGTAATCATCTTCCTGTTGAAAAGT
TGGGAAGTTTCTCCTTCTTGGTTGAGAATCTTAGTTAATGGATGAAGCATACCGATTGGA
AGCAGATTAAGCAAAGTTGGGGTTTTTCATAAAACGTCCTAACATATGATCTGTTCTTTT
CATTGGTCAAGATCATCTCTGAGCTTAATGATCGAGGATCATTCTGAGTTCAAATAAGAA
GGCCGGCGAGCACTGCATGTGGGTTTCAAGACGGATTCGAAAGAGGCGATAGTGTTTCAT
GCATCATCGGAGAGATGATCGGAAAATTGATCGGAGCGCCGGTGAGCAGGTCTACACATC
TCGGGAATCTTCTCACCACCCAAAGACAAAGCCCTTCTCTTAACACGTGTAGCATACGTG
TTTCTTCCTGAGTTAATTTTTATCAGATTTATATTGGGTTTTTTATTGTTGTAATGGGCT
TTCGAATTCTTCTTGTAATGTTTAAGCTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG69TF U 1
AF RR2BG69JQ C 135
BS 1 833 RR2BG69TF
BS 834 872 RR2BG69JQ

RD RR2BG69TF 833 0 0
GGAATATGAATAATGGAGAGCTTCTCTCTCTTCCTCTAGAGAGAGAAATTTCTCTCGAGA
CTCCCTTCTTATCAATCACATATCTTTCAGAAGGGAGGACTCGATTTTGTTTTGTTATGT
GATATATTCGATCAATAGATCGACTTTTGTTTTCGTTCTGGCGATTTAGTCTTCGCACGG
CGATTTCGGTTCCGCTTGTCGGAAATTTTCTTCGCTTGGCGATTTTTTTGTTGTGTTTTT
CTTCAAGCCAATCAGAGCTTTTCTTAACGTTTTCATCTTTTATCTCTGATTTGCTTGATT
CTCTTTTCCCCCGTGCAAGATTTAATTTTTTTTTATTCCGGTTCTTTGATTTGCTCTCTT
TGTGATCTTCGAGTGCTAGATCTCCTCCATGGGAGAGTAATCATCTTCCTGTTGAAAAGT
TGGGAAGTTTCTCCTTCTTGGTTGAGAATCTTAGTTAATGGATGAAGCATACCGATTGGA
AGCAGATTAAGCAAAGTTGGGGTTTTTCATAAAACGTCCTAACATATGATCTGTTCTTTT
CATTGGTCAAGATCATCTCTGAGCTTAATGATCGAGGATCATTCTGAGTTCAAATAAGAA
GGCCGGCGAGCACTGCATGTGGGTTTCAAGACGGATTCGAAAGAGGCGATAGTGTTTCAT
GCATCATCGGAGAGATGATCGGAAAATTGATCGGAGCGCCGGTGAGCAGGTCTACACATC
TCGGGAATCTTCTCACCACCCAAAGACAAAGCCCTTCTCTTAACACGTGTAGCATACGTG
TTTCTTCCTGAGTTAATTTTTATCAGATTTATATTGGGTTTTTTATTGTTGTA

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2BG69JQ 738 0 0
ATAGATCGACTTTTGTTTTCGTTCTGGCGATTTAGTCTTCGCACGGCGATTTCGGTTCCG
CTTGTCGGAAATTTTCTTCGCTTGGCGATTTTTTTGTTGTGTTTTTCTTCAAGCCAATCA
GAGCTTTTCTTAACGTTTTCATCTTTTATCTCTGATTTGCTTGATTCTCTTTTCCCCCGT
GCAAGATTTAATTTTTTTTTATTCCGGTTCTTTGATTTGCTCTCTTTGTGATCTTCGAGT
GCTAGATCTCCTCCATGGGAGAGTAATCATCTTCCTGTTGAAAAGTTGGGAAGTTTCTCC
TTCTTGGTTGAGAATCTTAGTTAATGGATGAAGCATACCGATTGGAAGCAGATTAAGCAA
AGTTGGGGTTTTTCATAAAACGTCCTAACATATGATCTGTTCTTTTCATTGGTCAAGATC
ATCTCTGAGCTTAATGATCGAGGATCATTCTGAGTTCAAATAAGAAGGCCGGCGAGCACT
GCATGTGGGTTTCAAGACGGATTCGAAAGAGGCGATAGTGTTTCATGCATCATCGGAGAG
ATGATCGGAAAATTGATCGGAGCGCCGGTGAGCAGGTCTACACATCTCGGGAATCTTCTC
ACCACCCAAAGACAAAGCCCTTCTCTTAACACGTGTAGCATACGTGTTTCTTCCTGAGTT
AATTTTTATCAGATTTATATTGGGTTTTTTATTGTTGTAATGGGCTTTCGAATTCTTCTT
GTAATGTTTAAGCTTTAT

QA 1 738 1 738
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5775Contig1 1079 2 2 U
GGAGCTGCTTGATGTTAAGGTTCGTTATGCTGAGAATCTTCCGACAGTACTCCACGGGAT
AAGCTGTGTGTTCCCTGGTGGAAAGAAGATTGGTATTGTTGGAAGAACGGGAAGCGGGAA
ATCGACTTTGACTCAAGCTTTGTTTCGGCTGATTGAGCCAACTGCTGGAAAGATCACTAT
AGACAACATTGATATCTCTCAGATTGGTCTTCATGATCTCCGTAGTCGCCTTGGTATCAT
ACCTCAGGATCCTACATTGTTTGAAGGAACGATCCGTGCAAATCTTGACCCTCTTGAAGA
GCATTCAGATGATAAAATCTGGGAGGCGCTTGATAAATCCCAGCTTGGAGACGTTGTTAG
AGGAAAAGACTTAAAACTCGACTCTCCAGTGCTGGAGAACGGAGATAACTGGGGTGTTGG
GCAGAGACAGCTAGTGTCGCTTGGGAGAGCATTACTTAAACAAGCGAGAATACTTGTTCT
TGATGAAGCAACAGCATCGGTAGACACAGCAACAGACAATTTAATCCAGAAGATTATCAG
AACTGAGTTTCAAGACTGCACAGTCTGCACCATTGCTCACCGGATCCCAACTGTTATCGA
CAGTGACCTTGTTTTGGTTCTCAGCGACGGTAGAGTAGCAGAGTTTGATACTCCTGCACG
GCTCTTAGAAGACAAATCATCCATGTTCTTAAAACTTGTGAGCGAATACTCCTCAAGATC
TAGTGGGATGCCTGACTTGTGATCATTCATGTTAAAAATTGAGGTTAGGGATTTTGTTTC
TCAAGAGAAACATAAAAAAACTGAAAAATGTGACAAAGCTTAAAGTCTCTAAGCAAGATA
GAGAGTTCCACTGGGTAGAAGAAAGAAAAAAGAATGACATGATGCAGTCTTCGTGCTCAT
ATTATACTTTTAAAGCCACTCTTTTGAACATTGAAAGAGACCTTTTTGTAAGGAACGAAG
CTTCTGTGGTGATCTTTTTAAATGTTATTTGATAATCTGCAAAAACAGTTCTTTTTTGCC
GTTTAGAAAATGATTATTATTAATTATTGTGTAATATAAATCACACCATGAATGTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH94TF U 1
AF RR2CH94JQ C 299
BS 1 625 RR2CH94TF
BS 626 1079 RR2CH94JQ

RD RR2CH94TF 625 0 0
GGAGCTGCTTGATGTTAAGGTTCGTTATGCTGAGAATCTTCCGACAGTACTCCACGGGAT
AAGCTGTGTGTTCCCTGGTGGAAAGAAGATTGGTATTGTTGGAAGAACGGGAAGCGGGAA
ATCGACTTTGACTCAAGCTTTGTTTCGGCTGATTGAGCCAACTGCTGGAAAGATCACTAT
AGACAACATTGATATCTCTCAGATTGGTCTTCATGATCTCCGTAGTCGCCTTGGTATCAT
ACCTCAGGATCCTACATTGTTTGAAGGAACGATCCGTGCAAATCTTGACCCTCTTGAAGA
GCATTCAGATGATAAAATCTGGGAGGCGCTTGATAAATCCCAGCTTGGAGACGTTGTTAG
AGGAAAAGACTTAAAACTCGACTCTCCAGTGCTGGAGAACGGAGATAACTGGGGTGTTGG
GCAGAGACAGCTAGTGTCGCTTGGGAGAGCATTACTTAAACAAGCGAGAATACTTGTTCT
TGATGAAGCAACAGCATCGGTAGACACAGCAACAGACAATTTAATCCAGAAGATTATCAG
AACTGAGTTTCAAGACTGCACAGTCTGCACCATTGCTCACCGGATCCCAACTGTTATCGA
CAGTGACCTTGTTTTGGTTCTCAGC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2CH94JQ 781 0 0
GAGCATTCAGATGATAAAATCTGGGAGGCGCTTGATAAATCCCAGCTTGGAGACGTTGTT
AGAGGAAAAGACTTAAAACTCGACTCTCCAGTGCTGGAGAACGGAGATAACTGGGGTGTT
GGGCAGAGACAGCTAGTGTCGCTTGGGAGAGCATTACTTAAACAAGCGAGAATACTTGTT
CTTGATGAAGCAACAGCATCGGTAGACACAGCAACAGACAATTTAATCCAGAAGATTATC
AGAACTGAGTTTCAAGACTGCACAGTTTGCACCATTGCTCACCGGATCCCAACTGTTATC
GACAGTGACCTTGTTTTGGTTTTCAGCGACGGTAGAGTAGCAGAGTTTGATACTCCTGCA
CGGCTCTTAGAAGACAAATCATCCATGTTCTTAAAACTTGTGAGCGAATACTCCTCAAGA
TCTAGTGGGATGCCTGACTTGTGATCATTCATGTTAAAAATTGAGGTTAGGGATTTTGTT
TCTCAAGAGAAACATAAAAAAACTGAAAAATGTGACAAAGCTTAAAGTCTCTAAGCAAGA
TAGAGAGTTCCACTGGGTAGAAGAAAGAAAAAAGAATGACATGATGCAGTCTTCGTGCTC
ATATTATACTTTTAAAGCCACTCTTTTGAACATTGAAAGAGACCTTTTTGTAAGGAACGA
AGCTTCTGTGGTGATCTTTTTAAATGTTATTTGATAATCTGCAAAAACAGTTCTTTTTTG
CCGTTTAGAAAATGATTATTATTAATTATTGTGTAATATAAATCACACCATGAATGTTAC
G

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL5776Contig1 767 2 3 U
TTCATAGGATCAAAAACTCAAGGTGACCAAACAATACCAAAAATAGTAGAAAGAAAGCTC
AAACGGAAAAAAAAAAGCTCTTGTGAACGAGCGGAAGAATACTAAAAGGAAACTGCCAAT
GATTGTGACCAAAGCAATTCATAGCGCTTATATTTGCACTGACTTCCGCTTCGTACAACA
GTTGGAGACACGATCAGTTCGAAGTCAGAGGTTTCTTCGCCTTCCGTTTACGTCGTGGCT
TTCCACTACTCGCTGGGGGTGGTGACGACGTCCCATCTTGTGAGCTTACGCTACACGGAG
AAACATCATCCTTCGTAACTTCACCAGCATCAAGACCATCAGAGATCTTGCACTCCTCGA
TATCCTCCTTGAGGGTCACGTCTTTCTCCTCGGCTACCTCCTTACGTTCCTTCTTCTTTT
TGTTTTTCTTAGCGGGGAGGCTGATCTCTTCTGAACCGGCCGCGGAAGGAGGAGGAGAAG
GAGGAAGACGGAGCTTTTCGAGTTCTTCGATAAGGGCGATGACGATTGGCTTCGAGAGGA
TGGCTTCTTTTTGCTCCTTGTTTAGGGTTTTGCCCTGAGAAACCGACTCTTCCATCTCGG
TAATACGGTTGTACTTCTTGCGGTGAGCGCGGAGACGCTTGCTGATGAGAGCCATGACTT
GTTGTCCTTCTGTGACGGCCATGTTGTCAATGAGCGATGTGAACGACGGCTGAGGAGAAG
AAAGATATAGAGGTTGGTTATAGGTTTAGGGATATGAAATAGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX64JQ U 10
AF RR2EX64TF C 1
BS 1 11 RR2EX64TF
BS 12 657 RR2EX64JQ
BS 658 767 RR2EX64TF

RD RR2EX64JQ 648 0 0
CA
AAAAACTCAAGGTGACCAAACAATACCAAAAATAGTAGAAAGAAAGCTCAAACGGAAAAA
AAAAAGCTCTTGTGAACGAGCGGAAGAATACTAAAAGGAAACTGCCAATGATTGTGACCA
AAGCAATTCATAGCGCTTATATTTGCACTGACTTCCGCTTCGTACAACAGTTGGAGACAC
GATCAGTTCGAAGTCAGAGGTTTCTTCGCCTTCCGTTTACGTCGTGGCTTTCCACTACTC
GCTGGGGGTGGTGACGACGTCCCATCTTGTGAGCTTACGCTACACGGAGAAACATCATCC
TTCGTAACTTCACCAGCATCAAGACCATCAGAGATCTTGCACTCCTCGATATCCTCCTTG
AGGGTCACGTCTTTCTCCTCGGCTACCTCCTTACGTTCCTTCTTCTTTTTGTTTTTCTTA
GCGGGGAGGCTGATCTCTTCTGAACCGGCCGCGGAAGGAGGAGGAGAAGGAGGAAGACGG
AGCTTTTCGAGTTCTTCGATAAGGGCGATGACGATTGGCTTCGAGAGGATGGCTTCTTTT
TGCTCCTTGTTTAGGGTTTTGCCCTGAGAAACCGACTCTTCCATCTCGGTAATACGGTTG
TACTTCTTGCGGTGAGCGCGGAGACGCTTGCTGATGAGAGCCATGA

QA 3 648 3 648
DS 

RD RR2EX64TF 767 0 0
TTCATAGGATCAAAAACTCAAGGTGACCAA*CAATACCAAAAATAGTAGAAAGAAAGCTC
AAACGGAAAAAAAAA*GCTCTTGTGAACGAGCGGAAGAATACTAAAAGGAAACTGCCAAT
GATTGTGACCAAAGCAATTCATAGCGCTTATATTTGCACTGACTTCCGCTTCGTACAACA
GTTGGAGACACGATCAGTTCGAAGTCAGAGGTTTCTTCGCCTTCCGTTTACGTCGTGGCT
TTCCACTACTCGCTGGGGGTGGTGACGACGTCCCATCTTGTGAGCTTACGCTACACGGAG
AAACATCATCCTTCGTAACTTCACCAGCATCAAGACCATCAGAGATCTTGCACTCCTCGA
TATCCTCCTTGAGGGTCACGTCTTTCTCCTCGGCTACCTCCTTACGTTCCTTCTTCTTTT
TGTTTTTCTTAGCGGGGAGGCTGATCTCTTCTGAACCGGCCGCGGAAGGAGGAGGAGAAG
GAGGAAGACGGAGCTTTTCGAGTTCTTCGATAAGGGCGATGACGATTGGCTTCGAGAGGA
TGGCTTCTTTTTGCTCCTTGTTTAGGGTTTTGCCCTGAGAAACCGACTCTTCCATCTCGG
TAATACGGTTGTACTTCTTGCGGTGAGCGCGGAGACGCTTGCTGATGAGAGCCATGACTT
GTTGTCCTTCTGTGACGGCCATGTTGTCAATGAGCGATGTGAACGACGGCTGAGGAGAAG
AAAGATATAGAGGTTGGTTATAGGTTTAGGGATATGAAATAGGATCC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL5777Contig1 1092 2 4 U
GGAGAGATCAATCATAGCCTTCACTCATGGTGCCTCTCTGACAATCCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTATTTGTCAACGCCCTCAAAAGACAGAAGAAGTTCGTTCCGCCGTGAAGCTTTCT
TCATCAGTATCATAAAGACCCACTCTTCTTACACGCAACCTCTAGAGTAGTTCGACTATC
GAGATCTCCCAACTTGCTTCCTCAAGGAAGCTTTTTCTCCGCTTCCATCAGCGCGTGTCC
CATCCCTCTTCTCCACAACTAGTAAAACATGGAGGTCATCAAGCTATGGAACGACAAGCG
TGAGCGCGAAATGTACGAGAACTTCTCCGAGCTCTACGCCATCATCAAATCCACCGAGAA
GCTCGAAAAAGCCTACATCCGCGACCTCATCTCCCCTTCCCAATACGAAACCGAGTGCCA
GAAACTCATCGTCCACTTCAAGACCCTCTCCGCAACCACCCTCAAGGACTCTGTTCCCAA
CATCGAGAGGTTCGCCGAGACCTACAAGATGGACTGCTCCGCTGCCGTGTACCGCCTCGT
GACCTCCGGTGGTGTTCCGGCTACCGTGGAGCATCGCGCCGCTGCGGTGGCGGCGTCTAC
TTCGAGCTCTGCTTCCGTTGTCGCCGAGTGTGTTCCGAATTTTATTACTTGTATGGATTC
TTTGAAGCTTAATATGGTGGCTGTTGACCAGGTGTATCCGTTGCTGTCTGATCTCTCTGC
TTCCCTTGGTAAGCTGAGTATTTTGCCGCCGGATTTTGAAGGGAAGGTTAAGATGAAAGA
GTGGCTTTTGAGGTTGTCTAAGATGGGAGCTTCTGATGAGCTCACTGAGCAGCAGGCCAG
GCAGCTTCACTTCGATCTTGAGTCTTCTTACAACTCCTTCATGGCTGCTTTGCCTAATGC
TGGTAATTAATTCAGGCAACTTTGGCTTTATGTCGTTACAACTATGGCTTTAGGATAATT
GGTTTTGGTCTGAAGCCTATTTTGCTGCTACACACTCTGTCTTTCTTTTGTTGTGTAAAG
ATCATGCCAAGCCAATACTTTGTCTTCTTCTGAATTGTAATGAATCTTAAGTAATGAGCT
TTCATCCGTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL92TF U 1
AF RR2CL92JQ C 404
BS 1 688 RR2CL92TF
BS 689 689 RR2CL92JQ
BS 690 727 RR2CL92TF
BS 728 1092 RR2CL92JQ

RD RR2CL92TF 727 0 0
GGAGAGATCAATCATAGCCTTCACTCATGGTGCCTCTCTGACAATCCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTATTTGTCAACGCCCTCAAAAGACAGAAGAAGTTCGTTCCGCCGTGAAGCTTTCT
TCATCAGTATCATAAAGACCCACTCTTCTTACACGCAACCTCTAGAGTAGTTCGACTATC
GAGATCTCCCAACTTGCTTCCTCAAGGAAGCTTTTTCTCCGCTTCCATCAGCGCGTGTCC
CATCCCTCTTCTCCACAACTAGTAAAACATGGAGGTCATCAAGCTATGGAACGACAAGCG
TGAGCGCGAAATGTACGAGAACTTCTCCGAGCTCTACGCCATCATCAAATCCACCGAGAA
GCTCGAAAAAGCCTACATCCGCGACCTCATCTCCCCTTCCCAATACGAAACCGAGTGCCA
GAAACTCATCGTCCACTTCAAGACCCTCTCCGCAACCACCCTCAAGGACTCTGTTCCCAA
CATCGAGAGGTTCGCCGAGACCTACAAGATGGACTGCTCCGCTGCCGTGTACCGCCTCGT
GACCTCCGGTGGTGTTCCGGCTACCGTGGAGCATCGCGCCGCTGCGGTGGCGGCGTCTAC
TTCGAGCTCTGCTTCCGTTGTCGCCGAGTGTGTTCCGAATTTTATTACTTGTATGGATTC
TTTGAAGCTTAATATGGTGGCTGTTGAC*AGGTGTATCCGTTGCTGTCTGATCTCTCTGC
TTCCCTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2CL92JQ 689 0 0
TACGAAACCGAGTGCCAGAAACTCATCGTCCACTTCAAGACCCTCTCCGCAACCACCCTC
AAGGACTCTGTTCCCAACATCGAGAGGTTCGCCGAGACCTACAAGATGGACTGCTCCGCT
GCCGTGTACCGCCTCGTGACCTCCGGTGGTGTTCCGGCTACCGTGGAGCATCGCGCCGCT
GCGGTGGCGGCGTCTACTTCGAGCTCTGCTTCCGTTGTCGCCGAGTGTGTTCCGAATTTT
ATTACTTGTATGGATTCTTTGAAGCTTAATATGGTGGCTGTTGACCAGGTGTATCCGTTG
CTGTCTGATCTCTCTGCTTCCCTTGGTAAGCTGAGTATTTTGCCGCCGGATTTTGAAGGG
AAGGTTAAGATGAAAGAGTGGCTTTTGAGGTTGTCTAAGATGGGAGCTTCTGATGAGCTC
ACTGAGCAGCAGGCCAGGCAGCTTCACTTCGATCTTGAGTCTTCTTACAACTCCTTCATG
GCTGCTTTGCCTAATGCTGGTAATTAATTCAGGCAACTTTGGCTTTATGTCGTTACAACT
ATGGCTTTAGGATAATTGGTTTTGGTCTGAAGCCTATTTTGCTGCTACACACTCTGTCTT
TCTTTTGTTGTGTAAAGATCATGCCAAGCCAATACTTTGTCTTCTTCTGAATTGTAATGA
ATCTTAAGTAATGAGCTTTCATCCGTACT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL5778Contig1 805 2 4 U
TTTTTTCTCTCTGTTTTCTCTCTAGACCTCCGCTCGCTTTGAATAGTATTTCCGGCCGAT
GAAATAGGCTTCCACAGCCACCGTCGGTCCAATTTATGTTTTTTCCTTCTCTTTTCTTTT
GTCTAAAGATTAAAATTACTCTGGTGGAAACCGAAATCTAGATCTACAGATCTGAGTTTG
GAGTGATGGTGGGTGTCGGTGTTCTCTCTCCCGTATCGTTCATTTGGGTCTCTTCGGGAT
CTCTCCTCTGCCTCCGCTTTTTCTCTAGTGATCCTAGCATCTGTTTGAGTATGATGTTTA
TCTTTGGCGGTGGTCTCTTTGTAGATTGGAGGATGTGCTTATCCTTGGCATCGTTTGCGA
CGGCTGATTTCCGTATGGTCTGGTGAAATTCCCGGCTCGTGACACAAGGATTTTGAGCAT
CGGCTGTTTTGCACCTTTCCGTGGAGGTTTGTGAGGTTAAATGGTTCTTCCTCCTCCCAG
GGTTGTCTCTATGTTGTGCTCATGGCTCGTCAGGTGTGTTCCGGAGCAGTTTAAAGAGCC
TTTCCCAAGCAAGTTCGATTGATGGTGTGCGCTTATCTCCTTCCTCACTCTGCGACAGAT
CTATTTACCTGAGTTTTATTCTATTGTTTTAGATTTCTTTTAGGCTTTTCTCTTAATCTT
TGTTTAGAGTGTAGTTTGGCTCCAGAGAATTTCTATAATTTTGCTGGCTTTTGGCTCTAT
AGGAATTGATGTTCCTGCTGGCTCTGTGTTTCAAATCTGTATTTCACCTCTGTATAATTC
TAATGATCAATGAACTTTCAGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H635TF U 1
AF RR2H635JQB C 271
BS 1 643 RR2H635TF
BS 644 644 RR2H635JQB
BS 645 678 RR2H635TF
BS 679 805 RR2H635JQB

RD RR2H635TF 678 0 0
TTTTTTCTCTCTGTTTTCTCTCTAGACCTCCGCTCGCTTTGAATAGTATTTCCGGCCGAT
GAAATAGGCTTCCACAGCCACCGTCGGTCCAATTTATGTTTTTTCCTTCTCTTTTCTTTT
GTCTAAAGATTAAAATTACTCTGGTGGAAACCGAAATCTAGATCTACAGATCTGAGTTTG
GAGTGATGGTGGGTGTCGGTGTTCTCTCTCCCGTATCGTTCATTTGGGTCTCTTCGGGAT
CTCTCCTCTGCCTCCGCTTTTTCTCTAGTGATCCTAGCATCTGTTTGAGTATGATGTTTA
TCTTTGGCGGTGGTCTCTTTGTAGATTGGAGGATGTGCTTATCCTTGGCATCGTTTGCGA
CGGCTGATTTCCGTATGGTCTGGTGAAATTCCCGGCTCGTGACACAAGGATTTTGAGCAT
CGGCTGTTTTGCACCTTTCCGTGGAGGTTTGTGAGGTTAAATGGTTCTTCCTCCTCCCAG
GGTTGTCTCTATGTTGTGCTCATGGCTCGTCAGGTGTGTTCCGGAGCAGTTTAAAGAGCC
TTTCCCAAGCAAGTTCGATTGATGGTGTGCGCTTATCTCCTTCCTCACTCTGCGACAGAT
CTATTTACCTGAGTTTTATTCTATTGTTTTAGATTTCTTTTAG*CTTTTCTCTTAATCTT
TGTTTAGAGTGTAGTTTG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2H635JQB 535 0 0
ATCCTAGCATCTGTTTGAGTATGATGTTTATCTTTGGCGGTGGTCTCTTTGTAGATTGGA
GGATGTGCTTATCCTTGGCATCGTTTGCGACGGCTGATTTCCGTATGGTCTGGTGAAATT
CCCGGCTCGTGACACAAGGATTTTGAGCATCGGCTGTTTTGCACCTTTCCGTGGAGGTTT
GTGAGGTTAAATGGTTCTTCCTCCTCCCAGGGTTGTCTTTATGTTGTGCTCATGGCTCGT
CAGGTGTGTTCCGGAGCAGTTTAAAGAGCCTTTCCCAAGCAAGTTCGATTGATGGTGTGC
GCTTATCTCCTTCCTCACTTTGCGACAGATCTATTTACCTGAGTTTTATTCTATTGTTTT
AGATTTCTTTTAGGCTTTTCTCTTAATCTTTGTTTAGAGTGTAGTTTGGCTCCAGAGAAT
TTCTATAATTTTGCTGGCTTTTGGCTCTATAGGAATTGATGTTCCTGCTGGCTCTGTGTT
TCAAATCTGTATTTCACCTCTGTATAATTCTAATGATCAATGAACTTTCAGTGTT

QA 1 535 1 535
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5780Contig1 1050 2 4 U
GAGAGATCTTTTCGAAGGAATACTCCAGGCTGGTTCGGCTATTGTCGAGAATCTGAGAAC
GTATGGGCAGCCGGTGTTTGTTTACATCCCTAAGATGGGAGAGCTGAGGGGTGGAGCGTG
GGTGGTTGTTGATAGCCAGATAAATTCGGATTACGTCGAGATGTATGCTGACGAGACTTC
TCGTGGGAATGTGCTTGAGCCGGAAGGGATGATTGAGATAAAGTTTAGAAAGAGAGAGAT
GTTGGAGTGCATGGGAAGGTTAGACCAGAAGCTGATTAGTCTCAAAGCAAAACTTCAAGA
TGCCAAACAAAGCGAGGGTTATGAACTTATCAAGCAACAGATTAAAGCGAGGAAGAAGCA
GCTTTTACCACTTTACATCCAGATCGCCACCAAATTTGCGGATCTTCACGACACTTCCAT
GAGGATGGCGGCAAAAGGAGTGATCAAAAGTGTTGTGGAATGGAGCGGGTCGCGGTCATT
CTTCTATAAAAAGCTCATTAGGAGAATTGCTGAGAGCTCTCTGGTGAAAAAGGTGAGAGA
GGCTTCTGGGGACAACTTGTCGTACAAATCTGCAATGGGTTTGATTAAGGATTGGTTCTG
TAAATCAGATGTTGCAAAGGGGAAAGAAGAAGAGGCTTGGACTGACGACCAAGTGTTCTT
TACGTGGAAAGACAATGTTGGTAACTACGAATCAGAGCTCAGCGAGTTGAGAGCACAGAA
ACTGCTGAAGCAACTTGCGGAGATTGGGAATTCATCTGATCTGCAGGCTCTGCCCCAGGG
ACTTGCTAATATTCTACACAAGGTGGAGCCTTTGAAAAGAAAAGAGCTAGTGGATGCGCT
TAGAAAGGTGTTGAGTTGAGAATACTTGTGCCCCAATAAAAGAGTATTTGGAATTGCTTG
TGTGCTACGGTGACGAAAATTCCCCTTGATTGAAACAAGAGTTGTCCTTTGCAATTGCTT
GTTGTTGTTTTTTTTTTTTGCCGTCAATTGCTTGTTGTTTATTTGATGAAATTTATAAGT
ATTTTGGTTATGATGAGTCGCCTTATTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F220TF U 1
AF RR2F220JQ C 523
BS 1 732 RR2F220TF
BS 733 733 RR2F220JQ
BS 734 762 RR2F220TF
BS 763 1050 RR2F220JQ

RD RR2F220TF 762 0 0
GAGAGATCTTTTCGAAGGAATACTCCAGGCTGGTTCGGCTATTGTCGAGAATCTGAGAAC
GTATGGGCAGCCGGTGTTTGTTTACATCCCTAAGATGGGAGAGCTGAGGGGTGGAGCGTG
GGTGGTTGTTGATAGCCAGATAAATTCGGATTACGTCGAGATGTATGCTGACGAGACTTC
TCGTGGGAATGTGCTTGAGCCGGAAGGGATGATTGAGATAAAGTTTAGAAAGAGAGAGAT
GTTGGAGTGCATGGGAAGGTTAGACCAGAAGCTGATTAGTCTCAAAGCAAAACTTCAAGA
TGCCAAACAAAGCGAGGGTTATGAACTTATCAAGCAACAGATTAAAGCGAGGAAGAAGCA
GCTTTTACCACTTTACATCCAGATCGCCACCAAATTTGCGGATCTTCACGACACTTCCAT
GAGGATGGCGGCAAAAGGAGTGATCAAAAGTGTTGTGGAATGGAGCGGGTCGCGGTCATT
CTTCTATAAAAAGCTCATTAGGAGAATTGCTGAGAGCTCTCTGGTGAAAAAGGTGAGAGA
GGCTTCTGGGGACAACTTGTCGTACAAATCTGCAATGGGTTTGATTAAGGATTGGTTCTG
TAAATCAGATGTTGCAAAGGGGAAAGAAGAAGAGGCTTGGACTGACGACCAAGTGTTCTT
TACGTGGAAAGACAATGTTGGTAACTACGAATCAGAGCTCAGCGAGTTGAGAGCACAGAA
ACTGCTGAAGCA*CTTGCGGAGATTGGGAATTCATCTGATCT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2F220JQ 528 0 0
GGTGAAAAAGGTGAGAGAGGCTTCTGGGGACAACTTGTCGTACAAATCTGCAATGGGTTT
GATTAAGGATTGGTTCTGTAAATCAGATGTTGCAAAGGGGAAAGAAGAAGAGGCTTGGAC
TGACGACCAAGTGTTCTTTACGTGGAAGGACAATGTTGGTAACTACGAATCAGAGCTCAG
CGAGTTGAGAGCACAGAAACTGCTGAAGCAACTTGCGGAGATTGGGAATTCATTTGATCT
GCAGGCTCTGCCCCAGGGACTTGCTAATATTCTACACAAGGTGGAGCCTTTGAAAAGAAA
AGAGCTAGTGGATGCGCTTAGAAAGGTGTTGAGTTGAGAATACTTGTGCCCCAATAAAAG
AGTATTTGGAATTGCTTGTGTGCTACGGTGACGAAAATTCCCCTTGATTGAAACAAGAGT
TGTCCTTTGCAATTGCTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTTGCCGTCAATTGCTTGTTGTTTAT
TTGATGAAATTTATAAGTATTTTGGTTATGATGAGTCGCCTTATTAGT

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL5781Contig1 318 2 1 U
GGTTTTAAGAAAAAAAAGAGTTCCTCCGCAATGAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGTATG
AGGAGGTTGAAGAGGAAGAGACGAAAGATGAGACAGCGATCTAAATAGACTCCTCTCTTT
GAAGACTTCGCTTTCCAGTTATTTCATTTCGCTAAGTACTTTTGTTTGGATCTTGTTTAA
GTTCTAAGTGTTCTTGTCTTCGTTTTTGTCGGATTGTATGGATCCTCAATTAACGTTAAA
TCTTTTTATCTTTCTAATCAGATTGTCACCAAATAATGTTTGTCTTCTTGCAAATGCTAA
TACTATAGATCTTTATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GN65JQ C 1
AF RR2GN65TF U 1
BS 1 318 RR2GN65TF

RD RR2GN65JQ 318 0 0
GGTTTTAAGAAAAAAAAGAGTTCCTCCGCAATGAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGTATG
AGGAGGTTGAAGAGGAAGAGACGAAAGATGAGACAGCGATCTAAATAGACTCCTCTCTTT
GAAGACTTCGCTTTCCAGTTATTTCATTTCGCTAAGTACTTTTGTTTGGATCTTGTTTAA
GTTCTAAGTGTTCTTGTCTTCGTTTTTGTCGGATTGTATGGATCCTCAATTAACGTTAAA
TCTTTTTATCTTTCTAATCAGATTGTCACCAAATAATGTTTGTCTTCTTGCAAATGCTAA
TACTATAGATCTTTATTG

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR2GN65TF 318 0 0
GGTTTTAAGAAAAAAAAGAGTTCCTCCGCAATGAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGTATG
AGGAGGTTGAAGAGGAAGAGACGAAAGATGAGACAGCGATCTAAATAGACTCCTCTCTTT
GAAGACTTCGCTTTCCAGTTATTTCATTTCGCTAAGTACTTTTGTTTGGATCTTGTTTAA
GTTCTAAGTGTTCTTGTCTTCGTTTTTGTCGGATTGTATGGATCCTCAATTAACGTTAAA
TCTTTTTATCTTTCTAATCAGATTGTCACCAAATAATGTTTGTCTTCTTGCAAATGCTAA
TACTATAGATCTTTATTG

QA 1 318 1 318
DS 



AS 1 2

CO CL5782Contig1 773 2 3 U
GAGAATATTTGCGGTGTACTCTTATTCACCCATCTTGAGGCAAGTTTCACAGATGAATCT
GACACACCTTGGAATATTCTCTTTGTTACAACTTTGACTGTAAACTTCGGTTGCAAAAAA
AAAAAAAGTCAAGCCCATGTGCGTAAATATATACAAAATCGGCTACTGATCACAGTTTGG
AGTATCTGTCCACAAAGGCCTTGGCTTTGTCTGGTGCGAAAAACCGTGCCTGAATGAACA
TTCTCTCTGCATCTCCTCTGCTTCCATTTTCTTTCAATATAATTCCCTTAGCCAAGTAAC
CTCGGAAGTCTTCAGGATGTTCAAAGATAAGCCGGTCATAAACAGCTATAGCGTCGCTGA
TATGTCCCCAGTCTGAATAAGCTTTTCCAAGAAGCAACTCAACCTGAACTGGGTCTAGAT
CTGGTTCATTTTCAGCGGTAACACTGTCTGCCGTGCTTGTTTTTCTTGTATTCAGACGTT
CGCGAGTATCCAGAAGAAATTTGACTGCCTCGTCTGGTTTCTTAGCAGCTAAATACGCGT
TCATGAGGCCTCGTGTGACTTCAAGATCAATGCCTTTAGAAACCTTTTCAGAGATTTTGT
AAGCAGCGACACTGCCTTCATAGTTCTGAAGTTCATAATTTACCTCTCCAAGCAATCGAA
AGACATCAGGGTCCGTTGGTCTCTCCTTAGCCAATTTCTCAAGAAGCGTAGCAGCCCGCG
AATACTCTCCTAGATTAGTCAGTGTCACAGCTGCGCCCTCTAGAGCAGTTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG39JQ U 49
AF RR2B343JQ U 1
BS 1 126 RR2B343JQ
BS 127 127 RR2DG39JQ
BS 128 773 RR2B343JQ

RD RR2DG39JQ 117 0 0
C
CAGATGAATCTGACACACCTTGGAATATTCTCTTTGTTACAACTTTGACTGTAAACTTCG
GTTGCAAAAAAAAAAAAAGTCAAGCCCATGTGCGTAAATATATACAAAATCGGCTA

QA 2 117 2 117
DS 

RD RR2B343JQ 773 0 0
GAGAATATTTGCGGTGTACTCTTATTCACCCATCTTGAGGCAAGTTTCACAGATGAATCT
GACACACCTTGGAATATTCTCTTTGTTACAACTTTGACTGTAAACTTCGGTTGCAAAAAA
AAAAAA*GTCAAGCCCATGTGCGTAAATATATACAAAATCGGCTACTGATCACAGTTTGG
AGTATCTGTCCACAAAGGCCTTGGCTTTGTCTGGTGCGAAAAACCGTGCCTGAATGAACA
TTCTCTCTGCATCTCCTCTGCTTCCATTTTCTTTCAATATAATTCCCTTAGCCAAGTAAC
CTCGGAAGTCTTCAGGATGTTCAAAGATAAGCCGGTCATAAACAGCTATAGCGTCGCTGA
TATGTCCCCAGTCTGAATAAGCTTTTCCAAGAAGCAACTCAACCTGAACTGGGTCTAGAT
CTGGTTCATTTTCAGCGGTAACACTGTCTGCCGTGCTTGTTTTTCTTGTATTCAGACGTT
CGCGAGTATCCAGAAGAAATTTGACTGCCTCGTCTGGTTTCTTAGCAGCTAAATACGCGT
TCATGAGGCCTCGTGTGACTTCAAGATCAATGCCTTTAGAAACCTTTTCAGAGATTTTGT
AAGCAGCGACACTGCCTTCATAGTTCTGAAGTTCATAATTTACCTCTCCAAGCAATCGAA
AGACATCAGGGTCCGTTGGTCTCTCCTTAGCCAATTTCTCAAGAAGCGTAGCAGCCCGCG
AATACTCTCCTAGATTAGTCAGTGTCACAGCTGCGCCCTCTAGAGCAGTTTGA

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL5783Contig1 779 2 4 U
GGGCGGAACAAAGCACAACTCTCAAAACAAACGAACCCTAAACCAACGATGATGATCAGG
CAAGCTGCGAAGAAGGCTCTAGGGCTTACGTCACGCCAATCTACGCCGTGGTCCGTCGGT
ATCTACCGATCGTACCACGAGAACGTCATCGACCACTACGACAACCCCCGAAACGTCGGA
TCTTTCGATAAGAACGATCCCACCGTCGGCACGGGTCTCGTGGGAGCTCCCGCCTGCGGT
GATGTCATGAAGCTGCAAATCAAGGTCGATGAGAAGACCGGTCAGATCGTCGATGCTCGC
TTCAAGACCTTCGGTTGTGGCTCCGCTATCGCCTCTTCGTCTGTCGCCACTGAATGGGTG
AAAGGCAAAGCTATGGAGGAGGTCCTAACCATCAAGAACACTGAAATTGCGAAGCATCTC
TCTCTGCCACCAGTGAAGCTCCACTGCAGTATGTTGGCGGAGGACGCCATCAAGGCAGCT
GTGAAAGACTACAAGGAGAAGCGTGTGAAGACAAACGGTGCTTGACAAATCCCCGCACAG
GCTTGATTCCTTCTGTTAATGTTTTATATACCATTATGTGTTATATGATGGTGAAAACAG
GGGAGGTGTAAAAGAGGACCTATATGGTATGTTCTCTTAAGGTTCAAGTTTGAATAAACT
CTGTTTGACAAAAACATGTGAGAAGAATATGATTTGCTTTTTATTTTTGCCCTTCAGTTT
TTGATGTTTTGTAATGATTTTTCCTTTATTTATATCATGGAGTATTGATAGATTATTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC46TF U 1
AF RR2CC46JQ C 1
BS 1 596 RR2CC46TF
BS 597 597 RR2CC46JQ
BS 598 674 RR2CC46TF
BS 675 779 RR2CC46JQ

RD RR2CC46TF 674 0 0
GGGCGGAACAAAGCACAACTCTCAAAACAAACGAACCCTAAACCAACGATGATGATCAGG
CAAGCTGCGAAGAAGGCTCTAGGGCTTACGTCACGCCAATCTACGCCGTGGTCCGTCGGT
ATCTACCGATCGTACCACGAGAACGTCATCGACCACTACGACAACCCCCGAAACGTCGGA
TCTTTCGATAAGAACGATCCCACCGTCGGCACGGGTCTCGTGGGAGCTCCCGCCTGCGGT
GATGTCATGAAGCTGCAAATCAAGGTCGATGAGAAGACCGGTCAGATCGTCGATGCTCGC
TTCAAGACCTTCGGTTGTGGCTCCGCTATCGCCTCTTCGTCTGTCGCCACTGAATGGGTG
AAAGGCAAAGCTATGGAGGAGGTCCTAACCATCAAGAACACTGAAATTGCGAAGCATCTC
TCTCTGCCACCAGTGAAGCTCCACTGCAGTATGTTGGCGGAGGACGCCATCAAGGCAGCT
GTGAAAGACTACAAGGAGAAGCGTGTGAAGACAAACGGTGCTTGACAAATCCCCGCACAG
GCTTGATTCCTTCTGTTAATGTTTTATATACCATTATGTGTTATATGATGGTGAAA*CAG
GGGAGGTGTAAAAGAGGACCTATATGGTATGTTCTCTTAAGGTTCAAGTTTGAATAAACT
CTGTTTGACAAAAA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2CC46JQ 779 0 0
GGGCGGAACAAAGCACAACTCTCAAAACAAACGAACCCTAAACCAACGATGATGATCAGG
CAAGCTGCGAAGAAGGCTCTAGGGCTTACGTCACGCCAATCTACGCCGTGGTCCGTCGGT
ATCTACCGATCGTACCACGAGAACGTCATCGACCACTACGACAACCCCCGAAACGTCGGA
TCTTTCGATAAGAACGATCCCACCGTCGGCACGGGTTTCGTGGGAGCTCCCGCCTGCGGT
GATGTCATGAAGCTGCAAATCAAGGTCGATGAGAAGACCGGTCAGATCGTCGATGCTCGC
TTCAAGACCTTCGGTTGTGGCTCCGCTATCGCCTCTTCGTCTGTCGCCACTGAATGGGTG
AAAGGCAAAGCTATGGAGGAGGTCCTAACCATCAAGAACACTGAAATTGCGAAGCATCTC
TTTCTGCCACCAGTGAAGCTCCACTGCAGTATGTTGGCGGAGGACGCCATCAAGGCAGCT
GTGAAAGACTACAAGGAGAAGCGTGTGAAGACAAACGGTGCTTGACAAATCCCCGCACAG
GCTTGATTCCTTCTGTTAATGTTTTATATACCATTATGTGTTATATGATGGTGAAAACAG
GGGAGGTGTAAAAGAGGACCTATATGGTATGTTCTCTTAAGGTTCAAGTTTGAATAAACT
CTGTTTGACAAAAACATGTGAGAAGAATATGATTTGCTTTTTATTTTTGCCCTTCAGTTT
TTGATGTTTTGTAATGATTTTTCCTTTATTTATATCATGGAGTATTGATAGATTATTAT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL5784Contig1 1536 2 4 U
GGAGAGTACAAAATATCAGCAATTTTGTAACAAAAATATTCAGCATGGGATATCGTTTAG
CACTCGTTTGCTCCGCTATCGTGTTGCTAAGCATCTCCGGCTTAAGTCATGCCGGAGTCA
CCAGTAGCTACACCAGAGTAGCTGAACCTTCTGAAGAGATGCCACTCGAAACCTTCCCTC
CTCCTGCCGGCTTAAATGCTCCAGAACAAGTTCATATAACGCAGGGAGATCACAACGGTC
GAGGTATGATAATCTCGTGGGTGACGCCAATTAGCGATGATGGTTCTAACATCGTTAAAT
ACTGGATCGCGGATAGTGATGAGAGTACAAACCAGAGCGCTGAAGCATCAACGTCGTCCT
ACACATACTACGACTACACCTCTGGTTTTCTTCATCACGCCACTATTAAAGGGCTTGAGT
ACGATACTAAGTATTTCTACGAGCTTGGATCCGGTCGTTCCACTAGACGATTCTCCTTCA
CGACTCCTCCCAAAGCCGGTCCTGATGTTCCCTACACATTTGGCGTCATTGGTGATCTAG
GGCAAACCTATGCCTCTAACCAGACATTGTATCATTACATGTCGAACCCTAAAGGCCAAG
CTGTTCTTTTTGTTGGAGATTTGTCGTACGCGGATGACCACCCGAACCACGACCAAAGAA
AATGGGATTCTTATGGCCGATTCGTGGAACCAAGTGCTGCGTATCAGCCTTGGATATGGG
CTGCAGGGAACCACGAAATAGATTATGCACCATCAATAGGCGAGACTCAGGCTTTCAAGC
CGTACAAAACCGTTACCACGTTCCCTACAGAGCCTCGAAGAGCACTTCTCCACTTTGGTA
CTCAATAAAACGAGCCTCAGCTTACATCATCGTACTCTCCTCTTACTCAGCTTTTGACAA
GTATACACCGCAAAACTCATGGCTCGAGAGTGAGCTCAAGAAAGTAAACAGAGAAGAGAC
CCCATGGTTGATTGTTCTTGTTCACTCGCCGTGGTACAACAGCAACGGTTATCACTATAT
GGAAGGTGAAAGCATGAGAGTCACATTCGAGCCATGGTTCGTAGAAAACAAAGTCGATAT
TGTCTTCGCTGGTCATGTTCATGCCTACGAGAGATCAGAGCGTGTCTCCAACATCAAGTA
CAATATCACTGATGGTTTGATTTCTCCAGTCAAAAATCCATCTGCTCCGATTTACACCAC
CATTGGAGATGGAGGCAACATAGAAGGAATCGCTAACGAGAACCAAGACGACGAGCCAGT
TATAGCCGACTCTCTGTGGGTGAAGAATAGACACTTTTTGCCGGAGGAGGAGGAGACACT
TTCCGGCGACTCAATTGCCTGATTTGCTTAGCAAAAAAAAGTGCCTGATTTGCTTTTGTT
TTTTCTAGTTTTAGTTTTCTTTCTTTTTTCCTTAGGATTTTTCCTCTCTTATTAAAAAAA
TAAGGTTATTAGTGTTATTTGAACTTTGGTATATTTTGTTAGCTTTATCTACTAGTTGTG
TTACTATTTTGTTCAAGAAGTGATAATAATTCCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN75TF U 1
AF RR2AN75JQ C 809
BS 1 879 RR2AN75TF
BS 880 880 RR2AN75JQ
BS 881 914 RR2AN75TF
BS 915 1536 RR2AN75JQ

RD RR2AN75TF 917 0 0
GGAGAGTACAAAATATCAGCAATTTTGTAACAAAAATATTCAGCATGGGATATCGTTTAG
CACTCGTTTGCTCCGCTATCGTGTTGCTAAGCATCTCCGGCTTAAGTCATGCCGGAGTCA
CCAGTAGCTACACCAGAGTAGCTGAACCTTCTGAAGAGATGCCACTCGAAACCTTCCCTC
CTCCTGCCGGCTTAAATGCTCCAGAACAAGTTCATATAACGCAGGGAGATCACAACGGTC
GAGGTATGATAATCTCGTGGGTGACGCCAATTAGCGATGATGGTTCTAACATCGTTAAAT
ACTGGATCGCGGATAGTGATGAGAGTACAAACCAGAGCGCTGAAGCATCAACGTCGTCCT
ACACATACTACGACTACACCTCTGGTTTTCTTCATCACGCCACTATTAAAGGGCTTGAGT
ACGATACTAAGTATTTCTACGAGCTTGGATCCGGTCGTTCCACTAGACGATTCTCCTTCA
CGACTCCTCCCAAAGCCGGTCCTGATGTTCCCTACACATTTGGCGTCATTGGTGATCTAG
GGCAAACCTATGCCTCTAACCAGACATTGTATCATTACATGTCGAACCCTAAAGGCCAAG
CTGTTCTTTTTGTTGGAGATTTGTCGTACGCGGATGACCACCCGAACCACGACCAAAGAA
AATGGGATTCTTATGGCCGATTCGTGGAACCAAGTGCTGCGTATCAGCCTTGGATATGGG
CTGCAGGGAACCACGAAATAGATTATGCACCATCAATAGGCGAGACTCAGGCTTTCAAGC
CGTACAAAACCGTTACCACGTTCCCTACAGAGCCTCGAAGAGCACTTCTCCACTTTGGTA
CTCAATAAAACGAGCCTCAGCTTACATCATCGTACTCTC*TCTTACTCAGCTTTTGACAA
GTATACACCGCAAA
CTC

QA 1 914 1 914
DS 

RD RR2AN75JQ 728 0 0
AGAGCCTCGAAGAGCACTTCTCCACTTTGGTACTCAATAAAACGAGCCTCAGCTTACATC
ATCGTACTCTCCTCTTACTCAGCTTTTGACAAGTATACACCGCAAAACTCATGGCTCGAG
AGTGAGCTCAAGAAAGTAAACAGAGAAGAGACCCCATGGTTGATTGTTCTTGTTCACTCG
CCGTGGTACAACAGCAACGGTTATCACTATATGGAAGGTGAAAGCATGAGAGTCACATTC
GAGCCATGGTTCGTAGAAAACAAAGTCGATATTGTCTTCGCTGGTCATGTTCATGCCTAC
GAGAGATCAGAGCGTGTCTCCAACATCAAGTACAATATCACTGATGGTTTGATTTCTCCA
GTCAAAAATCCATCTGCTCCGATTTACACCACCATTGGAGATGGAGGCAACATAGAAGGA
ATCGCTAACGAGAACCAAGACGACGAGCCAGTTATAGCCGACTCTCTGTGGGTGAAGAAT
AGACACTTTTTGCCGGAGGAGGAGGAGACACTTTCCGGCGACTCAATTGCCTGATTTGCT
TAGCAAAAAAAAGTGCCTGATTTGCTTTTGTTTTTTCTAGTTTTAGTTTTCTTTCTTTTT
TCCTTAGGATTTTTCCTCTCTTATTAAAAAAATAAGGTTATTAGTGTTATTTGAACTTTG
GTATATTTTGTTAGCTTTATCTACTAGTTGTGTTACTATTTTGTTCAAGAAGTGATAATA
ATTCCAAC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL5785Contig1 758 2 3 U
TTCTCGCGATCATCATCTCTTCCCTTTCAATCTCCAGCATCGCCGCTCGCCCTTGCAAAA
CCTTCCTCATCTCCTCCTATTCCCTCTCAATAACCCCCAACCTCGAATCATCATCCCAAC
CCGATCTCTCCTCAACCCGATTCGTCACCGTCTTCACAATCCGCCGTCTCTACCCCGTCC
CCTTCTTCGTCAATCGCCGCCACGGATCCCTCCCTTCCTCCGCCGCCGCCGCTGCCGAGA
AGCCTCGGATCCGAGAGGATCATCCTCAGACACCCTTCTCCGATAACGTCAAGGACCGCA
CCAGAGACATCCTCAGCGTCGTGGCGGCTCTCTTATTCGGCGCCGGGTGCGGTGCCCTCA
CCGCGGCTACCATGTACCTCGCCTGGGCTTTCGTCGTGGACCGTCGCGGCGGGTACGATT
TCGAGGAGGATGATTACGAGAACGAGGAGTCGGATGCGGCTAGCTTGAAGAAGTTGGGTT
ACGTCAAGATCCAAGATCCAGCTCCTGTGAAGGAAGCTGCTTAATTCTAGATTGTTATTA
TCATCATGAGTGTCTCTCGCGTTTATGTTATTGTCTACCTATGTTTATGGATCTATCTAA
ACCTAATTATTACCGAAGTACTAGTGTTTACCGTTTGTGTAGTGCATGTTTATAGTTTTA
AAGTGTTAGTTGTGTCTGCAGATATTATCTTGATACCAATGTGTCTCGTTTAAGACCGGA
TACTTTATGGTTTGTGAACGTATACCGATGTTGCTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY25TFB U 179
AF RR2AY25JQ C 1
BS 1 178 RR2AY25JQ
BS 179 293 RR2AY25TFB
BS 294 758 RR2AY25JQ

RD RR2AY25TFB 115 0 0
CCCCTTCTTCGTCAATCGCCGCCACGGATCCCTCCCTTCCTCCGCCGCCGCCGCTGCCGA
GAAGCCTCGGATCCGAGAGGATCATCCTCAGACACCCTTCTCCGATAACGTCAAG

QA 1 115 1 115
DS 

RD RR2AY25JQ 758 0 0
TTCTCGCGATCATCATCTCTTCCCTTTCAATCTCCAGCATCGCCGCTCGCCCTTGCAAAA
CCTTCCTCATCTCCTCCTATTCCCTCTCAATAACCCCCAACCTCGAATCATCATCCCAAC
CCGATCTCTCCTCAACCCGATTCGTCACCGTCTTCACAATCCGCCGTCTCTACCCCGTCC
CCTTCTTCGTCAATCGCCGCCACGGATCCCTCCCTTCCTCCGCCGCCGCCGCTGCCGAGA
AGCCTCGGATCCGAGAGGATCATCCTCAGACACCCTTCTCCGATAACGTCAAGGACCGCA
CCAGAGACATCCTCAGCGTCGTGGCGGCTCTCTTATTCGGCGCCGGGTGCGGTGCCCTCA
CCGCGGCTACCATGTACCTCGCCTGGGCTTTCGTCGTGGACCGTCGCGGCGGGTACGATT
TCGAGGAGGATGATTACGAGAACGAGGAGTCGGATGCGGCTAGCTTGAAGAAGTTGGGTT
ACGTCAAGATCCAAGATCCAGCTCCTGTGAAGGAAGCTGCTTAATTCTAGATTGTTATTA
TCATCATGAGTGTCTCTCGCGTTTATGTTATTGTCTACCTATGTTTATGGATCTATCTAA
ACCTAATTATTACCGAAGTACTAGTGTTTACCGTTTGTGTAGTGCATGTTTATAGTTTTA
AAGTGTTAGTTGTGTCTGCAGATATTATCTTGATACCAATGTGTCTCGTTTAAGACCGGA
TACTTTATGGTTTGTGAACGTATACCGATGTTGCTTGT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL5786Contig1 1250 2 14 U
GGGGTGTGTGAATGAAGCTTATCGTGTCTTGAAAGAGATGGTTGATCACGGGTTTAGGCC
TTCGGTCGTGACTTATAATGCTCTGATCAACGGACATTGTATTGCTGGGAAGATGGGAGA
TGCGAGAGGTGTTCTTGAAGATATGAAGGAGAAAGGTTTGGCTCCTGATGTTGTGAGTTA
CAGCACTGTGTTATCTGGGTTTTGTAGGAGCTACGATGTAGATGAAGCGGTGAGAGTCAA
GAGGGAAATGGTTGAGAAGGGGATTCAACCTGATAACATCACTTACTCATCGCTAATCCA
AGGGTTTTGCGAGCAGAGAAGAACAAAGGAAGCTTGTGATCTTTTCGATGAGATGCTGAG
AGGTGGCCTTACGCCTGATGAGTTTACTTACACGGCCTTGATCAATGCTCACTGCGTAGA
AGGGGGTCTGGAGAGAGCGTTAAACTTGCACAACGAAATGGTCGAGAAAGGTTTGTTGCC
TGATGTTGTCACTTATAGTGTGCTTATTAACGGGCTTAACAAGCAAGCTAGGACAAGAGA
AGCGAAGAGACTTCTTCTCAAGCTGTTTTATGATGAATCAGTTCCTAGTGATGTCACGTA
TCAGGCACTTATTGAGAACTGTGGTAACATGGAGTTCAAAAGCGTGGTGTCTCTTATCAA
AGGATTCTGTATGAAAGGGATGATGAATGAAGCTGATAGAGTCTTCGGTTCCTTGATTGA
GAAAAATCATAAGCCAGATGGAACAGCTTATAACGTGATGATCCACGGTCATTGCAGAGG
TGGAGATGTGAGGAAAGCGTATAGCTTATACAAGGAGATGGTAAAATCCGGATTTCTTGT
GCATACTGTGACGGTTATTGCTCTGGTTAAGGCGTTGCACAAGGAGGAAGGTATGGTAGA
TGAATTGAGTGGTGTGATTGACAATGTATTGAGAAGCTGTGAGTTGAGTGAAGCAGAGCA
AGCTAAAGTGCTTGTGGAAATCAATCGTAGAGAAGGGAATATGGATGTGGTCCTTGTGCT
TGCTGCAATGGCTAAAGATGGTTTTCTTCCCAATACAAGAAGTCATTAGTGAGATTTGTT
TAGTCAAATCTTTTAGTTACCAAATCATTTTGAGTTTGCATCATCTTTTGACATAGAGGT
AGAGATTTGATTTCGTTATCTTTTTGTAGGTGTGAAGAAACTGATGCTCTTGATTCATTC
ATGTTGAATAGATATCTTGATATTAAATAATAGGGATATACATTCGTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC32TF U 1
AF RR2GC32JQ C 433
BS 1 662 RR2GC32TF
BS 663 663 RR2GC32JQ
BS 664 707 RR2GC32TF
BS 708 708 RR2GC32JQ
BS 709 717 RR2GC32TF
BS 718 718 RR2GC32JQ
BS 719 725 RR2GC32TF
BS 726 726 RR2GC32JQ
BS 727 734 RR2GC32TF
BS 735 735 RR2GC32JQ
BS 736 742 RR2GC32TF
BS 743 743 RR2GC32JQ
BS 744 763 RR2GC32TF
BS 764 1250 RR2GC32JQ

RD RR2GC32TF 763 0 0
GGGGTGTGTGAATGAAGCTTATCGTGTCTTGAAAGAGATGGTTGATCACGGGTTTAGGCC
TTCGGTCGTGACTTATAATGCTCTGATCAACGGACATTGTATTGCTGGGAAGATGGGAGA
TGCGAGAGGTGTTCTTGAAGATATGAAGGAGAAAGGTTTGGCTCCTGATGTTGTGAGTTA
CAGCACTGTGTTATCTGGGTTTTGTAGGAGCTACGATGTAGATGAAGCGGTGAGAGTCAA
GAGGGAAATGGTTGAGAAGGGGATTCAACCTGATAACATCACTTACTCATCGCTAATCCA
AGGGTTTTGCGAGCAGAGAAGAACAAAGGAAGCTTGTGATCTTTTCGATGAGATGCTGAG
AGGTGGCCTTACGCCTGATGAGTTTACTTACACGGCCTTGATCAATGCTCACTGCGTAGA
AGGGGGTCTGGAGAGAGCGTTAAACTTGCACAACGAAATGGTCGAGAAAGGTTTGTTGCC
TGATGTTGTCACTTATAGTGTGCTTATTAACGGGCTTAACAAGCAAGCTAGGACAAGAGA
AGCGAAGAGACTTCTTCTCAAGCTGTTTTATGATGAATCAGTTCCTAGTGATGTCACGTA
TCAGGCACTTATTGAGAACTGTGGTAACATGGAGTTCAAAAGCGTGGTGTCTCTTATCAA
AG*ATTCTGTATGAAAGGGATGATGAATGAAGCTGATAGAGTCTTCG*TTCCTTGAT*GA
GAAAA*TCATAAGC*AGATGGA*CAGCTTATAACGTGATGATC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2GC32JQ 818 0 0
GAGAGCGTTAAACTTGCACAACGAAATGGTCGAGAAAGGTTTGTTGC*TGATGTTGTCAC
TTATAGTGTGCTTATTAACGGGCTTAACAAGCAAGCTAGGACAAGAGAAGCGAAGAGACT
TCTTCTCAAGCTGTTTTATGATGAATCAGTTCCTAGTGATGTCACGTATCAGGCACTTAT
TGAGAACTGTGGTAACATGGAGTTCAAAAGCGTGGTGTCTCTTATCAAAGGATTCTGTAT
GAAAGGGATGATGAATGAAGCTGATAGAGTCTTCGGTTCCTTGATTGAGAAAAATCATAA
GCCAGATGGAACAGCTTATAACGTGATGATCCACGGTCATTGCAGAGGTGGAGATGTGAG
GAAAGCGTATAGCTTATACAAGGAGATGGTAAAATCCGGATTTCTTGTGCATACTGTGAC
GGTTATTGCTCTGGTTAAGGCGTTGCACAAGGAGGAAGGTATGGTAGATGAATTGAGTGG
TGTGATTGACAATGTATTGAGAAGCTGTGAGTTGAGTGAAGCAGAGCAAGCTAAAGTGCT
TGTGGAAATCAATCGTAGAGAAGGGAATATGGATGTGGTCCTTGTGCTTGCTGCAATGGC
TAAAGATGGTTTTCTTCCCAATACAAGAAGTCATTAGTGAGATTTGTTTAGTCAAATCTT
TTAGTTACCAAATCATTTTGAGTTTGCATCATCTTTTGACATAGAGGTAGAGATTTGATT
TCGTTATCTTTTTGTAGGTGTGAAGAAACTGATGCTCTTGATTCATTCATGTTGAATAGA
TATCTTGATATTAAATAATAGGGATATACATTCGTAGC

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL5787Contig1 306 2 1 U
GGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACCAAGAGAAAGAGAAGCTGGAGCACAG
GTTCTAAAGCATGGGAAGAAGATGTTCTGATTGTTTTTATGATAATCCAGTTACTTTCTT
TCTTTCACTTTTCATTCTCCAGAATGAGTGTTTCCAAGAGAGTTTGTTTTTCCTCAACAC
TCCAAAAATAGAAGCGTGAAAGTTGCTTCGTTGAATACATTTTGTTGATTTTTTTTATGA
ATAAACAACATCGTGAAGGTCTTGAATATCTATGTTTATGACTAATGCTGAATGAGGATT
CTAGCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2DE37JQ C 1
AF RR2DE37TF U 1
BS 1 306 RR2DE37TF

RD RR2DE37JQ 306 0 0
GGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACCAAGAGAAAGAGAAGCTGGAGCACAG
GTTCTAAAGCATGGGAAGAAGATGTTCTGATTGTTTTTATGATAATCCAGTTACTTTCTT
TCTTTCACTTTTCATTCTCCAGAATGAGTGTTTCCAAGAGAGTTTGTTTTTCCTCAACAC
TCCAAAAATAGAAGCGTGAAAGTTGCTTCGTTGAATACATTTTGTTGATTTTTTTTATGA
ATAAACAACATCGTGAAGGTCTTGAATATCTATGTTTATGACTAATGCTGAATGAGGATT
CTAGCG

QA 1 306 1 306
DS 

RD RR2DE37TF 306 0 0
GGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACACTACCAAGAGAAAGAGAAGCTGGAGCACAG
GTTCTAAAGCATGGGAAGAAGATGTTCTGATTGTTTTTATGATAATCCAGTTACTTTCTT
TCTTTCACTTTTCATTCTCCAGAATGAGTGTTTCCAAGAGAGTTTGTTTTTCCTCAACAC
TCCAAAAATAGAAGCGTGAAAGTTGCTTCGTTGAATACATTTTGTTGATTTTTTTTATGA
ATAAACAACATCGTGAAGGTCTTGAATATCTATGTTTATGACTAATGCTGAATGAGGATT
CTAGCG

QA 1 306 1 306
DS 



AS 1 2

CO CL5788Contig1 971 2 2 U
GTGTCGCCACCTCGTGGGAAAGGGTTGCGGGAAGAAAAACAAGATAGACCACAAAACTTG
TCTTCGTATCCTCAAGAAACTTTAGACCGTGAAGAGAAAGTGAAGAAAGTATCAACACCT
CGTGGGAAAGGGTTACGGGAAGAAAAACCAGACAGACCACCACAAAACCTGTCTTCATAT
CCACAAGAAACTTCAGACCATGAAGAGAAAGTGAAGAAAGTGTCACCACCTCGTGGGAAA
GGGTTACGGGAAGAAAAACCAGACAGACCACCACAAAACTCGTCTTCATATCCCCAAGAA
ACTTCAGACCGTGAAGAGCGAGTGAAGAAAGTATCACCACCTCGTGGGAAAGGGTTACGG
GAAGAAAAATCAGACAGACCGCAAAACTTGTCTAAAAGAGACGTCAGGTCGTCAGATATC
CCTAGCTTTACAAACTTTAGGCAGAACACAAATGAAACTATTCCAAGACAGTATGAAACT
GACACTTCGCTTGATGAAAACATTGATGCACTGCTCGAGGTAACATACTTAAACATCTAT
AAAAATGAGACGATCCATTGAGATTGGTTTGCAAGCAATGGTAGAAAAACTTGTATTAAT
AGTTACCGCATGATTTTTTCAGGAAGAAGAAGCTCTGATCACAGCACACAGAAAGGAAAT
AGAGGATACAATGGAGATTGTTCGCGAGGTAAGTAAAAACGTAAATAAGTGACTGCGATT
GTAGATTAGTATCTCTCTGTTAAATTTTTCATAATCTTAATCAGGAAATGAAGCTTTTAG
CGGAGGTGGACAAACCAGGAAGCATGATAGAAAACTATGTAACGCAACTGAGCTTTGTCT
TGTCGCGGAAAGCGGCTGGGCTTGTGAGTCTACAAGCTAAGCTTGCTCGGTTCCAACACC
GTCTCAAGGAACAAGAAATATTTAGCCGTAAGAGAGTTCCTCCTCGGTAGTTGGTAGAAG
AAAATTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD90TF U 1
AF RR2FD90JQ C 286
BS 1 589 RR2FD90TF
BS 590 971 RR2FD90JQ

RD RR2FD90TF 589 0 0
GTGTCGCCACCTCGTGGGAAAGGGTTGCGGGAAGAAAAACAAGATAGACCACAAAACTTG
TCTTCGTATCCTCAAGAAACTTTAGACCGTGAAGAGAAAGTGAAGAAAGTATCAACACCT
CGTGGGAAAGGGTTACGGGAAGAAAAACCAGACAGACCACCACAAAACCTGTCTTCATAT
CCACAAGAAACTTCAGACCATGAAGAGAAAGTGAAGAAAGTGTCACCACCTCGTGGGAAA
GGGTTACGGGAAGAAAAACCAGACAGACCACCACAAAACTCGTCTTCATATCCCCAAGAA
ACTTCAGACCGTGAAGAGCGAGTGAAGAAAGTATCACCACCTCGTGGGAAAGGGTTACGG
GAAGAAAAATCAGACAGACCGCAAAACTTGTCTAAAAGAGACGTCAGGTCGTCAGATATC
CCTAGCTTTACAAACTTTAGGCAGAACACAAATGAAACTATTCCAAGACAGTATGAAACT
GACACTTCGCTTGATGAAAACATTGATGCACTGCTCGAGGTAACATACTTAAACATCTAT
AAAAATGAGACGATCCATTGAGATTGGTTTGCAAGCAATGGTAGAAAAA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2FD90JQ 686 0 0
TCATATCCCCAAGAAACTTCAGACCGTGAAGAGCGAGTGAAGAAAGTATCACCACCTCGT
GGGAAAGGGTTACGGGAAGAAAAATCAGACAGACCGCAAAACTTGTCTAAAAGAGACGTC
AGGTCGTCAGATATCCCTAGCTTTACAAACTTTAGGCAGAACACAAATGAAACTATTCCA
AGACAGTATGAAACTGACACTTCGCTTGATGAAAACATTGATGCACTGCTCGAGGTAACA
TACTTAAACATCTATAAAAATGAGACGATCCATTGAGATTGGTTTGCAAGCAATGGTAGA
AAAACTTGTATTAATAGTTACCGCATGATTTTTTCAGGAAGAAGAAGCTCTGATCACAGC
ACACAGAAAGGAAATAGAGGATACAATGGAGATTGTTCGCGAGGTAAGTAAAAACGTAAA
TAAGTGACTGCGATTGTAGATTAGTATCTCTCTGTTAAATTTTTCATAATCTTAATCAGG
AAATGAAGCTTTTAGCGGAGGTGGACAAACCAGGAAGCATGATAGAAAACTATGTAACGC
AACTGAGCTTTGTCTTGTCGCGGAAAGCGGCTGGGCTTGTGAGTCTACAAGCTAAGCTTG
CTCGGTTCCAACACCGTCTCAAGGAACAAGAAATATTTAGCCGTAAGAGAGTTCCTCCTC
GGTAGTTGGTAGAAGAAAATTAAACC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL5789Contig1 536 2 8 U
GGGAGCTCACTTGGAGGCCACCACGAACCCACCAATCTCCTTTCAGATTTCCCATTCGGA
AAGCGATGTGGAGTCAATGGATCACTACGTGAGGATGCCTGGTGGTAATAACAACCACTT
CCCTTCGTACATGTCCATGTCCGCATACCGTAAAAGACAAGCTTTTGTGTTGTATTTGCA
GATGAATCCAGGAGGGATAACGATATTCGGGTGGACAGTGGACAGACATTTGATAAACAC
AATATTCTTCATTGAGCTCTCTCTCGTTACCTTTGTACTTGGGAAGACTATAGTTTTCAG
TCCTGAATGACTCCAAAAAGAAAAGGGTGTGGTATATTATTACAACAGGCTTTACCCTTT
TTGCCAATATAGTGAATTTTTTGCAATTGATATGAGAAGAAACTGAACACAGGTTTCTCT
TGATTTGTTTACGTCTAGTGTGTATAATAAGCTTTTTTCTTTTACGAGGTTTTAGAACTA
CATACTTGTTGGAACTTGTTACACGATCTTATAGACTGTTGTTTTTTAGCATCACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E358TF U 1
AF RR2E358JQ C 1
BS 1 267 RR2E358TF
BS 268 268 RR2E358JQ
BS 269 292 RR2E358TF
BS 293 293 RR2E358JQ
BS 294 299 RR2E358TF
BS 300 300 RR2E358JQ
BS 301 318 RR2E358TF
BS 319 536 RR2E358JQ

RD RR2E358TF 322 0 0
GGGAGCTCACTTGGAGGCCACCACGAACCCACCAATCTCCTTTCAGATTTCCCATTCGGA
AAGCGATGTGGAGTCAATGGATCACTACGTGAGGATGCCTGGTGGTAATAACAACCACTT
CCCTTCGTACATGTCCATGTCCGCATACCGTAAAAGACAAGCTTTTGTGTTGTATTTGCA
GATGAATCCAGGAGGGATAACGATATTCGGGTGGACAGTGGACAGACATTTGATAAACAC
AATATTCTTCATTGAGCTCTCTCTCGT*ACCTTTGTACTTGGGAAGACTATA*TTTTCA*
TCCTGAATGACTCCAAAA
GAAA

QA 1 318 1 318
DS 

RD RR2E358JQ 536 0 0
GGGAGCTCACTTGGAGGCCACCACGAACCCACCAATCTCCTTTCAGATTTCCCATTCGGA
AAGCGATGTGGAGTCAATGGATCACTACGTGAGGATGCCTGGTGGTAATAACAACCACTT
CCCTTCGTACATGTCCATGTCCGCATACCGTAAAAGACAAGCTTTTGTGTTGTATTTGCA
GATGAATCCAGGAGGGATAACGATATTCGGGTGGACAGTGGACAGACATTTGATAAACAC
AATATTCTTCATTGAGCTCTCTCTCGTTACCTTTGTACTTGGGAAGACTATAGTTTTCAG
TCCTGAATGACTCCAAAAAGAAAAGGGTGTGGTATATTATTACAACAGGCTTTACCCTTT
TTGCCAATATAGTGAATTTTTTGCAATTGATATGAGAAGAAACTGAACACAGGTTTCTCT
TGATTTGTTTACGTCTAGTGTGTATAATAAGCTTTTTTCTTTTACGAGGTTTTAGAACTA
CATACTTGTTGGAACTTGTTACACGATCTTATAGACTGTTGTTTTTTAGCATCACG

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 2

CO CL5790Contig1 919 2 2 U
GGAGACGATGAATAACAATATAGAGTTGAATCTCACTTTGAATCCTTCATCGGCTCCCCC
CAATGAAACTCCCCCGAGTAACAACCAAACCCCAAGAAGAAAACGCACTAGGAGAACCTC
CAACAACGAAACCGGTTCTTCTTCCTCTCCGAGGCCTAAACCAGACCCTGATGCTCCCTT
AATCACAGAGCCATGCGAAGTATGTGGCAGAAAGTTCTGGTCTTCCAAGGCACTCCATGG
ACACATGAGATCTCACCCTGAGCGTCAATGGCGTGGCATCAACCCTCCTCCTAACCACCA
ACCAACCGTGACGGCAGCACCCCCGGTGTCTGTTACAGCGGAAGGCGGTCAAGTGTTGGC
TATTGCCTCCACGACCGGTTCAAGTGTAGTAGGAGTTGAATGTGGAGGTTGTAAGAAAGT
GTTTGAGTCACGTCAAGCATTAGATGGACATGTATGTTCCGCCATTTTGAACTTAAACGA
AGATCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCAAGAGGTCGTTGATGAGAGTAGGAGTGT
GATGTCGGCGTCAAGGATGAATCATCGATGTGACATCTGTTCTAAAGTGTTTTATAGTGG
TCAGGCTTTGGGTGGTCACATGAGGTGTCATTGGGTTAAGGATAAGGAGAAGAAACAAGC
TTCGACTGGTATCGATCTCAATGTTCCTGCGTCGTCGACCAACTTGCAGCCCGGTTCTTC
TTCAGACGCAGTGCCAGAGTCTTCTTTGGATCTTAAGTTACGACTCTGACATTATAATAT
CTTATGGGTATTGGTTTTTTTCTCTTTATGAAACTCTCTATTTTATGTGTGTGAGTCACA
CAGTATGACGATTTGTACGATGAATTTATACCATTGGGGGTATTGCAATAATCTTATTTA
AAACTTATTTGTTGACGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK71TF U 1
AF RR2EK71JQ C 295
BS 1 600 RR2EK71TF
BS 601 919 RR2EK71JQ

RD RR2EK71TF 600 0 0
GGAGACGATGAATAACAATATAGAGTTGAATCTCACTTTGAATCCTTCATCGGCTCCCCC
CAATGAAACTCCCCCGAGTAACAACCAAACCCCAAGAAGAAAACGCACTAGGAGAACCTC
CAACAACGAAACCGGTTCTTCTTCCTCTCCGAGGCCTAAACCAGACCCTGATGCTCCCTT
AATCACAGAGCCATGCGAAGTATGTGGCAGAAAGTTCTGGTCTTCCAAGGCACTCCATGG
ACACATGAGATCTCACCCTGAGCGTCAATGGCGTGGCATCAACCCTCCTCCTAACCACCA
ACCAACCGTGACGGCAGCACCCCCGGTGTCTGTTACAGCGGAAGGCGGTCAAGTGTTGGC
TATTGCCTCCACGACCGGTTCAAGTGTAGTAGGAGTTGAATGTGGAGGTTGTAAGAAAGT
GTTTGAGTCACGTCAAGCATTAGATGGACATGTATGTTCCGCCATTTTGAACTTAAACGA
AGATCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCAAGAGGTCGTTGATGAGAGTAGGAGTGT
GATGTCGGCGTCAAGGATGAATCATCGATGTGACATCTGTTCTAAAGTGTTTTATAGTGG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2EK71JQ 625 0 0
CCACCAACCAACCGTGACGGCAGCACCCCCGGTGTCTGTTACAGCGGAAGGCGGTCAAGT
GTTGGCTATTGCCTCCACGACCGGTTCAAGTGTAGTAGGAGTTGAATGTGGAGGTTGTAA
GAAAGTGTTTGAGTCACGTCAAGCATTAGATGGACATGTATGTTCCGCCATTTTGAACTT
AAACGAAGATCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCAAGAGGTCGTTGATGAGAGTAG
GAGTGTGATGTCGGCGTCAAGGATGAATCATCGATGTGACATCTGTTCTAAAGTGTTTTA
TAGTGGTCAGGCTTTGGGTGGTCACATGAGGTGTCATTGGGTTAAGGATAAGGAGAAGAA
ACAAGCTTCGACTGGTATCGATCTCAATGTTCCTGCGTCGTCGACCAACTTGCAGCCCGG
TTCTTCTTCAGACGCAGTGCCAGAGTCTTCTTTGGATCTTAAGTTACGACTCTGACATTA
TAATATCTTATGGGTATTGGTTTTTTTCTCTTTATGAAACTCTCTATTTTATGTGTGTGA
GTCACACAGTATGACGATTTGTACGATGAATTTATACCATTGGGGGTATTGCAATAATCT
TATTTAAAACTTATTTGTTGACGGC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL5791Contig1 498 2 1 U
TGTACGAAGTGGCGAAGGCAATGAGGGAAGCCTGTGTTGAAGAAATTAAGACTTGGGACG
AGTTTATCGTAGCACTCAACAAGAAGAAACTCATCTTAGCTCCCTGGTGCGATGAAGAGG
AAGTGGAGAGAGATGTCAAGGCACGTACTAAAGGTGAAACTGGAGCAGCGAAAACCCTCT
GTTCTCCATTTGAGCAGCCAGAGCTCCCTGAAGGTACTCTCTGCTTTGCATCTGGAAAGC
CTGCCAAGAAATGGACCTATTGGGGCAGGAGTTACTAAGTGTTCACCATGTTTTCGTTCA
GTTCATGAAATTTTACTTTGTAAAGACTCTCTCAAGTTCGTTGTGTTTTGATTTGATATT
TTGACTGAAAGCTATTTCAATTTTATAACTGTGTGTGATTGCACTATGAACAACTACAGA
ATGGTGTTTTTTGTTTCAAAAGAACTGTTAGAAAAAAGGAACCATGAATATATTTGAAAT
CCACTGCTTGTGGGAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D864TF U 1
AF RR2D864JQ C 181
BS 1 498 RR2D864TF

RD RR2D864TF 498 0 0
TGTACGAAGTGGCGAAGGCAATGAGGGAAGCCTGTGTTGAAGAAATTAAGACTTGGGACG
AGTTTATCGTAGCACTCAACAAGAAGAAACTCATCTTAGCTCCCTGGTGCGATGAAGAGG
AAGTGGAGAGAGATGTCAAGGCACGTACTAAAGGTGAAACTGGAGCAGCGAAAACCCTCT
GTTCTCCATTTGAGCAGCCAGAGCTCCCTGAAGGTACTCTCTGCTTTGCATCTGGAAAGC
CTGCCAAGAAATGGACCTATTGGGGCAGGAGTTACTAAGTGTTCACCATGTTTTCGTTCA
GTTCATGAAATTTTACTTTGTAAAGACTCTCTCAAGTTCGTTGTGTTTTGATTTGATATT
TTGACTGAAAGCTATTTCAATTTTATAACTGTGTGTGATTGCACTATGAACAACTACAGA
ATGGTGTTTTTTGTTTCAAAAGAACTGTTAGAAAAAAGGAACCATGAATATATTTGAAAT
CCACTGCTTGTGGGAACT

QA 1 498 1 498
DS 

RD RR2D864JQ 318 0 0
GTTT
TCCATTTGAGCAGCCAGAGCTCCCTGAAGGTACTTTTTGCTTTGCATCTGGAAAGCCTGC
CAAGAAATGGACCTATTGGGGCAGGAGTTACTAAGTGTTCACCATGTTTTCGTTCAGTTC
ATGAAATTTTACTTTGTAAAGACTCTCTCAAGTTCGTTGTGTTTTGATTTGATATTTTGA
CTGAAAGCTATTTCAATTTTATAACTGTGTGTGATTGCACTATGAACAACTACAGAATGG
TGTTTTTTGTTTCAAAAGAACTGTTAGAAAAAAGGAACCATGAATATATTTGAAATCCAC
TGCTTGTGGGAACT

QA 5 318 5 318
DS 



AS 1 2

CO CL5792Contig1 1078 2 2 U
GTACAAGGGAACATTTCCAGAAGGGCAAGAAATTGCAGTGAAGAGGCTCTCACGAGCATC
AGGACAAGGGCTAGAGGAACTTATGAACGAGGTAGTTGTGATTCGAAGTTGCAGCATCGG
AATCTGGTGAAGTTACTCGGCTGTTGCATTGAAGGTGAAGAAAGGTTGTTAGTGTATGAA
TATATGCCAAAGAAAAGCTTGGATGCCTATCTATTTGACCCATTAAAGCAAAAGATACTC
GATTGGAAGATTCGGTTCAACATAATGGAAGGGATTTGCAGAGGTCTTTTGTACCTTCAC
AGAGATTCAAGGCTAAAGATCATACACAGAGATCTAAAAGTTAGCAACATTTTGTTAGAT
GACAATCTGAATCCAAAGATATCTGATTTCGGACTTGCAAGAGTTTTTCAAGTGAATGAA
GATGAAGCTAACACAAGAAGGGTTGTTGGAACATACGGCTATATGTCACCGGAATATGCA
ATGGAAGGTTTCTTTTCAGAAAAGTCAGACGTTTTCAGCTTGGGGGTTATATTTCTAGAG
ATCATAAGTGGGACAAGAAACTCTCACAAGGAAGAAAATGACCTAAACCTTTTAGCTTAT
GCTTGGAAGCTATGGAATGACGGTGAGGCTACTTCTCTAGCCAATCCAGTCGTCTTTGAT
GAGTGTTTTGAGAAAGAGATTAGAAAATGTGTTCAGATTGGACTGTTATGTGTGCAAGAA
GTTGCAAACGATAGACCAAATGTTTCGACAGTGATTTGGATGCTAACTACCGAGAACACA
AACCTCCCTGAGCCAAAGCAGCCTGCGTTTATAGCAAGAAGAGGATTTTCAATCGCTGAA
TCTTCTGACCAGAGCAGTCAAAAGGTCTCTATTAACGATGTGAGCCTCACAGCTGTAACT
GGACGTTAAGCCAGACAGCTAATCTGTATGTTTATTAATACATAGACATATATGTTTTAA
GAACCTTCTATGTTTGCGAAGTTTTGATATTCTGTGTATGTTTAATGGTTAGAGTGAAGC
TAAAAAGATGTACTTGAGAGAAGTAAAGTTCTGATTTACTAATCACAGATTTGGTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL02TF U 1
AF RR2FL02JQ C 412
BS 1 718 RR2FL02TF
BS 719 1078 RR2FL02JQ

RD RR2FL02TF 718 0 0
GTACAAGGGAACATTTCCAGAAGGGCAAGAAATTGCAGTGAAGAGGCTCTCACGAGCATC
AGGACAAGGGCTAGAGGAACTTATGAACGAGGTAGTTGTGATTCGAAGTTGCAGCATCGG
AATCTGGTGAAGTTACTCGGCTGTTGCATTGAAGGTGAAGAAAGGTTGTTAGTGTATGAA
TATATGCCAAAGAAAAGCTTGGATGCCTATCTATTTGACCCATTAAAGCAAAAGATACTC
GATTGGAAGATTCGGTTCAACATAATGGAAGGGATTTGCAGAGGTCTTTTGTACCTTCAC
AGAGATTCAAGGCTAAAGATCATACACAGAGATCTAAAAGTTAGCAACATTTTGTTAGAT
GACAATCTGAATCCAAAGATATCTGATTTCGGACTTGCAAGAGTTTTTCAAGTGAATGAA
GATGAAGCTAACACAAGAAGGGTTGTTGGAACATACGGCTATATGTCACCGGAATATGCA
ATGGAAGGTTTCTTTTCAGAAAAGTCAGACGTTTTCAGCTTGGGGGTTATATTTCTAGAG
ATCATAAGTGGGACAAGAAACTCTCACAAGGAAGAAAATGACCTAAACCTTTTAGCTTAT
GCTTGGAAGCTATGGAATGACGGTGAGGCTACTTCTCTAGCCAATCCAGTCGTCTTTGAT
GAGTGTTTTGAGAAAGAGATTAGAAAATGTGTTCAGATTGGACTGTTATGTGTGCAAG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2FL02JQ 667 0 0
GTGAATGAAGATGAAGCTAACACAAGAAGGGTTGTTGGAACATACGGCTATATGTCACCG
GAATATGCAATGGAAGGTTTCTTTTCAGAAAAGTCAGACGTTTTCAGCTTGGGGGTTATA
TTTCTAGAGATCATAAGTGGGACAAGAAACTCTCACAAGGAAGAAAATGACCTAAACCTT
TTAGCTTATGCTTGGAAGCTATGGAATGACGGTGAGGCTACTTCTCTAGCCAATCCAGTC
GTCTTTGATGAGTGTTTTGAGAAAGAGATTAGAAAATGTGTTCAGATTGGACTGTTATGT
GTGCAAGAAGTTGCAAACGATAGACCAAATGTTTCGACAGTGATTTGGATGCTAACTACC
GAGAACACAAACCTCCCTGAGCCAAAGCAGCCTGCGTTTATAGCAAGAAGAGGATTTTCA
ATCGCTGAATCTTCTGACCAGAGCAGTCAAAAGGTCTCTATTAACGATGTGAGCCTCACA
GCTGTAACTGGACGTTAAGCCAGACAGCTAATCTGTATGTTTATTAATACATAGACATAT
ATGTTTTAAGAACCTTCTATGTTTGCGAAGTTTTGATATTCTGTGTATGTTTAATGGTTA
GAGTGAAGCTAAAAAGATGTACTTGAGAGAAGTAAAGTTCTGATTTACTAATCACAGATT
TGGTACT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL5793Contig1 864 2 6 U
GTGAGGGTAAGTAAGATCCAGAGATTGCATCAGCTTGAACATTTTTATTATAAAATCCAG
TTTATTCATTGGAGCTTTGAGACTTGTTAACTTGGAGAGAGGACAGTCTTCATGAGACAT
GACTTCTTCAGTGCATGAGCTCTCTGATAACAATGAAAGTCACAAGAAGCAAGAACGTCC
AGATTCCCAAACCCCACCACAGGTTCCTTCAGGACCGTGTTCTGAATCTATAGATACAAG
CTCCGTCTACTCAGAGCCGATGGCGCATGGGCTCTACCCGTATCCTGATCCTTACTACAG
AAGCGTCTTTGCACACCAAGCGTATCTTCCACATCCATATCCTGGGGTTCAAATGCAGTT
AATGGGAATGCATCAACAAGTGGTTCCATTACAGTGTGATGCAGTCGAGGAGCCTGTTTT
TGTTAACGCAAAGCAGTACCACGGTATACTCAGGCGTAGGCAATCCAGGGCAAAACTTGA
GGCTCGGAACAGAGCCATGAAGTCAAAGAAGCCGTATATGCATGAATCTCGGCATTTGCA
TGCGATAAACCGGCCAAGAGGATGTGGAGGACGGTTTCTCAATGCCAAGAAGAAGAATGG
AGGCCGTAAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCAACCTCTGATGAGAACACTTCAGAAGC
AAGTTCCAGCCTCAGGTCTGAGAAGTCAGCCATGGCTCCTAATGGTAGATCTTGAGTAAA
AAAGTTCATGCACAACAACCACATGTTTAGTTTTATATATTGGGTGGATGTTTGTATCAG
AACAATACTCTGTTTTGGACCCTCTCTGTAGACTGTGTATAGGTTATTTATTGCTTGGAA
CAGATAGGGTGGTGGCTTTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB23TF U 1
AF RR2CB23JQ C 52
BS 1 610 RR2CB23TF
BS 611 611 RR2CB23JQ
BS 612 631 RR2CB23TF
BS 632 632 RR2CB23JQ
BS 633 643 RR2CB23TF
BS 644 864 RR2CB23JQ

RD RR2CB23TF 643 0 0
GTGAGGGTAAGTAAGATCCAGAGATTGCATCAGCTTGAACATTTTTATTATAAAATCCAG
TTTATTCATTGGAGCTTTGAGACTTGTTAACTTGGAGAGAGGACAGTCTTCATGAGACAT
GACTTCTTCAGTGCATGAGCTCTCTGATAACAATGAAAGTCACAAGAAGCAAGAACGTCC
AGATTCCCAAACCCCACCACAGGTTCCTTCAGGACCGTGTTCTGAATCTATAGATACAAG
CTCCGTCTACTCAGAGCCGATGGCGCATGGGCTCTACCCGTATCCTGATCCTTACTACAG
AAGCGTCTTTGCACACCAAGCGTATCTTCCACATCCATATCCTGGGGTTCAAATGCAGTT
AATGGGAATGCATCAACAAGTGGTTCCATTACAGTGTGATGCAGTCGAGGAGCCTGTTTT
TGTTAACGCAAAGCAGTACCACGGTATACTCAGGCGTAGGCAATCCAGGGCAAAACTTGA
GGCTCGGAACAGAGCCATGAAGTCAAAGAAGCCGTATATGCATGAATCTCGGCATTTGCA
TGCGATAAACCGGCCAAGAGGATGTGGAGGACGGTTTCTCAATGCCAAGAAGAAGAATGG
AGGCCGTAAG*AGGAGGAGGAGGAGGAGGAG*CAACCTCTGAT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2CB23JQ 813 0 0
AAAATCCAGTTTATTCATTGGAGCTT*GAGACTTGTTAACTTGGAGAGAGGACAGTCTTC
ATGAGACATGACTTCTTCAGTGCATGAGCTCTCTGATAACAATGAAAGTCACAAGAAGCA
AGAACGTCCAGATTCCCAAACCCCACCACAGGTTCCTTCAGGACCGTGTTCTGAATCTAT
AGATACAAGCTCCGTCTATTCAGAGCCGATGGCGCATGGGCTCTACCCGTATCCTGATCC
TTACTACAGAAGCGTCTTTGCACACCAAGCGTATCTTCCACATCCATATCCTGGGGTTCA
AATGCAGTTAATGGGAATGCATCAACAAGTGGTTCCATTACAGTGTGATGCAGTCGAGGA
GCCTGTTTTTGTTAACGCAAAGCAGTACCACGGTATACTCAGGCGTAGGCAATCCAGGGC
AAAACTTGAGGCTCGGAACAGAGCCATGAAGTCAAAGAAGCCGTATATGCATGAATCTCG
GCATTTGCATGCGATAAACCGGCCAAGAGGATGTGGAGGACGGTTTCTCAATGCCAAGAA
GAAGAATGGAGGCCGTAAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCAACCTCTGATGAGAACAC
TTCAGAAGCAAGTTCCAGCCTCAGGTCTGAGAAGTCAGCCATGGCTCCTAATGGTAGATC
TTGAGTAAAAAAGTTCATGCACAACAACCACATGTTTAGTTTTATATATTGGGTGGATGT
TTGTATCAGAACAATACTCTGTTTTGGACCCTCTCTGTAGACTGTGTATAGGTTATTTAT
TGCTTGGAACAGATAGGGTGGTGGCTTTGTTTT

QA 1 813 1 813
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5795Contig1 607 2 2 U
TAGAGACCAAAGCGGCTGCTCCAGTCACCACTGAGACCAAACAGGAAGAGAAACCGGCTC
CGGTAGAGACCAAACCGGCTGCTCCAGTCACCACAGAGATAAAGAAAGAAGAAGAGAAAG
AAGAATTGGTAACAATCGAGAAGGCTTTCGCTGCTGAAGTAGAAGAAGCAACCAAAACGG
TCGAAGCAATCGCAGAGTCGATCGTCTCCATCACTCTTCCGGAGACAGCTGCTACGGTAG
AGCCAGAAGAAGTCTCAATCTGGGGCATCCCACTTCTCGAGGACGAAAGATCCGACGTCA
TCCTCCTCAAGTTCCTCCGAGCCCGCGACTTCAAGGTCAAAGAAGCCTTCACCATGCTGA
AAAACACCGTCCAGTGGCGCAAGGAAAACAACATAGACGACCTCGTGGAAGAAGATCTCC
AAGGAGCCGAGTTCGAGAAGATGGTTTTCACTCACGGAGTTGACAAGCAAGGACACGCTG
TAATATACAGCTCGTACGGTGAGTTCCAGAACAAGGAGATTTTCTCAGATAAAAGAGAAG
TTCAACAAGTTCCTCAAGTGGAGGATTCAGTTCCAAGAGAAGTGTGTGAGGTCTCTTGAC
TTTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY63TF U 1
AF RR2A932TF U 30
BS 1 345 RR2CY63TF
BS 346 607 RR2A932TF

RD RR2CY63TF 345 0 0
TAGAGACCAAAGCGGCTGCTCCAGTCACCACTGAGACCAAACAGGAAGAGAAACCGGCTC
CGGTAGAGACCAAACCGGCTGCTCCAGTCACCACAGAGATAAAGAAAGAAGAAGAGAAAG
AAGAATTGGTAACAATCGAGAAGGCTTTCGCTGCTGAAGTAGAAGAAGCAACCAAAACGG
TCGAAGCAATCGCAGAGTCGATCGTCTCCATCACTCTTCCGGAGACAGCTGCTACGGTAG
AGCCAGAAGAAGTCTCAATCTGGGGCATCCCACTTCTCGAGGACGAAAGATCCGACGTCA
TCCTCCTCAAGTTCCTCCGAGCCCGCGACTTCAAGGTCAAAGAAG

QA 1 345 1 345
DS 

RD RR2A932TF 578 0 0
ACTGAGACCAAACATGAAGAGAAACCGGCTCCGGTAGAGACCAGACCGGCTGCTCCAGTC
ACCACAGAGATAAAGAAAGAAGAAGAGAAAGAAGAATTGGTAACAATCGAGAAGGCTTTC
GCTGCTGAAGTAGAAGAAGCAACCAAAACGGTCGAAGCAATCGCAGAGTCGATCGTCTCC
ATCACTCTTCCGGAGACAGCTGCTACGGTAGAGCCAGAAGAAGTCTCAATCTGGGGCATC
CCACTTCTCGAGGACGAAAGATCCGACGTCATCCTCCTCAAGTTCCTCCGAGCCCGCGAC
TTCAAGGTCAAAGAAGCCTTCACCATGCTGAAAAACACCGTCCAGTGGCGCAAGGAAAAC
AACATAGACGACCTCGTGGAAGAAGATCTCCAAGGAGCCGAGTTCGAGAAGATGGTTTTC
ACTCACGGAGTTGACAAGCAAGGACACGCTGTAATATACAGCTCGTACGGTGAGTTCCAG
AACAAGGAGATTTTCTCAGATAAAAGAGAAGTTCAACAAGTTCCTCAAGTGGAGGATTCA
GTTCCAAGAGAAGTGTGTGAGGTCTCTTGACTTTAGCC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL5796Contig1 1121 2 2 U
GGACGATCGCCATTTTCCAATCTCTCTCTCTGTGTCTTCGTTCAATCTTATCTCAGTGAT
TTACTTGCAAGAGAAGTATCCTCTTAAGCTCTCTCTAGAGTCTCAGTTTTTTTTTTCCAC
CATGGCCGGCCAAAACGCGCGTTTGAATGTGGTCCCCACTGTCACAATGCACGGTGTGAT
GAAAGCTCGTCTCGTCGGAGCCACAAGAGGCCACGCTCTCCTAAAGAAGAAGAGCGACGC
TCTAACCGTTCAGTTCAGAGCCCTTCTCAAGAAAATCGTGACGGCCAAGGAATCGATGGG
AGATATGATGAAGACATCCTCTTTCGCTCTCACCGAAGTCAAGTACGTCGCCGGCGAGAA
CGTCAAGCACGTCGTCCTCGAGAACGTCAAAGAAGCCACGCTCAAAGTCAGGTCAAGGCA
AGAGAACATCGCCGGGGTGAAGCTCCCCAAGTTCGGTCATTTCTCAGAAGGAGAGACCAA
GAACGACTTGACCGGTTTAGCTAGAGGTGGACAGCAGGTCCAAGCTTGCCGTGTGGCTTA
CGTGAAAGCCATTGAGGTGCTTGTCGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCT
TGACGAAGCGATCAAGACGACTAATCGGAGGGTTAACGCTTTGGAGAACGTGGTGAAACC
GAAGATTGAGAATACGATTAGTTACATCAAGGGAGAGCTTGATGAGCTCGAGAGGAAAGA
TTTCTTTAGGCTGAAGAAGATTCAGGGGTACAAGAGGAGGGAAGTCGAGAGACAGGCGGC
TAATGCTAAGGCCTTTGCTGAGGAAATGGTTCTTGAAGGGATCTCTATGCAGAGAGGGAT
TTCGATAAACGCTGCTCGTGATATCCTTGCTGGTGGTGCGGAGAAGGATGCAGACATTAT
TTTTTGAGATGTGTGTGTGTGTGTCTGAGAGGCTCTCTATTTATATTTTTGTTTGTGATT
GTTTGGTTTATTAATCGGTTCATCGGAGTTTATGTTTCTTCAAATAAAATGGATTTGATG
TAGATGAAAGATTGTTGTATCATCTTGAGTTGTGATTTGCTATGATTTCCTGAAGAGGTT
TGTGATTGTTACTCTTGTGTAATGATTAATTACCTTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY59TF U 1
AF RR2FY59JQ C 381
BS 1 686 RR2FY59TF
BS 687 1121 RR2FY59JQ

RD RR2FY59TF 686 0 0
GGACGATCGCCATTTTCCAATCTCTCTCTCTGTGTCTTCGTTCAATCTTATCTCAGTGAT
TTACTTGCAAGAGAAGTATCCTCTTAAGCTCTCTCTAGAGTCTCAGTTTTTTTTTTCCAC
CATGGCCGGCCAAAACGCGCGTTTGAATGTGGTCCCCACTGTCACAATGCACGGTGTGAT
GAAAGCTCGTCTCGTCGGAGCCACAAGAGGCCACGCTCTCCTAAAGAAGAAGAGCGACGC
TCTAACCGTTCAGTTCAGAGCCCTTCTCAAGAAAATCGTGACGGCCAAGGAATCGATGGG
AGATATGATGAAGACATCCTCTTTCGCTCTCACCGAAGTCAAGTACGTCGCCGGCGAGAA
CGTCAAGCACGTCGTCCTCGAGAACGTCAAAGAAGCCACGCTCAAAGTCAGGTCAAGGCA
AGAGAACATCGCCGGGGTGAAGCTCCCCAAGTTCGGTCATTTCTCAGAAGGAGAGACCAA
GAACGACTTGACCGGTTTAGCTAGAGGTGGACAGCAGGTCCAAGCTTGCCGTGTGGCTTA
CGTGAAAGCCATTGAGGTGCTTGTCGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCT
TGACGAAGCGATCAAGACGACTAATCGGAGGGTTAACGCTTTGGAGAACGTGGTGAAACC
GAAGATTGAGAATACGATTAGTTACA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2FY59JQ 741 0 0
AGAACGTCAAAGAAGCCACGCTCAAAGTCAGGTCAAGGCAAGAGAACATCGCCGGGGTGA
AGCTCCCCAAGTTCGGTCATTTCTCAGAAGGAGAGACCAAGAACGACTTGACCGGTTTAG
CTAGAGGTGGACAGCAGGTCCAAGCTTGCCGTGTGGCTTACGTGAAAGCCATTGAGGTGC
TTGTCGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCTTGACGAAGCGATCAAGACGA
CTAATCGGAGGGTTAACGCTTTGGAGAACGTGGTGAAACCGAAGATTGAGAATACGATTA
GTTACATCAAGGGAGAGCTTGATGAGCTCGAGAGGAAAGATTTCTTTAGGCTGAAGAAGA
TTCAGGGGTACAAGAGGAGGGAAGTCGAGAGACAGGCGGCTAATGCTAAGGCCTTTGCTG
AGGAAATGGTTCTTGAAGGGATCTCTATGCAGAGAGGGATTTCGATAAACGCTGCTCGTG
ATATCCTTGCTGGTGGTGCGGAGAAGGATGCAGACATTATTTTTTGAGATGTGTGTGTGT
GTGTCTGAGAGGCTCTCTATTTATATTTTTGTTTGTGATTGTTTGGTTTATTAATCGGTT
CATCGGAGTTTATGTTTCTTCAAATAAAATGGATTTGATGTAGATGAAAGATTGTTGTAT
CATCTTGAGTTGTGATTTGCTATGATTTCCTGAAGAGGTTTGTGATTGTTACTCTTGTGT
AATGATTAATTACCTTGTTTC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL5797Contig1 705 2 3 U
TTTTTTTTGTTTAATATGAATTGATTCAGTGTTAAAAAAAAGCGTATTCTTAATTTGCAT
CAAACTCGAAATTAAATAGTGTGTGAATAATAGGGGACAGTGGAAATAGAAAATAAAGGG
GGGGGGGGGGGACTACTTGAAAATGGATCAACATTATCTCATTGGTGAAAGATCTAACTA
TAAGGGCTCCACTGCAGTCTTGAAAAAAAAAACATAAACTTTGCCGATCTGGAAATATAT
GAATCCTCCAATGGAATGTGTGACGTATGAACCAAAGCTGGTCCCAACTATGCAGTGCCA
TGCAGGGCCATAGGCTGAATCAAAGTCCTTTTTAAGGGAGAGAGCAAGTCTTTTGTTGTC
GGCCTTTCCAGGAGTGGCGTTCAAGAGCTCACGCGACAAACCGAAGGCCCTGTTCTGCAT
AACCAGAGGCATATCGGAAGCTCTGACACGAACATTGAACTCGCCTATCAGGTCCTGCTG
CTCTTTAGCCTTCTTCTTCTGCTGTATCAAGCTGTTCAAGAACTTGCTTCTTCTCTCTAG
TTCCAGCTCAACTCCTTCCATGTTCCTCGCTCTCTACTTGCATCACAATCGGCTAGGATC
TCGTTTTCCTCCTTGCTAATCGGAGAACAAAACCAGAGCTAGAGAGAGTCCCCGAAGGCG
CTGGTTAAGTTCGTTAAGCGAGCACCATCTGTTTGACAAAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H134JQ U 13
AF RR2H134TF C 1
BS 1 12 RR2H134TF
BS 13 339 RR2H134JQ
BS 340 705 RR2H134TF

RD RR2H134JQ 331 0 0
AATATGAATTGATTCAGTGTTAAAAAAAAGCGTATTCTTAATTTGCATCAAACTCGAAAT
TAAATAGTGTGTGAATAATAGGGGACAGTGGAAATAGAAAATAAAGGGGGGGGGGGGGGA
CTACTTGAAAATGGATCAACATTATCTCATTGGTGAAAGATCTAACTATAAGGGCTCCAC
TGCAGTCTTGAAAAAAAAAACATAAACTTTGCCGATCTGGAAATATATGAATCCTCCAAT
GGAATGTGTGACGTATGAACCAAAGCTGGTCCCAACTATGCAGTGCCATGCAGGGCCATA
GGCTGAATCAAAGTCCTTTTTAAGGGA
AAAA

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR2H134TF 705 0 0
TTTTTTTTGTTTAATATGAATTGATTCAGTGTTAAAAAAAAGCGTATTCTTAATT*GCAT
CAAACTCGAAATTAAATAGTGTGTGAATAATAGGGGACAGTGGAAATAGAAAATAAAGGG
GGGGGGGGGGGACTACTTGAAGATGGATCAACATTATCTCATTGGTGAGAGATCTAACTA
TAAGGGCTCCACTGCAGTCTTGAAAAGAAGAACATAAACTTTGCCGATCTGGAAATATAT
GAATCCTCCAATGGAATGTGTGACGTATGAACCAAAGCTGGTCCCAACTATGCAGTGCCA
TGCAGGGCCATAGGCTGAATCAAAGTCCTTTTTAAGGGAGAGAGCAAGTCTTTTGTTGTC
GGCCTTTCCAGGAGTGGCGTTCAAGAGCTCACGCGACAAACCGAAGGCCCTGTTCTGCAT
AACCAGAGGCATATCGGAAGCTCTGACACGAACATTGAACTCGCCTATCAGGTCCTGCTG
CTCTTTAGCCTTCTTCTTCTGCTGTATCAAGCTGTTCAAGAACTTGCTTCTTCTCTCTAG
TTCCAGCTCAACTCCTTCCATGTTCCTCGCTCTCTACTTGCATCACAATCGGCTAGGATC
TCGTTTTCCTCCTTGCTAATCGGAGAACAAAACCAGAGCTAGAGAGAGTCCCCGAAGGCG
CTGGTTAAGTTCGTTAAGCGAGCACCATCTGTTTGACAAAAGTCC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL5798Contig1 136 2 1 U
TCATGCTGTATACAACAAGCCCCATAAATAACCCTACAAATCAAATATGAATGGGACGTC
TTTTTATTTTTGTTTTCCCTTGGAAAAAAAATGAACTCCCCCCCCAAAGTTCTGTACAAA
TGAAATCTGTACAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GD15JQ U 1
AF RR2GE47JQ U 1
BS 1 136 RR2GD15JQ

RD RR2GD15JQ 136 0 0
TCATGCTGTATACAACAAGCCCCATAAATAACCCTACAAATCAAATATGAATGGGACGTC
TTTTTATTTTTGTTTTCCCTTGGAAAAAAAATGAACTCCCCCCCCAAAGTTCTGTACAAA
TGAAATCTGTACAAAA

QA 1 136 1 136
DS 

RD RR2GE47JQ 136 0 0
TCATGCTGTATACAACAAGCCCCATAAATAACGCTACAAATCAAATATGAATGGGACGTC
TTTTTATTTTTGTTTTCCCTTGGAAAAAAAATGAACTCCCCCCCCAAAGTTCTGTACAAA
TGAAATCTGTACAAAA

QA 1 136 1 136
DS 



AS 1 2

CO CL5799Contig1 911 2 2 U
AGTTCAACCTCCTCGGCCGGCGAAACCCTAGCTTCATGATCCACTTCAAACCCCAATTCG
GCGACTTCTCTATCAAGAAATCTCACTCCTCCTCCTCCTCTGGATTCGGATCCAATCTCA
ACGGATCCGTCTCGGAGGAGGATTCGTCGATCGAGGTTGTTGATTCTCCGGCGGAGGGTT
TCGAGAAGGTGACTCTTTTGCAGTCTGCTTCGGCGGGAGATATCGCCGGGTTGTTGTCCG
GTGTGGAGGTCGCGGCGAGGACGTGTTTGCCTGTGAGGGGACGCGCGGTTGTGAATTTCA
GGTGGGGGGTTAGGGTTCCGACGGAGATGAGACGGGAGTTTGATCCGACGGCTGCTGTGG
TTTCTCTGAGGAGGTTTCCGTTTCTGGTGATGGATAAGATTGGGATCGAACACGCGGAAG
GTAAAGAGGTTAATAATAAACCCGCGGGGGATACTACTGGTGTTGATTTGGGGAAGGTGC
GTTTGTTTATGGAGGAGCTTCGGTCCGAGAACAGAGAGTTGAAGAGAGCTGTCGAAGATC
TCAGGGGAGTGGTGATGATGTCAAACGTGTCGCCAGTAGTAGATTACGGATCGTACTCAT
CAAAGCAGCGGGAAGCGGAGAGGGGCAATAACAAAAGCAAGAACAACAGTGGTAGAGGGA
GAGCTGATCGGTGGAGCAGCGAGAGAACGGCCTCGGATTGTGGAGGGAAGCAAAGTAAGG
AAGAGGGTGACGTGGCGGAGGAGCTGAAGAAAGCCTTGAAAGGAGCTTCTTGATGGTGTT
TGGTTACACTCGCTATGATCTCGAGAGGTGATAAAAAAAGCTTTATTCGTATTGTTGTAC
TGCATTCCGTCTTCTTAGTTTTATCTATGCCTTTTGTATATATGCGTTAAGTTGCTGCTG
GATTTTGGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX10TFB U 1
AF RR2AX10JQ C 109
BS 1 260 RR2AX10TFB
BS 261 911 RR2AX10JQ

RD RR2AX10TFB 260 0 0
AGTTCAACCTCCTCGGCCGGCGAAACCCTAGCTTCATGATCCACTTCAAACCCCAATTCG
GCGACTTCTCTATCAAGAAATCTCACTCCTCCTCCTCCTCTGGATTCGGATCCAATCTCA
ACGGATCCGTCTCGGAGGAGGATTCGTCGATCGAGGTTGTTGATTCTCCGGCGGAGGGTT
TCGAGAAGGTGACTCTTTTGCAGTCTGCTTCGGCGGGAGATATCGCCGGGTTGTTGTCCG
GTGTGGAGGTCGCGGCGAGG

QA 1 260 1 260
DS 

RD RR2AX10JQ 803 0 0
GATCCAATCTCAACGGATCCGTCTCGGAGGAGGATTCGTCGATCGAGGTTGTTGATTCTC
CGGCGGAGGGTTTCGAGAAGGTGACTCTTTTGCAGTCTGCTTCGGCGGGAGATATCGCCG
GGTTGTTGTCCGGTGTGGAGGTCGCGGCGAGGACGTGTTTGCCTGTGAGGGGACGCGCGG
TTGTGAATTTCAGGTGGGGGGTTAGGGTTCCGACGGAGATGAGACGGGAGTTTGATCCGA
CGGCTGCTGTGGTTTCTCTGAGGAGGTTTCCGTTTCTGGTGATGGATAAGATTGGGATCG
AACACGCGGAAGGTAAAGAGGTTAATAATAAACCCGCGGGGGATACTACTGGTGTTGATT
TGGGGAAGGTGCGTTTGTTTATGGAGGAGCTTCGGTCCGAGAACAGAGAGTTGAAGAGAG
CTGTCGAAGATCTCAGGGGAGTGGTGATGATGTCAAACGTGTCGCCAGTAGTAGATTACG
GATCGTACTCATCAAAGCAGCGGGAAGCGGAGAGGGGCAATAACAAAAGCAAGAACAACA
GTGGTAGAGGGAGAGCTGATCGGTGGAGCAGCGAGAGAACGGCCTCGGATTGTGGAGGGA
AGCAAAGTAAGGAAGAGGGTGACGTGGCGGAGGAGCTGAAGAAAGCCTTGAAAGGAGCTT
CTTGATGGTGTTTGGTTACACTCGCTATGATCTCGAGAGGTGATAAAAAAAGCTTTATTC
GTATTGTTGTACTGCATTCCGTCTTCTTAGTTTTATCTATGCCTTTTGTATATATGCGTT
AAGTTGCTGCTGGATTTTGGAAG

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL5800Contig1 977 2 2 U
GGACAACAAACAACAACAAAAAAAAAAAAGATGAGGAATGTGATTCTGAATAGAGTAATC
TTTTCGAAATCACTCACTCTCGTCCCCTCTCTCACTCCTCCCCAAATCTTCCATCGCTCC
GCCGCCGCTGCTTCGTATCCCAACCGAGCGATGCACTGCATGGCAAACGACTCCCCACTC
TCTCAACCAGATCGAAGCGGAGATGGTTCCGTCTCCCTCCCTCCTCCTCCTACTTCTGCT
TCCTCCGCCATAGATTTTCTCTCCCTCTGCTCTCGCCTCAAGACAACTCCAAGAGCTGGA
TGGGTTAAAAGAGAAGTGAAGAATCCAGAGTCAATAGCGGATCACATGTACCGGATGGGT
CTTATGGCCTTAGTTTCTTCTGACATTCCCGGTGTTAACAGAGACAAGTGTATGAAAATG
GCAATTGTTCATGACATTGCAGAAGCCATTGTAGGGGATATCACACCTACTTGCGGTGTC
TCTAAAGAAGAGAAAAACCGTAGAGAAACTGAAGCACTTGAACACATGTGCAAACTCTTG
GGTGGAGGAGAAAGAGCTGAAGAAATCGCCGAGCTGTGGAGAGAATATGAAGCAAACGAA
TCACCAGAAGCCAAAGTCGTTAAAGATTTCGATAAGCTTGAGATGATTCTACAAGCTTTG
GAATATGAACAAGAGCAAGGTAAAGATTTAGATGAGTTTTTCCAATCCACTGCAGGGAAG
TTTCAGTTGATATAGGCAAAGCTTGGGCCTTGGAGATTGCTTCAAGAAGAACAAAACGAC
AGTAGTTACTTCTCACTTGAGCTAAATACACTCTTGGCGCTCAACTTTAATCATTTTCAA
GACTTATTGTGGATCTAGAACTTAAGGGTAACTCTTGTAGCTAAATACTTTTGAGGGAGA
AGCCTAAAATGGTTAAAAAACGCATAGGCTATTTTTATGGGTTTATGCTAAAACTCTTGA
GAAAATTTGGAAAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX55TF U 1
AF RR2EX55JQ C 375
BS 1 675 RR2EX55TF
BS 676 977 RR2EX55JQ

RD RR2EX55TF 675 0 0
GGACAACAAACAACAACAAAAAAAAAAAAGATGAGGAATGTGATTCTGAATAGAGTAATC
TTTTCGAAATCACTCACTCTCGTCCCCTCTCTCACTCCTCCCCAAATCTTCCATCGCTCC
GCCGCCGCTGCTTCGTATCCCAACCGAGCGATGCACTGCATGGCAAACGACTCCCCACTC
TCTCAACCAGATCGAAGCGGAGATGGTTCCGTCTCCCTCCCTCCTCCTCCTACTTCTGCT
TCCTCCGCCATAGATTTTCTCTCCCTCTGCTCTCGCCTCAAGACAACTCCAAGAGCTGGA
TGGGTTAAAAGAGAAGTGAAGAATCCAGAGTCAATAGCGGATCACATGTACCGGATGGGT
CTTATGGCCTTAGTTTCTTCTGACATTCCCGGTGTTAACAGAGACAAGTGTATGAAAATG
GCAATTGTTCATGACATTGCAGAAGCCATTGTAGGGGATATCACACCTACTTGCGGTGTC
TCTAAAGAAGAGAAAAACCGTAGAGAAACTGAAGCACTTGAACACATGTGCAAACTCTTG
GGTGGAGGAGAAAGAGCTGAAGAAATCGCCGAGCTGTGGAGAGAATATGAAGCAAACGAA
TCACCAGAAGCCAAAGTCGTTAAAGATTTCGATAAGCTTGAGATGATTCTACAAGCTTTG
GAATATGAACAAGAG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2EX55JQ 603 0 0
TTCTTCTGACATTCCCGGTGTTAACAGAGACAAGTGTATGAAAATGGCAATTGTTCATGA
CATTGCAGAAGCCATTGTAGGGGATATCACACCTACTTGCGGTGTCTCTAAAGAAGAGAA
AAACCGTAGAGAAACTGAAGCACTTGAACACATGTGCAAACTCTTGGGTGGAGGAGAAAG
AGCTGAAGAAATCGCCGAGCTGTGGAGAGAATATGAAGCAAACGAATCACCAGAAGCCAA
AGTCGTTAAAGATTTCGATAAGCTTGAGATGATTCTACAAGCTTTGGAATATGAACAAGA
GCAAGGTAAAGATTTAGATGAGTTTTTCCAATCCACTGCAGGGAAGTTTCAGTTGATATA
GGCAAAGCTTGGGCCTTGGAGATTGCTTCAAGAAGAACAAAACGACAGTAGTTACTTCTC
ACTTGAGCTAAATACACTCTTGGCGCTCAACTTTAATCATTTTCAAGACTTATTGTGGAT
CTAGAACTTAAGGGTAACTCTTGTAGCTAAATACTTTTGAGGGAGAAGCCTAAAATGGTT
AAAAAACGCATAGGCTATTTTTATGGGTTTATGCTAAAACTCTTGAGAAAATTTGGAAAG
AGC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL5801Contig1 449 2 5 U
TTGGCATGCAGCCTTGTGAGGGGACGGAGGCAGTTCCGAGCAATGCAAGGTCACACACTT
GCTTATTGTCAGGTGTGTACATAGGGAACGTGAAAGTGTTAGTGAGGGCACAGTTTGGGA
TGGACAGTTCAAGGGAGATTGCAATGAAACTGGCGGTTAGAGCAGAGGACGTCTCTGTCG
CTGAGGCCATTCATGAGATTGCTGCCAACGGCTAAAACTCTGATGGATCCACCTTTCAAG
TATCTACCACCACCAAAGCGTTTGTTATTCTTATAAGTACCAGACCAAAAATAAACAAGA
CTTTTCTTCATCTATTTTGCTTTGAATAGTATATTAGTACTTCTTTTTGTCTACATTACT
ATTGTCAAATACTGGATTTTTTTCCCTATATGATGGTTTTGTTACTTTTGTGTTTGATTT
GATGGTTAAAAGAAATAGTTGAACTGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY76TFB U 146
AF RR2GI91JQB C 1
BS 1 145 RR2GI91JQB
BS 146 201 RR2AY76TFB
BS 202 202 RR2GI91JQB
BS 203 412 RR2AY76TFB
BS 413 449 RR2GI91JQB

RD RR2AY76TFB 267 0 0
GAAACTGGCGGTTAGAGCAGAGGACGTCTCTGTCGCTGAGGCCATTCATGAGATTGTTGC
CAACGGCTAAAACTCTGATGGATCCACCTTTCAAGTATCTACCACCACCAAAGCGTTTGT
TATTCTTATAAGTACCAGACCAAAAATAAACAAGACTTTTCTTCATCTATTTTGCTTTGA
ATAGTATATTAGTACTTCTTTTTGTCTACATTACTATTGTCAAATACTGGATTTTTTTCC
CTATATGATGGTTTTGTTACTTTTGTG

QA 1 267 1 267
DS 

RD RR2GI91JQB 449 0 0
TTGGCATGCAGCCTTGTGAGGGGACGGAGGCAGTTCCGAGCAATGCAAGGTCACACACTT
GCTTATTGTCAGGTGTGTACATAGGGAACGTGAAAGTGTTAGTGAGGGCACAGTTTGGGA
TGGACAGTTCAAGGGAGATTGCAATGAAACTGGCGGTTAGAGCAGAGGACGTTTCTGTCG
CTGAGGCCATTCATGAGATTGCTGCCAACGGCTAAAACTTTGATGGATCCCCCTTTCAAG
TATCTACCACCACCAAAGCGTTTGTTATTCTTATAAGTACCAGACCAAAAATAAACAAGA
CTTTTTTTCATTTATTTTGCTTTGAATAGTATATTAGTACTTCTTTTTGTCTACATTACT
ATTGTCAAATACTGGATTTTTTTCCCTATATGATGGTTTTGTTACTTTTGTGTTTGATTT
GATGGTTAAAAGAAATAGTTGAACTGCCG

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 2

CO CL5802Contig1 992 2 4 U
GGACTTTCTTCAATTCATCCGGAGATTCGTCGCCGGAGACTGAAGCTTCCGAGAGGAGGA
GGAGGAGGAGGCGGAGAAGAAGAGTTCAGGAGAGATGGAAGATGGAAGAGAAGGAGATTG
GGAGTGTTTAGGTTGCAGTAACAGGAACTACGCGTTTCGATCATTCTGCAACAGATGCAA
GCAGCCTCGTCTTTTCATGGACAACAATACCTCTCACAACTCCAAGTGGCTTCCTCGTGT
CGGTGATTGGATCTGCACTGGTTGCACTAACAACAATTATGCATCACGAGAAAAGTGCAA
AAAGTGCGGACAGCCAAAGGAAGTAGCAGCTTTGTCAGCACTCGCTATCCCTGGAGCAGC
TTCCTATCTCAGTTACTTCACCACCCGTGGACTTGATCCAGCAAATCAAGTTTCGGCTGT
TAAAGAGTGGAGGAGCGGTGACTGGATCTGCACTTGTGGGTTTCACAACTATTCCTCTCG
TATACAGTGCAAAAAGTGCAATGAAACAGCTCCACTAGCACTTGGAACGAAGAGATTAGC
ATCAGAAGTGTTGGCTCATGAATGGGATAGCAAAAGATTGAATCAAGGATATACAAGCAT
GCAACCACAGTCATCGTTATATGCATCTTTTCCTGGTATATCCTCAGGCAGTATCTCAAA
CTGGCAACTTCCTCTCCCGTTTCTACAGCAACAACAGTTAACACCTGCTTTACTCGGATA
CGGAGCAAAACAATGGCGTGATGGAGACTGGATGTGCACAAACTGCAAGAATCACAATTA
TGCATCCCGATCAGAGTGCAATAGGTGCAAGACTAAACGAGATATCATTGAGCAGACCAT
AACTCCAGCACAATCTTAAAGAATCAAAAAGAGTGTTCTTTCACTCTCATTACAACCTTG
TTTGATTTGGGGTACACATTACTCGAAACTGGCATGAATATAAGCCTTCAAAATGTTTTA
TAACACAGAAAAGCTAAAAGCTTGCTTAGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU67TF U 1
AF RR2FU67JQ C 473
BS 1 647 RR2FU67TF
BS 648 648 RR2FU67JQ
BS 649 800 RR2FU67TF
BS 801 992 RR2FU67JQ

RD RR2FU67TF 800 0 0
GGACTTTCTTCAATTCATCCGGAGATTCGTCGCCGGAGACTGAAGCTTCCGAGAGGAGGA
GGAGGAGGAGGCGGAGAAGAAGAGTTCAGGAGAGATGGAAGATGGAAGAGAAGGAGATTG
GGAGTGTTTAGGTTGCAGTAACAGGAACTACGCGTTTCGATCATTCTGCAACAGATGCAA
GCAGCCTCGTCTTTTCATGGACAACAATACCTCTCACAACTCCAAGTGGCTTCCTCGTGT
CGGTGATTGGATCTGCACTGGTTGCACTAACAACAATTATGCATCACGAGAAAAGTGCAA
AAAGTGCGGACAGCCAAAGGAAGTAGCAGCTTTGTCAGCACTCGCTATCCCTGGAGCAGC
TTCCTATCTCAGTTACTTCACCACCCGTGGACTTGATCCAGCAAATCAAGTTTCGGCTGT
TAAAGAGTGGAGGAGCGGTGACTGGATCTGCACTTGTGGGTTTCACAACTATTCCTCTCG
TATACAGTGCAAAAAGTGCAATGAAACAGCTCCACTAGCACTTGGAACGAAGAGATTAGC
ATCAGAAGTGTTGGCTCATGAATGGGATAGCAAAAGATTGAATCAAGGATATACAAGCAT
GCAACCACAGTCATCGTTATATGCATCTTTTCCTGGTATATCCTCAG*CAGTATCTCAAA
CTGGCAACTTCCTCTCCCGTTTCTACAGCAACAACAGTTAACACCTGCTTTACTCGGATA
CGGAGCAAAACAATGGCGTGATGGAGACTGGATGTGCACAAACTGCAAGAATCACAATTA
TGCATCCCGATCAGAGTGCA

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2FU67JQ 520 0 0
TCCTTTCGTATACAGTGCAAAAAGTGCAATGAAACAGTTCCACTAGCACTTGGAACGAAG
AGATTAGCATCAGAAGTGTTGGTTCATGAATGGGATAGCAAAAGATTGAATCAAGGATAT
ACAAGCATGCAACCACAGTCATCGTTATATGCATCTTTTCCTGGTATATCCTCAGGCAGT
ATCTCAAACTGGCAACTTCCTCTCCCGTTTTTACAGCAACAACAGTTAACACCTGCTTTA
TTCGGATACGGAGCAAAACAATGGCGTGATGGAGACTGGATGTGCACAAACTGCAAGAAT
CACAATTATGCATCCCGATCAGAGTGCAATAGGTGCAAGACTAAACGAGATATCATTGAG
CAGACCATAACTCCAGCACAATCTTAAAGAATCAAAAAGAGTGTTCTTTCACTCTCATTA
CAACCTTGTTTGATTTGGGGTACACATTACTCGAAACTGGCATGAATATAAGCCTTCAAA
ATGTTTTATAACACAGAAAAGCTAAAAGCTTGCTTAGCAC

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 2

CO CL5803Contig1 747 2 2 U
GCCGAGCTGAGCTAAACCCTCTCTGACACAGTTCTGTAACTAATAAATAATGGGCCTATC
TACGCGTTTTGTGGGCCTTGTGTCTACAGGTGACCTTCTCTACGCTTTTAGGCCTTATTT
TCATTTTATTTCCCCCGAACAGCAGAGATATAAATAAACAAGACATGTGGAAATCTTTTC
TTTTTTTATGTAACCTTTCATGTAAACTAATAGATACCAGTCTCTTTTTTTTTTTTGGCA
ACGGTTAATTGAATTAAAGAAGGAAGAAAAGAGTCTTGGGCCTGGCCCAACTTACAAAGA
AGGAAAAGAAGAGACGTGGGCTTTAAGGACCCGCTTGGCTAAAGCATCAGTTTCTCCGTT
CTGAGAACGAGAGACAAACTGGAAAGAGATAGAAGAAAAACGAGAAGAGAAACGATCGAT
GTCGTGAAGAACACCAAAGATCTCTATGATTTGGTTTTTGCAGTTGATTGTTCTGGTGAG
CGTTTGGCAGTCCGAGTAGAAGGCGGCTGACTGAAATCCCATTTGGAGCGTCTGTTTGAT
TCCGGTTAGAAGCGCAAGCGATTCGGCGACTAGAGGAGATGAGACGGCTTCAAAAATTTG
AGTTCCTGAGAGGTGGAGGTGCGGTTGATTCCTGGAGATTCGCCATGCAACACCCGATCT
CTTCGATCTTGCATCCCAAGCGGCATCAACAAAGCAGGAGATCTCCGATGGAATAGATAC
CAGTCTCTAGGATAGGTTCAGAATCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH05TF U 1
AF RR2GH05JQB C 1
BS 1 301 RR2GH05TF
BS 302 747 RR2GH05JQB

RD RR2GH05TF 301 0 0
GCCGAGCTGAGCTAAACCCTCTCTGACACAGTTCTGTAACTAATAAATAATGGGCCTATC
TACGCGTTTTGTGGGCCTTGTGTCTACAGGTGACCTTCTCTACGCTTTTAGGCCTTATTT
TCATTTTATTTCCCCCGAACAGCAGAGATATAAATAAACAAGACATGTGGAAATCTTTTC
TTTTTTTATGTAACCTTTCATGTAAACTAATAGATACCAGTCTCTTTTTTTTTTTTGGCA
ACGGTTAATTGAATTAAAGAAGGAAGAAAAGAGTCTTGGGCCTGGCCCAACTTACAAAGA
A

QA 1 301 1 301
DS 

RD RR2GH05JQB 747 0 0
GCCGAGCTGAGCTAAACCCTCTCTGACACAGTTCTGTAACTAATAAATAATGGGCCTATC
TACGCGTTTTGTGGGCCTTGTGTCTACAGGTGACCTTCTCTACGCTTTTAGGCCTTATTT
TCATTTTATTTCCCCCGAACAGCAGAGATATAAATAAACAAGACATGTGGAAATCTTTTC
TTTTTTTATGTAACCTTTCATGTAAACTAATAGATACCAGTCTCTTTTTTTTTTTTGGCA
ACGGTTAATTGAATTAAAGAAGGAAGAAAAGAGTCTTGGGCCTGGCCCAACTTACAAAGA
AGGAAAAGAAGAGACGTGGGCTTTAAGGACCCGCTTGGCTAAAGCATCAGTTTCTCCGTT
CTGAGAACGAGAGACAAACTGGAAAGAGATAGAAGAAAAACGAGAAGAGAAACGATCGAT
GTCGTGAAGAACACCAAAGATCTCTATGATTTGGTTTTTGCAGTTGATTGTTCTGGTGAG
CGTTTGGCAGTCCGAGTAGAAGGCGGCTGACTGAAATCCCATTTGGAGCGTCTGTTTGAT
TCCGGTTAGAAGCGCAAGCGATTCGGCGACTAGAGGAGATGAGACGGCTTCAAAAATTTG
AGTTCCTGAGAGGTGGAGGTGCGGTTGATTCCTGGAGATTCGCCATGCAACACCCGATCT
CTTCGATCTTGCATCCCAAGCGGCATCAACAAAGCAGGAGATCTCCGATGGAATAGATAC
CAGTCTCTAGGATAGGTTCAGAATCTT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5805Contig1 788 2 3 U
CGAGTCTTTTACTTGCTTAGGTGAATGGGACTCCTCCTCTGTTTTTTCCTACCACCAAAC
CTATCCTCTCTGCGCCAATCATTTATGACCTCAGGACGAGAAGGGCTTTTCTGGTAGCTT
GGTCGAACCCTGGACCAGCAGGACTTGATCTGCCGCTGTAACGACGGTCATACACATCAT
CATATGGTGGACTTCGAGACCCACTAAAACTTCGTGTCTCACTATCTCCCATGGGTCCTC
TTGGAGGCTTGTCGTCATTCTTCTCATTGGTATACCTTTTGTTTACATACACCTGTCTAA
TGAAGTCTCTTAATCGCTCGACATTACTTCCGTCAGATACTGACTGCATCTGTTGATCCA
GTCCTTTAAAATAAATATCCTTAGCATGCTGATTGCCACCTTCTTTTAGAGCAGAGACTT
CTTGGGAAGTAAATTTAGCCATTGATATGGACTTAACACGATGAGTAAACTCACGGTGTA
CTCCACTGCAGTTGGTACAAACAAAAGTCCAGAAAGAAGTGCAAACATATTGTGGTCCGA
GGCTGTTACAGTTGATACACCTCTTGTTGTGTGGTAGTTTGAGAAGACTCCTAATAATCC
GCTCGTTCTTCTCCTCTTCTTTCACCCCACCACCCATCTGGCCAGGGTTTGACGATTCAA
CGACGACGATCTAAGAGTTTTTCTGATTTTTTTTCTGTCTCTCCTAGTTGGAATGAATCA
CATAGATAGATAGATGACTTCTTTCTTTCTTTCTAGAGAGAGAGAGAGAAAGTCTCTTGT
ACAGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU52JQ U 106
AF RR2FU52TF C 1
BS 1 106 RR2FU52TF
BS 107 410 RR2FU52JQ
BS 411 788 RR2FU52TF

RD RR2FU52JQ 305 0 0
T
TTTTCTGGTAGCTTGGTCGAACCCTGGACCAGCAGGACTTGATCTGCCGCTGTAACGACG
GTCATACACATCATCATATGGTGGACTTCGAGACCCACTAAAACTTCGTGTCTCACTATC
TCCCATGGGTCCTCTTGGAGGCTTGTCGTCATTCTTCTCATTGGTATACCTTTTGTTTAC
ATACACCTGTCTAATGAAGTCTCTTAATCGCTCGACATTACTTCCGTCAGATACTGACTG
CATCTGTTGATCCAGTCCTTTAAAATAAATATCCTTAGCATGCTGATTGCCACCTTCTTT
TAGA

QA 2 305 2 305
DS 

RD RR2FU52TF 788 0 0
CGAGTCTTTTACTTGCTTAGGTGAATGGGACTCCTCCTCTGTTTTTTCCTACCACCAAAC
CTATCCTCTCTGCGCCAATCATTTATGACCTCAGGACGAGAAGGGCTTTTCTGGTAGCTT
GGTCGAACCCTGGACCAGCAGGACTTGATCTGCCGCTGTAACGACGGTCATACACATCAT
CATATGGTGGACTTCGAGACCCACTAGAACTTCGTGTCTCACTATCTCCCATGGGTCCTC
TTGGAGGCTTGTCGTCATTCTTCTCATTGGTATACCTTTTGTTTACATACACCTGTCTAA
TGAAGTCTCTTAATCGCTCGACATTACTTCCGTCAGATACTGACTGCATCTGTTGATCCA
GTCCTTTAAAATAAATATCCTTAGCATGCTGATTGCCACCTTCTTTTAGAGCAGAGACTT
CTTGGGAAGTAAATTTAGCCATTGATATGGACTTAACACGATGAGTAAACTCACGGTGTA
CTCCACTGCAGTTGGTACAAACAAAAGTCCAGAAAGAAGTGCAAACATATTGTGGTCCGA
GGCTGTTACAGTTGATACACCTCTTGTTGTGTGGTAGTTTGAGAAGACTCCTAATAATCC
GCTCGTTCTTCTCCTCTTCTTTCACCCCACCACCCATCTGGCCAGGGTTTGACGATTCAA
CGACGACGATCTAAGAGTTTTTCTGATTTTTTTTCTGTCTCTCCTAGTTGGAATGAATCA
CATAGATAGATAGATGACTTCTTTCTTTCTTTCTAGAGAGAGAGAGAGAAAGTCTCTTGT
ACAGCACC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL5806Contig1 1090 2 2 U
GCACAAGACTTTGTTCAGGAGATATATGTCCAGGAGAATCATGCTGTTGAGCAGTCTGAT
GTGTTGTCGAAGAGCATTAATGGTCCTGAAGTGTTCGCTCCCACTGAAGAGGAACAGATA
TCAGTGACAGAAGACGATCCTGCTCCTGGAATAGTTCATGAAGCTCCAGTTGATGTGCAG
AAGGTTGGAGAGTCTGATTCTAGGACTGGCGAAGTTCCAAAGAGATCTTATGCATCCATT
GTGATGGTTATGAAAGAGAATGCTGCACCGATGTCTGCTTCGAGAACTCCAACTAAAGTA
GTGGAACCAAAGAGACAAGAAGATCAAGCCACACATGTCCCTCTACCGACACCGTTGTCT
GAGAAATCAGATTCAAGAGCAAATGTAGCTGTAAATGGGAACGATCAAGACAATGAAAGA
GCTCCAGGTCCATCCATCTATCTAAAGGGGTTGCCCCTTGATGCAACACCAGCCTTGCTC
GAGAATGAGTTCCAGAAGTTTGGACTTATTAGGACCAACGGAATTCAAGTAAGAAGTCAG
AAGGGATTCTGTTTTGGCTTTGTTGAGTTTGAATCCGCGAGTTCCATGCAAAGCGCAATC
GAGGCATCACCTATCATACTCGGTGGGCAGAACGTAGTTATCGAGGAAAAACGATCGACG
GCAAGAGGGAATCATAGAGGACGCTCAGCGTTTGGTGTAGGCGCAGGCTACAGAAACGAA
GGTGGAAGGGGTCGTGGAAGCTTTGGAGGTGGAAGAGGTCGGAACGAATTCAACGGATAT
GGTAACAACAGGGGAAACAATAGAGGAGGATATGCGAACAGAGCAAATGGTGACGGTGGT
GGGCTTCCGAGACGTGTAAGACGTGGTGCTGGTGGCGGAATAGATGCAAACGGAGCTACA
AAACCTGTGGATGCTCCTCTCGTGTCTCTCACTGCGTAACGTTTCAACCCCCACGAAAAG
AGGCTCGAATTGTTTTAGAGAGTATAGGCTTAGAGCTGTGACTAAAAAAAATAGCTATTA
TTCTCTTTTCCCTGCATCCCCCATTTTGTTAATTGGAGTTACAAATTCTATGAGGCAGAT
AAAGTTTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD27TF U 1
AF RR2DD27JQ C 351
BS 1 651 RR2DD27TF
BS 652 1090 RR2DD27JQ

RD RR2DD27TF 651 0 0
GCACAAGACTTTGTTCAGGAGATATATGTCCAGGAGAATCATGCTGTTGAGCAGTCTGAT
GTGTTGTCGAAGAGCATTAATGGTCCTGAAGTGTTCGCTCCCACTGAAGAGGAACAGATA
TCAGTGACAGAAGACGATCCTGCTCCTGGAATAGTTCATGAAGCTCCAGTTGATGTGCAG
AAGGTTGGAGAGTCTGATTCTAGGACTGGCGAAGTTCCAAAGAGATCTTATGCATCCATT
GTGATGGTTATGAAAGAGAATGCTGCACCGATGTCTGCTTCGAGAACTCCAACTAAAGTA
GTGGAACCAAAGAGACAAGAAGATCAAGCCACACATGTCCCTCTACCGACACCGTTGTCT
GAGAAATCAGATTCAAGAGCAAATGTAGCTGTAAATGGGAACGATCAAGACAATGAAAGA
GCTCCAGGTCCATCCATCTATCTAAAGGGGTTGCCCCTTGATGCAACACCAGCCTTGCTC
GAGAATGAGTTCCAGAAGTTTGGACTTATTAGGACCAACGGAATTCAAGTAAGAAGTCAG
AAGGGATTCTGTTTTGGCTTTGTTGAGTTTGAATCCGCGAGTTCCATGCAAAGCGCAATC
GAGGCATCACCTATCATACTCGGTGGGCAGAACGTAGTTATCGAGGAAAAA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2DD27JQ 740 0 0
ACCGTTGTCTGAGAAATCAGATTCAAGAGCAAATGTAGCTGTAAATGGGAACGATCAAGA
CAATGAAAGAGCTCCAGGTCCATCCATCTATCTAAAGGGGTTGCCCCTTGATGCAACACC
AGCCTTGCTCGAGAATGAGTTCCAGAAGTTTGGACTTATTAGGACCAACGGAATTCAAGT
AAGAAGTCAGAAGGGATTCTGTTTTGGCTTTGTTGAGTTTGAATCCGCGAGTTCCATGCA
AAGCGCAATCGAGGCATCACCTATCATACTCGGTGGGCAGAACGTAGTTATCGAGGAAAA
ACGATCGACGGCAAGAGGGAATCATAGAGGACGCTCAGCGTTTGGTGTAGGCGCAGGCTA
CAGAAACGAAGGTGGAAGGGGTCGTGGAAGCTTTGGAGGTGGAAGAGGTCGGAACGAATT
CAACGGATATGGTAACAACAGGGGAAACAATAGAGGAGGATATGCGAACAGAGCAAATGG
TGACGGTGGTGGGCTTCCGAGACGTGTAAGACGTGGTGCTGGTGGCGGAATAGATGCAAA
CGGAGCTACAAAACCTGTGGATGCTCCTCTCGTGTCTCTCACTGCGTAACGTTTCAACCC
CCACGAAAAGAGGCTCGAATTGTTTTAGAGAGTATAGGCTTAGAGCTGTGACTAAAAAAA
ATAGCTATTATTCTCTTTTCCCTGCATCCCCCATTTTGTTAATTGGAGTTACAAATTCTA
TGAGGCAGATAAAGTTTCGG

QA 1 740 1 740
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5808Contig1 1160 2 2 U
GGAGTTAAAAACTACCCAAAAAAAAAAAAAATCAGTATTACTTTTCCCCATCCTACAATA
AAATGGCAAGATCTCCTTTAGCAATATGTCTAATGTTCATAATAGTAGCATCAAGTACAT
TATATGAAGCGCAAGGACATTTCTTATTAAATGATTACTTGAAGAAATTTCCTGAAACGT
CCAGTGAATTTAAACCTTTCGCTTTCAAGGGTATGCTTAGTTTTGTAGACGGCCTTGAGA
GCTTATGTCCCTCCAAGGGGGAGTACAAGGAGTTCTTTACACAGCTGAAGGCTTTTATGA
GCTTCATAAACTCAGCATCAAGGTCGTCATCAGAATTCAATTCTCAGTTGAAAGCACAAT
CCGAGGGGCTCTTCAAGGCTATCTCTACATTGAGTGGCAAAGCAGGATCATCGGGGGATA
CAAGCAAATTGATTGACAGTTTGACGTCGATGGGAAAAACTTTGGCTGGGTACAAGAGGA
CAGGTTCACAAACAATAACAAGTGAACAGAGGGAAATGCCGACGAAATCTATGGTGAAAT
GGGCAAAAGGGATCGGTGATTTTGTGAAAACGGTAGGTGAGAAGAGTGGTAGCTGTAATA
TTGATCTCTCATCCCTTGGATTGGGAGATGGAAGCTCTAGCAAAGATGGAAGCAGTGGTG
GCAGTGAAAGTGGAACTCCAAGCTCCGACACTGGTTCCCCTCTAGCTGAAACTTCCACGG
AGAATGAAAGTGCTGGTGGTCCAAGTGGAAGTACATCAGATATGTCCACAGAAGGAACAA
GTACTATGGATGGTGGAACCACTGCCGGGAGCACGAGTGGAGGAGGTTCAACTGATAGCT
CTGCCGCAGGAGAAAGTTCCATGAATGGTGGAGGTTCTACTCCGATACAACAGGTGGAAG
CAGCATGGAAAGTCCTGTAGGTAGCCCCTCTGGTAGTAGTGGCTCATCTGACCAAGCTGG
AGGAGCATCTGCCGATGGCCCGAGTGGTTCAGTTTCAACTGAAGCCTCAACAAAGCCGTG
CTGACCCTAATACTTTTTGCCGCCTCAGGCCTCGAATTTTTAGTTAAAATTTCCAGGGCC
CCAATTTTGCAAATATGTTACTTTATTACATCATGTTCTTATGGGATATATCTATTATAT
TAAAAAGAAGTCACAACCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB84TF U 1
AF RR2HB84JQ C 376
BS 1 679 RR2HB84TF
BS 680 1160 RR2HB84JQ

RD RR2HB84TF 679 0 0
GGAGTTAAAAACTACCCAAAAAAAAAAAAAATCAGTATTACTTTTCCCCATCCTACAATA
AAATGGCAAGATCTCCTTTAGCAATATGTCTAATGTTCATAATAGTAGCATCAAGTACAT
TATATGAAGCGCAAGGACATTTCTTATTAAATGATTACTTGAAGAAATTTCCTGAAACGT
CCAGTGAATTTAAACCTTTCGCTTTCAAGGGTATGCTTAGTTTTGTAGACGGCCTTGAGA
GCTTATGTCCCTCCAAGGGGGAGTACAAGGAGTTCTTTACACAGCTGAAGGCTTTTATGA
GCTTCATAAACTCAGCATCAAGGTCGTCATCAGAATTCAATTCTCAGTTGAAAGCACAAT
CCGAGGGGCTCTTCAAGGCTATCTCTACATTGAGTGGCAAAGCAGGATCATCGGGGGATA
CAAGCAAATTGATTGACAGTTTGACGTCGATGGGAAAAACTTTGGCTGGGTACAAGAGGA
CAGGTTCACAAACAATAACAAGTGAACAGAGGGAAATGCCGACGAAATCTATGGTGAAAT
GGGCAAAAGGGATCGGTGATTTTGTGAAAACGGTAGGTGAGAAGAGTGGTAGCTGTAATA
TTGATCTCTCATCCCTTGGATTGGGAGATGGAAGCTCTAGCAAAGATGGAAGCAGTGGTG
GCAGTGAAAGTGGAACTCC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2HB84JQ 785 0 0
AGGCTATCTCTACATTGAGTGGCAAAGCAGGATCATCGGGGGATACAAGCAAATTGATTG
ACAGTTTGACGTCGATGGGAAAAACTTTGGCTGGGTACAAGAGGACAGGTTCACAAACAA
TAACAAGTGAACAGAGGGAAATGCCGACGAAATCTATGGTGAAATGGGCAAAAGGGATCG
GTGATTTTGTGAAAACGGTAGGTGAGAAGAGTGGTAGCTGTAATATTGATCTCTCATCCC
TTGGATTGGGAGATGGAAGCTCTAGCAAAGATGGAAGCAGTGGTGGCAGTGAAAGTGGAA
CTCCAAGCTCCGACACTGGTTCCCCTCTAGCTGAAACTTCCACGGAGAATGAAAGTGCTG
GTGGTCCAAGTGGAAGTACATCAGATATGTCCACAGAAGGAACAAGTACTATGGATGGTG
GAACCACTGCCGGGAGCACGAGTGGAGGAGGTTCAACTGATAGCTCTGCCGCAGGAGAAA
GTTCCATGAATGGTGGAGGTTCTACTCCGATACAACAGGTGGAAGCAGCATGGAAAGTCC
TGTAGGTAGCCCCTCTGGTAGTAGTGGCTCATCTGACCAAGCTGGAGGAGCATCTGCCGA
TGGCCCGAGTGGTTCAGTTTCAACTGAAGCCTCAACAAAGCCGTGCTGACCCTAATACTT
TTTGCCGCCTCAGGCCTCGAATTTTTAGTTAAAATTTCCAGGGCCCCAATTTTGCAAATA
TGTTACTTTATTACATCATGTTCTTATGGGATATATCTATTATATTAAAAAGAAGTCACA
ACCTC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL5809Contig1 304 2 1 U
GGAGTCTCTCTTCAATCTTCACCAATTCGTCTCGCCTACAATCTCTCTACCCAGTTTTTT
TTCTCTCTTATCTCGCCGTCGCAGGCTTCGCCGCCGGCAAGCTCCTACCCCTTTTCATCT
TCCCTCTCCTCTAATATCCCCAAAAAGAGAAAAAAAAACAGAAAAAAGTAAAACGATCAG
AAAAAAAATCGAATCTTTTGTTGTTGTGTTATTACTTTCCGCTTCATTTCTCCTTCGTTC
AATCCGATTTGGTTTTTACAGTCTAAAATAACGAAGAGGGGAGGGAAGAGTAATTGAAAA
CCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2BS61JQ C 1
AF RR2BS61TF U 1
BS 1 304 RR2BS61TF

RD RR2BS61JQ 304 0 0
GGAGTCTCTCTTCAATCTTCACCAATTCGTCTCGCCTACAATCTCTCTACCCAGTTTTTT
TTCTCTCTTATCTCGCCGTCGCAGGCTTCGCCGCCGGCAAGCTCCTACCCCTTTTCATCT
TCCCTCTCCTCTAATATCCCCAAAAAGAGAAAAAAAAACAGAAAAAAGTAAAACGATCAG
AAAAAAAATCGAATCTTTTGTTGTTGTGTTATTACTTTCCGCTTCATTTCTCCTTCGTTC
AATCCGATTTGGTTTTTACAGTCTAAAATAACGAAGAGGGGAGGGAAGAGTAATTGAAAA
CCCC

QA 1 304 1 304
DS 

RD RR2BS61TF 304 0 0
GGAGTCTCTCTTCAATCTTCACCAATTCGTCTCGCCTACAATCTCTCTACCCAGTTTTTT
TTCTCTCTTATCTCGCCGTCGCAGGCTTCGCCGCCGGCAAGCTCCTACCCCTTTTCATCT
TCCCTCTCCTCTAATATCCCCAAAAAGAGAAAAAAAAACAGAAAAAAGTAAAACGATCAG
AAAAAAAATCGAATCTTTTGTTGTTGTGTTATTACTTTCCGCTTCATTTCTCCTTCGTTC
AATCCGATTTGGTTTTTACAGTCTAAAATAACGAAGAGGGGAGGGAAGAGTAATTGAAAA
CCCC

QA 1 304 1 304
DS 



AS 1 2

CO CL5810Contig1 829 2 3 U
GCAAAAGTTCCTCGTTATATAATAAGAAGAGGATCAGGAAATGGTTAAAGAGAATTCAGA
ATTACACCAACCAAATTAACGGGTTTTTCTCATTTTATTACTCACAACCTTAATGGTGTA
AAAATGAAAAACTCAAAAGACGGAGGAACGGTTATTTGTGTCCTCTCCTAATTCCCTCCT
TTTTCACCTGATATTATTATTCCGATGCACCTAAAGAAATCATATGGGCTGCTGCTTGCT
TGCTTGCTTGCTTGTTTGAGGGAAAATAAAATCAATAAACGCGAGCTTTGGGAGGGAAAG
TGTCAATCTCATCGTCGAGAGTGTCCATGCGAACAGGCCTATACTCCAACCTCACTTTCT
CATCTTCCCAGTACCCCAATGTGTGCTTCATCCATTCTCCATCCTCCCTTTTCGTGAAAT
CCTCCCGAGCATGTGCTCCTCTGCTTTCCTTTCGTGCTTCCGCAGAATGCATTGTTATGG
ACGCGTTTATCAAAAGGTTCTCCAGTTCTATTGTCTCTATCAGATCAGAGTTCCATATCA
AACTCCGATCTTTAACCTAGACATCCTCGAAACTTTCCCATGCCTTGTCGATCAACTGAC
AACCTTCTTCCAATGTTTCTTGGGTGCGGAAGACAGCTGCATTGTTCTGCATAATCCTCT
GCATGTTCAGCCTGATACTTGAAGTAGGAAGTGAACCGCTTGAGTGTCTTAACTTGTTCA
GCCATTCGATCGTCTTCTTACCTGCAGTCTCTTCTAGAGGTCTCTGTTTCTGACCTGGTT
TGCTTATCTCTGCACCCTATTTGCACAAGCACGCCAATACGACATGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH77JQ U 147
AF RR2E855JQ U 1
BS 1 277 RR2E855JQ
BS 278 278 RR2DH77JQ
BS 279 829 RR2E855JQ

RD RR2DH77JQ 313 0 0
AACGGTTATTTGTGTCCTCTCCTAATTCCCTCCTTTTTCACCTGATATTATTATTCCGAT
GCACCTAAAGAAATCATATGGGCTGCTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGTTTGAGGGAAAA
TAAAATCAATAAACGCGAGCTTTGGGAGGGAAAGTGTCAATCTCATCGTCGAGAGTGTCC
ATGTGAACAGGCCTATACTCCAACCTCACTTTCTCATCTTCCCAGTACCCCAATGTGTGC
TTCATCCATTCTCCATCCTCCCTTTTCGTGAAATCCTCCCGAGCATGTGCTCCTCTGCTT
TCCTTTCGTGCTT

QA 1 313 1 313
DS 

RD RR2E855JQ 829 0 0
GCAAAAGTTCCTCGTTATATAATAAGAAGAGGATCAGGAAATGGTTAAAGAGAATTCAGA
ATTACACCAACCAAATTAACGGGTTTTTCTCATTTTATTACTCACAACCTTAATGGTGTA
AAAATGAAAAACTCAAAAGACGGAGGAACGGTTATTTGTGTCCTCTCCTAATTCCCTCCT
TTTTCACCTGATATTATTATTCCGATGCACCTAAAGAAATCATATGGGCTGCTGCTTGCT
TGCTTGCTTGCTTGTTTGAGGGAAAATAAAATCAATAGACGCGAGCTTTGGGAGGGAAAG
TGTCAATCTCATCGTCGAGAGTGTCCATGCGAACAGGCCTATACTCCAACCTCACTTTCT
CATCTTCCCAGTACCCCAATGTGTGCTTCATCCATTCTCCATCCTCCCTTTTCGTGAAAT
CCTCCCGAGCATGTGCTCCTCTGCTTTCCTTTCGTGCTTCCGCAGAATGCATTGTTATGG
ACGCGTTTATCAAAAGGTTCTCCAGTTCTATTGTCTCTATCAGATCAGAGTTCCATATCA
AACTCCGATCTTTAACCTAGACATCCTCGAAACTTTCCCATGCCTTGTCGATCAACTGAC
AACCTTCTTCCAATGTTTCTTGGGTGCGGAAGACAGCTGCATTGTTCTGCATAATCCTCT
GCATGTTCAGCCTGATACTTGAAGTAGGAAGTGAACCGCTTGAGTGTCTTAACTTGTTCA
GCCATTCGATCGTCTTCTTACCTGCAGTCTCTTCTAGAGGTCTCTGTTTCTGACCTGGTT
TGCTTATCTCTGCACCCTATTTGCACAAGCACGCCAATACGACATGTCG

QA 1 829 1 829
DS 



AS 1 2

CO CL5811Contig1 1121 2 2 U
GGAAGATGGTTATGAAAAAAATATTGAGCGTTGTTATGCTTATGCATGCAATCGTTGCAC
TTTCTTCTAACGTGAGGGGCTTAAATAAGAACTACTACATGAAGAGCTGTCCTACCGCAG
AGCAGATTGTGAAGAATAGTGTTAACAATGCTCTTCAAGCCGATCCCACTTTAGTCGCAG
GTCTTATCCGTATGCTCTTCCACGACTGTTTCGTTGAGGGATGTGACGCTTCGATTCTGC
TAGATTCAACAAATGACAACACTGCAGAAAAGGATTCGCCTGGGAATCTGAGTCTACGTG
GCTACGAGATCATAGATAATACAAAACAAGAAATCGAGAATAGTTGTCCAGGAGTTGTAT
CTTGCGCAGACATACTTGCCATGGCTGCTAGAGATGCTGTTTTTTGGGCTGGTGGTCCAT
ATTATCAAATATCTAAAGGAAGATTTGATGGTAAAAGATCCAAGATAGAAGATACAAAAA
ATCTTCTTCCGCCTTCTTTAAATGCCTCTCAACTCATTCAGGCTTTTGGCCGACGTGGGT
TCAGTCCGAAGGATGTTGTTGCTCTCTCTGGAGCACATACCCTTGGAGTTGCACGATGCT
CATCCTTCAAGGCTAGACTTATGACCCCAGATTCTTCGGTGGACTCTTCTTTTGCAAACA
CTCTCTCTAAAACTTGCAGTGCCGGTGACAATGCAGAGCAACCACTTGATGCCACACGCA
ACGATTTCGACAATGCTTATTTCAACGCGCTTCAGATGAATTCAGGAGTCCTCTTTTCAG
ACCAAACCTTATTCAACACTCCGGTGACCAGGAATCTTGTTATTGGCTATGCCTTTAACC
AATCCAAGTTTTTCTTTGATTTCCAAAAGGCCATGCGCAAAATGAGCAAGCTCAATGTCA
AAAATAGTTCTCAAGGTGAAGTCCGTAAACATTGTCGCTGTCTTAACTAAGCACGTGCCA
AATGTATTGATGATTATATGTACCTGTGTATCTCTATCATATGATTCATGACGACGAATC
ACTTGTGCACCATGTAAAAACTTGGTGTTCTTTATATGTTGTTGTGTACTACTTATTGTT
TGTGTGTTTCACATATCTAATAAAAACGTCTGATGTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS56TF U 1
AF RR2CS56JQ C 427
BS 1 727 RR2CS56TF
BS 728 1121 RR2CS56JQ

RD RR2CS56TF 727 0 0
GGAAGATGGTTATGAAAAAAATATTGAGCGTTGTTATGCTTATGCATGCAATCGTTGCAC
TTTCTTCTAACGTGAGGGGCTTAAATAAGAACTACTACATGAAGAGCTGTCCTACCGCAG
AGCAGATTGTGAAGAATAGTGTTAACAATGCTCTTCAAGCCGATCCCACTTTAGTCGCAG
GTCTTATCCGTATGCTCTTCCACGACTGTTTCGTTGAGGGATGTGACGCTTCGATTCTGC
TAGATTCAACAAATGACAACACTGCAGAAAAGGATTCGCCTGGGAATCTGAGTCTACGTG
GCTACGAGATCATAGATAATACAAAACAAGAAATCGAGAATAGTTGTCCAGGAGTTGTAT
CTTGCGCAGACATACTTGCCATGGCTGCTAGAGATGCTGTTTTTTGGGCTGGTGGTCCAT
ATTATCAAATATCTAAAGGAAGATTTGATGGTAAAAGATCCAAGATAGAAGATACAAAAA
ATCTTCTTCCGCCTTCTTTAAATGCCTCTCAACTCATTCAGGCTTTTGGCCGACGTGGGT
TCAGTCCGAAGGATGTTGTTGCTCTCTCTGGAGCACATACCCTTGGAGTTGCACGATGCT
CATCCTTCAAGGCTAGACTTATGACCCCAGATTCTTCGGTGGACTCTTCTTTTGCAAACA
CTCTCTCTAAAACTTGCAGTGCCGGTGACAATGCAGAGCAACCACTTGATGCCACACGCA
ACGATTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2CS56JQ 695 0 0
AAATATCTAAAGGAAGATTTGATGGTAAAAGATCCAAGATAGAAGATACAAAAAATCTTC
TTCCGCCTTCTTTAAATGCCTCTCAACTCATTCAGGCTTTTGGCCGACGTGGGTTCAGTC
CGAAGGATGTTGTTGCTCTCTCTGGAGCACATACCCTTGGAGTTGCACGATGCTCATCCT
TCAAGGCTAGACTTATGACCCCAGATTCTTCGGTGGACTCTTCTTTTGCAAACACTCTCT
CTAAAACTTGCAGTGCCGGTGACAATGCAGAGCAACCACTTGATGCCACACGCAACGATT
TCGACAATGCTTATTTCAACGCGCTTCAGATGAATTCAGGAGTCCTCTTTTCAGACCAAA
CCTTATTCAACACTCCGGTGACCAGGAATCTTGTTATTGGCTATGCCTTTAACCAATCCA
AGTTTTTCTTTGATTTCCAAAAGGCCATGCGCAAAATGAGCAAGCTCAATGTCAAAAATA
GTTCTCAAGGTGAAGTCCGTAAACATTGTCGCTGTCTTAACTAAGCACGTGCCAAATGTA
TTGATGATTATATGTACCTGTGTATCTCTATCATATGATTCATGACGACGAATCACTTGT
GCACCATGTAAAAACTTGGTGTTCTTTATATGTTGTTGTGTACTACTTATTGTTTGTGTG
TTTCACATATCTAATAAAAACGTCTGATGTTGTCC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL5812Contig1 1176 2 6 U
GGGGTGTTGAGTTCCATCAATTGTTCTCTCTCACAGGTTGGAAGTTGGTTCTTCTCTGCG
TTATTTATCTACCACCTAAACTATGTTTTTCGATGGATACCATTACCCTGGAACCACCTT
TGAGCAGAGTTACCGGTGCTATCCTGCATCTTTTATCGACAAGCCTCAAATTGAAAGTGG
TGACAAGATTATAATGCCACCATCAGCTCTTGACCGTCTCGCCTCTTTGCATATTGACTA
TCCTATGCTGTTTGAGCTTCGTAATGCTGGAATCGAACGTGTTTCACACTGTGGAGTCCT
TGAGTTCATTGCTGAAGAAGGCATGATTTACATGCCATATTGGATGATGCAGAATCTGCT
GCTGCAAGAAGGAGACATTGTGAGAGTTAGAAATGTCACTCTTCCAAAAGGAACCTATGT
TAAACTACAGCCGCACACTACGGACTTCCTGGATATATCTAATCCGAAAGCCATCTTGGA
GACTGCTTTGAGGAACTACTCATGCCTAACCACTGGGGATAGCATTATGGTTCCATACAA
CAATAAGAAGTACTTTATAGATATAGTTGAAACAAAGCCTGCTAATGGAATCAGCATCAT
AGAAACAGACTGTGAGGTTGATTTTGCACCTCCCCTTGATTACAAGGAGCCTGAACGTCC
CAAAACAGCACCTGCTGCAGCTAAGGGACCGGCGAAAGCCGAGGAAGTTGTGCCTGAACC
TGAACCAAAGTTCAACCCTTTCACGGGATCTGGAAGACGGTTAGATGGGAGACCTCTTTC
CTATGAGCCGCCACCAGCATTTTTTGCTTCTTCCTCTAGCTCAAAAGATAAACAGCCTGC
TGTTGCTAATGGCAATGGACAGGCATCTGTAGCAAGTAGTAGCTCAGAGAAAGCTGCTCG
ACAGGCTCAAGGAAAGCTTGTGTTTGGAGGCAACGCAAACCGTGCCCCAAAAGAAGCTCC
AAAGGTTGGAGCTGGGAAAGAGACAAAACAAGAGGAAGAGGAGAAGAAAGAAGAGCCGAA
GTTCCAAGCTTTCACTGGGAAGAAGTATTCGTTGAGGGGTTGATCAAGCAACTGTCTCTG
CTCAGTTTATTTTATGATCTGTTGTGTACTATATAAGTATTCGTTGTGCTTCGAATCAAA
CAAGGAAAACCAAATAATTTAATAAAGCTATTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR01TF U 1
AF RR2CR01JQ C 372
BS 1 644 RR2CR01TF
BS 645 646 RR2CR01JQ
BS 647 664 RR2CR01TF
BS 665 665 RR2CR01JQ
BS 666 686 RR2CR01TF
BS 687 1176 RR2CR01JQ

RD RR2CR01TF 692 0 0
GGGGTGTTGAGTTCCATCAATTGTTCTCTCTCACAGGTTGGAAGTTGGTTCTTCTCTGCG
TTATTTATCTACCACCTAAACTATGTTTTTCGATGGATACCATTACCCTGGAACCACCTT
TGAGCAGAGTTACCGGTGCTATCCTGCATCTTTTATCGACAAGCCTCAAATTGAAAGTGG
TGACAAGATTATAATGCCACCATCAGCTCTTGACCGTCTCGCCTCTTTGCATATTGACTA
TCCTATGCTGTTTGAGCTTCGTAATGCTGGAATCGAACGTGTTTCACACTGTGGAGTCCT
TGAGTTCATTGCTGAAGAAGGCATGATTTACATGCCATATTGGATGATGCAGAATCTGCT
GCTGCAAGAAGGAGACATTGTGAGAGTTAGAAATGTCACTCTTCCAAAAGGAACCTATGT
TAAACTACAGCCGCACACTACGGACTTCCTGGATATATCTAATCCGAAAGCCATCTTGGA
GACTGCTTTGAGGAACTACTCATGCCTAACCACTGGGGATAGCATTATGGTTCCATACAA
CAATAAGAAGTACTTTATAGATATAGTTGAAACAAAGCCTGCTAATGGAATCAGCATCAT
AGAAACAGACTGTGAGGTTGATTTTGCACCTCCCCTTGATTACA**GAGCCTGAACGTCC
CAAA*CAGCACCTGCTGCAGCTAAGG
ACCGGC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2CR01JQ 805 0 0
GAGACATTGTGAGAGTTAGAAATGTCACTCTTCCAAAAGGAACCTATGTTAAACTACAGC
CGCACACTACGGACTTCCTGGATATATCTAATCCGAAAGCCATCTTGGAGACTGCTTTGA
GGAACTACTCATGCCTAACCACTGGGGATAGCATTATGGTTCCATACAACAATAAGAAGT
ACTTTATAGATATAGTTGAAACAAAGCCTGCTAATGGAATCAGCATCATAGAAACAGACT
GTGAGGTTGATTTTGCACCTCCCCTTGATTACAAGGAGCCTGAACGTCCCAAAACAGCAC
CTGCTGCAGCTAAGGGACCGGCGAAAGCCGAGGAAGTTGTGCCTGAACCTGAACCAAAGT
TCAACCCTTTCACGGGATCTGGAAGACGGTTAGATGGGAGACCTCTTTCCTATGAGCCGC
CACCAGCATTTTTTGCTTCTTCCTCTAGCTCAAAAGATAAACAGCCTGCTGTTGCTAATG
GCAATGGACAGGCATCTGTAGCAAGTAGTAGCTCAGAGAAAGCTGCTCGACAGGCTCAAG
GAAAGCTTGTGTTTGGAGGCAACGCAAACCGTGCCCCAAAAGAAGCTCCAAAGGTTGGAG
CTGGGAAAGAGACAAAACAAGAGGAAGAGGAGAAGAAAGAAGAGCCGAAGTTCCAAGCTT
TCACTGGGAAGAAGTATTCGTTGAGGGGTTGATCAAGCAACTGTCTCTGCTCAGTTTATT
TTATGATCTGTTGTGTACTATATAAGTATTCGTTGTGCTTCGAATCAAACAAGGAAAACC
AAATAATTTAATAAAGCTATTGCTT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

CO CL5813Contig1 1085 2 2 U
GGGACTTGAAGGAGGACCTCGGGAGAAAGCAGACAACAACAGATGTTGAACTGCTCGTCG
GCGTTCCAAAGAGTAGCAGCCTCCTTAATAATGTCCATGGCTCCCAAGTTAAAACCTCAG
CGACTACTCCATCAAAGTATTGTTGAGAGTGGTGGTGGTGAGCAAGTGGTTAAGAAAGCT
AGGACGATGACTACCCAATCCTCAATGAAAGATGCTTTCTCTACATACGCTGATTATCTC
AACAACTTCAATGAGAAACGAGAGAGAGTGGTGAAGGCAAGTCGTGACATCACTATGAAC
AGTAAAAAAGTCATCTTTCAGGTTCACAGGCTCAGTAAAGACAACAAAGAGGAGGTTCTG
GAGAAAGCAGGGAAAGATTTAGAAGCAGTGAGGGAACAACACTTTGCCCGCCTGATGAAA
GAGCTTCAAGGCACTGATTTTTGGAAGCTCCGCCGAGCTTATTCCCCAGGGGTGCAGGAG
TATGTTGAAGCTGCAACGTTTTACAAGTTCTGTGTGTCAGGAACACTCTCTACTCTCGAT
GAGATTAACTCCACGCTTTTACCGCTAAGTGACCCTTCTTTGGAGCCGCTGCAGATCAAC
ATCCTTGACTATATTCTCGGGCTTGCGGATTTGACTGGAGAGCTAATGAGGATGGCGATT
GGTCGTATATCAGATGGTGAAGTCGAGTTCGCGCAGAGGATTTGTCAGTTTGTTAGACAG
ATTCACAGGGAACTGTTGCTGGTCGTGCCTCAGATGGATGAGAGTTACGACATGAAGTCA
AAGATGGAAGTGATGCTTCAAAGTGTGATCAAAATAGAGAATGCTTGCTTTAGCGTTCAC
GTGAGAGGATCAGAGTATATTCCGCTGCTTGGAGATGATGCACCAACGTCGTTCCTATTG
GGAGGTGCTGATGTTGAATGATTTAAGAAGTGAGCTCTTAATTGTATCCGCCTCTCGGAC
ACAACTCTAGGATCTTGTTAAGGTTGGTATGTTTTTGGAGTTATTGTGAGAATACGAGGA
TCGCTTTAGTATGGATGCTATGTTGCAAGACTTTTAACTTTTTAAGTATGAATGGTATTT
GTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2C386TF U 1
AF RR2C386JQ C 446
BS 1 749 RR2C386TF
BS 750 1085 RR2C386JQ

RD RR2C386TF 749 0 0
GGGACTTGAAGGAGGACCTCGGGAGAAAGCAGACAACAACAGATGTTGAACTGCTCGTCG
GCGTTCCAAAGAGTAGCAGCCTCCTTAATAATGTCCATGGCTCCCAAGTTAAAACCTCAG
CGACTACTCCATCAAAGTATTGTTGAGAGTGGTGGTGGTGAGCAAGTGGTTAAGAAAGCT
AGGACGATGACTACCCAATCCTCAATGAAAGATGCTTTCTCTACATACGCTGATTATCTC
AACAACTTCAATGAGAAACGAGAGAGAGTGGTGAAGGCAAGTCGTGACATCACTATGAAC
AGTAAAAAAGTCATCTTTCAGGTTCACAGGCTCAGTAAAGACAACAAAGAGGAGGTTCTG
GAGAAAGCAGGGAAAGATTTAGAAGCAGTGAGGGAACAACACTTTGCCCGCCTGATGAAA
GAGCTTCAAGGCACTGATTTTTGGAAGCTCCGCCGAGCTTATTCCCCAGGGGTGCAGGAG
TATGTTGAAGCTGCAACGTTTTACAAGTTCTGTGTGTCAGGAACACTCTCTACTCTCGAT
GAGATTAACTCCACGCTTTTACCGCTAAGTGACCCTTCTTTGGAGCCGCTGCAGATCAAC
ATCCTTGACTATATTCTCGGGCTTGCGGATTTGACTGGAGAGCTAATGAGGATGGCGATT
GGTCGTATATCAGATGGTGAAGTCGAGTTCGCGCAGAGGATTTGTCAGTTTGTTAGACAG
ATTCACAGGGAACTGTTGCTGGTCGTGCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2C386JQ 640 0 0
AGCTCCGCCGAGCTTATTCCCCAGGGGTGCAGGAGTATGTTGAAGCTGCAACGTTTTACA
AGTTCTGTGTGTCAGGAACACTCTCTACTCTCGATGAGATTAACTCCACGCTTTTACCGC
TAAGTGACCCTTCTTTGGAGCCGCTGCAGATCAACATCCTTGACTATATTCTCGGGCTTG
CGGATTTGACTGGAGAGCTAATGAGGATGGCGATTGGTCGTATATCAGATGGTGAAGTCG
AGTTCGCGCAGAGGATTTGTCAGTTTGTTAGACAGATTCACAGGGAACTGTTGCTGGTCG
TGCCTCAGATGGATGAGAGTTACGACATGAAGTCAAAGATGGAAGTGATGCTTCAAAGTG
TGATCAAAATAGAGAATGCTTGCTTTAGCGTTCACGTGAGAGGATCAGAGTATATTCCGC
TGCTTGGAGATGATGCACCAACGTCGTTCCTATTGGGAGGTGCTGATGTTGAATGATTTA
AGAAGTGAGCTCTTAATTGTATCCGCCTCTCGGACACAACTCTAGGATCTTGTTAAGGTT
GGTATGTTTTTGGAGTTATTGTGAGAATACGAGGATCGCTTTAGTATGGATGCTATGTTG
CAAGACTTTTAACTTTTTAAGTATGAATGGTATTTGTTCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL5814Contig1 1383 2 4 U
GGAGAAGAAGAAGAAGAGAATCCATGGCGGAGAGAATCGAAGAGAAGCCATGGCGAGTTC
TCGAGTTCTACAGTGGAATCGGTGGCATGAGATACTCTTTAATGGCGTCCGGGGTGGTGG
CAGAAGTAGTAGAAGCGTTTGAGATCAATGATGTTGCCAATGATGTTTATCAGCACAACT
TCGGTCATCGTCCTCATCAGGGGAATATCCAAAGCCTCACTGCTGCATACCTAGATAGGT
ATAATGCAGATGCTTGGCTTCTTTCTCTTCCTTGTCAACCTTATACTAGACAAGGCCTTC
AGAAACACTCTGGTGATGCTCGGGCTTCTTCGTTTCTTAAGATTCTTGAGCTTATACCTC
ATACTTCTACTCCCCCTAGAATGTTGTTTGTTGAGAACGTTGTTGGATTTGAGACTTCGG
ATACCCATATGGAAATGATTGATACATTGAAAAAATCAGATTATGTCACGCAAGAGTTTA
TTTTGAGTCCGTTGCAGTTTGGTGTGCCGTATTCAAGACCACGTTACTTTTGTCTGGCCA
AAAGAAAGCCTTTGTCCTTTCAGTCTCAGCACAATAACAACAAGCTACTCTGGTCTCCAG
GCCCGTTATGTGGGCGTGATGATCAGGTGGAGTTTGATAATTGTCAAGGAGAACAAGGAT
CTGAAAACTTACTTCAGTCTTGCGAACCAGTAGAGAAGTTTCTTGACTCAACAGCACAAG
TAAACGGCGATCCAAGTGGGGTTTGATGAGTCTGAGAATGGATCAAGAGATGGTGATGGA
CAAGGAGATGATACTGACTCAGACTCTGTACATCGATATCTAGTACCATTAAGTTTGATA
GAGAGATGGGGAAACGCAATGGACATTGTATACCCTGATTCGAAGAGATGCTGTTGTTTC
ACAAAGAGTTATTACCGATACGTGAAGGGCACTGGTTCCCTCTTGGCAACTGTCCAGCCA
AAAATAAAGGGGAAGGAAACTTGTTTGAAAGAGCAGCGGCTTAGATACTTCACCCCTAGA
GAGATGGTGTTTGGTTTCTATTTTGATTAGGTAGCAAACTTTCACTCATTCCCTGAAGAC
TTTGAGTTCCCAGAGCAGATTAGCCTTCGACAGAGATATGCAATGCTTGGAAACAGTTTA
AGTGTAGCAGTGGTGGCTCCTCTGCTTCGATATCTATTCGGCTCTTCTCCCGTCTTGACT
GCAGAATAGGAAGCAGCAAGTTACTCTCGACCAACGATGGTCCTGTTTTGTATCACTTAA
CAACAATTTTAATATATTTACTGAAATTGCGTTCTCTGATTTATTTCTATAGACAATACA
GATGGAGCCAAGTTTTGTTGACAATTGTGCGTGTACTCTTTCTTCAATTTATCGATTCTG
ACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2A929TF U 1
AF RR2A929JQ C 512
BS 1 784 RR2A929TF
BS 785 785 RR2A929JQ
BS 786 829 RR2A929TF
BS 830 1383 RR2A929JQ

RD RR2A929TF 829 0 0
GGAGAAGAAGAAGAAGAGAATCCATGGCGGAGAGAATCGAAGAGAAGCCATGGCGAGTTC
TCGAGTTCTACAGTGGAATCGGTGGCATGAGATACTCTTTAATGGCGTCCGGGGTGGTGG
CAGAAGTAGTAGAAGCGTTTGAGATCAATGATGTTGCCAATGATGTTTATCAGCACAACT
TCGGTCATCGTCCTCATCAGGGGAATATCCAAAGCCTCACTGCTGCATACCTAGATAGGT
ATAATGCAGATGCTTGGCTTCTTTCTCTTCCTTGTCAACCTTATACTAGACAAGGCCTTC
AGAAACACTCTGGTGATGCTCGGGCTTCTTCGTTTCTTAAGATTCTTGAGCTTATACCTC
ATACTTCTACTCCCCCTAGAATGTTGTTTGTTGAGAACGTTGTTGGATTTGAGACTTCGG
ATACCCATATGGAAATGATTGATACATTGAAAAAATCAGATTATGTCACGCAAGAGTTTA
TTTTGAGTCCGTTGCAGTTTGGTGTGCCGTATTCAAGACCACGTTACTTTTGTCTGGCCA
AAAGAAAGCCTTTGTCCTTTCAGTCTCAGCACAATAACAACAAGCTACTCTGGTCTCCAG
GCCCGTTATGTGGGCGTGATGATCAGGTGGAGTTTGATAATTGTCAAGGAGAACAAGGAT
CTGAAAACTTACTTCAGTCTTGCGAACCAGTAGAGAAGTTTCTTGACTCAACAGCACAAG
TAAACGGCGATCCAAGTGGGGTTTGATGAGTCTGAGAATGGATCAAGAGATGGTGATGGA
CAAG*AGATGATACTGACTCAGACTCTGTACATCGATATCTAGTACCAT

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2A929JQ 872 0 0
TTCAAGACCACGTTACTTTTGTCTGGCCAAAAGAAAGCCTTTGTCCTT*CAGTCTCAGCA
CAATAACAACAAGCTACTCTGGTCTCCAGGCCCGTTATGTGGGCGTGATGATCAGGTGGA
GTTTGATAATTGTCAAGGAGAACAAGGATCTGAAAACTTACTTCAGTCTTGCGAACCAGT
AGAGAAGTTTCTTGACTCAACAGCACAAGTAAACGGCGATCCAAGTGGG*TTTGATGAGT
CTGAGAATGGATCAAGAGATGGTGATGGACAAGGAGATGATACTGACTCAGACTCTGTAC
ATCGATATCTAGTACCATTAAGTTTGATAGAGAGATGGGGAAACGCAATGGACATTGTAT
ACCCTGATTCGAAGAGATGCTGTTGTTTCACAAAGAGTTATTACCGATACGTGAAGGGCA
CTGGTTCCCTCTTGGCAACTGTCCAGCCAAAAATAAAGGGGAAGGAAACTTGTTTGAAAG
AGCAGCGGCTTAGATACTTCACCCCTAGAGAGATGGTGTTTGGTTTCTATTTTGATTAGG
TAGCAAACTTTCACTCATTCCCTGAAGACTTTGAGTTCCCAGAGCAGATTAGCCTTCGAC
AGAGATATGCAATGCTTGGAAACAGTTTAAGTGTAGCAGTGGTGGCTCCTCTGCTTCGAT
ATCTATTCGGCTCTTCTCCCGTCTTGACTGCAGAATAGGAAGCAGCAAGTTACTCTCGAC
CAACGATGGTCCTGTTTTGTATCACTTAACAACAATTTTAATATATTTACTGAAATTGCG
TTCTCTGATTTATTTCTATAGACAATACAGATGGAGCCAAGTTTTGTTGACAATTGTGCG
TGTACTCTTTCTTCAATTTATCGATTCTGACT

QA 1 872 1 872
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5816Contig1 974 2 2 U
GGACTCTGCTTCCGCTGAAACTGGTCCGTCCCCTCATCGAAACGAACGAACGAACGAATA
TTCTCCGGTGAAAAAAAAAAACTATCTCTCGTAACCGATCGTAGAAACGAAAGAGATGGC
CGGTGGTGGTGGTGGATCGTCGAAATCAAACGCACCGAAGCAGAGGAAGAGAGTGGAAGC
CGAAACGAAAGATGAATCCACCACAAACAACAGCAACAGCAACAGCAGTACGTTGCTACG
CGCTAAAGATGGCAGCGCCTTCGCTCGATGTGAAGGATGTAGCAAGAACGTAGCTGTTGC
ACTTATAAGCATGCACAATTGCAGCCTCGACGCTAAGATTCGAGTCAATCTCGAGGCGCA
AGTTGTTGGGACGAAAGCTGAGGCGAAGAAGAAGAAACCTGTAGAGAGGAAGAAGTCAAC
ATCTGATGAACCTAAGGCAAAGAGAGTCAGGAAGGGCAAGGATGAGAAGAAGAGCTCTGC
CTCTAACAAGCCCAAGCGTCCTCTTACTGCCTTCTTCATTTTCATGAATGATTTCCGCAA
AACTTTCAAAGAAGAGAATCCTTCTTCTAGCGTCAAGGATGTTGCAAAGCAAGGTGGTGA
AAAGTGGAAGTCTTTGACTGAGGAAGAAAAGAAAGTTTATTTGGATAAGGCTGCTGAACT
AAAGGCAGAGTACAACAAGTCACTGGAGAGCAATGATGCCGATGAGGAAGAAGAGGATGA
GGAGGAGAAGCAATCAGATGATGATGATGCTGAAGAGAAACAAGCTGACGAGGCTGATGG
GTGTAAGGAGAATGAAGATGTGAACAAAGAATCTGAAGGTAAAGAAGAAGAGATTTTGGA
TGACTACTAGATATCTTAATCTCTCTTTTGGGTTTCTGATCTCATCTATCTATCTATCGG
TGATGGTTCATTGTATATTTTTAACCTCTGTTTTTCGTTAAACTAGTTATCTGAAGGTAG
TTTGTGAGCAGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO77TF U 1
AF RR2DO77JQ C 263
BS 1 573 RR2DO77TF
BS 574 974 RR2DO77JQ

RD RR2DO77TF 573 0 0
GGACTCTGCTTCCGCTGAAACTGGTCCGTCCCCTCATCGAAACGAACGAACGAACGAATA
TTCTCCGGTGAAAAAAAAAAACTATCTCTCGTAACCGATCGTAGAAACGAAAGAGATGGC
CGGTGGTGGTGGTGGATCGTCGAAATCAAACGCACCGAAGCAGAGGAAGAGAGTGGAAGC
CGAAACGAAAGATGAATCCACCACAAACAACAGCAACAGCAACAGCAGTACGTTGCTACG
CGCTAAAGATGGCAGCGCCTTCGCTCGATGTGAAGGATGTAGCAAGAACGTAGCTGTTGC
ACTTATAAGCATGCACAATTGCAGCCTCGACGCTAAGATTCGAGTCAATCTCGAGGCGCA
AGTTGTTGGGACGAAAGCTGAGGCGAAGAAGAAGAAACCTGTAGAGAGGAAGAAGTCAAC
ATCTGATGAACCTAAGGCAAAGAGAGTCAGGAAGGGCAAGGATGAGAAGAAGAGCTCTGC
CTCTAACAAGCCCAAGCGTCCTCTTACTGCCTTCTTCATTTTCATGAATGATTTCCGCAA
AACTTTCAAAGAAGAGAATCCTTCTTCTAGCGT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2DO77JQ 712 0 0
GCTCGATGTGAAGGATGTAGCAAGAACGTAGCTGTTGCACTTATAAGCATGCACAATTGC
AGCCTCGACGCTAAGATTCGAGTCAATCTCGAGGCGCAAGTTGTTGGGACGAAAGCTGAG
GCGAAGAAGAAGAAACCTGTAGAGAGGAAGAAGTCAACATCTGATGAACCTAAGGCAAAG
AGAGTCAGGAAGGGCAAGGATGAGAAGAAGAGCTCTGCCTCTAACAAGCCCAAGCGTCCT
CTTACTGCCTTCTTCATTTTCATGAATGATTTCCGCAAAACTTTCAAAGAAGAGAATCCT
TCTTCTAGCGTCAAGGATGTTGCAAAGCAAGGTGGTGAAAAGTGGAAGTCTTTGACTGAG
GAAGAAAAGAAAGTTTATTTGGATAAGGCTGCTGAACTAAAGGCAGAGTACAACAAGTCA
CTGGAGAGCAATGATGCCGATGAGGAAGAAGAGGATGAGGAGGAGAAGCAATCAGATGAT
GATGATGCTGAAGAGAAACAAGCTGACGAGGCTGATGGGTGTAAGGAGAATGAAGATGTG
AACAAAGAATCTGAAGGTAAAGAAGAAGAGATTTTGGATGACTACTAGATATCTTAATCT
CTCTTTTGGGTTTCTGATCTCATCTATCTATCTATCGGTGATGGTTCATTGTATATTTTT
AACCTCTGTTTTTCGTTAAACTAGTTATCTGAAGGTAGTTTGTGAGCAGGGC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL5817Contig1 1207 2 4 U
GGTGGATCTAATCAGTCTCTCTTTTAACCAACCACAAAGGGAGGGAAGAAAGAAAAGAAG
CAAATGGGAGGAAGTAACTTGGGATAGAGGAAGTAACCAATCCTAAGGATAGAGTGTTTC
CAGTGTCTTGGGATTCAAAATTTAATCTGCTTCTTATCAGATTTCCAGTGAGGAAGCTAT
TGAAACTGCAAAGCAACTAGCTCTCCAAGAAGGCTTGTTGGTTAGTCTTCTTTTTTTCTG
TTTGGCATATTTATGAGTGGGAGCAGCCTTTAAAGGAGTAATGAACCGAATGGTATGAGA
AATCTGTGATGATTGCTGCAATCCAGGTCGCAAAGAGACCTGAAAATGCCGGGAAACTCA
TAGCTGTTGTGTTCCCTAGCTTTGGGGAACGTTACCTCTCCACCCTTCTTTTTCAGTCAA
TCCGAGATGAGTGCGAGAAAATGCAGCCTGAGCTTTAAATTCCCTCTTGACCGACAAGGA
ACTCTTCTTTCATTTCTTTCTAGTTTCTCACGTCTCTGCAGAAAACTCTACGTCTACTGT
ATATTTGCATTTCCAATAGAGATGATAAGAGCAGGATCAGTGGGAACAAGAGCGACATAT
GACGAGCCATACGACGAAAATTGGGAGGAGACAGCTGATACTGAGTGGGACGAGAAGGGA
CGCACTATGATCTCTCACATATACGTTTCTTACAAACACTTCATAACATCTATTCAGTTT
GGTTACTTGAATAGCGAAGATGATGAAGCTCTGACCCTGTCTACCAAGTTTGGTCCATCT
AATGAGGGACACAGCTTTCAAGCTGTCATACTGAAAGAAGATGAATATGTGACTGGATTG
AGTGGAGTACATGGATATGGAGTGCATGGTGGAATAAAAAGTTTGACATTCCACACTAAC
TGTGGGAAGCACGGTCCGATTGGAAGAGTGAACGATGACTCTGAGGTTGGTTTGAAGATA
GATATTGATCCAGGAATACGTGATCGACGCGAGTTTGGTGGTTTCTTTGGTTCTTACAGT
AAGGATAATCTCTCATCGATTGGTATCTATGTGAGCCCCATTGCTAGGTATGACATGGTG
GCTAAACGTGAAAACATTGGACCCTCCAAATAAAGCCTTGTAGCAGCAGCCTTACAATAG
TTGTCTGGTTCAGTTTGTTGTTTAGTTTTTCTCTTTAATAAAGTAAGAACATTAGTGAAG
AAGACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F408TF U 1
AF RR2F408JQ C 501
BS 1 781 RR2F408TF
BS 782 782 RR2F408JQ
BS 783 816 RR2F408TF
BS 817 1207 RR2F408JQ

RD RR2F408TF 818 0 0
GGTGGATCTAATCAGTCTCTCTTTTAACCAACCACAAAGGGAGGGAAGAAAGAAAAGAAG
CAAATGGGAGGAAGTAACTTGGGATAGAGGAAGTAACCAATCCTAAGGATAGAGTGTTTC
CAGTGTCTTGGGATTCAAAATTTAATCTGCTTCTTATCAGATTTCCAGTGAGGAAGCTAT
TGAAACTGCAAAGCAACTAGCTCTCCAAGAAGGCTTGTTGGTTAGTCTTCTTTTTTTCTG
TTTGGCATATTTATGAGTGGGAGCAGCCTTTAAAGGAGTAATGAACCGAATGGTATGAGA
AATCTGTGATGATTGCTGCAATCCAGGTCGCAAAGAGACCTGAAAATGCCGGGAAACTCA
TAGCTGTTGTGTTCCCTAGCTTTGGGGAACGTTACCTCTCCACCCTTCTTTTTCAGTCAA
TCCGAGATGAGTGCGAGAAAATGCAGCCTGAGCTTTAAATTCCCTCTTGACCGACAAGGA
ACTCTTCTTTCATTTCTTTCTAGTTTCTCACGTCTCTGCAGAAAACTCTACGTCTACTGT
ATATTTGCATTTCCAATAGAGATGATAAGAGCAGGATCAGTGGGAACAAGAGCGACATAT
GACGAGCCATACGACGAAAATTGGGAGGAGACAGCTGATACTGAGTGGGACGAGAAGGGA
CGCACTATGATCTCTCACATATACGTTTCTTACAAACACTTCATAACATCTATTCAGTTT
GGTTACTTGAATAGCGAAGATGATGAAGCTCTGACCCTGTCTACCAAGTTTGGTCCATCT
A*TGAGGGACACAGCTTTCAAGCTGTCATACTGAAA
AA

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR2F408JQ 707 0 0
TAGTTTCTCACGTCTCTGCAGAAAACTCTACGTCTACTGTATATTTGCATTTCCAATAGA
GATGATAAGAGCAGGATCAGTGGGAACAAGAGCGACATATGACGAGCCATACGACGAAAA
TTGGGAGGAGACAGCTGATACTGAGTGGGACGAGAAGGGACGCACTATGATCTCTCACAT
ATACGTTTCTTACAAACACTTCATAACATCTATTCAGTTTGGTTACTTGAATAGCGAAGA
TGATGAAGCTCTGACCCTGTCTACCAAGTTTGGTCCATCTAATGAGGGACACAGCTTTCA
AGCTGTCATACTGAAAGAAGATGAATATGTGACTGGATTGAGTGGAGTACATGGATATGG
AGTGCATGGTGGAATAAAAAGTTTGACATTCCACACTAACTGTGGGAAGCACGGTCCGAT
TGGAAGAGTGAACGATGACTCTGAGGTTGGTTTGAAGATAGATATTGATCCAGGAATACG
TGATCGACGCGAGTTTGGTGGTTTCTTTGGTTCTTACAGTAAGGATAATCTCTCATCGAT
TGGTATCTATGTGAGCCCCATTGCTAGGTATGACATGGTGGCTAAACGTGAAAACATTGG
ACCCTCCAAATAAAGCCTTGTAGCAGCAGCCTTACAATAGTTGTCTGGTTCAGTTTGTTG
TTTAGTTTTTCTCTTTAATAAAGTAAGAACATTAGTGAAGAAGACAT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL5818Contig1 1018 2 2 U
GATCGTTCTTCCTCTCTCTCTCCGCCGCATTACGTCTCTCTCTCTCTCAATCTCTCAGCT
TAAGCGCAGAACCATGGCAGCGAAACAGGGAGCCGCAGCTACAACGTATTCACCCAAAAT
CATGGCGAGAACTAGGCCTCCTATCTTCAGAGACTCCGACCTCGATTGGACCCGTCCTGA
TGGCCGTGGATTCCACCAATGCCGACCTGCCTTACTTCAAACGGGTGCTGTGAGTGCTGC
TTCTGGTTCTGCTTATGCTGAGTTTGGGAACACCAAAGTCATTGTTTCAGTATTTGGGCC
AAGGGAGAGTAAGAAAGCAACGAGTTATAGTGATGTTGGTGGATTGAATTGCAATGTTAG
CTACACTACTTTTTCTTCCCCTGCTCTTGGGAGTCAGGGGACTGATCACAAAGAGTACTC
ATCAATGCTTCTCAAAGCGTTGGAAGGCGTAATCATGATGGAGACGTTCCCAAAGACAAC
TGTTGATGTTTTTGCGTTGGTGCTCGAATCTGGAGGCAGTGACCTCCCGGTTGTGATATC
ATGTGCTGGTCTTGCTCTAGCAGACGCCGGGATTATGATGTACGACCTTATCACAGCTGT
CTCAGTGTCTTGCATAGGGAAAAGCCTTATGATTGACCCGGTTACAGAAGAGGAAGGATG
TGAAGATGGAAGCTTCATGATGACGTGCATGCCTTCTCGGAGTGAAATCACTCAGCTGAC
CATCACTGGTGAATGGACTACGCCTAACATTAACGAGGCAACGCAGCTTTGCGTGGATGC
TTGTTCCAAACTTGGAGAAATCATGCGCGATTGTCTGAAACAGGCTGCCTCCGCTTCAGA
TGAATGAACATACAAGTCAAGAAACTATAGCTAGGATTGTACCTCAGCCATTGGTATGAA
ACCGGTTAAGCTGTTGGTTTAGGTAAAATTGAATTTATACTAAACCGGTGTGATGGAGTT
TAAAACAGATGACTGTGTGCTAAGTCAAATTTGATGGAACTAGATCTTTAAAGAGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES70TF U 1
AF RR2ES70JQ C 314
BS 1 624 RR2ES70TF
BS 625 1018 RR2ES70JQ

RD RR2ES70TF 624 0 0
GATCGTTCTTCCTCTCTCTCTCCGCCGCATTACGTCTCTCTCTCTCTCAATCTCTCAGCT
TAAGCGCAGAACCATGGCAGCGAAACAGGGAGCCGCAGCTACAACGTATTCACCCAAAAT
CATGGCGAGAACTAGGCCTCCTATCTTCAGAGACTCCGACCTCGATTGGACCCGTCCTGA
TGGCCGTGGATTCCACCAATGCCGACCTGCCTTACTTCAAACGGGTGCTGTGAGTGCTGC
TTCTGGTTCTGCTTATGCTGAGTTTGGGAACACCAAAGTCATTGTTTCAGTATTTGGGCC
AAGGGAGAGTAAGAAAGCAACGAGTTATAGTGATGTTGGTGGATTGAATTGCAATGTTAG
CTACACTACTTTTTCTTCCCCTGCTCTTGGGAGTCAGGGGACTGATCACAAAGAGTACTC
ATCAATGCTTCTCAAAGCGTTGGAAGGCGTAATCATGATGGAGACGTTCCCAAAGACAAC
TGTTGATGTTTTTGCGTTGGTGCTCGAATCTGGAGGCAGTGACCTCCCGGTTGTGATATC
ATGTGCTGGTCTTGCTCTAGCAGACGCCGGGATTATGATGTACGACCTTATCACAGCTGT
CTCAGTGTCTTGCATAGGGAAAAG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2ES70JQ 705 0 0
AAAGCAACGAGTTATAGTGATGTTGGTGGATTGAATTGCAATGTTAGCTACACTACTTTT
TCTTCCCCTGCTCTTGGGAGTCAGGGGACTGATCACAAAGAGTACTCATCAATGCTTCTC
AAAGCGTTGGAAGGCGTAATCATGATGGAGACGTTCCCAAAGACAACTGTTGATGTTTTT
GCGTTGGTGCTCGAATCTGGAGGCAGTGACCTCCCGGTTGTGATATCATGTGCTGGTCTT
GCTCTAGCAGACGCCGGGATTATGATGTACGACCTTATCACAGCTGTCTCAGTGTCTTGC
ATAGGGAAAAGCCTTATGATTGACCCGGTTACAGAAGAGGAAGGATGTGAAGATGGAAGC
TTCATGATGACGTGCATGCCTTCTCGGAGTGAAATCACTCAGCTGACCATCACTGGTGAA
TGGACTACGCCTAACATTAACGAGGCAACGCAGCTTTGCGTGGATGCTTGTTCCAAACTT
GGAGAAATCATGCGCGATTGTCTGAAACAGGCTGCCTCCGCTTCAGATGAATGAACATAC
AAGTCAAGAAACTATAGCTAGGATTGTACCTCAGCCATTGGTATGAAACCGGTTAAGCTG
TTGGTTTAGGTAAAATTGAATTTATACTAAACCGGTGTGATGGAGTTTAAAACAGATGAC
TGTGTGCTAAGTCAAATTTGATGGAACTAGATCTTTAAAGAGCGT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL5819Contig1 1204 2 2 U
TTTTTGTTCACAAGGGTGTAGTGAAAAGTGGAGCTTTGGAAGTTGGTAAGGAGGTGGAAG
CAGCTGTAGATGCAGACTTAAGACAACGAGTAAAGGTGCATCATACGGCCACTCATTTGC
TGCAATCAGCACTTAAGAAAGTAGTAGGACAAGAAACATCACAGGCTGGTTCATTAGTAG
CATTTGACCGCCTCCGGTTTGATTTCAATTTTAACCGGCCTCTACATGATGGTGAGCTTG
AGGAAATCGAGTGCTTGATCAACAGGTGGATTGGTGATGCTACGCGTCTTGAAACAAAAG
TCCTTCCTCTTGCTGATGCTAAAAAAGCTGGAGCTATTGTAATGTTTGGTGAAAAATATG
ATGACGAGGTTCGTGTAGTAGAGGTTCCTGGTGTCTCCATGGAACTGTGTGGTGGCACTC
ACGTTGGAAACACTGCGGAGATACGAGCCTTCAAGATTATCTCAGAACAGGGCATTGCAT
CTGGAATCAGACGTATTGAAGCAGTTGCAGGTGAAGCATTCATTGAATACATAAACTCAC
GAGATTCTCAAATGAAACGTCTATGCTCCACTCTCAAGGTGAAAGCAGAGGATGTTACAA
ACAGAGTTGATAATCTTCTAGAGGAACTGCGTACTGCTAGAAAAGAAGCATCAGACTTGC
GCTCAAAAGCAGCGGTTTACAGAGCATCTGTTATATCAAACAAAGCATTTACTGTCGGAA
CTTCACAGACAGTAAGAGTGCTGGTTGAGTCGATGGATGACACAGATGCTGACTCTTTAA
AGAGTGCAGCCGAGCATTTGGTAAGCACACTTGAAGAACCAGTGGCTGTGGTACTAGGAT
CATGTCCAGACAAAGACAAGGTTAGTTTAGTGGCTGCATTCAGTCCAGGAGTAGTGTCTC
TGGGAGTCCAGGCAGGGAAGTTCATTGGTTCCATAGCTAAGTTGTGCGGAGGAGGAGGTG
GTGGAAAGCCTAATTTCGCTCAAGCGGGTGGCAGAAAGCCTGAGAATCTCTCGAGTGCAT
TGGGGAAAGCTCGGGAAGAACTTGTGGCAACTCTATCTGAAAAGCTTGGTTGAAAGAACC
AACTTGCTATATACATGGAATGAGATTGTACACATTTGCTTGGTCTTGGAAAAGTGAATC
TCTCCTATAAGATGTAAAGAAATTTCTTTTTTTTTTAAATTTAATCTAGACGATTAATTT
ACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2EK40TF U 1
AF RR2EK40JQ C 460
BS 1 573 RR2EK40TF
BS 574 1204 RR2EK40JQ

RD RR2EK40TF 573 0 0
TTTTTGTTCACAAGGGTGTAGTGAAAAGTGGAGCTTTGGAAGTTGGTAAGGAGGTGGAAG
CAGCTGTAGATGCAGACTTAAGACAACGAGTAAAGGTGCATCATACGGCCACTCATTTGC
TGCAATCAGCACTTAAGAAAGTAGTAGGACAAGAAACATCACAGGCTGGTTCATTAGTAG
CATTTGACCGCCTCCGGTTTGATTTCAATTTTAACCGGCCTCTACATGATGGTGAGCTTG
AGGAAATCGAGTGCTTGATCAACAGGTGGATTGGTGATGCTACGCGTCTTGAAACAAAAG
TCCTTCCTCTTGCTGATGCTAAAAAAGCTGGAGCTATTGTAATGTTTGGTGAAAAATATG
ATGACGAGGTTCGTGTAGTAGAGGTTCCTGGTGTCTCCATGGAACTGTGTGGTGGCACTC
ACGTTGGAAACACTGCGGAGATACGAGCCTTCAAGATTATCTCAGAACAGGGCATTGCAT
CTGGAATCAGACGTATTGAAGCAGTTGCAGGTGAAGCATTCATTGAATACATAAACTCAC
GAGATTCTCAAATGAAACGTCTATGCTCCACTC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2EK40JQ 745 0 0
TCTCAGAACAGGGCATTGCATCTGGAATCAGACGTATTGAAGCAGTTGCAGGTGAAGCAT
TCATTGAATACATAAACTCACGAGATTCTCAAATGAAACGTCTATGCTCCACTCTCAAGG
TGAAAGCAGAGGATGTTACAAACAGAGTTGATAATCTTCTAGAGGAACTGCGTACTGCTA
GAAAAGAAGCATCAGACTTGCGCTCAAAAGCAGCGGTTTACAGAGCATCTGTTATATCAA
ACAAAGCATTTACTGTCGGAACTTCACAGACAGTAAGAGTGCTGGTTGAGTCGATGGATG
ACACAGATGCTGACTCTTTAAAGAGTGCAGCCGAGCATTTGGTAAGCACACTTGAAGAAC
CAGTGGCTGTGGTACTAGGATCATGTCCAGACAAAGACAAGGTTAGTTTAGTGGCTGCAT
TCAGTCCAGGAGTAGTGTCTCTGGGAGTCCAGGCAGGGAAGTTCATTGGTTCCATAGCTA
AGTTGTGCGGAGGAGGAGGTGGTGGAAAGCCTAATTTCGCTCAAGCGGGTGGCAGAAAGC
CTGAGAATCTCTCGAGTGCATTGGGGAAAGCTCGGGAAGAACTTGTGGCAACTCTATCTG
AAAAGCTTGGTTGAAAGAACCAACTTGCTATATACATGGAATGAGATTGTACACATTTGC
TTGGTCTTGGAAAAGTGAATCTCTCCTATAAGATGTAAAGAAATTTCTTTTTTTTTTAAA
TTTAATCTAGACGATTAATTTACTT

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL5820Contig1 1353 2 2 U
GGCACATGCAATTGTTGATGCAGCTGTCAAGAGCGAAATGAATCTGCGTGTTGTGGACTC
CAACACTATTACTGCTTCTTTTGACGAAACAACTACCTTGGATGATGTCGATAAACTTTT
CAAAGTCTTTGCTTCTGGCAAACCTGTTCCGTTCACGGCTGAATCTCTTGCACCTGAGGT
TAAGAATTCCATCCCCTCTAACCTAACAAGAGAGAGCTCTTATCTCACCCACCCAATCTT
CAACATGTACCACACAGAGCATGAGTTACTCAGGTACATCCACAAGTTGGCGACTAAGGA
TCTCTCACTCTGCCACAGCATGATTCCATTGGGATCTTGTACAATGAAGTTAAACGCAAC
AACTGAAATGATGCCAGTCTCATGGCCAAGTTTCACTGACATCCACCCATTTGCTCCAAT
TGATCAAGCACAAGGTTATCAGGAAATGTTCAGCGACTTGGGTGATCTATTGTGTACAAT
CACTGGGTTTGACTCTCTCTCATTGCAACCTAATGCTGGTGCTTCTGGTGAATACACCGG
GCTCATGGTTATCCGCGAATATCACAGGTCAAGAGGAGATCACCACAGAAATGTGTGTAT
CATACCCGTCTCTGCACACGGGACAAACCCTGCAAGCGCTGCTATGTGCGGGATGAAAAT
TATTACGGTTGGAACTGATGCTAAGGGAAATATCAACATGGAGGAGGTGGGAAAAGCTGC
TGAAGACAACAAAGACAGCTTAGCTGCCCTCATGGTTACATACCCTTCAACTCATGGAGT
CTATGAAGAGACTATTGATGAGATTTACAAAATAATTCACGACAATGGAGGTCAAGTGTA
CATGGATGGTGCCAACATGAATGCACAGGTTGGTTTGACCAGCCCTGGTTTCATTGGAGC
GGATGTGTGCCATCTCAATCTCCACAAGACTTTCTGTATTCCTCATGGAGGTGGTGGGCC
TGGAATGGGTCCCATTGGTGTGAAGAAGCATTTAGCACCATTTCTTCCTTCTCACCCTGT
GATACCCACTGGTGGTTTCCCGCAACCCGAGAAGACAGAACCGCTGGGTCCCATTGCCGC
TGCACCGTGGGGATTTGCGCTTATCTTGCCAATATCTTACTCTTACATTGCCATGATGGG
ATTTGGTGGACTCACTGAGGCCTCAAAGATTGCAATCTTGAATGCCAATTACATGGCAAA
GCGCCTAGAGAATCACTTCCCAATTTTGTTCCGTGGTGCCAACGGAACAGTAGCACACGA
ATTCATCCATGTTTATGTCCACAGTGTTCTTATTATCATACACTTTCTATCTAGCTGTGT
AATGTTTACATTGGAATGTTGCTATTCACATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX30TFB U 1
AF RR2AX30JQ C 550
BS 1 663 RR2AX30TFB
BS 664 1353 RR2AX30JQ

RD RR2AX30TFB 663 0 0
GGCACATGCAATTGTTGATGCAGCTGTCAAGAGCGAAATGAATCTGCGTGTTGTGGACTC
CAACACTATTACTGCTTCTTTTGACGAAACAACTACCTTGGATGATGTCGATAAACTTTT
CAAAGTCTTTGCTTCTGGCAAACCTGTTCCGTTCACGGCTGAATCTCTTGCACCTGAGGT
TAAGAATTCCATCCCCTCTAACCTAACAAGAGAGAGCTCTTATCTCACCCACCCAATCTT
CAACATGTACCACACAGAGCATGAGTTACTCAGGTACATCCACAAGTTGGCGACTAAGGA
TCTCTCACTCTGCCACAGCATGATTCCATTGGGATCTTGTACAATGAAGTTAAACGCAAC
AACTGAAATGATGCCAGTCTCATGGCCAAGTTTCACTGACATCCACCCATTTGCTCCAAT
TGATCAAGCACAAGGTTATCAGGAAATGTTCAGCGACTTGGGTGATCTATTGTGTACAAT
CACTGGGTTTGACTCTCTCTCATTGCAACCTAATGCTGGTGCTTCTGGTGAATACACCGG
GCTCATGGTTATCCGCGAATATCACAGGTCAAGAGGAGATCACCACAGAAATGTGTGTAT
CATACCCGTCTCTGCACACGGGACAAACCCTGCAAGCGCTGCTATGTGCGGGATGAAAAT
TAT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2AX30JQ 804 0 0
TATCCGCGAATATCACAGGTCAAGAGGAGATCACCACAGAAATGTGTGTATCATACCCGT
CTCTGCACACGGGACAAACCCTGCAAGCGCTGCTATGTGCGGGATGAAAATTATTACGGT
TGGAACTGATGCTAAGGGAAATATCAACATGGAGGAGGTGGGAAAAGCTGCTGAAGACAA
CAAAGACAGCTTAGCTGCCCTCATGGTTACATACCCTTCAACTCATGGAGTCTATGAAGA
GACTATTGATGAGATTTACAAAATAATTCACGACAATGGAGGTCAAGTGTACATGGATGG
TGCCAACATGAATGCACAGGTTGGTTTGACCAGCCCTGGTTTCATTGGAGCGGATGTGTG
CCATCTCAATCTCCACAAGACTTTCTGTATTCCTCATGGAGGTGGTGGGCCTGGAATGGG
TCCCATTGGTGTGAAGAAGCATTTAGCACCATTTCTTCCTTCTCACCCTGTGATACCCAC
TGGTGGTTTCCCGCAACCCGAGAAGACAGAACCGCTGGGTCCCATTGCCGCTGCACCGTG
GGGATTTGCGCTTATCTTGCCAATATCTTACTCTTACATTGCCATGATGGGATTTGGTGG
ACTCACTGAGGCCTCAAAGATTGCAATCTTGAATGCCAATTACATGGCAAAGCGCCTAGA
GAATCACTTCCCAATTTTGTTCCGTGGTGCCAACGGAACAGTAGCACACGAATTCATCCA
TGTTTATGTCCACAGTGTTCTTATTATCATACACTTTCTATCTAGCTGTGTAATGTTTAC
ATTGGAATGTTGCTATTCACATCG

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL5821Contig1 819 2 8 U
GAGAGTTTGTGGTTGGGGATGAGAAACGGCTAATGCAGATAATATTAAACATAGTTGGTA
ATGCTGTGAAGTTCTCCAAACAAGGTAGTATCTCTGTAACTGCTCTTGTCACAAAGTCGG
ACAACCGAGCTCCTCCTGACTTTTTTGTGGTGCCAACTGGGAGTCATTTCTACTTGAGGG
TAAAGGTAAAAGACATGGGAGCAGGAATAAATCCGCAAGACATTCCCAAGCTTTTCACCA
AATTTGCTCAAACACAGTCTTTAGCGACCAGAAGCTCGGGAGGTAGTGGGCTTGGTCCCG
CCATCTCCAAGAGGTTTGTGAATCTGATGGAGGGTAACATTTGGATTGAGAGCGACGGTG
TTGGAAAAGGATGCACAGCTATCTTTGATGTTAAACTTGGGATTTCAAACGAATCTAAAC
AGTCTGGCGTTCCAAAACTTCCAGCCCATCCACAGCATGCAAATTTCGCTGGACTTAAGG
TTCTTGTCATGGATGAGAATGGGGTAAGTAGAATGGTGACAAAGGGACTTCTTATACACC
TTGGATGCGAAGTGACCATGGTGAGTTCAAGCGAGGAGTGTCTCAGAGTTGTATCCCATG
AACACAAAGTGGTATTCATGGACGTGTGCACGCCCGGGGTAGAAAACTACCAAATCGCTC
TCCGTATACACGAGAAATTCACAAATCGCCGCCAACGCCCGCTGCTCGTGGCGCTCACTG
GTAACACCGACAAATCCACAAAGGAGAAGTGCATGAGCTTTGGTCTAGACGGCGTGTTGC
TCAAACCCGTGTCGCTAGACAACATGAGAAACGTCCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ38TF U 1
AF RR2BZ38JQ C 411
BS 1 694 RR2BZ38TF
BS 695 695 RR2BZ38JQ
BS 696 723 RR2BZ38TF
BS 724 724 RR2BZ38JQ
BS 725 733 RR2BZ38TF
BS 734 734 RR2BZ38JQ
BS 735 743 RR2BZ38TF
BS 744 819 RR2BZ38JQ

RD RR2BZ38TF 758 0 0
GAGAGTTTGTGGTTGGGGATGAGAAACGGCTAATGCAGATAATATTAAACATAGTTGGTA
ATGCTGTGAAGTTCTCCAAACAAGGTAGTATCTCTGTAACTGCTCTTGTCACAAAGTCGG
ACAACCGAGCTCCTCCTGACTTTTTTGTGGTGCCAACTGGGAGTCATTTCTACTTGAGGG
TAAAGGTAAAAGACATGGGAGCAGGAATAAATCCGCAAGACATTCCCAAGCTTTTCACCA
AATTTGCTCAAACACAGTCTTTAGCGACCAGAAGCTCGGGAGGTAGTGGGCTTGGTCCCG
CCATCTCCAAGAGGTTTGTGAATCTGATGGAGGGTAACATTTGGATTGAGAGCGACGGTG
TTGGAAAAGGATGCACAGCTATCTTTGATGTTAAACTTGGGATTTCAAACGAATCTAAAC
AGTCTGGCGTTCCAAAACTTCCAGCCCATCCACAGCATGCAAATTTCGCTGGACTTAAGG
TTCTTGTCATGGATGAGAATGGGGTAAGTAGAATGGTGACAAAGGGACTTCTTATACACC
TTGGATGCGAAGTGACCATGGTGAGTTCAAGCGAGGAGTGTCTCAGAGTTGTATCCCATG
AACACAAAGTGGTATTCATGGACGTGTGCACGCCCGGGGTAGAAAACTACCAAATCGCTC
TCCGTATACACGAGAAATTCACAAATCGCCGCCA*CGCCCGCTGCTCGTGGCGCTCACTG
GTA*CACCGACAA*TCCACAAAG
AGAGTGCATGAGCTT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2BZ38JQ 409 0 0
GAATCTAAACAGTCTGGCGTTCCAAAACTTCCAGCCCATCCACAGCATGCAAATTTCGCT
GGACTTAAGGTTCTTGTCATGGATGAGAATGGGGTAAGTAGAATGGTGACAAAGGGACTT
TTTATACACCTTGGATGCGAAGTGACCATGGTGAGTTCAAGCGAGGAGTGTTTCAGAGTT
GTATCCCATGAACACAAAGTGGTATTCATGGACGTGTGCACGCCCGGGGTAGAAAACTAC
CAAATCGCTTTCCGTATACACGAGAAATTCACAAATCGCCGCCAACGGCCGCTGCTCGTG
GCGCTCACTGGTAACACCGACAAATCCACAAAGGAGAAGTGCATGAGCTTTGGTCTAGAC
GGCGTGTTGCTCAAACCCGTGTCGCTAGACAACATGAGAAACGTCCTGT

QA 1 409 1 409
DS 



AS 1 2

CO CL5822Contig1 1196 2 2 U
ATCCGTTACTCGCTGTTAAGGCAACAGTTCGGTCCTCCAAAGCAACCTGAGGTCAGCATT
CTTGATTACCAGTCTCAGCAACACAAGCTCATGCCGATGCTGGCCTCCACCTATGCGTAC
CATTTTGCAACCGTGTACCTCGTGGAGAAATATTCAGAGATGAAGAAGACTCAGGAGGAG
CAGTTGGTTGCTGATGTCCATGCGCTCTCTGCTGGGCTCAAATCTTATATAACGTCGTAC
ACCGCTAAGTCACTCTCGGTCTGCAGAGAAGCTTGTGGAGGACATGGTTACGCAGCTGTT
AACAGGTTTGGAAGCTTGAGAAACGATCATGACATTTTCCAAACATTTGAAGGAGACAAC
ACTGTGCTTCTGCAACAGGTGGCAGCTGATTTACTGAAGCGATACAAAGAGAAGTTTCAA
GGTGGGACATTGACAGCTACATGGAGTTACTTGAGAGAGTCGATGAACGCTTACTTGTCT
CAGCCGAATCCTGTTACAGCTCGTTGGGAAAGTGAAGATCATCTAAGAGATCCTAAATTC
CAACTAGATGCTTTCCGGTATCGAACATCGCGTCTCCTACAAAGCGTTGCAATGAGATTG
ACGAAACACACCAAGACACTTGGACCATTCGGCGCTTGGAACAGATGCTTGAATCATCTC
TTGACACTTGCGGAGTCTCACATTGAATCAGTCATTCTCGCCAAGTTCATTGAAGCTGTT
CGAAAGTGTCCGGACCGGAGTGCAAGAGCTGGTCTGAAACTAGCATGTGATCTTTACGCA
TTGGAGCGAATATGGAAAGATATAGGAACCTACCGTAATGTGGATTATGTGGCGCCTAAC
AAAGCCAAGGCAATTCATAAGTTGACTGAGTATTTGAGTTTTCAAGTAAGGAATGTGGCC
AAGGAACTAGTGGACGCTTTCGACCTACCGGATCATGTTACTCGAGCGCCAATTGCTAGG
CAGTCTGATGCTTATGCACAGTATACTCAAGTTGTTGGATTCTGAAAACAGGTGAAAGGA
AAAAAAAAGAAATATCAGATCGAAATAATTAAATCTCCTTCGATTCTTTTTGATACGAAG
TGAAAATAACAATTTATAGTACGTGTTCTCCCTTTTCTGTTATGTGTTTTGTGTATTCGT
TGCTTTTTGTTTTCCACATGGGAATAAAAATCAATTAAGAAACATTGAATTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT35TF U 1
AF RR2CT35JQ C 419
BS 1 729 RR2CT35TF
BS 730 1196 RR2CT35JQ

RD RR2CT35TF 729 0 0
ATCCGTTACTCGCTGTTAAGGCAACAGTTCGGTCCTCCAAAGCAACCTGAGGTCAGCATT
CTTGATTACCAGTCTCAGCAACACAAGCTCATGCCGATGCTGGCCTCCACCTATGCGTAC
CATTTTGCAACCGTGTACCTCGTGGAGAAATATTCAGAGATGAAGAAGACTCAGGAGGAG
CAGTTGGTTGCTGATGTCCATGCGCTCTCTGCTGGGCTCAAATCTTATATAACGTCGTAC
ACCGCTAAGTCACTCTCGGTCTGCAGAGAAGCTTGTGGAGGACATGGTTACGCAGCTGTT
AACAGGTTTGGAAGCTTGAGAAACGATCATGACATTTTCCAAACATTTGAAGGAGACAAC
ACTGTGCTTCTGCAACAGGTGGCAGCTGATTTACTGAAGCGATACAAAGAGAAGTTTCAA
GGTGGGACATTGACAGCTACATGGAGTTACTTGAGAGAGTCGATGAACGCTTACTTGTCT
CAGCCGAATCCTGTTACAGCTCGTTGGGAAAGTGAAGATCATCTAAGAGATCCTAAATTC
CAACTAGATGCTTTCCGGTATCGAACATCGCGTCTCCTACAAAGCGTTGCAATGAGATTG
ACGAAACACACCAAGACACTTGGACCATTCGGCGCTTGGAACAGATGCTTGAATCATCTC
TTGACACTTGCGGAGTCTCACATTGAATCAGTCATTCTCGCCAAGTTCATTGAAGCTGTT
CGAAAGTGT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2CT35JQ 778 0 0
AAGGTGGGACATTGACAGCTACATGGAGTTACTTGAGAGAGTCGATGAACGCTTACTTGT
CTCAGCCGAATCCTGTTACAGCTCGTTGGGAAAGTGAAGATCATCTAAGAGATCCTAAAT
TCCAACTAGATGCTTTCCGGTATCGAACATCGCGTCTCCTACAAAGCGTTGCAATGAGAT
TGACGAAACACACCAAGACACTTGGACCATTCGGCGCTTGGAACAGATGCTTGAATCATC
TCTTGACACTTGCGGAGTCTCACATTGAATCAGTCATTCTCGCCAAGTTCATTGAAGCTG
TTCGAAAGTGTCCGGACCGGAGTGCAAGAGCTGGTCTGAAACTAGCATGTGATCTTTACG
CATTGGAGCGAATATGGAAAGATATAGGAACCTACCGTAATGTGGATTATGTGGCGCCTA
ACAAAGCCAAGGCAATTCATAAGTTGACTGAGTATTTGAGTTTTCAAGTAAGGAATGTGG
CCAAGGAACTAGTGGACGCTTTCGACCTACCGGATCATGTTACTCGAGCGCCAATTGCTA
GGCAGTCTGATGCTTATGCACAGTATACTCAAGTTGTTGGATTCTGAAAACAGGTGAAAG
GAAAAAAAAAGAAATATCAGATCGAAATAATTAAATCTCCTTCGATTCTTTTTGATACGA
AGTGAAAATAACAATTTATAGTACGTGTTCTCCCTTTTCTGTTATGTGTTTTGTGTATTC
GTTGCTTTTTGTTTTCCACATGGGAATAAAAATCAATTAAGAAACATTGAATTTGATT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL5823Contig1 436 2 3 U
AACATAAATATCACTTATTCATTACAAACTGCAACATACTGTATTTATTACATGGATCTC
ACAAGCATTTTATTCCCCAGCAAATCATGATACAATAATACATCACCTTATTTTATTTGA
TAATAATTCATGTGACCAAATTGAAACTCTCATGGACGGCAACCAGGTCGGCTGAAACAA
TGAGGTGGAACAGGAACATATCTCCTCGGCGGAACTCTCCTCGGCGGAACTATCCCCGGC
GTTACCGGACCGTACGCATTTTCCGGAGGATAATTAGTTAGTTTCCTAGCAGTAAAAAAG
GTTCGAGCCTGGGAAATTATGAAAAGCGCCATGAATGAAAAAAGCATCACCTCAAGGAGC
TTCGATGAACTTGGCATCTTAGCAATTAGTATGCTGTATCTCTTTGTCTTTCTTGTTTAC
TAGACTTGAAGCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK82JQ U 65
AF RR2BK82TF C 1
BS 1 64 RR2BK82TF
BS 65 387 RR2BK82JQ
BS 388 436 RR2BK82TF

RD RR2BK82JQ 323 0 0
GCATTTTATTCCCCAGCAAATCATGATACAATAATACATCACCTTATTTTATTTGATAAT
AATTCATGTGACCAAATTGAAACTCTCATGGACGGCAACCAGGTCGGCTGAAACAATGAG
GTGGAACAGGAACATATCTCCTCGGCGGAACTCTCCTCGGCGGAACTATCCCCGGCGTTA
CCGGACCGTACGCATTTTCCGGAGGATAATTAGTTAGTTTCCTAGCAGTAAAAAAGGTTC
GAGCCTGGGAAATTATGAAAAGCGCCATGAATGAAAAAAGCATCACCTCAAGGAGCTTCG
ATGAACTTGGCATCTTAGCAATT

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR2BK82TF 436 0 0
AACATAAATATCACTTATTCATTACAAACTGCAACATACTGTATTTATTACATGGATCTC
ACAAGCATTTTATTCCCCAGCAAATCATGATACAATAATACATCACCTTATTTTATTTGA
TAATAATTCATGTGACCAAATTGAAACTCTCATGGACGGCAACCAGGTCGGCTGAAACAA
TGAGGTGGAACAGGAACATATCTCCTCGGCGGAACTCTCCTCGGCGGAACTATCCCCGGC
GTTACCGGACCGTACGCATTTTCCGGAGGATAATTAGTTAGTTTCCTAGCAGTAGAAAAG
GTTCGAGCCTGGGAGATTATGAAAAGCGCCATGAATGAGAAAAGCATCACCTCAAGGAGC
TTCGATGAACTTGGCATCTTAGCAATTAGTATGCTGTATCTCTTTGTCTTTCTTGTTTAC
TAGACTTGAAGCCTCC

QA 1 436 1 436
DS 



AS 1 2

CO CL5824Contig1 1117 2 8 U
GGACGCTCTTCTTCCCCCTTTCGGTTTCGAAATTAGGGTTTCGCCCAGTGCTCTCCTTCA
ATCCCCAGTTTGGAAGATGCCTCGCTATGATGATCGTTACGGGAACACTCGTCTATACGT
TGGACACTTATCATCCAGAACTCGTACCAGAGACCTTGAACGCCTTTTCAACAGATACGG
AAGAGTGCGAGATGTGGATATGAAGCGGGACTATGCTTTTGTTGAGTTTAGTGATCCCCG
TGATGCTGACGATGCGAGACATTACTTGGATGGAAGAGACTTTGATGGAAGTCGCATCAC
TGTGGAGTTTTCAAGAGGGGCACCTCGTGGCTCTCGGGACTATGACAGCAGAGGCCCGCC
TCCTGGAGCTGGTCGCTGTTTTAACTGTGGTGTTGACGGTCATTGGGCTCGAGACCGCAC
TGCAGGGGACTGGAAGAACAAGTGTTACCGCTGCGGGGAGAGAGGACACATTGAGAGAAA
CTGCAAGAACAGTCCCAAGAAGCTCAGGCGAAGTGGAAGCTACTCCAGGTCACCTGTAAG
ATCCCGTTCTCCTCCTCGTCGTAGAAGAAGCCCAAGCCGTAGCAGGAGTCTTAGCCGAAG
CTACAGCCGATCAAGATCACCTGTGAAAGGAAGAGAGAGAAGTGCAGAGGAGAGATCTCG
GAGTCCAAAGAGAATGGAGGACTCTCTTTCGCCAAGAGGCAGAGACCGTAGTCCGATTAT
GGATGATGAAGGTAGCCCAAGGATCATAGACAGGAGTCCCCCACCTTCTCCAAAGCTTGA
AAAGCAAGCATGATCAGACCATGATGGTGGTGGTAGCCCTCAAAACAATGGCAATGGCAG
CAACACTGTGGGACGCAGTACTGACAGCCCGAGAGAGGACCGAAGCCCCGTTGATGATGA
TTACGAGGCCAACCGTGCTTCTCCTAGAGGAAGCGAGTCTCCTTGACTTTGATGGCTCAT
GGCCTCAAGTCACAGGCACTCTAGCATGTTGTACTATTATATCAGACTGCTCCAGATAAT
TACTTTCTCTTTTTGTGTTTGTTTGCTTTGGATCTTCTTGTGTTCATGTTGTCAGGATTT
CTTTCTTTTACTCAGTTGAGATGATGGTTAAACTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH89TF U 1
AF RR2FH89JQ C 437
BS 1 679 RR2FH89TF
BS 680 680 RR2FH89JQ
BS 681 698 RR2FH89TF
BS 699 699 RR2FH89JQ
BS 700 731 RR2FH89TF
BS 732 732 RR2FH89JQ
BS 733 762 RR2FH89TF
BS 763 1117 RR2FH89JQ

RD RR2FH89TF 770 0 0
GGACGCTCTTCTTCCCCCTTTCGGTTTCGAAATTAGGGTTTCGCCCAGTGCTCTCCTTCA
ATCCCCAGTTTGGAAGATGCCTCGCTATGATGATCGTTACGGGAACACTCGTCTATACGT
TGGACACTTATCATCCAGAACTCGTACCAGAGACCTTGAACGCCTTTTCAACAGATACGG
AAGAGTGCGAGATGTGGATATGAAGCGGGACTATGCTTTTGTTGAGTTTAGTGATCCCCG
TGATGCTGACGATGCGAGACATTACTTGGATGGAAGAGACTTTGATGGAAGTCGCATCAC
TGTGGAGTTTTCAAGAGGGGCACCTCGTGGCTCTCGGGACTATGACAGCAGAGGCCCGCC
TCCTGGAGCTGGTCGCTGTTTTAACTGTGGTGTTGACGGTCATTGGGCTCGAGACCGCAC
TGCAGGGGACTGGAAGAACAAGTGTTACCGCTGCGGGGAGAGAGGACACATTGAGAGAAA
CTGCAAGAACAGTCCCAAGAAGCTCAGGCGAAGTGGAAGCTACTCCAGGTCACCTGTAAG
ATCCCGTTCTCCTCCTCGTCGTAGAAGAAGCCCAAGCCGTAGCAGGAGTCTTAGCCGAAG
CTACAGCCGATCAAGATCACCTGTGAAAGGAAGAGAGAGAAGTGCAGAGGAGAGATCTCG
GAGTCCAAAGAGAATGGAG*ACTCTCTTTCGCCAAGAG*CAGAGACCGTAGTCCGATTAT
GGATGATGAAG*TAGCCCAAGGATCATAGACAGGAGTCCCCC
CCTTCTCA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2FH89JQ 681 0 0
AACAAGTGTTACCGCTGCGGGGAGAGAGGACACATTGAGAGAAACTGCAAGAACAGTCCC
AAGAAGCTCAGGCGAAGTGGAAGCTACTCCAGGTCACCTGTAAGATCCCGTTCTCCTCCT
CGTCGTAGAAGAAGCCCAAGCCGTAGCAGGAGTCTTAGCCGAAGCTACAGCCGATCAAGA
TCACCTGTGAAAGGAAGAGAGAGAAGTGCAGAGGAGAGATCTCGGAGTCCAAAGAGAATG
GAGGACTCTCTTTCGCCAAGAGGCAGAGACCGTAGTCCGATTATGGATGATGAAGGTAGC
CCAAGGATCATAGACGGGAGTCCCCCACCTTCTCCAAAGCTTGAAAAGCAAGCATGATCA
GACCATGATGGTGGTGGTAGCCCTCAAAACAATGGCAATGGCAGCAACACTGTGGGACGC
AGTACTGACAGCCCGAGAGAGGACCGAAGCCCCGTTGATGATGATTACGAGGCCAACCGT
GCTTCTCCTAGAGGAAGCGAGTCTCCTTGACTTTGATGGCTCATGGCCTCAAGTCACAGG
CACTCTAGCATGTTGTACTATTATATCAGACTGCTCCAGATAATTACTTTCTCTTTTTGT
GTTTGTTTGCTTTGGATCTTCTTGTGTTCATGTTGTCAGGATTTCTTTCTTTTACTCAGT
TGAGATGATGGTTAAACTTGC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL5825Contig1 940 2 4 U
GATACGTATTGTGTCAAAGCTCAAGTCGAGATGGCTTTAGGAAGGTTTGAAAATGCAGTT
AAGGCTGCTGATAAAGCTAGCCAAATAGATCCACGAAGCAACGACGTCGCCACCTTACAC
AATACTGTTACATTGGTTGCTAGGGCTCGTGTACGTGGTAACGATCTGTACAAATCAGAA
AGATACACGGAAGCAAGCTCAGCTTATGCAGAAGGCCTTAGGCTTGATCCGTGCAACGCT
ATTCTGTACTGTAACCGAGCGGCTTGTTGGTTCAAACTTCGAATGTGGGAACGCTCTATC
GAAGATTGTAACCAAGCGCTGCGTTTTCAACCACGTTACACAAAGCCACTTCTCCGTAGA
GCTGCCTCAAATATCAAGATGGAGAGATGGGCGGCTGCGGTGAGTGATTACGAAGCCTTG
AGAAAGGAACTGCCTCATGATAAGGAAGTTGCTGAATCTTTGTTTCACGCTCAAGTCGCG
TTGAAGAAGTCTCGCGGAGAAGAAGTTTTGAATATGGAGTTCGGTGGTGAAGTTGAGGAA
GTTTACAGCCGTGAACAGTTTAAAGCTGCCATGAATCTACCAGGAGTTTCGGTTATTCAT
TTCTCGACGGCCTCTGATCATCAGTGCAAGCAGTTGTCTCCGTTTGTGGATTCGCTATGT
ACTCGTTATCCTTCTATACACTTCCTCAAGGTGGACATAGATAAATGTCCGTCTATAGGT
AACGCAGAGAACGTGAGGGTTGTACCGACAGTGAAGATATACAAGAACGGTACTCGTGTA
AAGGAGATTGTCTGTCCAAGCAAAGAAGTGTTGGAGTACTCAGTGAGACACTATAGCAGT
TAGTTAATACACTCATTTTACCCCTCAATAATCCCACTTAAGTTCATTACCAGGGAACCT
CATTAGTGTAGAGTTATCAGCTCTTTATGATTTGTTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK40TF U 1
AF RR2BK40JQ C 600
BS 1 690 RR2BK40TF
BS 691 691 RR2BK40JQ
BS 692 718 RR2BK40TF
BS 719 940 RR2BK40JQ

RD RR2BK40TF 724 0 0
GATACGTATTGTGTCAAAGCTCAAGTCGAGATGGCTTTAGGAAGGTTTGAAAATGCAGTT
AAGGCTGCTGATAAAGCTAGCCAAATAGATCCACGAAGCAACGACGTCGCCACCTTACAC
AATACTGTTACATTGGTTGCTAGGGCTCGTGTACGTGGTAACGATCTGTACAAATCAGAA
AGATACACGGAAGCAAGCTCAGCTTATGCAGAAGGCCTTAGGCTTGATCCGTGCAACGCT
ATTCTGTACTGTAACCGAGCGGCTTGTTGGTTCAAACTTCGAATGTGGGAACGCTCTATC
GAAGATTGTAACCAAGCGCTGCGTTTTCAACCACGTTACACAAAGCCACTTCTCCGTAGA
GCTGCCTCAAATATCAAGATGGAGAGATGGGCGGCTGCGGTGAGTGATTACGAAGCCTTG
AGAAAGGAACTGCCTCATGATAAGGAAGTTGCTGAATCTTTGTTTCACGCTCAAGTCGCG
TTGAAGAAGTCTCGCGGAGAAGAAGTTTTGAATATGGAGTTCGGTGGTGAAGTTGAGGAA
GTTTACAGCCGTGAACAGTTTAAAGCTGCCATGAATCTACCAGGAGTTTCGGTTATTCAT
TTCTCGACGGCCTCTGATCATCAGTGCAAGCAGTTGTCTCCGTTTGTGGATTCGCTATGT
ACTCGTTATCCTTCTATACACTTCCTCAAG*TGGACATAGATAAATGTCCGTCTATAG
TACGCA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2BK40JQ 341 0 0
TTTCTCGACGGCCTCTGATCATCAGTGCAAGCAGTTGTCTCCGTTTGTGGATTCGCTATG
TACTCGTTATCCTTCTATACACTTCCTCAAGGTGGACATAGATAAATGTCCGTCTATAGG
TAACGCAGAGAACGTGAGGGTTGTACCGACAGTGAAGATATACAAGAACGGTACTCGTGT
AAAGGAGATTGTCTGTCCAAGCAAAGAAGTGTTGGAGTACTCAGTGAGACACTATAGCAG
TTAGTTAATACACTCATTTTACCCCTCAATAATCCCACTTAAGTTCATTACCAGGGAACC
TCATTAGTGTAGAGTTATCAGCTCTTTATGATTTGTTCATT

QA 1 341 1 341
DS 



AS 1 2

CO CL5826Contig1 1056 2 2 U
GGGCGATCATCGTCGATATCTTGAACAAAGTCGGTGACGTCAGAACCGTACTTCGTTGCA
GCTCTCTCTCAAAGCGATTCAACTCGCTCGTCCCTCAAACCGAGTCACTCATCCTCCGAC
CCGACCAGGTTGGCACCACCGAGTCACAAGCCGATTCTCCCCTCAGCAACATTTTAACGT
CAGTCCACGGTTTGTGTTCTTTATTCTCTAAAGCGGCTAAACCGATCCCGACCACGAGTC
TTTCTCCGAACGTCCCTTCCAAGATTCTCTCCCCGTTTGACCGGATCAAGAACCTCGAAG
TCGAGCTCCCCGGCGGCGATGCAAGCCTCGAGAAAGGCGCCGCCGTCAAATGGAAAGCAG
AGTACGGTGAAACTCTCCAAACCTGCGTCGTCTTCTCGTTTCGTTCCGCCTCCACCGTGT
CTCCTTCTCCCGGTTCTTCCGACGGTGAGTCAGACGCCGAGTTCGTGGCTGGGCTGAAAA
CGCGCGTGATGTGGACGATAAGCGCGTTGATAGCTGCGTCGACTCGTCATTTCTTGATGA
GCGAAGTCGTGAAGGACCACGAAGAGATGGAGAGTTTGGTGGTTCGCGACATGGGAGGAG
AAAGCACGCTGGTGATGAACTCGGAGGGGCTGAGAGAGTCTCGAAAGATGGAAGCGGCGC
GTGACGGAGAAGTCGAGGATGAGCGCGTGGAGAAAAACAGGAGCGTGGTCCCGAGCGTGA
GGATGAGCATGAGACACGCGCCGTCGCTGAAGCTCGAGAGTTGTGTCTGTTTAGAATCCG
CGACGCTCGTGATCGTAAGGCCGAGCGAGGGGTATTCCGATGTCGGAGACGATGAGCTGG
CGACGGAGGCTTTCGCCGGGAATAGTATGTACGTTGAAGCGGTCGTCGCTTTGTTGAAGT
GTAGGAAGAATGCTATAGAGATGAACTCTTTTTAAGCTTTGGTTGGGCCTTTTAATGGGC
CCTTTGGGGGCTTTATGCGTTTTTCATTTGTTACAATGTTTTTCTTGTACGTGAACATGT
GCTCCCTTTTGTGTATAAGTGTACAAAGTTGGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G994TF U 1
AF RR2G994JQ C 348
BS 1 668 RR2G994TF
BS 669 1056 RR2G994JQ

RD RR2G994TF 668 0 0
GGGCGATCATCGTCGATATCTTGAACAAAGTCGGTGACGTCAGAACCGTACTTCGTTGCA
GCTCTCTCTCAAAGCGATTCAACTCGCTCGTCCCTCAAACCGAGTCACTCATCCTCCGAC
CCGACCAGGTTGGCACCACCGAGTCACAAGCCGATTCTCCCCTCAGCAACATTTTAACGT
CAGTCCACGGTTTGTGTTCTTTATTCTCTAAAGCGGCTAAACCGATCCCGACCACGAGTC
TTTCTCCGAACGTCCCTTCCAAGATTCTCTCCCCGTTTGACCGGATCAAGAACCTCGAAG
TCGAGCTCCCCGGCGGCGATGCAAGCCTCGAGAAAGGCGCCGCCGTCAAATGGAAAGCAG
AGTACGGTGAAACTCTCCAAACCTGCGTCGTCTTCTCGTTTCGTTCCGCCTCCACCGTGT
CTCCTTCTCCCGGTTCTTCCGACGGTGAGTCAGACGCCGAGTTCGTGGCTGGGCTGAAAA
CGCGCGTGATGTGGACGATAAGCGCGTTGATAGCTGCGTCGACTCGTCATTTCTTGATGA
GCGAAGTCGTGAAGGACCACGAAGAGATGGAGAGTTTGGTGGTTCGCGACATGGGAGGAG
AAAGCACGCTGGTGATGAACTCGGAGGGGCTGAGAGAGTCTCGAAAGATGGAAGCGGCGC
GTGACGGA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2G994JQ 709 0 0
AAATGGAAAGCAGAGTACGGTGAAACTCTCCAAAC*TGCGTCGTCTTCTCGTTTCGTTCC
GCCTCCACCGTGTCTCCTTCTCCCGGTTCTTCCGACGGTGAGTCAGACGCCGAGTTCGTG
GCTGGGCTGAAAACGCGCGTGATGTGGACGATAAGCGCGTTGATAGCTGCGTCGACTCGT
CATTTCTTGATGAGCGAAGTCGTGAAGGACCACGAAGAGATGGAGAGTTTGGTGGTTCGC
GACATGGGAGGAGAAGGCACGCTGGTGATGAACTCGGAGGGGCTGAGAGAGTCTCGAAAG
ATGGAAGCGGCGCGTGACGGAGAAGTCGAGGATGAGCGCGTGGAGAAAAACAGGAGCGTG
GTCCCGAGCGTGAGGATGAGCATGAGACACGCGCCGTCGCTGAAGCTCGAGAGTTGTGTC
TGTTTAGAATCCGCGACGCTCGTGATCGTAAGGCCGAGCGAGGGGTATTCCGATGTCGGA
GACGATGAGCTGGCGACGGAGGCTTTCGCCGGGAATAGTATGTACGTTGAAGCGGTCGTC
GCTTTGTTGAAGTGTAGGAAGAATGCTATAGAGATGAACTCTTTTTAAGCTTTGGTTGGG
CCTTTTAATGGGCCCTTTGGGGGCTTTATGCGTTTTTCATTTGTTACAATGTTTTTCTTG
TACGTGAACATGTGCTCCCTTTTGTGTATAAGTGTACAAAGTTGGCTTC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL5827Contig1 312 2 1 U
TTTTTTACCGGCATGGACATGTAGATATCAAATAAAATAGAAAAAAAGATTTCTTTATCT
GAGTAATGAGTCATCTGACAATTCATGATTTAGATTCAACTACTTATTAATAAACTGATA
GCAAGAAAAAGGGTGTTGTGAAATGGTGTTTGTTGAAGCTTTATGTTAGATCTTTTAATA
TGTTATGTGAATGAACGTGGATTTTCCTCGTTTTGTTTTTTGTTTGTTTATGCCATTGTT
GGTGAACGTGGAAGGGATACAATTAGTGTTGGTTCTTTTTCTCTCTAAACCTACTATATA
ACCATTTGAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BM46JQ C 1
AF RR2BM46TF U 1
BS 1 312 RR2BM46TF

RD RR2BM46JQ 312 0 0
TTTTTTACCGGCATGGACATGTAGATATCAAATAAAATAGAAAAAAAGATTTCTTTATCT
GAGTAATGAGTCATCTGACAATTCATGATTTAGATTCAACTACTTATTAATAAACTGATA
GCAAGAAAAAGGGTGTTGTGAAATGGTGTTTGTTGAAGCTTTATGTTAGATCTTTTAATA
TGTTATGTGAATGAACGTGGATTTTCCTCGTTTTGTTTTTTGTTTGTTTATGCCATTGTT
GGTGAACGTGGAAGGGATACAATTAGTGTTGGTTCTTTTTCTCTCTAAACCTACTATATA
ACCATTTGAACC

QA 1 312 1 312
DS 

RD RR2BM46TF 312 0 0
TTTTTTACCGGCATGGACATGTAGATATCAAATAAAATAGAAAAAAAGATTTCTTTATCT
GAGTAATGAGTCATCTGACAATTCATGATTTAGATTCAACTACTTATTAATAAACTGATA
GCAAGAAAAAGGGTGTTGTGAAATGGTGTTTGTTGAAGCTTTATGTTAGATCTTTTAATA
TGTTATGTGAATGAACGTGGATTTTCCTCGTTTTGTTTTTTGTTTGTTTATGCCATTGTT
GGTGAACGTGGAAGGGATACAATTAGTGTTGGTTCTTTTTCTCTCTAAACCTACTATATA
ACCATTTGAACC

QA 1 312 1 312
DS 



AS 1 2

CO CL5828Contig1 644 2 4 U
GCCGCACAGCTCTTTTCGAGAAATTTAAGCCTACTCCTCAAGAAGTACCAACTACTACCC
CAGTTCATCTGAAGAAGCTACAAACGACGAAGCAGAGGCACCAAAGCCGGCGACATCAGA
GAGGACAGAGGAAGAATCATTGAACAACATTCATGAAGATTCAAAAGAAGAAGAAGCAGA
AGTAGAAGAAGAAGACAGCAACCTGCCTACTTTCCCATACGAACGCCTCAAAACGGACTC
AGAGGATCCTGTTCCAGATATCGACCTCGCTAGAAGAGAGGCATACATGAGTGCAGGAGA
GTTCAAGGAGAAACTTGAAATGACAAAGAAAGAGTTTTATAAACTGCCAAAGTGGAAACA
AAACAAGCTTAAAATGGCTGTTCAATTATTCTGAACCAACTCTTCCCCTCAGCTCATCCT
TTTTCTCGGAATCTGAACCTATTTGATAGATGAGAAGAGCAGGTTCAACTGAGAAGTCAG
ATTGTGATGCAATGATGGATCAAGAGAACCCAGTTTAGTATAGTGGTTATGCTATAGACT
TGATCTTTCTTCCTTTTTCGTTTGCAGTTCAAGAAACACTCAAAGAGAGGGAGGGTACAA
TTATCTTCATTCACCATTTGACCTTGCTTACAAATAATCAAATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP20TF U 1
AF RR2EP20JQ C 1
BS 1 232 RR2EP20TF
BS 233 233 RR2EP20JQ
BS 234 317 RR2EP20TF
BS 318 644 RR2EP20JQ

RD RR2EP20TF 317 0 0
GCCGCACAGCTCTTTTCGAGAAATTTAAGCCTACTCCTCAAGAAGTACCAACTACTACCC
CAGTTCATCTGAAGAAGCTACAAACGACGAAGCAGAGGCACCAAAGCCGGCGACATCAGA
GAGGACAGAGGAAGAATCATTGAACAACATTCATGAAGATTCAAAAGAAGAAGAAGCAGA
AGTAGAAGAAGAAGACAGCAACCTGCCTACTTTCCCATACGAACGCCTCAAA*CGGACTC
AGAGGATCCTGTTCCAGATATCGACCTCGCTAGAAGAGAGGCATACATGAGTGCAGGAGA
GTTCAAGGAGAAACTTG

QA 1 317 1 317
DS 

RD RR2EP20JQ 644 0 0
GCCGCACAGCTCTTTTCGAGAAATTTAAGCCTACTCCTCAAGAAGTACCAACTACTACCC
CAGTTCATCTGAAGAAGCTACAAACGACGAAGCAGAGGCACCAAAGCCGGCGACATCAGA
GAGGACAGAGGAAGAATCATTGAACAACATTCATGAAGATTCAAAAGAAGAAGAAGCAGA
AGTAGAAGAAGAAGACAGCAACCTGCCTACTTTCCCATACGAACGCCTCAAAACGGACTC
AGAGGATCCTGTTCCAGATATCGACCTCGCTAGAAGAGAGGCATACATGAGTGCAGGAGA
GTTCAAGGAGAAACTTGAAATGACAAAGAAAGAGTTTTATAAACTGCCAAAGTGGAAACA
AAACAAGCTTAAAATGGCTGTTCAATTATTCTGAACCAACTCTTCCCCTCAGCTCATCCT
TTTTCTCGGAATCTGAACCTATTTGATAGATGAGAAGAGCAGGTTCAACTGAGAAGTCAG
ATTGTGATGCAATGATGGATCAAGAGAACCCAGTTTAGTATAGTGGTTATGCTATAGACT
TGATCTTTCTTCCTTTTTCGTTTGCAGTTCAAGAAACACTCAAAGAGAGGGAGGGTACAA
TTATCTTCATTCACCATTTGACCTTGCTTACAAATAATCAAATT

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL5829Contig1 1188 2 2 U
TTTTTTTCTTTGAAAATATTACTATTAAGAATAATACTGGATATATAATGATCGGTATCA
GAAGATGGAGACGATCAAGAGTGGTTGGATTCGATGCTAGGCTTGTCAACGTGAGCAATC
TTATGTGTTTCCATCTTTGTTTCGTTGTCTGTTCGACCTTGGTCTCGATCTGTCCTCGGA
AACCCCAGTTCTCCAACCTTGTTAACCTATATCCGATTATTTCTTTCATACATCCTTCTT
ATGATCATATCATCAACTATTACATGATATCGATTTGTGAATAATCCGGATGACGATATA
AACTTTTAGTTTCTCAGGATTTTTTGGTATGGTTTTACATAGATAGTTTTAACTTTTAAC
CATACAAGACACACAACACTACACATACGATATTCTATTTGATTGATGGTATGCGTTTAA
GTTTTCAAAATACATATATAAATCAATATATTCATATACATACGGATTTTATTTATTTTG
CATAAAGTTGTATAGAAGCATGCAAGCGAATTTCGATATGAAGAAACAATTGTTAAAATA
TGGAAACATTCGTTTAAAAGCATTTAGGTTAGTCCGGTTAGAGGGAGAATGTTTTACCCA
TTGAGTATGATATACATATTATGTACATGGGTACAAATCAACATAGACATGTATATAGAA
CTTATTGACGTGAAAGAAGTCTGTATAGCTCAGCATGCTTGTTGCATCTGCACATACGCA
AGACCATGAGTATTGTTAATATTGATATACTGACATACTTATTTTCAAAAAAAAAGATAT
ACTGTAATATCACTAATTTTTCATATACAACAATTAAGAGTCGTTACGTCCTAAGGAGTC
GAAAGAACTAGCCTTGTTATTAAGAGTCGTTACTTCCTAAGGAGTCAAAATTTGCATTTG
GTTTTTAATTTGCCGTCATAGAGCTTAATATGTGATTTAAAAACCTTTTTTAACGTGATG
GTAAAAGCCAAAACCAAGGTCGAACAGAAAACGAAGATAAGATGGAATCAGATCGAGATT
ACTCCGTTGACAAGTGTTTGCGCACTGAATCCAACCACTTAGCTGTGCTTATACATACAT
TTTATGTGTATCTATATATATAATATTTATAAGTGCATGATTCTGACGTAGTGGAATAAT
TAAGCAATTTTGTAAGATGTAATTATGTAAATCGAGGCACGTTATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH59TF U 1
AF RR2CH59JQ C 427
BS 1 738 RR2CH59TF
BS 739 1188 RR2CH59JQ

RD RR2CH59TF 738 0 0
TTTTTTTCTTTGAAAATATTACTATTAAGAATAATACTGGATATATAATGATCGGTATCA
GAAGATGGAGACGATCAAGAGTGGTTGGATTCGATGCTAGGCTTGTCAACGTGAGCAATC
TTATGTGTTTCCATCTTTGTTTCGTTGTCTGTTCGACCTTGGTCTCGATCTGTCCTCGGA
AACCCCAGTTCTCCAACCTTGTTAACCTATATCCGATTATTTCTTTCATACATCCTTCTT
ATGATCATATCATCAACTATTACATGATATCGATTTGTGAATAATCCGGATGACGATATA
AACTTTTAGTTTCTCAGGATTTTTTGGTATGGTTTTACATAGATAGTTTTAACTTTTAAC
CATACAAGACACACAACACTACACATACGATATTCTATTTGATTGATGGTATGCGTTTAA
GTTTTCAAAATACATATATAAATCAATATATTCATATACATACGGATTTTATTTATTTTG
CATAAAGTTGTATAGAAGCATGCAAGCGAATTTCGATATGAAGAAACAATTGTTAAAATA
TGGAAACATTCGTTTAAAAGCATTTAGGTTAGTCCGGTTAGAGGGAGAATGTTTTACCCA
TTGAGTATGATATACATATTATGTACATGGGTACAAATCAACATAGACATGTATATAGAA
CTTATTGACGTGAAAGAAGTCTGTATAGCTCAGCATGCTTGTTGCATCTGCACATACGCA
AGACCATGAGTATTGTTA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2CH59JQ 762 0 0
AAAATACATATATAAATCAATATATTCATATACATACGGATTTTATTTATTTTGCATAAA
GTTGTATAGAAGCATGCAAGCGAATTTCGATATGAAGAAACAATTGTTAAAATATGGAAA
CATTCGTTTAAAAGCATTTAGGTTAGTCCGGTTAGAGGGAGAATGTTTTACCCATTGAGT
ATGATATACATATTATGTACATGGGTACAAATCAACATAGACATGTATATAGAACTTATT
GACGTGAAAGAAGTCTGTATAGCTCAGCATGCTTGTTGCATCTGCACATACGCAAGACCA
TGAGTATTGTTAATATTGATATACTGACATACTTATTTTCAAAAAAAAAGATATACTGTA
ATATCACTAATTTTTCATATACAACAATTAAGAGTCGTTACGTCCTAAGGAGTCGAAAGA
ACTAGCCTTGTTATTAAGAGTCGTTACTTCCTAAGGAGTCAAAATTTGCATTTGGTTTTT
AATTTGCCGTCATAGAGCTTAATATGTGATTTAAAAACCTTTTTTAACGTGATGGTAAAA
GCCAAAACCAAGGTCGAACAGAAAACGAAGATAAGATGGAATCAGATCGAGATTACTCCG
TTGACAAGTGTTTGCGCACTGAATCCAACCACTTAGCTGTGCTTATACATACATTTTATG
TGTATCTATATATATAATATTTATAAGTGCATGATTCTGACGTAGTGGAATAATTAAGCA
ATTTTGTAAGATGTAATTATGTAAATCGAGGCACGTTATTGT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL5830Contig1 793 2 2 U
TATAGATTATGGATTTTTTTTTTAAATTAAACGTGTATTTTCATATGCTAAAAAAAAAAA
CAAGTGAAAACATAAGTCTTTGATAAAAAATTTGATTTAAATCGAAAAGAATACTAGTAT
TATTATTTCGTTCTAGTATGACAGCAAGACTGACCTGTTTATAAAATCATTACATTTCAC
TTTTATAAAAATTCCAAAAATCATCACCATCATCATCCCCCTCGTTATCGTCATATTCAT
CCCCACCGTCTGATTCCTTAACTCCAGTTAGTCCATCACCAGCTCGCTCAGTCTCCTCAG
TCTTCGTCGGTTCCTCATTCTCTGGAACATCAGTAGTTGTCTATGCCTCTTCTCCAGCTT
CTTCTCCTTCTCCTTCTTCCTCTTCCTCCTCTTCTCCTTCCTTTTTAGCCGCAGCTTCTT
CCTCAAGGTTCTTAAGCACATTATGATAAAGAGAAAGATCTTTCGATCGAGTTGATAAAG
CATCATTAAGCTTCAATGGATTCTTGCGTTCTTCCAACTTGAATTTGAGTTTGATTTGGT
GATGCGTTCTTTCAGGTCTTTCAGGAGACCGAAACAGTTGTTGCACCATCAATAGATTGC
TCCCAAACTGTTGAATTCCCTCATAGAAGAGTTGTGTATCTTGTTTTGGCCATCGAGTTC
TTGGAGTCTTGTTCATGTACGAATGATAGTTAACCGGTGAGTCCGGTTTAACTACGTAAG
TTTCTTGATTTTCTCCCTCCTCCATACCAAACTCGTCTTCGACTTCTGCGTCGAAGCCTT
GTGAATAATAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW71JQ U 1
AF RR2FE61JQ U 103
BS 1 434 RR2EW71JQ
BS 435 793 RR2FE61JQ

RD RR2EW71JQ 434 0 0
TATAGATTATGGATTTTTTTTTTAAATTAAACGTGTATTTTCATATGCTAAAAAAAAAAA
CAAGTGAAAACATAAGTCTTTGATAAAAAATTTGATTTAAATCGAAAAGAATACTAGTAT
TATTATTTCGTTCTAGTATGACAGCAAGACTGACCTGTTTATAAAATCATTACATTTCAC
TTTTATAAAAATTCCAAAAATCATCACCATCATCATCCCCCTCGTTATCGTCATATTCAT
CCCCACCGTCTGATTCCTTAACTCCAGTTAGTCCATCACCAGCTCGCTCAGTCTCCTCAG
TCTTCGTCGGTTCCTCATTCTCTGGAACATCAGTAGTTGTCTATGCCTCTTCTCCAGCTT
CTTCTCCTTCTCCTTCTTCCTCTTCCTCCTCTTCTCCTTCCTTTTTAGCCGCAGCTTCTT
CCTCAAGGTTCTTA

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR2FE61JQ 691 0 0
CGAAAAGAATACTAGTATTATTATTTCGTTCTAGTATGACAGCAAGACTGACCTGTTTAT
ATAATCATTACATTTCACTTTTATAAGAATTCCAAAAATCATCACCATCATCATCTCCCT
CGTTATCGTCATATTCATCTCCACCGTCTGATTCCTTAACTCCAGTTAGTCCATCACCAG
CTCGCTCAGTCTCCTCAGTCTTCGTCGGTTCCTCATTCTCTGGAACATCAGTAGTTGTCT
CTGCCTCTTCTCCAGCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCCTCTTCCTCCTCTTCTCCTTCCT
TTTTAGCCGCAGCTTCTTCCTCAAGGTTCTTAAGCACATTATGATAAAGAGAAAGATCTT
TCGATCGAGTTGATAAAGCATCATTAAGCTTCAATGGATTCTTGCGTTCTTCCAACTTGA
ATTTGAGTTTGATTTGGTGATGCGTTCTTTCAGGTCTTTCAGGAGACCGAAACAGTTGTT
GCACCATCAATAGATTGCTCCCAAACTGTTGAATTCCCTCATAGAAGAGTTGTGTATCTT
GTTTTGGCCATCGAGTTCTTGGAGTCTTGTTCATGTACGAATGATAGTTAACCGGTGAGT
CCGGTTTAACTACGTAAGTTTCTTGATTTTCTCCCTCCTCCATACCAAACTCGTCTTCGA
CTTCTGCGTCGAAGCCTTGTGAATAATAATT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL5831Contig1 892 2 2 U
TTTGGTCGTCTTCAACCATTTAGAAAGCGATTGCGGCGGAGAGGAAGGAAGATCGGGGAT
TTATCTTTCTAGCTTTACTGTGGAGACTCGATACTGTATCACTATTTGATCTATGGATGC
GGTAGAGAAGCCAGAAGAAACCATCCCAGGCAACTCTTCAAGATTAGCTGGGAATCCAAA
CTGGGGAACAGCAACTGTTGTCGGGATATTCGCTGGAATGTTATATGGAGGGAGCAAAGA
GGCTTCTGCTTCTGTGAGCAAGGATGCAGAGGTGATGTTGAAGATGGGTAGTACACAGGA
CAAGCGAGAGCAACACAGATTGATGCGAGATGCGATGGAGAAAAGATTCACCCGAGTAAC
TCGTGGCTCCCTCATTGGAGGGATGCGCCTTGGAATGTTCACCGCATCCTACTTCAGTCT
ACAGAACTTTTTAGCTGAGACGCGAGGAGTGCATGATGTTTTCAATTTCGTGGGGGCTGG
TTCAGCTACTGCTGCTGTCTTTGGCTTAATCATGCCGGGGTCTCTTGCTTGGCGTGCGCG
GAATGTGATGCTTGGTTCAGTTCTCGGAGCTACAGTCTGCTTCCCTCTTGGTTGGTTACA
ACTGAAGCTTATGGAGAAAGCAAACGAAGGCAACAAAGAAGACACGAGCCACCATGGCGA
GGTCACGAGTGGTGTTGGTGCAGCTATTGAGAGACTCGAACAACAGTTGAGAAAATAAGA
AAGGGAACCGTTCACAGTTTTGTTTGTATGCTAAAATTTTCAAGCCGACTGGGAATAAGA
CAACGAACATAAACTCTGTTCTTTTTGTAATTGCGTAACAAAATGTTTATGGTTATTTTA
CTCTTTTAGCACTTTACATCACCCATGAGTCAATAACACTACTTACTTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G963TF U 1
AF RR2G963JQ C 156
BS 1 269 RR2G963TF
BS 270 892 RR2G963JQ

RD RR2G963TF 269 0 0
TTTGGTCGTCTTCAACCATTTAGAAAGCGATTGCGGCGGAGAGGAAGGAAGATCGGGGAT
TTATCTTTCTAGCTTTACTGTGGAGACTCGATACTGTATCACTATTTGATCTATGGATGC
GGTAGAGAAGCCAGAAGAAACCATCCCAGGCAACTCTTCAAGATTAGCTGGGAATCCAAA
CTGGGGAACAGCAACTGTTGTCGGGATATTCGCTGGAATGTTATATGGAGGGAGCAAAGA
GGCTTCTGCTTCTGTGAGCAAGGATGCAG

QA 1 269 1 269
DS 

RD RR2G963JQ 737 0 0
CTTCAAGATTAGCTGGGAATCCAAACTGGGGAACAGCAACTGTTGTCGGGATATTCGCTG
GAATGTTATATGGAGGGAGCAAAGAGGCTTCTGCTTCTGTGAGCAAGGATGCAGAGGTGA
TGTTGAAGATGGGTAGTACACAGGACAAGCGAGAGCAACACAGATTGATGCGAGATGCGA
TGGAGAAAAGATTCACCCGAGTAACTCGTGGCTCCCTCATTGGAGGGATGCGCCTTGGAA
TGTTCACCGCATCCTACTTCAGTCTACAGAACTTTTTAGCTGAGACGCGAGGAGTGCATG
ATGTTTTCAATTTCGTGGGGGCTGGTTCAGCTACTGCTGCTGTCTTTGGCTTAATCATGC
CGGGGTCTCTTGCTTGGCGTGCGCGGAATGTGATGCTTGGTTCAGTTCTCGGAGCTACAG
TCTGCTTCCCTCTTGGTTGGTTACAACTGAAGCTTATGGAGAAAGCAAACGAAGGCAACA
AAGAAGACACGAGCCACCATGGCGAGGTCACGAGTGGTGTTGGTGCAGCTATTGAGAGAC
TCGAACAACAGTTGAGAAAATAAGAAAGGGAACCGTTCACAGTTTTGTTTGTATGCTAAA
ATTTTCAAGCCGACTGGGAATAAGACAACGAACATAAACTCTGTTCTTTTTGTAATTGCG
TAACAAAATGTTTATGGTTATTTTACTCTTTTAGCACTTTACATCACCCATGAGTCAATA
ACACTACTTACTTCATT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL5832Contig1 746 2 2 U
AGGGGGCACGATCTCCCATTTGTTTTCGTTTACTTTTCTATTTCGATTTCTGTTTACCTT
TGTTTTTAAAAATATTGCTCTTCTCTTTCAGTTGTGGTTCTCACGCTCTTACGATAATTA
ATTCAACAATGGAATTACAATGTTTGTCCCAGCGCCGGCACTGACCACAATTGTCATTAG
TATTGAAGCACATTGTTGAAGAGAAACGCTGAAGGCATATATATGATCGAGGAAATTCAC
AAACAGATCCATTAAAAGAAGAAGTTTGAGATAAGACGATATTATTGGAGATGAATTTCA
CAGAATCGATGAACGTCGTGCACAGCAGAATCCAACATCTTGAACCTGAAAATGCATCAA
AAATCATCGGTTATCTCTTGATGCAAGACCACGGGGACCTTGACATGATCCGTCTCGCCT
TCTGCCCAGATTCTGTGATGCATTCCATGATCAACTTCGTGAAATACGAATTAGCTAAAG
ATCCTCGTTACAACAGCCCTCCTTCTGATCACGTTCCTACTCTTAGTTTCGGATCATTTA
CTGGTTCATCTATCCAGCCTCCCTCGGTTTCGGTTTCTCCTCCTTTGAGAACCGGTTATT
GGGAGAACTCAACCGAGATTGATTCGTTGCATAACAATGTTCAGTTCTTGAACGTTGAGG
ATTTTATGACGAGCCCTGAGTTCTCTAACGGCTTCTTCTCTCGAGATCATCAATGCTTTC
CTTTAAGAACAAGCAGGAGATCACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H530TF U 1
AF RR2H530JQB C 88
BS 1 396 RR2H530TF
BS 397 746 RR2H530JQB

RD RR2H530TF 396 0 0
AGGGGGCACGATCTCCCATTTGTTTTCGTTTACTTTTCTATTTCGATTTCTGTTTACCTT
TGTTTTTAAAAATATTGCTCTTCTCTTTCAGTTGTGGTTCTCACGCTCTTACGATAATTA
ATTCAACAATGGAATTACAATGTTTGTCCCAGCGCCGGCACTGACCACAATTGTCATTAG
TATTGAAGCACATTGTTGAAGAGAAACGCTGAAGGCATATATATGATCGAGGAAATTCAC
AAACAGATCCATTAAAAGAAGAAGTTTGAGATAAGACGATATTATTGGAGATGAATTTCA
CAGAATCGATGAACGTCGTGCACAGCAGAATCCAACATCTTGAACCTGAAAATGCATCAA
AAATCATCGGTTATCTCTTGATGCAAGACCACGGGG

QA 1 396 1 396
DS 

RD RR2H530JQB 659 0 0
TCAGTTGTGGTTCTCACGCTCTTACGATAATTAATTCAACAATGGAATTACAATGTTTGT
CCCAGCGCCGGCACTGACCACAATTGTCATTAGTATTGAAGCACATTGTTGAAGAGAAAC
GCTGAAGGCATATATATGATCGAGGAAATTCACAAACAGATCCATTAAAAGAAGAAGTTT
GAGATAAGACGATATTATTGGAGATGAATTTCACAGAATCGATGAACGTCGTGCACAGCA
GAATCCAACATCTTGAACCTGAAAATGCATCAAAAATCATCGGTTATCTCTTGATGCAAG
ACCACGGGGACCTTGACATGATCCGTCTCGCCTTCTGCCCAGATTCTGTGATGCATTCCA
TGATCAACTTCGTGAAATACGAATTAGCTAAAGATCCTCGTTACAACAGCCCTCCTTCTG
ATCACGTTCCTACTCTTAGTTTCGGATCATTTACTGGTTCATCTATCCAGCCTCCCTCGG
TTTCGGTTTCTCCTCCTTTGAGAACCGGTTATTGGGAGAACTCAACCGAGATTGATTCGT
TGCATAACAATGTTCAGTTCTTGAACGTTGAGGATTTTATGACGAGCCCTGAGTTCTCTA
ACGGCTTCTTCTCTCGAGATCATCAATGCTTTCCTTTAAGAACAAGCAGGAGATCACCG

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL5833Contig1 1357 2 4 U
GGATCACCAATCCAAAACAATCAATTACCTCTGTTCCATCTATACACCGAGATGGAAAGC
TTGGTGATTGCTATGCAAGAAGTTCATATCGATATTGATGACTCGATATCGAGCAGTAAA
GAGAGAAACACTGACCTCGTTCATGCCAAACCCATTGTTCTGATGTCTATTTTGAGTGGT
CTCCATGCCGGCTATTTCAGAATAAGCCTATCTCTCTGCAGCCAAGCTCTGCTGTGGAAG
ATAATGATTGCACCTGATTCAATGAGCATGTCGAATTTGCGTAGCAATCTCCCGTCTATG
GCATTCCATCTCCTATGGTACCTAGCACTTGCAACACAAGTGTTACTCTGTCTTTTGTAT
GCGTTGAAGTGTTTTTTCTTCTTTGACATGGTGAAAAAGGAGTTCTCGGATTATATTGGA
GTGAACTATCTTTACGCTCCATCCATCTCATGGCTTGTCTTGCTTCAGTCAGCTCCGATG
ATGGAACCACAAAGCATTTTGTATCAGACATTATTCTCGGTGTTTGCTCTTCCGGTCTTG
ACCCTCGACACAAAGCTTTACGGCCAGTGGTTCACCACAGAGAAAAGGTTTTTGTCCATG
ATGGCAAACCCGGCGAGCCAAGTATCAGTAATAGCAAACCTAGTGGCTGCAAGGGGAGCA
GCAGAGATGGGTTGGAGAGAGTGTGCTATATACTTGTTCTCGCTAGGGATGGTTCACTAT
GTGGTTATCTTTGTCACACTTTATCAACGCCTACCAGGTGGAAACAACTTCCCGACCAAG
CTGAGGCCAGTTTTCTTCTTGTTCTTTGCTGCACCAGCCATGGGAAGTCTAGCTTGGAAC
TCTATTTCAGGAACCTTTGATCCTCTAGCAAAGATGTTGTTCTTTCTTTCACTCTTCATC
TTCATGTCTCTGGTCTGTAGGCCAAATCTTTTCAAGAAGTCAATGAAAAGATTCAATGTC
GCATGGTGGGCTTACTCGTTTCCAATCACCTTTCTTGCTTTAAACTCAGTTCAGTATGCA
CAGGAGGTGAAAGAACAGGCCGCTGCTGGATTGATGCTTATCTTCTCATCTATCTCGGTT
TTGATTTTCCTCGGTTTGATGATACTGACAGCAGCAAACAGCAATCGACTACTCAGACGT
GATCATGTTCTCGGTTCTGTTACTAGTCCAAAAGTCAAGTCAAGCCAAAGAAGCTAGTCT
TCTTAAGATTTTCCACTTACAAAAACCAAGTGCTTTTTTTTTGGTAAACATTTTGACATT
ATATTACCAAACCCAAGTGGTTGTTTCTTCATAGCTTCCATGTTCTTCTTTATGTGTAAT
CTTTCAATGTAATGATGCAACCAATATGGTTTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM94TF U 1
AF RR2CM94JQ C 644
BS 1 746 RR2CM94TF
BS 747 747 RR2CM94JQ
BS 748 763 RR2CM94TF
BS 764 1357 RR2CM94JQ

RD RR2CM94TF 776 0 0
GGATCACCAATCCAAAACAATCAATTACCTCTGTTCCATCTATACACCGAGATGGAAAGC
TTGGTGATTGCTATGCAAGAAGTTCATATCGATATTGATGACTCGATATCGAGCAGTAAA
GAGAGAAACACTGACCTCGTTCATGCCAAACCCATTGTTCTGATGTCTATTTTGAGTGGT
CTCCATGCCGGCTATTTCAGAATAAGCCTATCTCTCTGCAGCCAAGCTCTGCTGTGGAAG
ATAATGATTGCACCTGATTCAATGAGCATGTCGAATTTGCGTAGCAATCTCCCGTCTATG
GCATTCCATCTCCTATGGTACCTAGCACTTGCAACACAAGTGTTACTCTGTCTTTTGTAT
GCGTTGAAGTGTTTTTTCTTCTTTGACATGGTGAAAAAGGAGTTCTCGGATTATATTGGA
GTGAACTATCTTTACGCTCCATCCATCTCATGGCTTGTCTTGCTTCAGTCAGCTCCGATG
ATGGAACCACAAAGCATTTTGTATCAGACATTATTCTCGGTGTTTGCTCTTCCGGTCTTG
ACCCTCGACACAAAGCTTTACGGCCAGTGGTTCACCACAGAGAAAAGGTTTTTGTCCATG
ATGGCAAACCCGGCGAGCCAAGTATCAGTAATAGCAAACCTAGTGGCTGCAAGGGGAGCA
GCAGAGATGGGTTGGAGAGAGTGTGCTATATACTTGTTCTCGCTAGGGATGGTTCACTAT
GTGGTTATCTTTGTCACACTTTATCA*CGCCTACCAGGTGGAA
CACTCCCGACAGC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2CM94JQ 714 0 0
TGGCTGCAAGGGGAGCAGCAGAGATGGGTTGGAGAGAGTGTGCTATATACTTGTTCTCGC
TAGGGATGGTTCACTATGTGGTTATCTTTGTCACACTTTATCAACGCCTACCAGGTGGAA
ACAACTTCCCGACCAAGCTGAGGCCAGTTTTCTTCTTGTTCTTTGCTGCACCAGCCATGG
GAAGTCTAGCTTGGAACTCTATTTCAGGAACCTTTGATCCTCTAGCAAAGATGTTGTTCT
TTCTTTCACTCTTCATCTTCATGTCTCTGGTCTGTAGGCCAAATCTTTTCAAGAAGTCAA
TGAAAAGATTCAATGTCGCATGGTGGGCTTACTCGTTTCCAATCACCTTTCTTGCTTTAA
ACTCAGTTCAGTATGCACAGGAGGTGAAAGAACAGGCCGCTGCTGGATTGATGCTTATCT
TCTCATCTATCTCGGTTTTGATTTTCCTCGGTTTGATGATACTGACAGCAGCAAACAGCA
ATCGACTACTCAGACGTGATCATGTTCTCGGTTCTGTTACTAGTCCAAAAGTCAAGTCAA
GCCAAAGAAGCTAGTCTTCTTAAGATTTTCCACTTACAAAAACCAAGTGCTTTTTTTTTG
GTAAACATTTTGACATTATATTACCAAACCCAAGTGGTTGTTTCTTCATAGCTTCCATGT
TCTTCTTTATGTGTAATCTTTCAATGTAATGATGCAACCAATATGGTTTTAACC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL5834Contig1 1361 2 2 U
GGAAAAAAAAATAAAGAAAAAACAAATAAAAAAGAGGTTCCTTTTTCGCTCGCCTCTCCT
CGCTCCCGGTATCGCCTTGGATAATCAAAATCCTCCGTTCATCGTGAATTACTCTACCAC
CACTTCTCACCATCCTTGCCTTTGCTCTGAAACAACAGACCGACCATGGATGATGACCTT
CATGGAAACAACGGTGGAATGCACAACAACGGCGGAGTTCAAGATCCAAATCACTCGATG
CATGTGCAGTATGAACATCACGGTATGATGGATGAGCAGCACGCTGATGATGTGATGAAT
GAGGGACTAGTGGAGGCTGACATTCCTTCCCACCTTGGAAACGCATCTGACCATCGCGGC
GAAGTCGTAGGCCGTGGCAGTGAGAATGGAGATCAGTTGACCTTGTCCTTTCAGGGACAA
GTTTATGTTTTCGACCGTGCCTTGCCTGAGAAGGTTCAAGCTGTGCTTTTGTTACTTGGA
GGAAGGGAAGTACCACAGACAATCCCTACAACCGTAGGATCACCTCATCAGAACAATAGG
GTACTGGTAATAAAAATACTTGTTAATACCTCGAGTTTATTTGCGTGACTAATGCATGAA
ACAGGGTCTGTCTGGTACTCCTCAAAGGTTTAGTGCCCCGCAGAGGCAAGCCTCGTTGCT
CAGATTCAGGGAGAAGAGAAAAGGGAGGAATTTTGATAAGACAATTCGTTACACTGTCAG
GAAGGAGGTAGCATTGAGAATGCAGCGTAAGAAAGGTCAGTTCACATCTGCCAAGTCAAG
CAATGAGGATTCTGCATCCACTGGATCGGACTGGGGGTCAGGCCAGAGCTGGGCCTTGGA
AGGGTCTGAGTCTCAGAAGCCAGAGGCTTTATGTCGGCACTGTGGAACCAGTGAGAAGTC
AACTCCAATGATGCGACGTGGACCTGAAGGACCAAGAACACTTTGTAATGCATGCGGATT
AATGTGGGCAAACAAGGGGGCACTTAGAGACTTATCCAAAGCCCCTCCTCCTCCAACAGT
CCAGAATCTGCCTGCAAATAAAATTGATGAATCAATTCTTGAGGCTGAGCTAGCTGGTGA
CATTAGCAACTCACAGTGAGAGAAGTTGGTAAACACATTGTACGCAATTAAAAAAAGATG
TGAGTTTGGTTGAGGGTTCTTTGGGACACTCATAATCTGTTGTTGTATAATTTAGAAAGA
TCACTCATGAGAAGAGAAACAAGAAAAACATATTTGCTCAGTTTCTTCCATCTGTAAGTT
TGATTTGTTTCAGAAGTCCTTTTTTTTTTTTTATCATGTGGTAGAAACAGAAACAGTGAA
CTTGTTGTAGCTTTTTAAATTTTACTGACACCAAATAAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B714TF U 1
AF RR2B714JQ C 506
BS 1 814 RR2B714TF
BS 815 1361 RR2B714JQ

RD RR2B714TF 814 0 0
GGAAAAAAAAATAAAGAAAAAACAAATAAAAAAGAGGTTCCTTTTTCGCTCGCCTCTCCT
CGCTCCCGGTATCGCCTTGGATAATCAAAATCCTCCGTTCATCGTGAATTACTCTACCAC
CACTTCTCACCATCCTTGCCTTTGCTCTGAAACAACAGACCGACCATGGATGATGACCTT
CATGGAAACAACGGTGGAATGCACAACAACGGCGGAGTTCAAGATCCAAATCACTCGATG
CATGTGCAGTATGAACATCACGGTATGATGGATGAGCAGCACGCTGATGATGTGATGAAT
GAGGGACTAGTGGAGGCTGACATTCCTTCCCACCTTGGAAACGCATCTGACCATCGCGGC
GAAGTCGTAGGCCGTGGCAGTGAGAATGGAGATCAGTTGACCTTGTCCTTTCAGGGACAA
GTTTATGTTTTCGACCGTGCCTTGCCTGAGAAGGTTCAAGCTGTGCTTTTGTTACTTGGA
GGAAGGGAAGTACCACAGACAATCCCTACAACCGTAGGATCACCTCATCAGAACAATAGG
GTACTGGTAATAAAAATACTTGTTAATACCTCGAGTTTATTTGCGTGACTAATGCATGAA
ACAGGGTCTGTCTGGTACTCCTCAAAGGTTTAGTGCCCCGCAGAGGCAAGCCTCGTTGCT
CAGATTCAGGGAGAAGAGAAAAGGGAGGAATTTTGATAAGACAATTCGTTACACTGTCAG
GAAGGAGGTAGCATTGAGAATGCAGCGTAAGAAAGGTCAGTTCACATCTGCCAAGTCAAG
CAATGAGGATTCTGCATCCACTGGATCGGACTGG

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR2B714JQ 856 0 0
CTACAACCGTAGGATCACCTCATCAGAACAATAGGGTACTGGTAATAAAAATACTTGTTA
ATACCTCGAGTTTATTTGCGTGACTAATGCATGAAACAGGGTCTGTCTGGTACTCCTCAA
AGGTTTAGTGCCCCGCAGAGGCAAGCCTCGTTGCTCAGATTCAGGGAGAAGAGAAAAGGG
AGGAATTTTGATAAGACAATTCGTTACACTGTCAGGAAGGAGGTAGCATTGAGAATGCAG
CGTAAGAAAGGTCAGTTCACATCTGCCAAGTCAAGCAATGAGGATTCTGCATCCACTGGA
TCGGACTGGGGGTCAGGCCAGAGCTGGGCCTTGGAAGGGTCTGAGTCTCAGAAGCCAGAG
GCTTTATGTCGGCACTGTGGAACCAGTGAGAAGTCAACTCCAATGATGCGACGTGGACCT
GAAGGACCAAGAACACTTTGTAATGCATGCGGATTAATGTGGGCAAACAAGGGGGCACTT
AGAGACTTATCCAAAGCCCCTCCTCCTCCAACAGTCCAGAATCTGCCTGCAAATAAAATT
GATGAATCAATTCTTGAGGCTGAGCTAGCTGGTGACATTAGCAACTCACAGTGAGAGAAG
TTGGTAAACACATTGTACGCAATTAAAAAAAGATGTGAGTTTGGTTGAGGGTTCTTTGGG
ACACTCATAATCTGTTGTTGTATAATTTAGAAAGATCACTCATGAGAAGAGAAACAAGAA
AAACATATTTGCTCAGTTTCTTCCATCTGTAAGTTTGATTTGTTTCAGAAGTCCTTTTTT
TTTTTTTATCATGTGGTAGAAACAGAAACAGTGAACTTGTTGTAGCTTTTTAAATTTTAC
TGACACCAAATAAAAC

QA 1 856 1 856
DS 



AS 1 2

CO CL5835Contig1 583 2 22 U
CACATGCAAGAACAACAATAACAAAAATAATACGATCCACACATAAACCCTATAAGTGAA
GGCTCATCAAATGAGTACATTGGGGGGGCAAAACAAAGCAAACAAGTCAAAAAAAAAAGA
AACAATGATAAGAATGTGTCTTAAAAGTGGGTCCGATAAAGAAACTAGTAAAATCCCAGA
AGATTTAAAATTTTATTCCCAGACCAGAGATAGTAGAGAAGCAGCAATAAACTAAAAAAA
ACAGCGGTTCCAAACGGAGCAACTCGAACAGCCTTCTCATACGACTTGGTAATTCTGTGT
TATCAGCTGCGTCCTCTGCACAAACTTTGGAGTCCCACCACCACCACCTCTGAAAGGAAT
CATTCCGTTCACCTTCAAGCCACTGTATGTAGTGGTGGCTGCAAACTGAACAGAAATAGG
GAAAAACACCGACGAATCAACTGGTGGCACAACAAACTCCATTGACCCACTGCGGTGGGA
GTTGTCAATGAAAAGTATAAACCATTCAACAACAGAATTTCTTGAGTCGTACCTCCAGTC
CCCATCGCATTGTTTAACGATTGGAGCATCTCTCAAAGCAGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ36JQ U 1
AF RR2FO11JQ U 213
BS 1 219 RR2FZ36JQ
BS 220 220 RR2FO11JQ
BS 221 237 RR2FZ36JQ
BS 238 238 RR2FO11JQ
BS 239 334 RR2FZ36JQ
BS 335 335 RR2FO11JQ
BS 336 353 RR2FZ36JQ
BS 354 354 RR2FO11JQ
BS 355 414 RR2FZ36JQ
BS 415 415 RR2FO11JQ
BS 416 423 RR2FZ36JQ
BS 424 424 RR2FO11JQ
BS 425 476 RR2FZ36JQ
BS 477 477 RR2FO11JQ
BS 478 491 RR2FZ36JQ
BS 492 492 RR2FO11JQ
BS 493 499 RR2FZ36JQ
BS 500 500 RR2FO11JQ
BS 501 507 RR2FZ36JQ
BS 508 508 RR2FO11JQ
BS 509 561 RR2FZ36JQ
BS 562 583 RR2FO11JQ

RD RR2FZ36JQ 561 0 0
CACATGCAAGAACAACAATAACAAAAATAATACGATCCACACATAAACCCTATAAGTGAA
GGCTCATCAAATGAGTACATTGGGGGGGCAAAACAAAGCAAACAAGTCAAAAAAAAAAGA
AACAATGATAAGAATGTGTCTTAAAAGTGGGTCCGATAAAGAAACTAGTAAAATCCCAGA
AGATTTAAAATTTTATTCCCAGACCAGAGATAGTAGAGAGGCAGCAATAAACTAAAAGAA
ACAGCGGTTCCAAACGGAGCAACTCGAACAGCCTTCTCATACGACTTGGTAATTCTGTGT
TATCAGCTGCGTCCTCTGCACAAACTTTGGAGTCGCACCACCACCACCTCTGAGAGGAAT
CATTCCGTTCACCTTCAAGCCACTGTATGTAGTGGTGGCTGCAAACTGAACAGAGATAGG
GAAGAACACCGACGAATCAACTGGTGGCACAACAAACTCCATTGACCCACTGCGGTTGGA
GTTGTCAATGAGAAGTATAGACCATTCCACAACAGAATTTCTTGAGTCGTACCTCCAGTC
CCCATCGCATTGTTTAACGAT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2FO11JQ 371 0 0
GTAGAGAAGCAGCAATAAACTAAAAAAAACAGCGGTTCCAAACGGAGCAACTCGAACAGC
CTTCTCATACGACTTGGTAATTCTGTGTTATCAGCTGCGTCCTCTGCACAAACTTTGGAG
TCCCACCACCACCACCTCTGAAAGGAATCATTCCGTTCACCTTCAAGCCACTGTATGTAG
TGGTGGCTGCAAACTGAACAGAAATAGGGAAAAACACCGACGAATCAACTGGTGGCACAA
CAAACTCCATTGACCCACTGCGGTGGGAGTTGTCAATGAAAAGTATAAACCATTCAACAA
CAGAATTTCTTGAGTCGTACCTCCAGTCCCCATCGCATTGTTTAACGATTGGAGCATCTC
TCAAAGCAGGA

QA 1 371 1 371
DS 



AS 1 2

CO CL5836Contig1 1113 2 6 U
ATGTTCTCTGATAAGTCCTCTGATAAAGATAGTACAGGATCTCAAGGCACTTGTGAGCAG
AATATGAGCAAAGCTAGAACACAAGAGAAGAAGAAAGGCACAGTAGAGAAGAATGTGAGC
TTAAGAGTTCTCCAACAGCATTTCTCTGGGAGTCTAAAAGATGCTGCAAGAAGCATTGGT
GTTTGTCCTACTACGCTGAAACGGATATGCAGACAGCATGGGATCATGAGGTGGCCGTCT
CGTAAGATCAACAAAGTGAACAGGTCGTTAAGGAAAATACAGACGGTGCTTGACTCTGTC
CATGGTGTAGAAGGAGGACTGAGGTTTTGACTCAGCGACTGGCGTATTCGTTGCAGTTTG
GCTCTTCTAATAATGGTAACAATGCGCATGTAAGAGTTTCAGGAGGATATGGCTAAAGAT
ACCTCCCTTATGTGAGCTCTGGAAAGCTAAATCAGTCGACAATGCAATTAAGTTAGAGGA
TGATATCATCACTAACGGATCATTCATGGAGGTTAATGCTAACCGGTCCAATTCAGATTC
ATCAAATGGCTCAGGAGCAGCTATGCTCAGAAGCTCATCTCCTTCCATGGACAATAGGAA
CCAAATGAGAACCCAAAAAGGCAATAGCAGCGAGAGTGGATCATCAACGCTCACTGTAAA
GGCTACTTATAGAGAAGACACATTACGTTTCAAGTTCGAGCCATCGGTTGGGTGTCTACA
GCTCTACAGAGAAGTTGGGAAACGCTTTAGACTGCAAGATGGGTCGTTTCAACTCAAGTA
CTTGGACGATGAAGAAGAATGGGTGATGCTGGTTACAGATTCTGATCTCCAAGAGTGTTT
GGAGATTTTATATGGTATGGGAAAACACACGGTGAAGTTCCTTGTTCGTGATTTACCTGC
GCATATAGGTAGTTCTGCTGGTAGCAACGGTTACCTTGGAGCAGGTTTATGACACCTACT
ACTGCTCAGTTATGTCTTCCCTAGTGAGAGAATGTTTGTTTGTTTCTCCATGTATTAGTT
TTGCTTGTAAGAAAAGGCGTGAGGGAGAAAGGCAATTTTGGTATATTGGAGTCATGATAC
TGTATATGATAATCGTTTTATATAAACTGAGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX27TF U 1
AF RR2CX27JQ C 280
BS 1 501 RR2CX27TF
BS 502 502 RR2CX27JQ
BS 503 597 RR2CX27TF
BS 598 598 RR2CX27JQ
BS 599 614 RR2CX27TF
BS 615 1113 RR2CX27JQ

RD RR2CX27TF 614 0 0
ATGTTCTCTGATAAGTCCTCTGATAAAGATAGTACAGGATCTCAAGGCACTTGTGAGCAG
AATATGAGCAAAGCTAGAACACAAGAGAAGAAGAAAGGCACAGTAGAGAAGAATGTGAGC
TTAAGAGTTCTCCAACAGCATTTCTCTGGGAGTCTAAAAGATGCTGCAAGAAGCATTGGT
GTTTGTCCTACTACGCTGAAACGGATATGCAGACAGCATGGGATCATGAGGTGGCCGTCT
CGTAAGATCAACAAAGTGAACAGGTCGTTAAGGAAAATACAGACGGTGCTTGACTCTGTC
CATGGTGTAGAAGGAGGACTGAGGTTTTGACTCAGCGACTGGCGTATTCGTTGCAGTTTG
GCTCTTCTAATAATGGTAACAATGCGCATGTAAGAGTTTCAGGAGGATATGGCTAAAGAT
ACCTCCCTTATGTGAGCTCTGGAAAGCTAAATCAGTCGACAATGCAATTAAGTTAGAGGA
TGATATCATCACTAACGGATC*TTCATGGAGGTTAATGCTAACCGGTCCAATTCAGATTC
ATCAAATGGCTCAGGAGCAGCTATGCTCAGAAGCTCATCTCCTTCCATGGACAATAG*AA
CCAAATGAGAACCC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2CX27JQ 834 0 0
CAGACGGTGCTTGACTCTGTCCATGGTGTAGAAGGAGGACTGAGGTTT*GACTCAGCGAC
TGGCGTATTCGTTGCAGTT*GGCTCTTCTAATAATGGTAACAATGCGCATGTAAGAGTT*
CAGGAGGATATGGCTAAAGATACCTCC*TTATGTGAGCTCTGGAAAGCTAAATCAGTCGA
CAATGCAATTAAGTTAGAGGATGATATCATCACTAACGGATCATTCATGGAGGTTAATGC
TAACCGGTCCAATTCAGATTCATCAAATGGCTCAGGAGCAGCTATGCTCAGAAGCTCATC
TCCTTCCATGGACAATAGGAACCAAATGAGAACCCAAAAAGGCAATAGCAGCGAGAGTGG
ATCATCAACGCTCACTGTAAAGGCTACTTATAGAGAAGACACATTACGTTTCAAGTTCGA
GCCATCGGTTGGGTGTCTACAGCTCTACAGAGAAGTTGGGAAACGCTTTAGACTGCAAGA
TGGGTCGTTTCAACTCAAGTACTTGGACGATGAAGAAGAATGGGTGATGCTGGTTACAGA
TTCTGATCTCCAAGAGTGTTTGGAGATTTTATATGGTATGGGAAAACACACGGTGAAGTT
CCTTGTTCGTGATTTACCTGCGCATATAGGTAGTTCTGCTGGTAGCAACGGTTACCTTGG
AGCAGGTTTATGACACCTACTACTGCTCAGTTATGTCTTCCCTAGTGAGAGAATGTTTGT
TTGTTTCTCCATGTATTAGTTTTGCTTGTAAGAAAAGGCGTGAGGGAGAAAGGCAATTTT
GGTATATTGGAGTCATGATACTGTATATGATAATCGTTTTATATAAACTGAGTA

QA 1 834 1 834
DS 



AS 1 2

CO CL5837Contig1 798 2 4 U
GCAGCAAGGATAGAAAGAACGTGGATCATTTAGGAGACATGACAAACTCTCATAGCAGAC
GAGAGCCTGGGAAGTTCGCCGTTCTTCATCTTCGCTTCGACAAGGACATGGCTGCGCATT
CGGCGTGTGATTTTGGTGGAGGCAAAGCGGAGAAACTTGCGTTGGCAAAGTATAGGCAAA
TGATATGGCAAGGAAGAGTGTTGAACTCTCAGTTCACAGATGAAGAGCTGAGAAGTCAAG
GACGGTGTCCGCTAACACCCGAAGAGATGGGACTTCTTCTGGCTGCTTTCGGTTTCGACA
ACAACACTCGTCTCTATCTCGCGTCCCACAAGGTGTATGGAGGAGAAGCTAGAATCTCAG
CACTAAGACAAGTATTCCCAAGAATGGAAGACAAAAGAAGCCTTGCTTCCTCCGAGGAAC
GAGCTCGAATCAAAGGCAAAGCTTCTTTATTAGCTGCACTTGATTACTACGTAAGCATGC
ACAGCGACATTTTCATCTCTGCATCGCCTGGAAACATGCACAACGCTCTGGTGGGTCATC
GAACGTTCGAGAATCTCAAGACTATTAAACCAAACATGGCTTTGATAGGACAGCTTTTCC
TGAACAAAAGCATCACGTGGGTCGATTTTCAACAGGCGCTTGGGGAAAGACACGTGAACA
GACTAGGGCAGATCCGGTTAAGGAGACCGAAACAGTCGATTTATACTTATCCGGCTCCTG
ACTGTATGTGTCATGTCTGATTGATTACAGAACAAGTCCTTTGGATTGTTTTTTGATAAT
AAAAGCTTTGGTTCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV16TF U 1
AF RR2BV16JQ C 36
BS 1 680 RR2BV16TF
BS 681 681 RR2BV16JQ
BS 682 745 RR2BV16TF
BS 746 798 RR2BV16JQ

RD RR2BV16TF 752 0 0
GCAGCAAGGATAGAAAGAACGTGGATCATTTAGGAGACATGACAAACTCTCATAGCAGAC
GAGAGCCTGGGAAGTTCGCCGTTCTTCATCTTCGCTTCGACAAGGACATGGCTGCGCATT
CGGCGTGTGATTTTGGTGGAGGCAAAGCGGAGAAACTTGCGTTGGCAAAGTATAGGCAAA
TGATATGGCAAGGAAGAGTGTTGAACTCTCAGTTCACAGATGAAGAGCTGAGAAGTCAAG
GACGGTGTCCGCTAACACCCGAAGAGATGGGACTTCTTCTGGCTGCTTTCGGTTTCGACA
ACAACACTCGTCTCTATCTCGCGTCCCACAAGGTGTATGGAGGAGAAGCTAGAATCTCAG
CACTAAGACAAGTATTCCCAAGAATGGAAGACAAAAGAAGCCTTGCTTCCTCCGAGGAAC
GAGCTCGAATCAAAGGCAAAGCTTCTTTATTAGCTGCACTTGATTACTACGTAAGCATGC
ACAGCGACATTTTCATCTCTGCATCGCCTGGAAACATGCACAACGCTCTGGTGGGTCATC
GAACGTTCGAGAATCTCAAGACTATTAAACCAAACATGGCTTTGATAGGACAGCTTTTCC
TGAACAAAAGCATCACGTGGGTCGATTTTCAACAGGCGCTTGGGGAAAGACACGTGAACA
GACTAGGGCAGATCCGGTTA*GGAGACCGAAACAGTCGATTTATACTTATCCGGCTCCTG
ACTGTATGTGTCATGTCTGATTGAT
ACAGAAC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2BV16JQ 763 0 0
GACATGACAAACTCTCATAGCAGACGAGAGCCTGGGAAGTTCGCCGTTCTTCATCTTCGC
TTCGACAAGGACATGGCTGCGCATTCGGCGTGTGATTTTGGTGGAGGCAAAGCGGAGAAA
CTTGCGTTGGCAAAGTATAGGCAAATGATATGGCAAGGAAGAGTGTTGAACTCTCAGTTC
ACAGATGAAGAGCTGAGAAGTCAAGGACGGTGTCCGCTAACACCCGAAGAGATGGGACTT
CTTCTGGCTGCTTTCGGTTTCGACAACAACACTCGTCTCTATCTCGCGTCCCACAAGGTG
TATGGAGGAGAAGCTAGAATCTCAGCACTAAGACAAGTATTCCCAAGAATGGAAGACAAA
AGAAGCCTTGCTTCCTCCGAGGAACGAGCTCGAATCAAAGGCAAAGCTTCTTTATTAGCT
GCACTTGATTACTACGTAAGCATGCACAGCGACATTTTCATCTTTGCATCGCCTGGAAAC
ATGCACAACGCTCTGGTGGGTCATCGAACGTTCGAGAATCTCAAGACTATTAAACCAAAC
ATGGCTTTGATAGGACAGCTTTTCCTGAACAAAAGCATCACGTGGGTCGATTTTCAACAG
GCGCTTGGGGAAGGACACGTGAACAGACTAGGGCAGATCCGGTTAAGGAGACCGAAACAG
TCGATTTATACTTATCCGGCTCCTGACTGTATGTGTCATGTCTGATTGATTACAGAACAA
GTCCTTTGGATTGTTTTTTGATAATAAAAGCTTTGGTTCTTTG

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL5838Contig1 1089 2 2 U
GGACAGAGCAACACATTGAGCCTGAAGAGAAGAAAAAGAAAAGAGAGAGAGAGATGAGGA
GTGACGTTGCACGGCTCAGGTGTGGGAAGATGATTCCATTGCTTGGAATGGGAACTTATT
GTCCTCAAAAAGATCGAGAGAGCACCATCTTAGCCGTCCATCAAGCCATCAAGATAGGGT
ATAGACATTTCGACAACGCAAAGATATATGGATCAGAAGAAGCTCTAGGAACTGCATTAG
GTCAAGCTATCTCCTATGGAACTGTCCAAAGAGAAGACATCTTTGTGACTTCAAAGTTAT
GGTCTAGTGATCACCATGACTCTATCTCTGCCCTCACACAAACTCTCAAGACAATGGGGC
TAGAGTATCTAGATAACTACTTGGTGCATTGGCCAATAAAGCTTAAACCAGGAGTGAGTG
AGCCCATCCCAAAGGAAGAGGAGTTTGAGAAAGATGTAGGAATTGAAGAAACTTGGCAAG
GCATGGAGAGATGCTTAGAGATGGGTTTGTGTAGATCCATCGGTGTTAGCAACTTCTCTT
CTAAAAAGATCTATGATCTCCTCGATTTTGCTTCTGTCTATCCTTCCGTTAACCAGGTGG
AGATGCATCCATTGTGGAGACAAAGCAAGCTAAGGAAAGTGTGTAACGAGAACAAGATCC
ATGTAAGTGGATATTCACCACTTGGTGGGCCAGGAAATTGTTGGGGATCAACGGCTGTGA
TTGAACATCCTGTCATCAAATTTATTGCTCTCAAGCATAGTGTCACTCCAGCTCAGGTGG
CTTTAAGGTGGGGAATGTCAAAGGGGGCAAGTGTGATAGTGAAAAGTTTTAATGGAGAAA
GAATGAGAGAAAACAAGAGAGCCTTGGATATAAAATTGGATGATCAGGACTTATCATTCA
TTGACCAATTGGAGGAGTGGAAGATCATGAGGGGAGATTTCCTTGTTAATCAAACTACAA
GCCCTTACAAATCGATCCAACAACTTTGGGACGATGAGATATAATTGATTAGGGTTTCAC
ATAACTTCATCCAAAATGTAATTTCATCTTCTGTTATGTTGCTTATGATCATGGTTTTCT
CATTTGGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC10TF U 1
AF RR2DC10JQ C 553
BS 1 619 RR2DC10TF
BS 620 1089 RR2DC10JQ

RD RR2DC10TF 619 0 0
GGACAGAGCAACACATTGAGCCTGAAGAGAAGAAAAAGAAAAGAGAGAGAGAGATGAGGA
GTGACGTTGCACGGCTCAGGTGTGGGAAGATGATTCCATTGCTTGGAATGGGAACTTATT
GTCCTCAAAAAGATCGAGAGAGCACCATCTTAGCCGTCCATCAAGCCATCAAGATAGGGT
ATAGACATTTCGACAACGCAAAGATATATGGATCAGAAGAAGCTCTAGGAACTGCATTAG
GTCAAGCTATCTCCTATGGAACTGTCCAAAGAGAAGACATCTTTGTGACTTCAAAGTTAT
GGTCTAGTGATCACCATGACTCTATCTCTGCCCTCACACAAACTCTCAAGACAATGGGGC
TAGAGTATCTAGATAACTACTTGGTGCATTGGCCAATAAAGCTTAAACCAGGAGTGAGTG
AGCCCATCCCAAAGGAAGAGGAGTTTGAGAAAGATGTAGGAATTGAAGAAACTTGGCAAG
GCATGGAGAGATGCTTAGAGATGGGTTTGTGTAGATCCATCGGTGTTAGCAACTTCTCTT
CTAAAAAGATCTATGATCTCCTCGATTTTGCTTCTGTCTATCCTTCCGTTAACCAGGTGG
AGATGCATCCATTGTGGAG

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2DC10JQ 537 0 0
ATGATCTCCTCGATTTTGCTTCTGTCTATCCTTCCGTTAACCAGGTGGAGATGCATCCAT
TGTGGAGACAAAGCAAGCTAAGGAAAGTGTGTAACGAGAACAAGATCCATGTAAGTGGAT
ATTCACCACTTGGTGGGCCAGGAAATTGTTGGGGATCAACGGCTGTGATTGAACATCCTG
TCATCAAATTTATTGCTCTCAAGCATAGTGTCACTCCAGCTCAGGTGGCTTTAAGGTGGG
GAATGTCAAAGGGGGCAAGTGTGATAGTGAAAAGTTTTAATGGAGAAAGAATGAGAGAAA
ACAAGAGAGCCTTGGATATAAAATTGGATGATCAGGACTTATCATTCATTGACCAATTGG
AGGAGTGGAAGATCATGAGGGGAGATTTCCTTGTTAATCAAACTACAAGCCCTTACAAAT
CGATCCAACAACTTTGGGACGATGAGATATAATTGATTAGGGTTTCACATAACTTCATCC
AAAATGTAATTTCATCTTCTGTTATGTTGCTTATGATCATGGTTTTCTCATTTGGTA

QA 1 537 1 537
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5840Contig1 869 2 8 U
ACTTGCAGATTTGTTCATTAACTAAGAACAAAGACGTCTAAAAGATTCCAGCTTTGCTGA
TAATATTCATTACATAGGCTCTTAAAAGGATGATACATGGTTTGCCAATTCAAAGCAGTG
TGGTTGATCAGGTAACAGTCTGTTCATGCAATGCAAGTGCCCATCGCCTCATTGTAGTTT
CAGAGCTTCACTTCCACATCAACACCAGCAGGAAGATCCAGCTGCATCAAGGAGTCGATG
GTCTGAGCAGTCGGGTAGAGAATATCAATCATCCGCTGGTGAGTCCGGATCTCGAAATGG
AACCTTGCATCCTTGTGGACGTGGGGAGACTTGAGAACACAGTAAACACGCTTCTTGGTT
GGCAAGGGAACAGGACCCATCGTCTTGGCATTGGTGTTCCTAGCAGCGTCAAGTATCTGC
TTGCATGAGTCCTCAATGAGAGGCACCCAGTATGATCTAAGCTTTATCCTAATCTTTTGC
TTTGGCGCCATCTTATCTGCGTCAACACTAATGGAGGAAGAGCTTGAAACCTCGGAGAAG
TCCTCAGAGGCGGGTTCGTCGAGAGTTTCTGGAGTAAGGGTCTCGGGAGCTGCGAAGACC
TTCTTCGTAAACGAGATGGAGGGTTTGTTGAGGACGCAGGAGCCAATGCCGCCATGAGTA
GAAGAAGATGGAACCAGAGATACTTTCTGTCTGGTAGAAGACGAAGAGGAGGGACTGACG
AAAGAGGGTAATATGAACGAAGTTACAGAAGAAACCGCCATTGAATTTCCAGATAAAGAA
TCCTTCTTCTTCCTCCTCTTAACGCTTCTTCACAAGGATGTGGTTTGGTTTTCTCTTCCT
CCAGCAGCTTCGTCGTTTCGAGGGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D092JQ U 1
AF RR2C396TF C 370
BS 1 526 RR2D092JQ
BS 527 527 RR2C396TF
BS 528 575 RR2D092JQ
BS 576 576 RR2C396TF
BS 577 634 RR2D092JQ
BS 635 635 RR2C396TF
BS 636 672 RR2D092JQ
BS 673 869 RR2C396TF

RD RR2D092JQ 672 0 0
ACTTGCAGATTTGTTCATTAACTAAGAACAAAGACGTCTAAAAGATTCCAGCTTTGCTGA
TAATATTCATTACATAGGCTCTTAAAAGGATGATACATGGTTTGCCAATTCAAAGCAGTG
TGGTTGATCAGGTAACAGTCTGTTCATGCAATGCAAGTGCCCATCGCCTCATTGTAGTTT
CAGAGCTTCACTTCCACATCAACACCAGCAGGAAGATCCAGCTGCATCAAGGAGTCGATG
GTCTGAGCAGTCGGGTAGAGAATATCAATCATCCGCTGGTGAGTCCGGATCTCGAAATGG
AACCTTGCATCCTTGTGGACGTGGGGAGACTTGAGAACACAGTAAACACGCTTCTTGGTT
GGCAAGGGAACAGGACCCATCGTCTTGGCATTGGTGTTCCTAGCAGCGTCAAGTATCTGC
TTGCATGAGTCCTCAATGAGAGGCACCCAGTATGATCTAAGCTTTATCCTAATCTTTTGC
TTTGGCGCCATCTTATCTGCGTCAACACTAATGGAGGAAGAGCTTGGAACCTCGGAGAAG
TCCTCAGAGGCGGGTTCGTCGAGAGTTTCTGGAGTTAGGGTCTCGGGAGCTGCGAAGACC
TTCTTCGTAAACGAGATGGAGGGTTTGTTGAGGATGCAGGAGCCAATGCCGCCATGAGTA
GAAGAAGATGGA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2C396TF 500 0 0
ACAGGACCCATCGTCTTGGCATTGGTGTTCCTAGCAGCGTCGAGTATCTGCTTGCATGAG
TCCTCAATGAGAGGCACCCAGTATGATCTAAGCTTTATCCTAATCTTTTGCTTTGGCGCC
ATCTTATCTGCGTCAACACTAATGGAGGAAGAGCTTGAAACCTCGGAGAAGTCCTCAGAG
GCGGGTTCGTCGAGAGTTTCTGGAGTAAGGGTCTCGGGAGCTGCGAAGACCTTCTTCGTA
AACGAGATGGAGGGTTTGTTGAGGACGGAGGAGCCAATGCC*CCATGAGTAGAAGAAGAT
GGAACCAGAGATACTTTCTGTCTGGTAGAAGACGAAGAGGAGGGACTGACGAAAGAGGGT
AATATGAACGAAGTTACAGAAGAAACCGCCATTGAATTTCCAGATAAAGAATCCTTCTTC
TTCCTCCTCTTAACGCTTCTTCACAAGGATGTGGTTTGGTTTTCTCTTCCTCCAGCAGCT
TCGTCGTTTCGAGGGTTCCC

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 2

CO CL5841Contig1 782 2 2 U
TTTTTGCTTGAATAGACCCGGTTCCATAAAACCTGTTTGGTGTTCAGTTTATTATAATTC
TTCTTTTTGTTTTGAATTATAAGATTATATTTTCCTCTTCGTTGAATATGAATCAGCCAC
ATCTACCTCTTTCTTTTCGTCTCCATATCACCGATCATATCATGTTTGCTTCTCCATCCT
TGTTATTTCATTATTGTTTCTCTTTCCTTACCTTCTTCTAATACGTGGGTTATTCACGGT
TGGAGTAGAGGAGATGTAATGTTCATCACGCACCATTAGCGCCACCACCACTGCTGATGA
TGCTTTGGAGCCGTCTATCACAACGGAGGAGTAGCCCATGCCATCACCACCTCGTTATGT
GCCGTCACGTCCATGACGATGGTGTTACTATTGGATTCATAACTCATGAGATGGAGAAGA
TGAAACCAGAGTCACCGTTTCAATCAGACCAGCCGTGATCATCAACCTTGAGTCACTGGA
GAGGACCATACACTCTTGGGGCTGAGATCCGCCGCTATGATTCCAAGCCGTGAAGGGCAT
ATAGAGGTTTATGCTAGCGGCACATTTTGTGGGGATTGCGGGGTATAAAGATGGAGTCTT
GTACTAGCGTTGCATATATATATATATATATGAGCTGAATGCGGAGTGCAGAGATTATTC
ATGTACTATCAACACATTAGTTGTTTGTGTGGTGTATTAGACACTGTGTTTTTTTCATAC
TAGATGTAGGTCTATATAGTCGTAGTGCTATGTACTGAGTCAATGTAGTTTGCATGTATA
AC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2GE31TF U 1
AF RR2GE31JQ C 220
BS 1 533 RR2GE31TF
BS 534 782 RR2GE31JQ

RD RR2GE31TF 533 0 0
TTTTTGCTTGAATAGACCCGGTTCCATAAAACCTGTTTGGTGTTCAGTTTATTATAATTC
TTCTTTTTGTTTTGAATTATAAGATTATATTTTCCTCTTCGTTGAATATGAATCAGCCAC
ATCTACCTCTTTCTTTTCGTCTCCATATCACCGATCATATCATGTTTGCTTCTCCATCCT
TGTTATTTCATTATTGTTTCTCTTTCCTTACCTTCTTCTAATACGTGGGTTATTCACGGT
TGGAGTAGAGGAGATGTAATGTTCATCACGCACCATTAGCGCCACCACCACTGCTGATGA
TGCTTTGGAGCCGTCTATCACAACGGAGGAGTAGCCCATGCCATCACCACCTCGTTATGT
GCCGTCACGTCCATGACGATGGTGTTACTATTGGATTCATAACTCATGAGATGGAGAAGA
TGAAACCAGAGTCACCGTTTCAATCAGACCAGCCGTGATCATCAACCTTGAGTCACTGGA
GAGGACCATACACTCTTGGGGCTGAGATCCGCCGCTATGATTCCAAGCCGTGA

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2GE31JQ 563 0 0
AATACGTGGGTTATTCACGGTTGGAGTAGAGGAGATGTAATGTTCATCACGCACCATTAG
CGCCACCACCACTGCTGATGATGCTTTGGAGCCGTCTATCACAACGGAGGAGTAGCCCAT
GCCATCACCACCTCGTTATGTGCCGTCACGTCCATGACGATGGTGTTATTATTGGATTCA
TAACTCATGAGATGGAGAAGATGAAACCAGAGTCACCGTTTCAATCAGACCAGCCGTGAT
CATCAACCTTGAGTCACTGGAGAGGACCATACACTCTTGGGGCTGAGATCCGCCGCTATG
ATTCCAAGCCGTGAAGGGCATATAGAGGTTTATGCTAGCGGCACATTTTGTGGGGATTGC
GGGGTATAAAGATGGAGTCTTGTACTAGCGTTGCATATATATATATATATATGAGCTGAA
TGCGGAGTGCAGAGATTATTCATGTACTATCAACACATTAGTTGTTTGTGTGGTGTATTA
GACACTGTGTTTTTTTCATACTAGATGTAGGTCTATATAGTCGTAGTGCTATGTACTGAG
TCAATGTAGTTTGCATGTATAAC

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 2

CO CL5842Contig1 327 2 2 U
GGAGAGAAGAAATGACCTCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGC
AAAGAAAAGGCAGAAGTTTTGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCAATTAACTTGA
GAAGCAAACAAAAGGTTCCTGATCATGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTA
GAAGAGAAGCAATTATTGGTTTTGGTGTCAGTATTACCCATTGTTGTGACATTAGTCTAA
AGCTACTAATACTACGATTCAGGATTTGTATGTATCTTAGTGTATATGCTTTACAAATTA
TATGCATGAGCATCACTATTCCACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CS32JQ C 1
AF RR2CS32TF U 17
BS 1 16 RR2CS32JQ
BS 17 327 RR2CS32TF

RD RR2CS32JQ 327 0 0
GGAGAGAAGAAATGACCTCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGC
AAAGAAAAGGCAGAAGTTTTGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCAATTAACTTGA
GAAGCAAACAAAAGGTTCCTGATCATGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTA
GAAGAGAAGCAATTATTGGTTTTGGTGTCAGTATTACCCATTGTTGTGACATTAGTCTAA
AGCTACTAATACTACGATTCAGGATTTGTATGTATCTTAGTGTATATGCTTTACAAATTA
TATGCATGAGCATCACTATTCCACTTC

QA 1 327 1 327
DS 

RD RR2CS32TF 311 0 0
CTCCTTAGGATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAAAGAAAAGGCAGAAG
TTTTGTGAGCAGTAGCTTAACCAAAGCAGATGCAATTAACTTGAGAAGCAAACAAAAGGT
TCCTGATCATGAGTTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGAAGAGAAGCAATTAT
TGGTTTTGGTGTCAGTATTACCCATTGTTGTGACATTAGTCTAAAGCTACTAATACTACG
ATTCAGGATTTGTATGTATCTTAGTGTATATGCTTTACAAATTATATGCATGAGCATCAC
TATTCCACTTC

QA 1 311 1 311
DS 



AS 1 2

CO CL5843Contig1 983 2 2 U
TTTGCACCCCATCACTCGTTATGTGATGAACTACCTCCGAGCCGCGTGTAGGTCGAGGGA
GACGCTGGAGCAAGTGTTTGAGGAAAGTAATAACGGTGTGCCGTGTAAAGATTCGACGCT
GTTGACTGTGCAGATGTCTTGGATCATGGAGCTTTTAGAGAGTAACCTGGAGGTGAAATC
CAAAGTGTATAAAGATCCAGCCTTGTGCTATGTGTTTCTGATGAACAACGGGAGGTACAT
TGTTCAGAAGGTGAAGGACGGGGAGCTAGGGTTGCTCTTAGGAGAGGACTGGATCCGGAA
ACACAATACTAAAGTTAGACAGTATCATTCGAGTTATCAGAGGAGCGCGTGGAATAAGAT
GCTGGGGTTGCTGAAGGTGGACAACACAGCTGCGGGAATGAACGGGTTAGGCAAAACCAT
GAAGGAGAAGCTGAAGCAGTTTAATAGTCAGTTCGATGAGACGTGTAAAGTGCATTCGAC
TTGGGTTGTGTTCGACGAGCAGCTCAGAGAGGAGCTGAGAATCTCGCTGGCGAGGCTGCT
GTTGCCGGCGTACGGGAACTTCATAGGGAGGTTTCAGAACCTTGGAGATTTAGGGAAAGG
GAAAAACGCGGACAAGTATATCAAGTATGGAGTTGAGAACATAGAGACGCGTATCAACGA
GCTGTTTAAAGGGTCTACGGGTGCAAGAAAATGAAGGTGAGTTTGTACAATGTTTGTAAC
GAACCATCTGCTAATGACCAATTGCGAAGCCTTGCATGGTGGGATTTGTAAAATGTATTG
TTTTAGACTATTAGATTAGCTTTATTGTGTTGTGTTATGATGTTGTATTGTACTAAATCA
GAGGTTTTCTATTGTAAAAAGAAGAAACAAGAATGACGTGTATCTCACTCAGTATTGATC
GCTTTCGACATAATTTTCTCACAAATTATACTCCGTATCTAAATAACGATGTTTAGCTGT
ATTTCACACATAGTCCCATACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G323TF U 1
AF RR2G323JQ C 366
BS 1 675 RR2G323TF
BS 676 983 RR2G323JQ

RD RR2G323TF 675 0 0
TTTGCACCCCATCACTCGTTATGTGATGAACTACCTCCGAGCCGCGTGTAGGTCGAGGGA
GACGCTGGAGCAAGTGTTTGAGGAAAGTAATAACGGTGTGCCGTGTAAAGATTCGACGCT
GTTGACTGTGCAGATGTCTTGGATCATGGAGCTTTTAGAGAGTAACCTGGAGGTGAAATC
CAAAGTGTATAAAGATCCAGCCTTGTGCTATGTGTTTCTGATGAACAACGGGAGGTACAT
TGTTCAGAAGGTGAAGGACGGGGAGCTAGGGTTGCTCTTAGGAGAGGACTGGATCCGGAA
ACACAATACTAAAGTTAGACAGTATCATTCGAGTTATCAGAGGAGCGCGTGGAATAAGAT
GCTGGGGTTGCTGAAGGTGGACAACACAGCTGCGGGAATGAACGGGTTAGGCAAAACCAT
GAAGGAGAAGCTGAAGCAGTTTAATAGTCAGTTCGATGAGACGTGTAAAGTGCATTCGAC
TTGGGTTGTGTTCGACGAGCAGCTCAGAGAGGAGCTGAGAATCTCGCTGGCGAGGCTGCT
GTTGCCGGCGTACGGGAACTTCATAGGGAGGTTTCAGAACCTTGGAGATTTAGGGAAAGG
GAAAAACGCGGACAAGTATATCAAGTATGGAGTTGAGAACATAGAGACGCGTATCAACGA
GCTGTTTAAAGGGTC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2G323JQ 618 0 0
GGTTGCTGAAGGTGGACAACACAGCTGCGGGAATGAACGGGTTAGGCAAAACCATGAAGG
AGAAGCTGAAGCAGTTTAATAGTCAGTTCGATGAGACGTGTAAAGTGCATTCGACTTGGG
TTGTGTTCGACGAGCAGCTCAGAGAGGAGCTGAGAATCTCGCTGGCGAGGCTGCTGTTGC
CGGCGTACGGGAACTTCATAGGGAGGTTTCAGAACCTTGGAGATTTAGGGAAAGGGAAAA
ACGCGGACAAGTATATCAAGTATGGAGTTGAGAACATAGAGACGCGTATCAACGAGCTGT
TTAAAGGGTCTACGGGTGCAAGAAAATGAAGGTGAGTTTGTACAATGTTTGTAACGAACC
ATCTGCTAATGACCAATTGCGAAGCCTTGCATGGTGGGATTTGTAAAATGTATTGTTTTA
GACTATTAGATTAGCTTTATTGTGTTGTGTTATGATGTTGTATTGTACTAAATCAGAGGT
TTTCTATTGTAAAAAGAAGAAACAAGAATGACGTGTATCTCACTCAGTATTGATCGCTTT
CGACATAATTTTCTCACAAATTATACTCCGTATCTAAATAACGATGTTTAGCTGTATTTC
ACACATAGTCCCATACTT

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL5844Contig1 350 2 1 U
TTTTTAGCTTCGCTTCGCAGCTGCAATTCGCACGACGTCAAGATGCCGTCGCACAAGTCG
TTTATGATCAAGAAGAGGCTGGCCAAGAAGCAGAGGCAGAACAGGCCTATTCCTCACTGG
ATTCGTCTTCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGCGCAGGCACTGGCGTAGA
ACCAAGCTCGGATTCTAAGTGGAACACTTCCTCCAAAAGAGTTTATCTTTTCTGTTTGTT
TTAGCATTTAAGTTTTTATGGATTTACGGTGTGACATTTTCATTTCTCTGTATGACTTTT
GTCTCGTGATGTTTGTTTCCAACTTTCTATCTATAAAAAGCACTTCGTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E722JQ C 1
AF RR2E722TF U 1
BS 1 350 RR2E722TF

RD RR2E722JQ 350 0 0
TTTTTAGCTTCGCTTCGCAGCTGCAATTCGCACGACGTCAAGATGCCGTCGCACAAGTCG
TTTATGATCAAGAAGAGGCTGGCCAAGAAGCAGAGGCAGAACAGGCCTATTCCTCACTGG
ATTCGTCTTCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGCGCAGGCACTGGCGTAGA
ACCAAGCTCGGATTCTAAGTGGAACACTTCCTCCAAAAGAGTTTATCTTTTCTGTTTGTT
TTAGCATTTAAGTTTTTATGGATTTACGGTGTGACATTTTCATTTCTCTGTATGACTTTT
GTCTCGTGATGTTTGTTTCCAACTTTCTATCTATAAAAAGCACTTCGTAG

QA 1 350 1 350
DS 

RD RR2E722TF 350 0 0
TTTTTAGCTTCGCTTCGCAGCTGCAATTCGCACGACGTCAAGATGCCGTCGCACAAGTCG
TTTATGATCAAGAAGAGGCTGGCCAAGAAGCAGAGGCAGAACAGGCCTATTCCTCACTGG
ATTCGTCTTCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGCGCAGGCACTGGCGTAGA
ACCAAGCTCGGATTCTAAGTGGAACACTTCCTCCAAAAGAGTTTATCTTTTCTGTTTGTT
TTAGCATTTAAGTTTTTATGGATTTACGGTGTGACATTTTCATTTCTCTGTATGACTTTT
GTCTCGTGATGTTTGTTTCCAACTTTCTATCTATAAAAAGCACTTCGTAG

QA 1 350 1 350
DS 



AS 1 2

CO CL5845Contig1 1111 2 10 U
CTTGGTTTGAGCGACAAGCAGTATCTCAGCAACGTTAAACGCGAGGCTGGCGATGATCGT
GTCGGAGAACTAGGGTTGAGCAAGATGGCAGCTAGACAATGGGGAAAGGCAAAGTTCTTG
CCTAGTTCAAGTTTCATGCCTGCTGCTGCAGATTTTCAGGCGTCATCGTGCCACTGGGGC
CCAGTTTCTGCGGCCAGCAATCTCCGCATAAGCCAATTAAGCGGTGGTGCGTTTCAGAAC
GCGAATCCGCTTTTACTTGGCGGATCAGTTCCGTTAACAAATCATTCTTCTTTCCGTCCT
GCCTTGAACTCGTCGGCTGATGCACGTGTGGCTTCCTCAGGATCACTACCTCAGCTCACT
ATCTTCTATGGTGGAACTGTTAGCGTCTTTCGTGATATATCTCCTGATAAGTCTCAAGCT
GTTATGTTATGTGCCCGGAACGGTTTGAAAGGAGAAACTGGAGAGAGCAGCTTGAAGAAA
CCGGTTCGAGAAACTGAAAGAGTCTATGGAAAACAAATCTATAACGCTACTGCTGCTGCA
GCATCATCAAGCTCTGCCAGTTACGCTGAAAGTTTCTCTAGGTGTAGAGACAGACCCGTT
GGTACGACTAATGCAATGTGTATGATTGAATCATTCAACGCAGCAGGTCCTGGAAATATG
ATTCCTTCAGTTCCTCAAGCTCTTAAAGCATCGTTGGCTCGGTTCTTGGAGAAGCGCAAA
GAGAGGCTCATGAGTGCACTGCCGTACAAGAAGATGCTTCTTGATTTGTCGACCGGAGAA
TCCAGTGGAATGAATTACTCTTCTGCTTCGCATACCTAAAACCTTTCTTCTTCTTCCTTT
TCTAAAACCACTCTCAGGTTTTATTACGATGGTAACTTGTATAATAATCAATAGATTATT
ATTATTAGCTACCATTATTATGCTACGAGCAGGAGAAGGCGTCAGGCGTCTATATATTTG
AGCATTGTTGTAATGGTTTAGTCTGTTATCGTAGGATCACTATTATTTCAAACACTAACA
TATATTTTATATGTTTTCATGTCTGTTAAGAATAAAAACCACCATTGTCATTATTGTTTT
ATTATCTAGAGAAAGGCAGTATTTGTTATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV47TF U 1
AF RR2BV47JQ C 408
BS 1 646 RR2BV47TF
BS 647 647 RR2BV47JQ
BS 648 652 RR2BV47TF
BS 653 653 RR2BV47JQ
BS 654 677 RR2BV47TF
BS 678 678 RR2BV47JQ
BS 679 683 RR2BV47TF
BS 684 684 RR2BV47JQ
BS 685 734 RR2BV47TF
BS 735 1111 RR2BV47JQ

RD RR2BV47TF 734 0 0
CTTGGTTTGAGCGACAAGCAGTATCTCAGCAACGTTAAACGCGAGGCTGGCGATGATCGT
GTCGGAGAACTAGGGTTGAGCAAGATGGCAGCTAGACAATGGGGAAAGGCAAAGTTCTTG
CCTAGTTCAAGTTTCATGCCTGCTGCTGCAGATTTTCAGGCGTCATCGTGCCACTGGGGC
CCAGTTTCTGCGGCCAGCAATCTCCGCATAAGCCAATTAAGCGGTGGTGCGTTTCAGAAC
GCGAATCCGCTTTTACTTGGCGGATCAGTTCCGTTAACAAATCATTCTTCTTTCCGTCCT
GCCTTGAACTCGTCGGCTGATGCACGTGTGGCTTCCTCAGGATCACTACCTCAGCTCACT
ATCTTCTATGGTGGAACTGTTAGCGTCTTTCGTGATATATCTCCTGATAAGTCTCAAGCT
GTTATGTTATGTGCCCGGAACGGTTTGAAAGGAGAAACTGGAGAGAGCAGCTTGAAGAAA
CCGGTTCGAGAAACTGAAAGAGTCTATGGAAAACAAATCTATAACGCTACTGCTGCTGCA
GCATCATCAAGCTCTGCCAGTTACGCTGAAAGTTTCTCTAGGTGTAGAGACAGACCCGTT
GGTACGACTAATGCAATGTGTATGATTGAATCATTCAACGCAGCAG*TCCTG*AAATATG
ATTCCTTCAGTTCCTCA*GCTCT*AAAGCATCGTTGGCTCGGTTCTTGGAGAAGCGCAAA
GAGAGGCTCATGAG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2BV47JQ 704 0 0
TAAGTCTCAAGCTGTTATGTTATGTGCCCGGAACGGTTTGAAAGGAGAAACTGGAGAGAG
CAGCTTGAAGAAACCGGTTCGAGAAACTGAAAGAGTCTATGGAAAACAAATCTATAACGC
TACTGCTGCTGCAGCATCATCAAGCTCTGCCAGTTACGCTGAAAGTTTCTCTAGGTGTAG
AGACAGACCCGTTGGTACGACTAATGCAATGTGTATGATTGAATCATTCAACGCAGCAGG
TCCTGGAAATATGATTCCTTCAGTTCCTCAAGCTCTTAAAGCATCGTTGGCTCGGTTCTT
GGAGAAGCGCAAAGAGAGGCTCATGAGTGCACTGCCGTACAAGAAGATGCTTCTTGATTT
GTCGACCGGAGAATCCAGTGGAATGAATTACTCTTCTGCTTCGCATACCTAAAACCTTTC
TTCTTCTTCCTTTTCTAAAACCACTCTCAGGTTTTATTACGATGGTAACTTGTATAATAA
TCAATAGATTATTATTATTAGCTACCATTATTATGCTACGAGCAGGAGAAGGCGTCAGGC
GTCTATATATTTGAGCATTGTTGTAATGGTTTAGTCTGTTATCGTAGGATCACTATTATT
TCAAACACTAACATATATTTTATATGTTTTCATGTCTGTTAAGAATAAAAACCACCATTG
TCATTATTGTTTTATTATCTAGAGAAAGGCAGTATTTGTTATTC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5847Contig1 1009 2 4 U
GGGATTCAAAACGGTAGAGACAAACAAAGGTAGTAGTAGAAGAAGAAGAAGACGAAGTGA
AGAAGAGTGAAAAAAAAAATCTAAGCTTTAGCTTCTTTTTTTTCTTTTATATCTGATCAT
CAATCATCGATAAATTTTACTTTTTTTGTCAAGTAAAAAAAGCTCATCAATCGAAGAAGA
GAAATCGTCAAATGCTTCTTCACTTTGGTTCCCTTTCTTCATCAGAAAACTCGAGGAGGT
AGATCAGTTCTTTGATGGGATGGGACACCAAATCACTAAGTGTTATGATACCATCAACTA
CTAGTAGTACGTGCAATCTTCAGAGTAAAAATACCAATGGCTTCTTCTGGACTGGGAAAC
GGAGTAGGCAGTTCGAGATCTTCCAAAGGTGTAAAAGCCTCTTCTAGCTCAGTCGATTGG
TTGACCAGAGATTTGGTTGACATGAGGATAAGGGACAAGGTCGAGACTGACGATGACAGG
GATAGTGAACCAGATATTATTGATGGCGCTGGCACTGAACCTGGGCATGTGATTAGAACC
ACACTCCGTGGACGAAATGGCCAATCAAGACAGACAGTCAGTTACATATCAGAACATGTA
GTTGGTACTGGCTCCTTTGGCATGGTTTTCCAAGCCAAATGTAGGGAAACTGGGGAGATT
GTTGCAATCAAGAAGGTTCTACAAGACAAGCGTTACAAGAACAGGGAGCTACAGATCATG
CAGATGCTAGACCACCCCAATGTCGTTGCTTTAAAGCATAGCTTCTACACGAGAGCAGAT
AATGAAGAGGTTTATTTGAATCTTGTCCTTGAGTTTGTGCCTGAGACCGTCAATCGGGCT
GCGAGAAGTTACACTAGGACGAACCAGCTCATGCCTTTGATATACGTTAAACTCTACACC
TATCAGATTTGCAGGGCGCTTGCTTACATCCATAATAGCTTCGGTCTTTGTCACCGCGAT
ATTAAGCCTCAAAACCTGCTAGTGAACCCACATACGCATCAGCTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D596TF U 1
AF RR2CT58TF U 314
BS 1 470 RR2D596TF
BS 471 471 RR2CT58TF
BS 472 640 RR2D596TF
BS 641 1009 RR2CT58TF

RD RR2D596TF 640 0 0
GGGATTCAAAACGGTAGAGACAAACAAAGGTAGTAGTAGAAGAAGAAGAAGACGAAGTGA
AGAAGAGTGAAAAAAAAAATCTAAGCTTTAGCTTCTTTTTTTTCTTTTATATCTGATCAT
CAATCATCGATAAATTTTACTTTTTTTGTCAAGTAAAAAAAGCTCATCAATCGAAGAAGA
GAAATCGTCAAATGCTTCTTCACTTTGGTTCCCTTTCTTCATCAGAAAACTCGAGGAGGT
AGATCAGTTCTTTGATGGGATGGGACACCAAATCACTAAGTGTTATGATACCATCAACTA
CTAGTAGTACGTGCAATCTTCAGAGTAAAAATACCAATGGCTTCTTCTGGACTGGGAAAC
GGAGTAGGCAGTTCGAGATCTTCCAAAGGTGTAAAAGCCTCTTCTAGCTCAGTCGATTGG
TTGACCAGAGATTTGGTTGACATGAGGATAAGGGACAAGGTCGAGACTGATGATGACAGG
GATAGTGAACCAGATATTATTGATGGCGCTGGCACTGAACCTGGGCATGTGATTAGAACC
ACACTCCGTGGACGAAATGGCCAATCAAGACAGACAGTCAGTTACATATCAGAACATGTA
GTTGGTACTGGCTCCTTTGGCATGGTTTTCCAAGCCAAAT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2CT58TF 696 0 0
G
AATCTTCAGAGTAAAAATACCAATGGCTTCTTCTGGACTGGGAAACGGAGTAGGCAGTTC
GAGATCTTCCAAAGGTGTAAAAGCCTCTTCTAGTTCTGTCGATTGGTTGACCAGAGATTT
GGTTGACATGAGGATAAGGGACAAGGTCGAGACTGACGATGAGAGGGATAGTGAACCAGA
TATTATTGATGGCGCTGGCACTGAACCTGGGCATGTGATTAGAACCACACTCCGTGGACG
AAATGGCCAATCAAGACAGACAGTCAGTTACATATCAGAACATGTAGTTGGTACTGGCTC
CTTTGGCATGGTTTTCCAAGCCAAATGTAGGGAAACTGGGGAGATTGTTGCAATCAAGAA
GGTTCTACAAGACAAGCGTTACAAGAACAGGGAGCTACAGATCATGCAGATGCTAGACCA
CCCCAATGTCGTTGCTTTAAAGCATAGCTTCTACACGAGAGCAGATAATGAAGAGGTTTA
TTTGAATCTTGTCCTTGAGTTTGTGCCTGAGACCGTCAATCGGGCTGCGAGAAGTTACAC
TAGGACGAACCAGCTCATGCCTTTGATATACGTTAAACTCTACACCTATCAGATTTGCAG
GGCGCTTGCTTACATCCATAATAGCTTCGGTCTTTGTCACCGCGATATTAAGCCTCAAAA
CCTGCTAGTGAACCCACATACGCATCAGCTAAAAA

QA 2 696 2 696
DS 



AS 1 2

CO CL5848Contig1 980 2 8 U
GGCTGCTTCTTCCTCCGCTTGAGTTGTAGCTTCAGATTTGCGAAAAATGAGAAGACAGGG
AAACTTTGCGGACTCGCCTGCAAGTGGATACGGAGCCGGACAGATACAGAATGCACATTC
TGATTTCCAAGGTCAGCTAGAGGCGTTCACGCCTGAGAGAGACCAACCACCGCAAACAGA
GGGTCAGTGGAGATGGGAAAGAGATGGTCCCCCGAATATGTCAAGGCCTATGTCAACTGC
TGTTTACAATGAAAGTCAAGGCGTCGATTCGTCAAGGACGTATTACCGCGGCCAAATGGA
CCCAAAATCAGGAATGTAGACACAAGGCAGCGGTCCAAGAGCTCAACCCCAGCACCACGA
TAACCCGAAGCCTGGTTATGAGAATAACCGTGGGGTACAGACCTTTGAAGGCCTTGAGCA
GAAGTTCATGGATGATATAACAAGACTAGCAAAAGATCAAATGGGAGCAGAGGATGCAGA
GATTGCCAGACATCGAGAGAAAATAAACACCATTAATGCCCGGTACGAAGAACAGTTAGC
TGCAGTGCGATCACGCCACGCAGGTAAAAGAGAAGAGATCATGAGGAAAGAATCACAAGC
TAGGCAGCAACAATACAAGCAGCAAACACCTGGGATGATGGATCAGTACCATCCAAACTC
GGCCAATCTAAGACCATCTGGTCATCCCCAGGGTTACATTGGCAATGCTCAAGATCCAGC
TGATGCGCCACCATCCAGAGCCTATGGATCAGATCGGTTTGAAGCATATGGAGAGAGACC
TAGGTTTCAGGGCGGAGATAGGGATCATGGATTCGAGTCTAGGGGTCAGTATCCTGGTGG
GACAGTCTCACGGTTTTACTGATGTAATATTTACTTAACAAATCGTGTTACTTTTGTTTC
TTGTTGTGTATTTTTTGGCCTATAGATCAGTTAAGCTTTCCTGACTTTTAAAATTGAATA
CAATGGCCTTGTGTTCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E626TF U 1
AF RR2E626JQ C 278
BS 1 665 RR2E626TF
BS 666 666 RR2E626JQ
BS 667 670 RR2E626TF
BS 671 671 RR2E626JQ
BS 672 711 RR2E626TF
BS 712 712 RR2E626JQ
BS 713 728 RR2E626TF
BS 729 980 RR2E626JQ

RD RR2E626TF 730 0 0
GGCTGCTTCTTCCTCCGCTTGAGTTGTAGCTTCAGATTTGCGAAAAATGAGAAGACAGGG
AAACTTTGCGGACTCGCCTGCAAGTGGATACGGAGCCGGACAGATACAGAATGCACATTC
TGATTTCCAAGGTCAGCTAGAGGCGTTCACGCCTGAGAGAGACCAACCACCGCAAACAGA
GGGTCAGTGGAGATGGGAAAGAGATGGTCCCCCGAATATGTCAAGGCCTATGTCAACTGC
TGTTTACAATGAAAGTCAAGGCGTCGATTCGTCAAGGACGTATTACCGCGGCCAAATGGA
CCCAAAATCAGGAATGTAGACACAAGGCAGCGGTCCAAGAGCTCAACCCCAGCACCACGA
TAACCCGAAGCCTGGTTATGAGAATAACCGTGGGGTACAGACCTTTGAAGGCCTTGAGCA
GAAGTTCATGGATGATATAACAAGACTAGCAAAAGATCAAATGGGAGCAGAGGATGCAGA
GATTGCCAGACATCGAGAGAAAATAAACACCATTAATGCCCGGTACGAAGAACAGTTAGC
TGCAGTGCGATCACGCCACGCAGGTAAAAGAGAAGAGATCATGAGGAAAGAATCACAAGC
TAGGCAGCAACAATACAAGCAGCAAACACCTGGGATGATGGATCAGTACCATCCAAACTC
GGCCA*TCTA*GACCATCTGGTCATCCCCAGGGTTACATTGGCAATGCTCA*GATCCAGC
TGATGCGC
AC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2E626JQ 703 0 0
ACGTATTACCGCGGCCAAATGGACCCAAAATCAGGAATGTAGACACAAGGCAGCGGTCCA
AGAGCTCAACCCCAGCACCACGATAACCCGAAGCCTGGTTATGAGAATAACCGTGGGGTA
CAGACCTTTGAAGGCCTTGAGCAGAAGTTCATGGATGATATAACAAGACTAGCAAAAGAT
CAAATGGGAGCAGAGGATGCAGAGATTGCCAGACATCGAGAGAAAATAAACACCATTAAT
GCCCGGTACGAAGAACAGTTAGCTGCAGTGCGATCACGCCACGCAGGTAAAAGAGAAGAG
ATCATGAGGAAAGAATCACAAGCTAGGCAGCAACAATACAAGCAGCAAACACCTGGGATG
ATGGATCAGTACCATCCAAACTCGGCCAATCTAAGACCATCTGGTCATCCCCAGGGTTAC
ATTGGCAATGCTCAAGATCCAGCTGATGCGCCACCATCCAGAGCCTATGGATCAGATCGG
TTTGAAGCATATGGAGAGAGACCTAGGTTTCAGGGCGGAGATAGGGATCATGGATTCGAG
TCTAGGGGTCAGTATCCTGGTGGGACAGTCTCACGGTTTTACTGATGTAATATTTACTTA
ACAAATCGTGTTACTTTTGTTTCTTGTTGTGTATTTTTTGGCCTATAGATCAGTTAAGCT
TTCCTGACTTTTAAAATTGAATACAATGGCCTTGTGTTCTTAT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL5849Contig1 845 2 2 U
GCACTCCGTGCTTGTGAACTCGACCAAGAGGGAGGAGGAGAGGCAGAGGATCGAGTCTCA
CCAGAGGAAAGACGGTCTGGTCGCGAAGAGTAGGTTGATGGGAGCCGAGGAGAGAGGGAT
TGTGGGGTTTAATGATGATTACGACGCGGGGAACCCCAAGCCTAATCTTAGGAAGATTGT
GGAAGGTGTGCCGATTATTCTTGTCCCCAGTGCGTTTCAGACGCTGATTACTATTTACAA
TGTGAAGGAGTTTCTAGAGGATGGGGTTTATATACCGAACGATGCCAAGGCTAAGGAGAT
GAAAGGGGTGAAGCCGGATTGCATTACGGTTCAGAAGAAGTTTAGTAGGGATAGGGAGAG
GGTTGTGACTGCTTATGAGGTTAGGGATAAGCCTTCTGCTTTGAAGCCTGATGACTGGGA
CCGTGTTGTTGCGGTTTTCGTGTTGGGGAAGGATTGGCAGTTCAAGGATTGGCCTTTCAA
GGACCATGTTGAGATTTTCAATAAGATAATTGGGTTCTTCTTGCGGTTTGAGGATGATAG
TATTGAATCAGCCAAGACGGTGAAGCAGTGGAATGTGAAGATTATCTCGATTAGTAAGAA
TAAGCGGCATCAAGACCGGGCAGCAGCATTAGAAGTCTGGGAAAAACTAGAGGAGTTTGT
TCGGTCTCGGTCACATTCTTAGCATCTAGCAGCTATAGAAATTCACTTTATATGTATTAT
CGTCTTTCATTCTTGTTACTTGATTATCTTTATTACTTTCTGTAACATTAGCGAGATAAA
CACAGTGAACATGTGATGCAGTGTGATTGTTTTCTATTAATGGTGAGTTAAATTGTTCAT
CAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2GE13TF U 1
AF RR2GE13JQ C 42
BS 1 645 RR2GE13TF
BS 646 845 RR2GE13JQ

RD RR2GE13TF 647 0 0
GCACTCCGTGCTTGTGAACTCGACCAAGAGGGAGGAGGAGAGGCAGAGGATCGAGTCTCA
CCAGAGGAAAGACGGTCTGGTCGCGAAGAGTAGGTTGATGGGAGCCGAGGAGAGAGGGAT
TGTGGGGTTTAATGATGATTACGACGCGGGGAACCCCAAGCCTAATCTTAGGAAGATTGT
GGAAGGTGTGCCGATTATTCTTGTCCCCAGTGCGTTTCAGACGCTGATTACTATTTACAA
TGTGAAGGAGTTTCTAGAGGATGGGGTTTATATACCGAACGATGCCAAGGCTAAGGAGAT
GAAAGGGGTGAAGCCGGATTGCATTACGGTTCAGAAGAAGTTTAGTAGGGATAGGGAGAG
GGTTGTGACTGCTTATGAGGTTAGGGATAAGCCTTCTGCTTTGAAGCCTGATGACTGGGA
CCGTGTTGTTGCGGTTTTCGTGTTGGGGAAGGATTGGCAGTTCAAGGATTGGCCTTTCAA
GGACCATGTTGAGATTTTCAATAAGATAATTGGGTTCTTCTTGCGGTTTGAGGATGATAG
TATTGAATCAGCCAAGACGGTGAAGCAGTGGAATGTGAAGATTATCTCGATTAGTAAGAA
TAAGCGGCATCAAGACCGGGCAGCAGCATTAGAAGTCTGGGAAAA
CT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2GE13JQ 804 0 0
GGCAGAGGATCGAGTCTCACCAGAGGAAAGACGGTCTGGTCGCGAAGAGTAGGTTGATGG
GAGCCGAGGAGAGAGGGATTGTGGGGTTTAATGATGATTACGACGCGGGGAACCCCAAGC
CTAATCTTAGGAAGATTGTGGAAGGTGTGCCGATTATTCTTGTCCCCAGTGCGTTTCAGA
CGCTGATTACTATTTACAATGTGAAGGAGTTTCTAGAGGATGGGGTTTATATACCGAACG
ATGCCAAGGCTAAGGAGATGAAAGGGGTGAAGCCGGATTGCATTACGGTTCAGAAGAAGT
TTAGTAGGGATAGGGAGAGGGTTGTGACTGCTTATGAGGTTAGGGATAAGCCTTCTGCTT
TGAAGCCTGATGACTGGGACCGTGTTGTTGCGGTTTTCGTGTTGGGGAAGGATTGGCAGT
TCAAGGATTGGCCTTTCAAGGACCATGTTGAGATTTTCAATAAGATAATTGGGTTCTTCT
TGCGGTTTGAGGATGATAGTATTGAATCAGCCAAGACGGTGAAGCAGTGGAATGTGAAGA
TTATCTCGATTAGTAAGAATAAGCGGCATCAAGACCGGGCAGCAGCATTAGAAGTCTGGG
AAAAACTAGAGGAGTTTGTTCGGTCTCGGTCACATTCTTAGCATCTAGCAGCTATAGAAA
TTCACTTTATATGTATTATCGTCTTTCATTCTTGTTACTTGATTATCTTTATTACTTTCT
GTAACATTAGCGAGATAAACACAGTGAACATGTGATGCAGTGTGATTGTTTTCTATTAAT
GGTGAGTTAAATTGTTCATCAGCT

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL5850Contig1 1073 2 4 U
GGGACCCTGAGTTCTGAGATTGTGTTTCATCTTCTTCCTTAAAATCTGAAAACCTACCAG
TTACATATTCTTAAAGTCCTTATTAAATCCATCACCCACGATCTACGATCTTCCCTCATG
CAAGGAGGTGGAACTGCATAAAAAAACAGGTGGAACTGCGACTATAAAAATTGATTGGAG
AGCAGTTTCATTTAACTTCGATATGTGACAGTGACAACGATTGCGGCTGTATCAACATCG
ATGAAGGAGTTCCCGTGATCCGAATGGAGTACAAACTGTCTCAGGTGTTGCAGTTCTCTT
GGTCATCATTAAAAAAGCCAGGAGATTGCAAAAATTCCCTTTAGGAGAAGGATCTATGAG
ACGTGGTCAGGTCCTGGAGGTTAATGGGGAGAAAGCAATTGGCCAGGTAGAGGAGTCCCA
AAGGTTAACATAACAAAAACTGCATTGTTGATTGTTCTCAATCATTCACCATGGTACAAC
ATCTACCATTACCCTTAATAAAGTAGCTGTTTCTGTTGAAGGCGTTGAAGCCAAACTATG
GCAGGTACCAGAGACGCTTTCAGAAGAAGCACTCTCTAAGATGAGCACACCAGCAAAGAG
TGAATCACCAATCATCACACCTAACGAACTAACTGAAGCTGATGGGTTCGTCTTTGGATT
CCCAACAAGGTACGGCATGATGGCTGCTCAGTTCAAAGTCTTCTTGACGCTACCGGTGGA
CTCTGGAGAACTCAGTCACTCGCTGGTAAACCAGCTGGATCTTCTACAGCACTGGCTCTC
AAGGTGGTAGCCAAGAAACCACTGCGTAAGTTCCCATGAAACCATGAGAGTCATGTATGA
ACCGTAGTTTGTCAATATTAAAGTAGATGTTTTTTTCTCAAGTCATGTTCACGCATACGT
GAGGTCAATAAGTACACAAAACTATAGCTCGTTATGTCTCCGTTTAAACTATAGATTATG
ACAATTTTTTTAGCTTCTGCGAAACCATGAACTCATATCAAACATAGCAGACACCGTGGT
TAATGACATTTCCAGTCCACTAAAAGATCAATCTACTCATGTCTACCCCAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A873TF U 1
AF RR2A873JQ C 268
BS 1 341 RR2A873TF
BS 342 342 RR2A873JQ
BS 343 802 RR2A873TF
BS 803 1073 RR2A873JQ

RD RR2A873TF 802 0 0
GGGACCCTGAGTTCTGAGATTGTGTTTCATCTTCTTCCTTAAAATCTGAAAACCTACCAG
TTACATATTCTTAAAGTCCTTATTAAATCCATCACCCACGATCTACGATCTTCCCTCATG
CAAGGAGGTGGAACTGCATAAAAAAACAGGTGGAACTGCGACTATAAAAATTGATTGGAG
AGCAGTTTCATTTAACTTCGATATGTGACAGTGACAACGATTGCGGCTGTATCAACATCG
ATGAAGGAGTTCCCGTGATCCGAATGGAGTACAAACTGTCTCAGGTGTTGCAGTTCTCTT
GGTCATCATTAAAAAAGCCAGGAGATTGCAAAAATTCCCTT*AGGAGAAGGATCTATGAG
ACGTGGTCAGGTCCTGGAGGTTAATGGGGAGAAAGCAATTGGCCAGGTAGAGGAGTCCCA
AAGGTTAACATAACAAAAACTGCATTGTTGATTGTTCTCAATCATTCACCATGGTACAAC
ATCTACCATTACCCTTAATAAAGTAGCTGTTTCTGTTGAAGGCGTTGAAGCCAAACTATG
GCAGGTACCAGAGACGCTTTCAGAAGAAGCACTCTCTAAGATGAGCACACCAGCAAAGAG
TGAATCACCAATCATCACACCTAACGAACTAACTGAAGCTGATGGGTTCGTCTTTGGATT
CCCAACAAGGTACGGCATGATGGCTGCTCAGTTCAAAGTCTTCTTGACGCTACCGGTGGA
CTCTGGAGAACTCAGTCACTCGCTGGTAAACCAGCTGGATCTTCTACAGCACTGGCTCTC
AAGGTGGTAGCCAAGAAACCAC

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2A873JQ 806 0 0
AGTACAAACTGTCTCAGGTGTTGCAGTTCTCTTGGTCATCATTAAAAAAGCCAGGAGATT
GCAAAAATTCCCTTTAGGAGAAGGATCTATGAGACGTGGTCAGGTCCTGGAGGTTAATGG
GGAGAAAGCAATTGGCCAGGTAGAGGAGTCCCAAAGGTTAACATAACAAAAACTGCATTG
TTGATTGTTCTCAATCATTCACCATGGTACAACATCTACCATTACCCTTAATAAAGTAGC
TGTTTCTGTTGAAGGCGTTGAAGCCAAACTATGGCAGGTACCAGAGACGCTTTCAGAAGA
AGCACTCTCTAAGATGAGCACACCAGCAAAGAGTGAATCACCAATCATCACACCTAACGA
ACTAACTGAAGCTGATGGGTTCGTCTTTGGATTCCCAACAAGGTACGGCATGATGGCTGC
TCAGTTCAAAGTCTTCTTGACGCTACCGGTGGACTCTGGAGAACTCAGTCACTCGCTGGT
AAACCAGCTGGATCTTCTACAGCACTGGCTCTCAAGGTGGTAGCCAAGAAACCACTGCGT
AAGTTCCCATGAAACCATGAGAGTCATGTATGAACCGTAGTTTGTCAATATTAAAGTAGA
TGTTTTTTTCTCAAGTCATGTTCACGCATACGTGAGGTCAATAAGTACACAAAACTATAG
CTCGTTATGTCTCCGTTTAAACTATAGATTATGACAATTTTTTTAGCTTCTGCGAAACCA
TGAACTCATATCAAACATAGCAGACACCGTGGTTAATGACATTTCCAGTCCACTAAAAGA
TCAATCTACTCATGTCTACCCCAAAA

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL5851Contig1 602 2 1 U
GCGAAGATGAGTTTTCAAGAAAAGCAAATTTGTCATCTCCACAGTCTCGACAAGGTGGGA
CTGAGACAGATGTGGCTGGACAAGTTAAGACAGCGAGGATTCCTGTTCGGCTGCATGTTC
GAAGTGTGAATAAAGATTTCGAGAATCTTGAAGATGTACCTGAGATCGATACATGGGATG
AGATCTCGTACTTGAATCGCCCTGTTGAGTTCCTCAGAGAAGAAGGGAAATGCTTTACTT
TACGGGACGCTATTGAAAGTCTCCTCCCGGAGTATAGTGGAGACAGAGCTCAAACGAGTG
GAGAAGAGGAAGCAGATGGGTCGCAGGAGACGAGGGGAGAAGTCAAACTGGTAAGGATCC
AAGGGATAGAAATGAAACTAGAGATACCGTTTTCGTGGGTGGTAAATAACTTGATGAACC
CAGAATTCTATCTCCACATCTCTGTTCTTGTGAAAGCTCCTCAAAGGTAGAAAAACTAGC
AGGACGCTGCATCTACACTCCATCTGTGAATCGATCAAATTGCTTTCTCGTTTTTTTCTC
AGAAGCCTAAAGAATCAACTTGTTTTATATGCAACCACTACTACTACTATGATATACATT
TG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2GY30JQ C 1
AF RR2GY30TF U 1
BS 1 602 RR2GY30TF

RD RR2GY30JQ 602 0 0
GCGAAGATGAGTTTTCAAGAAAAGCAAATTTGTCATCTCCACAGTCTCGACAAGGTGGGA
CTGAGACAGATGTGGCTGGACAAGTTAAGACAGCGAGGATTCCTGTTCGGCTGCATGTTC
GAAGTGTGAATAAAGATTTCGAGAATCTTGAAGATGTACCTGAGATCGATACATGGGATG
AGATCTCGTACTTGAATCGCCCTGTTGAGTTCCTCAGAGAAGAAGGGAAATGCTTTACTT
TACGGGACGCTATTGAAAGTCTCCTCCCGGAGTATAGTGGAGACAGAGCTCAAACGAGTG
GAGAAGAGGAAGCAGATGGGTCGCAGGAGACGAGGGGAGAAGTCAAACTGGTAAGGATCC
AAGGGATAGAAATGAAACTAGAGATACCGTTTTCGTGGGTGGTAAATAACTTGATGAACC
CAGAATTCTATCTCCACATCTCTGTTCTTGTGAAAGCTCCTCAAAGGTAGAAAAACTAGC
AGGACGCTGCATCTACACTCCATCTGTGAATCGATCAAATTGCTTTCTCGTTTTTTTTTC
AGAAGCCTAAAGAATCAACTTGTTTTATATGCAACCACTACTACTACTATGATATACATT
TG

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2GY30TF 602 0 0
GCGAAGATGAGTTTTCAAGAAAAGCAAATTTGTCATCTCCACAGTCTCGACAAGGTGGGA
CTGAGACAGATGTGGCTGGACAAGTTAAGACAGCGAGGATTCCTGTTCGGCTGCATGTTC
GAAGTGTGAATAAAGATTTCGAGAATCTTGAAGATGTACCTGAGATCGATACATGGGATG
AGATCTCGTACTTGAATCGCCCTGTTGAGTTCCTCAGAGAAGAAGGGAAATGCTTTACTT
TACGGGACGCTATTGAAAGTCTCCTCCCGGAGTATAGTGGAGACAGAGCTCAAACGAGTG
GAGAAGAGGAAGCAGATGGGTCGCAGGAGACGAGGGGAGAAGTCAAACTGGTAAGGATCC
AAGGGATAGAAATGAAACTAGAGATACCGTTTTCGTGGGTGGTAAATAACTTGATGAACC
CAGAATTCTATCTCCACATCTCTGTTCTTGTGAAAGCTCCTCAAAGGTAGAAAAACTAGC
AGGACGCTGCATCTACACTCCATCTGTGAATCGATCAAATTGCTTTCTCGTTTTTTTCTC
AGAAGCCTAAAGAATCAACTTGTTTTATATGCAACCACTACTACTACTATGATATACATT
TG

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL5852Contig1 768 2 2 U
CCACGGTTAAACTTTTGCATAAATTCAAAAAGAATTACAGGTTACAGAGTTCTGTCTGTA
AATAAACCCAAGTTCTAGAGAACACAAAAACTTTAACTCTCCTAAGAGCTCTTGTTGACA
TGATCGTACATTACCTTACGCAAATACCTACGGCAATCCTTATCACCAACATACCTAAAA
ACTTCAAGTTTTGTAGTGAACCTGTTTATCTCTGACACCAAAACCATCTGTTACGCTCAA
AGGACAAAGCACAATAACTCACGAAATGGCCTTCGCAATCCTTGATGAAACTTCAGATAG
CTCAAGAAAGAAATTGCTTGTAGAACCTGCCCCAATCTCATCTGCTCAAACCGAGAATGA
CATTTACTCCAAGAATATATTTGTGTATAAGCCAAGAGACTCCTTTGACTTCGTGAGGCT
TTAGAGCCGCCGTGACTCCGAACTCTCTTCAATAGAGAGGAAAGTGGATCTCAGTTGTAT
GCAATGGAAGTGAAGTACACATCAACCATTAGATTACGTGGAGGAGAGCCAGATCCATTT
GCTGTGCCAAAGAGACAGAGAAGCAATTAAAAATCAAAGAAATAAAAAAGTTTTACATTT
TTGCAAAAAAGAAAAAGCTTAGAAACTGAGATAACAGTGCTGCATCCCAGAGCTGCAAAG
GATCCAACAGTGAGAATAAGTCTTGTTGAGATTGAGGCAGCCATACAAACCAACTGAAGA
AACCCCTACTGCTCATCGGTCAGAGAAGTGGCGATGATTGACGGCGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2GH42JQB U 1
AF RR2H318JQ U 1
BS 1 764 RR2GH42JQB
BS 765 768 RR2H318JQ

RD RR2GH42JQB 764 0 0
CCACGGTTAAACTTTTGCATAAATTCAAAAAGAATTACAGGTTACAGAGTTCTGTCTGTA
AATAAACCCAAGTTCTAGAGAACACAAAAACTTTAACTCTCCTAAGAGCTCTTGTTGACA
TGATCGTACATTACCTTACGCAAATACCTACGGCAATCCTTATCACCAACATACCTAAAA
ACTTCAAGTTTTGTAGTGAACCTGTTTATCTCTGACACCAAAACCATCTGTTACGCTCAA
AGGACAAAGCACAATAACTCACGAAATGGCCTTCGCAATCCTTGATGAAACTTCAGATAG
CTCAAGAAAGAAATTGCTTGTAGAACCTGCCCCAATCTCATCTGCTCAAACCGAGAATGA
CATTTACTCCAAGAATATATTTGTGTATAAGCCAAGAGACTCCTTTGACTTCGTGAGGCT
TTAGAGCCGCCGTGACTCCGAACTCTCTTCAATAGAGAGGAAAGTGGATCTCAGTTGTAT
GCAATGGAAGTGAAGTACACATCAACCATTAGATTACGTGGAGGAGAGCCAGATCCATTT
GCTGTGCCAAAGAGACAGAGAAGCAATTAAAAATCAAAGAAATAAAAAAGTTTTACATTT
TTGCAAAAAAGAAAAAGCTTAGAAACTGAGATAACAGTGCTGCATCCCAGAGCTGCAAAG
GATCCAACAGTGAGAATAAGTCTTGTTGAGATTGAGGCAGCCATACAAACCAACTGAAGA
AACCCCTACTGCTCATCGGTCAGAGAAGTGGCGATGATTGACGG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2H318JQ 768 0 0
CCACGGTTAAACTTTTGCATAAATTCAAAAAGAATTACAGGTTACAGAGTTCTGTCTGTA
AATAAACCCAAGTTCTAGAGAACACAAAAACTTTAACTCTCCTAAGAGCTCTTGTTGACA
TGATCGTACATTACCTTACGCAAATACCTACGGCAATCCTTATCACCAACATACCTAAGA
ACTTCAAGTTTTGTAGTGAACCTGTTTATCTCTGACACCAAAACCATCTGTTACGCTCAA
AGGACAAAGCACAATAACTCACGAAATGGCCTTCGCAATCCTTGATGAAACTTCAGATAG
CTCAAGAAAGAAATTGCTTGTAGAACCTGCCCCAATCTCATCTGCTCAAACCGAGAATGA
CATTTACTCCAAGAATATATTTGTGTATAAGCCAAGAGACTCCTTTGACTTCGTGAGGCT
TTAGAGCCGCCGTGACTCCGAACTCTCTTCAATAGAGAGGAAAGTGGATCTCAGTTGTAT
GCAATGGAAGTGAAGTACACATCAACCATTAGATTACGTGGAGGAGAGCCAGATCCATTT
GCTGTGCCAAAGAGACAGAGAAGCAATTAAAAATCAAAGAAATAAAAAAGTTTTACATTT
TTGCAAAAAAGAAAAAGCTTAGAAACTGAGATAACAGTGCTGCATCCCAGAGCTGCAAAG
GATCCAACAGTGAGAATAAGTCTTGTTGAGATTGAGGCAGCCATACAAACCAACTGAAGA
AACCCCTACTGCTCATCGGTCAGAGAAGTGGCGATGATTGACGGCGAA

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL5853Contig1 738 2 3 U
TAAAGACCAGAAACGTCAAGTAACTCTCGGTTCTTACGAAAAAGTAGAGGGACAGACAAG
AGTGAGTGAATCTCGGCAACACAACAAAGGGGTAGGAGCAAAACCTAACTCGAAAAGAAA
AGAGACTTATTCTATGTTTTTTTTTGGTTGAATGAAAAAAGCAATTCAAGAAGACATTGA
TTTCTTCTTCTCTTCTTCGAGTCGCTGAAGCTCGGCCAGCCTTTCTTCCCAAGCTCGGTC
CCTTGCGACTTTAGCCATCTTGCGTTCCACTTCCTTGATTCTCTTCTTCCTCTTCGCCTC
TTGCACCAGCGCTTGCCTCTTCTTTTTCTCAGACAGTATGAAAGCACGGCGCTGCCCTAT
GCGCTTCTTAGCATTCCTTCTTTTGACACTACCCTTGTTGGGATTGTTTGACACAATTGG
CTCGCCAGGTGTATACTGAACATATGCATAAGGCCCTGGAGGTTTAAGTTTGAATCTTTT
CTTCTTGGGATGACTCATGGGCCGTCTCTTCGGGAGCCGAGTATCGGTTAAGCTCAAGCT
ATGAAAATGATTTGCCATCGGAATCCATGGCAACCTCGATCCACCGGAGAAGGAGGACCA
TACCTCGTGTTTCGAAGCCGGGATCGCCGGCGGCGTAGAGGAGTAGCTAGCGGCGACACG
CGAAGCTAGGGTTCTCGACAGTGGTCGGAGAATCGATCTAATCGCACCGAACCCCATTTC
ACCAAAAGCATTAGCTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS96JQ U 2
AF RR2DS96TF C 1
BS 1 1 RR2DS96TF
BS 2 599 RR2DS96JQ
BS 600 738 RR2DS96TF

RD RR2DS96JQ 598 0 0
AAAGACCAGAAACGTCAAGTAACTCTCGGTTCTTACGAAAAAGTAGAGGGACAGACAAGA
GTGAGTGAATCTCGGCAACACAACAAAGGGGTAGGAGCAAAACCTAACTCGAAAAGAAAA
GAGACTTATTCTATGTTTTTTTTTGGTTGAATGAAAAAAGCAATTCAAGAAGACATTGAT
TTCTTCTTCTCTTCTTCGAGTCGCTGAAGCTCGGCCAGCCTTTCTTCCCAAGCTCGGTCC
CTTGCGACTTTAGCCATCTTGCGTTCCACTTCCTTGATTCTCTTCTTCCTCTTCGCCTCT
TGCACCAGCGCTTGCCTCTTCTTTTTCTCAGACAGTATGAAAGCACGGCGCTGCCCTATG
CGCTTCTTAGCATTCCTTCTTTTGACACTACCCTTGTTGGGATTGTTTGACACAATTGGC
TCGCCAGGTGTATACTGAACATATGCATAAGGCCCTGGAGGTTTAAGTTTGAATCTTTTC
TTCTTGGGATGACTCATGGGCCGTCTCTTCGGGAGCCGAGTATCGGTTAAGCTCAAGCTA
TGAAAATGATTTGCCATCGGAATCCATGGCAACCTCGATCCACCGGAGAAGGAGGACC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2DS96TF 738 0 0
TAAAGACCAGAAACGTCAAGTAACTCTCGGTTCTTACGAAAAAGTAGAGGGACAGACAAG
AGTGAGTGAATCTCGGCAACACAACAAAGGGGTAGGAGCAAAACCTAACTCGAAAAGAAA
AGAGACTTATTCTATGTTTTTTTTTGGTTGAATGAAAAAAGCAATTCAAGAAGACATTGA
TTTCTTCTTCTCTTCTTCGAGTCGCTGAAGCTCGGCCAGCCTTTCTTCCCAAGCTCGGTC
CCTTGCGACTTTAGCCATCTTGCGTTCCACTTCCTTGATTCTCTTCTTCCTCTTCGCCTC
TTGCACCAGCGCTTGCCTCTTCTTTTTCTCAGACAGTATGAAAGCACGGCGCTGCCCTAT
GCGCTTCTTAGCATTCCTTCTTTTGACACTACCCTTGTTGGGATTGTTTGACACAATTGG
CTCGCCAGGTGTATACTGAACATATGCATAAGGCCCTGGAGGTTTAAGTTTGAATCTTTT
CTTCTTGGGATGACTCATGGGCCGTCTCTTCGGGAGCCGAGTATCGGTTAAGCTCAAGCT
ATGAAAATGATTTGCCATCGGAATCCATGGCAACCTCGATCCACCGGAGAAGGAGGACCA
TACCTCGTGTTTCGAAGCCGGGATCGCCGGCGGCGTAGAGGAGTAGCTAGCGGCGACACG
CGAAGCTAGGGTTCTCGACAGTGGTCGGAGAATCGATCTAATCGCACCGAACCCCATTTC
ACCAAAAGCATTAGCTCC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL5854Contig1 792 2 11 U
GTTGTGATCTGATCGAAACTTTCTTTAGAAACATAACTTCCAAACCTTGAGTTTGATTTC
AGGTTGTAAAACTTATCTCTCCTTGTTAGTGTCTTATCTGGTTTTCCTTGGAATTGATAG
TTTTCCATTGAAATTTCACTTGAACAAAAAACATAAGTGCTTTCGTCTTAGAAATGGCTA
TGACTAACAGAAAAAAATTATGAGGAAGATTTGTAAAGACATGTTTTTAGAGAGGGCTTA
ATAAAAAAACACTTATCTGCTAGGCTGCCTTGCTAATGGATTCCCAGTTTCAACTTGTTT
CAAAGCATATTATAAAGTTTGTAAATATACTTAGCATTTCAAGTTTTATTATTCATATAA
TGATTTTATTCGAATACAGCATTTGTGATTTCATAGTGTTGTCATGAAACACAAGTTATT
ATTCATCACCGTCCGATGTTGCTACTGTCTAATATTGTAACTAAAAAGTTAGAATTTCGA
ATTTAGTTTACATTTATTTATTTCAGTCAACTCTTTTTTAAAAAATTTCTTTTGCCATCC
TTTTATTGTTCTTTTTCTGGTCTTGGTCAAACACTTGTTTAGCATCCATTGTTAGTTGTC
TCTGTGCATTCATTAAAATTCTGTGCAAAAAATCGGATGCGTCATGAATCATGCCATGGT
CCCAGCAGATTAACAAAACAAAGCAAAAAAATCCACGCGTCATGTTCAGTTGCAACTGCA
TAGTTTGCTCAACCCTTTTTAAAGTCATCATGTAAATAAAGAATAAATCGAACCAAATAC
AAAGAAGCATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G571TF U 1
AF RR2G571JQ C 166
BS 1 690 RR2G571TF
BS 691 691 RR2G571JQ
BS 692 714 RR2G571TF
BS 715 715 RR2G571JQ
BS 716 755 RR2G571TF
BS 756 756 RR2G571JQ
BS 757 766 RR2G571TF
BS 767 767 RR2G571JQ
BS 768 776 RR2G571TF
BS 777 777 RR2G571JQ
BS 778 792 RR2G571TF

RD RR2G571TF 792 0 0
GTTGTGATCTGATCGAAACTTTCTTTAGAAACATAACTTCCAAACCTTGAGTTTGATTTC
AGGTTGTAAAACTTATCTCTCCTTGTTAGTGTCTTATCTGGTTTTCCTTGGAATTGATAG
TTTTCCATTGAAATTTCACTTGAACAAAAAACATAAGTGCTTTCGTCTTAGAAATGGCTA
TGACTAACAGAAAAAAATTATGAGGAAGATTTGTAAAGACATGTTTTTAGAGAGGGCTTA
ATAAAAAAACACTTATCTGCTAGGCTGCCTTGCTAATGGATTCCCAGTTTCAACTTGTTT
CAAAGCATATTATAAAGTTTGTAAATATACTTAGCATTTCAAGTTTTATTATTCATATAA
TGATTTTATTCGAATACAGCATTTGTGATTTCATAGTGTTGTCATGAAACACAAGTTATT
ATTCATCACCGTCCGATGTTGCTACTGTCTAATATTGTAACTAAAAAGTTAGAATTTCGA
ATTTAGTTTACATTTATTTATTTCAGTCAACTCTTTTTTAAAAAATTTCTTTTGCCATCC
TTTTATTGTTCTTTTTCTGGTCTTGGTCAAACACTTGTTTAGCATCCATTGTTAGTTGTC
TCTGTGCATTCATTAAAATTCTGTGCAAAAAATCGGATGCGTCATGAATCATGCCATGGT
CCCAGCAGATTAACAAAACAAAGCAAAAAA*TCCACGCGTCATGTTCAGTTGCA*CTGCA
TAGTTTGCTCAACCCTTTTTAAAGTCATCATGTAA*TAAAGAATAA*TCGAACCAA*TAC
AAAGAAGCATGG

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2G571JQ 627 0 0
TCTTAGAAATGGCTATGACTAACAGAAAAAAATTATGAGGAAGATTTGTAAAGACATGTT
TTTAGAGAGGGCTTAATAAAAAAACACTTATCTGCTAGGCTGCCTTGCTAATGGATTCCC
AGTTTCAACTTGTTTCAAAGCATATTATAAAGTTTGTAAATATACTTAGCATTTCAAGTT
TTATTATTCATATAATGATTTTATTCGAATACAGCATTTGTGATTTCATAGTGTTGTCAT
GAAACACAAGTTATTATTCATCACCGTCCGATGTTGCTACTGTCTAATATTGTAACTAAA
AAGTTAGAATTTCGAATTTAGTTTACATTTATTTATTTCAGTCAACTCTTTTTTAAAAAA
TTTCTTTTGCCATCCTTTTATTGTTCTTTTTCTGGTCTTGGTCAAACACTTGTTTAGCAT
CCATTGTTAGTTGTCTCTGTGCATTCATTAAAATTCTGTGCAAAAAATCGGATGCGTCAT
GAATCATGCCATGGTCCCAGCAGATTAACAAAACAAAGCAAAAAAATCCACGCGTCATGT
TCAGTTGCAACTGCATAGTTTGCTCAACCCTTTTTAAAGTCATCATGTAAATAAAGAATA
AATCGAACCAAATACAAAGAAGCATGG

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL5855Contig1 950 2 12 U
GGATCTTCTCTTTCATCTTTAATCTCGAACTATCAACAAAAGCTTCCTGCTTTATATTCT
TTCTTTGTATCTTTTTCTTGTTTCTCAATTCTCATCGTTAGAATCGAAAATGGGTCGAAT
CAGCATAGTGGCTTCTGATCTGGTATTGTCCTTTATGTGGACATGGGCAGGGGTTCTTGT
CAACATCTTAGTTCACGAAGTACTCGGATTCAGCCGGAAAGATACCACCGGCGAGATCGT
CCGGTATCTATTCTCCGTCCTCTCCATGTTCGTCTTCGCTTTCCTTCAGAAACTCACCAA
AGGCGGACTTTACAACCCTTTGACCGCTTTGGCTGCCGGTGTCACCGGTGGCTTCGGTAG
TTTCATCTTCACCGTCCTGGTTCGAATCCCCGTTGAGGTGATGGGATCAATCCTTGGGGT
TAAACATATCATTCATGTTTTCCCTGAGATTGGGAAAGGACCAAAACTAAATGTAGCGAT
CCATCACGGTGCTTTAACCGAGGGGGTACTAACATTCTTCATTGTAATGCTCTCACTGGG
ACTAGCAAGAAAGATCCCTGGAAGTTTCTTCATGAAGACTTGGATTGGTAGCATTGCTAA
ATTAAGTCTCCATGTTCTTGGAGCTGATCTAACCGGCGGATGCATGAATCCAGCAGCGGT
TATGGGATGGGCTTATGCACGCGGTGAACATATAACACAGGAGCATTTACTTGTGTATTG
GCTTGGACCTATAAAGGCGACATTGCTTGCTGTTTGGTTCTTCAATGTCGTGTTTAAGCC
TCTCACCGAAGAACAAGAGAAACCTAAGGCTAAATCTGATTGAGTAATAGAGTTTTAGCT
CTCATATTCAATCCTCTTCTCATTAGTTTACCTTAATGCGTTTATGTATGTAGCAAACTC
AACTGTAACAATCAGTTCAATAAAACCTGCCGAGTATTTTGGTTTATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G792TF U 1
AF RR2G792JQ C 259
BS 1 700 RR2G792TF
BS 701 701 RR2G792JQ
BS 702 723 RR2G792TF
BS 724 724 RR2G792JQ
BS 725 736 RR2G792TF
BS 737 737 RR2G792JQ
BS 738 743 RR2G792TF
BS 744 744 RR2G792JQ
BS 745 764 RR2G792TF
BS 765 765 RR2G792JQ
BS 766 776 RR2G792TF
BS 777 950 RR2G792JQ

RD RR2G792TF 776 0 0
GGATCTTCTCTTTCATCTTTAATCTCGAACTATCAACAAAAGCTTCCTGCTTTATATTCT
TTCTTTGTATCTTTTTCTTGTTTCTCAATTCTCATCGTTAGAATCGAAAATGGGTCGAAT
CAGCATAGTGGCTTCTGATCTGGTATTGTCCTTTATGTGGACATGGGCAGGGGTTCTTGT
CAACATCTTAGTTCACGAAGTACTCGGATTCAGCCGGAAAGATACCACCGGCGAGATCGT
CCGGTATCTATTCTCCGTCCTCTCCATGTTCGTCTTCGCTTTCCTTCAGAAACTCACCAA
AGGCGGACTTTACAACCCTTTGACCGCTTTGGCTGCCGGTGTCACCGGTGGCTTCGGTAG
TTTCATCTTCACCGTCCTGGTTCGAATCCCCGTTGAGGTGATGGGATCAATCCTTGGGGT
TAAACATATCATTCATGTTTTCCCTGAGATTGGGAAAGGACCAAAACTAAATGTAGCGAT
CCATCACGGTGCTTTAACCGAGGGGGTACTAACATTCTTCATTGTAATGCTCTCACTGGG
ACTAGCAAGAAAGATCCCTGGAAGTTTCTTCATGAAGACTTGGATTGGTAGCATTGCTAA
ATTAAGTCTCCATGTTCTTGGAGCTGATCTAACCGGCGGATGCATGAATCCAGCAGCGGT
TATGGGATGGGCTTATGCACGCGGTGAACATATAACACAG*AGCATTTACTTGTGTATTG
GCT*GGACCTATAAAG*CGACAT*GCTTGCTGTTTGGTTCTTCA*TGTCGTGTTTA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2G792JQ 692 0 0
CCTCTCCATGTTCGTCTTCGCTTTCCTTCAGAAACTCACCAAAGGCGGACTTTACAACCC
TTTGACCGCTTTGGCTGCCGGTGTCACCGGTGGCTTCGGTAGTTTCATCTTCACCGTCCT
GGTTCGAATCCCCGTTGAGGTGATGGGATCAATCCTTGGGGTTAAACATATCATTCATGT
TTTCCCTGAGATTGGGAAAGGACCAAAACTAAATGTAGCGATCCATCACGGTGCTTTAAC
CGAGGGGGTACTAACATTCTTCATTGTAATGCTCTCACTGGGACTAGCAAGAAAGATCCC
TGGAAGTTTCTTCATGAAGACTTGGATTGGTAGCATTGCTAAATTAAGTCTCCATGTTCT
TGGAGCTGATCTAACCGGCGGATGCATGAATCCAGCAGCGGTTATGGGATGGGCTTATGC
ACGCGGTGAACATATAACACAGGAGCATTTACTTGTGTATTGGCTTGGACCTATAAAGGC
GACATTGCTTGCTGTTTGGTTCTTCAATGTCGTGTTTAAGCCTCTCACCGAAGAACAAGA
GAAACCTAAGGCTAAATCTGATTGAGTAATAGAGTTTTAGCTCTCATATTCAATCCTCTT
CTCATTAGTTTACCTTAATGCGTTTATGTATGTAGCAAACTCAACTGTAACAATCAGTTC
AATAAAACCTGCCGAGTATTTTGGTTTATCAC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL5856Contig1 598 2 1 U
GGGCAGATTATCTGAAAAACGTTTCTGAGAGAGAAATATTAAGAAGATGTTGGAAGGAAA
AGCAATGGTGGAAGATTCAGACATGCCAGTAAAAATGCAGGTACAAGCCCTGGCTTTGGC
TTCTCAAGCTCTTGATCTCTTTGATGTCGTTGACTGTAAATCCATTGCTGGCCACATCAA
GAAGGAGTTTGATGAGAGATATGGGAGTGGATGGCAATGTGTGGCGGGATCAAATTTTGG
ATGTTTCTTCACACATTCTAAAGGGACATTCATCTATTTTCAATTGGAGACGCTTAAGTT
CCTAGTCTTCAAAGGCGCTTGTACTCTTTAATAAAACAAACCCTAAGCCAATGTTATATC
TTTTTCTATCCTTCTATGAAAATCTGTGAAAGAAAAGCTTGAAGAGCCTATCAAGATCTT
CTTTTTTTTCTTTTGTTGCTCTTTATAGCTTTGTTTGAATCTAGGTCTGTAAATAGACCC
AAGATGGGCTATTGATTTCAATGAGATGCAGAGAATTTTATTTCCAGGTTTTGTCATGTG
TTTGGTGATCAACAAAAGTGTAATGTACACGGTCTCATATATCTCTTAATTTTTCACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CY88JQ C 1
AF RR2CY88TF U 1
BS 1 598 RR2CY88TF

RD RR2CY88JQ 598 0 0
GGGCAGATTATCTGAAAAACGTTTCTGAGAGAGAAATATTAAGAAGATGTTGGAAGGAAA
AGCAATGGTGGAAGATTCAGACATGCCAGTAAAAATGCAGGTACAAGCCCTGGCTTTGGC
TTCTCAAGCTCTTGATCTCTTTGATGTCGTTGACTGTAAATCCATTGCTGGCCACATCAA
GAAGGAGTTTGATGAGAGATATGGGAGTGGATGGCAATGTGTGGCGGGATCAAATTTTGG
ATGTTTCTTCACACATTCTAAAGGGACATTCATCTATTTTCAATTGGAGACGCTTAAGTT
CCTAGTCTTCAAAGGCGCTTGTACTCTTTAATAAAACAAACCCTAAGCCAATGTTATATC
TTTTTCTATCCTTCTATGAAAATCTGTGAAAGAAAAGCTTGAAGAGCCTATCAAGATCTT
CTTTTTTTTCTTTTGTTGCTCTTTATAGCTTTGTTTGAATCTAGGTCTGTAAATAGACCC
AAGATGGGCTATTGATTTCAATGAGATGCAGAGAATTTTATTTCCAGGTTTTGTCATGTG
TTTGGTGATCAACAAAAGTGTAATGTACACGGTCTCATATATCTCTTAATTTTTCACT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2CY88TF 598 0 0
GGGCAGATTATCTGAAAAACGTTTCTGAGAGAGAAATATTAAGAAGATGTTGGAAGGAAA
AGCAATGGTGGAAGATTCAGACATGCCAGTAAAAATGCAGGTACAAGCCCTGGCTTTGGC
TTCTCAAGCTCTTGATCTCTTTGATGTCGTTGACTGTAAATCCATTGCTGGCCACATCAA
GAAGGAGTTTGATGAGAGATATGGGAGTGGATGGCAATGTGTGGCGGGATCAAATTTTGG
ATGTTTCTTCACACATTCTAAAGGGACATTCATCTATTTTCAATTGGAGACGCTTAAGTT
CCTAGTCTTCAAAGGCGCTTGTACTCTTTAATAAAACAAACCCTAAGCCAATGTTATATC
TTTTTCTATCCTTCTATGAAAATCTGTGAAAGAAAAGCTTGAAGAGCCTATCAAGATCTT
CTTTTTTTTCTTTTGTTGCTCTTTATAGCTTTGTTTGAATCTAGGTCTGTAAATAGACCC
AAGATGGGCTATTGATTTCAATGAGATGCAGAGAATTTTATTTCCAGGTTTTGTCATGTG
TTTGGTGATCAACAAAAGTGTAATGTACACGGTCTCATATATCTCTTAATTTTTCACT

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL5857Contig1 610 2 1 U
GGGCCGTAACGAAGAGGAGAACAGATCGGAGAAGGCTTGAAACTCTTTGCTTGCAAACAT
GACTTTCAAGCGTAGGAACGGTGGCAGGAACAAGCACAACCGTGGTCACGTGAACCCCAT
CAGGTGTTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCCAAGGATAAGGCGATTAAGAGATTCCTCGT
CAGGAACATTGTTGAGCAGGCTGCTATTAGAGATGTTCAAGAAGCCAGTGTCTACGATGG
TTACACTCTCCCAAAGCTGTACTCTAAGGTGCAATACTGTGTTTCATGTGCTATCCACTC
TCACGTTGTGAGAGTTCGATCCCGCACCAACCGTAGGGTTCGTACTCCTCCTCCCCGTTT
TGCCAGACGCAAGGAGGATACTCCCAAGCCTGGACAACCTGGTCAGGCCCCTCGCCCTGC
TGGTGGTGCACCTGCTGCTCCTCGTACTTAAAAGACTGCAAGAAGCTGGTCACTCAAAAC
TCTTAATGTTATAGTTTCAGTCTCTGCGCTGTCTGGAATTTTTGAACATGTTTTCTACCT
TTGGTTAGAGATGATTTTGTCATGTGTAACTTTGAATTCTTTGAGACCAATCTATCAGTT
CATTTTGACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H643JQB C 1
AF RR2H643TF U 1
BS 1 610 RR2H643TF

RD RR2H643JQB 610 0 0
GGGCCGTAACGAAGAGGAGAACAGATCGGAGAAGGCTTGAAACTCTTTGCTTGCAAACAT
GACTTTCAAGCGTAGGAACGGTGGCAGGAACAAGCACAACCGTGGTCACGTGAACCCCAT
CAGGTGTTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCCAAGGATAAGGCGATTAAGAGATTCCTCGT
CAGGAACATTGTTGAGCAGGCTGCTATTAGAGATGTTCAAGAAGCCAGTGTTTACGATGG
TTACACTCTCCCAAAGCTGTACTTTAAGGTGCAATACTGTGTTTCATGTGCTATCCACTC
TCACGTTGTGAGAGTTCGATCCCGCACCAACCGTAGGGTTCGTACTCCTCCTCCCCGTTT
TGCCAGACGCAAGGAGGATACTCCCAAGCCTGGACAACCTGGTCAGGCCCCTCGCCCTGC
TGGTGGTGCACCTGCTGCTCCTCGTACTTAAAAGACTGCAAGAAGCTGGTCACTCAAAAC
TCTTAATGTTATAGTTTCAGTCTTTGCGCTGTCTGGAATTTTTGAACATGTTTTCTACCT
TTGGTTAGAGATGATTTTGTCATGTGTAACTTTGAATTCTTTGAGACCAATCTATCAGTT
CATTTTGACG

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2H643TF 610 0 0
GGGCCGTAACGAAGAGGAGAACAGATCGGAGAAGGCTTGAAACTCTTTGCTTGCAAACAT
GACTTTCAAGCGTAGGAACGGTGGCAGGAACAAGCACAACCGTGGTCACGTGAACCCCAT
CAGGTGTTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCCAAGGATAAGGCGATTAAGAGATTCCTCGT
CAGGAACATTGTTGAGCAGGCTGCTATTAGAGATGTTCAAGAAGCCAGTGTCTACGATGG
TTACACTCTCCCAAAGCTGTACTCTAAGGTGCAATACTGTGTTTCATGTGCTATCCACTC
TCACGTTGTGAGAGTTCGATCCCGCACCAACCGTAGGGTTCGTACTCCTCCTCCCCGTTT
TGCCAGACGCAAGGAGGATACTCCCAAGCCTGGACAACCTGGTCAGGCCCCTCGCCCTGC
TGGTGGTGCACCTGCTGCTCCTCGTACTTAAAAGACTGCAAGAAGCTGGTCACTCAAAAC
TCTTAATGTTATAGTTTCAGTCTCTGCGCTGTCTGGAATTTTTGAACATGTTTTCTACCT
TTGGTTAGAGATGATTTTGTCATGTGTAACTTTGAATTCTTTGAGACCAATCTATCAGTT
CATTTTGACG

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL5858Contig1 1014 2 4 U
GGAGGACGACAACCCTTACGACATGGAGGAGATGCTTATGCCGCTGCACAAGTATCTCGA
TACCCCTACTGCTCATGACATTATCCACAACGGAGCAACGTTTCAGATTGCAGGGTTGAC
AAACAATTCACGTTTATCAGAAGCCCACGAGGTTCGGCATTGTGTGCAGAAGTACAGAAA
CCTCGGTGAGCCTGTTCTCCAAGTCGCCAAGAGAAGGTTAGACAGCATGTTGTATGTTGG
ACTGACAGAAGAGCATAGGGAATCTGCTTCACTTTTTGCCAATGTAGTGGGTTCTCAGGT
GCTTTCTCAGTTGGGTGCGTCAAATGCAACTGCAAAAACCGAAACTACTAAACAAGAAGC
AAGTGTTACAGTTTCAGAATCTGGATCAGATAAGAGTGAAATCCAGAATGGTACATCTGA
AGTTGCATCTACTAAGATAGAAGCTAAGAGTGGAAATATGACGGTAAAAACCTTAATGGA
AGTCTATGAGGGATGCATTACTCATCTAAGAAAGTCCCAAGGAACCAGACGTGTCAACTC
CTTGAAGAGAATCTCGCCAGCTAATTTTACCAGAGGGACGCGCACAAGAGTTCCTGACGA
GGTCATCCAGCAGATCAAATCTCTTAACAATCTTGATGTGGAGCTTTTCAAGTATGCTAA
AGAGATCTTTTGTCAGAGAGCATGAACTAGTGTCGAATAAAATGGTTTCAACTTCTAAGA
GGAGCATTGTTGATCTGCAGAACGTATTTGGAGAAATGGAGGGTGAGAAGCTGTGGAAGT
TAGTATCAGTGTCTTTGATGCTGTTACTACTCTTCCTCTTGTTTCTATTTGTAAACGCTA
GAAGGAGAAGAACCTCTAAAGTTAAGATTTGACCATTTCACTTTCTTTTGGGCCAAATTC
AGCAATTAGGAGAAGTTTCTGGGTCTAATTGTAATATTCTATTTTTTCTTTTCCTGGAAA
AGAAAAAGTTTTGGGTGTTTGCCTTACAGGTGAAAAAAATGAAAAATTAGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A964TF U 1
AF RR2A964JQ C 121
BS 1 768 RR2A964TF
BS 769 769 RR2A964JQ
BS 770 839 RR2A964TF
BS 840 1014 RR2A964JQ

RD RR2A964TF 839 0 0
GGAGGACGACAACCCTTACGACATGGAGGAGATGCTTATGCCGCTGCACAAGTATCTCGA
TACCCCTACTGCTCATGACATTATCCACAACGGAGCAACGTTTCAGATTGCAGGGTTGAC
AAACAATTCACGTTTATCAGAAGCCCACGAGGTTCGGCATTGTGTGCAGAAGTACAGAAA
CCTCGGTGAGCCTGTTCTCCAAGTCGCCAAGAGAAGGTTAGACAGCATGTTGTATGTTGG
ACTGACAGAAGAGCATAGGGAATCTGCTTCACTTTTTGCCAATGTAGTGGGTTCTCAGGT
GCTTTCTCAGTTGGGTGCGTCAAATGCAACTGCAAAAACCGAAACTACTAAACAAGAAGC
AAGTGTTACAGTTTCAGAATCTGGATCAGATAAGAGTGAAATCCAGAATGGTACATCTGA
AGTTGCATCTACTAAGATAGAAGCTAAGAGTGGAAATATGACGGTAAAAACCTTAATGGA
AGTCTATGAGGGATGCATTACTCATCTAAGAAAGTCCCAAGGAACCAGACGTGTCAACTC
CTTGAAGAGAATCTCGCCAGCTAATTTTACCAGAGGGACGCGCACAAGAGTTCCTGACGA
GGTCATCCAGCAGATCAAATCTCTTAACAATCTTGATGTGGAGCTTTTCAAGTATGCTAA
AGAGATCTTTTGTCAGAGAGCATGAACTAGTGTCGAATAAAATGGTTTCAACTTCTAAGA
GGAGCATTGTTGATCTGCAGAACGTATTTGGAGAAATGGAGGGTGAGA*GCTGTGGAAGT
TAGTATCAGTGTCTTTGATGCTGTTACTACTCTTCCTCTTGTTTCTATTTGTAAACGCT

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR2A964JQ 894 0 0
AAACAATTCACGTTTATCAGAAGCCCACGAGGTTCGGCATTGTGTGCAGAAGTACAGAAA
CCTCGGTGAGC*TGTTCTCCAAGTCGCCAAGAGAAGGTTAGACAGCATGTTGTATGTTGG
ACTGACAGAAGAGCATAGGGAATCTGCTTCACTTTTTGCCAATGTAGTGGGTTCTCAGGT
GCTTTCTCAGTTGGGTGCGTCAAATGCAACTGCAAAAACCGAAACTACTAAACAAGAAGC
AAGTGTTACAGTTTCAGAATCTGGATCAGATAAGAGTGAAATCCAGAATGGTACATCTGA
AGTTGCATCTACTAAGATAGAAGCTAAGAGTGGAAATATGACGGTAAAAACCTTAATGGA
AGTCTATGAGGGATGCATTACTCATCTAAGAAAGTCCCAAGGAACCAGACGTGTCAACTC
CTTGAAGAGAATCTCGCCAGCTAATTTTACCAGAGGGACGCGCACAAGAGTTCCTGACGA
GGTCATCCAGCAGATCAAATCTCTTAACAATCTTGATGTGGAGCTTTTCAAGTATGCTAA
AGAGATCTTT*GTCAGAGAGCATGAACTAGTGTCGAATAAAATGGTTTCAACTTCTAAGA
GGAGCATTGTTGATCTGCAGAACGTATTTGGAGAAATGGAGGGTGAGAAGCTGTGGAAGT
TAGTATCAGTGTCTTTGATGCTGTTACTACTCTTCCTCTTGTTTCTATTTGTAAACGCTA
GAAGGAGAAGAACCTCTAAAGTTAAGATTTGACCATTTCACTTTCTTTTGGGCCAAATTC
AGCAATTAGGAGAAGTTTCTGGGTCTAATTGTAATATTCTATTTTTTCTTTTCCTGGAAA
AGAAAAAGTTTTGGGTGTTTGCCTTACAGGTGAAAAAAATGAAAAATTAGAAGC

QA 1 894 1 894
DS 



AS 1 2

CO CL5859Contig1 583 2 1 U
GGAATTCCAAATATTCAAAATTTGAAACTGCAGAGATAGAGAGAGAAAGGGGTTATGGCG
ACAACTGCGAAGAACGTGAAGGGTTTCTACAAGCAGACGAAGAGCAACATCACCGGAGGT
ATCTCCAAGTCCAAACCTTCTTCCCGTAAGGTCTCTCCCAAACACGCGGCCACCCAGGGC
TCCGATGCTACGCAGCCGGCGGCGCTGATTTCGCACGGCTCCCTCGATGTCAAGGGTGAT
TACGACGAGAAGGAGGAGATGCTCAGGCAGTTTGACATGAACATGGCGTACGGTCCGTGC
GTGGGTATGACGAGACTTGATCGATGGGAACGTGCATTGCGCTTAGGGATGAATCCTCCC
AGTGAAATCGAGAAGCTTTTGAAAACTGAGAAGGTTCAGCAGGATTGTCTTTGGCAAGGT
CGCGTCTAATAAAGTTTCAATCTTTTTCAGCTATGCCCACCCCTTGTATGATCCATTGTC
ACTTGCTGTCTTTTGTGAATGTTTGGTTCAGCCACTGGCTGGATCATCCACTTTGTTGTT
TTAATCTTTAAAACCTTGGTAATGGAATGCGTTTTGTTGGCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EB22JQ C 1
AF RR2EB22TF U 1
BS 1 583 RR2EB22TF

RD RR2EB22JQ 583 0 0
GGAATTCCAAATATTCAAAATTTGAAACTGCAGAGATAGAGAGAGAAAGGGGTTATGGCG
ACAACTGCGAAGAACGTGAAGGGTTTCTACAAGCAGACGAAGAGCAACATCACCGGAGGT
ATCTCCAAGTCCAAACCTTCTTCCCGTAAGGTCTCTCCCAAACACGCGGCCACCCAGGGC
TCCGATGCTACGCAGCCGGCGGCGCTGATTTCGCACGGCTCCCTCGATGTCAAGGGTGAT
TACGACGAGAAGGAGGAGATGCTCAGGCAGTTTGACATGAACATGGCGTACGGTCCGTGC
GTGGGTATGACGAGACTTGATCGATGGGAACGTGCATTGCGCTTAGGGATGAATCCTCCC
AGTGAAATCGAGAAGCTTTTGAAAACTGAGAAGGTTCAGCAGGATTGTCTTTGGCAAGGT
CGCGTCTAATAAAGTTTCAATCTTTTTCAGCTATGCCCACCCCTTGTATGATCCATTGTC
ACTTGCTGTCTTTTGTGAATGTTTGGTTCAGCCACTGGCTGGATCATCCACTTTGTTGTT
TTAATCTTTAAAACCTTGGTAATGGAATGCGTTTTGTTGGCTC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2EB22TF 583 0 0
GGAATTCCAAATATTCAAAATTTGAAACTGCAGAGATAGAGAGAGAAAGGGGTTATGGCG
ACAACTGCGAAGAACGTGAAGGGTTTCTACAAGCAGACGAAGAGCAACATCACCGGAGGT
ATCTCCAAGTCCAAACCTTCTTCCCGTAAGGTCTCTCCCAAACACGCGGCCACCCAGGGC
TCCGATGCTACGCAGCCGGCGGCGCTGATTTCGCACGGCTCCCTCGATGTCAAGGGTGAT
TACGACGAGAAGGAGGAGATGCTCAGGCAGTTTGACATGAACATGGCGTACGGTCCGTGC
GTGGGTATGACGAGACTTGATCGATGGGAACGTGCATTGCGCTTAGGGATGAATCCTCCC
AGTGAAATCGAGAAGCTTTTGAAAACTGAGAAGGTTCAGCAGGATTGTCTTTGGCAAGGT
CGCGTCTAATAAAGTTTCAATCTTTTTCAGCTATGCCCACCCCTTGTATGATCCATTGTC
ACTTGCTGTCTTTTGTGAATGTTTGGTTCAGCCACTGGCTGGATCATCCACTTTGTTGTT
TTAATCTTTAAAACCTTGGTAATGGAATGCGTTTTGTTGGCTC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL5860Contig1 852 2 10 U
GTAGCTAACAGTTGACTTGAGGCCTGACTTACCAAGGGAAGCAGAGAGGATCAAACAGTG
TAAAGGTAGAGTGTTTGCGCTGGAAGACGAGCCAGAGGTGCCACGAGTCTGGCTACCGTA
TGATAATGCTCCTGGATTAGCCATGGCTAGGGCGTTTGGTGATTTCTGTCTGAAAGACTA
CGGTGTGATCTCAGTACCCGAGTTCTCTCACCGTGTTCTCACAGAGAGAGACCAGTTCAT
TGTCTTGGCCTCTGATGGAGTGTGGGATGTGCTAAGCAACGAAGAAGTGGTTGAAGTGGT
GGCATCAGCACCAAGCCGAGCATCAGCGTCCAGGCTAGTGGTGGATTCAGCTGCACGAGA
GTGGAAACTGAAGTACCCGACTTCGAAAATGGACGACTGTGCGGTCGTGTGTTTGTTTCT
AGACGGGAAGATGGACTCAGATTCATCAGACTACGAAGAGCAAGGATACTACTCGTCAGC
AACGAACGCAGTAGAAGAATCAGAGGAAAGCCAGGTGAATGCAGCAGAACCGTGTCTTCA
GAGAAACGTCACGGTGAGGGCGTCAACAGAGAACAGCAGTTACGGTAACGTGAATGCAGA
AGAGACTAATGATGCAGAGAAGGAGAAAACTAAGGAAAGTGAGCAGAACTGGTCGGGACT
AGAAGGAGTTACTCGAGTGAACTCATTAGTTCAGCTTCCAAGATTCTCTGGAGAAGAAAC
TAAGAAGACTTGAGATATGGCTTTTCATTTGTTTTAAAAGAATTGATTTTAGTTCCAAAA
GAAAAGAAAAGTTTGCTGGTTTGCATGCATCTATTGCCTAATCAAATTCATAAAATGTAA
ATGTGTTAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ13TF U 1
AF RR2CQ13JQ C 159
BS 1 665 RR2CQ13TF
BS 666 666 RR2CQ13JQ
BS 667 704 RR2CQ13TF
BS 705 705 RR2CQ13JQ
BS 706 714 RR2CQ13TF
BS 715 715 RR2CQ13JQ
BS 716 725 RR2CQ13TF
BS 726 726 RR2CQ13JQ
BS 727 742 RR2CQ13TF
BS 743 852 RR2CQ13JQ

RD RR2CQ13TF 742 0 0
GTAGCTAACAGTTGACTTGAGGCCTGACTTACCAAGGGAAGCAGAGAGGATCAAACAGTG
TAAAGGTAGAGTGTTTGCGCTGGAAGACGAGCCAGAGGTGCCACGAGTCTGGCTACCGTA
TGATAATGCTCCTGGATTAGCCATGGCTAGGGCGTTTGGTGATTTCTGTCTGAAAGACTA
CGGTGTGATCTCAGTACCCGAGTTCTCTCACCGTGTTCTCACAGAGAGAGACCAGTTCAT
TGTCTTGGCCTCTGATGGAGTGTGGGATGTGCTAAGCAACGAAGAAGTGGTTGAAGTGGT
GGCATCAGCACCAAGCCGAGCATCAGCGTCCAGGCTAGTGGTGGATTCAGCTGCACGAGA
GTGGAAACTGAAGTACCCGACTTCGAAAATGGACGACTGTGCGGTCGTGTGTTTGTTTCT
AGACGGGAAGATGGACTCAGATTCATCAGACTACGAAGAGCAAGGATACTACTCGTCAGC
AACGAACGCAGTAGAAGAATCAGAGGAAAGCCAGGTGAATGCAGCAGAACCGTGTCTTCA
GAGAAACGTCACGGTGAGGGCGTCAACAGAGAACAGCAGTTACGGTAACGTGAATGCAGA
AGAGACTAATGATGCAGAGAAGGAGAAAACTAAGGAAAGTGAGCAGAACTGGTCGGGACT
AGAAG*AGTTACTCGAGTGAACTCATTAGTTCAGCTTCCAAGAT*CTCTGGAGA*GAAAC
TAAGA*GACTTGAGATATGGCT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2CQ13JQ 694 0 0
GTGATTTCTGTCTGAAAGACTACGGTGTGATCTCAGTACCCGAGTTCTCTCACCGTGTTC
TCACAGAGAGAGACCAGTTCATTGTCTTGGCCTCTGATGGAGTGTGGGATGTGCTAAGCA
ACGAAGAAGTGGTTGAAGTGGTGGCATCAGCACCAAGCCGAGCATCAGCGTCCAGGCTAG
TGGTGGATTCAGCTGCACGAGAGTGGAAACTGAAGTACCCGACTTCGAAAATGGACGACT
GTGCGGTCGTGTGTTTGTTTCTAGACGGGAAGATGGACTCAGATTCATCAGACTACGAAG
AGCAAGGATACTACTCGTCAGCAACGAACGCAGTAGAAGAATCAGAGGAAAGCCAGGTGA
ATGCAGCAGAACCGTGTTTTCAGAGAAACGTCACGGTGAGGGCGTCAACAGAGAACAGCA
GTTACGGTAACGTGAATGCAGAAGAGACTAATGATGCAGAGAAGGAGAAAACTAAGGAAG
GTGAGCAGAACTGGTCGGGACTAGAAGGAGTTACTCGAGTGAACTCATTAGTTCAGCTTC
CAAGATTCTCTGGAGAAGAAACTAAGAAGACTTGAGATATGGCTTTTCATTTGTTTTAAA
AGAATTGATTTTAGTTCCAAAAGAAAAGAAAAGTTTGCTGGTTTGCATGCATCTATTGCC
TAATCAAATTCATAAAATGTAAATGTGTTAGCTT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5863Contig1 841 2 2 U
GGGTTAGTAAATGGAGAAACAGCTCTCCAATGCTTTCTCTCTCCTTGCTTTAGCCGACGA
CGAAGATGGTCTCCCCTCGTCTTCTTCTTCCCCCTCCGCTGGAGAAAGAGTAGTAGAGGA
TGTCGGAAACTATAAGCAACCACTTGTCTGGATTGACTTGGAGATGACTGGTCTTAATGT
TGAAGTTGACAGGATATTGGAGATCGCTTGTATAATTACTGATGGACAATTAACCAAATC
AGTGGATGGTCCAGATTTAGTTGTACATCAAACGAAAGACTGCATGGATAAAATGGGTGA
TTGGTGTCAAACTCATCATGGAGACAGTGGTTTGACAAAGAAAGTGCTCTCTAGTACTAT
AAGTGAAAGGCGAGCTGAACAAGAGGTCATCGAATTTGTAAAAAAGCATGTTGGTAATGA
AAATCCACAATTAGCTGGAAACTCTATCTACATGGATTTCCTTTTCCTAAAGAAGTACAT
GCCAGATTTGGCTGCCCTTTTCCCTCATGTACTTGTCGATGTCAGTAGTGTCAAGTCTCT
ATGCAACGGTTTCCAAAAGACAAAAACAGAGCTCCTGCAAAGAAAAACAATCACAGAGCC
ATGGATGATATAAGAGAAAGCATCAAGGAGCTTAAGTACTACAAAGAAACCATATTTAAA
GCAAACAAAGGCAGGAGGTGAGGTGAGGTTGGAGTGAAATCTCCTCTGACTAACCTTCTT
GATTAGAAGATATCGTTTAGGGAAAGGGGATATTGACATTGTCGTTTAGGAGTCATTCTC
TTGAATGTTTTTGTATTATGAAACCTAGTTACATGATGATCTTTAGTTATTGAGACTGGT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2CO82TF U 1
AF RR2CO82JQ C 86
BS 1 666 RR2CO82TF
BS 667 841 RR2CO82JQ

RD RR2CO82TF 666 0 0
GGGTTAGTAAATGGAGAAACAGCTCTCCAATGCTTTCTCTCTCCTTGCTTTAGCCGACGA
CGAAGATGGTCTCCCCTCGTCTTCTTCTTCCCCCTCCGCTGGAGAAAGAGTAGTAGAGGA
TGTCGGAAACTATAAGCAACCACTTGTCTGGATTGACTTGGAGATGACTGGTCTTAATGT
TGAAGTTGACAGGATATTGGAGATCGCTTGTATAATTACTGATGGACAATTAACCAAATC
AGTGGATGGTCCAGATTTAGTTGTACATCAAACGAAAGACTGCATGGATAAAATGGGTGA
TTGGTGTCAAACTCATCATGGAGACAGTGGTTTGACAAAGAAAGTGCTCTCTAGTACTAT
AAGTGAAAGGCGAGCTGAACAAGAGGTCATCGAATTTGTAAAAAAGCATGTTGGTAATGA
AAATCCACAATTAGCTGGAAACTCTATCTACATGGATTTCCTTTTCCTAAAGAAGTACAT
GCCAGATTTGGCTGCCCTTTTCCCTCATGTACTTGTCGATGTCAGTAGTGTCAAGTCTCT
ATGCAACGGTTTCCAAAAGACAAAAACAGAGCTCCTGCAAAGAAAAACAATCACAGAGCC
ATGGATGATATAAGAGAAAGCATCAAGGAGCTTAAGTACTACAAAGAAACCATATTTAAA
GCAAAC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2CO82JQ 756 0 0
TCTTCCCCCTCCGCTGGAGAAAGAGTAGTAGAGGATGTCGGAAACTATAAGCAACCACTT
GTCTGGATTGACTTGGAGATGACTGGTCTTAATGTTGAAGTTGACAGGATATTGGAGATC
GCTTGTATAATTACTGATGGACAATTAACCAAATCAGTGGATGGTCCAGATTTAGTTGTA
CATCAAACGAAAGACTGCATGGATAAAATGGGTGATTGGTGTCAAACTCATCATGGAGAC
AGTGGTTTGACAAAGAAAGTGCTCTCTAGTACTATAAGTGAAAGGCGAGCTGAACAAGAG
GTCATCGAATTTGTAAAAAAGCATGTTGGTAATGAAAATCCACAATTAGCTGGAAACTCT
ATCTACATGGATTTCCTTTTCCTAAAGAAGTACATGCCAGATTTGGCTGCCCTTTTCCCT
CATGTACTTGTCGATGTCAGTAGTGTCAAGTCTCTATGCAACGGTTTCCAAAAGACAAAA
ACAGAGCTCCTGCAAAGAAAAACAATCACAGAGCCATGGATGATATAAGAGAAAGCATCA
AGGAGCTTAAGTACTACAAAGAAACCATATTTAAAGCAAACAAAGGCAGGAGGTGAGGTG
AGGTTGGAGTGAAATCTCCTCTGACTAACCTTCTTGATTAGAAGATATCGTTTAGGGAAA
GGGGATATTGACATTGTCGTTTAGGAGTCATTCTCTTGAATGTTTTTGTATTATGAAACC
TAGTTACATGATGATCTTTAGTTATTGAGACTGGTG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL5864Contig1 1120 2 2 U
GGGTCTTTATCGCGAAAAAAAAATTTGAGAGCAACTCTTCTAAGGAGACGAAGAAGGAGA
CTCTTCATCGGAACTGCTATACCGTCAGAGGTGATCCAGCGGTGGTGTAGGAGGAGACTC
ATCATCAGAACTGCTATACCGTCAGCCCTGCGAAGGTGAAAGGGAGGTTCTCGAAATTGA
GATCCGTGGAGCTTAGGGGAAACGTGTATCCGTGGATAGAGGCGATGGGGAGGGTACGTG
TATCCGTGGATAGAGGCGATGTCAACGTCTGGCTGGAGGAGATAAGGCTGAAGAGGATGG
TTACAAGTCTCGTTGCCAGATTGTGAACCTCCACCACATGTTGTCAAAGGCTGTGATTAA
GTCCAATCCTAGTGTCTTATGGTGTTACAAGGACAAACTTGATATCAACGATTATTACCA
CCAAGCTCGGCTTGCCAAAAAGTCTGCAAAGCCTCTGTTCTGTCCTTCTCATCTGAAGGA
ACACCACCATCCCGCTTAGCATTGAGGGATCGTCCCTGAGGGATGCATAGGTTTGGTCAG
AGACATTTTTAAGAATAGCTGCATTGAAGTGGAGGATCAAATTGCTTGCTACAGAGAAAG
ACAGAGAGCTGCTTGCTGTTAAACTTGATAACGAAGCGGTATGTTTGTTGTTGGTTTATA
CGAATTAATTATCTGAATGGTTTGATACTCTTAAGTTTTCTTTGTAAACTTCCACTAGGC
CTGGTCGAAAGAGGGTCTTCTCAGAGAACAAAATAAAGAACTTGCTACTCTCAGAAGGGA
GCGTGATCATTCTGATGCTGAGAGGTCCCAAAACATACACAAACTATCTGAACTTCAGGA
CCATTTTCAAGAGAAAGAGAGACAATACGCTGAATTGCAGGAACAGGTTTGCTTTACACC
ATCAAGTTATGTTTGGACTACCATTCTTGCCACTCTTCACGCTCTCTGCCTAATGATCTG
GATCAGACCCCAAGTGGTATAGTTTTTAGAAAAATCTCATTGCTTTCTTATTATCTTAAG
GCTTCATAAAACCAAATGTAGTTCAAAGTTTTTCTCCCTTATATGTAGAACATAAACACA
TTGTATCATATTGATGAGTATTTATTTTCTAAGAACTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP66TF U 1
AF RR2FP66JQ C 546
BS 1 601 RR2FP66TF
BS 602 1120 RR2FP66JQ

RD RR2FP66TF 604 0 0
GGGTCTTTATCGCGAAAAAAAAATTTGAGAGCAACTCTTCTAAGGAGACGAAGAAGGAGA
CTCTTCATCGGAACTGCTATACCGTCAGAGGTGATCCAGCGGTGGTGTAGGAGGAGACTC
ATCATCAGAACTGCTATACCGTCAGCCCTGCGAAGGTGAAAGGGAGGTTCTCGAAATTGA
GATCCGTGGAGCTTAGGGGAAACGTGTATCCGTGGATAGAGGCGATGGGGAGGGTACGTG
TATCCGTGGATAGAGGCGATGTCAACGTCTGGCTGGAGGAGATAAGGCTGAAGAGGATGG
TTACAAGTCTCGTTGCCAGATTGTGAACCTCCACCACATGTTGTCAAAGGCTGTGATTAA
GTCCAATCCTAGTGTCTTATGGTGTTACAAGGACAAACTTGATATCAACGATTATTACCA
CCAAGCTCGGCTTGCCAAAAAGTCTGCAAAGCCTCTGTTCTGTCCTTCTCATCTGAAGGA
ACACCACCATCCCGCTTAGCATTGAGGGATCGTCCCTGAGGGATGCATAGGTTTGGTCAG
AGACATTTTTAAGAATAGCTGCATTGAAGTGGAGGATCAAATTGCTTGCTACAGAGAAAG
A
AAG

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2FP66JQ 575 0 0
TTTTTAAGAATAGCTGCATTGAAGTGGAGGATCAAATTGCTTGCTACAGAGAAAGACAGA
GAGCTGCTTGCTGTTAAACTTGATAACGAAGCGGTATGTTTGTTGTTGGTTTATACGAAT
TAATTATCTGAATGGTTTGATACTCTTAAGTTTTCTTTGTAAACTTCCACTAGGCCTGGT
CGAAAGAGGGTCTTCTCAGAGAACAAAATAAAGAACTTGCTACTCTCAGAAGGGAGCGTG
ATCATTCTGATGCTGAGAGGTCCCAAAACATACACAAACTATCTGAACTTCAGGACCATT
TTCAAGAGAAAGAGAGACAATACGCTGAATTGCAGGAACAGGTTTGCTTTACACCATCAA
GTTATGTTTGGACTACCATTCTTGCCACTCTTCACGCTCTCTGCCTAATGATCTGGATCA
GACCCCAAGTGGTATAGTTTTTAGAAAAATCTCATTGCTTTCTTATTATCTTAAGGCTTC
ATAAAACCAAATGTAGTTCAAAGTTTTTCTCCCTTATATGTAGAACATAAACACATTGTA
TCATATTGATGAGTATTTATTTTCTAAGAACTCTG

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL5865Contig1 742 2 4 U
GGGGAATCATTATTGTTCTTGCTAACCCAATCTCGATCTGATCGTTTCGAAACCGCGCGG
TTCTAAGGAATCTCAGCTTAGTTGATTGATTCCCATGGCTTCTTCAATGCTATCTCTAGG
TTCTACTTCTCTGTTACCTCGCGAGTTTATCAAGGATAAGCTAAAGCTTGGAACTTCCGG
TTCTAACTCCTTCCTTAAAGCAAAGTCTTTTAGCCGAGTGACCATGTCGGTTGCAGTCAA
GCCTTCTCGCTTTGAGGGTATTACCATGGCTCCACCAGACCCTATTCTTGGAGTCAGCGA
AGCATTCAAAGCTGACACTAACGAGCTTAAGCTCAATCTCGGTGTTGGTGCTTATCGTAC
TGAGGAACTCCAGCCTTATGTCCTTAACGTTGTTAAGAAGGCGGAGAACCTGATGTTGGA
GAGAGGAGATAATAAAGAGTATCTCCCAATCGAGGGGTTGGCTGCATTCAACAAGGCCAC
CGCTGAACTGCTGTTTGGTGCTGGTCACCCTGTTATCAAGGAACAAAAGGTGGCAACAAT
TCAGGGTCTTTCAGGAACAGGTTCACTACGATTAGCAGCGGCTCTTATCGAGCGTTATTT
TCCTGGAGCTAAAGTTCTGATATCTGCACCAACATGGGGTAATCACAAGAATATCTTCAA
CGATGCCAAGGTTCCCTGGTCTGAGTACAGATACTATGATCCCAAAACAATTGGTTTGGA
TTTTGAGGGGATGATAGCAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B628TF U 1
AF RR2BI54TF U 42
BS 1 276 RR2B628TF
BS 277 277 RR2BI54TF
BS 278 652 RR2B628TF
BS 653 742 RR2BI54TF

RD RR2B628TF 652 0 0
GGGGAATCATTATTGTTCTTGCTAACCCAATCTCGATCTGATCGTTTCGAAACCGCGCGG
TTCTAAGGAATCTCAGCTTAGTTGATTGATTCCCATGGCTTCTTCAATGCTATCTCTAGG
TTCTACTTCTCTGTTACCTCGCGAGTTTATCAAGGATAAGCTAAAGCTTGGAACTTCCGG
TTCTAACTCCTTCCTTAAAGCAAAGTCTTTTAGCCGAGTGACCATGTCGGTTGCAGTCAA
GCCTTCTCGCTTTGAGGGTATTACCATGGCTCCACCCGACCCTATTCTTGGAGTCAGCGA
AGCATTCAAAGCTGACACTAACGAGCTTAAGCTCAATCTCGGTGTTGGTGCTTATCGTAC
TGAGGAACTCCAGCCTTATGTCCTTAACGTTGTTAAGAAGGCGGAGAACCTGATGTTGGA
GAGAGGAGATAATAAAGAGTATCTCCCAATCGAGGGGTTGGCTGCATTCAACAAGGCCAC
CGCTGAACTGCTGTTTGGTGCTGGTCACCCTGTTATCAAGGAACAAAAGGTGGCAACAAT
TCAGGGTCTTTCAGGAACAGGTTCACTACGATTAGCAGCGGCTCTTATCGAGCGTTATTT
TCCTGGAGCTAAAGTTCTGATATCTGCACCAACATGGGGTAATCACAAGAAT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2BI54TF 701 0 0
GG
GTTTCGAAACCGCGCGGTTCTAAGGGATCTCAGCTTAGTTGATTGATTCCCATGGCTTCT
TCAATGCTATCTCTAGGTTCTACTTCTCTGTTACCTCGCGAGTTTATCAAGGATAAGCTA
AAGCTTGGAACTTCCGGTTCTAACTCCTTCCTTAAAGCAAAGTCTTTTAGCCGAGTGACC
ATGTCGGTTGCAGTCAAGCCTTCTCGCTTTGAGGGTATTACCATGGCTCCACCAGACCCT
ATTCTTGGAGTCAGCGAAGCATTCAAAGCTGACACTAACGAGCTTAAGCTCAATCTCGGT
GTTGGTGCTTATCGTACTGAGGAACTCCAGCCTTATGTCCTTAACGTTGTTAAGAAGGCG
GAGAACCTGATGTTGGAGAGAGGAGATAATAAAGAGTATCTCCCAATCGAGGGGTTGGCT
GCATTCAACAAGGCCACCGCTGAGCTGCTGTTTGGTGCTGGTCACCCTGTTATCAAGGAA
CAAAAGGTGGCAACAATTCAGGGTCTTTCAGGAACAGGTTCACTACGATTAGCAGCGGCT
CTTATCGAGCGTTATTTTCCTGGAGCTAAAGTTCTGATATCTGCACCAACATGGGGTAAT
CACAAGAATATCTTCAACGATGCCAAGGTTCCCTGGTCTGAGTACAGATACTATGATCCC
AAAACAATTGGTTTGGATTTTGAGGGGATGATAGCAGAT

QA 3 701 3 701
DS 



AS 1 2

CO CL5866Contig1 915 2 4 U
GAGAAGCAGATCCCTCCGCCTAGCGACGGTGGTGTCCCTAGGCTGGTTACTTTCGTGACT
GACTACTGCAATAAACTTATTGGAGATAAGTACAAGTCAACGCTCACTCAGGTTCTGCTC
ATACACAAAAGCTGGAGGTCAGAGAGGTTCCAAGAGAATCAGCTTATGGTTGAGGTGCTG
AGGATAATCAAAATGATCGAGCAGAACATGGATGCGTGGATGAAAGCGTATCCGGATCAA
ACGCTCGCTCATTTCTTCGGTATGAACAACCACTGGCATCTATACAAGAACTTGAAAGGT
ACGAGGATCGGAGATAAGCTGGGAGATTCGTGGCTGAAGGAACATGATCAGTACAAAGAG
TATTACGCTACCGTCTTCCTTAGAGACAGCTGGGGTAAGCTCCCTAGTCATCTGAGCAGA
GAAGGGCTTATACTATTCTCCGGTGGACACGCCACGGCACGTGATCTCGTCAAGAAGAGG
CTCAAGTCTTTCAACGACGCATTCGAGGAGATGTACAAGAAGCAGTCTGCGTGGGTCGTA
CCGGAGAAAGATCTGAGGGATAGGGTTTGTCAGCAGATTGTTCAGGCGGTTGTACCGGTT
TACAGAAGCTATATGCAGAACTATGGCCCGTTGGTTGAGAAAGACGCGAGTTCGAGTAAG
TACGTGAGGTACACTGTGGTGGCTTTGGAGAAGATGCTGAGCTCTCTTTACGTACCTAAG
CCTATGAGATATGGGAGTTTTAAAGGGACACCGGCTAGTGAGAAACTCAAGAGCGATGTT
GACCTCAGACGTACCACTTCCGCTGTTGTCTGATTTGAATGTTTGTGATCATGATTGTGT
CTGCTCTTCTTCAGTGGAGAGAGCAAGATGTGTACTCCTTTTTTATACGTATATAAATAC
TGTCAGATCAGGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC74TF U 1
AF RR2BC74JQ C 104
BS 1 865 RR2BC74TF
BS 866 866 RR2BC74JQ
BS 867 880 RR2BC74TF
BS 881 915 RR2BC74JQ

RD RR2BC74TF 880 0 0
GAGAAGCAGATCCCTCCGCCTAGCGACGGTGGTGTCCCTAGGCTGGTTACTTTCGTGACT
GACTACTGCAATAAACTTATTGGAGATAAGTACAAGTCAACGCTCACTCAGGTTCTGCTC
ATACACAAAAGCTGGAGGTCAGAGAGGTTCCAAGAGAATCAGCTTATGGTTGAGGTGCTG
AGGATAATCAAAATGATCGAGCAGAACATGGATGCGTGGATGAAAGCGTATCCGGATCAA
ACGCTCGCTCATTTCTTCGGTATGAACAACCACTGGCATCTATACAAGAACTTGAAAGGT
ACGAGGATCGGAGATAAGCTGGGAGATTCGTGGCTGAAGGAACATGATCAGTACAAAGAG
TATTACGCTACCGTCTTCCTTAGAGACAGCTGGGGTAAGCTCCCTAGTCATCTGAGCAGA
GAAGGGCTTATACTATTCTCCGGTGGACACGCCACGGCACGTGATCTCGTCAAGAAGAGG
CTCAAGTCTTTCAACGACGCATTCGAGGAGATGTACAAGAAGCAGTCTGCGTGGGTCGTA
CCGGAGAAAGATCTGAGGGATAGGGTTTGTCAGCAGATTGTTCAGGCGGTTGTACCGGTT
TACAGAAGCTATATGCAGAACTATGGCCCGTTGGTTGAGAAAGACGCGAGTTCGAGTAAG
TACGTGAGGTACACTGTGGTGGCTTTGGAGAAGATGCTGAGCTCTCTTTACGTACCTAAG
CCTATGAGATATGGGAGTTTTAAAGGGACACCGGCTAGTGAGAAACTCAAGAGCGATGTT
GACCTCAGACGTACCACTTCCGCTGTTGTCTGATTTGAATGTTTGTGATCATGATTGTGT
CTGCTCTTCTTCAGTGGAGAGAGCA*GATGTGTACTCCTT

QA 1 880 1 880
DS 

RD RR2BC74JQ 812 0 0
TCACTCAGGTTCTGCTCATACACAAAAGCTGGAGGTCAGAGAGGTTCCAAGAGAATCAGC
TTATGGTTGAGGTGCTGAGGATAATCAAAATGATCGAGCAGAACATGGATGCGTGGATGA
AAGCGTATCCGGATCAAACGCTCGCTCATTTCTTCGGTATGAACAACCACTGGCATCTAT
ACAAGAACTTGAAAGGTACGAGGATCGGAGATAAGCTGGGAGATTCGTGGCTGAAGGAAC
ATGATCAGTACAAAGAGTATTACGCTACCGTCTTCCTTAGAGACAGCTGGGGTAAGCTCC
CTAGTCATCTGAGCAGAGAAGGGCTTATACTATTTTCCGGTGGACACGCCACGGCACGTG
ATCTCGTCAAGAAGAGGCTCAAGTCTTTCAACGACGCATTCGAGGAGATGTACAAGAAGC
AGTCTGCGTGGGTCGTACCGGAGAAAGATCTGAGGGATAGGGTTTGTCAGCAGATTGTTC
AGGCGGTTGTACCGGTTTACAGAAGCTATATGCAGAACTATGGCCCGTTGGTTGAGAAAG
ACGCGAGTTCGAGTAAGTACGTGAGGTACACTGTGGTGGCTTTGGAGAAGATGCTGAGCT
CTCTTTACGTACCTAAGCCTATGAGATATGGGAGTTTTAAAGGGACACCGGCTAGTGAGA
AACTCAAGAGCGATGTTGACCTCAGACGTACCACTTCCGCTGTTGTCTGATTTGAATGTT
TGTGATCATGATTGTGTCTGCTCTTCTTCAGTGGAGAGAGCAAGATGTGTACTCCTTTTT
TATACGTATATAAATACTGTCAGATCAGGTAT

QA 1 812 1 812
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5868Contig1 597 2 1 U
GTTGTCCAGACTTTTGTGGTTTAATGCATCACCAAATTTCTAAAAGGTGGGGTCCCAACA
CTCATACCTTTGTTCTCATCTTCTTGATTTGTGGTCATACGATTCGTTCCGGTAGAATAA
ACCGCTGATTTTGATCCATTGATGTGCAATCCAGAAATTCGAGCAAACTGATCCAGGACT
CTGAGTACACCATACAACAAGTGTTTTTGTTCCATCCGTAAATACCAGAATTTCATCAAT
AAATCTAAGATGGGATGGACCAGAATGCGAGCAAATGGATCCATGGCTGTGAGTACACCA
TACAAGGATTATTTTGTTCCATTCGTAAATACCAAAATGTCATCGGTAAAACTAATATTT
TTCTCTCTACATTTGGGATGATATCCAAAACGTCCTTATAAAGCAGCTTGATTTAACAAC
TTGGAGAAAACATTGTTCAAAAACACATACAAATACAGAGAGAGGGAGCAACCTTGGAAA
ACTCCCAGTGCACTTATGTAGAAACAATTTAATTCACCATTTATATCAACTTAAAATGAT
GCTGTAGAGATGAAATCTGGATCCACTTGGCAACTAGATCATGTAGAGCCATTTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DM90JQ C 1
AF RR2DM90TF U 1
BS 1 597 RR2DM90TF

RD RR2DM90JQ 597 0 0
GTTGTCCAGACTTTTGTGGTTTAATGCATCACCAAATTTCTAAAAGGTGGGGTCCCAACA
CTCATACCTTTGTTCTCATCTTCTTGATTTGTGGTCATACGATTCGTTCCGGTAGAATAA
ACCGCTGATTTTGATCCATTGATGTGCAATCCAGAAATTCGAGCAAACTGATCCAGGACT
CTGAGTACACCATACAACAAGTGTTTTTGTTCCATCCGTAAATACCAGAATTTCATCAAT
AAATCTAAGATGGGATGGACCAGAATGCGAGCAAATGGATCCATGGCTGTGAGTACACCA
TACAAGGATTATTTTGTTCCATTCGTAAATACCAAAATGTCATCGGTAAAACTAATATTT
TTCTCTCTACATTTGGGATGATATCCAAAACGTCCTTATAAAGCAGCTTGATTTAACAAC
TTGGAGAAAACATTGTTCAAAAACACATACAAATACAGAGAGAGGGAGCAACCTTGGAAA
ACTCCCAGTGCACTTATGTAGAAACAATTTAATTCACCATTTATATCAACTTAAAATGAT
GCTGTAGAGATGAAATCTGGATCCACTTGGCAACTAGATCATGTAGAGCCATTTCTC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2DM90TF 597 0 0
GTTGTCCAGACTTTTGTGGTTTAATGCATCACCAAATTTCTAAAAGGTGGGGTCCCAACA
CTCATACCTTTGTTCTCATCTTCTTGATTTGTGGTCATACGATTCGTTCCGGTAGAATAA
ACCGCTGATTTTGATCCATTGATGTGCAATCCAGAAATTCGAGCAAACTGATCCAGGACT
CTGAGTACACCATACAACAAGTGTTTTTGTTCCATCCGTAAATACCAGAATTTCATCAAT
AAATCTAAGATGGGATGGACCAGAATGCGAGCAAATGGATCCATGGCTGTGAGTACACCA
TACAAGGATTATTTTGTTCCATTCGTAAATACCAAAATGTCATCGGTAAAACTAATATTT
TTCTCTCTACATTTGGGATGATATCCAAAACGTCCTTATAAAGCAGCTTGATTTAACAAC
TTGGAGAAAACATTGTTCAAAAACACATACAAATACAGAGAGAGGGAGCAACCTTGGAAA
ACTCCCAGTGCACTTATGTAGAAACAATTTAATTCACCATTTATATCAACTTAAAATGAT
GCTGTAGAGATGAAATCTGGATCCACTTGGCAACTAGATCATGTAGAGCCATTTCTC

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL5869Contig1 778 2 2 U
GCATCTCCCACGAACCACTCTGCTTCGCTTCTTTAAAAAAAATCCATTTTCTTTCGTATT
TGCTCCTCTGGTTTTAATTTAATTACGTAAACGTCCGGAATTTTAGTTTCTTCTGCTGGT
AACTTTCTTCGATTCTCACCGGGAAACATCCTCTCTCATCCCAAGACAGTCAAATCCCGC
AACGGAATCAACGCTCGGTTTCCCTCCAGAGCTACGTCGTTTAGGGCATACACGCAGACG
CTAAACGCTGAGCCAGCTGTAACAGAATCCGTTCGCCGGCGAGTGTCGAGTCTCTACGAA
CTGCTTAAAGTAAACGAAACGGCGTCGTTGACGGAGATAAAGACGGCGTACCGGAGCTTA
GCGAAGGTGCACCATCCGGATGCGTCGTAATCGGACGGACGAGATTTCATGGAGATCCAC
AGAGCTTACGCTACGCTGGCGGATCCGACAACGAGAGCGATATACGACTCGACGCTGGTA
TCACAACGGCGGAGACGGGTCCACGCTGGAGCTATGGGTCGGGTGTGCACGACGACACGG
AGATGGGAGACGGATCAGTGTTGGTGATTTAGTGTTTTTAGGGGTTTCTCCGATGATTTT
GCAGCAGCGAAACTGCACTTTTTGGCTTTGATTTTTTCCCCTTTCGTATACTTTTTGTTT
TCCTTTGTCATATCTTTGGAAAATTTAAAGGGGAAAATAAGAGTTTTATCATCTCAGCCC
TTTTATTTTTAACTTAAAAGAAGATACGTGTATATTATTTTGGGAATTTGTAGGGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV14TF U 1
AF RR2AV14JQ C 22
BS 1 767 RR2AV14TF
BS 768 778 RR2AV14JQ

RD RR2AV14TF 767 0 0
GCATCTCCCACGAACCACTCTGCTTCGCTTCTTTAAAAAAAATCCATTTTCTTTCGTATT
TGCTCCTCTGGTTTTAATTTAATTACGTAAACGTCCGGAATTTTAGTTTCTTCTGCTGGT
AACTTTCTTCGATTCTCACCGGGAAACATCCTCTCTCATCCCAAGACAGTCAAATCCCGC
AACGGAATCAACGCTCGGTTTCCCTCCAGAGCTACGTCGTTTAGGGCATACACGCAGACG
CTAAACGCTGAGCCAGCTGTAACAGAATCCGTTCGCCGGCGAGTGTCGAGTCTCTACGAA
CTGCTTAAAGTAAACGAAACGGCGTCGTTGACGGAGATAAAGACGGCGTACCGGAGCTTA
GCGAAGGTGCACCATCCGGATGCGTCGTAATCGGACGGACGAGATTTCATGGAGATCCAC
AGAGCTTACGCTACGCTGGCGGATCCGACAACGAGAGCGATATACGACTCGACGCTGGTA
TCACAACGGCGGAGACGGGTCCACGCTGGAGCTATGGGTCGGGTGTGCACGACGACACGG
AGATGGGAGACGGATCAGTGTTGGTGATTTAGTGTTTTTAGGGGTTTCTCCGATGATTTT
GCAGCAGCGAAACTGCACTTTTTGGCTTTGATTTTTTCCCCTTTCGTATACTTTTTGTTT
TCCTTTGTCATATCTTTGGAAAATTTAAAGGGGAAAATAAGAGTTTTATCATCTCAGCCC
TTTTATTTTTAACTTAAAAGAAGATACGTGTATATTATTTTGGGAAT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2AV14JQ 757 0 0
GCTTCGCTTCTTTAAAAAAAATCCATTTTCTTTCGTATTTGCTCCTCTGGTTTTAATTTA
ATTACGTAAACGTCCGGAATTTTAGTTTCTTCTGCTGGTAACTTTCTTCGATTCTCACCG
GGAAACATCTTCTCTCATCCCAAGACAGTCAAATCCCGCAACGGAATCAACGCTCGGTTT
CCCTCCAGAGCTACGTCGTTTAGGGCATACACGCAGACGCTAAACGCTGAGCCAGCTGTA
ACAGAATCCGTTCGCCGGCGAGTGTCGAGTCTCTACGAACTGCTTAAAGTAAACGAAACG
GCGTCGTTGACGGAGATAAAGACGGCGTACCGGAGCTTAGCGAAGGTGCACCATCCGGAT
GCGTCGTAATCGGACGGACGAGATTTCATGGAGATCCACAGAGCTTACGCTACGCTGGCG
GATCCGACAACGAGAGCGATATACGACTCGACGCTGGTATCACAACGGCGGAGACGGGTC
CACGCTGGAGCTATGGGTCGGGTGTGCACGACGACACGGAGATGGGAGACGGATCAGTGT
TGGTGATTTAGTGTTTTTAGGGGTTTCTCCGATGATTTTGCAGCAGCGAAACTGCACTTT
TTGGCTTTGATTTTTTCCCCTTTCGTATACTTTTTGTTTTCCTTTGTCATATCTTTGGAA
AATTTAA*GGGGAAAATAAGAGTTTTATCATCTCAGCCCTTTTATTTTTAACTTAAAAGA
AGATACGTGTATATTATTTTGGGAATTTGTAGGGAAC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL5870Contig1 792 2 6 U
GAGAAGAGTTATCTATCGGAACAATACTCTTACTGATCTATTAACAACAAGTAGATCTAC
ACCAGGGGAATTAGTAATGTGTCAGGAAAAATTGGTACAAGAAGCCGTGGATACACTTCT
TGATAATGGAATCCGTGGACAACCCATGAGGGATGGTCATAATAAGGTTTACAAGTCATT
TTCAGATGTAATTGAAGGAAAAGAGGGAAGATTTCGCGAGACTCTGCTTGGCAAACGGGC
CGATTATTCGGGGCGTTCGGTGATTGTCGTTGGACCCTCACTTTCATTACATCGCTGTGG
ATTGCCTCGCAAAATAGCAATAGAGCTCTTCCAGACATTTGTAATTCGTGGTCTAATTAG
ACAACATCTGGCTTCGAACATAGGAGTTGCTAAGAGTCAAATTCGTGAAAAAAAGCCCAT
TGTCTGGGAAATCCTTCAAGAAGTTATGCAGGGGCATCCCGTATTACTGAATAGAGCACC
TACTCTACATAGATTAGGCATACAGTCATTCCAACCCATTTTAGTGGAAGGACGCACTAT
TTGTTTACATCCATTAGTTTGTAAGGGGTTCAATGCAGACTTTGATGGGGATCAAATGGC
TGTTCATGTGCCTTTATCTTTAGAAGCTCAAGCAGAGGCTCGTTTACTTATGTTTTCTCA
TATGAATCTCTTATCTCCAGCTATTGGAGATCCCATTTCTGTACCGACTCAAGATATGCT
GATTGGACTCTATGTATTAACGAGCGGCACTCGTCGAGGTATTTGTGCAAACAGATATAA
TCCATGTAATCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D564TF U 1
AF RR2D564JQ C 1
BS 1 677 RR2D564TF
BS 678 678 RR2D564JQ
BS 679 711 RR2D564TF
BS 712 712 RR2D564JQ
BS 713 737 RR2D564TF
BS 738 792 RR2D564JQ

RD RR2D564TF 741 0 0
GAGAAGAGTTATCTATCGGAACAATACTCTTACTGATCTATTAACAACAAGTAGATCTAC
ACCAGGGGAATTAGTAATGTGTCAGGAAAAATTGGTACAAGAAGCCGTGGATACACTTCT
TGATAATGGAATCCGTGGACAACCCATGAGGGATGGTCATAATAAGGTTTACAAGTCATT
TTCAGATGTAATTGAAGGAAAAGAGGGAAGATTTCGCGAGACTCTGCTTGGCAAACGGGC
CGATTATTCGGGGCGTTCGGTGATTGTCGTTGGACCCTCACTTTCATTACATCGCTGTGG
ATTGCCTCGCAAAATAGCAATAGAGCTCTTCCAGACATTTGTAATTCGTGGTCTAATTAG
ACAACATCTGGCTTCGAACATAGGAGTTGCTAAGAGTCAAATTCGTGAAAAAAAGCCCAT
TGTCTGGGAAATCCTTCAAGAAGTTATGCAGGGGCATCCCGTATTACTGAATAGAGCACC
TACTCTACATAGATTAGGCATACAGTCATTCCAACCCATTTTAGTGGAAGGACGCACTAT
TTGTTTACATCCATTAGTTTGTAAGGGGTTCAATGCAGACTTTGATGGGGATCAAATGGC
TGTTCATGTGCCTTTATCTTTAGAAGCTCAAGCAGAGGCTCGTTTACTTATGTTTTCTCA
TATGAATCTCTTATCTC*AGCTATTGGAGATCCCATTTCTGTACCGACTCA*GATATGCT
GATTGGACTCTATGTAT
AACG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2D564JQ 792 0 0
GAGAAGAGTTATCTATCGGAACAATACTCTTACTGATCTATTAACAACAAGTAGATCTAC
ACCAGGGGAATTAGTAATGTGTCAGGAAAAATTGGTACAAGAAGCCGTGGATACACTTCT
TGATAATGGAATCCGTGGACAACCCATGAGGGATGGTCATAATAAGGTTTACAAGTCATT
TTCAGATGTAATTGAAGGAAAAGAGGGAAGATTTCGCGAGACTCTGCTTGGCAAACGGGC
CGATTATTCGGGGCGTTCGGTGATTGTCGTTGGACCCTCACTTTCATTACATCGCTGTGG
ATTGCCTCGCAAAATAGCAATAGAGCTCTTCCAGACATTTGTAATTCGTGGTCTAATTAG
ACAACATCTGGCTTCGAACATAGGAGTTGCTAAGAGTCAAATTCGTGAAAAAAAGCCCAT
TGTCTGGGAAATCCTTCAAGAAGTTATGCAGGGGCATCCCGTATTACTGAATAGAGCACC
TACTCTACATAGATTAGGCATACAGTCATTCCAACCCATTTTAGTGGAAGGACGCACTAT
TTGTTTACATCCATTAGTTTGTAAGGGGTTCAATGCAGACTTTGATGGGGATCAAATGGC
TGTTCATGTGCCTTTATCTTTAGAAGCTCAAGCAGAGGCTCGTTTACTTATGTTTTCTCA
TATGAATCTCTTATCTCCAGCTATTGGAGATCCCATTTCTGTACCGACTCAAGATATGCT
GATTGGACTCTATGTATTAACGAGCGGCACTCGTCGAGGTATTTGTGCAAACAGATATAA
TCCATGTAATCG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL5871Contig1 910 2 6 U
AAATTCAATTTGGTTTGCATCATACCCGGGGTTTCTTCACAAGATCGAGCAAGTATCTGA
GTGAGAGAGAATGGGGTCGTCAACTGGGAAAAGTGGAAACGATCTGTCGTTTAAGATATT
GTTGATTGGAGATTCTGGTGTTGGTAAAAGCAGTTTGCTTGTCAGCTTCATTTCCACCTC
CGTCGAAGATCTCGCTCCTACCATCGGTGTTGGTTTCAAGATTAAACAGTTGACAGTAGG
AGGCAAAAGACTGAAGCTCACAATCTGGGACACAGCTGGACAGGAACGGTTTAGAGCATT
AACGAGCTCTTACTACAGAGGCGCCCAAGGAATCATTCTCGTGTATGATGTGACGAGAAG
AGAGACATTTACAAACTTAGTAGATGTGTGGGGTAAAGAGATCGAGCTTTACTCCACTAA
CCAAGAATGCGTTAGGATGCTCGTTGGAAACAAAGTTGATAGAGAATCTGAGAGAGGAGT
TAGCAGAGAAGAAGGGATTGCTCTAGCGAAAGAACTCAAGTGCATGTTTCTCGAGTGTAG
TGCCAGAACTCGACAAAACGTAGAGCAATGTTTCGAAGAGCTGGCTTTGAAGATAATGGA
GGTACCTAGTCTTTTGGAAGAAGGATCAAGTGCTGTGAAGAGAAACATCTTGAAGCAAAA
CTCATCAGAACACCAGACTACTCCCCAAACTGGCTGCTGCAGCTAGTGAGACCGAATATC
CATGTTCATACAAAAAAAAAAAACTCGAATTGTTATTCCTTGTGTATTCCAAACTCAATC
TGATTCTTCTCTCTCTCTCTCTGAGGTTTGCCTCTTTTGTGTGTAGTTTCTCTGTAAATG
TGTGAGATTCCTGTTTGCTTCTGAAATGATATTTGTATTAAAATCATATAATAGAGTGAA
TAAACCCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH43TF U 1
AF RR2CH43JQ C 145
BS 1 623 RR2CH43TF
BS 624 624 RR2CH43JQ
BS 625 659 RR2CH43TF
BS 660 660 RR2CH43JQ
BS 661 725 RR2CH43TF
BS 726 910 RR2CH43JQ

RD RR2CH43TF 725 0 0
AAATTCAATTTGGTTTGCATCATACCCGGGGTTTCTTCACAAGATCGAGCAAGTATCTGA
GTGAGAGAGAATGGGGTCGTCAACTGGGAAAAGTGGAAACGATCTGTCGTTTAAGATATT
GTTGATTGGAGATTCTGGTGTTGGTAAAAGCAGTTTGCTTGTCAGCTTCATTTCCACCTC
CGTCGAAGATCTCGCTCCTACCATCGGTGTTGGTTTCAAGATTAAACAGTTGACAGTAGG
AGGCAAAAGACTGAAGCTCACAATCTGGGACACAGCTGGACAGGAACGGTTTAGAGCATT
AACGAGCTCTTACTACAGAGGCGCCCAAGGAATCATTCTCGTGTATGATGTGACGAGAAG
AGAGACATTTACAAACTTAGTAGATGTGTGGGGTAAAGAGATCGAGCTTTACTCCACTAA
CCAAGAATGCGTTAGGATGCTCGTTGGAAACAAAGTTGATAGAGAATCTGAGAGAGGAGT
TAGCAGAGAAGAAGGGATTGCTCTAGCGAAAGAACTCAAGTGCATGTTTCTCGAGTGTAG
TGCCAGAACTCGACAAAACGTAGAGCAATGTTTCGAAGAGCTGGCTTTGAAGATAATGGA
GGTACCTAGTCTTTTGGAAGAAG*ATCAAGTGCTGTGAAGAGAAACATCTTGAAGCAAA*
CTCATCAGAACACCAGACTACTCCCCAAACTGGCTGCTGCAGCTAGTGAGACCGAATATC
CATGT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2CH43JQ 766 0 0
TAAAAGCAGTTTGCTTGTCAGCTTCATTTCCACCTCCGTCGAAGATCTCGCTCCTACCAT
CGGTGTTGGTTTCAAGATTAAACAGTTGACAGTAGGAGGCAAAAGACTGAAGCTCACAAT
CTGGGACACAGCTGGACAGGAACGGTTTAGAGCATTAACGAGCTCTTACTACAGAGGCGC
CCAAGGAATCATTCTCGTGTATGATGTGACGAGAAGAGAGACATTTACAAACTTAGTAGA
TGTGTGGGGTAAAGAGATCGAGCTTTACTCCACTAACCAAGAATGCGTTAGGATGCTCGT
TGGAAACAAAGTTGATAGAGAATTTGAGAGAGGAGTTAGCAGAGAAGAAGGGATTGCTCT
AGCGAAAGAACTCAAGTGCATGTTTCTCGAGTGTAGTGCCAGAACTCGACAAAACGTAGA
GCAATGTTTCGAAGAGCTGGCTTTGAAGATAATGGAGGTACCTAGTCTTTTGGAAGAAGG
ATCAAGTGCTGTGAAGAGAAACATCTTGAAGCAAAACTCATCAGAACACCAGACTACTCC
CCAAACTGGCTGCTGCAGCTAGTGAGACCGAATATCCATGTTCATACAAAAAAAAAAAAC
TCGAATTGTTATTCCTTGTGTATTCCAAACTCAATCTGATTCTTCTCTCTCTCTCTCTGA
GGTTTGCCTCTTTTGTGTGTAGTTTCTCTGTAAATGTGTGAGATTCCTGTTTGCTTCTGA
AATGATATTTGTATTAAAATCATATAATAGAGTGAATAAACCCCCG

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL5872Contig1 656 2 2 U
GCTTGTAATGACAGGAGGTCATGTACAGGGTGATGATGTTTTTGGAACTGCGGATGTGGT
ATCGTTGCTTATGGATGATGCAGAGGCAGCACAACTAGAGCAGAAATTCAGAGAACTACC
GTTACAGGTAAAGGACAGGCAGAAGAAAAAACAGCCAATGAAACGAATCAGAATAGATGC
TGAAGGAGATGCAGCTTTGGAAGAGTTGGATGATGCTCCCGAACGTCAGGATAATGGGGA
GGAACCTGACCAAGAACCGGAAAATACAAAACCTAGTAACAAAAAGAGGAAAGCTGCGTC
AACTCCGAGAGCTAGAGCTCCTCAGAAAGCAAAGGAAGAAGAGAATGGTGAAGGAGATGA
TACTCCTCTTCAGCCTCAGAGAACAAAAAGAGTAAAGAGACAAACAAAGAGCATAAACGA
GTCTCTTGAACCTGTCTTCTCTGCATCAGTTACTCCAACAAATGGAGAATTCAACCCAGG
TAGCTCTAATGCAGATGGTTAAAGCTTTTAATAGATATATTAACTCCATGCAGATTTTAG
TAAACTTGGTTCCTAGCTTTTGAACTAATTGTACAGATTTTAATAAGTTTTACTCTTTAA
CCCTACATCGATCTAATGGCATGTACATTTATAAATATTATTGTCGATTTATAGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL62TF U 1
AF RR2DL62JQ C 1
BS 1 597 RR2DL62TF
BS 598 656 RR2DL62JQ

RD RR2DL62TF 597 0 0
GCTTGTAATGACAGGAGGTCATGTACAGGGTGATGATGTTTTTGGAACTGCGGATGTGGT
ATCGTTGCTTATGGATGATGCAGAGGCAGCACAACTAGAGCAGAAATTCAGAGAACTACC
GTTACAGGTAAAGGACAGGCAGAAGAAAAAACAGCCAATGAAACGAATCAGAATAGATGC
TGAAGGAGATGCAGCTTTGGAAGAGTTGGATGATGCTCCCGAACGTCAGGATAATGGGGA
GGAACCTGACCAAGAACCGGAAAATACAAAACCTAGTAACAAAAAGAGGAAAGCTGCGTC
AACTCCGAGAGCTAGAGCTCCTCAGAAAGCAAAGGAAGAAGAGAATGGTGAAGGAGATGA
TACTCCTCTTCAGCCTCAGAGAACAAAAAGAGTAAAGAGACAAACAAAGAGCATAAACGA
GTCTCTTGAACCTGTCTTCTCTGCATCAGTTACTCCAACAAATGGAGAATTCAACCCAGG
TAGCTCTAATGCAGATGGTTAAAGCTTTTAATAGATATATTAACTCCATGCAGATTTTAG
TAAACTTGGTTCCTAGCTTTTGAACTAATTGTACAGATTTTAATAAGTTTTACTCTT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2DL62JQ 656 0 0
GCTTGTAATGACAGGAGGTCATGTACAGGGTGATGATGTTTTTGGAACTGCGGATGTGGT
ATCGTTGCTTATGGATGATGCAGAGGCAGCACAACTAGAGCAGAAATTCAGAGAACTACC
GTTACAGGTAAAGGACAGGCAGAAGAAAAAACAGCCAATGAAACGAATCAGAATAGATGC
TGAAGGAGATGCAGCTTTGGAAGAGTTGGATGATGCTCCCGAACGTCAGGATAATGGGGA
GGAACCTGACCAAGAACCGGAAAATACAAAACCTAGTAACAAAAAGAGGAAAGCTGCGTC
AACTCCGAGAGCTAGAGCTCCTCAGAAAGCAAAGGAAGAAGAGAATGGTGAAGGAGATGA
TACTCCTCTTCAGCCTCAGAGAACAAAAAGAGTAAAGAGACAAACAAAGAGCATAAACGA
GTCTCTTGAACCTGTCTTCTCTGCATCAGTTACTCCAACAAATGGAGAATTCAACCCAGG
TAGCTCTAATGCAGATGGTTAAAGCTTTTAATAGATATATTAACTCCATGCAGATTTTAG
TAAACTTGGTTCCTAGCTTTTGAACTAATTGTACAGATTTTAATAAGTTTTACTCTTTAA
CCCTACATCGATCTAATGGCATGTACATTTATAAATATTATTGTCGATTTATAGTT

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL5873Contig1 846 2 2 U
GAGGGAAAGACCCGGCCGACCTGCCCAGGGCTCGAGGGCGAGCTTTAGTTAAGAGAGAAT
GGGGAGCGAATCGAAAGGCTTCCGTTTTCGTTCTTGGTTTGGTTCGGGCTCCTCTCGATC
TTTTTCGTAGTAGGGAAGGGGGAAGGAGTCTAAATCTATGGACATTAATGAACCATCATT
GATGGACGTTGCACATGACACGATCAATTCGACTCAAGGTCCGGCGCTAATAGAGGTTGC
TTACTTTCCTAGTAGCGAAGGAAAAGGGCAGGGCTTTTTTCGTGGTAATAGCGGGCGGGT
CTCCTTTCGAAGTAAAGGCCTTCGCATTCCTAATCCGCCCCACCAACCACGAACGGCTTA
GTTTGCCCCAGCTTGGTGAATCCCCGCGCAACGACATAGTTTGTGCGCCCTTTACCGTTC
TCGCTCAGTGTTTGCAACGGCTGGGGAGGCAGTCGTAGAAGCGAAGTCTATCGCCACGCC
AACCATCAAATACGAGATTGGGGGCCCCTTCTCAACGATTTGATGGAATGGCCCACCCAA
TAGCGCTTATGTCATATGGGAACTCATGGCTGGAAACAATCCTTATGGTTTTGATATCCG
GTAGGAATAATAAGAATCAAAGTCCAGGTAGGTTGGTGAGCCTAGTGATAGGAGACTATC
TAGCTTGGTTCGGAGAGCACTTGTTGGGTTAAAGACTTTTTTTGTTGCTAAATGTTACAG
CCTAAATGCTGAACTATTGACTCTACTCGTTCGGATGGGTGTTTACCCCAAAGTGTTCCT
GGACTGCATGCATACATCCGTAAGTAACTTAGTGCAACATGGCAAATTTCATTGAGAGGA
ATCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE52TF U 1
AF RR2BE52JQ C 81
BS 1 685 RR2BE52TF
BS 686 846 RR2BE52JQ

RD RR2BE52TF 685 0 0
GAGGGAAAGACCCGGCCGACCTGCCCAGGGCTCGAGGGCGAGCTTTAGTTAAGAGAGAAT
GGGGAGCGAATCGAAAGGCTTCCGTTTTCGTTCTTGGTTTGGTTCGGGCTCCTCTCGATC
TTTTTCGTAGTAGGGAAGGGGGAAGGAGTCTAAATCTATGGACATTAATGAACCATCATT
GATGGACGTTGCACATGACACGATCAATTCGACTCAAGGTCCGGCGCTAATAGAGGTTGC
TTACTTTCCTAGTAGCGAAGGAAAAGGGCAGGGCTTTTTTCGTGGTAATAGCGGGCGGGT
CTCCTTTCGAAGTAAAGGCCTTCGCATTCCTAATCCGCCCCACCAACCACGAACGGCTTA
GTTTGCCCCAGCTTGGTGAATCCCCGCGCAACGACATAGTTTGTGCGCCCTTTACCGTTC
TCGCTCAGTGTTTGCAACGGCTGGGGAGGCAGTCGTAGAAGCGAAGTCTATCGCCACGCC
AACCATCAAATACGAGATTGGGGGCCCCTTCTCAACGATTTGATGGAATGGCCCACCCAA
TAGCGCTTATGTCATATGGGAACTCATGGCTGGAAACAATCCTTATGGTTTTGATATCCG
GTAGGAATAATAAGAATCAAAGTCCAGGTAGGTTGGTGAGCCTAGTGATAGGAGACTATC
TAGCTTGGTTCGGAGAGCACTTGTT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2BE52JQ 766 0 0
TCCGTTTTCGTTCTTGGTTTGGTTCGGGCTCCTCTCGATCTTTTTCGTAGTAGGGAAGGG
GGAAGGAGTCTAAATCTATGGACATTAATGAACCATCATTGATGGACGTTGCACATGACA
CGATCAATTCGACTCAAGGTCCGGCGCTAATAGAGGTTGCTTACTTTCCTAGTAGCGAAG
GAAAAGGGCAGGGCTTTTTTCGTGGTAATAGCGGGCGGGTCTCCTTTCGAAGTAAAGGCC
TTCGCATTCCTAATCCGCCCCACCAACCACGAACGGCTTAGTTTGCCCCAGCTTGGTGAA
TCCCCGCGCAACGACATAGTTTGTGCGCCCTTTACCGTTCTCGCTCAGTGTTTGCAACGG
CTGGGGAGGCAGTCGTAGAAGCGAAGTCTATCGCCACGCCAACCATCAAATACGAGATTG
GGGGCCCCTTCTCAACGATTTGATGGAATGGCCCACCCAATAGCGCTTATGTCATATGGG
AACTCATGGCTGGAAACAATCCTTATGGTTTTGATATCCGGTAGGAATAATAAGAATCAA
AGTCCAGGTAGGTTGGTGAGCCTAGTGATAGGAGACTATCTAGCTTGGTTCGGAGAGCAC
TTGTTGGGTTAAAGACTTTTTTTGTTGCTAAATGTTACAGCCTAAATGCTGAACTATTGA
CTCTACTCGTTCGGATGGGTGTTTACCCCAAAGTGTTCCTGGACTGCATGCATACATCCG
TAAGTAACTTAGTGCAACATGGCAAATTTCATTGAGAGGAATCAGC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL5874Contig1 734 2 5 U
ACTCTTTTGACTTTGCGATAAAAATACATTTGGCTATCAAAATTAGTTACACCAATTGAT
ATATAATATGATCACTAGATAAAAACAACAATGAGATTTTGACCCAAAAAAAACAACAAT
GAGATGGAAAATGAGTTTTTACATAATAGTGCAAAAGGTACTGAGTCCCATAAAAATTGC
AAATTCCATTGCGCTCATCGCAGTCAACCATCCCCATCCTCGCAGGTCGTTGTTCGGGCA
TGTTTTGGTCGCCAGGCGGCTCCAAAGGAGGGTGGCTACCCCTAGATCGTAATAAAACGA
AACTATCCAGGAAGACATGATGCGGATGATTATAATTCCGCCGCATATAACAGTTGACGC
AAAGATCAAACGTCTCGCCAGCACACTGCGATTCGAAGCACGTTACACACGTAAAGTGTA
AACCAATGAAAGGCTGGAGGCACGTGCGGCAGCCGATGGTCCGCATCCGAGCCACATAGT
AAAGCGTCAAAACCTCCCAAAAGTCAAGCTGGCCGTCTCTATTTCGGTCTAGTTCCTGAA
ACATCTCGCGATGGACCCAAGCTAAACCAGTGGTTCTACACAAGAAGTCGGTATACTCTT
GAAAGCTGACACGGCCATTACCGTCACCGTCCATTGAACAGAAAAACTGCCATGCCAAAT
TCTGTTGCTCCGTGGAGCCGTTGTTGTAATAAGCCGTTGCCGCTTCATGAAGCTCTTGCA
TTGTTGATAAGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2BV64TF C 1
AF RR2BV64JQ U 8
BS 1 11 RR2BV64TF
BS 12 214 RR2BV64JQ
BS 215 215 RR2BV64TF
BS 216 729 RR2BV64JQ
BS 730 734 RR2BV64TF

RD RR2BV64TF 734 0 0
ACTCTTTTGACTTTGCGATAAAAATACATTTGGCTATCAAA*TTAGTTACACCAATTGAT
ATATAATATGATCACTAGATAAAAACAACAATGAGATTT*GACCCAAAAAAA*CAACAAT
GAGATGGAAAATGAGTTTTTACATAATAGTGCAAAAGGTACTGAGTCCCATAGAAATTGC
AAATTCCATTGCGCTCATCGCAGTCAACCATCCCCATCCTCGCAGGTCGTTGTTCGGGCA
TGTTTTGGTCGCCAGGCGGCTCCAGAGGAGGGTGGCTACGCCTAGATCGTAATAAAACGA
AACTATCCAGGAAGACATGATGCGGATGATTATAATTCCGCCGCATATAACAGTTGACGC
AGAGATCAAACGTCTCGCCAGCACACTGCGATTCGAAGCACGTTACACACGTAAAGTGTA
AACCAATGAGAGGCTGGAGGCACGTGCGGCAGCCGATGGTCCGCATCCGAGCCACATAGT
AAAGCGTCAAAACCTCCCAGAAGTCAAGCTGGCCGTCTCTATTTCGGTCTAGTTCCTGAA
ACATCTCGCGATGGACCCAAGCTAAACCAGTGGTTCTACACAAGAAGTCGGTATACTCTT
GAAAGCTGACACGGCCATTACCGTCACCGTCCATTGAACAGAAAAACTGCCATGCCAAAT
TCTGTTGCTCCGTGGAGCCGTTGTTGTAATAAGCCGTTGCCGCTTCATGAAGCTCTTGCA
TTGTTGATAAGGCT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2BV64JQ 722 0 0
GACT
TTTGCGATAAAAATACATTTGGCTATCAAAATTAGTTACACCAATTGATATATAATATGA
TCACTAGATAAAAACAACAATGAGATTTTGACCCAAAAAAAACAACAATGAGATGGAAAA
TGAGTTTTTACATAATAGTGCAAAAGGTACTGAGTCCCATAAAAATTGCAAATTCCATTG
CGCTCATCGCAGTCAACCATCCC*ATCCTCGCAGGTCGTTGTTCGGGCATGTTTTGGTCG
CCAGGCGGCTCCAAAGGAGGGTGGCTACCCCTAGATCGTAATAAAACGAAACTATCCAGG
AAGACATGATGCGGATGATTATAATTCCGCCGCATATAACAGTTGACGCAAAGATCAAAC
GTCTCGCCAGCACACTGCGATTCGAAGCACGTTACACACGTAAAGTGTAAACCAATGAAA
GGCTGGAGGCACGTGCGGCAGCCGATGGTCCGCATCCGAGCCACATAGTAAAGCGTCAAA
ACCTCCCAAAAGTCAAGCTGGCCGTCTCTATTTCGGTCTAGTTCCTGAAACATCTCGCGA
TGGACCCAAGCTAAACCAGTGGTTCTACACAAGAAGTCGGTATACTCTTGAAAGCTGACA
CGGCCATTACCGTCACCGTCCATTGAACAGAAAAACTGCCATGCCAAATTCTGTTGCTCC
GTGGAGCCGTTGTTGTAATAAGCCGTTGCCGCTTCATGAAGCTCTTGCATTGTTGATA

QA 5 722 5 722
DS 



AS 1 2

CO CL5875Contig1 892 2 2 U
GCCGCTTCGAACGAACGGTTCTTGCTCGGAGCTACAGGGAAGAAAGTGTCTCAGTTAAAC
CCGAGTCCCCTCGACTCGTCTGTTGAGTGGGAACTGGTGAGAGAAGGATCCAAGATCAAG
CTCAGGACCAGATACGGTAACTATCTAAGAGCTCACGGTGGACTTCCTCCGTGGAGAAAC
TCCGTCACGCACGATCATTTGTCAGCTACTCAGGATTCCATCTCGTGGGATGTTGAAGAG
TTCCTGATCAATCCTCAAGTCACGGCGGAGACAGAGCTCACTCCGTCCTCTTTTTCACTG
AGATATGATCAAAATTCGTCGGTTGTGTCTCCACCGAAATCGGATGGGAGAACGATATAC
TACCATATGGCTGACAATGAAGGACACGTGGAGGACGAATCAACCGTTGGATATGCTTTC
ACGTTTAAAGGAAACAGCGTGGCGGAGCTGACTCGGACGCTGCGAGAAGAAACGTGCTTG
GAGGATGCTGTGGTGTATACTCGCAGTCCATTAGACGGCAGCAAGCTGTTTCCCCTTCGT
TTGCAACTTCCTCCGAACAATGGAACCTCGTTTTAGTACCCTCCTGTGCTAGCCTCTAGA
CTGGCACAGGAGTTTTGCGGATACATTGCAAACCAAATACTTGAGCATTGCTTACTCTTT
AGTAAAGAGTTGATATACAAAAATACAATAAAAGTTTTGATAATATAAAATACATAACTA
CATTATAATGTAGATCGAGTTTTTTTGTTGTTGTAAATAAGCAATTTCTTTGTAAAATAA
CGTTTGGATTTTAGGAGTTAGTATGTGTGCATTCGCATTGCTGTTGTTGTTTTATATACA
TCACAGTTACTACTTACTAGTAAATGAAAATGAGTATTTTTTTTTGTAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ44TF U 1
AF RR2AJ44JQ C 43
BS 1 787 RR2AJ44TF
BS 788 892 RR2AJ44JQ

RD RR2AJ44TF 787 0 0
GCCGCTTCGAACGAACGGTTCTTGCTCGGAGCTACAGGGAAGAAAGTGTCTCAGTTAAAC
CCGAGTCCCCTCGACTCGTCTGTTGAGTGGGAACTGGTGAGAGAAGGATCCAAGATCAAG
CTCAGGACCAGATACGGTAACTATCTAAGAGCTCACGGTGGACTTCCTCCGTGGAGAAAC
TCCGTCACGCACGATCATTTGTCAGCTACTCAGGATTCCATCTCGTGGGATGTTGAAGAG
TTCCTGATCAATCCTCAAGTCACGGCGGAGACAGAGCTCACTCCGTCCTCTTTTTCACTG
AGATATGATCAAAATTCGTCGGTTGTGTCTCCACCGAAATCGGATGGGAGAACGATATAC
TACCATATGGCTGACAATGAAGGACACGTGGAGGACGAATCAACCGTTGGATATGCTTTC
ACGTTTAAAGGAAACAGCGTGGCGGAGCTGACTCGGACGCTGCGAGAAGAAACGTGCTTG
GAGGATGCTGTGGTGTATACTCGCAGTCCATTAGACGGCAGCAAGCTGTTTCCCCTTCGT
TTGCAACTTCCTCCGAACAATGGAACCTCGTTTTAGTACCCTCCTGTGCTAGCCTCTAGA
CTGGCACAGGAGTTTTGCGGATACATTGCAAACCAAATACTTGAGCATTGCTTACTCTTT
AGTAAAGAGTTGATATACAAAAATACAATAAAAGTTTTGATAATATAAAATACATAACTA
CATTATAATGTAGATCGAGTTTTTTTGTTGTTGTAAATAAGCAATTTCTTTGTAAAATAA
CGTTTGG

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2AJ44JQ 850 0 0
AAAGTGTCTCAGTTAAACCCGAGTCCCCTCGACTCGTCTGTTGAGTGGGAACTGGTGAGA
GAAGGATCCAAGATCAAGCTCAGGACCAGATACGGTAACTATCTAAGAGCTCACGGTGGA
CTTCCTCCGTGGAGAAACTCCGTCACGCACGATCATTTGTCAGCTACTCAGGATTCCATC
TCGTGGGATGTTGAAGAGTTCCTGATCAATCCTCAAGTCACGGCGGAGACAGAGCTCACT
CCGTCCTCTTTTTCACTGAGATATGATCAAAATTCGTCGGTTGTGTCTCCACCGAAATCG
GATGGGAGAACGATATACTACCATATGGCTGACAATGAAGGACACGTGGAGGACGAATCA
ACCGTTGGATATGCTTTCACGTTTAAAGGAAACAGCGTGGCGGAGCTGACTCGGACGCTG
CGAGAAGAAACGTGCTTGGAGGATGCTGTGGTGTATACTCGCAGTCCATTAGACGGCAGC
AAGCTGTTTCCCCTTCGTTTGCAACTTCCTCCGAACAATGGAACCTCGTTTTAGTACCCT
CCTGTGCTAGCCTCTAGACTGGCACAGGAGTTTTGCGGATACATTGCAAACCAAATACTT
GAGCATTGCTTACTCTTTAGTAAAGAGTTGATATACAAAAATACAATAAAAGTTTTGATA
ATATAAAATACATAACTACATTATAATGTAGATCGAGTTTTTTTGTTGTTGTAAATAAGC
AATTTCTTTGTAAAATAACGTTTGGATTTTAGGAGTTAGTATGTGTGCATTCGCATTGCT
GTTGTTGTTTTATATACATCACAGTTACTACTTACTAGTAAATGAAAATGAGTATTTTTT
TTTGTAAAAG

QA 1 850 1 850
DS 



AS 1 2

CO CL5876Contig1 1055 2 8 U
GGATCCGCGACGAATATCTCAAGCTCCGGAAGGACAAGGATTTGTGTTCATGGCAGCTTT
GCAAATGTCTCGTGAATGGATCGGTATTCAGCAGTTCCCACCTGCTACTCAATCTAAGTT
GCTCGAGATCCTTGGCAAGTTCAAAGAAGAGGATGTGAGCTCGCTAACAGTACTTGTGAT
GGGGAAAGGAGGTGTTGGAAAGTCATCTACTGTGAATTCAGTTATAGGCGAGAGAGCTGC
TGCAGTCAGTACTTTCCAGTCTGAAGGACTGAGACCTTCCTTGGTCTCTCGCTCAAGGTC
GGGTTTTACATTAAATATAATCGACACTCCTGGTCTTATTGAGGGAGGATATGTGAATGA
TCAAGCCGTCAACCTTATAAAAGGATTTCTCCTGAACAAGACTATAGATGTGCTACTATA
CGTAGACCGTTTGGATGTGTATCGGGTGGATGACTTAGATAAGCAGGTGGTGACGGCTAT
AACCGATGCATTTGGTAAAGAGATATGGAAGAAGTCTGCTCTTGTCCTCAGTCATGCTCA
GTTCTCTCCCCCGGACGGGTTAAACTATGATCTCTTTGTCTCCAGAAGATCCGACGCTCT
TCTGAAACTGATCTATGCTAGCGCTCAACTGAAGAAACAGGATATCCAGGATTCATCTCT
TCCTGTTATTCTTGTTGAGAACAGCGGGAGATGTCATAAGAATGAAAGCGATGAAAAGAT
TCTTCCAGACGGAAGAAGTTGGATTACGAATCTGCACAAGACAATCACAGAGATCTCTTT
TAATGGCAACAAGTCGATCCACGTTGACAAGAAACTGGTGGAAGGGCCAAACCCAAACGC
AAGAGGAAAAAGACTAATCCCATTAATCTTTGCATTCCAATACCTGCTAGTCATGAAGCC
GGTTCATCAGCAACTCGAAGGTCTTAGTTCGGGTTTTGTTTTGGTTTAGTTCGGTTTGTC
TCTGAGAAAATTTCCGTACTCGAATTTATATATGTTTACTCTCTGTAATGACATTGTAGC
TTTATGTATTGGTCTTCTTTTGGTGATTCACTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH75TF U 1
AF RR2FH75JQ C 357
BS 1 640 RR2FH75TF
BS 641 641 RR2FH75JQ
BS 642 680 RR2FH75TF
BS 681 681 RR2FH75JQ
BS 682 701 RR2FH75TF
BS 702 702 RR2FH75JQ
BS 703 716 RR2FH75TF
BS 717 1055 RR2FH75JQ

RD RR2FH75TF 724 0 0
GGATCCGCGACGAATATCTCAAGCTCCGGAAGGACAAGGATTTGTGTTCATGGCAGCTTT
GCAAATGTCTCGTGAATGGATCGGTATTCAGCAGTTCCCACCTGCTACTCAATCTAAGTT
GCTCGAGATCCTTGGCAAGTTCAAAGAAGAGGATGTGAGCTCGCTAACAGTACTTGTGAT
GGGGAAAGGAGGTGTTGGAAAGTCATCTACTGTGAATTCAGTTATAGGCGAGAGAGCTGC
TGCAGTCAGTACTTTCCAGTCTGAAGGACTGAGACCTTCCTTGGTCTCTCGCTCAAGGTC
GGGTTTTACATTAAATATAATCGACACTCCTGGTCTTATTGAGGGAGGATATGTGAATGA
TCAAGCCGTCAACCTTATAAAAGGATTTCTCCTGAACAAGACTATAGATGTGCTACTATA
CGTAGACCGTTTGGATGTGTATCGGGTGGATGACTTAGATAAGCAGGTGGTGACGGCTAT
AACCGATGCATTTGGTAAAGAGATATGGAAGAAGTCTGCTCTTGTCCTCAGTCATGCTCA
GTTCTCTCCCCCGGACGGGTTAAACTATGATCTCTTTGTCTCCAGAAGATCCGACGCTCT
TCTGAAACTGATCTATGCTAGCGCTCAACTGAAGAAACAG*ATATCCAGGATTCATCTCT
TCCTGTTATTCTTGTTGAGA*CAGCGGGAGATGTCATAAGA*TGAAAGCGATGAAA
GATCTTCA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2FH75JQ 699 0 0
ATGATCAAGCCGTCAACCTTATAAAAGGATTTCTCCTGAACAAGACTATAGATGTGCTAC
TATACGTAGACCGTTTGGATGTGTATCGGGTGGATGACTTAGATAAGCAGGTGGTGACGG
CTATAACCGATGCATTTGGTAAAGAGATATGGAAGAAGTCTGCTCTTGTCCTCAGTCATG
CTCAGTTCTCTCCCCCGGACGGGTTAAACTATGATCTCTTTGTCTCCAGAAGATCCGACG
CTCTTCTGAAACTGATCTATGCTAGCGCTCAACTGAAGAAACAGGATATCCAGGATTCAT
CTCTTCCTGTTATTCTTGTTGAGAACAGCGGGAGATGTCATAAGAATGAAAGCGATGAAA
AGATTCTTCCAGACGGAAGAAGTTGGATTACGAATCTGCACAAGACAATCACAGAGATCT
CTTTTAATGGCAACAAGTCGATCCACGTTGACAAGAAACTGGTGGAAGGGCCAAACCCAA
ACGCAAGAGGAAAAAGACTAATCCCATTAATCTTTGCATTCCAATACCTGCTAGTCATGA
AGCCGGTTCATCAGCAACTCGAAGGTCTTAGTTCGGGTTTTGTTTTGGTTTAGTTCGGTT
TGTCTCTGAGAAAATTTCCGTACTCGAATTTATATATGTTTACTCTCTGTAATGACATTG
TAGCTTTATGTATTGGTCTTCTTTTGGTGATTCACTAGG

QA 1 699 1 699
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5878Contig1 559 2 1 U
GATTGATGCTAAGTACTTGGGATACCCTCAGGTTTTGACCAAGTTCTGTTACTTTCTGAT
GGATGCTTTGAGAGAGAAAGGAGCTAGGATGAAGCCGATGCTATGTGCCTGCGCATCTCA
ACAACCGGGGAAGATACTTGTGGTTGGAGTTTGTGGGAAGCCGAGGCTCGGTGCAGTAAG
AGGGAATGCGTTTGGTAATGCTTTCAGAAAAGCAGCTCAAGAGAGTAGAGCTGATTACTT
TCACGAGCTATTCGAGTCCTCATGGATCGTCTTGGATGTTTCTGCTGTTAACTCTTTCAT
GATTAGATTAACTGAGAAGCTTTGACATAGAACTCCTCAAGGTATCTCTTTTTGTTATTC
GACTCATCATTGTGTGTTTTCATTTTCTAGTTTTTCAGTTCTTTATATCTTACATTGTTT
GGAATTTTACAAGCCTTTGTAATGGGCAAGAATCTGTTATCAATCATGTAACTTGTTTAA
TCAAATAACAATAGAGCATTATGGATCCTTTGACTCTTGTAATGTTGACAGAAATAAAGT
TTCTAACAGCTCTTATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H772TF U 1
AF RR2H772JQB C 58
BS 1 559 RR2H772TF

RD RR2H772TF 559 0 0
GATTGATGCTAAGTACTTGGGATACCCTCAGGTTTTGACCAAGTTCTGTTACTTTCTGAT
GGATGCTTTGAGAGAGAAAGGAGCTAGGATGAAGCCGATGCTATGTGCCTGCGCATCTCA
ACAACCGGGGAAGATACTTGTGGTTGGAGTTTGTGGGAAGCCGAGGCTCGGTGCAGTAAG
AGGGAATGCGTTTGGTAATGCTTTCAGAAAAGCAGCTCAAGAGAGTAGAGCTGATTACTT
TCACGAGCTATTCGAGTCCTCATGGATCGTCTTGGATGTTTCTGCTGTTAACTCTTTCAT
GATTAGATTAACTGAGAAGCTTTGACATAGAACTCCTCAAGGTATCTCTTTTTGTTATTC
GACTCATCATTGTGTGTTTTCATTTTCTAGTTTTTCAGTTCTTTATATCTTACATTGTTT
GGAATTTTACAAGCCTTTGTAATGGGCAAGAATCTGTTATCAATCATGTAACTTGTTTAA
TCAAATAACAATAGAGCATTATGGATCCTTTGACTCTTGTAATGTTGACAGAAATAAAGT
TTCTAACAGCTCTTATGTC

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2H772JQB 502 0 0
GATGGATGCTTTGAGAGAGAAAGGAGCTAGGATGAAGCCGATGCTATGTGCCTGCGCATC
TCAACAACCGGGGAAGATACTTGTGGTTGGAGTTTGTGGGAAGCCGAGGCTCGGTGCAGT
AAGAGGGAATGCGTTTGGTAATGCTTTCAGAAAAGCAGCTCAAGAGAGTAGAGCTGATTA
CTTTCACGAGCTATTCGAGTCCTCATGGATCGTCTTGGATGTTTCTGCTGTTAACTCTTT
CATGATTAGATTAACTGAGAAGCTTTGACATAGAACTCCTCAAGGTATCTCTTTTTGTTA
TTCGACTCATCATTGTGTGTTTTCATTTTCTAGTTTTTCAGTTCTTTATATCTTACATTG
TTTGGAATTTTACAAGCCTTTGTAATGGGCAAGAATCTGTTATCAATCATGTAACTTGTT
TAATCAAATAACAATAGAGCATTATGGATCCTTTGACTCTTGTAATGTTGACAGAAATAA
AGTTTCTAACAGCTCTTATGTC

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 2

CO CL5879Contig1 932 2 8 U
CATCACAAACAAACAACACCATTAAAACCTTCAAGCAGTACCAATACCACAAACCAAGCA
TGCGCAGCATGCAAATACCAACGCAGGAAATGCGCTCCCGATTGTCTCCTCGCTCCTTAT
TTCCCTCACGACCGTCACCGACAATTCCTCAACGCGCATAAGCTCTTTGGTGTCAGCAAC
ATCACCAAGATCATCAAAGACCTTAGCCCTCCTGAGAAAGACGCGGCTATGCATACAATC
ATGTTTCAGTCTGATGCTCGTGCCAATGATCCCATTGAAGGTTGCTATAGCATCATAAGA
AGGCTTCAGTACGAGATCGATTATAATAAGAATGAATTGGACATGGTTCTTCATCAATTG
GCTGTGTTTCGTGACCGTGCTCATAATCATTATCATCAAGAACCGCATATGCAGATGCAA
GAACCTGATGATCTCTCGAGTTCTCTTGATCTAAACAGCAACAACTCGATTCATTACAGT
TACCCGCTTCATCATGTCCAAGAACCAAACCAACAACAACAACAATATTGTTCTTCTGGA
AACTTCAATGGGTTACAAGAAGACATGTGGTGTCTTCAACTTCAAGATTCACCAACGACA
GTGAATATGAAGGGTGGCTTCGTTGATGAATGTGGGGGCGTTAAGCCTGTAGAAGAGGCT
TCTAACGAGTTCGAGCATCATGATGGTTTCGTTGAAGACAGTAAACTCGACTTGCCTTCA
ACACAATTCATTGTTTCTTCTTAGCTTTTATTTTCTTGATTTAAGAATCATTTATATAGG
GCTTAACAAATAATCCTCTCATAGATCGATCTCAATAGATTTTCTTTTGTACCTTATTTG
GTTAAATTCGTTATAGGATTAGATGTGAAGGAGACATGGAATTTTCAAAAATATATGTCA
CACAAGAATTTGATGGAATAAAAATTCAGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA39TF U 1
AF RR2EA39JQ C 216
BS 1 657 RR2EA39TF
BS 658 658 RR2EA39JQ
BS 659 695 RR2EA39TF
BS 696 696 RR2EA39JQ
BS 697 720 RR2EA39TF
BS 721 721 RR2EA39JQ
BS 722 735 RR2EA39TF
BS 736 932 RR2EA39JQ

RD RR2EA39TF 738 0 0
CATCACAAACAAACAACACCATTAAAACCTTCAAGCAGTACCAATACCACAAACCAAGCA
TGCGCAGCATGCAAATACCAACGCAGGAAATGCGCTCCCGATTGTCTCCTCGCTCCTTAT
TTCCCTCACGACCGTCACCGACAATTCCTCAACGCGCATAAGCTCTTTGGTGTCAGCAAC
ATCACCAAGATCATCAAAGACCTTAGCCCTCCTGAGAAAGACGCGGCTATGCATACAATC
ATGTTTCAGTCTGATGCTCGTGCCAATGATCCCATTGAAGGTTGCTATAGCATCATAAGA
AGGCTTCAGTACGAGATCGATTATAATAAGAATGAATTGGACATGGTTCTTCATCAATTG
GCTGTGTTTCGTGACCGTGCTCATAATCATTATCATCAAGAACCGCATATGCAGATGCAA
GAACCTGATGATCTCTCGAGTTCTCTTGATCTAAACAGCAACAACTCGATTCATTACAGT
TACCCGCTTCATCATGTCCAAGAACCAAACCAACAACAACAACAATATTGTTCTTCTGGA
AACTTCAATGGGTTACAAGAAGACATGTGGTGTCTTCAACTTCAAGATTCACCAACGACA
GTGAATATGAAGGGTGGCTTCGTTGATGAATGTGGGGGCGTTAAGCCTGTAGAAGAG*CT
TCTAACGAGTTCGAGCATCATGATGGTTTCGTTGA*GACAGTAAACTCGACTTGCCTTCA
*CACAATTCATTGTT
CTT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2EA39JQ 717 0 0
GAAAGACGCGGCTATGCATACAATCATGTTTCAGTCTGATGCTCGTGCCAATGATCCCAT
TGAAGGTTGCTATAGCATCATAAGAAGGCTTCAGTACGAGATCGATTATAATAAGAATGA
ATTGGACATGGTTCTTCATCAATTGGCTGTGTTTCGTGACCGTGCTCATAATCATTATCA
TCAAGAACCGCATATGCAGATGCAAGAACCTGATGATCTCTCGAGTTCTCTTGATCTAAA
CAGCAACAACTCGATTCATTACAGTTACCCGCTTCATCATGTCCAAGAACCAAACCAACA
ACAACAACAATATTGTTTTTCTGGAAACTTCAATGGGTTACAAGAAGACATGTGGTGTCT
TCAACTTCAAGATTCACCAACGACAGTGAATATGAAGGGTGGCTTCGTTGATGAATGTGG
GGGCGTTAAGCCTGTAGAAGAGGCTTCTAACGAGTTCGAGCATCATGATGGTTTCGTTGA
AGACAGTAAACTCGACTTGCCTTCAACACAATTCATTGTTTCTTCTTAGCTTTTATTTTC
TTGATTTAAGAATCATTTATATAGGGCTTAACAAATAATCCTCTCATAGATCGATCTCAA
TAGATTTTCTTTTGTACCTTATTTGGTTAAATTCGTTATAGGATTAGATGTGAAGGAGAC
ATGGAATTTTCAAAAATATATGTCACACAAGAATTTGATGGAATAAAAATTCAGTCG

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL5880Contig1 934 2 2 U
GGACTCTATTTTGCAAGAAACAGAGTTGCAGGTCACCGGAAATCTCTTTGATTCTACGGC
GTTGTTGAGTCTCTCTAGTTGCAGGTTGAAAGCAAATCTAAACATGTCGTCGCTACGTAA
TGCTGTTCCACGGCCAGCTCATAAGGAGCGTTCTCAACCACAAGCGAGGAAGAGGTTTGG
CCTCCTCGAGAAGCATAAGGACTATGTCATCCGAGCTAAAGCTTACCACCAAAAGGAAGA
CATTAAAAAGAAACTGAAGCAGAAGGCGGCATTCAAGAATCCAGATGAGTTCTATTTCAA
GATGATCAATAGTAAAACTGTTGATGGAGTTCACAGACCAAAGGAAGAGATAAACAAGTA
CAGTGCGGAAGAACTCATGATCATGAAGACCCAAGATATTGGATATGTGTTCCAAAAATG
GCATAGTGAGAAAAACAAAATTGATAAGCTCACTGCATCACTGCAATGTACGGAGGACCA
GCCTAGCCGGAGACATGTCTACTTTGCAGAAGACAGAAAGGAAGCTAGAGAGCTGGAGTT
GCAAGCAAAAAGCAAAATCGATATCTCCGCCACACATATTCCGAAAGATATTAAAAAGAA
AATGGATAGATCATACAGAGATCTCGAGGCGAGGAAGAGCAGAGCAAAAGATTTGGAGAA
ACTATACATGGACATGTCGATGCATAAGGAGTTACAGAAGAAGGGTCGCAAACGCAAGCT
GCGTCAAGACGAGATACTCAACCCAAATGGTAAACCGGTTTACAAATGGAAAGCTGATCG
AAAACGCTGAAAGTAAAAAAGCTTTCATGGTTGTGTATCTCTCTCTTCACATCATGTTTC
TCTATCTCTACTGAAGTTTATTTATATACCGTACTTTTTAATGGGACATTGTCGTTAAGC
TATAGTTAATGTGATTGATGAAATTTTGAAACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY30TF U 1
AF RR2EY30JQ C 256
BS 1 682 RR2EY30TF
BS 683 934 RR2EY30JQ

RD RR2EY30TF 682 0 0
GGACTCTATTTTGCAAGAAACAGAGTTGCAGGTCACCGGAAATCTCTTTGATTCTACGGC
GTTGTTGAGTCTCTCTAGTTGCAGGTTGAAAGCAAATCTAAACATGTCGTCGCTACGTAA
TGCTGTTCCACGGCCAGCTCATAAGGAGCGTTCTCAACCACAAGCGAGGAAGAGGTTTGG
CCTCCTCGAGAAGCATAAGGACTATGTCATCCGAGCTAAAGCTTACCACCAAAAGGAAGA
CATTAAAAAGAAACTGAAGCAGAAGGCGGCATTCAAGAATCCAGATGAGTTCTATTTCAA
GATGATCAATAGTAAAACTGTTGATGGAGTTCACAGACCAAAGGAAGAGATAAACAAGTA
CAGTGCGGAAGAACTCATGATCATGAAGACCCAAGATATTGGATATGTGTTCCAAAAATG
GCATAGTGAGAAAAACAAAATTGATAAGCTCACTGCATCACTGCAATGTACGGAGGACCA
GCCTAGCCGGAGACATGTCTACTTTGCAGAAGACAGAAAGGAAGCTAGAGAGCTGGAGTT
GCAAGCAAAAAGCAAAATCGATATCTCCGCCACACATATTCCGAAAGATATTAAAAAGAA
AATGGATAGATCATACAGAGATCTCGAGGCGAGGAAGAGCAGAGCAAAAGATTTGGAGAA
ACTATACATGGACATGTCGATG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2EY30JQ 679 0 0
GAAGCAGAAGGCGGCATTCAAGAATCCAGATGAGTTCTATTTCAAGATGATCAATAGTAA
AACTGTTGATGGAGTTCACAGACCAAAGGAAGAGATAAACAAGTACAGTGCGGAAGAACT
CATGATCATGAAGACCCAAGATATTGGATATGTGTTCCAAAAATGGCATAGTGAGAAAAA
CAAAATTGATAAGCTCACTGCATCACTGCAATGTACGGAGGACCAGCCTAGCCGGAGACA
TGTCTACTTTGCAGAAGACAGAAAGGAAGCTAGAGAGCTGGAGTTGCAAGCAAAAAGCAA
AATCGATATCTCCGCCACACATATTCCGAAAGATATTAAAAAGAAAATGGATAGATCATA
CAGAGATCTCGAGGCGAGGAAGAGCAGAGCAAAAGATTTGGAGAAACTATACATGGACAT
GTCGATGCATAAGGAGTTACAGAAGAAGGGTCGCAAACGCAAGCTGCGTCAAGACGAGAT
ACTCAACCCAAATGGTAAACCGGTTTACAAATGGAAAGCTGATCGAAAACGCTGAAAGTA
AAAAAGCTTTCATGGTTGTGTATCTCTCTCTTCACATCATGTTTCTCTATCTCTACTGAA
GTTTATTTATATACCGTACTTTTTAATGGGACATTGTCGTTAAGCTATAGTTAATGTGAT
TGATGAAATTTTGAAACGC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL5881Contig1 624 2 2 U
GGGCCGAGATACTCGTTCATTTGTTTCCGGCGATTTCTCTCGACGGCGATGTGAGTCATC
CTCTGGTTCTCGATCTCTTCCTTGTTCTTGCTACTCCGAGTCCTCCTCCTCTTCTTCCTC
TCTCCTCCAGTGGCCACATCCAAGGCCTGAGGATGGTTCTTGGTGTTGACGATAGATCCA
TAAGGAAGCTCGTCTCTTGGCCACTGAAGCTCCGCCTGATCGTTGTAACTATAGCCATCA
CTGTTATCTCCGCCTTTACGGTTGTAATTAATACTCGCGAACCCTTGTCTTTTTTCTTGC
CCTAGCTTAATGTTATTCTTGGTGTCTGGTGGATCTTGATCTTCTCCTTGTTGAAAGTAT
AAATCTTGAAACGGAAAATCTTTGGAGGAGCTGTAGGACAAAGGATCTTGCGGGTAAACA
ACAGCCTCTAAGGCCATAATTAGCTACAAATTTAGTGGAAAATAAACTCTAAAAATATGA
AAAGGGAGAGAGAAAAGAAAGACAGAAAGTGTTTGTCGTTCTCTTTTTGTCTTGAGAGGT
AGGCAAGTCAAAAGGTAAAGACACACTATAGGGAAATTAAACTTGTAATGATATCTCTAC
AATAAAAATAAAAAACATTTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM63TF U 1
AF RR2DM63JQ C 8
BS 1 600 RR2DM63TF
BS 601 624 RR2DM63JQ

RD RR2DM63TF 600 0 0
GGGCCGAGATACTCGTTCATTTGTTTCCGGCGATTTCTCTCGACGGCGATGTGAGTCATC
CTCTGGTTCTCGATCTCTTCCTTGTTCTTGCTACTCCGAGTCCTCCTCCTCTTCTTCCTC
TCTCCTCCAGTGGCCACATCCAAGGCCTGAGGATGGTTCTTGGTGTTGACGATAGATCCA
TAAGGAAGCTCGTCTCTTGGCCACTGAAGCTCCGCCTGATCGTTGTAACTATAGCCATCA
CTGTTATCTCCGCCTTTACGGTTGTAATTAATACTCGCGAACCCTTGTCTTTTTTCTTGC
CCTAGCTTAATGTTATTCTTGGTGTCTGGTGGATCTTGATCTTCTCCTTGTTGAAAGTAT
AAATCTTGAAACGGAAAATCTTTGGAGGAGCTGTAGGACAAAGGATCTTGCGGGTAAACA
ACAGCCTCTAAGGCCATAATTAGCTACAAATTTAGTGGAAAATAAACTCTAAAAATATGA
AAAGGGAGAGAGAAAAGAAAGACAGAAAGTGTTTGTCGTTCTCTTTTTGTCTTGAGAGGT
AGGCAAGTCAAAAGGTAAAGACACACTATAGGGAAATTAAACTTGTAATGATATCTCTAC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2DM63JQ 617 0 0
GATACTCGTTCATTTGTTTCCGGCGATTTCTCTCGACGGCGATGTGAGTCATCCTCTGGT
TCTCGATCTCTTCCTTGTTCTTGCTACTCCGAGTCCTCCTCCTCTTCTTCCTCTCTCCTC
CAGTGGCCACATCCAAGGCCTGAGGATGGTTCTTGGTGTTGACGATAGATCCATAAGGAA
GCTCGTCTCTTGGCCACTGAAGCTCCGCCTGATCGTTGTAACTATAGCCATCACTGTTAT
CTCCGCCTTTACGGTTGTAATTAATACTCGCGAACCCTTGTCTTTTTTCTTGCCCTAGCT
TAATGTTATTCTTGGTGTCTGGTGGATCTTGATCTTCTCCTTGTTGAAAGTATAAATCTT
GAAACGGAAAATCTTTGGAGGAGCTGTAGGACAAAGGATCTTGCGGGTAAACAACAGCCT
CTAAGGCCATAATTAGCTACAAATTTAGTGGAAAATAAACTCTAAAAATATGAAAAGGGA
GAGAGAAAAGAAAGACAGAAAGTGTTTGTCGTTCTCTTTTTGTCTTGAGAGGTAGGCAAG
TCAAAAGGTAAAGACACACTATAGGGAAATTAAACTTGTAATGATATCTCTACAATAAAA
ATAAAAAACATTTTCCT

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL5882Contig1 659 2 2 U
GACTTCGTCTGCAGCCCAACTTCTGTTTATACTTCTTGTTGCTCTCTATGGACTCGCTTT
TGTGCCCTCAAAGATTTTTGGGTTTCTTCAAGTCAAGAAAATACCTCCATGGAGATTCGG
GATCTCGGAGTCTGCAGTGAGAGATCTTAGCAGGGACATCGTAGTTGTATGGAACCACGG
AGTGCAGAGTCTTAATTCCTTAAGCAGAGGAGGAGACTGGATCAAGTTCTTCAAGATTGC
TGGATCACTATATCTCCTGAAGCTGATCGTATCACGTTCCTTGGCAACATTTATTTTCAC
AGCGATGCCATTCTCGTTCACTGCTTTCTTCATCTATGAGCAATACGAGCTTGAGCTGTA
TCACATAGCCCGGATCTTGATCGAATGCTTAACAGTTGTTAAAGAAGTGGTGCTGAAGAA
TCTGCCTCTACCTGATGGTTCATCTAAACCAATGTTCATGTGAAAGCTTTCAAGTCCAGG
CAACAATCACAGAGACTAACAGCAGTTATTAAATGTCTATGTACTGTCAAAGATGCTATT
AAAAAGTCCTTATTTTCATACTGTAATCCTTCGTGACAGATGAACAATATCCCTTACTCA
AGACAATTTATTGGTATTGACGATCTTGCCACTACTATAAAGCGCACCGTTTTGATCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FI83JQ C 1
AF RR2FI83TF U 1
BS 1 604 RR2FI83TF
BS 605 659 RR2FI83JQ

RD RR2FI83JQ 659 0 0
GACTTCGTCTGCAGCCCAACTTCTGTTTATACTTCTTGTTGCTCTCTATGGACTCGCTTT
TGTGCCCTCAAAGATTTTTGGGTTTCTTCAAGTCAAGAAAATACCTCCATGGAGATTCGG
GATCTCGGAGTCTGCAGTGAGAGATCTTAGCAGGGACATCGTAGTTGTATGGAACCACGG
AGTGCAGAGTCTTAATTCCTTAAGCAGAGGAGGAGACTGGATCAAGTTCTTCAAGATTGC
TGGATCACTATATCTCCTGAAGCTGATCGTATCACGTTCCTTGGCAACATTTATTTTCAC
AGCGATGCCATTCTCGTTCACTGCTTTCTTCATCTATGAGCAATACGAGCTTGAGCTGTA
TCACATAGCCCGGATCTTGATCGAATGCTTAACAGTTGTTAAAGAAGTGGTGCTGAAGAA
TCTGCCTCTACCTGATGGTTCATCTAAACCAATGTTCATGTGAAAGCTTTCAAGTCCAGG
CAACAATCACAGAGACTAACAGCAGTTATTAAATGTCTATGTACTGTCAAAGATGCTATT
AAAAAGTCCTTATTTTCATACTGTAATCCTTCGTGACAGATGAACAATATCCCTTACTCA
AGACAATTTATTGGTATTGACGATCTTGCCACTACTATAAAGCGCACCGTTTTGATCTC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2FI83TF 604 0 0
GACTTCGTCTGCAGCCCAACTTCTGTTTATACTTCTTGTTGCTCTCTATGGACTCGCTTT
TGTGCCCTCAAAGATTTTTGGGTTTCTTCAAGTCAAGAAAATACCTCCATGGAGATTCGG
GATCTCGGAGTCTGCAGTGAGAGATCTTAGCAGGGACATCGTAGTTGTATGGAACCACGG
AGTGCAGAGTCTTAATTCCTTAAGCAGAGGAGGAGACTGGATCAAGTTCTTCAAGATTGC
TGGATCACTATATCTCCTGAAGCTGATCGTATCACGTTCCTTGGCAACATTTATTTTCAC
AGCGATGCCATTCTCGTTCACTGCTTTCTTCATCTATGAGCAATACGAGCTTGAGCTGTA
TCACATAGCCCGGATCTTGATCGAATGCTTAACAGTTGTTAAAGAAGTGGTGCTGAAGAA
TCTGCCTCTACCTGATGGTTCATCTAAACCAATGTTCATGTGAAAGCTTTCAAGTCCAGG
CAACAATCACAGAGACTAACAGCAGTTATTAAATGTCTATGTACTGTCAAAGATGCTATT
AAAAAGTCCTTATTTTCATACTGTAATCCTTCGTGACAGATGAACAATATCCCTTACTCA
AGAC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL5883Contig1 914 2 2 U
GGAACTACCTTCTCATCAAAACCGCGATCGGATCTGGGTTTTATATTTTTTCTCTTTGAC
AAAACCCTTCTCCGTGTTTCGATCTGGAGTAGAAAGTCCCGATCTTTTTATATCGCTTTC
TTTCAAGCTTTACCCTTTGCTCAATCAAAAAAACCCTAATCTCGATTTTTTCTTTCCTCC
TTCTCCGTCCGATTGGTCGATTCTATCTCTTAGAGCATTGAATCGTTTGTGTTTTTTATA
GAAAGACCGTAACTTTTTCTTCAATTTTAGAGAGATGTCTTCTTGGGCTGGTCCTGAAGA
TATTTACCTTTCAACTTCACTAGCTAGCTATCTCGATAGAAAGATACTTGTGCTCCTTAG
AGATGGTAGAAAGCTAATGGGAACCCTCCGTTCATTTGATCAATTTGCCAATGCGGTTTT
AGAAGGTGCTTGTGAGAGGGTAATTGTTGGTGAGCAATACTGCGACATTCCTTTAGGCCT
CTATGTAATCCGTGGAGAGAATGTTGTTCTGATTGGTGATCTGGACACGGAGAGAGAGGA
GCTTCCTCCAAATATGATTCGTGTCTCAGAGACCGAGATTAAAAGGGCGCAAAAAGTGGA
GAGGGAAGCGAGTGAGCTGAGAGGAACAATGAGGAAGAGAATGGAGTTTCTCGACTTCGA
TTAAGCCCCCCTCCCCCATTCATTCTTGCCTTGATGTTCTGCTTTGGCTCACAAGTTTTA
TGAGGAGCCTTCTTGGTTTATGTGGATGTAGGCCTCATTTTTCAATTTGAAAGTGACAAA
AATAATTTAGTGTGTACCCTTGTCTTCAGATTTATTTTACCCTTTTATAAGAAAAAAAAA
AATTCACAAGTTTTAATCTTCAAATTTGTTTGACAATACCTAAAGACTTCTTTAGTAAAA
TTCTGATCGTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH22TF U 1
AF RR2GH22JQB C 254
BS 1 581 RR2GH22TF
BS 582 914 RR2GH22JQB

RD RR2GH22TF 581 0 0
GGAACTACCTTCTCATCAAAACCGCGATCGGATCTGGGTTTTATATTTTTTCTCTTTGAC
AAAACCCTTCTCCGTGTTTCGATCTGGAGTAGAAAGTCCCGATCTTTTTATATCGCTTTC
TTTCAAGCTTTACCCTTTGCTCAATCAAAAAAACCCTAATCTCGATTTTTTCTTTCCTCC
TTCTCCGTCCGATTGGTCGATTCTATCTCTTAGAGCATTGAATCGTTTGTGTTTTTTATA
GAAAGACCGTAACTTTTTCTTCAATTTTAGAGAGATGTCTTCTTGGGCTGGTCCTGAAGA
TATTTACCTTTCAACTTCACTAGCTAGCTATCTCGATAGAAAGATACTTGTGCTCCTTAG
AGATGGTAGAAAGCTAATGGGAACCCTCCGTTCATTTGATCAATTTGCCAATGCGGTTTT
AGAAGGTGCTTGTGAGAGGGTAATTGTTGGTGAGCAATACTGCGACATTCCTTTAGGCCT
CTATGTAATCCGTGGAGAGAATGTTGTTCTGATTGGTGATCTGGACACGGAGAGAGAGGA
GCTTCCTCCAAATATGATTCGTGTCTCAGAGACCGAGATTA

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2GH22JQB 661 0 0
TTTTTCTTCAATTTTAGAGAGATGTCTTCTTGGGCTGGTCCTGAAGATATTTACCTTTCA
ACTTCACTAGCTAGCTATCTCGATAGAAAGATACTTGTGCTCCTTAGAGATGGTAGAAAG
CTAATGGGAACCCTCCGTTCATTTGATCAATTTGCCAATGCGGTTTTAGAAGGTGCTTGT
GAGAGGGTAATTGTTGGTGAGCAATACTGCGACATTCCTTTAGGCCTTTATGTAATCCGT
GGAGAGAATGTTGTTCTGATTGGTGATCTGGACACGGAGAGAGAGGAGCTTCCTCCAAAT
ATGATTCGTGTTTCAGAGACCGAGATTAAAAGGGCGCAAAAAGTGGAGAGGGAAGCGAGT
GAGCTGAGAGGAACAATGAGGAAGAGAATGGAGTTTCTCGACTTCGATTAAGCCCCCCTC
CCCCATTCATTCTTGCCTTGATGTTCTGCTTTGGCTCACAAGTTTTATGAGGAGCCTTCT
TGGTTTATGTGGATGTAGGCCTCATTTTTCAATTTGAAAGTGACAAAAATAATTTAGTGT
GTACCCTTGTCTTCAGATTTATTTTACCCTTTTATAAGAAAAAAAAAAATTCACAAGTTT
TAATCTTCAAATTTGTTTGACAATACCTAAAGACTTCTTTAGTAAAATTCTGATCGTTGT
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL5884Contig1 773 2 2 U
GCCAGGGTTTGAGGTTGATGAGATTAAAGGTGGAGTTGCAGGTGGAAGTATCCTAAGGGG
TGTTTTGAAAGTGAACCAGTTGATTGAGATCCGACCTGGAATTGTTGTGAAAGACGAGCG
TGGGAACCCAAAATGCACTCCAATATACTCACGCATTATTTCACTATACGCGGAACAGAA
CGAGCTTCAGTATGCAGTGCCTGGAGGTTTAATAGGAGTAGGAACAACAATGGACCCAAC
TCTAACTCGTGCTGATCGTTTGGTCGGTCAAGTCCTTGGTGAAATAGGCTCCCTTCCTGA
TGTCTTTGTTGAACTCGAGGTGAACTTCTTTCTTCTACGGAGACTGTTGGGAGTGAGAAT
AAAGGGATCGGAGAAACAAGGGAAAGTGACGAAGCTAACAAAGGGAGAGATTCTGATGCT
CAACATTGGTTCCATGTCCACTGGAGCCAAAGTTGTAGGAGTGAAGAACGATCTGGCTAA
GTTGCAACTCACTGCTCCTGTTTGCACGAGCAAAGGAGAGAAAGTGGCTTTGAGTAGGCG
TGTGGAAAAGCATTGGCGTTTGATAGGTTGGGGGTCAGATTCAAGCTGGAACCACCATTG
AAGTTCCTCCTTCACCTTTCTGATGAGCTTGACAAATTTTATTAAAACCCTCAAAAAGAT
GATAAAACTCTTCCTTGTTCATTTGGGGTTTTTTTTTTGGGGGGAAAGTACCTATTTTCA
GATATATTTGTCACTACTAGTTTACTGTGTTATTTTTTCTTCCTTAGATGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN30TF U 1
AF RR2AN30JQ C 1
BS 1 701 RR2AN30TF
BS 702 773 RR2AN30JQ

RD RR2AN30TF 701 0 0
GCCAGGGTTTGAGGTTGATGAGATTAAAGGTGGAGTTGCAGGTGGAAGTATCCTAAGGGG
TGTTTTGAAAGTGAACCAGTTGATTGAGATCCGACCTGGAATTGTTGTGAAAGACGAGCG
TGGGAACCCAAAATGCACTCCAATATACTCACGCATTATTTCACTATACGCGGAACAGAA
CGAGCTTCAGTATGCAGTGCCTGGAGGTTTAATAGGAGTAGGAACAACAATGGACCCAAC
TCTAACTCGTGCTGATCGTTTGGTCGGTCAAGTCCTTGGTGAAATAGGCTCCCTTCCTGA
TGTCTTTGTTGAACTCGAGGTGAACTTCTTTCTTCTACGGAGACTGTTGGGAGTGAGAAT
AAAGGGATCGGAGAAACAAGGGAAAGTGACGAAGCTAACAAAGGGAGAGATTCTGATGCT
CAACATTGGTTCCATGTCCACTGGAGCCAAAGTTGTAGGAGTGAAGAACGATCTGGCTAA
GTTGCAACTCACTGCTCCTGTTTGCACGAGCAAAGGAGAGAAAGTGGCTTTGAGTAGGCG
TGTGGAAAAGCATTGGCGTTTGATAGGTTGGGGGTCAGATTCAAGCTGGAACCACCATTG
AAGTTCCTCCTTCACCTTTCTGATGAGCTTGACAAATTTTATTAAAACCCTCAAAAAGAT
GATAAAACTCTTCCTTGTTCATTTGGGGTTTTTTTTTTGGG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2AN30JQ 773 0 0
GCCAGGGTTTGAGGTTGATGAGATTAAAGGTGGAGTTGCAGGTGGAAGTATCCTAAGGGG
TGTTTTGAAAGTGAACCAGTTGATTGAGATCCGACCTGGAATTGTTGTGAAAGACGAGCG
TGGGAACCCAAAATGCACTCCAATATACTCACGCATTATTTCACTATACGCGGAACAGAA
CGAGCTTCAGTATGCAGTGCCTGGAGGTTTAATAGGAGTAGGAACAACAATGGACCCAAC
TTTAACTCGTGCTGATCGTTTGGTCGGTCAAGTCCTTGGTGAAATAGGCTCCCTTCCTGA
TGTCTTTGTTGAACTCGAGGTGAACTTCTTTTTTTTACGGAGACTGTTGGGAGTGAGAAT
AAAGGGATCGGAGAAACAAGGGAAAGTGACGAAGCTAACAAAGGGAGAGATTTTGATGCT
CAACATTGGTTCCATGTCCACTGGAGCCAAAGTTGTAGGAGTGAAGAACGATCTGGCTAA
GTTGCAACTCACTGCTCCTGTTTGCACGAGCAAAGGAGAGAAAGTGGCTTTGAGTAGGCG
TGTGGAAAAGCATTGGCGTTTGATAGGTTGGGG*TCAGATTCAAGCTGGAACCACCATTG
AAGTTCCTCCTTCACCTTTTTGATGAGCTTGACAAATTTTATTAAAACCCTCAAAAAGAT
GATAAAACTCTTCCTTGTTCATTTGGGGTTTTTTTTTTGGGGGGAAAGTACCTATTTTCA
GATATATTTGTCACTACTAGTTTACTGTGTTATTTTTTCTTCCTTAGATGATT

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL5885Contig1 803 2 2 U
GGACCCACACCACATTACAATCTCACCGAAAAGATTATATTCTTGTAATCATCAAAGTAG
CAAATTGATCAAAAAGGCTAGATAAATCTTGTAACACTATGAAGATAAAGATAACAAGCA
AAACACATGTGAAACCAAACAATCCAATACTAGGGAAGCAACAATTCCAGCTCACCGCAT
TTGATCTTCCTTACCTAGCTTTCTACTACAACCAGAAGTTTCTGCTTTACAAGTTCCAAA
ACCCTCTAGATCTCGAGGAACCCACTTTCCAAAACGATATCGTGGAGAAGCTCAAGGATG
GTTTGGGTTCGGTTCTCGAAGACTTCTATCAGCTTGCCGGTAAGCTGGCCAAGGACGACG
AAGGGGTCTTCCGAGTTGAGTATGATGCTGACGATGAGCAGATCAACGGCGTGGAGTTCT
CGGTTGCTGAAGCTCCTGATGTTAGCGTTGGTGATCTCATGGTTGAGGATGGGACAGCCA
AGCTCGAGGAGTTGGTTCCTTACAACAGGATCTCGAATTTGGAAGGACTTAGCAGGCCTC
TTCTTGTTATCCAGAAAAATGCTAGCATTGAAATTATGCGAGTCTGAATGATTTAATAAA
TATAATCTACACTGGTTATGTTTGTCGAATTTTGATGCATGGTATGTGGGTAATAGCATC
TCCAATGTAAAATTTTATTTTTTATTCTAAAATAGGACAACTTCAAAATGGAGTTGAGTT
TACTCTAAGAGCATCTCCAATGTATTACTCCAAATTTTACTTCAAAATGGTGCAATTCTA
AAATAAAGTGATGTTTTACTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE84TF U 1
AF RR2EE84JQ C 69
BS 1 668 RR2EE84TF
BS 669 803 RR2EE84JQ

RD RR2EE84TF 668 0 0
GGACCCACACCACATTACAATCTCACCGAAAAGATTATATTCTTGTAATCATCAAAGTAG
CAAATTGATCAAAAAGGCTAGATAAATCTTGTAACACTATGAAGATAAAGATAACAAGCA
AAACACATGTGAAACCAAACAATCCAATACTAGGGAAGCAACAATTCCAGCTCACCGCAT
TTGATCTTCCTTACCTAGCTTTCTACTACAACCAGAAGTTTCTGCTTTACAAGTTCCAAA
ACCCTCTAGATCTCGAGGAACCCACTTTCCAAAACGATATCGTGGAGAAGCTCAAGGATG
GTTTGGGTTCGGTTCTCGAAGACTTCTATCAGCTTGCCGGTAAGCTGGCCAAGGACGACG
AAGGGGTCTTCCGAGTTGAGTATGATGCTGACGATGAGCAGATCAACGGCGTGGAGTTCT
CGGTTGCTGAAGCTCCTGATGTTAGCGTTGGTGATCTCATGGTTGAGGATGGGACAGCCA
AGCTCGAGGAGTTGGTTCCTTACAACAGGATCTCGAATTTGGAAGGACTTAGCAGGCCTC
TTCTTGTTATCCAGAAAAATGCTAGCATTGAAATTATGCGAGTCTGAATGATTTAATAAA
TATAATCTACACTGGTTATGTTTGTCGAATTTTGATGCATGGTATGTGGGTAATAGCATC
TCCAATGT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2EE84JQ 735 0 0
TCAAAAAGGCTAGATAAATCTTGTAACACTATGAAGATAAAGATAACAAGCAAAACACAT
GTGAAACCAAACAATCCAATACTAGGGAAGCAACAATTCCAGCTCACCGCATTTGATCTT
CCTTACCTAGCTTTCTACTACAACCAGAAGTTTCTGCTTTACAAGTTCCAAAACCCTCTA
GATCTCGAGGAACCCACTTTCCAAAACGATATCGTGGAGAAGCTCAAGGATGGTTTGGGT
TCGGTTCTCGAAGACTTCTATCAGCTTGCCGGTAAGCTGGCCAAGGACGACGAAGGGGTC
TTCCGAGTTGAGTATGATGCTGACGATGAGCAGATCAACGGCGTGGAGTTCTCGGTTGCT
GAAGCTCCTGATGTTAGCGTTGGTGATCTCATGGTTGAGGATGGGACAGCCAAGCTCGAG
GAGTTGGTTCCTTACAACAGGATCTCGAATTTGGAAGGACTTAGCAGGCCTCTTCTTGTT
ATCCAGAAAAATGCTAGCATTGAAATTATGCGAGTCTGAATGATTTAATAAATATAATCT
ACACTGGTTATGTTTGTCGAATTTTGATGCATGGTATGTGGGTAATAGCATCTCCAATGT
AAAATTTTATTTTTTATTCTAAAATAGGACAACTTCAAAATGGAGTTGAGTTTACTCTAA
GAGCATCTCCAATGTATTACTCCAAATTTTACTTCAAAATGGTGCAATTCTAAAATAAAG
TGATGTTTTACTTCG

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL5886Contig1 750 2 2 U
GAAGGACGAGAGAAGAAGAAGATGGAGTGCGTATTCGGTCTAGTCGGGAAGGGATTCGCC
ATAGTGGCGGCGGATACATCGGCGGTTCACAGCATCCTTCTCCACAAAAACAACGAGGAC
AAGATCATGCTTCTTGACTCCCATAAGCTCGTCGCTGCCAGCGGCGAGCCTGGCGACCGG
GTTCAGTTCACGGAGTACGTTCAGAAGAACGTGTCGCTGTACAAGTTCCGCAACGGGATC
CCTTTGACCACCGCCGCCGCTGCAAACTTCACTCGCGGAGAGCTCGCCACCGCCTTGAGG
AAGAACCCGTATTCTGTGAATATCCTGATGGCTGGCTACGACGATGAGAGCGGTGCATCC
CTTTACTACATCGACTACATTGCAACCCTTCACAAGGTTGACAAGGGAGCTTTCGGTTAC
GGCTCTTACTTCTCCCTCTCCACCATGGACAGGCATTACCGCGAGGATATGTCTGTAGAA
GAAGCCATTGAACTGGTGGACAAGTGCATACTTGAGATTCGATCAAGACTGGTCGTTGCG
CCTCCAAACTTTGTGGTCAAGATTGTTGACAAAGATGGAGCTCGTGATTACGCTTGGCGT
CAGTCCGTACAAGACGTCACAACTGCTGCTGTCTGAGTTAAGTTTGTGTTTGGTTCCAGA
TGTCGCGTTTATTCTGCTTTTGTTGGGAGATTGTGTTTTTGACCATTTTTATTTAGTTTG
ACAATCAACAAGCAAACGAAATATTACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G493TF U 1
AF RR2G493JQ C 106
BS 1 705 RR2G493TF
BS 706 750 RR2G493JQ

RD RR2G493TF 705 0 0
GAAGGACGAGAGAAGAAGAAGATGGAGTGCGTATTCGGTCTAGTCGGGAAGGGATTCGCC
ATAGTGGCGGCGGATACATCGGCGGTTCACAGCATCCTTCTCCACAAAAACAACGAGGAC
AAGATCATGCTTCTTGACTCCCATAAGCTCGTCGCTGCCAGCGGCGAGCCTGGCGACCGG
GTTCAGTTCACGGAGTACGTTCAGAAGAACGTGTCGCTGTACAAGTTCCGCAACGGGATC
CCTTTGACCACCGCCGCCGCTGCAAACTTCACTCGCGGAGAGCTCGCCACCGCCTTGAGG
AAGAACCCGTATTCTGTGAATATCCTGATGGCTGGCTACGACGATGAGAGCGGTGCATCC
CTTTACTACATCGACTACATTGCAACCCTTCACAAGGTTGACAAGGGAGCTTTCGGTTAC
GGCTCTTACTTCTCCCTCTCCACCATGGACAGGCATTACCGCGAGGATATGTCTGTAGAA
GAAGCCATTGAACTGGTGGACAAGTGCATACTTGAGATTCGATCAAGACTGGTCGTTGCG
CCTCCAAACTTTGTGGTCAAGATTGTTGACAAAGATGGAGCTCGTGATTACGCTTGGCGT
CAGTCCGTACAAGACGTCACAACTGCTGCTGTCTGAGTTAAGTTTGTGTTTGGTTCCAGA
TGTCGCGTTTATTCTGCTTTTGTTGGGAGATTGTGTTTTTGACCA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2G493JQ 645 0 0
AAAAACAACGAGGACAAGATCATGCTTCTTGACTCCCATAAGCTCGTCGCTGCCAGCGGC
GAGCCTGGCGACCGGGTTCAGTTCACGGAGTACGTTCAGAAGAACGTGTCGCTGTACAAG
TTCCGCAACGGGATCCCTTTGACCACCGCCGCCGCTGCAAACTTCACTCGCGGAGAGCTC
GCCACCGCCTTGAGGAAGAACCCGTATTCTGTGAATATCCTGATGGCTGGCTACGACGAT
GAGAGCGGTGCATCCCTTTACTACATCGACTACATTGCAACCCTTCACAAGGTTGACAAG
GGAGCTTTCGGTTACGGCTCTTACTTCTCCCTCTCCACCATGGACAGGCATTACCGCGAG
GATATGTCTGTAGAAGAAGCCATTGAACTGGTGGACAAGTGCATACTTGAGATTCGATCA
AGACTGGTCGTTGCGCCTCCAAACTTTGTGGTCAAGATTGTTGACAAAGATGGAGCTCGT
GATTACGCTTGGCGTCAGTCCGTACAAGACGTCACAACTGCTGCTGTCTGAGTTAAGTTT
GTGTTTGGTTCCAGATGTCGCGTTTATTCTGCTTTTGTTGGGAGATTGTGTTTTTGACCA
TTTTTATTTAGTTTGACAATCAACAAGCAAACGAAATATTACTTC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL5887Contig1 600 2 1 U
AAAAACATGGCAACTCAAGCGTCCGGACTCTTTAGCTCCGCCATAACAACCACAGCAACC
TCCGGTGTGAAAAAACTCCACTTTTTCACAACAACAACCCACCGTCCAAGATCCAAACAC
ACCGTCACCGATCTTCGCGGGGAGCACCGGTGGGCTTCTCCGCAAAGCCCAGGTGGAAGA
GTTCTACGTTATTACGTGGAACTCGCCGAAAGAGCAGATCTTTGAGATGCCGACGGGAGG
TGCGGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTGGCGAGGAAAGAACAGTGCTT
GGCTTTGGGGACAAGGCTTAGGTCCAAGTACAAGATTAACTACCAGTTTTACAGGGTGTT
CCCGAATGGTGAGGTTCAGTATCTTCATCCTAAAGATGGAGTTTACCCGGAGAAGGCGAA
TCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGATCTATTGGGAAAAATGTCAGTCCCAT
TGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAAGTTGTGAAAACTTAAAATGT
GAAAATTAAAACAAAAAATCATGTGGATGTGACTATGTTTGGTTTTAATTTTTAATGGGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AU58JQ C 1
AF RR2AU58TF U 1
BS 1 600 RR2AU58TF

RD RR2AU58JQ 600 0 0
AAAAACATGGCAACTCAAGCGTCCGGACTCTTTAGCTCCGCCATAACAACCACAGCAACC
TCCGGTGTGAAAAAACTCCACTTTTTCACAACAACAACCCACCGTCCAAGATCCAAACAC
ACCGTCACCGATCTTCGCGGGGAGCACCGGTGGGCTTCTCCGCAAAGCCCAGGTGGAAGA
GTTCTACGTTATTACGTGGAACTCGCCGAAAGAGCAGATCTTTGAGATGCCGACGGGAGG
TGCGGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTGGCGAGGAAAGAACAGTGCTT
GGCTTTGGGGACAAGGCTTAGGTCCAAGTACAAGATTAACTACCAGTTTTACAGGGTGTT
CCCGAATGGTGAGGTTCAGTATCTTCATCCTAAAGATGGAGTTTACCCGGAGAAGGCGAA
TCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGATCTATTGGGAAAAATGTCAGTCCCAT
TGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAAGTTGTGAAAACTTAAAATGT
GAAAATTAAAACAAAAAATCATGTGGATGTGACTATGTTTGGTTTTAATTTTTAATGGGG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2AU58TF 600 0 0
AAAAACATGGCAACTCAAGCGTCCGGACTCTTTAGCTCCGCCATAACAACCACAGCAACC
TCCGGTGTGAAAAAACTCCACTTTTTCACAACAACAACCCACCGTCCAAGATCCAAACAC
ACCGTCACCGATCTTCGCGGGGAGCACCGGTGGGCTTCTCCGCAAAGCCCAGGTGGAAGA
GTTCTACGTTATTACGTGGAACTCGCCGAAAGAGCAGATCTTTGAGATGCCGACGGGAGG
TGCGGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTGGCGAGGAAAGAACAGTGCTT
GGCTTTGGGGACAAGGCTTAGGTCCAAGTACAAGATTAACTACCAGTTTTACAGGGTGTT
CCCGAATGGTGAGGTTCAGTATCTTCATCCTAAAGATGGAGTTTACCCGGAGAAGGCGAA
TCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGATCTATTGGGAAAAATGTCAGTCCCAT
TGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAAGTTGTGAAAACTTAAAATGT
GAAAATTAAAACAAAAAATCATGTGGATGTGACTATGTTTGGTTTTAATTTTTAATGGGG

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

CO CL5888Contig1 776 2 4 U
GGAGAGTTAAGCCCTTTCCCTCTACTCACCGTCGCCTCCGATCACATTTATCACCTGTCG
CAGTGTACTGGAATCGAAAATTTCCGGTTTGTGCAAGAAATGAATTTCTTAAACTCAGCA
GCATCCTTATGCAGAAGAGTTAGTTTGAGGGAGCTCATCACCGAGGTTCCTGCTTACGGT
GGCAGTGGCATCTCCGATTGTTCCTCGAGTGGGTTGAGTTTAGTGTTGAAGCGTTGGGCT
ACTAAGAAAACCGCCGGTTCCACCAAGAACGGACGTGACTCTAAGCCCAAGAATCTCGGC
GTCAAGAAATTCGGAGGAGAGAATGTGATACCGGGAAACATAATAGTCCGTCAACGTGGA
ACTCGTTTTCATCCGGGAGACTATGTCGGGATTGGGAAGGACCATACTCTGTTTGCATTG
AAGGAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAACAAGATCACTGGACGCAAATGGATTCATGTT
GATCCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCACCCTATCTACACTAAAGCTGCAATGGCCAAGTCC
ACTACGGTGGAGACAGCTTCGTCGTCCTGAAAAGAGATTGGTTCAACAATCTAAAGGTGT
CTTTTGTCAGATAACATCTTCTGTTGACTAGAAGATTGTGATACTTGTACCTTAGAACAG
CAAACAACCAATTCAATAACATCTGCTGTTTTGTCTCCTCTTTAGTAGTACAACAATGTA
TCCAGTACTCTCCTCGCTCTTTTTTGCTAGTGAAATTATCACTAAGGTTTTGATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H284TF U 1
AF RR2H284JQ C 150
BS 1 744 RR2H284TF
BS 745 745 RR2H284JQ
BS 746 766 RR2H284TF
BS 767 776 RR2H284JQ

RD RR2H284TF 769 0 0
GGAGAGTTAAGCCCTTTCCCTCTACTCACCGTCGCCTCCGATCACATTTATCACCTGTCG
CAGTGTACTGGAATCGAAAATTTCCGGTTTGTGCAAGAAATGAATTTCTTAAACTCAGCA
GCATCCTTATGCAGAAGAGTTAGTTTGAGGGAGCTCATCACCGAGGTTCCTGCTTACGGT
GGCAGTGGCATCTCCGATTGTTCCTCGAGTGGGTTGAGTTTAGTGTTGAAGCGTTGGGCT
ACTAAGAAAACCGCCGGTTCCACCAAGAACGGACGTGACTCTAAGCCCAAGAATCTCGGC
GTCAAGAAATTCGGAGGAGAGAATGTGATACCGGGAAACATAATAGTCCGTCAACGTGGA
ACTCGTTTTCATCCGGGAGACTATGTCGGGATTGGGAAGGACCATACTCTGTTTGCATTG
AAGGAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAACAAGATCACTGGACGCAAATGGATTCATGTT
GATCCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCACCCTATCTACACTAAAGCTGCAATGGCCAAGTCC
ACTACGGTGGAGACAGCTTCGTCGTCCTGAAAAGAGATTGGTTCAACAATCTAAAGGTGT
CTTTTGTCAGATAACATCTTCTGTTGACTAGAAGATTGTGATACTTGTACCTTAGAACAG
CAAACAACCAATTCAATAACATCTGCTGTTTTGTCTCCTCTTTAGTAGTACAACAATGTA
TCCAGTACTCTCCTCGCTCTTTTT*GCTAGTGAAATTATCACTAAG
TTT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2H284JQ 627 0 0
GGAGCTCATCACCGAGGTTCCTGCTTACGGTGGCAGTGGCATCTCCGATTGTTCCTCGAG
TGGGTTGAGTTTAGTGTTGAAGCGTTGGGCTACTAAGAAAACCGCCGGTTCCACCAAGAA
CGGACGTGACTCTAAGCCCAAGAATCTCGGCGTCAAGAAATTCGGAGGAGAGAATGTGAT
ACCGGGAAACATAATAGTCCGTCAACGTGGAACTCGTTTTCATCCGGGAGACTATGTCGG
GATTGGGAAGGACCATACTCTGTTTGCATTGAAGGAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAA
CAAGATCACTGGACGCAAATGGATTCATGTTGATCCTAAGGGAGGTCATGTTTTTCACCC
TATCTACACTAAAGCTGCAATGGCCAAGTCCACTACGGTGGAGACAGCTTTGTCGTCCTG
AAAAGAGATTGGTTCAACAATCTAAAGGTGTCTTTTGTCAGATAACATCTTCTGTTGACT
AGAAGATTGTGATACTTGTACCTTAGAACAGCAAACAACCAATTCAATAACATCTGCTGT
TTTGTCTCCTCTTTAGTAGTACAACAATGTATCCAGTACTCTCCTCGCTCTTTTTTGCTA
GTGAAATTATCACTAAGGTTTTGATAG

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL5889Contig1 927 2 4 U
CAACTCCGTTTCTTAATTTGGAGTAAATTATGGAGTGAGGTTGGAGATGCCCCAAAGGAA
CACTATTTCACATCAAGAGTAAAATGTTCACGTTCTCCCCCAGATGTTGTGTTGCCAACC
TACTCAAGAGATTAAACATACAAGTTTGCAATCAAACAATTGTATTATGGATTAAACCCT
AACTAAAATCATATAATCGACACATGGATTATACAGAGTGTGTAGTGTGTATATTTGTAC
CTTGAGAGATATATCATAGGAGTTGGAGCATGGCATGCTTATTTACCTAAGAGATATAAC
ACTGAGTCTGCGACCGTCTTGACTTGGAGGAAAAGAACCAAGAATGGTATATAAGAATAC
CTTGATATAAACTCAGAACTAGAGGTGTTCAATCCGGATATTGGTACGGTTTCGGTTCGG
TTTTTTCTGTTTTTCGGTATTTCGGTTAGTAAAATATAACTACCATTCTAAATCCATATT
TACTTCGGTTCGGTTTATATATTGTCGGTTTTCGGTTTATTCGGTTTTATACCAAAAAAA
TAATTCTTTATTTTGTGATCATATTATATGAATTTTAGAGTCATCTTGTCAACACATTCA
TTTATTAAAAAATATTATATGTTTAAATAAAAGAACAAAAAACTAAAAAACGCTTATACC
ATCTAATAAAATAATCAGACATATAATTAAAATCAAAGCTCAAAATTTTGAATAAAAGTA
AAAAGCTAAAAACAAAACAGAAGCACGAAGCACTAAAGAAACTTTTTATATTCTTCCATA
TTTAGCGTTCATCAAATTCATGTTTCTTCGATTGAACACGAATCTCTGTTCATTTATAGA
TTAAAAAAAGTTGCGAAGAATTTCTACTAATTGTGTTCCATCAAATTAATAATCTTTATT
TCAATTTAGTCAATGCTAAAATAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B725TF U 1
AF RR2B725JQ C 71
BS 1 100 RR2B725TF
BS 101 101 RR2B725JQ
BS 102 719 RR2B725TF
BS 720 927 RR2B725JQ

RD RR2B725TF 719 0 0
CAACTCCGTTTCTTAATTTGGAGTAAATTATGGAGTGAGGTTGGAGATGCCCCAAAGGAA
CACTATTTCACATCAAGAGTAAAATGTTCACGTTCTCCCC*AGATGTTGTGTTGCCAACC
TACTCAAGAGATTAAACATACAAGTTTGCAATCAAACAATTGTATTATGGATTAAACCCT
AACTAAAATCATATAATCGACACATGGATTATACAGAGTGTGTAGTGTGTATATTTGTAC
CTTGAGAGATATATCATAGGAGTTGGAGCATGGCATGCTTATTTACCTAAGAGATATAAC
ACTGAGTCTGCGACCGTCTTGACTTGGAGGAAAAGAACCAAGAATGGTATATAAGAATAC
CTTGATATAAACTCAGAACTAGAGGTGTTCAATCCGGATATTGGTACGGTTTCGGTTCGG
TTTTTTCTGTTTTTCGGTATTTCGGTTAGTAAAATATAACTACCATTCTAAATCCATATT
TACTTCGGTTCGGTTTATATATTGTCGGTTTTCGGTTTATTCGGTTTTATACCAAAAAAA
TAATTCTTTATTTTGTGATCATATTATATGAATTTTAGAGTCATCTTGTCAACACATTCA
TTTATTAAAAAATATTATATGTTTAAATAAAAGAACAAAAAACTAAAAAACGCTTATACC
ATCTAATAAAATAATCAGACATATAATTAAAATCAAAGCTCAAAATTTTGAATAAAAGT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2B725JQ 857 0 0
CATCAAGAGTAAAATGTTCACGTTCTCCCCCAGATGTTGTGTTGCCAACCTACTCAAGAG
ATTAAACATACAAGTTTGCAATCAAACAATTGTATTATGGATTAAACCCTAACTAAAATC
ATATAATCGACACATGGATTATACAGAGTGTGTAGTGTGTATATTTGTACCTTGAGAGAT
ATATCATAGGAGTTGGAGCATGGCATGCTTATTTACCTAAGAGATATAACACTGAGTCTG
CGACCGTCTTGACTTGGAGGAAAAGAACCAAGAATGGTATATAAGAATACCTTGATATAA
ACTCAGAACTAGAGGTGTTCAATCCGGATATTGGTACGGTTTCGGTTCGGTTTTTTCTGT
TTTTCGGTATTTCGGTTAGTAAAATATAACTACCATTCTAAATCCATATTTACTTCGGTT
CGGTTTATATATTGTCGGTTTTCGGTTTATTCGGTTTTATACCAAAAAAATAATTCTTTA
TTTTGTGATCATATTATATGAATTTTAGAGTCATCTTGTCAACACATTCATTTATTAAAA
AATATTATATGTTTAAATAAAAGAACAAAAAACTAAAAAACGCTTATACCATCTAATAAA
ATAATCAGACATATAATTAAAATCAAAGCTCAAAATTTTGAATAAAAGTAAAAAGCTAAA
AACAAAACAGAAGCACGAAGCACTAAAGAAACTTTTTATATTCTTCCATATTTAGCGTTC
ATCAAATTCATGTTTCTTCGATTGAACACGAATCTCTGTTCATTTATAGATTAAAAAAAG
TTGCGAAGAATTTCTACTAATTGTGTTCCATCAAATTAATAATCTTTATTTCAATTTAGT
CAATGCTAAAATAAAGC

QA 1 857 1 857
DS 



AS 1 2

CO CL5890Contig1 788 2 4 U
CTCGCCCTTTTGTTTTTCTGGGAGAGTTCATTCTCAGAGCCAAGGGCGAACCCAAAGGTA
ACAGTTTTCTTTAGCCACTGTGAAGATGGCTTCGGTTACTCCTACCTCTATCAGCAAAGC
ATGGCTCATTCCCGGAGCCTCTTTTACTGTAAAAAAGATTGATTGTTCCGTCAAATGCTG
CTTCTCGCGCAAAGCTAGCAAACAGATACCATCATCAACTCAAAGGCTCGTCCTGCCTCT
TTCAACTTCGCTTAAACTGTTTCCTACTCATGGAAGGCAGTTTGTGCTGCATCCTCATCG
TAGTAGAGCCACCACAGGAACTGATGTCGTGGCGGCTGTAGAGGGACAAGATTCTCCTCC
TGTTGCGGAAACCGATGCAAATGACAAGTCAGATGATGCTAGTGCTGCAGCAGCGCCTGC
TACAACATCTCAGTCAAGAGGAACAACAGCAAGACCTGGAAGGAAGAGCGAGATGCCTGC
GGTTAAGAACGAGGAGCTTGTTGCTGGTGCTACCTTCACTGGCAAAGTAAGAGCCATCCA
GCCCTTTGGTGCTTTCATCGATTTTGGTGCTTTCACTGATGGATTAGTCCATGTCTCTCA
ACTGAGCGACACCTTTGTTAAAGATGTTGCGAGTGTTGTCACTATTGGGCAAGAGGTAAA
AGTAAAGCTTGTGGAAGCTGACATTGAGGCTAAACGTATTTCTCTCACTATGCGTTCCAG
TGACGATCCTCCTAAACGCCAGCCCGGTGGTGGTGGGGGGTGGTGATAATAAGCCGAGGC
CAGGAGGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2BG67JQ C 1
AF RR2BG67TF U 1
BS 1 747 RR2BG67TF
BS 748 748 RR2BG67JQ
BS 749 785 RR2BG67TF
BS 786 788 RR2BG67JQ

RD RR2BG67JQ 788 0 0
CTCGCCCTTTTGTTTTTCTGGGAGAGTTCATTCTCAGAGCCAAGGGCGAACCCAAAGGTA
ACAGTTTTCTTTAGCCACTGTGAAGATGGCTTCGGTTACTCCTACCTCTATCAGCAAAGC
ATGGCTCATTCCCGGAGCCTCTTTTACTGTAAAAAAGATTGATTGTTCCGTCAAATGCTG
CTTCTCGCGCAAAGCTAGCAAACAGATACCATCATCAACTCAAAGGCTCGTCCTGCCTCT
TTCAACTTCGCTTAAACTGTTTCCTACTCATGGAAGGCAGTTTGTGCTGCATCCTCATCG
TAGTAGAGCCACCACAGGAACTGATGTCGTGGCGGCTGTAGAGGGACAAGATTCTCCTCC
TGTTGCGGAAACCGATGCAAATGACAAGTCAGATGATGCTAGTGCTGCAGCAGCGCCTGC
TACAACATCTCAGTCAAGAGGAACAACAGCAAGACCTGGAAGGAAGAGCGAGATGCCTGC
GGTTAAGAACGAGGAGCTTGTTGCTGGTGCTACCTTCACTGGCAAAGTAAGAGCCATCCA
GCCCTTTGGTGCTTTCATCGATTTTGGTGCTTTCACTGATGGATTAGTCCATGTCTCTCA
ACTGAGCGACACCTTTGTTAAAGATGTTGCGAGTGTTGTCACTATTGGGCAAGAGGTAAA
AGTAAGGCTTGTGGAAGCTGACATTGAGGCTAAACGTATTTCTCTCACTATGCGTTCCAG
TGACGATCCTCCTAAACGCCAGCCCGGTGGTGGTGGTGG*TGGTGATAATAAGCCGAGGC
CAGGAGGG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2BG67TF 785 0 0
CTCGCCCTTTTGTTTTTCTGGGAGAGTTCATTCTCAGAGCCAAGGGCGAACCCAAAGGTA
ACAGTTTTCTTTAGCCACTGTGAAGATGGCTTCGGTTACTCCTACCTCTATCAGCAAAGC
ATGGCTCATTCCCGGAGCCTCTTTTACTGTAAAAAAGATTGATTGTTCCGTCAAATGCTG
CTTCTCGCGCAAAGCTAGCAAACAGATACCATCATCAACTCAAAGGCTCGTCCTGCCTCT
TTCAACTTCGCTTAAACTGTTTCCTACTCATGGAAGGCAGTTTGTGCTGCATCCTCATCG
TAGTAGAGCCACCACAGGAACTGATGTCGTGGCGGCTGTAGAGGGACAAGATTCTCCTCC
TGTTGCGGAAACCGATGCAAATGACAAGTCAGATGATGCTAGTGCTGCAGCAGCGCCTGC
TACAACATCTCAGTCAAGAGGAACAACAGCAAGACCTGGAAGGAAGAGCGAGATGCCTGC
GGTTAAGAACGAGGAGCTTGTTGCTGGTGCTACCTTCACTGGCAAAGTAAGAGCCATCCA
GCCCTTTGGTGCTTTCATCGATTTTGGTGCTTTCACTGATGGATTAGTCCATGTCTCTCA
ACTGAGCGACACCTTTGTTAAAGATGTTGCGAGTGTTGTCACTATTGGGCAAGAGGTAAA
AGTAAAGCTTGTGGAAGCTGACATTGAGGCTAAACGTATTTCTCTCACTATGCGTTCCAG
TGACGATCCTCCTAAACGCCAGCCCGG*GGTGGTGGGGGGTGGTGATAATAAGCCGAGGC
CAGGA

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL5891Contig1 771 2 6 U
GCAAAAGTCACTTCACTGTCTACATCCCAGTCTTCTGTAAAGAAGGAGAGCGCCTCTTCT
CTGCTGAGAAACAAACAAACCGCTCCAAAGTCATTGCATATGTCTATGAGTCTTGGCCCA
TCATCTGCCTCTGATCCTAGTGCTCTTACAAGCGGTAGAAAGTCGTTGATCATGGAGCGT
ATGGGAGATAAGGACATTGTGAAACGTGCCTTTAAGTCATTTCAAAAGAGTTATGACCTC
GAAACTTCTGTCCAAGAGCAAAAGCAGATTCCAGCAAAGGCTACTACTATTCCTTCTGTA
GCTACGCGTCAGAAGGAAAATGGCAGGCCTGCAAAAGCAAGTGGCATGGAGAAGAGAAGT
AGTACTAGCGCTCATGGTTATTCTGCGTCTCGTGGGTTGAAAAGCAACGTGGCAGCTGAG
AAACAACAAAAAGAGCTTTCCAAATCTGGTACAAGACCTATAGACAAGACACGCTTGCAG
AAGAACCCAAAGGCTGGAGTGGTTGATGCCAAGACAAAGAGGGAGTCTCTGACTCCGAAA
GCAAAACCAGTACGTACCTTACCAAAAGTCTCTTCAGAGAAGATGTTATGATAGCTATAT
CCGTCCTGTTATAGTGTGATCTTTGCCACCAATGTTGTTTGTTTCATTAGTCTTGAGGTG
CAGAATCAATTTATACTTTTGTTATATAGAGGAGTCTCTAGTATCATGTAATAAGCGAGC
CTAATGTTAAAATATCCCTGAGGGGATGATGAATAGTTATATCTTAAATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2BV10JQ C 1
AF RR2BV10TF U 1
BS 1 731 RR2BV10TF
BS 732 732 RR2BV10JQ
BS 733 744 RR2BV10TF
BS 745 745 RR2BV10JQ
BS 746 767 RR2BV10TF
BS 768 771 RR2BV10JQ

RD RR2BV10JQ 771 0 0
GCAAAAGTCACTTCACTGTCTACATCCCAGTCTTCTGTAAAGAAGGAGAGCGCCTCTTCT
CTGCTGAGAAACAAACAAACCGCTCCAAAGTCATTGCATATGTCTATGAGTCTTGGCCCA
TCATCTGCCTCTGATCCTAGTGCTCTTACAAGCGGTAGAAAGTCGTTGATCATGGAGCGT
ATGGGAGATAAGGACATTGTGAAACGTGCCTTTAAGTCATTTCAAAAGAGTTATGACCTC
GAAACTTCTGTCCAAGAGCAAAAGCAGATTCCAGCAAAGGCTACTACTATTCCTTCTGTA
GCTACGCGTCAGAAGGAAAATGGCAGGCCTGCAAAAGCAAGTGGCATGGAGAAGAGAAGT
AGTACTAGCGCTCATGGTTATTCTGCGTCTCGTGGGTTGAAAAGCAACGTGGCAGCTGAG
AAACAACAAAAAGAGCTTTCCAAATCTGGTACAAGACCTATAGACAAGACACGCTTGCAG
AAGAACCCAAAGGCTGGAGTGGTTGATGCCAAGACAAAGAGGGAGTCTCTGACTCCGAAA
GCAAAACCAGTACGTACCTTACCAAAAGTCTCTTCAGAGAAGATGTTATGATAGCTATAT
CCGTCCTGTTATAGTGTGATCTTTGCCACCAATGTTGTTTGTTTCATTAGTCTTGAGGTG
CAGAATCAATTTATACTTTTGTTATATAGAGGAGTCTCTAGTATCATGTAATAAGCGAGC
CTAATGTTAAAATATCCCTGAGGGGATGATGAATAGTTATATCTTAAATCC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2BV10TF 770 0 0
GCAAAAGTCACTTCACTGTCTACATCCCAGTCTTCTGTAAAGAAGGAGAGCGCCTCTTCT
CTGCTGAGAAACAAACAAACCGCTCCAAAGTCATTGCATATGTCTATGAGTCTTGGCCCA
TCATCTGCCTCTGATCCTAGTGCTCTTACAAGCGGTAGAAAGTCGTTGATCATGGAGCGT
ATGGGAGATAAGGACATTGTGAAACGTGCCTTTAAGTCATTTCAAAAGAGTTATGACCTC
GAAACTTCTGTCCAAGAGCAAAAGCAGATTCCAGCAAAGGCTACTACTATTCCTTCTGTA
GCTACGCGTCAGAAGGAAAATGGCAGGCCTGCAAAAGCAAGTGGCATGGAGAAGAGAAGT
AGTACTAGCGCTCATGGTTATTCTGCGTCTCGTGGGTTGAAAAGCAACGTGGCAGCTGAG
AAACAACAAAAAGAGCTTTCCAAATCTGGTACAAGACCTATAGACAAGACACGCTTGCAG
AAGAACCCAAAGGCTGGAGTGGTTGATGCCAAGACAAAGAGGGAGTCTCTGACTCCGAAA
GCAAAACCAGTACGTACCTTACCAAAAGTCTCTTCAGAGAAGATGTTATGATAGCTATAT
CCGTCCTGTTATAGTGTGATCTTTGCCACCAATGTTGTTTGTTTCATTAGTCTTGAGGTG
CAGAATCAATTTATACTTTTGTTATATAGAGGAGTCTCTAGTATCATGTAATAAGCGAGC
CTAATGTTAAA*TATCCCTGAGGG*ATGATGAATAGTTATATCTTAA
TCC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL5892Contig1 605 2 1 U
GGGCCACACACAACACAAATCATAGAACTCACTGCTTCTATACTACACAAATGCAGTACT
ACGGAACCCGTGAAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGGCTAGAGCCGCCAGAGCAATA
GCCAGAATCACCAGGGATATGACCAGAGCCAAAGTCGTCCAGTATATGGCCATAGCCCTA
CTCTGAACTACCGTAGCCACGGTGGGTTTCTTGATGGGTTATTCAAGGGTCGAAATGGCC
AAAAAGGTCAGAACGGCCTAGGATCGTTTCTAGGGAAACACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGGAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGACAACTCATGAGACAAACA
AAGGTATCAATGGCCTAGGTCTGTTCATAAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAAGAAAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGAGAGTGGAAGCAGCAGCGGTAGCG
ACAGCGACTAAATCAAATGCTTTCATAAATGTTATGCTTCTATGGCAGACTATATAAAGT
AAACTAGGTGATACCCGCGCCCTGCGCGGAGAGAATGAACTAATAAAAATTATAACTTTT
ATTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2BE57JQ C 1
AF RR2BE57TF U 1
BS 1 605 RR2BE57TF

RD RR2BE57JQ 605 0 0
GGGCCACACACAACACAAATCATAGAACTCACTGCTTCTATACTACACAAATGCAGTATT
ACGGAACCCGTGAAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGGCTAGAGCCGCCAGAGCAATA
GCCAGAATCACCAGGGATATGACCAGAGCCAAAGTCGTCCAGTATATGGCCATAGCCCTA
CTCTGAACTACCGTAGCCACGGTGGGTTTCTTGATGGGTTATTCAAGGGTCGAAATGGCC
AAAAAGGTCAGAACGGCCTAGGATCGTTTCTAGGGAAACACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGGAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGACAACTCATGAGACAAACA
AAGGTATCAATGGCCTAGGTCTGTTCATAAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAAGAAAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGAGAGTGGAAGCAGCAGCGGTAGCG
ACAGCGACTAAATCAAATGCTTTCATAAATGTTATGCTTCTATGGCAGACTATATAAAGT
AAACTAGGTGATACCCGCGCCCTGCGCGGAGAGAATGAACTAATAAAAATTATAACTTTT
ATTCT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2BE57TF 605 0 0
GGGCCACACACAACACAAATCATAGAACTCACTGCTTCTATACTACACAAATGCAGTACT
ACGGAACCCGTGAAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGGCTAGAGCCGCCAGAGCAATA
GCCAGAATCACCAGGGATATGACCAGAGCCAAAGTCGTCCAGTATATGGCCATAGCCCTA
CTCTGAACTACCGTAGCCACGGTGGGTTTCTTGATGGGTTATTCAAGGGTCGAAATGGCC
AAAAAGGTCAGAACGGCCTAGGATCGTTTCTAGGGAAACACAAGAGCCAAGAGGCTAACA
AGGGCCATGGACATGGGAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGACAACTCATGAGACAAACA
AAGGTATCAATGGCCTAGGTCTGTTCATAAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAA
ATGAAGAAAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGAGAGTGGAAGCAGCAGCGGTAGCG
ACAGCGACTAAATCAAATGCTTTCATAAATGTTATGCTTCTATGGCAGACTATATAAAGT
AAACTAGGTGATACCCGCGCCCTGCGCGGAGAGAATGAACTAATAAAAATTATAACTTTT
ATTCT

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL5893Contig1 684 2 2 U
GGGTGGTCTTTGGAAGTTGACGGAAGTTGCGTGGACAGACACTATGTGCAGCTGGTCACC
TGATGGAGAATGGATCGCGTTTGCATCGGATAGAGAAAGCCCTGGCTCGGGAAGCTACGA
GCTGTTCTTGATCCACCCGGACGGAACAGGGTTAAGGAAGCTGATACAGAGTGGCACTGG
TGGGAGAACGAACCATCCGATCTTTAGTCCCGACAGTAAAAGTATCGTCTTTACATCTGA
TTACGCAGGGATATCAGCTGAACCGATCTCGAACCCTCATCATTACCAACCGTATGGTGA
TATCTTCACGGTGAAACTGGATGGCTCTAACTTAAGAAGACTGACGCATAACTCATACGA
AGATGGGACTCCTGCTTGGGCTCCTCGGTTCATCAGCCCAAGCGACGTGGTGTTGCGCAG
GAAGAATGATTCGAGTTGCTCATTCGAAGATTGTCACTGGCTCAATAAGAGTCCGACACT
AAAAGGCAGCAAAATCTCATGTTAAAATATGTGTATGATTATTAGTTGATTACCCGACCA
TTTGAGTATCCACCTTTGTCATAAATATGTTACTACTCCCTCTGTAAGATGTATTCCAGC
TTGTGGAACTCCTAGTTATAGACTTGTACGAGAGACTGTCGATGCATATGCATATCATAT
TGAATAATACTGTGATATATATGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW59TF U 1
AF RR2FW59JQ C 1
BS 1 604 RR2FW59TF
BS 605 684 RR2FW59JQ

RD RR2FW59TF 604 0 0
GGGTGGTCTTTGGAAGTTGACGGAAGTTGCGTGGACAGACACTATGTGCAGCTGGTCACC
TGATGGAGAATGGATCGCGTTTGCATCGGATAGAGAAAGCCCTGGCTCGGGAAGCTACGA
GCTGTTCTTGATCCACCCGGACGGAACAGGGTTAAGGAAGCTGATACAGAGTGGCACTGG
TGGGAGAACGAACCATCCGATCTTTAGTCCCGACAGTAAAAGTATCGTCTTTACATCTGA
TTACGCAGGGATATCAGCTGAACCGATCTCGAACCCTCATCATTACCAACCGTATGGTGA
TATCTTCACGGTGAAACTGGATGGCTCTAACTTAAGAAGACTGACGCATAACTCATACGA
AGATGGGACTCCTGCTTGGGCTCCTCGGTTCATCAGCCCAAGCGACGTGGTGTTGCGCAG
GAAGAATGATTCGAGTTGCTCATTCGAAGATTGTCACTGGCTCAATAAGAGTCCGACACT
AAAAGGCAGCAAAATCTCATGTTAAAATATGTGTATGATTATTAGTTGATTACCCGACCA
TTTGAGTATCCACCTTTGTCATAAATATGTTACTACTCCCTCTGTAAGATGTATTCCAGC
TTGT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2FW59JQ 684 0 0
GGGTGGTCTTTGGAAGTTGACGGAAGTTGCGTGGACAGACACTATGTGCAGCTGGTCACC
TGATGGAGAATGGATCGCGTTTGCATCGGATAGAGAAAGCCCTGGCTCGGGAAGCTACGA
GCTGTTCTTGATCCACCCGGACGGAACAGGGTTAAGGAAGCTGATACAGAGTGGCACTGG
TGGGAGAACGAACCATCCGATCTTTAGTCCCGACAGTAAAAGTATCGTCTTTACATCTGA
TTACGCAGGGATATCAGCTGAACCGATCTCGAACCCTCATCATTACCAACCGTATGGTGA
TATCTTCACGGTGAAACTGGATGGCTCTAACTTAAGAAGACTGACGCATAACTCATACGA
AGATGGGACTCCTGCTTGGGCTCCTCGGTTCATCAGCCCAAGCGACGTGGTGTTGCGCAG
GAAGAATGATTCGAGTTGCTCATTCGAAGATTGTCACTGGCTCAATAAGAGTCCGACACT
AAAAGGCAGCAAAATCTCATGTTAAAATATGTGTATGATTATTAGTTGATTACCCGACCA
TTTGAGTATCCACCTTTGTCATAAATATGTTACTACTCCCTCTGTAAGATGTATTCCAGC
TTGTGGAACTCCTAGTTATAGACTTGTACGAGAGACTGTCGATGCATATGCATATCATAT
TGAATAATACTGTGATATATATGC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL5894Contig1 803 2 10 U
CAAGAAAAAGCTAGACAAAGAACCTGATAATGAAGGGTCTTCATTTCCACCTCTTCCTAG
TCACCATGACGGTCGCTGCATCCATCTCCGCGGAAACACCAGCCGCTCCGGCGGGCGGAG
GAGCATTGGCTGAGAAATATAGTCAAGTTATTCCAAAGGTAAGTTTGTGTTTGGATTTCG
CGACCGGGAAAGCACCAAAACCGTCTGAGAAGTGTTGTGACGCTATCAAAGATATAAAAG
AGAAGGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGGTACAACAAGCGAAGACAGGAGGACAAGCTA
TGAAGGATCTTGGTGTTCAAGAAGCCAAGCTTATTCAACTTCCAACTGCTTGTCAGCTCC
AAAACGCTAGCATCTCCAATTGTCCAAAGCTTCTCGGGATTTCGCCGAGCTCACCAGACG
CATCCGTATTCACAAGCAATGCCACAACAATGACACCGGAGGCGCCGGCAGGGAAGTCTC
CGGCAACTCCAGCGACGTCTGCGGAGAAAGGAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTACCT
CGTTGTGGCTCTAGCCATCGCTTTGATTACCGTCTCCTTCGTCTCGACCTTACCTAGGAT
GGCTTTAGCATAGACGGTAGCTAAGCACGTGAGGTTTTGCTGAGGCACATGTGACATTAG
GGATGTAATTTTTCTCTCTGTATTATGTTGTGGTGCTTTTGTTTCAAACTTTCAAGACTT
TCTTTCCAAGTATGTTTCGTGGTTCGAACCATTTGTTGTAATGAGTGAACTTTCCTACCT
AATCGGATCTCTTTCGCAAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB85TF U 1
AF RR2EB85JQ C 55
BS 1 644 RR2EB85TF
BS 645 645 RR2EB85JQ
BS 646 707 RR2EB85TF
BS 708 708 RR2EB85JQ
BS 709 726 RR2EB85TF
BS 727 728 RR2EB85JQ
BS 729 747 RR2EB85TF
BS 748 748 RR2EB85JQ
BS 749 764 RR2EB85TF
BS 765 803 RR2EB85JQ

RD RR2EB85TF 764 0 0
CAAGAAAAAGCTAGACAAAGAACCTGATAATGAAGGGTCTTCATTTCCACCTCTTCCTAG
TCACCATGACGGTCGCTGCATCCATCTCCGCGGAAACACCAGCCGCTCCGGCGGGCGGAG
GAGCATTGGCTGAGAAATATAGTCAAGTTATTCCAAAGGTAAGTTTGTGTTTGGATTTCG
CGACCGGGAAAGCACCAAAACCGTCTGAGAAGTGTTGTGACGCTATCAAAGATATAAAAG
AGAAGGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGGTACAACAAGCGAAGACAGGAGGACAAGCTA
TGAAGGATCTTGGTGTTCAAGAAGCCAAGCTTATTCAACTTCCAACTGCTTGTCAGCTCC
AAAACGCTAGCATCTCCAATTGTCCAAAGCTTCTCGGGATTTCGCCGAGCTCACCAGACG
CATCCGTATTCACAAGCAATGCCACAACAATGACACCGGAGGCGCCGGCAGGGAAGTCTC
CGGCAACTCCAGCGACGTCTGCGGAGAAAGGAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGTACCT
CGTTGTGGCTCTAGCCATCGCTTTGATTACCGTCTCCTTCGTCTCGACCTTACCTAGGAT
GGCTTTAGCATAGACGGTAGCTAAGCACGTGAGGTTTTGCTGAG*CACATGTGACATTAG
GGATGTAATTTTTCTCTCTGTATTATGTTGTGGTGCTTTTGTTTCAA*CTTTCAAGACTT
TCTTTC**AGTATGTTTCGTGGTTCGA*CCATTTGTTGTAATGA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2EB85JQ 749 0 0
TCCTAGTCACCATGACGGTCGCTGCATCCATCTCCGCGGAAACACCAGCCGCTCCGGCGG
GCGGAGGAGCATTGGCTGAGAAATATAGTCAAGTTATTCCAAAGGTAAGTTTGTGTTTGG
ATTTCGCGACCGGGAAAGCACCAAAACCGTCTGAGAAGTGTTGTGACGCTATCAAAGATA
TAAAAGAGAAGGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGGTACAACAAGCGAAGACAGGAGGAC
AAGCTATGAAGGATCTTGGTGTTCAAGAAGCCAAGCTTATTCAACTTCCAACTGCTTGTC
AGCTCCAAAACGCTAGCATCTCCAATTGTCCAAAGCTTCTCGGGATTTCGCCGAGCTCAC
CAGACGCATCCGTATTCACAAGCAATGCCACAACAATGACACCGGAGGCGCCGGCAGGGA
AGTCTCCGGCAACTCCAGCGACGTCTGCGGAGAAAGGAGGATCAGCTTCCATAAAAGATG
GTACCTCGTTGTGGCTCTAGCCATCGCTTTGATTACCGTCTCCTTCGTCTCGACCTTACC
TAGGATGGCTTTAGCATAGACGGTAGCTAAGCACGTGAGGTTTTGCTGAGGCACATGTGA
CATTAGGGATGTAATTTTTCTCTCTGTATTATGTTGTGGTGCTTTTGTTTCAAACTTTCA
AGACTTTCTTTTCAAGTATGTTTCGTGGTTCGAACCATTTGTTGTAATGAGTGAACTTTC
CTACCTAATCGGATCTCTTTCGCAAAACC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL5895Contig1 780 2 2 U
GGGATCCTCTCTTCCAGAACTCATCGTCGCCGTCTCCGCGTTTCAAAGTCTCATCTCTTG
GTCTCCCCTTTCGTTATCTCACTCTCCACATTCCCTGTGGTTCAGTCTTCGTATTTTTGA
TCTTATTTTATCCAGATTCCGTGTCGACATCTCCTTTTCATTCATCTGAAATCTATAAAT
ATAAAGGGGTTGAAAGTACGATAGATGGTCAGCACCACTGTCTGTTTATCATTTTTAAAG
CGTACAAAGATTTTCCAAAATGGCTTCCTCCGATGCTGTTGTTTCGCACCCCCGTTTGAC
GCTCGCCGCCTTGGTAGATCTGGTCAGTTCATTGTTGCTTGTCTGCTCCGTTTTTGGGAC
TTGAAAAACATCAAGAATCATGGTGAATCACTCTACTCCTTGATGAGAAGGTGTAGTAAC
GAGAAACGTCTATTTCTCAGATGATGCTCCCCTTATCAACCTACAGAAATTCATGCTCCG
GGACTTTGACCATCTGCAAGCTCTCGCAAACACTAATTTAGAACTTCCTGATGTTCTTGG
GCAAATTCAATCTGTGCAAGGTTCGGATCTTAAGGACGCTGCGGTGATGAACCGAGTTAT
GCTCCGTTTCGTTGTTGAACTGAGTGTGGTCGTGTACCTTTCTCGGTGGGACGATGCTGC
AGCAATGTTTAGAGGTCTCATCAACTCACAACAGAGTTTACAGCCAGCTGCAGTCATATT
ATACCATCTGGTTCCAGCTTAGAAGCCCCAATGGGTGAAGCTTTCCCATGTATCGATACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA19TF U 1
AF RR2EA19JQ C 114
BS 1 555 RR2EA19TF
BS 556 780 RR2EA19JQ

RD RR2EA19TF 555 0 0
GGGATCCTCTCTTCCAGAACTCATCGTCGCCGTCTCCGCGTTTCAAAGTCTCATCTCTTG
GTCTCCCCTTTCGTTATCTCACTCTCCACATTCCCTGTGGTTCAGTCTTCGTATTTTTGA
TCTTATTTTATCCAGATTCCGTGTCGACATCTCCTTTTCATTCATCTGAAATCTATAAAT
ATAAAGGGGTTGAAAGTACGATAGATGGTCAGCACCACTGTCTGTTTATCATTTTTAAAG
CGTACAAAGATTTTCCAAAATGGCTTCCTCCGATGCTGTTGTTTCGCACCCCCGTTTGAC
GCTCGCCGCCTTGGTAGATCTGGTCAGTTCATTGTTGCTTGTCTGCTCCGTTTTTGGGAC
TTGAAAAACATCAAGAATCATGGTGAATCACTCTACTCCTTGATGAGAAGGTGTAGTAAC
GAGAAACGTCTATTTCTCAGATGATGCTCCCCTTATCAACCTACAGAAATTCATGCTCCG
GGACTTTGACCATCTGCAAGCTCTCGCAAACACTAATTTAGAACTTCCTGATGTTCTTGG
GCAAATTCAATCTGT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2EA19JQ 667 0 0
TTTTTGATCTTATTTTATCCAGATTCCGTGTCGACATCTCCTTTTCATTCATCTGAAATC
TATAAATATAAAGGGGTTGAAAGTACGATAGATGGTCAGCACCACTGTCTGTTTATCATT
TTTAAAGCGTACAAAGATTTTCCAAAATGGCTTCCTCCGATGCTGTTGTTTCGCACCCCC
GTTTGACGCTCGCCGCCTTGGTAGATCTGGTCAGTTCATTGTTGCTTGTCTGCTCCGTTT
TTGGGACTTGAAAAACATCAAGAATCATGGTGAATCACTCTACTCCTTGATGAGAAGGTG
TAGTAACGAGAAACGTCTATTTCTCAGATGATGCTCCCCTTATCAACCTACAGAAATTCA
TGCTCCGGGACTTTGACCATCTGCAAGCTCTCGCAAACACTAATTTAGAACTTCCTGATG
TTCTTGGGCAAATTCAATCTGTGCAAGGTTCGGATCTTAAGGACGCTGCGGTGATGAACC
GAGTTATGCTCCGTTTCGTTGTTGAACTGAGTGTGGTCGTGTACCTTTCTCGGTGGGACG
ATGCTGCAGCAATGTTTAGAGGTCTCATCAACTCACAACAGAGTTTACAGCCAGCTGCAG
TCATATTATACCATCTGGTTCCAGCTTAGAAGCCCCAATGGGTGAAGCTTTCCCATGTAT
CGATACT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL5896Contig1 601 2 1 U
GAACAGGGAAGACAAAACAATATCTTGCAAGGCAAGAAAGCAGGATGCAGAGTCACCGGA
TTGTTATGCGCCAAGTGAGGTAAGCATAGCTTGGAGTGTAGTAACAGCTAGTGTTGCGGA
TTACTCTGTTATCTCTGAATGTGCTACGAGTCCTGTCAAGAACCAGTCTTTCCAGATCCC
TCGAATCCCTATAACCGCCAAATCAAACCGAGAAAACGAGCCTCAGAGACAAAACCGAGA
AGTGGTGGTGGTTTATTGTTGGGCTGCAAGAGTCACAAAGCTGTCAGAGTGTCAGGTGAT
TCGTACACAAACGTGAACAGAACACCGAGTTATGTTCCAAGGTTCCCTGTAGAAGCTAAT
CCAACAAGTATCGAGACAAGGAGGAAAGTAAGCAGCAGTTCCGTTTCCCGCACGCAATCT
CCTTTTCTGTATATTTAATGATGCCCTAAAACCCTGAGCGCCTTTCTCTTTACATGTAAT
GTTTATTGAGTGAAAAAGATTTGTTTTACTAATACTATATTCAAATGTATTATCGTGTGA
TCTTAGAACTCATTTTTCATCAATCAATAGAAGACTGCAAATCAATATTTTAGAACTCAC
T


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2CH47JQ C 1
AF RR2CH47TF U 1
BS 1 601 RR2CH47TF

RD RR2CH47JQ 601 0 0
GAACAGGGAAGACAAAACAATATCTTGCAAGGCAAGAAAGCAGGATGCAGAGTCACCGGA
TTGTTATGCGCCAAGTGAGGTAAGCATAGCTTGGAGTGTAGTAACAGCTAGTGTTGCGGA
TTACTCTGTTATCTCTGAATGTGCTACGAGTCCTGTCAAGAACCAGTCTTTCCAGATCCC
TCGAATCCCTATAACCGCCAAATCAAACCGAGAAAACGAGCCTCAGAGACAAAACCGAGA
AGTGGTGGTGGTTTATTGTTGGGCTGCAAGAGTCACAAAGCTGTCAGAGTGTCAGGTGAT
TCGTACACAAACGTGAACAGAACACCGAGTTATGTTCCAAGGTTCCCTGTAGAAGCTAAT
CCAACAAGTATCGAGACAAGGAGGAAAGTAAGCAGCAGTTCCGTTTCCCGCACGCAATCT
CCTTTTCTGTATATTTAATGATGCCCTAAAACCCTGAGCGCCTTTCTCTTTACATGTAAT
GTTTATTGAGTGAAAAAGATTTGTTTTACTAATACTATATTCAAATGTATTATCGTGTGA
TCTTAGAACTCATTTTTCATCAATCAATAGAAGACTGCAAATCAATATTTTAGAACTCAC
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2CH47TF 601 0 0
GAACAGGGAAGACAAAACAATATCTTGCAAGGCAAGAAAGCAGGATGCAGAGTCACCGGA
TTGTTATGCGCCAAGTGAGGTAAGCATAGCTTGGAGTGTAGTAACAGCTAGTGTTGCGGA
TTACTCTGTTATCTCTGAATGTGCTACGAGTCCTGTCAAGAACCAGTCTTTCCAGATCCC
TCGAATCCCTATAACCGCCAAATCAAACCGAGAAAACGAGCCTCAGAGACAAAACCGAGA
AGTGGTGGTGGTTTATTGTTGGGCTGCAAGAGTCACAAAGCTGTCAGAGTGTCAGGTGAT
TCGTACACAAACGTGAACAGAACACCGAGTTATGTTCCAAGGTTCCCTGTAGAAGCTAAT
CCAACAAGTATCGAGACAAGGAGGAAAGTAAGCAGCAGTTCCGTTTCCCGCACGCAATCT
CCTTTTCTGTATATTTAATGATGCCCTAAAACCCTGAGCGCCTTTCTCTTTACATGTAAT
GTTTATTGAGTGAAAAAGATTTGTTTTACTAATACTATATTCAAATGTATTATCGTGTGA
TCTTAGAACTCATTTTTCATCAATCAATAGAAGACTGCAAATCAATATTTTAGAACTCAC
T

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL5897Contig1 885 2 12 U
GGAGACTCTTTTCTCGTTTTCACCTGAGGAAAAAAGAAGAAAAAAAAGAAGAATCTCTCT
CTCGATCGCCATGAGTCTGTTTGGATTGGGAAGAAATCAGAAGACATTCCGTCCTAAGAA
GAGTGCACCTTCTGGAAGCAAGGGTGCACAGCTTCGACAGCATATAGATGCAACTTTAGG
AAGTGGCAACTTGAGAGAAGCTGTTCGACTTCCTCCTGGAGAGGATGCCAACGAGTGGCT
TGCTGTCAACACTGTGGATTTTTTTAATCAAGTGAACTTGCTATATGGTACCCTTACCGA
GTTTTGCACACCTGATAACTGTCCTACTATGACTGCTGGCCCCAAGTACGAGTATAGATG
GGCAGATGGTGTGCAGATCAAGAAGCCAATAGAGGTTTCTGCTCCAAAGTATGTCGAGTA
CTTGATGGATTGGATCGAGACACAGCTCGATGATGAGACTTTATTCCCTCAAAGGCTTGG
AGCACCATTTCCTCAGAACTTCAAGGATGTGGTGAAGACAATATTTAAACGACTGTTCCG
TGTGTATGCCCACATATACCATTCTCATTTCCAGAAAATCGTTAGCCTTAAAGAAGAAGC
TCATCTCAACACTTGCTTCAAGCACTTCATCCTCTTTACTCATGAGTTTGGACTGATTGA
CAAGAAAGAACTGGCGCCTCTACAAGAGCTCATGGAATCTATCGTTTCACCTTATTGAGC
ATAAAAAAAGAAGCCAACTTCAGATATTAAAATCAAGAAATAAATTAAATGGTAATATGG
TTTTAAATTTATAAATCTATCCCGTTTGTTTCCAGTTTTCTTTTTTCTTCCTAATTTCTC
TGTAAAATTGAAACATTTACTATGTAAGAAAATGGGTGTTGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD34TF U 1
AF RR2FD34JQ C 329
BS 1 728 RR2FD34TF
BS 729 729 RR2FD34JQ
BS 730 751 RR2FD34TF
BS 752 752 RR2FD34JQ
BS 753 760 RR2FD34TF
BS 761 761 RR2FD34JQ
BS 762 774 RR2FD34TF
BS 775 775 RR2FD34JQ
BS 776 786 RR2FD34TF
BS 787 788 RR2FD34JQ
BS 789 806 RR2FD34TF
BS 807 885 RR2FD34JQ

RD RR2FD34TF 807 0 0
GGAGACTCTTTTCTCGTTTTCACCTGAGGAAAAAAGAAGAAAAAAAAGAAGAATCTCTCT
CTCGATCGCCATGAGTCTGTTTGGATTGGGAAGAAATCAGAAGACATTCCGTCCTAAGAA
GAGTGCACCTTCTGGAAGCAAGGGTGCACAGCTTCGACAGCATATAGATGCAACTTTAGG
AAGTGGCAACTTGAGAGAAGCTGTTCGACTTCCTCCTGGAGAGGATGCCAACGAGTGGCT
TGCTGTCAACACTGTGGATTTTTTTAATCAAGTGAACTTGCTATATGGTACCCTTACCGA
GTTTTGCACACCTGATAACTGTCCTACTATGACTGCTGGCCCCAAGTACGAGTATAGATG
GGCAGATGGTGTGCAGATCAAGAAGCCAATAGAGGTTTCTGCTCCAAAGTATGTCGAGTA
CTTGATGGATTGGATCGAGACACAGCTCGATGATGAGACTTTATTCCCTCAAAGGCTTGG
AGCACCATTTCCTCAGAACTTCAAGGATGTGGTGAAGACAATATTTAAACGACTGTTCCG
TGTGTATGCCCACATATACCATTCTCATTTCCAGAAAATCGTTAGCCTTAAAGAAGAAGC
TCATCTCAACACTTGCTTCAAGCACTTCATCCTCTTTACTCATGAGTTTGGACTGATTGA
CAAGAAAGAACTGGCGCCTCTACAAGAGCTCATGGAATCTATCGTTTCACCTTATTGAGC
ATAAAAAA*GAAGCCAACTTCAGATATTAAA*TCAAGAAA*AAATTAAATGGTA*TATGG
TTTTAA**TTATAAATCTATCCCGTT
G

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2FD34JQ 557 0 0
ATGACTGCTGGCCCCAAGTACGAGTATAGATGGGCAGATGGTGTGCAGATCAAGAAGCCA
ATAGAGGTTTCTGCTCCAAAGTATGTCGAGTACTTGATGGATTGGATCGAGACACAGCTC
GATGATGAGACTTTATTCCCTCAAAGGCTTGGAGCACCATTTCCTCAGAACTTCAAGGAT
GTGGTGAAGACAATATTTAAACGACTGTTCCGTGTGTATGCCCACATATACCATTTTCAT
TTCCAGAAAATCGTTAGCCTTAAAGAAGAAGCTCATCTCAACACTTGCTTCAAGCACTTC
ATCCTCTTTACTCATGAGTTTGGACTGATTGACAAGAAAGAACTGGCGCCTCTACAAGAG
CTCATGGAATCTATCGTTTCACCTTATTGAGCATAAAAAAAGAAGCCAACTTCAGATATT
AAAATCAAGAAATAAATTAAATGGTAATATGGTTTTTAATTTATAAATCTATCCCGTTTG
TTTCCAGTTTTCTTTTTTCTTCCTAATTTCTCTGTAAAATTGAAACATTTACTATGTAAG
AAAATGGGTGTTGAGCC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL5898Contig1 682 2 2 U
GATCTCATTTCTTCAAGCGCCTCCCCCTCCTCCATCGAGAAGAAGAAATCACACCAAAGA
CACAGCCATTCCTCCGAAGTTGGACCCGACCGCGATCGTCGACGTGTACGTCCGCGTAAC
CGGAGGAGAAGTCGGAGCAGCGAGTTCCCTCGCTCCCAAGATCGGACCCCTCGGTCTCGC
TCCCAAGAAGATCGGAGAAGACATCGCGAAAGAAACAGCCAAGGAGTGGAAAGGACTCCG
CGTCACCGTCAAGCTGACGGTGCAGAACCGTCAGGCGAAAGTGACGGTGGTTCCGTCGGC
GGCGGCGCTGGTGATAAAGGCGTTGAATGAGCCGGAGAGAGACAGGAAGAAGGTGAAGAA
CATTAAGCACAACGGGAACATTTCGTTCGATGACGTGATTGAGATCGCGAGGGTCATGAG
GCCGAGGTCTATCGCCAAGGAGCTGAGCGGGACAGTGAGGGAGATTCTCGGGACTTGTGT
GTCTGTTGGGTGTACTGTTGATGGGAAGGATCCCAAGGATATCCAGCAGGAGATTCAAGA
AGGTGAGGTTGAGATTCCTGAGAATTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAAAAAAGGA
GACGGGACTTTGAGAGATGTGTTGTGTTTGGTTCTTTGTTTTAGCTTCTATGTTTCGGTT
AAGGACAAGTCGGTTTTGGTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ94TF U 1
AF RR2CJ94JQ C 1
BS 1 587 RR2CJ94TF
BS 588 682 RR2CJ94JQ

RD RR2CJ94TF 587 0 0
GATCTCATTTCTTCAAGCGCCTCCCCCTCCTCCATCGAGAAGAAGAAATCACACCAAAGA
CACAGCCATTCCTCCGAAGTTGGACCCGACCGCGATCGTCGACGTGTACGTCCGCGTAAC
CGGAGGAGAAGTCGGAGCAGCGAGTTCCCTCGCTCCCAAGATCGGACCCCTCGGTCTCGC
TCCCAAGAAGATCGGAGAAGACATCGCGAAAGAAACAGCCAAGGAGTGGAAAGGACTCCG
CGTCACCGTCAAGCTGACGGTGCAGAACCGTCAGGCGAAAGTGACGGTGGTTCCGTCGGC
GGCGGCGCTGGTGATAAAGGCGTTGAATGAGCCGGAGAGAGACAGGAAGAAGGTGAAGAA
CATTAAGCACAACGGGAACATTTCGTTCGATGACGTGATTGAGATCGCGAGGGTCATGAG
GCCGAGGTCTATCGCCAAGGAGCTGAGCGGGACAGTGAGGGAGATTCTCGGGACTTGTGT
GTCTGTTGGGTGTACTGTTGATGGGAAGGATCCCAAGGATATCCAGCAGGAGATTCAAGA
AGGTGAGGTTGAGATTCCTGAGAATTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2CJ94JQ 682 0 0
GATCTCATTTCTTCAAGCGCCTCCCCCTCCTCCATCGAGAAGAAGAAATCACACCAAAGA
CACAGCCATTCCTCCGAAGTTGGACCCGACCGCGATCGTCGACGTGTACGTCCGCGTAAC
CGGAGGAGAAGTCGGAGCAGCGAGTTCCCTCGCTCCCAAGATCGGACCCCTCGGTCTCGC
TCCCAAGAAGATCGGAGAAGACATCGCGAAAGAAACAGCCAAGGAGTGGAAAGGACTCCG
CGTCACCGTCAAGCTGACGGTGCAGAACCGTCAGGCGAAAGTGACGGTGGTTCCGTCGGC
GGCGGCGCTGGTGATAAAGGCGTTGAATGAGCCGGAGAGAGACAGGAAGAAGGTGAAGAA
CATTAAGCACAACGGGAACATTTCGTTCGATGACGTGATTGAGATCGCGAGGGTCATGAG
GCCGAGGTCTATCGCCAAGGAGCTGAGCGGGACAGTGAGGGAGATTCTCGGGACTTGTGT
GTCTGTTGGGTGTACTGTTGATGGGAAGGATCCCAAGGATATCCAGCAGGAGATTCAAGA
AGGTGAGGTTGAGATTCCTGAGAATTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAAAAAAGGA
GACGGGACTTTGAGAGATGTGTTGTGTTTGGTTCTTTGTTTTAGCTTCTATGTTTCGGTT
AAGGACAAGTCGGTTTTGGTCT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL5899Contig1 515 2 1 U
GGAGAGAGATCCAGACTCGTATTCTGGTCATCGATGGCTAGCGATTGGAGAGGTTCAATG
GGGAAGGTGAGGTCTTTCGTGGGAAACTCCATGGGCGGTCTTAGAGGAGGTCAGAATCTC
GCGTCTTGGCTCGTGGCCGGAACGATCGCTTACTATCTCTGGGTTAAACCGGCTCAGGAT
CTCAAGAAGGAACGAGAGGCTAGGGCACTTCTGGCGGTGGCCGATCGAAATCAATACGTG
GAGAAGAGGAAACCAGTCGCTGATCCTCAGGTTACTGGTCTGGTTTATGGGAACAAGAAC
ATAACCGATGATAAACCACGGGATTGAATACTTTTTTTTTCTTTGTTTCTGCAAGTTTGA
GAACATCTCTTTGTGTAAGTCTGTTAACTAGTTCTGCAGTTTTGTCCGGTTTATCCTTAT
AGCTAAGAAGATGATCATTGTATAGACAAAACAACACTATAGTTGTGTGACTTTACAAAA
CAATCGAATAATAATGGAAACTTTTTTTTTGAAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FO47JQ C 1
AF RR2FO47TF U 1
BS 1 515 RR2FO47TF

RD RR2FO47JQ 515 0 0
GGAGAGAGATCCAGACTCGTATTCTGGTCATCGATGGCTAGCGATTGGAGAGGTTCAATG
GGGAAGGTGAGGTCTTTCGTGGGAAACTCCATGGGCGGTTTTAGAGGAGGTCAGAATCTC
GCGTCTTGGCTCGTGGCCGGAACGATCGCTTACTATCTTTGGGTTAAACCGGCTCAGGAT
CTCAAGAAGGAACGAGAGGCTAGGGCACTTCTGGCGGTGGCCGATCGAAATCAATACGTG
GAGAAGAGGAAACCAGTCGCTGATCCTCAGGTTACTGGTCTGGTTTATGGGAACAAGAAC
ATAACCGATGATAAACCACGGGATTGAATACTTTTTTTTTCTTTGTTTCTGCAAGTTTGA
GAACATCTCTTTGTGTAAGTCTGTTAACTAGTTCTGCAGTTTTGTCCGGTTTATCCTTAT
AGCTAAGAAGATGATCATTGTATAGACAAAACAACACTATAGTTGTGTGACTTTACAAAA
CAATCGAATAATAATGGAAACTTTTTTTTTGAAGG

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2FO47TF 515 0 0
GGAGAGAGATCCAGACTCGTATTCTGGTCATCGATGGCTAGCGATTGGAGAGGTTCAATG
GGGAAGGTGAGGTCTTTCGTGGGAAACTCCATGGGCGGTCTTAGAGGAGGTCAGAATCTC
GCGTCTTGGCTCGTGGCCGGAACGATCGCTTACTATCTCTGGGTTAAACCGGCTCAGGAT
CTCAAGAAGGAACGAGAGGCTAGGGCACTTCTGGCGGTGGCCGATCGAAATCAATACGTG
GAGAAGAGGAAACCAGTCGCTGATCCTCAGGTTACTGGTCTGGTTTATGGGAACAAGAAC
ATAACCGATGATAAACCACGGGATTGAATACTTTTTTTTTCTTTGTTTCTGCAAGTTTGA
GAACATCTCTTTGTGTAAGTCTGTTAACTAGTTCTGCAGTTTTGTCCGGTTTATCCTTAT
AGCTAAGAAGATGATCATTGTATAGACAAAACAACACTATAGTTGTGTGACTTTACAAAA
CAATCGAATAATAATGGAAACTTTTTTTTTGAAGG

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

CO CL5900Contig1 751 2 2 U
GGACACGTACAAAGGCAACTATTTGAGTCGAAGTTGACTTTATCACAGATCAAAGTGTCT
GTTTGATTTTCAAAGCGATCGCCCTTCAATGGAGGTGATTCACTCATGGTCTTGTCCAAG
ATCACTCAGCACCGCTCTCATGTACTCCTTTGCCCAGAGAGATGACACTGAAGTGCTGGA
CGAGCCATTAAACGCTTCGTTCCTTAAAGCTACAGGTGCTGATAGGCCATACCGAGATGA
GATTTTCGCTAGCATGGAAATTGATGGACATAAGTGGTGAAAGACATCATTTATGGTCCA
GGAAAGAAGAAATATAGGTTCTGTAAGAATTTGGCAAAACATCGTATTCTTGGCTTGCCA
AGTGAAATATTAAGTAAAGGAAAGCACTTCATTTTGATACGTAATCCCGTTCACATATTG
CCTTCATTTGACAAGGTAATCCCGTTATCATTTCTCGACGTGGGATTGGCAGACTTAGTT
TCAATATACAGCGATCTCTGCCAACTGGGAACACCACCACCTGTCATCGATGCCGATGAC
CTTCAGCGAAATCCCGAGGCTACGTTACGTGGTCTTTGCCATGACTTGGATATCCCGTTT
CAGGCATCTATGCTTAAATGGGAGGCTGGTCCTATACCAGAAGATGGAGTATGGGCTTCA
TGGTGGTACAAGACTGTTCACGAATCAACTGGTTTCTCATCTCCGAGGAAATACCCTCGT
ACATTCAATATGAGGCACTATGACTTGCTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN36TF U 1
AF RR2HA11TF U 1
BS 1 599 RR2GN36TF
BS 600 751 RR2HA11TF

RD RR2GN36TF 599 0 0
GGACACGTACAAAGGCAACTATTTGAGTCGAAGTTGACTTTATCACAGATCAAAGTGTCT
GTTTGATTTTCAAAGCGATCGCCCTTCAATGGAGGTGATTCACTCATGGTCTTGTCCAAG
ATCACTCAGCACCGCTCTCATGTACTCCTTTGCCCAGAGAGATGACACTGAAGTGCTGGA
CGAGCCATTAAACGCTTCGTTCCTTAAAGCTACAGGTGCTGATAGGCCATACCGAGATGA
GATTTTCGCTAGCATGGAAATTGATGGACATAAGTGGTGAAAGACATCATTTATGGTCCA
GGAAAGAAGAAATATAGGTTCTGTAAGAATTTGGCAAAACATCGTATTCTTGGCTTGCCA
AGTGAAATATTAAGTAAAGGAAAGCACTTCATTTTGATACGTAATCCCGTTCACATATTG
CCTTCATTTGACAAGGTAATCCCGTTATCATTTCTCGACGTGGGATTGGCAGACTTAGTT
TCAATATACAGCGATCTCTGCCAACTGGGAACACCACCACCTGTCATCGATGCCGATGAC
CTTCAGCGAAATCCCGAGGCTACGTTACGTGGTCTTTGCCATGACTTGGATATCCCGTT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2HA11TF 751 0 0
GGACACGTACAAAGGCAACTATTTGAGTCGAAGTTGACTTTATCACAGATCAAAGTGTCT
GTTTGATTTTCAAAGCGATCGCCCTTCAATGGAGGTGATTCACTCATGGTCTTGTCCAAG
ATCACTCAGCACCGCTCTCATGTACTCCTTTGCCCAGAGAGATGACACTGAAGTGCTGGA
CGAGCCATTAAACGCTTCGTTCCTTAAAGCTACAGGTGCTGATAGGCCATACCGAGATGA
GATTTTCGCTAGCATGGAAATTGATGGACATAAGTGGTGAAAGACATCATTTATGGTCCA
GGAAAGAAGAAATATAGGTTCTGTAAGAATTTGGCAAAACATCGTATTCTTGGCTTGCCA
AGTGAAATATTAAGTAAAGGAAAGCACTTCATTTTGATACGTAATCCCGTTCACATATTG
CCTTCATTTGACAAGGTAATCCCGTTATCATTTCTCGACGTGGGATTGGCAGACTTAGTT
TCAATATACAGCGATCTCTGCCAACTGGGAACACCACCACCTGTCATCGATGCCGATGAC
CTTCAGCGAAATCCCGAGGCTACGTTACGTGGTCTTTGCCATGACTTGGATATCCCGTTT
CAGGCATCTATGCTTAAATGGGAGGCTGGTCCTATACCAGAAGATGGAGTATGGGCTTCA
TGGTGGTACAAGACTGTTCACGAATCAACTGGTTTCTCATCTCCGAGGAAATACCCTCGT
ACATTCAATATGAGGCACTATGACTTGCTGG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL5901Contig1 879 2 16 U
GCAATGACGACTCAGATGATCCCAGGTCCATATTAGGGAAGCGGAAAGAGAGACCTGATT
CGGAGGTGGATGTTCTTAAGGTTAATACCTTAGCTCCGGTTAATGACGATTGCAGTTTGA
CAGATGAAGTGGCTATGGACAGTGAAATGGTTGGTGTCAGTCAAGGAACCAAAAGCGCCC
TTGGACGTGTTACCCTGGTAAACAAATGGGGGAATGTTCTATACGATGAGTTTGTCCGTC
CAGTGGAACGTGTTGTTGACTTTCGAACGCATATTAGTGGGATTCGACCTAGAGACTTAA
GAAAGGCCAAAGATTTCCGAGTGGCTCAGACTAAAGTGGCGGAGTTGATCAAGGGAAAGA
TTCTCGTGGGACATGCCTTGCATAACGATCTCAAGGTTTTACTGTTAACTCACCCGAAAA
AGGACATAAGAGACACAGCAGAGTATCAGCCCTTTCTCAAGGACAAAACGAGAAAGTCTC
TGAAACATCTAGCATCTGAGTTTCTAGGGGCCGACATTCAAAACGGAGAGCACTGTCCTA
TTGATGATGCACGAGCTGCAATGTTGCTTTACCAGAAGAACAGACGAGAGTGGGAGAGAA
ACGTGAAGGACCAGACACGGATGAGGCTGAAACAAAAGAAGCGTAAGCCTAAGAAGAAAG
TAAAAGTAGTAGACAAGGCTTCCCCAATTGTTTGAAATCAATCAAAGCTTAAAGCAAAAA
AAAACACACTGATCAAAACAGCCGAAAAGTTTTGTTCGTCTCTTCCAATTTTTGATGTGT
GCTTTGTATCACTCTTTTACTTCTTAGCATCAGGTTCCCCACAATGTATCATCTTGTTGT
ATACAAGTTCATCACGACCATATTAGCTCTTGTATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO50TF U 1
AF RR2EO50JQ C 184
BS 1 675 RR2EO50TF
BS 676 676 RR2EO50JQ
BS 677 696 RR2EO50TF
BS 697 697 RR2EO50JQ
BS 698 721 RR2EO50TF
BS 722 723 RR2EO50JQ
BS 724 737 RR2EO50TF
BS 738 738 RR2EO50JQ
BS 739 752 RR2EO50TF
BS 753 753 RR2EO50JQ
BS 754 763 RR2EO50TF
BS 764 764 RR2EO50JQ
BS 765 772 RR2EO50TF
BS 773 773 RR2EO50JQ
BS 774 813 RR2EO50TF
BS 814 879 RR2EO50JQ

RD RR2EO50TF 829 0 0
GCAATGACGACTCAGATGATCCCAGGTCCATATTAGGGAAGCGGAAAGAGAGACCTGATT
CGGAGGTGGATGTTCTTAAGGTTAATACCTTAGCTCCGGTTAATGACGATTGCAGTTTGA
CAGATGAAGTGGCTATGGACAGTGAAATGGTTGGTGTCAGTCAAGGAACCAAAAGCGCCC
TTGGACGTGTTACCCTGGTAAACAAATGGGGGAATGTTCTATACGATGAGTTTGTCCGTC
CAGTGGAACGTGTTGTTGACTTTCGAACGCATATTAGTGGGATTCGACCTAGAGACTTAA
GAAAGGCCAAAGATTTCCGAGTGGCTCAGACTAAAGTGGCGGAGTTGATCAAGGGAAAGA
TTCTCGTGGGACATGCCTTGCATAACGATCTCAAGGTTTTACTGTTAACTCACCCGAAAA
AGGACATAAGAGACACAGCAGAGTATCAGCCCTTTCTCAAGGACAAAACGAGAAAGTCTC
TGAAACATCTAGCATCTGAGTTTCTAGGGGCCGACATTCAAAACGGAGAGCACTGTCCTA
TTGATGATGCACGAGCTGCAATGTTGCTTTACCAGAAGAACAGACGAGAGTGGGAGAGAA
ACGTGAAGGACCAGACACGGATGAGGCTGAAACAAAAGAAGCGTAAGCCTAAGAAGAAAG
TAAAAGTAGTAGACA*GGCTTCCCCAATTGTTTGAA*TCAATCAAAGCTTAAAGCAAAAA
A**ACACACTGATCAAA*CAGCCGAAAAGTTT*GTTCGTCTCT*CCAATTTT*GATGTGT
GCTTTGTATCACTCTTTTACTTCTTAGCATCAG
TTCCCACAATGTATCA

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2EO50JQ 696 0 0
GACGTGTTACCCTGGTAAACAAATGGGGGAATGTTCTATACGATGAGTTTGTCCGTCCAG
TGGAACGTGTTGTTGACTTTCGAACGCATATTAGTGGGATTCGACCTAGAGACTTAAGAA
AGGCCAAAGATTTCCGAGTGGCTCAGACTAAAGTGGCGGAGTTGATCAAGGGAAAGATTC
TCGTGGGACATGCCTTGCATAACGATCTCAAGGTTTTACTGTTAACTCACCCGAAAAAGG
ACATAAGAGACACAGCAGAGTATCAGCCCTTTCTCAAGGACAAAACGAGAAAGTCTCTGA
AACATCTAGCATTTGAGTTTCTAGGGGCCGACATTCAAAACGGAGAGCACTGTCCTATTG
ATGATGCACGAGCTGCAATGTTGCTTTACCAGAAGAACAGACGAGAGTGGGAGAGAAACG
TGAAGGACCAGACACGGATGAGGCTGAAACAAAAGAAGCGTAAGCCTAAGAAGAAAGTAA
AAGTAGTAGACAAGGCTTCCCCAATTGTTTGAAATCAATCAAAGCTTAAAGCAAAAAAAA
ACACACTGATCAAAACAGCCGAAAAGTTTTGTTCGTCTCTTCCAATTTTTGATGTGTGCT
TTGTATCACTCTTTTACTTCTTAGCATCAGGTTCCCCACAATGTATCATCTTGTTGTATA
CAAGTTCATCACGACCATATTAGCTCTTGTATTATC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL5902Contig1 570 2 5 U
AAGATGCAAACTTGTTTATGTCGAAAGATAATTATACCGTTTTACAGTTTTCTTCTTCTT
CTTCTTAAAATTAAATCAACAAAACCCAAACATACCCATTTATTGTACATTAAAACAAGT
GATTAAAGGTCTCACACACGAAAACTAACCTCCCATTGCCCAAAAAAATTATCAAACAAC
AAATTCTTGAAAGAAAGAAAGAAAAAAAGCACGATAGAGAGACACTTCATTCATCAAGAG
GGACATTTGAAGCCAGGTGGTGGAGTCTTTCCACAGTCGATAAGAAGCTCAAGAGCAATG
GGGATAATAAGGTCGAGGTTGAGAAGTTTGGCTTTAATGGTGGTACATAAACAAACGGCT
GCGTCTAAGTCAACTAAACCTCCCAAAACCGGACAACACTCTTTCTTGGCGTTACTTCCA
CCAAGCCCGATGTGAATCAAACCTCCAAGAACGTCCACACAAGCGCCTAGCTTCAATGTG
TCGATTGGGCAAGTTTCTGGTTTAGGTGGAGTTGGTGTTGGTGGTGGCGGTGGGCACGGT
GGAGTTGGTGTTGGTGGTGTTACGACAGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF72JQ U 37
AF RR2DK40JQ U 1
BS 1 164 RR2DK40JQ
BS 165 165 RR2GF72JQ
BS 166 166 RR2DK40JQ
BS 167 167 RR2GF72JQ
BS 168 570 RR2DK40JQ

RD RR2GF72JQ 153 0 0
CCGTTTTACAGTTTTCTTCTTCTTCTTCTTAAAATTAAATCAACAAAACCCAAACATACC
CATTTATTGTACATTAAAACAAGTGATTAAAGGTCTCACACACGAAAACTAACCTCCCAT
TGCCCAAAAAAATTATCAAACAACAAATTCTTG

QA 1 153 1 153
DS 

RD RR2DK40JQ 570 0 0
AAGATGCAAACTTGTTTATGTCGAAAGATAATTATACCGTTTTACAGTTTTCTTCTTCTT
CTTCTTAAAATTAAATCAACAAAACCCAAACATACCCATTTATTGTACATTAAAACAAGT
GATTAAAGGTCTCACACACGAAAACTAACCTCCCATTGCCCAAAGAGATTATCAAACAAC
AAATTCTTGAAAGAAAGAAAGAAAAAAAGCACGATAGAGAGACACTTCATTCATCAAGAG
GGACATTTGAAGCCAGGTGGTGGAGTCTTTCCACAGTCGATAAGAAGCTCAAGAGCAATG
GGGATAATAAGGTCGAGGTTGAGAAGTTTGGCTTTAATGGTGGTACATAAACAAACGGCT
GCGTCTAAGTCAACTAAACCTCCCAAAACCGGACAACACTCTTTCTTGGCGTTACTTCCA
CCAAGCCCGATGTGAATCAAACCTCCAAGAACGTCCACACAAGCGCCTAGCTTCAATGTG
TCGATTGGGCAAGTTTCTGGTTTAGGTGGAGTTGGTGTTGGTGGTGGCGGTGGGCACGGT
GGAGTTGGTGTTGGTGGTGTTACGACAGGA

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL5903Contig1 914 2 2 U
GGCTCAACATCATTCTCACAAATCTCATTTCTCTGGCTCTCGGAGCTTTGTGACCCTTTA
CGGTATATATAAGTTTCGGACTCATCATCATCTCTCTATAGCTTCCTTCCCCTCTCCTCT
CTGCTCGTTTAGGGAAGTGCCAATTCTTACCATTTGCGTGTAAGCGGAGATAGAATCTTA
AGAGGGATCTTATAAAGGATCTACCTTTCTTCTTGCCCATCCCTCTCTTTCTCTCTCTCT
ATTAATGTTTGGGACTCTCGCTTCCGGAGATATCGAAACCGCCAGATTGAGGCGTAATTT
GGGGGTTACACGCAATTTAGGGTTTTCCTGCGGTGGATTTTAGGGTATGAGGTTGGAAGA
CGACAACATGAAGCCACAACACGGAGGTGACGAAGAAGATGACGTAGACGGAGAACAGGT
GGCTGAAACGTCGCCGTTTCAGATTCAGCAGCATCCGTTTCAGCAGATGCAGAAACTCGT
TGTTGGGTATGCTCTGACTTCCAAAAAGAAGAAGAGTTTCTTGCAGCCCAAGCTTGAACT
CATGGCTAGGTAATGAAAACACACAACACAAATGCTGATGTCTTTTTTTCTTTTGTTCCA
GAGACGACTGTTCTTTTTTGTTTGGCATATGAAAATAGAACCGACAGTTTCTGTTCAAAA
TTTCAAAAGGATGGACTTTGACATTTTCCCTAGATTTTGGTTCTTGTTTCCTTAGTCTTT
GTTTTGGTTGGTTTGCCTGATTCTATTGTGGAGGCCCCCTAGCTATTGTCTTGTCATTAG
CCCATGTGTTTTGTCCTTGCTTATTAGACTCTCACACTTACTAATGCTTGTGGGTGTATC
AGGAACCTTGTTTCTATGGGAATATTCCTTGAATATATCCTCTTCCGGATTAGTCTCTGT
TGAAGTTTTGACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD80TF U 1
AF RR2BD80JQ C 114
BS 1 720 RR2BD80TF
BS 721 914 RR2BD80JQ

RD RR2BD80TF 720 0 0
GGCTCAACATCATTCTCACAAATCTCATTTCTCTGGCTCTCGGAGCTTTGTGACCCTTTA
CGGTATATATAAGTTTCGGACTCATCATCATCTCTCTATAGCTTCCTTCCCCTCTCCTCT
CTGCTCGTTTAGGGAAGTGCCAATTCTTACCATTTGCGTGTAAGCGGAGATAGAATCTTA
AGAGGGATCTTATAAAGGATCTACCTTTCTTCTTGCCCATCCCTCTCTTTCTCTCTCTCT
ATTAATGTTTGGGACTCTCGCTTCCGGAGATATCGAAACCGCCAGATTGAGGCGTAATTT
GGGGGTTACACGCAATTTAGGGTTTTCCTGCGGTGGATTTTAGGGTATGAGGTTGGAAGA
CGACAACATGAAGCCACAACACGGAGGTGACGAAGAAGATGACGTAGACGGAGAACAGGT
GGCTGAAACGTCGCCGTTTCAGATTCAGCAGCATCCGTTTCAGCAGATGCAGAAACTCGT
TGTTGGGTATGCTCTGACTTCCAAAAAGAAGAAGAGTTTCTTGCAGCCCAAGCTTGAACT
CATGGCTAGGTAATGAAAACACACAACACAAATGCTGATGTCTTTTTTTCTTTTGTTCCA
GAGACGACTGTTCTTTTTTGTTTGGCATATGAAAATAGAACCGACAGTTTCTGTTCAAAA
TTTCAAAAGGATGGACTTTGACATTTTCCCTAGATTTTGGTTCTTGTTTCCTTAGTCTTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2BD80JQ 801 0 0
CTCCTCTCTGCTCGTTTAGGGAAGTGCCAATTCTTACCATTTGCGTGTAAGCGGAGATAG
AATCTTAAGAGGGATCTTATAAAGGATCTACCTTTCTTCTTGCCCATCCCTCTCTTTCTC
TCTCTCTATTAATGTTTGGGACTCTCGCTTCCGGAGATATCGAAACCGCCAGATTGAGGC
GTAATTTGGGGGTTACACGCAATTTAGGGTTTTCCTGCGGTGGATTTTAGGGTATGAGGT
TGGAAGACGACAACATGAAGCCACAACACGGAGGTGACGAAGAAGATGACGTAGACGGAG
AACAGGTGGCTGAAACGTCGCCGTTTCAGATTCAGCAGCATCCGTTTCAGCAGATGCAGA
AACTCGTTGTTGGGTATGCTCTGACTTCCAAAAAGAAGAAGAGTTTCTTGCAGCCCAAGC
TTGAACTCATGGCTAGGTAATGAAAACCCCCAACACAAATGCTGATGTCTTTTTTTCTTT
TGTTCCAGAGACGACTGTTCTTTTTTGTTTGGCATATGAAAATAGAACCGACAGTTTCTG
TTCAAAATTTCAAAAGGATGGACTTTGACATTTTCCCTAGATTTTGGTTCTTGTTTCCTT
AGTCTTTGTTTTGGTTGGTTTGCCTGATTCTATTGTGGAGGCCCCCTAGCTATTGTCTTG
TCATTAGCCCATGTGTTTTGTCCTTGCTTATTAGACTCTCACACTTACTAATGCTTGTGG
GTGTATCAGGAACCTTGTTTCTATGGGAATATTCCTTGAATATATCCTCTTCCGGATTAG
TCTCTGTTGAAGTTTTGACTG

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL5904Contig1 816 2 4 U
GCAGAATTTTTTATTAATAAAATACTATATTAATTCTAAAATCAATTAAAATACATAGAC
CAATAATAGTCATTGAGAACTGGCACAATACATACCACTTTCTTATTGCAACATTTTTTG
TTGTTGTATTCATTACATTACGTACGTGCGTAATGTCCTCAGCTGAATAAATAAACCAAA
CTAGAATAGAGACCAACCGGGACAATCTTATACTTACTGAGAAGAAGACATCGAGAGGCT
CTTCAGCTTTTGTGAACTAACGATTGTTCCTTCGAGAAGAGCAGTGTACCAAAGAGCAGA
GGTTTTTGGAGACCTTTCACGTTCTGGATCGCTGAAATTCACATAGTATAATCCATATGT
GTAATTGGGACCCATAAACTCGTACAAATCCATGAAGGACCACTGGAAATAGCCTCTTAT
ATCTGACCCATTTCTCACTGAACTGAGAACAGCAGCAATATACGCATGAAGGTATTCAAC
TCTTCCCACGTCGTTAAGAGATGAATGCTGGTTAGTTGGTAGACCATTTTCAATAATGTA
GATGGGAATATTCCCATAGTTCTGCTTTATGTATTCCAACACTCCTTCAAGACCCCATGG
AAGCACATCAAACTTGACCAGTGTAGAATTCCCAATGGGTAGTAGTAAAGCATTCATGTC
TGAATTAAAATCTCCTGCGTGGATACTACTAGATAATTGTGCCGTGTACATTGTTGTATA
GTGAATGAGTCCCAAGAAGTCGGATGAGCCTTTAACGAGTTCTGATTCTTCTTTCGAAAA
GCTTGGTATCCTCTCGCCCGCGGTTCTCTTCATCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS67JQ U 1
AF RR2CL70JQ U 82
BS 1 312 RR2FS67JQ
BS 313 313 RR2CL70JQ
BS 314 765 RR2FS67JQ
BS 766 816 RR2CL70JQ

RD RR2FS67JQ 765 0 0
GCAGAATTTTTTATTAATAAAATACTATATTAATTCTAAAATCAATTAAAATACATAGAC
CAATAATAGTCATTGAGAACTGGCACAATACATACCACTTTCTTATTGCAACATTTTTTG
TTGTTGTATTCATTACATTACGTACGTGCGTAATGTCCTCAGCTGAATAAATAAACCAAA
CTAGAATAGAGACCAACCGGGACAATCTTATACTTACTGAGAAGAAGACATCGAGAGGCT
CTTCAGCTTTTGTGAACTAACGATTGTTCCTTCGAGAAGAGCAGTGTACCAAAGAGCAGA
GGTTTTTGGAGATCTTTCACGTTCTGGATCGCTGAAATTCACATAGTATAATCCATATGT
GTAATTGGGACCCATAAACTCGTACAAATCCATGAAGGACCACTGGAAATAGCCTCTTAT
ATCTGACCCATTTCTCACTGAACTGAGAACAGCAGCAATATACGCATGAAGGTATTCAAC
TCTTCCCACGTCGTTAAGAGATGAATGCTGGTTAGTTGGTAGACCATTTTCAATAATGTA
GATGGGAATATTCCCATAGTTCTGCTTTATGTATTCCAACACTCCTTCAAGACCCCATGG
AAGCACATCAAACTTGACCAGTGTAGAATTCCCAATGGGTAGTAGTAAAGCATTCATGTC
TGAATTAAAATCTCCTGCGTGGATACTACTAGATAATTGTGCCGTGTACATTGTTGTATA
GTGAATGAGTCCCAAGAAGTCGGATGAGCCTTTAACGAGTTCTGA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2CL70JQ 735 0 0
GGCACAATACATACCACTTTCTTATTGCAACATTTTTTGTTGTTGTATTCATTACATTAC
GTACGTGCGTAATGTCCTCAGCTGAATAAATAAACCAAACTAGAATAGAGACCAACCGGG
ACAATCTTATACTTACTGAGAAGAAGACATCGAGAGGCTCTTCAGCTTTTGTGAACTAAC
GATTGTTCCTTCGAGAAGAGCAGTGTACCAAAGAGCAGAGGTTTTTGGAGACCTTTCACG
TTCTGGATCGCTGAAATTCACATAGTATAATCCATATGTGTAATTGGGACCCATAAACTC
GTACAAATCCATGAAGGACCACTGGAAATAGCCTCTTATATCTGACCCATTTCTCACTGA
ACTGAGAATAGCAGCAATATACGCATGAAGGTATTCAACTCTTCCCACGTCGTTAAGAGA
TGAATGCTGGTTAGTTGGTAGACCATTTTCAATAATGTAGATGGGAATATTCCCATAGTT
CTGCTTTATGTATTCCAACACTCCTTCAAGACCCCATGGAAGCACATCAAACTTGACCAG
TGTAGAATTCCCAATGGGTAGTAGTAAAGCATTCATGTCTGAATTAAAATCTCCTGCGTG
GATACTACTAGATAATTGTGCCGTGTACATTGTTGTATAGTGAATGAGTCCCAAGAAGTC
GGATGAGCCTTTAACGAGTTCTGATTCTTCTTTCGAAAAGCTTGGTATCCTCTCGCCCGC
GGTTCTCTTCATCGC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL5905Contig1 1110 2 4 U
AGAGCTTAAGGCACTAAGGAAAGAGAAAGAAGAGGCAGAAGAGTTTAGAAAAGAGAAGCA
GTTGCTGGAAGAGAGTAATTTGAAGAGGCGGTCTGAAATGGAGTTTGCGTTGAATAACAT
GACTAGACAGCTGGAGAAAGCGAACAACACAGTTCGGAGGCTCGAGCTCGAACAATCTCC
GTTGAAGAAAGAGAGGGAAGTTGCTAACATAAGAGCTGCTGAGGCTGCTGCGAGCTGTAT
AGGAGCCAAGGAGAGAGTGCAAAAGACGTTGAAGAGTGCTCAGTCATGGGAAGGGCAAAA
GGCTTTGTTGCAGGAAGAGCTCAAGAGTCAAAGGGACAAGGTGGCAGAGCTGCAACAAGA
AGTATCCAAAGCCAAAAATCGCCAAAACCAAATTGAGGCTACTTGGAAACAAGAAATGGC
AGCAAAGGAGAAACTTGTTGCTCAAGCGACTGCACTACAGGAAGAGAGAGTGAAACTGGA
AGAACTTGGCAAAGCAGAAGAAGAGAGAATCAAAACAAAAGCAGAGAACGACGTGAGATA
CTACACTGAGAACATCAAGAGACTGGAGAGCGAGATCTCAAAGCTAAAACTCAAATCAGA
TTGTCTGAAGATAGCTGCGTTGAAGAAAGGCATTGATGGAAGCAATGAAAGTAGCAAGAA
CGGAACGACTCATACCAACACCGCCACAAAGGCAAGCCTGATATGGGAGAACAGTAATGG
GACAGAGGCCAAGATTAAAAGAGAGAGGGAATGTGTGATGTGTTTGTCTGAAGAGATGAG
TGTGATATTCTTGCCTTGTGCTCATCAGGTTCTTTGCTCTAAATGCAACCAGCTTCATGA
GAAGGAAGCCATGGAGGATTGTCCGTCTTGTCGGGCCAAGATCCAGAGGAGGATCCAGGC
TCGTTTTGCTCGCGGGTAAAGCTTTTTTATCCGCTAACGTTTTCAGAATCACTATGGCAA
TGAAGGTTTTGCTTTGGTTTTTATCTCTTCGAACTGCTCTTATTAAATCAGTTACACCTA
AATTATACACATCTTGTAAAGGGTGACTTTACGTTTGCTCATTTTTCATATATCCATCAA
TAATAAATGGAAGAGGCTCTGCCTACTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C594TF U 1
AF RR2C594JQ C 384
BS 1 691 RR2C594TF
BS 692 692 RR2C594JQ
BS 693 727 RR2C594TF
BS 728 1110 RR2C594JQ

RD RR2C594TF 734 0 0
AGAGCTTAAGGCACTAAGGAAAGAGAAAGAAGAGGCAGAAGAGTTTAGAAAAGAGAAGCA
GTTGCTGGAAGAGAGTAATTTGAAGAGGCGGTCTGAAATGGAGTTTGCGTTGAATAACAT
GACTAGACAGCTGGAGAAAGCGAACAACACAGTTCGGAGGCTCGAGCTCGAACAATCTCC
GTTGAAGAAAGAGAGGGAAGTTGCTAACATAAGAGCTGCTGAGGCTGCTGCGAGCTGTAT
AGGAGCCAAGGAGAGAGTGCAAAAGACGTTGAAGAGTGCTCAGTCATGGGAAGGGCAAAA
GGCTTTGTTGCAGGAAGAGCTCAAGAGTCAAAGGGACAAGGTGGCAGAGCTGCAACAAGA
AGTATCCAAAGCCAAAAATCGCCAAAACCAAATTGAGGCTACTTGGAAACAAGAAATGGC
AGCAAAGGAGAAACTTGTTGCTCAAGCGACTGCACTACAGGAAGAGAGAGTGAAACTGGA
AGAACTTGGCAAAGCAGAAGAAGAGAGAATCAAAACAAAAGCAGAGAACGACGTGAGATA
CTACACTGAGAACATCAAGAGACTGGAGAGCGAGATCTCAAAGCTAAAACTCAAATCAGA
TTGTCTGAAGATAGCTGCGTTGAAGAAAGGCATTGATGGAAGCAATGAAAGTAGCAAGAA
CGGAACGACTCATACCAACACCGCCACAAAG*CAAGCCTGATATGGGAGAACAGTAATGG
GACAGAG
CCAGATA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2C594JQ 727 0 0
AAAACCAAATTGAGGCTACTTGGAAACAAGAAATGGCAGCAAAGGAGAAACTTGTTGCTC
AAGCGACTGCACTACAGGAAGAGAGAGTGAAACTGGAAGAACTTGGCAAAGCAGAAGAAG
AGAGAATCAAAACAAAAGCAGAGAACGACGTGAGATACTACACTGAGAACATCAAGAGAC
TGGAGAGCGAGATCTCAAAGCTAAAACTCAAATCAGATTGTCTGAAGATAGCTGCGTTGA
AGAAAGGCATTGATGGAAGCAATGAAGGTAGCAAGAACGGAACGACTCATACCAACACCG
CCACAAAGGCAAGCCTGATATGGGAGAACAGTAATGGGACAGAGGCCAAGATTAAAAGAG
AGAGGGAATGTGTGATGTGTTTGTCTGAAGAGATGAGTGTGATATTCTTGCCTTGTGCTC
ATCAGGTTCTTTGCTCTAAATGCAACCAGCTTCATGAGAAGGAAGCCATGGAGGATTGTC
CGTCTTGTCGGGCCAAGATCCAGAGGAGGATCCAGGCTCGTTTTGCTCGCGGGTAAAGCT
TTTTTATCCGCTAACGTTTTCAGAATCACTATGGCAATGAAGGTTTTGCTTTGGTTTTTA
TCTCTTCGAACTGCTCTTATTAAATCAGTTACACCTAAATTATACACATCTTGTAAAGGG
TGACTTTACGTTTGCTCATTTTTCATATATCCATCAATAATAAATGGAAGAGGCTCTGCC
TACTTTC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL5906Contig1 809 2 2 U
GGGTCGCTGGTGATAACCGGCAGATGCCGTACCAACCTTACATCGTCTACTCTCCTGTTG
AACATCCTCCGTCTAACAACCCTCTCGAGCCCGTCATCGGAATGTTCCATACTTGGAGCC
GCAAGGCTGAAACCGTCGCTCGCAACATCTGGCACAATCTGAAGACGGGACCGTCTATGC
AGGAAACGGCGTGGGGAAAGGTCAACCTGACGGCGAAAGCGATAACAAAGGGAGGTTTCG
AGTCTCTCTTCAAGCAGATATTTGGAACGGACCCGAACGAGAAGCTGAAGAAGACTTTCG
CATGTTATCTCTCCACGACGACAGGCCCTGTCGCTGGAACTCTGTATCTCTCGAATGTTC
GCGTTGCTTTCTGTAGCGACCGTCCTCTCTTCTTCACTGCGCCTTCCGGACAAGAAGCTT
GGAGTTACTACAGGGTGGTGGTACCATTGGTGAATATTGCGACGGTTAATCCGGTGGTGG
TGAAGGAGGATCCACCGGAAAAGTATATTCAGGTGACGACCGTGGACGGACATGACTTCT
GGTTCATGGGTTTTGTGAATTACGAGAAGGCTTCTCATCATTTGCTGACTAGTGTCTCGG
ATTCTCATACCGCTCGTACCTCTGCGTCTGGTTAGAGATATATATTTTACAATGTTTGTA
TTTTTTTTTTTTGTATCTTGTTCATTTGCTTTCTTTTGTATGTGTGTGATTGGTTTCTGC
TGCCGATTTTTTCTATATATGTTTATGTAAGTTTGATACTATAGTTGGCTTTTTGCGAGT
CTTGAATTTAAATACATATATGTTTCGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CN34TF U 1
AF RR2CN34JQ C 59
BS 1 662 RR2CN34TF
BS 663 809 RR2CN34JQ

RD RR2CN34TF 662 0 0
GGGTCGCTGGTGATAACCGGCAGATGCCGTACCAACCTTACATCGTCTACTCTCCTGTTG
AACATCCTCCGTCTAACAACCCTCTCGAGCCCGTCATCGGAATGTTCCATACTTGGAGCC
GCAAGGCTGAAACCGTCGCTCGCAACATCTGGCACAATCTGAAGACGGGACCGTCTATGC
AGGAAACGGCGTGGGGAAAGGTCAACCTGACGGCGAAAGCGATAACAAAGGGAGGTTTCG
AGTCTCTCTTCAAGCAGATATTTGGAACGGACCCGAACGAGAAGCTGAAGAAGACTTTCG
CATGTTATCTCTCCACGACGACAGGCCCTGTCGCTGGAACTCTGTATCTCTCGAATGTTC
GCGTTGCTTTCTGTAGCGACCGTCCTCTCTTCTTCACTGCGCCTTCCGGACAAGAAGCTT
GGAGTTACTACAGGGTGGTGGTACCATTGGTGAATATTGCGACGGTTAATCCGGTGGTGG
TGAAGGAGGATCCACCGGAAAAGTATATTCAGGTGACGACCGTGGACGGACATGACTTCT
GGTTCATGGGTTTTGTGAATTACGAGAAGGCTTCTCATCATTTGCTGACTAGTGTCTCGG
ATTCTCATACCGCTCGTACCTCTGCGTCTGGTTAGAGATATATATTTTACAATGTTTGTA
TT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2CN34JQ 751 0 0
TGAACATCCTCCGTCTAACAACCCTCTCGAGCCCGTCATCGGAATGTTCCATACTTGGAG
CCGCAAGGCTGAAACCGTCGCTCGCAACATCTGGCACAATCTGAAGACGGGACCGTCTAT
GCAGGAAACGGCGTGGGGAAAGGTCAACCTGACGGCGAAAGCGATAACAAAGGGAGGTTT
CGAGTCTCTCTTCAAGCAGATATTTGGAACGGACCCGAACGAGAAGCTGAAGAAGACTTT
CGCATGTTATCTCTCCACGACGACAGGCCCTGTCGCTGGAACTCTGTATCTCTCGAATGT
TCGCGTTGCTTTCTGTAGCGACCGTCCTCTTTTCTTCACTGCGCCTTCCGGACAAGAAGC
TTGGAGTTACTACAGGGTGGTGGTACCATTGGTGAATATTGCGACGGTTAATCCGGTGGT
GGTGAAGGAGGATCCACCGGAAAAGTATATTCAGGTGACGACCGTGGACGGACATGACTT
CTGGTTCATGGGTTTTGTGAATTACGAGAAGGCTTCTCATCATTTGCTGACTAGTGTCTC
GGATTCTCATACCGCTCGTACCTCTGCGTCTGGTTAGAGATATATATTTTACAATGTTTG
TATTTTTTTTTTTTGTATCTTGTTCATTTGCTTTCTTTTGTATGTGTGTGATTGGTTTCT
GCTGCCGATTTTTTCTATATATGTTTATGTAAGTTTGATACTATAGTTGGCTTTTTGCGA
GTCTTGAATTTAAATACATATATGTTTCGAT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL5907Contig1 551 2 1 U
GGAATCATTCCATGCTAATTTAAAACACGAAAATAACAAGAAAACAAAAAGAAACAAATG
ACCATCAGTTCAAATGGTATTATGTTTGCTGTTATTGTGATGCTATTTTTGTTGGTTTCA
ACAGGAATAGAAAATGGACATGCTCAAACATCTAATCATTATTGTAAGAAAACACGAAGC
AAATTGGCCTCACATGACACTTGTACAAAGAAAAATGGTGATGCGTTGTGCAAAACGTCT
TGCAAACATGAATATATAACCAATGGAAGTTGTCTAATACTTCCAAAGACGACAAAAAAA
GATTGCTATTGCTACCATTTCGATGATGGATCCAAATGCTCAGGTGTCTAAATCCACAGG
CCATGAAAGTGTATGGAAATTTTTCGTCATTACAACTACTACTTGATATCAATAGTTATT
ATGTTGATGTGTGTAATAAATTCATCTTACAATCAATCAAGTAATCAAGAAACATGTATA
AATAAGAATATCAACATTGAAGATATGAGAAAAAGTCTTTCAAAATTATAATGATAAAAT
AAATTAAACGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DN66JQ C 1
AF RR2DN66TF U 1
BS 1 551 RR2DN66TF

RD RR2DN66JQ 551 0 0
GGAATCATTCCATGCTAATTTAAAACACGAAAATAACAAGAAAACAAAAAGAAACAAATG
ACCATCAGTTCAAATGGTATTATGTTTGCTGTTATTGTGATGCTATTTTTGTTGGTTTCA
ACAGGAATAGAAAATGGACATGCTCAAACATCTAATCATTATTGTAAGAAAACACGAAGC
AAATTGGCCTCACATGACACTTGTACAAAGAAAAATGGTGATGCGTTGTGCAAAACGTCT
TGCAAACATGAATATATAACCAATGGAAGTTGTCTAATACTTCCAAAGACGACAAAAAAA
GATTGCTATTGCTACCATTTCGATGATGGATCCAAATGCTCAGGTGTCTAAATCCACAGG
CCATGAAAGTGTATGGAAATTTTTCGTCATTACAACTACTACTTGATATCAATAGTTATT
ATGTTGATGTGTGTAATAAATTCATCTTACAATCAATCAAGTAATCAAGAAACATGTATA
AATAAGAATATCAACATTGAAGATATGAGAAAAAGTCTTTCAAAATTATAATGATAAAAT
AAATTAAACGG

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2DN66TF 551 0 0
GGAATCATTCCATGCTAATTTAAAACACGAAAATAACAAGAAAACAAAAAGAAACAAATG
ACCATCAGTTCAAATGGTATTATGTTTGCTGTTATTGTGATGCTATTTTTGTTGGTTTCA
ACAGGAATAGAAAATGGACATGCTCAAACATCTAATCATTATTGTAAGAAAACACGAAGC
AAATTGGCCTCACATGACACTTGTACAAAGAAAAATGGTGATGCGTTGTGCAAAACGTCT
TGCAAACATGAATATATAACCAATGGAAGTTGTCTAATACTTCCAAAGACGACAAAAAAA
GATTGCTATTGCTACCATTTCGATGATGGATCCAAATGCTCAGGTGTCTAAATCCACAGG
CCATGAAAGTGTATGGAAATTTTTCGTCATTACAACTACTACTTGATATCAATAGTTATT
ATGTTGATGTGTGTAATAAATTCATCTTACAATCAATCAAGTAATCAAGAAACATGTATA
AATAAGAATATCAACATTGAAGATATGAGAAAAAGTCTTTCAAAATTATAATGATAAAAT
AAATTAAACGG

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

CO CL5908Contig1 600 2 1 U
AGGGGTCCAAGAACGCATTGCTCTCTACCTTCTTGTTCCTTGATCAAATTGTGTGGCTTG
GCAGGACTGGCATTTACAAGAACAAAGAACGAGCTGAGCTTCTTGGACGTATATCACTCT
TCTGTTGGATGGGTTCTTCGGCTTGCACATCCTTAGTCGAGATTGGGGAGCTTGGTAGGC
TCTCAGCTTCAATTAAGAAGCTTGAAAAAGAGATCGGCAACAAGGATAAACACCAAAATG
AGCAATACCGCGCGAAACTGCAGAGATCAAACGAGAGATCATTGGCCCTGATCAAAGCCG
GAATGGATTTCGTTGTTGCTTTCGGTTTGCTTCAATTGGCTCCCAAGAAAGTCACTCCCC
GTGTCGCTGGCGCTTTTGGTTTCGCCTCCTCTCTTATCTCTTGTTATCAGTTACTGCCAT
CGCATCCCAAGTCCAAGACGGTTTAGGAAACAAGGAAAAGATGAAGTAGAGAGTCGTAGT
TTCTTCATGTTCCATAGTGTTTTTCTGCATTAACTGCTGTTGTGTTTGATTTGTCTTTAA
CACTTGATTTTGTGCTAAAACGTTTCAGTCTGTTTGAGAATAAAATGAGAAAACGTTTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BF89JQ C 1
AF RR2BF89TF U 1
BS 1 600 RR2BF89TF

RD RR2BF89JQ 600 0 0
AGGGGTCCAAGAACGCATTGCTCTCTACCTTCTTGTTCCTTGATCAAATTGTGTGGCTTG
GCAGGACTGGCATTTACAAGAACAAAGAACGAGCTGAGCTTCTTGGACGTATATCACTCT
TCTGTTGGATGGGTTCTTCGGCTTGCACATCCTTAGTCGAGATTGGGGAGCTTGGTAGGC
TCTCAGCTTCAATTAAGAAGCTTGAAAAAGAGATCGGCAACAAGGATAAACACCAAAATG
AGCAATACCGCGCGAAACTGCAGAGATCAAACGAGAGATCATTGGCCCTGATCAAAGCCG
GAATGGATTTCGTTGTTGCTTTCGGTTTGCTTCAATTGGCTCCCAAGAAAGTCACTCCCC
GTGTCGCTGGCGCTTTTGGTTTCGCCTCCTCTCTTATCTCTTGTTATCAGTTACTGCCAT
CGCATCCCAAGTCCAAGACGGTTTAGGAAACAAGGAAAAGATGAAGTAGAGAGTCGTAGT
TTCTTCATGTTCCATAGTGTTTTTCTGCATTAACTGCTGTTGTGTTTGATTTGTCTTTAA
CACTTGATTTTGTGCTAAAACGTTTCAGTCTGTTTGAGAATAAAATGAGAAAACGTTTCG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2BF89TF 600 0 0
AGGGGTCCAAGAACGCATTGCTCTCTACCTTCTTGTTCCTTGATCAAATTGTGTGGCTTG
GCAGGACTGGCATTTACAAGAACAAAGAACGAGCTGAGCTTCTTGGACGTATATCACTCT
TCTGTTGGATGGGTTCTTCGGCTTGCACATCCTTAGTCGAGATTGGGGAGCTTGGTAGGC
TCTCAGCTTCAATTAAGAAGCTTGAAAAAGAGATCGGCAACAAGGATAAACACCAAAATG
AGCAATACCGCGCGAAACTGCAGAGATCAAACGAGAGATCATTGGCCCTGATCAAAGCCG
GAATGGATTTCGTTGTTGCTTTCGGTTTGCTTCAATTGGCTCCCAAGAAAGTCACTCCCC
GTGTCGCTGGCGCTTTTGGTTTCGCCTCCTCTCTTATCTCTTGTTATCAGTTACTGCCAT
CGCATCCCAAGTCCAAGACGGTTTAGGAAACAAGGAAAAGATGAAGTAGAGAGTCGTAGT
TTCTTCATGTTCCATAGTGTTTTTCTGCATTAACTGCTGTTGTGTTTGATTTGTCTTTAA
CACTTGATTTTGTGCTAAAACGTTTCAGTCTGTTTGAGAATAAAATGAGAAAACGTTTCG

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

CO CL5909Contig1 604 2 1 U
GGAAATTGTGGAATTTGACCCAATAAAGTATCACAACTGTTACTGCCCTTGGGTAAATGA
AAACGTGGCTGCTGCTGGATGTAGCAGCAACAGCTCGAGCTCTTCAAGTATCGCTGAGGC
GCTTTGTGGATGGCAATTAACTCTCGATGCCCTTGATTCGTTCCAGTCGCTCGAGAATGC
TCAAATCCAACCAATGGAATCAGAATCAGCTGCATCTCTTTGCAAGGATGATCACCGCAC
TCCTTCCCAGAAGCTCTTGAAGCGCCACTCTTTTATCAGCCGCCATGGGAAAAAATAAGA
AATCTAATTGCAAGGTACTATTGCAAAAAAGACACTCGATTTCAGACGATATATAAATAG
ACCAGTATGGTCACTGCTTAGGTTCTTTAGCTTGGGTTCATCTCTTAGCAGTATAAATAA
AAGAACTCTGCATAAATCTTTCGGGTCTGCAACCTGTGTTTTTTTCTTTGTTTTTTTCTT
CAAGTTTGTGTAGTAGTCAAGTTAAAGATACCTAAACAGAGGTGAGAGGATGATACTCAA
TAATCTTTTATATTTGATTCTTGTTTCTAATAATGTTTCTACCTGCTTGTTCCTGTGTAT
CATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2FS01JQ C 1
AF RR2FS01TF U 1
BS 1 604 RR2FS01TF

RD RR2FS01JQ 604 0 0
GGAAATTGTGGAATTTGACCCAATAAAGTATCACAACTGTTACTGCCCTTGGGTAAATGA
AAACGTGGCTGCTGCTGGATGTAGCAGCAACAGCTCGAGCTCTTCAAGTATCGCTGAGGC
GCTTTGTGGATGGCAATTAACTCTCGATGCCCTTGATTCGTTCCAGTCGCTCGAGAATGC
TCAAATCCAACCAATGGAATCAGAATCAGCTGCATCTCTTTGCAAGGATGATCACCGCAC
TCCTTCCCAGAAGCTCTTGAAGCGCCACTCTTTTATCAGCCGCCATGGGAAAAAATAAGA
AATCTAATTGCAAGGTACTATTGCAAAAAAGACACTCGATTTCAGACGATATATAAATAG
ACCAGTATGGTCACTGCTTAGGTTCTTTAGCTTGGGTTCATCTCTTAGCAGTATAAATAA
AAGAACTCTGCATAAATCTTTCGGGTCTGCAACCTGTGTTTTTTTCTTTGTTTTTTTCTT
CAAGTTTGTGTAGTAGTCAAGTTAAAGATACCTAAACAGAGGTGAGAGGATGATACTCAA
TAATCTTTTATATTTGATTCTTGTTTCTAATAATGTTTCTACCTGCTTGTTCCTGTGTAT
CATC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2FS01TF 604 0 0
GGAAATTGTGGAATTTGACCCAATAAAGTATCACAACTGTTACTGCCCTTGGGTAAATGA
AAACGTGGCTGCTGCTGGATGTAGCAGCAACAGCTCGAGCTCTTCAAGTATCGCTGAGGC
GCTTTGTGGATGGCAATTAACTCTCGATGCCCTTGATTCGTTCCAGTCGCTCGAGAATGC
TCAAATCCAACCAATGGAATCAGAATCAGCTGCATCTCTTTGCAAGGATGATCACCGCAC
TCCTTCCCAGAAGCTCTTGAAGCGCCACTCTTTTATCAGCCGCCATGGGAAAAAATAAGA
AATCTAATTGCAAGGTACTATTGCAAAAAAGACACTCGATTTCAGACGATATATAAATAG
ACCAGTATGGTCACTGCTTAGGTTCTTTAGCTTGGGTTCATCTCTTAGCAGTATAAATAA
AAGAACTCTGCATAAATCTTTCGGGTCTGCAACCTGTGTTTTTTTCTTTGTTTTTTTCTT
CAAGTTTGTGTAGTAGTCAAGTTAAAGATACCTAAACAGAGGTGAGAGGATGATACTCAA
TAATCTTTTATATTTGATTCTTGTTTCTAATAATGTTTCTACCTGCTTGTTCCTGTGTAT
CATC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL5910Contig1 932 2 6 U
GACTTCAGTCCACGTCTCAGAACTCTTGTGATAGCACTCTTAGCAGCAATGAGAAGGAGA
AGAAGCAGCCTCTCACTGGTGGTAGACATAACAACAATGATAGCACTCTTAACAGCAATG
AGCTACCTAAGGAGAAGGATAAGCAGCTTCTCGATGGTAGACATAACATCAACAACAACA
ACGACTCTGAAAGCATCATTCGGATTCGTTTGCCTATCCGAAGGCCTAAAGATCCTGAGG
TCACGATGATGATTACCAACAAGGATCAACCTTGTCCTTCCCGGGAATTAAAGTTTGATA
GTGTTACTAGAGAGCAGCCGCAACCTCATTGTTCCACTTCTGCACCACAACATGCGTCAA
AGCCACATGAAGAGAAGAGAAAAGACCACACTTCCACAAGGAAACACAAAGAGAAACACA
GAGAGAAGAAACACAAAGAGAAGAAATTGCCGTCTACTACTACTCAAGAAACTTATCAAC
CTTCAAGCCTATGCAGGTTATGCCCTCCATCAATGGCGGAGCAGTTCTTGAATGTAGTTG
AGAACTGGATCCCTAACACGATCGAGAGCAGAGTAGTCTCACTAGCTCTGAAGAGGATGA
ATGTTGGTGGTTGATGAAGAAGCCAAGTAGCAACAAGACTGACACAGAAATATGCAAACA
ACTTCTTGGCAGAAACAATGAAGTAATAAGCAGTTCAATAGCTTGGCCACGTGCTCGCCT
TTAACCAGAAGCTGATGTCTACGCCTTACCTTGCACCGTCCCTTTCTGATAACATTAATG
TCTCGTCTCATAAAGGTTGAGATAACAAGTAGTAGTAACCTGGTCGAGATGTCTATGCAC
CGGACTCGGACCAGACATTTTTTCGTGTAGCCTTAATGTTTGTATAAGAGAACACTGTTT
GTTATTCTTAGTAAAATCAAGTATTACGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS39TF U 1
AF RR2BS39JQ C 140
BS 1 697 RR2BS39TF
BS 698 698 RR2BS39JQ
BS 699 723 RR2BS39TF
BS 724 725 RR2BS39JQ
BS 726 756 RR2BS39TF
BS 757 932 RR2BS39JQ

RD RR2BS39TF 756 0 0
GACTTCAGTCCACGTCTCAGAACTCTTGTGATAGCACTCTTAGCAGCAATGAGAAGGAGA
AGAAGCAGCCTCTCACTGGTGGTAGACATAACAACAATGATAGCACTCTTAACAGCAATG
AGCTACCTAAGGAGAAGGATAAGCAGCTTCTCGATGGTAGACATAACATCAACAACAACA
ACGACTCTGAAAGCATCATTCGGATTCGTTTGCCTATCCGAAGGCCTAAAGATCCTGAGG
TCACGATGATGATTACCAACAAGGATCAACCTTGTCCTTCCCGGGAATTAAAGTTTGATA
GTGTTACTAGAGAGCAGCCGCAACCTCATTGTTCCACTTCTGCACCACAACATGCGTCAA
AGCCACATGAAGAGAAGAGAAAAGACCACACTTCCACAAGGAAACACAAAGAGAAACACA
GAGAGAAGAAACACAAAGAGAAGAAATTGCCGTCTACTACTACTCAAGAAACTTATCAAC
CTTCAAGCCTATGCAGGTTATGCCCTCCATCAATGGCGGAGCAGTTCTTGAATGTAGTTG
AGAACTGGATCCCTAACACGATCGAGAGCAGAGTAGTCTCACTAGCTCTGAAGAGGATGA
ATGTTGGTGGTTGATGAAGAAGCCAAGTAGCAACAAGACTGACACAGAAATATGCAAACA
ACTTCTTGGCAGAAACAATGAAGTAATAAGCAGTTCA*TAGCTTGGCCACGTGCTCGCCT
TTA**CAGAAGCTGATGTCTACGCCTTACCTTGCAC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2BS39JQ 793 0 0
TAAGCAGCTTCTCGATGGTAGACATAACATCAACAACAACAACGACTCTGAAAGCATCAT
TCGGATTCGTTTGCCTATCCGAAGGCCTAAAGATCCTGAGGTCACGATGATGATTACCAA
CAAGGATCAACCTTGTCCTTCCCGGGAATTAAAGTTTGATAGTGTTACTAGAGAGCAGCC
GCAACCTCATTGTTCCACTTCTGCACCACAACATGCGTCAAAGCCACATGAAGAGAAGAG
AAAAGACCACACTTCCACAAGGAAACACAAAGAGAAACACAGAGAGAAGAAACACAAAGA
GAAGAAATTGCCGTCTACTACTACTCAAGAAACTTATCAACCTTCAAGCCTATGCAGGTT
ATGCCCTCCATCAATGGCGGAGCAGTTCTTGAATGTAGTTGAGAACTGGATCCCTAACAC
GATCGAGAGCAGAGTAGTCTCACTAGCTCTGAAGAGGATGAATGTTGGTGGTTGATGAAG
AAGCCAAGTAGCAACAAGACTGACACAGAAATATGCAAACAACTTCTTGGCAGAAACAAT
GAAGTAATAAGCAGTTCAATAGCTTGGCCACGTGCTCGCCTTTTACCAGAAGCTGATGTT
TACGCCTTACCTTGCACCGTCCCTTTCTGATAACATTAATGTCTCGTCTCATAAAGGTTG
AGATAACAAGTAGTAGTAACCTGGTCGAGATGTCTATGCACCGGACTCGGACCAGACATT
TTTTCGTGTAGCCTTAATGTTTGTATAAGAGAACACTGTTTGTTATTCTTAGTAAAATCA
AGTATTACGTCTC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL5911Contig1 599 2 1 U
GTCCGGCGACCTCTCTCTCTCGCTCAGGTAAAACTCTCTGGGATTTAAATGTTGTAAGCT
TTTCAATGAAACTCTGTATCCAGGAGGTTCAAACATGCCATGAAAATGAGCGTAAGTGTC
ACAGTGAAGTGGTAACCTTGAGTGTTAATTGTTTCTGTTCTGTTTCTGTTCTGGTAAAGT
CAAAAAGTTCTTACTGCTCGTTTTTGGTTAATGTTTACTGCATTACGCTTTCTGTGCCTT
TCTTTTCCCGCAGGACCATATGGTTTGAGCTTCTTTTTTTTACATTATTTCATTTTGATA
TATCTCTTGCTTTTGGTTATTCTTACTGCTCGTTTTTGGTGCAGATTATTTGTATCAGTC
ATTTTTTTCTTTGTTAGTTTGCTTCAGAATATTTACTGATTTGAGATTGTTTCTTCTTTT
TTTTGCAGATCAGGGGTCACTTGTAAAAGAACTGATGAAGAAGGGGTCACTTGTTTGATG
CAAAACTATTTTGTTGTTTTTGATGTTTTTATTTCAAACACAAGCTTGATGCAAAACTGT
TTATTATTGCTGTCATGTTTTTTAACTATGATTATTGTTGAAATACGTGGTTGAATGGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FP64JQ C 1
AF RR2FP64TF U 1
BS 1 599 RR2FP64TF

RD RR2FP64JQ 599 0 0
GTCCGGCGACCTCTCTCTCTCGCTCAGGTAAAACTCTCTGGGATTTAAATGTTGTAAGCT
TTTCAATGAAACTCTGTATCCAGGAGGTTCAAACATGCCATGAAAATGAGCGTAAGTGTC
ACAGTGAAGTGGTAACCTTGAGTGTTAATTGTTTCTGTTCTGTTTCTGTTCTGGTAAAGT
CAAAAAGTTCTTACTGCTCGTTTTTGGTTAATGTTTACTGCATTACGCTTTCTGTGCCTT
TCTTTTCCCGCAGGACCATATGGTTTGAGCTTCTTTTTTTTACATTATTTCATTTTGATA
TATCTCTTGCTTTTGGTTATTCTTACTGCTCGTTTTTGGTGCAGATTATTTGTATCAGTC
ATTTTTTTCTTTGTTAGTTTGCTTCAGAATATTTACTGATTTGAGATTGTTTCTTCTTTT
TTTTGCAGATCAGGGGTCACTTGTAAAAGAACTGATGAAGAAGGGGTCACTTGTTTGATG
CAAAACTATTTTGTTGTTTTTGATGTTTTTATTTCAAACACAAGCTTGATGCAAAACTGT
TTATTATTGCTGTCATGTTTTTTAACTATGATTATTGTTGAAATACGTGGTTGAATGGT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2FP64TF 599 0 0
GTCCGGCGACCTCTCTCTCTCGCTCAGGTAAAACTCTCTGGGATTTAAATGTTGTAAGCT
TTTCAATGAAACTCTGTATCCAGGAGGTTCAAACATGCCATGAAAATGAGCGTAAGTGTC
ACAGTGAAGTGGTAACCTTGAGTGTTAATTGTTTCTGTTCTGTTTCTGTTCTGGTAAAGT
CAAAAAGTTCTTACTGCTCGTTTTTGGTTAATGTTTACTGCATTACGCTTTCTGTGCCTT
TCTTTTCCCGCAGGACCATATGGTTTGAGCTTCTTTTTTTTACATTATTTCATTTTGATA
TATCTCTTGCTTTTGGTTATTCTTACTGCTCGTTTTTGGTGCAGATTATTTGTATCAGTC
ATTTTTTTCTTTGTTAGTTTGCTTCAGAATATTTACTGATTTGAGATTGTTTCTTCTTTT
TTTTGCAGATCAGGGGTCACTTGTAAAAGAACTGATGAAGAAGGGGTCACTTGTTTGATG
CAAAACTATTTTGTTGTTTTTGATGTTTTTATTTCAAACACAAGCTTGATGCAAAACTGT
TTATTATTGCTGTCATGTTTTTTAACTATGATTATTGTTGAAATACGTGGTTGAATGGT

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL5912Contig1 1084 2 4 U
GAGGTAATGGAAATTTAAGTGGAATCAATTTAGGAAAGTGACGGTGTCTGTATATCTTTG
TCAAAGTGCACGCATTTGTTTAAATGTTATTTAATACAGAGCAGGACTTGTAAAACTGTG
TCGGCAGCATATATTTATTGTTTTTGACGTATTTAATTGATCAATAGTAGCTGTGATTAT
GAACAGGGAGTGGATTCAAGTCTCTTCGTTCTTACAAGTCGGGCTACTTTGGTGCTTCCA
TTAAGCTCCAATCAGGCTACACAGCTGGAGTTGATACATCTCTCTACCTCTCAAACAATC
AAGAACATCCCGGAGACCACGACGAGGTTGATATCGAATTTCTAGGAACAACGCCAGGGA
AACCATATAGCCTTCAGACGAACGTATTCGTCAGAGGAAGTGGTGACCGAAATGTTATTG
GGAGAGAAATGAAATTCAATTTGTGGTTCGACCCTACTCAAGATTTCCACCATTACGCAA
TTTTGTGGAACAGTAATCAAATTGTATTCTACGTAGATGATGTACCGATACGTACGTACG
ACAGAAAGAACGAAGCTATCTTCCCTACAAGACCGATGTGGTTGTACGGATCGATATGGG
ATGCATCGGACTGGGCCACGGAAAATGGAAGGATCAAAGCCGACTATCGATACCAACCAT
TTATTGCTAAGTACACAAACTTTAAGTTAGCGGGATGCACAGCAGACGGGTCTAGTTCAT
GTACACCGCCATCGGCTTCACCTATGGGGAGTCGAGGGTTAAGCAATCAACAAAGGGGGG
CTATGGCATGGGCACAGAGGAACTTTTTGGTCTATAACTATTGCCATGACCCTAAAAGAG
ACCATACCCAAACACCAGAATGTTAAGCGAAGCATACAAACAAAAAGATTTTAAAACATT
TGTTATGCATTATCAATTACACATTAAGTTAATAACGAGCTTATTGAGACGGGTCCACAC
TGGAAAAGTAGAGTGAAGCAGTTGAGCGTCCAATCCTCCATGATTTGAGATTTGTTTTTA
AAGGTTATTTCTAAGCTTGTCTTGTCCCATTGTAATATTTTAATAATTGTGGCAATATTG
CGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2DP25TF U 1
AF RR2D909JQ C 599
BS 1 631 RR2DP25TF
BS 632 632 RR2D909JQ
BS 633 704 RR2DP25TF
BS 705 1084 RR2D909JQ

RD RR2DP25TF 704 0 0
GAGGTAATGGAAATTTAAGTGGAATCAATTTAGGAAAGTGACGGTGTCTGTATATCTTTG
TCAAAGTGCACGCATTTGTTTAAATGTTATTTAATACAGAGCAGGACTTGTAAAACTGTG
TCGGCAGCATATATTTATTGTTTTTGACGTATTTAATTGATCAATAGTAGCTGTGATTAT
GAACAGGGAGTGGATTCAAGTCTCTTCGTTCTTACAAGTCGGGCTACTTTGGTGCTTCCA
TTAAGCTCCAATCAGGCTACACAGCTGGAGTTGATACATCTCTCTACCTCTCAAACAATC
AAGAACATCCCGGAGACCACGACGAGGTTGATATCGAATTTCTAGGAACAACGCCAGGGA
AACCATATAGCCTTCAGACGAACGTATTCGTCAGAGGAAGTGGTGACCGAAATGTTATTG
GGAGAGAAATGAAATTCAATTTGTGGTTCGACCCTACTCAAGATTTCCACCATTACGCAA
TTTTGTGGAACAGTAATCAAATTGTATTCTACGTAGATGATGTACCGATACGTACGTACG
ACAGAAAGAACGAAGCTATCTTCCCTACAAGACCGATGTGGTTGTACGGATCGATATGGG
ATGCATCGGACTGGGCCACGGAAAATGGAAG*ATCAAAGCCGACTATCGATACCAACCAT
TTATTGCTAAGTACACAAACTTTAAGTTAGCGGGATGCACAGCA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2D909JQ 486 0 0
GGATGCATCGGATTGGGCCACGGAAAATGGAAGGATCAAAGCCGACTATCGATACCAACC
ATTTATTGCTAAGTACACAAACTTTAAGTTAGCGGGATGCACAGCAGACGGGTCTAGTTC
ATGTACACCGCCATCGGCTTCACCTATGGGGAGTCGAGGGTTAAGCAATCAACAAAGGGG
GGCTATGGCATGGGCACAGAGGAACTTTTTGGTCTATAACTATTGCCATGACCCTAAAAG
AGACCATACCCAAACACCAGAATGTTAAGCGAAGCATACAAACAAAAAGATTTTAAAACA
TTTGTTATGCATTATCAATTACACATTAAGTTAATAACGAGCTTATTGAGACGGGTCCAC
ACTGGAAAAGTAGAGTGAAGCAGTTGAGCGTCCAATCCTCCATGATTTGAGATTTGTTTT
TAAAGGTTATTTCTAAGCTTGTCTTGTCCCATTGTAATATTTTAATAATTGTGGCAATAT
TGCGTG

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 2

CO CL5913Contig1 862 2 6 U
GGCTGTTGCGGTGGTGACTAACAACTAACGTCGCAGGGTGAAAGAGAAAACGGAGGAGAA
AGACCGGTTCGGATCATCTCTGATCGTCTTCCATGGCTCAGATCCCTAACTTGGAAAATG
CTCCTCTCAACCTCAAGTCCATTAGGGAGAAGTCTCAGAGGGAGCTCGTAAACTTGCTCA
AAGACATTCGTGGGACTAAGTGTCTGGTTATTGACCCAAAGCTCAGTGGTTCTGTCTCAT
TGATCATCCAGACCTCCACACTTAAGGAACTTGGTTTGGAATTACGACATCTTTCCGAAG
AACCAGTTCAGACGGAATGCACCAAAGTGGTTTATCTTGTTCGCTCTCAACTCAGTTTTA
TGAGACACATAGCTTCTCATATTCAGAACGATATTTCTAAAGCGATTCAGAGAGACTACT
ACGTTTTCTTTGTTCCTCGTAGGTCTGTTGCCTGTGAGAAGATTCTTGAGCAGGAGAAAG
TTCATAACCTGGTTACCGTAAAGGAGTTTCCCCTCTATATGGTTCCACTAGATGAGGATG
TCATCTCATTTGAGCTTGACCTCTCTGAAAAAGATTGCCTTGTGGATGGGGATGTTAGCT
CACTTTGGCATGTTGCAAAAGCAATACATGAGCTCGAGTTTTCTTTTGGAGTTATACCGA
AAGTGAGGGCAAAGGGAAAAGGATCAGTTCGTGTTGCAGATATACTTAATCGCATGCAAG
TGGAGGAACCTGTCAATACCAATGATGTGGGAAGGCCTGAAGTAGATACACTCATTCTGT
TGGATAGAGAGGTTGACATGGTTACACCAATGTGTACCCAGTTGACTTATGAGGACTGTT
TAAACGAGTTTTTGCATATCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL87TF U 1
AF RR2BA31TF U 11
BS 1 145 RR2BL87TF
BS 146 146 RR2BA31TF
BS 147 571 RR2BL87TF
BS 572 572 RR2BA31TF
BS 573 619 RR2BL87TF
BS 620 862 RR2BA31TF

RD RR2BL87TF 623 0 0
GGCTGTTGCGGTGGTGACTAACAACTAACGTCGCAGGGTGAAAGAGAAAACGGAGGAGAA
AGACCGGTTCGGATCATCTCTGATCGTCTTCCATGGCTCAGATCCCTAACTTGGAAAATG
CTCCTCTCAACCTCAAGTCCATTAGTGAGAAGTCTCAGAGGGAGCTCGTAAACTTGCTCA
AAGACATTCGTGGGACTAAGTGTCTGGTTATTGACCCAAAGCTCAGTGGTTCTGTCTCAT
TGATCATCCAGACCTCCACACTTAAGGAACTTGGTTTGGAATTACGACATCTTTCCGAAG
AACCAGTTCAGACGGAATGCACCAAAGTGGTTTATCTTGTTCGCTCTCAACTCAGTTTTA
TGAGACACATAGCTTCTCATATTCAGAACGATATTTCTAAAGCGATTCAGAGAGACTACT
ACGTTTTCTTTGTTCCTCGTAGGTCTGTTGCCTGTGAGAAGATTCTTGAGCAGGAGAAAG
TTCATAACCTGGTTACCGTAAAGGAGTTTCCCCTCTATATGGTTCCACTAGATGAGGATG
TCATCTCATTTGAGCTTGACCTCTCTGAAAA*GATTGCCTTGTGGATGGGGATGTTAGCT
CACTTTGGCATGTTGCAAA
GCAA

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2BA31TF 852 0 0
GG
GGTGACTAACAACTAACGTCGCAGGGTGAAAGAGAAAACGGAGGAGAAAGACCGGTTCGG
ATCATCTCTGATCGTCTTCCATGGCTCAGATCCCTAACTTGGAAAATGCTCCTCTCAACC
TCAAGTCCATTAGGGAGAAGTCTCAGAGGGAGCTCGTAAACTTGCTCAAAGACATTCGTG
GGACTAAGTGTCTGGTTATTGACCCAAAGCTCAGTGGTTCTGTCTCATTGATCATCCAGA
CCTCCACACTTAAGGAACTTGGTTTGGAATTACGACATCTTTCCGAAGAACCAGTTCAGA
CGGAATGCACCAAAGTGGTTTATCTTGTTCGCTCTCAACTCAGTTTTATGAGACACATAG
CTTCTCATATTCAGAACGATATTTCTAAAGCGATTCAGAGAGACTACTACGTTTTCTTTG
TTCCTCGTAGGTCTGTTGCCTGTGAGAAGATTCTTGAGCAGGAGAAAGTTCATAACCTGG
TTACCGTAAAGGAGTTTCCCCTCTATATGGTTCCACTAGATGAGGATGTCATCTCATTTG
AGCTTGACCTCTCTGAAAAAGATTGCCTTGTGGATGGGGATGTTAGCTCACTTTGGCATG
TTGCAAAAGCAATACATGAGCTCGAGTTTTCTTTTGGAGTTATACCGAAAGTGAGGGCAA
AGGGAAAAGGATCAGTTCGTGTTGCAGATATACTTAATCGCATGCAAGTGGAGGAACCTG
TCAATACCAATGATGTGGGAAGGCCTGAAGTAGATACACTCATTCTGTTGGATAGAGAGG
TTGACATGGTTACACCAATGTGTACCCAGTTGACTTATGAGGACTGTTTAAACGAGTTTT
TGCATATCAG

QA 3 852 3 852
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5915Contig1 790 2 2 U
GGATTCTCTCCGAAATTGAGAAAACAAAAAACTCCCAGATCCTCTTCTGTCTGGTTCTGT
TTCTAAAATCGTGCTTTGATTCTTCTCTCCTCCAAAGATTATGGATCTAAAGGGACAGCT
AGACAGGTTCAAGAAACAGCAAGAAAGATGCCAATCTACTCTCTCAAGCATCAATGCTTC
TCGAGCACCACCTTCTGCTCCTTCCAGGCCCTCCTCCTCCTCCTCTGTTCCTGCTGCCAC
CAGTCTCAAGCCTGCACCTCCCGTCAAATTCTCCAACGACACCGAGCGTCTTCAGTTTAT
CAACAGCATCAGGAAGGGTCCCGTCGGTGCTCAAATCAAGCGTGTCATCGAGCTTCTCTT
TGAGACAAGGCAAGCCTTTACACCGGAGCAGATTAACGAAAGGTGTTATGTTGATATGCT
TTCGAATAAAGCTGTCTTTGATAGTCTCAGGAACAATCCCAAAGTCTATTACGACGGAAG
AAGGTTCTCTTACAAGGCTAAGCATGATGTTAAAGACAAGAACCAGCTTCTCTCGCTGAT
CAAGAAGTATCCTGCTGGGATTGCGGCTGTTGATCTCAAAGACGCTTACCCTAATGTCAT
GGATGATTTACAGGCTCTGAAAGCTTCGAAACACATATGGTTCCTATCAAACGCTGATTC
ACAAGAGGACATTGCGTACCCGAACGACTTCAAGGGCAGATTGAGTTGACGACGAGTTTA
AATCTCTGTTCCGGGACATAGACATCCCAGCGACCTTCTTGATGTGGAGAAGAGCTGCAG
AAGATGGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW25TF U 1
AF RR2HA75TF U 1
BS 1 691 RR2GW25TF
BS 692 790 RR2HA75TF

RD RR2GW25TF 691 0 0
GGATTCTCTCCGAAATTGAGAAAACAAAAAACTCCCAGATCCTCTTCTGTCTGGTTCTGT
TTCTAAAATCGTGCTTTGATTCTTCTCTCCTCCAAAGATTATGGATCTAAAGGGACAGCT
AGACAGGTTCAAGAAACAGCAAGAAAGATGCCAATCTACTCTCTCAAGCATCAATGCTTC
TCGAGCACCACCTTCTGCTCCTTCCAGGCCCTCCTCCTCCTCCTCTGTTCCTGCTGCCAC
CAGTCTCAAGCCTGCACCTCCCGTCAAATTCTCCAACGACACCGAGCGTCTTCAGTTTAT
CAACAGCATCAGGAAGGGTCCCGTCGGTGCTCAAATCAAGCGTGTCATCGAGCTTCTCTT
TGAGACAAGGCAAGCCTTTACACCGGAGCAGATTAACGAAAGGTGTTATGTTGATATGCT
TTCGAATAAAGCTGTCTTTGATAGTCTCAGGAACAATCCCAAAGTCTATTACGACGGAAG
AAGGTTCTCTTACAAGGCTAAGCATGATGTTAAAGACAAGAACCAGCTTCTCTCGCTGAT
CAAGAAGTATCCTGCTGGGATTGCGGCTGTTGATCTCAAAGACGCTTACCCTAATGTCAT
GGATGATTTACAGGCTCTGAAAGCTTCGAAACACATATGGTTCCTATCAAACGCTGATTC
ACAAGAGGACATTGCGTACCCGAACGACTTC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2HA75TF 790 0 0
GGATTCTCTCCGAAATTGAGAAAACAAAAAACTCCCAGATCCTCTTCTGTCTGGTTCTGT
TTCTAAAATCGTGCTTTGATTCTTCTCTCCTCCAAAGATTATGGATCTAAAGGGACAGCT
AGACAGGTTCAAGAAACAGCAAGAAAGATGCCAATCTACTCTCTCAAGCATCAATGCTTC
TCGAGCACCACCTTCTGCTCCTTCCAGGCCCTCCTCCTCCTCCTCTGTTCCTGCTGCCAC
CAGTCTCAAGCCTGCACCTCCCGTCAAATTCTCCAACGACACCGAGCGTCTTCAGTTTAT
CAACAGCATCAGGAAGGGTCCCGTCGGTGCTCAAATCAAGCGTGTCATCGAGCTTCTCTT
TGAGACAAGGCAAGCCTTTACACCGGAGCAGATTAACGAAAGGTGTTATGTTGATATGCT
TTCGAATAAAGCTGTCTTTGATAGTCTCAGGAACAATCCCAAAGTCTATTACGACGGAAG
AAGGTTCTCTTACAAGGCTAAGCATGATGTTAAAGACAAGAACCAGCTTCTCTCGCTGAT
CAAGAAGTATCCTGCTGGGATTGCGGCTGTTGATCTCAAAGACGCTTACCCTAATGTCAT
GGATGATTTACAGGCTCTGAAAGCTTCGAAACACATATGGTTCCTATCAAACGCTGATTC
ACAAGAGGACATTGCGTACCCGAACGACTTCAAGGGCAGATTGAGTTGACGACGAGTTTA
AATCTCTGTTCCGGGACATAGACATCCCAGCGACCTTCTTGATGTGGAGAAGAGCTGCAG
AAGATGGTTT

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL5916Contig1 402 2 1 U
GGAATATTGTTTATTACCCAAGAAATAAAGAAAGGTAACGTTTGGTTCAAGAAATATGTC
GAAGACACCAGAGAAACAAGAACTGCCACTAGAAACAAGTCCGTACACAAAGTATGAGGA
CATTGAAGATTACAAGAAGAACGCTTATGGAACATCTGGTCACCAACAGGTTAAGCCTGG
CCAAGGTGGTGGCACAACCGACGCACCTACCCTCTCCGGCAGTGCTCCTCCATCCGCTAT
TGATTCAGCTAACCAACAAGCTAAGAAGTGAACCACCCAGTTTTTTTTTTAACCACTCAG
TTATTACAAAACATAAACATGTTTCTCTTGTTTCTGTTTTATTTACTATCCAATGTGATT
AATATAGCATTTTAATTAAGTTGTATAAGCAACATTTTAATT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2GB22TF U 1
AF RR2CX16TF U 4
BS 1 402 RR2GB22TF

RD RR2GB22TF 402 0 0
GGAATATTGTTTATTACCCAAGAAATAAAGAAAGGTAACGTTTGGTTCAAGAAATATGTC
GAAGACACCAGAGAAACAAGAACTGCCACTAGAAACAAGTCCGTACACAAAGTATGAGGA
CATTGAAGATTACAAGAAGAACGCTTATGGAACATCTGGTCACCAACAGGTTAAGCCTGG
CCAAGGTGGTGGCACAACCGACGCACCTACCCTCTCCGGCAGTGCTCCTCCATCCGCTAT
TGATTCAGCTAACCAACAAGCTAAGAAGTGAACCACCCAGTTTTTTTTTTAACCACTCAG
TTATTACAAAACATAAACATGTTTCTCTTGTTTCTGTTTTATTTACTATCCAATGTGATT
AATATAGCATTTTAATTAAGTTGTATAAGCAACATTTTAATT

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR2CX16TF 399 0 0
GG
ATTGTTTATTACCCAAGAAATAAAGAAAGGTAACGTTTGGTTCAAGAAATATGTCGAAGA
CACCAGAGAAACAAGAACTGCCACTAGAAACAAGTCCGTACACAAAGTATGAGGACATTG
AAGATTACAAGAAGAACGCTTATGGAACATCTGGTCACCAACAGGTTAAGCCTGGCCAAG
GTGGTGGCACAACCGACGCACCTACCCTCTCCGGCAGTGCTCCTCCATCCGCTATTGATT
CAGCTAACCAACAAGCTAAGAAGTGAACCACCCAGTTTTTTTTT*AACCACTCAGTTATT
ACAAAACATAAACATGTTTCTCTTGTTTCTGTTTTATTTACTATCCAATGTGATTAATAT
AGCATTTTAATTAAGTTGTATAAGCAACATTTTAATT

QA 3 399 3 399
DS 



AS 1 2

CO CL5917Contig1 573 2 3 U
TTTTTTAAAATAACACACTAGATTGATATTCATGTAGAGAGACATTCATCAAATCAAAAG
ACTTGAAAAACACACGAACATTTTTAATAAAAAAGATTTACACGAACTGATTTAAACAAC
CAAAGTAATTTAAAACCATAACTAAGAAACCATTGTTCTTCGAAACCATTGTTCTTCTTG
TTCATCACCACCGCTTCAAGCCCTCTCACCCCTGATCCTCCTCGCGAGCTGGATATCTTT
AGGCATAATGGTGACCCTCTTCGCGTGAATCGCACACAGGTTCGTGTCCTCGAACAGACC
GACGAGGTAAGCCTCCGCCGCCTCCTGGAGAGCAGCGACGGCGCTGCTCTGGAACCTCAG
ATCCGTCTTAAAATCCTGAGCGATCTCTGTGCGGCTTCTTCACTCCTCCGGTGGCCGGAG
CAGACTTCCTCGCCGCTTTCGTCGCCAGCTGCTTCCTCGGAGCCTTTCCTCCGGTTGATT
TTCTTGCTGTTTGCTTGGTACGAGCCATTTGAGGTTGTGAAAATAACGAAAGTTTTACTC
TTGTTTTTAGAGAGAATGAGATTTGATGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G977JQ U 7
AF RR2G977TF C 1
BS 1 6 RR2G977TF
BS 7 417 RR2G977JQ
BS 418 573 RR2G977TF

RD RR2G977JQ 411 0 0
AAAATAACACACTAGATTGATATTCATGTAGAGAGACATTCATCAAATCAAAAGACTTGA
AAAACACACGAACATTTTTAATAAAAAAGATTTACACGAACTGATTTAAACAACCAAAGT
AATTTAAAACCATAACTAAGAAACCATTGTTCTTCGAAACCATTGTTCTTCTTGTTCATC
ACCACCGCTTCAAGCCCTCTCACCCCTGATCCTCCTCGCGAGCTGGATATCTTTAGGCAT
AATGGTGACCCTCTTCGCGTGAATCGCACACAGGTTCGTGTCCTCGAACAGACCGACGAG
GTAAGCCTCCGCCGCCTCCTGGAGAGCAGCGACGGCGCTGCTCTGGAACCTCAGATCCGT
CTTAAAATCCTGAGCGATCTCTGTGCGGCTTCTTCACTCCTCCGGTGGCCG

QA 1 411 1 411
DS 

RD RR2G977TF 573 0 0
TTTTTTAAAATAACACACTAGATTGATATTCATGTAGAGAGACATTCATCAAATCAAAAG
ACTTGAAAAACACACGAACATTTTTAATAAAAAAGATTTACACGAACTGATTTAAACAAC
CAAAGTAATTTAAAACCATAACTAAGAAACCATTGTTCTTCGAAACCATTGTTCTTCTTG
TTCATCACCACCGCTTCAAGCCCTCTCACCCCTGATCCTCCTCGCGAGCTGGATATCTTT
AGGCATAATGGTGACCCTCTTCGCGTGAATCGCACACAGGTTCGTGTCCTCGAACAGACC
GACGAGGTAAGCCTCCGCCGCCTCCTGGAGAGCAGCGACGGCGCTGCTCTGGAACCTCAG
ATCCGTCTTAAAATCCTGAGCGATCTCTGTGCGGCTTCTTCACTCCTCCGGTGGCCGGAG
CAGACTTCCTCGCCGCTTTCGTCGCCAGCTGCTTCCTCGGAGCCTTTCCTCCGGTTGATT
TTCTTGCTGTTTGCTTGGTACGAGCCATTTGAGGTTGTGAAAATAACGAAAGTTTTACTC
TTGTTTTTAGAGAGAATGAGATTTGATGTGTCC

QA 1 573 1 573
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5919Contig1 925 2 4 U
GTCCCAGGAAGCTCACTTATCCCCTTAAACCATCCAGGTTCAAGAAGATATCAAGATACA
AGATCATCTCTTTGCAAAGGCCACAAATCAAGCTAAAGGCTAGTTTCATGGAGCCATCAA
AGCCTTTGCTTCCAAGATTTTTATTTCAATTTTATTTCTTTCCTTTAGTCGTTTTTAGAC
TGTTAGAGAGTCCCAAAGTCGAGCCTATATAAGCTCAGCAGTTGTCTTTGTAATAAAACC
ACCCTTGAATTTTATGAATAAATATGCAGTTTTTCTAGTTTTCTTAAAACTATTATCTAA
GTCTTTTGAGTGTTGTGAGAAGCAGCTCTTGAGCAACCTGACTTATCAAAGCATCCTTAC
ACAGAGCTTTGTGGCGTCCTCAATCCCCCTATCATTTCCATCTACTGATTTGCCTTGAGA
GAGACTTCAGTCCAGCAACAAAAATCCCATCTCCATCAATTTATCCCTTTTCTATTTGCT
TTTATTCTTATTATCATTCTGATTCATATTCATATTTGCTTCTGTTTGCATCATAAACTT
ATAAAACTCATAAAAAAGGTTCACTCTTTGTTTCAGGTACCAATCCGAACTATTGAACTA
AACCTCAGTTCCATATTTCCGGAAGGCCTGACCCTGTGCCCACAACATTTTGGTATCAGA
GCTCAAAGCTTCTGAATCAGGTCCATTCTATCTTTGCATCATATTTCATTTGCTTGCATT
TGTTTTTCATTTATAAATCAAAAGGCATAAAAACAGTTTCTGCATTTTTGTGTTCTTGTT
GCATTCAAAAAACAAATTTCATAAAAAAGAGGAAGACAAGTTTAATTTCGTGTAGATCAT
CTAGGATTCAAATTTTTTTTCATTAGCTTGTTTGCATTCATTGCCCAGCTCCATTTGCCA
TATTTATATTTTGTGCATTCATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH54TF U 1
AF RR2BH54JQ C 65
BS 1 442 RR2BH54TF
BS 443 443 RR2BH54JQ
BS 444 663 RR2BH54TF
BS 664 925 RR2BH54JQ

RD RR2BH54TF 663 0 0
GTCCCAGGAAGCTCACTTATCCCCTTAAACCATCCAGGTTCAAGAAGATATCAAGATACA
AGATCATCTCTTTGCAAAGGCCACAAATCAAGCTAAAGGCTAGTTTCATGGAGCCATCAA
AGCCTTTGCTTCCAAGATTTTTATTTCAATTTTATTTCTTTCCTTTAGTCGTTTTTAGAC
TGTTAGAGAGTCCCAAAGTCGAGCCTATATAAGCTCAGCAGTTGTCTTTGTAATAAAACC
ACCCTTGAATTTTATGAATAAATATGCAGTTTTTCTAGTTTTCTTAAAACTATTATCTAA
GTCTTTTGAGTGTTGTGAGAAGCAGCTCTTGAGCAACCTGACTTATCAAAGCATCCTTAC
ACAGAGCTTTGTGGCGTCCTCAATCCCCCTATCATTTCCATCTACTGATTTGCCTTGAGA
GAGACTTCAGTCCAGCAACAAAGATCCCATCTCCATCAATTTATCCCTTTTCTATTTGCT
TTTATTCTTATTATCATTCTGATTCATATTCATATTTGCTTCTGTTTGCATCATAAACTT
ATAAAACTCATAAAAAAGGTTCACTCTTTGTTTCAGGTACCAATCCGAACTATTGAACTA
AACCTCAGTTCCATATTTCCGGAAGGCCTGACCCTGTGCCCACAACATTTTGGTATCAGA
GCT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2BH54JQ 861 0 0
CATCTCTTTGCAAAGGCCACAAATCAAGCTAAAGGCTAGTTTCATGGAGCCATCAAAGCC
TTTGCTTCCAAGATTTTTATTTCAATTTTATTTCTTTCCTTTAGTCGTTTTTAGACTGTT
AGAGAGTCCCAAAGTCGAGCCTATATAAGCTCAGCAGTTGTCTTTGTAATAAAACCACCC
TTGAATTTTATGAATAAATATGCAGTTTTTCTAGTTTTCTTAAAACTATTATCTAAGTCT
TTTGAGTGTTGTGAGAAGCAGCTCTTGAGCAACCTGACTTATCAAAGCATCCTTACACAG
AGCTTTGTGGCGTCCTCAATCCCCCTATCATTTCCATCTACTGATTTGCCTTGAGAGAGA
CTTCAGTCCAGCAACAAAAATCCCATCTCCATCAATTTATCCCTTTTCTATTTGCTTTTA
TTCTTATTATCATTCTGATTCATATTCATATTTGCTTCTGTTTGCATCATAAACTTATAA
AACTCATAAAAAAGGTTCACTCTTTGTTTCAGGTACCAATCCGAACTATTGAACTAAACC
TCAGTTCCATATTTCCGGAAGGCCTGACCCTGTGCCCACAACATTTTGGTATCAGAGCTC
AAAGCTTCTGAATCAGGTCCATTCTATCTTTGCATCATATTTCATTTGCTTGCATTTGTT
TTTCATTTATAAATCAAAAGGCATAAAAACAGTTTCTGCATTTTTGTGTTCTTGTTGCAT
TCAAAAAACAAATTTCATAAAAAAGAGGAAGACAAGTTTAATTTCGTGTAGATCATCTAG
GATTCAAATTTTTTTTCATTAGCTTGTTTGCATTCATTGCCCAGCTCCATTTGCCATATT
TATATTTTGTGCATTCATTTC

QA 1 861 1 861
DS 



AS 1 2

CO CL5920Contig1 756 2 3 U
GATCCCGCGCACTGACCGCACACTGTCACTATTTGGAGGAATGGTTTCACTCTCGATGAT
GATAATACATTATCGACACTGGATGATCCGGAAAATGCAATCTTTCTTGAGATGCAGATC
ATTCGGAGGGGGTCTCAGTAAGTAATCTACAATGACACTGAAACAGAATGCGTAAAACAA
GATGGGGCTGGTGTTTACATCAACAGTCAGGCTTAGACGTGTTCGATTCAGGAATTTTTT
TCCAGGAATGAGCTTGGATGTTGGACGAATAGTTTTGATCTTGAAGGTTCCTTTTTAAAA
AACTACGATGGGAAAAGTTCACTACTGAACCATCTTTAAATAATCGCTGGGAAAAAAGAA
GCTTTAGCGGAGAGGTTAGCAGTCACTTTTTGCTTCTTTCTCAGACCAGCTCTTATGCAG
TTTGGTTCCAGTTCCATGTCGATAAGAGAGAGACAAATGGCTTCTACTTTCTCTTCCAGT
TGTTCTGAATCAAACCCAGCCAGGTCTGGCAAGGAATAACTCAGTGGAAGCAAGGAATCG
TATCTGCAGAAACTAAGAGTTTATCCCTAGAACTTCTCTTTTTTCCAATTATTACTGTCA
CACATACACGTGGTTACAGTTAGCCAAACAATAACAATCTACTTTAGCTATGCTATTTGT
AAATATTGGGTTTTATAAAAAATAGCGGTTTAGCGCATGTGTTATATGAAAGACCAATGT
ATTATCCTTACATAAGAAAAAGATGAAAATTATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C007TF U 1
AF RR2C007JQ C 46
BS 1 740 RR2C007TF
BS 741 741 RR2C007JQ
BS 742 756 RR2C007TF

RD RR2C007TF 756 0 0
GATCCCGCGCACTGACCGCACACTGTCACTATTTGGAGGAATGGTTTCACTCTCGATGAT
GATAATACATTATCGACACTGGATGATCCGGAAAATGCAATCTTTCTTGAGATGCAGATC
ATTCGGAGGGGGTCTCAGTAAGTAATCTACAATGACACTGAAACAGAATGCGTAAAACAA
GATGGGGCTGGTGTTTACATCAACAGTCAGGCTTAGACGTGTTCGATTCAGGAATTTTTT
TCCAGGAATGAGCTTGGATGTTGGACGAATAGTTTTGATCTTGAAGGTTCCTTTTTAAAA
AACTACGATGGGAAAAGTTCACTACTGAACCATCTTTAAATAATCGCTGGGAAAAAAGAA
GCTTTAGCGGAGAGGTTAGCAGTCACTTTTTGCTTCTTTCTCAGACCAGCTCTTATGCAG
TTTGGTTCCAGTTCCATGTCGATAAGAGAGAGACAAATGGCTTCTACTTTCTCTTCCAGT
TGTTCTGAATCAAACCCAGCCAGGTCTGGCAAGGAATAACTCAGTGGAAGCAAGGAATCG
TATCTGCAGAAACTAAGAGTTTATCCCTAGAACTTCTCTTTTTTCCAATTATTACTGTCA
CACATACACGTGGTTACAGTTAGCCAAACAATAACAATCTACTTTAGCTATGCTATTTGT
AAATATTGGGTTTTATAAAAAATAGCGGTTTAGCGCATGTGTTATATGAAAGACCAATGT
ATTATCCTTACATAAGAAAA*GATGAAAATTATTAC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2C007JQ 711 0 0
TTCACTCTCGATGATGATAATACATTATCGACACTGGATGATCCGGAAAATGCAATCTTT
CTTGAGATGCAGATCATTCGGAGGGGGTCTCAGTAAGTAATCTACAATGACACTGAAACA
GAATGCGTAAAACAAGATGGGGCTGGTGTTTACATCAACAGTCAGGCTTAGACGTGTTCG
ATTCAGGAATTTTTTTCCAGGAATGAGCTTGGATGTTGGACGAATAGTTTTGATCTTGAA
GGTTCCTTTTTAAAAAACTACGATGGGAAAAGTTCACTACTGAACCATCTTTAAATAATC
GCTGGGAAAAAAGAAGCTTTAGCGGAGAGGTTAGCAGTCACTTTTTGCTTCTTTCTCAGA
CCAGCTCTTATGCAGTTTGGTTCCAGTTCCATGTCGATAAGAGAGAGACAAATGGCTTCT
ACTTTCTCTTCCAGTTGTTCTGAATCAAACCCAGCCAGGTCTGGCAAGGAATAACTCAGT
GGAAGCAAGGAATCGTATCTGCAGAAACTAAGAGTTTATCCCTAGAACTTCTCTTTTTTC
CAATTATTACTGTCACACATACACGTGGTTACAGTTAGCCAAACAATAACAATCTACTTT
AGCTATGCTATTTGTAAATATTGGGTTTTATAAAAAATAGCGGTTTAGCGCATGTGTTAT
ATGAAAGACCAATGTATTATCCTTACATAAGAAAAAGATGAAAATTATTAC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL5921Contig1 868 2 2 U
GATTCAATGTTTATATATTTTACTTAATGGATCTCCTAATAAAAGCATATTGTGTAATCG
TCTAGTGACTGTGATTCGCGTGCTTGTCAAGTCAGCCGAAACGCTGATCACTATAGTATT
TATAACTATATAACCGTTTACGTCTCAAACAATGCAGTTTACTGTGCAGATGATATCCCA
CCACCCGAGCTAACAGCTGGCGCTTTGATGTCCACAGCAACAGAATCACTGCGAAATACA
TACAACATACATGAGCAATCTGCTACCGAAACATAGAGATGAACAAAAATTATAATTCTC
GAATGTGCAGAAATAGACAAACTACTACACCTTTCAACTAACCTTGTCACAGAAACTCTA
CATCCATCCAAGTACATAACATGAAACAGAAAAAAGTATTCAAGTCACGTGATGGGACAG
TAACTTATATGACTAAGCCATAGGCCACCTAAATACTTTCAAACCATTCAGACCTGGAAA
TTAACGCTCTGCTTATCAGTGCCTATACTGCGCAGGACAAACTTAACATTTAGAGGATCT
TGAAACAAAACCTACATTTAGTTGGCTGGATAGAAAGCCTACTAACTAAATCTTGCATAG
ACTACTACATTGTTGATTTTCATTTTTGTGGGACGTTCTTATGAATTTCCATTTCTTGGT
CAATCGCATACTATCCTATGATAATAGACAGGACATAAACTGGATCAAATCTTAATATTT
ATCTTTCAAGTATCTATATATATATATAAAGTTGGATTAGTAAATATCTGTCTAAAGAAA
GACTGCAAAGAACGTGATGTTCAAACTGTTTGATTGATGCAACTAAAAAGAAATCCCTTA
AACCAATTCTTCATTCCCTTTATCGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G577TF U 1
AF RR2G577JQ C 357
BS 1 728 RR2G577TF
BS 729 868 RR2G577JQ

RD RR2G577TF 734 0 0
GATTCAATGTTTATATATTTTACTTAATGGATCTCCTAATAAAAGCATATTGTGTAATCG
TCTAGTGACTGTGATTCGCGTGCTTGTCAAGTCAGCCGAAACGCTGATCACTATAGTATT
TATAACTATATAACCGTTTACGTCTCAAACAATGCAGTTTACTGTGCAGATGATATCCCA
CCACCCGAGCTAACAGCTGGCGCTTTGATGTCCACAGCAACAGAATCACTGCGAAATACA
TACAACATACATGAGCAATCTGCTACCGAAACATAGAGATGAACAAAAATTATAATTCTC
GAATGTGCAGAAATAGACAAACTACTACACCTTTCAACTAACCTTGTCACAGAAACTCTA
CATCCATCCAAGTACATAACATGAAACAGAAAAAAGTATTCAAGTCACGTGATGGGACAG
TAACTTATATGACTAAGCCATAGGCCACCTAAATACTTTCAAACCATTCAGACCTGGAAA
TTAACGCTCTGCTTATCAGTGCCTATACTGCGCAGGACAAACTTAACATTTAGAGGATCT
TGAAACAAAACCTACATTTAGTTGGCTGGATAGAAAGCCTACTAACTAAATCTTGCATAG
ACTACTACATTGTTGATTTTCATTTTTGTGGGACGTTCTTATGAATTTCCATTTCTTGGT
CAATCGCATACTATCCTATGATAATAGACAGGACATAAACTGGATCAAATCTTAATATTT
ATCTTTCA
GTATCT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2G577JQ 512 0 0
TCTACATCCATCCAAGTACATAACATGAAACAGAAAAAAGTATTCAAGTCACGTGATGGG
ACAGTAACTTATATGATTAAGCCATAGGCCACCTAAATACTTTCAAACCATTCAGACCTG
GAAATTAACGCTCTGCTTATCAGTGCCTATACTGCGCAGGACAAACTTAACATTTAGAGG
ATCTTGAAACAAAACCTACATTTAGTTGGCTGGATAGAAAGCCTACTAACTAAATCTTGC
ATAGACTACTACATTGTTGATTTTCATTTTTGTGGGACGTTCTTATGAATTTCCATTTTT
TGGTCAATCGCATACTATCCTATGATAATAGACAGGACATAAACTGGATCAAATCTTAAT
ATTTATCTTTCAAGTATCTATATATATATATAAAGTTGGATTAGTAAATATCTGTCTAAA
GAAAGACTGCAAAGAACGTGATGTTCAAACTGTTTGATTGATGCAACTAAAAAGAAATCC
CTTAAACCAATTCTTCATTCCCTTTATCGTAC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL5922Contig1 657 2 3 U
GGAGGGTTTGTTGATCTCGACCTCGCTCCCTTGACAGAGAACTATGAGGGTCACTAACAA
TCCGGAAGAATCAGCGCCACTCTCCTCCTTCTCGCTTTGCTCTCGGAACCTTTTGGATAA
AAGATAAGATGAGCAGTGAAGTTGGTAGAGTATACCGTGACCTTCTTAAAGCAGTGGTGA
AACATGTTGGCAAAGAAGACCACAAGTCTCATTTCACAGACTTTGTCAAGCACGAGTTTC
GCAAGAACGCAAACTCACTAGACAAAATCAACCTTGCCCGCAACTACGCTTATCTTCTTA
ATAGCATTCACTCTCACAAGGATCTGTTGTTCTCATACAACATTGCAGTTGACAGAACTG
AAGAAATGAAACGAGTTCTTGGGAAGTCTGCAGCTAGTGTAGGCCTTCGTCTTCCCGAGG
TTTACCAGCCTTGATCATGCAAATGCATTTTAAGCGCCACTCTGATGTCTTCATTTCCTT
ATTAGACATATCTTGGTTTTGGAATAACTGGTATCCTGTTTGTAGCCAGGGCAGAGCTCT
TTTGCATGGATTTACAAATTTTCCTTGTGTTGTTTACACATACGTTTGGGTACAAAAGTA
TGGTTACCAAGAACATATTCAGGTTCTTGATATATATACAATATGTTGTATCAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E856JQ C 1
AF RR2E856TF U 28
BS 1 27 RR2E856JQ
BS 28 618 RR2E856TF
BS 619 657 RR2E856JQ

RD RR2E856JQ 657 0 0
GGAGGGTTTGTTGATCTCGACCTCGCTCCCTTGACAGAGAACTATGAGGGTCACTAACAA
TCCGGAAGAATCAGCGCCACTCTCCTCCTTCTCGCTTTGCTCTCGGAACCTTTTGGATAA
AAGATAAGATGAGCAGTGAAGTTGGTAGAGTATACCGTGACCTTCTTAAAGCAGTGGTGA
AACATGTTGGCAAAGAAGACCACAAGTCTCATTTCACAGACTTTGTCAAGCACGAGTTTC
GCAAGAACGCAAACTCACTAGACAAAATCAACCTTGCCCGCAACTACGCTTATCTTCTTA
ATAGCATTCACTCTCACAAGGATCTGTTGTTCTCATACAACATTGCAGTTGACAGAACTG
AAGAAATGAAACGAGTTCTTGGGAAGTCTGCAGCTAGTGTAGGCCTTCGTCTTCCCGAGG
TTTACCAGCCTTGATCATGCAAATGCATTTTAAGCGCCACTCTGATGTCTTCATTTCCTT
ATTAGACATATCTTGGTTTTGGAATAACTGGTATCCTGTTTGTAGCCAGGGCAGAGCTCT
TTTGCATGGATTTACAAATTTTCCTTGTGTTGTTTACACATACGTTTGGGTACAAAAGTA
TGGTTACCAAGAACATATTCAGGTTCTTGATATATATACAATATGTTGTATCAAACC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2E856TF 591 0 0
CCCTTGACAGAGAACTATGAGGGTCACTAACAATCCGGAAGAATCAGCGCCACTCTCCTC
CTTCTCGCTTTGCTCTCGGAACCTTTTGGATAAAAGATAAGATGAGCAGTGAAGTTGGTA
GAGTATACCGTGACCTTCTTAAAGCAGTGGTGAAACATGTTGGCAAAGAAGACCACAAGT
CTCATTTCACAGACTTTGTCAAGCACGAGTTTCGCAAGAACGCAAACTCACTAGACAAAA
TCAACCTTGCCCGCAACTACGCTTATCTTCTTAATAGCATTCACTCTCACAAGGATCTGT
TGTTCTCATACAACATTGCAGTTGACAGAACTGAAGAAATGAAACGAGTTCTTGGGAAGT
CTGCAGCTAGTGTAGGCCTTCGTCTTCCCGAGGTTTACCAGCCTTGATCATGCAAATGCA
TTTTAAGCGCCACTCTGATGTCTTCATTTCCTTATTAGACATATCTTGGTTTTGGAATAA
CTGGTATCCTGTTTGTAGCCAGGGCAGAGCTCTTTTGCATGGATTTACAAATTTTCCTTG
TGTTGTTTACACATACGTTTGGGTACAAAAGTATGGTTACCAAGAACATAT

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL5923Contig1 595 2 1 U
GGGATCATCTCTCTTTCTCTTTCTCTCTCTCGAAAGCTCTCTTCTACGAAAGGCGATTTC
GACGTCTCTTTCTGTGGTTTTTGTCGGCGACGTCTCCTTCAATATCTCTCATCGGCGACG
TCTCTTTCGGTGGCTCTCATCGGCGACATCTCTTTCGGTGGTTCTCCTCGAGGCGACAGA
GCTCTCTCTCGGTGGCTCTCCTGAAATCGAAAGTTTTTTGGTTCTCGTCGAATCTGTCTC
TCGGTGGGTCTTCTCCTCGAAGGTTCTCTTCGGTGGCTAAAATCGAAGCTTTCACCTCAA
ATTGAATGATAGAAGGATCAAAGTTCATCGAGCAAAGGTTCATCTAGCTCAGGAGTTCAC
TGCAAAAATAAAGTTAGTGTTACTCTGATCTGGTTCTGCAAACTAGAATTGATTTTGGTT
GTAGTTTGAATTGAATCGACTGTAATTAATGTGTTGGTTAGGAGTAAAATATAGTTGGGT
GATAAATAAAAGTGATGGCTAGGTAGAATTGATAAGGCTTTTACAGTGATGAATGGCGTA
GATAAATGTTAACACGTTTTTGTTTGTTGGTTGTCATGAATGCATCTTCTCTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H127JQ C 1
AF RR2H127TF U 1
BS 1 595 RR2H127TF

RD RR2H127JQ 595 0 0
GGGATCATCTCTCTTTCTCTTTCTCTCTCTCGAAAGCTCTCTTCTACGAAAGGCGATTTC
GACGTCTCTTTCTGTGGTTTTTGTCGGCGACGTCTCCTTCAATATCTCTCATCGGCGACG
TCTCTTTCGGTGGCTCTCATCGGCGACATCTCTTTCGGTGGTTCTCCTCGAGGCGACAGA
GCTCTCTCTCGGTGGCTCTCCTGAAATCGAAAGTTTTTTGGTTCTCGTCGAATCTGTCTC
TCGGTGGGTCTTCTCCTCGAAGGTTCTCTTCGGTGGCTAAAATCGAAGCTTTCACCTCAA
ATTGAATGATAGAAGGATCAAAGTTCATCGAGCAAAGGTTCATCTAGCTCAGGAGTTCAC
TGCAAAAATAAAGTTAGTGTTACTCTGATCTGGTTCTGCAAACTAGAATTGATTTTGGTT
GTAGTTTGAATTGAATCGACTGTAATTAATGTGTTGGTTAGGAGTAAAATATAGTTGGGT
GATAAATAAAAGTGATGGCTAGGTAGAATTGATAAGGCTTTTACAGTGATGAATGGCGTA
GATAAATGTTAACACGTTTTTGTTTGTTGGTTGTCATGAATGCATCTTCTCTTCC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2H127TF 595 0 0
GGGATCATCTCTCTTTCTCTTTCTCTCTCTCGAAAGCTCTCTTCTACGAAAGGCGATTTC
GACGTCTCTTTCTGTGGTTTTTGTCGGCGACGTCTCCTTCAATATCTCTCATCGGCGACG
TCTCTTTCGGTGGCTCTCATCGGCGACATCTCTTTCGGTGGTTCTCCTCGAGGCGACAGA
GCTCTCTCTCGGTGGCTCTCCTGAAATCGAAAGTTTTTTGGTTCTCGTCGAATCTGTCTC
TCGGTGGGTCTTCTCCTCGAAGGTTCTCTTCGGTGGCTAAAATCGAAGCTTTCACCTCAA
ATTGAATGATAGAAGGATCAAAGTTCATCGAGCAAAGGTTCATCTAGCTCAGGAGTTCAC
TGCAAAAATAAAGTTAGTGTTACTCTGATCTGGTTCTGCAAACTAGAATTGATTTTGGTT
GTAGTTTGAATTGAATCGACTGTAATTAATGTGTTGGTTAGGAGTAAAATATAGTTGGGT
GATAAATAAAAGTGATGGCTAGGTAGAATTGATAAGGCTTTTACAGTGATGAATGGCGTA
GATAAATGTTAACACGTTTTTGTTTGTTGGTTGTCATGAATGCATCTTCTCTTCC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

CO CL5924Contig1 790 2 6 U
GACCAAAGCTACATAGTAAATCTTTCCCAAAGCATAATCCATCTTTTCAACACACACAAA
AATGGTCGTCGCTCACAAAGAGACCGTGTGCGTAACCGGCGCATCAGGGTTCATCGGTTC
ATGGCTCGTGATGCGGCTACTGGAACGTGGTTACTTCGTCCGTGCCACTGTTCGCGACCC
CGGAAATTTGAAGAAAGTGCAACATCTTCTTGATCTACCAAACGCGAAGACGCAACTCAC
TTTATGGAAAGCCGATTTATCTGACGAAGGAAGCTACGATGACGCCATAAACGGATGCGA
CGGCGTTTTCCACATCGCAACTCCCATGGATTTTGAGTCCAAGGATCCCGAGAACGAAGT
GATAAAACCGACAGTGAATGGCGTGTTGGGGATAATGAAAGCATGCGATAAGGCAAAGAC
CGTACGAAGAATTGTGTTTACTTCGTCTGCTGGAACGGTTAATGTTGAGGAACACCAGAA
AAATGTCTATGATGAAAACGATTGGAGTGATCTTGACTTTATCATGTCCAAGAAGATGAC
CGGATGGATGTATTTCATGTCGAAAACGTTAGCGGAGAAAGCAGCTTGGGATTACGCAAA
GGAAAAAGGAATAGATTTCATTAGTATTATCCCGACGTTGGTGATCGGCCCATTTATAAC
AACATCCATGCCGCCTAGTCTTATTACCGCGCTCTCTCCTACCACTCGTAACGAGGCACA
TTACTCCATCATAAGACAAGGACAGTATGTGCACTTGGACGACTTATGCAATGCTCATAT
ATTCTTGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A517TF U 1
AF RR2AQ25TF U 10
BS 1 631 RR2A517TF
BS 632 632 RR2AQ25TF
BS 633 648 RR2A517TF
BS 649 649 RR2AQ25TF
BS 650 752 RR2A517TF
BS 753 790 RR2AQ25TF

RD RR2A517TF 752 0 0
GACCAAAGCTACATAGTAAATCTTTCCCAAAGCATAATCCATCTTTTCAACACACACAAA
AATGGTCGTCGCTCACAAAGAGACCGTGTGCGTAACCGGCGCATCAGGGTTCATCGGTTC
ATGGCTCGTGATGCGGCTACTGGAACGTGGTTACTTCGTCCGTGCCACTGTTCGCGACCC
CGGAAATTTGAAGAAAGTGCAACATCTTCTTGATCTACCAAACGCGAAGACGCAACTCAC
TTTATGGAAAGCCGATTTATCTGACGAAGGAAGCTACGATGACGCCATAAACGGATGCGA
CGGCGTTTTCCACATCGCAACTCCCATGGATTTTGAGTCCAAGGATCCCGAGAACGAAGT
GATAAAACCGACAGTGAATGGCGTGTTGGGGATAATGAAAGCATGCGATAAGGCAAAGAC
CGTACGAAGAATTGTGTTTACTTCGTCTGCTGGAACGGTTAATGTTGAGGAACACCAGAA
AAATGTCTATGATGAAAACGATTGGAGTGATCTTGACTTTATCATGTCCAAGAAGATGAC
CGGATGGATGTATTTCATGTCGAAAACGTTAGCGGAGAAAGCAGCTTGGGATTACGCAAA
GGAAAAAGGAATAGATTTCATTAGTATTATCTCGACGTTGGTGATCGGTCCATTTATAAC
AACATCCATGCCGCCTAGTCTTATTACCGCGCTCTCTCCTACCACTCGTAACGAGGCACA
TTACTCCATCATAAGACAAGGACAGTATGTGC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2AQ25TF 781 0 0
GGG
ATAGTAAATCTTTCCCAGAGCATAATCCATCTTTTCAACACACACAAAAATGGTCGTCGC
TCACAAAGAGACCGTGTGCGTAACCGGCGCATCAGGGTTCATCGGTTCATGGCTCGTGAT
GCGGCTACTGGAACGTGGTTACTTCGTCCGTGCCACTGTTCGCGACCCCGGAAATTTGAA
GAAAGTGCAACATCTTCTTGATCTACCAAACGCGAAGACGCAACTCACTTTATGGAAAGC
CGATTTATCTGACGAAGGAAGCTACGATGACGCCATAAACGGATGCGACGGCGTTTTCCA
CATCGCAACTCCCATGGATTTTGAGTCCAAGGATCCCGAGAACGAAGTGATAAAACCGAC
AGTGAATGGCGTGTTGGGGATAATGAAAGCATGCGATAAGGCAAAGACCGTACGAAGAAT
TGTGTTTACTTCGTCTGCTGGAACGGTTAATGTTGAGGAACACCAGAAAAATGTCTATGA
TGAAAACGATTGGAGTGATCTTGACTTTATCATGTCCAAGAAGATGACCGGATGGATGTA
TTTCATGTCGAAAACGTTAGCGGAGAAAGCAGCTTGGGATTACGCAAAGGAAAAAGGAAT
AGATTTCATTAGTATTATCCCGACGTTGGTGATCGGCCCATTTATAACAACATCCATGCC
GCCTAGTCTTATTACCGCGCTCTCTCCTATCACTCGTAACGAGGCACATTACTCCATCAT
AAGACAAGGACAGTATGTGCACTTGGACGACTTATGCAATGCTCATATATTCTTGTAC

QA 4 781 4 781
DS 



AS 1 2

CO CL5925Contig1 934 2 2 U
GGGTTGTGCATTCTATTCCCTTCCACACAAAAAAAGAGACATTACTTCTCAACTCTCCGA
TATTTTCTCCAAGAGAAATCTAAATTTGCAGTTCCTTTTCACTAGTTTTCGATGCTGTAG
AATTGAAGAGTGAGAGAGAGAGAGATAGATCGTTGGAGACGCGGCTGTGACTGAAACAGA
GGAGAGATCCGAAAATGGAAGCTGGAGGATCCAACGTTAGATCTAGCTACTACAACGTCC
TCGGTATTCGGAAAGATGCCTCTGTCTCCGATGTCCGCGCTGCTTACCGTAAGCTCGCCA
TGAAATGGCATCCGGATAGATACGCGAGGAATCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCAAACGTC
GATTTCAGCAAATCCAAGAAGCCTATTCTGTTTTGAATGACGAGAATAAGCGCTCGATGT
ATGACGCTGGACTCTACGATCCCCACGAAGATGTCGACGATGTTCGTATCTTAATTTATT
TCGATCTTCTTCTCATTCATTACGGATTTGTTTAACACGTCGTCGTTTCGTGATGTTTGA
TTTATTTCTCAATTGGTGTTTTTCGTTTTAGAATATACCATTCCCACATCATGTTTATTT
TTATTAACTCAAATTTCCCCCGTAAATACTGTGATCAGGACTTCTGCGACTTCATGCAAG
AGATGATCTCCATGATGAACAATGTCAAAGGCGAGGGAGATAGCTTGGGAGGACTTGCAA
CGGATGTTCACGGATATGGTTGGGTGGAGATAGCGTGATCTTTGACTGTAACAACAATCC
AAGGGACAGCAAAAGACCACGTGTTAATATCTCACGGAGTAGTGCTGCGATGCGTTAGTT
TTCTGTTTTGTGTTTGTGTTTGTGTCGTGTCGTTTCGCGTTGAACTGTCTCATGCTAAGA
AGTCTCAAGTTCTCAATTGTCATTTCAGTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B380TF U 1
AF RR2B380JQ C 225
BS 1 840 RR2B380TF
BS 841 934 RR2B380JQ

RD RR2B380TF 843 0 0
GGGTTGTGCATTCTATTCCCTTCCACACAAAAAAAGAGACATTACTTCTCAACTCTCCGA
TATTTTCTCCAAGAGAAATCTAAATTTGCAGTTCCTTTTCACTAGTTTTCGATGCTGTAG
AATTGAAGAGTGAGAGAGAGAGAGATAGATCGTTGGAGACGCGGCTGTGACTGAAACAGA
GGAGAGATCCGAAAATGGAAGCTGGAGGATCCAACGTTAGATCTAGCTACTACAACGTCC
TCGGTATTCGGAAAGATGCCTCTGTCTCCGATGTCCGCGCTGCTTACCGTAAGCTCGCCA
TGAAATGGCATCCGGATAGATACGCGAGGAATCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCAAACGTC
GATTTCAGCAAATCCAAGAAGCCTATTCTGTTTTGAATGACGAGAATAAGCGCTCGATGT
ATGACGCTGGACTCTACGATCCCCACGAAGATGTCGACGATGTTCGTATCTTAATTTATT
TCGATCTTCTTCTCATTCATTACGGATTTGTTTAACACGTCGTCGTTTCGTGATGTTTGA
TTTATTTCTCAATTGGTGTTTTTCGTTTTAGAATATACCATTCCCACATCATGTTTATTT
TTATTAACTCAAATTTCCCCCGTAAATACTGTGATCAGGACTTCTGCGACTTCATGCAAG
AGATGATCTCCATGATGAACAATGTCAAAGGCGAGGGAGATAGCTTGGGAGGACTTGCAA
CGGATGTTCACGGATATGGTTGGGTGGAGATAGCGTGATCTTTGACTGTAACAACAATCC
AAGGGACAGCAAAAGACCACGTGTTAATATCTCACGGAGTAGTGCTGCGATGCGTTAGTT
CTC

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2B380JQ 710 0 0
AGCTACTACAACGTCCTCGGTATTCGGAAAGATGCCTCTGTCTCCGATGTCCGCGCTGCT
TACCGTAAGCTCGCCATGAAATGGCATCCGGATAGATACGCGAGGAATCCTGGTGTCGCC
GGAGAAGCCAAACGTCGATTTCAGCAAATCCAAGAAGCCTATTTTGTTTTGAATGACGAG
AATAAGCGCTCGATGTATGACGCTGGACTTTACGATCCCCACGAAGATGTCGACGATGTT
CGTATCTTAATTTATTTCGATCTTCTTCTCATTCATTACGGATTTGTTTAACACGTCGTC
GTTTCGTGATGTTTGATTTATTTCTCAATTGGTGTTTTTCGTTTTAGAATATACCATTCC
CACATCATGTTTATTTTTATTAACTCAAATTTCCCCCGTAAATACTGTGATCAGGACTTT
TGCGACTTCATGCAAGAGATGATCTCCATGATGAACAATGTCAAAGGCGAGGGAGATAGC
TTGG*AGGACTTGCAACGGATGTTCACGGATATGGTTGG*TGGAGATAGCGTGATCTTTG
ACTGTAACAACAATCCAAGGGACAGCAAAAGACCACGTGTTAATATCTCACGGAGTAGTG
CTGCGATGCGTTAGTTTTCTGTTTTGTGTTTGTGTTTGTGTCGTGTCGTTTCGCGTTGAA
CTGTCTCATGCTAAGAAGTCTCAAGTTCTCAATTGTCATTTCAGTGTTTT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL5926Contig1 613 2 1 U
GGAGCTGCGGATCGACGCCGTAGATTATTAATCTTAGGGTGGTTTCCCGAGCCCTCGTAT
CTGAAGCCCATCATCTTCTAGTATATATACAAAAAAAAAGAACCTGTTGTGGAAAATGGA
ACAAGAAGAAGCAGAGGGAAGCACCACCACTGTCGTTACTGCATCAACCTCTGAAGGTTC
GGGTTTAGATCCGATAGCACGAGTGAGGAGGCTCTTGTTCCGCCAGATGCTGGTTGGGAT
CGAAGACGGGAGGTTCTTCCTTGGCAGTTTCCACTGCATTGACAAACAAGGGAACATACT
TCTCCAAGATGCCATGGAGTATCGCAGCGTAAGAAGATCGTCGTCTCCTTCGCCTACCGA
ACAGCGTTGTCTTGGTATGATCCTAATCCCTGCCTCTTGCAGGACGTCTTGCCATGTCGA
TTGCTCTGTCGAGGAACAGCTTTCGCTGATCCAGATTAGAGAGTAGAGAGAGCCTCGAGA
GATTGCGTTAGTGTGTAACAGAACACTAGTCTTTTTATTATGGATTAGGTCTCTTGATTA
TGCATATTCCATGTCAATATGTCATTGTATGTTTCACATACGATTACATTATAAGAAACC
TTTTGGAAATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CO17TF U 1
AF RR2CO17JQ C 15
BS 1 613 RR2CO17TF

RD RR2CO17TF 613 0 0
GGAGCTGCGGATCGACGCCGTAGATTATTAATCTTAGGGTGGTTTCCCGAGCCCTCGTAT
CTGAAGCCCATCATCTTCTAGTATATATACAAAAAAAAAGAACCTGTTGTGGAAAATGGA
ACAAGAAGAAGCAGAGGGAAGCACCACCACTGTCGTTACTGCATCAACCTCTGAAGGTTC
GGGTTTAGATCCGATAGCACGAGTGAGGAGGCTCTTGTTCCGCCAGATGCTGGTTGGGAT
CGAAGACGGGAGGTTCTTCCTTGGCAGTTTCCACTGCATTGACAAACAAGGGAACATACT
TCTCCAAGATGCCATGGAGTATCGCAGCGTAAGAAGATCGTCGTCTCCTTCGCCTACCGA
ACAGCGTTGTCTTGGTATGATCCTAATCCCTGCCTCTTGCAGGACGTCTTGCCATGTCGA
TTGCTCTGTCGAGGAACAGCTTTCGCTGATCCAGATTAGAGAGTAGAGAGAGCCTCGAGA
GATTGCGTTAGTGTGTAACAGAACACTAGTCTTTTTATTATGGATTAGGTCTCTTGATTA
TGCATATTCCATGTCAATATGTCATTGTATGTTTCACATACGATTACATTATAAGAAACC
TTTTGGAAATGCT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2CO17JQ 599 0 0
ACGCCGTAGATTATTAATCTTAGGGTGGTTTCCCGAGCCCTCGTATCTGAAGCCCATCAT
CTTTTAGTATATATACAAAAAAAAAGAACCTGTTGTGGAAAATGGAACAAGAAGAAGCAG
AGGGAAGCACCACCACTGTCGTTACTGCATCAACCTCTGAAGGTTCGGGTTTAGATCCGA
TAGCACGAGTGAGGAGGCTCTTGTTCCGCCAGATGCTGGTTGGGATCGAAGACGGGAGGT
TCTTCCTTGGCAGTTTCCACTGCATTGACAAACAAGGGAACATACTTCTCCAAGATGCCA
TGGAGTATCGCAGCGTAAGAAGATCGTCGTCTCCTTCGCCTACCGAACAGCGTTGTCTTG
GTATGATCCTAATCCCTGCCTCTTGCAGGACGTCTTGCCATGTCGATTGCTCTGTCGAGG
AACAGCTTTCGCTGATCCAGATTAGAGAGTAGAGAGAGCCTCGAGAGATTGCGTTAGTGT
GTAACAGAACACTAGTCTTTTTATTATGGATTAGGTCTCTTGATTATGCATATTCCATGT
CAATATGTCATTGTATGTTTCACATACGATTACATTATAAGAAACCTTTTGGAAATGCT

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL5927Contig1 693 2 5 U
GGAAAGAAAGAGTGATGATCCATAGATGGAGAAGATCAGGAGATTTTATACGATCGGCAT
GCAAATCACTAAGTAGTTTCCGACAAAAACATAACTCAATGTCTCCTTCTGTTTCAGGCT
TTGTGAATCGTTACGAGTCAAAAGGAAAGACCTTTGAGTCAAATGCTGGGAAGGGTCGTA
ACACAGAGCTGCTTGATCATCATCATCATCATCATCATCCATGTCTTGGTGGAAGAAACT
TGTGGACGATGAGGCCGTATAAATCATTTGGGTCGTCATCATCATCAGCCTCAAAAGTCC
AGAGAAACCCATTGTTTTCTTCGTTAGAACCGAGAGATGTTAGCTACTTCAAGGAGATAC
TAGGTGAGAAACACGTGGTTGAAGATGAAGAGAGGCTCGAGACTGCTAATACAGATTGGA
TGCACAAGTACAGAGGATCTAGTAAGCTGATGCTCTTGCCCAAGAACACTGAAGAGGTGT
CTCAGATACTTAAGTATTGTGATTCTAGGAGTTTAGCTGTTGTTCCTCAAGGAGGAAACA
CCGGTCTTGTTGGTGGAAGTGTGCCTGTATTTGATGAGGTGATCATCAATGTTGGTTTGA
TGAATAAAGTCTTGTCCTTTGACGAGGTTAGTGGAGTCTTGGTGTGTGAAGCAGATGCAT
TTTGGAAAATCTGGCAACTTTCTTGACACAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL03TF U 1
AF RR2DP87TF U 36
BS 1 626 RR2BL03TF
BS 627 627 RR2DP87TF
BS 628 668 RR2BL03TF
BS 669 669 RR2DP87TF
BS 670 693 RR2BL03TF

RD RR2BL03TF 693 0 0
GGAAAGAAAGAGTGATGATCCATAGATGGAGAAGATCAGGAGATTTTATACGATCGGCAT
GCAAATCACTAAGTAGTTTCCGACAAAAACATAACTCAATGTCTCCTTCTGTTTCAGGCT
TTGTGAATCGTTACGAGTCAAAAGGAAAGACCTTTGAGTCAAATGCTGGGAAGGGTCGTA
ACACAGAGCTGCTTGATCATCATCATCATCATCATCATCCATGTCTTGGTGGAAGAAACT
TGTGGACGATGAGGCCGTATAAATCATTTGGGTCGTCATCATCATCAGCCTCAAAAGTCC
AGAGAAACCCATTGTTTTCTTCGTTAGAACCGAGAGATGTTAGCTACTTCAAGGAGATAC
TAGGTGAGAAACACGTGGTTGAAGATGAAGAGAGGCTCGAGACTGCTAATACAGATTGGA
TGCACAAGTACAGAGGATCTAGTAAGCTGATGCTCTTGCCCAAGAACACTGAAGAGGTGT
CTCAGATACTTAAGTATTGTGATTCTAGGAGTTTAGCTGTTGTTCCTCAAGGAGGAAACA
CCGGTCTTGTTGGTGGAAGTGTGCCTGTATTTGATGAGGTGATCATCAATGTTGGTTTGA
TGAATAAAGTCTTGTCCTTTGACGAG*TTAGTGGAGTCTTGGTGTGTGAAGCAGATGCAT
TTTGGAAA*TCTGGCAACTTTCTTGACACAAAA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2DP87TF 654 0 0
GG
AGGAGATTTTATACGATCGGCATGCAAATCACTAAGTAGTTTCCGACAAAAACATAACTC
AATGTCTCCTTCTGTTTCAGGCTTTGTGAATCGTTACGAGTCAAAAGGAAAGACCTTTGA
GTCAAATGCTGGGAAGGGTCGTAACACAGAGCTGCTTGATCATCATCATCATCATCATCA
TCCATGTCTTGGTGGAAGAAACTTGTGGACGATGAGGCCGTATAAATCATTTGGGTCGTC
ATCATCATCAGCCTCAAAAGTCCAGAGAAACCCATTGTTTTCTTCGTTAGAACCGAGAGA
TGTTAGCTACTTCAAGGAGATACTAGGTGAGAAACACGTGGTTGAAGATGAAGAGAGGCT
CGAGACTGCTAATACAGATTGGATGCACAAGTACAGAGGATCTAGTAAGCTGATGCTCTT
GCCCAAGAACACTGAAGAGGTGTCTCAGATACTTAAGTATTGTGATTCTAGGAGTTTAGC
TGTTGTTCCTCAAGGAGGAAACACCGGTCTTGTTGGTGGAAGTGTGCCTGTATTTGATGA
GGTGATCATCAATGTTGGTTTGATGAATAAAGTCTTGTCCTTTGACGAGGTTAGTGGAGT
CTTGGTGTGTGAAGCAGATGCATTTTGGAAAATCTGGCAACTTTC
CTTGACA

QA 3 647 3 647
DS 



AS 1 2

CO CL5928Contig1 731 2 2 U
GGAGAAGCAGAGACATTGGTTTCTCTATCAAGACAACAATGGATGAGGAAAGAGAAGGAG
AGATAGAGAAGAAGGAAGAAGAAGGAGAAGTAAAGGAAGGAGTAGCTTCAATAGCTTTAT
TGCCATGTGGTTCTATCTCCGGCCATTTCATCCACATGCCTCTCTCCATCTGTTATGGCC
TCCATGGCACTGAACTGGCTTGTGAGACTGAGTGCAGCCGTGGTGAGGATTATCGGTTGA
TGAAGCTCACCATCATAGACTACAATAGGAAGAAGGAACAAACAGTTGTGGTGGAGTGCA
AAGGCCACGATGCGGCTCGAATTAATGATGTTGAGCATGCTCATGGGTGGGAGGAAGATG
TGATAGGGTTAGTGGAAGAAAAGCACGGGAAGAAGAAAGTATCTGTTTCCTTCGAGTGTG
AGACGTTGAAGGCTGATCAAGCAGCAGAGGACCATATCAGACAGTTTATGCCCAAACTAG
CTGGACTTGATGCTGTTATTAACATTGGACCAATGAAGATCACCGGCCTCGATTTTGCTG
CGGTGGAAGAGGAACGCGCAAACTAGGACAACTTTCAACTCTTTCCTTTTTTGTTTCATC
TCGTAAAACACAATCAGATTTTGTTAAGTGCAAATGCAATCAAGGATCTAGTTTTGTTGA
AAAAGGACTTAGCAGTTGTAATCTTTCAACGCTCTTCTCATCTTAATGCTAATAAGAGGC
TGCAATTGTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA17TF U 1
AF RR2DA17JQ C 1
BS 1 638 RR2DA17TF
BS 639 731 RR2DA17JQ

RD RR2DA17TF 638 0 0
GGAGAAGCAGAGACATTGGTTTCTCTATCAAGACAACAATGGATGAGGAAAGAGAAGGAG
AGATAGAGAAGAAGGAAGAAGAAGGAGAAGTAAAGGAAGGAGTAGCTTCAATAGCTTTAT
TGCCATGTGGTTCTATCTCCGGCCATTTCATCCACATGCCTCTCTCCATCTGTTATGGCC
TCCATGGCACTGAACTGGCTTGTGAGACTGAGTGCAGCCGTGGTGAGGATTATCGGTTGA
TGAAGCTCACCATCATAGACTACAATAGGAAGAAGGAACAAACAGTTGTGGTGGAGTGCA
AAGGCCACGATGCGGCTCGAATTAATGATGTTGAGCATGCTCATGGGTGGGAGGAAGATG
TGATAGGGTTAGTGGAAGAAAAGCACGGGAAGAAGAAAGTATCTGTTTCCTTCGAGTGTG
AGACGTTGAAGGCTGATCAAGCAGCAGAGGACCATATCAGACAGTTTATGCCCAAACTAG
CTGGACTTGATGCTGTTATTAACATTGGACCAATGAAGATCACCGGCCTCGATTTTGCTG
CGGTGGAAGAGGAACGCGCAAACTAGGACAACTTTCAACTCTTTCCTTTTTTGTTTCATC
TCGTAAAACACAATCAGATTTTGTTAAGTGCAAATGCA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2DA17JQ 731 0 0
GGAGAAGCAGAGACATTGGTTTCTCTATCAAGACAACAATGGATGAGGAAAGAGAAGGAG
AGATAGAGAAGAAGGAAGAAGAAGGAGAAGTAAAGGAAGGAGTAGCTTCAATAGCTTTAT
TGCCATGTGGTTCTATCTCCGGCCATTTCATCCACATGCCTCTCTCCATCTGTTATGGCC
TCCATGGCACTGAACTGGCTTGTGAGACTGAGTGCAGCCGTGGTGAGGATTATCGGTTGA
TGAAGCTCACCATCATAGACTACAATAGGAAGAAGGAACAAACAGTTGTGGTGGAGTGCA
AAGGCCACGATGCGGCTCGAATTAATGATGTTGAGCATGCTCATGGGTGGGAGGAAGATG
TGATAGGGTTAGTGGAAGAAAAGCACGGGAAGAAGAAAGTATCTGTTTCCTTCGAGTGTG
AGACGTTGAAGGCTGATCAAGCAGCAGAGGACCATATCAGACAGTTTATGCCCAAACTAG
CTGGACTTGATGCTGTTATTAACATTGGACCAATGAAGATCACCGGCCTCGATTTTGCTG
CGGTGGAAGAGGAACGCGCAAACTAGGACAACTTTCAACTCTTTCCTTTTTTGTTTCATC
TCGTAAAACACAATCAGATTTTGTTAAGTGCAAATGCAATCAAGGATCTAGTTTTGTTGA
AAAAGGACTTAGCAGTTGTAATCTTTCAACGCTCTTCTCATCTTAATGCTAATAAGAGGC
TGCAATTGTGC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL5929Contig1 971 2 2 U
GGGAGACGATCTGGCTGATAATCAGAAATGGCTAAGACAGGGGAAAGCCTGAGAGACAAA
CCAAGATGGAACCTTGGAGGAATGACCGCTCTCGTCACCGGTGGTACCAAAGGCCTTGGG
GAAGCCGTGGTGAAGGAACTAGCCATGTTGGGAGCCAGAGTCCACACGTGCGCCAGAGAC
GAAACTCAGCTTCAAGAAAGCTTACATGAGTGGCAAGCAAACGGGTTTGATGTCACCACT
TCTGTCTGCGACGTTTCTTCTCCTGACCAACGAGAGAAACTCATAGAAACCGTTTCCTCT
GTTTTCCAAGGAAAACTCAACATCTTTGTAAGCAATGTGGGAAGGGGTGTTGTGAAGCCG
ACCATAGAGTGTACATCAGAAGAATTCTCGTTTATAATGGCTACAAATCTGGAGTCAGCA
TTTCATCTAGCACAGCTCGCGCACCCGCTGTTGAAAGCCTCTGGTTCAGGGAACATTGTG
CTCATGTCATCTGTTGCTGGGGTTGTAAATTTGAGTCTTACATCCATCTATGGAGCAACC
AAAGGAGCCATGAATCAGCTAGCGAGAAACTTGGCGTGCGAGTGGGCGAGTGATAGCATA
AGGGTTAACTCTGTTTGTCCATGGTTCATCAAAACTGCCTCAACTAAAGATTTTCTCATT
GGTGAAGTAGAAGAAAAGGTGGAAAGTGTGACACCAATGGGGCGTGTTGGAGAGGCAAAT
GAAGTGTCATCGCTTGTGGCATTTCTCTGTCTTCCTGCAGCTTCTTATATCACTGGGCAG
ACCATCTGCGTTGATGGAGGTTTCACTATCAACGGCTTCTCATTCCCTTAATTACATATA
TGTATAATTGCCAAATTGTAAAATAATATTGGACCATCTGTGTTGATGATGGCCATATTT
ACATATATGATGATTCTCCTCTAATGGTCGTGTTTACATTCAAATATTTAATATATGTTT
CAGATATTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY85TF U 1
AF RR2FY85JQ C 272
BS 1 674 RR2FY85TF
BS 675 971 RR2FY85JQ

RD RR2FY85TF 674 0 0
GGGAGACGATCTGGCTGATAATCAGAAATGGCTAAGACAGGGGAAAGCCTGAGAGACAAA
CCAAGATGGAACCTTGGAGGAATGACCGCTCTCGTCACCGGTGGTACCAAAGGCCTTGGG
GAAGCCGTGGTGAAGGAACTAGCCATGTTGGGAGCCAGAGTCCACACGTGCGCCAGAGAC
GAAACTCAGCTTCAAGAAAGCTTACATGAGTGGCAAGCAAACGGGTTTGATGTCACCACT
TCTGTCTGCGACGTTTCTTCTCCTGACCAACGAGAGAAACTCATAGAAACCGTTTCCTCT
GTTTTCCAAGGAAAACTCAACATCTTTGTAAGCAATGTGGGAAGGGGTGTTGTGAAGCCG
ACCATAGAGTGTACATCAGAAGAATTCTCGTTTATAATGGCTACAAATCTGGAGTCAGCA
TTTCATCTAGCACAGCTCGCGCACCCGCTGTTGAAAGCCTCTGGTTCAGGGAACATTGTG
CTCATGTCATCTGTTGCTGGGGTTGTAAATTTGAGTCTTACATCCATCTATGGAGCAACC
AAAGGAGCCATGAATCAGCTAGCGAGAAACTTGGCGTGCGAGTGGGCGAGTGATAGCATA
AGGGTTAACTCTGTTTGTCCATGGTTCATCAAAACTGCCTCAACTAAAGATTTTCTCATT
GGTGAAGTAGAAGA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2FY85JQ 700 0 0
GAGAGAAACTCATAGAAACCGTTTCCTCTGTTTTCCAAGGAAAACTCAACATCTTTGTAA
GCAATGTGGGAAGGGGTGTTGTGAAGCCGACCATAGAGTGTACATCAGAAGAATTCTCGT
TTATAATGGCTACAAATCTGGAGTCAGCATTTCATCTAGCACAGCTCGCGCACCCGCTGT
TGAAAGCCTCTGGTTCAGGGAACATTGTGCTCATGTCATCTGTTGCTGGGGTTGTAAATT
TGAGTCTTACATCCATCTATGGAGCAACCAAAGGAGCCATGAATCAGCTAGCGAGAAACT
TGGCGTGCGAGTGGGCGAGTGATAGCATAAGGGTTAACTCTGTTTGTCCATGGTTCATCA
AAACTGCCTCAACTAAAGATTTTCTCATTGGTGAAGTAGAAGAAAAGGTGGAAAGTGTGA
CACCAATGGGGCGTGTTGGAGAGGCAAATGAAGTGTCATCGCTTGTGGCATTTCTCTGTC
TTCCTGCAGCTTCTTATATCACTGGGCAGACCATCTGCGTTGATGGAGGTTTCACTATCA
ACGGCTTCTCATTCCCTTAATTACATATATGTATAATTGCCAAATTGTAAAATAATATTG
GACCATCTGTGTTGATGATGGCCATATTTACATATATGATGATTCTCCTCTAATGGTCGT
GTTTACATTCAAATATTTAATATATGTTTCAGATATTAGC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL5930Contig1 646 2 1 U
GAAGGAGGTGGCGCCTTTTATGGACCAAAGATTGATCTTAAGATCGAAGATGCATTGGGA
AGAAAGTGGCAGTGCTCAACCATACAGGTTGACTTTAATCTTCCTCAGAGGTTTGACATT
ACTTATGTGGACACGAACTCGGATAAAACGTCCTATAATGATCCACAGGGCGGTTTTGGG
ATCTTTGGAAAGATTTTTTGGGGTTCTCATTGAACACTACGCAGGGGATTTTCCATTGTG
GCTCTCTCCGGTTCAAGTTCGGGTTCTGCCCGTCACAGACAATCAGTTGGAGTTCTGCAA
GGAAGTGAGTAAGAAGCTGAGAGGTTGTGGAGTGAGAGCTGAGTTGTGCCATGGAGAGAG
GTTGCCAAAGCTCATAAGAAACGCAGAGACGCAGAAGATCCCGTTGATGGCGGTTGTGGG
TCCTAAGGAAGTCGAGACCGGAACTGTTACCGTTAGATCGAGGTTTGGAGGAGAGCTCGA
AACCATTCCTGTTGATGAATTCATCAACAAAATCAACATTGCAGTCGAAACAAGAACTGC
TTTGTAAACTTTATTGTAAGACTAGGACCCATACACATCTCTCTGTTTAAGACTTTGTTC
GTTTGCTTTAAAGATTGAAATGGCCAGCTAAAATCTTTGGTGACGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BH51JQ C 1
AF RR2BH51TF U 1
BS 1 646 RR2BH51TF

RD RR2BH51JQ 646 0 0
GAAGGAGGTGGCGCCTTTTATGGACCAAAGATTGATCTTAAGATCGAAGATGCATTGGGA
AGAAAGTGGCAGTGCTCAACCATACAGGTTGACTTTAATCTTCCTCAGAGGTTTGACATT
ACTTATGTGGACACGAACTCGGATAAAACGTCCTATAATGATCCACAGGGCGGTTTTGGG
ATCTTTGGAAAGATTTTTTGGGGTTCTCATTGAACACTACGCAGGGGATTTTCCATTGTG
GCTCTCTCCGGTTCAAGTTCGGGTTCTGCCCGTCACAGACAATCAGTTGGAGTTCTGCAA
GGAAGTGAGTAAGAAGCTGAGAGGTTGTGGAGTGAGAGCTGAGTTGTGCCATGGAGAGAG
GTTGCCAAAGCTCATAAGAAACGCAGAGACGCAGAAGATCCCGTTGATGGCGGTTGTGGG
TCCTAAGGAAGTCGAGACCGGAACTGTTACCGTTAGATCGAGGTTTGGAGGAGAGCTCGA
AACCATTCCTGTTGATGAATTCATCAACAAAATCAACATTGCAGTCGAAACAAGAACTGC
TTTGTAAACTTTATTGTAAGACTAGGACCCATACACATCTCTCTGTTTAAGACTTTGTTC
GTTTGCTTTAAAGATTGAAATGGCCAGCTAAAATCTTTGGTGACGC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2BH51TF 646 0 0
GAAGGAGGTGGCGCCTTTTATGGACCAAAGATTGATCTTAAGATCGAAGATGCATTGGGA
AGAAAGTGGCAGTGCTCAACCATACAGGTTGACTTTAATCTTCCTCAGAGGTTTGACATT
ACTTATGTGGACACGAACTCGGATAAAACGTCCTATAATGATCCACAGGGCGGTTTTGGG
ATCTTTGGAAAGATTTTTTGGGGTTCTCATTGAACACTACGCAGGGGATTTTCCATTGTG
GCTCTCTCCGGTTCAAGTTCGGGTTCTGCCCGTCACAGACAATCAGTTGGAGTTCTGCAA
GGAAGTGAGTAAGAAGCTGAGAGGTTGTGGAGTGAGAGCTGAGTTGTGCCATGGAGAGAG
GTTGCCAAAGCTCATAAGAAACGCAGAGACGCAGAAGATCCCGTTGATGGCGGTTGTGGG
TCCTAAGGAAGTCGAGACCGGAACTGTTACCGTTAGATCGAGGTTTGGAGGAGAGCTCGA
AACCATTCCTGTTGATGAATTCATCAACAAAATCAACATTGCAGTCGAAACAAGAACTGC
TTTGTAAACTTTATTGTAAGACTAGGACCCATACACATCTCTCTGTTTAAGACTTTGTTC
GTTTGCTTTAAAGATTGAAATGGCCAGCTAAAATCTTTGGTGACGC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL5931Contig1 681 2 6 U
GGGCTACGATGCTGCTGTGATCGAAATGGCGTCGTCTTCTCCAACTCAGCGTACCCACGT
CCCGATCCCTCCTGAGCCAGGAGGAAGGTCACTGACGCAAGATGCTAATGAGCCACCTGT
TCCTATTCACATAGTGACAGAGCCTTTGCAGCTTCCCGCTGATTTCTTAAACCCTTCTCC
TGAAAAGAAGCTGGTCGTTGGTTTTGACTGCGAGGGTGTTGACCTCTGCCGACATGGCAA
GCTTTGTATCATGCAGATTGCATTCCCTAATGCAATATACCTGGTTGATATCATCCAAGG
TGGAGAGGTGCTTATGAGAGCATGTAAGCCTGCACTCGAGTCTACTTACATCACCAAAGT
CATTCACGATTGCAAACGTGACAGTGAGGCCTTGTACTTTCAGTTTGGGATAAGGTTGCA
CAATGTTGTGGACACTCAAATTGCTTTTTCTCTGATAGAAGAACAAGAAGGCAGGAGGAG
ACCTCTAGATGACTACATATCGTTTGTTTCCCTCCTTGCTGATCCACGCTACTGCGGCAT
ATCTTATGAAGAGAAAGAAGAAGTTCGTGTGCTCATGCGACAGGACCCAAAGTTCTGGAC
ATACAGGCCAATGACTGAGCTCATGATCCGTGCAGCCGCAGATGATGTCCGCTTCCTTCT
GTATCTCTATCACAAATGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR18TF U 1
AF RR2EO69TF U 57
BS 1 552 RR2GR18TF
BS 553 553 RR2EO69TF
BS 554 606 RR2GR18TF
BS 607 607 RR2EO69TF
BS 608 668 RR2GR18TF
BS 669 681 RR2EO69TF

RD RR2GR18TF 668 0 0
GGGCTACGATGCTGCTGTGATCGAAATGGCGTCGTCTTCTCCAACTCAGCGTACCCACGT
CCCGATCCCTCCTGAGCCAGGAGGAAGGTCACTGACGCAAGATGCTAATGAGCCACCTGT
TCCTATTCACATAGTGACAGAGCCTTTGCAGCTTCCCGCTGATTTCTTAAACCCTTCTCC
TGAAAAGAAGCTGGTCGTTGGTTTTGACTGCGAGGGTGTTGACCTCTGCCGACATGGCAA
GCTTTGTATCATGCAGATTGCATTCCCTAATGCAATATACCTGGTTGATATCATCCAAGG
TGGAGAGGTGCTTATGAGAGCATGTAAGCCTGCACTCGAGTCTACTTACATCACCAAAGT
CATTCACGATTGCAAACGTGACAGTGAGGCCTTGTACTTTCAGTTTGGGATAAGGTTGCA
CAATGTTGTGGACACTCAAATTGCTTTTTCTCTGATAGAAGAACAAGAAGGCAGGAGGAG
ACCTCTAGATGACTACATATCGTTTGTTTCCCTCCTTGCTGATCCACGCTACTGCGGCAT
ATCTTATGAAGA*AAAGAAGAAGTTCGTGTGCTCATGCGACAGGACCCAAAGTTCTGGAC
ATACAG*CCAATGACTGAGCTCATGATCCGTGCAGCCGCAGATGATGTCCGCTTCCTTCT
GTATCTCT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2EO69TF 625 0 0
G
CGTCCCGATCCCTCCTGAGCCAGGAGGAAGGTCACTGACGCAAGATGCTAATGAGCCACC
TGTTCCTATTCACATAGTGACAGAGCCTTTGCAGCTTCCCGCTGATTTCTTAAACCCTTC
TCCTGAAAAGAAGCTGGTCGTTGGTTTTGACTGCGAGGGTGTTGACCTCTGCCGACATGG
CAAGCTTTGTATCATGCAGATTGCATTCCCTAATGCAATATACCTGGTTGATGTCATCCA
AGGTGGAGAGGTGCTTATGAGAGCATGTAAGCCTGCACTCGAGTCTACTTACATCACCAA
AGTCATTCACGATTGCAAACGTGACAGTGAGGCCTTGTACTTTCAGTTTGGGATAAGGTT
GCACAATGTTGTGGACACTCAAATTGCTTTTTCTCTGATAGAAGAACAAGAAGGCAGGAG
GAGACCTCTAGATGACTACATATCGTTTGTTTCCCTCCTTGCTGATCTACGCTACTGCGG
CATATCTTATGAAGAGAAAGAAGAAGTTCGTGTGCTCATGCGACAGGACCCAAAGTTCTG
GACATACAGGCCAATGACTGAGCTCATGATCCGTGCAGCCGCAGATGATGTCCGCTTCCT
TCTGTATCTCTATCACAAATGATG

QA 2 625 2 625
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5933Contig1 625 2 1 U
TGCAAAAGGCTGCCTTTGTACCACAGCCTGAGAATATACATGACACCAGCTATTTTGTAT
CACGGTTCGGTGAAAAGAGTTGCAGTGATTCTGATACTGACAAGGAAAGTGAATCATATC
CAAACTCAGGAGACGAGTTGGATGAATGCACCAACCTGGCCGACTTTGATTCTCCACCTT
ACTATCTCTCCTTCATAAACTTTTCTTTCAAGAATTTGTCACAATTCGCTTCGATCAATC
ATGATGTGTTATTGCAAAAGGATCCAACCAAAGGAGGAGGAGCCTCACCTTTTAATGGCC
ATGGAACGTAGAGCTTTGGTACAATCGTCAAAGCTGGCTTTAGTCAACGGGTTGGTCTGG
TTTGCACCTGCTTTGACGTTTGTAGCTGCTGCTGCTGCAACTTACTCTCCCTTTTTTTCT
ATGCGAGTTCGTTACCTTAATGGTTTAGGGTAACTATTTATGCAGTTTTGTCATAAAATC
ATTTGGAATGGTTTCAAATGCAAATCTCATAGCTAATTAATAGTGTGGCAACAAAACTGG
CGTACCCGCCCACAGCACATATCTATTAGATACACATTTGTATTATTAGATTGGTGTATA
TTTGAGGGTGATGAAAATAAAAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EL94TF U 1
AF RR2EL94JQ C 32
BS 1 625 RR2EL94TF

RD RR2EL94TF 625 0 0
TGCAAAAGGCTGCCTTTGTACCACAGCCTGAGAATATACATGACACCAGCTATTTTGTAT
CACGGTTCGGTGAAAAGAGTTGCAGTGATTCTGATACTGACAAGGAAAGTGAATCATATC
CAAACTCAGGAGACGAGTTGGATGAATGCACCAACCTGGCCGACTTTGATTCTCCACCTT
ACTATCTCTCCTTCATAAACTTTTCTTTCAAGAATTTGTCACAATTCGCTTCGATCAATC
ATGATGTGTTATTGCAAAAGGATCCAACCAAAGGAGGAGGAGCCTCACCTTTTAATGGCC
ATGGAACGTAGAGCTTTGGTACAATCGTCAAAGCTGGCTTTAGTCAACGGGTTGGTCTGG
TTTGCACCTGCTTTGACGTTTGTAGCTGCTGCTGCTGCAACTTACTCTCCCTTTTTTTCT
ATGCGAGTTCGTTACCTTAATGGTTTAGGGTAACTATTTATGCAGTTTTGTCATAAAATC
ATTTGGAATGGTTTCAAATGCAAATCTCATAGCTAATTAATAGTGTGGCAACAAAACTGG
CGTACCCGCCCACAGCACATATCTATTAGATACACATTTGTATTATTAGATTGGTGTATA
TTTGAGGGTGATGAAAATAAAAGAG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2EL94JQ 594 0 0
GAATATACATGACACCAGCTATTTTGTATCACGGTTCGGTGAAAAGAGTTGCAGTGATTC
TGATACTGACAAGGAAAGTGAATCATATCCAAACTCAGGAGACGAGTTGGATGAATGCAC
CAACCTGGCCGACTTTGATTCTCCACCTTACTATCTCTCCTTCATAAACTTTTCTTTCAA
GAATTTGTCACAATTCGCTTCGATCAATCATGATGTGTTATTGCAAAAGGATCCAACCAA
AGGAGGAGGAGCCTCACCTTTTAATGGCCATGGAACGTAGAGCTTTGGTACAATCGTCAA
AGCTGGCTTTAGTCAACGGGTTGGTCTGGTTTGCACCTGCTTTGACGTTTGTAGCTGCTG
CTGCTGCAACTTACTCTCCCTTTTTTTCTATGCGAGTTCGTTACCTTAATGGTTTAGGGT
AACTATTTATGCAGTTTTGTCATAAAATCATTTGGAATGGTTTCAAATGCAAATCTCATA
GCTAATTAATAGTGTGGCAACAAAACTGGCGTACCCGCCCACAGCACATATCTATTAGAT
ACACATTTGTATTATTAGATTGGTGTATATTTGAGGGTGATGAAAATAAAAGAG

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

CO CL5934Contig1 1054 2 2 U
GGAAGCCTTGCCAAACTCGAAATGGAAGGTTGCTCCAAGAACGAGATGAGATTAACCAAC
AGTGCTTCGCAAAAGAGGCAACGTACTTCCACAGAGTCTGAGGAGGAGAAGAAGAAACGC
ACCGGGACGCTGCTGGATCTGGATGCTACGGACTGTCCCATTTGCTTCGGTTCCCTCACC
ATTCCCATCTTTCAGCGTGAGAATGGTCATATTGCATGCTCTACTTGCTGCGGAAAGCTG
AGTGCAAAATGTGCAACATGCTCCTTAACCATGCTTTCCCGCAACAGAGCTTTGGAACGG
ATTCTTGAGCTGCTCACAGTTCCATGTCCGAATGATGGCTGCTCCGAGACTTTCGCTTTT
GCTGAAACATCAACACATGTAAAGCACTGTGCTTACACCCACCGTCCTTGCCCTTTTAGC
CGCTGCGGCTTTGTTTGCTCCTTCAAGGATTTATATGAACACTGCAAACATGCTAAACAC
TGCAAGTCCGCGCACACGTTTGAATGTGGAAGACGCATGGGTATAAGACCTTTAAATGGT
AAGAGGATCATTCTCAAGGAAGAGACTACAGAAGGAGAAGGAGAAATTGTGGTTGTGGAG
TGTTTTGAGATGCATCAAGGTCGAATAATATATGCTAGCTGTATTGGACCAGGAACAGAC
GAGTACTCCTGCAAATTTGATCTCTATCCAGCTTCGGGTAAGCGTTTGTCTTCTGAATTA
AAACTCGAGAGAGTCCGTGAAGTAAGCGATGAACTACCAGGTGGTTCTGTTATGTTTGTT
CCTTCATTCACGTGCCCTGACTACAAGTTTTTCATAACCATCATCAAGCGTGGAAACTTA
CTAGGATCGGATCATGAAGAAGCTACTAGTTCTTGACTCATAAGCCACACTTGCCTACTC
TATGTTTGTGCTTAAGAGTTTGAAAAAAGAGCTTTTGAGTTTAGTTATCGGAAATGTATA
TCTAAATGCAACATTACTTTTGTTTATTAGGTTTCCTCTGTAAACTATATCATCTAACAC
TTTAAAAACTAATGTGTGATGTGGACTTAAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ71TF U 1
AF RR2BJ71JQ C 284
BS 1 873 RR2BJ71TF
BS 874 1054 RR2BJ71JQ

RD RR2BJ71TF 881 0 0
GGAAGCCTTGCCAAACTCGAAATGGAAGGTTGCTCCAAGAACGAGATGAGATTAACCAAC
AGTGCTTCGCAAAAGAGGCAACGTACTTCCACAGAGTCTGAGGAGGAGAAGAAGAAACGC
ACCGGGACGCTGCTGGATCTGGATGCTACGGACTGTCCCATTTGCTTCGGTTCCCTCACC
ATTCCCATCTTTCAGCGTGAGAATGGTCATATTGCATGCTCTACTTGCTGCGGAAAGCTG
AGTGCAAAATGTGCAACATGCTCCTTAACCATGCTTTCCCGCAACAGAGCTTTGGAACGG
ATTCTTGAGCTGCTCACAGTTCCATGTCCGAATGATGGCTGCTCCGAGACTTTCGCTTTT
GCTGAAACATCAACACATGTAAAGCACTGTGCTTACACCCACCGTCCTTGCCCTTTTAGC
CGCTGCGGCTTTGTTTGCTCCTTCAAGGATTTATATGAACACTGCAAACATGCTAAACAC
TGCAAGTCCGCGCACACGTTTGAATGTGGAAGACGCATGGGTATAAGACCTTTAAATGGT
AAGAGGATCATTCTCAAGGAAGAGACTACAGAAGGAGAAGGAGAAATTGTGGTTGTGGAG
TGTTTTGAGATGCATCAAGGTCGAATAATATATGCTAGCTGTATTGGACCAGGAACAGAC
GAGTACTCCTGCAAATTTGATCTCTATCCAGCTTCGGGTAAGCGTTTGTCTTCTGAATTA
AAACTCGAGAGAGTCCGTGAAGTAAGCGATGAACTACCAGGTGGTTCTGTTATGTTTGTT
CCTTCATTCACGTGCCCTGACTACAAGTTTTTCATAACCATCATCAAGCGTGGAAACTTA
CTAGGATCGGATCATGAAGAAGCTACTAGTTCT
GACTCATA

QA 1 873 1 873
DS 

RD RR2BJ71JQ 771 0 0
ACAGAGCTTTGGAACGGATTCTTGAGCTGCTCACAGTTCCATGTCCGAATGATGGCTGCT
CCGAGACTTTCGCTTTTGCTGAAACATCAACACATGTAAAGCACTGTGCTTACACCCACC
GTCCTTGCCCTTTTAGCCGCTGCGGCTTTGTTTGCTCCTTCAAGGATTTATATGAACACT
GCAAACATGCTAAACACTGCAAGTCCGCGCACACGTTTGAATGTGGAAGACGCATGGGTA
TAAGACCTTTAAATGGTAAGAGGATCATTCTCAAGGAAGAGACTACAGAAGGAGAAGGAG
AAATTGTGGTTGTGGAGTGTTTTGAGATGCATCAAGGTCGAATAATATATGCTAGCTGTA
TTGGACCAGGAACAGACGAGTACTCCTGCAAATTTGATCTCTATCCAGCTTCGGGTAAGC
GTTTGTCTTCTGAATTAAAACTCGAGAGAGTCCGTGAAGTAAGCGATGAACTACCAGGTG
GTTCTGTTATGTTTGTTCCTTCATTCACGTGCCCTGACTACAAGTTTTTCATAACCATCA
TCAAGCGTGGAAACTTACTAGGATCGGATCATGAAGAAGCTACTAGTTCTTGACTCATAA
GCCACACTTGCCTACTCTATGTTTGTGCTTAAGAGTTTGAAAAAAGAGCTTTTGAGTTTA
GTTATCGGAAATGTATATCTAAATGCAACATTACTTTTGTTTATTAGGTTTCCTCTGTAA
ACTATATCATCTAACACTTTAAAAACTAATGTGTGATGTGGACTTAAGTTT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL5935Contig1 1046 2 4 U
ATTGATAGCAACACTTCCTCTTGAGGTTCGAGGTAAAATAGGTGGCTTCATAATGGGCGT
GTTTGCTGTATTTCAAGATTTGGATTTCAGTTTCATGGAGATGAATCCTTTTACGCTAGT
CGATGCAGAGCCATATCCTCTCGACATGAGGGGAGAGTTAGATGACACATCTGCCTTCAA
AAATTTCAACAAGTGGGGAGACATTGAGTTTCCTCTGCCATTTGGAAGGGTACTCAGTCC
AACGGAGAGCTTCATCCATGGTTTAGATGAGAAGACAAGTGCTTCTTTGAAGTTCACTTT
TCTGAATCCTAAAGGTCACATTTGGACTATGGTAGCTGGAGGCGGTGCTAGCGTCATATA
CGCTGATACGGTTGGAGATTTAGGCTACGCGTCAGAGCTCGGGAACTACGCAGAGTATAG
TGGAGCGCCTAATGAGGAAGAGGTGTTACAGTACGCTAGAGTTGTCATTGATTGTGCTAC
TGCTGATCCCGATGGGCGCAAACGAGCTTTGCTCATTGGAGGTGGCATTGCCAACTTCAC
TGACGTTGCAGCTACTTTCAACGGTATCATCCGCGCTCTAAGAGAAAAGGAAACAAGACT
GAAGGCATCAAGAATGCACATTTACGTAAGAAGAGGTGGTCCTAATTACCAGACTGGTTT
GGCTAGAATGCGTGCTCTTGGAGAGGAACTCGGTGTTCCTCTTGAGGTATATGGACCAGA
AGCAACGATGACAGGAATTTGCAAACGAGCCATTGACTGCATCATGTTGCCTGATGGGTA
ATCAACCAAACCTGAGATTTTTTTTTCAGTTGAAAAAAGCAGAACATACGTGGAGCTGGA
GACTGGGAGGAGTGTGAGTGTGTTGATTATTGTTTTTCACCTCTCTTTTTACATAAGAAA
TTGAAACGCTCTTTGAAACTTTTTATTTTGTGAATGTGTGAATTTGAAAACCATATCATT
GTGTTGCATGTGTAAAATTTGTAATCAAAACAGTCAAGATCCTATTTTGGAATGTACAAA
TAAGATATATAACTGCTTTGATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA14TF U 1
AF RR2BA14JQ C 387
BS 1 706 RR2BA14TF
BS 707 707 RR2BA14JQ
BS 708 732 RR2BA14TF
BS 733 1046 RR2BA14JQ

RD RR2BA14TF 732 0 0
ATTGATAGCAACACTTCCTCTTGAGGTTCGAGGTAAAATAGGTGGCTTCATAATGGGCGT
GTTTGCTGTATTTCAAGATTTGGATTTCAGTTTCATGGAGATGAATCCTTTTACGCTAGT
CGATGCAGAGCCATATCCTCTCGACATGAGGGGAGAGTTAGATGACACATCTGCCTTCAA
AAATTTCAACAAGTGGGGAGACATTGAGTTTCCTCTGCCATTTGGAAGGGTACTCAGTCC
AACGGAGAGCTTCATCCATGGTTTAGATGAGAAGACAAGTGCTTCTTTGAAGTTCACTTT
TCTGAATCCTAAAGGTCACATTTGGACTATGGTAGCTGGAGGCGGTGCTAGCGTCATATA
CGCTGATACGGTTGGAGATTTAGGCTACGCGTCAGAGCTCGGGAACTACGCAGAGTATAG
TGGAGCGCCTAATGAGGAAGAGGTGTTACAGTACGCTAGAGTTGTCATTGATTGTGCTAC
TGCTGATCCCGATGGGCGCAAACGAGCTTTGCTCATTGGAGGTGGCATTGCCAACTTCAC
TGACGTTGCAGCTACTTTCAACGGTATCATCCGCGCTCTAAGAGAAAAGGAAACAAGACT
GAAGGCATCAAGAATGCACATTTACGTAAGAAGAGGTGGTCCTAATTACCAGACTGGTTT
GGCTAGAATGCGTGCTCTTGGAGAGGAACTCGGTGTTCCTCTTGAG*TATATGGACCAGA
AGCAACGATGAC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2BA14JQ 660 0 0
ACGCGTCAGAGCTCGGGAACTACGCAGAGTATAGTGGAGCGCCTAATGAGGAAGAGGTGT
TACAGTACGCTAGAGTTGTCATTGATTGTGCTACTGCTGATCCCGATGGGCGCAAACGAG
CTTTGCTCATTGGAGGTGGCATTGCCAACTTCACTGACGTTGCAGCTACTTTCAACGGTA
TCATCCGCGCTTTAAGAGAAAAGGAAACAAGACTGAAGGCATCAAGAATGCACATTTACG
TAAGAAGAGGTGGTCCTAATTACCAGACTGGTTTGGCTAGAATGCGTGTTCTTGGAGAGG
AACTCGGTGTTCCTCTTGAGGTATATGGACCAGAAGCAACGATGACAGGAATTTGCAAAC
GAGCCATTGACTGCATCATGTTGCCTGATGGGTAATCAACCAAACCTGAGATTTTTTTTT
CAGTTGAAAAAAGCAGAACATACGTGGAGCTGGAGACTGGGAGGAGTGTGAGTGTGTTGA
TTATTGTTTTTCACCTCTCTTTTTACATAAGAAATTGAAACGCTCTTTGAAACTTTTTAT
TTTGTGAATGTGTGAATTTGAAAACCATATCATTGTGTTGCATGTGTAAAATTTGTAATC
AAAACAGTCAAGATCCTATTTTGGAATGTACAAATAAGATATATAACTGCTTTGATTTTT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL5936Contig1 1059 2 8 U
GAAAAGGGTGAGATGCATGTGGTTCCTGTTCAGCTACCATTAATTACTGCTTTGAGTAGA
CTAAGGATATCGGTTCCGTCTGATCTTCGGCCACTAGAAGCAAGACAAAGCATACTACTT
GCAGTACAGGAGTTGTCGAGTCGCTTCCCTTTAGGGTTCCCAAAACTCCATCCAGTCAAG
GACATGAATATCCAAGATACAGAGATAGTAGAGCTGGTCAGCCAAATTGAAGAAGTTGAG
CAGAAGTTACTTTCTCATCCGATGCACAAGTCTGAAGATGATCTTCAAATGAAGAGTTTC
CAGAGGATAGCAGAGGTGAATTATGAAATTCAGCAGTTCAAGTCGAAAATGCGTGATTCC
CAGCTTCAAAGGTTTAGAGATGAGCTTAGGAACCGATCTCGGGTATTAAAGAAACTTGGA
CACATTGATGCTGATGGTGTCGTCCTGGTAAAGGGACGAGCTGCCTGCTTGATAGACACC
GGGGATGAATTGCTTGTCACTGAACTTATGTTTAATGGTACTTTTAATGATCTGGATCAT
CACCAAATAGCAGCCCTTGCAAGCTGTTTCATTCCTGTAGATAAATCAAATGAAAAGGTA
GAGCTAAGAAATGAACTTAATAAACCGTTGCAGCAGCTCCAAGATAGTGCACGGAAAATT
GCAGAGATACAACATGAATGCAAACTGGAAATTGACGTCGAAGAGTATGTAGAATCCACC
AACAGGCCTTCCCTAATGGACGTTATCTACTGTTGGTCAAAGGGTTCAACATTTGCAGAG
ATAATGAATATGACTGATATATTCGAGGGTAGTATCATTAGGAGCGCCAGAAGGCTCGAC
GAGTTTCTGAACCAGCTTCGACTTGCAGCGGAAGCAGTTGGAGAGAACAATTTGTCGAGC
AAGTTTGCAGCTGCTAGCGAGAGCTTGCGAAGAGGGATTATGTTTGCGAATTCACTTTAT
TTATAAGTACTCTTTTGCAGAGTTTTTAGCTTCGCTGTATTGGGTAGCCATGGGGACAAT
ATGTAACATGACTTAACTTAGATATGGTTGTTTGTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV14TF U 1
AF RR2EV14JQ C 156
BS 1 191 RR2EV14TF
BS 192 192 RR2EV14JQ
BS 193 725 RR2EV14TF
BS 726 726 RR2EV14JQ
BS 727 765 RR2EV14TF
BS 766 766 RR2EV14JQ
BS 767 795 RR2EV14TF
BS 796 1059 RR2EV14JQ

RD RR2EV14TF 795 0 0
GAAAAGGGTGAGATGCATGTGGTTCCTGTTCAGCTACCATTAATTACTGCTTTGAGTAGA
CTAAGGATATCGGTTCCGTCTGATCTTCGGCCACTAGAAGCAAGACAAAGCATACTACTT
GCAGTACAGGAGTTGTCGAGTCGCTTCCCTTTAGGGTTCCCAAAACTCCATCCAGTCAAG
GACATGAATATTCAAGATACAGAGATAGTAGAGCTGGTCAGCCAAATTGAAGAAGTTGAG
CAGAAGTTACTTTCTCATCCGATGCACAAGTCTGAAGATGATCTTCAAATGAAGAGTTTC
CAGAGGATAGCAGAGGTGAATTATGAAATTCAGCAGTTCAAGTCGAAAATGCGTGATTCC
CAGCTTCAAAGGTTTAGAGATGAGCTTAGGAACCGATCTCGGGTATTAAAGAAACTTGGA
CACATTGATGCTGATGGTGTCGTCCTGGTAAAGGGACGAGCTGCCTGCTTGATAGACACC
GGGGATGAATTGCTTGTCACTGAACTTATGTTTAATGGTACTTTTAATGATCTGGATCAT
CACCAAATAGCAGCCCTTGCAAGCTGTTTCATTCCTGTAGATAAATCAAATGAAAAGGTA
GAGCTAAGAAATGAACTTAATAAACCGTTGCAGCAGCTCCAAGATAGTGCACGGAAAATT
GCAGAGATACAACATGAATGCAAACTGGAAATTGACGTCGAAGAGTATGTAGAATCCACC
AACAG*CCTTCCCTAATGGACGTTATCTACTGTTGGTCAAAGGGT*CAACATTTGCAGAG
ATAATGAATATGACT

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2EV14JQ 904 0 0
TAGGTCCCAAAC
CCATCCAGTCAAGGACATGAATATC**AGATACAGAGATAGTAGAGCTG*TCAGCCAAAT
*GAAGAAGT*GAGCAGAAGT*ACTTTCTCATCCGATGCACAAGTCTGAAGATGATCTTCA
AATGAAGAGTTTCCAGAGGATAGCAGAGGTGAATTATGAAATTCAGCAGTTCAAGTCGAA
AATGCGTGATTCCCAGCTTCAAAGGTTTAGAGATGAGCTTAGGAACCGATCTCGGGTATT
AAAGAAACTTGGACACATTGATGCTGATGGTGTCGTCCTGGTAAAGGGACGAGCTGCCTG
CTTGATAGACACCGGGGATGAATTGCTTGTCACTGAACTTATGTTTAATGGTACTTTTAA
TGATCTGGATCATCACCAAATAGCAGCCCTTGCAAGCTGTTTCATTCCTGTAGATAAATC
AAATGAAAAGGTAGAGCTAAGAAATGAACTTAATAAACCGTTGCAGCAGCTCCAAGATAG
TGCACGGAAAATTGCAGAGATACAACATGAATGCAAACTGGAAATTGACGTCGAAGAGTA
TGTAGAATCCACCAACAGGCCTTCCCTAATGGACGTTATCTACTGTTGGTCAAAGGGTTC
AACATTTGCAGAGATAATGAATATGACTGATATATTCGAGGGTAGTATCATTAGGAGCGC
CAGAAGGCTCGACGAGTTTCTGAACCAGCTTCGACTTGCAGCGGAAGCAGTTGGAGAGAA
CAATTTGTCGAGCAAGTTTGCAGCTGCTAGCGAGAGCTTGCGAAGAGGGATTATGTTTGC
GAATTCACTTTATTTATAAGTACTCTTTTGCAGAGTTTTTAGCTTCGCTGTATTGGGTAG
CCATGGGGACAATATGTAACATGACTTAACTTAGATATGGTTGTTTGTACTC

QA 13 904 13 904
DS 



AS 1 2

CO CL5937Contig1 753 2 1 U
GGTTGGCTACTAGGCAAGCTATTTGTGTGTGCTCTTTTCCTTGTTCTTGGTTTTGTCCCA
CGAGGTTTTCCGGAGGAAGGTTTTTAACGAGGCTACAGCTAGCTTACATATCACCTGAGT
GCATTCTCGGTCCAAGACTAAGAAGAAGCCATTTCTTCTTACTTCCCTTATTTGAACCAT
AGTTTATTTTAAGTATGACATTTTCGTAGAAGGAGCATGTTCCTTTATATTTGTGTTGCG
CAACCTTTTAGTTTTTCAGACTTGATATTTTATAAAACTTTTCTTTTCAAGAAAACCTAG
TTCTCTCTCTCAAGAAGAACAGCCGCCACCTCCTTGCCTTGTGAGACCAGCTCCTCCACG
GCTTGAGGTTCCTTGTGTTGTATCACGAGCCTTCCATCTCTCGTGTGGTGCACTTCAATC
CCCCTGGTTCCATCTCTCACGGTTTCTCTTGGTTGATTAGATCAAACAAAAGAACCACCT
CTTGATCTAGATCGGCTCCAACTCTCTTGCTTGGATCATACATCCTTCGTCAGCCTAGGC
TTGTATCATTTCTGGTATCAGAGCTGAAGTTCCTTCAGCATCAGGTTGTATCTATCTTGT
TACTTGTTCATCTCGATTTAGTTCATTTTGATTCATCCATTCGTTTCAAAAAAAATATAA
AGAACTCGTTTGTTTCATCTCATCTAGTGTTTTGCATTTTCATAACTTGTTTTGCATCGT
TGCATGATTCTGAATCCTTTGCTAGATAGATCA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AM02JQ C 1
AF RR2AM02TF U 1
BS 1 753 RR2AM02TF

RD RR2AM02JQ 753 0 0
GGTTGGCTACTAGGCAAGCTATTTGTGTGTGCTCTTTTCCTTGTTCTTGGTTTTGTCCCA
CGAGGTTTTCCGGAGGAAGGTTTTTAACGAGGCTACAGCTAGCTTACATATCACCTGAGT
GCATTCTCGGTCCAAGACTAAGAAGAAGCCATTTCTTCTTACTTCCCTTATTTGAACCAT
AGTTTATTTTAAGTATGACATTTTCGTAGAAGGAGCATGTTCCTTTATATTTGTGTTGCG
CAACCTTTTAGTTTTTCAGACTTGATATTTTATAAAACTTTTCTTTTCAAGAAAACCTAG
TTCTCTCTCTCAAGAAGAACAGCCGCCACCTCCTTGCCTTGTGAGACCAGCTCCTCCACG
GCTTGAGGTTCCTTGTGTTGTATCACGAGCCTTCCATCTCTCGTGTGGTGCACTTCAATC
CCCCTGGTTCCATCTCTCACGGTTTCTCTTGGTTGATTAGATCAAACAAAAGAACCACCT
CTTGATCTAGATCGGCTCCAACTCTCTTGCTTGGATCATACATCCTTCGTCAGCCTAGGC
TTGTATCATTTCTGGTATCAGAGCTGAAGTTCCTTCAGCATCAGGTTGTATCTATCTTGT
TACTTGTTCATCTCGATTTAGTTCATTTTGATTCATCCATTCGTTTCAAAAAAAATATAA
AGAACTCGTTTGTTTCATCTCATCTAGTGTTTTGCATTTTCATAACTTGTTTTGCATCGT
TGCATGATTCTGAATCCTTTGCTAGATAGATCA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2AM02TF 753 0 0
GGTTGGCTACTAGGCAAGCTATTTGTGTGTGCTCTTTTCCTTGTTCTTGGTTTTGTCCCA
CGAGGTTTTCCGGAGGAAGGTTTTTAACGAGGCTACAGCTAGCTTACATATCACCTGAGT
GCATTCTCGGTCCAAGACTAAGAAGAAGCCATTTCTTCTTACTTCCCTTATTTGAACCAT
AGTTTATTTTAAGTATGACATTTTCGTAGAAGGAGCATGTTCCTTTATATTTGTGTTGCG
CAACCTTTTAGTTTTTCAGACTTGATATTTTATAAAACTTTTCTTTTCAAGAAAACCTAG
TTCTCTCTCTCAAGAAGAACAGCCGCCACCTCCTTGCCTTGTGAGACCAGCTCCTCCACG
GCTTGAGGTTCCTTGTGTTGTATCACGAGCCTTCCATCTCTCGTGTGGTGCACTTCAATC
CCCCTGGTTCCATCTCTCACGGTTTCTCTTGGTTGATTAGATCAAACAAAAGAACCACCT
CTTGATCTAGATCGGCTCCAACTCTCTTGCTTGGATCATACATCCTTCGTCAGCCTAGGC
TTGTATCATTTCTGGTATCAGAGCTGAAGTTCCTTCAGCATCAGGTTGTATCTATCTTGT
TACTTGTTCATCTCGATTTAGTTCATTTTGATTCATCCATTCGTTTCAAAAAAAATATAA
AGAACTCGTTTGTTTCATCTCATCTAGTGTTTTGCATTTTCATAACTTGTTTTGCATCGT
TGCATGATTCTGAATCCTTTGCTAGATAGATCA

QA 1 753 1 753
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5939Contig1 602 2 2 U
GGGAGATTGATTCCCATTGATCCAGCTGCTCCTGTACTCTCGTTCTTCCCCAGCAAAGGA
AACAGTTTTTTGAGAAAATGGCATCAAAGCTGCTACAGCTGAAATCAAAAGCGTGTGAAG
CATCAAAGTTTGTGTCCAAGCACGGGACTAGTTACTACAAACAGTTGCTGGAGAAGAACA
AGCATTATATCCAGGAGCCAGCCACTGTTGAGAAATGCCAAGACTTGTCTAAGCAGCTTC
TCTACACTCGTCTTGCTAGCATTCCTGGACGTTCTGAGTCGTTGTGGAAGGAAGTAGATC
ACGTGAAGGGGTTGTGGAAGAACCGGGCAGATCTGAAGGTTGAAGATGCTGGGATTGCAG
CACTTTTTGGTCTTGAATGCTTCGCTTGGTACTGTGCGGGTGAGATCGTTGGAAGAGGCT
TCACTTTCACCGGCTACTACCCTTGAAGCAAACAAAAAGCAAACATGCCTTTCATTTCAT
GACTGTGATATTTTAGCAAAAGTTATAAATTTTTATTTCTGTCTTTGGATAGTTAAGTAG
ACACTTAACTAATCATTATATTACTCATGCCTAGCGCTTAATAATAATATCAGTCGACAA
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2C832JQ C 1
AF RR2C832TF U 31
BS 1 30 RR2C832JQ
BS 31 602 RR2C832TF

RD RR2C832JQ 602 0 0
GGGAGATTGATTCCCATTGATCCAGCTGCTCCTGTACTCTCGTTCTTCCCCAGCAAAGGA
AACAGTTTTTTGAGAAAATGGCATCAAAGCTGCTACAGCTGAAATCAAAAGCGTGTGAAG
CATCAAAGTTTGTGTCCAAGCACGGGACTAGTTACTACAAACAGTTGCTGGAGAAGAACA
AGCATTATATCCAGGAGCCAGCCACTGTTGAGAAATGCCAAGACTTGTCTAAGCAGCTTC
TCTACACTCGTCTTGCTAGCATTCCTGGACGTTCTGAGTCGTTGTGGAAGGAAGTAGATC
ACGTGAAGGGGTTGTGGAAGAACCGGGCAGATCTGAAGGTTGAAGATGCTGGGATTGCAG
CACTTTTTGGTCTTGAATGCTTCGCTTGGTACTGTGCGGGTGAGATCGTTGGAAGAGGCT
TCACTTTCACCGGCTACTACCCTTGAAGCAAACAAAAAGCAAACATGCCTTTCATTTCAT
GACTGTGATATTTTAGCAAAAGTTATAAATTTTTATTTCTGTCTTTGGATAGTTAAGTAG
ACACTTAACTAATCATTATATTACTCATGCCTAGCGCTTAATAATAATATCAGTCGACAA
CT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2C832TF 572 0 0
CCTGTACTCTCGTTCTTCCCCAGCAAAGGAAACAGTTTTTTGAGAAAATGGCATCAAAGC
TGCTACAGCTGAAATCAAAAGCGTGTGAAGCATCAAAGTTTGTGTCCAAGCACGGGACTA
GTTACTACAAACAGTTGCTGGAGAAGAACAAGCATTATATCCAGGAGCCAGCCACTGTTG
AGAAATGCCAAGACTTGTCTAAGCAGCTTCTCTACACTCGTCTTGCTAGCATTCCTGGAC
GTTCTGAGTCGTTGTGGAAGGAAGTAGATCACGTGAAGGGGTTGTGGAAGAACCGGGCAG
ATCTGAAGGTTGAAGATGCTGGGATTGCAGCACTTTTTGGTCTTGAATGCTTCGCTTGGT
ACTGTGCGGGTGAGATCGTTGGAAGAGGCTTCACTTTCACCGGCTACTACCCTTGAAGCA
AACAAAAAGCAAACATGCCTTTCATTTCATGACTGTGATATTTTAGCAAAAGTTATAAAT
TTTTATTTCTGTCTTTGGATAGTTAAGTAGACACTTAACTAATCATTATATTACTCATGC
CTAGCGCTTAATAATAATATCAGTCGACAACT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL5940Contig1 685 2 2 U
GAAATCTCGGGTCGGGAGGCTTGCTATTTCAACACGGGGGTGATGGTGATGGATATGGTT
AGGTGGAGGGAAGGGAACTACAGGGAGAATCTGGAGAAATGGATGCAGATTCAGAAGAAG
ATGAGGATCTACGATTTGGGTTCTTTGCCACCGTTCTTGCTTGTGTTCGGAGGGGATGTG
GAAGCTATCGATCATAGATGGAACCATCACGGTTTGGGAGGAGACAACATACGAGGAAGC
TGTCGGTCTCTGCATCCTGGTCCGGTGAGTTTGTTGCATTGGAGTGGGAAAGGGAAGCCG
TGGGTGAGACTTGATGAGAAGAGGGCTTGTCCGTTGGATCGTCTTTGGGAGCCGTATGAT
CTTTATAAGCACAAGATTGAGAGGGTTAAAGATCAGGCTCTGCTTTGGTTTGCTTCGTTG
TCGGAGTTAGCTGATGATTGAAGCTTCTTGTGAGAGAGGTTAAAAGAAAGGAAAGTTACA
TTGTTTATTTTCATGTTGTGCGTTTACAGGTTCTACAATACATTTGTTCAGGTGATTCTT
TGATTTTCTGGTGTATAAAATGGAATTAGAGAGGGAGAGAGTGAGATATAGAGGCTATGA
AGCCGTTGATGAACCCCTTCTTTGAGAATTCTTTTTCATTTTGGTGCTTCTCTTCTTGTT
CCTTAATAAAACTCTTCTTGAAGCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR80TF U 1
AF RR2FR80JQ C 1
BS 1 628 RR2FR80TF
BS 629 685 RR2FR80JQ

RD RR2FR80TF 628 0 0
GAAATCTCGGGTCGGGAGGCTTGCTATTTCAACACGGGGGTGATGGTGATGGATATGGTT
AGGTGGAGGGAAGGGAACTACAGGGAGAATCTGGAGAAATGGATGCAGATTCAGAAGAAG
ATGAGGATCTACGATTTGGGTTCTTTGCCACCGTTCTTGCTTGTGTTCGGAGGGGATGTG
GAAGCTATCGATCATAGATGGAACCATCACGGTTTGGGAGGAGACAACATACGAGGAAGC
TGTCGGTCTCTGCATCCTGGTCCGGTGAGTTTGTTGCATTGGAGTGGGAAAGGGAAGCCG
TGGGTGAGACTTGATGAGAAGAGGGCTTGTCCGTTGGATCGTCTTTGGGAGCCGTATGAT
CTTTATAAGCACAAGATTGAGAGGGTTAAAGATCAGGCTCTGCTTTGGTTTGCTTCGTTG
TCGGAGTTAGCTGATGATTGAAGCTTCTTGTGAGAGAGGTTAAAAGAAAGGAAAGTTACA
TTGTTTATTTTCATGTTGTGCGTTTACAGGTTCTACAATACATTTGTTCAGGTGATTCTT
TGATTTTCTGGTGTATAAAATGGAATTAGAGAGGGAGAGAGTGAGATATAGAGGCTATGA
AGCCGTTGATGAACCCCTTCTTTGAGAA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2FR80JQ 685 0 0
GAAATCTCGGGTCGGGAGGCTTGCTATTTCAACACGGGGGTGATGGTGATGGATATGGTT
AGGTGGAGGGAAGGGAACTACAGGGAGAATCTGGAGAAATGGATGCAGATTCAGAAGAAG
ATGAGGATCTACGATTTGGGTTCTTTGCCACCGTTCTTGCTTGTGTTCGGAGGGGATGTG
GAAGCTATCGATCATAGATGGAACCATCACGGTTTGGGAGGAGACAACATACGAGGAAGC
TGTCGGTCTCTGCATCCTGGTCCGGTGAGTTTGTTGCATTGGAGTGGGAAAGGGAAGCCG
TGGGTGAGACTTGATGAGAAGAGGGCTTGTCCGTTGGATCGTCTTTGGGAGCCGTATGAT
CTTTATAAGCACAAGATTGAGAGGGTTAAAGATCAGGCTCTGCTTTGGTTTGCTTCGTTG
TCGGAGTTAGCTGATGATTGAAGCTTCTTGTGAGAGAGGTTAAAAGAAAGGAAAGTTACA
TTGTTTATTTTCATGTTGTGCGTTTACAGGTTCTACAATACATTTGTTCAGGTGATTCTT
TGATTTTCTGGTGTATAAAATGGAATTAGAGAGGGAGAGAGTGAGATATAGAGGCTATGA
AGCCGTTGATGAACCCCTTCTTTGAGAATTCTTTTTCATTTTGGTGCTTCTCTTCTTGTT
CCTTAATAAAACTCTTCTTGAAGCG

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL5941Contig1 603 2 1 U
GAACGTCCTGGAGGGAGACGCCCTGGTGGGATCCAGCAACCTCAGCAGCACCAGATGCAC
GCGAGGGGACGAATGTTCCGCTATCCGCAAGGACGTGGGAGTGGTGGTGGTCCCCCTGAT
GTCCCTGGAAGGCTTCCATATGAGATGCCACTACTTCCTCAGCATGTTCCTATTGGAGCT
TTGGCTACTTCCCTTGCCAATGCTTCTCCAGAACACCAAAGGACGATGCTGGGTGAGAAT
CTGTATCCGCTTGTGGAGCAGCTAGAGGCAGAGTCTGCAGCCAAAGTGACTGGGATGCTT
TTGGAGATGGATCAGACCGAAGTGCTTCATCTCTTGGAGTCACCTGAAGCTCTCAAGGCT
AAAGTAGCCGAGGCTATGGACGTTCTCAGAAGTGTTGCTGCTGGTGGTGCAGCCGAGCAG
CTTGCCTCCTTGAACCTCAACGACAACCTTGTCTCTTAAATGTTCTCTTGTCTTTCTGTT
CGATTTGAAAAAACTACAGATATTTAAAGTGTGGCTTTTGTCTTCTCCATACACAAGTGT
GGCTTTGTGCTTCTACCTCAAACCTTCAAACTTAAATATTTATTTTCGTTTGTTTCTTTT
GCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2AN27JQ C 1
AF RR2AN27TF U 1
BS 1 603 RR2AN27TF

RD RR2AN27JQ 603 0 0
GAACGTCCTGGAGGGAGACGCCCTGGTGGGATCCAGCAACCTCAGCAGCACCAGATGCAC
GCGAGGGGACGAATGTTCCGCTATCCGCAAGGACGTGGGAGTGGTGGTGGTCCCCCTGAT
GTCCCTGGAAGGCTTCCATATGAGATGCCACTACTTCCTCAGCATGTTCCTATTGGAGCT
TTGGCTACTTCCCTTGCCAATGCTTCTCCAGAACACCAAAGGACGATGCTGGGTGAGAAT
CTGTATCCGCTTGTGGAGCAGCTAGAGGCAGAGTCTGCAGCCAAAGTGACTGGGATGCTT
TTGGAGATGGATCAGACCGAAGTGCTTCATCTCTTGGAGTCACCTGAAGCTCTCAAGGCT
AAAGTAGCCGAGGCTATGGACGTTTTCAGAAGTGTTGCTGCTGGTGGTGCAGCCGAGCAG
CTTGCCTCCTTGAACCTCAACGACAACCTTGTTTCTTAAATGTTCTCTTGTCTTTCTGTT
CGATTTGAAAAAACTACAGATATTTAAAGTGTGGCTTTTGTCTTCTCCATACACAAGTGT
GGCTTTGTGCTTCTACCTCAAACCTTCAAACTTAAATATTTATTTTCGTTTGTTTCTTTT
GCC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2AN27TF 603 0 0
GAACGTCCTGGAGGGAGACGCCCTGGTGGGATCCAGCAACCTCAGCAGCACCAGATGCAC
GCGAGGGGACGAATGTTCCGCTATCCGCAAGGACGTGGGAGTGGTGGTGGTCCCCCTGAT
GTCCCTGGAAGGCTTCCATATGAGATGCCACTACTTCCTCAGCATGTTCCTATTGGAGCT
TTGGCTACTTCCCTTGCCAATGCTTCTCCAGAACACCAAAGGACGATGCTGGGTGAGAAT
CTGTATCCGCTTGTGGAGCAGCTAGAGGCAGAGTCTGCAGCCAAAGTGACTGGGATGCTT
TTGGAGATGGATCAGACCGAAGTGCTTCATCTCTTGGAGTCACCTGAAGCTCTCAAGGCT
AAAGTAGCCGAGGCTATGGACGTTCTCAGAAGTGTTGCTGCTGGTGGTGCAGCCGAGCAG
CTTGCCTCCTTGAACCTCAACGACAACCTTGTCTCTTAAATGTTCTCTTGTCTTTCTGTT
CGATTTGAAAAAACTACAGATATTTAAAGTGTGGCTTTTGTCTTCTCCATACACAAGTGT
GGCTTTGTGCTTCTACCTCAAACCTTCAAACTTAAATATTTATTTTCGTTTGTTTCTTTT
GCC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL5942Contig1 772 2 2 U
GAGAAGGCCATGGAAAGCGTATTCAAAAACTATCATCATGGACACGTTTATACCTGATTT
TATTGCGGCCGAAGGATGGCAGGAGTGGCGAGGAAACTTCGGTATTGACACGTTATTTTA
TTCGGAGGCAAGGAATACTGGGCCGGGTGCAGGTGTCACGGGCCGGGTTACTTGGCCAGG
AATCAAGAAGTTGAGTGATGAAGAGATTCTTGGATACACACCGGCTAAGTACATCCAAGG
TGATGAGTGGGTTCCGGGTAAAGGTGTACCGTACACCCCCGGTCTTTTCGCCGGAAACGG
TTCAGCAACCGTTGCAGCTTCCTGCGATTCCACGACTACCGGTCCAAGCGTACCAGGGTC
GACAAATTCTACCGGTAATGTAACTGGTTCCAGTTCCAACACCACAGGGCCAGCTCCAGC
GGCTGCCCCAGGAATTTCAGCCATCACTAATTCCAGTGGCTTAGGGTCACCTTCAGCTTC
ACCATTAGCTTCTCCCTCAGCTACTCCTTCAGCTTCACCAGCTTCTCCCTCAGCTACTCC
TTCAGCTTCACCAGCTTCTCCCTCAGCTACTCCTTCAGCTTTACCGTCAGCTTCTCCATC
GGCTACTCCTTCAGCTACTCCACCTTCTGCCTCACCTTCGATTTCACCTTCGGCTTCTCC
GAAGACTGCGTCCACCTAGAGGTCGTGTCTGTAAATATTTTGACAAACCTTTAGGATTTT
GTAAATGAGGATATGATTAGCAAGCTTTGTAAATTCATGTTATTATCTTCCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B271TF U 1
AF RR2B271JQ C 1
BS 1 710 RR2B271TF
BS 711 772 RR2B271JQ

RD RR2B271TF 710 0 0
GAGAAGGCCATGGAAAGCGTATTCAAAAACTATCATCATGGACACGTTTATACCTGATTT
TATTGCGGCCGAAGGATGGCAGGAGTGGCGAGGAAACTTCGGTATTGACACGTTATTTTA
TTCGGAGGCAAGGAATACTGGGCCGGGTGCAGGTGTCACGGGCCGGGTTACTTGGCCAGG
AATCAAGAAGTTGAGTGATGAAGAGATTCTTGGATACACACCGGCTAAGTACATCCAAGG
TGATGAGTGGGTTCCGGGTAAAGGTGTACCGTACACCCCCGGTCTTTTCGCCGGAAACGG
TTCAGCAACCGTTGCAGCTTCCTGCGATTCCACGACTACCGGTCCAAGCGTACCAGGGTC
GACAAATTCTACCGGTAATGTAACTGGTTCCAGTTCCAACACCACAGGGCCAGCTCCAGC
GGCTGCCCCAGGAATTTCAGCCATCACTAATTCCAGTGGCTTAGGGTCACCTTCAGCTTC
ACCATTAGCTTCTCCCTCAGCTACTCCTTCAGCTTCACCAGCTTCTCCCTCAGCTACTCC
TTCAGCTTCACCAGCTTCTCCCTCAGCTACTCCTTCAGCTTTACCGTCAGCTTCTCCATC
GGCTACTCCTTCAGCTACTCCACCTTCTGCCTCACCTTCGATTTCACCTTCGGCTTCTCC
GAAGACTGCGTCCACCTAGAGGTCGTGTCTGTAAATATTTTGACAAACCT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2B271JQ 772 0 0
GAGAAGGCCATGGAAAGCGTATTCAAAAACTATCATCATGGACACGTTTATACCTGATTT
TATTGCGGCCGAAGGATGGCAGGAGTGGCGAGGAAACTTCGGTATTGACACGTTATTTTA
TTCGGAGGCAAGGAATACTGGGCCGGGTGCAGGTGTCACGGGCCGGGTTACTTGGCCAGG
AATCAAGAAGTTGAGTGATGAAGAGATTCTTGGATACACACCGGCTAAGTACATCCAAGG
TGATGAGTGGGTTCCGGGTAAAGGTGTACCGTACACCCCCGGTCTTTTCGCCGGAAACGG
TTCAGCAACCGTTGCAGCTTCCTGCGATTCCACGACTACCGGTCCAAGCGTACCAGGGTC
GACAAATTCTACCGGTAATGTAACTGGTTCCAGTTCCAACACCACAGGGCCAGCTCCAGC
GGCTGCCCCAGGAATTTCAGCCATCACTAATTCCAGTGGCTTAGGGTCACCTTCAGCTTC
ACCATTAGCTTCTCCCTCAGCTACTCCTTCAGCTTCACCAGCTTCTCCCTCAGCTACTCC
TTCAGCTTCACCAGCTTCTCCCTCAGCTACTCCTTCAGCTTTACCGTCAGCTTCTCCATC
GGCTACTCCTTCAGCTACTCCACCTTCTGCCTCACCTTCGATTTCACCTTCGGCTTCTCC
GAAGACTGCGTCCCCCTAGAGGTCGTGTCTGTAAATATTTTGACAAACCTTTAGGATTTT
GTAAATGAGGATATGATTAGCAAGCTTTGTAAATTCATGTTATTATCTTCCG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL5943Contig1 1081 2 2 U
GGAGTTTCTTTTCCTGTGTGTATGTTCAAAGAAGATAGATAGATAGAGAACAAGACTGAG
AGAGAAAATAAAAAAAATAAAAAGACAGTGTTAAATCTACACTCTTCCTTAGTGGAGTTT
TGAATCTATCCATTTATATATCTTCTGAGGGAGAGAAGAAAAATATCAAATTTTATTTTG
ATTTCTCTCTGATTTACCTCAAAGTTTCTGTCTTTGGTTTCATGAAGTTTCACTCTTGGT
GATTATTGTATTGTGGAAGCTAAAGCCGTTGAGTTTAAGTTGCAGATCTTGAGGTATTGT
GTGATGGAAGAAGTGAAGGGACAAAGAGGAAATGGAACCAGTGATGCAGATTTTGTGCTG
CAATGGGGTGAGAGGAAAAGAGTTAGATGCATGAAAGTGAAGAAAGATCAAAGCCGCAAG
TCAACTGATTGTTTGTCTAATAAGCGCAAACTCATTTCTCGAGCTGTCTCTTCTGAGAGA
GGCTCTCCTTCTCGTCATCTTAACCGTCCAAACAAGGTTGTAGATTCTCCTGGTAACGTG
AGGAGATCGCTTGTGGCGTCGCCTGAGAAGGAAGATAGGTACTACACAACGAGGGGTTCA
ATGGGTACAGATGAGAGTGGGAAGATTATAAAGGAACCTGTGAAGGAGACCAAGAAGCAT
GTGTGGCCAAAGTTGTTTATAACTTTGTCAAATAAAGAGAAAGAAGAAGATTTCTTGGCT
ATGAAAGGGTGCAAGCTTCCTCAAAGACCCAAGAAACGAGCCAAATTGGTTCAGAAGACA
TTGCTTCTGGTGAGTCCAGGTACTTGGTTATCAGATCTTTGCAAAGAGAGGTATGAAGTA
AGAGAGAAAAAGACTTCAAAGAAGCGACCAAGAGGATTGAAGGCAATGGGGAGCATGGAA
AGCGATTCAGAGTGAAGAAGAGTTGAAGTATAGAAACATTCAAGATTTTGGTGAAGGCTA
GAAGGAAGAATCTGTTTTGTTTCTTTCATTGCATTTTGAGATGCTCTCTCTCTCTTCATC
ACATGTCAACAACTATGAGGCATTTGTATTTTTTCCTGAATGTTTTGCTTTCTGAAGCTA
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2B973TF U 1
AF RR2B973JQ C 177
BS 1 775 RR2B973TF
BS 776 1081 RR2B973JQ

RD RR2B973TF 781 0 0
GGAGTTTCTTTTCCTGTGTGTATGTTCAAAGAAGATAGATAGATAGAGAACAAGACTGAG
AGAGAAAATAAAAAAAATAAAAAGACAGTGTTAAATCTACACTCTTCCTTAGTGGAGTTT
TGAATCTATCCATTTATATATCTTCTGAGGGAGAGAAGAAAAATATCAAATTTTATTTTG
ATTTCTCTCTGATTTACCTCAAAGTTTCTGTCTTTGGTTTCATGAAGTTTCACTCTTGGT
GATTATTGTATTGTGGAAGCTAAAGCCGTTGAGTTTAAGTTGCAGATCTTGAGGTATTGT
GTGATGGAAGAAGTGAAGGGACAAAGAGGAAATGGAACCAGTGATGCAGATTTTGTGCTG
CAATGGGGTGAGAGGAAAAGAGTTAGATGCATGAAAGTGAAGAAAGATCAAAGCCGCAAG
TCAACTGATTGTTTGTCTAATAAGCGCAAACTCATTTCTCGAGCTGTCTCTTCTGAGAGA
GGCTCTCCTTCTCGTCATCTTAACCGTCCAAACAAGGTTGTAGATTCTCCTGGTAACGTG
AGGAGATCGCTTGTGGCGTCGCCTGAGAAGGAAGATAGGTACTACACAACGAGGGGTTCA
ATGGGTACAGATGAGAGTGGGAAGATTATAAAGGAACCTGTGAAGGAGACCAAGAAGCAT
GTGTGGCCAAAGTTGTTTATAACTTTGTCAAATAAAGAGAAAGAAGAAGATTTCTTGGCT
ATGAAAGGGTGCAAGCTTCCTCAAAGACCCAAGAAACGAGCCAAATTGGTTCAGA
GACATT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2B973JQ 905 0 0
TTTTGA
TTCTCTCTGATTTACCTCAAAGTTTCTGTCTTTGGTTTCATGAAGTTTCACTCTTGGTGA
TTATTGTATTGTGGAAGCTAAAGCCGTTGAGTTTAAGTTGCAGATCTTGAGGTATTGTGT
GATGGAAGAAGTGAAGGGACAAAGAGGAAATGGAACCAGTGATGCAGATTTTGTGCTGCA
ATGGGGTGAGAGGAAAAGAGTTAGATGCATGAAAGTGAAGAAAGATCAAAGCCGCAAGTC
AACTGATTGTTTGTCTAATAAGCGCAAACTCATTTCTCGAGCTGTCTCTTCTGAGAGAGG
CTCTCCTTCTCGTCATCTTAACCGTCCAAACAAGGTTGTAGATTCTCCTGGTAACGTGAG
GAGATCGCTTGTGGCGTCGCCTGAGAAGGAAGATAGGTACTACACAACGAGGGGTTCAAT
GGGTACAGATGAGAGTGGGAAGATTATAAAGGAACCTGTGAAGGAGACCAAGAAGCATGT
GTGGCCAAAGTTGTTTATAACTTTGTCAAATAAAGAGAAGGAAGAAGATTTCTTGGCTAT
GAAAGGGTGCAAGCTTCCTCAAAGACCCAAGAAACGAGCCAAATTGGTTCAGAAGACATT
GCTTCTGGTGAGTCCAGGTACTTGGTTATCAGATCTTTGCAAAGAGAGGTATGAAGTAAG
AGAGAAAAAGACTTCAAAGAAGCGACCAAGAGGATTGAAGGCAATGGGGAGCATGGAAAG
CGATTCAGAGTGAAGAAGAGTTGAAGTATAGAAACATTCAAGATTTTGGTGAAGGCTAGA
AGGAAGAATCTGTTTTGTTTCTTTCATTGCATTTTGAGATGCTCTCTCTCTCTTCATCAC
ATGTCAACAACTATGAGGCATTTGTATTTTTTCCTGAATGTTTTGCTTTCTGAAGCTAA

QA 7 905 7 905
DS 



AS 1 2

CO CL5944Contig1 1116 2 2 U
GGAACCACACACAACTTGTTGTTCCGTCTTTGCTGTTTGATTCTCTTCTCTCTCTCTCCC
CGTGGAGATTTCTTTGTGTTGCAGAAAAAGATGCTCAAGGTCCCTGAACACCAAGTAGCT
GGTCACATCGCCAAAGATGGGAAGCTAGGTCCCCTCGTAGACGAACAAGGCAGATTCTAC
AAGCCGCTTCAAGGCGACGCGCGCGGCGAAAACGAGGCTAAGTTCTACGAGTCCTTCTTC
TCCAACAAGAACGTTCCCGACAACATCCGTGGCTACTTCCCTGCGTACCATGGAGTTCAG
CTAGTGGAAGCGTCCGACGGGTCAGGTCAGCTTCCACATTTGGTTCTCGAAGACTTGGTT
TCAGGTTACATGAAGCCTTCTGTTATGGATGTTAAGATCGGGTCTAGGACGTGGTACCCT
GATGTCTCCGAAGAGTATTTCGACAAGTGTATCAAGAAAGATAGAGAGACCACCACTGTT
TCTTTGGGGTTTAGGGTTTCGGGTTTAAAGATTTACGACTGTCAGGAATCGAGTTTCTGG
AGACCGGACAAGAGGGTTGTGCTCGCGTATAAAGCTGATGGTGCTAGAATGGCTTTAAGG
AAGTTTGTGTCTTCGAACCCGCGTGCTGACTCGACACCGAACTGTGCATTTGCGTCAGAA
GTTTATGGAGGTATCCCGGCGCAGCTGTTGGAGCTCAGGGCTTGGTTTGAGACGCAGACG
CTTTACCATTTCAACTCTTGCTCGATCTTGATGGTTTACGAGAATGAATTGGTTGGTGAT
GATGCGGCGAGGAGGGCGCGAGTGAAGCTGGTGGATTTCGCGCATGTTCTTGATGGAAAC
GGTGTTATTGATCATAACTTCTTTGGTGGTCTCTGCTCTTTCATTAAGTTCATCAAAGAT
ATAGTTGAGAGCTTAGAGAACTGCTGTGAAAATGGGCACTAAGGGACTTGTGTTTTTTTC
TTCAAATAAATGTCCGGTTCTTCCTTCCTTGGGGCTAACTGTGTTTGGACATAAGACTTG
TTGTGTCTCCTTTGAATTGTATAATTTGGTTATGCCCTACTGAACCAAACCATTGTACTG
TACTTCTTCATATGAGTTTTAATGAAGTTTCCATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW30TF U 1
AF RR2DW30JQ C 449
BS 1 525 RR2DW30TF
BS 526 1116 RR2DW30JQ

RD RR2DW30TF 530 0 0
GGAACCACACACAACTTGTTGTTCCGTCTTTGCTGTTTGATTCTCTTCTCTCTCTCTCCC
CGTGGAGATTTCTTTGTGTTGCAGAAAAAGATGCTCAAGGTCCCTGAACACCAAGTAGCT
GGTCACATCGCCAAAGATGGGAAGCTAGGTCCCCTCGTAGACGAACAAGGCAGATTCTAC
AAGCCGCTTCAAGGCGACGCGCGCGGCGAAAACGAGGCTAAGTTCTACGAGTCCTTCTTC
TCCAACAAGAACGTTCCCGACAACATCCGTGGCTACTTCCCTGCGTACCATGGAGTTCAG
CTAGTGGAAGCGTCCGACGGGTCAGGTCAGCTTCCACATTTGGTTCTCGAAGACTTGGTT
TCAGGTTACATGAAGCCTTCTGTTATGGATGTTAAGATCGGGTCTAGGACGTGGTACCCT
GATGTCTCCGAAGAGTATTTCGACAAGTGTATCAAGAAAGATAGAGAGACCACCACTGTT
TCTTTGGGGTTTAGGGTTTCGGGTTTAAAGATTTACGACTGTCAG
AATCG

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2DW30JQ 668 0 0
GTATCAAGAAAGATAGAGAGACCACCACTGTTTCTTTGGGGTTTAGGGTTTCGGGTTTAA
AGATTTACGACTGTCAGGAATCGAGTTTCTGGAGACCGGACAAGAGGGTTGTGCTCGCGT
ATAAAGCTGATGGTGCTAGAATGGCTTTAAGGAAGTTTGTGTCTTCGAACCCGCGTGCTG
ACTCGACACCGAACTGTGCATTTGCGTCAGAAGTTTATGGAGGTATCCCGGCGCAGCTGT
TGGAGCTCAGGGCTTGGTTTGAGACGCAGACGCTTTACCATTTCAACTCTTGCTCGATCT
TGATGGTTTACGAGAATGAATTGGTTGGTGATGATGCGGCGAGGAGGGCGCGAGTGAAGC
TGGTGGATTTCGCGCATGTTCTTGATGGAAACGGTGTTATTGATCATAACTTCTTTGGTG
GTCTCTGCTCTTTCATTAAGTTCATCAAAGATATAGTTGAGAGCTTAGAGAACTGCTGTG
AAAATGGGCACTAAGGGACTTGTGTTTTTTTCTTCAAATAAATGTCCGGTTCTTCCTTCC
TTGGGGCTAACTGTGTTTGGACATAAGACTTGTTGTGTCTCCTTTGAATTGTATAATTTG
GTTATGCCCTACTGAACCAAACCATTGTACTGTACTTCTTCATATGAGTTTTAATGAAGT
TTCCATGG

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL5945Contig1 644 2 14 U
GGAATCATGGTTTTAACCAAATACTTAAAGGTCGCGTTCATCACAGCATTGGAGAGTTTA
AAAGACTGTAAGATTTGACAGTCTTGAGACTCTCCCCACAGCTAAGATGGGGACACTAAA
ATAGTTTGCAATATATAAATCACTGTGTACAAACGAAGCAAAGATGAAAATAGCTAAGAA
AAAGAAAAACAGAGTTGGAACAGAGCAGCAGATAACACCAAAGCTGTGCACATGCTCTGT
CATAAACACACATTTTTTTTGTTTCGACAAGTTTTAGAGCAAAGGGTTTTTTTTTTGGGT
TTTTGAACTCAGTCACGGTTGTGAGGACATTACATAAGCGTATGTTCTTCCATAAAATCT
TCAGGCCTCATCCATCTGCTCCTGCATATCGGAGGTCCAGAGGGTTAGATTGTCCCTTAG
CAACTGCATGATGAGAGTACTGTCTTTGTATGACTCCTCTCCCAACGTGTCCAGCTCCGC
AATAGCTTCCTCAAAAGCCTGTTTGGCCATGCTACAAGCTTTCTCCGAAGAGTTGAGAAT
CTCGTAGTAAAACACCGAGAAGTTCAGAGCCAGTCCCAGCCTGATGGGATGCGTAGGCGC
TAGATCAGCAACCGCAACGTCCTGAGCAGCCTTGTAAGCGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D926JQ U 1
AF RR2AA42TF C 30
BS 1 96 RR2D926JQ
BS 97 97 RR2AA42TF
BS 98 142 RR2D926JQ
BS 143 143 RR2AA42TF
BS 144 180 RR2D926JQ
BS 181 181 RR2AA42TF
BS 182 205 RR2D926JQ
BS 206 206 RR2AA42TF
BS 207 285 RR2D926JQ
BS 286 286 RR2AA42TF
BS 287 492 RR2D926JQ
BS 493 493 RR2AA42TF
BS 494 529 RR2D926JQ
BS 530 644 RR2AA42TF

RD RR2D926JQ 529 0 0
GGAATCATGGTTTTAACCAAATACTTAAAGGTCGCGTTCATCACAGCATTGGAGAGTTTA
AAAGACTGTAAGATTTGACAGTCTTGAGACTCTCCC*ACAGCTAAGATGGGGACACTAAA
ATAGTTTGCAATATATAAATCATTGTGTACAAACGAAGCAAAGATGAAAATAGCTAAGAA
TAAGAAAAACAGAGTTGGAACAGAGTAGCAGATAACACCAAAGCTGTGCACATGCTCTGT
CATAAACACACATTTTTTTTGTTTCGACAAGTTTTAGAGCAAAGG*TTTTTTTTTTGGGT
TTTTGAACTCAGTCACGGTTGTGAGGACATTACATAAGCGTATGTTCTTCCATAAAATCT
TCAGGCCTCATCCATCTGCTCCTGCATATCGGAGGTCCAGAGGGTTAGATTGTCCCTTAG
CAACTGCATGATGAGAGTACTGTCTTTGTATGACTCCTCTCCCAACGTGTCCAGCTCCGC
AATAGCTTCCTCGAAAGCCTGTTTGGCCATGCTACAAGCTTTCTCCGAA

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2AA42TF 615 0 0
GGTA
GCGTTCATCACAGCATTGGAGAGTTTAAAAGACTGTAAGATTTGACAGTCTTGAGACTCT
CCCCACAGCTAAGATGGGGACACTAAAATAGTTTGCAATATATAAATCACTGTGTACAAA
CGAAGCAAAGATGAGAATAGCTAAGAAAAAGAAAAACAGAGTTGGAACAGAGCAGCAGAT
AACACCAAAGCTGTGCACATGCTCTGTCATAAACACACATTTTTTTTGTTTCGACAAGTT
TTAGAGCAAAGGGTTTTTTTTTTGGGTTTTTGAACTCAGTCACGGTTGTGAGGACATTAC
ATAAGCGTATGTTCTTCCATAAGATCTTCAGGCCTCATCCATCTGCTCCTGCATATCGGA
GGTCCAGAGGGTTAGATTGTCCCTTAGCAACTGCATGATGAGAGTACTGTCTTTGTATGA
CTCCTCTCCCAACGTGTCCAGCTCCGCAATAGCTTCCTCAAAAGCCTGTTTGGCCATGCT
GCAAGCTTTCTCCGAAGAGTTGAGAATCTCGTAGTAAAACACCGAGAAGTTCAGAGCCAG
TCCCAGCCTGATGGGATGCGTAGGCGCTAGATCAGCAACCGCAACGTCCTGAGCAGCCTT
GTAAGCGATCC

QA 5 615 5 615
DS 



AS 1 2

CO CL5946Contig1 945 2 2 U
GGAACTCACACTCTCTCTTCAATCCTTCTAGTTAAGAAAGACTTGGATAAGAAATGGCCA
CGTCAGCAATCCAGCAATCCTCCTTCGCAGGCCAAACGGCCCTCAAGCCCTCCAACGATC
TCCTCCGCAGGGTCGGTGTCTCCGGCGGCGGCCGCGTGACCATGCGCCGCACAGTCAAGT
CTACTCCTCAAAGCATTTGGTACGGACCAGACCGTCCAAAGTACTTGGGACCGTTCTCCG
AGAACACACCGTCCTACCTAACTGGAGAATACCCCGGAGACTACGGCTGGGACACCGCGG
GACTTTCCGCTGACCCAGAGACATTCGCTAAGAACCGTGAGCTCGAAGTAATCCACAGCA
GATGGGCGATGCTGGGAGCCTTAGACTGCACGTTCCCCGAGATCCTCTCCAAGAACGGAG
TCAAATTCGGAGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAGGCTCCCAGATCTTCTCAGAAGGAGGTC
TTGACTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCACGCGCAAAGCATCTTAGCCATCTGGGCTT
GTCAAGTTGTGCTCATGGGTTTGATAGAAGGGTACAGAATCGGAGGTGGTCCTCTCGGTG
AAGGTCTTGACCCGCTTTACCCTGGAGGTGCGTTCGACCCGTTGAATTTGGCAGAGGACC
CGGAGGCCTTCGCTGAGTTGAAGGTCAAGGAGCTCAAGAACGGACGTCTTGCCATGTTCT
CCATGTTTGGATTCTTTGTTCAAGCAATTGTTACTGGTAAAGGTCCCATCGAGAACTTGT
TTGATCACTTGGCAGATCCTGTGGCTAACAACGCCTGGTCTTTCGCTACCAACTTTGTCC
CCGGAAAGTGATTTATCTATCTTATGGATTTGCTTCACCGTCTTATCTTACTTTGTAAAA
GCATCAATGTATTGTTCGTGTTTTATGTGAATTTGGTACTTAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE48TF U 1
AF RR2BE48JQ C 308
BS 1 680 RR2BE48TF
BS 681 945 RR2BE48JQ

RD RR2BE48TF 680 0 0
GGAACTCACACTCTCTCTTCAATCCTTCTAGTTAAGAAAGACTTGGATAAGAAATGGCCA
CGTCAGCAATCCAGCAATCCTCCTTCGCAGGCCAAACGGCCCTCAAGCCCTCCAACGATC
TCCTCCGCAGGGTCGGTGTCTCCGGCGGCGGCCGCGTGACCATGCGCCGCACAGTCAAGT
CTACTCCTCAAAGCATTTGGTACGGACCAGACCGTCCAAAGTACTTGGGACCGTTCTCCG
AGAACACACCGTCCTACCTAACTGGAGAATACCCCGGAGACTACGGCTGGGACACCGCGG
GACTTTCCGCTGACCCAGAGACATTCGCTAAGAACCGTGAGCTCGAAGTAATCCACAGCA
GATGGGCGATGCTGGGAGCCTTAGACTGCACGTTCCCCGAGATCCTCTCCAAGAACGGAG
TCAAATTCGGAGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAGGCTCCCAGATCTTCTCAGAAGGAGGTC
TTGACTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCACGCGCAAAGCATCTTAGCCATCTGGGCTT
GTCAAGTTGTGCTCATGGGTTTGATAGAAGGGTACAGAATCGGAGGTGGTCCTCTCGGTG
AAGGTCTTGACCCGCTTTACCCTGGAGGTGCGTTCGACCCGTTGAATTTGGCAGAGGACC
CGGAGGCCTTCGCTGAGTTG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2BE48JQ 638 0 0
CGCTGACCCAGAGACATTCGCTAAGAACCGTGAGCTCGAAGTAATCCACAGCAGATGGGC
GATGCTGGGAGCCTTAGACTGCACGTTCCCCGAGATCCTCTCCAAGAACGGAGTCAAATT
CGGAGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAGGCTCCCAGATCTTCTCAGAAGGAGGTCTTGACTA
CCTCGGAAACCCTAACTTGATCCACGCGCAAAGCATCTTAGCCATCTGGGCTTGTCAAGT
TGTGCTCATGGGTTTGATAGAAGGGTACAGAATCGGAGGTGGTCCTCTCGGTGAAGGTCT
TGACCCGCTTTACCCTGGAGGTGCGTTCGACCCGTTGAATTTGGCAGAGGACCCGGAGGC
CTTCGCTGAGTTGAAGGTCAAGGAGCTCAAGAACGGACGTCTTGCCATGTTCTCCATGTT
TGGATTCTTTGTTCAAGCAATTGTTACTGGTAAAGGTCCCATCGAGAACTTGTTTGATCA
CTTGGCAGATCCTGTGGCTAACAACGCCTGGTCTTTCGCTACCAACTTTGTCCCCGGAAA
GTGATTTATCTATCTTATGGATTTGCTTCACCGTCTTATCTTACTTTGTAAAAGCATCAA
TGTATTGTTCGTGTTTTATGTGAATTTGGTACTTAAAG

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL5947Contig1 727 2 4 U
GGAGGGCTCAAACTCTCTCAAACCCTTAGAGTCATCCCTTAGAAAAATAATCTTAACATT
TTTCGTCGAGCCCCTTCTTGGATGCAGGGAGAAGAATCCACTGACAAATCTAGATCAGTA
AGAATTCCAACTCAAAATACTAAAATGCCCTTATCGGCTACGACAGTGGATACAAGCAAG
ACGATGAAGCATCTGATCAAAATGCCGAGAAACGGTGACGTGCCTTACACGCATGCGAAT
GTGAGCTTAGCGTATAGAGACTTCGGGTATAAACCAACGACGGAGCTCGCGACGGGGTTG
AGGAAGTTCGTCAAGTGGTACGTTGGTTATTATGGGATACAGCCGAGGGTAAAAAAGGAA
AACTCTCACGCTGATGATTCCACTTAATGACCTCACTCTCTCTCTCTGCTTCATTATCAT
CACATGCTCGTTTATTTCATTTTACAAAAAAAATGATTACAGATACATATTTCTGTATTT
TTCCTTTTTATTTTAAAATGCCAAAACTCATTAATGTTATAGTAGACAGATATGTAGAAG
GAGAAATGAGAAAAAAGAAAGAAAGAGGGGGTATAGTTGGATATATAATTAAGTGGGGTT
TGTTATGTAATAAATGATGGGTTAATGATCTTGCTGGAAAGTGTTTAGAGAGCACGTTGG
ATGCTTGTAATCAAGGAATGAAACCTGTGATCCATTATCAACTGTAATATAAAAGATTTA
TTCTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C511TF U 1
AF RR2C511JQ C 112
BS 1 675 RR2C511TF
BS 676 676 RR2C511JQ
BS 677 717 RR2C511TF
BS 718 727 RR2C511JQ

RD RR2C511TF 717 0 0
GGAGGGCTCAAACTCTCTCAAACCCTTAGAGTCATCCCTTAGAAAAATAATCTTAACATT
TTTCGTCGAGCCCCTTCTTGGATGCAGGGAGAAGAATCCACTGACAAATCTAGATCAGTA
AGAATTCCAACTCAAAATACTAAAATGCCCTTATCGGCTACGACAGTGGATACAAGCAAG
ACGATGAAGCATCTGATCAAAATGCCGAGAAACGGTGACGTGCCTTACACGCATGCGAAT
GTGAGCTTAGCGTATAGAGACTTCGGGTATAAACCAACGACGGAGCTCGCGACGGGGTTG
AGGAAGTTCGTCAAGTGGTACGTTGGTTATTATGGGATACAGCCGAGGGTAAAAAAGGAA
AACTCTCACGCTGATGATTCCACTTAATGACCTCACTCTCTCTCTCTGCTTCATTATCAT
CACATGCTCGTTTATTTCATTTTACAAAAAAAATGATTACAGATACATATTTCTGTATTT
TTCCTTTTTATTTTAAAATGCCAAAACTCATTAATGTTATAGTAGACAGATATGTAGAAG
GAGAAATGAGAAAAAAGAAAGAAAGAGGGGGTATAGTTGGATATATAATTAAGTGGGGTT
TGTTATGTAATAAATGATGGGTTAATGATCTTGCTGGAAAGTGTTTAGAGAGCACGTTGG
ATGCTTGTAATCAAG*AATGAAACCTGTGATCCATTATCAACTGTAATATAAAAGAT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2C511JQ 616 0 0
AGATCAGTAAGAATTCCAACTCAAAATACTAAAATGCCCTTATCGGCTACGACAGTGGAT
ACAAGCAAGACGATGAAGCATCTGATCAAAATGCCGAGAAACGGTGACGTGCCTTACACG
CATGCGAATGTGAGCTTAGCGTATAGAGACTTCGGGTATAAACCAACGACGGAGCTCGCG
ACGGGGTTGAGGAAGTTCGTCAAGTGGTACGTTGGTTATTATGGGATACAGCCGAGGGTA
AAAAAGGAAAACTCTCACGCTGATGATTCCACTTAATGACCTCACTCTCTCTCTCTGCTT
CATTATCATCACATGCTCGTTTATTTCATTTTACAAAAAAAATGATTACAGATACATATT
TCTGTATTTTTCCTTTTTATTTTAAAATGCCAAAACTCATTAATGTTATAGTAGACAGAT
ATGTAGAAGGAGAAATGAGAAAAAAGAAAGAAAGAGGGGGTATAGTTGGATATATAATTA
AGTGGGGTTTGTTATGTAATAAATGATGGGTTAATGATCTTGCTGGAAAGTGTTTAGAGA
GCAGGTTGGATGCTTGTAATCAAGGAATGAAACCTGTGATCCATTATCAACTGTAATATA
AAAGATTTATTCTCCT

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL5948Contig1 533 2 2 U
GAAACGTAAGAGACCATTAACAAAACCTTTTTTTGTAAATTTTGATTTGGAGATATGGGA
TTGTTGCACAAGCTGTGGGATGAAACGGTGGCCGGTCCTGCCCCCGAAAATGGCCTAGGA
AAGTTGAGAAATCACATTTCCGCCACAAAGAATACTAACCAGAAGTTGATGGTGAATCCT
GGTCGTGTCCCGGATTCTCCTGTCGGATCAAGCATCCCGAGCTCTCCTCTGACTCCTGGA
ACACCAAGTGAGACACATGCCACAAGTCTCAATGCTTGCGATTGGATTGTGCTAAACGCA
TTGGACCGTTGAAAGAGATCATTACTTCTACGAGTTTATAAGTAAACGATCAAACACTAC
TACTTCATCTTGTATTTATATGCAGTGACCATATTGTTAAAAAAATGTATGCATGTAATT
ATAGTATAGTCTCATGACGCTTTTTAGAATTTATGTTCGTCTTTTGCATGTAAATAATAG
TGGTGATCAAGATGGATTGTTCTTTGGAAACATGGTTTCTCTAATATGAATGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B770TF U 1
AF RR2DU77TF U 1
BS 1 522 RR2B770TF
BS 523 533 RR2DU77TF

RD RR2B770TF 522 0 0
GAAACGTAAGAGACCATTAACAAAACCTTTTTTTGTAAATTTTGATTTGGAGATATGGGA
TTGTTGCACAAGCTGTGGGATGAAACGGTGGCCGGTCCTGCCCCCGAAAATGGCCTAGGA
AAGTTGAGAAATCACATTTCCGCCACAAAGAATACTAACCAGAAGTTGATGGTGAATCCT
GGTCGTGTCCCGGATTCTCCTGTCGGATCAAGCATCCCGAGCTCTCCTCTGACTCCTGGA
ACACCAAGTGAGACACATGCCACAAGTCTCAATGCTTGCGATTGGATTGTGCTAAACGCA
TTGGACCGTTGAAAGAGATCATTACTTCTACGAGTTTATAAGTAAACGATCAAACACTAC
TACTTCATCTTGTATTTATATGCAGTGACCATATTGTTAAAAAAATGTATGCATGTAATT
ATAGTATAGTCTCATGACGCTTTTTAGAATTTATGTTCGTCTTTTGCATGTAAATAATAG
TGGTGATCAAGATGGATTGTTCTTTGGAAACATGGTTTCTCT

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2DU77TF 533 0 0
GAAACGTAAGAGACCATTAACAAAACCTTTTTT*GTAAATTTTGATTTGGAGATATGGGA
TTGTTGCACAAGCTGTGGGATGAAACGGTGGCCGGTCCTGCCCCCGAAAATGGCCTAGGA
AAGTTGAGAAATCACATTTCCGCCACAAAGAATACTAACCAGAAGTTGATGGTGAATCCT
GGTCGTGTCCCGGATTCTCCTGTCGGATCAAGCATCCCGAGCTCTCCTCTGACTCCTGGA
ACACCAAGTGAGACACATGCCACAAGTCTCAATGCTTGCGATTGGATTGTGCTAAACGCA
TTGGACCGTTGAAAGAGATCATTACTTCTACGAGTTTATAAGTAAACGATCAAACACTAC
TACTTCATCTTGTATTTATATGCAGTGACCATATTGTTAAAAAAATGTATGCATGTAATT
ATAGTATAGTCTCATGACGCTTTTTAGAATTTATGTTCGTCTTTTGCATGTAAATAATAG
TGGTGATCAAGATGGATTGTTCTTTGGAAACATGGTTTCTCTAATATGAATGT

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 2

CO CL5949Contig1 673 2 3 U
AAAATAAAACCCATATACATAGTATTACTAGATATGCTCTCGTTCTTGAAGAAAACGAGA
GAAAATAACAGACAGAGATGACTCTAGTCCAAGGACAAACATAAAAAAAAAGAACTAAAA
TTACAGGGTAAAACGAGAGGCCTGTTTTCAAAACAAAAAAAAAAAACTAAAGTCAAGTAG
CATCTTGAACAATCGACTTAAGAGCACTCGTCTGCAACTCAAGACACTTAATGTAATTGC
CAATCTCACTCAACATTTCTTCCACATTCATCTCTTCTCCACCTGGCAAAAGCTTCTGTA
ATTCCTTCAGTTTCTCCTCTATCTCTCCATCTTCGTCGTTGGATCTTTCTAGAATCTGAG
TTTGAATGGAAGAAGAACTTGTAGTAGTTGTTGGATTGTTCGAGGACGACAGCTTCTGTA
GCAAGAAACGGCTCCATGCAAATTCTTGAGCAGACAAAGCCAAAGCCTTGTCTACTTCAC
GCTTCACAGTTAGTTGGTTGATTTGTGGAGAGTTCTTTCCCATATTGAGCTTCTTGAGTG
CAGGAACTAAGTGGCTTATGTATTTCCTCGTAAAAACTTCACTAAGGGGTAGCTTGGTTG
GTTCAACAGAGAATACTCGTTTCTTCTTGTTTATCATTTGCCTCTCCATATGAAAATTTA
TTCTTGCTACCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD67JQ U 11
AF RR2DD67TF C 1
BS 1 10 RR2DD67TF
BS 11 607 RR2DD67JQ
BS 608 673 RR2DD67TF

RD RR2DD67JQ 597 0 0
CCATATACATAGTATTACTAGATATGCTCTCGTTCTTGAAGAAAACGAGAGAAAATAACA
GACAGAGATGACTCTAGTCCAAGGACAAACATAAAAAAAAAGAACTAAAATTACAGGGTA
AAACGAGAGGCCTGTTTTCAAAACAAAAAAAAAAAACTAAAGTCAAGTAGCATCTTGAAC
AATCGACTTAAGAGCACTCGTCTGCAACTCAAGACACTTAATGTAATTGCCAATCTCACT
CAACATTTCTTCCACATTCATCTCTTCTCCACCTGGCAAAAGCTTCTGTAATTCCTTCAG
TTTCTCCTCTATCTCTCCATCTTCGTCGTTGGATCTTTCTAGAATCTGAGTTTGAATGGA
AGAAGAACTTGTAGTAGTTGTTGGATTGTTCGAGGACGACAGCTTCTGTAGCAAGAAACG
GCTCCATGCAAATTCTTGAGCAGACAAAGCCAAAGCCTTGTCTACTTCACGCTTCACAGT
TAGTTGGTTGATTTGTGGAGAGTTCTTTCCCATATTGAGCTTCTTGAGTGCAGGAACTAA
GTGGCTTATGTATTTCCTCGTAAAAACTTCACTAAGGGGTAGCTTGGTTGGTTCAAC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2DD67TF 673 0 0
AAAATAAAACCCATATACATAGTATTACTAGATATGCTCTCGTTCTTGAAGAAAACGAGA
GAAAATAACAGACAGAGATGACTCTAGTCCAAGGACAAACATAAAAAAAAAGAACTAAAA
TTACAGGGTAAAACGAGAGGCCTGTTTTCAAAACAAAAAAAAAAAACTAAAGTCAAGTAG
CATCTTGAACAATCGACTTAAGAGCACTCGTCTGCAACTCAAGACACTTAATGTAATTGC
CAATCTCACTCAACATTTCTTCCACATTCATCTCTTCTCCACCTGGCAAAAGCTTCTGTA
ATTCCTTCAGTTTCTCCTCTATCTCTCCATCTTCGTCGTTGGATCTTTCTAGAATCTGAG
TTTGAATGGAAGAAGAACTTGTAGTAGTTGTTGGATTGTTCGAGGACGACAGCTTCTGTA
GCAAGAAACGGCTCCATGCAAATTCTTGAGCAGACAAAGCCAAAGCCTTGTCTACTTCAC
GCTTCACAGTTAGTTGGTTGATTTGTGGAGAGTTCTTTCCCATATTGAGCTTCTTGAGTG
CAGGAACTAAGTGGCTTATGTATTTCCTCGTAAAAACTTCACTAAGGGGTAGCTTGGTTG
GTTCAACAGAGAATACTCGTTTCTTCTTGTTTATCATTTGCCTCTCCATATGAAAATTTA
TTCTTGCTACCGC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL5950Contig1 966 2 2 U
GGACTACACAATCTAGCACATTCTCTTCTCTTCTCTCTCTCTTCAAATTGCTCTCACCAT
TGATTGAGTCATCATCTTGATCTTGACCACACAAGAATTGATCTCAGCCAAAATTAAAAT
CAGACAATAATGGACCTCACAGCAGATCGAACAGCTTTTAAGCGTCACTCGTCGCTTTCG
ACACTTGTGGCTCATTTCTTTGGCATCTTAGCCGTGATTCTAATGCTCATATGGCTTCTC
CATTACCGTGAAGGCATCGAGTATGGCTCCGACAATCCCCTTAAGGTTTTAAATGTGCAT
CCATTTCTCGTGTACTGTGGTTTTCTCTTCCTCGTGGGCCAAGCGATGATGATGTACAAA
ACGTCGTATGCCTCGCACCAAGTACAGAAAATGGTTCACGGTGGACTTCACTTGATAGGA
TTAGTTCTAGGTATCGTCGGAATCTGCGCCGCTTTTAGATTCCACGACAAATTAAACCTT
AAAGACATGGTCTCTCTTCACTCGTGGATTGGTCTCACCACTTTCATACTCCTTTGCCTC
CAGTGGGTGCTCGGCGCATTCACATTCCTTGCGCCACAATCTTCATCAGGGACAAGAACG
AGGATGATGCCGTAGCACGTCTTAGGTGGTCGGGCTCTACTTTATATGGGTATTGTCGCG
GCACTTACCGGACTCATGCAGAGAGCCACGATGCTTGGTCAGAGCACAAGCGCTGAGTCA
CGCCTCATTAACTTCACCGGCTTAGCCATTTTACTCTTTGGCGTTTCTGTCGATTTTTCC
GTCGCTCTTGGCCGTTACACTTGATGGATTCCTATATTAATTAGTCTGCCGTTTAATTAA
TCTTTCTTTGTTGTATCATTCAATGAATTATTGCTTGTTTGTGTTGGTGTGAAAATGTGA
TTGGTGTGATATCTAATTGGGCCCTGAGAGTTGATTTCTTGATGATATTTGATTCTTAAT
TTACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU88TF U 1
AF RR2FU88JQ C 522
BS 1 768 RR2FU88TF
BS 769 966 RR2FU88JQ

RD RR2FU88TF 768 0 0
GGACTACACAATCTAGCACATTCTCTTCTCTTCTCTCTCTCTTCAAATTGCTCTCACCAT
TGATTGAGTCATCATCTTGATCTTGACCACACAAGAATTGATCTCAGCCAAAATTAAAAT
CAGACAATAATGGACCTCACAGCAGATCGAACAGCTTTTAAGCGTCACTCGTCGCTTTCG
ACACTTGTGGCTCATTTCTTTGGCATCTTAGCCGTGATTCTAATGCTCATATGGCTTCTC
CATTACCGTGAAGGCATCGAGTATGGCTCCGACAATCCCCTTAAGGTTTTAAATGTGCAT
CCATTTCTCGTGTACTGTGGTTTTCTCTTCCTCGTGGGCCAAGCGATGATGATGTACAAA
ACGTCGTATGCCTCGCACCAAGTACAGAAAATGGTTCACGGTGGACTTCACTTGATAGGA
TTAGTTCTAGGTATCGTCGGAATCTGCGCCGCTTTTAGATTCCACGACAAATTAAACCTT
AAAGACATGGTCTCTCTTCACTCGTGGATTGGTCTCACCACTTTCATACTCCTTTGCCTC
CAGTGGGTGCTCGGCGCATTCACATTCCTTGCGCCACAATCTTCATCAGGGACAAGAACG
AGGATGATGCCGTAGCACGTCTTAGGTGGTCGGGCTCTACTTTATATGGGTATTGTCGCG
GCACTTACCGGACTCATGCAGAGAGCCACGATGCTTGGTCAGAGCACAAGCGCTGAGTCA
CGCCTCATTAACTTCACCGGCTTAGCCATTTTACTCTTTGGCGTTTCT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2FU88JQ 445 0 0
TTTCATACTCCTTTGCCTCCAGTGGGTGCTCGGCGCATTCACATTCCTTGCGCCACAATC
TTCATCAGGGACAAGAACGAGGATGATGCCGTAGCACGTCTTAGGTGGTCGGGCTCTACT
TTATATGGGTATTGTCGCGGCACTTACCGGACTCATGCAGAGAGCCACGATGCTTGGTCA
GAGCACAAGCGCTGAGTCACGCCTCATTAACTTCACCGGCTTAGCCATTTTACTCTTTGG
CGTTTCTGTCGATTTTTCCGTCGCTCTTGGCCGTTACACTTGATGGATTCCTATATTAAT
TAGTCTGCCGTTTAATTAATCTTTCTTTGTTGTATCATTCAATGAATTATTGCTTGTTTG
TGTTGGTGTGAAAATGTGATTGGTGTGATATCTAATTGGGCCCTGAGAGTTGATTTCTTG
ATGATATTTGATTCTTAATTTACTT

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 2

CO CL5951Contig1 764 2 3 U
CGGAAAAAATAAATAAATTTAGTTCAAATCAAATCGAGAAGAGATCTCTCTGATATTTTT
CATACAAACAGACAGCATCAAATCAATGTCTGCGAGCATCTCCCTGTCCGAATTTTACAG
ATCGGAAGCTTGAACCACGATTGAAGATTGTTTTTTTTTTCGTTTTTTCAAATTTGAGTT
TTAACTTTTAAACTTTAACCATCTTCGCCGCCTTGACGACCGGGTTTTCTCTAGCGATGG
CCTCGCGACCGGCGGTTTTATAGTCGTAGCTGCAATCGTGCCGATCCGAGTAACGGTGCT
CGGAGCAAAAAAGGTCTCCGCACCGGCACCTGAATCCGGTCAACCCCACCTTCTTCCGAC
AGCCAGAACACCGGTTTACCGTCTGTTGATCTCTTTTAACCGGATCGATCTCCCTGGGAC
GGATCACGACTCTGGCTGGTGTGGTGGGCCTAAAATTGACGGATCTCGACGTTCTCTTCG
AGATCGAAGGCGAAGGGGAATCTACACCGGCGGCGGCGATGGAGGCGTTGAAACATTTCT
GACACATGTTGTTGGTCGCTGGATTCGCCGTAACGCCGCAGTTATTCGAGCAGAGCGTCG
TGGTGGTGGGGGTCGTCAAGGTTTCGAGGACCTTGAACTCCGTCTCTTCCTTCTCCGCTC
TCTGCGCCATCTATACAAGATTTCACCTCCTCCGGCGAGCTTACGGGTCGAATAAAAAGA
GAAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAAATGAATGGAGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H359TF C 1
AF RR2H359JQ U 54
BS 1 65 RR2H359TF
BS 66 750 RR2H359JQ
BS 751 764 RR2H359TF

RD RR2H359TF 764 0 0
CGGAAAAAATAAATAAATTTAGTTCAAATCAAATCGAGAAGAGATCTCTCTGATATTTTT
CATACAAACAGACAGCATCAAATCAATGTCTGCGAGCATCTCCCTGTCCGAATTTTACAG
ATCGGAAGCTTGAACCACGATTGAAGATTGTTTTTTTTT*CGTTTTTTCAAATTTGAGTT
TTAACTTTTAAACTTTAACCATCTTCGCCGCCTTGACGACCGGGTTTTCTCTAGCGATGG
CCTCGCGACCGGCGGTTTTATAGTCGTAGCTGCAATCGTGCCGATCCGAGTAACGGTGCT
CGGAGCAGAAAAGGTCTCCGCACCGGCACCTGAATCCGGTCAACCCCACCTTCTTCCGAC
AGCCAGAACACCGGTTTACCGTCTGTTGATCTCTTTTAACCGGATCGATCTCCCTGGGAC
GGATCACGACTCTGGCTGGTGTGGTGGGCCTAAGATTGACGGATCTCGACGTTCTCTTCG
AGATCGAAGGCGAAGGGGAATCTACACCGGCGGCGGCGATGGAGGCGTTGAAACATTTCT
GACACATGTTGTTGGTCGCTGGATTCGCCGTAACGCCGCAGTTATTCGAGCAGAGCGTCG
TGGTGGTGGGGGTCGTCAAGGTTTCGAGGACCTTGAACTCCGTCTCTTCCTTCTCCGCTC
TCTGCGCCATCTATACAAGATTTCACCTCCTCCGGCGAGCTTACGGGTCGAATAAAAAGA
GAAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAAATGAATGGAGTATCC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2H359JQ 697 0 0
TTTTTCATTACA
AAACAGACAGCATCAAATCAATGTCTGCGAGCATCTCCCTGTCCGAATTTTACAGATCGG
AAGCTTGAACCACGATTGAAGATTGTTTTTTTTTTCGTTTTTTCAAATTTGAGTTTTAAC
TTTTAAACTTTAACCATCTTCGCCGCCTTGACGACCGGGTTTTCTCTAGCGATGGCCTCG
CGACCGGCGGTTTTATAGTCGTAGCTGCAATCGTGCCGATCCGAGTAACGGTGCTCGGAG
CAAAAAAGGTCTCCGCACCGGCACCTGAATCCGGTCAACCCCACCTTCTTCCGACAGCCA
GAACACCGGTTTACCGTCTGTTGATCTCTTTTAACCGGATCGATCTCCCTGGGACGGATC
ACGACTCTGGCTGGTGTGGTGGGCCTAAAATTGACGGATCTCGACGTTCTCTTCGAGATC
GAAGGCGAAGGGGAATCTACACCGGCGGCGGCGATGGAGGCGTTGAAACATTTCTGACAC
ATGTTGTTGGTCGCTGGATTCGCCGTAACGCCGCAGTTATTCGAGCAGAGCGTCGTGGTG
GTGGGGGTCGTCAAGGTTTCGAGGACCTTGAACTCCGTCTCTTCCTTCTCCGCTCTCTGC
GCCATCTATACAAGATTTCACCTCCTCCGGCGAGCTTACGGGTCGAATAAAAAGAGAAGA
GAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGGAAA

QA 13 697 13 697
DS 



AS 1 2

CO CL5952Contig1 596 2 1 U
GGGGGACGCCGGAGCTGAAATTGAAGTGGATCCACCGATGGATGGAGATTCTTCGGCGGC
GGAATCTGGGTTCGTCGGAAAACCGGATCCCTCGCCGTTGAATCAAGGGGAGATATTGAG
AACACTTGCCACGGTGGAGAAGGATTCGAAGGCAATCGCGGAGAGCTTCTCGTCTCTCTT
TGTCTCCCTCCGATCGACTCTCTCTGAGGCTACAGGAAGCTCAGTTGATCACATGAGTTG
CTTTGGAGATGCAGCTGGACGTCTTCAGGAAACCGCTCTAGATGCATCCACTAAAGGGAA
CCGCTACATCAACTCCTGCCTCAGATTAAACGAGGAAATTAAAGGCGTTGAGACTCTGGC
CGCTCGGTTAAAGCACCTGAGGAGAAATGTGGATGTTCTTGACACGGCTGTGAACAAGCT
TCTCCGTCCTCCATGACAAGTCTATTAGCTTTTCACGGACTTTTATCACTTATTTCTCGT
ACATAAAGATTTTGATTATAACTGCTGTTTTTCTTTTTGTGACAAAATGTTTTACGTCGT
GAAACGTTTTTTTTTTAATTTGTTTCTTCAAATAATAAATTTCTATACGATCCCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ES42JQ C 1
AF RR2ES42TF U 1
BS 1 596 RR2ES42TF

RD RR2ES42JQ 596 0 0
GGGGGACGCCGGAGCTGAAATTGAAGTGGATCCACCGATGGATGGAGATTCTTCGGCGGC
GGAATCTGGGTTCGTCGGAAAACCGGATCCCTCGCCGTTGAATCAAGGGGAGATATTGAG
AACACTTGCCACGGTGGAGAAGGATTCGAAGGCAATCGCGGAGAGCTTCTCGTCTCTCTT
TGTCTCCCTCCGATCGACTCTCTCTGAGGCTACAGGAAGCTCAGTTGATCACATGAGTTG
CTTTGGAGATGCAGCTGGACGTCTTCAGGAAACCGCTCTAGATGCATCCACTAAAGGGAA
CCGCTACATCAACTCCTGCCTCAGATTAAACGAGGAAATTAAAGGCGTTGAGACTCTGGC
CGCTCGGTTAAAGCACCTGAGGAGAAATGTGGATGTTCTTGACACGGCTGTGAACAAGCT
TCTCCGTCCTCCATGACAAGTCTATTAGCTTTTCACGGACTTTTATCACTTATTTCTCGT
ACATAAAGATTTTGATTATAACTGCTGTTTTTCTTTTTGTGACAAAATGTTTTACGTCGT
GAAACGTTTTTTTTTTAATTTGTTTCTTCAAATAATAAATTTCTATACGATCCCTC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2ES42TF 596 0 0
GGGGGACGCCGGAGCTGAAATTGAAGTGGATCCACCGATGGATGGAGATTCTTCGGCGGC
GGAATCTGGGTTCGTCGGAAAACCGGATCCCTCGCCGTTGAATCAAGGGGAGATATTGAG
AACACTTGCCACGGTGGAGAAGGATTCGAAGGCAATCGCGGAGAGCTTCTCGTCTCTCTT
TGTCTCCCTCCGATCGACTCTCTCTGAGGCTACAGGAAGCTCAGTTGATCACATGAGTTG
CTTTGGAGATGCAGCTGGACGTCTTCAGGAAACCGCTCTAGATGCATCCACTAAAGGGAA
CCGCTACATCAACTCCTGCCTCAGATTAAACGAGGAAATTAAAGGCGTTGAGACTCTGGC
CGCTCGGTTAAAGCACCTGAGGAGAAATGTGGATGTTCTTGACACGGCTGTGAACAAGCT
TCTCCGTCCTCCATGACAAGTCTATTAGCTTTTCACGGACTTTTATCACTTATTTCTCGT
ACATAAAGATTTTGATTATAACTGCTGTTTTTCTTTTTGTGACAAAATGTTTTACGTCGT
GAAACGTTTTTTTTTTAATTTGTTTCTTCAAATAATAAATTTCTATACGATCCCTC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL5953Contig1 787 2 4 U
GGATTTCTCCTTCGTCTCTAAGCTCTTGAAGTCTTTGGTCCGTTGTTGAATTTTCAAGCT
TCTTTCTTCTGTTTTTGAACTGAATTTTCGTCTTTATTTGAAACTTAAGGAGAAGGGAGA
TGACGACTATGGAGAGTTTAATTGGATTGGTTAATAGAATTCAAAGAGCATGCACCGTGC
TCGGTGATTACGGTGGTGGAACTGGTGACAACGCGTTCAATTCTCTCTGGGAAGCTCTTC
CTACCGTCGCCGTCGTCGGTGGTCAGAGTTCTGGAAAATCTTCGGTTCTTGAGAGTATAG
TTGGGAGAGACTTTCTTCCTAGAGGATCCGGTATCGTTACGAGACGTCCTTTGGTGTTGC
AGCTGCACAAGACGGAGGAAGGAACAGAGGAGCATGCAGAGTTCCTCCATCTTCCCAAGA
AGCAATTCACAGACTTCGCTTTGGTCCGGAAGGAGATTCAAGATGAGACTGATAGAATCA
CAGGGAAGAGCAAACAGATATCTCCAGTTCCTATTCACCTCAGTATCTTCTCTCCAAATG
TTGTGAATCTGACCCTCGTTGACCTACCGGGTTTAACTAAAGTGGCTGTTGAGGGACAAC
CAGAAACCATCGTTGAAGATATCGAATCCATGGTTCGCACATACGTTGATAAGCCTAATT
GTATCATACTAGCTATATCTCCCGCCAACCAGGACATAGCTACTTCTGATGCAATCAAAC
TTGCAAAAGAAGTTGATCCAACAGCGAGAGAACATTTGGTGTTCTTACCAAGTTAGACCT
GATGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF02TF U 1
AF RR2GA15TF U 84
BS 1 343 RR2GF02TF
BS 344 344 RR2GA15TF
BS 345 727 RR2GF02TF
BS 728 787 RR2GA15TF

RD RR2GF02TF 727 0 0
GGATTTCTCCTTCGTCTCTAAGCTCTTGAAGTCTTTGGTCCGTTGTTGAATTTTCAAGCT
TCTTTCTTCTGTTTTTGAACTGAATTTTCGTCTTTATTTGAAACTTAAGGAGAAGGGAGA
TGACGACTATGGAGAGTTTAATTGGATTGGTTAATAGAATTCAAAGAGCATGCACCGTGC
TCGGTGATTACGGTGGTGGAACTGGTGACAACGCGTTCAATTCTCTCTGGGAAGCTCTTC
CTACCGTCGCCGTCGTCGGTGGTCAGAGTTCTGGAAAATCTTCGGTTCTTGAGAGTATAG
TTGGGAGAGACTTTCTTCCTAGAGGATCCGGTATCGTTACGAGGCGTCCTTTGGTGTTGC
AGCTGCACAAGACGGAGGAAGGAACAGAGGAGCATGCAGAGTTCCTCCATCTTCCCAAGA
AGCAATTCACAGACTTCGCTTTGGTCCGGAAGGAGATTCAAGATGAGACTGATAGAATCA
CAGGGAAGAGCAAACAGATATCTCCAGTTCCTATTCACCTCAGTATCTTCTCTCCAAATG
TTGTGAATCTGACCCTCGTTGACCTACCGGGTTTAACTAAAGTGGCTGTTGAGGGACAAC
CAGAAACCATCGTTGAAGATATCGAATCCATGGTTCGCACATACGTTGATAAGCCTAATT
GTATCATACTAGCTATATCTCCCGCCAACCAGGACATAGCTACTTCTGATGCAATCAAAC
TTGCAAA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2GA15TF 704 0 0
ATTTTCGTCTTTATTTGAAACTTAAGGAGAAGGGAGATGACGACTATGGAGAGTTTAATT
GGATTGGTTAATAGAATTCAAAGAGCATGCACCGTGCTCGGTGATTACGGTGGTGGAACT
GGTGACAACGCGTTCAATTCTCTCTGGGAAGCTCTTCCTACCGTCGCCGTCGTCGGTGGT
CAGAGTTCTGGAAAATCTTCTGTTCTTGAGAGTATAGTTGGTAGAGACTTTCTTCCTAGA
GGATCCGGTATCGTTACGGGACGTCCTTTGGTGTTGCAGCTTCACAAGACGGAGGAAGGA
ACAGAGGAGTATGCTGAGTTCCTCCATCTTCCCAAGAAGCAATTCACAGACTTCGCTTTG
GTCCGGAAGGAGATTCAAGATGAGACTGATAGAATCGCTGGGAAGAGTAAACAGATATCT
CCAGTTCCTATTCACCTCAGTATCTTCTCTCCAAATGTTGTGAATCTGACCCTCGTTGAC
TTACCGGGTTTAACTAAAGTGGCTGTTGAGGGACAACCAGAAACCATCGTTGAAGATATC
GAATCCATGGTTCGCACATACGTTGATAAGCCTAATTGTATCATACTAGCTATATCTCCG
GCCAACCAGGACATAGCTACTTCTGATGCAATCAAACTTGCAAAAGAAGTTGATCCAACA
GCGAGAGAACATTTGGTGTTCTTACCAAGTTAGACCTGATGGAC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL5954Contig1 706 2 2 U
GGGACAACTATTAAACTCCCCAAAAAGAAGCAACAACATTTGTTTCTCACGTAACTTCCC
CCAGAAAATCAGCAGAGAAAAAGATATCGACGACTATGGAGACGAAGGAGCATCATCTCG
GCGTTAGTGGACAGGACTGCATTGTCGACCTTTTGCCGAACGATGACGATGACCACTCCT
CTCCACCGTCCTCATGGCGTCTCAGCCTCGACACGTTCCGCCTCCCTTCTTCTTCCCCCT
TGTCCTCTCGCCGTACTCGCTTGTCCCGTTATCTCCGGACTCCAAAAAAGGAACGTAAAG
TCTCTGAGTACTACAAGAAGCAAGAGAAGCTGCTTCAGGGTTTCAATGAGATGGAGACGA
TCAACGAAACTGGTTTTGTCTCTGGAGCTCCAACCGAGGAAGAGATGAAGAAGCTTGCGA
AGAGCGAGAGGCTTGCAGTACACATCTCAAACGCAGCAAACCTTGTGCTCTTCGTAGCAA
AAGTTTATGCTTCTGTTGAGAGTAGATCCATGGCTGTGATTGCGTCAACTTTGGACTCCC
TCTTGGATCTTTTGTCTGGATTTATTCTATGGTTTACTGCAAATGCCATGAGCAAACCAA
ACCATTTCCACTATCCAATCGGTAAACGAAGGATGCAACCTGTGGGGATCATTGTGTTTG
CATCTGTGATGGCAACTCTTGGGCTACAAGTGTTGCTAGAGTCAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2GY09TF U 1
AF RR2H016TF U 1
BS 1 705 RR2GY09TF
BS 706 706 RR2H016TF

RD RR2GY09TF 705 0 0
GGGACAACTATTAAACTCCCCAAAAAGAAGCAACAACATTTGTTTCTCACGTAACTTCCC
CCAGAAAATCAGCAGAGAAAAAGATATCGACGACTATGGAGACGAAGGAGCATCATCTCG
GCGTTAGTGGACAGGACTGCATTGTCGACCTTTTGCCGAACGATGACGATGACCACTCCT
CTCCACCGTCCTCATGGCGTCTCAGCCTCGACACGTTCCGCCTCCCTTCTTCTTCCCCCT
TGTCCTCTCGCCGTACTCGCTTGTCCCGTTATCTCCGGACTCCAAAAAAGGAACGTAAAG
TCTCTGAGTACTACAAGAAGCAAGAGAAGCTGCTTCAGGGTTTCAATGAGATGGAGACGA
TCAACGAAACTGGTTTTGTCTCTGGAGCTCCAACCGAGGAAGAGATGAAGAAGCTTGCGA
AGAGCGAGAGGCTTGCAGTACACATCTCAAACGCAGCAAACCTTGTGCTCTTCGTAGCAA
AAGTTTATGCTTCTGTTGAGAGTAGATCCATGGCTGTGATTGCGTCAACTTTGGACTCCC
TCTTGGATCTTTTGTCTGGATTTATTCTATGGTTTACTGCAAATGCCATGAGCAAACCAA
ACCATTTCCACTATCCAATCGGTAAACGAAGGATGCAACCTGTGGGGATCATTGTGTTTG
CATCTGTGATGGCAACTCTTGGGCTACAAGTGTTGCTAGAGTCAA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2H016TF 706 0 0
GGGACAACTATTAAACTCCCCAAAAAGAAGCAACAACATTTGTTTCTCACGTAACTTCCC
CCAGAAAATCAGCAGAGAAAAAGATATCGACGACTATGGAGACGAAGGAGCATCATCTCG
GCGTTAGTGGACAGGACTGCATTGTCGACCTTTTGCCGAACGATGACGATGACCACTCCT
CTCCACCGTCCTCATGGCGTCTCAGCCTCGACACGTTCCGCCTCCCTTCTTCTTCCCCCT
TGTCCTCTCGCCGTACTCGCTTGTCCCGTTATCTCCGGACTCCAAAAAAGGAACGTAAAG
TCTCTGAGTACTACAAGAAGCAAGAGAAGCTGCTTCAGGGTTTCAATGAGATGGAGACGA
TCAACGAAACTGGTTTTGTCTCTGGAGCTCCAACCGAGGAAGAGATGAAGAAGCTTGCGA
AGAGCGAGAGGCTTGCAGTACACATCTCAAACGCAGCAAACCTTGTGCTCTTCGTAGCAA
AAGTTTATGCTTCTGTTGAGAGTAGATCCATGGCTGTGATTGCGTCAACTTTGGACTCCC
TCTTGGATCTTTTGTCTGGATTTATTCTATGGTTTACTGCAAATGCCATGAGCAAACCAA
ACCATTTCCACTATCCAATCGGTAAACGAAGGATGCAACCTGTGGGGATCATTGTGTTTG
CATCTGTGATGGCAACTCTTGGGCTACAAGTGTTGCTAGAGTCAAC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL5955Contig1 605 2 1 U
GGTATTATGACCAAATATGTACAGTAATAACTTTGAAGGAAATATAAAAAATAAAATTTA
CAGACAAAACATTGTTGATGTTCCTAGCCGGCTTTGTGTAAGTTGATGTTCAAAATCTAC
CGGATGACAAAAAAAAACATTATTGGTAAGTAATATCTTGATTACAAAAAAATGGTATCG
GAGTTTGAAGTTTGTTGACCGTCAATTCACTAAATAAATTCCTCGTATTCTTTAACAGTT
TCAATTAGAAAAACGAAAGGCTGGTACTCGAATCTAACCATAACCTACCTGATAAACACC
AAGGTTTGGATCTTGAGATGATCTTTATTTTTCTTGAACACCATCTAGAGATGATCTTGT
CCTATTTGTTTATAGAATAAAGAAAATATAAAAGCTGGATTCATGTGGGTCACATCCATC
ATTTATCGTGTTCTTCAATTCACCAACCTCAGGTTCGCATCTTTTGTACTTTCTTTCTAA
TTTAAATCTTCCAATACAACTTATGTTTCTTTATAAAAACGATATATTTAAAGCTTTGTA
AAGTTTATGTATATACACGTTGGCTACAAAGATTGAATATTTGTATATACAGTCTCGAGT
GTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2D384JQ C 1
AF RR2D384TF U 1
BS 1 605 RR2D384TF

RD RR2D384JQ 605 0 0
GGTATTATGACCAAATATGTACAGTAATAACTTTGAAGGAAATATAAAAAATAAAATTTA
CAGACAAAACATTGTTGATGTTCCTAGCCGGCTTTGTGTAAGTTGATGTTCAAAATCTAC
CGGATGACAAAAAAAAACATTATTGGTAAGTAATATCTTGATTACAAAAAAATGGTATCG
GAGTTTGAAGTTTGTTGACCGTCAATTCACTAAATAAATTCCTCGTATTCTTTAACAGTT
TCAATTAGAAAAACGAAAGGCTGGTACTCGAATCTAACCATAACCTACCTGATAAACACC
AAGGTTTGGATCTTGAGATGATCTTTATTTTTCTTGAACACCATCTAGAGATGATCTTGT
CCTATTTGTTTATAGAATAAAGAAAATATAAAAGCTGGATTCATGTGGGTCACATCCATC
ATTTATCGTGTTTTTCAATTCACCAACCTCAGGTTCGCATCTTTTGTACTTTCTTTTTAA
TTTAAATCTTCCAATACAACTTATGTTTCTTTATAAAAACGATATATTTAAAGCTTTGTA
AAGTTTATGTATATACACGTTGGCTACAAAGATTGAATATTTGTATATACAGTCTCGAGT
GTTCC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2D384TF 605 0 0
GGTATTATGACCAAATATGTACAGTAATAACTTTGAAGGAAATATAAAAAATAAAATTTA
CAGACAAAACATTGTTGATGTTCCTAGCCGGCTTTGTGTAAGTTGATGTTCAAAATCTAC
CGGATGACAAAAAAAAACATTATTGGTAAGTAATATCTTGATTACAAAAAAATGGTATCG
GAGTTTGAAGTTTGTTGACCGTCAATTCACTAAATAAATTCCTCGTATTCTTTAACAGTT
TCAATTAGAAAAACGAAAGGCTGGTACTCGAATCTAACCATAACCTACCTGATAAACACC
AAGGTTTGGATCTTGAGATGATCTTTATTTTTCTTGAACACCATCTAGAGATGATCTTGT
CCTATTTGTTTATAGAATAAAGAAAATATAAAAGCTGGATTCATGTGGGTCACATCCATC
ATTTATCGTGTTCTTCAATTCACCAACCTCAGGTTCGCATCTTTTGTACTTTCTTTCTAA
TTTAAATCTTCCAATACAACTTATGTTTCTTTATAAAAACGATATATTTAAAGCTTTGTA
AAGTTTATGTATATACACGTTGGCTACAAAGATTGAATATTTGTATATACAGTCTCGAGT
GTTCC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL5956Contig1 725 2 4 U
GATTATAAAGCTTCTGACAAAGAGCATCTCCCAAAAGATACAACAAAGCATAGTAAACAG
ACGAAGAGAAGGGAATATCATGGTGAAGAAAGTTCTCATCATAGAGGACACGGAGACTTC
TCTGCACGCACAGATGAGACTGTTAACAATGAGAAAATACCAAGGCAGGAGAGGACAAGT
GCTAAAAGTGACAATGTTATTAATTCTTCGGACGGCCAGCAATTGCAAGACAGAAAACAT
AGAGATTCCAGACGAAAGAATAAAGAACAACGAGAGGGTGCAGATTCAGTGAGGAGCAAG
CAAGGAGAAGAAAATGGCAGTTCCGAAGTTACGGGCTCAAAAGGTAAAACCGAAGCAAGA
AATCACAGGAATGAGATCCCACAGCAGCTTAACGTCACCAAAAGACACAAGGAGGATGCT
TCATCTGGTGATGAGCTACAAGATTCAAAGAGAGGACGTACGAAATTGGAGCGTTGGGCA
AGCCACAAAGAGAGAGATGATGCTGTCACTGTCAAGGCACCATCCACTTCTTCAAAAACT
TCAAGAGAAGGAAAAAGGGACTAATGGCAGAGTTAGCGAACCTGTCCATGGCTCTATTGA
CAAAAATCGGGATGTAACTGAAGAGAAAAGTGGCTATGACCTTGCAGAGACCAAAGATAG
AAGCGAGAAGGGACCTCCCGGAGGAGATCGGCACTTGGACACGGTGAGAACTCAAGAAAC
GTAGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2AT25TF U 1
AF RR2H107TF U 1
BS 1 535 RR2AT25TF
BS 536 536 RR2H107TF
BS 537 601 RR2AT25TF
BS 602 725 RR2H107TF

RD RR2AT25TF 601 0 0
GATTATAAAGCTTCTGACAAAGAGCATCTCCCAAAAGATACAACAAAGCATAGTAAACAG
ACGAAGAGAAGGGAATATCATGGTGAAGAAAGTTCTCATCATAGAGGACACGGAGACTTC
TCTGCACGCACAGATGAGACTGTTAACAATGAGAAAATACCAAGGCAGGAGAGGACAAGT
GCTAAAAGTGACAATGTTATTAATTCTTCGGACGGCCAGCAATTGCAAGACAGAAAACAT
AGAGATTCCAGACGAAAGAATAAAGAACAACGAGAGGGTGCAGATTCAGTGAGGAGCAAG
CAAGGAGAAGAAAATGGCAGTTCCGAAGTTACGGGCTCAAAAGGTAAAACCGAAGCAAGA
AATCACAGGAATGAGATCCCACAGCAGCTTAACGTCACCAAAAGACACAAGGAGGATGCT
TCATCTGGTGATGAGCTACAAGATTCAAAGAGAGGACGTACGAAATTGGAGCGTTGGGCA
AGCCACAAAGAGAGAGATGATGCTGTCACTGTCAAGGCACCATCCACTTCTTCAACAACT
TCAAGAGAAGGAAAAAGGGACTAATGGCAGAGTTAGCGAACCTGTCCATGGCTCTATTGA
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2H107TF 725 0 0
GATTATAAAGCTTCTGACAAAGAGCATCTCCCAAAAGATACAACAAAGCATAGTAAACAG
ACGAAGAGAAGGGAATATCATGGTGAAGAAAGTTCTCATCATAGAGGACACGGAGACTTC
TCTGCACGCACAGATGAGACTGTTAACAATGAGAAAATACCAAGGCAGGAGAGGACAAGT
GCTAAAAGTGACAATGTTATTAATTCTTCGGACGGCCAGCAATTGCAAGACAGAAAACAT
AGAGATTCCAGACGAAAGAATAAAGAACAACGAGAGGGTGCAGATTCAGTGAGGAGCAAG
CAAGGAGAAGAAAATGGCAGTTCCGAAGTTACGGGCTCAAAAGGTAAAACCGAAGCAAGA
AATCACAGGAATGAGATCCCACAGCAGCTTAACGTCACCAAAAGACACAAGGAGGATGCT
TCATCTGGTGATGAGCTACAAGATTCAAAGAGAGGACGTACGAAATTGGAGCGTTGGGCA
AGCCACAAAGAGAGAGATGATGCTGTCACTGTCAAGGCACCATCCACTTCTTCAAAAACT
TCAAGAGAAGGAAAAAGGGACTAATGGCAGAGTTAGCGAACCTGTCCATGGCTCTATTGA
CAAAAATCGGGATGTAACTGAAGAGAAAAGTGGCTATGACCTTGCAGAGACCAAAGATAG
AAGCGAGAAGGGACCTCCCGGAGGAGATCGGCACTTGGACACGGTGAGAACTCAAGAAAC
GTAGT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL5957Contig1 920 2 8 U
GAAACATCATATCCTTCCATATCATCCAACTTTGAGTATAACATTTTGCTCTCCTCTCTA
CTTCTCTTCAAGATCCAGTAATATCGCATGGCTGAGGTTATGCTACCGATGAAAATGGAG
ATGGCTAACGCTCCTTCCAAGTTTAAATCACCTGATCTTCTTCATGTTCTCGCCGTCGAC
GATAGCCACATTGATCGGAAATTCATAGAGCGCTTGCTCAAAGTCTCTTCCTGTAAAGTT
ACTGTTGTTGATAGTGCCACAAGAGCTTTGCAATACCTTGGACTGGACGTAAACGAGAAA
CCCGTTAGTGTTAAGGATTTGAAAGTTAATTTGATTATGACGGATTACTCTATGCCCGGA
ATGACTGGATATGAACTCTCGAAGAAGATCAAAGAATCCTCAGCTTTCAGAGATGTGCCT
GTGGTTGTTATGTCCTCTGAGAACATTTTGCCTCGTATTGATAGACGTCTTGAAGAAGGT
GCTGAAGATTTCTTATTGAAACCTGTAAAACTCTCGGATGTAAGAAGAATAAGAGATTCT
CTGATGAAAGCTGAAGAAGATCTATCTTTCACGAAGAGTGTTAACAAGAGAGAGCTAGAA
ACAGAGAATGTCTACTCTTTGGATTCATCTGTTCCCTCACAACAGCTCAAACGCACAAAG
ATCTGAGCTTTTCCCAAAGCAGACTCCCATGACATGAGCTTAAAAAGGCTTAATCACCTA
TACAATTTTCCACCCCCTTGCGTCTTCTTTTTTGCTGAGTAAAACTCTCGGTGTTGACAG
AGAAACAGGGCTTATTCACATGACTGTTAGCGATGTAAATGGTAGAGATAAACCAATTAT
ATTATTATTCATTAGAGATGTCATGTTTTTTTCTTCTTACAAGAGATTGTAAGCTGGTTT
TATGAAAGTTGGCTAATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG75TF U 1
AF RR2DC74JQ C 178
BS 1 379 RR2GG75TF
BS 380 380 RR2DC74JQ
BS 381 465 RR2GG75TF
BS 466 466 RR2DC74JQ
BS 467 515 RR2GG75TF
BS 516 516 RR2DC74JQ
BS 517 702 RR2GG75TF
BS 703 920 RR2DC74JQ

RD RR2GG75TF 702 0 0
GAAACATCATATCCTTCCATATCATCCAACTTTGAGTATAACATTTTGCTCTCCTCTCTA
CTTCTCTTCAAGATCCAGTAATATCGCATGGCTGAGGTTATGCTACCGATGAAAATGGAG
ATGGCTAACGCTCCTTCCAAGTTTAAATCACCTGATCTTCTTCATGTTCTCGCCGTCGAC
GATAGCCACATTGATCGGAAATTCATAGAGCGCTTGCTCAAAGTCTCTTCCTGTAAAGTT
ACTGTTGTTGATAGTGCCACAAGAGCTTTGCAATACCTTGGACTGGACGTAAACGAGAAA
CCCGTTAGTGTTAAGGATTTGAAAGTTAATTTGATTATGACGGATTACTCTATGCCCGGA
ATGACTGGATATGAACTCTTGAAGAAGATCAAAGAATCCTCAGCTTTCAGAGATGTGCCT
GTGGTTGTTATGTCCTCTGAGAACATTTTGCCTCGTATTGATAGATGTCTTGAAGAAGGT
GCTGAAGATTTCTTATTGAAACCTGTAAAACTCTCTGATGTAAGAAGAATAAGAGATTCT
CTGATGAAAGCTGAAGAAGATCTATCTTTCACGAAGAGTGTTAACAAGAGAGAGCTAGAA
ACAGAGAATGTCTACTCTTTGGATTCATCTGTTCCCTCACAACAGCTCAAACGCACAAAG
ATCTGAGCTTTTCCCAAAGCAGACTCCCATGACATGAGCTTA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2DC74JQ 743 0 0
GACGATAGCCACGTTGATCGGAAATTCATAGAGCGCTTGCTCAAAGTCTCTTCCTGTAAA
GTTACTGTTGTTGATAGTGCCACAAGAGCTTTGCAATACCTTGGACTGGACGTAAACGAG
AAACCCGTTGGTGTTAAGGATTTGAAAGTTAATTTGATTATGACGGATTACTCTATGCCC
GGAATGACTGGATATGAACTCTCGAAGAAGATCAAAGAATCCTCAGCTTTCAGAGATGTG
CCTGTGGTTGTTATGTCCTCTGAGAACATTTTGCCTCGTATTGATAGACGTCTTGAAGAA
GGTGCTGAAGATTTCTTATTGAAACCTGTAAAACTCTCGGATGTAAGAAGAATAAGAGAT
TCTCTGATGAAAGCTGAAGAAGATCTATCTTTCACGAAGAGTGTTAACAAGAGAGAGCTA
GAAACAGAGAATGTCTACTCTTTGGATTCATCTGTTCCCTCACAACAGCTCAAACGCACA
AAGATCTGAGCTTTTCCCAAAGCAGACTCCCATGACATGAGCTTAAAAAGGCTTAATCAC
CTATACAATTTTCCACCCCCTTGCGTCTTCTTTTTTGCTGAGTAAAACTCTCGGTGTTGA
CAGAGAAACAGGGCTTATTCACATGACTGTTAGCGATGTAAATGGTAGAGATAAACCAAT
TATATTATTATTCATTAGAGATGTCATGTTTTTTTCTTCTTACAAGAGATTGTAAGCTGG
TTTTATGAAAGTTGGCTAATTAT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL5958Contig1 1124 2 2 U
GGCTGATTGCGAAGAGCAGAGAAAGCTAGAAGCAGCGAAACCCTAGAAGTTTGAATAATG
GTGAAGCTCACGGCTGATTTGATCTGGAACAGTCCTCACTTCTTCAATGCCGTTAAGGAG
CGAGAATTGGAGCTACGAGGTAACAAGATTCCTGTAATCGAGAACTTGGGTGCTACTGAG
GACCAGTTCGATACAATTGATTTGTCTGATAATGAGATAGTTAAGCTGGAAAACTTCCCA
CTCCTCAACCGCTTAGGGACTTTGATCATAAACAACAATCGGATCACCAGGATCAATCCT
AATATTGGAGAGTTCCTACCGAAGCTGCACACTCTGGTTCTCACAAACAACAGGCTTGTG
AATTTGGTTGAAATCGACCCCCTTGCCTCCATTCCAAAGCTTCAGTACCTTAGTTTACTG
GATAATAATATCACCAAAAAGCCGAATTATCGCCTCTATGTGATTCACAAGCTTAAATCA
CTTCGAGTTCTGGACTTTGTAAAAGTCAAAGCCAAGGAGAGAGCTGAAGCTGCGGCTTTG
TTTTCACCTAAGGAAGCCGAAGAGGAGGTTAAGAAGGTATCTCAGCAGGAGGTTCAAAAA
TTGTCGGATACTACAGAAGAGCCAGAGACTCCAAAAGTGGTGGCCCCAACACAGGAGCAA
ATTTTAGCAATCAAGGCTGCAATTATAAACTCCCAGACGATAGAAGAAATTGCAAGACTC
GAACAGGCTTTGAAGTTTGGCCAGGTTCCTGCAGGACTGATAGTTCCTGATCCTGCATCT
GGTGTTAATGACGGTTCTGGTCCTATGGAGGAATAGAAAGTGTGTCAGTTGAGCTCGAAT
GCTCTAACAGATATCATGTCTGACAAGCTTGACGCTCATATAAGGTTAATGTCGCTTCCT
TAGGAAATTGTAAACTACGTGTGCTCAAGAGCATCTGTTTTATGAATCCTTGAAAAGAGT
GGCATAGAGGAGATTGTAATTTTTAGTCTGCAGTAGCAGGGAGAGATATGGTGAACACAG
AATTTTCCAATGCTCTTTTTTCGCAAATATAGTCTCTTCTAATTTTGTCAGACACGAATG
TGAACTTTCTACCTCTCGTTAACATATGAACTCGAGTTAGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC41TF U 1
AF RR2CC41JQ C 396
BS 1 650 RR2CC41TF
BS 651 1124 RR2CC41JQ

RD RR2CC41TF 650 0 0
GGCTGATTGCGAAGAGCAGAGAAAGCTAGAAGCAGCGAAACCCTAGAAGTTTGAATAATG
GTGAAGCTCACGGCTGATTTGATCTGGAACAGTCCTCACTTCTTCAATGCCGTTAAGGAG
CGAGAATTGGAGCTACGAGGTAACAAGATTCCTGTAATCGAGAACTTGGGTGCTACTGAG
GACCAGTTCGATACAATTGATTTGTCTGATAATGAGATAGTTAAGCTGGAAAACTTCCCA
CTCCTCAACCGCTTAGGGACTTTGATCATAAACAACAATCGGATCACCAGGATCAATCCT
AATATTGGAGAGTTCCTACCGAAGCTGCACACTCTGGTTCTCACAAACAACAGGCTTGTG
AATTTGGTTGAAATCGACCCCCTTGCCTCCATTCCAAAGCTTCAGTACCTTAGTTTACTG
GATAATAATATCACCAAAAAGCCGAATTATCGCCTCTATGTGATTCACAAGCTTAAATCA
CTTCGAGTTCTGGACTTTGTAAAAGTCAAAGCCAAGGAGAGAGCTGAAGCTGCGGCTTTG
TTTTCACCTAAGGAAGCCGAAGAGGAGGTTAAGAAGGTATCTCAGCAGGAGGTTCAAAAA
TTGTCGGATACTACAGAAGAGCCAGAGACTCCAAAAGTGGTGGCCCCAAC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2CC41JQ 729 0 0
AAAGCTTCAGTAC*TTAGTTTACTGGATAATAATATCACCAAAAAGCCGAATTATCGCCT
CTATGTGATTCACAAGCTTAAATCACTTCGAGTTCTGGACTTTGTAAAAGTCAAAGCCAA
GGAGAGAGCTGAAGCTGCGGCTTTGTTTTCACCTAAGGAAGCCGAAGAGGAGGTTAAGAA
GGTATCTCAGCAGGAGGTTCAAAAATTGTCGGATACTACAGAAGAGCCAGAGACTCCAAA
AGTGGTGGCCCCAACACAGGAGCAAATTTTAGCAATCAAGGCTGCAATTATAAACTCCCA
GACGATAGAAGAAATTGCAAGACTCGAACAGGCTTTGAAGTTTGGCCAGGTTCCTGCAGG
ACTGATAGTTCCTGATCCTGCATCTGGTGTTAATGACGGTTCTGGTCCTATGGAGGAATA
GAAAGTGTGTCAGTTGAGCTCGAATGCTCTAACAGATATCATGTCTGACAAGCTTGACGC
TCATATAAGGTTAATGTCGCTTCCTTAGGAAATTGTAAACTACGTGTGCTCAAGAGCATC
TGTTTTATGAATCCTTGAAAAGAGTGGCATAGAGGAGATTGTAATTTTTAGTCTGCAGTA
GCAGGGAGAGATATGGTGAACACAGAATTTTCCAATGCTCTTTTTTCGCAAATATAGTCT
CTTCTAATTTTGTCAGACACGAATGTGAACTTTCTACCTCTCGTTAACATATGAACTCGA
GTTAGTTTC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL5959Contig1 1062 2 2 U
AATCGTGTTCTCATCTTCAAGCCATGACCGGTAAGGAAGTTCTCCACAAGATGAAGGAAA
CCGTCAAGGAGAAAGTTGGGCTTGGTGGGTCTGCAGATTCAGGGAAAGGCAAGAGCAAGA
TGTCAAAGCAGATCACACATGGTTTCCACTTGTTGAAAGGGAAAGCTCTCCACGAGATGG
AAGATTACGTGGTTGCCAAGTTTAAAGAAGTCGATGACAATGAGCTTGGCCTCTTTGCTA
TATTCGATGGGCATCTAAGCCACGAGATTCCTGACTACTTGTGCTCCCATTTGTTTGACA
ACATCTTGAAAGAGCCAAATTTCTGGCAAGAACCTGAGAAAGCGATCAAGAAAGCTTACT
ACATAACAGACACTAAGATTCTGGACAAAGCTTCTGACTTGGGGAAGGGTGGTTCCACTG
CTGCGACTGCTATACTAATCAACTGTCAGAAGTTAGTAGTTGCTAACGTTGGTGACTCTC
GAGCTGTTTTTTGCAAAGGTGGTGTTGCCAAGCCACTCTCTGTTGATCATGAGCCAAACA
TGGAGAAGGATGAAGTAGAGAACAGAGGCGGATTCGTTTCAAACTTTCCTGGGGACGTTC
CTAGAGTTGATGGTCAACTGGCTGTGACAAGAGCCTTTGGTGATAAGAGTTTGAAGATGC
ATTTGAGTTCAGAACCATATGTTACAGTGGAGATCATTGGTGATGATGCAGAGTTTCTTA
TCCTCGCAAGTGATGGACTTTGGAAAGGTCATGTCTAATCAAGAAGCGGTTGACTCGGTT
AAGGGAATAAAAGATGCAAAGTCTGCAGCAAAGCACCTTGCAGAAGAGGCTGTTGCAAGA
AAAAGTTCAGATGATATCTCAGTGGTGGTCGTGAAGTTCCAGTGAGCTCGCTTCACGGAG
GGAAGAAGAGAGACGTCTGGTGATTCCATTTTTTCATAGAGAGGAGAATGCGTATTTACG
TTTGTATACATGCAGTTTTTGAAGATATCTACAAACAAAAAAGATTGTTACTTTTCGTAG
CTTAATTCATTGTTTTAAAGCTAATAAAAGCAAATTGAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA45TF U 1
AF RR2AA45JQ C 174
BS 1 775 RR2AA45TF
BS 776 1062 RR2AA45JQ

RD RR2AA45TF 775 0 0
AATCGTGTTCTCATCTTCAAGCCATGACCGGTAAGGAAGTTCTCCACAAGATGAAGGAAA
CCGTCAAGGAGAAAGTTGGGCTTGGTGGGTCTGCAGATTCAGGGAAAGGCAAGAGCAAGA
TGTCAAAGCAGATCACACATGGTTTCCACTTGTTGAAAGGGAAAGCTCTCCACGAGATGG
AAGATTACGTGGTTGCCAAGTTTAAAGAAGTCGATGACAATGAGCTTGGCCTCTTTGCTA
TATTCGATGGGCATCTAAGCCACGAGATTCCTGACTACTTGTGCTCCCATTTGTTTGACA
ACATCTTGAAAGAGCCAAATTTCTGGCAAGAACCTGAGAAAGCGATCAAGAAAGCTTACT
ACATAACAGACACTAAGATTCTGGACAAAGCTTCTGACTTGGGGAAGGGTGGTTCCACTG
CTGCGACTGCTATACTAATCAACTGTCAGAAGTTAGTAGTTGCTAACGTTGGTGACTCTC
GAGCTGTTTTTTGCAAAGGTGGTGTTGCCAAGCCACTCTCTGTTGATCATGAGCCAAACA
TGGAGAAGGATGAAGTAGAGAACAGAGGCGGATTCGTTTCAAACTTTCCTGGGGACGTTC
CTAGAGTTGATGGTCAACTGGCTGTGACAAGAGCCTTTGGTGATAAGAGTTTGAAGATGC
ATTTGAGTTCAGAACCATATGTTACAGTGGAGATCATTGGTGATGATGCAGAGTTTCTTA
TCCTCGCAAGTGATGGACTTTGGAAAGGTCATGTCTAATCAAGAAGCGGTTGACT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2AA45JQ 889 0 0
GAGATGGAAGATTACGTGGTTGCCAAGTTTAAAGAAGTCGATGACAATGAGCTTGGCCTC
TTTGCTATATTCGATGGGCATCTAAGCCACGAGATTCCTGACTACTTGTGCTCCCATTTG
TTTGACAACATCTTGAAAGAGCCAAATTTCTGGCAAGAACCTGAGAAAGCGATCAAGAAA
GCTTACTACATAACAGACACTAAGATTCTGGACAAAGCTTCTGACTTGGGGAAGGGTGGT
TCCACTGCTGCGACTGCTATACTAATCAACTGTCAGAAGTTAGTAGTTGCTAACGTTGGT
GACTCTCGAGCTGTTTTTTGCAAAGGTGGTGTTGCCAAGCCACTCTCTGTTGATCATGAG
CCAAACATGGAGAAGGATGAAGTAGAGAACAGAGGCGGATTCGTTTCAAACTTTCCTGGG
GACGTTCCTAGAGTTGATGGTCAACTGGCTGTGACAAGAGCCTTTGGTGATAAGAGTTTG
AAGATGCATTTGAGTTCAGAACCATATGTTACAGTGGAGATCATTGGTGATGATGCAGAG
TTTCTTATCCTCGCAAGTGATGGACTTTGGAA*GGTCATGTCTAATCAAGAAGCGGTTGA
CTCGGTTAAGGGAATAAAAGATGCAAAGTCTGCAGCAAAGCACCTTGCAGAAGAGGCTGT
TGCAAGAAAAAGTTCAGATGATATCTCAGTGGTGGTCGTGAAGTTCCAGTGAGCTCGCTT
CACGGAGGGAAGAAGAGAGACGTCTGGTGATTCCATTTTTTCATAGAGAGGAGAATGCGT
ATTTACGTTTGTATACATGCAGTTTTTGAAGATATCTACAAACAAAAAAGATTGTTACTT
TTCGTAGCTTAATTCATTGTTTTAAAGCTAATAAAAGCAAATTGAAAAG

QA 1 889 1 889
DS 



AS 1 2

CO CL5960Contig1 955 2 2 U
GGATCTCACTCTCTCTAACACACACAACATTTAATCTCAGCCGTTCGATCTCTCTCCCAT
CATGCCGATCAGGAACATCGCCGTTGGCCGTCCCGATGAGGCCACCCGCCCCGACGCCTT
GAAGGCGGCGTTGGCTGAGTTCATATCAACTATGATCTTTGTCTTCGCCGGCTCAGGCTC
CGGAATGGCTTTCAACAAGCTCACTGAAAACGGTGCCACCACTCCCGCCGGCCTCGTAGC
CGCCTCACTGGCACACGCTTTCGGACTCTTTGTCGCCGTCTCCGTCGGCGCCAACATCTC
CGGTGGACACGTTAACCCTGCCGTCACTTTCGGCGCTTTCGTAGGTGGCAACATCACTCT
CCTCCGTGGTATACTCTACTGGATTGCTCAGCTACTCGGCTCAGTCGTTGCTTGTCTCCT
CCTCAAGTTCGCCACCGGCGGTCTGGTTGTGCCGGCTTTTGGCCTCTCCGCCGGAGTAGG
AGTGTCCAACGCTTTGGTTTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTTGTTTACACGGTCTA
CGCCACCGCCGTCGACCCCAAGAACGGAAGTCTTGGAACCATCGCTCCCATCGCAATCGG
TTTCATTGTCGGTGCCAACATCTTAGCCGGAGGAGCATTCAGCGGAGCCTCCATGAACCC
CGCCGTGGCTTTCGGACCAGCTGTGGTAAGCTGGTCGTGGAACAACCACTGGGTCTACTG
GGCCGGACCTCTTATTGGCGGTGGAATCGCTGGACTCATCTACGAGGTTTTCTTCATCAA
CACCACCCACGAACAGCTCCCCACCACCGACTACTGAATCAATCTCTCTGTTTCTCTCAT
GTGTAATTTGATTTGTCGTCTTTGAGTTTTAATGCTTTTTCCCGTTTGTGTAATTTCGCA
TCAGCATGGCTTTATGACCGTTGGTTCTTTTCAGATTAATCATTTTCTGTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX86TF U 1
AF RR2CX86JQ C 192
BS 1 737 RR2CX86TF
BS 738 955 RR2CX86JQ

RD RR2CX86TF 737 0 0
GGATCTCACTCTCTCTAACACACACAACATTTAATCTCAGCCGTTCGATCTCTCTCCCAT
CATGCCGATCAGGAACATCGCCGTTGGCCGTCCCGATGAGGCCACCCGCCCCGACGCCTT
GAAGGCGGCGTTGGCTGAGTTCATATCAACTATGATCTTTGTCTTCGCCGGCTCAGGCTC
CGGAATGGCTTTCAACAAGCTCACTGAAAACGGTGCCACCACTCCCGCCGGCCTCGTAGC
CGCCTCACTGGCACACGCTTTCGGACTCTTTGTCGCCGTCTCCGTCGGCGCCAACATCTC
CGGTGGACACGTTAACCCTGCCGTCACTTTCGGCGCTTTCGTAGGTGGCAACATCACTCT
CCTCCGTGGTATACTCTACTGGATTGCTCAGCTACTCGGCTCAGTCGTTGCTTGTCTCCT
CCTCAAGTTCGCCACCGGCGGTCTGGTTGTGCCGGCTTTTGGCCTCTCCGCCGGAGTAGG
AGTGTCCAACGCTTTGGTTTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTTGTTTACACGGTCTA
CGCCACCGCCGTCGACCCCAAGAACGGAAGTCTTGGAACCATCGCTCCCATCGCAATCGG
TTTCATTGTCGGTGCCAACATCTTAGCCGGAGGAGCATTCAGCGGAGCCTCCATGAACCC
CGCCGTGGCTTTCGGACCAGCTGTGGTAAGCTGGTCGTGGAACAACCACTGGGTCTACTG
GGCCGGACCTCTTATTG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2CX86JQ 764 0 0
TCAACAAGCTCACTGAAAACGGTGCCACCACTCCCGCCGGC*TCGTAGCCGC*TCACTGG
CACACGCTTTCGGACTCTTTGTCGCCGTCTCCGTCGGCGCCAACATCTCCGGTGGACACG
TTAACCCTGCCGTCACTTTCGGCGCTTTCGTAGGTGGCAACATCACTCTCCTCCGTGGTA
TACTCTACTGGATTGCTCAGCTACTCGGCTCAGTCGTTGCTTGTCTCCTCCTCAAGTTCG
CCACCGGCGGTCTGGTTGTGCCGGCTTTTGGCCTCTCCGCCGGAGTAGGAGTGTCCAACG
CTTTGGTTTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTTGTTTACACGGTCTACGCCACCGCCG
TCGACCCCAAGAACGGAAGTCTTGGAACCATCGCTCCCATCGCAATCGGTTTCATTGTCG
GTGCCAACATCTTAGCCGGAGGAGCATTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCCGCCGTGGCTT
TCGGACCAGCTGTGGTAAGCTGGTCGTGGAACAACCACTGGGTCTACTGGGCCGGACCTC
TTATTGGCGGTGGAATCGCTGGACTCATCTACGAGGTTTTCTTCATCAACACCACCCACG
AACAGCTCCCCACCACCGACTACTGAATCAATCTCTCTGTTTCTCTCATGTGTAATTTGA
TTTGTCGTCTTTGAGTTTTAATGCTTTTTCCCGTTTGTGTAATTTCGCATCAGCATGGCT
TTATGACCGTTGGTTCTTTTCAGATTAATCATTTTCTGTTGATT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL5961Contig1 869 2 2 U
GCCTCTGCAAAGACCAGACGAAATCCACATCCCAAACCCTTCCTGGATGCAGCGATCGCC
TCCTTACGAAGAGGCTCCCAACGAGCAAGGGATCCCCACTATGATCACTTGGTGCCACGG
CGGCAAAGACATCTCTGTTGAAGGATCTTGGGATAATTGGAAGTCAAGAAGTCGGCTCCA
GAGATCTGGTAAAGACTTTACTATAATGAAAGTGCTTCCTTCAGGTGTCTATGAGTACAG
GTTCATCGTCGATGGTCAGTGGATGCACGCCCCTGAGCTCCCTTTTGCTCGTGATGACGC
TGGCAACACTTTCAACCTTTTGGACCTCCAGGACTATGTTCCTGAAGACATTCAAAGCAT
ATCTGGATTCGAGCCTCCACAATCTCCAGAGGCTAGTTACAGCAGCTTGCTTCTTGGAGC
TGAGGACTACTCCAAAGAACCGCCTCTCGTTCCGCCTCACTTGCAGATGACTCTGCTGAA
CCTCCCGCCAGGCAACAACCCTGACGTTCCCTCGCCGCCGCTGCCGAGACCTCAGCATGT
TATTCTCAATCATCTCTACATGCAGAAGGGCAAGAGCGGTCCTTCTGTGGTTGCCCTTGG
TTCCACTAACTGCTTTTTGGCCAAGTATGTAACCGTGGTGCTCTACAAGTCCCTCCAGAG
GTGATCTGAGTTTACATGCGGTTATCTAAGTTTGGTGTTTTTAAAAGTTAACTCATGGAG
AATGGGTGAGAGATTAGTAATTGCTAGCAAAGTTATTATTGTAAAGCCGGCAAATCTCTC
TCTTTTTTTTGGGTTTTAGTTTGTTTGGCTTTCAAGTTTTCACAACAGTTGTCTCACACC
TGCTAGTCTTACTATATTATTGTTTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AI49TF U 1
AF RR2AI49JQ C 152
BS 1 734 RR2AI49TF
BS 735 869 RR2AI49JQ

RD RR2AI49TF 734 0 0
GCCTCTGCAAAGACCAGACGAAATCCACATCCCAAACCCTTCCTGGATGCAGCGATCGCC
TCCTTACGAAGAGGCTCCCAACGAGCAAGGGATCCCCACTATGATCACTTGGTGCCACGG
CGGCAAAGACATCTCTGTTGAAGGATCTTGGGATAATTGGAAGTCAAGAAGTCGGCTCCA
GAGATCTGGTAAAGACTTTACTATAATGAAAGTGCTTCCTTCAGGTGTCTATGAGTACAG
GTTCATCGTCGATGGTCAGTGGATGCACGCCCCTGAGCTCCCTTTTGCTCGTGATGACGC
TGGCAACACTTTCAACCTTTTGGACCTCCAGGACTATGTTCCTGAAGACATTCAAAGCAT
ATCTGGATTCGAGCCTCCACAATCTCCAGAGGCTAGTTACAGCAGCTTGCTTCTTGGAGC
TGAGGACTACTCCAAAGAACCGCCTCTCGTTCCGCCTCACTTGCAGATGACTCTGCTGAA
CCTCCCGCCAGGCAACAACCCTGACGTTCCCTCGCCGCCGCTGCCGAGACCTCAGCATGT
TATTCTCAATCATCTCTACATGCAGAAGGGCAAGAGCGGTCCTTCTGTGGTTGCCCTTGG
TTCCACTAACTGCTTTTTGGCCAAGTATGTAACCGTGGTGCTCTACAAGTCCCTCCAGAG
GTGATCTGAGTTTACATGCGGTTATCTAAGTTTGGTGTTTTTAAAAGTTAACTCATGGAG
AATGGGTGAGAGAT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2AI49JQ 718 0 0
GATAATTGGAAGTCAAGAAGTCGGCTCCAGAGATCTGGTAAAGACTTTACTATAATGAAA
GTGCTTCCTTCAGGTGTCTATGAGTACAGGTTCATCGTCGATGGTCAGTGGATGCACGCC
CCTGAGCTCCCTTTTGCTCGTGATGACGCTGGCAACACTTTCAACCTTTTGGACCTCCAG
GACTATGTTCCTGAAGACATTCAAAGCATATCTGGATTCGAGCCTCCACAATCTCCAGAG
GCTAGTTACAGCAGCTTGCTTCTTGGAGCTGAGGACTACTCCAAAGAACCGCCTCTCGTT
CCGCCTCACTTGCAGATGACTCTGCTGAACCTCCCGCCAGGCAACAACCCTGACGTTCCC
TCGCCGCCGCTGCCGAGACCTCAGCATGTTATTCTCAATCATCTCTACATGCAGAAGGGC
AAGAGCGGTCCTTCTGTGGTTGCCCTTGGTTCCACTAACTGCTTTTTGGCCAAGTATGTA
ACCGTGGTGCTCTACAAGTCCCTCCAGAGGTGATCTGAGTTTACATGCGGTTATCTAAGT
TTGGTGTTTTTAAAAGTTAACTCATGGAGAATGGGTGAGAGATTAGTAATTGCTAGCAAA
GTTATTATTGTAAAGCCGGCAAATCTCTCTCTTTTTTTTGGGTTTTAGTTTGTTTGGCTT
TCAAGTTTTCACAACAGTTGTCTCACACCTGCTAGTCTTACTATATTATTGTTTGGCC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL5962Contig1 739 2 2 U
GGGCACTAGTCTTTCTCTCCTCTAACTCCGCCGTCGTCTGTACTTTCACTGGTGCAGGAG
ATCGAAATGGCAACAGTTCCAGGACAGCTAGTCTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACTGT
TTCTTGGTCAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAAGTTCAGTTCAGCAAAGAGAGCAAC
AACCTCTGCAACCTCAACTCTTGCAAGCACTCTGGTTTGGCGAACAAGAAGACAGTGACC
ATTCAGGTAGCTGACAAGGAGCAAGGTGTGGTACTCGGAACTACCAAGACCAAGAAGCAG
AACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCTAGGATGGCC
AAAGCTGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAGCG
CTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAGGGTCTTAGAGTCGCCAAGTCTGGTCCCAAGAGG
AGGAACAGGCAGGCTTGAAGAATCCACCACTGAACGAACATTTTTACTTCTAAAAGAAAA
GTTTGTTTTGAGAGTTTCAGGCAGTGCTTGTAGGTTAAAGATTATTTTTGGATAGCTGAG
AATCTTTGCTTGAAACACCTCGGTTGTTAATCCTTTTCTCAAAAAATGATATTAAAAACT
ATTTTTAATATTGTATTCCAGCTAAAGAGTGCCATATCTTGTAGAATCTGAAATGAATTA
AAGAACAGGTTAAATCTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP28JQ C 1
AF RR2AP28TF U 1
BS 1 724 RR2AP28TF
BS 725 739 RR2AP28JQ

RD RR2AP28JQ 739 0 0
GGGCACTAGTCTTTCTCTCCTCTAACTCCGCCGTCGTCTGTACTTTCACTGGTGCAGGAG
ATCGAAATGGCAACAGTTCCAGGACAGCTAGTCTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACTGT
TTCTTGGTCAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAAGTTCAGTTCAGCAAAGAGAGCAAC
AACCTCTGCAACCTCAACTCTTGCAAGCACTCTGGTTTGGCGAACAAGAAGACAGTGACC
ATTCAGGTAGCTGACAAGGAGCAAGGTGTGGTACTCGGAACTACCAAGACCAAGAAGCAG
AACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCTAGGATGGCC
AAAGCTGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAGCG
CTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAGGGTCTTAGAGTCGCCAAGTCTGGTCCCAAGAGG
AGGAACAGGCAGGCTTGAAGAATCCACCACTGAACGAACATTTTTACTTCTAAAAGAAAA
GTTTGTTTTGAGAGTTTCAGGCAGTGCTTGTAGGTTAAAGATTATTTTTGGATAGCTGAG
AATCTTTGCTTGAAACACCTCGGTTGTTAATCCTTTTCTCAAAAAATGATATTAAAAACT
ATTTTTAATATTGTATTCCAGCTAAAGAGTGCCATATCTTGTAGAATCTGAAATGAATTA
AAGAACAGGTTAAATCTTG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2AP28TF 724 0 0
GGGCACTAGTCTTTCTCTCCTCTAACTCCGCCGTCGTCTGTACTTTCACTGGTGCAGGAG
ATCGAAATGGCAACAGTTCCAGGACAGCTAGTCTGGGAGATCGTGAAGAGAAACAACTGT
TTCTTGGTCAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAAGTTCAGTTCAGCAAAGAGAGCAAC
AACCTCTGCAACCTCAACTCTTGCAAGCACTCTGGTTTGGCGAACAAGAAGACAGTGACC
ATTCAGGTAGCTGACAAGGAGCAAGGTGTGGTACTCGGAACTACCAAGACCAAGAAGCAG
AACAAGCCAAAGCTCTCTGTTAACAAGTCTGTCCTCAAGAAGGAGTTCCCTAGGATGGCC
AAAGCTGTTGCCAACCAGGTTGTGGACAACTACTACAGGCCTGATTTGAAGAAGGCAGCG
CTTGCTAGGCTCAGCGTGATCAGCAAGGGTCTTAGAGTCGCCAAGTCTGGTCCCAAGAGG
AGGAACAGGCAGGCTTGAAGAATCCACCACTGAACGAACATTTTTACTTCTAAAAGAAAA
GTTTGTTTTGAGAGTTTCAGGCAGTGCTTGTAGGTTAAAGATTATTTTTGGATAGCTGAG
AATCTTTGCTTGAAACACCTCGGTTGTTAATCCTTTTCTCAAAAAATGATATTAAAAACT
ATTTTTAATATTGTATTCCAGCTAAAGAGTGCCATATCTTGTAGAATCTGAAATGAATTA
AAGA

QA 1 724 1 724
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5964Contig1 757 2 2 U
GGATCGTCTTCGTTCAATTCAATCTTATCTCTCAGTGATTTACTTGCAAGAGAAGTTGCC
TCTTAAACTCTCTCGAGAAGGCTCAGTTTTTTTTTTCCACCATGGCCGGCCAAAACGCGC
GTTTGAATGTGGTCCCCACTGTCACGATGCTCGGTGTGATGAAAGCTCGTCTCGTTGGAG
CCACAAGAGGCCACGCTCTCCTCAAGAAGAAGAGCGACGCTCTAACCGTTCAGTTCAGAG
CCCTTCTCAAGAAAATCGTGACGGCCAAGGAATCAATGGGAGATATGATGAAGACATCCT
CCTTGATGAGCTCGAGAGGGAAGATTTCTTTAGGCTGAAGAAGATTCAGGGGTACAAGAG
GAGGGAAGTCGAGAGACAGGCTGCTAATGCTAAGGCCTTTGCTGAGGAAATGGTTCTTGA
AGGGATCTCTATGCAGAGAGGGATTTCGATAAACGTTGCTCGTGATTTACTTGCTGGTGG
TGCGGAGAAGGATGCAGACATTATTTTCTGAGGTGTGCGTGTGTGTGTCTGAGAGGCTCT
CTATTTATATTTTTGTTTGTGATTGTTTGGTTTATTAATCGGTTCATCGGAGTTTATGTT
TCTTCAAATAAAATGGATTTGATGTAGATGAAAGATTGTTGTATCATCTTGAGTTGTGAT
TTGTTATGATTTTCCTGAAGAGGTTTGTGATTGTTACTCTTGTGTAATGATTAATTACCT
TGTTTCAAATAAGTATGGATGTTACATGTTGACAAGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX71TF U 1
AF RR2BX71JQ C 2
BS 1 725 RR2BX71TF
BS 726 757 RR2BX71JQ

RD RR2BX71TF 725 0 0
GGATCGTCTTCGTTCAATTCAATCTTATCTCTCAGTGATTTACTTGCAAGAGAAGTTGCC
TCTTAAACTCTCTCGAGAAGGCTCAGTTTTTTTTTTCCACCATGGCCGGCCAAAACGCGC
GTTTGAATGTGGTCCCCACTGTCACGATGCTCGGTGTGATGAAAGCTCGTCTCGTTGGAG
CCACAAGAGGCCACGCTCTCCTCAAGAAGAAGAGCGACGCTCTAACCGTTCAGTTCAGAG
CCCTTCTCAAGAAAATCGTGACGGCCAAGGAATCAATGGGAGATATGATGAAGACATCCT
CCTTGATGAGCTCGAGAGGGAAGATTTCTTTAGGCTGAAGAAGATTCAGGGGTACAAGAG
GAGGGAAGTCGAGAGACAGGCTGCTAATGCTAAGGCCTTTGCTGAGGAAATGGTTCTTGA
AGGGATCTCTATGCAGAGAGGGATTTCGATAAACGTTGCTCGTGATTTACTTGCTGGTGG
TGCGGAGAAGGATGCAGACATTATTTTCTGAGGTGTGCGTGTGTGTGTCTGAGAGGCTCT
CTATTTATATTTTTGTTTGTGATTGTTTGGTTTATTAATCGGTTCATCGGAGTTTATGTT
TCTTCAAATAAAATGGATTTGATGTAGATGAAAGATTGTTGTATCATCTTGAGTTGTGAT
TTGTTATGATTTTCCTGAAGAGGTTTGTGATTGTTACTCTTGTGTAATGATTAATTACCT
TGTTT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2BX71JQ 756 0 0
GATCGTCTTCGTTCAATTCAATCTTATCTCTCAGTGATTTACTTGCAAGAGAAGTTGCCT
CTTAAACTCTCTCGAGAAGGCTCAGTTTTTTTTTTCCACCATGGCCGGCCAAAACGCGCG
TTTGAATGTGGTCCCCACTGTCACGATGCTCGGTGTGATGAAAGCTCGTCTCGTTGGAGC
CACAAGAGGCCACGCTCTCCTCAAGAAGAAGAGCGACGCTCTAACCGTTCAGTTCAGAGC
CCTTCTCAAGAAAATCGTGACGGCCAAGGAATCAATGGGAGATATGATGAAGACATCCTC
CTTGATGAGCTCGAGAGGGAAGATTTCTTTAGGCTGAAGAAGATTCAGGGGTACAAGAGG
AGGGAAGTCGAGAGACAGGCTGCTAATGCTAAGGCCTTTGCTGAGGAAATGGTTCTTGAA
GGGATCTCTATGCAGAGAGGGATTTCGATAAACGTTGCTCGTGATTTACTTGCTGGTGGT
GCGGAGAAGGATGCAGACATTATTTTCTGAGGTGTGCGTGTGTGTGTCTGAGAGGCTCTC
TATTTATATTTTTGTTTGTGATTGTTTGGTTTATTAATCGGTTCATCGGAGTTTATGTTT
CTTCAAATAAAATGGATTTGATGTAGATGAAAGATTGTTGTATCATCTTGAGTTGTGATT
TGTTATGATTTTCCTGAAGAGGTTTGTGATTGTTACTCTTGTGTAATGATTAATTACCTT
GTTTCAAATAAGTATGGATGTTACATGTTGACAAGC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL5965Contig1 805 2 6 U
GCAAGAAATATCGCACCAAACTCCCCATCAAGGATGTCATTCAGCTCGCTTTGGATCTCG
CTAGAGGGCTGAGTTACCTCCACTCCAAGGTGATTGTACATCGGGACGTCAAGTCAGAGA
ACATGTTACTTGAACCTAACAAGACCCTCAAGATTGCTGATTTCGGAGTCGCTAGAGTCG
AGGCTCAGAACCCTCAAGACATGACCGGTGAAACTGGAACTCTCGGCTACATGGCACCCG
AGGTTCTAGAAGGAAAGGCTTACAACAGGAAATGCGATGTGTATAGCTTTGGTGTATGCC
TCTGGGAAATATACTGCTGCGACATGCCCTACGCTGACTGTAGTTTTGCTGAGATCTCTC
ATGCCGTTGTTCATAAGAATCTGAGACCAGAGATTCCGAAATGCTGCCCACAGTCGGTGG
CAAACATAATGAGGAGATGCTGGGACCCGAATCCAGACAAGCGACCGGAGATGGAGGAGG
TAGTGAAGCTGCTTGAAGCGGTAAACACAAGCAAAGGCGGGGGAATGATACCACCGGACA
AGTTTCAGGGGTGCCTCTGTTTCTTCAAACCTCGTGGCCCCTAATCTCTCTCTCCCTCTC
TCTCCCTTGGCTCTGAATATTCTTGAGAGCTGCGTGATTATTTTTTCCGAATTTTTGTTG
AGACATTGGAGTTGGATTGGTGTGGTCTTTGTCATAAACAATCCATCTCTCTCTCTTTTT
TTTTTGTCAATCATCCATCTCTCTCTATATATATTGTATTTATACTACTACTAGTACACA
GTCCTGTTGTGTATAAAAACTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS21TF U 1
AF RR2BS21JQ C 42
BS 1 724 RR2BS21TF
BS 725 725 RR2BS21JQ
BS 726 729 RR2BS21TF
BS 730 730 RR2BS21JQ
BS 731 787 RR2BS21TF
BS 788 805 RR2BS21JQ

RD RR2BS21TF 787 0 0
GCAAGAAATATCGCACCAAACTCCCCATCAAGGATGTCATTCAGCTCGCTTTGGATCTCG
CTAGAGGGCTGAGTTACCTCCACTCCAAGGTGATTGTACATCGGGACGTCAAGTCAGAGA
ACATGTTACTTGAACCTAACAAGACCCTCAAGATTGCTGATTTCGGAGTCGCTAGAGTCG
AGGCTCAGAACCCTCAAGACATGACCGGTGAAACTGGAACTCTCGGCTACATGGCACCCG
AGGTTCTAGAAGGAAAGGCTTACAACAGGAAATGCGATGTGTATAGCTTTGGTGTATGCC
TCTGGGAAATATACTGCTGCGACATGCCCTACGCTGACTGTAGTTTTGCTGAGATCTCTC
ATGCCGTTGTTCATAAGAATCTGAGACCAGAGATTCCGAAATGCTGCCCACAGTCGGTGG
CAAACATAATGAGGAGATGCTGGGACCCGAATCCAGACAAGCGACCGGAGATGGAGGAGG
TAGTGAAGCTGCTTGAAGCGGTAAACACAAGCAAAGGCGGGGGAATGATACCACCGGACA
AGTTTCAGGGGTGCCTCTGTTTCTTCAAACCTCGTGGCCCCTAATCTCTCTCTCCCTCTC
TCTCCCTTGGCTCTGAATATTCTTGAGAGCTGCGTGATTATTTTTTCCGAATTTTTGTTG
AGACATTGGAGTTGGATTGGTGTGGTCTTTGTCATAAACAATCCATCTCTCTCTCTTTTT
TTTT*GTCA*TCATCCATCTCTCTCTATATATATTGTATTTATACTACTACTAGTACACA
GTCCTGT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2BS21JQ 764 0 0
CAGCTCGCTTTGGATCTCGCTAGAGGGCTGAGTTACCTCCACTCCAAGGTGATTGTACAT
CGGGACGTCAAGTCAGAGAACATGTTACTTGAACCTAACAAGACCCTCAAGATTGCTGAT
TTCGGAGTCGCTAGAGTCGAGGCTCAGAACCCTCAAGACATGACCGGTGAAACTGGAACT
CTCGGCTACATGGCACCCGAGGTTCTAGAAGGAAAGGCTTACAACAGGAAATGCGATGTG
TATAGCTTTGGTGTATGCCTCTGGGAAATATACTGCTGCGACATGCCCTACGCTGACTGT
AGTTTTGCTGAGATCTCTCATGCCGTTGTTCATAAGAATCTGAGACCAGAGATTCCGAAA
TGCTGCCCACAGTCGGTGGCAAACATAATGAGGAGATGCTGGGACCCGAATCCAGACAAG
CGACCGGAGATGGAGGAGGTAGTGAAGCTGCTTGAAGCGGTAAACACAAGCAAAGGCGGG
GGAATGATACCACCGGACAAGTTTCAGGGGTGCCTCTGTTTCTTCAAACCTCGTGGCCCC
TAATCTCTCTCTCCCTCTCTCTCCCTTGGCTCTGAATATTCTTGAGAGCTGCGTGATTAT
TTTTTCCGAATTTTTGTTGAGACATTGGAGTTGGATTGGTGTGGTCTTTGTCATAAACAA
TCCATCTCTCTCTCTTTTTTTTTTGTCAATCATCCATCTCTCTCTATATATATTGTATTT
ATACTACTACTAGTACACAGTCCTGTTGTGTATAAAAACTGATG

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL5966Contig1 895 2 2 U
GTACACACTTTCACCACCGATCTTCGAATCTTTTGCGCTTTTTTTCCCCTCAGTCTCTCT
TCAAAAGCACACAAATGGCGTCGGCGAACAGAGACATGGCTGTGTACTGTTTTGACACTT
TGGTCTCTCACTACAACAACGAAGACTCTCCTCCACCTGCCTTTGACGACGCCAATCACC
CATTGTTTGTCACCTGGAAGAAAATAGTTAACGGTGGGGAGCCTCGTTTGCGTGGATGTA
TCGGTACACTCGAAGCACGCCGCTTGATCAGTGGCTTCAAGGACTATGCCTTGACCAGTG
CCCTGAGGGATCGTAGGTTCCCGCCAATACAACCCAAAGAACTACCGTTTCTGCAGTGTA
CGGTCTCAGTCCTTACTGATTATGAAGATGCGGAGGATTATCTCGACTGGGAGGTTGGAA
AGCATGGTATAATCATCGAGTTCACTGAACCTGTGACCAATATAAAGCGAAACGCCACCT
ATCTCCCTGAGGTGCCAGCTCATGAAGGCTGGACAAAGATAGAGGCAATAGACTCGCTGG
TGCGTAAAGCAGGATACAATGGGGAGATAACGGAGTCAGTGCGTAGGCGTATCCAGCTAA
CACGTTATCAGAGCACATTATTCAGCATGCATTATAGTGAATACCTTTCGTACGTGAAGG
CCACAAGGGGCCTTGTCCCTGCTATTAATGGGACCAGCAAGCCCGCCACGGCCTTCTCCT
GATTTGCGCCATGAAACTGGGTGCGTGAGATTGTGTCCTGTTTGGGACCTCTCCTAATTT
ATCTTTAGTATTTGTGATTCGAAAACTGTAAGGCTCTCTCTTATTTGTTTTTTTAAACGA
GACAAGATTTGCCTGTTTCACCATTCTATGAAAACGCAACCGCACTTACCATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH67TF U 1
AF RR2CH67JQ C 61
BS 1 668 RR2CH67TF
BS 669 895 RR2CH67JQ

RD RR2CH67TF 668 0 0
GTACACACTTTCACCACCGATCTTCGAATCTTTTGCGCTTTTTTTCCCCTCAGTCTCTCT
TCAAAAGCACACAAATGGCGTCGGCGAACAGAGACATGGCTGTGTACTGTTTTGACACTT
TGGTCTCTCACTACAACAACGAAGACTCTCCTCCACCTGCCTTTGACGACGCCAATCACC
CATTGTTTGTCACCTGGAAGAAAATAGTTAACGGTGGGGAGCCTCGTTTGCGTGGATGTA
TCGGTACACTCGAAGCACGCCGCTTGATCAGTGGCTTCAAGGACTATGCCTTGACCAGTG
CCCTGAGGGATCGTAGGTTCCCGCCAATACAACCCAAAGAACTACCGTTTCTGCAGTGTA
CGGTCTCAGTCCTTACTGATTATGAAGATGCGGAGGATTATCTCGACTGGGAGGTTGGAA
AGCATGGTATAATCATCGAGTTCACTGAACCTGTGACCAATATAAAGCGAAACGCCACCT
ATCTCCCTGAGGTGCCAGCTCATGAAGGCTGGACAAAGATAGAGGCAATAGACTCGCTGG
TGCGTAAAGCAGGATACAATGGGGAGATAACGGAGTCAGTGCGTAGGCGTATCCAGCTAA
CACGTTATCAGAGCACATTATTCAGCATGCATTATAGTGAATACCTTTCGTACGTGAAGG
CCACAAGG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2CH67JQ 835 0 0
CTC
AAAGCACACAAATGGCGTCGGCGA*CAGAGACATGGCTGTGTACTGTTTTGACACTT*GG
TCTCTCACTACAACAACGAAGACTCTCCTCCACCTGCCTTTGACGACGCCAATCACCCAT
TGTTTGTCACCTGGAAGAAAATAGTTAACGGTGGGGAGCCTCGTTTGCGTGGATGTATCG
GTACACTCGAAGCACGCCGCTTGATCAGTGGCTTCAAGGACTATGCCTTGACCAGTGCCC
TGAGGGATCGTAGGTTCCCGCCAATACAACCCAAAGAACTACCGTTTCTGCAGTGTACGG
TCTCAGTCCTTACTGATTATGAAGATGCGGAGGATTATCTCGACTGGGAGGTTGGAAAGC
ATGGTATAATCATCGAGTTCACTGAACCTGTGACCAATATAAAGCGAAACGCCACCTATC
TCCCTGAGGTGCCAGCTCATGAAGGCTGGACAAAGATAGAGGCAATAGACTCGCTGGTGC
GTAAAGCAGGATACAATGGGGAGATAACGGAGTCAGTGCGTAGGCGTATCCAGCTAACAC
GTTATCAGAGCACATTATTCAGCATGCATTATAGTGAATACCTTTCGTACGTGAAGGCCA
CAAGGGGCCTTGTCCCTGCTATTAATGGGACCAGCAAGCCCGCCACGGCCTTCTCCTGAT
TTGCGCCATGAAACTGGGTGCGTGAGATTGTGTCCTGTTTGGGACCTCTCCTAATTTATC
TTTAGTATTTGTGATTCGAAAACTGTAAGGCTCTCTCTTATTTGTTTTTTTAAACGAGAC
AAGATTTGCCTGTTTCACCATTCTATGAAAACGCAACCGCACTTACCATTTT

QA 4 835 4 835
DS 



AS 1 2

CO CL5967Contig1 935 2 2 U
GGAAACATCGATAAAAGCAAAGAACAAGATCGAAAAACTTCTCTCTCTCCCACAAAAACT
CATCAAGACACTGCCTCTTCTGATTTAGGTTTCGATTAAACTGTTCATCGCGAGATCTTT
CCGGTGAAACCTATGGCGAACATGAACACTCTTCAACAGATGATCTTTCCTGACGAGAAC
GCTCCGATTCATCGCAAAAGGACCGTTACTGGTGCTTCTGTGAAAAGTACCAGAGGATCT
GTTCTTAGTCAGAAGAAACTTGGAGGAGCTCGTAAGGCTCTGAATGATATCACAAACAAG
TCTGGTGTTCAACCCAAAGCTTCTTCTAAGAACAAGCAGATCGCTTCTACTACTGCAACT
GCTGTGAAGGGAGAAATCAACATAGCTGGAGAGTTGTACTTGCATGATCACAGCAAGTGC
ATCAAAGGGCAGCAGAATCTCTGGGACGATCACTTCTCTGCTGATATTCTACTCCACCAT
GATTCTTCTAGCATCAAGGAGAAGCATCTCAAGTATGACATAGAAATGATGGATGCTAAG
AACAACCTTACTTGTGACGAACCAGAAGAGATTCCATCTCCCAAGCTGACCGATTGGCTC
AAGAGCTCGACTCCATGGCGCTCCCCAGTCCGTCATGGCTCTATGATGACGCCTTCCACT
CCTCTGGCTTGGCGATTTGATTCAGATGAATTCACTCTCAAGGAATACTATGACGACCTC
TTCTGAATGTCTGTTTCTTAATAATGTCTTTGAAAAGCTTTTCATCCTTCAGATGAAGTC
GTAGTACTAGCAGTTCTGTTTCAGCGCAACTATCTTTTGTGTTCAGCTCATCAATGCTTC
AGTTCCTCATGTACTTAACAACTCTGTGTCCATCACTCTGTAACTGATTTGGAATCTTTT
TCTAGCGTATGAGCATTATGAGCATTTTCATTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E967TF U 1
AF RR2E967JQ C 141
BS 1 697 RR2E967TF
BS 698 935 RR2E967JQ

RD RR2E967TF 697 0 0
GGAAACATCGATAAAAGCAAAGAACAAGATCGAAAAACTTCTCTCTCTCCCACAAAAACT
CATCAAGACACTGCCTCTTCTGATTTAGGTTTCGATTAAACTGTTCATCGCGAGATCTTT
CCGGTGAAACCTATGGCGAACATGAACACTCTTCAACAGATGATCTTTCCTGACGAGAAC
GCTCCGATTCATCGCAAAAGGACCGTTACTGGTGCTTCTGTGAAAAGTACCAGAGGATCT
GTTCTTAGTCAGAAGAAACTTGGAGGAGCTCGTAAGGCTCTGAATGATATCACAAACAAG
TCTGGTGTTCAACCCAAAGCTTCTTCTAAGAACAAGCAGATCGCTTCTACTACTGCAACT
GCTGTGAAGGGAGAAATCAACATAGCTGGAGAGTTGTACTTGCATGATCACAGCAAGTGC
ATCAAAGGGCAGCAGAATCTCTGGGACGATCACTTCTCTGCTGATATTCTACTCCACCAT
GATTCTTCTAGCATCAAGGAGAAGCATCTCAAGTATGACATAGAAATGATGGATGCTAAG
AACAACCTTACTTGTGACGAACCAGAAGAGATTCCATCTCCCAAGCTGACCGATTGGCTC
AAGAGCTCGACTCCATGGCGCTCCCCAGTCCGTCATGGCTCTATGATGACGCCTTCCACT
CCTCTGGCTTGGCGATTTGATTCAGATGAATTCACTC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2E967JQ 795 0 0
CATGAACACTCTTCAACAGATGATCTTTC*TGACGAGAACGCTCCGATTCATCGCAAAAG
GACCGTTACTGGTGCTTCTGTGAAAAGTACCAGAGGATCTGTTCTTAGTCAGAAGAAACT
TGGAGGAGCTCGTAAGGCTCTGAATGATATCACAAACAAGTCTGGTGTTCAACCCAAAGC
TTCTTCTAAGAACAAGCAGATCGCTTCTACTACTGCAACTGCTGTGAAGGGAGAAATCAA
CATAGCTGGAGAGTTGTACTTGCATGATCACAGCAAGTGCATCAAAGGGCAGCAGAATCT
CTGGGACGATCACTTCTCTGCTGATATTCTACTCCACCATGATTCTTCTAGCATCAAGGA
GAAGCATCTCAAGTATGACATAGAAATGATGGATGCTAAGAACAACCTTACTTGTGACGA
ACCAGAAGAGATTCCATCTCCCAAGCTGACCGATTGGCTCAAGAGCTCGACTCCATGGCG
CTCCCCAGTCCGTCATGGCTCTATGATGACGCCTTCCACTCCTCTGGCTTGGCGATTTGA
TTCAGATGAATTCACTCTCAAGGAATACTATGACGACCTCTTCTGAATGTCTGTTTCTTA
ATAATGTCTTTGAAAAGCTTTTCATCCTTCAGATGAAGTCGTAGTACTAGCAGTTCTGTT
TCAGCGCAACTATCTTTTGTGTTCAGCTCATCAATGCTTCAGTTCCTCATGTACTTAACA
ACTCTGTGTCCATCACTCTGTAACTGATTTGGAATCTTTTTCTAGCGTATGAGCATTATG
AGCATTTTCATTCTC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

CO CL5968Contig1 782 2 2 U
GGCGAGTCATCCATCCAAGGGGAGAGAAAAGAAACGCTACGATCACGAGAAGGGCAAAAG
ATTCGTTCCGATCCGAACTCGAGAAGGAAGATTCATCATGATAGGGTTGTTCAAGGTTAA
GGAGAAGCAAAAAGAGGAAGCAAAGAACAACAACACAAGAGGAGCTTCTGCCAAGAAACA
ATCTGCCGGTGAACTTCGTCTTCACAAAGATATAACAGAGCTGAATTTGCCAAAGTCTTG
TTCCATATCTTTTCCTAATGGAAAGAATGACTTGATGAACTTTGAAGTCACCATCAAACC
CGACGACGGCTATTACTTAGGTGGTAAATTCGTTTTCACGTTCCAAGTCTCTCCGGTGTA
TCCACATGAAGCTCCAAAAGTTAAGTGCAAGACCAAGGTGTACCATCCGAATATCGATTT
AGAAGGAAACGTTTGTCTGAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCCCAACATTAA
CACTCTCATCTACGGTCTTTTCCATCTCTTCACTGAACCCAATCACGAGGATCCTCTCAA
CCATGACGCAGCAGCGGTTTTAAGGGATAACCCCAAGCAGTTTGAGTCTAATGTCAAGAG
GGCTATGAGTGGTGGCTATGTTGGCCAAACCTCATTCCCTCGCTGCATCTAAGTTATAAT
AAGCTATGCTTCTGTTTCACTTCACTTTTCTTCTTCTCTATAGACTCTTTTTGTGTTTAC
TCTTTTGTACATTTGGCTTTTATGACATCGCTTTTATTATAATATATCATCAAATACCGG
GG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2AJ40TF U 1
AF RR2AJ40JQ C 1
BS 1 776 RR2AJ40TF
BS 777 782 RR2AJ40JQ

RD RR2AJ40TF 776 0 0
GGCGAGTCATCCATCCAAGGGGAGAGAAAAGAAACGCTACGATCACGAGAAGGGCAAAAG
ATTCGTTCCGATCCGAACTCGAGAAGGAAGATTCATCATGATAGGGTTGTTCAAGGTTAA
GGAGAAGCAAAAAGAGGAAGCAAAGAACAACAACACAAGAGGAGCTTCTGCCAAGAAACA
ATCTGCCGGTGAACTTCGTCTTCACAAAGATATAACAGAGCTGAATTTGCCAAAGTCTTG
TTCCATATCTTTTCCTAATGGAAAGAATGACTTGATGAACTTTGAAGTCACCATCAAACC
CGACGACGGCTATTACTTAGGTGGTAAATTCGTTTTCACGTTCCAAGTCTCTCCGGTGTA
TCCACATGAAGCTCCAAAAGTTAAGTGCAAGACCAAGGTGTACCATCCGAATATCGATTT
AGAAGGAAACGTTTGTCTGAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCCCAACATTAA
CACTCTCATCTACGGTCTTTTCCATCTCTTCACTGAACCCAATCACGAGGATCCTCTCAA
CCATGACGCAGCAGCGGTTTTAAGGGATAACCCCAAGCAGTTTGAGTCTAATGTCAAGAG
GGCTATGAGTGGTGGCTATGTTGGCCAAACCTCATTCCCTCGCTGCATCTAAGTTATAAT
AAGCTATGCTTCTGTTTCACTTCACTTTTCTTCTTCTCTATAGACTCTTTTTGTGTTTAC
TCTTTTGTACATTTGGCTTTTATGACATCGCTTTTATTATAATATATCATCAAATA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2AJ40JQ 782 0 0
GGCGAGTCATCCATCCAAGGGGAGAGAAAAGAAACGCTACGATCACGAGAAGGGCAAAAG
ATTCGTTCCGATCCGAACTCGAGAAGGAAGATTCATCATGATAGGGTTGTTCAAGGTTAA
GGAGAAGCAAAAAGAGGAAGCAAAGAACAACAACACAAGAGGAGCTTCTGCCAAGAAACA
ATCTGCCGGTGAACTTCGTCTTCACAAAGATATAACAGAGCTGAATTTGCCAAAGTCTTG
TTCCATATCTTTTCCTAATGGAAAGAATGACTTGATGAACTTTGAAGTCACCATCAAACC
CGACGACGGCTATTACTTAGGTGGTAAATTCGTTTTCACGTTCCAAGTCTCTCCGGTGTA
TCCACATGAAGCTCCAAAAGTTAAGTGCAAGACCAAGGTGTACCATCCGAATATCGATTT
AGAAGGAAACGTTTGTCTGAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCCCAACATTAA
CACTCTCATTTACGGTCTTTTCCATCTCTTCACTGAACCCAATCACGAGGATCCTCTCAA
CCATGACGCAGCAGCGGTTTTAAGGGATAACCCCAAGCAGTTTGAGTCTAATGTCAAGAG
GGCTATGAGTGGTGGCTATGTTGGCCAAACCTCATTCCCTCGCTGCATCTAAGTTATAAT
AAGCTATGCTTCTGTTTCACTTCACTTTTCTTCTTCTCTATAGACTCTTTTTGTGTTTAC
TCTTTTGTACATTTGGCTTTTATGACATCGCTTTTATTATAATATATCATCAAATACCGG
GG

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL5969Contig1 734 2 5 U
GGACACAAAGCCCATCGTTTACGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGTCGCTCGCGCTCTTC
ACCGACGAAGATCGCGCCCGTATTCTCTATTCACAACTAGCGGTAGTTTTCGAGATCAAC
CAACCATGAATCCTGAATATGACTATCTGTTCAAGCTTCTGCTCATTGGTGATTCTGGTG
TTGGCAAGTCATGCTTGCTTCTTAGGTTTGCTGATGATTCCTACCTGGATAGCTACATCA
GCACCATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGCACAGTTGAACAAGATGGAAAGACCATCAAAC
TCCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAAGAACGTTTCAGAACCATCACTAGCAGTTACTACA
GAGGAGCTCACGGCATCATTGTGACTTATGATGTAACAGACCAAGAAAGTTTCAACAATG
TCAAGCAATGGCTAAATGAAATCGACCGCTACGCCAGTGAGAATGTTAACAAGCTACTGG
TTGGCAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAAGTTGTCTCCACTGAAACTGCCAAGGCTT
TCGCTGATGAACTTGGGATCCCATTCCTGGAAACAAGTGCGAAGAATGCTACCAATGTAG
AAGAAGCTTTCATGGCCATAACCGCTGCAATCAAGACAAGAATGGCGAGTCAACCTGCAG
GAAGGGCCAAGCCAGCAACGGTCCAGATCCGAGGACAACCAGTAAACCAACAATCAGCTG
CTGCTCTTCTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG66TF U 44
AF RR2H115TF U 1
BS 1 236 RR2H115TF
BS 237 237 RR2FG66TF
BS 238 660 RR2H115TF
BS 661 662 RR2FG66TF
BS 663 734 RR2H115TF

RD RR2FG66TF 671 0 0
AGGGTTACGGCCGGGGG
ACCGACGAAGGTCGCGTCCGTATTCTCTATTCACAACTAGCGGTAGTTTTCGAGATCAAC
CAACCATGAATCCTGAATATGACTATCTGTTCAAGCTTCTGCTCATTGGTGATTCTGGTG
TTGGCAAGTCATGCTTGCTTCTTAGGTTTGCTGATGATTCCTACCTGGATAGCTACATCA
GCACCATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGCACAGTTGAACAAGATGGAAAGACCATCAAAC
TCCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAAGAACGTTTCAGAACCATCACTAGCAGTTACTACA
GAGGAGCTCACGGCATCATTGTGACTTATGATGTAACAGACCAAGAAAGTTTCAACAATG
TCAAGCAATGGCTAAATGAAATCGACCGCTACGCCAGTGAGAATGTTAACAAGCTACTGG
TTGGCAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAAGTTGTCTCCACTGAAACTGCCAAGGCTT
TCGCTGATGAACTTGGGATCCCATTCCTGGAAACAAGTGCGAAGAATGCTACCAATGTAG
AAGAAGCTTTCATGGCCATGACCGCTGCAATCAAGACAAGAATGGCGAGTCAACCTGCAG
GAGGGGCCAAGCCAGCAACGGTCCAGATCCGAGGACAACCAGTAAACCAACAAT

QA 18 671 18 671
DS 

RD RR2H115TF 734 0 0
GGACACAAAGCCCATCGTTTACGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGTCGCTCGCGCTCTTC
ACCGACGAAGATCGCGCCCGTATTCTCTATTCACAACTAGCGGTAGTTTTCGAGATCAAC
CAACCATGAATCCTGAATATGACTATCTGTTCAAGCTTCTGCTCATTGGTGATTCTGGTG
TTGGCAAGTCATGCTTGCTTCTTAGGTTTGCTGATGATTCCTACCTGGATAGCTACGTCA
GCACCATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGCACAGTTGAACAAGATGGAAAGACCATCAAAC
TCCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAAGAACGTTTCAGAACCATCACTAGCAGTTACTACA
GAGGAGCTCACGGCATCATTGTGACTTATGATGTAACAGACCAAGAAAGTTTCAACAATG
TCAAGCAATGGCTAAATGAAATCGACCGCTACGCCAGTGAGAATGTTAACAAGCTACTGG
TTGGCAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAAGTTGTCTCCACTGAAACTGCCAAGGCTT
TCGCTGATGAACTTGGGATCCCATTCCTGGAAACAAGTGCGAAGAATGCTACCAATGTAG
AAGAAGCTTTCATGGCCATAACCGCTGCAATCAAGACAAGAATGGCGAGTCAACCTGCAG
**AGGGCCAAGCCAGCAACGGTCCAGATCCGAGGACAACCAGTAAACCAACAATCAGCTG
CTGCTCTTCTAATC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5971Contig1 942 2 2 U
GGTAGCGGGTGGGGAATGCGAAGGGATACAGAGGACACTGCGGTCAGCTGAGGTTTATGA
TCCGAACAAGAACAGGTGGAGTTTTGTTGCGGATATGAGCACAGCGATGGTGCCTCTTAT
CGGTGTGGTTTACGATAAGAAGTGGTTTCTCAAGGGTCTTGGGTCTCACCAGCAGGTCAT
GAGTGAAGCTTATGACCCTGAAACTAACTCGTGGAGGCCGGTCGGTGACGGGATGGTTAC
TGGTTGGAGAAACCCATGTACTTCACTGAATGGTCGTCTTTACGGGTTGGATTGTAGGGA
CGGGTGCAAGGTCAGGGTGTTTGATGAATCGACGGACTCTTGGAACAGGTTCATGGACAG
TAAATTACACTTGGGGAACTCGAGGTCGCTTGAAGCTGCGGCTCTTGTTCCGCTGAACAA
TAAGCTTTGTATCATACGGAACAACATGAGCATGAGTCTGGTTGATGTAACGAATCCTGA
TAAGAGCAACCCTCGAGTATGGGAAAACATTGCGGTGAAAGGACAGTCCAAGAGCATACT
CAGTAATATATGGTCGAGTATCGCAGGAAGGGCTGTGAAAAGTCACATTGTGCATTGCCA
AGTGCTTCAAGCCTAGTGTTGAGAAGAAACTCAAACCACATTGAGCTTCCAAGAAGAGAA
GAGAAGAGAAGACGGCAAAGCAGCTCTTGTTTGCTTGCTTAGTAAATGTTTCAGATAGAG
GGAATTTTCGCTACAGAGGCGAAGAACTCAATGTCTGGGCTTAACAGTCGTACAAGAGTC
AAAGAGAGATAGTAAGAACCGAGATGGCCATCTCTTCTGGTGTTGTTAATCTTTGTTAGT
ATTTATAGGAAGGTCTGGTCTTTTCAATGGTTCTAGCAATTGTTATTGACATTTTGTTTT
TTGTGGTCTGTAAATCTCAAGTCTTTTTTTTTTGTTTATAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL72TF U 1
AF RR2DL72JQ C 618
BS 1 670 RR2DL72TF
BS 671 942 RR2DL72JQ

RD RR2DL72TF 670 0 0
GGTAGCGGGTGGGGAATGCGAAGGGATACAGAGGACACTGCGGTCAGCTGAGGTTTATGA
TCCGAACAAGAACAGGTGGAGTTTTGTTGCGGATATGAGCACAGCGATGGTGCCTCTTAT
CGGTGTGGTTTACGATAAGAAGTGGTTTCTCAAGGGTCTTGGGTCTCACCAGCAGGTCAT
GAGTGAAGCTTATGACCCTGAAACTAACTCGTGGAGGCCGGTCGGTGACGGGATGGTTAC
TGGTTGGAGAAACCCATGTACTTCACTGAATGGTCGTCTTTACGGGTTGGATTGTAGGGA
CGGGTGCAAGGTCAGGGTGTTTGATGAATCGACGGACTCTTGGAACAGGTTCATGGACAG
TAAATTACACTTGGGGAACTCGAGGTCGCTTGAAGCTGCGGCTCTTGTTCCGCTGAACAA
TAAGCTTTGTATCATACGGAACAACATGAGCATGAGTCTGGTTGATGTAACGAATCCTGA
TAAGAGCAACCCTCGAGTATGGGAAAACATTGCGGTGAAAGGACAGTCCAAGAGCATACT
CAGTAATATATGGTCGAGTATCGCAGGAAGGGCTGTGAAAAGTCACATTGTGCATTGCCA
AGTGCTTCAAGCCTAGTGTTGAGAAGAAACTCAAACCACATTGAGCTTCCAAGAAGAGAA
GAGAAGAGAA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2DL72JQ 325 0 0
GTTGAGAAGAAACTCAAACCACATTGAGCTTCCAAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGACGGCA
AAGCAGCTCTTGTTTGCTTGCTTAGTAAATGTTTCAGATAGAGGGAATTTTCGCTACAGA
GGCGAAGAACTCAATGTCTGGGCTTAACAGTCGTACAAGAGTCAAAGAGAGATAGTAAGA
ACCGAGATGGCCATCTCTTCTGGTGTTGTTAATCTTTGTTAGTATTTATAGGAAGGTCTG
GTCTTTTCAATGGTTCTAGCAATTGTTATTGACATTTTGTTTTTTGTGGTCTGTAAATCT
CAAGTCTTTTTTTTTTGTTTATAAT

QA 1 325 1 325
DS 



AS 1 2

CO CL5972Contig1 878 2 2 U
GAAAGAAGTGTCTAAGGGTAAAAAAGATAAGAGATACCTCAATTACTTCAAAATCGATCA
TGCCCTTGAGTTCTCGACAATCCCTAGAGAAATCAACAAAAGCAATAACCAGTCGATCTA
GACAATCCCTAGATCGTCTTTGAAACCCGTAAGATAAAACCTATAGGAGATTGTTGTTTG
TTGATTCCGACGGTTAAGATTCAGCTCCGGTCCGTGATTGAAGATCGGGTTGCTGCTGGT
TCCATCGAGCTTTTGCATGTTCAGATCTCGGCTAAATCCGAGAATCGTAGGACTGGTTCT
TGCGTAGACAGGAAACGTGTCTCGATCACTAGCGGTGTAAGGGCCAAACTGAGAGAGACG
ATGAGCGAGTTTCATCGCTTGCTTGAGGGAGGGAGACGATCTTTGCTGAGTACAGAGAAG
ATCTGAAAAGGAGGTACTTTTTAAGAGCCAAGCAACGAGCACATGGAGAAGATGATGATA
TCTGGAGATGGGTTAGTGAAGACGTCTGAAGTGAAGCCGGATATGGATTTGAAGACCAAA
AAAAGACATGAAGCTGTGAATGACATAAGAGGAGTTTTAACAGGCTTCATTAAGTGTTTC
TATATATGCCCGTTTCTTTATAGGGTTGATGATATTGAAGCTAATGTGGCTGTTGCAGGG
AGCTTTGTGAGTGGAGGAACCAACAGTTATTTCTATGCGAATCAGATGGTGAAATGTGAT
ATTTACATTATTATAAGCTTTTGAATAAGACAAATGGAGAATACCAAAAGGTACTTCACT
GGTCCAGCTAATATGTATGGCTTTAAACAATGGCCTTAAACATTAATCACGCTTTTATAT
TTATCAAATACAATATTGGGCCAGGGCCCAATCAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH32TF U 1
AF RR2EH32JQ C 305
BS 1 515 RR2EH32TF
BS 516 878 RR2EH32JQ

RD RR2EH32TF 515 0 0
GAAAGAAGTGTCTAAGGGTAAAAAAGATAAGAGATACCTCAATTACTTCAAAATCGATCA
TGCCCTTGAGTTCTCGACAATCCCTAGAGAAATCAACAAAAGCAATAACCAGTCGATCTA
GACAATCCCTAGATCGTCTTTGAAACCCGTAAGATAAAACCTATAGGAGATTGTTGTTTG
TTGATTCCGACGGTTAAGATTCAGCTCCGGTCCGTGATTGAAGATCGGGTTGCTGCTGGT
TCCATCGAGCTTTTGCATGTTCAGATCTCGGCTAAATCCGAGAATCGTAGGACTGGTTCT
TGCGTAGACAGGAAACGTGTCTCGATCACTAGCGGTGTAAGGGCCAAACTGAGAGAGACG
ATGAGCGAGTTTCATCGCTTGCTTGAGGGAGGGAGACGATCTTTGCTGAGTACAGAGAAG
ATCTGAAAAGGAGGTACTTTTTAAGAGCCAAGCAACGAGCACATGGAGAAGATGATGATA
TCTGGAGATGGGTTAGTGAAGACGTCTGAAGTGAA

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2EH32JQ 574 0 0
TAGACAGGAAACGTGTCTCGATCACTAGCGGTGTAAGGGCCAAACTGAGAGAGACGATGA
GCGAGTTTCATCGCTTGCTTGAGGGAGGGAGACGATCTTTGCTGAGTACAGAGAAGATCT
GAAAAGGAGGTACTTTTTAAGAGCCAAGCAACGAGCACATGGAGAAGATGATGATATCTG
GAGATGGGTTAGTGAAGACGTCTGAAGTGAAGCCGGATATGGATTTGAAGACCAAAAAAA
GACATGAAGCTGTGAATGACATAAGAGGAGTTTTAACAGGCTTCATTAAGTGTTTCTATA
TATGCCCGTTTCTTTATAGGGTTGATGATATTGAAGCTAATGTGGCTGTTGCAGGGAGCT
TTGTGAGTGGAGGAACCAACAGTTATTTCTATGCGAATCAGATGGTGAAATGTGATATTT
ACATTATTATAAGCTTTTGAATAAGACAAATGGAGAATACCAAAAGGTACTTCACTGGTC
CAGCTAATATGTATGGCTTTAAACAATGGCCTTAAACATTAATCACGCTTTTATATTTAT
CAAATACAATATTGGGCCAGGGCCCAATCAATTT

QA 1 574 1 574
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5974Contig1 686 2 2 U
CCGGCCGTTGGTTCTTCGGGATCTAATGAGAGCGTTACAAAGATTGAGCCGATCCGGATG
CCAACCATCGAGGAGATCCGAGCACAAGATGTTTGGAACAACTGCGCCGTCAAAAGTGTA
GCTAGTGGAGTCATGGGAGGAGGGCTTGGGTTGATGATGGGTTTGTTCTTGGGAGCATTG
GATAACCCTATAATGAATGATACCATGACTGGTAGGCAGCAGTTTGTGTTCACTGCCAAA
CAAATGGGACAAAGGAGTTGGAGTTCCTGCAAGACTTTTGCGGTTATGGGTTTGGTTTTC
TCTGCAGCTGAATGCATTATCGAGAAGGCAAGGGCGAAGCATGACACAACAAACACTGCT
TTTGCTGGATGTGTGACCGGTGGCTCGATGTCTGCCCGAGGTGGGCCAAAAGCTGCGTGT
ATAGGTTGCGCTGGCTTTGCAACTTTCTCTGTACTGATAGAGAAGTTTTTCGACAGGCAT
ACGTAAACCAACGATATATCCAACAAACGCCATGGCTGCGAATTGTTTAGCTGTTTCTTA
TTACAGTTCATCACCTGAGCACAGGAAGAGAGGGAAAACTAGAATTACATTTTCCAACAT
AGAAGAAGAAACCGAAGCTTGTTTCGATCGAATATTTGTTCAGTTATTGTCATTATTTAT
CGTAGATTTTGTTTTATACTCATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A113TF U 1
AF RR2A113JQ C 47
BS 1 457 RR2A113TF
BS 458 686 RR2A113JQ

RD RR2A113TF 457 0 0
CCGGCCGTTGGTTCTTCGGGATCTAATGAGAGCGTTACAAAGATTGAGCCGATCCGGATG
CCAACCATCGAGGAGATCCGAGCACAAGATGTTTGGAACAACTGCGCCGTCAAAAGTGTA
GCTAGTGGAGTCATGGGAGGAGGGCTTGGGTTGATGATGGGTTTGTTCTTGGGAGCATTG
GATAACCCTATAATGAATGATACCATGACTGGTAGGCAGCAGTTTGTGTTCACTGCCAAA
CAAATGGGACAAAGGAGTTGGAGTTCCTGCAAGACTTTTGCGGTTATGGGTTTGGTTTTC
TCTGCAGCTGAATGCATTATCGAGAAGGCAAGGGCGAAGCATGACACAACAAACACTGCT
TTTGCTGGATGTGTGACCGGTGGCTCGATGTCTGCCCGAGGTGGGCCAAAAGCTGCGTGT
ATAGGTTGCGCTGGCTTTGCAACTTTCTCTGTACTGA

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR2A113JQ 640 0 0
AGCCGATCCGGATGCCAACCATCGAGGAGATCCGAGCACAAGATGTTTGGAACAACTGCG
CCGTCAAAAGTGTAGCTAGTGGAGTCATGGGAGGAGGGCTTGGGTTGATGATGGGTTTGT
TCTTGGGAGCATTGGATAACCCTATAATGAATGATACCATGACTGGTAGGCAGCAGTTTG
TGTTCACTGCCAAACAAATGGGACAAAGGAGTTGGAGTTCCTGCAAGACTTTTGCGGTTA
TGGGTTTGGTTTTCTCTGCAGCTGAATGCATTATCGAGAAGGCAAGGGCGAAGCATGACA
CAACAAACACTGCTTTTGCTGGATGTGTGACCGGTGGCTCGATGTCTGCCCGAGGTGGGC
CAAAAGCTGCGTGTATAGGTTGCGCTGGCTTTGCAACTTTCTCTGTACTGATAGAGAAGT
TTTTCGACAGGCATACGTAAACCAACGATATATCCAACAAACGCCATGGCTGCGAATTGT
TTAGCTGTTTCTTATTACAGTTCATCACCTGAGCACAGGAAGAGAGGGAAAACTAGAATT
ACATTTTCCAACATAGAAGAAGAAACCGAAGCTTGTTTCGATCGAATATTTGTTCAGTTA
TTGTCATTATTTATCGTAGATTTTGTTTTATACTCATGCT

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL5975Contig1 817 2 3 U
GGACATAGAAAAGAAATCCACCCACTGTAAAGAAAGACAACACACAAGAATCAATCAAAG
AAAGCAGACACATCTTCGAGATCAAACAAAACCAATTTCATTCATCGTCGGCTTCTCCAC
ATGGCCGGAAGAGCAGCAATGCTCGTTAACGTCGGTACGGTTGTAATGACCGTTTTGACC
CTGGCTAGTTTTGTCGAAGGCTTCGGTGTCAATTGGGGTAATATCGCATCACATCCGCTG
AATCCTGATATTGTTGTTAGGATGCTTAAGGAGAACAAGATCAACAAAGTGAAGCTTTTT
GACGCTGATTCATGGACGATGAATGCTTTGGCCGGTTCGGGCATGGAGGTTATGGTCGGA
ATCCCTAATAACCTTCTTGAAACTCTAGCCGATGATTACGGTAATGCTAAAGACTGGGTC
AAAGAAAATATCACTGCTTACATGCGCAAGGATGGCGTCAACATCAAGTACGTGGCTGTG
GGGAACGAGCCGTTCTTGTCAGCATACAATGGATCATACTTGAAAACAACGTTTCCAGCT
TTAAAGAACATTCACAGAGCGTTAAAAGAGGCCGGACATACCGATGTAATGAGAGCCACG
ATCCCACAAAACGCTGAAGTTTACGAATCAGCTAACGATAAGCCATCAGAAGGCGATTTC
CGCAGCGACGTTAAGCAAATAATGCTCGACATCGTCAAGTTCTTCCATGATAATGATTTG
CCTTTCACCGTCAACATTTACCCTTTCCTTAGTCTTTATCTGAACGACATTTTCCGTCGA
ATATGCGTTTTTCGATGGTAATGGTCAGACTATTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO30TF U 138
AF RR2AO01TF U 1
BS 1 227 RR2AO01TF
BS 228 228 RR2BO30TF
BS 229 817 RR2AO01TF

RD RR2BO30TF 267 0 0
AATGCTCGTTAACGTCGGTACGGTTGTAATGACCGTTTTGACCCTGGCTAGTTTTGTCGA
AGGCTTCGGTGTCAATTGGGGTAATATCGCATCACATCCGCTGAATTCTGATATTGTTGT
TAGGATGCTTAAGGAGAACAAGATCAACAAAGTGAAGCTTTTTGACGCTGATTCATGGAC
GATGAATGCTTTGGCCGGTTCGGGCATGGAGGTTATGGTCGGAATCCCTAATAACCTTCT
TGAAACTCTAGCCGATGATTACGGTAA

QA 1 267 1 267
DS 

RD RR2AO01TF 817 0 0
GGACATAGAAAAGAAATCCACCCACTGTAAAGAAAGACAACACACAAGAATCAATCAAAG
AAAGCAGACACATCTTCGAGATCAAACAAAACCAATTTCATTCATCGTCGGCTTCTCCAC
ATGGCCGGAAGAGCAGCAATGCTCGTTAACGTCGGTACGGTTGTAATGACCGTTTTGACC
CTGGCTAGTTTTGTCGAAGGCTTCGGTGTCAATTGGGGTAATATCGCGTCACATCCGCTG
AATCCTGATATTGTTGTTAGGATGCTTAAGGAGAACAAGATCAACAAAGTGAAGCTTTTT
GACGCTGATTCATGGACGATGAATGCTTTGGCCGGTTCGGGCATGGAGGTTATGGTCGGA
ATCCCTAATAACCTTCTTGAAACTCTAGCCGATGATTACGGTAATGCTAAAGACTGGGTC
AAAGAAAATATCACTGCTTACATGCGCAAGGATGGCGTCAACATCAAGTACGTGGCTGTG
GGGAACGAGCCGTTCTTGTCAGCATACAATGGATCATACTTGAAAACAACGTTTCCAGCT
TTAAAGAACATTCACAGAGCGTTAAAAGAGGCCGGACATACCGATGTAATGAGAGCCACG
ATCCCACAAAACGCTGAAGTTTACGAATCAGCTAACGATAAGCCATCAGAAGGCGATTTC
CGCAGCGACGTTAAGCAAATAATGCTCGACATCGTCAAGTTCTTCCATGATAATGATTTG
CCTTTCACCGTCAACATTTACCCTTTCCTTAGTCTTTATCTGAACGACATTTTCCGTCGA
ATATGCGTTTTTCGATGGTAATGGTCAGACTATTCCT

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

CO CL5976Contig1 656 2 1 U
GGGCCAGGAGAGAACTCTGTTTCTTTCCTCGTCCTCGCCTTCTCTCTCAAAGACGACAAA
AGAAGAGCCTTTCTGTGCGTTCGAGAAGAAGCATCTCCATCCATGGCCGATGCGCGCGGT
GATGATCTAACTGAATCGCTACAGAATCTCTTCACGAGTGTATCGTCCATGGTGAAATCC
GAGCTCCAGGGAACGAACAATCAGTTGGATCTGTTGGAGAAGATGAACGCGAGAGTTGCG
GCGGAGTACGATGATCTGGGTTACGTGGCGGCTGGGCTGAGGGTTTTCGCGGAGCAGATG
AAGTCGAAAAGTGGAGGCTTGGATGAGTTCGTGGGACAGATGGACGCGATCGAGAAACAA
GTGTCGGAGTTCGAAGCTGTCATCTCTGTTCTCGATCGTTATGTCTCTGTCTTAGAATCC
AAAGTCCGTTGCGCAAAAAAAAAAAAAAAAGAATCCAAAGTCCGAGCTGAGTGTCGTCAT
CATCAACATCGTCGGTCTAATGAGACGGTTACAGAATGATTCACCATTGTAATAATTAAT
TAGTCAGTCATCATCACTCTTGTTGTTTTGTTTTTTTTCTCCATTCAGAATGTGGAAAGT
TAACCAAAACTGTAATTGGATTAACCAAACTTGTCTCCTTGCGTCGGAACCAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DO28TF U 1
AF RR2DO28JQ C 62
BS 1 656 RR2DO28TF

RD RR2DO28TF 656 0 0
GGGCCAGGAGAGAACTCTGTTTCTTTCCTCGTCCTCGCCTTCTCTCTCAAAGACGACAAA
AGAAGAGCCTTTCTGTGCGTTCGAGAAGAAGCATCTCCATCCATGGCCGATGCGCGCGGT
GATGATCTAACTGAATCGCTACAGAATCTCTTCACGAGTGTATCGTCCATGGTGAAATCC
GAGCTCCAGGGAACGAACAATCAGTTGGATCTGTTGGAGAAGATGAACGCGAGAGTTGCG
GCGGAGTACGATGATCTGGGTTACGTGGCGGCTGGGCTGAGGGTTTTCGCGGAGCAGATG
AAGTCGAAAAGTGGAGGCTTGGATGAGTTCGTGGGACAGATGGACGCGATCGAGAAACAA
GTGTCGGAGTTCGAAGCTGTCATCTCTGTTCTCGATCGTTATGTCTCTGTCTTAGAATCC
AAAGTCCGTTGCGCAAAAAAAAAAAAAAAAGAATCCAAAGTCCGAGCTGAGTGTCGTCAT
CATCAACATCGTCGGTCTAATGAGACGGTTACAGAATGATTCACCATTGTAATAATTAAT
TAGTCAGTCATCATCACTCTTGTTGTTTTGTTTTTTTTCTCCATTCAGAATGTGGAAAGT
TAACCAAAACTGTAATTGGATTAACCAAACTTGTCTCCTTGCGTCGGAACCAAACT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2DO28JQ 595 0 0
GAAGAGCCTTTCTGTGCGTTCGAGAAGAAGCATCTCCATCCATGGCCGATGCGCGCGGTG
ATGATCTAACTGAATCGCTACAGAATCTCTTCACGAGTGTATCGTCCATGGTGAAATCCG
AGCTCCAGGGAACGAACAATCAGTTGGATCTGTTGGAGAAGATGAACGCGAGAGTTGCGG
CGGAGTACGATGATTTGGGTTACGTGGCGGCTGGGCTGAGGGTTTTCGCGGAGCAGATGA
AGTCGAAAAGTGGAGGCTTGGATGAGTTCGTGGGACAGATGGACGCGATCGAGAAACAAG
TGTCGGAGTTCGAAGCTGTCATCTCTGTTCTCGATCGTTATGTCTCTGTCTTAGAATCCA
AAGTCCGTTGCGCAAAAAAAAAAAAAAAAGAATCCAAAGTCCGAGCTGAGTGTCGTCATC
ATCAACATCGTCGGTCTAATGAGACGGTTACAGAATGATTCACCATTGTAATAATTAATT
AGTCAGTCATCATCACTCTTGTTGTTTTGTTTTTTTTCTCCATTCAGAATGTGGAAAGTT
AACCAAAACTGTAATTGGATTAACCAAACTTGTCTCCTTGCGTCGGAACCAAACT

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

CO CL5977Contig1 1064 2 6 U
ACAAAACAAGGACAAACAAAAACCCTCTAGTCTCCGTAAAAACCCTAAGCCTGGTGGGTC
TCCGATGGCGAGCCTTCGATGCATTCGCGAGTTGAGCCGCCGCGCCACGACTGTTTTCTC
GATCAACCAGTCGCGCTTGATCTCTTCACTTCGGGGAATAGAGCTTTCCGGTGCCAGCAT
TACTCACGAGGCCCCAACTCAGAACCGATCTCTCGCTAGGGACTTCCCTTGGCACAGTCG
TTCCCAAGGTCGCCATTTCGCTTCGAAAACAAACGATACGGATGAAAGCAGCGAAGATGA
GGATAAGGAGGAGTACGAGGATTCGGCGGAGATGGAAGTGGAAAGGGAATATTCACCGGC
GGAGAAAGTAGAGGCGGCGGCGGAGATAGGGTACAAGGTGATGGGTCCTCTCAAACCTTC
GGAGCGACTCTTCAAACCCTACGAGCCAGTCTTTGCCGTTGTTCAGATTGGTTCTCATCA
GTTCAAAGTAAGCAACGGAGATTCAATTTTCACAGAGAAGTTGAAATTTTGTGACATCAA
TGATAAGTTGACACTGACCAAGGTTCTTCTATTGGGATCGGCAAGCCAGACGATTATTGG
GAGGCCTGTCTTGCCTGATGCCACTGTTCATGCTGTTGTGGAAGAGCATGCATTGGATGA
AAAAGTGCTCATTTTCAAAAAGAAACGAAGGAAGAATTATAGGAGAACCACAGGACATCG
ACAGGAATTAACAAAGTTGAGAATAACTGATATCCAAGGAATTGAGAAACCAGAACCAGA
GATTGTCCGTAGCCTTCCAAGTCGGCTGATACAGAGCAACCAGAGGCTGAGCTAGTTGGT
TGAAGAGAAGAACTGTTTTTTTCTCGTTGTTGCTGATGCCACTACTAGTGGCTTAAAGGA
CGAAAAGGCCTTGGTAATTACTAGGCTCCTAAGATATGAACGTCATTGCGTTTAGTTATC
TCGTTCAACTCCACTGTTTGTTTATGCTCTTATTTGTATTGGAACTCGCTCAAGCTTCTG
GATACTGTTTGTTTGTTTCAAAATCATAAATAAAATATATGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA71TF U 1
AF RR2HA71JQ C 341
BS 1 680 RR2HA71TF
BS 681 681 RR2HA71JQ
BS 682 690 RR2HA71TF
BS 691 691 RR2HA71JQ
BS 692 702 RR2HA71TF
BS 703 1064 RR2HA71JQ

RD RR2HA71TF 709 0 0
ACAAAACAAGGACAAACAAAAACCCTCTAGTCTCCGTAAAAACCCTAAGCCTGGTGGGTC
TCCGATGGCGAGCCTTCGATGCATTCGCGAGTTGAGCCGCCGCGCCACGACTGTTTTCTC
GATCAACCAGTCGCGCTTGATCTCTTCACTTCGGGGAATAGAGCTTTCCGGTGCCAGCAT
TACTCACGAGGCCCCAACTCAGAACCGATCTCTCGCTAGGGACTTCCCTTGGCACAGTCG
TTCCCAAGGTCGCCATTTCGCTTCGAAAACAAACGATACGGATGAAAGCAGCGAAGATGA
GGATAAGGAGGAGTACGAGGATTCGGCGGAGATGGAAGTGGAAAGGGAATATTCACCGGC
GGAGAAAGTAGAGGCGGCGGCGGAGATAGGGTACAAGGTGATGGGTCCTCTCAAACCTTC
GGAGCGACTCTTCAAACCCTACGAGCCAGTCTTTGCCGTTGTTCAGATTGGTTCTCATCA
GTTCAAAGTAAGCAACGGAGATTCAATTTTCACAGAGAAGTTGAAATTTTGTGACATCAA
TGATAAGTTGACACTGACCAAGGTTCTTCTATTGGGATCGGCAAGCCAGACGATTATTGG
GAGGCCTGTCTTGCCTGATGCCACTGTTCATGCTGTTGTGGAAGAGCATGCATTGGATGA
AAAAGTGCTCATTTTCAAAA*GAAACGAAG*AAGAATTATAG
AGAACCA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2HA71JQ 724 0 0
GAAAGGGAATATTCACCGGCGGAGAAAGTAGAGGCGGCGGCGGAGATAGGGTACAAGGTG
ATGGGTCCTCTCAAACCTTCGGAGCGACTCTTCAAACCCTACGAGCCAGTCTTTGCCGTT
GTTCAGATTGGTTCTCATCAGTTCAAAGTAAGCAACGGAGATTCAATTTTCACAGAGAAG
TTGAAATTTTGTGACATCAATGATAAGTTGACACTGACCAAGGTTCTTCTATTGGGATCG
GCAAGCCAGACGATTATTGGGAGGCCTGTCTTGCCTGATGCCACTGTTCATGCTGTTGTG
GAAGAGCATGCATTGGATGAAAAAGTGCTCATTTTCAAAAAGAAACGAAGGAAGAATTAT
AGGAGAACCACAGGACATCGACAGGAATTAACAAAGTTGAGAATAACTGATATCCAAGGA
ATTGAGAAACCAGAACCAGAGATTGTCCGTAGCCTTCCAAGTCGGCTGATACAGAGCAAC
CAGAGGCTGAGCTAGTTGGTTGAAGAGAAGAACTGTTTTTTTCTCGTTGTTGCTGATGCC
ACTACTAGTGGCTTAAAGGACGAAAAGGCCTTGGTAATTACTAGGCTCCTAAGATATGAA
CGTCATTGCGTTTAGTTATCTCGTTCAACTCCACTGTTTGTTTATGCTCTTATTTGTATT
GGAACTCGCTCAAGCTTCTGGATACTGTTTGTTTGTTTCAAAATCATAAATAAAATATAT
GCCG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL5978Contig1 710 2 10 U
GGATTCAAAAGCAAAATCTACATAGAGAGAAAGAAGTAAGAAATGGCAACCACCCCCAAG
TGCACTGAGTGGCAGTTCAGCGGTAGCGAGGCAGCCAAAGAAGCTGCTGCGGCCGCCCTA
GGTGCCTACACCTCTAAACTCATGGCTCTTTGTGATCCTAATGGCAAGCCCATTTTGCCC
CCAAACAAAAAGGCCATAGAGACCAGCAATTCAGCCGAAAAAGCTGTCGTTAAAGTTGTT
CTCTCCGGCACTGGAAACGCCTATGCTCCTAGCATTGGCCTTCCCATCGCAAAAAGTGCC
GTAGCAGAGTATCTAAACCGAGATCTTCCGAAGAAGCTAACAACAGATGACGTGTTTATG
ACTGTTGGATGCAAACGAGCGATTGACCTTGCGGTCGATATTCTTGCTAAACCAAAAGCC
AACGTTCTGCTTCCGAGGCCAGGCTTCCCATGGGATATAGTACGCTCCATCTACAAGAAG
CTCGAGGTCCGTTACTATGATTTTATCCCTGAACAAAACTTTGAGATCGACTTCGAAAGC
GTCAAAAAGGTGACAGACAAGAACACGTTTGCTATATTTATCATCAATCCTCACAATCCC
AATGGAAACACCTACTCGGAGGCTCATCTCAAACAGCTCGCTGAATTGGCTAAGAACTCT
CCATTATGGTGGTTTCTGATGAAGTTTTTAGATGGACCGTCTTCGGAATA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ71TF U 1
AF RR2ES01TF U 1
BS 1 40 RR2CZ71TF
BS 41 41 RR2ES01TF
BS 42 112 RR2CZ71TF
BS 113 113 RR2ES01TF
BS 114 156 RR2CZ71TF
BS 157 157 RR2ES01TF
BS 158 253 RR2CZ71TF
BS 254 254 RR2ES01TF
BS 255 614 RR2CZ71TF
BS 615 710 RR2ES01TF

RD RR2CZ71TF 614 0 0
GGATTCAAAAGCAAAATCTACATAGAGAGAAAGAAGTAAGTAATGGCAACCACCCCCAAG
TGCACTGAGTGGCAGTTCAGCGGTAGCGAGGCAGCCAAAGAAGCTGCTGCGGTCGCCCTA
GGTGCCTACACCTCTAAACTCATGGCTCTTTGTGATGCTAATGGCAAGCCCATTTTGCCC
CCAAACAAAAAGGCCATAGAGACCAGCAATTCAGCCGAAAAAGCTGTCGTTAAAGTTGTT
CTCTCCGGCACTGTAAACGCCTATGCTCCTAGCATTGGCCTTCCCATCGCAAAAAGTGCC
GTAGCAGAGTATCTAAACCGAGATCTTCCGAAGAAGCTAACAACAGATGACGTGTTTATG
ACTGTTGGATGCAAACGAGCGATTGACCTTGCGGTCGATATTCTTGCTAAACCAAAAGCC
AACGTTCTGCTTCCGAGGCCAGGCTTCCCATGGGATATAGTACGCTCCATCTACAAGAAG
CTCGAGGTCCGTTACTATGATTTTATCCCTGAACAAAACTTTGAGATCGACTTCGAAAGC
GTCAAAAAGGTGACAGACAAGAACACGTTTGCTATATTTATCATCAATCCTCACAATCCC
AATGGAAACACCTA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2ES01TF 710 0 0
GGATTCAAAAGCAAAATCTACATAGAGAGAAAGAAGTAAGAAATGGCAACCACCCCCAAG
TGCACTGAGTGGCAGTTCAGCGGTAGCGAGGCAGCCAAAGAAGCTGCTGCGGCCGCCCTA
GGTGCCTACACCTCTAAACTCATGGCTCTTTGTGATCCTAATGGCAAGCCCATTTTGCCC
CCAAACAAAAAGGCCATAGAGACCAGCAATTCAGCCGAAAAAGCTGTCGTTAAAGTTGTT
CTCTCCGGCACTGGAAACGCCTATGCTCCTAGCATTGGCCTTCCCATCGCAAAAAGTGCC
GTAGCAGAGTATCTAAACCGAGATCTTCCGAAGAAGCTGACAGCAGATGACGTGTTTATG
ACTGTTGGATGCAAACGAGCGATTGACCTTGCGGTCGATATTCTTGCTAAACCAAAAGCC
AACGTTCTGCTTCCGAGGCCAGGCTTCCCATGGGATGTAGTACGCTCCATCTACAAGAAG
CTCGAGGTCCGTTACTATGATTTTATCCCTGAACAAAACTTTGAGATCGACTTCGAAAGC
GTCAAAAAGGTGACAGACAAGAACACGTTTGCTATATTTATCATCAATCCTCACAATCCC
AATGGAAACACCTACTCGGAGGCTCATCTCAAACAGCTCGCTGAATTGGCTAAGAACTCT
CCATTATGGTGGTTTCTGATGAAGTTTTTAGATGGACCGTCTTCGGAATA

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL5979Contig1 728 2 1 U
GGGGCAATTTAGAAGAGCATATATATATTGTATAAAAATCTTGGTTTCTCTCTTTTTTTT
TCTGTCTCTGTATATATATCTTGATGCTCTTATGTCTGCGTGTGTAGTCTTCCAATGCAT
TTCAAAGTAGGCATTGAAAGAAAAGTAAATGAATTGGTATGTTAAGGAAAGAAGAGGAGG
TGCATCGGAGTGAGGATGACGTCATCAACACCTCCACTTAAACTACTAACTCTCTTTGCC
ATCATATCTCTACTCCTCTTTCCATCTTCCTACCCACGTTACAGGTACGAGGTCGAGAAA
ACCACCACAAATCTCAAACTCTTCTTACTGTTCCTCCCGATTCTCTTTGTCTTTTTGTTG
GTCTCTCTACAATTCGTCCATCGAGCTCTCTTCAGCTCCTCTTACTACGTCAGAGGAAAC
CATGCCGCGTCTCTTTTCGGAGGAGGCCATTTTCCCTGGGGAGTGTTGTTTATGCTAATC
CTTCTACTTGTTTTAGTTTCTAAACAATCTTACTTCCACGCCTTATGGTACCCGATCTTA
TGACCTTAAAATTTTCATCGTTTTTATTGTTCACATATATGTTTTGTATATTGGTATGTT
TGCTTCCTGTAATCCATCTAGACCATACACATGTACAAGATTTATTGTCTCAACCAGTTT
TTCTACATTGTTCGTTTTTTGTAGTAAGTACTGGCTGTTCATGCTAAATCTATAATGAAT
AATGGGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AJ03JQ C 1
AF RR2AJ03TF U 1
BS 1 728 RR2AJ03TF

RD RR2AJ03JQ 728 0 0
GGGGCAATTTAGAAGAGCATATATATATTGTATAAAAATCTTGGTTTCTCTCTTTTTTTT
TCTGTCTCTGTATATATATCTTGATGCTCTTATGTCTGCGTGTGTAGTCTTCCAATGCAT
TTCAAAGTAGGCATTGAAAGAAAAGTAAATGAATTGGTATGTTAAGGAAAGAAGAGGAGG
TGCATCGGAGTGAGGATGACGTCATCAACACCTCCACTTAAACTACTAACTCTCTTTGCC
ATCATATCTCTACTCCTCTTTCCATCTTCCTACCCACGTTACAGGTACGAGGTCGAGAAA
ACCACCACAAATCTCAAACTCTTCTTACTGTTCCTCCCGATTCTCTTTGTCTTTTTGTTG
GTCTCTCTACAATTCGTCCATCGAGCTCTCTTCAGCTCCTCTTACTACGTCAGAGGAAAC
CATGCCGCGTCTCTTTTCGGAGGAGGCCATTTTCCCTGGGGAGTGTTGTTTATGCTAATC
CTTCTACTTGTTTTAGTTTCTAAACAATCTTACTTCCACGCCTTATGGTACCCGATCTTA
TGACCTTAAAATTTTCATCGTTTTTATTGTTCACATATATGTTTTGTATATTGGTATGTT
TGCTTCCTGTAATCCATCTAGACCATACACATGTACAAGATTTATTGTCTCAACCAGTTT
TTCTACATTGTTCGTTTTTTGTAGTAAGTACTGGCTGTTCATGCTAAATCTATAATGAAT
AATGGGAT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2AJ03TF 728 0 0
GGGGCAATTTAGAAGAGCATATATATATTGTATAAAAATCTTGGTTTCTCTCTTTTTTTT
TCTGTCTCTGTATATATATCTTGATGCTCTTATGTCTGCGTGTGTAGTCTTCCAATGCAT
TTCAAAGTAGGCATTGAAAGAAAAGTAAATGAATTGGTATGTTAAGGAAAGAAGAGGAGG
TGCATCGGAGTGAGGATGACGTCATCAACACCTCCACTTAAACTACTAACTCTCTTTGCC
ATCATATCTCTACTCCTCTTTCCATCTTCCTACCCACGTTACAGGTACGAGGTCGAGAAA
ACCACCACAAATCTCAAACTCTTCTTACTGTTCCTCCCGATTCTCTTTGTCTTTTTGTTG
GTCTCTCTACAATTCGTCCATCGAGCTCTCTTCAGCTCCTCTTACTACGTCAGAGGAAAC
CATGCCGCGTCTCTTTTCGGAGGAGGCCATTTTCCCTGGGGAGTGTTGTTTATGCTAATC
CTTCTACTTGTTTTAGTTTCTAAACAATCTTACTTCCACGCCTTATGGTACCCGATCTTA
TGACCTTAAAATTTTCATCGTTTTTATTGTTCACATATATGTTTTGTATATTGGTATGTT
TGCTTCCTGTAATCCATCTAGACCATACACATGTACAAGATTTATTGTCTCAACCAGTTT
TTCTACATTGTTCGTTTTTTGTAGTAAGTACTGGCTGTTCATGCTAAATCTATAATGAAT
AATGGGAT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL5980Contig1 1199 2 8 U
GAGGTCTAAGTGTCATAGTTAGTGCTGTACTAACGAGCAGAGCCATCTTCCAGAGAATGA
AGAACTACACAATCTATGCAGTTTCCATCACAGTCCGTGTAGTCATGGGCTTTATGCTTC
TTGCACTCATATGGAAGTACGACTTCTCACCGTTCATGGTGTTGGTAATAGCGATCCTGA
ATGATGGTACTATCATGACCATATCGAAGGATAGAGTAAAGCCTTCTCCACTTCCTGATT
CATGGAAACTCAAAGAGATATTTGCCACTGGTGTTGTTCTTGGCACTTACCTTGCAGTGA
TGACTGTCGTTTTCTTCTGGGCTGTAGAGAGCACTGACTTCTTCTCGGCAAAGTTTGGGG
TGAGATCTATTAGTGGCAATCCGCACGAGCTCACATCAGCTATATACCTCCAAGTTAGTA
TTATTAGCCAGGCGCTTATATTTGTCACAAGGTCACGTAGCTGGTCATATGCTGAACGTC
CTGGCTTCTGGTTAATCTTTGCCTTTTTCTTAGCTCAGCTGGTTGCTACTCTCATTGCCG
TGTATGCAAACTGGGGTTTTGCAAGAATCAGAGGTACTGGGGTGGGGATGGGCAGGAGTT
ATCTGGTTATACAGTTTAGTTACTTACATCCCTTTGGATATCCTCAAGTTCATCATCAGA
TATGCACTAAGTGGTAGAGCTTGGGATAATGTCATTGAGAACAAGACCGCTTTCACGTCA
AAGAAAGACTATGGAAAGGGAGAGAGGGAAGCACAATGGGCACAAGCTCAACGTACTCTT
CACGGATTGCAACCTGCTCAACCCTCAGAGATGTTCAATGATAAGAGCACTTACAGAGAA
CTTTCAGAGATAGCAGATCAGGCCAAGAGACGAGCTGAAGTCGCAAGGTTAAGAGAGCGT
CATACCTTGAAAGGTCACGTGGAATCAGTAGTGAAGCAGAAAGGACTTGACATAGAGGCT
ATCCAGCAACACTACACCCTGTGATTTCAGAAAGAAGTGTTTCTCAGATTAGTTTAGAAA
CAAAACCACAAGAGTATTGAATAATAAACCACCACCTTCATCATTAGAAAAATACTGCAA
AAGGAAAAAAGAAAAGAAATGTTTCTTTTATGAGCAGTGGCTGTTGGCTGCTTTATTTGT
TTTGAGATATTCTTGTTTTTATTGCATTTACAGAAGTAATAAGATTTTACAATTACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D118TF U 1
AF RR2D118JQ C 539
BS 1 700 RR2D118TF
BS 701 701 RR2D118JQ
BS 702 725 RR2D118TF
BS 726 726 RR2D118JQ
BS 727 739 RR2D118TF
BS 740 740 RR2D118JQ
BS 741 769 RR2D118TF
BS 770 1199 RR2D118JQ

RD RR2D118TF 769 0 0
GAGGTCTAAGTGTCATAGTTAGTGCTGTACTAACGAGCAGAGCCATCTTCCAGAGAATGA
AGAACTACACAATCTATGCAGTTTCCATCACAGTCCGTGTAGTCATGGGCTTTATGCTTC
TTGCACTCATATGGAAGTACGACTTCTCACCGTTCATGGTGTTGGTAATAGCGATCCTGA
ATGATGGTACTATCATGACCATATCGAAGGATAGAGTAAAGCCTTCTCCACTTCCTGATT
CATGGAAACTCAAAGAGATATTTGCCACTGGTGTTGTTCTTGGCACTTACCTTGCAGTGA
TGACTGTCGTTTTCTTCTGGGCTGTAGAGAGCACTGACTTCTTCTCGGCAAAGTTTGGGG
TGAGATCTATTAGTGGCAATCCGCACGAGCTCACATCAGCTATATACCTCCAAGTTAGTA
TTATTAGCCAGGCGCTTATATTTGTCACAAGGTCACGTAGCTGGTCATATGCTGAACGTC
CTGGCTTCTGGTTAATCTTTGCCTTTTTCTTAGCTCAGCTGGTTGCTACTCTCATTGCCG
TGTATGCAAACTGGGGTTTTGCAAGAATCAGAGGTACTGGGGTGGGGATGGGCAGGAGTT
ATCTGGTTATACAGTTTAGTTACTTACATCCCTTTGGATATCCTCAAGTTCATCATCAGA
TATGCACTAAGTGGTAGAGCTTGGGATAATGTCATTGAGA*CAAGACCGCTTTCACGTCA
AAGAA*GACTATGGAAAGG*AGAGAGGGAAGCACAATGGGCACAAGCTC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2D118JQ 661 0 0
CGTGTATGCAAACTGGGGTTTTGCAAGAATCAGAGGTACTGGG*TGGGGATGGGCAGGAG
TTATCTGGTTATACAGTTTAGTTACTTACATCCCTTTGGATATCCTCAAGTTCATCATCA
GATATGCACTAAGTGGTAGAGCTTGGGATAATGTCATTGAGAACAAGACCGCTTTCACGT
CAAAGAAAGACTATGGAAAGGGAGAGAGGGAAGCACAATGGGCACAAGCTCAACGTACTC
TTCACGGATTGCAACCTGCTCAACCCTCAGAGATGTTCAATGATAAGAGCACTTACAGAG
AACTTTCAGAGATAGCAGATCAGGCCAAGAGACGAGCTGAAGTCGCAAGGTTAAGAGAGC
GTCATACCTTGAAAGGTCACGTGGAATCAGTAGTGAAGCAGAAAGGACTTGACATAGAGG
CTATCCAGCAACACTACACCCTGTGATTTCAGAAAGAAGTGTTTCTCAGATTAGTTTAGA
AACAAAACCACAAGAGTATTGAATAATAAACCACCACCTTCATCATTAGAAAAATACTGC
AAAAGGAAAAAAGAAAAGAAATGTTTCTTTTATGAGCAGTGGCTGTTGGCTGCTTTATTT
GTTTTGAGATATTCTTGTTTTTATTGCATTTACAGAAGTAATAAGATTTTACAATTACTT
T

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL5981Contig1 553 2 1 U
GATGTGCGGTTTCTCGTGACACAGCCGCCTGGGGAGACAACCCTAATGAGTTCATTCCAG
AGAGGTTCATGAACGAGCACAAAGGAGTGGACTTCAAGGGGCAAGATTTTTGAGCTCCTA
CCTTTCGGGTCGGGCAGAAGAATGTGCCCCGCTATGCATCTTGGGGTCGCAATGGTAGAG
ATACCTTTTGCTAACCTTCTCTACCGATTCGATTGGAACCTACCAAAAGGGATTAAACCT
GAGGACATAAAGATGGATGTCATGACCGGACTCGCTATGCATAAGAAAGATCACCTAGTC
CTTGCACCAAGGACGCACATTTGATCAGGGTGATGGGTTGTGCTGAACAATATATTAGGA
GAATTCTGCTAGTAGATATGGCTACCAATGGTTGTTTTCCAACGTACGGCAAATTTTCGG
TTTATATTGTCATTACTATATTTTCGCTCGATTTTGGGTTTAACAAATAATGTATTCGTG
TTTTCATTCGAACCCTGTGTGTAATGTTCCTTCAATTTCGAAATCATTGTGTAATAATAC
CCATCTCATACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BO65JQ C 1
AF RR2BO65TF U 1
BS 1 553 RR2BO65TF

RD RR2BO65JQ 553 0 0
GATGTGCGGTTTCTCGTGACACAGCCGCCTGGGGAGACAACCCTAATGAGTTCATTCCAG
AGAGGTTCATGAACGAGCACAAAGGAGTGGACTTCAAGGGGCAAGATTTTTGAGCTCCTA
CCTTTCGGGTCGGGCAGAAGAATGTGCCCCGCTATGCATCTTGGGGTCGCAATGGTAGAG
ATACCTTTTGCTAACCTTCTCTACCGATTCGATTGGAACCTACCAAAAGGGATTAAACCT
GAGGACATAAAGATGGATGTCATGACCGGACTCGCTATGCATAAGAAAGATCACCTAGTC
CTTGCACCAAGGACGCACATTTGATCAGGGTGATGGGTTGTGCTGAACAATATATTAGGA
GAATTCTGCTAGTAGATATGGCTACCAATGGTTGTTTTCCAACGTACGGCAAATTTTCGG
TTTATATTGTCATTACTATATTTTCGCTCGATTTTGGGTTTAACAAATAATGTATTCGTG
TTTTCATTCGAACCCTGTGTGTAATGTTCCTTCAATTTCGAAATCATTGTGTAATAATAC
CCATCTCATACCC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2BO65TF 553 0 0
GATGTGCGGTTTCTCGTGACACAGCCGCCTGGGGAGACAACCCTAATGAGTTCATTCCAG
AGAGGTTCATGAACGAGCACAAAGGAGTGGACTTCAAGGGGCAAGATTTTTGAGCTCCTA
CCTTTCGGGTCGGGCAGAAGAATGTGCCCCGCTATGCATCTTGGGGTCGCAATGGTAGAG
ATACCTTTTGCTAACCTTCTCTACCGATTCGATTGGAACCTACCAAAAGGGATTAAACCT
GAGGACATAAAGATGGATGTCATGACCGGACTCGCTATGCATAAGAAAGATCACCTAGTC
CTTGCACCAAGGACGCACATTTGATCAGGGTGATGGGTTGTGCTGAACAATATATTAGGA
GAATTCTGCTAGTAGATATGGCTACCAATGGTTGTTTTCCAACGTACGGCAAATTTTCGG
TTTATATTGTCATTACTATATTTTCGCTCGATTTTGGGTTTAACAAATAATGTATTCGTG
TTTTCATTCGAACCCTGTGTGTAATGTTCCTTCAATTTCGAAATCATTGTGTAATAATAC
CCATCTCATACCC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL5982Contig1 786 2 6 U
CAACACAATGTTTTCGTTTATTTGGTGGATCATTGGGTTCTACTGGGTATCTGCTGGTGG
CCAAGAGTTGGCACAAGAGTCCCCCCGGATCTACTGGTTGTCTATCGTTTTTCTTGGTTT
CGATGTGTTCTTCGTTGTCTTCTGTGTTGCGTTGGCCTGCGTTATTGGCATTGCTGTTTG
CTGTTGCCTCCCATGCATCATTGCTGTCTTATACGCTGTTGCAGATCGGGAAGGGGCTTC
GAAAGAAGACATTGAGCAGCTCACCAAATTCAAGTTTCGTAAAGTTGGTGATGTTAGCAA
ACATGCTGGTGATGAAGCTCAAGGAAACACCGAGGGAGTAATGACAGAGTGCGGTACAGA
TTCACCCGTTGAACATACTATTCTGGAGGAGGATGCAGAATGCTGCATTTGTCTCTGTGC
ATATGAAGACGGAAGCGAACTAAGGGAACTTCCTTGTGGCCACCATTTCCACTGCTCATG
TGTAGACAAGTGGCTATACATAAACGCTACTTGCCCGCTCTGCAAATACGACATCCTCAA
GAGTAGCAACTTGGATCGTGAGGAAGTCTAGAGGAGACTGGTTTTACTTATTCATGACCC
CCCACACAACATTTCATCAGGAAACTTGGGGTCCAAAGGAAAAAAACACCACTGGTGTTT
TTTTTATATATATGAGTGCATTGTCTGTTATGTGCTATCTATACAAATTATTATACTTTT
GTTTTTATTTTTTGGATTGGAAAGGAATCAGGTCTGTACATGTATATTTATCTTACTTTC
ATTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES60TF U 1
AF RR2ES60JQ C 1
BS 1 620 RR2ES60TF
BS 621 621 RR2ES60JQ
BS 622 645 RR2ES60TF
BS 646 646 RR2ES60JQ
BS 647 695 RR2ES60TF
BS 696 786 RR2ES60JQ

RD RR2ES60TF 695 0 0
CAACACAATGTTTTCGTTTATTTGGTGGATCATTGGGTTCTACTGGGTATCTGCTGGTGG
CCAAGAGTTGGCACAAGAGTCCCCCCGGATCTACTGGTTGTCTATCGTTTTTCTTGGTTT
CGATGTGTTCTTCGTTGTCTTCTGTGTTGCGTTGGCCTGCGTTATTGGCATTGCTGTTTG
CTGTTGCCTCCCATGCATCATTGCTGTCTTATACGCTGTTGCAGATCGGGAAGGGGCTTC
GAAAGAAGACATTGAGCAGCTCACCAAATTCAAGTTTCGTAAAGTTGGTGATGTTAGCAA
ACATGCTGGTGATGAAGCTCAAGGAAACACCGAGGGAGTAATGACAGAGTGCGGTACAGA
TTCACCCGTTGAACATACTATTCTGGAGGAGGATGCAGAATGCTGCATTTGTCTCTGTGC
ATATGAAGACGGAAGCGAACTAAGGGAACTTCCTTGTGGCCACCATTTCCACTGCTCATG
TGTAGACAAGTGGCTATACATAAACGCTACTTGCCCGCTCTGCAAATACGACATCCTCAA
GAGTAGCAACTTGGATCGTGAGGAAGTCTAGAGGAGACTGGTTTTACTTATTCATGACCC
CCCACACAACATTTCATCAG*AAACTTGGGGTCCAAAGGAAAAAA*CACCACTGGTGTTT
TTTTTATATATATGAGTGCATTGTCTGTTATGTGC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2ES60JQ 786 0 0
CAACACAATGTTTTCGTTTATTTGGTGGATCATTGGGTTCTACTGGGTATCTGCTGGTGG
CCAAGAGTTGGCACAAGAGTCCCCCCGGATCTACTGGTTGTCTATCGTTTTTCTTGGTTT
CGATGTGTTCTTCGTTGTCTTCTGTGTTGCGTTGGCCTGCGTTATTGGCATTGCTGTTTG
CTGTTGCCTCCCATGCATCATTGCTGTCTTATACGCTGTTGCAGATCGGGAAGGGGCTTC
GAAAGAAGACATTGAGCAGCTCACCAAATTCAAGTTTCGTAAAGTTGGTGATGTTAGCAA
ACATGCTGGTGATGAAGCTCAAGGAAACACCGAGGGAGTAATGACAGAGTGCGGTACAGA
TTCACCCGTTGAACATACTATTCTGGAGGAGGATGCAGAATGCTGCATTTGTCTCTGTGC
ATATGAAGACGGAAGCGAACTAAGGGAACTTCCTTGTGGCCACCATTTCCACTGCTCATG
TGTAGACAAGTGGCTATACATAAACGCTACTTGCCCGCTCTGCAAATACGACATCCTCAA
GAGTAGCAACTTGGATCGTGAGGAAGTCTAGAGGAGACTGGTTTTACTTATTCATGACCC
CCCACACAACATTTCATCAGGAAACTTGGGGTCCAAAGGAAAAAAACACCACTGGTGTTT
TTTTTATATATATGAGTGCATTGTCTGTTATGTGCTATCTATACAAATTATTATACTTTT
GTTTTTATTTTTTGGATTGGAAAGGAATCAGGTCTGTACATGTATATTTATCTTACTTTC
ATTTGC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL5983Contig1 953 2 10 U
GAGGCATCAAGCGACTCAGATTGTGTCGATGAGGCTAACCAGAGCAGAACCGCCTCTAAG
AAAAGAAGTAGTTGAGTACATGCTTGATGTTGGCTCTCACATGTGGAGCATGAGGAGAAG
CAAAGCCAACTTTTTCAGGATCATGGGTGTTTTGAGCGGGTTGATAGCTGTGGGGAAATG
GTTTGAACAGATCTGTAACTGGAAGAATCCAATCACAACGGTCTTGATCCATCTCTTGTT
CATCATCCTTGTCCTCTACCCTGAGCTAATCTTGCCCACCATCTTCCTCTACCTCTTCCT
TATCGGTGTTTGGTACTACCGTTGGAGACCCAGGCATCCTCCGCACATGGACACGCGTCT
CTCTCACGCTGACTCAGCTCACCCTGACGAGCTTGATGAAGAGTTCGACACTTTTCCTAC
TTCGAGGCCATCTGATATCGTCAGGATGAGGTATGACAGGTTGAGGAGTATCGCTGGGAG
GATTCAGACAGTGGTTGGTGATCTTGCGATGCAAGGTGAAAGGCTTCAGTCTCTGCTGAG
CTGGCGTGATCTGCGTGTAACTGCGCTGTTTGTCTTGTTCTGTTTGATTGCTGCGGTTGT
TCTCTATGTGACTCCGTTTCAGGTTGTGGCGCTTCTGGTTGGGATCTATGTACTGAGACA
TCCGAGGTTTAGGTACAGGCTACCATCAGTTCCTCTCAATTTCTTCAGGAGGCTTCCTGC
AAGAACTGATTGCATGCTCTGAGCTCAAAGACAAAACTTCCATCTCTCTCTCCCCTTCGG
GTCTTCCTTCCCATCTCAAAGAAACTTCCTCTAGAATTGTTTATTTGTTTTGTTCAAGTG
TCATGTCATGAATCTTTTCTTGGTTGTTACTTATCATGTCTTATTTCGTTTATAACATTA
TCAAGACTTTTGTCTGATTGTGGTAAATCGGTATCTGTGTGATTTTGATGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN03TF U 1
AF RR2GN03JQ C 399
BS 1 622 RR2GN03TF
BS 623 623 RR2GN03JQ
BS 624 666 RR2GN03TF
BS 667 667 RR2GN03JQ
BS 668 672 RR2GN03TF
BS 673 673 RR2GN03JQ
BS 674 678 RR2GN03TF
BS 679 679 RR2GN03JQ
BS 680 698 RR2GN03TF
BS 699 953 RR2GN03JQ

RD RR2GN03TF 703 0 0
GAGGCATCAAGCGACTCAGATTGTGTCGATGAGGCTAACCAGAGCAGAACCGCCTCTAAG
AAAAGAAGTAGTTGAGTACATGCTTGATGTTGGCTCTCACATGTGGAGCATGAGGAGAAG
CAAAGCCAACTTTTTCAGGATCATGGGTGTTTTGAGCGGGTTGATAGCTGTGGGGAAATG
GTTTGAACAGATCTGTAACTGGAAGAATCCAATCACAACGGTCTTGATCCATCTCTTGTT
CATCATCCTTGTCCTCTACCCTGAGCTAATCTTGCCCACCATCTTCCTCTACCTCTTCCT
TATCGGTGTTTGGTACTACCGTTGGAGACCCAGGCATCCTCCGCACATGGACACGCGTCT
CTCTCACGCTGACTCAGCTCACCCTGACGAGCTTGATGAAGAGTTCGACACTTTTCCTAC
TTCGAGGCCATCTGATATCGTCAGGATGAGGTATGACAGGTTGAGGAGTATCGCTGGGAG
GATTCAGACAGTGGTTGGTGATCTTGCGATGCAAGGTGAAAGGCTTCAGTCTCTGCTGAG
CTGGCGTGATCTGCGTGTAACTGCGCTGTTTGTCTTGTTCTGTTTGATTGCTGCGGTTGT
TCTCTATGTGACTCCGTTTCAG*TTGTGGCGCTTCTGGTTGGGATCTATGTACTGAGACA
TCCGAG*TTTAG*TACAG*CTACCATCAGTTCCTCTCA
TTTCT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2GN03JQ 555 0 0
AAGAGTTCGACACTTTTCCTACTTCGAGGCCATCTGATATCGTCAGGATGAGGTATGACA
GGTTGAGGAGTATCGCTGGGAGGATTCAGACAGTGGTTGGTGATCTTGCGATGCAAGGTG
AAAGGCTTCAGTCTCTGCTGAGCTGGCGTGATCTGCGTGTAACTGCGCTGTTTGTCTTGT
TCTGTTTGATTGCTGCGGTTGTTCTCTATGTGACTCCGTTTCAGGTTGTGGCGCTTCTGG
TTGGGATCTATGTACTGAGACATCCGAGGTTTAGGTACAGGCTACCATCAGTTCCTCTCA
ATTTCTTCAGGAGGCTTCCTGCAAGAACTGATTGCATGCTCTGAGCTCAAAGACAAAACT
TCCATCTCTCTCTCCCCTTCGGGTCTTCCTTCCCATCTCAAAGAAACTTCCTCTAGAATT
GTTTATTTGTTTTGTTCAAGTGTCATGTCATGAATCTTTTCTTGGTTGTTACTTATCATG
TCTTATTTCGTTTATAACATTATCAAGACTTTTGTCTGATTGTGGTAAATCGGTATCTGT
GTGATTTTGATGTTC

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

CO CL5984Contig1 997 2 4 U
GCTCACGTGATTGTTAACACGTGCTTGATTCTCAAGGTTTTAGAAGAGAATCGGATCGAT
GACGGGATGAGTCTGTTGAAGAGGTTGTTACAGAAGAACATGGTTTTTGATACGATCGGC
TACTCTCTCGTTGTGTACGCTAGAACGAAGGAAGGTGATTTGGTTTCTGCGCGGAAAGTG
TTTGATGAAATGCTTCAGAGAGGTTTCGACGCGAACGCTTTCGTTTACACGGCTTTCGTA
AGAGTGTATTGCGAGACGGGTGAGGTTGACGAAGCGGAGAAGTTGATCGCTGAGATGGAA
GGGTCTGGGATCGATCCGTATGAAGAAACTTTTAACTCTCTCGTCGTTGGTTGCGCGAGA
TTCGGAAGAGAAGGAGAGAGCTTGAAGTATTGTGAGATGATGGTCGCGAGAGGACTTCTT
CCTAGTTGCTGGGCGTTCAATGAGATGGTTGAGAGAGTAAGCAAGATCGAGGATGTGAAA
CGTGCAGACGAAATCCTAACGAAGTCGATTGAGAAAGGGTTTGTGCCTGATGAACATACA
TACTCTCATCTGGCTCAAGGGTTTGTTAAAGGAAACGATATGGAACAAGCTCTCAAGATG
TTCTACGAGATGGAGTACCGAAATATCTCACCGGGTCTCGAGGTGTTTAGGTCACTGATA
GTGGGGCTTTACTCTTGTGGTAAAGTGGAAGCCGGCGAGAAGTACGTGAGAATTATGAAG
AGGAGGCTGATACAGCCTAATGTAGAGATATATGAGGCGTCATTAAGGCATTCCAAAGAA
CAGAGAATAAAACGAGTGCGGATAGGGTTTATGATGAAATGATATCAATAAGATGATTCA
AACTCGGTGGTCAAACTTGTTTGTAGCTTCATTTCGAATTATCATTGAATTTTTGTCAAG
TTTAATCATGCGCCAGTTATCCAACTATCCTGTAATAAGTTTTGATTGTTACACGAATAG
ATATTAGATGGTTAGACTGTAATCTGTAACTGTATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D921TF U 1
AF RR2D921JQ C 198
BS 1 574 RR2D921TF
BS 575 575 RR2D921JQ
BS 576 756 RR2D921TF
BS 757 997 RR2D921JQ

RD RR2D921TF 762 0 0
GCTCACGTGATTGTTAACACGTGCTTGATTCTCAAGGTTTTAGAAGAGAATCGGATCGAT
GACGGGATGAGTCTGTTGAAGAGGTTGTTACAGAAGAACATGGTTTTTGATACGATCGGC
TACTCTCTCGTTGTGTACGCTAGAACGAAGGAAGGTGATTTGGTTTCTGCGCGGAAAGTG
TTTGATGAAATGCTTCAGAGAGGTTTCGACGCGAACGCTTTCGTTTACACGGCTTTCGTA
AGAGTGTATTGCGAGACGGGTGAGGTTGACGAAGCGGAGAAGTTGATCGCTGAGATGGAA
GGGTCTGGGATCGATCCGTATGAAGAAACTTTTAACTCTCTCGTCGTTGGTTGCGCGAGA
TTCGGAAGAGAAGGAGAGAGCTTGAAGTATTGTGAGATGATGGTCGCGAGAGGACTTCTT
CCTAGTTGCTGGGCGTTCAATGAGATGGTTGAGAGAGTAAGCAAGATCGAGGATGTGAAA
CGTGCAGACGAAATCCTAACGAAGTCGATTGAGAAAGGGTTTGTGCCTGATGAACATACA
TACTCTCATCTGGCTCAAGGGTTTGTTAAAGGAA*CGATATGGAACAAGCTCTCAAGATG
TTCTACGAGATGGAGTACCGAAATATCTCACCGGGTCTCGAGGTGTTTAGGTCACTGATA
GTGGGGCTTTACTCTTGTGGTAAAGTGGAAGCCGGCGAGAAGTACGTGAGAATTATGAAG
AGGAGGCTGATACAGCCTAATGTAGAGATATATGAG
CGTCAT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2D921JQ 800 0 0
AGAGAGG
TTCGACGCGAACGCTTTCGTTTACACGGCTTTCGTAAGAGTGTATTGCGAGACGGGTGAG
GTTGACGAAGCGGAGAAGTTGATCGCTGAGATGGAAGGGTCTGGGATCGATCCGTATGAA
GAAACTTTTAACTCTCTCGTCGTTGGTTGCGCGAGATTCGGAAGAGAAGGAGAGAGCTTG
AAGTATTGTGAGATGATGGTCGCGAGAGGACTTCTTCCTAGTTGCTGGGCGTTCAATGAG
ATGGTTGAGAGAGTAAGCAAGATCGAGGATGTGAAACGTGCAGACGAAATCCTAACGAAG
TCGATTGAGAAAGGGTTTGTGCCTGATGAACATACATACTCTCATCTGGCTCAAGGGTTT
GTTAAAGGAAACGATATGGAACAAGCTCTCAAGATGTTTTACGAGATGGAGTACCGAAAT
ATCTCACCGGGTCTCGAGGTGTTTAGGTCACTGATAGTGGGGCTTTACTCTTGTGGTAAA
GTGGAAGCCGGCGAGAAGTACGTGAGAATTATGAAGAGGAGGCTGATACAGCCTAATGTA
GAGATATATGAGGCGTCATTAAGGCATTCCAAAGAACAGAGAATAAAACGAGTGCGGATA
GGGTTTATGATGAAATGATATCAATAAGATGATTCAAACTCGGTGGTCAAACTTGTTTGT
AGCTTCATTTCGAATTATCATTGAATTTTTGTCAAGTTTAATCATGCGCCAGTTATCCAA
CTATCCTGTAATAAGTTTTGATTGTTACACGAATAGATATTAGATGGTTAGACTGTAATC
TGTAACTGTATAA

QA 8 800 8 800
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5986Contig1 1003 2 2 U
GGACGATCCTCCATAGCTGTACAGTACATAGATCCCCCACAAAGAAAAAAAAACTAATCA
ATCAATCATGCCTTCCGGTGCTAAGAAAAGAAAAGCCGCCAAGAAAAAGCAGCAACAAGA
AGCCTCTTCTACTCTCAAATCAACCAACCATGGATCTACTGAGGAAGAAGCTGTCAGAAT
CGTAAAAGAAACTGATGAGCGTATAGAGATCACTGATTCAAGCCATGATCATGACAAGAG
CTCTAGCAGCAACAGCAGTAGCGGTAGTGGTAGTGGTAGCAGCAGCTCTGATGATGATGA
ATCCCATGAAGTCAAGGAGGAGACTGAAGTGATCACTGTGCCAAGTCAACCTGTTCCAGT
TGCTGGAGAAGCTCCCTTTATTGGTTCTACTGCTAATGCGATTGTAGAGAATGCCGGTTT
GATGGATTCAGCTACACCTAGTGGTCCAGACACTGAGAACATTGTTGTGACCTCGTCTGC
CGTTGAAGCTTCTCTTGCATCTGATGAGAGTAAGCAGGCGTCTTCAAGCACGACTGGCTC
TGATAAAAAAGAACCCAAAAAATGTGTTCCTGAAGGGGGCAAAGAGTCTGAAGTTGTCAT
TTCTCATGTGGAAGAGGATCCGGTGGTGCGACCAACACATGGAGTTGCGCAAAGAACCTC
ATGGTTAAGTTGTTGTGGCTTGTTTGATGTGATGACAGGATCCAATAGATAAGCTCCAGA
AACTTGAGTCGCCTATAAAGTCAGAAGCTGCAATATGCTAAATGTAATGAATGTCTCTCT
CTCTTTCACTTATACCTTTTCTCATATGAAATAGAACTCAGCTTCTAGTAGTAGTCTCTT
CATTAGCAGGCATGTCTGCATAGTCTTCCCTTTCGCTCTGTACCATTACTTGTCTATTGT
CGTTTTTGTTCTCTCAGGTTTTGAGACTTTGAGACCGTTGTTGTTGGCCAATTTATGTAA
TGATTAAATCACTACGCATGAGCTCAAAATGTATATTATCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AU84TF U 1
AF RR2AU84JQ C 208
BS 1 760 RR2AU84TF
BS 761 1003 RR2AU84JQ

RD RR2AU84TF 760 0 0
GGACGATCCTCCATAGCTGTACAGTACATAGATCCCCCACAAAGAAAAAAAAACTAATCA
ATCAATCATGCCTTCCGGTGCTAAGAAAAGAAAAGCCGCCAAGAAAAAGCAGCAACAAGA
AGCCTCTTCTACTCTCAAATCAACCAACCATGGATCTACTGAGGAAGAAGCTGTCAGAAT
CGTAAAAGAAACTGATGAGCGTATAGAGATCACTGATTCAAGCCATGATCATGACAAGAG
CTCTAGCAGCAACAGCAGTAGCGGTAGTGGTAGTGGTAGCAGCAGCTCTGATGATGATGA
ATCCCATGAAGTCAAGGAGGAGACTGAAGTGATCACTGTGCCAAGTCAACCTGTTCCAGT
TGCTGGAGAAGCTCCCTTTATTGGTTCTACTGCTAATGCGATTGTAGAGAATGCCGGTTT
GATGGATTCAGCTACACCTAGTGGTCCAGACACTGAGAACATTGTTGTGACCTCGTCTGC
CGTTGAAGCTTCTCTTGCATCTGATGAGAGTAAGCAGGCGTCTTCAAGCACGACTGGCTC
TGATAAAAAAGAACCCAAAAAATGTGTTCCTGAAGGGGGCAAAGAGTCTGAAGTTGTCAT
TTCTCATGTGGAAGAGGATCCGGTGGTGCGACCAACACATGGAGTTGCGCAAAGAACCTC
ATGGTTAAGTTGTTGTGGCTTGTTTGATGTGATGACAGGATCCAATAGATAAGCTCCAGA
AACTTGAGTCGCCTATAAAGTCAGAAGCTGCAATATGCTA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2AU84JQ 796 0 0
GATCACTGATTCAAGCCATGATCATGACAAGAGCTCTAGCAGCAACAGCAGTAGCGGTAG
TGGTAGTGGTAGCAGCAGCTCTGATGATGATGAATCCCATGAAGTCAAGGAGGAGACTGA
AGTGATCACTGTGCCAAGTCAACCTGTTCCAGTTGCTGGAGAAGCTCCCTTTATTGGTTC
TACTGCTAATGCGATTGTAGAGAATGCCGGTTTGATGGATTCAGCTACACCTAGTGGTCC
AGACACTGAGAACATTGTTGTGACCTCGTCTGCCGTTGAAGCTTCTCTTGCATCTGATGA
GAGTAAGCAGGCGTCTTCAAGCACGACTGGCTCTGATAAAAAAGAACCCAAAAAATGTGT
TCCTGAAGGGGGCAAAGAGTCTGAAGTTGTCATTTCTCATGTGGAAGAGGATCCGGTGGT
GCGACCAACACATGGAGTTGCGCAAAGAACCTCATGGTTAAGTTGTTGTGGCTTGTTTGA
TGTGATGACAGGATCCAATAGATAAGCTCCAGAAACTTGAGTCGCCTATAAAGTCAGAAG
CTGCAATATGCTAAATGTAATGAATGTCTCTCTCTCTTTCACTTATACCTTTTCTCATAT
GAAATAGAACTCAGCTTCTAGTAGTAGTCTCTTCATTAGCAGGCATGTCTGCATAGTCTT
CCCTTTCGCTCTGTACCATTACTTGTCTATTGTCGTTTTTGTTCTCTCAGGTTTTGAGAC
TTTGAGACCGTTGTTGTTGGCCAATTTATGTAATGATTAAATCACTACGCATGAGCTCAA
AATGTATATTATCTAG

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL5987Contig1 911 2 2 U
CATCAAACCTCATCATTATCAAAATATTCAAACCTAACCCCAACTCAAACCATGTCTTCT
TCCGACTGTCCGTCACCGTTACCCACCGCCCCGAAACTTCAAGTTGATTCCGTTACTTTT
CCACCGTCCGTCATCTCACCGGCTTCCTCCAACCCTCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGTGTG
CGAGGTTTGGAAATTCAAGGAAAGTTTGTGATCTTCACCGTCATCGGAGTTTACCTAGAT
CCTGTCTCTATACCGTCACTCTCGGTTAAGTGGAAAGGTAAAACGACAGAAGAATTAACG
GAATCCGTCCCTTTCTTCCGTGAAATCGTCACAGGTTCGTTTGAGAAATTCATTAAAGTG
ACGATGAAGCTGCCGTTAACGGGACAGCAATATTCAGAGAAAGTAACGGAGAACTGTGTG
GCGATATGGAAATCGTTAGGGATTTACACAGACTCTGAGGCTAAAGCAGTGGAGAGGTTC
TTGGAAGTCTTCAAGGACGAAACGTTTCCTCCTGGTGCTTCCATCCTCTTCGCTCTCTCC
CCTACAGGCTCTCTTACGGTTGCGTTTTCGAAAGATGATAGCATTCCTGAAACGGGAAAA
GCGGTGATCGAAAATAAGTTGTTGGCAGGGGCAGTTCTTGAATCGATCATTGGAAAGAAC
GGTGTGTCTCCTGGGGCTAGGTTGAGTGTTGCCGAGAGATTGGCTCAGCTGATGAAGGAG
AATAAGGTCGAAGAAGATGCAACAAAGACTGATCAAGAGGAAGCTAACGATCTCTCCCTG
GCCAAAGAAAACTGATCCTGTGGGAGATTTTTATGTTTCTATGCTTAATAACATTGTGTT
TAGTTCCCATCGCATGTTTTAACTCTGCTTATATTCGTAAGAATTATTAGATAATCATAT
GGAGTTGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F710TF U 1
AF RR2F710JQ C 259
BS 1 631 RR2F710TF
BS 632 911 RR2F710JQ

RD RR2F710TF 631 0 0
CATCAAACCTCATCATTATCAAAATATTCAAACCTAACCCCAACTCAAACCATGTCTTCT
TCCGACTGTCCGTCACCGTTACCCACCGCCCCGAAACTTCAAGTTGATTCCGTTACTTTT
CCACCGTCCGTCATCTCACCGGCTTCCTCCAACCCTCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGTGTG
CGAGGTTTGGAAATTCAAGGAAAGTTTGTGATCTTCACCGTCATCGGAGTTTACCTAGAT
CCTGTCTCTATACCGTCACTCTCGGTTAAGTGGAAAGGTAAAACGACAGAAGAATTAACG
GAATCCGTCCCTTTCTTCCGTGAAATCGTCACAGGTTCGTTTGAGAAATTCATTAAAGTG
ACGATGAAGCTGCCGTTAACGGGACAGCAATATTCAGAGAAAGTAACGGAGAACTGTGTG
GCGATATGGAAATCGTTAGGGATTTACACAGACTCTGAGGCTAAAGCAGTGGAGAGGTTC
TTGGAAGTCTTCAAGGACGAAACGTTTCCTCCTGGTGCTTCCATCCTCTTCGCTCTCTCC
CCTACAGGCTCTCTTACGGTTGCGTTTTCGAAAGATGATAGCATTCCTGAAACGGGAAAA
GCGGTGATCGAAAATAAGTTGTTGGCAGGGG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2F710JQ 653 0 0
CTCTCGGTTAAGTGGAAAGGTAAAACGACAGAAGAATTAACGGAATCCGTCCCTTTCTTC
CGTGAAATCGTCACAGGTTCGTTTGAGAAATTCATTAAAGTGACGATGAAGCTGCCGTTA
ACGGGACAGCAATATTCAGAGAAAGTAACGGAGAACTGTGTGGCGATATGGAAATCGTTA
GGGATTTACACAGACTCTGAGGCTAAAGCAGTGGAGAGGTTCTTGGAAGTCTTCAAGGAC
GAAACGTTTCCTCCTGGTGCTTCCATCCTCTTCGCTCTCTCCCCTACAGGCTTTCTTACG
GTTGCGTTTTCGAAAGATGATAGCATTCCTGAAACGGGAAAAGCGGTGATCGAAAATAAG
TTGTTGGCAGGGGCAGTTCTTGAATCGATCATTGGAAAGAACGGTGTGTCTCCTGGGGCT
AGGTTGAGTGTTGCCGAGAGATTGGCTCAGCTGATGAAGGAGAATAAGGTCGAAGAAGAT
GCAACAAAGACTGATCAAGAGGAAGCTAACGATCTCTCCCTGGCCAAAGAAAACTGATCC
TGTGGGAGATTTTTATGTTTCTATGCTTAATAACATTGTGTTTAGTTCCCATCGCATGTT
TTAACTCTGCTTATATTCGTAAGAATTATTAGATAATCATATGGAGTTGATTC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5989Contig1 796 2 4 U
GGAATCACCTTCTCCTTAGTTTCTGAACCTACCCTCATCGGGTCTCCAAGGGGCCAAGAA
AGAACTGCTTTCTCGGCTTCCCGGAGTCTCACCATCCTCTGTTTTCACGCTTTCTTCATC
CACACGCAACCTCTTACCCAAACCTAACCCTAAAAAAATGGATTCCACGGAGCTAAAACG
TGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACACAGAAGGAGCTAAACGA
GTCATTCAAAAACCTCGGCATCATAATCCCTGAAAACGAGCTATCGCAGATGGTCGAGAA
GATCGATGTGAACGGTGATGGCTGTGTTGACGCTGAAGAGTTTGGAGAGCTTTACAAGTC
GATAATGGTCCAAGGCGACGATGAGGAGGTAGAAGATGAAGATATGAAGGAAGCGTTCAA
CGTTTTTGATCAGAATGGAGATGGGTTTATTACGGTGGATGAGTTGAAAACCGTCTTGTC
TTCCTTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATAATACAAGT
GGATGTTGATGGTGATGGTAGGGTTAATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAAGAAGGG
TCAGCTTTTAGCTCAATGAGCTGATGGTTTATATATTTGTTTTTTTTTGTGTTTACCATT
TTTCTCTCGCATTCTAAGGAAATATCAGATGATCTGTAACTGAACTGTCTTATATAGTGT
CTAGGTTTGCGAGAGCCCATTGTAAAAAACTTAGACCTGTTCGTTTCTGATGTGATTTGT
GATGATTTTTTTTATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C721TF U 1
AF RR2C721JQ C 107
BS 1 678 RR2C721TF
BS 679 679 RR2C721JQ
BS 680 720 RR2C721TF
BS 721 796 RR2C721JQ

RD RR2C721TF 720 0 0
GGAATCACCTTCTCCTTAGTTTCTGAACCTACCCTCATCGGGTCTCCAAGGGGCCAAGAA
AGAACTGCTTTCTCGGCTTCCCGGAGTCTCACCATCCTCTGTTTTCACGCTTTCTTCATC
CACACGCAACCTCTTACCCAAACCTAACCCTAAAAAAATGGATTCCACGGAGCTAAAACG
TGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACACAGAAGGAGCTAAACGA
GTCATTCAAAAACCTCGGCATCATAATCCCTGAAAACGAGCTATCGCAGATGGTCGAGAA
GATCGATGTGAACGGTGATGGCTGTGTTGACGCTGAAGAGTTTGGAGAGCTTTACAAGTC
GATAATGGTCCAAGGCGACGATGAGGAGGTAGAAGATGAAGATATGAAGGAAGCGTTCAA
CGTTTTTGATCAGAATGGAGATGGGTTTATTACGGTGGATGAGTTGAAAACCGTCTTGTC
TTCCTTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATAATACAAGT
GGATGTTGATGGTGATGGTAGGGTTAATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAAGAAGGG
TCAGCTTTTAGCTCAATGAGCTGATGGTTTATATATTTGTTTTTTTTTGTGTTTACCATT
TTTCTCTCGCATTCTAAG*AAATATCAGATGATCTGTAACTGAACTGTCTTATATAGTGT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2C721JQ 690 0 0
ACGCTTTCTTCATCCACACGCAACCTCTTACCCAAACCTAACCCTAAAAAAATGGATTCC
ACGGAGCTAAAACGTGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACACAG
AAGGAGCTAAACGAGTCATTCAAAAACCTCGGCATCATAATCCCTGAAAACGAGCTATCG
CAGATGGTCGAGAAGATCGATGTGAACGGTGATGGCTGTGTTGACGCTGAAGAGTTTGGA
GAGCTTTACAAGTCGATAATGGTCCAAGGCGACGATGAGGAGGTAGAAGATGAAGATATG
AAGGAAGCGTTCAACGTTTTTGATCAGAATGGAGATGGGTTTATTACGGTGGATGAGTTG
AAAACCGTCTTGTCTTCCTTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAG
ATGATAATACAAGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGGGTTAATTACAAGGAGTTTAGACAA
ATGATGAAGAAGGGTCAGCTTTTAGCTCAATGAGCTGATGGTTTATATATTTGTTTTTTT
TTGTGTTTACCATTTTTCTCTCGCATTTTAAGGAAATATCAGATGATCTGTAACTGAACT
GTCTTATATAGTGTCTAGGTTTGCGAGAGCCCATTGTAAAAAACTTAGACCTGTTCGTTT
CTGATGTGATTTGTGATGATTTTTTTTATA

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL5990Contig1 1402 2 4 U
GGCTGAAACAAAGTTTTAGACTTTCAATTTTGATTCTCTTCATCTATCGAAGGCAGATAG
AGAAAGAGAGAAAGAAAGGAAGAAAGATGACAGCTCCGGTGATCCTAAACGGCGGCGAAG
CAACGGAGAGACAAGCTCGAATGGCGCACGCTGCAATGACCTTTGTTCAGCTACTAAATG
GCGCTTACCATGTGATTACGAAAGTAGCTCTTAACGTTGGCGTCAATCAGCTCGTCTTCT
GTGTCTTCCGTGATCTTCTTGCTATCTCTATCCTCGCACCTCTTGCTTATTTCCACGAAA
GAGGGATCAGACCTCCTATGACTAGGAGCGTTCTCTTTTCACTCTTATTCATAGGTTTGG
CAGGGATATTTGGGAACCAATTACTATTTCTTATGGGTTTATCATACACAAATCCAACTT
ACGCCGCCGCTATACAACCATCCATCCCAGTCTTCACCTTTATCTTAGCTGTAATCATAG
GTATAGAGAAAGTGAACTTGTTTAAAATAGAGGGCCTAATGAAAGTTGGAGGTACTATCA
TTTGTGTTTCCGGTGCCTTAGTGATGGTTTTGTTCCGTGGTCCAGCCTTGTATGGAGAAA
AAGATGCAGACTCTACACCGAAAACTGTAGTTATTGATGCAAGTGAATGTGAGCTTCACG
GTTGGTTAGTTTCTAGTTTCCTCGGTCTTGGTCTTGATCTATGGCACATTGGAGTTATAT
GCTTGATTGGAAACTGCATGTGTATGGCTGCTTTCATCACCGTCCAAGCACCGGTGTTGA
AGAAGTATCCTGCTTACCTTTCGGTTGCTGCGTATTCATACTTCTTCGGTACGTTATTAA
TGATCACTACAGCTTCAGTGTTTGTTAGAGAGCCTAAGGATTGGAGATTGACAGAATCCG
AGATTCTTGCTGTTATATTTGCGGGAGTGTTTGCATCAGCTCTGAACTATGGACTCCTGA
CTTGGTCTAATAAAATTATTGGAGCTGCTTTGGTTTCTCTTTACAACCCTCTTCAGCCTG
CAACATCTGCCTTTTTATCGACAATTTTCCTCGGCAGTCCAATCTATCTCGGAAGCGTTG
TGGGTGGAGTACTCATCATTTCGGGGCTATATATGGTTACGTGGGCATCTTACAGAGAAC
AACACACAACAGTTTCAGGAAACGTGATTGCTTCTTCTAGTGATGTAAGAGTTTCGGAAC
CTTTGATTTACAGAGATGGGACTGGTGAAAAATTTGCGTAAAAAGACATTCATCTTACCA
TCAGACAAGAAGTATATAAACAGACAGTTCCTTTTACAGTTAAGCTTTTTTCGTTTTATC
TCTTAAGCAGCTGCTTGCTTGATTTTTCATTCAACTGAACTGAGGCAGTAGCAAATTATC
AATAAATTTATTAAATTTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN18TF U 1
AF RR2GN18JQ C 622
BS 1 727 RR2GN18TF
BS 728 728 RR2GN18JQ
BS 729 760 RR2GN18TF
BS 761 1402 RR2GN18JQ

RD RR2GN18TF 762 0 0
GGCTGAAACAAAGTTTTAGACTTTCAATTTTGATTCTCTTCATCTATCGAAGGCAGATAG
AGAAAGAGAGAAAGAAAGGAAGAAAGATGACAGCTCCGGTGATCCTAAACGGCGGCGAAG
CAACGGAGAGACAAGCTCGAATGGCGCACGCTGCAATGACCTTTGTTCAGCTACTAAATG
GCGCTTACCATGTGATTACGAAAGTAGCTCTTAACGTTGGCGTCAATCAGCTCGTCTTCT
GTGTCTTCCGTGATCTTCTTGCTATCTCTATCCTCGCACCTCTTGCTTATTTCCACGAAA
GAGGGATCAGACCTCCTATGACTAGGAGCGTTCTCTTTTCACTCTTATTCATAGGTTTGG
CAGGGATATTTGGGAACCAATTACTATTTCTTATGGGTTTATCATACACAAATCCAACTT
ACGCCGCCGCTATACAACCATCCATCCCAGTCTTCACCTTTATCTTAGCTGTAATCATAG
GTATAGAGAAAGTGAACTTGTTTAAAATAGAGGGCCTAATGAAAGTTGGAGGTACTATCA
TTTGTGTTTCCGGTGCCTTAGTGATGGTTTTGTTCCGTGGTCCAGCCTTGTATGGAGAAA
AAGATGCAGACTCTACACCGAAAACTGTAGTTATTGATGCAAGTGAATGTGAGCTTCACG
GTTGGTTAGTTTCTAGTTTCCTCGGTCTTGGTCTTGATCTATGGCACATTGGAGTTATAT
GCTTGAT*GGAAACTGCATGTGTATGGCTGCTTTCATCAC
GT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2GN18JQ 781 0 0
AAACTGTAGTTATTGATGCAAGTGAATGTGAGCTTCACGGTTGGTTAGTTTCTAGTTTCC
TCGGTCTTGGTCTTGATCTATGGCACATTGGAGTTATATGCTTGATTGGAAACTGCATGT
GTATGGCTGCTTTCATCACCGTCCAAGCACCGGTGTTGAAGAAGTATCCTGCTTACCTTT
CGGTTGCTGCGTATTCATACTTCTTCGGTACGTTATTAATGATCACTACAGCTTCAGTGT
TTGTTAGAGAGCCTAAGGATTGGAGATTGACAGAATCCGAGATTCTTGCTGTTATATTTG
CGGGAGTGTTTGCATCAGCTCTGAACTATGGACTCCTGACTTGGTCTAATAAAATTATTG
GAGCTGCTTTGGTTTCTCTTTACAACCCTCTTCAGCCTGCAACATCTGCCTTTTTATCGA
CAATTTTCCTCGGCAGTCCAATCTATCTCGGAAGCGTTGTGGGTGGAGTACTCATCATTT
CGGGGCTATATATGGTTACGTGGGCATCTTACAGAGAACAACACACAACAGTTTCAGGAA
ACGTGATTGCTTCTTCTAGTGATGTAAGAGTTTCGGAACCTTTGATTTACAGAGATGGGA
CTGGTGAAAAATTTGCGTAAAAAGACATTCATCTTACCATCAGACAAGAAGTATATAAAC
AGACAGTTCCTTTTACAGTTAAGCTTTTTTCGTTTTATCTCTTAAGCAGCTGCTTGCTTG
ATTTTTCATTCAACTGAACTGAGGCAGTAGCAAATTATCAATAAATTTATTAAATTTTCA
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL5991Contig1 1280 2 2 U
GGGAACAACCGCTAAAACCCCTACCTCCACTTGTTTCCGCCTACTCTTCCGCCATTTTTC
ACTCAGCTGCTTGTTAACTAAAAACATGGGAAGCGATACAGAAGCAGAGAAGTCGATTCA
AAAGGAGAAGAAGAAGGTCATCTCCCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTCGCCGGGAAAAA
GCTCCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAGAAGTGTCTGAAGAG
AGGTGTTAAAGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGACAGAAAGGGTTAGTTTTCATTTT
TTTCATGTAATCTCTTTCGTGTTGAATGCGTCATCTGATAGTTTATGATTGAACCGTGTA
CAATTAAGCCGATGCTCTGGATTAAACGTAATGAATGTAGCATGGTACTGTACACGAATA
ATGATTTATGGATCGACATGTCTGCTATCTATGAGTTTAATATGATTAGACGGCCTGGTT
TAGATCCACATTCTTACATCTTTAATTTTGTACTTGGTTTAGTTTTGCATATGGTTGTTT
TGATTCGTGTACAATTAAGCCGATGCTCTGGATGAACTAGATGAAGGTAGCATGGTACTG
TGCACGTAAACCGAGCTTTCTGCGGATTGACATGTCTGCCCTCTCTGAGTTTTTTCTTTG
ATTAGAGGGCCTGGTTGAGATCCACATTCATGATGTTAGTAGTAGTTAGTTTGATGTGAA
ATCCGTGTACAATTAAGCCGATGCTCTGGATTAAACATAAATGAATGTAGCATGGTACTG
TACACGAAAACTGAATCATGAGTTTGAAATGTCTGTGCCCTCTCTGATAACCTTTGTAGG
TTCTTTGATTTGCGGGCCTGGTTTAAACCCACATTTTCTCTTGTATGTTTTATCTTCTTT
GATTGCAACTTGTAATAGATTGTTGTTCTTTATGCAGGATATGTGTTATAGCTGGAAACA
TATCTCCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGCTGGTATTCCTT
ACATCTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGTGCTACAAAACGACCAACTT
GTTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGTAGAGCTAAGTGCAGAGGATCTCGAGA
AGTTGAAGTCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTCATCATCTGTAA
TCTGAATCAGAAAAACACATGAACGTGTCTTTCTTATTTGGTTTGTTGTTGCTTAATGAA
TATGACGAGATTTTAAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF63TF U 1
AF RR2BF63JQ C 656
BS 1 829 RR2BF63TF
BS 830 1280 RR2BF63JQ

RD RR2BF63TF 834 0 0
GGGAACAACCGCTAAAACCCCTACCTCCACTTGTTTCCGCCTACTCTTCCGCCATTTTTC
ACTCAGCTGCTTGTTAACTAAAAACATGGGAAGCGATACAGAAGCAGAGAAGTCGATTCA
AAAGGAGAAGAAGAAGGTCATCTCCCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTCGCCGGGAAAAA
GCTCCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAGAAGTGTCTGAAGAG
AGGTGTTAAAGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGACAGAAAGGGTTAGTTTTCATTTT
TTTCATGTAATCTCTTTCGTGTTGAATGCGTCATCTGATAGTTTATGATTGAACCGTGTA
CAATTAAGCCGATGCTCTGGATTAAACGTAATGAATGTAGCATGGTACTGTACACGAATA
ATGATTTATGGATCGACATGTCTGCTATCTATGAGTTTAATATGATTAGACGGCCTGGTT
TAGATCCACATTCTTACATCTTTAATTTTGTACTTGGTTTAGTTTTGCATATGGTTGTTT
TGATTCGTGTACAATTAAGCCGATGCTCTGGATGAACTAGATGAAGGTAGCATGGTACTG
TGCACGTAAACCGAGCTTTCTGCGGATTGACATGTCTGCCCTCTCTGAGTTTTTTCTTTG
ATTAGAGGGCCTGGTTGAGATCCACATTCATGATGTTAGTAGTAGTTAGTTTGATGTGAA
ATCCGTGTACAATTAAGCCGATGCTCTGGATTAAACATAAATGAATGTAGCATGGTACTG
TACACGAAAACTGAATCATGAGTTTGAAATGTCTGTGCCCTCTCTGATA
CCTTT

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2BF63JQ 625 0 0
CTTTGATTAGAGGGCCTGGTTGAGATCCACATTCATGATGTTAGTAGTAGTTAGTTTGAT
GTGAAATCCGTGTACAATTAAGCCGATGCTCTGGATTAAACATAAATGAATGTAGCATGG
TACTGTACACGAAAACTGAATCATGAGTTTGAAATGTCTGTGCCCTCTCTGATAACCTTT
GTAGGTTCTTTGATTTGCGGGCCTGGTTTAAACCCACATTTTCTCTTGTATGTTTTATCT
TCTTTGATTGCAACTTGTAATAGATTGTTGTTCTTTATGCAGGATATGTGTTATAGCTGG
AAACATATCTCCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGCTGGTAT
TCCTTACATCTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGTGCTACAAAACGACC
AACTTGTTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGTAGAGCTAAGTGCAGAGGATCT
CGAGAAGTTGAAGTCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTCATCATC
TGTAATCTGAATCAGAAAAACACATGAACGTGTCTTTCTTATTTGGTTTGTTGTTGCTTA
ATGAATATGACGAGATTTTAAAGCC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL5992Contig1 846 2 4 U
ACGATGGAGAAAGCGATGGATTATCTAGGAATCGACCTTCTCTGCGCCACCGATTCCCTC
CGTCACGGCCACTTTCCGACAAAAGATTGCCTCTTCCCTCTCTTCCCTCTCCTCACGAAC
CTCCTCAGTTACTTCCTCGTCGCTGCTTCAATGACCGTCAAGCTTCCTCAGATAATGAAA
ATTGTGGACAAGAAGAGCGTAAGAGGCCTCAGCGTTACAGCATTCGAGCTAGAAGTCGTG
GGCTACACGATCTCACTCGCCTACTGTCTCCACAAGAAGCTCCCCTTCTCGTCTTTCGGC
GAAGTCGCGTTTCTTCTGGTCCAAGCTTTGATCTTGATGGCTTGTATCTATCACTACTCC
TCAAAGCCTCTCTCTGTTTCCACTTGGGTCAGAGCGGTTGTGTACTTTGCCTTGGCGCCG
GCTCTGTTCGCTGGGAAGATTGATGCGTTGGTGTTTGAAGCTCTCTACGCTTCGAAGCAT
TTGATTTTTTTGTCGGCGAGGGTGCCTCAGATCTGGAAGAATTTCGGGAGTAAGAGTACT
GGGCAGCTTAGTTTCTTGACGTGTTTGATGAACCTGGGTGGGTCCATGGCGAGGGTTTTC
ACTAGCGTTCAGGTGAATGCTCCGTTTAGTATGGTAGTGGGTGTTGTTCTTGCTGTTTTC
ACCAATGGTATTATCATGAGTCAGATTCTCTTGTATTGGAGAAAAGGAGAAGGAAAGCAA
GTGGATGATAAAAAGTTGTCATGATATAGTCATGTACTTGTTGGCTTTGTAAAAGTGATT
ACAAAAAAAAAAGAAGAAGATGTTTGGTCTCATATATTATCAATTAAATAAAACTCAATT
TGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG16TF U 1
AF RR2FG16JQ C 142
BS 1 611 RR2FG16TF
BS 612 612 RR2FG16JQ
BS 613 702 RR2FG16TF
BS 703 846 RR2FG16JQ

RD RR2FG16TF 702 0 0
ACGATGGAGAAAGCGATGGATTATCTAGGAATCGACCTTCTCTGCGCCACCGATTCCCTC
CGTCACGGCCACTTTCCGACAAAAGATTGCCTCTTCCCTCTCTTCCCTCTCCTCACGAAC
CTCCTCAGTTACTTCCTCGTCGCTGCTTCAATGACCGTCAAGCTTCCTCAGATAATGAAA
ATTGTGGACAAGAAGAGCGTAAGAGGCCTCAGCGTTACAGCATTCGAGCTAGAAGTCGTG
GGCTACACGATCTCACTCGCCTACTGTCTCCACAAGAAGCTCCCCTTCTCGTCTTTCGGC
GAAGTCGCGTTTCTTCTGGTCCAAGCTTTGATCTTGATGGCTTGTATCTATCACTACTCC
TCAAAGCCTCTCTCTGTTTCCACTTGGGTCAGAGCGGTTGTGTACTTTGCCTTGGCGCCG
GCTCTGTTCGCTGGGAAGATTGATGCGTTGGTGTTTGAAGCTCTCTACGCTTCGAAGCAT
TTGATTTTTTTGTCGGCGAGGGTGCCTCAGATCTGGAAGAATTTCGGGAGTAAGAGTACT
GGGCAGCTTAGTTTCTTGACGTGTTTGATGAACCTGGGTGGGTCCATGGCGAGGGTTTTC
ACTAGCGTTCATGTGAATGCTCCGTTTAGTATGGTAGTGGGTGTTGTTCTTGCTGTTTTC
ACCAATGGTATTATCATGAGTCAGATTCTCTTGTATTGGAGA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2FG16JQ 705 0 0
GCTGCTTCAATGACCGTCAAGCTTCCTCAGATAATGAAAATTGTGGACAAGAAGAGCGTA
AGAGGCCTCAGCGTTACAGCATTCGAGCTAGAAGTCGTGGGCTACACGATCTCACTCGCC
TACTGTCTCCACAAGAAGCTCCCCTTCTCGTCTTTCGGCGAAGTCGCGTTTCTTCTGGTC
CAAGCTTTGATCTTGATGGCTTGTATCTATCACTACTCCTCAAAGCCTCTCTCTGTTTCC
ACTTGGGTCAGAGCGGTTGTGTACTTTGCCTTGGCGCCGGCTCTGTTCGCTGGGAAGATT
GATGCGTTGGTGTTTGAAGCTCTTTACGCTTCGAAGCATTTGATTTTTTTGTCGGCGAGG
GTGCCTCAGATCTGGAAGAATTTCGGGAGTAAGAGTACTGGGCAGCTTAGTTTCTTGACG
TGTTTGATGAACCTGGGTGGGTCCATGGCGAGGGTTTTCACTAGCGTTCAGGTGAATGCT
CCGTTTAGTATGGTAGTGGGTGTTGTTCTTGCTGTTTTCACCAATGGTATTATCATGAGT
CAGATTCTCTTGTATTGGAGAAAAGGAGAAGGAAAGCAAGTGGATGATAAAAAGTTGTCA
TGATATAGTCATGTACTTGTTGGCTTTGTAAAAGTGATTACAAAAAAAAAAGAAGAAGAT
GTTTGGTCTCATATATTATCAATTAAATAAAACTCAATTTGTTTC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL5993Contig1 1267 2 2 U
CTAGAGGGATGGACTTCCAGAGCTGAACTATGCGCCAACTTACATGTACCGGTGAGAATC
GCTGTTGTGGGGAAATATACCAGCCTCTCTGATGCCTATCTCTCTATCTTGAAGGCTCTC
TTGCATGCTTCTGTGGCTTGTCGCAAAAAGCTCGTAGTTGATTGGGTTCCTGCTTGTGAT
CTCGAAAAGGAAACTGAGAAAGAGAATCCAAATGCGTATAAAGCTGCTTGGAAGTTGCTC
AAGGGGGTAGATGGAGTTCTTGTACCTGGAGGTTTTGGTGATAGGGGAGTGGAAGGAAAG
ATTCTTGCTGCAAAGTATGCTCGTGAAAACAAAATCCCTTTCCTCGGTATATGTCTCGGG
ATGCAGGTCGCTGTCATCGAGTTTGCACGATCAGTTCTCTGCTTGCACGACGCAAACAGC
ACAGAATTCAAACCTGACACTAAACATCCATGCATCATATTCATGCCTGAGGGCTCAAGA
ACTCATATGGGAGGCACTATGCGCCTAGGATCAAGAAAATCCATCTTCAGTTTCAAAGAC
AGCAAATCCGCCAAACTTTATGGGAACATGACCTTTGTTGATGAGAGGCATCGCCATAGA
TACGAGGTAAATCCTGATATGGTTGAACGGCTAGAGAAGGCTGGTCTCTCTTTTGCTGCC
AAAGATGAAACTGGCAAACGCATGGAGATTGTTGAACTTCCAAGTCATCCTTTCTTCATT
GGTGCTCAGTTCCACCCAGAGTACAAATCCAGACCCGGGAAAGCTTCTCCTCTCCTCTTA
GGACTCATTGCAGCACCGTGTGGTGAGCTAGAGTCTGTCATGAATCCAGCCTATGCTCAA
CAGCATCTGATTAGTAACGGTCCAAAAAACGTTTTAGTCAATGGAAACTCAAAGAAAGCT
CCCAATGGTTTGGCTGATGTAAGACACAACAACGGATACTGCAGAGACACACTTTTCTCT
ATCCCTTAGAATTGCTTCATTTTCCGATTTTGGTTTGCTTTTTTTTTTAATGCTAAATTT
AGGATCTTTCCTGTGTACATATGATTTAAGCTTTTTTTCAGGTTCTTAGACTCTTTTTAA
CAGAATTTATGTTCTGGAAAGACTCTAGAAACGTCTGAAAATCGCGGTTGATTATCCCTG
GTTTGTTTTTTATCAATCAAAAGGGGATGATATGATCATATGTACCTTTGCAACATTCTG
TATTTTGATTTTCTTTTGAGTGTGAAAGAAGCATTAGATAAATAAAACTCGAAACAAAGA
CTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C172TF U 1
AF RR2C172JQ C 530
BS 1 726 RR2C172TF
BS 727 1267 RR2C172JQ

RD RR2C172TF 726 0 0
CTAGAGGGATGGACTTCCAGAGCTGAACTATGCGCCAACTTACATGTACCGGTGAGAATC
GCTGTTGTGGGGAAATATACCAGCCTCTCTGATGCCTATCTCTCTATCTTGAAGGCTCTC
TTGCATGCTTCTGTGGCTTGTCGCAAAAAGCTCGTAGTTGATTGGGTTCCTGCTTGTGAT
CTCGAAAAGGAAACTGAGAAAGAGAATCCAAATGCGTATAAAGCTGCTTGGAAGTTGCTC
AAGGGGGTAGATGGAGTTCTTGTACCTGGAGGTTTTGGTGATAGGGGAGTGGAAGGAAAG
ATTCTTGCTGCAAAGTATGCTCGTGAAAACAAAATCCCTTTCCTCGGTATATGTCTCGGG
ATGCAGGTCGCTGTCATCGAGTTTGCACGATCAGTTCTCTGCTTGCACGACGCAAACAGC
ACAGAATTCAAACCTGACACTAAACATCCATGCATCATATTCATGCCTGAGGGCTCAAGA
ACTCATATGGGAGGCACTATGCGCCTAGGATCAAGAAAATCCATCTTCAGTTTCAAAGAC
AGCAAATCCGCCAAACTTTATGGGAACATGACCTTTGTTGATGAGAGGCATCGCCATAGA
TACGAGGTAAATCCTGATATGGTTGAACGGCTAGAGAAGGCTGGTCTCTCTTTTGCTGCC
AAAGATGAAACTGGCAAACGCATGGAGATTGTTGAACTTCCAAGTCATCCTTTCTTCATT
GGTGCT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2C172JQ 738 0 0
GTTTCAAAGACAGCAAATCCGCCAAACTTTATGGGAACATGACCTTTGTTGATGAGAGGC
ATCGCCATAGATACGAGGTAAATCCTGATATGGTTGAACGGCTAGAGAAGGCTGGTCTCT
CTTTTGCTGCCAAAGATGAAACTGGCAAACGCATGGAGATTGTTGAACTTCCAAGTCATC
CTTTCTTCATTGGTGCTCAGTTCCACCCAGAGTACAAATCCAGACCCGGGAAAGCTTCTC
CTCTCCTCTTAGGACTCATTGCAGCACCGTGTGGTGAGCTAGAGTCTGTCATGAATCCAG
CCTATGCTCAACAGCATCTGATTAGTAACGGTCCAAAAAACGTTTTAGTCAATGGAAACT
CAAAGAAAGCTCCCAATGGTTTGGCTGATGTAAGACACAACAACGGATACTGCAGAGACA
CACTTTTCTCTATCCCTTAGAATTGCTTCATTTTCCGATTTTGGTTTGCTTTTTTTTTTA
ATGCTAAATTTAGGATCTTTCCTGTGTACATATGATTTAAGCTTTTTTTCAGGTTCTTAG
ACTCTTTTTAACAGAATTTATGTTCTGGAAAGACTCTAGAAACGTCTGAAAATCGCGGTT
GATTATCCCTGGTTTGTTTTTTATCAATCAAAAGGGGATGATATGATCATATGTACCTTT
GCAACATTCTGTATTTTGATTTTCTTTTGAGTGTGAAAGAAGCATTAGATAAATAAAACT
CGAAACAAAGACTTAACC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL5994Contig1 739 2 4 U
GAAAGATCATCTTCTTAAAAAAAAAAAACAAGAAAGGCTCTCTTCTCTCTACAGCTTTGA
TCATATGGACGATTCAAAAGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGG
AGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCGTTCCTGATTACTCAATGGATTTCTCAAAGATCAG
AGAGATGAGGAAACAGCACAAGAGATATCCTTCCCGTGTCAGTCTTGGCAATGAACAAGA
CTTCATTAACCCTTTTCATAATCAACCTACTTCTGTTGATAAAACTAAGGCTAAGCTCAC
GACTGTCCACAGTGACAACAACGTAACCGACAATGAGTTCCCCCACCACCAGCGACATCC
TCCATCCACTAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTCCTGCGTTAAAGCTTGAAG
CTATTTTATAACTGAGAGTCAGAGACAATGAGGAAATGTGTTTCACTTATTTATTATAAT
GACGACAGAAATGAGATATGGTAGTGACATCTTTTCACATACATTCCTGCGAAAGCAGCA
GCGTCAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACCGTTATCTTACGATTATCTAACTATGTGTTTG
GTAATTGTCAAGAATAGTTAGCTTTATTTCTTTTCTTTTTGTTGTAGTTTTTGGTTTATT
TAGAGATGTGTAACTTTCAATATTGTGATACATTACTATAAAAAGATGCATTAAGATTAT
AAATGATGAGTTGTGTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN81TF U 1
AF RR2BN81JQ C 17
BS 1 22 RR2BN81TF
BS 23 23 RR2BN81JQ
BS 24 703 RR2BN81TF
BS 704 739 RR2BN81JQ

RD RR2BN81TF 709 0 0
GAAAGATCATCTTCTTAAAAAATAAAAACAAGAAAGGCTCTCTTCTCTCTACAGCTTTGA
TCATATGGACGATTCAAAAGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGG
AGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCGTTCCTGATTACTCAATGGATTTCTCAAAGATCAG
AGAGATGAGGAAACAGCACAAGAGATATCCTTCCCGTGTCAGTCTTGGCAATGAACAAGA
CTTCATTAACCCTTTTCATAATCAACCTACTTCTGTTGATAAAACTAAGGCTAAGCTCAC
GACTGTCCACAGTGACAACAACGTAACCGACAATGAGTTCCCCCACCACCAGCGACATCC
TCCATCCACTAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTCCTGCGTTAAAGCTTGAAG
CTATTTTATAACTGAGAGTCAGAGACAATGAGGAAATGTGTTTCACTTATTTATTATAAT
GACGACAGAAATGAGATATGGTAGTGACATCTTTTCACATACATTCCTGCGAAAGCAGCA
GCGTCAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACCGTTATCTTACGATTATCTAACTATGTGTTTG
GTAATTGTCAAGAATAGTTAGCTTTATTTCTTTTCTTTTTGTTGTAGTTTTTGGTTTATT
TAGAGATGTGTAACTTTCAATATTGTGATACATTACTATAAAA
GATGCA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2BN81JQ 723 0 0
T
AAAAAAAAAAACAAGAAAGGCTCTCTTCTCTCTACAGCTTTGATCATATGGACGATTCAA
AAGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAG
GAGGAACCGTTCCTGATTACTCAATGGATTTCTCAAAGATCAGAGAGATGAGGAAACAGC
ACAAGAGATATCCTTCCCGTGTCAGTCTTGGCAATGAACAAGACTTCATTAACCCTTTTC
ATAATCAACCTACTTCTGTTGATAAAACTAAGGCTAAGCTCACGACTGTCCACAGTGACA
ACAACGTAACCGACAATGAGTTCCCCCACCACCAGCGACATCCTCCATCCACTAGGAGAG
GAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTCCTGCGTTAAAGCTTGAAGCTATTTTATAACTGAGA
GTCAGAGACAATGAGGAAATGTGTTTCACTTATTTATTATAATGACGACAGAAATGAGAT
ATGGTAGTGACATCTTTTCACATACATTCCTGCGAAAGCAGCAGCGTCAATCAAGTTTGT
CTGCTGTTTACCGTTATCTTACGATTATCTAACTATGTGTTTGGTAATTGTCAAGAATAG
TTAGCTTTATTTCTTTTCTTTTTGTTGTAGTTTTTGGTTTATTTAGAGATGTGTAACTTT
CAATATTGTGATACATTACTATAAAAAGATGCATTAAGATTATAAATGATGAGTTGTGTG
CT

QA 2 723 2 723
DS 



AS 1 2

CO CL5995Contig1 754 2 2 U
GGTAGCACCCAAAAGACAATAAAATCTCGACAAAAAAGGATGAGTTCATCATCCTTTTTA
CGAGTAATATTGCTCTTGGGTGCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAACAACCAAAGCT
GCAACACTCGGTCAAGTATTTGAAATCTGTAGGAGTTTATGCCCGGGATGTGACTACGAC
TCGTTACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACCCCTTTGA
TATGGGATCAATCACTCCAGGACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAGATT
GTGCCTTGCAACACTCTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGAATATTTTCTGGG
GATACGGAGCCAACTGGTCTCCGGCTGACGCTGTGGTCGCGTGGGCCAGCGAGAAGAGGT
TTTATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACTCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACACAGC
TCGTGTGGAAGAACACGAGGAGGATCGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCGACAACGGTGGGA
TCTTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACTACATCGGCCAGAAACCCTATTGAT
CGATCATTCATCTTATTTTTAGAAGTTCTTATGACTTTTTAAAGGAATTTAGGTGGATGT
ATTTTGTATTTTACTAGAAATTGAAGTGTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATACGTTTGT
ATCGCTATACATGATTTTGTTCACGTCAAGGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH61TF U 1
AF RR2FH61JQ C 196
BS 1 748 RR2FH61TF
BS 749 754 RR2FH61JQ

RD RR2FH61TF 748 0 0
GGTAGCACCCAAAAGACAATAAAATCTCGACAAAAAAGGATGAGTTCATCATCCTTTTTA
CGAGTAATATTGCTCTTGGGTGCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAACAACCAAAGCT
GCAACACTCGGTCAAGTATTTGAAATCTGTAGGAGTTTATGCCCGGGATGTGACTACGAC
TCGTTACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACCCCTTTGA
TATGGGATCAATCACTCCAGGACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAGATT
GTGCCTTGCAACACTCTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGAATATTTTCTGGG
GATACGGAGCCAACTGGTCTCCGGCTGACGCTGTGGTCGCGTGGGCCAGCGAGAAGAGGT
TTTATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACTCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACACAGC
TCGTGTGGAAGAACACGAGGAGGATCGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCGACAACGGTGGGA
TCTTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACTACATCGGCCAGAAACCCTATTGAT
CGATCATTCATCTTATTTTTAGAAGTTCTTATGACTTTTTAAAGGAATTTAGGTGGATGT
ATTTTGTATTTTACTAGAAATTGAAGTGTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATACGTTTGT
ATCGCTATACATGATTTTGTTCACGTCA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2FH61JQ 559 0 0
TTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACCCCTTTGATATGGGATCAATCAC
TCCAGGACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAGATTGTGCCTTGCAACACT
CTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGAATATTTTCTGGGGATACGGAGCCAACT
GGTCTCCGGCTGACGCTGTGGTCGCGTGGGCCAGCGAGAAGAGGTTTTATCATTATGGCT
CCAACTCGTGCGACTCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACACAGCTCGTGTGGAAGAACA
CGAGGAGGATCGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCGACAACGGTGGGATCTTCATGACTTGTA
ACTATGATCCTCCCGGTAACTACATCGGCCAGAAACCCTATTGATCGATCATTCATCTTA
TTTTTAGAAGTTCTTATGACTTTTTAAAGGAATTTAGGTGGATGTATTTTGTATTTTACT
AGAAATTGAAGTGTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATACGTTTGTATCGCTATACATGAT
TTTGTTCACGTCAAGGTTG

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL5996Contig1 747 2 7 U
GGGTACTCGATAGAATTATTTCTCTCGCTTAAACGTGCTTAATTACAAACATAAATTATG
TCGACAGAAATGGAAGTCGTAAGTAGTTCTTCAGTACCTTGACAACAAATCAATATTGGT
CATCGGAGCTGCTGGGTTCTTAGCAAATATTTTCGTGGAGAAGATACTAAGGGTGGCACC
AAACGTGAAGAAACTCTATCTTCTTCTAAGAGCATCAAATGAAAAATCTGCTACCCAGAG
GTTTAAAGACGAGATTTTGAGGAAGGATTTGTACAGGGTGCTGAAGGAGAAGTATGATCC
AAATCTAAATCAACTTACATCTGAGAAAGTTACAGTTGTCAATGGGGACGTTTCCCTTGA
GGATCTGGGTCTCCAAGACACTAACTTGGAACATGAGATGATCCAGCAAGTTGATGCCAT
TGTTAATTTAGCTGCAACTACTAGATTTGATGAAAGATACGATATTGCACTTGGTATCAA
CACATTGGGTGTCCTCAATGTCTTGGATTTCGCCAAGAGATGTGCAAAGGTTAATATCTT
TGTTCAAGTATCAACAGCTTACGTGTGCGGGGAAAAATCTGGTTTGATAATGGAAACACC
ATACCGTATGGGTGAAACGTTGAATGGAACCACCGGCCTAGACATCAACCATGAGAAGAA
ATTGGTCGAGGAGAAACTTGACCAGCTCCGCGTCACCGAAGCCTCTCCTGAAACCATAAC
ACAAACAATGAAAGATATGGGACTCAC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2B435TF U 1
AF RR2BD51TF U 2
BS 1 11 RR2B435TF
BS 12 12 RR2BD51TF
BS 13 84 RR2B435TF
BS 85 85 RR2BD51TF
BS 86 285 RR2B435TF
BS 286 286 RR2BD51TF
BS 287 747 RR2B435TF

RD RR2B435TF 747 0 0
GGGTACTCGATTGAATTATTTCTCTCGCTTAAACGTGCTTAATTACAAACATAAATTATG
TCGACAGAAATGGAAGTCGTAAGT*GTTCTTCAGTACCTTGACAACAAATCAATATTGGT
CATCGGAGCTGCTGGGTTCTTAGCAAATATTTTCGTGGAGAAGATACTAAGGGTGGCACC
AAACGTGAAGAAACTCTATCTTCTTCTAAGAGCATCAAATGAAAAATCTGCTACCCAGAG
GTTTAAAGACGAGATTTTGAGGAAGGATTTGTACAGGGTGCTGAATGAGAAGTATGATCC
AAATCTAAATCAACTTACATCTGAGAAAGTTACAGTTGTCAATGGGGACGTTTCCCTTGA
GGATCTGGGTCTCCAAGACACTAACTTGGAACATGAGATGATCCAGCAAGTTGATGCCAT
TGTTAATTTAGCTGCAACTACTAGATTTGATGAAAGATACGATATTGCACTTGGTATCAA
CACATTGGGTGTCCTCAATGTCTTGGATTTCGCCAAGAGATGTGCAAAGGTTAATATCTT
TGTTCAAGTATCAACAGCTTACGTGTGCGGGGAAAAATCTGGTTTGATAATGGAAACACC
ATACCGTATGGGTGAAACGTTGAATGGAACCACCGGCCTAGACATCAACCATGAGAAGAA
ATTGGTCGAGGAGAAACTTGACCAGCTCCGCGTCACCGAAGCCTCTCCTGAAACCATAAC
ACAAACAATGAAAGATATGGGACTCAC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2BD51TF 745 0 0
GGTACTCGATAGAATTATTTCTCTCGCTTAAACGTGCTTAATTACAAACATAAATTATGT
CGACAGAAATGGAAGTCGTAAGTAGTTCTTCAGTACCTTGACAACAAATCAATATTGGTC
ATCGGAGCTGCTGGGTTCTTAGCAAATATTTTCGTGGAGAAGATATTAAGGGTGGCACCA
AACGTGAAGAAACTCTATCTTCTTCTAAGAGCATCAAATGAAAAATCTGCTACCCAGAGG
TTTAAAGACGAGATTTTGAGGAAGGATTTGTACAGGGTGCTGAAGGAGAAGTATGATCCA
AATCTAAATCAACTTACATCTGAGAAAGTTACAGTTGTCAATGGGGACGTTTCCCTTGAG
GATCTGGGTCTCCAAGACACTAACTTGGAACATGAGATGATCCAGCAAGTTGATGCCATT
GTTAATTTAGCTGCAACTACTAGATTTGATGAAAGATACGATATTGCACTTGGTATCAAC
ACATTGGGTGTCCTCAATGTCTTGGATTTCGCCAAGAGATGTGCAAAGGTTAATATCTTT
GTTCAAGTATCAACAGCTTACGTGTGCGGGGAAAAATCTGGTTTGATAATGGAAACACCA
TACCGTATGGGTGAAACGTTGAATGGAACCACCGGCCTAGACATCAACCATGAGAAGAAA
TTGGTCGAGGAGAAACTTGACCAGCTCCGCGTCACCGAAGCCTCTCCTGAAACCATAACA
CAAACAATGAAAGATATGGGACTCA

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL5997Contig1 1058 2 2 U
GTGGTGTTGTTCTTGTCACTCGTGATGCTATGTGTGCATCAATAAAGGATATGTTTGAGG
AGAAACGGAACATATTAGAACCAGCAGGTGCTCTTGCGCTCGCTGGAGCTGAAGCGTACT
GTAAGTATTACGGCCTAAAGGACGTGAACGTTGTAGCCATAACCAGTGGTGCGACATGAA
CTTTGACAAGCTCAGGATTGTGACAGGACTCGCCAATGTCGGTAGGCAACAGGAGGCTGT
TCTTGCTACTATCTTGCCGGAAAAACCTGGAAGCTTTAAGAAATTCTGTGAATTGGTTGG
ATCAATGAACATAACCGAGTTCAAGTATAGGTGTGGCTCGAGAAAAGAAGCTGTTGTACT
ATACAGTGTTGGAGTGCACACACCCGGTGAGCTCAAAGCACTAGAGAAGAGAATGGAATC
TTCTCAGCTCAGGACTACGAACCTTACAACCAGTGACTTAGTAAAAGATCACCTGCGTTA
CTTGATGGGTGGAAAATCAAGTGTTGAAAACGAGGTTCTATGCCAATTCACATTCCCCGA
GAGACCTGGTGCTCTAATGAAGTTCTTGGACTCTTTCAGTCCAAGGTGGAACATTAGCCT
TTTCCATTACCGTGCAGAGGGTACGGCGGGAGCGAACGTGCTGGTCGGGATCCAAGTCCC
GGAACAAGAAATGGAGGAATTTCGAAACCGAGCTCAAGTTCTTGGATACGAGTATGTCTT
GGTAAGTGAGGACATCAATTTCAAGCTTTTGATGCAGTGATTTTGGAGCTATCTGTGATG
GAGAAACCGAAACCGAGGAAGTAGAAGAACACATCAGAGTCGTCCATGGTTGTTTTTGAG
CTCTTGGTCTTGCTGTTAAACAAACAACTCTCGTGCTACTCTTCCATTACTCTCGGGGTG
TATTTGGACGGGCTTTGTCACGGGCCTGTTACACTGGCCAGTGTGCCTTTATTTTTGTAA
GAGCGCTAATCGCTATGCAGTAGACTTTTGTACCTTTCAGCAAATAACAAATAATGTAAG
GCTAACCTCCAATAAAAGAAACATTGGTATGTTGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A426TF U 1
AF RR2A426JQ C 257
BS 1 793 RR2A426TF
BS 794 1058 RR2A426JQ

RD RR2A426TF 793 0 0
GTGGTGTTGTTCTTGTCACTCGTGATGCTATGTGTGCATCAATAAAGGATATGTTTGAGG
AGAAACGGAACATATTAGAACCAGCAGGTGCTCTTGCGCTCGCTGGAGCTGAAGCGTACT
GTAAGTATTACGGCCTAAAGGACGTGAACGTTGTAGCCATAACCAGTGGTGCGACATGAA
CTTTGACAAGCTCAGGATTGTGACAGGACTCGCCAATGTCGGTAGGCAACAGGAGGCTGT
TCTTGCTACTATCTTGCCGGAAAAACCTGGAAGCTTTAAGAAATTCTGTGAATTGGTTGG
ATCAATGAACATAACCGAGTTCAAGTATAGGTGTGGCTCGAGAAAAGAAGCTGTTGTACT
ATACAGTGTTGGAGTGCACACACCCGGTGAGCTCAAAGCACTAGAGAAGAGAATGGAATC
TTCTCAGCTCAGGACTACGAACCTTACAACCAGTGACTTAGTAAAAGATCACCTGCGTTA
CTTGATGGGTGGAAAATCAAGTGTTGAAAACGAGGTTCTATGCCAATTCACATTCCCCGA
GAGACCTGGTGCTCTAATGAAGTTCTTGGACTCTTTCAGTCCAAGGTGGAACATTAGCCT
TTTCCATTACCGTGCAGAGGGTACGGCGGGAGCGAACGTGCTGGTCGGGATCCAAGTCCC
GGAACAAGAAATGGAGGAATTTCGAAACCGAGCTCAAGTTCTTGGATACGAGTATGTCTT
GGTAAGTGAGGACATCAATTTCAAGCTTTTGATGCAGTGATTTTGGAGCTATCTGTGATG
GAGAAACCGAAAC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2A426JQ 802 0 0
CCGGAAAAACCTGGAAGCTTTAAGAAATTCTGTGAATTGGTTGGATCAATGAACATAACC
GAGTTCAAGTATAGGTGTGGCTCGAGAAAAGAAGCTGTTGTACTATACAGTGTTGGAGTG
CACACACCCGGTGAGCTCAAAGCACTAGAGAAGAGAATGGAATCTTCTCAGCTCAGGACT
ACGAACCTTACAACCAGTGACTTAGTAAAAGATCACCTGCGTTACTTGATGGGTGGAAAA
TCAAGTGTTGAAAACGAGGTTCTATGCCAATTCACATTCCCCGAGAGACCTGGTGCTCTA
ATGAAGTTCTTGGACTCTTTCAGTCCAAGGTGGAACATTAGCCTTTTCCATTACCGTGCA
GAGGGTACGGCGGGAGCGAACGTGCTGGTCGGGATCCAAGTCCCGGAACAAGAAATGGAG
GAATTTCGAAACCGAGCTCAAGTTCTTGGATACGAGTATGTCTTGGTAAGTGAGGACATC
AATTTCAAGCTTTTGATGCAGTGATTTTGGAGCTATCTGTGATGGAGAAACCGAAACCGA
GGAAGTAGAAGAACACATCAGAGTCGTCCATGGTTGTTTTTGAGCTCTTGGTCTTGCTGT
TAAACAAACAACTCTCGTGCTACTCTTCCATTACTCTCGGGGTGTATTTGGACGGGCTTT
GTCACGGGCCTGTTACACTGGCCAGTGTGCCTTTATTTTTGTAAGAGCGCTAATCGCTAT
GCAGTAGACTTTTGTACCTTTCAGCAAATAACAAATAATGTAAGGCTAACCTCCAATAAA
AGAAACATTGGTATGTTGACCC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL5998Contig1 1140 2 2 U
GGTTGAAGAAGCAGTTGCTTACTCTGAACATAGTGCAACCAAATGCATTGGCATGACCAT
TGAAACGAGGCCAGATTACTGTCTTGGACCTCATCTAAGACAAATGCTGACTTATGGTTG
CACCCGACTAGAGATCGGTGTCCAGAGCACATATGAAGATGTTGCCCGTGACACAAATAG
AGGCCATACTGTTGCTGCTGTAGCCGACTGCTTCTGCTTGGCTAAAGATGCTGGTTTCAA
GGTGGTTGCACATATGATGCCTGATCTTCCTAATGTTGGGGTTGAGAGAGACATGGAAAG
TTTCAAGGAGTTTTTCGAGAGTCCGTCATTTAGAGCGGATGGGTTAAAAATATATCCTAC
CCTTGTGATACGTGGAACTGGCCTTTATGAATTATGGAAAACTGGGAGATACCGAAACTA
TCCACCTGAGCAACTTGTGGATATAGTTGCAAGGATTCTCTCCATGGTACCTCCATGGAC
ACGTGTTTATAGAGTTCAGCGTGATATTCCTATGCCTCTGGTTACGTCGGGGGTTGAAAA
AGGAAATCTCCGTGAGCTGGCTCTGGCAAGAATGGATGATTTGGGCCTTAAATGCCGTGA
TGTTCGTACTCGTGAAGCTGGAATTCAGGACATTCATCACAAAATTAAGCCAGAACAAGT
AGAGCTTGTGCGTCGTGATTACACTGCAAACGAAGGTTGGGAGACATTCCTTTCATATGA
AGATACACGCCAGGACATTCTTGTTGGGTTATTACGTTTGCGTAAATGTGGTAAGAACGT
AACGTGTCCAGAACTCATGGGAAAGTGTTCTGTTGTCCGTGAGCTTCACGTGTATGGAAC
GGCTGTACCAGTTCATGGTCGGGAGGCTGATAAGTTGCAACATCAGGGGTACGGAACACT
TTTGATGGAAGAGGCAGAGAGGATTGCTAGAAGAGAACATCGATCTAACAAAATCGGTGT
GATTTCAGGTGTGGGAACCCGACATTACTACAGAAAGTTGGGTTATGAATTGGAAGGTCC
TTACATGGTGAAGCATCTTCTTTGAGATTCTTCCTGTTGAACTACTAAAACCCCAAAACT
CGGAAACGTTCTTGTTGAATTATCCCTGTTCCCTTTTGAGTGTATTACTTTTGTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A287TF U 1
AF RR2A287JQ C 368
BS 1 852 RR2A287TF
BS 853 1140 RR2A287JQ

RD RR2A287TF 852 0 0
GGTTGAAGAAGCAGTTGCTTACTCTGAACATAGTGCAACCAAATGCATTGGCATGACCAT
TGAAACGAGGCCAGATTACTGTCTTGGACCTCATCTAAGACAAATGCTGACTTATGGTTG
CACCCGACTAGAGATCGGTGTCCAGAGCACATATGAAGATGTTGCCCGTGACACAAATAG
AGGCCATACTGTTGCTGCTGTAGCCGACTGCTTCTGCTTGGCTAAAGATGCTGGTTTCAA
GGTGGTTGCACATATGATGCCTGATCTTCCTAATGTTGGGGTTGAGAGAGACATGGAAAG
TTTCAAGGAGTTTTTCGAGAGTCCGTCATTTAGAGCGGATGGGTTAAAAATATATCCTAC
CCTTGTGATACGTGGAACTGGCCTTTATGAATTATGGAAAACTGGGAGATACCGAAACTA
TCCACCTGAGCAACTTGTGGATATAGTTGCAAGGATTCTCTCCATGGTACCTCCATGGAC
ACGTGTTTATAGAGTTCAGCGTGATATTCCTATGCCTCTGGTTACGTCGGGGGTTGAAAA
AGGAAATCTCCGTGAGCTGGCTCTGGCAAGAATGGATGATTTGGGCCTTAAATGCCGTGA
TGTTCGTACTCGTGAAGCTGGAATTCAGGACATTCATCACAAAATTAAGCCAGAACAAGT
AGAGCTTGTGCGTCGTGATTACACTGCAAACGAAGGTTGGGAGACATTCCTTTCATATGA
AGATACACGCCAGGACATTCTTGTTGGGTTATTACGTTTGCGTAAATGTGGTAAGAACGT
AACGTGTCCAGAACTCATGGGAAAGTGTTCTGTTGTCCGTGAGCTTCACGTGTATGGAAC
GGCTGTACCAGT

QA 1 852 1 852
DS 

RD RR2A287JQ 773 0 0
ATACGTGGAACTGGCCTTTATGAATTATGGAAAACTGGGAGATACCGAAACTATCCACCT
GAGCAACTTGTGGATATAGTTGCAAGGATTCTCTCCATGGTACCTCCATGGACACGTGTT
TATAGAGTTCAGCGTGATATTCCTATGCCTCTGGTTACGTCGGGGGTTGAAAAAGGAAAT
CTCCGTGAGCTGGCTCTGGCAAGAATGGATGATTTGGGCCTTAAATGCCGTGATGTTCGT
ACTCGTGAAGCTGGAATTCAGGACATTCATCACAAAATTAAGCCAGAACAAGTAGAGCTT
GTGCGTCGTGATTACACTGCAAACGAAGGTTGGGAGACATTCCTTTCATATGAAGATACA
CGCCAGGACATTCTTGTTGGGTTATTACGTTTGCGTAAATGTGGTAAGAACGTAACGTGT
CCAGAACTCATGGGAAAGTGTTCTGTTGTCCGTGAGCTTCACGTGTATGGAACGGCTGTA
CCAGTTCATGGTCGGGAGGCTGATAAGTTGCAACATCAGGGGTACGGAACACTTTTGATG
GAAGAGGCAGAGAGGATTGCTAGAAGAGAACATCGATCTAACAAAATCGGTGTGATTTCA
GGTGTGGGAACCCGACATTACTACAGAAAGTTGGGTTATGAATTGGAAGGTCCTTACATG
GTGAAGCATCTTCTTTGAGATTCTTCCTGTTGAACTACTAAAACCCCAAAACTCGGAAAC
GTTCTTGTTGAATTATCCCTGTTCCCTTTTGAGTGTATTACTTTTGTTTTATT

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL5999Contig1 552 2 1 U
GGAGACGACTCCGTGGACGCATCCGATCGTCTCATCTCAGCCGTCTGTTACTTCTACCCG
TTCTTCGACGGCATTCAGTACGGTAAATTCATCATCACGCAATACCAACCTTTCCAGATT
CTCATCCAGCCTCTGTTTCCCGCCATCAAGGCCTTCAAGAGCTTCCCTTTCAACGGCTTC
CTCATCTTCATCACTCTCTACTTCGTCGTCGTCAGGAACCAGAACTTCAGCAGGTACGTT
AGGTTCAACACGATGCAGGCCATCGTCCTCGACGTGCTGTTGATCTTCCCGGATTTGCTC
CAGAGGAGCTTCAACCCCAGAGATGGGTTTGGTTTGGATGTGGTGATGAGTCTGGACAGC
ACTGTGTTCCTCTTCTTGCTTGTCTCTTTGATCTATGGTTTCTCTGCTTGCTTGTTTGGT
CTGATCCCGAGATTGCCCATTGTCGCTGATGCTGCTGATAGGCAAGTCCTTTGAACAAAC
AACATATATGTATATGTGATTGAACTTCTCTGTGATGAATCTGTTTCTGATTATGTAACT
TTTTGATCAATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DA95JQ C 1
AF RR2DA95TF U 1
BS 1 552 RR2DA95TF

RD RR2DA95JQ 552 0 0
GGAGACGACTCCGTGGACGCATCCGATCGTCTCATCTCAGCCGTCTGTTACTTCTACCCG
TTCTTCGACGGCATTCAGTACGGTAAATTCATCATCACGCAATACCAACCTTTCCAGATT
CTCATCCAGCCTCTGTTTCCCGCCATCAAGGCCTTCAAGAGCTTCCCTTTCAACGGCTTC
CTCATCTTCATCACTCTCTACTTCGTCGTCGTCAGGAACCAGAACTTCAGCAGGTACGTT
AGGTTCAACACGATGCAGGCCATCGTCCTCGACGTGCTGTTGATCTTCCCGGATTTGCTC
CAGAGGAGCTTCAACCCCAGAGATGGGTTTGGTTTGGATGTGGTGATGAGTCTGGACAGC
ACTGTGTTCCTCTTCTTGCTTGTCTCTTTGATCTATGGTTTCTCTGCTTGCTTGTTTGGT
CTGATCCCGAGATTGCCCATTGTCGCTGATGCTGCTGATAGGCAAGTCCTTTGAACAAAC
AACATATATGTATATGTGATTGAACTTCTCTGTGATGAATCTGTTTCTGATTATGTAACT
TTTTGATCAATG

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2DA95TF 552 0 0
GGAGACGACTCCGTGGACGCATCCGATCGTCTCATCTCAGCCGTCTGTTACTTCTACCCG
TTCTTCGACGGCATTCAGTACGGTAAATTCATCATCACGCAATACCAACCTTTCCAGATT
CTCATCCAGCCTCTGTTTCCCGCCATCAAGGCCTTCAAGAGCTTCCCTTTCAACGGCTTC
CTCATCTTCATCACTCTCTACTTCGTCGTCGTCAGGAACCAGAACTTCAGCAGGTACGTT
AGGTTCAACACGATGCAGGCCATCGTCCTCGACGTGCTGTTGATCTTCCCGGATTTGCTC
CAGAGGAGCTTCAACCCCAGAGATGGGTTTGGTTTGGATGTGGTGATGAGTCTGGACAGC
ACTGTGTTCCTCTTCTTGCTTGTCTCTTTGATCTATGGTTTCTCTGCTTGCTTGTTTGGT
CTGATCCCGAGATTGCCCATTGTCGCTGATGCTGCTGATAGGCAAGTCCTTTGAACAAAC
AACATATATGTATATGTGATTGAACTTCTCTGTGATGAATCTGTTTCTGATTATGTAACT
TTTTGATCAATG

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL6000Contig1 680 2 1 U
GGAAGAACAATATAGAAACCACCAAGAAAAGATACTCACCGGATCGTCAGTGACCGGAGA
AGCCGTGTGAAAGACGCCATCGCAACCATCGATAGCCTCCTTAAGAGCATCATAGTCCTG
GAGATCTGCTTTGCACAGAATCAGTCTCTCCTTGGCACCCTCTAGTTCTCTCAAATGTGT
ATTCTTTGGATCATCTGCAAAAAAAAAAAGCATTAACAAAAAATAAACAGTTCTCATCCA
AGCAATTAATTAATCCAACCAGAAAAAATATTATTATTACAGTGAGCAAAAGGAGTAATA
TCGGACCTGGATTCCGTACGGTTCCTTTGACCGTGTAGCCTCTCTCAAGTAGTAACTTAA
CAATCCAAGAAGCGATGTATCCACCAGCTCCAGTGACACAGACTGTTTTCCCTGGCGTTA
AAGATTCGTCGACTGGCATCGTTTCCGGCAGTAGAAAACAAAAGCTACGGTCTTCGAAGA
GACAGAAACAAAATGATGAATGCTCTGTTACAAAGTGAATTACGTTTTGTATATATAAAG
GACCGAAAAAGAAGGTTTTCCTTTTATGATTCCAGACACCTAACCACTGCAATAGTTTGG
TTTACATATTTATGTATTTTATTTGTTTGCATATGTGTAGAAACTAGAAAGACAACAAAT
TTATTTTATTTCTTTTTAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AE86JQ C 1
AF RR2AE86TF U 1
BS 1 680 RR2AE86TF

RD RR2AE86JQ 680 0 0
GGAAGAACAATATAGAAACCACCAAGAAAAGATACTCACCGGATCGTCAGTGACCGGAGA
AGCCGTGTGAAAGACGCCATCGCAACCATCGATAGCCTCCTTAAGAGCATCATAGTCCTG
GAGATTTGCTTTGCACAGAATCAGTCTCTCCTTGGCACCCTCTAGTTCTTTCAAATGTGT
ATTCTTTGGATCATCTGCAAAAAAAAAAAGCATTAACAAAAAATAAACAGTTCTCATCCA
AGCAATTAATTAATCCAACCAGAAAAAATATTATTATTACAGTGAGCAAAAGGAGTAATA
TCGGACCTGGATTCCGTACGGTTCCTTTGACCGTGTAGCCTCTCTCAAGTAGTAACTTAA
CAATCCAAGAAGCGATGTATCCACCAGCTCCAGTGACACAGACTGTTTTCCCTGGCGTTA
AAGATTCGTCGACTGGCATCGTTTCCGGCAGTAGAAAACAAAAGCTACGGTCTTCGAAGA
GACAGAAACAAAATGATGAATGCTCTGTTACAAAGTGAATTACGTTTTGTATATATAAAG
GACCGAAAAAGAAGGTTTTCCTTTTATGATTCCAGACACCTAACCACTGCAATAGTTTGG
TTTACATATTTATGTATTTTATTTGTTTGCATATGTGTAGAAACTAGAAAGACAACAAAT
TTATTTTATTTCTTTTTAAG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2AE86TF 680 0 0
GGAAGAACAATATAGAAACCACCAAGAAAAGATACTCACCGGATCGTCAGTGACCGGAGA
AGCCGTGTGAAAGACGCCATCGCAACCATCGATAGCCTCCTTAAGAGCATCATAGTCCTG
GAGATCTGCTTTGCACAGAATCAGTCTCTCCTTGGCACCCTCTAGTTCTCTCAAATGTGT
ATTCTTTGGATCATCTGCAAAAAAAAAAAGCATTAACAAAAAATAAACAGTTCTCATCCA
AGCAATTAATTAATCCAACCAGAAAAAATATTATTATTACAGTGAGCAAAAGGAGTAATA
TCGGACCTGGATTCCGTACGGTTCCTTTGACCGTGTAGCCTCTCTCAAGTAGTAACTTAA
CAATCCAAGAAGCGATGTATCCACCAGCTCCAGTGACACAGACTGTTTTCCCTGGCGTTA
AAGATTCGTCGACTGGCATCGTTTCCGGCAGTAGAAAACAAAAGCTACGGTCTTCGAAGA
GACAGAAACAAAATGATGAATGCTCTGTTACAAAGTGAATTACGTTTTGTATATATAAAG
GACCGAAAAAGAAGGTTTTCCTTTTATGATTCCAGACACCTAACCACTGCAATAGTTTGG
TTTACATATTTATGTATTTTATTTGTTTGCATATGTGTAGAAACTAGAAAGACAACAAAT
TTATTTTATTTCTTTTTAAG

QA 1 680 1 680
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6002Contig1 728 2 1 U
CCCCCAAAGGAAACCAAATAAACAGAGCACAGAGTCTTTGACCAGAAAAAAAACAGAGCA
CACCCATATATATTAAAGACATTCAACGTTTCTCTGAAAGTATTCATTCTGATGGAGCTT
GATAGCAGCTGCGGCGTGGAAAATAACATCAAGGAGAAGTTTGGTTCCTCATCGACTTCT
TCTTCTTATTCGATCGGCGTGAACAGCGACGATGAAAGCGGGGACAATGAAGCTGAGTCT
CCTTACAAGGGTCCTCTTGATATGATAAAATCTCTCGAAGAGGTTTTACCAATCAGGAGA
GGCATATCGAAGTTCTACAAGGGAAAATCAAAGTCTTTCAGGAGCTTAAAGGAAACTGAA
TCCTCTCCGATGAAAGATTTAGGGACACCAGAGAACCTTTACAGTCGCCGTCGGAGAAAC
CTTCTCAGTCACCGGCTTTGTAGCTGAGGTGGGATCTCGAAGAAACCCGTCAAGACTGCT
GCCTTTACGGTGGTCTCTTTCTCCGGCGATGATTCTTCGCCTAAAGCCCCTCCTCTTTCG
AAGAGAAATCTCCAGCCGTTGCAGAGCAAAGAGTGTTCTGGTAATTGTGTTCCCGTTGTT
GTTTCGCCGCGTTGCTTCCAGTCGGTGGCGAATAGAGACATCCATAATATTATTTGTTAG
AAAATTTACTATATCGATTTTTGCTAAGTGAGTTTTGATTTGAAATAAAAAAAATTGTTA
CAGTTTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B601JQ C 1
AF RR2B601TF U 1
BS 1 728 RR2B601TF

RD RR2B601JQ 728 0 0
CCCCCAAAGGAAACCAAATAAACAGAGCACAGAGTCTTTGACCAGAAAAAAAACAGAGCA
CACCCATATATATTAAAGACATTCAACGTTTCTCTGAAAGTATTCATTCTGATGGAGCTT
GATAGCAGCTGCGGCGTGGAAAATAACATCAAGGAGAAGTTTGGTTCCTCATCGACTTCT
TCTTCTTATTCGATCGGCGTGAACAGCGACGATGAAAGCGGGGACAATGAAGCTGAGTCT
CCTTACAAGGGTCCTCTTGATATGATAAAATCTCTCGAAGAGGTTTTACCAATCAGGAGA
GGCATATCGAAGTTCTACAAGGGAAAATCAAAGTCTTTCAGGAGCTTAAAGGAAACTGAA
TCCTCTCCGATGAAAGATTTAGGGACACCAGAGAACCTTTACAGTCGCCGTCGGAGAAAC
CTTCTCAGTCACCGGCTTTGTAGCTGAGGTGGGATCTCGAAGAAACCCGTCAAGACTGCT
GCCTTTACGGTGGTCTCTTTCTCCGGCGATGATTCTTCGCCTAAAGCCCCTCCTCTTTCG
AAGAGAAATCTCCAGCCGTTGCAGAGCAAAGAGTGTTCTGGTAATTGTGTTCCCGTTGTT
GTTTCGCCGCGTTGCTTCCAGTCGGTGGCGAATAGAGACATCCATAATATTATTTGTTAG
AAAATTTACTATATCGATTTTTGCTAAGTGAGTTTTGATTTGAAATAAAAAAAATTGTTA
CAGTTTAG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2B601TF 728 0 0
CCCCCAAAGGAAACCAAATAAACAGAGCACAGAGTCTTTGACCAGAAAAAAAACAGAGCA
CACCCATATATATTAAAGACATTCAACGTTTCTCTGAAAGTATTCATTCTGATGGAGCTT
GATAGCAGCTGCGGCGTGGAAAATAACATCAAGGAGAAGTTTGGTTCCTCATCGACTTCT
TCTTCTTATTCGATCGGCGTGAACAGCGACGATGAAAGCGGGGACAATGAAGCTGAGTCT
CCTTACAAGGGTCCTCTTGATATGATAAAATCTCTCGAAGAGGTTTTACCAATCAGGAGA
GGCATATCGAAGTTCTACAAGGGAAAATCAAAGTCTTTCAGGAGCTTAAAGGAAACTGAA
TCCTCTCCGATGAAAGATTTAGGGACACCAGAGAACCTTTACAGTCGCCGTCGGAGAAAC
CTTCTCAGTCACCGGCTTTGTAGCTGAGGTGGGATCTCGAAGAAACCCGTCAAGACTGCT
GCCTTTACGGTGGTCTCTTTCTCCGGCGATGATTCTTCGCCTAAAGCCCCTCCTCTTTCG
AAGAGAAATCTCCAGCCGTTGCAGAGCAAAGAGTGTTCTGGTAATTGTGTTCCCGTTGTT
GTTTCGCCGCGTTGCTTCCAGTCGGTGGCGAATAGAGACATCCATAATATTATTTGTTAG
AAAATTTACTATATCGATTTTTGCTAAGTGAGTTTTGATTTGAAATAAAAAAAATTGTTA
CAGTTTAG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL6003Contig1 1129 2 2 U
GGGACTGAGCCTTGAGAAAGATTAAGAGAAACAATTAGCTCAACAAGAATGAGGAAACCA
GAGGTAGCAAGTGCAGCCACTCATCAAGTAAAGAAGATGAAGAAGGGACTATGGTCTCCA
GAGGAAGACTCAAAGCTGATGCAGTATATGATAAACAATGGGCAAGGATGTTGGAGTGAT
GTCGCCAAAAACGCAGGCCTTCAACGATGTGGCAAAAGCTGCCGTCTTCGTCGGATCAAT
TATCTTCGTCCTGACCTTAAGCGTGGTGCTTTCTCTCCTCAAGAAGAGGAACTCATTATT
CGCTTTCATTCCATTCTCGGTAACAGGTGGTCTCAGATTGCAGCACGAATGCCTGGTCGA
ACCGACAACGAGATCAAAAACTTCTGGAACTCAACAATAAAGAAAAGGCTAAAGAGGATG
TCCGATGCATCCAGCCTCGTCAACAATTCATCTTCATCACCCAACGCAAGTGATTCATCT
TCTAATAATACCTCCTCTTCATTGGACCTTAAAGACATTATAGGAAGCTTCATGTCCTTC
CAAGAACAAGGATTTGTCAACCCCTCTTTGACCAACATACCAACCAGTAACAATCCATTC
CAAGCGCCACACATGATCAGCCACCCTTGTCATGACGATTATACCCCTTATGTAGATGGT
TTCTATGGAGTAAACACAGGGCTACAAGGGGGAATCTACTTTCCACCTTTGGAGTGCGAA
GAAGGTGATTGGTACAAGGCAGATATTAACAACCACGTAGTCGAGATGAACACTAATGGA
GCTGGAAATGTACCTGAGGGTATGAGAATGGAAGAATATTGGGACCTTGACCAGTTGATG
AGCACTGAGGTTCCTTCATTTCACTTCAACTTCAAACAAAACACATGATTCATTTTCACG
TCATTTTTTTTTCTGTTGCGGAATTATACCAAAGCGATTCATAGCCACACGTAAATGCAA
ATACTGATATATATTACATTCTCTGATTCTCATAGATAGATATTGAAAAGTTAGAGTGTC
TTTTGTATTTCGAATAATTGTCTCGTACAAGGGCTTGACGTGCCAAGTGTAATGATTAGT
CAATGTAAGCTAAATCTCTTAATGAAATATGAAATAAACACATACATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE79TF U 1
AF RR2CE79JQ C 293
BS 1 684 RR2CE79TF
BS 685 1129 RR2CE79JQ

RD RR2CE79TF 684 0 0
GGGACTGAGCCTTGAGAAAGATTAAGAGAAACAATTAGCTCAACAAGAATGAGGAAACCA
GAGGTAGCAAGTGCAGCCACTCATCAAGTAAAGAAGATGAAGAAGGGACTATGGTCTCCA
GAGGAAGACTCAAAGCTGATGCAGTATATGATAAACAATGGGCAAGGATGTTGGAGTGAT
GTCGCCAAAAACGCAGGCCTTCAACGATGTGGCAAAAGCTGCCGTCTTCGTCGGATCAAT
TATCTTCGTCCTGACCTTAAGCGTGGTGCTTTCTCTCCTCAAGAAGAGGAACTCATTATT
CGCTTTCATTCCATTCTCGGTAACAGGTGGTCTCAGATTGCAGCACGAATGCCTGGTCGA
ACCGACAACGAGATCAAAAACTTCTGGAACTCAACAATAAAGAAAAGGCTAAAGAGGATG
TCCGATGCATCCAGCCTCGTCAACAATTCATCTTCATCACCCAACGCAAGTGATTCATCT
TCTAATAATACCTCCTCTTCATTGGACCTTAAAGACATTATAGGAAGCTTCATGTCCTTC
CAAGAACAAGGATTTGTCAACCCCTCTTTGACCAACATACCAACCAGTAACAATCCATTC
CAAGCGCCACACATGATCAGCCACCCTTGTCATGACGATTATACCCCTTATGTAGATGGT
TTCTATGGAGTAAACACAGGGCTA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2CE79JQ 837 0 0
AACTCATTTTCGCTTCA
TCCATTCTCGGTAACAGGTGGTCTCAGATTGCAGCACGAATGCCTGGTCGAACCGACAAC
GAGATCAAAAACTTCTGGAACTCAACAATAAAGAAAAGGCTAAAGAGGATGTCCGATGCA
TCCAGCCTCGTCAACAATTCATCTTCATCACCCAACGCAAGTGATTCATCTTCTAATAAT
ACCTCCTCTTCATTGGACCTTAAAGACATTATAGGAAGCTTCATGTCCTTCCAAGAACAA
GGATTTGTCAACCCCTCTTTGACCAACATACCAACCAGTAACAATCCATTCCAAGCGCCA
CACATGATCAGCCACCCTTGTCATGACGATTATACCCCTTATGTAGATGGTTTCTATGGA
GTAAACACAGGGCTACAAGGGGGAATCTACTTTCCACCTTTGGAGTGCGAAGAAGGTGAT
TGGTACAAGGCAGATATTAACAACCACGTAGTCGAGATGAACACTAATGGAGCTGGAAAT
GTACCTGAGGGTATGAGAATGGAAGAATATTGGGACCTTGACCAGTTGATGAGCACTGAG
GTTCCTTCATTTCACTTCAACTTCAAACAAAACACATGATTCATTTTCACGTCATTTTTT
TTTCTGTTGCGGAATTATACCAAAGCGATTCATAGCCACACGTAAATGCAAATACTGATA
TATATTACATTCTCTGATTCTCATAGATAGATATTGAAAAGTTAGAGTGTCTTTTGTATT
TCGAATAATTGTCTCGTACAAGGGCTTGACGTGCCAAGTGTAATGATTAGTCAATGTAAG
CTAAATCTCTTAATGAAATATGAAATAAACACATACATCG

QA 18 837 18 837
DS 



AS 1 2

CO CL6004Contig1 892 2 2 U
GGGCTGACCCAAATCAGATCTCGACTCTCTGCTCATTATCATCGACTCTTAAGTTTTTCT
ATTTGATCGCCTCTTTGAGCTCTACGTAAGCCCTCTGAGTTTTTGGCAAGGGAGGATGTC
AAATCTCCATACCAATTTTAACCAGAAGATAGATTATGTGTTCAAAGTAGTCTTGATTGG
CGACTCTGCCGTTGGCAAATCTCAGCTTCTCGCTAGATTCTCTAGGAACGAGTCCAGCAT
CGAGTCCAAAGCAACGATCGGTGTCGAGTTTCAGACAAGAACACTTACCATCGATAATAA
AACTGTCAAAGCTCAGATATGGGACACTGCTGGTCAAGAACGGTACCGAGCTGTGACGAG
TGCATACTACAGAGGTGCAGTAGGGGCAATGCTAGTGTACGACATAACAAAACGACAGTC
TTTTGATCATGTCGCGAGGTGGTTAGAAGAACTGAGAGGACACGCAGACAAGAACATTGT
GATCATGCTTGTAGGGAACAAGACTGATCTCGGCACACTTCGAGCTGTACCAACCGAGGA
TGCCAAAGAGTTTTCTCAAAGAGAAAACCTCTTCTTCATGGAGACATCAGCTCTTGATTC
CATCAATGTCGAGCCGTCTTTCCTCACGGTTTTGACTGAGATCTATAGGATAGTGAGCAA
AAAGAATCTTGTTGCTAATGAGGAAGGAGAATCTGGTGGTGACTCTTCTCTCCTGCAAGG
AACTAAGATTGTTGTTCCTGGTGAAGAGGTTGAAGCTAAAGGAAAGAGCTGTTGTGGAAC
ATCATAGAATCATTTTCTCTTGTGATTTTATTACCTCCTCTGTTTTGACTGCATGAATAA
TGTGTCTACTTTGTATGTAAGCTGTTGATTATAGAGTTGAAAGATTATACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D276TF U 1
AF RR2D276JQ C 232
BS 1 657 RR2D276TF
BS 658 892 RR2D276JQ

RD RR2D276TF 657 0 0
GGGCTGACCCAAATCAGATCTCGACTCTCTGCTCATTATCATCGACTCTTAAGTTTTTCT
ATTTGATCGCCTCTTTGAGCTCTACGTAAGCCCTCTGAGTTTTTGGCAAGGGAGGATGTC
AAATCTCCATACCAATTTTAACCAGAAGATAGATTATGTGTTCAAAGTAGTCTTGATTGG
CGACTCTGCCGTTGGCAAATCTCAGCTTCTCGCTAGATTCTCTAGGAACGAGTCCAGCAT
CGAGTCCAAAGCAACGATCGGTGTCGAGTTTCAGACAAGAACACTTACCATCGATAATAA
AACTGTCAAAGCTCAGATATGGGACACTGCTGGTCAAGAACGGTACCGAGCTGTGACGAG
TGCATACTACAGAGGTGCAGTAGGGGCAATGCTAGTGTACGACATAACAAAACGACAGTC
TTTTGATCATGTCGCGAGGTGGTTAGAAGAACTGAGAGGACACGCAGACAAGAACATTGT
GATCATGCTTGTAGGGAACAAGACTGATCTCGGCACACTTCGAGCTGTACCAACCGAGGA
TGCCAAAGAGTTTTCTCAAAGAGAAAACCTCTTCTTCATGGAGACATCAGCTCTTGATTC
CATCAATGTCGAGCCGTCTTTCCTCACGGTTTTGACTGAGATCTATAGGATAGTGAG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2D276JQ 661 0 0
GTCCAGCATCGAGTCCAAAGCAACGATCGGTGTCGAGTTTCAGACAAGAACACTTACCAT
CGATAATAAAACTGTCAAAGCTCAGATATGGGACACTGCTGGTCAAGAACGGTACCGAGC
TGTGACGAGTGCATACTACAGAGGTGCAGTAGGGGCAATGCTAGTGTACGACATAACAAA
ACGACAGTCTTTTGATCATGTCGCGAGGTGGTTAGAAGAACTGAGAGGACACGCAGACAA
GAACATTGTGATCATGCTTGTAGGGAACAAGACTGATCTCGGCACACTTCGAGCTGTACC
AACCGAGGATGCCAAAGAGTTTTCTCAAAGAGAAAACCTCTTCTTCATGGAGACATCAGC
TCTTGATTCCATCAATGTCGAGCCGTCTTTCCTCACGGTTTTGACTGAGATCTATAGGAT
AGTGAGCAAAAAGAATCTTGTTGCTAATGAGGAAGGAGAATCTGGTGGTGACTCTTCTCT
CCTGCAAGGAACTAAGATTGTTGTTCCTGGTGAAGAGGTTGAAGCTAAAGGAAAGAGCTG
TTGTGGAACATCATAGAATCATTTTCTCTTGTGATTTTATTACCTCCTCTGTTTTGACTG
CATGAATAATGTGTCTACTTTGTATGTAAGCTGTTGATTATAGAGTTGAAAGATTATACC
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL6005Contig1 810 2 2 U
GGGAAACGGCGGAGATCAGCGACCGAAAAGAAACGGCGATCATCCGATTAAAAACGTAAC
CGAAGGGAACGATGGTGCTGTGGGAGATAACGCTGGGAACAGCCTACTTCTTGGGGCTGA
GGCGGACTTATAGGCTCGCCTTGAAGATCCAACGTCGGGTTGTTGGTCCCAAGCATCCAA
AAATCCGTCAATTTCTTCATCGGAGGACTCGTAAAATCTTCGATGTGGCAGTTTCAGTTC
ACAAGAACATACAGCAGAGAGACATTGAAGTTGGTCGGAATCTCGGCAACTGGATTCTCC
GTTGGCTCGACCGGATTAAACCGGCTGCTCAGATCCGTACTCGACCTGAACCAAACTCCA
ACGTCGGCAAGGCAAAAAGGCTATCGGAGTCGGCTCGTCCCAAATCAAACACGACGCAGA
GTCCACAAAAACGTGAATCCGATAGGCACTTGTTCTCTTCACTGAAACACTTCCAGCACA
GGCCTTTCCCCACGATGATCCAGCCACCTAGACCTAATGGAATTACTACTCAGTACAGAC
ATTACAGTGCCGGTGCAGCCGCCAGTCTGATTCCTCCGAGCTATGTAAGAGGCAGCGGGT
TAATCAGGAAGGACATTTTGCAGTGGATGTTACAGAGATGACGACCAAGTAGAAAAATCC
CCAACATCTTTTTTTTTTAACGACATAGTTTAGCACCTTTGTACTTGTTAATTCCAGAAA
CTAATGTGATTGTGGATCGTTTCGGAAGTATGTCTGAACCTCTGTCTTCATCAAGAATCT
GTGACCAATGATGTAAAGTTTTTAAGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H047TF U 1
AF RR2H047JQ C 110
BS 1 607 RR2H047TF
BS 608 810 RR2H047JQ

RD RR2H047TF 609 0 0
GGGAAACGGCGGAGATCAGCGACCGAAAAGAAACGGCGATCATCCGATTAAAAACGTAAC
CGAAGGGAACGATGGTGCTGTGGGAGATAACGCTGGGAACAGCCTACTTCTTGGGGCTGA
GGCGGACTTATAGGCTCGCCTTGAAGATCCAACGTCGGGTTGTTGGTCCCAAGCATCCAA
AAATCCGTCAATTTCTTCATCGGAGGACTCGTAAAATCTTCGATGTGGCAGTTTCAGTTC
ACAAGAACATACAGCAGAGAGACATTGAAGTTGGTCGGAATCTCGGCAACTGGATTCTCC
GTTGGCTCGACCGGATTAAACCGGCTGCTCAGATCCGTACTCGACCTGAACCAAACTCCA
ACGTCGGCAAGGCAAAAAGGCTATCGGAGTCGGCTCGTCCCAAATCAAACACGACGCAGA
GTCCACAAAAACGTGAATCCGATAGGCACTTGTTCTCTTCACTGAAACACTTCCAGCACA
GGCCTTTCCCCACGATGATCCAGCCACCTAGACCTAATGGAATTACTACTCAGTACAGAC
ATTACAGTGCCGGTGCAGCCGCCAGTCTGATTCCTCCGAGCTATGTAAGAGGCAGCGGGT
TAATCAG
AA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2H047JQ 701 0 0
CTTGGGGCTGAGGCGGACTTATAGGCTCGCCTTGAAGATCCAACGTCGGGTTGTTGGTCC
CAAGCATCCAAAAATCCGTCAATTTCTTCATCGGAGGACTCGTAAAATCTTCGATGTGGC
AGTTTCAGTTCACAAGAACATACAGCAGAGAGACATTGAAGTTGGTCGGAATCTCGGCAA
CTGGATTCTCCGTTGGCTCGACCGGATTAAACCGGCTGCTCAGATCCGTACTCGACCTGA
ACCAAACTCCAACGTCGGCAAGGCAAAAAGGCTATCGGAGTCGGCTCGTCCCAAATCAAA
CACGACGCAGAGTCCACAAAAACGTGAATCCGATAGGCACTTGTTCTCTTCACTGAAACA
CTTCCAGCACAGGCCTTTCCCCACGATGATCCAGCCACCTAGACCTAATGGAATTACTAC
TCAGTACAGACATTACAGTGCCGGTGCAGCCGCCAGTTTGATTCCTCCGAGCTATGTAAG
AGGCAGCGGGTTAATCAGGAAGGACATTTTGCAGTGGATGTTACAGAGATGACGACCAAG
TAGAAAAATCCCCAACATCTTTTTTTTTTAACGACATAGTTTAGCACCTTTGTACTTGTT
AATTCCAGAAACTAATGTGATTGTGGATCGTTTCGGAAGTATGTCTGAACCTCTGTCTTC
ATCAAGAATCTGTGACCAATGATGTAAAGTTTTTAAGTGTG

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL6006Contig1 463 2 1 U
GGACGGCCACACTGTTCATTTCATACCTTTCCTCGCGAATCTGAGAATTCGGAAGTTTCG
ATCGATTTTGGGAGGGGGGTTTAGGGTTTTTGTCTGCTAATAATACTCTGATCAATGACG
CCGCCTCCAGGTCTTTACTCCGGTACCAGCACTCTTGCTCTGGTCGCTCGTGCTTCGGCT
TTCGGGCTGGGTCTCATCTACGGGAACGTCAAGCTCAAGGCTTTGAAGATTAAGAAGAAC
TCTCAGATTAAAGCAGAAGCCAAGGCTCATCACTAAGCACCAAACGTCTTTCTCTTTATT
CAAAATAAGAAGATGAAGCCCAAGTGACTCTCCTCTCCAAATGTTACTTGTTTCTTCGTA
AGCTATATCTCCCTCTGTGACTTTTTTTTTTCAGTTTTTCTTTTCTCGAATAACAAAACA
TTTTGTCTGGACAACAATCATAATACCATTTTGGTCTGAAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A315JQ C 1
AF RR2A315TF U 1
BS 1 463 RR2A315TF

RD RR2A315JQ 463 0 0
GGACGGCCACACTGTTCATTTCATACCTTTCCTCGGGAATCTGAGAATTCGGAAGTTTCG
ATCGATTTTGGGAGGGGGGTTTAGGGTTTTTGTCTGCTAATAATACTCTGATCAATGACG
CCGCCTCCAGGTCTTTACTCCGGTACCAGCACTCTTGCTCTGGTCGCTCGTGCTTCGGCT
TTCGGGCTGGGTCTCATCTACGGGAACGTCAAGCTCAAGGCTTTGAAGATTAAGAAGAAC
TCTCAGATTAAAGCAGAAGCCAAGGCTCATCACTAAGCACCAAACGTCTTTCTCTTTATT
CAAAATAAGAAGATGAAGCCCAAGTGACTCTCCTCTCCAAATGTTACTTGTTTCTTCGTA
AGCTATATCTCCCTCTGTGACTTTTTTTTTTCAGTTTTTCTTTTCTCGAATAACAAAACA
TTTTGTCTGGACAACAATCATAATACCATTTTGGTCTGAAGCC

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2A315TF 463 0 0
GGACGGCCACACTGTTCATTTCATACCTTTCCTCGCGAATCTGAGAATTCGGAAGTTTCG
ATCGATTTTGGGAGGGGGGTTTAGGGTTTTTGTCTGCTAATAATACTCTGATCAATGACG
CCGCCTCCAGGTCTTTACTCCGGTACCAGCACTCTTGCTCTGGTCGCTCGTGCTTCGGCT
TTCGGGCTGGGTCTCATCTACGGGAACGTCAAGCTCAAGGCTTTGAAGATTAAGAAGAAC
TCTCAGATTAAAGCAGAAGCCAAGGCTCATCACTAAGCACCAAACGTCTTTCTCTTTATT
CAAAATAAGAAGATGAAGCCCAAGTGACTCTCCTCTCCAAATGTTACTTGTTTCTTCGTA
AGCTATATCTCCCTCTGTGACTTTTTTTTTTCAGTTTTTCTTTTCTCGAATAACAAAACA
TTTTGTCTGGACAACAATCATAATACCATTTTGGTCTGAAGCC

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 2

CO CL6007Contig1 892 2 8 U
GCTTCCAAGTGACATAACTGTAGTTGTTGATGATGTGAAGTTTCATCTTCATAAGTTTCC
TCTAGTGTCAAAATGTGGGAAGCTTGCACGTATGTATGAAGAAGATTCTAGAAGTACAGA
CAAGAAAGCTCTGTGGACAACAGTTCTTGAAGAGTTCCCAGGTGGATCAGAAACTTTCCT
GACAAGTGCAAGATTCTGTTACGGGGCTCGGGTAGATTTCACATCGAAGAACATACTTTC
CATACACTGCGCAGCTGAGTACCTAGAGATGACCAATGAGTACGGGGAAGATAACTTGAT
ATCCCAAGTGGAAACCTTTTTGCACAAGCACGTCCTTCGCAACTGGAAAGACTGTATCCT
GGCCTTACAAAGCTCCAGTCCGGTGTTGAAATCCGCTGAGAAGCTTCAGACAGTACCCAA
ACTGATGAACGCGGTTTCCACCATGGTTTGCACTGACCCTAGTTTGTTCGGATGGCCTAT
GATGATGTACGGTACGTTGCAGAGTCCTGGTGGAAGCTTCTCATTTTTCGGATGAATCTC
CCTCCCTCCCAAGCGGAGCAGAAGCTGTGTCATTTGGAACTGGATCTCTTTCTGTTAAGC
AAAGCCTTCTGTTTCTCTATTACTCTTCGGTTAAGAGTATTTACTGCGGTTTTCTCTCAA
GGTAAAAGTTTTGAAGACTCTTGATAGTGTTCTCGGACAAGTCATGCCTTTGTAATCTTG
GTGGTTTTTGGGAAATGGGTATACTGTAAAAGTAAATAACTAGAGTTAGGATCTATAGAG
AAAAGAGGGTATAATTCTTGTCTGATTTGATATGATTCTGTTTGAATCTTCGTAGATGTG
TTGTTGTGTCTACCTGTGTGTAACGCTTTCTTCTGTATCTGCCTACAAGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G581TF U 1
AF RR2G581JQ C 228
BS 1 728 RR2G581TF
BS 729 730 RR2G581JQ
BS 731 732 RR2G581TF
BS 733 733 RR2G581JQ
BS 734 750 RR2G581TF
BS 751 751 RR2G581JQ
BS 752 793 RR2G581TF
BS 794 892 RR2G581JQ

RD RR2G581TF 793 0 0
GCTTCCAAGTGACATAACTGTAGTTGTTGATGATGTGAAGTTTCATCTTCATAAGTTTCC
TCTAGTGTCAAAATGTGGGAAGCTTGCACGTATGTATGAAGAAGATTCTAGAAGTACAGA
CAAGAAAGCTCTGTGGACAACAGTTCTTGAAGAGTTCCCAGGTGGATCAGAAACTTTCCT
GACAAGTGCAAGATTCTGTTACGGGGCTCGGGTAGATTTCACATCGAAGAACATACTTTC
CATACACTGCGCAGCTGAGTACCTAGAGATGACCAATGAGTACGGGGAAGATAACTTGAT
ATCCCAAGTGGAAACCTTTTTGCACAAGCACGTCCTTCGCAACTGGAAAGACTGTATCCT
GGCCTTACAAAGCTCCAGTCCGGTGTTGAAATCCGCTGAGAAGCTTCAGACAGTACCCAA
ACTGATGAACGCGGTTTCCACCATGGTTTGCACTGACCCTAGTTTGTTCGGATGGCCTAT
GATGATGTACGGTACGTTGCAGAGTCCTGGTGGAAGCTTCTCATTTTTCGGATGAATCTC
CCTCCCTCCCAAGCGGAGCAGAAGCTGTGTCATTTGGAACTGGATCTCTTTCTGTTAAGC
AAAGCCTTCTGTTTCTCTATTACTCTTCGGTTAAGAGTATTTACTGCGGTTTTCTCTCAA
GGTAAAAGTTTTGAAGACTCTTGATAGTGTTCTCGGACAAGTCATGCCTTTGTAATCTTG
GTGGTTTT**GGGAATGGGTATACTGTAAA*GTAAATAACTAGAGTTAGGATCTATAGAG
AAAAGAGGGTATA

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2G581JQ 665 0 0
AGAACATACTTTCCATACACTGCGCAGCTGAGTACCTAGAGATGACCAATGAGTACGGGG
AAGATAACTTGATATCCCAAGTGGAAACCTTTTTGCACAAGCACGTCCTTCGCAACTGGA
AAGACTGTATCCTGGCCTTACAAAGCTCCAGTCCGGTGTTGAAATCCGCTGAGAAGCTTC
AGACAGTACCCAAACTGATGAACGCGGTTTCCACCATGGTTTGCACTGACCCTAGTTTGT
TCGGATGGCCTATGATGATGTACGGTACGTTGCAGAGTCCTGGTGGAAGCTTCTCATTTT
TCGGATGAATCTCCCTCCCTCCCAAGCGGAGCAGAAGCTGTGTCATTTGGAACTGGATCT
CTTTCTGTTAAGCAAAGCCTTCTGTTTCTCTATTACTCTTCGGTTAAGAGTATTTACTGC
GGTTTTCTCTCAAGGTAAAAGTTTTGAAGACTCTTGATAGTGTTCTCGGACAAGTCATGC
CTTTGTAATCTTGGTGGTTTTTGGGAAATGGGTATACTGTAAAAGTAAATAACTAGAGTT
AGGATCTATAGAGAAAAGAGGGTATAATTCTTGTCTGATTTGATATGATTCTGTTTGAAT
CTTCGTAGATGTGTTGTTGTGTCTACCTGTGTGTAACGCTTTCTTCTGTATCTGCCTACA
AGCAT

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL6008Contig1 543 2 1 U
GGATCCCTAAGCCAAGAGAAGAGCAAATCCATCCAAGTAGTTGCAAAAACAATTGGTGGA
AAAATTCTCTCAAAGTACTCGAAAGCCATGGAGCCAAACAGTAAGGTTGTCTTTATTACC
TTGGTTCTTGCCTTGACACTCACGGCAGCAACGGGACAGTTCTGCGGCATGTCTGCTGGT
GGTCTGTACTCTTGCAAGCCGTATGTGCAGACTAAGAACCCATTGACCACGGCGATTGAT
CCCAAGGGCCCTTGCTGCACTGCCCTCTCTGGGGCAGACTTCCAGTGTCTGTGCAAGCAG
AAAACCAAAACCAATCCGTTTCTCAGTGGGATTGACCTTGACCTAGCTTCTAAACTCCCG
GAGATGTGTGGTTTATCTACGGCAACTTGCTAAGACAAGGTTTTTATTTGTGTTTTGATT
TTCTTCATGAGTCCATTGTTTTTGTACTTTTTGTTTCTGTTGTTGTTGTTTGTTGGCTTG
ATGTTGTTTCAGTTGTTGACTTAACTGCATTGTATCGCTGTTGCTTGATTTCTTCAAAAT
AAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2AG93JQ C 1
AF RR2AG93TF U 1
BS 1 543 RR2AG93TF

RD RR2AG93JQ 543 0 0
GGATCCCTAAGCCAAGAGAAGAGCAAATCCATCCAAGTAGTTGCAAAAACAATTGGTGGA
AAAATTCTCTCAAAGTACTCGAAAGCCATGGAGCCAAACAGTAAGGTTGTCTTTATTACC
TTGGTTCTTGCCTTGACACTCACGGCAGCAACGGGACAGTTCTGCGGCATGTCTGCTGGT
GGTCTGTACTCTTGCAAGCCGTATGTGCAGACTAAGAACCCATTGACCACGGCGATTGAT
CCCAAGGGCCCTTGCTGCACTGCCCTCTCTGGGGCAGACTTCCAGTGTCTGTGCAAGCAG
AAAACCAAAACCAATCCGTTTCTCAGTGGGATTGACCTTGACCTAGCTTCTAAACTCCCG
GAGATGTGTGGTTTATCTACGGCAACTTGCTAAGACAAGGTTTTTATTTGTGTTTTGATT
TTCTTCATGAGTCCATTGTTTTTGTACTTTTTGTTTCTGTTGTTGTTGTTTGTTGGCTTG
ATGTTGTTTCAGTTGTTGACTTAACTGCATTGTATCGCTGTTGCTTGATTTCTTCAAAAT
AAT

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2AG93TF 543 0 0
GGATCCCTAAGCCAAGAGAAGAGCAAATCCATCCAAGTAGTTGCAAAAACAATTGGTGGA
AAAATTCTCTCAAAGTACTCGAAAGCCATGGAGCCAAACAGTAAGGTTGTCTTTATTACC
TTGGTTCTTGCCTTGACACTCACGGCAGCAACGGGACAGTTCTGCGGCATGTCTGCTGGT
GGTCTGTACTCTTGCAAGCCGTATGTGCAGACTAAGAACCCATTGACCACGGCGATTGAT
CCCAAGGGCCCTTGCTGCACTGCCCTCTCTGGGGCAGACTTCCAGTGTCTGTGCAAGCAG
AAAACCAAAACCAATCCGTTTCTCAGTGGGATTGACCTTGACCTAGCTTCTAAACTCCCG
GAGATGTGTGGTTTATCTACGGCAACTTGCTAAGACAAGGTTTTTATTTGTGTTTTGATT
TTCTTCATGAGTCCATTGTTTTTGTACTTTTTGTTTCTGTTGTTGTTGTTTGTTGGCTTG
ATGTTGTTTCAGTTGTTGACTTAACTGCATTGTATCGCTGTTGCTTGATTTCTTCAAAAT
AAT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6010Contig1 907 2 4 U
GGAGCGAAAAGTGATCATCTTCATCTTTATAGATAGGAACCGTCAAATAGATATATTTGA
CTTTTAATCAAAGATCATGTCTCACATCGCTGTTGAGATGAATCGAAGAAGGCAGATGAA
CGAGCATCTTAAAGCCCTTCGTTCTTTGACTCCTTGTTTCTATATCAAAAGGGGAGATCA
AGCTTCGATCATTGGAGGAGTGGTAGAATTCATCAAAGAGCTTCAGCAACTAGTGCAAGT
TCTCGAGTCCAAGAAACGTAGAAAGACACTAAACCGGCCTTCTCTTCCTTATGAACACCA
AACACTCGAATCATCTACATTAGCCGCCACCACCAACAACGCAACCACTAGGGTGCCGTT
TAGTAGAATTGAAAACGTAATGACCACAAGCACTTTCAAGGAAGTAGGAGCATGTTGCAA
TTCCCCTCATGCTAACGTCGAAGCCAAGATCTCAGGCTCTAACGTTGTATTGAGAGTTGT
CTCTAGGCGAACTGAGGGGCAGCTGGCGAGGATCATATCCGTCTTGGAGAAACTATCTTT
TCAGGTTCTTCATCTCAATATTAGCAGCATGGAGGAGACTGTCTTGTACTTCTTCGTTGT
TAAGATAGGACTGGAGTGTCACTTAAGCCTGGAAGATCTAACCCTTGAGATTCAGAAAAG
CTTTGTGCCTGATGTGATCGTCTATACCAGCTAAAACCAAAAGTATAGGCGAACTAGCGT
CATAGCATGTATGGTTACATGAGCATACTTGACACTTTGCTAGAAATAAGCTCCAAGAAA
CTTAATTATTGTGTGACTTGTATCGATCTTATTACTTATGTTTTTCTCAGTTTGTTTTTG
TATCCTAACTCGATCAAAGTTATAATTTTCCATAATAAATAATAAAAAATTATGCCCTAA
CTATGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B686TF U 1
AF RR2B686JQ C 72
BS 1 658 RR2B686TF
BS 659 659 RR2B686JQ
BS 660 866 RR2B686TF
BS 867 907 RR2B686JQ

RD RR2B686TF 866 0 0
GGAGCGAAAAGTGATCATCTTCATCTTTATAGATAGGAACCGTCAAATAGATATATTTGA
CTTTTAATCAAAGATCATGTCTCACATCGCTGTTGAGATGAATCGAAGAAGGCAGATGAA
CGAGCATCTTAAAGCCCTTCGTTCTTTGACTCCTTGTTTCTATATCAAAAGGGGAGATCA
AGCTTCGATCATTGGAGGAGTGGTAGAATTCATCAAAGAGCTTCAGCAACTAGTGCAAGT
TCTCGAGTCCAAGAAACGTAGAAAGACACTAAACCGGCCTTCTCTTCCTTATGAACACCA
AACACTCGAATCATCTACATTAGCCGCCACCACCAACAACGCAACCACTAGGGTGCCGTT
TAGTAGAATTGAAAACGTAATGACCACAAGCACTTTCAAGGAAGTAGGAGCATGTTGCAA
TTCCCCTCATGCTAACGTCGAAGCCAAGATCTCAGGCTCTAACGTTGTATTGAGAGTTGT
CTCTAGGCGAACTGAGGGGCAGCTGGCGAGGATCATATCCGTCTTGGAGAAACTATCTTT
TCAGGTTCTTCATCTCAATATTAGCAGCATGGAGGAGACTGTCTTGTACTTCTTCGTTGT
TAAGATAGGACTGGAGTGTCACTTAAGCCTGGAAGATCTAACCCTTGAGATTCAGAAA*G
CTTTGTGCCTGATGTGATCGTCTATACCAGCTAAAACCAAAAGTATAGGCGAACTAGCGT
CATAGCATGTATGGTTACATGAGCATACTTGACACTTTGCTAGAAATAAGCTCCAAGAAA
CTTAATTATTGTGTGACTTGTATCGATCTTATTACTTATGTTTTTCTCAGTTTGTTTTTG
TATCCTAACTCGATCAAAGTTATAAT

QA 1 866 1 866
DS 

RD RR2B686JQ 836 0 0
AGATCATGTCTCACATCGCTGTTGAGATGAATCGAAGAAGGCAGATGAACGAGCATCTTA
AAGCCCTTCGTTCTTTGACTCCTTGTTTCTATATCAAAAGGGGAGATCAAGCTTCGATCA
TTGGAGGAGTGGTAGAATTCATCAAAGAGCTTCAGCAACTAGTGCAAGTTCTCGAGTCCA
AGAAACGTAGAAAGACACTAAACCGGCCTTCTCTTCCTTATGAACACCAAACACTCGAAT
CATCTACATTAGCCGCCACCACCAACAACGCAACCACTAGGGTGCCGTTTAGTAGAATTG
AAAACGTAATGACCACAAGCACTTTCAAGGAAGTAGGAGCATGTTGCAATTCCCCTCATG
CTAACGTCGAAGCCAAGATCTCAGGCTCTAACGTTGTATTGAGAGTTGTCTCTAGGCGAA
CTGAGGGGCAGCTGGCGAGGATCATATCCGTCTTGGAGAAACTATCTTTTCAGGTTCTTC
ATCTCAATATTAGCAGCATGGAGGAGACTGTCTTGTACTTCTTCGTTGTTAAGATAGGAC
TGGAGTGTCACTTAAGCCTGGAAGATCTAACCCTTGAGATTCAGAAAAGCTTTGTGCCTG
ATGTGATCGTCTATACCAGCTAAAACCAAAAGTATAGGCGAACTAGCGTCATAGCATGTA
TGGTTACATGAGCATACTTGACACTTTGCTAGAAATAAGCTCCAAGAAACTTAATTATTG
TGTGACTTGTATCGATCTTATTACTTATGTTTTTCTCAGTTTGTTTTTGTATCCTAACTC
GATCAAAGTTATAATTTTCCATAATAAATAATAAAAAATTATGCCCTAACTATGGG

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 2

CO CL6011Contig1 670 2 2 U
TTTGAATATGAGAAGATATATTTTATTATAATTTGGATTGAATAATTGTTAGAGATTACA
TAGCGTGAAGCAATTAAAAAAGAGAAATTACATAGCATCAATGTTGTGTATTTCAAGAGC
ATCATGCCTTATTTTATTTTTTTTAATTAAATTGAGAGCATCATGCCATGCTCGGTGTTT
CTCAAGACAATTGTACGATAATCACCTTCCACCTATCATCATCATCACTGCCACTCTTCC
TTTTTTCTCTGAAAATATCACTGCCACTAACTTAATAAATCCAATTCACATTGCTAAAGG
TTAACCATTCATATTATTCACCATAAACCGCATGCATTCTCTAGCACATTTATCTTCTTT
CACCGAAAAGATCTCCAAACACTCCTGAAAGATCAAATACATATTTGTAGTAGCAAATTC
ACACAATTGAATGAATGAGTGGATTCACTGAATGAGTGGATTCACTGAATGAGTTGGGAA
ATTGGTGTTATGTTAGTAACGACAATGCATGAATCGAGTCGAGTACCGTAACGGCAGCGA
CTCAGGGTGAAGCACTCCAATCGACAAAACAGTGACAACGATTCTATATGCGCTTGCTCG
AAATTAACAGTAGCCCGTGAAACACTCAGATCTTCATTGATGTTTGGGAGAAAATAACGG
TTAGTCGGCG


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BO70TF C 1
AF RR2BO70JQ U 4
BS 1 3 RR2BO70TF
BS 4 670 RR2BO70JQ

RD RR2BO70TF 670 0 0
TTTGAATATGAGAAGATATATTTTATTATAATTTGGATTGAATAATTGTTAGAGATTACA
TAGCGTGAAGCAATTAAAAAAGAGAAATTACATAGCATCAATGTTGTGTATTTCAAGAGC
ATCATGCCTTATTTTATTTTTTTTAATTAAATTGAGAGCATCATGCCATGCTCGGTGTTT
CTCAAGACAATTGTACGATAATCACCTTCCACCTATCATCATCATCACTGCCACTCTTCC
TTTTTTCTCTGAAAATATCACTGCCACTAACTTAATAAATCCAATTCACATTGCTAAAGG
TTAACCATTCATATTATTCACCATAAACCGCATGCATTCTCTAGCACATTTATCTTCTTT
CACCGAAAAGATCTCCAAACACTCCTGAAAGATCAAATACATATTTGTAGTAGCAAATTC
ACACAATTGAATGAATGAGTGGATTCACTGAATGAGTGGATTCACTGAATGAGTTGGGAA
ATTGGTGTTATGTTAGTAACGACAATGCATGAATCGAGTCGAGTACCGTAACGGCAGCGA
CTCAGGGTGAAGCACTCCAATCGACAAAACAGTGACAACGATTCTATATGCGCTTGCTCG
AAATTAACAGTAGCCCGTGAAACACTCAGATCTTCATTGATGTTTGGGAGAAAATAACGG
TTAGTCGGCG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2BO70JQ 667 0 0
GAATATGAGAAGATATATTTTATTATAATTTGGATTGAATAATTGTTAGAGATTACATAG
CGTGAAGCAATTAAAAAAGAGAAATTACATAGCATCAATGTTGTGTATTTCAAGAGCATC
ATGCCTTATTTTATTTTTTTTAATTAAATTGAGAGCATCATGCCATGCTCGGTGTTTCTC
AAGACAATTGTACGATAATCACCTTCCACCTATCATCATCATCACTGCCACTCTTCCTTT
TTTCTCTGAAAATATCACTGCCACTAACTTAATAAATCCAATTCACATTGCTAAAGGTTA
ACCATTCATATTATTCACCATAAACCGCATGCATTCTCTAGCACATTTATCTTCTTTCAC
CGAAAAGATCTCCAAACACTCCTGAAAGATCAAATACATATTTGTAGTAGCAAATTCACA
CAATTGAATGAATGAGTGGATTCACTGAATGAGTGGATTCACTGAATGAGTTGGGAAATT
GGTGTTATGTTAGTAACGACAATGCATGAATCGAGTCGAGTACCGTAACGGCAGCGACTC
AGGGTGAAGCACTCCAATCGACAAAACAGTGACAACGATTCTATATGCGCTTGCTCGAAA
TTAACAGTAGCCCGTGAAACACTCAGATCTTCATTGATGTTTGGGAGAAAATAACGGTTA
GTCGGCG

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL6012Contig1 665 2 4 U
GGAAATCAGAGAGCGAAAAGAAAAAGATCGCCGTAAATAGTATTTTCGGTCGACGAAGTG
TGCTTCTATAGCTACTGAATCGGTCTGATTTGTTTTTCTTCTGGTTCTGAGATGTGGAAG
TTTTTACAACTCCATCATCGCTGGTTTATGACTCTGGGGATGAAGATTTTCTAAGATCTA
CATCGCTAGCTTTATGATTTTAACTTTTTCCTATGATCCTATTGTCCTCATGTGGTCGGT
TTGGTTTGTTGGATGAGATTTCGACATAGGTTGATTGATGCTCTCTGATGATGAAGCTAA
AGTGAGAAAGATGAACGAATTGTATGTTCTGGTTTCTTAATTTCTTGATTAGTGATTTAG
TGGTTCTGGATAAGATCTCGACGAGGTTTGATGGACGCTCTCTGTTGAAAGGAGCTCAAC
CGCCGAAGGTGCATGTGCTGTTTCTGGTATGATTCCGACGATATGCCGCTTAGATTTCTG
GTGTCGAGGAAGATGTAAGGATTTGGCGATATGTGTTTCTTCGTTGTTGAAAATCGTTTG
GCACATCTATGTTTGTTGGTTTGGGCTTAGCCCATTGATTCATATTTGGGCATTTAGCTT
TTGTTCCTGGTTTTTGTGTGGGTTTGTACCTTTGAACTTTGTCTGCTTAATACAAATGTA
GATGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2E817TF U 1
AF RR2E817JQ C 1
BS 1 569 RR2E817TF
BS 570 570 RR2E817JQ
BS 571 613 RR2E817TF
BS 614 665 RR2E817JQ

RD RR2E817TF 613 0 0
GGAAATCAGAGAGCGAAAAGAAAAAGATCGCCGTAAATAGTATTTTCGGTCGACGAAGTG
TGCTTCTATAGCTACTGAATCGGTCTGATTTGTTTTTCTTCTGGTTCTGAGATGTGGAAG
TTTTTACAACTCCATCATCGCTGGTTTATGACTCTGGGGATGAAGATTTTCTAAGATCTA
CATCGCTAGCTTTATGATTTTAACTTTTTCCTATGATCCTATTGTCCTCATGTGGTCGGT
TTGGTTTGTTGGATGAGATTTCGACATAGGTTGATTGATGCTCTCTGATGATGAAGCTAA
AGTGAGAAAGATGAACGAATTGTATGTTCTGGTTTCTTAATTTCTTGATTAGTGATTTAG
TGGTTCTGGATAAGATCTCGACGAGGTTTGATGGACGCTCTCTGTTGAAAGGAGCTCAAC
CGCCGAAGGTGCATGTGCTGTTTCTGGTATGATTCCGACGATATGCCGCTTAGATTTCTG
GTGTCGAGGAAGATGTAAGGATTTGGCGATATGTGTTTCTTCGTTGTTGAAAATCGTTTG
GCACATCTATGTTTGTTGGTTTGGGCTTA*CCCATTGATTCATATTTGGGCATTTAGCTT
TTGTTCCTGGTTT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2E817JQ 665 0 0
GGAAATCAGAGAGCGAAAAGAAAAAGATCGCCGTAAATAGTATTTTCGGTCGACGAAGTG
TGCTTCTATAGCTACTGAATCGGTCTGATTTGTTTTTCTTCTGGTTCTGAGATGTGGAAG
TTTTTACAACTCCATCATCGCTGGTTTATGACTCTGGGGATGAAGATTTTCTAAGATCTA
CATCGCTAGCTTTATGATTTTAACTTTTTCCTATGATCCTATTGTCCTCATGTGGTCGGT
TTGGTTTGTTGGATGAGATTTCGACATAGGTTGATTGATGCTCTCTGATGATGAAGCTAA
AGTGAGAAAGATGAACGAATTGTATGTTCTGGTTTCTTAATTTCTTGATTAGTGATTTAG
TGGTTCTGGATAAGATCTCGACGAGGTTTGATGGACGCTCTCTGTTGAAAGGAGCTCAAC
CGCCGAAGGTGCATGTGCTGTTTCTGGTATGATTCCGACGATATGCCGCTTAGATTTCTG
GTGTCGAGGAAGATGTAAGGATTTGGCGATATGTGTTTCTTCGTTGTTGAAAATCGTTTG
GCACATCTATGTTTGTTGGTTTGGGCTTAGCCCATTGATTCATATTTGGGCATTTAGCTT
TTGTTCCTGGTTTTTGTGTGGGTTTGTACCTTTGAACTTTGTCTGCTTAATACAAATGTA
GATGG

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL6013Contig1 664 2 4 U
GTTACCAAGGGCGTAAAGTGCTGAACAAAGCTAGAGAGTTGGCTGCACAAAAGAATGTTG
ATGAGCTTGAGGCCCTCTCCAATACAGAGGTTGAGAAGTTTTTATCTCTCTGGTGCAGTA
AGAAGTTCAGAGAGGATTACGAGAAGAGACTCTTGGGCTCGCTTGATGCTAGGCAGATGA
GCCGAGATGGAAGGATGAGGAACCCTGACGAGAAGCCTCTTGTTACTCCAGAGGCACCAT
CAGCCAAGGCAGCTCCTTCTGAAACTGTGGCTGCCCCTAAAGCTAAAGTGAAGCAGCAGC
CAAAGGAGGAGCAATTGTCTGCACCTGAACCAGACGCTGCTCCTGTTGCTCAGAAGACCG
AGAAAACTAAAGATGCAGTGAAAGCAAAGAACGTTGTTGTTGTTGATGATGAAGAAGAAC
AAGAAGTATATGGTCTTGGAAAGCCGCAGAAAGAAGAGGAGGAAGTAGATGAAGCTACGA
TGAAAGAGATGAGAAAGCAAGAGGAGATTGCTAAAGCCAAGCTAGCCATGGAAAGGAAAA
AGAAGCAGGCGGAGAAAGCTGCTGCTAAAGCTGCCATAAGAGCTCAAAAGGAAGCTGAGA
AGAAAGAAAAAAGGAGCAAGAGAAGGCGGCCAAGAAGAAGACAGGAGGCAGCAACAAATA
CGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2G424TF U 1
AF RR2GQ79TF U 1
BS 1 548 RR2G424TF
BS 549 549 RR2GQ79TF
BS 550 607 RR2G424TF
BS 608 664 RR2GQ79TF

RD RR2G424TF 607 0 0
GTTACCAAGGGCGTAAAGTGCTGAACAAAGCTAGAGAGTTGGCTGCACAAAAGAATGTTG
ATGAGCTTGAGGCCCTCTCCAATACAGAGGTTGAGAAGTTTTTATCTCTCTGGTGCAGTA
AGAAGTTCAGAGAGGATTACGAGAAGAGACTCTTGGGCTCGCTTGATGCTAGGCAGATGA
GCCGAGATGGAAGGATGAGGAACCCTGACGAGAAGCCTCTTGTTACTCCAGAGGCACCAT
CAGCCAAGGCAGCTCCTTCTGAAACTGTGGCTGCCCCTAAAGCTAAAGTGAAGCAGCAGC
CAAAGGAGGAGCAATTGTCTGCACCTGAACCAGACGCTGCTCCTGTTGCTCAGAAGACCG
AGAAAACTAAAGATGCAGTGAAAGCAAAGAACGTTGTTGTTGTTGATGATGAAGAAGAAC
AAGAAGTATATGGTCTTGGAAAGCCGCAGAAAGAAGAGGAGGAAGTAGATGAAGCTACGA
TGAAAGAGATGAGAAAGCAAGAGGAGATTGCTAAAGCCAAGCTAGCCATGGAAAGGAAAA
AGAAGCAG*CGGAGAAAGCTGCTGCTAAAGCTGCCATAAGAGCTCAAAAGGAAGCTGAGA
AGAAAGA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2GQ79TF 664 0 0
GTTACCAAGGGCGTAAAGTGCTGAACAAAGCTAGAGAGTTGGCTGCACAAAAGAATGTTG
ATGAGCTTGAGGCCCTCTCCAATACAGAGGTTGAGAAGTTTTTATCTCTCTGGTGCAGTA
AGAAGTTCAGAGAGGATTACGAGAAGAGACTCTTGGGCTCGCTTGATGCTAGGCAGATGA
GCCGAGATGGAAGGATGAGGAACCCTGACGAGAAGCCTCTTGTTACTCCAGAGGCACCAT
CAGCCAAGGCAGCTCCTTCTGAAACTGTGGCTGCCCCTAAAGCTAAAGTGAAGCAGCAGC
CAAAGGAGGAGCAATTGTCTGCACCTGAACCAGACGCTGCTCCTGTTGCTCAGAAGACCG
AGAAAACTAAAGATGCAGTGAAAGCAAAGAACGTTGTTGTTGTTGATGATGAAGAAGAAC
AAGAAGTATATGGTCTTGGAAAGCCGCAGAAAGAAGAGGAGGAAGTAGATGAAGCTACGA
TGAAAGAGATGAGAAAGCAAGAGGAGATTGCTAAAGCCAAGCTAGCCATGGAAAGGAAAA
AGAAGCAGGCGGAGAAAGCTGCTGCTAAAGCTGCCATAAGAGCTCAAAAGGAAGCTGAGA
AGAAAGAAAAAAGGAGCAAGAGAAGGCGGCCAAGAAGAAGACAGGAGGCAGCAACAAATA
CGAT

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL6014Contig1 1225 2 6 U
GAGGCTGAGATTGTATCTACAGAGGAAGAAGAGTTGAGGGATCATCAAGACGAGGAAGAA
GATGAGGATGCGTTGGAAGAAAGAAGGAGGAGAATCAGAGAGAAGAATCTCAAAAGAGCT
AAGGAGGAGGCTGATCTGCTTCCTGTGGAGGAAGAGGACGAGGTGGAAGATGAAGATGAG
GAGGAAGATGAGTCCGAGTACGAGACTGATTCCGAAGACGATATGCCCGGTGGTATCACC
ATGATCAAACCTGTTTTCGTACCGAAAGCCGAGAGAGACACGGTTGCAGAGCGTGAAAGG
CTTGAAGCCGAGGAGCAAGCTCTGGAGGAGTTAGCTAAGAGGAAGCTCGAGATGAGGAAG
ATAGAGACGAAGCAGATAGTTGTTGAGGAAGTGAGGAAAGACGAGGAGATACGCAAGAAC
ATGTTACTGCAAGAAGCGAACATCGGAGACGTGGAGACCGACGACGAGATCAACGAAGCT
GAGGAGTACGAAGTCTGGAAGACGAGAGAGATCGCTAGGATCAAGAGGGAGAGGGATGCG
AAGGAAGCGATGTTGAGAGAGAGGGAAGAGATAGAGAAGCTGAGGAACATGACGGAGCAG
GAGAGGAGAGAGTGGGAGAGGAAGAATCCGAAGCCTTCGTCGACTCAGCCGAAAAAGAAG
TGGAACTTCATGCAGAAGTACTATCACAAGGGAGCCTTCTTCCAGGCGGATCCTGATGAT
GAGGCGGGATCCGTGGGGACGGACGGTATATTTCAGCGTGACTTCTCTGCGCCAACGGGA
GAAGATAGGTTGGACAAATCGATTCTGCCGAAAGTCATGCAAGTCAAGCACTTTGGTCGT
AGTGGAAGGACTAAGTGGACTCACCTTGTCAATGAGGATATAACAGATTGGAGTAACCCG
TGGACATCTAATGATCCTCTACGCGAAAAATACAACAAGAAAATGGCGGGAATGAATGGT
CCTATTGAGAAACCGAAGGGGAGCAAGAAGATGAAAGATTGGGAGAAATAAACCGCGCAT
CAAGATCTGTTCGAGTTTAAGACAAAAACTTAAACAAAGTGGTTATGTTCTAGTTAAAAA
GAAACATCTTATTCTCTGTTATCTCTGAGAACTCTATCTAAACCGCAGATATTAACAAAG
TTTGCTTTGTTACTACCATAAGCTCGTGGATGATAGACACCTGGTTCGTAAGATCGGGTC
AGTTATAGAATCAATCAAGTTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO94TF U 1
AF RR2CO94JQ C 476
BS 1 600 RR2CO94TF
BS 601 601 RR2CO94JQ
BS 602 655 RR2CO94TF
BS 656 656 RR2CO94JQ
BS 657 688 RR2CO94TF
BS 689 1225 RR2CO94JQ

RD RR2CO94TF 688 0 0
GAGGCTGAGATTGTATCTACAGAGGAAGAAGAGTTGAGGGATCATCAAGACGAGGAAGAA
GATGAGGATGCGTTGGAAGAAAGAAGGAGGAGAATCAGAGAGAAGAATCTCAAAAGAGCT
AAGGAGGAGGCTGATCTGCTTCCTGTGGAGGAAGAGGACGAGGTGGAAGATGAAGATGAG
GAGGAAGATGAGTCCGAGTACGAGACTGATTCCGAAGACGATATGCCCGGTGGTATCACC
ATGATCAAACCTGTTTTCGTACCGAAAGCCGAGAGAGACACGGTTGCAGAGCGTGAAAGG
CTTGAAGCCGAGGAGCAAGCTCTGGAGGAGTTAGCTAAGAGGAAGCTCGAGATGAGGAAG
ATAGAGACGAAGCAGATAGTTGTTGAGGAAGTGAGGAAAGACGAGGAGATACGCAAGAAC
ATGTTACTGCAAGAAGCGAACATCGGAGACGTGGAGACCGACGACGAGATCAACGAAGCT
GAGGAGTACGAAGTCTGGAAGACGAGAGAGATCGCTAGGATCAAGAGGGAGAGGGATGCG
AAGGAAGCGATGTTGAGAGAGAGGGAAGAGATAGAGAAGCTGAGGAACATGACGGAGCAG
*AGAGGAGAGAGTGGGAGAGGAAGAATCCGAAGCCTTCGTCGACTCAGCCGAAAA*GAAG
TGGAACTTCATGCAGAAGTACTATCACA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2CO94JQ 750 0 0
AAGCTGAGGAGTACGAAGTCTGGAAGACGAGAGAGATCGCTAGGATCAAGAGGGAGAGGG
ATGCGAAGGAAGCGATGTTGAGAGAGAGGGAAGAGATAGAGAAGCTGAGGAACATGACGG
AGCAGGAGAGGAGAGAGTGGGAGAGGAAGAATCCGAAGCCTTCGTCGACTCAGCCGAAAA
AGAAGTGGAACTTCATGCAGAAGTACTATCACAAGGGAGCCTTCTTCCAGGCGGATCCTG
ATGATGAGGCGGGATCCGTGGGGACGGACGGTATATTTCAGCGTGACTTCTCTGCGCCAA
CGGGAGAAGATAGGTTGGACAAATCGATTCTGCCGAAAGTCATGCAAGTCAAGCACTTTG
GTCGTAGTGGAAGGACTAAGTGGACTCACCTTGTCAATGAGGATATAACAGATTGGAGTA
ACCCGTGGACATCTAATGATCCTCTACGCGAAAAATACAACAAGAAAATGGCGGGAATGA
ATGGTCCTATTGAGAAACCGAAGGGGAGCAAGAAGATGAAAGATTGGGAGAAATAAACCG
CGCATCAAGATCTGTTCGAGTTTAAGACAAAAACTTAAACAAAGTGGTTATGTTCTAGTT
AAAAAGAAACATCTTATTCTCTGTTATCTCTGAGAACTCTATCTAAACCGCAGATATTAA
CAAAGTTTGCTTTGTTACTACCATAAGCTCGTGGATGATAGACACCTGGTTCGTAAGATC
GGGTCAGTTATAGAATCAATCAAGTTACAT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL6015Contig1 500 2 1 U
GGAATCTGACGATGTGGAAGCTCGGAACCTTGCCTCCAGCACTTATTGCTTTTAAAGGTC
ATGTTCACATATTAGACCCGTCATGGCATATGCTTGGTTTAGGCTATCAGAAGAACACCA
ACTTAGAGAATGTAAGGAAAGCTGCAGTGATACACTACAATGGGCAGTCAAAGCCATGGC
TGGAGATTGGTTTCGAGCATCTCAGGCCGTTCTGGACAAAATACGTCAACTACTCCAATG
ATTTCATCAAGAACTGTCACATCTTGGAGTAGCAGCAAAAACGAAAACTTTTCAGATGAT
ATTGAAGGTACTGCAGGGTGTAAAAGACAAAGAGTAAAGATACTAGGAAGTAAAAGAGAA
AGAGAGAAAGAAAACACAGAGCACTGCAGGTTTTACTCACTATATAAAGAAAGATTCAGA
AATTTTTAGTTTGCCATATATACACATAAGGAAGTTGTTGCAGCGAAGGGGAAGCTGCTA
GATAAGTGAAAGTTAAAAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BS32JQ C 1
AF RR2BS32TF U 1
BS 1 500 RR2BS32TF

RD RR2BS32JQ 500 0 0
GGAATCTGACGATGTGGAAGCTCGGAACCTTGCCTCCAGCACTTATTGCTTTTAAAGGTC
ATGTTCACATATTAGACCCGTCATGGCATATGCTTGGTTTAGGCTATCAGAAGAACACCA
ACTTAGAGAATGTAAGGAAAGCTGCAGTGATACACTACAATGGGCAGTCAAAGCCATGGC
TGGAGATTGGTTTCGAGCATCTCAGGCCGTTCTGGACAAAATACGTCAACTACTCCAATG
ATTTCATCAAGAACTGTCACATCTTGGAGTAGCAGCAAAAACGAAAACTTTTCAGATGAT
ATTGAAGGTACTGCAGGGTGTAAAAGACAAAGAGTAAAGATACTAGGAAGTAAAAGAGAA
AGAGAGAAAGAAAACACAGAGCACTGCAGGTTTTACTCACTATATAAAGAAAGATTCAGA
AATTTTTAGTTTGCCATATATACACATAAGGAAGTTGTTGCAGCGAAGGGGAAGCTGCTA
GATAAGTGAAAGTTAAAAAG

QA 1 500 1 500
DS 

RD RR2BS32TF 500 0 0
GGAATCTGACGATGTGGAAGCTCGGAACCTTGCCTCCAGCACTTATTGCTTTTAAAGGTC
ATGTTCACATATTAGACCCGTCATGGCATATGCTTGGTTTAGGCTATCAGAAGAACACCA
ACTTAGAGAATGTAAGGAAAGCTGCAGTGATACACTACAATGGGCAGTCAAAGCCATGGC
TGGAGATTGGTTTCGAGCATCTCAGGCCGTTCTGGACAAAATACGTCAACTACTCCAATG
ATTTCATCAAGAACTGTCACATCTTGGAGTAGCAGCAAAAACGAAAACTTTTCAGATGAT
ATTGAAGGTACTGCAGGGTGTAAAAGACAAAGAGTAAAGATACTAGGAAGTAAAAGAGAA
AGAGAGAAAGAAAACACAGAGCACTGCAGGTTTTACTCACTATATAAAGAAAGATTCAGA
AATTTTTAGTTTGCCATATATACACATAAGGAAGTTGTTGCAGCGAAGGGGAAGCTGCTA
GATAAGTGAAAGTTAAAAAG

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 2

CO CL6016Contig1 122 2 1 U
TTTTTGCAACCAGGGTTTGGTTTTGTTTTTCCTAGAGTTTGTGGCGTAGTATTTTTCTTG
TGAAATGTTTTCTCTACACTCTTGAGTGTGAAGAGTTTTCTAATGAGACATAATACTTGG
TT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2BU51JQ C 1
AF RR2BU51TF U 1
BS 1 122 RR2BU51TF

RD RR2BU51JQ 122 0 0
TTTTTGCAACCAGGGTTTGGTTTTGTTTTTCCTAGAGTTTGTGGCGTAGTATTTTTCTTG
TGAAATGTTTTCTCTACACTCTTGAGTGTGAAGAGTTTTCTAATGAGACATAATACTTGG
TT

QA 1 122 1 122
DS 

RD RR2BU51TF 122 0 0
TTTTTGCAACCAGGGTTTGGTTTTGTTTTTCCTAGAGTTTGTGGCGTAGTATTTTTCTTG
TGAAATGTTTTCTCTACACTCTTGAGTGTGAAGAGTTTTCTAATGAGACATAATACTTGG
TT

QA 1 122 1 122
DS 



AS 1 2

CO CL6017Contig1 610 2 2 U
GGACCCATATTTGCTTGGTTGCTCTGTCTTCCTCAAAATCGAAACAGAAGAGAAACTGTC
AAATCTCGCACTGGAACTCTAGGTCCAGCAAAGGGGATCAAGAACATCATGCCTGGAATC
TTACTGGGCTCCAACCTGCTAAAGAAGGGAGTATCATGGAGAGGTCTTAAGGGTTCAGTA
ATTTTTTCTCTTGGATTCTATGCACATGGTGTTCTGTTCCCTAATCCAGAAAGGGTACTT
GAAGAAGCCAAAGAGTCATGTGCAAAAGCCAAGTCTTTATCAGAGGAGTATTACGCTCAA
CTGGATGAGTTAATTGAAAATAAAAATGTGTTGGACGATGCATTGCAGTTGTATCTGGCT
GGAAATGCTCAGTTGAAAGAACTTAAAGAAGCCAATGGACTTTGAAAACGTTTTGTCAAT
CGCAGGAAAAATCTGAGTGGAGTCTCTTGTGATGAAATTGAACAGAAGAAATGATCTAAT
TTGGTGCGAAGAATGAAAGCAGTATATGGAATCTTTAAACTTTTGAGCTGTTAGTAATTA
GTATATATATCACCTTTGGAGTAACATTCTTCAGTTTGTTTTGTTGTTAGCTAATATCAT
TTCAGGCTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D451JQ C 1
AF RR2D451TF U 1
BS 1 602 RR2D451TF
BS 603 610 RR2D451JQ

RD RR2D451JQ 610 0 0
GGACCCATATTTGCTTGGTTGCTCTGTCTTCCTCAAAATCGAAACAGAAGAGAAACTGTC
AAATCTCGCACTGGAACTCTAGGTCCAGCAAAGGGGATCAAGAACATCATGCCTGGAATC
TTACTGGGCTCCAACCTGCTAAAGAAGGGAGTATCATGGAGAGGTCTTAAGGGTTCAGTA
ATTTTTTCTCTTGGATTCTATGCACATGGTGTTCTGTTCCCTAATCCAGAAAGGGTACTT
GAAGAAGCCAAAGAGTCATGTGCAAAAGCCAAGTCTTTATCAGAGGAGTATTACGCTCAA
CTGGATGAGTTAATTGAAAATAAAAATGTGTTGGACGATGCATTGCAGTTGTATCTGGCT
GGAAATGCTCAGTTGAAAGAACTTAAAGAAGCCAATGGACTTTGAAAACGTTTTGTCAAT
CGCAGGAAAAATCTGAGTGGAGTCTCTTGTGATGAAATTGAACAGAAGAAATGATCTAAT
TTGGTGCGAAGAATGAAAGCAGTATATGGAATCTTTAAACTTTTGAGCTGTTAGTAATTA
GTATATATATCACCTTTGGAGTAACATTCTTCAGTTTGTTTTGTTGTTAGCTAATATCAT
TTCAGGCTTC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2D451TF 602 0 0
GGACCCATATTTGCTTGGTTGCTCTGTCTTCCTCAAAATCGAAACAGAAGAGAAACTGTC
AAATCTCGCACTGGAACTCTAGGTCCAGCAAAGGGGATCAAGAACATCATGCCTGGAATC
TTACTGGGCTCCAACCTGCTAAAGAAGGGAGTATCATGGAGAGGTCTTAAGGGTTCAGTA
ATTTTTTCTCTTGGATTCTATGCACATGGTGTTCTGTTCCCTAATCCAGAAAGGGTACTT
GAAGAAGCCAAAGAGTCATGTGCAAAAGCCAAGTCTTTATCAGAGGAGTATTACGCTCAA
CTGGATGAGTTAATTGAAAATAAAAATGTGTTGGACGATGCATTGCAGTTGTATCTGGCT
GGAAATGCTCAGTTGAAAGAACTTAAAGAAGCCAATGGACTTTGAAAACGTTTTGTCAAT
CGCAGGAAAAATCTGAGTGGAGTCTCTTGTGATGAAATTGAACAGAAGAAATGATCTAAT
TTGGTGCGAAGAATGAAAGCAGTATATGGAATCTTTAAACTTTTGAGCTGTTAGTAATTA
GTATATATATCACCTTTGGAGTAACATTCTTCAGTTTGTTTTGTTGTTAGCTAATATCAT
TT

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL6018Contig1 720 2 1 U
GGAACGAAAGTCTCTCGTTTCGCACTGATCCTAGTTCCTTTATCAAGGGGCCATCATCAT
AAGCAGATTTTCGAAATCAGAGATGAAATTTGAAGGATCGCAAACGCTCTTACCGGTGAG
AAAACCTGCAAACGGCGGTTCCGACCGCAGACTCGCTGGTTACAAGCTGTGGGTTTTAGT
AGCTGTTCTCCTCTTGGCGTTAGGTTCTATGTTAACCGGTTCCGTCACTCTCAAAGGACT
CGGTCTGTTTCATTCCGTTGAAGGCAAGTTCGGATTCCACGTCAGCCACGATCTCGACGT
TTTGGAAATTGAGGAGAGAGAGAAAGTGGTGAGGCATATGTGGGATGTGTACGGACGATC
CGGCGGAGTTAGGGTGCCTCAGTTCTGGCGAGAGGCTTTCGAGGCGGCATATGAGTTCCT
GGTCAGTGATTCCGCCGCCGTTAGAAACGGGGCTATTTCCGATATAGCTAAACTGTCACT
TACTCGCTCTCTTAAGCCTGACTCTACCCTGGCCCAGCCCAGTCGTCGTTGAGCTGTGAA
GACAAAAAAGCCCATGAGAATAACAAAAGGATTCTCTTGTATATAGATAGAAATCAAATA
AATGAAATTGCATAAATAGCGTTTTCATTGAAGTATTGTTGTCTGAAAACTATTATGTAG
CAACCAAATTGTTGTCTACGTATTACAAATTTACAAGCAATCTATTTTCAAATCTGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BU07TF U 1
AF RR2BU07JQ C 45
BS 1 720 RR2BU07TF

RD RR2BU07TF 720 0 0
GGAACGAAAGTCTCTCGTTTCGCACTGATCCTAGTTCCTTTATCAAGGGGCCATCATCAT
AAGCAGATTTTCGAAATCAGAGATGAAATTTGAAGGATCGCAAACGCTCTTACCGGTGAG
AAAACCTGCAAACGGCGGTTCCGACCGCAGACTCGCTGGTTACAAGCTGTGGGTTTTAGT
AGCTGTTCTCCTCTTGGCGTTAGGTTCTATGTTAACCGGTTCCGTCACTCTCAAAGGACT
CGGTCTGTTTCATTCCGTTGAAGGCAAGTTCGGATTCCACGTCAGCCACGATCTCGACGT
TTTGGAAATTGAGGAGAGAGAGAAAGTGGTGAGGCATATGTGGGATGTGTACGGACGATC
CGGCGGAGTTAGGGTGCCTCAGTTCTGGCGAGAGGCTTTCGAGGCGGCATATGAGTTCCT
GGTCAGTGATTCCGCCGCCGTTAGAAACGGGGCTATTTCCGATATAGCTAAACTGTCACT
TACTCGCTCTCTTAAGCCTGACTCTACCCTGGCCCAGCCCAGTCGTCGTTGAGCTGTGAA
GACAAAAAAGCCCATGAGAATAACAAAAGGATTCTCTTGTATATAGATAGAAATCAAATA
AATGAAATTGCATAAATAGCGTTTTCATTGAAGTATTGTTGTCTGAAAACTATTATGTAG
CAACCAAATTGTTGTCTACGTATTACAAATTTACAAGCAATCTATTTTCAAATCTGTTCT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2BU07JQ 676 0 0
AAGGGGCCATCATCATAAGCAGATTTTCGAAATCAGAGATGAAATTTGAAGGATCGCAAA
CGCTCTTACCGGTGAGAAAACCTGCAAACGGCGGTTCCGACCGCAGACTCGCTGGTTACA
AGCTGTGGGTTTTAGTAGCTGTTCTCCTCTTGGCGTTAGGTTCTATGTTAACCGGTTCCG
TCACTCTCAAAGGACTCGGTCTGTTTCATTCCGTTGAAGGCAAGTTCGGATTCCACGTCA
GCCACGATCTCGACGTTTTGGAAATTGAGGAGAGAGAGAAAGTGGTGAGGCATATGTGGG
ATGTGTACGGACGATCCGGCGGAGTTAGGGTGCCTCAGTTCTGGCGAGAGGCTTTCGAGG
CGGCATATGAGTTCCTGGTCAGTGATTCCGCCGCCGTTAGAAACGGGGCTATTTCCGATA
TAGCTAAACTGTCACTTACTCGCTCTCTTAAGCCTGACTCTACCCTGGCCCAGCCCAGTC
GTCGTTGAGCTGTGAAGACAAAAAAGCCCATGAGAATAACAAAAGGATTCTCTTGTATAT
AGATAGAAATCAAATAAATGAAATTGCATAAATAGCGTTTTCATTGAAGTATTGTTGTCT
GAAAACTATTATGTAGCAACCAAATTGTTGTCTACGTATTACAAATTTACAAGCAATCTA
TTTTCAAATCTGTTCT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL6019Contig1 575 2 3 U
GGAGAGAAAACAAAGGTAAAGAGATACTCTCTTTAACAATGCTTAGACTGATAACAGTGC
TTCAACAGGGAAGCTGGTTCTCCAGCTTGATGATACTCTCTGCAATTTGCTCGTTATCGT
CTCTCATGCTAAAATCTGAAGGAACAAACCATACAGTTGGCGACAGCTCTGGTTGGGACC
TCATGACAAACTATACCAACTGGACACAGGGAAGAGAATTTCATGTCGGCGATGTCTTAG
TTTTCAACTACAACGTGGACCAGCATAACGTTATGCAAGTTAACTCTACAGCATATGCAG
ATTGTGGAAGAGACAATTACATCTCTCTCTTCACCAAAGGCAACGACTCGATCACTATGT
CAGAGGTTGGAGAGCACTGTTTCGTCTGTGGAATGTACGATCACTGTGAGAATGGCCAGA
AGCTAAGTATTAATGTAGCTCCTTGAGTACTGTTGATGAGTGATAATCAAAGATAGGCAG
CTTGTTGTTTGGGTCGTCTCTAGTACCAAAAAATAATGTCATTTACTTGAATAATTATAT
ATCATGAGCTTGAATAATATAGGAAGGATAATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CE10TF U 1
AF RR2CE10JQ C 99
BS 1 103 RR2CE10TF
BS 104 104 RR2CE10JQ
BS 105 575 RR2CE10TF

RD RR2CE10TF 575 0 0
GGAGAGAAAACAAAGGTAAAGAGATACTCTCTTTAACAATGCTTAGACTGATAACAGTGC
TTCAACAGGGAAGCTGGTTCTCCAGCTTGATGATACTCTCTGCCATTTGCTCGTTATCGT
CTCTCATGCTAAAATCTGAAGGAACAAACCATACAGTTGGCGACAGCTCTGGTTGGGACC
TCATGACAAACTATACCAACTGGACACAGGGAAGAGAATTTCATGTCGGCGATGTCTTAG
TTTTCAACTACAACGTGGACCAGCATAACGTTATGCAAGTTAACTCTACAGCATATGCAG
ATTGTGGAAGAGACAATTACATCTCTCTCTTCACCAAAGGCAACGACTCGATCACTATGT
CAGAGGTTGGAGAGCACTGTTTCGTCTGTGGAATGTACGATCACTGTGAGAATGGCCAGA
AGCTAAGTATTAATGTAGCTCCTTGAGTACTGTTGATGAGTGATAATCAAAGATAGGCAG
CTTGTTGTTTGGGTCGTCTCTAGTACCAAAAAATAATGTCATTTACTTGAATAATTATAT
ATCATGAGCTTGAATAATATAGGAAGGATAATCTC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2CE10JQ 477 0 0
TCTGCAATTTGCTCGTTATCGTCTCTCATGCTAAAATCTGAAGGAACAAACCATACAGTT
GGCGACAGCTCTGGTTGGGACCTCATGACAAACTATACCAACTGGACACAGGGAAGAGAA
TTTCATGTCGGCGATGTTTTAGTTTTCAACTACAACGTGGACCAGCATAACGTTATGCAA
GTTAACTTTACAGCATATGCAGATTGTGGAAGAGACAATTACATCTCTCTCTTCACCAAA
GGCAACGACTCGATCACTATGTCAGAGGTTGGAGAGCACTGTTTCGTCTGTGGAATGTAC
GATCACTGTGAGAATGGCCAGAAGCTAAGTATTAATGTAGCTCCTTGAGTACTGTTGATG
AGTGATAATCAAAGATAGGCAGCTTGTTGTTTGGGTCGTCTCTAGTACCAAAAAATAATG
TCATTTACTTGAATAATTATATATCATGAGCTTGAATAATATAGGAAGGATAATCTC

QA 1 477 1 477
DS 



AS 1 2

CO CL6020Contig1 848 2 6 U
AAGTTAAGAAACTATTAATAGGTTCTGAGTATTTGACCAAATGACATTAATAAAAATTAA
AACAAAGTACTTGTTACAACTTACAAGTTACATATACACAACCACTTTATAGAGGTTTTA
ACGAACATATATTATATAAACACATACATAGGGAGAGAGATTCTTTTCTCTCATCTTCTT
CCCAGATAGGCCACTTTCTGCGACTCATTTCCGCTTTCCGGAACCAATAGTAAGCAAATC
AAAGCTTCTCAGGGCGTCATCACGCCCAAGCCTTGCGGTTGGCTTAAATTCTTGGCCCGG
TTGAATCTTTTGGGTACCGCTTGAAAATAGTTTACTTGAACGGTTCTCACTCAGCTCACC
TGATGAGCCAGGTCAGCTGCTTGACACCACCGCCCTCACACTCTCGTTTCTCGTCTTTTC
AGACACGAGCACTTCTTTGGAAGAGCGAATGCCAGGACTGGATACATTACGTCTGGCGAA
CGCTTCAACCGCACCTGAAAATCTTTATCGCAGATCCTTCCCCTCTGAAGGCTTTTCACT
TTTTTCTGCTGATGGTCCTGGAGGGTCTTGAGCTGCTTTTGGATTTGCCCTTGGTCTATT
AGAACTAGAGCCCATCTGAGGATATTTCAAGATTGTCCAATCAAACACATAGTCAAACTG
ATAACCTTCACGAATGAAAAGGTCCCTGAAGAGTCTTTTCGAATATGAATAATCTGGTTT
GTCCTCAAACCTCAATGATCGGCAGTAATGGAAATATGATGTGAACTCCGAGGGAAATGA
CTTGCAAAGAAGCTCAACTGGAGTAAGCATCTTCCTTTCACTAATCTTGTCATACTTCTG
TTTCTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B241TF C 1
AF RR2AH28JQ U 35
BS 1 36 RR2B241TF
BS 37 374 RR2AH28JQ
BS 375 375 RR2B241TF
BS 376 506 RR2AH28JQ
BS 507 507 RR2B241TF
BS 508 848 RR2AH28JQ

RD RR2B241TF 663 0 0
AAGTTAAGAAACTATTAATAGGTTCTGAGTATTTGACCAAATGACGTTAATAAAAATTAA
AACAAAGTACTTGTTACAACTTACAAGTTACATATACACAACCACTTTATAGAGGTTTTA
ACGAACATATATTATATAAACACATACATAGGGAGAGAGATTCTTTTCTCTCATCTTCTT
CCCAGATAGGCCACTTTCTGCGACTCATTTCCGCTTTCCGGAACCAATAGTAAGCAAATC
AAAGCTTCTCAGGGCGTCATCACGCCCAAGCCTTGCGGTTGGCTTAGATTCTTGGCCCGG
TTGAATCTTTTGGGTACCGCTTGAAAATAGTTTACTTGAACGGTTCTCACTCAGCTCACC
TGATGAGCCAGGTCAGCTGCTTGACACCACCGCCCTCACACTCTCGTTTCTCGTCTTTTC
AGACACGAGCACTTCTTTGGAAGAGCGAATGCCAGGACTGGATACATTACGTCTGGCGAA
CGCTTCAACCGCACCTGAGAATCTTTATCGCAGATCCTTCCCCTCTGAAGGCTTTTCACT
TTTTTCTGCTGATGGTCCTGGAGGGTCTTGAGCTGCTTTTGGATTTGCCCTTGGTCTATT
AGAACTAGAGCCCATCTGAGGATATTTCAAGATTGTCCAATCAAACACATAGTCAAACTG
AT
C

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2AH28JQ 814 0 0
GG
CCAAATGACATTAATAAAAATTAAAACAAAGTACTTGTTACAACTTACAAGTTACATATA
CACAACCACTTTATAGAGGTTTTAACGAACATATATTATATAAACACATACATAGGGAGA
GAGATTCTTTTCTCTCATCTTCTTCCCAGATAGGCCACTTTCTGCGACTCATTTCCGCTT
TCCGGAACCAATAGTAAGCAAATCAAAGCTTCTCAGGGCGTCATCACGCCCAAGCCTTGC
GGTTGGCTTAAATTCTTGGCCCGGTTGAATCTTTTGGGTACCGCTTGAAAATAGTTTACT
TGAACGGTTCTCACTCAGCTCACCTGATGAGCCAGGTCGGCTGCTTGACACCACCGCCCT
CACACTCTCGTTTCTCGTCTTTTCAGACACGAGCACTTCTTTGGAAGAGCGAATGCCAGG
ACTGGATACATTACGTCTGGCGAACGCTTCAACCGCACCTGAAAATCTTTCTCGCAGATC
CTTCCCCTCTGAAGGCTTTTCACTTTTTTCTGCTGATGGTCCTGGAGGGTCTTGAGCTGC
TTTTGGATTTGCCCTTGGTCTATTAGAACTAGAGCCCATCTGAGGATATTTCAAGATTGT
CCAATCAAACACATAGTCAAACTGATAACCTTCACGAATGAAAAGGTCCCTGAAGAGTCT
TTTCGAATATGAATAATCTGGTTTGTCCTCAAACCTCAATGATCGGCAGTAATGGAAATA
TGATGTGAACTCCGAGGGAAATGACTTGCAAAGAAGCTCAACTGGAGTAAGCATCTTCCT
TTCACTAATCTTGTCATACTTCTGTTTCTTGG

QA 3 814 3 814
DS 



AS 1 2

CO CL6021Contig1 934 2 8 U
GGGCAAAAGAAACATAACAAAAACAGAGTTTAATTTTCTTAAAGCCAATGGCGGAGAAGT
TACTATTGATTCTCGTCCTTGCTTTACATGTCTTCGTATCGGGAGTGTTGTCGACGAGTA
TCCTTACCATAGAGAACAAATGCGACCAAACTGTGTGGCCAGTAATCTACTCATGGCAGT
CGCAAGTCTCCACGACCGGCTTCGCTCTCAAGAAAGGAGAGGTGCGTGACATATACGCGC
CGTCTTCATGGTTCGGTCTCATCTCGGCTAGGACGCTATGCTCCATTGACTCGACCGGAA
CATTCTCTTGCGCCACTGGAGACTGTGAATCCGGCAAGATCGAGTGTCCCGGCTCATACA
GTTGGGCTCCGGTGACTTATGCGTACTTTAGAATCGATAACGGCGGAGTAAATAGCCACA
CCGTCAGTGTCGAGTACGGTTACAACCTTCCACTAATGGTTGTGCCGTCAAAAAGTAGCG
GGACATGTAGCAGCAGCGGTTGCGTGGTTGACCTGAACAAGACTTGCCCAAAGGATCTTG
TGAGAGTTTCCACCAGAGGAGATCCAGTTGCATGTAGCAGCGCGTGCCAGGCGTCCAATA
CGCCCGAGACTTGCTGCACACTTGACTTCAAGTCAAAGCAAAACTGCAAGCCGACAGTGT
ACACTCAGAACTTCAACCGTGCTTGTCCGCTTGCTCATATCTACGCCTATGACAACAATA
AGAGCACCTTCACGTGCCCAAAGTCTACTGACTACGTCATCACGTTTTGCTCTTCCTCTA
AAACAACAACTAAATTTCAGTAAACATTACGATGTTCCTAAACACGTTTACTATTTTCCT
ATATGTGACCACTTGGTAAGGGAGCATAAGTTAGCATGTGGTGCATTTGATGTAAGAAAA
AGACTACTAAGATAAACAAAATTGGATTTCCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN44TF U 1
AF RR2BN44JQ C 138
BS 1 714 RR2BN44TF
BS 715 715 RR2BN44JQ
BS 716 718 RR2BN44TF
BS 719 719 RR2BN44JQ
BS 720 741 RR2BN44TF
BS 742 742 RR2BN44JQ
BS 743 765 RR2BN44TF
BS 766 934 RR2BN44JQ

RD RR2BN44TF 765 0 0
GGGCAAAAGAAACATAACAAAAACAGAGTTTAATTTTCTTAAAGCCAATGGCGGAGAAGT
TACTATTGATTCTCGTCCTTGCTTTACATGTCTTCGTATCGGGAGTGTTGTCGACGAGTA
TCCTTACCATAGAGAACAAATGCGACCAAACTGTGTGGCCAGTAATCTACTCATGGCAGT
CGCAAGTCTCCACGACCGGCTTCGCTCTCAAGAAAGGAGAGGTGCGTGACATATACGCGC
CGTCTTCATGGTTCGGTCTCATCTCGGCTAGGACGCTATGCTCCATTGACTCGACCGGAA
CATTCTCTTGCGCCACTGGAGACTGTGAATCCGGCAAGATCGAGTGTCCCGGCTCATACA
GTTGGGCTCCGGTGACTTATGCGTACTTTAGAATCGATAACGGCGGAGTAAATAGCCACA
CCGTCAGTGTCGAGTACGGTTACAACCTTCCACTAATGGTTGTGCCGTCAAAAAGTAGCG
GGACATGTAGCAGCAGCGGTTGCGTGGTTGACCTGAACAAGACTTGCCCAAAGGATCTTG
TGAGAGTTTCCACCAGAGGAGATCCAGTTGCATGTAGCAGCGCGTGCCAGGCGTCCAATA
CGCCCGAGACTTGCTGCACACTTGACTTCAAGTCAAAGCAAAACTGCAAGCCGACAGTGT
ACACTCAGAACTTCAACCGTGCTTGTCCGCTTGCTCATATCTACGCCTATGACA*CAA*A
AGAGCACCTTCACGTGCCCAA*GTCTACTGACTACGTCATCACGT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2BN44JQ 797 0 0
AAATGCGACCAAACTGTGTGGCCAGTA*TCTACTCATGGCAGTCGCAAGTCTCCACGACC
GGCTTCGCTCTCAAGAAAGGAGAGGTGCGTGACATATACGCGCCGTCTTCATGGTTCGGT
CTCATCTCGGCTAGGACGCTATGCTCCATTGACTCGACCGGAACATTCTCTTGCGCCACT
GGAGACTGTGAATCCGGCAAGATCGAGTGTCCCGGCTCATACAGTTGGGCTCCGGTGACT
TATGCGTACTTTAGAATCGATAACGGCGGAGTAAATAGCCACACCGTCAGTGTCGAGTAC
GGTTACAACCTTCCACTAATGGTTGTGCCGTCAAAAAGTAGCGGGACATGTAGCAGCAGC
GGTTGCGTGGTTGACCTGAACAAGACTTGCCCAAAGGATCTTGTGAGAGTTTCCACCAGA
GGAGATCCAGTTGCATGTAGCAGCGCGTGCCAGGCGTCCAATACGCCCGAGACTTGCTGC
ACACTTGACTTCAAGTCAAAGCAAAACTGCAAGCCGACAGTGTACACTCAGAACTTCAAC
CGTGCTTGTCCGCTTGCTCATATTTACGCCTATGACAACAATAAGAGCACCTTCACGTGC
CCAAAGTCTACTGACTACGTCATCACGTTTTGCTCTTCCTCTAAAACAACAACTAAATTT
CAGTAAACATTACGATGTTCCTAAACACGTTTACTATTTTCCTATATGTGACCACTTGGT
AAGGGAGCATAAGTTAGCATGTGGTGCATTTGATGTAAGAAAAAGACTACTAAGATAAAC
AAAATTGGATTTCCATG

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL6022Contig1 626 2 1 U
GGGTTTTCCTTTGTCTTTCTGTCTTCCATTTTAAGAGTTTGCCTTGGTTCTTGATTCTCT
CTCTCTCTGTTATTTTGCTTCATAGAATCTTTAAAATCAATAAACGTCAAAACAGTTGCT
TATAATCAGGCTTTCTTTATCATATGGAGGAAGAAGGAGAAGGAATGAGAAAGCAGGTAG
TGTTGGCGAAGCCTTTCTCGTTAGAAGATGATAAATACTCTGAACATACTTCCAATCTCA
TCCAACGGATTCTAAGTCTCTTCAAAAACGTACGGCCAGGATCCGATCTCACTAACTTTC
AGCTTCCACCTCAACTGAACCTACCGAGGTCGCAACTTCAGTGCTATGGCGAGATGGTCT
ACAGCTTCAACGGTCAAGACTTACTGGGAGAGTGTGGTCGCCGTGACCAACCAATAGACC
GGCTCAAATCAATCGTAACGTGGAACATCTCAACTCTCCGGCCATTGATCTTTGGCTTGG
CCCCGTATAATCCTATCGTCGGCGAAACTCACCATGTGTCCAATGGTGACCTTAACGTTC
TCGTGGAGCAAGCAAGTTTATTTTTTTCTACACTATCTAAATTAATAACAAGTGTGTTAC
TATTTCAATGCGAAAGTGTAATCATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BQ87JQ C 1
AF RR2BQ87TF U 1
BS 1 626 RR2BQ87TF

RD RR2BQ87JQ 626 0 0
GGGTTTTCCTTTGTCTTTCTGTCTTCCATTTTAAGAGTTTGCCTTGGTTCTTGATTCTCT
CTCTCTCTGTTATTTTGCTTCATAGAATCTTTAAAATCAATAAACGTCAAACCAGTTGCT
TATAATCAGGCTTTCTTTATCATATGGAGGAAGAAGGAGAAGGAATGAGAAAGCAGGTAG
TGTTGGCGAAGCCTTTCTCGTTAGAAGATGATAAATACTTTGAACATACTTCCAATTTCA
TCCAACGGATTTTAAGTCTCTTCAAAAACGTACGGCCAGGATCCGATCTCACTAACTTTC
AGCTTCCACCTCAACTGAACCTACCGAGGTCGCAACTTCAGTGCTATGGCGAGATGGTTT
ACAGCTTCAACGGTCAAGACTTACTGGGAGAGTGTGGTCGCCGTGACCAACCAATAGACC
GGCTCAAATCAATCGTAACGTGGAACATCTCAACTCTCCGGCCATTGATCTTTGGCTTGG
CCCCGTATAATCCTATCGTCGGCGAAACTCACCATGTGTCCAATGGTGACCTTAACGTTC
TCGTGGAGCAAGCAAGTTTATTTTTTTTTACACTATCTAAATTAATAACAAGTGTGTTAC
TATTTCAATGCGAAAGTGTAATCATT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2BQ87TF 626 0 0
GGGTTTTCCTTTGTCTTTCTGTCTTCCATTTTAAGAGTTTGCCTTGGTTCTTGATTCTCT
CTCTCTCTGTTATTTTGCTTCATAGAATCTTTAAAATCAATAAACGTCAAAACAGTTGCT
TATAATCAGGCTTTCTTTATCATATGGAGGAAGAAGGAGAAGGAATGAGAAAGCAGGTAG
TGTTGGCGAAGCCTTTCTCGTTAGAAGATGATAAATACTCTGAACATACTTCCAATCTCA
TCCAACGGATTCTAAGTCTCTTCAAAAACGTACGGCCAGGATCCGATCTCACTAACTTTC
AGCTTCCACCTCAACTGAACCTACCGAGGTCGCAACTTCAGTGCTATGGCGAGATGGTCT
ACAGCTTCAACGGTCAAGACTTACTGGGAGAGTGTGGTCGCCGTGACCAACCAATAGACC
GGCTCAAATCAATCGTAACGTGGAACATCTCAACTCTCCGGCCATTGATCTTTGGCTTGG
CCCCGTATAATCCTATCGTCGGCGAAACTCACCATGTGTCCAATGGTGACCTTAACGTTC
TCGTGGAGCAAGCAAGTTTATTTTTTTCTACACTATCTAAATTAATAACAAGTGTGTTAC
TATTTCAATGCGAAAGTGTAATCATT

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL6023Contig1 625 2 2 U
GGAACGCAAGAAAAGTCAAATCGACGACTAAACCAAAAAGAGAGAAAGAGAGAGTCTTTT
CGTGGCTATGGTGTTCAACAGCGCGGCGGTTGTGGCGATCGCCGACGTCTCAACGGAGAC
ATGGCAGCTGGTGTGGAGGATACCGTCGTCGCAGAGGATCAACACGCGGCAGCTTGTGGA
CATGGCCGTTTGCTACCCGATGTACCAGTTGAGTCGTTTGGTTCTATGTTTATGGACTTT
TATTTGTCTCCCTCCTGATGATTCCTTCTACTCCTACACCTACCAGAACGAATCTCAATC
CTCCTCTTCTTCTTCTTTGTCTGATGATGCTGATGATGAAGATCGACTTGCTTTTGAGCA
TAATCTCTATCAGAATCATCGTGTTTATGATTCTGATGATGATGATCGATCTTCTTCTTC
CTCGTTTGATGACTATTACAGTCCGTACTCCCATTATGATTGACTTTTCTAAGCTGATTG
ATTAGGTGACGATGATGATGATGCCTCTGTTTATTGAGAAAAGTTATAATCTTTTTTTTT
TTGTTGTATATGATTACGCTTCTTGGATGTTCAGAATATAAAAGACAGATCATACAAAGT
CAATAAAGTTTCCAGTTTCAATTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC96JQ C 1
AF RR2DC96TF U 1
BS 1 612 RR2DC96TF
BS 613 625 RR2DC96JQ

RD RR2DC96JQ 625 0 0
GGAACGCAAGAAAAGTCAAATCGACGACTAAACCAAAAAGAGAGAAAGAGAGAGTCTTTT
CGTGGCTATGGTGTTCAACAGCGCGGCGGTTGTGGCGATCGCCGACGTCTCAACGGAGAC
ATGGCAGCTGGTGTGGAGGATACCGTCGTCGCAGAGGATCAACACGCGGCAGCTTGTGGA
CATGGCCGTTTGCTACCCGATGTACCAGTTGAGTCGTTTGGTTCTATGTTTATGGACTTT
TATTTGTCTCCCTCCTGATGATTCCTTCTACTCCTACACCTACCAGAACGAATCTCAATC
CTCCTCTTCTTCTTCTTTGTCTGATGATGCTGATGATGAAGATCGACTTGCTTTTGAGCA
TAATCTCTATCAGAATCATCGTGTTTATGATTCTGATGATGATGATCGATCTTCTTCTTC
CTCGTTTGATGACTATTACAGTCCGTACTCCCATTATGATTGACTTTTCTAAGCTGATTG
ATTAGGTGACGATGATGATGATGCCTCTGTTTATTGAGAAAAGTTATAATCTTTTTTTTT
T*GTTGTATATGATTACGCTTCTTGGATGTTCAGAATATAAAAGACAGATCATACAAAGT
CAATAAAGTTTCCAGTTTCAATTTG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2DC96TF 612 0 0
GGAACGCAAGAAAAGTCAAATCGACGACTAAACCAAAAAGAGAGAAAGAGAGAGTCTTTT
CGTGGCTATGGTGTTCAACAGCGCGGCGGTTGTGGCGATCGCCGACGTCTCAACGGAGAC
ATGGCAGCTGGTGTGGAGGATACCGTCGTCGCAGAGGATCAACACGCGGCAGCTTGTGGA
CATGGCCGTTTGCTACCCGATGTACCAGTTGAGTCGTTTGGTTCTATGTTTATGGACTTT
TATTTGTCTCCCTCCTGATGATTCCTTCTACTCCTACACCTACCAGAACGAATCTCAATC
CTCCTCTTCTTCTTCTTTGTCTGATGATGCTGATGATGAAGATCGACTTGCTTTTGAGCA
TAATCTCTATCAGAATCATCGTGTTTATGATTCTGATGATGATGATCGATCTTCTTCTTC
CTCGTTTGATGACTATTACAGTCCGTACTCCCATTATGATTGACTTTTCTAAGCTGATTG
ATTAGGTGACGATGATGATGATGCCTCTGTTTATTGAGAAAAGTTATAATCTTTTTTTTT
TTGTTGTATATGATTACGCTTCTTGGATGTTCAGAATATAAAAGACAGATCATACAAAGT
CAATAAAGTTTC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL6024Contig1 861 2 2 U
TGAGTGCTGCGGACAACCTCATGTACGCTTACGCCTACGCCTACCTCCCTGCATCCACCT
CCTCTCTTCTTGCCTCTTCTTCCCTCGCCTTCTCAGCTTTTTTCGGCTACCTCATCGTCA
AGAACCCTATGAACGCTTCTGTAATCAACTCCATTGTGATAATAACTGCCGCCATGGCTA
TAATAGCGCTTGACTCGAGCTCTGACCGGTACGATTACGTCAGCAACCGCCAGTACTTTG
CAGGTTTCTTCTGGGACGTCATGGGTTCCGCGCTTCACGGGCTCATTTTCGCCTTATCGG
AGCTCGTGTTCGTGAAGCTCCTTGGAAGAAGGTTCTTCCACGTGGCATTGGAGCAGCAGG
TTATGGTTTCGTTGGCGGCGTTTGCGTTTACGACTCTCGGGATGGTTGTGAGCGGAGATC
TACAAGGGATGGCTCGAGAAGCCGAGAGTTTCGAAGGCGGGGAGTCTCGGTACGTTCGGG
TTCTTGTCTGGAGCGCGGTCACGTTTCAGCTGGGTGTTCTCGGGGCCACCGCTGTGTTGT
TTCTTGCGTCCACGGTCATGGCGGGAGTGCTTAACGCTGTGAGAGTGCCTATCACTAGTA
TAGCGGCTGTGATATTGTTGCGTGATCCGATGAGTGGGTTTAAGATTCTGTCTTTGGTCT
TGACGTTTTGGGGATTCAGCTCTTACATCTATGGGAGCTCGAGCACAACCCCAAGTACTC
GAGGTTCTTCTTCTTCCTAGTTTGCAGCATATTCCTCTGTTTCTATTCCTAAGAGTGTGA
TCTGATGATTTCATGTAATATATATGATTATATTGCGGCTACCAAAGTTGTAAGCTGATG
GATCTGATGATCTCTTCGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW71TF U 1
AF RR2GW71JQ C 115
BS 1 720 RR2GW71TF
BS 721 861 RR2GW71JQ

RD RR2GW71TF 720 0 0
TGAGTGCTGCGGACAACCTCATGTACGCTTACGCCTACGCCTACCTCCCTGCATCCACCT
CCTCTCTTCTTGCCTCTTCTTCCCTCGCCTTCTCAGCTTTTTTCGGCTACCTCATCGTCA
AGAACCCTATGAACGCTTCTGTAATCAACTCCATTGTGATAATAACTGCCGCCATGGCTA
TAATAGCGCTTGACTCGAGCTCTGACCGGTACGATTACGTCAGCAACCGCCAGTACTTTG
CAGGTTTCTTCTGGGACGTCATGGGTTCCGCGCTTCACGGGCTCATTTTCGCCTTATCGG
AGCTCGTGTTCGTGAAGCTCCTTGGAAGAAGGTTCTTCCACGTGGCATTGGAGCAGCAGG
TTATGGTTTCGTTGGCGGCGTTTGCGTTTACGACTCTCGGGATGGTTGTGAGCGGAGATC
TACAAGGGATGGCTCGAGAAGCCGAGAGTTTCGAAGGCGGGGAGTCTCGGTACGTTCGGG
TTCTTGTCTGGAGCGCGGTCACGTTTCAGCTGGGTGTTCTCGGGGCCACCGCTGTGTTGT
TTCTTGCGTCCACGGTCATGGCGGGAGTGCTTAACGCTGTGAGAGTGCCTATCACTAGTA
TAGCGGCTGTGATATTGTTGCGTGATCCGATGAGTGGGTTTAAGATTCTGTCTTTGGTCT
TGACGTTTTGGGGATTCAGCTCTTACATCTATGGGAGCTCGAGCACAACCCCAAGTACTC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2GW71JQ 747 0 0
TCGTCAAGAACCCTATGAACGCTTCTGTAATCAACTCCATTGTGATAATAACTGCCGCCA
TGGCTATAATAGCGCTTGACTCGAGCTCTGACCGGTACGATTACGTCAGCAACCGCCAGT
ACTTTGCAGGTTTCTTCTGGGACGTCATGGGTTCCGCGCTTCACGGGCTCATTTTCGCCT
TATCGGAGCTCGTGTTCGTGAAGCTCCTTGGAAGAAGGTTCTTCCACGTGGCATTGGAGC
AGCAGGTTATGGTTTCGTTGGCGGCGTTTGCGTTTACGACTCTCGGGATGGTTGTGAGCG
GAGATCTACAAGGGATGGCTCGAGAAGCCGAGAGTTTCGAAGGCGGGGAGTCTCGGTACG
TTCGGGTTCTTGTCTGGAGCGCGGTCACGTTTCAGCTGGGTGTTCTCGGGGCCACCGCTG
TGTTGTTTCTTGCGTCCACGGTCATGGCGGGAGTGCTTAACGCTGTGAGAGTGCCTATCA
CTAGTATAGCGGCTGTGATATTGTTGCGTGATCCGATGAGTGGGTTTAAGATTCTGTCTT
TGGTCTTGACGTTTTGGGGATTCAGCTCTTACATCTATGGGAGCTCGAGCACAACCCCAA
GTACTCGAGGTTCTTCTTCTTCCTAGTTTGCAGCATATTCCTCTGTTTCTATTCCTAAGA
GTGTGATCTGATGATTTCATGTAATATATATGATTATATTGCGGCTACCAAAGTTGTAAG
CTGATGGATCTGATGATCTCTTCGTGG

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL6025Contig1 883 2 4 U
GTGGCTAACCGACAATCTGCTGCTCGTTCAAAAGAGAGAAAGGTTCGCTATATAATGGAG
CTCGAGAGGAAAGTCCAGTCATTGCAAACCGAAGCTACTACCCTCTCTGCACAACTGTCT
TTGTTCCAGAGAGACACAACTGGTTTGTCATCTGAGAACACAGAGCTCAAGCTTCGTTTA
CAAGTCATGGAACAACAAGCCAAGTTGCGAGACGCACTCAACGACCAGCTGAAAAAGGAA
GTAGAGAGGCTCAAATTCGCCACGGGAGAAGTCTCACACGCTGATGCTTATAACCTCGGG
ATGGCACACATGCAATACTCTCAACAACAGCAGCAACAACAACAACAACAACAACAATCC
TTCTTTCAACATCATCATCAGCAACAACAACAACAAACTGATGCTCAAAACATACAACAA
ATGACTCATCAGTTTCATCTCTTCCAGCCTAACAACAACAACCACAACCAGAACCAGAAC
CCTCAGCTTATGCACCACGCTACTTCTAACGCCTCTGGTCAATCTCATTCCTTTGCAGAG
GCGATGCATGAAGATCATCTTGGCAGGTTACAGGGGCTTGACATTAGCAGCTGTGGCAGA
GGTTCGAACTTTGGTAGGTCTGATACTGTCAGTGAAAGCAGCAGCACCATGTGAAGCTCT
GCCTTTGTCGATAAAAACCTTATTCTTTTGCTCTCCCTTGACCATTCATTGTTTTTTTAC
ATTCTGTAAAACTGGTTTCAAGTTTCAATTTAGAGACCACAGGTGTTTTTAACTTGTCTC
ATTTCTCTGTTTTATGATTCTTCTGTATGTTCTCTTGCTTCCTTCACTAGTTGCTTCTTC
AATCATCCTTGTAAATGGTGGTTGTATTTGGATTTGGCTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY35TF U 1
AF RR2CY35JQ C 103
BS 1 617 RR2CY35TF
BS 618 618 RR2CY35JQ
BS 619 709 RR2CY35TF
BS 710 883 RR2CY35JQ

RD RR2CY35TF 709 0 0
GTGGCTAACCGACAATCTGCTGCTCGTTCAAAAGAGAGAAAGGTTCGCTATATAATGGAG
CTCGAGAGGAAAGTCCAGTCATTGCAAACCGAAGCTACTACCCTCTCTGCACAACTGTCT
TTGTTCCAGAGAGACACAACTGGTTTGTCATCTGAGAACACAGAGCTCAAGCTTCGTTTA
CAAGTCATGGAACAACAAGCCAAGTTGCGAGACGCACTCAACGACCAGCTGAAAAAGGAA
GTAGAGAGGCTCAAATTCGCCACGGGAGAAGTCTCACACGCTGATGCTTATAACCTCGGG
ATGGCACACATGCAATACTCTCAACAACAGCAGCAACAACAACAACAACAACAACAATCC
TTCTTTCAACATCATCATCAGCAACAACAACAACAAACTGATGCTCAAAACATACAACAA
ATGACTCATCAGTTTCATCTCTTCCAGCCTAACAACAACAACCACAACCAGAACCAGAAC
CCTCAGCTTATGCACCACGCTACTTCTAACGCCTCTGGTCAATCTCATTCCTTTGCAGAG
GCGATGCATGAAGATCATCTTGGCAGGTTACAGGGGCTTGACATTAGCAGCTGTGGCAGA
GGTTCGAACTTTGGTAG*TCTGATACTGTCAGTGAAAGCAGCAGCACCATGTGAAGCTCT
GCCTTTGTCGATAAAAACCTTATTCTTTTGCTCTCCCTTGACCATTCAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2CY35JQ 781 0 0
CTCTCTGCACAACTGTCTTTGTTCCAGAGAGACACAACTGGTTTGTCATCTGAGAACACA
GAGCTCAAGCTTCGTTTACAAGTCATGGAACAACAAGCCAAGTTGCGAGACGCACTCAAC
GACCAGCTGAAAAAGGAAGTAGAGAGGCTCAAATTCGCCACGGGAGAAGTCTCACACGCT
GATGCTTATAACCTCGGGATGGCACACATGCAATACTCTCAACAACAGCAGCAACAACAA
CAACAACAACAACAATCCTTCTTTCAACATCATCATCAGCAACAACAACAACAAACTGAT
GCTCAAAACATACAACAAATGACTCATCAGTTTCATCTCTTCCAGCCTAACAACAACAAC
CACAACCAGAACCAGAACCCTCAGCTTATGCACCACGCTACTTCTAACGCCTCTGGTCAA
TCTCATTCCTTTGCAGAGGCGATGCATGAAGATCATCTTGGCAGGTTACAGGGGCTTGAC
ATTAGCAGCTGTGGCAGAGGTTCGAACTTTGGTAGGTCTGATACTGTCAGTGAAAGCAGC
AGCACCATGTGAAGCTCTGCCTTTGTCGATAAAAACCTTATTCTTTTGCTCTCCCTTGAC
CATTCATTGTTTTTTTACATTCTGTAAAACTGGTTTCAAGTTTCAATTTAGAGACCACAG
GTGTTTTTAACTTGTCTCATTTCTCTGTTTTATGATTCTTCTGTATGTTCTCTTGCTTCC
TTCACTAGTTGCTTCTTCAATCATCCTTGTAAATGGTGGTTGTATTTGGATTTGGCTTTG
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL6026Contig1 683 2 4 U
TTTTTTGTGGTGTTGGTTTTCTGAGAGATCTGAAGTGGTGTAGCGATGCACGTACCAGTG
ACCGTGACCGATAACTCATTATCTTCATTCTACAAGGGTTTATACGCTGTGGTGGATGAT
CCTTCACTGGACTCAGTAGTCTCGTGGAGCAAAGACAAGAAAAGTTTCGTCATTTGGGAT
CCGATAGAGTTTCAGAGAAGGGTTCTGCCGACGACGGGCAGACAAAGAAGAATACTATCC
TTAAACTTCTCCTTGTTTATGGTCAACCTTAAGTTCTATGGATTTATAAGGGTTAAGGGA
TCTAAGCATCGTTATCACATTGGACATCCGAAATATTTTGTGAGAGGTAAACCTGAGCTT
ATGAAAAAGATGCAGGAAGAGAGAATCCACAAATTTGAACAAGCCAGGGCTATGAGAAAG
AAAGCCAAAGCTAGAGCCATGGAGTTAGCGGATTCCTTGGGTGGTTTAGCTCTTTGATTG
TATGTAGCTATGTGCTTTTCTTTGTTGACATCTTTAATGTTTGGGTCGATTGCGTTTTGT
TCCTAATAAAACATCTCTCCTCTTTTGTCTGTTTTAAGAAATGTTTCTCTTGTTAACAGG
TCACACTTTTTACTTTAGTGATATCAAAATTTCTGGCTAAAAAACTTGTACGTCCTTTCC
ATTAATAAAATCTTCTTCCTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2D028JQ C 1
AF RR2D028TF U 1
BS 1 643 RR2D028TF
BS 644 644 RR2D028JQ
BS 645 682 RR2D028TF
BS 683 683 RR2D028JQ

RD RR2D028JQ 683 0 0
TTTTTTGTGGTGTTGGTTTTCTGAGAGATCTGAAGTGGTGTAGCGATGCACGTACCAGTG
ACCGTGACCGATAACTCATTATCTTCATTCTACAAGGGTTTATACGCTGTGGTGGATGAT
CCTTCACTGGACTCAGTAGTCTCGTGGAGCAAAGACAAGAAAAGTTTCGTCATTTGGGAT
CCGATAGAGTTTCAGAGAAGGGTTCTGCCGACGACGGGCAGACAAAGAAGAATACTATCC
TTAAACTTCTCCTTGTTTATGGTCAACCTTAAGTTCTATGGATTTATAAGGGTTAAGGGA
TCTAAGCATCGTTATCACATTGGACATCCGAAATATTTTGTGAGAGGTAAACCTGAGCTT
ATGAAAAAGATGCAGGAAGAGAGAATCCACAAATTTGAACAAGCCAGGGCTATGAGAAAG
AAAGCCAAAGCTAGAGCCATGGAGTTAGCGGATTCCTTGGGTGGTTTAGCTCTTTGATTG
TATGTAGCTATGTGCTTTTCTTTGTTGACATCTTTAATGTTTGGGTCGATTGCGTTTTGT
TCCTAATAAAACATCTCTCCTCTTTTGTCTGTTTTAAGAAATGTTTCTCTTGTTAACAGG
TCACACTTTTTACTTTAGTGATATCAAAATTTCTGGCTAAAAAACTTGTACGTCCTTTCC
ATTAATAAAATCTTCTTCCTTCT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2D028TF 682 0 0
TTTTTTGTGGTGTTGGTTTTCTGAGAGATCTGAAGTGGTGTAGCGATGCACGTACCAGTG
ACCGTGACCGATAACTCATTATCTTCATTCTACAAGGGTTTATACGCTGTGGTGGATGAT
CCTTCACTGGACTCAGTAGTCTCGTGGAGCAAAGACAAGAAAAGTTTCGTCATTTGGGAT
CCGATAGAGTTTCAGAGAAGGGTTCTGCCGACGACGGGCAGACAAAGAAGAATACTATCC
TTAAACTTCTCCTTGTTTATGGTCAACCTTAAGTTCTATGGATTTATAAGGGTTAAGGGA
TCTAAGCATCGTTATCACATTGGACATCCGAAATATTTTGTGAGAGGTAAACCTGAGCTT
ATGAAAAAGATGCAGGAAGAGAGAATCCACAAATTTGAACAAGCCAGGGCTATGAGAAAG
AAAGCCAAAGCTAGAGCCATGGAGTTAGCGGATTCCTTGGGTGGTTTAGCTCTTTGATTG
TATGTAGCTATGTGCTTTTCTTTGTTGACATCTTTAATGTTTGGGTCGATTGCGTTTTGT
TCCTAATAAAACATCTCTCCTCTTTTGTCTGTTTTAAGAAATGTTTCTCTTGTTAACAGG
TCACACTTTTTACTTTAGTGATATCAAAATTTCTGGCTAAAAA*CTTGTACGTCCTTTCC
ATTAATAAAATCTTCTTCCTTC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL6027Contig1 634 2 1 U
AGGGAACAGATCTCGTCACTTTCGTCGACAAAAAAAGAACAGACCTCGTCTTCCTTAGAG
AGAAGCAGAGAGAGAATATTGAAGAAATGGAGTTCAAGAATACGCGACGGCCGCTACCAT
GCATCGCTTGTCACCACCACCACCATCGCCATCTCTCCCATCCGCCATCACTCGTCACCA
CCACCATCGCTTGTTAGATCCGTCTTCACCGGAGTCGCCACCACCACCGTCATTTGCTTA
TCTCAGATCATCTATGGAGCAGGGAAGGAGAAGAAGTGGTGTTACAGAGCATTATCCGGT
TTAAAAAAGGCGGAGTAGCTAAAGAAGGTTGATGGTGGTTGTTTCGGCGTCAACCATGGT
GGTCTCGACGCCAACAGTGGTGGTCTCGACCCCAACAGTGGTGGTCTCGACGTCGTCAAT
GGTAGCTTAGTGCGGTGGAAGCAGCTGAATAACCTTTACTGTGGCGTTCTTGGCTGGTGG
TCTCGGCCTCAAAGATGAAGAAACTGAAGTTGACGGCAAAAAGTTTAGACATAGGGTTAA
TTTTTTTTAGGTTAGACTTTAGGTTTACATTTCTAAACCCGGGTTTTGTTAACCGGAATT
TATTTGTAAACCAGAACTAAATTACTAAATAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A685TF U 1
AF RR2A685JQ C 63
BS 1 634 RR2A685TF

RD RR2A685TF 634 0 0
AGGGAACAGATCTCGTCACTTTCGTCGACAAAAAAAGAACAGACCTCGTCTTCCTTAGAG
AGAAGCAGAGAGAGAATATTGAAGAAATGGAGTTCAAGAATACGCGACGGCCGCTACCAT
GCATCGCTTGTCACCACCACCACCATCGCCATCTCTCCCATCCGCCATCACTCGTCACCA
CCACCATCGCTTGTTAGATCCGTCTTCACCGGAGTCGCCACCACCACCGTCATTTGCTTA
TCTCAGATCATCTATGGAGCAGGGAAGGAGAAGAAGTGGTGTTACAGAGCATTATCCGGT
TTAAAAAAGGCGGAGTAGCTAAAGAAGGTTGATGGTGGTTGTTTCGGCGTCAACCATGGT
GGTCTCGACGCCAACAGTGGTGGTCTCGACCCCAACAGTGGTGGTCTCGACGTCGTCAAT
GGTAGCTTAGTGCGGTGGAAGCAGCTGAATAACCTTTACTGTGGCGTTCTTGGCTGGTGG
TCTCGGCCTCAAAGATGAAGAAACTGAAGTTGACGGCAAAAAGTTTAGACATAGGGTTAA
TTTTTTTTAGGTTAGACTTTAGGTTTACATTTCTAAACCCGGGTTTTGTTAACCGGAATT
TATTTGTAAACCAGAACTAAATTACTAAATAAAA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2A685JQ 572 0 0
AAGCAGAGAGAGAATATTGAAGAAATGGAGTTCAAGAATACGCGACGGCCGCTACCATGC
ATCGCTTGTCACCACCACCACCATCGCCATCTCTCCCATCCGCCATCACTCGTCACCACC
ACCATCGCTTGTTAGATCCGTCTTCACCGGAGTCGCCACCACCACCGTCATTTGCTTATC
TCAGATCATCTATGGAGCAGGGAAGGAGAAGAAGTGGTGTTACAGAGCATTATCCGGTTT
AAAAAAGGCGGAGTAGCTAAAGAAGGTTGATGGTGGTTGTTTCGGCGTCAACCATGGTGG
TCTCGACGCCAACAGTGGTGGTCTCGACCCCAACAGTGGTGGTCTCGACGTCGTCAATGG
TAGCTTAGTGCGGTGGAAGCAGCTGAATAACCTTTACTGTGGCGTTCTTGGCTGGTGGTT
TCGGCCTCAAAGATGAAGAAACTGAAGTTGACGGCAAAAAGTTTAGACATAGGGTTAATT
TTTTTTAGGTTAGACTTTAGGTTTACATTTCTAAACCCGGGTTTTGTTAACCGGAATTTA
TTTGTAAACCAGAACTAAATTACTAAATAAAA

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL6028Contig1 606 2 1 U
GGGAGTCAACATGGCTGCCCTGGCAGCAAAAAAGCACGCAGTCCCATTTGTGGTTCTAGC
CGGTAGTCACAAGCTATGTCCACTGTATCCTCACAATCCGGAGGTATTACTAAACGAGCT
GAGATCTCCTTCTGAACTGTTGGATTTTGGCGACTTCTCTGATTGCCTTGATTTTGGATC
CGGTTCCGGGTCTCCCCTTCTTCAAGTTGTCAACCCAACCTTCGATTACGTCCCACCAAG
CCTCGTCAGTCTCTTCATTACCGACACGGGAGGACACATCCCATCTTACATGTACCGTCT
TATCGCTGACTACTACTCTGCCGATGATTTGGTGATGTAGCAAGCAATAACGACCAAGTT
CTTTGGTCATTTAGACCATACAACACTCGCTTGGTTGGGGTCATTCACAAAGTGGAAGGA
AAGATACATGTACATTGCACAAAACAGTTGCTCAATGGTAGTGAATGAGAAAAGAGAAAA
CTATCTTTTCGCGTCTGTGAAATTACTCTGGCCAAGTGTATTTTTGCCGTGTTCTACTTA
TACTTCTGCTCAATCTCAATACTCTCAATGGTGTTTATTGCTACCTTGATAAACCTTTCG
TCAACA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2AC66JQ C 1
AF RR2AC66TF U 1
BS 1 606 RR2AC66TF

RD RR2AC66JQ 606 0 0
GGGAGTCAACATGGCTGCCCTGGCAGCAAAAAAGCACGCAGTCCCATTTGTGGTTCTAGC
CGGTAGTCACAAGCTATGTCCACTGTATCCTCACAATCCGGAGGTATTACTAAACGAGCT
GAGATCTCCTTCTGAACTGTTGGATTTTGGCGACTTCTCTGATTGCCTTGATTTTGGATC
CGGTTCCGGGTCTCCCCTTCTTCAAGTTGTCAACCCAACCTTCGATTACGTCCCACCAAG
CCTCGTCAGTCTCTTCATTACCGACACGGGAGGACACATCCCATCTTACATGTACCGTCT
TATCGCTGACTACTACTCTGCCGATGATTTGGTGATGTAGCAAGCAATAACGACCAAGTT
CTTTGGTCATTTAGACCATACAACACTCGCTTGGTTGGGGTCATTCACAAAGTGGAAGGA
AAGATACATGTACATTGCACAAAACAGTTGCTCAATGGTAGTGAATGAGAAAAGAGAAAA
CTATCTTTTCGCGTCTGTGAAATTACTCTGGCCAAGTGTATTTTTGCCGTGTTCTACTTA
TACTTCTGCTCAATCTCAATACTCTCAATGGTGTTTATTGCTACCTTGATAAACCTTTCG
TCAACA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2AC66TF 606 0 0
GGGAGTCAACATGGCTGCCCTGGCAGCAAAAAAGCACGCAGTCCCATTTGTGGTTCTAGC
CGGTAGTCACAAGCTATGTCCACTGTATCCTCACAATCCGGAGGTATTACTAAACGAGCT
GAGATCTCCTTCTGAACTGTTGGATTTTGGCGACTTCTCTGATTGCCTTGATTTTGGATC
CGGTTCCGGGTCTCCCCTTCTTCAAGTTGTCAACCCAACCTTCGATTACGTCCCACCAAG
CCTCGTCAGTCTCTTCATTACCGACACGGGAGGACACATCCCATCTTACATGTACCGTCT
TATCGCTGACTACTACTCTGCCGATGATTTGGTGATGTAGCAAGCAATAACGACCAAGTT
CTTTGGTCATTTAGACCATACAACACTCGCTTGGTTGGGGTCATTCACAAAGTGGAAGGA
AAGATACATGTACATTGCACAAAACAGTTGCTCAATGGTAGTGAATGAGAAAAGAGAAAA
CTATCTTTTCGCGTCTGTGAAATTACTCTGGCCAAGTGTATTTTTGCCGTGTTCTACTTA
TACTTCTGCTCAATCTCAATACTCTCAATGGTGTTTATTGCTACCTTGATAAACCTTTCG
TCAACA

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL6029Contig1 848 2 4 U
TCTCGCTTCGCCCATTCACGTCGCCGGAAGAGAGGCGGTTTACAAAGTCATCCGAAGCTG
GGCCTCCAAAAAGTTCATGACAGGATGTGTCATTCTTCTTCCAATCGCCATCACATTCTA
CTTTACATGGTGGTTTATTCATTTCGTTGACGGTTTCTTCTCCCCAATCTACACTCATCT
CGGTATCAATATGTTCGGTCTTGGGTTTGTGACATCCATAACATTCATCTTTGTGGTTGG
TGTCTTCATGTCCTCATGGCTAGGAGCTTCATTTCTCAGCATTGGAGAATGCTTTATCAA
GAAAATGCCTCTTATCAGCTACATCTACTCAGCTTCTAAACAAATCAGCGGAGCTATCTC
CCCAGATCACAGCTCAGGTGCATTCAAGGAGGTAGCCATTATCAGGCATCCTCATAGGGG
AGAATACGCTTTTGGATTCATTACATCGACTGTGGTTCTCCGAGGCCGTGCTGGTGGAGA
AGAGCTCTGCTGTGTCTATGTCCCCACCAATCATCTTTACCTTGGAGACATTTTCCTCAT
TAGCTCAAAGGACATCATAAGGCCTAATCTCTCAGTCCGTGAAGGCATAGAAATAGTCAT
CTCTGGTGGCATGTCAATCCCAGAGGTACTAACAACGCTGGACGCAGAGACTATTCACAG
GACAGTAGCAGGAAGCTTTGCTATTCCACCAGTGTAAAGTCGATGAATCATAGTTTCTTT
TTTTTTCTTTTTAATCCGAAGGTTAAGTCTCCAGTGGAGCCTCTGATTTTAGGTGATTTT
CAACGTTTGTTAATCCAAGAATGTTGGAAAAGTTTTGAACTCGTTATGATATATGAGTGT
TTAAGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B631TF U 1
AF RR2B631JQ C 31
BS 1 671 RR2B631TF
BS 672 672 RR2B631JQ
BS 673 720 RR2B631TF
BS 721 848 RR2B631JQ

RD RR2B631TF 720 0 0
TCTCGCTTCGCCCATTCACGTCGCCGGAAGAGAGGCGGTTTACAAAGTCATCCGAAGCTG
GGCCTCCAAAAAGTTCATGACAGGATGTGTCATTCTTCTTCCAATCGCCATCACATTCTA
CTTTACATGGTGGTTTATTCATTTCGTTGACGGTTTCTTCTCCCCAATCTACACTCATCT
CGGTATCAATATGTTCGGTCTTGGGTTTGTGACATCCATAACATTCATCTTTGTGGTTGG
TGTCTTCATGTCCTCATGGCTAGGAGCTTCATTTCTCAGCATTGGAGAATGCTTTATCAA
GAAAATGCCTCTTATCAGCTACATCTACTCAGCTTCTAAACAAATCAGCGGAGCTATCTC
CCCAGATCACAGCTCAGGTGCATTCAAGGAGGTAGCCATTATCAGGCATCCTCATAGGGG
AGAATACGCTTTTGGATTCATTACATCGACTGTGGTTCTCCGAGGCCGTGCTGGTGGAGA
AGAGCTCTGCTGTGTCTATGTCCCCACCAATCATCTTTACCTTGGAGACATTTTCCTCAT
TAGCTCAAAGGACATCATAAGGCCTAATCTCTCAGTCCGTGAAGGCATAGAAATAGTCAT
CTCTGGTGGCATGTCAATCCCAGAGGTACTAACAACGCTGGACGCAGAGACTATTCACAG
GACAGTAGCAG*AAGCTTTGCTATTCCACCAGTGTAAAGTCGATGAATCATAGTTTCTTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2B631JQ 818 0 0
AGAGGCGGTTTACAAAGTCATCCGAAGCTGGGCCTCCAAAAAGTTCATGACAGGATGTGT
CATTCTTCTTCCAATCGCCATCACATTCTACTTTACATGGTGGTTTATTCATTTCGTTGA
CGGTTTCTTCTCCCCAATCTACACTCATCTCGGTATCAATATGTTCGGTCTTGGGTTTGT
GACATCCATAACATTCATCTTTGTGGTTGGTGTCTTCATGTCCTCATGGCTAGGAGCTTC
ATTTCTCAGCATTGGAGAATGCTTTATCAAGAAAATGCCTCTTATCAGCTACATCTACTC
AGCTTCTAAACAAATCAGCGGAGCTATCTCCCCAGATCACAGCTCAGGTGCATTCAAGGA
GGTAGCCATTATCAGGCATCCTCATAGGGGAGAATACGCTTTTGGATTCATTACATCGAC
TGTGGTTCTCCGAGGCCGTGCTGGTGGAGAAGAGCTCTGCTGTGTCTATGTCCCCACCAA
TCATCTTTACCTTGGAGACATTTTCCTCATTAGCTCAAAGGACATCATAAGGCCTAATCT
CTCAGTCCGTGAAGGCATAGAAATAGTCATCTCTGGTGGCATGTCAATCCCAGAGGTACT
AACAACGCTGGACGCAGAGACTATTCACAGGACAGTAGCAGGAAGCTTTGCTATTCCACC
AGTGTAAAGTCGATGAATCATAGTTTCTTTTTTTTTCTTTTTAATCCGAAGGTTAAGTCT
CCAGTGGAGCCTCTGATTTTAGGTGATTTTCAACGTTTGTTAATCCAAGAATGTTGGAAA
AGTTTTGAACTCGTTATGATATATGAGTGTTTAAGCCT

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL6030Contig1 610 2 1 U
GGATCTAGGGTTCCAAAAGGCGTATTGCTTATACCGTCAAAACAAGCTAGACGAGGCCTT
TGCGTGTTTAAGAGGCCGAGAGAGAGATTCCGAGACCTCGCTTTTGGAGGCTCAGATTCT
CTACCGCTTGGGGAAAACAGATGCTTGCGTGGGTGTGTATCAGACGCTCAAGGACTCCAA
GATTGAGACCGCAGAGGTCAATTTCGTGGCCGGATTGGTTTCAGCTGGTAAAGCTTCTCA
GGTGAAAGGAGCGGTGGAGTCTTGGAGGATCAAACCAACTAGTAGCTTTGAGTTGGCTTT
TAACACCGCTCGCTCTTTGATTGAGAACGGTAACTATACTGATGCAGAACAGCTTTTGCT
CACTGCCAGGAGGTATATATCACAGTTCATCATCATCTCTCTTTGTTTTCTCTGAGAATT
TGAGCTATAATGTTTCTTAGAATTGGTCATTCTCTGTATCTTCTAGGCAATCGTTCCTAC
TAGTAATTGCTAATAGGGCTGCCATTTGTAGATGAACACTGAACCTTGCTGTTTGGTCTC
AGTTTTTTCTTGTCTTAGCATCACTGCCAACTGTTTAGTCATAATATGATAAGTTTGAAA
GTGTAATCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FQ37JQ C 1
AF RR2FQ37TF U 1
BS 1 610 RR2FQ37TF

RD RR2FQ37JQ 610 0 0
GGATCTAGGGTTCCAAAAGGCGTATTGCTTATACCGTCAAAACAAGCTAGACGAGGCCTT
TGCGTGTTTAAGAGGCCGAGAGAGAGATTCCGAGACCTCGCTTTTGGAGGTTCAGATTCT
CTACCGCTTGGGGAAAACAGATGCTTGCGTGGGTGTGTATCAGACGCTCAAGGACTCCAA
GATTGAGACCGCAGAGGTCAATTTCGTGGCCGGATTGGTTTCAGCTGGTAAAGCTTCTCA
GGTGAAAGGAGCGGTGGAGTCTTGGAGGATCAAACCAACTAGTAGCTTTGAGTTGGCTTT
TAACACCGCTCGCTCTTTGATTGAGAACGGTAACTATACTGATGCAGAACAGCTTTTGCT
CACTGCCAGGAGGTATATATCACAGTTCATCATCATCTCTCTTTGTTTTTTCTGAGAATT
TGAGCTATAATGTTTCTTAGAATTGGTCATTCTCTGTATCTTCTAGGCAATCGTTCCTAC
TAGTAATTGCTAATAGGGCTGCCATTTGTAGATGAACACTGAACCTTGCTGTTTGGTCTC
AGTTTTTTCTTGTCTTAGCATCACTGCCAACTGTTTAGTCATAATATGATAAGTTTGAAA
GTGTAATCCC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2FQ37TF 610 0 0
GGATCTAGGGTTCCAAAAGGCGTATTGCTTATACCGTCAAAACAAGCTAGACGAGGCCTT
TGCGTGTTTAAGAGGCCGAGAGAGAGATTCCGAGACCTCGCTTTTGGAGGCTCAGATTCT
CTACCGCTTGGGGAAAACAGATGCTTGCGTGGGTGTGTATCAGACGCTCAAGGACTCCAA
GATTGAGACCGCAGAGGTCAATTTCGTGGCCGGATTGGTTTCAGCTGGTAAAGCTTCTCA
GGTGAAAGGAGCGGTGGAGTCTTGGAGGATCAAACCAACTAGTAGCTTTGAGTTGGCTTT
TAACACCGCTCGCTCTTTGATTGAGAACGGTAACTATACTGATGCAGAACAGCTTTTGCT
CACTGCCAGGAGGTATATATCACAGTTCATCATCATCTCTCTTTGTTTTCTCTGAGAATT
TGAGCTATAATGTTTCTTAGAATTGGTCATTCTCTGTATCTTCTAGGCAATCGTTCCTAC
TAGTAATTGCTAATAGGGCTGCCATTTGTAGATGAACACTGAACCTTGCTGTTTGGTCTC
AGTTTTTTCTTGTCTTAGCATCACTGCCAACTGTTTAGTCATAATATGATAAGTTTGAAA
GTGTAATCCC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL6031Contig1 1089 2 6 U
GCTACTACAAAGGAAGATGTACCTCCTCCTGTTAAGCCCCGGAGACCGAGGTCATTAAGG
AAGAGCTTCTCTGCGAACATAGAGTTCACTGAACTGACAACTCTCTACTCTGATGAGAGG
AATGAGAAACAACAGAACAGTGACGTTGATGAGGTGCCGGAGAACTTGGGGAACGAAGAG
TTTGAAGAAATTGAATCCGAGGCAGAAGAAGAAGTGAAACAAGTTGTGGAGGATCATGTC
AAAGAAGAAGAGGAAACTCTAGTAGTTGAGGAGGACATTGTTGATGAAAAGACTACACTA
CTCAGTGACAAAGCTGAGAACTCCTCAGAGGATGAAAACGTCACTTGCTTGAGGTCAATC
TCTCAGGTAGTAGACTTACCGGTGATGAACACTACTCTACCTTCACCGTTTCAGCATCAC
CACCACATTGCCTCGTTAATGGATTCACCTAGCGAGAGTCCTCTCTCGTGGAACTCAAAC
TTGCAACACGCTTTCTCTTATCCTCACGAGCATTCAGATGCTGATGCTTCGATGGATTAC
TCTCCCATGGGAAGTCCTGCTTCTTGGAGTTCGAGGATGAGAAAGAAATGGGGAACAACA
ACAACAGGTCAGAGTCCCACCATTGTTACAAACTCTTCACCGCTCCACTCTCGGAAGGAT
TTGGCAAAAGGGATCAAACGTTTGCTTAAGTTTGGGAAGAAAACTCGTGCTGCGGATAGT
CTGATGGACTGGGTCTCTGTAACCACATCTGAAGGTGACGATGATTTTGCTTATCGGTCA
TCGGATGAACTAAGGAAAACAAGAATGGCATCTTCTCAAAGTCAGCATTCTGAGGATGAA
CAAGGGAGCTTTAAAGCGAAAGATGGCGAGTTTAAGAAATCTTTCTTCTCACTCTCTACA
TTCCGTAACAAAGGAAACGACTCGTAGCCAAGATAACAGAAGAAGAAGGAAACAAAAACC
AATCTGTGTTTACCTTTTACAACAACACAAGTACAAAGTTTGTAATCTTGAAAGTGTTTG
ATATGATTTGAGTACATTATTGTTTGTTGATTTTCTTTAATATTTTAAATGAGATAAACA
TATTTTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ20TF U 1
AF RR2AM76TF U 411
BS 1 617 RR2DJ20TF
BS 618 618 RR2AM76TF
BS 619 620 RR2DJ20TF
BS 621 621 RR2AM76TF
BS 622 740 RR2DJ20TF
BS 741 1089 RR2AM76TF

RD RR2DJ20TF 740 0 0
GCTACTACAAAGGAAGATGTACCTCCTCCTGTTAAGCCCCGGAGACCGAGGTCATTAAGG
AAGAGCTTCTCTGCGAACATAGAGTTCACTGAACTGACAACTCTCTACTCTGATGAGAGG
AATGAGAAACAACAGAACAGTGACGTTGATGAGGTGCCGGAGAACTTGGGGAACGAAGAG
TTTGAAGAAATTGAATCCGAGGCAGAAGAAGAAGTGAAACAAGTTGTGGAGGATCATGTC
AAAGAAGAAGAGGAAACTCTAGTAGTTGAGGAGGACATTGTTGATGAAAAGACTACACTA
CTCAGTGACAAAGCTGAGAACTCCTCAGAGGATGAAAACGTCACTTGCTTGAGGTCAATC
TCTCAGGTAGTAGACTTACCGGTGATGAACACTACTCTACCTTCACCGTTTCAGCATCAC
CACCACATTGCCTCGTTAATGGATTCACCTAGCGAGAGTCCTCTCTCGTGGAACTCAAAC
TTGCAACACGCTTTCTCTTATCCTCACGAGCATTCAGATGCTGATGCTTCGATGGATTAC
TCTCCCATGGGAAGTCCTGCTTCTTGGAGTTCGAGGATGAGAAAGAAATGGGGAACAACA
ACAACAGGTCAGAGTCCTACTATTGTTACAAACTCTTCACCGCTCCACTCTCGGAAGGAT
TTGGCAAAAGGGATCAAACGTTTGCTTAAGTTTGGGAAGAAAACTCGTGCTGCGGATAGT
CTGATGGACTGGGTCTCTGT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2AM76TF 679 0 0
TCAGCATCACCACCACATTGCCTCGTTAATGGATTCACCTAGCGAGAGTCCTCTCTCGTG
GAACTCAAACTTGCAACACGCTTTCTCTTATCCTCACGAGCATTCAGATGCTGATGCTTC
GATGGATTACTCTCCCATGGGAAGTCCTGCTTCTTGGAGTTCGAGGATGAGAAAGAAATG
GGGAACAACCACAACAGGTCAGAGTCCCACCATTGTTTCAAACTCTTCACCGCTCCACTC
TCGGAAGGATTTGGCAAAAGGGATCAAACGTTTGCTTAAGTTTGGGAAGAAAACTCGTGC
TGCGGATAGTCTGATGGATTGGGTCTCTGTAACCACATCTGAAGGTGACGATGATTTTGC
TTATCGGTCATCGGATGAACTAAGGAAAACAAGAATGGCATCTTCTCAAAGTCAGCATTC
TGAGGATGAACAAGGGAGCTTTAAAGCGAAAGATGGCGAGTTTAAGAAATCTTTCTTCTC
ACTCTCTACATTCCGTAACAAAGGAAACGACTCGTAGCCAAGATAACAGAAGAAGAAGGA
AACAAAAACCAATCTGTGTTTACCTTTTACAACAACACAAGTACAAAGTTTGTAATCTTG
AAAGTGTTTGATATGATTTGAGTACATTATTGTTTGTTGATTTTCTTTAATATTTTAAAT
GAGATAAACATATTTTTGA

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL6032Contig1 843 2 2 U
GATGCTTTCCGAAGTTTCTAAACGTCTCGGGATCACAATCATTGGTGGCTCTATACCCGA
AAGAGTTGGTGATCATTTGTATAACACTTGCTGTGTCTTTGGCTCTGATGGTGAGCTCAA
AGCTAAGCATCGAAAGATACATTTATTTGATATAGACATTCCCGGGAAGATTACTTTCAT
GGAATCAAAAACTCTTACAGCCGGAGAGACGCCAACAATCGTTGACACAGATGTGGGGCG
TATTGGAATAGGCATCTGCTATGACATACGGTTCCAGGAGTTGGCTATGATATATGCTGC
CAGAGGGGCTCATTTACTGTGCTATCCAGGAGCATTTAACATGACAACTGGACCTCTGCA
TTGGGAATTACTACAAAGGGCGAGGGCTACGGATAATCAGTTATATGTAGCGACGTGCTC
GCCTGCTAGAGATTCAGGAGCTGGCTACACTGCTTGGGGACACTCTACACTCATCGGGCC
TTTTGGAGAAGTTCTAGCGACGACTGAGCATGAGGAAGCAATCATCATAGCAGAGATTGA
TTACTCTATTCTTGAACAACGAAGGACAAGTCTTCCACTGAATAAACAGCGGCGGGGAGA
TCTCTACCAGCTTGTAGACGTGCAGCGCCTGAACTCTAAATGAGTGCAGAGAGAGAGAGA
GTGTGTACATCTTGAGATGTTGTCTTTAGCTTTTGTTGAGTCTGAGAACTGTTTGGTTAC
TTGCAACTTCTTGACATGGTCATTTCTCTTCAAGTTTGTAGAGATGCAATAAATAAAAAC
TTGATGTTTGAGATTATATGGAACAAAATAAATAAACTTCTGGTCAAAGTTATTATCATC
TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2AD13TF U 1
AF RR2AD13JQ C 114
BS 1 718 RR2AD13TF
BS 719 843 RR2AD13JQ

RD RR2AD13TF 718 0 0
GATGCTTTCCGAAGTTTCTAAACGTCTCGGGATCACAATCATTGGTGGCTCTATACCCGA
AAGAGTTGGTGATCATTTGTATAACACTTGCTGTGTCTTTGGCTCTGATGGTGAGCTCAA
AGCTAAGCATCGAAAGATACATTTATTTGATATAGACATTCCCGGGAAGATTACTTTCAT
GGAATCAAAAACTCTTACAGCCGGAGAGACGCCAACAATCGTTGACACAGATGTGGGGCG
TATTGGAATAGGCATCTGCTATGACATACGGTTCCAGGAGTTGGCTATGATATATGCTGC
CAGAGGGGCTCATTTACTGTGCTATCCAGGAGCATTTAACATGACAACTGGACCTCTGCA
TTGGGAATTACTACAAAGGGCGAGGGCTACGGATAATCAGTTATATGTAGCGACGTGCTC
GCCTGCTAGAGATTCAGGAGCTGGCTACACTGCTTGGGGACACTCTACACTCATCGGGCC
TTTTGGAGAAGTTCTAGCGACGACTGAGCATGAGGAAGCAATCATCATAGCAGAGATTGA
TTACTCTATTCTTGAACAACGAAGGACAAGTCTTCCACTGAATAAACAGCGGCGGGGAGA
TCTCTACCAGCTTGTAGACGTGCAGCGCCTGAACTCTAAATGAGTGCAGAGAGAGAGAGA
GTGTGTACATCTTGAGATGTTGTCTTTAGCTTTTGTTGAGTCTGAGAACTGTTTGGTT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2AD13JQ 730 0 0
AGCTCAAAGCTAAGCATCGAAAGATACATTTATTTGATATAGACATTCCCGGGAAGATTA
CTTTCATGGAATCAAAAACTCTTACAGCCGGAGAGACGCCAACAATCGTTGACACAGATG
TGGGGCGTATTGGAATAGGCATCTGCTATGACATACGGTTCCAGGAGTTGGCTATGATAT
ATGCTGCCAGAGGGGCTCATTTACTGTGCTATCCAGGAGCATTTAACATGACAACTGGAC
CTCTGCATTGGGAATTACTACAAAGGGCGAGGGCTACGGATAATCAGTTATATGTAGCGA
CGTGCTCGCCTGCTAGAGATTCAGGAGCTGGCTACACTGCTTGGGGACACTCTACACTCA
TCGGGCCTTTTGGAGAAGTTCTAGCGACGACTGAGCATGAGGAAGCAATCATCATAGCAG
AGATTGATTACTCTATTCTTGAACAACGAAGGACAAGTCTTCCACTGAATAAACAGCGGC
GGGGAGATCTCTACCAGCTTGTAGACGTGCAGCGCCTGAACTCTAAATGAGTGCAGAGAG
AGAGAGAGTGTGTACATCTTGAGATGTTGTCTTTAGCTTTTGTTGAGTCTGAGAACTGTT
TGGTTACTTGCAACTTCTTGACATGGTCATTTCTCTTCAAGTTTGTAGAGATGCAATAAA
TAAAAACTTGATGTTTGAGATTATATGGAACAAAATAAATAAACTTCTGGTCAAAGTTAT
TATCATCTCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL6033Contig1 681 2 3 U
TCAGTACTAAAAGAAATTCAATATGGAGATCATAGTGACAAAAGATAAAACTACAAGTAC
TCTTTTCCGGTTCTATGCACCAACAAACCGGAATTTTATTAATCCCAAAATCTAACACCT
AAAACACATCCATCCAGCACCATCACTACCACCAGTTTCACTCAAGCTGAAAACTCAAAC
AGCATAGTGTGCTTGTACTTCTCACCAGCCTTAACTACAACACACGGGAAACTCTTCTGA
TTAATCGCGTTCGGGAACCCTTGCGTCTCAAGGCAGACACCTGCATGCTTCCCATAAACC
GCATTCCCTTTACCCACCACTCCATCCACATAGTTCCCCGTATAAAACTGCACACCAGGA
GCATCGGTCCACAAGTCCATCACCCTTGAGCTCTCACCGTCTCTAAGCCTCGCCACGTGT
TTCAGCCCGTCTTTCTCTTGATCAGGACAGTCCAACACGTAGTTGTGATCGTATCCAATC
CCCACCTCTCCTATACGCTCTCCTATCCGTTTCTCCTCGGTGAAATCGAAAGGAGTTCCT
TTTACTGGCAAGAGCTCTCCCGTAGGAACTGAGTGTTGTTGTTCTTGCTCTGATCCGCCA
TTAGAGAGATTGAAGTTCAAGTTAGGGTTAAGGATAAGAAGGAAGAGAAAGCCAAGTGAA
TTAGATTTTGTTGATATGTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F832JQ U 2
AF RR2F832TF C 1
BS 1 1 RR2F832TF
BS 2 606 RR2F832JQ
BS 607 681 RR2F832TF

RD RR2F832JQ 605 0 0
CAGTACTAAAAGAAATTCAATATGGAGATCATAGTGACAAAAGATAAAACTACAAGTACT
CTTTTCCGGTTCTATGCACCAACAAACCGGAATTTTATTAATCCCAAAATCTAACACCTA
AAACACATCCATCCAGCACCATCACTACCACCAGTTTCACTCAAGCTGAAAACTCAAACA
GCATAGTGTGCTTGTACTTCTCACCAGCCTTAACTACAACACACGGGAAACTCTTCTGAT
TAATCGCGTTCGGGAACCCTTGCGTCTCAAGGCAGACACCTGCATGCTTCCCATAAACCG
CATTCCCTTTACCCACCACTCCATCCACATAGTTCCCCGTATAAAACTGCACACCAGGAG
CATCGGTCCACAAGTCCATCACCCTTGAGCTCTCACCGTCTCTAAGCCTCGCCACGTGTT
TCAGCCCGTCTTTCTCTTGATCAGGACAGTCCAACACGTAGTTGTGATCGTATCCAATCC
CCACCTCTCCTATACGCTCTCCTATCCGTTTCTCCTCGGTGAAATCGAAAGGAGTTCCTT
TTACTGGCAAGAGCTCTCCCGTAGGAACTGAGTGTTGTTGTTCTTGCTCTGATCCGCCAT
TAGAG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RR2F832TF 681 0 0
TCAGTACTAAAAGAAATTCAATATGGAGATCATAGTGACAAAAGATAAAACTACAAGTAC
TCTTTTCCGGTTCTATGCACCAACAAACCGGAATTTTATTAATCCCAAAATCTAACACCT
AAAACACATCCATCCAGCACCATCACTACCACCAGTTTCACTCAAGCTGAAAACTCAAAC
AGCATAGTGTGCTTGTACTTCTCACCAGCCTTAACTACAACACACGGGAAACTCTTCTGA
TTAATCGCGTTCGGGAACCCTTGCGTCTCAAGGCAGACACCTGCATGCTTCCCATAAACC
GCATTCCCTTTACCCACCACTCCATCCACATAGTTCCCCGTATAAAACTGCACACCAGGA
GCATCGGTCCACAAGTCCATCACCCTTGAGCTCTCACCGTCTCTAAGCCTCGCCACGTGT
TTCAGCCCGTCTTTCTCTTGATCAGGACAGTCCAACACGTAGTTGTGATCGTATCCAATC
CCCACCTCTCCTATACGCTCTCCTATCCGTTTCTCCTCGGTGAAATCGAAAGGAGTTCCT
TTTACTGGCAAGAGCTCTCCCGTAGGAACTGAGTGTTGTTGTTCTTGCTCTGATCCGCCA
TTAGAGAGATTGAAGTTCAAGTTAGGGTTAAGGATAAGAAGGAAGAGAAAGCCAAGTGAA
TTAGATTTTGTTGATATGTCC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL6034Contig1 157 2 1 U
GACCGCCTAACATGAGAAATATCCTTTTGGAGAACCATTAACCAAGACAGAGAGCTTGGC
AGCGTCGAGGTGCTAAAGCACCTCTCCTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATGCTCGAGT
TACTAAACACCCCCTAGGGAGCCCCTCTCTGATAAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FP41JQ C 1
AF RR2FP41TF U 1
BS 1 157 RR2FP41TF

RD RR2FP41JQ 157 0 0
GACCGCCTAACATGAGAAATATCCTTTTGGAGAACCATTAACCAAGACAGAGAGCTTGGC
AGCGTCGAGGTGCTAAAGCACCTCTCCTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATGCTCGAGT
TACTAAACACCCCCTAGGGAGCCCCTCTCTGATAAGG

QA 1 157 1 157
DS 

RD RR2FP41TF 157 0 0
GACCGCCTAACATGAGAAATATCCTTTTGGAGAACCATTAACCAAGACAGAGAGCTTGGC
AGCGTCGAGGTGCTAAAGCACCTCTCCTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATGCTCGAGT
TACTAAACACCCCCTAGGGAGCCCCTCTCTGATAAGG

QA 1 157 1 157
DS 



AS 1 2

CO CL6035Contig1 714 2 15 U
GGGAGCAATTAGGGTTCTATAGTCCGATTCAGATGGATTTGATGGAGAAAAACTTGGAGT
TAGTCGAGGTTCAGAGACTGGAAGGCCACACCGACCGAGTTTGGAACGTAGCCTGGAACC
CTGTCTCTTCCTCTCTTCTAGCCTCTTGCAGTGGTGACAACACCGTTAGAATCTGGGAAC
AGTCCTCTCTCTCTCGCTCCTGGTCCTGCAAGACAGTTTTAGAAGAAACGCACACAAGAA
CTGTGAGGTCGTGTTCTTGGTCACCTTCTGGGAAGTTATTGGCCACTGCAAGCTTCGATG
GCACCACTGGTATTTGGGAAGACTTTGGGGATGAGTTTGAGTGTATTTCCACATTGGAGG
GACATGAAAACGAAGTCAAGAGCGTATCATGGAATGCATCTGGTTCATACCTTGCAACAT
GTAGCAGAGACAAATCTGTGTGGATTTGGGAAGTGCTAGGAGGGAATGAATATGATTGTG
CTGCAGTCTCGAATGGGCACACACAAGATGTGAAGATGGTTCAGTGGCATCCCACCATGG
ATGTTTTGTTTTCTTGCAGTTACGATAACACCATCAAAGTTTGGTGGGCTGAAGATGACG
ATGGCGATTATCAATGTGTCCAGACCTTAAATGAATCTAGCAATGGTCACTCCTCTACTG
TCTGGGCCATCTCGTTTAACGCTACAGGGACAAGTTGGTCACCTGTAGTGATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO74TF U 1
AF RR2HB54TF U 9
BS 1 110 RR2DO74TF
BS 111 111 RR2HB54TF
BS 112 142 RR2DO74TF
BS 143 143 RR2HB54TF
BS 144 290 RR2DO74TF
BS 291 291 RR2HB54TF
BS 292 295 RR2DO74TF
BS 296 296 RR2HB54TF
BS 297 388 RR2DO74TF
BS 389 389 RR2HB54TF
BS 390 499 RR2DO74TF
BS 500 500 RR2HB54TF
BS 501 604 RR2DO74TF
BS 605 605 RR2HB54TF
BS 606 714 RR2DO74TF

RD RR2DO74TF 714 0 0
GGGAGCAATTAGGGTTCTATAGTCCGATTCAGATGGATTTGATGGAGAAAAACTTGGAGT
TAGTCGAGGTTCAGAGACTGGAAGGCCACACCGACCGAGTTTGGAACGTATCCTGGAACC
CTGTCTCTTCCTCTCTTCTAGCTTCTTGCAGTGGTGACAACACCGTTAGAATCTGGGAAC
AGTCCTCTCTCTCTCGCTCCTGGTCCTGCAAGACAGTTTTAGAAGAAACGCACACAAGAA
CTGTGAGGTCGTGTTCTTGGTCACCTTCTGGGAAGTTATTGGCCACTGCAGGCTTTGATG
GCACCACTGGTATTTGGGAAGACTTTGGGGATGAGTTTGAGTGTATTTCCACATTGGAGG
GACATGAAAACGAAGTCAAGAGCGTATCGTGGAATGCATCTGGTTCATACCTTGCAACAT
GTAGCAGAGACAAATCTGTGTGGATTTGGGAAGTGCTAGGAGGGAATGAATATGATTGTG
CTGCAGTCTCGAATGGGCATACACAAGATGTGAAGATGGTTCAGTGGCATCCCACCATGG
ATGTTTTGTTTTCTTGCAGTTACGATAACACCATCAAAGTTTGGTGGGCTGAAGATGACG
ATGGTGATTATCAATGTGTCCAGACCTTAAATGAATCTAGCAATGGTCACTCCTCTACTG
TCTGGGCCATCTCGTTTAACGCTACAGGGACAAGTTGGTCACCTGTAGTGATGA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2HB54TF 684 0 0
GG
AGGGTTCTATAGTCCGATTCAGATGGATTTGATGGAGAAAAACTTGGAGTTAGTCGAGGT
TCAGAGACTGGAAGGCCACACCGACCGAGTTTGGAACGTGGCCTGGAACCCTGTCTCTTC
TTCTCTTCTAGCCTCTTGCAGTGGTGACAACACCGTTAGAATCTGGGAACAGTCCTCTCT
CTCTCGCTCCTGGTCCTGCAAGGCGGTTTTAGAAGAAACGCACACAAGAACTGTGAGGTC
GTGTTCTTGGTCACCTTCTGGGAAGTTATTGGCCACTGCAAGTTTCGATGGCACCACTGG
TATTTGGGAAGACTTTGGTGATGAGTTTGAGTGTATTTCCACTTTGGAGGGACATGAAAA
CGAAGTCAAGAGTGTTTCATGGAATGCATCTGGTTCATACCTTGCAACATGTAGCCGAGA
CAAATCTGTGTGGATTTGGGAAGTGCTAGGAGGGAATGAATATGATTGTGCTGCAGTCTT
GAATGGGCACACACAAGATGTGAAGATGGTTCAGTGGCATCCCACCATGGATGTTTTGTT
TTCTTGCAGTTATGATAACACCATCAAGGTTTGGTGGGCTGAAGATGACGATGGCGATTA
TCAATGTGTCCAGACCTTAAATGAATCTAGCAATGGTCACTCCTCTACTGTCTGGGCCAT
CTCGTTTAACGCTACAGGGACA

QA 3 684 3 684
DS 



AS 1 2

CO CL6036Contig1 606 2 2 U
GAAAATAAAAGTTTTCTTATTATTGACCAGTTTTTAAACTTATCCACCAACACTCTTTAT
GGGCTAAGAAGTAAAGAGAGTATGTCTGCAACAAAATCACCAAGGTGGTTGTTTTCTCAA
ACAAAGATTCAGAAGAGAATGGTCTTTGGGTTTATTAGAGAGTAGTGGAATCAACAAGGG
CTTCCGTAATCTTCTTCTCCAGTTCCTTTGGCTCGATCCACAGTGAGCTTTGCTCATGCA
ACAGCTTCTTTCTCGCTTTCTTCTTATCTTCCCTTTTTAGTCCCGTCATTCTCCAGAACT
CCAGCTTTTCCTCTCTTTCTTTCATCAAAGTCCTCCTGAACTCTTCCTCGAAAACCTTAC
GCTCCTCAGCTCTAACCTTAGCAGCCTCAGCTTTCAATCGCCGTCTCTCCTCATTAGCAG
CACGCTCGGCGAGCAGCCTCGCCTCGTCCTTACGCTGCTTCTCCACCCTAAGCATCTCGA
TCTCGTGAACGTAGTCTCTACGATACAGGCGCACTTTCTTCGCGTAGTCTCTCCTGATCC
GCGCGAGCAATCTCTCCGCGTCTTTGGGATCTTTGGGAGCCTCCCAGCTTCCGATGTAGC
TCTCCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2EL06TF C 1
AF RR2EL06JQ U 2
BS 1 1 RR2EL06TF
BS 2 606 RR2EL06JQ

RD RR2EL06TF 606 0 0
GAAAATAAAAGTTTTCTTATTATTGACCAGTTTTTAAACTTATCCACCAACACTCTTTAT
GGGCTAAGAAGTAAAGAGAGTATGTCTGCAACAAAATCACCAAGGTGGTTGTTTTCTCAA
ACAAAGATTCAGAAGAGAATGGTCTTTGGGTTTATTAGAGAGTAGTGGAATCAACAAGGG
CTTCCGTAATCTTCTTCTCCAGTTCCTTTGGCTCGATCCACAGTGAGCTTTGCTCATGCA
ACAGCTTCTTTCTCGCTTTCTTCTTATCTTCCCTTTTTAGTCCCGTCATTCTCCAGAACT
CCAGCTTTTCCTCTCTTTCTTTCATCAAAGTCCTCCTGAACTCTTCCTCGAAAACCTTAC
GCTCCTCAGCTCTAACCTTAGCAGCCTCAGCTTTCAATCGCCGTCTCTCCTCATTAGCAG
CACGCTCGGCGAGCAGCCTCGCCTCGTCCTTACGCTGCTTCTCCACCCTAAGCATCTCGA
TCTCGTGAACGTAGTCTCTACGATACAGGCGCACTTTCTTCGCGTAGTCTCTCCTGATCC
GCGCGAGCAATCTCTCCGCGTCTTTGGGATCTTTGGGAGCCTCCCAGCTTCCGATGTAGC
TCTCCC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2EL06JQ 605 0 0
AAAATAAAAGTTTTCTTATTATTGACCAGTTTTTAAACTTATCCACCAACACTCTTTATG
GGCTAAGAAGTAAAGAGAGTATGTCTGCAACAAAATCACCAAGGTGGTTGTTTTCTCAAA
CAAAGATTCAGAAGAGAATGGTCTTTGGGTTTATTAGAGAGTAGTGGAATCAACAAGGGC
TTCCGTAATCTTCTTCTCCAGTTCCTTTGGCTCGATCCACAGTGAGCTTTGCTCATGCAA
CAGCTTCTTTCTCGCTTTCTTCTTATCTTCCCTTTTTAGTCCCGTCATTCTCCAGAACTC
CAGCTTTTCCTCTCTTTCTTTCATCAAAGTCCTCCTGAACTCTTCCTCGAAAACCTTACG
CTCCTCAGCTCTAACCTTAGCAGCCTCAGCTTTCAATCGCCGTCTCTCCTCATTAGCAGC
ACGCTCGGCGAGCAGCCTCGCCTCGTCCTTACGCTGCTTCTCCACCCTAAGCATCTCGAT
CTCGTGAACGTAGTCTCTACGATACAGGCGCACTTTCTTCGCGTAGTCTCTCCTGATCCG
CGCGAGCAATCTCTCCGCGTCTTTGGGATCTTTGGGAGCCTCCCAGCTTCCGATGTAGCT
CTCCC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL6037Contig1 809 2 4 U
GGACTCAATCTCTCTTCTCTTCTGTATTACAATCAAAGAACGTAGATAAGATTAAACCAA
AACACTGTCTGAACAAAAAAACTTGTCTTTCTGTTTGAACCAAAATCAAGAACAATGGCT
TGCAGTAATCTAACAACAATGTGGGTTTCATCAAACGCATCTCTTTCCGATTCCTCTTCC
TTGTCCTTCCGTTCTGTTCTCAACCCACTTCCTCTCCCAAACCACAACCTCTCTCCTTCA
AGATCCTCCTCCGTTGCTCCAATCCAATCCTCCCTCCGTGAGCTCAGAGACCGTATCGAT
TCAGTCAAAAACACCCAGAAGATCACCGAAGCCATGAAGCTTGTCGCTGCCGCAAAAGTC
AGGAGAGCTCAAGAAGCCGTCGTCAATGGACGACCATTCTCCGAAACCCTAGTCGAAGTT
CTTGATGCTTTGTTGCCTTTGTATCTGAACAGTCAGATTCTTAGGGCGTTACAGGAGTCT
TTGGCGAGTGAGCTCGCGGCTCGGATGAGTGCGATGAGTAGTGCTTCGGATAATGCGTCG
GATCTTAAGAAGTCGCTTTCCAGGGTTTATAATAGAAAACGTCAAGCTAAGATTACTGGT
GAGATTCTTGAGATTGTTGCTGGAGCTAATGCACAGGCTTGATTCGATATGAGCAGGTTG
TTTTTTAAATATATATCATTTTCGGTCGTATAATGTATAATCGTCTAGACTCCTATGATT
TTTATATAATCATGCAATTACAAACATAATGCGGTCGTATTTATTTTGGTCTTTCATTGG
ATAAATGATTAAGAAAAAACTTCGTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H135TF U 1
AF RR2H135JQ C 71
BS 1 656 RR2H135TF
BS 657 657 RR2H135JQ
BS 658 764 RR2H135TF
BS 765 809 RR2H135JQ

RD RR2H135TF 764 0 0
GGACTCAATCTCTCTTCTCTTCTGTATTACAATCAAAGAACGTAGATAAGATTAAACCAA
AACACTGTCTGAACAAAAAAACTTGTCTTTCTGTTTGAACCAAAATCAAGAACAATGGCT
TGCAGTAATCTAACAACAATGTGGGTTTCATCAAACGCATCTCTTTCCGATTCCTCTTCC
TTGTCCTTCCGTTCTGTTCTCAACCCACTTCCTCTCCCAAACCACAACCTCTCTCCTTCA
AGATCCTCCTCCGTTGCTCCAATCCAATCCTCCCTCCGTGAGCTCAGAGACCGTATCGAT
TCAGTCAAAAACACCCAGAAGATCACCGAAGCCATGAAGCTTGTCGCTGCCGCAAAAGTC
AGGAGAGCTCAAGAAGCCGTCGTCAATGGACGACCATTCTCCGAAACCCTAGTCGAAGTT
CTTGATGCTTTGTTGCCTTTGTATCTGAACAGTCAGATTCTTAGGGCGTTACAGGAGTCT
TTGGCGAGTGAGCTCGCGGCTCGGATGAGTGCGATGAGTAGTGCTTCGGATAATGCGTCG
GATCTTAAGAAGTCGCTTTCCAGGGTTTATAATAGAAAACGTCAAGCTAAGATTACTGGT
GAGATTCTTGAGATTGTTGCTGGAGCTAATGCACAGGCTTGATTCGATATGAGCAG*TTG
TTTTTTAAATATATATCATTTTCGGTCGTATAATGTATAATCGTCTAGACTCCTATGATT
TTTATATAATCATGCAATTACAAACATAATGCGGTCGTATTTAT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2H135JQ 739 0 0
GAACAAAAAAACTTGTCTTTCTGTTTGAACCAAAATCAAGAACAATGGCTTGCAGTAATC
TAACAACAATGTGGGTTTCATCAAACGCATCTCTTTCCGATTCCTCTTCCTTGTCCTTCC
GTTCTGTTCTCAACCCACTTCCTCTCCCAAACCACAACCTCTCTCCTTCAAGATCCTCCT
CCGTTGCTCCAATCCAATCCTCCCTCCGTGAGCTCAGAGACCGTATCGATTCAGTCAAAA
ACACCCAGAAGATCACCGAAGCCATGAAGCTTGTCGCTGCCGCAAAAGTCAGGAGAGCTC
AAGAAGCCGTCGTCAATGGACGACCATTTTCCGAAACCCTAGTCGAAGTTCTTGATGCTT
TGTTGCCTTTGTATCTGAACAGTCAGATTCTTAGGGCGTTACAGGAGTCTTTGGCGAGTG
AGCTCGCGGCTCGGATGAGTGCGATGAGTAGTGCTTCGGATAATGCGTCGGATCTTAAGA
AGTCGCTTTCCAGGGTTTATAATAGAAAACGTCAAGCTAAGATTACTGGTGAGATTCTTG
AGATTGTTGCTGGAGCTAATGCACAGGCTTGATTCGATATGAGCAGGTTGTTTTTTAAAT
ATATATCATTTTCGGTCGTATAATGTATAATCGTCTAGACTCCTATGATTTTTATATAAT
CATGCAATTACAAACATAATGCGGTCGTATTTATTTTGGTCTTTCATTGGATAAATGATT
AAGAAAAAACTTCGTGATG

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL6038Contig1 855 2 2 U
GGACATAACTTTCATTTCTTCTCTGTATTAATCTTCTTTCCTACTTGGAGATTCACGAGT
CTGTCCGTCGATTCATTATATTCGGATCCATGACTAGCCGAAAAAACACACATTGGTGTA
GTACTTGCAGACGAGGAATCCGTCTTCTCCTTGAAGGCTCAAGAGGAGGGGTTTGCATTT
ACTGTGGTAACACTTTTCTTGAACGTCTCTATGAGAATGTTGAACTTAGCCCTTTTGATT
TTTTCGGAGTATCCAATGAACAATCTCGTAACCATCCTAGCAACAACAGAAGATTGATTC
TTGAAAACCAATCAAGTTTTCAAGAATTGTTTAACCGTTTCCCATCACAAAATCGCCGTG
GTCCACCTCCAGCTTCGCTAACCGTGATTAACTCAATGCCAAAGATCAAGATTAGGAAGA
AGCATCTTGGTTTCGATCCGTGTTGTCCGGTTTGCCAAGACCGGTTTGAAGTCGGATCGG
TTGCAAGAAAGTTGCCGTGTAAACATATCTACCATTCGGAATGCATAGTTCCCTGGCTAG
TACAGCGTAATACTTGTCCAGTGTGTCGCAAAGAGCTGCCACAAGACCGGAATAATGGCG
GGAAGAATCCTTTGTTTTATCTATGGCCGTTTAGCTCCTCTGGTTCGGCCTCAAACACCA
GCGGATCACCTTTTCATTGAGACGCTTGTATAGTTGTGTCTCAGTCCATAAGGCTCCAAT
CCATGAAATATGCAACTTCTTCTGATAAATTGTTGGTTTTTAAAAAAAATATATACGTTG
ATGTACAAAAGGGTTTTGGATGTTATTACGATTTGTATTTATATCGAACGTATTATTTAA
TTATTATTTTGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G012TF U 1
AF RR2G012JQ C 103
BS 1 708 RR2G012TF
BS 709 855 RR2G012JQ

RD RR2G012TF 708 0 0
GGACATAACTTTCATTTCTTCTCTGTATTAATCTTCTTTCCTACTTGGAGATTCACGAGT
CTGTCCGTCGATTCATTATATTCGGATCCATGACTAGCCGAAAAAACACACATTGGTGTA
GTACTTGCAGACGAGGAATCCGTCTTCTCCTTGAAGGCTCAAGAGGAGGGGTTTGCATTT
ACTGTGGTAACACTTTTCTTGAACGTCTCTATGAGAATGTTGAACTTAGCCCTTTTGATT
TTTTCGGAGTATCCAATGAACAATCTCGTAACCATCCTAGCAACAACAGAAGATTGATTC
TTGAAAACCAATCAAGTTTTCAAGAATTGTTTAACCGTTTCCCATCACAAAATCGCCGTG
GTCCACCTCCAGCTTCGCTAACCGTGATTAACTCAATGCCAAAGATCAAGATTAGGAAGA
AGCATCTTGGTTTCGATCCGTGTTGTCCGGTTTGCCAAGACCGGTTTGAAGTCGGATCGG
TTGCAAGAAAGTTGCCGTGTAAACATATCTACCATTCGGAATGCATAGTTCCCTGGCTAG
TACAGCGTAATACTTGTCCAGTGTGTCGCAAAGAGCTGCCACAAGACCGGAATAATGGCG
GGAAGAATCCTTTGTTTTATCTATGGCCGTTTAGCTCCTCTGGTTCGGCCTCAAACACCA
GCGGATCACCTTTTCATTGAGACGCTTGTATAGTTGTGTCTCAGTCCA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2G012JQ 753 0 0
AAAACACACATTGGTGTAGTACTTGCAGACGAGGAATCCGTCTTCTCCTTGAAGGCTCAA
GAGGAGGGGTTTGCATTTACTGTGGTAACACTTTTCTTGAACGTCTCTATGAGAATGTTG
AACTTAGCCCTTTTGATTTTTTCGGAGTATCCAATGAACAATCTCGTAACCATCCTAGCA
ACAACAGAAGATTGATTCTTGAAAACCAATCAAGTTTTCAAGAATTGTTTAACCGTTTCC
CATCACAAAATCGCCGTGGTCCACCTCCAGCTTCGCTAACCGTGATTAACTCAATGCCAA
AGATCAAGATTAGGAAGAAGCATCTTGGTTTCGATCCGTGTTGTCCGGTTTGCCAAGACC
GGTTTGAAGTCGGATCGGTTGCAAGAAAGTTGCCGTGTAAACATATCTACCATTCGGAAT
GCATAGTTCCCTGGCTAGTACAGCGTAATACTTGTCCAGTGTGTCGCAAAGAGCTGCCAC
AAGACCGGAATAATGGCGGGAAGAATCCTTTGTTTTATCTATGGCCGTTTAGCTCCTCTG
GTTCGGCCTCAAACACCAGCGGATCACCTTTTCATTGAGACGCTTGTATAGTTGTGTCTC
AGTCCATAAGGCTCCAATCCATGAAATATGCAACTTCTTCTGATAAATTGTTGGTTTTTA
AAAAAAATATATACGTTGATGTACAAAAGGGTTTTGGATGTTATTACGATTTGTATTTAT
ATCGAACGTATTATTTAATTATTATTTTGTACC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL6039Contig1 647 2 1 U
GGGTGCTGTTCTCTCTGTTCTCTCTCGAGGCGATTCATCTGCTTCTCTCCCTTCGTCGCG
TTCTCTCTCTGACGGCGCTTCGTTTGGCGTCTATCTCGACCGGCGTTAACTCTCGACAGT
GATTCCAAAGCGTCTCTCCCTTCCTCTCGACGGCGATTCGTTTGGCGTCTCTCCCTTCCT
TGCGTTCTCTCTCGACGGTAATTCCAAAGCCTCTTGGCCGTTTCGAATAAGGTAACACAA
GTAATGGGACTGGATTATAGCTACACACAACCTTCTGAATTGGAGGACTATGGTTTAAGA
AACTCAGCAGACAGTGGCTACAGCCAAACCGAAGCTGAGTTTGAAGCTGGTATACTGCTG
GACCAAGCTGAGATTGAAGCCCCGCGGGTTCAGTACCCTCCGTAGTCTGAGGTCGAGTTC
GGTTTTGTAAGACCCGAACCTGGATCCTAAGACCCAACTGATCCGCGGCCTTAACCTAAT
CATCTAAGTGCAATTGGCCGGTTCATGTCCATATATTTCTAAGTCGTTTTCAAGTGATCT
GAGGTTCATATACAATTCATAAGCAATGCGGAAGCTAAGATAAACATTCATTTTATTAAT
ATAAACCATGTGATCCATACAATGTAGTAATATCAATCAGTTTGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B881TF U 1
AF RR2B881JQ C 38
BS 1 647 RR2B881TF

RD RR2B881TF 647 0 0
GGGTGCTGTTCTCTCTGTTCTCTCTCGAGGCGATTCATCTGCTTCTCTCCCTTCGTCGCG
TTCTCTCTCTGACGGCGCTTCGTTTGGCGTCTATCTCGACCGGCGTTAACTCTCGACAGT
GATTCCAAAGCGTCTCTCCCTTCCTCTCGACGGCGATTCGTTTGGCGTCTCTCCCTTCCT
TGCGTTCTCTCTCGACGGTAATTCCAAAGCCTCTTGGCCGTTTCGAATAAGGTAACACAA
GTAATGGGACTGGATTATAGCTACACACAACCTTCTGAATTGGAGGACTATGGTTTAAGA
AACTCAGCAGACAGTGGCTACAGCCAAACCGAAGCTGAGTTTGAAGCTGGTATACTGCTG
GACCAAGCTGAGATTGAAGCCCCGCGGGTTCAGTACCCTCCGTAGTCTGAGGTCGAGTTC
GGTTTTGTAAGACCCGAACCTGGATCCTAAGACCCAACTGATCCGCGGCCTTAACCTAAT
CATCTAAGTGCAATTGGCCGGTTCATGTCCATATATTTCTAAGTCGTTTTCAAGTGATCT
GAGGTTCATATACAATTCATAAGCAATGCGGAAGCTAAGATAAACATTCATTTTATTAAT
ATAAACCATGTGATCCATACAATGTAGTAATATCAATCAGTTTGCAC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2B881JQ 610 0 0
TCTGCTTCTCTCCCTTCGTCGCGTTCTCTCTCTGACGGCGCTTCGTTTGGCGTCTATCTC
GACCGGCGTTAACTCTCGACAGTGATTCCAAAGCGTCTCTCCCTTCCTCTCGACGGCGAT
TCGTTTGGCGTCTCTCCCTTCCTTGCGTTCTCTCTCGACGGTAATTCCAAAGCCTCTTGG
CCGTTTCGAATAAGGTAACACAAGTAATGGGACTGGATTATAGCTACACACAACCTTCTG
AATTGGAGGACTATGGTTTAAGAAACTCAGCAGACAGTGGCTACAGCCAAACCGAAGCTG
AGTTTGAAGCTGGTATACTGCTGGACCAAGCTGAGATTGAAGCCCCGCGGGTTCAGTACC
CTCCGTAGTCTGAGGTCGAGTTCGGTTTTGTAAGACCCGAACCTGGATCCTAAGACCCAA
CTGATCCGCGGCCTTAACCTAATCATCTAAGTGCAATTGGCCGGTTCATGTCCATATATT
TTTAAGTCGTTTTCAAGTGATCTGAGGTTCATATACAATTCATAAGCAATGCGGAAGCTA
AGATAAACATTCATTTTATTAATATAAACCATGTGATCCATACAATGTAGTAATATCAAT
CAGTTTGCAC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL6040Contig1 529 2 1 U
GATACACACTTCCACTGCAAGCAGAAAGATAAGACGAAACAATATGTCTGTGTCAGCGAT
CTTTGGCACCGGAATCGCCACCGTGACTTCTTCTCCGGCTCTCCGTCAGTTTCAAGTTCC
GAAACTGGGGAACGGAGGAGGAGTCGGAGGAGGAATGGGGATGGTGATAGAGTGTTCGTC
GAGGCCGCAGAAGAAATCGACGGCTCATCACAGGAAGACGAGGCCGAAGAAGACGCAGCC
TTGGGACATTAAGAGAAAGCCCACCGTTTACGCTCCTCTTCCTCCTCTCCCTCCTGATTG
GTCTCCCCTCGCTCTTTCTTCCGACGACGGTGGTGCCACCGCCGCCGCCGCTGCCGGAGA
TTTGGTTTCAGGCGGTGCCGCCGCCTAGTTATGAGTTATCTACTGTTCGGGTGTTGGAAC
CTAGTTGAGAATTTGTGTCTGTGTCTGTTTAATGTTTTTCTGTTTCATGCTGTATGTTTC
TTCTTATGGACTTTGTTGTCTGAACGGTGAATGAATGGACCGAACTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EN51JQ C 1
AF RR2EN51TF U 1
BS 1 529 RR2EN51TF

RD RR2EN51JQ 529 0 0
GATACACACTTCCACTGCAAGCAGAAAGATAAGACGAAACAATATGTCTGTGTCAGCGAT
CTTTGGCACCGGAATCGCCACCGTGACTTCTTCTCCGGCTCTCCGTCAGTTTCAAGTTCC
GAAACTGGGGAACGGAGGAGGAGTCGGAGGAGGAATGGGGATGGTGATAGAGTGTTCGTC
GAGGCCGCAGAAGAAATCGACGGCTCATCACAGGAAGACGAGGCCGAAGAAGACGCAGCC
TTGGGACATTAAGAGAAAGCCCACCGTTTACGCTCCTCTTCCTCCTCTCCCTCCTGATTG
GTCTCCCCTCGCTCTTTCTTCCGACGACGGTGGTGCCACCGCCGCCGCCGCTGCCGGAGA
TTTGGTTTCAGGCGGTGCCGCCGCCTAGTTATGAGTTATCTACTGTTCGGGTGTTGGAAC
CTAGTTGAGAATTTGTGTCTGTGTCTGTTTAATGTTTTTCTGTTTCATGCTGTATGTTTC
TTCTTATGGACTTTGTTGTCTGAACGGTGAATGAATGGACCGAACTTTG

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2EN51TF 529 0 0
GATACACACTTCCACTGCAAGCAGAAAGATAAGACGAAACAATATGTCTGTGTCAGCGAT
CTTTGGCACCGGAATCGCCACCGTGACTTCTTCTCCGGCTCTCCGTCAGTTTCAAGTTCC
GAAACTGGGGAACGGAGGAGGAGTCGGAGGAGGAATGGGGATGGTGATAGAGTGTTCGTC
GAGGCCGCAGAAGAAATCGACGGCTCATCACAGGAAGACGAGGCCGAAGAAGACGCAGCC
TTGGGACATTAAGAGAAAGCCCACCGTTTACGCTCCTCTTCCTCCTCTCCCTCCTGATTG
GTCTCCCCTCGCTCTTTCTTCCGACGACGGTGGTGCCACCGCCGCCGCCGCTGCCGGAGA
TTTGGTTTCAGGCGGTGCCGCCGCCTAGTTATGAGTTATCTACTGTTCGGGTGTTGGAAC
CTAGTTGAGAATTTGTGTCTGTGTCTGTTTAATGTTTTTCTGTTTCATGCTGTATGTTTC
TTCTTATGGACTTTGTTGTCTGAACGGTGAATGAATGGACCGAACTTTG

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL6041Contig1 606 2 1 U
GGACCCACAAAACAAAACCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTAATGGAGGTTTCAGCGACAA
AGTCTTATTTTATTGAAGAAGAAGATGATCTGGGTTCTTCTTTATCGGAGATGGAAGCTG
GATTTTCTGGTAACAGTGGAAACCCACAACACGGCGTCGTTTCGAGACCTTTCTCTTATA
CGAGGATGAACAGTATCAACAAGAACACGAACTGTTGTTATAACAACTATCCTTGTTATT
ACCGACAATACTCTGTTTCGTCTCCGAGATCTGTTGTGTCCGGAAGATTCCATGACTTGA
GATTCGATAATCAGCCTCATTTCTTGGATTCGTGTTTCCTCTGCAAGAAACCACTTGGTG
ATAACAGAGACATCTACATGTACAGAGGAGACACACCGTTTTGCAGCGAAGAGTGTAGAC
AAGAACAGATAGAGAGATGAAGCAAAAGAGAAGAAAAAGAATCTGTCTCATTCTGTGAAA
TCAGCAATGAGGAGAAAAGAACAACGAAGCTCATCTTCGTCTCCTACTAGATCTCGTGAC
TATGCTTTTCACAACGGAACTGTTGCTGCTGCTTGAAATTCCGAATCTGATAATGAGTTT
GAGAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2E659JQ C 1
AF RR2E659TF U 1
BS 1 606 RR2E659TF

RD RR2E659JQ 606 0 0
GGACCCACAAAACAAAACCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTAATGGAGGTTTCAGCGACAA
AGTCTTATTTTATTGAAGAAGAAGATGATCTGGGTTCTTCTTTATCGGAGATGGAAGCTG
GATTTTCTGGTAACAGTGGAAACCCACAACACGGCGTCGTTTCGAGACCTTTCTCTTATA
CGAGGATGAACAGTATCAACAAGAACACGAACTGTTGTTATAACAACTATCCTTGTTATT
ACCGACAATACTCTGTTTCGTCTCCGAGATCTGTTGTGTCCGGAAGATTCCATGACTTGA
GATTCGATAATCAGCCTCATTTCTTGGATTCGTGTTTCCTCTGCAAGAAACCACTTGGTG
ATAACAGAGACATCTACATGTACAGAGGAGACACACCGTTTTGCAGCGAAGAGTGTAGAC
AAGAACAGATAGAGAGATGAAGCAAAAGAGAAGAAAAAGAATCTGTCTCATTCTGTGAAA
TCAGCAATGAGGAGAAAAGAACAACGAAGCTCATCTTCGTCTCCTACTAGATCTCGTGAC
TATGCTTTTCACAACGGAACTGTTGCTGCTGCTTGAAATTCCGAATCTGATAATGAGTTT
GAGAAT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2E659TF 606 0 0
GGACCCACAAAACAAAACCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTAATGGAGGTTTCAGCGACAA
AGTCTTATTTTATTGAAGAAGAAGATGATCTGGGTTCTTCTTTATCGGAGATGGAAGCTG
GATTTTCTGGTAACAGTGGAAACCCACAACACGGCGTCGTTTCGAGACCTTTCTCTTATA
CGAGGATGAACAGTATCAACAAGAACACGAACTGTTGTTATAACAACTATCCTTGTTATT
ACCGACAATACTCTGTTTCGTCTCCGAGATCTGTTGTGTCCGGAAGATTCCATGACTTGA
GATTCGATAATCAGCCTCATTTCTTGGATTCGTGTTTCCTCTGCAAGAAACCACTTGGTG
ATAACAGAGACATCTACATGTACAGAGGAGACACACCGTTTTGCAGCGAAGAGTGTAGAC
AAGAACAGATAGAGAGATGAAGCAAAAGAGAAGAAAAAGAATCTGTCTCATTCTGTGAAA
TCAGCAATGAGGAGAAAAGAACAACGAAGCTCATCTTCGTCTCCTACTAGATCTCGTGAC
TATGCTTTTCACAACGGAACTGTTGCTGCTGCTTGAAATTCCGAATCTGATAATGAGTTT
GAGAAT

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL6042Contig1 640 2 2 U
TAATAACTCAAATCTTGTCTACTTTCCTGTTATCAATATTACCGTTCTTTACCACTTTGA
GATTATGGCAAAGTGTTTTCTCACTCTCTTCTTGGTTCTTGCCCTAGCCTCAGTTTTTGC
TTCTGGAGCAAGAAACATCCCAGGAGGACTCTCCGACCAGAAGAACTACCTTGGATACGG
TGGCGGGTACTCCGGCATCGGAGACAACGGTTTACCTTTCGGTGGCGTCGGTGGAGGTGT
GGCTGGTCCCGGTGGTAACCTTGGTTTTGGTGGACTTGGTGGTGTTGGTGGAGGATTAGG
CGGTGGCTTAGGAAATGGGATAGGCGGTGGCTTAGGAAACGGGATAGGCGGTGGACTAGG
CGGTGGTGTTGGTTCCGGAGTCGGTGGAGGAAGTACCGGAGGAGTTCATTTCCCTTGAGT
AGTTGAGTTGTTAATTTTGGTTTAAGGATTCGTAAAGGTCCTTGAGCTAGGTCTAGCTTA
AGATGATGTCAGAGCAACAATAATAATCATGTCTTTTTTTTCAAAATTTCATTAGCTGTT
TACGTGCGTTTTAAGTTACTATGGTGTGATGGTGTCCTTAGAATCAGACTCGTGTCTTTG
TCGTGTCGTGGCTTGGTGCAATTTCAAATTCTATTTAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C796JQ C 1
AF RR2C796TF U 1
BS 1 606 RR2C796TF
BS 607 640 RR2C796JQ

RD RR2C796JQ 640 0 0
TAATAACTCAAATCTTGTCTACTTTCCTGTTATCAATATTACCGTTCTTTACCACTTTGA
GATTATGGCAAAGTGTTTTCTCACTCTCTTCTTGGTTCTTGCCCTAGCCTCAGTTTTTGC
TTCTGGAGCAAGAAACATCCCAGGAGGACTCTCCGACCAGAAGAACTACCTTGGATACGG
TGGCGGGTACTCCGGCATCGGAGACAACGGTTTACCTTTCGGTGGCGTCGGTGGAGGTGT
GGCTGGTCCCGGTGGTAACCTTGGTTTTGGTGGACTTGGTGGTGTTGGTGGAGGATTAGG
CGGTGGCTTAGGAAATGGGATAGGCGGTGGCTTAGGAAACGGGATAGGCGGTGGACTAGG
CGGTGGTGTTGGTTCCGGAGTCGGTGGAGGAAGTACCGGAGGAGTTCATTTCCCTTGAGT
AGTTGAGTTGTTAATTTTGGTTTAAGGATTCGTAAAGGTCCTTGAGCTAGGTCTAGCTTA
AGATGATGTCAGAGCAACAATAATAATCATGTCTTTTTTTTCAAAATTTCATTAGCTGTT
TACGTGCGTTTTAAGTTACTATGGTGTGATGGTGTCCTTAGAATCAGACTCGTGTCTTTG
TCGTGTCGTGGCTTGGTGCAATTTCAAATTCTATTTAACT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2C796TF 606 0 0
TAATAACTCAAATCTTGTCTACTTTCCTGTTATCAATATTACCGTTCTTTACCACTTTGA
GATTATGGCAAAGTGTTTTCTCACTCTCTTCTTGGTTCTTGCCCTAGCCTCAGTTTTTGC
TTCTGGAGCAAGAAACATCCCAGGAGGACTCTCCGACCAGAAGAACTACCTTGGATACGG
TGGCGGGTACTCCGGCATCGGAGACAACGGTTTACCTTTCGGTGGCGTCGGTGGAGGTGT
GGCTGGTCCCGGTGGTAACCTTGGTTTTGGTGGACTTGGTGGTGTTGGTGGAGGATTAGG
CGGTGGCTTAGGAAATGGGATAGGCGGTGGCTTAGGAAACGGGATAGGCGGTGGACTAGG
CGGTGGTGTTGGTTCCGGAGTCGGTGGAGGAAGTACCGGAGGAGTTCATTTCCCTTGAGT
AGTTGAGTTGTTAATTTTGGTTTAAGGATTCGTAAAGGTCCTTGAGCTAGGTCTAGCTTA
AGATGATGTCAGAGCAACAATAATAATCATGTCTTTTTTTTCAAAATTTCATTAGCTGTT
TACGTGCGTTTTAAGTTACTATGGTGTGATGGTGTCCTTAGAATCAGACTCGTGTCTTTG
TCGTGT

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL6043Contig1 798 2 4 U
GGAGAGATGTGACTTCAGAGCTAGGTGTTGCTAAAGAATTGCTTCAAAGAGTAGTAGCTC
AAGAGCAGAGTCATCACGAATTAGATGCGAGTAGTAGCAATGTGATTGTTGTGACTTCAG
AGCTAGGTGTTGCTAAGGAATCACTTCATAGAGTAGCTGAAGAGGAGAGTGAATTAATTA
AACTAATGGAGTCTCTTAAGCTCGAGCTTGAAAACGTGAAGAAAGAACATTCACAGCTTA
TAGAGAAAGAGAGAGAGCAAAGAGAAAGAGACCAAGCCATTGAGGAGCTGAGGAAGGAAG
CTGAAGATGCAAAGAGGGAGCTCCTGATGTTAGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCAGAAGATG
CCAAAGCAAAAGCTGTAGAGGAGGAATGTGTAAACGTTCACGAAAGTGGTGGTGGTGGTG
GAGGATTAACAGAGACGGAAGTGTTGAGAGCATGCAGAGACGGAACGCTAAAGAAACTAG
AGATGAGCGAGAAGGAGATTGAAGATATAAAAGCAGCAACACAAGAGGCGTTGAAGAAAG
CAGAGATGGCTGAGGAAGCAACAATTGTGGTGGACGCAGAGCTTAAAAGACGGCGTAAAG
CAGCTAGTAGGATCATGGCAGAATCCAAAATTTGTGCTAATAAGTCGTTCCCCTCTGCAA
AGGAAGTCCACAAGTCGAAAACGAGATCCAAAGAGACTTGTTTGGTCAAGTGTTAGGGAA
AAGGACCTGTGGTCTCTTTTGAAAATTTGTGACAATCTGTATTAACTCATACGTAATTAG
AAGAAATAAGTGTCACCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ92TF U 1
AF RR2GQ92JQ C 3
BS 1 610 RR2GQ92TF
BS 611 611 RR2GQ92JQ
BS 612 691 RR2GQ92TF
BS 692 798 RR2GQ92JQ

RD RR2GQ92TF 695 0 0
GGAGAGATGTGACTTCAGAGCTAGGTGTTGCTAAAGAATTGCTTCAAAGAGTAGTAGCTC
AAGAGCAGAGTCATCACGAATTAGATGCGAGTAGTAGCAATGTGATTGTTGTGACTTCAG
AGCTAGGTGTTGCTAAGGAATCACTTCATAGAGTAGCTGAAGAGGAGAGTGAATTAATTA
AACTAATGGAGTCTCTTAAGCTCGAGCTTGAAAACGTGAAGAAAGAACATTCACAGCTTA
TAGAGAAAGAGAGAGAGCAAAGAGAAAGAGACCAAGCCATTGAGGAGCTGAGGAAGGAAG
CTGAAGATGCAAAGAGGGAGCTCCTGATGTTAGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCAGAAGATG
CCAAAGCAAAAGCTGTAGAGGAGGAATGTGTAAACGTTCACGAAAGTGGTGGTGGTGGTG
GAGGATTAACAGAGACGGAAGTGTTGAGAGCATGCAGAGACGGAACGCTAAAGAAACTAG
AGATGAGCGAGAAGGAGATTGAAGATATAAAAGCAGCAACACAAGAGGCGTTGAAGAAAG
CAGAGATGGCTGAGGAAGCAACAATTGTGGTGGACGCAGAGCTTAAAAGACGGCGTAAAG
CAGCTAGTAG*ATCATGGCAGAATCCAAAATTTGTGCTAATAAGTCGTTCCCCTCTGCAA
AGGAAGTCCACAAGTCGAAAACGAGATCCAA
GAGA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2GQ92JQ 796 0 0
AGAGATGTGACTTCAGAGCTAGGTGTTGCTAAAGAATTGCTTCAAAGAGTAGTAGCTCAA
GAGCAGAGTCATCACGAATTAGATGCGAGTAGTAGCAATGTGATTGTTGTGACTTCAGAG
CTAGGTGTTGCTAAGGAATCACTTCATAGAGTAGCTGAAGAGGAGAGTGAATTAATTAAA
CTAATGGAGTCTCTTAAGCTCGAGCTTGAAAACGTGAAGAAAGAACATTCACAGCTTATA
GAGAAAGAGAGAGAGCAAAGAGAAAGAGACCAAGCCATTGAGGAGCTGAGGAAGGAAGCT
GAAGATGCAAAGAGGGAGCTCCTGATGTTAGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCAGAAGATGCC
AAAGCAAAAGCTGTAGAGGAGGAATGTGTAAACGTTCACGAAAGTGGTGGTGGTGGTGGA
GGATTAACAGAGACGGAAGTGTTGAGAGCATGCAGAGACGGAACGCTAAAGAAACTAGAG
ATGAGCGAGAAGGAGATTGAAGATATAAAAGCAGCAACACAAGAGGCGTTGAAGAAAGCA
GAGATGGCTGAGGAAGCAACAATTGTGGTGGACGCAGAGCTTAAAAGACGGCGTAAAGCA
GCTAGTAGGATCATGGCAGAATCCAAAATTTGTGCTAATAAGTCGTTCCCCTCTGCAAAG
GAAGTCCACAAGTCGAAAACGAGATCCAAAGAGACTTGTTTGGTCAAGTGTTAGGGAAAA
GGACCTGTGGTCTCTTTTGAAAATTTGTGACAATCTGTATTAACTCATACGTAATTAGAA
GAAATAAGTGTCACCC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL6044Contig1 697 2 4 U
GGCCTCAGCCAATGCTGAGTTTGTGTCACTTGTGGACATTGACTCCACAAGGCTCAAATC
TTTCTTCAGCGAGAACAAATCAGTGAAGGTTTGCTCGCTGCGGATGTGCAGGGATATAGA
CAACCTTTTCTTTGAAGTGGATGGAGAAAGTTTGGGATCAGTGGAGACGTTGTCGATTTC
AAACTTTCCATTGTTGGAGACTATCTGCTGGGGTGAAAACTTCAAGAATCTGAAGAAGCT
AAGCATAGATTGCTGCCCGAAAATCAAAACGCTTTTCCGGGAGGCATCACAGATGCCTAA
CAGCCTAGAAGAGCTGAACATAAAGTATTGTGAGAACATGGAGACAGTTGTTCAAGGAGT
GGAGCTCTCAAGTCTTACTAATTTGAGACCGCAAGTACAGAAATGCCCAAAGCTGGAGGA
AATGGTCGGAGGTCCTTGAGTGGTCTTGTACAAAATCTAGTCTCTTCTGAGGTTCATCTG
AGCATTTTACACTGCGTGTATTTGCAGGACTGGGTTATGGTAGATCACCCTTGAAGTATC
ATTACAAGGTTGAAGATGGAGCAACAAGATCTACTTACTTCGCACTAAGCATCTGAATCG
TTGCATGTAATGATTTACCTACCCTTTTTTTTTCTGCGTGCGTTTCTCAACTGTTGCGTG
TTAAATAACGACCGGCTTGAAACATCATATTAACCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C846TF U 1
AF RR2C846JQ C 82
BS 1 632 RR2C846TF
BS 633 633 RR2C846JQ
BS 634 688 RR2C846TF
BS 689 697 RR2C846JQ

RD RR2C846TF 688 0 0
GGCCTCAGCCAATGCTGAGTTTGTGTCACTTGTGGACATTGACTCCACAAGGCTCAAATC
TTTCTTCAGCGAGAACAAATCAGTGAAGGTTTGCTCGCTGCGGATGTGCAGGGATATAGA
CAACCTTTTCTTTGAAGTGGATGGAGAAAGTTTGGGATCAGTGGAGACGTTGTCGATTTC
AAACTTTCCATTGTTGGAGACTATCTGCTGGGGTGAAAACTTCAAGAATCTGAAGAAGCT
AAGCATAGATTGCTGCCCGAAAATCAAAACGCTTTTCCGGGAGGCATCACAGATGCCTAA
CAGCCTAGAAGAGCTGAACATAAAGTATTGTGAGAACATGGAGACAGTTGTTCAAGGAGT
GGAGCTCTCAAGTCTTACTAATTTGAGACCGCAAGTACAGAAATGCCCAAAGCTGGAGGA
AATGGTCGGAGGTCCTTGAGTGGTCTTGTACAAAATCTAGTCTCTTCTGAGGTTCATCTG
AGCATTTTACACTGCGTGTATTTGCAGGACTGGGTTATGGTAGATCACCCTTGAAGTATC
ATTACAAGGTTGAAGATGGAGCAACAAGATCTACTTACTTCGCACTAAGCATCTGAATCG
TTGCATGTAATGATTTACCTACCCTTTTTTTT*CTGCGTGCGTTTCTCAACTGTTGCGTG
TTAAATAACGACCGGCTTGAAACATCAT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2C846JQ 616 0 0
AGTGAAGGTTTGCTCGCTGCGGATGTGCAGGGATATAGACAACCTTTTCTTTGAAGTGGA
TGGAGAAAGTTTGGGATCAGTGGAGACGTTGTCGATTTCAAACTTTCCATTGTTGGAGAC
TATCTGCTGGGGTGAAAACTTCAAGAATCTGAAGAAGCTAAGCATAGATTGCTGCCCGAA
AATCAAAACGCTTTTCCGGGAGGCATCACAGATGCCTAACAGCCTAGAAGAGCTGAACAT
AAAGTATTGTGAGAACATGGAGACAGTTGTTCAAGGAGTGGAGCTCTCAAGTCTTACTAA
TTTGAGACCGCAAGTACAGAAATGCCCAAAGCTGGAGGAAATGGTCGGAGGTCCTTGAGT
GGTCTTGTACAAAATCTAGTCTCTTCTGAGGTTCATCTGAGCATTTTACACTGCGTGTAT
TTGCAGGACTGGGTTATGGTAGATCACCCTTGAAGTATCATTACAAGGTTGAAGATGGAG
CAACAAGATCTACTTACTTCGCACTAAGCATCTGAATCGTTGCATGTAATGATTTACCTA
CCCTTTTTTTTTCTGCGTGCGTTTCTCAACTGTTGCGTGTTAAATAACGACCGGCTTGAA
ACATCATATTAACCGG

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL6045Contig1 482 2 3 U
GGAAAACAGAAAAATTCGATTTACAGAGAAAAAAATGGAGTTTACGGCAGAGCAGCTCAG
CCAATACAACGGGACCGACTCATCGAAGCCGATCTACGTGGCGATCAAGGGCCGAGTATT
CGACGTCACCACCGGCAAATCCTTCTACGGTCCCGGAGGCGATTACGCGATGTTCGCGGG
AAAAGACGCGAGCAGAGCCCTGGGGAAGATGAGCAAGAACGAAGAAGACGTGTCTCCTTC
TCTCGAAGGTCTCACCGAGAAGGAGATGAGCACTCTTAATGATTGGGAGACGAAGTTTGA
AGCTAAGTATCCCGTCGTTGGCCGCGTTGTCTCCTAAGCTCAATCAAATTGTTCCGATCT
CTCTGGTTTGTAACTATGGTGTGTTAGGATCTGTGTGTTTGTGTTTGTGTGTTTCATGTT
TGATCTGATCGTTTGATGACGATTTGAGATATAATAATGTAATAAATTGCTGTTCCTTAC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2DT86TF U 62
AF RR2DT86JQ C 1
BS 1 61 RR2DT86JQ
BS 62 459 RR2DT86TF
BS 460 482 RR2DT86JQ

RD RR2DT86TF 398 0 0
CAATACAACGGGACCGACTCATCGAAGCCGATCTACGTGGCGATCAAGGGCCGAGTATTC
GACGTCACCACCGGCAAATCCTTCTACGGTCCCGGAGGCGATTACGCGATGTTCGCGGGA
AAAGACGCGAGCAGAGCCCTGGGGAAGATGAGCAAGAACGAAGAAGACGTGTCTCCTTCT
CTCGAAGGTCTCACCGAGAAGGAGATGAGCACTCTTAATGATTGGGAGACGAAGTTTGAA
GCTAAGTATCCCGTCGTTGGCCGCGTTGTCTCCTAAGCTCAATCAAATTGTTCCGATCTC
TCTGGTTTGTAACTATGGTGTGTTAGGATCTGTGTGTTTGTGTTTGTGTGTTTCATGTTT
GATCTGATCGTTTGATGACGATTTGAGATATAATAATG

QA 1 398 1 398
DS 

RD RR2DT86JQ 482 0 0
GGAAAACAGAAAAATTCGATTTACAGAGAAAAAAATGGAGTTTACGGCAGAGCAGCTCAG
CCAATACAACGGGACCGACTCATCGAAGCCGATCTACGTGGCGATCAAGGGCCGAGTATT
CGACGTCACCACCGGCAAATCCTTCTACGGTCCCGGAGGCGATTACGCGATGTTCGCGGG
AAAAGACGCGAGCAGAGCCCTGGGGAAGATGAGCAAGAACGAAGAAGACGTGTCTCCTTC
TCTCGAAGGTCTCACCGAGAAGGAGATGAGCACTCTTAATGATTGGGAGACGAAGTTTGA
AGCTAAGTATCCCGTCGTTGGCCGCGTTGTCTCCTAAGCTCAATCAAATTGTTCCGATCT
CTCTGGTTTGTAACTATGGTGTGTTAGGATCTGTGTGTTTGTGTTTGTGTGTTTCGTGTT
TGATCTGATCGTTTGATGACGATTTGAGATATAATAATGTAATAAATTGCTGTTCCTTAC
CC

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL6046Contig1 883 2 8 U
TCGTCAAGCTCAAGGTGATGAACGTCCCATGTGGATGCTGATATCGTCACTGCCATAACT
GGATCGCACGGTTCCTTTTCTTCTGTTTGATACCGATTGGATGGGTCGTGAGGTGTACGG
TGGAGACTCGAGCGGGAACGATGGTTTGAAGAAGCTTTACAACCAAGGAGTGCAAGCCGG
TGCGTTGGGACTGATGATAAATGCCATCGTTCTTGGATTCATGTCGCTTGGTATTGAATG
GATTAGTCGGATAATGGGAGGTGCTAAACGACTTTGGGGAGTTGTGAACTTTATTCTTGC
AGTGTGTTTGGCTATGACGGTTTTGGTTACAAAGTTGGCTGAAGCTCACAGGAAAACCGC
CGGTGAATTGGCCGGTCCGACCGATGGCATTAGAGCTGGTGCATTGACTCTCTTTGCTAT
TCTTGGTATTCCACTTGCTATTACGTTTAGTATTCCGTTTGCATTAGCTTCCATAATCTC
AAGCAATTCTGGCGCTGGTCAAGGGCTTTCACTGGGAGTTTTAAATTTGGCAATCGTGGT
ACCACAAATGGTGGTGTCGCTTGGAGCTGGACAGTTCGATTCGTGGTTCGGAGGTGGAAA
CCTACCAGCATTTGTGGTCGGAGCAATTGCAGCTGCAATCAGTGGTGTAGTGGCAATAAT
TGTTTTACCTTGACGAGATCTATCTGGTCATGTGGCAAGCTCTAATAATTCATGAGTGGA
TTACTTCATAAGACACTTTCGTCTTTTTATTTGCATCCTAAGACACATTATACTTGAGAA
GCACTTTCTCTTTCCCTAGTTGATTTTTGGACTTTTTTTCCCTTCCAAATAAAAGAAACT
AGTTGTGCTTTTGGTCTGTACGGAGTGGTTGCAGCTTTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV39JQ C 1
AF RR2C738TF U 277
BS 1 276 RR2CV39JQ
BS 277 637 RR2C738TF
BS 638 638 RR2CV39JQ
BS 639 673 RR2C738TF
BS 674 674 RR2CV39JQ
BS 675 771 RR2C738TF
BS 772 772 RR2CV39JQ
BS 773 883 RR2C738TF

RD RR2CV39JQ 849 0 0
TCGTCAAGCTCAAGGTGATGAACGTCCCATGTGGATGCTGATATCGTCACTGCCATAACT
GGATCGCACGGTTCCTTTTCTTCTGTTTGATACCGATTGGATGGGTCGTGAGGTGTACGG
TGGAGACTCGAGCGGGAACGATGGTTTGAAGAAGCTTTACAACCAAGGAGTGCAAGCCGG
TGCGTTGGGACTGATGATAAATGCCATCGTTCTTGGATTCATGTCGCTTGGTATTGAATG
GATTAGTCGGATAATGGGAGGTGCTAAACGACTTTGGGGAGTTGTGAACTTTATTCTTGC
AGTGTGTTTGGCTATGACGGTTTTGGTTACAAAGTTGGCTGAAGCTCACAGGAAAACCGC
CGGTGAATTGGCCGGTCCGACCGATGGCATTAGAGCTGGTGCATTGACTCTCTTTGCTAT
TCTTGGTATTCCACTTGCTATTACGTTTAGTATTCCGTTTGCATTAGCTTCCATAATCTC
AAGCAATTCTGGCGCTGGTCAAGGGCTTTCACTGGGAGTTTTAAATTTGGCAATCGTGGT
ACCACAAATGGTGGTGTCGCTTGGAGCTGGACAGTTCGATTCGTGGTTCGGAGGTGGAAA
CCTACCAGCATTTGTGGTCGGAGCAATTGCAGCTGCAATCAGTGGTGTAGTGGCAATAAT
TGTTTTACCTTGACTAGATCTGTCTGGTCATGTGGCAAGCTCTA*TAATTCATGAGTGGA
TTACTTCATAAGACACTTTCGTCTTTTTATTTGCATCCTAAGACACATTATACTTGAGAA
GCACTTTCTCTTTCCCTAGTTGATTTTTGGACTTTTTTTCCCTTCCAAATAAAAGAAACT
AGTTGTGCT

QA 1 849 1 849
DS 

RD RR2C738TF 607 0 0
GGGAGTTGTGAACTTTATTCTTGCAGTGTGTTTGGCTATGACGGTTTTGGTTACAAAGTT
GGCTGAAGCTCACAGGAAAACCGCCGGTGAATTGGCCGGTCCGACCGATGGCATTAGAGC
TGGTGCATTGACTCTCTTTGCTATTCTTGGTATTCCACTTGCTATTACGTTTAGTATTCC
GTTTGCATTAGCTTCCATAATCTCAAGCAATTCTGGCGCTGGTCAAGGGCTTTCACTGGG
AGTTTTAAATTTGGCAATCGTGGTACCACAAATGGTGGTGTCGCTTGGAGCTGGACAGTT
CGATTCGTGGTTCGGAGGTGGAAACCTACCAGCATTTGTGGTCGGAGCAATTGCAGCTGC
AGTCAGTGGTGTAGTGGCAATAATTGTTTTACCTTGAGGAGATCTATCTGGTCATGTGGC
AAGCTCTAATAATTCATGAGTGGATTACTTCATAAGACACTTTCGTCTTTTTATTTGCAT
CCTAAGACACATTATGCTTGAGAAGCACTTTCTCTTTCCCTAGTTGATTTTTGGACTTTT
TTTCCCTTCCAAATAAAAGAAACTAGTTGTGCTTTTGGTCTGTACGGAGTGGTTGCAGCT
TTTTCTT

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL6047Contig1 848 2 4 U
GGATCATCTGCTTAAAATCCACATCGCTTCGGACATTAGCTTAAAGTCTTTTCTCCTTCA
CCTACCATTCTTTCTATCTCACTCACTCTGCCTTTTTGTACCTCTCGACAGCGCCGGGGA
GAGAGAGAGAGTGTGTGAAATGACTTGGTCGGTCTTCAGATCCATAAACCCTCAAACGCT
CGACATCTCAGCCGCACTTCGCTCCAGTCGTAGCCCTTTGTTCGCCGCAGGTGCAGGCTG
CGCAACACTCGCTGGTGTTTCTCTCTTACGAATGTTGATCTCAAGGATGTGGCGACAGAC
ATTATAATGCTATCTTTCAGAACATCTAAAGGGCTTGAACTTAAGGAATTTGGAGAGGCT
TTTGGGAGAAAGGTAGTGGTGTTGATTACTCCTCCGTGGTGAAGACAACCATCATGCTTG
CTGACTTAGCCGACTTCAAGAAAGTGAACGAGATTTACGCCAAATACTTCCCAGCTCCTT
CTCCAGCAAGATCGACATATCAAGTCGCAGCTTTGCCACTAAACGCCAAGATTGAGATTG
AATGTATTGCAACACTCTAGAATACCATCAAATCTCATCCAGGAGGGTTTAGATTCGGAT
AATGTCAGAACAAATAAAAGAGGAAACCATGGTTAGGTGGGCTTATCATATATCAACCAT
TAGGTTGGTTGCAAAACCCCACTACCTTAATCAAGAATAAATGGTTTTATTTTAGGACCT
TCGTGTGCTGTTGACTTAATATGTATTAAGTACAATATTTGATTAGAATTCCTTAATGTT
TGAGGTTCATTGCTGGTGTTCAATTTAGTCAAAAGGTACTCCAGTTTATATGTTACAAGC
GTTAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY80TF U 1
AF RR2FY80JQ C 175
BS 1 662 RR2FY80TF
BS 663 663 RR2FY80JQ
BS 664 669 RR2FY80TF
BS 670 848 RR2FY80JQ

RD RR2FY80TF 669 0 0
GGATCATCTGCTTAAAATCCACATCGCTTCGGACATTAGCTTAAAGTCTTTTCTCCTTCA
CCTACCATTCTTTCTATCTCACTCACTCTGCCTTTTTGTACCTCTCGACAGCGCCGGGGA
GAGAGAGAGAGTGTGTGAAATGACTTGGTCGGTCTTCAGATCCATAAACCCTCAAACGCT
CGACATCTCAGCCGCACTTCGCTCCAGTCGTAGCCCTTTGTTCGCCGCAGGTGCAGGCTG
CGCAACACTCGCTGGTGTTTCTCTCTTACGAATGTTGATCTCAAGGATGTGGCGACAGAC
ATTATAATGCTATCTTTCAGAACATCTAAAGGGCTTGAACTTAAGGAATTTGGAGAGGCT
TTTGGGAGAAAGGTAGTGGTGTTGATTACTCCTCCGTGGTGAAGACAACCATCATGCTTG
CTGACTTAGCCGACTTCAAGAAAGTGAACGAGATTTACGCCAAATACTTCCCAGCTCCTT
CTCCAGCAAGATCGACATATCAAGTCGCAGCTTTGCCACTAAACGCCAAGATTGAGATTG
AATGTATTGCAACACTCTAGAATACCATCAAATCTCATCCAGGAGGGTTTAGATTCGGAT
AATGTCAGAACAAATAAAAGAGGAAACCATGGTTAGGTGGGCTTATCATATATCAACCAT
TATGTTGGT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2FY80JQ 674 0 0
AACGCTCGACATCTCAGCCGCACTTCGCTCCAGTCGTAGCCCTTTGTTCGCCGCAGGTGC
AGGCTGCGCAACACTCGCTGGTGTTTCTCTCTTACGAATGTTGATCTCAAGGATGTGGCG
ACAGACATTATAATGCTATCTTTCAGAACATCTAAAGGGCTTGAACTTAAGGAATTTGGA
GAGGCTTTTGGGAGAAAGGTAGTGGTGTTGATTACTCCTCCGTGGTGAAGACAACCATCA
TGCTTGCTGACTTAGCCGACTTCAAGAAAGTGAACGAGATTTACGCCAAATACTTCCCAG
CTCCTTTTCCAGCAAGATCGACATATCAAGTCGCAGCTTTGCCACTAAACGCCAAGATTG
AGATTGAATGTATTGCAACACTCTAGAATACCATCAAATTTCATCCAGGAGGGTTTAGAT
TCGGATAATGTCAGAACAAATAAAAGAGGAAACCATGGTTAGGTGGGCTTATCATATATC
AACCATTAGGTTGGTTGCAAAACCCCACTACCTTAATCAAGAATAAATGGTTTTATTTTA
GGACCTTCGTGTGCTGTTGACTTAATATGTATTAAGTACAATATTTGATTAGAATTCCTT
AATGTTTGAGGTTCATTGCTGGTGTTCAATTTAGTCAAAAGGTACTCCAGTTTATATGTT
ACAAGCGTTAAATT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL6048Contig1 1188 2 2 U
GGTCTCACCTTTCGACTCCCATCTCTTCCTTTTCTCATCTCTTCCAAACCGTTTCGAGTA
TTAACTTCTGGAGTCCGTTACAAGGATTATCTGCCTCCCTCTCTTCTCCCTATCTATAAA
TTGATACCATTTAATTGTCGAGAATTACTTCAAAGCAACACCCGACTCTTCCACTTCGTA
TTCACCGTCTCGGTTGCTCTCTTCCATGTAGATGATGGTATCGTGTTGTAATTTGGACAT
TCGAGTTTTGGATGAAAAATGTATGCAGGTAGTTCCACGAATCCCATTTTTGCTTCTTTT
GTTTTTTGAATGATATTTTTATTGGTCGGTAATATTGAGCTTCGAACATTATCAGGTCTC
AATACAAAGACAGCTAGACAATCTGGATCTCCAAAGCTAATGAGGGCTCCTTGATTGTGT
TGTTGGCCATCTGGAATCTCAGTTGATTATATTAGTTGCTTTGAAGATTGCAGGGCGCCT
TCATGAAACCGCTCTAGATGCTGCCACTAGAGGGAACCGATACATCCACTCTTGCCTCAG
GTACTTCAATAATGATCTCAATGTTAGTCTTATCTGGACAGAGAAAACACTGCCTATTTA
CCAAATAATTTTGCTTCATATGGTTCCTTAATATGGTTCTTTGCGTGTCAACCATGCGGT
TGAATGTTGTACACAAGGAGAGAAATAAATACCATGCTTAGGTTATCTAGCGGAGATAAC
AATAGTGAGTCTCACAATAACATTTTCCTTTGGAAGTCACTGAATTATTTTTTGCTAACC
TCCCTTACATGACAATGTTTTCTATATATAGAGGAAGACAACCGTTAGGATCACAAGCCA
AAGATCCAAATCTGAATACTAGGTCAGAGATCCAACCAGATTCAGACAAGGCCAGCCAGA
GTTTGGTTCTTGGCTCATGCTTGGAGGCAGCACACAGAGGAACAACGAAAATAATTCTTT
TACTGGACACTAGACAACATTCAAGATTTTTTTCGACAAAGAGGAATGTGTAGAGTAATT
GAGCGAATCTCAAATATGTCGAAGAGATTTTCAATGCAACCATCGTGAAGGATGTTGTGG
TTTACAATGCAATGGTTGAGGTTGTAAGCCGATCAGTTGAAACTATATTTTGTGTGGGGA
ATAAGAGAATAAAAGGAAATATTTACAAAAGGTGATGATTAATAAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO24TF U 1
AF RR2CO24JQ C 486
BS 1 650 RR2CO24TF
BS 651 1188 RR2CO24JQ

RD RR2CO24TF 650 0 0
GGTCTCACCTTTCGACTCCCATCTCTTCCTTTTCTCATCTCTTCCAAACCGTTTCGAGTA
TTAACTTCTGGAGTCCGTTACAAGGATTATCTGCCTCCCTCTCTTCTCCCTATCTATAAA
TTGATACCATTTAATTGTCGAGAATTACTTCAAAGCAACACCCGACTCTTCCACTTCGTA
TTCACCGTCTCGGTTGCTCTCTTCCATGTAGATGATGGTATCGTGTTGTAATTTGGACAT
TCGAGTTTTGGATGAAAAATGTATGCAGGTAGTTCCACGAATCCCATTTTTGCTTCTTTT
GTTTTTTGAATGATATTTTTATTGGTCGGTAATATTGAGCTTCGAACATTATCAGGTCTC
AATACAAAGACAGCTAGACAATCTGGATCTCCAAAGCTAATGAGGGCTCCTTGATTGTGT
TGTTGGCCATCTGGAATCTCAGTTGATTATATTAGTTGCTTTGAAGATTGCAGGGCGCCT
TCATGAAACCGCTCTAGATGCTGCCACTAGAGGGAACCGATACATCCACTCTTGCCTCAG
GTACTTCAATAATGATCTCAATGTTAGTCTTATCTGGACAGAGAAAACACTGCCTATTTA
CCAAATAATTTTGCTTCATATGGTTCCTTAATATGGTTCTTTGCGTGTCA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2CO24JQ 703 0 0
AAACCGCTCTAGATGCTGCCACTAGAGGGAACCGATACATCCACTCTTGCCTCAGGTACT
TCAATAATGATCTCAATGTTAGTCTTATCTGGACAGAGAAAACACTGCCTATTTACCAAA
TAATTTTGCTTCATATGGTTCCTTAATATGGTTCTTTGCGTGTCAACCATGCGGTTGAAT
GTTGTACACAAGGAGAGAAATAAATACCATGCTTAGGTTATCTAGCGGAGATAACAATAG
TGAGTCTCACAATAACATTTTCCTTTGGAAGTCACTGAATTATTTTTTGCTAACCTCCCT
TACATGACAATGTTTTCTATATATAGAGGAAGACAACCGTTAGGATCACAAGCCAAAGAT
CCAAATCTGAATACTAGGTCAGAGATCCAACCAGATTCAGACAAGGCCAGCCAGAGTTTG
GTTCTTGGCTCATGCTTGGAGGCAGCACACAGAGGAACAACGAAAATAATTCTTTTACTG
GACACTAGACAACATTCAAGATTTTTTTCGACAAAGAGGAATGTGTAGAGTAATTGAGCG
AATCTCAAATATGTCGAAGAGATTTTCAATGCAACCATCGTGAAGGATGTTGTGGTTTAC
AATGCAATGGTTGAGGTTGTAAGCCGATCAGTTGAAACTATATTTTGTGTGGGGAATAAG
AGAATAAAAGGAAATATTTACAAAAGGTGATGATTAATAAACA

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL6049Contig1 904 2 4 U
TAGTTTATCAATTTTGATTTGTTTCTGGCCATTGATTCTTTGTTCTGTTTCTGGGATGGA
TCAAATCCGTCGGGAGCGCGAAGAGGAAGTTCGAATCGCCGCCATGAATCCAGCAAATGC
GACGGCGACCGAAGCCGAAGGTGGAGGAAACGGCGACGAGTACGAGGTGGGGAAGATGTA
CGAGGTGAAGCTGACGACTGGAATCGAGATCAAGGGGATCGTCTTGGCATACGACTCTGA
TCAACACGTCGTCATCTTCCAAGAAGGAACGGCGCCGGAAACCGGTAAATCGATGGCAAA
GATCGGCGATTTTATTAGAGCTTGGCGAACGGAATCAATGGCGGAAACTGCTATTGAACT
TGGCAATGAACTGAATATCTGGCGAGACTGTAAAATGCAGTGGCACAAGAAGCTTCAATG
GAATATTGTATTTCATTGCCATTTTCTGCAGGTGCTCGTAACATCATCGTTGTTTCTGCA
CCATCTGCCAAAGAACTTCTGGAGAAGATGGATGTACCTGCAACAACTACATCTTGAGAG
CGTCATTATTTGGATCAATTGTTTGGTTCTTGTTGATAATGAAATGCTTGTGACATGACT
CCAGCCTGTGATGATTGGTTTGTACAGAGCCTGGATATGAGTTTGACAAGGCTTCTTTGT
TGGAATACAACCACATGAGCTTTGGGGGACCTCCGGTTAAAACAGAGACTAGTGAAGAGG
AAGATGAGCTTGTGCGCCATGATGAAAACGAATCGAAGATTGGTAGGTTTTGTTCTGCTT
TATTTACATAGCAAACGAGACTCTTGTTTGGATTGGCTCATAGAAATTTCCCATCTTTTA
AACATGTAATTGACGACAAACGAGACTCTTGTTTGGATTGGCTCAAAATAATTTGCTAAG
ATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2D956TF U 1
AF RR2D956JQ C 139
BS 1 697 RR2D956TF
BS 698 698 RR2D956JQ
BS 699 747 RR2D956TF
BS 748 904 RR2D956JQ

RD RR2D956TF 753 0 0
TAGTTTATCAATTTTGATTTGTTTCTGGCCATTGATTCTTTGTTCTGTTTCTGGGATGGA
TCAAATCCGTCGGGAGCGCGAAGAGGAAGTTCGAATCGCCGCCATGAATCCAGCAAATGC
GACGGCGACCGAAGCCGAAGGTGGAGGAAACGGCGACGAGTACGAGGTGGGGAAGATGTA
CGAGGTGAAGCTGACGACTGGAATCGAGATCAAGGGGATCGTCTTGGCATACGACTCTGA
TCAACACGTCGTCATCTTCCAAGAAGGAACGGCGCCGGAAACCGGTAAATCGATGGCAAA
GATCGGCGATTTTATTAGAGCTTGGCGAACGGAATCAATGGCGGAAACTGCTATTGAACT
TGGCAATGAACTGAATATCTGGCGAGACTGTAAAATGCAGTGGCACAAGAAGCTTCAATG
GAATATTGTATTTCATTGCCATTTTCTGCAGGTGCTCGTAACATCATCGTTGTTTCTGCA
CCATCTGCCAAAGAACTTCTGGAGAAGATGGATGTACCTGCAACAACTACATCTTGAGAG
CGTCATTATTTGGATCAATTGTTTGGTTCTTGTTGATAATGAAATGCTTGTGACATGACT
CCAGCCTGTGATGATTGGTTTGTACAGAGCCTGGATATGAGTTTGACAAGGCTTCTTTGT
TGGAATACAACCACATGAGCTTTGGGGGACCTCCGGT*AAAACAGAGACTAGTGAAGAGG
AAGATGAGCTTGTGCGCCATGATGAAA
CGATCG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2D956JQ 766 0 0
AGGTGGAGGAAACGGCGACGAGTACGAGGTGGGGAAGATGTACGAGGTGAAGCTGACGAC
TGGAATCGAGATCAAGGGGATCGTCTTGGCATACGACTCTGATCAACACGTCGTCATCTT
CCAAGAAGGAACGGCGCCGGAAACCGGTAAATCGATGGCAAAGATCGGCGATTTTATTAG
AGCTTGGCGAACGGAATCAATGGCGGAAACTGCTATTGAACTTGGCAATGAACTGAATAT
CTGGCGAGACTGTAAAATGCAGTGGCACAAGAAGCTTCAATGGAATATTGTATTTCATTG
CCATTTTCTGCAGGTGCTCGTAACATCATCGTTGTTTCTGCACCATCTGCCAAAGAACTT
CTGGAGAAGATGGATGTACCTGCAACAACTACATCTTGAGAGCGTCATTATTTGGATCAA
TTGTTTGGTTCTTGTTGATAATGAAATGCTTGTGACATGACTCCAGCCTGTGATGATTGG
TTTGTACAGAGCCTGGATATGAGTTTGACAAGGCTTCTTTGTTGGAATACAACCACATGA
GCTTTGGGGGACCTCCGGTTAAAACAGAGACTAGTGAAGAGGAAGATGAGCTTGTGCGCC
ATGATGAAAACGAATCGAAGATTGGTAGGTTTTGTTCTGCTTTATTTACATAGCAAACGA
GACTCTTGTTTGGATTGGCTCATAGAAATTTCCCATCTTTTAAACATGTAATTGACGACA
AACGAGACTCTTGTTTGGATTGGCTCAAAATAATTTGCTAAGATAC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL6050Contig1 570 2 2 U
GGAGGCCAATTTCGATTTCTGAGAGACGGAAGGAAGATCGGGGAAGGAGGGAGAGCAAGA
TGATGACGGGCGGGAGCTACACGACTATTGACAGCCAGAAAGTCTCTGGATCTGTACCTT
CCGTTCCAGATCCAGGCCATACCACCGTCAAATTCGCAGAGTCAAATCTTCAAACCTTTC
CTCCTTCTGCTACTCAGGGCAAGATCTCTGGAGGTAGTAATCCTCCTCGAGATGCTGACG
ATACATTTTCTGGTCATGGTAATGGTAGTACCGATGAACCTCAAAGCGCATATCAATTCA
GCTGGAGAGAGATCGATCCTGATAATCGCAAGCATCTTTCTTTTGCAGCTCGGGCTTGCG
GTTGTTTTGAAGCTCTATCTGTTCACTGTCACCGTATGACTCAGTAATTTTTAGATCCAT
CCATAAACGTTTTCTCCTACTCAAATTTTAATCAAAATTTTGAACTGTTTGGAAACTGAA
CTCTATGATTCCATTTCATTTAGTTACTTGAACCTTCCATGGTCTACTTGTAGAAAATAG
TGTAATAAAAGTATATCGATTTGTTTGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CM32JQ C 1
AF RR2CM32TF U 19
BS 1 18 RR2CM32JQ
BS 19 570 RR2CM32TF

RD RR2CM32JQ 570 0 0
GGAGGCCAATTTCGATTTCTGAGAGACGGAAGGAAGATCGGGGAAGGAGGGAGAGCAAGA
TGATGACGGGCGGGAGCTACACGACTATTGACAGCCAGAAAGTCTCTGGATCTGTACCTT
CCGTTCCAGATCCAGGCCATACCACCGTCAAATTCGCAGAGTCAAATCTTCAAACCTTTC
CTCCTTTTGCTACTCAGGGCAAGATCTCTGGAGGTAGTAATCCTCCTCGAGATGCTGACG
ATACATTTTCTGGTCATGGTAATGGTAGTACCGATGAACCTCAAAGCGCATATCAATTCA
GCTGGAGAGAGATCGATCCTGATAATCGCAAGCATCTTTCTTTTGCAGCTCGGGCTTGCG
GTTGTTTTGAAGCTCTATCTGTTCACTGTCACCGTATGACTCAGTAATTTTTAGATCCAT
CCATAAACGTTTTCTCCTACTCAAATTTTAATCAAAATTTTGAACTGTTTGGAAACTGAA
CTCTATGATTCCATTTCATTTAGTTACTTGAACCTTCCATGGTCTACTTGTAGAAAATAG
TGTAATAAAAGTATATCGATTTGTTTGCCG

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2CM32TF 552 0 0
CTGAGAGACGGAAGGAAGATCGGGGAAGGAGGGAGAGCAAGATGATGACGGGCGGGAGCT
ACACGACTATTGACAGCCAGAAAGTCTCTGGATCTGTACCTTCCGTTCCAGATCCAGGCC
ATACCACCGTCAAATTCGCAGAGTCAAATCTTCAAACCTTTCCTCCTTCTGCTACTCAGG
GCAAGATCTCTGGAGGTAGTAATCCTCCTCGAGATGCTGACGATACATTTTCTGGTCATG
GTAATGGTAGTACCGATGAACCTCAAAGCGCATATCAATTCAGCTGGAGAGAGATCGATC
CTGATAATCGCAAGCATCTTTCTTTTGCAGCTCGGGCTTGCGGTTGTTTTGAAGCTCTAT
CTGTTCACTGTCACCGTATGACTCAGTAATTTTTAGATCCATCCATAAACGTTTTCTCCT
ACTCAAATTTTAATCAAAATTTTGAACTGTTTGGAAACTGAACTCTATGATTCCATTTCA
TTTAGTTACTTGAACCTTCCATGGTCTACTTGTAGAAAATAGTGTAATAAAAGTATATCG
ATTTGTTTGCCG

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL6051Contig1 854 2 2 U
GTGAGAGAAGAAGACTATCCATACACCGGAAAGGATGTTGTTGTTTCGGGCCTGGGGATT
ACGGGCCTTGGGCTTACGGGCCGTAAAACTCATATACTTAGTTCAGGTTGCTTACTTCAA
ATGGTTATCTATACAATCCACAATGGTTTCATGGTCATGTGATTCTAAATATTAATTTAC
TAATAATATATGTGAATTTCTGCTAATAAGTGTAGATATGTCTTTATGCAGTGTGACCCA
GAAGAAGCAGGTTCATGCGACTCTGGTTGCAACGGTGGCCTCATGAACAGCGCATTCGAA
TACACACTCAAAACCGGAGGGCTCATGAGAGAAGAAGACTATCCATCTCCATCGATGGAG
ACCAGATCGCTGCGAACCTTGTCAAGAACGGACCTCTTGCGGTGGCCATCAACGCCGCAT
ATATGCAGACTTACATCGGAGGAGTCTCGTGCCCTTACGTGTGCATGAGGAGGCTCAACC
ACGGTGTCTTATTGGTAGGTTATGGATCGGCTGGTTACGCTCCCGCTAGGTTCAAGGAGA
AGCCTTACTGGATTATTAAGAACTCGTGGGGAGAGACTTGGGGTGAGAATGGTTTTTACA
AAATCTGTAGAGGCCGTAACGTTTGTGGCGTTGACAGTCTTGTCTCAACCGTTACAGCCA
CCGTCTCACCCGCCTCCCATTAGTTACTTAAGCCAGCTCTTGTTTTAATAAATTAACTAA
CGCTGGTGATTTGTATGAGCGAGGACTCTTTGCTTTGACTCCCTATTTCTCTCTGCTTTT
TTAAAAAGGATGATGAAGTTTGTATTGTAAATAAAAATGCATTTTCCTATCAAAACCCAA
TACAGTGACTGTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A549TF U 1
AF RR2A549JQ C 167
BS 1 770 RR2A549TF
BS 771 854 RR2A549JQ

RD RR2A549TF 770 0 0
GTGAGAGAAGAAGACTATCCATACACCGGAAAGGATGTTGTTGTTTCGGGCCTGGGGATT
ACGGGCCTTGGGCTTACGGGCCGTAAAACTCATATACTTAGTTCAGGTTGCTTACTTCAA
ATGGTTATCTATACAATCCACAATGGTTTCATGGTCATGTGATTCTAAATATTAATTTAC
TAATAATATATGTGAATTTCTGCTAATAAGTGTAGATATGTCTTTATGCAGTGTGACCCA
GAAGAAGCAGGTTCATGCGACTCTGGTTGCAACGGTGGCCTCATGAACAGCGCATTCGAA
TACACACTCAAAACCGGAGGGCTCATGAGAGAAGAAGACTATCCATCTCCATCGATGGAG
ACCAGATCGCTGCGAACCTTGTCAAGAACGGACCTCTTGCGGTGGCCATCAACGCCGCAT
ATATGCAGACTTACATCGGAGGAGTCTCGTGCCCTTACGTGTGCATGAGGAGGCTCAACC
ACGGTGTCTTATTGGTAGGTTATGGATCGGCTGGTTACGCTCCCGCTAGGTTCAAGGAGA
AGCCTTACTGGATTATTAAGAACTCGTGGGGAGAGACTTGGGGTGAGAATGGTTTTTACA
AAATCTGTAGAGGCCGTAACGTTTGTGGCGTTGACAGTCTTGTCTCAACCGTTACAGCCA
CCGTCTCACCCGCCTCCCATTAGTTACTTAAGCCAGCTCTTGTTTTAATAAATTAACTAA
CGCTGGTGATTTGTATGAGCGAGGACTCTTTGCTTTGACTCCCTATTTCT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2A549JQ 688 0 0
AAATATTAATTTACTAATAATATATGTGAATTTCTGCTAATAAGTGTAGATATGTCTTTA
TGCAGTGTGACCCAGAAGAAGCAGGTTCATGCGACTCTGGTTGCAACGGTGGCCTCATGA
ACAGCGCATTCGAATACACACTCAAAACCGGAGGGCTCATGAGAGAAGAAGACTATCCAT
CTCCATCGATGGAGACCAGATCGCTGCGAACCTTGTCAAGAACGGACCTCTTGCGGTGGC
CATCAACGCCGCATATATGCAGACTTACATCGGAGGAGTCTCGTGCCCTTACGTGTGCAT
GAGGAGGCTCAACCACGGTGTCTTATTGGTAGGTTATGGATCGGCTGGTTACGCTCCCGC
TAGGTTCAAGGAGAAGCCTTACTGGATTATTAAGAACTCGTGGGGAGAGACTTGGGGTGA
GAATGGTTTTTACAAAATCTGTAGAGGCCGTAACGTTTGTGGCGTTGACAGTCTTGTCTC
AACCGTTACAGCCACCGTCTCACCCGCCTCCCATTAGTTACTTAAGCCAGCTCTTGTTTT
AATAAATTAACTAACGCTGGTGATTTGTATGAGCGAGGACTCTTTGCTTTGACTCCCTAT
TTCTCTCTGCTTTTTTAAAAAGGATGATGAAGTTTGTATTGTAAATAAAAATGCATTTTC
CTATCAAAACCCAATACAGTGACTGTCA

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL6052Contig1 650 2 1 U
GGAGCGATTTTCCGTAAACCTTAAGAGAGCGATGGCGACTACAACAGGAAACGCATCGGT
TGCAACGGGAACGTCGTCGTCGACGACGGCAGCGAAGAGGAAACCAGTGTTTGTGAAAGT
GGAACAGCTAAAGCCTGGGACGACTGGTCACACATTGACCGTTAAGGTCGTTGACTCCAA
TCCGGTGGTTCCGGTTACCCGAAAGGCTCGTCCTGGGATGAGTAGTCGTCCGTCTCAGCC
TAGTCGAATCGCTGAGTGTCTTATCGGAGATGAGACCGGTTGCATTCTCTTCACTGCTCG
TAACGACCAAGTTGATCTAATGAAACCAGGGGAGACGGTGATACTGCGGAATTCGAGGAT
AGACATGTACAAGGGTACAATGAGGCTAGGTGTTGATAAATGGGGACGCATCGAAGCAAC
TGAGCCATCGTCTTTCACGGTCAAAGAGGATAACAATCTGTCTCTGGTTGAATACGAGCT
GATTAACGTTAACGATCAGTGATCTAATTTTTAGTATGTTTTATTGAAAGTTAACCCCTG
AGAGTGTTTTTGATTTACATGATTAAGATGTGTGACTAAGTTCAGAGATGCTTTTGCTGT
AGGATTTGCTTTTGCCCTTAAAAACATGAAACAGTATCTCGATTTGGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A531TF U 1
AF RR2A531JQ C 83
BS 1 650 RR2A531TF

RD RR2A531TF 650 0 0
GGAGCGATTTTCCGTAAACCTTAAGAGAGCGATGGCGACTACAACAGGAAACGCATCGGT
TGCAACGGGAACGTCGTCGTCGACGACGGCAGCGAAGAGGAAACCAGTGTTTGTGAAAGT
GGAACAGCTAAAGCCTGGGACGACTGGTCACACATTGACCGTTAAGGTCGTTGACTCCAA
TCCGGTGGTTCCGGTTACCCGAAAGGCTCGTCCTGGGATGAGTAGTCGTCCGTCTCAGCC
TAGTCGAATCGCTGAGTGTCTTATCGGAGATGAGACCGGTTGCATTCTCTTCACTGCTCG
TAACGACCAAGTTGATCTAATGAAACCAGGGGAGACGGTGATACTGCGGAATTCGAGGAT
AGACATGTACAAGGGTACAATGAGGCTAGGTGTTGATAAATGGGGACGCATCGAAGCAAC
TGAGCCATCGTCTTTCACGGTCAAAGAGGATAACAATCTGTCTCTGGTTGAATACGAGCT
GATTAACGTTAACGATCAGTGATCTAATTTTTAGTATGTTTTATTGAAAGTTAACCCCTG
AGAGTGTTTTTGATTTACATGATTAAGATGTGTGACTAAGTTCAGAGATGCTTTTGCTGT
AGGATTTGCTTTTGCCCTTAAAAACATGAAACAGTATCTCGATTTGGAAT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2A531JQ 568 0 0
ACGACGGCAGCGAAGAGGAAACCAGTGTTTGTGAAAGTGGAACAGCTAAAGCCTGGGACG
ACTGGTCACACATTGACCGTTAAGGTCGTTGACTCCAATCCGGTGGTTCCGGTTACCCGA
AAGGCTCGTCCTGGGATGAGTAGTCGTCCGTTTCAGCCTAGTCGAATCGCTGAGTGTCTT
ATCGGAGATGAGACCGGTTGCATTTTTTTCACTGCTCGTAACGACCAAGTTGATTTAATG
AAACCAGGGGAGACGGTGATACTGCGGAATTCGAGGATAGACATGTACAAGGGTACAATG
AGGCTAGGTGTTGATAAATGGGGACGCATCGAAGCAACTGAGCCATCGTCTTTCACGGTC
AAAGAGGATAACAATCTGTCTCTGGTTGAATACGAGCTGATTAACGTTAACGATCAGTGA
TTTAATTTTTAGTATGTTTTATTGAAAGTTAACCCCTGAGAGTGTTTTTGATTTACATGA
TTAAGATGTGTGACTAAGTTCAGAGATGCTTTTGCTGTAGGATTTGCTTTTGCCCTTAAA
AACATGAAACAGTATCTCGATTTGGAAT

QA 1 568 1 568
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6054Contig1 941 2 2 U
GGATTAAAATCTCCTTTTACTGAAAAGAATAAAAACATCTAAAACAATGATATTTTCATA
TTCTCTACCCAAACAAATTTGGTTTCCTATTGTGGCCATGCAATTCCTCATCATACATAG
TGTATTGTCACTGAACATTACCAATGAGTATCTCAACCACAAATGCTTCCTTAATCAAGG
AAAATATAACTCTGGAAGTGGTTATGAGGAGATCCTCAACATTCTCTTCGGTAGAGTTCG
TACTGATGATTATGATACAACCGGTTTCAGATACACAAGTAAGGAAACATCTCCTCTTGA
TTCTGCTTCCGTGATGCTCCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGGTCTAAATGCAATATATG
CGCTGACATCGTAGTCGCAGGGTTTCTTAAAAGATGTCCAAAGAACAAAGGAGGAATAAT
ATGGTACGAACAATGTTTTCTCTATGTTACTGCGTTCGATGATCAGTTGAGACTTAAAAC
TAATTACAAGAATATTTTTTCTATGTACAACCCAAAAAACGTGAGAGGGGATGGAAAATT
GTTTGCCAAGAAGACGATGGATTTTTTCTCTGAACTAACACTTAAAGTGAAGAAATCTGC
CAAATACAATCCCGTCATATTATACGCAGCAGGGGAAAAGAAACTTGGAAAAAATACATT
ATATGCAATGGTGCAGTGTATAGAACTAACATTAGATTGTAAAACTTGTTTGGTATGGAG
TATCACAAAAATTTTCATGAACAACAACATTAAACAAGGAGGAAGAGTTTTTGGTATGAA
CTGTGAGATAAGATATGAGCTATACCCTTTTTTAAGGAGTTAAGCATTTATGTGGTGGTG
ATTGATACATCTTATTCATATATAATTATGTTTTAGTTTTGCTTACTTTTTCATTTTGCT
GAAATTTAATATACATATATTAATAAAAAGAGTGTTTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS13TF U 1
AF RR2AS13JQ C 178
BS 1 726 RR2AS13TF
BS 727 941 RR2AS13JQ

RD RR2AS13TF 726 0 0
GGATTAAAATCTCCTTTTACTGAAAAGAATAAAAACATCTAAAACAATGATATTTTCATA
TTCTCTACCCAAACAAATTTGGTTTCCTATTGTGGCCATGCAATTCCTCATCATACATAG
TGTATTGTCACTGAACATTACCAATGAGTATCTCAACCACAAATGCTTCCTTAATCAAGG
AAAATATAACTCTGGAAGTGGTTATGAGGAGATCCTCAACATTCTCTTCGGTAGAGTTCG
TACTGATGATTATGATACAACCGGTTTCAGATACACAAGTAAGGAAACATCTCCTCTTGA
TTCTGCTTCCGTGATGCTCCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGGTCTAAATGCAATATATG
CGCTGACATCGTAGTCGCAGGGTTTCTTAAAAGATGTCCAAAGAACAAAGGAGGAATAAT
ATGGTACGAACAATGTTTTCTCTATGTTACTGCGTTCGATGATCAGTTGAGACTTAAAAC
TAATTACAAGAATATTTTTTCTATGTACAACCCAAAAAACGTGAGAGGGGATGGAAAATT
GTTTGCCAAGAAGACGATGGATTTTTTCTCTGAACTAACACTTAAAGTGAAGAAATCTGC
CAAATACAATCCCGTCATATTATACGCAGCAGGGGAAAAGAAACTTGGAAAAAATACATT
ATATGCAATGGTGCAGTGTATAGAACTAACATTAGATTGTAAAACTTGTTTGGTATGGAG
TATCAC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2AS13JQ 764 0 0
AGGAAAATATAACTCTGGAAGTGGTTATGAGGAGATCCTCAACATTCTCTTCGGTAGAGT
TCGTACTGATGATTATGATACAACCGGTTTCAGATACACAAGTAAGGAAACATCTCCTCT
TGATTCTGCTTCCGTGATGCTCCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGGTCTAAATGCAATAT
ATGCGCTGACATCGTAGTCGCAGGGTTTCTTAAAAGATGTCCAAAGAACAAAGGAGGAAT
AATATGGTACGAACAATGTTTTCTCTATGTTACTGCGTTCGATGATCAGTTGAGACTTAA
AACTAATTACAAGAATATTTTTTCTATGTACAACCCAAAAAACGTGAGAGGGGATGGAAA
ATTGTTTGCCAAGAAGACGATGGATTTTTTCTCTGAACTAACACTTAAAGTGAAGAAATC
TGCCAAATACAATCCCGTCATATTATACGCAGCAGGGGAAAAGAAACTTGGAAAAAATAC
ATTATATGCAATGGTGCAGTGTATAGAACTAACATTAGATTGTAAAACTTGTTTGGTATG
GAGTATCACAAAAATTTTCATGAACAACAACATTAAACAAGGAGGAAGAGTTTTTGGTAT
GAACTGTGAGATAAGATATGAGCTATACCCTTTTTTAAGGAGTTAAGCATTTATGTGGTG
GTGATTGATACATCTTATTCATATATAATTATGTTTTAGTTTTGCTTACTTTTTCATTTT
GCTGAAATTTAATATACATATATTAATAAAAAGAGTGTTTACAT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL6055Contig1 690 2 1 U
GGGTTCAATCCCGAAAACTCCTCTAAAAAGTTCGAACAATGACGATGAATTGAGAAAAAG
AAAATGCCATACGGAATAGAAATCGAGATGAATTAAAAGTAATTTGCTACATGGTCGTTA
CCAGATCCTTGAAGATGACGTAGGCTATAACGAAGAATAGCACAAACAAGATCTCAAGCT
CAGCTAATCGGAATAGAGAAAACACTGAGTCAACGAACCGAGTCAGAATGGAGACGTCCC
TCCTCATACCGGCTCGATTCGTTCCAGCACGACGCCCGATCATCCTTATACAATCCTCCC
GCCGGTTTTGATAACAGATCTCCGCCGCTCGCTCGCTCGCTCCTCCTCTCTCAAGTGTTA
CCGGCGAGTTCATAATAATTGTCAACGAAAAGGTATTTTGGTTTTTTGAACCAACTAATT
TCAACAGAATATAAATCTTAGTTATTATGGAATATACCCAAACTGAGTTGGTTAATGATG
AACATAGAAACGACAAGGCGTTCATTTTGATTTATATACAATGCAATTTATGTTCTTAGT
CTTTTGGCTGTATTGCTTTCATTTCTGGATATGTAACGTCTTCTTTGTGGACAATGATGT
GTCTCTATGCCGGAGTTGTGATCTTTACGAGTTCGATCATCTTTAACTAGCCTTTCTTCA
GTTGTGTAAGCTGAGAAGCATAACCCAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A613JQ C 1
AF RR2A613TF U 1
BS 1 690 RR2A613TF

RD RR2A613JQ 690 0 0
GGGTTCAATCCCGAAAACTCCTCTAAAAAGTTCGAACAATGACGATGAATTGAGAAAAAG
AAAATGCCATACGGAATAGAAATCGAGATGAATTAAAAGTAATTTGCTACATGGTCGTTA
CCAGATCCTTGAAGATGACGTAGGCTATAACGAAGAATAGCACAAACAAGATCTCAAGCT
CAGCTAATCGGAATAGAGAAAACACTGAGTCAACGAACCGAGTCAGAATGGAGACGTCCC
TCCTCATACCGGCTCGATTCGTTCCAGCACGACGCCCGATCATCCTTATACAATCCTCCC
GCCGGTTTTGATAACAGATTTCCGCCGCTCGCTCGCTCGCTCCTCCTCTCTCAAGTGTTA
CCGGCGAGTTCATAATAATTGTCAACGAAAAGGTATTTTGGTTTTTTGAACCAACTAATT
TCAACAGAATATAAATCTTAGTTATTATGGAATATACCCAAACTGAGTTGGTTAATGATG
AACATAGAAACGACAAGGCGTTCATTTTGATTTATATACAATGCAATTTATGTTCTTAGT
CTTTTGGCTGTATTGCTTTCATTTCTGGATATGTAACGTCTTCTTTGTGGACAATGATGT
GTCTCTATGCCGGAGTTGTGATCTTTACGAGTTCGATCATCTTTAACTAGCCTTTCTTCA
GTTGTGTAAGCTGAGAAGCATAACCCAGAC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2A613TF 690 0 0
GGGTTCAATCCCGAAAACTCCTCTAAAAAGTTCGAACAATGACGATGAATTGAGAAAAAG
AAAATGCCATACGGAATAGAAATCGAGATGAATTAAAAGTAATTTGCTACATGGTCGTTA
CCAGATCCTTGAAGATGACGTAGGCTATAACGAAGAATAGCACAAACAAGATCTCAAGCT
CAGCTAATCGGAATAGAGAAAACACTGAGTCAACGAACCGAGTCAGAATGGAGACGTCCC
TCCTCATACCGGCTCGATTCGTTCCAGCACGACGCCCGATCATCCTTATACAATCCTCCC
GCCGGTTTTGATAACAGATCTCCGCCGCTCGCTCGCTCGCTCCTCCTCTCTCAAGTGTTA
CCGGCGAGTTCATAATAATTGTCAACGAAAAGGTATTTTGGTTTTTTGAACCAACTAATT
TCAACAGAATATAAATCTTAGTTATTATGGAATATACCCAAACTGAGTTGGTTAATGATG
AACATAGAAACGACAAGGCGTTCATTTTGATTTATATACAATGCAATTTATGTTCTTAGT
CTTTTGGCTGTATTGCTTTCATTTCTGGATATGTAACGTCTTCTTTGTGGACAATGATGT
GTCTCTATGCCGGAGTTGTGATCTTTACGAGTTCGATCATCTTTAACTAGCCTTTCTTCA
GTTGTGTAAGCTGAGAAGCATAACCCAGAC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL6056Contig1 821 2 1 U
CGATGTAATGTTTTTCTTATATAACATTACATCACGTACAAGAGAAAATGCACTTGCAAT
ATGTGATCTTGAAGAAGCAATCTCCGATAACAAATACTTCTGAGCAAATTTACATAATCA
TGCTTCTTCTTTAGTTTCCTGAAAATCCGCTCTCTCTCGAAGAATCTTCTGCCCCATATA
CCTACCGAGCATCATGATCGTGGCTTGAGGATTAGTCCCTGGGGTCTTGAGAAACGTGGA
TGCATCAATGACCCTCAAAGCATCAATCCCTAATACTTTGTAATCATTGTCGACCACTTT
TCCAACTTGACAACCTCCATAGTAATGATAAATAGTCATCACCGTATCTTTACAATATTG
CTTCAAATCAAACAATGATTGTATGTGCCTTTGCCTCACATTGATGGGCAGACCAAGAAT
GAAATCTAACAATCCCCGTCCGGTCACTCCAGGTAACATGTACTTGGAGTACTTCTTCGA
ATTTATCACTTTAATTATAGTACTAAGTCCTTCAACACAGTTATTCAAATCTCCTTGTTC
TTGGTAGTAGTTAAATGTCACTGAAGGATTATCGTCTGGATTCGTGTTCCGCAGTTCCAA
ATGACCTCTCGAGATCGGCCAATCAACTTTCTGAACCATCCCTCCTGCTTGTGCTGTCAC
ATTAACTCGAAGATCCAATAACTTGAAAAAGCGTGAGAAAGTTTTGGTGGGAAGTTTCAT
CTCATTGAGAACATTTATAACAGCACTGAAGAAGCTATGCGTCAAACTAATAGAGAGACT
TAACCCACTCCCGCCTTCATGTAACTACCAAAATGGGGGAT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H477JQB U 1
AF RR2EK21JQ U 1
BS 1 821 RR2EK21JQ

RD RR2H477JQB 690 0 0
A
GATGTAATGTTTTTCTTATATAACATTACATCACGTACAAGAGAAAATGCACTTGCAATA
TGTGATCTTGAAGAAGCAATCTCCGATAACAAATACTTCTGAGCAAATTTACATAATCAT
GCTTCTTCTTTAGTTTCCTGAAAATCCGCTCTCTCTCGAAGAATCTTCTGCCCCATATAC
CTACCGAGCATCATGATCGTGGCTTGAGGATTAGTCCCTGGGGTCTTGAGAAACGTGGAT
GCATCAATGACCCTCAAAGCATCAATCCCTAATACTTTGTAATCATTGTCGACCACTTTT
CCAACTTGACAACCTCCATGGTAATGATAAATAGTCATCACCGTATCTT*ACAATATTGC
TTCAAATCAAACAATGATTGTATGTGCCTTTGCCTCACATTGATGGGCAGACCAAGAATG
AAATCTAACAATCCCCGTCCGGTCACTCCAGGTAACATGTACTTGGAGTACTTCTTCGAA
TTTATCACTTTAATTATAGTACTAAGTCCTTCAACACAGTTATTCAAATCTTCTTGTTCT
TGGTAGTAGTTAAATGTCACTGAAGGATTATCGTCTGGATTCGTGTTCCGCAGTTCCAAA
TGACCTCTCGAGATCGGCCAATCAACTTTCTGAACCATCCCTCCTGCTTGTGCTGTCACA
TTAACTCGAAGATCCAATAACTTGAAAAA

QA 2 690 2 690
DS 

RD RR2EK21JQ 821 0 0
CGATGTAATGTTTTTCTTATATAACATTACATCACGTACAAGAGAAAATGCACTTGCAAT
ATGTGATCTTGAAGAAGCAATCTCCGATAACAAATACTTCTGAGCAAATTTACATAATCA
TGCTTCTTCTTTAGTTTCCTGAAAATCCGCTCTCTCTCGAAGAATCTTCTGCCCCATATA
CCTACCGAGCATCATGATCGTGGCTTGAGGATTAGTCCCTGGGGTCTTGAGAAACGTGGA
TGCATCAATGACCCTCAAAGCATCAATCCCTAATACTTTGTAATCATTGTCGACCACTTT
TCCAACTTGACAACCTCCATAGTAATGATAAATAGTCATCACCGTATCTTTACAATATTG
CTTCAAATCAAACAATGATTGTATGTGCCTTTGCCTCACATTGATGGGCAGACCAAGAAT
GAAATCTAACAATCCCCGTCCGGTCACTCCAGGTAACATGTACTTGGAGTACTTCTTCGA
ATTTATCACTTTAATTATAGTACTAAGTCCTTCAACACAGTTATTCAAATCTCCTTGTTC
TTGGTAGTAGTTAAATGTCACTGAAGGATTATCGTCTGGATTCGTGTTCCGCAGTTCCAA
ATGACCTCTCGAGATCGGCCAATCAACTTTCTGAACCATCCCTCCTGCTTGTGCTGTCAC
ATTAACTCGAAGATCCAATAACTTGAAAAAGCGTGAGAAAGTTTTGGTGGGAAGTTTCAT
CTCATTGAGAACATTTATAACAGCACTGAAGAAGCTATGCGTCAAACTAATAGAGAGACT
TAACCCACTCCCGCCTTCATGTAACTACCAAAATGGGGGAT

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 2

CO CL6057Contig1 457 2 2 U
TTACGAGGTGGCAAGTACATATGTAAGATAAATTCTCCAAATCCATACCAAGTACGGAGG
GTTCGTTTATGAGAGTCAAATTTACAAAGGCCTCAAGAGTGGGTAATCTTCAAGTAGCTC
CCTTTCTGACAAAGTGTCCTTCTCATTCTGCGGTGTCCACAGTACTTCAACTGCCATGAT
TTTGTTTCTAGGTATCGACCCAATTTTTTGTAAGGCTTCCTTTAGATCCGCAGTTCCATT
TATAGGCTGCAGTTTATGAATGCCCTCTGTAGCTACCAAGATGGTTACCACAATATATTC
ATTGCTGAAACCGCTAGCTGTCCGAATCTTTGAGCTTTGTCTCTTTATGCTGTTCACGTT
AACAAGCGTCTCCTCATCGAATTTCCCCCGTTCTTCAATAGAGAGCTGATTAACGTTTTC
CTGATCTGAATCACGATTTGGTCAATTGATTTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E467JQ U 1
AF RR2AZ60TFB C 106
BS 1 199 RR2E467JQ
BS 200 457 RR2AZ60TFB

RD RR2E467JQ 199 0 0
TTACGAGGTGGCAAGTACATATGTAAGATAAATTCTCCAAATCCATACCAAGTACGGAGG
GTTCGTTTATGAGAGTCAAATTTACAAAGGCCTCAAGAGTGGGTAATCTTCAAGTAGCTC
CCTTTCTGACAAAGTGTCCTTCTCATTCTGCGGTGTCCACAGTACTTCAACTGCCATGAT
TTTGTTTCTAGGTATCGAC

QA 1 199 1 199
DS 

RD RR2AZ60TFB 352 0 0
ATCTTCAAGTAGCTCCCTTTCTGACAAAGTGTC*TTCTCATTCTGCGGTGTCCACAGTAC
TTCAACTGCCATGATTTTGTTTCTAGGTATCGACCCAATTTTTTGTAAGGCTTCCTTTAG
ATCCGCAGTTCCATTTATAGGCTGCAGTTTATGAATGCCCTCTGTAGCTACCAAGATGGT
TACCACAATATATTCATTGCTGAAACCGCTAGCTGTCCGAATCTTTGAGCTTTGTCTCTT
TATGCTGTTCACGTTAACAAGCGTCTCCTCATCGAATTTCCCCCGTTCTTCAATAGAGAG
CTGATTAACGTTTTCCTGATCTGAATCACGATTTGGTCAATTGATTTTTTAC

QA 1 352 1 352
DS 



AS 1 2

CO CL6058Contig1 690 2 4 U
GCATTTCTGTGATATGATGGGCTCTGACTCGTCATTCGCTCCTCGCGATCCCAGGGAAAA
CATGCTTCCACCACTGATCACCAGGTACAGAGTGAAGCCAATATGGACCCTCTAATCAAG
ACAGGGTATTTTCTCTCAGGAGGAGCAACAACTTTGAACTTCACGCTGCTTGTAGCCCAA
GACGTGATATCTTAGCTCAAACTGTTAGCGATCTCAAAGAAAATGTGCTCCCACCACTGA
TCACGATGTTATACCGTACACGTCGTCTTTCTGATGTCTACATCACCCTTCATTAAGGAG
TTATAAGTTGTTTCATGGATACCAGTATTCTCCATACGAAGCATAGACGGCTGGTAAATA
ACCTTGGTCCTCAGGACAACGGAACCGCTCAGAACCAATTGTCATCACTTGCCCATCAGG
TAGCTCGTAATTCTTCTCAGCAGCTTAGCTAGTTTTGGCTTTCTCAAAACTCCTCCTTGT
AGTCAAGACCAATGTAGCAAAGCTTCTTTAATGTCTCAGACATTTTCACGCTCTGATGTG
GTGGTGAAAGAATAACCACGCTCGGTTACGATCTTCATCAGTGCATCAGTGAGGTCACGA
CCCGCAAGATCAAAACATATGATACCATGCGGAAAGGGCATAACATCATAGATAGGAACA
GTGCGGCTCCGACCATCTCCTGTTTCAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL40TF C 1
AF RR2AL40JQ U 81
BS 1 80 RR2AL40TF
BS 81 468 RR2AL40JQ
BS 469 469 RR2AL40TF
BS 470 690 RR2AL40JQ

RD RR2AL40TF 497 0 0
GCATTTCTGTGATATGATGGGCTCTGACTCGTCATTCGCTCCTCGCGATCCCAGGGAAAA
CATGCTTCCACCACTGATCACCAGGTACAGAGTGAAGCCAATATGGACCCTCTAATCAAG
ACAGGGTATTT*CTCTCAGGAGGAGCAACAACTTTGATCTTCACGCTGCTTGTAGCCCAA
GACGTGATATCTTAGCTCAAACTGTTAGCGATCTCAAAGAAAATGTGCTCCCACCACTGA
TCACGATGTTATACCGTACACGTCGTCTTTCTGATGTCTACATCACCCTTCATTAAGGAG
TTATAAGTTGTTTCATGGATACCAGTATTCTCCATACGAAGCATAGACGGCTGGTAAATA
ACCTTGGTCCTCAGGACAACGGAACCGCTCAGAACCAATTGTCATCACTTGCCCATCAGG
TAGCTCGTAGTTCTTCTCAGCAGCTTAGCTAGTTTTGGCTTTCTCAAAACTCCTCCTTGT
AGTCAAGACCAATGTAG

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2AL40JQ 610 0 0
CCAGGTACAGAGTGAAGCCAATATGGACCCTCTAATCAAGACAGGGTATTTTCTCTCAGG
AGGAGCAACAACTTTGAACTTCACGCTGCTTGTAGCCCAAGACGTGATATCTTAGCTCAA
ACTGTTAGCGATCTCAAAGAAAATGTGCTCCCACCACTGATCACGATGTTATACCGTACA
CGTCGTCTTTCTGATGTCTACATCACCCTTCATTAAGGAGTTATAAGTTGTTTCATGGAT
ACCAGTATTCTCCATACGAAGCATAGACGGCTGGTAAATAACCTTGGTCCTCAGGACAAC
GGAACCGCTCAGAACCAATTGTCATCACTTGCCCATCAGGTAGCTCGTAATTCTTCTCAG
CAGCTTAGCTAGTTTTGGCTTTCTCAAA*CTCCTCCTTGTAGTCAAGACCAATGTAGCAA
AGCTTCTTTAATGTCTCAGACATTTTCACGCTCTGATGTGGTGGTGAAAGAATAACCACG
CTCGGTTACGATCTTCATCAGTGCATCAGTGAGGTCACGACCCGCAAGATCAAAACATAT
GATACCATGCGGAAAGGGCATAACATCATAGATAGGAACAGTGCGGCTCCGACCATCTCC
TGTTTCAGAT

QA 1 610 1 610
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6060Contig1 827 2 2 U
CGCAAGGCAAATTCGGAAATCAAAGCCCTTAACGTCTTAGGCGAACCCTCTAGCTCATCT
GGAGGCAAAGCCAAAGCTACCAATCTCAGTGAACCATCAGATCCGGGAAGTTCCCAGCTG
ACAATCTTCTTTGGAGGAAAAGTTTTAGTATACAATGAGTTTCCTTCAGACAAAGCTAAA
GAGATAATACAAGTAGCAAAACAAGCCAAGCCTGTGACTGATATTAACATTCAGACACAA
ATCAATGTCCAAAAGGACCACAACAAAAGCAACATGGTTCTTCCTGATCTCAACGAGCCC
ACAGATTCTGCTGATGTCAATCAACAGTAACAACAACAAAACCAGCTTGTGGAACGTATA
GCACGTCGAGCTTCCCTTCATCGATTCTTTGCTAAACGTAAAGACAGAGCTGTGGCTAGA
GCTCCATACCAAGTTAACCAAAATGGTGGTGGTCATCACTATCCTCCAAAGCCAGAGACT
GTGCCTGGTCAACAGCTAGAGCAGGGACAGTCGTCACAACGACCGGCTCAAACCGCTTCC
CAACTCACACCAGAATGTGATAAAGATATGTTGATGGAAGTTAAGGAAGAAGGCCAGTGT
TCGAAAGATCTCGAACTTAGGCTATAGTCAAATTTTGTCAAATATTTGTAAGAAACTTAA
ACTTAAGTTTATCGTCTGACTTATTTTAAGTGATTTTTGCTTTGTCCTAAAGTTTGTAAT
CATTTTTAACTTTAATATTTATAATTGCAACTAGAGCTGGATTCGTCCGACCGAACGTGT
ATTTATTTTCATTTTTTATATAAATAAATATTATTTAATTGTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW09TF U 1
AF RR2CW09JQ C 31
BS 1 579 RR2CW09TF
BS 580 827 RR2CW09JQ

RD RR2CW09TF 579 0 0
CGCAAGGCAAATTCGGAAATCAAAGCCCTTAACGTCTTAGGCGAACCCTCTAGCTCATCT
GGAGGCAAAGCCAAAGCTACCAATCTCAGTGAACCATCAGATCCGGGAAGTTCCCAGCTG
ACAATCTTCTTTGGAGGAAAAGTTTTAGTATACAATGAGTTTCCTTCAGACAAAGCTAAA
GAGATAATACAAGTAGCAAAACAAGCCAAGCCTGTGACTGATATTAACATTCAGACACAA
ATCAATGTCCAAAAGGACCACAACAAAAGCAACATGGTTCTTCCTGATCTCAACGAGCCC
ACAGATTCTGCTGATGTCAATCAACAGTAACAACAACAAAACCAGCTTGTGGAACGTATA
GCACGTCGAGCTTCCCTTCATCGATTCTTTGCTAAACGTAAAGACAGAGCTGTGGCTAGA
GCTCCATACCAAGTTAACCAAAATGGTGGTGGTCATCACTATCCTCCAAAGCCAGAGACT
GTGCCTGGTCAACAGCTAGAGCAGGGACAGTCGTCACAACGACCGGCTCAAACCGCTTCC
CAACTCACACCAGAATGTGATAAAGATATGTTGATGGAA

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2CW09JQ 797 0 0
AACGTCTTAGGCGAACCCTCTAGCTCATCTGGAGGCAAAGCCAAAGCTACCAATCTCAGT
GAACCATCAGATCCGGGAAGTTCCCAGCTGACAATCTTCTTTGGAGGAAAAGTTTTAGTA
TACAATGAGTTTCCTTCAGACAAAGCTAAAGAGATAATACAAGTAGCAAAACAAGCCAAG
CCTGTGACTGATATTAACATTCAGACACAAATCAATGTCCAAAAGGACCACAACAAAAGC
AACATGGTTCTTCCTGATCTCAACGAGCCCACAGATTCTGCTGATGTCAATCAACAGTAA
CAACAACAAAACCAGCTTGTGGAACGTATAGCACGTCGAGCTTCCCTTCATCGATTCTTT
GCTAAACGTAAAGACAGAGCTGTGGCTAGAGCTCCATACCAAGTTAACCAAAATGGTGGT
GGTCATCACTATCCTCCAAAGCCAGAGACTGTGCCTGGTCAACAGCTAGAGCAGGGACAG
TCGTCACAACGACCGGCTCAAACCGCTTCCCAACTCACACCAGAATGTGATAAAGATATG
TTGATGGAAGTTAAGGAAGAAGGCCAGTGTTCGAAAGATCTCGAACTTAGGCTATAGTCA
AATTTTGTCAAATATTTGTAAGAAACTTAAACTTAAGTTTATCGTCTGACTTATTTTAAG
TGATTTTTGCTTTGTCCTAAAGTTTGTAATCATTTTTAACTTTAATATTTATAATTGCAA
CTAGAGCTGGATTCGTCCGACCGAACGTGTATTTATTTTCATTTTTTATATAAATAAATA
TTATTTAATTGTTTATC

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL6061Contig1 727 2 6 U
GAGAAACAAGAGTATGCAAGTTTGGAAACACAAAAAGGATTGATTACACATGAACTGATA
AAACACAACACACTAAAAAAGACACACGAGAGAATATCAGAAGGTCCTGATAAACAGACA
CACTCCCATTATTTTCTTCTCACCATAATAACTAAAAAACATTCGTCAAGACACTAAGAA
AACAAAAGAAGCTTAATTAATTATTTCGAAGACGTGCACATAATAGGGTTCCATAGATCA
TCACTCTTCTTCAGTTTCAAGCATTTGCACAATCTGAGTCACTCCCTCCGCGATTTCATT
GCGGATCAAACTGTCTGGCATATCGAATGTTCTTCTCCTCATCGACAGTGACTTCCCCTG
CGGCTGCGGGTCTACAACCTCCAACATTGCTTCCAGCTCATCCACCATCGATCTCTTTGC
TCCTCTAACCATCACATCAACTCCCTCAATGGCATCAACAGTGAGGAGGAGGACGATAAT
CTTCTCAGAGAACTTCTGACGCTCCTCTGCATCACGAGAGATCACGCGACGGTAGTTGAA
GTTGTGGAAAGAAGCTCTTAACTCCTTGAGTTTGGTCTTTGCGATAGCTAGATCACGAAG
AGCACGTAATGCTTTAGAGCGGCGAATCAGATAGGCTCTGAAAGCCCACTGGATCATCGC
AGCCGCATATTCAGGTGGCATTTCCTTGTTCTTCCCCTTCTTGCTCCTAACTGCTCCACT
TCTTCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY47JQ U 1
AF RR2BT80JQ U 56
BS 1 142 RR2DY47JQ
BS 143 143 RR2BT80JQ
BS 144 155 RR2DY47JQ
BS 156 156 RR2BT80JQ
BS 157 615 RR2DY47JQ
BS 616 727 RR2BT80JQ

RD RR2DY47JQ 615 0 0
GAGAAACAAGAGTATGCAAGTTTGGAAACACAAAAAGGATTGATTACACATGAACTGATA
AAACACAACACACTAAAAAAGACACACGAGAGAATATCAGAAGGTCCTGATAAACAGACA
CACTCCCATTATTTTCTTCTCATCATAATAACTAAGAAACATTCGTCAAGACACTAAGAA
AACAAAAGAAGCTTAATTAATTATTTCGAAGACGTGCACATAATAGGGTTCCATAGATCA
TCACTCTTCTTCAGTTTCAAGCATTTGCACAATCTGAGTCACTCCCTCCGCGATTTCATT
GCGGATCAAACTGTCTGGCATATCGAATGTTCTTCTCCTCATCGACAGTGACTTCCCCTG
CGGCTGCGGGTCTACAACCTCCAACATTGCTTCCAGCTCATCCACCATCGATCTCTTTGC
TCCTCTAACCATCACATCAACTCCCTCAATGGCATCAACAGTGAGGAGGAGGACGATAAT
CTTCTCAGAGAACTTCTGACGCTCCTCTGCATCACGAGAGATCACGCGACGGTAGTTGAA
GTTGTGGAAAGAAGCTCTTAACTCCTTGAGTTTGGTCTTTGCGATAGCTAGATCACGAAG
AGCACGTAATGCTTT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2BT80JQ 672 0 0
TGATAAAACACAACACACTAAAAAAGACACACGAGAGAATATCAGAAGGTCCTGATAAAC
AGACACACTCCCATTATTTTCTTCTCACCATAATAACTAAAAAACATTCGTCAAGACACT
AAGAAAACAAAAGAAGCTTAATTAATTATTTCGAAGACGTGCACATAATAGGGTTCCATA
GATCATCACTCTTCTTCAGTTTCAAGCATTTGCACAATCTGAGTCACTCCCTCTGCGATT
TCATTGCGGATCAAACTGTCTGGCATATCGAATGTTCTTCTCCTCATCGACAGTGACTTC
CCCTGCGGCTGCGGGTCTACAACCTCCAACATTGCTTCCAGCTCATCCACCATCGATCTC
TTTGCTCCTCTAACCATCACATCAACTCCCTCAATGGCATCAACAGTGAGGAGGAGGACG
ATAATCTTCTCAGAGAACTTCTGACGCTCCTCTGCATCACGAGAGATCACGCGACGGTAG
TTGAAGTTGTGGAAAGAAGCTCTTAACTCCTTGAGTTTGGTCTTTGCGATAGCTAGATCA
CGAAGAGCACGTAATGCTTTAGAGCGGCGAATCAGATAGGCTCTGAAAGCCCACTGGATC
ATCGCAGCCGCATATTCAGGTGGCATTTCCTTGTTCTTCCCCTTCTTGCTCCTAACTGCT
CCACTTCTTCGA

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL6062Contig1 898 2 4 U
GATTGGGACGGCTCTTGGGGAGCTTCCTCCATATTTCATCTCAAGGGCAGCTAGTATCTC
TGGGGACACGGTGGAAGAGTTAGATGCTTCGCCATCTGAGGATAGTGGATTTATGGCTAA
GTTCCTGAACCGGATTAAGCGTTGGCTGTTGACGCATTCGCAGCACTTGAATTTCTTCAC
CGTCTTGGTTCTTGCTTCGGTCCCAAATCCTCTGTTTGACCTCGCTGGGATAATGTGTGG
ACAATTTGGAATACCGTTTTGGGAGTTCTTTCTGGCGACTTTGATCGGCAAAGCGATCAT
CAAAACTCACATACAGACAATATTATCATCTGTGTCTGTAACAACCAACTGCTCGATTGG
ATGGAGAACGAGCTGATCTGGATACTTAGCCATGTCCCCGGTTTGGCTGCTGTGTTGCCT
GGACTCACAGTCAAACTCCATGCCATGAAAGAAAAGTATATTGATGCTCCACCTCCTGTT
CCATCTCATATCAAGGTGAAAAGATGGGATTTTTCATTTGCATCAATCTGGAATGGGATA
GTGTGGCTGATGCTCCTCAACTTCTTCGTCAAGATTGTGACAGCGACTGCACAGAGACAC
TTAAAGAAGAAGCAAGAGAAAGAAGTAGCTGCTTTGACTCATTTAGATTGATCTTTCTTC
CTTATATGCTCTCCAACATCAAAACTGAAGGACCAAAACTAATCAAGAAAATGGCAGTTT
TTCTTCTTCTCATTTTCGCATCGTTGACACATTGTTCTGGTGGGATTTGTACTTTATAGA
ACATAAAATGGTTAGGAGGAATTGGGATTATGAGATTGCAGGAGGCTTATTTTGACCCTG
TGATTCCATTGAGAATGATTTGTTGGAATAATTCAGAAAATGGAAGCTATTATGCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF66TF U 1
AF RR2CF66JQ C 138
BS 1 604 RR2CF66TF
BS 605 605 RR2CF66JQ
BS 606 690 RR2CF66TF
BS 691 898 RR2CF66JQ

RD RR2CF66TF 690 0 0
GATTGGGACGGCTCTTGGGGAGCTTCCTCCATATTTCATCTCAAGGGCAGCTAGTATCTC
TGGGGACACGGTGGAAGAGTTAGATGCTTCGCCATCTGAGGATAGTGGATTTATGGCTAA
GTTCCTGAACCGGATTAAGCGTTGGCTGTTGACGCATTCGCAGCACTTGAATTTCTTCAC
CGTCTTGGTTCTTGCTTCGGTCCCAAATCCTCTGTTTGACCTCGCTGGGATAATGTGTGG
ACAATTTGGAATACCGTTTTGGGAGTTCTTTCTGGCGACTTTGATCGGCAAAGCGATCAT
CAAAACTCACATACAGACAATATTATCATCTGTGTCTGTAACAACCAACTGCTCGATTGG
ATGGAGAACGAGCTGATCTGGATACTTAGCCATGTCCCCGGTTTGGCTGCTGTGTTGCCT
GGACTCACAGTCAAACTCCATGCCATGAAAGAAAAGTATATTGATGCTCCACCTCCTGTT
CCATCTCATATCAAGGTGAAAAGATGGGATTTTTCATTTGCATCAATCTGGAATGGGATA
GTGTGGCTGATGCTCCTCAACTTCTTCGTCAAGATTGTGACAGCGACTGCACAGAGACAC
TTAA*GAAGAAGCAAGAGAAAGAAGTAGCTGCTTTGACTCATTTAGATTGATCTTTCTTC
CTTATATGCTCTCCAACATCAAAACTGAAG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2CF66JQ 761 0 0
AGCGTTGGCTGTTGACGCATTCGCAGCACTTGAATTTCTTCACCGTCTTGGTTCTTGCTT
CGGTCCCAAATCCTCTGTTTGACCTCGCTGGGATAATGTGTGGACAATTTGGAATACCGT
TTTGGGAGTTCTTTCTGGCGACTTTGATCGGCAAAGCGATCATCAAAACTCACATACAGA
CAATATTATCATCTGTGTCTGTAACAACCAACTGCTCGATTGGATGGAGAACGAGCTGAT
CTGGATACTTAGCCATGTCCCCGGTTTGGCTGCTGTGTTGCCTGGACTCACAGTCAAACT
CCATGCCATGAAAGAAAAGTATATTGATGCTCCACCTCCTGTTCCATCTCATATCAAGGT
GAAAAGATGGGATTTTTCATTTGCATCAATCTGGAATGGGATAGTGTGGCTGATGCTCCT
CAACTTCTTCGTCAAGATTGTGACAGCGACTGCACAGAGACACTTAAAGAAGAAGCAAGA
GAAAGAAGTAGCTGCTTTGACTCATTTAGATTGATCTTTCTTCCTTATATGCTCTCCAAC
ATCAAAACTGAAGGACCAAAACTAATCAAGAAAATGGCAGTTTTTCTTCTTCTCATTTTC
GCATCGTTGACACATTGTTCTGGTGGGATTTGTACTTTATAGAACATAAAATGGTTAGGA
GGAATTGGGATTATGAGATTGCAGGAGGCTTATTTTGACCCTGTGATTCCATTGAGAATG
ATTTGTTGGAATAATTCAGAAAATGGAAGCTATTATGCCCC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL6063Contig1 969 2 10 U
GGCTACGGAGGTGGTTTGAAAGGGCTTGAGAGGTTGTCTTACATCAACTCTGTGGTGTAT
CCGTGGACCTCTATACCACTTCTCGTCTACTGCTCTCTCCCTGCTATCTGTCTCCTCACC
GGGAAGTTCATCGTCCCTGAGATTAGTAACTACGCAAGTATCCTCTTCATGGCACTTTTC
GCGTCGATAGCTGTGACAGGCATCCTAGAGATGCAATGGAGCAGAGTAGGGATCCATGAC
TGGTGGAGAAACGAGCAGTTTTGGGTGATAGGAGGCGTTTCAGCTCATCTCTTCGCTCTC
TTCCAAGGTCTCCTCAAGGTTTTAGCCGGAGTCGAAACAAACTTCACCGTCACGTCAAAG
GCGGCGGACGACGGGGAGTTCTCGGAGCTCTATATTTTCAAATGGACGTCACTCCTGATC
CCTCCGACCACGCTGTTCATCATCAACGTGATCGGAGTCGTCGTGGGAATCTCTGACGCC
ATCAGCAACGAGTATGACTCGTGGGGACCGTTGTTCGGGAGACTGTTCTTTGCTCTTTGG
GTGATTCTTCATCTTTATCCTTTCTTGAAAGGGTTGCTTGGGAAGCAAGACAGGATGCCT
ACTATTATTCTTGTTTGGTCGATTCTTCTGTCCTCTATCTTGACGCTTCTTTGGGTCAGA
GTTAATCCGTTTGTGGCTAAAGGTGGTCCGGTGCTAGAGATATGCGGTTTGGACTGTCTT
TGATTGATTTACATTTTAAAAAAAACGTTTTTTCTTTCCACAGGTTTAAGTAGAGAGGAG
TGTCTCGCGGATTTGTGTTAATGTGTTGTATTATTTATTGGGGAGAAGAAAAAAATAGTA
GATTGGAGAAGAAAATGGATTTAGATATGTAATGCTTTTTTTTTTCTTCTTCTGAAAGGT
GTTGTATTGTAGATATAGTAGATGTTGTTTCTATTTGTTCTTGTTATACATATATTTTTT
TTTGTGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F650TF U 1
AF RR2DH80JQ C 143
BS 1 336 RR2F650TF
BS 337 337 RR2DH80JQ
BS 338 744 RR2F650TF
BS 745 745 RR2DH80JQ
BS 746 752 RR2F650TF
BS 753 753 RR2DH80JQ
BS 754 763 RR2F650TF
BS 764 764 RR2DH80JQ
BS 765 788 RR2F650TF
BS 789 969 RR2DH80JQ

RD RR2F650TF 791 0 0
GGCTACGGAGGTGGTTTGAAAGGGCTTGAGAGGTTGTCTTACATCAACTCTGTGGTGTAT
CCGTGGACCTCTATACCACTTCTCGTCTACTGCTCTCTCCCTGCTATCTGTCTCCTCACC
GGGAAGTTCATCGTCCCTGAGATTAGTAACTACGCAAGTATCCTCTTCATGGCACTTTTC
GCGTCGATAGCTGTGACAGGCATCCTAGAGATGCAATGGAGCAGAGTAGGGATCCATGAC
TGGTGGAGAAACGAGCAGTTTTGGGTGATAGGAGGCGTTTCAGCTCATCTCTTCGCTCTC
TTCCAAGGTCTCCTCAAGGTTTTAGCCGGAGTCGAAGCAAACTTCACCGTCACGTCAAAG
GCGGCGGACGACGGGGAGTTCTCGGAGCTCTATATTTTCAAATGGACGTCACTCCTGATC
CCTCCGACCACGCTGTTCATCATCAACGTGATCGGAGTCGTCGTGGGAATCTCTGACGCC
ATCAGCAACGAGTATGACTCGTGGGGACCGTTGTTCGGGAGACTGTTCTTTGCTCTTTGG
GTGATTCTTCATCTTTATCCTTTCTTGAAAGGGTTGCTTGGGAAGCAAGACAGGATGCCT
ACTATTATTCTTGTTTGGTCGATTCTTCTGTCCTCTATCTTGACGCTTCTTTGGGTCAGA
GTTAATCCGTTTGTGGCTAAAGGTGGTCCGGTGCTAGAGATATGCGGTTTGGACTGTCTT
TGATTGATTTACATTTTAAAAAAA*CGTTTTT*CTTTCCACAG*TTTAAGTAGAGAGGAG
TGTCTCGC
AGA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2DH80JQ 827 0 0
GATAGT
ACTACGCAAGTATCCTCTTCATG*CACTTT*CGCGTCGATAGCTGTGACAGGCATCCTAG
AGATGCAATG*AGCAGAGTAGGGATCCATGACTGG*GGAGAAACGAGCAGTTTTGGGTGA
TAGGAGGCGTTTCAGCTCATCTCTTCGCTCTCTTCCAAGGTCTCCTCAAGGTTTTAGCCG
GAGTCGAAACAAACTTCACCGTCACGTCAAAGGCGGCGGACGACGGGGAGTTCTCGGAGC
TCTATATTTTCAAATGGACGTCACTCCTGATCCCTCCGACCACGCTGTTCATCATCAACG
TGATCGGAGTCGTCGTGGGAATCTCTGACGCCATCAGCAACGGGTATGACTCGTGGGGAC
CGTTGTTCGGGAGACTGTTCTTTGCTCTTTGGGTGATTCTTCATCTTTATCCTTTCTTGA
AAGGGTTGCTTGGGAAGCAAGACAGGATGCCTACTATTATTCTTGTTTGGTCGATTCTTC
TGTCCTCTATCTTGACGCTTCTTTGGGTCAGAGTTAATCCGTTTGTGGCTAAAGGTGGTC
CGGTGCTAGAGATATGCGGTTTGGACTGTCTTTGATTGATTTACATTTTAAAAAAAACGT
TTTTTCTTTCCACAGGTTTAAGTAGAGAGGAGTGTCTCGCGGATTTGTGTTAATGTGTTG
TATTATTTATTGGGGAGAAGAAAAAAATAGTAGATTGGAGAAGAAAATGGATTTAGATAT
GTAATGCTTTTTTTTTTCTTCTTCTGAAAGGTGTTGTATTGTAGATATAGTAGATGTTGT
TTCTATTTGTTCTTGTTATACATATATTTTTTTTTGTGGCG

QA 7 827 7 827
DS 



AS 1 2

CO CL6064Contig1 1017 2 8 U
GGAAGGTAGTTGTTGAAGAGGAAGCTTCGGAGGAAAACGAGAGAGATGCAAAACCAAATG
GAGACTCAACTGTGGATAGTTCTGAAAGAGCGAAAGAAGCAGAGAGTGTCAGCGAGGAAA
AGAGGAGTAGAGGCAATAGGAGAGGGAGTAGAGCGACGAGGCATAAGTTGCTAGCAGATG
TTGATCGGAAATGCAAGTTGGTTGATTTTGGGAATGCTTGTTGGACTTACAAGCAGTTTA
CGAGTGATATTCAGACAAGGCAGTACCGATGTCCTGAGGTTATTCTTGGCTCAAAGTACT
CGACCTCCGCGGATATGTGGTCGTTTGCCTGCATTTGTTTCGAGCTTGCTACTGGAGATG
TTCTCTTTGATCCTCACAGTGGTGAAAACTATGAGAGGGATGAGGATCACTTGGCATTGA
TGATGGAGCTTCTAGGAATGACGCCACGAAAGATTGCATTAGGAGGACGCTACTCGCGGG
ACTACTTCAACCGACAAGGTGAACTAAGGCACATTAGGCGGTTGCGGTTTTGGCCACTGA
GCAAGGTTTTGATGGAGAAATACGAATTCAGCGAGGAAGACGCGGTTGCTATGCAAGATT
TCATCACTCCAATTCTTGAATTTGCACCTGACAAGAGACCAACGGCTGCAAAGTGCCTAA
CGCACCCGTGGTTGAATCCTGTCCCTAGATCGCTTAAACCAGCGTCATCTAGTCCGCAAA
AGTCTAAAGAAGAAGAAGATTCTAAAGATGAGAATGGAAGCAAGGAGAAGGATGAGAGGG
AGGCCATGGAGGTTGGTGTTGGGAATATGGCCATTGATGGCTCAGAGGCAAAGACCTCAG
GAAGAGCAGGTCGTCAATCTGCTCGTGATCTTCGCAATTGAGGAAACACGTGTCCCTGAA
AAAAGTTTTGTATTTGTCTTTTGAATCACGGATTTAGAGTGTGTTTGTTTTTCTTTTCCC
TCGGCTTGTTGGTACCAAAAGATTTGAACTTTCATTCGCTTTCGAAGATACGATTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX15TF U 1
AF RR2CX15JQ C 238
BS 1 641 RR2CX15TF
BS 642 642 RR2CX15JQ
BS 643 656 RR2CX15TF
BS 657 657 RR2CX15JQ
BS 658 720 RR2CX15TF
BS 721 721 RR2CX15JQ
BS 722 731 RR2CX15TF
BS 732 1017 RR2CX15JQ

RD RR2CX15TF 747 0 0
GGAAGGTAGTTGTTGAAGAGGAAGCTTCGGAGGAAAACGAGAGAGATGCAAAACCAAATG
GAGACTCAACTGTGGATAGTTCTGAAAGAGCGAAAGAAGCAGAGAGTGTCAGCGAGGAAA
AGAGGAGTAGAGGCAATAGGAGAGGGAGTAGAGCGACGAGGCATAAGTTGCTAGCAGATG
TTGATCGGAAATGCAAGTTGGTTGATTTTGGGAATGCTTGTTGGACTTACAAGCAGTTTA
CGAGTGATATTCAGACAAGGCAGTACCGATGTCCTGAGGTTATTCTTGGCTCAAAGTACT
CGACCTCCGCGGATATGTGGTCGTTTGCCTGCATTTGTTTCGAGCTTGCTACTGGAGATG
TTCTCTTTGATCCTCACAGTGGTGAAAACTATGAGAGGGATGAGGATCACTTGGCATTGA
TGATGGAGCTTCTAGGAATGACGCCACGAAAGATTGCATTAGGAGGACGCTACTCGCGGG
ACTACTTCAACCGACAAGGTGAACTAAGGCACATTAGGCGGTTGCGGTTTTGGCCACTGA
GCAAGGTTTTGATGGAGAAATACGAATTCAGCGAGGAAGACGCGGTTGCTATGCAAGATT
TCATCACTCCAATTCTTGAATTTGCACCTGACAAGAGACCA*CGGCTGCAAAGTGC*TAA
CGCACCCGTGGTTGAATCCTGTCCCTAGATCGCTTAAACCAGCGTCATCTAGTCCGCAAA
*GTCTAAAGAA
AAGAGATTCTAAAGAT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2CX15JQ 780 0 0
TTACGAGTGATATTCAGACAAGGCAGTACCGATGTCCTGAGGTTATTCTTGGCTCAAAGT
ACTCGACCTCCGCGGATATGTGGTCGTTTGCCTGCATTTGTTTCGAGCTTGCTACTGGAG
ATGTTCTCTTTGATCCTCACAGTGGTGAAAACTATGAGAGGGATGAGGATCACTTGGCAT
TGATGATGGAGCTTCTAGGAATGACGCCACGAAAGATTGCATTAGGAGGACGCTACTCGC
GGGACTACTTCAACCGACAAGGTGAACTAAGGCACATTAGGCGGTTGCGGTTTTGGCCAC
TGAGCAAGGTTTTGATGGAGAAATACGAATTCAGCGAGGAAGACGCGGTTGCTATGCAAG
ATTTCATCACTCCAATTCTTGAATTTGCACCTGACAAGAGACCAACGGCTGCAAAGTGCC
TAACGCACCCGTGGTTGAATCCTGTCCCTAGATCGCTTAAACCAGCGTCATTTAGTCCGC
AAAAGTCTAAAGAAGAAGAAGATTCTAAAGATGAGAATGGAAGCAAGGAGAAGGATGAGA
GGGAGGCCATGGAGGTTGGTGTTGGGAATATGGCCATTGATGGCTCAGAGGCAAAGACCT
CAGGAAGAGCAGGTCGTCAATCTGCTCGTGATCTTCGCAATTGAGGAAACACGTGTCCCT
GAAAAAAGTTTTGTATTTGTCTTTTGAATCACGGATTTAGAGTGTGTTTGTTTTTCTTTT
CCCTCGGCTTGTTGGTACCAAAAGATTTGAACTTTCATTCGCTTTCGAAGATACGATTCA

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL6065Contig1 715 2 3 U
GGATCGACAAAAAAAAAAACACATTTGCGAATCTTATCTCCGTCCGTCCTCCGTCGCGAT
GGAAACGCCAAAGACCTCTCTGATCCCTAGCTTCCTCTATTCCTCTTCCTTATCCTCATC
TCCGAGATCTCTTTTGAGCTCCTCCAATTCCGACGCCGCGTTCGTCGCATCCCCCAATCT
CGAGAAGTCTCCTTCTCCGGCGATGCTGTCTCGGAAGAGTTTTCTCATTGCGTCCCCCAC
GGAGCCAGGGAAGGGGATCGAGATGTACTCGCCTGCCTTCTACGCCGCGTGTACCTTCGG
TGGAGTTCTCAGCTGTGGTCTCACGCATATGACCGTCACCCCTCTTGATCTCGTCAAGTG
TAATATGCAGATCGATCCGGCCAAGTACAAGAGCATCTCGTCTGGTTTCGGGATTTTGCT
GAAAGAGCAAGGAGTCAAAGGCTTCTTCCGTGGATGGGTTCCTACTCTGTTGGGTTACAG
TGCTCAGGGTGCCTGCAAGTTTGGATTCTACGAGTTCTTTAAGAAGTACTACTCTGATCT
CGCTGGACCTGAGTTCGCCGCCAAATACAAGACCCTCATCTACCTTGCTGGTTCCGCCTC
TGCTGAGGTTATCGCCGATATCGCACTCTGCCCGTTTGAAGCTGTTAGGTCCGTGTTCAG
ACACAGCCTGATTTGCCAGGGGGATGTCTGATGGGTTTCCTAAGTTTGTCAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C887TF U 46
AF RR2BR89TF U 1
BS 1 324 RR2BR89TF
BS 325 325 RR2C887TF
BS 326 715 RR2BR89TF

RD RR2C887TF 301 0 0
CGTCC
CCGTCGCGATGGAAACGCCAAAGACTTCTCTGATCCCTAGCTTCCTCTATTCCTCTTCCT
TATCCTCATCTCCGAGATCTCTTTTGAGCTCCTCCAATTCCGACGCCGCGTTCGTCGCAT
CCCCCAATCTCGAGAAGTCTCCTTCTCCGGCGATGCTGTCTCGGAAGAGTTTTCTCATTG
CGTCCCCCACGGAGCCAGGGAAGGGGATCGAGATGTACTCGCCTGCCTTCTACGCCGCGT
GTACCTTCGGTGGAGTTCTCAGCTGTGGTCTCACGCATATGACCGTCACCCCTCTT

QA 6 301 6 301
DS 

RD RR2BR89TF 715 0 0
GGATCGACAAAAAAAAAAACACATTTGCGAATCTTATCTCCGTCCGTCCTCCGTCGCGAT
GGAAACGCCAAAGACCTCTCTGATCCCTAGCTTCCTCTATTCCTCTTCCTTATCCTCATC
TCCGAGATCTCTTTTGAGCTCCTCCAATTCCGACGCCGCGTTCGTCGCATCCCCCAATCT
CGAGAAGTCTCCTTCTCCGGCGATGCTGTCTCGGAAGAGTTTTCTCATTGCGTCCCCCAC
GGAGCCAGGGAAGGGGATCGAGATGTACTCGCCTGCCTTCTACGCCGCGTGTACCTTCGG
TGGAGTTCTCAGCTGTGGTCTCACTCATATGACCGTCACCCCTCTTGATCTCGTCAAGTG
TAATATGCAGATCGATCCGGCCAAGTACAAGAGCATCTCGTCTGGTTTCGGGATTTTGCT
GAAAGAGCAAGGAGTCAAAGGCTTCTTCCGTGGATGGGTTCCTACTCTGTTGGGTTACAG
TGCTCAGGGTGCCTGCAAGTTTGGATTCTACGAGTTCTTTAAGAAGTACTACTCTGATCT
CGCTGGACCTGAGTTCGCCGCCAAATACAAGACCCTCATCTACCTTGCTGGTTCCGCCTC
TGCTGAGGTTATCGCCGATATCGCACTCTGCCCGTTTGAAGCTGTTAGGTCCGTGTTCAG
ACACAGCCTGATTTGCCAGGGGGATGTCTGATGGGTTTCCTAAGTTTGTCAAGTC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL6066Contig1 484 2 1 U
GGACTTATTTTGAAACAAAAAATTTCCTCTAGAACTACATATAATTTGAAACGGAGGGAG
TAACTTTCTACGTCAAATTCATTACTCTTTTTGTTAGGAAAAGTATAAATTTGAAATAAG
AAAATGGCAACTAACAAAATCTCCTTCTTCTTGGTTCTTTGCATCTGTGTTTTGTTATCC
TCAGGATTTGGAAAAGCAGCACTAAATCCAACGGGGAAAAAATGTCCGGATCCAAATGGT
GTAGACAAAAAAGCTGCATGTTATAGCTACTGCAAAACACAGGGTTTTATGGGTGGTTCT
TGTCAAGGACATAAAGGTAATTACATGTGTAAGTGTTATGAAGGTAAATGAATATTTGCG
AATTTTGTTACTTTCAAATAAATACTCGTTGGTTTGGTTTTATGAGGAATAATAAACTCA
AATAAATACTTTAGTTGATGTATCTGTTTTATTCTACTTTTCAATATTTAAGATATTTTT
CACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2DH36JQ C 1
AF RR2DH36TF U 1
BS 1 484 RR2DH36TF

RD RR2DH36JQ 484 0 0
GGACTTATTTTGAAACAAAAAATTTCCTCTAGAACTACATATAATTTGAAACGGAGGGAG
TAACTTTCTACGTCAAATTCATTACTCTTTTTGTTAGGAAAAGTATAAATTTGAAATAAG
AAAATGGCAACTAACAAAATCTCCTTCTTCTTGGTTCTTTGCATCTGTGTTTTGTTATCC
TCAGGATTTGGAAAAGCAGCACTAAATCCAACGGGGAAAAAATGTCCGGATCCAAATGGT
GTAGACAAAAAAGCTGCATGTTATAGCTACTGCAAAACACAGGGTTTTATGGGTGGTTCT
TGTCAAGGACATAAAGGTAATTACATGTGTAAGTGTTATGAAGGTAAATGAATATTTGCG
AATTTTGTTACTTTCAAATAAATACTCGTTGGTTTGGTTTTATGAGGAATAATAAACTCA
AATAAATACTTTAGTTGATGTATCTGTTTTATTCTACTTTTCAATATTTAAGATATTTTT
CACG

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2DH36TF 484 0 0
GGACTTATTTTGAAACAAAAAATTTCCTCTAGAACTACATATAATTTGAAACGGAGGGAG
TAACTTTCTACGTCAAATTCATTACTCTTTTTGTTAGGAAAAGTATAAATTTGAAATAAG
AAAATGGCAACTAACAAAATCTCCTTCTTCTTGGTTCTTTGCATCTGTGTTTTGTTATCC
TCAGGATTTGGAAAAGCAGCACTAAATCCAACGGGGAAAAAATGTCCGGATCCAAATGGT
GTAGACAAAAAAGCTGCATGTTATAGCTACTGCAAAACACAGGGTTTTATGGGTGGTTCT
TGTCAAGGACATAAAGGTAATTACATGTGTAAGTGTTATGAAGGTAAATGAATATTTGCG
AATTTTGTTACTTTCAAATAAATACTCGTTGGTTTGGTTTTATGAGGAATAATAAACTCA
AATAAATACTTTAGTTGATGTATCTGTTTTATTCTACTTTTCAATATTTAAGATATTTTT
CACG

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 2

CO CL6067Contig1 687 2 1 U
CTATTAAAAATGGCTACTGAAAGGATGAATCCCATCAACATGAACACCATGTCTTCATCT
CTTCGGAGAACCGGTCAATGGGTTTTTTCACAAGATATTCCTACAGATGTTGTAGTTTAT
GTCGGAGAAGCTAATTTTTCCCTTCATAAGTTCATGCTAGTGGCCAAGAGCAACTACATG
AGGAAGCTAATAATGGAATCCAAAGACAGTGACGTGGCGAGAATAGATCTCTCGGATATC
CCCGGAGGTCCTGCGATGTTCGAGAAAGCTGCCAAATTCTGCTACGGTGTTAACTTCGAG
ATTACTGTCCAGAACGTGGCGGCTCTTCATTGCGCCGCTGAGTTTCTTCAGATGACTGAC
AAGTACTGCGACATCAACCTCGCCGGTAGGACACAAGACTTCCTTTCTCAGGCCACTCTC
TCTAGCCTCTCTGGAGCCATCGTCGTCCTCAAGTCTTGCGAGATACTCCTTCCTATTTCT
AGTGATATAGGTGTTGTCCGCCGTTGTGTGGACGTCGTCGGTGCTAAGGTTTTTTTTTTA
ATTCATAGCTTATTCTCACTTACTTTCTATGTGTTAAACTTAGATCCTGGTTTTGGTTAG
TGTTTAGTAGTATTCAAGAAATCATTAGACGGTAAGTAAGTGATGTATAGAAGATTAACG
GCTATGCGAAAAGCTTAGATGCTGCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C113JQ C 1
AF RR2C113TF U 1
BS 1 687 RR2C113TF

RD RR2C113JQ 687 0 0
CTATTAAAAATGGCTACTGAAAGGATGAATCCCATCAACATGAACACCATGTCTTCATCT
CTTCGGAGAACCGGTCAATGGGTTTTTTCACAAGATATTCCTACAGATGTTGTAGTTTAT
GTCGGAGAAGCTAATTTTTCCCTTCATAAGTTCATGCTAGTGGCCAAGAGCAACTACATG
AGGAAGCTAATAATGGAATCCAAAGACAGTGACGTGGCGAGAATAGATCTCTCGGATATC
CCCGGAGGTCCTGCGATGTTCGAGAAAGCTGCCAAATTCTGCTACGGTGTTAACTTCGAG
ATTACTGTCCAGAACGTGGCGGCTCTTCATTGCGCCGCTGAGTTTCTTCAGATGACTGAC
AAGTACTGCGACATCAACCTCGCCGGTAGGACACAAGACTTCCTTTCTCAGGCCACTCTC
TCTAGCCTCTCTGGAGCCATCGTCGTCCTCAAGTCTTGCGAGATACTCCTTCCTATTTCT
AGTGATATAGGTGTTGTCCGCCGTTGTGTGGACGTCGTCGGTGCTAAGGTTTTTTTTTTA
ATTCATAGCTTATTCTCACTTACTTTCTATGTGTTAAACTTAGATCCTGGTTTTGGTTAG
TGTTTAGTAGTATTCAAGAAATCATTAGACGGTAAGTAAGTGATGTATAGAAGATTAACG
GCTATGCGAAAAGCTTAGATGCTGCCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2C113TF 687 0 0
CTATTAAAAATGGCTACTGAAAGGATGAATCCCATCAACATGAACACCATGTCTTCATCT
CTTCGGAGAACCGGTCAATGGGTTTTTTCACAAGATATTCCTACAGATGTTGTAGTTTAT
GTCGGAGAAGCTAATTTTTCCCTTCATAAGTTCATGCTAGTGGCCAAGAGCAACTACATG
AGGAAGCTAATAATGGAATCCAAAGACAGTGACGTGGCGAGAATAGATCTCTCGGATATC
CCCGGAGGTCCTGCGATGTTCGAGAAAGCTGCCAAATTCTGCTACGGTGTTAACTTCGAG
ATTACTGTCCAGAACGTGGCGGCTCTTCATTGCGCCGCTGAGTTTCTTCAGATGACTGAC
AAGTACTGCGACATCAACCTCGCCGGTAGGACACAAGACTTCCTTTCTCAGGCCACTCTC
TCTAGCCTCTCTGGAGCCATCGTCGTCCTCAAGTCTTGCGAGATACTCCTTCCTATTTCT
AGTGATATAGGTGTTGTCCGCCGTTGTGTGGACGTCGTCGGTGCTAAGGTTTTTTTTTTA
ATTCATAGCTTATTCTCACTTACTTTCTATGTGTTAAACTTAGATCCTGGTTTTGGTTAG
TGTTTAGTAGTATTCAAGAAATCATTAGACGGTAAGTAAGTGATGTATAGAAGATTAACG
GCTATGCGAAAAGCTTAGATGCTGCCC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL6068Contig1 734 2 3 U
GGACTTCAAAAGATGCAAAGCCCTCTCTCTTCTGAAGGTCCATCAGGTTCAAATCCATTC
CCAATGGCACAAAAGTTGGAAGCGAAAGGCGGGAATGGAGGCAAGGAATGGGATGATGGA
GCCGATCATGAGGGTGTATCAAAGATTTATATACGAGAGGGTAGCGAAGGTATAGAGTCC
ATCAAGTTCGACTATGTCAAGAGAGGAGAACCTGAAGCTGGACAAGTCCATGGTGGCTCG
GGTCAAGATTTCACTGACTCGTTTGATCTTAACCATACCATTGGTGAGCATATCGTATCT
ATTAAGTGTTACTACCACGAGGGTGCGATACAAGGCCTTGTGGTCAAAACTAACACCAGG
AGTTCTGCACTCATGGGGTACAACCTTGGTACCAAGTTTAAACTTCAAGTGAAAGACAAG
AAGATCATTGGGTTTCGTGGATCTTCTAACAAAACCCTAAACTCTCTTGGAGCTTATTTC
GTACCTCTTCCTCCTGCTAATATGGAAATCTAAGAGTTCTACCGAAAAGCTATATACAAG
ATTCATCGGTTTGATTTTTATGTTGCTTTGAATCTGTAATTGACTTTGTACCATCTTCCT
TATTGTTTTAGCGTGCCTTTCACTTATTCAATTGCTTGCACGTTACATATTGCGATAAGG
TATATATTTATTTTGTTTTTTGTTCGGACCAAGTTCCATTCTTAATAAAAAAACAAATAT
GCCATTTTATCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B259TF U 173
AF RR2B259JQ C 1
BS 1 172 RR2B259JQ
BS 173 685 RR2B259TF
BS 686 734 RR2B259JQ

RD RR2B259TF 513 0 0
TAGAGTCCATCAAGTTCGACTATGTCAAGAGAGGAGAACCTGAAGCTGGACAAGTCCATG
GTGGCTCGGGTCAAGATTTCACTGACTCGTTTGATCTTAACCATACCATTGGTGAGCATA
TCGTATCTATTAAGTGTTACTACCACGAGGGTGCGATACAAGGCCTTGTGGTCAAAACTA
ACACCAGGAGTTCTGCACTCATGGGGTACAACCTTGGTACCAAGTTTAAACTTCAAGTGA
AAGACAAGAAGATCATTGGGTTTCGTGGATCTTCTAACAAAACCCTAAACTCTCTTGGAG
CTTATTTCGTACCTCTTCCTCCTGCTAATATGGAAATCTAAGAGTTCTACCGAAAAGCTA
TATACAAGATTCATCGGTTTGATTTTTATGTTGCTTTGAATCTGTAATTGACTTTGTACC
ATCTTCCTTATTGTTTTAGCGTGCCTTTCACTTATTCAATTGCTTGCACGTTACATATTG
CGATAAGGTATATATTTATTTTGTTTTTTGTTC

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2B259JQ 734 0 0
GGACTTCAAAAGATGCAAAGCCCTCTCTCTTCTGAAGGTCCATCAGGTTCAAATCCATTC
CCAATGGCACAAAAGTTGGAAGCGAAAGGCGGGAATGGAGGCAAGGAATGGGATGATGGA
GCCGATCATGAGGGTGTATCAAAGATTTATATACGAGAGGGTAGCGAAGGTATAGAGTCC
ATCAAGTTCGACTATGTCAAGAGAGGAGAACCTGAAGCTGGACAAGTCCATGGTGGCTCG
GGTCAAGATTTCACTGACTCGTTTGATCTTAACCATACCATTGGTGAGCATATCGTATCT
ATTAAGTGTTACTACGACGAGGGTGCGATACAAGGCCTTGTGGTCAAAACTAACACCAGG
AGTTCTGCACTCATGGGGTACAACCTTGGTACCAAGTTTAAACTTCAAGTGAAAGACAAG
AAGATCATTGGGTTTCGTGGATCTTCTAACAAAACCCTAAACTCTCTTGGAGCTTATTTC
GTACCTCTTCCTCCTGGTAATATGGAAATTTAAGAGTTCTACCGAAAAGCTATATACAAG
ATTCATCGGTTTGATTTTTATGTTGCTTTGAATCTGTAATTGACTTTGTACCATCTTCCT
TATTGTTTTAGCGTGCCTTTCACTTATTCAATTGCTTGCACGTTACATATTGCGATAAGG
TATATATTTATTTTGTTTTTTGTTCGGACCAAGTTCCATTCTTAATAAAAAAACAAATAT
GCCATTTTATCAGT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL6069Contig1 1067 2 2 U
GGATCAAACTCTGATCAGAAAACAAACAAACACAGGAGGATGAAGATCTTCTTCATCTTT
TTCTTTGTTTTATTCTCCTTCCTTGTCCATTCTTGTTTGTCCAACAACATGATCATGAGA
ACACAGTCCATGAGAGATGGTGATGTTATATACTCTGAAGGAAAGAGATTCGTTTTTGGA
TTCTTCAGCCTGGGGGCTTCAAAGCTCAGGTACGTTGGGATTTGGTATGCTCAAGTCTCT
GAGCAAACTGTTGTATGGGTTGCAAACAGAGACCATCCTATTAATGCCACATCTGGTGTG
ATAAGGTTCAGCAGCAGAGGGAATCTCTGCATCTATACATCAGTCAACGGAACAGAACCT
ATCTGGTCCACTGATGTTTTGGATACCATCTCAGAACCGGCTCTAGTTGCGAAGCTATCT
GATCTAGGCAACCTTGTTCTGCTTGATCCTGTCACAGGAAAAAGCTTCTGGGAGAGCTTT
AACCATCCTACAAACACTTTGCTTCCGTTTATGAAGTTTGGATTCACTCGCCAAGACGGT
GTGGATCGGTTCATAACGTCGTGGAGATCTCCTGGTGACCCTGGTTTTGGAAACGTTACG
TACAGGATAGACCGCAGAGGGTTTCCGCAGATGATGATGTATAAAGGAACGGCTCTGTGG
TGGCGAACTGGGTCATGGACAGGGCAGAGATGGAGCGGTGTGCCTCAAATGACAAACAAG
TTCATCTTCAATATCTCGTTTTGAATAGTCCTGATGAAGTATCAATCACTTACGGTGTGT
TGGATCCTTCGGTCGTAACAAGAATGGTTTTAAACGAGACGGGGATCCTGCAACGGTTCA
CATGGAACGGGAGGGATAAAAAGTGGATAGGGTTTTGGTCGGCTCCTGAAGAGAAGTGTG
ACAACTACAACCACTGTGGCCTCAACGGTTATTGCGATACCACAAGTCCAGACAAGTTTG
AGTGCTCTTGCTTACCGGGGCACGAGCCTAAAACACCCCAAGCTTGGAACTTGAGGGATG
CTTCGGATGGGTGTAAGAGGAGCAAAGCAGCTTCGACATGTAAAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT74TF U 1
AF RR2FT74JQ C 504
BS 1 744 RR2FT74TF
BS 745 1067 RR2FT74JQ

RD RR2FT74TF 744 0 0
GGATCAAACTCTGATCAGAAAACAAACAAACACAGGAGGATGAAGATCTTCTTCATCTTT
TTCTTTGTTTTATTCTCCTTCCTTGTCCATTCTTGTTTGTCCAACAACATGATCATGAGA
ACACAGTCCATGAGAGATGGTGATGTTATATACTCTGAAGGAAAGAGATTCGTTTTTGGA
TTCTTCAGCCTGGGGGCTTCAAAGCTCAGGTACGTTGGGATTTGGTATGCTCAAGTCTCT
GAGCAAACTGTTGTATGGGTTGCAAACAGAGACCATCCTATTAATGCCACATCTGGTGTG
ATAAGGTTCAGCAGCAGAGGGAATCTCTGCATCTATACATCAGTCAACGGAACAGAACCT
ATCTGGTCCACTGATGTTTTGGATACCATCTCAGAACCGGCTCTAGTTGCGAAGCTATCT
GATCTAGGCAACCTTGTTCTGCTTGATCCTGTCACAGGAAAAAGCTTCTGGGAGAGCTTT
AACCATCCTACAAACACTTTGCTTCCGTTTATGAAGTTTGGATTCACTCGCCAAGACGGT
GTGGATCGGTTCATAACGTCGTGGAGATCTCCTGGTGACCCTGGTTTTGGAAACGTTACG
TACAGGATAGACCGCAGAGGGTTTCCGCAGATGATGATGTATAAAGGAACGGCTCTGTGG
TGGCGAACTGGGTCATGGACAGGGCAGAGATGGAGCGGTGTGCCTCAAATGACAAACAAG
TTCATCTTCAATATCTCGTTTTGA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2FT74JQ 564 0 0
TCCGTTTATGAAGTTTGGATTCACTCGCCAAGACGGTGTGGATCGGTTCATAACGTCGTG
GAGATCTCCTGGTGACCCTGGTTTTGGAAACGTTACGTACAGGATAGACCGCAGAGGGTT
TCCGCAGATGATGATGTATAAAGGAACGGCTCTGTGGTGGCGAACTGGGTCATGGACGGG
GCAGAGATGGAGCGGTGTGCCTCAAATGACAAACAAGTTCATCTTCAATATCTCGTTTTG
AATAGTCCTGATGAAGTATCAATCACTTACGGTGTGTTGGATCCTTCGGTCGTAACAAGA
ATGGTTTTAAACGAGACGGGGATCCTGCAACGGTTCACATGGAACGGGAGGGATAAAAAG
TGGATAGGGTTTTGGTCGGCTCCTGAAGAGAAGTGTGACAACTACAACCACTGTGGCCTC
AACGGTTATTGCGATACCACAAGTCCAGACAAGTTTGAGTGCTCTTGCTTACCGGGGCAC
GAGCCTAAAACACCCCAAGCTTGGAACTTGAGGGATGCTTCGGATGGGTGTAAGAGGAGC
AAAGCAGCTTCGACATGTAAAGGG

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

CO CL6070Contig1 806 2 2 U
GGCTCGTGCTTCATCTCTGCACATGTAAGCACCGCTTCTGGGTTACACGCAGACATGGCT
TCTCTATCGTACGGAGTTTCGAACATATGCAGAAGCCATGAGATTCTGTCGGCAACGGTT
CAGATTCGTCCCACTGGGCTACATATCACAGGAAGAATCAGAGCTGCGAAGAAAACCTTA
TATAATGGATTGTCATCATCAGTGGAGGGGAGAGTCAATACACAAAGAATGATGTGTAGA
GTGAGCTCAGAATCATCTACTGAAACTGAAGAAGATTCTGCCACAAAGACCAAGGTCTCA
TCATCTTCATCTCCTCAATTGCATATCTTCATGTCCTAAAGCAAACTCTTGTTGGCTTGT
AATTACAGAAGACGCCGTTTGGATACACGAGGAAGGATGTTCTCTTGATAGGAGTGGGAG
TGACTGCACTCGGTATCGGGCTAGAGAGTGGCCTTGAGTATGTGGGAGTAGATCCTTTGC
AAGCAGGTAATGCTGTACAGCTGATATTGGTGCTAGGCTCGACACTAGGTTGGATATCGA
CTTACATCTTTAGAGTCGGTAACAAGGAGATGACTTATGCTCAGCAGCTTCGTGACTACG
AGTCACAAGTCATGCAGAAACGGTTGGAGAGCTTATCTGAGGCCGAGTTAGAGGCGTTGA
TGGAACAAGTTGATGAAGAGAAGAGACAAGTTTAGTAGGCTTAGGCTCCTCTACTGTTCC
GTTCACCTGCAAAATTAGTAAAAGAATCACAGGAAGGTTTTAATGTTGGTTCTTGTCCCT
CAATGTTGGTTGTATGATACACAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D724TF U 1
AF RR2D724JQ C 50
BS 1 736 RR2D724TF
BS 737 806 RR2D724JQ

RD RR2D724TF 736 0 0
GGCTCGTGCTTCATCTCTGCACATGTAAGCACCGCTTCTGGGTTACACGCAGACATGGCT
TCTCTATCGTACGGAGTTTCGAACATATGCAGAAGCCATGAGATTCTGTCGGCAACGGTT
CAGATTCGTCCCACTGGGCTACATATCACAGGAAGAATCAGAGCTGCGAAGAAAACCTTA
TATAATGGATTGTCATCATCAGTGGAGGGGAGAGTCAATACACAAAGAATGATGTGTAGA
GTGAGCTCAGAATCATCTACTGAAACTGAAGAAGATTCTGCCACAAAGACCAAGGTCTCA
TCATCTTCATCTCCTCAATTGCATATCTTCATGTCCTAAAGCAAACTCTTGTTGGCTTGT
AATTACAGAAGACGCCGTTTGGATACACGAGGAAGGATGTTCTCTTGATAGGAGTGGGAG
TGACTGCACTCGGTATCGGGCTAGAGAGTGGCCTTGAGTATGTGGGAGTAGATCCTTTGC
AAGCAGGTAATGCTGTACAGCTGATATTGGTGCTAGGCTCGACACTAGGTTGGATATCGA
CTTACATCTTTAGAGTCGGTAACAAGGAGATGACTTATGCTCAGCAGCTTCGTGACTACG
AGTCACAAGTCATGCAGAAACGGTTGGAGAGCTTATCTGAGGCCGAGTTAGAGGCGTTGA
TGGAACAAGTTGATGAAGAGAAGAGACAAGTTTAGTAGGCTTAGGCTCCTCTACTGTTCC
GTTCACCTGCAAAATT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2D724JQ 757 0 0
CAGACATGGCTTCTCTATCGTACGGAGTTTCGAACATATGCAGAAGCCATGAGATTCTGT
CGGCAACGGTTCAGATTCGTCCCACTGGGCTACATATCACAGGAAGAATCAGAGCTGCGA
AGAAAACCTTATATAATGGATTGTCATCATCAGTGGAGGGGAGAGTCAATACACAAAGAA
TGATGTGTAGAGTGAGCTCAGAATCATCTACTGAAACTGAAGAAGATTCTGCCACAAAGA
CCAAGGTCTCATCATCTTCATCTCCTCAATTGCATATCTTCATGTCCTAAAGCAAACTCT
TGTTGGCTTGTAATTACAGAAGACGCCGTTTGGATACACGAGGAAGGATGTTCTCTTGAT
AGGAGTGGGAGTGACTGCACTCGGTATCGGGCTAGAGAGTGGCCTTGAGTATGTGGGAGT
AGATCCTTTGCAAGCAGGTAATGCTGTACAGCTGATATTGGTGCTAGGCTCGACACTAGG
TTGGATATCGACTTACATCTTTAGAGTCGGTAACAAGGAGATGACTTATGCTCAGCAGCT
TCGTGACTACGAGTCACAAGTCATGCAGAAACGGTTGGAGAGCTTATCTGAGGCCGAGTT
AGAGGCGTTGATGGAACAAGTTGATGAAGAGAAGAGACAAGTTTAGTAGGCTTAGGCTCC
TCTACTGTTCCGTTCACCTGCAAAATTAGTAAAAGAATCACAGGAAGGTTTTAATGTTGG
TTCTTGTCCCTCAATGTTGGTTGTATGATACACAAAA

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL6071Contig1 633 2 2 U
GACTTTAAAGTCTATCTCTTCTGCAACTCTTTAGGGTTTTATCCTCCAAAGTCACAACCT
TTTCTTATCCTCAAGAAATGGCGGCGACGCAGCTTACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAG
CTAGGAGCTTAGCCTCACTGGAAGGTCTCCGTGCTGCTTCGAGCGCAAAGTTTTCATCTT
TTGGAACTTTGAAAGCAGGGAACTTTAGGCAGAGTCACTTCCGTCCTTTGGTTGTTAGAG
CTGCTTCTGTGGTTGCTCCCAAGTACACATCGATTAAGCCATTGGGAGATAGAGTTTTAG
TGAAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAAGAGTATGGGAGGTATCTTTCTTCCATCCACAGCTC
AATCAAAACCTCAAGGAGGTGAAGTCGTTGCTGTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGA
CTAAAATCGACTGGAAGCACAGTTCTGTACTCCAAGTATGCAGGCAATGACTTCAAGGGC
AAAGATGGTTCCAACTACATCGCCCTCAGAGCTTCAGATGTTATGGCTATCCTTTCTTAG
TTTTTCTTTTTTCTTTGTAACCTGCAACTTGTGGAGATTTTTTCATCAACTGAGCATAAT
CTTGAATAAAAAGACTTACATGATTGCGATTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FV52JQ C 1
AF RR2FV52TF U 1
BS 1 612 RR2FV52TF
BS 613 633 RR2FV52JQ

RD RR2FV52JQ 633 0 0
GACTTTAAAGTCTATCTCTTCTGCAACTCTTTAGGGTTTTATCCTCCAAAGTCACAACCT
TTTCTTATCCTCAAGAAATGGCGGCGACGCAGCTTACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAG
CTAGGAGCTTAGCCTCACTGGAAGGTCTCCGTGCTGCTTCGAGCGCAAAGTTTTCATCTT
TTGGAACTTTGAAAGCAGGGAACTTTAGGCAGAGTCACTTCCGTCCTTTGGTTGTTAGAG
CTGCTTCTGTGGTTGCTCCCAAGTACACATCGATTAAGCCATTGGGAGATAGAGTTTTAG
TGAAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAAGAGTATGGGAGGTATCTTTTTTCCATCCACAGCTC
AATCAAAACCTCAAGGAGGTGAAGTCGTTGCTGTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGA
CTAAAATCGACTGGAAGCACAGTTCTGTACTCCAAGTATGCAGGCAATGACTTCAAGGGC
AAAGATGGTTCCAACTACATCGCCCTCAGAGCTTCAGATGTTATGGCTATCCTTTTTTAG
TTTTTCTTTTTTCTTTGTAACCTGCAACTTGTGGAGATTTTTTCATCAACTGAGCATAAT
CTTGAATAAAAAGACTTACATGATTGCGATTTG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2FV52TF 612 0 0
GACTTTAAAGTCTATCTCTTCTGCAACTCTTTAGGGTTTTATCCTCCAAAGTCACAACCT
TTTCTTATCCTCAAGAAATGGCGGCGACGCAGCTTACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAG
CTAGGAGCTTAGCCTCACTGGAAGGTCTCCGTGCTGCTTCGAGCGCAAAGTTTTCATCTT
TTGGAACTTTGAAAGCAGGGAACTTTAGGCAGAGTCACTTCCGTCCTTTGGTTGTTAGAG
CTGCTTCTGTGGTTGCTCCCAAGTACACATCGATTAAGCCATTGGGAGATAGAGTTTTAG
TGAAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAAGAGTATGGGAGGTATCTTTCTTCCATCCACAGCTC
AATCAAAACCTCAAGGAGGTGAAGTCGTTGCTGTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGA
CTAAAATCGACTGGAAGCACAGTTCTGTACTCCAAGTATGCAGGCAATGACTTCAAGGGC
AAAGATGGTTCCAACTACATCGCCCTCAGAGCTTCAGATGTTATGGCTATCCTTTCTTAG
TTTTTCTTTTTTCTTTGTAACCTGCAACTTGTGGAGATTTTTTCATCAACTGAGCATAAT
CTTGAATAAAAA

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL6072Contig1 514 2 3 U
AACAATATCAGTGTGCAAAGTTATCACTTGTGTTATTACAAATCCAAGGAACACCCCACC
AACTCTTTAAACACATCTTGTTACATAAGGAATTATATGATAAAATGGGGTAGGCTTCTT
ATATTTTCGTCATCTACCTACTACCTCCATTGGCAAGTCTCTTGAGATGGTTAAATGCCT
TGTGCTTAATCCACTGCCTGTCATATGGCAGATACGCATTCATCGAGTGTTCATACACCA
AAGCGCTCATGTCAGCAAAACCATCCATAAAGTTGTAAAGATCAGAAATGTCATAGCTAA
GATTTCTGAGAGATGGATTAATCTCCTTCAACTTCCTCTCGTACAAGCCACATATACCAT
CCATAGCTTGGCCTATAGAATCATAGTCCATAAACGTCCTCGTAGCTCTGCTTGGTGAGT
TTTGCAACAAGATGATGGTGTGCCTACCGTTATGGTTACTAGCCATCCTCAAGTGACGGA
TTGACTTCGATGGCAGATTCAAGGGTTGGAGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C550JQ U 49
AF RR2C550TF C 1
BS 1 54 RR2C550TF
BS 55 209 RR2C550JQ
BS 210 514 RR2C550TF

RD RR2C550JQ 161 0 0
GGAACA
CCCACCAACTCTTTAAACACATCTTGTTACATAAGGAATTATATGATAAAATGGGGTAGG
CTTCTTATATTTTCGTCATCTACCTACTACCTCCATTGGCAAGTCTCTTGAGATGGTTAA
ATGCCTTGTGCTTAATCCACTGCCTGTCATATGGC

QA 7 161 7 161
DS 

RD RR2C550TF 514 0 0
AACAATATCAGTGTGCAAAGTTATCACTTGTGTTATTACAAATCCAAGGAACACCCCACC
AACTCTTTAAACACATCTTGTTACATAAGGAATTATATGATAAAATGGGGTAGGCTTCTT
ATATTTTCGTCATCTACCTACTACCTCCATTGGCAAGTCTCTTGAGATGGTTAAATGCCT
TGTGCTTAATCCACTGCCTGTCATATGGCAGATACGCATTCATCGAGTGTTCATACACCA
AAGCGCTCATGTCAGCAAAACCATCCATAAAGTTGTAAAGATCAGAAATGTCATAGCTAA
GATTTCTGAGAGATGGATTAATCTCCTTCAACTTCCTCTCGTACAAGCCACATATACCAT
CCATAGCTTGGCCTATAGAATCATAGTCCATAAACGTCCTCGTAGCTCTGCTTGGTGAGT
TTTGCAACAAGATGATGGTGTGCCTACCGTTATGGTTACTAGCCATCCTCAAGTGACGGA
TTGACTTCGATGGCAGATTCAAGGGTTGGAGACG

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL6073Contig1 774 2 4 U
TGTGCACAATTAACGTTAACCCTGTTGGTCCACTCATACCACCTCCTGCCATTGATGGAA
CCCCTGTACCTCCTCGGGCTAACCCTAAGGTTTACTTTTATATGACCGTGGACGGCAAAC
CAGCTGGTATGATCATAATGGAACTCTTTGCCGACACGACCCCACGGACGGCAGAGAACT
TTCGCGCCCTCTGTACAGGCGAGAAAGGCATGGGGAAGCTTGGTAAGCCACTCCATTACA
AAGGATCGATCATCCACCATGTTGACCCAGGTTATATGATCCAAGGAGGAGATATCATTG
ACGGAGGGAAAGGAAACGGAGGCGAATGTATCTACGACAGTAGGTTTTTCGAGGTTGAGA
ACTTCATCAAGAAGCACACCGGTCCAGGTATCCTCTCCATGTGGAGCCGTGGTCGAAACA
GCACCGGATCTCAGTTCATGATCCACGCGCAGGCGAACCCGGATCTGGATGACGAGTGTG
TTGTGTTCGGCCAAGTCGTTCAAGGAATGGATATAGTCACGAGCATTATGGCTTTGAGCA
CGGAAACTTCCGTACCCGTTGCTGTGATACACAACTGCGGTCAAATTTCATAGATATTTG
AGAGGTTTACATATTACGACGTTTTATATGTTTATGCTCGTATTTGAGTTTATATGTTTA
TGTTCATATGTCTCAATTTCATTTCGTTTATGAACAAATAAAATATTTGTTACTTTGATT
TTTAAAATGACCGTTTCCTATCAATGTACTTAAATCAATATCATTATTTTAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E337TF U 1
AF RR2E337JQ C 204
BS 1 722 RR2E337TF
BS 723 724 RR2E337JQ
BS 725 759 RR2E337TF
BS 760 774 RR2E337JQ

RD RR2E337TF 759 0 0
TGTGCACAATTAACGTTAACCCTGTTGGTCCACTCATACCACCTCCTGCCATTGATGGAA
CCCCTGTACCTCCTCGGGCTAACCCTAAGGTTTACTTTTATATGACCGTGGACGGCAAAC
CAGCTGGTATGATCATAATGGAACTCTTTGCCGACACGACCCCACGGACGGCAGAGAACT
TTCGCGCCCTCTGTACAGGCGAGAAAGGCATGGGGAAGCTTGGTAAGCCACTCCATTACA
AAGGATCGATCATCCACCATGTTGACCCAGGTTATATGATCCAAGGAGGAGATATCATTG
ACGGAGGGAAAGGAAACGGAGGCGAATGTATCTACGACAGTAGGTTTTTCGAGGTTGAGA
ACTTCATCAAGAAGCACACCGGTCCAGGTATCCTCTCCATGTGGAGCCGTGGTCGAAACA
GCACCGGATCTCAGTTCATGATCCACGCGCAGGCGAACCCGGATCTGGATGACGAGTGTG
TTGTGTTCGGCCAAGTCGTTCAAGGAATGGATATAGTCACGAGCATTATGGCTTTGAGCA
CGGAAACTTCCGTACCCGTTGCTGTGATACACAACTGCGGTCAAATTTCATAGATATTTG
AGAGGTTTACATATTACGACGTTTTATATGTTTATGCTCGTATTTGAGTTTATATGTTTA
TGTTCATATGTCTCAATTTCATTTCGTTTATGAACAAATAAAATATTTGTTACTTTGATT
TT**AAATGACCGTTTCCTATCAATGTACTTAAATCAAT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2E337JQ 571 0 0
AAAGGCATGGGGAAGCTTGGTAAGCCACTCCATTACAAAGGATCGATCATCCACCATGTT
GACCCAGGTTATATGATCCAAGGAGGAGATATCATTGACGGAGGGAAAGGAAACGGAGGC
GAATGTATCTACGACAGTAGGTTTTTCGAGGTTGAGAACTTCATCAAGAAGCACACCGGT
CCAGGTATCCTCTCCATGTGGAGCCGTGGTCGAAACAGCACCGGATCTCAGTTCATGATC
CACGCGCAGGCGAACCCGGATCTGGATGACGAGTGTGTTGTGTTCGGCCAAGTCGTTCAA
GGAATGGATATAGTCACGAGCATTATGGCTTTGAGCACGGAAACTTCCGTACCCGTTGCT
GTGATACACAACTGCGGTCAAATTTCATAGATATTTGAGAGGTTTACATATTACGACGTT
TTATATGTTTATGCTCGTATTTGAGTTTATATGTTTATGTTCATATGTCTCAATTTCATT
TCGTTTATGAACAAATAAAATATTTGTTACTTTGATTTTTAAAATGACCGTTTCCTATCA
ATGTACTTAAATCAATATCATTATTTTAACT

QA 1 571 1 571
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6075Contig1 1096 2 6 U
GGATTGACACTTGCCTTAAGAGGGGGGCCAAAGAAAGGTCTTGTCTCTTTGTCTGAGCTG
TTCATTTTCTTGATTTCTTGCATCTGGGATTTTGCTTCCTTATTTTTCTTGAAACTTCTG
TAAGTGACTCTGTCTTTTATCAAATTTGGGTTGTTCATGATCTAGAATCTGGAATTGTTT
CTTCTCAAAGATTGGTAAATGAGTTTGTGAAGTCTCAAGTCTTCAAAGATCTGAAAATTA
AAGAGGGTCAAAATGGGCAGTGACCTGAAGAGCCAGCTATCTAGAGATAGCCATATATTT
GGACTCAAGTTTTGGGAAGTAACTGGAATAGCTGTTGCATTACTCATCATAGCCATCCTC
TCCGTTCTTTCGTTTTGTCTGACTTCGAAAAAGAAATCAAGAAGATCCAAAACCAGTCTT
CCGGTTATCCAAATCCCTCAAGTCTCCAAAGAGATCAAAGAAGTGAGAGTTGAGCATGTC
TCAGCAAATAACTTTGCTCCACGTGAAGGCATTCTTCTCACAATTCAGGACAGGAACAAC
AAAGACTCAGACAAAGTAATGGTTCATCTAGATATGGGGAAGAAGAGAAAGAACGGTGGA
AGTAGTTGTAGCCGGTCAGGCTCGTTTCACAATTTAGAGATCATAGATAAACATTCAGAG
TCAGTTGAAGTCTCTTTGAACCAACCTTCTTCATCATCGTTGTATAACATTGCAACTCCA
TCTCCATTGGCTGGCTTGCCTGAGTCTCATCTTGGTTGGGGCCACTGGTTTACACTGAGA
GATCTTGAAATAGCAACTAATAGATTCTCAAAGGAGAATGTTATCGGTGAAGGCGGTTAC
GGAGTTGTTTACAGAGGAAACTTGATCAATGGAACTCCTGTTGCAGTTAAAAAGATTCTT
AATCAGTTGGGACAAGCAGAGAAAGAGTTTAGAGTCGAGGTTGATGCTATTGGTCACGTG
CGTCACAAGAACCTGGTCCGTCTTCTTGGTTACTGCATTGAAGGCACTCACAGGATATTG
GTTTACGAGTACGTGAACAATGGAAACTTAGAACAATGGCTTCACGGAGCAATGAGACAG
CATGGATATCTAACGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC47TF U 1
AF RR2CG66TF U 499
BS 1 567 RR2GC47TF
BS 568 568 RR2CG66TF
BS 569 619 RR2GC47TF
BS 620 620 RR2CG66TF
BS 621 775 RR2GC47TF
BS 776 1096 RR2CG66TF

RD RR2GC47TF 775 0 0
GGATTGACACTTGCCTTAAGAGGGGGGCCAAAGAAAGGTCTTGTCTCTTTGTCTGAGCTG
TTCATTTTCTTGATTTCTTGCATCTGGGATTTTGCTTCCTTATTTTTCTTGAAACTTCTG
TAAGTGACTCTGTCTTTTATCAAATTTGGGTTGTTCATGATCTAGAATCTGGAATTGTTT
CTTCTCAAAGATTGGTAAATGAGTTTGTGAAGTCTCAAGTCTTCAAAGATCTGAAAATTA
AAGAGGGTCAAAATGGGCAGTGACCTGAAGAGCCAGCTATCTAGAGATAGCCATATATTT
GGACTCAAGTTTTGGGAAGTAACTGGAATAGCTGTTGCATTACTCATCATAGCCATCCTC
TCCGTTCTTTCGTTTTGTCTGACTTCGAAAAAGAAATCAAGAAGATCCAAAACCAGTCTT
CCGGTTATCCAAATCCCTCAAGTCTCCAAAGAGATCAAAGAAGTGAGAGTTGAGCATGTC
TCAGCAAATAACTTTGCTCCACGTGAAGGCATTCTTCTCACAATTCAGGACAGGAACAAC
AAAGACTCAGACAAAGTAATGGTTCATTTAGATATGGGGAAGAAGAGAAAGAACGGTGGA
AGTAGTTGTAGCCGGTCAG*CTCGTTTCACAATTTAGAGATCATAGATAAACATTCAGAG
TCAGTTGAAGTCTCTTTGAACCAACCTTCTTCATCATCGTTGTATAACATTGCAACTCCA
TCTCCATTGGCTGGCTTGCCTGAGTCTCATCTTGGTTGGGGCCACTGGTTTACAC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2CG66TF 598 0 0
CCACGTGAAGGCATTCTTCTCACAATTCAGGACAGGAACAACAAAGACTCAGACAAAGTA
ATGGTTCATCTAGATATGGGGAAGAAGAGAAAGAACGGTGGAAGTAGTTGTAGCCGGTCA
GGCTCGTTTCACAATTTAGAGATCATAGATAAACATTCAGATTCAGTTGAAGTCTCTTTG
AACCAACCTTCTTCATCATCGTTGTATAACATTGCAACTCCATCTCCATTGGCTGGCTTG
CCTGAGTCTCATCTTGGTTGGGGCCACTGGTTTACACTGAGAGATCTTGAAATAGCAACT
AATAGATTCTCAAAGGAGAATGTTATCGGTGAAGGCGGTTACGGAGTTGTTTACAGAGGA
AACTTGATCAATGGAACTCCTGTTGCAGTTAAAAAGATTCTTAATCAGTTGGGACAAGCA
GAGAAAGAGTTTAGAGTCGAGGTTGATGCTATTGGTCACGTGCGTCACAAGAACCTGGTC
CGTCTTCTTGGTTACTGCATTGAAGGCACTCACAGGATATTGGTTTACGAGTACGTGAAC
AATGGAAACTTAGAACAATGGCTTCACGGAGCAATGAGACAGCATGGATATCTAACGT

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL6076Contig1 528 2 1 U
GGACAATCAAACACATTCTCTCCCAAAGCAAATAGCAAATCTAGAAATCACAAATGGCTC
GTACCAAGCAAACCGCCAGGAAATCCACCGGAGGCAGAGCCCCAAGGAAGCAGCTCGCGA
CGAAGCCGCCAGGAAATCAGCTCCGGCGACCGGAGGAGTAAAGAAGCCGCACAGATTCCG
TCCCGGAACGGTGGCGCTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACCGAGCTTCTGAT
CCGCAAGCTCCCCTTCCAGCGTCTGGTCCGTGAGATCGCTCAGGACTTCAAGACGGATCT
GAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAAGCGGCCGAGGCTTACCTCGTCGG
GTTGTTTGAGGACACCAATCTCTGCGCGATTCACGCCAAGAGGGTTTAATATGTCTATAT
GTGAAGGTTACAATAGTGTATTTTGTTCGATTTGTCTAATAACTCACATTTTGATAATCA
TTGCATGTGGAATATGTTATACTAGGATATGATCCGCCTTTTGCGCGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B573JQ C 1
AF RR2B573TF U 1
BS 1 528 RR2B573TF

RD RR2B573JQ 528 0 0
GGACAATCAAACACATTCTCTCCCAAAGCAAATAGCAAATCTAGAAATCACAAATGGCTC
GTACCAAGCAAACCGCCAGGAAATCCACCGGAGGCAGAGCCCCAAGGAAGCAGCTCGCGA
CGAAGCCGCCAGGAAATCAGCTCCGGCGACCGGAGGAGTAAAGAAGCCGCACAGATTCCG
TCCCGGAACGGTGGCGCTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACCGAGCTTCTGAT
CCGCAAGCTCCCCTTCCAGCGTCTGGTCCGTGAGATCGCTCAGGACTTCAAGACGGATCT
GAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAAGCGGCCGAGGCTTACCTCGTCGG
GTTGTTTGAGGACACCAATCTCTGCGCGATTCACGCCAAGAGGGTTTAATATGTCTATAT
GTGAAGGTTACAATAGTGTATTTTGTTCGATTTGTCTAATAACTCACATTTTGATAATCA
TTGCATGTGGAATATGTTATACTAGGATATGATCCGCCTTTTGCGCGC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2B573TF 528 0 0
GGACAATCAAACACATTCTCTCCCAAAGCAAATAGCAAATCTAGAAATCACAAATGGCTC
GTACCAAGCAAACCGCCAGGAAATCCACCGGAGGCAGAGCCCCAAGGAAGCAGCTCGCGA
CGAAGCCGCCAGGAAATCAGCTCCGGCGACCGGAGGAGTAAAGAAGCCGCACAGATTCCG
TCCCGGAACGGTGGCGCTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACCGAGCTTCTGAT
CCGCAAGCTCCCCTTCCAGCGTCTGGTCCGTGAGATCGCTCAGGACTTCAAGACGGATCT
GAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAAGCGGCCGAGGCTTACCTCGTCGG
GTTGTTTGAGGACACCAATCTCTGCGCGATTCACGCCAAGAGGGTTTAATATGTCTATAT
GTGAAGGTTACAATAGTGTATTTTGTTCGATTTGTCTAATAACTCACATTTTGATAATCA
TTGCATGTGGAATATGTTATACTAGGATATGATCCGCCTTTTGCGCGC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL6077Contig1 650 2 9 U
AGAGAAAGCTCCATGTATTATCTTCATTGATGAAATCGATGCAATTGGTACAAAGCGTTT
TGACAGTGAAGTAAGCGGAGACAGGGAAGTGCAGAGGACTATGTTGGAGCTTCTCAATCA
GCTTGATGGGTTCAGTAGCGATGAGCGTATTAAGGTGATAGCAGCCACTAACCGTGCAGA
TATTCTGGACCCAGCACTCATGCGTTCTGGTCGACTAGACAGGAAGATTGAGTTCCCACA
TCCAACGGAAGAAGCAAGAGCCAGAATCTTGCAGATTCACTCGAGGAAGATGAATGTACA
CCCAGACGTCAACTTTGAGGAGCTTGCAAGATCGACAGATGATTTCAATGGCGCTCAACT
GAAAGCAGTATGTGTAGAAGCTGGCATGTTAGCTCTTCGTCGCGATGCCACAGAGGTGAA
CCATGAGGACTTCAATGAAGGTATCATCCAAGTCCAGGCTAAGAAGAAAGCAAGTTTGAA
CTACTACGCCTAATCTCTCCACCATCAGTTATCTTTCTGTTTGCTTTCTATATTTCAACT
CCGGTTTCACTCTTTTCATATATTCGAATCATGATATCTATTATCGAAATACATTTAGTT
GTGTTAGTCTTCTTTTTCTTCTGAGACAGGAAAAGGAACTTTATACGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF33JQ C 1
AF RR2F656TF U 67
BS 1 67 RR2FF33JQ
BS 68 152 RR2F656TF
BS 153 153 RR2FF33JQ
BS 154 208 RR2F656TF
BS 209 209 RR2FF33JQ
BS 210 482 RR2F656TF
BS 483 483 RR2FF33JQ
BS 484 626 RR2F656TF
BS 627 650 RR2FF33JQ

RD RR2FF33JQ 650 0 0
AGAGAAAGCTCCATGTATTATCTTCATTGATGAAATCGATGCAATTGGTACAAAGCGTTT
TGACAGTGAAGTAAGCGGAGACAGGGAAGTGCAGAGGACTATGTTGGAGCTTCTCAATCA
GCTTGATGGGTTCAGTAGCGATGAGCGTATTAAGGTGATAGCAGCCACTAACCGTGCAGA
TATTCTGGACCCAGCACTCATGCGTTCTGGTCGACTAGACAGGAAGATTGAGTTCCCACA
TCCAACGGAAGAAGCAAGAGCCAGAATCTTGCAGATTCACTCGAGGAAGATGAATGTACA
CCCAGACGTCAACTTTGAGGAGCTTGCAAGATCGACAGATGATTTCAATGGCGCTCAACT
GAAAGCAGTATGTGTAGAAGCTGGCATGTTAGCTCTTCGTCGCGATGCCACAGAGGTGAA
CCATGAGGACTTCAATGAAGGTATCATCCAAGTCCAGGCTAAGAAGAAAGCAAGTTTGAA
CTACTACGCCTAATCTCTCCACCATCAGTTATCTTTCTGTTTGCTTTCTATATTTCAACT
CCGGTTTCACTCTTTTCATATATTCGAATCATGATATCTATTATCGAAATACATTTAGTT
GTGTTAGTCTTCTTTTTCTTCTGAGACAGGAAAAGGAACTTTATACGGTC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2F656TF 560 0 0
G
GAAGTAAGCGGAGACAGGGAAGTGCAGAGGACTATGTTGGAGCTTCTCAATCAGCTTGAT
GGGTTCAGTAGCGATGAGCGTATTAGGGTGATAGCAGCCACTAACCGTGCAGATATTCTG
GACCCAGCACTCATGCGTTCTTGTCGACTAGACAGGAAGATTGAGTTCCCACATCCAACG
GAAGAAGCAAGAGCCAGAATCTTGCAGATTCACTCGAGGAAGATGAATGTACACCCAGAC
GTCAACTTTGAGGAGCTTGCAAGATCGACAGATGATTTCAATGGCGCTCAACTGAAAGCA
GTATGTGTAGAAGCTGGCATGTTAGCTCTTCGTCGCGATGCCACAGAGGTGAACCATGAG
GACTTCAATGAAGGTATCATCCAAGTCCAGGCTAAGAAGAAAGCAAGTTTGAACTGCTAC
GCCTAATCTCTCCACCATCAGTTATCTTTCTGTTTGCTTTCTATATTTCAACTCCGGTTT
CACTCTTTTCATATATTCGAATCATGATATCTATTATCGAAATACATTTAGTTGTGTTAG
TCTTCTTTTTCTTCTGAGA

QA 2 560 2 560
DS 



AS 1 2

CO CL6078Contig1 876 2 2 U
GGGTCTGTACTCTCCCGGTGAGGTGACTATAGAGTCTCGTAGCCGTCGCCGTTGGCTTAT
CCTCTTTAGGTCAACTAAGGTTTCCCGTTTCGTCCCAATGGCTTCGCCACCAGAGGAGAT
GGATGATGAAATTCAATCCCCGCCAAAGAGCAGTTACAAGGATCCCGACGATGGAAGGCA
ACGATTCTTACTGGAACTTGAGTTCATTCAGTGTCTCGCCAATCCTACTTACACCCATTA
CCTGGCGCAGAATCGGTATTTTGAAGATGAAGCATTTATTGGGTACCTCAAGTATCTTCA
ATACTGGCAGCGACCAGAGTACATCAAGTTCATTATGTATCCACACTGCTTATATTTCCT
CGAACTTCTTCAAAACCCCAACAGGCTGAAGCACATTCTACCTCGTCCTCTTCTCTGCCT
CCTGCTCCATCTGCACCTGCTGCTCCCTCTCCAGCTATTTCTCCGATGCAGTACAACAAT
AATATGCTTCCTAAGAACGAGTCGCGGAATATGGTTTCTACTGGAATTGATCGTAGGAAG
AGAAAGAAAGGTCCATAAGGCATATCTTGCTCTGAAGCAAACACCATGGTGTCCGGGGAT
ATGTTTTCCTGCTTTTTCTAGAGAGGGGAAACCTGCTTGACTCAGGTTACAAAAATGTTG
AAAACTCTGGTCATAGAGATTGATGATATTAAGCCTGTTGGCTTTATAGTAAATGGTAGT
TGTGAGATTGATTCTGTTTCCTATTTTTCGTTGCTCTAGGCTCCAACAGGAGCCTTACTC
ATACTTTTTACTTTTGGCATATTTGTTTCGTTATTGCAATGAATGTTCTTACTTATGCAC
ATGATATAGTTGCAGAGAATTGAGAATTTTTGGGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC21TF U 1
AF RR2BC21JQ C 1
BS 1 759 RR2BC21TF
BS 760 876 RR2BC21JQ

RD RR2BC21TF 763 0 0
GGGTCTGTACTCTCCCGGTGAGGTGACTATAGAGTCTCGTAGCCGTCGCCGTTGGCTTAT
CCTCTTTAGGTCAACTAAGGTTTCCCGTTTCGTCCCAATGGCTTCGCCACCAGAGGAGAT
GGATGATGAAATTCAATCCCCGCCAAAGAGCAGTTACAAGGATCCCGACGATGGAAGGCA
ACGATTCTTACTGGAACTTGAGTTCATTCAGTGTCTCGCCAATCCTACTTACACCCATTA
CCTGGCGCAGAATCGGTATTTTGAAGATGAAGCATTTATTGGGTACCTCAAGTATCTTCA
ATACTGGCAGCGACCAGAGTACATCAAGTTCATTATGTATCCACACTGCTTATATTTCCT
CGAACTTCTTCAAAACCCCAACAGGCTGAAGCACATTCTACCTCGTCCTCTTCTCTGCCT
CCTGCTCCATCTGCACCTGCTGCTCCCTCTCCAGCTATTTCTCCGATGCAGTACAACAAT
AATATGCTTCCTAAGAACGAGTCGCGGAATATGGTTTCTACTGGAATTGATCGTAGGAAG
AGAAAGAAAGGTCCATAAGGCATATCTTGCTCTGAAGCAAACACCATGGTGTCCGGGGAT
ATGTTTTCCTGCTTTTTCTAGAGAGGGGAAACCTGCTTGACTCAGGTTACAAAAATGTTG
AAAACTCTGGTCATAGAGATTGATGATATTAAGCCTGTTGGCTTTATAGTAAATGGTAGT
TGTGAGATTGATTCTGTTTCCTATTTTTCGTTGCTCTAG
CTCC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2BC21JQ 876 0 0
GGGTCTGTACTCTCCCGGTGAGGTGACTATAGAGTCTCGTAGCCGTCGCCGTTGGCTTAT
CCTCTTTAGGTCAACTAAGGTTTCCCGTTTCGTCCCAATGGCTTCGCCACCAGAGGAGAT
GGATGATGAAATTCAATCCCCGCCAAAGAGCAGTTACAAGGATCCCGACGATGGAAGGCA
ACGATTCTTACTGGAACTTGAGTTCATTCAGTGTCTCGCCAATCCTACTTACACCCATTA
CCTGGCGCAGAATCGGTATTTTGAAGATGAAGCATTTATTGGGTACCTCAAGTATCTTCA
ATACTGGCAGCGACCAGAGTACATCAAGTTCATTATGTATCCACACTGCTTATATTTCCT
CGAACTTCTTCAAAACCCCAACAGGCTGAAGCACATTCTACCTCGTCCTCTTCTCTGCCT
CCTGCTCCATCTGCACCTGCTGCTCCCTCTCCAGCTATTTCTCCGATGCAGTACAACAAT
AATATGCTTCCTAAGAACGAGTCGCGGAATATGGTTTCTACTGGAATTGATCGTAGGAAG
AGAAAGAAAGGTCCATAAGGCATATCTTGCTCTGAAGCAAACACCATGGTGTCCGGGGAT
ATGTTTTCCTGCTTTTTCTAGAGAGGGGAAACCTGCTTGACTCAGGTTACAAAAATGTTG
AAAACTCTGGTCATAGAGATTGATGATATTAAGCCTGTTGGCTTTATAGTAAATGGTAGT
TGTGAGATTGATTCTGTTTCCTATTTTTCGTTGCTCTAGGCTCCAACAGGAGCCTTACTC
ATACTTTTTACTTTTGGCATATTTGTTTCGTTATTGCAATGAATGTTCTTACTTATGCAC
ATGATATAGTTGCAGAGAATTGAGAATTTTTGGGCC

QA 1 876 1 876
DS 



AS 1 2

CO CL6079Contig1 773 2 3 U
TTTTTTTTGAATGCATAAGAAAGCATGTTATTTATCATCATCAGAAGTTACACCCTAGGA
CTTTATAATACATAAAGCTTCAACTTAAAGTACTTGTAGATGCTTAACAGACACAAACAC
TTGTAGTGATCTAAAGCTTATTCTAAGTGAAAACCATTACAACAAGCTTTAGTATATGTG
TTGGTCTGCACTTTTCCGTTATCAAAAATAACAACTATAAACACTTTTATACAAACTCAC
CATCCATCTTCAACATTATTTAGTTTCCCGCCGCTTATTTACGAAATTCCTTTATAAGAA
CCCCTCCATAGAGTTGGACGGCCTCGTCGCAGCTAATAGCCCGTCCCTTCGGAGTTTCAA
ACCCGTTTGGATGGCCCATATGAGGACGGACACCACCGAAGTATTGAATATGTTCTGTGG
GGAGAGAAACAACCGGTTCCTTTGTGGTTGACTCCTTTGAATACTGATAAATGACCCGGC
GGCAACTAGTAGTATTAGTTAGGCCCCTAGTATTAGTTGCCTCTTTTACGGTATAGACTT
TTGGACCACCATATTCGTAAGAATTTTGGTTAAAACGAGGAGCAGGCTCGTCCCTAGGAA
CATATAGTAGTGGAAGGCCTGTTTTCTGGGACCTACCGTACACCTTATCGACCATTTCAA
AAGCCTTTTGAGCCATCCTTGTATTCCTATCCTTTTGAGCCATTGCCATTTGAATATGAA
AGGTGTTTTGTTTCTATGTTTGTCTTAGTTTCTTTGGATTCAGTTTGATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK66JQ U 8
AF RR2EK66TF C 1
BS 1 15 RR2EK66TF
BS 16 584 RR2EK66JQ
BS 585 773 RR2EK66TF

RD RR2EK66JQ 577 0 0
GAATGCAT
TAAGAAAGCATGTTATTTATCATCATCAGAAGTTACACCCTAGGACTTTATAATACATAA
AGCTTCAACTTAAAGTACTTGTAGATGCTTAACAGACACAAACACTTGTAGTGATCTAAA
GCTTATTCTAAGTGAAAACCATTACAACAAGCTTTAGTATATGTGTTGGTCTGCACTTTT
CCGTTATCAAAAATAACAACTATAAACACTTTTATACAAACTCACCATCCATCTTCAACA
TTATTTAGTTTCCCGCCGCTTATTTACGAAATTCCTTTATAAGAACCCCTCCATAGAGTT
GGACGGCCTCGTCGCAGCTAATAGCCCGTCCCTTCGGAGTTTCAAACCCGTTTGGATGGC
CCATATGAGGACGGACACCACCGAAGTATTGAATATGTTCTGTGGGGAGAGAAACAACCG
GTTCCTTTGTGGTTGACTCCTTTGAATACTGATAAATGACCCGGCGGCAACTAGTAGTAT
TAGTTAGGCCCCTAGTATTAGTTGCCTCTTTTACGGTATAGACTTTTGGACCACCATATT
CGTAAGAATTTTGGTTAAAACGAGGAGCA

QA 9 577 9 577
DS 

RD RR2EK66TF 773 0 0
TTTTTTTTGAATGCATAAGAAAGCATGTTATT*ATCATCATCAGAAGT*ACACC*TAGGA
CTTTATAATACATAAAGCTTCAACTTAAAGTACT*GTAGATGCTTAACAGACACAAACAC
TTGTAGTGATCTAAAGCTTATTCTAAGTGAAAACCATTACAACAAGCTTTAGTATATGTG
TTGGTCTGCACTTTTCCGTTATCAGAAATAACAACTATAAACACTTTTATACAAACTCAC
CATCCATCTTCAACATTATTTAGTTTCCCGCCGCTTATTTACGAAATTCCTTTATAAGAA
CCCCTCCATAGAGTTGGACGGCCTCGTCGCAGCTAATAGCCCGTCCCTTCGGAGTTTCAA
ACCCGTTTGGATGGCCCATATGAGGACGGACACCACCGAAGTATTGAATATGTTCTGTGG
GGAGAGAAACAACCGGTTCCTTTGTGGTTGACTCCTTTGAATACTGATAAATGACCCGGC
GGCAACTAGTAGTATTAGTTAGGCCCCTAGTATTAGTTGCCTCTTTTACGGTATAGACTT
TTGGACCACCATATTCGTAAGAATTTTGGTTAAAACGAGGAGCAGGCTCGTCCCTAGGAA
CATATAGTAGTGGAAGGCCTGTTTTCTGGGACCTACCGTACACCTTATCGACCATTTCAA
AAGCCTTTTGAGCCATCCTTGTATTCCTATCCTTTTGAGCCATTGCCATTTGAATATGAA
AGGTGTTTTGTTTCTATGTTTGTCTTAGTTTCTTTGGATTCAGTTTGATTTCC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL6080Contig1 858 2 2 U
GCACTTCAACTTCTACACCTCGTGGACGGAGAAGCAGCGTAGGGTCTGCCTCTGGATTTT
CATTCAGGTTGGAGGAACGTGCTGAGAAGCGGAAGGAGTTCTATATGAAACTAGAAGAGA
AGATCCATGCTAAGGAAGTGGAGAAGACTACTCTGCGGGCCAAATCAAAGGAGAGTCAAG
AAGAAGAGATCAAAAGGTTGAGGAAGAGCTTGACGTTTAAGGCTGGTCCTATGCCTAGTT
TCTACAAAGAACCTCCTCCCAAGGTTGAACTGAAGAAGATACCAACTACTCGTCCTAAAT
CACCAAAGCTAGGACGCAGAAAGAGTAGCAGTGATGCAACAGGAGGTGAAGCTGGTCCTC
GTGTGACAAAACCAAAAGACTTATCTATCTTGAAGAAACCGATAACAAAGTCTCTGTCAA
AACCTGCGTCTCAGGAAAAGTCAGGGAAGGTTCAAGAAAGGAAAAAAGAAGGGAAGAAAG
AAGAAGCAGAGGAAGACAAGACTTCTTCTGTGGCTGATAAACCAGAAGAGAAGAAAGAAG
AAGCAGAGGAAGAGAAGGCTTCTTCCGTGTTGACTGCTAAACCCGAAGATATGGAACCAA
ACTCCAACAGCATCCATGTGAAGGCTGAGATTATGACAAGTGAAGTTGCAGTGGGAGGCT
GATAAAGCTAAAGAGAGCGATTGGGACTTGGCATTGATCACTTTGTCTCTGCTTTTGCTT
CTTCTTTCAAAAGCATTAATGTGAATAGAGTCGTTGTTGCATTGCGTCTACATTTTTGAG
TTACTCCATTTCTTTAGTTCTGTTTCGGAAAACTATGCCTCAGATTATTTCTTAAGTTAT
AGTCATTAATGTTTGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F203TF U 1
AF RR2F203JQ C 141
BS 1 694 RR2F203TF
BS 695 858 RR2F203JQ

RD RR2F203TF 694 0 0
GCACTTCAACTTCTACACCTCGTGGACGGAGAAGCAGCGTAGGGTCTGCCTCTGGATTTT
CATTCAGGTTGGAGGAACGTGCTGAGAAGCGGAAGGAGTTCTATATGAAACTAGAAGAGA
AGATCCATGCTAAGGAAGTGGAGAAGACTACTCTGCGGGCCAAATCAAAGGAGAGTCAAG
AAGAAGAGATCAAAAGGTTGAGGAAGAGCTTGACGTTTAAGGCTGGTCCTATGCCTAGTT
TCTACAAAGAACCTCCTCCCAAGGTTGAACTGAAGAAGATACCAACTACTCGTCCTAAAT
CACCAAAGCTAGGACGCAGAAAGAGTAGCAGTGATGCAACAGGAGGTGAAGCTGGTCCTC
GTGTGACAAAACCAAAAGACTTATCTATCTTGAAGAAACCGATAACAAAGTCTCTGTCAA
AACCTGCGTCTCAGGAAAAGTCAGGGAAGGTTCAAGAAAGGAAAAAAGAAGGGAAGAAAG
AAGAAGCAGAGGAAGACAAGACTTCTTCTGTGGCTGATAAACCAGAAGAGAAGAAAGAAG
AAGCAGAGGAAGAGAAGGCTTCTTCCGTGTTGACTGCTAAACCCGAAGATATGGAACCAA
ACTCCAACAGCATCCATGTGAAGGCTGAGATTATGACAAGTGAAGTTGCAGTGGGAGGCT
GATAAAGCTAAAGAGAGCGATTGGGACTTGGCAT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2F203JQ 718 0 0
GAGAAGACTACTCTGCGGGCCAAATCAAAGGAGAGTCAAGAAGAAGAGATCAAAAGGTTG
AGGAAGAGCTTGACGTTTAAGGCTGGTCCTATGCCTAGTTTCTACAAAGAACCTCCTCCC
AAGGTTGAACTGAAGAAGATACCAACTACTCGTCCTAAATCACCAAAGCTAGGACGCAGA
AAGAGTAGCAGTGATGCAACAGGAGGTGAAGCTGGTCCTCGTGTGACAAAACCAAAAGAC
TTATCTATCTTGAAGAAACCGATAACAAAGTCTCTGTCAAAACCTGCGTCTCAGGAAAAG
TCAGGGAAGGTTCAAGAAAGGAAAAAAGAAGGGAAGAAAGAAGAAGCAGAGGAAGACAAG
ACTTTTTCTGTGGCTGATAAACCAGAAGAGAAGAAAGAAGAAGCAGAGGAAGAGAAGGCT
TCTTCCGTGTTGACTGCTAAACCCGAAGATATGGAACCAAACTCCAACAGCATCCATGTG
AAGGCTGAGATTATGACAAGTGAAGTTGCAGTGGGAGGCTGATAAAGCTAAAGAGAGCGA
TTGGGACTTGGCATTGATCACTTTGTCTCTGCTTTTGCTTCTTCTTTCAAAAGCATTAAT
GTGAATAGAGTCGTTGTTGCATTGCGTCTACATTTTTGAGTTACTCCATTTCTTTAGTTC
TGTTTCGGAAAACTATGCCTCAGATTATTTCTTAAGTTATAGTCATTAATGTTTGCTG

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL6081Contig1 664 2 6 U
GGATCTAAAGCTTTTGCAGTATTAAGAACATAAATAAGATACTGCTTTAGTTTTGGAACA
CACCTCATTACATTATTAATCAATACAAAAATGGCACGTCAATTTATCGTTTTTGCCCTT
TTGGCTTTGGCTGTGGCCACCGCATTTGCTGCCGACGCACCTTCAGCTGCACCCACTGCT
TCTCCGACCAAGGCACCCACCACCCAAACCAAGGCTCCCGCCTCCGCACCCAAATCCTCC
TCCTCCGCCCCTGCACCCAAAGCATCGTCCCCTGTCGCAGAGGAACCAACCCCCGAAGAT
GATTACTCAGCAACCAGCCCCAGTGACTCTGCCGAGGGACCCACTGCCTCCTCCCCACCG
GCTCCTACCCCGGAAAGCACCTCCGCCGATGGACCATCATCTGACGCACCCACGGCTGAG
TCACCCCAAAGCGGCGCCGTAACTAATGTGAAGCTCTCCATCGTCGGCACCGTCGCCGCC
GCTGGATTCTTCTTCTTTTCTCTCTAAGTTTTTTTTTAAACCTGGAGGACGGAATCATAT
TTGTTTAACATTTATGAGATGAGGCCGACTCTTCTTTAACTACTGCATGCAATTATACCT
AAAATATTAAATGGAGTTTTAATTACTATGTATACATGTTTTTGATTAATTTTGTGTGTT
CATC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2D905TF U 1
AF RR2GZ21TF U 5
BS 1 283 RR2D905TF
BS 284 284 RR2GZ21TF
BS 285 516 RR2D905TF
BS 517 517 RR2GZ21TF
BS 518 622 RR2D905TF
BS 623 664 RR2GZ21TF

RD RR2D905TF 622 0 0
GGATCTAAAGCTTTTGCAGTATTAAGAACATAAATAAGATACTGCTTTAGTTTTGGAACA
CACCTCATTACATTATTAATCAATACAAAAATGGCACGTCAATTTATCGTTTTTGCCCTT
TTGGCTTTGGCTGTGGCCACCGCATTTGCTGCCGACGCACCTTCAGCTGCACCCACTGCT
TCTCCGACCAAGGCACCCACCACCCAAACCAAGGCTCCCGCCTCCGCACCCAAATCCTCC
TCCTCCGCCCCTGCACCCAAAGCATCGTCCCCTGTCGCAGAGGGACCAACCCCCGAAGAT
GATTACTCAGCAACCAGCCCCAGTGACTCTGCCGAGGGACCCACTGCCTCCTCCCCACCG
GCTCCTACCCCGGAAAGCACCTCCGCCGATGGACCATCATCTGACGCACCCACGGCTGAG
TCACCCCAAAGCGGCGCCGTAACTAATGTGAAGCTCTCCATCGTCGGCACCGTCGCCGCC
GCTGGATTCTTCTTCTTTTCTCTCTAAGTTTTTTTT*AAACCTGGAGGACGGAATCATAT
TTGTTTAACATTTATGAGATGAGGCCGACTCTTCTTTAACTACTGCATGCAATTATACCT
AAAATATTAAATGGAGTTTTAA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2GZ21TF 660 0 0
GG
AAAGCTTTTGCAGTATTAAGAACATAAATAAGATACTGCTTTAGTTTTGGAACACACCTC
ATTACATTATTAATCAATACAAAAATGGCACGTCAATTTATCGTTTTTGCCCTTTTGGCT
TTGGCTGTGGCCACCGCATTTGCTGCCGACGCACCTTCAGCTGCACCCACTGCTTCTCCG
ACCAAGGCACCCACCACCCAAACCAAGGCTCCCGCCTCCGCACCCAAATCCTCCTCCTCC
GCCCCTGCACCCAAAGCATCGTCCCCTGTCGCAGAGGAACCAACCCCCGAAGATGATTAC
TCAGCAACCAGCCCCAGTGACTCTGCCGAGGGACCCACTGCCTCCTCCCCACCGGCTCCT
ACCCCGGAAAGCACCTCCGCCGATGGACCATCATCTGACGCACCCACGGCTGAGTCACCC
CAAAGCGGCGCCGTAACTAATGTGAAGCTCTCCATCGTCGGCACCGTCGCCGCCGCTGGA
TTCTTCTTCTTTTCTCTCTAAGTTTTTTTTTAAACCTGGAGGACGGAATCATATTTGTTT
AACATTTATGAGATGAGGCCGACTCTTCTTTAACTACTGCATGCAGTTATACCTAAAATA
TTAAATGGAGTTTTAATTACTATGTATACATGTTTTTGATTAATTTTGTGTGTTCATC

QA 3 660 3 660
DS 



AS 1 2

CO CL6082Contig1 728 2 9 U
TCGACGCACAAGCGTCTAAACGTGAGTTTCATCGTATCTCTTATGGTACTTTGTGCTAGA
CAAGCAAGCCGAGTCTCCAAGAAGCTTAAACTCAAGCCAACTCGGAAGTCAACTCATCTC
GAGGACCATCTCGAGAGTCCGAACTCCGGCAAAAACCCCGGCGGTGGAGAAAGGTTTGGA
TGTAGTCCGGCGAGGGCTTTTTCGCCGATGAGAGCACGTCCAAAGGAGCTTTTTACGACT
TTGAGCAACAAGGCCAAGACTATGGTTGGCCGGAAAAATAAAGCTTACGACGTCGGAGGT
ACACCGGCCAAGAAAAAGACGGCGGTGGAGATGGTGCTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGTTT
GGCATTTGGCAGAGAGAGATTTTGATGGGAGGCAAGTGTGAGCCGTTGGATCATTCAGGC
GTGATCTACTATGATTGCAGTGGACATCAGCTAAAGGAACTGCCTCCGAGGTCGCCACGT
GCCAATTTGGTGCCGGATCGCCCGACCCGTTCGTATGTCGGGTCGATGTTGAATCCGACA
GGAAAGGAAATGTAAATTTAGTTTGAGAATATGATATGATTTTCTTTTTGGTGTGCTATG
CGGTGAGTGGTAACTAAATTCTCTAGATGTTTCGTTCTTCGCTTGTTATTGGTAGATGAT
ATCACAAATTTTATGCATATTGTTGTGCATATTGTTGTGTAATCTAATTACGTTTGGAAA
ATTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H481TF U 68
AF RR2H481JQB C 1
BS 1 67 RR2H481JQB
BS 68 549 RR2H481TF
BS 550 550 RR2H481JQB
BS 551 588 RR2H481TF
BS 589 589 RR2H481JQB
BS 590 612 RR2H481TF
BS 613 613 RR2H481JQB
BS 614 631 RR2H481TF
BS 632 728 RR2H481JQB

RD RR2H481TF 564 0 0
GCCGAGTCTCCAAGAAGCTTAAACTCAAGCCAACTCGGAAGTCAACTCATCTCGAGGACC
ATCTCGAGAGTCCGAACTCCGGCAAAAACCCCGGCGGTGGAGAAAGGTTTGGATGTAGTC
CGGCGAGGGCTTTTTCGCCGATGAGAGCACGTCCAAAGGAGCTTTTTACGACTTTGAGCA
ACAAGGCCAAGACTATGGTTGGCCGGAAAAATAAAGCTTACGACGTCGGAGGTACACCGG
CCAAGAAAAAGACGGCGGTGGAGATGGTGCTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGTTTGGCATTT
GGCAGAGAGAGATTTTGATGGGAGGCAAGTGTGAGCCGTTGGATCATTCAGGCGTGATCT
ACTATGATTGCAGTGGACATCAGCTAAAGGAACTGCCTCCGAGGTCGCCACGTGCCAATT
TGGTGCCGGATCGCCCGACCCGTTCGTATGTCGGGTCGATGTTGAATCCGACAGGAAAGG
AA*TGTAAATTTAGTTTGAGAATATGATATGATTTTCTTTT*GGTGTGCTATGCGGTGAG
TGGTA*CTAAATTCTCTAGATGTT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2H481JQB 728 0 0
TCGACGCACAAGCGTCTAAACGTGAGTTTCATCGTATCTCTTATGGTACTTTGTGCTAGA
CAAGCAAGCCGAGTCTCCAAGAAGCTTAAACTCAAGCCAACTCGGAAGTCAACTCATCTC
GAGGACCATCTCGAGAGTCCGAACTCCGGCAAAAACCCCGGCGGTGGAGAAAGGTTTGGA
TGTAGTCCGGCGAGGGCTTTTTCGCCGATGAGAGCACGTCCAAAGGAGCTTTTTACGACT
TTGAGCAACAAGGCCAAGACTATGGTTGGCCGGAAAAATAAAGCTTACGACGTCGGAGGT
ACACCGGCCAAGAAAAAGACGGCGGTGGAGATGGTGCTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGTTT
GGCATTTGGCAGAGAGAGATTTTGATGGGAGGCAAGTGTGAGCCGTTGGATCATTCAGGC
GTGATCTACTATGATTGCAGTGGACATCAGCTAAAGGAACTGCCTCCGAGGTCGCCACGT
GCCAATTTGGTGCCGGATCGCCCGACCCGTTCGTATGTCGGGTCGATGTTGAATCCGACA
GGAAAGGAAATGTAAATTTAGTTTGAGAATATGATATGATTTTCTTTTTGGTGTGCTATG
CGGTGAGTGGTAACTAAATTCTCTAGATGTTTCGTTCTTCGCTTGTTATTGGTAGATGAT
ATCACAAATTTTATGCATATTGTTGTGCATATTGTTGTGTAATCTAATTACGTTTGGAAA
ATTAAAAA

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL6083Contig1 715 2 2 U
GGCACAACTAGCTAGTACAGTTCTTAGATTCTTGTCTGCATAATTTACTTCCATCTTCTC
TCAATCTCACCTCAAGATGCCGATCAGCAAAGATCCATCAACACCTCCGCCTGTCATCGG
AAAGATCGGGCCTTACACTGTCTTCATGACTCCTCCGGCGACTCCAAAACCACCTGACTC
TCCTGCCGCCGTGTCTCAGAAGGCTATCGTTCAACCGCCGGTTCTTCCTCCGCCGCAGCA
GTTTAAATCGGTGGCTTCCTCTGAACAAGAAGGCTCGGTTTTGGGTTTCCTCAAAAACGC
CGCCACAAAGGTTCAAAATGCACATTCAAGCGTGGATGATCATTTGGTGAGATGGTTTGG
GTTAAACCAATCTAAGTACCAGTGGGCTTTGGACGAGTATTACCAAGGCAATGGATCTGG
AGTGAAGTGTGTGAAAGCAGAGGAGATGCCAGGGAAAGTACAAAGCGTATAAGCGCAAAC
ATATTTATATGTATCCAAAACCTGTTTTTCCTGAGAGAGCTGAAAAAGATAAAGCTGGAA
TCTTGATGAAAGTTATCTTCGATCATTGAATTTATTTAACATTGGAGATATCTTTTGGTA
TATTTGAGAAACTATTGTAGTGGTCTTCATTTGGTTTGTTGTAAGTTTATAATATATATA
TGATGATGATGTCTCGGTTAAAAACAATGTATCAAGTAACTATTTACTAAATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY09TF U 1
AF RR2FY09JQ C 234
BS 1 680 RR2FY09TF
BS 681 715 RR2FY09JQ

RD RR2FY09TF 680 0 0
GGCACAACTAGCTAGTACAGTTCTTAGATTCTTGTCTGCATAATTTACTTCCATCTTCTC
TCAATCTCACCTCAAGATGCCGATCAGCAAAGATCCATCAACACCTCCGCCTGTCATCGG
AAAGATCGGGCCTTACACTGTCTTCATGACTCCTCCGGCGACTCCAAAACCACCTGACTC
TCCTGCCGCCGTGTCTCAGAAGGCTATCGTTCAACCGCCGGTTCTTCCTCCGCCGCAGCA
GTTTAAATCGGTGGCTTCCTCTGAACAAGAAGGCTCGGTTTTGGGTTTCCTCAAAAACGC
CGCCACAAAGGTTCAAAATGCACATTCAAGCGTGGATGATCATTTGGTGAGATGGTTTGG
GTTAAACCAATCTAAGTACCAGTGGGCTTTGGACGAGTATTACCAAGGCAATGGATCTGG
AGTGAAGTGTGTGAAAGCAGAGGAGATGCCAGGGAAAGTACAAAGCGTATAAGCGCAAAC
ATATTTATATGTATCCAAAACCTGTTTTTCCTGAGAGAGCTGAAAAAGATAAAGCTGGAA
TCTTGATGAAAGTTATCTTCGATCATTGAATTTATTTAACATTGGAGATATCTTTTGGTA
TATTTGAGAAACTATTGTAGTGGTCTTCATTTGGTTTGTTGTAAGTTTATAATATATATA
TGATGATGATGTCTCGGTTA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2FY09JQ 482 0 0
CGCAGCAGTTTAAATCGGTGGCTTCCTCTGAACAAGAAGGCTCGGTTTTGGGTTTCCTCA
AAAACGCCGCCACAAAGGTTCAAAATGCACATTCAAGCGTGGATGATCATTTGGTGAGAT
GGTTTGGGTTAAACCAATCTAAGTACCAGTGGGCTTTGGACGAGTATTACCAAGGCAATG
GATCTGGAGTGAAGTGTGTGAAAGCAGAGGAGATGCCAGGGAAAGTACAAAGCGTATAAG
CGCAAACATATTTATATGTATCCAAAACCTGTTTTTCCTGAGAGAGCTGAAAAAGATAAA
GCTGGAATCTTGATGAAAGTTATCTTCGATCATTGAATTTATTTAACATTGGAGATATCT
TTTGGTATATTTGAGAAACTATTGTAGTGGTCTTCATTTGGTTTGTTGTAAGTTTATAAT
ATATATATGATGATGATGTCTCGGTTAAAAACAATGTATCAAGTAACTATTTACTAAATT
GG

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL6084Contig1 690 2 1 U
GGACTCGCTCACTCTTTCATCTTCTCTCAAGTTCCTTCGGAGCAATTCTTCCTTCATCGT
CGCGTGGATTTCATTTTCGTTTACACAATCGCTGAAAATGGAAGGAGAAGCAGGAAACGG
AGGATCTCGGAAACGCATGAAACCTTCTGATGAAGAGGGAAAAGGAGATTCGAGAGATGG
AATGAGCCTTGATACAACTGAGAATGAAGAAACCGAGACGAAACTTGTTGCTTCTGATGA
GATGGAACTTAACATTGCTCAGATTCTCGACAAGATTGAGAGCTTCACTCAGACTGTTTC
TAATCTGCTTGACACAGGAAAGACAATGTTCAAGGAACTCAGTAACGAATTCGAAGAACG
CTTGATCATGATACACAAGGAGCATGTTGAGAAATGGCAGGAAGAGATCAAGGAATTGCG
TTTGCTTGATGCATCTAACGAGGAGACTACTTCCCTCTTACACAACGCTCGCTTCCTCAT
TCAGAATCCTAACATTGAGCCTTGAGTCAGGTAACCATCTAAACCCACAAAGGAAGTATA
CTATCAGCCATTTCTGAGAACATATTACATATTGCCTTAGACCAACATATATAATGTGTT
TAGTTGGGAAAATAAGATTTGCACGCTTTAAAAGCTGTATCATGTTCTGAAGGAACACAT
GGAACAATCTTATCATGAACCTTCTCAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FG20JQ C 1
AF RR2FG20TF U 1
BS 1 690 RR2FG20TF

RD RR2FG20JQ 690 0 0
GGACTCGCTCACTCTTTCATCTTCTCTCAAGTTCCTTCGGAGCAATTCTTCCTTCATCGT
CGCGTGGATTTCATTTTCGTTTACACAATCGCTGAAAATGGAAGGAGAAGCAGGAAACGG
AGGATCTCGGAAACGCATGAAACCTTCTGATGAAGAGGGAAAAGGAGATTCGAGAGATGG
AATGAGCCTTGATACAACTGAGAATGAAGAAACCGAGACGAAACTTGTTGCTTCTGATGA
GATGGAACTTAACATTGCTCAGATTCTCGACAAGATTGAGAGCTTCACTCAGACTGTTTC
TAATCTGCTTGACACAGGAAAGACAATGTTCAAGGAACTCAGTAACGAATTCGAAGAACG
CTTGATCATGATACACAAGGAGCATGTTGAGAAATGGCAGGAAGAGATCAAGGAATTGCG
TTTGCTTGATGCATCTAACGAGGAGACTACTTCCCTCTTACACAACGCTCGCTTCCTCAT
TCAGAATCCTAACATTGAGCCTTGAGTCAGGTAACCATCTAAACCCACAAAGGAAGTATA
CTATCAGCCATTTCTGAGAACATATTACATATTGCCTTAGACCAACATATATAATGTGTT
TAGTTGGGAAAATAAGATTTGCACGCTTTAAAAGCTGTATCATGTTCTGAAGGAACACAT
GGAACAATCTTATCATGAACCTTTTCAGAC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2FG20TF 690 0 0
GGACTCGCTCACTCTTTCATCTTCTCTCAAGTTCCTTCGGAGCAATTCTTCCTTCATCGT
CGCGTGGATTTCATTTTCGTTTACACAATCGCTGAAAATGGAAGGAGAAGCAGGAAACGG
AGGATCTCGGAAACGCATGAAACCTTCTGATGAAGAGGGAAAAGGAGATTCGAGAGATGG
AATGAGCCTTGATACAACTGAGAATGAAGAAACCGAGACGAAACTTGTTGCTTCTGATGA
GATGGAACTTAACATTGCTCAGATTCTCGACAAGATTGAGAGCTTCACTCAGACTGTTTC
TAATCTGCTTGACACAGGAAAGACAATGTTCAAGGAACTCAGTAACGAATTCGAAGAACG
CTTGATCATGATACACAAGGAGCATGTTGAGAAATGGCAGGAAGAGATCAAGGAATTGCG
TTTGCTTGATGCATCTAACGAGGAGACTACTTCCCTCTTACACAACGCTCGCTTCCTCAT
TCAGAATCCTAACATTGAGCCTTGAGTCAGGTAACCATCTAAACCCACAAAGGAAGTATA
CTATCAGCCATTTCTGAGAACATATTACATATTGCCTTAGACCAACATATATAATGTGTT
TAGTTGGGAAAATAAGATTTGCACGCTTTAAAAGCTGTATCATGTTCTGAAGGAACACAT
GGAACAATCTTATCATGAACCTTCTCAGAC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL6085Contig1 505 2 3 U
GTCACTGTCAGCATATATGCCTCTATAACAAGTCTAATATTATTTGGTTTGTGCCATTCT
TAAATGTCTACGTTAAATTTATAGCTAATATAGTTCTGTTTAGTCAAACTTTAGTTTTTT
CTCTTAACTCTGCTGGGTGGGTTTCTTTGGTTTTAGAGTAATAAAAAGGCTGATACTTCA
GTTGAGAAAGGGAAAGACGTCTAAATTCAGGCTATAAAAATGTCCCCAAGTGTTGGGATT
ATTCCAGGAAAGCAACTCTTCTTCCCATTTCCCTCCCTTGAGCTGTTGTCTGCTTGGTTC
ACTGGTAATATTTTTTTCAATTGTTACCATATCTCATTTGCTTTATAACCTCAGGATTGC
ATGGTCATGCAAAGGAGTACAGTCTTTTATGATTCCTGGTGGAATTTAAGATCTAAGCAT
CCTTCATTTCCAGGTTATCATCGATGCATATCTATTTATAGTCTTTCATGTTTATTCAAA
ATGTATAATGTATGTCATAATGAGG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ40JQ U 3
AF RR2DJ40TF C 1
BS 1 2 RR2DJ40TF
BS 3 407 RR2DJ40JQ
BS 408 505 RR2DJ40TF

RD RR2DJ40JQ 405 0 0
CACTGTCAGCATATATGCCTCTATAACAAGTCTAATATTATTTGGTTTGTGCCATTCTTA
AATGTCTACGTTAAATTTATAGCTAATATAGTTCTGTTTAGTCAAACTTTAGTTTTTTCT
CTTAACTCTGCTGGGTGGGTTTCTTTGGTTTTAGAGTAATAAAAAGGCTGATACTTCAGT
TGAGAAAGGGAAAGACGTCTAAATTCAGGCTATAAAAATGTCCCCAAGTGTTGGGATTAT
TCCAGGAAAGCAACTCTTCTTCCCATTTCCCTCCCTTGAGCTGTTGTCTGCTTGGTTCAC
TGGTAATATTTTTTTCAATTGTTACCATATCTCATTTGCTTTATAACCTCAGGATTGCAT
GGTCATGCAAAGGAGTACAGTCTTTTATGATTCCTGGTGGAATTT

QA 1 405 1 405
DS 

RD RR2DJ40TF 505 0 0
GTCACTGTCAGCATATATGCCTCTATAACAAGTCTAATATTATTTGGTTTGTGCCATTCT
TAAATGTCTACGTTAAATTTATAGCTAATATAGTTCTGTTTAGTCAAACTTTAGTTTTTT
CTCTTAACTCTGCTGGGTGGGTTTCTTTGGTTTTAGAGTAATAAAAAGGCTGATACTTCA
GTTGAGAAAGGGAAAGACGTCTAAATTCAGGCTATAAAAATGTCCCCAAGTGTTGGGATT
ATTCCAGGAAAGCAACTCTTCTTCCCATTTCCCTCCCTTGAGCTGTTGTCTGCTTGGTTC
ACTGGTAATATTTTTTTCAATTGTTACCATATCTCATTTGCTTTATAACCTCAGGATTGC
ATGGTCATGCAAAGGAGTACAGTCTTTTATGATTCCTGGTGGAATTTAAGATCTAAGCAT
CCTTCATTTCCAGGTTATCATCGATGCATATCTATTTATAGTCTTTCATGTTTATTCAAA
ATGTATAATGTATGTCATAATGAGG

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 2

CO CL6086Contig1 593 2 1 U
GCTTTGGTGGGTTTATGATTATGACGTCACCCTCTTCTTCCTCTTCGTCTTCCTCATGGG
TATCATCATCGTCAGCTGAACAACAGCAGCAACAGCAACATCATCAGAACAACATGGGTC
ATGGTGGAAGGAGCAGAGGTTGGGGATGGGCGTTTGCTAGTCCAATGAGAGCTTTTGGTC
CTTCTTCCTCTGGGAAAAGAGGTCGTACGATTACTGATTCTACAAGCAAGAAGAACTCAG
TTCCTCCAAACTTGGATGCTATTCCTTCATTGTTGGTAGTCAAAAGCTAAATTAAAAGCC
CACGTTGCAATAAGTGTTTTGTTTTCAGTCTCAAAACAAGAAAGTTTACGTTAAGGCTAG
TTTCATGTTTTTCATCATTTTAGATGTTTTCTTGAACATTGGGTTTGATGATCTAATAGT
ATTATTGTAATGTTACACTACCTCTTCTATGTTAATTATCATCTTTTTTTGTCAAATAAG
GAGAGAGTGGAGCTTAGGATACTTGGGAGTCTTACTTTCTTCTGTTTATTTGTCTTGTTC
TCTTGATTATTTTTCTTATTGTTTTGTCTTTCTAATCTCTACTCAGAAGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AJ04TF U 1
AF RR2AJ04JQ C 44
BS 1 593 RR2AJ04TF

RD RR2AJ04TF 593 0 0
GCTTTGGTGGGTTTATGATTATGACGTCACCCTCTTCTTCCTCTTCGTCTTCCTCATGGG
TATCATCATCGTCAGCTGAACAACAGCAGCAACAGCAACATCATCAGAACAACATGGGTC
ATGGTGGAAGGAGCAGAGGTTGGGGATGGGCGTTTGCTAGTCCAATGAGAGCTTTTGGTC
CTTCTTCCTCTGGGAAAAGAGGTCGTACGATTACTGATTCTACAAGCAAGAAGAACTCAG
TTCCTCCAAACTTGGATGCTATTCCTTCATTGTTGGTAGTCAAAAGCTAAATTAAAAGCC
CACGTTGCAATAAGTGTTTTGTTTTCAGTCTCAAAACAAGAAAGTTTACGTTAAGGCTAG
TTTCATGTTTTTCATCATTTTAGATGTTTTCTTGAACATTGGGTTTGATGATCTAATAGT
ATTATTGTAATGTTACACTACCTCTTCTATGTTAATTATCATCTTTTTTTGTCAAATAAG
GAGAGAGTGGAGCTTAGGATACTTGGGAGTCTTACTTTCTTCTGTTTATTTGTCTTGTTC
TCTTGATTATTTTTCTTATTGTTTTGTCTTTCTAATCTCTACTCAGAAGAACC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2AJ04JQ 550 0 0
TTCGTCTTCCTCATGGGTATCATCATCGTCAGCTGAACAACAGCAGCAACAGCAACATCA
TCAGAACAACATGGGTCATGGTGGAAGGAGCAGAGGTTGGGGATGGGCGTTTGCTAGTCC
AATGAGAGCTTTTGGTCCTTCTTCCTCTGGGAAAAGAGGTCGTACGATTACTGATTCTAC
AAGCAAGAAGAACTCAGTTCCTCCAAACTTGGATGCTATTCCTTCATTGTTGGTAGTCAA
AAGCTAAATTAAAAGCCCACGTTGCAATAAGTGTTTTGTTTTCAGTCTCAAAACAAGAAA
GTTTACGTTAAGGCTAGTTTCATGTTTTTCATCATTTTAGATGTTTTCTTGAACATTGGG
TTTGATGATCTAATAGTATTATTGTAATGTTACACTACCTCTTCTATGTTAATTATCATC
TTTTTTTGTCAAATAAGGAGAGAGTGGAGCTTAGGATACTTGGGAGTCTTACTTTCTTCT
GTTTATTTGTCTTGTTCTCTTGATTATTTTTCTTATTGTTTTGTCTTTCTAATCTCTACT
CAGAAGAACC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

CO CL6087Contig1 1197 2 6 U
GGGACCTGAGCTAGAGAAGAAGCTTAAGTATGCTCAAGATGTTTCTTATGGTGTAATTTT
CGGGAGAGAGCTCGTTAATTCACCAGCCAACGTCCTCACCCCTGCTGTACTAGCTGAGGA
GGCCTCAAATCTGGCTTCCACGTACAGTGATGTGATGACTGCAAACATCTTGAATGAGGA
GCAATGCAAAGAGTTGAAGATGGGTTCTTATCTCGCTGTTGCTGCTGCTTCAGCTAATCC
ACCTCGTTTCATTCACCTTGTTTACAAACCTTCTAGTGGCCCTGTCAAGACCAAACTTGC
TCTTGTTGGTAAAGGATTGACATTTGACAGTGGTGGCTACAACATTAAGACCGGACCAGG
TTGCTTAATTGAGCTCATGAAATTTGATATGGGAGGTTCAGCTGCTGTTCTTGGCGCTGC
AAAGGCCATTGGTCAAATTAAGCCTCCCGGTGTTGAGGTGCATTTCATTGTCGCAGCCTG
TGAGAATATGATAAGTGGTACTGGAATGAGACCTGGAGATGTTATCACTGCCTCAAACGG
AAAGACAATCGAGGTTAACAACACAGATGCCGAAGGGCGACTAACACTGGCAGATGCTCT
GGTTTATGCTTGCAACCAGGGCGTCGATAAGATTGTTGACCTTGCAACGTTGACTGGAGC
TTGTATTATTGCTCTTGGAAATTCCATGGCAGGCATATATACGCCTAGTGATGAGCTTGC
AAAGGAGGTAATTGCTGCATCAGAAAGAAGCGGGGAGAAGCTATGGAGAATGCCCATGGA
AGAGAGTTACTGGGAGATGATGAAATCAGGTGTTGCAGATATGGTTAACACTGGAGGCCG
TGCAGGTGGATCAATCACCGCGGCTCTCTTCTTGAAACAGTTTGTGGACGAGAAGGTAGA
GTGGATGCACATAGATATGGCTGGACCAGTGTGGAACGAGAAGAAGAAAGCTGCGACTGG
GTTTGGAGTTGCGACACTCGTTGAGTGGGTACAAAACAATTTTTCTTCGTAAAGATGAAA
CCTCATGATCAGAGACCAATCATTATGCCCCCCGAATAATTTACTTTAGATATTGATGGG
CTTATTCCGTTCTCATTGTTTCCTTTTGGACTCTCCTTGTTATGGAGGCTCTTCATGATG
AACGCATGATCTATGATAGATAGTGAGATAATATTCAAAGAAACAAAAACTTGGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G909TF U 1
AF RR2G909JQ C 430
BS 1 680 RR2G909TF
BS 681 681 RR2G909JQ
BS 682 692 RR2G909TF
BS 693 693 RR2G909JQ
BS 694 718 RR2G909TF
BS 719 1197 RR2G909JQ

RD RR2G909TF 718 0 0
GGGACCTGAGCTAGAGAAGAAGCTTAAGTATGCTCAAGATGTTTCTTATGGTGTAATTTT
CGGGAGAGAGCTCGTTAATTCACCAGCCAACGTCCTCACCCCTGCTGTACTAGCTGAGGA
GGCCTCAAATCTGGCTTCCACGTACAGTGATGTGATGACTGCAAACATCTTGAATGAGGA
GCAATGCAAAGAGTTGAAGATGGGTTCTTATCTCGCTGTTGCTGCTGCTTCAGCTAATCC
ACCTCGTTTCATTCACCTTGTTTACAAACCTTCTAGTGGCCCTGTCAAGACCAAACTTGC
TCTTGTTGGTAAAGGATTGACATTTGACAGTGGTGGCTACAACATTAAGACCGGACCAGG
TTGCTTAATTGAGCTCATGAAATTTGATATGGGAGGTTCAGCTGCTGTTCTTGGCGCTGC
AAAGGCCATTGGTCAAATTAAGCCTCCCGGTGTTGAGGTGCATTTCATTGTCGCAGCCTG
TGAGAATATGATAAGTGGTACTGGAATGAGACCTGGAGATGTTATCACTGCCTCAAACGG
AAAGACAATCGAGGTTAACAACACAGATGCCGAAGGGCGACTAACACTGGCAGATGCTCT
GGTTTATGCTTGCAACCAGGGCGTCGATAAGATTGTTGACCTTGCAACGTTGACTGGAGC
TTGTATTATTGCTCTTGGAA*TTCCATGGCAG*CATATATACGCCTAGTGATGAGCTT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2G909JQ 768 0 0
TGGTCAAATTAAGCCTCCCGGTGTTGAGGTGCATTTCATTGTCGCAGCCTGTGAGAATAT
GATAAGTGGTACTGGAATGAGACCTGGAGATGTTATCACTGCCTCAAACGGAAAGACAAT
CGAGGTTAACAACACAGATGCCGAAGGGCGACTAACACTGGCAGATGCTCTGGTTTATGC
TTGCAACCAGGGCGTCGATAAGATTGTTGACCTTGCAACGTTGACTGGAGCTTGTATTAT
TGCTCTTGGAAATTCCATGGCAGGCATATATACGCCTAGTGATGAGCTTGCAAAGGAGGT
AATTGCTGCATCAGAAAGAAGCGGGGAGAAGCTATGGAGAATGCCCATGGAAGAGAGTTA
CTGGGAGATGATGAAATCAGGTGTTGCAGATATGGTTAACACTGGAGGCCGTGCAGGTGG
ATCAATCACCGCGGCTCTCTTCTTGAAACAGTTTGTGGACGAGAAGGTAGAGTGGATGCA
CATAGATATGGCTGGACCAGTGTGGAACGAGAAGAAGAAAGCTGCGACTGGGTTTGGAGT
TGCGACACTCGTTGAGTGGGTACAAAACAATTTTTCTTCGTAAAGATGAAACCTCATGAT
CAGAGACCAATCATTATGCCCCCCGAATAATTTACTTTAGATATTGATGGGCTTATTCCG
TTCTCATTGTTTCCTTTTGGACTCTCCTTGTTATGGAGGCTCTTCATGATGAACGCATGA
TCTATGATAGATAGTGAGATAATATTCAAAGAAACAAAAACTTGGGGC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL6088Contig1 969 2 10 U
GAGAGGAATCAGAGACTCTCAGCTTGTCGGTCTCTCTGGTTATTCAAAAGAGGGTCTCCC
TGTCATTGCCATTGGTGTTGGGCTTAGCACATATGACAAAGCCTCTGTTCACTACTATAT
ACAGTCTCACATTCAAATGAACGAGTACCGAGATCGAATTGTATTGCCATCTGCTACAAA
GAAACAGGGACGACCAATCTGCACCTGTTTGAAAATTTTAGATATGTCTGGTCTAAAACT
TTCAGCATTAAGTCAAATCAAGTTGATGACAGCCATAACCACAATTGACGATTTAAACTA
TCCAGAGAAGACAGACACATATTACATTGTCAACGTCCCCTACATATTTTCTGCTTGCTG
GAAAACCATTAAGCCTCTGTTGCAAGAGATAACCAAGAAGAAGATTCAAGTGCTCAAAGG
CTGCGGTAAAGAAGAGCTGCTCAAGGTAATGGACTACGAGTCTCTCCCACATTTCTGTAG
AAGAGAAGGGTCTGGGTCTGGGTCTGGTAGACATATCTCAGAAGGAACAGTAGACAATTG
TTTCTCTTTGGACCGCTATTTCCACCAAGAGCTTTACAACTATGTCCATCAACAGGCTCT
GGTTAAAGCGTCGAATGCTCCCATCACGCATGGTTCTGTCCACGTTAGGTTCCCTGAACC
AGACACGGAAGGCACCAAAATATTCGACAGCTTAGAATCTGAGTTCCAAAAGCTTGGAAA
TGACCAGAAGGCCTGATTTTTTTTCTGGTTATGAGCAAAAGTATTTTAAGATAAAAAATC
ACCTCTACTTGTTGAGTATCACAAACAAGACTGTATTTACTAGATCTGCTTGCATCAGCT
AAATGCAGGTTTTGTTGGAAAGAAAAAAGAGAGGAAACACACACAATTTCCTCAGGAATG
GATCTTTATGTTCATTTGCAAATAGAGAAAAAGCTCTTTTATTTTTATATAATATACAAC
TCATTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG78TF U 1
AF RR2EG78JQ C 164
BS 1 648 RR2EG78TF
BS 649 649 RR2EG78JQ
BS 650 671 RR2EG78TF
BS 672 672 RR2EG78JQ
BS 673 710 RR2EG78TF
BS 711 711 RR2EG78JQ
BS 712 730 RR2EG78TF
BS 731 731 RR2EG78JQ
BS 732 740 RR2EG78TF
BS 741 969 RR2EG78JQ

RD RR2EG78TF 740 0 0
GAGAGGAATCAGAGACTCTCAGCTTGTCGGTCTCTCTGGTTATTCAAAAGAGGGTCTCCC
TGTCATTGCCATTGGTGTTGGGCTTAGCACATATGACAAAGCCTCTGTTCACTACTATAT
ACAGTCTCACATTCAAATGAACGAGTACCGAGATCGAATTGTATTGCCATCTGCTACAAA
GAAACAGGGACGACCAATCTGCACCTGTTTGAAAATTTTAGATATGTCTGGTCTAAAACT
TTCAGCATTAAGTCAAATCAAGTTGATGACAGCCATAACCACAATTGACGATTTAAACTA
TCCAGAGAAGACAGACACATATTACATTGTCAACGTCCCCTACATATTTTCTGCTTGCTG
GAAAACCATTAAGCCTCTGTTGCAAGAGATAACCAAGAAGAAGATTCAAGTGCTCAAAGG
CTGCGGTAAAGAAGAGCTGCTCAAGGTAATGGACTACGAGTCTCTCCCACATTTCTGTAG
AAGAGAAGGGTCTGGGTCTGGGTCTGGTAGACATATCTCAGAAGGAACAGTAGACAATTG
TTTCTCTTTGGACCGCTATTTCCACCAAGAGCTTTACAACTATGTCCATCAACAGGCTCT
GGTTAAAGCGTCGAATGCTCCCATCACGCATGGTTCTGTCCACGTTAG*TTCCCTGAACC
AGACACGGAAG*CACCAAAATATTCGACAGCTTAGAATCTGAGTTCCAAA*GCTTGGAAA
TGACCAGAAG*CCTGATTTT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2EG78JQ 806 0 0
TTGCCATCTGCTACAAAGAAACAGGGACGACCAATCTGCAC*TGTTTGAAAATTTTAGAT
ATGTCTGGTCTAAAACTTTCAGCATTAAGTCAAATCAAGTTGATGACAGCCATAACCACA
ATTGACGATTTAAACTATCCAGAGAAGACAGACACATATTACATTGTCAACGTCCCCTAC
ATATTTTCTGCTTGCTGGAAAACCATTAAGCCTCTGTTGCAAGAGATAACCAAGAAGAAG
ATTCAAGTGCTCAAAGGCTGCGGTAAAGAAGAGCTGCTCAAGGTAATGGACTACGAGTCT
CTCCCACATTTCTGTAGAAGAGAAGGGTCTGGGTCTGGGTCTGGTAGACATATCTCAGAA
GGAACAGTAGACAATTGTTTCTCTTTGGACCGCTATTTCCACCAAGAGCTTTACAACTAT
GTCCATCAACAGGCTCTGGTTAAAGCGTCGAATGCTCCCATCAGGCATGGTTCTGTCCAC
GTTAGGTTCCCTGAACCAGACACGGAAGGCACCAAAATATTCGACAGCTTAGAATCTGAG
TTCCAAAAGCTTGGAAATGACCAGAAGGCCTGATTTTTTTTCTGGTTATGAGCAAAAGTA
TTTTAAGATAAAAAATCACCTCTACTTGTTGAGTATCACAAACAAGACTGTATTTACTAG
ATCTGCTTGCATCAGCTAAATGCAGGTTTTGTTGGAAAGAAAAAAGAGAGGAAACACACA
CAATTTCCTCAGGAATGGATCTTTATGTTCATTTGCAAATAGAGAAAAAGCTCTTTTATT
TTTATATAATATACAACTCATTTTCT

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL6089Contig1 912 2 16 U
GGAAGGACACGTAGTTCAGAAGGGATCAGAGCTCAAATTGTCTCAGTTGCGATTCAGCTT
GACTTCTTTCTTATATTTTCTAGTGACAAAAAATTCTTTGAGGTTACAGATATCAAATGA
TTCTTGTGATAGCTCGCTAAACTACGGCAACCAACGTTGATGCTGCTTGCATCTCTTCTT
TCGCATGTGACTGATTCCCTCGAGGGGGCTGCAGAGAAAAAGTCATTACTCCTTCATAAG
ATTAGAGACATTAACGAGCTCTCAAGACAAGATGTAGATGCAATAATCAAGATGTGTGAT
TGCCAAGAATATGTCACAGCATCAGACAACATACATAAAAGGAGATACATAGCTATGGTC
CAAATGTGCAAAATCGTGGGCAGCAGGGACCAGTTAATCACATTGTTACTACAACTAACA
GAGCATGTACTAAATATCATCCTGGTCCATCTCCAAGATAGATCTGGTAGTTCAAATGAG
CGGGCATCACCATATGGTTCAAAATCTCATCAACAACAGGAAGTTACAGATCTCTGTGGC
AAATTGTCACCTATCACAGAAAGGCTTGCATTACTGAATGAGGGAAAAGTAGGACACAAC
TTGAAGGTTTTCAAGAGACTGGCGACTACTGTAAAAGAAATGGCTGTCCAAAAGTGTTTA
TGATCGGGCTCTCAAGAAATGTAGAGAAATCGTATCTGGTGGCTGAACTATTTCCTTGTA
TGAAATGTCCAAATCAAAAATGTATTGTTGGCTATGTATAACTTGGCTCACCGATTTCAC
TGCTAAAAGGTTGCAAGTTGTATCCACGAGATCTAACTCTGATTGCGATTTCTCTATTAC
TGGATATTTTTGTCTCCGCTTTCAACAGCCATACTCTCGGCCAATGGCCTTGTATTGACA
TTTCCGTAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E256TF U 1
AF RR2E256JQ C 237
BS 1 706 RR2E256TF
BS 707 707 RR2E256JQ
BS 708 724 RR2E256TF
BS 725 725 RR2E256JQ
BS 726 760 RR2E256TF
BS 761 761 RR2E256JQ
BS 762 771 RR2E256TF
BS 772 772 RR2E256JQ
BS 773 776 RR2E256TF
BS 777 777 RR2E256JQ
BS 778 789 RR2E256TF
BS 790 790 RR2E256JQ
BS 791 795 RR2E256TF
BS 796 796 RR2E256JQ
BS 797 815 RR2E256TF
BS 816 912 RR2E256JQ

RD RR2E256TF 823 0 0
GGAAGGACACGTAGTTCAGAAGGGATCAGAGCTCAAATTGTCTCAGTTGCGATTCAGCTT
GACTTCTTTCTTATATTTTCTAGTGACAAAAAATTCTTTGAGGTTACAGATATCAAATGA
TTCTTGTGATAGCTCGCTAAACTACGGCAACCAACGTTGATGCTGCTTGCATCTCTTCTT
TCGCATGTGACTGATTCCCTCGAGGGGGCTGCAGAGAAAAAGTCATTACTCCTTCATAAG
ATTAGAGACATTAACGAGCTCTCAAGACAAGATGTAGATGCAATAATCAAGATGTGTGAT
TGCCAAGAATATGTCACAGCATCAGACAACATACATAAAAGGAGATACATAGCTATGGTC
CAAATGTGCAAAATCGTGGGCAGCAGGGACCAGTTAATCACATTGTTACTACAACTAACA
GAGCATGTACTAAATATCATCCTGGTCCATCTCCAAGATAGATCTGGTAGTTCAAATGAG
CGGGCATCACCATATGGTTCAAAATCTCATCAACAACAGGAAGTTACAGATCTCTGTGGC
AAATTGTCACCTATCACAGAAAGGCTTGCATTACTGAATGAGGGAAAAGTAGGACACAAC
TTGAAGGTTTTCAAGAGACTGGCGACTACTGTAAAAGAAATGGCTGTCCAAAAGTGTTTA
TGATCGGGCTCTCAAGAAATGTAGAGAAATCGTATCTGGTGGCTGA*CTATTTCCTTGTA
TGAA*TGTCCAAATCAAAAATGTATTGTTGGCTATGTATA*CTTGGCTCAC*GATT*CAC
TGCTAAAAG*TTGCA*GTTGTATCCACGAGATCTA
CTCTGATG

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR2E256JQ 676 0 0
TAAGATTAGAGACATTAACGAGCTCTCAAGACAAGATGTAGATGCAATAATCAAGATGTG
TGATTGCCAAGAATATGTCACAGCATCAGACAACATACATAAAAGGAGATACATAGCTAT
GGTCCAAATGTGCAAAATCGTGGGCAGCAGGGACCAGTTAATCACATTGTTACTACAACT
AACAGAGCATGTACTAAATATCATCCTGGTCCATCTCCAAGATAGATCTGGTAGTTCAAA
TGAGCGGGCATCACCATATGGTTCAAAATCTCATCAACAACAGGAAGTTACAGATCTCTG
TGGCAAATTGTCACCTATCACAGAAAGGCTTGCATTACTGAATGAGGGAAAAGTAGGACA
CAACTTGAAGGTTTTCAAGAGACTGGCGACTACTGTAAAAGAAATGGCTGTCCAAAAGTG
TTTATGATCGGGCTCTCAAGAAATGTAGAGAAATCGTATCTGGTGGCTGAACTATTTCCT
TGTATGAAATGTCCAAATCAAAAATGTATTGTTGGCTATGTATAACTTGGCTCACCGATT
TCACTGCTAAAAGGTTGCAAGTTGTATCCACGAGATCTAACTCTGATTGCGATTTCTCTA
TTACTGGATATTTTTGTCTCCGCTTTCAACAGCCATACTCTCGGCCAATGGCCTTGTATT
GACATTTCCGTAGATC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL6090Contig1 555 2 1 U
GGAGGTAGGAGTGAGTAGCAATGAGAATCTTGAAGAAGCCAAGTTCTTAGAATCATACCA
CAAACCAATTCCCATCCATAGTTCCATTGCCAAGAAGCTTGGGATCACAGCATTACCAGT
AAGGATGGATAGCCAAGCAAAGTATGCAGCTGTGTCGAGAGGAGACGCAGAGATATACTT
GCGTTTCACTCTCAGTGGACACCGTGAGACTATATGGGACCATGCTCCTGGTTTCATCAT
CACAACAGAAGCTGGAGGCGTCGTTTGCGATGCTGCAGGGAAATCTCTGGACTTCTCGAA
AGGAAAATATCTTGCTCACAAGACAGGGATCATTGTTACCACCAAGAAACTCGAGCCATG
GGTTTTGATGGCAGTCAGAGAAGCAATGGAAGAGGAGAGAAAATTTATCTCTGAGTCACA
CAGCTGAAACTATACTCTTTTATCTGTATATGTCTGAACTGGTAACTGGTGTGTATGCTT
AGTTCGTTGGATACGCAAGATATGAAAATAACTTGTACAAAGATTGAATAATGACAATAA
GCAAGATTCCATTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BL69JQ C 1
AF RR2BL69TF U 1
BS 1 555 RR2BL69TF

RD RR2BL69JQ 555 0 0
GGAGGTAGGAGTGAGTAGCAATGAGAATCTTGAAGAAGCCAAGTTCTTAGAATCATACCA
CAAACCAATTCCCATCCATAGTTCCATTGCCAAGAAGCTTGGGATCACAGCATTACCAGT
AAGGATGGATAGCCAAGCAAAGTATGCAGCTGTGTCGAGAGGAGACGCAGAGATATACTT
GCGTTTCACTCTCAGTGGACACCGTGAGACTATATGGGACCATGCTCCTGGTTTCATCAT
CACAACAGAAGCTGGAGGCGTCGTTTGCGATGCTGCAGGGAAATCTCTGGACTTCTCGAA
AGGAAAATATCTTGCTCACAAGACAGGGATCATTGTTACCACCAAGAAACTCGAGCCATG
GGTTTTGATGGCAGTCAGAGAAGCAATGGAAGAGGAGAGAAAATTTATCTTTGAGTCACA
CAGCTGAAACTATACTCTTTTATCTGTATATGTCTGAACTGGTAACTGGTGTGTATGCTT
AGTTCGTTGGATACGCAAGATATGAAAATAACTTGTACAAAGATTGAATAATGACAATAA
GCAAGATTCCATTCG

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2BL69TF 555 0 0
GGAGGTAGGAGTGAGTAGCAATGAGAATCTTGAAGAAGCCAAGTTCTTAGAATCATACCA
CAAACCAATTCCCATCCATAGTTCCATTGCCAAGAAGCTTGGGATCACAGCATTACCAGT
AAGGATGGATAGCCAAGCAAAGTATGCAGCTGTGTCGAGAGGAGACGCAGAGATATACTT
GCGTTTCACTCTCAGTGGACACCGTGAGACTATATGGGACCATGCTCCTGGTTTCATCAT
CACAACAGAAGCTGGAGGCGTCGTTTGCGATGCTGCAGGGAAATCTCTGGACTTCTCGAA
AGGAAAATATCTTGCTCACAAGACAGGGATCATTGTTACCACCAAGAAACTCGAGCCATG
GGTTTTGATGGCAGTCAGAGAAGCAATGGAAGAGGAGAGAAAATTTATCTCTGAGTCACA
CAGCTGAAACTATACTCTTTTATCTGTATATGTCTGAACTGGTAACTGGTGTGTATGCTT
AGTTCGTTGGATACGCAAGATATGAAAATAACTTGTACAAAGATTGAATAATGACAATAA
GCAAGATTCCATTCG

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

CO CL6091Contig1 676 2 5 U
GGGGAGCGTGTGTCTTGGGTCCGATTCAATTCGATTTTAGCTATGGCGGCGGAGAACTGT
TTTGGTGGTGGTGGTTCAGGCGATCAGAGCACGAAAGGATTGGCTACTCACGGAGGTAGC
TACGTTCAGTACAATGTTTATGGAAACATCTTCGAAGTGAGTAGAAAGTATGTTCCTCCT
CTTCGTCCCATCGGCAGAGGCGCTTACGGCATCGTCTGTGCTGCTACAAACTCAGAGACG
GGAGAGGAAGTGGCTATCAAGAAGATCGGTAACGCTTTTGACAACATCATCGACGCCAAA
AGGACTTTGAGAGAGATTAAGCTTCTCAAGCACATGGATCACGAGAACGTTATTGCTGCT
AAGGATATAATAAGACCACCCCTGAGAGAGAACTTCAACGATGTTTACATTGTCTATGAG
CTTATGGACACTGATCTCCACCAGATTATACGCTCTAACCAACCCTTAACTGATGATCAT
TGCCGGTTCTTCTTGTATCAGTTGTTGCGTGGGCTCAAGTACGTTCATTCAGCTAATGTC
TTACACCGAGATTTAAAGCCCAGCAATTTGCTCCTCAATGCAAACTGTGATCTAAAGCTT
GGGGATTTCGGGCTTGCGAGGACCAAATCCGAGACCGACTTCATGACTGAGTACGTTGTT
ACACGCTGGTACCGTG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA01TF U 2
AF RR2CC89TF U 1
BS 1 121 RR2CC89TF
BS 122 122 RR2GA01TF
BS 123 358 RR2CC89TF
BS 359 359 RR2GA01TF
BS 360 676 RR2CC89TF

RD RR2GA01TF 615 0 0
GGGAGCGTGTGTCTTGGGTCCGATTCAATTCGATTTTAGCTATGGCGGCGGAGAACTGTT
TTGGTGGTGGTGGTTCAGGCGATCAGAGCACGAAAGGATTGGCTACTCACGGAGGTAGCT
ACGTTCAGTACAATGTTTATGGAAACATCTTCGAAGTGAGTAGAAAGTATGTTCCTCCTC
TTCGTCCCATCGGCAGAGGCGCTTACGGCATCGTCTGTGCTGCTACAAACTCAGAGACGG
GAGAGGAAGTGGCTATCAAGAAGATCGGTAACGCTTTTGACAACATCATCGACGCCAAAA
GGACTTTGAGAGAGATTAAGCTTCTCAAGCACATGGATCACGAGAACGTTATTGCTGCTA
AGGATATAATAAGACCACCCCTGAGAGAGAACTTCAACGATGTTTACATTGTTTATGAGC
TTATGGACACTGATCTCCACCAGATTATACGCTCTAACCAACCCTTAACTGATGATCATT
GCCGGTTCTTCTTGTATCAGTTGTTGCGTGGGCTCAAGTACGTTCATTCAGCTAATGTCT
TACACCGAGATTTAAAGCCCAGCAATTTGCTCCTCAATGCAAACTGTGATCTAAAGCTTG
GGGATTTCGGGCTTG

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2CC89TF 676 0 0
GGGGAGCGTGTGTCTTGGGTCCGATTCAATTCGATTTTAGCTATGGCGGCGGAGAACTGT
TTTGGTGGTGGTGGTTCAGGCGATCAGAGCACGAAAGGATTGGCTACTCACGGAGGTAGC
TGCGTTCAGTACAATGTTTATGGAAACATCTTCGAAGTGAGTAGAAAGTATGTTCCTCCT
CTTCGTCCCATCGGCAGAGGCGCTTACGGCATCGTCTGTGCTGCTACAAACTCAGAGACG
GGAGAGGAAGTGGCTATCAAGAAGATCGGTAACGCTTTTGACAACATCATCGACGCCAAA
AGGACTTTGAGAGAGATTAAGCTTCTCAAGCACATGGATCACGAGAACGTTATTGCTGTT
AAGGATATAATAAGACCACCCCTGAGAGAGAACTTCAACGATGTTTACATTGTCTATGAG
CTTATGGACACTGATCTCCACCAGATTATACGCTCTAACCAACCCTTAACTGATGATCAT
TGCCGGTTCTTCTTGTATCAGTTGTTGCGTGGGCTCAAGTACGTTCATTCAGCTAATGTC
TTACACCGAGATTTAAAGCCCAGCAATTTGCTCCTCAATGCAAACTGTGATCTAAAGCTT
GGGGATTTCGGGCTTGCGAGGACCAAATCCGAGACCGACTTCATGACTGAGTACGTTGTT
ACACGCTGGTACCGTG

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL6092Contig1 846 2 2 U
GGAAAAGTGTAGAGGAGAAGAAAGGTCTGTTGGCTAAATGTGCTGCTACCACACTTTCCT
CTAAGCTTGTTGGTGGAGAGAAGGAGTTCTTTGCTACGATGGTTGTTGATGCTGTTATGG
CGATTGGGGATGACGATAGGCTAAATTTGATTGGAATCAAAAAGGTTCCCGGTGGTAACA
TGCGAGACTCTTTCTTAGTTGATGGTGTGGCTTTCAAAAAGACATTCTCATATGCGGGTT
TTGAACAACAGCCAAAGAAGTTTCTTAATCCCAAGTACCTGAGGCAGCATTCAAGAACAA
TCGCTGGGAAATCACAGCTTTTCATCAACTCGTATGCAAAGGCCTTGGAGGTTATTCCAC
GACAATTGTGTGACAATGCTGGATTTGATGCCACTGATGTCCTAAATAAATTAAGACAAA
AACACGCCATGCAAAGCGGTGAAGGAGCTTCTTATGGAGTGGACATTAACACTGGTGGAA
TCGCTGATTCCTATGCTAACTTTGTCTGGGAACCAGCTGTTGTTAAGATTAATGCTATAA
ACGCTGCGACTGAAGCAGCTTGCCTTATTCTCAGCGTGGACGAAACTGTGAAGAACCCTA
AATCTGAGAGCGCACAGGGAGATGCTGCCGCACGTGCTATGGGAAGAGGACGCGGTGGAG
GTCGTGGCCGTGGTATGAGGAGACGTTAAGTTATTTTTTAAAAAAATCTTATGGCAAACT
TTAGCTTCTCTGAATTTTAGTTTTGTTGAATTTTGATCTTGGAATCAAGAAGCTAATGTC
GTGCTTGTGTTTGTTGACCTACGTCCCTACAATTTGTTATAGTGAAATTTCAGTGTGGTT
TTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ54TF U 1
AF RR2BQ54JQ C 91
BS 1 644 RR2BQ54TF
BS 645 846 RR2BQ54JQ

RD RR2BQ54TF 649 0 0
GGAAAAGTGTAGAGGAGAAGAAAGGTCTGTTGGCTAAATGTGCTGCTACCACACTTTCCT
CTAAGCTTGTTGGTGGAGAGAAGGAGTTCTTTGCTACGATGGTTGTTGATGCTGTTATGG
CGATTGGGGATGACGATAGGCTAAATTTGATTGGAATCAAAAAGGTTCCCGGTGGTAACA
TGCGAGACTCTTTCTTAGTTGATGGTGTGGCTTTCAAAAAGACATTCTCATATGCGGGTT
TTGAACAACAGCCAAAGAAGTTTCTTAATCCCAAGTACCTGAGGCAGCATTCAAGAACAA
TCGCTGGGAAATCACAGCTTTTCATCAACTCGTATGCAAAGGCCTTGGAGGTTATTCCAC
GACAATTGTGTGACAATGCTGGATTTGATGCCACTGATGTCCTAAATAAATTAAGACAAA
AACACGCCATGCAAAGCGGTGAAGGAGCTTCTTATGGAGTGGACATTAACACTGGTGGAA
TCGCTGATTCCTATGCTAACTTTGTCTGGGAACCAGCTGTTGTTAAGATTAATGCTATAA
ACGCTGCGACTGAAGCAGCTTGCCTTATTCTCAGCGTGGACGAAACTGTGAAGAACCCTA
AATCTGAGAGCGCACAGGGAGATGCTGCCGCACGTGCTATGGGA
GAGAC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2BQ54JQ 756 0 0
TTGCTACGATGGTTGTTGATGCTGTTATGGCGATTGGGGATGACGATAGGCTAAATTTGA
TTGGAATCAAAAAGGTTCCCGGTGGTAACATGCGAGACTCTTTCTTAGTTGATGGTGTGG
CTTTCAAAAAGACATTCTCATATGCGGGTTTTGAACAACAGCCAAAGAAGTTTCTTAATC
CCAAGTACCTGAGGCAGCATTCAAGAACAATCGCTGGGAAATCACAGCTTTTCATCAACT
CGTATGCAAAGGCCTTGGAGGTTATTCCACGACAATTGTGTGACAATGCTGGATTTGATG
CCACTGATGTCCTAAATAAATTAAGACAAAAACACGCCATGCAAAGCGGTGAAGGAGCTT
CTTATGGAGTGGACATTAACACTGGTGGAATCGCTGATTCCTATGCTAACTTTGTCTGGG
AACCAGCTGTTGTTAAGATTAATGCTATAAACGCTGCGACTGAAGCAGCTTGCCTTATTC
TCAGCGTGGACGAAACTGTGAAGAACCCTAAATCTGAGAGCGCACAGGGAGATGCTGCCG
CAGGTGCTATGGGAAGAGGACGCGGTGGAGGTCGTGGCCGTGGTATGAGGAGACGTTAAG
TTATTTTTTAAAAAAATCTTATGGCAAACTTTAGCTTCTCTGAATTTTAGTTTTGTTGAA
TTTTGATCTTGGAATCAAGAAGCTAATGTCGTGCTTGTGTTTGTTGACCTACGTCCCTAC
AATTTGTTATAGTGAAATTTCAGTGTGGTTTTTGTT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL6093Contig1 819 2 3 U
TATGTTGAAAGAGTTTTCCAATTCTTATATCTGAGTGCAGAGATAGAGAGTAGAGGGAGG
AGTTTAAACTAAAACTTACAAAGCCTAGCAGTTTTTAACATAATAAACTGTTTGGCTTGG
TTCTGTGAAAAAATGTAGGTTGTGGAATACAATCAGCTCTGAACTTCATTGTATTTGATG
ACGCAGTCATAAAGCCGTCCTCCCAGAAACTGTGCTACCTCTGGATGCTTCACCATTCCA
ATCTTGAGGGAATCACACTTGAACTGAGCATAAAGGTTTGTCTCTATTCCACGTCCCATG
CCTTCTAAGATGACCAAGTCTGCATCGGTTGAAAGGTATGCAACCTCCTGTGATACTCTT
GCCAGATCAATAACCGGTAAGTCATTCCCAGAGTTTGCAATCAGAAGATTCGAGATATCA
ACACCCATCAGTTGTCCATTTTCATCCTTAAGCTTGGACAAGATCTCTGCAAGCTCGGTA
TAAGTGACATCATTGATAGATGGAAGCTCATTAGCAGCCAGCACCACCTGCATTCCTTGA
CGTAGCATTTCTCTAGCAAACGGCAAGATACCCAAAATTATGTCTGCACCAGAGTTGTCA
ACAAATATCACAGCCTTCTTGGGGTTATCAGAAGGGAATCGATAAGGAATGGTGCACGCT
CTGTAGTTTGATTCTATCGGTATAGGTAACAGAGGCAACGGTACCATCACTGAGTCGCTC
TCCATTTTTTGATGATCCTTCTTCTTCACTCTAAAGCCAGTAACAAAATTGCAACGTAGG
CGAGAAGAAAGAAAGAGATCTCAGAATCTTCCTCCCCCG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B021JQ U 2
AF RR2B021TF C 1
BS 1 1 RR2B021TF
BS 2 774 RR2B021JQ
BS 775 819 RR2B021TF

RD RR2B021JQ 773 0 0
ATGTTGAAAGAGTTTTCCAATTCTTATATCTGAGTGCAGAGATAGAGAGTAGAGGGAGGA
GTTTAAACTAAAACTTACAAAGCCTAGCAGTTTTTAACATAATAAACTGTTTGGCTTGGT
TCTGTGAAAAAATGTAGGTTGTGGAATACAATCAGCTCTGAACTTCATTGTATTTGATGA
CGCAGTCATAAAGCCGTCCTCCCAGAAACTGTGCTACCTCTGGATGCTTCACCATTCCAA
TCTTGAGGGAATCACACTTGAACTGAGCATAAAGGTTTGTCTCTATTCCACGTCCCATGC
CTTCTAAGATGACCAAGTCTGCATCGGTTGAAAGGTATGCAACCTCCTGTGATACTCTTG
CCAGATCAATAACCGGTAAGTCATTCCCAGAGTTTGCAATCAGAAGATTCGAGATATCAA
CACCCATCAGTTGTCCATTTTCATCCTTAAGCTTGGACAAGATCTCTGCAAGCTCGGTAT
AAGTGACATCATTGATAGATGGAAGCTCATTAGCAGCCAGCACCACCTGCATTCCTTGAC
GTAGCATTTCTCTAGCAAACGGCAAGATACCCAAAATTATGTCTGCACCAGAGTTGTCAA
CAAATATCACAGCCTTCTTGGGGTTATCAGAAGGGAATCGATAAGGAATGGTGCACGCTC
TGTAGTTTGATTCTATCGGTATAGGTAACAGAGGCAACGGTACCATCACTGAGTCGCTCT
CCATTTTTTGATGATCCTTCTTCTTCACTCTAAAGCCAGTAACAAAATTGCAA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2B021TF 819 0 0
TATGTTGAAAGAGTTTTCCAATTCTTATATCTGAGTGCAGAGATAGAGAGTAGAGGGAGG
AGTTTAAACTAAAACTTACAAAGCCTAGCAGTTTTTAACATAATAAACTGTTTGGCTTGG
TTCTGTGAAAAAATGTAGGTTGTGGAATACAATCAGCTCTGAACTTCATTGTATTTGATG
ACGCAGTCATAAAGCCGTCCTCCCAGAAACTGTGCTACCTCTGGATGCTTCACCATTCCA
ATCTTGAGGGAATCACACTTGAACTGAGCATAAAGGTTTGTCTCTATTCCACGTCCCATG
CCTTCTAAGATGACCAAGTCTGCATCGGTTGAAAGGTATGCAACCTCCTGTGATACTCTT
GCCAGATCAATAACCGGTAAGTCATTCCCAGAGTTTGCAATCAGAAGATTCGAGATATCA
ACACCCATCAGTTGTCCATTTTCATCCTTAAGCTTGGACAAGATCTCTGCAAGCTCGGTA
TAAGTGACATCATTGATAGATGGAAGCTCATTAGCAGCCAGCACCACCTGCATTCCTTGA
CGTAGCATTTCTCTAGCAAACGGCAAGATACCCAAAATTATGTCTGCACCAGAGTTGTCA
ACAAATATCACAGCCTTCTTGGGGTTATCAGAAGGGAATCGATAAGGAATGGTGCACGCT
CTGTAGTTTGATTCTATCGGTATAGGTAACAGAGGCAACGGTACCATCACTGAGTCGCTC
TCCATTTTTTGATGATCCTTCTTCTTCACTCTAAAGCCAGTAACAAAATTGCAACGTAGG
CGAGAAGAAAGAAAGAGATCTCAGAATCTTCCTCCCCCG

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 2

CO CL6094Contig1 608 2 2 U
CCAGCATCAACATTTTCACTAATTTCTTGCACATTTGTATACATACATTATTGGAATTAT
CAGACAAACAAAGTTCACACTCAAGTTTTTTTATATTTTTGTTAAGTTGATACTCTACAA
TCTCTTCCTCTGTGCTCCCTCCCTCTCATTCTCTCTCTGCTTCTAACGATCGATGATCCT
TGAAATGTAGATGTGCCATTGTTGATGCACCATCTCTCTGTCTCATGGTGTTCTTTTTCC
CATCTGGAAATCATTTTTCTGCGGAATCATCGGGTTTAGGAGACTTAGAACTCGACTGTA
GCGAAGGAAGAGGATTGGAGCCTTTGATGATCCAACCGAGCCCGAAGAAGACTCCCCCGG
CGAGTATCGCAGTTCCCCAGGCGTGCGAGTACCACTTGCTGTACTGCCTCATCGCGAACT
TCCACTGCTCCCTCAGCGTCGCCTGATCCGGATTCACCGACTCTGGACGGTTCGGATACG
TCATCCTCTGTCCCGTGTAGCTCGATCCGGATCCGATCTCAGGCGCCGGTTTCTTCCCCG
ACGGAGAAGAAGCGGCGTTGTTGTTATTTTTATCGGGGATTTGGCTCTTCTCAGACATTT
TGCCGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EI67TF C 1
AF RR2EI67JQ U 104
BS 1 103 RR2EI67TF
BS 104 608 RR2EI67JQ

RD RR2EI67TF 608 0 0
CCAGCATCAACATTTTCACTAATTTCTTGCACATTTGTATACATACATTATTGGAATTAT
CAGACAAACAAAGTTCACACTCAAGTTTTTTTATATTTTTGTTAAGTTGATACTCTACAA
TCTCTTCCTCTGTGCTCCCTCCCTCTCATTCTCTCTCTGCTTCTAACGATCGATGATCCT
TGAAATGTAGATGTGCCATTGTTGATGCACCATCTCTCTGTCTCATGGTGTTCTTTTTCC
CATCTGGAAATCATTTTTCTGCGGAATCATCGGGTTTAGGAGACTTAGAACTCGACTGTA
GCGAAGGAAGAGGATTGGAGCCTTTGATGATCCAACCGAGCCCGAAGAAGACTCCCCCGG
CGAGTATCGCAGTTCCCCAGGCGTGCGAGTACCACTTGCTGTACTGCCTCATCGCGAACT
TCCACTGCTCCCTCAGCGTCGCCTGATCCGGATTCACCGACTCTGGACGGTTCGGATACG
TCATCCTCTGTCCCGTGTAGCTCGATCCGGATCCGATCTCAGGCGCCGGTTTCTTCCCCG
ACGGAGAAGAAGCGGCGTTGTTGTTATTTTTATCGGGGATTTGGCTCTTCTCAGACATTT
TGCCGCCG

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2EI67JQ 505 0 0
AAGTTGATACTCTACAATCTCTTCCTCTGTGCTCCCTCCCTCTCATTCTCTCTCTGCTTC
TAACGATCGATGATCCTTGAAATGTAGATGTGCCATTGTTGATGCACCATCTCTCTGTCT
CATGGTGTTCTTTTTCCCATCTGGAAATCATTTTTCTGCGGAATCATCGGGTTTAGGAGA
CTTAGAACTCGACTGTAGCGAAGGAAGAGGATTGGAGCCTTTGATGATCCAACCGAGCCC
GAAGAAGACTCCCCCGGCGAGTATCGCAGTTCCCCAGGCGTGCGAGTACCACTTGCTGTA
CTGCCTCATCGCGAACTTCCACTGCTCCCTCAGCGTCGCCTGATCCGGATTCACCGACTC
TGGACGGTTCGGATACGTCATCCTCTGTCCCGTGTAGCTCGATCCGGATCCGATCTCAGG
CGCCGGTTTCTTCCCCGACGGAGAAGAAGCGGCGTTGTTGTTATTTTTATCGGGGATTTG
GCTCTTCTCAGACATTTTGCCGCCG

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 2

CO CL6095Contig1 757 2 6 U
GGCTAAGAGCTGCCTTGCTCGGAGCCAACGATGGTCTGGTCACAGTCGCGTCACTCATGA
TGGGTGTTGGTTCTATCAAAGAAGATGTCAAAGCAATGTTGCTTGTTGGTTTTGCCGGCC
TTGTAGCAGGTGCGTGCAGTATGGCCATTGGAGAATTTGTGTCTGTCTGCACACAAAGGG
ATATTGAAACTGCTCAGATGAAGAGAGCAATTGAGACTAACACAACACTATCAGCAATCG
ACGAACAAGATGAGGAGGAGAAGAAAGAACGGCTACCAAATCCAGGACAAGCAGCGTTGG
CATCAGCATTAGCGTTTTCAATGGGAGCAGCAATGCCGCTTCTTGCAGCTGTATTCATAG
TGAATCATAAGGTAAGAATGGCGGTGGTAGCGATTGTGGCCACCCTGGCATTATTGGTGT
TTGGAGTGACCGGTGCGGTTCTGGGAAAGACAAGTGTGTTCAAGTCAAGCGTTAGGGTGA
TAATTGGTGGCTGGATGGCTATGGCTCTTACCTTTGGTCTTACCAAGTTCATTGGTTCCG
AAGCTATGCAAATCTAGACATCATCTTGTTTTCATGCATCTCAATTAATAGTGTTTGCTG
TGTTTGTATCATATAAGCACACTATCTTACCTCGAATTTGTATGAAATGTATTTTACGGA
AAAAAAACTATGTATGAAATGTATAATACATCAATCGCACAATAAACACCAAAAAGGTTA
AATAAACGGTTCTGTTATCTTTCGTTTGACAGTACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK24TF U 1
AF RR2CK24JQ C 42
BS 1 551 RR2CK24TF
BS 552 552 RR2CK24JQ
BS 553 571 RR2CK24TF
BS 572 572 RR2CK24JQ
BS 573 611 RR2CK24TF
BS 612 757 RR2CK24JQ

RD RR2CK24TF 611 0 0
GGCTAAGAGCTGCCTTGCTCGGAGCCAACGATGGTCTGGTCACAGTCGCGTCACTCATGA
TGGGTGTTGGTTCTATCAAAGAAGATGTCAAAGCAATGTTGCTTGTTGGTTTTGCCGGCC
TTGTAGCAGGTGCGTGCAGTATGGCCATTGGAGAATTTGTGTCTGTCTGCACACAAAGGG
ATATTGAAACTGCTCAGATGAAGAGAGCAATTGAGACTAACACAACACTATCAGCAATCG
ACGAACAAGATGAGGAGGAGAAGAAAGAACGGCTACCAAATCCAGGACAAGCAGCGTTGG
CATCAGCATTAGCGTTTTCAATGGGAGCAGCAATGCCGCTTCTTGCAGCTGTATTCATAG
TGAATCATAAGGTAAGAATGGCGGTGGTAGCGATTGTGGCCACCCTGGCATTATTGGTGT
TTGGAGTGACCGGTGCGGTTCTGGGAAAGACAAGTGTGTTCAAGTCAAGCGTTAGGGTGA
TAATTGGTGGCTGGATGGCTATGGCTCTTACCTTTGGTCTTACCAAGTTCATTGGTTCCG
AAGCTATGCAA*TCTAGACATCATCTTGTTT*CATGCATCTCAATTAATAGTGTTTGCTG
TGTTTGTATCA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2CK24JQ 716 0 0
ACAGTCGCGTCGCTCATGATGGGTGTTGGTTCTATCAAAGAAGATGTCAAAGCAATGTTG
CTTGTTGGTTTTGCCGGCCTTGTAGCAGGTGCGTGCAGTATGGCCATTGGAGAATTTGTG
TCTGTCTGCACACAAAGGGATATTGAAACTGCTCAGATGAAGAGAGCAATTGAGATTAAG
ACAACACTATCAGCAATCGACGAACAAGATGAGGAGGAGAAGAAAGAACGGCTACCAAAT
CCAGGACAAGCAGCGTTGGCATCAGCATTAGCGTTTTCAATGGGAGCAGCAATGCCGCTT
CTTGCAGCTGTATTCATAGTGAATCATAAGGTAAGAATGGCGGTGGTAGCGATTGTGGCC
ACCCTGGCATTATTGGTGTTTGGAGTGACCGGTGCGGTTCTGGGAAAGACAAGTGTGTTC
AAGTCAAGCGTTAGGGTGATAATTGGTGGCTGGATGGCTATGGCTCTTACCTTTGGTCTT
ACCAAGTTCATTGGTTCCGAAGCTATGCAAATCTAGACATCATCTTGTTTTCATGCATCT
CAATTAATAGTGTTTGCTGTGTTTGTATCATATAAGCACACTATCTTACCTCGAATTTGT
ATGAAATGTATTTTACGGAAAAAAAACTATGTATGAAATGTATAATACATCAATCGCACA
ATAAACACCAAAAAGGTTAAATAAACGGTTCTGTTATCTTTCGTTTGACAGTACTT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL6096Contig1 764 2 6 U
ACTTAATTTTGGAACAAGCAACCATATGAGAAAACTTCTGTCACAAGAAAGGAAAGTTTT
ACAAAACAACAACAAAAAGAACAGATCATAAATCCTTGGAAGGATTACATAACATCATCT
CTTAGCAATCGATCAAAAGGCAGTTCTGCGAAAGGGAAGTCGTATCAGTCTTAGAGACAA
AAGGATTGATACGAACCCAAACAAGAGAAAACACAGAAGCAAGCAAGATAGACCAGAGAA
TAACAATGGTGGGTGTCCTGTTCTGTCTTCCCATAAGACCTTTAAGGAAAGGATAAAGAT
GAAGAACGACCCAAAAGGCGAAGAAAATCTTCCCAAACAAAGGTCCCCAAGCTTCATAAC
CTTTGTTTAAAGCATCAGAGAAGCCAGCAACGACTCCAACCAAGTTAATTATGAGAAGCG
ATGTTGGAGGGATCAAGAGAGTTGTCCATTTGACAATGTACAGCTCACCGAACTCCAAAT
CTTCTGCGGTTTTCGATGTGACTGTGAAGTTTGTGTCGAGACCAGCGAGCATGTTGAGGA
AGCCTTGGAAGACAGCAAACAGGTGAGCTGAGACACCTCCAATCACCCAAAACTGCTCGT
TTCTCCATAAGTCTTCAATGCTCACTCCACTCCATCTAAGCTCAAGGACGCTTGTTAAGA
TGATTGATATGAAGAGCCCAAGAAACAGCATGCTTGCAAGGTTTGATAGCGTTGGGATGA
TGAATTTCCCGGTGAGAAGACAAATGGCGGGAAGAGTACAGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY08JQ U 1
AF RR2EJ47JQ U 67
BS 1 244 RR2DY08JQ
BS 245 245 RR2EJ47JQ
BS 246 383 RR2DY08JQ
BS 384 384 RR2EJ47JQ
BS 385 493 RR2DY08JQ
BS 494 764 RR2EJ47JQ

RD RR2DY08JQ 493 0 0
ACTTAATTTTGGAACAAGCAACCATATGAGAAAACTTCTGTCACAAGAAAGGAAAGTTTT
ACAAAACAACAACAAAAAGAACAGATCATAAATCCTTGGAAGGATTACATAACATCATCT
CTTAGCAATCGATCAAAAGGCAGTTCTGCGAAAGGGAAGTCGTATCAGTCTTAGAGACAA
AAGGATTGATACGAACCCAAACAAGAGAAAACACAGAAGCAAGCAAGATAGACCAGAGAA
TAACGATGGTGGGTGTCCTGTTCTGTCTTCCCATAAGACCTTTAAGGAAAGGATAAAGAT
GAAGAACGACCCAAAAGGCGAAGAAAATCTTCCCAAACAAAGGTCCCCAAGCTTCATAAC
CTTTGTTTAAAGCATCAGAGAAGTCAGCAACGACTCCAACCAAGTTAATTATGAGAAGCG
ATGTTGGAGGGATCAAGAGAGTTGTCCATTTGACAATGTACAGCTCACCGAACTCCAAAT
CTTCTGCGGTTTT

QA 1 493 1 493
DS 

RD RR2EJ47JQ 698 0 0
CAACAACAAAAAGAACAGATCATAAATCCTTGGAAGGATTACATAACATCATCTCTTAGC
AATCGATCAAAAGGCAGTTCTGCGAAAGGGAAGTCGTATCAGTCTTAGAGACAAAAGGAT
TGATACGAACCCAAACAAGAGAAAACACAGAAGCAAGCAAGATAGACCAGAGAATAACAA
TGGTGGGTGTTCTGTTCTGTCTTCCCATAAGACCTTTAAGGAAAGGATAAAGATGAAGAA
CGACCCAAAAGGCGAAGAACATCTTCCCAAACAAAGGTCCCCAAGCTTCATAGCCTTTGT
TTAAAGCATCAGAGAAGCCAGCAACGACTCCAACCAAGTTAATTATGAGAAGTGATGTTG
GAGGGATCAAGAGAGTTGTCCATTTGACAATGTACAGCTCACCGAACTCCAAATCTTCTG
CGGTTTTCGATGTGACTGTGAAGTTTGTGTCGAGACCAGCGAGCATGTTGAGGAAGCCTT
GGAAGACAGCAAACAGGTGAGCTGAGACACCTCCAATCACCCAAAACTGCTCGTTTCTCC
ATAAGTCTTCAATGCTCACTCCACTCCATCTAAGCTCAAGGACGCTTGTTAAGATGATTG
ATATGAAGAGCCCAAGAAACAGCATGCTTGCAAGGTTTGATAGCGTTGGGATGATGAATT
TCCCGGTGAGAAGACAAATGGCGGGAAGAGTACAGTAA

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL6097Contig1 626 2 3 U
TAAATCAATAGCATGAAAACTTTTATAAGTTATTGTGAATTTTTGTCATTTATATCTGAA
GCACTTGATCACGCTGTAACACTAGGTGCATATCACATTCATTCATTACACTGACAGAGA
TTGAAGGAGCCAACAGAGAGCATGAAAATATGATATGGATGGATTGTTTCAGAGTACTCT
GGTTTTGCCAATTTCAACGGGTAAGATAGTAAATGACTAGAAATAAACCCACGAATGCTG
CGACGAGTGTCAGCATTCTTCTGCTTGATTTGGTCTCAAAAACAGTTTTAAACCGGTCCA
TGGTTCCTGAAAAAATTCCCCTTGATGAATCCATATCATTACCCATTCTGTCAAGCATGC
GGTTATGAGTATCCACCTCTTCGTTAATATCGCCAGAAAGTCGTTTTAAGAGAACGACTC
TGTCTTGTAACCCTTCCAAGACACGCTCATTCTCATGCTCATTGATTTCATGAGAGTAAG
AAGAAGCAGCTCTGATTCCTCCCTCTTCGATTCCATCAAAGAGCGAACTTCTTCCACCAC
GAGGCTCCCTTCTAGGATTCATAGCTCAATCAAATCCTCGATTTGGCTTCAAAGTTCCTC
GGATGTTTCCAGATTTCACCTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ67JQ U 271
AF RR2EQ67TF C 1
BS 1 270 RR2EQ67TF
BS 271 379 RR2EQ67JQ
BS 380 626 RR2EQ67TF

RD RR2EQ67JQ 109 0 0
TGGTCTCAAAAACAGTTTTAAACCGGTCCATGGTTCCTGAAAAAATTCCCCTTGATGAAT
CCATATCATTACCCATTCTGTCAAGCATGCGGTTATGAGTATCCACCTC

QA 1 109 1 109
DS 

RD RR2EQ67TF 626 0 0
TAAATCAATAGCATGAAAACTTTTATAAGTTATTGTGAATTTTTGTCATTTATATCTGAA
GCACTTGATCACGCTGTAACACTAGGTGCATATCACATTCATTCATTACACTGACAGAGA
TTGAAGGAGCCAACAGAGAGCATGAAAATATGATATGGATGGATTGTTTCAGAGTACTCT
GGTTTTGCCAATTTCAACGGGTAAGATAGTAAATGACTAGAAATAAACCCACGAATGCTG
CGACGAGTGTCAGCATTCTTCTGCTTGATTTGGTCTCAAAAACAGTTTTAAACCGGTCCA
TGGTTCCTGAGAGAATTCCCCTTGATGAATCCATATCATTACCCATTCTGTCAAGCATGC
GGTTATGAGTATCCACCTCTTCGTTAATATCGCCAGAAAGTCGTTTTAAGAGAACGACTC
TGTCTTGTAACCCTTCCAAGACACGCTCATTCTCATGCTCATTGATTTCATGAGAGTAAG
AAGAAGCAGCTCTGATTCCTCCCTCTTCGATTCCATCAAAGAGCGAACTTCTTCCACCAC
GAGGCTCCCTTCTAGGATTCATAGCTCAATCAAATCCTCGATTTGGCTTCAAAGTTCCTC
GGATGTTTCCAGATTTCACCTCCTCC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL6098Contig1 1030 2 10 U
GGGTCCGCGCTCGAGCGAGAGAGGTTGATAAACTCTGCAGAGATCTCTAAGGAGATCGAG
AGACTGAGTCACGAGGCGTTGGAGTTTAGTAAGACAGGGGAGGAGGCTCGTCATGTTGTT
GATAAAGCTGTGTGTGAGATGGAAGAGACGAGGAGCAAGATCGAAGCTGCTGAGATGCGT
TTGGTGGCTGCTAGGAAGATGAAGGAAGCTGCTAGAGCGGCTGAAGCGGTTGCAATCGCT
GAAATCAAAGCTGTCACTAGGAGGAGGAGGAGAAGAGAGACGTGGCAGGAGGAGATTCTT
GAGAAGATTGAAGAGACGGCTCAGGAGATCAGAAGCAGCAGGAGGACGATCGAGGAAGGT
CTGGAGAGAGTGAACAGCGCGAAAATGGAAGAAGAAGAGGCACAATGGCAGTGGTCAGAA
CGTAGGAGGAGATCGTACAAGAACAGGAGAGAGACGGTTCTGATGGATGTAAACGGTCTG
GATATGATGATGAATGGGGACGGGACAGCGTCTTCGGTTGCGGTGTTGAAACCAACGATG
TCTATAGGGCAAATACTGAGCAGGAAGCTACTTCTTGCGGATGAGTCGGCGATGATGATG
AACGGGAGAGTGTCGTTGGGTCAGATACTTGGAAAGACTAACAAGATCAAAGAAAAAGAA
AAAAAGGTTAATGGGAAGAGGAAGAGGTTCGGATTGGCTAAGTTGTCTGTGATGTTGAAC
AAAGAGTGCAAGAACAAGAAGAAGAAGATAGCTTTGAACTTACAGTGATGAAGTGAGTGT
GACCTGTCTTAGGGATTGTTATGTGTTCGGTGCGTTGTCTTATTATGTTAAGGAAATTGG
GTTTCCATTGATTTTCTTTATGTAACTGGTTTATTGTGCTACAATAGTAAAATGTGGTGT
GTGATTTGTTTTTTACAGTGTGACTGAATTGAAAATGGTCTAATCTCTTATCTTAGGAGT
TAAACGTCCTTGTTAAGTCTCATTATGTTAACAATTGGTTTATTGTGCTAATAATACATT
CTGGTGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR87TF U 1
AF RR2AH57JQ C 250
BS 1 377 RR2FR87TF
BS 378 378 RR2AH57JQ
BS 379 442 RR2FR87TF
BS 443 443 RR2AH57JQ
BS 444 533 RR2FR87TF
BS 534 534 RR2AH57JQ
BS 535 626 RR2FR87TF
BS 627 627 RR2AH57JQ
BS 628 655 RR2FR87TF
BS 656 1030 RR2AH57JQ

RD RR2FR87TF 655 0 0
GGGTCCGCGCTCGAGCGAGAGAGGTTGATAAACTCTGCAGAGATCTCTAAGGAGATCGAG
AGACTGAGTCACGAGGCGTTGGAGTTTAGTAAGACAGGGGAGGAGGCTCGTCATGTTGTT
GATAAAGCTGTGTGTGAGATGGAAGAGACGAGGAGCAAGATCGAAGCTGCTGAGATGCGT
TTGGTGGCTGCTAGGAAGATGAAGGAAGCTGCTAGAGCGGCTGAAGCGGTTGCAATCGCT
GAAATCAAAGCTGTCACTAGGAGGAGGAGGAGAAGAGAGACGTGGCAGGAGGAGATTCTT
GAGAAGATTGAAGAGACGGCTCAGGAGATCAGAAGCAGCAGGAGGACGATCGAGGAAGGT
CTGGAGAGAGTGAACAGTGCGAAAATGGAAGAAGAAGAGGCACAATGGCAGTGGTCAGAA
CGTAGGAGGAGATCGTACAAGAGCAGGAGAGAGACGGTTCTGATGGATGTAAACGGTCTG
GATATGATGATGAATGGGGACGGGACAGCGTCTTCGGTTGCGGTGTTGAAACCGACGATG
TCTATAGGGCAAATACTGAGCAGGAAGCTACTTCTTGCGGATGAGTCGGCGATGATGATG
AACGGGAGAGTGTCGTTGGGTCAGATTCTTGGAAAGACTAACAAGATCAAAGAAA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2AH57JQ 781 0 0
GTCACCAGG
AGGAGGAGGAGGAGGAGAGAGACGTGGCAGGAGGAGATTCTTGAGAAGATTGTAGAGACG
GCTCAGGAGATCAGAAGCAGCAGGAGGACGATCGAGGAAGGTTTGGAGAGAGTGAACAGC
GCGAAAATGGAAGGAGAAGAGGCACAATGGCAGTGGTCAGAACGTAGGAGGAGATCGTAC
AAGAACAGGAGAGAGACGGTTCTGATGGATGTAAACGGTCTGGATATGATGATGAATGGG
GACGGGACAGCGTCTTCGGTTGCTGTGTTGAAACCAACGATGTCTATTGGGCAAATACTG
AGCAGGAAGCTACTTCTTGCGGATGAGTCGGCGATGATGATGAACGGGAGAGTGTCGTTG
GGTCAGATACTTGGGAAGACTAACAAGATCAAGGAAAAAGAAAAAAAGGTTAATGGGAAG
AGGAAGAGGTTCGGATTGGCTAAGTTGTCTGTGATGTTGAACAAAGAGTGCAAGAACAAG
AAGAAGAAGATAGCTTTGAACTTACAGTGATGAAGTGAGTGTGACCTGTCTTAGGGATTG
TTATGTGTTCGGTGCGTTGTCTTATTATGTTAAGGAAATTGGGTTTCCATTGATTTTCTT
TATGTAACTGGTTTATTGTGCTACAATAGTAAAATGTGGTGTGTGATTTGTTTTTTACAG
TGTGACTGAATTGAAAATGGTCTAATCTCTTATCTTAGGAGTTAAACGTCCTTGTTAAGT
CTCATTATGTTAACAATTGGTTTATTGTGCTAATAATACATTCTGGTGTGTG

QA 10 781 10 781
DS 



AS 1 2

CO CL6099Contig1 328 2 2 U
GCAATAGAAAATTAATTAAATATGTTTAGCAAGAAAAAAAAAACAAAATGAAATGTATGA
AACCAAGAAAACTTTTTTTAAGAATCAGACATTGATTAAGGCTTCAGCTTCTTAGAGAGA
ATCCAGAAACCAAAAACCAAATCCTATATATTAGTTTGATGAGGTGGTGGCTTAGAGATC
TTGTTCGAGGAGGTAACCACCCAGCCTCTCGACGACCATGTTGCACTGTCCTGGTGTCAC
GGGCTCTTCATAGATCCCAAACACACATGACTGTCCTGTTTTCTTTATGGTTATGCCTCC
CGCTCCCTTCTTTCCACGGATAACAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FG11TF C 1
AF RR2FG11JQ U 73
BS 1 72 RR2FG11TF
BS 73 328 RR2FG11JQ

RD RR2FG11TF 328 0 0
GCAATAGAAAATTAATTAAATATGTTTAGCAAGAAAAAAAAAACAAAATGAAATGTATGA
AACCAAGAAAACTTTTTTTAAGAATCAGACATTGATTAAGGCTTCAGCTTCTTAGAGAGA
ATCCAGAAACCAAAAACCAAATCCTATATATTAGTTTGATGAGGTGGTGGCTTAGAGATC
TTGTTCGAGGAGGTAACCACCCAGCCTCTCGACGACCATGTTGCACTGTCCTGGTGTCAC
GGGCTCTTCATAGATCCCAAACACACATGACTGTCCTGTTTTCTTTATGGTTATGCCTCC
CGCTCCCTTCTTTCCACGGATAACAGCC

QA 1 328 1 328
DS 

RD RR2FG11JQ 256 0 0
TTTTTTTAAGAATCAGACATTGATTAAGGCTTCAGCTTCTTAGAGAGAATCCAGAAACCA
AAAACCAAATCCTATATATTAGTTTGATGAGGTGGTGGCTTAGAGATCTTGTTCGAGGAG
GTAACCACCCAGCCTCTCGACGACCATGTTGCACTGTCCTGGTGTCACGGGCTCTTCATA
GATCCCAAACACACATGACTGTCCTGTTTTCTTTATGGTTATGCCTCCCGCTCCCTTCTT
TCCACGGATAACAGCC

QA 1 256 1 256
DS 



AS 1 2

CO CL6100Contig1 603 2 1 U
GGATAAAAGCCCCAAATTATTTTCTCCGCTCAAGAGAACCGAATCCTTCGCAATCGGACC
CCAACGGTACCGTACCCATCCTCCTTCTTAAGTCGCCGGAGATCGATCGTTAGATAATGG
CGACGTTTGAGCTATACAGGAGATCGACGATAGGGATGTGTTTGACGGAGACTTTGGATG
AGATGGTTCAGAGCGGTACCTTGAGCCCTGAGCTAGCTATCCAAGTCCTTGTTCAGTTTG
ATAAGTCCATGACTGAAGCTTTGGAGAGCCAAGTGAAGACCAAGGTGTCTATCAAGGGGC
ACTTGCACACTTACAGGTTCTGTGACAACGTATGGACCTTTATATTACAGGACGCAATGT
TCAAGATTGACGACCGTCAAGAGAATGTGAGCCGGGTCAAGATAGTGGCATGTGACTCCA
AGCTGCTCACACAGTGAGAGATGTAATAGATTTTTGAGTTTTCCCTTTTTCACTTTGTAA
ACTCAGCACTTGCTATATGTTGAGCTCCATTTGCAGCCATCAATTTAGCCCCTTTATATG
TACATTATCGGCCCAAAGACATATGGGACTCCTGTTGCTATGAGAAAGTTCTTAAGATTC
ACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2CL30JQ C 1
AF RR2CL30TF U 1
BS 1 603 RR2CL30TF

RD RR2CL30JQ 603 0 0
GGATAAAAGCCCCAAATTATTTTCTCCGCTCAAGAGAACCGAATCCTTCGCAATCGGACC
CCAACGGTACCGTACCCATCCTCCTTCTTAAGTCGCCGGAGATCGATCGTTAGATAATGG
CGACGTTTGAGCTATACAGGAGATCGACGATAGGGATGTGTTTGACGGAGACTTTGGATG
AGATGGTTCAGAGCGGTACCTTGAGCCCTGAGCTAGCTATCCAAGTCCTTGTTCAGTTTG
ATAAGTCCATGACTGAAGCTTTGGAGAGCCAAGTGAAGACCAAGGTGTCTATCAAGGGGC
ACTTGCACACTTACAGGTTCTGTGACAACGTATGGACCTTTATATTACAGGACGCAATGT
TCAAGATTGACGACCGTCAAGAGAATGTGAGCCGGGTCAAGATAGTGGCATGTGACTCCA
AGCTGCTCACACAGTGAGAGATGTAATAGATTTTTGAGTTTTCCCTTTTTCACTTTGTAA
ACTCAGCACTTGCTATATGTTGAGCTCCATTTGCAGCCATCAATTTAGCCCCTTTATATG
TACATTATCGGCCCAAAGACATATGGGACTCCTGTTGCTATGAGAAAGTTCTTAAGATTC
ACC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RR2CL30TF 603 0 0
GGATAAAAGCCCCAAATTATTTTCTCCGCTCAAGAGAACCGAATCCTTCGCAATCGGACC
CCAACGGTACCGTACCCATCCTCCTTCTTAAGTCGCCGGAGATCGATCGTTAGATAATGG
CGACGTTTGAGCTATACAGGAGATCGACGATAGGGATGTGTTTGACGGAGACTTTGGATG
AGATGGTTCAGAGCGGTACCTTGAGCCCTGAGCTAGCTATCCAAGTCCTTGTTCAGTTTG
ATAAGTCCATGACTGAAGCTTTGGAGAGCCAAGTGAAGACCAAGGTGTCTATCAAGGGGC
ACTTGCACACTTACAGGTTCTGTGACAACGTATGGACCTTTATATTACAGGACGCAATGT
TCAAGATTGACGACCGTCAAGAGAATGTGAGCCGGGTCAAGATAGTGGCATGTGACTCCA
AGCTGCTCACACAGTGAGAGATGTAATAGATTTTTGAGTTTTCCCTTTTTCACTTTGTAA
ACTCAGCACTTGCTATATGTTGAGCTCCATTTGCAGCCATCAATTTAGCCCCTTTATATG
TACATTATCGGCCCAAAGACATATGGGACTCCTGTTGCTATGAGAAAGTTCTTAAGATTC
ACC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL6101Contig1 460 2 4 U
AAAAAAAACAATCAAATTTTGGACTTGCCAGTTGCCATACAAAGGGGAATACCATCAAAC
ATAAACATGATAATGAAATAGGCGAGGAGGACAAAACACACTTGACTTGCACGCGACCAA
CTTTTTTACATTGGTCCAAACCATCATGTGCTAAAAACATCATGCACTTATTATTATCAA
AGTGAAAAAACGACCCAACGTCTTTTATGGAACTTTTGCGTAAACACCCATCGTTCTTTG
AACACGGTTCAAAGTTCTTGGTAAGTAGGTATTGGAACCCCTGAATCATCGGTGAGCTTC
TTGTAAGCACTTTGCAGCTTTCTAGTAACCGGTCCTACTTCTCCTTTACCGATCACACGA
CCATCGATTTTCACAACCGGGCTGAGTTCTCCCATAGTTCCTGGGGTCCACACCTCATCA
GCTGTATGAAATTCAAACAAGCTGATGTTTCGTTCTTCCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN36JQ U 1
AF RR2HA11JQ U 1
BS 1 308 RR2GN36JQ
BS 309 309 RR2HA11JQ
BS 310 419 RR2GN36JQ
BS 420 460 RR2HA11JQ

RD RR2GN36JQ 419 0 0
AAAAAAAACAATCAAATTTTGGACTTGCCAGTTGCCATACAAAGGGGAATACCATCAAAC
ATAAACATGATAATGAAATAGGCGAGGAGGACAAAACACACTTGACTTGCACGCGACCAA
CTTTTTTACATTGGTCCAAACCATCATGTGCTAAAAACATCATGCACTTATTATTATCAA
AGTGAAAAAACGACCCAACGTCTTTTATGGAACTTTTGCGTAAACACCCATCGTTCTTTG
AACACGGTTCAAAGTTCTTGGTAAGTAGGTATTGGAACCCCTGAATCATCGGTGAGCTTC
TTGTAAGCCCTTTGCAGCTTTCTAGTAACCGGTCCTACTTCTCCTTTACCGATCACACGA
CCATCGATTTTCACAACCGGGCTGAGTTCTCCCATAGTTCCTGGGGTCCACACCTCATC

QA 1 419 1 419
DS 

RD RR2HA11JQ 460 0 0
AAAAAAAACAATCAAATTTTGGACTTGCCAGTTGCCATACAAAGGGGAATACCATCAAAC
ATAAACATGATAATGAAATAGGCGAGGAGGACGAAACACACTTGACTTGCACGCGACCAA
CTTTTTTACATTGGTCCAAACCATCATGTGCTAAAAACATCATGCACTTATTATTATCAA
AGTGAAAAAACGACCCAACGTCTTTTATGGAACTTTTGCGTAAACACCCATCGTTCTTTG
AACACGGTTCAAAGTTCTTGGTAAGTAGGTATTGGAACGCCTGAATCATCGGTGAGCTTC
TTGTAAGCACTTTGCAGCTTTCTAGTAACCGGTCCTACTTCTCCTTTACCGATCACACGA
CCATCGATTTTCACAACCGGGCTGAGTTCTCCCATAGTTCCTGTGGTCCACACCTCATCA
GCTGTATGAAATTCAAACAAGCTGATGTTTCGTTCTTCCA

QA 1 460 1 460
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6103Contig1 1189 2 2 U
GCACCTTACGAGATAATGATGTTTTGAGGAGAAAATCATTCTATGAGATGAGTAAAGTGG
AAATGGTTGTTCCTATGGTGATTGGTGACTATACAGACTTCTTTGCGTCCATGCATCACG
CCAAGAACTGCGGTCTTATGTTTCGTGGGCCTCAGAATGCTATTAACCCAAACTGGTTTC
GTCTTCCCATCGCATATCATGGACGAGCATCATCTATCGTCATCTCTGGGACTGACATTA
TTCGACCAAGAGGTCAAGGCCATCCACAAGGAAACTCTGAACCATATTTTGGTCCTTCAC
AGAAACTTGATTTTGAGCTTGAAATGGCTGCTGTGGTTGGCCCAGGAAATGAATTGGGAA
AGCCTATTGACGTGAATAACGCAGCCGATCATATATTTGGTCTTGTACTGATGAATGACT
GGAGTGCTAGGGACATTCAAGCGTGGGAGTACGTACCTCTTGGACCTTTCCTGGGAAAGA
GTTTCGGTACTACGGTATCTCCTTGGATTGTTGCCTTAGATGCGCTTGAACCTTTCAGTT
GTCAAGCTCCCAAGCAGGATCCACCTCCATTGCCATATCTGGCTGAGAAAGAGTCTGTAA
ACTACGATATCTCCTTGGAGGTTCAACTCAAACCTTCTGGCAAAGATGAATCTTCTGTAA
TAACAAAGAGCAACTTCCAAAACTTATATTGGACCATAACGCAGCAGCTAGCGCACCATA
CGGTTAATGGTTGCAATTTGAGGCCTGGTGATCTCCTTGGAACCGGAACCTTAAGCGGAC
CCGAGCCAGATTCATACGGGTGTCTACTTGAGCTAACTTGGAATGGACAGAAGCCTTTAT
CAATGAACGGAACGACTCAGACGTTTCTTCAAGACGGTGATCAAGTGACCTTTTCAGGTG
TATGCAAGGGAGATGGTTACAATGTCGGATTTGGAACATGCGCAGGGAAAATTTTACCTT
CACTGCCTTGATGAGCTTTCCAAGGAAAGTTGGTGGAAAGAAAGATCTCATCCGTATTCA
CATCACGATTAAGCACTTGGAGAATGAAGATGATCAAAGTAGATAACCCTATCCAATTAA
TAAAATTAGTCATCTCGATATTTGGTGTAATATGATATTATTGTTGAATCTCTTACTATT
AAGAAGACAACGGAATCTAAATACTTTCTTTATATATAAAACGACTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD83TF U 1
AF RR2GD83JQ C 419
BS 1 607 RR2GD83TF
BS 608 1189 RR2GD83JQ

RD RR2GD83TF 607 0 0
GCACCTTACGAGATAATGATGTTTTGAGGAGAAAATCATTCTATGAGATGAGTAAAGTGG
AAATGGTTGTTCCTATGGTGATTGGTGACTATACAGACTTCTTTGCGTCCATGCATCACG
CCAAGAACTGCGGTCTTATGTTTCGTGGGCCTCAGAATGCTATTAACCCAAACTGGTTTC
GTCTTCCCATCGCATATCATGGACGAGCATCATCTATCGTCATCTCTGGGACTGACATTA
TTCGACCAAGAGGTCAAGGCCATCCACAAGGAAACTCTGAACCATATTTTGGTCCTTCAC
AGAAACTTGATTTTGAGCTTGAAATGGCTGCTGTGGTTGGCCCAGGAAATGAATTGGGAA
AGCCTATTGACGTGAATAACGCAGCCGATCATATATTTGGTCTTGTACTGATGAATGACT
GGAGTGCTAGGGACATTCAAGCGTGGGAGTACGTACCTCTTGGACCTTTCCTGGGAAAGA
GTTTCGGTACTACGGTATCTCCTTGGATTGTTGCCTTAGATGCGCTTGAACCTTTCAGTT
GTCAAGCTCCCAAGCAGGATCCACCTCCATTGCCATATCTGGCTGAGAAAGAGTCTGTAA
ACTACGA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2GD83JQ 771 0 0
CTGGAGTGCTAGGGACATTCAAGCGTGGGAGTACGTACCTCTTGGACCTTTCCTGGGAAA
GAGTTTCGGTACTACGGTATCTCCTTGGATTGTTGCCTTAGATGCGCTTGAACCTTTCAG
TTGTCAAGCTCCCAAGCAGGATCCACCTCCATTGCCATATCTGGCTGAGAAAGAGTCTGT
AAACTACGATATCTCCTTGGAGGTTCAACTCAAACCTTCTGGCAAAGATGAATCTTCTGT
AATAACAAAGAGCAACTTCCAAAACTTATATTGGACCATAACGCAGCAGCTAGCGCACCA
TACGGTTAATGGTTGCAATTTGAGGCCTGGTGATCTCCTTGGAACCGGAACCTTAAGCGG
ACCCGAGCCAGATTCATACGGGTGTCTACTTGAGCTAACTTGGAATGGACAGAAGCCTTT
ATCAATGAACGGAACGACTCAGACGTTTCTTCAAGACGGTGATCAAGTGACCTTTTCAGG
TGTATGCAAGGGAGATGGTTACAATGTCGGATTTGGAACATGCGCAGGGAAAATTTTACC
TTCACTGCCTTGATGAGCTTTCCAAGGAAAGTTGGTGGAAAGAAAGATCTCATCCGTATT
CACATCACGATTAAGCACTTGGAGAATGAAGATGATCAAAGTAGATAACCCTATCCAATT
AATAAAATTAGTCATCTCGATATTTGGTGTAATATGATATTATTGTTGAATCTCTTACTA
TTAAGAAGACAACGGAATCTAAATACTTTCTTTATATATAAAACGACTTAT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL6104Contig1 902 2 8 U
GGAAGCAGTCATATTTTCATCCAATCATGCCAATCTTTGGGGGATCTTCTGATTCTGAAG
ACGAAAGAACAATGCATCAAACGACTAAGTTCTTCAATCGCCAACGATCAACTCACTCTA
TATTTGGAGGAGGCAAATTTGCGGATATTTTGTTATGGAGAGAGCCAAAAATAGCTGCAA
CTTTGGTGATAGGAGTTAGTCTCTTCTGGTTCTTGATGGAAGTAGTGGAATACAATTTCA
TACCCCTAATTTGTCATGCTTCCATGACTTCTATGATTCTTTTCTTTATTTGGTCCACTG
CTTCTGATTTTCTCAATTGGGAAAGGCCAATTATACCAGAAGTGGTACTAGAGGAATCTT
CTTTCAAGGAATTAGCAAGAAGCTTTCATGATAGATTCAACAAAATCCTCTCCAAGCTTC
TAGACATTGCTTGTGGAAGAGATCCTCCACTCTTTTTCCTCACAACCTTCTCACTTTACA
TCATCTCCATCATCGGGACATATTTCAACTTTATGAATCTTTTGTTCATAGGGTTTATAA
GCATGCAAACGTTGCCGGTTATGTACGAGCTGTACGAGGATGACGTTGATAGAGTGGTGA
GTAAGTTGACGACGAAGATGAGGAAGCTGTACAGAAAAATTGACTCGAACGTTCTTAGCA
AGATCCCAAGAGGAACTGTCAAAAGCAAGAAACATACTTAAAATATTGTTTATATATTAA
TTCATGTATAATCAGAATTCATATGCATATATTGTGTGCCATAATCCATTGCTTAACTAT
GCCTATGCTCTGGGCCGGACTTGCTTTCCGGCAAGGCGGCAACAATTCTGTAACTGTAAG
ACATACACACTGTACTGGTTATCCTTTTCTTATGGTTCCCTGAGTGGAATCCACTTCTAG
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2EW63TF U 1
AF RR2EW63JQ C 250
BS 1 683 RR2EW63TF
BS 684 684 RR2EW63JQ
BS 685 759 RR2EW63TF
BS 760 760 RR2EW63JQ
BS 761 775 RR2EW63TF
BS 776 776 RR2EW63JQ
BS 777 801 RR2EW63TF
BS 802 902 RR2EW63JQ

RD RR2EW63TF 801 0 0
GGAAGCAGTCATATTTTCATCCAATCATGCCAATCTTTGGGGGATCTTCTGATTCTGAAG
ACGAAAGAACAATGCATCAAACGACTAAGTTCTTCAATCGCCAACGATCAACTCACTCTA
TATTTGGAGGAGGCAAATTTGCGGATATTTTGTTATGGAGAGAGCCAAAAATAGCTGCAA
CTTTGGTGATAGGAGTTAGTCTCTTCTGGTTCTTGATGGAAGTAGTGGAATACAATTTCA
TACCCCTAATTTGTCATGCTTCCATGACTTCTATGATTCTTTTCTTTATTTGGTCCACTG
CTTCTGATTTTCTCAATTGGGAAAGGCCAATTATACCAGAAGTGGTACTAGAGGAATCTT
CTTTCAAGGAATTAGCAAGAAGCTTTCATGATAGATTCAACAAAATCCTCTCCAAGCTTC
TAGACATTGCTTGTGGAAGAGATCCTCCACTCTTTTTCCTCACAACCTTCTCACTTTACA
TCATCTCCATCATCGGGACATATTTCAACTTTATGAATCTTTTGTTCATAGGGTTTATAA
GCATGCAAACGTTGCCGGTTATGTACGAGCTGTACGAGGATGACGTTGATAGAGTGGTGA
GTAAGTTGACGACGAAGATGAGGAAGCTGTACAGAAAAATTGACTCGAACGTTCTTAGCA
AGATCCCAAGAGGAACTGTCAAA*GCAAGAAACATACTTAAAATATTGTTTATATATTAA
TTCATGTATAATCAGAATTCATATGCATATATTGTGTGC*ATAATCCATTGCTTA*CTAT
GCCTATGCTCTGGGCCGGACT

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2EW63JQ 653 0 0
TTTGTCATGCTTCCATGACTTCTATGATTCTTTTCTTTATTTGGTCCACTGCTTCTGATT
TTCTCAATTGGGAAAGGCCAATTATACCAGAAGTGGTACTAGAGGAATCTTCTTTCAAGG
AATTAGCAAGAAGCTTTCATGATAGATTCAACAAAATCCTCTCCAAGCTTCTAGACATTG
CTTGTGGAAGAGATCCTCCACTCTTTTTCCTCACAACCTTCTCACTTTACATCATCTCCA
TCATCGGGACATATTTCAACTTTATGAATCTTTTGTTCATAGGGTTTATAAGCATGCAAA
CGTTGCCGGTTATGTACGAGCTGTACGAGGATGACGTTGATAGAGTGGTGAGTAAGTTGA
CGACGAAGATGAGGAAGCTGTACAGAAAAATTGACTCGAACGTTCTTAGCAAGATCCCAA
GAGGAACTGTCAAAAGCAAGAAACATACTTAAAATATTGTTTATATATTAATTCATGTAT
AATCAGAATTCATATGCATATATTGTGTGCCATAATCCATTGCTTAACTATGCCTATGCT
CTGGGCCGGACTTGCTTTCCGGCAAGGCGGCAACAATTCTGTAACTGTAAGACATACACA
CTGTACTGGTTATCCTTTTCTTATGGTTCCCTGAGTGGAATCCACTTCTAGCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL6105Contig1 969 2 2 U
GACAACTCTTTCACAAAGAAAAAAAAAAGATGAGTGCTTTAGAAGAATCGAAGGTCTATA
TTTTTTTGTGGCTTCTCTGCTTTTCAATCTTCTTCACTTCGAGTCTCCAGGCAAATGAGC
TAACAACACCATCTAAAGAAGAAGGAGAGACGAGGATGGTACCATTAATGGAGGAGAAGT
TTATGGTGATGAATGAGACAAGAAGGAAGCTTGGGAGTTTCCAGATATGCTCAGTTTGTA
CTTGTTGTGGAGGTGCTAAAGGACTTTGCTTGCCTTCACCTTGTTGCTTTGCAATTAACT
GCAATATCCCAAATAGACCCTTTGGTTATTGCTCCTTCACTCCCAAATCTTGCAATTGCT
TTGGTTGCCACATCTAATATCTTTTACTGTGCAGAGAAAAAAAGTAAAATCAACATCTTG
ATTTCATCTGCAAAGTGCGAAAGGGAAGATAAGAAGGAGTATGTGTTCTTGGTTTGGTTC
TTTATTTTTATATTTTTGTTCATAATTCTATATCCAGCTTTCATTAAATTTCATTACCTA
CTATCTTCAGCAACATCATCATCCTCATTAATTTAATATCTTCTTTTTGCCTTGCCATTA
TGATAAAGAAATTTGGGTCTTTCATGGAGGATCTTGTTCACACTTCAAGCTAGATTTGTT
TTTCTTTGCCTCTCTTCAATCAATTTATGTATCTTTTTTTTCTTTTTCCTTCTTCTGTTT
ACTCCAGTTTTTTTCTCATGGGTTAGTATTTTATCACCAGGATTGTACTTGTAGCATATT
TTGGGAAGGGTCTTTTTGTTTTGTTTTGTTAAGTTGGCAATTGGAACTGGAAGATTAATA
TGATGATGATGGTGTTGATGGTAGTGATGCTGAAGCTGCCTGTTAAAGCTAAGTCTTTTG
TGATGTGATATGTTAAGATTATTAAGAAATGGATAAAGTTAAGTAAGTAGTTCTCTGTTC
TGATCTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP72TF U 1
AF RR2CP72JQ C 146
BS 1 694 RR2CP72TF
BS 695 969 RR2CP72JQ

RD RR2CP72TF 694 0 0
GACAACTCTTTCACAAAGAAAAAAAAAAGATGAGTGCTTTAGAAGAATCGAAGGTCTATA
TTTTTTTGTGGCTTCTCTGCTTTTCAATCTTCTTCACTTCGAGTCTCCAGGCAAATGAGC
TAACAACACCATCTAAAGAAGAAGGAGAGACGAGGATGGTACCATTAATGGAGGAGAAGT
TTATGGTGATGAATGAGACAAGAAGGAAGCTTGGGAGTTTCCAGATATGCTCAGTTTGTA
CTTGTTGTGGAGGTGCTAAAGGACTTTGCTTGCCTTCACCTTGTTGCTTTGCAATTAACT
GCAATATCCCAAATAGACCCTTTGGTTATTGCTCCTTCACTCCCAAATCTTGCAATTGCT
TTGGTTGCCACATCTAATATCTTTTACTGTGCAGAGAAAAAAAGTAAAATCAACATCTTG
ATTTCATCTGCAAAGTGCGAAAGGGAAGATAAGAAGGAGTATGTGTTCTTGGTTTGGTTC
TTTATTTTTATATTTTTGTTCATAATTCTATATCCAGCTTTCATTAAATTTCATTACCTA
CTATCTTCAGCAACATCATCATCCTCATTAATTTAATATCTTCTTTTTGCCTTGCCATTA
TGATAAAGAAATTTGGGTCTTTCATGGAGGATCTTGTTCACACTTCAAGCTAGATTTGTT
TTTCTTTGCCTCTCTTCAATCAATTTATGTATCT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2CP72JQ 824 0 0
AGAGACGAGGATGGTACCATTAATGGAGGAGAAGTTTATGGTGATGAATGAGACAAGAAG
GAAGCTTGGGAGTTTCCAGATATGCTCAGTTTGTACTTGTTGTGGAGGTGCTAAAGGACT
TTGCTTGCCTTCACCTTGTTGCTTTGCAATTAACTGCAATATCCCAAATAGACCCTTTGG
TTATTGCTCCTTCACTCCCAAATCTTGCAATTGCTTTGGTTGCCACATCTAATATCTTTT
ACTGTGCAGAGAAAAAAAGTAAAATCAACATCTTGATTTCATCTGCAAAGTGCGAAAGGG
AAGATAAGAAGGAGTATGTGTTCTTGGTTTGGTTCTTTATTTTTATATTTTTGTTCATAA
TTCTATATCCAGCTTTCATTAAATTTCATTACCTACTATCTTCAGCAACATCATCATCCT
CATTAATTTAATATCTTCTTTTTGCCTTGCCATTATGATAAAGAAATTTGGGTCTTTCAT
GGAGGATCTTGTTCACACTTCAAGCTAGATTTGTTTTTCTTTGCCTCTCTTCAATCAATT
TATGTATCTTTTTTTTCTTTTTCCTTCTTCTGTTTACTCCAGTTTTTTTCTCATGGGTTA
GTATTTTATCACCAGGATTGTACTTGTAGCATATTTTGGGAAGGGTCTTTTTGTTTTGTT
TTGTTAAGTTGGCAATTGGAACTGGAAGATTAATATGATGATGATGGTGTTGATGGTAGT
GATGCTGAAGCTGCCTGTTAAAGCTAAGTCTTTTGTGATGTGATATGTTAAGATTATTAA
GAAATGGATAAAGTTAAGTAAGTAGTTCTCTGTTCTGATCTGAT

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

CO CL6106Contig1 961 2 2 U
GACGCTTACACTTATCGCAGCGAACTCCAAACTCTCAAAAAAAACTCTCGAAAATGGCGG
AACATGGTGGAGAACGTGGAGCCGTCGGAGAACGTGGTGGTTTCGGACGTGGATTCGGAG
GTGGTCGTGGCGACCGTGGTGGTCGCGGTGGTCCGAGAGGACTCGGTGGCAGACGCGGAG
GACGTCCCGCGGAGGAGGAGAAGTGGACTCCAGTGACCAAGCTCGGCCGTCTCGTGAAAG
ACGGAAAGATCCAGAAGCTCGAGCAGATCTACCTCCACTCCCTCCCCGTCAAGGAGTACC
AGATCATCGACCTCCTCGTCGGTCCCACCTTGAAAGACGAGGTGATGAAGATCATGCCGG
TTCAGAAACTGACCAGAGCCGGTCAGATGACCAGGTTCAAGGCCTTTGTTGTCGTCGGAG
ACACGAACGGGCATGTCGGTTTGGGAGTGAAGTGCTCCAAGGAGGTGGCGACGGCGATCA
GAGGAGGGATTATATTGGCGAAGCTGTCTGTGATTCCGGTGAGGAGAGGTTACTGGGGGA
ACAAGATTGGGAAGCCGCATACGGTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGTTCAGTTA
CGGTGAGGATGGTGCCTGCTCCGAGAGGTGCGGGGGATTGTGGCGGCTAGGGTTCAGAAG
ACTTATGGATTCCTGACACCAGAGTTCTGGAAAGGGACGAGCTTTAAGAAATCACCGTAC
CAGGAGTACACTGATTTGCTGGCCTCAAAGGGAACTACGACCAAAGTCATCACCGAGGTC
GAAGACCAAGCCGCCGCCTAAATCATCACCCACATTTTGAATTTATCCTTGATTTTGGTC
TCGAACTTTGTTGGATTGCATCTTATGTTTTACTCTCTTCCCAAACCATTACTTTTCAGT
TTTATAGTTGGATAATATTCTATCTTTTTGTTTTCATTTCAAAACCATTTTCTTTTGATT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BA52TF U 1
AF RR2BA52JQ C 87
BS 1 880 RR2BA52TF
BS 881 961 RR2BA52JQ

RD RR2BA52TF 880 0 0
GACGCTTACACTTATCGCAGCGAACTCCAAACTCTCAAAAAAAACTCTCGAAAATGGCGG
AACATGGTGGAGAACGTGGAGCCGTCGGAGAACGTGGTGGTTTCGGACGTGGATTCGGAG
GTGGTCGTGGCGACCGTGGTGGTCGCGGTGGTCCGAGAGGACTCGGTGGCAGACGCGGAG
GACGTCCCGCGGAGGAGGAGAAGTGGACTCCAGTGACCAAGCTCGGCCGTCTCGTGAAAG
ACGGAAAGATCCAGAAGCTCGAGCAGATCTACCTCCACTCCCTCCCCGTCAAGGAGTACC
AGATCATCGACCTCCTCGTCGGTCCCACCTTGAAAGACGAGGTGATGAAGATCATGCCGG
TTCAGAAACTGACCAGAGCCGGTCAGATGACCAGGTTCAAGGCCTTTGTTGTCGTCGGAG
ACACGAACGGGCATGTCGGTTTGGGAGTGAAGTGCTCCAAGGAGGTGGCGACGGCGATCA
GAGGAGGGATTATATTGGCGAAGCTGTCTGTGATTCCGGTGAGGAGAGGTTACTGGGGGA
ACAAGATTGGGAAGCCGCATACGGTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGTTCAGTTA
CGGTGAGGATGGTGCCTGCTCCGAGAGGTGCGGGGGATTGTGGCGGCTAGGGTTCAGAAG
ACTTATGGATTCCTGACACCAGAGTTCTGGAAAGGGACGAGCTTTAAGAAATCACCGTAC
CAGGAGTACACTGATTTGCTGGCCTCAAAGGGAACTACGACCAAAGTCATCACCGAGGTC
GAAGACCAAGCCGCCGCCTAAATCATCACCCACATTTTGAATTTATCCTTGATTTTGGTC
TCGAACTTTGTTGGATTGCATCTTATGTTTTACTCTCTTC

QA 1 880 1 880
DS 

RD RR2BA52JQ 875 0 0
GGAGAACGTGGTGGTT*CGGACGTGGATTCGGAGGTGGTCGTGGCGACCGTGGTGGTCGC
GGTGGTCCGAGAGGACTCGGTGGCAGACGCGGAGGACGTCCCGCGGAGGAGGAGAAGTGG
ACTCCAGTGACCAAGCTCGGCCGTCTCGTGAAAGACGGAAAGATCCAGAAGCTCGAGCAG
ATCTACCTCCACTCCCTCCCCGTCAAGGAGTACCAGATCATCGACCTCCTCGTCGGTCCC
ACCTTGAAAGACGAGGTGATGAAGATCATGCCGGTTCAGAAACTGACCAGAGCCGGTCAG
ATGACCAGGTTCAAGGCCTTTGTTGTCGTCGGAGACACGAACGGGCATGTCGGTTTGGGA
GTGAAGTGCTCCAAGGAGGTGGCGACGGCGATCAGAGGAGGGATTATATTGGCGAAGCTG
TCTGTGATTCCGGTGAGGAGAGGTTACTGGGGGAACAAGATTGGGAAGCCGCATACGGTT
CCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGTTCAGTTACGGTGAGGATGGTGCCTGCTCCGAGA
GGTGCGGGG*ATTGTGGCGGCTAGGGTTCAGAAGACTTATGGATTCCTGACACCAGAGTT
CTGGAAAGGGACGAGCTTTAAGAAATCACCGTACCAGGAGTACACTGATTTGCTGGCCTC
AAAGGGAACTACGACCAAAGTCATCACCGAGGTCGAAGACCAAGCCGCCGCCTAAATCAT
CACCCACATTTTGAATTTATCCTTGATTTTGGTCTCGAACTTTGTTGGATTGCATCTTAT
GTTTTACTCTCTTCCCAAACCATTACTTTTCAGTTTTATAGTTGGATAATATTCTATCTT
TTTGTTTTCATTTCAAAACCATTTTCTTTTGATTC

QA 1 875 1 875
DS 



AS 1 2

CO CL6107Contig1 741 2 2 U
GGGTTCCCGACGAGTCGCTGCTCTCTCTGAAATAATGACGGCGAGACCTGAAGGAAGTCC
CCCGGAGGTTACACTAGAAACCTCCATGGGTCCGTTCACAGTCGAGATGTATTACAAACA
CTCCCCGAGAACGTGCCGTAACTTCGTCGAGCTATCACGGAGAGGTTACTACGACAACGT
TCTCTTCCACAGAATCATCAAGGATTTCACCGTGCAAGGTGGTGATCCTACTGGAACTGG
AAGAGGTGGCCAATCCATTTACGGTTCCAAGTTTGAGGACGAGATAAAGCCAGAGTTGAA
GCACACGGGAGCTGGGATCTTGTCAACGGCAAACGCTGGTCCCAACACAAATGGGAGTCA
GTTCTTCATCACTTTAGCTCCAGCACCCTCCTTGGATGGAAAGCACACGATATTTGGCAG
AGTCTGCCGTGGTATGGAGGTGATCAAGAGGCTCGGTAGTGTCCAAACCGATAACACCGA
CAGGCCAATCCATGAAGTGAAGATTCTGAGGACCAAAGTGATTGATTAGAAGCAACACTA
GTAAACGATGTTGACATGAAGAATTGTAACCTATTCTATACTGATCCTTGCTACTACTAT
GGGGACTGGTTTTGGTCAGGTTTTGACTCTTCCTGACCAAAAAAAAATGTTTCAAGGTTG
ATTTTAACCAGTTCACTATCTATGTTTCTGTAATACGGATCGTTTCTATCAAAAACCATC
TATCCTAATTTCTCTATACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW83TF U 1
AF RR2DW83JQ C 58
BS 1 614 RR2DW83TF
BS 615 741 RR2DW83JQ

RD RR2DW83TF 614 0 0
GGGTTCCCGACGAGTCGCTGCTCTCTCTGAAATAATGACGGCGAGACCTGAAGGAAGTCC
CCCGGAGGTTACACTAGAAACCTCCATGGGTCCGTTCACAGTCGAGATGTATTACAAACA
CTCCCCGAGAACGTGCCGTAACTTCGTCGAGCTATCACGGAGAGGTTACTACGACAACGT
TCTCTTCCACAGAATCATCAAGGATTTCACCGTGCAAGGTGGTGATCCTACTGGAACTGG
AAGAGGTGGCCAATCCATTTACGGTTCCAAGTTTGAGGACGAGATAAAGCCAGAGTTGAA
GCACACGGGAGCTGGGATCTTGTCAACGGCAAACGCTGGTCCCAACACAAATGGGAGTCA
GTTCTTCATCACTTTAGCTCCAGCACCCTCCTTGGATGGAAAGCACACGATATTTGGCAG
AGTCTGCCGTGGTATGGAGGTGATCAAGAGGCTCGGTAGTGTCCAAACCGATAACACCGA
CAGGCCAATCCATGAAGTGAAGATTCTGAGGACCAAAGTGATTGATTAGAAGCAACACTA
GTAAACGATGTTGACATGAAGAATTGTAACCTATTCTATACTGATCCTTGCTACTACTAT
GGGGACTGGTTTTG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2DW83JQ 684 0 0
TCCCCCGGAGGTTACACTAGAAACCTCCATGGGTCCGTTCACAGTCGAGATGTATTACAA
ACACTCCCCGAGAACGTGCCGTAACTTCGTCGAGCTATCACGGAGAGGTTACTACGACAA
CGTTCTCTTCCACAGAATCATCAAGGATTTCACCGTGCAAGGTGGTGATCCTACTGGAAC
TGGAAGAGGTGGCCAATCCATTTACGGTTCCAAGTTTGAGGACGAGATAAAGCCAGAGTT
GAAGCACACGGGAGCTGGGATCTTGTCAACGGCAAACGCTGGTCCCAACACAAATGGGAG
TCAGTTTTTCATCACTTTAGCTCCAGCACCCTCCTTGGATGGAAAGCACACGATATTTGG
CAGAGTCTGCCGTGGTATGGAGGTGATCAAGAGGCTCGGTAGTGTCCAAACCGATAACAC
CGACAGGCCAATCCATGAAGTGAAGATTTTGAGGACCAAAGTGATTGATTAGAAGCAACA
CTAGTAAACGATGTTGACATGAAGAATTGTAACCTATTCTATACTGATCCTTGCTACTAC
TATGGGGACTGGTTTTGGTCAGGTTTTGACTCTTCCTGACCAAAAAAAAATGTTTCAAGG
TTGATTTTAACCAGTTCACTATCTATGTTTCTGTAATACGGATCGTTTCTATCAAAAACC
ATCTATCCTAATTTCTCTATACAT

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL6108Contig1 765 2 20 U
GGGTCAAACGCCATTCTCGTTTCTTCAAGGGGAAACCAAGCGAGAAGAAGCATCATCTCT
CTCTCTACTCGACTGTTACGCCGCGAAATGACGAGATCACCCCTCCTCGTCTCCGTCCTC
CTCCTCCTCATCTCCGCCGCCACTTTCATCACTCGCGCATCGGCGGAGATAAAGTCCCTC
ACGATCTCCGACGACGACAGACCGATGATCCTCTTCGAGAAGTTCGGATTCACACGATCG
GGCCACGTCAGCGTCTCCGTCTCCTCCGTATCGGTAACCACCCCTACCTCCGCCACGATC
CCGGATCCGTCGCGGCTAGGTTTCTTCCTCATGTCGGAGGAATCGCTCCTCCAAGTCCTC
CTCGAGATCCAGCAAAACCCTAGCTTCTGCGTGCTCGACTCCCCTTACGTCCTCCAGCTC
TTCACGTTCCACGATCTCTCCCCTCCGCCGAACTCCAAGTTCGAGCACTTGTCCCCCGTG
AATTCTCCGGACGAGTACTCTCTCTTCTTCGTCAATTGCGTGAGGGATACGAAGATTTCG
ATGAAGGTCCGAACGGAAATGTATAACCTAGATCCGAACGGGTCGAAGGACTACCTCCCA
GCCGGGTCGACCCGATTACCCGGGTTGTATTTCGTATTCTTCCTCGGATACTTAGCTTTC
CTCGGTCTCTGGGGGTATGTTTGTTGGATTAATAAACGAGTCGTTCATAGGATCCACGTC
CTCATGGCGGCTCTTCTGTTAATGAAAGCTTTGAATCTGATCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR49TF U 1
AF RR2EU72TF U 47
BS 1 130 RR2FR49TF
BS 131 133 RR2EU72TF
BS 134 147 RR2FR49TF
BS 148 148 RR2EU72TF
BS 149 176 RR2FR49TF
BS 177 177 RR2EU72TF
BS 178 279 RR2FR49TF
BS 280 280 RR2EU72TF
BS 281 374 RR2FR49TF
BS 375 375 RR2EU72TF
BS 376 451 RR2FR49TF
BS 452 452 RR2EU72TF
BS 453 476 RR2FR49TF
BS 477 477 RR2EU72TF
BS 478 503 RR2FR49TF
BS 504 504 RR2EU72TF
BS 505 590 RR2FR49TF
BS 591 591 RR2EU72TF
BS 592 739 RR2FR49TF
BS 740 765 RR2EU72TF

RD RR2FR49TF 739 0 0
GGGTCAAACGCCATTCTCGTTTCTTCAAGGGGAAACCAAGCGAGAAGAAGCATCATCTCT
CTCTCTACTCGACTGTTACGCCGCGAAATGACGAGATCACCCCTCCTCGTCTCCGTCCTC
CTCCTCCTCA***CCGCCGCCACTTTCGTCACTCGCGCATCGGCGGAGATAAAGTCTCTC
ACGATCTCCGACGACGACAGACCGATGATCCTCTTCGAGAAGTTCGGATTCACACGATCG
GGCCACGTCAGCGTCTCCGTCTCCTCCGTATCGGTAACCTCCCCTACCTCCGCCACGATC
CCGGATCCGTCGCGGCTAGGTTTCTTCCTCATGTCGGAGGAATCGCTCCTCCAAGTCCTC
CTCGAGATCCAGCAGAACCCTAGCTTCTGCGTGCTCGACTCCCCTTACGTCCTCCAGCTC
TTCACGTTCCACGATCTCTCCCCTCCGCCGAGCTCCAAGTTCGAGCACTTGTCCCCGGTG
AATTCTCCGGACGAGTACTCTCTGTTCTTCGTCAATTGCGTGAGGGATACGAAGATTTCG
ATGAAGGTCCGAACGGAAATGTATAACCTAGATCCGAACGGGTCGAAGGATTACCTCCCA
GCCGGGTCGACCCGATTACCCGGGTTGTATTTCGTATTCTTCCTCGGATACTTAGCTTTC
CTCGGTCTCTGGGGGTATGTTTGTTGGATTAATAAACGAGTCGTTCATAGGATCCACGTC
CTCATGGCGGCTCTTCTGT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2EU72TF 719 0 0
GGAT
CATCATCTCTCTCTCTACTCGACTGTTACGCCGCGAAATGACGAGATCACCCCTCCTCGT
CTCCGTCCTCCTCCTCCTCCTCTCCGCCGCCACTTTCATCACTCGCGCATCGGCGGAGAT
AAAGTCCCTCACGATCTCCGACGACGACAGACCGATGATCCTCTTCGAGAAGTTCGGATT
CACACGATCGGGCCACGTCAGCGTCTCCGTCTCCTCCGTATCGGTAACCACCCCTACGTC
CGCCACGATCCCGGATCCGTCGCGGCTAGGTTTCTTCCTCATGTCGGAGGAATCTCTCCT
CCAAGTCCTCCTCGAGATCCAGCAAAACCCTAGCTTCTGCGTGCTCGACTCCCCTTACGT
CCTCCAGCTCTTCACGTTCCACGATCTCTCCCCTCCGCCGAACTCCAAGTTCGAGCACTT
GTCCCCCGTGGCTTCTCCGGATGAGTACTCTCTCTTCTTCGTCAATTGCGTGAGGGATAC
GAAGATTTCGATGAAGGTCCGAACGGAAATGTATAACCTAGATCCGAACGGGTCGAAGGA
CTACCTCCCCGCCGGGTCGACCCGATTACCCGGGTTGTATTTCTTATTCTTCCTCGGTTA
CTTAGCTTTCCTCGGTCTCTGGGGGTATGTTTGTTGGATTAATAAACGTGTCGTTCATAG
GATCCACGTCCTCATGGCGGCTCTTCTGTTAATGAAAGCTTTGAATCTGATCTGC

QA 5 719 5 719
DS 



AS 1 2

CO CL6109Contig1 859 2 4 U
GGGACGGCTTCTCTTCATCTCTCAGATCCACTGTCATCATCTCTCAGTTCTGCCATCATC
GTTGTTCTCTAGATTTGTCCTTCTCAGCTTCGTCGAAAGTCAGTTATAACAGTCTTTCTC
ATCTCCACCGCCGACGATCTCCTTCAGCTATGTCGTTGACGTTACCCTTCAGCTCCGCCG
TCGACGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTACTGTTCGCGATTGCTAAGTGAG
ATCTGTGTTGATTTGTTTAATGAAATATTAGACTGGGATGTCCATGATGAAGAACGACAA
CTTATCTATATGTTGGATGAATTGCAGAGAGATGGGTTAGAGCCGGAGATGCCAGTTCCA
ACAGATGGCTGGCTTCTTCTTTACGTGGAAAGAAGCAAAGTGCTAGTGGATGGGAAAAGA
GCTAGTAAAGCTCGAAAGCCTGTAGCCAATGGTGTTTCCATTAAGATTACAGCTGAGGTT
CCCAAATGTGTATGTAGGTGATGATTCTTACCCTGTCTTTACACGGTTTCCTTAGTGCTT
TGGGATCTTGTTTTTTTTTGACTTTCCTCTCTCTGTTGTCTTCAACTTGCAGAGGTGGGC
TTAAGCTGGAAGCTGCAATAGAGAAGCTAGATGTTTTGTTTCTGAGAAAGTAGTTCTTGA
TTCTGGAATTTCTACCGGAGGGTTTACAGATTGTTTGCTTCTTTATGGTGTAGCTCATGT
GTATGGGGTTGATGTTGGTTATGGTCAGCTGCTAAGTATTTTCTACTTTTTTTGGTTTTG
TAAAGTCATCCAGAATATGTACAATGATTTCTTGTTACATTTAGAAATTTGAAAAATTTC
AATAATCAACATAAATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ11TF U 1
AF RR2CJ11JQ C 184
BS 1 684 RR2CJ11TF
BS 685 685 RR2CJ11JQ
BS 686 741 RR2CJ11TF
BS 742 859 RR2CJ11JQ

RD RR2CJ11TF 741 0 0
GGGACGGCTTCTCTTCATCTCTCAGATCCACTGTCATCATCTCTCAGTTCTGCCATCATC
GTTGTTCTCTAGATTTGTCCTTCTCAGCTTCGTCGAAAGTCAGTTATAACAGTCTTTCTC
ATCTCCACCGCCGACGATCTCCTTCAGCTATGTCGTTGACGTTACCCTTCAGCTCCGCCG
TCGACGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTACTGTTCGCGATTGCTAAGTGAG
ATCTGTGTTGATTTGTTTAATGAAATATTAGACTGGGATGTCCATGATGAAGAACGACAA
CTTATCTATATGTTGGATGAATTGCAGAGAGATGGGTTAGAGCCGGAGATGCCAGTTCCA
ACAGATGGCTGGCTTCTTCTTTACGTGGAAAGAAGCAAAGTGCTAGTGGATGGGAAAAGA
GCTAGTAAAGCTCGAAAGCCTGTAGCCAATGGTGTTTCCATTAAGATTACAGCTGAGGTT
CCCAAATGTGTATGTAGGTGATGATTCTTACCCTGTCTTTACACGGTTTCCTTAGTGCTT
TGGGATCTTGTTTTTTTTTGACTTTCCTCTCTCTGTTGTCTTCAACTTGCAGAGGTGGGC
TTAAGCTGGAAGCTGCAATAGAGAAGCTAGATGTTTTGTTTCTGAGAAAGTAGTTCTTGA
TTCTGGAATTTCTACCGGAGGGTT*ACAGATTGTTTGCTTCTTTATGGTGTAGCTCATGT
GTATGGGGTTGATGTTGGTTA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2CJ11JQ 676 0 0
ACGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTACTGTTCGCGATTGCTAAGTGAGATC
TGTGTTGATTTGTTTAATGAAATATTAGACTGGGATGTCCATGATGAAGAACGACAACTT
ATCTATATGTTGGATGAATTGCAGAGAGATGGGTTAGAGCCGGAGATGCCAGTTCCAACA
GATGGCTGGCTTCTTCTTTACGTGGAAAGAAGCAAAGTGCTAGTGGATGGGAAAAGAGCT
AGTAAAGCTCGAAAGCCTGTAGCCAATGGTGTTTCCATTAAGATTACAGCTGAGGTTCCC
AAATGTGTATGTAGGTGATGATTCTTACCCTGTCTTTACACGGTTTCCTTAGTGCTTTGG
GATCTTGTTTTTTTTTGACTTTCCTCTCTCTGTTGTCTTCAACTTGCAGAGGTGGGCTTA
AGCTGGAAGCTGCAATAGAGAAGCTAGATGTTTTGTTTCTGAGAAAGTAGTTCTTGATTC
TGGAATTTCTACCGGAGGGTTTACAGATTGTTTGCTTCTTTATGGTGTAGCTCATGTGTA
TGGTGTTGATGTTGGTTATGGTCAGCTGCTAAGTATTTTCTACTTTTTTTGGTTTTGTAA
AGTCATCCAGAATATGTACAATGATTTCTTGTTACATTTAGAAATTTGAAAAATTTCAAT
AATCAACATAAATCTC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL6110Contig1 801 2 2 U
GGAGAGACAAGGAAAAGAAAACCAATGGCTGATAAAGAAGAAGTGAAGCTTTTGGGGATA
TGGGCGAGTCCTTATAGCCGTCGGATAGAGATGGCTCTCAAAATCAAAGGCGTACCGTAC
GAATACGTCGAAGAGATATTGGAGAAGAAAAGCTCTTTGCTCCTTGCTCTAAACCCTATT
CACAAGAAGATCCCTGTTCTTGTCCACAATGATAAAACCATTCTCGAGTCTCAAGTGATT
CTTGAGTACATCGATGAGACTTGGAAACATAATCCACTTCTCCCTCAGGATCCTTACGAG
AGATCTAAGGCTCGGTTCTTGGCTAAACTCGTCGATGAGCAGATTTTAACCGCAGGGTTT
GTATCAATGGCAAGAGCAGATGAGAAAGGAAGAGAAGTTCTTGCTGAGCAGACAAGAGAA
CTGATTATGAATCTTGAGAAGGAACTTGTGGGAAAAGATTTCTTTGGTGGTAAGACTGTC
GGATTCTTGGATTTAGTCGCCGGAAGTATGATCCCTTTTTGTTTGGAGAGAGGTTGGGAA
GGAGTTGGACTGGAAGTGATCTCAGAGGAGAAGTTTCCAGAGTACAAGAAATGGGTGAAG
AATCTTGAGAAGGTTGAGTTTGTCAAGGATTGTATTCCTCCAAGAGAGGAACATGTTGAA
CACATGAATTGCATGGGAGAGAGAATCAGATCAGCTTAAACGTATCAAGACAAGAATCAT
CTTTAGTGATTTGTTCCAATGTTTAAGTTTGTAATGCTAGTAAGCTTGTTATATGTTATG
TCTAAAATAAAAATTGGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA28TF U 1
AF RR2HA28JQ C 171
BS 1 712 RR2HA28TF
BS 713 801 RR2HA28JQ

RD RR2HA28TF 726 0 0
GGAGAGACAAGGAAAAGAAAACCAATGGCTGATAAAGAAGAAGTGAAGCTTTTGGGGATA
TGGGCGAGTCCTTATAGCCGTCGGATAGAGATGGCTCTCAAAATCAAAGGCGTACCGTAC
GAATACGTCGAAGAGATATTGGAGAAGAAAAGCTCTTTGCTCCTTGCTCTAAACCCTATT
CACAAGAAGATCCCTGTTCTTGTCCACAATGATAAAACCATTCTCGAGTCTCAAGTGATT
CTTGAGTACATCGATGAGACTTGGAAACATAATCCACTTCTCCCTCAGGATCCTTACGAG
AGATCTAAGGCTCGGTTCTTGGCTAAACTCGTCGATGAGCAGATTTTAACCGCAGGGTTT
GTATCAATGGCAAGAGCAGATGAGAAAGGAAGAGAAGTTCTTGCTGAGCAGACAAGAGAA
CTGATTATGAATCTTGAGAAGGAACTTGTGGGAAAAGATTTCTTTGGTGGTAAGACTGTC
GGATTCTTGGATTTAGTCGCCGGAAGTATGATCCCTTTTTGTTTGGAGAGAGGTTGGGAA
GGAGTTGGACTGGAAGTGATCTCAGAGGAGAAGTTTCCAGAGTACAAGAAATGGGTGAAG
AATCTTGAGAAGGTTGAGTTTGTCAAGGATTGTATTCCTCCAAGAGAGGAACATGTTGAA
CACATGAATTGCATGGGAGAGAGAATCAGATCAGCTTAAACGTATCAAGACA
GATCATCTTTAGTG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2HA28JQ 631 0 0
AAACCCTATTCACAAGAAGATCCCTGTTCTTGTCCACAATGATAAAACCATTCTCGAGTC
TCAAGTGATTCTTGAGTACATCGATGAGACTTGGAAACATAATCCACTTCTCCCTCAGGA
TCCTTACGAGAGATCTAAGGCTCGGTTCTTGGCTAAACTCGTCGATGAGCAGATTTTAAC
CGCAGGGTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGATGAGAAAGGAAGAGAAGTTCTTGCTGAGCA
GACAAGAGAACTGATTATGAATCTTGAGAAGGAACTTGTGGGAAAAGATTTCTTTGGTGG
TAAGACTGTCGGATTCTTGGATTTAGTCGCCGGAAGTATGATCCCTTTTTGTTTGGAGAG
AGGTTGGGAAGGAGTTGGACTGGAAGTGATCTCAGAGGAGAAGTTTCCAGAGTACAAGAA
ATGGGTGAAGAATCTTGAGAAGGTTGAGTTTGTCAAGGATTGTATTCCTCCAAGAGAGGA
ACATGTTGAACACATGAATTGCATGGGAGAGAGAATCAGATCAGCTTAAACGTATCAAGA
CAAGAATCATCTTTAGTGATTTGTTCCAATGTTTAAGTTTGTAATGCTAGTAAGCTTGTT
ATATGTTATGTCTAAAATAAAAATTGGCTTC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL6111Contig1 932 2 2 U
GAGCCGGATTTAATAATCCAATTCCACTTCAGCTGGCCACTTGGATTTCTTCTTGCTTCC
CCACCAACTGCCCTTGCTCATGAAAGAGATAAGTGGCTTTACTGTTATCTTGTTCTTTGC
CATATCTTTCCTTGCTGGGCTAATAAGATTAGGGAAAAATAAGATATAGACTATGTATAT
CCATTTCTTCCTCTCTTTCTTACTTCGATTCTGGTCGTAGCCCTTATAAGACGGGTAGGA
TAGGATTAATATCCGTAGTAGAGAGGTTTCAGTGATCTCGTGCTAGTGCCCTTATCATTT
CACTAATCAAGAGAAGCGCTGGCTTCTTTAAGTTCAAAAGTGCAGAAAGTGCTCTTCACC
CGCTCCGCTCTCTTCACTTGCTTCCCCTCACTTCGTTTGAGGACTTGTTCTGTAGCTTTC
TCACCTAAAAGATTAGCTCCTTTATCGCCGAAAAGATGCTTTCGAAATGCATTCCCTATG
GACTGCAAAAATATTGACACTCGGGCACCACCATCTGGAAATTTGATGACTGGCATAAGA
TAAGATTCACGTCAAGTTCAGAAAAGTATTATTATCGCTTAGCGCTTGTGCTAAGGTAGC
TTTTTCTAAAAAATACCCTACCTTAACCTATTTAGGTGTAGAACCCATTTTTTTCTTACA
GAGAGATGAAGATTTTGACTTGGTTTAGCTGTCATAGTGGAGCGAAGGGACCAGACTCCT
ACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTCCGCAATACATTTTTCCGTGGTCGAACTCTAATTC
TGAAAATAAGTCGGGGTCCTTTTACCAAGTCTACTAGATAGAAGATGATAGAGGGCCAAC
CATGGTTGCGTTGCACAAGACGGTGCCGCCTCATCTCAAGTTCCTTTCTTCGTAGTCAAA
TCAGATGATAGGCTTCGGCGATGTTACCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM06TF U 1
AF RR2FM06JQ C 162
BS 1 708 RR2FM06TF
BS 709 932 RR2FM06JQ

RD RR2FM06TF 717 0 0
GAGCCGGATTTAATAATCCAATTCCACTTCAGCTGGCCACTTGGATTTCTTCTTGCTTCC
CCACCAACTGCCCTTGCTCATGAAAGAGATAAGTGGCTTTACTGTTATCTTGTTCTTTGC
CATATCTTTCCTTGCTGGGCTAATAAGATTAGGGAAAAATAAGATATAGACTATGTATAT
CCATTTCTTCCTCTCTTTCTTACTTCGATTCTGGTCGTAGCCCTTATAAGACGGGTAGGA
TAGGATTAATATCCGTAGTAGAGAGGTTTCAGTGATCTCGTGCTAGTGCCCTTATCATTT
CACTAATCAAGAGAAGCGCTGGCTTCTTTAAGTTCAAAAGTGCAGAAAGTGCTCTTCACC
CGCTCCGCTCTCTTCACTTGCTTCCCCTCACTTCGTTTGAGGACTTGTTCTGTAGCTTTC
TCACCTAAAAGATTAGCTCCTTTATCGCCGAAAAGATGCTTTCGAAATGCATTCCCTATG
GACTGCAAAAATATTGACACTCGGGCACCACCATCTGGAAATTTGATGACTGGCATAAGA
TAAGATTCACGTCAAGTTCAGAAAAGTATTATTATCGCTTAGCGCTTGTGCTAAGGTAGC
TTTTTCTAAAAAATACCCTACCTTAACCTATTTAGGTGTAGAACCCATTTTTTTCTTACA
GAGAGATGAAGATTTTGACTTGGTTTAGCTGTCATAGTGGAGCGAAGG
ACAGACTCC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2FM06JQ 771 0 0
AGATATAGACTATGTATATCCATTTCTTCCTCTCTTTCTTACTTCGATTCTGGTCGTAGC
CCTTATAAGACGGGTAGGATAGGATTAATATCCGTAGTAGAGAGGTTTCAGTGATCTCGT
GCTAGTGCCCTTATCATTTCACTAATCAAGAGAAGCGCTGGCTTCTTTAAGTTCAAAAGT
GCAGAAAGTGCTCTTCACCCGCTCCGCTCTCTTCACTTGCTTCCCCTCACTTCGTTTGAG
GACTTGTTCTGTAGCTTTCTCACCTAAAAGATTAGCTCCTTTATCGCCGAAAAGATGCTT
TCGAAATGCATTCCCTATGGACTGCAAAAATATTGACACTCGGGCACCACCATCTGGAAA
TTTGATGACTGGCATAAGATAAGATTCACGTCAAGTTCAGAAAAGTATTATTATCGCTTA
GCGCTTGTGCTAAGGTAGCTTTTTCTAAAAAATACCCTACCTTAACCTATTTAGGTGTAG
AACCCATTTTTTTCTTACAGAGAGATGAAGATTTTGACTTGGTTTAGCTGTCATAGTGGA
GCGAAGGGACCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTCCGCAATACATTTTTC
CGTGGTCGAACTCTAATTCTGAAAATAAGTCGGGGTCCTTTTACCAAGTCTACTAGATAG
AAGATGATAGAGGGCCAACCATGGTTGCGTTGCACAAGACGGTGCCGCCTCATCTCAAGT
TCCTTTCTTCGTAGTCAAATCAGATGATAGGCTTCGGCGATGTTACCTACC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL6112Contig1 808 2 1 U
GGAGGTTTCGTTGCGACTCCTCTCCTCCTCCTTTCTCTGAGTGTCTCTTGTCTGCAGAAT
CAAACCGTCGTGCACTCGCCATCGATTTTCAGGTCGCCGGTTACTTTTTTCCCGGTTGGT
GTGCAGATATAGATGTTGAAGAAAGTGTATTCGATAAGTAAAGCAGTTTATGGAAGTAAC
AGAGCAAAGCTTAAACCTTTCTTGTGCCAAACTAATCGTGGATTCCACAATGGGCGGACG
GTTCTTGCTCCGAGAAGTTTCTTTGGTGTAGAAGACTACGTGGACGACGACACAAGCCGA
CCATACACATACCAAAAGGAGAAAAAATCAAAGAACCCAGACAAACACGTCTCCTTCAAG
CAACGCACAGTCGCATACATGGAGCCCTTCACTCTCGACGTCTTCATCTCAAAACGTTTC
GTCTCAGCGTCCCTCACCCACCGTGTCACATGTAAGCAAGTCGCTGTCGCGGGAACGAAC
TCTAAAGACGTGAAAGCGGTTTTGAGGTCGAGATGCGATATCCCAGCGTGTATGTCCATA
GGGAGGATCTTGTCTGAGCGTGCAAAAGAGGCTGATGTGTACACAGCTTCTTACACGCCG
CGAGACCAAGACAAGTTCGAAGGGAAGATCAGAGCTGTTGTCCAGTCTCTTATTGATAAC
GGGATCGATGTCAAAATCTATCTGGATTAGAGTCATCTAGACGCAAGCGAGTCACTGCTC
ATTGTTCATTTCATGACAATTTCGTTTCATATCTTAATCGTGACGAATTGAAAGTTCTTA
TAAACAGTGATATAAACCATTTTTTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B955JQ C 1
AF RR2B955TF U 1
BS 1 808 RR2B955TF

RD RR2B955JQ 808 0 0
GGAGGTTTCGTTGCGACTCCTCTCCTCCTCCTTTCTCTGAGTGTCTCTTGTCTGCAGAAT
CAAACCGTCGTGCACTCGCCATCGATTTTCAGGTCGCCGGTTACTTTTTTCCCGGTTGGT
GTGCAGATATAGATGTTGAAGAAAGTGTATTCGATAAGTAAAGCAGTTTATGGAAGTAAC
AGAGCAAAGCTTAAACCTTTCTTGTGCCAAACTAATCGTGGATTCCACAATGGGCGGACG
GTTCTTGCTCCGAGAAGTTTCTTTGGTGTAGAAGACTACGTGGACGACGACACAAGCCGA
CCATACACATACCAAAAGGAGAAAAAATCAAAGAACCCAGACAAACACGTCTCCTTCAAG
CAACGCACAGTCGCATACATGGAGCCCTTCACTCTCGACGTCTTCATCTCAAAACGTTTC
GTCTCAGCGTCCCTCACCCACCGTGTCACATGTAAGCAAGTCGCTGTCGCGGGAACGAAC
TCTAAAGACGTGAAAGCGGTTTTGAGGTCGAGATGCGATATCCCAGCGTGTATGTCCATA
GGGAGGATCTTGTCTGAGCGTGCAAAAGAGGCTGATGTGTACACAGCTTCTTACACGCCG
CGAGACCAAGACAAGTTCGAAGGGAAGATCAGAGCTGTTGTCCAGTCTCTTATTGATAAC
GGGATCGATGTCAAAATCTATCTGGATTAGAGTCATCTAGACGCAAGCGAGTCACTGCTC
ATTGTTCATTTCATGACAATTTCGTTTCATATCTTAATCGTGACGAATTGAAAGTTCTTA
TAAACAGTGATATAAACCATTTTTTTTC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2B955TF 808 0 0
GGAGGTTTCGTTGCGACTCCTCTCCTCCTCCTTTCTCTGAGTGTCTCTTGTCTGCAGAAT
CAAACCGTCGTGCACTCGCCATCGATTTTCAGGTCGCCGGTTACTTTTTTCCCGGTTGGT
GTGCAGATATAGATGTTGAAGAAAGTGTATTCGATAAGTAAAGCAGTTTATGGAAGTAAC
AGAGCAAAGCTTAAACCTTTCTTGTGCCAAACTAATCGTGGATTCCACAATGGGCGGACG
GTTCTTGCTCCGAGAAGTTTCTTTGGTGTAGAAGACTACGTGGACGACGACACAAGCCGA
CCATACACATACCAAAAGGAGAAAAAATCAAAGAACCCAGACAAACACGTCTCCTTCAAG
CAACGCACAGTCGCATACATGGAGCCCTTCACTCTCGACGTCTTCATCTCAAAACGTTTC
GTCTCAGCGTCCCTCACCCACCGTGTCACATGTAAGCAAGTCGCTGTCGCGGGAACGAAC
TCTAAAGACGTGAAAGCGGTTTTGAGGTCGAGATGCGATATCCCAGCGTGTATGTCCATA
GGGAGGATCTTGTCTGAGCGTGCAAAAGAGGCTGATGTGTACACAGCTTCTTACACGCCG
CGAGACCAAGACAAGTTCGAAGGGAAGATCAGAGCTGTTGTCCAGTCTCTTATTGATAAC
GGGATCGATGTCAAAATCTATCTGGATTAGAGTCATCTAGACGCAAGCGAGTCACTGCTC
ATTGTTCATTTCATGACAATTTCGTTTCATATCTTAATCGTGACGAATTGAAAGTTCTTA
TAAACAGTGATATAAACCATTTTTTTTC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL6113Contig1 1099 2 2 U
GGACGCGCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTCTGTCGCACTCTCCTC
TAGAACCTGGCAATTGAAGAGAATCAGCAAGCTACTGTCAGAGAAATCAAACCCACAAGC
AAAGGAATCATCATGGGAGCTGAAGAAGAAAAAAACAAGATGTTGCCTCCATGGCTTAAA
CCTCTGCTTCGAGAGAAGTTCTTCGTACAATGCAAATTACACGCAGATTCACACAAGAGT
GAGTGTAACATGTACTGTTTAGACTGTACCAATGGTCCTCTCTGTTCTCTCTGCCTCTTT
TTCCACAAGGATCATCACGCCATTCAGATAAGGAGATCATCGTATCACGATGTGATCAGG
GTATCGAAGATCCAGAAATTTCTGGACATAACAGGAGTTCAGACATATGTGATCAACAGT
GCTAAGGTTGTCTTCTTGAACGAAAGACCTCAACCCCGACCGGGCAAAGGCATCGTGAAC
ACCTGCCAAGTCTGTTATCGGAGCCTCGTTGATTCTTTCAGATTCTGCTCTCTTGGCTGT
AAGATCTCTGGAGTATCTAAGAGTTTCAATAAGAAAAGAAAGGATTGGACAAACAATCTC
TCAGATTCTGATGGTTCGTATAGCAGTTCTACTAGTATAGGGAGGCTCAAGAAGAATGAT
GACATGATTCATAATAGTTTCACACCGTCAACACCACCTCTATCTGCCGTGAATCGTCGA
ATTGCAAAACGAAGAAAGGGAATACCGCACCGTGCTCCTTTTGGGGGACTAATCATAGAA
TACTAAGAAAATGGTAATGTATAGTCTTATGCTAATAACCATCACTAGTAGTTTGTGGGG
GTATATATAAGTATGTGCGTATATATATATTTCTATAATGGTCTAAAGCAATGTAAAAAC
AGAAGCTTAACACCATAGTGTGAAGTTAGATAGAAAGTGTAAGAAGTGGGAAAGATTATA
GAATGAAGTATGAAAGGAATACTTGTTCTTGTATATTTGGCTCAAAGGGTGGATATGTAA
ATGAAAAAAGACAATAGTAATAAAAGCATGTGATGGAATACAAATGTGAATGAAATAAAA
GCACTTAAACATTCGATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ40TF U 1
AF RR2AQ40JQ C 301
BS 1 835 RR2AQ40TF
BS 836 1099 RR2AQ40JQ

RD RR2AQ40TF 835 0 0
GGACGCGCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTCTGTCGCACTCTCCTC
TAGAACCTGGCAATTGAAGAGAATCAGCAAGCTACTGTCAGAGAAATCAAACCCACAAGC
AAAGGAATCATCATGGGAGCTGAAGAAGAAAAAAACAAGATGTTGCCTCCATGGCTTAAA
CCTCTGCTTCGAGAGAAGTTCTTCGTACAATGCAAATTACACGCAGATTCACACAAGAGT
GAGTGTAACATGTACTGTTTAGACTGTACCAATGGTCCTCTCTGTTCTCTCTGCCTCTTT
TTCCACAAGGATCATCACGCCATTCAGATAAGGAGATCATCGTATCACGATGTGATCAGG
GTATCGAAGATCCAGAAATTTCTGGACATAACAGGAGTTCAGACATATGTGATCAACAGT
GCTAAGGTTGTCTTCTTGAACGAAAGACCTCAACCCCGACCGGGCAAAGGCATCGTGAAC
ACCTGCCAAGTCTGTTATCGGAGCCTCGTTGATTCTTTCAGATTCTGCTCTCTTGGCTGT
AAGATCTCTGGAGTATCTAAGAGTTTCAATAAGAAAAGAAAGGATTGGACAAACAATCTC
TCAGATTCTGATGGTTCGTATAGCAGTTCTACTAGTATAGGGAGGCTCAAGAAGAATGAT
GACATGATTCATAATAGTTTCACACCGTCAACACCACCTCTATCTGCCGTGAATCGTCGA
ATTGCAAAACGAAGAAAGGGAATACCGCACCGTGCTCCTTTTGGGGGACTAATCATAGAA
TACTAAGAAAATGGTAATGTATAGTCTTATGCTAATAACCATCACTAGTAGTTTG

QA 1 835 1 835
DS 

RD RR2AQ40JQ 799 0 0
TTCCACAAGGATCATCACGCCATTCAGATAAGGAGATCATCGTATCACGATGTGATCAGG
GTATCGAAGATCCAGAAATTTCTGGACATAACAGGAGTTCAGACATATGTGATCAACAGT
GCTAAGGTTGTCTTCTTGAACGAAAGACCTCAACCCCGACCGGGCAAAGGCATCGTGAAC
ACCTGCCAAGTCTGTTATCGGAGCCTCGTTGATTCTTTCAGATTCTGCTCTCTTGGCTGT
AAGATCTCTGGAGTATCTAAGAGTTTCAATAAGAAAAGAAAGGATTGGACAAACAATCTC
TCAGATTCTGATGGTTCGTATAGCAGTTCTACTAGTATAGGGAGGCTCAAGAAGAATGAT
GACATGATTCATAATAGTTTCACACCGTCAACACCACCTCTATCTGCCGTGAATCGTCGA
ATTGCAAAACGAAGAAAGGGAATACCGCACCGTGCTCCTTTTGGGGGACTAATCATAGAA
TACTAAGAAAATGGTAATGTATAGTCTTATGCTAATAACCATCACTAGTAGTTTGTGGGG
GTATATATAAGTATGTGCGTATATATATATTTCTATAATGGTCTAAAGCAATGTAAAAAC
AGAAGCTTAACACCATAGTGTGAAGTTAGATAGAAAGTGTAAGAAGTGGGAAAGATTATA
GAATGAAGTATGAAAGGAATACTTGTTCTTGTATATTTGGCTCAAAGGGTGGATATGTAA
ATGAAAAAAGACAATAGTAATAAAAGCATGTGATGGAATACAAATGTGAATGAAATAAAA
GCACTTAAACATTCGATGT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL6114Contig1 753 2 2 U
GAAAGAATACACGAATCTCTCCGACCCTAAAGATAAGAAACAAGGGAAGGGTAAGATAGA
TGATGAATACGTCACCTTTCAACGTATGGTTGCAAAGATGCAAGATGTTGCTGGTGAACG
TGGAGGCTATCTTCATGGACGTGGCACTTTGGACAGCGACGATTTGCTTTATCTTAAAGA
GCAGATGGAAGCAGAGCAGGATGCAGAGCGCCTTCTCAGACGAACTGAGAAACGGGCTTT
TGCTGCCTTTGAAAAAGCTGCAACCCAGGCTGATTCATCTCCAGCATCTATTCCTTTGCC
GCTTCGTGTTGAGCCCAAACCTAAGAGTGGTATCAGGCAGCAAGATTTGCTGAGAAAGGT
TGTCGAGGTTAAACCGAAGCGACCAAAGGTCTCTACAAGCTTGTCACCTCCTAAAAGAAG
CGATATAGTTCCAACAGAAGCAAAGGTTCAGAGAGAGAAACTGGACAGACCTGAGGAGCA
ACCCGGAGGTAAAGCAGCAGCAGAAAGCAATGGGCAAGGTCAAAATGCTTTGAAAGGCTT
GTTGGGATTAGCGTACGAGTCTTCAGATGAAGATGACTGAGATGAGTGTATGAATCTTTC
TCCTTGTAGTCTTGGTCGCGTTTTGTTTTGTCTGTCTCCATTTTATGTCGAAAAGCTTAC
AAGAGTTTTATTAGCTTTAGGATTCAAATACAGCTTTGTTGTAATTGTTGAAACCAAACG
GGTTTTTGTTGGAATGAAGATGGTTTCTAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT12TF U 1
AF RR2AT12JQ C 10
BS 1 718 RR2AT12TF
BS 719 753 RR2AT12JQ

RD RR2AT12TF 718 0 0
GAAAGAATACACGAATCTCTCCGACCCTAAAGATAAGAAACAAGGGAAGGGTAAGATAGA
TGATGAATACGTCACCTTTCAACGTATGGTTGCAAAGATGCAAGATGTTGCTGGTGAACG
TGGAGGCTATCTTCATGGACGTGGCACTTTGGACAGCGACGATTTGCTTTATCTTAAAGA
GCAGATGGAAGCAGAGCAGGATGCAGAGCGCCTTCTCAGACGAACTGAGAAACGGGCTTT
TGCTGCCTTTGAAAAAGCTGCAACCCAGGCTGATTCATCTCCAGCATCTATTCCTTTGCC
GCTTCGTGTTGAGCCCAAACCTAAGAGTGGTATCAGGCAGCAAGATTTGCTGAGAAAGGT
TGTCGAGGTTAAACCGAAGCGACCAAAGGTCTCTACAAGCTTGTCACCTCCTAAAAGAAG
CGATATAGTTCCAACAGAAGCAAAGGTTCAGAGAGAGAAACTGGACAGACCTGAGGAGCA
ACCCGGAGGTAAAGCAGCAGCAGAAAGCAATGGGCAAGGTCAAAATGCTTTGAAAGGCTT
GTTGGGATTAGCGTACGAGTCTTCAGATGAAGATGACTGAGATGAGTGTATGAATCTTTC
TCCTTGTAGTCTTGGTCGCGTTTTGTTTTGTCTGTCTCCATTTTATGTCGAAAAGCTTAC
AAGAGTTTTATTAGCTTTAGGATTCAAATACAGCTTTGTTGTAATTGTTGAAACCAAA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2AT12JQ 744 0 0
CACGAATCTCTCCGACCCTAAAGATAAGAAACAAGGGAAGGGTAAGATAGATGATGAATA
CGTCACCTTTCAACGTATGGTTGCAAAGATGCAAGATGTTGCTGGTGAACGTGGAGGCTA
TCTTCATGGACGTGGCACTTTGGACAGCGACGATTTGCTTTATCTTAAAGAGCAGATGGA
AGCAGAGCAGGATGCAGAGCGCCTTCTCAGACGAACTGAGAAACGGGCTTTTGCTGCCTT
TGAAAAAGCTGCAACCCAGGCTGATTCATCTCCAGCATCTATTCCTTTGCCGCTTCGTGT
TGAGCCCAAACCTAAGAGTGGTATCAGGCAGCAAGATTTGCTGAGAAAGGTTGTCGAGGT
TAAACCGAAGCGACCAAAGGTCTCTACAAGCTTGTCACCTCCTAAAAGAAGCGATATAGT
TCCAACAGAAGCAAAGGTTCAGAGAGAGAAACTGGACAGACCTGAGGAGCAACCCGGAGG
TAAAGCAGCAGCAGAAAGCAATGGGCAAGGTCAAAATGCTTTGAAAGGCTTGTTGGGATT
AGCGTACGAGTCTTCAGATGAAGATGACTGAGATGAGTGTATGAATCTTTCTCCTTGTAG
TCTTGGTCGCGTTTTGTTTTGTCTGTCTCCATTTTATGTCGAAAAGCTTACAAGAGTTTT
ATTAGCTTTAGGATTCAAATACAGCTTTGTTGTAATTGTTGAAACCAAACGGGTTTTTGT
TGGAATGAAGATGGTTTCTAAAGC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL6115Contig1 607 2 4 U
TAATTCAAAGCTAAAGATACATCATATCTCGACCGTTAGGAGCCACAGGATCAGAATCTG
ATCATGGACAAGGTGATGAGAATGTCATCAGGAAAAGGAGTTGTGATCTTCACCAAAAAC
TCATGTTGTCTTTGCTACGCCGTGCAGGTACTTTTCCGTGACCTTAGGGTTCAACCAACA
ATCCACGAGATTGACAACGATCCTGACTACCTCGAGATCGAGAAGGCCTTAGTCCGTCTT
GGCTGCCCCAACGCGGTTCCTGCTGTTTTTGTAAGTGGTAAGCTGGTGGGTTCTACCAAT
GAAGTCATGTCGCTTCACCTAAGTGGCTCTCTCGTTCCCTTGATCAAGCCGTATCAGTTA
TTTCATAATTAGAAATAAAGGTCCTTAAGAAAAAGAAAGACAATTGTTGTATGTTGAGAT
TGGATAGTAAATAATGATGGAAAGATTACACTTGAATGTGTATCATGTTCTTATATATAG
CTAATTTTATATTTTGTTTCGCTCATGTCCAAGAAATTAATTAACTAGCTTTGTATTTCC
CACCTCAACTAATCAGTGGATGTACTGCTGTGTTATCTATAGTAATGAGAAAATTATACT
TATCATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F390TF U 1
AF RR2F390JQ C 1
BS 1 553 RR2F390TF
BS 554 554 RR2F390JQ
BS 555 587 RR2F390TF
BS 588 607 RR2F390JQ

RD RR2F390TF 587 0 0
TAATTCAAAGCTAAAGATACATCATATCTCGACCGTTAGGAGCCACAGGATCAGAATCTG
ATCATGGACAAGGTGATGAGAATGTCATCAGGAAAAGGAGTTGTGATCTTCACCAAAAAC
TCATGTTGTCTTTGCTACGCCGTGCAGGTACTTTTCCGTGACCTTAGGGTTCAACCAACA
ATCCACGAGATTGACAACGATCCTGACTACCTCGAGATCGAGAAGGCCTTAGTCCGTCTT
GGCTGCCCCAACGCGGTTCCTGCTGTTTTTGTAAGTGGTAAGCTGGTGGGTTCTACCAAT
GAAGTCATGTCGCTTCACCTAAGTGGCTCTCTCGTTCCCTTGATCAAGCCGTATCAGTTA
TTTCATAATTAGAAATAAAGGTCCTTAAGAAAAAGAAAGACAATTGTTGTATGTTGAGAT
TGGATAGTAAATAATGATGGAAAGATTACACTTGAATGTGTATCATGTTCTTATATATAG
CTAATTTTATATTTTGTTTCGCTCATGTCCAAGAAATTAATTAACTAGCTTTGTATTTCC
CACCTCAACTAATTAGTGGATGTACTGCTGTGTTATCTATAGTAATG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2F390JQ 607 0 0
TAATTCAAAGCTAAAGATACATCATATCTCGACCGTTAGGAGCCACAGGATCAGAATCTG
ATCATGGACAAGGTGATGAGAATGTCATCAGGAAAAGGAGTTGTGATCTTCACCAAAAAC
TCATGTTGTCTTTGCTACGCCGTGCAGGTACTTTTCCGTGACCTTAGGGTTCAACCAACA
ATCCACGAGATTGACAACGATCCTGACTACCTCGAGATCGAGAAGGCCTTAGTCCGTCTT
GGCTGCCCCAACGCGGTTCCTGCTGTTTTTGTAAGTGGTAAGCTGGTGGGTTCTACCAAT
GAAGTCATGTCGCTTCACCTAAGTGGCTCTCTCGTTCCCTTGATCAAGCCGTATCAGTTA
TTTCATAATTAGAAATAAAGGTCCTTAAGAAAAAGAAAGACAATTGTTGTATGTTGAGAT
TGGATAGTAAATAATGATGGAAAGATTACACTTGAATGTGTATCATGTTCTTATATATAG
CTAATTTTATATTTTGTTTCGCTCATGTCCAAGAAATTAATTAACTAGCTTTGTATTTCC
CACCTCAACTAATCAGTGGATGTACTGCTGTGTTATCTATAGTAATGAGAAAATTATACT
TATCATC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL6116Contig1 583 2 1 U
GGGTGATGTTTCTTCTGAAGGGATGTATGCTCAGTCAAGTCACTTTGAGGGGTTAGACGA
ATCAATGCCAAATCATAATAATACCTCTGAGAGTTTACCACCAACGCCGAATGTGGAGAG
GAAGAGGAAGAGAGAGACTTCTTCTGTGTCCCCGAGCCAGATTGATCCAGCAGTAATGGA
AACTATGGCAGGTACTTTGTCGGACATGATCACTAGTCTGAGGTCAAGGATAAGTGGTTT
GGAGACGGAAGAGGAAGACGATAGGTTTAGTATCGCAAACTGCATCGGTGCGCTTGACGA
GAATGAGAATGTGGATGAAGGTGTCTACTTTGCAGCTTTGGATCTTTTTGAGAGTCCTGG
TCTTAGAGAGACGTTTATCTCTCTTAAAGCTAACAAGTTGCGGTTGACATGGTTGCAAGT
TAAGTGCAGGAACAAACTTACTCCTTCAGTTGCACAGCTAGGTTGACTTCAAGCTATATA
TATATATATTGATTTGGTCTTTTGTAGCTTTCTTTTCTTTTTTGGATTGCTAATGACAAA
TAATTGAGTGAAAATAGTATCAGCTAGTTTATCATGTTTGCGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D439JQ C 1
AF RR2D439TF U 1
BS 1 583 RR2D439TF

RD RR2D439JQ 583 0 0
GGGTGATGTTTCTTCTGAAGGGATGTATGCTCAGTCAAGTCACTTTGAGGGGTTAGACGA
ATCAATGCCAAATCATAATAATACCTCTGAGAGTTTACCACCAACGCCGAATGTGGAGAG
GAAGAGGAAGAGAGAGACTTCTTCTGTGTCCCCGAGCCAGATTGATCCAGCAGTAATGGA
AACTATGGCAGGTACTTTGTCGGACATGATCACTAGTCTGAGGTCAAGGATAAGTGGTTT
GGAGACGGAAGAGGAAGACGATAGGTTTAGTATCGCAAACTGCATCGGTGCGCTTGACGA
GAATGAGAATGTGGATGAAGGTGTCTACTTTGCAGCTTTGGATCTTTTTGAGAGTCCTGG
TCTTAGAGAGACGTTTATCTCTCTTAAAGCTAACAAGTTGCGGTTGACATGGTTGCAAGT
TAAGTGCAGGAACAAACTTACTCCTTCAGTTGCACAGCTAGGTTGACTTCAAGCTATATA
TATATATATTGATTTGGTCTTTTGTAGCTTTCTTTTCTTTTTTGGATTGCTAATGACAAA
TAATTGAGTGAAAATAGTATCAGCTAGTTTATCATGTTTGCGC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2D439TF 583 0 0
GGGTGATGTTTCTTCTGAAGGGATGTATGCTCAGTCAAGTCACTTTGAGGGGTTAGACGA
ATCAATGCCAAATCATAATAATACCTCTGAGAGTTTACCACCAACGCCGAATGTGGAGAG
GAAGAGGAAGAGAGAGACTTCTTCTGTGTCCCCGAGCCAGATTGATCCAGCAGTAATGGA
AACTATGGCAGGTACTTTGTCGGACATGATCACTAGTCTGAGGTCAAGGATAAGTGGTTT
GGAGACGGAAGAGGAAGACGATAGGTTTAGTATCGCAAACTGCATCGGTGCGCTTGACGA
GAATGAGAATGTGGATGAAGGTGTCTACTTTGCAGCTTTGGATCTTTTTGAGAGTCCTGG
TCTTAGAGAGACGTTTATCTCTCTTAAAGCTAACAAGTTGCGGTTGACATGGTTGCAAGT
TAAGTGCAGGAACAAACTTACTCCTTCAGTTGCACAGCTAGGTTGACTTCAAGCTATATA
TATATATATTGATTTGGTCTTTTGTAGCTTTCTTTTCTTTTTTGGATTGCTAATGACAAA
TAATTGAGTGAAAATAGTATCAGCTAGTTTATCATGTTTGCGC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL6117Contig1 998 2 6 U
ATTGATCCTGTGTTGTGTTGTGTTGGAGATGGAGGCCCCTAGGCACAGATTACACTCTGG
CTTGCGTTTATGGGAATTTCCTGATCAGTACGTTATCGAGCCGACCGATGGTTCGGCCGC
TCCATGCTTGGACATTAGTCGTCTTGACGGCTCCATGAAGCTCATTTATCAAGTCGCAGA
ATGCAACTCTTTGCGTGTCCCTAAGATCCGTTCCATATTCGGTGTCGTTGGGGTGCTGAA
GCTCCTGGCAGGATCATACTTGGTGGTGGTGACAGAGAGCCAATCTGTTGGCTCGTTCCT
GGGGCATCCCATTTTCAGAATTAATTCACTCAAGGTTCTTCCTTGTGATCATTCACTTAA
AAACTCGCCTGAAGAACAGAAAAAGGTTGAGACCGACTTCTCTAGGCTGCTAAGTGTCGC
AGAGAGGACAAATGGTCTCTACTTCTCATATGAAATTAACTTGACTCTCAGTGCACAGCG
CTTGCATGATCTGGGGGGATGAGTCTAAGTCACTTCCTCTGTGGAGACAGGCTGAGCCTC
GATTTCTTTGGAACAATTATATGTTAGAAGTGCTTATCGATAATAAGCTTGATCAGTTCT
TGCTTCCAGTAATTCAAGGAAGTTTCCATAGTTTTCAAACAGCCATAGGAAGAGATATTG
TTGACATTACTCTGATTGCTAGGAGGTGCACCAGAAGAAATTGTACTCGCATGTGGCGGA
GAGGAGCTGACCCTGATGGTTATGTTGCTAATTTTGTGGAGACTGAGCAAATTGTACAGA
TGAACGGATACACATCATCGTTAACTCAGATTAGAGGATCCATGCCTTTTATGTGGGAGC
AAATTGTTGATCTGACCTACAAGCCCAAGTTTGAGATTGTCCAACCTGAAGAAGCTGCGG
GGATAGCTGAGCGTCACTTTCTGGACCTCAGAAAAATATGGATCAGTTTTGGCTGTTGAT
CTTGTCAATAAGCATGGAGGTGAGGGGCGCTTAAGCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH80TF U 1
AF RR2CB35TF U 327
BS 1 638 RR2EH80TF
BS 639 639 RR2CB35TF
BS 640 648 RR2EH80TF
BS 649 650 RR2CB35TF
BS 651 682 RR2EH80TF
BS 683 998 RR2CB35TF

RD RR2EH80TF 689 0 0
ATTGATCCTGTGTTGTGTTGTGTTGGAGATGGAGGCCCCTAGGCACAGATTACACTCTGG
CTTGCGTTTATGGGAATTTCCTGATCAGTACGTTATCGAGCCGACCGATGGTTCGGCCGC
TCCATGCTTGGACATTAGTCGTCTTGACGGCTCCATGAAGCTCATTTATCAAGTCGCAGA
ATGCAACTCTTTGCGTGTCCCTAAGATCCGTTCCATATTCGGTGTCGTTGGGGTGCTGAA
GCTCCTGGCAGGATCATACTTGGTGGTGGTGACAGAGAGCCAATCTGTTGGCTCGTTCCT
GGGGCATCCCATTTTCAGAATTAATTCACTCAAGGTTCTTCCTTGTGATCATTCACTTAA
AAACTCGCCTGAAGAACAGAAAAAGGTTGAGACCGACTTCTCTAGGCTGCTAAGTGTCGC
AGAGAGGACAAATGGTCTCTACTTCTCATATGAAATTAACTTGACTCTCAGTGCACAGCG
CTTGCATGATCTGGGGGGATGAGTCTAAGTCACTTCCTCTGTGGAGACAGGCTGAGCCTC
GATTTCTTTGGAACAATTATATGTTAGAAGTGCTTATCGATAATAAGCTTGATCAGTTCT
TGCTTCCAGTAATTCAAGGAAGTTTCCATAGTTTTCAA*CAGCCATAG**AGAGATATTG
TTGACATTACTCTGATTGCTAG
AGTGCAC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2CB35TF 672 0 0
G
ACTCAAGGTTCTTCCTTGTGATCATTCACTTAAAAACTCGCCTGAAGAACAGAAAAAGGT
TGAGACCGACTTCTCTAGGCTGCTAAGTGTCGCAGAGAGGACAAATGGTCTCTACTTCTC
ATATGAAATTAACTTGACTCTCAGTGCACAGCGCTTGCATGATCTGGGGG*ATGAGTCTA
AGTCACTTCCTCTGTGGAGACAGGCTGAGCCTCGATTTCTTTGGAACAATTATATGTTGG
AAGTGCTTATCGATAATAAGCTTGATCAGTTCTTGCTTCCAGTAATTCAAGGAAGTTTCC
ATAGTTTTCAAACAGCCATAGGAAGAGATATTGTTGACATTACTCTGATTGCTAGGAGGT
GCACCAGAAGAAATTGTACTCGCATGTGGCGGAGAGGAGCTGACCCTGATGGTTATGTTG
CTAATTTTGTGGAGACTGAGCAAATTGTACAGATGAACGGATACACATCATCGTTAACTC
AGATTAGAGGATCCATGCCTTTTATGTGGGAGCAAATTGTTGATCTGACCTACAAGCCCA
AGTTTGAGATTGTCCAACCTGAAGAAGCTGCGGGGATAGCTGAGCGTCACTTTCTGGACC
TCAGAAAAATATGGATCAGTTTTGGCTGTTGATCTTGTCAATAAGCATGGAGGTGAGGGG
CGCTTAAGCGA

QA 2 672 2 672
DS 



AS 1 2

CO CL6118Contig1 929 2 2 U
GCTCCTGGTGAATACAAAGAGAAGGTCACTATCGACAAAAAGAAACCCTTTATTACATTG
ATGGGTGATCCCAAGGCCATGCCCGTTCTGACATTCGACGGTACTGCCGCCCAGTATGGA
ACCGTAAATAGCGCCTCTCTCATTATCTTATCCGATTATTTCATTGCCGAAAACATCATC
GTTAAGAACTCTGCGCCGGAACCAGATGGTAAGAGGAAGGGAGCACAGGCCTTAGCTATG
AGAATCTCTGGAGACAAGGCGGCTTTCTACAACTGCAAATTCCGCGGTTTCCAAGATACA
CTTTGTGACGATGCTGGAAACCATTTCTTTAAGGATTGTTACATTGAAGGGACATTTGAT
TTCATCTTCGGAAGTGGAACCTCTATGTATTTGGAAACACAATTACACGCGGTGGGAGAT
GGTATTAAAGTGATTTCAGCGCATGCGGGAAAGAGCGCAGAAGAGAAGAGCGGATACACT
TTCGTGCACTGCAAGGTAACTGGAAGTGATGGTGGTGGAATCTATTTAGGTAGATCATGG
AAGAGTCACCCCAAGGTTGTCTACGCCTACACCGAGATGAGCAGCGTCGTCAACCCAACC
GGATGGCAAGCAAACAAGGTGGCCGCACATGACAAGACCGTGTTCTACGGAGAGTACAAG
TGCATAGGACCAGGATCACATAAAGCCAAGAGAGTTCCATTCACACAAGACATTGACGAC
AATGAAGCTAAACGTTTCCTTTCCCTCGGCTACATCCAAGGGTCCTCGTGGCTTCTCCCA
CCTTCCGGCTTTGAGGCTTAATATTAAGCTATTCAAAACTGTATGTATAGCGGTGTATTT
TCTTTTCCAACAGTCCTCTCTTCTTAGTTGAGAGACTTGTGTAATTTTGGTTTCATGACA
ATAAAATGGCGGTCCCGGTTCTGTATAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A530TF U 1
AF RR2A530JQ C 172
BS 1 754 RR2A530TF
BS 755 929 RR2A530JQ

RD RR2A530TF 754 0 0
GCTCCTGGTGAATACAAAGAGAAGGTCACTATCGACAAAAAGAAACCCTTTATTACATTG
ATGGGTGATCCCAAGGCCATGCCCGTTCTGACATTCGACGGTACTGCCGCCCAGTATGGA
ACCGTAAATAGCGCCTCTCTCATTATCTTATCCGATTATTTCATTGCCGAAAACATCATC
GTTAAGAACTCTGCGCCGGAACCAGATGGTAAGAGGAAGGGAGCACAGGCCTTAGCTATG
AGAATCTCTGGAGACAAGGCGGCTTTCTACAACTGCAAATTCCGCGGTTTCCAAGATACA
CTTTGTGACGATGCTGGAAACCATTTCTTTAAGGATTGTTACATTGAAGGGACATTTGAT
TTCATCTTCGGAAGTGGAACCTCTATGTATTTGGAAACACAATTACACGCGGTGGGAGAT
GGTATTAAAGTGATTTCAGCGCATGCGGGAAAGAGCGCAGAAGAGAAGAGCGGATACACT
TTCGTGCACTGCAAGGTAACTGGAAGTGATGGTGGTGGAATCTATTTAGGTAGATCATGG
AAGAGTCACCCCAAGGTTGTCTACGCCTACACCGAGATGAGCAGCGTCGTCAACCCAACC
GGATGGCAAGCAAACAAGGTGGCCGCACATGACAAGACCGTGTTCTACGGAGAGTACAAG
TGCATAGGACCAGGATCACATAAAGCCAAGAGAGTTCCATTCACACAAGACATTGACGAC
AATGAAGCTAAACGTTTCCTTTCCCTCGGCTACA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RR2A530JQ 758 0 0
AACATCATCGTTAAGAACTCTGCGCCGGAACCAGATGGTAAGAGGAAGGGAGCACAGGCC
TTAGCTATGAGAATCTCTGGAGACAAGGCGGCTTTCTACAACTGCAAATTCCGCGGTTTC
CAAGATACACTTTGTGACGATGCTGGAAACCATTTCTTTAAGGATTGTTACATTGAAGGG
ACATTTGATTTCATCTTCGGAAGTGGAACCTCTATGTATTTGGAAACACAATTACACGCG
GTGGGAGATGGTATTAAAGTGATTTCAGCGCATGCGGGAAAGAGCGCAGAAGAGAAGAGC
GGATACACTTTCGTGCACTGCAAGGTAACTGGAAGTGATGGTGGTGGAATCTATTTAGGT
AGATCATGGAAGAGTCACCCCAAGGTTGTCTACGCCTACACCGAGATGAGCAGCGTCGTC
AACCCAACCGGATGGCAAGCAAACAAGGTGGCCGCACATGACAAGACCGTGTTCTACGGA
GAGTACAAGTGCATAGGACCAGGATCACATAAAGCCAAGAGAGTTCCATTCACACAAGAC
ATTGACGACAATGAAGCTAAACGTTTCCTTTCCCTCGGCTACATCCAAGGGTCCTCGTGG
CTTCTCCCACCTTCCGGCTTTGAGGCTTAATATTAAGCTATTCAAAACTGTATGTATAGC
GGTGTATTTTCTTTTCCAACAGTCCTCTCTTCTTAGTTGAGAGACTTGTGTAATTTTGGT
TTCATGACAATAAAATGGCGGTCCCGGTTCTGTATAAG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6120Contig1 758 2 2 U
GAGCCCTGGGGTCAAGGATCCAGTGGCAAGGAAAGTTCGAAGTGCAACAGATGATTCTAA
AGCACAAATGATGGTTGACCAAGGACTAGAAATCTTTCTGGAGAACTGGTACAATGGAGG
CTTGTGGAAAAGTTTGAGAACTCATCCCCATTTTAGGAAGATTGTTGCAAGCCGCTTGAT
ACATGACGATGTCCTTAGTGTTGCAAAGCTCCTCTCAGATCTAAGCACTGGGAGACAGCC
GTCATTGTGGGAAGAGTTGGCGGATTGTAATACAAATGTGTCGCTTGTTTTCGGAGAGAA
AGATATAAAATTCAAGAAAATTGCTACTAGGATGTACGTTGAGATGAGTAAAGGCAAAAA
GAGCGAAAACTATATCATCGAGACGGTTGAAATCCCAGAGGCTGGTCACGCTGTTCATCT
GGAGAGCGCTCTGCTCTTGATCCTCGCCCTTAGAAAGTTCTTAACAAGAGTGCGCAAAAA
CTCTGCAGAGACAGCTTTCTCAGAAGCTCTTGTTAGCACTTAAAGAAACATAAGCAACTC
TGCTGAAATCTGAGAATTGAATAATAGATTTTGGAACATGAAGATTGGACTTCTTTCAGG
CATATTTAATACTCAAAATGAATCAAAATTCAATTGTATTGTACTGAGTGGTGCAGTGGT
TATCAAGGGGGATATACTAAATTGATTTAAATAATCTAAAATATTTGTTTTGAATTTGTG
TATTTGCTCCGCTGTCTAATAAAGTAGAAGTTATGACG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH57TF U 1
AF RR2FH57JQ C 5
BS 1 595 RR2FH57TF
BS 596 758 RR2FH57JQ

RD RR2FH57TF 595 0 0
GAGCCCTGGGGTCAAGGATCCAGTGGCAAGGAAAGTTCGAAGTGCAACAGATGATTCTAA
AGCACAAATGATGGTTGACCAAGGACTAGAAATCTTTCTGGAGAACTGGTACAATGGAGG
CTTGTGGAAAAGTTTGAGAACTCATCCCCATTTTAGGAAGATTGTTGCAAGCCGCTTGAT
ACATGACGATGTCCTTAGTGTTGCAAAGCTCCTCTCAGATCTAAGCACTGGGAGACAGCC
GTCATTGTGGGAAGAGTTGGCGGATTGTAATACAAATGTGTCGCTTGTTTTCGGAGAGAA
AGATATAAAATTCAAGAAAATTGCTACTAGGATGTACGTTGAGATGAGTAAAGGCAAAAA
GAGCGAAAACTATATCATCGAGACGGTTGAAATCCCAGAGGCTGGTCACGCTGTTCATCT
GGAGAGCGCTCTGCTCTTGATCCTCGCCCTTAGAAAGTTCTTAACAAGAGTGCGCAAAAA
CTCTGCAGAGACAGCTTTCTCAGAAGCTCTTGTTAGCACTTAAAGAAACATAAGCAACTC
TGCTGAAATCTGAGAATTGAATAATAGATTTTGGAACATGAAGATTGGACTTCTT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2FH57JQ 754 0 0
CCTGGGGTCAAGGATCCAGTGGCAAGGAAAGTTCGAAGTGCAACAGATGATTCTAAAGCA
CAAATGATGGTTGACCAAGGACTAGAAATCTTTCTGGAGAACTGGTACAATGGAGGCTTG
TGGAAAAGTTTGAGAACTCATCCCCATTTTAGGAAGATTGTTGCAAGCCGCTTGATACAT
GACGATGTCCTTAGTGTTGCAAAGCTCCTCTCAGATTTAAGCACTGGGAGACAGCCGTCA
TTGTGGGAAGAGTTGGCGGATTGTAATACAAATGTGTCGCTTGTTTTCGGAGAGAAAGAT
ATAAAATTCAAGAAAATTGCTACTAGGATGTACGTTGAGATGAGTAAAGGCAAAAAGAGC
GAAAACTATATCATCGAGACGGTTGAAATCCCAGAGGCTGGTCACGCTGTTCATCTGGAG
AGCGCTCTGCTCTTGATCCTCGCCCTTAGAAAGTTCTTAACAAGAGTGCGCAAAAACTCT
GCAGAGACAGCTTTCTCAGAAGCTCTTGTTAGCACTTAAAGAAACATAAGCAACTTTGCT
GAAATCTGAGAATTGAATAATAGATTTTGGAACATGAAGATTGGACTTCTTTCAGGCATA
TTTAATACTCAAAATGAATCAAAATTCAATTGTATTGTACTGAGTGGTGCAGTGGTTATC
AAGGGGGATATACTAAATTGATTTAAATAATCTAAAATATTTGTTTTGAATTTGTGTATT
TGCTCCGCTGTCTAATAAAGTAGAAGTTATGACG

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL6121Contig1 668 2 12 U
GGAGATAGGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCATCTCCGGGAAGACACATTCAACCCTA
GAAGGTCTTCAATTCTCATCGCCAGCCATCTCCGTAGAACACCATGGGCTCTGAAGACGA
TACCATCGGTTTTGAGTCATTGAAGCAGACACTGGTGTTCTGGAACATAGATGACTACCC
AATCCCCTTAGATGCTACCAATAATCTCGATCCTATTTTTGGTGATATCTCAAAAGCTCT
TGACGTAATGGGCTTTCTTGGCGGGTTTATGAGTGTGTGGCTGTATTCTAAGCAAATCAA
CTACGACAAAAGAGAGTTGTGCGAGGCCCAAGTAATCAACGAATACTTAACCCCCAACGG
TACATCTTATTCAGTTTACAAAGTGCCGGCCATGACTTTGTATATGATTACTTTGCCTTC
AAAAACTGGTCCAGGACCGGTCAACTTTTTGGTTATCGCAAAACCAGAAAGGGAGTTAGA
TAGAGTTGTGCAGTGTCTCAAGTCTAGGCGACACAATGTTCTTGTAATTAAGAAGCCTGA
AGAATTTCGCTTTTTTAGTGTTGACTCTCTAGTTGAGAATGCCCGGCTTTTAGGTGGAGG
AAAGCCTAGATTCGAACCTTTATATACTCATTATGTGGAGGAGTATGATGTGTCGGAAGA
AAGGTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL41TF U 1
AF RR2EW03TF U 28
BS 1 40 RR2CL41TF
BS 41 41 RR2EW03TF
BS 42 409 RR2CL41TF
BS 410 411 RR2EW03TF
BS 412 422 RR2CL41TF
BS 423 423 RR2EW03TF
BS 424 425 RR2CL41TF
BS 426 426 RR2EW03TF
BS 427 526 RR2CL41TF
BS 527 527 RR2EW03TF
BS 528 653 RR2CL41TF
BS 654 668 RR2EW03TF

RD RR2CL41TF 653 0 0
GGAGATAGGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCATCTCCGTGAAGACACATTCAACCCTA
GAAGGTCTTCAATTCTCATCGCCAGCCATCTCCGTAGAACACCATGGGCTCTGAAGACGA
TACCATCGGTTTTGAGTCATTGAAGCAGACACTGGTGTTCTGGAACATAGATGACTACCC
AATCCCCTTAGATGCTACCAATAATCTCGATCCTATTTTTGGTGATATCTCAAAAGCTCT
TGACGTAATGGGCTTTCTTGGCGGGTTTATGAGTGTGTGGCTGTATTCTAAGCAAATCAA
CTACGACAAAAGAGAGTTGTGCGAGGCCCAAGTAATCAACGAATACTTAACCCCCAACGG
TACATCTTATTCAGTTTACAAAGTGCCGGCCATGACTTTGTATATGATTTGTTTGCCTTC
AACAATTGGTCCAGGACCGGTCAACTTTTTGGTTATCGCAAAACCAGAAAGGGAGTTAGA
TAGAGTTGTGCAGTGTCTCAAGTCTAGGCGACACAATGTTCTTGTAGTTAAGAAGCCTGA
AGAATTTCGCTTTTTTAGTGTTGACTCTCTAGTTGAGAATGCCCGGCTTTTAGGTGGAGG
AAAGCCTAGATTCGAACCTTTATATACTCATTATGTGGAGGAGTATGATGTGT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2EW03TF 641 0 0
G
CACTCATCTCCGGGAAGACACATTCAGCCCTAGAAGGTCTTCAATTCTCATCGCCAGCCA
TCTCCGTAGAACACCATGGGCTCTGAAGACGATACCATCGGTTTTGAGTCATTGAAGCAT
ACACTGGTGTTCTGGAACATAGATGACTACCCAATCCCCTTAGATGCTACCAATAATCTT
GATCCTATTTTTGGTGATATCTCAAAAGCTCTTGACGTAATGGGCTTTCTTGGTGGGTTT
ATGAGTGTGTGGCTGTATTCTAAGCAAATCAACTACGACAAAAGAGAGTTGTGCGAGGCC
CAAGTAATCAACGAATACTTAACCCCCAACGGTACATCTTATTCAGTTTACAAAGTGCCG
GCCATGACTTTGTATATGATTACTTTGGCTTCACAAACTGGTCCAGGACCGGTCAACTTT
TTGGTTATCGCAAAACCAGAAAGGGAGTTAGATAGAGTTGTGCAGTGTCTCAAGTCTAGG
CGACACAATGTTCTTGTAATTAAGAAGCCTGAAGAATTTCGCTTT***AGTGTTGACTCT
CTAGTTGAGAATGCCCGGCTTTTAGGTGGAGGAAAGCCTAGATTCGAACCTTTATATACT
CATTATGTGGAGGAGTATGATGTGTCGGAAGAAAGGTATG

QA 2 641 2 641
DS 



AS 1 2

CO CL6122Contig1 1172 2 4 U
GGGTCGGAAACTGAACTTAATATAACGATAACAGATTCGATTTGTTCATCCTCTCCTCTC
CGGAACCGGAAATCTTGTTTTGGTATCTGTATCGGAGAAGAAGCTACAATGGCAAAGAGG
GGGATTAGTAGTACTTTGAGGAATCTAAAGTTTATGCAAAGATCTGCTGCGAAAGAGGAG
AAGAAGATTGATGAAGAGCCTAATGGGAGTTTTTCTTCTCCCGGAAGTGTTGTTGCAAAG
AAGTGGTTTGTTTTTTTTCTTGTTAATGTGTTGTTTGCTGTAGTTGTGTATGTATGTGTT
GTTTTACCCTTTGTTCATGAATCATGACATTAACTTTTGTGGTTCGTTTTTTTTTGTTGT
CAGTATCAGATATCATGTGTTTGGTTTTATTTTCTAACACATGATTTGATGATTGATTGA
TGCAGTGTGGTTATAACAGACTGGGATCCTCAGCCTGGAGCCTTGTTAGGACGCATGTCG
TTTCAGTCTTTCAACCCCTCCATCGAGGTTTGTTTCTGTGGACGCTAAGGCCTGAGATAG
TTTACGGTTGATGTTCTTCTCCTTTTGAGCTTTCTGTAAAAATTAGACTCTTTCTTTCTT
TAGAAACTGAATGAAGAAGCCACAAGCGGTCGAGAAACAGATGCTTCTGTTCCCACAAGC
TCTAGCAGTAATGGAGGAAGAATGTCTTTTAGGTCTGTACCACCCTTCGATTTTATATTC
CGTTTGCTTCTCAACAAATGAAGTCATTATTGATAGCAGTGGATTCTGTCACCTATTATC
TGTTTCGTTTCTGTTTTTCTTTTTTTTACTGTCTCTCTATAAATTGTAAAAACTCAAATT
GCATGCTCTTTCAGTGAACCGAAGATTGAGCCAAGCCGGGAAACAAACGGTGACTTGAAA
AGGAAACAGTCTGAGGAACAAAACCATCCAAGCAAGTCCCCTAAGAGCAGTGACAAACCA
TCACCGAGCAACAAGAAAGGCAGCGATGGTTTCAAGAAACCCAGGAGCAGGAAGGCGGCC
TGGAGCGTTTTGAAGCCACCAAAACAACCTCAAACCAACAAGGGTTTACATTAGCTGCCT
GCAGCAACCTATTTGCAGTTAGTTCACACCGGTTCATATGTGCTTGTAGATTACTCCTTC
CGCTTTGTGTTAGCTCCAGCCATTTATACGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA20TF U 1
AF RR2CA20JQ C 535
BS 1 652 RR2CA20TF
BS 653 653 RR2CA20JQ
BS 654 680 RR2CA20TF
BS 681 1172 RR2CA20JQ

RD RR2CA20TF 680 0 0
GGGTCGGAAACTGAACTTAATATAACGATAACAGATTCGATTTGTTCATCCTCTCCTCTC
CGGAACCGGAAATCTTGTTTTGGTATCTGTATCGGAGAAGAAGCTACAATGGCAAAGAGG
GGGATTAGTAGTACTTTGAGGAATCTAAAGTTTATGCAAAGATCTGCTGCGAAAGAGGAG
AAGAAGATTGATGAAGAGCCTAATGGGAGTTTTTCTTCTCCCGGAAGTGTTGTTGCAAAG
AAGTGGTTTGTTTTTTTTCTTGTTAATGTGTTGTTTGCTGTAGTTGTGTATGTATGTGTT
GTTTTACCCTTTGTTCATGAATCATGACATTAACTTTTGTGGTTCGTTTTTTTTTGTTGT
CAGTATCAGATATCATGTGTTTGGTTTTATTTTCTAACACATGATTTGATGATTGATTGA
TGCAGTGTGGTTATAACAGACTGGGATCCTCAGCCTGGAGCCTTGTTAGGACGCATGTCG
TTTCAGTCTTTCAACCCCTCCATCGAGGTTTGTTTCTGTGGACGCTAAGGCCTGAGATAG
TTTACGGTTGATGTTCTTCTCCTTTTGAGCTTTCTGTAAAAATTAGACTCTTTCTTTCTT
TAGAAACTGAATGAAGAAGCCACAAGCGGTCGAGAAACAGATGCTTCTGTTCTCACAAGC
TCTAGCAGTAATGGAGGAAG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2CA20JQ 638 0 0
AGATAGTTTACGGTTGATGTTCTTCTCCTTTTGAGCTTTCTGTAAAAATTAGACTCTTTC
TTTCTTTAGAAACTGAATGAAGAAGCCACAAGCGGTCGAGAAACAGATGCTTCTGTTCCC
ACAAGCTCTAGCAGTAATGGAGGAAGAATGTCTTTTAGGTCTGTACCACCCTTCGATTTT
ATATTCCGTTTGCTTCTCAACAAATGAAGTCATTATTGATAGCAGTGGATTCTGTCACCT
ATTATCTGTTTCGTTTCTGTTTTTCTTTTTTTTACTGTCTCTCTATAAATTGTAAAAACT
CAAATTGCATGCTCTTTCAGTGAACCGAAGATTGAGCCAAGCCGGGAAACAAACGGTGAC
TTGAAAAGGAAACAGTCTGAGGAACAAAACCATCCAAGCAAGTCCCCTAAGAGCAGTGAC
AAACCATCACCGAGCAACAAGAAAGGCAGCGATGGTTTCAAGAAACCCAGGAGCAGGAAG
GCGGCCTGGAGCGTTTTGAAGCCACCAAAACAACCTCAAACCAACAAGGGTTTACATTAG
CTGCCTGCAGCAACCTATTTGCAGTTAGTTCACACCGGTTCATATGTGCTTGTAGATTAC
TCCTTCCGCTTTGTGTTAGCTCCAGCCATTTATACGAA

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL6123Contig1 264 2 1 U
GGACTTTTCCCACCATTACCTTACCTTCGATTTTGAATCACAAGACCATATATGCAATCA
AAGAAATCAATGGTCTTTGTTAATTGTTGGGATCTTCCACATATGGGACGGACGAGACTA
CACCATTTTGGGGTGGAGGTAAAAAAAATCCAGATTTACGGATTGAGTTCCGTAAAGTTG
TTTTACAATTTGGATAACAACTTTGTTAACCAATATTTTCTTTTGTACCTGATATTAGTT
ATGTTGTAGCAAAACCTCAATTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CF27JQ C 1
AF RR2CF27TF U 1
BS 1 264 RR2CF27TF

RD RR2CF27JQ 264 0 0
GGACTTTTCCCACCATTACCTTACCTTCGATTTTGAATCACAAGACCATATATGCAATCA
AAGAAATCAATGGTCTTTGTTAATTGTTGGGATCTTCCACATATGGGACGGACGAGACTA
CACCATTTTGGGGTGGAGGTAAAAAAAATCCAGATTTACGGATTGAGTTCCGTAAAGTTG
TTTTACAATTTGGATAACAACTTTGTTAACCAATATTTTCTTTTGTACCTGATATTAGTT
ATGTTGTAGCAAAACCTCAATTAC

QA 1 264 1 264
DS 

RD RR2CF27TF 264 0 0
GGACTTTTCCCACCATTACCTTACCTTCGATTTTGAATCACAAGACCATATATGCAATCA
AAGAAATCAATGGTCTTTGTTAATTGTTGGGATCTTCCACATATGGGACGGACGAGACTA
CACCATTTTGGGGTGGAGGTAAAAAAAATCCAGATTTACGGATTGAGTTCCGTAAAGTTG
TTTTACAATTTGGATAACAACTTTGTTAACCAATATTTTCTTTTGTACCTGATATTAGTT
ATGTTGTAGCAAAACCTCAATTAC

QA 1 264 1 264
DS 



AS 1 2

CO CL6124Contig1 763 2 2 U
GATGAAGTCCACCGCATTCACCGCTTCTTCTCCGGTCTTCCCTTAATCCATCTTGTCTTT
CCTTTCTCTGATTTCTTAATTTCTCCAACCAAAATCAATCTTCTCTTTTTGTTCTCGTCT
CTTCCGTGTAAAAAGGACTGAAAGTTGTCGATCTCACTCGACCGCATACTGAAATCAACT
TGGCAGCACTTGCTGTTGACAAAATCGGGTCAGGTTGTCTAGACGAGATTATAGACCCGG
TTCTTGACCTGAATCTTGACGCATGGACTCTCTCGTCTATACACAGCGTGGCTGAGCTCG
CGTTCCAATGCTTAGCCTTTCACAGTGACATGAGACCTACGATGACTGAAGTAGCGGACG
AGCTTGAGCAGATACGGCTCAGCGGTTGGATCCCAAACATGAGCTTGGATTCACCAACCG
GTTCTCTCAGGTCATCTGATCAAGGAAGTGAAAGATCAGCATCAGTTAAAAAAATATTAG
CAGGAAGCAGAAGACTTGTTGTACCTCCCAAGCAACCTGATATCCTCGCTTCTGTCGAAG
AGATGAATGATAAGTTGATAACTCTCCAGTCTATTTACTACTTTGGAGTTCGTGAGAACA
GATGTTGAAGCCTTGGAGGAGAGCTAACATGTTGGAGATTTGGAATCTTGGAAGAGTGCA
ACTTTGGGTTTTTAGTTTTATGATAAACATTATAAAATTATGAATAAAAATATGTAAACT
TTGAAATTTTTAATTTCTTGATGAACATATACAAGTATAAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C281TF U 1
AF RR2C281JQ C 33
BS 1 389 RR2C281TF
BS 390 763 RR2C281JQ

RD RR2C281TF 389 0 0
GATGAAGTCCACCGCATTCACCGCTTCTTCTCCGGTCTTCCCTTAATCCATCTTGTCTTT
CCTTTCTCTGATTTCTTAATTTCTCCAACCAAAATCAATCTTCTCTTTTTGTTCTCGTCT
CTTCCGTGTAAAAAGGACTGAAAGTTGTCGATCTCACTCGACCGCATACTGAAATCAACT
TGGCAGCACTTGCTGTTGACAAAATCGGGTCAGGTTGTCTAGACGAGATTATAGACCCGG
TTCTTGACCTGAATCTTGACGCATGGACTCTCTCGTCTATACACAGCGTGGCTGAGCTCG
CGTTCCAATGCTTAGCCTTTCACAGTGACATGAGACCTACGATGACTGAAGTAGCGGACG
AGCTTGAGCAGATACGGCTCAGCGGTTGG

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2C281JQ 731 0 0
CGGTCTTCCCTTAATCCATCTTGTCTTTCCTTTCTCTGATTTCTTAATTTCTCCAACCAA
AATCAATCTTCTCTTTTTGTTCTCGTCTCTTCCGTGTAAAAAGGACTGAAAGTTGTCGAT
CTCACTCGACCGCATACTGAAATCAACTTGGCAGCACTTGCTGTTGACAAAATCGGGTCA
GGTTGTCTAGACGAGATTATAGACCCGGTTCTTGACCTGAATCTTGACGCATGGACTCTC
TCGTCTATACACAGCGTGGCTGAGCTCGCGTTCCAATGCTTAGCCTTTCACAGTGACATG
AGACCTACGATGACTGAAGTAGCGGACGAGCTTGAGCAGATACGGCTCAGCGGTTGGATC
CCAAACATGAGCTTGGATTCACCAACCGGTTCTCTCAGGTCATCTGATCAAGGAAGTGAA
AGATCAGCATCAGTTAAAAAAATATTAGCAGGAAGCAGAAGACTTGTTGTACCTCCCAAG
CAACCTGATATCCTCGCTTCTGTCGAAGAGATGAATGATAAGTTGATAACTCTCCAGTCT
ATTTACTACTTTGGAGTTCGTGAGAACAGATGTTGAAGCCTTGGAGGAGAGCTAACATGT
TGGAGATTTGGAATCTTGGAAGAGTGCAACTTTGGGTTTTTAGTTTTATGATAAACATTA
TAAAATTATGAATAAAAATATGTAAACTTTGAAATTTTTAATTTCTTGATGAACATATAC
AAGTATAAATA

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL6125Contig1 820 2 4 U
GGACGCCTCAAAACCAAAGTAAGAAGATGGAAGCAAACACTATGTTTCTAATAAAAGCTT
TACTTCTTGTATGTTTCAAAGTCTGCTTCACATTAGCTTCAGACCCCGACCCAATCCAAG
ACTTCTGTATACCAAAACAAATCACATCTCCTCATCATCATCCCTTCTCCACAAACCTCC
CATGCAAAAACTCCTCCGAACTAACCACCGAAGATTTCATCTTTTCCGGTTTACAAACAG
CAGGAAACTTCTCCGAGACCGGTCTAGCCACGGTCCCCGTAAACCCGACAACCTTTCCGG
GCCTTAACACTTTGGGCTTGTCGTTTGTCCGGGCTGATCTCAAACCCGGAGCTATAAACC
CTCCACATTATCATCCAAAAGGCACTGAAGTAGCCCACGTGGTTAAAGGACGGGTTTACT
CCGGTTTTGTGGACTCTAACAATAAAGTCTACGCTAAAGTTATGGAAGTAGGAGAGATGA
TGGTGTACCCAAAAGTGCTTGTGCATTTTCAGATGAACGTGGGAGATGTTACGGCCACGA
TTCTAGGCGGACTTAATAGCCAAAGCCCCGGGATTCAGAAGATACCATCAGTGGTTTTTG
GGTCAGGGATCAATGAAGAGTTGCTTGTGAAAGCTTTTGGGCTGAGTCTTGATCAGATTG
GTAATTTGAAGAAAAGATTTAATCCTATCAAGTCGAATGAACATTGATGTATGTATTTTC
TTAAACGAGATTATATTTTAAACAAATTATAAGTTATAGATCTTTATGTGTTCTTGATCG
TAACGGTATTTATAACTTTTTACCGTAAGAGTTTATCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV65TF U 1
AF RR2CV65JQ C 254
BS 1 696 RR2CV65TF
BS 697 697 RR2CV65JQ
BS 698 706 RR2CV65TF
BS 707 820 RR2CV65JQ

RD RR2CV65TF 706 0 0
GGACGCCTCAAAACCAAAGTAAGAAGATGGAAGCAAACACTATGTTTCTAATAAAAGCTT
TACTTCTTGTATGTTTCAAAGTCTGCTTCACATTAGCTTCAGACCCCGACCCAATCCAAG
ACTTCTGTATACCAAAACAAATCACATCTCCTCATCATCATCCCTTCTCCACAAACCTCC
CATGCAAAAACTCCTCCGAACTAACCACCGAAGATTTCATCTTTTCCGGTTTACAAACAG
CAGGAAACTTCTCCGAGACCGGTCTAGCCACGGTCCCCGTAAACCCGACAACCTTTCCGG
GCCTTAACACTTTGGGCTTGTCGTTTGTCCGGGCTGATCTCAAACCCGGAGCTATAAACC
CTCCACATTATCATCCAAAAGGCACTGAAGTAGCCCACGTGGTTAAAGGACGGGTTTACT
CCGGTTTTGTGGACTCTAACAATAAAGTCTACGCTAAAGTTATGGAAGTAGGAGAGATGA
TGGTGTACCCAAAAGTGCTTGTGCATTTTCAGATGAACGTGGGAGATGTTACGGCCACGA
TTCTAGGCGGACTTAATAGCCAAAGCCCCGGGATTCAGAAGATACCATCAGTGGTTTTTG
GGTCAGGGATCAATGAAGAGTTGCTTGTGAAAGCTTTTGGGCTGAGTCTTGATCAGATTG
GTAATTTGAAGAAAAGATTTAATCCTATCAAGTCGA*TGAACATTG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2CV65JQ 567 0 0
CGAGACCGGTCTAGCCACGGTCCCCGTAAACCCGACAACCTTTCCGGGCCTTAACACTTT
GGGCTTGTCGTTTGTCCGGGCTGATTTCAAACCCGGAGCTATAAACCCTCCACATTATCA
TCCAAAAGGCACTGAAGTAGCCCACGTGGTTAAAGGACGGGTTTACTCCGGTTTTGTGGA
CTCTAACAATAAAGTTTACGCTAAAGTTATGGAAGTAGGAGAGATGATGGTGTACCCAAA
AGTGCTTGTGCATTTTCAGATGAACGTGGGAGATGTTACGGCCACGATTCTAGGCGGACT
TAATAGCCAAAGCCCCGGGATTCAGAAGATACCATCAGTGGTTTTTGGGTCAGGGATCAA
TGAAGAGTTGCTTGTGAAAGCTTTTGGGCTGAGTCTTGATCAGATTGGTAATTTGAAGAA
AAGATTTAATCCTATCAAGTCGAATGAACATTGATGTATGTATTTTCTTAAACGAGATTA
TATTTTAAACAAATTATAAGTTATAGATCTTTATGTGTTCTTGATCGTAACGGTATTTAT
AACTTTTTACCGTAAGAGTTTATCTAT

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL6126Contig1 600 2 1 U
GGACAATGGCTTCGTCTGCGCCTATTGATCCTCTCACCGGGAAAGATCCGGCGAAGGCTT
TAACCGCCGTAGCATCGGGTTTTTTCGAGAATGTGAAGAAAAACAAGCAAAGCTTCTTCC
AGTTCGCCGCGATGACTGGGATCTTGCTTCTGAGCTTCCGATCTGTAAGTCAGAAGTATC
GAATTCACGATCTGGAGGAAGACACTGCTGTTCTCAAGAAGGAGAGCGATAGTTTGACGG
ATCGTATGAATAGAATCAAGAGCGATCTTCTGCATCAAGCGTCCATTGACTCTTCCGGCG
TCTTTGCTGCTCGACTCCGTCTGCTTTTCGGTGACGATAAAAAGTGACGGGGGATTGAAT
TTGGTTTGAAGTGAACGAGGTTACGATCATGCGATGTTGTATTAATTCTATATAGATGTC
TCTGTCTGTAAAGGATGTGTCTTTGTCAGGAAATTAGCGAATGAATAAGTAGGGTTGCAA
GGTGTTGTGATTCAGACAATGGAGTATCGTTTTAGTTTTGTCTGAAATCGGGCTTCGATG
TTTATGTTTTTGAACGGTTAGGCTTTGCAGATTTGTATGAGGAATTTCATCGAACACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AQ04TF U 1
AF RR2AQ04JQ C 10
BS 1 600 RR2AQ04TF

RD RR2AQ04TF 600 0 0
GGACAATGGCTTCGTCTGCGCCTATTGATCCTCTCACCGGGAAAGATCCGGCGAAGGCTT
TAACCGCCGTAGCATCGGGTTTTTTCGAGAATGTGAAGAAAAACAAGCAAAGCTTCTTCC
AGTTCGCCGCGATGACTGGGATCTTGCTTCTGAGCTTCCGATCTGTAAGTCAGAAGTATC
GAATTCACGATCTGGAGGAAGACACTGCTGTTCTCAAGAAGGAGAGCGATAGTTTGACGG
ATCGTATGAATAGAATCAAGAGCGATCTTCTGCATCAAGCGTCCATTGACTCTTCCGGCG
TCTTTGCTGCTCGACTCCGTCTGCTTTTCGGTGACGATAAAAAGTGACGGGGGATTGAAT
TTGGTTTGAAGTGAACGAGGTTACGATCATGCGATGTTGTATTAATTCTATATAGATGTC
TCTGTCTGTAAAGGATGTGTCTTTGTCAGGAAATTAGCGAATGAATAAGTAGGGTTGCAA
GGTGTTGTGATTCAGACAATGGAGTATCGTTTTAGTTTTGTCTGAAATCGGGCTTCGATG
TTTATGTTTTTGAACGGTTAGGCTTTGCAGATTTGTATGAGGAATTTCATCGAACACTTT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2AQ04JQ 591 0 0
CTTCGTCTGCGCCTATTGATCCTCTCACCGGGAAAGATCCGGCGAAGGCTTTAACCGCCG
TAGCATCGGGTTTTTTCGAGAATGTGAAGAAAAACAAGCAAAGCTTCTTCCAGTTCGCCG
CGATGACTGGGATCTTGCTTCTGAGCTTCCGATCTGTAAGTCAGAAGTATCGAATTCACG
ATCTGGAGGAAGACACTGCTGTTCTCAAGAAGGAGAGCGATAGTTTGACGGATCGTATGA
ATAGAATCAAGAGCGATTTTTTGCATCAAGCGTCCATTGACTCTTCCGGCGTCTTTGCTG
CTCGACTCCGTCTGCTTTTCGGTGACGATAAAAAGTGACGGGGGATTGAATTTGGTTTGA
AGTGAACGAGGTTACGATCATGCGATGTTGTATTAATTCTATATAGATGTCTCTGTCTGT
AAAGGATGTGTCTTTGTCAGGAAATTAGCGAATGAATAAGTAGGGTTGCAAGGTGTTGTG
ATTCAGACAATGGAGTATCGTTTTAGTTTTGTCTGAAATCGGGCTTCGATGTTTATGTTT
TTGAACGGTTAGGCTTTGCAGATTTGTATGAGGAATTTCATCGAACACTTT

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL6127Contig1 961 2 2 U
GAGACTTGTTCTCTTCTTGGGAAACAAGAGCACTTCTCCACTTACATCAGTCCAAGCTCT
AATACTACCCCCCGCCCATTTAAAATTGGAACTGTCTCCAGTACCTGATACGATTCCTCC
TCGAGCACAGGTTCAATCTCCACTTGAAGTGATGAACATCCGCCCTAGCAGAGATGTCGC
GGTTTTGGATTTCTCCTACAAGCTTGGTACAATCGTGGTTGGTGCCAAACTGCGCATCCC
AGCAGTTATAAATAAGTTTCTTCAACCTCTTCAATTGACAACTGAAGAGTTCTTCCCGCA
ATGGAGAGCACTTTCAGGGCCACCCTTGAAACTTCAGGAAGTTGTAAGAGGTGTAAGACC
TCTAGCACTTCCGGAAATGGCGAACTTGTTCAACAGTTTCCGGGTGACGATATGCCCTGG
GCTTGATCCGAACCCTAATAATCTAGTGGCAAGCACAACCTTTTACTCTGATACTACAGT
AGCCATGCTCTGTTTGGCAAGAATTGAAACAGACCCAGCAGACAGAACCCAACTACGAAT
GACAGTAGGCTCAGGAGATCCTACCCTTACATTTGAGTTGAAAGAATTTATCAAGGAACA
GCTAATTGTTATGCCAATGGGATCTCGAGCTCTAGTTCCAGCAGCAGCACCACCACCACC
ACCACCAGTAGCTCAACCGCCTAGCCCAGCGGCTTTAGCTGATGATCCAGGAGCTATGCT
TGCGGGCTTACTATAAGTTCATTGGGTAAGAGAATACTTCTTGCAGATGTCGAGTGAAAG
TTATTTTTTTTTCGTGAGTTCAGGTGGTTGTATCAAAGCTTATTCTTGTTCCTAAACATT
ATTTTCAATCTGTTTCTCCGCGATGATTTATTTGAGGTCTTTGAAACTTAATGTATAGAG
AAACAGAAATTCACAGTCGTTTAACTCAATTTTAAGTTTGGTATTTAGTAGGTTGAATAT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2B677TF U 1
AF RR2B677JQ C 232
BS 1 790 RR2B677TF
BS 791 961 RR2B677JQ

RD RR2B677TF 790 0 0
GAGACTTGTTCTCTTCTTGGGAAACAAGAGCACTTCTCCACTTACATCAGTCCAAGCTCT
AATACTACCCCCCGCCCATTTAAAATTGGAACTGTCTCCAGTACCTGATACGATTCCTCC
TCGAGCACAGGTTCAATCTCCACTTGAAGTGATGAACATCCGCCCTAGCAGAGATGTCGC
GGTTTTGGATTTCTCCTACAAGCTTGGTACAATCGTGGTTGGTGCCAAACTGCGCATCCC
AGCAGTTATAAATAAGTTTCTTCAACCTCTTCAATTGACAACTGAAGAGTTCTTCCCGCA
ATGGAGAGCACTTTCAGGGCCACCCTTGAAACTTCAGGAAGTTGTAAGAGGTGTAAGACC
TCTAGCACTTCCGGAAATGGCGAACTTGTTCAACAGTTTCCGGGTGACGATATGCCCTGG
GCTTGATCCGAACCCTAATAATCTAGTGGCAAGCACAACCTTTTACTCTGATACTACAGT
AGCCATGCTCTGTTTGGCAAGAATTGAAACAGACCCAGCAGACAGAACCCAACTACGAAT
GACAGTAGGCTCAGGAGATCCTACCCTTACATTTGAGTTGAAAGAATTTATCAAGGAACA
GCTAATTGTTATGCCAATGGGATCTCGAGCTCTAGTTCCAGCAGCAGCACCACCACCACC
ACCACCAGTAGCTCAACCGCCTAGCCCAGCGGCTTTAGCTGATGATCCAGGAGCTATGCT
TGCGGGCTTACTATAAGTTCATTGGGTAAGAGAATACTTCTTGCAGATGTCGAGTGAAAG
TTATTTTTTT

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2B677JQ 730 0 0
GCGCATCCCAGCAGTTATAAATAAGTTTCTTCAACCTCTTCAATTGACAACTGAAGAGTT
CTTCCCGCAATGGAGAGCACTTTCAGGGCCACCCTTGAAACTTCAGGAAGTTGTAAGAGG
TGTAAGACCTCTAGCACTTCCGGAAATGGCGAACTTGTTCAACAGTTTCCGGGTGACGAT
ATGCCCTGGGCTTGATCCGAACCCTAATAATCTAGTGGCAAGCACAACCTTTTACTCTGA
TACTACAGTAGCCATGCTCTGTTTGGCAAGAATTGAAACAGACCCAGCAGACAGAACCCA
ACTACGAATGACAGTAGGCTCAGGAGATCCTACCCTTACATTTGAGTTGAAAGAATTTAT
CAAGGAACAGCTAATTGTTATGCCAATGGGATCTCGAGCTCTAGTTCCAGCAGCAGCACC
ACCACCACCACCACCAGTAGCTCAACCGCCTAGCCCAGCGGCTTTAGCTGATGATCCAGG
AGCTATGCTTGCGGGCTTACTATAAGTTCATTGGGTAAGAGAATACTTCTTGCAGATGTC
GAGTGAAAGTTATTTTTTTTTCGTGAGTTCAGGTGGTTGTATCAAAGCTTATTCTTGTTC
CTAAACATTATTTTCAATCTGTTTCTCCGCGATGATTTATTTGAGGTCTTTGAAACTTAA
TGTATAGAGAAACAGAAATTCACAGTCGTTTAACTCAATTTTAAGTTTGGTATTTAGTAG
GTTGAATATC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6129Contig1 822 2 2 U
GGACCTCAGCTGCTAATAAACCCTAAGTCACTCAACCTTTTCTTCCTCGATTGTCAGCTA
TGGAGTTCTGGGGAGTCGAAGTTCAAGCAGGGAAGCCACTTAAAGTGACGCCCGAAGATG
GCACTCTTGTCCACATCTCTCATGCATCGCTTGGAGATTGTAAAGGAAAGAAAGGAGAAG
CTGTGACTTTGAATGTGAAGGTTGGGGACAAGAAGTTCGTCATGGGAACTCTTTTGTCTG
AGAGCATTCCTCAGACTTGCTTTGATATGTCATTCGATCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACA
ACTGAGGAAAAGGAAGTGTCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCAACAACAAAGATGATGA
GGGAGGAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAGGAAGTTGC
TGCCACTGTTGCAGCTAATGGGAATGCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAAGCCTGAAGC
AGATGATTCTGATTCTGAAGGAATGGATGAAGATGATTCTGAGGAAGAAGAGGAGACTCC
TAAGGCTGAAACACTCCCGCAACTGCAACGCAGAGCCCAAAGTCTGCAAGTCAAGTCTCA
TGTGGTTCATGCAAGAAGACATTCAACTCATCGAACGCACTTGAGTCTCACACCAAGGCC
AAGCACTCTGCTACCGCCAAGTGAAGTGGATTCCTAAGAGTAACAACTTCCGCTGTTTTG
GATTTAGTTGGAGACTTTTCTTTTTGAACTTTGGCTGTAGTCTTTTTGAAACCTCTCGGA
TTTGTATTTACCAGTTACCAGTATCTTTCAGTATTCTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B325TF U 1
AF RR2B325JQ C 52
BS 1 803 RR2B325TF
BS 804 822 RR2B325JQ

RD RR2B325TF 803 0 0
GGACCTCAGCTGCTAATAAACCCTAAGTCACTCAACCTTTTCTTCCTCGATTGTCAGCTA
TGGAGTTCTGGGGAGTCGAAGTTCAAGCAGGGAAGCCACTTAAAGTGACGCCCGAAGATG
GCACTCTTGTCCACATCTCTCATGCATCGCTTGGAGATTGTAAAGGAAAGAAAGGAGAAG
CTGTGACTTTGAATGTGAAGGTTGGGGACAAGAAGTTCGTCATGGGAACTCTTTTGTCTG
AGAGCATTCCTCAGACTTGCTTTGATATGTCATTCGATCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACA
ACTGAGGAAAAGGAAGTGTCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCAACAACAAAGATGATGA
GGGAGGAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAGGAAGTTGC
TGCCACTGTTGCAGCTAATGGGAATGCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAAGCCTGAAGC
AGATGATTCTGATTCTGAAGGAATGGATGAAGATGATTCTGAGGAAGAAGAGGAGACTCC
TAAGGCTGAAACACTCCCGCAACTGCAACGCAGAGCCCAAAGTCTGCAAGTCAAGTCTCA
TGTGGTTCATGCAAGAAGACATTCAACTCATCGAACGCACTTGAGTCTCACACCAAGGCC
AAGCACTCTGCTACCGCCAAGTGAAGTGGATTCCTAAGAGTAACAACTTCCGCTGTTTTG
GATTTAGTTGGAGACTTTTCTTTTTGAACTTTGGCTGTAGTCTTTTTGAAACCTCTCGGA
TTTGTATTTACCAGTTACCAGTA

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2B325JQ 771 0 0
TGTCAGCTATGGAGTTCTGGGGAGTCGAAGTTCAAGCAGGGAAGCCACTTAAAGTGACGC
CCGAAGATGGCACTCTTGTCCACATCTCTCATGCATCGCTTGGAGATTGTAAAGGAAAGA
AAGGAGAAGCTGTGACTTTGAATGTGAAGGTTGGGGACAAGAAGTTCGTCATGGGAACTC
TTTTGTCTGAGAGCATTCCTCAGACTTGCTTTGATATGTCATTCGATCAGGAGTTTGAGC
TTTCTCACAACTGAGGAAAAGGAAGTGTCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCAACAACAA
AGATGATGAGGGAGGAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGA
GGAAGTTGCTGCCACTGTTGCAGCTAATGGGAATGCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAA
GCCTGAAGCAGATGATTCTGATTCTGAAGGAATGGATGAAGATGATTCTGAGGAAGAAGA
GGAGACTCCTAAGGCTGAAACACTCCCGCAACTGCAACGCAGAGCCCAAAGTCTGCAAGT
CAAGTCTCATGTGGTTCATGCAAGAAGACATTCAACTCATCGAACGCACTTGAGTCTCAC
ACCAAGGCCAAGCACTCTGCTACCGCCAAGTGAAGTGGATTCCTAAGAGTAACAACTTCC
GCTGTTTTGGATTTAGTTGGAGACTTTTCTTTTTGAACTTTGGCTGTAGTCTTTTTGAAA
CCTCTCGGATTTGTATTTACCAGTTACCAGTATCTTTCAGTATTCTTTCTC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL6130Contig1 857 2 2 U
GGACAACAATAGAAGTGTGTATGAGAAGAAAGTTCTCATATATCCAAGTTATATTATAAC
TTATAATAAAAGTAGAAGGTAAAAAATGGAAAAAGGTGGATTTGAGCATGAGATAACGGA
GCTGAGATTGGGTCTTCCGGGTAGAGATGCGGCGGAGAAGATTCTGAAGAAGAGAGGCTT
CACGGAGATGATAATGACGTCTTCTGGAAGTAACAGTGATGAAAGCGGTGTCGTTTCATC
AGGTGGTGACGTGGAGAAAATTAATGAATCACCCGCGGCGAAAAGTCAGGTGGTGGGATG
GCCGCCGGTTTGTTCTTACCGGAGAAAGAATAACGGTAAGGAAGCGTCGACGACAAAAGT
GGGGTTAGGATATGTGAAAGTGAGCATGGATGGTGTGCCTTACTTAAGGAAGATGGATCT
TGGTTCGAGCCAAGGCTATGATGACTTAGCATTTGCTCTCGATAAGCTCTTTGGTGTCCG
TGGCATTGTGACCTTTAGAGATGGTGATAACTGCGACTACGTTACCATATACGAAGACAA
AGATGGAGATTGGATGCTGGCGGGAGATGTACCATGGGGGAATGTTCATAGAGTCATGCA
AGAGGTTGAGGATTATGAAAAGATCGGATGCTACCCGGGTTTGGGCTGCAGCCTAGAGGT
CTTGACGAGTGATACGATGTCCTGAACAAGAAGCAAGTACCTGATTAATTATTATCCTTT
TTAAGTATCAAGATCCTCTTGAACATTTTTCCTATTCATGTTATATATGTTTTGGTTTGT
ATAATTATATTCAGAAAGACAGCTATATCTATACAATACTTGTTTCTTGATTATGAATTA
AGACATTATTCTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AI66TF U 1
AF RR2AI66JQ C 64
BS 1 654 RR2AI66TF
BS 655 857 RR2AI66JQ

RD RR2AI66TF 654 0 0
GGACAACAATAGAAGTGTGTATGAGAAGAAAGTTCTCATATATCCAAGTTATATTATAAC
TTATAATAAAAGTAGAAGGTAAAAAATGGAAAAAGGTGGATTTGAGCATGAGATAACGGA
GCTGAGATTGGGTCTTCCGGGTAGAGATGCGGCGGAGAAGATTCTGAAGAAGAGAGGCTT
CACGGAGATGATAATGACGTCTTCTGGAAGTAACAGTGATGAAAGCGGTGTCGTTTCATC
AGGTGGTGACGTGGAGAAAATTAATGAATCACCCGCGGCGAAAAGTCAGGTGGTGGGATG
GCCGCCGGTTTGTTCTTACCGGAGAAAGAATAACGGTAAGGAAGCGTCGACGACAAAAGT
GGGGTTAGGATATGTGAAAGTGAGCATGGATGGTGTGCCTTACTTAAGGAAGATGGATCT
TGGTTCGAGCCAAGGCTATGATGACTTAGCATTTGCTCTCGATAAGCTCTTTGGTGTCCG
TGGCATTGTGACCTTTAGAGATGGTGATAACTGCGACTACGTTACCATATACGAAGACAA
AGATGGAGATTGGATGCTGGCGGGAGATGTACCATGGGGGAATGTTCATAGAGTCATGCA
AGAGGTTGAGGATTATGAAAAGATCGGATGCTACCCGGGTTTGGGCTGCAGCCT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2AI66JQ 794 0 0
TAATAAAAGTAGAAGGTAAAAAATGGAAAAAGGTGGATTTGAGCATGAGATAACGGAGCT
GAGATTGGGTCTTCCGGGTAGAGATGCGGCGGAGAAGATTCTGAAGAAGAGAGGCTTCAC
GGAGATGATAATGACGTCTTCTGGAAGTAACAGTGATGAAAGCGGTGTCGTTTCATCAGG
TGGTGACGTGGAGAAAATTAATGAATCACCCGCGGCGAAAAGTCAGGTGGTGGGATGGCC
GCCGGTTTGTTCTTACCGGAGAAAGAATAACGGTAAGGAAGCGTCGACGACAAAAGTGGG
GTTAGGATATGTGAAAGTGAGCATGGATGGTGTGCCTTACTTAAGGAAGATGGATCTTGG
TTCGAGCCAAGGCTATGATGACTTAGCATTTGCTCTCGATAAGCTCTTTGGTGTCCGTGG
CATTGTGACCTTTAGAGATGGTGATAACTGCGACTACGTTACCATATACGAAGACAAAGA
TGGAGATTGGATGCTGGCGGGAGATGTACCATGGGG*AATGTTCATAGAGTCATGCAAGA
GGTTGAGGATTATGAAAAGATCGGATGCTACC*GGGTTTGGGCTGCAGCCTAGAGGTCTT
GACGAGTGATACGATGTCCTGAACAAGAAGCAAGTACCTGATTAATTATTATCCTTTTTA
AGTATCAAGATCCTCTTGAACATTTTTCCTATTCATGTTATATATGTTTTGGTTTGTATA
ATTATATTCAGAAAGACAGCTATATCTATACAATACTTGTTTCTTGATTATGAATTAAGA
CATTATTCTGTTTG

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL6131Contig1 615 2 2 U
GGATCTAAAGCTTTTGCAGTATTAAGAAAATAAATAAATAAGACATACCGCTTAAGCTTT
GGAACACCTTTAATCCTTTTTACAAAAAGAAAAATGGCACGTCAATTTGTAGTATTTGGT
CTATTGGCTTTGGTGGTGGCCACCGCATTCGCTGCTGAGGCACCCTCAGCTGCTCCCACC
GCCTCCCCTACCAAGGCACCCGCCACCAAGGCTCCGGCTGCTGCACCCAAATCCTCCACC
TCAACATCCGCACCCAAAGCATCGTCCCCTGTGGCAGAGGAACCAACAGCCGAAGACGAT
TACACAGGAAACAGCCCCACTGAGTCTGTCGAGGGACCCACCGTCTCCTCCCCACCAGCT
CCTACCCCAGAGGGTTCGGCTGATGGACCATCATCCGATGCACCCACCCCTGGCCCCGAG
GTACTTGATGGCAGCGCCACTAACGTGAAGCTTTCCATCGCCTGCACTGTCGCCGCCCTC
GGATTCTTCTTCTTCTCTCTCTAAGTTTTTCAAAAAAGAAAAACAACTTTTGTTTGGGAC
TAATCATATGACTGACTTTGTGTGACCAAATATTACTTATATGCCAATTGTTATCAAAAG
ATTAAACGGACCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN52TF U 1
AF RR2EN52JQ C 177
BS 1 323 RR2EN52TF
BS 324 615 RR2EN52JQ

RD RR2EN52TF 323 0 0
GGATCTAAAGCTTTTGCAGTATTAAGAAAATAAATAAATAAGACATACCGCTTAAGCTTT
GGAACACCTTTAATCCTTTTTACAAAAAGAAAAATGGCACGTCAATTTGTAGTATTTGGT
CTATTGGCTTTGGTGGTGGCCACCGCATTCGCTGCTGAGGCACCCTCAGCTGCTCCCACC
GCCTCCCCTACCAAGGCACCCGCCACCAAGGCTCCGGCTGCTGCACCCAAATCCTCCACC
TCAACATCCGCACCCAAAGCATCGTCCCCTGTGGCAGAGGAACCAACAGCCGAAGACGAT
TACACAGGAAACAGCCCCACTGA

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR2EN52JQ 439 0 0
CACCGCCTCCCCTACCAAGGCACCCGCCACCAAGGCTCCGGCTGCTGCACCCAAATCCTC
CACCTCAGCATCCGCACCCAAAGCATCGTCCCCTGTGGCAGAGGAACCAACAGCCGAAGA
CGATTACACAGGAAACAGCCCCACTGAGTCTGTCGAGGGACCCACCGTCTCCTCCCCACC
AGCTCCTACCCCAGAGGGTTCGGCTGATGGACCATCATCCGATGCACCCACCCCTGGCCC
CGAGGTACTTGATGGCAGCGCCACTAACGTGAAGCTTTCCATCGCCTGCACTGTCGCCGC
CCTCGGATTCTTCTTCTTCTCTCTCTAAGTTTTTCAAAAAAGAAAAACAACTTTTGTTTG
GGACTAATCATATGACTGACTTTGTGTGACCAAATATTACTTATATGCCAATTGTTATCA
AAAGATTAAACGGACCTAT

QA 1 439 1 439
DS 



AS 1 2

CO CL6132Contig1 822 2 2 U
GTCTGTGATTCTTGAGACTAAGTCATCTTCAGGGGAACAGCTCAAGATCTTGAAGGTGAA
GAATGTTGGGGAGTTTTGTAAGAAAGACAAACTTGGAGGAGTGGATAATGGTGATGTTCT
GTATGATTCAGACAATTCTGATTCTGGATACTTCAGGAATGGACCAAAGAAGTTGGACTC
AGATGTTACTGTTGATGGGTTCCTCAAGAACACTGGATTTAATAACAAGGCTGCAATGGG
ATTCAATAGCTATACAGCAAAACAGGATAAGAGCTTGAACGTATTCAGGAAGGAATGGTC
AGCTTCAGGATCAGGATCTGGATCAGGTCGGTCTTCTACAAAGTATGATCTGAGGAAAAG
CAAAAGAGGGTTTCCTTGTTACGGTAGAAAGAAAATCAAGTATGAGTTCACTGAATCTGT
GTATGACAGTGGTGACCAGCTTAGCTTGGAGACTGATTCTTGTGCGGACACAATCAAGAT
CCATAGTAAATCCACAATGGTTAAGAAAGCAAGTGGTGGTGCAAAGAAGAAAAACAAAGG
TCACGAGTGTCCGATTTGCTTCAGGGTGTTTAAATCAGGACAGGCTTTAGGTGGTCACAA
GAGATCACATTTCATTGGGAGTCAAGATCACAGGACTCTAGTGATCCAACAACACCAAGT
AGCTCATGATATGCATACACTCATCGATCTCAATCTTCCTGCTCCTATTGATGAGTGAAC
CAGTTATCAAAATTTTTGTTCTCATTATTAATTATTATTATTGTTTCCTCTCTGTTTTCA
TTTTTCTTGCTTCAGATTCAAGAATGCTTTTGGTTCAGAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL22TF U 1
AF RR2AL22JQ C 31
BS 1 808 RR2AL22TF
BS 809 822 RR2AL22JQ

RD RR2AL22TF 808 0 0
GTCTGTGATTCTTGAGACTAAGTCATCTTCAGGGGAACAGCTCAAGATCTTGAAGGTGAA
GAATGTTGGGGAGTTTTGTAAGAAAGACAAACTTGGAGGAGTGGATAATGGTGATGTTCT
GTATGATTCAGACAATTCTGATTCTGGATACTTCAGGAATGGACCAAAGAAGTTGGACTC
AGATGTTACTGTTGATGGGTTCCTCAAGAACACTGGATTTAATAACAAGGCTGCAATGGG
ATTCAATAGCTATACAGCAAAACAGGATAAGAGCTTGAACGTATTCAGGAAGGAATGGTC
AGCTTCAGGATCAGGATCTGGATCAGGTCGGTCTTCTACAAAGTATGATCTGAGGAAAAG
CAAAAGAGGGTTTCCTTGTTACGGTAGAAAGAAAATCAAGTATGAGTTCACTGAATCTGT
GTATGACAGTGGTGACCAGCTTAGCTTGGAGACTGATTCTTGTGCGGACACAATCAAGAT
CCATAGTAAATCCACAATGGTTAAGAAAGCAAGTGGTGGTGCAAAGAAGAAAAACAAAGG
TCACGAGTGTCCGATTTGCTTCAGGGTGTTTAAATCAGGACAGGCTTTAGGTGGTCACAA
GAGATCACATTTCATTGGGAGTCAAGATCACAGGACTCTAGTGATCCAACAACACCAAGT
AGCTCATGATATGCATACACTCATCGATCTCAATCTTCCTGCTCCTATTGATGAGTGAAC
CAGTTATCAAAATTTTTGTTCTCATTATTAATTATTATTATTGTTTCCTCTCTGTTTTCA
TTTTTCTTGCTTCAGATTCAAGAATGCT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2AL22JQ 792 0 0
AGGGGAACAGCTCAAGATCTTGAAGGTGAAGAATGTTGGGGAGTTTTGTAAGAAAGACAA
ACTTGGAGGAGTGGATAATGGTGATGTTCTGTATGATTCAGACAATTCTGATTCTGGATA
CTTCAGGAATGGACCAAAGAAGTTGGACTCAGATGTTACTGTTGATGGGTTCCTCAAGAA
CACTGGATTTAATAACAAGGCTGCAATGGGATTCAATAGCTATACAGCAAAACAGGATAA
GAGCTTGAACGTATTCAGGAAGGAATGGTCAGCTTCAGGATCAGGATTTGGATCAGGTCG
GTTTTTTACAAAGTATGATTTGAGGAAAAGCAAAAGAGGGTTTCCTTGTTACGGTAGAAA
GAAAATCAAGTATGAGTTCACTGAATCTGTGTATGACAGTGGTGACCAGCTTAGCTTGGA
GACTGATTTTTGTGCGGACACAATCAAGATCCATAGTAAATCCACAATGGTTAAGAAAGC
AAGTGGTGGTGCAAAGAAGAAAAACAAAGGTCACGAGTGTCCGATTTGCTTCAGGGTGTT
TAAATCAGGACAGGCTTTAGGTGGTCACAAGAGATCACATTTCATTGGGAGTCAAGATCA
CAGGACTCTAGTGATCCAACAACACCAAGTAGCTCATGATATGCATACACTCATCGATCT
CAATCTTCCTGCTCCTATTGATGAGTGAACCAGTTATCAAAATTTTTGTTCTCATTATTA
ATTATTATTATTGTTTCCTCTCTGTTTTCATTTTTCTTGCTTCAGATTCAAGAATGCTTT
TGGTTCAGAAGG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL6133Contig1 702 2 4 U
AGGACGTTCAAAAGACCAGGTGTCGATGCATTCTTGGAGCACCTTGGCAAATTCTATGAG
ATTGTCGTCTATTCTGACCAGATGGATATGTACGTATATCCGGTCTGTGAGAAGTTAGAC
CCGAATGGCTACATACGTTATAAGCTAGCTAGAGGCGCTACCAAATATGAGAATGGGAAG
CACTACAGGGATTTGTCGAAGCTGAACAGAGACCCCAAGAGGATTCTGTATGTTAGCGGG
AATGCTTTTGATACAAGCCTTCAGCCTGAGAATTGCGTGCCAATCAAGCCTTACAAACTC
GAGTCCGATGACACAGCGCTTGTAGATCTCATACCCTTCCTCGAATATGTTGCACGTAAC
GGTCCAGCGGATATCAGAACGGTTCTAGCCTCTTACGAGAGAAAAGATGTTGCAAAAGAG
TTCCTTGAGAGGTCCATTGAGTATCAAAAGCGAATGCAAGGACAAAGACAAGGCCGACTC
TGGAGGCGTTAGAAGGATCTAAAAACATTTTATGTATAGTGAGAGACGATTATATCCTCA
TTGATGCATTACACCCATAAAAACAGGACCAAGAGCTACTGTTTTCGTCTGTGAGGAGTT
TAGGTAAACTCCAAACTAAAAAATCGTGTCTTTACTCGTCAAAAAAGAGTTTGTGTTATG
TGTGACCTCTTCTGTCTCGGCTTTACAAAGTAAACTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2G332TF U 1
AF RR2G332JQ C 52
BS 1 645 RR2G332TF
BS 646 646 RR2G332JQ
BS 647 700 RR2G332TF
BS 701 702 RR2G332JQ

RD RR2G332TF 701 0 0
AGGACGTTCAAAAGACCAGGTGTCGATGCATTCTTGGAGCACCTTGGCAAATTCTATGAG
ATTGTCGTCTATTCTGACCAGATGGATATGTACGTATATCCGGTCTGTGAGAAGTTAGAC
CCGAATGGCTACATACGTTATAAGCTAGCTAGAGGCGCTACCAAATATGAGAATGGGAAG
CACTACAGGGATTTGTCGAAGCTGAACAGAGACCCCAAGAGGATTCTGTATGTTAGCGGG
AATGCTTTTGATACAAGCCTTCAGCCTGAGAATTGCGTGCCAATCAAGCCTTACAAACTC
GAGTCCGATGACACAGCGCTTGTAGATCTCATACCCTTCCTCGAATATGTTGCACGTAAC
GGTCCAGCGGATATCAGAACGGTTCTAGCCTCTTACGAGAGAAAAGATGTTGCAAAAGAG
TTCCTTGAGAGGTCCATTGAGTATCAAAAGCGAATGCAAGGACAAAGACAAGGCCGACTC
TGGAGGCGTTAGAAGGATCTAAAAACATTTTATGTATAGTGAGAGACGATTATATCCTCA
TTGATGCATTACACCCATAAAAACAGGACCAAGAGCTACTGTTTTCGTCTGTGAGGAGTT
TAGGTAAACTCCAAACTAAAAAATCGTGTCTTTACTCGTCAAAAA*GAGTTTGTGTTATG
TGTGACCTCTTCTGTCTCGGCTTTACAAAGTAAACTTTTT
C

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2G332JQ 651 0 0
TTCTATGAGATTGTCGTCTATTCTGACCAGATGGATATGTACGTATATCCGGTCTGTGAG
AAGTTAGACCCGAATGGCTACATACGTTATAAGCTAGCTAGAGGCGCTACCAAATATGAG
AATGGGAAGCACTACAGGGATTTGTCGAAGCTGAACAGAGACCCCAAGAGGATTCTGTAT
GTTAGCGGGAATGCTTTTGATACAAGCCTTCAGCCTGAGAATTGCGTGCCAATCAAGCCT
TACAAACTCGAGTCCGATGACACAGCGCTTGTAGATCTCATACCCTTCCTCGAATATGTT
GCACGTAACGGTCCAGCGGATATCAGACCGGTTCTAGCCTCTTACGAGAGAAAAGATGTT
GCAAAAGAGTTCCTTGAGAGGTCCATTGAGTATCAAAAGCGAATGCAAGGACAAAGACAA
GGCCGACTCTGGAGGCGTTAGAAGGATCTAAAAACATTTTATGTATAGTGAGAGACGATT
ATATCCTCATTGATGCATTACACCCATAAAAACAGGACCAAGAGCTACTGTTTTCGTCTG
TGAGGAGTTTAGGTAAACTCCAAACTAAAAAATCGTGTCTTTACTCGTCAAAAAAGAGTT
TGTGTTATGTGTGACCTCTTCTGTCTCGGCTTTACAAAGTAAACTTTTTTC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL6134Contig1 1024 2 4 U
GGGTCGCCCCTGCGTGGGTTCTAGCGGCCGCCTCCTGTGGGCTTTTGAGTCTGGAAAAAT
GTTTGGTTGTCCGCCAGTTATTGTAGTAAGTCGAGTATCTAATGGAATGAATTTCAATTT
GGGAAAAAAAAATATTAGTTAATCAAATCGTGGAGGAAAAGAAACAACAAACACCAATTG
GATTTTCCATGGCTACAAAATAAGATCCTCTCCTCCGACACAACACATAGATTCCTCAAC
TTCTGCTCTCAGAAACAAGAAAAAAAAATAGGTTTTAATCTCTTATGGGCTACAAGAGAC
TGATGACTGGTGGGACTTCAAGCAGAGGCCATCGGGATCCTCTTTTGCACAACCAGGATA
GAACGAAAGCAAATGGAGAAGAAACGGGCGAGAATGGTACAACTGATCTCGAGCACGGTG
TAGGTGAGGCAGCAAATGTCGGGTTTGGCAGAGTCTTTTCGTTGGCAAAGCCTGATGCAG
GGAAGCTAGTGATTGGTACCATTGCTTTGTTAATAGCTTCAACTACTAATCTCCTCGTTC
CAAAATTTGGTGGAATGATTATAGACATTGTATCCAGAGATGCCAAGACGTCTGAACAGC
AATCTGAATCCATTCTTGCTGTTAGAAACGCTGTCGTAATCATTCTGCTAATCGTTGTAC
TCGGGTCTTTGTGCACGGCGTTGCGATCGTGGCTGTTTAACTCTGCCAGTGAAAGAGTTG
TGGCTAGACTGAGAAAGGATCTGTTCAAACACCTAATGCATCAGGAAATAGCATTTTATG
ATGTGACAAAAACTGGAGAGCTGTTAAGTAGACTTTCTGAAGACACTCAAATCATTAAAA
ACGCTGCTACTACGAATCTTTTTGAAGCTCTTCGTAATGTAACAACGGCCCTTATTGGAG
TTGGTTTCATGTTTACATCTTCTTGGAAACTAACATGTACGAAAGCTTCTCTTTTCCTTT
TTTTTTTTTTTTTTGATTTGTAACAAATTTAACTAACTAATATGTATGAAGCTGACTTTT
GGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2AU19TF U 1
AF RR2AU19JQ C 170
BS 1 267 RR2AU19TF
BS 268 268 RR2AU19JQ
BS 269 760 RR2AU19TF
BS 761 1024 RR2AU19JQ

RD RR2AU19TF 760 0 0
GGGTCGCCCCTGCGTGGGTTCTAGCGGCCGCCTCCTGTGGGCTTTTGAGTCTGGAAAAAT
GTTTGGTTGTCCGCCAGTTATTGTAGTAAGTCGAGTATCTAATGGAATGAATTTCAATTT
GGGAAAAAAAAATATTAGTTAATCAAATCGTGGAGGAAAAGAAACAACAAACACCAATTG
GATTTTCCATGGCTACAAAATAAGATCCTCTCCTCCGACACAACACATAGATTCCTCAAC
TTCTGCTCTCAGAAACAAGAAAAAAAA*TAGGTTTTAATCTCTTATGGGCTACAAGAGAC
TGATGACTGGTGGGACTTCAAGCAGAGGCCATCGGGATCCTCTTTTGCACAACCAGGATA
GAACGAAAGCAAATGGAGAAGAAACGGGCGAGAATGGTACAACTGATCTCGAGCACGGTG
TAGGTGAGGCAGCAAATGTCGGGTTTGGCAGAGTCTTTTCGTTGGCAAAGCCTGATGCAG
GGAAGCTAGTGATTGGTACCATTGCTTTGTTAATAGCTTCAACTACTAATCTCCTCGTTC
CAAAATTTGGTGGAATGATTATAGACATTGTATCCAGAGATGCCAAGACGTCTGAACAGC
AATCTGAATCCATTCTTGCTGTTAGAAACGCTGTCGTAATCATTCTGCTAATCGTTGTAC
TCGGGTCTTTGTGCACGGCGTTGCGATCGTGGCTGTTTAACTCTGCCAGTGAAAGAGTTG
TGGCTAGACTGAGAAAGGATCTGTTCAAACACCTAATGCA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2AU19JQ 855 0 0
AACACCAATTGGATTTTCCATGGCTACAAAATAAGATCCTCTCCTCCGACACAACACATA
GATTCCTCAACTTCTGCTCTCAGAAACAAGAAAAAAAAATAGGTTTTAATCTCTTATGGG
CTACAAGAGACTGATGACTGGTGGGACTTCAAGCAGAGGCCATCGGGATCCTCTTTTGCA
CAACCAGGATAGAACGAAAGCAAATGGAGAAGAAACGGGCGAGAATGGTACAACTGATCT
CGAGCACGGTGTAGGTGAGGCAGCAAATGTCGGGTTTGGCAGAGTCTTTTCGTTGGCAAA
GCCTGATGCAGGGAAGCTAGTGATTGGTACCATTGCTTTGTTAATAGCTTCAACTACTAA
TCTCCTCGTTCCAAAATTTGGTGGAATGATTATAGACATTGTATCCAGAGATGCCAAGAC
GTTTGAACAGCAATCTGAATCCATTCTTGCTGTTAGAAACGCTGTCGTAATCATTCTGCT
AATCGTTGTACTCGGGTCTTTGTGCACGGCGTTGCGATCGTGGCTGTTTAACTCTGCCAG
TGAAAGAGTTGTGGCTAGACTGAGAAAGGATCTGTTCAAACACCTAATGCATCAGGAAAT
AGCATTTTATGATGTGACAAAAACTGGAGAGCTGTTAAGTAGACTTTCTGAAGACACTCA
AATCATTAAAAACGCTGCTACTACGAATCTTTTTGAAGCTCTTCGTAATGTAACAACGGC
CCTTATTGGAGTTGGTTTCATGTTTACATCTTCTTGGAAACTAACATGTACGAAAGCTTC
TCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTGATTTGTAACAAATTTAACTAACTAATATGTATGA
AGCTGACTTTTGGTT

QA 1 855 1 855
DS 



AS 1 2

CO CL6135Contig1 748 2 2 U
GGTTTAGTTAAAATCAAAGATGATTATACAACAAGTTAAGCAAAAAAAAAGAAGATAAAT
ATACAACACCTATTTGGATCATCCAAGAACTCTTAGGCAACGAGGAACGAAGTTTACAAA
CATAAATAATGACATTGTGGCGTCGAACAACATATACATCGAGGTAAAAGGACTGAAGTG
GTGTGTTATGGTGGCCAATATAGAAATAACGACTAAAGAACCCGAGCAAGGTTAAATAAT
TTCCTGAGTGTTACAATGACTCATCCTTGTACAGTAAGATTTTAAATTCGTATGGTATGG
AGGTCACCTTACGGATAAGTTATAGTGGAGAAAAAACGAACTTTCAAATTTTAATTAAAT
ATATGTCACGTTAAGTTTCTCTCGTATTGTAGCTCAACAACTTCGAATAATAAATCCACG
TTTCGCTACACTTTTATAGCTGGGGCTGGACTTGTAAAAACAATGAATAATAAACCTTTG
ATCTAAAAGTAAAAATTATGTCTGAACTAATTTTGTCAACTTGTTGTTAACTATCAACGA
GGTTATAAATTACCAACAATTTACGTATATCAAATTCTCTGTTGTTAAAAATAAAATAAA
CTGCCTAAAACATCATGGCCCAATGGTAAGGACGGGCTCCTTCCTGCCTATTTGTATATC
CGGGAGAGAGGGTCCATCCGTGGGCTGCACCTCCCCTTGGGGATTAGTCTGGGCCCTTCC
ATAGGCCCGGGATACCTCCAGGTTAATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B339TF U 1
AF RR2B339JQ C 1
BS 1 698 RR2B339TF
BS 699 748 RR2B339JQ

RD RR2B339TF 698 0 0
GGTTTAGTTAAAATCAAAGATGATTATACAACAAGTTAAGCAAAAAAAAAGAAGATAAAT
ATACAACACCTATTTGGATCATCCAAGAACTCTTAGGCAACGAGGAACGAAGTTTACAAA
CATAAATAATGACATTGTGGCGTCGAACAACATATACATCGAGGTAAAAGGACTGAAGTG
GTGTGTTATGGTGGCCAATATAGAAATAACGACTAAAGAACCCGAGCAAGGTTAAATAAT
TTCCTGAGTGTTACAATGACTCATCCTTGTACAGTAAGATTTTAAATTCGTATGGTATGG
AGGTCACCTTACGGATAAGTTATAGTGGAGAAAAAACGAACTTTCAAATTTTAATTAAAT
ATATGTCACGTTAAGTTTCTCTCGTATTGTAGCTCAACAACTTCGAATAATAAATCCACG
TTTCGCTACACTTTTATAGCTGGGGCTGGACTTGTAAAAACAATGAATAATAAACCTTTG
ATCTAAAAGTAAAAATTATGTCTGAACTAATTTTGTCAACTTGTTGTTAACTATCAACGA
GGTTATAAATTACCAACAATTTACGTATATCAAATTCTCTGTTGTTAAAAATAAAATAAA
CTGCCTAAAACATCATGGCCCAATGGTAAGGACGGGCTCCTTCCTGCCTATTTGTATATC
CGGGAGAGAGGGTCCATCCGTGGGCTGCACCTCCCCTT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2B339JQ 748 0 0
GGTTTAGTTAAAATCAAAGATGATTATACAACAAGTTAAGCAAAAAAAAAGAAGATAAAT
ATACAACACCTATTTGGATCATCCAAGAACTCTTAGGCAACGAGGAACGAAGTTTACAAA
CATAAATAATGACATTGTGGCGTCGAACAACATATACATCGAGGTAAAAGGACTGAAGTG
GTGTGTTATGGTGGCCAATATAGAAATAACGACTAAAGAACCCGAGCAAGGTTAAATAAT
TTCCTGAGTGTTACAATGACTCATCCTTGTACAGTAAGATTTTAAATTCGTATGGTATGG
AGGTCACCTTACGGATAAGTTATAGTGGAGAAAAAACGAACTTTCAAATTTTAATTAAAT
ATATGTCACGTTAAGTTTCTCTCGTATTGTAGCTCAACAACTTCGAATAATAAATCCACG
TTTCGCTACACTTTTATAGCTGGGGCTGGACTTGTAAAAACAATGAATAATAAACCTTTG
ATCTAAAAGTAAAAATTATGTCTGAACTAATTTTGTCAACTTGTTGTTAACTATCAACGA
GGTTATAAATTACCAACAATTTACGTATATCAAATTCTCTGTTGTTAAAAATAAAATAAA
CTGCCTAAAACATCATGGCCCAATGGTAAGGACGGGCTCCTTCCTGCCTATTTGTATATC
CGG*AGAGAGGGTCCATCCGTGGGCTGCACCTCCCCTTGGGGATTAGTCTGGGCCCTTCC
ATAGGCCCGGGATACCTCCAGGTTAATC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL6136Contig1 828 2 4 U
CGCAAAACAAACTATCTGATAGTACAATTATTGAGAGATATTCAACAAAAGATTCCATCA
TCTAACTTTTCTTCTGTTAAGACAGAATACTAGTCTAAAAACATCTGATAATGGCTGCTA
AGAGTTTTAAGTTGCAAATAAAGTCAAGAAAAAAAACAGATAAAAAAACTTGCAACACTA
CAAAAAGAAAAAAACTGTCATGGTCTATTCATCATCTTGTGACTTAGTTTTCTTCTTCTT
TTTCTTCTCGCTGTGACCATTATCTGTTGTCGTTTCCTCTTCAACTACTTTGCTTTTCTT
CTTTTTCTTTGATTTCACCTCTTCTTCTACTTCCTCCTCATCCTTCTCCTCTGCCTTTCT
CTTCTCTTTCTTCTTTTTCTTCTCAAAGGCCTCCACCACTTTATCTTCTCCCTCATCTTT
CTTGTCAAGAGTATCCATCACTTCTTTCATTACATCCACATTCTTACGTGGGGCAACACC
TTTGTCATAAAATTCTAGTCGTTCCTCCACTTGTTCCCTAAGTTTCTCACCAAAAGCCGT
AGTGCTGCTATCAGCGAAACAATCAATCCGGGAAGCAATGGAGCACTTGTTTGCGAGGTA
ACGAGCAATACGTCCCTTGTTTTTAGCAGCCGCACGTCCAATGAACGAAGAATGGAATAT
CAGACCGTACTTGGGCGTGTTCCCACGTGTTTTTAGCGCCCTAAAGAGTGCCTTCTCAGC
ACCAAGAATCTGGAGAGTTGAAGATGGGCACTTGGCGAGATTCGTCAGACTCCCTGCATG
TGAGATCAGCCTTGCACCAACCATATCTCCGATCATGCCGCCAAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ15JQB U 1
AF RR2G520JQ U 43
BS 1 248 RR2GJ15JQB
BS 249 249 RR2G520JQ
BS 250 659 RR2GJ15JQB
BS 660 828 RR2G520JQ

RD RR2GJ15JQB 659 0 0
CGCAAAACAAACTATCTGATAGTACAATTATTGAGAGATATTCAACAAAAGATTCCATCA
TCTAACTTTTCTTCTGTTAAGACAGAATACTAGTCTAAAAACATCTGATAATGGCTGCTA
AGAGTTTTAAGTTGCAAATAAAGTCAAGAAAAAAAACAGATAAAAAAACTTGCAACACTA
CAAAAAGAAAAAAACTGTCATGGTCTATTCATCATCTTGTGACTTAGTTTTCTTCTTCTT
TTTCTTCTTGCTGTGACCATTATCTGTTGTCGTTTCCTCTTCAACTACTTTGCTTTTCTT
CTTTTTCTTTGATTTCACCTCTTCTTCTACTTCCTCCTCATCCTTCTCCTCTGCCTTTCT
CTTCTCTTTCTTCTTTTTCTTCTCAAAGGCCTCCACCACTTTATCTTCTCCCTCATCTTT
CTTGTCAAGAGTATCCATCACTTCTTTCATTACATCCACATTCTTACGTGGGGCAACACC
TTTGTCATAAAATTCTAGTCGTTCCTCCACTTGTTCCCTAAGTTTCTCACCAAAAGCCGT
AGTGCTGCTATCAGCGAAACAATCAATCCGGGAAGCAATGGAGCACTTGTTTGCGAGGTA
ACGAGCAATACGTCCCTTGTTTTTAGCAGCCGCACGTCCAATGAACGAAGAATGGAATA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2G520JQ 786 0 0
CAACAAAAGATTCCATCATCTAACTTTTCTTCTGTTAAGACAGAATACTAGTCTAAAAAC
ATCTGATAATGGCTGCTAAGAGTTTTAAGTTGCAAATAAAGTCAAGAAAAAAAACAGATA
AAAAAACTTGCAACACTACAAAAAGAAAAAAACTGTCATGGTCTATTCATCATCTTGTGA
CTTAGTTTTCTTCTTCTTTTTCTTCTCGCTGTGACCATTATCTGTTGTCGTTTCCTCTTC
AACTACTTTGCTTTTCTTCTTTTTCTTTGATTTCACCTCTTCTTCTACTTCCTCCTCATC
CTTCTCCTCTGCCTTTCTCTTCTCTTTCTTCTTTTTCTTCTCAAAGGCCTCCACCACTTT
ATCTTCTCCCTCATCTTTCTTGTCAAGAGTATCCATCACTTCTTTCATTACATCCACATT
CTTACGTGGGGCAACACCTTTGTCATAAAATTCTAGTCGTTCCTCCACTTGTTCCCTAAG
TTTCTCACCAAAAGCCGTAGTGCTGCTATCAGCGAAACAATCAATCCGGGAAGCAATGGA
GCACTTGTTTGCGAGGTAACGAGCAATACGTCCCTTGTTTTTAGCAGCCGCACGTCCAAT
GAACGAAGAATGGAATATCAGACCGTACTTGGGCGTGTTCCCACGTGTTTTTAGCGCCCT
AAAGAGTGCCTTCTCAGCACCAAGAATCTGGAGAGTTGAAGATGGGCACTTGGCGAGATT
CGTCAGACTCCCTGCATGTGAGATCAGCCTTGCACCAACCATATCTCCGATCATGCCGCC
AAGTTT

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL6137Contig1 874 2 4 U
TTTTTCTTTATTTTTCTCCTTCATCTTAGCTTCTTTTCCAACAAAATAAAAACTCCATTT
TTTATCAAGAGGTTTCATATCCCAAGAACATTTTCTCGTACTTTTCCTCAGAGTTCCACA
CATTATTCAACAAGCTATAGGAGACTACGACTGCAAATTTCAAATCGTCAGGAGAATTTT
AATTTAAAAATGGAGGAGAGTTCAAGTTGTGTGCAAATACAAGTAGAAGAGGAGCTGCCA
ACTTTACTGAGACGAGCCACAACAGAAGAAATGCTTGGCTTTGACAATTACAAAGAGAGT
AATCTTCCTCTTTCCCACTTCGTCAGTCGTTTTCATCATTCTCATGCCTCCACAACTAAT
TTGAGTGGTCAAGAAGTATCAAGAGAAGCAATGGAAGAGACTACACCATGGATGATGCCC
AAACACCAAAGGAAACCATCAGCAACCGGCCAAGACCCAAACAGACCAGCCACCACCGGT
GGCTGGACCAGCTGAGAAACGTGAGCTCGGAGAACATCGAGAATTACTTGAAATTCACGG
ACTCGGACAGCAGTCATAGTAATGATCTAGAAGCTGGCAATAATGGCAAAGCTCAAGAGA
GTGATTCCGCATAAATCAATACACCATTGAAGAATTTACAATCCCTGGAATAATCGAGTC
GTAGTATCTAAATTTTGGTTTTGATGTGTTGTCAGTGTCTATGACACAAGTGAGGAACCG
AGTAGCCTAAGTGTTTGGTTGCTATGGTTCTAATGAGCATGTGTAAAACTAGTAGTAAAA
CAAATGGTAACGATAGTGGTTATCAAAGTATAGTAGTATGGAAACACGTTTTGTTTCCAA
TAAATAAAAAAAGTTTTGAGGGTTTAATCATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CN06TF U 1
AF RR2CN06JQ C 110
BS 1 716 RR2CN06TF
BS 717 717 RR2CN06JQ
BS 718 767 RR2CN06TF
BS 768 874 RR2CN06JQ

RD RR2CN06TF 772 0 0
TTTTTCTTTATTTTTCTCCTTCATCTTAGCTTCTTTTCCAACAAAATAAAAACTCCATTT
TTTATCAAGAGGTTTCATATCCCAAGAACATTTTCTCGTACTTTTCCTCAGAGTTCCACA
CATTATTCAACAAGCTATAGGAGACTACGACTGCAAATTTCAAATCGTCAGGAGAATTTT
AATTTAAAAATGGAGGAGAGTTCAAGTTGTGTGCAAATACAAGTAGAAGAGGAGCTGCCA
ACTTTACTGAGACGAGCCACAACAGAAGAAATGCTTGGCTTTGACAATTACAAAGAGAGT
AATCTTCCTCTTTCCCACTTCGTCAGTCGTTTTCATCATTCTCATGCCTCCACAACTAAT
TTGAGTGGTCAAGAAGTATCAAGAGAAGCAATGGAAGAGACTACACCATGGATGATGCCC
AAACACCAAAGGAAACCATCAGCAACCGGCCAAGACCCAAACAGACCAGCCACCACCGGT
GGCTGGACCAGCTGAGAAACGTGAGCTCGGAGAACATCGAGAATTACTTGAAATTCACGG
ACTCGGACAGCAGTCATAGTAATGATCTAGAAGCTGGCAATAATGGCAAAGCTCAAGAGA
GTGATTCCGCATAAATCAATACACCATTGAAGAATTTACAATCCCTGGAATAATCGAGTC
GTAGTATCTAAATTTTGGTTTTGATGTGTTGTCAGTGTCTATGACACAAGTGAGGA*CCG
AGTAGCCTAAGTGTTTGGTTGCTATGGTTCTAATGAGCATGTGTAAA
CTAGT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2CN06JQ 765 0 0
AGAGTTCCACACATTATTCAACAAGCTATAGGAGACTACGACTGCAAATTTCAAATCGTC
AGGAGAATTTTAATTTAAAAATGGAGGAGAGTTCAAGTTGTGTGCAAATACAAGTAGAAG
AGGAGCTGCCAACTTTACTGAGACGAGCCACAACAGAAGAAATGCTTGGCTTTGACAATT
ACAAAGAGAGTAATCTTCCTCTTTCCCACTTCGTCAGTCGTTTTCATCATTCTCATGCCT
CCACAACTAATTTGAGTGGTCAAGAAGTATCAAGAGAAGCAATGGAAGAGACTACACCAT
GGATGATGCCCAAACACCAAAGGAAACCATCAGCAACCGGCCAAGACCCAAACAGACCAG
CCACCACCGGTGGCTGGACCAGCTGAGAAACGTGAGCTCGGAGAACATCGAGAATTACTT
GAAATTCACGGACTCGGACAGCAGTCATAGTAATGATCTAGAAGCTGGCAATAATGGCAA
AGCTCAAGAGAGTGATTCCGCATAAATCAATACACCATTGAAGAATTTACAATCCCTGGA
ATAATCGAGTCGTAGTATCTAAATTTTGGTTTTGATGTGTTGTCAGTGTCTATGACACAA
GTGAGGAACCGAGTAGCCTAAGTGTTTGGTTGCTATGGTTCTAATGAGCATGTGTAAAAC
TAGTAGTAAAACAAATGGTAACGATAGTGGTTATCAAAGTATAGTAGTATGGAAACACGT
TTTGTTTCCAATAAATAAAAAAAGTTTTGAGGGTTTAATCATTGT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL6138Contig1 517 2 1 U
GAGTGGTGGATGCTTCTTGCAGCTCAGAGCATGGCTATTGGTACTGTGATGGTTCGATGG
GCCTCAAAATACTCTGATCCAATCATGGCAACCGGCTGGCATATGGTTATCGGTGGCCTT
CCTCTTCTTGCTATATCCGTTATAAACAATGACCCAGTTTTCAACGGCAGTCTTCAAGAA
CTATCCACAAATGATATCATAGCACTTCTCTACACATCTATATTTGGCAGTGCGGTTAGC
TACGGTGTTTACTTCTACAGCGCTACTAAAGGAAGCTTGACTAAACTCAGCTCACTCACC
TTCTTGACACCAATGTTTGCGTCAATCTTTGGGTATCTATACCTTGATGAGACTTTCTCT
TCACTGCAACTGGTTGGAGCAGCCGTCACTTTGGTCGCTATATACTTGGTCAACTTTCCA
GAAGGCAGCGATTGATAAACACACTCAGTTTTCAAAGCTTCTTATGAATGTTAAAACCTT
ACATTTGTATATATAATAAAGTGAATAATCATAGGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EF67JQ C 1
AF RR2EF67TF U 1
BS 1 517 RR2EF67TF

RD RR2EF67JQ 517 0 0
GAGTGGTGGATGCTTCTTGCAGCTCAGAGCATGGCTATTGGTACTGTGATGGTTCGATGG
GCCTCAAAATACTCTGATCCAATCATGGCAACCGGCTGGCATATGGTTATCGGTGGCCTT
CCTCTTCTTGCTATATCCGTTATAAACAATGACCCAGTTTTCAACGGCAGTCTTCAAGAA
CTATCCACAAATGATATCATAGCACTTCTCTACACATCTATATTTGGCAGTGCGGTTAGC
TACGGTGTTTACTTCTACAGCGCTACTAAAGGAAGCTTGACTAAACTCAGCTCACTCACC
TTCTTGACACCAATGTTTGCGTCAATCTTTGGGTATCTATACCTTGATGAGACTTTCTCT
TCACTGCAACTGGTTGGAGCAGCCGTCACTTTGGTCGCTATATACTTGGTCAACTTTCCA
GAAGGCAGCGATTGATAAACACACTCAGTTTTCAAAGCTTCTTATGAATGTTAAAACCTT
ACATTTGTATATATAATAAAGTGAATAATCATAGGCC

QA 1 517 1 517
DS 

RD RR2EF67TF 517 0 0
GAGTGGTGGATGCTTCTTGCAGCTCAGAGCATGGCTATTGGTACTGTGATGGTTCGATGG
GCCTCAAAATACTCTGATCCAATCATGGCAACCGGCTGGCATATGGTTATCGGTGGCCTT
CCTCTTCTTGCTATATCCGTTATAAACAATGACCCAGTTTTCAACGGCAGTCTTCAAGAA
CTATCCACAAATGATATCATAGCACTTCTCTACACATCTATATTTGGCAGTGCGGTTAGC
TACGGTGTTTACTTCTACAGCGCTACTAAAGGAAGCTTGACTAAACTCAGCTCACTCACC
TTCTTGACACCAATGTTTGCGTCAATCTTTGGGTATCTATACCTTGATGAGACTTTCTCT
TCACTGCAACTGGTTGGAGCAGCCGTCACTTTGGTCGCTATATACTTGGTCAACTTTCCA
GAAGGCAGCGATTGATAAACACACTCAGTTTTCAAAGCTTCTTATGAATGTTAAAACCTT
ACATTTGTATATATAATAAAGTGAATAATCATAGGCC

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 2

CO CL6139Contig1 946 2 4 U
ACTGCAACAAGATGGTTCGTGTTACTAACGTAGTACAAAAATAGATGTATAAGTGATTAA
TTTAGACAAATTTCTATAGCTAAAACACACTCAAATTTCTCTCCTCTCACGTTACATTGT
GATTTGGTATTGCACGCCAAGTGAAACTTTCTTGAAGTGTGTAGTCAAACACTTTGACAA
ACTCATAACTCTACCATCTGCGAGCTCCACCAGTGGTTCGTGTAGCAATATAGTTTCTAA
GAAAAGGAGACTGAGTAAGACCATCTGGTGCAACTGTGGTGTTCTGAGTACCATTCTTCT
TCTTCATCCTCCTTCTTGCTACGTAACCTCTAACCCAAGGAGTTACATCCTCGTTGGTCT
TTATCATTATGAAGAAAATGATGCGGTAGATGATTATCATGCTAAGAATCACACTGAGGT
TAATCCATTTTGATCGGTGCAAGTTGATCTGGAAGACGTTTTCCAGAACGTATTCACCTG
GAATCTTGAAAGCACTCCCTTGGCTGTCAAACATCAAGCCTCTCAGATCATTCTGGTATT
GACCTTGTAACGCCCAGAAGTGGAAACTAATATATGACATTGGGTAACGCCAGAAAGGTT
TTGGGATGTCATTTGGTAGCCTGAAGAATCCAGACACCAGCATGAAGATCCCCTGAATAC
CAGCTCCAATGATGATACCCATGAGGAAGTTTGGAACAATACTAGCTATCGCCATCATCA
AGCTCTCCACAACGGTGACACTTGCATAGAGGCAGAGAACAAAGAAAAGGTAGTGAGTGA
ATCCAGGATGCAGACCAACCATGAAGTAACATATTGTCCCGGAGATGAAAGTTGTGATGA
TCAAGAACGGAGTTGCAGCTAGTGTATTGGCTATCACAAACGAAGCTACTCCATAGTGAC
CGTTTAGCCTCTCTCTTTGGAACACCTTCATGTCTTCAACAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG32JQ U 1
AF RR2A044TF C 131
BS 1 259 RR2FG32JQ
BS 260 260 RR2A044TF
BS 261 729 RR2FG32JQ
BS 730 946 RR2A044TF

RD RR2FG32JQ 729 0 0
ACTGCAACAAGATGGTTCGTGTTACTAACGTAGTACAAAAATAGATGTATAAGTGATTAA
TTTAGACAAATTTCTATAGCTAAAACACACTCAAATTTCTCTCCTCTCACGTTACATTGT
GATTTGGTATTGCACGCCAAGTGAAACTTTCTTGAAGTGTGTAGTCAAACACTTTGACAA
ACTCATAACTCTACCATCTGCGAGCTCCACCAGTGGTTCGTGTAGCAATATAGTTTCTAA
GAAAAGGAGACTGAGTAAGGCCATCTGGTGCAACTGTGGTGTTCTGAGTACCATTCTTCT
TCTTCATCCTCCTTCTTGCTACGTAACCTCTAACCCAAGGAGTTACATCCTCGTTGGTCT
TTATCATTATGAAGAAAATGATGCGGTAGATGATTATCATGCTAAGAATCACACTGAGGT
TAATCCATTTTGATCGGTGCAAGTTGATCTGGAAGACGTTTTCCAGAACGTATTCACCTG
GAATCTTGAAAGCACTCCCTTGGCTGTCAAACATCAAGCCTCTCAGATCATTCTGGTATT
GACCTTGTAACGCCCAGAAGTGGAAACTAATATATGACATTGGGTAACGCCAGAAAGGTT
TTGGGATGTCATTTGGTAGCCTGAAGAATCCAGACACCAGCATGAAGATCCCCTGAATAC
CAGCTCCAATGATGATACCCATGAGGAAGTTTGGAACAATACTAGCTATCGCCATCATCA
AGCTCTCCA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2A044TF 816 0 0
TGCACGCCAAGTGAAACTTTCTTGAAGTGTGTAGTCAAACACTTTGACAAACTTATAACT
CTACCATCTGCGAGCTCCACCAGTGGTTCGTGTAGCAATATAGTTTCTAAGAGAAGGAGA
CTGAGTAAGACCATCTGGTGCAACTGTGGTGTTCTGAGTACCATTCTTCTTCTTCATCCT
CCTTCTTGCTACGTAACCTCTAACCCAAGGAGTTACATCCTCGTTGGTCTTTATCATTAT
GAAGAAAATGATGCGGTAGATGATTATCATGCTAAGAATCACACTGAGGTTAATCCATTT
TGATCGGTGCAAGTTGATCTGGAAGACGTTTTCCAGAACGTATTCACCTGGAATCTTGAA
AGCACTCCCTTGGCTGTCAAACATCAAGCCTCTCAGATCATTCTGGTATTGACCTTGTAA
CGCCCAGAAGTGGAAACTAATATATGACATTGGGTAACGCCAGAAAGGTTTTGGGATGTC
ATTTGGTAGCCTGAAGAATCCAGACACCAGCATGAAGATCCCCTGAATACCAGCTCCAAT
GATGATACCCATGAGGAAGTTTGGAACAATACTAGCTATCGCCGTCATCAAGCTCTCCAC
AACGGTGACACTTGCATAGAGGCAGAGAACAAAGAAAAGGTAGTGAGTGAATCCAGGATG
CAGACCAACCATGAAGTAACATATTGTCCCGGAGATGAAAGTTGTGATGATCAAGAACGG
AGTTGCAGCTAGTGTATTGGCTATCACAAACGAAGCTACTCCATAGTGACCGTTTAGCCT
CTCTCTTTGGAACACCTTCATGTCTTCAACAAACCC

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

CO CL6140Contig1 786 2 10 U
GCTACGCAGCCGTCTCCCTCAGGCCGTCCTTGGCCAGGGATACGGTATGACAGAGGCAGG
ACCAGTGTTGTCAATGAGCCTTGGGTTTGCTAAAGAGCCAATTCCGTCAAAATCAGGCTC
TTGTGGGACTGTTGTCCGAAACGCAGAGCTTAAAGTGGTTCACCTTGAGACACGTCTCTC
TCTTGGCTACAACCAAACTGGTGAGATTTGTATCCGTGGTCAACAAATCATGAAAGAGTA
CTTGAAGGATCCGGAAGCCACGTCAGCTACAATTGACGAGGAAGGTTGGCTTCACACAGG
GGACATTGGGTATGTTGATGAAGATGACGAGATATTCATTGTTGATCGACTCAAAGAGGT
CATCAAGTTCAAAGGCTTTCAGGTGCCTCCGGCTGAGCTAGAGGCTTTGCTCATCAATCA
CCACTCTATTGCGGATGCTGCGGTTGTTCCTCAAAGAGATGAAGTGGCTGGAGAAGTTCC
GGTGGCTTTCGTAGTCCGATCAAATGGAAACGTCATCACGGAAGAAGATATAAAAGAATA
TGTATCCAAACAGGTGGTATTCTACAAGAGATTGCACAAGGTCTTCTTTGTTCCCTCCAT
TCCCAAATCTCCTTCCGGAAAAATTCTGAGAAAGGATCTTAAAGCCAAACTCTGTTGAAT
GTAATTTATTTATTTTTCTTTAATATGATTTAAATGTCCTTCTGTATTCACGATATTCGT
GACTTCCTTTTAGATCCTTTGTCGCAACATGTGTTGACAATTATGAGTTTAATAATCTAT
TATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF57TF U 1
AF RR2GF57JQ C 182
BS 1 622 RR2GF57TF
BS 623 623 RR2GF57JQ
BS 624 663 RR2GF57TF
BS 664 664 RR2GF57JQ
BS 665 682 RR2GF57TF
BS 683 683 RR2GF57JQ
BS 684 690 RR2GF57TF
BS 691 691 RR2GF57JQ
BS 692 724 RR2GF57TF
BS 725 786 RR2GF57JQ

RD RR2GF57TF 724 0 0
GCTACGCAGCCGTCTCCCTCAGGCCGTCCTTGGCCAGGGATACGGTATGACAGAGGCAGG
ACCAGTGTTGTCAATGAGCCTTGGGTTTGCTAAAGAGCCAATTCCGTCAAAATCAGGCTC
TTGTGGGACTGTTGTCCGAAACGCAGAGCTTAAAGTGGTTCACCTTGAGACACGTCTCTC
TCTTGGCTACAACCAAACTGGTGAGATTTGTATCCGTGGTCAACAAATCATGAAAGAGTA
CTTGAAGGATCCGGAAGCCACGTCAGCTACAATTGACGAGGAAGGTTGGCTTCACACAGG
GGACATTGGGTATGTTGATGAAGATGACGAGATATTCATTGTTGATCGACTCAAAGAGGT
CATCAAGTTCAAAGGCTTTCAGGTGCCTCCGGCTGAGCTAGAGGCTTTGCTCATCAATCA
CCACTCTATTGCGGATGCTGCGGTTGTTCCTCAAAGAGATGAAGTGGCTGGAGAAGTTCC
GGTGGCTTTCGTAGTCCGATCAAATGGAAACGTCATCACGGAAGAAGATATAAAAGAATA
TGTATCCAAACAGGTGGTATTCTACAAGAGATTGCACAAGGTCTTCTTTGTTCCCTCCAT
TCCCAAATCTCCTTCCGGAAAA*TTCTGAGAAAGGATCTTAAAGCCAAACTCTGTTGAAT
GTA*TTTATTTATTTTTCTTTA*TATGATT*AAATGTCCTTCTGTATTCACGATATTCGT
GACT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2GF57JQ 605 0 0
CTTGGCTACAACCAAACTGGTGAGATTTGTATCCGTGGTCAACAAATCATGAAAGAGTAC
TTGAAGGATCCGGAAGCCACGTCAGCTACAATTGACGAGGAAGGTTGGCTTCACACAGGG
GACATTGGGTATGTTGATGAAGATGACGAGATATTCATTGTTGATCGACTCAAAGAGGTC
ATCAAGTTCAAAGGCTTTCAGGTGCCTCCGGCTGAGCTAGAGGCTTTGCTCATCAATCAC
CACTCTATTGCGGATGCTGCGGTTGTTCCTCAAAGAGATGAAGTGGCTGGAGAAGTTCCG
GTGGCTTTCGTAGTCCGATCAAATGGAAACGTCATCACGGAAGAAGATATAAAAGAATAT
GTATCCAAACAGGTGGTATTCTACAAGAGATTGCACAAGGTCTTCTTTGTTCCCTCCATT
CCCAAATCTCCTTCCGGAAAAATTCTGAGAAAGGATCTTAAAGCCAAACTCTGTTGAATG
TAATTTATTTATTTTTCTTTAATATGATTTAAATGTCCTTCTGTATTCACGATATTCGTG
ACTTCCTTTTAGATCCTTTGTCGCAACATGTGTTGACAATTATGAGTTTAATAATCTATT
ATTGG

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL6141Contig1 860 2 4 U
GTCCAGGCTTGAGGAAGCTTTCGGAGCACCGGTTCTTGAGGCTTATGCTATGACGGAAGC
AACTCACCTGATGAGTTCTAATCCCTTACCGGAGGAAGGTCCACACAAGCCTGGGTCTGT
TGGGAAACCGGTGGGTCAAGAAATGGCGATCCTTAATGAGAAAGGGGAGATACAAGAGCC
AAATAGCAAGGGAGAGGTTTGTATTAGAGGCCCAAATGTGACAAAGGGTTACAAGAACAA
CCCGGAGGCCAACAAGGCGGGTTTCGAGTTTGGGTGGTTCCACACTGGTGATATTGGTTA
CTTTGATTCTGAAGGGTATTTGCATCTGGTGGGTCGGATCAAAGAGCTTATTAACCGTGG
AGGTGAGAAAATATCCCCAATTGAAGTGGATTCAGTGCTCTTAACTCATCCTGATGTTTC
TCAAGGAGTTGCGTTCGGGGTTCCTGATGAGAAATATGGAGAAGAGATTAACTGTGCGGT
GATTCCAAGAGAAGGAACAACAGTGACGGAAGAGGACATAAAAACGTTCTGTAAGAAGAA
TTTGGCAGCTTTCAAGGTGCCAAAGAGAGTGTTCATCACTGATAGCCTCCCCAAAACTGC
CTCCGGTAAGATTCAGCGTCGTATCGTGGCCCAGCATTTCCTCGAAAAACCCTAAATAAA
ACACTGTACACCATCTTGCTGGAATCCTTCGGTGATGAGTCGTAGCTTGTTACTCGAGTG
GTTTTGCTCTCTCTATTTGTTTTTTTTTCCCTTTCGGGGTTTGTATGTTACGTTTCATAT
GTTATCAATGATTAAAAGTGAACATCTATCTTATTAAATCAGAAACATTACAACTTTTTC
TTAGTGGATTTTAAAAGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D964TF U 1
AF RR2D964JQ C 100
BS 1 648 RR2D964TF
BS 649 649 RR2D964JQ
BS 650 687 RR2D964TF
BS 688 860 RR2D964JQ

RD RR2D964TF 687 0 0
GTCCAGGCTTGAGGAAGCTTTCGGAGCACCGGTTCTTGAGGCTTATGCTATGACGGAAGC
AACTCACCTGATGAGTTCTAATCCCTTACCGGAGGAAGGTCCACACAAGCCTGGGTCTGT
TGGGAAACCGGTGGGTCAAGAAATGGCGATCCTTAATGAGAAAGGGGAGATACAAGAGCC
AAATAGCAAGGGAGAGGTTTGTATTAGAGGCCCAAATGTGACAAAGGGTTACAAGAACAA
CCCGGAGGCCAACAAGGCGGGTTTCGAGTTTGGGTGGTTCCACACTGGTGATATTGGTTA
CTTTGATTCTGAAGGGTATTTGCATCTGGTGGGTCGGATCAAAGAGCTTATTAACCGTGG
AGGTGAGAAAATATCCCCAATTGAAGTGGATTCAGTGCTCTTAACTCATCCTGATGTTTC
TCAAGGAGTTGCGTTCGGGGTTCCTGATGAGAAATATGGAGAAGAGATTAACTGTGCGGT
GATTCCAAGAGAAGGAACAACAGTGACGGAAGAGGACATAAAAACGTTCTGTAAGAAGAA
TTTGGCAGCTTTCAAGGTGCCAAAGAGAGTGTTCATCACTGATAGCCTCCCCAAAACTGC
CTCCGGTAAGATTCAGCGTCGTATCGTGGCCCAGCATTTCCTCGAAAA*CCCTAAATAAA
ACACTGTACACCATCTTGCTGGAATCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2D964JQ 761 0 0
TCCACACAAGCCTGGGTCTGTTGGGAAACCGGTGGGTCAAGAAATGGCGATCCTTAATGA
GAAAGGGGAGATACAAGAGCCAAATAGCAAGGGAGAGGTTTGTATTAGAGGCCCAAATGT
GACAAAGGGTTACAAGAACAACCCGGAGGCCAACAAGGCGGGTTTCGAGTTTGGGTGGTT
CCACACTGGTGATATTGGTTACTTTGATTCTGAAGGGTATTTGCATCTGGTGGGTCGGAT
CAAAGAGCTTATTAACCGTGGAGGTGAGAAAATATCCCCAATTGAAGTGGATTCAGTGCT
CTTAACTCATCCTGATGTTTCTCAAGGAGTTGCGTTCGGGGTTCCTGATGAGAAATATGG
AGAAGAGATTAACTGTGCGGTGATTCCAAGAGAAGGAACAACAGTGACGGAAGAGGACAT
AAAAACGTTCTGTAAGAAGAATTTGGCAGCTTTCAAGGTGCCAAAGAGAGTGTTCATCAC
TGATAGCCTCCCCAAAACTGCCTCCGGTAAGATTCAGCGTCGTATCGTGGCCCAGCATTT
CCTCGAAAAACCCTAAATAAAACACTGTACACCATCTTGCTGGAATCCTTCGGTGATGAG
TCGTAGCTTGTTACTCGAGTGGTTTTGCTCTCTCTATTTGTTTTTTTTTCCCTTTCGGGG
TTTGTATGTTACGTTTCATATGTTATCAATGATTAAAAGTGAACATCTATCTTATTAAAT
CAGAAACATTACAACTTTTTCTTAGTGGATTTTAAAAGTGG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL6142Contig1 827 2 2 U
GGATGACGGCAGTTTCAGAGGTTTTGGCCATGTTGAGTTTGCAACTGCTGAACAAGCACA
AAAGGCACTGGAGCCTCACGGTACATCCATGCTTGGTCGTGATATCCGTCTTGATGTTGC
TCAAGAGAGGGGAGAGAGACCCGCATACACTCCACAAAACGGTGCCGGTGGAAGAAGCGG
TGGTGGAGGTCAATCCATTTTCGTTAAGGGATTTGACTCTTCTCTTCCTGAAGAAGACAT
CAAGAGCGCATTGACTAAACACTTTTCTTCATGTGGAGAGATCACAAGGGTTTCTGTTCC
CTGTGACCGTGAAACCGGATCTTCCAAAGGAATTGCTTTCCTTGATTTTCAAGAAGGCGC
AGACAAGGCGTTGGACCTTAATGGTAGTGACATGGGAGGATGGAGTCTTGTTGTTGATCA
ACCGAGGGAGAAGACTAGTGGAGGATTCAGTGGTGGCGGAAGGAGCGGTGGTAGAGGAAG
AGATAGTGGTGGTCGTTTTGGTGGAAGGAGCGGTGGTGGTAGAGGAAGAGATGGTGGCCG
TGGTCGTTTTGGTGGTGGAAGGGGCGGTGGCAGAGGAAGAGATGGAGGTCGTGGATACAA
ACCTAGTTTCACTCACTCATCAGGTAAGAAGACTACCTTTAACGACGAGTAGAAGCTTTA
TATGTAGGAAGAAAATGCTCTTCTTATGTCCTTTTAACTTATGATACTTCACATCTCCTT
TCTATTGTTTCAGTTTTGTTTCTGTTCTAGTTATGTTTTTGTCCGAACCTTCAATTTTTG
TCTCAATGTTAAATCAAAGCTCAATCTTGAGTTCTCTTTTTGGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK96TF U 1
AF RR2DK96JQ C 133
BS 1 620 RR2DK96TF
BS 621 827 RR2DK96JQ

RD RR2DK96TF 620 0 0
GGATGACGGCAGTTTCAGAGGTTTTGGCCATGTTGAGTTTGCAACTGCTGAACAAGCACA
AAAGGCACTGGAGCCTCACGGTACATCCATGCTTGGTCGTGATATCCGTCTTGATGTTGC
TCAAGAGAGGGGAGAGAGACCCGCATACACTCCACAAAACGGTGCCGGTGGAAGAAGCGG
TGGTGGAGGTCAATCCATTTTCGTTAAGGGATTTGACTCTTCTCTTCCTGAAGAAGACAT
CAAGAGCGCATTGACTAAACACTTTTCTTCATGTGGAGAGATCACAAGGGTTTCTGTTCC
CTGTGACCGTGAAACCGGATCTTCCAAAGGAATTGCTTTCCTTGATTTTCAAGAAGGCGC
AGACAAGGCGTTGGACCTTAATGGTAGTGACATGGGAGGATGGAGTCTTGTTGTTGATCA
ACCGAGGGAGAAGACTAGTGGAGGATTCAGTGGTGGCGGAAGGAGCGGTGGTAGAGGAAG
AGATAGTGGTGGTCGTTTTGGTGGAAGGAGCGGTGGTGGTAGAGGAAGAGATGGTGGCCG
TGGTCGTTTTGGTGGTGGAAGGGGCGGTGGCAGAGGAAGAGATGGAGGTCGTGGATACAA
ACCTAGTTTCACTCACTCAT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2DK96JQ 695 0 0
AGAGAGACCCGCATACACTCCACAAAACGGTGCCGGTGGAAGAAGCGGTGGTGGAGGTCA
ATCCATTTTCGTTAAGGGATTTGACTCTTCTCTTCCTGAAGAAGACATCAAGAGCGCATT
GACTAAACACTTTTCTTCATGTGGAGAGATCACAAGGGTTTCTGTTCCCTGTGACCGTGA
AACCGGATCTTCCAAAGGAATTGCTTTCCTTGATTTTCAAGAAGGCGCAGACAAGGCGTT
GGACCTTAATGGTAGTGACATGGGAGGATGGAGTCTTGTTGTTGATCAACCGAGGGAGAA
GACTAGTGGAGGATTCAGTGGTGGCGGAAGGAGCGGTGGTAGAGGAAGAGATAGTGGTGG
TCGTTTTGGTGGAAGGAGCGGTGGTGGTAGAGGAAGAGATGGTGGCCGTGGTCGTTTTGG
TGGTGGAAGGGGCGGTGGCAGAGGAAGAGATGGAGGTCGTGGATACAAACCTAGTTTCAC
TCACTCATCAGGTAAGAAGACTACCTTTAACGACGAGTAGAAGCTTTATATGTAGGAAGA
AAATGCTCTTCTTATGTCCTTTTAACTTATGATACTTCACATCTCCTTTCTATTGTTTCA
GTTTTGTTTCTGTTCTAGTTATGTTTTTGTCCGAACCTTCAATTTTTGTCTCAATGTTAA
ATCAAAGCTCAATCTTGAGTTCTCTTTTTGGTGTT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL6143Contig1 591 2 1 U
GGAGGAGTGTTGACATTTGCAGATAATCGTGAGTTGTGATCTCTACTTTAGGTTAGAAGA
AGGAGAAGAGAGGAGGAATGGCGAACAAGATTGCAATGCTGGTCTCGGAAGCAATGAACA
GCAACGCTGTGATAAACACGTGTCTTTGAGTATCGTTTGTAGTTCTGGGGCTGAGATCTG
ATAAACAGCAAAAGTATGTCGAGGCTTTGCAGGAGCAGAAAGATTCGCTCTCCAAGTCTA
ACAAGGATATGAAAGTTACAATGTGGGATTGGAAACAACAGCTCTTCGCTGAAGCCACCT
CTGCTGGTACTTCCGCTGTTGTTCCTCTCTCCACTCTTAAGGCCATCTATGGAGAAGTCA
CCGCAACCACCCAATCTGGTGAAGCAGTCAAAGAAGAGTCTAAAGTGTCTACCCCCAGGA
TCATGGTTTGAGAGGATTTTAGTCTCGTCATTTTCATTTGTAATCATCAAACTGTCTGTT
GTTGTGATTCTAAAATAAGGTAAGACCCTCTGATATGGGATTGTGGTTAAGGCTTTTCAT
TATTGGAACCCATTGGTTGAAAGTGGGACTTGCATGAAGAATTGATGACTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DL87JQ C 1
AF RR2DL87TF U 1
BS 1 591 RR2DL87TF

RD RR2DL87JQ 591 0 0
GGAGGAGTGTTGACATTTGCAGATAATCGTGAGTTGTGATCTCTACTTTAGGTTAGAAGA
AGGAGAAGAGAGGAGGAATGGCGAACAAGATTGCAATGCTGGTCTCGGAAGCAATGAACA
GCAACGCTGTGATAAACACGTGTCTTTGAGTATCGTTTGTAGTTCTGGGGCTGAGATCTG
ATAAACAGCAAAAGTATGTCGAGGCTTTGCAGGAGCAGAAAGATTCGCTCTCCAAGTCTA
ACAAGGATATGAAAGTTACAATGTGGGATTGGAAACAACAGCTTTTCGCTGAAGCCACCT
CTGCTGGTACTTCCGCTGTTGTTCCTCTCTCCACTCTTAAGGCCATCTATGGAGAAGTCA
CCGCAACCACCCAATCTGGTGAAGCAGTCAAAGAAGAGTTTAAAGTGTCTACCCCCAGGA
TCATGGTTTGAGAGGATTTTAGTCTCGTCATTTTCATTTGTAATCATCAAACTGTCTGTT
GTTGTGATTCTAAAATAAGGTAAGACCCTCTGATATGGGATTGTGGTTAAGGCTTTTCAT
TATTGGAACCCATTGGTTGAAAGTGGGACTTGCATGAAGAATTGATGACTG

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2DL87TF 591 0 0
GGAGGAGTGTTGACATTTGCAGATAATCGTGAGTTGTGATCTCTACTTTAGGTTAGAAGA
AGGAGAAGAGAGGAGGAATGGCGAACAAGATTGCAATGCTGGTCTCGGAAGCAATGAACA
GCAACGCTGTGATAAACACGTGTCTTTGAGTATCGTTTGTAGTTCTGGGGCTGAGATCTG
ATAAACAGCAAAAGTATGTCGAGGCTTTGCAGGAGCAGAAAGATTCGCTCTCCAAGTCTA
ACAAGGATATGAAAGTTACAATGTGGGATTGGAAACAACAGCTCTTCGCTGAAGCCACCT
CTGCTGGTACTTCCGCTGTTGTTCCTCTCTCCACTCTTAAGGCCATCTATGGAGAAGTCA
CCGCAACCACCCAATCTGGTGAAGCAGTCAAAGAAGAGTCTAAAGTGTCTACCCCCAGGA
TCATGGTTTGAGAGGATTTTAGTCTCGTCATTTTCATTTGTAATCATCAAACTGTCTGTT
GTTGTGATTCTAAAATAAGGTAAGACCCTCTGATATGGGATTGTGGTTAAGGCTTTTCAT
TATTGGAACCCATTGGTTGAAAGTGGGACTTGCATGAAGAATTGATGACTG

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL6144Contig1 1003 2 4 U
ATCACAAGTATAAATTATTCTTCATCAGCTTACATCGTACAAATATGACTCGTTATATCT
GGCAATCTTATACACAACAAAACAAAATTTTGCAACTTGTTGGCCCTAACTACAACATCA
AAATGTGTTTACAAGCCCTATGCCTACCTCTTCGGCGAGTTCGTCCCATACAGGCAGGAG
TATCAAAACCACCAGAATAATTGCAGTCCCGACAAGTGCCTTCCTCCATGTTCCAACCTC
GGTCACATCGTTCAGGCATGCTTTTTCGGGTGTTCTCTGGCAGATTAGCACGTAGAGACC
CCAAGGAAGTGCCAAAGGGCCACCGAGCACTCTGAGTCCAAGCATTACATAGGTTGACAA
ACCAAATGTAAACAGTACATTTTTCCCAAATGCGCCCTGTACAGCTCTTCCTCCATCCAA
ACACCCAACAGGAAGCATATTAAAAGCCGTTGTTGTTAAACCACACCATCCAGCAATAAC
AAGCGGGTGGATCGAAACTGTTGTAGCATGCATAGCTGCGTATCCCAGGGTTGCTCGGCT
GATGAGTCCAAGAAGTAATGAACCTTGGAATAACATGCTGGGGACCTGCACCAGATCGCT
AGCTGCATCTGGGTTAGTAGATAGAAACAGACCAACAGCAAACATGGAAACTGAGAGTGC
AGCTCCAGCAAATGGACCAGCTAGCGAAATGTCAACTTTTGTACTCCGGTCGGGAAGAAT
CGACTTGAACTGTGTGATTGCACCAAAACTGCCGAGTGTAATGTTTGGAATGAAGTAAGG
AATGCTAAGCTTTACTTTCTTTGGAACTGCAGCAAGAAAGTGCCCCAATTCATGAAACAA
AAGAATTCCCAAGACACCATATGCCAAAGGCAATGCAGAATCTACAAACGGATACAAAAG
CTCCATATCAGGTGGTTCAACAGCATTTGGATCGGTGAAATACCTTACCACCTCAGGAGG
TAAACGGTTAATCTGAGAAGCAATTCCCAATTCTACAGAGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP84JQ U 1
AF RR2AF77TF C 226
BS 1 779 RR2EP84JQ
BS 780 780 RR2AF77TF
BS 781 806 RR2EP84JQ
BS 807 1003 RR2AF77TF

RD RR2EP84JQ 806 0 0
ATCACAAGTATAAATTATTCTTCATCAGCTTACATCGTACAAATATGACTCGTTATATCT
GGCAATCTTATACACAACAAAACAAAATTTTGCAACTTGTTGGCCCTAACTACAACATCA
AAATGTGTTTACAAGCCCTATGCCTACCTCTTCGGCGAGTTCGTCCCATACAGGCAGGAG
TATCAAAACCACCAGAATAATTGCAGTCCCGACAAGTGCCTTCCTCCATGTTCCAACCTC
GGTCACATCGTTCAGGCATGCTTTTTCGGGTGTTCTCTGGCAGATTAGCACGTAGAGACC
CCAAGGAAGTGCCAAAGGGCCACCGAGCACTCTGAGTCCAAGCATTACATAGGTTGACAA
ACCAAATGTAAACAGTACATTTTTCCCAAATGCGCCCTGTACAGCTCTTCCTCCATCCAA
ACACCCAACAGGAAGCATATTAAAAGCCGTTGTTGTTAAACCACACCATCCAGCAATAAC
AAGCGGGTGGATCGAAACTGTTGTAGCATGCATAGCTGCGTATCCCAGGGTTGCTCGGCT
GATGAGTCCAAGAAGTAATGAACCTTGGAATAACATGCTGGGGACCTGCACCAGATCGCT
AGCTGCATCTGGGTTAGTAGATAGAAACAGACCAACAGCAAACATGGAAACTGAGAGTGC
AGCTCCAGCAAATGGACCAGCTAGCGAAATGTCAACTTTTGTACTCCGGTCGGGAAGAAT
CGACTTGAACTGTGTGATTGCACCAAAACTGCCGAGTGTAATGTTTGGAATGAAGTAAG*
AATGCTAAGCTTTACTTTCTTTGGAA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2AF77TF 778 0 0
CCATGTTCCAAC*TCGGTCACATCGTTCAGGCATGCTTTTTCGGGTGTTCTCTGGCAGAT
TAGCACGTAGAGACCCCAAGGAAGTGCCAAAGGGCCACCGAGCACTCTGAGTCCAAGCAT
TACATAGGTTGACAAACCAAATGTAAACAGTACATTTTTCCCAAATGCGCCCTGTACAGC
TCTTCCTCCATCCAAACACCCAACAGGAAGCATATTAAAAGCCGTTGTTGTTAAACCACA
CCATCCAGCAATAACAAGCGGGTGGATCGAAACTGTTGTAGCATGCATAGCTGCGTATCC
CAGGGTTGCTCGGCTGATGAGTCCAAGAAGTAATGAACCTTGGAATAACATGCTGGGGAC
CTGCACCAGATCGCTAGCTGCATCTGGGTTAGTAGATAGAAACAGACCAACAGCAAACAT
GGAAACTGAGAGTGCAGCTCCAGCAAATGGACCAGCTAGCGAAATGTCAACTTTTGTACT
CCGGTCGGGAAGAATCGACTTGAACTGTGTGATTGCACCAAAACTGCCGAGTGTAATGTT
TGGAATGAAGTAAGGAATGCTAAGCTTTACTTTCTTTGGAACTGCAGCAAGAAAGTGCCC
CAATTCATGAAACAAAAGAATTCCCAAGACACCATATGCCAAAGGCAATGCAGAATCTAC
AAACGGATACAAAAGCTCCATATCAGGTGGTTCAACAGCATTTGGATCGGTGAAATACCT
TACCACCTCAGGAGGTAAACGGTTAATCTGAGAAGCAATTCCCAATTCTACAGAGGGC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL6145Contig1 710 2 1 U
GACAAGACTCTTTACTACGACGTTGATCTGTTTCTGTTCTATATTCTGTGTGAATGTGAT
GATCGGGGTTGCCACATGGTTGGATACTTCTCAAAGGAAAAGCATTCTGAAGAAGCGTAC
AACTTGGCTTGCATCCTTCCCCTTCCTCCATATCAAAGGAAAGGCTATGGCAAATTCTTA
ATAGCCTTCTCCTATGAACTTTCAAAGAAAGAGGGTAAAGTGGGGACACCAGAAAGACCC
CTCTCTGATTTAGGCTTAGTGAGTTACAGAGGTTACTGGACTCGGATTCTATTAGACATC
TTGAAGAAGCACAAGGGGAACATATCTATCAAGGATCTGAGCGACATGACAGCGATCAAA
GCAGAAGATATACTAAGCACCCTTCAGAGCTTGGAACTGATACAGTACAGGAAAGGACAA
CACGTGATCTGCGCTGATCCTAAAGTACTGGACCGACATTTGAAAGCAGCAGGCCGAGGT
GGTCTTGATGTAGACGTTAGCAAAATGATATGGACTCCTTACAAAGAGCAGAGCTAAGGG
TGAGTGGGAAGAGCACTATATTTCAAATGGTATGGTGTTCTTTTAGATGACTTTGCAGAT
CCTTCTAGATTGACTTTTGTCTGTAAAAATCTTAACACCACTTTGTTCAGTTTATCTTCT
TGTAATCTTGTCTGAATGGTATTACCACTAAGTGTTTCATTCTTGTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B415JQ C 1
AF RR2B415TF U 1
BS 1 710 RR2B415TF

RD RR2B415JQ 710 0 0
GACAAGACTCTTTACTACGACGTTGATCTGTTTCTGTTCTATATTCTGTGTGAATGTGAT
GATCGGGGTTGCCACATGGTTGGATACTTCTCAAAGGAAAAGCATTCTGAAGAAGCGTAC
AACTTGGCTTGCATCCTTCCCCTTCCTCCATATCAAAGGAAAGGCTATGGCAAATTCTTA
ATAGCCTTCTCCTATGAACTTTCAAAGAAAGAGGGTAAAGTGGGGACACCAGAAAGACCC
CTCTCTGATTTAGGCTTAGTGAGTTACAGAGGTTACTGGACTCGGATTCTATTAGACATC
TTGAAGAAGCACAAGGGGAACATATCTATCAAGGATCTGAGCGACATGACAGCGATCAAA
GCAGAAGATATACTAAGCACCCTTCAGAGCTTGGAACTGATACAGTACAGGAAAGGACAA
CACGTGATCTGCGCTGATCCTAAAGTACTGGACCGACATTTGAAAGCAGCAGGCCGAGGT
GGTCTTGATGTAGACGTTAGCAAAATGATATGGACTCCTTACAAAGAGCAGAGCTAAGGG
TGAGTGGGAAGAGCACTATATTTCAAATGGTATGGTGTTCTTTTAGATGACTTTGCAGAT
CCTTCTAGATTGACTTTTGTCTGTAAAAATCTTAACACCACTTTGTTCAGTTTATCTTCT
TGTAATCTTGTCTGAATGGTATTACCACTAAGTGTTTCATTCTTGTTTCC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2B415TF 710 0 0
GACAAGACTCTTTACTACGACGTTGATCTGTTTCTGTTCTATATTCTGTGTGAATGTGAT
GATCGGGGTTGCCACATGGTTGGATACTTCTCAAAGGAAAAGCATTCTGAAGAAGCGTAC
AACTTGGCTTGCATCCTTCCCCTTCCTCCATATCAAAGGAAAGGCTATGGCAAATTCTTA
ATAGCCTTCTCCTATGAACTTTCAAAGAAAGAGGGTAAAGTGGGGACACCAGAAAGACCC
CTCTCTGATTTAGGCTTAGTGAGTTACAGAGGTTACTGGACTCGGATTCTATTAGACATC
TTGAAGAAGCACAAGGGGAACATATCTATCAAGGATCTGAGCGACATGACAGCGATCAAA
GCAGAAGATATACTAAGCACCCTTCAGAGCTTGGAACTGATACAGTACAGGAAAGGACAA
CACGTGATCTGCGCTGATCCTAAAGTACTGGACCGACATTTGAAAGCAGCAGGCCGAGGT
GGTCTTGATGTAGACGTTAGCAAAATGATATGGACTCCTTACAAAGAGCAGAGCTAAGGG
TGAGTGGGAAGAGCACTATATTTCAAATGGTATGGTGTTCTTTTAGATGACTTTGCAGAT
CCTTCTAGATTGACTTTTGTCTGTAAAAATCTTAACACCACTTTGTTCAGTTTATCTTCT
TGTAATCTTGTCTGAATGGTATTACCACTAAGTGTTTCATTCTTGTTTCC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL6146Contig1 835 2 2 U
GGGCCGATAAGACTCCGTCTTCGCCGCTACTCCGCCTCCGCTTCGATCTGGATTGAATTA
GAGAGAGATAAAACGATGGATCCGATGGATATAGTTGGAAAATCTAAGGAAGATGCTTCG
CTTCCAAAAGCTACAATGACTAAAATTATAAAGGAGATGTTACCAGCAGATGTTCGTGTT
GCTAGAGATGCTCAAGATCTTCTCATCGAGTGTTGTGTAGAGTTCATAAATCTGATATCG
TCAGAGTCTAATGAAGTCTGTAACAAAGAGGATAAACGAACAATCGCGCCTGAGCATGTG
CTCAAAGCGCTTCAGGTTCTTGGCTTTGGGGAATACGTTGAAGAAGTCTACGCTGCTTAT
GAGCAACATAAATACGAAACCATGCAAGATTCTCAGAGGAGTGTGAAGATGAACAGCGGA
GCAGAGATGACGGAGGAGGAAGCAGCGGCGGAACAACAGAGAATGTTTGCTGAAGCTCGA
GCTAGAATGAATGGTGGTGTTTCTGTTCCTCAACCAGATCAAGAGCAACAAGTGGATGAT
AATACCCAACAGTCGAATCTACAAAGCTAATCAAGAAGAAAGGGAGAATCCTTTTGTTTT
TAACATTATCCTTTTGACTTTATTTTTCTAGCGTTTCTTTGTAAAGTGCCAAAAAAAACA
TGGTCAGTCTTGGTGTTGATATGCTTTCCACATTTTAACTTAGATTCGTTTTTTTTCTTC
TCTCCTTCGAATCTAAAATCACTTGGTGATTCAGATGTAATTAGTAAGCATTGCCTTGTT
TTTTTGCAACTGTCAGATCCAGGTCCTTGTGTTTATAAGTTGATTGTTCTAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A791TF U 1
AF RR2A791JQ C 69
BS 1 653 RR2A791TF
BS 654 835 RR2A791JQ

RD RR2A791TF 653 0 0
GGGCCGATAAGACTCCGTCTTCGCCGCTACTCCGCCTCCGCTTCGATCTGGATTGAATTA
GAGAGAGATAAAACGATGGATCCGATGGATATAGTTGGAAAATCTAAGGAAGATGCTTCG
CTTCCAAAAGCTACAATGACTAAAATTATAAAGGAGATGTTACCAGCAGATGTTCGTGTT
GCTAGAGATGCTCAAGATCTTCTCATCGAGTGTTGTGTAGAGTTCATAAATCTGATATCG
TCAGAGTCTAATGAAGTCTGTAACAAAGAGGATAAACGAACAATCGCGCCTGAGCATGTG
CTCAAAGCGCTTCAGGTTCTTGGCTTTGGGGAATACGTTGAAGAAGTCTACGCTGCTTAT
GAGCAACATAAATACGAAACCATGCAAGATTCTCAGAGGAGTGTGAAGATGAACAGCGGA
GCAGAGATGACGGAGGAGGAAGCAGCGGCGGAACAACAGAGAATGTTTGCTGAAGCTCGA
GCTAGAATGAATGGTGGTGTTTCTGTTCCTCAACCAGATCAAGAGCAACAAGTGGATGAT
AATACCCAACAGTCGAATCTACAAAGCTAATCAAGAAGAAAGGGAGAATCCTTTTGTTTT
TAACATTATCCTTTTGACTTTATTTTTCTAGCGTTTCTTTGTAAAGTGCCAAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2A791JQ 767 0 0
TAAAACGATGGATCCGATGGATATAGTTGGAAAATCTAAGGAAGATGCTTCGCTTCCAAA
AGCTACAATGACTAAAATTATAAAGGAGATGTTACCAGCAGATGTTCGTGTTGCTAGAGA
TGCTCAAGATCTTCTCATCGAGTGTTGTGTAGAGTTCATAAATCTGATATCGTCAGAGTC
TAATGAAGTCTGTAACAAAGAGGATAAACGAACAATCGCGCCTGAGCATGTGCTCAAAGC
GCTTCAGGTTCTTGGCTTTGGGGAATACGTTGAAGAAGTCTACGCTGCTTATGAGCAACA
TAAATACGAAACCATGCAAGATTCTCAGAGGAGTGTGAAGATGAACAGCGGAGCAGAGAT
GACGGAGGAGGAAGCAGCGGCGGAACAACAGAGAATGTTTGCTGAAGCTCGAGCTAGAAT
GAATGGTGGTGTTTCTGTTCCTCAACCAGATCAAGAGCAACAAGTGGATGATAATACCCA
ACAGTCGAATCTACAAAGCTAATCAAGAAGAAAGGGAGAATCCTTTTGTTTTTAACATTA
TCCTTTTGACTTTATTTTTCTAGCGTTTCTTTGTAAAGTGCCAAAAAAAACATGGTCAGT
CTTGGTGTTGATATGCTTTCCACATTTTAACTTAGATTCGTTTTTTTTCTTCTCTCCTTC
GAATCTAAAATCACTTGGTGATTCAGATGTAATTAGTAAGCATTGCCTTGTTTTTTTGCA
ACTGTCAGATCCAGGTCCTTGTGTTTATAAGTTGATTGTTCTAAATT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL6147Contig1 546 2 4 U
GGGATTCATTTTGGATATCTCTATCTCTAGTTTTAGTCGTCTTTGTTAGATCCATCGCTA
TATAAAGACTTCTATCGGTGAAGGAAGACATAAAGATATAGAGAGAAGAGAGACATGGGT
TCTTCACAGTTAAGTCAAGTACTCATTGTGCTTCTGCTTCTTTGCGTCCTTCCTTGCCTT
ATCGAATCTGCTATACCTTCTCACCAGCAACCACTTCCAGTCACCGGGAGAAGGTTGATG
AGTATTTATAGGCCAAATGGAGAAATATTTACAGGACCATCAGGCAGTGGACATGGTGGT
GGTCGCACTCCAGCCCCCTTGTCCTACAGCTAAAGCCGTGGACATTGTATGTGTTGGTTT
ATTAATGTAATTTGCAGTCTCTAAGCTCACAACTCTAGCTTTTAATTTCTTTCGATTTTA
TGTATATTGTATGTGTTGGTGTATTATGTATAATGTATGTGTTCTTAAGTTTCTGTTCTC
AAAGTCATGCTTTAACTTTTCATTGTGTATAAACTTAATGAATATTAAAAAAAGTGTTGG
GTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE12TF U 1
AF RR2BT54TF U 90
BS 1 156 RR2CE12TF
BS 157 157 RR2BT54TF
BS 158 532 RR2CE12TF
BS 533 546 RR2BT54TF

RD RR2CE12TF 532 0 0
GGGATTCATTTTGGATATCTCTATCTCTAGTTTTAGTCGTCTTTGTTAGATCCATCGCTA
TATAAAGACTTCTATCGGTGAAGGAAGACATAAAGATATAGAGAGAAGAGAGACATGGGT
TCTTCACAGTTAAGTCAAGTACTCATTGTGCTTCTGTTTCTTTGCGTCCTTCCTTGCCTT
ATCGAATCTGCTATACCTTCTCACCAGCAACCACTTCCAGTCACCGGGAGAAGGTTGATG
AGTATTTATAGGCCAAATGGAGAAATATTTACAGGACCATCAGGCAGTGGACATGGTGGT
GGTCGCACTCCAGCCCCCTTGTCCTACAGCTAAAGCCGTGGACATTGTATGTGTTGGTTT
ATTAATGTAATTTGCAGTCTCTAAGCTCACAACTCTAGCTTTTAATTTCTTTCGATTTTA
TGTATATTGTATGTGTTGGTGTATTATGTATAATGTATGTGTTCTTAAGTTTCTGTTCTC
AAAGTCATGCTTTAACTTTTCATTGTGTATAAACTTAATGAATATTAAAAAA

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2BT54TF 457 0 0
GG
AAAGATATAGAGAGAAGAGAGACATGGGTTCTTCACAGTTAAGTCAAGTACTCATTGTGC
TTCTGCTTCTTTGCGTCCTTCCTTGCCTTATCGAATCTGCTATACCTTCTCACCAGCAAC
CACTTCCAGTCACCGGGAGAAGGTTGATGAGTATTTATAGGCCAAATGGAGAAATATTTA
CAGGACCATCAGGCAGTGGACATGGTGGTGGTCGCACTCCAGCCCCCTTGTCCTACAGCT
AAAGCCGTGGACATTGTATGTGTTGGTTTATTAATGTAATTTGCAGTCTCTAAGCTCACA
ACTCTAGCTTTTAATTTCTTTCGATTTTATGTATATTGTATGTGTTGGTGTATTATGTAT
AGTGTATGTGTTCTTAAGTTTCTGTTCTCAAAGTCATGCTTTAACTTTTCATTGTGTATA
AACTTAATGAATATTAAAAAAAGTGTTGGGTTACT

QA 3 457 3 457
DS 



AS 1 2

CO CL6148Contig1 719 2 2 U
TTTTTTTTTCTCGCTATCCAGGTGAAAAAATCAGATGAACTCACATCTCTTCCGCGTAAT
CTGTATCCTCCACTCGGTAATCGCACTCACGAGTGGGACCCTGATGATGTTCTACACGGA
GAAAGCTTCCATCTTTGGCCACGGCAGCGACATAGCCAACAAGCTCAAAGGTTCGACGCC
TCACGACGAGCTGCTCATCCAGATCTCTCAGTCCTTCTCCGGTTTGCTCCTCTTTGCGAT
AGGTTTGGTGCTGTTCATGGTGTCGTTTGTTAAGGATAGAGAGTTTCATGGCTTCTTCGC
TGGAGGGTCTGTGGTTCTCTATGTGCTTATGGCTCTGTGGAGAGTTGTGTTTGAGTGGAA
GATTGAAGATCTTGCGTTTGAGTGTCCTAAGCAAGCGCTTGGAGATATTGCTTTGGCTGT
TTCTTGGGTGTTCTTCCTTGTTTATACTTGGAGGGAGAAGTATGATTGATTGATGCAAAA
CAAAAGATGAGGGGCTTTTATGGAAACTGGAGATTAAGAGAACCACTAGCTTTGCGTAGA
TCATACTATTGTCAGTTTCATAGTTGTCAGAAGATGATCAAGTGTGAAAAAAATTGGATT
TTGTAGTTGAAAATTAGAGAAAAATTGTCAATGACAATAATTTGGTTGTTTCATCTGAAA
AAAGCACATTGTAGAATCTGAGAGTGTAAATAATTTGTTGGTGAGACTATATCCCATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E559TF U 1
AF RR2E559JQ C 1
BS 1 585 RR2E559TF
BS 586 719 RR2E559JQ

RD RR2E559TF 585 0 0
TTTTTTTTTCTCGCTATCCAGGTGAAAAAATCAGATGAACTCACATCTCTTCCGCGTAAT
CTGTATCCTCCACTCGGTAATCGCACTCACGAGTGGGACCCTGATGATGTTCTACACGGA
GAAAGCTTCCATCTTTGGCCACGGCAGCGACATAGCCAACAAGCTCAAAGGTTCGACGCC
TCACGACGAGCTGCTCATCCAGATCTCTCAGTCCTTCTCCGGTTTGCTCCTCTTTGCGAT
AGGTTTGGTGCTGTTCATGGTGTCGTTTGTTAAGGATAGAGAGTTTCATGGCTTCTTCGC
TGGAGGGTCTGTGGTTCTCTATGTGCTTATGGCTCTGTGGAGAGTTGTGTTTGAGTGGAA
GATTGAAGATCTTGCGTTTGAGTGTCCTAAGCAAGCGCTTGGAGATATTGCTTTGGCTGT
TTCTTGGGTGTTCTTCCTTGTTTATACTTGGAGGGAGAAGTATGATTGATTGATGCAAAA
CAAAAGATGAGGGGCTTTTATGGAAACTGGAGATTAAGAGAACCACTAGCTTTGCGTAGA
TCATACTATTGTCAGTTTCATAGTTGTCAGAAGATGATCAAGTGT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2E559JQ 719 0 0
TTTTTTTTTCTCGCTATCCAGGTGAAAAAATCAGATGAACTCACATCTCTTCCGCGTAAT
CTGTATCCTCCACTCGGTAATCGCACTCACGAGTGGGACCCTGATGATGTTCTACACGGA
GAAAGCTTCCATCTTTGGCCACGGCAGCGACATAGCCAACAAGCTCAAAGGTTCGACGCC
TCACGACGAGCTGCTCATCCAGATCTCTCAGTCCTTCTCCGGTTTGCTCCTCTTTGCGAT
AGGTTTGGTGCTGTTCATGGTGTCGTTTGTTAAGGATAGAGAGTTTCATGGCTTCTTCGC
TGGAGGGTCTGTGGTTCTCTATGTGCTTATGGCTCTGTGGAGAGTTGTGTTTGAGTGGAA
GATTGAAGATCTTGCGTTTGAGTGTCCTAAGCAAGCGCTTGGAGATATTGCTTTGGCTGT
TTCTTGGGTGTTCTTCCTTGTTTATACTTGGAGGGAGAAGTATGATTGATTGATGCAAAA
CAAAAGATGAGGGGCTTTTATGGAAACTGGAGATTAAGAGAACCACTAGCTTTGCGTAGA
TCATACTATTGTCAGTTTCATAGTTGTCAGAAGATGATCAAGTGTGAAAAAAATTGGATT
TTGTAGTTGAAAATTAGAGAAAAATTGTCAATGACAATAATTTGGTTGTTTCATCTGAAA
AAAGCACATTGTAGAATCTGAGAGTGTAAATAATTTGTTGGTGAGACTATATCCCATTC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL6149Contig1 921 2 2 U
GGATAAAAAAAAATCTGTGGACTTTGATGAGCTCAACTTCAATGGCTGAGCCAACACGAA
ACGTTTCGTTTTGGAGGATACCGCCACCGATTATAGCATTACTCTTGCTTCTCCCGATCG
TCTCGGGAAGCTTCTTCGAACCGTTCAATGTGAGCTACGACCACAGGGCTCTAACCGTCG
CCGGGAAACGGCGCATGTTAGTCTCCGCTGGAGTTCGCTACCCTCGCGCCACTCCTCAAA
TGTGGCCTGACCTCATCGCGAAGAGCAAAGAAGGTGGTGCTGACGTGGTTCAGACTTATG
TGTTTTGGAGTGGCCACGAGCCTGTTAAGGGTCAGTATAACTTTGAAGGAAGATACGACC
TTGTTAAATTTGTGAAGCTTGTTGGATCAAGTGGTCTATATCTACATCTTCGCATTGGTC
CTTACGTTTGTGCTGAGTGGAACTTTGGAGGGTTCCCAGTGTGGTTGCGTGATGTTCCTG
GGATTGAGTTTCGAACAGACAATGAGCCTTTCAAGAAGGAGATGCAGAGGTTTGTAACGA
AGATTGTGGATCTGATGAGAGAAGCAGAGCTGTTCTGTTGGCAAGGCGGTCCTGTAATCA
TGCTGCAGATTGAGAATGAATATGGGGATGTTGAGAAATCATATAGGCAGAAGGGAAAGG
ATTACGTCAAATGGGCTGCTAGTATGGCTCTAGGGCTTGGTGCTGGAGTTCCTTGGGTTA
TGTGCAAGCAAACAGATGCTCCAGAAAATATTATTGATGCATGCAATGGATACTATTGTG
ATGGTTTCAAACCAAATTCGAAGACCAAGCCAGTACTTTCTCCACTTGAAACCAATAAAC
CCTTGAATGTTTATGCATGTACAGTTTGTTGTTAATGTTCGGCAACACTCTGCTGTTTGT
AATGTTTTAGACTCGATTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ39TF U 1
AF RR2AQ39JQ C 22
BS 1 817 RR2AQ39TF
BS 818 921 RR2AQ39JQ

RD RR2AQ39TF 817 0 0
GGATAAAAAAAAATCTGTGGACTTTGATGAGCTCAACTTCAATGGCTGAGCCAACACGAA
ACGTTTCGTTTTGGAGGATACCGCCACCGATTATAGCATTACTCTTGCTTCTCCCGATCG
TCTCGGGAAGCTTCTTCGAACCGTTCAATGTGAGCTACGACCACAGGGCTCTAACCGTCG
CCGGGAAACGGCGCATGTTAGTCTCCGCTGGAGTTCGCTACCCTCGCGCCACTCCTCAAA
TGTGGCCTGACCTCATCGCGAAGAGCAAAGAAGGTGGTGCTGACGTGGTTCAGACTTATG
TGTTTTGGAGTGGCCACGAGCCTGTTAAGGGTCAGTATAACTTTGAAGGAAGATACGACC
TTGTTAAATTTGTGAAGCTTGTTGGATCAAGTGGTCTATATCTACATCTTCGCATTGGTC
CTTACGTTTGTGCTGAGTGGAACTTTGGAGGGTTCCCAGTGTGGTTGCGTGATGTTCCTG
GGATTGAGTTTCGAACAGACAATGAGCCTTTCAAGAAGGAGATGCAGAGGTTTGTAACGA
AGATTGTGGATCTGATGAGAGAAGCAGAGCTGTTCTGTTGGCAAGGCGGTCCTGTAATCA
TGCTGCAGATTGAGAATGAATATGGGGATGTTGAGAAATCATATAGGCAGAAGGGAAAGG
ATTACGTCAAATGGGCTGCTAGTATGGCTCTAGGGCTTGGTGCTGGAGTTCCTTGGGTTA
TGTGCAAGCAAACAGATGCTCCAGAAAATATTATTGATGCATGCAATGGATACTATTGTG
ATGGTTTCAAACCAAATTCGAAGACCAAGCCAGTACT

QA 1 817 1 817
DS 

RD RR2AQ39JQ 900 0 0
AC
TTGATGAGCTCAACTTCAATGGCTGAGCCAACACGAAACGTTTCGTTTTGGAGGATACCG
CCACCGATTATAGCATTACTCTTGCTTCTCCCGATCGTCTCGGGAAGCTTCTTCGAACCG
TTCAATGTGAGCTACGACCACAGGGCTCTAACCGTCGCCGGGAAACGGCGCATGTTAGTC
TCCGCTGGAGTTCGCTACCCTCGCGCCACTCCTCAAATGTGGCCTGACCTCATCGCGAAG
AGCAAAGAAGGTGGTGCTGACGTGGTTCAGACTTATGTGTTTTGGAGTGGCCACGAGCCT
GTTAAGGGTCAGTATAACTTTGAAGGAAGATACGACCTTGTTAAATTTGTGAAGCTTGTT
GGATCAAGTGGTCTATATCTACATCTTCGCATTGGTCCTTACGTTTGTGCTGAGTGGAAC
TTTGGAGGGTTCCCAGTGTGGTTGCGTGATGTTCCTGGGATTGAGTTTCGAACAGACAAT
GAGCCTTTCAAGAAGGAGATGCAGAGGTTTGTAACGAAGATTGTGGATCTGATGAGAGAA
GCAGAGCTGTTCTGTTGGCAAGGCGGTCCTGTAATCATGCTGCAGATTGAGAATGAATAT
GGGGATGTTGAGAAATCATATAGGCAGAAGGGAAAGGATTACGTCAAATGGGCTGCTAGT
ATGGCTCTAGGGCTTGGTGCTGGAGTTCCTTGGGTTATGTGCAAGCAAACAGATGCTCCA
GAAAATATTATTGATGCATGCAATGGATACTATTGTGATGGTTTCAAACCAAATTCGAAG
ACCAAGCCAGTACTTTCTCCACTTGAAACCAATAAACCCTTGAATGTTTATGCATGTACA
GTTTGTTGTTAATGTTCGGCAACACTCTGCTGTTTGTAATGTTTTAGACTCGATTGTC

QA 3 900 3 900
DS 



AS 1 2

CO CL6150Contig1 790 2 2 U
AGGGGCCTTTCAAAAAATACATATTCTAGTTAAAAATTATTAAAAAAAATATATTTTTAC
GTTTTTAATGTATTAATTAATAAAAAATTATGAATTTCCAAAAATTTAACGGTAGTTATT
AGATTTCTATTGGTTAAAAAATTATAAAAAATTGTTATTCACAAAACAATATAGTTTTAA
TATGTTTTTTTAATACATGTGAAATATTTTAAATAGGTATCTTTTTAAAACAAATGAATA
TATTTCTAATTCTTTTTGAGATTTTTCCTGGTACTTATGATGTGATTTAGATTTGAAAAT
TGGAAAAGATCAGAAAAAGGAAAAATCTCTAAAAAGACATCTTTTAAATTATTTCATTCC
TCTATGTTCTATCAAAAAGCACAAAATAATCTTATTTAGACTTTACATCAATAAAGCTAG
ATGTTGATTTTTTTAAAAGCAAAAAATTAAATAGATGTTTCAGATACAAAGGATAATGCC
ATTAAATCACCTAAAAGGTTTACAATTGTATAAAGACTTATTTTATTCAATGATTCTATA
TCCTGCTATTTTATTTATTTATTATTAATGGTAAAAATCTTAAATACTTTGTTTTTGATA
TACCTTTTCATTAATATCTTTGCATTATGATCTATTTAATCTACCATTATTTTCAGTTTA
CCAGTAACCTCTTTATAAAAAATGGAGAAATAAAAAACGTAATTTGAATAGTTATTAATT
ATTATAGAAAGCAATTACTACTATTTTTTTAATAATTACAAGGGAAAACGCGTTTTCCAC
ATCTTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ73TF U 1
AF RR2BQ73JQ C 97
BS 1 681 RR2BQ73TF
BS 682 790 RR2BQ73JQ

RD RR2BQ73TF 681 0 0
AGGGGCCTTTCAAAAAATACATATTCTAGTTAAAAATTATTAAAAAAAATATATTTTTAC
GTTTTTAATGTATTAATTAATAAAAAATTATGAATTTCCAAAAATTTAACGGTAGTTATT
AGATTTCTATTGGTTAAAAAATTATAAAAAATTGTTATTCACAAAACAATATAGTTTTAA
TATGTTTTTTTAATACATGTGAAATATTTTAAATAGGTATCTTTTTAAAACAAATGAATA
TATTTCTAATTCTTTTTGAGATTTTTCCTGGTACTTATGATGTGATTTAGATTTGAAAAT
TGGAAAAGATCAGAAAAAGGAAAAATCTCTAAAAAGACATCTTTTAAATTATTTCATTCC
TCTATGTTCTATCAAAAAGCACAAAATAATCTTATTTAGACTTTACATCAATAAAGCTAG
ATGTTGATTTTTTTAAAAGCAAAAAATTAAATAGATGTTTCAGATACAAAGGATAATGCC
ATTAAATCACCTAAAAGGTTTACAATTGTATAAAGACTTATTTTATTCAATGATTCTATA
TCCTGCTATTTTATTTATTTATTATTAATGGTAAAAATCTTAAATACTTTGTTTTTGATA
TACCTTTTCATTAATATCTTTGCATTATGATCTATTTAATCTACCATTATTTTCAGTTTA
CCAGTAACCTCTTTATAAAAA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2BQ73JQ 694 0 0
TCCAAAAATTTAACGGTAGTTATTAGATTTCTATTGGTTAAAAAATTATAAAAAATTGTT
ATTCACAAAACAATATAGTTTTAATATGTTTTTTTAATACATGTGAAATATTTTAAATAG
GTATCTTTTTAAAACAAATGAATATATTTCTAATTCTTTTTGAGATTTTTCCTGGTACTT
ATGATGTGATTTAGATTTGAAAATTGGAAAAGATCAGAAAAAGGAAAAATCTCTAAAAAG
ACATCTTTTAAATTATTTCATTCCTCTATGTTCTATCAAAAAGCACAAAATAATCTTATT
TAGACTTTACATCAATAAAGCTAGATGTTGATTTTTTTAAAAGCAAAAAATTAAATAGAT
GTTTCAGATACAAAGGATAATGCCATTAAATCACCTAAAAGGTTTACAATTGTATAAAGA
CTTATTTTATTCAATGATTCTATATCCTGCTATTTTATTTATTTATTATTAATGGTAAAA
ATCTTAAATACTTTGTTTTTGATATACCTTTTCATTAATATCTTTGCATTATGATCTATT
TAATCTACCATTATTTTCAGTTTACCAGTAACCTCTTTATAAAAAATGGAGAAATAAAAA
ACGTAATTTGAATAGTTATTAATTATTATAGAAAGCAATTACTACTATTTTTTTAATAAT
TACAAGGGAAAACGCGTTTTCCACATCTTTAACC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL6151Contig1 777 2 6 U
TTTTTCGATGCAAGGTGCTCCAGCTCCAAGACGTTAATTCCCTCCGCATTTCTTCACTGT
CTCCACCGCAATAAAGCAAAACACCGTCGCTGTAATCATCTCCGATGACCTAATATCAGC
AAATCAGGATTTCCTTCGGCCAATCGGTAGATCCAGTCATGGAGATTTTGTTTCTGAGTT
CTCTCATCAGAGGAAACCCCTCCTTTTCAAACTAGGACGAAAAGAATATCTCTCTTACCT
CTACCTGAAAAGACCTTCTACCTTTCGTTTACCTCTGGATTGAGGACAGTCTCGCTTTTC
ATTTCCATCTCTAAGCTTTTCTTTTTCTCTGTCAATGGAGTCTCCTTCAGTTGATTCATC
TGGTTCTTCTCCCCTGCCGCCTGAGCCACCACCTCCTTATGTCTACAGCTCCCCACCGCC
TCCTCCATATGTTTACAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAGCTCTCCACCACC
TCCAAGCTATAGTTATAGCTATAGCTCACCTCCTCCACCGATATACTAACCATATATATC
ATATTGAAGTGAGTTTCAAAAGAAGCTTTTACGTAATAAGTTACGACCATGGTATCCACG
GTTTTAAAATATATCAGTTTCGAGACTTCAATATAAGACGAAATGTAATTTCGTTTGTAC
TTCTACTTTGTGCATTTTGACTTTGGATTGTTGCTTCTGATGTTTGTTACTTATGCCTAC
TAAAAGGCCAGTGTATTGTCTTAATTTATAGCTATTGAATAAACTCAATTACCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DT40TF U 1
AF RR2DT40JQ C 397
BS 1 688 RR2DT40TF
BS 689 689 RR2DT40JQ
BS 690 726 RR2DT40TF
BS 727 727 RR2DT40JQ
BS 728 742 RR2DT40TF
BS 743 777 RR2DT40JQ

RD RR2DT40TF 742 0 0
TTTTTCGATGCAAGGTGCTCCAGCTCCAAGACGTTAATTCCCTCCGCATTTCTTCACTGT
CTCCACCGCAATAAAGCAAAACACCGTCGCTGTAATCATCTCCGATGACCTAATATCAGC
AAATCAGGATTTCCTTCGGCCAATCGGTAGATCCAGTCATGGAGATTTTGTTTCTGAGTT
CTCTCATCAGAGGAAACCCCTCCTTTTCAAACTAGGACGAAAAGAATATCTCTCTTACCT
CTACCTGAAAAGACCTTCTACCTTTCGTTTACCTCTGGATTGAGGACAGTCTCGCTTTTC
ATTTCCATCTCTAAGCTTTTCTTTTTCTCTGTCAATGGAGTCTCCTTCAGTTGATTCATC
TGGTTCTTCTCCCCTGCCGCCTGAGCCACCACCTCCTTATGTCTACAGCTCCCCACCGCC
TCCTCCATATGTTTACAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAGCTCTCCACCACC
TCCAAGCTATAGTTATAGCTATAGCTCACCTCCTCCACCGATATACTAACCATATATATC
ATATTGAAGTGAGTTTCAAAAGAAGCTTTTACGTAATAAGTTACGACCATGGTATCCACG
GTTTTAAAATATATCAGTTTCGAGACTTCAATATAAGACGAAATGTAATTTCGTTTGTAC
TTCTACTTTGTGCATTTTGACTTTGGAT*GTTGCTTCTGATGTTTGTTACTTATGCCTAC
TAAAAG*CCAGTGTATTGTCTT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2DT40JQ 381 0 0
CTTATGT
TACAGCTCCCCACCGCCTCCTCCATATGTTT*CAAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGT*
TATAGCTCTCCACCACCTCCAAGCTATAGTTATAGCTATAGCTCACCTCCTCCACCGATA
TACTAACCATATATATCATATTGAAGTGAGTTTCAAAAGAAGCTTTTACGTAATAAGTTA
CGACCATGGTATCCACGGTTTTAAAATATATCAGTTTCGAGACTTCAATATAAGACGAAA
TGTAATTTCGTTTGTACTTCTACTTTGTGCATTTTGACTTTGGATTGTTGCTTCTGATGT
TTGTTACTTATGCCTACTAAAAGGCCAGTGTATTGTCTTAATTTATAGCTATTGAATAAA
CTCAATTACCTTTT

QA 8 381 8 381
DS 



AS 1 2

CO CL6152Contig1 1127 2 2 U
GACAACTATCTCTTCATAAACTCCCACTTATTCTTCTTCTTAGTGTCTAGGTGAATGACT
ATTACATATATTTATAGACACTTGCCTACTCAATGTGAAAGCGTGTATGCAGGATTCAAG
CAACGGCTTTGATGACTACCGAGAGATTTTCTGACTCTGTTCTTCGCCTACATGTCAAAC
AAGGTTTATTGTAATTATTTTCTTGTATCTATATATGTCCAATGTGTTCGTTAAGACACA
TGATCAGTAGATTTTTTGTCTTTCGACAATGGTTTTGGTGGATTTTTGTAGTTTTCTTGA
CTGGAATTTTTTCTTTGTTTATTAGTTAGTGTAATGACTCATTTGTTTTGTTATTCAGAC
AGTGATAACGAGATTGGAGAAATACATGATCTAGATGCGGGAGAGCAGTCGTTGACGGGA
TCAGAAGGTGTTAAACTCTTAGGACAAGGTCAGAGACGACGCAGAGGGAAAGAACCCGCG
GAGAGAGAGAGCAGTAGGCTGAAGAGGTAAGTTCTTTAAAAAATATTGGTTGTTTTAACG
AAAAAGTCCATACAGGTTTTAGTATAGAGCAGGTGACGTGAAGGGTATTATGGGGAATTG
AAAAGGTTGCTTAGGAACAGAGTGTCTGCACAGAGAGCGAGGGAGAGGAAGAAAGTTTAC
GTGAACGAATTGGAGAAGAAAGTGAATGATTTGGAGGCGAAGAACACTGAGCTTGAAGAG
AGACTTTCCACTTTGCAGAAAGAGAATCACATGCTTAGACATGTATGTCTTTTCTTTACC
AAACATTCAACCTAAATTCATCGAACTATCATATAGGTTAGCGAAATAAAAATTGTAGAA
TAGGAAAATGTATTTTTCTTGAACAAAAAAATTATATTTAAGCAGATGTAAGATCAAACT
TCAAAGGTTGATGTATGGTGTTTGTGTGTATTTCAGATAATAAAGAACACGTCGTCAAGC
AGTAGCAGCCGTTAAGAAAGTGCCTAGTGGATTCATACAAACATAAAACTATCAGCCTCG
ATTATGTTTTAGAGTTAAAAATAAAAAGATTATGTTCTACAGTTTATTTTGGTTTTCAAT
ATATACTTTAAAATTTAAATTTGCAGTTGGAACATCGTGTTTTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ65TF U 1
AF RR2GJ65JQB C 359
BS 1 468 RR2GJ65TF
BS 469 1127 RR2GJ65JQB

RD RR2GJ65TF 468 0 0
GACAACTATCTCTTCATAAACTCCCACTTATTCTTCTTCTTAGTGTCTAGGTGAATGACT
ATTACATATATTTATAGACACTTGCCTACTCAATGTGAAAGCGTGTATGCAGGATTCAAG
CAACGGCTTTGATGACTACCGAGAGATTTTCTGACTCTGTTCTTCGCCTACATGTCAAAC
AAGGTTTATTGTAATTATTTTCTTGTATCTATATATGTCCAATGTGTTCGTTAAGACACA
TGATCAGTAGATTTTTTGTCTTTCGACAATGGTTTTGGTGGATTTTTGTAGTTTTCTTGA
CTGGAATTTTTTCTTTGTTTATTAGTTAGTGTAATGACTCATTTGTTTTGTTATTCAGAC
AGTGATAACGAGATTGGAGAAATACATGATCTAGATGCGGGAGAGCAGTCGTTGACGGGA
TCAGAAGGTGTTAAACTCTTAGGACAAGGTCAGAGACGACGCAGAGGG

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR2GJ65JQB 769 0 0
ACAGTGATAACGAGATTGGAGAAATACATGATCTAGATGCGGGAGAGCAGTCGTTGACGG
GATCAGAAGGTGTTAAACTCTTAGGACAAGGTCAGAGACGACGCAGAGGGAAAGAACCCG
CGGAGAGAGAGAGCAGTAGGCTGAAGAGGTAAGTTCTTTAAAAAATATTGGTTGTTTTAA
CGAAAAAGTCCATACAGGTTTTAGTATAGAGCAGGTGACGTGAAGGGTATTATGGGGAAT
TGAAAAGGTTGCTTAGGAACAGAGTGTCTGCACAGAGAGCGAGGGAGAGGAAGAAAGTTT
ACGTGAACGAATTGGAGAAGAAAGTGAATGATTTGGAGGCGAAGAACACTGAGCTTGAAG
AGAGACTTTCCACTTTGCAGAAAGAGAATCACATGCTTAGACATGTATGTCTTTTCTTTA
CCAAACATTCAACCTAAATTCATCGAACTATCATATAGGTTAGCGAAATAAAAATTGTAG
AATAGGAAAATGTATTTTTCTTGAACAAAAAAATTATATTTAAGCAGATGTAAGATCAAA
CTTCAAAGGTTGATGTATGGTGTTTGTGTGTATTTCAGATAATAAAGAACACGTCGTCAA
GCAGTAGCAGCCGTTAAGAAAGTGCCTAGTGGATTCATACAAACATAAAACTATCAGCCT
CGATTATGTTTTAGAGTTAAAAATAAAAAGATTATGTTCTACAGTTTATTTTGGTTTTCA
ATATATACTTTAAAATTTAAATTTGCAGTTGGAACATCGTGTTTTTAGC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL6153Contig1 820 2 7 U
CGAGTGAAATAAAGGGTCACTTATAAAGTTTGTCAAACCCAAATGTTACGTACAAATGAT
ACACTTAAACACAAACACATGCCCAAACTAGTTTCACAACAAGCTGCTCAACATACACTA
AGTTAAAGAGACTGATGGCTACACAGAATTGAAGGAAACCAAGTGGGTACACAGAGTAGT
AGTAACTAAACGAAGATGATGTGAAGTGAAGTGAAATCAATTGGACCAGACATGAACAAA
GCCATGTCTGTTTCCTGTGTATATCTCATTGCGTTCTTCGTCATAAAATAGAGCCGTTAT
GTCTTCCAAAGCTTCAGCCACAGCGTTTCTTCTCTGCTTTGAGTTCGTCCCCAAACTACT
ACTGCTAGTGCTACTCTCATTTTCTTTTGGTGGTCCACTACTAGATGTTATCTTAGCTAA
GCACTTCCCAGTCAATATATTGCTGATATTGATTGATCCCGCATTTCCTTCTATCCACTG
ATCTTCAGTATCAGCTTTGCAATACGAGATGATGAGATCTTGATCACTTGTTATGTAGAT
GTTGTTTGTGTTGCAGTCCGGATGCCATAGAAGATGATCCTCAAAGGAAGTCACGAGCTC
TCCACGAAAATTCCACACAGACACGTTCCGGTTCCTGAATGTTAGAAACAGCTGGTTCTC
GTAAAGGAATATGAACGCAGAGGGTGTCATGAACTCTGCTCTACTAACTTCCATTTGTTT
AGCGGTTCTCACGTCAAGAATCTGGAGATTCTCATTCTCTTGCTTAACAAGGAGTTTCTC
ATTGAATTGTTCATGAAATCAACTTTCTTGTTTCGGTGAA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW06JQ U 6
AF RR2EO81JQ U 1
BS 1 184 RR2EO81JQ
BS 185 185 RR2FW06JQ
BS 186 285 RR2EO81JQ
BS 286 286 RR2FW06JQ
BS 287 722 RR2EO81JQ
BS 723 723 RR2FW06JQ
BS 724 820 RR2EO81JQ

RD RR2FW06JQ 757 0 0
GAAATAAAGGGTCACTTATAAAGTTTGTCAAACCCAAATGTTACGTACAAATGATACACT
TAAACACAAACACATGCCCAAACTAGTTTCACAACAAGCTGCTCGACATACACTAAGTTA
AAGAGACTGATGGCTACACAGAATTGAAGGAAACCAAGTGGGTACACAGAGTAGTAGTAA
CTAAACGAAGATGATGTGAAGTGAAGTGAAATCAATTGGACCAGACATGAACAAAGCCAT
GTCTGTTTCCTGTGTATATCTCATTGCGTTCTTCGTCATAAAATAGAGCCGTTATGTCTT
CCAAAGCTTCAGCCACAGCGTTTCTTCTCTGCTTTGAGTTCGTCCCCAAACTACTACTGC
TAGTGCTACTCTCATTTTCTTTTGGTGGTCCACTACTAGATGTTATCTTAGCTAAGCATT
TCCCAGTCAATATATTGCTGATATTGATTGATCCCGCATTTCCTTCTATCCACTGATCTT
CAGTATCAGCTTTGCAATACGAGATGATGAGATCTTGATCACTTGTTATGTAGATGTTGT
TTGTGTTGCAGTCCGGATGCCATAGAAGATGATCCTCAAAGGAAGTCACGAGCTCTCCAC
GAAAATTCCACACAGACACGTTCCGGTTCCTGAATGTTAGAAACAGCTGGTTCTCGTAAA
GGAATATGAACGCAGAGGGTGTCATGAACTCTGCTCTACTAACTTCCATTTGTTTAGCGG
TTCTCACGTCAAGAATCTGGAGATTCTCATTCTCTTG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2EO81JQ 820 0 0
CGAGTGAAATAAAGGGTCACTTATAAAGTTTGTCAAACCCAAATGTTACGTACAAATGAT
ACACTTAAACACAAACACATGCCCAAACTAGTTTCACAACAAGCTGCTCAACATACACTA
AGTTAAAGAGACTGATGGCTACACAGAATTGAAGGAAACCAAGTGGGTACACAGAGTAGT
AGTAGCTAAACGAAGATGATGTGAAGTGAAGTGAAATCAATTGGACCAGACATGAACAAA
GCCATGTCTGTTTCCTGTGTATATCTCATTGCGTTCTTCGTCATAGAATAGAGCCGTTAT
GTCTTCCAAAGCTTCAGCCACAGCGTTTCTTCTCTGCTTTGAGTTCGTCCCCAAACTACT
ACTGCTAGTGCTACTCTCATTTTCTTTTGGTGGTCCACTACTAGATGTTATCTTAGCTAA
GCACTTCCCAGTCAATATATTGCTGATATTGATTGATCCCGCATTTCCTTCTATCCACTG
ATCTTCAGTATCAGCTTTGCAATACGAGATGATGAGATCTTGATCACTTGTTATGTAGAT
GTTGTTTGTGTTGCAGTCCGGATGCCATAGAAGATGATCCTCAAAGGAAGTCACGAGCTC
TCCACGAAAATTCCACACAGACACGTTCCGGTTCCTGAATGTTAGAAACAGCTGGTTCTC
GTAAAGGAATATGAACGCAGAGGGTGTCATGAACTCTGCTCTACTAACTTCCATTTGTTT
AGTGGTTCTCACGTCAAGAATCTGGAGATTCTCATTCTCTTGCTTAACAAGGAGTTTCTC
ATTGAATTGTTCATGAAATCAACTTTCTTGTTTCGGTGAA

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 2

CO CL6154Contig1 622 2 1 U
GGGGGAAAATGGGTTGCGGAGATCCGAGAGCCTAACAAACGGACAAGGCTATGGCTCGGC
TCTTACTCCACTCCCGAGGCGGCGGCGAGAGCCTACGACACGGCGGTTTTCTACCTCAGA
GGACCGACGGCGAGGCTTAACTTCCCTGAGCTTCTCAACGGAGAGAAATTCTCAGAGGAG
GACATGTCGGGTGATACTATTAGGAAAAAAGCGACGGAGGTCGGTGCTCAGGTAGACGCT
TTGGGCACGGCGGTGCTAAATAACCGCCACCGTGTGTTTGGTCAGAGCAGAGAGAGTGAT
GATGATAGTAGCAAGAGATATCACCGGAGTTATCAAAACGGTGAGTTGGAAGAGGATGAT
AAGAGTTTGAAAAGTGGCGGCTGGTTATTGGAACGGGTTGACTTGAATAAGGTACCCGAC
CCGGAAAGCTCCGATGACTAAGACTGGGAAAAGAAATGAAAAATTATAATATTTGGAGCG
GTGGTTGCTTAATGCACGCCTGCAAAGATCATTAGCGCCGTTTATGTTTTTTTTTTGCAT
TGTCTGAAATTTTAGGTTTTGTTTTAGTTATAATCGTCTGTATCTTTTTGTCATTTATCA
CGGATTTGCGATTTATGGAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BF75JQ C 1
AF RR2BF75TF U 1
BS 1 622 RR2BF75TF

RD RR2BF75JQ 622 0 0
GGGGGAAAATGGGTTGCGGAGATCCGAGAGCCTAACAAACGGACAAGGCTATGGCTCGGC
TCTTACTCCACTCCCGAGGCGGCGGCGAGAGCCTACGACACGGCGGTTTTCTACCTCAGA
GGACCGACGGCGAGGCTTAACTTCCCTGAGCTTCTCAACGGAGAGAAATTCTCAGAGGAG
GACATGTCGGGTGATACTATTAGGAAAAAAGCGACGGAGGTCGGTGCTCAGGTAGACGCT
TTGGGCACGGCGGTGCTAAATAACCGCCACCGTGTGTTTGGTCAGAGCAGAGAGAGTGAT
GATGATAGTAGCAAGAGATATCACCGGAGTTATCAAAACGGTGAGTTGGAAGAGGATGAT
AAGAGTTTGAAAAGTGGCGGCTGGTTATTGGAACGGGTTGACTTGAATAAGGTACCCGAC
CCGGAAAGCTCCGATGACTAAGACTGGGAAAAGAAATGAAAAATTATAATATTTGGAGCG
GTGGTTGCTTAATGCACGCCTGCAAAGATCATTAGCGCCGTTTATGTTTTTTTTTTGCAT
TGTCTGAAATTTTAGGTTTTGTTTTAGTTATAATCGTCTGTATCTTTTTGTCATTTATCA
CGGATTTGCGATTTATGGAACT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2BF75TF 622 0 0
GGGGGAAAATGGGTTGCGGAGATCCGAGAGCCTAACAAACGGACAAGGCTATGGCTCGGC
TCTTACTCCACTCCCGAGGCGGCGGCGAGAGCCTACGACACGGCGGTTTTCTACCTCAGA
GGACCGACGGCGAGGCTTAACTTCCCTGAGCTTCTCAACGGAGAGAAATTCTCAGAGGAG
GACATGTCGGGTGATACTATTAGGAAAAAAGCGACGGAGGTCGGTGCTCAGGTAGACGCT
TTGGGCACGGCGGTGCTAAATAACCGCCACCGTGTGTTTGGTCAGAGCAGAGAGAGTGAT
GATGATAGTAGCAAGAGATATCACCGGAGTTATCAAAACGGTGAGTTGGAAGAGGATGAT
AAGAGTTTGAAAAGTGGCGGCTGGTTATTGGAACGGGTTGACTTGAATAAGGTACCCGAC
CCGGAAAGCTCCGATGACTAAGACTGGGAAAAGAAATGAAAAATTATAATATTTGGAGCG
GTGGTTGCTTAATGCACGCCTGCAAAGATCATTAGCGCCGTTTATGTTTTTTTTTTGCAT
TGTCTGAAATTTTAGGTTTTGTTTTAGTTATAATCGTCTGTATCTTTTTGTCATTTATCA
CGGATTTGCGATTTATGGAACT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL6155Contig1 580 2 1 U
TTTTTATGTTAGTTTTTGCTATGTGTTTTGGATTTAAAGAGAGTTTTGGATGCGCTCCAA
ACAGTTTACTATTTAGAAACCGATTTGGAAATGGTCATGTACTCACTGTAAACTGCTGGT
CAAACAGACGCGAAACCCATGGTACCCTTATGGTATTACCCAATTCAATCAACGGCCTTT
CGGTTAACGAGAAAGGATCACCGAGAATAGTGTGGAAATGTCGATTATGGGATAAAAAGA
GTGGAATTTATCTTACAATATGGAGGGCATATAGAGGAGCTGCCCGAGCTCGATGTGGTC
AGATGCGCGAATATATTGTTGAAGTTAAAGGCGTTTCCTTAATGAAAAATAAAGAACCGG
CCAAAGAATTCTTTACTTGGACTAAAGAATGACAATATGGAGGGCATATAGTGTATTTCT
TCTTTTCTTTTGAGACTAGTATTTATGAAGCTGAATTTCTGTACCTCGTACTTTAAGTCA
TTTATTTTTCAATTTTGTGGTTATAATATAAATAAGAAGAATAAAGTATTGTACCAATCT
TCTAAATAATGATGATAATAATAAATTATGCGTTTATTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EK76JQ C 1
AF RR2EK76TF U 1
BS 1 580 RR2EK76TF

RD RR2EK76JQ 580 0 0
TTTTTATGTTAGTTTTTGCTATGTGTTTTGGATTTAAAGAGAGTTTTGGATGCGCTCCAA
ACAGTTTACTATTTAGAAACCGATTTGGAAATGGTCATGTACTCACTGTAAACTGCTGGT
CAAACAGACGCGAAACCCATGGTACCCTTATGGTATTACCCAATTCAATCAACGGCCTTT
CGGTTAACGAGAAAGGATCACCGAGAATAGTGTGGAAATGTCGATTATGGGATAAAAAGA
GTGGAATTTATCTTACAATATGGAGGGCATATAGAGGAGCTGCCCGAGCTCGATGTGGTC
AGATGCGCGAATATATTGTTGAAGTTAAAGGCGTTTCCTTAATGAAAAATAAAGAACCGG
CCAAAGAATTCTTTACTTGGACTAAAGAATGACAATATGGAGGGCATATAGTGTATTTCT
TCTTTTCTTTTGAGACTAGTATTTATGAAGCTGAATTTCTGTACCTCGTACTTTAAGTCA
TTTATTTTTCAATTTTGTGGTTATAATATAAATAAGAAGAATAAAGTATTGTACCAATCT
TCTAAATAATGATGATAATAATAAATTATGCGTTTATTTG

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2EK76TF 580 0 0
TTTTTATGTTAGTTTTTGCTATGTGTTTTGGATTTAAAGAGAGTTTTGGATGCGCTCCAA
ACAGTTTACTATTTAGAAACCGATTTGGAAATGGTCATGTACTCACTGTAAACTGCTGGT
CAAACAGACGCGAAACCCATGGTACCCTTATGGTATTACCCAATTCAATCAACGGCCTTT
CGGTTAACGAGAAAGGATCACCGAGAATAGTGTGGAAATGTCGATTATGGGATAAAAAGA
GTGGAATTTATCTTACAATATGGAGGGCATATAGAGGAGCTGCCCGAGCTCGATGTGGTC
AGATGCGCGAATATATTGTTGAAGTTAAAGGCGTTTCCTTAATGAAAAATAAAGAACCGG
CCAAAGAATTCTTTACTTGGACTAAAGAATGACAATATGGAGGGCATATAGTGTATTTCT
TCTTTTCTTTTGAGACTAGTATTTATGAAGCTGAATTTCTGTACCTCGTACTTTAAGTCA
TTTATTTTTCAATTTTGTGGTTATAATATAAATAAGAAGAATAAAGTATTGTACCAATCT
TCTAAATAATGATGATAATAATAAATTATGCGTTTATTTG

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 2

CO CL6156Contig1 813 2 7 U
GGGCTCCGATCCTCATCATGGCGTCTTCTCTCGCCTCCAAATCCATTCTCGGATCCACCA
AACCAGCCTCTTCTTCTCCTCTGTCTCCGGACCTCCGTCGTCTCTCCTCTCCCGCGGTTC
AGATCTCAATCCGAACCCAATCCAAGAAGAACCTCCAGATAATAAAAGCTACTGGAAGCT
CATACGGGACTCACTTTCGAGTTTCCACCTTTGGAGAATCTCATGGAGGAGGCGTTGGCT
GTATAATCGATGGATGTCCTCCTCGGATTCCCCCCTCTGAATCTGATTTGCAATTTGATC
TGGATAGGAGGAGACCCGGTCAGAGCCGGATCACGACTCCTAGAAAAGAGACTGATACTT
GCCGGATATCTTCTGGTGTCTCCGAAGGAATGACGACGGGAACACCTATCCATGTCTTTG
TGCCAAACACTGATCAGAGAGGACTTGATTACAGTGAGATGTCAGTTGCCTATAGGCCAT
CTCATGCTGATGCTACTTATGACATGAAGTATGGTGTCAGATCAGTACAGGGTGGTGGGA
GATCATCAGCAAGAGAGACCATAGGAAGAGTTGCTCCTGGAGCTTTAGCCAAGAAAATCC
TGAAGCAATTTGCAGGAACTGAGATTCTTGCCTATGTCTCGCAAGTCCACCAAGCTGTAC
TTCCAGAGGATTTGGTCGACCACGAGAATCTGACACTCGAACAGATAGAAACAACATTGT
CAGTGCCCCAATCAGAGTATGCAGAGAGATGATTGCTGCCATTGATGCTGTCAGACTAAA
GGAACTCTGTTGGTGGTGTGTGACTGCATCGTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F462TF U 1
AF RR2D804TF U 1
BS 1 166 RR2D804TF
BS 167 167 RR2F462TF
BS 168 273 RR2D804TF
BS 274 274 RR2F462TF
BS 275 343 RR2D804TF
BS 344 344 RR2F462TF
BS 345 813 RR2D804TF

RD RR2F462TF 611 0 0
GGGCTCCGATCCTCATCATGGCGTCTTCTCTCGCCTCCAAATCCATTCTCGGATCCACCA
AACCAGCCTCTTCTTCTCCTCTGTCTCCGGACCTCCGTCGTCTCTCCTCTCCCGCGGTTC
AGATCTCAATCCGAGCCCAATCCAAGAAGAACCTCCAGATAATAAAAGCTACTGGAAGCT
CATACGGGACTCACTTTCGAGTTTCCACCTTTGGAGAATCTCATGGAGGAGGCGTTGGCT
GTATAATCGATGGATGTCCTCCTCGGATTCCCCCCT*TGAATCTGATTTGCAATTTGATC
TGGATAGGAGGAGACCCGGTCAGAGCCGGATCACGACTCCTAGAAAAGAGACTGATACTT
GCCGGATATCTTCTGGTGTCTCCGAAGGAATGACGACGGGAACACCTATCCATGTCTTTG
TGCCAAACACTGATCAGAGAGGACTTGATTACAGTGAGATGTCAGTTGCCTATAGGCCAT
CTCATGCTGATGCTACTTATGACATGAAGTATGGTGTCAGATCAGTACAGGGTGGTGGGA
GATCATCAGCAAGAGAGACCATAG*AAGAGTTGCTCCTGGAGCTTTAGCCAAGAAAATCC
TGAAGCAATTT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2D804TF 813 0 0
GGGCTCCGATCCTCATCATGGCGTCTTCTCTCGCCTCCAAATCCATTCTCGGATCCACCA
AACCAGCCTCTTCTTCTCCTCTGTCTCCGGACCTCCGTCGTCTCTCCTCTCCCGCGGTTC
AGATCTCAATCCGAACCCAATCCAAGAAGAACCTCCAGATAATAAAGGCTACTGGAAGCT
CATACGGGACTCACTTTCGAGTTTCCACCTTTGGAGAATCTCATGGAGGAGGCGTTGGCT
GTATAATCGATGGATGTCCTCCTCGGATTCCCCTCTCTGAATCTGATTTGCAATTTGATC
TGGATAGGAGGAGACCCGGTCAGAGCCGGATCACGACTCCTAGGAAAGAGACTGATACTT
GCCGGATATCTTCTGGTGTCTCCGAAGGAATGACGACGGGAACACCTATCCATGTCTTTG
TGCCAAACACTGATCAGAGAGGACTTGATTACAGTGAGATGTCAGTTGCCTATAGGCCAT
CTCATGCTGATGCTACTTATGACATGAAGTATGGTGTCAGATCAGTACAGGGTGGTGGGA
GATCATCAGCAAGAGAGACCATAGGAAGAGTTGCTCCTGGAGCTTTAGCCAAGAAAATCC
TGAAGCAATTTGCAGGAACTGAGATTCTTGCCTATGTCTCGCAAGTCCACCAAGCTGTAC
TTCCAGAGGATTTGGTCGACCACGAGAATCTGACACTCGAACAGATAGAAACAACATTGT
CAGTGCCCCAATCAGAGTATGCAGAGAGATGATTGCTGCCATTGATGCTGTCAGACTAAA
GGAACTCTGTTGGTGGTGTGTGACTGCATCGTC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

CO CL6157Contig1 834 2 5 U
GCTCGAAATCAAACTATGTACAAAACCAAGAAACTCCAAATGATCCCGTGGTGTTCAGGT
AATGATAAAACGGTCGCAACTTTATGGCCATAGACACACACACTTTACACACACAAAGAC
ACAACAAACCATTGCGCCGGATTTTCCAAACAAAAGATTAGCAAAAGTACTTTTAGTCGT
CAGTACCAAAGTAGCGATCACCAAACTCACCCAAGCCTGGTATAACCCGAAAGTCTTCGT
TTATACACAGATCTATTTCCGATGTCACAATCTTCAACAATGGAAACCGTTTGCAGACGC
AATGGATTCCTTCTGGAGCCGAAATAAGATTGAGGAATATAATGTGGGATTCAGGAACTC
CTTTCTGTATGAGTAGTTCTATCGCTTGACTTGCCGAGTTACCTGTGCCTAGAACAGGAT
CCAAAAGCAGGACATGGCGCTCGGAGATATCACTTGGAAGCTTCTCATATATAAGCTGCA
TTCCATTGTCACCCACACGATGAATAAGAATCTTCCCTATTTTAATCCCTTTGCAGCATG
CGCGTAAAGCGTTTTCCATACTTTCACCACTTCGAATGACTGAGACCCCACAGAGCTTCT
TGCAGAAATCAACACCGCTATACACAGCTCCTGTTGGAGTAACAACTTGTTTCTCAGTGA
ATGGCAAATGGCCAAGACCATGCTCCACAACCAGACGAATGAGACGATCTGAGTAAAACA
CAAAGTCATGTTTTGATATGTCCTTCTCTCGAATAAGTGTATGCATGCCTCTTATCTGAA
ATGTTGACTGGATGACAAAAACATTTGGGTAGATTTTGCAGAGATCATGTTGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD06JQ U 1
AF RR2CN79JQ U 1
BS 1 423 RR2CN79JQ
BS 424 424 RR2DD06JQ
BS 425 559 RR2CN79JQ
BS 560 560 RR2DD06JQ
BS 561 834 RR2CN79JQ

RD RR2DD06JQ 602 0 0
GCTCGAAATCAAACTATGTACAAAACCAAGAAACTCCAAATGATCCCGTGGTGTTCAGGT
AATGATAAAACGGTCGCAACTTTATGGCCATAGACACACACACTTTACACACACAAAGAC
ACAACAAACCGTTGCGCCGGATTTTCCAAACAAAAGATTAGCAAAAGTACTTTTAGTCGT
CAGTACCAAAGTAGCGATCACCAAACTCACCCAAGCCTGGTATAACCCGAAAGTCTTCGT
TTATACACAGATCTATTTCCGATGTCACAATCTTCAACAATGGAAACCGTTTGCAGACGC
AATGGATTCCTTCTGGAGCCGAGATAAGATTGAGGAATATAATGTGGGATTCAGGAACTC
CTTTCTGTATGAGTAGTTCTATCGCTTGACTTGCCGAGTTACCTGTGCCTAGAACAGGAT
CCAAAAGCAGGACATGGCGCTCGGAGATATCACTTGGAAGCTTCTCATATATAAGCTGCA
TTCCATTGTCACCCACACGATGAATAAGAATCTTCCCTATTTTAATCCCTTTGCAGCATG
CGCGTAAAGCGTTTTCCATACTTTCACCACTTCGAATGACTGAGACCCCACAGAGCTTCT
TG

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2CN79JQ 834 0 0
GCTCGAAATCAAACTATGTACAAAACCAAGAAACTCCAAATGATCCCGTGGTGTTCAGGT
AATGATAAAACGGTCGCAACTTTATGGCCATAGACACACACACTTTACACACACAAAGAC
ACAACAAACCATTGCGCCGGATTTTCCAAACAAAAGATTAGCAAAAGTACTTTTAGTCGT
CAGTACCAAAGTAGCGATCACCAAACTCACCCAAGCCTGGTATAACCCGAAAGTCTTCGT
TTATACACAGATCTATTTCCGATGTCACAATCTTCAACAATGGAAACCGTTTGCAGACGC
AATGGATTCCTTCTGGAGCCGAAATAAGATTGAGGAATATAATGTGGGATTCAGGAACTC
CTTTCTGTATGAGTAGTTCTATCGCTTGACTTGCCGAGTTACCTGTGCCTAGAACAGGAT
CCATAAGCAGGACATGGCGCTCGGAGATATCACTTGGAAGCTTCTCATATATAAGCTGCA
TTCCATTGTCACCCACACGATGAATAAGAATCTTCCCTATTTTAATCCCTTTGCAGCATG
CGCGTAAAGCGTTTTCCATGCTTTCACCACTTCGAATGACTGAGACCCCACAGAGCTTCT
TGCAGAAATCAACACCGCTATACACAGCTCCTGTTGGAGTAACAACTTGTTTCTCAGTGA
ATGGCAAATGGCCAAGACCATGCTCCACAACCAGACGAATGAGACGATCTGAGTAAAACA
CAAAGTCATGTTTTGATATGTCCTTCTCTCGAATAAGTGTATGCATGCCTCTTATCTGAA
ATGTTGACTGGATGACAAAAACATTTGGGTAGATTTTGCAGAGATCATGTTGCC

QA 1 834 1 834
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6159Contig1 585 2 1 U
GAATCGTTTGTTTATCGTCTCATTTGCTTGCTTACTTATCGGGGAGATGGCGTTTTTGCT
TAAAAACAACTCGATTTCATCTCACCTCCGATCTTACCCCCAGAAGAAGGATGGTGGAGC
TCTAGGTCAATCCCGTCGGGGATTCCATGTGGAGCTAGGTGCTCGCGAGAAAGATCTTTT
GGCTGAGAATGATGCATTGAGGAGATTCAAGTCGCATAAGAAAGGAGTGCGTCAATTGAA
AAGAATTGGAGATGTGATCACTGCTGTCGTTGTTGCTGGGTGCTGCTATGAGATCTATGC
GAGAGCAACGGTTAAAAAGGAAGCTTAGGCTGCATGATGAGGAAGCTCTCATGTGTCCTC
TCCTTTTGCTTTTATCATCAATCTCCCCTTTTCTTCTAGCATGTCTCTGGGAATTCATGT
TGCCTAATTATTGCTCAACGGTCTCTGAATAAGTGAATAATCGAAAAGGATTTGGTATTT
TTTTGTTTTCGAGAAACTCAAATTGATATACAAGACGGAATAAACCAGAAAGACTCGTTT
GTTGAGCTCATAAACTTACAAGACTCGTCAAATGTTATTTCTACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G463JQ C 1
AF RR2G463TF U 1
BS 1 585 RR2G463TF

RD RR2G463JQ 585 0 0
GAATCGTTTGTTTATCGTCTCATTTGCTTGCTTACTTATCGGGGAGATGGCGTTTTTGCT
TAAAAACAACTCGATTTCATCTCACCTCCGATCTTACCCCCAGAAGAAGGATGGTGGAGC
TCTAGGTCAATCCCGTCGGGGATTCCATGTGGAGCTAGGTGCTCGCGAGAAAGATCTTTT
GGCTGAGAATGATGCATTGAGGAGATTCAAGTCGCATAAGAAAGGAGTGCGTCAATTGAA
AAGAATTGGAGATGTGATCACTGCTGTCGTTGTTGCTGGGTGCTGCTATGAGATCTATGC
GAGAGCAACGGTTAAAAAGGAAGCTTAGGCTGCATGATGAGGAAGCTCTCATGTGTCCTC
TCCTTTTGCTTTTATCATCAATCTCCCCTTTTCTTCTAGCATGTCTCTGGGAATTCATGT
TGCCTAATTATTGCTCAACGGTCTCTGAATAAGTGAATAATCGAAAAGGATTTGGTATTT
TTTTGTTTTCGAGAAACTCAAATTGATATACAAGACGGAATAAACCAGAAAGACTCGTTT
GTTGAGCTCATAAACTTACAAGACTCGTCAAATGTTATTTCTACG

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2G463TF 585 0 0
GAATCGTTTGTTTATCGTCTCATTTGCTTGCTTACTTATCGGGGAGATGGCGTTTTTGCT
TAAAAACAACTCGATTTCATCTCACCTCCGATCTTACCCCCAGAAGAAGGATGGTGGAGC
TCTAGGTCAATCCCGTCGGGGATTCCATGTGGAGCTAGGTGCTCGCGAGAAAGATCTTTT
GGCTGAGAATGATGCATTGAGGAGATTCAAGTCGCATAAGAAAGGAGTGCGTCAATTGAA
AAGAATTGGAGATGTGATCACTGCTGTCGTTGTTGCTGGGTGCTGCTATGAGATCTATGC
GAGAGCAACGGTTAAAAAGGAAGCTTAGGCTGCATGATGAGGAAGCTCTCATGTGTCCTC
TCCTTTTGCTTTTATCATCAATCTCCCCTTTTCTTCTAGCATGTCTCTGGGAATTCATGT
TGCCTAATTATTGCTCAACGGTCTCTGAATAAGTGAATAATCGAAAAGGATTTGGTATTT
TTTTGTTTTCGAGAAACTCAAATTGATATACAAGACGGAATAAACCAGAAAGACTCGTTT
GTTGAGCTCATAAACTTACAAGACTCGTCAAATGTTATTTCTACG

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL6160Contig1 585 2 1 U
GGGAATCAAAAATTTTAGGGTTCTTGCTTGTTCTTTCCAAATTTTCTCCATTCTTCTTCG
TTCAGGTAAGCAAATTTGCGTGTTCTGATGTTTTCAATTTCGGTTCTTATGTCATTATCT
CGTATGTGATTTGCTATTTCTTCATTTAAGTTGTGTTAATGTTTGAACTTTCTTTTGATT
TTAGTGTAAAGAGATAGATAGTAGTAGTCATAACCACAAATGGATTTAGATCGTGTAATA
CCCAGAAAGTATCAATGTGGGTTATTGACAATTATGTTGACTTTAAAAAAAAAAGAAAAT
TATGTCCATGTGGAGCTATCTTTGGTCCAGACCATATGTTTAAGTGGGCAGATGAAGCTA
CCGTAGAGAAAGAATTAATGGAGCCGAAGCAAGATGTTCTTGATATGAAGAAAGACATTG
GAGAGAGAATTAGAAGTGTTGTTTGTGTCTTAAGCTCAAGTTGTTGCTGTTAATATTTTA
TCATTTATGATTCCTACCTTGTGTGTCGTATGAGTTGTTTGTGTCTCAGATTGTTGCTGT
TAACATTTTATCATTTATGATCTACAATCAAGTTGCTAAGTCACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AU64JQ C 1
AF RR2AU64TF U 1
BS 1 585 RR2AU64TF

RD RR2AU64JQ 585 0 0
GGGAATCAAAAATTTTAGGGTTCTTGCTTGTTCTTTCCAAATTTTCTCCATTCTTCTTCG
TTCAGGTAAGCAAATTTGCGTGTTCTGATGTTTTCAATTTCGGTTCTTATGTCATTATCT
CGTATGTGATTTGCTATTTCTTCATTTAAGTTGTGTTAATGTTTGAACTTTCTTTTGATT
TTAGTGTAAAGAGATAGATAGTAGTAGTCATAACCACAAATGGATTTAGATCGTGTAATA
CCCAGAAAGTATCAATGTGGGTTATTGACAATTATGTTGACTTTAAAAAAAAAAGAAAAT
TATGTCCATGTGGAGCTATCTTTGGTCCAGACCATATGTTTAAGTGGGCAGATGAAGCTA
CCGTAGAGAAAGAATTAATGGAGCCGAAGCAAGATGTTCTTGATATGAAGAAAGACATTG
GAGAGAGAATTAGAAGTGTTGTTTGTGTCTTAAGCTCAAGTTGTTGCTGTTAATATTTTA
TCATTTATGATTCCTACCTTGTGTGTCGTATGAGTTGTTTGTGTCTCAGATTGTTGCTGT
TAACATTTTATCATTTATGATCTACAATCAAGTTGCTAAGTCACT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2AU64TF 585 0 0
GGGAATCAAAAATTTTAGGGTTCTTGCTTGTTCTTTCCAAATTTTCTCCATTCTTCTTCG
TTCAGGTAAGCAAATTTGCGTGTTCTGATGTTTTCAATTTCGGTTCTTATGTCATTATCT
CGTATGTGATTTGCTATTTCTTCATTTAAGTTGTGTTAATGTTTGAACTTTCTTTTGATT
TTAGTGTAAAGAGATAGATAGTAGTAGTCATAACCACAAATGGATTTAGATCGTGTAATA
CCCAGAAAGTATCAATGTGGGTTATTGACAATTATGTTGACTTTAAAAAAAAAAGAAAAT
TATGTCCATGTGGAGCTATCTTTGGTCCAGACCATATGTTTAAGTGGGCAGATGAAGCTA
CCGTAGAGAAAGAATTAATGGAGCCGAAGCAAGATGTTCTTGATATGAAGAAAGACATTG
GAGAGAGAATTAGAAGTGTTGTTTGTGTCTTAAGCTCAAGTTGTTGCTGTTAATATTTTA
TCATTTATGATTCCTACCTTGTGTGTCGTATGAGTTGTTTGTGTCTCAGATTGTTGCTGT
TAACATTTTATCATTTATGATCTACAATCAAGTTGCTAAGTCACT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL6161Contig1 763 2 2 U
GGGTTGCAGATTGAAAGAAAAACAAATATCCACACAAACACAATACATATCTGAGAGACA
CAGAGGAAGAGAATAACCCATTCGTAGTTTTCTTGCAAAAAAAAAAAACGAGCCAAAAAT
CAGAACGAGAAGATGGGAGTTGGAGGAACATTAGAGTATATATCTGAGCTAATAGGAAGT
GGAGGAAGTCATAGCTATGGCAAGAGGAAGAAGAAGAAGCAGTTTCAGACAGTGGAGCTC
AAGGTGAGAATGGATTGTGATGGTTGTGTCCTCAAAGTCAAGAACTCTCTTTCTTCTCTA
AAAGGAGTTAAATCGGTGGAGATAAACAAGAAGCAGCAAAAGGTGACGGTGAGTGGTTAC
GCGGAACCGAGCAAGGTGCTGAAGAAGGCCAAAGCGACGGGGAAGAAGGCTGAGATATGG
CCTTACGTTCCCTACAACTTGGTGGCTCAGCCCTACATAGCTCAGGCTTACGACAAGAAG
GCGCCGCCTGGTTACGTCAGAAAAGTCGACCCATACGCCACCACGGGGACGATGGCTGTT
TACAACGATGACCCTTCTTACACTTCTATGTTTAGTGATGATAATCCTAATGCTTGCTCC
ATTATGTAATTACTAAATCAATAATAAAGACGGTTTATATGTATATGTATATAAATATGA
GTTATATAGATTTTGGTGTTTTTTTGTTCAGGATTTTGTCTTCTTTTGCATGTGCTTTCT
GTTTGTGTTATAAGAATGTTAATAAATGCCTATTATATAGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ43TF U 1
AF RR2EQ43JQ C 98
BS 1 682 RR2EQ43TF
BS 683 763 RR2EQ43JQ

RD RR2EQ43TF 682 0 0
GGGTTGCAGATTGAAAGAAAAACAAATATCCACACAAACACAATACATATCTGAGAGACA
CAGAGGAAGAGAATAACCCATTCGTAGTTTTCTTGCAAAAAAAAAAAACGAGCCAAAAAT
CAGAACGAGAAGATGGGAGTTGGAGGAACATTAGAGTATATATCTGAGCTAATAGGAAGT
GGAGGAAGTCATAGCTATGGCAAGAGGAAGAAGAAGAAGCAGTTTCAGACAGTGGAGCTC
AAGGTGAGAATGGATTGTGATGGTTGTGTCCTCAAAGTCAAGAACTCTCTTTCTTCTCTA
AAAGGAGTTAAATCGGTGGAGATAAACAAGAAGCAGCAAAAGGTGACGGTGAGTGGTTAC
GCGGAACCGAGCAAGGTGCTGAAGAAGGCCAAAGCGACGGGGAAGAAGGCTGAGATATGG
CCTTACGTTCCCTACAACTTGGTGGCTCAGCCCTACATAGCTCAGGCTTACGACAAGAAG
GCGCCGCCTGGTTACGTCAGAAAAGTCGACCCATACGCCACCACGGGGACGATGGCTGTT
TACAACGATGACCCTTCTTACACTTCTATGTTTAGTGATGATAATCCTAATGCTTGCTCC
ATTATGTAATTACTAAATCAATAATAAAGACGGTTTATATGTATATGTATATAAATATGA
GTTATATAGATTTTGGTGTTTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2EQ43JQ 666 0 0
AAAAAAAAAAACGAGCCAAAAATCAGAACGAGAAGATGGGAGTTGGAGGAACATTAGAGT
ATATATCTGAGCTAATAGGAAGTGGAGGAAGTCATAGCTATGGCAAGAGGAAGAAGAAGA
AGCAGTTTCAGACAGTGGAGCTCAAGGTGAGAATGGATTGTGATGGTTGTGTCCTCAAAG
TCAAGAACTCTCTTTCTTCTCTAAAAGGAGTTAAATCGGTGGAGATAAACAAGAAGCAGC
AAAAGGTGACGGTGAGTGGTTACGCGGAACCGAGCAAGGTGCTGAAGAAGGCCAAAGCGA
CGGGGAAGAAGGCTGAGATATGGCCTTACGTTCCCTACAACTTGGTGGCTCAGCCCTACA
TAGCTCAGGCTTACGACAAGAAGGCGCCGCCTGGTTACGTCAGAAAAGTCGACCCATACG
CCACCACGGGGACGATGGCTGTTTACAACGATGACCCTTCTTACACTTCTATGTTTAGTG
ATGATAATCCTAATGCTTGCTCCATTATGTAATTACTAAATCAATAATAAAGACGGTTTA
TATGTATATGTATATAAATATGAGTTATATAGATTTTGGTGTTTTTTTGTTCAGGATTTT
GTCTTCTTTTGCATGTGCTTTCTGTTTGTGTTATAAGAATGTTAATAAATGCCTATTATA
TAGACT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL6162Contig1 722 2 2 U
GTAAGAGACTTTGATGCGTTTGATCTGAGACTGCGTCTTCCTGCCGTGGTTAGCACACTC
TACAAAGCTGTTAAGCGAAATGGAGGAGTTACGTACGTCCACTGCACTGCTGGAATGGGA
AGGGCTCCTGCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCAAGGCTATAAACTAATGGAA
GCTCACAGATTACTTATGAGCAAACGGACCTGCTCTCCGAACCTTGATGCTATCAGAAAT
GCAACAATTGATATTCTTACAGGACTCAAGAAGAAGATTATTACTCTGACACTGAAAGAC
AAGGAGTTCTCCACAGTTGAAGTTTCTGGCCTTGACATTGGATGGGGACAGAAAATACCT
CTGACGCTAGACGAGGGAACAGGACTCTGGAGCCTAAAGAGAGAATTGCCTGAAGGACAG
TTTGAATATAAATATATCATAGACGGTGAATGGACACACAATGAGCAAGAGCCGTTTATA
GGACCTAACAAAGATGGTCATACCAATAACTACGTAAAAGTGGTGGATGATCCAACGAGC
GTGGATGGTGCAACGAGGGAGAGGTTATCGAGTGAAGACCCTGAGCTCTTGGAGGAGGAA
CGCTTGAAACTAATCCAGTTCTTGGAGACTTGTTCTGAACAACCTGAAGTTTGAGACTTG
AGAGCAATCCTTGTGAATGTACCACTTACTAGTAATAATAATTAATAAAATACTTTAATG
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2BO69TF U 1
AF RR2BO69JQ C 47
BS 1 639 RR2BO69TF
BS 640 722 RR2BO69JQ

RD RR2BO69TF 639 0 0
GTAAGAGACTTTGATGCGTTTGATCTGAGACTGCGTCTTCCTGCCGTGGTTAGCACACTC
TACAAAGCTGTTAAGCGAAATGGAGGAGTTACGTACGTCCACTGCACTGCTGGAATGGGA
AGGGCTCCTGCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCAAGGCTATAAACTAATGGAA
GCTCACAGATTACTTATGAGCAAACGGACCTGCTCTCCGAACCTTGATGCTATCAGAAAT
GCAACAATTGATATTCTTACAGGACTCAAGAAGAAGATTATTACTCTGACACTGAAAGAC
AAGGAGTTCTCCACAGTTGAAGTTTCTGGCCTTGACATTGGATGGGGACAGAAAATACCT
CTGACGCTAGACGAGGGAACAGGACTCTGGAGCCTAAAGAGAGAATTGCCTGAAGGACAG
TTTGAATATAAATATATCATAGACGGTGAATGGACACACAATGAGCAAGAGCCGTTTATA
GGACCTAACAAAGATGGTCATACCAATAACTACGTAAAAGTGGTGGATGATCCAACGAGC
GTGGATGGTGCAACGAGGGAGAGGTTATCGAGTGAAGACCCTGAGCTCTTGGAGGAGGAA
CGCTTGAAACTAATCCAGTTCTTGGAGACTTGTTCTGAA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2BO69JQ 676 0 0
TGGTTAGCACACTCTACAAAGCTGTTAAGCGAAATGGAGGAGTTACGTACGTCCACTGCA
CTGCTGGAATGGGAAGGGCTCCTGCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCAAGGCT
ATAAACTAATGGAAGCTCACAGATTACTTATGAGCAAACGGACCTGCTTTCCGAACCTTG
ATGCTATCAGAAATGCAACAATTGATATTCTTACAGGACTCAAGAAGAAGATTATTATTC
TGACACTGAAAGACAAGGAGTTCTCCACAGTTGAAGTTTCTGGCCTTGACATTGGATGGG
GACAGAAAATACCTCTGACGCTAGACGAGGGAACAGGACTCTGGAGCCTAAAGAGAGAAT
TGCCTGAAGGACAGTTTGAATATAAATATATCATAGACGGTGAATGGACACACAATGAGC
AAGAGCCGTTTATAGGACCTAACAAAGATGGTCATACCAATAACTACGTAAAAGTGGTGG
ATGATCCAACGAGCGTGGATGGTGCAACGAGGGAGAGGTTATCGAGTGAAGACCCTGAGC
TCTTGGAGGAGGAACGCTTGAAACTAATCCAGTTCTTGGAGACTTGTTCTGAACAACCTG
AAGTTTGAGACTTGAGAGCAATCCTTGTGAATGTACCACTTACTAGTAATAATAATTAAT
AAAATACTTTAATGTC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6164Contig1 756 2 6 U
GGACACTATGGCTCATCTTCAATCTCTTAACCTCATTGAAACCAGTCACATCTCTCCCTT
GAAGGGCACTGTTCCATCCACCACTCTTCCTCTCACTTTTTTCGATGCACCTTGGCTCAC
TCTCCCACTCGGCGAATCTCTCTTCTTCTATTCTTACCAAAACTCAACTGAATGTTTCCT
CAAAGATTACCTCCCTAACCTCAAACAATCACTTTCCACCACACTCCAACATTTCTTCCC
TTACGCCGGTAACCTGATCACCCCACCTCGACCTGACCCTCCCTACTTACGCTACAACGA
TGGCCAGGACTCTCTTCTTTTCACAGTCGCAGAGTCTCTCGGAACTGAGTTCGAACTTCT
CATAACAGATTCTCCTAAAGACATCAGAGTGTTGCATGACTTCTTGCCCAAGTTACCTCC
TCCTCATGTATCTCCGGAGGGTATTCAGACACGGCCAATGATGGTGATACAGGTCACCAT
CTTCCCTGGAAGAGGAATCTGCATAGGAAACACGTCTTCACATGTTGCAGCAGATGGAGT
CGCTTTCACTCATTTCATGAAGTATTGGATGTCATTAACCAAATCCAACGGCGGAGATCC
TGCCACGCTTCTACTACCAGCTCCTCCTATTCACAGCTGCAGAAACATTATTAAGGATCC
AGGCCAAGTAACCGCAGTACATTTGGAGAGGTTTGGAGCCAAACTCTGGAAAACACGCTC
ACATGCACACCTGAGAACATGGTTAGAGCTACTTTA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS13TF U 1
AF RR2H120TF U 2
BS 1 322 RR2DS13TF
BS 323 323 RR2H120TF
BS 324 324 RR2DS13TF
BS 325 325 RR2H120TF
BS 326 651 RR2DS13TF
BS 652 756 RR2H120TF

RD RR2DS13TF 651 0 0
GGACACTATGGCTCATCTTCAATCTCTTAACCTCATTGAAACCAGTCACATCTCTCCCTT
GAAGGGCACTGTTCCATCCACCACTCTTCCTCTCACTTTTTTCGATGCACCTTGGCTCAC
TCTCCCACTCGGCGAATCTCTCTTCTTCTATTCTTACCAAAACTCAACTGAATGTTTCCT
CAAAGATTACCTCCCTAACCTCAAACAATCACTTTCCACCACACTCCAACATTTCTTCCC
TTACGCCGGTAACCTGATCACCCCACCTCGACCTGACCCTCCCTACTTACGCTACAACGA
TGGCCAGGACTCTCTTCTTTTCGCTGTCGCAGAGTCTCTCGGAACTGAGTTCGAACTTCT
CATAACAGATTCTCCTAAAGACATCAGAGTGTTGCATGACTTCTTGCCCAAGTTACCTCC
TCCTCATGTATCTCCGGAGGGTATTCAGACACGGCCAATGATGGTGATACAGGTCACCAT
CTTCCCTGGAAGAGGAATCTGCATAGGAAACACGTCTTCACATGTTGCAGCAGATGGAGT
CGCTTTCACTCATTTCATGAAGTATTGGATGTCATTAACCAAATCCAACGGCGGAGATCC
TGCCACGCTTCTACTACCAGCTCCTCCTATTCACAGCTGCAGAAACATTAT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2H120TF 755 0 0
GGG
ACTATGGCTCATCTTCAATCTCTTAACCTCATTGAAACCAGTCACATCTCTCCCTTGAAG
GGCACTGTTCCATCCACCACTCTTCCTCTCACTTTTTTCGATGCACCTTTGCTCACTCTC
CCACTCGGCGAATCTCTCTTCTTCTATTCTTACCAAAACTCAACTGAATGTTTCCTCAAA
GATTACCTCCCTAACCTCAAACAATCACTTTCCACCACACTCCAACATTTCTTCCCTTAC
GCCGGTAACCTGATCACCCCACCTCGACCTGACCCTCCCTACTTACGCTACAACGATGGC
CAGGACTCTCTTCTTTTCACAGTCGCAGAGTCTCTCGGAACTGAGTTCGAACTTCTCATA
ACAGATTCTCCTAAAGACATCAGAGTGTTGCATGACTTCTTGCCCAAGTTACCTCCTCCT
CATGTATCTCCGGAGGGTATTCAGACACGGCCAATGATGGTGATACAGGTCACCATCTTC
CCTGGAAGAGGAATCTGCATAGGAAACACGTCTTCACATGTTGCAGCAGATGGAGTCGCT
TTCACTCATTTCATGAAGTATTGGATGTCATTAACCAAATCCAACGGCGGAGATCCTGCC
ACGCTTCTACTACCAGCTCCTCCTATTCACAGCTGCAGAAACATTATTAAGGATCCAGGC
CAAGTAACCGCAGTACATTTGGAGAGGTTTGGAGCCAAACTCTGGAAAACACGCTCACAT
GCACACCTGAGAACATGGTTAGAGCTACTTTA

QA 4 755 4 755
DS 



AS 1 2

CO CL6165Contig1 919 2 4 U
GGAGAGTATCGGTCACTGCTCGTCGTCCTCCCTGCAACCTGAGTTACAATAGAAGTCTAC
AATATACTTGATGGGGACTTCTGTTGATAAAGGAGAACCTGCAATGGACACACAAGACTG
GAAAACTCAATTGCCAGCTGGTTCACGCCAGAAGATCATCAACAAGATAATGGAAACAAT
GCATAAGCACCTTCCATTTTCTGGACCAGAGGGAATGAACGAGCTCAGGAGGATTGCTTC
CAGATACGAGGAGAAAGTTTTCAGTGATGCTGTTAGCCAGACTGCTTACCTTCGGACAAT
ATCCATGAAGATGCTGACCATGGAGACTAAAGCACAAAATGCAGCTGGTTCTTCTTCTTC
TTCCTTGCCGACCCCTGCTGGTTATAACAGTCTGCCGTTGAATCCGGGTTGTCCTCAAAT
GACAATCGAAGGCCCCGTCAAAGCAGAGCCTGTCGCGAACACAGTTGACTGGAGAACTCG
TCTACCACCGGATTCACGCAAGAAGAATGCCAACAAAATAACGTTGCTGCTAGCTTTGAG
GAGCTGACATATTGCCATACGTGTGACCTATGTTGATGCACAGTTAAACTGTTTTGTGAG
CAGAAAAGGAACACTAAAGAAACATGTTCCAGACTGTGGGGAAGAAGGAAATAAAGAGCT
CGAGAAAATTGCTGCTAGCTTTGAGGAGCTGATTTTCAACACTGCTATTGATCAGGTGGA
TTATCTTCTCAAAACATCCTTCAAGATTACACCTTGAAACTTCCAAAGTTCAAGGCGTGA
TATAAACATGGAGGGATTTATTTAAAGCATCCAAATTCCTCAAAAGGAAAAACAACGTTT
TTTAATTGGTGTAGAATCAAAACTTTTTTTTTGTAGCTGTTGATTTAAATAGAACTTTTT
TTTGAGCAATAAAACAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV81TF U 1
AF RR2GV81JQB C 378
BS 1 608 RR2GV81TF
BS 609 609 RR2GV81JQB
BS 610 641 RR2GV81TF
BS 642 919 RR2GV81JQB

RD RR2GV81TF 641 0 0
GGAGAGTATCGGTCACTGCTCGTCGTCCTCCCTGCAACCTGAGTTACAATAGAAGTCTAC
AATATACTTGATGGGGACTTCTGTTGATAAAGGAGAACCTGCAATGGACACACAAGACTG
GAAAACTCAATTGCCAGCTGGTTCACGCCAGAAGATCATCAACAAGATAATGGAAACAAT
GCATAAGCACCTTCCATTTTCTGGACCAGAGGGAATGAACGAGCTCAGGAGGATTGCTTC
CAGATACGAGGAGAAAGTTTTCAGTGATGCTGTTAGCCAGACTGCTTACCTTCGGACAAT
ATCCATGAAGATGCTGACCATGGAGACTAAAGCACAAAATGCAGCTGGTTCTTCTTCTTC
TTCCTTGCCGACCCCTGCTGGTTATAACAGTCTGCCGTTGAATCCGGGTTGTCCTCAAAT
GACAATCGAAGGCCCCGTCAAAGCAGAGCCTGTCGCGAACACAGTTGACTGGAGAACTCG
TCTACCACCGGATTCACGCAAGAAGAATGCCAACAAAATAACGTTGCTGCTAGCTTTGAG
GAGCTGACATATTGCCATACGTGTGACCTATGTTGATGCACAGTTAAACTGTTTTGTGAG
CAGAAAAG*AACACTAAAGAAACATGTTCCAGACTGTGGGG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2GV81JQB 542 0 0
CTGGTTATAACAGTCTGCCGTTGAATCCGGGTTGTCCTCAAATGACAATCGAAGGCCCCG
TCAAAGCAGAGCCTGTCGCGAACACAGTTGACTGGAGAACTCGTCTACCACCGGATTCAC
GCAAGAAGAATGCCAACAAAATAACGTTGCTGCTAGCTTTGAGGAGCTGACATATTGCCA
TACGTGTGACCTATGTTGATGCACAGTTAAACTGTTTTGTGAGCAGAAAAGGAACACTAA
AGAAACATGTTCCAGACTGTGGGGAAGAAGGAAATAAAGAGCTCGAGAAAATTGCTGCTA
GCTTTGAGGAGCTGATTTTCAACACTGCTATTGATCAGGTGGATTATCTTCTCAAAACAT
CCTTCAAGATTACACCTTGAAACTTCCAAAGTTCAAGGCGTGATATAAACATGGAGGGAT
TTATTTAAAGCATCCAAATTCCTCAAAAGGAAAAACAACGTTTTTTAATTGGTGTAGAAT
CAAAACTTTTTTTTTGTAGCTGTTGATTTAAATAGAACTTTTTTTTGAGCAATAAAACAG
AA

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

CO CL6166Contig1 798 2 2 U
GGATCCACGACTGATCCATACCATTCCATTCCATTCCATTCCTCAAAGCTCTCTATCATA
TCAAATCAACAATGGCGTTCCCTAAGGTGTTCTTCGACATGACCGTAGGTGGCCAGCCTG
CTGGAAGGATCGTGATGGAGCTGTACACCGACAAGACTCCCAAGACCGCCGAGAATTTCA
GAGCTCTCTGCACCGGAGAGAAGGGAGTCGAACGTAACGGCAAGCCTCTCCACTTCAAGG
GGTCTTCCTTCCACCGCGTGATCCCTAACTTCATGTGCCAGGGAGGCGACTTCACCGCCG
GGAACGGGACGGGAGGCGAGTCCATCTACGGTGATAAGTTCGCGGACGAGAATTTCGAGA
GAAAGCACACCGGTCCTGGGATCCTGTCCATGGCCAACGCTGGTCCAAACACCAACGGAT
CTCAGTTCTTTATCTGCACTGTTAAGACCGATTGGCTTGATGGTAAGCACGTGGTGTTCG
GGCAGGTGGTGGAAGGGTTGGACGTGGTGAAGGCCATCGAGAAGGTGGGATCCGCGTCTG
GAAAGACGTCGAAGCCTGTGGTTGTGGCTGACTGTGGTCAGCTCTCTTGGATCGCATGAG
ATCTATCCTCAGTTTTAAAATTAGCGTCGTGGTCGTACTCTAGTGAGTGGTGTTGGGTCC
TCATCGTGTGTCTCTCTGTTTTTGCTTTTGTTTTCTTTTCATCTGGTGTAGTCATGAAAG
CTTGGTGTGTTCGGTCTCTTGTCAACCTAATTAGTAGCTAGTCCCATAAATAATCAATGA
GCTTGTGTTTTACCCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC15TF U 1
AF RR2DC15JQ C 86
BS 1 729 RR2DC15TF
BS 730 798 RR2DC15JQ

RD RR2DC15TF 729 0 0
GGATCCACGACTGATCCATACCATTCCATTCCATTCCATTCCTCAAAGCTCTCTATCATA
TCAAATCAACAATGGCGTTCCCTAAGGTGTTCTTCGACATGACCGTAGGTGGCCAGCCTG
CTGGAAGGATCGTGATGGAGCTGTACACCGACAAGACTCCCAAGACCGCCGAGAATTTCA
GAGCTCTCTGCACCGGAGAGAAGGGAGTCGAACGTAACGGCAAGCCTCTCCACTTCAAGG
GGTCTTCCTTCCACCGCGTGATCCCTAACTTCATGTGCCAGGGAGGCGACTTCACCGCCG
GGAACGGGACGGGAGGCGAGTCCATCTACGGTGATAAGTTCGCGGACGAGAATTTCGAGA
GAAAGCACACCGGTCCTGGGATCCTGTCCATGGCCAACGCTGGTCCAAACACCAACGGAT
CTCAGTTCTTTATCTGCACTGTTAAGACCGATTGGCTTGATGGTAAGCACGTGGTGTTCG
GGCAGGTGGTGGAAGGGTTGGACGTGGTGAAGGCCATCGAGAAGGTGGGATCCGCGTCTG
GAAAGACGTCGAAGCCTGTGGTTGTGGCTGACTGTGGTCAGCTCTCTTGGATCGCATGAG
ATCTATCCTCAGTTTTAAAATTAGCGTCGTGGTCGTACTCTAGTGAGTGGTGTTGGGTCC
TCATCGTGTGTCTCTCTGTTTTTGCTTTTGTTTTCTTTTCATCTGGTGTAGTCATGAAAG
CTTGGTGTG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2DC15JQ 713 0 0
GGTGTTCTTCGACATGACCGTAGGTGGCCAGCCTGCTGGAAGGATCGTGATGGAGCTGTA
CACCGACAAGACTCCCAAGACCGCCGAGAATTTCAGAGCTCTCTGCACCGGAGAGAAGGG
AGTCGAACGTAACGGCAAGCCTCTCCACTTCAAGGGGTCTTCCTTCCACCGCGTGATCCC
TAACTTCATGTGCCAGGGAGGCGACTTCACCGCCGGGAACGGGACGGGAGGCGAGTCCAT
CTACGGTGATAAGTTCGCGGACGAGAATTTCGAGAGAAAGCACACCGGTCCTGGGATCCT
GTCCATGGCCAACGCTGGTCCAAACACCAACGGATCTCAGTTCTTTATTTGCACTGTTAA
GACCGATTGGCTTGATGGTAAGCACGTGGTGTTCGGGCAGGTGGTGGAAGGGTTGGACGT
GGTGAAGGCCATCGAGAAGGTGGGATCCGCGTCTGGAAAGACGTCGAAGCCTGTGGTTGT
GGCTGACTGTGGTCAGCTCTCTTGGATCGCATGAGATCTATCCTCAGTTTTAAAATTAGC
GTCGTGGTCGTACTCTAGTGAGTGGTGTTGGGTCCTCATCGTGTGTCTCTCTGTTTTTGC
TTTTGTTTTCTTTTCATCTGGTGTAGTCATGAAAGCTTGGTGTGTTCGGTCTCTTGTCAA
CCTAATTAGTAGCTAGTCCCATAAATAATCAATGAGCTTGTGTTTTACCCCCG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL6167Contig1 503 2 1 U
GGAAGTCATCACACACAAAACAACAAATCAAAGCATCAGTTTAAGTTCTAAGCAAACACG
AGAGAGAAAGAAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCAAGCAGGCCAAGCAACTGG
CCAGACCAAGGAGAAGGCAAGTGGTTTGATGGACAGGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCCGC
TCAAGACTCCATGCAACATGCTGGACAACAGATGAAGCAGAAGGCACAAGGCGCTGCTGA
CGTGGTCAAGGACAAAACTGGCTTGAACAAAAACACTTAACAACTTTCATTTTACTCTAT
TATAGTCCTCTCTTTTAGTTATTTAATAAATTTGGAAATGTTTTAATTCTCATTTCTGCT
GCTCCTGATGTTTATGTAAGGAGATGATTTCCGGCAATATCGCAAGATAGTATCATTTGA
AAGTAGATTTATTCATTACAATTTACATATTATGTAATAATAATTTATACAAATTTTAAA
ACATTAGTTGATATTTCTTGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP32TF U 85
AF RR2DT85TF U 1
BS 1 503 RR2DT85TF

RD RR2BP32TF 132 0 0
GCAAAACCTAAGCTACCAAGCAGGCCAAGCAACTGGCCAGACCAAGGAGAAGGCAAGTGG
TTTGATGGACAGGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCCGCTCAAGACTCCATGCAACATGCTGG
ACAACGGATGAA

QA 1 132 1 132
DS 

RD RR2DT85TF 503 0 0
GGAAGTCATCACACACAAAACAACAAATCAAAGCATCAGTTTAAGTTCTAAGCAAACACG
AGAGAGAAAGAAAATGTCAGACAAGCAAAACCTAAGCTACCAAGCAGGCCAAGCAACTGG
CCAGACCAAGGAGAAGGCAAGTGGTTTGATGGACAGGGCCAAAGATGCTGCTGCTTCCGC
TCAAGACTCCATGCAACATGCTGGACAACAGATGAAGCAGAAGGCACAAGGCGCTGCTGA
CGTGGTCAAGGACAAAACTGGCTTGAACAAAAACACTTAACAACTTTCATTTTACTCTAT
TATAGTCCTCTCTTTTAGTTATTTAATAAATTTGGAAATGTTTTAATTCTCATTTCTGCT
GCTCCTGATGTTTATGTAAGGAGATGATTTCCGGCAATATCGCAAGATAGTATCATTTGA
AAGTAGATTTATTCATTACAATTTACATATTATGTAATAATAATTTATACAAATTTTAAA
ACATTAGTTGATATTTCTTGCCG

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL6168Contig1 680 2 17 U
GGAACAGATAAAACTCAAAGAGAAACAAAAGCTTTACAATAATAACAAATCTCCATCGAT
CATTCATTGCAGCTAAAGAGCATCTGAATCCTACCTAGGGTTTGTTGGCATCTCGTCCAC
AATGACGACCTCTGTTTGCCCTTTCTCCAAAGCTGCTCGTCCCGACGACGCCTCTACTCG
AAAACAAGGCGAAACTACTGCTTCTGCTTGCCCTTTCTCCAAATCCGATCCCTCTGCTCG
AAAACAAGCCGACACGACAGCCTCTGCTTGCCCTTTCTCCAAACCTGATGATGCCTCGGC
TCGTAAAGCATGTCCTGAAAACGAAGGAAGAGTGAACAAGGAGGAATCTACTGATTCCGC
AACGGTTCCTGCCAAGTGCCCGTTTGGTTATGACTCCCAGACGTTCAAGCTTGGGCCTTT
TAGCTGTATGCTATGTCAAGCACTTCTTTATGATAGCAGTAGATGTGTGCCTTGCACACA
TGCGTTCTGCAAGGTGTGCGTATCACGGTTTAAGGACTGCCCTTTATGTGGTGCTGACGT
TGAGAATATTGAAGCTGATGAAAGCCTTCAGAAGATGGTTGATCAGTTTATTGAAAGCCA
TGCTAGGATCAAGAGGTCTGTTGTGAACAGCACAGATGAAGAAGAGGTCGGGAATGATAA
CAAGAAGTGATTTACGCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER54TF U 7
AF RR2FW87TF U 1
BS 1 102 RR2FW87TF
BS 103 103 RR2ER54TF
BS 104 308 RR2FW87TF
BS 309 309 RR2ER54TF
BS 310 336 RR2FW87TF
BS 337 337 RR2ER54TF
BS 338 468 RR2FW87TF
BS 469 469 RR2ER54TF
BS 470 501 RR2FW87TF
BS 502 502 RR2ER54TF
BS 503 537 RR2FW87TF
BS 538 538 RR2ER54TF
BS 539 597 RR2FW87TF
BS 598 598 RR2ER54TF
BS 599 606 RR2FW87TF
BS 607 607 RR2ER54TF
BS 608 680 RR2FW87TF

RD RR2ER54TF 652 0 0
GGA
AAAACTCGAAGAGAAACAAAAGCTTTACAATAATAACAAATCTCCATCGATCATTCATTG
CAGCTAAAGAGCATCTGAATCCTACCTAGGGTTTGTTGGTATCTCGTCCACAATGACGAC
TTCTGTTTGCCCTTTCTCCAAAGCTGCTCGTCCCGACGACGCCTCTACTCGAAAACAAGG
CGAAACTACTGCTTCTGCTTGCCCTTTCTCCAAATCCGATCCCTCTGCTCGAAAACAAGC
CGACACGACAGCCTCTGCTTGCCCTTTCTCCAAACCTGATGATGCCTCGGCTCGTAAAGC
ATGTCCTGAAAACGAAGGAAGAGTGAACAAGGAGGAATCTACTGATTCCGCAACGGTTCC
TGCCAAGTGCCCGTTTGGTTATGACTCCCAGACGTTCAAGCTTGGGCCTTTTAGCTTTAT
GCTATGTCAAGCACTTCTTTATGATAGCAGTAGATGTGTGCCTTGCACACATGTGTTCTG
CAAGGTGTGCGTATCACGGTTTAAGGACTGCCCTTTATGTGGTGCTGACGTTGAGAGTAT
TGAAGCTGATGAAAGCCTTCAGAAGATGGTTGATCAGTTTATTGAAGGCCATGCTAGGAT
CAAGAGGTCTGTTGTGAACAGCACAGGTGAAGAAGAGGTCGGGAATGAT

QA 4 652 4 652
DS 

RD RR2FW87TF 680 0 0
GGAACAGATAAAACTCAAAGAGAAACAAAAGCTTTACAATAATAACAAATCTCCATCGAT
CATTCATTGCAGCTAAAGAGCATCTGAATCCTACCTAGGGTT*GTTGGCATCTCGTCCAC
AATGACGACCTCTGTTTGCCCTTTCTCCAAAGCTGCTCGTCCCGACGACGCCTCTACTCG
AAAACAAGGCGAAACTACTGCTTCTGCTTGCCCTTTCTCCAAATCCGATCCCTCTGCTCG
AAAACAAGCCGACACGACAGCCTCTGCTTGCCCTTTCTCCAAACCTGATGATGCCTCGGC
TCGTAAAGGATGTCCTGAAAACGAAGGAAGAGTGAAGAAGGAGGAATCTACTGATTCCGC
AACGGTTCCTGCCAAGTGCCCGTTTGGTTATGACTCCCAGACGTTCAAGCTTGGGCCTTT
TAGCTGTATGCTATGTCAAGCACTTCTTTATGATAGCAGTAGATGTGTTCCTTGCACACA
TGCGTTCTGCAAGGTGTGCGTGTCACGGTTTAAGGACTGCCCTTTATGTGGTGCTGATGT
TGAGAATATTGAAGCTGATGAAAGCCTTCAGAAGATGGTTGATCAGTTTATTGAAAGTCA
TGCTAG*ATCAAGAGGTCTGTTGTGAACAGCACAGATGAAGAAGAGGTCGGGAATGATAA
CAAGAAGTGATTTACGCTGA

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL6169Contig1 807 2 2 U
GCAAGAAGCGAAGTCGATGAGGTAAAGGAGCTGGTCACCATCGTTAAAGAATATGTCCTC
GGTCTGAAAATGGAGCTTAAGAGAAGAGAGACGAAAGATGATCCAGTGAGGCAGCAGGAG
CTAGCTGCTTACTTCACTCACTGCAACCTCCAACTACCTCACTTACGACTCGCGCTGTTT
AGTGCAATGGGCGTCTGCTACAAGTCAAAGAACCTCGCCACTGCCTATACCTTCGCCAAA
AGATTGCTGGAAACCAACCCAATGGAGAGCCAAGCCAAGACGGCTAGACAAATTGTTCAA
GCCGCTGAACGCAATATGACTGATACAACCGAGCTCAACTACGATTTCAGAAACCCGTTC
GTGATATGTGGGTCAACCTATGTCCCCATCTACAGAGGTCAGAAAGACGTGTCTTGTCCA
TACTGCACTGCTAGGTTTGTACCAAGCCAAGCAGGAAACATATGCGGGGTCTGTGATCTT
GCAGTCATTGGCGCAGACGCATCTGGTCTGGTGTGCTCTCCGTCTCAAGTCCGGTGATCA
GTTCAGATTCATTATCTTGTCCAAACGTAAGGTAAGTACAAGATGCTCTCCTTTTATATG
GAAGAAGAGTGTTGAGCTTTTGGTCTTGGTGGTTGTGTACTTAAAAAATTATTTTGGTTT
GTGAACTTTTCATTGCAGGTTCTATTATTACTATTTCGGTCTTTTAAGTTGTTTCTCATC
TTTGTAACGACCCATGAGAACTTTTACTTGTTGCTCTATATTTCATTTTGTTTGTTTTTT
ATATTTACATAAGTGAGAACTTCAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE77TF U 1
AF RR2EE77JQ C 235
BS 1 640 RR2EE77TF
BS 641 807 RR2EE77JQ

RD RR2EE77TF 640 0 0
GCAAGAAGCGAAGTCGATGAGGTAAAGGAGCTGGTCACCATCGTTAAAGAATATGTCCTC
GGTCTGAAAATGGAGCTTAAGAGAAGAGAGACGAAAGATGATCCAGTGAGGCAGCAGGAG
CTAGCTGCTTACTTCACTCACTGCAACCTCCAACTACCTCACTTACGACTCGCGCTGTTT
AGTGCAATGGGCGTCTGCTACAAGTCAAAGAACCTCGCCACTGCCTATACCTTCGCCAAA
AGATTGCTGGAAACCAACCCAATGGAGAGCCAAGCCAAGACGGCTAGACAAATTGTTCAA
GCCGCTGAACGCAATATGACTGATACAACCGAGCTCAACTACGATTTCAGAAACCCGTTC
GTGATATGTGGGTCAACCTATGTCCCCATCTACAGAGGTCAGAAAGACGTGTCTTGTCCA
TACTGCACTGCTAGGTTTGTACCAAGCCAAGCAGGAAACATATGCGGGGTCTGTGATCTT
GCAGTCATTGGCGCAGACGCATCTGGTCTGGTGTGCTCTCCGTCTCAAGTCCGGTGATCA
GTTCAGATTCATTATCTTGTCCAAACGTAAGGTAAGTACAAGATGCTCTCCTTTTATATG
GAAGAAGAGTGTTGAGCTTTTGGTCTTGGTGGTTGTGTAC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2EE77JQ 573 0 0
GCCAAAAGATTGCTGGAAACCAACCCAATGGAGAGCCAAGCCAAGACGGCTAGACAAATT
GTTCAAGCCGCTGAACGCAATATGACTGATACAACCGAGCTCAACTACGATTTCAGAAAC
CCGTTCGTGATATGTGGGTCAACCTATGTCCCCATCTACAGAGGTCAGAAAGACGTGTTT
TGTCCATACTGCACTGCTAGGTTTGTACCAAGCCAAGCAGGAAACATATGCGGGGTCTGT
GATCTTGCAGTCATTGGCGCAGACGCATCTGGTTTGGTGTGCTCTCCGTCTCAAGTCCGG
TGATCAGTTCAGATTCATTATCTTGTCCAAACGTAAGGTAAGTACAAGATGCTCTCCTTT
TATATGGAAGAAGAGTGTTGAGCTTTTGGTCTTGGTGGTTGTGTACTTAAAAAATTATTT
TGGTTTGTGAACTTTTCATTGCAGGTTCTATTATTACTATTTCGGTCTTTTAAGTTGTTT
CTCATCTTTGTAACGACCCATGAGAACTTTTACTTGTTGCTCTATATTTCATTTTGTTTG
TTTTTTATATTTACATAAGTGAGAACTTCAACT

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL6170Contig1 604 2 2 U
GTGATAATTAATTTATCTGGTACCACACCATCACCAAAATAATAAATTGAAGTACAGTAG
TGGGAAATAACATGATAGGATAAAATTTGGTAGAGAAGATAAATAGAAAGGTTTAGACCT
TTTTGCTTGGATACTATTGATCAGAAGCAGAAGAAAGAGGTTGTTCAGCTTCAACAGCAA
CAGGAGCAGCAGAAGGAGGAGTTGGCTCATTTTTGACAACAACAGGAGCAGAAGGAGAAG
ATGAAGATGGTTTGTCTTCATCAACAACAGATTTGCCTCTCTCTCTAAGCTTAGACATGG
AAGCCTTCATTGCCTTTTTACGCTTCTTGCTCGCTAATACCTTAGCCTGAACTCCACTCA
CATTCGGATCCTTCTTCTCAGCGGCTGGTGGTGGAGGTGGCCGTCTTGCTGCCGCCATTG
CCTCCTCCTTACCGTTCAGGGCGTTCCAACTCCATAGTGCACTGCCTAATCCCACCACAA
TTTCCCCGCGATTAGTTTGTGGAACTGGGAGGATGATGGGTGGAGTCTGTGGCCGTGACG
GCTGTGATAGAGAGGAGATGCTGCCGGCGTGAGCAGCCGGTAAAAGAGGAGAGAGTGAGT
GTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 

AF RR2CZ06TF C 1
AF RR2CZ06JQ U 27
BS 1 26 RR2CZ06TF
BS 27 604 RR2CZ06JQ

RD RR2CZ06TF 603 0 0
GTGATAATTAATTTATCTGGTACCACACCATCACCAAAATAATAAATTGAAGTACAGTAG
TGTGAAATAACATGATAGGATAAAATTTGGTAGAGAAGATAAATAGAAAGGTTTAGACCT
TTTTGCTTGGATACTATTGATCAGAAGCAGAAGAAAGAGGTTGTTCAGCTTCAACAGCAA
CAGGAGCAGCAGAAGGAGGAGTTGGCTCATTTTTGACAACAACAGGAGCAGAAGGAGAAG
ATGAAGATGGTTTGTCTTCATCAACAACAGATTTGCCTCTCTCTCTAAGCTTAGACATGG
AAGCCTTCATTGCCTTTTTACGCTTCTTGCTCGCTAATACCTTAGCCTGAACTCCACTCA
CATTCGGATCCTTCTTCTCAGCGGCTGGTGGTGGAGGTGGCCGTCTTGCTGCCGCCATTG
CCTCCTCCTTACCGTTCAGGGCGTTCCAACTCCATAGTGCACTGCCTAATCCCACCACAA
TTTCCCCGCGATTAGTTTGTGGAACTGGGAGGATGATGGGTGGAGTCTGTGGCCGTGACG
GCTGTGATAGAGAGGAGATGCTGCCGGCGTGAGCAGCCGGTAAAAGAGGAGAGAGTGAGT
TCC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2CZ06JQ 578 0 0
ACCATCACCAAAATAATAAATTGAAGTACAGTAGTGGGAAATAACATGATAGGATAAAAT
TTGGTAGAGAAGATAAATAGAAAGGTTTAGACCTTTTTGCTTGGATACTATTGATCAGAA
GCAGAAGAAAGAGGTTGTTCAGCTTCAACAGCAACAGGAGCAGCAGAAGGAGGAGTTGGC
TCATTTTTGACAACAACAGGAGCAGAAGGAGAAGATGAAGATGGTTTGTCTTCATCAACA
ACAGATTTGCCTCTCTCTCTAAGCTTAGACATGGAAGCCTTCATTGCCTTTTTACGCTTC
TTGCTCGCTAATACCTTAGCCTGAACTCCACTCACATTCGGATCCTTCTTCTCAGCGGCT
GGTGGTGGAGGTGGCCGTCTTGCTGCCGCCATTGCCTCCTCCTTACCGTTCAGGGCGTTC
CAACTCCATAGTGCACTGCCTAATCCCACCACAATTTCCCCGCGATTAGTTTGTGGAACT
GGGAGGATGATGGGTGGAGTCTGTGGCCGTGACGGCTGTGATAGAGAGGAGATGCTGCCG
GCGTGAGCAGCCGGTAAAAGAGGAGAGAGTGAGTGTCC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL6171Contig1 528 2 3 U
GGAACTGAAATCAACTTCAAGCTTGGCATATACTTTCTTGGCAGATTTAGTAGCTAGATC
ATTACTCGGGTGAGCCTTAGATACAAATACAATAAACCATTCCTTGTCATCATTCTGAAC
AATTAATTTCAGACGTGGTTTAAGAATGTTCTTAAACTCATCAAGATCCTCACAGGTCAC
AAGAACTATAGTCGCATATGGTTCTCGGAACCAGTACAAATACTGCTCATGCGGGAACCG
ACTGCGAAGCCTGGCGTCTGTTGTTAATATGAACTCAACCGGCAAATTCTCAACGAGAAC
CGGGTTCCCAGTCTTGTTTGTCAAGACCGCACTCTTCAAGGGCTGATGTTCTTCGAACAA
GCCTTTAACTGTGGGCCACAGATCAGATACATCTTCGACGGCGGCGACGACGCGATCGCA
AGAGTTCTTAATCGTCTGGAACTGAGCCAGATAGTTCGCCATTTCTGAGCAGTGGAAGTA
TCCGATGCCGGAATCTTTTGATAAGATCCGAGATCGGTCTTAACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU83JQ U 45
AF RR2BU83TF C 1
BS 1 44 RR2BU83TF
BS 45 368 RR2BU83JQ
BS 369 528 RR2BU83TF

RD RR2BU83JQ 327 0 0
ATTTAGTAGCTAGATCATTACTCGGGTGAGCCTTAGATACAAATACAATAAACCATTCCT
TGTCATCATTCTGAACAATTAATTTCAGACGTGGTTTAAGAATGTTCTTAAACTCATCAA
GATCCTCACAGGTCACAAGAACTATAGTCGCATATGGTTCTCGGAACCAGTACAAATACT
GCTCATGCGGGAACCGACTGCGAAGCCTGGCGTCTGTTGTTAATATGAACTCAACCGGCA
AATTCTCAACGAGAACCGGGTTCCCAGTCTTGTTTGTCAAGACCGCACTCTTCAAGGGCT
GATGTTCTTCGAACAAGCCTTTAA
GTG

QA 1 324 1 324
DS 

RD RR2BU83TF 528 0 0
GGAACTGAAATCAACTTCAAGCTTGGCATATACTTTCTTGGCAGATTTAGTAGCTAGATC
ATTACTCGGGTGAGCCTTAGATACAAATACAATAAACCATTCCTTGTCATCATTCTGAAC
AATTAATTTCAGACGTGGTTTAAGAATGTTCTTAAACTCATCAAGATCCTCACAGGTCAC
AAGAACTATAGTCGCATATGGTTCTCGGAACCAGTACAAATACTGCTCATGCGGGAACCG
ACTGCGAAGCCTGGCGTCTGTTGTTAATATGAACTCAACCGGCAAATTCTCAACGAGAAC
CGGGTTCCGAGTCTTGTTTGTCAAGACCGCACTCTTCAAGGGCTGATGTTCTTCGAACAA
GCCTTTAACTGTGGGCCACAGATCAGATACATCTTCGACGGCGGCGACGACGCGATCGCA
AGAGTTCTTAATCGTCTGGAACTGAGCCAGATAGTTCGCCATTTCTGAGCAGTGGAAGTA
TCCGATGCCGGAATCTTTTGATAAGATCCGAGATCGGTCTTAACTTCC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL6172Contig1 934 2 8 U
GAATCCCTAATCTGCGGAATCCATCGCTCCAGAGAGATAGAGTATGAAGAGAAAAGTATC
GCCGGAGAGTGAGATCCCCGAAAACCAGGCCAAGAAGACTACCTTCTCCAAGTCTCTTTC
TCCAGGACAAAACTGGAAGTCTAAATCAATGAGGATTATTCCTCAAGAGATTGCGAGAAG
CAACCACGCGGCTTTTGAACACAGAGTGGTGTTCACTGTTCCATGGAAGAACTCCTGGCA
GCTCTGGCTCCAGCGAGACAACAAGAATTGTCTGTTCATGATAAAAGAAGATTGGGATGA
GTTCGTTGACGACAACCTTTTAGGTTCGGATGATACTTTGGTCTTCGCGCATCAAGGCAC
TATGTATTTCCAAGTGCGTATCTTTAAGAAAGATGGGAAAGAGGTCGTCTCCGCTCCTCT
TGAAGTTACTGAACCGGTAACTAAACCGGTTCTTCATTCTAAGCCCGAGAGTTCTCACCA
GGAGGAGACAACCCCTGCCTCTGTTGTATTGGCGACTGAACGACTTTCAGCAAGTGGAGG
GAGGGAGAGTTTTGCTGAGCGATGCCTCTTGAATCCCAACAACCCTTACTTTGAGAAGAC
GCTTAGTAAAACTAACAAGATTCTGTATGTGAGTCCTTTGGTGATTAAGAAGTATGACTT
GGAGTTTGGTCCCCATAATTCTTCCATGGACTTTCTTCTCCCTGATGGAGACAAACTCGA
GGGCTTCACTAAGAGTTACAGCGGTTTATATGCTTTCTCTGGCTGGGAAGATGTTTGTCA
AAAGTACAACCTCAAACAAGGAGACACTGTGGTTTGTGAATTTGAACTCTCTGGACGTGT
TGTCACTGCTGTTAGAGTGCATTTGGTGAGTGAATGAATGAATGAGTCATTGTTTCTGAA
CATAGTTTTTACCGACCTATTATTTTAACGCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT31TF U 1
AF RR2BT31JQ C 162
BS 1 714 RR2BT31TF
BS 715 715 RR2BT31JQ
BS 716 731 RR2BT31TF
BS 732 732 RR2BT31JQ
BS 733 747 RR2BT31TF
BS 748 748 RR2BT31JQ
BS 749 763 RR2BT31TF
BS 764 934 RR2BT31JQ

RD RR2BT31TF 763 0 0
GAATCCCTAATCTGCGGAATCCATCGCTCCAGAGAGATAGAGTATGAAGAGAAAAGTATC
GCCGGAGAGTGAGATCCCCGAAAACCAGGCCAAGAAGACTACCTTCTCCAAGTCTCTTTC
TCCAGGACAAAACTGGAAGTCTAAATCAATGAGGATTATTCCTCAAGAGATTGCGAGAAG
CAACCACGCGGCTTTTGAACACAGAGTGGTGTTCACTGTTCCATGGAAGAACTCCTGGCA
GCTCTGGCTCCAGCGAGACAACAAGAATTGTCTGTTCATGATAAAAGAAGATTGGGATGA
GTTCGTTGACGACAACCTTTTAGGTTCGGATGATACTTTGGTCTTCGCGCATCAAGGCAC
TATGTATTTCCAAGTGCGTATCTTTAAGAAAGATGGGAAAGAGGTCGTCTCCGCTCCTCT
TGAAGTTACTGAACCGGTAACTAAACCGGTTCTTCATTCTAAGCCCGAGAGTTCTCACCA
GGAGGAGACAACCCCTGCCTCTGTTGTATTGGCGACTGAACGACTTTCAGCAAGTGGAGG
GAGGGAGAGTTTTGCTGAGCGATGCCTCTTGAATCCCAACAACCCTTACTTTGAGAAGAC
GCTTAGTAAAACTAACAAGATTCTGTATGTGAGTCCTTTGGTGATTAAGAAGTATGACTT
GGAGTTTGGTCCCCATAATTCTTCCATGGACTTTCTTCTCCCTGATGGAGACAA*CTCGA
GGGCTTCACTA*GAGTTACAGCGGTTT*TATGCTTTCTCTGGC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2BT31JQ 773 0 0
CTCAAGAGATTGCGAGAAGCAACCACGCGGCTTTTGAACACAGAGTGGTGTTCACTGTTC
CATGGAAGAACTCCTGGCAGCTCTGGCTCCAGCGAGACAACAAGAATTGTCTGTTCATGA
TAAAAGAAGATTGGGATGAGTTCGTTGACGACAACCTTTTAGGTTCGGATGATACTTTGG
TCTTCGCGCATCAAGGCACTATGTATTTCCAAGTGCGTATCTTTAAGAAAGATGGGAAAG
AGGTCGTCTCCGCTCCTCTTGAAGTTACTGAACCGGTAACTAAACCGGTTCTTCATTTTA
AGCCCGAGAGTTCTCACCAGGAGGAGACAACCCCTGCCTCTGTTGTATTGGCGACTGAAC
GACTTTCAGCAAGTGGAGGGAGGGAGAGTTTTGCTGAGCGATGCCTCTTGAATCCCAACA
ACCCTTACTTTGAGAAGACGCTTAGTAAAACTAACAAGATTCTGTATGTGAGTCCTTTGG
TGATTAAGAAGTATGACTTGGAGTTTGGTCCCCATAATTCTTCCATGGACTTTCTTCTCC
CTGATGGAGACAAACTCGAGGGCTTCACTAAGAGTTACAGCGGTTTATATGCTTTCTCTG
GCTGGGAAGATGTTTGTCAAAAGTACAACCTCAAACAAGGAGACACTGTGGTTTGTGAAT
TTGAACTCTCTGGACGTGTTGTCACTGCTGTTAGAGTGCATTTGGTGAGTGAATGAATGA
ATGAGTCATTGTTTCTGAACATAGTTTTTACCGACCTATTATTTTAACGCTGG

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL6173Contig1 580 2 2 U
GGAAAAGTAAACTAGGGTTTTCTTTCCCGCCACTGCCTAAATCGTCTCCCGCTTCTTCTT
CGTCTTCCGGAGATGGATACTTCAAGTCCTGCTGCGTTTGTGAATGGAGCTTTGTTGAGA
CGGTACATTGGTCAGAAAGTGATAGCTGTGGTTCAGGTGATCCGGTCTGATATTGGATCC
GTCACTGGGAAATCCACTGATGATCAGCAGATTGTTGTTAAAGGCTCGCCTCCTCCTTCG
CTGACCACTTTCCTCGAGGTTATTGGAATCGCTGAGAGTGACAACACCATTCGAGCTGAT
GTTTGGACCAACTTTGGTGACAATTTCGATGCAGGGAACTACAATGAGCTATGTAAGCTC
GCAAATGGGGAGTTCAGACACGTGTTCATCTAGAATAACAGGGTACCGCCGATGAATAAC
GGAAGCCCTTCTTGTTTCACGCTTGAACTATTTGATCATATTATGAGATTCACTTTTCTG
TATGGAAACTCTTTTAATAGATTCAGTGACTTTGTTGTGTTAATTTGACTATGAATCATA
TGTTTTCTTATTTATTAGTGTTTCGGTTCTCTTCCGTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F912JQ C 1
AF RR2F912TF U 1
BS 1 570 RR2F912TF
BS 571 580 RR2F912JQ

RD RR2F912JQ 580 0 0
GGAAAAGTAAACTAGGGTTTTCTTTCCCGCCACTGCCTAAATCGTCTCCCGCTTCTTCTT
CGTCTTCCGGAGATGGATACTTCAAGTCCTGCTGCGTTTGTGAATGGAGCTTTGTTGAGA
CGGTACATTGGTCAGAAAGTGATAGCTGTGGTTCAGGTGATCCGGTCTGATATTGGATCC
GTCACTGGGAAATCCACTGATGATCAGCAGATTGTTGTTAAAGGCTCGCCTCCTCCTTCG
CTGACCACTTTCCTCGAGGTTATTGGAATCGCTGAGAGTGACAACACCATTCGAGCTGAT
GTTTGGACCAACTTTGGTGACAATTTCGATGCAGGGAACTACAATGAGCTATGTAAGCTC
GCAAATGGGGAGTTCAGACACGTGTTCATCTAGAATAACAGGGTACCGCCGATGAATAAC
GGAAGCCCTTCTTGTTTCACGCTTGAACTATTTGATCATATTATGAGATTCACTTTTCTG
TATGGAAACTCTTTTAATAGATTCAGTGACTTTGTTGTGTTAATTTGACTATGAATCATA
TGTTTTCTTATTTATTAGTGTTTCGGTTCTCTTCCGTTTT

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2F912TF 570 0 0
GGAAAAGTAAACTAGGGTTTTCTTTCCCGCCACTGCCTAAATCGTCTCCCGCTTCTTCTT
CGTCTTCCGGAGATGGATACTTCAAGTCCTGCTGCGTTTGTGAATGGAGCTTTGTTGAGA
CGGTACATTGGTCAGAAAGTGATAGCTGTGGTTCAGGTGATCCGGTCTGATATTGGATCC
GTCACTGGGAAATCCACTGATGATCAGCAGATTGTTGTTAAAGGCTCGCCTCCTCCTTCG
CTGACCACTTTCCTCGAGGTTATTGGAATCGCTGAGAGTGACAACACCATTCGAGCTGAT
GTTTGGACCAACTTTGGTGACAATTTCGATGCAGGGAACTACAATGAGCTATGTAAGCTC
GCAAATGGGGAGTTCAGACACGTGTTCATCTAGAATAACAGGGTACCGCCGATGAATAAC
GGAAGCCCTTCTTGTTTCACGCTTGAACTATTTGATCATATTATGAGATTCACTTTTCTG
TATGGAAACTCTTTTAATAGATTCAGTGACTTTGTTGTGTTAATTTGACTATGAATCATA
TGTTTTCTTATTTATTAGTGTTTCGGTTCT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL6174Contig1 978 2 8 U
GGAAAACACATATACACACTTTCTCTCTTCCTACTTCTTGATCAAAGCCGCTCTCTCCCT
CTCTTTCTACTTCTTGAACAAAGCATTTGGACAGTACAGAGCAGAAGACATGTCGGACGA
CGAGGGAGGTGAAGAGTACCTCTTCAAGATCGTCATCATCGGAGACTCCGCCGTCGGCAA
ATCCAACCTCCTCACCCGCTACGCTCGCAACGAGTTCAACCCCAACTCAAAGGCCACGAT
AGGCGTCGAGTTTCAGACACAGAGCATGGTCATCGACGGCAAAGAAGTCAAAGCTCAGAT
TTGGGATACCGCAGGTCAAGAACGTTTCCGTGCCGTCACTTCCGCTTATTACCGTGGCGC
TGTAGGAGCACTCGTCGTCTACGATATCGCTCGCAGCTCCACCTTCGAAAACATAGGTCG
CTGGCTCGATGAACTCAACACTCACTCTGATACAACAGTAGCGAAGATGCTTATTGGTAA
CAAGTGTGATCTCGAGAGCATTAGAGCGGTGAGTGTTGAGGAAGGGAAAGGCCTTGCGGA
GTCTCATGGTTTGTTTTTCATGGAGACATCAGCGCTTGACTCGACCAATGTGAAGACGGC
TTTCGAGATGGTCATTCGTGAGATCTATGGTATCATTAGTAGGAAGCAGCTTAACTCTGA
TTCTTACAAAGAGGAACTAACTGTGAATCGGGTTAGTTTGGTCCAGAACGAGAATGAAGG
GACGAAGGCGTTTTCTTGCTGTTCGAGTTAATGTCTCTTTGTAACCGGTTTTTGTTTGGA
TCCTGAGGGTTATAACTTATAGAAATATCAGAGACATTGTTTTGGTTCTCAAATGAAGTT
AAAGCAAAAGTGTTATAGAGATACAAAAGAAATGTAAGAAAATTCGGACAAGAAGTTTGG
TCATTGTAGAAGTTAAGTTCTCATTTTTACTTGTAACCTTTGTAAACTTTTTTTTTTGAA
TGAATGTTAAATTTATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU39TF U 1
AF RR2FU39JQ C 196
BS 1 707 RR2FU39TF
BS 708 708 RR2FU39JQ
BS 709 727 RR2FU39TF
BS 728 728 RR2FU39JQ
BS 729 750 RR2FU39TF
BS 751 751 RR2FU39JQ
BS 752 769 RR2FU39TF
BS 770 978 RR2FU39JQ

RD RR2FU39TF 769 0 0
GGAAAACACATATACACACTTTCTCTCTTCCTACTTCTTGATCAAAGCCGCTCTCTCCCT
CTCTTTCTACTTCTTGAACAAAGCATTTGGACAGTACAGAGCAGAAGACATGTCGGACGA
CGAGGGAGGTGAAGAGTACCTCTTCAAGATCGTCATCATCGGAGACTCCGCCGTCGGCAA
ATCCAACCTCCTCACCCGCTACGCTCGCAACGAGTTCAACCCCAACTCAAAGGCCACGAT
AGGCGTCGAGTTTCAGACACAGAGCATGGTCATCGACGGCAAAGAAGTCAAAGCTCAGAT
TTGGGATACCGCAGGTCAAGAACGTTTCCGTGCCGTCACTTCCGCTTATTACCGTGGCGC
TGTAGGAGCACTCGTCGTCTACGATATCGCTCGCAGCTCCACCTTCGAAAACATAGGTCG
CTGGCTCGATGAACTCAACACTCACTCTGATACAACAGTAGCGAAGATGCTTATTGGTAA
CAAGTGTGATCTCGAGAGCATTAGAGCGGTGAGTGTTGAGGAAGGGAAAGGCCTTGCGGA
GTCTCATGGTTTGTTTTTCATGGAGACATCAGCGCTTGACTCGACCAATGTGAAGACGGC
TTTCGAGATGGTCATTCGTGAGATCTATGGTATCATTAGTAGGAAGCAGCTTAACTCTGA
TTCTTACAAAGAGGAACTAACTGTGAATCGGGTTAGTTTGGTCCAGA*CGAGAATGAAGG
GACGAAG*CGTTTTCTTGCTGTTCGAGTTA*TGTCTCTTTGTAACCGGT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2FU39JQ 783 0 0
CCGCTACGCTCGCAACGAGTTCAACCCCAACTCAAAGGCCACGATAGGCGTCGAGTTTCA
GACACAGAGCATGGTCATCGACGGCAAAGAAGTCAAAGCTCAGATTTGGGATACCGCAGG
TCAAGAACGTTTCCGTGCCGTCACTTCCGCTTATTACCGTGGCGCTGTAGGAGCACTCGT
CGTCTACGATATCGCTCGCAGCTCCACCTTCGAAAACATAGGTCGCTGGCTCGATGAACT
CAACACTCACTCTGATACAACAGTAGCGAAGATGCTTATTGGTAACAAGTGTGATCTCGA
GAGCATTAGAGCGGTGAGTGTTGAGGAAGGGAAAGGCCTTGCGGAGTCTCATGGTTTGTT
TTTCATGGAGACATCAGCGCTTGACTCGACCAATGTGAAGACGGCTTTCGAGATGGTCAT
TCGTGAGATCTATGGTATCATTAGTAGGAAGCAGCTTAACTCTGATTCTTACAAAGAGGA
ACTAACTGTGAATCGGGTTAGTTTGGTCCAGAACGAGAATGAAGGGACGAAGGCGTTTTC
TTGCTGTTCGAGTTAATGTCTCTTTGTAACCGGTTTTTGTTTGGATCCTGAGGGTTATAA
CTTATAGAAATATCAGAGACATTGTTTTGGTTCTCAAATGAAGTTAAAGCAAAAGTGTTA
TAGAGATACAAAAGAAATGTAAGAAAATTCGGACAAGAAGTTTGGTCATTGTAGAAGTTA
AGTTCTCATTTTTACTTGTAACCTTTGTAAACTTTTTTTTTTGAATGAATGTTAAATTTA
TTC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL6175Contig1 701 2 2 U
GGACAAACCCCAGCCAAAAGTTCTCAGCCATTGAGAGTTTAACATTTCATCCAAAAAATG
TTTTTTCAGATTATTCAGGAGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTC
GCTGGTATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTTTTTTGTCCTATTCAGTCCGATTCTCGTGCC
AGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTGTCGGCCACCGGCGGCCTCGGTTT
AACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTTTAAGGCGAAGGGAGGGTCAAA
AATATTCAAGGATTGGCCCCCGGCGGAGTCTAAACCAGCGTCTGGGGGTAAACGGAGTAG
GCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTTAATGAGAATTATTGGGATTCCTTA
AATAAAACCTAAAATTATCCAGTCTCTTTAATATAATACTAATTACGCGCGGATGAAACT
AATGTTTCAAATACCATCTTCATATGTATATCGTGTTACGAAATTATGATAAACGTACTC
GATTGTGTTGTATTTTTTAACGAATTAAGTGGTATCAGTCACTATCAGTGAGATTACCAT
AGATGATTATAGTCAAGTTACATTATTGATTCACTGAATCATTCGACTTTGAAACTAGTG
TTGTTTCTACCATTATGTTTTAAAAGATAAACCTTAAAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI08TF U 1
AF RR2GI08JQB C 68
BS 1 651 RR2GI08TF
BS 652 701 RR2GI08JQB

RD RR2GI08TF 651 0 0
GGACAAACCCCAGCCAAAAGTTCTCAGCCATTGAGAGTTTAACATTTCATCCAAAAAATG
TTTTTTCAGATTATTCAGGAGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTC
GCTGGTATAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTTTTTTGTCCTATTCAGTCCGATTCTCGTGCC
AGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTGTCGGCCACCGGCGGCCTCGGTTT
AACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTTTAAGGCGAAGGGAGGGTCAAA
AATATTCAAGGATTGGCCCCCGGCGGAGTCTAAACCAGCGTCTGGGGGTAAACGGAGTAG
GCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTTAATGAGAATTATTGGGATTCCTTA
AATAAAACCTAAAATTATCCAGTCTCTTTAATATAATACTAATTACGCGCGGATGAAACT
AATGTTTCAAATACCATCTTCATATGTATATCGTGTTACGAAATTATGATAAACGTACTC
GATTGTGTTGTATTTTTTAACGAATTAAGTGGTATCAGTCACTATCAGTGAGATTACCAT
AGATGATTATAGTCAAGTTACATTATTGATTCACTGAATCATTCGACTTTG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2GI08JQB 634 0 0
AGATTATTCAGGAGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCTGGTA
TAACCCTTGGTAGCTCAGCCGTTTTTTGTCCTATTCAGTCCGATTCTCGTGCCAGCAACT
ATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTGTCGGCCACCGGCGGCCTCGGTTTAACGGCT
ATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTTTTAAGGCGAAGGGAGGGTCAAAAATATTC
AAGGATTGGCCCCCGGCGGAGTCTAAACCAGCGTCTGGGGGTAAACGGAGTAGGCCTTTC
GTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTTAATGAGAATTATTGGGATTCCTTAAATAAAA
CCTAAAATTATCCAGTCTCTTTAATATAATACTAATTACGCGCGGATGAAACTAATGTTT
CAAATACCATCTTCATATGTATATCGTGTTACGAAATTATGATAAACGTACTCGATTGTG
TTGTATTTTTTAACGAATTAAGTGGTATCAGTCACTATCAGTGAGATTACCATAGATGAT
TATAGTCAAGTTACATTATTGATTCACTGAATCATTCGACTTTGAAACTAGTGTTGTTTC
TACCATTATGTTTTAAAAGATAAACCTTAAAGCT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL6176Contig1 604 2 2 U
GGATTCAACAAATTACAAAGACCTCATTATCTATTTCGGATCATTAGTCTCAGAGCTTCT
CGTCTCGTTTCATCAAATTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTC
ATGCCAAGGCTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCTTGGGGAAAATGGAAGGGGTTGAGTC
ATTTGACATTGATATAAAGAAGCAAAAGGTGACAGTGAAAGGTAATGTTGAACCTGAAGC
AGTTTTTCAAACGGTTTCAAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCTGTGGAGACTGA
GGCTGCGACTGAGAGTAAAACCGAGACTGAGACTAAGACTGAGGCTAAGGTTGATGCAAC
GGCTGATGTTGAGCCAAAACTCGCTGAAGCTGAGACTAAGCCATCACAAGTTTAAATACA
AAAGATGACAATGAGACTTCTTATCCGTATTTCCAGTACTTCTATTATATTTGGCTTGTT
TGTTATTGTAAGAACTAAGAGATTTATGGTTTCTCTATGTACCTAATACTTTTTCTACTA
TTGAAAACAAGATGTTGGAGACCCATGTTGTTACAACTTCTTTTATTATAAGTTTTAACT
TTTT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2DW03TF U 1
AF RR2FT11TF U 2
BS 1 593 RR2DW03TF
BS 594 604 RR2FT11TF

RD RR2DW03TF 593 0 0
GGATTCAACAAATTACAAAGACCTCATTATCTATTTCGGATCATTAGTCTCAGAGCTTCT
CGTCTCGTTTCATCAAATTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTC
ATGCCAAGGCTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCTTGGGGAAAATGGAAGGGGTTGAGTC
ATTTGACATTGATATAAAGAAGCAAAAGGTGACAGTGAAAGGTAATGTTGAACCTGAAGC
AGTTTTTCAAACGGTTTCAAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCTGTGGAGACTGA
GGCTGCGACTGAGAGTAAAACCGAGACTGAGACTAAGACTGAGGCTAAGGTTGATGCAAC
GGCTGATGTTGAGCCAAAACTCGCTGAAGCTGAGACTAAGCCATCACAAGTTTAAATACA
AAAGATGACAATGAGACTTCTTATCCGTATTTCCAGTACTTCTATTATATTTGGCTTGTT
TGTTATTGTAAGAACTAAGAGATTTATGGTTTCTCTATGTACCTAATACTTTTTCTACTA
TTGAAAACAAGATGTTGGAGACCCATGTTGTTACAACTTCTTTTATTATAAGT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2FT11TF 603 0 0
GATTCAACAAATTACAAAGACCTCATTATCTATTTCGGATCATTAGTCTCAGAGCTTCTC
GTCTCGTTTCATCAAATTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTCA
TGCCAAGGCTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCTTGGGGAAAATGGAAGGGGTTGAGTCA
TTTGACATTGATATAAAGGAGCAAAAGGTGACAGTGAAAGGTAATGTTGAACCTGAAGCA
GTTTTTCAAACGGTTTCAAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCTGTGGAGACTGAG
GCTGCGACTGAGAGTAAAACCGAGACTGAGACTAAGACTGAGGCTAAGGTTGATGCAACG
GCTGATGTTGAGCCGAAACTCGCTGAAGCTGAGACTAAGCCATCACAAGTTTAAATACAA
AAGATGACAATGAGACTTCTTATCCGTATTTCCAGTACTTCTATTATATTTGGCTTGTTT
GTTATTGTAAGAACTAAGAGATTTATGGTTTCTCTATGTACCTAATACTTTTTCTACTAT
TGAAAACAAGATGTTGGAGACCCATGTTGTTACAACTTCTTTTATTATAAGTTTTAACTT
TTT

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL6177Contig1 1210 2 2 U
GAACGCTAAATTTTCTTCGATTAAAGTTCTCCCTAATAAGAGTTCTCTCTGTCCCGATTA
TCAAGGCGTCGTCACCGTTCATCTCTTCTCGTTCTTAGCTTCATCGTCAGCCTCCTTTGT
TTTACTTTTGGTCCGTGTCTCTCCTTTGCGTCGGACCGTTTGTCTCCTCCGACGAAGGCG
TTCAGCTTGGACTCAAGTGACGTCTCCATGTTCATTGTGCTTGCCGCAGTCCGCTTCTCT
GGGGATTCCCGGAAAGCCTTTTCAAACGGCTCCTCGTTTCACTGCGTCCTCCACCACTGC
AACTCTCTCTCTTCTTGTTCCAGATCTGTAAGACAAAGCGTGGTAGCCAAAGAACTGCAC
CGAAAATCGCATCCCATCCCACTGCAATCACCTTCCACGCTCTCCGCCATTGATGATATA
GATCCCTGCTTTGTCGACAGATTTTGCTACTGCAGAGAAGTAATAACTGAGGCAACTGAG
ATCCAACTCGCAGAAAGAGTCGACTGCTCTGGCGTCTCTCTTGATGCTATCTGCCTCTCA
AGTGGCGACATCTCCCCTGTCTCCGGCGACCGTCTACAACTATGCAAATCTCCGACGATG
TTATCGGAAGAGTCAAAGCCGTCAGGTATTTGTTCATGGGCCATGCCCGTTATTTTTATT
GAGCTGGTTAGCTCTAAGCCTAACCTATCAGGATCCGGGTCCAGTGAAATGGATGTTGTG
GTTTTGATATTTGTGGTTAGATTGCAAAGGATTTCCGGTGGATTCACCGGGGCCTTTGAA
TTGCGTTTAATGCTATACTTATCTTGTGCGAAGATTAATTTTCCGGTGAGCTCACCGTGT
TGGTTCGTGGTTCTATCTGTGCTTGATTCATCTTTCTCAATGGAGGAATGGATTTCGCCA
CCCTACCTTTTTTCTATGAAAGGAGATGGTTTTCCGAATCTGGTATCAAGGTTCGGTTTC
AGCTTCTTCACTAGTGAGGGCTGGTTTTCAACGTCACTATATGTTACTATTTCTCTGCCG
TTCGACTCTGTCGTAAAGGCTATGTCATTGACGCATTCAAGCTTCGTCTCGAATTCGCTG
TCACCTTCTCATGAAGAACTATCCCGTTTGTTTTGCAATGTTGTAAGTTTTCTTTTCAAT
CAAAGAGGATGGATAATTCCCTCAGACTGTTGTAATCTTTTAAGTTGAGAAGTGAAAAAT
AAGTTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E867TF U 1
AF RR2E867JQ C 406
BS 1 621 RR2E867TF
BS 622 1210 RR2E867JQ

RD RR2E867TF 621 0 0
GAACGCTAAATTTTCTTCGATTAAAGTTCTCCCTAATAAGAGTTCTCTCTGTCCCGATTA
TCAAGGCGTCGTCACCGTTCATCTCTTCTCGTTCTTAGCTTCATCGTCAGCCTCCTTTGT
TTTACTTTTGGTCCGTGTCTCTCCTTTGCGTCGGACCGTTTGTCTCCTCCGACGAAGGCG
TTCAGCTTGGACTCAAGTGACGTCTCCATGTTCATTGTGCTTGCCGCAGTCCGCTTCTCT
GGGGATTCCCGGAAAGCCTTTTCAAACGGCTCCTCGTTTCACTGCGTCCTCCACCACTGC
AACTCTCTCTCTTCTTGTTCCAGATCTGTAAGACAAAGCGTGGTAGCCAAAGAACTGCAC
CGAAAATCGCATCCCATCCCACTGCAATCACCTTCCACGCTCTCCGCCATTGATGATATA
GATCCCTGCTTTGTCGACAGATTTTGCTACTGCAGAGAAGTAATAACTGAGGCAACTGAG
ATCCAACTCGCAGAAAGAGTCGACTGCTCTGGCGTCTCTCTTGATGCTATCTGCCTCTCA
AGTGGCGACATCTCCCCTGTCTCCGGCGACCGTCTACAACTATGCAAATCTCCGACGATG
TTATCGGAAGAGTCAAAGCCG

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2E867JQ 805 0 0
GCCATTGATGATATAGATCC*TGCTTTGTCGACAGATTTTGCTACTGCAGAGAAGTAATA
ACTGAGGCAACTGAGATCCAACTCGCAGAAAGAGTCGACTGCTCTGGCGTCTCTCTTGAT
GCTATCTGCCTCTCAAGTGGCGACATCTCCCCTGTCTCCGGCGACCGTCTACAACTATGC
AAATCTCCGACGATGTTATCGGAAGAGTCAAAGCCGTCAGGTATTTGTTCATGGGCCATG
CCCGTTATTTTTATTGAGCTGGTTAGCTCTAAGCCTAACCTATCAGGATCCGGGTCCAGT
GAAATGGATGTTGTGGTTTTGATATTTGTGGTTAGATTGCAAAGGATTTCCGGTGGATTC
ACCGGGGCCTTTGAATTGCGTTTAATGCTATACTTATCTTGTGCGAAGATTAATTTTCCG
GTGAGCTCACCGTGTTGGTTCGTGGTTCTATCTGTGCTTGATTCATCTTTCTCAATGGAG
GAATGGATTTCGCCACCCTACCTTTTTTCTATGAAAGGAGATGGTTTTCCGAATCTGGTA
TCAAGGTTCGGTTTCAGCTTCTTCACTAGTGAGGGCTGGTTTTCAACGTCACTATATGTT
ACTATTTCTCTGCCGTTCGACTCTGTCGTAAAGGCTATGTCATTGACGCATTCAAGCTTC
GTCTCGAATTCGCTGTCACCTTCTCATGAAGAACTATCCCGTTTGTTTTGCAATGTTGTA
AGTTTTCTTTTCAATCAAAGAGGATGGATAATTCCCTCAGACTGTTGTAATCTTTTAAGT
TGAGAAGTGAAAAATAAGTTGTGTT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

CO CL6178Contig1 802 2 2 U
TTCACCAACCACATCTTTCTCTCTTCTAACAATCAACCCTAATAATTCCAAAAATGGAAG
CCACCATCTTCAAGGGGCAGAAGAAGCTCATCATCAGCCCTAGCGATGCACAAACAGTCA
TACTCAATAACCAAATCAAAGCCAAAGATACGTATAATTCACATATATGCACCTGAGATC
ATCAAGACCGACGTTGCCAACTTCCGTGAGCTCGTGCAAAGCCTCACCGGCAAACCAGAA
ACCCATGGCGTTTCCAAAACAAAACCAAGAAGAGATACTCATTGTCAAGTCCAAGACATG
ACCAACATGGAAAAACTGAGAGAACCAGAATGTTATGATCAAAGGTTCTGCTTAAACTCA
GAGATGGAAGAGATCTCGATGACATGGAACGGTAATAACGGCATTGGTGAGAGCTCCGGA
GAGGTTCCTGAATGGTATGGGAGATTTCGAAGGGGTTTATCCAAGAACTTGGTGAATTTC
CCTATCTGCCCTTGACATCCATGGATGTTTCTGCTTCTTCTAATTCATCTTCTTCCTCGC
ATTTACATGGCGGATCAATGTTCTCAGATTCTCACCACCAGTTCGTGTGACTCTCTCTGT
CTCTCAAACGAAGTAACTTTTTCTTTTTAAGTGTTGTAATTTATTTTGTTTATTTAGGTT
TTTGTTGAAAATAAATTTAATTTATTAATTTTGTTTACTATGAAGTTAATTAATTTATTT
ATTGCATGAAAAGCTTAGGCTCCTTTTAATCCTCCATTAATGTCTCATGAGTTCATCGTG
TCAAGCATGTTACACTTACAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G217TF U 1
AF RR2G217JQ C 34
BS 1 653 RR2G217TF
BS 654 802 RR2G217JQ

RD RR2G217TF 653 0 0
TTCACCAACCACATCTTTCTCTCTTCTAACAATCAACCCTAATAATTCCAAAAATGGAAG
CCACCATCTTCAAGGGGCAGAAGAAGCTCATCATCAGCCCTAGCGATGCACAAACAGTCA
TACTCAATAACCAAATCAAAGCCAAAGATACGTATAATTCACATATATGCACCTGAGATC
ATCAAGACCGACGTTGCCAACTTCCGTGAGCTCGTGCAAAGCCTCACCGGCAAACCAGAA
ACCCATGGCGTTTCCAAAACAAAACCAAGAAGAGATACTCATTGTCAAGTCCAAGACATG
ACCAACATGGAAAAACTGAGAGAACCAGAATGTTATGATCAAAGGTTCTGCTTAAACTCA
GAGATGGAAGAGATCTCGATGACATGGAACGGTAATAACGGCATTGGTGAGAGCTCCGGA
GAGGTTCCTGAATGGTATGGGAGATTTCGAAGGGGTTTATCCAAGAACTTGGTGAATTTC
CCTATCTGCCCTTGACATCCATGGATGTTTCTGCTTCTTCTAATTCATCTTCTTCCTCGC
ATTTACATGGCGGATCAATGTTCTCAGATTCTCACCACCAGTTCGTGTGACTCTCTCTGT
CTCTCAAACGAAGTAACTTTTTCTTTTTAAGTGTTGTAATTTATTTTGTTTAT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2G217JQ 769 0 0
TC
ACCCTAATAAT*CCAAAAATGGAAGCCACCATCTTCAAGGG*CAGAAGAAGCTCATCATC
AGCCCTAGCGATGCACAAACAGTCATACTCAATAACCAAATCAAAGCCAAAGATACGTAT
AATTCACATATATGCACCTGAGATCATCAAGACCGACGTTGCCAACTTCCGTGAGCTCGT
GCAAAGCCTCACCGGCAAACCAGAAACCCATGGCGTTTCCAAAACAAAACCAAGAAGAGA
TACTCATTGTCAAGTCCAAGACATGACCAACATGGAAAAACTGAGAGAACCAGAATGTTA
TGATCAAAGGTTCTGCTTAAACTCAGAGATGGAAGAGATCTCGATGACATGGAACGGTAA
TAACGGCATTGGTGAGAGCTCCGGAG*GGTTCCTGAATGGTATGGGAGATTTCGAAGGG*
TTTATCCAAGAACTTGGTGAATTTCCCTATCTGCCCTTGACATCCATGGATGTTTTTGCT
TCTTTTAATTCATCTTTTTCCTCGCATTTACATGGCGGATCAATGTTTTCAGATTCTCAC
CACCAGTTCGTGTGACTCTCTCTGTCTCTCAAACGAAGTAACTTTTTCTTTTTAAGTGTT
GTAATTTATTTTGTTTATTTAGGTTTTTGTTGAAAATAAATTTAATTTATTAATTTTGTT
TACTATGAAGTTAATTAATTTATTTATTGCATGAAAAGCTTAGGCTCCTTTTAATCCTCC
ATTAATGTCTCATGAGTTCATCGTGTCAAGCATGTTACACTTACAAT

QA 3 769 3 769
DS 



AS 1 2

CO CL6179Contig1 579 2 1 U
GGAGCTTATTAAAACTTTCACGTCTAAAAGTATCGTTTCTTGTGGTAAACATGAGCTCGG
AGAAGAAACAAGAACGCCTCGGAGAAGATAACGGTGATGGAAACAAAGGGTTATCGTCAA
CGGAAGTTGTACGTACGGTAACGGAGGAAGAAGTGGATGAGTTTTTCAAGATACTACGTA
GAGTACACGTGGCGACACGGACGGCTGCGAAAGTTAACGTCGGTGTCGATGAACGAGAGT
TACCGTCTAAGAAAGGGAAACGGAGTCAGAGTCTTGGTTTGGTAAACTCATTGCATGGTA
ACGGTGTTAGAGACGGAGAACTCGATGGAATAACTCGGGTCGGGTTAAGGAATTCGGGTT
TGGATCTGAACTGTAAACCGGAACCTGAAACCGTTAGTTTGTAATCCTTCTCCAGAGTTT
TACATCTTTCTTCCTATAATTATTTTTCAATATTACCTAAATAGTTCTTAACATTCTATA
CGACAATATTAGTTTATAGTAGTATATTTACGAAGCTTCATATTAGCTCTTGTTCATGAG
CATAAATCATAAATGCTGCCAATAAAAATCTTTGTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GF15JQ C 1
AF RR2GF15TF U 1
BS 1 579 RR2GF15TF

RD RR2GF15JQ 579 0 0
GGAGCTTATTAAAACTTTCACGTCTAAAAGTATCGTTTCTTGTGGTAAACATGAGCTCGG
AGAAGAAACAAGAACGCCTCGGAGAAGATAACGGTGATGGAAACAAAGGGTTATCGTCAA
CGGAAGTTGTACGTACGGTAACGGAGGAAGAAGTGGATGAGTTTTTCAAGATACTACGTA
GAGTACACGTGGCGACACGGACGGCTGCGAAAGTTAACGTCGGTGTCGATGAACGAGAGT
TACCGTCTAAGAAAGGGAAACGGAGTCAGAGTCTTGGTTTGGTAAACTCATTGCATGGTA
ACGGTGTTAGAGACGGAGAACTCGATGGAATAACTCGGGTCGGGTTAAGGAATTCGGGTT
TGGATCTGAACTGTAAACCGGAACCTGAAACCGTTAGTTTGTAATCCTTCTCCAGAGTTT
TACATCTTTCTTCCTATAATTATTTTTCAATATTACCTAAATAGTTCTTAACATTCTATA
CGACAATATTAGTTTATAGTAGTATATTTACGAAGCTTCATATTAGCTCTTGTTCATGAG
CATAAATCATAAATGCTGCCAATAAAAATCTTTGTTTTT

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2GF15TF 579 0 0
GGAGCTTATTAAAACTTTCACGTCTAAAAGTATCGTTTCTTGTGGTAAACATGAGCTCGG
AGAAGAAACAAGAACGCCTCGGAGAAGATAACGGTGATGGAAACAAAGGGTTATCGTCAA
CGGAAGTTGTACGTACGGTAACGGAGGAAGAAGTGGATGAGTTTTTCAAGATACTACGTA
GAGTACACGTGGCGACACGGACGGCTGCGAAAGTTAACGTCGGTGTCGATGAACGAGAGT
TACCGTCTAAGAAAGGGAAACGGAGTCAGAGTCTTGGTTTGGTAAACTCATTGCATGGTA
ACGGTGTTAGAGACGGAGAACTCGATGGAATAACTCGGGTCGGGTTAAGGAATTCGGGTT
TGGATCTGAACTGTAAACCGGAACCTGAAACCGTTAGTTTGTAATCCTTCTCCAGAGTTT
TACATCTTTCTTCCTATAATTATTTTTCAATATTACCTAAATAGTTCTTAACATTCTATA
CGACAATATTAGTTTATAGTAGTATATTTACGAAGCTTCATATTAGCTCTTGTTCATGAG
CATAAATCATAAATGCTGCCAATAAAAATCTTTGTTTTT

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL6180Contig1 1053 2 2 U
GAACGCCATTTAGCGTTATAATTAATCACGATACATTCCCTCGCTTGAAGATAAGTTGAG
AAAAGCATCAGTCTCGTCTCTTCTACATCGTGGAAGAGAATCTAAAGAGATCATCATCTG
ATGGGTCTTCTCTCCAACAGAATTGATCGATCGAGTTTGAAACCTGGAGATCATATCTAT
TCGTGGAGAACCGCTTACATCTATGCCCATCACGGTATCTATGTTGGAGATGATAGAGTC
ATCCATTTCACAAGACGAGGCCAAGAAGTTGGAACCGGAACCGTTCTCGATCTCATACTC
GTGAGCTCAGGTCCATCGCGAACCCACACGCACTGTCCAACGTGCGTTCCACCCAACGAA
GGCCACGGCGTCGTTTCCTCGTGCCTAAACTGTTTCCTAGCCGGCGGCGCCTTGTACCGC
TTCGAGTACTCCGTCAACGCCGCTCACTTCCTCGCCAAAGCCCGTGGAGGAACCTGCACG
CTCGCGGTCTCCGACCCCAACGACGTAGTCGTCCACCGGGCCAACCACCTCCTCAGAAAC
GGGTTCGGATGCTACGACGTTTTCAAGAACAACTGCGAGGATTTCGCGATATACTGCAAG
ACGGGGTTGCTTGTTCTCGAAGGAAGAAGGACGATGGGGCAGAGCGGTCAGGCTGTTTCG
ATCATCGGCGGGCCGATAGCTGCTGTTTTGTCCACGCCGATGAGGCTTGTGACGACGAAT
ATCTATGGGATGGCTGCGACGGCGGTCGGTGTGTACTGTGCGAGTAGGTACGCTACTGAT
ATCGGAATGAGAGCTGACGTAGCGAAAGTTGAAGTGGAGGATCTCACAAGGAGGCTCTCT
GTAGGGTTGTTCCAAGTGATTGAGCCTACGGTGGCAGCCGTAGCTTTGCCAAACGCAAGT
TGATAGATAAAGCTTAAGCTTCATCTGTTGCTTTCTTGTTTCAGTGATTGTATCATGTGT
ATCCAGTTGCCTTTCCTTTCTAAACACATTCTAATAAGCAAACTCTACTTGTATACTTAT
ATGTTTTTCATGAACAAGTGATCGTTGTGTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G626TF U 1
AF RR2G626JQ C 430
BS 1 606 RR2G626TF
BS 607 1053 RR2G626JQ

RD RR2G626TF 607 0 0
GAACGCCATTTAGCGTTATAATTAATCACGATACATTCCCTCGCTTGAAGATAAGTTGAG
AAAAGCATCAGTCTCGTCTCTTCTACATCGTGGAAGAGAATCTAAAGAGATCATCATCTG
ATGGGTCTTCTCTCCAACAGAATTGATCGATCGAGTTTGAAACCTGGAGATCATATCTAT
TCGTGGAGAACCGCTTACATCTATGCCCATCACGGTATCTATGTTGGAGATGATAGAGTC
ATCCATTTCACAAGACGAGGCCAAGAAGTTGGAACCGGAACCGTTCTCGATCTCATACTC
GTGAGCTCAGGTCCATCGCGAACCCACACGCACTGTCCAACGTGCGTTCCACCCAACGAA
GGCCACGGCGTCGTTTCCTCGTGCCTAAACTGTTTCCTAGCCGGCGGCGCCTTGTACCGC
TTCGAGTACTCCGTCAACGCCGCTCACTTCCTCGCCAAAGCCCGTGGAGGAACCTGCACG
CTCGCGGTCTCCGACCCCAACGACGTAGTCGTCCACCGGGCCAACCACCTCCTCAGAAAC
GGGTTCGGATGCTACGACGTTTTCAAGAACAACTGCGAGGATTTCGCGATATACTGCAAG
ACGGGG
G

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2G626JQ 624 0 0
TCCGTCAACGCCGCTCACTTCCTCGCCAAAGCCCGTGGAGGAACCTGCACGCTCGCGGTC
TCCGACCCCAACGACGTAGTCGTCCACCGGGCCAACCACCTCCTCAGAAACGGGTTCGGA
TGCTACGACGTTTTCAAGAACAACTGCGAGGATTTCGCGATATACTGCAAGACGGGGTTG
CTTGTTCTCGAAGGAAGAAGGACGATGGGGCAGAGCGGTCAGGCTGTTTCGATCATCGGC
GGGCCGATAGCTGCTGTTTTGTCCACGCCGATGAGGCTTGTGACGACGAATATCTATGGG
ATGGCTGCGACGGCGGTCGGTGTGTACTGTGCGAGTAGGTACGCTACTGATATCGGAATG
AGAGCTGACGTAGCGAAAGTTGAAGTGGAGGATCTCACAAGGAGGCTCTCTGTAGGGTTG
TTCCAAGTGATTGAGCCTACGGTGGCAGCCGTAGCTTTGCCAAACGCAAGTTGATAGATA
AAGCTTAAGCTTCATCTGTTGCTTTCTTGTTTCAGTGATTGTATCATGTGTATCCAGTTG
CCTTTCCTTTCTAAACACATTCTAATAAGCAAACTCTACTTGTATACTTATATGTTTTTC
ATGAACAAGTGATCGTTGTGTGTC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6182Contig1 719 2 5 U
GGAAAAACACATATACTTAAAAAGTAAAAAGAACTAATCTCTCACAGATTCGACTGGTCA
AACAAAAAAAGAAAAAAAACAAACCAAAGAACTCGAGATGAAAGGCGGCCAATCGAAAGC
TGAAGCGACGAGCACCGACCAGAGACTGAAAACAAGAGGAAGGAAGAAGAAGACGGCGAC
GAAGGACCCAAACAAACCAAAGAGACCTCCAAGCGCTTTCTTCGTCTTCCTAGATGATTT
TCGACGGGAGTTCAAAGAGGCGAACCCTAACAACAAGTCCGTCGCCGCCGTTGGTAAGGC
TGCTGGAGAGAAGTGGAAGTCTATGAGTGAAGAAGAAAAGCTCCTTATGCTTCCAAGGCA
GAGACCAGAAAGAGTGAATATAATAAGAGTATGCAACAGTACAACATGAAACTGGCTAAT
GGAACCAGTAGAGGTGAAGATGATGAGTCCAAGTCTGAAGTGGACGAAGCTGGAGGAGGA
AGCGAAGAGGAGGAAGAAGACGATGATTAAGGAGGCTTTCTAGTTATTGCTATTTGACTG
ACTCATATTTGAGGATGGGATTAGGAATTTAAGTGTGACCTTAAACCTAAAAAAAATGGT
TATGCTTTGTGTGTTTTGTAATATTAAGAACCTCATTTGCTACTTGTTTTGTGTTTTGTA
ATATTAAGAACCTCATTACCTTCGGTGTTTGTTTATTAAGGATTTATTTGATGAGTGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GQ85JQ C 1
AF RR2GQ85TF U 1
BS 1 684 RR2GQ85TF
BS 685 685 RR2GQ85JQ
BS 686 700 RR2GQ85TF
BS 701 701 RR2GQ85JQ
BS 702 719 RR2GQ85TF

RD RR2GQ85JQ 719 0 0
GGAAAAACACATATACTTAAAAAGTAAAAAGAACTAATCTCTCACAGATTCGACTGGTCA
AACAAAAAAAGAAAAAAAACAAACCAAAGAACTCGAGATGAAAGGCGGCCAATCGAAAGC
TGAAGCGACGAGCACCGACCAGAGACTGAAAACAAGAGGAAGGAAGAAGAAGACGGCGAC
GAAGGACCCAAACAAACCAAAGAGACCTCCAAGCGCTTTCTTCGTCTTCCTAGATGATTT
TCGACGGGAGTTCAAAGAGGCGAACCCTAACAACAAGTCCGTCGCCGCCGTTGGTAAGGC
TGCTGGAGAGAAGTGGAAGTCTATGAGTGAAGAAGAAAAGCTCCTTATGCTTCCAAGGCA
GAGACCAGAAAGAGTGAATATAATAAGAGTATGCAACAGTACAACATGAAACTGGCTAAT
GGAACCAGTAGAGGTGAAGATGATGAGTCCAAGTCTGAAGTGGACGAAGCTGGAGGAGGA
AGCGAAGAGGAGGAAGAAGACGATGATTAAGGAGGCTTTCTAGTTATTGCTATTTGACTG
ACTCATATTTGAGGATGGGATTAGGAATTTAAGTGTGACCTTAAACCTAAAAAAAATGGT
TATGCTTTGTGTGTTTTGTAATATTAAGAACCTCATTTGCTACTTGTTTTGTGTTTTGTA
ATATTAAGAACCTCATTACCTTCGGTGTTTGTTTATTAAGGATTTATTTGATGAGTGGC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2GQ85TF 719 0 0
GGAAAAACACATATACTTAAAAAGTAAAAAGAACTAATCTCTCACAGATTCGACTGGTCA
AACAAAAAAAGAAAAAAAACAAACCAAAGAACTCGAGATGAAAGGCGGCCAATCGAAAGC
TGAAGCGACGAGCACCGACCAGAGACTGAAAACAAGAGGAAGGAAGAAGAAGACGGCGAC
GAAGGACCCAAACAAACCAAAGAGACCTCCAAGCGCTTTCTTCGTCTTCCTAGATGATTT
TCGACGGGAGTTCAAAGAGGCGAACCCTAACAACAAGTCCGTCGCCGCCGTTGGTAAGGC
TGCTGGAGAGAAGTGGAAGTCTATGAGTGAAGAAGAAAAGCTCCTTATGCTTCCAAGGCA
GAGACCAGAAAGAGTGAATATAATAAGAGTATGCAACAGTACAACATGAAACTGGCTAAT
GGAACCAGTAGAGGTGAAGATGATGAGTCCAAGTCTGAAGTGGACGAAGCTGGAGGAGGA
AGCGAAGAGGAGGAAGAAGACGATGATTAAGGAGGCTTTCTAGTTATTGCTATTTGACTG
ACTCATATTTGAGGATGGGATTAGGAATTTAAGTGTGACCTTAAACCTAAAAAAAATGGT
TATGCTTTGTGTGTTTTGTAATATTAAGAACCTCATTTGCTACTTGTTTTGTGTTTTGTA
ATATTAAGAACCTCATTACCTTCG*TGTTTGTTTATTAAG*ATTTATTTGATGAGTGGC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL6183Contig1 579 2 1 U
GGATCCTTATCAAATCGATTTGTTTTCCTAGCAAACCCTAAGTTTCGACGAATCGCATAC
AGTTCCTTCTCCGGATCGAATGGCCATGGCTAAGAGTTCCTTCAAGCTTTCTCATCCTCT
CGAAGCAAGGATGGGTGAAGCTACTAGAATCAGAGAGAAGTACCCTGACAGAGTCCCTGT
GATCGTTGAAAAGGCTGGACAAAGTGATGTTCCTGACATTGACAAGAGAAAGTATCTCGT
CCCAGCAGACCTAACGGTTGGTCAATTTGTTTACGTGGTTCGCAAAAGAATCAAGCTCGG
TGCTGAGAAAGCAATCTTCGTCTTTGTCAAGAACACATTGCCTCCAACTGCTGCATTGAT
GTCTGCAATCTATGAAGAGCACAAAGATGAAGATGGGTTCCTCTACATGACTTACAGTGG
AGAGAACACTTTTGGTTCTCTTATCGCTCATTGAATAATCTTTCGATCTTGATGTATATG
CATAAACTAGGAAGATAAGATGCACATTCCTTTTCCTTCTTTGGCTTTTGCTTTGCTTTT
GATGTTTTGGATTTTATAATATTTAGAAACCTTTCTTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D775JQ C 1
AF RR2D775TF U 1
BS 1 579 RR2D775TF

RD RR2D775JQ 579 0 0
GGATCCTTATCAAATCGATTTGTTTTCCTAGCAAACCCTAAGTTTCGACGAATCGCATAC
AGTTCCTTCTCCGGATCGAATGGCCATGGCTAAGAGTTCCTTCAAGCTTTCTCATCCTCT
CGAAGCAAGGATGGGTGAAGCTACTAGAATCAGAGAGAAGTACCCTGACAGAGTCCCTGT
GATCGTTGAAAAGGCTGGACAAAGTGATGTTCCTGACATTGACAAGAGAAAGTATCTCGT
CCCAGCAGACCTAACGGTTGGTCAATTTGTTTACGTGGTTCGCAAAAGAATCAAGCTCGG
TGCTGAGAAAGCAATCTTCGTCTTTGTCAAGAACACATTGCCTCCAACTGCTGCATTGAT
GTCTGCAATCTATGAAGAGCACAAAGATGAAGATGGGTTCCTCTACATGACTTACAGTGG
AGAGAACACTTTTGGTTCTCTTATCGCTCATTGAATAATCTTTCGATCTTGATGTATATG
CATAAACTAGGAAGATAAGATGCACATTCCTTTTCCTTCTTTGGCTTTTGCTTTGCTTTT
GATGTTTTGGATTTTATAATATTTAGAAACCTTTCTTCG

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2D775TF 579 0 0
GGATCCTTATCAAATCGATTTGTTTTCCTAGCAAACCCTAAGTTTCGACGAATCGCATAC
AGTTCCTTCTCCGGATCGAATGGCCATGGCTAAGAGTTCCTTCAAGCTTTCTCATCCTCT
CGAAGCAAGGATGGGTGAAGCTACTAGAATCAGAGAGAAGTACCCTGACAGAGTCCCTGT
GATCGTTGAAAAGGCTGGACAAAGTGATGTTCCTGACATTGACAAGAGAAAGTATCTCGT
CCCAGCAGACCTAACGGTTGGTCAATTTGTTTACGTGGTTCGCAAAAGAATCAAGCTCGG
TGCTGAGAAAGCAATCTTCGTCTTTGTCAAGAACACATTGCCTCCAACTGCTGCATTGAT
GTCTGCAATCTATGAAGAGCACAAAGATGAAGATGGGTTCCTCTACATGACTTACAGTGG
AGAGAACACTTTTGGTTCTCTTATCGCTCATTGAATAATCTTTCGATCTTGATGTATATG
CATAAACTAGGAAGATAAGATGCACATTCCTTTTCCTTCTTTGGCTTTTGCTTTGCTTTT
GATGTTTTGGATTTTATAATATTTAGAAACCTTTCTTCG

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL6184Contig1 780 2 2 U
GCCTGAGTCATGTGATATGACGAAACTGAGCACCTCCTTCTCACATGGGCTCTTGACGAT
TGAGTTTCCGCTGGTCGTGGAAAGTGAGAAAGCGGGGAAGATGGCTAATGACAAGGGAAA
GACTGTGCAGAGGCCTAATCTTGAGGGGAACAGAGGGACTGGTCCTGACGGGAGTAGCGT
GAGAAGAAGCAGACTTTCGGACAAGGAGAATCAAGTGGGAACAAGTCAAGAGAAAACTGG
TCCAACGGCGGGAAAAGAAGAACCAAAAACGTATAAATCAGTGCTTGAGGGCAAGAGAGA
GGTGCCAGCTGCAAATCGAGTGAAGAATGAACAGAAACTGAAAGAGGGAGAAGCTAGCCC
TAGCTTGGGACATAAGGAACATTCGAAACAAGAGAAGGTGGTTGAGAAAAAGGAGCTTTC
TCAAATGGGTCAACAAAAGACTGTACAGAAGCTGAAGGACGAAGAGGCTAGAGGTAGACC
GACCGTTGGTGGTAGCTTGAAAGCCAAGGTACCTCCTGCACAAGAAGAGAAGGTGACTGA
GAGAAAGAAACATGGTGATATTGGTCAGAAAAAGACTGAACAGAAGGTGAAGGAAGAAGT
AATTGCTAAAACGCCAACAATTGGTGGTAGCTCGGAACACAAGGTACTTCCTAAAGCAGA
AAAGGTAGTTGAGAGAAAGGGTCATGGTGAAACAGGTCAGAAGTTGAAAGAGGAAGGAAA
AATTGCCTTGGGACAAAAGAAAGAGGAGAATCACACAAAACCAGCCGTTGGTGATGAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK34TF U 1
AF RR2EK34JQ C 59
BS 1 637 RR2EK34TF
BS 638 780 RR2EK34JQ

RD RR2EK34TF 637 0 0
GCCTGAGTCATGTGATATGACGAAACTGAGCACCTCCTTCTCACATGGGCTCTTGACGAT
TGAGTTTCCGCTGGTCGTGGAAAGTGAGAAAGCGGGGAAGATGGCTAATGACAAGGGAAA
GACTGTGCAGAGGCCTAATCTTGAGGGGAACAGAGGGACTGGTCCTGACGGGAGTAGCGT
GAGAAGAAGCAGACTTTCGGACAAGGAGAATCAAGTGGGAACAAGTCAAGAGAAAACTGG
TCCAACGGCGGGAAAAGAAGAACCAAAAACGTATAAATCAGTGCTTGAGGGCAAGAGAGA
GGTGCCAGCTGCAAATCGAGTGAAGAATGAACAGAAACTGAAAGAGGGAGAAGCTAGCCC
TAGCTTGGGACATAAGGAACATTCGAAACAAGAGAAGGTGGTTGAGAAAAAGGAGCTTTC
TCAAATGGGTCAACAAAAGACTGTACAGAAGCTGAAGGACGAAGAGGCTAGAGGTAGACC
GACCGTTGGTGGTAGCTTGAAAGCCAAGGTACCTCCTGCACAAGAAGAGAAGGTGACTGA
GAGAAAGAAACATGGTGATATTGGTCAGAAAAAGACTGAACAGAAGGTGAAGGAAGAAGT
AATTGCTAAAACGCCAACAATTGGTGGTAGCTCGGAA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2EK34JQ 722 0 0
ATTGAGTTTCCGCTGGTCGTGGAAAGTGAGAAAGCGGGGAAGATGGCTAATGACAAGGGA
AAGACTGTGCAGAGGCCTAATCTTGAGGGGAACAGAGGGACTGGTCCTGACGGGAGTAGC
GTGAGAAGAAGCAGACTTTCGGACAAGGAGAATCAAGTGGGAACAAGTCAAGAGAAAACT
GGTCCAACGGCGGGAAAAGAAGAACCAAAAACGTATAAATCAGTGCTTGAGGGCAAGAGA
GAGGTGCCAGCTGCAAATCGAGTGAAGAATGAACAGAAACTGAAAGAGGGAGAAGCTAGC
CCTAGCTTGGGACATAAGGAACATTCGAAACAAGAGAAGGTGGTTGAGAAAAAGGAGCTT
TCTCAAATGGGTCAACAAAAGACTGTACAGAAGCTGAAGGACGAAGAGGCTAGAGGTAGA
CCGACCGTTGGTGGTAGCTTGAAAGCCAAGGTACCTCCTGCACAAGAAGAGAAGGTGACT
GAGAGAAAGAAACATGGTGATATTGGTCAGAAAAAGACTGAACAGAAGGTGAAGGAAGAA
GTAATTGCTAAAACGCCAACAATTGGTGGTAGCTCGGAACACAAGGTACTTCCTAAAGCA
GAAAAGGTAGTTGAGAGAAAGGGTCATGGTGAAACAGGTCAGAAGTTGAAAGAGGAAGGA
AAAATTGCCTTGGGACAAAAGAAAGAGGAGAATCACACAAAACCAGCCGTTGGTGATGAG
GC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL6185Contig1 698 2 2 U
GTCCGGCCCTGCTGCGTCCGCAACTGCCACACAACCTAGCTTTGATTTTGATGATCTCCT
TGGTTTGGGTTTATCAACAGCTCCTGTTCCAACACCATCACCGCCTCTTTTAAAGCTGAA
CCCAAGAGCTTCTCTAGATCCACGTGCCTTCCAACAGAAATGGCGCCAACTGCCGATATC
ATCAACACAGGAGTATTCTGTGAATCCCCAAGGAATGGCGGCCTTGACAGTTCCACAGTC
ACTTATCAAACACATGCAGAGTCATTCCATTCGCTGCATCGCATCGGGAGGCCAGTCTCC
AAACTTCAAGTTCTTCTTCTTTGCTCAAAAGGAAGCAGAACAATCGGACTATCTCACCGA
GTGCATCATAAACTCTTCAACGGCCAAAGCTCAGATAAAAGTGAAAGCAGACGAGCAGAG
TACCTCTCAGGCATTCGCCACTGTATTCGAAACAGCCTTATCCAAATTTGGCATGTCTTG
AAAAAAAAAGCTCTTTATGCAATCAATAGAATTCGCTGGATCGGATCTCTACCTCTGTTT
CAAATGAGATAATACTGTTTCGAGCTTTGTAACGTCTCTCACATTTGATATCGTTTGGTC
TTTGTGTTGTAGAAAATAGATACAGAGAGATCCTTTTTTTATCGTTGTACTTTTGGAACT
TTAACGTTTGATGTTCAATAAAGTCTCATGTGTTGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR68TF U 1
AF RR2BR68JQ C 13
BS 1 507 RR2BR68TF
BS 508 698 RR2BR68JQ

RD RR2BR68TF 507 0 0
GTCCGGCCCTGCTGCGTCCGCAACTGCCACACAACCTAGCTTTGATTTTGATGATCTCCT
TGGTTTGGGTTTATCAACAGCTCCTGTTCCAACACCATCACCGCCTCTTTTAAAGCTGAA
CCCAAGAGCTTCTCTAGATCCACGTGCCTTCCAACAGAAATGGCGCCAACTGCCGATATC
ATCAACACAGGAGTATTCTGTGAATCCCCAAGGAATGGCGGCCTTGACAGTTCCACAGTC
ACTTATCAAACACATGCAGAGTCATTCCATTCGCTGCATCGCATCGGGAGGCCAGTCTCC
AAACTTCAAGTTCTTCTTCTTTGCTCAAAAGGAAGCAGAACAATCGGACTATCTCACCGA
GTGCATCATAAACTCTTCAACGGCCAAAGCTCAGATAAAAGTGAAAGCAGACGAGCAGAG
TACCTCTCAGGCATTCGCCACTGTATTCGAAACAGCCTTATCCAAATTTGGCATGTCTTG
AAAAAAAAAGCTCTTTATGCAATCAAT

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2BR68JQ 686 0 0
TGCGTCCGCAACTGCCACACAACCTAGCTTTGATTTTGATGATCTCCTTGGTTTGGGTTT
ATCAACAGCTCCTGTTCCAACACCATCACCGCCTCTTTTAAAGCTGAACCCAAGAGCTTC
TCTAGATCCACGTGCCTTCCAACAGAAATGGCGCCAACTGCCGATATCATCAACACAGGA
GTATTCTGTGAATCCCCAAGGAATGGCGGCCTTGACAGTTCCACAGTCACTTATCAAACA
CATGCAGAGTCATTCCATTCGCTGCATCGCATCGGGAGGCCAGTCTCCAAACTTCAAGTT
CTTTTTCTTTGCTCAAAAGGAAGCAGAACAATCGGACTATCTCACCGAGTGCATCATAAA
CTCTTCAACGGCCAAAGCTCAGATAAAAGTGAAAGCAGACGAGCAGAGTACCTCTCAGGC
ATTCGCCACTGTATTCGAAACAGCCTTATCCAAATTTGGCATGTCTTGAAAAAAAAAGCT
CTTTATGCAATCAATAGAATTCGCTGGATCGGATCTCTACCTCTGTTTCAAATGAGATAA
TACTGTTTCGAGCTTTGTAACGTCTCTCACATTTGATATCGTTTGGTCTTTGTGTTGTAG
AAAATAGATACAGAGAGATCCTTTTTTTATCGTTGTACTTTTGGAACTTTAACGTTTGAT
GTTCAATAAAGTCTCATGTGTTGTCT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL6186Contig1 631 2 2 U
GCACGCACTTTGAAGCTTCAATAGTTTTCTCAGCAACTTCTTAAAGCTTAAGAAAAATGG
GAACAGCTACTTTCATAGATATTCTTCTCGCTATCCTCTTGCCTCCTCTTGGTGTCTTTT
TCAGATATGGTTGCGAGGTTGAATTTTGGATATGCTTGGTTTTGACGCTTTTTGGGTATC
TTCCTGGGATCCTCTACGCCCTTTATGTCCTCACCAAATAAATTACCATCTATCCTCTCT
TCTTTTCATTTCATCTCCTTGAACAACTGTTTCGTCGTGTTTTCCTATCTTTGTGTGACT
GTGATTGATTCATCGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAACAAAAAGGGTTAAACTC
GGGTCAATGATGACACAAGCCTAACCCCCGGGTGGAGGTACAGTCCACGGATAGACCCTC
TCCTGGGCATTCAAATGAGTCGAAAGCAATAACTCATATCCGTGTGGCCGGTGGAGATTG
AATCCGGGTTCGCTTGATTCATCGTTTCTCTAGTCAGGGTTTTATCATTGTTCTGTGTTG
CATAGCTTTTGTTGATATAAAGAAGAGATCCTTTGTTTTGTGTGAAGAACTTGTTTATTC
AAGTTTTTCAAATATATAATAGTTTTTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES77TF U 1
AF RR2ES77JQ C 1
BS 1 587 RR2ES77TF
BS 588 631 RR2ES77JQ

RD RR2ES77TF 587 0 0
GCACGCACTTTGAAGCTTCAATAGTTTTCTCAGCAACTTCTTAAAGCTTAAGAAAAATGG
GAACAGCTACTTTCATAGATATTCTTCTCGCTATCCTCTTGCCTCCTCTTGGTGTCTTTT
TCAGATATGGTTGCGAGGTTGAATTTTGGATATGCTTGGTTTTGACGCTTTTTGGGTATC
TTCCTGGGATCCTCTACGCCCTTTATGTCCTCACCAAATAAATTACCATCTATCCTCTCT
TCTTTTCATTTCATCTCCTTGAACAACTGTTTCGTCGTGTTTTCCTATCTTTGTGTGACT
GTGATTGATTCATCGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAACAAAAAGGGTTAAACTC
GGGTCAATGATGACACAAGCCTAACCCCCGGGTGGAGGTACAGTCCACGGATAGACCCTC
TCCTGGGCATTCAAATGAGTCGAAAGCAATAACTCATATCCGTGTGGCCGGTGGAGATTG
AATCCGGGTTCGCTTGATTCATCGTTTCTCTAGTCAGGGTTTTATCATTGTTCTGTGTTG
CATAGCTTTTGTTGATATAAAGAAGAGATCCTTTGTTTTGTGTGAAG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2ES77JQ 631 0 0
GCACGCACTTTGAAGCTTCAATAGTTTTCTCAGCAACTTCTTAAAGCTTAAGAAAAATGG
GAACAGCTACTTTCATAGATATTCTTCTCGCTATCCTCTTGCCTCCTCTTGGTGTCTTTT
TCAGATATGGTTGCGAGGTTGAATTTTGGATATGCTTGGTTTTGACGCTTTTTGGGTATC
TTCCTGGGATCCTTTACGCCCTTTATGTCCTCACCAAATAAATTACCATCTATCCTTTCT
TCTTTTCATTTCATCTCCTTGAACAACTGTTTCGTCGTGTTTTCCTATCTTTGTGTGACT
GTGATTGATTCATCGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAACAAAAAGGGTTAAACTC
GGGTCAATGATGACACAAGCCTAACCCCCGGGTGGAGGTACAGTCCACGGATAGACCCTC
TCCTGGGCATTCAAATGAGTCGAAAGCAATAACTCATATCCGTGTGGCCGGTGGAGATTG
AATCCGGGTTCGCTTGATTCATCGTTTCTCTAGTCAGGGTTTTATCATTGTTCTGTGTTG
CATAGCTTTTGTTGATATAAAGAAGAGATCCTTTGTTTTGTGTGAAGAACTTGTTTATTC
AAGTTTTTCAAATATATAATAGTTTTTTTCC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL6187Contig1 876 2 2 U
GGAGTTCAAAACTAAAACCCTAATTTTCTTCTTCCGTTGAGAGAACTTCTCCGTCGAAAC
GATGCCTACCCCGGCCAGCTTGACTATAGGCAAGATGATGATCCTCATAACTCTGGGCCA
ACCAATGCCTTCCGTCGACACCTCATCATACGCAGATGCTAAGACAGGAGTCTTCTGGGA
CGTGGAGGACTGTCCGATCCCGGAAGATCTCGACCCTGAGTCTGTTTATCAGAACATCAG
ATCGGCTCTCGCGAACAGTGGTTACCACGGCGAGGTGAAAATCAAGGCGTTTGGTGACAG
GAACCAGATCCCTGGTTACTACGAATCTGCCGGAATCCAAATCTTTCCCAAAGGAGATAA
GTATGAGAGGAATGGTCAGATGCAGTTAGAGTTTTTCGGGTGGATGAGGGATAATAAGAC
TGAGTACACGAACATGATGGTGGTGTCACGATCCGCGATGGAGTTGGTTTCTTATCTCGA
GTATAAACATACTCATCACAACCTTCTCTTTGCGGATCCTCTGAACCCGATAAAGAAGGC
TTGCGGCTGCAAATTCGGAGCTCGGTCCGAAGATCCTTGCACTGAGAGATGGGTCTGGGA
AACCCTAGCTGTCGGAGGAGACCCCACCACCAAAACAGAAGAAGAAGAGCCTTGCAGATA
TCGTAATGCTGTTCAGGATTCTGTTTCTCCATGACAACGTGGAATTTCCTTCCACGTAGC
TACATATTGCTAATTAGTTAAATGTTTCTAAGTAGAGCTACTTAATTGCTTAGTAGTTAA
ATATTTATAACTTGCTACAAAGTAGTATTGCTTAGTATTTAATGTTTATAAGTTGCTTAC
TTAGTTGCTTAGTAGTTCATGTATTTAATTTGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H625TF U 1
AF RR2H625JQB C 326
BS 1 676 RR2H625TF
BS 677 876 RR2H625JQB

RD RR2H625TF 681 0 0
GGAGTTCAAAACTAAAACCCTAATTTTCTTCTTCCGTTGAGAGAACTTCTCCGTCGAAAC
GATGCCTACCCCGGCCAGCTTGACTATAGGCAAGATGATGATCCTCATAACTCTGGGCCA
ACCAATGCCTTCCGTCGACACCTCATCATACGCAGATGCTAAGACAGGAGTCTTCTGGGA
CGTGGAGGACTGTCCGATCCCGGAAGATCTCGACCCTGAGTCTGTTTATCAGAACATCAG
ATCGGCTCTCGCGAACAGTGGTTACCACGGCGAGGTGAAAATCAAGGCGTTTGGTGACAG
GAACCAGATCCCTGGTTACTACGAATCTGCCGGAATCCAAATCTTTCCCAAAGGAGATAA
GTATGAGAGGAATGGTCAGATGCAGTTAGAGTTTTTCGGGTGGATGAGGGATAATAAGAC
TGAGTACACGAACATGATGGTGGTGTCACGATCCGCGATGGAGTTGGTTTCTTATCTCGA
GTATAAACATACTCATCACAACCTTCTCTTTGCGGATCCTCTGAACCCGATAAAGAAGGC
TTGCGGCTGCAAATTCGGAGCTCGGTCCGAAGATCCTTGCACTGAGAGATGGGTCTGGGA
AACCCTAGCTGTCGGAGGAGACCCCACCACCAAAACAGAAGAAGAAGAGCCTTGCAGATA
TCGTAATGCTGTTCAG
ATTCT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2H625JQB 551 0 0
TCTGCCGGAATCCAAATCTTTCCCAAAGGAGATAAGTATGAGAGGAATGGTCAGATGCAG
TTAGAGTTTTTCGGGTGGATGAGGGATAATAAGACTGAGTACACGAACATGATGGTGGTG
TCACGATCCGCGATGGAGTTGGTTTCTTATCTCGAGTATAAACATACTCATCACAACCTT
CTCTTTGCGGATCCTCTGAACCCGATAAAGAAGGCTTGCGGCTGCAAATTCGGAGCTCGG
TCCGAAGATCCTTGCACTGAGAGATGGGTCTGGGAAACCCTAGCTGTCGGAGGAGACCCC
ACCACCAAAACAGAAGAAGAAGAGCCTTGCAGATATCGTAATGCTGTTCAGGATTCTGTT
TCTCCATGACAACGTGGAATTTCCTTCCACGTAGCTACATATTGCTAATTAGTTAAATGT
TTCTAAGTAGAGCTACTTAATTGCTTAGTAGTTAAATATTTATAACTTGCTACAAAGTAG
TATTGCTTAGTATTTAATGTTTATAAGTTGCTTACTTAGTTGCTTAGTAGTTCATGTATT
TAATTTGCTAC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

CO CL6188Contig1 836 2 8 U
GGACTCTCACTAAACCAAAACCTCAAAAGTTATATTTGGGGATTATCAGAGCTTCTCCAT
GGATCCTTACAAGGTATCTTCTTGTTCTTCTCCAAATTTCATGTGTGTGCGTGTCTTAAA
TCAATTATGCTTCACTATGATCTCATGTTTCATTATGATCGTTTTTTCCAACTCTTTTTA
CTGAAAAATGAAAGTTGCTCTCACGTCTTAGTGTTAACATGCTTTTCTGGTTCCAAAATA
GGTTTTATTTCAATGATCGTTTGAGCTATAAGGTGGTGATGTTGATTTTTGGGTTGGGTA
TCTAGATAGCATATTTTAAAACGTTTGAGCTATAAACCAGTGCATGCGTAAAAAACGTCC
CATGTGGTTCGTTTGTTTTTTTCCTTATAGGAGACCTTATTTTGTTGTTTGTGTGTTTTT
ATCAAAAACATGCGTTTTTATTAATGTTGTTTAATAGATTTCTCAGATCTACGTACCTGA
TTAATCAAGTCTATCCAATAAATTAATCATAATATAAGTAATCTGATTAAATAAGATATA
AACATATGATTAATCATTTTAATTATTCAATTAACCAGAGTGCTAATCATTCCAAAAAAA
TAAATTGAAGTATTTTATTCGTATGAAAAACGCACATATCTCTGAATCATCCGATCAACA
CTTATAATAATAGTATTTAACATACCATGGTATATGAAAATAATCGTGTGGATTTTTCTT
TAATTTTTCTAATGGATTTATTACTCGAACCATTAAAAGTGGTAGATCCATCAAACAAGG
CTATGCATATACGAAAGTAAGCAATAATCGAATTAAAAGTAGCCCTTTTATATCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL52TF U 1
AF RR2AL52JQ C 168
BS 1 699 RR2AL52TF
BS 700 700 RR2AL52JQ
BS 701 727 RR2AL52TF
BS 728 728 RR2AL52JQ
BS 729 748 RR2AL52TF
BS 749 749 RR2AL52JQ
BS 750 770 RR2AL52TF
BS 771 836 RR2AL52JQ

RD RR2AL52TF 770 0 0
GGACTCTCACTAAACCAAAACCTCAAAAGTTATATTTGGGGATTATCAGAGCTTCTCCAT
GGATCCTTACAAGGTATCTTCTTGTTCTTCTCCAAATTTCATGTGTGTGCGTGTCTTAAA
TCAATTATGCTTCACTATGATCTCATGTTTCATTATGATCGTTTTTTCCAACTCTTTTTA
CTGAAAAATGAAAGTTGCTCTCACGTCTTAGTGTTAACATGCTTTTCTGGTTCCAAAATA
GGTTTTATTTCAATGATCGTTTGAGCTATAAGGTGGTGATGTTGATTTTTGGGTTGGGTA
TCTAGATAGCATATTTTAAAACGTTTGAGCTATAAACCAGTGCATGCGTAAAAAACGTCC
CATGTGGTTCGTTTGTTTTTTTCCTTATAGGAGACCTTATTTTGTTGTTTGTGTGTTTTT
ATCAAAAACATGCGTTTTTATTAATGTTGTTTAATAGATTTCTCAGATCTACGTACCTGA
TTAATCAAGTCTATCCAATAAATTAATCATAATATAAGTAATCTGATTAAATAAGATATA
AACATATGATTAATCATTTTAATTATTCAATTAACCAGAGTGCTAATCATTCCAAAAAAA
TAAATTGAAGTATTTTATTCGTATGAAAAACGCACATATCTCTGAATCATCCGATCAACA
CTTATAATAATAGTATTTAACATACCATGGTATATGAAA*TAATCGTGTGGATTTTTCTT
TAATTTT*CTAATGGATTTATTACTCGA*CCATTAAAAGTGGTAGATCCA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2AL52JQ 669 0 0
CCAACTCTTTTTACTGAAAAATGAAAGTTGCTCTCACGTCTTAGTGTTAACATGCTTTTC
TGGTTCCAAAATAGGTTTTATTTCAATGATCGTTTGAGCTATAAGGTGGTGATGTTGATT
TTTGGGTTGGGTATCTAGATAGCATATTTTAAAACGTTTGAGCTATAAACCAGTGCATGC
GTAAAAAACGTCCCATGTGGTTCGTT*GTTTTTTTCCTTATAGGAGACCTTATTTTGTTG
TTTGTGTGTTTTTATCAAAAACATGCGTTTTTATTAATGTTGTTTAATAGATTTCTCAGA
TCTACGTACCTGATTAATCAAGTCTATCCAATAAATTAATCATAATATAAGTAATCTGAT
TAAATAAGATATAAACATATGATTAATCATTTTAATTATTCAATTAACCAGAGTGCTAAT
CATTCCAAAAAAATAAATTGAAGTATTT*ATTCGTATGAAAAACGCACATATCTCTGAAT
CATCCGATCAACACTTATAATAATAGTATTTAACATACCATGGTATATGAAAATAATCGT
GTGGATTTTTCTTTAATTTTTCTAATGGATTTATTACTCGAACCATTAAAAGTGGTAGAT
CCATCAAACAAGGCTATGCATATACGAAAGTAAGCAATAATCGAATTAAAAGTAGCCCTT
TTATATCCG

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL6189Contig1 627 2 1 U
GGGAGCGCCTCCCCATCGAGTAGAAGAAGACAGAAACCCCCTCAAACCACACCAAAGACA
GCCATGCCTCCGAAGTTGGACCCGACCGCGATCGTCGACGTGTACGTCCGCGTAACCGGA
GGAGAAGTCGGAGCAGCAAGTTCCCTCGCTCCAAAGATCGGACCCCTCGGTCTCGCTCCC
AAGAAGATCGGGTCATGAGGCCGAGGTCTATCGCCAAGTAGCTGAGCGGGACCGTGAGGG
AGATTCTCGGGACTTGTGTTTCCGTTGGGTGTACTGTTGATGGGAAGGATCCCAAGGATA
TCCAGCAGGAGATTCAAGAAGGTGAGGTTGAGATTCCTGAGAATTGAGAGAGAGAGAGAA
AAAAAAGGAGACGGGACTTTGAGAGATGTGTTGTGTTTGGTTCTTTGTTTTAGCTTCTAT
GTTTCGGTTAAGGACAAGTCGGTTTTGGTTTTGTTGTTTTGTTTTATGCTATGCTTTGAT
ACTTTTTTCGACGAGCTTTTTTAAATTGGAATGGTTGAAACTTTGGCCTAGGAATCGAAA
TGGTATTTTGCAGGTTTTTGTAGTAAGAGTACTATGTTCATCAAATGGTGTAATCACTAG
TAGAAAATGAGTAAAGTTATTGGGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DN19TF U 1
AF RR2DN19JQ C 44
BS 1 627 RR2DN19TF

RD RR2DN19TF 627 0 0
GGGAGCGCCTCCCCATCGAGTAGAAGAAGACAGAAACCCCCTCAAACCACACCAAAGACA
GCCATGCCTCCGAAGTTGGACCCGACCGCGATCGTCGACGTGTACGTCCGCGTAACCGGA
GGAGAAGTCGGAGCAGCAAGTTCCCTCGCTCCAAAGATCGGACCCCTCGGTCTCGCTCCC
AAGAAGATCGGGTCATGAGGCCGAGGTCTATCGCCAAGTAGCTGAGCGGGACCGTGAGGG
AGATTCTCGGGACTTGTGTTTCCGTTGGGTGTACTGTTGATGGGAAGGATCCCAAGGATA
TCCAGCAGGAGATTCAAGAAGGTGAGGTTGAGATTCCTGAGAATTGAGAGAGAGAGAGAA
AAAAAAGGAGACGGGACTTTGAGAGATGTGTTGTGTTTGGTTCTTTGTTTTAGCTTCTAT
GTTTCGGTTAAGGACAAGTCGGTTTTGGTTTTGTTGTTTTGTTTTATGCTATGCTTTGAT
ACTTTTTTCGACGAGCTTTTTTAAATTGGAATGGTTGAAACTTTGGCCTAGGAATCGAAA
TGGTATTTTGCAGGTTTTTGTAGTAAGAGTACTATGTTCATCAAATGGTGTAATCACTAG
TAGAAAATGAGTAAAGTTATTGGGTAT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2DN19JQ 584 0 0
AAACCACACCAAAGACAGCCATGCCTCCGAAGTTGGACCCGACCGCGATCGTCGACGTGT
ACGTCCGCGTAACCGGAGGAGAAGTCGGAGCAGCAAGTTCCCTCGCTCCAAAGATCGGAC
CCCTCGGTCTCGCTCCCAAGAAGATCGGGTCATGAGGCCGAGGTCTATCGCCAAGTAGCT
GAGCGGGACCGTGAGGGAGATTCTCGGGACTTGTGTTTCCGTTGGGTGTACTGTTGATGG
GAAGGATCCCAAGGATATCCAGCAGGAGATTCAAGAAGGTGAGGTTGAGATTCCTGAGAA
TTGAGAGAGAGAGAGAAAAAAAAGGAGACGGGACTTTGAGAGATGTGTTGTGTTTGGTTC
TTTGTTTTAGCTTCTATGTTTCGGTTAAGGACAAGTCGGTTTTGGTTTTGTTGTTTTGTT
TTATGCTATGCTTTGATACTTTTTTCGACGAGCTTTTTTAAATTGGAATGGTTGAAACTT
TGGCCTAGGAATCGAAATGGTATTTTGCAGGTTTTTGTAGTAAGAGTACTATGTTCATCA
AATGGTGTAATCACTAGTAGAAAATGAGTAAGGTTATTGGGTAT

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL6190Contig1 1207 2 2 U
GGCCACCGTACCGTCGCCGTGATCGGACCTAACTCTGATGTCACTGAGACCATGATCGGA
AACTATGCAGGGAAAGCTTGCGCCTATACAACGCCTTTACAGGGAATCTCAGGATACGCG
AGAACACTTCATCAAGCTGGTTGTTCTGGCGTGGCTTGTGCAGGAAACCAAGGGTTTGGT
GCAGCGGATATGGCGGCACGTGAAGCTGATGCAGCGGTTCTTGTGATGGGATTAGACCAG
TCTATAGAGGCAGAGACAAGAGATAGAACCGGACTACTCTTACCAGGTTACCAACAAGAC
CTTGTGACCCGTGTGGCTCAAGCCTCTAGAGGTCCAGTCATTCTAGTCCTAATGAGTGGT
GGACCCATCGATGTATCTTTTGCTAAGAACAATCCACGTGTCACTGCTATTATATGGGCT
GGGTATCCGGGTCAAGCTTGTGGAGCTGCCATCGCTGATATCATCTTTGGTGCTACTAAT
CCTGGAGGAAAACTACCAATGACATGGTATCAACAAGACTACGTGGCGAATGTGCCAATG
ACGATAATGGCCATGAGAGCATCTGGAGATTACCCAGGAAGGACCTACAGATTCTATAAA
GGTCCAGTGGTATTTCCATTTGGGTTCGGTTTAAGTTACACTACCTTCACTCACAGTTTA
TCTCAAAGCCTACCATCCCAACTATCGGTTTCACCCTACAAACTCAACTCTGCCATTTTC
AACTCCTCATCTAACTCCATCAAAGTCTCTCATGCCAACTGTGAAATATTTTCAAAAATG
CCTATCCATGTTGAAGTATCAAACACTGGTGAAGTGGACGGAACACACACAGTTTTGGTC
TTTGCTGAGCCGCCAAGGAACGGGATAAAAGGACTGGATGTGAATAAACAATTGATTGCG
TTTGAGAAAGTTCATATCACGGCAGGTGCAAAACGGACTGTTCAAATTGATTTTGATGCT
TGCAAGCATCTTGGTGTAGTGGATGAGTATGGTAAGAGGAGAATCCCAATGGGTGAACAT
AGTTTGCATATTGGTGACCTTAAACATACCATTTTGGTCCAACCACAACTTTGACAGAGG
CATATAAAAGAAAGCAACAAATAAGAAGCTCTTAACAAAGTCAGTGTCTTTGTCTCTTTT
TCGGGTCAAAAGTGAGTGTGTCTCCCTCTTATATATTTATATAAAAGACAGCTGAAAATT
ACTAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A838TF U 1
AF RR2A838JQ C 367
BS 1 750 RR2A838TF
BS 751 1207 RR2A838JQ

RD RR2A838TF 750 0 0
GGCCACCGTACCGTCGCCGTGATCGGACCTAACTCTGATGTCACTGAGACCATGATCGGA
AACTATGCAGGGAAAGCTTGCGCCTATACAACGCCTTTACAGGGAATCTCAGGATACGCG
AGAACACTTCATCAAGCTGGTTGTTCTGGCGTGGCTTGTGCAGGAAACCAAGGGTTTGGT
GCAGCGGATATGGCGGCACGTGAAGCTGATGCAGCGGTTCTTGTGATGGGATTAGACCAG
TCTATAGAGGCAGAGACAAGAGATAGAACCGGACTACTCTTACCAGGTTACCAACAAGAC
CTTGTGACCCGTGTGGCTCAAGCCTCTAGAGGTCCAGTCATTCTAGTCCTAATGAGTGGT
GGACCCATCGATGTATCTTTTGCTAAGAACAATCCACGTGTCACTGCTATTATATGGGCT
GGGTATCCGGGTCAAGCTTGTGGAGCTGCCATCGCTGATATCATCTTTGGTGCTACTAAT
CCTGGAGGAAAACTACCAATGACATGGTATCAACAAGACTACGTGGCGAATGTGCCAATG
ACGATAATGGCCATGAGAGCATCTGGAGATTACCCAGGAAGGACCTACAGATTCTATAAA
GGTCCAGTGGTATTTCCATTTGGGTTCGGTTTAAGTTACACTACCTTCACTCACAGTTTA
TCTCAAAGCCTACCATCCCAACTATCGGTTTCACCCTACAAACTCAACTCTGCCATTTTC
AACTCCTCATCTAACTCCATCAAAGTCTCT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2A838JQ 841 0 0
ATCGATGTATCTTTTGCTAAGAACAATCCACGTGTCACTGCTATTATATGGGCTGGGTAT
CCGGGTCAAGCTTGTGGAGCTGCCATCGCTGATATCATCTTTGGTGCTACTAATCCTGGA
GGAAAACTACCAATGACATGGTATCAACAAGACTACGTGGCGAATGTGCCAATGACGATA
ATGGCCATGAGAGCATCTGGAGATTACCCAGGAAGGACCTACAGATTCTATAAAGGTCCA
GTGGTATTTCCATTTGGGTTCGGTTTAAGTTACACTACCTTCACTCACAGTTTATCTCAA
AGCCTACCATCCCAACTATCGGTTTCACCCTACAAACTCAACTCTGCCATTTTCAACTCC
TCATCTAACTCCATCAAAGTCTCTCATGCCAACTGTGAAATATTTTCAAAAATGCCTATC
CATGTTGAAGTATCAAACACTGGTGAAGTGGACGGAACACACACAGTTTTGGTCTTTGCT
GAGCCGCCAAGGAACGGGATAAAAGGACTGGATGTGAATAAACAATTGATTGCGTTTGAG
AAAGTTCATATCACGGCAGGTGCAAAACGGACTGTTCAAATTGATTTTGATGCTTGCAAG
CATCTTGGTGTAGTGGATGAGTATGGTAAGAGGAGAATCCCAATGGGTGAACATAGTTTG
CATATTGGTGACCTTAAACATACCATTTTGGTCCAACCACAACTTTGACAGAGGCATATA
AAAGAAAGCAACAAATAAGAAGCTCTTAACAAAGTCAGTGTCTTTGTCTCTTTTTCGGGT
CAAAAGTGAGTGTGTCTCCCTCTTATATATTTATATAAAAGACAGCTGAAAATTACTAGA
G

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 2

CO CL6191Contig1 738 2 4 U
GGGTGGAACCAAAAGTGAGGCTAGATGCTGAAGGGTTTCGTCATCTCTTGTGATAGCATA
TGCGTTAGCCTTTGCTGGACCTTAGATTTCCATTTTTGTTTCAAGTTATTGTACACACGG
GAAGAGATATAGTCGTCACTGCTATCTACGAGCGCATCATCACATTGCACTGCATTCGTC
GTCAACCTCTATAGTAGGTCCTTCATTTTCTGACACATCCCAACAATCATATGATCTCAC
TCCACCGCTTGTTCCGAAGTGACAATAAGAAGGCAACAACAACCAGTGAATCTCTCTTTG
AATATGCAACTACTGTAAGAAGAGGCCATATGATAAAGCTCAACATATACACAGCTTCAG
CTCTCGTATCAGAAGAATACATCCGAAGAACTTCTGGAGCTTCTCGTGACCATGCCACTG
TTCTTGGAGATGTTCAGGTATACAAACAAGTAGAAATCTATGCTTTCAACGATGCCACAC
ATGATTAGCTGATCCATGAAGCTCATGTATCTCACAAGGACAGCTCCGGTATAAGAAATG
CAAAAGAACTACAGAACCAATGGTGAACACAACACTGACCACACACACGATCTGTTGTAT
GTCTCTTGAATGTTGCACTGATCTGAGTAGATCACTAGAGCAGTAAATGGTATATTTTTT
TCCCTGAAGATTCATGTGTTTGTATTTGAAAAGCTAAGCTCTGCTGAGTTTCTATAATAA
CCATTATTGTAGTGTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ49TF U 1
AF RR2GJ49JQB C 1
BS 1 691 RR2GJ49TF
BS 692 692 RR2GJ49JQB
BS 693 715 RR2GJ49TF
BS 716 738 RR2GJ49JQB

RD RR2GJ49TF 715 0 0
GGGTGGAACCAAAAGTGAGGCTAGATGCTGAAGGGTTTCGTCATCTCTTGTGATAGCATA
TGCGTTAGCCTTTGCTGGACCTTAGATTTCCATTTTTGTTTCAAGTTATTGTACACACGG
GAAGAGATATAGTCGTCACTGCTATCTACGAGCGCATCATCACATTGCACTGCATTCGTC
GTCAACCTCTATAGTAGGTCCTTCATTTTCTGACACATCCCAACAATCATATGATCTCAC
TCCACCGCTTGTTCCGAAGTGACAATAAGAAGGCAACAACAACCAGTGAATCTCTCTTTG
AATATGCAACTACTGTAAGAAGAGGCCATATGATAAAGCTCAACATATACACAGCTTCAG
CTCTCGTATCAGAAGAATACATCCGAAGAACTTCTGGAGCTTCTCGTGACCATGCCACTG
TTCTTGGAGATGTTCAGGTATACAAACAAGTAGAAATCTATGCTTTCAACGATGCCACAC
ATGATTAGCTGATCCATGAAGCTCATGTATCTCACAAGGACAGCTCCGGTATAAGAAATG
CAAAAGAACTACAGAACCAATGGTGAACACAACACTGACCACACACACGATCTGTTGTAT
GTCTCTTGAATGTTGCACTGATCTGAGTAGATCACTAGAGCAGTAAATGGTATATTTTTT
TCCCTGAAGATTCATGTGTTTGTATTTGAAA*GCTAAGCTCTGCTGAGTTTCTAT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2GJ49JQB 738 0 0
GGGTGGAACCAAAAGTGAGGCTAGATGCTGAAGGGTTTCGTCATCTCTTGTGATAGCATA
TGCGTTAGCCTTTGCTGGACCTTAGATTTCCATTTTTGTTTCAAGTTATTGTACACACGG
GAAGAGATATAGTCGTCACTGCTATCTACGAGCGCATCATCACATTGCACTGCATTCGTC
GTCAACCTCTATAGTAGGTCCTTCATTTTCTGACACATCCCAACAATCATATGATCTCAC
TCCACCGCTTGTTCCGAAGTGACAATAAGAAGGCAACAACAACCAGTGAATCTCTCTTTG
AATATGCAACTACTGTAAGAAGAGGCCATATGATAAAGCTCAACATATACACAGCTTCAG
CTCTCGTATCAGAAGAATACATCCGAAGAACTTCTGGAGCTTCTCGTGACCATGCCACTG
TTCTTGGAGATGTTCAGGTATACAAACAAGTAGAAATCTATGCTTTCAACGATGCCACAC
ATGATTAGCTGATCCATGAAGCTCATGTATCTCACAAGGACAGCTCCGGTATAAGAAATG
CAAAAGAACTACAGAACCAATGGTGAACACAACACTGACCACACACACGATCTGTTGTAT
GTCTCTTGAATGTTGCACTGATCTGAGTAGATCACTAGAGCAGTAAATGGTATATTTTTT
TCCCTGAAGATTCATGTGTTTGTATTTGAAAAGCTAAGCTCTGCTGAGTTTCTATAATAA
CCATTATTGTAGTGTTGC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL6192Contig1 714 2 3 U
GATCGAAACGATCCTTGAACATCTCAAGATTCGTGAGTATTTCTCTGAGATTAACACAAA
CCCTGGACTTGTAGATGAACAAGGAAGGTTAATAATCTCTCCTTACCACGACTTCACTAA
ATCCTCCCACGGTTGCTCTCGTTGCCCTCCTAACATGTGCAAGGGGTTGATAATTGAGAG
GATTCAAGCTTCCTTTGCCAAAGAAGGAAATAAGATGAAGATGATCTATCTAGGAGATGG
TGCTAATGATTACTGTCCGAGTCTTAGACTCAAACCTGAAGATTGCATGATGCCAAGGAA
GAATTTCCCTGTTTGGGATTTGATTAGTCAAAACCCGTCCTTGGTTAAGGCCACGGTTAA
AGACTGGACCGATGGGGAAGCTATGGAAAGAATGCTAATGGGAAAGATCAACGAGATTAT
ATCATCAGATGAAGAAGAAAAGGAGAAGATGTTGAGCTCTGATCATTGCAAGATGTCTGT
TGGGATTGTTCACGAGCCTTTGGTGCCTCTTGCTCTTCAAGTTCCTCTTAATCTCGTTAA
GTGATTGATGAAGAGAACGAGGAATCTAAGATTCTTTTGTTTCGAATATAGTATTATATC
TCTCATGTACTGGAGAATATTGGTATAAGATGCCTAAAGTTGATTGTTTTGGATTGGTAT
TGATGTAACTCTCTTGAAAGCTTAAACGGGCCTTATGTCGGAATCTTAATAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DF62TF U 1
AF RR2DF62JQ C 137
BS 1 702 RR2DF62TF
BS 703 703 RR2DF62JQ
BS 704 714 RR2DF62TF

RD RR2DF62TF 714 0 0
GATCGAAACGATCCTTGAACATCTCAAGATTCGTGAGTATTTCTCTGAGATTAACACAAA
CCCTGGACTTGTAGATGAACAAGGAAGGTTAATAATCTCTCCTTACCACGACTTCACTAA
ATCCTCCCACGGTTGCTCTCGTTGCCCTCCTAACATGTGCAAGGGGTTGATAATTGAGAG
GATTCAAGCTTCCTTTGCCAAAGAAGGAAATAAGATGAAGATGATCTATCTAGGAGATGG
TGCTAATGATTACTGTCCGAGTCTTAGACTCAAACCTGAAGATTGCATGATGCCAAGGAA
GAATTTCCCTGTTTGGGATTTGATTAGTCAAAACCCGTCCTTGGTTAAGGCCACGGTTAA
AGACTGGACCGATGGGGAAGCTATGGAAAGAATGCTAATGGGAAAGATCAACGAGATTAT
ATCATCAGATGAAGAAGAAAAGGAGAAGATGTTGAGCTCTGATCATTGCAAGATGTCTGT
TGGGATTGTTCACGAGCCTTTGGTGCCTCTTGCTCTTCAAGTTCCTCTTAATCTCGTTAA
GTGATTGATGAAGAGAACGAGGAATCTAAGATTCTTTTGTTTCGAATATAGTATTATATC
TCTCATGTACTGGAGAATATTGGTATAAGATGCCTAAAGTTGATTGTTTTGGATTGGTAT
TGATGTAACTCTCTTGAAAGCTTAAACGGGCCTTATGTCGGA*TCTTAATAGAC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2DF62JQ 578 0 0
TCTCGTTGCCCTCCTAACATGTGCAAGGGGTTGATAATTGAGAGGATTCAAGCTTCCTTT
GCCAAAGAAGGAAATAAGATGAAGATGATCTATCTAGGAGATGGTGCTAATGATTACTGT
CCGAGTCTTAGACTCAAACCTGAAGATTGCATGATGCCAAGGAAGAATTTCCCTGTTTGG
GATTTGATTAGTCAAAACCCGTCCTTGGTTAAGGCCACGGTTAAAGACTGGACCGATGGG
GAAGCTATGGAAAGAATGCTAATGGGAAAGATCAACGAGATTATATCATCAGATGAAGAA
GAAAAGGAGAAGATGTTGAGCTCTGATCATTGCAAGATGTCTGTTGGGATTGTTCACGAG
CCTTTGGTGCCTCTTGCTCTTCAAGTTCCTCTTAATCTCGTTAAGTGATTGATGAAGAGA
ACGAGGAATCTAAGATTCTTTTGTTTCGAATATAGTATTATATCTCTCATGTACTGGAGA
ATATTGGTATAAGATGCCTAAAGTTGATTGTTTTGGATTGGTATTGATGTAACTCTCTTG
AAAGCTTAAACGGGCCTTATGTCGGAATCTTAATAGAC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL6193Contig1 561 2 2 U
TTTTTTTTGGACATCATAACTAAGCCCTTTAATTGATAGTGACCAGTGTAATAAGCAAGA
ACTACAGTGCTATTAAACAGTGAAAAAAGTAGACATAGGTTAAGTAGAAAAATAGTACAC
AAGTCAAAAAGGGTTGATAGGAAAAACGACACAAGACTAGGAAAGATCGCTTCATTTTTA
CTAATAAGATACGTTTCTACACTCCCCAAAACTACTACATCCACAAAATTACCTTAAGCT
AAGAATGTACATAGTTTCCCTGCTTCTCTTCTACATGACAGGAGTTGGATGTTTTTCTCA
AAATGGAGATGTCCAAGACCGTTGAAGCTTTCTCTTTGCTTGGTGTTGAGTTGCTTCCGC
CATTTTCAACTGCTCTTCTTGTCTCTTGAGTCTTGCATTTTCCTTCTGCAAGTGAGATAT
TGCAAGCTCCAGCTCGTTTGTGTATGCCTGTTTCCTAGCCCTGGACCGAGCAGCAGATTC
TCTGTTCTTGATCATACGCTTATGCCTTCTGTCTCCTCTGCTTTCATCAGAATCTTGGCC
TCCTCTTTTCTTCCCGAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D425TF C 1
AF RR2D425JQ U 9
BS 1 8 RR2D425TF
BS 9 561 RR2D425JQ

RD RR2D425TF 561 0 0
TTTTTTTTGGACATCATAACTAAGCCCTTTAATTGATAGTGACCAGTGTAATAAGCAAGA
ACTACAGTGCTATTAAACAGTGAAAAAAGTAGACATAGGTTAAGTAGAAAAATAGTACAC
AAGTCAAAAAGGGTTGATAGGAAAAACGACACAAGACTAGGAAAGATCGCTTCATTTTTA
CTAATAAGATACGTTTCTACACTCCCCAAAACTACTACATCCACAAAATTACCTTAAGCT
AAGAATGTACATAGTTTCCCTGCTTCTCTTCTACATGACAGGAGTTGGATGTTTTTCTCA
AAATGGAGATGTCCAAGACCGTTGAAGCTTTCTCTTTGCTTGGTGTTGAGTTGCTTCCGC
CATTTTCAACTGCTCTTCTTGTCTCTTGAGTCTTGCATTTTCCTTCTGCAAGTGAGATAT
TGCAAGCTCCAGCTCGTTTGTGTATGCCTGTTTCCTAGCCCTGGACCGAGCAGCAGATTC
TCTGTTCTTGATCATACGCTTATGCCTTCTGTCTCCTCTGCTTTCATCAGAATCTTGGCC
TCCTCTTTTCTTCCCGAAACC

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2D425JQ 553 0 0
GGACATCATAACTAAGCCCTTTAATTGATAGTGACCAGTGTAATAAGCAAGAACTACAGT
GCTATTAAACAGTGAAAAAAGTAGACATAGGTTAAGTAGAAAAATAGTACACAAGTCAAA
AAGGGTTGATAGGAAAAACGACACAAGACTAGGAAAGATCGCTTCATTTTTACTAATAAG
ATACGTTTCTACACTCCCCAAAACTACTACATCCACAAAATTACCTTAAGCTAAGAATGT
ACATAGTTTCCCTGCTTCTCTTCTACATGACAGGAGTTGGATGTTTTTCTCAAAATGGAG
ATGTCCAAGACCGTTGAAGCTTTCTCTTTGCTTGGTGTTGAGTTGCTTCCGCCATTTTCA
ACTGCTCTTCTTGTCTCTTGAGTCTTGCATTTTCCTTCTGCAAGTGAGATATTGCAAGCT
CCAGCTCGTTTGTGTATGCCTGTTTCCTAGCCCTGGACCGAGCAGCAGATTCTCTGTTCT
TGATCATACGCTTATGCCTTCTGTCTCCTCTGCTTTCATCAGAATCTTGGCCTCCTCTTT
TCTTCCCGAAACC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL6194Contig1 718 2 3 U
TGCTGTCAGACAAACGCATCAAGTGATAACAAAACCAAGTCTTTTTCTGTTCGTAACGAC
TAGAGAAAACAAGAATCTGAACGGGGCTCAAAAAAGGTCGAGCACCAAACATTTTTTTTT
ATGGTGAGGGGTTTTGCTGGTGAGCCTCCTTCACTTAGGAGGCAGTAGCTTTAGCAGCAG
GAGTCTCGAAAGTCTCTCCCGCTACAAGTTCTGGGACATCATCATCATCGTTGTCCTCTT
CTTGGATAGTCGCTGGAACATCAGCTCCTCCACCTGGTGCCTGTTTCTGGAACTGCTCTG
CTAGCTTCTTTAGGTTGTCCAAGTTATCAGTTCCAAGGCTGATAATCTGAGGAAGTATGT
CTTGCAACTTTTTGGTCTGTGGTGTACCGCTCACAGCCCATGTGTTAGCAGCAACGGATG
CTTGAACTTTAGGGTTAAGGAACTGAATCACAGAATCATCCTTAAAGATGTTAACTTCTT
CGATACCGGGAATGGAGTTGACTCCAACTCTCTTGAGAGTGCTCTGTAGCTTCTTGTCGT
CCGTCGTGTTTGTCTTGTGAACAGCCTTCTTCTTCCTTCTTACTGTTCCTTTACCGCCAG
TGCGGACAGTGTTAGCCATCTTCATCAACTTCTCTCTATTCATCTTGTTATTCGATTTTT
AGGGTTCTTCTTCCTAGGTTGGGTATAAGAAGCAGAAGATAAGTAAGAGTGAGAGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2BL14TF C 1
AF RR2BL14JQ U 3
BS 1 11 RR2BL14TF
BS 12 715 RR2BL14JQ
BS 716 718 RR2BL14TF

RD RR2BL14TF 718 0 0
TGCTGTCAGACAAACGCATCAAGTGATA*CAAAACCAAGTCTTTT*CTGTTCGTAACGAC
TAGAGAAAACAAGAATCTGAACGGTGCTCAAAAAAGGTCGAGCACCAAACATTTTTTTTT
ATGGTGAGGGGTTTTGCTGGTGAGCCTCCTTCACTTAGGAGGCAGTAGCTTTAGCAGCAG
GAGTCTCGAAAGTCTCTCCCGCTACAAGTTCTGGGACATCATCATCATCGTTGTCCTCTT
CTTGGATAGTCGCTGGAACATCAGCTCCTCCACCTGGTGCCTGTTTCTGGAACTGCTCTG
CTAGCTTCTTTAGGTTGTCCAAGTTATCAGTTCCAAGGCTGATAATCTGAGGAAGTATGT
CTTGCAACTTTTTGGTCTGTGGTGTACCGCTCACAGCCCATGTGTTAGCAGCAACGGATG
CTTGAACTTTAGGGTTAAGGAACTGAATCACAGAATCATCCTTAAAGATGTTAACTTCTT
CGATACCGGGAATGGAGTTGACTCCAACTCTCTTGAGAGTGCTCTGTAGCTTCTTGTCGT
CCGTCGTGTTTGTCTTGTGAACAGCCTTCTTCTTCCTTCTTACTGTTCCTTTACCGCCAG
TGCGGACAGTGTTAGCCATCTTCATCAACTTCTCTCTATTCATCTTGTTATTCGATTTTT
AGGGTTCTTCTTCCTAGGTTGGGTATAAGAAGCAGAAGATAAGTAAGAGTGAGAGGCC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2BL14JQ 714 0 0
GTTCAGACA
AAACGCATCAAGTGATAACAAAACCAAGTCTTTTTCTGTTCGTAACGACTAGAGAAAACA
AGAATCTGAACGGGGCTCAAAAAAGGTCGAGCACCAAACATTTTTTTTTATGGTGAGGGG
TTTTGCTGGTGAGCCTCCTTCACTTAGGAGGCAGTAGCTTTAGCAGCAGGAGTCTCGAAA
GTCTCTCCCGCTACAAGTTCTGGGACATCATCATCATCGTTGTCCTCTTCTTGGATAGTC
GCTGGAACATCAGCTCCTCCACCTGGTGCCTGTTTCTGGAACTGCTCTGCTAGCTTCTTT
AGGTTGTCCAAGTTATCAGTTCCAAGGCTGATAATCTGAGGAAGTATGTCTTGCAACTTT
TTGGTCTGTGGTGTACCGCTCACAGCCCATGTGTTAGCAGCAACGGATGCTTGAACTTTA
GGGTTAAGGAACTGAATCACAGAATCATCCTTAAAGATGTTAACTTCTTCGATACCGGGA
ATGGAGTTGACTCCAACTCTCTTGAGAGTGCTCTGTAGCTTCTTGTCGTCCGTCGTGTTT
GTCTTGTGAACAGCCTTCTTCTTCCTTCTTACTGTTCCTTTACCGCCAGTGCGGACAGTG
TTAGCCATCTTCATCAACTTCTCTCTATTCATCTTGTTATTCGATTTTTAGGGTTCTTCT
TCCTAGGTTGGGTATAAGAAGCAGAAGATAAGTAAGAGTGAGAG
C

QA 10 713 10 713
DS 



AS 1 2

CO CL6195Contig1 661 2 2 U
GGACCTCTTCGGATCACATCGTCTCCAAACAAAGCAGTGTAACGTCTGCATTATCAGTCT
TCCCCATTAAACCAAGCATTTACGTTGTCTTCACCACTCCCCCACTCTCTAGCACTAAAT
CAGCTTCATCACTCTTTAAGGAAATTTTCTCATAAAAAGTGACAAATTCAGCAGTTTGGA
GCTTTCTTCTCCAAAAGATCTACCTACCAGCAGCTGTGAAGTATCAAAAAAGTGATGATT
TGTATAGAGAGATCGAGCACGAGATGTGGAGGAGCATAGGAGACTTGAAGTAGATTGGAT
TATGTGAAAGCTGGATTGAGTTTTGAAGACGCTAAGGGATTTGAGAAGGTCATAAGAGAT
GTGATTTCAAGGGCTAAAGGGATTGGCTCCAGAGATCATTGGGAGGCTTTAGTGGATGTG
AGTGTACTCCCAAGCCATGTCATCCTCATCCTCTGCATCAGCTTCTCTTTTACTGTATTT
ATTCAAACTGGGATTCTTTTATCCACTGCCCTCCTCTCTATTGGTTCCCCTCTCCGTACG
TCTCTCTCTGTATTTGACTTCATATATAAGATACGCTTAATTTTCTGAATTGCTGAGTGT
CTGCCTATTTCTTCTTTGTCTACGTTTAGATCTTGTCAAAGTCCACCAATTTTTGGAAAG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2EJ65TF U 1
AF RR2EJ65JQ C 109
BS 1 636 RR2EJ65TF
BS 637 661 RR2EJ65JQ

RD RR2EJ65TF 636 0 0
GGACCTCTTCGGATCACATCGTCTCCAAACAAAGCAGTGTAACGTCTGCATTATCAGTCT
TCCCCATTAAACCAAGCATTTACGTTGTCTTCACCACTCCCCCACTCTCTAGCACTAAAT
CAGCTTCATCACTCTTTAAGGAAATTTTCTCATAAAAAGTGACAAATTCAGCAGTTTGGA
GCTTTCTTCTCCAAAAGATCTACCTACCAGCAGCTGTGAAGTATCAAAAAAGTGATGATT
TGTATAGAGAGATCGAGCACGAGATGTGGAGGAGCATAGGAGACTTGAAGTAGATTGGAT
TATGTGAAAGCTGGATTGAGTTTTGAAGACGCTAAGGGATTTGAGAAGGTCATAAGAGAT
GTGATTTCAAGGGCTAAAGGGATTGGCTCCAGAGATCATTGGGAGGCTTTAGTGGATGTG
AGTGTACTCCCAAGCCATGTCATCCTCATCCTCTGCATCAGCTTCTCTTTTACTGTATTT
ATTCAAACTGGGATTCTTTTATCCACTGCCCTCCTCTCTATTGGTTCCCCTCTCCGTACG
TCTCTCTCTGTATTTGACTTCATATATAAGATACGCTTAATTTTCTGAATTGCTGAGTGT
CTGCCTATTTCTTCTTTGTCTACGTTTAGATCTTGT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2EJ65JQ 553 0 0
CTAGCACTAAATCAGCTTCATCACTCTTTAAGGAAATTTTCTCATAAAAAGTGACAAATT
CAGCAGTTTGGAGCTTTCTTCTCCAAAAGATCTACCTACCAGCAGCTGTGAAGTATCAAA
AAAGTGATGATTTGTATAGAGAGATCGAGCACGAGATGTGGAGGAGCATAGGAGACTTGA
AGTAGATTGGATTATGTGAAAGCTGGATTGAGTTTTGAAGACGCTAAGGGATTTGAGAAG
GTCATAAGAGATGTGATTTCAAGGGCTAAAGGGATTGGCTCCAGAGATCATTGGGAGGCT
TTAGTGGATGTGAGTGTACTCCCAAGCCATGTCATCCTCATCCTCTGCATCAGCTTCTCT
TTTACTGTATTTATTCAAACTGGGATTCTTTTATCCACTGCCCTCCTCTCTATTGGTTCC
CCTCTCCGTACGTCTCTCTCTGTATTTGACTTCATATATAAGATACGCTTAATTTTCTGA
ATTGCTGAGTGTCTGCCTATTTCTTCTTTGTCTACGTTTAGATCTTGTCAAAGTCCACCA
ATTTTTGGAAAGC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6197Contig1 1149 2 2 U
TAGTCTCTCCACTAAGAATCAACATCGACATGAGTAAGAATCTGGGTGTCTCGTACTCTT
CTTTCTCCAGTGTTTCTACTCCACTGCGCACTCGGAAACCCCTCGTCACCGTCGTCGTCT
CTAGCCGTAAAAATATAGGAACTGGTTTGGGAAGCGAGGATAAGAAACTGTTGCTGGAAC
GATATGGTTATGATGCTAATGAGTTTGCCTCTCAATCTAAGAAGACGAGAAGGAAAGAGG
AGGAAAGGAACAGTGGAAAAGAGGAAGAAGTTGCTGTGCAGCCAAGAACAACTCATAGGT
TGCTTCAGGTTCTTGCAGGAACGGCCAAACTAAAGAAGTTGCTTTCTCTCAAGGGGATGG
ATGTTAGACCTATGATGGAAGTTGTCAAAGGGGCAGCTTTTGGGATTCTCCAGGCAGCTG
GTGGTTGTCCGACGTCTCTCCGTCCTGGGAGGTGGTTGGATTTGTACAGTGGTACTGGAT
CCCGTTGGAATCGAAGCAATCAGCCGAGGATGTTCTGAGGCACACTTTGTTGAGATGGAT
CCTTGGGTTGTTTCAAATGTTCTACAACCCGAACTTGGAACACACTGGGTTTGTTGAAGC
TTCGGTTATACACACTGCTCGTGTCGAAAACTTCTTGGAACGTGCAGATAAATTAGTAGG
TAAGGATGGAGCATTTGATTATATCAGCGTTACACCACCGTACATGGAGGTTGATTATGA
GGTTCTGATGGATCAGATTTCTAAGTCGGCAGCAATTGGCGAGAATACATTTATTGTGGT
TGAGTATCCTTCACGAACCACAATGCTTGATTCATGCGGATGCCTTGAAAAGATGACTGA
TCGGAGGTTTGGCCGGACACATCTAGCTATATATGGACCAAAGTGGGCTCAAAAGCCAAG
AAAATCTTGAATCCACAGTGAATCTCAGCAGTCACATTTTGCCATTTTGTCGTTTAAAGG
CACTGGATAGATGCTGGGATTGAAGAGCTATAGTTTGTTCCAACCTTCGAATACTAGAGT
GTTTTTGTACATTGATCGCCATTTTGTTTGTCCTAAGATGGAAACAAGTTGCAGTGTTAA
TGATAGTTATGAAACCGGTAATGGTGTGTATGTCTCCCTATGTGTTTGTGAAAGCAGAAA
TATAGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL58TF U 1
AF RR2AL58JQ C 373
BS 1 655 RR2AL58TF
BS 656 1149 RR2AL58JQ

RD RR2AL58TF 655 0 0
TAGTCTCTCCACTAAGAATCAACATCGACATGAGTAAGAATCTGGGTGTCTCGTACTCTT
CTTTCTCCAGTGTTTCTACTCCACTGCGCACTCGGAAACCCCTCGTCACCGTCGTCGTCT
CTAGCCGTAAAAATATAGGAACTGGTTTGGGAAGCGAGGATAAGAAACTGTTGCTGGAAC
GATATGGTTATGATGCTAATGAGTTTGCCTCTCAATCTAAGAAGACGAGAAGGAAAGAGG
AGGAAAGGAACAGTGGAAAAGAGGAAGAAGTTGCTGTGCAGCCAAGAACAACTCATAGGT
TGCTTCAGGTTCTTGCAGGAACGGCCAAACTAAAGAAGTTGCTTTCTCTCAAGGGGATGG
ATGTTAGACCTATGATGGAAGTTGTCAAAGGGGCAGCTTTTGGGATTCTCCAGGCAGCTG
GTGGTTGTCCGACGTCTCTCCGTCCTGGGAGGTGGTTGGATTTGTACAGTGGTACTGGAT
CCCGTTGGAATCGAAGCAATCAGCCGAGGATGTTCTGAGGCACACTTTGTTGAGATGGAT
CCTTGGGTTGTTTCAAATGTTCTACAACCCGAACTTGGAACACACTGGGTTTGTTGAAGC
TTCGGTTATACACACTGCTCGTGTCGAAAACTTCTTGGAACGTGCAGATAAATTA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2AL58JQ 777 0 0
TGATGGAAGTTGTCAAAGGGGCAGCTTTTGGGATTCTCCAGGCAGCTGGTGGTTGTCCGA
CGTCTCTCCGTCCTGGGAGGTGGTTGGATTTGTACAGTGGTACTGGATCC*GTTGGAATC
GAAGCAATCAGCCGAGGATGTTCTGAGGCACACTTTGTTGAGATGGATCCTTGGGTTGTT
TCAAATGTTCTACAACC*GAACTTGGAACACACTGGGTTTGTTGAAGCTTCGGTTATACA
CACTGCTCGTGTCGAAAACTTCTTGGAACGTGCAGATAAATTAGTAGGTAAGGATGGAGC
ATTTGATTATATCAGCGTTACACCACCGTACATGGAGGTTGATTATGAGGTTCTGATGGA
TCAGATTTCTAAGTCGGCAGCAATTGGCGAGAATACATTTATTGTGGTTGAGTATCCTTC
ACGAACCACAATGCTTGATTCATGCGGATGCCTTGAAAAGATGACTGATCGGAGGTTTGG
CCGGACACATCTAGCTATATATGGACCAAAGTGGGCTCAAAAGCCAAGAAAATCTTGAAT
CCACAGTGAATCTCAGCAGTCACATTTTGCCATTTTGTCGTTTAAAGGCACTGGATAGAT
GCTGGGATTGAAGAGCTATAGTTTGTTCCAACCTTCGAATACTAGAGTGTTTTTGTACAT
TGATCGCCATTTTGTTTGTCCTAAGATGGAAACAAGTTGCAGTGTTAATGATAGTTATGA
AACCGGTAATGGTGTGTATGTCTCCCTATGTGTTTGTGAAAGCAGAAATATAGTTGT

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL6198Contig1 728 2 3 U
ATAACAAGAACAAACACAAACTGTCAATTACAAAACCAAATCATAAATAACATTCAAAGC
ATCTGCTATTGAGAGATTGAAAAAACCTCTTCTACAGATACCATTAAATTTTTACATTAT
ACTATCACTCTCCATTTTATTTTCTCTAAACCGATATATAGTTAAATTGTAATTATTTTG
AGAGGGGGTTGATTATTAAAAACATCGGCCAGGTAATGAAACTACTGGAAAAAAAAATCT
CATAGGTTATTTTTTCTGTTTGAAATTACTTCCACTTCTTGAATTTGCCTCCTCCAAACA
TACCGTGTTTCCCATGCTTTCCATGCTTGAACTTGCCTCCGTGCTTGAATTTGCCTCCAT
GCTTTCCGTGCTTGAACTTACCATGACCATATCCACCGTGACCAACGTGGCCAAACCCTG
CGGGCCCTGCATGACCGTAAGGGTTGTGTGCTACATGAGCAATGTGTGAGCTCCATAGGC
TGCTGCGGCGGCACCAGCTGCACCTGCAATCATACCTCCTAGTCCACCACTAAAATGTCC
TGCATGGGGAGGAACAGGATAGCCTGCAGGAGGATAACCTCCGGGTGCACCAGGAGGGTA
ATGATGTCCACCTCCTGGGAAACCATGAAACCCTTTGTCTTGCTCATCATGATGCTTGTC
TTTACCACCTCCCATTGTTTTTACTATTCAGCAAACCGATACGAACTTCGAAGATTGTTT
CAGAACCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN57JQ U 3
AF RR2GN57TF C 1
BS 1 2 RR2GN57TF
BS 3 555 RR2GN57JQ
BS 556 728 RR2GN57TF

RD RR2GN57JQ 553 0 0
AACAAGAACAAACACAAACTGTCAATTACAAAACCAAATCATAAATAACATTCAAAGCAT
CTGCTATTGAGAGATTGAAAAAACCTCTTCTACAGATACCATTAAATTTTTACATTATAC
TATCACTCTCCATTTTATTTTCTCTAAACCGATATATAGTTAAATTGTAATTATTTTGAG
AGGGGGTTGATTATTAAAAACATCGGCCAGGTAATGAAACTACTGGAAAAAAAAATCTCA
TAGGTTATTTTTTCTGTTTGAAATTACTTCCACTTCTTGAATTTGCCTCCTCCAAACATA
CCGTGTTTCCCATGCTTTCCATGCTTGAACTTGCCTCCGTGCTTGAATTTGCCTCCATGC
TTTCCGTGCTTGAACTTACCATGACCATATCCACCGTGACCAACGTGGCCAAACCCTGCG
GGCCCTGCATGACCGTAAGGGTTGTGTGCTACATGAGCAATGTGTGAGCTCCATAGGCTG
CTGCGGCGGCACCAGCTGCACCTGCAATCATACCTCCTAGTCCACCACTAAAATGTCCTG
CATGGGGAGGAAC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2GN57TF 728 0 0
ATAACAAGAACAAACACAAACTGTCAATTACAAAACCAAATCATAGATAACATTCAAAGC
ATCTGCTATTGAGAGATTGAAGAAACGTCTTCTACAGATACCATTAGATTTTTACATTAT
ACTATCACTCTCCATTTTATTTTCTCTAAACCGATATATAGTTAAATTGTAATTATTTTG
AGAGGGGGTTGATTATTAGAAACATCGGCCAGGTAATGAGACTACTGGAGAAGAGAATCT
CATAGGTTATTTTTTCTGTTTGAGATTACTTCCACTTCTTGAATTTGCCTCCTCCAAACA
TACCGTGTTTCCCATGCTTTCCATGCTTGAACTTGCCTCCGTGCTTGAATTTGCCTCCAT
GCTTTCCGTGCTTGAACTTACCATGACCATATCCACCGTGACCAACGTGGCCAAACCCTG
CGGGCCCTGCATGACCGTAAGGGTTGTGTGCTACATGAGCAATGTGTGAGCTCCATAGGC
TGCTGCGGCGGCACCAGCTGCACCTGCAATCATACCTCCTAGTCCACCACTAGAATGTCC
TGCATGGGGAGGAACAGGATAGCCTGCAGGAGGATAACCTCCGGGTGCACCAGGAGGGTA
ATGATGTCCACCTCCTGGGAAACCATGAAACCCTTTGTCTTGCTCATCATGATGCTTGTC
TTTACCACCTCCCATTGTTTTTACTATTCAGCAAACCGATACGAACTTCGAAGATTGTTT
CAGAACCC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL6199Contig1 1294 2 6 U
GGGAGTCAAACCAGAGATACTTAAGACTGTTGGCAAGGCAATATCATCGCTACCGGAAAA
CTTCAAGCCTCACAGAGCGGTGAAGAAAGTGTATGAACAGCGTGCTCAAATGATTGAAAC
AGGAGAAGGCATTGACTGGGCACTTGCGGAAGCTCTTGCTTTTGCTACCTTAGTTGTGGA
AGGCAACCATGTCCGCTTGAGTGGTCAGGATGTCGAAAGAGGAACCTTTAGTCATCGTCA
TTCTGTTCTTCATGACCAGGAAACTGGAGAAGAGTATTGCCCCTTAGATCATCTCGTCAT
GAATCAGGATCCTGAGATGTTCACTGTCAGCAACAGTTCTCTTTCAGAATTTGGAGTTCT
TGGGTTTGAGTTGGGTTACTCAATGGAAAGTCCAAACTCGTTGTGCTACTTCCCCATGGA
TATGATGGTCAGGGCCCTGAACATTCAAGTGCTAGGCTGGAACGTTACCTTCAGATGAGT
GATGACAACCCCTATGTCATACCAGACATGGAACCTACATTGAGAAAGCAAATCCAAGAA
TGCAATTGGCAGATTGTTAATGCCACCACTCCTGCCAACTATTTCCATGTTCTGCGTCGT
CAGCTACACAGAGACTTCCGTAAGCCTCTGATTGTAATGGCACCAAAGAACTTGCTCCGT
CACAAGGACTGCAAATCAAATCTCTCTGAGTTTGATGATGTCCAAGGACACCCTGGTTTT
GACAAGCAAGGGACTAGGTTCAAGCGATTGATCAAGGATCAGAATGATCACTCTGATCTT
GAAGAAGGCATCAGAAGATTGGTACTTTGCTCCGGAAAGGTTTATTACGAGCTTGATGAC
GAGAGGAAGAAGGTTGGAGCAAGCGACGTGGCTATTTGTAGAGTGGAACAGCTTTGTCCT
TTCCCATATGATCTCATTCAGCGTGAGCTCAAGAGATATCCAAATGCGGAGATAGTTTGG
TGCCAAGAAGAGGCGATGAACATGGGAGCATTCAGCTACATAACTCCAAGGCTATGGACA
GCAATGAGAAGCTTAGGCAGAGGAGATATGGAAGACATTAAGTACGTTGGTCGTGGACCT
TCTGCTGCTACGGCCACTGGTTTCTACACTTTCCATGTCAAAGAGCAAGCCGAGCTCGTC
CAGAAAGCCATTGGAAAGGAACCCATCAGTTAAAACCAAACTTAATTTTTTTGAATGAAT
TCTTTAAATAAGAAACTTTGGGTGAATCAAAGTGATAAACAACACTGACAAAATCATGTA
TTTGCTTTATTTGGCCCCTTTGATTTTTTCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU76TF U 1
AF RR2CU76JQ C 582
BS 1 666 RR2CU76TF
BS 667 667 RR2CU76JQ
BS 668 706 RR2CU76TF
BS 707 707 RR2CU76JQ
BS 708 724 RR2CU76TF
BS 725 1294 RR2CU76JQ

RD RR2CU76TF 729 0 0
GGGAGTCAAACCAGAGATACTTAAGACTGTTGGCAAGGCAATATCATCGCTACCGGAAAA
CTTCAAGCCTCACAGAGCGGTGAAGAAAGTGTATGAACAGCGTGCTCAAATGATTGAAAC
AGGAGAAGGCATTGACTGGGCACTTGCGGAAGCTCTTGCTTTTGCTACCTTAGTTGTGGA
AGGCAACCATGTCCGCTTGAGTGGTCAGGATGTCGAAAGAGGAACCTTTAGTCATCGTCA
TTCTGTTCTTCATGACCAGGAAACTGGAGAAGAGTATTGCCCCTTAGATCATCTCGTCAT
GAATCAGGATCCTGAGATGTTCACTGTCAGCAACAGTTCTCTTTCAGAATTTGGAGTTCT
TGGGTTTGAGTTGGGTTACTCAATGGAAAGTCCAAACTCGTTGTGCTACTTCCCCATGGA
TATGATGGTCAGGGCCCTGAACATTCAAGTGCTAGGCTGGAACGTTACCTTCAGATGAGT
GATGACAACCCCTATGTCATACCAGACATGGAACCTACATTGAGAAAGCAAATCCAAGAA
TGCAATTGGCAGATTGTTAATGCCACCACTCCTGCCAACTATTTCCATGTTCTGCGTCGT
CAGCTACACAGAGACTTCCGTAAGCCTCTGATTGTAATGGCACCAAAGAACTTGCTCCGT
CACAAG*ACTGCAAATCAAATCTCTCTGAGTTTGATGATGTCCAAG*ACACCCTGGTTTT
GACA
GCAAG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2CU76JQ 713 0 0
TTTCCATGTTCTGCGTCGTCAGCTACACAGAGACTTCCGTAAGCCTCTGATTGTAATGGC
ACCAAAGAACTTGCTCCGTCACAAGGACTGCAAATCAAATCTCTCTGAGTTTGATGATGT
CCAAGGACACCCTGGTTTTGACAAGCAAGGGACTAGGTTCAAGCGATTGATCAAGGATCA
GAATGATCACTCTGATCTTGAAGAAGGCATCAGAAGATTGGTACTTTGCTCCGGAAAGGT
TTATTACGAGCTTGATGACGAGAGGAAGAAGGTTGGAGCAAGCGACGTGGCTATTTGTAG
AGTGGAACAGCTTTGTCCTTTCCCATATGATCTCATTCAGCGTGAGCTCAAGAGATATCC
AAATGCGGAGATAGTTTGGTGCCAAGAAGAGGCGATGAACATGGGAGCATTCAGCTACAT
AACTCCAAGGCTATGGACAGCAATGAGAAGCTTAGGCAGAGGAGATATGGAAGACATTAA
GTACGTTGGTCGTGGACCTTCTGCTGCTACGGCCACTGGTTTCTACACTTTCCATGTCAA
AGAGCAAGCCGAGCTCGTCCAGAAAGCCATTGGAAAGGAACCCATCAGTTAAAACCAAAC
TTAATTTTTTTGAATGAATTCTTTAAATAAGAAACTTTGGGTGAATCAAAGTGATAAACA
ACACTGACAAAATCATGTATTTGCTTTATTTGGCCCCTTTGATTTTTTCGACC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL6200Contig1 590 2 3 U
GATTCGGTGAGTGCATTGAGGTCATGGCGACTTCAGACAACGTAGTACGAGCTGGCCTCA
CTCCCAAACCTCTGGATATTCAAACACTTTGTTCCATGCTCTCCTATAAACTGGTAAACC
TTTTAACTTAATAACCAAACTCAAGAGTCTTTTATAGCAGAGTTACTGAGTTCTCATTTT
TGAGTTTTCAGGGCTTTCCTGAAATCCTAAAGGGAACAAGGATTCGACCATACATCACAA
GATACCTCCCGCCTTTCGAGGAGTTTGAAGTTGATCTCTGTGATCTTCCCTGTGGAGCCT
CGACGGTGTTTCCTTCTGTTCCAGGCCCTTCTCTTTTGCTTGTACTTCAAGGTGAAGGAA
GAATGTCTACAGATGCTTCAGCAGATGAGATTTCAATGGGAGATGTTCTGTTTGTACCTG
CAGATACTGAGATTCACTTGAAGTCTTCATCTGACTTGAAGCTGTACAGAGCAGGAATTA
ACAGTAGGTTTTTGGATTCTCCATAGTTGAACTACATACTGTTATCAGTGAAGCTTTTCT
TCAGTTTATTGTATTATTATTATACAACCTGTGTCAAATGCGCTTACTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ62TF U 295
AF RR2CZ62JQ C 1
BS 1 294 RR2CZ62JQ
BS 295 410 RR2CZ62TF
BS 411 590 RR2CZ62JQ

RD RR2CZ62TF 116 0 0
GAGCCTCGACGGTGTTTCCTTCTGTTCCAGGCCCTTCTCTTTTGCTTGTACTTCAAGGTG
AAGGAAGAATGTCTACAGATGCTTCAGCAGATGAGATTTCAATGGGAGATGTTCTG

QA 1 116 1 116
DS 

RD RR2CZ62JQ 590 0 0
GATTCGGTGAGTGCATTGAGGTCATGGCGACTTCAGACAACGTAGTACGAGCTGGCCTCA
CTCCCAAACCTCTGGATATTCAAACACTTTGTTCCATGCTCTCCTATAAACTGGTAAACC
TTTTAACTTAATAACCAAACTCAAGAGTCTTTTATAGCAGAGTTACTGAGTTCTCATTTT
TGAGTTTTCAGGGCTTTCCTGAAATCCTAAAGGGAACAAGGATTCGACCATACATCACAA
GATACCTCCCGCCTTTCGAGGAGTTTGAAGTTGATCTCTGTGATCTTCCCTGTGGAGCCT
CGACGGTGTTTCCTTCTGTTCCAGGCCCTTCTCTTTTGCTTGTACTTCAAGGTGAAGGAA
GAATGTCTACAGATGCTTCAGCAGATGAGATTTCAATGGGAGATGTTCTGTTTGTACCTG
CAGATACTGAGATTCACTTGAAGTCTTCATCTGACTTGAAGCTGTACAGAGCAGGAATTA
ACAGTAGGTTTTTGGATTCTCCATAGTTGAACTACATACTGTTATCAGTGAAGCTTTTCT
TCAGTTTATTGTATTATTATTATACAACCTGTGTCAAATGCGCTTACTTG

QA 1 590 1 590
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6202Contig1 771 2 3 U
TTAAGTTTGATCATATAATTATCACCAAAAAGACAGGTTATTAACACACAAAGGCAAAAC
CAACAACATATAATTATCTAAGTACATAGTCACAATAGTCTTATTCAATCTTTTCTTTAT
GTGCCCCCAAAAACCTGCCTTGCACGTTTTACCTTATTTTTCTCTTCTTCCGCTTTCAAC
ATACCGCCCTGTATCGCACAGCCAAACACCAACAGTTCCAAGTATCCCATACCGTCAAGC
TCTTTACCAATCATTCTCTGGTTCAAAAGCCGTAGTCTCTCCTTCTCGATCTTCAAAAAT
TCGATGGTTAACATCAGTGTTTCAGGGTCATAGCTATGAGGAGGGCTGTCTTGAGGAGGA
CTGAGGCGGAGTTCTCGAGCCTTGTTCCTCAAAGCTGTTCTTCTCCTTGCCAAAAGCGAT
TGGTAAGCCAAATCCTCTTTCTCTTTTTCGTCAAGCCATTCCTTTCCCATAACATCGCAA
TCAAGAATCTCGCTGAGTAATAACTCCTGCTGTGCCTTATCTGTTTGTTCATCCACAATG
CGGAAGCCCTCCTTTAACATACTTTCAAGTGAAGCCAGCTCGGTGTAGCTCAGACCGTCT
AGACCCTCACCATTCAGTTTCTCGTTGGAAATCTGTAACATTTTGATCTCCTCCTGCAAT
TCTTGGATAACTTGTATACATTGGAGCCTCTGTTTTACAGATCTTCGTGTAGTTCTTGGC
CTTGGCATCTCTCTCCCTGTCTCGCCTCGCGCTTCCGCGTTCCGTTTCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BB23JQ U 13
AF RR2BB23TF C 1
BS 1 12 RR2BB23TF
BS 13 482 RR2BB23JQ
BS 483 771 RR2BB23TF

RD RR2BB23JQ 470 0 0
ATATAATTATCACCAAAAAGACAGGTTATTAACACACAAAGGCAAAACCAACAACATATA
ATTATCTAAGTACATAGTCACAATAGTCTTATTCAATCTTTTCTTTATGTGCCCCCAAAA
ACCTGCCTTGCACGTTTTACCTTATTTTTCTCTTCTTCCGCTTTCAACATACCGCCCTGT
ATCGCACAGCCAAACACCAACAGTTCCAAGTATCCCATACCGTCAAGCTCTTTACCAATC
ATTCTCTGGTTCAAAAGCCGTAGTCTCTCCTTCTCGATCTTCAAAAATTCGATGGTTAAC
ATCAGTGTTTCAGGGTCATAGCTATGAGGAGGGCTGTCTTGAGGAGGACTGAGGCGGAGT
TCTCGAGCCTTGTTCCTCAAAGCTGTTCTTCTCCTTGCCAAAAGCGATTGGTAAGCCAAA
TCCTCTTTCTCTTTTTCGTCAAGCCATTCCTTTCCCATAACATCGCAATC

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR2BB23TF 771 0 0
TTAAGTTTGATCATATAATTATCACCAGAGAGACAGGTTATTAACACACAAAGGCAGAAC
CAACAACATATAATTATCTAAGTACATAGTCACAATAGTCTTATTCAATCTTTTCTTTAT
GTGCCCCCAAGAACCTGCCTTGCACGTTTTACCTTATTTTTCTCTTCTTCCGCTTTCAAC
ATACCGCCCTGTATCGCACAGCCAAACACCAACAGTTCCAAGTATCCCATACCGTCAAGC
TCTTTACCAATCATTCTCTGGTTCAAAAGCCGTAGTCTCTCCTTCTCGATCTTCAAAGAT
TCGATGGTTAACATCAGTGTTTCAGGGTCATAGCTATGAGGAGGGCTGTCTTGAGGAGGA
CTGAGGCGGAGTTCTCGAGCCTTGTTCCTCAAAGCTGTTCTTCTCCTTGCCAGAAGCGAT
TGGTAAGCCGAATCCTCTTTCTCTTTTTCGTCAAGCCATTCCTTTCCCATAACATCGCAA
TCAAGAATCTCGCTGAGTAATAACTCCTGCTGTGCCTTATCTGTTTGTTCATCCACAATG
CGGAAGCCCTCCTTTAACATACTTTCAAGTGAAGCCAGCTCGGTGTAGCTCAGACCGTCT
AGACCCTCACCATTCAGTTTCTCGTTGGAAATCTGTAACATTTTGATCTCCTCCTGCAAT
TCTTGGATAACTTGTATACATTGGAGCCTCTGTTTTACAGATCTTCGTGTAGTTCTTGGC
CTTGGCATCTCTCTCCCTGTCTCGCCTCGCGCTTCCGCGTTCCGTTTCCGC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL6203Contig1 786 2 2 U
GGACGAGACACAAAGAAAATATCATCCAAGAGCTTCTTCTAGGGCTTCGACGCGACAACG
GCTGCCAACTACTTCAGTTTCATAACTGCACAGGAATCATGAAGCCAGTCTTCTGTGGGA
ACTTTGAGTATGATGCACGTGGGGGCGATCTTGAAAGACTATTCAGGAAATACGGAAGGG
TCGAGAGGGTTGATATGAAAGCTGGGTTTGCTTTCGTGTACATGGAAGACGAGAGGGATG
CTGAGGATGCAATCCGAGCCCTTGACCGCATTGAATTTGGGCGCAAGGGACGCAGACTCC
GTGTTGAGTGGACAAAGGGTGAGCGTGGAGGCAATGAGAGCCCTAGGAGGAGGGAGAGAG
TTGCAAGCCCCAGGTACAGTCGAAGTCCTGATAACAAGAGAGAGAGGGTGAGTCCTGACC
GCAGCCCGTTTAAGAAGGAAAGTTTGAAGAACGGAGATGGTGAAGTTGATAGCCCAAGGA
GGGAGAGATCAAGGTCTAGCCCTGAGAATGGGCAAGTTGAAAGCCCTGGCTCTATAGGGA
GAAGGGACAGTGATGGTGGCTACGATGGTGCAGATAGCCCCCCGATGCAGAAGAGCCGGT
CTCGTTCGCCTCCAGCTGAAGAGTGAATGAAAAGTGGATACATCAAAGTAGGGTGATGTA
GTCAAACTCTCTGTGTCATGTGTTGTGTTTAGTTTCTTTGCTATTTGATACATTTGAACT
AGGATCTCTTTTTATTGTTGGATTGAAGAAAACTTATCTTGTGTGCTTAAAGTGTGCCAT
GTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2C983TF U 1
AF RR2C983JQ C 50
BS 1 690 RR2C983TF
BS 691 786 RR2C983JQ

RD RR2C983TF 690 0 0
GGACGAGACACAAAGAAAATATCATCCAAGAGCTTCTTCTAGGGCTTCGACGCGACAACG
GCTGCCAACTACTTCAGTTTCATAACTGCACAGGAATCATGAAGCCAGTCTTCTGTGGGA
ACTTTGAGTATGATGCACGTGGGGGCGATCTTGAAAGACTATTCAGGAAATACGGAAGGG
TCGAGAGGGTTGATATGAAAGCTGGGTTTGCTTTCGTGTACATGGAAGACGAGAGGGATG
CTGAGGATGCAATCCGAGCCCTTGACCGCATTGAATTTGGGCGCAAGGGACGCAGACTCC
GTGTTGAGTGGACAAAGGGTGAGCGTGGAGGCAATGAGAGCCCTAGGAGGAGGGAGAGAG
TTGCAAGCCCCAGGTACAGTCGAAGTCCTGATAACAAGAGAGAGAGGGTGAGTCCTGACC
GCAGCCCGTTTAAGAAGGAAAGTTTGAAGAACGGAGATGGTGAAGTTGATAGCCCAAGGA
GGGAGAGATCAAGGTCTAGCCCTGAGAATGGGCAAGTTGAAAGCCCTGGCTCTATAGGGA
GAAGGGACAGTGATGGTGGCTACGATGGTGCAGATAGCCCCCCGATGCAGAAGAGCCGGT
CTCGTTCGCCTCCAGCTGAAGAGTGAATGAAAAGTGGATACATCAAAGTAGGGTGATGTA
GTCAAACTCTCTGTGTCATGTGTTGTGTTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2C983JQ 737 0 0
ACGCGACAACGGCTGCCAACTACTTCAGTTTCATAACTGCACAGGAATCATGAAGCCAGT
CTTCTGTGGGAACTTTGAGTATGATGCACGTGGGGGCGATCTTGAAAGACTATTCAGGAA
ATACGGAAGGGTCGAGAGGGTTGATATGAAAGCTGGGTTTGCTTTCGTGTACATGGAAGA
CGAGAGGGATGCTGAGGATGCAATCCGAGCCCTTGACCGCATTGAATTTGGGCGCAAGGG
ACGCAGACTCCGTGTTGAGTGGACAAAGGGTGAGCGTGGAGGCAATGAGAGCCCTAGGAG
GAGGGAGAGAGTTGCAAGCCCCAGGTACAGTCGAAGTCCTGATAACAAGAGAGAGAGGGT
GAGTCCTGACCGCAGCCCGTTTAAGAAGGAAAGTTTGAAGAACGGAGATGGTGAAGTTGA
TAGCCCAAGGAGGGAGAGATCAAGGTCTAGCCCTGAGAATGGGCAAGTTGAAAGCCCTGG
CTCTATAGGGAGAAGGGACAGTGATGGTGGCTACGATGGTGCAGATAGCCCCCCGATGCA
GAAGAGCCGGTCTCGTTCGCCTCCAGCTGAAGAGTGAATGAAAAGTGGATACATCAAAGT
AGGGTGATGTAGTCAAACTCTCTGTGTCATGTGTTGTGTTTAGTTTCTTTGCTATTTGAT
ACATTTGAACTAGGATCTCTTTTTATTGTTGGATTGAAGAAAACTTATCTTGTGTGCTTA
AAGTGTGCCATGTTACC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL6204Contig1 833 2 3 U
TTTTTTTTGCAAATACGAATACTTTATTGGACACAAAATGAGGATACAATATATAACACA
TGTAAATATAAACACTCTATATAAACATTAGGGTATAATTGGTAATTATGGCTGTAAATC
AGCAATTTATATAGGTTTATAGTATATATAAGCAAATATTATTTAGTTTGTATTGAGAAG
CTCCTCTATCATTTGCAAAGCAACCTTCTCTTCCTCGTCCATTGTTCCTTCTTCTCTGCC
GCCGCCAACCTCAGTGGCCAGACCAAGATTGTCTAGTGAAGCTTTTCCAGTAGGCTCCTG
GGAAGAGCCGGTGGGGCCAAGCTCCACCGTCATGACCCAACTAGAATCAGAATTGGAACC
GGCGCGTTTCTGCCAAACACCAATGTCGGAGCTGTTCGGGTCAAGACGGAGGCAGGTGAG
TGATGGCGAAGGAGACTTGCAGCATTTCCTCAGTTTGGCGCTGAGGATGGAAGAGAGGGA
TGAAGATGGTGAAGATAAGGATGAGGATGCAGAGGCTGAAACGTTGGTTTTACTCGCAGA
AGTGTCTCCGGTGTTGTTGTTGTTGAGGGGGAAGTTGGTCTTGGCGTTGCGGCCACTCAT
TAAAACAGCGGCCTCGTCGTAGGCTCTTGCTGCCTCCTCCGCAGTCTCAAACGTCCCCAG
CCAAATTCTCCTTTTCAAGAGAGGATGACGAATCTCAGCGACCCAAGAACCCCAATGGCG
TTGCCTGACACCTCTGAACTTCTTCGTATGTACCATTCTTACTTACTCTCTGTTCTTTGT
CAGAGAGAAGAGTAAGAATTCTTGATGACGAGTAATATATGCATGATGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FD06JQ U 9
AF RR2FD06TF C 1
BS 1 8 RR2FD06TF
BS 9 686 RR2FD06JQ
BS 687 833 RR2FD06TF

RD RR2FD06JQ 678 0 0
GCAAATACGAATACTTTATTGGACACAAAATGAGGATACAATATATAACACATGTAAATA
TAAACACTCTATATAAACATTAGGGTATAATTGGTAATTATGGCTGTAAATCAGCAATTT
ATATAGGTTTATAGTATATATAAGCAAATATTATTTAGTTTGTATTGAGAAGCTCCTCTA
TCATTTGCAAAGCAACCTTCTCTTCCTCGTCCATTGTTCCTTCTTCTCTGCCGCCGCCAA
CCTCAGTGGCCAGACCAAGATTGTCTAGTGAAGCTTTTCCAGTAGGCTCCTGGGAAGAGC
CGGTGGGGCCAAGCTCCACCGTCATGACCCAACTAGAATCAGAATTGGAACCGGCGCGTT
TCTGCCAAACACCAATGTCGGAGCTGTTCGGGTCAAGACGGAGGCAGGTGAGTGATGGCG
AAGGAGACTTGCAGCATTTCCTCAGTTTGGCGCTGAGGATGGAAGAGAGGGATGAAGATG
GTGAAGATAAGGATGAGGATGCAGAGGCTGAAACGTTGGTTTTACTCGCAGAAGTGTCTC
CGGTGTTGTTGTTGTTGAGGGGGAAGTTGGTCTTGGCGTTGCGGCCACTCATTAAAACAG
CGGCCTCGTCGTAGGCTCTTGCTGCCTCCTCCGCAGTCTCAAACGTCCCCAGCCAAATTC
TCCTTTTCAAGAGAGGAT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2FD06TF 833 0 0
TTTTTTTTGCAAATACGAATACTTT*TTGGACACAAA*TGAGGATACAATATATAACACA
TGTAAATATAAACACTCTATATAAACAT*AGGGTATAATTGGTAATTATGGCTGTAAATC
AGCAATTTATATAGGTTTATAGTATATATAAGCAAATATTATTTAGTTTGTATTGAGAAG
CTCCTCTATCATTTGCAAAGCAACTTTCTCTTCCTCGTCCATTGTTCCTTCTTCTCTGCC
GCCGCCAACCTCAGTGGCCAGACCAAGATTGTCTAGTGAAGCTTTTCCAGTAGGCTCCTG
GGAAGAGCCGGTGGGGCCAAGCTCCACCGTCATGACCCAACTAGAATCAGAATTGGAACC
GGCGCGTTTCTGCCAAACACCAATGTCGGAGCTGTTCGGGTCAAGACGGAGGCAGGTGAG
TGATGGCGAAGGAGACTTGCAGCATTTCCTCAGTTTGGCGCTGAGGATGGAAGAGAGGGA
TGAAGATGGTGAAGATAAGGATGAGGATGCAGAGGCTGAAACGTTGGTTTTACTCGCAGA
CGTGTCTCCGGTGTTGTTGTTGTTGAGGGGGAAGTTGGTCTTGGCGTTGCGGCCACTCAT
TAAAACAGCGGCCTCGTCGTAGGCTCTTGCTGCCTCCTCCGCAGTCTCAAACGTCCCCAG
CCAAATTCTCCTTTTCAAGAGAGGATGACGAATCTCAGCGACCCAAGAACCCCAATGGCG
TTGCCTGACACCTCTGAACTTCTTCGTATGTACCATTCTTACTTACTCTCTGTTCTTTGT
CAGAGAGAAGAGTAAGAATTCTTGATGACGAGTAATATATGCATGATGAATCC

QA 1 833 1 833
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6206Contig1 723 2 2 U
TTTTTTTTGGAAGAGGATACATTACTCATTTATGAATATTTTTGAAAATTCGAACTGACT
AGAAATGGAGATTCGGAGGTAATAATAAATGATTTAAGACACAATAAAATATCCGAAAAA
AGAACCAATCACTTTTGCTTTTTGGACAGAACAAAATTAATAAAATATTCAATAATTGCC
ATTTTCACATGATAGCACCGACGACGACAGCGCAGGCCAGCGAAGCAACGACGGTGGAAA
ATTGCAGCGACGAAGAAGAAGATTTCTGAGAGAGTGGGATAGATCCAAATGCGTTTTGGT
AAGAGGGAGTATCGGCATCGGCAGAAGACGAGGGAGACAAGGCGTCTGCTGCCTTCCTTG
GATGTGGTAGCCGTTTCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTAATTCTCCGTCACCC
GTTACCAGATTGGATCTTTGGTGTTGCAGCTCTTGAAGTTGGAAGGTGTCACTTGAATCA
TTGAATCTTCGCCTGGTGGGTACAAGAACACTGTTTCAGTTGCATCAAGAGGGAGTCGCC
GATCTTGAAAGAATGAGATTTGGGCCATTTGGTGTAGACTTTAGCATCAACCGGGATACC
CCATGAGTCCAAGTTCCCAACTTTGTACTGCGTCGAAGATACTTGCACTAACAGTATCAT
CACCAAAACCATTACGCTGCTCAAACTCATCATTCCCATCTCTCCCTCTTTCTCTTGTCC
TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2D589TF C 1
AF RR2D589JQ U 9
BS 1 8 RR2D589TF
BS 9 723 RR2D589JQ

RD RR2D589TF 723 0 0
TTTTTTTTGGAAGAGGATACATTACTCATTTATGAATATTTT*GAAAATTCGAACTGACT
AGAAATGGAGATTCGGAGGTAATAATAAATGATTTAAGACACAATAAAATATCCGAAAAA
AGAACCAATCACTTTTGCTTTTTGGACAGAACAAAATTAATAAAATATTCAATAATTGCC
ATTTTCACATGATAGCACCGACGACGACAGCGCAGGCCAGCGAAGCAACGACGGTGGAAA
ATTGCAGCGACGAAGAAGAAGATTTCTGAGAGAGTGGGATAGATCCAAATGCGTTTTGGT
AAGAGGGAGTATCGGCATCGGCAGAAGACGAGGGAGACAAGGCGTCTGCTGCCTTCCTTG
GATGTGGTAGCCGTTTCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTAATTCTCCGTCACCC
GTTACCAGATTGGATCTTTGGTGTTGCAGCTCTTGAAGTTGGAAGGTGTCACTTGAATCA
TTGAATCTTCGCCTGGTGGGTACAAGAACACTGTTTCAGTTGCATCAAGAGGGAGTCGCC
GATCTTGAAAGAATGAGATTTGGGCCATTTGGTGTAGACTTTAGCATCAACCGGGATACC
CCATGAGTCCAAGTTCCCAACTTTGTACTGCGTCGAAGATACTTGCACTAACAGTATCAT
CACCAAAACCATTACGCTGCTCAAACTCATCATTCCCATCTCTCCCTCTTTCTCTTGTCC
TCC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2D589JQ 715 0 0
GGAAGAGGATACATTACTCATTTATGAATATTTTTGAAAATTCGAACTGACTAGAAATGG
AGATTCGGAGGTAATAATAAATGATTTAAGACACAATAAAATATCCGAAAAAAGAACCAA
TCACTTTTGCTTTTTGGACAGAACAAAATTAATAAAATATTCAATAATTGCCATTTTCAC
ATGATAGCACCGACGACGACAGCGCAGGCCAGCGAAGCAACGACGGTGGAAAATTGCAGC
GACGAAGAAGAAGATTTCTGAGAGAGTGGGATAGATCCAAATGCGTTTTGGTAAGAGGGA
GTATCGGCATCGGCAGAAGACGAGGGAGACAAGGCGTCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGT
AGCCGTTTCTCAGGCTCCCTCTCCGGAATCGAACCCTAATTCTCCGTCACCCGTTACCAG
ATTGGATCTTTGGTGTTGCAGCTCTTGAAGTTGGAAGGTGTCACTTGAATCATTGAATCT
TCGCCTGGTGGGTACAAGAACACTGTTTCAGTTGCATCAAGAGGGAGTCGCCGATCTTGA
AAGAATGAGATTTGGGCCATTTGGTGTAGACTTTAGCATCAACCGGGATACCCCATGAGT
CCAAGTTCCCAACTTTGTACTGCGTCGAAGATACTTGCACTAACAGTATCATCACCAAAA
CCATTACGCTGCTCAAACTCATCATTCCCATCTCTCCCTCTTTCTCTTGTCCTCC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL6207Contig1 848 2 4 U
GAATCCATTCCTGTGGTGCTTGTAATCGATCCAACAACTGGTCAAAAGATGAGAATGTGG
TCTGGAATGGTCGAACCCGAGAATCTGCTAGAGGATTTAGTGCCCTTCATGGACGGTGGT
CCTCGTGAACACTTTGCTTCTCTCTCAAAGAAACGTCCAAGAGGCAGCTTCTCATTGGCT
CCTCATTCCAAACCCAAAGAGGTGGTAGCGAAAGATGACGATGAAGAAGCAGAACTTCAA
CGAGCATTGGCTGCTTCATTGGAAGACAACGACATGAAAGAGTCTTCAGATGATAATAAA
TCAGCAATAACGCCTGAAGAAGTGGTAGCGGTTGAAGCTGTTATAACAACAACTGTGCTG
CCAACATTCCCACCTCTGCCGGAAGAACCAAAGGGAGGCGACCGCAGCGTTCAGTGCAGA
GTCGGTATACGTTTACCAAACGGACAGAGAGTCCAGAGAAACTTCCTCAAAACCCACTCA
ATTCAGCTTCTCTGGTCGTTCTGCTATTCTCAGCTTGAGGAGTCAGAGAGGAAGAAGCCA
CTGAAGCTAACACAGGCGATTCCAGGTGAATCAAAGACGTTAGAGTATGAGTCTAACTTG
ACCTTGGAGCAATCTGGTGTTGCCAATTCCATGATCTCTGCTACATGGGAATGACAATAC
CATATCTATTAAACTTATCTCTATGATGCTGTGTTTTAACTTTTTTAAGGTTTATTAGAT
TTGTTCTTTTAAGATTCTGACCTTCTGAAGAATGAAAAGTTTGTGATATTTTATTTGCTA
CGAATTGAAAAAAATATATCTATCATCGGTTTAAAATTTTGAGTTCTTAAAATATTGAAA
TTTAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G383TF U 1
AF RR2G383JQ C 8
BS 1 709 RR2G383TF
BS 710 710 RR2G383JQ
BS 711 784 RR2G383TF
BS 785 848 RR2G383JQ

RD RR2G383TF 784 0 0
GAATCCATTCCTGTGGTGCTTGTAATCGATCCAACAACTGGTCAAAAGATGAGAATGTGG
TCTGGAATGGTCGAACCCGAGAATCTGCTAGAGGATTTAGTGCCCTTCATGGACGGTGGT
CCTCGTGAACACTTTGCTTCTCTCTCAAAGAAACGTCCAAGAGGCAGCTTCTCATTGGCT
CCTCATTCCAAACCCAAAGAGGTGGTAGCGAAAGATGACGATGAAGAAGCAGAACTTCAA
CGAGCATTGGCTGCTTCATTGGAAGACAACGACATGAAAGAGTCTTCAGATGATAATAAA
TCAGCAATAACGCCTGAAGAAGTGGTAGCGGTTGAAGCTGTTATAACAACAACTGTGCTG
CCAACATTCCCACCTCTGCCGGAAGAACCAAAGGGAGGCGACCGCAGCGTTCAGTGCAGA
GTCGGTATACGTTTACCAAACGGACAGAGAGTCCAGAGAAACTTCCTCAAAACCCACTCA
ATTCAGCTTCTCTGGTCGTTCTGCTATTCTCAGCTTGAGGAGTCAGAGAGGAAGAAGCCA
CTGAAGCTAACACAGGCGATTCCAGGTGAATCAAAGACGTTAGAGTATGAGTCTAACTTG
ACCTTGGAGCAATCTGGTGTTGCCAATTCCATGATCTCTGCTACATGGGAATGACAATAC
CATATCTATTAAACTTATCTCTATGATGCTGTGTTTTAACTTTTTTAAG*TTTATTAGAT
TTGTTCTTTTAAGATTCTGACCTTCTGAAGAATGAAAAGTTTGTGATATTTTATTTGCTA
CGAA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2G383JQ 841 0 0
ATT
CTGTGGTGCTTGTAATCGATCCAACAACTGGTCAAA*GATGAGAATGTGGTCTGGAATGG
TCGAACCCGAGAATCTGCTAGAGGATTTAGTGCCCTTCATGGACGGTGGTC*TCGTGAAC
ACTTTGCTTCTCTCTCAAAGAAACGTCCAAGAGGCAGCTTCTCATTGGCTCCTCATTCCA
AACCCAAAGAGGTGGTAGCGAAAGATGACGATGAAGAAGCAGAACTTCAACGAGCATTGG
CTGCTTCATTGGAAGACAACGACATGAAAGAGTCTTCAGATGATAATAAATCAGCAATAA
CGCCTGAAGAAGTGGTAGCGGTTGAAGCTGTTATAACAACAACTGTGCTGCCAACATTCC
CACCTCTGCCGGAAGAACCAAAGGGAGGCGACCGCAGCGTTCAGTGCAGAGTCGGTATAC
GTTTACCAAACGGACAGAGAGTCCAGAGAAACTTCCTCAAAACCCACTCAATTCAGCTTC
TCTGGTCGTTCTGCTATTCTCAGCTTGAGGAGTCAGAGAGGAAGAAGCCACTGAAGCTAA
CACAGGCGATTCCAGGTGAATCAAAGACGTTAGAGTATGAGTCTAACTTGACCTTGGAGC
AATCTGGTGTTGCCAATTCCATGATCTCTGCTACATGGGAATGACAATACCATATCTATT
AAACTTATCTCTATGATGCTGTGTTTTAACTTTTTTAAGGTTTATTAGATTTGTTCTTTT
AAGATTCTGACCTTCTGAAGAATGAAAAGTTTGTGATATTTTATTTGCTACGAATTGAAA
AAAATATATCTATCATCGGTTTAAAATTTTGAGTTCTTAAAATATTGAAATTTAATGC

QA 4 841 4 841
DS 



AS 1 2

CO CL6208Contig1 1099 2 2 U
GATATTGCATCCAAATATAGCAATCCTTTTGTAGACTGTAATCCAAAAAAAGGAGTTTCA
AAATCCATTTTGGGGAAGAGAGATTGGAACTCCTTTTCTTCTTCTTCTCTTCTATGCTCA
AAGATATGGGTCGTGGAAAAATTGAGATAAAGAGGACCGAGAATGCGAACAGCAGGCAAG
TTACCTTCTCCAAGAGGCGTGCTGGTTTGCTCAAGAAAGCTCATGAGCTCTCTGTTCTCT
GTGACGCGGAGGTTGCCGTTATCGTCTTCTCCAAGTCTGGCAAGCTCTTCGAGTTCTCAA
GTAGTAGCATGAAGAAAACGCTTTGAGATACAGCAATTATCAGATCTCTTCAGATGTTCC
TGGGATTATTAACTGTAAAGCAGAGAACCAGGAGGAGAGTACAGAGGTGGATCTTTTAAA
GGATGAGATCTCAAAGCTTCAAGAGAAACATTTACAACTGAAGGGTAAGCGCTTGAATAC
TCTGAGCTTGAAACAGCTGCAACACCTTGAGCAGCAACTAAATGTCTCATTAATATCCGT
GAGAGAGCGAAAGGAACTATTGTTGACTAAACAACTTGAAGAATCACGGTTGAAGGAACA
GCGAGCAGAGCTGGAAAACGAGACCTTACGTAGACAGGTTCAAGAACTCAGGAGTTTTCT
CCCTTCGATCAACCAACAACACTATGCTCCATCCTACATCAGATGCTTCACTATAGATCC
TAAGAGCTCACTCTTAAACAACACTTGCTATGGCCACATTAACTGCAGCCTCCTCCAGAA
CACTAACTCAGATACAACTTTGCAACTAAGGTTGCCGGGGGAAGCACATGATACAAGGAA
GAACGAAGGAGACAGAGAGAGCCCATCAAGTGATTCAGTGACAACGAGCACAACTAGAGC
AAGTGCTCAAAGGATTAGTCTAGTTTAGAAATTAATATTCTATCTGAAAAAACAAAAGCC
AAAATGTTCTCTGTTTAACCTCGCTCTTTGTACTTTTATCTTTTGATTAACTAGTTTGTG
GAGTTTTAATATTCCATAATCTGTACAATTAACTCTATGCTTTATTAATTAATCACTAGC
TATTAAAGCTTGGATCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK31TF U 1
AF RR2CK31JQ C 297
BS 1 592 RR2CK31TF
BS 593 1099 RR2CK31JQ

RD RR2CK31TF 592 0 0
GATATTGCATCCAAATATAGCAATCCTTTTGTAGACTGTAATCCAAAAAAAGGAGTTTCA
AAATCCATTTTGGGGAAGAGAGATTGGAACTCCTTTTCTTCTTCTTCTCTTCTATGCTCA
AAGATATGGGTCGTGGAAAAATTGAGATAAAGAGGACCGAGAATGCGAACAGCAGGCAAG
TTACCTTCTCCAAGAGGCGTGCTGGTTTGCTCAAGAAAGCTCATGAGCTCTCTGTTCTCT
GTGACGCGGAGGTTGCCGTTATCGTCTTCTCCAAGTCTGGCAAGCTCTTCGAGTTCTCAA
GTAGTAGCATGAAGAAAACGCTTTGAGATACAGCAATTATCAGATCTCTTCAGATGTTCC
TGGGATTATTAACTGTAAAGCAGAGAACCAGGAGGAGAGTACAGAGGTGGATCTTTTAAA
GGATGAGATCTCAAAGCTTCAAGAGAAACATTTACAACTGAAGGGTAAGCGCTTGAATAC
TCTGAGCTTGAAACAGCTGCAACACCTTGAGCAGCAACTAAATGTCTCATTAATATCCGT
GAGAGAGCGAAAGGAACTATTGTTGACTAAACAACTTGAAGAATCACGGTTG

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2CK31JQ 803 0 0
TCAAGTAGTAGCATGAAGAAAACGCTTTGAGATACAGCAATTATCAGATCTCTTCAGATG
TTCCTGGGATTATTAACTGTAAAGCAGAGAACCAGGAGGAGAGTACAGAGGTGGATCTTT
TAAAGGATGAGATCTCAAAGCTTCAAGAGAAACATTTACAACTGAAGGGTAAGCGCTTGA
ATACTCTGAGCTTGAAACAGCTGCAACACCTTGAGCAGCAACTAAATGTCTCATTAATAT
CCGTGAGAGAGCGAAAGGAACTATTGTTGACTAAACAACTTGAAGAATCACGGTTGAAGG
AACAGCGAGCAGAGCTGGAAAACGAGACCTTACGTAGACAGGTTCAAGAACTCAGGAGTT
TTCTCCCTTCGATCAACCAACAACACTATGCTCCATCCTACATCAGATGCTTCACTATAG
ATCCTAAGAGCTCACTCTTAAACAACACTTGCTATGGCCACATTAACTGCAGCCTCCTCC
AGAACACTAACTCAGATACAACTTTGCAACTAAGGTTGCCGGGGGAAGCACATGATACAA
GGAAGAACGAAGGAGACAGAGAGAGCCCATCAAGTGATTCAGTGACAACGAGCACAACTA
GAGCAAGTGCTCAAAGGATTAGTCTAGTTTAGAAATTAATATTCTATCTGAAAAAACAAA
AGCCAAAATGTTCTCTGTTTAACCTCGCTCTTTGTACTTTTATCTTTTGATTAACTAGTT
TGTGGAGTTTTAATATTCCATAATCTGTACAATTAACTCTATGCTTTATTAATTAATCAC
TAGCTATTAAAGCTTGGATCTGG

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL6209Contig1 747 2 2 U
GGGCGATTCACCACTACTGTCAAACCAGTTTCTCAGATCTCTTCAGATTCATCTTAGTCG
TACCTCTAAGATGGGTCTGAAGAATCTTTGATTACATCAAATACTGTTTTTTTCTCCTGT
CAAAACATCATCGAACACAAAAGAAATCTTATCCAAGCGGTTGAAGTATTAGCTACATGA
TGTGTGTAACGCATCTATGAAGAAAGAAAAGTTTGATTTGTGCAAGGTCGGGCAGAAATA
TAATCAAAGCTGGAGTAAAGTGTCTAACATTGCAATCATTGAAGATAGAAAATGGGAATG
TCAAACACTTTCAGAATTACAATAGATTGTATAGGTGTTTAACCTGGATAGAGAACTCAG
AGCCTATTCAATAAGATTTACTTTTTGAAGAATATAGAATCTTAAATTCAAAGGTCATAC
ATATTAGAAAAAGGGACTTCTAATTGTATAGATTGCGGTAGCTATTATTTTCCGGAAGGT
GGGGATTACTTTCACTTGAATACACTAACTAGTTTTGAATGGTTTCACGCCAGAAAGGCG
TGGATGACTTTGGCTTCTCAACCAAGTTGTTAATCGCTTCAAGAATCCCATAAACTTTGA
ACCTTGGATGTCCATGGAGCATTATTATAAATATACAAAAATTTGGTACATATACTGTTT
AAGAAATGAGAATCAGTGTGTTATAACAATAGAAACTTCGGCGTAATCTATACAATATCT
TTGGATAAGAAGCTGAAGTTAATTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F732TF U 1
AF RR2F732JQ C 107
BS 1 358 RR2F732TF
BS 359 747 RR2F732JQ

RD RR2F732TF 358 0 0
GGGCGATTCACCACTACTGTCAAACCAGTTTCTCAGATCTCTTCAGATTCATCTTAGTCG
TACCTCTAAGATGGGTCTGAAGAATCTTTGATTACATCAAATACTGTTTTTTTCTCCTGT
CAAAACATCATCGAACACAAAAGAAATCTTATCCAAGCGGTTGAAGTATTAGCTACATGA
TGTGTGTAACGCATCTATGAAGAAAGAAAAGTTTGATTTGTGCAAGGTCGGGCAGAAATA
TAATCAAAGCTGGAGTAAAGTGTCTAACATTGCAATCATTGAAGATAGAAAATGGGAATG
TCAAACACTTTCAGAATTACAATAGATTGTATAGGTGTTTAACCTGGATAGAGAACTC

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR2F732JQ 641 0 0
TTTTTTTCTCCTGTCAAAACATCATCGAACACAAAAGAAATCTTATCCAAGCGGTTGAAG
TATTAGCTACATGATGTGTGTAACGCATCTATGAAGAAAGAAAAGTTTGATTTGTGCAAG
GTCGGGCAGAAATATAATCAAAGCTGGAGTAAAGTGTCTAACATTGCAATCATTGAAGAT
AGAAAATGGGAATGTCAAACACTTTCAGAATTACAATAGATTGTATAGGTGTTTAACCTG
GATAGAGAACTCAGAGCCTATTCAATAAGATTTACTTTTTGAAGAATATAGAATCTTAAA
TTCAAAGGTCATACATATTAGAAAAAGGGACTTCTAATTGTATAGATTGCGGTAGCTATT
ATTTTCCGGAAGGTGGGGATTACTTTCACTTGAATACACTAACTAGTTTTGAATGGTTTC
ACGCCAGAAAGGCGTGGATGACTTTGGCTTCTCAACCAAGTTGTTAATCGCTTCAAGAAT
CCCATAAACTTTGAACCTTGGATGTCCATGGAGCATTATTATAAATATACAAAAATTTGG
TACATATACTGTTTAAGAAATGAGAATCAGTGTGTTATAACAATAGAAACTTCGGCGTAA
TCTATACAATATCTTTGGATAAGAAGCTGAAGTTAATTTAA

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL6210Contig1 909 2 4 U
GGAGATCAAACTCTCTCTCTCGACGACGGCGATGAAAGTAGCGGAGAAGATTGTTCTCCT
CTGGAAGGACTCCGATGGATTCGCGGCGACAATCGCCGATGCTCTGAACCCTAATCCAAC
CTCCTCTCTTCGTAAACTAGAAGAGCAGATCCAGCTTCCGTTGGTTAATTACGGCGTCGA
AGACGGCGGAAACGGCGGGAGCGTCGTTCACTTCGTCGATGAAGCCGGAGCTTACCAGGT
CTCTGTTTTTCTGCTGCGAAGCTATGAACCTCCTGCGCTAGTGTGTGCAATGAACGAACT
GCTTGATATGATTACAAGGGAAGCGGCATCGACTCTGCTGCCGACTATTGTTGCTCCTTT
CTTTGTGCCGGCGTCTAAGCTTAAGTTCAATAACAAGTCCCTTGAAGCAAGCAGCAGAGA
AGTAGCTAGTCTTCGTTACTTTCACGTTGGTCCAGAAACAGAGGCGGCCAGGCTGTTTGC
TACTCGCGTGGAGAAACCGCCACCGTTGATGCAGATTCATCATGAGCCTTTGTCGTGCTT
GCTTCATCTAGCTCGTGTCAAATGCTTGCCTACATCTATTCTCATAGGGCAAAGGAGTGG
TAGCGTATCTCATAAAGCACTAAACGAAGAGCTTCAGGTGATCCGTGAAACACGGGAGCT
TGCGGCTAGTTGGACCGGATTGACTTTTGAAAGAGACGGAATCAAGTGGAACGCATCAAA
GACATCCAAAGAAGAAGAAAGTCCATGGCGAGCTCTTTACGGTTAAATCTTCTCAAGGTC
AGGTTTTTTTTTTTTCATGGCCCAACACTGTTGCTACAGTATGGGCTTGGATCTTTGCAC
GTTATTTCCCATGTTGTAGCTCTTTGTTAAATACTCTTTTGCTCAGCTGAATCAAAAACC
CTTGTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU47TF U 1
AF RR2FU47JQ C 157
BS 1 637 RR2FU47TF
BS 638 638 RR2FU47JQ
BS 639 744 RR2FU47TF
BS 745 909 RR2FU47JQ

RD RR2FU47TF 744 0 0
GGAGATCAAACTCTCTCTCTCGACGACGGCGATGAAAGTAGCGGAGAAGATTGTTCTCCT
CTGGAAGGACTCCGATGGATTCGCGGCGACAATCGCCGATGCTCTGAACCCTAATCCAAC
CTCCTCTCTTCGTAAACTAGAAGAGCAGATCCAGCTTCCGTTGGTTAATTACGGCGTCGA
AGACGGCGGAAACGGCGGGAGCGTCGTTCACTTCGTCGATGAAGCCGGAGCTTACCAGGT
CTCTGTTTTTCTGCTGCGAAGCTATGAACCTCCTGCGCTAGTGTGTGCAATGAACGAACT
GCTTGATATGATTACAAGGGAAGCGGCATCGACTCTGCTGCCGACTATTGTTGCTCCTTT
CTTTGTGCCGGCGTCTAAGCTTAAGTTCAATAACAAGTCCCTTGAAGCAAGCAGCAGAGA
AGTAGCTAGTCTTCGTTACTTTCACGTTGGTCCAGAAACAGAGGCGGCCAGGCTGTTTGC
TACTCGCGTGGAGAAACCGCCACCGTTGATGCAGATTCATCATGAGCCTTTGTCGTGCTT
GCTTCATCTAGCTCGTGTCAAATGCTTGCCTACATCTATTCTCATAGGGCAAAGGAGTGG
TAGCGTATCTCATAAAGCACTAAACGAAGAGCTTCAG*TGATCCGTGAAACACGGGAGCT
TGCGGCTAGTTGGACCGGATTGACTTTTGAAAGAGACGGAATCAAGTGGAACGCATCAAA
GACATCCAAAGAAGAAGAAAGTCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2FU47JQ 753 0 0
TCCGTTGGTTAATTACGGCGTCGAAGACGGCGGAAACGGCGGGAGCGTCGTTCACTTCGT
CGATGAAGCCGGAGCTTACCAGGTCTCTGTTTTTCTGCTGCGAAGCTATGAACCTCCTGC
GCTAGTGTGTGCAATGAACGAACTGCTTGATATGATTACAAGGGAAGCGGCATCGACTCT
GCTGCCGACTATTGTTGCTCCTTTCTTTGTGCCGGCGTCTAAGCTTAAGTTCAATAACAA
GTCCCTTGAAGCAAGCAGCAGAGAAGTAGCTAGTCTTCGTTACTTTCACGTTGGTCCAGA
AACAGAGGCGGCCAGGCTGTTTGCTACTCGCGTGGAGAAACCGCCACCGTTGATGCAGAT
TCATCATGAGCCTTTGTCGTGCTTGCTTCATCTAGCTCGTGTCAAATGCTTGCCTACATC
TATTCTCATAGGGCAAAGGAGTGGTAGCGTATCTCATAAAGCACTAAACGAAGAGCTTCA
GGTGATCCGTGAAACAGGGGAGCTTGCGGCTAGTTGGACCGGATTGACTTTTGAAAGAGA
CGGAATCAAGTGGAACGCATCAAAGACATCCAAAGAAGAAGAAAGTCCATGGCGAGCTCT
TTACGGTTAAATCTTCTCAAGGTCAGGTTTTTTTTTTTTCATGGCCCAACACTGTTGCTA
CAGTATGGGCTTGGATCTTTGCACGTTATTTCCCATGTTGTAGCTCTTTGTTAAATACTC
TTTTGCTCAGCTGAATCAAAAACCCTTGTCACC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL6211Contig1 996 2 2 U
GGGAACCACAAAAGAAAAGGTAAAATAACAAAGCGAAGAAAAAATGCCTTCTTCTTCATC
AAGAAACGCCTTTGTGGATGGTAAACACAAGACAGATCTCATAACGGTGGACTTATCTCG
GTGCTGCAAAACGACACCATCTTCTTCTATGACTCCGCCGCCTCCTCCCAAGGGACTGTT
GGTGGCAACGCCGGTGGAGGAAGGAGAATATCCGGTGGTGATGCTCCTCCATGGTTACCT
TCTCTACAACTCATTTTACTCCCAGCTTATGTTGCATGTCTCTTCCCATGGCTTCATAGT
CATAGCTCCGCAGTTATATAGCATTGCTGGACCAGATACGATGGACGAGATAAAATCAAC
GGCGGAGATTATTGATTGGTTATCAGACGGACTTGATCACTTTCTTCCACCACAAGTAAC
TCCAGACCTATCCAAATTTGCACTCTCCGGCCATAGCCGCGGCGGTAAAACAGCATTTTC
CGTGGCCCTAAAGAAATTTGGATACTCATCCGACCTAAAGATCTCGGCACTTATCGGTAT
AGACCCAGTTGATGGAACAGGGAAAGGGAAACAAACCCCTCCTCCGGTTTTGACCTATGA
GCCAAACTCATTTGACCTAGACAAGATGCATGTTTTAGTGATCGGTTCAGGACTTGGTGA
ACTTGCCCGGAACCCGTTGTTTCCACCGTGTGCGCCTCCGGGAGTGAACCACCGAGAGTT
TTTCCGGGAATGTCAAGGCCCAGCGTGGCATTTTGTCGCAAAGGATTACGGGCATTTGGA
CATGCTTGATGATGATACCAAAGGGCTTAGAGGGAAGAGTTCTTACTGTTTGTGTAAGAA
TGGTGAAGAGAGAAGACCAATGAGGATATTTGTTGGTGGAATTGTTGTGTCGTTTTTGAT
GGCTTATCTGGAAGGAGATGAACGTGAATTGGCGAAAATCAAAGATGGGGGTCATGAAGG
TCTTCCTGTCGAAATTCAAGAGTTTGAAGTTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ41TF U 1
AF RR2CZ41JQ C 385
BS 1 640 RR2CZ41TF
BS 641 996 RR2CZ41JQ

RD RR2CZ41TF 640 0 0
GGGAACCACAAAAGAAAAGGTAAAATAACAAAGCGAAGAAAAAATGCCTTCTTCTTCATC
AAGAAACGCCTTTGTGGATGGTAAACACAAGACAGATCTCATAACGGTGGACTTATCTCG
GTGCTGCAAAACGACACCATCTTCTTCTATGACTCCGCCGCCTCCTCCCAAGGGACTGTT
GGTGGCAACGCCGGTGGAGGAAGGAGAATATCCGGTGGTGATGCTCCTCCATGGTTACCT
TCTCTACAACTCATTTTACTCCCAGCTTATGTTGCATGTCTCTTCCCATGGCTTCATAGT
CATAGCTCCGCAGTTATATAGCATTGCTGGACCAGATACGATGGACGAGATAAAATCAAC
GGCGGAGATTATTGATTGGTTATCAGACGGACTTGATCACTTTCTTCCACCACAAGTAAC
TCCAGACCTATCCAAATTTGCACTCTCCGGCCATAGCCGCGGCGGTAAAACAGCATTTTC
CGTGGCCCTAAAGAAATTTGGATACTCATCCGACCTAAAGATCTCGGCACTTATCGGTAT
AGACCCAGTTGATGGAACAGGGAAAGGGAAACAAACCCCTCCTCCGGTTTTGACCTATGA
GCCAAACTCATTTGACCTAGACAAGATGCATGTTTTAGTG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2CZ41JQ 612 0 0
AGACGGACTTGATCACTTTCTTCCACCACAAGTAACTCCAGACCTATCCAAATTTGCACT
CTCCGGCCATAGCCGCGGCGGTAAAACAGCATTTTCCGTGGCCCTAAAGAAATTTGGATA
CTCATCCGACCTAAAGATTTCGGCACTTATCGGTATAGACCCAGTTGATGGAACAGGGAA
AGGGAAACAAACCCCTCCTCCGGTTTTGACCTATGAGCCAAACTCATTTGACCTAGACAA
GATGCATGTTTTAGTGATCGGTTCAGGACTTGGTGAACTTGCCCGGAACCCGTTGTTTCC
ACCGTGTGCGCCTCCGGGAGTGAACCACCGAGAGTTTTTCCGGGAATGTCAAGGCCCAGC
GTGGCATTTTGTCGCAAAGGATTACGGGCATTTGGACATGCTTGATGATGATACCAAAGG
GCTTAGAGGGAAGAGTTCTTACTGTTTGTGTAAGAATGGTGAAGAGAGAAGACCAATGAG
GATATTTGTTGGTGGAATTGTTGTGTCGTTTTTGATGGCTTATCTGGAAGGAGATGAACG
TGAATTGGCGAAAATCAAAGATGGGGGTCATGAAGGTCTTCCTGTCGAAATTCAAGAGTT
TGAAGTTAAAAA

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL6212Contig1 757 2 3 U
GGGCGAAGAACAGAGTCCGCGCGGTTGTGAAGTAGAAGAAGATGAAGCTAACGTGGAACA
AGAACCCAAAGAAACGATCTCGTGTAGCTTTACCGAACATCCTGGATGTTCCTTCCGAGG
AGGAAGCTCCAGAGACCAAATCTCAGCGCCAAGATGATGATTCAGAGTTCGGAGGGACTC
ACTCGGAAAATGATGACAGGAGACTCGATCTCGAAGATAATAAGCTCGCAGATTCGTTTA
GATCACAAGGAGACAAGCTCGCTGAGGAAGGAAGATACGAGGAGGCTCTAGGGAAATGGG
AAGCTGCTCTTAACGTCGTGCCTGAAAACGCTGTCATTCATGAACAAAAAGCACAAGTCT
TTCTTGAGCTTGGTGATTCATGGAAAGCACTCAAGTCTGCTTCACGAGCTACTGAGATAG
ATCCATCATGGGCTGAGGCGTGGACTACTCTTGGAAGAGCACAACTCAATTTTGGAGAGC
CAGACAGTGCTATCAGGAGTTTTGAAACCCCCTTATCTATCAATGCGGAATCAAGAGAGG
CGAAAGAGGATTTACAAGCTGCAAAACAACTAATAAAGAAGAGAGAACAGCTTCAGACAT
CAGGACAGGACACTGATGCCAAACGTTTTGTGGTGGGCGACAAGAAAATAGAGCCAAGCT
AAATGAAACATAGACTTGTACTTTAGGTAAAGAGTAGAACTTTGTAGCCGTACAGTGTAA
TAAGAGAAACAAGATCGAAGAATAATCTTCTTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BC42TF U 1
AF RR2BC42JQ C 214
BS 1 509 RR2BC42TF
BS 510 510 RR2BC42JQ
BS 511 757 RR2BC42TF

RD RR2BC42TF 757 0 0
GGGCGAAGAACAGAGTCCGCGCGGTTGTGAAGTAGAAGAAGATGAAGCTAACGTGGAACA
AGAACCCAAAGAAACGATCTCGTGTAGCTTTACCGAACATCCTGGATGTTCCTTCCGAGG
AGGAAGCTCCAGAGACCAAATCTCAGCGCCAAGATGATGATTCAGAGTTCGGAGGGACTC
ACTCGGAAAATGATGACAGGAGACTCGATCTCGAAGATAATAAGCTCGCAGATTCGTTTA
GATCACAAGGAGACAAGCTCGCTGAGGAAGGAAGATACGAGGAGGCTCTAGGGAAATGGG
AAGCTGCTCTTAACGTCGTGCCTGAAAACGCTGTCATTCATGAACAAAAAGCACAAGTCT
TTCTTGAGCTTGGTGATTCATGGAAAGCACTCAAGTCTGCTTCACGAGCTACTGAGATAG
ATCCATCATGGGCTGAGGCGTGGACTACTCTTGGAAGAGCACAACTCAATTTTGGAGAGC
CAGACAGTGCTATCAGGAGTTTTGAAACCGCCTTATCTATCAATGCGGAATCAAGAGAGG
CGAAAGAGGATTTACAAGCTGCAAAACAACTAATAAAGAAGAGAGAACAGCTTCAGACAT
CAGGACAGGACACTGATGCCAAACGTTTTGTGGTGGGCGACAAGAAAATAGAGCCAAGCT
AAATGAAACATAGACTTGTACTTTAGGTAAAGAGTAGAACTTTGTAGCCGTACAGTGTAA
TAAGAGAAACAAGATCGAAGAATAATCTTCTTTCATC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2BC42JQ 544 0 0
AAGATAATAAGCTCGCAGATTCGTTTAGATCACAAGGAGACAAGCTCGCTGAGGAAGGAA
GATACGAGGAGGCTTTAGGGAAATGGGAAGCTGCTTTTAACGTCGTGCCTGAAAACGCTG
TCATTCATGAACAAAAAGCACAAGTCTTTCTTGAGCTTGGTGATTCATGGAAAGCACTCA
AGTTTGCTTCACGAGCTACTGAGATAGATCCATCATGGGGTGAGGCGTGGACTACTCTTG
GAAGAGCACAACTCAATTTTGGAGAGCCAGACAGTGCTATCAGGAGTTTTGAAACCCCCT
TATCTATCAATGCGGAATCAAGAGAGGCGAAAGAGGATTTACAAGCTGCAAAACAACTAA
TAAAGAAGAGAGAACAGCTTCAGACATCAGGACAGGACACTGATGCCAAACGTTTTGTGG
TGGGGGACAAGAAAATAGAGCCAAGCTAAATGAAACATAGACTTGTACTTTAGGTAAAGA
GTAGAACTTTGTAGCCGTACAGTGTAATAAGAGAAACAAGATCGAAGAATAATCTTCTTT
CATC

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 2

CO CL6213Contig1 926 2 4 U
GGTAGAAAAAAGTCTCCATGAACATACTCAACAGGTTCGGTTTAGGATCAGGCGAGCAAA
GAAGCATGGATCCTTCTCCGATCGCCCAGGGAAACGACGATGACTCTCCGGCGCCGGGAA
ATCACTTTGCGCAATTCGCCGCGGGATGTTTCTGGGGCGTGGAGCTGGCGTTTCAGAGGC
TTTCAGGGGTGACTCATACAGAGGTTGGATACACACAAGGGATCACCCACAATCCTTCGT
ACGAGGATGTCTGCTCTGAAACCACGGGACATGCCGAGGTCGTTAGGGTTCAGTATGATC
CCAAAGACCGCACCTTTGAGTCTCTCCTTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCA
CCTTGAATCGCCAGGGAAATGATGTGGGAACCCGATACCGATCAGGGATATACTACTACA
CACCCGAGCAGGAGAAACTAGCCCGCGAGACACTTGAGCGTCACCAGGAAAAAATGGAGA
GGAAGATCATGACTGAGATCTTGCCTGCTAAGAAATTCTACAGAGCCGAGGAGCAACAGC
AGCAGTATCTGTCCAAGGGTGGAAGGTTCGGCCTCGGGCAGTCCTGTGCCAAAGGCCGCA
CCGACCCAATCCGCTGCTACGGCTAAAAGCCTGAGCTCCTCTGTTTCTCTCCCAAAACAG
AGTTCTGTTTCTCTCCCAAAACAGAGTGTGCTAGTGACTTTTGTGTAAAAGCTATGTAAC
GCATGTTTATCGTTTGTACGATTATTTGTTGGTGGTGTTTCTCAAACTATTTGAATGAAT
AAGAGAATCTTCAATCTTGTGGACAAAAGAAATAGTCCAATGGATATAGCCAAATGGGCT
AATGGTAGGACACTTGGTTTCTTATTGTCCATTTCTGCATGCTTGTATACATCTTGTAAG
ACCATTTGTAATGTTTTTAACTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AJ26TF U 1
AF RR2AJ26JQ C 120
BS 1 765 RR2AJ26TF
BS 766 766 RR2AJ26JQ
BS 767 798 RR2AJ26TF
BS 799 926 RR2AJ26JQ

RD RR2AJ26TF 798 0 0
GGTAGAAAAAAGTCTCCATGAACATACTCAACAGGTTCGGTTTAGGATCAGGCGAGCAAA
GAAGCATGGATCCTTCTCCGATCGCCCAGGGAAACGACGATGACTCTCCGGCGCCGGGAA
ATCACTTTGCGCAATTCGCCGCGGGATGTTTCTGGGGCGTGGAGCTGGCGTTTCAGAGGC
TTTCAGGGGTGACTCATACAGAGGTTGGATACACACAAGGGATCACCCACAATCCTTCGT
ACGAGGATGTCTGCTCTGAAACCACGGGACATGCCGAGGTCGTTAGGGTTCAGTATGATC
CCAAAGACCGCACCTTTGAGTCTCTCCTTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCA
CCTTGAATCGCCAGGGAAATGATGTGGGAACCCGATACCGATCAGGGATATACTACTACA
CACCCGAGCAGGAGAAACTAGCCCGCGAGACACTTGAGCGTCACCAGGAAAAAATGGAGA
GGAAGATCATGACTGAGATCTTGCCTGCTAAGAAATTCTACAGAGCCGAGGAGCAACAGC
AGCAGTATCTGTCCAAGGGTGGAAGGTTCGGCCTCGGGCAGTCCTGTGCCAAAGGCCGCA
CCGACCCAATCCGCTGCTACGGCTAAAAGCCTGAGCTCCTCTGTTTCTCTCCCAAAACAG
AGTTCTGTTTCTCTCCCAAAACAGAGTGTGCTAGTGACTTTTGTGTAAAAGCTATGTAAC
GCATGTTTATCGTTTGTACGATTATTTGTTGGTGGTGTTTCTCAA*CTATTTGAATGAAT
AAGAGAATCTTCAATCTT

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2AJ26JQ 807 0 0
AATCACTTTGCGCAATTCGCCGCGGGATGTTTCTGGGGCGTGGAGCTGGCGTTTCAGAGG
CTTTCAGGGGTGACTCATACAGAGGTTGGATACACACAAGGGATCACCCACAATCCTTCG
TACGAGGATGTCTGCTCTGAAACCACGGGACATGCCGAGGTCGTTAGGGTTCAGTATGAT
CCCAAAGACCGCACCTTTGAGTCTCTCCTTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACC
ACCTTGAATCGCCAGGGAAATGATGTGGGAACCCGATACCGATCAGGGATATACTACTAC
ACACCCGAGCAGGAGAAACTAGCCCGCGAGACACTTGAGCGTCACCAGGAAAAAATGGAG
AGGAAGATCATGACTGAGATCTTGCCTGCTAAGAAATTCTACAGAGCCGAGGAGCAACAG
CAGCAGTATCTGTCCAAGGGTGGAAGGTTCGGCCTCGGGCAGTCCTGTGCCAAAGGCCGC
ACCGACCCAATCCGCTGCTACGGCTAAAAGCCTGAGCTCCTCTGTTTCTCTCCCAAAACA
GAGTTCTGTTTCTCTCCCAAAACAGAGTGTGCTAGTGACTTTTGTGTAAAAGCTATGTAA
CGCATGTTTATCGTTTGTACGATTATTTGTTGGTGGTGTTTCTCAAACTATTTGAATGAA
TAAGAGAATCTTCAATCTTGTGGACAAAAGAAATAGTCCAATGGATATAGCCAAATGGGC
TAATGGTAGGACACTTGGTTTCTTATTGTCCATTTCTGCATGCTTGTATACATCTTGTAA
GACCATTTGTAATGTTTTTAACTATTT

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

CO CL6214Contig1 730 2 2 U
GGAAAAAGAGATATTATTAAATTTTAAAAGACTTGTTAGTAGAAATAAAAAAAAACGATC
AGATGGAGACGGAGAAGAAAAATAGCAAGGAGCTAGGTCTGAAACACCTAGGGTTCGTGA
GAGTTGCGGCGATCCATGTTTTCGTTAGCCTCTCGAGCCTCTACGACTACGCGAAACAAA
ACCCCGGTCCTCTTAAATCGGCGGTGGGGAAGGTGGAAGGAGCCGTCACCACCTTCGTCA
ACCCTGTCTGCAACAAACTCAAGGATGTTCCAGATACTCTCCTCCTCTTTCTAGATCACA
AGTTCGGTGAAGTTTCGGACAAGTTTGATAAGCATGCTCCAACGATGGCTAAGAAAGTAG
CAAATCAAGCTAATGTGTTGATCCATAAGGCTCAGTCCTTTGTGAAAGAGGCTCGTACCG
GTGGTCCCAGAGCTGCTTTTAACTATGCTGCATCCGAGTACAAGTGTTTCCTTGTGAACA
CCTCTGTTAAAGTCTGGGCTAAACTCAACCGGTATAAACCGATTCATGCTGTGGGGAACA
AAGCTTTGCCCGTGGCTGCACACTTGTCTGGTATTTACAACGATTTGGTGACGGACATGA
CTCAGATGGGTTACCCTGTGGTTGGTTATCTCCCTTTTAGTTCCTGTTGATGACATTGTC
AAGGCTTATGCAAAGGAGGAAGGTGCAGCGCAGAGGAAAGGAGATGCTGCTGCTGATGGA
AACAAATCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A543TF U 1
AF RR2A543JQ C 240
BS 1 666 RR2A543TF
BS 667 730 RR2A543JQ

RD RR2A543TF 666 0 0
GGAAAAAGAGATATTATTAAATTTTAAAAGACTTGTTAGTAGAAATAAAAAAAAACGATC
AGATGGAGACGGAGAAGAAAAATAGCAAGGAGCTAGGTCTGAAACACCTAGGGTTCGTGA
GAGTTGCGGCGATCCATGTTTTCGTTAGCCTCTCGAGCCTCTACGACTACGCGAAACAAA
ACCCCGGTCCTCTTAAATCGGCGGTGGGGAAGGTGGAAGGAGCCGTCACCACCTTCGTCA
ACCCTGTCTGCAACAAACTCAAGGATGTTCCAGATACTCTCCTCCTCTTTCTAGATCACA
AGTTCGGTGAAGTTTCGGACAAGTTTGATAAGCATGCTCCAACGATGGCTAAGAAAGTAG
CAAATCAAGCTAATGTGTTGATCCATAAGGCTCAGTCCTTTGTGAAAGAGGCTCGTACCG
GTGGTCCCAGAGCTGCTTTTAACTATGCTGCATCCGAGTACAAGTGTTTCCTTGTGAACA
CCTCTGTTAAAGTCTGGGCTAAACTCAACCGGTATAAACCGATTCATGCTGTGGGGAACA
AAGCTTTGCCCGTGGCTGCACACTTGTCTGGTATTTACAACGATTTGGTGACGGACATGA
CTCAGATGGGTTACCCTGTGGTTGGTTATCTCCCTTTTAGTTCCTGTTGATGACATTGTC
AAGGCT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2A543JQ 491 0 0
AACCCTGTCTGCAACAAACTCAAGGATGTTCCAGATACTCTCCTCCTCTTTCTAGATCAC
AAGTTCGGTGAAGTTTCGGACAAGTTTGATAAGCATGCTCCAACGATGGCTAAGAAAGTA
GCAAATCAAGCTAATGTGTTGATCCATAAGGCTCAGTCCTTTGTGAAAGAGGCTCGTACC
GGTGGTCCCAGAGCTGCTTTTAACTATGCTGCATCCGAGTACAAGTGTTTCCTTGTGAAC
ACCTCTGTTAAAGTCTGGGCTAAACTCAACCGGTATAAACCGATTCATGCTGTGGGGAAC
AAAGCTTTGCCCGTGGCTGCACACTTGTCTGGTATTTACAACGATTTGGTGACGGACATG
ACTCAGATGGGTTACCCTGTGGTTGGTTATCTCCCTTT*AGTTCCTGTTGATGACATTGT
CAAGGCTTATGCAAAGGAGGAAGGTGCAGCGCAGAGGAAAGGAGATGCTGCTGCTGATGG
AAACAAATCGT

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 2

CO CL6215Contig1 585 2 1 U
GGAGACCACCTTCATAAACGTAGACATTACGTATAAGCAAAAAAAAAAAAGAGAAAAAAA
AATACACAAGACTCTTTATTCGATTCTTAAAACAATTCTCAACATGCCGGAGACTTCTCA
CCGTTTGAAACCTCTCGTGTTCGCTATCTTCATCGCGATCGCGTTTCCGATGATGATCAA
CGCATTGAATCCTCCTCCACCACGGCCTCCTTCTCCCCCGAAGAAGTCTTACTGTCCGCC
TCCTGCGTCGACTTGCATATACATGACGGGTCCACCAGGAGAGTTGTATCCCGTTGACCA
ACAGTTTGGAGAGGCTGCTGCAAAGAGCTTAGGGGTCGTGAAGATCTCTGGCCTGATCGC
GTTTGGAGTTATGGGGTTCTTGATGATCATGATTTGATGGATTTTCCATTGTTTGATCGT
CTCATAGATTCGTTTTGCTTGAACGGATCGGTATAATGATGTTCCTGATAACTCATAGTT
ATTTCCGGTGAAATTAACGATTTGGATTATGTTTTTATCTCAAGTTAGGACCGATTTATC
ATTTTTCGTTGTGTCAACAGTTCTAATGAATATGCTTATTCAATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AC59JQ C 1
AF RR2AC59TF U 1
BS 1 585 RR2AC59TF

RD RR2AC59JQ 585 0 0
GGAGACCACCTTCATAAACGTAGACATTACGTATAAGCAAAAAAAAAAAAGAGAAAAAAA
AATACCCAAGACTCTTTATTCGATTCTTAAAACAATTCTCAACATGCCGGAGACTTCTCA
CCGTTTGAAACCTCTCGTGTTCGCTATCTTCATCGCGATCGCGTTTCCGATGATGATCAA
CGCATTGAATCCTCCTCCACCACGGCCTCCTTCTCCCCCGAAGAAGTCTTACTGTCCGCC
TCCTGCGTCGACTTGCATATACATGACGGGTCCACCAGGAGAGTTGTATCCCGTTGACCA
ACAGTTTGGAGAGGCTGCTGCAAAGAGCTTAGGGGTCGTGAAGATCTCTGGCCTGATCGC
GTTTGGAGTTATGGGGTTCTTGATGATCATGATTTGATGGATTTTCCATTGTTTGATCGT
CTCATAGATTCGTTTTGCTTGAACGGATCGGTATAATGATGTTCCTGATAACTCATAGTT
ATTTCCGGTGAAATTAACGATTTGGATTATGTTTTTATCTCAAGTTAGGACCGATTTATC
ATTTTTCGTTGTGTCAACAGTTCTAATGAATATGCTTATTCAATC

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2AC59TF 585 0 0
GGAGACCACCTTCATAAACGTAGACATTACGTATAAGCAAAAAAAAAAAAGAGAAAAAAA
AATACACAAGACTCTTTATTCGATTCTTAAAACAATTCTCAACATGCCGGAGACTTCTCA
CCGTTTGAAACCTCTCGTGTTCGCTATCTTCATCGCGATCGCGTTTCCGATGATGATCAA
CGCATTGAATCCTCCTCCACCACGGCCTCCTTCTCCCCCGAAGAAGTCTTACTGTCCGCC
TCCTGCGTCGACTTGCATATACATGACGGGTCCACCAGGAGAGTTGTATCCCGTTGACCA
ACAGTTTGGAGAGGCTGCTGCAAAGAGCTTAGGGGTCGTGAAGATCTCTGGCCTGATCGC
GTTTGGAGTTATGGGGTTCTTGATGATCATGATTTGATGGATTTTCCATTGTTTGATCGT
CTCATAGATTCGTTTTGCTTGAACGGATCGGTATAATGATGTTCCTGATAACTCATAGTT
ATTTCCGGTGAAATTAACGATTTGGATTATGTTTTTATCTCAAGTTAGGACCGATTTATC
ATTTTTCGTTGTGTCAACAGTTCTAATGAATATGCTTATTCAATC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL6216Contig1 581 2 1 U
GGGTCTCCTCCTCTCTCGTTCAAGAGCTAAAAGACGCCGCTCGACTTCAAGGAAAAGGTT
AAGAAAATGAGTCGTGGAGGTGCAGCTGTTGCAAAGGGGAAGAAGAAGGGAGTGTCCCTC
TCCATTGACTGCTCGAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAG
TTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCTGGTGCGCTCGGTGACTCTGTCACA
ATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACCTCTGATGGTCAAATTCCAAGAGGTACC
TCAAGTACTTGACAAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGAGGGATTGGCTTAGAGTGA
TTGCGGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATTGCTGAGAACG
AGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTACTATACTCGTACCTTCTTGTTTCTGGTTGTTT
TGTTTTCTGCTGCTCAGTACAATTTATCTCCGTTCTTTTTTTTGTGACAGATCTTATCTA
GTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTTTTTGAGAGTTTGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FT46JQ C 1
AF RR2FT46TF U 1
BS 1 581 RR2FT46TF

RD RR2FT46JQ 581 0 0
GGGTCTCCTCCTCTCTCGTTCAAGAGCTAAAAGACGCCGCTCGACTTCAAGGAAAAGGTT
AAGAAAATGAGTCGTGGAGGTGCAGCTGTTGCAAAGGGGAAGAAGAAGGGAGTGTCCCTC
TCCATTGACTGCTCGAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAG
TTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCTGGTGCGCTCGGTGACTCTGTCACA
ATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACCTCTGATGGTCAAATTCCAAGAGGTACC
TCAAGTACTTGACAAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGAGGGATTGGCTTAGAGTGA
TTGCGGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATTGCTGAGAACG
AGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTACTATACTCGTACCTTCTTGTTTCTGGTTGTTT
TGTTTTCTGCTGCTCAGTACAATTTATCTCCGTTCTTTTTTTTGTGACAGATCTTATCTA
GTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTTTTTGAGAGTTTGAT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2FT46TF 581 0 0
GGGTCTCCTCCTCTCTCGTTCAAGAGCTAAAAGACGCCGCTCGACTTCAAGGAAAAGGTT
AAGAAAATGAGTCGTGGAGGTGCAGCTGTTGCAAAGGGGAAGAAGAAGGGAGTGTCCCTC
TCCATTGACTGCTCGAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAG
TTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCTGGTGCGCTCGGTGACTCTGTCACA
ATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACCTCTGATGGTCAAATTCCAAGAGGTACC
TCAAGTACTTGACAAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGAGGGATTGGCTTAGAGTGA
TTGCGGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATTGCTGAGAACG
AGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTACTATACTCGTACCTTCTTGTTTCTGGTTGTTT
TGTTTTCTGCTGCTCAGTACAATTTATCTCCGTTCTTTTTTTTGTGACAGATCTTATCTA
GTTTTGGTTGAAGTTATAACTCTTGTTTTTGAGAGTTTGAT

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL6217Contig1 696 2 1 U
GGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCGCCGTCCTTCCTTCTTTCAACACTTTCCTTAGCTGCG
TATGTGGATCCTGCTGAGGCAAAACATCACATGGAAGGCTGTCTTCTTCTCGGTCGTGAG
CTATTTGCAGAAGAAAACGGGAAGAGGACAACTGAAATGATAAAGAGGGATCGAGGTGGA
AAAGGTGAGTTGGAGATTATTCCTCTCTTCAACCCTGACAAGTGACAGAAGACGTTCTCC
TCCCCCTAAAAGACATCAATCAAGATCTGTCTCACCTCAGGAAAGACAACACTAGAAGGA
GAGCTCATACTCTCGTTCACCACCAAAAAGGGTTCGCAGTGGAAGTCATGAGAGAGTGAA
GAGCCACAGCAGGAGCCGGGAGCTACACGCCTGAACAAGCCAAGAGCCCGGTCCTTTAGG
CAGAGCACGAGTAGAAGTCCAATCCCCTCGTGGAGAAAGAAATGGAGACCAGTTCTCCAA
GCCAGTGATTTATTACACAAACCCCATGTGTCTCTCTACACACTAGTTCTGCAGTCTTGT
TTCTTAGCTAGCTCTACGTTATCAGATAGATATTCGTTTGCCACTAGGTTGAATTCTCTT
AACTTTTAAGTCTTTTTTTGTTTTGATAAGTTTTCTAAGACAGATCCTCTTGTGTTATTG
TTTAATGTTTGATTCATGAATCAGCTTAAAGACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DK87TF U 1
AF RR2DK87JQ C 56
BS 1 696 RR2DK87TF

RD RR2DK87TF 696 0 0
GGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCGCCGTCCTTCCTTCTTTCAACACTTTCCTTAGCTGCG
TATGTGGATCCTGCTGAGGCAAAACATCACATGGAAGGCTGTCTTCTTCTCGGTCGTGAG
CTATTTGCAGAAGAAAACGGGAAGAGGACAACTGAAATGATAAAGAGGGATCGAGGTGGA
AAAGGTGAGTTGGAGATTATTCCTCTCTTCAACCCTGACAAGTGACAGAAGACGTTCTCC
TCCCCCTAAAAGACATCAATCAAGATCTGTCTCACCTCAGGAAAGACAACACTAGAAGGA
GAGCTCATACTCTCGTTCACCACCAAAAAGGGTTCGCAGTGGAAGTCATGAGAGAGTGAA
GAGCCACAGCAGGAGCCGGGAGCTACACGCCTGAACAAGCCAAGAGCCCGGTCCTTTAGG
CAGAGCACGAGTAGAAGTCCAATCCCCTCGTGGAGAAAGAAATGGAGACCAGTTCTCCAA
GCCAGTGATTTATTACACAAACCCCATGTGTCTCTCTACACACTAGTTCTGCAGTCTTGT
TTCTTAGCTAGCTCTACGTTATCAGATAGATATTCGTTTGCCACTAGGTTGAATTCTCTT
AACTTTTAAGTCTTTTTTTGTTTTGATAAGTTTTCTAAGACAGATCCTCTTGTGTTATTG
TTTAATGTTTGATTCATGAATCAGCTTAAAGACATG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2DK87JQ 641 0 0
CTGCGTATGTGGATCCTGCTGAGGCAAAACATCACATGGAAGGCTGTCTTCTTCTCGGTC
GTGAGCTATTTGCAGAAGAAAACGGGAAGAGGACAACTGAAATGATAAAGAGGGATCGAG
GTGGAAAAGGTGAGTTGGAGATTATTCCTCTCTTCAACCCTGACAAGTGACAGAAGACGT
TCTCCTCCCCCTAAAAGACATCAATCAAGATCTGTCTCACCTCAGGAAAGACAACACTAG
AAGGAGAGCTCATACTCTCGTTCACCACCAAAAAGGGTTCGCAGTGGAAGTCATGAGAGA
GTGAAGAGCCACAGCAGGAGCCGGGAGCTACACGCCTGAACAAGCCAAGAGCCCGGTCCT
TTAGGCAGAGCACGAGTAGAAGTCCAATCCCCTCGTGGAGAAAGAAATGGAGACCAGTTC
TCCAAGCCAGTGATTTATTACACAAACCCCATGTGTCTCTCTACACACTAGTTCTGCAGT
CTTGTTTCTTAGCTAGCTCTACGTTATCAGATAGATATTCGTTTGCCACTAGGTTGAATT
CTCTTAACTTTTAAGTCTTTTTTTGTTTTGATAAGTTTTCTAAGACAGATCCTCTTGTGT
TATTGTTTAATGTTTGATTCATGAATCAGCTTAAAGACATG

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL6218Contig1 645 2 3 U
GGGTCCACACCTGTTACACATTACATCAACCCTTTGTGTAAGCATACTCTATGGAATAAC
CGTGACCACCAAGCTAATAGATTAGTTGGCGGAATGTGGTCGTCATCTTTGGTTCTGGAG
AGGGGTCGTAAGGAGACGAGGGATTTTGGTGGTGTTAAGGAAGAAGATTCTTGGATAGAT
TTGTATTTACCAGAAAGAGCTAGAGGTTATGCCAAGCTTGCTCGTTTTGATAGACCTATT
GGTACTTGGTTGCTTGCTTGGCCTTGTATGTGGTCAATTGCGTTGGCTGCTGATCCCGGG
AGCTTTCCGAGTTTTAAAATGATGGGTTTGTTTGGTTGCGGAGCTATACTTCTTAGAGGT
GCTGGCTGTACTATTAATGATCTGCTTGATCAGGACATTGATACAAAGGTTGATCGTACA
AGATTAAGACCTATAGCCAGTGGTCTTTTGACACCATTCCAAGGGCTTAAATTTCTTGTG
TTGCAGTTGCTTTTAGGCTTAGGGATTCTTCTCCAACTTAACAATTACAGCCGTGTGTTA
GGGGCTTCCTCTTTGTTCCTTGTCTTCTCCTACCCACTTATGATACTATTTATGCATATC
AGGATAAAGATGATGATGTGAAGGTTGGTGTGAAGTCGACTGCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2G619TF U 1
AF RR2GR53TF U 1
BS 1 602 RR2G619TF
BS 603 603 RR2GR53TF
BS 604 645 RR2G619TF

RD RR2G619TF 645 0 0
GGGTCCACACCTGTTACACATTACATCAACCCTTTGTGTAAGCATACTCTATGGAATAAC
CGTGACCACCAAGCTAATAGATTAGTTGGCGGAATGTGGTCGTCATCTTTGGTTCTGGAG
AGGGGTCGTAAGGAGACGAGGGATTTTGGTGGTGTTAAGGAAGAAGATTCTTGGATAGAT
TTGTATTTACCAGAAAGAGCTAGAGGTTATGCCAAGCTTGCTCGTTTTGATAGACCTATT
GGTACTTGGTTGCTTGCTTGGCCTTGTATGTGGTCAATTGCGTTGGCTGCTGATCCCGGG
AGCTTTCCGAGTTTTAAAATGATGGGTTTGTTTGGTTGCGGAGCTATACTTCTTAGAGGT
GCTGGCTGTACTATTAATGATCTGCTTGATCAGGACATTGATACAAAGGTTGATCGTACA
AGATTAAGACCTATAGCCAGTGGTCTTTTGACACCATTCCAAGGGCTTAAATTTCTTGTG
TTGCAGTTGCTTTTAGGCTTAGGGATTCTTCTCCAACTTAACAATTACAGCCGTGTGTTA
GGGGCTTCCTCTTTGTTCCTTGTCTTCTCCTACCCACTTATGATACTATTTATGCATATC
AG*ATAAAGATGATGATGTGAAGGTTGGTGTGAAGTCGACTGCTC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2GR53TF 645 0 0
GGGTCCACACCTGTTACACATTACATCAACCCTTTGTGTAAGCATACTCTATGGAATAAC
CGTGACCACCAAGCTAATAGATTAGTTGGCGGAATGTGGTCGTCATCTTTGGTTCTGGAG
AGGGGTCGTAAGGAGACGAGGGATTTTGGTGGTGTTAAGGAAGAAGATTCTTGGATAGAT
TTGTATTTACCAGAAAGAGCTAGAGGTTATGCCAAGCTTGCTCGTTTTGATAGACCTATT
GGTACTTGGTTGCTTGCTTGGCCTTGTATGTGGTCAATTGCGTTGGCTGCTGATCCCGGG
AGCTTTCCGAGTTTTAAAATGATGGGTTTGTTTGGTTGCGGAGCTATACTTCTTAGAGGT
GCTGGCTGTACTATTAATGATCTGCTTGATCAGGACATTGATACAAAGGTTGATCGTACA
AGATTAAGACCTATAGCCAGTGGTCTTTTGACACCATTCCAAGGGCTTAAATTTCTTGTG
TTGCAGTTGCTTTTAGGCTTAGGGATTCTTCTCCAACTTAACAATTACAGCCGTGTGTTA
GGGGCTTCCTCTTTGTTCCTTGTCTTCTCCTACCCACTTATGATACTATTTATGCATATC
AGGATAAAGATGATGATGTGAAGGTTGGTGTGAAGTCGACTGCTC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL6219Contig1 508 2 1 U
GGATCAATCTCACAATAACAACAACAAATGTCTAAAACATCAATCCTTTTACCTTTTCTT
CTCCTAATCGTATATATCTCTACATCTCAAGCAAGTCGTGAACTCTGGGATGGTGGGTTA
TTCGGATCCAAAGCCGCGGTTAAAGGGATTCCTGGGTTTCAAGGAAATGTAAATTGGATG
AATCCAACACGTACATGCACAATGAAAGGACCTTGTCAAGGTAAGAAGCTCACGTGTCCC
GCAGCGTGCTACAAATCATCCAACGTTAACAAGGAAGGTTATAGAAGCAGCAGCAAGAGC
GGAGGATGTACATTTGACTGCACTAATAAGTGTATCGCCTCTTGTTAATTTGGACATATA
TATTATATGTTCTTCTTATGCTATACTATCTTATAATCTATGTATATGTATACTAAAACG
GTATTTCTATTGGAGAGTTTGTTTCTCTTTTGTATTGATTAGTAGTGTTATATCATTCTA
TGTACATAATATTTATACTTATGATAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A005JQ C 1
AF RR2A005TF U 1
BS 1 508 RR2A005TF

RD RR2A005JQ 508 0 0
GGATCAATCTCACAATAACAACAACAAATGTCTAAAACATCAATCCTTTTACCTTTTCTT
CTCCTAATCGTATATATCTCTACATCTCAAGCAAGTCGTGAACTCTGGGATGGTGGGTTA
TTCGGATCCAAAGCCGCGGTTAAAGGGATTCCTGGGTTTCAAGGAAATGTAAATTGGATG
AATCCAACACGTACATGCACAATGAAAGGACCTTGTCAAGGTAAGAAGCTCACGTGTCCC
GCAGCGTGCTACAAATCATCCAACGTTAACAAGGAAGGTTATAGAAGCAGCAGCAAGAGC
GGAGGATGTACATTTGACTGCACTAATAAGTGTATCGCCTCTTGTTAATTTGGACATATA
TATTATATGTTCTTCTTATGCTATACTATCTTATAATCTATGTATATGTATACTAAAACG
GTATTTCTATTGGAGAGTTTGTTTCTCTTTTGTATTGATTAGTAGTGTTATATCATTCTA
TGTACATAATATTTATACTTATGATAAA

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2A005TF 508 0 0
GGATCAATCTCACAATAACAACAACAAATGTCTAAAACATCAATCCTTTTACCTTTTCTT
CTCCTAATCGTATATATCTCTACATCTCAAGCAAGTCGTGAACTCTGGGATGGTGGGTTA
TTCGGATCCAAAGCCGCGGTTAAAGGGATTCCTGGGTTTCAAGGAAATGTAAATTGGATG
AATCCAACACGTACATGCACAATGAAAGGACCTTGTCAAGGTAAGAAGCTCACGTGTCCC
GCAGCGTGCTACAAATCATCCAACGTTAACAAGGAAGGTTATAGAAGCAGCAGCAAGAGC
GGAGGATGTACATTTGACTGCACTAATAAGTGTATCGCCTCTTGTTAATTTGGACATATA
TATTATATGTTCTTCTTATGCTATACTATCTTATAATCTATGTATATGTATACTAAAACG
GTATTTCTATTGGAGAGTTTGTTTCTCTTTTGTATTGATTAGTAGTGTTATATCATTCTA
TGTACATAATATTTATACTTATGATAAA

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 2

CO CL6220Contig1 691 2 1 U
GGCTAACTATTAAACCAGAAAATTTCTCAATCTGTAGCTCTTAGTCCTTGTCTCACTGAT
GAACCCATTTCATCTTCCTTACACGACAAATCCGAAATCCCGACAGACCCATTTCATTTC
CCAGGAAAATATCTCATCTTTCGATTCTTTTCAGTAACCAACATCCACAAAACCGGCATT
TCCACTCGCAAATCTATTTTTTTAAAAGTCAGATACTTTATCGGGTTTGAATCTCGAGAA
TTCTAAAGATTGAGAGACCCCACGAGCTCCCTCGGTTCGAAGTGGCTTTAAAGATGGAAG
CAGCAGAAACTTCTTGGACCACTTATCCGTACAACTACATTACTACACATGCCCCGGAAG
CTGAATCATACTCTGAGCAGAGCCAAGATGAGACCAAAGTCCAAACCTTTTCAATGGATT
CTCTTCTCCCAAACGATCTATTAGAAAGAATCCTCACCTTTCTCCCCATCGCAAGCATCT
TCAGAGCTGGCACCGTCTGCAAAAGATGGAACGAGATTGTATCTTCCCAAAGATTCTTAT
CCAACTACTCCAACAACAACAACTCTGTTCCTCAGAGTCCTTGGTACTTCATGTTCACTA
CCACGGACGACCCATCCGGTTATGCTTACGACCCGGTTATCAGAAAATGGTACAGCTTTG
ATCTCCCTTGCATCGAGACTTCGAACTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E457TF U 17
AF RR2B210TF U 1
BS 1 691 RR2B210TF

RD RR2E457TF 595 0 0
G
GAAAATTTCTCAATCTGTAGCTCTTAGTCCTTGTCTCACTGATGAACCCATTTCATCTTT
CTTACACGACAAATCCGAAATCCCGACAGACCCATTTCATTTCCCAGGAAAATATCTCAT
CTTTCGATTCTTTTCAGTAACCAACATCCACAAAACCGGCATTTCCACTCGCAAATCTAT
TTTTTTAAAAGTCAGATACTTTATCGGGTTTGAATCTCGAGAATTCTAAAGATTGAGAGA
CCCCACGAGCTCCCTCGGTTCGAAGTGGCTTTAAAGATGGAAGCAGCAGAAACTTCTTGG
ACCACTTATCCGTACAACTACATTACTACACATGCCCCGGAAGTTGAATCATACTCTGAG
CAGAGCCAAGATGAGACCAAAGTCCAAACCTTTTCAATGGATTCTCTTCTCCCAAACGAT
CTATTAGAAAGAATCCTCACCTTTCTCCCCATCGCAAGCATCTTCAGAGCTGGCACCGTC
TGCAAAAGATGGAACGAGATTGTATCTTCCCAAAGGTTCTTATCCAACTACTCCAACAAC
AACAACTCTGTTCCTCAGAGTCCTTGGTACTTCATGTTCACTACCACGGACGAC

QA 2 595 2 595
DS 

RD RR2B210TF 691 0 0
GGCTAACTATTAAACCAGAAAATTTCTCAATCTGTAGCTCTTAGTCCTTGTCTCACTGAT
GAACCCATTTCATCTTCCTTACACGACAAATCCGAAATCCCGACAGACCCATTTCATTTC
CCAGGAAAATATCTCATCTTTCGATTCTTTTCAGTAACCAACATCCACAAAACCGGCATT
TCCACTCGCAAATCTATTTTTTTAAAAGTCAGATACTTTATCGGGTTTGAATCTCGAGAA
TTCTAAAGATTGAGAGACCCCACGAGCTCCCTCGGTTCGAAGTGGCTTTAAAGATGGAAG
CAGCAGAAACTTCTTGGACCACTTATCCGTACAACTACATTACTACACATGCCCCGGAAG
CTGAATCATACTCTGAGCAGAGCCAAGATGAGACCAAAGTCCAAACCTTTTCAATGGATT
CTCTTCTCCCAAACGATCTATTAGAAAGAATCCTCACCTTTCTCCCCATCGCAAGCATCT
TCAGAGCTGGCACCGTCTGCAAAAGATGGAACGAGATTGTATCTTCCCAAAGATTCTTAT
CCAACTACTCCAACAACAACAACTCTGTTCCTCAGAGTCCTTGGTACTTCATGTTCACTA
CCACGGACGACCCATCCGGTTATGCTTACGACCCGGTTATCAGAAAATGGTACAGCTTTG
ATCTCCCTTGCATCGAGACTTCGAACTGGTT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL6221Contig1 745 2 2 U
GGGCCGCTTTGTCTCTCTGCCTCCTCCTCGATTCATTTCTCGTGTAAGTTTGCAAAGCTC
GTAGCTTTATCTTCCTCAATGGCTACTCGTCTTCAGTTTGAGAACAACTGTGAAGTTGGT
GTCTTTTCGAAACTCACTAACGCCTATTGCTTAGTCGCTATTGGAGGCTCTGAGAACTTT
TACAGTGCTTTTGAGTCGGAGTTAGCTGATGTTATCCCTATCGTTAAAACCTCTATTGGT
GGAACACGAATCATTGGTCGTCTTTGTGCTGGAAACAAGAATGGCCTTCTTGTGCCCCAT
ACAACTACTGACCAAGAGCTTCGGCACTTGAGGAACAGTCTACCTGATTCAGTTGTTGTC
CAGAGAATCGAGGAACGTCTGTCTGCTCTTGGAAATTGCATTGCCTGTAATGACCATGTT
GCTCTTGCTCACACTGATCTTGACAAGGAAACTGAGGAAATAATAGCAGATGTTCTCGGT
GTTGAAGTCTTCCGTCAGACCATTGCAGGCAACATTCTTGTGGGCAGTTACTGTGCTTTG
TCCAACAGAGGTGGAATTGTCCATCCTCACACCTCAGTGGAAGACTTGGACGAACTATCA
ACACTTCTTCAAGTCCCTCTAGTTGCAGGAACCGTGAACCGTGGTAGTGAAGTTATTGGC
GCTGGTATGACGGTTAACGACTGGACTGCTTTCTGCGGGTCAGACACAACCGCAACAGAG
CTCTCTGTTATAGACAGCATCTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A271TF U 1
AF RR2A271JQ C 152
BS 1 733 RR2A271TF
BS 734 745 RR2A271JQ

RD RR2A271TF 733 0 0
GGGCCGCTTTGTCTCTCTGCCTCCTCCTCGATTCATTTCTCGTGTAAGTTTGCAAAGCTC
GTAGCTTTATCTTCCTCAATGGCTACTCGTCTTCAGTTTGAGAACAACTGTGAAGTTGGT
GTCTTTTCGAAACTCACTAACGCCTATTGCTTAGTCGCTATTGGAGGCTCTGAGAACTTT
TACAGTGCTTTTGAGTCGGAGTTAGCTGATGTTATCCCTATCGTTAAAACCTCTATTGGT
GGAACACGAATCATTGGTCGTCTTTGTGCTGGAAACAAGAATGGCCTTCTTGTGCCCCAT
ACAACTACTGACCAAGAGCTTCGGCACTTGAGGAACAGTCTACCTGATTCAGTTGTTGTC
CAGAGAATCGAGGAACGTCTGTCTGCTCTTGGAAATTGCATTGCCTGTAATGACCATGTT
GCTCTTGCTCACACTGATCTTGACAAGGAAACTGAGGAAATAATAGCAGATGTTCTCGGT
GTTGAAGTCTTCCGTCAGACCATTGCAGGCAACATTCTTGTGGGCAGTTACTGTGCTTTG
TCCAACAGAGGTGGAATTGTCCATCCTCACACCTCAGTGGAAGACTTGGACGAACTATCA
ACACTTCTTCAAGTCCCTCTAGTTGCAGGAACCGTGAACCGTGGTAGTGAAGTTATTGGC
GCTGGTATGACGGTTAACGACTGGACTGCTTTCTGCGGGTCAGACACAACCGCAACAGAG
CTCTCTGTTATAG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2A271JQ 594 0 0
TAGTCGCTATTGGAGGCTCTGAGAACTTTTACAGTGCTTTTGAGTCGGAGTTAGCTGATG
TTATCCCTATCGTTAAAACCTCTATTGGTGGAACACGAATCATTGGTCGTCTTTGTGCTG
GAAACAAGAATGGCCTTCTTGTGCCCCATACAACTACTGACCAAGAGCTTCGGCACTTGA
GGAACAGTCTACCTGATTCAGTTGTTGTCCAGAGAATCGAGGAACGTCTGTCTGCTCTTG
GAAATTGCATTGCCTGTAATGACCATGTTGCTCTTGCTCACACTGATCTTGACAAGGAAA
CTGAGGAAATAATAGCAGATGTTCTCGGTGTTGAAGTCTTCCGTCAGACCATTGCAGGCA
ACATTCTTGTGGGCAGTTACTGTGCTTTGTCCAACAGAGGTGGAATTGTCCATCCTCACA
CCTCAGTGGAAGACTTGGACGAACTATCAACACTTCTTCAAGTCCCTCTAGTTGCAGGAA
CCGTGAACCGTGGTAGTGAAGTTATTGGCGCTGGTATGACGGTTAACGACTGGACTGCTT
TCTGCGGGTCAGACACAACCGCAACAGAGCTCTCTGTTATAGACAGCATCTTCA

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

CO CL6222Contig1 764 2 4 U
GGATATCACAAACTCAATTCCCTTTTCATCATCACCAAATCATAAGCGGCTCTCTCTCAA
ATTAGGGTTTTTTGTTCTAAGTCAGGTTTCATTTGATTGATATAAAAAGAAGAGATCGAA
AAACTCCAGATCGAGATCAAAATATATTTCATATACATAAGAGCGTGAATGAGATTATGA
TGGAATCGAAAGCTGGTAATAAAAAGTCGTCGTCGTCAAGTAGTTCCTTATTTTACGAAG
CTCCCCTCGGTTACAGCATTGAAGACGTTCGTCCCAACGGTGGCATCAAGAAATTCAAAT
CCTCTGTCTACTCCAACTGCGCGAAGAGGCCTTCCTGAGTACCCTTCAGTTCAGACATTC
CTCGTAGTTTAACTAGTCTTTCGATTTCAGTTTTTACTTTCTGTCCAAAGCTCTGGTTCC
CAACTCCCCTCGTTCTCTCTTCTTCCTCCAAGAAGATCTCTTTCCTCTCACAATGTCACT
CTCTGCAATCGGGTTCGAAGGCTACGAGAAGCGTCTCGAAGTCTCCTTCTTCGAACCGAG
CCTATTCCTCGACACTCACGGGAAAGGACTCCGCGCCTTACCCAAATCTCAGATCGACGA
GATCCTCGCACCGGCTGAGTGCACCATCGTCTCGTCTCTCTCCAACGATGAGCTCGACTC
TTACGTCCTCTCCGAGTCAAGCCTCTTTATCTTCCCTTACAAGATCATCATCAAGACTTG
CGGGACCACCAAGCTCCTCCTCTCATCGAGCCGCTCTTGAGCTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B230TF U 1
AF RR2FB75TF U 1
BS 1 204 RR2B230TF
BS 205 205 RR2FB75TF
BS 206 744 RR2B230TF
BS 745 764 RR2FB75TF

RD RR2B230TF 750 0 0
GGATATCACAAACTCAATTCCCTTTTCATCATCACCAAATCATAAGCGGCTCTCTCTCAA
ATTAGGGTTTTTTGTTCTAAGTCAGGTTTCATTTGATTGATATAAAAAGAAGAGATCGAA
AAACTCCAGATCGAGATCAAAATATATTTCATATACATAAGAGCGTGAATGAGATTATGA
TGGAATCGAAAGCTGGTAATAAAAGGTCGTCGTCGTCAAGTAGTTCCTTATTTTACGAAG
CTCCCCTCGGTTACAGCATTGAAGACGTTCGTCCCAACGGTGGCATCAAGAAATTCAAAT
CCTCTGTCTACTCCAACTGCGCGAAGAGGCCTTCCTGAGTACCCTTCAGTTCAGACATTC
CTCGTAGTTTAACTAGTCTTTCGATTTCAGTTTTTACTTTCTGTCCAAAGCTCTGGTTCC
CAACTCCCCTCGTTCTCTCTTCTTCCTCCAAGAAGATCTCTTTCCTCTCACAATGTCACT
CTCTGCAATCGGGTTCGAAGGCTACGAGAAGCGTCTCGAAGTCTCCTTCTTCGAACCGAG
CCTATTCCTCGACACTCACGGGAAAGGACTCCGCGCCTTACCCAAATCTCAGATCGACGA
GATCCTCGCACCGGCTGAGTGCACCATCGTCTCGTCTCTCTCCAACGATGAGCTCGACTC
TTACGTCCTCTCCGAGTCAAGCCTCTTTATCTTCCCTTACAAGATCATCATCAAGACTTG
CGGGACCACCAAGCTCCTCCTCTC
CATCGA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2FB75TF 764 0 0
GGATATCACAAACTCAATTCCCTTTTCATCATCACCAAATCATAAGCGGCTCTCTCTCAA
ATTAGGGTTTTTTGTTCTAAGTCAGGTTTCATTTGATTGATATAAAAAGAAGAGATCGAA
AAACTCCAGATCGAGATCAAAATATATTTCATATACATAAGAGCGTGAATGAGATTATGA
TGGAATCGAAGGCTGGTAATAAAAAGTCGTCGTCGTCAAGTAGTTCCTTATTTTACGAAG
CTCCCCTCGGTTACAGCATTGAAGACGTTCGTCCCAACGGTGGCATCAAGAAATTCAAAT
CCTCTGTCTACTCCAACTGCGCGAAGAGGCCTTCCTGAGTACCCTTCAGTTCAGACATTC
CTCGTAGTTTAACTAGTTTTTCGATTTCAGTTTTTACTTTCTGTCCAAAGCTCTGGTTCC
CAACTCCCCTCGTTCTCTCTTCTTCCTCCAAGAAGATCTCTTTCCTCTCACAATGTCACT
CTCTGCAATCGGGTTCGAAGGCTACGAGAAGCGTCTCGAAGTCTCCTTCTTCGAACCGAG
TCTATTCCTCGACACTCACGGGAAAGGACTCCGCGCCTTACCCAAATCTCAGATCGACGA
GATCCTCGCACCGGCTGAGTGCACCATCGTCTCGTCTCTCTCCAACGATGAGCTCGACTC
TTACGTCCTCTCCGAGTCAAGCCTCTTTATCTTCCCTTACAAGATCATCATCAAGACTTG
CGGGACCACCAAGCTCCTCCTCTCATCGAGCCGCTCTTGAGCTG

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL6223Contig1 643 2 2 U
GGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGACGATAGGAAGGGGAAAAGCAGAAAGAAACCCTAA
TTTCACACCAGCAGAAGAAAAAGAAGAAGATTCAGCAGCAACAAGAGATGATGAAGAACA
CGCAAACGATTTTCGGCAAGTACTGGCGTAGAGGTTTTTCATCCATCGCTTCTTCCCCTC
TGACCTCGAGGGTCAAGCAGGAGTTGGCGGAGCAGAATGGCTTGGGTCTCTTTGGAGCAT
TTATTGGTGGATGGTGTATCAAAGCTTCCATAAATGTTTACAAGAAAAGAGAGCATTGGT
ACAGAGTGGACAGATTGTCTAAAGAGAACGACGAGCGTTTTGTTAATCTGTTGACTAGAT
CTTCCCAGCTCACAATGGCAAGGACTGAAGCCAGTCGCAAACGTTTGATGGATATGAAAG
ACAGAGTCGATTCTGACTAGTCTCTTCCCCGATGGCAGTGTTCTCTCTATCAGAACATGC
TTGATGGAGTTGATTGGAGATAGTTTATCTTGTGCTTTGTTGTTGGTATTTGTAACTAAT
CTGTGTCAAATGATCTTAGAACAACAACTAGTTCTGATAATAGCATCTATTATTAAGTCT
TAGATAACATGAATCATCATCATTTATTTAACCATCTAAATCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FZ03JQ C 1
AF RR2FZ03TF U 4
BS 1 3 RR2FZ03JQ
BS 4 643 RR2FZ03TF

RD RR2FZ03JQ 643 0 0
GGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGACGATAGGAAGGGGAAAAGCAGAAAGAAACCCTAA
TTTCACACCAGCAGAAGAAAAAGAAGAAGATTCAGCAGCAACAAGAGATGATGAAGAACA
CGCAAACGATTTTCGGCAAGTACTGGCGTAGAGGTTTTTCATCCATCGCTTCTTCCCCTC
TGACCTCGAGGGTCAAGCAGGAGTTGGCGGAGCAGAATGGCTTGGGTCTCTTTGGAGCAT
TTATTGGTGGATGGTGTATCAAAGCTTCCATAAATGTTTACAAGAAAAGAGAGCATTGGT
ACAGAGTGGACAGATTGTCTAAAGAGAACGACGAGCGTTTTGTTAATCTGTTGACTAGAT
CTTCCCAGCTCACAATGGCAAGGACTGAAGCCAGTCGCAAACGTTTGATGGATATGAAAG
ACAGAGTCGATTCTGACTAGTCTCTTCCCCGATGGCAGTGTTCTCTCTATCAGAACATGC
TTGATGGAGTTGATTGGAGATAGTTTATCTTGTGCTTTGTTGTTGGTATTTGTAACTAAT
CTGTGTCAAATGATCTTAGAACAACAACTAGTTCTGATAATAGCATCTATTATTAAGTCT
TAGATAACATGAATCATCATCATTTATTTAACCATCTAAATCC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2FZ03TF 640 0 0
GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGACGATAGGAAGGGGAAAAGCAGAAAGAAACCCTAATTT
CACACCAGCAGAAGAAAAAGAAGAAGATTCAGCAGCAACAAGAGATGATGAAGAACACGC
AAACGATTTTCGGCAAGTACTGGCGTAGAGGTTTTTCATCCATCGCTTCTTCCCCTCTGA
CCTCGAGGGTCAAGCAGGAGTTGGCGGAGCAGAATGGCTTGGGTCTCTTTGGAGCATTTA
TTGGTGGATGGTGTATCAAAGCTTCCATAAATGTTTACAAGAAAAGAGAGCATTGGTACA
GAGTGGACAGATTGTCTAAAGAGAACGACGAGCGTTTTGTTAATCTGTTGACTAGATCTT
CCCAGCTCACAATGGCAAGGACTGAAGCCAGTCGCAAACGTTTGATGGATATGAAAGACA
GAGTCGATTCTGACTAGTCTCTTCCCCGATGGCAGTGTTCTCTCTATCAGAACATGCTTG
ATGGAGTTGATTGGAGATAGTTTATCTTGTGCTTTGTTGTTGGTATTTGTAACTAATCTG
TGTCAAATGATCTTAGAACAACAACTAGTTCTGATAATAGCATCTATTATTAAGTCTTAG
ATAACATGAATCATCATCATTTATTTAACCATCTAAATCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL6224Contig1 892 2 4 U
GCAGCCAAATAAGTTTCAATGCACAAGCCTTATTCCAGGTAAGAGTAAAGGTGGCACACC
AGAAGTTAGAGATCCCAGCTATCACTTTAATGCATTTGTACTTGTTTTAGCTCCTTGAGT
ACCATTTATCAGCGCTAGTTTACATCTTCTGGTCCGGTTTATATAAGCTCTTTGTAGTTT
ATATGTTCTTCTCTGAGTGGTATTTGACATCATTGTACGTACTCTCCTTTAATACCACAG
AAGCTGCAGCATTTGGTGAAGGTGGCAATGAGAATGAGTCGCTTGAAGCCAAGGCACAGA
AAGCCCTGGGTTGTCCTTGCATAGCAGATCTGCGTAATGGATCTTGCGGGTCTCAGTTCA
CTGAGGCTTTCCGTTGCTTTCTAATTGAAAACACTCTAGATTGTTTGGGATAATGTAAAC
CGTAATATAGTGAGCTTCACAAGGATATTGGATATGTAAATTGTTGTTGCAGGGATCAGA
CTGTGTGCATCCATTTGTGGCATTGCAAAGCTGTATCAAAGCCAACCCAAGCGCATTCTC
AAAAGAGATTCTTGAGGACGAGAAAAAAGGAAGAGCAGCAGCCTGTGCAACCAGACCATA
GAAACATCCCTCCTCTCTGGGCTAAGGACACTCCTCGCCGTGGCAAATCCAAGCTTTAGA
ACCTCTACAACAATGGAACCTTATTCTTTTCTATCTTCTCTTACGAACAACAAACTGAAG
GAATTACAAGAAACCATTGTGTAAACGTTTGGTTCTTTTGTTCACATTCTCGTGTATGAT
CCAAAACGAATCGCTTATTCGGAAGCTTAACCGTTTGGTTTAATTCACAAATCAAAACTT
TATTCGGTGCAATAATAATATAACCAACCGGTTTAATTCGGTTTGATTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC93TF U 1
AF RR2AC93JQ C 33
BS 1 803 RR2AC93TF
BS 804 804 RR2AC93JQ
BS 805 836 RR2AC93TF
BS 837 892 RR2AC93JQ

RD RR2AC93TF 841 0 0
GCAGCCAAATAAGTTTCAATGCACAAGCCTTATTCCAGGTAAGAGTAAAGGTGGCACACC
AGAAGTTAGAGATCCCAGCTATCACTTTAATGCATTTGTACTTGTTTTAGCTCCTTGAGT
ACCATTTATCAGCGCTAGTTTACATCTTCTGGTCCGGTTTATATAAGCTCTTTGTAGTTT
ATATGTTCTTCTCTGAGTGGTATTTGACATCATTGTACGTACTCTCCTTTAATACCACAG
AAGCTGCAGCATTTGGTGAAGGTGGCAATGAGAATGAGTCGCTTGAAGCCAAGGCACAGA
AAGCCCTGGGTTGTCCTTGCATAGCAGATCTGCGTAATGGATCTTGCGGGTCTCAGTTCA
CTGAGGCTTTCCGTTGCTTTCTAATTGAAAACACTCTAGATTGTTTGGGATAATGTAAAC
CGTAATATAGTGAGCTTCACAAGGATATTGGATATGTAAATTGTTGTTGCAGGGATCAGA
CTGTGTGCATCCATTTGTGGCATTGCAAAGCTGTATCAAAGCCAACCCAAGCGCATTCTC
AAAAGAGATTCTTGAGGACGAGAAAAAAGGAAGAGCAGCAGCCTGTGCAACCAGACCATA
GAAACATCCCTCCTCTCTGGGCTAAGGACACTCCTCGCCGTGGCAAATCCAAGCTTTAGA
ACCTCTACAACAATGGAACCTTATTCTTTTCTATCTTCTCTTACGAACAACAAACTGAAG
GAATTACAAGAAACCATTGTGTAAACGTTTGGTTCTTTTGTTCACATTCTCGTGTATGAT
CCAAAACGAATCGCTTATTCGGA*GCTTAACCGTTTGGTTTAATTCACAAATCAAA
CTTTA

QA 1 836 1 836
DS 

RD RR2AC93JQ 860 0 0
TTCCAGGTAAGAGTAAAGGTGGCACACCAGAAGTTAGAGATCCCAGCTATCACTTTAATG
CATTTGTACTTGTTTTAGCTCCTTGAGTACCATTTATCAGCGCTAGTTTACATCTTCTGG
TCCGGTTTATATAAGCTCTTTGTAGTTTATATGTTCTTCTCTGAGTGGTATTTGACATCA
TTGTACGTACTCTCCTTTAATACCACAGAAGCTGCAGCATTTGGTGAAGGTGGCAATGAG
AATGAGTCGCTTGAAGCCAAGGCACAGAAAGCCCTGGGTTGTCCTTGCATAGCAGATCTG
CGTAATGGATCTTGCGGGTCTCAGTTCACTGAGGCTTTCCGTTGCTTTCTAATTGAAAAC
ACTCTAGATTGTTTGGGATAATGTAAACCGTAATATAGTGAGCTTCACAAGGATATTGGA
TATGTAAATTGTTGTTGCAGGGATCAGACTGTGTGCATCCATTTGTGGCATTGCAAAGCT
GTATCAAAGCCAACCCAAGCGCATTCTCAAAAGAGATTCTTGAGGACGAGAAAAAAGGAA
GAGCAGCAGCCTGTGCAACCAGACCATAGAAACATCCCTCCTCTTTGGGCTAAGGACACT
CCTCGCCGTGGCAAATCCAAGCTTTAGAACCTCTACAACAATGGAACCTTATTCTTTTCT
ATCTTTTCTTACGAACAACAAACTGAAGGAATTACAAGAAACCATTGTGTAAACGTTTGG
TTCTTTTGTTCACATTCTCGTGTATGATCCAAAACGAATCGCTTATTCGGAAGCTTAACC
GTTTGGTTTAATTCACAAATCAAAACTTTATTCGGTGCAATAATAATATAACCAACCGGT
TTAATTCGGTTTGATTTGAG

QA 1 860 1 860
DS 



AS 1 2

CO CL6225Contig1 847 2 20 U
GAAGAACCTAATCCTACTCCGACTAATATTATGGTCATATCTGATACAGATGCACATGAG
GCCTTCTCACTTGCCGTTGCCCACCTAGTACAAGAGCAGAAACACAACCTTTTTCTGGCT
TATTCATCTAGGCCTTACCAAATCTTAGTCCTGCTCCCTTCTGCCGAGTGGCTCTGGCAT
AGCTTACTTGAAGTTTCAGAGAAAAGGAAACACGTTCTTCAGAAATGCAGTAGTGAAAGT
GATAGGGGTGGTGGATCTAGCGCAATGTTTTATTGCAAATTGTGCCGTGATGGCAAAGGC
CCTGATTACAAATGCCTTGACAATTTAAGAACGCATCTCTCAACTGAAGAACATTTGCAA
GAAGAGTGTAGTATTACTGCGTTTGTTCAATTAAAAATGAAGAATAGGCATCTATCTCTC
TTAGCCCAGTACGATCGAGAGCATCGAGAGCAATTGCGACAGGTAAAAGGTTCTCCAAAT
ATCAAACGTATGAGGAAGGCATGCCGGACGGGTTTTCGTCTGCTTGATAATCATTTACGT
CCACTTATAGCTCGTAAATCTCAAACCTGCAGACGTCGTCGTGGTGGCTCTCGACGTAGA
GCTCCAAAATCTCAAAACATGTGGTGAAATTGTTTCCAGGTCATCATCAGTCCTTGAAGA
AGCTCTTGTTTTTCGTTTCTTGTCTATGTTTCAATTTCAAGCGGTACTTATTTTTCATTG
CGTTTTACTTTGTTTAAAACCATCTTATTATTCACTCATGTAATGTTATTAGTAACTAGA
GTTTGATGTATTTCGTTTGAAGTCTAGTACAGTAGTATAATTGTGGAACGTTTTCGGCTT
TAGTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F879TF U 1
AF RR2F879JQ C 209
BS 1 677 RR2F879TF
BS 678 678 RR2F879JQ
BS 679 693 RR2F879TF
BS 694 694 RR2F879JQ
BS 695 725 RR2F879TF
BS 726 726 RR2F879JQ
BS 727 738 RR2F879TF
BS 739 739 RR2F879JQ
BS 740 769 RR2F879TF
BS 770 770 RR2F879JQ
BS 771 774 RR2F879TF
BS 775 775 RR2F879JQ
BS 776 783 RR2F879TF
BS 784 784 RR2F879JQ
BS 785 792 RR2F879TF
BS 793 793 RR2F879JQ
BS 794 800 RR2F879TF
BS 801 801 RR2F879JQ
BS 802 824 RR2F879TF
BS 825 847 RR2F879JQ

RD RR2F879TF 824 0 0
GAAGAACCTAATCCTACTCCGACTAATATTATGGTCATATCTGATACAGATGCACATGAG
GCCTTCTCACTTGCCGTTGCCCACCTAGTACAAGAGCAGAAACACAACCTTTTTCTGGCT
TATTCATCTAGGCCTTACCAAATCTTAGTCCTGCTCCCTTCTGCCGAGTGGCTCTGGCAT
AGCTTACTTGAAGTTTCAGAGAAAAGGAAACACGTTCTTCAGAAATGCAGTAGTGAAAGT
GATAGGGGTGGTGGATCTAGCGCAATGTTTTATTGCAAATTGTGCCGTGATGGCAAAGGC
CCTGATTACAAATGCCTTGACAATTTAAGAACGCATCTCTCAACTGAAGAACATTTGCAA
GAAGAGTGTAGTATTACTGCGTTTGTTCAATTAAAAATGAAGAATAGGCATCTATCTCTC
TTAGCCCAGTACGATCGAGAGCATCGAGAGCAATTGCGACAGGTAAAAGGTTCTCCAAAT
ATCAAACGTATGAGGAAGGCATGCCGGACGGGTTTTCGTCTGCTTGATAATCATTTACGT
CCACTTATAGCTCGTAAATCTCAAACCTGCAGACGTCGTCGTGGTGGCTCTCGACGTAGA
GCTCCAAAATCTCAAAACATGTGGTGAAATTGTTTCCAGGTCATCATCAGTCCTTGAAGA
AGCTCTTGTTTTTCGTT*CTTGTCTATGTTTCA*TTTCAAGCGGTACTTATTTTTCATTG
CGTTT*ACTTTGTTTAAA*CCATCTTATTATTCACTCATGTAATGTTAT*AGTA*CTAGA
GTT*GATGTATT*CGTTTGA*GTCTAGTACAGTAGTATAATTGT

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2F879JQ 639 0 0
AACACGTTCTTCAGAAATGCAGTAGTGAAAGTGATAGGGGTGGTGGATCTAGCGCAATGT
TTTATTGCAAATTGTGCCGTGATGGCAAAGGCCCTGATTACAAATGCCTTGACAATTTAA
GAACGCATCTCTCAACTGAAGAACATTTGCAAGAAGAGTGTAGTATTACTGCGTTTGTTC
AATTAAAAATGAAGAATAGGCATCTATCTCTCTTAGCCCAGTACGATCGAGAGCATCGAG
AGCAATTGCGACAGGTAAAAGGTTCTCCAAATATCAAACGTATGAGGAAGGCATGCCGGA
CGGGTTTTCGTCTGCTTGATAATCATTTACGTCCACTTATAGCTCGTAAATCTCAAACCT
GCAGACGTCGTCGTGGTGGCTCTCGACGTAGAGCTCCAAAATCTCAAAACATGTGGTGAA
ATTGTTTCCAGGTCATCATCAGTCCTTGAAGAAGCTCTTGTTTTTCGTTTCTTGTCTATG
TTTCAATTTCAAGCGGTACTTATTTTTCATTGCGTTTTACTTTGTTTAAAACCATCTTAT
TATTCACTCATGTAATGTTATTAGTAACTAGAGTTTGATGTATTTCGTTTGAAGTCTAGT
ACAGTAGTATAATTGTGGAACGTTTTCGGCTTTAGTAGT

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL6226Contig1 935 2 2 U
GGAGGAGAGTGTTTCCTTCCAGAGAAGTTTCATCCTTAAGCAGATCTGAAGAGGGTGAAA
CTCGCTTTTCATTATTAATCCGCAACCTTCTCCCAGGAATATAAAAAAAAGCGTTTCTTT
CCTTTGGTGAGATAGAAGAAGAATAATGGCGCATAGAGTAGAACAGGATTACGACTACTT
GTTCAAGATCGTGTTGATAGGTGATTCTGGTGTCGGGAAATCAAACATATTGTCTAGATT
CACCAGGAATGAGTTTTGCTTGGAATCCAAGTCCACTATTGGTGTTGAATTCGCCACAAG
AACTCTTCAGGTTGAAGGAAAGACAGTAAAAGCCCAAATATGGGACACTGCAGGTCAAGA
GCGGTACAGAGCCATCACAAGCGCTTACTACAGAGGCGCAGTAGGTGCATTTCTTGTCTA
TGACATCACCAAACGCCAGACCTTTGACAATGCCCTAAGGTGGCTACGCGAACTAAGAGA
CCATGCGGATTCCAACATTGTGATCATGATGGCTGGGAACAAATCCGATCTAAACCACTT
GAGGTCGGTTGCTGAGGAAGATGGTAGGAGTCTAGCTGAGACAGAAAGTCTCTCTTTCTT
GGAGACGTCTGCTCTTGAATCAACGAATGTCGAGAAATCATTTCAAACCGTGTTGACAGA
GATTTACAAGATCATCAGCAAAAAAGCTTTGGCTGCTCAAGAGGCAGCGGGTGCTAATTT
TGCGATTCCTGGTCAAGGAACAACGATTAACGTTGATGACACATCTGGAGTTGCCAATAG
AGGTTGCTGCTCTACTTAATTACCTCTCGAAAGCTTCTCCTCTTCTCTCTCTCTTTTTTT
TTTTTTTGGGCTGATGAGTGTAACAATGCAAGAGCATGTAGACTACTTCTCTTCAATCAC
TCTTGTCTTGCAATCTCTGATGGGTTTGTGTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN92TF U 1
AF RR2DN92JQ C 305
BS 1 684 RR2DN92TF
BS 685 935 RR2DN92JQ

RD RR2DN92TF 684 0 0
GGAGGAGAGTGTTTCCTTCCAGAGAAGTTTCATCCTTAAGCAGATCTGAAGAGGGTGAAA
CTCGCTTTTCATTATTAATCCGCAACCTTCTCCCAGGAATATAAAAAAAAGCGTTTCTTT
CCTTTGGTGAGATAGAAGAAGAATAATGGCGCATAGAGTAGAACAGGATTACGACTACTT
GTTCAAGATCGTGTTGATAGGTGATTCTGGTGTCGGGAAATCAAACATATTGTCTAGATT
CACCAGGAATGAGTTTTGCTTGGAATCCAAGTCCACTATTGGTGTTGAATTCGCCACAAG
AACTCTTCAGGTTGAAGGAAAGACAGTAAAAGCCCAAATATGGGACACTGCAGGTCAAGA
GCGGTACAGAGCCATCACAAGCGCTTACTACAGAGGCGCAGTAGGTGCATTTCTTGTCTA
TGACATCACCAAACGCCAGACCTTTGACAATGCCCTAAGGTGGCTACGCGAACTAAGAGA
CCATGCGGATTCCAACATTGTGATCATGATGGCTGGGAACAAATCCGATCTAAACCACTT
GAGGTCGGTTGCTGAGGAAGATGGTAGGAGTCTAGCTGAGACAGAAAGTCTCTCTTTCTT
GGAGACGTCTGCTCTTGAATCAACGAATGTCGAGAAATCATTTCAAACCGTGTTGACAGA
GATTTACAAGATCATCAGCAAAAA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2DN92JQ 631 0 0
CTTCAGGTTGAAGGAAAGACAGTAAAAGCCCAAATATGGGACACTGCAGGTCAAGAGCGG
TACAGAGCCATCACAAGCGCTTACTACAGAGGCGCAGTAGGTGCATTTCTTGTCTATGAC
ATCACCAAACGCCAGACCTTTGACAATGCCCTAAGGTGGCTACGCGAACTAAGAGACCAT
GCGGATTCCAACATTGTGATCATGATGGCTGGGAACAAATCCGATTTAAACCACTTGAGG
TCGGTTGCTGAGGAAGATGGTAGGAGTCTAGCTGAGACAGAAGGTCTCTCTTTCTTGGAG
ACGTCTGCTCTTGAATCAACGAATGTCGAGAAATCATTTCAAACCGTGTTGACAGAGATT
TACAAGATCATCAGCAAAAAAGCTTTGGCTGCTCAAGAGGCAGCGGGTGCTAATTTTGCG
ATTCCTGGTCAAGGAACAACGATTAACGTTGATGACACATCTGGAGTTGCCAATAGAGGT
TGCTGCTCTACTTAATTACCTCTCGAAAGCTTCTCCTCTTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTT
TTTGGGCTGATGAGTGTAACAATGCAAGAGCATGTAGACTACTTCTCTTCAATCACTCTT
GTCTTGCAATCTCTGATGGGTTTGTGTTCAG

QA 1 631 1 631
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6228Contig1 427 2 1 U
GCTCCACCACCTCAGGGATACGGTCAGGCATATCCAGCACAAGGGTATCCTCCACCGCAA
TATCCTCAAGGTCCTCCGCCGCAGTATCCTTATCAGGGTCCCCCACCACCACAATATGGT
CAGGCTCCACAAAAGAAAAAGAAAGAATCAGGATTTGTCGAAGGATGTTTGGCTATGCTC
TGTTGTTGCTTTCTATTGGAAGCTTGCTTCTGATTGAAGATTGAGATGATATTCGCCCGT
TGACCGTCTTCAGGATTTCTTTTTTCTGAAAACAAAATATTTGTCAGATACTTTCATTGA
GATTGACCGTCTTCAGGATGCCATCGTATTTTATGAAACAAGATTATAATTATTACGTGT
TAAAAACAAAAAAGAGATGAGTTATATAATTGTTTCTAAAAGACGTGTTTGATCAAACAT
TTAGACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CT77JQ C 1
AF RR2CT77TF U 1
BS 1 427 RR2CT77TF

RD RR2CT77JQ 427 0 0
GCTCCACCACCTCAGGGATACGGTCAGGCATATCCAGCACAAGGGTATCCTCCACCGCAA
TATCCTCAAGGTCCTCCGCCGCAGTATCCTTATCAGGGTCCCCCACCACCACAATATGGT
CAGGCTCCACAAAAGAAAAAGAAAGAATCAGGATTTGTCGAAGGATGTTTGGCTATGCTC
TGTTGTTGCTTTCTATTGGAAGCTTGCTTTTGATTGAAGATTGAGATGATATTCGCCCGT
TGACCGTCTTCAGGATTTCTTTTTTCTGAAAACAAAATATTTGTCAGATACTTTCATTGA
GATTGACCGTCTTCAGGATGCCATCGTATTTTATGAAACAAGATTATAATTATTACGTGT
TAAAAACAAAAAAGAGATGAGTTATATAATTGTTTTTAAAAGACGTGTTTGATCAAACAT
TTAGACG

QA 1 427 1 427
DS 

RD RR2CT77TF 427 0 0
GCTCCACCACCTCAGGGATACGGTCAGGCATATCCAGCACAAGGGTATCCTCCACCGCAA
TATCCTCAAGGTCCTCCGCCGCAGTATCCTTATCAGGGTCCCCCACCACCACAATATGGT
CAGGCTCCACAAAAGAAAAAGAAAGAATCAGGATTTGTCGAAGGATGTTTGGCTATGCTC
TGTTGTTGCTTTCTATTGGAAGCTTGCTTCTGATTGAAGATTGAGATGATATTCGCCCGT
TGACCGTCTTCAGGATTTCTTTTTTCTGAAAACAAAATATTTGTCAGATACTTTCATTGA
GATTGACCGTCTTCAGGATGCCATCGTATTTTATGAAACAAGATTATAATTATTACGTGT
TAAAAACAAAAAAGAGATGAGTTATATAATTGTTTCTAAAAGACGTGTTTGATCAAACAT
TTAGACG

QA 1 427 1 427
DS 



AS 1 2

CO CL6229Contig1 746 2 2 U
GGCTCCTCCTCCTCACTTCAAGGTGGTTTTGGGATCTTCATCGATTGCTCGACGAAGTAT
ATTAACAGACATGGGATACCAGTTCACTCTAATGAGTGCTGATATTGACGAGAAAAGCAT
CCGTAAGGAGAATCCTGAAGACTTGGTTTTAGCTTTAGCTGGGGCAAAGGCTGAAGCAAT
CATGTAGCGTATGGCTAATGACGAGGACGACATAAAGGAGACCTTACTTGTTACTTGTGA
CCAAGTTGTGGTCTATGCAAGTGCCGTTAGAGAGAAACCCTCGAGTGTGGAAGAAGCAAG
GGAATACATAAGAGGCTATTCCAAGGGACACACTGCAACAGTCAGTTCTGTGGTTGTAAC
AAATACCAAAACTGGATTCAGAAAAGGAGGCGTCGATAGAGTGGAGATATATTTCAACGA
AATATCGGAGGAGATTATCGCGAAACTGATTGAGGAAGGCACGGTGCTTAAGGTGGCTGG
TGCACTCCTAATTGAACATCCTCTAATATCGCCATGCGTCAGAGAAATGGTTGGGACAAT
AGATAGCGTCATGGGTCTGCCTAAAAAACTGACCGAGGAACTTCTAAAGGAAGCAATGGC
AAGCACACGGGAGAAAATGTCTGGTGTCTAAAAATGTTGGTTTATTATTTTAATGATCGA
TCTGCTTTTGCTACTTGTGAGAATTTATGGATCAGTTGTTTTGACTTGTCTGTAACAAGT
AACCAAACCTTTGGATTGTGATTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN14TF U 1
AF RR2GN14JQ C 10
BS 1 719 RR2GN14TF
BS 720 746 RR2GN14JQ

RD RR2GN14TF 719 0 0
GGCTCCTCCTCCTCACTTCAAGGTGGTTTTGGGATCTTCATCGATTGCTCGACGAAGTAT
ATTAACAGACATGGGATACCAGTTCACTCTAATGAGTGCTGATATTGACGAGAAAAGCAT
CCGTAAGGAGAATCCTGAAGACTTGGTTTTAGCTTTAGCTGGGGCAAAGGCTGAAGCAAT
CATGTAGCGTATGGCTAATGACGAGGACGACATAAAGGAGACCTTACTTGTTACTTGTGA
CCAAGTTGTGGTCTATGCAAGTGCCGTTAGAGAGAAACCCTCGAGTGTGGAAGAAGCAAG
GGAATACATAAGAGGCTATTCCAAGGGACACACTGCAACAGTCAGTTCTGTGGTTGTAAC
AAATACCAAAACTGGATTCAGAAAAGGAGGCGTCGATAGAGTGGAGATATATTTCAACGA
AATATCGGAGGAGATTATCGCGAAACTGATTGAGGAAGGCACGGTGCTTAAGGTGGCTGG
TGCACTCCTAATTGAACATCCTCTAATATCGCCATGCGTCAGAGAAATGGTTGGGACAAT
AGATAGCGTCATGGGTCTGCCTAAAAAACTGACCGAGGAACTTCTAAAGGAAGCAATGGC
AAGCACACGGGAGAAAATGTCTGGTGTCTAAAAATGTTGGTTTATTATTTTAATGATCGA
TCTGCTTTTGCTACTTGTGAGAATTTATGGATCAGTTGTTTTGACTTGTCTGTAACAAG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2GN14JQ 737 0 0
TCCTCACTTCAAGGTGGTTTTGGGATCTTCATCGATTGCTCGACGAAGTATATTAACAGA
CATGGGATACCAGTTCACTCTAATGAGTGCTGATATTGACGAGAAAAGCATCCGTAAGGA
GAATCCTGAAGACTTGGTTTTAGCTTTAGCTGGGGCAAAGGCTGAAGCAATCATGTAGCG
TATGGCTAATGACGAGGACGACATAAAGGAGACCTTACTTGTTACTTGTGACCAAGTTGT
GGTCTATGCAAGTGCCGTTAGAGAGAAACCCTCGAGTGTGGAAGAAGCAAGGGAATACAT
AAGAGGCTATTCCAAGGGACACACTGCAACAGTCAGTTCTGTGGTTGTAACAAATACCAA
AACTGGATTCAGAAAAGGAGGCGTCGATAGAGTGGAGATATATTTCAACGAAATATCGGA
GGAGATTATCGCGAAACTGATTGAGGAAGGCACGGTGCTTAAGGTGGCTGGTGCACTCCT
AATTGAACATCCTCTAATATCGCCATGCGTCAGAGAAATGGTTGGGACAATAGATAGCGT
CATGGGTCTGCCTAAAAAACTGACCGAGGAACTTCTAAAGGAAGCAATGGCAAGCACACG
GGAGAAAATGTCTGGTGTCTAAAAATGTTGGTTTATTATTTTAATGATCGATCTGCTTTT
GCTACTTGTGAGAATTTATGGATCAGTTGTTTTGACTTGTCTGTAACAAGTAACCAAACC
TTTGGATTGTGATTGGC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6231Contig1 1024 2 4 U
GGAGTCCACGGCGTCTTCTCGATTTAATTTATAAAAAAAAAGGATCCAAACCAGAGAGAG
AGCTATGGAAGGAGGAGCTGGTATCTACAATCCTCGCACTGTCGAAGAAGTTTTCAGGGA
TTTCAAAGGCCGTAGAGCCGCCATTGTCAAAGCTCTCACCTCCGATGTTGCAGAGTTTTA
CCAGCAATGCGATCCTGCGAAGGAGAATCTTTGCTTGTATGGGTTACCGAACGAACAATG
GGAAGTGAACTTACCAGCAGAAGAAGTGCCTCCAGAGCTTCCAGAGCCAGCTCTAGGCAT
TAACTTTGCAAGAGATGGACTCTCTGAGAAGGAATGGCTTTCTCTTGTTGCTATCCACAG
TGACACTTGGTTGCTCTCCGTCTCTTTTTACTTCGGCTCCAGATTCGCTTTCGACAAATA
TGAGAGGAAACGCTTGTTTGATATGATCAATGGGATTCCTACCATATTTGAAGTAGTCAC
TGGAAATATGAAAAAGCAAACTAAGGAAAAGTCCTCTGCTTCAAATCGAAATGGCAATCT
ATCCAAGTCGGATTCCAAAGTGAGATCTTCAGATGGCAAAAGCTCAAAGGCCATGCAGGC
AAACAATGAGGAAGAGGGATCAGAGGAAGAGGATGAGGATGAACACGGGGAAACCCTTTG
TGGTGCATGTGGAGACGGTGATGGTAATGGTACTGATGATTTCTGGATCTGCTGTGACGT
TTGTGAGGTATGGTTCCACGGGAAGTGTGTGAAGATAACTCCAGCTAGAGCTGAGCATAT
CAAACAGTACAAGTGCCCTGCATGTAGCAACAAAAGAGCTCGATCTTAAATGTTCTATTT
GTAGAGAGTGTAGCCTGTAGTAAGAAACTCTTACTACCCTCATCTTTATTTGGCTAGTTC
TTAGCTCTTTCTATCCACCATAACAACTTAGCCCCTATTTCTCATTTGAATTTGCTGTAT
AATTAATTGGTTTGTTTCCAGAAACATATTTCCAAGTCCATTAATCAAACTTCTCATATG
CAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2BH04TF U 1
AF RR2BH04JQ C 180
BS 1 814 RR2BH04TF
BS 815 815 RR2BH04JQ
BS 816 894 RR2BH04TF
BS 895 1024 RR2BH04JQ

RD RR2BH04TF 894 0 0
GGAGTCCACGGCGTCTTCTCGATTTAATTTATAAAAAAAAAGGATCCAAACCAGAGAGAG
AGCTATGGAAGGAGGAGCTGGTATCTACAATCCTCGCACTGTCGAAGAAGTTTTCAGGGA
TTTCAAAGGCCGTAGAGCCGCCATTGTCAAAGCTCTCACCTCCGATGTTGCAGAGTTTTA
CCAGCAATGCGATCCTGCGAAGGAGAATCTTTGCTTGTATGGGTTACCGAACGAACAATG
GGAAGTGAACTTACCAGCAGAAGAAGTGCCTCCAGAGCTTCCAGAGCCAGCTCTAGGCAT
TAACTTTGCAAGAGATGGACTCTCTGAGAAGGAATGGCTTTCTCTTGTTGCTATCCACAG
TGACACTTGGTTGCTCTCCGTCTCTTTTTACTTCGGCTCCAGATTCGCTTTCGACAAATA
TGAGAGGAAACGCTTGTTTGATATGATCAATGGGATTCCTACCATATTTGAAGTAGTCAC
TGGAAATATGAAAAAGCAAACTAAGGAAAAGTCCTCTGCTTCAAATCGAAATGGCAATCT
ATCCAAGTCGGATTCCAAAGTGAGATCTTCAGATGGCAAAAGCTCAAAGGCCATGCAGGC
AAACAATGAGGAAGAGGGATCAGAGGAAGAGGATGAGGATGAACACGGGGAAACCCTTTG
TGGTGCATGTGGAGACGGTGATGGTAATGGTACTGATGATTTCTGGATCTGCTGTGACGT
TTGTGAGGTATGGTTCCACGGGAAGTGTGTGAAGATAACTCCAGCTAGAGCTGAGCATAT
CAAACAGTACAAGTGCCCTGCATGTAGCAACAAA*GAGCTCGATCTTAAATGTTCTATTT
GTAGAGAGTGTAGCCTGTAGTAAGAAACTCTTACTACCCTCATCTTTATTTGGC

QA 1 894 1 894
DS 

RD RR2BH04JQ 845 0 0
ACCAGCAATGCGATCCTGCGAAGGAGAATCTTTGCTTGTATGGGTTACCGAACGAACAAT
GGGAAGTGAACTTACCAGCAGAAGAAGTGCCTCCAGAGCTTCCAGAGCCAGCTCTAGGCA
TTAACTTTGCAAGAGATGGACTCTCTGAGAAGGAATGGCTTTCTCTTGTTGCTATCCACA
GTGACACTTGGTTGCTCTCCGTCTCTTTTTACTTCGGCTCCAGATTCGCTTTCGACAAAT
ATGAGAGGAAACGCTTGTTTGATATGATCAATGGGATTCCTACCATATTTGAAGTAGTCA
CTGGAAATATGAAAAAGCAAACTAAGGAAAAGTCCTCTGCTTCAAATCGAAATGGCAATC
TATCCAAGTCGGATTCCAAAGTGAGATCTTCAGATGGCAAAAGCTCAAAGGCCATGCAGG
CAAACAATGAGGAAGAGGGATCAGAGGAAGAGGATGAGGATGAACACGGGGAAACCCTTT
GTGGTGCATGTGGAGACGGTGATGGTAATGGTACTGATGATTTCTGGATCTGCTGTGACG
TTTGTGAGGTATGGTTCCACGGGAAGTGTGTGAAGATAACTCCAGCTAGAGCTGAGCATA
TCAAACAGTACAAGTGCCCTGCATGTAGCAACAAAAGAGCTCGATCTTAAATGTTCTATT
TGTAGAGAGTGTAGCCTGTAGTAAGAAACTCTTACTACCCTCATCTTTATTTGGCTAGTT
CTTAGCTCTTTCTATCCACCATAACAACTTAGCCCCTATTTCTCATTTGAATTTGCTGTA
TAATTAATTGGTTTGTTTCCAGAAACATATTTCCAAGTCCATTAATCAAACTTCTCATAT
GCAGC

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

CO CL6232Contig1 772 2 4 U
GGAGGAGAGAGAGCCTACGACATCTTCTCTCGCTTGCTCAAGGAGCGTATCATCTGCATC
AACGGCCCAATCAACGACGACACCTCCCACGTCGTCGTCGCTCAGCTTCTCTTCCTCGAA
TCCGAGAACCCTTCCAAGCCGATCCATATGTATCTCAATTCACCAGGTGGCCACGTCACC
ACCGGTCTAGCAATTTATGATACTATGCAGTACATTCGATCTCCGATAAGCACAATCTGT
TTAGGCCAGGCTGCATCGATGGCCTCTCTCCTCTTGGCGTCTGGCGCCAAGGGACAGAGG
CGGTCGCTGCCTAACGCGACGGTTATGATTCATCAGCCTTCGGGTGGGTATAGCGGCCAG
GCCAAGGATATAACGATTCATACGAAGCAGATTGTTCGCGTGTGGGATGCGTTGAATGGT
CTGTATGCCAAACACACGGGTCAGGCTGTTGATGTGATCGCAGAGAACATGGATAGGGAT
AACTTCATGACTCCTGAAGAGGCTAAGGCGTTTGGGATAATCGATGAAGTGATTGATGAG
AGGCCGTTGGAGTTGGTGAAAGATGCAGTTGGGAGTGGAAGCAAAGATGATAAGAAGAGT
TCGAGTTAAGGGAAGAAGTAACACTCTGGTAAATCAAAGTATCTTCTTTTCCTTTTGCTT
CAGTTAGATCAATCACACTTTTCTTCTATGGATGAATATTGATGCACTGCAGGGGCATAG
TCTCTTAAAAAACTGTTTTTATTCTTTTAATAAATCGTTCATGTTTCAGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE59TF U 1
AF RR2CE59JQ C 121
BS 1 250 RR2CE59TF
BS 251 251 RR2CE59JQ
BS 252 709 RR2CE59TF
BS 710 772 RR2CE59JQ

RD RR2CE59TF 709 0 0
GGAGGAGAGAGAGCCTACGACATCTTCTCTCGCTTGCTCAAGGAGCGTATCATCTGCATC
AACGGCCCAATCAACGACGACACCTCCCACGTCGTCGTCGCTCAGCTTCTCTTCCTCGAA
TCCGAGAACCCTTCCAAGCCGATCCATATGTATCTCAATTCACCAGGTGGCCACGTCACC
ACCGGTCTAGCAATTTATGATACTATGCAGTACATTCGATCTCCGATAAGCACAATCTGT
TTAGGCCAGG*TGCATCGATGGCCTCTCTCCTCTTGGCGTCTGGCGCCAAGGGACAGAGG
CGGTCGCTGCCTAACGCGACGGTTATGATTCATCAGCCTTCGGGTGGGTATAGCGGCCAG
GCCAAGGATATAACGATTCATACGAAGCAGATTGTTCGCGTGTGGGATGCGTTGAATGGT
CTGTATGCCAAACACACGGGTCAGGCTGTTGATGTGATCGCAGAGAACATGGATAGGGAT
AACTTCATGACTCCTGAAGAGGCTAAGGCGTTTGGGATAATCGATGAAGTGATTGATGAG
AGGCCGTTGGAGTTGGTGAAAGATGCAGTTGGGAGTGGAAGCAAAGATGATAAGAAGAGT
TCGAGTTAAGGGAAGAAGTAACACTCTGGTAAATCAAAGTATCTTCTTTTCCTTTTGCTT
CAGTTAGATCAATCACACTTTTCTTCTATGGATGAATATTGATGCACTG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2CE59JQ 652 0 0
TCCGAGAACCCTTCCAAGCCGATCCATATGTATCTCAATTCACCAGGTGGCCACGTCACC
ACCGGTCTAGCAATTTATGATACTATGCAGTACATTCGATTTCCGATAAGCACAATCTGT
TTAGGCCAGGCTGCATCGATGGCCTCTCTCCTCTTGGCGTCTGGCGCCAAGGGACAGAGG
CGGTCGCTGCCTAACGCGACGGTTATGATTCATCAGCCTTCGGGTGGGTATAGCGGCCAG
GCCAAGGATATAACGATTCATACGAAGCAGATTGTTCGCGTGTGGGATGCGTTGAATGGT
CTGTATGCCAAACACACGGGTCAGGCTGTTGATGTGATCGCAGAGAACATGGATAGGGAT
AACTTCATGACTCCTGAAGAGGCTAAGGCGTTTGGGATAATCGATGAAGTGATTGATGAG
AGGCCGTTGGAGTTGGTGAAAGATGCAGTTGGGAGTGGAAGCAAAGATGATAAGAAGAGT
TCGAGTTAAGGGAAGAAGTAACACTCTGGTAAATCAAAGTATCTTCTTTTCCTTTTGCTT
CAGTTAGATCAATCACACTTTTCTTCTATGGATGAATATTGATGCACTGCAGGGGCATAG
TCTCTTAAAAAACTGTTTTTATTCTTTTAATAAATCGTTCATGTTTCAGTAC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL6233Contig1 580 2 1 U
GGACTTCTTCATTATTCTCTCAAACACAACTCCTCTCTCTCCCTCTCTCTAAATGGAGAA
AACTCTAGCAACTCCTGACAACACTAGATCTCTTTCAGTGTTGTGCTCAGCCGCCGTGAA
AACACGTTCCGGTGGTTTCGAGCGCAGAACCAAACGGAGATTGTCGCAGACGAAGGCAAG
CGTGCGTGTGTCCGGTGAAGAAGATGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAGGTAAAGGAGAA
GATTGAGGCGTTAAAGAGAATAATTCCAGGAGGAACGGCGCTTGGTGTGGACGAGCTATT
CGAAGAGACAGCTGGTTACATAATGTCTCTACAATGTCAGATCAAAAGCATTAAAGTCCT
CACTTCATTTCTCCAACGCTTAGATAAACAAGACATGAAGTTCGGAGGTTGAAGATGATG
ATGGCACCAAGATTGCTCTTCTTTATATTTAATTTAATTTTAGTTCTTCTTTTTCCTTTT
TAATATGGCTTTCAGCTTTGATATATGGGGAAAGAGATCTCAGCATTTTTTTTCTTCGAA
ATCTTTTTCTTTACCAAGACTTTAAAGTTATGGTTTATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AY34JQ C 1
AF RR2AY34TFB U 1
BS 1 580 RR2AY34TFB

RD RR2AY34JQ 580 0 0
GGACTTCTTCATTATTCTCTCAAACACAACTCCTCTCTCTCCCTCTCTCTAAATGGAGAA
AACTCTAGCAACTCCTGACAACACTAGATCTCTTTCAGTGTTGTGCTCAGCCGCCGTGAA
AACACGTTCCGGTGGTTTCGAGCGCAGAACCAAACGGAGATTGTCGCAGACGAAGGCAAG
CGTGCGTGTGTCCGGTGAAGAAGATGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAGGTAAAGGAGAA
GATTGAGGCGTTAAAGAGAATAATTCCAGGAGGAACGGCGCTTGGTGTGGACGAGCTATT
CGAAGAGACAGCTGGTTACATAATGTCTCTACAATGTCAGATCAAAAGCATTAAAGTCCT
CACTTCATTTCTCCAACGCTTAGATAAACAAGACATGAAGTTCGGAGGTTGAAGATGATG
ATGGCACCAAGATTGCTCTTCTTTATATTTAATTTAATTTTAGTTCTTCTTTTTCCTTTT
TAATATGGCTTTCAGCTTTGATATATGGGGAAAGAGATCTCAGCATTTTTTTTCTTCGAA
ATCTTTTTCTTTACCAAGACTTTAAAGTTATGGTTTATCC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2AY34TFB 580 0 0
GGACTTCTTCATTATTCTCTCAAACACAACTCCTCTCTCTCCCTCTCTCTAAATGGAGAA
AACTCTAGCAACTCCTGACAACACTAGATCTCTTTCAGTGTTGTGCTCAGCCGCCGTGAA
AACACGTTCCGGTGGTTTCGAGCGCAGAACCAAACGGAGATTGTCGCAGACGAAGGCAAG
CGTGCGTGTGTCCGGTGAAGAAGATGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAGGTAAAGGAGAA
GATTGAGGCGTTAAAGAGAATAATTCCAGGAGGAACGGCGCTTGGTGTGGACGAGCTATT
CGAAGAGACAGCTGGTTACATAATGTCTCTACAATGTCAGATCAAAAGCATTAAAGTCCT
CACTTCATTTCTCCAACGCTTAGATAAACAAGACATGAAGTTCGGAGGTTGAAGATGATG
ATGGCACCAAGATTGCTCTTCTTTATATTTAATTTAATTTTAGTTCTTCTTTTTCCTTTT
TAATATGGCTTTCAGCTTTGATATATGGGGAAAGAGATCTCAGCATTTTTTTTCTTCGAA
ATCTTTTTCTTTACCAAGACTTTAAAGTTATGGTTTATCC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6235Contig1 761 2 4 U
GGGAATTCAACCCATCTGAAAATGGAGGCTCAAAAGCAAGACAATGAACACATTTTCCGC
AGTCTATATCCATCTGTGCCTATTCCCGACAAGCTTACACTGCCTGAGTTTGTGCTACAA
GGAGTAGAAGAATTCACAGAGAAGGTGGCGTTCGTTGAAGCTGTGACCGGTAAAGCCGTC
ACGTACGGTGATGTAGTGAGGGACACAAAGAGGCTAGCCAAAGCGTTGACCTCAGTTGGA
CTAAGAAAAGGTCAGGTAATGGTTGTGGTTCTACCAAACGTGGCCGAGTATGGGATTATT
GCCCTTGGCATTATGTCCGCCGGTGGAGTTTTCTCCGGCGCTAATCCCACGGCTCTTGTC
TCGGAAATCAAGAAGCAAGTTGAAGCTTCTGGTGCTAGAGGAATCATCACTGATTCTACT
AACTTCGAAAAGGTTAAGAATTTGGGTCTACCGGTAATATTGTTAGGTGAAGAGAAGATC
GAAGGAGCAGTGAACTGGAAAGATATTCTAGAAGCAGGAGATAAATGTGGAGATAACAAC
AGAGTAGAGATTCTTCAGACAGATCTATGTGCACTTCCTTTCTCTTCAGGCACGACAGGG
TTACAAAAAGGAGTAATGCTCACGAATCGCAACCTCATAGCAAATCTTTGCTCTACTCTC
TTCAGCGTCCGGTCTGAAATGATCGGTGAGATCGTGACTCTTGGTTTGATTCCTTTCTTT
CATATTACGTATCGTTGGAATTTGTTGTGCTACATGAGATA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP11TF U 1
AF RR2GN16TF U 2
BS 1 60 RR2DP11TF
BS 61 61 RR2GN16TF
BS 62 587 RR2DP11TF
BS 588 761 RR2GN16TF

RD RR2DP11TF 593 0 0
GGGAATTCAACCCATCTGAAAATGGAGGCTCAAAAGCAAGACAATGAACACATTTTCCGC
GGTCTATATCCATCTGTGCCTATTCCCGACAAGCTTACACTGCCTGAGTTTGTGCTACAA
GGAGTAGAAGAATTCACAGAGAAGGTGGCGTTCGTTGAAGCTGTGACCGGTAAAGCCGTC
ACGTACGGTGATGTAGTGAGGGACACAAAGAGGCTAGCCAAAGCGTTGACCTCAGTTGGA
CTAAGAAAAGGTCAGGTAATGGTTGTGGTTCTACCAAACGTGGCCGAGTATGGGATTATT
GCCCTTGGCATTATGTCCGCCGGTGGAGTTTTCTCCGGCGCTAATCCCACGGCTCTTGTC
TCGGAAATCAAGAAGCAAGTTGAAGCTTCTGGTGCTAGAGGAATCATCACTGATTCTACT
AACTTCGAAAAGGTTAAGAATTTGGGTCTACCGGTAATATTGTTAGGTGAAGAGAAGATC
GAAGGAGCAGTGAACTGGAAAGATATTCTAGAAGCAGGAGATAAATGTGGAGATAACAAC
AGAGTAGAGATTCTTCAGACAGATCTATGTGCACTTCCTTTCTCTTC
GGCACG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2GN16TF 760 0 0
GGAATTCAACCCATCTGAAAATGGAGGCTCAAAAGCAAGACAATGAACACATTTTCCGCA
GTCTATATCCATCTGTGCCTATTCCCGACAAGCTTACACTGCCTGAGTTTGTGCTACAAG
GAGTAGAAGAATTCACAGAGAAGGTGGCGTTCGTTGAAGCTGTGACCGGTAAAGCCGTCA
TGTACGGTGATGTAGTGAGGGACACAAAGAGGCTAGCCAAAGCGTTGACCTCAGTTGGAC
TAAGAAAAGGTCAGGTAATGGTTGTGGTTCTACCAAACGTGGCCGAGTATGGGATTATTG
CCCTTGGCATTATGTCCGCCGGTGGAGTTTTCTCCGGCGCTAATCCCACGGCTCTTGTCT
CGGAAATCAAGAAGCAAGTTGAAGCTTCTGGTGCTAGAGGAATCATCACTGATTCTACTA
ACTTCGAAAAGGTTAAGAATTTGGGTCTACCGGTAATATTGTTAGGTGAAGAGAAGATCG
AAGGAGCAGTGAACTGGAAAGATATTCTAGAAGCAGGAGATAAATGTGGAGATAACAACA
GAGTAGAGATTCTTCAGACAGATCTATGTGCACTTCCTTTCTCTTCAGGCACGACAGGGT
TACAAAAAGGAGTAATGCTCACGAATCGCAACCTCATAGCAAATCTTTGCTCTACTCTCT
TCAGCGTCCGGTCTGAAATGATCGGTGAGATCGTGACTCTTGGTTTGATTCCTTTCTTTC
ATATTACGTATCGTTGGAATTTGTTGTGCTACATGAGATA

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL6236Contig1 898 2 2 U
GGGATTAAAAAAACACACACAAAAGAATGGCAGCTCTAGCATCAAACCCTCAGATGTTAA
CGAGACAAGGTCACAGTAATTACAAAAAGGAACAATTCTGGAGGAAAGAGAGTTTGAATA
CGGAGAAGAAGTGTGGGGTTTTCTGTGTGAAGGTTTACAATCATGAAAAGCTTGGGAGGT
CACAAGTAGAAAAGGAGTGGAGGTTAAAAGCTTTTTGGTCAAACGTGTCACAGCCTGAGA
CTGTGGAGATGGTACCCATTAATGACGTTGATGAGCTTGAAGCTGTTCTCTCCGACGCAC
GCAACCTCTCTCAGCCTATCATCATCGAATGGATGGCTTCTTGGTGTCGGAAATGTATTT
ACTTGAAGCCAAAGTTGGAGAAATTGGCAGCGGAATATAATAACCGAACAAAGTTTTATT
ACGTGGATGTGAACAAGGTCCCTCAAACTTTGGTGAAGCGTGGCAACATCTCGAAAATGC
CACCATTCAGGTATGCTTTCTTGTTTTACAAGTTGTTTTTAACGGTAAGGAACGTTATGA
ATGGAAAATGAAAGTACTAATGATAATATTTATGTAACTGAGAGAGAATTGAGTGGGTGC
AGTTGTGGAAGGAAGGGGAGATGCAAGAGGAAGTGATAGGAGGACACAAAGGATGGCTTG
TTATTGAAGAAGTCCGAGAATTGATCAACAAATATGTCTGATTCTCTTCTATTTTTTTTT
CTCTTCCTCATATTTTCTGTTAATTTGTACAGTAGCTTTTAAATTTTGCATTTTTGGTAT
TTGAGACATATAGAATGGAGAAAGAGAACTAAAATTGATAAGCTGTGTTTTCAGTTTTCA
ACAGTTTGTTTGCGAATAGATGACATACAAGACAGTAAGACGCATAAGATATTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E434TF U 1
AF RR2E434JQ C 117
BS 1 695 RR2E434TF
BS 696 898 RR2E434JQ

RD RR2E434TF 695 0 0
GGGATTAAAAAAACACACACAAAAGAATGGCAGCTCTAGCATCAAACCCTCAGATGTTAA
CGAGACAAGGTCACAGTAATTACAAAAAGGAACAATTCTGGAGGAAAGAGAGTTTGAATA
CGGAGAAGAAGTGTGGGGTTTTCTGTGTGAAGGTTTACAATCATGAAAAGCTTGGGAGGT
CACAAGTAGAAAAGGAGTGGAGGTTAAAAGCTTTTTGGTCAAACGTGTCACAGCCTGAGA
CTGTGGAGATGGTACCCATTAATGACGTTGATGAGCTTGAAGCTGTTCTCTCCGACGCAC
GCAACCTCTCTCAGCCTATCATCATCGAATGGATGGCTTCTTGGTGTCGGAAATGTATTT
ACTTGAAGCCAAAGTTGGAGAAATTGGCAGCGGAATATAATAACCGAACAAAGTTTTATT
ACGTGGATGTGAACAAGGTCCCTCAAACTTTGGTGAAGCGTGGCAACATCTCGAAAATGC
CACCATTCAGGTATGCTTTCTTGTTTTACAAGTTGTTTTTAACGGTAAGGAACGTTATGA
ATGGAAAATGAAAGTACTAATGATAATATTTATGTAACTGAGAGAGAATTGAGTGGGTGC
AGTTGTGGAAGGAAGGGGAGATGCAAGAGGAAGTGATAGGAGGACACAAAGGATGGCTTG
TTATTGAAGAAGTCCGAGAATTGATCAACAAATAT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2E434JQ 782 0 0
AATACGGAGAAGAAGTGTGGGGTTTTCTGTGTGAAGGTTTACAATCATGAAAAGCTTGGG
AGGTCACAAGTAGAAAAGGAGTGGAGGTTAAAAGCTTTTTGGTCAAACGTGTCACAGCCT
GAGACTGTGGAGATGGTACCCATTAATGACGTTGATGAGCTTGAAGCTGTTCTCTCCGAC
GCACGCAACCTCTCTCAGCCTATCATCATCGAATGGATGGCTTCTTGGTGTCGGAAATGT
ATTTACTTGAAGCCAAAGTTGGAGAAATTGGCAGCGGAATATAATAACCGAACAAAGTTT
TATTACGTGGATGTGAACAAGGTCCCTCAAACTTTGGTGAAGCGTGGCAACATCTCGAAA
ATGCCACCATTCAGGTATGCTTTCTTGTTTTACAAGTTGTTTTTAACGGTAAGGAACGTT
ATGAATGGAAAATGAAAGTACTAATGATAATATTTATGTAACTGAGAGAGAATTGAGTGG
GTGCAGTTGTGGAAGGAAGGGGAGATGCAAGAGGAAGTGATAGGAGGACACAAAGGATGG
CTTGTTATTGAAGAAGTCCGAGAATTGATCAACAAATATGTCTGATTCTCTTCTATTTTT
TTTTCTCTTCCTCATATTTTCTGTTAATTTGTACAGTAGCTTTTAAATTTTGCATTTTTG
GTATTTGAGACATATAGAATGGAGAAAGAGAACTAAAATTGATAAGCTGTGTTTTCAGTT
TTCAACAGTTTGTTTGCGAATAGATGACATACAAGACAGTAAGACGCATAAGATATTTAA
TC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL6237Contig1 1044 2 2 U
GGATACCGATGGCGATTATCTACGCGGTAGTGGCAAGGGGCACGGTGGTATTAGCAGAGT
TCAGCGCCGTAACGGGAAACACAGGCGCCGTGGTACGACGAATCCTCGAGAAGCTTTCGC
CGGAAACCGCAGACGAGATACTCTGTTTCTCCCAAGACCGTTACATCTTCCACATCCTCA
GATCCGATGGGCTCACCTTTCTCTGCATGGCCAACGATACCTTCGGAAGGAGGATCCCGT
TTTCGTATTTGGAAGACATTCACATGAGGTTCATGAAAAACTACGGGAGAGTGGCGCGTA
GTGCTCCAGCTTACGCGATGAATGACGAGTTCTCGAGGGTTCTGCATCAGCAGATGGAGT
TCTTCTCTAGTAATCAGAGTGTTGATACTCTCAATCGTGTGAGAGGAGAAGTCAGTGAGA
TTCGAGCGGTGATGGTGGAGAATATCGAGAAGATAATGGAGAGAGGTGATAGGATTGAGC
TTCTTGTTGATAAAACAGCAACGATGCAAGATAATGCGTTTCACTTTAGGAAACAATCTA
AGCGATTACGCCGAGCTCTCTGGATGAAAAACGCTAAGCTCTTAGTAATGTTGACGTGCT
TGATAGTTCTCGTGCTGTACATAATCATCGCGTCTTTCTGTGGTGGTATCACATTACCCT
CCTGCAGATCTTAATCTCAGAGGCCCTCTCCATTGAAAGGTAATGGTGCTTCAAAAACTT
TTGAACCGGATCAGACCACTGTTTTTTTTTGTAATCAACTCAGTCGAATCCTTTCAGTTT
TCGGTTTTGATTTTTTTGTCATGAAAATGGCAGTGAGTTTGAGGTTACATGGCATGGTCC
TCCTAGCTTATGTAACGCTCTAGTAAATGTCAAAATGATAGAGAGTTTCCTAAACATTGT
AGAGTGTTTGTCACTTGAGTGAGATTTTGTTCTCTGTATTTCCAAAACTGTGTCCGGTTT
GTCACGTACATATTAGTTGTTTATGTTTAACAGCATTTCTAGTTTTAGTGATTTCTTCTT
GTTCATCCTGTCTCTGTTTTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B302TF U 1
AF RR2B302JQ C 242
BS 1 772 RR2B302TF
BS 773 1044 RR2B302JQ

RD RR2B302TF 772 0 0
GGATACCGATGGCGATTATCTACGCGGTAGTGGCAAGGGGCACGGTGGTATTAGCAGAGT
TCAGCGCCGTAACGGGAAACACAGGCGCCGTGGTACGACGAATCCTCGAGAAGCTTTCGC
CGGAAACCGCAGACGAGATACTCTGTTTCTCCCAAGACCGTTACATCTTCCACATCCTCA
GATCCGATGGGCTCACCTTTCTCTGCATGGCCAACGATACCTTCGGAAGGAGGATCCCGT
TTTCGTATTTGGAAGACATTCACATGAGGTTCATGAAAAACTACGGGAGAGTGGCGCGTA
GTGCTCCAGCTTACGCGATGAATGACGAGTTCTCGAGGGTTCTGCATCAGCAGATGGAGT
TCTTCTCTAGTAATCAGAGTGTTGATACTCTCAATCGTGTGAGAGGAGAAGTCAGTGAGA
TTCGAGCGGTGATGGTGGAGAATATCGAGAAGATAATGGAGAGAGGTGATAGGATTGAGC
TTCTTGTTGATAAAACAGCAACGATGCAAGATAATGCGTTTCACTTTAGGAAACAATCTA
AGCGATTACGCCGAGCTCTCTGGATGAAAAACGCTAAGCTCTTAGTAATGTTGACGTGCT
TGATAGTTCTCGTGCTGTACATAATCATCGCGTCTTTCTGTGGTGGTATCACATTACCCT
CCTGCAGATCTTAATCTCAGAGGCCCTCTCCATTGAAAGGTAATGGTGCTTCAAAAACTT
TTGAACCGGATCAGACCACTGTTTTTTTTTGTAATCAACTCAGTCGAATCCT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2B302JQ 803 0 0
TTCGTATTTGGAAGACATTCACATGAGGTTCATGAAAAACTACGGGAGAGTGGCGCGTAG
TGCTCCAGCTTACGCGATGAATGACGAGTTCTCGAGGGTTCTGCATCAGCAGATGGAGTT
CTTCTCTAGTAATCAGAGTGTTGATACTCTCAATCGTGTGAGAGGAGAAGTCAGTGAGAT
TCGAGCGGTGATGGTGGAGAATATCGAGAAGATAATGGAGAGAGGTGATAGGATTGAGCT
TCTTGTTGATAAAACAGCAACGATGCAAGATAATGCGTTTCACTTTAGGAAACAATCTAA
GCGATTACGCCGAGCTCTCTGGATGAAAAACGCTAAGCTCTTAGTAATGTTGACGTGCTT
GATAGTTCTCGTGCTGTACATAATCATCGCGTCTTTCTGTGGTGGTATCACATTACCCTC
CTGCAGATCTTAATCTCAGAGGCCCTCTCCATTGAA*GGTAATGGTGCTTCAAAAACTTT
TGAACCGGATCAGACCACTGTTTTTTTTTGTAATCAACTCAGTCGAATCCTTTCAGTTTT
CGGTTTTGATTTTTTTGTCATGAAAATGGCAGTGAGTTTGAGGTTACATGGCATGGTCCT
CCTAGCTTATGTAACGCTCTAGTAAATGTCAAAATGATAGAGAGTTTCCTAAACATTGTA
GAGTGTTTGTCACTTGAGTGAGATTTTGTTCTCTGTATTTCCAAAACTGTGTCCGGTTTG
TCACGTACATATTAGTTGTTTATGTTTAACAGCATTTCTAGTTTTAGTGATTTCTTCTTG
TTCATCCTGTCTCTGTTTTCAGC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL6238Contig1 1275 2 2 U
GGGTTGCCAAAAAAACACAGAAAGCAAACAATTTTTTCAACAACCGTAACGTATGGAAAT
CGTTAACTCAGACATTTATTCTGAGTTTTCCCTACTTTAATCCACTCTTAATGCATCATG
ACTTCGATCTGCCTCTTCCTTTACCCTGTACCCTCCTGCAAGCCCATCTATAAATATCGG
CCCTCATTTCCATTCACAGCACATCTCAAACTATTTACTCAAATGATTTCCTAGCAGCAA
CAAATTCAGATGGCAATTTGAGAGCCGGCCAATGCTCTAATACTGCAGAAGTCCGCCTGT
TGAGGTTCTGGGAGGCGAGAAGTTGCTTGACGACGACGCTGTTCTTTAGGATGTCAGAGT
CCAGAACAAGTCTCAGGTTCATCTATGTCTTTTCACATGCATACAGATCGCATCTGTTCC
ATATGTGACGAAGAAGGGTCCGGACACTCGAAGAGGAAAAAGTATCATCTCTTTCGTTCA
CTCCACAGATTTGTTAGATAGTAGCGGTAGGTTGTCGACCAAACATAGGTATGTCGCTCA
ACACTTGAGCTAAAATTTGAAGTCACTAGATACATTTTAAAAGCGCTATGATTTTTAATT
TGTTTTTTTGGAAGTTAGTTCTGATTTGTTTCTGAAACTATGTCAAGATTCCCAGTGATG
AAAGTTTTAGTAATCTGTAACGGTGAGAAACTGGCGCTCCTTCTTCGGTTACTTACCATG
GAAGTTTTAGAGGAACCATTGATGTAGATTTTTGGCATCTTCTGAGGGTTTCTTCACTGG
TTCTTTTTTTAACTTTTTCTTTGAGATTCTGGACTAGACTTCCGTCTTCTCCATTTTATT
ATTATTATAGCTACTTTTGATCACTCTGTAATTATCATAGTTAATTTGATAACTCTGTAA
TGATGGTCCTAAGAGCAGTGTCGTCAACCATGGTGTATGTGATGCTAATAGTGATGTGGA
AGAGGTGAGGCCACTGAACCAAGTAACAGCTCTGATGATAGGAGGAACACAAGCGAGGTC
GCACCACGGAAGGAAGTTGTGTCCTTCGGAAAAGGCACTGACTGACTAATAATTACAGGT
CTGTTGCATTTGGAGTGTTGGTCACAACTAAGGAACCAAGAGCTTGAACTCAAGTGTCAG
ATAGATTAATTATCTTCATGACTTTTTGATGTAAATAAAGCATCTTCTCTGCTCTGAGGG
TATTATTTCTATGTTTGATCATTGATGTGCCTGAAATTTAACAACTTCGATTAAGTGTTT
ATTGATGGTCTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF34TF U 1
AF RR2FF34JQ C 613
BS 1 703 RR2FF34TF
BS 704 1275 RR2FF34JQ

RD RR2FF34TF 703 0 0
GGGTTGCCAAAAAAACACAGAAAGCAAACAATTTTTTCAACAACCGTAACGTATGGAAAT
CGTTAACTCAGACATTTATTCTGAGTTTTCCCTACTTTAATCCACTCTTAATGCATCATG
ACTTCGATCTGCCTCTTCCTTTACCCTGTACCCTCCTGCAAGCCCATCTATAAATATCGG
CCCTCATTTCCATTCACAGCACATCTCAAACTATTTACTCAAATGATTTCCTAGCAGCAA
CAAATTCAGATGGCAATTTGAGAGCCGGCCAATGCTCTAATACTGCAGAAGTCCGCCTGT
TGAGGTTCTGGGAGGCGAGAAGTTGCTTGACGACGACGCTGTTCTTTAGGATGTCAGAGT
CCAGAACAAGTCTCAGGTTCATCTATGTCTTTTCACATGCATACAGATCGCATCTGTTCC
ATATGTGACGAAGAAGGGTCCGGACACTCGAAGAGGAAAAAGTATCATCTCTTTCGTTCA
CTCCACAGATTTGTTAGATAGTAGCGGTAGGTTGTCGACCAAACATAGGTATGTCGCTCA
ACACTTGAGCTAAAATTTGAAGTCACTAGATACATTTTAAAAGCGCTATGATTTTTAATT
TGTTTTTTTGGAAGTTAGTTCTGATTTGTTTCTGAAACTATGTCAAGATTCCCAGTGATG
AAAGTTTTAGTAATCTGTAACGGTGAGAAACTGGCGCTCCTTC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2FF34JQ 663 0 0
AGTTAGTTCTGATTTGTTTCTGAAACTATGTCAAGATTCCCAGTGATGAAAGTTTTAGTA
ATCTGTAACGGTGAGAAACTGGCGCTCCTTCTTCGGTTACTTACCATGGAAGTTTTAGAG
GAACCATTGATGTAGATTTTTGGCATCTTCTGAGGGTTTCTTCACTGGTTCTTTTTTTAA
CTTTTTCTTTGAGATTCTGGACTAGACTTCCGTCTTCTCCATTTTATTATTATTATAGCT
ACTTTTGATCACTCTGTAATTATCATAGTTAATTTGATAACTCTGTAATGATGGTCCTAA
GAGCAGTGTCGTCAACCATGGTGTATGTGATGCTAATAGTGATGTGGAAGAGGTGAGGCC
ACTGAACCAAGTAACAGCTCTGATGATAGGAGGAACACAAGCGAGGTCGCACCACGGAAG
GAAGTTGTGTCCTTCGGAAAAGGCACTGACTGACTAATAATTACAGGTCTGTTGCATTTG
GAGTGTTGGTCACAACTAAGGAACCAAGAGCTTGAACTCAAGTGTCAGATAGATTAATTA
TCTTCATGACTTTTTGATGTAAATAAAGCATCTTCTCTGCTCTGAGGGTATTATTTCTAT
GTTTGATCATTGATGTGCCTGAAATTTAACAACTTCGATTAAGTGTTTATTGATGGTCTT
CTC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL6239Contig1 941 2 2 U
GGGTGCAAAGTCTCTCTGTCTCTCTGTATAATCTGAAGCTTTGTCGATGGCAGATTATCA
CTTCGTCTACAAGGACGTGGAAGGAACGTCGACGCAATGGGACGACATCCAACGGAAGCT
AGGGAATCTCCCGGAGAAGGCTCCGGCGTTCAAACCGCCGGCTTACACTCCGGCACATGA
CGAGGCTTCAGCTCCAAAGGACAAAGCTTGGTTCGATAAAAAAACAGAGGAGGAGCTTGA
GGATCTCGAGGACGACAAAGATCTCGACGACGATCGCTTCCTCGAAGAATACAGGAAGAA
GAGGTTGACTGAGCTGAGAGAAGCTGCTAAAGTTAGGAGGTATGGATCGGTGACTCCCAT
CTCTAGCTCTGATTTCGTGAGGGAGGTTACTCAAGCTTCTGCTGAGGTTTGGGTTGTTGT
GTGTCTCTACAAAGATGGTTTTGCGGAATGTGGATTGTTATTGGGTTGTCTAGAGGAACT
GGCTGGTAGATACCCTGGAACAAAGTTTGTTAAGATTGTATCAACTGATTGTATTCCCAA
CTACCCTGATTGCAATCTCCCTACCTTGCTGGTGTACCATCATGGTGCTGTTAAAGGAAC
TCATGTTGGCTTGAAGAGCGTTGGCCGTAGGTGCACCCCTGATAGTGTGGCCCTGGCTTT
GTGTCAATCAGAGCCAGTTCTCAACAATGGCAAAAGTGGAGACGATGACTCCTCAAGAGA
AGCTGTGATGGCTGGCGTTCGAAGACAGTTCATAGAACGAGTGGTCAAAGACCATGAAGA
CGAGGATAACGATGATGATGGTTACAATAGCGATTAAGTCTCCTAAAGCTTCTCCGTTTA
TTTCGGTTGGTTATGTTTGTTGCATCTGTGACTGGTAAACAAGAGTGCTGTCTCCATTTG
TGTTGTACTGCTTTTCCACAACTATTTCATTCTCAAATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF62TF U 1
AF RR2BF62JQ C 63
BS 1 626 RR2BF62TF
BS 627 941 RR2BF62JQ

RD RR2BF62TF 626 0 0
GGGTGCAAAGTCTCTCTGTCTCTCTGTATAATCTGAAGCTTTGTCGATGGCAGATTATCA
CTTCGTCTACAAGGACGTGGAAGGAACGTCGACGCAATGGGACGACATCCAACGGAAGCT
AGGGAATCTCCCGGAGAAGGCTCCGGCGTTCAAACCGCCGGCTTACACTCCGGCACATGA
CGAGGCTTCAGCTCCAAAGGACAAAGCTTGGTTCGATAAAAAAACAGAGGAGGAGCTTGA
GGATCTCGAGGACGACAAAGATCTCGACGACGATCGCTTCCTCGAAGAATACAGGAAGAA
GAGGTTGACTGAGCTGAGAGAAGCTGCTAAAGTTAGGAGGTATGGATCGGTGACTCCCAT
CTCTAGCTCTGATTTCGTGAGGGAGGTTACTCAAGCTTCTGCTGAGGTTTGGGTTGTTGT
GTGTCTCTACAAAGATGGTTTTGCGGAATGTGGATTGTTATTGGGTTGTCTAGAGGAACT
GGCTGGTAGATACCCTGGAACAAAGTTTGTTAAGATTGTATCAACTGATTGTATTCCCAA
CTACCCTGATTGCAATCTCCCTACCTTGCTGGTGTACCATCATGGTGCTGTTAAAGGAAC
TCATGTTGGCTTGAAGAGCGTTGGCC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2BF62JQ 879 0 0
TCGTCTACAAGGACGTGGAAGGAACGTCGACGCAATGGGACGACATCCAACGGAAGCTAG
GGAATCTCCCGGAGAAGGCTCCGGCGTTCAAACCGCCGGCTTACACTCCGGCACATGACG
AGGCTTCAGCTCCAAAGGACAAAGCTTGGTTCGATAAAAAAACAGAGGAGGAGCTTGAGG
ATCTCGAGGACGACAAAGATCTCGACGACGATCGCTTCCTCGAAGAATACAGGAAGAAGA
GGTTGACTGAGCTGAGAGAAGCTGCTAAAGTTAGGAGGTATGGATCGGTGACTCCCATCT
CTAGCTCTGATTTCGTGAGGGAGGTTACTCAAGCTTCTGCTGAGGTTTGGGTTGTTGTGT
GTCTCTACAAAGATGGTTTTGCGGAATGTGGATTGTTATTGGGTTGTCTAGAGGAACTGG
CTGGTAGATACCCTGGAACAAAGTTTGTTAAGATTGTATCAACTGATTGTATTCCCAACT
ACCCTGATTGCAATCTCCCTACCTTGCTGGTGTACCATCATGGTGCTGTTAAAGGAACTC
ATGTTGGCTTGAAGAGCGTTGGCCGTAGGTGCACCCCTGATAGTGTGGCCCTGGCTTTGT
GTCAATCAGAGCCAGTTCTCAACAATGGCAAAAGTGGAGACGATGACTCCTCAAGAGAAG
CTGTGATGGCTGGCGTTCGAAGACAGTTCATAGAACGAGTGGTCAAAGACCATGAAGACG
AGGATAACGATGATGATGGTTACAATAGCGATTAAGTCTCCTAAAGCTTCTCCGTTTATT
TCGGTTGGTTATGTTTGTTGCATCTGTGACTGGTAAACAAGAGTGCTGTCTCCATTTGTG
TTGTACTGCTTTTCCACAACTATTTCATTCTCAAATTAC

QA 1 879 1 879
DS 



AS 1 2

CO CL6240Contig1 710 2 1 U
GAATACACAATGAAAATGTTGATGTACACTGTTGTGTTTGTTCTTCTCTTCAATGGTTGC
ATGGCTAACAAAGTGGCTGATTCGCTGATTCAAAAATCTTGCAAAAACATTTCAGTTTCT
ATAATAGTGGAAACCATTCCACATTTCGAAAAGGATTGCATTGCATCTTTCAAAGAGAAT
CCGGAGAGCCAAAAAGCAAGAAATGTCGAAGATTTGATCATGTTCGGAGCGAATAACGCC
TTATCATACTTGATGAACGTGAAAGGAATTGTAGAGAAGATTATAAAAGAGAAGAAATAT
AAGAGTAGCCTTAGTAAGAAGTCGTTGGAAGATTGCCTTCAGCTTTATTCCAAGAGCGCT
CACATGTTAACCTCAGGTTTGAAATACCTCAAAAAGAGGAATTTTGAGAAGGCTCAATAT
GAAATTATTGATGCAGATGAAGCACCAATATTTTGCGAGTTGAAATTCAACGGCGACAAT
AAACAAATATCTCCCGTGAAAAAGGAGAATAATCTTCTCTTAACAATGATCTATGTTCCT
TATTGTTTACTTGATTTATAGTCTAGTGGGATGATAGGCCAGAATTTTAAAAGAGGTATT
AAAGTGATTTTTACTGAAAATTAAATATAAATAGTTCTCACTAATAATTTTATTTTGTGT
GTTAAATTCTTCTTTGTTTGAATAATGTAATCAAATTATATTTTCAGGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FK27JQ C 1
AF RR2FK27TF U 1
BS 1 710 RR2FK27TF

RD RR2FK27JQ 710 0 0
GAATACACAATGAAAATGTTGATGTACACTGTTGTGTTTGTTCTTCTCTTCAATGGTTGC
ATGGCTAACAAAGTGGCTGATTCGCTGATTCAAAAATCTTGCAAAAACATTTCAGTTTCT
ATAATAGTGGAAACCATTCCACATTTCGAAAAGGATTGCATTGCATCTTTCAAAGAGAAT
CCGGAGAGCCAAAAAGCAAGAAATGTCGAAGATTTGATCATGTTCGGAGCGAATAACGCC
TTATCATACTTGATGAACGTGAAAGGAATTGTAGAGAAGATTATAAAAGAGAAGAAATAT
AAGAGTAGCCTTAGTAAGAAGTCGTTGGAAGATTGCCTTCAGCTTTATTCCAAGAGCGCT
CACATGTTAACCTCAGGTTTGAAATACCTCAAAAAGAGGAATTTTGAGAAGGCTCAATAT
GAAATTATTGATGCAGATGAAGCACCAATATTTTGCGAGTTGAAATTCAACGGCGACAAT
AAACAAATATCTCCCGTGAAAAAGGAGAATAATCTTCTCTTAACAATGATCTATGTTCCT
TATTGTTTACTTGATTTATAGTCTAGTGGGATGATAGGCCAGAATTTTAAAAGAGGTATT
AAAGTGATTTTTACTGAAAATTAAATATAAATAGTTCTCACTAATAATTTTATTTTGTGT
GTTAAATTCTTCTTTGTTTGAATAATGTAATCAAATTATATTTTCAGGTC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2FK27TF 710 0 0
GAATACACAATGAAAATGTTGATGTACACTGTTGTGTTTGTTCTTCTCTTCAATGGTTGC
ATGGCTAACAAAGTGGCTGATTCGCTGATTCAAAAATCTTGCAAAAACATTTCAGTTTCT
ATAATAGTGGAAACCATTCCACATTTCGAAAAGGATTGCATTGCATCTTTCAAAGAGAAT
CCGGAGAGCCAAAAAGCAAGAAATGTCGAAGATTTGATCATGTTCGGAGCGAATAACGCC
TTATCATACTTGATGAACGTGAAAGGAATTGTAGAGAAGATTATAAAAGAGAAGAAATAT
AAGAGTAGCCTTAGTAAGAAGTCGTTGGAAGATTGCCTTCAGCTTTATTCCAAGAGCGCT
CACATGTTAACCTCAGGTTTGAAATACCTCAAAAAGAGGAATTTTGAGAAGGCTCAATAT
GAAATTATTGATGCAGATGAAGCACCAATATTTTGCGAGTTGAAATTCAACGGCGACAAT
AAACAAATATCTCCCGTGAAAAAGGAGAATAATCTTCTCTTAACAATGATCTATGTTCCT
TATTGTTTACTTGATTTATAGTCTAGTGGGATGATAGGCCAGAATTTTAAAAGAGGTATT
AAAGTGATTTTTACTGAAAATTAAATATAAATAGTTCTCACTAATAATTTTATTTTGTGT
GTTAAATTCTTCTTTGTTTGAATAATGTAATCAAATTATATTTTCAGGTC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL6241Contig1 668 2 2 U
GATTCATTCGATGCTTCTCGAATGAACATGACACATTTTGTAAACCATCTATCGTTTGGT
AGGATGATTTCAGATAGGTTGTTGACTGATATGAAACAGTTACTGCCTTATCTTGGTCTA
AGCCATGACAGGCTTAATGGAAAATGGTTCGTTAATGAAGGAAAGTTTGCTGCTAATGTT
ACTATAGAACATTATCTTCAAGTAGTCAAAACAGAAGTCGTTTCAAGAAGGTTCGGTCAA
GAACACTCAGTTATTGAGGAATATGAATATACAGCTCATAGCAGTGTGGCTCATGGTTAC
TATTACCCTGTTGCAAAGTTTCACTTCGACCTCTCTCCTATGCAGGTCATGATAAGCGAG
AACCCAAAGTCATTCTCACACTTCCTTACAAATGTTTGCGCCATAATAGGTGGTGTTTTC
ACGGTTGCCGGGATACTAGATTTGATATTTCAAAGCACTTACGGAATAATGAAAAAGGTC
GAACTAGGGAAGAACTTTTGAAAGGGAGGAGCGAGTGATTATTACAAGTTGAATTTTTCA
GTTTTATTTTTATGATCTACAAAACCATAGAAGAAGAACTCGGTTCTTAAATAATTTGTA
GACTCTGTTTGTTTTGGAATAAAAGTTCCAAAGAGAAGATAAATAATAGCATCTTGATGA
TTCTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP34TF U 1
AF RR2DP34JQ C 42
BS 1 621 RR2DP34TF
BS 622 668 RR2DP34JQ

RD RR2DP34TF 621 0 0
GATTCATTCGATGCTTCTCGAATGAACATGACACATTTTGTAAACCATCTATCGTTTGGT
AGGATGATTTCAGATAGGTTGTTGACTGATATGAAACAGTTACTGCCTTATCTTGGTCTA
AGCCATGACAGGCTTAATGGAAAATGGTTCGTTAATGAAGGAAAGTTTGCTGCTAATGTT
ACTATAGAACATTATCTTCAAGTAGTCAAAACAGAAGTCGTTTCAAGAAGGTTCGGTCAA
GAACACTCAGTTATTGAGGAATATGAATATACAGCTCATAGCAGTGTGGCTCATGGTTAC
TATTACCCTGTTGCAAAGTTTCACTTCGACCTCTCTCCTATGCAGGTCATGATAAGCGAG
AACCCAAAGTCATTCTCACACTTCCTTACAAATGTTTGCGCCATAATAGGTGGTGTTTTC
ACGGTTGCCGGGATACTAGATTTGATATTTCAAAGCACTTACGGAATAATGAAAAAGGTC
GAACTAGGGAAGAACTTTTGAAAGGGAGGAGCGAGTGATTATTACAAGTTGAATTTTTCA
GTTTTATTTTTATGATCTACAAAACCATAGAAGAAGAACTCGGTTCTTAAATAATTTGTA
GACTCTGTTTGTTTTGGAATA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2DP34JQ 627 0 0
AAACCATCTATCGTTTGGTAGGATGATTTCAGATAGGTTGTTGACTGATATGAAACAGTT
ACTGCCTTATCTTGGTCTAAGCCATGACAGGCTTAATGGAAAATGGTTCGTTAATGAAGG
AAAGTTTGCTGCTAATGTTACTATAGAACATTATCTTCAAGTAGTCAAAACAGAAGTCGT
TTCAAGAAGGTTCGGTCAAGAACACTCAGTTATTGAGGAATATGAATATACAGCTCATAG
CAGTGTGGCTCATGGTTACTATTACCCTGTTGCAAAGTTTCACTTCGACCTCTCTCCTAT
GCAGGTCATGATAAGCGAGAACCCAAAGTCATTCTCACACTTCCTTACAAATGTTTGCGC
CATAATAGGTGGTGTTTTCACGGTTGCCGGGATACTAGATTTGATATTTCAAAGCACTTA
CGGAATAATGAAAAAGGTCGAACTAGGGAAGAACTTTTGAAAGGGAGGAGCGAGTGATTA
TTACAAGTTGAATTTTTCAGTTTTATTTTTATGATCTACAAAACCATAGAAGAAGAACTC
GGTTCTTAAATAATTTGTAGACTCTGTTTGTTTTGGAATAAAAGTTCCAAAGAGAAGATA
AATAATAGCATCTTGATGATTCTTGAC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL6242Contig1 870 2 2 U
AATGGTTTAAAGGGATGAAGAGTTTTGATTTGCATAAGCTTATATTATGGCGCAGTGCAT
AGACGGTTTCAAGCATTTATGCACCTCTGTTTTAGGGTGTTTTGATCTTGATTTGTATAA
ACAACCTGGTGGCCTTGGTGACCCTGAATTGCTTGCCAGAGACACTGTTTTTAGTGTGAG
TGAAATAGAAGCTCTTTATGAGCTGTTTAAGAAAATCAGCAGTACTGTGATTGACGATGG
ACTAATCAACAAGGAATAGTTTCAGTTGGCTTTGTTTAAGACAAATAAAAAAGAGAGCTT
GTTCGCAGATCGGGTTTTTGATTTGTTTGATACAAAGCACAATGGGATACTAGGGTTTGA
GGAGTTTGCTCGTGCTCTCTCTGTTTTTCACCCAAATGCGCCTATAGATGACAAAATCCA
CTTTTCATTTCAGCTATATGATCTTAAACAGCAAGGGTTCATCGAACGTGAAGAGCTGAA
ACAAATGGTTGTGGCTACGCTTGCTGAATCCGGAATGAACTTGATGGATACTGTCATTGA
GGATATCATCGACAAGACGTTTGAAGAAGCAGACACAAAACACGATGGAAAGATTGACTG
GGAGGAGTGGAGAAGCCTTGTTCTTAGACATCCCAGCCTCCTCAAGAACATGACTCTTCA
GTATCTCAAGGATATCACGACTACGTTTCCAAGCTTTGTGTTCCACTCTCAAGTTGAAGA
TACCTGATGATGAGAAAAAAATAACAGCAAGAGTTTATGGTTTATTTTTGGTCATCTGTT
TCGTTGATGTTTTCTTTTATTGTGAAGCAAAATACAAAATTCATTTGTTTTTATCGAGCT
ATTTCTGTGAAGCAAAGTTCTTTTCGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT48TF U 1
AF RR2GT48JQB C 384
BS 1 737 RR2GT48TF
BS 738 870 RR2GT48JQB

RD RR2GT48TF 737 0 0
AATGGTTTAAAGGGATGAAGAGTTTTGATTTGCATAAGCTTATATTATGGCGCAGTGCAT
AGACGGTTTCAAGCATTTATGCACCTCTGTTTTAGGGTGTTTTGATCTTGATTTGTATAA
ACAACCTGGTGGCCTTGGTGACCCTGAATTGCTTGCCAGAGACACTGTTTTTAGTGTGAG
TGAAATAGAAGCTCTTTATGAGCTGTTTAAGAAAATCAGCAGTACTGTGATTGACGATGG
ACTAATCAACAAGGAATAGTTTCAGTTGGCTTTGTTTAAGACAAATAAAAAAGAGAGCTT
GTTCGCAGATCGGGTTTTTGATTTGTTTGATACAAAGCACAATGGGATACTAGGGTTTGA
GGAGTTTGCTCGTGCTCTCTCTGTTTTTCACCCAAATGCGCCTATAGATGACAAAATCCA
CTTTTCATTTCAGCTATATGATCTTAAACAGCAAGGGTTCATCGAACGTGAAGAGCTGAA
ACAAATGGTTGTGGCTACGCTTGCTGAATCCGGAATGAACTTGATGGATACTGTCATTGA
GGATATCATCGACAAGACGTTTGAAGAAGCAGACACAAAACACGATGGAAAGATTGACTG
GGAGGAGTGGAGAAGCCTTGTTCTTAGACATCCCAGCCTCCTCAAGAACATGACTCTTCA
GTATCTCAAGGATATCACGACTACGTTTCCAAGCTTTGTGTTCCACTCTCAAGTTGAAGA
TACCTGATGATGAGAAA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2GT48JQB 487 0 0
TTTTTCACCCAAATGCGCCTATAGATGACAAAATCCACTTTTCATTTCAGCTATATGATC
TTAAACAGCAAGGGTTCATCGAACGTGAAGAGCTGAAACAAATGGTTGTGGCTACGCTTG
CTGAATCCGGAATGAACTTGATGGATACTGTCATTGAGGATATCATCGACAAGACGTTTG
AAGAAGCAGACACAAAACACGATGGAAAGATTGACTGGGAGGAGTGGAGAAGCCTTGTTC
TTAGACATCCCAGCCTCCTCAAGAACATGACTCTTCAGTATCTCAAGGATATCACGACTA
CGTTTCCAAGCTTTGTGTTCCACTCTCAAGTTGAAGATACCTGATGATGAGAAAAAAATA
ACAGCAAGAGTTTATGGTTTATTTTTGGTCATCTGTTTCGTTGATGTTTTCTTTTATTGT
GAAGCAAAATACAAAATTCATTTGTTTTTATCGAGCTATTTCTGTGAAGCAAAGTTCTTT
TCGATCC

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL6243Contig1 581 2 1 U
TTCCGGTCTCGAGGACTGAAGAAAAACCATTCTAGGTCTTTACTTGGGAGCAAGGACTTC
CCTGCAAATTTTACAAATCATATTAAGGGAACATATATGGTTTCAAAAAAAATATTAAGG
GAACATATGAATTAGGTCTATTCAACAATAACTTTGAATACACTTAGGTTCTTAACATGA
GAATCCAAAAGACTAAATAAAAGACAAAAATAGAATATTTTTTATAAAACAAAAGTTGAG
GGTGAATGAGAAGCTTCCGAAACCCTAAAGCACATCCGAAATCTTAGTTGTGTTACTTTT
TTTCTTTCCTTTTTTGTATCTTCTCCCCTTTTTGACTCAGTCTTCCAAATTTGTCTCACT
ATCTCTCGGTAATTTCATTACAATCCTCTTAAAGAATAAAGGTGAGGGTGGGTCCATTTA
AATTTTATTCCAAGATAAAGTAGGCATTGTTTTTTCTTCATAAACTATAAAGTAGGCATT
TTTTATTATTTTTAGTTAATAAAGCATTCAAGTTCGATGCGTGTCTGGAGATACATAACT
TGGTACGTAAACAATTTTTTAAAACTAGAAACTAGTGTTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BO60JQ C 1
AF RR2BO60TF U 1
BS 1 581 RR2BO60TF

RD RR2BO60JQ 581 0 0
TTCCGGTCTCGAGGACTGAAGAAAAACCATTCTAGGTCTTTACTTGGGAGCAAGGACTTC
CCTGCAAATTTTACAAATCATATTAAGGGAACATATATGGTTTCAAAAAAAATATTAAGG
GAACATATGAATTAGGTCTATTCAACAATAACTTTGAATACACTTAGGTTCTTAACATGA
GAATCCAAAAGACTAAATAAAAGACAAAAATAGAATATTTTTTATAAAACAAAAGTTGAG
GGTGAATGAGAAGCTTCCGAAACCCTAAAGCACATCCGAAATCTTAGTTGTGTTACTTTT
TTTCTTTCCTTTTTTGTATCTTCTCCCCTTTTTGACTCAGTCTTCCAAATTTGTCTCACT
ATCTCTCGGTAATTTCATTACAATCCTCTTAAAGAATAAAGGTGAGGGTGGGTCCATTTA
AATTTTATTCCAAGATAAAGTAGGCATTGTTTTTTCTTCATAAACTATAAAGTAGGCATT
TTTTATTATTTTTAGTTAATAAAGCATTCAAGTTCGATGCGTGTCTGGAGATACATAACT
TGGTACGTAAACAATTTTTTAAAACTAGAAACTAGTGTTGG

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2BO60TF 581 0 0
TTCCGGTCTCGAGGACTGAAGAAAAACCATTCTAGGTCTTTACTTGGGAGCAAGGACTTC
CCTGCAAATTTTACAAATCATATTAAGGGAACATATATGGTTTCAAAAAAAATATTAAGG
GAACATATGAATTAGGTCTATTCAACAATAACTTTGAATACACTTAGGTTCTTAACATGA
GAATCCAAAAGACTAAATAAAAGACAAAAATAGAATATTTTTTATAAAACAAAAGTTGAG
GGTGAATGAGAAGCTTCCGAAACCCTAAAGCACATCCGAAATCTTAGTTGTGTTACTTTT
TTTCTTTCCTTTTTTGTATCTTCTCCCCTTTTTGACTCAGTCTTCCAAATTTGTCTCACT
ATCTCTCGGTAATTTCATTACAATCCTCTTAAAGAATAAAGGTGAGGGTGGGTCCATTTA
AATTTTATTCCAAGATAAAGTAGGCATTGTTTTTTCTTCATAAACTATAAAGTAGGCATT
TTTTATTATTTTTAGTTAATAAAGCATTCAAGTTCGATGCGTGTCTGGAGATACATAACT
TGGTACGTAAACAATTTTTTAAAACTAGAAACTAGTGTTGG

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL6244Contig1 886 2 2 U
GACAAGCGTGAGGGTCCTTGATCATAGCAATCAGCTCCTTGCAATATGTACCGAAGCTCT
GGCATGTCGAATGTTGAAGCATATTCTCCATCGGCCATCACAGTGCTTCTACTTCCGAAT
GCAACACTGATTCTCGTCTAGGTATATTTCATGTTCCCATGAGTTGAAGATTCTCACTAC
TGTCCATCCAGACCCATCCACAGCCACTAAATTGATCATGGCCTGTCCATGATCCATCTA
TTAAGCAGATATTACCCAAGCTTAAGACTTGGGATTCCTCGTCATTGTTCCCTTGTATCA
CTGATGGCACCACCTCGTTTGCAGCAAACCAAGCCTGACATTCACTCTCAACATATCTTA
CTAGCTCCAGTGGATCCCTATCTATTCCCCTAAAGAGTTTATCATTTCGAACCTTCCAAA
TATACCAAATTATCCAGAGATATGGATTTCTGTCTTGTTCAGGTTCAATTATGTTGTTCT
TCATCCATAATAGGTAGTCCATGTTCGCATAGATGCTTGGTACTGGAAAAATATCTTGAC
TCGTTGGAGTTGATGATAATGTCCAAACTTGTAAAGCAGACGGACATTCAAAAATAGTAT
AGGTTACAGATTCCTCTGGTTCACCTCACCTTGGGTAGTAGTTATCACATCTCATATGAT
ATGATACTTATGTGTTTCTATGGACTTGCAAAAGATTTGATGTAAAAAAGGCATTATCGA
TGTTTTCTACCGCTCTACTCAGCTAATTTTGTAAAGTTACTTTTTTTAATTGGTCAACCA
TAATTTTCGACCCAAAATTCTCTTCTTACCAGAATATTAGTTGGCTTATATTTGTGTTTA
AATTTGGATAATGAAAGAAATAAAAGTCTATATATGTGATCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C874TF U 1
AF RR2C874JQ C 104
BS 1 526 RR2C874TF
BS 527 886 RR2C874JQ

RD RR2C874TF 526 0 0
GACAAGCGTGAGGGTCCTTGATCATAGCAATCAGCTCCTTGCAATATGTACCGAAGCTCT
GGCATGTCGAATGTTGAAGCATATTCTCCATCGGCCATCACAGTGCTTCTACTTCCGAAT
GCAACACTGATTCTCGTCTAGGTATATTTCATGTTCCCATGAGTTGAAGATTCTCACTAC
TGTCCATCCAGACCCATCCACAGCCACTAAATTGATCATGGCCTGTCCATGATCCATCTA
TTAAGCAGATATTACCCAAGCTTAAGACTTGGGATTCCTCGTCATTGTTCCCTTGTATCA
CTGATGGCACCACCTCGTTTGCAGCAAACCAAGCCTGACATTCACTCTCAACATATCTTA
CTAGCTCCAGTGGATCCCTATCTATTCCCCTAAAGAGTTTATCATTTCGAACCTTCCAAA
TATACCAAATTATCCAGAGATATGGATTTCTGTCTTGTTCAGGTTCAATTATGTTGTTCT
TCATCCATAATAGGTAGTCCATGTTCGCATAGATGCTTGGTACTGG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2C874JQ 783 0 0
AGTGCTCTAC
TCCGAATGCA*CACTGATTCTCGTCTAGGTATATTTCATGTTCCCATGAGTTGAAGAT*C
TCACTACTGTCCATCCAGACCCATCCACAGCCACTAAATTGATCATGGCCTGTCCATGAT
CCATCTATTAAGCAGATATTACCCAAGCTTAAGACTTGGGATTCCTCGTCATTGTTCCCT
TGTATCACTGATGGCACCACCTCGTTTGCAGCAAACCAAGCCTGACATTCACTCTCAACA
TATCTTACTAGCTCCAGTGGATCCCTATCTATTCCCCTAAAGAGTTTATCATTTCGAACC
TTCCAAATATACCAAATTATCCAGAGATATGGATTTCTGTCTTGTTCAGGTTCAATTATG
TTGTTCTTCATCCATAATAGGTAGTCCATGTTCGCATAGATGCTTGGTACTGGAAAAATA
TCTTGACTCGTTGGAGTTGATGATAATGTCCAAACTTGTAAAGCAGACGGACATTCAAAA
ATAGTATAGGTTACAGATTCCTCTGGTTCACCTCACCTTGGGTAGTAGTTATCACATCTC
ATATGATATGATACTTATGTGTTTCTATGGACTTGCAAAAGATTTGATGTAAAAAAGGCA
TTATCGATGTTTTCTACCGCTCTACTCAGCTAATTTTGTAAAGTTACTTTTTTTAATTGG
TCAACCATAATTTTCGACCCAAAATTCTCTTCTTACCAGAATATTAGTTGGCTTATATTT
GTGTTTAAATTTGGATAATGAAAGAAATAAAAGTCTATATATGTGATCAAAAA

QA 11 783 11 783
DS 



AS 1 2

CO CL6245Contig1 736 2 19 U
GGAAATCGTTTCTTCCCTTTGTTTGAACCAGACCTACCTCCAAGAAGAAAAAGAACAAAA
TCTACTCTGTTTGCTCCTCTGTGAAACAGAAAAGTCAACAACACTGAGTCTTAGACCACA
TCAGAGAAATGGCTGGAGGGTTCGTCAGTCAAACGCCGGGAGTTCGAAACTATAACTACA
AACTAACACCAAAAGTATTTGTAACATGTTTCATCGGTGCTTTCGGTGGTCTCATCTTCG
GATACGATCTCGGGATCTCAGGAGGGGTAACCTCAATGGATCCGTTCTTGGAAAAGTTTT
TCCCTTACGTGTACCAGAAGAGGAAGAACGCACACGAGAACGAGTATTGTCGTTTCGATA
ATGAGCTTCTCACTCTCTTCACTTCGTCTCTCTATTTAGCGGCTCTGGTCTCTTCCTTAT
TCGCCTCCACGATAACCCGAATTTTCGGAAGGAAATGGTCTATGTTCCTCGGCGGTTTCA
CCTTCTTCGTCGGCTCTGCTTTCAACGGCTTTGCCCAAAACATAGCCATGCTTCTCATCG
GTCGTATTCTACTCGGTTTCGGTGTCGGATTTGCCAATCAATCTGTTCCGGTTTACCTGT
CGGAAATGGCACCTCCGAATCTTAGAGGAGCGTTCAACAATGGATTCCAAGTAGCAATCA
TATTTGGTATTGTTGTTGCAACGATCATCAACTACTTCACTGCACAGATGAAAGGGAACA
TTGGATGGAGATCTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F218TF U 1
AF RR2HB71TF U 1
BS 1 59 RR2F218TF
BS 60 60 RR2HB71TF
BS 61 119 RR2F218TF
BS 120 120 RR2HB71TF
BS 121 190 RR2F218TF
BS 191 191 RR2HB71TF
BS 192 196 RR2F218TF
BS 197 197 RR2HB71TF
BS 198 404 RR2F218TF
BS 405 405 RR2HB71TF
BS 406 502 RR2F218TF
BS 503 503 RR2HB71TF
BS 504 514 RR2F218TF
BS 515 515 RR2HB71TF
BS 516 559 RR2F218TF
BS 560 560 RR2HB71TF
BS 561 691 RR2F218TF
BS 692 692 RR2HB71TF
BS 693 736 RR2F218TF

RD RR2F218TF 736 0 0
GGAAATCGTTTCTTCCCTTTGTTTGAACCAGACCTACCTCCAAGAAGAAAAAGAACAAA*
TCTACTCTGTTTGCTCCTCTGTGAAACAGAAAAGTCAACAACACTGAGTCTTAGACCACG
TCAGAGAAATGGCTGGAGGGTTCGTCAGTCAAACGCCGGGAGTTCGAAACTATAACTACA
AACTAACACCGAAAGTGTTTGTAACATGTTTCATCGGTGCTTTCGGTGGTCTCATCTTCG
GATACGATCTCGGGATCTCAGGAGGGGTAACCTCAATGGATCCGTTCTTGGAAAAGTTTT
TCCCTTACGTGTACCAGAAGAGGAAGAACGCACACGAGAACGAGTATTGTCGTTTCGATA
ATGAGCTTCTCACTCTCTTCACTTCGTCTCTCTATTTAGCGGCTTTGGTCTCTTCCTTAT
TCGCCTCCACGATAACCCGAATTTTCGGAAGGAAATGGTCTATGTTCCTCGGCGGTTTCA
CCTTCTTCGTCGGCTCTGCTTTTAACGGCTTTGCTCAAAACATAGCCATGCTTCTCATCG
GTCGTATTCTACTCGGTTTTGGTGTCGGATTTGCCAATCAATCTGTTCCGGTTTACCTGT
CGGAAATGGCACCTCCGAATCTTAGAGGAGCGTTCAACAATGGATTCCAAGTAGCAATCA
TATTTGGTATTGTTGTTGCAACGATCATCAATTACTTCACTGCACAGATGAAAGGGAACA
TTGGATGGAGATCTCT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2HB71TF 723 0 0
GGAAATCGTTTCTTTCCTTTGTTTGAACCAGACCTACCTCCAAGAAGAAAAAGAACAAAA
TCTACTCTGTTTGCTCCTCTGTGAAACAGAAAAGTCAACAACACTGAGTCTTAGACCACA
TCAGAGAAATGGCTGGAGGGTTCGTCAGTCAAACGCCGGGAGTTCGAAACTATAACTACA
AACTGACACCAAAAGTATTTGTGACATGTTTCATCGGTGCTTTTGGTGGTCTCATCTTCG
GATACGATCTCGGGATCTCAGGAGGGGTAACCTCAATGGATCCGTTCTTGGAAAAGTTTT
TCCCTTACGTGTACCAGAAGAGGAAGAACGCACACGAGAACGAGTATTGTCGTTTCGATA
GTGAGCTTCTCACTCTCTTCACTTCGTCTCTCTATTTAGCGGCTCTGGTCTCTTCCTTAT
TCGCCTCCACGATAACCCGAATTTTCGGAAGGAAATGGTCTATGTTCCTCGGTGGTTTCA
CCTTCTTCGTTGGCTCTGCTTTCAACGGCTTTGCCCAAAACATAGCCATGCTTCTCATCG
GTCGTATTCTACTCGGTTTCGGTGTTGGATTTGCTAATCAGTCTGTTCCGGTTTACCTGT
CGGAAATGGCACCTCCGAATCTTAGAGGAGCGTTCAACAATGGATTTCAAGTAGCAATCA
TATTTG*TATTGTTGTTGCAACGATCATCAACTACTTCACTGCACAGATGAAAGGGAACA
TTG

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL6246Contig1 638 2 1 U
GGAAGCAGAAGAGTATGATAACAAGTTTGACAATGTCCACATAAGCATTAAAGGTAAGAG
AAGAGACAATGGTGATGGACTGTTCCTGAGACTCAGAATCGCCGAGAAGGAAGGGCTTGT
GAGAAACATATACTTCCCGTTTGACATAGAAAGCGACACAGCAATTAGCGTTGCAAGAGA
GATGGTGGAAGAGCTGGAGATGGACGACCGTGATGTGACAAAGATAGCCAACATGATCGA
TGGAGAGGCTCTACTGTGAGATACATCTCCTCAAAACACTAAAACACAAGAGCAGCTTTT
GCAGCTGCGCCTCGAACCGCTCAGACATAGACTTCAACGTGAGGCAGTGTTGTAGAAACA
TTTGTGGAGAGAAGCATGGACGGTTTGAGGAGATCACTTCGGGAGTAAACAACTCTGACG
AAGAAGAGTTGTTTTCTTCTATGTCAAGTAACTAACTACAACATACGTGTATGTTGTTAA
TAACGAGCTTTGGGAAAAGCTTTACTCCCATGGAAAAATGACATTTTCGCTGTCTTTTGT
TAATATGTGTAGAATTATTTTGCAGTAATGCTGACAAACCAAAAATATCACAGTAGTTAT
TTAACTATAGCTCATTAAACCCGTGATGGTCTTAAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GF79JQ C 1
AF RR2GF79TF U 1
BS 1 638 RR2GF79TF

RD RR2GF79JQ 638 0 0
GGAAGCAGAAGAGTATGATAACAAGTTTGACAATGTCCACATAAGCATTAAAGGTAAGAG
AAGAGACAATGGTGATGGACTGTTCCTGAGACTCAGAATCGCCGAGAAGGAAGGGCTTGT
GAGAAACATATACTTCCCGTTTGACATAGAAAGCGACACAGCAATTAGCGTTGCAAGAGA
GATGGTGGAAGAGCTGGAGATGGACGACCGTGATGTGACAAAGATAGCCAACATGATCGA
TGGAGAGGCTCTACTGTGAGATACATCTCCTCAAAACACTAAAACACAAGAGCAGCTTTT
GCAGCTGCGCCTCGAACCGCTCAGACATAGACTTCAACGTGAGGCAGTGTTGTAGAAACA
TTTGTGGAGAGAAGCATGGACGGTTTGAGGAGATCACTTCGGGAGTAAACAACTCTGACG
AAGAAGAGTTGTTTTCTTCTATGTCAAGTAACTAACTACAACATACGTGTATGTTGTTAA
TAACGAGCTTTGGGAAAAGCTTTACTCCCATGGAAAAATGACATTTTCGCTGTCTTTTGT
TAATATGTGTAGAATTATTTTGCAGTAATGCTGACAAACCAAAAATATCACAGTAGTTAT
TTAACTATAGCTCATTAAACCCGTGATGGTCTTAAACT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2GF79TF 638 0 0
GGAAGCAGAAGAGTATGATAACAAGTTTGACAATGTCCACATAAGCATTAAAGGTAAGAG
AAGAGACAATGGTGATGGACTGTTCCTGAGACTCAGAATCGCCGAGAAGGAAGGGCTTGT
GAGAAACATATACTTCCCGTTTGACATAGAAAGCGACACAGCAATTAGCGTTGCAAGAGA
GATGGTGGAAGAGCTGGAGATGGACGACCGTGATGTGACAAAGATAGCCAACATGATCGA
TGGAGAGGCTCTACTGTGAGATACATCTCCTCAAAACACTAAAACACAAGAGCAGCTTTT
GCAGCTGCGCCTCGAACCGCTCAGACATAGACTTCAACGTGAGGCAGTGTTGTAGAAACA
TTTGTGGAGAGAAGCATGGACGGTTTGAGGAGATCACTTCGGGAGTAAACAACTCTGACG
AAGAAGAGTTGTTTTCTTCTATGTCAAGTAACTAACTACAACATACGTGTATGTTGTTAA
TAACGAGCTTTGGGAAAAGCTTTACTCCCATGGAAAAATGACATTTTCGCTGTCTTTTGT
TAATATGTGTAGAATTATTTTGCAGTAATGCTGACAAACCAAAAATATCACAGTAGTTAT
TTAACTATAGCTCATTAAACCCGTGATGGTCTTAAACT

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL6247Contig1 961 2 2 U
GGATGGAAACACAACTCTCAAACGCGGACACTGATTCCCTCCAGCAACTCCTAAATTTGA
GCCTCGGAGCTAAAGACAGCACCACCAAAATCTTCGTCAACGGATCACGATCCGCAAACT
CCACCAATCCACAGTACCAGCCTTTGGACATCGAGTTCGTGGAGAAGATCTTGAACTACA
AGTTCAAAGACGAGAGTTTGCTGCTGCAAGCATTCACAGACGCTACTTTCGATGAAAACT
GCGTTTCGTATGAACGCCTTGAGTTCTTAGGAGACACAGTCTTAAATATGGTTATAACCA
AATATTTGTATAGTCGCTACGGTGATTGTTCCCCAGGTTTGTTGACCAATCTCCGAGCGG
TCAACGTTGATACAGAGAAACTTGCTCGAGTCGCCGTAAAACACAACCTCCATCGCTGTC
TCCGTCATAAAAAACCCTTGCTTGAGGACCAAATTTTGGAATTTAGAAAAGCAATGGAAA
AATATCCATTACATTCGCGTGGTCTATTGAAAGTCCCTAAATCTCTAGCAGACATAGTAG
AGTCTACCATTGGAGCTCTATACACCGACTGTGACTCCTTCGAGACCGTGTGGAAGGTGG
TAATGCCCTTGTTGGAGCCGATAATATCTTTAGATAAACTGGAGAACCATCCAATGACAG
AACTCCATGAGATGTGTCAGAAGAAGAACTTGAAATTGAGGCTCGACGACAATACTTGGG
AAGTTGACAAAGGGTTCTTGTCTTTATTGAGGAACATCTGGTTGGACGTGGACATCATCT
AGTCAAGAAAGACAGTGCTAAAAATTGCGCTGCAAAAGATGCTCTCGACAATTTTTCCTA
TTTCTTCACGAAGATGTAAATATGATATATTAAATTTGTATGAATTCTCTTGAAAAGATT
GTATTGTTTCTTTCTATTTGAATCAACATGAATAAAATTGGGCTACTAGCCCACCATGCC
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BP19TF U 1
AF RR2BP19JQ C 142
BS 1 581 RR2BP19TF
BS 582 961 RR2BP19JQ

RD RR2BP19TF 581 0 0
GGATGGAAACACAACTCTCAAACGCGGACACTGATTCCCTCCAGCAACTCCTAAATTTGA
GCCTCGGAGCTAAAGACAGCACCACCAAAATCTTCGTCAACGGATCACGATCCGCAAACT
CCACCAATCCACAGTACCAGCCTTTGGACATCGAGTTCGTGGAGAAGATCTTGAACTACA
AGTTCAAAGACGAGAGTTTGCTGCTGCAAGCATTCACAGACGCTACTTTCGATGAAAACT
GCGTTTCGTATGAACGCCTTGAGTTCTTAGGAGACACAGTCTTAAATATGGTTATAACCA
AATATTTGTATAGTCGCTACGGTGATTGTTCCCCAGGTTTGTTGACCAATCTCCGAGCGG
TCAACGTTGATACAGAGAAACTTGCTCGAGTCGCCGTAAAACACAACCTCCATCGCTGTC
TCCGTCATAAAAAACCCTTGCTTGAGGACCAAATTTTGGAATTTAGAAAAGCAATGGAAA
AATATCCATTACATTCGCGTGGTCTATTGAAAGTCCCTAAATCTCTAGCAGACATAGTAG
AGTCTACCATTGGAGCTCTATACACCGACTGTGACTCCTTC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2BP19JQ 820 0 0
CTTTGGACATCGAGTTCGTGGAGAAGATCTTGAACTACAAGTTCAAAGACGAGAGTTTGC
TGCTGCAAGCATTCACAGACGCTACTTTCGATGAAAACTGCGTTTCGTATGAACGCCTTG
AGTTCTTAGGAGACACAGTCTTAAATATGGTTATAACCAAATATTTGTATAGTCGCTACG
GTGATTGTTCCCCAGGTTTGTTGACCAATCTCCGAGCGGTCAACGTTGATACAGAGAAAC
TTGCTCGAGTCGCCGTAAAACACAACCTCCATCGCTGTCTCCGTCATAAAAAACCCTTGC
TTGAGGACCAAATTTTGGAATTTAGAAAAGCAATGGAAAAATATCCATTACATTCGCGTG
GTCTATTGAAAGTCCCTAAATCTCTAGCAGACATAGTAGAGTCTACCATTGGAGCTCTAT
ACACCGACTGTGACTCCTTCGAGACCGTGTGGAAGGTGGTAATGCCCTTGTTGGAGCCGA
TAATATCTTTAGATAAACTGGAGAACCATCCAATGACAGAACTCCATGAGATGTGTCAGA
AGAAGAACTTGAAATTGAGGCTCGACGACAATACTTGGGAAGTTGACAAAGGGTTCTTGT
CTTTATTGAGGAACATCTGGTTGGACGTGGACATCATCTAGTCAAGAAAGACAGTGCTAA
AAATTGCGCTGCAAAAGATGCTCTCGACAATTTTTCCTATTTCTTCACGAAGATGTAAAT
ATGATATATTAAATTTGTATGAATTCTCTTGAAAAGATTGTATTGTTTCTTTCTATTTGA
ATCAACATGAATAAAATTGGGCTACTAGCCCACCATGCCG

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 2

CO CL6248Contig1 1181 2 2 U
GGAATTATCTTTGACACAAATCCTGATCGTCTCTTTATCCGCCACCAAACCGATAAGTTG
ATGAGTAGTTTTTAACACCTTCTCAAAAACCAAAGCTGCCATCTTTCTCTTTTGATTCTC
AGGCTCGACATAATTTCTTGGTGACTTCCATATGGCTTCATCCGTCTCTGATCAGTCCGT
ACAACCTCAAGATGTTTGTGTTGTGGGAGTGGCGAGAACGCCTATGGGAGACTTCCTAGG
CTCCCTCTCTTCTTTACCCGCCACAAGACTCGGCTCCATAGCCATTGAAGCCTCACTTAA
GAGAGCAAAGGTTGAACCGGTTCTTGTGGAAGAGGTTTTCTTTGGAAATGTCTTAACAGC
CAATCTTGGACAAGCGCCAGCAAGACAGGCTGCACTCGGTGCTGGGATTCCTTATTCAGT
GATCTGCACCACTGTCAACAAAGTCTGTGCTGCTGGAATGAAAGCTGTAATGTTAGCTGC
TCAAAGCATCCAGCTCGGTTTGAATGATGTTGTTGTCGCTGGTGGAATGGAGAGTATGTC
AAACGTCCCCAAGTACCTCCCAAACGCTAGGAGGGGTTCACGGCTAGGACATGATACTGT
TATTGACGGTATGACGAAAGATGGACTATGGGATGTGTACAATGACTTTGGAATGGGAGT
TTGCGGAGAAATATGCGCTGAGCAGTACCGTATCACAAGAGAAGAACAGGATGCTTATGC
TATACAGAGCTTTGAGCGTTAGTGCTAGTTAGTGGAAAGAAGGCTCTTGAGCTTGGACTG
CATGTTATTGCTAGGATTAGAGGATACGCTGATGCTGCTCAGGCACCTGAGTTGTTCACG
ACCACTCCGGCACTTGCTATTCCTAAAGCAAAGAAGGGAAAGTATGGAGTGGCATCAATA
TGCAACGGAGGAGGAGGAGCATCAGCACTTGTTCTTGAGTTCATGTAAGCTCCTTCTTTT
TAACTCTGGTCGGAGAAGACAATCGGATATTCAGCACTCTGAAGCTTGTTATAGAACGCA
AAGCATGTAATGTGTACATTGTTTTAAGTTTGCGTGTCATATGCAATAAAAGTGTGTTAG
AAATCAAAACTAATATTGACACACACTTGAGTAAATTTGTTATGCCAGGGAGTTGAGAGA
TACTTTTTCCAAAACTTCAAATAGATTTGCTACAAATGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY36TF U 1
AF RR2BY36JQ C 522
BS 1 757 RR2BY36TF
BS 758 1181 RR2BY36JQ

RD RR2BY36TF 757 0 0
GGAATTATCTTTGACACAAATCCTGATCGTCTCTTTATCCGCCACCAAACCGATAAGTTG
ATGAGTAGTTTTTAACACCTTCTCAAAAACCAAAGCTGCCATCTTTCTCTTTTGATTCTC
AGGCTCGACATAATTTCTTGGTGACTTCCATATGGCTTCATCCGTCTCTGATCAGTCCGT
ACAACCTCAAGATGTTTGTGTTGTGGGAGTGGCGAGAACGCCTATGGGAGACTTCCTAGG
CTCCCTCTCTTCTTTACCCGCCACAAGACTCGGCTCCATAGCCATTGAAGCCTCACTTAA
GAGAGCAAAGGTTGAACCGGTTCTTGTGGAAGAGGTTTTCTTTGGAAATGTCTTAACAGC
CAATCTTGGACAAGCGCCAGCAAGACAGGCTGCACTCGGTGCTGGGATTCCTTATTCAGT
GATCTGCACCACTGTCAACAAAGTCTGTGCTGCTGGAATGAAAGCTGTAATGTTAGCTGC
TCAAAGCATCCAGCTCGGTTTGAATGATGTTGTTGTCGCTGGTGGAATGGAGAGTATGTC
AAACGTCCCCAAGTACCTCCCAAACGCTAGGAGGGGTTCACGGCTAGGACATGATACTGT
TATTGACGGTATGACGAAAGATGGACTATGGGATGTGTACAATGACTTTGGAATGGGAGT
TTGCGGAGAAATATGCGCTGAGCAGTACCGTATCACAAGAGAAGAACAGGATGCTTATGC
TATACAGAGCTTTGAGCGTTAGTGCTAGTTAGTGGAA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2BY36JQ 660 0 0
GTGGAATGGAGAGTATGTCAAACGTCCCCAAGTACCTCCCAAACGCTAGGAGGGGTTCAC
GGCTAGGACATGATACTGTTATTGACGGTATGACGAAAGATGGACTATGGGATGTGTACA
ATGACTTTGGAATGGGAGTTTGCGGAGAAATATGCGCTGAGCAGTACCGTATCACAAGAG
AAGAACAGGATGCTTATGCTATACAGAGCTTTGAGCGTTAGTGCTAGTTAGTGGAAAGAA
GGCTCTTGAGCTTGGACTGCATGTTATTGCTAGGATTAGAGGATACGCTGATGCTGCTCA
GGCACCTGAGTTGTTCACGACCACTCCGGCACTTGCTATTCCTAAAGCAAAGAAGGGAAA
GTATGGAGTGGCATCAATATGCAACGGAGGAGGAGGAGCATCAGCACTTGTTCTTGAGTT
CATGTAAGCTCCTTCTTTTTAACTCTGGTCGGAGAAGACAATCGGATATTCAGCACTCTG
AAGCTTGTTATAGAACGCAAAGCATGTAATGTGTACATTGTTTTAAGTTTGCGTGTCATA
TGCAATAAAAGTGTGTTAGAAATCAAAACTAATATTGACACACACTTGAGTAAATTTGTT
ATGCCAGGGAGTTGAGAGATACTTTTTCCAAAACTTCAAATAGATTTGCTACAAATGTCT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL6249Contig1 945 2 2 U
GCAAGATCTGATCTCGTGAGTTGTGTCCTATCCTTGATGAAGGAGAAAGAGGTCGAGGTG
AAACATGATGAGAAGCCATCTGAAGTTGGTGATGGTGTGATGTTACCAAAGGGTGAAGCT
AAACCCACCACCAGCTCTCTTCCGGTAGCTACTACATCCCATAAGCCATCTTCTTCTACT
AAGAAACAAGTTCCAGATCTTCTTAAAGACGTCTTAGTCTCTGAGTTAAACTGGGAGCCA
TCGAAGAAGAGGAGAAGAACCGCCAGTTACTGTAAACACAAGCCTAGCGAGACTGAAGGT
TTGTCATGCGAAAGATCCTTGGATTGTAAGAAGTGCAGTTCCATGGGAGATTCTCTGTTT
AGCTCATCCGTTGTTGTTGGCCGGAGGAAGCGTAACCGAATTGTCAGCTGCTGTCCGCAC
AAACCTAGTTTGACTGATGGTTTCTCGTGTGAAAAGCCCTTGGACTGTGAGAACGGCAAG
TTCATGGGAGACTCTGTGTTTGGCTCCTCGGTTGGGCAGCCTATGACTGGCCTAGTAATG
TCAAGATGATGATGAGCAGCTTTGGGGATTTGGAGTGTGTTTCGTCTTGTGAGGTACATA
TGGGGCATTTGCTTAATGCGGTGTTGGGGTTTTAGATTATAATTGTGACTCGCAAGATTT
TCTTTGGGATTTATAGGTTTTTTAGCTCGTCATGGCATCCAAATTCGTTTCTGTATGTGT
AACAAGTAGGCTTTAGAGCTTTGGCTGCAAGTTTTGGGTGGGTAATAATAGCATTACCTA
GCTAGGTGTTTTAGACTCTAAACAGTTTTTTTTTTTTCAGAATTAATCTTTATATTTGTC
TTTCTTTAGAATTAGAGAATCGATTTGTTTTCTTTCTGGTGTGGTGGGGTTTTTTTCGTT
TCATGTAAACTATGTATTATTAAATAAAACTAATCTCTTTTAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B529TF U 1
AF RR2B529JQ C 109
BS 1 798 RR2B529TF
BS 799 945 RR2B529JQ

RD RR2B529TF 798 0 0
GCAAGATCTGATCTCGTGAGTTGTGTCCTATCCTTGATGAAGGAGAAAGAGGTCGAGGTG
AAACATGATGAGAAGCCATCTGAAGTTGGTGATGGTGTGATGTTACCAAAGGGTGAAGCT
AAACCCACCACCAGCTCTCTTCCGGTAGCTACTACATCCCATAAGCCATCTTCTTCTACT
AAGAAACAAGTTCCAGATCTTCTTAAAGACGTCTTAGTCTCTGAGTTAAACTGGGAGCCA
TCGAAGAAGAGGAGAAGAACCGCCAGTTACTGTAAACACAAGCCTAGCGAGACTGAAGGT
TTGTCATGCGAAAGATCCTTGGATTGTAAGAAGTGCAGTTCCATGGGAGATTCTCTGTTT
AGCTCATCCGTTGTTGTTGGCCGGAGGAAGCGTAACCGAATTGTCAGCTGCTGTCCGCAC
AAACCTAGTTTGACTGATGGTTTCTCGTGTGAAAAGCCCTTGGACTGTGAGAACGGCAAG
TTCATGGGAGACTCTGTGTTTGGCTCCTCGGTTGGGCAGCCTATGACTGGCCTAGTAATG
TCAAGATGATGATGAGCAGCTTTGGGGATTTGGAGTGTGTTTCGTCTTGTGAGGTACATA
TGGGGCATTTGCTTAATGCGGTGTTGGGGTTTTAGATTATAATTGTGACTCGCAAGATTT
TCTTTGGGATTTATAGGTTTTTTAGCTCGTCATGGCATCCAAATTCGTTTCTGTATGTGT
AACAAGTAGGCTTTAGAGCTTTGGCTGCAAGTTTTGGGTGGGTAATAATAGCATTACCTA
GCTAGGTGTTTTAGACTC

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2B529JQ 837 0 0
AAGGGTGAAGCTAAACCCACCACCAGCTCTCTTCCGGTAGCTACTACATCCCATAAGCCA
TCTTCTTCTACTAAGAAACAAGTTCCAGATCTTCTTAAAGACGTCTTAGTCTCTGAGTTA
AACTGGGAGCCATCGAAGAAGAGGAGAAGAACCGCCAGTTACTGTAAACACAAGCCTAGC
GAGACTGAAGGTTTGTCATGCGAAAGATCCTTGGATTGTAAGAAGTGCAGTTCCATGGGA
GATTCTCTGTTTAGCTCATCCGTTGTTGTTGGCCGGAGGAAGCGTAACCGAATTGTCAGC
TGCTGTCCGCACAAACCTAGTTTGACTGATGGTTTTTCGTGTGAAAAGCCCTTGGACTGT
GAGAACGGCAAGTTCATGGGAGACTCTGTGTTTGGCTCCTCGGTTGGGCAGCCTATGACT
GGCCTAGTAATGTCAAGATGATGATGAGCAGCTTTGGGGATTTGGAGTGTGTTTCGTCTT
GTGAGGTACATATGGGGCATTTGCTTAATGCGGTGTTGGGGTTTTAGATTATAATTGTGA
CTCGCAAGATTTTCTTTGGGATTTATAGGTTTTTTAGCTCGTCATGGCATCCAAATTCGT
TTCTGTATGTGTAACAAGTAGGCTTTAGAGCTTTGGCTGCAAGTTTTGGGTGGGTAATAA
TAGCATTACCTAGCTAGGTGTTTTAGACTCTAAACAGTTTTTTTTTTTTCAGAATTAATC
TTTATATTTGTCTTTCTTTAGAATTAGAGAATCGATTTGTTTTCTTTCTGGTGTGGTGGG
GTTTTTTTCGTTTCATGTAAACTATGTATTATTAAATAAAACTAATCTCTTTTAACG

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 2

CO CL6250Contig1 984 2 2 U
GGACAGAGACGACGAGGACTAGCGCCGCCGTGGTTGGGAAAATAGGAGGCTCACCGCAAA
AACGATGATGGCCACTCAATCTTTCAGTCTGCTTCCCTCTCCACAGTTGCCGCCAAACAT
CGCTTCACTCAGACCAAATATCCTAAGATTTGACTCATCAAAGCTGACGACGACATGTGG
AAGGCATCGGAGGCAAAATCTAAGCATCCGATCCGTGTTCACTGGAATCGTGGAAGAAAT
GGGGCACGTTAAGGATCCGGGATTAGCTGATCACGGCGGATTCGACCTTAAAATCGGGGC
GAGAGTGGTGGTGGAGGACGTGAAGCTTGGCGACAGCATCGCCGTCAACGGTACTTGCCT
AACTGTCACCCATTTCGACGCCGAGGAGTTCACCGTCGGGTTAGCGCCGGAGACGCTGCG
GAAAACGTCGCTGGAGGAGCTGGAGAGAGGATCCCTGGTGAATCTGGAGCGCGCGCTGCA
GCCGGTGAGCCGAATGGGGGGACACGTGGTGCAGGGACACGTGGACGGTACGGGAGTGAT
CGTTTCGATGGAGGCTGAGGGAGATTCGCTGTGGGTGAAGGTGAAAGCGGACAAGGCTTT
GCTCAAATACATTGTCCCCAAGGGCTTTGTGGCGGTGGATGGGACGAGCCTGACGGTGGT
GGATGTGTCTGACGAGGAGAGCTGCTTTAGCTTCATGCTCGTTGCTTATACGCAACAGAA
TGTGGTGATTCCAACCAAGAAAGTTGGGCAGAAAGTGAACTTGGAGGTTGATATTATGGG
CAAATACGTTGAGAGGCTTCTTCTCACCATCAACACCCCACAGGAAAACAAGGACTGAAG
CTCAGCTTGGAGAAAAAGGAAGCTCATTTGGCAACTGTTGCTGTATGTAAAATTGATCTT
CACACTCTGTTTCTTTGTAATATCAGCGACACCAAACTTACGTGCTGTGTGTAATGATGG
TCTATTCATTTGTGTCAATTGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C017TF U 1
AF RR2C017JQ C 184
BS 1 618 RR2C017TF
BS 619 984 RR2C017JQ

RD RR2C017TF 618 0 0
GGACAGAGACGACGAGGACTAGCGCCGCCGTGGTTGGGAAAATAGGAGGCTCACCGCAAA
AACGATGATGGCCACTCAATCTTTCAGTCTGCTTCCCTCTCCACAGTTGCCGCCAAACAT
CGCTTCACTCAGACCAAATATCCTAAGATTTGACTCATCAAAGCTGACGACGACATGTGG
AAGGCATCGGAGGCAAAATCTAAGCATCCGATCCGTGTTCACTGGAATCGTGGAAGAAAT
GGGGCACGTTAAGGATCCGGGATTAGCTGATCACGGCGGATTCGACCTTAAAATCGGGGC
GAGAGTGGTGGTGGAGGACGTGAAGCTTGGCGACAGCATCGCCGTCAACGGTACTTGCCT
AACTGTCACCCATTTCGACGCCGAGGAGTTCACCGTCGGGTTAGCGCCGGAGACGCTGCG
GAAAACGTCGCTGGAGGAGCTGGAGAGAGGATCCCTGGTGAATCTGGAGCGCGCGCTGCA
GCCGGTGAGCCGAATGGGGGGACACGTGGTGCAGGGACACGTGGACGGTACGGGAGTGAT
CGTTTCGATGGAGGCTGAGGGAGATTCGCTGTGGGTGAAGGTGAAAGCGGACAAGGCTTT
GCTCAAATACATTGTCCC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2C017JQ 801 0 0
GCATCGGAGGCAAAATCTAAGCATCCGATCCGTGTTCACTGGAATCGTGGAAGAAATGGG
GCACGTTAAGGATCCGGGATTAGCTGATCACGGCGGATTCGACCTTAAAATCGGGGCGAG
AGTGGTGGTGGAGGACGTGAAGCTTGGCGACAGCATCGCCGTCAACGGTACTTGCCTAAC
TGTCACCCATTTCGACGCCGAGGAGTTCACCGTCGGGTTAGCGCCGGAGACGCTGCGGAA
AACGTCGCTGGAGGAGCTGGAGAGAGGATCCCTGGTGAATCTGGAGCGCGCGCTGCAGCC
GGTGAGCCGAATGGGGGGACACGTGGTGCAGGGACACGTGGACGGTACGGGAGTGATCGT
TTCGATGGAGGCTGAGGGAGATTCGCTGTGGGTGAAGGTGAAAGCGGACAAGGCTTTGCT
CAAATACATTGTCCCCAAGGGCTTTGTGGCGGTGGATGGGACGAGCCTGACGGTGGTGGA
TGTGTCTGACGAGGAGAGCTGCTTTAGCTTCATGCTCGTTGCTTATACGCAACAGAATGT
GGTGATTCCAACCAAGAAAGTTGGGCAGAAAGTGAACTTGGAGGTTGATATTATGGGCAA
ATACGTTGAGAGGCTTCTTCTCACCATCAACACCCCACAGGAAAACAAGGACTGAAGCTC
AGCTTGGAGAAAAAGGAAGCTCATTTGGCAACTGTTGCTGTATGTAAAATTGATCTTCAC
ACTCTGTTTCTTTGTAATATCAGCGACACCAAACTTACGTGCTGTGTGTAATGATGGTCT
ATTCATTTGTGTCAATTGGAG

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL6251Contig1 592 2 1 U
GGGTTATACAATAAATTTTGGCTCTAGTTAATTACTTCTTTGATAGCTGATAAAACGATC
GATTAGTTTGGAGCTCCAACGACTTGAGATCGGTAGAAATGGGAGGAGCTGACTGGGGTC
CGGTGGCGGTAGCGGTGGTGCTGTTCGTAGTGTTATCTCCGGGACTTCTCTTTCAGCTGC
CGGCCAGAAGAAGGGTGTTGGAGTGCGGCAACATGACCACGAGTGGCATATCCATATTGG
TTCATGCCATCCTCTTTTTCGCTATTATCACGATTTTGGTCATCGCCATTCAAATTCACA
TCCACATCTAGTTTGTGTGGGTTTGTTTATTTCTCCTATAATTATAAAAGGTCTACAAGT
TAGGCTGTACAAATTCCCCCTCATGTGATCGATGTTAGTGTAAAATCATGGAATGCATTA
TTCAAGAATCAACAATATAAATTCTCTTTGTTGTATAGATATATTGTTGTAATCGTTGAA
AATTGGTTATTTCGATTATTATTTTTTATGGTTTAATCAATACATTGGATTTTAAAAATA
TTTGTAGATGTAAATTGGAATGAAGCAATGTAAAACAACAAAGAGATCTGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GI76JQB C 1
AF RR2GI76TF U 1
BS 1 592 RR2GI76TF

RD RR2GI76JQB 592 0 0
GGGTTATACAATAAATTTTGGCTCTAGTTAATTACTTCTTTGATAGCTGATAAAACGATC
GATTAGTTTGGAGCTCCAACGACTTGAGATCGGTAGAAATGGGAGGAGCTGACTGGGGTC
CGGTGGCGGTAGCGGTGGTGCTGTTCGTAGTGTTATTTCCGGGACTTCTCTTTCAGCTGC
CGGCCAGAAGAAGGGTGTTGGAGTGCGGCAACATGACCACGAGTGGCATATCCATATTGG
TTCATGCCATCCTCTTTTTCGCTATTATCACGATTTTGGTCATCGCCATTCAAATTCACA
TCCACATCTAGTTTGTGTGGGTTTGTTTATTTCTCCTATAATTATAAAAGGTCTACAAGT
TAGGCTGTACAAATTCCCCCTCATGTGATCGATGTTAGTGTAAAATCATGGAATGCATTA
TTCAAGAATCAACAATATAAATTCTCTTTGTTGTATAGATATATTGTTGTAATCGTTGAA
AATTGGTTATTTCGATTATTATTTTTTATGGTTTAATCAATACATTGGATTTTAAAAATA
TTTGTAGATGTAAATTGGAATGAAGCAATGTAAAACAACAAAGAGATCTGAT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2GI76TF 592 0 0
GGGTTATACAATAAATTTTGGCTCTAGTTAATTACTTCTTTGATAGCTGATAAAACGATC
GATTAGTTTGGAGCTCCAACGACTTGAGATCGGTAGAAATGGGAGGAGCTGACTGGGGTC
CGGTGGCGGTAGCGGTGGTGCTGTTCGTAGTGTTATCTCCGGGACTTCTCTTTCAGCTGC
CGGCCAGAAGAAGGGTGTTGGAGTGCGGCAACATGACCACGAGTGGCATATCCATATTGG
TTCATGCCATCCTCTTTTTCGCTATTATCACGATTTTGGTCATCGCCATTCAAATTCACA
TCCACATCTAGTTTGTGTGGGTTTGTTTATTTCTCCTATAATTATAAAAGGTCTACAAGT
TAGGCTGTACAAATTCCCCCTCATGTGATCGATGTTAGTGTAAAATCATGGAATGCATTA
TTCAAGAATCAACAATATAAATTCTCTTTGTTGTATAGATATATTGTTGTAATCGTTGAA
AATTGGTTATTTCGATTATTATTTTTTATGGTTTAATCAATACATTGGATTTTAAAAATA
TTTGTAGATGTAAATTGGAATGAAGCAATGTAAAACAACAAAGAGATCTGAT

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL6252Contig1 711 2 1 U
GATCATCGGCTGGTGACGTGGAACAACGGCGGAGCAGCTGACTCCGCCGCAAGTGGAGGA
GGAGGAGGGTTTGTGTTTGCTTCTCCGGCTACAACGACGTCGTATCAGCCACAAAGTCAG
TTTTTTTCTCAGAGGGGTCCCCTTCAGTCCATTAACACACCAATGCTTCGTGCTTGGTTT
GATCCTTACCATCACCATCAGTCCGTTACTACCAACGATCATCATCATCATCATCATTAC
CATCCTTACCAATCAGCAATACCAGGCATTGCGTTTGCCTCTAGTGGTGAATTATCCGGT
TTACGTGTACCAGCCCGGTATCAGAGTGAACAAGATGATCACGGCGACAAGCCATCGTCT
GATTCATCTGATTCTCGCAATTGAACTAGATCCACAACATAAGATGGTGCAATAGAAATG
GTTTCGGCTCATCAAACTGGTAATAACGTTTCATGGAGCTTGTGTAATAAGGAATGTGTT
CTTGTTGTTGTGTGTTTAGGATATGGAATTATTATGTGTGTTATCAAGAGTTGCAGATTC
TTGTTTCTTCCGTGTAACCAAGCATTTTATGATTCAAATTCAGTTTGTATCAGTTAGACA
ATTTTCTGTAAACTCTATTGTGTTTTTCTAGTCACGCAAGCTCACGTCTTGTGTTATTGT
ATCCTGATTGTGTAGCAATGTGTTCTTGTATTAAATAAATGTGTAATTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EO22JQ C 1
AF RR2EO22TF U 1
BS 1 711 RR2EO22TF

RD RR2EO22JQ 711 0 0
GATCATCGGCTGGTGACGTGGAACAACGGCGGAGCAGCTGACTCCGCCGCAAGTGGAGGA
GGAGGAGGGTTTGTGTTTGCTTCTCCGGCTACAACGACGTCGTATCAGCCACAAAGTCAG
TTTTTTTCTCAGAGGGGTCCCCTTCAGTCCATTAACACACCAATGCTTCGTGCTTGGTTT
GATCCTTACCATCACCATCAGTCCGTTACTACCAACGATCATCATCATCATCATCATTAC
CATCCTTACCAATCAGCAATACCAGGCATTGCGTTTGCCTCTAGTGGTGAATTATCCGGT
TTACGTGTACCAGCCCGGTATCAGAGTGAACAAGATGATCACGGCGACAAGCCATCGTCT
GATTCATCTGATTCTCGCAATTGAACTAGATCCACAACATAAGATGGTGCAATAGAAATG
GTTTCGGCTCATCAAACTGGTAATAACGTTTCATGGAGCTTGTGTAATAAGGAATGTGTT
CTTGTTGTTGTGTGTTTAGGATATGGAATTATTATGTGTGTTATCAAGAGTTGCAGATTC
TTGTTTCTTCCGTGTAACCAAGCATTTTATGATTCAAATTCAGTTTGTATCAGTTAGACA
ATTTTCTGTAAACTTTATTGTGTTTTTCTAGTCACGCAAGCTCACGTCTTGTGTTATTGT
ATCCTGATTGTGTAGCAATGTGTTCTTGTATTAAATAAATGTGTAATTCCC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2EO22TF 711 0 0
GATCATCGGCTGGTGACGTGGAACAACGGCGGAGCAGCTGACTCCGCCGCAAGTGGAGGA
GGAGGAGGGTTTGTGTTTGCTTCTCCGGCTACAACGACGTCGTATCAGCCACAAAGTCAG
TTTTTTTCTCAGAGGGGTCCCCTTCAGTCCATTAACACACCAATGCTTCGTGCTTGGTTT
GATCCTTACCATCACCATCAGTCCGTTACTACCAACGATCATCATCATCATCATCATTAC
CATCCTTACCAATCAGCAATACCAGGCATTGCGTTTGCCTCTAGTGGTGAATTATCCGGT
TTACGTGTACCAGCCCGGTATCAGAGTGAACAAGATGATCACGGCGACAAGCCATCGTCT
GATTCATCTGATTCTCGCAATTGAACTAGATCCACAACATAAGATGGTGCAATAGAAATG
GTTTCGGCTCATCAAACTGGTAATAACGTTTCATGGAGCTTGTGTAATAAGGAATGTGTT
CTTGTTGTTGTGTGTTTAGGATATGGAATTATTATGTGTGTTATCAAGAGTTGCAGATTC
TTGTTTCTTCCGTGTAACCAAGCATTTTATGATTCAAATTCAGTTTGTATCAGTTAGACA
ATTTTCTGTAAACTCTATTGTGTTTTTCTAGTCACGCAAGCTCACGTCTTGTGTTATTGT
ATCCTGATTGTGTAGCAATGTGTTCTTGTATTAAATAAATGTGTAATTCCC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL6253Contig1 1585 2 2 U
GGAACTCTCATTTCTTAAGGGAGAAAGATCGATCATTTGAGAAAATTAAAAACCCTAGAC
TCCCTGCGACTCTTCTCTTCCTCCTCTCTCTCTCTATATTTCTCTGATCGATTTTCATTT
TTTTTTACCGTAAGACAAAAATCGAAAGTATGAGGGGATTGGTGAAGAAGCTCGTATCCA
GATCTCTCTCCGTCTCCGGCAAATGGCAACACCAACAGCTTCGCCGTCTCAACATCCACG
AGTACCAGGGAGCAGAGCTGATGGGTAAATACGGAGTGAATGTGCCCAACGGAGTCGCTG
TCTCTTCTCTCGATGAAGTTAAAAACGCTATCGAACAAGTTTTCCCTAATGAAACCGAGT
TGGTCGTTAAGAGCCAGATCTTGGCTGGTGGAAGAGGTCTCGGGACTTTCAAGAGTGGTC
TTCAAGGTGGTGTTCACATTGTCAAACGTGATCAGGTTCAAGACATTGCTGGAAAGATGC
TTGGACAAGTACTCGTCACCAAACAAACTGGTCCTCAAGGCAAAGTAGTCAGCTAGGTTT
ACTTGTGTGAGAAGTTGTCACTCGTCAATGAGATGTACTTTTCCATTATTCTCGACCGTA
AATCTGCTGGACCGCTTATAATTGCCTGTAAGAAGGGTGGTACTAGCATTGAAGATCTTG
CTGAGAAGTTCCCTGACATGATTATAAAGGTACCGATCGATGTATTTGCAGGAATTACAG
ATGAAGATGCTGCCAAGGTTGTGGATGGTCTGGCTCCAAAAGCTGCTGACAGAAAAGATT
CGATTGAACAAGTGAAGAAGCTTTACGAACTCTTTCGCAAGAGTGACTGCACTATGTTGG
GAAATCAACCCTCTCGCTGAGACATCCACGAACCAATTGGTAGCTGCTGATGCTAAGTTG
AACTTTGATGATAATGCTGCTTTCCGTCAGAAAGAGATTTTTGCCCTTCGTGATCCAACA
CAGGAGGATCCACGAGAGGTGGCTGCAGCAAAAGTAGACCTGAACTATATCGGTTTAGAT
GGAGAGATTGGGTGCATGGTGAATGGTGCGGGATTGGCCATGGCAACCATGGACATCATT
AAACTCCACGGTGGGACACCCGCAAATTTCCTTGACGTTGGTGGAAACGCTTCTGAACAC
CAGGTGGTGGAGGCGTTTAAGATACTGACATCGGACGATAAAGTGAAAGCAATATTGGTG
AACATATTCGGTGGGATAATGAAATGTGATGTGATTGCTAGTGGAATTGTGAATGCTGCT
AAAGAGGTGTCACTGAAAGTACCAGTGGTGGTTCGTCTGGAAGGAACAAATGTTGAACAA
GGAAAGAGAATCCTCAAGGAGAGTGGAATGAAACTCATAACAGCTGATGATTTGGATGAC
GCAGCAGAGAAAGCTGTAAAGGCATTAGCTGATTAGGCTAAAAGGGGTTGGTTTTAAACA
AGAAAAAAGAGCTATTTGTTGAGAGATTTTTTTCCTATGGTTCTAGTCCATTTCTATGTG
GTTGAGGCAATTGCATATTTGTTGCCGATATAATTTGCTGAAACAGATCAATAATGTTAT
TGTTGAAAATTGAATTTTTCATCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B603TF U 1
AF RR2B603JQ C 732
BS 1 855 RR2B603TF
BS 856 1585 RR2B603JQ

RD RR2B603TF 855 0 0
GGAACTCTCATTTCTTAAGGGAGAAAGATCGATCATTTGAGAAAATTAAAAACCCTAGAC
TCCCTGCGACTCTTCTCTTCCTCCTCTCTCTCTCTATATTTCTCTGATCGATTTTCATTT
TTTTTTACCGTAAGACAAAAATCGAAAGTATGAGGGGATTGGTGAAGAAGCTCGTATCCA
GATCTCTCTCCGTCTCCGGCAAATGGCAACACCAACAGCTTCGCCGTCTCAACATCCACG
AGTACCAGGGAGCAGAGCTGATGGGTAAATACGGAGTGAATGTGCCCAACGGAGTCGCTG
TCTCTTCTCTCGATGAAGTTAAAAACGCTATCGAACAAGTTTTCCCTAATGAAACCGAGT
TGGTCGTTAAGAGCCAGATCTTGGCTGGTGGAAGAGGTCTCGGGACTTTCAAGAGTGGTC
TTCAAGGTGGTGTTCACATTGTCAAACGTGATCAGGTTCAAGACATTGCTGGAAAGATGC
TTGGACAAGTACTCGTCACCAAACAAACTGGTCCTCAAGGCAAAGTAGTCAGCTAGGTTT
ACTTGTGTGAGAAGTTGTCACTCGTCAATGAGATGTACTTTTCCATTATTCTCGACCGTA
AATCTGCTGGACCGCTTATAATTGCCTGTAAGAAGGGTGGTACTAGCATTGAAGATCTTG
CTGAGAAGTTCCCTGACATGATTATAAAGGTACCGATCGATGTATTTGCAGGAATTACAG
ATGAAGATGCTGCCAAGGTTGTGGATGGTCTGGCTCCAAAAGCTGCTGACAGAAAAGATT
CGATTGAACAAGTGAAGAAGCTTTACGAACTCTTTCGCAAGAGTGACTGCACTATGTTGG
GAAATCAACCCTCTC

QA 1 855 1 855
DS 

RD RR2B603JQ 854 0 0
GCCAAGGTTGTGGATGGTCTGGCTCCAAAAGCTGCTGACAGAAAAGATTCGATTGAACAA
GTGAAGAAGCTTTACGAACTCTTTCGCAAGAGTGACTGCACTATGTTGG*AAATCAACCC
TCTCGCTGAGACATCCACGAACCAATTGGTAGCTGCTGATGCTAAGTTGAACTTTGATGA
TAATGCTGCTTTCCGTCAGAAAGAGATTTTTGCCCTTCGTGATCCAACACAGGAGGATCC
ACGAGAGGTGGCTGCAGCAAAAGTAGACCTGAACTATATCGGTTTAGATGGAGAGATTGG
GTGCATGGTGAATGGTGCGGGATTGGCCATGGCAACCATGGACATCATTAAACTCCACGG
TGGGACACCCGCAAATTTCCTTGACGTTGGTGGAAACGCTTCTGAACACCAGGTGGTGGA
GGCGTTTAAGATACTGACATCGGACGATAAAGTGAAAGCAATATTGGTGAACATATTCGG
TGGGATAATGAAATGTGATGTGATTGCTAGTGGAATTGTGAATGCTGCTAAAGAGGTGTC
ACTGAAAGTACCAGTGGTGGTTCGTCTGGAAGGAACAAATGTTGAACAAGGAAAGAGAAT
CCTCAAGGAGAGTGGAATGAAACTCATAACAGCTGATGATTTGGATGACGCAGCAGAGAA
AGCTGTAAAGGCATTAGCTGATTAGGCTAAAAGGGGTTGGTTTTAAACAAGAAAAAAGAG
CTATTTGTTGAGAGATTTTTTTCCTATGGTTCTAGTCCATTTCTATGTGGTTGAGGCAAT
TGCATATTTGTTGCCGATATAATTTGCTGAAACAGATCAATAATGTTATTGTTGAAAATT
GAATTTTTCATCAG

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 2

CO CL6254Contig1 831 2 2 U
GGTGTTCCCGGAGAGCTGTCACTGTCATCGTCACTGATGAGTGTCCCGGCTGCTCCAAAA
CCAACACTCACTTTGATCTCAGTGGCGCTGCCTTTGGTCGATTGGCTATCACCGGAGAGT
CTGGTCCTCTTCGCAACCGTGGTCTCATCCCCGTTATTTACCGCCGGACGGCATGCAAAT
ATAGACGGCAGAACATAGCGTTCCATGTGAACGAAGGCTCAACTGATTTCTGGTTGTCTC
TACTGGTCGAGTTTGAAGAAGGAGAAGGCGACATTGGCTCCATGCATATTCGCCAAGCAG
GAGCGAGGGAATGGTTAGAGATGAAGCACGTATGGGGAGCCAACTGGTGCATCATTGGAG
GGCCACTCAGAGGACCATTCTCCGTCAAGATCACCACTTTGTCCGCCGGTAGAACACTGT
CCGCCACTGACGTCGTTCCTAGAAACTGGGTTCCTAAAGCAACTTACACTTCTCGCCTCA
ACTTCTCCCCCGTCCTCTGAAAAACTAATATTCCTAACTATTATCTGTGTGATCTTTTTT
TTCTTTTTGAAGAGAGAAATAGAGAGTGACTGCTGGCCGTAGGATGGCAATTGTAAGTAA
GTCCATCTGAATTCAACGGCTCTAGCGTTCTCTCCTCTTCTTCCTTTGTGTTGTGGATTT
GTGTGTGTGTGTCGGTGAGTGTGTGGGCGCCATTGTAGCCATCTCCAAAGGGGAGATAGA
GCTTGGAGTAGTATTTGGTGGTGTCATATGTCTTCTTTTTCTATCTAATTATTGTCATTT
CCTACTTCTATTATGGGACACTACATAATATATATCGTATGAATGTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX88TF U 1
AF RR2BX88JQ C 112
BS 1 706 RR2BX88TF
BS 707 831 RR2BX88JQ

RD RR2BX88TF 706 0 0
GGTGTTCCCGGAGAGCTGTCACTGTCATCGTCACTGATGAGTGTCCCGGCTGCTCCAAAA
CCAACACTCACTTTGATCTCAGTGGCGCTGCCTTTGGTCGATTGGCTATCACCGGAGAGT
CTGGTCCTCTTCGCAACCGTGGTCTCATCCCCGTTATTTACCGCCGGACGGCATGCAAAT
ATAGACGGCAGAACATAGCGTTCCATGTGAACGAAGGCTCAACTGATTTCTGGTTGTCTC
TACTGGTCGAGTTTGAAGAAGGAGAAGGCGACATTGGCTCCATGCATATTCGCCAAGCAG
GAGCGAGGGAATGGTTAGAGATGAAGCACGTATGGGGAGCCAACTGGTGCATCATTGGAG
GGCCACTCAGAGGACCATTCTCCGTCAAGATCACCACTTTGTCCGCCGGTAGAACACTGT
CCGCCACTGACGTCGTTCCTAGAAACTGGGTTCCTAAAGCAACTTACACTTCTCGCCTCA
ACTTCTCCCCCGTCCTCTGAAAAACTAATATTCCTAACTATTATCTGTGTGATCTTTTTT
TTCTTTTTGAAGAGAGAAATAGAGAGTGACTGCTGGCCGTAGGATGGCAATTGTAAGTAA
GTCCATCTGAATTCAACGGCTCTAGCGTTCTCTCCTCTTCTTCCTTTGTGTTGTGGATTT
GTGTGTGTGTGTCGGTGAGTGTGTGGGCGCCATTGTAGCCATCTCC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2BX88JQ 720 0 0
CCGGAGAGTCTGGTCCTCTTCGCAACCGTGGTCTCATCCCCGTTATTTACCGCCGGACGG
CATGCAAATATAGACGGCAGAACATAGCGTTCCATGTGAACGAAGGCTCAACTGATTTCT
GGTTGTCTCTACTGGTCGAGTTTGAAGAAGGAGAAGGCGACATTGGCTCCATGCATATTC
GCCAAGCAGGAGCGAGGGAATGGTTAGAGATGAAGCACGTATGGGGAGCCAACTGGTGCA
TCATTGGAGGGCCACTCAGAGGACCATTTTCCGTCAAGATCACCACTTTGTCCGCCGGTA
GAACACTGTCCGCCACTGACGTCGTTCCTAGAAACTGGGTTCCTAAAGCAACTTACACTT
CTCGCCTCAACTTCTCCCCCGTCCTCTGAAAAACTAATATTCCTAACTATTATCTGTGTG
ATCTTTTTTTTCTTTTTGAAGAGAGAAATAGAGAGTGACTGCTGGCCGTAGGATGGCAAT
TGTAAGTAAGTCCATCTGAATTCAACGGCTCTAGCGTTCTCTCCTCTTCTTCCTTTGTGT
TGTGGATTTGTGTGTGTGTGTCGGTGAGTGTGTGGGCGCCATTGTAGCCATCTCCAAAGG
GGAGATAGAGCTTGGAGTAGTATTTGGTGGTGTCATATGTCTTCTTTTTCTATCTAATTA
TTGTCATTTCCTACTTCTATTATGGGACACTACATAATATATATCGTATGAATGTTTGTC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL6255Contig1 922 2 8 U
GGATGCGAAGGATCTGATATCGCTGCAAGAAATATATCTGGAAATGAAACTGTGTGATGG
CTTGTTCATTGACCGAACTGCATTTACAGCAGTCGTTGATGCTCTTCTTAAGTGTGGTTC
AACAAGCGGGGCCCTTTGTGTCTTTGGTGAAGTATTGAAGAGAAGCGGAGCTAGTGTAGA
CTTGAGACCAAAGCCGCACTTGTATATGTCTATGATGCGTGCGTTTGCTGTCCAAGGAGA
TTATGGCATGGTTAGAAACCTGTATCTTCGCCTATGGCCAGATTCTTCGGGAAGAATCTC
CAAGGGGGTCCAACAAGAAGCTGATAATCTGCTGATGGAAGCAGCTCTCAATGCTGGTCA
GCTCGATGAGGCCCTTGGGATTCTTACAAGTATTGTTAAAAGGTGGAAGGCAATACCCTG
GACGACTAGTGGAGGCATGGCTGCTGTTCGCCTGGAAGCATTGTTGGGGTTTTCCAGGTC
TATACTGCGTCCACATCTACTCAGTAAGGTGATACCAGGCGAACCAATAGAAAGTATCAT
GATTCCATTTGAAGCCACTCGGCCGCTGCTAGGCACGATGCAGCTGAAGAATGTGGTCAT
GCGGTTTTTCAATGAGAAAGTTGTGCCAATTATAGACGAATGGGGAAGCTGCATAGGCCT
TTTGCATCGAGAGGATTGCAACGATCTTGATGCGCCATTGGTCTCAATGATGAGAAGCCC
GCCTCCATGTGTGAGTACAACAACATCGATCGGTCGCGTGGTAGATCTTGTTTTAGAAAA
GAAACATAAGATGGTTATAGTTATTCATTGTTGTGGGAGCGGTTACAGCTCAAAGGCAGT
AGGAGCTTTTACAAGAGCACAATTGTATCGGTTGTTTGAACCAGAGCAAAAGCTACTCTG
GTGGATGTAAGTTAAGTAGGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF13TF U 1
AF RR2CF13JQ C 141
BS 1 656 RR2CF13TF
BS 657 657 RR2CF13JQ
BS 658 706 RR2CF13TF
BS 707 707 RR2CF13JQ
BS 708 739 RR2CF13TF
BS 740 740 RR2CF13JQ
BS 741 752 RR2CF13TF
BS 753 922 RR2CF13JQ

RD RR2CF13TF 752 0 0
GGATGCGAAGGATCTGATATCGCTGCAAGAAATATATCTGGAAATGAAACTGTGTGATGG
CTTGTTCATTGACCGAACTGCATTTACAGCAGTCGTTGATGCTCTTCTTAAGTGTGGTTC
AACAAGCGGGGCCCTTTGTGTCTTTGGTGAAGTATTGAAGAGAAGCGGAGCTAGTGTAGA
CTTGAGACCAAAGCCGCACTTGTATATGTCTATGATGCGTGCGTTTGCTGTCCAAGGAGA
TTATGGCATGGTTAGAAACCTGTATCTTCGCCTATGGCCAGATTCTTCGGGAAGAATCTC
CAAGGGGGTCCAACAAGAAGCTGATAATCTGCTGATGGAAGCAGCTCTCAATGCTGGTCA
GCTCGATGAGGCCCTTGGGATTCTTACAAGTATTGTTAAAAGGTGGAAGGCAATACCCTG
GACGACTAGTGGAGGCATGGCTGCTGTTCGCCTGGAAGCATTGTTGGGGTTTTCCAGGTC
TATACTGCGTCCACATCTACTCAGTAAGGTGATACCAGGCGAACCAATAGAAAGTATCAT
GATTCCATTTGAAGCCACTCGGCCGCTGCTAGGCACGATGCAGCTGAAGAATGTGGTCAT
GCGGTTTTTCAATGAGAAAGTTGTGCCAATTATAGACGAATGGGGAAGCTGCATAG*CCT
TTTGCATCGAGAGGATTGCAACGATCTTGATGCGCCATTGGTCTCA*TGATGAGAAGCCC
GCCTCCATGTGTGAGTACA*CAACATCGATCG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2CF13JQ 782 0 0
GTC
TTGGTGAAGTAT*GAAGAGAAGCGGAGCTAGTGTAGACTTGAGACCAAAGCCGCACTTGT
ATATGTCTATGATGCGTGCGTTTGCTGTCCAAGGAGATTATGGCATGGTTAGAAACCTGT
ATCTTCGCCTATGGCCAGATTCTTCGGGAAGAATCTCCAAGGGGGTCCAACAAGAAGCTG
ATAATCTGCTGATGGAAGCAGCTCTCAATGCTGGTCAGCTCGATGAGGCCCTTGGGATTC
TTACAAGTATTGTTAAAAGGTGGAAGGCAATACCCTGGACGACTAGTGGAGGCATGGCTG
CTGTTCGCCTGGAAGCATTGTTGGGGTTTTCCAGGTCTATACTGCGTCCACATCTACTCA
GTAAGGTGATACCAGGCGAACCAATAGAAAGTATCATGATTCCATTTGAAGCCACTCGGC
CGCTGCTAGGCACGATGCAGCTGAAGAATGTGGTCATGCGGTTTTTCAATGAGAAAGTTG
TGCCAATTATAGACGAATGGGGAAGCTGCATAGGCCTTTTGCATCGAGAGGATTGCAACG
ATCTTGATGCGCCATTGGTCTCAATGATGAGAAGCCCGCCTCCATGTGTGAGTACAACAA
CATCGATCGGTCGCGTGGTAGATCTTGTTTTAGAAAAGAAACATAAGATGGTTATAGTTA
TTCATTGTTGTGGGAGCGGTTACAGCTCAAAGGCAGTAGGAGCTTTTACAAGAGCACAAT
TGTATCGGTTGTTTGAACCAGAGCAAAAGCTACTCTGGTGGATGTAAGTTAAGTAGGCA

QA 4 782 4 782
DS 



AS 1 2

CO CL6256Contig1 658 2 1 U
GGTCTCCAAGAGCTAGGAGGGAATGTAAAACTCGTTAAATGGAATGATTCTCCTCACGTT
GGTCATTATCGGTACAATCAAGTCGACTATAAAGCAGCTGTATCCGACTTCTTGTCAAAA
GCAGCGTCGGTTTATTTGCAGAAGACAAGAAGTCTTGACAGAGAAGCAATGAAAGAAGAA
ACTCCATGCGATGATGATATAACAGAGCCAACTCAAAGCTTTGGGGCATCAACCTCTGGT
CTTAACCGAAGCTTCAACGGAACTCCACTTGTTACAACTGATCATTTCTTCGTTCCTAGA
AGCACCGTTGGTTACTACGTGGGCAACAGTGGGTCTGTGCAAGATGAACATAAACAGGAT
TTGATCCGTTTGTCCAGTGCTCAAAACGGAGATGATGCTGTTCAGCCCAATGGTGTTCTT
GGTCAAATCTTGTTTGATGTTTACATCCCCAAGAACGTCGAGGATTGGGATGTGAAGCTG
CCGGAAACCGGCCGGTCTGGGAGGAGACAAGGGAAGAGGTTTATATGTAGATCGAGATTG
TAGCATCCGTGTTGTGTTTACCATTTGTGTTCTTCGCATACTGTTGCAATGGAATTGTAT
TTGTTTTTTTTTTGTTTCCCTTGCAGAGATTCTAAATAAAATCAATAAAGTAAGATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FB94JQ C 1
AF RR2FB94TF U 1
BS 1 658 RR2FB94TF

RD RR2FB94JQ 658 0 0
GGTCTCCAAGAGCTAGGAGGGAATGTAAAACTCGTTAAATGGAATGATTCTCCTCACGTT
GGTCATTATCGGTACAATCAAGTCGACTATAAAGCAGCTGTATCCGACTTCTTGTCAAAA
GCAGCGTCGGTTTATTTGCAGAAGACAAGAAGTCTTGACAGAGAAGCAATGAAAGAAGAA
ACTCCATGCGATGATGATATAACAGAGCCAACTCAAAGCTTTGGGGCATCAACCTCTGGT
CTTAACCGAAGCTTCAACGGAACTCCACTTGTTACAACTGATCATTTCTTCGTTCCTAGA
AGCACCGTTGGTTACTACGTGGGCAACAGTGGGTCTGTGCAAGATGAACATAAACAGGAT
TTGATCCGTTTGTCCAGTGCTCAAAACGGAGATGATGCTGTTCAGCCCAATGGTGTTCTT
GGTCAAATCTTGTTTGATGTTTACATCCCCAAGAACGTCGAGGATTGGGATGTGAAGCTG
CCGGAAACCGGCCGGTCTGGGAGGAGACAAGGGAAGAGGTTTATATGTAGATCGAGATTG
TAGCATCCGTGTTGTGTTTACCATTTGTGTTCTTCGCATACTGTTGCAATGGAATTGTAT
TTGTTTTTTTTTTGTTTCCCTTGCAGAGATTCTAAATAAAATCAATAAAGTAAGATCC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2FB94TF 658 0 0
GGTCTCCAAGAGCTAGGAGGGAATGTAAAACTCGTTAAATGGAATGATTCTCCTCACGTT
GGTCATTATCGGTACAATCAAGTCGACTATAAAGCAGCTGTATCCGACTTCTTGTCAAAA
GCAGCGTCGGTTTATTTGCAGAAGACAAGAAGTCTTGACAGAGAAGCAATGAAAGAAGAA
ACTCCATGCGATGATGATATAACAGAGCCAACTCAAAGCTTTGGGGCATCAACCTCTGGT
CTTAACCGAAGCTTCAACGGAACTCCACTTGTTACAACTGATCATTTCTTCGTTCCTAGA
AGCACCGTTGGTTACTACGTGGGCAACAGTGGGTCTGTGCAAGATGAACATAAACAGGAT
TTGATCCGTTTGTCCAGTGCTCAAAACGGAGATGATGCTGTTCAGCCCAATGGTGTTCTT
GGTCAAATCTTGTTTGATGTTTACATCCCCAAGAACGTCGAGGATTGGGATGTGAAGCTG
CCGGAAACCGGCCGGTCTGGGAGGAGACAAGGGAAGAGGTTTATATGTAGATCGAGATTG
TAGCATCCGTGTTGTGTTTACCATTTGTGTTCTTCGCATACTGTTGCAATGGAATTGTAT
TTGTTTTTTTTTTGTTTCCCTTGCAGAGATTCTAAATAAAATCAATAAAGTAAGATCC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6258Contig1 591 2 3 U
AATATACAACTTAATTAGATTATGAAACACATATACAATCATATATGCGAGGACATATTT
TGAGTCTCGAATATTATTATATACACATAAAATATATTTGTTTCTAAATTTCAAACATAA
AATGAACCAATCATCACTTGCAACAAGCGAAATATTAAAAAATTGGTTTATAACCAATGA
TACATAAATTCAGGAAACCTATGTTCCCATATTTTGTAAAGACCTTTCTCAGCGGCTAAC
CATGTCGCGTTTGATCTATTCTTGAGGGAGCCATTCCATTTTGACGTATAAGCTTTGAAC
TTTTGGAAATGCATGAAGTGATACCCATGCTTTAACTCACATGTAAAGAGTGTCTCGTGA
AAAAACGCATCGTCAAATCTCCAATGTTTTTCTTGCCCATTCATTAAAATTAAAGGCTCG
AACTTGTCGTTTCCTGACCAGCATCTGACGCTGAGCTTTGTAGGCTTTCGAAACTTGTTT
ACAATCCCAAATGAGTTTTTCCCAAACGTATCTTCAACATAAACCCCTAAAACGATAAGA
GCAATTATGAAAACTTTCATTTTTTTTGTGAAAATGTTAAACTCTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI10JQB U 26
AF RR2GI10TF C 1
BS 1 25 RR2GI10TF
BS 26 535 RR2GI10JQB
BS 536 591 RR2GI10TF

RD RR2GI10JQB 510 0 0
AACACATATACAATCATATATGCGAGGACATATTTTGAGTCTCGAATATTATTATATACA
CATAAAATATATTTGTTTCTAAATTTCAAACATAAAATGAACCAATCATCACTTGCAACA
AGCGAAATATTAAAAAATTGGTTTATAACCAATGATACATAAATTCAGGAAACCTATGTT
CCCATATTTTGTAAAGACCTTTCTCAGCGGCTAACCATGTCGCGTTTGATCTATTCTTGA
GGGAGCCATTCCATTTTGACGTATAAGCTTTGAACTTTTGGAAATGCATGAAGTGATACC
CATGCTTTAACTCACATGTAAAGAGTGTCTCGTGAAAAAACGCATCGTCAAATCTCCAAT
GTTTTTCTTGCCCATTCATTAAAATTAAAGGCTCGAACTTGTCGTTTCCTGACCAGCATC
TGACGCTGAGCTTTGTAGGCTTTCGAAACTTGTTTACAATCCCAAATGAGTTTTTCCCAA
ACGTATCTTCAACATAAACCCCTAAAACGA

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2GI10TF 591 0 0
AATATACAACTTAATTAGATTATGAAACACATATACAATCATATATGCGAGGACATATTT
TGAGTCTCGAATATTATTATATACACATAAGATATATTTGTTTCTAAATTTCAAACATAA
AATGAACCAATCATCACTTGCAACAAGCGAAATATTAGAAAATTGGTTTATAACCAATGA
TACATAAATTCAGGAGACCTATGTTCCCATATTTTGTAGAGACCTTTCTCAGCGGCTAAC
CATGTCGCGTTTGATCTATTCTTGAGGGAGCCATTCCATTTTGACGTATAAGCTTTGAAC
TTTTGGAAATGCATGAAGTGATACCCATGCTTTAACTCACATGTAAAGAGTGTCTCGTGA
AAAAACGCATCGTCGAATCTCCAATGTTTTTCTTGCCCATTCATTAAGATTAGAGGCTCG
AACTTGTCGTTTCCTGACCAGCATCTGACGCTGAGCTTTGTAGGCTTTCGAAACTTGTTT
ACGATCCCAAATGAGTTTTTCCCAAACGTATCTTCAACATAAACCCCTAAAACGATAAGA
GCAATTATGAAAACTTTCATTTTTTTTGTGAAAATGTTAAACTCTTCTTCC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL6259Contig1 587 2 1 U
GGAAAGGATTATCGACCGAAGAATCTGAGATTTCTTGTTCGAGGGGTTCGGACTTTGCGA
TTTCAGCTGTTCTCGGCAACTCCATAAGCTCTCTTTCTCCCCCGTCGCCTCCTCTCTCCG
TTCTGTCACCATAATCTCTTCAACCATTCCTGATTTGAGTTTGATTCATTGTGGTTTCGC
GATGGGAGGCAAAGGGAACCTCGAGGCATCTCTCAGAGATGGTTGTGTCGAAAGCACTAA
TTGCAAAAATAGACAGACCATCAGGAATCGTGTGCTTCCAGATCGCAAAGGACAGCAACG
AGATTCTCAACTCGTGGGCAGTGAATTTGGAGAAGCTCTTAGATCTTGTTGAGAAGAGTT
GCCACCAAATTCACAAGGAAACCATGGTCCATAAAGCCGCACTGAGACCTTGAACATGTT
GTTTCCTTGGCGAAACCTTTTAAGGATGTTCGTTGAGTTATTAGCGATTTGTGTTGAAAA
AATAACTCGAAACAGTTGTTACCTTGGCAAGACTTGAAAAATGTAGTATGGTTCTGTACA
CTAGTGGAGTTTTTGCCACTTTATTTTATCAGTCATCTGTTTTCTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BG76JQ C 1
AF RR2BG76TF U 1
BS 1 587 RR2BG76TF

RD RR2BG76JQ 587 0 0
GGAAAGGATTATCGACCGAAGAATCTGAGATTTCTTGTTCGAGGGGTTCGGACTTTGCGA
TTTCAGCTGTTCTCGGCAACTCCATAAGCTCTCTTTCTCCCCCGTCGCCTCCTCTCTCCG
TTCTGTCACCATAATCTCTTCAACCATTCCTGATTTGAGTTTGATTCATTGTGGTTTCGC
GATGGGAGGCAAAGGGAACCTCGAGGCATCTTTCAGAGATGGTTGTGTCGAAAGCACTAA
TTGCAAAAATAGACAGACCATCAGGAATCGTGTGCTTCCAGATCGCAAAGGACAGCAACG
AGATTCTCAACTCGTGGGCAGTGAATTTGGAGAAGCTCTTAGATCTTGTTGAGAAGAGTT
GCCACCAAATTCACAAGGAAACCATGGTCCATAAAGCCGCACTGAGACCTTGAACATGTT
GTTTCCTTGGCGAAACCTTTTAAGGATGTTCGTTGAGTTATTAGCGATTTGTGTTGAAAA
AATAACTCGAAACAGTTGTTACCTTGGCAAGACTTGAAAAATGTAGTATGGTTCTGTACA
CTAGTGGAGTTTTTGCCACTTTATTTTATCAGTCATCTGTTTTCTCC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2BG76TF 587 0 0
GGAAAGGATTATCGACCGAAGAATCTGAGATTTCTTGTTCGAGGGGTTCGGACTTTGCGA
TTTCAGCTGTTCTCGGCAACTCCATAAGCTCTCTTTCTCCCCCGTCGCCTCCTCTCTCCG
TTCTGTCACCATAATCTCTTCAACCATTCCTGATTTGAGTTTGATTCATTGTGGTTTCGC
GATGGGAGGCAAAGGGAACCTCGAGGCATCTCTCAGAGATGGTTGTGTCGAAAGCACTAA
TTGCAAAAATAGACAGACCATCAGGAATCGTGTGCTTCCAGATCGCAAAGGACAGCAACG
AGATTCTCAACTCGTGGGCAGTGAATTTGGAGAAGCTCTTAGATCTTGTTGAGAAGAGTT
GCCACCAAATTCACAAGGAAACCATGGTCCATAAAGCCGCACTGAGACCTTGAACATGTT
GTTTCCTTGGCGAAACCTTTTAAGGATGTTCGTTGAGTTATTAGCGATTTGTGTTGAAAA
AATAACTCGAAACAGTTGTTACCTTGGCAAGACTTGAAAAATGTAGTATGGTTCTGTACA
CTAGTGGAGTTTTTGCCACTTTATTTTATCAGTCATCTGTTTTCTCC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL6260Contig1 658 2 5 U
GGGAAGTTTAACAACGATGGCTAAAACCAGAGGATCTTGTTTTGTCATCATCGCTATTTT
AGTGATCACCGATCTTTGTATCTGTGAAGCTCTCTTGTCTCAGAAAGAAGAGGACAAGGT
CTCTAAACTGCCTGGTCAGAACTTCAACGTTGACTTCGCTCACTACTCTGGGTTTATTAC
TACTAACGAGAAACTGGGAAGAGCACTCTTCTACTGGTTCTTTGAAGCCGCCGATGATGC
TGCCTCCAAACCCCTCGTTCTCTGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTTCATCTGTTGCATA
TGGTGAAGCAGAAGAGATAGGACCTTTTCACATCAAATCAGATGGGAAGACTCTTTACCT
TAATCAATATTCTTGGAACCAAGCTGCGAATATTTTGTTCCTAGATGCACCTGTTGGAGT
TGGCTATTCATACTCAAACACTTCATCTGATTTGCGTAGTAATGGTGATAAGAGAACTGC
TCAAGACTCACTGAAGTTTCTGCTGAAATAGGTTGAGCGTTATCCCGAGTATAAAGGAAG
AGAGTTTTACATAGTTGGAGAGAGCTATGCAGGGCATTACGTTCCCCAGCTGAGTCAAGC
TATTGTAAGACATAACCAAGCTTCTGGCGACAACACTATTAATCTTAAGGTTACATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D211TF U 11
AF RR2H084TF U 1
BS 1 117 RR2H084TF
BS 118 118 RR2D211TF
BS 119 295 RR2H084TF
BS 296 296 RR2D211TF
BS 297 658 RR2H084TF

RD RR2D211TF 558 0 0
GG
AACGATGGCTAAAACCAGAGGATCTTGTTTTGTCATCATCGCTATTTTAGTGATCACCGA
TCTTTGTATCTGTGAAGCTCTCTTGTCTCAGAAAGAAGAGGACAAGGTCTCTAAACTGCC
TGGTCAGAACTTCAACGTTGGCTTCGCTCACTACTCTGGGTTTATTACTACTAACGAGAA
ACTGGGAAGGGCACTCTTCTACTGGTTCTTTGAAGCCGCCGATGATGCTGCCTCCAAACC
CCTCGTTCTCTGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTTCATCTGTTGCATATGGTGAAGCAGA
AGAGATAGGACCTTTTCACATCAAATCAGATGGGAAGACTCTTTACCTTAATCAATATTC
TTGGAACCAAGCTGCGAATATTTTGTTCCTAGATGCACCTGTTGGAGTTGGCTATTCATA
CTCAAACACTTCATCTGATTTGCGTAGTAATGGTGATAAGAGAACTGCTCAAGACTCACT
GAAGTTTCTGCTGAAATGGGTTGAGCGTTATCCCGAGTATAAAGGAAGAGAGTTTTACAT
AGTTGGAGAGAGCTAT

QA 3 558 3 558
DS 

RD RR2H084TF 658 0 0
GGGAAGTTTAACAACGATGGCTAAAACCAGAGGATCTTGTTTTGTCATCATCGCTATTTT
AGTGATCACCGATCTTTGTATCTGTGAAGCTCTCTTGTCTCAGAAAGAAGAGGACAATGT
CTCTAAACTGCCTGGTCAGAACTTCAACGTTGACTTCGCTCACTACTCTGGGTTTATTAC
TACTAACGAGAAACTGGGAAGAGCACTCTTCTACTGGTTCTTTGAAGCCGCCGATGATGC
TGCCTCCAAACCCCTCGTTCTCTGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTTCATCTGTTTCATA
TGGTGAAGCAGAAGAGATAGGACCTTTTCACATCAAATCAGATGGGAAGACTCTTTACCT
TAATCAATATTCTTGGAACCAAGCTGCGAATATTTTGTTCCTAGATGCACCTGTTGGAGT
TGGCTATTCATACTCAAACACTTCATCTGATTTGCGTAGTAATGGTGATAAGAGAACTGC
TCAAGACTCACTGAAGTTTCTGCTGAAATAGGTTGAGCGTTATCCCGAGTATAAAGGAAG
AGAGTTTTACATAGTTGGAGAGAGCTATGCAGGGCATTACGTTCCCCAGCTGAGTCAAGC
TATTGTAAGACATAACCAAGCTTCTGGCGACAACACTATTAATCTTAAGGTTACATGG

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL6261Contig1 664 2 2 U
GGGTTATCATACTTCCTCACCGGTCCGATCACGACGGAGCTCACTCACTCGACTCCTCAT
CGTCGGTCTCCGGCGAACGTGTTTCATCCGTATTTTGTTACATCCTCTACTAACCATCAC
TCAAGTCTTATTAGCGAATTTCAATAGCAGAGAGAGGAGGATGTTGATGACACTAGGGGC
GGCAAACGCCGTCTCGTTCAACCCAAAGCTTATCTTGTTTCAAATTCGCTGCTCCGATTC
TAACCCTAAACGTGGCTTTGGCTCTAAAAAGGAAGAGAGAGATCCATCATTACAGCAAAG
GAAATCATCTTCGAAACAGTCCGTCTCTGCTCCCAAAAAGGCACCTGGTTTGAATTCTCA
GTTTGAAGGAAAACCTGGTCGATCTTTCGATGATGTAGACTTTGAGGAACGGCCGGAAAC
CATTAGAAGGTCAGCTCTTGAGAAGAAAAAGACTGAAGTAGTTAACGAGTTCGGTCCAAT
AGACTATGATGCACCTGTTCAGTCTGATCAAAAAACAATTGGTCTTGGTACCAAGGTTGG
AGTTGGCATAGCTGTTGTTGTCTTTGGTTTAGTTTTTGCTCTTGGAGACTTTCTCCCCAC
CGGAAGTGATAGTCCAACGGAGAAGACCTCGGTGGTTAAAAACAAAATTTCAGAAGAGGA
GAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2DG39TF U 1
AF RR2B343TF U 9
BS 1 616 RR2DG39TF
BS 617 664 RR2B343TF

RD RR2DG39TF 616 0 0
GGGTTATCATACTTCCTCACCGGTCCGATCACGACGGAGCTCACTCACTCGACTCCTCAT
CGTCGGTCTCCGGCGAACGTGTTTCATCCGTATTTTGTTACATCCTCTACTAACCATCAC
TCAAGTCTTATTAGCGAATTTCAATAGCAGAGAGAGGAGGATGTTGATGACACTAGGGGC
GGCAAACGCCGTCTCGTTCAACCCAAAGCTTATCTTGTTTCAAATTCGCTGCTCCGATTC
TAACCCTAAACGTGGCTTTGGCTCTAAAAAGGAAGAGAGAGATCCATCATTACAGCAAAG
GAAATCATCTTCGAAACAGTCCGTCTCTGCTCCCAAAAAGGCACCTGGTTTGAATTCTCA
GTTTGAAGGAAAACCTGGTCGATCTTTCGATGATGTAGACTTTGAGGAACGGCCGGAAAC
CATTAGAAGGTCAGCTCTTGAGAAGAAAAAGACTGAAGTAGTTAACGAGTTCGGTCCAAT
AGACTATGATGCACCTGTTCAGTCTGATCAAAAAACAATTGGTCTTGGTACCAAGGTTGG
AGTTGGCATAGCTGTTGTTGTCTTTGGTTTAGTTTTTGCTCTTGGAGACTTTCTCCCCAC
CGGAAGTGATAGTCCA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2B343TF 656 0 0
GG
ACTTCCTCACCGGTCCGATCACGACGGAGCTCACTCACTCGACTCCTCATCGTCGGTCTC
CGGCGAACGTGTTTCATCCGTATTTTGTTACATCCTCTACTAACCATCACTCAAGTCTTA
TTAGCGAATTTCAATAGCAGAGAGAGGAGGATGTTGATGACACTAGGGGCGGCAAACGCC
GTCTCGTTCAACCCAAAGCTTATCTTGTTTCAAATTCGCTGCTCCGATTCTAACCCTAAA
CGTGGCTTTGGCTCTAAAAAGGAAGAGAGAGATCCATCATTACAGCAAAGGAAATCATCT
TCGAAACAGTCCGTCTCTGCTCCCAGAAAGGCACCTGGTTTGAATTCTCAGTTTGAAGGA
AAACCTGGTCGATCTTTCGATGATGTAGACTTTGAGGAACGGCTGGAAACCATTAGAAGG
TCAGCTCTTGAGAAGAAAAAGACTGAAGTAGTTAACGAGTTCGGTCCAATAGACTATGAT
GCACCTGTTCAGTCTGATCAGAAAACAATTTGTCTTGGTACCAAGGTTGGAGTTGGCATA
GCTGTTGTTGTCTTTGGTTTAGTTTTTGCTCTTGGAGACTTTCTCCCCACCGGAAGTGAT
AGTCCAACGGAGAAGACCTCGGTGGTTAAAAACAAAATTTCAGAAGAGGAGAAA

QA 3 656 3 656
DS 



AS 1 2

CO CL6262Contig1 489 2 3 U
ATAAACTCTTTTATTATTTGCATTCTCCGGTAGTTTAATGATCCAAAAGTGTTACAAACC
CAAGATAGAGAATGATAAAAAAAAGGAAAAAATGGAATCTGGAATCACAAGTTCTTGAAA
GCAAAGTCATGTGCATCCTTGGGAGGAGTAAGCCTAGCCAACAACCCCTTGTTGGGACAC
CGCTCCCCATCCACAAAGTAATCTTCTTTCTTGTCTTGGGGTCCGATGCTGATCTTGTGC
TCATCATCATTATCTTCCTCTCTAGTGTTTGCTCTAAATGATGCCCAGCTTCTCTGGTAA
AAAGTTTGAGCCTCAGGGAATCTGACCTTAGGGGTCACTGATGATGGTGATGGTGACCAT
GTCCCTGCAATTGACCGGCCATATCCTGAAGCGAAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGAGACGG
CGAGATTGAGAGCGGATCAAGTGAATCAGAGCTGATCTTCCCATCGCCGTTTTCGATTTG
CACGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AU22JQ U 72
AF RR2AU22TF C 1
BS 1 71 RR2AU22TF
BS 72 394 RR2AU22JQ
BS 395 489 RR2AU22TF

RD RR2AU22JQ 323 0 0
ATGATAAAAAAAAGGAAAAAATGGAATCTGGAATCACAAGTTCTTGAAAGCAAAGTCATG
TGCATCCTTGGGAGGAGTAAGCCTAGCCAACAACCCCTTGTTGGGACACCGCTCCCCATC
CACAAAGTAATCTTCTTTCTTGTCTTGGGGTCCGATGCTGATCTTGTGCTCATCATCATT
ATCTTCCTCTCTAGTGTTTGCTCTAAATGATGCCCAGCTTCTCTGGTAAAAAGTTTGAGC
CTCAGGGAATCTGACCTTAGGGGTCACTGATGATGGTGATGGTGACCATGTCCCTGCAAT
TGACCGGCCATATCCTGAAGCGA

QA 1 323 1 323
DS 

RD RR2AU22TF 489 0 0
ATAAACTCTTTTATTATTTGCATTCTCCGGTAGTTTAATGATCCAAAAGTGTTACAAACC
CAAGATAGAGAATGATAAAGAAGAGGAAAAAATGGAATCTGGAATCACAAGTTCTTGAAA
GCAGAGTCATGTGCATCCTTGGGAGGAGTAAGCCTAGCCAACAACGCCTTGTTGGGACAC
CGCTCCGCATCCACAAAGTAGTCTTCTTTCTTGTCTTGTGGTCCGATGCTGATCTTGTGC
TCATCATCATTATCTTCCTCTCTAGTGTTTGCTCTAGATGATGCCCAGCTTCTCTGGTAA
AGAGTTTGAGCCTCAGGGAATCTGACCTTAGGGGTCACTGATGATGGTGATGGTGACCAT
GTCCCTGCAATTGACCGGCCATATCCTGAAGCGAAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGAGACGG
CGAGATTGAGAGCGGATCAAGTGAATCAGAGCTGATCTTCCCATCGCCGTTTTCGATTTG
CACGATTCC

QA 1 489 1 489
DS 



AS 1 2

CO CL6263Contig1 774 2 6 U
GGGAGGCAATAAAACAGCACAAGAGAAACCAAATCAAAAGAAGAACAAAAAGAGAGAGTA
AATGTCTCCAGATCACTTACCTTCTTCATCTCAAGTCTTCCAAGAACATTCCATTGAAAG
TTTCATCTCCAGAAAATTGCTTCAGCAACTTTCCTTTACTCACAACATACAACAGCAACA
AGGTCATGTACCTGATAAGAACAACTTGAGCGGCAACGTTCTCCTTATTCTCTCTGTCCT
TGTATGCGGTATCATCTGCTCACTCGGGTTACATTACGTAATCCGCTGCGTGTTCAGACG
TCACTCAAGTTTCATGATCTCTGATCCCATCTCAAGCCCGTCCACGCCAGCAGCAAACAA
AGGCATCAAGAAGAAAGCTCTCAAGATGTTCCCTGTAGTTAAATACTCACGTGAGATGAA
CCTCTCAGGGCTTGGCGAGGAGTGTGTTATTTGTTTGTCTGATTTCGTAGCTGGAGAACA
GATACGGCTGCTTCCTAAGTGCAACCACGGGTTCCACGTTCGTTGTATCGACAGGTGGCT
TACGCAACATATCACTTGTCCGAAGTGCAGACACTGTCTGGTTGAGACATGCCAAAAGAT
CTTAGGCGACTGCGATGAAGATCATCAGGTTCCAGCAAGGGAAAGCATAGATGTCAGAAT
TGCTCCTCTAGAACCTGAAGCAAGAGTAAACACTTTTAGATAAAGCAGCTAGAGAATATG
CCAAGAAACAGTTAGGTTTCAAGAACTTAATTGGTTCTTCTCTTTTAGATGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C494TF U 1
AF RR2C494JQ C 120
BS 1 605 RR2C494TF
BS 606 606 RR2C494JQ
BS 607 628 RR2C494TF
BS 629 629 RR2C494JQ
BS 630 715 RR2C494TF
BS 716 774 RR2C494JQ

RD RR2C494TF 722 0 0
GGGAGGCAATAAAACAGCACAAGAGAAACCAAATCAAAAGAAGAACAAAAAGAGAGAGTA
AATGTCTCCAGATCACTTACCTTCTTCATCTCAAGTCTTCCAAGAACATTCCATTGAAAG
TTTCATCTCCAGAAAATTGCTTCAGCAACTTTCCTTTACTCACAACATACAACAGCAACA
AGGTCATGTACCTGATAAGAACAACTTGAGCGGCAACGTTCTCCTTATTCTCTCTGTCCT
TGTATGCGGTATCATCTGCTCACTCGGGTTACATTACGTAATCCGCTGCGTGTTCAGACG
TCACTCAAGTTTCATGATCTCTGATCCCATCTCAAGCCCGTCCACGCCAGCAGCAAACAA
AGGCATCAAGAAGAAAGCTCTCAAGATGTTCCCTGTAGTTAAATACTCACGTGAGATGAA
CCTCTCAGGGCTTGGCGAGGAGTGTGTTATTTGTTTGTCTGATTTCGTAGCTGGAGAACA
GATACGGCTGCTTCCTAAGTGCAACCACGGGTTCCACGTTCGTTGTATCGACAGGTGGCT
TACGCAACATATCACTTGTCCGAAGTGCAGACACTGTCTGGTTGAGACATGCCAAAAGAT
CTTAG*CGACTGCGATGAAGATCATCAG*TTCCAGCAAGGGAAAGCATAGATGTCAGAAT
TGCTCCTCTAGAACCTGAAGCAAGAGTAAACACTTTTAGATAAAGCAGCTAGAGA
TATGCCA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2C494JQ 655 0 0
GTTTCATCTCCAGAAAATTGCTTCAGCAACTTTCCTTTACTCACAACATACAACAGCAAC
AAGGTCATGTACCTGATAAGAACAACTTGAGCGGCAACGTTCTCCTTATTCTCTCTGTCC
TTGTATGCGGTATCATCTGCTCACTCGGGTTACATTACGTAATCCGCTGCGTGTTCAGAC
GTCACTCAAGTTTCATGATCTCTGATCCCATCTCAAGCCCGTCCACGCCAGCAGCAAACA
AAGGCATCAAGAAGAAAGCTCTCAAGATGTTCCCTGTAGTTAAATACTCACGTGAGATGA
ACCTCTCAGGGCTTGGCGAGGAGTGTGTTATTTGTTTGTCTGATTTCGTAGCTGGAGAAC
AGATACGGCTGCTTCCTAAGTGCAACCACGGGTTCCACGTTCGTTGTATCGACAGGTGGC
TTACGCAACATATCACTTGTCCGAAGTGCAGACACTGTCTGGTTGAGACATGCCAAAAGA
TCTTAGGCGACTGCGATGAAGATCATCAGGTTCCAGCAAGGGAAAGCATAGATGTCAGAA
TTGCTCCTCTAGAACCTGAAGCAAGAGTAAACACTTTTAGATAAAGCAGCTAGAGAATAT
GCCAAGAAACAGTTAGGTTTCAAGAACTTAATTGGTTCTTCTCTTTTAGATGTGA

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL6264Contig1 639 2 1 U
GGCTGGAGACATTCATCACATTTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTAGTTGGTTGGAAACGAG
ATGAATCCCCAAGTGGACAAGGTGGTGAGAAGAACGACTATTGTGGCCACTGCTGTTGCG
TCTTACTTACTCCTCACCGCTGATTACGGCCCCGAGCCTAACGCTCTTGATCCTATCAAA
CAGAGAATAGTATCGGCTCAAGATTCTGTCAAAGACTTCTTCTTTCCTTCATCAAAGCAC
AAGTAACAAGCGCGACACACTATCTGAAGCAACAAAGATGTTTGCTGAACATCAAAAACA
CCAACTTTCATCAGTCTTTTGTTCTTTTTCTTTGTCTCTTTTTCAGAATTTACTCTTGCT
CTCTCCACTCTACTCTTTAGACGACTATAAGATATATAATGTTCATAATAACATGACTGG
GTGAAGGAAGTTTTATATATTCGTGGAAATACATAACCGAACCAACTGAACAGAATCTGA
CTTGAAAGCTTGGGTTTAGTATATCATTATTTATGTTCAAGATTTCTCTTTGTAAGATTA
CCGCCACCACCATACAAAACCTCCTTCACCCAGTCAAAAACAACTAATCACAGACAGGGG
GACGGATAGAAGAAATAAGATTATTACGACAGAGATAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AI20JQ C 1
AF RR2AI20TF U 1
BS 1 639 RR2AI20TF

RD RR2AI20JQ 639 0 0
GGCTGGAGACATTCATCACATTTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTAGTTGGTTGGAAACGAG
ATGAATCCCCAAGTGGACAAGGTGGTGAGAAGAACGACTATTGTGGCCACTGCTGTTGCG
TCTTACTTACTCCTCACCGCTGATTACGGCCCCGAGCCTAACGCTCTTGATCCTATCAAA
CAGAGAATAGTATCGGCTCAAGATTCTGTCAAAGACTTCTTCTTTCCTTCATCAAAGCAC
AAGTAACAAGCGCGACACACTATCTGAAGCAACAAAGATGTTTGCTGAACATCAAAAACA
CCAACTTTCATCAGTCTTTTGTTCTTTTTCTTTGTCTCTTTTTCAGAATTTACTCTTGCT
CTCTCCACTCTACTCTTTAGACGACTATAAGATATATAATGTTCATAATAACATGACTGG
GTGAAGGAAGTTTTATATATTCGTGGAAATACATAACCGAACCAACTGAACAGAATCTGA
CTTGAAAGCTTGGGTTTAGTATATCATTATTTATGTTCAAGATTTCTCTTTGTAAGATTA
CCGCCACCACCATACAAAACCTCCTTCACCCAGTCAAAAACAACTAATCACAGACAGGGG
GACGGATAGAAGAAATAAGATTATTACGACAGAGATAGG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2AI20TF 639 0 0
GGCTGGAGACATTCATCACATTTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTAGTTGGTTGGAAACGAG
ATGAATCCCCAAGTGGACAAGGTGGTGAGAAGAACGACTATTGTGGCCACTGCTGTTGCG
TCTTACTTACTCCTCACCGCTGATTACGGCCCCGAGCCTAACGCTCTTGATCCTATCAAA
CAGAGAATAGTATCGGCTCAAGATTCTGTCAAAGACTTCTTCTTTCCTTCATCAAAGCAC
AAGTAACAAGCGCGACACACTATCTGAAGCAACAAAGATGTTTGCTGAACATCAAAAACA
CCAACTTTCATCAGTCTTTTGTTCTTTTTCTTTGTCTCTTTTTCAGAATTTACTCTTGCT
CTCTCCACTCTACTCTTTAGACGACTATAAGATATATAATGTTCATAATAACATGACTGG
GTGAAGGAAGTTTTATATATTCGTGGAAATACATAACCGAACCAACTGAACAGAATCTGA
CTTGAAAGCTTGGGTTTAGTATATCATTATTTATGTTCAAGATTTCTCTTTGTAAGATTA
CCGCCACCACCATACAAAACCTCCTTCACCCAGTCAAAAACAACTAATCACAGACAGGGG
GACGGATAGAAGAAATAAGATTATTACGACAGAGATAGG

QA 1 639 1 639
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6266Contig1 752 2 5 U
AGCTGTAATCAAGACATTTATAAATCTGGCTAAATAGAACAGATAAATGGTAGCTATTAT
TGTTATTATATCTTAAATGAAACATGGATACGTCGTAATATGCTGCTACTTATTGTAGTA
CTCTTCGTAAACACAAAGATAGACATATGTATATGTAGTACCCAGTATCCGGTCTAGAAC
AACTCAACTCCTAAAGCACAAATAAAGAAAAGTTGCCCTTTAGAGGTATCGAATCCAAAG
CCTCAACCATCTATACCAAAGAAATTCTCGGTAAATGGCGTCCCACAATTTACTTATAAC
GTCTAGCGCCTAAAGCTCCTGTTTCATGGGATTTAGCTCAAAGCCGACATTGGTGGTACC
TAGTCGTTTAGAAAGTTCTCGAGGCAATGTCCTTGGTCCAGATGCCGACTCCAAAACTTC
TTGTAGTACTCCGCATAAGTGTAGTCTCTGTAGATTGGCTTGGCCTCTTCCTCTTTGGCT
TCCCACAAGGGCTTTGCCGGGCTTATGACAGCACCGTTATCAGGGCACATAAATGATGCG
ATCGATAGTCTCGGTTTTTCAGTGTTTGTCACTGCGCGATGCCAAACACTTTTGTAAACT
CCGTTACTCAATGCCTGTAACTGGTCACCAATGTTGATGACAAAAGCATCAGGACGAGGA
TTAATAGCGAACCAGTGACCGTCGATCAAGATCTGGAGACCGCAAACGGTAGCATCTTGG
AGAAGAATGGTGAGGGCATTTGGGTCGGTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E016JQ U 40
AF RR2A782JQ U 1
BS 1 390 RR2A782JQ
BS 391 391 RR2E016JQ
BS 392 403 RR2A782JQ
BS 404 404 RR2E016JQ
BS 405 752 RR2A782JQ

RD RR2E016JQ 615 0 0
CAGATAAATGGTAGCTATTATTGTTATTATATCTTAAATGAAACATGGATACGTCGTAGT
ATGCTGCTACTTATTGTAGTACTCTTCGTAAACACAAAGATAGACATATGTATATGTAGT
ACCCAGTATCCGGTCTAGAACAACTCAACTCCTAAAGCACAAATAAAGAAAAGTTGCCCT
TTAGAG**ATCGAATCCAAAGCCTCAACCATCTATACCAAAGAAATTCTCGGTAAATGGC
GTCCCACAATTTACTTATAACGTCTAGCGCCTAAAGCTCCTGTTTCATGGGATTTAGCTC
AAAGCCGACATTGGTGGTACCTAGTCGTTTAGAAAGTTCTCGAGGCAATGTCCTTGGTCC
AGATGCCGACTCCAAAACTTCTTGTAGTACTCTGCATAAGTGTAGTCTCTGTAGATTGGC
TTGGCCTCTTCCTCTTTGGCTTCCCACAAGGGCTTTGCCGGGCTTATGACAGCACCGTTA
TCAGGGCACATAAATGATGCGATCGATAGTCTCGGTTTTTCAGTGTTTGTCACTGCGCGA
TGCCAAACACTTTTGTAAACTCCGTTACTCAATGCCTGTAACTGGTCACCAATGTTGATG
ACAAAAGCATCAGGA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2A782JQ 752 0 0
AGCTGTAATCAAGACATTTATAAATCTGGCTAAATAGAACAGATAAATGGTAGCTATTAT
TGTTATTATATCTTAAATGAAACATGGATACGTCGTAATATGCTGCTACTTATTGTAGTA
CTCTTCGTAAACACAAAGATAGACATATGTATATGTAGTACCCAGTATCCGGTCTAGAAC
AACTCAACTCCTAAAGCACAAATAAAGAAAAGTTGCCCTTTAGAGGTATCGAATCCAAAG
CCTCAACCATCTATACCAAAGAAATTCTCGGTAAATGGCGTCCCACAATTTACTTATAAC
GTCTAGCGCCTAAAGCTCCTGTTTCATGGGATTTAGCTCAAAGCCGACATTGGTGGTACC
TAGTCGTTTAGAAAGTTCTCGAGGCAATGTTCTTGGTCCAGATTCCGACTCCAAAACTTC
TTGTAGTACTCCGCATAAGTGTAGTCTCTGTAGATTGGCTTGGCCTCTTCCTCTTTGGCT
TCCCACAAGGGCTTTGCCGGGCTTATGACAGCACCGTTATCAGGGCACATAAATGATGCG
ATCGATAGTCTCGGTTTTTCAGTGTTTGTCACTGCGCGATGCCAAACACTTTTGTAAACT
CCGTTACTCAATGCCTGTAACTGGTCACCAATGTTGATGACAAAAGCATCAGGACGAGGA
TTAATAGCGAACCAGTGACCGTCGATCAAGATCTGGAGACCGCAAACGGTAGCATCTTGG
AGAAGAATGGTGAGGGCATTTGGGTCGGTATG

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL6267Contig1 665 2 3 U
TTTTTTAGTGAATAACTTGGATAAATTAATCAAATCGACAAAAATAAACCACAATCAGAA
ACGGATACGAAGATAGATGGAGAAGCTAAACATACAATGTATCCAAACAAAACAAATCGG
AAAAAACTCTAAAAAAAACTCCGCCTAAAAATAACATCAAGATGCATCCTTCCTGAGCTT
AGATGTTAACAGGGCTTAGAGTGTTGGTCTAGGAGCTTCAACTACATGCCTAACAACAAA
CCCGTAAACCCAAATCTCTTTGCCGAGTGTTTTCTGACCGATTGGTTTCACCGGAGCAGC
GAAGCCACCAATGCACCTTCACGTTTCTCGGAGTTCACCACGCCGGAAGTGACCACGGTC
TGATCGACGGAGCTGTTCTGACCGGAGGAGACGGCGGAGTCACGGAGTGTTTTCTGTGAG
TCGGATAACGTCATCGTAATGAGCAGTGGAGAGGATTGGACTATTTTTTTGAGAAAATCT
AAAACCAAAAGATAGATTTATATAGGATGTCGAAGCAAACAACACGAAACGCTCCAAGGA
GCTAAGAGTGAGAAATCGAAGAGATTCCATTAAAGAGAGTAAAAGGAGTGGGCAGAGAAT
TGATTGTTCGAAAAAGATCACGAAGAAGAGAAGGAAGATGAAAGGATTCTCAATCGAGAT
CGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2EJ39JQ U 7
AF RR2EJ39TF C 1
BS 1 6 RR2EJ39TF
BS 7 654 RR2EJ39JQ
BS 655 665 RR2EJ39TF

RD RR2EJ39JQ 648 0 0
AGTGAATAACTTGGATAAATTAATCAAATCGACAAAAATAAACCACAATCAGAAACGGAT
ACGAAGATAGATGGAGAAGCTAAACATACAATGTATCCAAACAAAACAAATCGGAAAAAA
CTCTAAAAAAAACTCCGCCTAAAAATAACATCAAGATGCATCCTTCCTGAGCTTAGATGT
TAACAGGGCTTAGAGTGTTGGTCTAGGAGCTTCAACTACATGCCTAACAACAAACCCGTA
AACCCAAATCTCTTTGCCGAGTGTTTTCTGACCGATTGGTTTCACCGGAGCAGCGAAGCC
ACCAATGCACCTTCACGTTTCTCGGAGTTCACCACGCCGGAAGTGACCACGGTCTGATCG
ACGGAGCTGTTCTGACCGGAGGAGACGGCGGAGTCACGGAGTGTTTTCTGTGAGTCGGAT
AACGTCATCGTAATGAGCAGTGGAGAGGATTGGACTATTTTTTTGAGAAAATCTAAAACC
AAAAGATAGATTTATATAGGATGTCGAAGCAAACAACACGAAACGCTCCAAGGAGCTAAG
AGTGAGAAATCGAAGAGATTCCATTAAAGAGAGTAAAAGGAGTGGGCAGAGAATTGATTG
TTCGAAAAAGATCACGAAGAAGAGAAGGAAGATGAAAGGATTCTCAAT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2EJ39TF 665 0 0
TTTTTTAGTGAATAACTTGGATAAATTAATCAAATCGACAAAA*TAAACCACAATCAGAA
ACGGATACGAAGATAGATGGAGAAGCTAAACATACAATGTATCCAAACAAAACAAATCGG
AAAAAACTCTAAAAAAAACTCCGCCTAAAAATAACATCAAGATGCATCCTTCCTGAGCTT
AGATGTTAACAGGGCTTAGAGTGTTGGTCTAGGAGCTTCAACTACATGCCTAACAACAAA
CCCGTAAACCCAAATCTCTTTGCCGAGTGTTTTCTGACCGATTGGTTTCACCGGAGCAGC
GAAGCCACCAATGCACCTTCACGTTTCTCGGAGTTCACCACGCCGGAAGTGACCACGGTC
TGATCGACGGAGCTGTTCTGACCGGAGGAGACGGCGGAGTCACGGAGTGTTTTCTGTGAG
TCGGATAACGTCATCGTAATGAGCAGTGGAGAGGATTGGACTATTTTTTTGAGAAAATCT
AAAACCAAAAGATAGATTTATATAGGATGTCGAAGCAAACAACACGAAACGCTCCAAGGA
GCTAAGAGTGAGAAATCGAAGAGATTCCATTAAAGAGAGTAAAAGGAGTGGGCAGAGAAT
TGATTGTTCGAAAAAGATCACGAAGAAGAGAAGGAAGATGAAAGGATTCTCAATCGAGAT
CGTCC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6269Contig1 878 2 2 U
TTTTTCAAGATCTGAAGACAGGAGAAAAGGAACAAAGAATATCTAAATACCAGAGAGACC
AAACTCGTCGTTTATGTGTTCCATCGTGTTGTGTGCTTTAAATTAGAAACCAAACCAAAA
GGGTGACAATAAAAACACATTTAGAAGCTTAGAAGAAGGAGTTTGTGAAGTTCTAGTTGG
TTAGTGTACCGTTTCTGGCAAATGCAGTGTCTCTTCTCTCTGGATGGAATACTATTAGAG
TAATATAGACTTTATGATGATGGAGAATAAGCACAGTGTCTGTTCTCTTGAAGAAAGCAG
CATGAAACGACACAAGTCTGATCTCTCTTTCTCTTCCAAGGAGAGGAAGGACAAGGTTGG
AGAACGTGTTTCAGCTCTTCAACAGCTAGTTTCCCCTTATGGAAAGACCGACACTGCATC
AGTTCTTCTGGAGGCGATGCAATACATTCAGTTTCTTCAAGAACAAGTCAAGGTTCTGAG
CGCTCCATATCTGCAAACATCTCCCACTATTACGCAGGAAGAGCTGGATGAGCACAGTTT
GAGAAACATAGGGTTGTGTCTTGTCCCAATGGAGTATACATTAGGGATTGCTCAAAGTAA
TGGTGCAGATATATGGGCTCCTGTGAAGACTCCAACATTTCCTGCTTTTGATGTCTGATT
CCACCGCTGCTAAGATATGTGTGTCTCAAGAATCAAGATTAATGAAAGATAAATCAAAAA
GTTAGTCTGAGGATGTCTATGTAACATACATTGATGGAGAGTGATCATAGTCATCAGTGA
TGGCTGTTTCTGTTTCTTCTTTACTGCTTAATCTCCAAACTATGTTGATGGCTTCATAGC
CCATTATTTGGATTTGTATAATTTTTCTACTGCGTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C786TF U 1
AF RR2C786JQ C 17
BS 1 606 RR2C786TF
BS 607 878 RR2C786JQ

RD RR2C786TF 606 0 0
TTTTTCAAGATCTGAAGACAGGAGAAAAGGAACAAAGAATATCTAAATACCAGAGAGACC
AAACTCGTCGTTTATGTGTTCCATCGTGTTGTGTGCTTTAAATTAGAAACCAAACCAAAA
GGGTGACAATAAAAACACATTTAGAAGCTTAGAAGAAGGAGTTTGTGAAGTTCTAGTTGG
TTAGTGTACCGTTTCTGGCAAATGCAGTGTCTCTTCTCTCTGGATGGAATACTATTAGAG
TAATATAGACTTTATGATGATGGAGAATAAGCACAGTGTCTGTTCTCTTGAAGAAAGCAG
CATGAAACGACACAAGTCTGATCTCTCTTTCTCTTCCAAGGAGAGGAAGGACAAGGTTGG
AGAACGTGTTTCAGCTCTTCAACAGCTAGTTTCCCCTTATGGAAAGACCGACACTGCATC
AGTTCTTCTGGAGGCGATGCAATACATTCAGTTTCTTCAAGAACAAGTCAAGGTTCTGAG
CGCTCCATATCTGCAAACATCTCCCACTATTACGCAGGAAGAGCTGGATGAGCACAGTTT
GAGAAACATAGGGTTGTGTCTTGTCCCAATGGAGTATACATTAGGGATTGCTCAAAGTAA
TGGTGC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2C786JQ 862 0 0
GACAGGAGAAAAGGAACAAAGAATATCTAAATACCAGAGAGACCAAACTCGTCGTTTATG
TGTTCCATCGTGTTGTGTGCTTTAAATTAGAAACCAAACCAAAAGGGTGACAATAAAAAC
ACATTTAGAAGCTTAGAAGAAGGAGTTTGTGAAGTTCTAGTTGGTTAGTGTACCGTTTCT
GGCAAATGCAGTGTCTCTTCTCTCTGGATGGAATACTATTAGAGTAATATAGACTTTATG
ATGATGGAGAATAAGCACAGTGTCTGTTCTCTTGAAGAAAGCAGCATGAAACGACACAAG
TCTGATCTCTCTTTCTCTTCCAAGGAGAGGAAGGACAAGGTTGGAGAACGTGTTTCAGCT
CTTCAACAGCTAGTTTCCCCTTATGGAAAGACCGACACTGCATCAGTTCTTCTGGAGGCG
ATGCAATACATTCAGTTTCTTCAAGAACAAGTCAAGGTTCTGAGCGCTCCATATCTGCAA
ACATCTCCCACTATTACGCAGGAAGAGCTGGATGAGCACAGTTTGAGAAACATAGGGTTG
TGTCTTGTCCCAATGGAGTATACATTAGGGATTGCTCAAAGTAATGGTGCAGATATATGG
GCTCCTGTGAAGACTCCAACATTTCCTGCTTTTGATGTCTGATTCCACCGCTGCTAAGAT
ATGTGTGTCTCAAGAATCAAGATTAATGAAAGATAAATCAAAAAGTTAGTCTGAGGATGT
CTATGTAACATACATTGATGGAGAGTGATCATAGTCATCAGTGATGGCTGTTTCTGTTTC
TTCTTTACTGCTTAATCTCCAAACTATGTTGATGGCTTCATAGCCCATTATTTGGATTTG
TATAATTTTTCTACTGCGTTCG

QA 1 862 1 862
DS 



AS 1 2

CO CL6270Contig1 874 2 2 U
GCAAGCCCTTGACATGGGCCTGCTGGTCGAAAACACAACCATTGATCAGTTGGGTATTGC
TCGTAAAGTCACCATAAGCAAAGATTCGACTACGCTTATTGCAGATGCAGCTTCCAAGGA
CGAGTTACAAGCTCGTATCTCCCAGCTGAAGAAAGAGCTATTCGAGACTGATTCTGTGTA
TGACTCAGAGAAGCTCGCTGAGAGAATAGCTAAACTCTCTGGCGGTGTTGCTGTCATTAA
AGTCGGAGCAGCGACTGAAACTGAGCTTGAGGACCGTAAGCTTCGTATTGAGGACGCAAA
GAACGCTACATTTGCTGCTATCGAAGAAGGTATAGTTCCTGGTGGTGGTGCGACTTTGGT
GCATCTCTCAACCGTGATTCCTGCCATTAAAGAGAAGCTGGAGGATGCTGATGAACGTTT
GGGAGCTGACATAGTACAGAAGGCTTTGGTGGCACCAGCTGCACTTATTGCTCAGAACGC
TGGAATCGAAGGAGAAGTTGTAGTTGAAAAGATTATGTTCAGTGAATGGGAGATAGGGTA
CAACGCCATGACTGATACCTATGAGAATCTGTTGGAAGCTGGAGTGATTGATCCAGCTAA
AGTCACGAGATGTGGGCTTCAGAACGCTGCATCGGTTGCAGGAATGGTACTGACAACTCA
GGCCATTGTTGTTGACAAACCGAAACCTAAGGCTCCTGCTGCTGCTGCTCCTCAGGGTCT
CATGGTGTAATGGGAAAATTACACACTTTTTACCATATGGTCATATTTGTTGACCCCAGT
GATCTCACAATGTTTTTTGTTTTTTTTTTAACTTTCTTCGTTGGGGATATGAGTAATCTT
TTTAACGGCAACAACAAATAAATTCACTTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO94TF U 1
AF RR2BO94JQ C 87
BS 1 637 RR2BO94TF
BS 638 874 RR2BO94JQ

RD RR2BO94TF 637 0 0
GCAAGCCCTTGACATGGGCCTGCTGGTCGAAAACACAACCATTGATCAGTTGGGTATTGC
TCGTAAAGTCACCATAAGCAAAGATTCGACTACGCTTATTGCAGATGCAGCTTCCAAGGA
CGAGTTACAAGCTCGTATCTCCCAGCTGAAGAAAGAGCTATTCGAGACTGATTCTGTGTA
TGACTCAGAGAAGCTCGCTGAGAGAATAGCTAAACTCTCTGGCGGTGTTGCTGTCATTAA
AGTCGGAGCAGCGACTGAAACTGAGCTTGAGGACCGTAAGCTTCGTATTGAGGACGCAAA
GAACGCTACATTTGCTGCTATCGAAGAAGGTATAGTTCCTGGTGGTGGTGCGACTTTGGT
GCATCTCTCAACCGTGATTCCTGCCATTAAAGAGAAGCTGGAGGATGCTGATGAACGTTT
GGGAGCTGACATAGTACAGAAGGCTTTGGTGGCACCAGCTGCACTTATTGCTCAGAACGC
TGGAATCGAAGGAGAAGTTGTAGTTGAAAAGATTATGTTCAGTGAATGGGAGATAGGGTA
CAACGCCATGACTGATACCTATGAGAATCTGTTGGAAGCTGGAGTGATTGATCCAGCTAA
AGTCACGAGATGTGGGCTTCAGAACGCTGCATCGGTT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2BO94JQ 788 0 0
CGACTACGCTTAT*GCAGATGCAGCTTCCAAGGACGAGTTACAAGCTCGTATCTCCCAGC
TGAAGAAAGAGCTATTCGAGACTGATTCTGTGTATGACTCAGAGAAGCTCGCTGAGAGAA
TAGCTAAACTCTCTGGCGGTGTTGCTGTCATTAAAGTCGGAGCAGCGACTGAAACTGAGC
TTGAGGACCGTAAGCTTCGTATTGAGGACGCAAAGAACGCTACATTTGCTGCTATCGAAG
AAGGTATAGTTCCTGGTGGTGGTGCGACTTTGGTGCATCTCTCAACCGTGATTCCTGCCA
TTAAAGAGAAGCTGGAGGATGCTGATGAACGTTTGGGAGCTGACATAGTACAGAAGGCTT
TGGTGGCACCAGCTGCACTTATTGCTCAGAACGCTGGAATCGAAGGAGAAGTTGTAGTTG
AAAAGATTATGTTCAGTGAATGGGAGATAGGGTACAACGCCATGACTGATACCTATGAGA
ATCTGTTGGAAGCTGGAGTGATTGATCCAGCTAAAGTCACGAGATGTGGGCTTCAGAACG
CTGCATCGGTTGCAGGAATGGTACTGACAACTCAGGCCATTGTTGTTGACAAACCGAAAC
CTAAGGCTCCTGCTGCTGCTGCTCCTCAGGGTCTCATGGTGTAATGGGAAAATTACACAC
TTTTTACCATATGGTCATATTTGTTGACCCCAGTGATCTCACAATGTTTTTTGTTTTTTT
TTTAACTTTCTTCGTTGGGGATATGAGTAATCTTTTTAACGGCAACAACAAATAAATTCA
CTTTGATT

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL6271Contig1 901 2 2 U
GGCATCCACCTCTCTGATCAATAAAATGTCGCTTAGCCTGTCCAGAACAAGCAGCATCGT
TATGCTTATTGCTTACATTGCTTATCTCATCTTCCAGCTCTGGACTCACCGCCAATTGTT
TGAAGCACAAGAGGATGATGAGGATGATGCGTATAATGATGAAGTGACCGTTGAGGAAAC
TCCGGTGATAGGATTTTGGAGCGGATTTGCTTGGCTCGCTGGAATGACACTCGTCATCGC
ATTGCTATCAGAGTATGTTGTGGCCACAATCGAGGATGCATCGGATTCATGGGGACTATC
AGTGAGTTTCATAAGTATCATATTGCTTCCCATTGTTGGAAATGCGGCTGAGCATGCTGG
AGCCATCATCTTCGCTTTCAAAAACAAGCTTGATATATCTCTAGGGGTGGCGTTGCGCTC
TACAACTTCAACATCCTTGAAACAAGCTGTCTAGCCCTGGCAATTATCATCACAGCATTC
ACTTTACAGGATGGAACATCTCACTACATGAAGGGACTTGTCCTAGTGTTGTGCTATGTC
ATCATCGCCGCATGTTTCTTTGTCGATCAAATTCCTCAACCAAAAGGTACCGGCCTGGGG
ATGCAACCCAAGAACAGTGTGGGAGGAGGATTTGTCTCTGCTTAGAATTAGATAAAATAA
ATCATCAAATGACTTGGAAAAAAGAAAGATAATATGATTTGATTGATTTGTCAGACAAAA
CGGAAAAGACTTGTTAGAGAGATTCCTCAGCATGAATGAGTGAGAGAGGTAGCTCGGTGA
AAATAGGTTTCTTTGATGTTTTATAAGAGGGTTACATTTCTTTCTTTTTTGTTTGTTGGG
ATTTTATGTTTCATCTTGTATATTATATGTTCTTTTGATCAAACTATATATATAAAAGAG
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2B588TF U 1
AF RR2B588JQ C 42
BS 1 778 RR2B588TF
BS 779 901 RR2B588JQ

RD RR2B588TF 778 0 0
GGCATCCACCTCTCTGATCAATAAAATGTCGCTTAGCCTGTCCAGAACAAGCAGCATCGT
TATGCTTATTGCTTACATTGCTTATCTCATCTTCCAGCTCTGGACTCACCGCCAATTGTT
TGAAGCACAAGAGGATGATGAGGATGATGCGTATAATGATGAAGTGACCGTTGAGGAAAC
TCCGGTGATAGGATTTTGGAGCGGATTTGCTTGGCTCGCTGGAATGACACTCGTCATCGC
ATTGCTATCAGAGTATGTTGTGGCCACAATCGAGGATGCATCGGATTCATGGGGACTATC
AGTGAGTTTCATAAGTATCATATTGCTTCCCATTGTTGGAAATGCGGCTGAGCATGCTGG
AGCCATCATCTTCGCTTTCAAAAACAAGCTTGATATATCTCTAGGGGTGGCGTTGCGCTC
TACAACTTCAACATCCTTGAAACAAGCTGTCTAGCCCTGGCAATTATCATCACAGCATTC
ACTTTACAGGATGGAACATCTCACTACATGAAGGGACTTGTCCTAGTGTTGTGCTATGTC
ATCATCGCCGCATGTTTCTTTGTCGATCAAATTCCTCAACCAAAAGGTACCGGCCTGGGG
ATGCAACCCAAGAACAGTGTGGGAGGAGGATTTGTCTCTGCTTAGAATTAGATAAAATAA
ATCATCAAATGACTTGGAAAAAAGAAAGATAATATGATTTGATTGATTTGTCAGACAAAA
CGGAAAAGACTTGTTAGAGAGATTCCTCAGCATGAATGAGTGAGAGAGGTAGCTCGGT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2B588JQ 860 0 0
CCAGAACAAGCAGCATCGTTATGCTTATTGCTTACATTGCTTATCTCATCTTCCAGCTCT
GGACTCACCGCCAATTGTTTGAAGCACAAGAGGATGATGAGGATGATGCGTATAATGATG
AAGTGACCGTTGAGGAAACTCCGGTGATAGGATTTTGGAGCGGATTTGCTTGGCTCGCTG
GAATGACACTCGTCATCGCATTGCTATCAGAGTATGTTGTGGCCACAATCGAGGATGCAT
CGGATTCATGGGGACTATCAGTGAGTTTCATAAGTATCATATTGCTTCCCATTGTTGGAA
ATGCGGCTGAGCATGCTGGAGCCATCATCTTCGCTTTCAAAAACAAGCTTGATATATCTC
TAGGGGTGGCGTTGCGCTCTACAACTTCAACATCCTTGAAACAAGCTGTCTAGCCCTGGC
AATTATCATCACAGCATTCACTTTACAGGATGGAACATCTCACTACATGAAGGGACTTGT
CCTAGTGTTGTGCTATGTCATCATCGCCGCATGTTTCTTTGTCGATCAAATTCCTCAACC
AAAAGGTACCGGCCTGGGGATGCAACCCAAGAACAGTGTGGGAGGAGGATTTGTCTCTGC
TTAGAATTAGATAAAATAAATCATCAAATGACTTGGAAAAAAGAAAGATAATATGATTTG
ATTGATTTGTCAGACAAAACGGAAAAGACTTGTTAGAGAGATTCCTCAGCATGAATGAGT
GAGAGAGGTAGCTCGGTGAAAATAGGTTTCTTTGATGTTTTATAAGAGGGTTACATTTCT
TTCTTTTTTGTTTGTTGGGATTTTATGTTTCATCTTGTATATTATATGTTCTTTTGATCA
AACTATATATATAAAAGAGG

QA 1 860 1 860
DS 



AS 1 2

CO CL6272Contig1 690 2 1 U
GGAATTAACCTCAACTATACCAACGTACGACGTCGACGCCATTGTTATTTAGGAGTTTTC
TCGAGAGAAAAAAAAATGAAGGAGAACGCAGGAAACCCTCTCCATCTCACGTCACTGAAC
CATGTGTCTCTCTTGTGCCGATCCGTCGAAGAATCCATGAATTTTTACCAAATGGTGTTA
GGGTTCTTCCCTATTCGAAGACCTGAATCTTTAAATTTTGAAGGCGCTTGGTTGTTTGGG
CATGGAATTGGAATACATCTCTTGCGTTCTTCAGAACCAGATAAACTACCCAAGAAAACC
GAAATCAATCCCAAAGACAACCATATCTCTTTTCAGTGCGAGAGTATGGAGGCAGTGGAG
AAGAAGCTTGAGGAGATGGAGATAGAGTATGTGAGGGCGATAGTTGAAGAAGGAGGGATC
CAAGTGGATCAGCTTTTCTTCCACGATCCAGATGGCTTCATGATTGAGATATGCAACTGT
GAGTGTCTCCCCGTTGTCCCCCTCATAGGAGGAATGGCTCGCTCCTGCTCCAGAGCCAAA
CTCCATCAGATGGTGCAGCCACAACCGCAGACTCAGATCCGCCAAGTGGTCCAGCCTTAA
CAATGATCTCTGTTTTTGTTGTCATTGTGTTTTGTGTGTTTGTATGTATTGTTTGTGCGT
GTAATGAATAAGAGACTGACGTGAATCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BX57TF U 1
AF RR2BX57JQ C 36
BS 1 690 RR2BX57TF

RD RR2BX57TF 690 0 0
GGAATTAACCTCAACTATACCAACGTACGACGTCGACGCCATTGTTATTTAGGAGTTTTC
TCGAGAGAAAAAAAAATGAAGGAGAACGCAGGAAACCCTCTCCATCTCACGTCACTGAAC
CATGTGTCTCTCTTGTGCCGATCCGTCGAAGAATCCATGAATTTTTACCAAATGGTGTTA
GGGTTCTTCCCTATTCGAAGACCTGAATCTTTAAATTTTGAAGGCGCTTGGTTGTTTGGG
CATGGAATTGGAATACATCTCTTGCGTTCTTCAGAACCAGATAAACTACCCAAGAAAACC
GAAATCAATCCCAAAGACAACCATATCTCTTTTCAGTGCGAGAGTATGGAGGCAGTGGAG
AAGAAGCTTGAGGAGATGGAGATAGAGTATGTGAGGGCGATAGTTGAAGAAGGAGGGATC
CAAGTGGATCAGCTTTTCTTCCACGATCCAGATGGCTTCATGATTGAGATATGCAACTGT
GAGTGTCTCCCCGTTGTCCCCCTCATAGGAGGAATGGCTCGCTCCTGCTCCAGAGCCAAA
CTCCATCAGATGGTGCAGCCACAACCGCAGACTCAGATCCGCCAAGTGGTCCAGCCTTAA
CAATGATCTCTGTTTTTGTTGTCATTGTGTTTTGTGTGTTTGTATGTATTGTTTGTGCGT
GTAATGAATAAGAGACTGACGTGAATCAGC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2BX57JQ 655 0 0
ACGCCATTGTTATTTAGGAGTTTTCTCGAGAGAAAAAAAAATGAAGGAGAACGCAGGAAA
CCCTCTCCATCTCACGTCACTGAACCATGTGTCTTTCTTGTGCCGATCCGTCGAAGAATC
CATGAATTTTTACCAAATGGTGTTAGGGTTTTTCCCTATTCGAAGACCTGAATCTTTAAA
TTTTGAAGGCGCTTGGTTGTTTGGGCATGGAATTGGAATACATTTCTTGCGTTCTTCAGA
ACCAGATAAACTACCCAAGAAAACCGAAATCAATCCCAAAGACAACCATATCTCTTTTCA
GTGCGAGAGTATGGAGGCAGTGGAGAAGAAGCTTGAGGAGATGGAGATAGAGTATGTGAG
GGCGATAGTTGAAGAAGGAGGGATCCAAGTGGATCAGCTTTTTTTCCACGATCCAGATGG
CTTCATGATTGAGATATGCAACTGTGAGTGTCTCCCCGTTGTCCCCCTCATAGGAGGAAT
GGCTCGCTCCTGCTCCAGAGCCAAACTCCATCAGATGGTGCAGCCACAACCGCAGACTCA
GATCCGCCAAGTGGTCCAGCCTTAACAATGATCTCTGTTTTTGTTGTCATTGTGTTTTGT
GTGTTTGTATGTATTGTTTGTGCGTGTAATGAATAAGAGACTGACGTGAATCAGC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL6273Contig1 814 2 9 U
GGAAAAGGAAAGTAAAATTATAAATCTAACTGACAATATACCAGAAAAGTTAAAAAAGTT
ATAATAATTGAATTACATATATAGTAATATAATTTACTAAGAATACTTTCGTAATCAACC
TGTTATAATTATCGTGAGCTTCACATGTATGGAACTAACTTCTCATATAGAGATTTAAAA
TACAAAATTTTTGTTTTTCAACATTATTTGAAGATTACAACATTCGTATTCTAGTTTCAT
CCGTATTGCAGGATTTTTTACTTTTTTGATAGCCTCTCAAAAATCCGACTCGAAAGGTTT
GTAAGTCTTGATTTTACTAACAATGCCAACTACTGATCCTGCTGCCGCGGCTAAAGAGAC
AATAAGACAAACCAAACTCAAGACTTGAAGACTAACCCATCTTGTGCTCCAGCTCGGCAA
ATTCTTCTGTGCAATGTACATTTCCACAGGGAAATAAACTGTTAGAGGCCAAAAACCAAT
GGCTCCCAAGAAACCAACAACATCGTTAAAGAAAGGCATTAGCATTGAGATCGACGTTAT
TACAATCACAAAGACCGTCCTCCACACGAGCCTAAAGAGATTGAAATTGAAGGGCTTGGA
TCCAGAAAAGAATGGAATCTCGGTCTCTTTTGTGACGAACTTACTCTCTGGAAACATCTT
GGAAGCTTTTTTCTCGACAAAGGCAAAGATTGGTTGTGCATAGACTTGGTAAGCTCCGAT
TAGATGGATCAATATGGCGACATTGGCTATGTTAAGCAACCAATATAGGTCTGTGAATCC
TCCAGCAGCGAGGAGGTTTCCTGGTGCAGACTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL75JQ U 111
AF RR2AP96JQ U 1
BS 1 202 RR2AP96JQ
BS 203 203 RR2EL75JQ
BS 204 279 RR2AP96JQ
BS 280 280 RR2EL75JQ
BS 281 491 RR2AP96JQ
BS 492 492 RR2EL75JQ
BS 493 543 RR2AP96JQ
BS 544 544 RR2EL75JQ
BS 545 814 RR2AP96JQ

RD RR2EL75JQ 606 0 0
GTAATCAACCTGTTATAATTATCGTGAGCTTCACATGTATGGAACTAACTTCTCATATAG
AGATTTAAAATACAAAATTTTTGTTTTTCAACATTATTTGAAGATTACAACATTCGTATT
CTAGTTTCATCCGTATTGCAGGATTTTTTACTTTTTTGATAGCCTCTCAAAAATCCGACT
CGAAAGGTTTGTAAGTCTTGATTTTACTAACAATGCCAACTACTGATCCTGCTGCCGCGG
CTAAAGAGACAATAAGACAAACCAAACTCAAGACTTGAAGACTAACCCATCTTGTGCTCC
AGCTCGGCAAATTCTTCTGTGCAATGTACATTTCCACAGGGAAATAAACTGTTAGAGGCC
AAAAACCAATGGCTCCCAAGAAACCAACAACATCGTTAAAGAAAGGCATTAGCATTGAGA
TCGACGTTATTACAATCACAAAGACCGTCCTCCACACGAGCCTAAAGAGATTGAAATTGA
AGGGCTTGGATCCAGAAAAGAATGGAATCTCGGTCTCTTTTGTGACGAACTTACTCTCTG
GAAACATCTTGGAAGCTTTTTTCTCGACAAAGGCAAAGATTGGTTGTGCATAGACTTGGT
AAGCTC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2AP96JQ 814 0 0
GGAAAAGGAAAGTAAAATTATAAATCTAACTGACAATATACCAGAAAAGTTAAAAAAGTT
ATAATAATTGAATTACATATATAGTAATATAATTTACTAAGAATACTTTCGTAATCAACC
TGTTATAATTATCGTGAGCTTCACATGTATGGAACTAACTTCTCATATAGAGATTTAAAA
TACAAAATTTTTGTTTTTCAACGTTATTTGAAGATTACAACATTCGTATTCTAGTTTCAT
CCGTATTGCAGGATTTTTTACTTTTTTGATAGCCTCTCAGAAATCCGACTCGAAAGGTTT
GTAAGTCTTGATTTTACTAACAATGCCAACTACTGATCCTGCTGCCGCGGCTAAAGAGAC
AATAAGACAAACCAAACTCAAGACTTGAAGACTAACCCATCTTGTGCTCCAGCTCGGCAA
ATTCTTCTGTGCAATGTACATTTCCACAGGGAAATAAACTGTTAGAGGCCAAAAACCAAT
GGCTCCCAAGAGACCAACAACATCGTTAAAGAAAGGCATTAGCATTGAGATCGACGTTAT
TACGATCACAAAGACCGTCCTCCACACGAGCCTAAAGAGATTGAAATTGAAGGGCTTGGA
TCCAGAAAAGAATGGAATCTCGGTCTCTTTTGTGACGAACTTACTCTCTGGAAACATCTT
GGAAGCTTTTTTCTCGACAAAGGCAAAGATTGGTTGTGCATAGACTTGGTAAGCTCCGAT
TAGATGGATCAATATGGCGACATTGGCTATGTTAAGCAACCAATATAGGTCTGTGAATCC
TCCAGCAGCGAGGAGGTTTCCTGGTGCAGACTCT

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL6274Contig1 845 2 2 U
AAACCCTAATCTCATTCTTCATCTTCAAGCAGCCACCTCCCTCGCTAGCTATGGAGTTTT
GGGGTATTGAGATTAAGCCTGGAAAGCCCACCAAGGTCGAACAGGAAGATGGGCATCTGA
TCCACGTCTCTCAGATTGCCATTGGTGAGTTCAACAAGGTGGGAGATAAGACTGTTCAGG
TCTTTGTCAAGGTCGATGGTGAAAATGATGAGCAAAAGCTTCTCATTGGAAACCTCTCTC
AGAAGATTCCTCAAGTTACCCTCGATCTCATCTTCGAGCAAGATTTTGAGATTTCTCATG
AGTGCAAAAGCACCAGCGTCTATATTCTTGGCTACAAGACCGTTGATTCTATGGATGATG
AGATCAACTCTGATTTTGATTCAGAGGATGAGGGTATTCCCATGGAAATGTTTAAAAATC
AATTGGAGAAATCAAACGCCAACATTGAAGATGAGTCTGAAGATGAGGATGAGGATGACT
CTGAAGAAGATGACGAAACACCTGTAAAGGTTGAGCCTCCGAGCAAGAAGAGACCAAATG
GTGGAGCAATGAACAATAACAACAACAACGCAGTTGCGTCAAAGAAAGCCAAAGTTGCAA
ATCAGCAAAAGCCATCAGGAGCGCATAAGGGGCACAAGTGCGGCGGTGTTCATCCTCCAA
AAAGAAACTAGAGAAAAGAGACCAAGTCTCAGTTTTTCATATGAATTTTTGATAGTATTT
TTCCCTATTGTGGTGAACTGTTGAGTTTTACTTGTGAGGATTTTGGATTGTTAAATCATT
CAAATATATTTTATGTTGTCATATGCTATGTCACAGTGGTTTTGAATGAAGTATGCTTTT
TTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2AG81TF U 1
AF RR2AG81JQ C 10
BS 1 599 RR2AG81TF
BS 600 845 RR2AG81JQ

RD RR2AG81TF 599 0 0
AAACCCTAATCTCATTCTTCATCTTCAAGCAGCCACCTCCCTCGCTAGCTATGGAGTTTT
GGGGTATTGAGATTAAGCCTGGAAAGCCCACCAAGGTCGAACAGGAAGATGGGCATCTGA
TCCACGTCTCTCAGATTGCCATTGGTGAGTTCAACAAGGTGGGAGATAAGACTGTTCAGG
TCTTTGTCAAGGTCGATGGTGAAAATGATGAGCAAAAGCTTCTCATTGGAAACCTCTCTC
AGAAGATTCCTCAAGTTACCCTCGATCTCATCTTCGAGCAAGATTTTGAGATTTCTCATG
AGTGCAAAAGCACCAGCGTCTATATTCTTGGCTACAAGACCGTTGATTCTATGGATGATG
AGATCAACTCTGATTTTGATTCAGAGGATGAGGGTATTCCCATGGAAATGTTTAAAAATC
AATTGGAGAAATCAAACGCCAACATTGAAGATGAGTCTGAAGATGAGGATGAGGATGACT
CTGAAGAAGATGACGAAACACCTGTAAAGGTTGAGCCTCCGAGCAAGAAGAGACCAAATG
GTGGAGCAATGAACAATAACAACAACAACGCAGTTGCGTCAAAGAAAGCCAAAGTTGCA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2AG81JQ 836 0 0
TCTCATTCTTCATCTTCAAGCAGCCACCTCCCTCGCTAGCTATGGAGTTTTGGGGTATTG
AGATTAAGCCTGGAAAGCCCACCAAGGTCGAACAGGAAGATGGGCATCTGATCCACGTCT
CTCAGATTGCCATTGGTGAGTTCAACAAGGTGGGAGATAAGACTGTTCAGGTCTTTGTCA
AGGTCGATGGTGAAAATGATGAGCAAAAGCTTCTCATTGGAAACCTCTCTCAGAAGATTC
CTCAAGTTACCCTCGATCTCATCTTCGAGCAAGATTTTGAGATTTCTCATGAGTGCAAAA
GCACCAGCGTCTATATTCTTGGCTACAAGACCGTTGATTCTATGGATGATGAGATCAACT
CTGATTTTGATTCAGAGGATGAGGGTATTCCCATGGAAATGTTTAAAAATCAATTGGAGA
AATCAAACGCCAACATTGAAGATGAGTCTGAAGATGAGGATGAGGATGACTCTGAAGAAG
ATGACGAAACACCTGTAAAGGTTGAGCCTCCGAGCAAGAAGAGACCAAATGGTGGAGCAA
TGAACAATAACAACAACAACGCAGTTGCGTCAAAGAAAGCCAAAGTTGCAAATCAGCAAA
AGCCATCAGGAGCGCATAAGGGGCACAAGTGCGGCGGTGTTCATCCTCCAAAAAGAAACT
AGAGAAAAGAGACCAAGTCTCAGTTTTTCATATGAATTTTTGATAGTATTTTTCCCTATT
GTGGTGAACTGTTGAGTTTTACTTGTGAGGATTTTGGATTGTTAAATCATTCAAATATAT
TTTATGTTGTCATATGCTATGTCACAGTGGTTTTGAATGAAGTATGCTTTTTTGTC

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 2

CO CL6275Contig1 803 2 2 U
GGACAACAACAGCCATGGACTACGAATACGGTGGAGTAGGAGAGTACTGCAGGAGGGGAC
ACGTGCCGGCGTTTGGAAGCTGGGACTGGAACGACGCCGTTCCATTCACTCAGTGCTTCG
AGACAGCAACCACCACCACTCATCATCAGCAACCTTCTTTTCTCCACTACGCTGCTCACC
CTCAATATCGTGATCTTTACCTCGCTGGCGGCGATCTTTATGATAACCACCACCTTGTCG
CTCCTGCCGTGATCCTCGTCCCTCGACGCCGAGCTAAGGTGGGCCAGGAGCCAAAGAGGA
CCAGTTCCAAGGAACAACACAAGTTCAAGACGGAGGCGCGTGAGTCTGACGCACCGATAA
GTTGTCCAACACCTGTGGTGAAGCGGAGGACGAAGCCAGTGGACGAAGACTTGTACAGGA
TCTCACCTACACTTCTCTCCGTCAAATCCACAAAGAAAAGAGGAGGTGGGTTTGGGTGCT
TTCCAAGTTGTTTTTTGCCAACACGAGTGCTTTGAAGCCACAACGCGTGGGAGACTGAGT
CAGACAACACTCTGGTTGTGTCTTAATATTTTTATATTTTTAAAAAAGGGGGAAGATTGT
ATGCTTGTGAAACCGTGTATGTATTTATGCGTAGGGTTATATATGGAGATGAATTCTAGA
AGATAAGATATGTTGTAGTAGGGCTTTGGGAAGAGCGAGCCATATTGTATTACGTAAACT
ATTAAACAATGTGAGACTTGTTTTGCAGTTGCAGCTTTATATTTTCCTAAGTATGTCTAA
ATTTGAACTGATTTTTGTTTGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD25JQ C 1
AF RR2AD25TF U 1
BS 1 797 RR2AD25TF
BS 798 803 RR2AD25JQ

RD RR2AD25JQ 803 0 0
GGACAACAACAGCCATGGACTACGAATACGGTGGAGTAGGAGAGTACTGCAGGAGGGGAC
ACGTGCCGGCGTTTGGAAGCTGGGACTGGAACGACGCCGTTCCATTCACTCAGTGCTTCG
AGACAGCAACCACCACCACTCATCATCAGCAACCTTCTTTTCTCCACTACGCTGCTCACC
CTCAATATCGTGATCTTTACCTCGCTGGCGGCGATCTTTATGATAACCACCACCTTGTCG
CTCCTGCCGTGATCCTCGTCCCTCGACGCCGAGCTAAGGTGGGCCAGGAGCCAAAGAGGA
CCAGTTCCAAGGAACAACACAAGTTCAAGACGGAGGCGCGTGAGTCTGACGCACCGATAA
GTTGTCCAACACCTGTGGTGAAGCGGAGGACGAAGCCAGTGGACGAAGACTTGTACAGGA
TCTCACCTACACTTCTCTCCGTCAAATCCACAAAGAAAAGAGGAGGTGGGTTTGGGTGCT
TTCCAAGTTGTTTTTTGCCAACACGAGTGCTTTGAAGCCACAACGCGTGGGAGACTGAGT
CAGACAACACTCTGGTTGTGTCTTAATATTTTTATATTTTTAAAAAAGGGGGAAGATTGT
ATGCTTGTGAAACCGTGTATGTATTTATGCGTAGGGTTATATATGGAGATGAATTCTAGA
AGATAAGATATGTTGTAGTAGGGCTTTGGGAAGAGCGAGCCATATTGTATTACGTAAACT
ATTAAACAATGTGAGACTTGTTTTGCAGTTGCAGCTTTATATTTTCCTAAGTATGTCTAA
ATTTGAACTGATTTTTGTTTGTG

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2AD25TF 797 0 0
GGACAACAACAGCCATGGACTACGAATACGGTGGAGTAGGAGAGTACTGCAGGAGGGGAC
ACGTGCCGGCGTTTGGAAGCTGGGACTGGAACGACGCCGTTCCATTCACTCAGTGCTTCG
AGACAGCAACCACCACCACTCATCATCAGCAACCTTCTTTTCTCCACTACGCTGCTCACC
CTCAATATCGTGATCTTTACCTCGCTGGCGGCGATCTTTATGATAACCACCACCTTGTCG
CTCCTGCCGTGATCCTCGTCCCTCGACGCCGAGCTAAGGTGGGCCAGGAGCCAAAGAGGA
CCAGTTCCAAGGAACAACACAAGTTCAAGACGGAGGCGCGTGAGTCTGACGCACCGATAA
GTTGTCCAACACCTGTGGTGAAGCGGAGGACGAAGCCAGTGGACGAAGACTTGTACAGGA
TCTCACCTACACTTCTCTCCGTCAAATCCACAAAGAAAAGAGGAGGTGGGTTTGGGTGCT
TTCCAAGTTGTTTTTTGCCAACACGAGTGCTTTGAAGCCACAACGCGTGGGAGACTGAGT
CAGACAACACTCTGGTTGTGTCTTAATATTTTTATATTTTTAAAAAAGGGGGAAGATTGT
ATGCTTGTGAAACCGTGTATGTATTTATGCGTAGGGTTATATATGGAGATGAATTCTAGA
AGATAAGATATGTTGTAGTAGGGCTTTGGGAAGAGCGAGCCATATTGTATTACGTAAACT
ATTAAACAATGTGAGACTTGTTTTGCAGTTGCAGCTTTATATTTTCCTAAGTATGTCTAA
ATTTGAACTGATTTTTG

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL6276Contig1 590 2 1 U
GCTGCTGATGAGATTCAGAGAGATTCATCACTCTTTAGTTCAATCTTTCAAGATCAAGCA
GAGAAGTCATTGCAGATTGTTCTTGTGAGAGATGTTGATGGCAAAACCTTCTGGGATGCA
TTAGACGAAGCCGTTTCACCTAGAATCAAATCTCCTACATCTGACGATAAAACCGCTCTC
TCTACATTCCAAGGGATCTTCCATAACAGACCTCTCAACAAAGGAAGTGTCATTCTCTTG
ACTTGGATCCATCCTTCTAAAATGCTTGTTTCTGTTTCTTCTGGAGGGTTGCCAAAGGAT
GTGGATGCAGAGATCGAGTCAGGTAGTGTTACATCTGCTTTATTTGATGTGTTCTTTGGG
GACTCTCCTGTTTCTCCTACATTGAAATCTTCAGTGGCTAACCAATTAGCTATGGTCCTC
AAGTAAACACTCTAAATGTAACATATCATGTTGTAGTATGAACATCTTGAATCGTGTGAT
GTGTTAGGTCTATGTTTGTATTATCTTTTATAACCAAAGACACCATGTTTTGAGCTTAAA
AATGATGTATGTTTTGAAATTTTCATTGATATTAAAAGAACATATTAGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H145JQ C 1
AF RR2H145TF U 1
BS 1 590 RR2H145TF

RD RR2H145JQ 590 0 0
GCTGCTGATGAGATTCAGAGAGATTCATCACTCTTTAGTTCAATCTTTCAAGATCAAGCA
GAGAAGTCATTGCAGATTGTTCTTGTGAGAGATGTTGATGGCAAAACCTTCTGGGATGCA
TTAGACGAAGCCGTTTCACCTAGAATCAAATCTCCTACATCTGACGATAAAACCGCTCTC
TCTACATTCCAAGGGATCTTCCATAACAGACCTCTCAACAAAGGAAGTGTCATTCTCTTG
ACTTGGATCCATCCTTCTAAAATGCTTGTTTCTGTTTCTTCTGGAGGGTTGCCAAAGGAT
GTGGATGCAGAGATCGAGTCAGGTAGTGTTACATCTGCTTTATTTGATGTGTTCTTTGGG
GACTCTCCTGTTTCTCCTACATTGAAATCTTCAGTGGCTAACCAATTAGCTATGGTCCTC
AAGTAAACACTCTAAATGTAACATATCATGTTGTAGTATGAACATCTTGAATCGTGTGAT
GTGTTAGGTCTATGTTTGTATTATCTTTTATAACCAAAGACACCATGTTTTGAGCTTAAA
AATGATGTATGTTTTGAAATTTTCATTGATATTAAAAGAACATATTAGGC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2H145TF 590 0 0
GCTGCTGATGAGATTCAGAGAGATTCATCACTCTTTAGTTCAATCTTTCAAGATCAAGCA
GAGAAGTCATTGCAGATTGTTCTTGTGAGAGATGTTGATGGCAAAACCTTCTGGGATGCA
TTAGACGAAGCCGTTTCACCTAGAATCAAATCTCCTACATCTGACGATAAAACCGCTCTC
TCTACATTCCAAGGGATCTTCCATAACAGACCTCTCAACAAAGGAAGTGTCATTCTCTTG
ACTTGGATCCATCCTTCTAAAATGCTTGTTTCTGTTTCTTCTGGAGGGTTGCCAAAGGAT
GTGGATGCAGAGATCGAGTCAGGTAGTGTTACATCTGCTTTATTTGATGTGTTCTTTGGG
GACTCTCCTGTTTCTCCTACATTGAAATCTTCAGTGGCTAACCAATTAGCTATGGTCCTC
AAGTAAACACTCTAAATGTAACATATCATGTTGTAGTATGAACATCTTGAATCGTGTGAT
GTGTTAGGTCTATGTTTGTATTATCTTTTATAACCAAAGACACCATGTTTTGAGCTTAAA
AATGATGTATGTTTTGAAATTTTCATTGATATTAAAAGAACATATTAGGC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

CO CL6277Contig1 607 2 4 U
CTCAAATTGTTAATCATTTAATATAGCGTATCTAAACAAGAGTCAAAGAACAGTATGATT
CAATTTGAAGTACATTGAGTTGGAAACGAAGATCACCAATGTTATGAATTCATTGAAGCT
ACTACTCCATTACAAAGTTCTTTTATTAAAGCTAACCAAGCTTGCATTGTGTTGGCATAC
AATGAACGAACGAGAGAGCGTATAACGATGAAAGTCAGCAACAAGTTTCCGCATCAGGAT
CTCTGGCTAACCTTGCGTCCTGTTAGCTTCTCTGACTCGAACAACATGTGATTGATGAGT
CCACGAGCAGCATCATCCTTTAACTTCTGAATCTTCTCGGGGTCTGTCTCATTCATGTGT
TTCTTAAATTGTTGCCTCACCATACCAACCACCAGCTCAGTGTTGTGTTGCTGCTTACCA
ATGAAAGTAGCTCTACGAAGACATTCACGGTACAACCTAACCACATTGTTAGCGAGCTCA
GGAGGTAAAGAGCCTTGTAAAGTCGGCATTTCCACAAGGAGATTCAAACTACGGTTTTCT
TTTCAAATAGATCAAGTTCTTTCCCGGCGAGATGACCGGAGCTTGAGATAGACGGAATGA
GAAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AW54TFB C 1
AF RR2AW54JQ U 10
BS 1 9 RR2AW54TFB
BS 10 562 RR2AW54JQ
BS 563 563 RR2AW54TFB
BS 564 607 RR2AW54JQ

RD RR2AW54TFB 607 0 0
CTCAAATTGTTAATCATTTAATATAGCGTATCTAAACAAGAGTCAAAGAACAGTATGATT
CAATTTGAAGTACATTGAGTTGGAAACGAAGATCACCAATGTTATGAATTCATTGAAGCT
ACTACTCCATTACAAAGTTCTTTTATTAAAGCTAACCAAGCTTGCATTGTGTTGGCATAC
AATGAACGAACGAGAGAGCGTATAACGATGAAAGTCAGCAACAAGTTTCCGCATCAGGAT
CTCTGGCTAACCTTGCGTCCTGTTAGCTTCTCTGACTCGAACAACATGTGATTGATGAGT
CCACGAGCAGCATCATCCTTTAACTTCTGAATCTTCTCGGGGTCTGTCTCATTCATGTGT
TTCTTAAATTGTTGCCTCACCATACCAACCACCAGCTCAGTGTTGTGTTGCTGCTTACCA
ATGAAAGTAGCTCTACGAAGACATTCACGGTACAACCTAACCACATTGTTAGCGAGCTCA
GGAGGTAAAGAGCCTTGTAGAGTCGGCATTTCCACAAGGAGATTCAAACTACGGTTTTCT
TTTCAAATAGATCAAGTTCTTTCCCGGCGAGATGACCGGAGCTTGAGATAGACGGAATGA
GAAGCCC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2AW54JQ 598 0 0
TTAATCATTTAATATAGCGTATCTAAACAAGAGTCAAAGAACAGTATGATTCAATTTGAA
GTACATTGAGTTGGAAACGAAGATCACCAATGTTATGAATTCATTGAAGCTACTACTCCA
TTACAAAGTTCTTTTATTAAAGCTAACCAAGCTTGCATTGTGTTGGCATACAATGAACGA
ACGAGAGAGCGTATAACGATGAAAGTCAGCAACAAGTTTCCGCATCAGGATCTCTGGCTA
ACCTTGCGTCCTGTTAGCTTCTCTGACTCGAACAACATGTGATTGATGAGTCCACGAGCA
GCATCATCCTTTAACTTCTGAATCTTCTCGGGGTCTGTCTCATTCATGTGTTTCTTAAAT
TGTTGCCTCACCATACCAACCACCAGCTCAGTGTTGTGTTGCTGCTTACCAATGAAAGTA
GCTCTACGAAGACATTCACGGTACAACCTAACCACATTGTTAGCGAGCTCAGGAGGTAAA
GAGCCTTGTAAAGTCGGCATTTCCACAAGGAGATTCAAACTACGGTTTTCTTTTCAAATA
GATCAAGTTCTTTGCCGGCGAGATGACCGGAGCTTGAGATAGACGGAATGAGAAGCCC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL6278Contig1 672 2 2 U
GGGAGGGCATAGTACGATGTTACTGTCCTGACGCCACTGGAATTAACTATTGGGGAAATG
GACACCGGAGCTGAAGGTAACGTGGAGCGGCCACTGGATGGAGATTCTTCGGCGGAGGAA
TCTGGTTCGAATAAAGAAATCGCCGGAAGATCGGATCCGTCGCCGTCGAATCAAGGGGAG
ATTCTGAGAACACTTGCCACGGTGGAGAAGGATTCACAGGCAATCGCGGAGAGCTTCTCG
TCTCTCTTTGTCTCCCTCCGATCAACTCTCTCTGAGGCTACTGGAAGCTCAGTTGATCAC
ATGAGTTGCTTTGGAGATGCAGCTGGACGTCTTCAGGAAACCGCTCTAGGCGCATCCACT
AAAGGGAACCGCTACATCAACTCCTGCCTCAGATTAAACGAGGAAATTAAAGGCGTTGAG
ACTCTGGCCGCTCGGTTAAAGCACCTGAGGAGAAATGTGGATGTTCTTGACACGGCTGTG
AACAAGCTTCTCCGTCCTCCATGACAAGTCTATCAGCTTTTCACGGACTTTTATCACTTG
TTTTCTCGTACATAAAGATTTTGATTATAACCGCTGTTTTTCTTTTTGTGACAAAATGTT
TTATGTCGTGAAACTTCTTCTTTCTTTTTTTCTTCAAATGATAAATTTCAATACGATCCC
TCTATTTGAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ51TF U 1
AF RR2FQ51JQ C 1
BS 1 596 RR2FQ51TF
BS 597 672 RR2FQ51JQ

RD RR2FQ51TF 596 0 0
GGGAGGGCATAGTACGATGTTACTGTCCTGACGCCACTGGAATTAACTATTGGGGAAATG
GACACCGGAGCTGAAGGTAACGTGGAGCGGCCACTGGATGGAGATTCTTCGGCGGAGGAA
TCTGGTTCGAATAAAGAAATCGCCGGAAGATCGGATCCGTCGCCGTCGAATCAAGGGGAG
ATTCTGAGAACACTTGCCACGGTGGAGAAGGATTCACAGGCAATCGCGGAGAGCTTCTCG
TCTCTCTTTGTCTCCCTCCGATCAACTCTCTCTGAGGCTACTGGAAGCTCAGTTGATCAC
ATGAGTTGCTTTGGAGATGCAGCTGGACGTCTTCAGGAAACCGCTCTAGGCGCATCCACT
AAAGGGAACCGCTACATCAACTCCTGCCTCAGATTAAACGAGGAAATTAAAGGCGTTGAG
ACTCTGGCCGCTCGGTTAAAGCACCTGAGGAGAAATGTGGATGTTCTTGACACGGCTGTG
AACAAGCTTCTCCGTCCTCCATGACAAGTCTATCAGCTTTTCACGGACTTTTATCACTTG
TTTTCTCGTACATAAAGATTTTGATTATAACCGCTGTTTTTCTTTTTGTGACAAAA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2FQ51JQ 672 0 0
GGGAGGGCATAGTACGATGTTACTGTCCTGACGCCACTGGAATTAACTATTGGGGAAATG
GACACCGGAGCTGAAGGTAACGTGGAGCGGCCACTGGATGGAGATTCTTCGGCGGAGGAA
TCTGGTTCGAATAAAGAAATCGCCGGAAGATCGGATCCGTCGCCGTCGAATCAAGGGGAG
ATTCTGAGAACACTTGCCACGGTGGAGAAGGATTCACAGGCAATCGCGGAGAGCTTCTCG
TCTCTCTTTGTCTCCCTCCGATCAACTCTCTCTGAGGCTACTGGAAGCTCAGTTGATCAC
ATGAGTTGCTTTGGAGATGCAGCTGGACGTCTTCAGGAAACCGCTCTAGGCGCATCCACT
AAAGGGAACCGCTACATCAACTCCTGCCTCAGATTAAACGAGGAAATTAAAGGCGTTGAG
ACTCTGGCCGCTCGGTTAAAGCACCTGAGGAGAAATGTGGATGTTCTTGACACGGCTGTG
AACAAGCTTCTCCGTCCTCCATGACAAGTCTATCAGCTTTTCACGGACTTTTATCACTTG
TTTTTTCGTACATAAAGATTTTGATTATAACCGCTGTTTTTCTTTTTGTGACAAAATGTT
TTATGTCGTGAAACTTCTTCTTTCTTTTTTTCTTCAAATGATAAATTTCAATACGATCCC
TCTATTTGAACT

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL6279Contig1 741 2 1 U
GGGAAGCTAAATTAGAATCTGAATATCTCTCTTCTCTCTGTCGCGATCGTGGAGGATCGA
TCGAGTAGCGAGTGAACATCATGTTTATGATAGATTGGTTCTATGGTGTTCTCGCTTCGC
TAGGGTTATGGCAGAAAGAGGCGAAGATCTTGTTCCTCGGACTCGACAACGCCGGCAAAA
CCACCTTGCTTCACATGCTCAAGGACGAGAGATTGGTGCAGCACCGTGGTGTACCTGGTG
GATGCATACGACAAGGAGAGGTTTGCAGAATCGAAAAAGGAATTGGACGCACTTCTCTCA
GACGAATCTTTAGCCACCGTCCCCTTCCTCATCCTAGGAAACAAGATAGACATACCGTAC
GCTGCATCAGAGGACGAGCTCCGTTACCATCTCGGCCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAG
GGTAAAGTGAACCTAGTTGATTCCAACGTAAGACCATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATC
GTCAGGAAGATGGGTTATGGCGAAGGCTTCAAGTGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACCG
AAGCCACCAAGACTCCAACCACATGGCTATCATTATTGTTAAACCGTAAGTTTCTATAAA
TCTCGTTTTGTATTTTCTCCTGCGTTTCTTTTTTTTTTGCATGTGTTGTAAGAAATGTCG
TGAAACGTAGCATCTCGTGTGTCTCTCTGCCTTTTGTTTCTTGTAGTGACTTTAAATTTT
AATTCATATTATTTTGAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A687TF U 1
AF RR2A687JQ C 35
BS 1 741 RR2A687TF

RD RR2A687TF 741 0 0
GGGAAGCTAAATTAGAATCTGAATATCTCTCTTCTCTCTGTCGCGATCGTGGAGGATCGA
TCGAGTAGCGAGTGAACATCATGTTTATGATAGATTGGTTCTATGGTGTTCTCGCTTCGC
TAGGGTTATGGCAGAAAGAGGCGAAGATCTTGTTCCTCGGACTCGACAACGCCGGCAAAA
CCACCTTGCTTCACATGCTCAAGGACGAGAGATTGGTGCAGCACCGTGGTGTACCTGGTG
GATGCATACGACAAGGAGAGGTTTGCAGAATCGAAAAAGGAATTGGACGCACTTCTCTCA
GACGAATCTTTAGCCACCGTCCCCTTCCTCATCCTAGGAAACAAGATAGACATACCGTAC
GCTGCATCAGAGGACGAGCTCCGTTACCATCTCGGCCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAG
GGTAAAGTGAACCTAGTTGATTCCAACGTAAGACCATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATC
GTCAGGAAGATGGGTTATGGCGAAGGCTTCAAGTGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACCG
AAGCCACCAAGACTCCAACCACATGGCTATCATTATTGTTAAACCGTAAGTTTCTATAAA
TCTCGTTTTGTATTTTCTCCTGCGTTTCTTTTTTTTTTGCATGTGTTGTAAGAAATGTCG
TGAAACGTAGCATCTCGTGTGTCTCTCTGCCTTTTGTTTCTTGTAGTGACTTTAAATTTT
AATTCATATTATTTTGAACTT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2A687JQ 707 0 0
TCTCTGTCGCGATCGTGGAGGATCGATCGAGTAGCGAGTGAACATCATGTTTATGATAGA
TTGGTTCTATGGTGTTCTCGCTTCGCTAGGGTTATGGCAGAAAGAGGCGAAGATCTTGTT
CCTCGGACTCGACAACGCCGGCAAAACCACCTTGCTTCACATGCTCAAGGACGAGAGATT
GGTGCAGCACCGTGGTGTACCTGGTGGATGCATACGACAAGGAGAGGTTTGCAGAATCGA
AAAAGGAATTGGACGCACTTCTCTCAGACGAATCTTTAGCCACCGTCCCCTTCCTCATCC
TAGGAAACAAGATAGACATACCGTACGCTGCATCAGAGGACGAGCTCCGTTACCATCTCG
GCCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAACCTAGTTGATTCCAACGTAAGAC
CATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAAGATGGGTTATGGCGAAGGCTTCAAGT
GGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACCGAAGCCACCAAGACTCCAACCACATGGCTATCATT
ATTGTTAAACCGTAAGTTTCTATAAATCTCGTTTTGTATTTTCTCCTGCGTTTCTTTTTT
TTTTGCATGTGTTGTAAGAAATGTCGTGAAACGTAGCATCTCGTGTGTCTCTCTGCCTTT
TGTTTCTTGTAGTGACTTTAAATTTTAATTCATATTATTTTGAACTT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL6280Contig1 597 2 1 U
GAAATCACAACTAATCGGAAACCTAAAATCATCTTCCTATTTGCTCCGCCACGATGCACA
GCCGTCGCCAGATCTTCGTCAAATCTCCTTACAATCAGCAATCCGTCGCTCTGCAATTAG
ATCCTTCGCAACCCGTACTAACTCTTTCGAATCTCACTTCCTTGCTCGAACCCTCGCACC
GTAGATCGCTATCCGATGTCTCCCTCTCTCTCGACGGGAAGAGAAGGCGAAGGTTAGAGA
GAAGAAAGTTGGGGGGAAGAAGAGCAAGAAGAGCGGTGTTGCTGTGGTGGTGGCTGATGC
AAGTGTGAAGGTGGCGAAGAGACAGATGGATGATGGGAATGTAAATGTTAATGGGGTGAC
AGGGAAGAAGTTCAAGGCGGGGGATGCAGTGCCGGTTAATGCGACGAAGGAAGTGTATGC
TTCTCTATTTACTTCCTCCAAGAAGAAGTCTGACATCAGGGAGACTTACTCTTGCAGGTC
ACTACCTCTGGGAAGGAATTGATTTGTTTGAATACATGTTTGTTTGTTTCATGCTTTGCT
TTGTAATAATCAATTTGCATTTGTAACTTTGATATTGGATGATATCACGTTTTTACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BS27JQ C 1
AF RR2BS27TF U 1
BS 1 597 RR2BS27TF

RD RR2BS27JQ 597 0 0
GAAATCACAACTAATCGGAAACCTAAAATCATCTTCCTATTTGCTCCGCCACGATGCACA
GCCGTCGCCAGATTTTCGTCAAATCTCCTTACAATCAGCAATCCGTCGCTCTGCAATTAG
ATCCTTCGCAACCCGTACTAACTCTTTCGAATCTCACTTCCTTGCTCGAACCCTCGCACC
GTAGATCGCTATCCGATGTCTCCCTCTCTCTCGACGGGAAGAGAAGGCGAAGGTTAGAGA
GAAGAAAGTTGGGGGGAAGAAGAGCAAGAAGAGCGGTGTTGCTGTGGTGGTGGCTGATGC
AAGTGTGAAGGTGGCGAAGAGACAGATGGATGATGGGAATGTAAATGTTAATGGGGTGAC
AGGGAAGAAGTTCAAGGCGGGGGATGCAGTGCCGGTTAATGCGACGAAGGAAGTGTATGC
TTCTCTATTTACTTCCTCCAAGAAGAAGTCTGACATCAGGGAGACTTACTCTTGCAGGTC
ACTACCTCTGGGAAGGAATTGATTTGTTTGAATACATGTTTGTTTGTTTCATGCTTTGCT
TTGTAATAATCAATTTGCATTTGTAACTTTGATATTGGATGATATCACGTTTTTACT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2BS27TF 597 0 0
GAAATCACAACTAATCGGAAACCTAAAATCATCTTCCTATTTGCTCCGCCACGATGCACA
GCCGTCGCCAGATCTTCGTCAAATCTCCTTACAATCAGCAATCCGTCGCTCTGCAATTAG
ATCCTTCGCAACCCGTACTAACTCTTTCGAATCTCACTTCCTTGCTCGAACCCTCGCACC
GTAGATCGCTATCCGATGTCTCCCTCTCTCTCGACGGGAAGAGAAGGCGAAGGTTAGAGA
GAAGAAAGTTGGGGGGAAGAAGAGCAAGAAGAGCGGTGTTGCTGTGGTGGTGGCTGATGC
AAGTGTGAAGGTGGCGAAGAGACAGATGGATGATGGGAATGTAAATGTTAATGGGGTGAC
AGGGAAGAAGTTCAAGGCGGGGGATGCAGTGCCGGTTAATGCGACGAAGGAAGTGTATGC
TTCTCTATTTACTTCCTCCAAGAAGAAGTCTGACATCAGGGAGACTTACTCTTGCAGGTC
ACTACCTCTGGGAAGGAATTGATTTGTTTGAATACATGTTTGTTTGTTTCATGCTTTGCT
TTGTAATAATCAATTTGCATTTGTAACTTTGATATTGGATGATATCACGTTTTTACT

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL6281Contig1 720 2 2 U
TTTTGAAATAGTGACCGTTGTTACTTTATTACCGACGTTGCTAACGTTTTTAAGACAGAC
ATGTCGAGCAAATGAAATAGAAGAATGCTTACAAAGTCTTCTCATACAATCATTACTGTA
TTGAGAAGATGTTTTATGACCTGACTAGAAAATACATATATATAGGCTACTTCACTTCTT
CCATATCCTCATGGTACCTAAACCATCATAACTTCCACCAGGCATTCATTATTCATTTAC
TCCACCTCGAAATAGCTTGTTACCCTTATTCAATCAGATAGAGACGTGCATTTGAACCCA
CCTCTCACAAGTTCATTTACTGCGTCCTTAAGCCTATGATACTCCTCAGGTTTGTTATAA
ACTTGAAACGAAATGCGAACATACCCCGTGATCGAATCATCAGTCTCTCCCTCACCAGGC
GCTCTATAGTAGGTCGGGATCTCAATGCAGAACCTCTCTCTCAAAAGGTTCCTAAGCTTC
ACAGCATCCGACTCGCTCGACACACCTAAACACACAGGCAACCCAACCATGACCATACTC
GCACACATCTCAGGCGGACAACCTAGCTGCGTCCCCCAAGACTTAACCAGCATCTGTCCC
ATCTCAACCACAGACTCATGATTCCTCCTCTTTATCCCATCAATCCCACCTTCGAACCGG
TTCACGAACTCCACAATCGAAGGCACAACCAACTGCGCACTGTAGTCTCTAGTCCCTACC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FZ68TF C 1
AF RR2FZ68JQ U 4
BS 1 5 RR2FZ68TF
BS 6 720 RR2FZ68JQ

RD RR2FZ68TF 720 0 0
TTTTGAAATAGTGACCGTTGTTACTTTATTAC*GACGTTGCTAACGTTTT*AAGACAGAC
ATGTCGAGCAAATGAAATAGAAGAATGCTTACAAAGTCTTCTCATACAATCATTACTGTA
TTGAGAAGATGTTTTATGACCTGACTAGAAAATACATATATATAGGCTACTTCACTTCTT
CCATATCCTCATGGTACCTAAACCATCATAACTTCCACCAGGCATTCATTATTCATTTAC
TCCACCTCGAAATAGCTTGTTACCCTTATTCAATCAGATAGAGACGTGCATTTGAACCCA
CCTCTCACAAGTTCATTTACTGCGTCCTTAAGCCTATGATACTCCTCAGGTTTGTTATAA
ACTTGAAACGAAATGCGAACATACCCCGTGATCGAATCATCAGTCTCTCCCTCACCAGGC
GCTCTATAGTAGGTCGGGATCTCAATGCAGAACCTCTCTCTCAAAAGGTTCCTAAGCTTC
ACAGCATCCGACTCGCTCGACACACCTAAACACACAGGCAACCCAACCATGACCATACTC
GCACACATCTCAGGCGGACAACCTAGCTGCGTCCCCCAAGACTTAACCAGCATCTGTCCC
ATCTCAACCACAGACTCATGATTCCTCCTCTTTATCCCATCAATCCCACCTTCGAACCGG
TTCACGAACTCCACAATCGAAGGCACAACCAACTGCGCACTGTAGTCTCTAGTCCCTACC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2FZ68JQ 717 0 0
GA
AAATAGTGACCGTTGTTACTTTATTACCGACGTTGCTAACGTTTTTAAGACAGACATGTC
GAGCAAATGAAATAGAAGAATGCTTACAAAGTCTTCTCATACAATCATTACTGTATTGAG
AAGATGTTTTATGACCTGACTAGAAAATACATATATATAGGCTACTTCACTTCTTCCATA
TCCTCATGGTACCTAAACCATCATAACTTCCACCAGGCATTCATTATTCATTTACTCCAC
CTCGAAATAGCTTGTTACCCTTATTCAATCAGATAGAGACGTGCATTTGAACCCACCTCT
CACAAGTTCATTTACTGCGTCCTTAAGCCTATGATACTCCTCAGGTTTGTTATAAACTTG
AAACGAAATGCGAACATACCCCGTGATCGAATCATCAGTCTCTCCCTCACCAGGCGCTCT
ATAGTAGGTCGGGATCTCAATGCAGAACCTCTCTCTCAAAAGGTTCCTAAGCTTCACAGC
ATCCGACTCGCTCGACACACCTAAACACACAGGCAACCCAACCATGACCATACTCGCACA
CATCTCAGGCGGACAACCTAGCTGCGTCCCCCAAGACTTAACCAGCATCTGTCCCATCTC
AACCACAGACTCATGATTCCTCCTCTTTATCCCATCAATCCCACCTTCGAACCGGTTCAC
GAACTCCACAATCGAAGGCACAACCAACTGCGCACTGTAGTCTCTAGTCCCTACC

QA 3 717 3 717
DS 



AS 1 2

CO CL6282Contig1 698 2 2 U
GGAGGTAAAGTTAACTGCAGTTACCGCAACGAGGCTCATATGTGAGACTCCAGCCCTTCT
TAATCCAGCAGCTTCTAATATCTGGGGGGCTATGCTGGACAGTATAGTGACGCTTGTTTC
AAGGCCTGAGCAGGAAAGAGCCGTTGAAGAACCTGAAATGCCAGAAGGCTTGGAGAATGC
TGGATACACAGCTGCGTTTGTGAGTCTTCACAATGCTGGGAGAAGGGAAGCGGATCCTCT
CCCAGACATTAGAGATCCGAAGCAGTTCGTGGTTGCTTCTTTGGCCAGGCTTTCTGCTGC
TTCTCCTGGTAGATACCCGCAGATAATTGGTGAGAATCTCGAAAAAGCTAACCAGGCAGC
TTTGCTCCAGCTCTGCAGCGCTTACAGCAGTGTAATCGTTTGAAAGAGAGGTGGGTGTGA
GGAGAAAGGAGGAAAACACACAGCAACATTGCATTTGTGTCTGCGAAGAAAAGTGGTGGT
TTATTTTTTCTTTTGGGGTCTTAAACCGAGGAGTTTCATATCATTTGGAAAGGGAGAAGA
ACATTATCTTACAAAACATGAGTTTCTTTGTTTGGGTTTTTGGCAATTTTCATGGGGTTG
TTGTTTATCTATTGAATGGTGGTGTTACTATGTGTTTATGTGCATTCTGTTCTGTCGTTG
TCTCCTCTAGAAATTTTACATCTAAGAAATGATTCTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW45TF U 1
AF RR2FW45JQ C 1
BS 1 592 RR2FW45TF
BS 593 698 RR2FW45JQ

RD RR2FW45TF 592 0 0
GGAGGTAAAGTTAACTGCAGTTACCGCAACGAGGCTCATATGTGAGACTCCAGCCCTTCT
TAATCCAGCAGCTTCTAATATCTGGGGGGCTATGCTGGACAGTATAGTGACGCTTGTTTC
AAGGCCTGAGCAGGAAAGAGCCGTTGAAGAACCTGAAATGCCAGAAGGCTTGGAGAATGC
TGGATACACAGCTGCGTTTGTGAGTCTTCACAATGCTGGGAGAAGGGAAGCGGATCCTCT
CCCAGACATTAGAGATCCGAAGCAGTTCGTGGTTGCTTCTTTGGCCAGGCTTTCTGCTGC
TTCTCCTGGTAGATACCCGCAGATAATTGGTGAGAATCTCGAAAAAGCTAACCAGGCAGC
TTTGCTCCAGCTCTGCAGCGCTTACAGCAGTGTAATCGTTTGAAAGAGAGGTGGGTGTGA
GGAGAAAGGAGGAAAACACACAGCAACATTGCATTTGTGTCTGCGAAGAAAAGTGGTGGT
TTATTTTTTCTTTTGGGGTCTTAAACCGAGGAGTTTCATATCATTTGGAAAGGGAGAAGA
ACATTATCTTACAAAACATGAGTTTCTTTGTTTGGGTTTTTGGCAATTTTCA

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2FW45JQ 698 0 0
GGAGGTAAAGTTAACTGCAGTTACCGCAACGAGGCTCATATGTGAGACTCCAGCCCTTCT
TAATCCAGCAGCTTCTAATATCTGGGGGGCTATGCTGGACAGTATAGTGACGCTTGTTTC
AAGGCCTGAGCAGGAAAGAGCCGTTGAAGAACCTGAAATGCCAGAAGGCTTGGAGAATGC
TGGATACACAGCTGCGTTTGTGAGTCTTCACAATGCTGGGAGAAGGGAAGCGGATCCTCT
CCCAGACATTAGAGATCCGAAGCAGTTCGTGGTTGCTTCTTTGGCCAGGCTTTCTGCTGC
TTCTCCTGGTAGATACCCGCAGATAATTGGTGAGAATCTCGAAAAAGCTAACCAGGCAGC
TTTGCTCCAGCTCTGCAGCGCTTACAGCAGTGTAATCGTTTGAAAGAGAGGTGGGTGTGA
GGAGAAAGGAGGAAAACACACAGCAACATTGCATTTGTGTCTGCGAAGAAAAGTGGTGGT
TTATTTTTTCTTTTGGGGTCTTAAACCGAGGAGTTTCATATCATTTGGAAAGGGAGAAGA
ACATTATCTTACAAAACATGAGTTTCTTTGTTTGGGTTTTTGGCAATTTTCATGGGGTTG
TTGTTTATCTATTGAATGGTGGTGTTACTATGTGTTTATGTGCATTCTGTTCTGTCGTTG
TCTCCTCTAGAAATTTTACATCTAAGAAATGATTCTGC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL6283Contig1 746 2 1 U
GGGATGTCAATTGGTGAGTGAGCGAAAGAGATTCTGAAACAAATGGGATTGACTCAAAAC
AAGCTCAAGTCTTTCTGTCTCTTCTTCTTCTCTCTTCTCACTCTTACTCCCTTGGCTTTC
TCCGAGATCTTCCTTGAGGAGCATTTCGAAGGTGGATGGAAAAGCAGGTGGGTCTTATCT
GATTGGAAGAGAAACGAAGGCAAAGCCGGAACCTTTAAGCACACTGCCGGTAAATGGCCC
GGTGATCCCGACAATAAAGGCATTCAGACCTATAATGATGCCAAGCATTATGCCATTTCT
GCAAAGATTCCAGAGTTCAGCAACAAAAACAGGACTCTTGTTGTCCAGTACTCTGTCAAA
ATCGAACAAGACATAGAATGTGGTGGCGCTTACATCAAGCTCCTCTCTGGCTACGTTAAC
CAGAAGCAATTTGGTGGTGATACTCCTTACAGTCTAATGTTTGGACCAGACATCTGCGGC
ACGCAGACAAAGAAGCTTCATGTGATTCTTTCATACCAGGGACAGAACTACCCAATCAAA
AAGGATTTGGAATGTGAAACAGACAAGTTAAATCATTTCTACACATTTATTCTGCGGCCT
GACGCTTCTTACAGCGTCCTTGTTGATAATAAAGAGAGGGAGTTTGGCAGTATGTACACT
GACTGGGACATCCTTCCTCCAAGAAGATAAAGTTAAAATGCAAAGAAGCCTGTGGACTGG
GATGACAGAGAATATATTGATGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK03TF U 541
AF RR2CO21TF U 1
BS 1 746 RR2CO21TF

RD RR2FK03TF 139 0 0
AAGGATTTGGAATGTGAAACAGACAAGTTAAATCATTTCTACACATTTATTCTGCGGCCT
GACGCTTCTTACAGCGTCCTTGTTGATAATAAAGAGAGGGAGTTTGGCAGTATGTACACT
GACTGGGACATCCTTCCTC

QA 1 139 1 139
DS 

RD RR2CO21TF 746 0 0
GGGATGTCAATTGGTGAGTGAGCGAAAGAGATTCTGAAACAAATGGGATTGACTCAAAAC
AAGCTCAAGTCTTTCTGTCTCTTCTTCTTCTCTCTTCTCACTCTTACTCCCTTGGCTTTC
TCCGAGATCTTCCTTGAGGAGCATTTCGAAGGTGGATGGAAAAGCAGGTGGGTCTTATCT
GATTGGAAGAGAAACGAAGGCAAAGCCGGAACCTTTAAGCACACTGCCGGTAAATGGCCC
GGTGATCCCGACAATAAAGGCATTCAGACCTATAATGATGCCAAGCATTATGCCATTTCT
GCAAAGATTCCAGAGTTCAGCAACAAAAACAGGACTCTTGTTGTCCAGTACTCTGTCAAA
ATCGAACAAGACATAGAATGTGGTGGCGCTTACATCAAGCTCCTCTCTGGCTACGTTAAC
CAGAAGCAATTTGGTGGTGATACTCCTTACAGTCTAATGTTTGGACCAGACATCTGCGGC
ACGCAGACAAAGAAGCTTCATGTGATTCTTTCATACCAGGGACAGAACTACCCAATCAAA
AAGGATTTGGAATGTGAAACAGACAAGTTAAATCATTTCTACACATTTATTCTGCGGCCT
GACGCTTCTTACAGCGTCCTTGTTGATAATAAAGAGAGGGAGTTTGGCAGTATGTACACT
GACTGGGACATCCTTCCTCCAAGAAGATAAAGTTAAAATGCAAAGAAGCCTGTGGACTGG
GATGACAGAGAATATATTGATGACCC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6285Contig1 774 2 4 U
GGAGACAGCTTCATAATGCTCAGCCATCTCCTCAATCGCTCTCCCAATCCATCTCTTGTC
TTCTCCAGAACCTTCTCCTCTACTACACTTTTCGTCAAAGGCATCTCTTTCTCAAGCACA
GAAGAAACATTAACACAAGCTTTTTCTCAATATGGTCGTGTTCTTGGTGTGAATGTTGTG
ATGGACAAAGTCAGATGCAGACCAAAAGGGTTTGCTTATGTCAAATTCTCTTCCAAAGAA
GAAGCCGACGAAGCCTTATTACAACTTAACGGACAGTTGGTAGACGGGCGGGTCGTGGTC
CTCGACACAACAAAAACCGTAAAACAGAAAGACCAACCAGACTGCAAGCCTAAGCATGCA
GTGGAAGGAGTTCCCAGCTGCCAGAACAAGGTTATCCCTGAAAATTAGGCAAGAAGGTTT
GATGTGGAGTTTGCTAGATCTACCGGTTCTTTCTACTAAGAAGATCTCATTTCTGGAAGA
CCGCAATGGGTATTTGAACAGAGGGCTGGGTGATGGTTGCTGTATGCAAAAAGGTCTTAC
AATTTTCTACTCTCTCTATCTCAACTCTTGTCTCTTTGTCCTCCTTTAGATTTGTACCCC
CCTCGTAGTACCTCTTTACTTTCTTTTTTGGCTGTTTTCTTTTTCGCCTTCCAGCGACGC
CATGGGTTTGGATTACTTAGTCTTGTAGGCAATTCTTTTGTGTTTTTGTCCTTTTTCCCT
CGGGAACAAAGCTCTTTTCTTAAGTTAATTGGCAGTGCAGGTCAATAACATTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A893JQ C 1
AF RR2A893TF U 1
BS 1 688 RR2A893TF
BS 689 689 RR2A893JQ
BS 690 725 RR2A893TF
BS 726 774 RR2A893JQ

RD RR2A893JQ 774 0 0
GGAGACAGCTTCATAATGCTCAGCCATCTCCTCAATCGCTCTCCCAATCCATCTCTTGTC
TTCTCCAGAACCTTCTCCTCTACTACACTTTTCGTCAAAGGCATCTCTTTCTCAAGCACA
GAAGAAACATTAACACAAGCTTTTTCTCAATATGGTCGTGTTCTTGGTGTGAATGTTGTG
ATGGACAAAGTCAGATGCAGACCAAAAGGGTTTGCTTATGTCAAATTCTCTTCCAAAGAA
GAAGCCGACGAAGCCTTATTACAACTTAACGGACAGTTGGTAGACGGGCGGGTCGTGGTC
CTCGACACAACAAAAACCGTAAAACAGAAAGACCAACCAGACTGCAAGCCTAAGCATGCA
GTGGAAGGAGTTCCCAGCTGCCAGAACAAGGTTATCCCTGAAAATTAGGCAAGAAGGTTT
GATGTGGAGTTTGCTAGATCTACCGGTTCTTTCTACTAAGAAGATCTCATTTCTGGAAGA
CCGCAATGGGTATTTGAACAGAGGGCTGG*TGATGGTTGCTGTATGCAAAAAGGTCTTAC
AATTTTCTACTCTCTCTATCTCAACTCTTGTCTCTTTGTCCTCCTTTAGATTTGTACCCC
CCTCGTAGTACCTCTTTACTTTCTTTTT*GGCTGTTTTCTTTTTCGCCTTCCAGCGACGC
CATGG*TTTGGATTACTTAGTCTTGTAGGCAATTCTTTTGTGTTTTTGTCCTTTTTCCCT
CGGGAACAAAGCTCTTTTCTTAAGTTAATTGGCAGTGCAGGTCAATAACATTTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2A893TF 725 0 0
GGAGACAGCTTCATAATGCTCAGCCATCTCCTCAATCGCTCTCCCAATCCATCTCTTGTC
TTCTCCAGAACCTTCTCCTCTACTACACTTTTCGTCAAAGGCATCTCTTTCTCAAGCACA
GAAGAAACATTAACACAAGCTTTTTCTCAATATGGTCGTGTTCTTGGTGTGAATGTTGTG
ATGGACAAAGTCAGATGCAGACCAAAAGGGTTTGCTTATGTCAAATTCTCTTCCAAAGAA
GAAGCCGACGAAGCCTTATTACAACTTAACGGACAGTTGGTAGACGGGCGGGTCGTGGTC
CTCGACACAACAAAAACCGTAAAACAGAAAGACCAACCAGACTGCAAGCCTAAGCATGCA
GTGGAAGGAGTTCCCAGCTGCCAGAACAAGGTTATCCCTGAAAATTAGGCAAGAAGGTTT
GATGTGGAGTTTGCTAGATCTACCGGTTCTTTCTACTAAGAAGATCTCATTTCTGGAAGA
CCGCAATGGGTATTTGAACAGAGGGCTGGGTGATGGTTGCTGTATGCAAAAAGGTCTTAC
AATTTTCTACTCTCTCTATCTCAACTCTTGTCTCTTTGTCCTCCTTTAGATTTGTACCCC
CCTCGTAGTACCTCTTTACTTTCTTTTTTGGCTGTTTTCTTTTTCGCCTTCCAGCGACGC
CATGGGTTTGGATTACTTAGTCTTGTAG*CAATTCTTTTGTGTTTTTGTCCTTTTTCCCT
CGGGA

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL6286Contig1 677 2 2 U
TGTCTTCAATAACCTAGACGAACCCTTCCTCCTCACTTGGAATGGGATCCAGCACAGGAA
GAACTGTTGGCAAGATGGGACACCAGGTACCATGTGTCCAATCCCAGCAGGCACAAACTT
CACTTACCATTTCCAGCCTAAGGATCAGATCGGTAGCTACTTCTACTACCCAACCACAGG
GATGCACCGTGCAGCTGGTGGATACGGTGGCCTCCGTGTCAACAGCCGTCTCCTCATCCC
GGTCCCTTACGCTGATCCGGAAGATGATTACACCGTCCTCATCAGTGACTGGTACACTAA
GAGTCACACTCAGCTGAAGAAGTTCCTTGACGGTGGTCGTACTCTTGGTCGTCCAAACGG
TGTTCTCATCAACGGAAAGACAGGGAAAGGAGATGGATCCGACGCACCTCTCTTCACCAT
GAAACCTGGAAAGAGTTATAGGGTTAGGATTTGTAACGTGGGTCTCAAGACATCTCTCAA
CTTCAGGATTCAGAATCACAAGATGAAGCTCGTTGAGATGGAAGGATCGCACGTTCTTCA
GAACGATTTCGACTCTCTTGACGTTCACGTTGGTCAGTGCTTTGGTACCATCGTCACCGC
GAATCAAGAACCTAAAGATTACTACATGGTTGCATCCTCTAGTTCTTGAAGTCGGTGATT
ACAACAACCGGACTCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G993TF U 1
AF RR2GB30TF U 1
BS 1 613 RR2G993TF
BS 614 677 RR2GB30TF

RD RR2G993TF 613 0 0
TGTCTTCAATAACCTAGACGAACCCTTCCTCCTCACTTGGAATGGGATCCAGCACAGGAA
GAACTGTTGGCAAGATGGGACACCAGGTACCATGTGTCCAATCCCAGCAGGCACAAACTT
CACTTACCATTTCCAGCCTAAGGATCAGATCGGTAGCTACTTCTACTACCCAACCACAGG
GATGCACCGTGCAGCTGGTGGATACGGTGGCCTCCGTGTCAACAGCCGTCTCCTCATCCC
GGTCCCTTACGCTGATCCGGAAGATGATTACACCGTCCTCATCAGTGACTGGTACACTAA
GAGTCACACTCAGCTGAAGAAGTTCCTTGACGGTGGTCGTACTCTTGGTCGTCCAAACGG
TGTTCTCATCAACGGAAAGACAGGGAAAGGAGATGGATCCGACGCACCTCTCTTCACCAT
GAAACCTGGAAAGAGTTATAGGGTTAGGATTTGTAACGTGGGTCTCAAGACATCTCTCAA
CTTCAGGATTCAGAATCACAAGATGAAGCTCGTTGAGATGGAAGGATCGCACGTTCTTCA
GAACGATTTCGACTCTCTTGACGTTCACGTTGGTCAGTGCTTTGGTACCATCGTCACCGC
GAATCAAGAACCT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2GB30TF 677 0 0
TGTCTTCAATAACCTAGACGAACCCTTCCTCCTCACTTGGAATGGGATCCAGCACAGGAA
GAACTGTTGGCAAGATGGGACACCAGGTACCATGTGTCCAATCCCAGCAGGCACAAACTT
CACTTACCATTTCCAGCCTAAGGATCAGATCGGTAGCTACTTCTACTACCCAACCACAGG
GATGCACCGTGCAGCTGGTGGATACGGTGGCCTCCGTGTCAACAGCCGTCTCCTCATCCC
GGTCCCTTACGCTGATCCGGAAGATGATTACACCGTCCTCATCAGTGACTGGTACACTAA
GAGTCACACTCAGCTGAAGAAGTTCCTTGACGGTGGTCGTACTCTTGGTCGTCCAAACGG
TGTTCTCATCAACGGAAAGACAGGGAAAGGAGATGGATCCGACGCACCTCTCTTCACCAT
GAAACCTGGAAAGAGTTATAGGGTTAGGATTTGTAACGTGGGTCTCAAGACATCTCTCAA
CTTCAGGATTCAGAATCACAAGATGAAGCTCGTTGAGATGGAAGGATCGCACGTTCTTCA
GAACGATTTCGACTCTCTTGACGTTCACGTTGGTCAGTGCTTTGGTACCATCGTCACCGC
GAATCAAGAACCTAAAGATTACTACATGGTTGCATCCTCTAGTTCTTGAAGTCGGTGATT
ACAACAACCGGACTCTC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL6287Contig1 1086 2 2 U
GGCGAAAACCTAAATCTTGTCTGTATTCCGTCTTTCTCCGTCGTGGTTGCCACCAACACA
CCAAGCTGCGTCACCTCCGGTTCGATAAAGCTCTTCTCCATATAATATCTTCTTCTCTGC
CTAAAGAGACCAGAGTGAAATTAAAGTGATGGATCGTTCTGTGAACCTGCTGGATGTAGC
CTTAGGGTTTGATGCTGATCAATCGCCACTAAGTGGGAAGGTGGTGGTGATAGAGGACTG
TGTGGAGACGAGTGGTTCGTTTGTGCTTCACCAGATGATGAAGCGTCTTCTCTCCCCTCC
TTCCTCTGATTCCCTTATCTTTCTCGCCTTTGCTCGCCCTTTCTCTCATTACGATCGTAT
TCTCCGCAAACTGGGATGCAATTTATCTACTCAAAAGACAAACAATCGATTGGTTTTCGT
TGACATGCTCATGATGAAATGCTCAGCAGATGGTGAAGAAACGAAAGACTCTGCGAGTGC
AGTTGCAAAGCTATTTCGGGAGATACAAGCAACGGTTCGAAAGTTACGCACTGTGACTAA
TAGCAACATAACTGTTATGGTGGATGACATGTCTCTCCTAGAAATTGCTGCTACCAATAA
CAGCAATTCAGATCACGTCTTGGACTTCCTTCATTACTGCCACACCTTAACTTCTGAAGG
CAATTGTTCGCTGGTCATTCTCAATCATGAAGACATTTACTCGAGCATGGAGAGACCTGC
GTATTTGCTGCAGATGGTATGCCTTGCCGATGTTGTCATTAAAGCAGAGCCTTTAGCCTC
AGGTTTAGCTAATGACGTACATGGCCAACTTACAGTTCTGAACAAGGGGATAAGCAGCAA
TTCGAGGAACAAGTTGCAGAATTTTCAATTCAGGATTAAGGAAAATGGCATCGAGTATTT
CTACCCTGGTTCTAGAAGCTGAGGATTGGAGACGGTTTTCATGTTGTATGGTAGTGAGAT
ATGCAGCTAAGACATTGTTTATGTATGTGTGGAAGAAGCTATTTGGTGCATTTCGGTTTG
AAAGATTCTTTGACTCTGCTCAGCATTCTTTTACTCTTTGAGATCTCAACCACTTCTGTT
TTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS31TF U 1
AF RR2BS31JQ C 343
BS 1 657 RR2BS31TF
BS 658 1086 RR2BS31JQ

RD RR2BS31TF 657 0 0
GGCGAAAACCTAAATCTTGTCTGTATTCCGTCTTTCTCCGTCGTGGTTGCCACCAACACA
CCAAGCTGCGTCACCTCCGGTTCGATAAAGCTCTTCTCCATATAATATCTTCTTCTCTGC
CTAAAGAGACCAGAGTGAAATTAAAGTGATGGATCGTTCTGTGAACCTGCTGGATGTAGC
CTTAGGGTTTGATGCTGATCAATCGCCACTAAGTGGGAAGGTGGTGGTGATAGAGGACTG
TGTGGAGACGAGTGGTTCGTTTGTGCTTCACCAGATGATGAAGCGTCTTCTCTCCCCTCC
TTCCTCTGATTCCCTTATCTTTCTCGCCTTTGCTCGCCCTTTCTCTCATTACGATCGTAT
TCTCCGCAAACTGGGATGCAATTTATCTACTCAAAAGACAAACAATCGATTGGTTTTCGT
TGACATGCTCATGATGAAATGCTCAGCAGATGGTGAAGAAACGAAAGACTCTGCGAGTGC
AGTTGCAAAGCTATTTCGGGAGATACAAGCAACGGTTCGAAAGTTACGCACTGTGACTAA
TAGCAACATAACTGTTATGGTGGATGACATGTCTCTCCTAGAAATTGCTGCTACCAATAA
CAGCAATTCAGATCACGTCTTGGACTTCCTTCATTACTGCCACACCTTAACTTCTGA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2BS31JQ 744 0 0
CTCTCATTACGATCGTATTCTCCGCAAACTGGGATGCAATTTATCTACTCAAAAGACAAA
CAATCGATTGGTTTTCGTTGACATGCTCATGATGAAATGCTCAGCAGATGGTGAAGAAAC
GAAAGACTCTGCGAGTGCAGTTGCAAAGCTATTTCGGGAGATACAAGCAACGGTTCGAAA
GTTACGCACTGTGACTAATAGCAACATAACTGTTATGGTGGATGACATGTCTCTCCTAGA
AATTGCTGCTACCAATAACAGCAATTCAGATCACGTCTTGGACTTCCTTCATTACTGCCA
CACCTTAACTTCTGAAGGCAATTGTTCGCTGGTCATTCTCAATCATGAAGACATTTACTC
GAGCATGGAGAGACCTGCGTATTTGCTGCAGATGGTATGCCTTGCCGATGTTGTCATTAA
AGCAGAGCCTTTAGCCTCAGGTTTAGCTAATGACGTACATGGCCAACTTACAGTTCTGAA
CAAGGGGATAAGCAGCAATTCGAGGAACAAGTTGCAGAATTTTCAATTCAGGATTAAGGA
AAATGGCATCGAGTATTTCTACCCTGGTTCTAGAAGCTGAGGATTGGAGACGGTTTTCAT
GTTGTATGGTAGTGAGATATGCAGCTAAGACATTGTTTATGTATGTGTGGAAGAAGCTAT
TTGGTGCATTTCGGTTTGAAAGATTCTTTGACTCTGCTCAGCATTCTTTTACTCTTTGAG
ATCTCAACCACTTCTGTTTTTCTT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6289Contig1 993 2 6 U
GGGTTCTTTCTTCAGCAGAAAGAAGAAGATGGCGGCCAGAAGCATCTCTTACATCACCTC
TACTCAGCTCCTTCCTCTCCATCGTCGTCCCAACATCGCCATCATCGATGTCAGGTTTGA
CTTTCCAATTACACAACACACACGGTTTTGAGTCACTAATCTGATCCGTTTAGCAATAAA
TTTAGATCGAATCAATCCAATTGCTTTTTAGGTTTAATTTGCTCTACGATGTAGTACTGA
TATAGATTTTTAGGACTTACGATTCCTGCTTGAATATATTTAACTATGAGGAATCTCATC
AATGTTCTGTAAAAAAGATGAAGTTTTGTCGGAATTTAATTGGGCTTCGAACAAAGCTTC
TGTGTGGTTTAGGTGTCTGAGAAGTTAATAAAGGATCCAAATTTTTTATTGTACTACGTA
GTCATATCTATAAAAATCGAGACTTTAGTAAGTGTTTTCGTTTTCAAGGGATGAAGAGAG
GAATTATGATGGGCATATAGCTGGTTCTCTACACTATGCTAGTGGCTCTTTTGATGATAG
GATCTCTCATCTTGTTCAACATGTCAAGGATAAAGACACACTTGTCTTCCATTGTGCTCT
CAGCCAGGTTCGTGGCCCAACATGTGCAAGGAGACTCGTGAATTATCTTGACGAGAAGAA
ACAAGAAACTGGAATAAAAAACATAATGATCTTGGAACGCGGCTTCAATGGCTGGGAAGC
TGCTGGAAAACCGGTTTGCCGCTGCGCAGACGTTCCTTGCAAAGGCGACTGCACCTAAGA
AGCCCTACTGAACCATTCGAAACCTAAATTGATCTCCACATTTGTCATGTGTATCAAGAG
ATATGATGATTACATACTATTCATAAATAATCTCTTAGGCCAATATGCCTAGTTACCTCT
CTTTCTATTGACAAATCACAATATTAAAGAGCCCTTTCGATATGTATTGGACGTCGTAAA
AGTCACGTTTATTGTATTTATAATAACTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR57TF U 1
AF RR2GR57JQ C 635
BS 1 680 RR2GR57TF
BS 681 681 RR2GR57JQ
BS 682 707 RR2GR57TF
BS 708 708 RR2GR57JQ
BS 709 729 RR2GR57TF
BS 730 993 RR2GR57JQ

RD RR2GR57TF 729 0 0
GGGTTCTTTCTTCAGCAGAAAGAAGAAGATGGCGGCCAGAAGCATCTCTTACATCACCTC
TACTCAGCTCCTTCCTCTCCATCGTCGTCCCAACATCGCCATCATCGATGTCAGGTTTGA
CTTTCCAATTACACAACACACACGGTTTTGAGTCACTAATCTGATCCGTTTAGCAATAAA
TTTAGATCGAATCAATCCAATTGCTTTTTAGGTTTAATTTGCTCTACGATGTAGTACTGA
TATAGATTTTTAGGACTTACGATTCCTGCTTGAATATATTTAACTATGAGGAATCTCATC
AATGTTCTGTAAAAAAGATGAAGTTTTGTCGGAATTTAATTGGGCTTCGAACAAAGCTTC
TGTGTGGTTTAGGTGTCTGAGAAGTTAATAAAGGATCCAAATTTTTTATTGTACTACGTA
GTCATATCTATAAAAATCGAGACTTTAGTAAGTGTTTTCGTTTTCAAGGGATGAAGAGAG
GAATTATGATGGGCATATAGCTGGTTCTCTACACTATGCTAGTGGCTCTTTTGATGATAG
GATCTCTCATCTTGTTCAACATGTCAAGGATAAAGACACACTTGTCTTCCATTGTGCTCT
CAGCCAGGTTCGTGGCCCAACATGTGCAAGGAGACTCGTGAATTATCTTGACGAGAAGAA
ACAAGAAACTGGAATAAAAA*CATAATGATCTTGGAACGCGGCTTCA*TGGCTGGGAAGC
TGCTGGAAA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2GR57JQ 359 0 0
CTCGTGAATTATCTTGACGAGAAGAAACAAGAAACTGGAATAAAAAACATAATGATCTTG
GAACGCGGCTTCAATGGCTGGGAAGCTGCTGGAAAACCGGTTTGCCGCTGCGCAGACGTT
CCTTGCAAAGGCGACTGCACCTAAGAAGCCCTACTGAACCATTCGAAACCTAAATTGATC
TCCACATTTGTCATGTGTATCAAGAGATATGATGATTACATACTATTCATAAATAATCTC
TTAGGCCAATATGCCTAGTTACCTCTCTTTCTATTGACAAATCACAATATTAAAGAGCCC
TTTCGATATGTATTGGACGTCGTAAAAGTCACGTTTATTGTATTTATAATAACTCTCTC

QA 1 359 1 359
DS 



AS 1 2

CO CL6290Contig1 777 2 3 U
ACGAGTTGTTACATCTTGAGCAGAGTTGGCTTGAGAAGGAAAACGAATTTCAAAGACTTC
AACAAGAAAATGAAGAGCTTAGGGAGCAGGAAGCTTCAGCTGCAAAGAAGATAGAGGAAT
TGTCAATCCTGCTTGACAAAGAAGCCGAGTTTGCAGGCTGTGATTCATGATAACGTCGAG
CTGAAGGTCAGGGAGGCTTCTGCGCTTGAGAAGATCGAAGAGTTATCAAAGTCGCTAGAA
AAAGCTGCTTCTTCCACACTAGAGAAACCACATGAAAACGGCAAGCCTAGAAGCGGGGAA
CAAAAGGTAGAAGAAAGTCCAGTGGAAGCCATTGATAACCATTTGAATGGTGACACACCA
ATCAATTTGTTACCTCACAAAGATGAAGGAGACAAGGAGAAAGACTCCATGGAAGGAGAA
GCAAAGAGAGAAGTTTCTTCAGAGAGGGAGTCAGATCACGAGTTTGCTGAAGAGGAAGAG
GAATCAAAAGCAGAAGGCAGTGAAAATTTTGATCAGTTGAGCAATGGCTTGTCTTCAGCA
GAGCACATAGAATATTCTGGAAGTCTGAACTCAAGGGAACTAGAGCAGAAGAAGAAGAAA
CCTCTGCTCCGGAAGTTTGGAAATTTACTGAAGAAGAAGAGTACAAGCAGCAGCAGCCAT
AAATAGAGGGAAGATGTGATGGATGGTACTGTTATCATTCTATTGCAACTGAACATATTC
TTTGGTTGACTTTTGTCTTTTAAATCTTTGAAGAGTATAGCTCCAAATTCAATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C258TF U 29
AF RR2C258JQ C 1
BS 1 28 RR2C258JQ
BS 29 432 RR2C258TF
BS 433 777 RR2C258JQ

RD RR2C258TF 404 0 0
GCTTGAGAAGGAAAACGAATTTCAAAGACTTCAACAAGAAAATGAAGAGCTTAGGGAGCA
GGAAGCTTCAGCTGCAAAGAAGATAGAGGAATTGTCAATCCTGCTTGACAAAGAAGCCGA
GTTTGCAGGCTGTGATTCATGATAACGTCGAGCTGAAGGTCAGGGAGGCTTCTGCGCTTG
AGAAGATCGAAGAGTTATCAAAGTCGCTAGAAAAAGCTGCTTCTTCCACACTAGAGAAAC
CACATGAAAACGGCAAGCCTAGAAGCGGGGAACAAAAGGTAGAAGAAAGTCCAGTGGAAG
CCATTGATAACCATTTGAATGGTGACACACCAATCAATTTGTTACCTCACAAAGATGAAG
GAGACAAGGAGAAAGACTCCATGGAAGGAGAAGCAAAGAGAGAA

QA 1 404 1 404
DS 

RD RR2C258JQ 777 0 0
ACGAGTTGTTACATCTTGAGCAGAGTTGGCTTGAGAAGGAAAACGAATTTCAAAGACTTC
AACAAGAAAATGAAGAGCTTAGGGAGCAGGAAGCTTCAGCTGCAAAGAAGATAGAGGAAT
TGTCAATCCTGCTTGACAAAGAAGCCGAGTT*GCAGGCTGTGATTCATGATAACGTCGAG
CTGAAGGTCAGGGAGGCTTCTGCGCTTGAGAAGATCGAAGAGTTATCAAAGTCGCTAGAA
AAAGCTGCTTCTTCCACACTAGAGAAACCACATGAAAACGGCAAGCCTAGAAGCGGGGAA
CAAAAGGTAGAAGAAAGTCCAGTGGAAGCCATTGATAACCATTTGAATGGTGACACACCA
ATCAATTTGTTACCTCACAAAGATGAAGGAGACAAGGAGAAAGACTCCATGGAAGGAGAA
GCAAAGAGAGAAGTTTCTTCAGAGAGGGAGTCAGATCACGAGTTTGCTGAAGAGGAAGAG
GAATCAAAAGCAGAAGGCAGTGAAAATTTTGATCAGTTGAGCAATGGCTTGTCTTCAGCA
GAGCACATAGAATATTCTGGAAGTCTGAACTCAAGGGAACTAGAGCAGAAGAAGAAGAAA
CCTCTGCTCCGGAAGTTTGGAAATTTACTGAAGAAGAAGAGTACAAGCAGCAGCAGCCAT
AAATAGAGGGAAGATGTGATGGATGGTACTGTTATCATTCTATTGCAACTGAACATATTC
TTTGGTTGACTTTTGTCTTTTAAATCTTTGAAGAGTATAGCTCCAAATTCAATTTTT

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL6291Contig1 724 2 1 U
GCAACCCGGCCAACCTTCAAGCAGCCTCGGTGTCATTGGACGCAGAAGTAACTCTGAATT
AGGAGCCATTGGTGACCCTTCAGCTTTAGGGGCAATGCATGATCAGATGCACAATCTCCA
GATGCTTGAAGCTGCGTACTATAGACTTCCTCAACCCAAAGATTCAGAACGGCCTAGACC
CTATACTCCGAGGAACCCTGCAATCACACCTCAAACATTTCCCCAAACACAAGCGCCAAT
CGTAAACAACCCTTTGTTCTGGGAACGTTTAGGCAGCGATGCTTATGGAACCGATACTTT
GTTCTTTGCATTTTATTATCAGCAGAACTCGTATCAGCAGTATCTAGCGGCAAAAGAGCT
GAAGAAACAGTCATGGAGATACCACAGAAAGTTCAACACATGGTTTCAGAGACACAAGGA
GCCAAAGATTGCAACGGATGAGTATGAACAAGGAGCCTATGTTTACTTTGATTTCCAAAC
CCCTAAAGACGAGAGCCAAGAAGGCGGATGGTGTCAAAGGATCAAAAACGAGTTCACGTT
TGAATACAGTTATCTTGAAGATGAACTCGCCGTGTAGAAAAGATAAAAGAGAGATATATG
TTTCATAATGTATATACTCTTCTGCAATGTTTTCTTTCTTTCAATAAACAAATTACTTTT
CAGTTTCAAAGTTTGAGATAGTATTATTTTCTTGCTTCTATAAGCAATCCGAATATTATT
TAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2BT49TF U 1
AF RR2BT49JQ C 19
BS 1 724 RR2BT49TF

RD RR2BT49TF 724 0 0
GCAACCCGGCCAACCTTCAAGCAGCCTCGGTGTCATTGGACGCAGAAGTAACTCTGAATT
AGGAGCCATTGGTGACCCTTCAGCTTTAGGGGCAATGCATGATCAGATGCACAATCTCCA
GATGCTTGAAGCTGCGTACTATAGACTTCCTCAACCCAAAGATTCAGAACGGCCTAGACC
CTATACTCCGAGGAACCCTGCAATCACACCTCAAACATTTCCCCAAACACAAGCGCCAAT
CGTAAACAACCCTTTGTTCTGGGAACGTTTAGGCAGCGATGCTTATGGAACCGATACTTT
GTTCTTTGCATTTTATTATCAGCAGAACTCGTATCAGCAGTATCTAGCGGCAAAAGAGCT
GAAGAAACAGTCATGGAGATACCACAGAAAGTTCAACACATGGTTTCAGAGACACAAGGA
GCCAAAGATTGCAACGGATGAGTATGAACAAGGAGCCTATGTTTACTTTGATTTCCAAAC
CCCTAAAGACGAGAGCCAAGAAGGCGGATGGTGTCAAAGGATCAAAAACGAGTTCACGTT
TGAATACAGTTATCTTGAAGATGAACTCGCCGTGTAGAAAAGATAAAAGAGAGATATATG
TTTCATAATGTATATACTCTTCTGCAATGTTTTCTTTCTTTCAATAAACAAATTACTTTT
CAGTTTCAAAGTTTGAGATAGTATTATTTTCTTGCTTCTATAAGCAATCCGAATATTATT
TAGC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2BT49JQ 706 0 0
AAGCAGCCTCGGTGTCATTGGACGCAGAAGTAACTCTGAATTAGGAGCCATTGGTGACCC
TTCAGCTTTAGGGGCAATGCATGATCAGATGCACAATCTCCAGATGCTTGAAGCTGCGTA
CTATAGACTTCCTCAACCCAAAGATTCAGAACGGCCTAGACCCTATACTCCGAGGAACCC
TGCAATCACACCTCAAACATTTCCCCAAACACAAGCGCCAATCGTAAACAACCCTTTGTT
CTGGGAACGTTTAGGCAGCGATGCTTATGGAACCGATACTTTGTTCTTTGCATTTTATTA
TCAGCAGAACTCGTATCAGCAGTATCTAGCGGCAAAAGAGCTGAAGAAACAGTCATGGAG
ATACCACAGAAAGTTCAACACATGGTTTCAGAGACACAAGGAGCCAAAGATTGCAACGGA
TGAGTATGAACAAGGAGCCTATGTTTACTTTGATTTCCAAACCCCTAAAGACGAGAGCCA
AGAAGGCGGATGGTGTCAAAGGATCAAAAACGAGTTCACGTTTGAATACAGTTATCTTGA
AGATGAACTCGCCGTGTAGAAAAGATAAAAGAGAGATATATGTTTCATAATGTATATACT
CTTCTGCAATGTTTTCTTTCTTTCAATAAACAAATTACTTTTCAGTTTCAAAGTTTGAGA
TAGTATTATTTTCTTGCTTCTATAAGCAATCCGAATATTATTTAGC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL6292Contig1 920 2 2 U
GGGTAGACCCCTTCCATGGCGATCTAGAAATCCACGGAGAGAAGTTTTTTTCTTCGTCGA
AGATTAATCTGCCCAAAGTCTCTACTCTGGTTTCGTCATCTTTCTCTTCGATCTCATAGC
CTTGTTCGTCGTCGGTGTTCTTTCTCTTTGTTCTTCCTTTTCATCAGACGGGTCAAATCG
AAATCGAAGCCTTCTTTATTGTGTTTCGTATTGGTTAAAAAGATCGTTTCTTTATTGTGT
GATTCTTTCAAAAAGTTTGATGCTTTTGTTTTGATTAAAATTCAGACAAGCACAGAGAGT
TCTGTCCTTACTTCTTGCTGAATGATTTGTGGGATTCGTTCGAGGAGTGGAGTGCTTACG
GTGTTGGGGTTCCTCTTCTATTATAGAGATTGTATACTTCTTCAATTAATCATCTGGGAC
ACATATTTAATTTGACAAAGACAATATGGCTATTGGCTAGCCAGCACCTGTACCACGATA
CCCACAGAATTTTCGCAGGAAGTGGGTTGCAGGCGTGTTAAGAAACTTGAGAGCGTCACA
GTTGCTGAGCTTAACACAAACGTTCTCAATTCTCACCCGCAGAAACCGTGAAAGACATTA
TTTTTCTTTACAAAGCTCCCCTCGGTTACAGCATTGAAGACCTTCACACAAATGGTGGAA
TCAAGAAATTTAAATCTTCTGTCTACTCAAACGTAAGCTTAGATATCACCTCCGATGGAA
CTCATCACTACAATGAGAAAGTTTTGTGTTTCATCAAAGGATATTTTTTTGATTCTGGTA
GGTCATTGTTCCTTTTGCTTTTTTGCTTAATCAAGTGATGTATAAGCTATGTAAACATGG
TTGTACAGTTGGCAACATTGTAATTTGTACATGTATTTTTACTATATTTAAAGTTTATGG
ATAAGCATAGATTATAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ64TF U 1
AF RR2CJ64JQ C 154
BS 1 746 RR2CJ64TF
BS 747 920 RR2CJ64JQ

RD RR2CJ64TF 746 0 0
GGGTAGACCCCTTCCATGGCGATCTAGAAATCCACGGAGAGAAGTTTTTTTCTTCGTCGA
AGATTAATCTGCCCAAAGTCTCTACTCTGGTTTCGTCATCTTTCTCTTCGATCTCATAGC
CTTGTTCGTCGTCGGTGTTCTTTCTCTTTGTTCTTCCTTTTCATCAGACGGGTCAAATCG
AAATCGAAGCCTTCTTTATTGTGTTTCGTATTGGTTAAAAAGATCGTTTCTTTATTGTGT
GATTCTTTCAAAAAGTTTGATGCTTTTGTTTTGATTAAAATTCAGACAAGCACAGAGAGT
TCTGTCCTTACTTCTTGCTGAATGATTTGTGGGATTCGTTCGAGGAGTGGAGTGCTTACG
GTGTTGGGGTTCCTCTTCTATTATAGAGATTGTATACTTCTTCAATTAATCATCTGGGAC
ACATATTTAATTTGACAAAGACAATATGGCTATTGGCTAGCCAGCACCTGTACCACGATA
CCCACAGAATTTTCGCAGGAAGTGGGTTGCAGGCGTGTTAAGAAACTTGAGAGCGTCACA
GTTGCTGAGCTTAACACAAACGTTCTCAATTCTCACCCGCAGAAACCGTGAAAGACATTA
TTTTTCTTTACAAAGCTCCCCTCGGTTACAGCATTGAAGACCTTCACACAAATGGTGGAA
TCAAGAAATTTAAATCTTCTGTCTACTCAAACGTAAGCTTAGATATCACCTCCGATGGAA
CTCATCACTACAATGAGAAAGTTTTG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2CJ64JQ 767 0 0
TTCCTTTTCATCAGACGGGTCAAATCGAAATCGAAGCCTTCTTTATTGTGTTTCGTATTG
GTTAAAAAGATCGTTTCTTTATTGTGTGATTCTTTCAAAAAGTTTGATGCTTTTGTTTTG
ATTAAAATTCAGACAAGCACAGAGAGTTCTGTCCTTACTTCTTGCTGAATGATTTGTGGG
ATTCGTTCGAGGAGTGGAGTGCTTACGGTGTTGGGGTTCCTCTTCTATTATAGAGATTGT
ATACTTCTTCAATTAATCATCTGGGACACATATTTAATTTGACAAAGACAATATGGCTAT
TGGCTAGCCAGCACCTGTACCACGATACCCACAGAATTTTCGCAGGAAGTGGGTTGCAGG
CGTGTTAAGAAACTTGAGAGCGTCACAGTTGCTGAGCTTAACACAAACGTTCTCAATTCT
CACCCGCAGAAACCGTGAAAGACATTATTTTTCTTTACAAAGCTCCCCTCGGTTACAGCA
TTGAAGACCTTCACACAAATGGTGGAATCAAGAAATTTAAATCTTCTGTCTACTCAAACG
TAAGCTTAGATATCACCTCCGATGGAACTCATCACTACAATGAGAAAGTTTTGTGTTTCA
TCAAAGGATATTTTTTTGATTCTGGTAGGTCATTGTTCCTTTTGCTTTTTTGCTTAATCA
AGTGATGTATAAGCTATGTAAACATGGTTGTACAGTTGGCAACATTGTAATTTGTACATG
TATTTTTACTATATTTAAAGTTTATGGATAAGCATAGATTATAGATC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL6293Contig1 829 2 6 U
GCAGGATTCTCCAAAGAATTATCTTTATAAATGTGATCAGCTAAAATCTATTCGCCAAGA
CCTCACGGTACAGCGGATACACAATCATCTAACAGCGAAGGTTTATGAAACACATGCTAG
ATTTGCTTTGGAAGCTGGGGATTTAACTGAGTATAATCAGTGCCTGTCACAGTTGAAAAT
CCTTTATGCCGAAGGTATAGAAGGATGCACTCTGGAATTTGCTGCGTACAGTCTGCTCTA
TATTACCTTACACTCAAACAACAACCGAGAACTGTTATCATCTATGTCCAGGTTATCCAA
AGCAGCTAAGAAGGATGAAGCAGTTAGACATGCTCTCTCAGTTCGTGCAGCTGTTACATC
AGGAAATTATGTTATGTTCTTCAGACTTTACAAGACTGCGCCAAACATGAACAGTTGCCT
CATGGATCTCTATGTGGAGAAAATGCGTTATAAGGCTGTGACTTTTATGTCACGGAGTTG
TCGTCCTACAATCCCGGTCTCATACTTAGCCCAAGTGTTGGGCTTTGCTGGTACTTCAAG
CGAAGGGGCTGGTGAAAAGGAGATTGATGGTATGGAGGAGTGCTCTGAATGGCTAAAAGC
CCATGGTGCTAGCCTCATAGCTGACAGTAACGGAGATATGGTTCTTGATACCAAGGCGTC
ATCAACGAGTCTCTTCATGCCAGAACCTGAAGATGCAGTTGCTCATGGAGATCGATATCT
AGATGTCAATGATTTCTTTACGCGTACATGATGAAAAAAAAAGTTAATATTTGTTGTGTA
GTCTGATGGGGAGAAAAAGGAAACTAATATATATACCAAATTGAAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C625TF U 1
AF RR2C625JQ C 37
BS 1 655 RR2C625TF
BS 656 656 RR2C625JQ
BS 657 728 RR2C625TF
BS 729 729 RR2C625JQ
BS 730 751 RR2C625TF
BS 752 829 RR2C625JQ

RD RR2C625TF 751 0 0
GCAGGATTCTCCAAAGAATTATCTTTATAAATGTGATCAGCTAAAATCTATTCGCCAAGA
CCTCACGGTACAGCGGATACACAATCATCTAACAGCGAAGGTTTATGAAACACATGCTAG
ATTTGCTTTGGAAGCTGGGGATTTAACTGAGTATAATCAGTGCCTGTCACAGTTGAAAAT
CCTTTATGCCGAAGGTATAGAAGGATGCACTCTGGAATTTGCTGCGTACAGTCTGCTCTA
TATTACCTTACACTCAAACAACAACCGAGAACTGTTATCATCTATGTCCAGGTTATCCAA
AGCAGCTAAGAAGGATGAAGCAGTTAGACATGCTCTCTCAGTTCGTGCAGCTGTTACATC
AGGAAATTATGTTATGTTCTTCAGACTTTACAAGACTGCGCCAAACATGAACAGTTGCCT
CATGGATCTCTATGTGGAGAAAATGCGTTATAAGGCTGTGACTTTTATGTCACGGAGTTG
TCGTCCTACAATCCCGGTCTCATACTTAGCCCAAGTGTTGGGCTTTGCTGGTACTTCAAG
CGAAGGGGCTGGTGAAAAGGAGATTGATGGTATGGAGGAGTGCTCTGAATGGCTAAAAGC
CCATGGTGCTAGCCTCATAGCTGACAGTAACGGAGATATGGTTCTTGATACCAAG*CGTC
ATCAACGAGTCTCTTCATGCCAGAACCTGAAGATGCAGTTGCTCATGGAGATCGATATCT
AGATGTCA*TGATTTCTTTACGCGTACATGA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2C625JQ 793 0 0
TCAGCTAAAATCTATTCGCCAAGACCTCACGGTACAGCGGATACACAATCATCTAACAGC
GAAGGTTTATGAAACACATGCTAGATTTGCTTTGGAAGCTGGGGATTTAACTGAGTATAA
TCAGTGCCTGTCACAGTTGAAAATCCTTTATGCCGAAGGTATAGAAGGATGCACTCTGGA
ATTTGCTGCGTACAGTCTGCTCTATATTACCTTACACTCAAACAACAACCGAGAACTGTT
ATCATCTATGTCCAGGTTATCCAAAGCAGCTAAGAAGGATGAAGCAGTTAGACATGCTCT
CTCAGTTCGTGCAGCTGTTACATCAGGAAATTATGTTATGTTCTTCAGACTTTACAAGAC
TGCGCCAAACATGAACAGTTGCCTCATGGATCTCTATGTGGAGAAAATGCGTTATAAGGC
TGTGACTTTTATGTCACGGAGTTGTCGTCCTACAATCCCGGTCTCATACTTAGCCCAAGT
GTTGGGCTTTGCTGGTACTTCAAGCGAAGGGGCTGGTGAAAAGGAGATTGATGGTATGGA
GGAGTGCTCTGAATGGCTAAAAGCCCATGGTGCTAGCCTCATAGCTGACAGTAACGGAGA
TATGGTTCTTGATACCAAGGCGTCATCAACGAGTCTCTTCATGCCAGAACCTGAAGATGC
AGTTGCTCATGGAGATCGATATCTAGATGTCAATGATTTCTTTACGCGTACATGATGAAA
AAAAAAGTTAATATTTGTTGTGTAGTCTGATGGGGAGAAAAAGGAAACTAATATATATAC
CAAATTGAAGTTC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL6294Contig1 567 2 1 U
GGATAGCGAACAAGTACCGCGAGGTAAAGATGAAAAGGACTTTGAAAAGAGAGTCAAAGA
GTGCTTGAAATTGTCGGAAGTGAGGAAGAAGCTAAGAGGAAGATCTACAACGTTTCTTGC
GAGAGGTATTTTGGGTTTGGCTGTGAGATTGATGAGGAGACATCAAACAAACTCGAAGGG
ATTCCTGGTGTTCTCTTCGTGCTTCCTGACTCTTATGTTGATCCAGAGTACAAAGATTAC
GGAGCGGAGTTGTTTGTGAATGGAGAAGTGGTTCCACGTCCACCAGAGAGACAGAGGAGG
ATGGTGGAGTTTACGACTCACAGAAGCTCGGATAGACCCAAGTACAATGACAGAACCAAG
AATGTTCGACGGAGAGATAATATGCGTTAGGACTCCAGTTTCTCAGAGTCTTCTATGCTT
AAACATCTTCTTTTTTCCCCTTTGAACTGTGATCTCATTACCCTTTTTTTTTCTTATGTT
ATTTGCTTCACTAAGTCTGAATAATGTAAATGGTGATGATGGTGTTATGAATAATGCTGT
TGAGTTTATGATATTATGGATTGAGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DC13JQ C 1
AF RR2DC13TF U 1
BS 1 567 RR2DC13TF

RD RR2DC13JQ 567 0 0
GGATAGCGAACAAGTACCGCGAGGTAAAGATGAAAAGGACTTTGAAAAGAGAGTCAAAGA
GTGCTTGAAATTGTCGGAAGTGAGGAAGAAGCTAAGAGGAAGATCTACAACGTTTCTTGC
GAGAGGTATTTTGGGTTTGGCTGTGAGATTGATGAGGAGACATCAAACAAACTCGAAGGG
ATTCCTGGTGTTCTCTTCGTGCTTCCTGACTCTTATGTTGATCCAGAGTACAAAGATTAC
GGAGCGGAGTTGTTTGTGAATGGAGAAGTGGTTCCACGTCCACCAGAGAGACAGAGGAGG
ATGGTGGAGTTTACGACTCACAGAAGCTCGGATAGACCCAAGTACAATGACAGAACCAAG
AATGTTCGACGGAGAGATAATATGCGTTAGGACTCCAGTTTCTCAGAGTCTTCTATGCTT
AAACATCTTCTTTTTTCCCCTTTGAACTGTGATCTCATTACCCTTTTTTTTTCTTATGTT
ATTTGCTTCACTAAGTCTGAATAATGTAAATGGTGATGATGGTGTTATGAATAATGCTGT
TGAGTTTATGATATTATGGATTGAGTT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2DC13TF 567 0 0
GGATAGCGAACAAGTACCGCGAGGTAAAGATGAAAAGGACTTTGAAAAGAGAGTCAAAGA
GTGCTTGAAATTGTCGGAAGTGAGGAAGAAGCTAAGAGGAAGATCTACAACGTTTCTTGC
GAGAGGTATTTTGGGTTTGGCTGTGAGATTGATGAGGAGACATCAAACAAACTCGAAGGG
ATTCCTGGTGTTCTCTTCGTGCTTCCTGACTCTTATGTTGATCCAGAGTACAAAGATTAC
GGAGCGGAGTTGTTTGTGAATGGAGAAGTGGTTCCACGTCCACCAGAGAGACAGAGGAGG
ATGGTGGAGTTTACGACTCACAGAAGCTCGGATAGACCCAAGTACAATGACAGAACCAAG
AATGTTCGACGGAGAGATAATATGCGTTAGGACTCCAGTTTCTCAGAGTCTTCTATGCTT
AAACATCTTCTTTTTTCCCCTTTGAACTGTGATCTCATTACCCTTTTTTTTTCTTATGTT
ATTTGCTTCACTAAGTCTGAATAATGTAAATGGTGATGATGGTGTTATGAATAATGCTGT
TGAGTTTATGATATTATGGATTGAGTT

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL6295Contig1 809 2 10 U
GAAGTGCCGTGGACGTGTGTTTGCGCTTAGAGATGAGCCTGAAGTTTGTAGAGTCTGGCT
GCCAAACTGTGACTCACCTGGACTTGCAATGGCGCGTGCTTTCGGTGACTTTTGCCTTAA
AGACTTTGGTCTAATCTCTGTCCCTGAGGTTTCGTTTCGCCGGTTAACTGACAAAGATGA
GTTTATAGTGTTGGCTACAGATGGGATTTGGGATGTGCTCTCAAACGAAGAAGTAGTGAA
GATTGTGGCTTCAGCACCATCTCGTTCCTCTGCGGCAAAAGCTTTAGTTGAGACTGCGGT
TAGAGCTTGGAGACACAAATACCCAACCTCCAAAGTGGATGACTGTGCTGCGGTCCGCTT
GTATCTAAACTCCAACGACTCAAACGGCATATCTACAGCTTCTTCCTTCTCCAAACTTGA
AGATGAAGATGAGATTGATGATGATGGATCAGTAGGTCCAAGCGGTCTAGGACGTTCGAG
TACTGTCAGGACCACAGGGAAAGAGATTGCTCTCGACGAAAGCGAAGCTGAGAAGCTGAT
TAAAGAAGAGGATACAGAGCATGGAACAGAGTACTCTGCATTAGAAGGTGTTGCAAGAGT
GAATACACTTTTAAACTTGCCAAGATTTGTGCCTGGAAAGTGAAGAAAGAGTAAAGAAGA
GTTTGAAGTGTGACAAAATAAATCACTCAGGAGAGGTTCTGTGTTTTTTTTCCCCACCTT
TCTACATTTGATCTCTTATTCTTTGTTTTTTATTTTAATTTGTTAGATATTCATTGTTTT
TTTTTGGAACTACTTGAATACTTTTGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F011TF U 1
AF RR2BM62JQ C 135
BS 1 355 RR2F011TF
BS 356 356 RR2BM62JQ
BS 357 638 RR2F011TF
BS 639 639 RR2BM62JQ
BS 640 690 RR2F011TF
BS 691 691 RR2BM62JQ
BS 692 710 RR2F011TF
BS 711 711 RR2BM62JQ
BS 712 750 RR2F011TF
BS 751 809 RR2BM62JQ

RD RR2F011TF 752 0 0
GAAGTGCCGTGGACGTGTGTTTGCGCTTAGAGATGAGCCTGAAGTTTGTAGAGTCTGGCT
GCCAAACTGTGACTCACCTGGACTTGCAATGGCGCGTGCTTTCGGTGACTTTTGCCTTAA
AGACTTTGGTCTAATCTCTGTCCCTGAGGTTTCGTTTCGCCGGTTAACTGACAAAGATGA
GTTTATAGTGTTGGCTACAGATGGGATTTGGGATGTGCTCTCAAACGAAGAAGTAGTGAA
GATTGTGGCTTCAGCACCATCTCGTTCCTCTGCGGCAAAAGCTTTAGTTGAGACTGCGGT
TAGAGCTTGGAGACACAAATACCCAACCTCCAAAGTGGATGACTGTGCTGCGGTCTGCTT
GTATCTAAACTCCAACGACTCAAACGGCATATCTACAGCTTCTTCCTTCTCCAAACTTGA
AGATGAAGATGAGATTGATGATGATGGATCAGTAGGTCCAAGCGGTCTAGGACGTTCGAG
TACTGTCAGGACCACAGGGAAAGAGATTGCTCTCGACGAAAGCGAAGCTGAGAAGCTGAT
TAAAGAAGAGGATACAGAGCATGGAACAGAGTACTCTGCATTAGAAGGTGTTGCAAGAGT
GAATACACTTTTAAACTTGCCAAGATTTGTGCCTGGAAGGTGAAGAAAGAGTAAAGAAGA
GTTTGAAGTGTGACAAAATAAATCACTCAG*AGAGGTTCTGTGTTTTTTT*CCCCACCTT
TCTACATTTGATCTCTTATTCTTTGTTTTT
AT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2BM62JQ 675 0 0
TCTCTGTCCCTGAGGTTTCGTTTCGCCGGTTAACTGACAAAGATGAGTTTATAGTGTTGG
CTACAGATGGGATTTGGGATGTGCTCTCAAACGAAGAAGTAGTGAAGATTGTGGCTTCAG
CACCATCTCGTTCCTCTGCGGCAAAAGCTTTAGTTGAGACTGCGGTTAGAGCTTGGAGAC
ACAAATACCCAACCTCCAAAGTGGATGACTGTGCTGCGGTCCGCTTGTATCTAAACTCCA
ACGACTCAAACGGCATATCTACATCTTCTTCCTTCTCCAAACTTGAAGATGAAGATGAGA
TTGATGATGATGGATCAGTAGGTCCAAGCGGTCTAGGACGTTCGAGTACTGTCAGGACCA
CAGGGAAAGAGATTGCTCTCGACGAAAGCGAAGCTGAGAAGCTGATTAAAGAAGAGGATA
CAGAGCATGGAACAGAGTACTTTGCATTAGAAGGTGTTGCAAGAGTGAATACACTTTTAA
ACTTGCCAAGATTTGTGCCTGGAAAGTGAAGAAAGAGTAAAGAAGAGTTTGAAGTGTGAC
AAAATAAATCACTCAGGAGAGGTTCTGTGTTTTTTTTCCCCACCTTTCTACATTTGATCT
CTTATTCTTTGTTTTTTATTTTAATTTGTTAGATATTCATTGTTTTTTTTTGGAACTACT
TGAATACTTTTGCCG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL6296Contig1 869 2 3 U
TTTTGCTATGCATAGATTTATAGATCAAAACTTACTCCAACAATGTTTTACATGCATTAA
ACTGAAACACGAACTCAGTTTCAGTTTAGTTATTAGAGAATTATTATTCAATTCCTTTCC
AAAAAGGAAAATGATTGTAAAACAAAAAATAAAAGGAAAATTGATTTAGCTTTTTGATCC
CTCAAAAGCAAATCAATCAAAGTCTCCATTTCGTGTTCCTTAAGAGAGAAGCCAATCTCC
GCACCACTAATCCCATCTCTACCTTCCGCCATAGATACCCCTTCCCCTTGATCGATCGAC
ACAATCGCAACCCTCTCCGGTTTACCCCACCCGAAATCTAACCCGTACACTCCAAACCGG
GTCGACCCGGAAGCAGAAATAAGCTGCGCTCCTGGTTTAAGACTAGAATACGCTGCATAA
ATCTCCGGAATCTTAAACGCCACCGTTTCATCCAACTCCTCAACCGAACCGCTAACCATT
CTCGCCGCATTTAAGAACCCTTCCTCACCCATAAACGTCTCCGCCGTTAACTTCATGTTA
AACGACGGCGTAAGGCAGTTCCCGAAATAATTCGACGGGACCGGCGGATCAAGAAGGCTT
CGACAGTCCACCGAGAACACGTACCCGACTGGTCTCTTCGGATCTCCGCCGCGAGCTCTT
ACCTAACACGTCAACGCGTACGAGAACGTAACCACAAACGTCGACAATCGAAGCTCTTTA
GGTGACGATTCTCTCTTGAGTCGCTCTCGAAGCGTCTGGATATCTTCGCGAGTGAGATCG
AGAGTGAACCGGACGACGTCGGGACTGATCTCCGGCGTCGGAAATCTTTAAGCTCTTCAC
GTTGCCGTCGGAGATTATTTCGAGTCTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ08JQ U 5
AF RR2AQ08TF C 1
BS 1 4 RR2AQ08TF
BS 5 817 RR2AQ08JQ
BS 818 869 RR2AQ08TF

RD RR2AQ08JQ 813 0 0
GCTATGCATAGATTTATAGATCAAAACTTACTCCAACAATGTTTTACATGCATTAAACTG
AAACACGAACTCAGTTTCAGTTTAGTTATTAGAGAATTATTATTCAATTCCTTTCCAAAA
AGGAAAATGATTGTAAAACAAAAAATAAAAGGAAAATTGATTTAGCTTTTTGATCCCTCA
AAAGCAAATCAATCAAAGTCTCCATTTCGTGTTCCTTAAGAGAGAAGCCAATCTCCGCAC
CACTAATCCCATCTCTACCTTCCGCCATAGATACCCCTTCCCCTTGATCGATCGACACAA
TCGCAACCCTCTCCGGTTTACCCCACCCGAAATCTAACCCGTACACTCCAAACCGGGTCG
ACCCGGAAGCAGAAATAAGCTGCGCTCCTGGTTTAAGACTAGAATACGCTGCATAAATCT
CCGGAATCTTAAACGCCACCGTTTCATCCAACTCCTCAACCGAACCGCTAACCATTCTCG
CCGCATTTAAGAACCCTTCCTCACCCATAAACGTCTCCGCCGTTAACTTCATGTTAAACG
ACGGCGTAAGGCAGTTCCCGAAATAATTCGACGGGACCGGCGGATCAAGAAGGCTTCGAC
AGTCCACCGAGAACACGTACCCGACTGGTCTCTTCGGATCTCCGCCGCGAGCTCTTACCT
AACACGTCAACGCGTACGAGAACGTAACCACAAACGTCGACAATCGAAGCTCTTTAGGTG
ACGATTCTCTCTTGAGTCGCTCTCGAAGCGTCTGGATATCTTCGCGAGTGAGATCGAGAG
TGAACCGGACGACGTCGGGACTGATCTCCGGCG

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2AQ08TF 869 0 0
TTTTGCTATGCATAGATTTATAGATCAAAACTTACTCCAACAATGTTTTACATGCATTAA
ACTGAAACACGAACTCAGTTTCAGTTTAGTTATTAGAGAATTATTATTCAATTCCTTTCC
AAAAAGGAAAATGATTGTAAAACAAAAAATAAAAGGAAAATTGATTTAGCTTTTTGATCC
CTCAAAAGCAAATCAATCAAAGTCTCCATTTCGTGTTCTTTAAGAGAGAAGCCAATCTCC
GCACCACTAATCCCATCTCTACCTTCCGCCATAGATACCCCTTCCCCTTGATCGATCGAC
ACAATCGCAACCCTCTCCGGTTTACCCCACCCGAAATCTAACCCGTACACTCCAAACCGG
GTCGACCCGGAAGCAGAAATAAGCTGCGCTCCTGGTTTAAGACTAGAATACGCTGCATAA
ATCTCCGGAATCTTAAACGCCACCGTTTCATCCAACTCCTCAACCGAACCGCTAACCATT
CTCGCCGCATTTAAGAACCCTTCCTCACCCATAAACGTCTCCGCCGTTAACTTCATGTTA
AACGACGGCGTAAGGCAGTTCCCGAAATAATTCGACGGGACCGGCGGATCAAGAAGGCTT
CGACAGTCCACCGAGAACACGTACCCGACTGGTCTCTTCGGATCTCCGCCGCGAGCTCTT
ACCTAACACGTCAACGCGTACGAGAACGTAACCACAAACGTCGACAATCGAAGCTCTTTA
GGTGACGATTCTCTCTTGAGTCGCTCTCGAAGCGTCTGGATATCTTCGCGAGTGAGATCG
AGAGTGAACCGGACGACGTCGGGACTGATCTCCGGCGTCGGAAATCTTTAAGCTCTTCAC
GTTGCCGTCGGAGATTATTTCGAGTCTCC

QA 1 869 1 869
DS 



AS 1 2

CO CL6297Contig1 858 2 12 U
GGAGGTGAATGGAACCGCAAGTGAGAAGAAACCCACTGTTATTTTTGTCCTCGGTGGTCC
CGGAAGTGGGAAAGGTACACAGTGTGCCTATATTGTTGACCATTTTGGTTACACACATCT
GAGTGCTGGAGACCTTCTCAGGGCTGAGATTAAGTCAGGTTCTGAAAATGGAACTATGAT
CCAGAATATGATTAAAGAAGGGAAGATTGTACCTTCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTCCG
GAAAGCAATTCAGGAAAACGGGAACGATAAGTTCCTCATTGATGGCTTCCCTCGCAATGA
GGAGAACCGAGCAGCTTTTGAGAAAGTTACTGGGATGAACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTT
GATTGTCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTTTTGGGCCGGAACCAGGGGAGAGAGGAT
GACAATATAGAGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCCAGTG
ATTCAGTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTTCGTAAGATTCATGCAGCAAAGCCCATTGAA
GATGTGTTTCAGGAGGTGAAGGCAGTCTTTCCTCCTGAAGCTGAGAAGGTTGAAGCCTAG
GCAGTAGCAGCCTAAATAGATACCTGATTCATTGATCAGGTGGCTTGGCGGTTGCATCTT
TACAATGAAGTCTCTGCTTGGTTGTATTTTCATTATTCTATATAACCCATATTTTGATAA
ATGTTACTATCATTATTATACACCTTTACCTATTGTATAATTTTTTGTATTTGATGAAAT
TTTGTGATTGGTACTTTCTGTTATTTCATTTGAATTAATGGGATTTTATAATCCTTTTAT
AATATGCCTAGATTAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY31TF U 1
AF RR2BY31JQ C 110
BS 1 720 RR2BY31TF
BS 721 721 RR2BY31JQ
BS 722 724 RR2BY31TF
BS 725 725 RR2BY31JQ
BS 726 736 RR2BY31TF
BS 737 737 RR2BY31JQ
BS 738 749 RR2BY31TF
BS 750 750 RR2BY31JQ
BS 751 759 RR2BY31TF
BS 760 760 RR2BY31JQ
BS 761 771 RR2BY31TF
BS 772 858 RR2BY31JQ

RD RR2BY31TF 786 0 0
GGAGGTGAATGGAACCGCAAGTGAGAAGAAACCCACTGTTATTTTTGTCCTCGGTGGTCC
CGGAAGTGGGAAAGGTACACAGTGTGCCTATATTGTTGACCATTTTGGTTACACACATCT
GAGTGCTGGAGACCTTCTCAGGGCTGAGATTAAGTCAGGTTCTGAAAATGGAACTATGAT
CCAGAATATGATTAAAGAAGGGAAGATTGTACCTTCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTCCG
GAAAGCAATTCAGGAAAACGGGAACGATAAGTTCCTCATTGATGGCTTCCCTCGCAATGA
GGAGAACCGAGCAGCTTTTGAGAAAGTTACTGGGATGAACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTT
GATTGTCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTTTTGGGCCGGAACCAGGGGAGAGAGGAT
GACAATATAGAGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCCAGTG
ATTCAGTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTTCGTAAGATTCATGCAGCAAAGCCCATTGAA
GATGTGTTTCAGGAGGTGAAGGCAGTCTTTCCTCCTGAAGCTGAGAAGGTTGAAGCCTAG
GCAGTAGCAGCCTAAATAGATACCTGATTCATTGATCAGGTGGCTTGGCGGTTGCATCTT
TACAATGAAGTCTCTGCTTGGTTGTATTTTCATTATTCTATATAACCCATATTTTGATAA
*TGT*ACTATCATTAT*ATACACCTTTAC*TATTGTATA*TTTTTTGTATT
GATGAATTTGTGATG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2BY31JQ 749 0 0
TACACACATCTGAGTGCTGGAGAC*TTCTCAGGGCTGAGATTAAGTCAGGTTCTGAAAAT
GGAACTATGATCCAGAATATGATTAAAGAAGGGAAGATTGTACCTTCTGAGGTTACAATC
AAGCTTCTCCGGAAAGCAATTCAGGAAAACGGGAACGATAAGTTCCTCATTGATGGCTTC
CCTCGCAATGAGGAGAACCGAGCAGCTTTTGAGAAAGTTACTGGGATGAACCCAAGTTTG
TCTTGTTCTTTGATTGTCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTTTTGGGCCGGAACCAGG
GGAGAGAGGATGACAATATAGAGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATCTA
GCTTGCCAGTGATTCAGTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTTCGTAAGATTCATGCAGCAA
AGCCCATTGAAGATGTGTTTCAGGAGGTGAAGGCAGTCTTTCCTCCTGAAGCTGAGAAGG
TTGAAGCCTAGGCAGTAGCAGCCTAAATAGATACCTGATTCATTGATCAGGTGGCTTGGC
GGTTGCATCTTTACAATGAAGTCTCTGCTTGGTTGTATTTTCATTATTCTATATAACCCA
TATTTTGATAAATGTTACTATCATTATTATACACCTTTACCTATTGTATAATTTTTTGTA
TTTGATGAAATTTTGTGATTGGTACTTTCTGTTATTTCATTTGAATTAATGGGATTTTAT
AATCCTTTTATAATATGCCTAGATTAACG

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL6298Contig1 752 2 3 U
GGGAGAAATAAGATTTTGCGGAGACGCTAATCTCTTGTGTGTTGAATCTTTAAGCTTCTC
TTGAATGGCGTCTATTTTCAGACCTTCAGTTTCACTTGACCTACGACTAAAGGTGGCCTG
CACTAATCTCTCCACTAAAGAACAGCTTAAGTTTCAGAGCAAGAGTCTGAGAAACGAGAA
GCTCAACGTTAGGAGGTTACGTGGCGTGAAAGCTAATCAAGCACAAGGGACTAGTGTGGT
TACAGAAGAAAAAGAGCTTAACAACAAAACCGATTATGGAGTTGTAGGGGTTCACCATGT
GGGTCTGCTGTGTGAAAACCTAGAAAGGTCACTTGAGTTTTACCAGAACATCCTAGGACT
TGAGATCAACGAGGCGAGGCCACACGACAAGCTTCCGTATAGAGGAGCATGGTTATGGGT
GGGTTCAGAGATGATTCATCTAATGGAGCTTCCAAATCCTGATCCATTAACTGGTAGACC
CGAGCACGGTGGCCGTGATCGACATGCTTGTATCGCAATCCGGGACGTTTCAAATCTCAA
AGAGATTTTGGATAAAGCTGGGATTGAGTATACGATGAGTAAGTCAGGGAGGCCAGCAAT
ATTCACTCGTGATCCAGACGCAAACGCTCTTGAGTTTACTCAAATTTGATTCTCTAGTTT
CTCTTTTGGGTCTTCTAGTGTATGGATGAATGGATGGATATAAGTTGTAGATACATACTT
TATACTGCTCAATTTATATTATTTCTTACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E966TF U 13
AF RR2E966JQ C 1
BS 1 13 RR2E966JQ
BS 14 688 RR2E966TF
BS 689 752 RR2E966JQ

RD RR2E966TF 676 0 0
T
TTTTGCGGAGACGCTAATCTCTTGTGTGTTGAATCTTTAAGCTTCTCTTGAATGGCGTCT
ATTTTCAGACCTTCAGTTTCACTTGACCTACGACTAAAGGTGGCCTGCACTAATCTCTCC
ACTAAAGAACAGCTTAAGTTTCAGAGCAAGAGTCTGAGAAACGAGAAGCTCAACGTTAGG
AGGTTACGTGGCGTGAAAGCTAATCAAGCACAAGGGACTAGTGTGGTTACAGAAGAAAAA
GAGCTTAACAACAAAACCGATTATGGAGTTGTAGGGGTTCACCATGTGGGTCTGCTGTGT
GAAAACCTAGAAAGGTCACTTGAGTTTTACCAGAACATCCTAGGACTTGAGATCAACGAG
GCGAGGCCACACGACAAGCTTCCGTATAGAGGAGCATGGTTATGGGTGGGTTCAGAGATG
ATTCATCTAATGGAGCTTCCAAATCCTGATCCATTAACTGGTAGACCCGAGCACGGTGGC
CGTGATCGACATGCTTGTATCGCAATCCGGGACGTTTCAAATCTCAAAGAGATTTTGGAT
AAAGCTGGGATTGAGTATACGATGAGTAAGTCAGGGAGGCCAGCAATATTCACTCGTGAT
CCAGACGCAAACGCTCTTGAGTTTACTCAAATTTGATTCTCTAGTTTCTCTTTTGGGTCT
TCTAGTGTATGGATG

QA 2 676 2 676
DS 

RD RR2E966JQ 752 0 0
GGGAGAAATAAGATTTTGCGGAGACGCTAATCTCTTGTGTGTTGAATCTTTAAGCTTCTC
TTGAATGGCGTCTATTTTCAGACCTTCAGTTTCACTTGACCTACGACTAAAGGTGGCCTG
CACTAATCTCTCCACTAAAGAACAGCTTAAGTTTCAGAGCAAGAGTCTGAGAAACGAGAA
GCTCAACGTTAGGAGGTTACGTGGCGTGAAAGCTAATCAAGCACAAGGGACTAGTGTGGT
TACAGAAGAAAAAGAGCTTAACAACAAAACCGATTATGGAGTTGTAGGGGTTCACCATGT
GGGTCTGCTGTGTGAAAACCTAGAAAGGTCACTTGAGTTTTACCAGAACATCCTAGGACT
TGAGATCAACGAGGCGAGGCCACACGACAAGCTTCCGTATAGAGGAGCATGGTTATGGGT
GGGTTCAGAGATGATTCATCTAATGGAGCTTCCAAATCCTGATCCATTAACTGGTAGACC
CGAGCACGGTGGCCGTGATCGACATGCTTGTATCGCAATCCGGGACGTTTCAAATCTCAA
AGAGATTTTGGATAAAGCTGGGATTGAGTATACGATGAGTAAGTCAGGGAGGCCAGCAAT
ATTCACTCGTGATCCAGACGCAAACGCTCTTGAGTTTACTCAAATTTGATTCTCTAGTTT
CTCTTTTGGGTCTTCTAGTGTATGGATGAATGGATGGATATAAGTTGTAGATACATACTT
TATACTGCTCAATTTATATTATTTCTTACCCC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL6299Contig1 666 2 2 U
GATTGTTTTCATCTCCCAGCAACGATGCTAAGTCATCAGAAAACGGCGGCTCTGGAACGG
CCAGTAACACGCTCAATGAACCTTCTAATAACCAGACCGAGGCCAAGGGCTCAGTGTCTA
GTACAAAGAGGAGAGAAGCATTGGTCGACGACATTATTGGATGCGCTTCTTCCAAAGTGA
CAACGAGTATAGATAGCGCGGTTCTTAGCGGAGGAGGTGGTGGAAGTTTCAGGAACAAGA
ACAAACCGAAACACCAAGAAAAGAACAACAACAGCAAGAACGAAAACCAATCAAGATCGA
CAACAACAACAACTCACCCAACAGGTCCAGCAAGCAGATGCAGAGGAGGTGTCTCTGGAG
ATGGCGCAGCAGTAGATGAGGAAGCTCCAATAGATTTCTCAAAACTAGCGTTCCATGATC
TAGAGGAAATGGATGAGCAGGCAGATATAGGAAACTGGTTCGAGGGTCTTCAGGATATTG
ATACAGCAGGGCTTGATGAAGTTCCTATGGATGATCTCTCTTTCATGTTTGGATAAAACT
TTTATCCCATCACAAAGTAAAAAGTCAATTTCTTAAGTTGTATATTTGTACTGAATAGTG
ATTATCTGCCTTCAAGGCTAGTATTAAACTATGATCTAATATAAATGTATTCCCATTTTT
CAAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 

AF RR2BM34TF U 1
AF RR2BM34JQ C 57
BS 1 663 RR2BM34TF
BS 664 666 RR2BM34JQ

RD RR2BM34TF 665 0 0
GATTGTTTTCATCTCCCAGCAACGATGCTAAGTCATCAGAAAACGGCGGCTCTGGAACGG
CCAGTAACACGCTCAATGAACCTTCTAATAACCAGACCGAGGCCAAGGGCTCAGTGTCTA
GTACAAAGAGGAGAGAAGCATTGGTCGACGACATTATTGGATGCGCTTCTTCCAAAGTGA
CAACGAGTATAGATAGCGCGGTTCTTAGCGGAGGAGGTGGTGGAAGTTTCAGGAACAAGA
ACAAACCGAAACACCAAGAAAAGAACAACAACAGCAAGAACGAAAACCAATCAAGATCGA
CAACAACAACAACTCACCCAACAGGTCCAGCAAGCAGATGCAGAGGAGGTGTCTCTGGAG
ATGGCGCAGCAGTAGATGAGGAAGCTCCAATAGATTTCTCAAAACTAGCGTTCCATGATC
TAGAGGAAATGGATGAGCAGGCAGATATAGGAAACTGGTTCGAGGGTCTTCAGGATATTG
ATACAGCAGGGCTTGATGAAGTTCCTATGGATGATCTCTCTTTCATGTTTGGATAAAACT
TTTATCCCATCACAAAGTAAAAAGTCAATTTCTTAAGTTGTATATTTGTACTGAATAGTG
ATTATCTGCCTTCAAGGCTAGTATTAAACTATGATCTAATATAAATGTATTCCCATTTTT
CAA
CG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2BM34JQ 610 0 0
ACGGCCAGTAACACGCTCAATGAACCTTCTAATAACCAGACCGAGGCCAAGGGCTCAGTG
TCTAGTACAAAGAGGAGAGAAGCATTGGTCGACGACATTATTGGATGCGCTTCTTCCAAA
GTGACAACGAGTATAGATAGCGCGGTTCTTAGCGGAGGAGGTGGTGGAAGTTTCAGGAAC
AAGAACAAACCGAAACACCAAGAAAAGAACAACAACAGCAAGAACGAAAACCAATCAAGA
TCGACAACAACAACAACTCACCCAACAGGTCCAGCAAGCAGATGCAGAGGAGGTGTTTCT
GGAGATGGCGCAGCAGTAGATGAGGAAGCTCCAATAGATTTTTCAAAACTAGCGTTCCAT
GATCTAGAGGAAATGGATGAGCAGGCAGATATAGGAAACTGGTTCGAGGGTTTTCAGGAT
ATTGATACAGCAGGGCTTGATGAAGTTCCTATGGATGATCTTTCTTTCATGTTTGGATAA
AACTTTTATCCCATCACAAAGTAAAAAGTCAATTTCTTAAGTTGTATATTTGTACTGAAT
AGTGATTATCTGCCTTCAAGGCTAGTATTAAACTATGATCTAATATAAATGTATTCCCAT
TTTTCAAACG

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL6300Contig1 906 2 4 U
CCATAACCAAGAACAAAGCAAACAAAAAACCTTCAAAATATCCTAATCTCACTAGAACAG
CACAAGATTACAGAAACCAAAGGATCATCAACTAAAATATAAATGATGAGCCCATGTAGA
TCTTCATGTTCTTTGCCAAGAAAATCAAGAAAATCGAGCAAGAACCCTTATTCAAATCGT
GGACTTGACAAATTTTCTAAGCTTCTCTCAGAGCTCGACGAGAAGAGACAGAGCATCTAC
TCCAAGAAGCTCGATTCTGGAGGCCCGCCTCTTGTCCGATTCGTGTTCACAAGCTCCGGC
GAGTGTGTCCCCGTCGTGATCAGATCATCCTATCTTCACAAACAGAAGAAGACCAAAGAT
GTTGCTCCTGCTTCTAAAGTCAGAACAGTGGTCAACGAATCGAAAACAGAGGAAACGAAG
AAAACAGAGCTCGAAACAGAGAAGAAACAGAGCTGCGTTTTGAACGAGAATCTGAAGAAG
ATCGTTTTGAACGAGAATCTGAAGAAGATCACGCAACCGAACCGGTTCTTGCCTGTGACT
GTGATGTTGGTTCTTGTTTTATCGGTTTTATTTGGAAGATCTGTTGCGATTATGTTCACT
TGTATTGCTTGGTACTTGGTTCCAACGATCAAGGAGCAGAGCGGAAACAGAGGATCTTCC
TCATACGCTATGAAGAAGAAAGATTTCGCTAGGAAATTGAGTATTGAAACAAGAGCATCT
TTTAATCCAAGAACTGTTCGTGACCATTCTCCTCGCAAGTAGAATTTTCGTTTTCTGGCT
GCTCGTGTAAAAAACCGCTTGACCGAGCAAAAGCGTTCTTTGGTTTATTTCCTTGTTACG
TTGTTTCTTGTCTGTTTCTTTCATAGTTGTTAATTTTTAGACAGCTGAATTAGCAGAAAA
TTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG23TF U 1
AF RR2GG23JQB C 54
BS 1 633 RR2GG23TF
BS 634 634 RR2GG23JQB
BS 635 649 RR2GG23TF
BS 650 906 RR2GG23JQB

RD RR2GG23TF 649 0 0
CCATAACCAAGAACAAAGCAAACAAAAAACCTTCAAAATATCCTAATCTCACTAGAACAG
CACAAGATTACAGAAACCAAAGGATCATCAACTAAAATATAAATGATGAGCCCATGTAGA
TCTTCATGTTCTTTGCCAAGAAAATCAAGAAAATCGAGCAAGAACCCTTATTCAAATCGT
GGACTTGACAAATTTTCTAAGCTTCTCTCAGAGCTCGACGAGAAGAGACAGAGCATCTAC
TCCAAGAAGCTCGATTCTGGAGGCCCGCCTCTTGTCCGATTCGTGTTCACAAGCTCCGGC
GAGTGTGTCCCCGTCGTGATCAGATCATCCTATCTTCACAAACAGAAGAAGACCAAAGAT
GTTGCTCCTGCTTCTAAAGTCAGAACAGTGGTCAACGAATCGAAAACAGAGGAAACGAAG
AAAACAGAGCTCGAAACAGAGAAGAAACAGAGCTGCGTTTTGAACGAGAATCTGAAGAAG
ATCGTTTTGAACGAGAATCTGAAGAAGATCACGCAACCGAACCGGTTCTTGCCTGTGACT
GTGATGTTGGTTCTTGTTTTATCGGTTTTATTTGGAAGATCTGTTGCGATTATGTTCACT
TGTATTGCTTGGTACTTGGTTCCAACGATCAAG*AGCAGAGCGGAAACA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2GG23JQB 853 0 0
AGAACAGCACAAGATTACAGAAACCAAAGGATCATCAACTAAAATATAAATGATGAGCCC
ATGTAGATCTTCATGTTCTTTGCCAAGAAAATCAAGAAAATCGAGCAAGAACCCTTATTC
AAATCGTGGACTTGACAAATTTTCTAAGCTTCTCTCAGAGCTCGACGAGAAGAGACAGAG
CATCTACTCCAAGAAGCTCGATTCTGGAGGCCCGCCTCTTGTCCGATTCGTGTTCACAAG
CTCCGGCGAGTGTGTCCCCGTCGTGATCAGATCATCCTATCTTCACAAACAGAAGAAGAC
CAAAGATGTTGCTCCTGCTTCTAAAGTCAGAACAGTGGTCAACGAATCGAAAACAGAGGA
AACGAAGAAAACAGAGCTCGAAACAGAGAAGAAACAGAGCTGCGTTTTGAACGAGAATCT
GAAGAAGATCGTTTTGAACGAGAATCTGAAGAAGATCACGCAACCGAACCGGTTCTTGCC
TGTGACTGTGATGTTGGTTCTTGTTTTATCGGTTTTATTTGGAAGATCTGTTGCGATTAT
GTTCACTTGTATTGCTTGGTACTTGGTTCCAACGATCAAGGAGCAGAGCGGAAACAGAGG
ATCTTCCTCATACGCTATGAAGAAGAAAGATTTCGCTAGGAAATTGAGTATTGAAACAAG
AGCATCTTTTAATCCAAGAACTGTTCGTGACCATTCTCCTCGCAAGTAGAATTTTCGTTT
TCTGGCTGCTCGTGTAAAAAACCGCTTGACCGAGCAAAAGCGTTCTTTGGTTTATTTCCT
TGTTACGTTGTTTCTTGTCTGTTTCTTTCATAGTTGTTAATTTTTAGACAGCTGAATTAG
CAGAAAATTGTGC

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 2

CO CL6301Contig1 772 2 4 U
GGGAGTCGGTGGAGTTTGTTTGCTTCATTTACACTTTCTTCTTCTGCTGCGGATCCGAAG
TGAACAATATGAATCGTCATCACGATCCCAATCCCTTCGATGAAGAAGAAGACGAAATCG
TCAATCCCTTCTCGAAAGGAGGTGGCGGCGGTGGAAGGCCTGTGGCATCTAGGCCATTTA
ACGTTGATGCTACCGTCGATATTCCATTGGATACTGTGAATGACTCTTCAAAGAAGCAGA
GAGAGCTTTCTGATTGGGAATCTGAGCTTAAGAAGAGAGAAATGGATATTAAAAGAAGAG
AAGATGCTGTTGCTAAATCTGGCGTGAAGACAAGCAATAAAAACTGGCCACCTTTTCTCC
CTATTATACACCACGACATTGCTAATGAGATACCAGTTCATGCACAGAAACTCCAATATC
TGGCATTTGCTAGTTGGTTGGGTATAGTTTTGTGTCTCGTATTCAATGTCATTGCAGTGA
TAGTCTGCTGGATTAAAGGCGGAGGTGTCAAAATCTTTTTTCTTGCCACGATCTATGCGC
TGCTTGGATGTCCAATTTCATATCTATTATGGTATAGGCCTCTCTACCGAGCTATGAGGA
CTGACAGCGCTCTGAAGTTCGGTTGGTTTTTCTTCTTCTACCTGATTCACATTGGCTTCT
GCATATTTGCCGCCATTGCTCCTCCGATCTTTTTCCGCGGCTTGTCATTAACGGGTGTGC
TGGCAGCAATTGATGTAATCAGAGCCAGTTTACTAGCCGGATCTTCTACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H065TF U 1
AF RR2H701TF U 6
BS 1 693 RR2H065TF
BS 694 694 RR2H701TF
BS 695 737 RR2H065TF
BS 738 772 RR2H701TF

RD RR2H065TF 741 0 0
GGGAGTCGGTGGAGTTTGTTTGCTTCATTTACACTTTCTTCTTCTGCTGCGGATCCGAAG
TGAACAATATGAATCGTCATCACGATCCCAATCCCTTCGATGAAGAAGAAGACGAAATCG
TCAATCCCTTCTCGAAAGGAGGTGGCGGCGGTGGAAGGCCTGTGGCATCTAGGCCATTTA
ACGTTGATGCTACCGTCGATATTCCATTGGATACTGTGAATGACTCTTCAAAGAAGCAGA
GAGAGCTTTCTGATTGGGAATCTGAGCTTAAGAAGAGAGAAATGGATATTAAAAGAAGAG
AAGATGCTGTTGCTAAATCTGGCGTGAAGACAAGCAATAAAAACTGGCCACCTTTTCTCC
CTATTATACACCACGACATTGCTAATGAGATACCAGTTCATGCACAGAAACTCCAATATC
TGGCATTTGCTAGTTGGTTGGGTATAGTTTTGTGTCTCGTATTCAATGTCATTGCAGTGA
TAGTCTGCTGGATTAAAGGCGGAGGTGTCAAAATCTTTTTTCTTGCCACGATCTATGCGC
TGCTTGGATGTCCAATTTCATATCTATTATGGTATAGGCCTCTCTACCGAGCTATGAGGA
CTGACAGCGCTCTGAAGTTCGGTTGGTTTTTCTTCTTCTACCTGATTCACATTGGCTTCT
GCATATTTGCCGCCATTGCTCCTCCGATCTTTT*CCGCGGCTTGTCATTAACGGGTGTGC
TGGCAGCAATTGATGTA
TCAG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2H701TF 767 0 0
AGGGG
GGAGTTTGTTTGCTTCATTTACACTTTCTTCTTCTGCTGCGGATCCGAAGTGAACAATAT
GAATCGTTATCACGATCCCAATCCCTTCGATGAAGAAGAAGACGAAATCGTCAATCCCTT
CTCGAAAGGAGGTGGCGGCGGTGGAAGGCCTGTGGCATCTAGGCCATTTAACGTTGATGC
TACCGTCGATATTCCATTGGATACTGTGAATGACTCTTCAAAGAAGCAGAGAGAGCTTTC
TGATTGGGAATCTGAGCTTAAGAAGAGAGAAATGGATATTAAAAGAAGAGAAGATGCTGT
TGCTAAATCTGGCGTGAAGACAAGCAATAAAAACTGGCCACCTTTTTTCCCTATTATACA
CCACGACATTGCTAATGAGATACCAGTTCATGCACAGAAACTCCAATATCTGGCATTTGC
TAGTTGGTTGGGTATAGTTTTGTGTCTCGTATTCAATGTCATTGCAGTGATAGTCTGCTG
GATTAAAGGCGGAGGTGTCAAAATTTTTTTTCTTGCCACGATCTATGCGCTGCTTGGATG
TCCAATTTCATATCTATTATGGTATAGGCCTCTCTACCGAGCTATGAGGACTGACAGCGC
TCTGAAGTTCGGTTGGTTTTTCTTCTTCTACCTGATTCACATTGGCTTCTGCATATTTGC
CGCCATTGCTCCTCCGATCTTTTTCCGCGGCTTGTCATTAACGGGTGTGCTGGCGGCAAT
TGATGTAATCAGAGCCAGTTTACTAGCCGGATCTTCTACTTT

QA 6 767 6 767
DS 



AS 1 2

CO CL6302Contig1 696 2 11 U
GATCCATCTTTCGAAACAGAACACAAAATTCAGGAAAGTAGAGAGAAAAAAATGGACCGA
ACAAAGACTGCAAAGGTATCTCTGTTTGCTGTTTGGACAATCCTCCTTGTCTTAAATGTG
AACGGCCAATCAGGTTGTGATACCCACAGCTTCGCCAATAACATCGCTTTCACCTCTTGC
TCTCCCCTACCGGCCCTTGGCTCATTCCTTCACTGGAACTTCAACGAACAAAACGGCACC
GTTTCAATCGCTTATCGCCACCCAGGAACTTCCTCTTCTTCATGGATTGCTTGGGGGCTT
AACCCAAGTGGGCCTCAGATGTCCGGGACACAAGCTCTTGTCGCCTTCACCAATTCTGGT
GGACAGTTCCAAGCCTACACCTCTTCGGTCGATGGGTACAGCACCCAGCTAACACGTGGA
AACCTCAGTTTTGGGGTCAGCCTCGTCTCCGCGACTCTGGTCAACGGAGAGGCTACCATC
TTTGCGACTCTTGAGTTACCGGCCAATTTGGTCATGACCAACCAGGTTTGGCAAGAAGGT
CCGGTCGCTAATGGTATTCCTCAGATTCATCAAAGAACAGGAGATAATATGAGATCGATC
GGTAGGATCGATTTCAGGACAGGTCAGTCATCGGCTAGTGGAGGAGGCTCTGGTAGCACG
CTGAGGAGGAGAAATACACACGGGATACTAAATGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ04TF U 16
AF RR2AA41TF U 1
BS 1 36 RR2AA41TF
BS 37 37 RR2CZ04TF
BS 38 48 RR2AA41TF
BS 49 49 RR2CZ04TF
BS 50 70 RR2AA41TF
BS 71 71 RR2CZ04TF
BS 72 329 RR2AA41TF
BS 330 330 RR2CZ04TF
BS 331 484 RR2AA41TF
BS 485 485 RR2CZ04TF
BS 486 696 RR2AA41TF

RD RR2CZ04TF 642 0 0
GG
AGAACACAAAATTCAGGAAAGTAGAGTGAAAAAAATGGACCGAACAAAGACTGCAAAGGT
ATCTCTGTTTGCTGTTTGGACAATCCTCCTTGTCTTAAATGTGAACGGCCAATCAGGTTG
TGATACCCACAGCTTCGCCAATAACATCGCTTTCACCTCTTGTTCTCCTCTCCCGGCCCT
TGGCTCATTCCTTCACTGGAACTTCAACGAACAAAACGGCACCGTTTCAATCGCTTATCG
CCACCCAGGAACTTCCTCTTCTTCATGGATTGCTTGGGGGCTTAACCCAAGTGGGCCTCA
GATGTCCGGGACACAAGCTCTTGTCGCCTTCACCAATTCTGGTGGACAGTTCCAAGCCTA
CACCTCTTCGGTCGATGGGTACATCACCCAGCTAACACGTGGAAACCTCAGTTTTGGGGT
CAGCCTCGTTTCCGCGACTCTGGTCAACGGAGAGGCTACCATCTTTGCGACTCTTGAGTT
ACCGGCCAATTTGGTCATGACCAACCAGGTTTGGCAAGAAGGTCCGGTCGCTAATGGTAT
TCCTCAGATTCATCAAAGAACAGGAGATAATATGAGATCGATCGGTAGGATCGATTTCAG
GACAGGTCAGTCATCGGCTAGTGGAGGAGGTTCTGGTAGC

QA 3 642 3 642
DS 

RD RR2AA41TF 696 0 0
GATCCATCTTTCGAAACAGAACACAAAATTCAGGAACGTAGAGAGAAATAAATGGACCGA
ACAAAGACTGGAAAGGTATCTCTGTTTGCTGTTTGGACAATCCTCCTTGTCTTAAATGTG
AACGGCCAATCAGGTTGTGATACCCACAGCTTCGCCAATAACATCGCTTTCACCTCTTGC
TCTCCCCTACCGGCCCTTGGCTCATTCCTTCACTGGAACTTCAACGAACAAAACGGCACC
GTTTCAATCGCTTATCGCCACCCAGGAACTTCCTCTTCTTCATGGATTGCTTGGGGGCTT
AACCCAAGTGGGCCTCAGATGTCCGGGAC*CAAGCTCTTGTCGCCTTCACCAATTCTGGT
GGACAGTTCCAAGCCTACACCTCTTCGGTCGATGGGTACAGCACCCAGCTAACACGTGGA
AACCTCAGTTTTGGGGTCAGCCTCGTCTCCGCGACTCTGGTCAACGGAGAGGCTACCATC
TTTGTGACTCTTGAGTTACCGGCCAATTTGGTCATGACCAACCAGGTTTGGCAAGAAGGT
CCGGTCGCTAATGGTATTCCTCAGATTCATCAAAGAACAGGAGATAATATGAGATCGATC
GGTAGGATCGATTTCAGGACAGGTCAGTCATCGGCTAGTGGAGGAGGCTCTGGTAGCACG
CTGAGGAGGAGAAATACACACGGGATACTAAATGCG

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL6303Contig1 722 2 1 U
GGATCAATACAAGTTTATACGTTCTCTCTCTACGTAAATCTTGTGGCCAAACAAGTAACA
GTCTAAAAATGGAAGGCAAAACTGTGGTTTTAAGTTTTCTCATAGTGAGTCTTGTCACGG
CGCAAAATCAAGTCGAAGCAGGAGGGATTTGTTGCCCGAGCATAACTGCCAAAACAGCGT
ATACCGAATGCTTTGTTTTATATCGCTTAATAAATTGTGCAGAAACCAGTGGATGCATAT
ACTTTTCTGGGACGACATGTCCTCCGGGATATCCATATGCCGGTCTCGGAAATTCTGGTG
ATACTGTCAATGAATACTGCAAGTTTGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCGGTGCCTTAACCA
CTCTCCAGGACAACGATGCAGGTGAAATTGTCAATGAAGCGGTGCGCAATGCACCAACGC
ATGTTCTAATTTCTGCACCAAGGACTCAGCTAATGCAGTTGAAACTGCCTAAGAAGCATA
TCCACTATGTATAATTAATGTGTTGTATGTGTTGTTGTTCTCCCGTTTTCAATAATTGAC
CTGTATGTGACAAAATGCTAGACTCATCTTATGCTATTTCGAGGTTTTCTATATGACGTG
GAAGGTCAACGATCCCTAGATATTGCTTATCCTTTCTACTTGCTATATCTGATTTCATTA
TATCAAACTTGGTTTTTTAATGTTAGTAATTAACAATATTGTGATATATGTCAATAAATT
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2F472TF U 1
AF RR2F472JQ C 43
BS 1 722 RR2F472TF

RD RR2F472TF 722 0 0
GGATCAATACAAGTTTATACGTTCTCTCTCTACGTAAATCTTGTGGCCAAACAAGTAACA
GTCTAAAAATGGAAGGCAAAACTGTGGTTTTAAGTTTTCTCATAGTGAGTCTTGTCACGG
CGCAAAATCAAGTCGAAGCAGGAGGGATTTGTTGCCCGAGCATAACTGCCAAAACAGCGT
ATACCGAATGCTTTGTTTTATATCGCTTAATAAATTGTGCAGAAACCAGTGGATGCATAT
ACTTTTCTGGGACGACATGTCCTCCGGGATATCCATATGCCGGTCTCGGAAATTCTGGTG
ATACTGTCAATGAATACTGCAAGTTTGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCGGTGCCTTAACCA
CTCTCCAGGACAACGATGCAGGTGAAATTGTCAATGAAGCGGTGCGCAATGCACCAACGC
ATGTTCTAATTTCTGCACCAAGGACTCAGCTAATGCAGTTGAAACTGCCTAAGAAGCATA
TCCACTATGTATAATTAATGTGTTGTATGTGTTGTTGTTCTCCCGTTTTCAATAATTGAC
CTGTATGTGACAAAATGCTAGACTCATCTTATGCTATTTCGAGGTTTTCTATATGACGTG
GAAGGTCAACGATCCCTAGATATTGCTTATCCTTTCTACTTGCTATATCTGATTTCATTA
TATCAAACTTGGTTTTTTAATGTTAGTAATTAACAATATTGTGATATATGTCAATAAATT
TT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2F472JQ 680 0 0
GTGGCCAAACAAGTAACAGTCTAAAAATGGAAGGCAAAACTGTGGTTTTAAGTTTTCTCA
TAGTGAGTCTTGTCACGGCGCAAAATCAAGTCGAAGCAGGAGGGATTTGTTGCCCGAGCA
TAACTGCCAAAACAGCGTATACCGAATGCTTTGTTTTATATCGCTTAATAAATTGTGCAG
AAACCAGTGGATGCATATACTTTTTTGGGACGACATGTCCTCCGGGATATCCATATGCCG
GTTTCGGAAATTTTGGTGATACTGTCAATGAATACTGCAAGTTTGGTTGTGCATCCTCTG
TGTGCGGTGCCTTAACCACTTTCCAGGACAACGATGCAGGTGAAATTGTCAATGAAGCGG
TGCGCAATGCACCAACGCATGTTTTAATTTTTGCACCAAGGACTCAGCTAATGCAGTTGA
AACTGCCTAAGAAGCATATCCACTATGTATAATTAATGTGTTGTATGTGTTGTTGTTCTC
CCGTTTTCAATAATTGACCTGTATGTGACAAAATGCTAGACTCATTTTATGCTATTTCGA
GGTTTTTTATATGACGTGGAAGGTCAACGATCCCTAGATATTGCTTATCCTTTTTACTTG
CTATATCTGATTTCATTATATCAAACTTGGTTTTTTAATGTTAGTAATTAACAATATTGT
GATATATGTCAATAAATTTT

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL6304Contig1 707 2 1 U
GGTTTTCTCTACTCTCTCCGACATTTTCTTTCTTCTTTCTCCTCATTCATTTCTTCTGCA
AACAGAAGATATCTCTCATTCAATTGTTTCTTTCTCTTCCTTTCTCAAACACAAATGCAC
GAGTAAAGGTTGATTAATTTATACAAACAATTGTATTTAACTCCAGCAATCCAACGTATT
CTGAAGCTGTTCAACAATCTAAGTACAGATTGATTGGAGAATCCAGTCAAACATACGTCT
CAAGAACTGGATTCTGGCGGAGAAGAGATGCCATATGCGGCGGACGAATTGAGATCCAGG
CGAGTCATCAATGGACTTGGCGCTGTTGCCTGAAGGTAAGACCAAGCGGCTTGCTTAACC
TCTCTGTCTTTGTTTACTTTTTTCTTTGTCTTTATCTAAGGTCAAATACGGCTGCTGTAG
TTTATTTTTTTTTTCTCAGGTTGAAGAATCAAAGAACGGGAAGCAGAAGGTGGAACAGGA
AGAAGAAGAAAAGACGGCGTGAAATAGTGTGATGGTGTACGAGCGCGACGCCGCGCTTGG
TAAAACGGAGCAACACGACGGCTCTTCAGCTCCAGCCGTACACTTCCTCGTGGCGGCGCA
AGAGGCTATCCAAGACATAGGTTTAGGTTATTTTGTAAACCAGTTTGTAAACCAGATATC
ATTTGTAAACCAATTTAAATTTGTAAACCATAAATGCTATTGTTAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BG46JQ C 1
AF RR2BG46TF U 1
BS 1 707 RR2BG46TF

RD RR2BG46JQ 707 0 0
GGTTTTCTCTACTCTCTCCGACATTTTCTTTCTTCTTTCTCCTCATTCATTTCTTCTGCA
AACAGAAGATATCTCTCATTCAATTGTTTCTTTCTCTTCCTTTCTCAAACACAAATGCAC
GAGTAAAGGTTGATTAATTTATACAAACAATTGTATTTAACTCCAGCAATCCAACGTATT
CTGAAGCTGTTCAACAATCTAAGTACAGATTGATTGGAGAATCCAGTCAAACATACGTCT
CAAGAACTGGATTCTGGCGGAGAAGAGATGCCATATGCGGCGGACGAATTGAGATCCAGG
CGAGTCATCAATGGACTTGGCGCTGTTGCCTGAAGGTAAGACCAAGCGGCTTGCTTAACC
TCTCTGTCTTTGTTTACTTTTTTCTTTGTCTTTATCTAAGGTCAAATACGGCTGCTGTAG
TTTATTTTTTTTTTCTCAGGTTGAAGAATCAAAGAACGGGAAGCAGAAGGTGGAACAGGA
AGAAGAAGAAAAGACGGCGTGAAATAGTGTGATGGTGTACGAGCGCGACGCCGCGCTTGG
TAAAACGGAGCAACACGACGGCTCTTCAGCTCCAGCCGTACACTTCCTCGTGGCGGCGCA
AGAGGCTATCCAAGACATAGGTTTAGGTTATTTTGTAAACCAGTTTGTAAACCAGATATC
ATTTGTAAACCAATTTAAATTTGTAAACCATAAATGCTATTGTTAAT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2BG46TF 707 0 0
GGTTTTCTCTACTCTCTCCGACATTTTCTTTCTTCTTTCTCCTCATTCATTTCTTCTGCA
AACAGAAGATATCTCTCATTCAATTGTTTCTTTCTCTTCCTTTCTCAAACACAAATGCAC
GAGTAAAGGTTGATTAATTTATACAAACAATTGTATTTAACTCCAGCAATCCAACGTATT
CTGAAGCTGTTCAACAATCTAAGTACAGATTGATTGGAGAATCCAGTCAAACATACGTCT
CAAGAACTGGATTCTGGCGGAGAAGAGATGCCATATGCGGCGGACGAATTGAGATCCAGG
CGAGTCATCAATGGACTTGGCGCTGTTGCCTGAAGGTAAGACCAAGCGGCTTGCTTAACC
TCTCTGTCTTTGTTTACTTTTTTCTTTGTCTTTATCTAAGGTCAAATACGGCTGCTGTAG
TTTATTTTTTTTTTCTCAGGTTGAAGAATCAAAGAACGGGAAGCAGAAGGTGGAACAGGA
AGAAGAAGAAAAGACGGCGTGAAATAGTGTGATGGTGTACGAGCGCGACGCCGCGCTTGG
TAAAACGGAGCAACACGACGGCTCTTCAGCTCCAGCCGTACACTTCCTCGTGGCGGCGCA
AGAGGCTATCCAAGACATAGGTTTAGGTTATTTTGTAAACCAGTTTGTAAACCAGATATC
ATTTGTAAACCAATTTAAATTTGTAAACCATAAATGCTATTGTTAAT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL6305Contig1 637 2 1 U
CATCATAATATATATACATACCAAATGGCTGCCTCTGTTCAATTTTTCCCCGTCTACCCA
CCACCCTCCGATCAACATCCCCAGTTCCCACCGCCTTCACCTCACGTTCTTCCACCACCA
CCGCCACCGGGGCACCATTCAACTGTTATCATTGTGGTGGTTGTCTCTCTTGGCAGTTTG
TTTTTCCTTGCGTTCCTCGCTGCTGCTCTCTTCTGCTATGTCAAGAAACGAAGAAGGTCT
TCTGAGAAGACTGAAATCACCAAGTTTGATGGACACCTCAAGGTCGAAGAAGTCATAGTG
CCAGGACCCCATGGCGAACCAACGAGAGTGGTCATGATTGAAGAAGACATTCATTTGGAA
GAGGATATTCACAAGGCTGAAAAGTTTAGCCGAGCTCCTCACCTTAATTCAACTGGAGGA
CATGCCATTGATATATCAGAGCCAAACCATCACTTTATAGAGCACAAGTCCTAACTCAGG
AGACGGAAAAACACTGAGATATGATCATATTCCTAAATGTAATCAATCATCTATAATCTA
AATAATAATAATGACAATATATTGTATCAAATCTTAAACTTCAAATTAAACTTAACAGTT
GCTTTTCGCCCGGTTATTGGTTGCGAAATATAGTTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AS91JQ C 1
AF RR2AS91TF U 1
BS 1 637 RR2AS91TF

RD RR2AS91JQ 637 0 0
CATCATAATATATATACATACCAAATGGCTGCCTCTGTTCAATTTTTCCCCGTCTACCCA
CCACCCTCCGATCAACATCCCCAGTTCCCACCGCCTTCACCTCACGTTCTTCCACCACCA
CCGCCACCGGGGCACCATTCAACTGTTATCATTGTGGTGGTTGTCTCTCTTGGCAGTTTG
TTTTTCCTTGCGTTCCTCGCTGCTGCTCTCTTCTGCTATGTCAAGAAACGAAGAAGGTCT
TCTGAGAAGACTGAAATCACCAAGTTTGATGGACACCTCAAGGTCGAAGAAGTCATAGTG
CCAGGACCCCATGGCGAACCAACGAGAGTGGTCATGATTGAAGAAGACATTCATTTGGAA
GAGGATATTCACAAGGCTGAAAAGTTTAGCCGAGCTCCTCACCTTAATTCAACTGGAGGA
CATGCCATTGATATATCAGAGCCAAACCATCACTTTATAGAGCACAAGTCCTAACTCAGG
AGACGGAAAAACACTGAGATATGATCATATTCCTAAATGTAATCAATCATCTATAATCTA
AATAATAATAATGACAATATATTGTATCAAATCTTAAACTTCAAATTAAACTTAACAGTT
GCTTTTCGCCCGGTTATTGGTTGCGAAATATAGTTAT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2AS91TF 637 0 0
CATCATAATATATATACATACCAAATGGCTGCCTCTGTTCAATTTTTCCCCGTCTACCCA
CCACCCTCCGATCAACATCCCCAGTTCCCACCGCCTTCACCTCACGTTCTTCCACCACCA
CCGCCACCGGGGCACCATTCAACTGTTATCATTGTGGTGGTTGTCTCTCTTGGCAGTTTG
TTTTTCCTTGCGTTCCTCGCTGCTGCTCTCTTCTGCTATGTCAAGAAACGAAGAAGGTCT
TCTGAGAAGACTGAAATCACCAAGTTTGATGGACACCTCAAGGTCGAAGAAGTCATAGTG
CCAGGACCCCATGGCGAACCAACGAGAGTGGTCATGATTGAAGAAGACATTCATTTGGAA
GAGGATATTCACAAGGCTGAAAAGTTTAGCCGAGCTCCTCACCTTAATTCAACTGGAGGA
CATGCCATTGATATATCAGAGCCAAACCATCACTTTATAGAGCACAAGTCCTAACTCAGG
AGACGGAAAAACACTGAGATATGATCATATTCCTAAATGTAATCAATCATCTATAATCTA
AATAATAATAATGACAATATATTGTATCAAATCTTAAACTTCAAATTAAACTTAACAGTT
GCTTTTCGCCCGGTTATTGGTTGCGAAATATAGTTAT

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL6306Contig1 1007 2 2 U
GGAATGAATTGAACTTTGCTCTTCGGTCTCATCGATGCGTCTGTGTAACTGTGGCGATGG
CGTTTGAGTTTCATAACGGAGGCGTCGTGATTACTCCGACTTTAATCCTGCTGTCTTAAA
TGGTGATTGCGAACTCTCCAGATGCATCGTTCAGTCGTCAAATCGGGTGTTTCCCGGTTG
TGGAGGCTAGGAATATCAAGCATGGTGGAGAGTTTATGTGGGTCGATATGCTCCTGTTGG
ATGTCAATGATTGTTAAAGCTGAAATCATGGTGGTACAGATGTTGGAGAAGAAGTATTGA
TCCCTATGATTCAGCTAAGGTGACAAGAGACAGAGCATTGAGATAATGGTTGATAGAGAA
AACTGGAGAAAACATAAACATAGACTTTGGTTCTGGATAATCTAGAGATCCTGAGACAAA
GGCATGGTTAGAGCAACACAAACATTCGGTGTGATCACCTCCACCACCAATCGCACAAAC
ATACCAAACGATTGGCCTCGGAAATTAAGTTACATGGGTTTTTTTTTGTGTTGCTCTTTG
TTCTCCCATTCACAATTTCTGGTGAGCTACTATTCTACTTTCACTTCTGGAAAGCATGAA
GTTCTCAATTTTTAAAGTCATATTTCCCCATCCGAGGTTGGTTTCTTCTTCCATAATAAT
GAAAGATTCTTCTATACAAATCTACATCAGCTAATGGTGTTTTACCAAAGATTTTGTGAG
GACTGATGGTGCAACAACATTGTAGAAGTTTGCTGGAGGGATTTACAAAGACTCAGATGG
GAAGTTTGGAGGTCAAAAAAAGAGAGATAGCACCAGCTGGAGCAACAAGAGAGTAGAAAC
AGAGGTGAACCAAGTTTTGTTGATTATGGAAGAAAGAAAATACTCTGACGTTTTTAATAT
GTTGATGCATAGTAATGCTTTTGTTTTGTCAATCTGCATAGTAATTGAGTAGGAAAGAAT
GGAAAACCTCCAAATACGGTATTTGCTTTTGAGTTATTTTAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW02TF U 1
AF RR2EW02JQ C 406
BS 1 791 RR2EW02TF
BS 792 1007 RR2EW02JQ

RD RR2EW02TF 799 0 0
GGAATGAATTGAACTTTGCTCTTCGGTCTCATCGATGCGTCTGTGTAACTGTGGCGATGG
CGTTTGAGTTTCATAACGGAGGCGTCGTGATTACTCCGACTTTAATCCTGCTGTCTTAAA
TGGTGATTGCGAACTCTCCAGATGCATCGTTCAGTCGTCAAATCGGGTGTTTCCCGGTTG
TGGAGGCTAGGAATATCAAGCATGGTGGAGAGTTTATGTGGGTCGATATGCTCCTGTTGG
ATGTCAATGATTGTTAAAGCTGAAATCATGGTGGTACAGATGTTGGAGAAGAAGTATTGA
TCCCTATGATTCAGCTAAGGTGACAAGAGACAGAGCATTGAGATAATGGTTGATAGAGAA
AACTGGAGAAAACATAAACATAGACTTTGGTTCTGGATAATCTAGAGATCCTGAGACAAA
GGCATGGTTAGAGCAACACAAACATTCGGTGTGATCACCTCCACCACCAATCGCACAAAC
ATACCAAACGATTGGCCTCGGAAATTAAGTTACATGGGTTTTTTTTTGTGTTGCTCTTTG
TTCTCCCATTCACAATTTCTGGTGAGCTACTATTCTACTTTCACTTCTGGAAAGCATGAA
GTTCTCAATTTTTAAAGTCATATTTCCCCATCCGAGGTTGGTTTCTTCTTCCATAATAAT
GAAAGATTCTTCTATACAAATCTACATCAGCTAATGGTGTTTTACCAAAGATTTTGTGAG
GACTGATGGTGCAACAACATTGTAGAAGTTTGCTGGAGGGATTTACAAAGACTCAGATGG
GAAGTTTGGAG
TCAAAAAA

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2EW02JQ 602 0 0
AGATCCTGAGACAAAGGCATGGTTAGAGCAACACAAACATTCGGTGTGATCACCTCCACC
ACCAATCGCACAAACATACCAAACGATTGGCCTCGGAAATTAAGTTACATGGGTTTTTTT
TTGTGTTGCTCTTTGTTCTCCCATTCACAATTTCTGGTGAGCTACTATTCTACTTTCACT
TCTGGAAAGCATGAAGTTCTCAATTTTTAAAGTCATATTTCCCCATCCGAGGTTGGTTTC
TTCTTCCATAATAATGAAAGATTCTTCTATACAAATCTACATCAGCTAATGGTGTTTTAC
CAAAGATTTTGTGAGGACTGATGGTGCAACAACATTGTAGAAGTTTGCTGGAGGGATTTA
CAAAGACTCAGATGGGAAGTTTGGAGGTCAAAAAAAGAGAGATAGCACCAGCTGGAGCAA
CAAGAGAGTAGAAACAGAGGTGAACCAAGTTTTGTTGATTATGGAAGAAAGAAAATACTC
TGACGTTTTTAATATGTTGATGCATAGTAATGCTTTTGTTTTGTCAATCTGCATAGTAAT
TGAGTAGGAAAGAATGGAAAACCTCCAAATACGGTATTTGCTTTTGAGTTATTTTAAAAA
AA

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL6307Contig1 928 2 4 U
GGAAACTAGCCAAAAACTCTCTTTCTTTGACCCGATCGAGAGAATTGAATCGAACCCAAA
GTGCGATGGCGACAGAGGATGTGAACGAAGCCCTCACGGCGGCGGAAGTACCGGCAATAG
AGACGACGGAGAAGCAGCCCCCTCACAAGCTCGAAAGAAAGTGGAGTTTCTGGTTCGATA
ACCAATCCAAACCTAAGCAAGGCGCCGCCTGGGGAGCCTCTCTTCGCAAAGCCTATACCT
TCGACACCGTCGAAGATTTCTGGGGTTTGCACGAGACTATATTCGTCCCTAGCAAATTGA
CGGCGAATGCAGAAATTCACATGTTCAAAGCTGGTGTTGAGCCCAAGTGGGAAGATCCTG
AGTGTGCTAATGGCGGAAAGTGGACTTTTGTTGTTACCTCCAACAGGAAGCCTGCTTTAG
ACAAGGCTTGGCTTGAAACTTTGATGGCTCTTGTCGGAGAGCAATTTGATGAGGCAGATG
AGATTTGTGGTGTGGTTGCTAGTGTGCGCCCAAAGCAGGACAAGCTCTCCTTGTGGACAA
GGACCAAATCTAATGAAGCTGTTCTGATGGGTATTGGGAAGAAGTGGAAGGATATACTTG
ATGTCGCTGACAAGATAACTTTCACTAACCATGATGATTCTAGAAGAACTCGGTTCACTG
TCTGAAGAGAAATGACGCAAGTGTGGTGAGACCTGAGGAAGATGCAATATCGCTTTGTCT
TGCATTATTCTGTCGGTTTACTCATAGCTGAGACCTTTAGGGACACTCACTTTGAGGTGA
AACTCTACAAAGTTTTATTTTCACTGGAAAGAGTTTTTTAATATTAAGTTCAGTTGTTTC
TTTTTGGAAGTATCAAGTTTTGGAGACACTTGTTAAATTTAAATGTTTGATTTTTATGCT
ATTTTGTATTTTCATTGTGACATTCCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ10TF U 1
AF RR2AS59TF U 171
BS 1 395 RR2AQ10TF
BS 396 396 RR2AS59TF
BS 397 771 RR2AQ10TF
BS 772 928 RR2AS59TF

RD RR2AQ10TF 771 0 0
GGAAACTAGCCAAAAACTCTCTTTCTTTGACCCGATCGAGAGAATTGAATCGAACCCAAA
GTGCGATGGCGACAGAGGATGTGAACGAAGCCCTCACGGCGGCGGAAGTACCGGCAATAG
AGACGACGGAGAAGCAGCCCCCTCACAAGCTCGAAAGAAAGTGGAGTTTCTGGTTCGATA
ACCAATCCAAACCTAAGCAAGGCGCCGCCTGGGGAGCCTCTCTTCGCAAAGCCTATACCT
TCGACACCGTCGAAGATTTCTGGGGTTTGCACGAGACTATATTCGTCCCTAGCAAATTGA
CGGCGAATGCAGAAATTCACATGTTCAAAGCTGGTGTTGAGCCCAAGTGGGAAGATCCTG
AGTGTGCTAATGGCGGAAAGTGGACTTTTGTTGTTGCCTCCAACAGGAAGCCTGCTTTAG
ACAAGGCTTGGCTTGAAACTTTGATGGCTCTTGTCGGAGAGCAATTTGATGAGGCAGATG
AGATTTGTGGTGTGGTTGCTAGTGTGCGCCCAAAGCAGGACAAGCTCTCCTTGTGGACAA
GGACCAAATCTAATGAAGCTGTTCTGATGGGTATTGGGAAGAAGTGGAAGGATATACTTG
ATGTCGCTGACAAGATAACTTTCACTAACCATGATGATTCTAGAAGAACTCGGTTCACTG
TCTGAAGAGAAATGACGCAAGTGTGGTGAGACCTGAGGAAGATGCAATATCGCTTTGTCT
TGCATTATTCTGTCGGTTTACTCATAGCTGAGACCTTTAGGGACACTCACT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2AS59TF 758 0 0
G
GGTTCGATAACCAATCCAAACCTAAGCAAGGCGCCGCCTGGGGAGCCTCTCTTCGCAAAG
CCTATACCTTCGACACCGTCGAAGATTTCTGGGGTTTGCACGAGACTATATTCGTCCCTA
GCAAATTGACGGCGAATGCAGAAATTCACATGTTCAAAGCTGGTGTTGAGCCCAAGTGGG
AAGATCCTGAGTGTGCTAATGGCGGAAAGTGGACTTTTGTTGTTACCTCCAACAGGAAGC
CTGCTTTAGACAAGGCTTGGCTTGAAACTTTGATGGCTCTTGTCGGAGAGCAATTTGATG
AGGCAGATGAGATTTGTGGTGTGGTTTCTAGTGTGCGCCCAAAGCAGGACAAGCTCTCCT
TGTGGACAAGGACCAAATCTAATGAAGCTGTTCTGATGGGTATTGGGAAGAAGTGGAAGG
ATATACTTGATGTCGCTGACAAGATAACTTTCACTAACCATGATGATTCTAGAAGAACTC
GGTTCACTGTCTGAAGAGAAATGACGCAAGTGTGGTGAGACCTGAGGAAGATGCAATATC
GCTTTGTCTTGCATTATTCTGTCGGTTTACTCATAGCTGAGACCTTTAGGGACACTCACT
TTGAGGTGAAACTCTACAAAGTTTTATTTTCACTGGAAAGAGTTTTTTAATATTAAGTTC
AGTTGTTTCTTTTTGGAAGTATCAAGTTTTGGAGACACTTGTTAAATTTAAATGTTTGAT
TTTTATGCTATTTTGTATTTTCATTGTGACATTCCAA

QA 2 758 2 758
DS 



AS 1 2

CO CL6308Contig1 890 2 2 U
GGATACATCTTCTTGTTTAAGTTGTTAAGATCTTTGTCTGATAATTCTAGAGTTATTACT
AATTGACCAACGATAAATGTCAATGGACAGAGTCATGAAATGAGAAATCTCAACCAATTC
TCTCGTTTCCTCGTTTATCATTCTGTATCCGTCCTGATTCTTCACTGGTTTTACGTATTT
TCTTGAACAATTTTCTCCATTTCTTGTTTTTTTTTTTCTCGCAAAGTGTTAGGACAAAAA
AAAAGCTTTAGGACAAAACATGGCAAACGCTGAGAAGACAAGTTCAGGTTCCGACATAGA
CGAGAAGAAGAGGAAACGCAAGTTGTCAAACCGCGAATCTGCTAGGAGATCGCGTCTGAA
GAAACAGAAGATGATGGAAGACACGATCCACGAGATCTCGACTCTTGAGAGACGAATCAA
AGAGTACAGCGAGAGATGCAAAGTGGCGAGACGGAGGCTTGACTCGGTCGAGTCGGAAAA
CGCGGCTTTGAGATCGGAGAAGACGTGGCTTTCAAGCTACGTGAGAGATTTAGAGAATAT
GATTGGTACGTCGACTTCATTAACGCTGACGCAGAGTGGCGGCGATGATCAGAACGCAAA
CGCGGATGGAGATTGTAGGCGTAGACCATGGCAGCAGTATGGTTGTGATTCTCTACAACC
AGTTGCGTCCTTCAAGACATGAGCTTTGTGTGCTTAGTTCTCTACAACCAGTTGCGTCCT
TCGAGACATGAGCTTTGTGTGCTTAGTTCTCTACAACCAGTTGCGTCCTTCGAGACATGA
GCTTTGCGTGTGTTTAGTTTGTGATTTTGTGACCATTTTATGATTTGCATCTTTCATATT
GAATTGTTTTCTCCTTCCTGGAGATACACAATTGTTTTTTACTATATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C212TF U 1
AF RR2C212JQ C 162
BS 1 753 RR2C212TF
BS 754 890 RR2C212JQ

RD RR2C212TF 753 0 0
GGATACATCTTCTTGTTTAAGTTGTTAAGATCTTTGTCTGATAATTCTAGAGTTATTACT
AATTGACCAACGATAAATGTCAATGGACAGAGTCATGAAATGAGAAATCTCAACCAATTC
TCTCGTTTCCTCGTTTATCATTCTGTATCCGTCCTGATTCTTCACTGGTTTTACGTATTT
TCTTGAACAATTTTCTCCATTTCTTGTTTTTTTTTTTCTCGCAAAGTGTTAGGACAAAAA
AAAAGCTTTAGGACAAAACATGGCAAACGCTGAGAAGACAAGTTCAGGTTCCGACATAGA
CGAGAAGAAGAGGAAACGCAAGTTGTCAAACCGCGAATCTGCTAGGAGATCGCGTCTGAA
GAAACAGAAGATGATGGAAGACACGATCCACGAGATCTCGACTCTTGAGAGACGAATCAA
AGAGTACAGCGAGAGATGCAAAGTGGCGAGACGGAGGCTTGACTCGGTCGAGTCGGAAAA
CGCGGCTTTGAGATCGGAGAAGACGTGGCTTTCAAGCTACGTGAGAGATTTAGAGAATAT
GATTGGTACGTCGACTTCATTAACGCTGACGCAGAGTGGCGGCGATGATCAGAACGCAAA
CGCGGATGGAGATTGTAGGCGTAGACCATGGCAGCAGTATGGTTGTGATTCTCTACAACC
AGTTGCGTCCTTCAAGACATGAGCTTTGTGTGCTTAGTTCTCTACAACCAGTTGCGTCCT
TCGAGACATGAGCTTTGTGTGCTTAGTTCTCTA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2C212JQ 729 0 0
TCACTGGTTTTACGTATTTTCTTGAACAATTTTCTCCATTTCTTGTTTTTTTTTTTCTCG
CAAAGTGTTAGGACAAAAAAAAAGCTTTAGGACAAAACATGGCAAACGCTGAGAAGACAA
GTTCAGGTTCCGACATAGACGAGAAGAAGAGGAAACGCAAGTTGTCAAACCGCGAATCTG
CTAGGAGATCGCGTCTGAAGAAACAGAAGATGATGGAAGACACGATCCACGAGATCTCGA
CTCTTGAGAGACGAATCAAAGAGTACAGCGAGAGATGCAAAGTGGCGAGACGGAGGCTTG
ACTCGGTCGAGTCGGAAAACGCGGCTTTGAGATCGGAGAAGACGTGGCTTTCAAGCTACG
TGAGAGATTTAGAGAATATGATTGGTACGTCGACTTCATTAACGCTGACGCAGAGTGGCG
GCGATGATCAGAACGCAAACGCGGATGGAGATTGTAGGCGTAGACCATGGCAGCAGTATG
GTTGTGATTCTCTACAACCAGTTGCGTCCTTCAAGACATGAGCTTTGTGTGCTTAGTTCT
CTACAACCAGTTGCGTCCTTCGAGACATGAGCTTTGTGTGCTTAGTTCTCTACAACCAGT
TGCGTCCTTCGAGACATGAGCTTTGCGTGTGTTTAGTTTGTGATTTTGTGACCATTTTAT
GATTTGCATCTTTCATATTGAATTGTTTTCTCCTTCCTGGAGATACACAATTGTTTTTTA
CTATATTCT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL6309Contig1 908 2 7 U
TCTCCGTTTAATCTAACGGCCATGTCAACTACAACCATCGCCCCTCTCCGTCGTAGTTCT
AACTCTCTCAACGGATATCACACCAACGCCGTTGCCTTTGACGGAACCGTCGAGTCAGTA
AGTACTATCCAAATGGAGGACATTGTTGCAGCAACCGACGACGGCTACGCCAACCCCAAC
AACGGAGACAGAGGAAGAAGCAAGGTGTCGTTTATGACGTGGAGGATGTGCAACCCTGTC
CACGTGGTGAGAGTCCATTGGGTACCGTGTTTGTTAGCGGTAGGAGTTCTGTTCTTCACG
GGAGTAGAGGAGTACATGCTCCAGATGATTCCGCCGAGTTCTGAGCCGTTCGATATTGGT
TTTGTGGCCACGCGCTCTCTGTATCGCCTCTTGGCTTCTTCACCTGATCTAAATACCGTT
CTAGCCGCTCTAAACACGGTGTTCGTAGGGATGCAAACGACATATATTGTATGGACATGG
TTGATGGAAGGACGACCAAGAGCGACCATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTTGTCGTGGC
ATTCTTGGTTACTCTACTCAGGCCATGTCGCAGGGTCGACGATAGCATCCTTGGACATGA
GGAGAATGAGGAGGTTGAGACTAGCCTTGCTTTTTTGACATCCTTAATGTATTACAATCG
ATCAGGCTTCTCGGGACGAGAGGACAATACACGATCGATCTTGCTGTCGGAGTTGGCGCT
GGGGTTCTCTTTGACTCACTGGCTGGAAAATACGAAGAGATGATGAGCAAGAGACACAGT
GTAGGCAATAGTTCTAGTTTGATTTCGGCTCGCTAGTTATTAATTTTTTTTCTAAAAGTT
TTTAGTCTGGACATATTTAATGTAGTTGAAATCTAATTTGTTAAATTTACTTTCTTTCAG
ATTGCTCT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B444TF U 2
AF RR2B444JQ C 1
BS 1 1 RR2B444JQ
BS 2 784 RR2B444TF
BS 785 785 RR2B444JQ
BS 786 807 RR2B444TF
BS 808 808 RR2B444JQ
BS 809 824 RR2B444TF
BS 825 908 RR2B444JQ

RD RR2B444TF 823 0 0
CTCCGTTTAATCTAACGGCCATGTCAACTACAACCATCGCCCCTCTCCGTCGTAGTTCTA
ACTCTCTCAACGGATATCACACCAACGCCGTTGCCTTTGACGGAACCGTCGAGTCAGTAA
GTACTATCCAAATGGAGGACATTGTTGCAGCAACCGACGACGGCTACGCCAACCCCAACA
ACGGAGACAGAGGAAGAAGCAAGGTGTCGTTTATGACGTGGAGGATGTGCAACCCTGTCC
ACGTGGTGAGAGTCCATTGGGTACCGTGTTTGTTAGCGGTAGGAGTTCTGTTCTTCACGG
GAGTAGAGGAGTACATGCTCCAGATGATTCCGCCGAGTTCTGAGCCGTTCGATATTGGTT
TTGTGGCCACGCGCTCTCTGTATCGCCTCTTGGCTTCTTCACCTGATCTAAATACCGTTC
TAGCCGCTCTAAACACGGTGTTCGTAGGGATGCAAACGACATATATTGTATGGACATGGT
TGATGGAAGGACGACCAAGAGCGACCATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTTGTCGTGGCA
TTCTTGGTTACTCTACTCAGGCCATGTCGCAGGGTCGACGATAGCATCCTTGGACATGAG
GAGAATGAGGAGGTTGAGACTAGCCTTGCTTTTTTGACATCCTTAATGTATTACAATCGA
TCAGGCTTCTCGGGACGAGAGGACAATACACGATCGATCTTGCTGTCGGAGTTGGCGCTG
GGGTTCTCTTTGACTCACTGGCTGGAAAATACGAAGAGATGATGAGCAAGAGACACAGTG
TAG*CAATAGTTCTAGTTTGATTTCG*CTCGCTAGTTATTAAT

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR2B444JQ 908 0 0
TCTCCGTTTAATCTAACGGCCATGTCAACTACAACCATCGCCCCTCTCCGTCGTAGTTCT
AACTCTCTCAACGGATATCACACCAACGCCGTTGCCTTTGACGGAACCGTCGAGTCAGTA
AGTACTATCCAAATGGAGGACATTGTTGCAGCAACCGACGACGGCTACGCCAACCCCAAC
AACGGAGACAGAGGAAGAAGCAAGGTGTCGTTTATGACGTGGAGGATGTGCAACCCTGTC
CACGTGGTGAGAGTCCATTGGGTACCGTGTTTGTTAGCGGTAGGAGTTCTGTTCTTCACG
GGAGTAGAGGAGTACATGCTCCAGATGATTCCGCCGAGTTCTGAGCCGTTCGATATTGGT
TTTGTGGCCACGCGCTCTCTGTATCGCCTCTTGGCTTCTTCACCTGATCTAAATACCGTT
CTAGCCGCTCTAAACACGGTGTTCGTAGGGATGCAAACGACATATATTGTATGGACATGG
TTGATGGAAGGACGACCAAGAGCGACCATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTTGTCGTGGC
ATTCTTGGTTACTCTACTCAGGCCATGTCGCAGGGTCGACGATAGCATCCTTGGACATGA
GGAGAATGAGGAGGTTGAGACTAGCCTTGCTTTTT*GACATCCTTAATGTATTACAATCG
ATCAGGCTTCTCGGGACGAGAGGACAATACACGATCGATCTTGCTGTCGGAGTTGGCGCT
GGGGTTCTCTTTGACTCACTGGCTGGAAAATACGAAGAGATGATGAGCAAGAGACACAGT
GTAGGCAATAGTTCTAGTTTGATTTCGGCTCGCTAGTTATTAATTTTTTTTCTAAAAGTT
TTTAGTCTGGACATATTTAATGTAGTTGAAATCTAATTTGTTAAATTTACTTTCTTTCAG
ATTGCTCT

QA 1 908 1 908
DS 



AS 1 2

CO CL6310Contig1 670 2 8 U
GGATATTAATAACAGTGAAGCAAATCAACGAGAAGAATCATCTGAATGGTTCATAAAATA
CCTAAACCGTCAAGGTGATTGGTTAGAGAAAACAAGAGGCAATCTGATGGTTGCGGCGAC
GGTCATAGCCGGTATGAGTTTTCAAGTTATGGTTAATCCTCCAGGTGGCGTTTGGCAAAG
TGACATATGTTCCTCCGGACATCAAACTGGTGTTTGTAAGGCGAAAGTCGGAACTTCGGT
ACTGGGGGACAATAGTTCAAAGCGTGGGTTTTATCATGGAATGGTTATTAGTAGTACGGT
ATCTTTTTCTGCCTCTATGACTATAATTCTTCTCATCATCAGCGGGTTACGATTGAGGAA
CCGTTTGATAATGGCGATCCTGGTAACATTCATGACAGTAGCAGTTCTTTGTACATCGGC
AGCATTCTATTGTGCAGTAGCTTTGGTTCAATCCGACGATCAAGTCATCACTCGTATACT
AAGAATTTATTTGGGAATTTGGATCGTGTTTTTTATTTTAATACTCTTAATCCAACTCAT
TCGGTTCACATGTTGGCTTATTTATTTTATATTTTATAATTCACATAATTTATTATTTGT
TATATAATTTCGTATACCATATTCCTGTTGTATCAAGGTTGATATCTTTATATAAACACC
TTGCTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E642TF U 1
AF RR2CK04TF U 49
BS 1 111 RR2E642TF
BS 112 112 RR2CK04TF
BS 113 179 RR2E642TF
BS 180 180 RR2CK04TF
BS 181 200 RR2E642TF
BS 201 201 RR2CK04TF
BS 202 216 RR2E642TF
BS 217 670 RR2CK04TF

RD RR2E642TF 224 0 0
GGATATTAATAACAGTGAAGCAAATCAACGAGAAGAATCATCTGAATGGTTCATAAAATA
CCTAAACCGTCAAGGTGATTGGTTAGAGAAAACAAGAGGCAATCTGATGGT*GCGGCGAC
GGTCATAGCCGGTATGAGTTTTCAAGTTATGGTTAATCCTCCAGGTGGCGTTTGGCAAA*
TGACATATGTTCCTCCGGAC*TCAAACTGGTGTTTG
AAGGCGAA

QA 1 216 1 216
DS 

RD RR2CK04TF 622 0 0
GTTCATAAAATACCTAAACCGTCAAGGTGATTGGTTAGAGAAAACAAGAGGCAATCTGAT
GGTTGCGGGGACGGTCATAGCCGGTATGAGTTTTCAAGTTATGGTTAATCCTCCAGGTGG
CGTTTGGCAAAGTGACATATGTTCCTCCGGACATCAAACTGGTGTTTGTAAGGCGAAAGT
CGGAACTTCGGTACTGGGGGACAATAGTTCAAAGCGTGGGTTTTATCATGGAATGGTTAT
TAGTAGTACGGTATCTTTTTCTGCCTCTATGACTATAATTCTTCTCATCATCAGCGGGTT
ACGATTGAGGAACCGTTTGATAATGGCGATCCTGGTAACATTCATGACAGTAGCAGTTCT
TTGTACATCGGCAGCATTCTATTGTGCAGTAGCTTTGGTTCAATCCGACGATCAAGTCAT
CACTCGTATACTAAGAATTTATTTGGGAATTTGGATCGTGTTTTTTATTTTAATACTCTT
AATCCAACTCATTCGGTTCACATGTTGGCTTATTTATTTTATATTTTATAATTCACATAA
TTTATTATTTGTTATATAATTTCGTATACCATATTCCTGTTGTATCAAGGTTGATATCTT
TATATAAACACCTTGCTTTGTC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL6311Contig1 688 2 2 U
TGTTTTCCTCTTTCCTCTTGAAGAAGAACCCTAAAACCCATTCCCGCATCCCCGATCCGA
TAGAGAGAACCGATAATCGAACAATTTTTTTGTTATTTGTTTTAGTCCGATTTTTATCTG
TGTGTAGCTTCTTCGCTCAAATCTACGTGAACGATGGCTACGCCAATGGTTGCAGGTGCT
GCAGTAGCTGCTGCTGCTATAGCTGGTAGATATGGTATACTCGCTTGGCAAGCCTTCAAG
GCCAGGCCCATCGTTCCTAGAATGCGCAGGTTTTATGAAGGTGGTTTCCAAGCTGCCATG
ACACGCCGTGAAGCTGCTCTCATTCTTGGTGTTAGGGAGAGGGTAGCGGCGGAGAAGGTG
AAAGAAGCTCACAGGAGAGTGATGGTAGCAAACCACCCTGACGCTGGAGGTAGTCATTAT
CTCGCTTCTAAGATCAACGAAGCCAAAGATATCATGCTTGGCAAATCCAACAACTCTGGC
TCTGCTTTTTGATCTGTCATATTGAGAGTTTGATACAATCATCCCTCACAAGGAAACTCT
TTCGTCTCTTCATTTGAATGTACTCTACCAATTTCTTGTTGTATATCAATTATTATTATG
TTCCCAAAGAAGCAGGTGGTGATCTATATATTTGATATATCTTGTGTACTCAGAAACATG
AGCTGAATAAAAAAGGAAGTATTTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG87TF U 1
AF RR2FG87JQ C 17
BS 1 611 RR2FG87TF
BS 612 688 RR2FG87JQ

RD RR2FG87TF 611 0 0
TGTTTTCCTCTTTCCTCTTGAAGAAGAACCCTAAAACCCATTCCCGCATCCCCGATCCGA
TAGAGAGAACCGATAATCGAACAATTTTTTTGTTATTTGTTTTAGTCCGATTTTTATCTG
TGTGTAGCTTCTTCGCTCAAATCTACGTGAACGATGGCTACGCCAATGGTTGCAGGTGCT
GCAGTAGCTGCTGCTGCTATAGCTGGTAGATATGGTATACTCGCTTGGCAAGCCTTCAAG
GCCAGGCCCATCGTTCCTAGAATGCGCAGGTTTTATGAAGGTGGTTTCCAAGCTGCCATG
ACACGCCGTGAAGCTGCTCTCATTCTTGGTGTTAGGGAGAGGGTAGCGGCGGAGAAGGTG
AAAGAAGCTCACAGGAGAGTGATGGTAGCAAACCACCCTGACGCTGGAGGTAGTCATTAT
CTCGCTTCTAAGATCAACGAAGCCAAAGATATCATGCTTGGCAAATCCAACAACTCTGGC
TCTGCTTTTTGATCTGTCATATTGAGAGTTTGATACAATCATCCCTCACAAGGAAACTCT
TTCGTCTCTTCATTTGAATGTACTCTACCAATTTCTTGTTGTATATCAATTATTATTATG
TTCCCAAAGAA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2FG87JQ 672 0 0
CTTGAAGAAGAACCCTAAAACCCATTCCCGCATCCCCGATCCGATAGAGAGAACCGATAA
TCGAACAATTTTTTTGTTATTTGTTTTAGTCCGATTTTTATCTGTGTGTAGCTTCTTCGC
TCAAATCTACGTGAACGATGGCTACGCCAATGGTTGCAGGTGCTGCAGTAGCTGCTGCTG
CTATAGCTGGTAGATATGGTATACTCGCTTGGCAAGCCTTCAAGGCCAGGCCCATCGTTC
CTAGAATGCGCAGGTTTTATGAAGGTGGTTTCCAAGCTGCCATGACACGCCGTGAAGCTG
CTCTCATTCTTGGTGTTAGGGAGAGGGTAGCGGCGGAGAAGGTGAAAGAAGCTCACAGGA
GAGTGATGGTAGCAAACCACCCTGACGCTGGAGGTAGTCATTATCTCGCTTTTAAGATCA
ACGAAGCCAAAGATATCATGCTTGGCAAATCCAACAACTCTGGCTTTGCTTTTTGATCTG
TCATATTGAGAGTTTGATACAATCATCCCTCACAAGGAAACTCTTTCGTCTCTTCATTTG
AATGTACTCTACCAATTTCTTGTTGTATATCAATTATTATTATGTTCCCAAAGAAGCAGG
TGGTGATCTATATATTTGATATATCTTGTGTACTCAGAAACATGAGCTGAATAAAAAAGG
AAGTATTTAATT

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL6312Contig1 337 2 1 U
GTGAGTTAAACATGGATGAGTGGAAGCTAGTTGTAAAACTGAAGAACATCTTCAAGATAC
AGTAGAGATTTCCCCCCCACACAACATTGGGAGTTTTGGATGACGTGTCTGCGTCGATGC
AGAATGAACTGATTCATCTTCATGCATCTTAACCAAAGCAAGTCACGAAGAGAGACGAAA
GAGTTTTTTTTTGTTTTTATGTTATCTTTCTCCCTGGAGAGTGCTGAATAATTGAGAACC
TTCTTGTGGGCACAAACTTGCAGGGAAACAAGATATTGAGTTTTGAGATATACAACAAAA
TATCGTTATATGCCCTTTTAAAATAACCTTTTAAGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GX76JQ C 1
AF RR2GX76TF U 1
BS 1 337 RR2GX76TF

RD RR2GX76JQ 337 0 0
GTGAGTTAAACATGGATGAGTGGAAGCTAGTTGTAAAACTGAAGAACATCTTCAAGATAC
AGTAGAGATTTCCCCCCCACACAACATTGGGAGTTTTGGATGACGTGTCTGCGTCGATGC
AGAATGAACTGATTCATCTTCATGCATCTTAACCAAAGCAAGTCACGAAGAGAGACGAAA
GAGTTTTTTTTTGTTTTTATGTTATCTTTCTCCCTGGAGAGTGCTGAATAATTGAGAACC
TTCTTGTGGGCACAAACTTGCAGGGAAACAAGATATTGAGTTTTGAGATATACAACAAAA
TATCGTTATATGCCCTTTTAAAATAACCTTTTAAGTT

QA 1 337 1 337
DS 

RD RR2GX76TF 337 0 0
GTGAGTTAAACATGGATGAGTGGAAGCTAGTTGTAAAACTGAAGAACATCTTCAAGATAC
AGTAGAGATTTCCCCCCCACACAACATTGGGAGTTTTGGATGACGTGTCTGCGTCGATGC
AGAATGAACTGATTCATCTTCATGCATCTTAACCAAAGCAAGTCACGAAGAGAGACGAAA
GAGTTTTTTTTTGTTTTTATGTTATCTTTCTCCCTGGAGAGTGCTGAATAATTGAGAACC
TTCTTGTGGGCACAAACTTGCAGGGAAACAAGATATTGAGTTTTGAGATATACAACAAAA
TATCGTTATATGCCCTTTTAAAATAACCTTTTAAGTT

QA 1 337 1 337
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6315Contig1 818 2 2 U
GGGATTGGTTTCGGTTTGGTTATTTTATTTATTTTTGTTCAGTTTAGAGAGATTATCTCC
GTTGCTCTTCCGATGACCACCGCCGTCACCGGCGTTTCCTCGCCGGAACCGCCAAATCCA
CCAGACCCACCAGATCTAACTTCACCATTTACTATCCCTTCCAGCTCTGTTTGCTTCCTT
GTCCTTATTCTCACCATTTCAAATCTAGATCTAAAAATTCAAACTTTTAGAAAGATAGAT
TTGAACAGCCATATCTTTCTCCCAAAGGATTTGAGTTGGATGATTCTCACTGTCGTGTTA
ATACGACCCCTTACTGAAGTTCCCCCGTCTCTCATTTTCACCATGTCTACCACCACCGGA
TCTCGTTCAACGCCATCACTGGAACCGTTAATTCTCCTAGTACTGGACACATCCCTGCAG
GGAGTATTGTGCCCAAGATTATGTATGCTTCCATGTTTGTTCTGTTAAAAGGCTCACCCA
TCTGGTGCTTTGTCGCCTTTGTTTGTGATGCCGAACTTCTGACTGTTAAATCTGCTTCTG
TTGCGGTTTCAATCACGGGTGTTAGACCAGTACTTGTGCTCTCTAATCCCCAAAGCCTCA
TTACACTTCTTAGCACGATTGGCGTTGAGTTTCGAGGACTGCTCAGCGACATTTGGTGTT
GTTTATGTGTTATTGTTGCTTCTATCCTAAAGTGTTATATCTCATTGTTCTGTTTTGCTA
TGGTAGCAGCAGATGTTTTAGCTGTTTTAGCCGGTTTGGCTTTGTTATTGCTTGATGTAA
ACAATTTCTCCAGCAATGGAGACTAATGATTTTTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL04TF U 1
AF RR2AL04JQ C 37
BS 1 749 RR2AL04TF
BS 750 818 RR2AL04JQ

RD RR2AL04TF 749 0 0
GGGATTGGTTTCGGTTTGGTTATTTTATTTATTTTTGTTCAGTTTAGAGAGATTATCTCC
GTTGCTCTTCCGATGACCACCGCCGTCACCGGCGTTTCCTCGCCGGAACCGCCAAATCCA
CCAGACCCACCAGATCTAACTTCACCATTTACTATCCCTTCCAGCTCTGTTTGCTTCCTT
GTCCTTATTCTCACCATTTCAAATCTAGATCTAAAAATTCAAACTTTTAGAAAGATAGAT
TTGAACAGCCATATCTTTCTCCCAAAGGATTTGAGTTGGATGATTCTCACTGTCGTGTTA
ATACGACCCCTTACTGAAGTTCCCCCGTCTCTCATTTTCACCATGTCTACCACCACCGGA
TCTCGTTCAACGCCATCACTGGAACCGTTAATTCTCCTAGTACTGGACACATCCCTGCAG
GGAGTATTGTGCCCAAGATTATGTATGCTTCCATGTTTGTTCTGTTAAAAGGCTCACCCA
TCTGGTGCTTTGTCGCCTTTGTTTGTGATGCCGAACTTCTGACTGTTAAATCTGCTTCTG
TTGCGGTTTCAATCACGGGTGTTAGACCAGTACTTGTGCTCTCTAATCCCCAAAGCCTCA
TTACACTTCTTAGCACGATTGGCGTTGAGTTTCGAGGACTGCTCAGCGACATTTGGTGTT
GTTTATGTGTTATTGTTGCTTCTATCCTAAAGTGTTATATCTCATTGTTCTGTTTTGCTA
TGGTAGCAGCAGATGTTTTAGCTGTTTTA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2AL04JQ 782 0 0
GTTCAGTTTAGAGAGATTATCTCCGTTGCTCTTCCGATGACCACCGCCGTCACCGGCGTT
TCCTCGCCGGAACCGCCAAATCCACCAGACCCACCAGATCTAACTTCACCATTTACTATC
CCTTCCAGCTCTGTTTGCTTCCTTGTCCTTATTCTCACCATTTCAAATCTAGATCTAAAA
ATTCAAACTTTTAGAAAGATAGATTTGAACAGCCATATCTTTCTCCCAAAGGATTTGAGT
TGGATGATTCTCACTGTCGTGTTAATACGACCCCTTACTGAAGTTCCCCCGTCTCTCATT
TTCACCATGTCTACCACCACCGGATCTCGTTCAACGCCATCACTGGAACCGTTAATTCTC
CTAGTACTGGACACATCCCTGCAGGGAGTATTGTGCCCAAGATTATGTATGCTTCCATGT
TTGTTCTGTTAAAAGGCTCACCCATCTGGTGCTTTGTCGCCTTTGTTTGTGATGCCGAAC
TTCTGACTGTTAAATCTGCTTCTGTTGCGGTTTCAATCACGGGTGTTAGACCAGTACTTG
TGCTCTCTAATCCCCAAAGCCTCATTACACTTCTTAGCACGATTGGCGTTGAGTTTCGAG
GACTGCTCAGCGACATTTGGTGTTGTTTATGTGTTATTGTTGCTTCTATCCTAAGGTGTT
ATATCTCATTGTTCTGTTTTGCTATGGTAGCAGCAGATGTTTTAGCTGTTTTAGCCGGTT
TGGCTTTGTTATTGCTTGATGTAAACAATTTCTCCAGCAATGGAGACTAATGATTTTTGG
TC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL6316Contig1 683 2 11 U
GGGGAAGAAGTAGAGAGAGAGATCCATCGGAGAAGAAGAAGAAAAAGAGAGAGTCAGATT
GAGAGAAACAATGACTTCGAGGTACTGGGTGGTGTCTCTACCAGTGAAGGACTCTTCTTC
CACCTCGTGGAATCGTCTTCAAGAGCAGATCTCCAAGCATTCCTTTGATACTCCTCTTTA
TCGGTTCAACATCCCTAATCTTCGTGTTGGAACCTTAGATTCTCTTCTCGCCCTCGGAGA
TGATCTGCTCAAGTCGAATAGCTTTGTGGAAGGAGTTTCTCAGAAGATCAGGAGACAGAT
CGAGGAGCTGGAGAGGATCTCTGGCGTTGAGAGCAATGCTCTTACTGTTGATGGAGTTCC
TGTTGATTCGTATCTCACCAGGTTTGTGTGGGATGAAGCTAAGTACCCAACAATGTCACC
TTTGAAGGAGGTTGTGGAGAATATTCAGTCTCAGGTTGCAAAGATTGAGGATGATCTCAA
GGTTCGTGTCGCTGAGTATAACAATGTCCGCGGTCAACTCAATGCCATTAACCGAAAGCA
GAGTGGAAGCTTAGCTGTTCGTGACCTCTCGAACTTGGTTAAGCCAGAAGATATTGTCGC
CTCAGAACATCTCGTGACTCTCCTTGCTGTTGTTCCAAAGTATTCCCAGAAAGACTGGCT
TGCATGTTATGAGACATTAACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX76TF U 24
AF RR2FP11TF U 1
BS 1 42 RR2FP11TF
BS 43 43 RR2FX76TF
BS 44 44 RR2FP11TF
BS 45 45 RR2FX76TF
BS 46 63 RR2FP11TF
BS 64 65 RR2FX76TF
BS 66 324 RR2FP11TF
BS 325 325 RR2FX76TF
BS 326 417 RR2FP11TF
BS 418 418 RR2FX76TF
BS 419 683 RR2FP11TF

RD RR2FX76TF 406 0 0
GG
ATCGGAGAAGAAGCAGAAGAAGAGAGAGTCAGATTGAGAGAAACAATGACTTCGAGGTAC
TGGGTGGTGTCTCTACCAGTGAAGGACTCTTCTTCCACCTCGTGGAATCGTCTTCAAGAG
CAGATCTCCAAGCATTCCTTTGATACTCCTCTTTATCGGTTCAACATCCCTAATCTTCGT
GTTGGAACCTTAGATTCTCTTCTCGCCCTCGGCGATGATCTGCTCAAGTCGAATAGCTTT
GTGGAAGGAGTTTCTCAGAAGATCAGGAGACAGATCGAGGAGCTGGAGAGGATTTCTGGC
GTTGAGAGCAATGCTCTTACTGTTGATGGAGTTCCTGTTGATTCTTATCTCACCAGGTTT
GTGTGGGATGAAGCTAAGTATCCAACAATGTCACCTTTGAAGGA

QA 3 406 3 406
DS 

RD RR2FP11TF 683 0 0
GGGGAAGAAGTAGAGAGAGAGATCCATCGGAGAAGAAGAAGACAGAGAGAGAGTCAGATT
GAG**AAACAATGACTTCGAGGTACTGGGTGGTGTCTCTACCAGTGAAGGACTCTTCTTC
CACCTCGTGGAATCGTCTTCAAGAGCAGATCTCCAAGCATTCCTTTGATACTCCTCTTTA
TCGGTTCAACATCCCTAATCTTCGTGTTGGAACCTTAGATTCTCTTCTCGCCCTCGGAGA
TGATCTGCTCAAGTCGAATAGCTTTGTGGAAGGAGTTTCTCAGAAGATCAGGAGACAGAT
CGAGGAGCTGGAGAGGATCTCTGGTGTTGAGAGCAATGCTCTTACTGTTGATGGAGTTCC
TGTTGATTCGTATCTCACCAGGTTTGTGTGGGATGAAGCTAAGTACCCAACAATGTCGCC
TTTGAAGGAGGTTGTGGAGAATATTCAGTCTCAGGTTGCAAAGATTGAGGATGATCTCAA
GGTTCGTGTCGCTGAGTATAACAATGTCCGCGGTCAACTCAATGCCATTAACCGAAAGCA
GAGTGGAAGCTTAGCTGTTCGTGACCTCTCGAACTTGGTTAAGCCAGAAGATATTGTCGC
CTCAGAACATCTCGTGACTCTCCTTGCTGTTGTTCCAAAGTATTCCCAGAAAGACTGGCT
TGCATGTTATGAGACATTAACCG

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL6317Contig1 693 2 8 U
GGATACCAAAACATATTCTTGAAGAAAACGAAAACAAACTAAAAAGCAAAAATGGCTTTG
CATAAGTTTCCTCTCATGGGACTGCTTTTGCTCCTAACCGTCGTAGTCTCTCCGGCAATA
GCCGATGGACCTGTTTGCCCGACGACGACCAAACTAAGCCGGGCAAGTTTCCCTGAAGGT
TTTTTATTTGGCACGGCTACGGCAGCATATCAGGTTGAAGGTGCAGTGAATGAAACTTGT
CGTGGACCGTCCTTATGGGATATCTACTGCAAGAGATTTCCACCCAGATGCAACAACGAT
AACGGCGATGTGGCCGTTGATTTCTTCCATCGTTATAAGGAAGATATCCAACTAATGAAG
AATCTGAACACAGATGCCTTCAGAATGTCTATCGCATGGCCAAGAATATTTCCTCATGGG
AGAAAGGAGAAAGGAGTGAGTCAAGCTGGTGTGCAATTTTACCACGACCTCATCGACGAG
CTCCTAAAAAATGGTATAACTCCGTTCGTGACAGTTTTTCACTGGGACACTCCACAAGAT
TTAGAGGACGAATATGGCGGCTTTTTAAGTGAAAGAATTGTGAAAGATTTCCGAGAATAT
GCAGATTTTGTTTTCCAAGAATATGGTGGAAAAGTGAAAAATTGGATCACTTTCAACGAA
CCATGGGTTTTCTCCCACGCTGGGTTATGATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A949TF U 1
AF RR2A291TF U 72
BS 1 80 RR2A949TF
BS 81 81 RR2A291TF
BS 82 274 RR2A949TF
BS 275 275 RR2A291TF
BS 276 618 RR2A949TF
BS 619 619 RR2A291TF
BS 620 683 RR2A949TF
BS 684 693 RR2A291TF

RD RR2A949TF 690 0 0
GGATACCAAAACATATTCTTGAAGAAAACGAAAACAAACTAAAAAGCAAAAATGGCTTTG
CATAAGTTTCCTCTCATGGGGCTGCTTTTGCTCCTAACCGTCGTAGTCTCTCCGGCAATA
GCCGATGGACCTGTTTGCCCGACGACGACCAAACTAAGCCGGGCAAGTTTCCCTGAAGGT
TTTTTATTTGGCACGGCTACGGCAGCATATCAGGTTGAAGGTGCAGTGAATGAAACTTGT
CGTGGACCGTCCTTATGGGATATCTACTGCAAGATATTTCCACCCAGATGCAACAACGAT
AACGGCGATGTGGCCGTTGATTTCTTCCATCGTTATAAGGAAGATATCCAACTAATGAAG
AATCTGAACACAGATGCCTTCAGAATGTCTATCGCATGGCCAAGAATATTTCCTCATGGG
AGAAAGGAGAAAGGAGTGAGTCAAGCTGGTGTGCAATTTTACCACGACCTCATCGACGAG
CTCCTAAAAAATGGTATAACTCCGTTCGTGACAGTTTTTCACTGGGACACTCCACAAGAT
TTAGAGGACGAATATGGCGGCTTTTTAAGTGAAAGAATTGTGAAAGATTTCCGAGAATAT
GCAGATTTTGTTTTCCAATAATATGGTGGAAAAGTGAAAAATTGGATCACTTTCAACGAA
CCATGGGTTTTCTCCCACGCTGG
TTATGAT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2A291TF 622 0 0
TCTCATGGGACTGCTTTTGCTCCTAACCGTCGTAGTCTCTCCGGCAATAGCCGATGGACC
TGTTTGCCCGACGACGACCAAACTAAGCCGGGCAAGTTTCCCTGAAGTTTTTTTATTTGG
CACGGCTACGGCAGCATATCAGGTTGAAGGTGCAGTGAATGAAACTTGTCGTGGACCGTC
CTTATGGGATATCTACTGCAAGAGATTTCCATCCAGATGCAACAACGATAACGGCGATGT
GGCCGTTGATTTCTTCCATCGTTATAAGGAAGATATCCAACTAATGAAGAATCTGAACAC
AGATGCCTTCAGAATGTCTATCGCATGGCCAAGAATATTTCCTCATGGGAGAAAGGAGAA
AGGAGTGAGTCAAGCTGGTGTGCAATTTTACCACGACCTCATCGACGAGCTCCTAAAAAA
TGGTATAACTCCGTTCGTGACAGTTTTTCACTGGGACACTCCACAAGATTTAGAGGACGA
ATATGGCGGCTTTTTAAGTGAACGAATTGTGAAAGATTTCCGAGAATATGCAGATTTTGT
TTTCCAAGAATATGGTGGAAAAGTGAAAAATTGGATCACTTTCAACGAACCATGGGTTTT
CTCGCACGCTGGGTTATGATGT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6319Contig1 1120 2 6 U
GGACCGGCAAGTTGCTCTGCTTCTTTTAACCTAAACCAATTCAAAACTCGCCGCTACGGT
CGCCGGGGAACTTCGGAGTTGCTGTCTTCTATCGAATTCTCAAGGAAGTGATGGTGGGGG
TTTCTTTTGGGGAGCAAAACTTCATTAAAGGTGGGATTGCTCAAGATCTTCGAACTGATG
GTCGGAAAAGATTGACTTACCGTGACATCTATGTCGAAACCGGTGTTATTCCTCAGGCTA
ACGGTTCAGCGAGAGTTAGGATAGGTGGAACTGATGTGATTGCAAGTGTAAAGGCTGAGC
TTGGGAGGCCAAGTTCTCTTCAGCCTGATAAAGGGGGTTGCTGTTTTCATTGATTGCAGT
CCAACAGCAGAACCTACCTTCGGGGGGAGAGGTGGTGAGGAGTTGTCTTCTGAGCTTGCT
TTGGCTCTTCAAATCTGTCTTCTTGGTGGCAAAAGTGGAGCAGGGGCTGGTATAAATTTA
TCTTCGCTTTTGATCAAAGAGGGAAGAGTCTGCTGGGACCTTTACATAGATGGCCTTGTC
ATTAGCTCCGATGGGAATCTATTGGATGCACTGGGTGCTGGCATCAAGGCTGCATTAACC
AACACTGCTATACCAAAAGTCCAAGTTTCAGCTGAAATGGCGGATGATGAGCAACCAGAG
ATTGACATCAGCGAAGAAGAGTATCAACAGTTTGATACTTCCAGTGTCCCAGTCATAGTC
ACGTTAACTAAAGTGGGGAATCATTACATAGTTGATGCAACAGCGGAAGAGGAGTCTCAG
ATGAGCTCAGCCGTGTCTATATCAGTGAACCGGGCAGGACATATCTGTGGGTTGACCAAA
AGAGGAGGGTCTGGTTTAGACCCGAGCGTCATCCTTGACATGATCTCTGTGGCTAAGCAT
GTGTCAGAGACTCTGATGAACAATCTTGATTCTAAGATTTCAGCTGCAGAGGCCTGTGAA
GACGACGAGTCTTGACTTTACAGTCCTTTTTTTGAGTTTCAGGGAGTCAAAAGGCTCAAG
ATATGTTTGGAACGATCAAATGTTTGAATCAATCCTATGTGTATCTAAGTTATAGAACAG
TTTAGCTAATCAAAACAATCCTCCATGCGTTCTAATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D813TF U 1
AF RR2D813JQ C 471
BS 1 677 RR2D813TF
BS 678 678 RR2D813JQ
BS 679 767 RR2D813TF
BS 768 768 RR2D813JQ
BS 769 808 RR2D813TF
BS 809 1120 RR2D813JQ

RD RR2D813TF 812 0 0
GGACCGGCAAGTTGCTCTGCTTCTTTTAACCTAAACCAATTCAAAACTCGCCGCTACGGT
CGCCGGGGAACTTCGGAGTTGCTGTCTTCTATCGAATTCTCAAGGAAGTGATGGTGGGGG
TTTCTTTTGGGGAGCAAAACTTCATTAAAGGTGGGATTGCTCAAGATCTTCGAACTGATG
GTCGGAAAAGATTGACTTACCGTGACATCTATGTCGAAACCGGTGTTATTCCTCAGGCTA
ACGGTTCAGCGAGAGTTAGGATAGGTGGAACTGATGTGATTGCAAGTGTAAAGGCTGAGC
TTGGGAGGCCAAGTTCTCTTCAGCCTGATAAAGGGGGTTGCTGTTTTCATTGATTGCAGT
CCAACAGCAGAACCTACCTTCGGGGGGAGAGGTGGTGAGGAGTTGTCTTCTGAGCTTGCT
TTGGCTCTTCAAATCTGTCTTCTTGGTGGCAAAAGTGGAGCAGGGGCTGGTATAAATTTA
TCTTCGCTTTTGATCAAAGAGGGAAGAGTCTGCTGGGACCTTTACATAGATGGCCTTGTC
ATTAGCTCCGATGGGAATCTATTGGATGCACTGGGTGCTGGCATCAAGGCTGCATTAACC
AACACTGCTATACCAAAAGTCCAAGTTTCAGCTGAAATGGCGGATGATGAGCAACCAGAG
ATTGACATCAGCGAAGA*GAGTATCAACAGTTTGATACTTCCAGTGTCCCAGTCATAGTC
ACGTTAACTAAAGTGGGGAATCATTACATAGTTGATGCAACAGCGGA*GAGGAGTCTCAG
ATGAGCTCAGCCGTGTCTATATCAGTGA
CCGG

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2D813JQ 650 0 0
TATAAATTTATCTTCGCTTTTGATCAAAGAGGGAAGAGTCTGCTGGGACCTTTACATAGA
TGGCCTTGTCATTAGCTCCGATGGGAATCTATTGGATGCACTGGGTGCTGGCATCAAGGC
TGCATTAACCAACACTGCTATACCAAAAGTCCAAGTTTCAGCTGAAATGGCGGATGATGA
GCAACCAGAGATTGACATCAGCGAAGAAGAGTATCAACAGTTTGATACTTCCAGTGTCCC
AGTCATAGTCACGTTAACTAAAGTGGGGAATCATTACATAGTTGATGCAACAGCGGAAGA
GGAGTCTCAGATGAGCTCAGCCGTGTCTATATCAGTGAACCGGGCAGGACATATCTGTGG
GTTGACCAAAAGAGGAGGGTCTGGTTTAGACCCGAGCGTCATCCTTGACATGATCTCTGT
GGCTAAGCATGTGTCAGAGACTCTGATGAACAATCTTGATTCTAAGATTTCAGCTGCAGA
GGCCTGTGAAGACGACGAGTCTTGACTTTACAGTCCTTTTTTTGAGTTTCAGGGAGTCAA
AAGGCTCAAGATATGTTTGGAACGATCAAATGTTTGAATCAATCCTATGTGTATCTAAGT
TATAGAACAGTTTAGCTAATCAAAACAATCCTCCATGCGTTCTAATTTTC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL6320Contig1 748 2 2 U
GAAGAAAGATCCCAAAAAAGATGATGAGACAAACCCTGAAGCAGATGATGAGGACTTGTA
TGTGGAGCGTATTCGCCTTGAGAATACACAATTGAGCTTTAAGAGTTTCTTGAGCAAGCT
CACGATACAAGAGCCTACATTTGATAGAATGATTGTTGTTTATAGGCGAGCCAGCTCTAA
AACAAATCAGGAAAGAGGAATTTACGTCAAGCACTTCAAAAACATTCCTATGGCCGACAT
GGAGATTGTGCTTCCTGAGAAAAGAAATCCTGGACTGACTCCAATGGATTGGGTCAAATT
TCTGATATCAGCCGTAGTTGGTCTGGTTGCCGTGGTTACTTCAGTTGAGATGCCGAAAGC
AGACCCATGGGTAATCTTTGCAGTTCTCTCCACAGTGGTTGGTTATTGTGCCAAAACATA
CTTCACCTTCCAGCAGAACATGGCAACGTACCAGAACTTGATAACACAATCCATGTATGA
TAAACAACTAGACAGCGGGAAGGGAACGCTATTACACTTGTGCGATGACGTTATTCAGCA
AGAAGTAAAAGAGGTGATGATTTCCTTCTACATACTAATGGAGCTTGTCCTGAAGGCCAA
ACAGGGCGTCACTCCTTCTTGAACTTACCACCTTTTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTTTAA
CATTTGTTCTCTCATTTCAGTAAAACTCTAAATGACGAAAGTGATATCGGTTGTTTACAA
AATCCAAATGCAACAAACCAATTCACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D642TF U 1
AF RR2D642JQ C 81
BS 1 684 RR2D642TF
BS 685 748 RR2D642JQ

RD RR2D642TF 698 0 0
GAAGAAAGATCCCAAAAAAGATGATGAGACAAACCCTGAAGCAGATGATGAGGACTTGTA
TGTGGAGCGTATTCGCCTTGAGAATACACAATTGAGCTTTAAGAGTTTCTTGAGCAAGCT
CACGATACAAGAGCCTACATTTGATAGAATGATTGTTGTTTATAGGCGAGCCAGCTCTAA
AACAAATCAGGAAAGAGGAATTTACGTCAAGCACTTCAAAAACATTCCTATGGCCGACAT
GGAGATTGTGCTTCCTGAGAAAAGAAATCCTGGACTGACTCCAATGGATTGGGTCAAATT
TCTGATATCAGCCGTAGTTGGTCTGGTTGCCGTGGTTACTTCAGTTGAGATGCCGAAAGC
AGACCCATGGGTAATCTTTGCAGTTCTCTCCACAGTGGTTGGTTATTGTGCCAAAACATA
CTTCACCTTCCAGCAGAACATGGCAACGTACCAGAACTTGATAACACAATCCATGTATGA
TAAACAACTAGACAGCGGGAAGGGAACGCTATTACACTTGTGCGATGACGTTATTCAGCA
AGAAGTAAAAGAGGTGATGATTTCCTTCTACATACTAATGGAGCTTGTCCTGAAGGCCAA
ACAGGGCGTCACTCCTTCTTGAACTTACCACCTTTTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTTTAA
CATTTGTTCTCTCATTTCAGTAAA
CTCTAATGACGAAA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2D642JQ 668 0 0
AGAATACACAATTGAGCTTTAAGAGTTTCTTGAGCAAGCTCACGATACAAGAGCCTACAT
TTGATAGAATGATTGTTGTTTATAGGCGAGCCAGCTCTAAAACAAATCAGGAAAGAGGAA
TTTACGTCAAGCACTTCAAAAACATTCCTATGGCCGACATGGAGATTGTGCTTCCTGAGA
AAAGAAATCCTGGACTGACTCCAATGGATTGGGTCAAATTTCTGATATCAGCCGTAGTTG
GTCTGGTTGCCGTGGTTACTTCAGTTGAGATGCCGAAAGCAGACCCATGGGTAATCTTTG
CAGTTCTCTCCACAGTGGTTGGTTATTGTGCCAAAACATACTTCACCTTCCAGCAGAACA
TGGCAACGTACCAGAACTTGATAACACAATCCATGTATGATAAACAACTAGACAGCGGGA
AGGGAACGCTATTACACTTGTGCGATGACGTTATTCAGCAAGAAGTAAAAGAGGTGATGA
TTTCCTTCTACATACTAATGGAGCTTGTCCTGAAGGCCAAACAGGGCGTCACTCCTTCTT
GAACTTACCACCTTTTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTTTAACATTTGTTCTCTCATTTCAG
TAAAACTCTAAATGACGAAAGTGATATCGGTTGTTTACAAAATCCAAATGCAACAAACCA
ATTCACCG

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL6321Contig1 1062 2 2 U
GGACCATCACACATTCACGTTTCTCTTTCTTTCTCTCTCGACGGATGCTCTTCTCTCCTT
CTCTCTTGACTCCTCGACGAAACCGACTGTCTCTGGTCATCTCTCCTCGAATCTTGTCTC
TGTTTGATCGGGCTCGGATTCGCTTGATGCAGGTCGGAACTGATTGGCTGACACAATCAC
ATAGGTGCTTTTGCCTTATTGGTTTGTAAGTAGGGATTGGCTCCCGCCTTACATCAACTG
AATCGGAGCCTTCAATGGTGAAACGAGTCCAATTAAATCTGGAGAACAGTTTGATTCAAG
ATCTAGGGTTTGGATTCTTACAATCCTCATGTGATTTGATTTCTAAAGGTAGAGAACTAG
GATAAAAGGTAATTGGTTTATGGAAATTTTCTGGCTTTTTTTCTTTAAATTGTTGATTTT
AAGTTAAAATCATCAATAAAAACGTATGTGATATTTGAAAAAAAAACAGTTTGACAAATC
CACTGTATGATATGAAGAAGATAGAGATCTCGTTACATGAGCAATCTGTTGTCTTGGTTT
TCTCTAAGAAGGTTCATCTATGTTTTGATTTAGCTTCTTGATGAAATCAATGTTTATCTC
TAGTCTTATTGTAGTAGAAACGCAGGTTTAAAGATGTCCACTTCCATCTCCTTATTTCAA
GACAGGCATCATCGGAGATGGGTTGCAGGGAAACTGGATCCTGACTTTGCAGGAAAGGGA
CTTGACTTAGTCACATAAGCCGTGGGCACTACAAGCATTAGGTGGATGGGAGAATGAGCT
TGATTACTGCTAAGAGCTCCTTGAAGCTGACGTCTTTAACAACTCCTTATGGAATCAGGT
AAATATGATTCATCAGTACCCAATTTTGCTAGATTGTGTTTCACAAATTTTTTATTTTTT
TAAGAACTCATAAATAAGAGATTTGCATTGGAGGCCTTCAAACGTTGGGTCTCTTAAATA
TGTCTCTTAACCTCACATTTACTACTAATACTATTAAAAAAATATTAAGGGATCCATTTT
GAGTCATTGGGATAATGATGCTCTGAAGTGTATAAAGTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC73TF U 1
AF RR2CC73JQ C 330
BS 1 684 RR2CC73TF
BS 685 1062 RR2CC73JQ

RD RR2CC73TF 684 0 0
GGACCATCACACATTCACGTTTCTCTTTCTTTCTCTCTCGACGGATGCTCTTCTCTCCTT
CTCTCTTGACTCCTCGACGAAACCGACTGTCTCTGGTCATCTCTCCTCGAATCTTGTCTC
TGTTTGATCGGGCTCGGATTCGCTTGATGCAGGTCGGAACTGATTGGCTGACACAATCAC
ATAGGTGCTTTTGCCTTATTGGTTTGTAAGTAGGGATTGGCTCCCGCCTTACATCAACTG
AATCGGAGCCTTCAATGGTGAAACGAGTCCAATTAAATCTGGAGAACAGTTTGATTCAAG
ATCTAGGGTTTGGATTCTTACAATCCTCATGTGATTTGATTTCTAAAGGTAGAGAACTAG
GATAAAAGGTAATTGGTTTATGGAAATTTTCTGGCTTTTTTTCTTTAAATTGTTGATTTT
AAGTTAAAATCATCAATAAAAACGTATGTGATATTTGAAAAAAAAACAGTTTGACAAATC
CACTGTATGATATGAAGAAGATAGAGATCTCGTTACATGAGCAATCTGTTGTCTTGGTTT
TCTCTAAGAAGGTTCATCTATGTTTTGATTTAGCTTCTTGATGAAATCAATGTTTATCTC
TAGTCTTATTGTAGTAGAAACGCAGGTTTAAAGATGTCCACTTCCATCTCCTTATTTCAA
GACAGGCATCATCGGAGATGGGTT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2CC73JQ 733 0 0
TGTGATTTGATTTCTAAAGGTAGAGAACTAGGATAAAAGGTAATTGGTTTATGGAAATTT
TCTGGCTTTTTTTCTTTAAATTGTTGATTTTAAGTTAAAATCATCAATAAAAACGTATGT
GATATTTGAAAAAAAAACAGTTTGACAAATCCACTGTATGATATGAAGAAGATAGAGATC
TCGTTACATGAGCAATCTGTTGTCTTGGTTTTCTCTAAGAAGGTTCATCTATGTTTTGAT
TTAGCTTCTTGATGAAATCAATGTTTATCTCTAGTCTTATTGTAGTAGAAACGCAGGTTT
AAAGATGTCCACTTCCATCTCCTTATTTCAAGACAGGCATCATCGGAGATGGGTTGCAGG
GAAACTGGATCCTGACTTTGCAGGAAAGGGACTTGACTTAGTCACATAAGCCGTGGGCAC
TACAAGCATTAGGTGGATGGGAGAATGAGCTTGATTACTGCTAAGAGCTCCTTGAAGCTG
ACGTCTTTAACAACTCCTTATGGAATCAGGTAAATATGATTCATCAGTACCCAATTTTGC
TAGATTGTGTTTCACAAATTTTTTATTTTTTTAAGAACTCATAAATAAGAGATTTGCATT
GGAGGCCTTCAAACGTTGGGTCTCTTAAATATGTCTCTTAACCTCACATTTACTACTAAT
ACTATTAAAAAAATATTAAGGGATCCATTTTGAGTCATTGGGATAATGATGCTCTGAAGT
GTATAAAGTATTT

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL6322Contig1 1049 2 2 U
GGATCTTCATCTATACCACGAGACAGAGACTAGAAACCCCTCTCACTATCTACTTCACTC
ACATTCTTTTATTTTTTATTTGTCGGATCGCTCTCTCTCTCTCGCTTTTATCCGACAGTA
CATCTCAGATTCCTTGGTCTCAATTTCCTCTGAAGACGACAATGAGAACTCCTGGAACTC
CACTTTCGAAAACGGACAGAACACCAGCTGTGACGCCAGGTGGGAGCTCAAGATCCAGGG
AGGAGAAGATCGTTGTTACCGTAAGGCTAAGGCCACTGAACAAGAAGGAACAGTTAGCTA
AAGACCAAGTGGCTTGGGAATGTGTTGATGACCACACCATTGTCTCTAAACCACAAGCTC
CTCATGAACGCTCCCATCACCAGTCCTCCTTTACGTTCGATAAAGTGTTTGGACCAGAGA
GTGTCACAGAAGATGTGTATGAAGATGGTGTAAAGAATGTTGCATTGTCTGCTTTGATGG
GCATTAACGCAACAATATTTGCTTATGGACAAACGAGCAGTGGAAAGACATTTACCATGA
GAGGAGTAACGGAGAAAGCTGTTAATGATATTACAATCACATAATCAATACCCCTGAAAG
AGACTTTACTATCAAGATCTCTGGTCTGGAAATATATAACGAAAATGTCAGGGATCTGCT
GAATTCAGATTCAGGGCGTGCCCTTAAACTCCTTGATGACCCTGAGAAAGGGACTGTGGT
TGAAAAACTGGTCGAAGAAACAGCTAATAACGATCAACACTTGAGGCATCTCATTAGCAT
TTGTGAAGCTCAAAGGCAAGTTGGAGAGACTGCTTTGAATGACACGAGCTCACGGTCACA
CCAAATTATCAGACTGACGATACAAAGTACTCACCGTGAAAATTCAGATTGTGTGAGATC
ATACATGGCTAGTCTGAACTTTGTGGACTTAGCAGGAAGTGAAAGAGCGTCACAGTCGCA
GGCAGATGGAACGAGACTCAGGGAAGGTTGCCATATCAATCTAAGTCTAATGACACTTAC
AACTGTCATAAGGAAGCTAAGTGTGGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX11TF U 1
AF RR2EX11JQ C 370
BS 1 647 RR2EX11TF
BS 648 1049 RR2EX11JQ

RD RR2EX11TF 647 0 0
GGATCTTCATCTATACCACGAGACAGAGACTAGAAACCCCTCTCACTATCTACTTCACTC
ACATTCTTTTATTTTTTATTTGTCGGATCGCTCTCTCTCTCTCGCTTTTATCCGACAGTA
CATCTCAGATTCCTTGGTCTCAATTTCCTCTGAAGACGACAATGAGAACTCCTGGAACTC
CACTTTCGAAAACGGACAGAACACCAGCTGTGACGCCAGGTGGGAGCTCAAGATCCAGGG
AGGAGAAGATCGTTGTTACCGTAAGGCTAAGGCCACTGAACAAGAAGGAACAGTTAGCTA
AAGACCAAGTGGCTTGGGAATGTGTTGATGACCACACCATTGTCTCTAAACCACAAGCTC
CTCATGAACGCTCCCATCACCAGTCCTCCTTTACGTTCGATAAAGTGTTTGGACCAGAGA
GTGTCACAGAAGATGTGTATGAAGATGGTGTAAAGAATGTTGCATTGTCTGCTTTGATGG
GCATTAACGCAACAATATTTGCTTATGGACAAACGAGCAGTGGAAAGACATTTACCATGA
GAGGAGTAACGGAGAAAGCTGTTAATGATATTACAATCACATAATCAATACCCCTGAAAG
AGACTTTACTATCAAGATCTCTGGTCTGGAAATATATAACGAAAATG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2EX11JQ 680 0 0
GCTCCCATCACCAGTCCTCCTTTACGTTCGATAAAGTGTTTGGACCAGAGAGTGTCACAG
AAGATGTGTATGAAGATGGTGTAAAGAATGTTGCATTGTCTGCTTTGATGGGCATTAACG
CAACAATATTTGCTTATGGACAAACGAGCAGTGGAAAGACATTTACCATGAGAGGAGTAA
CGGAGAAAGCTGTTAATGATATTACAATCACATAATCAATACCCCTGAAAGAGACTTTAC
TATCAAGATCTCTGGTCTGGAAATATATAACGAAAATGTCAGGGATCTGCTGAATTCAGA
TTCAGGGCGTGCCCTTAAACTCCTTGATGACCCTGAGAAAGGGACTGTGGTTGAAAAACT
GGTCGAAGAAACAGCTAATAACGATCAACACTTGAGGCATCTCATTAGCATTTGTGAAGC
TCAAAGGCAAGTTGGAGAGACTGCTTTGAATGACACGAGCTCACGGTCACACCAAATTAT
CAGACTGACGATACAAAGTACTCACCGTGAAAATTCAGATTGTGTGAGATCATACATGGC
TAGTCTGAACTTTGTGGACTTAGCAGGAAGTGAAAGAGCGTCACAGTCGCAGGCAGATGG
AACGAGACTCAGGGAAGGTTGCCATATCAATCTAAGTCTAATGACACTTACAACTGTCAT
AAGGAAGCTAAGTGTGGGGT

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL6323Contig1 1012 2 2 U
GGTAATAATCAGCGCATCAGAGTTATACAGGAGAGGTTCCACCTCTCTTGTGAAACCATT
AGCCGCCATTTCAACAATGTGTTGAAGGCGGTTAAGGCGGTGTCACGAGGGTTTTTTCAG
CCACCGGTTATGGAAACACATGAAGATATAGTCAGTAGCAAAAGGCTTTATCCATATTTC
AAGGATTGTTGGAGTTATAGATGGGTTGCGACTTCTTGCTAACCTTCCTATAAAAGACCA
GCCCCGGTTTCAGAACAAGAAAGGCGTACTTAAACAGAACGTGCTTGCAGCTTGCACTTT
TGATTTGGAGTTTATATTTGTATGCCCTGGATGGGAAGGCTCTATCAACGATTCACGCGT
CTTAAGAGCAGTCCTAGATGATCCAAAACAGAACTTCCCTCAACCTCCCAAAGGAAAATA
CTATCTTGTTGACAGAGGTTACACCAACACAGAAGGGTTCATTGCTCCATACCAGGGAAC
TAGGTACGGTCTCCACGAGTACCGTGGCGCACGCCAAATGCCGCAGAACGCTCCTGACCT
TTTCAATCATAGGCACATGTTTCTAAGCAACGTTATCCAAAGATCATTCAGCCTTCTGAA
AACCAGGTTTCCAATCCTGAAATCCGCGCCTCCTTACCATTTTCAAGTCCAGAGGGATCT
GGTGATTGTGACTTGTGCTCTCCATAACTTCATTAAAAGGGAAGACGGCGTTCACGACTG
GCTCTTTGCAGCTGAAGGTAAAGATGCTGTGTCTGAGGAGGAATCTCGTGGAGAAGAGGA
AGAAGAAGAGCTAGAGTTGCTGCACATGGATTCTACTCCTAGGGAGCTTGTTGCTGATTC
TCTACGAGACTTTATTGCATTTACTATGTGGGATGACTTCATGAATAAGTGCGAAGAATG
GTAGATAAAAACAAGAATGTGCTAACGAGTTTGGTTTATGTTTATATTAGTTTTAACAAG
AACCAAAGGAGTTTGATTTATGTTATATTAGTGAACAAAGGGTCATTATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ76TF U 1
AF RR2GQ76JQ C 232
BS 1 696 RR2GQ76TF
BS 697 1012 RR2GQ76JQ

RD RR2GQ76TF 696 0 0
GGTAATAATCAGCGCATCAGAGTTATACAGGAGAGGTTCCACCTCTCTTGTGAAACCATT
AGCCGCCATTTCAACAATGTGTTGAAGGCGGTTAAGGCGGTGTCACGAGGGTTTTTTCAG
CCACCGGTTATGGAAACACATGAAGATATAGTCAGTAGCAAAAGGCTTTATCCATATTTC
AAGGATTGTTGGAGTTATAGATGGGTTGCGACTTCTTGCTAACCTTCCTATAAAAGACCA
GCCCCGGTTTCAGAACAAGAAAGGCGTACTTAAACAGAACGTGCTTGCAGCTTGCACTTT
TGATTTGGAGTTTATATTTGTATGCCCTGGATGGGAAGGCTCTATCAACGATTCACGCGT
CTTAAGAGCAGTCCTAGATGATCCAAAACAGAACTTCCCTCAACCTCCCAAAGGAAAATA
CTATCTTGTTGACAGAGGTTACACCAACACAGAAGGGTTCATTGCTCCATACCAGGGAAC
TAGGTACGGTCTCCACGAGTACCGTGGCGCACGCCAAATGCCGCAGAACGCTCCTGACCT
TTTCAATCATAGGCACATGTTTCTAAGCAACGTTATCCAAAGATCATTCAGCCTTCTGAA
AACCAGGTTTCCAATCCTGAAATCCGCGCCTCCTTACCATTTTCAAGTCCAGAGGGATCT
GGTGATTGTGACTTGTGCTCTCCATAACTTCATTAA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2GQ76JQ 781 0 0
AAAAGACCAGCCCCGGTTTCAGAACAAGAAAGGCGTACTTAAACAGAACGTGCTTGCAGC
TTGCACTTTTGATTTGGAGTTTATATTTGTATGCCCTGGATGGGAAGGCTCTATCAACGA
TTCACGCGTCTTAAGAGCAGTCCTAGATGATCCAAAACAGAACTTCCCTCAACCTCCCAA
AGGAAAATACTATCTTGTTGACAGAGGTTACACCAACACAGAAGGGTTCATTGCTCCATA
CCAGGGAACTAGGTACGGTCTCCACGAGTACCGTGGCGCACGCCAAATGCCGCAGAACGC
TCCTGACCTTTTCAATCATAGGCACATGTTTTTAAGCAACGTTATCCAAAGATCATTCAG
CCTTCTGAAAACCAGGTTTCCAATCCTGAAATCCGCGCCTCCTTACCATTTTCAAGTCCA
GAGGGATCTGGTGATTGTGACTTGTGCTCTCCATAACTTCATTAAAAGGGAAGACGGCGT
TCACGACTGGCTCTTTGCAGCTGAAGGTAAAGATGCTGTGTCTGAGGAGGAATCTCGTGG
AGAAGAGGAAGAAGAAGAGCTAGAGTTGCTGCACATGGATTCTACTCCTAGGGAGCTTGT
TGCTGATTCTCTACGAGACTTTATTGCATTTACTATGTGGGATGACTTCATGAATAAGTG
CGAAGAATGGTAGATAAAAACAAGAATGTGCTAACGAGTTTGGTTTATGTTTATATTAGT
TTTAACAAGAACCAAAGGAGTTTGATTTATGTTATATTAGTGAACAAAGGGTCATTATTA
T

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL6324Contig1 814 2 2 U
GATTCCAATAGCCATGAACATTTTCAAGAAGAAGACAACTCCCAAAGATGCTCTCCGCAC
CAGCAAGAGAGAAATGGCTGTGGCTACACGAGGTATTGAGCGCGAGATTACATCTCTTCA
AATGGAGGAGAAGAGGCTTGTAGCAGAAATCAAGAAAACAGCTAAGACTGGAAATGAGGC
TGCCACGAAGATCTTAGCTCGACAACTTGTTAGGTTGAGGCAACAGATCACCAATCTGCA
GGGAAGCCGTGCTCAGATTCGTGGTGTCACCACCCATACACAGGCGTTGTATGCAAGCAC
CTCAATCTCATCAGGAATGAAAGGTGCAACCACAGCTATGGTTGCCATGAACAAGCAAAT
GGCACCAACGAAACAAGCTAAGGTGATCAAGGATTTCCAGAAGCAGTCTGCACAACTGGA
CATGACGATAGAGATGATGTCAGAGGCAATTGATGAAACACTTGACAAAGATGAAGCTGA
AGAAGAAACTGAAGATCTCACTAACCAGGTGCTCGATGAGATTGGTGTTGGTGTTGCATC
TCAGCTATCTTCAGCTCCAAAGGGCCGGATTGCAACAAAAGCCGCTGCGCCCACCATAGT
CAGTAACAAGAACGACGAAGGATCTACTGAAGTGGATGATCTAGAGAGGAGATTGGCTTC
ACTTCGACGTATCTGAGAGACATGACACTTCCTATTTTGTAGTTATCATCCATCATGCAT
CAAAAGAAAGCAGCTACTTCCTATTATGAGAAATCTGTATTATATCTAGTGTAGCAACAA
GTTTAAATCAAACATATTTTATATTAAAACACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA91TF U 1
AF RR2DA91JQ C 195
BS 1 797 RR2DA91TF
BS 798 814 RR2DA91JQ

RD RR2DA91TF 797 0 0
GATTCCAATAGCCATGAACATTTTCAAGAAGAAGACAACTCCCAAAGATGCTCTCCGCAC
CAGCAAGAGAGAAATGGCTGTGGCTACACGAGGTATTGAGCGCGAGATTACATCTCTTCA
AATGGAGGAGAAGAGGCTTGTAGCAGAAATCAAGAAAACAGCTAAGACTGGAAATGAGGC
TGCCACGAAGATCTTAGCTCGACAACTTGTTAGGTTGAGGCAACAGATCACCAATCTGCA
GGGAAGCCGTGCTCAGATTCGTGGTGTCACCACCCATACACAGGCGTTGTATGCAAGCAC
CTCAATCTCATCAGGAATGAAAGGTGCAACCACAGCTATGGTTGCCATGAACAAGCAAAT
GGCACCAACGAAACAAGCTAAGGTGATCAAGGATTTCCAGAAGCAGTCTGCACAACTGGA
CATGACGATAGAGATGATGTCAGAGGCAATTGATGAAACACTTGACAAAGATGAAGCTGA
AGAAGAAACTGAAGATCTCACTAACCAGGTGCTCGATGAGATTGGTGTTGGTGTTGCATC
TCAGCTATCTTCAGCTCCAAAGGGCCGGATTGCAACAAAAGCCGCTGCGCCCACCATAGT
CAGTAACAAGAACGACGAAGGATCTACTGAAGTGGATGATCTAGAGAGGAGATTGGCTTC
ACTTCGACGTATCTGAGAGACATGACACTTCCTATTTTGTAGTTATCATCCATCATGCAT
CAAAAGAAAGCAGCTACTTCCTATTATGAGAAATCTGTATTATATCTAGTGTAGCAACAA
GTTTAAATCAAACATAT

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2DA91JQ 620 0 0
TAGCTCGACAACTTGTTAGGTTGAGGCAACAGATCACCAATCTGCAGGGAAGCCGTGCTC
AGATTCGTGGTGTCACCACCCATACACAGGCGTTGTATGCAAGCACCTCAATCTCATCAG
GAATGAAAGGTGCAACCACAGCTATGGTTGCCATGAACAAGCAAATGGCACCAACGAAAC
AAGCTAAGGTGATCAAGGATTTCCAGAAGCAGTTTGCACAACTGGACATGACGATAGAGA
TGATGTCAGAGGCAATTGATGAAACACTTGACAAAGATGAAGCTGAAGAAGAAACTGAAG
ATCTCACTAACCAGGTGCTCGATGAGATTGGTGTTGGTGTTGCATTTCAGCTATCTTCAG
CTCCAAAGGGCCGGATTGCAACAAAAGCCGCTGCGCCCACCATAGTCAGTAACAAGAACG
ACGAAGGATTTACTGAAGTGGATGATCTAGAGAGGAGATTGGCTTCACTTCGACGTATTT
GAGAGACATGACACTTCCTATTTTGTAGTTATCATCCATCATGCATCAAAAGAAAGCAGC
TACTTCCTATTATGAGAAATCTGTATTATATCTAGTGTAGCAACAAGTTTAAATCAAACA
TATTTTATATTAAAACACCG

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL6325Contig1 645 2 2 U
TTTTTTGAAAAACTAACATAGTGTAGATAAGAATTAGCATTCATTTACTGCATAATAAAC
AAGTCGTTACATTTAAGCATATAGTCTTAATAAACACGATAGAATATTAATAATATATTA
ATGTTCCGTAATTAAAACCCTAGGCACTATACAAACGAGATTCCGAAGTCTTCTCAACAA
AAACCTCCCCAAAAATCAATACTTAATTATATTATTATCGGATAATGCGAAATTAGTAAA
TAATAATATGAACACACTTCTAGATCTCCTCCTCTTTTCCTTGGAAGAGATTCCAGAAAA
CAGCCGAGACTGGGGTACGGGTCGGATCTTACCATCCTACATCACCAGCTCAGATACCCA
CCCGACATCAGGAGCTTCACCCGAATTCTGATCAGGATCCGGTTCTACCCGATCCATGCA
ATTCTCCTTACTGAGTTTCTCAAACATCTTCGCTCGCAGCTCACGACCCGACTCTACGAC
CCGCTCCATTGCTGGCTCTTCCTCTATACCATTCTCCCATATATCCATATTTCCGTGTCG
GGTTGGGGTTGTGGGCAGACTCTGAAACCCAGGACCCAAGATGGATCCTCGGGGAGACCC
GAATCCGGATTGGTAGCATCGTAACGGATTGTTGTAAGACGGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FT45TF C 1
AF RR2FT45JQ U 7
BS 1 6 RR2FT45TF
BS 7 645 RR2FT45JQ

RD RR2FT45TF 645 0 0
TTTTTTGAAAAACTAACATAGTGTAGATAAGAATTAGCATTCATTTACTGCATAATAAAC
AAGTCGTTACATTTAAGCATATAGTCTTAATAAACACGATAGAATATTAATAATATATTA
ATGTTCCGTAATTAAAACCCTAGGCACTATACAAACGAGATTCCGAAGTCTTCTCAACAA
AAACCTCCCCAAAAATCAATACTTAATTATATTATTATCGGATAATGCGAAATTAGTAAA
TAATAATATGAACACACTTCTAGATCTCCTCCTCTTTTCCTTGGAAGAGATTCCAGAAAA
CAGCCGAGACTGGGGTACGGGTCGGATCTTACCATCCTACATCACCAGCTCAGATACCCA
CCCGACATCAGGAGCTTCACCCGAATTCTGATCAGGATCCGGTTCTACCCGATCCATGCA
ATTCTCCTTACTGAGTTTCTCAAACATCTTCGCTCGCAGCTCACGACCCGACTCTACGAC
CCGCTCCATTGCTGGCTCTTCCTCTATACCATTCTCCCATATATCCATATTTCCGTGTCG
GGTTGGGGTTGTGGGCAGACTCTGAAACCCAGGACCCAAGATGGATCCTCGGGGAGACCC
GAATCCGGATTGGTAGCATCGTAACGGATTGTTGTAAGACGGAGC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2FT45JQ 639 0 0
GAAAAACTAACATAGTGTAGATAAGAATTAGCATTCATTTACTGCATAATAAACAAGTCG
TTACATTTAAGCATATAGTCTTAATAAACACGATAGAATATTAATAATATATTAATGTTC
CGTAATTAAAACCCTAGGCACTATACAAACGAGATTCCGAAGTCTTCTCAACAAAAACCT
CCCCAAAAATCAATACTTAATTATATTATTATCGGATAATGCGAAATTAGTAAATAATAA
TATGAACACACTTCTAGATCTCCTCCTCTTTTCCTTGGAAGAGATTCCAGAAAACAGCCG
AGACTGGGGTACGGGTCGGATCTTACCATCCTACATCACCAGCTCAGATACCCACCCGAC
ATCAGGAGCTTCACCCGAATTCTGATCAGGATCCGGTTCTACCCGATCCATGCAATTCTC
CTTACTGAGTTTCTCAAACATCTTCGCTCGCAGCTCACGACCCGACTCTACGACCCGCTC
CATTGCTGGCTCTTCCTCTATACCATTCTCCCATATATCCATATTTCCGTGTCGGGTTGG
GGTTGTGGGCAGACTCTGAAACCCAGGACCCAAGATGGATCCTCGGGGAGACCCGAATCC
GGATTGGTAGCATCGTAACGGATTGTTGTAAGACGGAGC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6327Contig1 1169 2 4 U
GGTCTCGTTTCCCACATCGGTGATATAAGCTATGCTCGTGGTTACTCGTGGGTGTGGGAT
GAGTTCTTTGCTCAGATCGAGCCTATTGCCTCGAGAGTTCCTTACCATGTCTGCATCGGT
AACCACGAGTATGATTTTCCTACTCAGCCTTGGAAACCTGATTGGGGAACGTATGGTAAT
GATGGTGGTGGTGAGTGTGGTGTGCCGTATAGTCTCAAGTTCAACATGCCTGGAAACTCA
TCGGAACCAACCGGAACGAAAGCTCCACCGACGGGGAATCTGTACTATTCTTACGATATG
GGGTCGGTTCATTTTCTTTATATCTCCACTGAGACGAACTTTCTTAAAGGAGGGAGTCAG
CACGAGTTCATAAAACGAGATCTTGAGTCTGTGAACAGGGACAAAACACCGTTTGTCGTC
GCGCAAGGGCACAGACCGATGTACACTACTAGCAACGAGGTTAGAGACGCTATGATTAGA
CAAAAGATGGTGGAGCATTTGGAACCGCTGTTTGTGGAAAACAACGTGACGCTTGCTCTG
TGGGGACATGTTCATAGATACGAGAGGTTCTGTCCGATAATCAACAACACTTGCGGCAAA
CAGTGGAGAGGAAGCCCGTTTCATCTAGTGATCGGTATGGGTAGTCAAGACTGGCAACCG
ATTTGGCAGCCGAGACCGAACCATCCAGGGCTTCCTATATTCCCTCAGCCTGAACAGTCC
ATGTACCGAACAGGTGAGTTTGGGTACACTCGTCTAGTTGCAAACAAAGAGAAGCTCACT
GTTTCTTTTGTGGGTAACCACGACGGAGAGGTTCATGACACGGTTGAGATGTTTGCATTT
GGGGAAGTAATCAGTGGGAGCAAAGACGATAGTCACGATACTGTTAAGAACGTTCCTGCA
TTTGCAACACTTGTGGGTAAACCTGAGTCTAATGTCTCATGGTATGTTAAAGGAGCAGGC
TTGTTGGTTATGGGTGTGCTGTTAGGGTTCGTTATAGGGTTTTTTACCCGGGGAAAGAAA
GGAACTACATTTGATAACCGTTGGATCCCAGTCAAGAACGAGGAGACATGATATTAACCA
AGTGAATCTATTTAGAGGCACGATTTGTATAGTATATGTCTTTGTGAGAACCGTGCTTTG
CACACTGTAATAATATTGATTCTTGTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ42TF U 1
AF RR2GJ42JQB C 325
BS 1 719 RR2GJ42TF
BS 720 720 RR2GJ42JQB
BS 721 729 RR2GJ42TF
BS 730 1169 RR2GJ42JQB

RD RR2GJ42TF 729 0 0
GGTCTCGTTTCCCACATCGGTGATATAAGCTATGCTCGTGGTTACTCGTGGGTGTGGGAT
GAGTTCTTTGCTCAGATCGAGCCTATTGCCTCGAGAGTTCCTTACCATGTCTGCATCGGT
AACCACGAGTATGATTTTCCTACTCAGCCTTGGAAACCTGATTGGGGAACGTATGGTAAT
GATGGTGGTGGTGAGTGTGGTGTGCCGTATAGTCTCAAGTTCAACATGCCTGGAAACTCA
TCGGAACCAACCGGAACGAAAGCTCCACCGACGGGGAATCTGTACTATTCTTACGATATG
GGGTCGGTTCATTTTCTTTATATCTCCACTGAGACGAACTTTCTTAAAGGAGGGAGTCAG
CACGAGTTCATAAAACGAGATCTTGAGTCTGTGAACAGGGACAAAACACCGTTTGTCGTC
GCGCAAGGGCACAGACCGATGTACACTACTAGCAACGAGGTTAGAGACGCTATGATTAGA
CAAAAGATGGTGGAGCATTTGGAACCGCTGTTTGTGGAAAACAACGTGACGCTTGCTCTG
TGGGGACATGTTCATAGATACGAGAGGTTCTGTCCGATAATCAACAACACTTGCGGCAAA
CAGTGGAGAGGAAGCCCGTTTCATCTAGTGATCGGTATGGGTAGTCAAGACTGGCAACCG
ATTTGGCAGCCGAGACCGAACCATCCAGGGCTTCCTATATTCCCTCAGCCTGAACAGTC*
ATGTACCGA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2GJ42JQB 845 0 0
TCCACTGAGACGAACTT*CTTAAAGGAGG*AGTCAGCACGAGT*CATAAAACGAGATCTT
GAGTCTGTGAACAGGGACAAAACACCGTTTGTCGTCGCGCAAGGGCACAGACCGATGTAC
ACTACTAGCAACGAGGTTAGAGACGCTATGATTAGACAAAAGATGGTGGAGCATTTGGAA
CCGCTGTTTGTGGAAAACAACGTGACGCTTGCTCTGTGGGGACATGTTCATAGATACGAG
AGGTTCTGTCCGATAATCAACAACACTTGCGGCAAACAGTGGAGAGGAAGCCCGTTTCAT
CTAGTGATCGGTATGGGTAGTCAAGACTGGCAACCGATTTGGCAGCCGAGACCGAACCAT
CCAGGGCTTCCTATATTCCCTCAGCCTGAACAGTCCATGTACCGAACAGGTGAGTTTGGG
TACACTCGTCTAGTTGCAAACAAAGAGAAGCTCACTGTTTCTTTTGTGGGTAACCACGAC
GGAGAGGTTCATGACACGGTTGAGATGTTTGCATTTGGGGAAGTAATCAGTGGGAGCAAA
GACGATAGTCACGATACTGTTAAGAACGTTCCTGCATTTGCAACACTTGTGGGTAAACCT
GAGTCTAATGTCTCATGGTATGTTAAAGGAGCAGGCTTGTTGGTTATGGGTGTGCTGTTA
GGGTTCGTTATAGGGTTTTTTACCCGGGGAAAGAAAGGAACTACATTTGATAACCGTTGG
ATCCCAGTCAAGAACGAGGAGACATGATATTAACCAAGTGAATCTATTTAGAGGCACGAT
TTGTATAGTATATGTCTTTGTGAGAACCGTGCTTTGCACACTGTAATAATATTGATTCTT
GTATG

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

CO CL6328Contig1 684 2 1 U
GGAGACATGGCTTCTCTATCGTACGGAGTTTCGAACATATGCAGAAGCCAAGAGATTCTG
TCGGCAACGGTTCAGATTCGTCCCACCGGGCTACATATCACAGGAAGAATCAGAGCTGCG
AAGAAAACCTTATATAATGGATTGTCATCATCAGTGGAGGGGAGAGTCAATACACAAAGA
ATGATGTGTAGAGTGAGCTCAGAATCATCTACTGAAACTGAAGAAGATTCTGCCACAAAG
ACCAAGAAGACGCCGTTTGGATACACGAGGAAGGATGTTCTCTTGATAGGAGTGGGAGTG
ACTGCACTCGGTATCGGGCTAGAGAGTGGTCTTGAGTATGTGGGAGTAGATCCTTTGCAA
GCAGGTAATGCTGTACAGCTGATATTGGTGCTAGGCTTGACACTAGGTTGGATATCGACT
TACATCTTTAGAGTCGGTAACAAGGAGATGACTTATGCTCAGCAACTTCGTGACTACGAG
TCACAAGTCATGCAGAAACGGTTGGAGAGCTTATCTGAGGCCGAGTTAGAGGCGTTGATG
GAACAAGTTGATGAAGAGAAGAGACAAGTTTAGTAGGCTTAGGCTCCTCTACTGTTCCGT
TCACCTGCAAAATTAGTAAAAGAATCACAGGAAGGTTTTAATGTTGGTTCTTGTCCCTCA
ATGTTGGTTGTATGATACACAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AD46JQ C 1
AF RR2AD46TF U 1
BS 1 684 RR2AD46TF

RD RR2AD46JQ 684 0 0
GGAGACATGGCTTCTCTATCGTACGGAGTTTCGAACATATGCAGAAGCCAAGAGATTCTG
TCGGCAACGGTTCAGATTCGTCCCACCGGGCTACATATCACAGGAAGAATCAGAGCTGCG
AAGAAAACCTTATATAATGGATTGTCATCATCAGTGGAGGGGAGAGTCAATACACAAAGA
ATGATGTGTAGAGTGAGCTCAGAATCATCTACTGAAACTGAAGAAGATTCTGCCACAAAG
ACCAAGAAGACGCCGTTTGGATACACGAGGAAGGATGTTCTCTTGATAGGAGTGGGAGTG
ACTGCACTCGGTATCGGGCTAGAGAGTGGTCTTGAGTATGTGGGAGTAGATCCTTTGCAA
GCAGGTAATGCTGTACAGCTGATATTGGTGCTAGGCTTGACACTAGGTTGGATATCGACT
TACATCTTTAGAGTCGGTAACAAGGAGATGACTTATGCTCAGCAACTTCGTGACTACGAG
TCACAAGTCATGCAGAAACGGTTGGAGAGCTTATCTGAGGCCGAGTTAGAGGCGTTGATG
GAACAAGTTGATGAAGAGAAGAGACAAGTTTAGTAGGCTTAGGCTCCTCTACTGTTCCGT
TCACCTGCAAAATTAGTAAAAGAATCACAGGAAGGTTTTAATGTTGGTTCTTGTCCCTCA
ATGTTGGTTGTATGATACACAAAA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2AD46TF 684 0 0
GGAGACATGGCTTCTCTATCGTACGGAGTTTCGAACATATGCAGAAGCCAAGAGATTCTG
TCGGCAACGGTTCAGATTCGTCCCACCGGGCTACATATCACAGGAAGAATCAGAGCTGCG
AAGAAAACCTTATATAATGGATTGTCATCATCAGTGGAGGGGAGAGTCAATACACAAAGA
ATGATGTGTAGAGTGAGCTCAGAATCATCTACTGAAACTGAAGAAGATTCTGCCACAAAG
ACCAAGAAGACGCCGTTTGGATACACGAGGAAGGATGTTCTCTTGATAGGAGTGGGAGTG
ACTGCACTCGGTATCGGGCTAGAGAGTGGTCTTGAGTATGTGGGAGTAGATCCTTTGCAA
GCAGGTAATGCTGTACAGCTGATATTGGTGCTAGGCTTGACACTAGGTTGGATATCGACT
TACATCTTTAGAGTCGGTAACAAGGAGATGACTTATGCTCAGCAACTTCGTGACTACGAG
TCACAAGTCATGCAGAAACGGTTGGAGAGCTTATCTGAGGCCGAGTTAGAGGCGTTGATG
GAACAAGTTGATGAAGAGAAGAGACAAGTTTAGTAGGCTTAGGCTCCTCTACTGTTCCGT
TCACCTGCAAAATTAGTAAAAGAATCACAGGAAGGTTTTAATGTTGGTTCTTGTCCCTCA
ATGTTGGTTGTATGATACACAAAA

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL6329Contig1 756 2 8 U
GGAATAAACCATCTTTCAAAACACTTCAAAGCAATGGCAAAGCAAATTCTCTACACCCTC
TTTCTATTCCTCTTCTTATCTACGACGATGGATCTCACCACGGCGTCCTCCGCCACAGCT
GCAGGAACTTCCAAACGCGCAGTAAACTTCATTCAAGCCTCTTGCAAATCCACCACATAC
CCGACCGTCTGCTTCAGTTCTCTCTCCAGCTACGCCAACTCCATCCAAACAAGCCCTCAA
CGTCTAGCTGAAACCGCACTCACCGTGACCGTTAGCCAGGCCAAGTCCACGAAAGTCTTC
GTCTCACGCTTGGCCCGTTTCAAGGGTCTCAAGAAACGAGAGGTTCAAGCCATTAGGGAC
TGCATCGAGGAGATCAGTGACACGGTTGACCGTTTGACCAAGTCCGTCCAAGAAGTGAAG
ATGTGTGGCCGTGCTAAGGGGCGAGACCAGTTTTGGTTCCACATGAGCAATGCTCAGACT
TGGACGAGCGCAGCTTTGACGAATGCAATCACTTGCTCCGATGGATTCGCGCGTAGGATC
ATGGATGGGCGGATCAAGAACTCGGTCCGGGCACGGATCGTGAATTTGGGCAGAGGAACC
AGCAACGCTTTAGCTTTGATTAACGCTTTTGCAAAAAAATACTAGTAACTATACACGTAA
CTCTTCTATGTTCAAAAAAAAAGAAAAAAAACTTTTCTATGTTTTTACATGTAAAGTAAG
CTATGAATGTGTTGAAGCTTGAAATGAATATTGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2DC59JQ C 1
AF RR2DC59TF U 1
BS 1 638 RR2DC59TF
BS 639 639 RR2DC59JQ
BS 640 681 RR2DC59TF
BS 682 684 RR2DC59JQ
BS 685 705 RR2DC59TF
BS 706 706 RR2DC59JQ
BS 707 755 RR2DC59TF
BS 756 756 RR2DC59JQ

RD RR2DC59JQ 756 0 0
GGAATAAACCATCTTTCAAAACACTTCAAAGCAATGGCAAAGCAAATTCTCTACACCCTC
TTTCTATTCCTCTTCTTATCTACGACGATGGATCTCACCACGGCGTCCTCCGCCACAGCT
GCAGGAACTTCCAAACGCGCAGTAAACTTCATTCAAGCCTCTTGCAAATCCACCACATAC
CCGACCGTTTGCTTCAGTTCTCTCTCCAGCTACGCCAACTCCATCCAAACAAGCCCTCAA
CGTCTAGCTGAAACCGCACTCACCGTGACCGTTAGCCAGGCCAAGTCCACGAAAGTCTTC
GTCTCACGCTTGGCCCGTTTCAAGGGTCTCAAGAAACGAGAGGTTCAAGCCATTAGGGAC
TGCATCGAGGAGATCAGTGACACGGTTGACCGTTTGACCAAGTCCGTCCAAGAAGTGAAG
ATGTGTGGCCGTGCTAAGGGGCGAGACCAGTTTTGGTTCCACATGAGCAATGCTCAGACT
TGGACGAGCGCAGCTTTGACGAATGCAATCACTTGCTCCGATGGATTCGCGCGTAGGATC
ATGGATGGGCGGATCAAGAACTCGGTCCGGGCACGGATCGTGAATTTGGGCAGAGGAACC
AGCAACGCTTTAGCTTTGATTAACGCTTTTGCAAAAAAATACTAGTAACTATACACGTAA
CTCTTCTATGTTCAAAAAAAAAGAAAAAAAACTTTTTTATGTTTTTACATGTAAAGTAAG
CTATGAATGTGTTGAAGCTTGAAATGAATATTGATT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2DC59TF 755 0 0
GGAATAAACCATCTTTCAAAACACTTCAAAGCAATGGCAAAGCAAATTCTCTACACCCTC
TTTCTATTCCTCTTCTTATCTACGACGATGGATCTCACCACGGCGTCCTCCGCCACAGCT
GCAGGAACTTCCAAACGCGCAGTAAACTTCATTCAAGCCTCTTGCAAATCCACCACATAC
CCGACCGTCTGCTTCAGTTCTCTCTCCAGCTACGCCAACTCCATCCAAACAAGCCCTCAA
CGTCTAGCTGAAACCGCACTCACCGTGACCGTTAGCCAGGCCAAGTCCACGAAAGTCTTC
GTCTCACGCTTGGCCCGTTTCAAGGGTCTCAAGAAACGAGAGGTTCAAGCCATTAGGGAC
TGCATCGAGGAGATCAGTGACACGGTTGACCGTTTGACCAAGTCCGTCCAAGAAGTGAAG
ATGTGTGGCCGTGCTAAGGGGCGAGACCAGTTTTGGTTCCACATGAGCAATGCTCAGACT
TGGACGAGCGCAGCTTTGACGAATGCAATCACTTGCTCCGATGGATTCGCGCGTAGGATC
ATGGATGGGCGGATCAAGAACTCGGTCCGGGCACGGATCGTGAATTTGGGCAGAGGAACC
AGCAACGCTTTAGCTTTGATTAACGCTTTTGCAAAAAA*TACTAGTAACTATACACGTAA
CTCTTCTATGTTCAAAAAAAAG**AAAAAAACTTTTCTATGTTTT*ACATGTAAAGTAAG
CTATGAATGTGTTGAAGCTTGAAATGAATATTGAT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL6330Contig1 839 2 2 U
GGAAAATTGCGCAACTAAACCCACAAGTCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGTGTCAA
TAGAGAGAGAGAAAAATGGCGAGATTGACGGTGCTGATTGCTGCGGTGGTACTGGCTTAT
GTAGTGGTGATGCCACTGCCGGGAGTGACCGCGAAGAAGTATACCGTCGGTGACAACAAG
TTCTGGAACCCAAACATCAACTACACCATCTGGGCTCAGGGAAAGCATTTCTACCTCGGT
GACTGGCTCTATTTCGTGTTCGACAGAAACCAACACAACATTCTCGAAGTAAACAAAACC
GACTATGAAAACTGCAATTCCGACCATCCTCTCGTAAACTGGACACGTGGAGCAGGGAGA
GACGTTGTCCCTCTCAACGTGACAAAGCATTACTATCTGCTCGACGGAAAGGGTGGATGT
TACGGAGGCATGAAGCTCGCAGTTAAAGTAGAGAAGCTCCCTCCTCCACCAAAATCGGCA
CCTGTCAAGAACATTGGATCAGTCTCCGTGGTCACAGGTCTCGCTCAGTTCATGATTCCG
TTTGCCCTGTTAAGGATGTGGTAAGTGACCAATCTCACATTTTTTGGATCAAATCCAATT
TGAAAAAAAAAACCTAAAATTCTTTTTCAGGGAAAGCCTTTAAGTTAGAAATGTCCAATC
AAGTCAGTTTACTTTATTTTTGTAATGTTTGGTTTTGTTATGTTTGTGTGTTTGAATCAA
TTGTCTAAAAGGGCTGTGTACTTGTTTTATTTTGCTGAAATTAATTGTTGAACAAAGAGA
GAGAGAATGTATTATCTGGATCATGTATTATCTGGATCATGTGTGAATGAAAATCATAT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY14TF U 1
AF RR2CY14JQ C 3
BS 1 589 RR2CY14TF
BS 590 839 RR2CY14JQ

RD RR2CY14TF 589 0 0
GGAAAATTGCGCAACTAAACCCACAAGTCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGTGTCAA
TAGAGAGAGAGAAAAATGGCGAGATTGACGGTGCTGATTGCTGCGGTGGTACTGGCTTAT
GTAGTGGTGATGCCACTGCCGGGAGTGACCGCGAAGAAGTATACCGTCGGTGACAACAAG
TTCTGGAACCCAAACATCAACTACACCATCTGGGCTCAGGGAAAGCATTTCTACCTCGGT
GACTGGCTCTATTTCGTGTTCGACAGAAACCAACACAACATTCTCGAAGTAAACAAAACC
GACTATGAAAACTGCAATTCCGACCATCCTCTCGTAAACTGGACACGTGGAGCAGGGAGA
GACGTTGTCCCTCTCAACGTGACAAAGCATTACTATCTGCTCGACGGAAAGGGTGGATGT
TACGGAGGCATGAAGCTCGCAGTTAAAGTAGAGAAGCTCCCTCCTCCACCAAAATCGGCA
CCTGTCAAGAACATTGGATCAGTCTCCGTGGTCACAGGTCTCGCTCAGTTCATGATTCCG
TTTGCCCTGTTAAGGATGTGGTAAGTGACCAATCTCACATTTTTTGGAT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2CY14JQ 837 0 0
G
AAATTGCGCAACTAAACCCACAAGTCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGTGTCAATAG
AGAGAGAGAAAAATGGCGAGATTGACGGTGCTGATTGCTGCGGTGGTACTGGCTTATGTA
GTGGTGATGCCACTGCCGGGAGTGACCGCGAAGAAGTATACCGTCGGTGACAACAAGTTC
TGGAACCCAAACATCAACTACACCATCTGGGCTCAGGGAAAGCATTTCTACCTCGGTGAC
TGGCTCTATTTCGTGTTCGACAGAAACCAACACAACATTCTCGAAGTAAACAAAACCGAC
TATGAAAACTGCAATTCCGACCATCCTCTCGTAAACTGGACACGTGGAGCAGGGAGAGAC
GTTGTCCCTCTCAACGTGACAAAGCATTACTATCTGCTCGACGGAAAGGGTGGATGTTAC
GGAGGCATGAAGCTCGCAGTTAAAGTAGAGAAGCTCCCTCCTCCACCAAAATCGGCACCT
GTCAAGAACATTGGATCAGTCTCCGTGGTCACAGGTCTCGCTCAGTTCATGATTCCGTTT
GCCCTGTTAAGGATGTGGTAAGTGACCAATCTCACATTTTTTGGATCAAATCCAATTTGA
AAAAAAAAACCTAAAATTCTTTTTCAGGGAAAGCCTTTAAGTTAGAAATGTCCAATCAAG
TCAGTTTACTTTATTTTTGTAATGTTTGGTTTTGTTATGTTTGTGTGTTTGAATCAATTG
TCTAAAAGGGCTGTGTACTTGTTTTATTTTGCTGAAATTAATTGTTGAACAAAGAGAGAG
AGAATGTATTATCTGGATCATGTATTATCTGGATCATGTGTGAATGAAAATCATAT

QA 2 837 2 837
DS 



AS 1 2

CO CL6331Contig1 591 2 3 U
GGAGAGGCGTGATGGAAGAGATGCAAACTCAGAAGAAAGAAGAGGAGGAGGAAGGTCCTC
CTCCGGGATGGGAGTCTATCGTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCGATCTCCGCCGTCATCA
CCGCCGCGAACTCCACTACCCACCACCACCACCACCACCGTCGAAATTCCCGAGAAGGCG
CAAATGGTGTGTGGATCTTGCAGGCGTTTACTTTCGTATCCACGAGGAACCAAACACGTC
AAGTGCTCTTGCTGTCTGACTCTTAATCTCGTTCTTGAAGCTTACCAGGTTGGTCAGGTG
AAGTGCAGCAGTTGCGAACTGCTCCTGATGTATCCTTATGGAGCTCCATCGGTTAGATGT
TCCTCCTGCAAATCTGTCACAGACATCAGAGAAGACAACAAACGACCTCCGTGGTCTGTG
CAGCAAGGACCGCTCAAAACTTCCAGCAGTGTCCGATGAGGAGACTAGACTTAAACCGTG
TTTCCTTTTTCCAAATTTTGGATCGTTTTGATGATAAAACTGGTCATAATGTTTTAAAGA
ATAGTATAATTTAGTGAAACAAATCATCTTCAATAATCATATTGAGTTACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BS33JQ C 1
AF RR2BS33TF U 1
BS 1 140 RR2BS33TF
BS 141 141 RR2BS33JQ
BS 142 591 RR2BS33TF

RD RR2BS33JQ 591 0 0
GGAGAGGCGTGATGGAAGAGATGCAAACTCAGAAGAAAGAAGAGGAGGAGGAAGGTCCTC
CTCCGGGATGGGAGTCTATCGTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCGATCTCCGCCGTCATCA
CCGCCGCGAACTCCACTACCCACCACCACCACCACCACCGTCGAAATTCCCGAGAAGGCG
CAAATGGTGTGTGGATCTTGCAGGCGTTTACTTTCGTATCCACGAGGAACCAAACACGTC
AAGTGCTCTTGCTGTCTGACTCTTAATCTCGTTCTTGAAGCTTACCAGGTTGGTCAGGTG
AAGTGCAGCAGTTGCGAACTGCTCCTGATGTATCCTTATGGAGCTCCATCGGTTAGATGT
TCCTCCTGCAAATCTGTCACAGACATCAGAGAAGACAACAAACGACCTCCGTGGTCTGTG
CAGCAAGGACCGCTCAAAACTTCCAGCAGTGTCCGATGAGGAGACTAGACTTAAACCGTG
TTTCCTTTTTCCAAATTTTGGATCGTTTTGATGATAAAACTGGTCATAATGTTTTAAAGA
ATAGTATAATTTAGTGAAACAAATCATCTTCAATAATCATATTGAGTTACC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2BS33TF 591 0 0
GGAGAGGCGTGATGGAAGAGATGCAAACTCAGAAGAAAGAAGAGGAGGAGGAAGGTCCTC
CTCCGGGATGGGAGTCTATCGTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCGATCTCCGCCGTCATCA
CCGCCGCGAACTCCACTACC*ACCACCACCACCACCACCGTCGAAATTCCCGAGAAGGCG
CAAATGGTGTGTGGATCTTGCAGGCGTTTACTTTCGTATCCACGAGGAACCAAACACGTC
AAGTGCTCTTGCTGTCTGACTCTTAATCTCGTTCTTGAAGCTTACCAGGTTGGTCAGGTG
AAGTGCAGCAGTTGCGAACTGCTCCTGATGTATCCTTATGGAGCTCCATCGGTTAGATGT
TCCTCCTGCAAATCTGTCACAGACATCAGAGAAGACAACAAACGACCTCCGTGGTCTGTG
CAGCAAGGACCGCTCAAAACTTCCAGCAGTGTCCGATGAGGAGACTAGACTTAAACCGTG
TTTCCTTTTTCCAAATTTTGGATCGTTTTGATGATAAAACTGGTCATAATGTTTTAAAGA
ATAGTATAATTTAGTGAAACAAATCATCTTCAATAATCATATTGAGTTACC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL6332Contig1 1462 2 4 U
GGGACCTCAGACGCATAGATGAATTCTGTGCGTGATCAATCAGGTAGCCCCTATGGAGAT
ACGACAACTCCTCGTAGTCCCTTCTCTCCCTTCTCTCCATTATCTGTTGGAGACGAAAGG
CATAGAAACCTTTCGGATTCCAAAAGAGATACAACTACTACTCCTCGTAGTCCTTTCTCT
CCTTTTTCTCCATTATCTGTAGACAAAAGTCTCGCTGAGTCCAAGTTCCAGCAAGCCCTC
GCCAGTTCTGGCGCATTAGATCCACTATCCCCTGGATCACACCATGGAGGACACAAGTTC
CATGAGGTTTTCCAAATGAAACAGGGCCGTTATGATCTTCAAGCCTCAAAGATCTCTGAA
ATGATGAAATCAAGTAGCTTAGATAACGCTCCTACGCAGTCACTGCTAAGCGTTGTGAAT
GGGATTCTTGATGAAAGTATTGAAAGAAAGAACGGTGAAATCCCTCCGCGTGTGGCGTGC
TTGTTGAGAAAAGTCGTGCAAGAGATTGAGCGACGTATATCAACTCAAGCTGAACATCTA
AGAACGCAAAACAATATATTCAAAGCTCTCTTGGAGGACGAGCAAAGACCTTAATGTTTG
TGCAACTCAATCCTGATGCTACTTCATATTCAGAGTCAATGAGTACCTTAAATTCGCAGA
ACGTGTCTCTGGAGTTGAACTTGGTGCTGCAAAGAGCAGTAAAGATGGTAAAGATGCTCG
AGACTTGATGGAACAGGTAGCGTCCCTTAAGGACACAATAGCAAGGAAAGACGAAGAGAT
AGAGAGGCTTCTTTTGGTAAAGGACAGTCATCATCCTAATAGACTTCAGAAACCAATGGT
GAGGAGAAAGAGCTTTGGACAAACCGATGATATGAACTCGGAAACTGGAGAATATTCATC
ACAATCAAGACACTCCGTTACTGACGGTGAGGGTTTATCTTCTTCGGTCGAAGGAGAGTA
CGAGGAGAGGTTGAGCGAGGCTACATCTGATGCTTCTTCTATTGGAACTCAAAGATCCAC
TGATGCTGCTAAAAGACCACCAAAAATCTCAGACAGAGCTAAGTCAATGACTTCAAGGAC
AACAACGAGTGTAACGAGACCACTAGATAAACTTCGTAAAGTAGCTACAAGAACAACATC
GACCGTTGCTAAGGTTACATCAGGGTTGTCGTCATCATCAAGCATTAAGAAGACAGGCAG
TGCTTCTAGTTTGGCTAGTTTGGCCAAGTCTTCTAAACGGTGGGCGTAAACTACGTAACA
CTGCATGTTTCGTTCGGGAAACTTTACGTACGTTTTCTTCATATATTTTTTCTCATTTTC
GTCTTATATATGACTTCGACTGGGACTACAAATTTTTTCCAAATTTTTATGTGATTTATG
TAAAAACCTTGTAAATACATGAAACCTTATTACTTCAGTACAGGTTTTGTTTTTCACAAC
CAACGAAAATAACTGATTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY04TF U 1
AF RR2BY04JQ C 628
BS 1 702 RR2BY04TF
BS 703 703 RR2BY04JQ
BS 704 728 RR2BY04TF
BS 729 1462 RR2BY04JQ

RD RR2BY04TF 728 0 0
GGGACCTCAGACGCATAGATGAATTCTGTGCGTGATCAATCAGGTAGCCCCTATGGAGAT
ACGACAACTCCTCGTAGTCCCTTCTCTCCCTTCTCTCCATTATCTGTTGGAGACGAAAGG
CATAGAAACCTTTCGGATTCCAAAAGAGATACAACTACTACTCCTCGTAGTCCTTTCTCT
CCTTTTTCTCCATTATCTGTAGACAAAAGTCTCGCTGAGTCCAAGTTCCAGCAAGCCCTC
GCCAGTTCTGGCGCATTAGATCCACTATCCCCTGGATCACACCATGGAGGACACAAGTTC
CATGAGGTTTTCCAAATGAAACAGGGCCGTTATGATCTTCAAGCCTCAAAGATCTCTGAA
ATGATGAAATCAAGTAGCTTAGATAACGCTCCTACGCAGTCACTGCTAAGCGTTGTGAAT
GGGATTCTTGATGAAAGTATTGAAAGAAAGAACGGTGAAATCCCTCCGCGTGTGGCGTGC
TTGTTGAGAAAAGTCGTGCAAGAGATTGAGCGACGTATATCAACTCAAGCTGAACATCTA
AGAACGCAAAACAATATATTCAAAGCTCTCTTGGAGGACGAGCAAAGACCTTAATGTTTG
TGCAACTCAATCCTGATGCTACTTCATATTCAGAGTCAATGAGTACCTTAAATTCGCAGA
ACGTGTCTCTGGAGTTGAACTTGGTGCTGCAAAGAGCAGTAA*GATGGTAAAGATGCTCG
AGACTTGA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2BY04JQ 835 0 0
ATTCAGAGTCAATGAGTAC*TTAAATTCGCAGAACGTGTCTCTGGAGT*GAACTTGGTGC
TGCAAAGAGCAGTAAAGATGGTAAAGATGCTCGAGACTTGATGGAACAGGTAGCGTCCCT
TAAGGACACAATAGCAAGGAAAGACGAAGAGATAGAGAGGCTTCTTTTGGTAAAGGACAG
TCATCATCCTAATAGACTTCAGAAACCAATGGTGAGGAGAAAGAGCTTTGGACAAACCGA
TGATATGAACTCGGAAACTGGAGAATATTCATCACAATCAAGACACTCCGTTACTGACGG
TGAGGGTTTATCTTCTTCGGTCGAAGGAGAGTACGAGGAGAGGTTGAGCGAGGCTACATC
TGATGCTTCTTCTATTGGAACTCAAAGATCCACTGATGCTGCTAAAAGACCACCAAAAAT
CTCAGACAGAGCTAAGTCAATGACTTCAAGGACAACAACGAGTGTAACGAGACCACTAGA
TAAACTTCGTAAAGTAGCTACAAGAACAACATCGACCGTTGCTAAGGTTACATCAGGGTT
GTCGTCATCATCAAGCATTAAGAAGACAGGCAGTGCTTCTAGTTTGGCTAGTTTGGCCAA
GTCTTCTAAACGGTGGGCGTAAACTACGTAACACTGCATGTTTCGTTCGGGAAACTTTAC
GTACGTTTTCTTCATATATTTTTTCTCATTTTCGTCTTATATATGACTTCGACTGGGACT
ACAAATTTTTTCCAAATTTTTATGTGATTTATGTAAAAACCTTGTAAATACATGAAACCT
TATTACTTCAGTACAGGTTTTGTTTTTCACAACCAACGAAAATAACTGATTATAT

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 2

CO CL6333Contig1 383 2 4 U
CTAATACAACAAAGACCATTTTATTAAATACAAATTATACAACACAGTCGATAACATTAA
GCTAATTAAATGCTAGTCGAAACAAAAGTAATATTTTGCTCTTGCTCTTGGTCCGAGTTT
AACACACATGCAATTCAAGAACAAATGATATAATGACGTGCAAGACGTAAACGTATCTGG
TCCCAAGCTTCTGAGGGGAACCAGAGAGCGAGAGAGATAGAGATGATATTCTTTCAGAGT
TAACTTTAGCCCTCAAGGTAACCTTTGTTTTGCAAGTAAGAGATGATATTTTCCGCCATC
TGACGTGGCGAACAAGAATCGTTGTCCCCTGTGTGTTTCAGCACGACCTCGCAGTTCAAT
GGCGCCTCGTAAGGGTCATCGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G502JQ U 1
AF RR2FY38JQ U 6
BS 1 241 RR2G502JQ
BS 242 242 RR2FY38JQ
BS 243 279 RR2G502JQ
BS 280 383 RR2FY38JQ

RD RR2G502JQ 283 0 0
CTAATACAACAAAGACCATTTTATTAAATACAAATTATACAACACAGTCGATAACATTAA
GCTAATTAAATGCTAGTCGAAACAAAAGTAATATTTTGCTCTTGCTCTTGGTCCGAGTTT
AACACACATGCAATTCAAGAACAAATGATATAATGACGTGCAAGACGTAAACGTATCTGG
TCCCAAGCTTCTGAGGGGAACCAGAGAGCGAGAGAGATAGAGATGATATTCTTTCAGAGT
TGACTTTAGCCCTCAAGGTAACCTTTGTTTTGCAAGTAA
AAAA

QA 1 279 1 279
DS 

RD RR2FY38JQ 378 0 0
G
CAACAAAGACCATTTTATTAAATACACATTATACAACACAGTCGATAACATTAAGCTAAT
TAAATGCTAGTCGAAACAAAAGTAATATTTTGCTCTTGCTCTTGGTCCGAGTTTAACACA
CATGCAATTCAAGAACAAATGATATAATGACGTGCAAGACGTAAACGTATCTGGTCCCAA
GCTTCTGAGGGGAACCAGAGAGCGAGAGAGATAGAGATGATATTCTTTCAGAGTTAACTT
TAGCCCTCAAGGTAACCTTTGTTTTGCAAGTAAGAGATGATATTTTCCGCCATCTGACGT
GGCGAACAAGAATCGTTGTCCCCTGTGTGTTTCAGCACGACCTCGCAGTTCAATGGCGCC
TCGTAAGGGTCATCGAT

QA 2 378 2 378
DS 



AS 1 2

CO CL6334Contig1 624 2 2 U
CTTTAGAAAAATATTTTTTTATCAAACTATCAAAAACAAGAGTTATAACTTCAACCAAAA
CTAGATAAGATCTGTCACAAAAAAAAGAACGGAGATAAATTGTACTGAGCAGCAGAAAAC
AAAACAACCAGAAACAAGAAGGTACGAGTATAGTAGCTCTTCTAGTCTTCTTCCTCTCCC
TCGTTCTCAGCAATGTTGAAGTACCTCAACTCGTAGAGGTTACGGTCCTTGTTGGCCGCA
ATCACTCTAAGCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTACTTCTTTGTCAAGTACTTG
AGGTACCTCTTGGAGAATTGACCATCAGAGGTGACAGTGATCTTGTTCTTCTCACGGGTG
ATTGTGACAGAGTCACCGAGCGCACCAGCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCTCCTGAAGG
AACTTCTCGAGGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACAGGCTTCGAGCAGTCAATG
GAGAAGGACACTCCCTTCTTCTTCCCCTTTGCAACAGCTGCACCTCCACGACTCATTTTC
TTAACCTTTTCGAGATGATTCTTATTAAATCTAATATAAGGCACTGAAAAGTGTGTTCAA
TCGGATAGAGAGAGATCGTAACCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BF94TF C 1
AF RR2BF94JQ U 5
BS 1 4 RR2BF94TF
BS 5 624 RR2BF94JQ

RD RR2BF94TF 624 0 0
CTTTAGAAAAATATTTTTTTATCAAACTATCAAAAACAAGAGTTATAACTTCAACCAAAA
CTAGATAAGATCTGTCACAAAAAAAAGAACGGAGATAAATTGTACTGAGCAGCAGAAAAC
AAAACAACCAGAAACAAGAAGGTACGAGTATAGTAGCTCTTCTAGTCTTCTTCCTCTCCC
TCGTTCTCAGCAATGTTGAAGTACCTCAACTCGTAGAGGTTACGGTCCTTGTTGGCCGCA
ATCACTCTAAGCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTACTTCTTTGTCAAGTACTTG
AGGTACCTCTTGGAGAATTGACCATCAGAGGTGACAGTGATCTTGTTCTTCTCACGGGTG
ATTGTGACAGAGTCACCGAGCGCACCAGCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCTCCTGAAGG
AACTTCTCGAGGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACAGGCTTCGAGCAGTCAATG
GAGAAGGACACTCCCTTCTTCTTCCCCTTTGCAACAGCTGCACCTCCACGACTCATTTTC
TTAACCTTTTCGAGATGATTCTTATTAAATCTAATATAAGGCACTGAAAAGTGTGTTCAA
TCGGATAGAGAGAGATCGTAACCC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2BF94JQ 620 0 0
AGAAAAATATTTTTTTATCAAACTATCAAAAACAAGAGTTATAACTTCAACCAAAACTAG
ATAAGATCTGTCACAAAAAAAAGAACGGAGATAAATTGTACTGAGCAGCAGAAAACAAAA
CAACCAGAAACAAGAAGGTACGAGTATAGTAGCTCTTCTAGTCTTCTTCCTCTCCCTCGT
TCTCAGCAATGTTGAAGTACCTCAACTCGTAGAGGTTACGGTCCTTGTTGGCCGCAATCA
CTCTAAGCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTACTTCTTTGTCAAGTACTTGAGGT
ACCTCTTGGAGAATTGACCATCAGAGGTGACAGTGATCTTGTTCTTCTCACGGGTGATTG
TGACAGAGTCACCGAGCGCACCAGCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCTCCTGAAGGAACT
TCTCGAGGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACAGGCTTCGAGCAGTCAATGGAGA
AGGACACTCCCTTCTTCTTCCCCTTTGCAACAGCTGCACCTCCACGACTCATTTTCTTAA
CCTTTTCGAGATGATTCTTATTAAATCTAATATAAGGCACTGAAAAGTGTGTTCAATCGG
ATAGAGAGAGATCGTAACCC

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL6335Contig1 807 2 6 U
GGTTCTGCTCAGTCTGGTTTAGATTAATTCTGGTTCCGTTTGTGTATAAATTGCATGCAA
ATACAGGCTTACAATGCAACGATCATGTTCTCAAGAAACGCGTTTCTGGTGGATATAGTC
GGAGCTCCACCAAAGCGAGTGATGAAGCTCGACTCGATCTCGACCGGTTCGCTGTGGAAA
ACCGCAGACGTTTTGGTCTTCAACTCTTGGCATTGGTGGCTTCACACCGGCCGTAAACAA
CCTTGGGACGCAGTTGAATATGGAAATGTAACGGTTAGAGACATGGACCGATTAGTGGCG
TATGAGAAAGCCATTAGGACTTGGGCTATGTGGATCGATCGAAACATTGATCATTCTAAA
ACTAAAGTCTTTTTCCAAGGTGTCTCTCCTGACCATGCCCAGTCAAACGATTGGTCGAAT
CAAGGTGGTAATGGCAGCTGCATTGGAGAAACAAAGCCAGTTATGGGATCAAACTATCGG
GCAGGGCCACACCCAGCGGAGATGGTGGTGGAGAAAGTTATCAAGACCATGAAGAATCCG
GCACGGTTATTGGACGTGACACTAATGTCTCAATTAAGGAAAGATGGACATCCTTCGGTC
TATGGGTTCGGTGGTCACAAGACCCCGGATTGTAGCCACTGGTGTCTTGCTGGAGTCCCG
GATAGCTGGAACCAGATATTGTACTCTGAGTTGTTTCATTCTTGATTCCTGATGGATATA
AGGAGTCATGAACCTAGCTCAATTCACAATATATAATGTATGCGGCTTGGTTATTTTGAA
TGAATTATGTCTGAAGTCTTTGATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C093TF U 1
AF RR2C093JQ C 37
BS 1 660 RR2C093TF
BS 661 661 RR2C093JQ
BS 662 679 RR2C093TF
BS 680 680 RR2C093JQ
BS 681 697 RR2C093TF
BS 698 807 RR2C093JQ

RD RR2C093TF 697 0 0
GGTTCTGCTCAGTCTGGTTTAGATTAATTCTGGTTCCGTTTGTGTATAAATTGCATGCAA
ATACAGGCTTACAATGCAACGATCATGTTCTCAAGAAACGCGTTTCTGGTGGATATAGTC
GGAGCTCCACCAAAGCGAGTGATGAAGCTCGACTCGATCTCGACCGGTTCGCTGTGGAAA
ACCGCAGACGTTTTGGTCTTCAACTCTTGGCATTGGTGGCTTCACACCGGCCGTAAACAA
CCTTGGGACGCAGTTGAATATGGAAATGTAACGGTTAGAGACATGGACCGATTAGTGGCG
TATGAGAAAGCCATTAGGACTTGGGCTATGTGGATCGATCGAAACATTGATCATTCTAAA
ACTAAAGTCTTTTTCCAAGGTGTCTCTCCTGACCATGCCCAGTCAAACGATTGGTCGAAT
CAAGGTGGTAATGGCAGCTGCATTGGAGAAACAAAGCCAGTTATGGGATCAAACTATCGG
GCAGGGCCACACCCAGCGGAGATGGTGGTGGAGAAAGTTATCAAGACCATGAAGAATCCG
GCACGGTTATTGGACGTGACACTAATGTCTCAATTAAGGAAAGATGGACATCCTTCGGTC
TATGGGTTCGGTGGTCACAAGACCCCGGATTGTAGCCACTGGTGTCTTGCTGGAGTCCCG
*ATAGCTGGAACCAGATAT*GTACTCTGAGTTGTTTC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2C093JQ 771 0 0
CGTTTGTGTATAAATTGCATGCAAATACAGGCTTACAATGCAACGATCATGTTCTCAAGA
AACGCGTTTCTGGTGGATATAGTCGGAGCTCCACCAAAGCGAGTGATGAAGCTCGACTCG
ATCTCGACCGGTTCGCTGTGGAAAACCGCAGACGTTTTGGTCTTCAACTCTTGGCATTGG
TGGCTTCACACCGGCCGTAAACAACCTTGGGACGCAGTTGAATATGGAAATGTAACGGTT
AGAGACATGGACCGATTAGTGGCGTATGAGAAAGCCATTAGGACTTGGGCTATGTGGATC
GATCGAAACATTGATCATTCTAAAACTAAAGTCTTTTTCCAAGGTGTCTTTCCTGACCAT
GCCCAGTCAAACGATTGGTCGAATCAAGGTGGTAATGGCAGCTGCATTGGAGAAACAAAG
CCAGTTATGGGATCAAACTATCGGGCAGGGCCACACCCAGCGGAGATGGTGGTGGAGAAA
GTTATCAAGACCATGAAGAATCCGGCACGGTTATTGGACGTGACACTAATGTCTCAATTA
AGGAAAGATGGACATCCTTCGGTCTATGGGTTCGGTGGTCACAAGACCCCGGATTGTAGC
CACTGGTGTCTTGCTGGAGTTCCGGATAGCTGGAACCAGATATTGTACTTTGAGTTGTTT
CATTCTTGATTCCTGATGGATATAAGGAGTCATGAACCTAGCTCAATTCACAATATATAA
TGTATGCGGCTTGGTTATTTTGAATGAATTATGTCTGAAGTCTTTGATTGG

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL6336Contig1 600 2 2 U
GCTTCAACCATATATGTTCTTGCTCATATTCTAATTTAACAAAAGATAATACACAATTTA
TACAACAATATCACACCATCAGTTTTCAGTAGGGGATAAAAAGAACAAAATAAAAACATA
ACCCTTTCTTGTTCTCTCCAAAAGGGTTTTGTTTAGAAACTTTTGGAAGGAAGCCAGGCA
TTTGCCCTTTCGCTTTTCTTCTGCAAGTAGTAAGCAAAGTAAAGATAAAACAATCAAACC
TCAGCAAAAATCATTCTGTACATAGTGTGATTTCTTTCCTTCTACGTGTGAGTCACACGT
GTGACTGGTTTCTTCTCCCACTCACGCGTGAGCGCACATGTTGTTGACCGCTTCTCCTCA
GGTGAAACGCTTTTTCTGCCCTTGGAAGGATTCTGATTGCTACAACTATGACAAAAGGGA
TCCTCAAAAAACGCAAATGGTTTGTAGGCGTTTTAACCCAACATACCAATGTATGTTTTT
GAGTTTTTACCCCTTGTTATGCTTGTTCTCTCTGTAAAATAGCTAATGGGAACATCACAA
TATTCCATTTAAGACCCTTTGGTAGTAATCATACTGCCGTGTTCGCCAAGCATCTAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BK59TF C 1
AF RR2BK59JQ U 24
BS 1 23 RR2BK59TF
BS 24 600 RR2BK59JQ

RD RR2BK59TF 600 0 0
GCTTCAACCATATATGTTCTTGCTCATATTCTAATTTAACAAAAGATAATACACAATTTA
TACAACAATATCACACCATCAGTTTTCAGTAGGGGATAAAAAGAACAAAATAAAAACATA
ACCCTTTCTTGTTCTCTCCAAAAGGGTTTTGTTTAGAAACTTTTGGAAGGAAGCCAGGCA
TTTGCCCTTTCGCTTTTCTTCTGCAAGTAGTAAGCAAAGTAAAGATAAAACAATCAAACC
TCAGCAAAAATCATTCTGTACATAGTGTGATTTCTTTCCTTCTACGTGTGAGTCACACGT
GTGACTGGTTTCTTCTCCCACTCACGCGTGAGCGCACATGTTGTTGACCGCTTCTCCTCA
GGTGAAACGCTTTTTCTGCCCTTGGAAGGATTCTGATTGCTACAACTATGACAAAAGGGA
TCCTCAAAAAACGCAAATGGTTTGTAGGCGTTTTAACCCAACATACCAATGTATGTTTTT
GAGTTTTTACCCCTTGTTATGCTTGTTCTCTCTGTAAAATAGCTAATGGGAACATCACAA
TATTCCATTTAAGACCCTTTGGTAGTAATCATACTGCCGTGTTCGCCAAGCATCTAAGCC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2BK59JQ 577 0 0
TCATATTCTAATTTAACAAAAGATAATACACAATTTATACAACAATATCACACCATCAGT
TTTCAGTAGGGGATAAAAAGAACAAAATAAAAACATAACCCTTTCTTGTTCTCTCCAAAA
GGGTTTTGTTTAGAAACTTTTGGAAGGAAGCCAGGCATTTGCCCTTTCGCTTTTCTTCTG
CAAGTAGTAAGCAAAGTAAAGATAAAACAATCAAACCTCAGCAAAAATCATTCTGTACAT
AGTGTGATTTCTTTCCTTCTACGTGTGAGTCACACGTGTGACTGGTTTCTTCTCCCACTC
ACGCGTGAGCGCACATGTTGTTGACCGCTTCTCCTCAGGTGAAACGCTTTTTCTGCCCTT
GGAAGGATTCTGATTGCTACAACTATGACAAAAGGGATCCTCAAAAAACGCAAATGGTTT
GTAGGCGTTTTAACCCAACATACCAATGTATGTTTTTGAGTTTTTACCCCTTGTTATGCT
TGTTCTCTCTGTAAAATAGCTAATGGGAACATCACAATATTCCATTTAAGACCCTTTGGT
AGTAATCATACTGCCGTGTTCGCCAAGCATCTAAGCC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

CO CL6337Contig1 993 2 4 U
GGGATAAAGGCACAGAGAGATCTCGAACCCTTAGGAAGTTTACTTTGCGAGTCGGTGATT
TTTGGTTTTCCGATCAAATGATGAATAACCGGGTGGGATATAGGTTTAGTCCTACGAATG
AGGAACTGATAAACTTTTATCTGAAGAACAAAATTATGGGGCTCGTTGACGATTCGATTA
GCGAGGTCGACATCTACAGCTACGACCCAAAGCTTCTGCCTTCTTTATCGAATATCAAAT
CGAATGATCTTGTATGGTACTTCTTCTCTCGGCTTGAATATAAAAACCCGAACCTGAGGA
GGAGGAGGAGGACTACGCCTTCTGGGTTCTGGAGAGCTACTGGTAAGGATCGGACAATCA
GGGATAAGGGAGAAAATGGCACCGAGATCGGGATTCTGAAGATGTATATGTACTATGAAG
GAAGGGGTGCCGATGGAGTTCAGACTCCTTGGTTTATGCACGAGTGTCGCATCACTTGCT
TGCCTCCCGGGCAGCAGAGTACCTGTGTTATCTGCAAGATAATGTATAAGGGTCCAGATG
GAAACCTCCTGTATGGTGCTAATGAGGCTGGAACCTTCCCATCTGCTGCTAGCACAGTTA
AAAACCTCCCATCTGGTACAAGGGAAGTTGAAAACTTTTCATCTGGTTTGAATTCTATCC
GAGAAGCAACTGTTACAGAGATGGACAAGCGTCAGCAAAATCTTCCATCAGTACAAAGAC
CGGTCGTTGATTCTAAGGCTTTCAGAGCAGCTACGTTTGAAAAGATGTACAAACTTCTGC
AAAACCTTCCATCATCCGAACGAACACAGGGTAAGCTCAACTCACACGCCGCACCATAAC
ATTAAATACATGCAGTCTTGTGCCTACCCTGTGTATCTCATAATCTCAAACATTTGTTGG
ATTGTAAAGTTATTTGATTATGTGGTTTCCTTTTAAAGGGTGAAAACAATGTTTGGGTTT
TTTAAAAATAAAATGCTTCTGAATAGTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE10TF U 1
AF RR2GE10JQ C 303
BS 1 623 RR2GE10TF
BS 624 624 RR2GE10JQ
BS 625 684 RR2GE10TF
BS 685 993 RR2GE10JQ

RD RR2GE10TF 684 0 0
GGGATAAAGGCACAGAGAGATCTCGAACCCTTAGGAAGTTTACTTTGCGAGTCGGTGATT
TTTGGTTTTCCGATCAAATGATGAATAACCGGGTGGGATATAGGTTTAGTCCTACGAATG
AGGAACTGATAAACTTTTATCTGAAGAACAAAATTATGGGGCTCGTTGACGATTCGATTA
GCGAGGTCGACATCTACAGCTACGACCCAAAGCTTCTGCCTTCTTTATCGAATATCAAAT
CGAATGATCTTGTATGGTACTTCTTCTCTCGGCTTGAATATAAAAACCCGAACCTGAGGA
GGAGGAGGAGGACTACGCCTTCTGGGTTCTGGAGAGCTACTGGTAAGGATCGGACAATCA
GGGATAAGGGAGAAAATGGCACCGAGATCGGGATTCTGAAGATGTATATGTACTATGAAG
GAAGGGGTGCCGATGGAGTTCAGACTCCTTGGTTTATGCACGAGTGTCGCATCACTTGCT
TGCCTCCCGGGCAGCAGAGTACCTGTGTTATCTGCAAGATAATGTATAAGGGTCCAGATG
GAAACCTCCTGTATGGTGCTAATGAGGCTGGAACCTTCCCATCTGCTGCTAGCACAGTTA
AAAACCTCCCATCTGGTACAAGG*AAGTTGAAAACTTTTCATCTGGTTTGAATTCTATCC
GAGAAGCAACTGTTACAGAGATGG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2GE10JQ 691 0 0
AGGAGGAGGACTACGCCTTCTGGGTTCTGGAGAGCTACTGGTAAGGATCGGACAATCAGG
GATAAGGGAGAAAATGGCACCGAGATCGGGATTCTGAAGATGTATATGTACTATGAAGGA
AGGGGTGCCGATGGAGTTCAGACTCCTTGGTTTATGCACGAGTGTCGCATCACTTGCTTG
CCTCCCGGGCAGCAGAGTACCTGTGTTATCTGCAAGATAATGTATAAGGGTCCAGATGGA
AACCTCCTGTATGGTGCTAATGAGGCTGGAACCTTCCCATCTGCTGCTAGCACAGTTAAA
AACCTCCCATCTGGTACAAGGGAAGTTGAAAACTTTTCATCTGGTTTGAATTCTATCCGA
GAAGCAACTGTTACAGAGATGGACAAGCGTCAGCAAAATCTTCCATCAGTACAAAGACCG
GTCGTTGATTCTAAGGCTTTCAGAGCAGCTACGTTTGAAAAGATGTACAAACTTCTGCAA
AACCTTCCATCATCCGAACGAACACAGGGTAAGCTCAACTCACACGCCGCACCATAACAT
TAAATACATGCAGTCTTGTGCCTACCCTGTGTATCTCATAATCTCAAACATTTGTTGGAT
TGTAAAGTTATTTGATTATGTGGTTTCCTTTTAAAGGGTGAAAACAATGTTTGGGTTTTT
TAAAAATAAAATGCTTCTGAATAGTCTTTCC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL6338Contig1 572 2 2 U
GGATAACGAACTCGGTTCTTCTTGCTCCCTCTTCGATCTGCAATGGCGGACGCGTCTAAT
TCCGACAACGGCGGAGAGAAACAGACACTCAAGATCCGAAGACTGGAGATCTCGGACAAG
AGAAAGGGATACATTGAGCTTCTCGGTCAACTCACAGTCACCGGATCAGTAACCGACGAT
GAGTTCGATCAGCGTTTCGAGGAGATCACCTCCCGTGGAGACGACCATCTGATCTGCGTG
ATCGAAGACGAGTCTTCAGGAAGAATCGCGGCGACGGGGAGCGTAATGATAGAGAAGAAG
TTCCTGAGAAACTGCGGCAAAGTTGGGCACATCGAGGACGTTGTCGTGGATACAGAGTTT
CGCGGGAAACATCTCGGGAAGCAAGTGGTTGAGTTTCTATCGGATCATTGTCGAGACATG
GGTTGCTACAATGTGATTCTTGATTGTAGCGTGGAGAAGAAAGTGTTCTATGAGAAATGT
GGGTTGGTTAATAAAGGGATTCAGATGTCAAAGTACTTTTGATTGAATTCTTGTTTTTTT
CTTTGTCCTAATATAAGCTTTGGTCTGAATCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN60TF U 1
AF RR2GW73TF U 1
BS 1 531 RR2GN60TF
BS 532 572 RR2GW73TF

RD RR2GN60TF 531 0 0
GGATAACGAACTCGGTTCTTCTTGCTCCCTCTTCGATCTGCAATGGCGGACGCGTCTAAT
TCCGACAACGGCGGAGAGAAACAGACACTCAAGATCCGAAGACTGGAGATCTCGGACAAG
AGAAAGGGATACATTGAGCTTCTCGGTCAACTCACAGTCACCGGATCAGTAACCGACGAT
GAGTTCGATCAGCGTTTCGAGGAGATCACCTCCCGTGGAGACGACCATCTGATCTGCGTG
ATCGAAGACGAGTCTTCAGGAAGAATCGCGGCGACGGGGAGCGTAATGATAGAGAAGAAG
TTCCTGAGAAACTGCGGCAAAGTTGGGCACATCGAGGACGTTGTCGTGGATACAGAGTTT
CGCGGGAAACATCTCGGGAAGCAAGTGGTTGAGTTTCTATCGGATCATTGTCGAGACATG
GGTTGCTACAATGTGATTCTTGATTGTAGCGTGGAGAAGAAAGTGTTCTATGAGAAATGT
GGGTTGGTTAATAAAGGGATTCAGATGTCAAAGTACTTTTGATTGAATTCT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2GW73TF 572 0 0
GGATAACGAACTCGGTTCTTCTTGCTCCCTCTTCGATCTGCAATGGCGGACGCGTCTAAT
TCCGACAACGGCGGAGAGAAACAGACACTCAAGATCCGAAGACTGGAGATCTCGGACAAG
AGAAAGGGATACATTGAGCTTCTCGGTCAACTCACAGTCACCGGATCAGTAACCGACGAT
GAGTTCGATCAGCGTTTCGAGGAGATCACCTCCCGTGGAGACGACCATCTGATCTGCGTG
ATCGAAGACGAGTCTTCAGGAAGAATCGCGGCGACGGGGAGCGTAATGATAGAGAAGAAG
TTCCTGAGAAACTGCGGCAAAGTTGGGCACATCGAGGACGTTGTCGTGGATACAGAGTTT
CGCGGGAAACATCTCGGGAAGCAAGTGGTTGAGTTTCTATCGGATCATTGTCGAGACATG
GGTTGCTACAATGTGATTCTTGATTGTAGCGTGGAGAAGAAAGTGTTCTATGAGAAATGT
GGGTTGGTTAATAAAGGGATTCAGATGTCAAAGTACTTTTGATTGAATTCTTGTTTTTTT
CTTTGTCCTAATATAAGCTTTGGTCTGAATCT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL6339Contig1 431 2 1 U
GGGCAAGAGAAAAGAGACAGATAACAGTGCAGTTCTCAAACCTAATCCCCTTTTTGAACA
GATTCGAAGAAGAGAAAGCGGATTCACTGAGGGAGAGCAGAATGGGCAAATCATCATCTT
CCTCTAAGAAACTCAAACGCTCTAAAGAAGATCCCTCTAAGTTGCGATCGGTGAAGAAGA
AGAATAAGAAGAAGACGAAGAGAAGTAAGACTCGTCGGATTAAAGACTCTTCTGATGAGA
GTGAATCAGATTCTTCTTTCTACTCTTCTTCTTCTTCTAGTTCTGAAGATGATTACAGGA
GAGAGAAGCAGCGTAGGTCTAAACTGAGCAAGAAGAAGAAGAGGAAGTCACGTAAGAGGT
ATTCTAGCAGCAGCGACAGTGAGGATGATGACATTCGTGTTAAGAAAAGGAAGGACAAAC
ATGTCATGACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BW08JQ C 1
AF RR2BW08TF U 1
BS 1 431 RR2BW08TF

RD RR2BW08JQ 431 0 0
GGGCAAGAGAAAAGAGACAGATAACAGTGCAGTTCTCAAACCTAATCCCCTTTTTGAACA
GATTCGAAGAAGAGAAAGCGGATTCACTGAGGGAGAGCAGAATGGGCAAATCATCATCTT
CCTCTAAGAAACTCAAACGCTCTAAAGAAGATCCCTCTAAGTTGCGATCGGTGAAGAAGA
AGAATAAGAAGAAGACGAAGAGAAGTAAGACTCGTCGGATTAAAGACTCTTCTGATGAGA
GTGAATCAGATTCTTCTTTCTACTCTTCTTCTTCTTCTAGTTCTGAAGATGATTACAGGA
GAGAGAAGCAGCGTAGGTCTAAACTGAGCAAGAAGAAGAAGAGGAAGTCACGTAAGAGGT
ATTCTAGCAGCAGCGACAGTGAGGATGATGACATTCGTGTTAAGAAAAGGAAGGACAAAC
ATGTCATGACC

QA 1 431 1 431
DS 

RD RR2BW08TF 431 0 0
GGGCAAGAGAAAAGAGACAGATAACAGTGCAGTTCTCAAACCTAATCCCCTTTTTGAACA
GATTCGAAGAAGAGAAAGCGGATTCACTGAGGGAGAGCAGAATGGGCAAATCATCATCTT
CCTCTAAGAAACTCAAACGCTCTAAAGAAGATCCCTCTAAGTTGCGATCGGTGAAGAAGA
AGAATAAGAAGAAGACGAAGAGAAGTAAGACTCGTCGGATTAAAGACTCTTCTGATGAGA
GTGAATCAGATTCTTCTTTCTACTCTTCTTCTTCTTCTAGTTCTGAAGATGATTACAGGA
GAGAGAAGCAGCGTAGGTCTAAACTGAGCAAGAAGAAGAAGAGGAAGTCACGTAAGAGGT
ATTCTAGCAGCAGCGACAGTGAGGATGATGACATTCGTGTTAAGAAAAGGAAGGACAAAC
ATGTCATGACC

QA 1 431 1 431
DS 



AS 1 2

CO CL6340Contig1 704 2 1 U
ACTCGAATTGATTTTATTCTTGTAATATATGGTAAAAAAAATAGAGCTTTACAGGTAGAA
AGTACAAATACACGAACCAACAGTATATGTTTTTGTTTGTGGATCTTAAAAGAAAGAATG
CAAGCAAAACTGGACAAAATAAATATCAGCAAGAATGGGAGAAAGAAGACACATAATGCA
AAGATGATGCAATCACTCACAACATAAGCAAAAGGTAAATAAGCTTTTTTTGCTTTTCCC
TTTTTCTTAAGCTTCTTTTATCGCAGCTTTCCACTTTTGTGTTTATCCAAATGAGGAAAC
GCTTCTAGAATGTTATAAGCCCTTAAATCTTGCCTTGTCAAGATTCCTATCACAGGAGAC
ATTCCTGAAGCTTGAATCTTGGGAACAATCAGCAAATGTCTGAAACCGACTGATCGGAAA
AGCACCAAAGCCTTAGCCACTGACATACTCTGCACCACTGTGTAAGGTGTAGTGTTGGTC
AAAGGATGAAGATCAACATACATTTGCATCTCTGAGCTTGTGATTACAACATCGTCAAAA
TTGTCTTCTCTCTCAGCCAACTCCACCGCTGTGAACTTTTCTTTAACTTCCCAGTCTTCT
GTTCTTCTCTTCTCATTCAAGAACCATCTCTTTTTCAAAACTTTAACAAGATGTGCTCTC
AAGATCAACCCATGAAGCTCTGTAGCATCACCATCCAATACCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G336JQ U 22
AF RR2EH27JQ U 1
BS 1 704 RR2EH27JQ

RD RR2G336JQ 602 0 0
GTAATATATGGTAAAAAAAATAGAGCTTTACAGGTAGAAAGTACAAATACACGAACCAAC
AGTATATGTTTTTGTTTGTGGATCTTAAAAGAAAGAATGCAAGCAAAACTGGACAGAATA
AATATCAGCAAGAATGGGAGAAAGAAGACACATAATGCAAAGATGATGCAATCACTCACA
ACATAAGCAAAAGGTAAATAAGCTTTTTTTGCTTTTCCCTTTTTCTTAAGCTTCTTTTAT
CGCAGCTTTCCACTTTTGTGTTTATCCAAATGAGGAAACGCTTCTAGAATGTTATAAGCC
CTTAGATCTTGCCTTGTCAAGATTCCTATCACAGGAGACATTCCTGAAGCTTGAATCTTG
GGAACAATCAGCAAATGTCTGAGACCGACTGATCGGAAAAGCACCAAAGCCTTAGCCACT
GACATACTCTGCACCACTGTGTAAGGTGTAGTGTTGGTCAAAGGATGAAGATCAACATAC
ATTTGCATCTCTGAGCTTGTGATTGCAACATCGTCAAAATTGTCTTCTCTCTCAGCCAAC
TCCACCGCTGTGAACTTTTCTTTAACTTCCCAGTCTTCTGTTCTTCTCTTCTCATTCAAG
AA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2EH27JQ 704 0 0
ACTCGAATTGATTTTATTCTTGTAATATATGGTAAAAAAAATAGAGCTTTACAGGTAGAA
AGTACAAATACACGAACCAACAGTATATGTTTTTGTTTGTGGATCTTAAAAGAAAGAATG
CAAGCAAAACTGGACAAAATAAATATCAGCAAGAATGGGAGAAAGAAGACACATAATGCA
AAGATGATGCAATCACTCACAACATAAGCAAAAGGTAAATAAGCTTTTTTTGCTTTTCCC
TTTTTCTTAAGCTTCTTTTATCGCAGCTTTCCACTTTTGTGTTTATCCAAATGAGGAAAC
GCTTCTAGAATGTTATAAGCCCTTAAATCTTGCCTTGTCAAGATTCCTATCACAGGAGAC
ATTCCTGAAGCTTGAATCTTGGGAACAATCAGCAAATGTCTGAAACCGACTGATCGGAAA
AGCACCAAAGCCTTAGCCACTGACATACTCTGCACCACTGTGTAAGGTGTAGTGTTGGTC
AAAGGATGAAGATCAACATACATTTGCATCTCTGAGCTTGTGATTACAACATCGTCAAAA
TTGTCTTCTCTCTCAGCCAACTCCACCGCTGTGAACTTTTCTTTAACTTCCCAGTCTTCT
GTTCTTCTCTTCTCATTCAAGAACCATCTCTTTTTCAAAACTTTAACAAGATGTGCTCTC
AAGATCAACCCATGAAGCTCTGTAGCATCACCATCCAATACCGG

QA 1 704 1 704
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6342Contig1 682 2 3 U
GGACCCATCTCCTTTCTCCATAACTCTCTCACCCTCTCCTTCTACAACCAAAAGCTTTTC
TCTCTCAAGAACCCCAAAACAAATGGCTATAATGAAGAAATCTTCAAAACTCACTCAAAC
AGCAATGCTGAAGCAGATTCTGAAAAGATGTTCGAGCTTAGGGAAGAAAAATGGAGGAGG
CTACGATGAAGAGTGCCTTCCACTCGATGTACCAAAGGGACACTTCCCTGTCTATGTGGG
AGAAAACAGAAGCAGATACATTGTCCCAATCTCCTTCTTGACTCACCCTGAGTTCCAAAC
TCTTCTAAGACGAGCTGAAGAAGAGTTTGGATTCGATCACGACATGGGTCTCACCATCCC
TTGTGATGAACTCGTCTTTCAGACCCTAACCTCAATGATCCGATGATATTTTTCAGTTAA
ACCATTTGAAGAAGAAGCAGACGCTTATCTTTACAAAAAGAAAATAGCATATCTTCTCTT
ATATTAGTTTTTTGTTCTCTATTTTTAAGCCCATCATCCAGGGTTTTTTACGAGTTAATT
TACTCGTCTAACAAGAAAGAAACCCGTATGAGAAGAGGTTATATGGGTTTAGATCTGTAA
AAAGAAGCTTGTAGTGTTTTCCTCGCAGATTTTGATTCTGTGAGAGAAGTTGATTAATGC
AAGAAAGAAATATTTCTCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DM21TF U 1
AF RR2DM21JQ C 45
BS 1 357 RR2DM21TF
BS 358 358 RR2DM21JQ
BS 359 682 RR2DM21TF

RD RR2DM21TF 682 0 0
GGACCCATCTCCTTTCTCCATAACTCTCTCACCCTCTCCTTCTACAACCAAAAGCTTTTC
TCTCTCAAGAACCCCAAAACAAATGGCTATAATGAAGAAATCTTCAAAACTCACTCAAAC
AGCAATGCTGAAGCAGATTCTGAAAAGATGTTCGAGCTTAGGGAAGAAAAATGGAGGAGG
CTACGATGAAGAGTGCCTTCCACTCGATGTACCAAAGGGACACTTCCCTGTCTATGTGGG
AGAAAACAGAAGCAGATACATTGTCCCAATCTCCTTCTTGACTCACCCTGAGTTCCAAAC
TCTTCTAAGACGAGCTGAAGAAGAGTTTGGATTCGATCACGACATGGGTCTCACCATTCC
TTGTGATGAACTCGTCTTTCAGACCCTAACCTCAATGATCCGATGATATTTTTCAGTTAA
ACCATTTGAAGAAGAAGCAGACGCTTATCTTTACAAAAAGAAAATAGCATATCTTCTCTT
ATATTAGTTTTTTGTTCTCTATTTTTAAGCCCATCATCCAGGGTTTTTTACGAGTTAATT
TACTCGTCTAACAAGAAAGAAACCCGTATGAGAAGAGGTTATATGGGTTTAGATCTGTAA
AAAGAAGCTTGTAGTGTTTTCCTCGCAGATTTTGATTCTGTGAGAGAAGTTGATTAATGC
AAGAAAGAAATATTTCTCGACC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2DM21JQ 638 0 0
CAACCAAAAGCTTTTCTCTCTCAAGAACCCCAAAACAAATGGCTATAATGAAGAAATCTT
CAAAACTCACTCAAACAGCAATGCTGAAGCAGATTCTGAAAAGATGTTCGAGCTTAGGGA
AGAAAAATGGAGGAGGCTACGATGAAGAGTGCCTTCCACTCGATGTACCAAAGGGACACT
TCCCTGTCTATGTGGGAGAAAACAGAAGCAGATACATTGTCCCAATCTCCTTCTTGACTC
ACCCTGAGTTCCAAACTCTTCTAAGACGAGCTGAAGAAGAGTTTGGATTCGATCACGACA
TGGGTCTCACCATCCCTTGTGATGAACTCGTCTTTCAGACCCTAACCTCAATGATCCGAT
GATATTTTTCAGTTAAACCATTTGAAGAAGAAGCAGACGCTTATCTTTACAAAAAGAAAA
TAGCATATCTTCTCTTATATTAGTTTTTTGTTCTCTATTTTTAAGCCCATCATCCAGGGT
TTTTTACGAGTTAATTTACTCGTCTAACAAGAAAGAAACCCGTATGAGAAGAGGTTATAT
GGGTTTAGATCTGTAAAAAGAAGCTTGTAGTGTTTTCCTCGCAGATTTTGATTCTGTGAG
AGAAGTTGATTAATGCAAGAAAGAAATATTTCTCGACC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL6343Contig1 590 2 1 U
GGAGAGCAAAGATCTGGTCACAAGCACAAGACACGGATCGATGAAAAGAATAGTAAAGTT
TGAAAGCTCCATGACGAAGATGTCTGCTAAGATGCACGACGGTCTCACGACAGCGCTCCT
TCTGTTCGTTATGGTTCCGGTCGGTGAGGCGATTTGGCTAGACGTGCCTCCCTCGGGAAC
AAAGTGCGTGTCTGAAGAAATACAGAGCAATATTGTCGTCTTGGCCGATTACATCATCAT
CTCCGAGGATCATTCCATCAAACCCACTATATCCGCCAAGGTGACGTTCCCATACGGAAA
CAATCTGCACCATTCGGAAAACGTGACGCATGGAGAATTTGCATTTACGACATGAGGGAG
AGAGTGTGGAAGCCACATTGGTTCTGGAAGAGGTATATGCTTGCTGAGGATGATGACGTG
GAGAAGAGAACTGAATGAAACCATACCTGTCTTTGTGTGTTTCTTTTTCCAGTTTCTTTT
TCTTGTTGATGTTTGAATTCTTTTGTTAATTATTTTGTTTCGTGGGAACATAGAGTGTGT
AATAAGACAAACTTGTTGATTCAGGTTAGGTATTTTATCAACGAAACTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H618JQB C 1
AF RR2H618TF U 1
BS 1 590 RR2H618TF

RD RR2H618JQB 590 0 0
GGAGAGCAAAGATCTGGTCACAAGCACAAGACACGGATCGATGAAAAGAATAGTAAAGTT
TGAAAGCTCCATGACGAAGATGTCTGTTAAGATGCACGACGGTCTCACGACAGCGCTCCT
TCTGTTCGTTATGGTTCCGGTCGGTGAGGCGATTTGGCTAGACGTGCCTCCCTCGGGAAC
AAAGTGCGTGTCTGAAGAAATACAGAGCAATATTGTCGTCTTGGCCGATTACATCATCAT
CTCCGAGGATCATTCCATCAAACCCACTATATCCGCCAAGGTGACGTTCCCATACGGAAA
CAATCTGCACCATTCGGAAAACGTGACGCATGGAGAATTTGCATTTACGACATGAGGGAG
AGAGTGTGGAAGCCACATTGGTTCTGGAAGAGGTATATGCTTGCTGAGGATGATGACGTG
GAGAAGAGAACTGAATGAAACCATACCTGTCTTTGTGTGTTTCTTTTTCCAGTTTCTTTT
TCTTGTTGATGTTTGAATTCTTTTGTTAATTATTTTGTTTCGTGGGAACATAGAGTGTGT
AATAAGACAAACTTGTTGATTCAGGTTAGGTATTTTATCAACGAAACTCC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2H618TF 590 0 0
GGAGAGCAAAGATCTGGTCACAAGCACAAGACACGGATCGATGAAAAGAATAGTAAAGTT
TGAAAGCTCCATGACGAAGATGTCTGCTAAGATGCACGACGGTCTCACGACAGCGCTCCT
TCTGTTCGTTATGGTTCCGGTCGGTGAGGCGATTTGGCTAGACGTGCCTCCCTCGGGAAC
AAAGTGCGTGTCTGAAGAAATACAGAGCAATATTGTCGTCTTGGCCGATTACATCATCAT
CTCCGAGGATCATTCCATCAAACCCACTATATCCGCCAAGGTGACGTTCCCATACGGAAA
CAATCTGCACCATTCGGAAAACGTGACGCATGGAGAATTTGCATTTACGACATGAGGGAG
AGAGTGTGGAAGCCACATTGGTTCTGGAAGAGGTATATGCTTGCTGAGGATGATGACGTG
GAGAAGAGAACTGAATGAAACCATACCTGTCTTTGTGTGTTTCTTTTTCCAGTTTCTTTT
TCTTGTTGATGTTTGAATTCTTTTGTTAATTATTTTGTTTCGTGGGAACATAGAGTGTGT
AATAAGACAAACTTGTTGATTCAGGTTAGGTATTTTATCAACGAAACTCC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

CO CL6344Contig1 690 2 1 U
CATCAACGTTGTTGGGAGTCAGCAAGAATCTGATATTCGGTTTATAGACAACCCGAAAGC
TCGAAGGTTCATCAAGTCTCTTCCTTTCTCAAGGGGCACACATCTCTCCCGTCTCTACCC
GCAAGCCAATCCTCTGGCTATAGATTTGCTGCAGAGGATGCTTGTGTTTGATCCAACCAA
GAGAATCTCTGTGACTGATGCACTCTTGCACCCTTACATGGCGGGACTGTTTGACCCTGG
TTCTAATCCGCCTGCACATGTCCCGATCTCTCTGGACATAGATGAGAACATGGAGGAGCG
GATGATCAGAGAGATGATGTGGGACGAGATGTTTTATTACCACCCTGGAGCTGAAAATGC
AAACCCCTAATCATCATCATCATCATCATCATCCAGTTATCTTTTTACCTTCTTAAATGC
AGCTTTGATGTTATGTTATATAGCGAATGTTTTCATCTCGCCTGTTTCTTTAGTTGCAGT
GAGTGAGTGAGTAGTAACAAACATAATTTGAAGAACTGATTAGTATCCCTTTTCAAACTT
TGTAAATGTGAATCGTGTGAGACTGTTTTTAAGTTTAAGGCTTTTTCTTCTTCTTTATTG
TCCTTGGACCAATGAGTTTACTTCATATTTTTAGACCAGACCCTGTGTATTGTTTCAAGA
AAGTGTTATCTATTTAGAAACTTGTCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DI28TF U 1
AF RR2DI28JQ C 97
BS 1 690 RR2DI28TF

RD RR2DI28TF 690 0 0
CATCAACGTTGTTGGGAGTCAGCAAGAATCTGATATTCGGTTTATAGACAACCCGAAAGC
TCGAAGGTTCATCAAGTCTCTTCCTTTCTCAAGGGGCACACATCTCTCCCGTCTCTACCC
GCAAGCCAATCCTCTGGCTATAGATTTGCTGCAGAGGATGCTTGTGTTTGATCCAACCAA
GAGAATCTCTGTGACTGATGCACTCTTGCACCCTTACATGGCGGGACTGTTTGACCCTGG
TTCTAATCCGCCTGCACATGTCCCGATCTCTCTGGACATAGATGAGAACATGGAGGAGCG
GATGATCAGAGAGATGATGTGGGACGAGATGTTTTATTACCACCCTGGAGCTGAAAATGC
AAACCCCTAATCATCATCATCATCATCATCATCCAGTTATCTTTTTACCTTCTTAAATGC
AGCTTTGATGTTATGTTATATAGCGAATGTTTTCATCTCGCCTGTTTCTTTAGTTGCAGT
GAGTGAGTGAGTAGTAACAAACATAATTTGAAGAACTGATTAGTATCCCTTTTCAAACTT
TGTAAATGTGAATCGTGTGAGACTGTTTTTAAGTTTAAGGCTTTTTCTTCTTCTTTATTG
TCCTTGGACCAATGAGTTTACTTCATATTTTTAGACCAGACCCTGTGTATTGTTTCAAGA
AAGTGTTATCTATTTAGAAACTTGTCTTTG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2DI28JQ 594 0 0
CACACATCTCTCCCGTCTCTACCCGCAAGCCAATCCTCTGGCTATAGATTTGCTGCAGAG
GATGCTTGTGTTTGATCCAACCAAGAGAATCTCTGTGACTGATGCACTCTTGCACCCTTA
CATGGCGGGACTGTTTGACCCTGGTTCTAATCCGCCTGCACATGTCCCGATCTCTCTGGA
CATAGATGAGAACATGGAGGAGCGGATGATCAGAGAGATGATGTGGGACGAGATGTTTTA
TTACCACCCTGGAGCTGAAAATGCAAACCCCTAATCATCATCATCATCATCATCATCCAG
TTATCTTTT*ACCTTCTTAAATGCAGCTTTGATGTTATGTTATATAGCGAATGTTTTCAT
CTCGCCTGTTTCTTTAGTTGCAGTGAGTGAGTGAGTAGTAACAAACATAATTTGAAGAAC
TGATTAGTATCCCTTTTCAAACTTTGTAAATGTGAATCGTGTGAGACTGTTTTTAAGTTT
AAGGCTTTTTCTTCTTCTTTATTGTCCTTGGACCAATGAGTTTACTTCATATTTTTAGAC
CAGACCCTGTGTATTGTTTCAAGAAAGTGTTATCTATTTAGAAACTTGTCTTTG

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

CO CL6345Contig1 952 2 6 U
GGCCGATGGACAGGTAACAAGAAGTGTGGATACGGAACATGGGCAGTTAAGTCCCCAGGA
ACAGAGGACTGTTGACGCAATTGTGAAAGCAAGTACACTTCCTTTGTCAATAGTGTTAGT
CGGGGTAGGGGATGGACCATGGGACATGATGCAGGAATTTGATGATAACATACCTTCCCG
AGCTTTCGATAACTTCCAAGTAACATTACCCTCCCTTTTTCTTTCTTGTTTTTCATCTCG
TAACATAAAGATTTGATTCTTCCATTTTCCCCATCTCTCTTTTTCTTATCTGTTTATAGT
TTGTGAACTTCACTGAGATCATGTCAAAGAACAAAGAGCAGTCTCGAAAGGAGACGGAGT
TCGCACTCTCTGCTCTCATGGAGATTCCTCCACAGTACAAAGCCACCATCGAGCTTGGCC
TTTTAGGGTGACTAATTAACCAAAAAATAAATAAAAGCAAAAACTTTGAAACGGCTATGA
AATTTGTTTATCAACTTTAGTCTTCTTGTCCTCCTGGCATATTTTGCAGGCGAAGAAACG
GGAGTATCCCATAGAGAATCCCACTTCCACCTCCGGCGGTACTGCAGACTGGAGCAACAT
TCTTCAAGCCGTCAGCAATACCGAGTTATGAACCGAGTGTACCTACCTTTCCGATGGAGA
GCAAGAATATGACCAGCAGTGTGGATGACAACCAGCTATGCCCGATATGCCTGAGCAATC
CTAAAAACATGGCCTTTGGTTGCGGCCATCAGACATGTTGTGAATGCGGTCCAGGCCTTA
AGGTGTGTCCTATTTGCCGTGCACCCATCCACACCAGAATTAAGCTCTACTAAATGCACA
CAACTCTAGGCTCCATCCTCTTCAAATATATATTTCACAACTTTCTTGTTAAAAAAAACA
AAATGTTCTTTTGTTCTTTGATTGAATTCAGAAACTTAGCTGTTTTGTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW25TF U 1
AF RR2BW25JQ C 235
BS 1 726 RR2BW25TF
BS 727 727 RR2BW25JQ
BS 728 746 RR2BW25TF
BS 747 747 RR2BW25JQ
BS 748 763 RR2BW25TF
BS 764 952 RR2BW25JQ

RD RR2BW25TF 763 0 0
GGCCGATGGACAGGTAACAAGAAGTGTGGATACGGAACATGGGCAGTTAAGTCCCCAGGA
ACAGAGGACTGTTGACGCAATTGTGAAAGCAAGTACACTTCCTTTGTCAATAGTGTTAGT
CGGGGTAGGGGATGGACCATGGGACATGATGCAGGAATTTGATGATAACATACCTTCCCG
AGCTTTCGATAACTTCCAAGTAACATTACCCTCCCTTTTTCTTTCTTGTTTTTCATCTCG
TAACATAAAGATTTGATTCTTCCATTTTCCCCATCTCTCTTTTTCTTATCTGTTTATAGT
TTGTGAACTTCACTGAGATCATGTCAAAGAACAAAGAGCAGTCTCGAAAGGAGACGGAGT
TCGCACTCTCTGCTCTCATGGAGATTCCTCCACAGTACAAAGCCACCATCGAGCTTGGCC
TTTTAGGGTGACTAATTAACCAAAAAATAAATAAAAGCAAAAACTTTGAAACGGCTATGA
AATTTGTTTATCAACTTTAGTCTTCTTGTCCTCCTGGCATATTTTGCAGGCGAAGAAACG
GGAGTATCCCATAGAGAATCCCACTTCCACCTCCGGCGGTACTGCAGACTGGAGCAACAT
TCTTCAAGCCGTCAGCAATACCGAGTTATGAACCGAGTGTACCTACCTTTCCGATGGAGA
GCAAGAATATGACCAGCAGTGTGGATGACAACCAGCTATGCCCGATATGCCTGAGCAATC
CTAAAA*CATGGCCTTTGGTTGCGGC*ATCAGACATGTTGTGA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2BW25JQ 718 0 0
ATCTCGTAACATAAAGATTTGATTCTTCCATTTTCCCCATCTCTCTTTTTCTTATCTGTT
TATAGTTTGTGAACTTCACTGAGATCATGTCAAAGAACAAAGAGCAGTCTCGAAAGGAGA
CGGAGTTCGCACTCTCTGCTCTCATGGAGATTCCTCCACAGTACAAAGCCACCATCGAGC
TTGGCCTTTTAGGGTGACTAATTAACCAAAAAATAAATAAAAGCAAAAACTTTGAAACGG
CTATGAAATTTGTTTATCAACTTTAGTCTTCTTGTCCTCCTGGCATATTTTGCAGGCGAA
GAAACGGGAGTATCCCATAGAGAATCCCACTTCCACCTCCGGCGGTACTGCAGACTGGAG
CAACATTCTTCAAGCCGTCAGCAATACCGAGTTATGAACCGAGTGTACCTACCTTTCCGA
TGGAGAGCAAGAATATGACCAGCAGTGTGGATGACAACCAGCTATGCCCGATATGCCTGA
GCAATCCTAAAAACATGGCCTTTGGTTGCGGCCATCAGACATGTTGTGAATGCGGTCCAG
GCCTTAAGGTGTGTCCTATTTGCCGTGCACCCATCCACACCAGAATTAAGCTCTACTAAA
TGCACACAACTCTAGGCTCCATCCTCTTCAAATATATATTTCACAACTTTCTTGTTAAAA
AAAACAAAATGTTCTTTTGTTCTTTGATTGAATTCAGAAACTTAGCTGTTTTGTTCGC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL6346Contig1 895 2 4 U
GGACCCATTTCTTGGCTTACAACAACAACTAATAAACGTTTTTACTTTACGCTGCACTCA
ACTGCAATGGCCGCCTCAACAATGGCTATCTCCTCCCCTGCATTCGCCGGAAAGGCCGTG
AACCTTTCTCCAGCAGCATCAGATGTCCTCGGAAGCGGCCGTGTGACAATGAGGGAGACT
GTGGCCAAGCCAAAGGGACCATCAGGCAGCCCAGGAGACTACGGATGGGACACTGCTGGT
CTCTCAGCCGATCCCGAGACATTTGCAAGGAACCGTGAGCTAGAAGTTATCCACTGCAGG
TGGGCCATGCTCGGAGCCCTAGGCTGTGTCTTCCCGGAGTTGTTGGCCAGGAACGGTGTC
AAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTTGGCGACGGAGGCCTT
GACTACTTGGGAAACCCAAGCTTGGTTCACGCTCAGAGCATTTTGGCGATTTGGGCCACT
CAAGTGATCTTGATGGGAGCCGTTGAAGGTTACGGAGTGGCTGGAGATGGGCCGTTGGGA
GAGGCCGAGGACTTGCTTTACCCCGGTGGCAGCTTCGACCCATTGGGCTTGGCTACAGAC
CCAGAGGCCTTCGCGGAGTTGAAGGTGAAAGGAGATCAAGAACGGAAGATTGGCTATGTT
CTCTATGTTTGGATTCTTTGTTCAAGCTATCGTCACTGGTAAGGGACCTTTGGAGAATCT
TGCTGACCATTTGGCTGATCCAGTTAACAACAACGCATGGGCCTTCGCCACCAACTTCGT
TCCCCGAAAGTGAGCCAAGTTTTGTTTCGTAATAAGAGAAAGAGAGGTTGTTTAGATGTA
AGACTTGCAAGTCTTTGTATAATTTTACTATTTAATCAAATAACTCTTTTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR64TF U 1
AF RR2AR64JQ C 143
BS 1 704 RR2AR64TF
BS 705 705 RR2AR64JQ
BS 706 826 RR2AR64TF
BS 827 895 RR2AR64JQ

RD RR2AR64TF 826 0 0
GGACCCATTTCTTGGCTTACAACAACAACTAATAAACGTTTTTACTTTACGCTGCACTCA
ACTGCAATGGCCGCCTCAACAATGGCTATCTCCTCCCCTGCATTCGCCGGAAAGGCCGTG
AACCTTTCTCCAGCAGCATCAGATGTCCTCGGAAGCGGCCGTGTGACAATGAGGGAGACT
GTGGCCAAGCCAAAGGGACCATCAGGCAGCCCAGGAGACTACGGATGGGACACTGCTGGT
CTCTCAGCCGATCCCGAGACATTTGCAAGGAACCGTGAGCTAGAAGTTATCCACTGCAGG
TGGGCCATGCTCGGAGCCCTAGGCTGTGTCTTCCCGGAGTTGTTGGCCAGGAACGGTGTC
AAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTTGGCGACGGAGGCCTT
GACTACTTGGGAAACCCAAGCTTGGTTCACGCTCAGAGCATTTTGGCGATTTGGGCCACT
CAAGTGATCTTGATGGGAGCCGTTGAAGGTTACGGAGTGGCTGGAGATGGGCCGTTGGGA
GAGGCCGAGGACTTGCTTTACCCCGGTGGCAGCTTCGACCCATTGGGCTTGGCTACAGAC
CCAGAGGCCTTCGCGGAGTTGAAGGTGAAAGGAGATCAAGAACGGAAGATTGGCTATGTT
CTCTATGTTTGGATTCTTTGTTCAAGCTATCGTCACTGGTAAGG*ACCTTTGGAGAATCT
TGCTGACCATTTGGCTGATCCAGTTAACAACAACGCATGGGCCTTCGCCACCAACTTCGT
TCCCCGAAAGTGAGCCAAGTTTTGTTTCGTAATAAGAGAAAGAGAG

QA 1 826 1 826
DS 

RD RR2AR64JQ 753 0 0
ATGTCCTCGGAAGCGGCCGTGTGACAATGAGGGAGACTGTGGCCAAGCCAAAGGGACCAT
CAGGCAGCCCAGGAGACTACGGATGGGACACTGCTGGTCTCTCAGCCGATCCCGAGACAT
TTGCAAGGAACCGTGAGCTAGAAGTTATCCACTGCAGGTGGGCCATGCTCGGAGCCCTAG
GCTGTGTCTTCCCGGAGTTGTTGGCCAGGAACGGTGTCAAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGT
TCAAGGCCGGTTCACAGATCTTTGGCGACGGAGGCCTTGACTACTTGGGAAACCCAAGCT
TGGTTCACGCTCAGAGCATTTTGGCGATTTGGGCCACTCAAGTGATCTTGATGGGAGCCG
TTGAAGGTTACGGAGTGGCTGGAGATGGGCCGTTGGGAGAGGCCGAGGACTTGCTTTACC
CCGGTGGCAGCTTCGACCCATTGGGCTTGGCTACAGACCCAGAGGCCTTCGCGGAGTTGA
AGGTGAA*GGAGATCAAGAACGGAAGATTGGCTATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTTGTT
CAAGCTATCGTCACTGGTAAGGGACCTTTGGAGAATCTTGCTGACCATTTGGCTGATCCA
GTTAACAACAACGCATGGGCCTTCGCCACCAACTTCGTTCCCCGAAAGTGAGCCAAGTTT
TGTTTCGTAATAAGAGAAAGAGAGGTTGTTTAGATGTAAGACTTGCAAGTCTTTGTATAA
TTTTACTATTTAATCAAATAACTCTTTTTCCCC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL6347Contig1 1259 2 6 U
TTTTTAACCAGAGGCTCCTCTGTTGGATACTGGCGTGGCGACATTCGGTACTTGATGGAT
GATGTTCATGCACTGAAACCAACTGTGTTTTGCGGCGTTCCACGAGTTTACGACAAACTC
TATGCTGGTGTAATGCAAAAAATCTCGGCTGGTGGTTTGATACGCAAGAAACTCTTCGAT
TTGGCTTATAACTATAAATTGGGGAATATGAGAAAAGGATTGTCTCAAGAAGAAGCTTCT
CCTCGTCTGGACAGACTTATGTTCGATAAGATAAAAGATGCATTAGGAGGAAGAGCTCAT
ATGTTGTTATCAGGTGCAGCACCTTTACCTCGTCACGTAGAGGAGTTCTTAAGAATCATC
CCTGCCTCTAATCTCTCTCAAGGTTATGGGTTGACTGAGAGCTGTGGAGGGAGCTTCACG
ACTTTAGCAGGAGTATTTTCTATGGTGGGGACAGTGGGTGTGCCAATGCCTACGGTGGAG
GCAAGGCTAGTTTCTGTGCCGGAGATGGGCTATGAAGCTTTGTCCGGGGATGTGGCTAGA
GGAGAGATTTGTCTTAGAGGGAATTCAATGTTCTCTGGTTACCACAAAAGACAAGACCTA
ACTGATCAAGTCGTGATCAATGGATGGTTCCACACAGGAGATATTGGGGAATGGCAAGAA
GATGGATCGATGAAGATTATAGATAGGAAGAAGAACATCTTCAAGTTGTCTCAAGGTGAA
TATGTTGCTGTCGAAAGCCTCGAGAACACTTACTCAAGATGCCCTCTCATTGCTCAGATA
TGGATCTATGGAAACAGCTTCGAGTCTTTTCTGGTAGCAGTGGTTGTACCCGAGAGAAAG
GCTATTGAAGATTGGGCTAAACTTAATAACCAATCATCTCCCAATGATTTTGAATCTCTA
TGTCAAAATATCAAAGCTCAAAAATACTTCTTGGATGAGCTTAACTCTACCGCAAAGCAA
TACCAACTTAAAGGGTTTGAAATGTTAAAAGCGGTTCATTTGGAACCAAACCTTTTCGAT
ATTGAAAGAGATCTTATAACTCCAACTTTCAAGTTGAAAAGGCCACAGCTCCTCAAACAT
TACAAGGGCATAATTGATCAACTTTACACTGAAGCAAAGGCGTCCAGAGCATAGAACCGA
GTGGCTATTCATTTTCCTATGTTTTTTTAGTTGTGATATGTCAAGATTGTATTCGAATCC
TCTTATCATATATTATTCATATGATACACCTTTACATTATTTATCACCATTTACTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ25TF U 1
AF RR2GZ25JQ C 535
BS 1 637 RR2GZ25TF
BS 638 638 RR2GZ25JQ
BS 639 673 RR2GZ25TF
BS 674 674 RR2GZ25JQ
BS 675 687 RR2GZ25TF
BS 688 1259 RR2GZ25JQ

RD RR2GZ25TF 687 0 0
TTTTTAACCAGAGGCTCCTCTGTTGGATACTGGCGTGGCGACATTCGGTACTTGATGGAT
GATGTTCATGCACTGAAACCAACTGTGTTTTGCGGCGTTCCACGAGTTTACGACAAACTC
TATGCTGGTGTAATGCAAAAAATCTCGGCTGGTGGTTTGATACGCAAGAAACTCTTCGAT
TTGGCTTATAACTATAAATTGGGGAATATGAGAAAAGGATTGTCTCAAGAAGAAGCTTCT
CCTCGTCTGGACAGACTTATGTTCGATAAGATAAAAGATGCATTAGGAGGAAGAGCTCAT
ATGTTGTTATCAGGTGCAGCACCTTTACCTCGTCACGTAGAGGAGTTCTTAAGAATCATC
CCTGCCTCTAATCTCTCTCAAGGTTATGGGTTGACTGAGAGCTGTGGAGGGAGCTTCACG
ACTTTAGCAGGAGTATTTTCTATGGTGGGGACAGTGGGTGTGCCAATGCCTACGGTGGAG
GCAAGGCTAGTTTCTGTGCCGGAGATGGGCTATGAAGCTTTGTCCGGGGATGTGGCTAGA
GGAGAGATTTGTCTTAGAGGGAATTCAATGTTCTCTGGTTACCACAAAAGACAAGACCTA
ACTGATCAAGTCGTGATCAATGGATGGTTCCACACAG*AGATATTGGGGAATGGCAAGAA
GATGGATCGATGA*GATTATAGATAGG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2GZ25JQ 725 0 0
GCTAGAGGAGAGATTTGTCTTAGAGGGAATTCAATGTTCTCTGGTTACCACAAAAGACAA
GACCTAACTGATCAAGTCGTGATCAATGGATGGTTCCACACAGGAGATATTGGGGAATGG
CAAGAAGATGGATCGATGAAGATTATAGATAGGAAGAAGAACATCTTCAAGTTGTCTCAA
GGTGAATATGTTGCTGTCGAAAGCCTCGAGAACACTTACTCAAGATGCCCTCTCATTGCT
CAGATATGGATCTATGGAAACAGCTTCGAGTCTTTTCTGGTAGCAGTGGTTGTACCCGAG
AGAAAGGCTATTGAAGATTGGGCTAAACTTAATAACCAATCATCTCCCAATGATTTTGAA
TCTCTATGTCAAAATATCAAAGCTCAAAAATACTTCTTGGATGAGCTTAACTCTACCGCA
AAGCAATACCAACTTAAAGGGTTTGAAATGTTAAAAGCGGTTCATTTGGAACCAAACCTT
TTCGATATTGAAAGAGATCTTATAACTCCAACTTTCAAGTTGAAAAGGCCACAGCTCCTC
AAACATTACAAGGGCATAATTGATCAACTTTACACTGAAGCAAAGGCGTCCAGAGCATAG
AACCGAGTGGCTATTCATTTTCCTATGTTTTTTTAGTTGTGATATGTCAAGATTGTATTC
GAATCCTCTTATCATATATTATTCATATGATACACCTTTACATTATTTATCACCATTTAC
TTGAG

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL6348Contig1 1061 2 2 U
GGTGGTCTAAGCTATATTTCATACAGATTGTTTTGGTTGGAGTTTCGTCGGTGATGGTGT
TTCTGTCAACAAAGCACCGAACACAGAATCAAGAATTACATTCGTCACACCAGTTCATAA
ACTGGTTAGTTGCCGGTTCTTCGATGGTTCTTCCGTTGTTTTCAGGAAATGGCATCCTTT
CACGTCTAAGTTCAATATTTCTTGGTTTTGCGCCTCCATTCCTTCTTCTCTCTATTGGAT
ATGAAGCTGTCTTTTACAGTGCTCTTGCCGTTGTACTAATGGCATGGATATTATTTGAGA
ACGCTTCTCATCATTCTAGCAAAGCAAAAGATTCATCTCCATCAGAACAAAACACAGAGG
AACATGTCACTATTGGAAGTGAGGAGAGATACTTGCAGCTATCAGATGTGCGGATTCCTT
TGATTTTTATGGTTTTGTTCAATGTGGCTTTCTTTGGAACTGGGAATTTTGCAAGTATAG
CAAGTTTTGAGATATCATCCGTCTACCGGTTCATCACAATCTTCAGCCCCTTTCTGATGG
CAGCACTTCTTATATTCAAGCCCTTCATACCGTTCATGCTTGTCATATGTGCGTTCAGTG
CAATAACGAAATTAGTTAGAGTGCCAAGACTGGGATGTTACTTCCTTGTGATCTTATTTT
CAGACACAATGACGATACATTTCTTCTTCCTGGTGAAAAACACAGGAAGCTGGATGGAGA
TAGGGAATAGCATAAGCCATTTTGGGATAGTGAGTGCTCAAGTGGTCTTTGTGCTTTTAC
TCTTTGCGCTCACAAACGTCTACACCAGAACCATCCGAGTCAAGCCGCTCTCTTCCTCCC
CTTCTCTCAAAACGCTTTGAGATATGTGTAGCAAATCAAATCTTAGTTAGAGCGGTTCGA
TCAGGAGATTAGTTTATGTTATATCGTTTGCTCTATGAATATGAAGTTTTGTTTCAATCC
ATTTCGAGTTTTAGAGGAAACTTATAGAATATTCTCTTCATTCAGGTTTTATAGTATTTT
GATAAACTAACATCTGATAAATTGATTCAAACATTTTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G584TF U 1
AF RR2G584JQ C 424
BS 1 559 RR2G584TF
BS 560 1061 RR2G584JQ

RD RR2G584TF 559 0 0
GGTGGTCTAAGCTATATTTCATACAGATTGTTTTGGTTGGAGTTTCGTCGGTGATGGTGT
TTCTGTCAACAAAGCACCGAACACAGAATCAAGAATTACATTCGTCACACCAGTTCATAA
ACTGGTTAGTTGCCGGTTCTTCGATGGTTCTTCCGTTGTTTTCAGGAAATGGCATCCTTT
CACGTCTAAGTTCAATATTTCTTGGTTTTGCGCCTCCATTCCTTCTTCTCTCTATTGGAT
ATGAAGCTGTCTTTTACAGTGCTCTTGCCGTTGTACTAATGGCATGGATATTATTTGAGA
ACGCTTCTCATCATTCTAGCAAAGCAAAAGATTCATCTCCATCAGAACAAAACACAGAGG
AACATGTCACTATTGGAAGTGAGGAGAGATACTTGCAGCTATCAGATGTGCGGATTCCTT
TGATTTTTATGGTTTTGTTCAATGTGGCTTTCTTTGGAACTGGGAATTTTGCAAGTATAG
CAAGTTTTGAGATATCATCCGTCTACCGGTTCATCACAATCTTCAGCCCCTTTCTGATGG
CAGCACTTCTTATATTCAA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2G584JQ 638 0 0
TTTTTATGGTTTTGTTCAATGTGGCTTTCTTTGGAACTGGGAATTTTGCAAGTATAGCAA
GTTTTGAGATATCATCCGTCTACCGGTTCATCACAATCTTCAGCCCCTTTCTGATGGCAG
CACTTCTTATATTCAAGCCCTTCATACCGTTCATGCTTGTCATATGTGCGTTCAGTGCAA
TAACGAAATTAGTTAGAGTGCCAAGACTGGGATGTTACTTCCTTGTGATCTTATTTTCAG
ACACAATGACGATACATTTCTTCTTCCTGGTGAAAAACACAGGAAGCTGGATGGAGATAG
GGAATAGCATAAGCCATTTTGGGATAGTGAGTGCTCAAGTGGTCTTTGTGCTTTTACTCT
TTGCGCTCACAAACGTCTACACCAGAACCATCCGAGTCAAGCCGCTCTCTTCCTCCCCTT
CTCTCAAAACGCTTTGAGATATGTGTAGCAAATCAAATCTTAGTTAGAGCGGTTCGATCA
GGAGATTAGTTTATGTTATATCGTTTGCTCTATGAATATGAAGTTTTGTTTCAATCCATT
TCGAGTTTTAGAGGAAACTTATAGAATATTCTCTTCATTCAGGTTTTATAGTATTTTGAT
AAACTAACATCTGATAAATTGATTCAAACATTTTTCTG

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL6349Contig1 987 2 2 U
GGAAAACTTCAAAGGAAACCAGTGAGCTCAAGAAGAGTCTCTCTACCTTTCTCCATATTT
CTCCTCTTCATTCAGATTCTTTCCTATAATCTTGCGTTTCTTGATTCTTGACTATGACAC
TAAGCAAGGGATCTCATCTAATGATCCGAAAGTTGTCGGAGATGTTGGTTCCGGGAAGAA
GATCTGCTACCAAACGGGAAGATTCCTCGGCGAGTCCGAGGAGTCCGTTAGATATGAAAT
TCCCCTCCCCGGTTACCTCGAAACGGTACAGCTCCGGTGGTATCGGTTTAGGTATCGTCG
CTGCGTTGGAGGAAAGTAACCGGTACGATCCGGTTTGCTACTCCGGGAGATTCCGGTGCC
CGGAGATCGATCTGTCGGATGAGGAATACACTTACGTGACTAGCCCTGGTGGGCCTACCA
AAGTGTATTACAGTGACGATGGGTTTGAACTGTTTGAAAATGGGTCGGAGTATGATGATC
GGAGAAAGCATAAACCGTTGGTTAACCCCGTTGAACCACCGGTTATTAAGAGAGAGGTTT
TTAAGGAATCGACAGAGTTTCTGAGCGCGTGTTGCTTGTGTAAGAAGAGACTTCAAGGCA
AAGACATATACATGTACAAAGGAGAGATAGGATTCTGCAGTGCAGAGTGCAGATCAGTGC
AGATAATGCAGGACGAACGAAATGAGAAATGTAAATCGCAAATCTCCATAAACGTCGACA
TTTCAAGCTCTCCTTGTGCCGGCGAGCAGAGTAACTCCGCCGGGATATTCATATTTTAGG
ATGAGCAAAATCGTTCGAAGAGAAGTACATTGACATAAAAAAAGTCGTCATTATTCAATA
GTACCTTCAAAGTTTTAATAAGAAAAGAAAAAAAGATTGAAAATTTTGGTTAGGTTGTAA
GCAACTTGTATAGAAGCTTTGCTTTTGGTTTTGATTAAGGTTTATATGTATTAAAATAAA
TCAATAGAAGTGTTTGTTGGTTCTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B740TF U 1
AF RR2B740JQ C 171
BS 1 759 RR2B740TF
BS 760 987 RR2B740JQ

RD RR2B740TF 759 0 0
GGAAAACTTCAAAGGAAACCAGTGAGCTCAAGAAGAGTCTCTCTACCTTTCTCCATATTT
CTCCTCTTCATTCAGATTCTTTCCTATAATCTTGCGTTTCTTGATTCTTGACTATGACAC
TAAGCAAGGGATCTCATCTAATGATCCGAAAGTTGTCGGAGATGTTGGTTCCGGGAAGAA
GATCTGCTACCAAACGGGAAGATTCCTCGGCGAGTCCGAGGAGTCCGTTAGATATGAAAT
TCCCCTCCCCGGTTACCTCGAAACGGTACAGCTCCGGTGGTATCGGTTTAGGTATCGTCG
CTGCGTTGGAGGAAAGTAACCGGTACGATCCGGTTTGCTACTCCGGGAGATTCCGGTGCC
CGGAGATCGATCTGTCGGATGAGGAATACACTTACGTGACTAGCCCTGGTGGGCCTACCA
AAGTGTATTACAGTGACGATGGGTTTGAACTGTTTGAAAATGGGTCGGAGTATGATGATC
GGAGAAAGCATAAACCGTTGGTTAACCCCGTTGAACCACCGGTTATTAAGAGAGAGGTTT
TTAAGGAATCGACAGAGTTTCTGAGCGCGTGTTGCTTGTGTAAGAAGAGACTTCAAGGCA
AAGACATATACATGTACAAAGGAGAGATAGGATTCTGCAGTGCAGAGTGCAGATCAGTGC
AGATAATGCAGGACGAACGAAATGAGAAATGTAAATCGCAAATCTCCATAAACGTCGACA
TTTCAAGCTCTCCTTGTGCCGGCGAGCAGAGTAACTCCG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2B740JQ 817 0 0
CCGGGAAGAAGATCTGCTACCAAACGGGAAGATTCCTCGGCGAGTCCGAGGAGTCCGTTA
GATATGAAATTCCCCTCCCCGGTTACCTCGAAACGGTACAGCTCCGGTGGTATCGGTTTA
GGTATCGTCGCTGCGTTGGAGGAAAGTAACCGGTACGATCCGGTTTGCTACTCCGGGAGA
TTCCGGTGCCCGGAGATCGATCTGTCGGATGAGGAATACACTTACGTGACTAGCCCTGGT
GGGCCTACCAAAGTGTATTACAGTGACGATGGGTTTGAACTGTTTGAAAATGGGTCGGAG
TATGATGATCGGAGAAAGCATAAACCGTTGGTTAACCCCGTTGAACCACCGGTTATTAAG
AGAGAGGTTTTTAAGGAATCGACAGAGTTTTTGAGCGCGTGTTGCTTGTGTAAGAAGAGA
CTTCAAGGCAAAGACATATACATGTACAAAGGAGAGATAGGATTTTGCAGTGCAGAGTGC
AGATCAGTGCAGATAATGCAGGACGAACGAAATGAGAAATGTAAATCGCAAATCTCCATA
AACGTCGACATTTCAAGCTCTCCTTGTGCCGGCGAGCAGAGTAACTCCGCCGGGATATTC
ATATTTTAGGATGAGCAAAATCGTTCGAAGAGAAGTACATTGACATAAAAAAAGTCGTCA
TTATTCAATAGTACCTTCAAAGTTTTAATAAGAAAAGAAAAAAAGATTGAAAATTTTGGT
TAGGTTGTAAGCAACTTGTATAGAAGCTTTGCTTTTGGTTTTGATTAAGGTTTATATGTA
TTAAAATAAATCAATAGAAGTGTTTGTTGGTTCTTGG

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

CO CL6350Contig1 906 2 6 U
GGGCGTCGGCTCGGCGTCCAAGGAATCGAGATTAGGAAGGCGGAGCAGCTTCTCACCGTC
TCATCTCTCATAATCCCTGGCGGCGAGAGCACCACCATGGCCAAACTCGCCGAGTACCAT
AACCTGTTCCCGGCTCTACGTGAGTTTGTAAAGACGGGGAAACCTGTTTGGGGGACATGC
GCTGGTCTTATCTTCTTGGCAGACAGAGCCGTTGGTCAGAAAGAGGGAGGTCAAGAACTA
GTTGGTGGTCTTGATTGCACCGTGCATAGGAACTTCTTTGGCAGCCAGATTCAAAGTTTT
GAAGCTGATATCTCAGTACCTCTACTAACATCTAAAGAAGGTGGGCCGGAGACGTACCGA
GGAGTCTTCATACGTGCTCCAGCTGTTCTCGACGTTGGCCCTGATGTCGAAGTCTTGGCG
CATTATCCCGTCCCATCAAACAAGGTCTTGTATTCAAGCTCCACTGTCCAAATCCAAGAG
GAAGATGCTGTTCCAGAAACGAACGTCATTGTTGCTGTGAAGCGAAGAAACTTGTTAGCG
ACTGCGTTTCATCCCGAGTTAACCGCAGACACACGATGGCACAGTTATTTCATGAAGATG
GCGAAAGAGGTCGAAGAAGGAGCTTCTTCAAGCAGTAGTGGAACGATTGTTTCTATTGGA
GAAACCAGCGTTGGTACCGAGCAACCTAAGCCTGATATTCCTATATATCAGTAACTAAAA
TGAGAGAGAAGAGACTAATTTCTCTTGAAATAAATGAAAAAAAGAAAACTATAGAAAAAG
TGTCAGATTCTTTTTGATGTTTTGGAAAGAAAATGTCAATCTAGTTTGCATTTTTGAGCA
CACAAGCAAATTTCACAGTGAGCCATGTACTTGTTTTCTTGACACAACTTTGTATACCGT
TGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2G778TF U 1
AF RR2G778JQ C 135
BS 1 609 RR2G778TF
BS 610 610 RR2G778JQ
BS 611 619 RR2G778TF
BS 620 620 RR2G778JQ
BS 621 713 RR2G778TF
BS 714 906 RR2G778JQ

RD RR2G778TF 713 0 0
GGGCGTCGGCTCGGCGTCCAAGGAATCGAGATTAGGAAGGCGGAGCAGCTTCTCACCGTC
TCATCTCTCATAATCCCTGGCGGCGAGAGCACCACCATGGCCAAACTCGCCGAGTACCAT
AACCTGTTCCCGGCTCTACGTGAGTTTGTAAAGACGGGGAAACCTGTTTGGGGGACATGC
GCTGGTCTTATCTTCTTGGCAGACAGAGCCGTTGGTCAGAAAGAGGGAGGTCAAGAACTA
GTTGGTGGTCTTGATTGCACCGTGCATAGGAACTTCTTTGGCAGCCAGATTCAAAGTTTT
GAAGCTGATATCTCAGTACCTCTACTAACATCTAAAGAAGGTGGGCCGGAGACGTACCGA
GGAGTCTTCATACGTGCTCCAGCTGTTCTCGACGTTGGCCCTGATGTCGAAGTCTTGGCG
CATTATCCCGTCCCATCAAACAAGGTCTTGTATTCAAGCTCCACTGTCCAAATCCAAGAG
GAAGATGCTGTTCCAGAAACGAACGTCATTGTTGCTGTGAAGCGAAGAAACTTGTTAGCG
ACTGCGTTTCATCCCGAGTTAACCGCAGACACACGATGGCACAGTTATTTCATGAAGATG
GCGAAAGAG*TCGAAGAAG*AGCTTCTTCAAGCAGTAGTGGAACGATTGTTTCTATTGGA
GAAACCAGCGTTGGTACCGAGCAACCTAAGCCTGATATTCCTATATATCAGTA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2G778JQ 772 0 0
TCTACGTGAGTTTGTAAAGACGGGGAAACCTGTTTGGGGGACATGCGCTGGTCTTATCTT
CTTGGCAGACAGAGCCGTTGGTCAGAAAGAGGGAGGTCAAGAACTAGTTGGTGGTCTTGA
TTGCACCGTGCATAGGAACTTCTTTGGCAGCCAGATTCAAAGTTTTGAAGCTGATATCTC
AGTACCTCTACTAACATCTAAAGAAGGTGGGCCGGAGACGTACCGAGGAGTCTTCATACG
TGCTCCAGCTGTTCTCGACGTTGGCCCTGATGTCGAAGTCTTGGCGCATTATCCCGTCCC
ATCAAACAAGGTCTTGTATTCAAGCTCCACTGTCCAAATCCAAGAGGAAGATGCTGTTCC
AGAAACGAACGTCATTGTTGCTGTGAAGCGAAGAAACTTGTTAGCGACTGCGTTTCATCC
CGAGTTAACCGCAGACACACGATGGCACAGTTATTTCATGAAGATGGCGAAAGAGGTCGA
AGAAGGAGCTTCTTCAAGCAGTAGTGGAACGATTGTTTCTATTGGAGAAACCAGCGTTGG
TACCGAGCAACCTAAGCCTGATATTCCTATATATCAGTAACTAAAATGAGAGAGAAGAGA
CTAATTTCTCTTGAAATAAATGAAAAAAAGAAAACTATAGAAAAAGTGTCAGATTCTTTT
TGATGTTTTGGAAAGAAAATGTCAATCTAGTTTGCATTTTTGAGCACACAAGCAAATTTC
ACAGTGAGCCATGTACTTGTTTTCTTGACACAACTTTGTATACCGTTGAAGC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL6351Contig1 589 2 1 U
GGAGGGGGAATGAATGTTGGTGGTTATGGAGGTATGAACCAAAACCAACCAATGGGTGGT
ATGGGAATGAGACCAGGCATGAACCAAAACCAACCAATGGGTGGTATGGGAATGGGACCA
GGCATGAACCAGAACCAAAACCAACCGATGGGTGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAAC
ATGGGAGGATATGGCCAAGGCTATCCGATGCAGCAACCACAAAACCCTGGTCAAAACATG
CCAGGCAACAACAACAATTATAATCCGATGATGGGTCAAGGCGGTTACAACCATCAACAA
TCCTATGGTGGTGGATACAGGTGAGATGAAGCCAAACCATTACACATTAGACTACTCTCC
ACTTGTAAAATCAAGAACTGAGCACACTCTGTCTCTGTTCCTCTCTCTCTTTGCTTGTTG
TGAAATTTGTGCTGGTGAGAGTGGCAGACCTCCCTCTGGTCTGTCTGTCTTTTTTGTTAT
ATGCGTATTATAAATTTGATATATACACATTTTCTTCTTTATTTTTGGGTTTCACGTATT
AAATGTGTAAAACAATTTTATTCACGGAACAAATAAAAATATTTACTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BJ85JQ C 1
AF RR2BJ85TF U 1
BS 1 589 RR2BJ85TF

RD RR2BJ85JQ 589 0 0
GGAGGGGGAATGAATGTTGGTGGTTATGGAGGTATGAACCAAAACCAACCAATGGGTGGT
ATGGGAATGAGACCAGGCATGAACCAAAACCAACCAATGGGTGGTATGGGAATGGGACCA
GGCATGAACCAGAACCAAAACCAACCGATGGGTGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAAC
ATGGGAGGATATGGCCAAGGCTATCCGATGCAGCAACCACAAAACCCTGGTCAAAACATG
CCAGGCAACAACAACAATTATAATCCGATGATGGGTCAAGGCGGTTACAACCATCAACAA
TCCTATGGTGGTGGATACAGGTGAGATGAAGCCAAACCATTACACATTAGACTACTCTCC
ACTTGTAAAATCAAGAACTGAGCACACTCTGTCTCTGTTCCTCTCTCTCTTTGCTTGTTG
TGAAATTTGTGCTGGTGAGAGTGGCAGACCTCCCTCTGGTCTGTCTGTCTTTTTTGTTAT
ATGCGTATTATAAATTTGATATATACACATTTTCTTCTTTATTTTTGGGTTTCACGTATT
AAATGTGTAAAACAATTTTATTCACGGAACAAATAAAAATATTTACTTT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2BJ85TF 589 0 0
GGAGGGGGAATGAATGTTGGTGGTTATGGAGGTATGAACCAAAACCAACCAATGGGTGGT
ATGGGAATGAGACCAGGCATGAACCAAAACCAACCAATGGGTGGTATGGGAATGGGACCA
GGCATGAACCAGAACCAAAACCAACCGATGGGTGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAAC
ATGGGAGGATATGGCCAAGGCTATCCGATGCAGCAACCACAAAACCCTGGTCAAAACATG
CCAGGCAACAACAACAATTATAATCCGATGATGGGTCAAGGCGGTTACAACCATCAACAA
TCCTATGGTGGTGGATACAGGTGAGATGAAGCCAAACCATTACACATTAGACTACTCTCC
ACTTGTAAAATCAAGAACTGAGCACACTCTGTCTCTGTTCCTCTCTCTCTTTGCTTGTTG
TGAAATTTGTGCTGGTGAGAGTGGCAGACCTCCCTCTGGTCTGTCTGTCTTTTTTGTTAT
ATGCGTATTATAAATTTGATATATACACATTTTCTTCTTTATTTTTGGGTTTCACGTATT
AAATGTGTAAAACAATTTTATTCACGGAACAAATAAAAATATTTACTTT

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL6352Contig1 529 2 1 U
GGCCCTCATCGAAGTCTTGTAAACTCTCTGATTTCCTTTCTAGTTTCTACATCCATCGAG
ACTAATGGGAGAAGGCAAAACGCTTCCTACTTATTTCTGCAGAAACTGTGAAAATCCACT
AGCTCTCGGTGAAGATCTCATCTCCAAAAAATTTGTGGGAGCTTCAGGGCCAGCGTTTAT
GTTTTCGCATGCGATGAACGTGGTGATTGGACCGAAGATCGAGAGGAAACTAATAACCGG
ATCCTACGTGGTGGCAGATGTGATGTGTGGTAATTGTGGTGAGACGTTGGGTTGGAAGTA
TGTGGAGACCTTCCATCTTAAACAGAGGTATAAAGAAGGCATGTTTGTGATCGAGAAGCT
CAAGTTGACCAAAAAGCTTTAGTCAAGGAAAGTGATGATCATGTGTGTATCCTTGTTTAT
AAATGTGAATAAATTGGTTGTTAATATGAGAACCCTCTTACTTGCTTATTGTTCTAGTCC
AACTGAAAAAAAAGTTAAAAGTTTACTCTCGACCGTAATGGTCATGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FD45TF U 1
AF RR2FD45JQ C 12
BS 1 529 RR2FD45TF

RD RR2FD45TF 529 0 0
GGCCCTCATCGAAGTCTTGTAAACTCTCTGATTTCCTTTCTAGTTTCTACATCCATCGAG
ACTAATGGGAGAAGGCAAAACGCTTCCTACTTATTTCTGCAGAAACTGTGAAAATCCACT
AGCTCTCGGTGAAGATCTCATCTCCAAAAAATTTGTGGGAGCTTCAGGGCCAGCGTTTAT
GTTTTCGCATGCGATGAACGTGGTGATTGGACCGAAGATCGAGAGGAAACTAATAACCGG
ATCCTACGTGGTGGCAGATGTGATGTGTGGTAATTGTGGTGAGACGTTGGGTTGGAAGTA
TGTGGAGACCTTCCATCTTAAACAGAGGTATAAAGAAGGCATGTTTGTGATCGAGAAGCT
CAAGTTGACCAAAAAGCTTTAGTCAAGGAAAGTGATGATCATGTGTGTATCCTTGTTTAT
AAATGTGAATAAATTGGTTGTTAATATGAGAACCCTCTTACTTGCTTATTGTTCTAGTCC
AACTGAAAAAAAAGTTAAAAGTTTACTCTCGACCGTAATGGTCATGACC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2FD45JQ 518 0 0
AAGTCTTGTAAACTCTCTGATTTCCTTTCTAGTTTCTACATCCATCGAGACTAATGGGAG
AAGGCAAAACGCTTCCTACTTATTTCTGCAGAAACTGTGAAAATCCACTAGCTCTCGGTG
AAGATCTCATCTCCAAAAAATTTGTGGGAGCTTCAGGGCCAGCGTTTATGTTTTCGCATG
CGATGAACGTGGTGATTGGACCGAAGATCGAGAGGAAACTAATAACCGGATCCTACGTGG
TGGCAGATGTGATGTGTGGTAATTGTGGTGAGACGTTGGGTTGGAAGTATGTGGAGACCT
TCCATCTTAAACAGAGGTATAAAGAAGGCATGTTTGTGATCGAGAAGCTCAAGTTGACCA
AAAAGCTTTAGTCAAGGAAAGTGATGATCATGTGTGTATCCTTGTTTATAAATGTGAATA
AATTGGTTGTTAATATGAGAACCCTCTTACTTGCTTATTGTTCTAGTCCAACTGAAAAAA
AAGTTAAAAGTTTACTCTCGACCGTAATGGTCATGACC

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

CO CL6353Contig1 589 2 1 U
GGGAGTTAGGGTTTGGTTCTTCACAGAGAAGCCTTCCTTCATCGTCTCTTTCTATCAAAT
TTCATCGTTTCTGAGAAAGGAGAAGTTTTTATTTATTTTATTTCAAGTAAGGTTCAATGG
AAGGGATCACGGAAGGCGTTAACAGTATGAGCCTAGGCGTTGATACGCAGAAGAAGAATC
GGATTCAGGTTTCCCACACCAAGAAACCGTTGTTCTTCTACGTCAATCTCGCCAAGAGGT
ACATGCAGCAGTACACAGATGTTGAAAAGAAGATCATGACTTCGACTGTGGATATCAAAG
ATGATTCAAGGGGACGCCCTGTGCAGAAAGCCAAGATTGAGATAACGCTAGCCAAGTCTG
AGAAGTTTGATGAGTTAATGGCTGCAGCCAGTGAGGAGAAGGAGGCTGCGGAAGCCCAAG
GGCAGAGCTGAGATATCTTTTTCCATGTCTCTCTTTCTTAATGTTGTAAACACTTTGATT
CCGTTAATTTTTGGCTCATTTTGAATGTCAACTTCAATTTTGTCTTCTCTGCACCTGTGA
AAGTTTTTTGTTTTGAGTATCGTATTACGTCTAGAAAAGATTTTGGCAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GN69JQ C 1
AF RR2GN69TF U 1
BS 1 589 RR2GN69TF

RD RR2GN69JQ 589 0 0
GGGAGTTAGGGTTTGGTTCTTCACAGAGAAGCCTTCCTTCATCGTCTCTTTCTATCAAAT
TTCATCGTTTCTGAGAAAGGAGAAGTTTTTATTTATTTTATTTCAAGTAAGGTTCAATGG
AAGGGATCACGGAAGGCGTTAACAGTATGAGCCTAGGCGTTGATACGCAGAAGAAGAATC
GGATTCAGGTTTCCCACACCAAGAAACCGTTGTTCTTCTACGTCAATCTCGCCAAGAGGT
ACATGCAGCAGTACACAGATGTTGAAAAGAAGATCATGACTTCGACTGTGGATATCAAAG
ATGATTCAAGGGGACGCCCTGTGCAGAAAGCCAAGATTGAGATAACGCTAGCCAAGTCTG
AGAAGTTTGATGAGTTAATGGCTGCAGCCAGTGAGGAGAAGGAGGCTGCGGAAGCCCAAG
GGCAGAGCTGAGATATCTTTTTCCATGTCTCTCTTTCTTAATGTTGTAAACACTTTGATT
CCGTTAATTTTTGGCTCATTTTGAATGTCAACTTCAATTTTGTCTTCTCTGCACCTGTGA
AAGTTTTTTGTTTTGAGTATCGTATTACGTCTAGAAAAGATTTTGGCAT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RR2GN69TF 589 0 0
GGGAGTTAGGGTTTGGTTCTTCACAGAGAAGCCTTCCTTCATCGTCTCTTTCTATCAAAT
TTCATCGTTTCTGAGAAAGGAGAAGTTTTTATTTATTTTATTTCAAGTAAGGTTCAATGG
AAGGGATCACGGAAGGCGTTAACAGTATGAGCCTAGGCGTTGATACGCAGAAGAAGAATC
GGATTCAGGTTTCCCACACCAAGAAACCGTTGTTCTTCTACGTCAATCTCGCCAAGAGGT
ACATGCAGCAGTACACAGATGTTGAAAAGAAGATCATGACTTCGACTGTGGATATCAAAG
ATGATTCAAGGGGACGCCCTGTGCAGAAAGCCAAGATTGAGATAACGCTAGCCAAGTCTG
AGAAGTTTGATGAGTTAATGGCTGCAGCCAGTGAGGAGAAGGAGGCTGCGGAAGCCCAAG
GGCAGAGCTGAGATATCTTTTTCCATGTCTCTCTTTCTTAATGTTGTAAACACTTTGATT
CCGTTAATTTTTGGCTCATTTTGAATGTCAACTTCAATTTTGTCTTCTCTGCACCTGTGA
AAGTTTTTTGTTTTGAGTATCGTATTACGTCTAGAAAAGATTTTGGCAT

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL6354Contig1 793 2 1 U
GGACAGTAAAAGAGCAACTCTACTTAAAACTATTTGCTCCTTTCGACAGAGAGATAAAAC
GAGACAATGGGTGCTAATGTTTCTTCGCCAGACCAGAGATATTCAGTGACGTCCGACCTC
CCTTCCAGGAGGCCATGGACACCTCGCTTCGAGTCCCAGATTTCTCCTTACAAAGTCAAC
ATCCCCCGCATTGTGGAAATCAAAAACAAGAATCAGTGGAAATCTCGACTCAACGCTCTC
AAGGACACCAACAAGCTGCTGGTGATCGAGTTCACGGCCAAATGGTGTGGACCTTGTAAA
TCCCTTGAACCGAAGGTTGAAGAGTTGGCGGCTAAGTACACCGATGTTGAGTTCGTGAAG
ATTGATGTCGATGTGTTAATGAGTGTGTGGATGGAGTATAACCTTCATACTTTGCCTGCG
ATTGTATTCATGAAGAGAGGCCAAGAAGTAGACAGAGTTGTGGGTGTGAAGTTTGATGAA
TTAGAGAGGAAACTCCACAAATACGCACAAATCTTCTTCTGAAAAATATGAAGCTTTTAC
TTGCATACCAAACAAAGCTCCTCATGCATGATCACCTTATGCCAAGAATAGTATGCTACT
ATATATAAATAAATTTAGCTCCTCATGCTTGATCACCTAAGTCAAGAATAGTATGCTGTT
ATATATAAATAAATGTTTGAACGTAGATTCAGCAAATAAACAAAATTTGTGTGATATAAG
GAATTTGAAGTTGGTTTTGCATGTACGTTCCTGTCTCGTGTAATATATTTATGACTACTG
GTTTGTATGGTTT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B650TF U 1
AF RR2B650JQ C 4
BS 1 793 RR2B650TF

RD RR2B650TF 793 0 0
GGACAGTAAAAGAGCAACTCTACTTAAAACTATTTGCTCCTTTCGACAGAGAGATAAAAC
GAGACAATGGGTGCTAATGTTTCTTCGCCAGACCAGAGATATTCAGTGACGTCCGACCTC
CCTTCCAGGAGGCCATGGACACCTCGCTTCGAGTCCCAGATTTCTCCTTACAAAGTCAAC
ATCCCCCGCATTGTGGAAATCAAAAACAAGAATCAGTGGAAATCTCGACTCAACGCTCTC
AAGGACACCAACAAGCTGCTGGTGATCGAGTTCACGGCCAAATGGTGTGGACCTTGTAAA
TCCCTTGAACCGAAGGTTGAAGAGTTGGCGGCTAAGTACACCGATGTTGAGTTCGTGAAG
ATTGATGTCGATGTGTTAATGAGTGTGTGGATGGAGTATAACCTTCATACTTTGCCTGCG
ATTGTATTCATGAAGAGAGGCCAAGAAGTAGACAGAGTTGTGGGTGTGAAGTTTGATGAA
TTAGAGAGGAAACTCCACAAATACGCACAAATCTTCTTCTGAAAAATATGAAGCTTTTAC
TTGCATACCAAACAAAGCTCCTCATGCATGATCACCTTATGCCAAGAATAGTATGCTACT
ATATATAAATAAATTTAGCTCCTCATGCTTGATCACCTAAGTCAAGAATAGTATGCTGTT
ATATATAAATAAATGTTTGAACGTAGATTCAGCAAATAAACAAAATTTGTGTGATATAAG
GAATTTGAAGTTGGTTTTGCATGTACGTTCCTGTCTCGTGTAATATATTTATGACTACTG
GTTTGTATGGTTT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2B650JQ 790 0 0
CAGTAAAAGAGCAACTCTACTTAAAACTATTTGCTCCTTTCGACAGAGAGATAAAACGAG
ACAATGGGTGCTAATGTTTCTTCGCCAGACCAGAGATATTCAGTGACGTCCGACCTCCCT
TCCAGGAGGCCATGGACACCTCGCTTCGAGTCCCAGATTTCTCCTTACAAAGTCAACATC
CCCCGCATTGTGGAAATCAAAAACAAGAATCAGTGGAAATCTCGACTCAACGCTCTCAAG
GACACCAACAAGCTGCTGGTGATCGAGTTCACGGCCAAATGGTGTGGACCTTGTAAATCC
CTTGAACCGAAGGTTGAAGAGTTGGCGGCTAAGTACACCGATGTTGAGTTCGTGAAGATT
GATGTCGATGTGTTAATGAGTGTGTGGATGGAGTATAACCTTCATACTTTGCCTGCGATT
GTATTCATGAAGAGAGGCCAAGAAGTAGACAGAGTTGTGGGTGTGAAGTTTGATGAATTA
GAGAGGAAACTCCACAAATACGCACAAATCTTCTTCTGAAAAATATGAAGCTTTTACTTG
CATACCAAACAAAGCTCCTCATGCATGATCACCTTATGCCAAGAATAGTATGCTACTATA
TATAAATAAATTTAGCTCCTCATGCTTGATCACCTAAGTCAAGAATAGTATGCTGTTATA
TATAAATAAATGTTTGAACGTAGATTCAGCAAATAAACAAAATTTGTGTGATATAAGGAA
TTTGAAGTTGGTTTTGCATGTACGTTCCTGTCTCGTGTAATATATTTATGACTACTGGTT
TGTATGGTTT

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL6355Contig1 809 2 18 U
TTTCTATAGAACTATAATGTTATTCAAAACTGAGCTTGTGTAACTAAACTAATGATCCTA
ATACAAACTAGCAAGTGTAATCGAGTTTCTGTAATCTCCATGGTTCACAAGATTTACATC
TCTCCATGCTTTTAAAGCCCTGATTTCACCAAATTTTGCAGATTCACCCCTACTCTTGTA
ATCCATGTTCAGAAACAACCCTTTAGCTGCAAACCCCATGATCTCAGTAGAGTCCAGAAA
CCTCTTAACCTTCAGGCTGATGCTTCCTTCGGATGGCAATCCCCTTTTAGGAACCCGACA
ATCCAAACCATCTGACACGACCTCGGTTTGGGAAATTTGGGCTGGTAATTCTTCCGAGAA
GTGTGCTCCCAGAGATACTTTATCAACCTGTTGCTTTAACTGGTGTAGTCTTTGTCCTAT
CCTGGAAGATACAGCGTCATACAACTGCTTCCTTGAAACGTTTTTGGCTCCTTCAGTGTC
TGAAAGGTCGCTTAAGTGAATAGGATCTCCAATGATCACTGTCACTGTTTTGCCAATCCG
TGGAACACTGGCTCCTATAGGCATTATATCTTGCATACCAGTATGCACAAAGGGAACAAC
CATAGGGAGGGTATCTGCGTCCAAAATCAACCTTCCAATACCTCTTTTTGCTGCACCCAT
AGTCTTACCACCATCTCGAGAGCGACTACCTTCTGGAAATATGTGAACCCACCCTCCACT
ATTCAGCTTCGAAATCGCAATGTCCATTCCCTGCTGATAAATTCCTTCACCGCGAGAAAC
TGGCAAACCTTGACGATCGAAAGAAAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G513JQ U 1
AF RR2DE43JQ U 8
BS 1 295 RR2G513JQ
BS 296 296 RR2DE43JQ
BS 297 311 RR2G513JQ
BS 312 312 RR2DE43JQ
BS 313 346 RR2G513JQ
BS 347 347 RR2DE43JQ
BS 348 358 RR2G513JQ
BS 359 359 RR2DE43JQ
BS 360 360 RR2G513JQ
BS 361 361 RR2DE43JQ
BS 362 387 RR2G513JQ
BS 388 388 RR2DE43JQ
BS 389 438 RR2G513JQ
BS 439 439 RR2DE43JQ
BS 440 457 RR2G513JQ
BS 458 458 RR2DE43JQ
BS 459 516 RR2G513JQ
BS 517 809 RR2DE43JQ

RD RR2G513JQ 520 0 0
TTTCTATAGAACTATAATGTTATTCAAAACTGAGCTTGTGTAACTAAACTAATGATCCTA
ATACAAACTAGCAAGTGTAATCGAGTTTCTGTAATCTCCATGGTTCACAAGATTTACATC
TCTCCATGCTTTTAAAGCCCTGATTTCACCAAATTTTGCAGATTCACCCCTACTCTTGTA
ATCCATGTTCAGAAACAACCCTTTAGCTGCAAACCCCATGATCTCAGTAGAGTCCAGAAA
CCTCTTAACCTTCAGGCTGATGCTTCCTTCGGATGGCAATCCCCTTTTAGGAACCTGACA
ATCCAAACCATTTGACACGACCTCGGTTTGGGAAATTTGGGCTGGTGATTCTTCCGAGTA
TTGTGCTCCCAGAGATACTTTATCAACTTGTTGCTTTAACTGGTGTAGTCTTTGTCCTAT
CCTGGAAGATACAGCGTCGTACAACTGCTTCCTTGAACCGTTTTTGGCTCCTTCAGTGTC
TGAAAGGTCGCTTAAGTGAATAGGATCTCCAATGAT
TACT

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2DE43JQ 802 0 0
G
GAACTATAATGTTATTCAAAACTGAGCTTGTGTAACTAAACTAATGATCCTAATACAAAC
TAGCAAGTGTAATCGAGTTTCTGTAATCTCCATGGTTCACAAGATTTACATCTCTCCATG
CTTTTAAAGCCCTGATTTCACCAAATTTTGCAGATTCACCCCTACTCTTGTAATCCATGT
TCAGAAACAACCCTTTAGCTGCAAACCCCATGATCTCAGTAGAGTCCAGAAACCTCTTAA
CCTTCAGGCTGATGCTTCCTTCGGATGGCAATCCCCTTTTAGGAACCCGACATTCCAAAC
CATCTGACACGACGTCGGTTTGGGAAATTTGGGCTGGTAATTCTTCTGAGAAGTGTGCTC
CCAGAGATACTTTATCAACCTGTTGCTTTAACTGGTGTAGTCTTTGTCCTATCCTGGAAG
ATACAGCGTCATACAACTGCTTCCTTGAAACGTTTTTGGCTCCTTCAGTGTCTGAAAGGT
CGCTTAAGTGAATAGGATCTCCAATGATCACTGTCACTGTTTTGCCAATCCGTGGAACAC
TGGCTCCTATAGGCATTATATCTTGCATACCAGTATGCACAAAGGGAACAACCATAGGGA
GGGTATCTGCGTCCAAAATCAACCTTCCAATACCTCTTTTTGCTGCACCCATAGTCTTAC
CACCATCTCGAGAGCGACTACCTTCTGGAAATATGTGAACCCACCCTCCACTATTCAGCT
TCGAAATCGCAATGTCCATTCCCTGCTGATAAATTCCTTCACCGCGAGAAACTGGCAAAC
CTTGACGATCGAAAGAAAGCT

QA 2 802 2 802
DS 



AS 1 2

CO CL6356Contig1 712 2 1 U
GGACACTATAAAATCCAACATCCCATAAAAGAAAGAAGAGAGAAAAAAAATGGATACGAT
GAAAACAACAAAAGTGAAGTTCACAAAAGAGATGCTAGAGTCTATCAAAGACAAGCTCCC
AAGGCTCAGCTTTCTCCTCCTCTTCCTCCGACAATGCTACGGCGGTTGTGGAGACCGGAC
CCACTTACTCCCTTGCTCGATCACCACTTCATCCACCCGCTTCTGGAACCTCTCTGATCG
TCCCGTGGAGCTTCAGATTCGAGTCGGGTCGATCCTTAAACGCGTCCACACTCTCAAACC
GGGACGTTCCAAAAAGCTCAGACACAGTAACCTCCACAGAGCCTACGTTCCTGACCAGGA
AGGACGTCGATGGTTGTACTACGACGACACATGTTTACCGTACGTATGGGTTCATGAGAC
GGGTACAGACTTGTCGAAGATGGTGAAGCAACAGTACGTGAGTCTTGATGATCTGAGAGA
TTGCTCGGAGATTAGGATTTTTAAGGATTTACAGAGAGGTTGTGTCTCTGTTGAGAAGAA
AGACAGAGCTTCTGCTTTGTGTTGATTCTGAAAATTTTCATTAATGATTACTTCATCTAT
ATAATTATGAGTACTACATATAAGTTAAATATGCATTTCATTGTGTGAAACATGATGCTT
GTATCCATTTATATGTAACTCCATCTCCAGTATTGACTCTTGTTGATCTTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BV24JQ C 1
AF RR2BV24TF U 1
BS 1 712 RR2BV24TF

RD RR2BV24JQ 712 0 0
GGACACTATAAAATCCAACATCCCATAAAAGAAAGAAGAGAGAAAAAAAATGGATACGAT
GAAAACAACAAAAGTGAAGTTCACAAAAGAGATGCTAGAGTCTATCAAAGACAAGCTCCC
AAGGCTCAGCTTTCTCCTCCTCTTCCTCCGACAATGCTACGGCGGTTGTGGAGACCGGAC
CCACTTACTCCCTTGCTCGATCACCACTTCATCCACCCGCTTCTGGAACCTCTCTGATCG
TCCCGTGGAGCTTCAGATTCGAGTCGGGTCGATCCTTAAACGCGTCCACACTCTCAAACC
GGGACGTTCCAAAAAGCTCAGACACAGTAACCTCCACAGAGCCTACGTTCCTGACCAGGA
AGGACGTCGATGGTTGTACTACGACGACACATGTTTACCGTACGTATGGGTTCATGAGAC
GGGTACAGACTTGTCGAAGATGGTGAAGCAACAGTACGTGAGTCTTGATGATCTGAGAGA
TTGCTCGGAGATTAGGATTTTTAAGGATTTACAGAGAGGTTGTGTCTCTGTTGAGAAGAA
AGACAGAGCTTTTGCTTTGTGTTGATTCTGAAAATTTTCATTAATGATTACTTCATCTAT
ATAATTATGAGTACTACATATAAGTTAAATATGCATTTCATTGTGTGAAACATGATGCTT
GTATCCATTTATATGTAACTCCATCTCCAGTATTGACTCTTGTTGATCTTGG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2BV24TF 712 0 0
GGACACTATAAAATCCAACATCCCATAAAAGAAAGAAGAGAGAAAAAAAATGGATACGAT
GAAAACAACAAAAGTGAAGTTCACAAAAGAGATGCTAGAGTCTATCAAAGACAAGCTCCC
AAGGCTCAGCTTTCTCCTCCTCTTCCTCCGACAATGCTACGGCGGTTGTGGAGACCGGAC
CCACTTACTCCCTTGCTCGATCACCACTTCATCCACCCGCTTCTGGAACCTCTCTGATCG
TCCCGTGGAGCTTCAGATTCGAGTCGGGTCGATCCTTAAACGCGTCCACACTCTCAAACC
GGGACGTTCCAAAAAGCTCAGACACAGTAACCTCCACAGAGCCTACGTTCCTGACCAGGA
AGGACGTCGATGGTTGTACTACGACGACACATGTTTACCGTACGTATGGGTTCATGAGAC
GGGTACAGACTTGTCGAAGATGGTGAAGCAACAGTACGTGAGTCTTGATGATCTGAGAGA
TTGCTCGGAGATTAGGATTTTTAAGGATTTACAGAGAGGTTGTGTCTCTGTTGAGAAGAA
AGACAGAGCTTCTGCTTTGTGTTGATTCTGAAAATTTTCATTAATGATTACTTCATCTAT
ATAATTATGAGTACTACATATAAGTTAAATATGCATTTCATTGTGTGAAACATGATGCTT
GTATCCATTTATATGTAACTCCATCTCCAGTATTGACTCTTGTTGATCTTGG

QA 1 712 1 712
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6358Contig1 806 2 6 U
GGAGCAACAAAAAAAAGTGTTTGGCATCGGAGATTAGATATGGCGACGGAGTCATCGGAA
TCGGAGGAAGAAGGGAAGATCAGTGGAGGAAACGAGAAGCTAATCGTGGACGAGGATCTG
AGAGAGATGGGGAAAAACGCAGCTTGGAGCGTCAGCTCTTGCAAGCCCGGCAACGGCGTC
AACACTCTCCGCGACGACAATCTCGAGACCTATTGGCAATCGGATGGTTTGCAGCCACAT
TTGATTAACATTCAGTTCCAGAAGAAAGTGAGATTACAGTTAGTGGCTTTGTACGTTGAC
TTTAAGCTCGATGAGAGCTATACGCCTAGTAAGATCTCTGTTCGTGCTGGTGATGGCTTT
CATAACTTAAAGGAGGTAAAAAGTGTTGAGCTTGTAAAGCCATCTGGTTGGGTTTCCGTA
TCTTTGTCTGGGACCGATCCGAGGGAGACATTTGTGAATACATTCATGTTGCAAATAGCC
ATGTTGTCAAATCACCTCAACGGGAGAGATACTCATATCCGTCAGATCAAAGTTTATGGC
CCTAGACCGAACCCTATTCCGCGCCAACCATTTCAGTTTACTTCAACGGAGTTTCTCACA
TACTCCACGTTGAGATGAGAGCTTTGTGCAGGAGGAGTGTGAAGAACATGGACTGTTGAA
GATAACTGCTGATTGATCTCGGGAAGACTCTACTGTCGCGTTAGGTTTAAAAACTATTAT
ATGTTGTTGTGTAATGGCCTCTTCTTATATATTACATTGGATCATATAACAATCATAACT
TCATTAATCTTACCACCAAGAGCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G814TF U 1
AF RR2G814JQ C 80
BS 1 631 RR2G814TF
BS 632 632 RR2G814JQ
BS 633 659 RR2G814TF
BS 660 660 RR2G814JQ
BS 661 677 RR2G814TF
BS 678 806 RR2G814JQ

RD RR2G814TF 677 0 0
GGAGCAACAAAAAAAAGTGTTTGGCATCGGAGATTAGATATGGCGACGGAGTCATCGGAA
TCGGAGGAAGAAGGGAAGATCAGTGGAGGAAACGAGAAGCTAATCGTGGACGAGGATCTG
AGAGAGATGGGGAAAAACGCAGCTTGGAGCGTCAGCTCTTGCAAGCCCGGCAACGGCGTC
AACACTCTCCGCGACGACAATCTCGAGACCTATTGGCAATCGGATGGTTTGCAGCCACAT
TTGATTAACATTCAGTTCCAGAAGAAAGTGAGATTACAGTTAGTGGCTTTGTACGTTGAC
TTTAAGCTCGATGAGAGCTATACGCCTAGTAAGATCTCTGTTCGTGCTGGTGATGGCTTT
CATAACTTAAAGGAGGTAAAAAGTGTTGAGCTTGTAAAGCCATCTGGTTGGGTTTCCGTA
TCTTTGTCTGGGACCGATCCGAGGGAGACATTTGTGAATACATTCATGTTGCAAATAGCC
ATGTTGTCAAATCACCTCAACGGGAGAGATACTCATATCCGTCAGATCAAAGTTTATGGC
CCTAGACCGAACCCTATTCCGCGCCAACCATTTCAGTTTACTTCAACGGAGTTTCTCACA
TACTCCACGTTGAGATGAGAGCTTTGTGCAG*AGGAGTGTGAAGAACATGGACTGTTGA*
GATAACTGCTGATTGAT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2G814JQ 727 0 0
TCAGTGGAGGAAACGAGAAGCTAATCGTGGACGAGGATCTGAGAGAGATGGGGAAAAACG
CAGCTTGGAGCGTCAGCTCTTGCAAGCCCGGCAACGGCGTCAACACTCTCCGCGACGACA
ATCTCGAGACCTATTGGCAATCGGATGGTTTGCAGCCACATTTGATTAACATTCAGTTCC
AGAAGAAAGTGAGATTACAGTTAGTGGCTTTGTACGTTGACTTTAAGCTCGATGAGAGCT
ATACGCCTAGTAAGATCTCTGTTCGTGCTGGTGATGGCTTTCATAACTTAAAGGAGGTAA
AAAGTGTTGAGCTTGTAAAGCCATCTGGTTGGGTTTCCGTATCTTTGTCTGGGACCGATC
CGAGGGAGACATTTGTGAATACATTCATGTTGCAAATAGCCATGTTGTCAAATCACCTCA
ACGGGAGAGATACTCATATCCGTCAGATCAAAGTTTATGGCCCTAGACCGAACCCTATTC
CGCGCCAACCATTTCAGTTTACTTCAACGGAGTTTCTCACATACTCCACGTTGAGATGAG
AGCTTTGTGCAGGAGGAGTGTGAAGAACATGGACTGTTGAAGATAACTGCTGATTGATCT
CGGGAAGACTCTACTGTCGCGTTAGGTTTAAAAACTATTATATGTTGTTGTGTAATGGCC
TCTTCTTATATATTACATTGGATCATATAACAATCATAACTTCATTAATCTTACCACCAA
GAGCCCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL6359Contig1 765 2 2 U
GGATCAGAAAGCTACTTTGAGAGAAAGAGAGTGAGCTCTGAGAAAAGCACCAATGGCTTC
GAAGCTTGTAGTCATGATTGTGTTCATCCTCGATCTCGTCGCCGTTGGTTTAGCCATTGC
CGCCGAGCAGAGAAGAAGTTTCGGGAAAGTTGTAACGGACACTGAGAAGACGTATGAGTA
CTGCGTGTACGGCACGGACATAGCTACGAGCTATGGAGCTGGTGCCTTTCTCCTCCTCTT
TATAAGCCAAGTCCTTATTATGAGTGCTAGCCGCTGCTTCTGCTGTGGGAGGTCTCTTAA
CCCGGGCGGTTCAAGAGCTTGTGCCCTCCTTCTCTTCCTCATTTGCTGGGTATTCTTCCT
GGTCGCTGAGGTATGTTTGCTTGCCGCATCAATCAGAAACGCGTACCACACAAAATACAG
GAAGATGTGGAACATCGATAACCCGCCGAGCTGTGAAGTTATAAGGAAAGGAGTGTTCGC
AGCTGGTGCTGCTTTTACTCTCTTCACCGCCATCGTCTCTCAGTTCTATTACGTTTGCTA
CTCGCGTGCTAGAGATGCCTACCAGAATCCGTCCTACTAAAATATGTCATACTTTCACAG
CAAGCTACGTTTAGGCTTCAAGAGTTGGAAACCATATTCATGTGGGCAGTGAGTTTGTTT
AGTTTCAAGTGATACTACTTATTCGATGCTAAAAATTTGATGGTTTATCTTGAGGATGAT
ACATTGAGAAGTGGTTGTTTCTTAGTAAAAACATGCTTTTATATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B114TF U 1
AF RR2B114JQ C 1
BS 1 689 RR2B114TF
BS 690 765 RR2B114JQ

RD RR2B114TF 689 0 0
GGATCAGAAAGCTACTTTGAGAGAAAGAGAGTGAGCTCTGAGAAAAGCACCAATGGCTTC
GAAGCTTGTAGTCATGATTGTGTTCATCCTCGATCTCGTCGCCGTTGGTTTAGCCATTGC
CGCCGAGCAGAGAAGAAGTTTCGGGAAAGTTGTAACGGACACTGAGAAGACGTATGAGTA
CTGCGTGTACGGCACGGACATAGCTACGAGCTATGGAGCTGGTGCCTTTCTCCTCCTCTT
TATAAGCCAAGTCCTTATTATGAGTGCTAGCCGCTGCTTCTGCTGTGGGAGGTCTCTTAA
CCCGGGCGGTTCAAGAGCTTGTGCCCTCCTTCTCTTCCTCATTTGCTGGGTATTCTTCCT
GGTCGCTGAGGTATGTTTGCTTGCCGCATCAATCAGAAACGCGTACCACACAAAATACAG
GAAGATGTGGAACATCGATAACCCGCCGAGCTGTGAAGTTATAAGGAAAGGAGTGTTCGC
AGCTGGTGCTGCTTTTACTCTCTTCACCGCCATCGTCTCTCAGTTCTATTACGTTTGCTA
CTCGCGTGCTAGAGATGCCTACCAGAATCCGTCCTACTAAAATATGTCATACTTTCACAG
CAAGCTACGTTTAGGCTTCAAGAGTTGGAAACCATATTCATGTGGGCAGTGAGTTTGTTT
AGTTTCAAGTGATACTACTTATTCGATGC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2B114JQ 765 0 0
GGATCAGAAAGCTACTTTGAGAGAAAGAGAGTGAGCTCTGAGAAAAGCACCAATGGCTTC
GAAGCTTGTAGTCATGATTGTGTTCATCCTCGATCTCGTCGCCGTTGGTTTAGCCATTGC
CGCCGAGCAGAGAAGAAGTTTCGGGAAAGTTGTAACGGACACTGAGAAGACGTATGAGTA
CTGCGTGTACGGCACGGACATAGCTACGAGCTATGGAGCTGGTGCCTTTCTCCTCCTCTT
TATAAGCCAAGTCCTTATTATGAGTGCTAGCCGCTGCTTCTGCTGTGGGAGGTCTCTTAA
CCCGGGCGGTTCAAGAGCTTGTGCCCTCCTTCTCTTCCTCATTTGCTGGGTATTCTTCCT
GGTCGCTGAGGTATGTTTGCTTGCCGCATCAATCAGAAACGCGTACCACACAAAATACAG
GAAGATGTGGAACATCGATAACCCGCCGAGCTGTGAAGTTATAAGGAAAGGAGTGTTCGC
AGCTGGTGCTGCTTTTACTCTCTTCACCGCCATCGTCTCTCAGTTCTATTACGTTTGCTA
CTCGCGTGCTAGAGATGCCTACCAGAATCCGTCCTACTAAAATATGTCATACTTTCACAG
CAAGCTACGTTTAGGCTTCAAGAGTTGGAAACCATATTCATGTGGGCAGTGAGTTTGTTT
AGTTTCAAGTGATACTACTTATTCGATGCTAAAAATTTGATGGTTTATCTTGAGGATGAT
ACATTGAGAAGTGGTTGTTTCTTAGTAAAAACATGCTTTTATATT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL6360Contig1 1286 2 2 U
GCAAACCTTTAGCAAAACCTTCGCCCAATAAGGTCCCCCCACCATCTTCCCCGGCAAAGG
GAAAAAAGAAAATTATCCAGTCTTCCTTGCCATGGACGGAAAAGTACAGACCGAAGGTTC
CAAATGAGATTGTTGGGAATCAGTCATTGGTTACTCAGCTTCACAACTGGCTGTCCCATT
GGCATGAACAATTTGGGGGTACTGGAGGTAAAGGAAAGGGGAAGAAATTAAATGATGCTA
GTGCCAAGAAGGCTGTACTTTTGAGCGGAACACCTGGTGTTGGAAAAACAACATCAGCCA
AGTTGGTTAGTCAGATGCTTGGTTTCCAGGCAGTTGGGGTTAATGCTAGTACAGTCGGGG
AAAGGCCAACTCGAATATTGCCAAAGGAATTGGTGGGAGCAATGCAAATTCTGTAAAAGA
ACTTGTCAATAACGAAGCCATAGCTCCTAACATTGATAAGTCAAAGCACCCGAAGACTGT
TCTAATCATGGATGAAGTAGATGGAATGTCTGCAGGTGACAGAGGCGGTGTTGCGGACCT
CATTGCTAGCATTAAAATATCAAAGATTCCTATCATCTGCATTTGTAATGACCGATACAG
TCAGAAATTGAAGAGTTTAGTAAACTACTGTCTGGCCCTCAACTACCGGAAGCCCACGAA
ACAGCAGATGGCGAAAAGGCTGGCACATGTTGCGAGAGCAGAAGGCCTTGATGTTAATGA
TATTGCCTTGGAGGAACTCGCTGAGAGAGTGAATGGTGACATACGGTTGGCCCTGAACCA
AATGTTGAAAGTTTGGGAGATGAAGATGGCGAGCCGTTAGCAGAAAATGAAGAAGAAAAC
GAATCAGACGCTGAAGACTCAGAAGAGGCAACTAATGGAGAAAAGCTGGAGTCAAATCTA
AAAAGTTTGAATGCCAGAGGGATCCAAGTTGAAGTGGATTTGAAAGGAGCAGGAAGCTCA
GGTACAAGAAAGGCAGCTGGTAAAGGCAGAGGGAGAGGCAAAGCAGCAGATGCTCCTGCT
GCTGAGAAGAAGGCTACAGGACGAGGCGCTGGTGCCAAGAGAAAGAGATGAGAAAAAAAG
CCAAAATCGTTTCGGATTTCGCGTAGTTTTATCAAGAAACGTCTCTTTTCCTCGAATGTT
CATGTTTGGATATAACAGCCTTCTCTCGCTTTGTTTTTTTTTCTTCCTGGATTGACAAAT
GAAGTTTATGCCGTCTCACTGGAGTTTTAGGGCGGATTTTAGTTTGTATCGAACGCACAT
GGCTTTGCTCTTTTAACTGATTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A627TF U 1
AF RR2A627JQ C 558
BS 1 700 RR2A627TF
BS 701 1286 RR2A627JQ

RD RR2A627TF 700 0 0
GCAAACCTTTAGCAAAACCTTCGCCCAATAAGGTCCCCCCACCATCTTCCCCGGCAAAGG
GAAAAAAGAAAATTATCCAGTCTTCCTTGCCATGGACGGAAAAGTACAGACCGAAGGTTC
CAAATGAGATTGTTGGGAATCAGTCATTGGTTACTCAGCTTCACAACTGGCTGTCCCATT
GGCATGAACAATTTGGGGGTACTGGAGGTAAAGGAAAGGGGAAGAAATTAAATGATGCTA
GTGCCAAGAAGGCTGTACTTTTGAGCGGAACACCTGGTGTTGGAAAAACAACATCAGCCA
AGTTGGTTAGTCAGATGCTTGGTTTCCAGGCAGTTGGGGTTAATGCTAGTACAGTCGGGG
AAAGGCCAACTCGAATATTGCCAAAGGAATTGGTGGGAGCAATGCAAATTCTGTAAAAGA
ACTTGTCAATAACGAAGCCATAGCTCCTAACATTGATAAGTCAAAGCACCCGAAGACTGT
TCTAATCATGGATGAAGTAGATGGAATGTCTGCAGGTGACAGAGGCGGTGTTGCGGACCT
CATTGCTAGCATTAAAATATCAAAGATTCCTATCATCTGCATTTGTAATGACCGATACAG
TCAGAAATTGAAGAGTTTAGTAAACTACTGTCTGGCCCTCAACTACCGGAAGCCCACGAA
ACAGCAGATGGCGAAAAGGCTGGCACATGTTGCGAGAGCA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2A627JQ 729 0 0
TATCAAAGATTCCTATCATCTGCATTTGTAATGACCGATACAGTCAGAAATTGAAGAGTT
TAGTAAACTACTGTCTGGCCCTCAACTACCGGAAGCCCACGAAACAGCAGATGGCGAAAA
GGCTGGCACATGTTGCGAGAGCAGAAGGCCTTGATGTTAATGATATTGCCTTGGAGGAAC
TCGCTGAGAGAGTGAATGGTGACATACGGTTGGCCCTGAACCAAATGTTGAAAGTTTGGG
AGATGAAGATGGCGAGCCGTTAGCAGAAAATGAAGAAGAAAACGAATCAGACGCTGAAGA
CTCAGAAGAGGCAACTAATGGAGAAAAGCTGGAGTCAAATCTAAAAAGTTTGAATGCCAG
AGGGATCCAAGTTGAAGTGGATTTGAAAGGAGCAGGAAGCTCAGGTACAAGAAAGGCAGC
TGGTAAAGGCAGAGGGAGAGGCAAAGCAGCAGATGCTCCTGCTGCTGAGAAGAAGGCTAC
AGGACGAGGCGCTGGTGCCAAGAGAAAGAGATGAGAAAAAAAGCCAAAATCGTTTCGGAT
TTCGCGTAGTTTTATCAAGAAACGTCTCTTTTCCTCGAATGTTCATGTTTGGATATAACA
GCCTTCTCTCGCTTTGTTTTTTTTTCTTCCTGGATTGACAAATGAAGTTTATGCCGTCTC
ACTGGAGTTTTAGGGCGGATTTTAGTTTGTATCGAACGCACATGGCTTTGCTCTTTTAAC
TGATTTACG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL6361Contig1 312 2 2 U
GTGTACAGGGCCCGGGTACATATCCACCGCGGCATGCTGATCCGCGATTACTAGCGATTC
CAACTTCATGTTCCCGAGTTGCAGAAAACAATCCGAACTGAGGCAATCTTTCCGGATTCG
CTCCGCCTTACAGCCTTGCTTCCCATTGTAATTGCCATTGTAGCACGTGTGTGGCCCAGC
CCATAAGGGCCATGCGGACTTGACGTCATCCCCACCTTCCTCCAGTATATCACTGGCAGT
CCCTCGTGAGTGCGTCACGCATCTTTTTGTTTGTTTCGGAACGGTTTTGTCAGGGCGTAC
TAAACCCACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F078TF C 1
AF RR2F078JQ U 9
BS 1 8 RR2F078TF
BS 9 312 RR2F078JQ

RD RR2F078TF 312 0 0
GTGTACAGGGCCCGGGTACATATCCACCGCGGCATGCTGATCCGCGATTACTAGCGATTC
CAACTTCATGTTCCCGAGTTGCAGAGAACAATCCGAACTGAGGCAATCTTTCCGGATTCG
CTCCGCCTTACAGCCTTGCTTCCCATTGTAATTGCCATTGTAGCACGTGTGTGGCCCAGC
CCATAAGGGCCATGCGGACTTGACGTCATCCCCACCTTCCTCCAGTATATCACTGGCAGT
CCCTCGTGAGTGCGTCACGCATCTTTTTGTTTGTTTCGGAGCGGTTTTGTCAGGGCGTAC
TAAACCCACTTC

QA 1 312 1 312
DS 

RD RR2F078JQ 304 0 0
GGCCCGGGTACATATCCACCGCGGCATGCTGATCCGCGATTACTAGCGATTCCAACTTCA
TGTTCCCGAGTTGCAGAAAACAATCCGAACTGAGGCAATCTTTCCGGATTCGCTCCGCCT
TACAGCCTTGCTTCCCATTGTAATTGCCATTGTAGCACGTGTGTGGCCCAGCCCATAAGG
GCCATGCGGACTTGACGTCATCCCCACCTTCCTCCAGTATATCACTGGCAGTCCCTCGTG
AGTGCGTCACGCATCTTTTTGTTTGTTTCGGAACGGTTTTGTCAGGGCGTACTAAACCCA
CTTC

QA 1 304 1 304
DS 



AS 1 2

CO CL6362Contig1 827 2 2 U
GGAAGCTTCTACTGAAGATCCATCTTAAAGTTTAAAACCTTTTGTTTCATACTTCAGATC
GTCCTCTTTCACTCGAACACTTAAGTCTTTGGAAATGGCAATGGCGTCGTTTAACATGCA
GTCAGTCTTCGCCGGTGGATTGACCATTCGCAAGATCAACACAAACAACCTTTTCTTCGC
CGGAAACTTCCCTAATCTCAAGAGGAAGTTCCCTGTGGGAGTGAGATGCATGGCTGAGGG
AGAACCAATGAAGGATGAGTCTGCACCGTCGACCTCGGCGGCTCAGCCTTTGCCTAAGTC
ATCGTCCCCACCACCACCACCTCCTCCTAGTAAGCCTAAGGTGAGCACCAAGTTTAGCGA
CTTGCTAGCGTTTAGCGGCCCAGCACCAGAGAGAATAAATGGCCGTTTAGCGATGGTTGG
GTTTGTGGCTGCGTTGGCAGTTGAACTTTCCAAAGGAGAAAATGTTTTCGCCCAGATCTC
CGACGGTGGAGTCTCGTGGTTCCTTGGCACGACAGCTATCTTGACACTTGCGTCGCTTGT
GCCACTTTTCCAAGGCGTCACCGTTGAGTCGAAGTCCAAAGGTTTCATGACATCAAACGC
TGAGCTTTGGAATGGGCGATTCGCAATGCTTGGTTTAGTCGCATTGGCCTTCACTGAGTT
TGTCAAGGGTGGAACTCTCATCTGAGGAAATATAATTTTGGTTTGCCCCTGGATTCTGTA
AAGTAAAATCTGACTTGCTCTTTATGTCCAGTTATGTACTAGTGAGTTTGAGTTATATGA
AAAACTTTTGGTTATGTATAATCTTCTTAGCAAAAAAGTATCATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA77TF U 1
AF RR2GA77JQ C 281
BS 1 577 RR2GA77TF
BS 578 827 RR2GA77JQ

RD RR2GA77TF 577 0 0
GGAAGCTTCTACTGAAGATCCATCTTAAAGTTTAAAACCTTTTGTTTCATACTTCAGATC
GTCCTCTTTCACTCGAACACTTAAGTCTTTGGAAATGGCAATGGCGTCGTTTAACATGCA
GTCAGTCTTCGCCGGTGGATTGACCATTCGCAAGATCAACACAAACAACCTTTTCTTCGC
CGGAAACTTCCCTAATCTCAAGAGGAAGTTCCCTGTGGGAGTGAGATGCATGGCTGAGGG
AGAACCAATGAAGGATGAGTCTGCACCGTCGACCTCGGCGGCTCAGCCTTTGCCTAAGTC
ATCGTCCCCACCACCACCACCTCCTCCTAGTAAGCCTAAGGTGAGCACCAAGTTTAGCGA
CTTGCTAGCGTTTAGCGGCCCAGCACCAGAGAGAATAAATGGCCGTTTAGCGATGGTTGG
GTTTGTGGCTGCGTTGGCAGTTGAACTTTCCAAAGGAGAAAATGTTTTCGCCCAGATCTC
CGACGGTGGAGTCTCGTGGTTCCTTGGCACGACAGCTATCTTGACACTTGCGTCGCTTGT
GCCACTTTTCCAAGGCGTCACCGTTGAGTCGAAGTCC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2GA77JQ 547 0 0
GCTCAGCCTTTGCCTAAGTCATCGTCCCCACCACCACCACCTCCTCCTAGTAAGCCTAAG
GTGAGCACCAAGTTTAGCGACTTGCTAGCGTTTAGCGGCCCAGCACCAGAGAGAATAAAT
GGCCGTTTAGCGATGGTTGGGTTTGTGGCTGCGTTGGCAGTTGAACTTTCCAAAGGAGAA
AATGTTTTCGCCCAGATCTCCGACGGTGGAGTCTCGTGGTTCCTTGGCACGACAGCTATC
TTGACACTTGCGTCGCTTGTGCCACTTTTCCAAGGCGTCACCGTTGAGTCGAAGTCCAAA
GGTTTCATGACATCAAACGCTGAGCTTTGGAATGGGCGATTCGCAATGCTTGGTTTAGTC
GCATTGGCCTTCACTGAGTTTGTCAAGGGTGGAACTCTCATCTGAGGAAATATAATTTTG
GTTTGCCCCTGGATTCTGTAAAGTAAAATCTGACTTGCTCTTTATGTCCAGTTATGTACT
AGTGAGTTTGAGTTATATGAAAAACTTTTGGTTATGTATAATCTTCTTAGCAAAAAAGTA
TCATTTT

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 2

CO CL6363Contig1 864 2 2 U
GGGAACTGATTCTGCTAAGCAAGCTATGGAATTCATTCATGAACTCGGTTGGCTACTTCA
GAGAAGTAAGCTCGGTGTGTTCCCATTAACGCGTTTCAAGTGGCTCATCGAGTTCTCAAT
GGACCGAGAGTGGTGCGCTGTGATCAGGAAGCTGTTGAACATGTTCTTTGAAGGAGCTGT
TGGTGACTACTCTTCCTCCTCCCCCTCTGATGCCGCGCTATCAGAACTGTGCCTTCTTCA
CAGAGCCGTCAGGAAAAACTCTAAGCCTATGGTGGAAATGCTCTTGAGATACGCTCCTAA
GCAGCGAAGAATACACAGCTTGTTTAGACCCGATCTGCTGGTCCAGCAGGTTTAACACCT
CTTCACATTGCAGCCGGTAAAGATGGTTCAGAAGATGTGCTGGACGCTCTTACAGAAGAT
CCAGCAATGGTGGGGATTGGAGCATGGAGAACATCTAGGGACAGGAAGGCAGTCTGTAGC
ATACAGACCAGCTATGTTGTCAATGGTGGCGATTGCTGCGGTTTGCGTCTGTGTGGCACT
TCTCTTCAAGAGTTGCCCAGAAGTGCTTTATGTGTTTCAACCTTTCAGGTGGGAGTTGTT
GGACTATGAGACAAGATGAGTGCAAGCAAGTCTTACGTTGAAGAATCTTCTTCCTAAGAT
ATGAAATAAAAATGTTTACTTATATATAAAAAGTGTGATTTCTATATGTAACTATATAAG
ATATATAGAGACATGTACTTTAGAAGGTTGTTTGTGTGTAAAACCTGGTGGATTCGCTTT
CTGTAACTCTCTGATTAGTATATTTTATTTGTTGACATGATTATATATTTTTGTAACTTT
ATAATGGAGATGATGTTTGTACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG10TF U 1
AF RR2BG10JQ C 105
BS 1 743 RR2BG10TF
BS 744 864 RR2BG10JQ

RD RR2BG10TF 743 0 0
GGGAACTGATTCTGCTAAGCAAGCTATGGAATTCATTCATGAACTCGGTTGGCTACTTCA
GAGAAGTAAGCTCGGTGTGTTCCCATTAACGCGTTTCAAGTGGCTCATCGAGTTCTCAAT
GGACCGAGAGTGGTGCGCTGTGATCAGGAAGCTGTTGAACATGTTCTTTGAAGGAGCTGT
TGGTGACTACTCTTCCTCCTCCCCCTCTGATGCCGCGCTATCAGAACTGTGCCTTCTTCA
CAGAGCCGTCAGGAAAAACTCTAAGCCTATGGTGGAAATGCTCTTGAGATACGCTCCTAA
GCAGCGAAGAATACACAGCTTGTTTAGACCCGATCTGCTGGTCCAGCAGGTTTAACACCT
CTTCACATTGCAGCCGGTAAAGATGGTTCAGAAGATGTGCTGGACGCTCTTACAGAAGAT
CCAGCAATGGTGGGGATTGGAGCATGGAGAACATCTAGGGACAGGAAGGCAGTCTGTAGC
ATACAGACCAGCTATGTTGTCAATGGTGGCGATTGCTGCGGTTTGCGTCTGTGTGGCACT
TCTCTTCAAGAGTTGCCCAGAAGTGCTTTATGTGTTTCAACCTTTCAGGTGGGAGTTGTT
GGACTATGAGACAAGATGAGTGCAAGCAAGTCTTACGTTGAAGAATCTTCTTCCTAAGAT
ATGAAATAAAAATGTTTACTTATATATAAAAAGTGTGATTTCTATATGTAACTATATAAG
ATATATAGAGACATGTACTTTAG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2BG10JQ 760 0 0
TCATCGAGTTCTCAATGGACCGAGAGTGGTGCGCTGTGATCAGGAAGCTGTTGAACATGT
TCTTTGAAGGAGCTGTTGGTGACTACTCTTCCTCCTCCCCCTCTGATGCCGCGCTATCAG
AACTGTGCCTTCTTCACAGAGCCGTCAGGAAAAACTCTAAGCCTATGGTGGAAATGCTCT
TGAGATACGCTCCTAAGCAGCGAAGAATACACAGCTTGTTTAGACCCGATCTGCTGGTCC
AGCAGGTTTAACACCTCTTCACATTGCAGCCGGTAAAGATGGTTCAGAAGATGTGCTGGA
CGCTCTTACAGAAGATCCAGCAATGGTGGGGATTGGAGCATGGAGAACATCTAGGGACAG
GAAGGCAGTCTGTAGCATACAGACCAGCTATGTTGTCAATGGTGGCGATTGCTGCGGTTT
GCGTCTGTGTGGCACTTCTCTTCAAGAGTTGCCCAGAAGTGCTTTATGTGTTTCAACCTT
TCAGGTGGGAGTTGTTGGACTATGAGACAAGATGAGTGCAAGCAAGTCTTACGTTGAAGA
ATCTTCTTCCTAAGATATGAAATAAAAATGTTTACTTATATATAAAAAGTGTGATTTCTA
TATGTAACTATATAAGATATATAGAGACATGTACTTTAGAAGGTTGTTTGTGTGTAAAAC
CTGGTGGATTCGCTTTCTGTAACTCTCTGATTAGTATATTTTATTTGTTGACATGATTAT
ATATTTTTGTAACTTTATAATGGAGATGATGTTTGTACCT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL6364Contig1 588 2 1 U
GCTCGTTCCTTTGAACACTCTCTACCTCACAAGCCTGGTGTTAAGGAAGCCTCCTTACGG
TTCACACAAATTTACCGGAGTAGAGAAGTTGGTCAGTCTTATGTGACTTCGGTTTGGACT
ACTATTGTTGCTATTGTTCATGCTCTTTGCCTCATGATCCGGATCAGACCCCAAGTGATC
CTTTGCAATGGTCCTGGGACCTGTATTCCTCTCTGTGTGATCGCTTTCTTGTTCAAGGTG
CTGGGAATTAGATGGTCATCGATCTTTTATGTTGAGAGTGTAGCAAGAGTTAAGAAGCTC
TCTTTAAGTGGATTGCTTCTCTATAAGTTAAGGATTGCTGATCAGTTCTTTGTTCAATGG
CCACATCTCCAAAAGAACTACCCTCGTGCTCACTATGTTGGCTGCCTCATGTAAAGCTCA
TTTCAGGAACCATCCTCACACATGCATTGTCTACAATAACTTAGAATAAAGCTACAAAGT
CTACCACTCTCTCTTTATATACAGGACTGAATCACATTTGGTAATACTACTCTTCTTTGG
TTGCTATGAACTTGAGTTTTGTAAACAAAGTCGTGCACTATTTCAAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2HB19JQ C 1
AF RR2HB19TF U 1
BS 1 588 RR2HB19TF

RD RR2HB19JQ 588 0 0
GCTCGTTCCTTTGAACACTCTCTACCTCACAAGCCTGGTGTTAAGGAAGCCTCCTTACGG
TTCACACAAATTTACCGGAGTAGAGAAGTTGGTCAGTCTTATGTGACTTCGGTTTGGACT
ACTATTGTTGCTATTGTTCATGCTCTTTGCCTCATGATCCGGATCAGACCCCAAGTGATC
CTTTGCAATGGTCCTGGGACCTGTATTCCTCTCTGTGTGATCGCTTTCTTGTTCAAGGTG
CTGGGAATTAGATGGTCATCGATCTTTTATGTTGAGAGTGTAGCAAGAGTTAAGAAGCTC
TCTTTAAGTGGATTGCTTCTCTATAAGTTAAGGATTGCTGATCAGTTCTTTGTTCAATGG
CCACATCTCCAAAAGAACTACCCTCGTGCTCACTATGTTGGCTGCCTCATGTAAAGCTCA
TTTCAGGAACCATCCTCACACATGCATTGTCTACAATAACTTAGAATAAAGCTACAAAGT
CTACCACTCTCTCTTTATATACAGGACTGAATCACATTTGGTAATACTACTCTTCTTTGG
TTGCTATGAACTTGAGTTTTGTAAACAAAGTCGTGCACTATTTCAAGG

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2HB19TF 588 0 0
GCTCGTTCCTTTGAACACTCTCTACCTCACAAGCCTGGTGTTAAGGAAGCCTCCTTACGG
TTCACACAAATTTACCGGAGTAGAGAAGTTGGTCAGTCTTATGTGACTTCGGTTTGGACT
ACTATTGTTGCTATTGTTCATGCTCTTTGCCTCATGATCCGGATCAGACCCCAAGTGATC
CTTTGCAATGGTCCTGGGACCTGTATTCCTCTCTGTGTGATCGCTTTCTTGTTCAAGGTG
CTGGGAATTAGATGGTCATCGATCTTTTATGTTGAGAGTGTAGCAAGAGTTAAGAAGCTC
TCTTTAAGTGGATTGCTTCTCTATAAGTTAAGGATTGCTGATCAGTTCTTTGTTCAATGG
CCACATCTCCAAAAGAACTACCCTCGTGCTCACTATGTTGGCTGCCTCATGTAAAGCTCA
TTTCAGGAACCATCCTCACACATGCATTGTCTACAATAACTTAGAATAAAGCTACAAAGT
CTACCACTCTCTCTTTATATACAGGACTGAATCACATTTGGTAATACTACTCTTCTTTGG
TTGCTATGAACTTGAGTTTTGTAAACAAAGTCGTGCACTATTTCAAGG

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL6365Contig1 831 2 2 U
TTTTTCTTTCGTTTTCGTCAAAAAAAAAAGAAAAAAAAACAATTGGGAAGGGATGGCGGT
TACGAAGAAATGGGCATCGACAATCTCGGTGGTGGCTTCATCTGTGTTTGCATTCATCAT
CGTCTTCCAGATTCCTCTCTTCCGAGTAGGGTGCAGGAACAGAACCTGCGAGTCACCTTT
GGAGGTTATAGCCTCTCAGTTGATTGGAAGCGAACTCCTTCCTTCATCTCTTGTCAAGAC
TCTCCTTTATCCTGGTGCCATTGCCAAGTCTCTTCTCCGTCGCTCTCCACTCCCAACCTA
CCACAACTTGTTCCACTTTTACCATTTCCACCACCTGAATCCAGCCTCCTCCTCCTCTCT
TTCAACCGATGATATCCGCCATCTTGAGGTGTTTGCTGGGTGCTGTTTATGTCTGCTAGG
AGCTTTGCTCAGCATCTTCAAACCCAGAAGACTAACCTTCATTGGCACCCTTTTGATCTA
TTGGGGTCTTCTCAGAGACATTCTTCTCTTCAACTCCTCCTCTGTTCGTGTCTACCCAAC
GCTCTTCCTCGCTTCAATCTCTGCATTCCTCTCCATACGAAGCGACGTCAGGAAGATCAT
CCATTGTTGCTGCTGTTGCACTTCTAAGCCCCTTTCCAAATCTCTCTGACACTCACAATA
CTCAAAAAACGGAGACTAATCTTCTTACTTAGAGATTCCAAAGAGGTAGTAGAATAAGAA
GTCACTATTATTACTCTTGTAATCATCATCAGATAAAACTGTTAAAAAGCTTGTCATTTC
TGCGGATTACAAAAAAAAAAACTGCTTCTATATAAGCTAGAATCTTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ95TF U 1
AF RR2DJ95JQ C 271
BS 1 532 RR2DJ95TF
BS 533 831 RR2DJ95JQ

RD RR2DJ95TF 532 0 0
TTTTTCTTTCGTTTTCGTCAAAAAAAAAAGAAAAAAAAACAATTGGGAAGGGATGGCGGT
TACGAAGAAATGGGCATCGACAATCTCGGTGGTGGCTTCATCTGTGTTTGCATTCATCAT
CGTCTTCCAGATTCCTCTCTTCCGAGTAGGGTGCAGGAACAGAACCTGCGAGTCACCTTT
GGAGGTTATAGCCTCTCAGTTGATTGGAAGCGAACTCCTTCCTTCATCTCTTGTCAAGAC
TCTCCTTTATCCTGGTGCCATTGCCAAGTCTCTTCTCCGTCGCTCTCCACTCCCAACCTA
CCACAACTTGTTCCACTTTTACCATTTCCACCACCTGAATCCAGCCTCCTCCTCCTCTCT
TTCAACCGATGATATCCGCCATCTTGAGGTGTTTGCTGGGTGCTGTTTATGTCTGCTAGG
AGCTTTGCTCAGCATCTTCAAACCCAGAAGACTAACCTTCATTGGCACCCTTTTGATCTA
TTGGGGTCTTCTCAGAGACATTCTTCTCTTCAACTCCTCCTCTGTTCGTGTC

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2DJ95JQ 561 0 0
TCTTCTCCGTCGCTCTCCACTCCCAACCTACCACAACTTGTTCCACTTTTACCATTTCCA
CCACCTGAATCCAGCCTCCTCCTCCTCTCTTTCAACCGATGATATCCGCCATCTTGAGGT
GTTTGCTGGGTGCTGTTTATGTCTGCTAGGAGCTTTGCTCAGCATCTTCAAACCCAGAAG
ACTAACCTTCATTGGCACCCTTTTGATCTATTGGGGTCTTTTCAGAGACATTCTTCTCTT
CAACTCCTCCTCTGTTCGTGTCTACCCAACGCTCTTCCTCGCTTCAATCTCTGCATTCCT
CTCCATACGAAGCGACGTCAGGAAGATCATCCATTGTTGCTGCTGTTGCACTTCTAAGCC
CCTTTCCAAATCTCTCTGACACTCACAATACTCAAAAAACGGAGACTAATCTTCTTACTT
AGAGATTCCAAAGAGGTAGTAGAATAAGAAGTCACTATTATTACTCTTGTAATCATCATC
AGATAAAACTGTTAAAAAGCTTGTCATTTCTGCGGATTACAAAAAAAAAAACTGCTTCTA
TATAAGCTAGAATCTTTGTTC

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL6366Contig1 588 2 1 U
GGAGGCAACAGATTACAAACTTACAGGGAAGCCGTGCTCAGATTAGAGGTGTAACCACTC
ACACACAGGCTCTGTATGCGAGCACTTCGATTTCTTCTGGTATGAAAGGTGCAACCAAAG
CTATGGTTGCAATGAACAAGCAAATGGCACCAACGAAACAAGCCAAGGTGATTAAGGACT
TCCAGAAACAGTCTGCACAGCTAGACATGACGATAGAGATGATGTCAGAGGCAATTGATG
AAACACTTGACAAAGATGAGGCTGAAGAAGAAACAGACGACCTCACTAACCAAGTTCTTG
ATGAGATTGGTGTTGGAGTTGCATCTCAGTTATCTTCAGCTCCAAAAGGTCGCATCGCTA
CAAAAACTGCAGCTCCTCCTACTACCACTGCCAACAGCAACAGCTCTGAATCAAGTGAAG
TGGATGAGCTTGAAAAGAGGTTGGCTTCACTGCGAAGAATCTGAGAGTCAGCTTTTATGC
ATGCTGTATGATTAAATAAAAAAAATAACAGCTTCCCTTTTTTTTCTTTTTGCTTCTTGT
GATCTCTGTATAAATCTACTGAAACTTATTACGTTGGAAGCTTAATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BB59JQ C 1
AF RR2BB59TF U 1
BS 1 588 RR2BB59TF

RD RR2BB59JQ 588 0 0
GGAGGCAACAGATTACAAACTTACAGGGAAGCCGTGCTCAGATTAGAGGTGTAACCACTC
ACACACAGGCTCTGTATGCGAGCACTTCGATTTCTTCTGGTATGAAAGGTGCAACCAAAG
CTATGGTTGCAATGAACAAGCAAATGGCACCAACGAAACAAGCCAAGGTGATTAAGGACT
TCCAGAAACAGTCTGCACAGCTAGACATGACGATAGAGATGATGTCAGAGGCAATTGATG
AAACACTTGACAAAGATGAGGCTGAAGAAGAAACAGACGACCTCACTAACCAAGTTCTTG
ATGAGATTGGTGTTGGAGTTGCATCTCAGTTATCTTCAGCTCCAAAAGGTCGCATCGCTA
CAAAAACTGCAGCTCCTCCTACTACCACTGCCAACAGCAACAGCTCTGAATCAAGTGAAG
TGGATGAGCTTGAAAAGAGGTTGGCTTCACTGCGAAGAATCTGAGAGTCAGCTTTTATGC
ATGCTGTATGATTAAATAAAAAAAATAACAGCTTCCCTTTTTTTTCTTTTTGCTTCTTGT
GATCTCTGTATAAATCTACTGAAACTTATTACGTTGGAAGCTTAATTG

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2BB59TF 588 0 0
GGAGGCAACAGATTACAAACTTACAGGGAAGCCGTGCTCAGATTAGAGGTGTAACCACTC
ACACACAGGCTCTGTATGCGAGCACTTCGATTTCTTCTGGTATGAAAGGTGCAACCAAAG
CTATGGTTGCAATGAACAAGCAAATGGCACCAACGAAACAAGCCAAGGTGATTAAGGACT
TCCAGAAACAGTCTGCACAGCTAGACATGACGATAGAGATGATGTCAGAGGCAATTGATG
AAACACTTGACAAAGATGAGGCTGAAGAAGAAACAGACGACCTCACTAACCAAGTTCTTG
ATGAGATTGGTGTTGGAGTTGCATCTCAGTTATCTTCAGCTCCAAAAGGTCGCATCGCTA
CAAAAACTGCAGCTCCTCCTACTACCACTGCCAACAGCAACAGCTCTGAATCAAGTGAAG
TGGATGAGCTTGAAAAGAGGTTGGCTTCACTGCGAAGAATCTGAGAGTCAGCTTTTATGC
ATGCTGTATGATTAAATAAAAAAAATAACAGCTTCCCTTTTTTTTCTTTTTGCTTCTTGT
GATCTCTGTATAAATCTACTGAAACTTATTACGTTGGAAGCTTAATTG

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL6367Contig1 597 2 1 U
GATAATGGCTTTTATGGTAATTTACCGACGACGGCCCACGATGATGATGGGCCAGTGAGA
CGGGCCCTTAGCGCCGGAGATCCGCCGAGGAGTAGCAGAAGAGAAAGCAGCACGGTGTGG
AGTGAGAGCAATGCAATAATCGAAGGTATGAGCAAACCCTATAAGTACAGTCCTGAGGAG
AAGAAAGAGAGGATCGAAAAATATCGTAGCAAACGAAATCTTAGGAATTTCAACAAGAGG
ATTAAGTATGAATGCAGGAAGACATTAGCGGACAGTAGGCCAAGAATAAGAGGAAGATTT
GCAAGGAATGATGAGATGTCACAACAAGAACAAGTTGATGTAGTCGAAGCTGTCGTTGGA
GATGTTGACACGTGGGCATCTTTTCTTGAATCTTTCTCTTCTAATCACTTCCTTAATTAA
CTTGTGCTAAAGCCTGTTCTTCAAAAAAAAAAATTAACTTGTGCTAGTTATGTTTATGTT
TTTCATTTCTTATGTATGTTTATATAGCACTTAATTTGTTGGTTTACAAGATTGCACCAT
GTTTCTAAACTCATGTAGGTTTTGGGTTTCATTGTAAATAAGAATAACATATTTTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B676JQ C 1
AF RR2B676TF U 1
BS 1 597 RR2B676TF

RD RR2B676JQ 597 0 0
GATAATGGCTTTTATGGTAATTTACCGACGACGGCCCACGATGATGATGGGCCAGTGAGA
CGGGCCCTTAGCGCCGGAGATCCGCCGAGGAGTAGCAGAAGAGAAAGCAGCACGGTGTGG
AGTGAGAGCAATGCAATAATCGAAGGTATGAGCAAACCCTATAAGTACAGTCCTGAGGAG
AAGAAAGAGAGGATCGAAAAATATCGTAGCAAACGAAATTTTAGGAATTTCAACAAGAGG
ATTAAGTATGAATGCAGGAAGACATTAGCGGACAGTAGGCCAAGAATAAGAGGAAGATTT
GCAAGGAATGATGAGATGTCACAACAAGAACAAGTTGATGTAGTCGAAGCTGTCGTTGGA
GATGTTGACACGTGGGCATCTTTTCTTGAATCTTTTTCTTCTAATCACTTCCTTAATTAA
CTTGTGCTAAAGCCTGTTTTTCAAAAAAAAAAATTAACTTGTGCTAGTTATGTTTATGTT
TTTCATTTCTTATGTATGTTTATATAGCACTTAATTTGTTGGTTTACAAGATTGCACCAT
GTTTCTAAACTCATGTAGGTTTTGGGTTTCATTGTAAATAAGAATAACATATTTTGT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2B676TF 597 0 0
GATAATGGCTTTTATGGTAATTTACCGACGACGGCCCACGATGATGATGGGCCAGTGAGA
CGGGCCCTTAGCGCCGGAGATCCGCCGAGGAGTAGCAGAAGAGAAAGCAGCACGGTGTGG
AGTGAGAGCAATGCAATAATCGAAGGTATGAGCAAACCCTATAAGTACAGTCCTGAGGAG
AAGAAAGAGAGGATCGAAAAATATCGTAGCAAACGAAATCTTAGGAATTTCAACAAGAGG
ATTAAGTATGAATGCAGGAAGACATTAGCGGACAGTAGGCCAAGAATAAGAGGAAGATTT
GCAAGGAATGATGAGATGTCACAACAAGAACAAGTTGATGTAGTCGAAGCTGTCGTTGGA
GATGTTGACACGTGGGCATCTTTTCTTGAATCTTTCTCTTCTAATCACTTCCTTAATTAA
CTTGTGCTAAAGCCTGTTCTTCAAAAAAAAAAATTAACTTGTGCTAGTTATGTTTATGTT
TTTCATTTCTTATGTATGTTTATATAGCACTTAATTTGTTGGTTTACAAGATTGCACCAT
GTTTCTAAACTCATGTAGGTTTTGGGTTTCATTGTAAATAAGAATAACATATTTTGT

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL6368Contig1 1355 2 10 U
GGAATCTAGTTGCTTTGGTCGGAAAAAAAAGGGTTAAAAAAAAAAAAAAATTGGATTAAA
CGATTCAGATGGTTTCGCAGATGATCTCGTGTTTAACTAAATCTCCGTCTCTTTTCTGCA
TCTCCGGTCCCCGGAGTTTAATTCCGCCGAAGACTTATTATAACCGCGGCGGTTTGTACC
GGTTTTCTCTGGGATTCGCTAGCCGCCGGTTATCTACGGTTAACCGGAGGAAATGGAGAT
CCGCGTGCATTTTCAATTCAGGGAAAGAGACTGAAGGAGAGGGAAAGTTGAAGGGAGGTG
GGTCAGAGTGGTCGATAATTGAGAGATGGGAAGTGCCATGGGAATGGCAGACAGTTTCTT
TAACTTCGCTTGCTTGTGGTTTAAGGTACTCTCCATCAAAACCTTACCTTTGGGACGAAT
TAGGTTTTAAGTTTGATGAAACTTCTTAAACCCTATGATGAGAATATTATCATCTCATAG
CTTCTTAGTGAGATTAACTTAGTTCCCAGGCAGTTTTGTTTTGACAGGGTTAACTGAGAT
GGTAGCCATGCCGTATCTAGGAATCGATGTTCAGAAGCTGAGCATGGACGAAAAGGCGGA
GATTTTATTCCTGGATCAAGGCTTAACAACTGCAGTGGTACTTGCTGTCATTTTCACCGT
TGCCAGAACATTCGAGCCACTTCCTCCAGACATTTTGCGCTACGAATTGAAAGAACCCTT
TAACTTGCGAAAAGGATGGGTCGTGTGGAGTGGGATCGGTCTGGTTGGTGCTGTTGGCGC
TATTGCGTTAACAGGTGTTGCTTTGTCCTTATTCAGGACAGAGACACCTGAAAGAGAGGT
AGACTCTTTGATGAAGCTTCTCCCATTAATTGGATCCTCAAACGTAAGCACGTTAGGCTT
AGTGGGGATAACTGGAGTCCTTGCTCCACTTCTCGAGGAGACAGTGTTTCGCGGATTCTT
CATGGTCTCTCTTACCAAATGGGTGCCGACCCCAATAGCGATCATCATCAGCTCAGCTGC
GTTTGCACTTGCGCACCTCACACCCGGTGAATTCCCGCAGCTGTTTATACTAGGTTCGGT
TTTGGGATTATCGTATGCGCAGACCCGTAATCTCATTACCCCCATGGTCATACATGGTTT
CTGGAACTCGGGAGTTATTTTGCTGCTCACTTTTCTTCAGGTCCAAGGGTATGACATCAA
GGAACTGTTATTGCAGGGAAACTAGCTTTTGCTCTTCCTTTCTGTCCGCAATTAACATGT
AAAGGCTTCTTGTACGATTCTCGTTCCTAGTAAGTTTTGTTTTTATTCGACGAAAGAATT
CAAAACTTTGATGCAAGACTTTTTGAGTTTTGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E121TF U 1
AF RR2E121JQ C 647
BS 1 714 RR2E121TF
BS 715 715 RR2E121JQ
BS 716 732 RR2E121TF
BS 733 733 RR2E121JQ
BS 734 774 RR2E121TF
BS 775 775 RR2E121JQ
BS 776 794 RR2E121TF
BS 795 795 RR2E121JQ
BS 796 806 RR2E121TF
BS 807 1355 RR2E121JQ

RD RR2E121TF 806 0 0
GGAATCTAGTTGCTTTGGTCGGAAAAAAAAGGGTTAAAAAAAAAAAAAAATTGGATTAAA
CGATTCAGATGGTTTCGCAGATGATCTCGTGTTTAACTAAATCTCCGTCTCTTTTCTGCA
TCTCCGGTCCCCGGAGTTTAATTCCGCCGAAGACTTATTATAACCGCGGCGGTTTGTACC
GGTTTTCTCTGGGATTCGCTAGCCGCCGGTTATCTACGGTTAACCGGAGGAAATGGAGAT
CCGCGTGCATTTTCAATTCAGGGAAAGAGACTGAAGGAGAGGGAAAGTTGAAGGGAGGTG
GGTCAGAGTGGTCGATAATTGAGAGATGGGAAGTGCCATGGGAATGGCAGACAGTTTCTT
TAACTTCGCTTGCTTGTGGTTTAAGGTACTCTCCATCAAAACCTTACCTTTGGGACGAAT
TAGGTTTTAAGTTTGATGAAACTTCTTAAACCCTATGATGAGAATATTATCATCTCATAG
CTTCTTAGTGAGATTAACTTAGTTCCCAGGCAGTTTTGTTTTGACAGGGTTAACTGAGAT
GGTAGCCATGCCGTATCTAGGAATCGATGTTCAGAAGCTGAGCATGGACGAAAAGGCGGA
GATTTTATTCCTGGATCAAGGCTTAACAACTGCAGTGGTACTTGCTGTCATTTTCACCGT
TGCCAGAACATTCGAGCCACTTCCTCCAGACATTTTGCGCTACGAATTGAAAGA*CCCTT
TAACTTGCGAAA*GGATGGGTCGTGTGGAGTGGGATCGGTCTGGTTGGTGCTGT*GGCGC
TATTGCGTTAACAG*TGTTGCTTTGT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2E121JQ 709 0 0
GTCATTTTCACCGTTGCCAGAACATTCGAGCCACTTCCTCCAGACATTTTGCGCTACGAA
TTGAAAGAACCCTTTAACTTGCGAAAAGGATGGGTCGTGTGGAGTGGGATCGGTCTGGTT
GGTGCTGTTGGCGCTATTGCGTTAACAGGTGTTGCTTTGTCCTTATTCAGGACAGAGACA
CCTGAAAGAGAGGTAGACTCTTTGATGAAGCTTCTCCCATTAATTGGATCCTCAAACGTA
AGCACGTTAGGCTTAGTGGGGATAACTGGAGTCCTTGCTCCACTTCTCGAGGAGACAGTG
TTTCGCGGATTCTTCATGGTCTCTCTTACCAAATGGGTGCCGACCCCAATAGCGATCATC
ATCAGCTCAGCTGCGTTTGCACTTGCGCACCTCACACCCGGTGAATTCCCGCAGCTGTTT
ATACTAGGTTCGGTTTTGGGATTATCGTATGCGCAGACCCGTAATCTCATTACCCCCATG
GTCATACATGGTTTCTGGAACTCGGGAGTTATTTTGCTGCTCACTTTTCTTCAGGTCCAA
GGGTATGACATCAAGGAACTGTTATTGCAGGGAAACTAGCTTTTGCTCTTCCTTTCTGTC
CGCAATTAACATGTAAAGGCTTCTTGTACGATTCTCGTTCCTAGTAAGTTTTGTTTTTAT
TCGACGAAAGAATTCAAAACTTTGATGCAAGACTTTTTGAGTTTTGGAT

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL6369Contig1 787 2 10 U
GGGTTCGAGATTATTCTAGCGACTTGCGACTTCCTTCCTTCTCTGAGTGTCACCTATGCA
AAATCAAACCGTCGTGCCTTCGCCATCGATTTGCAGGTTGGTGCAGGTATAATGTTGAAG
CAAGTTGTTGGCAAGTATTCGATAGGTAAAGCATTTTATGGAAGTGACAGAGCAAAGCTT
AGACCCTTCTTATACCAAACCAACTGTCGATTTCACAATGGGCAGACTGTTCTTGCTCCG
AGAAGCTTCTTTGGCGTAGAATACTACGTCGACGATGACACAAGCCGACCATACACATAC
CAAAAAGAGAAAAAGTCGAAGAATCCTGACAAACACGTCTCCTTCAAGCAACGGACAGTG
GCGTACATGGAGCCATTCACACTCGACGTCTTCATCTCAAAACGTTTCGTATCCGCATCT
CTCACGCACCGTGTCACGTGCAAGCAAGTCGCGGTTGCGGGAACGAACTCAAAAGACGTA
AAAGCGGTGTTGAGGTCGAGATGCGATATCCCGGCTTGCATGTCCATAGGGAGGATCTTG
TCCGAACGTGCTAAAGAGGCTGATGTGTACACTGCTTCTTACACGCCGCGAGACCAAGAC
AAGTTTGAAGGGAAAATCAGAGCTGTTGTCCAGTCCCTTATTGATAACGGAATCGATGTC
AAAATCTACCTGGATTAGATACCAAAATGGTTTGGTTCTGTGTTTTAGAAAAAAAAACTA
AGGTTTGACTTCTAAGTGTACTTGCTATGTATCTGTTTAATCACCACAAATAAAGCATCA
GTTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H057TF U 1
AF RR2H057JQ C 82
BS 1 646 RR2H057TF
BS 647 647 RR2H057JQ
BS 648 663 RR2H057TF
BS 664 664 RR2H057JQ
BS 665 675 RR2H057TF
BS 676 676 RR2H057JQ
BS 677 705 RR2H057TF
BS 706 706 RR2H057JQ
BS 707 715 RR2H057TF
BS 716 787 RR2H057JQ

RD RR2H057TF 715 0 0
GGGTTCGAGATTATTCTAGCGACTTGCGACTTCCTTCCTTCTCTGAGTGTCACCTATGCA
AAATCAAACCGTCGTGCCTTCGCCATCGATTTGCAGGTTGGTGCAGGTATAATGTTGAAG
CAAGTTGTTGGCAAGTATTCGATAGGTAAAGCATTTTATGGAAGTGACAGAGCAAAGCTT
AGACCCTTCTTATACCAAACCAACTGTCGATTTCACAATGGGCAGACTGTTCTTGCTCCG
AGAAGCTTCTTTGGCGTAGAATACTACGTCGACGATGACACAAGCCGACCATACACATAC
CAAAAAGAGAAAAAGTCGAAGAATCCTGACAAACACGTCTCCTTCAAGCAACGGACAGTG
GCGTACATGGAGCCATTCACACTCGACGTCTTCATCTCAAAACGTTTCGTATCCGCATCT
CTCACGCACCGTGTCACGTGCAAGCAAGTCGCGGTTGCGGGAACGAACTCAAAAGACGTA
AAAGCGGTGTTGAGGTCGAGATGCGATATCCCGGCTTGCATGTCCATAGGGAGGATCTTG
TCCGAACGTGCTAAAGAGGCTGATGTGTACACTGCTTCTTACACGCCGCGAGACCAAGAC
AAGTTTGAAGGGAAAATCAGAGCTGTTGTCCAGTCCCTTATTGATA*CGGAATCGATGTC
AAA*TCTACCTGGAT*AGATACCAAAATGGTTTGGTTCTGTGTTT*AGAAAAAAA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2H057JQ 706 0 0
GCCATCGATTTGCAGGTTGGTGCAGGTATAATGTTGAAGCAAGTTGTTGGCAAGTATTCG
ATAGGTAAAGCATTTTATGGAAGTGACAGAGCAAAGCTTAGACCCTTTTTATACCAAACC
AACTGTCGATTTCACAATGGGCAGACTGTTCTTGCTCCGAGAAGCTTCTTTGGCGTAGAA
TACTACGTCGACGATGACACAAGCCGACCATACACATACCAAAAAGAGAAAAAGTCGAAG
AATCCTGACAAACACGTTTCCTTCAAGCAACGGACAGTGGCGTACATGGAGCCATTCACA
CTCGACGTTTTCATCTCAAAACGTTTTGTATCCGCATTTCTCACGCACCGTGTCACGTGC
AAGCAAGTCGCGGTTGCGGGAACGAACTCAAAAGACGTAAAAGCGGTGTTGAGGTCGAGA
TGCGATATCCCGGCTTGCATGTCCATAGGGAGGATCTTGTCCGAACGTGCTAAAGAGGGT
GATGTGTACACTGCTTTTTACACGCCGCGAGACCAAGACAAGTTTGAAGGGAAAATCAGA
GCTGTTGTCCAGTCCCTTATTGATAACGGAATCGATGTCAAAATCTACCTGGATTAGATA
CCAAAATGGTTTGGTTCTGTGTTTTAGAAAAAAAAACTAAGGTTTGACTTCTAAGTGTAC
TTGCTATGTATCTGTTTAATCACCACAAATAAAGCATCAGTTCACG

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL6370Contig1 857 2 3 U
GAGGTGGAGGCGGAGGTGATGCTGGAGGTGCAGCTGATAGAGTCCTGAACCAGCTTTTGA
CTGAGATGGATGGGATGAACGCAAAGAAGACTGTCTTCATCATCGGAGCGACCAACAGAC
CCGACATTATTGACTCTGCTCTCCCCCGTCCTGGGAGGCTCGACCAGCTCATTTACATTC
CGCTGCCGGACGAGGATTCACGTCTCAACATCTTCAAGGCCGCTTTGAGGAAGTCTCCTA
TTGCTAAAGATGTTGACATCAACGCTCTGGCTAAGTACACGCAGGGATTCAGTGGTGCTG
ATATCACTGAGATTTGCCAGAGGGCTTGCAAATACGCCATCAGAGAAAACATCGAGAAGG
ACATTGAGAAGGAGAAGAGGAGGAGCGAGAATCCAGAGGCCATGGAGGAAGATGTAGTGG
ATGAAGTGTCAGAGATCAAGGCTGCACATTTTGAGGAGTCGATGAAGTATGCGCGCAGGA
GTGTGAGTGATGCAGACATCAGGAAGTACCAAGCCTTTGCCCAGACGCTGCAGCAGTCTA
GAGGGTTTGGTTCTGAGTTCAGGTTCGAGACTAACGCTGCTGGTTCAGGTGCAACTACTG
GAGTGGCTGATCCGTTTGCCACCTCGGCAGCTGCTGCTGCGGACGATGATGATCTCTACA
ACTAAAAGATCCATCCTTTCTAATATTTTAAGTTGTCAATCGAATTCAGACTCGGAAAAG
TGATACTCTCATCTTTTCATAGTGTTTTTAAGTTTATCAGAAACTTTGTTTGACATTTTA
ATCAATGCTCTTTGTTATGTTTGGGCGGCAGTTAAAAGTAGTACATGCCCCAATAAAAGC
TCAAATTTACATCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO39TF U 19
AF RR2AO39JQ C 1
BS 1 18 RR2AO39JQ
BS 19 815 RR2AO39TF
BS 816 857 RR2AO39JQ

RD RR2AO39TF 797 0 0
ATGCTGGAGGTGCAGCTGATAGAGTCCTGAACCAGCTTTTGACTGAGATGGATGGGATGA
ACGCAAAGAAGACTGTCTTCATCATCGGAGCGACCAACAGACCCGACATTATTGACTCTG
CTCTCCCCCGTCCTGGGAGGCTCGACCAGCTCATTTACATTCCGCTGCCGGACGAGGATT
CACGTCTCAACATCTTCAAGGCCGCTTTGAGGAAGTCTCCTATTGCTAAAGATGTTGACA
TCAACGCTCTGGCTAAGTACACGCAGGGATTCAGTGGTGCTGATATCACTGAGATTTGCC
AGAGGGCTTGCAAATACGCCATCAGAGAAAACATCGAGAAGGACATTGAGAAGGAGAAGA
GGAGGAGCGAGAATCCAGAGGCCATGGAGGAAGATGTAGTGGATGAAGTGTCAGAGATCA
AGGCTGCACATTTTGAGGAGTCGATGAAGTATGCGCGCAGGAGTGTGAGTGATGCAGACA
TCAGGAAGTACCAAGCCTTTGCCCAGACGCTGCAGCAGTCTAGAGGGTTTGGTTCTGAGT
TCAGGTTCGAGACTAACGCTGCTGGTTCAGGTGCAACTACTGGAGTGGCTGATCCGTTTG
CCACCTCGGCAGCTGCTGCTGCGGACGATGATGATCTCTACAACTAAAAGATCCATCCTT
TCTAATATTTTAAGTTGTCAATCGAATTCAGACTCGGAAAAGTGATACTCTCATCTTTTC
ATAGTGTTTTTAAGTTTATCAGAAACTTTGTTTGACATTTTAATCAATGCTCTTTGTTAT
GTTTGGGCGGCAGTTAA

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2AO39JQ 857 0 0
GAGGTGGAGGCGGAGGTGATGCTGGAGGTGCAGCTGATAGAGTCCTGAACCAGCTTTTGA
CTGAGATGGATGGGATGAACGCAAAGAAGACTGTCTTCATCATCGGAGCGACCAACAGAC
CCGACATTATTGACTCTGCTCTCCCCCGTCCTGGGAGGCTCGACCAGCTCATTTACATTC
CGCTGCCGGACGAGGATTCACGTCTCAACATCTTCAAGGCCGCTTTGAGGAAGTCTCCTA
TTGCTAAAGATGTTGACATCAACGCTCTGGCTAAGTACACGCAGGGATTCAGTGGTGCTG
ATATCACTGAGATTTGCCAGAGGGCTTGCAAATACGCCATCAGAGAAAACATCGAGAAGG
ACATTGAGAAGGAGAAGAGGAGGAGCGAGAATCCAGAGGCCATGGAGGAAGATGTAGTGG
ATGAAGTGTCAGAGATCAAGGCTGCACATTTTGAGGAGTCGATGAAGTATGCGCGCAGGA
GTGTGAGTGATGCAGACATCAGGAAGTACCAAGCCTTTGCCCAGACGCTGCAGCAGTCTA
GAGGGTTTGGTTCTGAGTTCAGGTTCGAGACTAACGCTGCTGGTTCAGGTGCAACTACTG
GAGTGGCTGATCCGTTTGCCACCTCGGCAGCTGCTGCTGCGGACGATGATGATCTCTACA
ACTAAAAGATCCATCCTTTCTAATATTTTAAGTTGTCAATCGAATTCAGACTCGGAAAAG
TGATACTCTCATCTTTTCATAGTGTTTTTAAGTTTATCAGAAACTTTGTTTGACATTTTA
ATCAATGCTCTTTGTTATGTTTGGGCGGCAGTTAAAAGTAGTACATGCCCCAATAAAAGC
TCAAATTTACATCGACC

QA 1 857 1 857
DS 



AS 1 2

CO CL6371Contig1 806 2 2 U
AAAACAAAGGGAGTATTAAACTTATAGAGCAGTTCAACTTTTACAGAAACTGTATATAAT
AAATACAGTAAACTGAGAAAGAAAACATAGACATCTATATGAAAGGAGTTATATCCAACT
TGATTAATTTACGAAGATAGACCAGCAATGTATTTGATACCAGTTGCAGGCAGCCATAAG
TTCCCTTTTATGAACTGTGCCACCGTAAAGTTAATAGCTTCTGCCGAATTATTCAACAGA
TGGTACCCTGGCCACTTAACACGACGGTCAAGGCTAGCCCCCGGTCCGTTGTTCATATAT
TCGGCATAGTACAACGTGTCCAACGCAAAATTGCCGTTCCATTCGAGCCATCCTTCGGGC
TTGAGTACTTCACTCATGTAGTTTTGCATGAACACTGTTCTAGAATATAGTTTCCATGGC
CGACCCAGGTAAGTAAAAATGGTATTTAAGTTTGGAAATAGGTCTGTGTCAGCCGTTATG
TTACTAAATTGGATCATGAATCCGGTCGGCTGGTTAGGATCTTTACGTCCTTGAGCCGTG
ATGCTGTTCTTCTGGTTTGGTAGGCCTTGTTTTGCTTTGATTTGGCAGTCTTGAAATACA
GCTGTAGCGTCTCCAAACATGAAATCCACGGTGCCTGTTATAATGCATTCTCTAAAGAAT
TGACGCATTGTGTGGGCGTAGAGAGTATCTTGATAACCTCTCATCGCACATCGATAAAAA
CTCCGAGATCCGAGTCTGACCGGATTGCAACTGCTTGATGTTTTCCGGTCCTGCTGTGTT
TTGAAACGTTATGTCCCGTGCGAGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D507JQ U 1
AF RR2DU44JQ U 1
BS 1 720 RR2D507JQ
BS 721 806 RR2DU44JQ

RD RR2D507JQ 721 0 0
AAAACAAAGGGAGTATTAAACTTATAGAGCAGTTCAACTTTTACAGAAACTGTATATAAT
AAATACAGTAAACTGAGAAAGAAAACATAGACATCTATATGAAAGGAGTTATATCCAACT
TGATTAATTTACGAAGATAGACCAGCAATGTATTTGATACCAGTTGCAGGCAGCCATAAG
TTCCCTTTTATGAACTGTGCCACCGTAAAGTTAATAGCTTCTGCCGAATTATTCAACAGA
TGGTACCCTGGCCACTTAACACGACGGTCAAGGCTAGCCCCCGGTCCGTTGTTCATATAT
TCGGCATAGTACAACGTGTCCAACGCAAAATTGCCGTTCCATTCGAGCCATCCTTCGGGC
TTGAGTACTTCACTCATGTAGTTTTGCATGAACACTGTTCTAGAATATAGTTTCCATGGC
CGACCCAGGTAAGTAAAAATGGTATTTAAGTTTGGAAATAGGTCTGTGTCAGCCGTTATG
TTACTAAATTGGATCATGAATCCGGTCGGCTGGTTAGGATCTTTACGTCCTTGAGCCGTG
ATGCTGTTCTTCTGGTTTGGTAGGCCTTGTTTTGCTTTGATTTGGCAGTCTTGAAATACA
GCTGTAGCGTCTCCAAACATGAAATCCACGGTGCCTGTTATAATGCATTCTCTAAAGAAT
TGACGCATTGTGTGGGCGTAGAGAGTATCTTGATAACCTCTCATCGCACATCGATAAAAA
A

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2DU44JQ 806 0 0
AAAACAAAGGGAGTATTAAACTTATAGAGCAGTTCAACTTTTACAGAAACTGTATATAAT
AAATACAGTAAACTGAGAAAGAAAACATAGACATCTATATGAAAGGAGTTATATCCAACT
TGATTAATTTACGAAGATAGACCAGCAATGTATTTGATACCAGTTGCAGGCAGCCATAAG
TTCCCTTTTATGAACTGTGCCACCGTAAAGTTAATAGCTTCTGCCGAATTATTCAACAGA
TGGTACCCTGGCCACTTAACACGACGGTCAAGGCTAGCCCCCGGTCCGTTGTTCATATAT
TCGGCATAGTACAACGTGTCCAACGCAAAATTGCCGTTCCATTCGAGCCATCCTTCGGGC
TTGAGTACTTCACTCATGTAGTTTTGCATGAACACTGTTCTAGAATATAGTTTCCATGGC
CGACCCAGGTAAGTAGAAGTGGTATTTAAGTTTGGAAGTAGGTCTGTGTCAGCCGTTATG
TTACTAAATTGGATCATGAATCCGGTTGGCTGGTTAGGATCTTTACGTCCTTGAGCCGTG
ATGCTGTTCTTCTGGTTTGGTAGGCCTTGTTTTGCTTTGATTTGGCAGTCTTGAAATACA
GCTGTAGCGTCTCCAAACATGAAATCCACGGTGCCTGTTATAATGCATTCTCTAAAGAAT
TGACGCATTGTGTGGGCGTAGAGAGTATCTTGATAACCTCTCATCGCACATCGATAAAAA
CTCCGAGATCCGAGTCTGACCGGATTGCAACTGCTTGATGTTTTCCGGTCCTGCTGTGTT
TTGAAACGTTATGTCCCGTGCGAGAA

QA 1 806 1 806
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6375Contig1 1131 2 2 U
ATTTGTTCTTTTAAACTTTCATCGTCTCCGATTTTCTCTCACCTTACCACAATTCTCCAG
CTTCAACCTAACGCCAAGAGCCGCCTTTGGATTGATAATCAATTGAAGCAATCGAAATCG
ATCAGATAATTGCAGAGCGCAGCCTTTCTCAGGCAAAACTAGGAAATGGTTAAAAGGCAT
GGAGAGATTTGATTTGGTTAAGAAGATATCATGGCGCAGTGCATAGACGGTTTCAAGCAT
TTGTGCACCTCTGTTTAGGGTGTTTTGATCTTGATTTGTATAAGCAACCTGGTGGCCTTG
GAGACCCTGAGTTGCTTGCAAGAGATACTGTTTTTAGTGTGAGTGAAATAGAAGCTCTTT
ATGAGCTGTTTAAAAAAATCAGCAGTGCCGTCATTGATGATGGGTTGATTAACAAGGAAG
AGTTTCAGTTGGCTTTGTTTAAGACAAATAAAAAAGAGAGCTTGTTTGCTGATCGGGTTT
TTGGTTTGTTTGATACAAAACACAATGGAATACTTGGTTTTGAGGAGTTTGCTCGTGCTC
TCTCCGTTTTTCACCCAAATGCGCCTATAGATGACAAAATCCACTTTTCATTTCAGCTAT
ATGATCTTAAACAGCAAGGGTTCATTGAACGGCAAGAGGTGAAACAAATGGTTGTCGCCA
CGCTTGCTGAATCTGGAATGAACTTGAAGGATACTGTCATTGAGGATATAATCGACAAGA
CGTTTGAGGAAGCAGACACAAAACATGATGGAAAGATTGATAAGGAAGAGTGGAGAAGCC
TTGTTCTTAGACATCCCAGCCTTCTCAAGAACATGACTCTTCAGTATTTCAAGGATATCA
CGACTACGTTTCCAAGTTTTGTGTTCCATTCACAGGTTGGAGATACCTGAAGATTAAAAA
AAAAGGCAAGCAGCAAAAGACTTGATGGTTTGTTTTGTTCATTTGTTTCATTGAGCTTTT
TTGTGAAGCAATATACATAATTCATTTTATTTCTCTCAACTCCTATGTTTTTATTGAGGT
TTTTTTCTTTCTTGTGAAGCAAACTTCATATCGATTTCGCATCTTTGGTCAGGCCTATTT
TGTAGATATAACGTTTGCTTCTTGATATGATATATAAAGATTTTAATTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B960TF U 1
AF RR2B960JQ C 669
BS 1 827 RR2B960TF
BS 828 1131 RR2B960JQ

RD RR2B960TF 831 0 0
ATTTGTTCTTTTAAACTTTCATCGTCTCCGATTTTCTCTCACCTTACCACAATTCTCCAG
CTTCAACCTAACGCCAAGAGCCGCCTTTGGATTGATAATCAATTGAAGCAATCGAAATCG
ATCAGATAATTGCAGAGCGCAGCCTTTCTCAGGCAAAACTAGGAAATGGTTAAAAGGCAT
GGAGAGATTTGATTTGGTTAAGAAGATATCATGGCGCAGTGCATAGACGGTTTCAAGCAT
TTGTGCACCTCTGTTTAGGGTGTTTTGATCTTGATTTGTATAAGCAACCTGGTGGCCTTG
GAGACCCTGAGTTGCTTGCAAGAGATACTGTTTTTAGTGTGAGTGAAATAGAAGCTCTTT
ATGAGCTGTTTAAAAAAATCAGCAGTGCCGTCATTGATGATGGGTTGATTAACAAGGAAG
AGTTTCAGTTGGCTTTGTTTAAGACAAATAAAAAAGAGAGCTTGTTTGCTGATCGGGTTT
TTGGTTTGTTTGATACAAAACACAATGGAATACTTGGTTTTGAGGAGTTTGCTCGTGCTC
TCTCCGTTTTTCACCCAAATGCGCCTATAGATGACAAAATCCACTTTTCATTTCAGCTAT
ATGATCTTAAACAGCAAGGGTTCATTGAACGGCAAGAGGTGAAACAAATGGTTGTCGCCA
CGCTTGCTGAATCTGGAATGAACTTGAAGGATACTGTCATTGAGGATATAATCGACAAGA
CGTTTGAGGAAGCAGACACAAAACATGATGGAAAGATTGATAAGGAAGAGTGGAGAAGCC
TTGTTCTTAGACATCCCAGCCTTCTCAAGAACATGACTCTTCAGTAT
CTCA

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2B960JQ 463 0 0
GAATCTGGAATGAACTTGAAGGATACTGTCATTGAGGATATAATCGACAAGACGTTTGAG
GAAGCAGACACAAAACATGATGGAAAGATTGATAAGGAAGAGTGGAGAAGCCTTGTTCTT
AGACATCCCAGCCTTCTCAAGAACATGACTTTTCAGTATTTCAAGGATATCACGACTACG
TTTCCAAGTTTTGTGTTCCATTCACAGGTTGGAGATACCTGAAGATTAAAAAAAAAGGCA
AGCAGCAAAAGACTTGATGGTTTGTTTTGTTCATTTGTTTCATTGAGCTTTTTTGTGAAG
CAATATACATAATTCATTTTATTTCTCTCAACTCCTATGTTTTTATTGAGGTTTTTTTCT
TTCTTGTGAAGCAAACTTCATATCGATTTCGCATCTTTGGTCAGGCCTATTTTGTAGATA
TAACGTTTGCTTCTTGATATGATATATAAAGATTTTAATTTGT

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 2

CO CL6376Contig1 624 2 6 U
AGCGCCTCAGATTTTATTGTTTTTTATTTATTGTTCTTGTTTTGAAAATAGGCACTAATA
TTTAATTTTATTGTAGCTACTAAATCCATGGTAATTCACAGTCGTCTTCTTCTTCTTCTT
TTACGTCCTCCTTTGCCATATCGCCATTGAGAATCCATGTCCCGTCATGAGTTTTAACCA
TTCCTTTGTTCCCAAGAACCCACGAATCCCCAGGGACTAAGTACTTATCTTCAAGAGCAT
CTAAACCATTTTTAACCATCCCGATATCCCGGTTAATCTCCAGCTTGAGTTCTGATCGAT
TGTGTTGTGTCTCCGCCACGCCTTGCAAGTAGGCCTTCAGGTTGTGGAAATGCGCCAGGT
TAAGAGACCGTTTCAGGTACTCTGATTTCAGTGTGTTGATATGGAGCTCCTCCCCAACAT
CCGTGAACCTGAACAGCGGGTAATGTGGGATGAGATCAGGGACATTTGCTACTCTCAGGA
TGTTGAGTTGTTTGAGTGACTCGACGAGTGTTTTGAAGTTGCGGTCACCGATGCGGGGGC
TTCCGAAAGCGAAAACCGTGACACAAGAAAGCCTGTCTTGAAGACTTGGTGTGATCTTTG
CCCATTCGTTACGGAGAAAGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2C984TF C 1
AF RR2C984JQ U 36
BS 1 35 RR2C984TF
BS 36 600 RR2C984JQ
BS 601 601 RR2C984TF
BS 602 611 RR2C984JQ
BS 612 612 RR2C984TF
BS 613 624 RR2C984JQ

RD RR2C984TF 620 0 0
AGCGCCTCAGATTTTATTGTTTTTTATTTATTGTTCTTGTTTTGAAAATAGGCACTAATA
TTTAATTTTATTGTAGCTACTAAATCCATGGTAATTCACAGTCGTCTTCTTCTTCTTCTT
TTACGTCCTCCTTTGCCATATCGCCATTGAGAATCCATGTCCCGTCATGAGTTTTAACCA
TTCCTTTGTTCCCAAGAACCCACGAATCCCCAGGGACTAAGTACTTATCTTCAAGAGCAT
CTAAACCATTTTTAACCATCCCGATATCCCGGTTAATCTCCAGCTTGAGTTCTGATCGAT
TGTGTTGTGTCTCCGCCACGCCTTGCAAGTAGGCCTTCAGGTTGTGGAAATGCGCCAGGT
TAAGAGACCGTTTCAGGTACTCTGATTTCAGTGTGTTGATATGGAGCTCCTCCCCAACAT
CCGTGAACCTGAACAGCGGGTAATGTGGGATGAGATCAGGGACATTTGCTACTCTCAGGA
TGTTGAGTTGTTTGAGTGACTCGACGAGTGTTTTGAAGTTGCGGTCACCGATGCGGGGGC
TTCCGAAAGCGAAAACCGTGACACAAGAAAGCCTGTCTTGAAGACTTGGTGTGATCTTTG
CCCATTCGTTACGGAGAAAG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2C984JQ 589 0 0
CTTGTTTTGAAAATAGGCACTAATATTTAATTTTATTGTAGCTACTAAATCCATGGTAAT
TCACAGTCGTCTTCTTCTTCTTCTTTTACGTCCTCCTTTGCCATATCGCCATTGAGAATC
CATGTCCCGTCATGAGTTTTAACCATTCCTTTGTTCCCAAGAACCCACGAATCCCCAGGG
ACTAAGTACTTATCTTCAAGAGCATCTAAACCATTTTTAACCATCCCGATATCCCGGTTA
ATCTCCAGCTTGAGTTCTGATCGATTGTGTTGTGTCTCCGCCACGCCTTGCAAGTAGGCC
TTCAGGTTGTGGAAATGCGCCAGGTTAAGAGACCGTTTCAGGTACTCTGATTTCAGTGTG
TTGATATGGAGCTCCTCCCCAACATCCGTGAACCTGAACAGCGGGTAATGTGGGATGAGA
TCAGGGACATTTGCTACTCTCAGGATGTTGAGTTGTTTGAGTGACTCGACGAGTGTTTTG
AAGTTGCGGTCACCGATGCGGGGGCTTCCGAAAGCGAAAACCGTGACACAAGAAAGCCTG
TCTTGAAGACTTGGTGTGATCTTTGGCCATTCGTTATGGAGAAAGTCTC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL6377Contig1 1378 2 4 U
GGAGGTCGATCATCATGGAGTACGAAGATGTTGTGTCCATGGGGAGATCCGATTTCCAAG
TCATAAGACCAAAGGACGAGTGCGATGCGATCTCTCTGAACTACACTTCCGGAACCACTT
CGAGTCCCAAGGGCGTTGTCTACAGTCACAGAGGCGCTTATCTGAACTCTCTAGCGACAG
TTATACTCAACGAGATGCAATCCTCGCCTACTTACCTATGGACTAACCCCATGTTTCATT
GCAACGGCTGGTGTTTGATCTGGGGTGTTACCTCGATTGGTGGGACTCATATATGTCTGA
GGAATATAACAGCAAAGGGTGTGTTTGATAATATTTGTAAGCATAATGTGACTCACACGG
GAGGTGCACCGACTATACTGAACATGATCATCAACGCCAGCGATGATGAGAAGAAGCCGC
TTCCAGGGAAGGTGTCTTTTATAACCGGCGCTGCACCACCGCCGCCTCACGTGATTTACA
AGATGGAGGAGCTGGGGTCCTCTGTGTTTCACTCTTACGGGTTGACGGAGACTTACGGAC
CGGGCACGGTATGCACGTGGAAGCCTGAGTGGGAGTCTCTGCCTAGGGAAGAGCAGGCGA
AAATGAAGGCGAGGCAAGGAGTGAATCACGTTGGGATCGAAGAAGTCGCTGTTATGGATC
CTGTGACCATGAGGACTTTGCCGGCTGATGGTGTGAGTATGGGTGAGGTTGTCTTTAGAG
GGAACACGGTGATGAATGGTTACTTGAAGAACCCTGAGGCAACCAAAGAGTGTTTCAAGG
GAGGTTGGTTTTGGAGTGGGGACTTGGGTGTGAAGCATCCTGATGGGTACGTAGAGCTGA
AAGATAGGTCTAAAGACATAATAATCTCGGGAGGAGAAAACATTAGCTCGATCGAAGTCG
AGTCTGTTCTGTTTACTCATCCTTGCGTTCTCGAAGCAGCTGTGGTCGCGAGGCCTGATG
AGTATTGGGGTGAGACTGCTTGTGCGTTTGTGAAGCTTAAAGACGGGTATAAGGCCACGG
CCGAGGAGATTATAAGCTACTGCAGAGGGAAGCTTCCGCATTACATGGCTCCGAGGAGTA
TTGTATTCGAGGATCTTCCGAAAACATCGACTGGGGAAGTTCAGAAGTTTGTTCTGAGGA
GTAAGGCTGAGGCGTTGGGAAGCTTATCGAAGAAAGGAACAAGCAAGCTATGAACCGGTA
AGTGTTTTTTTTTGTGTCGTGTTGGTTAAGGTAAACCGGAAACATTGTACTACTACGTTC
AAGCCAAGTTGTGTCGTTCTGAAATAAAGCATCATGTTTGATTAAGATAAACAGGAATTG
ATTACTGTTTTAAAATAAACCAAGTTGAAATAAATAAAAACAGGTATGAGGGTTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B654TF U 1
AF RR2B654JQ C 544
BS 1 758 RR2B654TF
BS 759 759 RR2B654JQ
BS 760 812 RR2B654TF
BS 813 1378 RR2B654JQ

RD RR2B654TF 812 0 0
GGAGGTCGATCATCATGGAGTACGAAGATGTTGTGTCCATGGGGAGATCCGATTTCCAAG
TCATAAGACCAAAGGACGAGTGCGATGCGATCTCTCTGAACTACACTTCCGGAACCACTT
CGAGTCCCAAGGGCGTTGTCTACAGTCACAGAGGCGCTTATCTGAACTCTCTAGCGACAG
TTATACTCAACGAGATGCAATCCTCGCCTACTTACCTATGGACTAACCCCATGTTTCATT
GCAACGGCTGGTGTTTGATCTGGGGTGTTACCTCGATTGGTGGGACTCATATATGTCTGA
GGAATATAACAGCAAAGGGTGTGTTTGATAATATTTGTAAGCATAATGTGACTCACACGG
GAGGTGCACCGACTATACTGAACATGATCATCAACGCCAGCGATGATGAGAAGAAGCCGC
TTCCAGGGAAGGTGTCTTTTATAACCGGCGCTGCACCACCGCCGCCTCACGTGATTTACA
AGATGGAGGAGCTGGGGTCCTCTGTGTTTCACTCTTACGGGTTGACGGAGACTTACGGAC
CGGGCACGGTATGCACGTGGAAGCCTGAGTGGGAGTCTCTGCCTAGGGAAGAGCAGGCGA
AAATGAAGGCGAGGCAAGGAGTGAATCACGTTGGGATCGAAGAAGTCGCTGTTATGGATC
CTGTGACCATGAGGACTTTGCCGGCTGATGGTGTGAGTATGGGTGAGGTTGTCTTTAGAG
GGAACACGGTGATGAATGGTTACTTGAAGAACCCTGAG*CAACCAAAGAGTGTTTCAAGG
GAGGTTGGTTTTGGAGTGGGGACTTGGGTGTG

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR2B654JQ 835 0 0
GCACGGTATGCACGTGGAAGCCTGAGTGGGAGTCTCTGCCTAGGGAAGAGCAGGCGAAAA
TGAAGGCGAGGCAAGGAGTGAATCACGTTGGGATCGAAGAAGTCGCTGTTATGGATCCTG
TGACCATGAGGACTTTGCCGGCTGATGGTGTGAGTATGGGTGAGGTTGTCTTTAGAGGGA
ACACGGTGATGAATGGTTACTTGAAGAACCCTGAGGCAACCAAGGAGTGTTTCAAGGGAG
GTTGGTTTTGGAGTGGGGACTTGGGTGTGAAGCATCCTGATGGGTACGTAGAGCTGAAAG
ATAGGTCTAAAGACATAATAATCTCGGGAGGAGAAAACATTAGCTCGATCGAAGTCGAGT
CTGTTCTGTTTACTCATCCTTGCGTTCTCGAAGCAGCTGTGGTCGCGAGGCCTGATGAGT
ATTGGGGTGAGACTGCTTGTGCGTTTGTGAAGCTTAAAGACGGGTATAAGGCCACGGCCG
AGGAGATTATAAGCTACTGCAGAGGGAAGCTTCCGCATTACATGGCTCCGAGGAGTATTG
TATTCGAGGATCTTCCGAAAACATCGACTGGGGAAGTTCAGAAGTTTGTTCTGAGGAGTA
AGGCTGAGGCGTTGGGAAGCTTATCGAAGAAAGGAACAAGCAAGCTATGAACCGGTAAGT
GTTTTTTTTTGTGTCGTGTTGGTTAAGGTAAACCGGAAACATTGTACTACTACGTTCAAG
CCAAGTTGTGTCGTTCTGAAATAAAGCATCATGTTTGATTAAGATAAACAGGAATTGATT
ACTGTTTTAAAATAAACCAAGTTGAAATAAATAAAAACAGGTATGAGGGTTGTGC

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 2

CO CL6378Contig1 1194 2 2 U
GGAGGGTTTTCTCTTCCACTCTCCGCCGCCCTTTTCTCTCTCACTTCCGCTTCTCTTCCT
CCGCCGCAGTCATGCCTGGTTCCGAACCATCGTCAGAGATTATTCAATGGCCTGCCAAAA
CCGTCAGGGATACGTATCTCGATTTCTTCAAAGGGAAAGGTCACAAGTTCTGGCCGTCAA
GCCCCGTTGTTCCCCACAACGATCCCACTCTTCTCTTCGCCAACGCATGGATGAACCAGT
ACAAGCCTATATTTCTGGGGACGGCTGATCCGAACACGGAGCTCAGCAAGTTAACTCGGG
CGTGTAACACACAGAAGTGTATTCGTGCTGGTGGGAAGCATAATGATCTTGACGATGTTG
GGAAAGATACTTACCATCACACCTTCTTTGAGATGCTGGGTAACTGGTCATTTGGAGATT
ATTTCAAGAAGGAAGCTATTGAGTGGGGATGGGAGCTCTTGACTAAGGTTTATGGACTAC
CAACTGATCGAATTTATGCTACCTATTTTGGCGGGGATGAGAAAGCTGGCCTTCAACCTG
ATAATGAGGCTCGAGATATATGGCTACAGTTTCTTCCACCTGGACGTGTGCTGCCTTTTG
GTTGCAAAGACAACTTCTGGGAAATGGGAGACACCGGTCCGTGTGGACCCTGTACTGAGA
TACACTATGATCGTGTTGGCAACCGTGATGCTGCATCACTAGTTAATAATGACGATCCAA
CATGTTTGGAAATTTGGAATCTTGTGTTTATTCAGTTCAACAGAGAGAGTGATGGCTCAC
TAAAACCTCTCCCTGCTAAGCATGTCGATACAGGAATGGGTTTTGAGAGATTAACTTCTG
TTCTTCAGAACAAAATGAGCAACTACGATACAGATGTGTTCATGCCTATCTTTCATGACA
TCCAGAAGGCCGCAGGAGCTAGGCCATATGCTGGCAAAGTTGGTGCGGAAGATGTCGACA
GAGTTGACATGGCTTATAGAGTGGTTGCGGATCATATTAGGACGCTGTCATTTGCTATCG
CTGATGGCTCTCGTCCTGGTAATGAGGGCCGTGAGTATGTTTTGAGGCGTATTCTTCGCA
GAGCAGTTCGCTATGGAAAGGAAATCCTTAAAGCTGAAGAAGGGTTTTTCAACGGATTAG
TCAGTTCTGTTATTCGAGTTATGGGTGATACCTTTACAGAATTGAAGGAACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR22TF U 1
AF RR2FR22JQ C 434
BS 1 674 RR2FR22TF
BS 675 1194 RR2FR22JQ

RD RR2FR22TF 674 0 0
GGAGGGTTTTCTCTTCCACTCTCCGCCGCCCTTTTCTCTCTCACTTCCGCTTCTCTTCCT
CCGCCGCAGTCATGCCTGGTTCCGAACCATCGTCAGAGATTATTCAATGGCCTGCCAAAA
CCGTCAGGGATACGTATCTCGATTTCTTCAAAGGGAAAGGTCACAAGTTCTGGCCGTCAA
GCCCCGTTGTTCCCCACAACGATCCCACTCTTCTCTTCGCCAACGCATGGATGAACCAGT
ACAAGCCTATATTTCTGGGGACGGCTGATCCGAACACGGAGCTCAGCAAGTTAACTCGGG
CGTGTAACACACAGAAGTGTATTCGTGCTGGTGGGAAGCATAATGATCTTGACGATGTTG
GGAAAGATACTTACCATCACACCTTCTTTGAGATGCTGGGTAACTGGTCATTTGGAGATT
ATTTCAAGAAGGAAGCTATTGAGTGGGGATGGGAGCTCTTGACTAAGGTTTATGGACTAC
CAACTGATCGAATTTATGCTACCTATTTTGGCGGGGATGAGAAAGCTGGCCTTCAACCTG
ATAATGAGGCTCGAGATATATGGCTACAGTTTCTTCCACCTGGACGTGTGCTGCCTTTTG
GTTGCAAAGACAACTTCTGGGAAATGGGAGACACCGGTCCGTGTGGACCCTGTACTGAGA
TACACTATGATCGT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2FR22JQ 761 0 0
AGCTATTGAGTGGGGATGGGAGCTCTTGACTAAGGTTTATGGACTACCAACTGATCGAAT
TTATGCTACCTATTTTGGCGGGGATGAGAAAGCTGGCCTTCAACCTGATAATGAGGCTCG
AGATATATGGCTACAGTTTCTTCCACCTGGACGTGTGCTGCCTTTTGGTTGCAAAGACAA
CTTCTGGGAAATGGGAGACACCGGTCCGTGTGGACCCTGTACTGAGATACACTATGATCG
TGTTGGCAACCGTGATGCTGCATCACTAGTTAATAATGACGATCCAACATGTTTGGAAAT
TTGGAATCTTGTGTTTATTCAGTTCAACAGAGAGAGTGATGGCTCACTAAAACCTCTCCC
TGCTAAGCATGTCGATACAGGAATGGGTTTTGAGAGATTAACTTCTGTTCTTCAGAACAA
AATGAGCAACTACGATACAGATGTGTTCATGCCTATCTTTCATGACATCCAGAAGGCCGC
AGGAGCTAGGCCATATGCTGGCAAAGTTGGTGCGGAAGATGTCGACAGAGTTGACATGGC
TTATAGAGTGGTTGCGGATCATATTAGGACGCTGTCATTTGCTATCGCTGATGGCTCTCG
TCCTGGTAATGAGGGCCGTGAGTATGTTTTGAGGCGTATTCTTCGCAGAGCAGTTCGCTA
TGGAAAGGAAATCCTTAAAGCTGAAGAAGGGTTTTTCAACGGATTAGTCAGTTCTGTTAT
TCGAGTTATGGGTGATACCTTTACAGAATTGAAGGAACATG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL6379Contig1 775 2 2 U
GGGCACTCAGAGGCCCGGGGGAGACGAGGATGGCGATGAAGAGAGGATTCGAGATGATTC
TGGGATCTCAATCGATGGCGAGAAAAAGGATACTGGCTGAAATGGGATATGAATTCACTG
TCGTGACAGCAGACATTGATGAGAAAGCAATCAGGAGAGAGAATCCTGAAGAATTGGTCG
TAGCTATCGCTCAAGCTAAGGCAGATGAGATAATATCGAAATTGGGAGGTCAAAGTCAGT
TTGCTCAGGATCCTCAACCTACCTTATTGATTACTTCTGACACTGTTGTTGTGTACAAAG
GTGTCATTAGAGAAAAACCAACCACCAAGGATGAAGCTCGTCAATTTATCAAAGGCTATT
CCGGGTCACACGGAGGCGTTGTGGGCTCTGTTTTAGTAAGCAACTTGAAAACTGGTGTTC
AAAGAATTGGATGGGACAAAGCTGAGGTTTATTTCCATGAGATACCAGAAAAAGTTATAG
ACGATCTTATAGATGATGCGGTAACATACAAAGTTGCTGGAGGTTTAATGCTGGAGCATC
CCCTCATTGCACCCTTTATCGATACCGTGGTGGGAGGAGTTGATACAGTCATGGGACTTC
CTAAAGACCTCACTGAAAAATTCATCAGCGATGTGTTGTAGCTCAACCCCCTCCCCCTTT
GAAGATTCCTCATGTAGGAAGGCTTAGACCGATATATTCTGAGATTCTTATTGCAACATT
TAAATATTATGATGATGATCTTTAATCCACTTTTGGTATACAAAGATTGAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A739TF U 1
AF RR2A739JQ C 48
BS 1 674 RR2A739TF
BS 675 775 RR2A739JQ

RD RR2A739TF 674 0 0
GGGCACTCAGAGGCCCGGGGGAGACGAGGATGGCGATGAAGAGAGGATTCGAGATGATTC
TGGGATCTCAATCGATGGCGAGAAAAAGGATACTGGCTGAAATGGGATATGAATTCACTG
TCGTGACAGCAGACATTGATGAGAAAGCAATCAGGAGAGAGAATCCTGAAGAATTGGTCG
TAGCTATCGCTCAAGCTAAGGCAGATGAGATAATATCGAAATTGGGAGGTCAAAGTCAGT
TTGCTCAGGATCCTCAACCTACCTTATTGATTACTTCTGACACTGTTGTTGTGTACAAAG
GTGTCATTAGAGAAAAACCAACCACCAAGGATGAAGCTCGTCAATTTATCAAAGGCTATT
CCGGGTCACACGGAGGCGTTGTGGGCTCTGTTTTAGTAAGCAACTTGAAAACTGGTGTTC
AAAGAATTGGATGGGACAAAGCTGAGGTTTATTTCCATGAGATACCAGAAAAAGTTATAG
ACGATCTTATAGATGATGCGGTAACATACAAAGTTGCTGGAGGTTTAATGCTGGAGCATC
CCCTCATTGCACCCTTTATCGATACCGTGGTGGGAGGAGTTGATACAGTCATGGGACTTC
CTAAAGACCTCACTGAAAAATTCATCAGCGATGTGTTGTAGCTCAACCCCCTCCCCCTTT
GAAGATTCCTCATG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2A739JQ 728 0 0
TTCGAGATGATTCTGGGATCTCAATCGATGGCGAGAAAAAGGATACTGGCTGAAATGGGA
TATGAATTCACTGTCGTGACAGCAGACATTGATGAGAAAGCAATCAGGAGAGAGAATCCT
GAAGAATTGGTCGTAGCTATCGCTCAAGCTAAGGCAGATGAGATAATATCGAAATTGGGA
GGTCAAAGTCAGTTTGCTCAGGATCCTCAACCTACCTTATTGATTACTTCTGACACTGTT
GTTGTGTACAAAGGTGTCATTAGAGAAAAACCAACCACCAAGGATGAAGCTCGTCAATTT
ATCAAAGGCTATTCCGGGTCACACGGAGGCGTTGTGGGCTCTGTTTTAGTAAGCAACTTG
AAAACTGGTGTTCAAAGAATTGGATGGGACAAAGCTGAGGTTTATTTCCATGAGATACCA
GAAAAAGTTATAGACGATTTTATAGATGATGCGGTAACATACAAAGTTGCTGGAGGTTTA
ATGCTGGAGCATCCCCTCATTGCACCCTTTATCGATACCGTGGTGGGAGGAGTTGATACA
GTCATGGGACTTCCTAAAGACCTCACTGAAAAATTCATCAGCGATGTGTTGTAGCTCAAC
CCCCTCCCCCTTTGAAGATTCCTCATGTAGGAAGGCTTAGACCGATATATTCTGAGATTC
TTATTGCAACATTTAAATATTATGATGATGATCTTTAATCCACTTTTGGTATACAAAGAT
TGAAATCC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL6380Contig1 689 2 2 U
TTTTTTTTTGCCTAACCAAACTTATGGGTTTGAGATTTGATAAAATGAGAGCAAACATAC
ATAAAGGATCCAGTGTACACACCAGAAACATTAAGAGGCACCAATTCACCAATACCAACA
CTTCTTATTGTGTCTAGACTACTACTTATGACTTCCCTCACACCTTGTCGGAATCTTAAA
GTTACAAGTGGATCTTAAGCAAAAGTGACGATTCGAAGAGGCTTTACCCATCTTCTTGAA
AAAAACTCAAGACATGTTGGAGGAGCCTGTTGCAGGAGGGCTTGAATGACTGACAACAAG
TGGCGGACGCAGAGCTTTATGGTTAGCTTCAGCTTCCTTGCGAGCTTTGTACATCTCCTC
CGTTTCAACAACAACCATCCTTTTAACCTGTTGAATCATTCCTCTGATGGAAGAAGTGTT
GGAGTGCAAAACAGTGCGGTGACATCTCCGGAGTCCCATAGCCTCGAGTGTACGCCTGTG
AAGCTTCCTGGTTCCAGGGAGACCTCTCACTAACGTTATGTACAAGCTCTGGCTCCATTC
GATGGGCACTTTAGCTTTGAATGCTCTAAAACCACTCATCCTTACTTTCTGGAAGAAATG
GATGCGACAAGTCCGGTGAAACAGATCGTCGACGGCGAACCAGAGCTCGGAACAATCTGA
GCTTTCGCGTTTGGCCAAGGGTTTTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GX94TF C 1
AF RR2GX94JQ U 10
BS 1 9 RR2GX94TF
BS 10 689 RR2GX94JQ

RD RR2GX94TF 689 0 0
TTTTTTTTTGCCTAACCAAACTTATGGGTTTGAGATTTGATAAAATGAGAGCAAACATAC
ATAAAGGATCCAGTGTACACACCAGAAACATTAAGAGGCACCAATTCACCAATACCAACA
CTTCTTATTGTGTCTAGACTACTACTTATGACTTCCCTCACACCTTGTCGGAATCTTAAA
GTTACAAGTGGATCTTAAGCAAAAGTGACGATTCGAAGAGGCTTTACCCATCTTCTTGAA
AAAAACTCAAGACATGTTGGAGGAGCCTGTTGCAGGAGGGCTTGAATGACTGACAACAAG
TGGCGGACGCAGAGCTTTATGGTTAGCTTCAGCTTCCTTGCGAGCTTTGTACATCTCCTC
CGTTTCAACAACAACCATCCTTTTAACCTGTTGAATCATTCCTCTGATGGAAGAAGTGTT
GGAGTGCAAAACAGTGCGGTGACATCTCCGGAGTCCCATAGCCTCGAGTGTACGCCTGTG
AAGCTTCCTGGTTCCAGGGAGACCTCTCACTAACGTTATGTACAAGCTCTGGCTCCATTC
GATGGGCACTTTAGCTTTGAATGCTCTAAAACCACTCATCCTTACTTTCTGGAAGAAATG
GATGCGACAAGTCCGGTGAAACAGATCGTCGACGGCGAACCAGAGCTCGGAACAATCTGA
GCTTTCGCGTTTGGCCAAGGGTTTTAGCC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2GX94JQ 680 0 0
GCCTAACCAAACTTATGGGTTTGAGATTTGATAAAATGAGAGCAAACATACATAAAGGAT
CCAGTGTACACACCAGAAACATTAAGAGGCACCAATTCACCAATACCAACACTTCTTATT
GTGTCTAGACTACTACTTATGACTTCCCTCACACCTTGTCGGAATCTTAAAGTTACAAGT
GGATCTTAAGCAAAAGTGACGATTCGAAGAGGCTTTACCCATCTTCTTGAAAAAAACTCA
AGACATGTTGGAGGAGCCTGTTGCAGGAGGGCTTGAATGACTGACAACAAGTGGCGGACG
CAGAGCTTTATGGTTAGCTTCAGCTTCCTTGCGAGCTTTGTACATCTCCTCCGTTTCAAC
AACAACCATCCTTTTAACCTGTTGAATCATTCCTCTGATGGAAGAAGTGTTGGAGTGCAA
AACAGTGCGGTGACATCTCCGGAGTCCCATAGCCTCGAGTGTACGCCTGTGAAGCTTCCT
GGTTCCAGGGAGACCTCTCACTAACGTTATGTACAAGCTCTGGCTCCATTCGATGGGCAC
TTTAGCTTTGAATGCTCTAAAACCACTCATCCTTACTTTCTGGAAGAAATGGATGCGACA
AGTCCGGTGAAACAGATCGTCGACGGCGAACCAGAGCTCGGAACAATCTGAGCTTTCGCG
TTTGGCCAAGGGTTTTAGCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL6381Contig1 1188 2 4 U
GGAATCTCAAAAAAATACTCAAATCAATTTCTTATATAATATTTATTTACTTTCTTTTTT
GCCTTTACTCCTTTGAATACAAAACAACCAAAGCTTTTCCTCTCTCACCTGCAATTTACC
AGAAGAAGCAACAAACGGTTACTTTACTTTTTTTTTAAAACGTCTACCCAGAAACTCTGA
GAGCAGATTAGAGTAGATGGAGTTTGAATCATTCCTTGCGTCCTTAGGGACATCAGCAGT
CATCTTCGTGGTTCTCATGCTCCTCTTCACCTGGCTCTCTCGTAGACCCGGTAACGTTCC
CGTTTATTACCCGAATCGGATCCTCAAAGAAATGGATCCGTGGGAAGGCAGCTCCTTGAC
CCGAAACCCATTCGCCTGGATCCGTGAAGCTTTCACTTCCACCGAACAAGACGTCGTTAA
GCTCTCCGGCGTCGATACTGCCGTCTACTTCGTCTTCTTGAGCACCGTTCTTGGTATCCA
GGAGACTTAAGCTACGCGACTAGGGTTCCAAGCGACATGCTCATCCTCACTATCACCTTC
TGCTACTCCGTGATCGCTCCTCTTATCCTCGTATTCGGCGTTATCTACTTCGGTCTAGGG
TGGCTCATCCTTAGGAACCAGGCTTTGAAAGTGTACGTTCCAGCATACGAGAGCTACGGG
AGGATGTGGCCGCATATTCACACCCGCATTCTAGCGGCATTGTTTCTGTTCCAGCTTGTC
ATGTTCGGTTACTTGGGGGTCAAGCTATTCGTTCGGGCCACTCTCTTGGTTCCTCTCATC
TTCATCTCTCTCGTATTCGGTTACGTGTGCCGCCAGAAATTCTACAAAGGGTTCGAACAC
ACGGCTCTGGAGGTGGCTTGCCGTGAGCTGAAGACGAGACCGGATCTCGAGGAGGTTTTC
AGAGCGTACATCCCGCATAGCTTGAGCACTCACAAAGGAGACGATCACAAGTTTAAAGGC
GCTATGACTCGTTATCAAGACTATGCTGCGATATCAGCCGCTTAAAGATTTGAATCCTTA
TTATTATCTCACAGATTTGTTTTTTTTCCTTTTAGAAGCTTTTATTGTTGTTGTGTGTGA
TTTTAGGGTTTGTTTAGGGTATTTTCGTTTGTATGTGTTCTTTGGTTGTTGTATAACTTG
TAACCATGTAAGCTACGCTTTAATTATCAACTTCATCAGTCTTCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE67TF U 1
AF RR2BE67JQ C 572
BS 1 801 RR2BE67TF
BS 802 802 RR2BE67JQ
BS 803 836 RR2BE67TF
BS 837 1188 RR2BE67JQ

RD RR2BE67TF 845 0 0
GGAATCTCAAAAAAATACTCAAATCAATTTCTTATATAATATTTATTTACTTTCTTTTTT
GCCTTTACTCCTTTGAATACAAAACAACCAAAGCTTTTCCTCTCTCACCTGCAATTTACC
AGAAGAAGCAACAAACGGTTACTTTACTTTTTTTTTAAAACGTCTACCCAGAAACTCTGA
GAGCAGATTAGAGTAGATGGAGTTTGAATCATTCCTTGCGTCCTTAGGGACATCAGCAGT
CATCTTCGTGGTTCTCATGCTCCTCTTCACCTGGCTCTCTCGTAGACCCGGTAACGTTCC
CGTTTATTACCCGAATCGGATCCTCAAAGAAATGGATCCGTGGGAAGGCAGCTCCTTGAC
CCGAAACCCATTCGCCTGGATCCGTGAAGCTTTCACTTCCACCGAACAAGACGTCGTTAA
GCTCTCCGGCGTCGATACTGCCGTCTACTTCGTCTTCTTGAGCACCGTTCTTGGTATCCA
GGAGACTTAAGCTACGCGACTAGGGTTCCAAGCGACATGCTCATCCTCACTATCACCTTC
TGCTACTCCGTGATCGCTCCTCTTATCCTCGTATTCGGCGTTATCTACTTCGGTCTAGGG
TGGCTCATCCTTAGGAACCAGGCTTTGAAAGTGTACGTTCCAGCATACGAGAGCTACGGG
AGGATGTGGCCGCATATTCACACCCGCATTCTAGCGGCATTGTTTCTGTTCCAGCTTGTC
ATGTTCGGTTACTTGGGGGTCAAGCTATTCGTTCGGGCCACTCTCTTGGTTCCTCTCATC
TTCATCTCTCTCGTATTCGGT*ACGTGTGCCGCCAGAAATTCTACAAAGGGTTCGA
CACACGCTC

QA 1 836 1 836
DS 

RD RR2BE67JQ 617 0 0
TATTCGGCGTTATCTACTTCGGTCTAGGGTGGCTCATCCTTAGGAACCAGGCTTTGAAAG
TGTACGTTCCAGCATACGAGAGCTACGGGAGGATGTGGCCGCATATTCACACCCGCATTC
TAGCGGCATTGTTTCTGTTCCAGCTTGTCATGTTCGGTTACTTGGGGGTCAAGCTATTCG
TTCGGGCCACTCTCTTGGTTCCTCTCATCTTCATCTCTCTCGTATTCGGTTACGTGTGCC
GCCAGAAATTCTACAAAGGGTTCGAACACACGGCTCTGGAGGTGGCTTGCCGTGAGCTGA
AGACGAGACCGGATCTCGAGGAGGTTTTCAGAGCGTACATCCCGCATAGCTTGAGCACTC
ACAAAGGAGACGATCACAAGTTTAAAGGCGCTATGACTCGTTATCAAGACTATGCTGCGA
TATCAGCCGCTTAAAGATTTGAATCCTTATTATTATCTCACAGATTTGTTTTTTTTCCTT
TTAGAAGCTTTTATTGTTGTTGTGTGTGATTTTAGGGTTTGTTTAGGGTATTTTCGTTTG
TATGTGTTCTTTGGTTGTTGTATAACTTGTAACCATGTAAGCTACGCTTTAATTATCAAC
TTCATCAGTCTTCGTCC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL6382Contig1 627 2 1 U
GCTGATAAGACCAGCAGCAAGAAGTTTGTTCTCTCGGTGGCTTGGTCTCCCAACGGGAAA
CGCCTCGCTTGTGGTTCAATGGATGGCACCATCTGCGTCTTTGATGTTGATCGGTCTAAG
CTTCTTCACTAGCTTGAAGGACACAACATGCCTGTGAGGTCCCTTGTGTTCTCCCCTGTG
GACCCGAGAGTCCTCTTCTCCGGATCAGATGATGGGCATGTGAACATGCATGATGCAGAA
GGGAAAACGCTGGTGGGGTCCATGTCGGGGCATACGAGCTGGGTGCTGAGCGTTGATGCT
AGCCCAGACGGTGGAGCTATAGCAACTGGCTCGAGTGATAGGACTGTGAGGCTGTGGGAT
CTTAAGATGAGAGCTGCTATTCAGACAATGAGCAACCATAATGACCAGGTTTGGTCTGTG
GCGTTTAGACCACCTGGTGGAACCGGTGTCCGTGCTGGTCGTCTCGCTAGTGTCTCCGAC
GACAAGAGTGTATCACTCTATGATTACTCATGAAACTCTTGTTTTTCTTTTCTTTGATGC
ATTCTTCAAGACACATCTTGTTTCCAAGGATTCTATGTAAACACTAGTTTTGTAACATTG
TAATCTGCAAGAGATTTTTGTTGGTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B451JQ C 1
AF RR2B451TF U 1
BS 1 627 RR2B451TF

RD RR2B451JQ 627 0 0
GCTGATAAGACCAGCAGCAAGAAGTTTGTTCTCTCGGTGGCTTGGTCTCCCAACGGGAAA
CGCCTCGCTTGTGGTTCAATGGATGGCACCATCTGCGTCTTTGATGTTGATCGGTTTAAG
CTTCTTCACTAGCTTGAAGGACACAACATGCCTGTGAGGTCCCTTGTGTTCTCCCCTGTG
GACCCGAGAGTCCTCTTCTCCGGATCAGATGATGGGCATGTGAACATGCATGATGCAGAA
GGGAAAACGCTGGTGGGGTCCATGTCGGGGCATACGAGCTGGGTGCTGAGCGTTGATGCT
AGCCCAGACGGTGGAGCTATAGCAACTGGCTCGAGTGATAGGACTGTGAGGCTGTGGGAT
CTTAAGATGAGAGCTGCTATTCAGACAATGAGCAACCATAATGACCAGGTTTGGTCTGTG
GCGTTTAGACCACCTGGTGGAACCGGTGTCCGTGCTGGTCGTCTCGCTAGTGTCTCCGAC
GACAAGAGTGTATCACTCTATGATTACTCATGAAACTCTTGTTTTTCTTTTCTTTGATGC
ATTCTTCAAGACACATCTTGTTTCCAAGGATTCTATGTAAACACTAGTTTTGTAACATTG
TAATCTGCAAGAGATTTTTGTTGGTTC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2B451TF 627 0 0
GCTGATAAGACCAGCAGCAAGAAGTTTGTTCTCTCGGTGGCTTGGTCTCCCAACGGGAAA
CGCCTCGCTTGTGGTTCAATGGATGGCACCATCTGCGTCTTTGATGTTGATCGGTCTAAG
CTTCTTCACTAGCTTGAAGGACACAACATGCCTGTGAGGTCCCTTGTGTTCTCCCCTGTG
GACCCGAGAGTCCTCTTCTCCGGATCAGATGATGGGCATGTGAACATGCATGATGCAGAA
GGGAAAACGCTGGTGGGGTCCATGTCGGGGCATACGAGCTGGGTGCTGAGCGTTGATGCT
AGCCCAGACGGTGGAGCTATAGCAACTGGCTCGAGTGATAGGACTGTGAGGCTGTGGGAT
CTTAAGATGAGAGCTGCTATTCAGACAATGAGCAACCATAATGACCAGGTTTGGTCTGTG
GCGTTTAGACCACCTGGTGGAACCGGTGTCCGTGCTGGTCGTCTCGCTAGTGTCTCCGAC
GACAAGAGTGTATCACTCTATGATTACTCATGAAACTCTTGTTTTTCTTTTCTTTGATGC
ATTCTTCAAGACACATCTTGTTTCCAAGGATTCTATGTAAACACTAGTTTTGTAACATTG
TAATCTGCAAGAGATTTTTGTTGGTTC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL6383Contig1 655 2 19 U
GGGTTTCTTCGAAGTTTCTTCACTGTGCGTCAAAAGATTTTCTCTCAGAGGTTTTCTCGG
GGGAAGAAGAAACTGACGACATCTTATATAAGATCCTAGAGAGAGAGAGAGAGATCTAAA
CAGCTTCGTCTCCGATGGGAACGCTTCAGTCATTCCGAAGAGCGTACGGAGCCTTAAAAG
ACACCACTAAAGTCGGCCTCGTCCGAGTCAACAGCGATTACGCCGATATAGAGGTTGCCA
TAGTCAAAGCTACTAACCATGTCGAGTGTCCTCCCAAAGATCGCCATCTCAGGAAGATCT
TCATAGCAACATCAGCAACTAGGCCTCGAGCAGATGTTGCTTACTGCATTCACACTCTCT
CTCGTCGATTGCACAAAACCAGAAACTGGACGGTCGCGTTAAAAGCATTGCTTGTTCTAC
ACCGGCTTGTAAGGGAGGGAGATCCCACATTTAGAGAAGAACTATTAAACTTTTCGCGAA
AAGGACGCTTCCTGCAGCTTTCTAATTTCAAGGATGACTCATCCACAGCGGCATGGGATT
GTTCGGTCTGGGTACGCGCTTATGCTTTATTTCTCGAAGAACGGCTTCAGTGCTTCAGAG
TTTTGAAATATGATATTGAGGCTGAACGTCTTCCTAAAGTCTCCCCGGGGCAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL35TF U 1
AF RR2C722TF U 4
BS 1 140 RR2BL35TF
BS 141 141 RR2C722TF
BS 142 262 RR2BL35TF
BS 263 263 RR2C722TF
BS 264 277 RR2BL35TF
BS 278 278 RR2C722TF
BS 279 283 RR2BL35TF
BS 284 284 RR2C722TF
BS 285 445 RR2BL35TF
BS 446 446 RR2C722TF
BS 447 466 RR2BL35TF
BS 467 467 RR2C722TF
BS 468 547 RR2BL35TF
BS 548 548 RR2C722TF
BS 549 574 RR2BL35TF
BS 575 575 RR2C722TF
BS 576 577 RR2BL35TF
BS 578 578 RR2C722TF
BS 579 655 RR2BL35TF

RD RR2BL35TF 655 0 0
GGGTTTCTTCGAAGTTTCTTCACTGTGCGTCAAAAGATTTTCTCTCAGAGGTTTTCTCGG
GGGAAGAAGAAACTGACGACATCTTATATAAGATCCTAGAGAGAGAGAGAGAGATCTAAA
CAGCTTCGTCTCCGATGGGACCGCTTCAGTCATTCCGAAGAGCGTACGGAGCCTTAAAAG
ACACCACTAAAGTCGGCCTCGTCCGAGTCAACAGCGATTACGCCGATATAGAGGTTGCCA
TAGTCAAAGCTACTAACCATGTTGAGTGTCCTCCCAAGGATCGGCATCTCAGGAAGATCT
TCATAGCAACATCAGCAACTAGGCCTCGAGCAGATGTTGCTTACTGCATTCACACTCTCT
CTCGTCGATTGCACAAAACCAGAAACTGGACGGTCGCGTTAAAAGCATTGCTTGTTCTAC
ACCGGCTTGTAAGGGAGGGAGATCCTACATTTAGAGAAGAACTATTGAACTTTTCGCGAA
AAGGACGCTTCCTGCAGCTTTCTAATTTCAAGGATGACTCATCCACAGCGGCATGGGATT
GTTCGGTGTGGGTACGCGCTTATGCTTTATTTCTTGAGGAACGGCTTCAGTGCTTCAGAG
TTTTGAAATATGATATTGAGGCTGAACGTCTTCCTAAAGTCTCCCCGGGGCAGAG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2C722TF 646 0 0
TTTT
TTCGAAGTTTCTTCACTGTGCGTCAAAAGATTTTCTCTCAGAGGTTTTCTCGGGGGAAGA
AGAAACTGACTACATCTTATATAAGATCCTAGAGAGAGAGAGAGAGATCTAAACAGGTTC
GTCTCCGATGGGAACGCTTCAGTCATTCCGAAGAGCGTACGGAGCCTTAAAAGACACCAC
TAAAGTCGGCCTCGTCCGAGTCAACAGCGATTACGCCGATATAGAGGTTGCCATAGTCAA
AGCTACTAACCATGTCGAGTGTCCTCCCAAAGATCGCCATCTCAGGAAGATCTTCATAGC
AACATCCGCAACTAGGCCTCGAGCGGATGTTGCTTACTGCATTCACACTCTCTCTCGTCG
ATTGCACAAAACCAGAAACTGGACGGTTGCGTTAAAAGCGTTGCTTGTTCTACACCGGCT
TGTAAGGGAGGGAGATCCCACATTTAGAGAAGAACTTTTAAACTTTTCGCGAAAAGGACG
CTTCCTGCAGCTTTCTAATTTCAAGGATGACTCATCCACAGCGGCATGGGATTGTTCGGT
CTGGGTACGCGCTTATGCTTTATTTCTCGAAGAACGGCTTCAGTGCTTCAGAGTTTTGAA
ATATGATATTGAGGCTGAACGTCTTCCTAAAGTTTCCCCGGG

QA 5 646 5 646
DS 



AS 1 2

CO CL6384Contig1 632 2 1 U
GGGTCGGGCAGCATCTCGTGCTGCGGAATCATCCAGTTCAGGAGGCAAAACCCAAGACGG
AGAATCCTTAACCAACGATGAACTTCTCTCTATCGTCAAGCCAATGCTAGTCTACACCGG
CATGATAGAACAGCTTCAACAGTTCTTCAAACCAAAGAAGCCGGCCCAAGTCGAACCAGT
CAAGAAAGAAGGTACGTCAAGTGGGGTAGAACTGGAGCCGTGGGAGATTGTAATGAAAGA
GAAGTTGCTGAATGTGAAAGATATGGTTGGTTTCTCAAAAGAATTGATCTCGTGGCTTGA
CGACATCAACTCTGCAACTGATCTACAAGAAGCTTTTGATATAGTCGGCGTTCTGGCTGA
TGTTTTGTCCGGAGGAGTTACTCAGTGCGATGAGTTTGTGAGATCAGCGATCGATGCTGG
AAATGGGAAAAGCTGAAAATAGTTTGGTTTTTGTCGAGAACAACGAACAGCTCTAATATG
TGTGTTTTTCTATTTGGTAATGTGTGTCTGTCTCTCTTGTTTGGGATATTGTGTGATTGA
GTTGTTGTACTTTAGAGAATGTTCGTTCTTGTAAAACGTCGAGACACTTGTTTTCTTCTT
TTGCTATTAATGCAAAACTCACGTATTGCGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AS85JQ C 1
AF RR2AS85TF U 1
BS 1 632 RR2AS85TF

RD RR2AS85JQ 632 0 0
GGGTCGGGCAGCATCTCGTGCTGCGGAATCATCCAGTTCAGGAGGCAAAACCCAAGACGG
AGAATCCTTAACCAACGATGAACTTCTCTCTATCGTCAAGCCAATGCTAGTCTACACCGG
CATGATAGAACAGCTTCAACAGTTCTTCAAACCAAAGAAGCCGGCCCAAGTCGAACCAGT
CAAGAAAGAAGGTACGTCAAGTGGGGTAGAACTGGAGCCGTGGGAGATTGTAATGAAAGA
GAAGTTGCTGAATGTGAAAGATATGGTTGGTTTCTCAAAAGAATTGATCTCGTGGCTTGA
CGACATCAACTCTGCAACTGATCTACAAGAAGCTTTTGATATAGTCGGCGTTCTGGCTGA
TGTTTTGTCCGGAGGAGTTACTCAGTGCGATGAGTTTGTGAGATCAGCGATCGATGCTGG
AAATGGGAAAAGCTGAAAATAGTTTGGTTTTTGTCGAGAACAACGAACAGCTCTAATATG
TGTGTTTTTCTATTTGGTAATGTGTGTCTGTCTCTCTTGTTTGGGATATTGTGTGATTGA
GTTGTTGTACTTTAGAGAATGTTCGTTCTTGTAAAACGTCGAGACACTTGTTTTCTTCTT
TTGCTATTAATGCAAAACTCACGTATTGCGCT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2AS85TF 632 0 0
GGGTCGGGCAGCATCTCGTGCTGCGGAATCATCCAGTTCAGGAGGCAAAACCCAAGACGG
AGAATCCTTAACCAACGATGAACTTCTCTCTATCGTCAAGCCAATGCTAGTCTACACCGG
CATGATAGAACAGCTTCAACAGTTCTTCAAACCAAAGAAGCCGGCCCAAGTCGAACCAGT
CAAGAAAGAAGGTACGTCAAGTGGGGTAGAACTGGAGCCGTGGGAGATTGTAATGAAAGA
GAAGTTGCTGAATGTGAAAGATATGGTTGGTTTCTCAAAAGAATTGATCTCGTGGCTTGA
CGACATCAACTCTGCAACTGATCTACAAGAAGCTTTTGATATAGTCGGCGTTCTGGCTGA
TGTTTTGTCCGGAGGAGTTACTCAGTGCGATGAGTTTGTGAGATCAGCGATCGATGCTGG
AAATGGGAAAAGCTGAAAATAGTTTGGTTTTTGTCGAGAACAACGAACAGCTCTAATATG
TGTGTTTTTCTATTTGGTAATGTGTGTCTGTCTCTCTTGTTTGGGATATTGTGTGATTGA
GTTGTTGTACTTTAGAGAATGTTCGTTCTTGTAAAACGTCGAGACACTTGTTTTCTTCTT
TTGCTATTAATGCAAAACTCACGTATTGCGCT

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL6385Contig1 743 2 1 U
GGATCGTGGAACGTGGAGCTCACATAACGTAACAAGATCCGATCTAACCCCGGTTCTCGT
CGGAATCTCTTTAACGGTTAACCGGCGTTCCTCATCCACCTTTCGTTGTTATGTAAGACG
TCAAGGGAAAGGAGCTTGTTGATGATACTCCACCTCCTGTTGACCAAAATGATAACAAGA
ATGAAACTGAGATTCATAAACAGCCAAAAGAAGATTCCTTTGATATCCAAGGATCATGAG
CGCGCGTTTTTTGACTCTGCTGATTGGGCATTAGGCAAGCAAAAAGGACAAAAGCCTAAA
GGGCCTTTGGAAGCTCTCCGACCAAAACTGCAGCCAACCCCGCACCAGCAACCTAGAGCT
AGACGGATGGCTTTATCTTCAGGCGATAACACTGAAGACGCTGAGGCTGACAACAACGAA
CCTCTCGATGACCAAGCTAGCGCATCAGCTGCTGACAACGCCAAGGATGATGCTGGTGAC
GCCGCCGCCAAAGACAACATCAAGTCCTGAACAAAAACATATCACAAGTCAATTTTACAG
AAGAATAAGCGACCAGGTTTGCTGCTATGCAAACGGTCGTAGTAATATCGAGTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTTTACATTATATTCCATACATACTTGGGCACCAGCAAATCTGTATCACAC
CATACAAAACCTAGTAGTTGTTTGAAACGGTCTATTTGACGATTTGCAAAATGGTTTGCT
TTTTAATGATCCATTAAAATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BE65TF U 1
AF RR2BE65JQ C 64
BS 1 743 RR2BE65TF

RD RR2BE65TF 743 0 0
GGATCGTGGAACGTGGAGCTCACATAACGTAACAAGATCCGATCTAACCCCGGTTCTCGT
CGGAATCTCTTTAACGGTTAACCGGCGTTCCTCATCCACCTTTCGTTGTTATGTAAGACG
TCAAGGGAAAGGAGCTTGTTGATGATACTCCACCTCCTGTTGACCAAAATGATAACAAGA
ATGAAACTGAGATTCATAAACAGCCAAAAGAAGATTCCTTTGATATCCAAGGATCATGAG
CGCGCGTTTTTTGACTCTGCTGATTGGGCATTAGGCAAGCAAAAAGGACAAAAGCCTAAA
GGGCCTTTGGAAGCTCTCCGACCAAAACTGCAGCCAACCCCGCACCAGCAACCTAGAGCT
AGACGGATGGCTTTATCTTCAGGCGATAACACTGAAGACGCTGAGGCTGACAACAACGAA
CCTCTCGATGACCAAGCTAGCGCATCAGCTGCTGACAACGCCAAGGATGATGCTGGTGAC
GCCGCCGCCAAAGACAACATCAAGTCCTGAACAAAAACATATCACAAGTCAATTTTACAG
AAGAATAAGCGACCAGGTTTGCTGCTATGCAAACGGTCGTAGTAATATCGAGTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTTTACATTATATTCCATACATACTTGGGCACCAGCAAATCTGTATCACAC
CATACAAAACCTAGTAGTTGTTTGAAACGGTCTATTTGACGATTTGCAAAATGGTTTGCT
TTTTAATGATCCATTAAAATACC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2BE65JQ 680 0 0
AATCTCTTTAACGGTTAACCGGCGTTCCTCATCCACCTTTCGTTGTTATGTAAGACGTCA
AGGGAAAGGAGCTTGTTGATGATACTCCACCTCCTGTTGACCAAAATGATAACAAGAATG
AAACTGAGATTCATAAACAGCCAAAAGAAGATTCCTTTGATATCCAAGGATCATGAGCGC
GCGTTTTTTGACTCTGCTGATTGGGCATTAGGCAAGCAAAAAGGACAAAAGCCTAAAGGG
CCTTTGGAAGCTCTCCGACCAAAACTGCAGCCAACCCCGCACCAGCAACCTAGAGCTAGA
CGGATGGCTTTATCTTCAGGCGATAACACTGAAGACGCTGAGGCTGACAACAACGAACCT
CTCGATGACCAAGCTAGCGCATCAGCTGCTGACAACGCCAAGGATGATGCTGGTGACGCC
GCCGCCAAAGACAACATCAAGTCCTGAACAAAAACATATCACAAGTCAATTTTACAGAAG
AATAAGCGACCAGGTTTGCTGCTATGCAAACGGTCGTAGTAATATCGAGTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTTTACATTATATTCCATACATACTTGGGCACCAGCAAATCTGTATCACACCAT
ACAAAACCTAGTAGTTGTTTGAAACGGTCTATTTGACGATTTGCAAAATGGTTTGCTTTT
TAATGATCCATTAAAATACC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL6386Contig1 657 2 2 U
GGAGATTTAGTTTATTCGTCTCTCTCTCTCTCCGTCTCAGATCTAGAAAGTGGGCAGCAT
CAACTGCGAGCGAACATGGCAGGCAAGGGAGGGAAAGGTCTCATCGCAACCAAGACCATG
GCCGGTAACAAGGACAAAGACAAGGACAAGAAGAAACCCATCACTCGCTCTGCTCGTGCT
GGTATTCAGTTTCCGGTGGGTCGTATCCATAGGCAACTCAAGACGAGAGTTTCAGCACAC
GGAAGGGTTGGTGCCACTGCTGCTGTCTACACGGCTTCGATTCTCGAGTACCTGACTGCG
GAGGTTCTTGAGTTGGCTGGAAACGCGAGCAAAGATCTGAAAGTGAAGAGGATCACTCCA
AGGCATTTGCAGCTGGCTATCAGAGGAGACGAGGAGCTCGACACGCTCATCAAGGGAACC
ATTGCTGGAGGAGGTGTGATCCCTCACATCCACAAGTCTCTCATCAACAAAACCATCAAG
GAGTGATTTGTTTTCTTAGGCACTGTGGGTTATTTGATATGCTAATTAGTAAGCTTATTG
GTGTTTGTGTTTGTTTAGTCTTGGACTGCTTATCCTTTTTCTTTAGTTTCCTCTGTTAGT
GTGTTGTGCTCTTTTGAACATCATCAGGTGTACATTAGTTAATCTGAACTCTTAGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G920JQ C 1
AF RR2G920TF U 1
BS 1 623 RR2G920TF
BS 624 657 RR2G920JQ

RD RR2G920JQ 657 0 0
GGAGATTTAGTTTATTCGTCTCTCTCTCTCTCCGTCTCAGATCTAGAAAGTGGGCAGCAT
CAACTGCGAGCGAACATGGCAGGCAAGGGAGGGAAAGGTCTCATCGCAACCAAGACCATG
GCCGGTAACAAGGACAAAGACAAGGACAAGAAGAAACCCATCACTCGCTCTGCTCGTGCT
GGTATTCAGTTTCCGGTGGGTCGTATCCATAGGCAACTCAAGACGAGAGTTTCAGCACAC
GGAAGGGTTGGTGCCACTGCTGCTGTCTACACGGCTTCGATTCTCGAGTACCTGACTGCG
GAGGTTCTTGAGTTGGCTGGAAACGCGAGCAAAGATCTGAAAGTGAAGAGGATCACTCCA
AGGCATTTGCAGCTGGCTATCAGAGGAGACGAGGAGCTCGACACGCTCATCAAGGGAACC
ATTGCTGGAGGAGGTGTGATCCCTCACATCCACAAGTCTCTCATCAACAAAACCATCAAG
GAGTGATTTGTTTTCTTAGGCACTGTGGGTTATTTGATATGCTAATTAGTAAGCTTATTG
GTGTTTGTGTTTGTTTAGTCTTGGACTGCTTATCCTTTTTCTTTAGTTTCCTCTGTTAGT
GTGTTGTGCTCTTTTGAACATCATCAGGTGTACATTAGTTAATCTGAACTCTTAGAT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2G920TF 623 0 0
GGAGATTTAGTTTATTCGTCTCTCTCTCTCTCCGTCTCAGATCTAGAAAGTGGGCAGCAT
CAACTGCGAGCGAACATGGCAGGCAAGGGAGGGAAAGGTCTCATCGCAACCAAGACCATG
GCCGGTAACAAGGACAAAGACAAGGACAAGAAGAAACCCATCACTCGCTCTGCTCGTGCT
GGTATTCAGTTTCCGGTGGGTCGTATCCATAGGCAACTCAAGACGAGAGTTTCAGCACAC
GGAAGGGTTGGTGCCACTGCTGCTGTCTACACGGCTTCGATTCTCGAGTACCTGACTGCG
GAGGTTCTTGAGTTGGCTGGAAACGCGAGCAAAGATCTGAAAGTGAAGAGGATCACTCCA
AGGCATTTGCAGCTGGCTATCAGAGGAGACGAGGAGCTCGACACGCTCATCAAGGGAACC
ATTGCTGGAGGAGGTGTGATCCCTCACATCCACAAGTCTCTCATCAACAAAACCATCAAG
GAGTGATTTGTTTTCTTAGGCACTGTGGGTTATTTGATATGCTAATTAGTAAGCTTATTG
GTGTTTGTGTTTGTTTAGTCTTGGACTGCTTATCCTTTTTCTTTAGTTTCCTCTGTTAGT
GTGTTGTGCTCTTTTGAACATCA

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL6387Contig1 727 2 8 U
GGATACTCTCGAAAGCGAAGAACTCTGTGTCTTCTCGCCGGATCGTTTCATTGTAGCTTC
TGATCTTGTCTTTCCGGCAAAGTCAAGTTACAGACTGGAAAAAAAATGTTCATCAAAGTC
AAATTGCCATGGAATGTCATCATACCAGCTGAAGCAATGGACCCCAACGGCCACATAATC
CAAACAGCTGTTCTCACTCGTTTACTAGATGCCTTTGCTTCCAAGAAAGCAACCAAAGAT
CTCGGCTACTTCATAGCACTCAAAAGCTTGGAGGAAATAGGCGAGGGGAGAATCAGAGAA
ACCACTGGCGAGATTGTCTTCCCGGTGGTTTTCAGTGGGATCACCTTCAAAATGTTCAAA
GGCGAGATCGCTCGTGGTGTGGTTCACAAGGTGCACAAGTCCGGTGTCTTCTTGAGATGC
GGCCCTTGTGAAAACGTTTACTTATCACATTATAAGATGCCTGGTTACGACTACTTTGGA
CAAGGAAACCCGTTGTTCGTGAACGAGAACATGTCCCGGATTCAGATCGGTTCCACGGTT
CGTTTCGTTGTGCTTGATATCCAGTGGAAAGAGGCAGAGAAGGAGTTCATTGCTTTAGCT
AGCCTTGAAGGAATCAATCTTGGCCCGTTCTAAAATAATTTGTAATCTGAATATATATAA
CGTTATGTAAATAAATAAATAAATAAAATAAAACCTTTACAAAGTTTATTCAAATCAATT
AATAATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E853TF U 1
AF RR2E853JQ C 1
BS 1 383 RR2E853TF
BS 384 384 RR2E853JQ
BS 385 424 RR2E853TF
BS 425 425 RR2E853JQ
BS 426 433 RR2E853TF
BS 434 436 RR2E853JQ
BS 437 452 RR2E853TF
BS 453 727 RR2E853JQ

RD RR2E853TF 452 0 0
GGATACTCTCGAAAGCGAAGAACTCTGTGTCTTCTCGCCGGATCGTTTCATTGTAGCTTC
TGATCTTGTCTTTCCGGCAAAGTCAAGTTACAGACTGGAAAAAAAATGTTCATCAAAGTC
AAATTGCCATGGAATGTCATCATACCAGCTGAAGCAATGGACCCCAACGGCCACATAATC
CAAACAGCTGTTCTCACTCGTTTACTAGATGCCTTTGCTTCCAAGAAAGCAACCAAAGAT
CTCGGCTACTTCATAGCACTCAAAAGCTTGGAGGAAATAGGCGAGGGGAGAATCAGAGAA
ACCACTGGCGAGATTGTCTTCCCGGTGGTTTTCAGTGGGATCACCTTCAAAATGTTCAAA
GGCGAGATCGCTCGTGGTGTGGT*CACAAGGTGCACAAGTCCGGTGTCTTCTTGAGATGC
GGCC*TTGTGAAAC**TTTACTTATCACATTA

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2E853JQ 727 0 0
GGATACTCTCGAAAGCGAAGAACTCTGTGTCTTCTCGCCGGATCGTTTCATTGTAGCTTC
TGATCTTGTCTTTCCGGCAAAGTCAAGTTACAGACTGGAAAAAAAATGTTCATCAAAGTC
AAATTGCCATGGAATGTCATCATACCAGCTGAAGCAATGGACCCCAACGGCCACATAATC
CAAACAGCTGTTCTCACTCGTTTACTAGATGCCTTTGCTTCCAAGAAAGCAACCAAAGAT
CTCGGCTACTTCATAGCACTCAAAAGCTTGGAGGAAATAGGCGAGGGGAGAATCAGAGAA
ACCACTGGCGAGATTGTCTTCCCGGTGGTTTTCAGTGGGATCACCTTCAAAATGTTCAAA
GGCGAGATCGCTCGTGGTGTGGTTCACAAGGTGCACAAGTCCGGTGTCTTCTTGAGATGC
GGCCCTTGTGAAAACGTTTACTTATCACATTATAAGATGCCTGGTTACGACTACTTTGGA
CAAGGAAACCCGTTGTTCGTGAACGAGAACATGTCCCGGATTCAGATCGGTTCCACGGTT
CGTTTCGTTGTGCTTGATATCCAGTGGAAAGAGGCAGAGAAGGAGTTCATTGCTTTAGCT
AGCCTTGAAGGAATCAATCTTGGCCCGTTCTAAAATAATTTGTAATCTGAATATATATAA
CGTTATGTAAATAAATAAATAAATAAAATAAAACCTTTACAAAGTTTATTCAAATCAATT
AATAATC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL6388Contig1 689 2 3 U
GATAGAGAAGGATGTCGATGGATTCCACCCGCTAAATATTGGACGACTCGCCATGCGTGG
TAGAGAACCCTTGTTCGTTCCGTGTACTCCTAAGGGGTGCATCGATCTGTTGCATAGATA
CAACGTTGAGATCAAAGGGAAAAGAGCCGTTGTTATTGGAAGGAGTAACATTGTTGGTAT
GCCAGCTGCTCTCTTATTGCAGAGGGAGGATGCAACTGTTTCCATTATCCACTCAAGAAC
CAAGAACCCTGAAGAAATCACACGAGAAGCTGATATCATTATTGCAGCAGTTGGGCGACC
AAACATGGTTAGAGGAAACTGGATTAAACCTGGCGCAGCCATCATTGATGTTGGGATCAA
TCCGGTTGATGATCCAAATGTTCCACGTGGTTATCGTTTGGTTGGAGACGTATGTTACGA
GGAGGCTTGCAAAATTGCATCAGCCATCACACCTGTTCCTGGTGGTGTTGGACCAATGAC
CATAGCTATGCTTCTGTCCAATACCTTGATATCGGCCAAGAGAATTCACAACTTCGAGTG
ACTTTGTAGGAAGAGCGATGACTTTTTTTTTTTTGATTTAGCAAGCCCGGATACAATAGT
TTGCTATGGTCCTTTCATAAAATGTCTTTTTTCGTTGTATGAAGCCAAACATGTTTTCTC
TTAAAAATGGAAGATAATGGCCTTTTTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CC72JQ C 1
AF RR2CC72TF U 1
BS 1 666 RR2CC72TF
BS 667 667 RR2CC72JQ
BS 668 689 RR2CC72TF

RD RR2CC72JQ 689 0 0
GATAGAGAAGGATGTCGATGGATTCCACCCGCTAAATATTGGACGACTCGCCATGCGTGG
TAGAGAACCCTTGTTCGTTCCGTGTACTCCTAAGGGGTGCATCGATCTGTTGCATAGATA
CAACGTTGAGATCAAAGGGAAAAGAGCCGTTGTTATTGGAAGGAGTAACATTGTTGGTAT
GCCAGCTGCTCTCTTATTGCAGAGGGAGGATGCAACTGTTTCCATTATCCACTCAAGAAC
CAAGAACCCTGAAGAAATCACACGAGAAGCTGATATCATTATTGCAGCAGTTGGGCGACC
AAACATGGTTAGAGGAAACTGGATTAAACCTGGCGCAGCCATCATTGATGTTGGGATCAA
TCCGGTTGATGATCCAAATGTTCCACGTGGTTATCGTTTGGTTGGAGACGTATGTTACGA
GGAGGCTTGCAAAATTGCATCAGCCATCACACCTGTTCCTGGTGGTGTTGGACCAATGAC
CATAGCTATGCTTCTGTCCAATACCTTGATATCGGCCAAGAGAATTCACAACTTCGAGTG
ACTTTGTAGGAAGAGCGATGACTTTTTTTTTTTTGATTTAGCAAGCCCGGATACAATAGT
TTGCTATGGTCCTTTCATAAAATGTCTTTTTTCGTTGTATGAAGCCAAACATGTTTTCTT
TTAAAAATGGAAGATAATGGCCTTTTTGG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2CC72TF 689 0 0
GATAGAGAAGGATGTCGATGGATTCCACCCGCTAAATATTGGACGACTCGCCATGCGTGG
TAGAGAACCCTTGTTCGTTCCGTGTACTCCTAAGGGGTGCATCGATCTGTTGCATAGATA
CAACGTTGAGATCAAAGGGAAAAGAGCCGTTGTTATTGGAAGGAGTAACATTGTTGGTAT
GCCAGCTGCTCTCTTATTGCAGAGGGAGGATGCAACTGTTTCCATTATCCACTCAAGAAC
CAAGAACCCTGAAGAAATCACACGAGAAGCTGATATCATTATTGCAGCAGTTGGGCGACC
AAACATGGTTAGAGGAAACTGGATTAAACCTGGCGCAGCCATCATTGATGTTGGGATCAA
TCCGGTTGATGATCCAAATGTTCCACGTGGTTATCGTTTGGTTGGAGACGTATGTTACGA
GGAGGCTTGCAAAATTGCATCAGCCATCACACCTGTTCCTGGTGGTGTTGGACCAATGAC
CATAGCTATGCTTCTGTCCAATACCTTGATATCGGCCAAGAGAATTCACAACTTCGAGTG
ACTTTGTAGGAAGAGCGATGACTTTTTTTTTTTTGATTTAGCAAGCCCGGATACAATAGT
TTGCTATGGTCCTTTCATAAAATGTCTTTTTTCGTTGTATGAAGCCAAACATGTTTTCTC
TTAAAA*TGGAAGATAATGGCCTTTTTGG

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL6389Contig1 619 2 1 U
GGAAACTAAGAGGAAGTATTAAGATGGCATCTTCTATAGTGTCCAACGGATTTTTTGAGC
GTTCCAGTTTCTCGTCCATGCTTCTCTTTCTCTCTATTCTTCTTGTGTTTCCCCATATCA
GTACACAAATGGAATTCCGGAAACTTAAGGAGACGTACCATCCACATCAAGTGACTGTCC
ACAGGCGCGTTAGTATTCCTCGGAATCGTTCGCCAAGAGTACCGAGCTCATCATGTCGCT
TCAGTAAGCGTCATTTCAATGACCCTTCTCCGCCAACCGAAACGTATGTTCCTCGTCGTC
CCTTTACAAGGCCAAAAGGCCCTCAGAAATTTCCGCCTCGTCGTCCCATAACAATGCCAA
AATGCCTAAAATTATTTCCCGCATGTACACCTCAAATAATTTATAGAACGCCTCCTCCGC
CGCCCCCAGGAGCTTTTGAAAGCACATATGGACTTGGTCACTGAGCTCGCATTAGCTTCG
AATGCGTTTAAAATATATATGTGCACGTTTCTTATGTTATATTTTTTTTTTGGTCCCTGT
GGTACGTTATCCATATGCTGGTATTTGTCATATTTTACGGATATATCGAATGCAATTATA
TATGATATTTCTGTTCAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F321JQ C 1
AF RR2F321TF U 1
BS 1 619 RR2F321TF

RD RR2F321JQ 619 0 0
GGAAACTAAGAGGAAGTATTAAGATGGCATCTTCTATAGTGTCCAACGGATTTTTTGAGC
GTTCCAGTTTCTCGTCCATGCTTCTCTTTCTCTCTATTCTTCTTGTGTTTCCCCATATCA
GTACACAAATGGAATTCCGGAAACTTAAGGAGACGTACCATCCACATCAAGTGACTGTCC
ACAGGCGCGTTAGTATTCCTCGGAATCGTTCGCCAAGAGTACCGAGCTCATCATGTCGCT
TCAGTAAGCGTCATTTCAATGACCCTTCTCCGCCAACCGAAACGTATGTTCCTCGTCGTC
CCTTTACAAGGCCAAAAGGCCCTCAGAAATTTCCGCCTCGTCGTCCCATAACAATGCCAA
AATGCCTAAAATTATTTCCCGCATGTACACCTCAAATAATTTATAGAACGCCTCCTCCGC
CGCCCCCAGGAGCTTTTGAAAGCACATATGGACTTGGTCACTGAGCTCGCATTAGCTTCG
AATGCGTTTAAAATATATATGTGCACGTTTCTTATGTTATATTTTTTTTTTGGTCCCTGT
GGTACGTTATCCATATGCTGGTATTTGTCATATTTTACGGATATATCGAATGCAATTATA
TATGATATTTCTGTTCAGC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2F321TF 619 0 0
GGAAACTAAGAGGAAGTATTAAGATGGCATCTTCTATAGTGTCCAACGGATTTTTTGAGC
GTTCCAGTTTCTCGTCCATGCTTCTCTTTCTCTCTATTCTTCTTGTGTTTCCCCATATCA
GTACACAAATGGAATTCCGGAAACTTAAGGAGACGTACCATCCACATCAAGTGACTGTCC
ACAGGCGCGTTAGTATTCCTCGGAATCGTTCGCCAAGAGTACCGAGCTCATCATGTCGCT
TCAGTAAGCGTCATTTCAATGACCCTTCTCCGCCAACCGAAACGTATGTTCCTCGTCGTC
CCTTTACAAGGCCAAAAGGCCCTCAGAAATTTCCGCCTCGTCGTCCCATAACAATGCCAA
AATGCCTAAAATTATTTCCCGCATGTACACCTCAAATAATTTATAGAACGCCTCCTCCGC
CGCCCCCAGGAGCTTTTGAAAGCACATATGGACTTGGTCACTGAGCTCGCATTAGCTTCG
AATGCGTTTAAAATATATATGTGCACGTTTCTTATGTTATATTTTTTTTTTGGTCCCTGT
GGTACGTTATCCATATGCTGGTATTTGTCATATTTTACGGATATATCGAATGCAATTATA
TATGATATTTCTGTTCAGC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL6390Contig1 627 2 1 U
GGGACAAAACGTTTTCTCCAATTCATAATCTTTATCAATTTTTGAATCATGAAGGGTACT
ACTTTGGTTATGGTTTCTTGTGTTTTCATGTGTTTCGTTCTGAGTCATGGTAAAGACGGG
GACTGTTATGATCAAATCCCGTTCCCTGAAAAATGCAGCAAACATGGAGACAAGAAATGC
TTCAAAGACATGCTTTCTGCGAACATAACACGGCGTTTTCTTAGTTGCAACTGTATAAAC
CGGGAACCATTCAAATCACCTGAAAACCTACAAACCGATTTACACAAGAAGGAACACCCC
GGACATATCTGCAATTGTCTCAGAGCTGTTCCCGGTGATTGTGTGCCAGATGCGTAACAG
AGTTTATGGTGGTGACACATAGATAAGCAATGGTGGTAATCTAATGGTATTCTTCTTCTT
AGTAAAGGCAATAATATTTGTTTCTAGTGTTCATGGTCAACACAGAGTGTGATGGTCACC
AATTAGACCCTAGGCGTTATTAATTAATTATGGACAATATATACGTATTTCACTCAATTT
TTTCGCTTATTTTTGTTTACTTTCGATATTTCCAAATCTGTATTAATAAAAAATATCACA
CTCTATTTAATTCTATTTAGTGTTACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FI68JQ C 1
AF RR2FI68TF U 1
BS 1 627 RR2FI68TF

RD RR2FI68JQ 627 0 0
GGGACAAAACGTTTTCTCCAATTCATAATCTTTATCAATTTTTGAATCATGAAGGGTACT
ACTTTGGTTATGGTTTCTTGTGTTTTCATGTGTTTCGTTCTGAGTCATGGTAAAGACGGG
GACTGTTATGATCAAATCCCGTTCCCTGAAAAATGCAGCAAACATGGAGACAAGAAATGC
TTCAAAGACATGCTTTCTGCGAACATAACACGGCGTTTTCTTAGTTGCAACTGTATAAAC
CGGGAACCATTCAAATCACCTGAAAACCTACAAACCGATTTACACAAGAAGGAACACCCC
GGACATATCTGCAATTGTTTCAGAGCTGTTCCCGGTGATTGTGTGCCAGATGCGTAACAG
AGTTTATGGTGGTGACACATAGATAAGCAATGGTGGTAATCTAATGGTATTCTTCTTCTT
AGTAAAGGCAATAATATTTGTTTCTAGTGTTCATGGTCAACACAGAGTGTGATGGTCACC
AATTAGACCCTAGGCGTTATTAATTAATTATGGACAATATATACGTATTTCACTCAATTT
TTTCGCTTATTTTTGTTTACTTTCGATATTTCCAAATCTGTATTAATAAAAAATATCACA
CTCTATTTAATTCTATTTAGTGTTACC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2FI68TF 627 0 0
GGGACAAAACGTTTTCTCCAATTCATAATCTTTATCAATTTTTGAATCATGAAGGGTACT
ACTTTGGTTATGGTTTCTTGTGTTTTCATGTGTTTCGTTCTGAGTCATGGTAAAGACGGG
GACTGTTATGATCAAATCCCGTTCCCTGAAAAATGCAGCAAACATGGAGACAAGAAATGC
TTCAAAGACATGCTTTCTGCGAACATAACACGGCGTTTTCTTAGTTGCAACTGTATAAAC
CGGGAACCATTCAAATCACCTGAAAACCTACAAACCGATTTACACAAGAAGGAACACCCC
GGACATATCTGCAATTGTCTCAGAGCTGTTCCCGGTGATTGTGTGCCAGATGCGTAACAG
AGTTTATGGTGGTGACACATAGATAAGCAATGGTGGTAATCTAATGGTATTCTTCTTCTT
AGTAAAGGCAATAATATTTGTTTCTAGTGTTCATGGTCAACACAGAGTGTGATGGTCACC
AATTAGACCCTAGGCGTTATTAATTAATTATGGACAATATATACGTATTTCACTCAATTT
TTTCGCTTATTTTTGTTTACTTTCGATATTTCCAAATCTGTATTAATAAAAAATATCACA
CTCTATTTAATTCTATTTAGTGTTACC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL6391Contig1 570 2 2 U
TATGATGATAAGGGGTATATCAATTTTTGCATTTTAACGTTTTAAACACACAATTTTGCT
ATTTTTACAAACGATTCCATTATTTATTATGACCTTTAAAAATATATTGTTGAATTACGT
AAATGCAGTATTTATTAAACTCTTACCACTGGTTTGGCCCTTCCATGACCTTTCCAGTTT
CTCCATACTTTCCTTGCTCGAACTCTCTGTAACAATCAATTGCTTCGTGAAAATCTTGTT
TCCCATTCGTAAAGTTTTCTCCAATTCTCTGATATCCTCTGTATCCAGCTGCTGGTTTAA
TCTTGATCTTAAGTTTCTCCTCATATGGAAGCTTGAAGAATTGATGTGACATCTCTTTCA
CCTTCTTCATAAGACTCTCAGAAATTCCATGGTCAGTCACGTAGAAAAAACCGACGTCCC
GACAAGCTCGGTCTAGTCTACGGACAACCTCGGCAACGCCGGCATCTTCCTTCATGCTGG
GATCATCGCATTTGACTAGTAAAGGGCTGATGTCAATAATTGGTAGAAGTGATTTAGAGT
CTGTATCCATCTCAGATTCTTAGAGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GK18TF C 1
AF RR2GK18JQ U 24
BS 1 23 RR2GK18TF
BS 24 570 RR2GK18JQ

RD RR2GK18TF 570 0 0
TATGATGATAAGGGGTATATCAATTTTTGCATTTTAACGTTTTAAACACACAATTTTGCT
ATTTTTACAAACGATTCCATTATTTATTATGACCTTTAAAAATATATTGTTGAATTACGT
AAATGCAGTATTTATTAAACTCTTACCACTGGTTTGGCCCTTCCATGACCTTTCCAGTTT
CTCCATACTTTCCTTGCTCGAACTCTCTGTAACAATCAATTGCTTCGTGAAAATCTTGTT
TCCCATTCGTAAAGTTTTCTCCAATTCTCTGATATCCTCTGTATCCAGCTGCTGGTTTAA
TCTTGATCTTAAGTTTCTCCTCATATGGAAGCTTGAAGAATTGATGTGACATCTCTTTCA
CCTTCTTCATAAGACTCTCAGAAATTCCATGGTCAGTCACGTAGAAGAAACCGACGTCCC
GACAAGCTCGGTCTAGTCTACGGACAACCTCGGCAACGCCGGCATCTTCCTTCATGCTGG
GATCATCGCATTTGACTAGTAAAGGGCTGATGTCAATAATTGGTAGAAGTGATTTAGAGT
CTGTATCCATCTCAGATTCTTAGAGAATCC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2GK18JQ 547 0 0
TTTTTGCATTTTAACGTTTTAAACACACAATTTTGCTATTTTTACAAACGATTCCATTAT
TTATTATGACCTTTAAAAATATATTGTTGAATTACGTAAATGCAGTATTTATTAAACTCT
TACCACTGGTTTGGCCCTTCCATGACCTTTCCAGTTTCTCCATACTTTCCTTGCTCGAAC
TCTCTGTAACAATCAATTGCTTCGTGAAAATCTTGTTTCCCATTCGTAAAGTTTTCTCCA
ATTCTCTGATATCCTCTGTATCCAGCTGCTGGTTTAATCTTGATCTTAAGTTTCTCCTCA
TATGGAAGCTTGAAGAATTGATGTGACATCTCTTTCACCTTCTTCATAAGACTCTCAGAA
ATTCCATGGTCAGTCACGTAGAAAAAACCGACGTCCCGACAAGCTCGGTCTAGTCTACGG
ACAACCTCGGCAACGCCGGCATCTTCCTTCATGCTGGGATCATCGCATTTGACTAGTAAA
GGGCTGATGTCAATAATTGGTAGAAGTGATTTAGAGTCTGTATCCATCTCAGATTCTTAG
AGAATCC

QA 1 547 1 547
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6393Contig1 851 2 2 U
GGATATCTTAGGCATTAATGTCGGACGTTCGCTCCTTATTGTTGGCTTGAGCAATTGAAC
TTCTTCTTATAGGATTCGAACTTGGTTGTGCAACTGTCGAATCTCATTGGTGAAAGCTTC
ATCGACCCATTTGAAGATGTGGTCGTCGTTCTCCAGCTACAACATTAGATCGAATACTCC
ATTAGATCCCACAACATTAGGTAAAATACCAAAAAAACGTGAAGCTTAAGAGACACCGAT
AATACCCTAAGTGAAGCCGCATAAAGACACCGATAATACCGGCGGTATGGATTTGGCCGG
GATTTGGATATTAGCTCGACGATTCTCTCCCCGCACGAACAATTTCTAGGTATTCCCGCA
GTTCTTGCTCGTCGCAGACCACTGGTAACGGTAATATCTCCAGTCGTGGACGATGGAGCG
GCCATTATTGAGTTGGACATTATCTTATCTGACGGAGAGGGAAAAGAGACGATTATTCGA
TTGAGCAGAAGAGGGATGGAGGAGAGAGAAAATTGAAGATAGAAATGGGGAAAATATAAA
AAGGTCTTTAATACGATTTTGGGATTTTAGCAAATTGGAAAGAGGGAAATTCAAAATTCG
CATAGCTGGGCGGGAAAATTATCACAGGGTACCTTTGGATTTAGCATACAAACGAGCATC
GGTCTGCTGATTACTAGTGTACACAATATTGCATTGCCTTTGTTTTTGTCGATTACGGAT
TAGTCTTGTTAATCAAGTTATTCAAAATCTCAAGCGCAATTATAATGTTTTTTCTTGCGC
GGATTAGTACAGAGTTTCTAATAATTTCTTTAGAATTTCTAATATTTTTTCTTCACTCAA
AGCGTAATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS11TF U 1
AF RR2BS11JQ C 86
BS 1 706 RR2BS11TF
BS 707 851 RR2BS11JQ

RD RR2BS11TF 712 0 0
GGATATCTTAGGCATTAATGTCGGACGTTCGCTCCTTATTGTTGGCTTGAGCAATTGAAC
TTCTTCTTATAGGATTCGAACTTGGTTGTGCAACTGTCGAATCTCATTGGTGAAAGCTTC
ATCGACCCATTTGAAGATGTGGTCGTCGTTCTCCAGCTACAACATTAGATCGAATACTCC
ATTAGATCCCACAACATTAGGTAAAATACCAAAAAAACGTGAAGCTTAAGAGACACCGAT
AATACCCTAAGTGAAGCCGCATAAAGACACCGATAATACCGGCGGTATGGATTTGGCCGG
GATTTGGATATTAGCTCGACGATTCTCTCCCCGCACGAACAATTTCTAGGTATTCCCGCA
GTTCTTGCTCGTCGCAGACCACTGGTAACGGTAATATCTCCAGTCGTGGACGATGGAGCG
GCCATTATTGAGTTGGACATTATCTTATCTGACGGAGAGGGAAAAGAGACGATTATTCGA
TTGAGCAGAAGAGGGATGGAGGAGAGAGAAAATTGAAGATAGAAATGGGGAAAATATAAA
AAGGTCTTTAATACGATTTTGGGATTTTAGCAAATTGGAAAGAGGGAAATTCAAAATTCG
CATAGCTGGGCGGGAAAATTATCACAGGGTACCTTTGGATTTAGCATACAAACGAGCATC
GGTCTGCTGATTACTAGTGTACACAATATTGCATTGCCTTTGTTTT
GTCGAT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2BS11JQ 766 0 0
TTGTGCAACTGTCGAATCTCATTGGTGAAAGCTTCATCGACCCATTTGAAGATGTGGTCG
TCGTTCTCCAGCTACAACATTAGATCGAATACTCCATTAGATCCCACAACATTAGGTAAA
ATACCAAAAAAACGTGAAGCTTAAGAGACACCGATAATACCCTAAGTGAAGCCGCATAAA
GACACCGATAATACCGGCGGTATGGATTTGGCCGGGATTTGGATATTAGCTCGACGATTC
TCTCCCCGCACGAACAATTTCTAGGTATTCCCGCAGTTCTTGCTCGTCGCAGACCACTGG
TAACGGTAATATCTCCAGTCGTGGACGATGGAGCGGCCATTATTGAGTTGGACATTATCT
TATCTGACGGAGAGGGAAAAGAGACGATTATTCGATTGAGCAGAAGAGGGATGGAGGAGA
GAGAAAATTGAAGATAGAAATGGGGAAAATATAAAAAGGTCTTTAATACGATTTTGGGAT
TTTAGCAAATTGGAAAGAGGGAAATTCAAAATTCGCATAGCTGGGCGGGAAAATTATCAC
AGGGTACCTTTGGATTTAGCATACAAACGAGCATCGGTCTGCTGATTACTAGTGTACACA
ATATTGCATTGCCTTTGTTTTTGTCGATTACGGATTAGTCTTGTTAATCAAGTTATTCAA
AATCTCAAGCGCAATTATAATGTTTTTTCTTGCGCGGATTAGTACAGAGTTTCTAATAAT
TTCTTTAGAATTTCTAATATTTTTTCTTCACTCAAAGCGTAATTAG

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL6394Contig1 1146 2 10 U
GGAACTCTATAAACTACACTTCCTTCCTCACTTCTCGGATCCTGTTCTGTCTGAATCTGA
GGTCAACCTTTTTTTTTGAAAAAATCGTTGGAGATGGACCCTCCGCTAGTGAACGATTCA
TCCTTCTCCCCAGCGAATCCATCATCTTACACTCTCTCCGAGATTTGGCCATTCCCCGTA
AACGACGCCGTTCGCTCCGGTCTCCGTTTAGCTGTCAATTCCACTCCCTCTGATAAAGAC
GTCTCTACGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGGCGGCGGAGGAATCAACGGTCACGGACTTA
ACTGCAGGCTGGGGAGGAGGGAGAAAGGGTCGAGCTTTGAACTCGGAGGAGGACGAATCT
TCGAAGATGGTTTCTTTAAGCAGCAGCGGTAATGAAGTGAAAGACTCTGGGGAAAAGAAA
AGGAAACTTTGTGGATCTGAAAATGGGAATGGTGACGGTTCAATGAGACCTGAAGGCGAA
ACGAGTTCAGGTGGTGGAAGCAAAGCGACTGAACAGAAGAACAAACCTGAGCCACCAAAG
GACTATATCCATGTCAGAGCAAGAAGAGGACAAGCTACTGACCGGCATAGTCTAGCTGAG
CGAGCTAGGAGAGAAAAGATCAGTGAGAAGATGACAGCTCTTCAAGATATAATCCCAGGT
TGTAATAAGATAATAGGAAAAGCACTTGTGCTGGATGAGATTATCAACTATATTCAATCA
TTGCAGCGGCAAGTTGAGTTTCTGTCAATGAAGCTAGAAGTGGTTAACTCTGGCCCAAGC
ACTGGTCCAACAATAGGAGTTTTTCCCACAGGAGATCTGGGGACTTTACCTATTGACCTC
CATCGGAATATATATGAGCAACAAGAAGCCAACGAGTCCCGGGGTTCACACCCAGAGTGG
CTCCATATGCAGGTTGATGGGAGCTTTAACCGAACCACATGAAAAGAATCTTTTCTTTGT
AGGCAGTAAAGGATGAATGAAATCTTTCACTTATGTGTGTCTGTTAAAAATCTCCTTGTA
TTGTTATATCAGGGAGATGATTAACACTTTATAAAAAAAAAAGACAAGATTGTTGTATTA
TTGTCTGTTATAACTTGTAACAGAAGTGATTCAGTGACACAAAGAGATCTCATATCTTTT
CCCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2E210TF U 1
AF RR2E210JQ C 562
BS 1 676 RR2E210TF
BS 677 677 RR2E210JQ
BS 678 701 RR2E210TF
BS 702 702 RR2E210JQ
BS 703 731 RR2E210TF
BS 732 732 RR2E210JQ
BS 733 747 RR2E210TF
BS 748 748 RR2E210JQ
BS 749 762 RR2E210TF
BS 763 1146 RR2E210JQ

RD RR2E210TF 762 0 0
GGAACTCTATAAACTACACTTCCTTCCTCACTTCTCGGATCCTGTTCTGTCTGAATCTGA
GGTCAACCTTTTTTTTTGAAAAAATCGTTGGAGATGGACCCTCCGCTAGTGAACGATTCA
TCCTTCTCCCCAGCGAATCCATCATCTTACACTCTCTCCGAGATTTGGCCATTCCCCGTA
AACGACGCCGTTCGCTCCGGTCTCCGTTTAGCTGTCAATTCCACTCCCTCTGATAAAGAC
GTCTCTACGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGGCGGCGGAGGAATCAACGGTCACGGACTTA
ACTGCAGGCTGGGGAGGAGGGAGAAAGGGTCGAGCTTTGAACTCGGAGGAGGACGAATCT
TCGAAGATGGTTTCTTTAAGCAGCAGCGGTAATGAAGTGAAAGACTCTGGGGAAAAGAAA
AGGAAACTTTGTGGATCTGAAAATGGGAATGGTGACGGTTCAATGAGACCTGAAGGCGAA
ACGAGTTCAGGTGGTGGAAGCAAAGCGACTGAACAGAAGAACAAACCTGAGCCACCAAAG
GACTATATCCATGTCAGAGCAAGAAGAGGACAAGCTACTGACCGGCATAGTCTAGCTGAG
CGAGCTAGGAGAGAAAAGATCAGTGAGAAGATGACAGCTCTTCAAGATATAATCCCAGGT
TGTAATAAGATAATAG*AAAAGCACTTGTGCTGGATGAGAT*ATCAACTATATTCAATCA
TTGCAGCGGCA*GTTGAGTTTCTGTCA*TGAAGCTAGAAGTG

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2E210JQ 585 0 0
AGAAGAGGACAAGCTACTGACCGGCATAGTCTAGCTGAGCGAGCTAGGAGAGAAAAGATC
AGTGAGAAGATGACAGCTCTTCAAGATATAATCCCAGGTTGTAATAAGATAATAGGAAAA
GCACTTGTGCTGGATGAGATTATCAACTATATTCAATCATTGCAGCGGCAAGTTGAGTTT
CTGTCAATGAAGCTAGAAGTGGTTAACTCTGGCCCAAGCACTGGTCCAACAATAGGAGTT
TTTCCCACAGGAGATCTGGGGACTTTACCTATTGACCTCCATCGGAATATATATGAGCAA
CAAGAAGCCAACGAGTCCCGGGGTTCACACCCAGAGTGGCTCCATATGCAGGTTGATGGG
AGCTTTAACCGAACCACATGAAAAGAATCTTTTCTTTGTAGGCAGTAAAGGATGAATGAA
ATCTTTCACTTATGTGTGTCTGTTAAAAATCTCCTTGTATTGTTATATCAGGGAGATGAT
TAACACTTTATAAAAAAAAAAGACAAGATTGTTGTATTATTGTCTGTTATAACTTGTAAC
AGAAGTGATTCAGTGACACAAAGAGATCTCATATCTTTTCCCTTG

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL6395Contig1 705 2 18 U
GGGCGTCTCACTTCTCTCTCTCACCGTCTCACCGCTTTCGAAGTAACAATGCCGCAGGGA
GATTATATCGATTTGCACCAGAAGAGGCATGGACGCCGCCTCGATTACGAAGAGCGCAAG
CGCAAGAAGGAGGCTCGTCAAGTTCACAAGCGCTCCAAACAGGCTCAGAATTCTATAGGT
ATAAAGGGTAAGATGATTGCTAAGAAAAACTACGCTGAGAAAGCTCAAATGAAGAAAACA
TTGAAGATGCATGAGGAGAGTTCATCAAGGCGTAAAACTGATGAGGATGTTCAGGAAGGA
GCTGTTCCTGCTTATCTTCTTGATCGTGAGAATACCTCTCGGGCCAAGGTTCTTAGCAAC
ACTATTAAACAAAAGAGGAAAGAGAAAGCTGGGAAGTGGGAGGTTCCTCTGCCAAAGGTC
CGCCCCGTGGCTGAAGATGAGATGTTCAGAGTGATCAGATCTGGGAAGAGGAAAACAAAA
CAGTGGAAGAGGATGGTTACAAAAGCTACATTTGTTGGACCTGGTTTCACAAGGAAGCCG
CCAAAGTACGAGCAATTCATCCGCCCTTCTGGACTTCGTTTCACCAAGGCCCACGTCACT
CACCCTGAGCTAAGATGCACTTTCTGTCTTGAGATCATCGGGATCAAGAAGAATCCCAAC
GGTCCAATGTATACATCGCTTGGTGTCATGACCAGAGGACATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD45TF U 1
AF RR2ES63TF U 9
BS 1 25 RR2GD45TF
BS 26 26 RR2ES63TF
BS 27 158 RR2GD45TF
BS 159 159 RR2ES63TF
BS 160 212 RR2GD45TF
BS 213 213 RR2ES63TF
BS 214 236 RR2GD45TF
BS 237 237 RR2ES63TF
BS 238 422 RR2GD45TF
BS 423 423 RR2ES63TF
BS 424 549 RR2GD45TF
BS 550 550 RR2ES63TF
BS 551 553 RR2GD45TF
BS 554 554 RR2ES63TF
BS 555 596 RR2GD45TF
BS 597 597 RR2ES63TF
BS 598 694 RR2GD45TF
BS 695 705 RR2ES63TF

RD RR2GD45TF 694 0 0
GGGCGTCTCACTTCTCTCTCTCACCTTCTCACCGCTTTCGAAGTAACAATGCCGCAGGGA
GATTATATCGATTTGCACCAGAAGAGGCATGGACGCCGCCTCGATTACGAAGAGCGCAAG
CGCAAGAAGGAGGCTCGTCAAGTTCACAAGCGCTCCAAGCAGGCTCAGAATTCTATAGGT
ATAAAGGGTAAGATGATTGCTAAGAAAAACTATGCTGAGAAAGCTCAAATGAAGAAGACA
TTGAAGATGCATGAGGAGAGTTCATCAAGGCGTAAAACTGATGAGGATGTTCAGGAAGGA
GCTGTTCCTGCTTATCTTCTTGATCGTGAGAATACCTCTCGGGCCAAGGTTCTTAGCAAC
ACTATTAAACAAAAGAGGAAAGAGAAAGCTGGGAAGTGGGAGGTTCCTCTGCCAAAGGTC
CGTCCCGTGGCTGAAGATGAGATGTTCAGAGTGATCAGATCTGGGAAGAGGAAAACAAAA
CAGTGGAAGAGGATGGTTACAAAAGCTACATTTGTTGGACCTGGTTTCACAAGGAAGCCG
CCAAAGTACTAGCGATTCATCCGCCCTTCTGGACTTCGTTTCACCAAGGCCCACGTTACT
CACCCTGAGCTAAGATGCACTTTCTGTCTTGAGATCATCGGGATCAAGAAGAATCCCAAC
GGTCCAATGTATACATCGCTTGGTGTCATGACCA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2ES63TF 697 0 0
G
ACTTCTCTCTCTCACCGTCTCACCGCTTTGGAAGTAACAATGCCGCAGGGAGATTATATT
GATTTGCACCAGAAGAGGCATGGACGCCGCCTCGATTACGAAGAGCGCAAGCGCAAGAAG
GAGGCTCGTCAAGTTCACAAGCGCTCCAAACAGGCTCAGAATTCTATAGGTATAAAGGGT
AAGATGATTGCTAAGAAAAACTACGCTGAGAAAGCTCAAATGAAGAAAACATTGAAGATG
CATGAGGAGAGTTCATCAAGGCGTAAAACTGATGAGGATGTTCAGGAAGGAGCTGTTCCT
GCTTATCTTCTTGATCGTGAGAATACCTCTCGGGCCAAGGTTCTTAGCAACACTATTAAA
CAAAAGAGGAAAGAGAAAGCTGGGAAGTGGGAGGTTCCTCTGCCTAAGGTCCGCCCCGTG
GCTGAAGATGAGATGTTCAGAGTGATCAGATCTGGGAAGAGGAAAACGAAACAGTGGAAG
AGGATGGTTACAAAAGCTACATTTGTTGGACCTGGTTTCACTAGGAAGCCGCCAAAGTAC
GAGCAATTCATCCGCCCTTCTGGACTTCGTTTCACCAAGGCCCACGTCACTCACCCTGAG
CTAAGATGCACTTTCTGTCTTGAGATCATCGGGATCAAGAAGAATCCCAACGGTCCAATG
TATACATCGTTTGGTGTCATGACCAGAGGACATCAT

QA 2 697 2 697
DS 



AS 1 2

CO CL6396Contig1 1499 2 4 U
GGTGATAAATGATTTACTGGATCCAACCGGCCAAAATTTACGAGTTAGAGAGGATTCCCA
GGGGACTTATGTCGAAGGTATCAAGGAAGAAGTTGTTTTGTCTCCTGGTCATGCACTATC
ATTCATTGCAGCCGGTGAAGAACATCGCCATGTCGGTTCAAATAATTTCAATTTGATGAG
CAGCAGAAGTCACACTTTGTTTACACTGATGATTGAAAGTAGTGCTACTGGAGATGAATA
TGATGGAGTTATTTTTTCTCAACTCAATTTGATTGATTTGGCTGGATCTGAGAGTTCCAA
AACTGAAACAACTGGATTGAGGAGAAAGGAAGGTGCATACATCAACAAGAGTCTTCTAAC
TCTTGGAACTGTGATTGGAAAACTTAGTGAGGGTAAGGCAACTCACATTCCATATCGTGA
CTCTAAGCTAACTCGTCTTCTGCAATCATCACTAAGTGGTCATGGGCATGTTTCGCTCAT
ATGTACAATTACTCCCGCGTCAAGCAGTAATAAGGAAACTCATAATACGTTGAAATTTGC
CAGCAGAGCAAAGAGTATAGAAATATATGCTTCGCGCAATCAGCAGATAATTGCATTCTC
CAAGAACAACTACAGAAAAAGTGCACCGAGAACAAAGAACTACATGAAAAGGTGAACCTT
CTAGAGCAACGTTTGAATGCAGTATCTAGTGAAAAATCATCACCATCTTGTTCCAACAAC
GCGGTATCTGGAGAGTTTGCTGACGATCTAAAAAGGAAAATACAGTCGCAGGAGATAGAG
AACGAACAGTTGAAGCTAGAACATGTCCATATTGTAGAAGAGAACAGTGGTTTGCGAGTA
CAGAATCAAAAACTAGCTGAAGAAGCTTCATACGCCAAGGAACTAGCCTCTGCTGCCGCT
GTTGAGCTGAAAAATCTGGCTAGTGAAGTAACAAAACTCTCACTCCAAAACACAAAGCTA
GGCAAGGAATTGGCAGCTGCAAGAGACTTGGCTCAAACGCGTAACCCCATGAACGGAGTT
AATAATCGCGAATGTACCGAGATAGCCTGAAGTAGTTGTGGTAGCTAAAACTGAAGAGAC
ACCAAAAGAGGAACCTCTTGTTGCTCGTCTCAAGGCACGGATGCAAGAAATGAAGGAGAA
AGAGATGAGATCACAAGCGCATGGAGACGCAAACTCTCACATTTGTAAAGTGTGTTTCGA
GTCTTCCACGGCAGCAATTCTACTCCCTTGCCGCCATTTCTGCTTATGTAAATCATGTTC
CCTGGCTTGCTCTGAATGCCCAATCTGCCGCACAAAGATCTCTGATCGGCTCTTTGCCTT
TCCGTCTTGACAAAGGCAACAAAGGGTGGATGATTGCAGGTTTCAAGAACTGTGGGTGAA
GCCTGTTGCTATATATTTTGAAGACAAGAACAGGTTTAAATTGTTTTAACATGGACCATT
TTGTATGTAATATAAAATGATTATATTTATCACTAAAATGGAAAAGGGGCTTCTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF61TF U 1
AF RR2AF61JQ C 631
BS 1 771 RR2AF61TF
BS 772 772 RR2AF61JQ
BS 773 827 RR2AF61TF
BS 828 1499 RR2AF61JQ

RD RR2AF61TF 827 0 0
GGTGATAAATGATTTACTGGATCCAACCGGCCAAAATTTACGAGTTAGAGAGGATTCCCA
GGGGACTTATGTCGAAGGTATCAAGGAAGAAGTTGTTTTGTCTCCTGGTCATGCACTATC
ATTCATTGCAGCCGGTGAAGAACATCGCCATGTCGGTTCAAATAATTTCAATTTGATGAG
CAGCAGAAGTCACACTTTGTTTACACTGATGATTGAAAGTAGTGCTACTGGAGATGAATA
TGATGGAGTTATTTTTTCTCAACTCAATTTGATTGATTTGGCTGGATCTGAGAGTTCCAA
AACTGAAACAACTGGATTGAGGAGAAAGGAAGGTGCATACATCAACAAGAGTCTTCTAAC
TCTTGGAACTGTGATTGGAAAACTTAGTGAGGGTAAGGCAACTCACATTCCATATCGTGA
CTCTAAGCTAACTCGTCTTCTGCAATCATCACTAAGTGGTCATGGGCATGTTTCGCTCAT
ATGTACAATTACTCCCGCGTCAAGCAGTAATAAGGAAACTCATAATACGTTGAAATTTGC
CAGCAGAGCAAAGAGTATAGAAATATATGCTTCGCGCAATCAGCAGATAATTGCATTCTC
CAAGAACAACTACAGAAAAAGTGCACCGAGAACAAAGAACTACATGAAAAGGTGAACCTT
CTAGAGCAACGTTTGAATGCAGTATCTAGTGAAAAATCATCACCATCTTGTTCCAACAAC
GCGGTATCTGGAGAGTTTGCTGACGATCTAAAAAGGAAAATACAGTCGCAG*AGATAGAG
AACGAACAGTTGAAGCTAGAACATGTCCATATTGTAGAAGAGAACAG

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2AF61JQ 869 0 0
AACAAAGAACTACATGAAAAGGTGAACCTTCTAGAGCAACGTTTGAATGCAGTATCTAGT
GAAAAATCATCACCATCTTGTTCCAACAACGCGGTATCTGGAGAGTTTGCTGACGATCTA
AAAAGGAAAATACAGTCGCAGGAGATAGAGAACGAACAGTTGAAGCTAGAACATGTCCAT
ATTGTAGAAGAGAACAGTGGTTTGCGAGTACAGAATCAAAAACTAGCTGAAGAAGCTTCA
TACGCCAAGGAACTAGCCTCTGCTGCCGCTGTTGAGCTGAAAAATCTGGCTAGTGAAGTA
ACAAAACTCTCACTCCAAAACACAAAGCTAGGCAAGGAATTGGCAGCTGCAAGAGACTTG
GCTCAAACGCGTAACCCCATGAACGGAGTTAATAATCGCGAATGTACCGAGATAGCCTGA
AGTAGTTGTGGTAGCTAAAACTGAAGAGACACCAAAAGAGGAACCTCTTGTTGCTCGTCT
CAAGGCACGGATGCAAGAAATGAAGGAGAAAGAGATGAGATCACAAGCGCATGGAGACGC
AAACTCTCACATTTGTAAAGTGTGTTTCGAGTCTTCCACGGCAGCAATTCTACTCCCTTG
CCGCCATTTCTGCTTATGTAAATCATGTTCCCTGGCTTGCTCTGAATGCCCAATCTGCCG
CACAAAGATCTCTGATCGGCTCTTTGCCTTTCCGTCTTGACAAAGGCAACAAAGGGTGGA
TGATTGCAGGTTTCAAGAACTGTGGGTGAAGCCTGTTGCTATATATTTTGAAGACAAGAA
CAGGTTTAAATTGTTTTAACATGGACCATTTTGTATGTAATATAAAATGATTATATTTAT
CACTAAAATGGAAAAGGGGCTTCTTTTAC

QA 1 869 1 869
DS 



AS 1 2

CO CL6397Contig1 1531 2 2 U
GGAAACACTTTAAGAGAGAGAGAGAGACGCGTTCTTCTTCTTCGTCTTCCTTGGAGAATT
TGGCCGGCGTCAACGATATTGACTTGTCGTAGGTTTTGAAGAATCAGCAAAGATGAGTGA
CAATCTCATGGACAAAGTCACCGCATTCGGCGAGCGCCTCAAGATCGGAGGATCTGAAGT
GAGCAACAAGATCACCGCTGGCATGACCTCGATGAGCTTCAAAGTCAAGGAGCTTTTCCA
AGGTCCGAACCCAACTGATAAAATAGTCGAAGATGCCACTTCGGAGAATCTAGAGGAGCC
TGACTGGGATATGAATTTGGAGATATGCGACATGATTAATCAGGAGGCTATTAACGGCGT
TGATCTGATCCGTGGGATAAAGAAGAGGATAATGATGATGAAGCAGCCGAGGATTCAGTA
CCTTGCCTTGGTTTTGCTTGAGACGTGTGTTAAGAACTGTGAGAAGGCCTTCTCGGAGGT
GGCAGCTGAGAGAGTCCTTGATGAAATGGTTAAGCTTGTTGATGATCCGCAGACGGTTGT
GAATAATCGGAACAAGGCTTTGATGCTGATTGAAGCTTGGGGAGAATCGACCAGTGAACT
CCGTTACCTTCCAGTTTTCGAAGAAACTTACAAGAGCTTAAAAGCGAGAGGTATCCGTTT
CCCTGGACGAGACAACGAGAGCTTGGCACCTATCTTCACACCTGCTCGGTCAGCTCCAGC
ACCAGAATTGAATGCTGATCCTCCTCAGCATGCGCGTGAGCCTGAACATGCTCCTGTAAG
AAGCTTTACCGCTGAGCAGACGAAGGAAGCTTTCGATATAGCAAGAAACAGCATTGAACT
TCTTTCCACGGTTCTGTCCTCTTCCCCTCAACACGACGCTTTACAGGATGACTTAACAAT
GACACTTGTACAGCAATGTCGTCAGTCTCAAACCACTGTCCAAAGAATCATCGAAACAGC
GGGTGAAGACGAAGCCCTTCTGTTTGAAGCATTGAATGTGAACGACGAGCTCGTGAAAAC
ACTGTCCAAGTACGAGGAGATGAACAAACCCTCAGCACCGCTAACCGCACCTGAACCAGC
CATGATTCCTGTTGCCGAAGAGCCTGATGACTCTTCGGATCATGGAAAAGAAGAATCTCT
GGTCAGAAAACCATCGATTGCACGAGCTGGGGTCCACGGAAGTGGTGGTGGGAGTGGGGA
TGACATGATGGATGATCTTGATGAGATGATATTTGGCAAGAAAAGCGGCGGTGATGGTGA
TTCTTCTTCAACTGATGACCCGAAGAAGCAGCAGTCCTCGTCTAAAAGCGATGATCCCAT
TCGATTCTGAGATGGTTTTCTTTCCTGCGAAAACAAAACTCTTTTTTTTAATGAATTTAT
GAAGTTTAATTGGTGATTCAAAGCAGTTTCAGTGTAAGTAAGTTGTGTTTAAGGATCTCT
CTGGACTTATGCGTTAGGTTTTATAATGGAGGAGATGTTTATGACACAAAGATTTCAAGT
TTATCTTTGAGATAAAGACAAACGTTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC62TF U 1
AF RR2BC62JQ C 706
BS 1 800 RR2BC62TF
BS 801 1531 RR2BC62JQ

RD RR2BC62TF 800 0 0
GGAAACACTTTAAGAGAGAGAGAGAGACGCGTTCTTCTTCTTCGTCTTCCTTGGAGAATT
TGGCCGGCGTCAACGATATTGACTTGTCGTAGGTTTTGAAGAATCAGCAAAGATGAGTGA
CAATCTCATGGACAAAGTCACCGCATTCGGCGAGCGCCTCAAGATCGGAGGATCTGAAGT
GAGCAACAAGATCACCGCTGGCATGACCTCGATGAGCTTCAAAGTCAAGGAGCTTTTCCA
AGGTCCGAACCCAACTGATAAAATAGTCGAAGATGCCACTTCGGAGAATCTAGAGGAGCC
TGACTGGGATATGAATTTGGAGATATGCGACATGATTAATCAGGAGGCTATTAACGGCGT
TGATCTGATCCGTGGGATAAAGAAGAGGATAATGATGATGAAGCAGCCGAGGATTCAGTA
CCTTGCCTTGGTTTTGCTTGAGACGTGTGTTAAGAACTGTGAGAAGGCCTTCTCGGAGGT
GGCAGCTGAGAGAGTCCTTGATGAAATGGTTAAGCTTGTTGATGATCCGCAGACGGTTGT
GAATAATCGGAACAAGGCTTTGATGCTGATTGAAGCTTGGGGAGAATCGACCAGTGAACT
CCGTTACCTTCCAGTTTTCGAAGAAACTTACAAGAGCTTAAAAGCGAGAGGTATCCGTTT
CCCTGGACGAGACAACGAGAGCTTGGCACCTATCTTCACACCTGCTCGGTCAGCTCCAGC
ACCAGAATTGAATGCTGATCCTCCTCAGCATGCGCGTGAGCCTGAACATGCTCCTGTAAG
AAGCTTTACCGCTGAGCAGA

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2BC62JQ 826 0 0
TCGGTCAGCTCCAGCACCAGAATTGAATGCTGATCCTCCTCAGCATGCGCGTGAGCCTGA
ACATGCTCCTGTAAGAAGCTTTACCGCTGAGCAGACGAAGGAAGCTTTCGATATAGCAAG
AAACAGCATTGAACTTCTTTCCACGGTTCTGTCCTCTTCCCCTCAACACGACGCTTTACA
GGATGACTTAACAATGACACTTGTACAGCAATGTCGTCAGTCTCAAACCACTGTCCAAAG
AATCATCGAAACAGCGGGTGAAGACGAAGCCCTTCTGTTTGAAGCATTGAATGTGAACGA
CGAGCTCGTGAAAACACTGTCCAAGTACGAGGAGATGAACAAACCCTCAGCACCGCTAAC
CGCACCTGAACCAGCCATGATTCCTGTTGCCGAAGAGCCTGATGACTCTTCGGATCATGG
AAAAGAAGAATCTCTGGTCAGAAAACCATCGATTGCACGAGCTGGGGTCCACGGAAGTGG
TGGTGGGAGTGGGGATGACATGATGGATGATCTTGATGAGATGATATTTGGCAAGAAAAG
CGGCGGTGATGGTGATTCTTCTTCAACTGATGACCCGAAGAAGCAGCAGTCCTCGTCTAA
AAGCGATGATCCCATTCGATTCTGAGATGGTTTTCTTTCCTGCGAAAACAAAACTCTTTT
TTTTAATGAATTTATGAAGTTTAATTGGTGATTCAAAGCAGTTTCAGTGTAAGTAAGTTG
TGTTTAAGGATCTCTCTGGACTTATGCGTTAGGTTTTATAATGGAGGAGATGTTTATGAC
ACAAAGATTTCAAGTTTATCTTTGAGATAAAGACAAACGTTTTCAT

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL6398Contig1 941 2 2 U
GGAATAAGTGGAAGCTTGTACCGTCTAAAAAAGTAGCTCTGACCTCTCTCTTCTTTTCTC
TCTCTACTGATCGTCTTCGCCGCTCTCTGTTTCTCGCCGACGACGGTGGGTTCCCATAGC
CACGTCGTCGGTCGGGATTTGTTTTCTATCTTCGTTTGTCCTCTCGGTTGCAACTCGCTT
TGGACTCGTCGGTTCTACGGAGCTGCACGTCCGTTTTTCCTCAATTCCAGTATCGCACCT
TCAAGATGGTGGATGACTGGCTTATGACTCTGGGACCGTGCCGTCTTGTCTTCGATGGTG
GTCGCCGGCTATCGTTTCCATGGAAGTACTCAATCTCTGTGATGGTTTTCGTGTTGTGTG
TTGTGGCCAAGTTTTGGATGAGACATCGATTCAATCGATTGATTCTCTCAAAAACTTAGG
CGTTTGATTGGAAGATACCGATCCCCTATATGTCCAATACAGTTGTTGGAGATGGGTTTT
GGTGATCAAGGGTAGTGTCCCGGTTGAATCCGGAGGTCAAGTGCAGAGTTTCTATCAGAG
ACGAGTTCCAGTCGGAGATGATGACGGTGGCTCCCCTTCCCTGTAGAGTATCGGTTAAGC
GGTCCCGGCGGCGATCTCCCAGCCGAAAGTGATGGAGTTTTTTCTTTTCTCGCCACGCGT
CTTTTGGTGTTTCAGATTACACGTGGTGGCGGTGGCGTGAAGACTCGGTCACTTTATTTT
TTTTTGGGCTTGGGATTTAAGGTGGATCTGGTGGGCCTTTGTTGTTTTTCGGGTTTAGAT
CCTGGTCTTGGGCTGGGCTGTATGTACTGTTTTTCAGCCTGTTTAGGCTTTATTAATAAT
ATAAGATGGTAAAAAAAAAAAAAAAAGTGGAAGCTTTGGTGGGTCTGGGTCTCGTTGTGT
ATTTACTATTTAGTGGCCGAAGAAAACAATAATATTAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F480TF U 1
AF RR2F480JQ C 244
BS 1 562 RR2F480TF
BS 563 941 RR2F480JQ

RD RR2F480TF 562 0 0
GGAATAAGTGGAAGCTTGTACCGTCTAAAAAAGTAGCTCTGACCTCTCTCTTCTTTTCTC
TCTCTACTGATCGTCTTCGCCGCTCTCTGTTTCTCGCCGACGACGGTGGGTTCCCATAGC
CACGTCGTCGGTCGGGATTTGTTTTCTATCTTCGTTTGTCCTCTCGGTTGCAACTCGCTT
TGGACTCGTCGGTTCTACGGAGCTGCACGTCCGTTTTTCCTCAATTCCAGTATCGCACCT
TCAAGATGGTGGATGACTGGCTTATGACTCTGGGACCGTGCCGTCTTGTCTTCGATGGTG
GTCGCCGGCTATCGTTTCCATGGAAGTACTCAATCTCTGTGATGGTTTTCGTGTTGTGTG
TTGTGGCCAAGTTTTGGATGAGACATCGATTCAATCGATTGATTCTCTCAAAAACTTAGG
CGTTTGATTGGAAGATACCGATCCCCTATATGTCCAATACAGTTGTTGGAGATGGGTTTT
GGTGATCAAGGGTAGTGTCCCGGTTGAATCCGGAGGTCAAGTGCAGAGTTTCTATCAGAG
ACGAGTTCCAGTCGGAGATGAT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2F480JQ 698 0 0
AGATGGTGGATGACTGGCTTATGACTCTGGGACCGTGCCGTCTTGTCTTCGATGGTGGTC
GCCGGCTATCGTTTCCATGGAAGTACTCAATCTCTGTGATGGTTTTCGTGTTGTGTGTTG
TGGCCAAGTTTTGGATGAGACATCGATTCAATCGATTGATTCTCTCAAAAACTTAGGCGT
TTGATTGGAAGATACCGATCCCCTATATGTCCAATACAGTTGTTGGAGATGGGTTTTGGT
GATCAAGGGTAGTGTCCCGGTTGAATCCGGAGGTCAAGTGCAGAGTTTCTATCAGAGACG
AGTTCCAGTCGGAGATGATGACGGTGGCTCCCCTTCCCTGTAGAGTATCGGTTAAGCGGT
CCCGGCGGCGATCTCCCAGCCGAAAGTGATGGAGTTTTTTCTTTTCTCGCCACGCGTCTT
TTGGTGTTTCAGATTACACGTGGTGGCGGTGGCGTGAAGACTCGGTCACTTTATTTTTTT
TTGGGCTTGGGATTTAAGGTGGATCTGGTGGGCCTTTGTTGTTTTTCGGGTTTAGATCCT
GGTCTTGGGCTGGGCTGTATGTACTGTTTTTCAGCCTGTTTAGGCTTTATTAATAATATA
AGATGGTAAAAAAAAAAAAAAAAGTGGAAGCTTTGGTGGGTCTGGGTCTCGTTGTGTATT
TACTATTTAGTGGCCGAAGAAAACAATAATATTAGTTG

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL6399Contig1 847 2 2 U
GGCTGAGAGCCCAACAAAGTAAACCCTAATCGTGTTCTAGGCGAAGACATCGAAGTGTTT
GTCTCTCTTCTCTGTTCAGCGGCGACCTTTGAATTTCAACACTGAACCTGAAACGGTCGG
AGTTATGTGTTTTCCGTGTGGTGTTAAAGCCTTATTAATTCAATCTACCACGATGAAGTT
TTGAATTCGGGCTTAGCTTTGTTGAATCGGTGACCTGCGAGTATAAATATGTGTCCTTCT
GTCGTCGAATTTAGGTTGCTCCTTTCTCGGAGGCCAGAAATGTGAGGCGCTGTGGAGAGC
TCATGTAGGTTGATCCTCTCATGGTGGATGTAAATGAAAAGTTCCATGGCCCCCGTTTCA
TCCAATACCTTATCCTCCATCAATCATCAATCATCTTCGCCACCGTTAGCTTTCAGAAGT
ATCTTCTGATTAGCCAAATATAGCAGTGGATCTCCCAGATTCCTTTTATCTATACCAATT
GAAGTCGGGTTCTTTTGATGGGAAAATCAGGAACCTAGGGAGAATGAGAAGCTATATTGC
CTTATACCAGCACCTAAAGAATATGTTACGCCTCTCTCTTGGCCCAAGAGTATAGATTAT
GTGCCTTACGCTAATGCCCCGAACAAGGCTATTCAGAGATGGATTTAGTATGAGAGGGAC
GTTTTTAGATTCCTTAGTGGTGGAACTCATTAAGGTGGTAGGACTGCTCTGGACACTGGT
TGTGAGATAATGTCTTATGTTTGCTTCTGTTTATATTCTTCGAGTCTCATATTCTTCATT
AGTGACGTTGTGGGATTATATGTTTGTAGTTGCTTTATTTCAGTTTTACCACACCTGAAT
TACCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV16TF U 1
AF RR2CV16JQ C 91
BS 1 694 RR2CV16TF
BS 695 847 RR2CV16JQ

RD RR2CV16TF 696 0 0
GGCTGAGAGCCCAACAAAGTAAACCCTAATCGTGTTCTAGGCGAAGACATCGAAGTGTTT
GTCTCTCTTCTCTGTTCAGCGGCGACCTTTGAATTTCAACACTGAACCTGAAACGGTCGG
AGTTATGTGTTTTCCGTGTGGTGTTAAAGCCTTATTAATTCAATCTACCACGATGAAGTT
TTGAATTCGGGCTTAGCTTTGTTGAATCGGTGACCTGCGAGTATAAATATGTGTCCTTCT
GTCGTCGAATTTAGGTTGCTCCTTTCTCGGAGGCCAGAAATGTGAGGCGCTGTGGAGAGC
TCATGTAGGTTGATCCTCTCATGGTGGATGTAAATGAAAAGTTCCATGGCCCCCGTTTCA
TCCAATACCTTATCCTCCATCAATCATCAATCATCTTCGCCACCGTTAGCTTTCAGAAGT
ATCTTCTGATTAGCCAAATATAGCAGTGGATCTCCCAGATTCCTTTTATCTATACCAATT
GAAGTCGGGTTCTTTTGATGGGAAAATCAGGAACCTAGGGAGAATGAGAAGCTATATTGC
CTTATACCAGCACCTAAAGAATATGTTACGCCTCTCTCTTGGCCCAAGAGTATAGATTAT
GTGCCTTACGCTAATGCCCCGAACAAGGCTATTCAGAGATGGATTTAGTATGAGAGGGAC
GTTTTTAGATTCCTTAGTGGTGGAACTCATTAAG
TG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2CV16JQ 757 0 0
GAATTTCAACACTGAAC*TGAAACGGTCGGAGTTATGTGTTTTCCGTGTGGTGTTAAAGC
CTTATTAATTCAATCTACCACGATGAAGTTTTGAATTCGGGCTTAGCTTTGTTGAATCGG
TGACCTGCGAGTATAAATATGTGTCCTTCTGTCGTCGAATTTAGGTTGCTCCTTTCTCGG
AGGCCAGAAATGTGAGGCGCTGTGGAGAGCTCATGTAGGTTGATCCTCTCATGGTGGATG
TAAATGAAAAGTTCCATGGCCCCCGTTTCATCCAATACCTTATCCTCCATCAATCATCAA
TCATCTTCGCCACCGTTAGCTTTCAGAAGTATCTTCTGATTAGCCAAATATAGCAGTGGA
TCTCCCAGATTCCTTTTATCTATACCAATTGAAGTCGGGTTCTTTTGATGGGAAAATCAG
GAACCTAGGGAGAATGAGAAGCTATATTGCCTTATACCAGCACCTAAAGAATATGTTACG
CCTCTCTCTTGGCCCAAGAGTATAGATTATGTGCCTTACGCTAATGCCCCGAACAAGGCT
ATTCAGAGATGGATTTAGTATGAGAGGGACGTTTTTAGATTCCTTAGTGGTGGAACTCAT
TAAGGTGGTAGGACTGCTCTGGACACTGGTTGTGAGATAATGTCTTATGTTTGCTTCTGT
TTATATTCTTCGAGTCTCATATTCTTCATTAGTGACGTTGTGGGATTATATGTTTGTAGT
TGCTTTATTTCAGTTTTACCACACCTGAATTACCTGC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL6400Contig1 958 2 10 U
GGATTCAACCGAGACATGACGATCCAACTAAAAGAAGAACTCATAATGAACTCTTTCAAA
ACTCTAGACGGACGAGGAGCATCAGTCCACATCTCCGGTGGGCCGTGTATAACCATACAA
TACGTGACAAACATCATCATCCATGGTTTACACATACATGATTGTAAGCAAGGTGGGAAC
ACTTACGTACGAGATTCTCCAGAGCACTACGGGTGGCGGACGATATCGGACGGTGACGGT
GTTTCCATCTTCGGTGGGAGCCACGTGTGGGTTGATCATTGCTCGCTCTCGAATTGTAAC
GATGGGTTGATTGATGCGATCCGTGGATCGACGGCTATAACGATTTCTAATAATTACTTG
ACGCATCACAATAAGGTTATGTTATTGGGACATAGTGATACGTACGAGCAAGACAAGAAT
ATGCAAGTCACTATCGCTTTTAACCACTTTGGAGAAGGCCTTGTCCAAAGAATGCCAAGG
TGTCGACATGGATATTTCCATGTGGTGAACAATGACTATACACATTGGGAAATGTATGCA
ATTGGAGGAAGTGCTAATCCTACCATCAACTCTCAAGGGAACCGGTTCCTTGCTCCTGAT
AACTCTTTTAGCAAAGAGGTAACAAAGCATGAGGATGCGCCAGAAAGCGAGTGGAGTCAC
TGGAATTGGAGATCCGAAGGAGATCTAATGCTTAATGGTGCATTCTTTACACTTTCTGGA
GCTGGACCAACCAAGTCGTCAAGCTATTCGAGAGCCTCAAGCCTAGCTGCTAGACCGTCA
TCTAATGTTGGTGAGATAACTATATCATCTGGTGCACTCAGCTGCAAAAAGGGTTCTCAC
TGCTGATCATAGCCCCACCAGCGTGTATGTATTTGTGTATATATAATATAATGAAACCAG
CAATTCAAAGCTAGTTGTGTGATAATCTTGATGGAAAAGTGAAGAGGAGTTGATTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK02TF U 1
AF RR2EK02JQ C 149
BS 1 679 RR2EK02TF
BS 680 680 RR2EK02JQ
BS 681 727 RR2EK02TF
BS 728 728 RR2EK02JQ
BS 729 775 RR2EK02TF
BS 776 776 RR2EK02JQ
BS 777 788 RR2EK02TF
BS 789 789 RR2EK02JQ
BS 790 798 RR2EK02TF
BS 799 958 RR2EK02JQ

RD RR2EK02TF 802 0 0
GGATTCAACCGAGACATGACGATCCAACTAAAAGAAGAACTCATAATGAACTCTTTCAAA
ACTCTAGACGGACGAGGAGCATCAGTCCACATCTCCGGTGGGCCGTGTATAACCATACAA
TACGTGACAAACATCATCATCCATGGTTTACACATACATGATTGTAAGCAAGGTGGGAAC
ACTTACGTACGAGATTCTCCAGAGCACTACGGGTGGCGGACGATATCGGACGGTGACGGT
GTTTCCATCTTCGGTGGGAGCCACGTGTGGGTTGATCATTGCTCGCTCTCGAATTGTAAC
GATGGGTTGATTGATGCGATCCGTGGATCGACGGCTATAACGATTTCTAATAATTACTTG
ACGCATCACAATAAGGTTATGTTATTGGGACATAGTGATACGTACGAGCAAGACAAGAAT
ATGCAAGTCACTATCGCTTTTAACCACTTTGGAGAAGGCCTTGTCCAAAGAATGCCAAGG
TGTCGACATGGATATTTCCATGTGGTGAACAATGACTATACACATTGGGAAATGTATGCA
ATTGGAGGAAGTGCTAATCCTACCATCAACTCTCAAGGGAACCGGTTCCTTGCTCCTGAT
AACTCTTTTAGCAAAGAGGTAACAAAGCATGAGGATGCGCCAGAAAGCGAGTGGAGTCAC
TGGAATTGGAGATCCGAAG*AGATCTAATGCTTAATGGTGCATTCTTTACACTTTCTGGA
GCTGGAC*AACCAAGTCGTCAAGCTATTCGAGAGCCTCAAGCCTAGCTGCTAGAC*GTCA
TCTAATGT*GGTGAGATA
CTAT

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2EK02JQ 810 0 0
TACACATACATGATTGTAAGCAAGGTGGGAACACTTACGTACGAGATTCTCCAGAGCACT
ACGGGTGGCGGACGATATCGGACGGTGACGGTGTTTCCATCTTCGGTGGGAGCCACGTGT
GGGTTGATCATTGCTCGCTCTCGAATTGTAACGATGGGTTGATTGATGCGATCCGTGGAT
CGACGGCTATAACGATTTCTAATAATTACTTGACGCATCACAATAAGGTTATGTTATTGG
GACATAGTGATACGTACGAGCAAGACAAGAATATGCAAGTCACTATCGCTTTTAACCACT
TTGGAGAAGGCCTTGTCCAAAGAATGCCAAGGTGTCGACATGGATATTTCCATGTGGTGA
ACAATGACTATACACATTGGGAAATGTATGCAATTGGAGGAAGTGCTAATCCTACCATCA
ACTCTCAAGGGAACCGGTTCCTTGCTCCTGATAACTCTTTTAGCAAAGAGGTAACAAAGC
ATGAGGATGCGCCAGAAAGCGAGTGGAGTCACTGGAATTGGAGATCCGAAGGAGATCTAA
TGCTTAATGGTGCATTCTTTACACTTTCTGGAGCTGGACCAACCAAGTCGTCAAGCTATT
CGAGAGCCTCAAGCCTAGCTGCTAGACCGTCATCTAATGTTGGTGAGATAACTATATCAT
CTGGTGCACTCAGCTGCAAAAAGGGTTCTCACTGCTGATCATAGCCCCACCAGCGTGTAT
GTATTTGTGTATATATAATATAATGAAACCAGCAATTCAAAGCTAGTTGTGTGATAATCT
TGATGGAAAAGTGAAGAGGAGTTGATTACG

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

CO CL6401Contig1 747 2 8 U
GCAGAAGAGGCAAAAGGTGGGTTTGAACAGTCTAAACTCTCCAACCAATGCAATCACCGG
TACAAAATATATGCAGAGGGTTACGCGTGGTCAGTATCTCTAAAGTATATCGTGTCATGT
GGTTCCATGACACTCATAATCTCACCAGAGTATGAAGATTTCTTCAGCAGAGGCCTTCTT
CCCAAGGAAAACTACTGGCCTGTCTCTCCCACTGATCTATGTCGGTCCATCAAATTCGCT
GTGGACTGGGGCAATGCCAACCCCTCTGATGCTGAAACAATAGGAAAAAGAGGACAGGGT
TACATGGAGAGCATTAGCATGAACCGGGTGTATGACTACATGCTTCATCTCATCACAGAG
TACTCAAAGCTTCAGAAGTTCAAACCGGTGAAGCCGCCTTCAGCTAAAGAGGTCTGTGAA
GGATCATTGCTTTGCTTCGCTGAGCAAAAGGAGCGGGATCTACTCGAAAAATCAATAGCT
GTACCTTCTATGGACCGACCATGTAAACTTCCAGATGCAGATAGGGATAGGCTTGAGAGG
TTGATTCAACGGAAGAGGCAAACAATCGAAGATGTTAGAAACATGGAGATGACGAAAACA
TAGAGGGGTTCTAGATAGTTTCCTGGACCATAAATTCTGTAATCTTTTTTTCCTTGCATA
CGTGTGGTCATCATCATCAGCTGTAGCACGAGATGATACTTGATTAAGTCTTGGTTTATA
GAATAAAGAAACCATAATCTTACAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2DC75TF U 1
AF RR2DC75JQ C 102
BS 1 650 RR2DC75TF
BS 651 651 RR2DC75JQ
BS 652 723 RR2DC75TF
BS 724 724 RR2DC75JQ
BS 725 730 RR2DC75TF
BS 731 731 RR2DC75JQ
BS 732 745 RR2DC75TF
BS 746 747 RR2DC75JQ

RD RR2DC75TF 746 0 0
GCAGAAGAGGCAAAAGGTGGGTTTGAACAGTCTAAACTCTCCAACCAATGCAATCACCGG
TACAAAATATATGCAGAGGGTTACGCGTGGTCAGTATCTCTAAAGTATATCGTGTCATGT
GGTTCCATGACACTCATAATCTCACCAGAGTATGAAGATTTCTTCAGCAGAGGCCTTCTT
CCCAAGGAAAACTACTGGCCTGTCTCTCCCACTGATCTATGTCGGTCCATCAAATTCGCT
GTGGACTGGGGCAATGCCAACCCCTCTGATGCTGAAACAATAGGAAAAAGAGGACAGGGT
TACATGGAGAGCATTAGCATGAACCGGGTGTATGACTACATGCTTCATCTCATCACAGAG
TACTCAAAGCTTCAGAAGTTCAAACCGGTGAAGCCGCCTTCAGCTAAAGAGGTCTGTGAA
GGATCATTGCTTTGCTTCGCTGAGCAAAAGGAGCGGGATCTACTCGAAAAATCAATAGCT
GTACCTTCTATGGACCGACCATGTAAACTTCCAGATGCAGATAGGGATAGGCTTGAGAGG
TTGATTCAACGGAAGAGGCAAACAATCGAAGATGTTAGAAACATGGAGATGACGAAAACA
TAGAGGGGTTCTAGATAGTTTCCTGGACCATAAATTCTGTAATCTTTTTT*CCTTGCATA
CGTGTGGTCATCATCATCAGCTGTAGCACGAGATGATACTTGATTAAGTCTTGGTTTATA
GAA*AAAGAA*CCATAATCTTACAG
C

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2DC75JQ 646 0 0
AAAGTATATCGTGTCATGTGGTTCCATGACACTCATAATCTCACCAGAGTATGAAGATTT
CTTCAGCAGAGGCCTTCTTCCCAAGGAAAACTACTGGCCTGTCTCTCCCACTGATCTATG
TCGGTCCATCAAATTCGCTGTGGACTGGGGCAATGCCAACCCCTCTGATGCTGAAACAAT
AGGAAAAAGAGGACAGGGTTACATGGAGAGCATTAGCATGAACCGGGTGTATGACTACAT
GCTTCATCTCATCACAGAGTACTCAAAGCTTCAGAAGTTCAAACCGGTGAAGCCGCCTTC
AGCTAAAGAGGTCTGTGAAGGATCATTGCTTTGCTTCGCTGAGCAAAAGGAGCGGGATTT
ACTCGAAAAATCAATAGCTGTACCTTTTATGGACCGACCATGTAAACTTCCAGATGCAGA
TAGGGATAGGCTTGAGAGGTTGATTCAACGGAAGAGGCAAACAATCGAAGATGTTAGAAA
CATGGAGATGACGAAAACATAGAGGGGTTCTAGATAGTTTCCTGGACCATAAATTCTGTA
ATCTTTTTTTCCTTGCATACGTGTGGTCATCATCATCAGCTGTAGCACGAGATGATACTT
GATTAAGTCTTGGTTTATAGAATAAAGAAACCATAATCTTACAGGC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL6402Contig1 724 2 4 U
GGAAGAAACATGCAGAACTCAAAATGAGATCTAAGCGAGAGTTTTGAGTTTAAACGCTAA
GCAGCTTTAGCTGTGTAAGAAGAAAAACTCCATGAGCCTAGATCTTGAAATAAAGCAAAT
AGTTCTCTAACATCTTCACTCTCTCTCATCTCTTGAAGCCATAGCTCTCTCTCCACACCC
GTTTCTTCTTCACCTTGGCTCCTGAAGGACCTGAACTCATCTGATCTCCTTCTCTTCTTC
ATCCCCTTCCTTCTCTTGTCATGATCTGCCATTCTTCAACACAGAAGGAGAGAGAGAGAT
ACAAGTCAGAAAGAAAACAGAGGAGATCTCAAGAGAGATGAGAGATGAAAGTAAGAAACA
TGTTTACTCTTTGGAGACAGATAACTGCTGAGCGATCCCAGAGATGCAGAGAGGGAAGCC
ATAGTTGCCACTAAGAGTTGTCAGCATTTCTTTCTCTGTAGATTCAGAATTTTGTGATCT
TGCTTTTACAGAGACCTAAAGAAAGAGAAGAAAGAGACAAGATCTTGAATTGGGAAAGGA
TTAAGGTGGCTATAGATTATATACAAGTACTATGCAGTTAATACACTTTACTATTTGTAA
TACACGAGTTTGTCCTGCTGCGTGGCAATTGAATTGATATGTGGTGATAAAGTAGTAGTA
GTAGTAGTAGGTATGGACCATATGGTCTCTTCTTTTTCTTCATAATTTAGTAAACGGTGA
AAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2DR03TF U 1
AF RR2DR03JQ C 1
BS 1 670 RR2DR03TF
BS 671 671 RR2DR03JQ
BS 672 689 RR2DR03TF
BS 690 724 RR2DR03JQ

RD RR2DR03TF 689 0 0
GGAAGAAACATGCAGAACTCAAAATGAGATCTAAGCGAGAGTTTTGAGTTTAAACGCTAA
GCAGCTTTAGCTGTGTAAGAAGAAAAACTCCATGAGCCTAGATCTTGAAATAAAGCAAAT
AGTTCTCTAACATCTTCACTCTCTCTCATCTCTTGAAGCCATAGCTCTCTCTCCACACCC
GTTTCTTCTTCACCTTGGCTCCTGAAGGACCTGAACTCATCTGATCTCCTTCTCTTCTTC
ATCCCCTTCCTTCTCTTGTCATGATCTGCCATTCTTCAACACAGAAGGAGAGAGAGAGAT
ACAAGTCAGAAAGAAAACAGAGGAGATCTCAAGAGAGATGAGAGATGAAAGTAAGAAACA
TGTTTACTCTTTGGAGACAGATAACTGCTGAGCGATCCCAGAGATGCAGAGAGGGAAGCC
ATAGTTGCCACTAAGAGTTGTCAGCATTTCTTTCTCTGTAGATTCAGAATTTTGTGATCT
TGCTTTTACAGAGACCTAAAGAAAGAGAAGAAAGAGACAAGATCTTGAATTGGGAAAGGA
TTAAGGTGGCTATAGATTATATACAAGTACTATGCAGTTAATACACTTTACTATTTGTAA
TACACGAGTTTGTCCTGCTGCGTGGCAATTGAATTGATATGTGGTGATAAAGTAGTAGTA
GTAGTAGTAG*TATGGACCATATGGTCTC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2DR03JQ 724 0 0
GGAAGAAACATGCAGAACTCAAAATGAGATCTAAGCGAGAGTTTTGAGTTTAAACGCTAA
GCAGCTTTAGCTGTGTAAGAAGAAAAACTCCATGAGCCTAGATCTTGAAATAAAGCAAAT
AGTTCTCTAACATCTTCACTCTCTCTCATCTCTTGAAGCCATAGCTCTCTCTCCACACCC
GTTTCTTCTTCACCTTGGCTCCTGAAGGACCTGAACTCATCTGATCTCCTTCTCTTCTTC
ATCCCCTTCCTTCTCTTGTCATGATCTGCCATTCTTCAACACAGAAGGAGAGAGAGAGAT
ACAAGTCAGAAAGAAAACAGAGGAGATCTCAAGAGAGATGAGAGATGAAAGTAAGAAACA
TGTTTACTCTTTGGAGACAGATAACTGCTGAGCGATCCCAGAGATGCAGAGAGGGAAGCC
ATAGTTGCCACTAAGAGTTGTCAGCATTTCTTTTTCTGTAGATTCAGAATTTTGTGATCT
TGCTTTTACAGAGACCTAAAGAAAGAGAAGAAAGAGACAAGATCTTGAATTGGGAAAGGA
TTAAGGTGGCTATAGATTATATACAAGTACTATGCAGTTAATACACTTTACTATTTGTAA
TACACGAGTTTGTCCTGCTGCGTGGCAATTGAATTGATATGTGGTGATAAAGTAGTAGTA
GTAGTAGTAGGTATGGACCATATGGTCTCTTCTTTTTCTTCATAATTTAGTAAACGGTGA
AAGT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL6403Contig1 784 2 2 U
GATTTTCGTCTATGTGTCCTTGTTCACCGTTGTGTTCGGTTCCGCTAGCTTCAACCCTAC
CGGAAACGCTGCGTTTTACGCCGCCGGGATCCCCGGAGATACCCTCTTCACCTTGGCCAT
CAGAATGCCTGCCCAGGCAGCTGGTGCTGCAGGAGGTGCATTGGCCATCATGGAGTTCAT
ACCAGAGAAGTACAAGCATATGATTTCTGGACCTTCCCTTCTAGTTGATGTGCACACTGG
GGCTATTGCAGAGACCATCTTGAGTTTTGGTATTACCTTCGCGGTTTTGCTTATTATCCT
CAAGGGTCCACGGAGGTTACTAGCCAAGACCTTCTTGCTTTCTCTTGCAACCATTTGCTT
CGTTGTTGCTGGCGCTAAATACACCGGACCAGCCATGAATCCTGCCATTGCGTTTGGGTG
GGCGTACATGACCAGCTCTCACAAGACGTGGGACCATTTCTACGTGTACTGGATCAGTTC
TTTTGTTGGAGCTTTATCTGCTGCACTGGTCTTCCGTACTATATTCCCTCCACATCGGCC
TCGACCTCGACCTCAGAAGATGAAACAAAAGAAAGAGAAGAAACCGAAGAAAGAGAAGAA
ACAGAAGAAAGCCTGAGGAGTAAACCAATCAACACAACACCGGTTCAATTCTTTACCGGT
TTTGGGATTTAGAAAGATTCAAAATGTTTTTTTTTTAATTCCAAAATTAAGGAGAAACCA
ACAAAAGGTTCTCCTTATCATTGTTTAGATTCAAGCTTTTATTTATCAAATTGATTCAAC
TGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2EO94TF U 1
AF RR2EO94JQ C 65
BS 1 690 RR2EO94TF
BS 691 784 RR2EO94JQ

RD RR2EO94TF 690 0 0
GATTTTCGTCTATGTGTCCTTGTTCACCGTTGTGTTCGGTTCCGCTAGCTTCAACCCTAC
CGGAAACGCTGCGTTTTACGCCGCCGGGATCCCCGGAGATACCCTCTTCACCTTGGCCAT
CAGAATGCCTGCCCAGGCAGCTGGTGCTGCAGGAGGTGCATTGGCCATCATGGAGTTCAT
ACCAGAGAAGTACAAGCATATGATTTCTGGACCTTCCCTTCTAGTTGATGTGCACACTGG
GGCTATTGCAGAGACCATCTTGAGTTTTGGTATTACCTTCGCGGTTTTGCTTATTATCCT
CAAGGGTCCACGGAGGTTACTAGCCAAGACCTTCTTGCTTTCTCTTGCAACCATTTGCTT
CGTTGTTGCTGGCGCTAAATACACCGGACCAGCCATGAATCCTGCCATTGCGTTTGGGTG
GGCGTACATGACCAGCTCTCACAAGACGTGGGACCATTTCTACGTGTACTGGATCAGTTC
TTTTGTTGGAGCTTTATCTGCTGCACTGGTCTTCCGTACTATATTCCCTCCACATCGGCC
TCGACCTCGACCTCAGAAGATGAAACAAAAGAAAGAGAAGAAACCGAAGAAAGAGAAGAA
ACAGAAGAAAGCCTGAGGAGTAAACCAATCAACACAACACCGGTTCAATTCTTTACCGGT
TTTGGGATTTAGAAAGATTCAAAATGTTTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2EO94JQ 720 0 0
AACGCTGCGTTTTACGCCGCCGGGATCCCCGGAGATACCCTCTTCACCTTGGCCATCAGA
ATGCCTGCCCAGGCAGCTGGTGCTGCAGGAGGTGCATTGGCCATCATGGAGTTCATACCA
GAGAAGTACAAGCATATGATTTCTGGACCTTCCCTTCTAGTTGATGTGCACACTGGGGCT
ATTGCAGAGACCATCTTGAGTTTTGGTATTACCTTCGCGGTTTTGCTTATTATCCTCAAG
GGTCCACGGAGGTTACTAGCCAAGACCTTCTTGCTTTTTCTTGCAACCATTTGCTTCGTT
GTTGCTGGCGCTAAATACACCGGACCAGCCATGAATCCTGCCATTGCGTTTGGGTGGGCG
TACATGACCAGCTCTCACAAGACGTGGGACCATTTCTACGTGTACTGGATCAGTTCTTTT
GTTGGAGCTTTATCTGCTGCACTGGTCTTCCGTACTATATTCCCTCCACATCGGCCTCGA
CCTCGACCTCAGAAGATGAAACAAAAGAAAGAGAAGAAACCGAAGAAAGAGAAGAAACAG
AAGAAAGCCTGAGGAGTAAACCAATCAACACAACACCGGTTCAATTCTTTACCGGTTTTG
GGATTTAGAAAGATTCAAAATGTTTTTTTTTTAATTCCAAAATTAAGGAGAAACCAACAA
AAGGTTCTCCTTATCATTGTTTAGATTCAAGCTTTTATTTATCAAATTGATTCAACTGCT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL6404Contig1 622 2 1 U
GGATCACTAACAAACCTCGCAAATCACATTCTCTAGAAGAAGAAGCTTCTGTAACCATCT
GATTTCGATTATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCAAGGAAATCCACCGGAGGCAAAGCCCC
GAGGAAGCAGCTCGCGACCAAAACCGCGAGAAAATCAGCTCCGGCCACCGGAGGAGTGAA
GAAGCCTCACAGATTCCGTCCAGGAACGGTGGCGTTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAA
GAGCACCGAGCTTCTGATCCGCAAGCTCCCCTTCCAGCGTCTGGTTCGTGAGATCGCTCA
GGATTTCAAGACGGATCTGAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCTGCTTTACAAGAAGCTGC
GGAGGCTTACCTCGTTGGATTGTTCGAAGACACGAATCTCTGCGCGATTCACGCCAAGAG
AGTCACGATCATGCCCAAGGATATCCAGCTCGCGAGGAGGATCCGTGGTGAAAGAGCTTG
AAGACACTCTTATGATTCTCTGTTTAGCTCGTTAATGGTGACTTGTTATGTGTAATGTTT
AGCCTTTGTTATAATAGTCTCGAAGGTGTTCGATTAAATGTCAAAGTTTGTTAAGTTTAA
TATAATCGTATTTGTCCATTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H075JQ C 1
AF RR2H075TF U 1
BS 1 622 RR2H075TF

RD RR2H075JQ 622 0 0
GGATCACTAACAAACCTCGCAAATCACATTCTCTAGAAGAAGAAGCTTCTGTAACCATCT
GATTTCGATTATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCAAGGAAATCCACCGGAGGCAAAGCCCC
GAGGAAGCAGCTCGCGACCAAAACCGCGAGAAAATCAGCTCCGGCCACCGGAGGAGTGAA
GAAGCCTCACAGATTCCGTCCAGGAACGGTGGCGTTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAA
GAGCACCGAGCTTCTGATCCGCAAGCTCCCCTTCCAGCGTCTGGTTCGTGAGATCGCTCA
GGATTTCAAGACGGATCTGAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCTGCTTTACAAGAAGCTGC
GGAGGCTTACCTCGTTGGATTGTTCGAAGACACGAATCTCTGCGCGATTCACGCCAAGAG
AGTCACGATCATGCCCAAGGATATCCAGCTCGCGAGGAGGATCCGTGGTGAAAGAGCTTG
AAGACACTCTTATGATTCTCTGTTTAGCTCGTTAATGGTGACTTGTTATGTGTAATGTTT
AGCCTTTGTTATAATAGTCTCGAAGGTGTTCGATTAAATGTCAAAGTTTGTTAAGTTTAA
TATAATCGTATTTGTCCATTGC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2H075TF 622 0 0
GGATCACTAACAAACCTCGCAAATCACATTCTCTAGAAGAAGAAGCTTCTGTAACCATCT
GATTTCGATTATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCAAGGAAATCCACCGGAGGCAAAGCCCC
GAGGAAGCAGCTCGCGACCAAAACCGCGAGAAAATCAGCTCCGGCCACCGGAGGAGTGAA
GAAGCCTCACAGATTCCGTCCAGGAACGGTGGCGTTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAA
GAGCACCGAGCTTCTGATCCGCAAGCTCCCCTTCCAGCGTCTGGTTCGTGAGATCGCTCA
GGATTTCAAGACGGATCTGAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCTGCTTTACAAGAAGCTGC
GGAGGCTTACCTCGTTGGATTGTTCGAAGACACGAATCTCTGCGCGATTCACGCCAAGAG
AGTCACGATCATGCCCAAGGATATCCAGCTCGCGAGGAGGATCCGTGGTGAAAGAGCTTG
AAGACACTCTTATGATTCTCTGTTTAGCTCGTTAATGGTGACTTGTTATGTGTAATGTTT
AGCCTTTGTTATAATAGTCTCGAAGGTGTTCGATTAAATGTCAAAGTTTGTTAAGTTTAA
TATAATCGTATTTGTCCATTGC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL6405Contig1 714 2 1 U
AGGACTTACGAGAAGATTTCTCAGCTTTTCTCAGGGAAAGACAAAAGCTATGGACTTGGC
TCTTCATTTTCCTTCGTTAACCAAACAAGGATTCACGAGAGCCAATCATCTTCCTGTTCG
AGATTCTCTTTCACCAAGCTTTGGGCAGAGTTTTTCAAGCTGGCCTGGAGAGAAGGCTTG
GTGGTCTTCCTCCCTAACTAGGAGATCCAAGAAAGGATCTGTTGTTTGTTGCAAGAATCC
GTCTGATGAACAGAGCTCAGACTCGAGTAAATCGAAGCAAGAGGAGATCATTGCTCTCTT
AAGTCGGATTCAAGCTTCAATCTCCAAAGGAGAGTCTCAGGGAGCTGATGAGAAGAACAG
CAATGAGTCTTCTGGGAACGGGTCGCTGAGCAAAGCTATTCTTGACGTTCTTGAGAAACC
AAGAAATAAAACTGAGGGAGATGCTGGTGTAACGAAAGAGCCACCAAAGAGACATGTAGC
TAGGCCACCGTCGAGTTTTGCCAAGAAGTCTCCTACTAGACCATCTGCCTCGCCTCAAAG
AGAGCTCAAAGAAGTTGCAAAGAACAAAGGACTCAAAGGATACTCGAAGCTAAAGAAGAG
TGAGATTCTGGAGCTACTCAGATCTTCCTGAATTTAAATTCTCTTTGCTATGTAAATTAG
AAACACAGATATGGCTTGGAGTTGTTTTTAAAATAGATAAAGAGTTTAAAATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AG80JQ C 1
AF RR2AG80TF U 1
BS 1 714 RR2AG80TF

RD RR2AG80JQ 714 0 0
AGGACTTACGAGAAGATTTCTCAGCTTTTCTCAGGGAAAGACAAAAGCTATGGACTTGGC
TCTTCATTTTCCTTCGTTAACCAAACAAGGATTCACGAGAGCCAATCATCTTCCTGTTCG
AGATTCTCTTTCACCAAGCTTTGGGCAGAGTTTTTCAAGCTGGCCTGGAGAGAAGGCTTG
GTGGTCTTCCTCCCTAACTAGGAGATCCAAGAAAGGATCTGTTGTTTGTTGCAAGAATCC
GTCTGATGAACAGAGCTCAGACTCGAGTAAATCGAAGCAAGAGGAGATCATTGCTCTCTT
AAGTCGGATTCAAGCTTCAATCTCCAAAGGAGAGTCTCAGGGAGCTGATGAGAAGAACAG
CAATGAGTCTTCTGGGAACGGGTCGCTGAGCAAAGCTATTCTTGACGTTCTTGAGAAACC
AAGAAATAAAACTGAGGGAGATGCTGGTGTAACGAAAGAGCCACCAAAGAGACATGTAGC
TAGGCCACCGTCGAGTTTTGCCAAGAAGTCTCCTACTAGACCATCTGCCTCGCCTCAAAG
AGAGCTCAAAGAAGTTGCAAAGAACAAAGGACTCAAAGGATACTCGAAGCTAAAGAAGAG
TGAGATTCTGGAGCTACTCAGATCTTCCTGAATTTAAATTCTCTTTGCTATGTAAATTAG
AAACACAGATATGGCTTGGAGTTGTTTTTAAAATAGATAAAGAGTTTAAAATTG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2AG80TF 714 0 0
AGGACTTACGAGAAGATTTCTCAGCTTTTCTCAGGGAAAGACAAAAGCTATGGACTTGGC
TCTTCATTTTCCTTCGTTAACCAAACAAGGATTCACGAGAGCCAATCATCTTCCTGTTCG
AGATTCTCTTTCACCAAGCTTTGGGCAGAGTTTTTCAAGCTGGCCTGGAGAGAAGGCTTG
GTGGTCTTCCTCCCTAACTAGGAGATCCAAGAAAGGATCTGTTGTTTGTTGCAAGAATCC
GTCTGATGAACAGAGCTCAGACTCGAGTAAATCGAAGCAAGAGGAGATCATTGCTCTCTT
AAGTCGGATTCAAGCTTCAATCTCCAAAGGAGAGTCTCAGGGAGCTGATGAGAAGAACAG
CAATGAGTCTTCTGGGAACGGGTCGCTGAGCAAAGCTATTCTTGACGTTCTTGAGAAACC
AAGAAATAAAACTGAGGGAGATGCTGGTGTAACGAAAGAGCCACCAAAGAGACATGTAGC
TAGGCCACCGTCGAGTTTTGCCAAGAAGTCTCCTACTAGACCATCTGCCTCGCCTCAAAG
AGAGCTCAAAGAAGTTGCAAAGAACAAAGGACTCAAAGGATACTCGAAGCTAAAGAAGAG
TGAGATTCTGGAGCTACTCAGATCTTCCTGAATTTAAATTCTCTTTGCTATGTAAATTAG
AAACACAGATATGGCTTGGAGTTGTTTTTAAAATAGATAAAGAGTTTAAAATTG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL6406Contig1 539 2 2 U
GCAGCAAAGATCAAACTCAAATAGGAAGAAACAAAAGCTACTTATTAAGCAGCTCTTGCA
AGAAGGAAGACTTTCCTAACATCAGAAGGATCAATAAAGAAACAAGCTTTGTTTAAGCAG
CTCTTGCAAGAACTTGAAGACTTTCAGGAACATCAGAAGGATCAATGAAGAAACTCCTCC
TTCTCAAAACCACCTTTGGTACAGTCACAGTCAACACACCGTCTTCATAACCAGCTGATA
TCCCGGTTATATCTATCGATTCTGGTAACCGGAATTTCCTCTTGAAACTCCTGACCGGCG
GATCCGGGGATCTATCCGTGGTCTCCGTGCGTATGATTAAGTATATAGAATCTTCGATCT
CCACTTTTATTTCTTCTTTCCTCAAACCAGGAAGGTCAACAGAGAAAATGTGAGAATCTG
GAGTCTGAGACCAACGAATATGATTCTCTTGAGTAACTTGGTAGCCATTAAGAGCTCGAG
TAGATAGAAGATACTCCCATGGTGTCATTTGAATCCTCTGAAAGTCCATTTTCTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FQ91TF C 1
AF RR2FQ91JQ U 17
BS 1 16 RR2FQ91TF
BS 17 539 RR2FQ91JQ

RD RR2FQ91TF 539 0 0
GCAGCAAAGATCAAACTCAAATAGGAAGAAACAAAAGCTACTTATTAAGCAGCTCTTGCA
AGAAGGAAGACTTTCCTAACATCAGAAGGATCAATAAAGAAACAAGCTTTGTTTAAGCAG
CTCTTGCAAGAACTTGAAGACTTTCAGGAACATCAGAAGGATCAATGAAGAAACTCCTCC
TTCTCAAAACCACCTTTGGTACAGTCACAGTCAACACACCGTCTTCATAACCAGCTGATA
TCCCGGTTATATCTATCGATTCTGGTAACCGGAATTTCCTCTTGAAACTCCTGACCGGCG
GATCCGGGGATCTATCCGTGGTCTCCGTGCGTATGATTAAGTATATAGAATCTTCGATCT
CCACTTTTATTTCTTCTTTCCTCAAACCAGGAAGGTCAACAGAGAAAATGTGAGAATCTG
GAGTCTGAGACCAACGAATATGATTCTCTTGAGTAACTTGGTAGCCATTAAGAGCTCGAG
TAGATAGAAGATACTCCCATGGTGTCATTTGAATCCTCTGAAAGTCCATTTTCTCTCTC

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2FQ91JQ 523 0 0
TCAAATAGGAAGAAACAAAAGCTACTTATTAAGCAGCTCTTGCAAGAAGGAAGACTTTCC
TAACATCAGAAGGATCAATAAAGAAACAAGCTTTGTTTAAGCAGCTCTTGCAAGAACTTG
AAGACTTTCAGGAACATCAGAAGGATCAATGAAGAAACTCCTCCTTCTCAAAACCACCTT
TGGTACAGTCACAGTCAACACACCGTCTTCATAACCAGCTGATATCCCGGTTATATCTAT
CGATTCTGGTAACCGGAATTTCCTCTTGAAACTCCTGACCGGCGGATCCGGGGATCTATC
CGTGGTCTCCGTGCGTATGATTAAGTATATAGAATCTTCGATCTCCACTTTTATTTCTTC
TTTCCTCAAACCAGGAAGGTCAACAGAGAAAATGTGAGAATCTGGAGTCTGAGACCAACG
AATATGATTCTCTTGAGTAACTTGGTAGCCATTAAGAGCTCGAGTAGATAGAAGATACTC
CCATGGTGTCATTTGAATCCTCTGAAAGTCCATTTTCTCTCTC

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 2

CO CL6407Contig1 598 2 4 U
GGGCTTTCAGCCGCCCAAGTAAGTAAGCTTTCCGATTGAAACCCTTTTTTTGTCAGTAAT
TCGTTTGGCTGCATTGCATTCAGAAATGAACCACCACCACCGTATCCGTATCCAAGAATT
GATGGCCACCGGATCCAAGAATGTGGTCCGGAGAACGTTTGCAGCAGCTGGTAAAGCCAA
GAAAGGAGGAGGAGGAGGAGGCGGCGATGGTCCTAAAGAATCGTCTCTGACTCTGAGAAA
AGAGATCAAATCCACAACCGTTGTCGGTGCCAACACTCTGAAAGATGGATGTGATCCCAA
GATCTCTACGGACTCCTCTGATTACCCTGATTGGCTCTGCCGTCTTCTCCATAACCGACC
AGCGCTTAGTGAGCTCAGTAGGAAGAACGTCGAGAACGATGATCTCAAACGTTTTGTCAA
GCTCAACACCCGAGTCCAAATCAAGGAGAACAACTCCATCAAGGCCAATAACTGATTTGC
TTCCGTACATGTTGCTTCTTAGTTACTACTGTGTTTGATGCTCTTCTAACTCTTTTATCT
TTAATTTTGCATCACTACTACTATTCTCATATTTATTTTGAATGCCAACTCTCTCTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D257TF U 1
AF RR2D257JQ C 1
BS 1 218 RR2D257TF
BS 219 219 RR2D257JQ
BS 220 277 RR2D257TF
BS 278 598 RR2D257JQ

RD RR2D257TF 277 0 0
GGGCTTTCAGCCGCCCAAGTAAGTAAGCTTTCCGATTGAAACCCTTTTTTTGTCAGTAAT
TCGTTTGGCTGCATTGCATTCAGAAATGAACCACCACCACCGTATCCGTATCCAAGAATT
GATGGCCACCGGATCCAAGAATGTGGTCCGGAGAACGTTTGCAGCAGCTGGTAAAGCCAA
GAAAGGAGGAGGAGGAGGAGGCGGCGATGGTCCTAAAGGATCGTCTCTGACTCTGAGAAA
AGAGATCAAATCCACAACCGTTGTCGGTGCCAACACT

QA 1 277 1 277
DS 

RD RR2D257JQ 598 0 0
GGGCTTTCAGCCGCCCAAGTAAGTAAGCTTTCCGATTGAAACCCTTTTTTTGTCAGTAAT
TCGTTTGGCTGCATTGCATTCAGAAATGAACCACCACCACCGTATCCGTATCCAAGAATT
GATGGCCACCGGATCCAAGAATGTGGTCCGGAGAACGTTTGCAGCAGCTGGTAAAGCCAA
GAAAGGAGGAGGAGGAGGAGGCGGCGATGGTCCTAAAGAATCGTCTCTGACTCTGAGAAA
AGAGATCAAATCCACAACCGTTGTCGGTGCCAACACTCTGAAAGATGGATGTGATCCCAA
GATCTCTACGGACTCCTCTGATTACCCTGATTGGCTCTGCCGTCTTCTCCATAACCGACC
AGCGCTTAGTGAGCTCAGTAGGAAGAACGTCGAGAACGATGATCTCAAACGTTTTGTCAA
GCTCAACACCCGAGTCCAAATCAAGGAGAACAACTCCATCAAGGCCAATAACTGATTTGC
TTCCGTACATGTTGCTTCTTAGTTACTACTGTGTTTGATGCTCTTCTAACTCTTTTATCT
TTAATTTTGCATCACTACTACTATTCTCATATTTATTTTGAATGCCAACTCTCTCTCT

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL6408Contig1 643 2 2 U
TTTTTAACATCACCTCACAAAATTGACATATATTTAAGAAGATAACATAAAAAAGACTTT
AAGAAAATATTGGTTCGTAAATTACGAGCATACTTGAACGCTAAAAGCATACTAGTATTT
ATTTGGTGAGGGAAAACGGAATGTACATGTCTCTCCCGCGTGTGACACCGATATTACGGA
GAAGCCCAAACGAAAAAAAATCGAGAAAGAAGAGTCCCGGTCAAGTAAGGAAGCGTAAAT
TAGTGAACAAAGACGAGATAAAGTGACGGCTGTGATTTAAGATTACAAAGCAGCCGACTC
AAGAGTAAAGGAACAAAAACAACTCGTGAAATGCATGTCATATCAGGAAAGGAGAAAGTG
GAAAAGACAAGAAAATAGTGGTACAAATAATGCTCTTCTCAAAATTTCACCAAGAAAATA
ATCTAAACTTTTTAAACAATATATATAATCGTCTAAAGGGGTAAAACGGCATTCACGGAC
TAACCTTTGATCGAGGGAAAACTTGACGGCGTGATTCCATGTAGGGTCAAATAGATCCTC
CGGTTCGGTCGAAGGCGGTTTTCTCCTTATGAATCTTCTTGGAAGCTTTCCGTTGATCGA
AACAACAGTGTATACGTCCATCTTGGTGATCACACAGTGACCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CI64TF C 1
AF RR2CI64JQ U 6
BS 1 5 RR2CI64TF
BS 6 643 RR2CI64JQ

RD RR2CI64TF 643 0 0
TTTTTAACATCACCTCACAAAATTGACATATATTTAAGAAGATAACATAAAAAAGACTTT
AAGAGAATATTGGTTCGTAAATTACGAGCATACTTGAACGCTAAAAGCATACTAGTATTT
ATTTGGTGAGGGAAAACGGAATGTACATGTCTCTCCCGCGTGTGACACCGATATTACGGA
GAAGCCCAAACGAAGAAAAATCGAGAAAGAAGAGTCCCGGTCAAGTAAGGAAGCGTAAAT
TAGTGAACAAAGACGAGATAAAGTGACGGCTGTGATTTAAGATTACAAAGCAGCCGACTC
AAGAGTAAAGGAACAAAAACAACTCGTGAAATGCATGTCATATCAGGAAAGGAGAAAGTG
GAAAAGACAAGAAAATAGTGGTACAAATAATGCTCTTCTCAGAATTTCACCAAGAAAATA
ATCTAAACTTTTTAAACAATATATATAATCGTCTAAAGGGGTAAAACGGCATTCACGGAC
TAACCTTTGATCGAGGGAAAACTTGACGGCGTGATTCCATGTAGGGTCAGATAGATCCTC
CGGTTCGGTCGAAGGCGGTTTTCTCCTTATGAATCTTCTTGGAAGCTTTCCGTTGATCGA
AACAACAGTGTATACGTCCATCTTGGTGATCACACAGTGACCC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2CI64JQ 638 0 0
AACATCACCTCACAAAATTGACATATATTTAAGAAGATAACATAAAAAAGACTTTAAGAA
AATATTGGTTCGTAAATTACGAGCATACTTGAACGCTAAAAGCATACTAGTATTTATTTG
GTGAGGGAAAACGGAATGTACATGTCTCTCCCGCGTGTGACACCGATATTACGGAGAAGC
CCAAACGAAAAAAAATCGAGAAAGAAGAGTCCCGGTCAAGTAAGGAAGCGTAAATTAGTG
AACAAAGACGAGATAAAGTGACGGCTGTGATTTAAGATTACAAAGCAGCCGACTCAAGAG
TAAAGGAACAAAAACAACTCGTGAAATGCATGTCATATCAGGAAAGGAGAAAGTGGAAAA
GACAAGAAAATAGTGGTACAAATAATGCTCTTCTCAAAATTTCACCAAGAAAATAATCTA
AACTTTTTAAACAATATATATAATCGTCTAAAGGGGTAAAACGGCATTCACGGACTAACC
TTTGATCGAGGGAAAACTTGACGGCGTGATTCCATGTAGGGTCAAATAGATCCTCCGGTT
CGGTCGAAGGCGGTTTTCTCCTTATGAATCTTCTTGGAAGCTTTCCGTTGATCGAAACAA
CAGTGTATACGTCCATCTTGGTGATCACACAGTGACCC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL6409Contig1 1280 2 12 U
TTTTTATTGTTTTCAGATCGAATCCAAGAAATGGGTAACGCTATTAGGTTACTCTACCGG
AAATGTTGCAGCCCCACGACGGACGATAAGCCTCACGGAGTCTCAGCTCTTTCACGTGAT
CTCTTTAGCTTCGAGACCAGATCTCAGGTTCCTGAAGGGCTTGGAAGTTATGTTGTGTCT
TCTTCAAAGGCTCAAGCAAACTGGTATGGAAAGATACTCGAGACATGGAAGCAAGCTAAG
CCTCGGCCTCAGACCGATGAGGAAGCTGCAAGGCTTGTTGTCAAGACTCTAAAGGGGCAT
AAGAAAGCTGATGTTGAGGGACTTTTGTCTTTCTATAGACTTCCTTCACCTGGTAAGCTT
GATGAGGTCTCCAATGAATCCCCTGCGCCTGTACTTGAAGGCCTTAAATTTGAGCTCCTA
ACGCTTCCGGCGGATGAAAAATCTGTGGCAGATGGGGATACAGTTAATGTGTATGTTAGT
AGCACAGACCCTATTGTGTCATCTACGCTTCCTAAGGAAGTGAGTCTTGCAGCGGCTAAA
AGAGCCAAGGCACGTGAGAGTAAGAATTACACAGAAGCAGATGCACTTCACAAGAAGATC
ATAGCTTCTGGTTACAGGATGATAAATGTTCAGAACAAAGAAGTGCTCGCTAAAAAGTTC
AGAATAAGACTAAGGGGAATTGATGCACCGGAATGTAAAATGCCGTTTGGAAAAGAGTCG
CATGATGAGCTGCTTAAGATGGTTGAAGGGAAAAGCTTGAAGGTGTTAGTGTATGCAGAG
GATCGTTATGGAAGATGTGTTGGAGACATATACTGTAATGGAAAGTTTGTACAAGAAGTA
ATGTTAAAGAAAGGTCTTGCATGGCATTATTTAGCCTATGACAAGTGTCCAGAGCTTGCA
AAGTGGGAAAATGAGGCTAAGCAGAAGCGTATCGGCTTGTGGGCGGCCAAAAATCCAGAG
AAGCCATGGGAGTGGAGAAAAAACAAACGTGGAGGGAACTAACACTGTACCGACTATGTT
GCTTCCTTTGCAAGTTAGGGTCTGTTCCAATTCTTGGGTTCTGGATGTGACAGATACCTT
TTATTCTATGTCCATTCCGGTAATAAAAATAATTATATTGTTCTGTAATGATTAAAGATG
TGATATGTTGTTGTAACTGTAAGAGCACTCTGCACATGTTTCATGTATTGATAAGTTTTT
TTTTTTGTAACTGAAAAGATGTATACTAAAGGATATTTGATAAGTTTATTGGCAATGGAG
AATCTCTTTTTTGAGTCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA04TF U 1
AF RR2DA04JQ C 519
BS 1 655 RR2DA04TF
BS 656 656 RR2DA04JQ
BS 657 663 RR2DA04TF
BS 664 664 RR2DA04JQ
BS 665 678 RR2DA04TF
BS 679 679 RR2DA04JQ
BS 680 713 RR2DA04TF
BS 714 714 RR2DA04JQ
BS 715 736 RR2DA04TF
BS 737 737 RR2DA04JQ
BS 738 749 RR2DA04TF
BS 750 1280 RR2DA04JQ

RD RR2DA04TF 758 0 0
TTTTTATTGTTTTCAGATCGAATCCAAGAAATGGGTAACGCTATTAGGTTACTCTACCGG
AAATGTTGCAGCCCCACGACGGACGATAAGCCTCACGGAGTCTCAGCTCTTTCACGTGAT
CTCTTTAGCTTCGAGACCAGATCTCAGGTTCCTGAAGGGCTTGGAAGTTATGTTGTGTCT
TCTTCAAAGGCTCAAGCAAACTGGTATGGAAAGATACTCGAGACATGGAAGCAAGCTAAG
CCTCGGCCTCAGACCGATGAGGAAGCTGCAAGGCTTGTTGTCAAGACTCTAAAGGGGCAT
AAGAAAGCTGATGTTGAGGGACTTTTGTCTTTCTATAGACTTCCTTCACCTGGTAAGCTT
GATGAGGTCTCCAATGAATCCCCTGCGCCTGTACTTGAAGGCCTTAAATTTGAGCTCCTA
ACGCTTCCGGCGGATGAAAAATCTGTGGCAGATGGGGATACAGTTAATGTGTATGTTAGT
AGCACAGACCCTATTGTGTCATCTACGCTTCCTAAGGAAGTGAGTCTTGCAGCGGCTAAA
AGAGCCAAGGCACGTGAGAGTAAGAATTACACAGAAGCAGATGCACTTCACAAGAAGATC
ATAGCTTCTGGTTACAGGATGATAAATGTTCAGAACAAAGAAGTGCTCGCTAAAA*GTTC
AGA*TAAGACTAAGGGGA*TTGATGCACCGGAATGTAAAATGCCGTTTGGAAA*GAGTCG
CATGATGAGCTGCTTA*GATGGTTGAAGG
AAAGCTTGA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2DA04JQ 762 0 0
AGTGAGTCTTGCAGCGGCTAAAAGAGCCAAGGCACGTGAGAGTAAGAATTACACAGAAGC
AGATGCACTTCACAAGAAGATCATAGCTTCTGGTTACAGGATGATAAATGTTCAGAACAA
AGAAGTGCTCGCTAAAAAGTTCAGAATAAGACTAAGGGGAATTGATGCACCGGAATGTAA
AATGCCGTTTGGAAAAGAGTCGCATGATGAGCTGCTTAAGATGGTTGAAGGGAAAAGCTT
GAAGGTGTTAGTGTATGCAGAGGATCGTTATGGAAGATGTGTTGGAGACATATACTGTAA
TGGAAAGTTTGTACAAGAAGTAATGTTAAAGAAAGGTCTTGCATGGCATTATTTAGCCTA
TGACAAGTGTCCAGAGCTTGCAAAGTGGGAAAATGAGGCTAAGCAGAAGCGTATCGGCTT
GTGGGCGGCCAAAAATCCAGAGAAGCCATGGGAGTGGAGAAAAAACAAACGTGGAGGGAA
CTAACACTGTACCGACTATGTTGCTTCCTTTGCAAGTTAGGGTCTGTTCCAATTCTTGGG
TTCTGGATGTGACAGATACCTTTTATTCTATGTCCATTCCGGTAATAAAAATAATTATAT
TGTTCTGTAATGATTAAAGATGTGATATGTTGTTGTAACTGTAAGAGCACTCTGCACATG
TTTCATGTATTGATAAGTTTTTTTTTTTGTAACTGAAAAGATGTATACTAAAGGATATTT
GATAAGTTTATTGGCAATGGAGAATCTCTTTTTTGAGTCTCG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL6410Contig1 691 2 6 U
TTTTTCCACACAACAAATATTTTAAAAAGACGGGAGGGAGCGAGAGAGAGAGACAAATTC
CAAGTGGGGGAGGGTTGCCGTCGTATTTGTTGTGCAGAATCCGTCGTCGTCACTGATCAC
TTACACATCATTCCTCCTTTTCTTCTTCTCCGGAGACTAAATCGGAATCTCGCTCGCCAG
TAAACCTAATGCCGGAAGACTCAACGTCGATCGACTATGTCATGGAGAAGGCATCGGGGC
CTCACTTCTCCGGTCTTCGCCTCGACGGCCTTCTCTCTTCTCCCTCCAAATCATCCACCT
CTTCTCCTTCTCACTTCCGCTCCGCTGTTCCGCCCTTCTCCCTCATCTCCGATCCCGCCG
CGCCTAATCAGCCGTTCGTCATCGGAGTTACTGGTGGTACCGCTTCGGGGAAGACCACGG
TATGTGACATGATCATCCAGCAACTTCATAATCATCGCATTGTTCTTGTTAACCAGGATT
CCTTTTACCGTGGTCTGACACCTGAAGAACTGGCTCATGTTCAAGAATACAATTTCGATC
ACCCTGATGCATTTGACACTGAGCAGATGTTGCATTGCATTGATACACTTAAGAGTGGAC
AACCCTATCAAGTTCCTATTTACGACTTCAAGACTCATCAACGTAAAGCAGATGCTTTTC
GCCAGGTTAATGCTTGTGATGTTATAATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD06TF U 1
AF RR2CN79TF U 53
BS 1 110 RR2DD06TF
BS 111 113 RR2CN79TF
BS 114 630 RR2DD06TF
BS 631 631 RR2CN79TF
BS 632 666 RR2DD06TF
BS 667 691 RR2CN79TF

RD RR2DD06TF 666 0 0
TTTTTCCACACAACAAATATTTTAAAAAGACGGGAGGGAGCGAGAGAGAGAGACAAATTC
CAAGTGGGGGAGGGTTGCCGTCGTATTTGTTGTGCAGAATCCGTCGTCGT***TGATCAC
TTACACATCATTCCTCCTTTTCTTCTTCTCCGGAGACTAAATCGGAATCTCGCTCGCCAG
TAAACCTAATGCCGGAAGACTCAACGTCGATCGACTATGTCATGGAGAAGGCATCGGGGC
CTCACTTCTCCGGTCTTCGCCTCGACGGCCTTCTCTCTTCTCCCTCCAAATCATCCACCT
CTTCTCCTTCTCACTTCCGCTCCGCTGTTCCGCCCTTCTCCCTCATCTCCGATCCCGCCG
CGCCTAATCAGCCGTTCGTCATCGGAGTTACTGGTGGTACCGCTTCGGGGAAGACCACGG
TATGTGACATGATCATCCAGCAACTTCATAATCATCGCATTGTTCTTGTTAACCAGGATT
CCTTTTACCGTGGTCTGACACCTGAAGAACTGGCTCATGTTCAAGAATACAATTTCGATC
ACCCTGATGCATTTGACACTGAGCAGATGTTGCATTGCATTGATACACTTAAGAGTGGAC
AACCCTATCAAGTTCCTATTTACGACTTCA*GACTCATCAACGTAAAGCAGATGCTTTTC
GCCAGG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2CN79TF 639 0 0
GG
AAATTCCAAGTGGGGGAGGGTTGCCGTCGTATTTGTTGTGCAGAATCCGTCGTCGTCACT
GATCACTTACACATCATTCCTCCTTTTCTTCTTCTCCGGAGACTAAATCGGAATCTCGCT
CGCCAGTAAACCTAATGCCGGAAGACTCAACGTCGATCGACTATGTCATGGAGAAGGCAT
CGGGGCCTCACTTCTCCGGTCTTCGCCTCGACGGCCTTCTCTCTTCTCCCTCCAAATCAT
CCACCTCTTCTCCTTCTCACTTCCGCTCCGCTGTTCCGCCCTTCTCCCTCATCTCCGATC
CTGCCGCGCCTAATCAGCCGTTCGTCATCGGAGTTACTGGTGGTACCGCTTCGGGGAAGA
CCACGGTATGTGACATGATCATCCAGCAACTTCATGATCATCGCATTGTTCTTGTTAACC
AGGATTCCTTTTACCGTGGTCTGACACCTGAAGAACTGGCTCATGTTCAAGAATACAATT
TCGATCACCCTGATGCATTTGACACTGAGCAGATGTTGCATTGCATTGATACACTTAAGA
GTGGACAACCCTATCAAGTTCCTATTTATGACTTCAAGACTCATCAACGTAAAGCAGATG
CTTTTCGCCAGGTTAATGCTTGTGATGTTATAATTTT

QA 3 639 3 639
DS 



AS 1 2

CO CL6411Contig1 781 2 6 U
GGATTCATCGCCTTCTCCAATGGCCTCTAGCAACACCCCTCAAGGGGTTGACAATACGTT
CAGAAAGAAGTTCGATACGGAAGAGTATCGGGAGCGTGCACGTGAACGCGAAAAGAAGGA
GGCGGAACGGTCTAAATCTCAGTCTAAAGGTCCTCCTGTGCAAAGAGCTCCTTTGAAACA
TAGAGATTATCATGTAGACCTAGAGTCTCGTCTGGGGAAGACCCAGGTTGTTACACCGGT
AGCGCCTCTAAGTCAGCAGGCCGGTTATTTCTGTCGCGTTTGTGACTGTGTTGTTAAAGA
TTCAGCAAACTACTTGGATCACATAAATGGGAAGAAACATCAAAGAGCGTTGGGAATGTC
TATGCGGGTGGAGAGATCATCTCTTGAACAGGTTCAGGAGCGGTTTGAGGTGCTAAAGAA
GCGGAAAACGCCAGGAACTTTCTCAGAACAAGACCTGGACGAACGGATCCGGAAACAGCA
AGAAGAAGAGGAGGAATATAAACGGCAGCGGAGAGAGAAAAAGAAAGAAAAGAAGAAAGG
GAAGGTGCTGGAGGAGGAGCCTGAGATGGATCCCGAGGTTGCAGAGATGATGGGATTTGG
GGGCTTTGGATCTTCCAAAAAATCATGATGATCTTCAATATGTGTCTTTTGTGTTGTAAC
GTTTTTGATCCAAAAGCTTGAAACTTTGTAATCTAACATCGCACAACGATATCGTTTGTT
TCATTGTGACTAAGAAAAACAGTTTGTTTCTTTCAACTATCTTTGAGAGGCTTTGACAAC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2ET86TF U 1
AF RR2ET86JQ C 29
BS 1 621 RR2ET86TF
BS 622 622 RR2ET86JQ
BS 623 674 RR2ET86TF
BS 675 675 RR2ET86JQ
BS 676 687 RR2ET86TF
BS 688 781 RR2ET86JQ

RD RR2ET86TF 687 0 0
GGATTCATCGCCTTCTCCAATGGCCTCTAGCAACACCCCTCAAGGGGTTGACAATACGTT
CAGAAAGAAGTTCGATACGGAAGAGTATCGGGAGCGTGCACGTGAACGCGAAAAGAAGGA
GGCGGAACGGTCTAAATCTCAGTCTAAAGGTCCTCCTGTGCAAAGAGCTCCTTTGAAACA
TAGAGATTATCATGTAGACCTAGAGTCTCGTCTGGGGAAGACCCAGGTTGTTACACCGGT
AGCGCCTCTAAGTCAGCAGGCCGGTTATTTCTGTCGCGTTTGTGACTGTGTTGTTAAAGA
TTCAGCAAACTACTTGGATCACATAAATGGGAAGAAACATCAAAGAGCGTTGGGAATGTC
TATGCGGGTGGAGAGATCATCTCTTGAACAGGTTCAGGAGCGGTTTGAGGTGCTAAAGAA
GCGGAAAACGCCAGGAACTTTCTCAGAACAAGACCTGGACGAACGGATCCGGAAACAGCA
AGAAGAAGAGGAGGAATATAAACGGCAGCGGAGAGAGAAAAAGAAAGAAAAGAAGAAAGG
GAAGGTGCTGGAGGAGGAGCCTGAGATGGATCCCGAGGTTGCAGAGATGATGGGATTTGG
GGGCTTTGGATCTTCCAAAAA*TCATGATGATCTTCAATATGTGTCTTTTGTGTTGTAAC
GTTTTTGATCCAAA*GCTTGAAACTTT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2ET86JQ 753 0 0
AGCAACACCCCTCAAGGGGTTGACAATACGTTCAGAAAGAAGTTCGATACGGAAGAGTAT
CGGGAGCGTGCACGTGAACGCGAAAAGAAGGAGGCGGAACGGTCTAAATCTCAGTCTAAA
GGTCCTCCTGTGCAAAGAGCTCCTTTGAAACATAGAGATTATCATGTAGACCTAGAGTCT
CGTCTGGGGAAGACCCAGGTTGTTACACCGGTAGCGCCTCTAAGTCAGCAGGCCGGTTAT
TTCTGTCGCGTTTGTGACTGTGTTGTTAAAGATTCAGCAAACTACTTGGATCACATAAAT
GGGAAGAAACATCAAAGAGCGTTGGGAATGTCTATGCGGGTGGAGAGATCATCTCTTGAA
CAGGTTCAGGAGCGGTTTGAGGTGCTAAAGAAGCGGAAAACGCCAGGAACTTTCTCAGAA
CAAGACCTGGACGAACGGATCCGGAAACAGCAAGAAGAAGAGGAGGAATATAAACGGCAG
CGGAGAGAGAAAAAGAAAGAAAAGAAGAAAGGGAAGGTGCTGGAGGAGGAGCCTGAGATG
GATCCCGAGGTTGCAGAGATGATGGGATTTGGGGGCTTTGGATCTTCCAAAAAATCATGA
TGATCTTCAATATGTGTCTTTTGTGTTGTAACGTTTTTGATCCAAAAGCTTGAAACTTTG
TAATCTAACATCGCACAACGATATCGTTTGTTTCATTGTGACTAAGAAAAACAGTTTGTT
TCTTTCAACTATCTTTGAGAGGCTTTGACAACC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL6412Contig1 706 2 2 U
GGGTTAACCTGACGCAAAGACAACCAGTCTCTCAAGTCAAGTCTGTAGCTGCGTAGGGTT
TTATACTTTCACCGAGATCTAAGCATGGCGGATGTGGAACCAGAGGTTGCTGCGGCAGGA
GTCCCGAAGAAGAGGACGTTCAAGAAGTTTGCCTTCAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTT
CTCGATATGTCTACTGATGACCTTGTCAAGCTCTTCCCTTCTCGTATTCGTAGAAGGTTC
TCTAGAGGTTTGACCAGGAAGCCAATGGCTCTGATTAAGAAGCTTCGCAAGGCGAAAAGG
GAGGCACCATAAGGTGAGAAACCAGAACCAGTGAGAACCCACCTGAGGAACATGATCATT
GTCCCTGAGATGATCGGAAGCATCATTGGTGTGTACAATGGAAAGACGTTTAACCAGGTC
GAGATCAGTCCTGAGATGATTGGTCACTACCTGGCTGAGTTCTCCATCTCATACAAGCCG
GTTAAGCACGGTAGGCCTGTTGTTGGTGCTACCCACTCCTCCCGTTTCATTCCTCTCAAG
TGAGGGAATAGCTTTTTATACTCGTGGAATGTGTTCCATCTGTTTTTGTTGTTGTTTTAT
GATGAGACAGATACTTCTATGCGTTTTTATGTGACCTTGATCTTAAAAATCAAATCCTTT
CTAGTTTCTTTATGTTCTTCTGCTGTATAATTTATTTTGATTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW70TF U 1
AF RR2GW70JQ C 6
BS 1 632 RR2GW70TF
BS 633 706 RR2GW70JQ

RD RR2GW70TF 632 0 0
GGGTTAACCTGACGCAAAGACAACCAGTCTCTCAAGTCAAGTCTGTAGCTGCGTAGGGTT
TTATACTTTCACCGAGATCTAAGCATGGCGGATGTGGAACCAGAGGTTGCTGCGGCAGGA
GTCCCGAAGAAGAGGACGTTCAAGAAGTTTGCCTTCAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTT
CTCGATATGTCTACTGATGACCTTGTCAAGCTCTTCCCTTCTCGTATTCGTAGAAGGTTC
TCTAGAGGTTTGACCAGGAAGCCAATGGCTCTGATTAAGAAGCTTCGCAAGGCGAAAAGG
GAGGCACCATAAGGTGAGAAACCAGAACCAGTGAGAACCCACCTGAGGAACATGATCATT
GTCCCTGAGATGATCGGAAGCATCATTGGTGTGTACAATGGAAAGACGTTTAACCAGGTC
GAGATCAGTCCTGAGATGATTGGTCACTACCTGGCTGAGTTCTCCATCTCATACAAGCCG
GTTAAGCACGGTAGGCCTGTTGTTGGTGCTACCCACTCCTCCCGTTTCATTCCTCTCAAG
TGAGGGAATAGCTTTTTATACTCGTGGAATGTGTTCCATCTGTTTTTGTTGTTGTTTTAT
GATGAGACAGATACTTCTATGCGTTTTTATGT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2GW70JQ 701 0 0
TAA
CTGACGCAAAGACAACCAGTCTCTCAAGTCAAGTCTGTAGCTGCGTAGGGTTTTATACTT
TCACCGAGATCTAAGCATGGCGGATGTGGAACCAGAGGTTGCTGCGGCAGGAGTCCCGAA
GAAGAGGACGTTCAAGAAGTTTGCCTTCAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTCTCGATAT
GTCTACTGATGACCTTGTCAAGCTCTTCCCTTCTCGTATTCGTAGAAGGTTCTCTAGAGG
TTTGACCAGGAAGCCAATGGCTCTGATTAAGAAGCTTCGCAAGGCGAAAAGGGAGGCACC
ATAAGGTGAGAAACCAGAACCAGTGAGAACCCACCTGAGGAACATGATCATTGTCCCTGA
GATGATCGGAAGCATCATTGGTGTGTACAATGGAAAGACGTTTAACCAGGTCGAGATCAG
TCCTGAGATGATTGGTCACTACCTGGCTGAGTTCTCCATCTCATACAAGCCGGTTAAGCA
CGGTAGGCCTGTTGTTGGTGCTACCCACTCCTCCCGTTTCATTCCTCTCAAGTGAGGGAA
TAGCTTTTTATACTCGTGGAATGTGTTCCATCTGTTTTTGTTGTTGTTTTATGATGAGAC
AGATACTTCTATGCGTTTTTATGTGACCTTGATCTTAAAAATCAAATCCTTTCTAGTTTC
TTTATGTTCTTCTGCTGTATAATTTATTTTGATTTCTT

QA 4 701 4 701
DS 



AS 1 2

CO CL6413Contig1 628 2 1 U
GGGAGCTGAGCTTCCTCTTCTTCATTTCTTCTGCAAATCCAAAGAAATGGAACCATCATC
AGTAAAACCCAATCCTTTCCTCTCTTTCTCCTCTTTCCTTCACACCCACTGTAACCGATT
CGCCTCCGACCTCTCCGCCCGATTCGAAGACACCACCAAACGCTTCGCCGAATCCATAAC
CACTCGACGTTTCTCTCCTCTTCCGTTCGCCTCCCTCTCTCAGTCCTCCAAGCCTTCCGA
TGGAACCTCTACGCCTACTTTGAACCCATCTCACGTCGCTAAAGCTCTCGCTGGCACGTC
GGTCTTCACGGTCAGCAACACCAATAACGAGTTCGTTCTCATCTCGGATCCTACAGGAGA
CAAGTCTATCGGTTTGCTCTGTTTCCGACAAGAGGACGCTGAAGCTTTTCTCGCTCAGGC
GCGCCTCCGGAGAAGAGAGTTGAAAGCCAATGCTAAGGTTGTTCCCATTAATCTCGACCA
GGTGTACTTGTTAAAAGTTGAGGGGATTTCTTTTCGCTTCCTGCCCGATCCTATCCAAAT
AAAGAATGCATTGGAGCTCAAATCCTCATCAAGTAAGAATGGGTTTGATGGAGTTCCGGT
ATTCCAGTCTGAGCTTCTTGTTGTGAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BZ25JQ C 1
AF RR2BZ25TF U 1
BS 1 628 RR2BZ25TF

RD RR2BZ25JQ 628 0 0
GGGAGCTGAGCTTCCTCTTCTTCATTTCTTCTGCAAATCCAAAGAAATGGAACCATCATC
AGTAAAACCCAATCCTTTCCTCTCTTTCTCCTCTTTCCTTCACACCCACTGTAACCGATT
CGCCTCCGACCTCTCCGCCCGATTCGAAGACACCACCAAACGCTTCGCCGAATCCATAAC
CACTCGACGTTTCTCTCCTCTTCCGTTCGCCTCCCTCTCTCAGTCCTCCAAGCCTTCCGA
TGGAACCTTTACGCCTACTTTGAACCCATCTCACGTCGCTAAAGCTCTCGCTGGCACGTC
GGTCTTCACGGTCAGCAACACCAATAACGAGTTCGTTCTCATCTCGGATCCTACAGGAGA
CAAGTCTATCGGTTTGCTCTGTTTCCGACAAGAGGACGCTGAAGCTTTTCTCGCTCAGGC
GCGCCTCCGGAGAAGAGAGTTGAAAGCCAATGCTAAGGTTGTTCCCATTAATCTCGACCA
GGTGTACTTGTTAAAAGTTGAGGGGATTTCTTTTCGCTTCCTGCCCGATCCTATCCAAAT
AAAGAATGCATTGGAGCTCAAATCCTCATCAAGTAAGAATGGGTTTGATGGAGTTCCGGT
ATTCCAGTCTGAGCTTCTTGTTGTGAGG

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2BZ25TF 628 0 0
GGGAGCTGAGCTTCCTCTTCTTCATTTCTTCTGCAAATCCAAAGAAATGGAACCATCATC
AGTAAAACCCAATCCTTTCCTCTCTTTCTCCTCTTTCCTTCACACCCACTGTAACCGATT
CGCCTCCGACCTCTCCGCCCGATTCGAAGACACCACCAAACGCTTCGCCGAATCCATAAC
CACTCGACGTTTCTCTCCTCTTCCGTTCGCCTCCCTCTCTCAGTCCTCCAAGCCTTCCGA
TGGAACCTCTACGCCTACTTTGAACCCATCTCACGTCGCTAAAGCTCTCGCTGGCACGTC
GGTCTTCACGGTCAGCAACACCAATAACGAGTTCGTTCTCATCTCGGATCCTACAGGAGA
CAAGTCTATCGGTTTGCTCTGTTTCCGACAAGAGGACGCTGAAGCTTTTCTCGCTCAGGC
GCGCCTCCGGAGAAGAGAGTTGAAAGCCAATGCTAAGGTTGTTCCCATTAATCTCGACCA
GGTGTACTTGTTAAAAGTTGAGGGGATTTCTTTTCGCTTCCTGCCCGATCCTATCCAAAT
AAAGAATGCATTGGAGCTCAAATCCTCATCAAGTAAGAATGGGTTTGATGGAGTTCCGGT
ATTCCAGTCTGAGCTTCTTGTTGTGAGG

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL6414Contig1 774 2 2 U
CACAGCAAAGTCTTAACATCAAAAGGGTTGAGAGATCGGAGGATACGTCTCTCAGTCGCT
ACAGCAATCCAGTTCTACGATCTCCAAGACCGCCTCGGGTTCGATCAGCCGAGCAAAGCC
GTCGAGTGGCTTATCAACGCGGCTTCTGATTCGATCTCCGGTTTGGATCCGATCGACACG
AACTTCGACCAGACGCTCTCCCTGTCCAAATCCAGCACATCTGAGAGCTCGTTGTTGTCT
TTGTCGAGGACAGAGAGTCGTGGCAAAGCGAGAGAGAGGACATCGAAAGAGAGACACAAA
GACTTGCAAAGCTCCTTCACTCAGCTTCTCACGAGCGGTTTCGACGAACCGAACCGGAAT
TGGACCGGTGGTGGTTCTTCTGATTGTTTCAACCCGGTTCAGCTCATGCCAAACTCAAAC
TCCTTGAATCATCATCATAGTCAAAACCAATACTCTTTTGTACCGAACTACAACTTTGGA
ATCTCTTCTTCTGATTCTCCCGGAGCAACCGGTTGTTACAGTAGTAGGGGGCCCCTTCAG
TCCAATTCACAATCTCTCTTTCTCCACAACAACAACAACAACGTTAATCAGAGATCCATA
TCTTCGTCTTCTTCTTCATCTTCTCCAATGGACAGTCAGAGCATTTCTTTTTTCATGGCT
CCGCCTCTCAACCACCATAGTCCTCAGCTTCCAGAGGCTTTTGACGGCCGGTTATATCTC
TACTACGGTGAAGGAAACCGGAGCTCCGACGATAAAGGAAAGGAGAGGAGATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C658TF U 1
AF RR2C658JQ C 81
BS 1 704 RR2C658TF
BS 705 774 RR2C658JQ

RD RR2C658TF 704 0 0
CACAGCAAAGTCTTAACATCAAAAGGGTTGAGAGATCGGAGGATACGTCTCTCAGTCGCT
ACAGCAATCCAGTTCTACGATCTCCAAGACCGCCTCGGGTTCGATCAGCCGAGCAAAGCC
GTCGAGTGGCTTATCAACGCGGCTTCTGATTCGATCTCCGGTTTGGATCCGATCGACACG
AACTTCGACCAGACGCTCTCCCTGTCCAAATCCAGCACATCTGAGAGCTCGTTGTTGTCT
TTGTCGAGGACAGAGAGTCGTGGCAAAGCGAGAGAGAGGACATCGAAAGAGAGACACAAA
GACTTGCAAAGCTCCTTCACTCAGCTTCTCACGAGCGGTTTCGACGAACCGAACCGGAAT
TGGACCGGTGGTGGTTCTTCTGATTGTTTCAACCCGGTTCAGCTCATGCCAAACTCAAAC
TCCTTGAATCATCATCATAGTCAAAACCAATACTCTTTTGTACCGAACTACAACTTTGGA
ATCTCTTCTTCTGATTCTCCCGGAGCAACCGGTTGTTACAGTAGTAGGGGGCCCCTTCAG
TCCAATTCACAATCTCTCTTTCTCCACAACAACAACAACAACGTTAATCAGAGATCCATA
TCTTCGTCTTCTTCTTCATCTTCTCCAATGGACAGTCAGAGCATTTCTTTTTTCATGGCT
CCGCCTCTCAACCACCATAGTCCTCAGCTTCCAGAGGCTTTTGA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2C658JQ 694 0 0
TCTCCAAGACCGCCTCGGGTTCGATCAGCCGAGCAAAGCCGTCGAGTGGCTTATCAACGC
GGCTTCTGATTCGATCTCCGGTTTGGATCCGATCGACACGAACTTCGACCAGACGCTCTC
CCTGTCCAAATCCAGCACATCTGAGAGCTCGTTGTTGTCTTTGTCGAGGACAGAGAGTCG
TGGCAAAGCGAGAGAGAGGACATCGAAAGAGAGACACAAAGACTTGCAAAGCTCCTTCAC
TCAGCTTCTCACGAGCGGTTTCGACGAACCGAACCGGAATTGGACCGGTGGTGGTTCTTC
TGATTGTTTCAACCCGGTTCAGCTCATGCCAAACTCAAACTCCTTGAATCATCATCATAG
TCAAAACCAATACTCTTTTGTACCGAACTACAACTTTGGAATCTCTTCTTCTGATTCTCC
CGGAGCAACCGGTTGTTACAGTAGTAGGGGGCCCCTTCAGTCCAATTCACAATCTCTCTT
TCTCCACAACAACAACAACAACGTTAATCAGAGATCCATATCTTCGTCTTCTTCTTCATC
TTCTCCAATGGACAGTCAGAGCATTTCTTTTTTCATGGCTCCGCCTCTCAACCACCATAG
TCCTCAGCTTCCAGAGGCTTTTGACGGCCGGTTATATCTCTACTACGGTGAAGGAAACCG
GAGCTCCGACGATAAAGGAAAGGAGAGGAGATAG

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL6415Contig1 786 2 3 U
AACCAAACCAGGCTCATTTGGAAATTCGAAACAGCATAAAAATGTCATCACACAACCACT
GTGACTGTGTACTTATTAGTGTTAATGTAGTAAGAAAATATTTATTGGACTACAAAACTC
CATTTAAATAAAAATAATAAAATTTGGTTGGGTCTTCTTCTCTTCTCCCCAAAAGATTTA
TTTTACATGTCTCAAAACATTGTTGATTTGTCTAGCAAATATTTTCCTGCTTCAACAAAA
CTTGCTGCTTACGGTGTCGTAACTCGGAACAGACAACACATCTCCAAAGGAACCCATTGT
CAAAGGCTTTGAAATAATCTTGCTGGTGAAATCTGTAATGTCTTTCAATGTAAGTTCGTC
TACTGTCTTCAAGAACTGCTCAACTGGTTTCCTCTCTCCGTATGTAAGAATCTGCCTGCC
AATGTCTTCTGCTGCAATCATCCGAGATTCCAAATTCATCAAAACTGCAGATTTTGTGGC
TGCTTTGGCGCGATCTAGATGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCCTGCTACATCTTTCAGCTC
TTTAGCTGCTAATTCAATTGCTTTAGCAGCAAACTCAGGACTCGAGCAACCATAGATTCC
AAACAGTCCGGTGTTGTCAAAGATGCTAGTGAATGCGGTGCATGACTGAACTTGCTGATA
TTCGTTCAGAATACGGAGATAGAGCCATGAGTGCATTCCTTTTCCAGGGCCTCCAGCTGA
GAAGGAGCCACCTCCTCCCATAAGCATCTGGAGAACAGAGGCGATGAGTGCTTCTTTCTC
GTTCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG45JQ U 1
AF RR2B874JQ U 1
BS 1 461 RR2B874JQ
BS 462 462 RR2EG45JQ
BS 463 786 RR2B874JQ

RD RR2EG45JQ 693 0 0
AACCAAACCAGGCTCATTTGGAAATTCGAAACAGCATAAAAATGTCATCACACAACCACT
GTGACTGTGTACTTATTAGTGTTAATGTAGTAAGAAAATATTTATTGGACTACAAAATTC
CATTTAAATAAAAATAATAAAATTTGGTTGGGTCTTCTTCTCTTCTCCCCAAAAGATTTA
TTTTACATGTCTCAAAACATTGTTGATTTGTCTAGCAAATATTTTCCTGCTTCAACAAAA
CTTGCTGCTTACGGTGTCGTAACTCGGAACAGACAACACATCTCCAAAGGAACCCATTGT
CAAAGGCTTTGAAATAATCTTGCTGGTGAAATCTGTAATGTCTTTCAATGTAAGTTCGTC
TACTGTCTTCAAGAACTGCTCAACTGGTTTCCTCTCTCCGTATGTAAGAATCTGCCTGCC
AATGTCTTCTGCTGCAATCATCCGAGATTCCAAATTCATCAAAACTGCAGATTTTGTGGC
TGCTTTGGCGCGATCTAGATGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCCTGCTACATCTTTCAGCTC
TT*AGCTGCTAATTCAATTGCTTTAGCAGCAAACTCAGGACTCGAGCAACCATAGATTCC
AAACAGTCCGGTGTTGTCAAAGATGCTAGTGAATGCGGTGCATGACTGAACTTGCTGATA
TTCGTTCAGAATACGGAGATAGAGCCATGAGTG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2B874JQ 786 0 0
AACCAAACCAGGCTCATTTGGAAATTCGAAACAGCATAAAAATGTCATCACACAACCACT
GTGACTGTGTACTTATTAGTGTTAATGTAGTAAGAAAATATTTATTGGACTACAAAACTC
CATTTAAATAAAAATAATAAAATTTGGTTGGGTCTTCTTCTCTTCTCCCCAAAAGATTTA
TTTTACATGTCTCAAAACATTGTTGATTTGTCTAGCAAATATTTTCCTGCTTCAACAAAA
CTTGCTGCTTACGGTGTCGTAACTCGGAACAGACAACACATCTCCAAAGGAACCCATTGT
CAAAGGCTTTGAAATAATCTTGCTGGTGAAATCTGTAATGTCTTTCAATGTAAGTTCGTC
TACTGTCTTCAAGAACTGCTCAACTGGTTTCCTCTCTCCGTATGTAAGAATCTGCCTGCC
AATGTCTTCTGCTGCAATCATCCGAGATTCCAAATTCATCAGAACTGCAGATTTTGTGGC
TGCTTTGGCGCGATCTAGATGCTTCTGGTTAACTTTTCCTCCTGCTACATCTTTCAGCTC
TTTAGCTGCTAATTCAATTGCTTTAGCAGCAAACTCAGGACTCGAGCAACCATAGATTCC
AAACAGTCCGGTGTTGTCAAAGATGCTAGTGAATGCGGTGCATGACTGAACTTGCTGATA
TTCGTTCAGAATACGGAGATAGAGCCATGAGTGCATTCCTTTTCCAGGGCCTCCAGCTGA
GAAGGAGCCACCTCCTCCCATAAGCATCTGGAGAACAGAGGCGATGAGTGCTTCTTTCTC
GTTCTT

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL6416Contig1 801 2 4 U
GCAGTTCGGATGCATAAAGAAAGATGGAGTGGGCTTGTTCCCTGGCCACGGAGGCTGACA
GCTCCCCCACCACGTCTTGAAGAAGTGGGTGTCACTCCCGAGAAATTCCGTGAAGATACG
GAAACATGGCGGCATAGAGTGACTGAATACTGGAAACTGCTTAAACCAATGGTGCAAAAG
AACTCAATTAGAAACGTGATGGACATGAGCTCAAACCTCGGCGGTTTTGCAGCTGCTCTA
AACGATAAAGATGTATGGGTAATGAACGTCATACCCGTACAATCCCAACCGAGAATGAAG
ATAATCTACGACCGTGGCCTTATCGGAGCCACTCATGATTGGTGTGAAGCCTTTGACACA
TACCCCCGAACATTTGACCTTATCCACGCGTGGAACACATTCACAGAAACCGAAGCACGT
GGATGCAGCATCGAAGATCTGCTGATCGAGATAGACAGGATACTACGGCCAGAAGGATTT
GTCATAATTCGTGACACGTCAGAGAGTATTAGCTACATCAAGAAGTATCTGACATTGTTG
AAATGGGACAAATGGTTCACAGAGACGACTCCAAAAGGTGACTCTCTGTCGACCAAAGAC
GAGAGAGTTTTGATAGCCAGAAAGAAACTTTGGAGCGTGGCGGCCATTTCAGAGGTTTGA
AAGGTTTGCTTATCTTGCAAGCCATCTATCTACTACTTGATATGAGGAACTGTAAATTAC
AAAAAATTCATACGTAGTTATGATTTTGATTTTGTTGTAGGAAAAATGCTTAAAATCTTC
TTATTTTCAATTTTCTAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN20TF U 1
AF RR2FN20JQ C 113
BS 1 626 RR2FN20TF
BS 627 627 RR2FN20JQ
BS 628 644 RR2FN20TF
BS 645 801 RR2FN20JQ

RD RR2FN20TF 650 0 0
GCAGTTCGGATGCATAAAGAAAGATGGAGTGGGCTTGTTCCCTGGCCACGGAGGCTGACA
GCTCCCCCACCACGTCTTGAAGAAGTGGGTGTCACTCCCGAGAAATTCCGTGAAGATACG
GAAACATGGCGGCATAGAGTGACTGAATACTGGAAACTGCTTAAACCAATGGTGCAAAAG
AACTCAATTAGAAACGTGATGGACATGAGCTCAAACCTCGGCGGTTTTGCAGCTGCTCTA
AACGATAAAGATGTATGGGTAATGAACGTCATACCCGTACAATCCCAACCGAGAATGAAG
ATAATCTACGACCGTGGCCTTATCGGAGCCACTCATGATTGGTGTGAAGCCTTTGACACA
TACCCCCGAACATTTGACCTTATCCACGCGTGGAACACATTCACAGAAACCGAAGCACGT
GGATGCAGCATCGAAGATCTGCTGATCGAGATAGACAGGATACTACGGCCAGAAGGATTT
GTCATAATTCGTGACACGTCAGAGAGTATTAGCTACATCAAGAAGTATCTGACATTGTTG
AAATGGGACAAATGGTTCACAGAGACGACTCCAAAAGGTGACTCTCTGTCGACCAAAGAC
GAGAGAGTTTTGATAGCCAGAAAGAA*CTTTGGAGCGTGGCGGC
ATTTCA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2FN20JQ 689 0 0
AAGATACGGAAACATGGCGGCATAGAGTGACTGAATACTGGAAACTGCTTAAACCAATGG
TGCAAAAGAACTCAATTAGAAACGTGATGGACATGAGCTCAAACCTCGGCGGTTTTGCAG
CTGCTCTAAACGATAAAGATGTATGGGTAATGAACGTCATACCCGTACAATCCCAACCGA
GAATGAAGATAATCTACGACCGTGGCCTTATCGGAGCCACTCATGATTGGTGTGAAGCCT
TTGACACATACCCCCGAACATTTGACCTTATCCACGCGTGGAACACATTCACAGAAACCG
AAGCACGTGGATGCAGCATCGAAGATCTGCTGATCGAGATAGACAGGATACTACGGCCAG
AAGGATTTGTCATAATTCGTGACACGTCAGAGAGTATTAGCTACATCAAGAAGTATCTGA
CATTGTTGAAATGGGACAAATGGTTCACAGAGACGACTCCAAAAGGTGACTTTCTGTCGA
CCAAAGACGAGAGAGTTTTGATAGCCAGAAAGAAACTTTGGAGCGTGGCGGCCATTTCAG
AGGTTTGAAAGGTTTGCTTATCTTGCAAGCCATCTATCTACTACTTGATATGAGGAACTG
TAAATTACAAAAAATTCATACGTAGTTATGATTTTGATTTTGTTGTAGGAAAAATGCTTA
AAATCTTCTTATTTTCAATTTTCTAGTCC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL6417Contig1 638 2 2 U
GGACACACCTCCATCATAGACAACAAAATAATCTCTACCATCAAAGCAAAACATGAGAGC
CACTTTCACTAACTTGCTTGTGCTTCTCTTCATTGCACTTGTTTGTGTAAATGTCGGTGC
TAGGAAACTTATTTCCGGAGATACCCAATTCAAAGATGAAAAATTCCTTGGCGGCGGTGG
AGCCGGTGGTGGCCTTGGTGGGCTAGGGATTGGAGCTAATATCAATGTTGGAGCTGGATT
AGGACTAGGTGGTGGACTTGGCGGTGGTGGTGGACTCCTCGGTGGAGGTGATTTAGGCGG
AGATGGTTTAGGCGGAGGTGGTTTAGGTGGAGGTGGTTTAGGCGGAGGTGGTTTAGGCGG
AGGTGCCGGTGGACTTGGTGGTGGTGGCTTTCCTTGAACGTATAGTCAAGTGTTTGTGTG
TGTGTGAGCTCATTCACAGCTTATTATGCTACTCAAGTCATTTCCATTGTCATAATAAAT
TTAGAGTGATTTAATCACATTTACATCTTTTATTTCAACTTCAATGTTTTAATCGAGAAA
GGCCTTAGCTAATAGCTACTACTTCTAGCGGTTATGGTCAGACTCGTAGTATGTGTAACG
TCAAATATTATTACTTAATTAGTGAAAAAATTCCGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ22JQ C 1
AF RR2AQ22TF U 1
BS 1 624 RR2AQ22TF
BS 625 638 RR2AQ22JQ

RD RR2AQ22JQ 638 0 0
GGACACACCTCCATCATAGACAACAAAATAATCTCTACCATCAAAGCAAAACATGAGAGC
CACTTTCACTAACTTGCTTGTGCTTCTCTTCATTGCACTTGTTTGTGTAAATGTCGGTGC
TAGGAAACTTATTTCCGGAGATACCCAATTCAAAGATGAAAAATTCCTTGGCGGCGGTGG
AGCCGGTGGTGGCCTTGGTGGGCTAGGGATTGGAGCTAATATCAATGTTGGAGCTGGATT
AGGACTAGGTGGTGGACTTGGCGGTGGTGGTGGACTCCTCGGTGGAGGTGATTTAGGCGG
AGATGGTTTAGGCGGAGGTGGTTTAGGTGGAGGTGGTTTAGGCGGAGGTGGTTTAGGCGG
AGGTGCCGGTGGACTTGGTGGTGGTGGCTTTCCTTGAACGTATAGTCAAGTGTTTGTGTG
TGTGTGAGCTCATTCACAGCTTATTATGCTACTCAAGTCATTTCCATTGTCATAATAAAT
TTAGAGTGATTTAATCACATTTACATCTTTTATTTCAACTTCAATGTTTTAATCGAGAAA
GGCCTTAGCTAATAGCTACTACTTCTAGCGGTTATGGTCAGACTCGTAGTATGTGTAACG
TCAAATATTATTACTTAATTAGTGAAAAAATTCCGATT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2AQ22TF 624 0 0
GGACACACCTCCATCATAGACAACAAAATAATCTCTACCATCAAAGCAAAACATGAGAGC
CACTTTCACTAACTTGCTTGTGCTTCTCTTCATTGCACTTGTTTGTGTAAATGTCGGTGC
TAGGAAACTTATTTCCGGAGATACCCAATTCAAAGATGAAAAATTCCTTGGCGGCGGTGG
AGCCGGTGGTGGCCTTGGTGGGCTAGGGATTGGAGCTAATATCAATGTTGGAGCTGGATT
AGGACTAGGTGGTGGACTTGGCGGTGGTGGTGGACTCCTCGGTGGAGGTGATTTAGGCGG
AGATGGTTTAGGCGGAGGTGGTTTAGGTGGAGGTGGTTTAGGCGGAGGTGGTTTAGGCGG
AGGTGCCGGTGGACTTGGTGGTGGTGGCTTTCCTTGAACGTATAGTCAAGTGTTTGTGTG
TGTGTGAGCTCATTCACAGCTTATTATGCTACTCAAGTCATTTCCATTGTCATAATAAAT
TTAGAGTGATTTAATCACATTTACATCTTTTATTTCAACTTCAATGTTTTAATCGAGAAA
GGCCTTAGCTAATAGCTACTACTTCTAGCGGTTATGGTCAGACTCGTAGTATGTGTAACG
TCAAATATTATTACTTAATTAGTG

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL6418Contig1 1066 2 4 U
GCTGGTGAAGAAAGCATTTGTACTGAGTTTAAAGATGGGGTGGATAGATCCAGCAAGGTG
CCAGTCACTGATGGAAACATTACGGGAAAGAAGGAACCAGTGAGGTTTGAATGTGACTTT
GATCGATCTTACTCTTCTAGTTCTTCAAAGAACAGCATTTCAAAGATACCTGAGAAGGCT
GGAAAAGGTAAACTGACCTCATTGAAGCTATCTGATGAGATTCAAACTCTTGGAACCATG
GTTCCTGCAAATATAGAATCAGCAGCAAGGGGGAGAGCAAGAACCAGGTCGCAGCGTGTG
CATTCACCTTCCAATCTCATTGCAAACGCCTCCATATGCAATCTCCCTGAAGATTCAGAT
GAAATCCAAGAACACACTAAAGTGCAGGCTTGCAATGAGAAGAAAGAAAGTGAATCTCCC
TTATCAGTAACTTGTGAGGGAAAGTTGGAAGAGAGTTCAGAGAAGAGTAACCAATCAACC
ATAACTTATGGGGACAGGCCTATCATTGGAACTGCTGCTGCTCACTGGAACGAGAAAGAG
CAGTCTCAAATCTCACCCAAATGGTGGGATGGTAATGGAATACCAAACTCTACAAACAAG
TACAAAGAGGATCAGAAAGTGAGATGGCACGCAACATCTTTCGAGGAGAGATTGGAGAAA
GCACTTTCAGAAGAAGGTGGTCACTGTTTCATCCCATCACGAAAACTTGAAGTAATGGAA
GATGCGGAAAGGGACACAGCTATGTCACAGCTGCATCATCCAGCGCAATCCACATCAATC
GTTTCCTTCTGATCATTGAGTATTGTTGAGACAATATTGGCTTTCGTACAGAATGGTTAT
CATGAGTTCATGACTCATGAGCAATATGATACGTAGAAGAATCTATATAGCAAACTATAC
ACGACGGTTCGTGGTTTCATAAAAACTTTTTATTGCAAGTCCTGAATCTATTTTAGATTT
TTTTTTTTATAATATTCATTATCTATTGATTCTGTCTACTGTACTTTATTCTGATTCTGT
TAGGAGGGAAGTTTTGGAACGGAGATATCAACACATTATTTTCTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY25TF U 1
AF RR2GY25JQ C 413
BS 1 676 RR2GY25TF
BS 677 677 RR2GY25JQ
BS 678 711 RR2GY25TF
BS 712 1066 RR2GY25JQ

RD RR2GY25TF 711 0 0
GCTGGTGAAGAAAGCATTTGTACTGAGTTTAAAGATGGGGTGGATAGATCCAGCAAGGTG
CCAGTCACTGATGGAAACATTACGGGAAAGAAGGAACCAGTGAGGTTTGAATGTGACTTT
GATCGATCTTACTCTTCTAGTTCTTCAAAGAACAGCATTTCAAAGATACCTGAGAAGGCT
GGAAAAGGTAAACTGACCTCATTGAAGCTATCTGATGAGATTCAAACTCTTGGAACCATG
GTTCCTGCAAATATAGAATCAGCAGCAAGGGGGAGAGCAAGAACCAGGTCGCAGCGTGTG
CATTCACCTTCCAATCTCATTGCAAACGCCTCCATATGCAATCTCCCTGAAGATTCAGAT
GAAATCCAAGAACACACTAAAGTGCAGGCTTGCAATGAGAAGAAAGAAAGTGAATCTCCC
TTATCAGTAACTTGTGAGGGAAAGTTGGAAGAGAGTTCAGAGAAGAGTAACCAATCAACC
ATAACTTATGGGGACAGGCCTATCATTGGAACTGCTGCTGCTCACTGGAACGAGAAAGAG
CAGTCTCAAATCTCACCCAAATGGTGGGATGGTAATGGAATACCAAACTCTACAAACAAG
TACAAAGAGGATCAGAAAGTGAGATGGCACGCAACATCTTTCGAGGAGAGATTGGAGAAA
GCACTTTCAGAAGAAG*TGGTCACTGTTTCATCCCATCACGAAAACTTGAA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2GY25JQ 654 0 0
AATCTCCCTTATCAGTAACTTGTGAGGGAAAGTTGGAAGAGAGTTCAGAGAAGAGTAACC
AATCAACCATAACTTATGGGGACAGGCCTATCATTGGAACTGCTGCTGCTCACTGGAACG
AGAAAGAGCAGTCTCAAATCTCACCCAAATGGTGGGATGGTAATGGAATACCAAACTCTA
CAAACAAGTACAAAGAGGATCAGAAAGTGAGATGGCACGCAACATCTTTCGAGGAGAGAT
TGGAGAAAGCACTTTCAGAAGAAGGTGGTCACTGTTTCATCCCATCACGAAAACTTGAAG
TAATGGAAGATGCGGAAAGGGACACAGCTATGTCACAGCTGCATCATCCAGCGCAATCCA
CATCAATCGTTTCCTTCTGATCATTGAGTATTGTTGAGACAATATTGGCTTTCGTACAGA
ATGGTTATCATGAGTTCATGACTCATGAGCAATATGATACGTAGAAGAATCTATATAGCA
AACTATACACGACGGTTCGTGGTTTCATAAAAACTTTTTATTGCAAGTCCTGAATCTATT
TTAGATTTTTTTTTTTATAATATTCATTATCTATTGATTCTGTCTACTGTACTTTATTCT
GATTCTGTTAGGAGGGAAGTTTTGGAACGGAGATATCAACACATTATTTTCTTA

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL6419Contig1 468 2 1 U
GGAAACCTTAATTTCGTCTTCAAGCATAGAGAGTAGTTCATCTTCCGATTTTTCCACTTT
GTCTTCCCCTGATTACTCTCTAAATCCGTTACCGCTTGCTCATCTCTTCTTTATTTGTTC
TACCTCCCTCTCTTTCTCCTTATATATAAGTTGATACCATACCTTTGTCGTGAATTACTT
CAAAGCAGCACCCGACTCTTCCACTTCTTCTTCACCGTCTTGGTTGCTCTGTAATCTTCG
TCTTCACCTGAGTACTTTGAAATCTCTTTCATGGAGCTGATGGTATCGTATCATTATTTG
GAGATTCGAGATCTGATTCTACTCACGTCTCTCACACTCTCATCGCGCTTCTTCTCTGGT
TAGTTCTTCTCTCTCTGGTTAGCTGTTATGTTTTAGCTTTGATTAGATTTACAGAGAGAT
CGCATTGCTTCTTCAGCTTCGAGATCACAAATTGGAATATTAGGAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FS92JQ C 1
AF RR2FS92TF U 1
BS 1 468 RR2FS92TF

RD RR2FS92JQ 468 0 0
GGAAACCTTAATTTCGTCTTCAAGCATAGAGAGTAGTTCATCTTCCGATTTTTCCACTTT
GTCTTCCCCTGATTACTCTCTAAATCCGTTACCGCTTGCTCATCTCTTCTTTATTTGTTC
TACCTCCCTCTCTTTCTCCTTATATATAAGTTGATACCATACCTTTGTCGTGAATTACTT
CAAAGCAGCACCCGACTCTTCCACTTCTTCTTCACCGTCTTGGTTGCTCTGTAATCTTCG
TCTTCACCTGAGTACTTTGAAATCTCTTTCATGGAGCTGATGGTATCGTATCATTATTTG
GAGATTCGAGATCTGATTCTACTCACGTCTCTCACACTCTCATCGCGCTTCTTCTCTGGT
TAGTTCTTCTCTCTCTGGTTAGCTGTTATGTTTTAGCTTTGATTAGATTTACAGAGAGAT
CGCATTGCTTCTTCAGCTTCGAGATCACAAATTGGAATATTAGGAACC

QA 1 468 1 468
DS 

RD RR2FS92TF 468 0 0
GGAAACCTTAATTTCGTCTTCAAGCATAGAGAGTAGTTCATCTTCCGATTTTTCCACTTT
GTCTTCCCCTGATTACTCTCTAAATCCGTTACCGCTTGCTCATCTCTTCTTTATTTGTTC
TACCTCCCTCTCTTTCTCCTTATATATAAGTTGATACCATACCTTTGTCGTGAATTACTT
CAAAGCAGCACCCGACTCTTCCACTTCTTCTTCACCGTCTTGGTTGCTCTGTAATCTTCG
TCTTCACCTGAGTACTTTGAAATCTCTTTCATGGAGCTGATGGTATCGTATCATTATTTG
GAGATTCGAGATCTGATTCTACTCACGTCTCTCACACTCTCATCGCGCTTCTTCTCTGGT
TAGTTCTTCTCTCTCTGGTTAGCTGTTATGTTTTAGCTTTGATTAGATTTACAGAGAGAT
CGCATTGCTTCTTCAGCTTCGAGATCACAAATTGGAATATTAGGAACC

QA 1 468 1 468
DS 



AS 1 2

CO CL6420Contig1 881 2 2 U
GGGATTGTAACCCACTACTACTCATCACAAGGAACAGAGACCAAAAAGCCTCATCATTAA
TCCCTCACGATAACCACCAATGGGTTCTCACCTCTCGAAACAGCTCGAGCGTCGTAAAGC
CATCTCAACCGAGAAGAAAGCCCTCTCCGATCTCCAACAATCCTGCGGCTGCGAGTTTCC
GGGGTCCGATTACACCCCCACCGATCGCAAAACCTGGATGGCCGGCGTGGGACCTGAGAA
GCTCCACGTCAACAAGATCGTCTGGCCAGGGACGCACGACTCAGCCACCAACAAGATCGG
GATCCGCTGTGGAGCGCGGGATATCTGAAAGACAACTGGATCGATACGGATCTTCCTTCC
ACGAAATTCGAGAGCAACTTAAAGCATCTGAGCCAGCAGCAGCCGGCTGCTTCGCGGAAG
TTTTTCTACAGGGTGGAGAACACTGTCACGCCGCAGGCTGATAACCCGATTTTGTGTGTT
AAACCGGTCACTAACCGGATTCATTGTTACGCCAAGGTGTTTATTATTGAGTGTGTGAAG
AGGGGATGTGCTGATAAGCTGCAGATCTTCTCCACGGATTTTATTGATAAAGACTTTGTT
GATGCTTGTGTTGGCCTCACTTCTGCGAGAGCTGAGGGGAAGGCTTGAGGTTTGTGTATA
TGTATGAGTGGAATTCACGTAGATACATTGTTTGTATATTTGTTTTGTAGAAAAAAAATC
ACAACACATGGCTGTGTTTTTAGATGTGTATTATGTTAGGGTGTATTAGTCAAGTCGTTT
GTTTGTTTTTTTCTTTGTGAAAACATGTATGTGTGCATTTGATCTGAGGCTGTATATTCC
TCACTTTCTTTTGTGAATGTAATTATATGCATTCTGCAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D450TF U 1
AF RR2D450JQ C 174
BS 1 637 RR2D450TF
BS 638 881 RR2D450JQ

RD RR2D450TF 637 0 0
GGGATTGTAACCCACTACTACTCATCACAAGGAACAGAGACCAAAAAGCCTCATCATTAA
TCCCTCACGATAACCACCAATGGGTTCTCACCTCTCGAAACAGCTCGAGCGTCGTAAAGC
CATCTCAACCGAGAAGAAAGCCCTCTCCGATCTCCAACAATCCTGCGGCTGCGAGTTTCC
GGGGTCCGATTACACCCCCACCGATCGCAAAACCTGGATGGCCGGCGTGGGACCTGAGAA
GCTCCACGTCAACAAGATCGTCTGGCCAGGGACGCACGACTCAGCCACCAACAAGATCGG
GATCCGCTGTGGAGCGCGGGATATCTGAAAGACAACTGGATCGATACGGATCTTCCTTCC
ACGAAATTCGAGAGCAACTTAAAGCATCTGAGCCAGCAGCAGCCGGCTGCTTCGCGGAAG
TTTTTCTACAGGGTGGAGAACACTGTCACGCCGCAGGCTGATAACCCGATTTTGTGTGTT
AAACCGGTCACTAACCGGATTCATTGTTACGCCAAGGTGTTTATTATTGAGTGTGTGAAG
AGGGGATGTGCTGATAAGCTGCAGATCTTCTCCACGGATTTTATTGATAAAGACTTTGTT
GATGCTTGTGTTGGCCTCACTTCTGCGAGAGCTGAGG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2D450JQ 708 0 0
AGTTTCCGGGGTCCGATTACACCCCCACCGATCGCAAAACCTGGATGGCCGGCGTGGGAC
CTGAGAAGCTCCACGTCAACAAGATCGTCTGGCCAGGGACGCACGACTCAGCCACCAACA
AGATCGGGATCCGCTGTGGAGCGCGGGATATCTGAAAGACAACTGGATCGATACGGATCT
TCCTTCCACGAAATTCGAGAGCAACTTAAAGCATTTGAGCCAGCAGCAGCCGGCTGCTTC
GCGGAAGTTTTTCTACAGGGTGGAGAACACTGTCACGCCGCAGGCTGATAACCCGATTTT
GTGTGTTAAACCGGTCACTAACCGGATTCATTGTTACGCCAAGGTGTTTATTATTGAGTG
TGTGAAGAGGGGATGTGCTGATAAGCTGCAGATCTTCTCCACGGATTTTATTGATAAAGA
CTTTGTTGATGCTTGTGTTGGCCTCACTTTTGCGAGAGCTGAGGGGAAGGCTTGAGGTTT
GTGTATATGTATGAGTGGAATTCACGTAGATACATTGTTTGTATATTTGTTTTGTAGAAA
AAAAATCACAACACATGGCTGTGTTTTTAGATGTGTATTATGTTAGGGTGTATTAGTCAA
GTCGTTTGTTTGTTTTTTTCTTTGTGAAAACATGTATGTGTGCATTTGATCTGAGGCTGT
ATATTCCTCACTTTCTTTTGTGAATGTAATTATATGCATTCTGCAGGT

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL6421Contig1 524 2 1 U
GGAACTAACGCAAGAGCGAAAGAGAAAACCCTAAAAAAGAAAAGAAGAAATCGCAAGAGC
GGCGACACAGTTCGTGGCAGGATGATCATTCCAGTTCGCTGCTTTACTTGTGGAAAGGTG
ATTGGGAACAAATGGGACACATACCTTGATCTTCTCCAGGCTGATTATACCGAAGGGGAT
GCTCTTGATGCGATTGGTTTAGTCCGTTACTGCTGCAGGCGTATGCTTATGACTCACGTT
GATCTCATCGAAAAGCTTCTTAACTACAACACTCTTGAGAAATCTGATGCCAATTAAAAG
ATTGCTATTACGAATAACAGATGAGCAAGACCAATAGTCAAGTCTTTACCTATGAATGAT
GATGTCTACTTTTCTTTTGTTCGGGTCTTTAGGAATCTGAGTCTAGTTTGGATTGGCCAC
AAGTAAAGCTCGAGCTCTCTTGTAGATTCGTCCTCTGTTGATGATTTGCTTTTGATAATC
TAGTCTAGTCTACTGATACTGCCTTTAAGATCATAAATACATAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BS06JQ C 1
AF RR2BS06TF U 1
BS 1 524 RR2BS06TF

RD RR2BS06JQ 524 0 0
GGAACTAACGCAAGAGCGAAAGAGAAAACCCTAAAAAAGAAAAGAAGAAATCGCAAGAGC
GGCGACACAGTTCGTGGCAGGATGATCATTCCAGTTCGCTGCTTTACTTGTGGAAAGGTG
ATTGGGAACAAATGGGACACATACCTTGATCTTCTCCAGGCTGATTATACCGAAGGGGAT
GCTCTTGATGCGATTGGTTTAGTCCGTTACTGCTGCAGGCGTATGCTTATGACTCACGTT
GATCTCATCGAAAAGCTTCTTAACTACAACACTCTTGAGAAATCTGATGCCAATTAAAAG
ATTGCTATTACGAATAACAGATGAGCAAGACCAATAGTCAAGTCTTTACCTATGAATGAT
GATGTCTACTTTTCTTTTGTTCGGGTCTTTAGGAATCTGAGTCTAGTTTGGATTGGCCAC
AAGTAAAGCTCGAGCTCTCTTGTAGATTCGTCCTCTGTTGATGATTTGCTTTTGATAATC
TAGTCTAGTCTACTGATACTGCCTTTAAGATCATAAATACATAA

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2BS06TF 524 0 0
GGAACTAACGCAAGAGCGAAAGAGAAAACCCTAAAAAAGAAAAGAAGAAATCGCAAGAGC
GGCGACACAGTTCGTGGCAGGATGATCATTCCAGTTCGCTGCTTTACTTGTGGAAAGGTG
ATTGGGAACAAATGGGACACATACCTTGATCTTCTCCAGGCTGATTATACCGAAGGGGAT
GCTCTTGATGCGATTGGTTTAGTCCGTTACTGCTGCAGGCGTATGCTTATGACTCACGTT
GATCTCATCGAAAAGCTTCTTAACTACAACACTCTTGAGAAATCTGATGCCAATTAAAAG
ATTGCTATTACGAATAACAGATGAGCAAGACCAATAGTCAAGTCTTTACCTATGAATGAT
GATGTCTACTTTTCTTTTGTTCGGGTCTTTAGGAATCTGAGTCTAGTTTGGATTGGCCAC
AAGTAAAGCTCGAGCTCTCTTGTAGATTCGTCCTCTGTTGATGATTTGCTTTTGATAATC
TAGTCTAGTCTACTGATACTGCCTTTAAGATCATAAATACATAA

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

CO CL6422Contig1 632 2 1 U
GGGTTGGATTTTGAGGCGCGGTACGGCAGTAGTTCGACTTTTGGCATCCAGAGAACAAAC
GGAGAGGTGCATCTATGGCTGATCCTGAGCTAGAAGCTATTAGACAGAGGAGGATGCAAG
AGCTTATGGCTCAACATGGCACTGGTAAGCAGGGCAGTCAGCAGAATCCAGACCAAGAGA
GAGCACAAGAAGATGCTAAAAGGGAAGCTGATGAACGTAGACAAATGATGCTTAGTCAGA
TATTGTCTTCCCAAGCCCGAGAGAGAATTGCTCGAATTGCACTGGTGAAACCTGAGAAAG
CTAGAGGCGTAGAGGATGTTATTCTGAGGGCTGCTCAAATGGGACAGATTGTTGAGAAGG
TTTCTGAGGAACGGCTTATAACGCTGCTGGAACAAATTAACAGCCAAACTAGCAAACAGA
CAAAAGTCACGATCCAGAGGCGTCGTGGGGTGTTCGACGATTAGGAAAGAAGAAGTTTAT
GATGTGCTTTGTACATCTGACTGTTAAGTTTGTGTGTGTTCAGTAAACTAAGATCTAGAC
GTTACTGTGAAATATGTTCATTGTGGTGAATCTTAATGATCTTCCTTTATGCTTTGGTTG
AGATAAAATCTGAAACTAAAACTCCGTATTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BE89JQ C 1
AF RR2BE89TF U 1
BS 1 632 RR2BE89TF

RD RR2BE89JQ 632 0 0
GGGTTGGATTTTGAGGCGCGGTACGGCAGTAGTTCGACTTTTGGCATCCAGAGAACAAAC
GGAGAGGTGCATCTATGGCTGATCCTGAGCTAGAAGCTATTAGACAGAGGAGGATGCAAG
AGCTTATGGCTCAACATGGCACTGGTAAGCAGGGCAGTCAGCAGAATCCAGACCAAGAGA
GAGCACAAGAAGATGCTAAAAGGGAAGCTGATGAACGTAGACAAATGATGCTTAGTCAGA
TATTGTCTTCCCAAGCCCGAGAGAGAATTGCTCGAATTGCACTGGTGAAACCTGAGAAAG
CTAGAGGCGTAGAGGATGTTATTCTGAGGGCTGCTCAAATGGGACAGATTGTTGAGAAGG
TTTCTGAGGAACGGCTTATAACGCTGCTGGAACAAATTAACAGCCAAACTAGCAAACAGA
CAAAAGTCACGATCCAGAGGCGTCGTGGGGTGTTCGACGATTAGGAAAGAAGAAGTTTAT
GATGTGCTTTGTACATCTGACTGTTAAGTTTGTGTGTGTTCAGTAAACTAAGATCTAGAC
GTTACTGTGAAATATGTTCATTGTGGTGAATCTTAATGATCTTCCTTTATGCTTTGGTTG
AGATAAAATCTGAAACTAAAACTCCGTATTTT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2BE89TF 632 0 0
GGGTTGGATTTTGAGGCGCGGTACGGCAGTAGTTCGACTTTTGGCATCCAGAGAACAAAC
GGAGAGGTGCATCTATGGCTGATCCTGAGCTAGAAGCTATTAGACAGAGGAGGATGCAAG
AGCTTATGGCTCAACATGGCACTGGTAAGCAGGGCAGTCAGCAGAATCCAGACCAAGAGA
GAGCACAAGAAGATGCTAAAAGGGAAGCTGATGAACGTAGACAAATGATGCTTAGTCAGA
TATTGTCTTCCCAAGCCCGAGAGAGAATTGCTCGAATTGCACTGGTGAAACCTGAGAAAG
CTAGAGGCGTAGAGGATGTTATTCTGAGGGCTGCTCAAATGGGACAGATTGTTGAGAAGG
TTTCTGAGGAACGGCTTATAACGCTGCTGGAACAAATTAACAGCCAAACTAGCAAACAGA
CAAAAGTCACGATCCAGAGGCGTCGTGGGGTGTTCGACGATTAGGAAAGAAGAAGTTTAT
GATGTGCTTTGTACATCTGACTGTTAAGTTTGTGTGTGTTCAGTAAACTAAGATCTAGAC
GTTACTGTGAAATATGTTCATTGTGGTGAATCTTAATGATCTTCCTTTATGCTTTGGTTG
AGATAAAATCTGAAACTAAAACTCCGTATTTT

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL6423Contig1 951 2 4 U
GCATTGTCCGATCCATTTCTTTTGACAACCGCAAAGCTCTTGAAACTAGCGCAGATCAAA
TCTCTCCAGTTCCAACTGAAGAAACAGAAGAAGAGATTCCAGAAGAAGAAGCGGTGTGCA
GGATCTGTCTCGACGTGTGCGAAGAAGGCAACACTCTGAAGATGGAGTGCAGCTGCAAAG
ACGATCTCAGACTAGTTCACGAAGCGTGTGCCATCAAGTGGTTTAGCACGAAGGGGACGA
GAACCTTTGACGTCTGTAGACGAGAAGTCCAGAACCTACCGGTTATATTGCTTCGCGTGC
CTACAACTAATCAACTTAGTAGCAGACGTGGTGGTGATCGCAGCAGTCAACAGACTATGC
AGTCACAAACCGCTAGTGCTTGGCAAGAGTTTGTGGTGCTGGTTCTAATCAGCACAGTCT
GTTACTTCTTCTTCCTCGAGCAATTACTAATTCGGGATCTCAGCACGCAAGCTATCTACA
TAGCTGGACCGTTTTCATTAACGTTAGGCCTCTTAGCATCTGTTTTTGCCATTGTCCTAG
CTATCAGAGAATACATTTGGACATACGCAGCGCTTGAGTTTGCGCTTGTAGACATCTTGG
TTCATCTATTATATTCTACAGTGAGACTACCTCCGATCTATTCTATACTATTCGCACGGA
TTCTTGGTTTTGGGATAGCAGTGTGCCTAAACTCATTGTACCTTCATTATTTCGCCTGGC
GTATTCGTGTTGCAGAAAACTCAAATCCAGTGTGAATACACCTATATATCCTCTGCTGTG
TGCTTGTTGTATTCTAGAAAAAAAAAATGAAGAAGAAGGTGTTTCATCTGATCCAGCAGT
GACATGTAAAATGTATATATGTCCAACTCTTCTCCAAACGTGTTGCAAGTTGTAAAAGAG
AAATTGTTGTATCAGGTGAAAAGAGTTTTAATGTATGTGATCTGTTGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF92TF U 1
AF RR2GF92JQ C 126
BS 1 715 RR2GF92TF
BS 716 716 RR2GF92JQ
BS 717 731 RR2GF92TF
BS 732 951 RR2GF92JQ

RD RR2GF92TF 731 0 0
GCATTGTCCGATCCATTTCTTTTGACAACCGCAAAGCTCTTGAAACTAGCGCAGATCAAA
TCTCTCCAGTTCCAACTGAAGAAACAGAAGAAGAGATTCCAGAAGAAGAAGCGGTGTGCA
GGATCTGTCTCGACGTGTGCGAAGAAGGCAACACTCTGAAGATGGAGTGCAGCTGCAAAG
ACGATCTCAGACTAGTTCACGAAGCGTGTGCCATCAAGTGGTTTAGCACGAAGGGGACGA
GAACCTTTGACGTCTGTAGACGAGAAGTCCAGAACCTACCGGTTATATTGCTTCGCGTGC
CTACAACTAATCAACTTAGTAGCAGACGTGGTGGTGATCGCAGCAGTCAACAGACTATGC
AGTCACAAACCGCTAGTGCTTGGCAAGAGTTTGTGGTGCTGGTTCTAATCAGCACAGTCT
GTTACTTCTTCTTCCTCGAGCAATTACTAATTCGGGATCTCAGCACGCAAGCTATCTACA
TAGCTGGACCGTTTTCATTAACGTTAGGCCTCTTAGCATCTGTTTTTGCCATTGTCCTAG
CTATCAGAGAATACATTTGGACATACGCAGCGCTTGAGTTTGCGCTTGTAGACATCTTGG
TTCATCTATTATATTCTACAGTGAGACTACCTCCGATCTATTCTATACTATTCGCACGGA
TTCTTGGTTTTGGGATAGCAGTGTGCCTAAACTCATTGTACCTTCATTATTTCGC*TGGC
GTATTCGTGTT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2GF92JQ 826 0 0
TGTCTCGACGTGTGCGAAGAAGGCAACACTCTGAAGATGGAGTGCAGCTGCAAAGACGAT
CTCAGACTAGTTCACGAAGCGTGTGCCATCAAGTGGTTTAGCACGAAGGGGACGAGAACC
TTTGACGTCTGTAGACGAGAAGTCCAGAACCTACCGGTTATATTGCTTCGCGTGCCTACA
ACTAATCAACTTAGTAGCAGACGTGGTGGTGATCGCAGCAGTCAACAGACTATGCAGTCA
CAAACCGCTAGTGCTTGGCAAGAGTTTGTGGTGCTGGTTCTAATCAGCACAGTCTGTTAC
TTCTTCTTCCTCGAGCAATTACTAATTCGGGATCTCAGCACGCAAGCTATCTACATAGCT
GGACCGTTTTCATTAACGTTAGGCCTCTTAGCATCTGTTTTTGCCATTGTCCTAGCTATC
AGAGAATACATTTGGACATACGCAGCGCTTGAGTTTGCGCTTGTAGACATCTTGGTTCAT
CTATTATATTCTACAGTGAGACTACCTCCGATCTATTCTATACTATTCGCAGGGATTCTT
GGTTTTGGGATAGCAGTGTGCCTAAACTCATTGTACCTTCATTATTTCGCCTGGCGTATT
CGTGTTGCAGAAAACTCAAATCCAGTGTGAATACACCTATATATCCTCTGCTGTGTGCTT
GTTGTATTCTAGAAAAAAAAAATGAAGAAGAAGGTGTTTCATCTGATCCAGCAGTGACAT
GTAAAATGTATATATGTCCAACTCTTCTCCAAACGTGTTGCAAGTTGTAAAAGAGAAATT
GTTGTATCAGGTGAAAAGAGTTTTAATGTATGTGATCTGTTGCACC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL6424Contig1 934 2 2 U
GCACGGAGAGGTCAAAAGTTGACCCAGTAGTTGTACCTTTTGCCAAAAATCCAGCTGAGA
TACGTGAGGGTGCAAGTATCGTTGAAGTGGTGAAGACAGTGAGGCCACATGTTCTTCTTG
GTTTATCTGGAGTTGGTGGCATCTTCAATGAAGAAGTTCTCAAGGCAATGCGAGAATCTG
ATTCATGCAAGCCCGCCATTTTTGCTATGTCGAATCCCACCTTGAACGCCGAGTGCACTG
CTGCTGATGCATTTAAGCACGCCGGAGAAAACATAGTCTTTGGAAGCGGAAGCCCATTTG
AAAACGTTCAACTTGAGAATGGTAGTGTTGGGCATGTGAATCAGGCCAACAACATGTACC
TATTCCCCGGGATCGGGTTAGGGACTCTTCTGTCTGGTGCACGTATTGTAACTGATGGAA
TGCTGCTAGCTGCTGCTGAATGCCTCGCGTCCTACATGACTGACGAAGAAGTCCAAAAAG
GCATCCCTTACCCTTCGATCAACAACATCCGACACATAACAGCTGAGGTAGGGGCGGCTG
TTCTAAGAGCTGCAGTATCTGATGACATTGTAGAAGGACATGGGGATGTTGGTCCCAGAG
ATCTCGGTTACATGTCTAAGGAGGAGACAGTGGAGTACATCACAAGGAACATGTGGTTCC
CAATTTACAGCCCTCTCGTGCACGAGAAGTAGACAGCAGTGGCGCTTTGAACTCTCTCAT
CTCGCATCTCTCATAATAAAAGCCAAAAATACAAAAACAAGTTCCTCCTTGTCGTCTTAT
ATGCGATCAACAACATTGTTTCTTCTTTTCTAATTCTCAGTATGTGCTACATAAGCCATG
ATGCCTAATGTTTAAAAAGACAGAAAACAAGAACAGGGTTAGCTCTAGGTCACCTGTACC
TTGTCCTTTTTCCGATATTTTTTTCCAATGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AI47TF U 1
AF RR2AI47JQ C 123
BS 1 739 RR2AI47TF
BS 740 934 RR2AI47JQ

RD RR2AI47TF 739 0 0
GCACGGAGAGGTCAAAAGTTGACCCAGTAGTTGTACCTTTTGCCAAAAATCCAGCTGAGA
TACGTGAGGGTGCAAGTATCGTTGAAGTGGTGAAGACAGTGAGGCCACATGTTCTTCTTG
GTTTATCTGGAGTTGGTGGCATCTTCAATGAAGAAGTTCTCAAGGCAATGCGAGAATCTG
ATTCATGCAAGCCCGCCATTTTTGCTATGTCGAATCCCACCTTGAACGCCGAGTGCACTG
CTGCTGATGCATTTAAGCACGCCGGAGAAAACATAGTCTTTGGAAGCGGAAGCCCATTTG
AAAACGTTCAACTTGAGAATGGTAGTGTTGGGCATGTGAATCAGGCCAACAACATGTACC
TATTCCCCGGGATCGGGTTAGGGACTCTTCTGTCTGGTGCACGTATTGTAACTGATGGAA
TGCTGCTAGCTGCTGCTGAATGCCTCGCGTCCTACATGACTGACGAAGAAGTCCAAAAAG
GCATCCCTTACCCTTCGATCAACAACATCCGACACATAACAGCTGAGGTAGGGGCGGCTG
TTCTAAGAGCTGCAGTATCTGATGACATTGTAGAAGGACATGGGGATGTTGGTCCCAGAG
ATCTCGGTTACATGTCTAAGGAGGAGACAGTGGAGTACATCACAAGGAACATGTGGTTCC
CAATTTACAGCCCTCTCGTGCACGAGAAGTAGACAGCAGTGGCGCTTTGAACTCTCTCAT
CTCGCATCTCTCATAATAA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2AI47JQ 812 0 0
TTATCTGGAGTTGGTGGCATCTTCAATGAAGAAGTTCTCAAGGCAATGCGAGAATCTGAT
TCATGCAAGCCCGCCATTTTTGCTATGTCGAATCCCCCCTTGAACGCCGAGTGCACTGCT
GCTGATGCATTTAAGCACGCCGGAGAAAACATAGTCTTTGGAAGCGGAAGCCCATTTGAA
AACGTTCAACTTGAGAATGGTAGTGTTGGGCATGTGAATCAGGCCAACAACATGTACCTA
TTCCCCGGGATCGGGTTAGGGACTCTTCTGTCTGGTGCACGTATTGTAACTGATGGAATG
CTGCTAGCTGCTGCTGAATGCCTCGCGTCCTACATGACTGACGAAGAAGTCCAAAAAGGC
ATCCCTTACCCTTCGATCAACAACATCCGACACATAACAGCTGAGGTAGGGGCGGCTGTT
CTAAGAGCTGCAGTATCTGATGACATTGTAGAAGGACATGGGGATGTTGGTCCCAGAGAT
CTCGGTTACATGTCTAAGGAGGAGACAGTGGAGTACATCACAAGGAACATGTGGTTCCCA
ATTTACAGCCCTCTCGTGCACGAGAAGTAGACAGCAGTGGCGCTTTGAACTCTCTCATCT
CGCATCTCTCATAATAAAAGCCAAAAATACAAAAACAAGTTCCTCCTTGTCGTCTTATAT
GCGATCAACAACATTGTTTCTTCTTTTCTAATTCTCAGTATGTGCTACATAAGCCATGAT
GCCTAATGTTTAAAAAGACAGAAAACAAGAACAGGGTTAGCTCTAGGTCACCTGTACCTT
GTCCTTTTTCCGATATTTTTTTCCAATGTCTT

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

CO CL6425Contig1 1005 2 2 U
GAAGTGAGTGTGCCATACGTTCTTGATCTCATTATCCGTTCTTCCTGGCAATTTTGCTGC
GATTGCTGACCATCTAGAGACGATAGCAAAAGAAAACGTTAATATAAATTTTCAAAGACT
CGATCATTGTATATTCAACTTTTATATTATAGTGGACCAAGACATGTTTCTTGTGATGAT
TATTGTATGAACGTATAATGTATATACAGATAAATTTATATATGTAAAAGTAGAGGAGTG
TAGAGTAATACCTATTGCCAAGGATTTGGTGCAAACTAATGATAGCATCCTCCTCTTCTT
GGGTGAAATTGCCTCTTTTAATATCAGGTTTTAAATAGTTCATCCACCTAAGTCTACAGC
TTTTTCCACATCTCAAAAGACCTGTAATTAATAGTCACCATCTCTGTTAAGATAATTTAA
TTATAATTTGTTGATACAAGCTTGCTTAGGAAGCTGGACTACATATGTATATATAAGTAA
ATTTTAGTTTGTTCATACCAGCTTGCTTAGGGAGGGCGCGCCAGTTACTATGGCCATGTT
GGTGGATAAAAGAGACCAAAATTTGATCTTCTTCAGGCGTCCATGGGCCTCTGTTCAATC
CCATCTTCTCGCAGCATGGAGCTCTTCCCATCTTCCGATGATGTGTTTTGTTACTGATGA
AAAGTTTGTATTGTGGGTAAGATCGAGATAGATTGTGCTGATCAAATGCTTATGAGCTAT
ATGATCAAGTCTTGTTGATGAGTGTGAGAATAACTGGCTGGTTTTGAGTATTTATACTGA
ATTTGTTGAAAGCCATGTGGGAGAATTCAAAAGCATTTCGTCAGCTTCCAGGCAAGAGAA
AGAGAGGGAGATGTGTTTTGGTTATTGGCACCATAGTCAAAAAGTATGTTGTACATGCAT
ATATTATATTGCATGTGGGAACGAATAATATGTTTTTGTATAAGACTACAAAAGTAAAAT
AAAAATGTATGGGCATGTTATAACAAATGTGTGTAAAATCCCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G477TF U 1
AF RR2G477JQ C 421
BS 1 750 RR2G477TF
BS 751 1005 RR2G477JQ

RD RR2G477TF 750 0 0
GAAGTGAGTGTGCCATACGTTCTTGATCTCATTATCCGTTCTTCCTGGCAATTTTGCTGC
GATTGCTGACCATCTAGAGACGATAGCAAAAGAAAACGTTAATATAAATTTTCAAAGACT
CGATCATTGTATATTCAACTTTTATATTATAGTGGACCAAGACATGTTTCTTGTGATGAT
TATTGTATGAACGTATAATGTATATACAGATAAATTTATATATGTAAAAGTAGAGGAGTG
TAGAGTAATACCTATTGCCAAGGATTTGGTGCAAACTAATGATAGCATCCTCCTCTTCTT
GGGTGAAATTGCCTCTTTTAATATCAGGTTTTAAATAGTTCATCCACCTAAGTCTACAGC
TTTTTCCACATCTCAAAAGACCTGTAATTAATAGTCACCATCTCTGTTAAGATAATTTAA
TTATAATTTGTTGATACAAGCTTGCTTAGGAAGCTGGACTACATATGTATATATAAGTAA
ATTTTAGTTTGTTCATACCAGCTTGCTTAGGGAGGGCGCGCCAGTTACTATGGCCATGTT
GGTGGATAAAAGAGACCAAAATTTGATCTTCTTCAGGCGTCCATGGGCCTCTGTTCAATC
CCATCTTCTCGCAGCATGGAGCTCTTCCCATCTTCCGATGATGTGTTTTGTTACTGATGA
AAAGTTTGTATTGTGGGTAAGATCGAGATAGATTGTGCTGATCAAATGCTTATGAGCTAT
ATGATCAAGTCTTGTTGATGAGTGTGAGAA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2G477JQ 585 0 0
TTATAATTTGTTGATACAAGCTTGCTTAGGAAGCTGGACTACATATGTATATATAAGTAA
ATTTTAGTTTGTTCATACCAGCTTGCTTAGGGAGGGCGCGCCAGTTACTATGGCCATGTT
GGTGGATAAAAGAGACCAAAATTTGATCTTCTTCAGGCGTCCATGGGCCTCTGTTCAATC
CCATCTTCTCGCAGCATGGAGCTCTTCCCATCTTCCGATGATGTGTTTTGTTACTGATGA
AAAGTTTGTATTGTGGGTAAGATCGAGATAGATTGTGCTGATCAAATGCTTATGAGCTAT
ATGATCAAGTCTTGTTGATGAGTGTGAGAATAACTGGCTGGTTTTGAGTATTTATACTGA
ATTTGTTGAAAGCCATGTGGGAGAATTCAAAAGCATTTCGTCAGCTTCCAGGCAAGAGAA
AGAGAGGGAGATGTGTTTTGGTTATTGGCACCATAGTCAAAAAGTATGTTGTACATGCAT
ATATTATATTGCATGTGGGAACGAATAATATGTTTTTGTATAAGACTACAAAAGTAAAAT
AAAAATGTATGGGCATGTTATAACAAATGTGTGTAAAATCCCACC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL6426Contig1 624 2 1 U
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCGCTCTTAAGG
CTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCTCCTCAATGTTT
GCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATATGTAATTTCAG
TACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATTCTGTTTACTCT
TATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTTATGGGGTTCATT
GGAGCCATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAGTTAATAGTTCCATTA
TTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCCTATGAAAATAAATCA
ATTATATTTTATGTTAAAAAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2HB17JQ C 1
AF RR2HB17TF U 1
BS 1 624 RR2HB17TF

RD RR2HB17JQ 624 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCGCTCTTAAGG
CTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCTCCTCAATGTTT
GCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATATGTAATTTCAG
TACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATTCTGTTTACTCT
TATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTTATGGGGTTCATT
GGAGCCATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAGTTAATAGTTCCATTA
TTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCCTATGAAAATAAATCA
ATTATATTTTATGTTAAAAAAAAA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2HB17TF 624 0 0
GGACACTCAATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGTGTATTCTAAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCGCTCTTAAGG
CTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCTCCTCAATGTTT
GCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATATGTAATTTCAG
TACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATTCTGTTTACTCT
TATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTTATGGGGTTCATT
GGAGCCATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAGTTAATAGTTCCATTA
TTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCCTATGAAAATAAATCA
ATTATATTTTATGTTAAAAAAAAA

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL6427Contig1 743 2 6 U
GGGAAAGTATGCGAGATGTGCCATATCACGGTCAACAAAGTCGCCATCTTCAGTGAAAAT
GGTGTTATTTCCCCTGGAGGAGTGAGAATAGGTAGTCCGGCTATGACTTCGAGGGGTTGT
CTGGAACCAGATTTTGAGACAATGGCTGAGTTTCTGTATAGAGCTGCTCTGATAGCAAGT
GCTGCACAAAGGGAGCAGGGGAAGTCGCAGAGGGAACCACTCAAAAGCATCTATCACTGT
AAAGATATTGCAGATCTTAGGAACCAAGTCGAGGCTTTTGCTTCTCAGTTTGCAATGCCT
GCGTTTGAGATTTGAGTCAGCCTGCAAAGAATGTGAACAGCACAAACCTCCCTCATTTTT
TTTTGCCATGGTAATCTAAATCCAGCACCCATTTCTCTATTTTACAGTGTCAAGTTATTT
ACATTATGCTAAACTTAGATCAACATTTGTGGGAGAAAAAACAAAACTTCCCTGTCTTGC
TATGGTTATAAACTTGTAATTCTTCAAGGCTTGTGTACATAGTCATTGGAGGTGTGTTGG
GACTTAGTGTATCCCTTTATAATCTTTTTAAATGGTAATAATAATGATAGAAAAGGAAAA
AAACAAAACAAAGTCTGCAAAATTAGCTGTAATTTCAGGATGTTTATGTGTTGGGGAACA
CAAATAATGTCTGTAACCAGATGAAAACTTGCTTCTGGCCTCAATCATTGCTTTTTCCTT
ACGGAAAATCATTACATTTTGAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU68JQ C 1
AF RR2BU68TF U 1
BS 1 638 RR2BU68TF
BS 639 639 RR2BU68JQ
BS 640 677 RR2BU68TF
BS 678 678 RR2BU68JQ
BS 679 723 RR2BU68TF
BS 724 743 RR2BU68JQ

RD RR2BU68JQ 743 0 0
GGGAAAGTATGCGAGATGTGCCATATCACGGTCAACAAAGTCGCCATCTTCAGTGAAAAT
GGTGTTATTTCCCCTGGAGGAGTGAGAATAGGTAGTCCGGCTATGACTTCGAGGGGTTGT
CTGGAACCAGATTTTGAGACAATGGCTGAGTTTCTGTATAGAGCTGCTCTGATAGCAAGT
GCTGCACAAAGGGAGCAGGGGAAGTCGCAGAGGGAACCACTCAAAAGCATCTATCACTGT
AAAGATATTGCAGATCTTAGGAACCAAGTCGAGGCTTTTGCTTCTCAGTTTGCAATGCCT
GCGTTTGAGATTTGAGTCAGCCTGCAAAGAATGTGAACAGCACAAACCTCCCTCATTTTT
TTTTGCCATGGTAATCTAAATCCAGCACCCATTTCTCTATTTTACAGTGTCAAGTTATTT
ACATTATGCTAAACTTAGATCAACATTTGTGGGAGAAAAAACAAAACTTCCCTGTCTTGC
TATGGTTATAAACTTGTAATTCTTCAAGGCTTGTGTACATAGTCATTGGAGGTGTGTTGG
GACTTAGTGTATCCCTTTATAATCTTTTTAAATGGTAATAATAATGATAGAAAAGGAAAA
AAACAAAACAAAGTCTGCAAAATTAGCTGTAATTTCAGGATGTTTATGTGTTGGGGAACA
CAAATAATGTCTGTAACCAGATGAAAACTTGCTTCTGGCCTCAATCATTGCTTTTTCCTT
ACGGAAAATCATTACATTTTGAG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2BU68TF 726 0 0
GGGAAAGTATGCGAGATGTGCCATATCACGGTCAACAAAGTCGCCATCTTCAGTGAAAAT
GGTGTTATTTCCCCTGGAGGAGTGAGAATAGGTAGTCCGGCTATGACTTCGAGGGGTTGT
CTGGAACCAGATTTTGAGACAATGGCTGAGTTTCTGTATAGAGCTGCTCTGATAGCAAGT
GCTGCACAAAGGGAGCAGGGGAAGTCGCAGAGGGAACCACTCAAAAGCATCTATCACTGT
AAAGATATTGCAGATCTTAGGAACCAAGTCGAGGCTTTTGCTTCTCAGTTTGCAATGCCT
GCGTTTGAGATTTGAGTCAGCCTGCAAAGAATGTGAACAGCACAAACCTCCCTCATTTTT
TTTTGCCATGGTAATCTAAATCCAGCACCCATTTCTCTATTTTACAGTGTCAAGTTATTT
ACATTATGCTAAACTTAGATCAACATTTGTGGGAGAAAAAACAAAACTTCCCTGTCTTGC
TATGGTTATAAACTTGTAATTCTTCAAGGCTTGTGTACATAGTCATTGGAGGTGTGTTGG
GACTTAGTGTATCCCTTTATAATCTTTTTAAATGGTAATAATAATGATAGAAAAGGAAAA
AAACAAAACAAAGTCTGCAAAATTAGCTGTAATTTCAG*ATGTTTATGTGTTGGGGAACA
CAAATAATGTCTGTAAC*AGATGAAAACTTGCTTCTGGCCTCAATCATTGCTTTTTCCTT
ACG
AAA

QA 1 723 1 723
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6429Contig1 1029 2 2 U
TTTTTCCTTTGGGTTTAGTGGTGGGGGTTCTCTCTATAAAACATTTTCGCAACTATATAT
AAATAAAAATAAGAATAATCTGGTTTTATATAAAATAGCAAAAGAGATGCAACAGCACCT
GATGCAGATGCAGCCCATGATGGCTGGTTACTACCCCAGCAATGTCACCTCTGATCATAT
CCAGCAGTACTTGGACGAGAACAAGTCTTTGATTCTGAAGATAGTTGAGTCTCAAAACTC
TGGAAAGCTCAGCGAGTGTGCCGAGAATCAGGCAAGGCTTCAACGCAACCTGATGTACTT
GTCTGCAATAGCAGATTCTCAGCCTCGACCTCCAAACGTGCATGGCCAGTATGGATCTGC
TGGTGGTGGGTTGATTCAAGGAGAAGGAGCGTCACACTATTTGCAGCAGCAACAGGCGAC
TCAACAGCAGCAGATGACTCAGCAGTCTCTTATGGCAGCTCGTTCTTCAATGATGTATGG
TCAGCAGCAGCAACAGCCTTATGCAACGCTTCAGCATCAGCAGTTGCACCATAGCCAGCT
GGGGATGAGCTCTAGCAGCGGAGGAGGAAGCAGTGGTCTCCATATCCTTCAGGGAGAGGC
TGGTGGGTTTCATGAGTTTGGCCGTGGGAAGCCGGAGATGGGGAGTGGTGAAGGCAGAGG
AGGGAGCTCAGGGGATGGTGGAGAAACACTCTACTCGAAGTCATCAGATGATGGGAACTG
AAAGAGTGTGGCACAAGTAAGTCCAGTGAAGAAGCAGTTGTAGTAGTAGCAGTAAGTGTC
TGAAGTTTGTGTGTTTTGGTTTAGTTGCTTGTCGAAGAAGCGAAGAACTCGTATTTACGT
TTTAGTGTGTTTTTTTTTTTAATTTTCTATATGTTTGTTCCCTAAAAGTATGAACTCTTA
CGTGGTGTAGTGTGCCAAGCAGATCTGCTCGCTACAAGTTGTGTCGCAATCCTAGTATGT
TATTTCTTAGAACGATACATGAGTCTACTCTTTCGCTTGAGCAATAATTTCTAGAGATCC
TTGTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW20TF U 1
AF RR2GW20JQ C 250
BS 1 522 RR2GW20TF
BS 523 1029 RR2GW20JQ

RD RR2GW20TF 522 0 0
TTTTTCCTTTGGGTTTAGTGGTGGGGGTTCTCTCTATAAAACATTTTCGCAACTATATAT
AAATAAAAATAAGAATAATCTGGTTTTATATAAAATAGCAAAAGAGATGCAACAGCACCT
GATGCAGATGCAGCCCATGATGGCTGGTTACTACCCCAGCAATGTCACCTCTGATCATAT
CCAGCAGTACTTGGACGAGAACAAGTCTTTGATTCTGAAGATAGTTGAGTCTCAAAACTC
TGGAAAGCTCAGCGAGTGTGCCGAGAATCAGGCAAGGCTTCAACGCAACCTGATGTACTT
GTCTGCAATAGCAGATTCTCAGCCTCGACCTCCAAACGTGCATGGCCAGTATGGATCTGC
TGGTGGTGGGTTGATTCAAGGAGAAGGAGCGTCACACTATTTGCAGCAGCAACAGGCGAC
TCAACAGCAGCAGATGACTCAGCAGTCTCTTATGGCAGCTCGTTCTTCAATGATGTATGG
TCAGCAGCAGCAACAGCCTTATGCAACGCTTCAGCATCAGCA

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2GW20JQ 780 0 0
CAGCGAGTGTGCCGAGAATCAGGCAAGGCTTCAACGCAACCTGATGTACTTGTCTGCAAT
AGCAGATTCTCAGCCTCGACCTCCAAACGTGCATGGCCAGTATGGATCTGCTGGTGGTGG
GTTGATTCAAGGAGAAGGAGCGTCACACTATTTGCAGCAGCAACAGGCGACTCAACAGCA
GCAGATGACTCAGCAGTCTCTTATGGCAGCTCGTTCTTCAATGATGTATGGTCAGCAGCA
GCAACAGCCTTATGCAACGCTTCAGCATCAGCAGTTGCACCATAGCCAGCTGGGGATGAG
CTCTAGCAGCGGAGGAGGAAGCAGTGGTCTCCATATCCTTCAGGGAGAGGCTGGTGGGTT
TCATGAGTTTGGCCGTGGGAAGCCGGAGATGGGGAGTGGTGAAGGCAGAGGAGGGAGCTC
AGGGGATGGTGGAGAAACACTCTACTCGAAGTCATCAGATGATGGGAACTGAAAGAGTGT
GGCACAAGTAAGTCCAGTGAAGAAGCAGTTGTAGTAGTAGCAGTAAGTGTCTGAAGTTTG
TGTGTTTTGGTTTAGTTGCTTGTCGAAGAAGCGAAGAACTCGTATTTACGTTTTAGTGTG
TTTTTTTTTTTAATTTTCTATATGTTTGTTCCCTAAAAGTATGAACTCTTACGTGGTGTA
GTGTGCCAAGCAGATCTGCTCGCTACAAGTTGTGTCGCAATCCTAGTATGTTATTTCTTA
GAACGATACATGAGTCTACTCTTTCGCTTGAGCAATAATTTCTAGAGATCCTTGTTTGTC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL6430Contig1 847 2 2 U
GGAAGGAACTGTGGAATTGAAAAACGTAGCTGCATTCATTTCTTAACCAAAAGCGTCTTC
TGACTCTAACCAATCGTGTCATTACTGAGATCACAGGCACACACACACACACAGATAGAG
AGAAGGAATAAATTAATGGAGGTTCAGTTTCGGTAGCGAGAAACTATTGAAGACGATCAT
GAACTGTCGGAGAATGTTAAAGTCCGTGCAAGCCCTGTCGGCTCACAGCTTCCTCTTCTG
TTTCACCCTCGTTTTGGTCCTCAAACTCGACCACACCGTCTCTTACTCGTGGTGGGTTGT
GTGTCTACCTCTGTGTATACCTCGAGAGTGCACATGCTCGTTCGCCACCAGCTGTGAGCT
TGAAGATTGTTTTCCTCCCTCTATTGGCGTTTGAAGTAACTATACTTGTGGACAATGCCA
GAATGTGTCGAGCGCTGGTGCCTGGAGACGAAGAGCAAATAAATGATGAAGCAATATGGG
AAGCACTTCCTCATTTTTGGGTTGCAATTTCCATGGTGTTCTTTCTGGCTGCTACAGTCT
TCACCCTCCTAAAGCTCTCCGGTGATGTAGCTGCTCTTGGTTGGTGGGATTTATTCATTA
ACTTCGGAATTGCACAGTGCTTTGCTTTTCTTGTTTGTACAAAATGGTCCAATCCAGTTA
TCCATAGAAACTGCTCAGAAAAGTGTAAAAAATGTCCCTTCTGCCGTGTAACCATCGAAG
AGCGGCTCCCAGTATATGATGTTTAACGTCTTGACCATCTTCGATATATAAATGTATATA
TAATTGTAGAAGTAGAGAGTTTATGATGAGTCCAGCTCTTTATTAATTACAATCTCTACA
TTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2A079TF U 1
AF RR2A079JQ C 219
BS 1 846 RR2A079TF
BS 847 847 RR2A079JQ

RD RR2A079TF 846 0 0
GGAAGGAACTGTGGAATTGAAAAACGTAGCTGCATTCATTTCTTAACCAAAAGCGTCTTC
TGACTCTAACCAATCGTGTCATTACTGAGATCACAGGCACACACACACACACAGATAGAG
AGAAGGAATAAATTAATGGAGGTTCAGTTTCGGTAGCGAGAAACTATTGAAGACGATCAT
GAACTGTCGGAGAATGTTAAAGTCCGTGCAAGCCCTGTCGGCTCACAGCTTCCTCTTCTG
TTTCACCCTCGTTTTGGTCCTCAAACTCGACCACACCGTCTCTTACTCGTGGTGGGTTGT
GTGTCTACCTCTGTGTATACCTCGAGAGTGCACATGCTCGTTCGCCACCAGCTGTGAGCT
TGAAGATTGTTTTCCTCCCTCTATTGGCGTTTGAAGTAACTATACTTGTGGACAATGCCA
GAATGTGTCGAGCGCTGGTGCCTGGAGACGAAGAGCAAATAAATGATGAAGCAATATGGG
AAGCACTTCCTCATTTTTGGGTTGCAATTTCCATGGTGTTCTTTCTGGCTGCTACAGTCT
TCACCCTCCTAAAGCTCTCCGGTGATGTAGCTGCTCTTGGTTGGTGGGATTTATTCATTA
ACTTCGGAATTGCACAGTGCTTTGCTTTTCTTGTTTGTACAAAATGGTCCAATCCAGTTA
TCCATAGAAACTGCTCAGAAAAGTGTAAAAAATGTCCCTTCTGCCGTGTAACCATCGAAG
AGCGGCTCCCAGTATATGATGTTTAACGTCTTGACCATCTTCGATATATAAATGTATATA
TAATTGTAGAAGTAGAGAGTTTATGATGAGTCCAGCTCTTTATTAATTACAATCTCTACA
TTTCTT

QA 1 846 1 846
DS 

RD RR2A079JQ 629 0 0
CGGCTCACAGCTTCCTCTTCTGTTTCACCCTCGTTTTGGTCCTCAAACTCGACCACACCG
TCTCTTACTCGTGGTGGGTTGTGTGTCTACCTCTGTGTATACCTCGAGAGTGCACATGCT
CGTTCGCCACCAGCTGTGAGCTTGAAGATTGTTTTCCTCCCTCTATTGGCGTTTGAAGTA
ACTATACTTGTGGACAATGCCAGAATGTGTCGAGCGCTGGTGCCTGGAGACGAAGAGCAA
ATAAATGATGAAGCAATATGGGAAGCACTTCCTCATTTTTGGGTTGCAATTTCCATGGTG
TTCTTTCTGGCTGCTACAGTCTTCACCCTCCTAAAGCTCTCCGGTGATGTAGCTGCTCTT
GGTTGGTGGGATTTATTCATTAACTTCGGAATTGCACAGTGCTTTGCTTTTCTTGTTTGT
ACAAAATGGTCCAATCCAGTTATCCATAGAAACTGTTCAGAAAAGTGTAAAAAATGTCCC
TTCTGCCGTGTAACCATCGAAGAGCGGCTCCCAGTATATGATGTTTAACGTCTTGACCAT
CTTCGATATATAAATGTATATATAATTGTAGAAGTAGAGAGTTTATGATGAGTCCAGCTC
TTTATTAATTACAATCTCTACATTTCTTC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL6431Contig1 736 2 3 U
TTTTTTAAGAAACAACAAAACCATGAGAAACTCTTCACACTGTAGGAAACTTTCTACACT
TTCAGGGAGAGCGAAGTGCTTGTTCTTGTTCAAGAAACAAATTAAACTCAGAAAAATAAA
AAAGAAAACCACCAATGATGTCTTTGTTGAAACTACTTAACCAGCTTGTTCTACCTTCTT
ATGAGATAGCTTTCTCTTTGTCTCCATTATTGCTTCTTCTCTCTTCTTTGCTATCTCCTT
CATCTCTTCCTGATACTTAGCCTCTATCTCCTCCAGTTCCTGCCTTAACCTCTCTTCTTC
CTCCAAACTCACCGGTTCTGTTGCCTCCTCTGCTTCGTGATTGGAGCTCCCGTTTTCTCC
TCCTTTCAAGGCATCGACATACTGCTTCTCTTCATCTTCTGATCTTGGGCAATCCGAGGT
CCAAGAGTGCCTAACCGACTCACAAGCGTCGTGAAAAGCGGCCTCATCTTGACTCTGAGG
CTTATTAGCTTCGTTCTGATGGCTTCTTGAGCTCTGGTTCAGCTGCGAATGGATGAGATG
ATCGACCGTGACATCAGTTTTCCACGTGGGTATCATGTTGACAAGCAGTATATCGATCAG
TTCCGCTATAAACGTCACGTTCTGGTCAGTCAACTCGAGCTGCTCAACCATATCACTCGA
CACCTTGGAAGCAGTGTCACCTTCTTGATAGAAGAGGAAATGAATGTTCCTCACTCGTCC
ATTCTCATCGACTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH38JQ U 7
AF RR2DH38TF C 1
BS 1 6 RR2DH38TF
BS 7 635 RR2DH38JQ
BS 636 736 RR2DH38TF

RD RR2DH38JQ 629 0 0
AAGAAACAACAAAACCATGAGAAACTCTTCACACTGTAGGAAACTTTCTACACTTTCAGG
GAGAGCGAAGTGCTTGTTCTTGTTCAAGAAACAAATTAAACTCAGAAAAATAAAAAAGAA
AACCACCAATGATGTCTTTGTTGAAACTACTTAACCAGCTTGTTCTACCTTCTTATGAGA
TAGCTTTCTCTTTGTCTCCATTATTGCTTCTTCTCTCTTCTTTGCTATCTCCTTCATCTC
TTCCTGATACTTAGCCTCTATCTCCTCCAGTTCCTGCCTTAACCTCTCTTCTTCCTCCAA
ACTCACCGGTTCTGTTGCCTCCTCTGCTTCGTGATTGGAGCTCCCGTTTTCTCCTCCTTT
CAAGGCATCGACATACTGCTTCTCTTCATCTTCTGATCTTGGGCAATCCGAGGTCCAAGA
GTGCCTAACCGACTCACAAGCGTCGTGAAAAGCGGCCTCATCTTGACTCTGAGGCTTATT
AGCTTCGTTCTGATGGCTTCTTGAGCTCTGGTTCAGCTGCGAATGGATGAGATGATCGAC
CGTGACATCAGTTTTCCACGTGGGTATCATGTTGACAAGCAGTATATCGATCAGTTCCGC
TATAAACGTCACGTTCTGGTCAGTCAACT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2DH38TF 736 0 0
TTTTTTAAGAAACAACAAAACCATGAGAA*CTCTTCACACTGTAGGAAACTTTCTACACT
TTCAGGGAGAGCGAAGTGCTTGTTCTTGTTCAAGAAACAAATTAAACTCAGAAAAATAAA
AAAGAAAACCACCAATGATGTCTTTGTTGAAACTACTTAACCAGCTTGTTCTACCTTCTT
ATGAGATAGCTTTCTCTTTGTCTCCATTATTGCTTCTTCTCTCTTCTTTGCTATCTCCTT
CATCTCTTCCTGATACTTAGCCTCTATCTCCTCCAGTTCCTGCCTTAACCTCTCTTCTTC
CTCCAAACTCACCGGTTCTGTTGCCTCCTCTGCTTCGTGATTGGAGCTCCCGTTTTCTCC
TCCTTTCAAGGCATCGACATACTGCTTCTCTTCATCTTCTGATCTTGGGCAATCCGAGGT
CCAAGAGTGCCTAACCGACTCACAAGCGTCGTGAAAAGCGGCCTCATCTTGACTCTGAGG
CTTATTAGCTTCGTTCTGATGGCTTCTTGAGCTCTGGTTCAGCTGCGAATGGATGAGATG
ATCGACCGTGACATCAGTTTTCCACGTGGGTATCATGTTGACAAGCAGTATATCGATCAG
TTCCGCTATAAACGTCACGTTCTGGTCAGTCAACTCGAGCTGCTCAACCATATCACTCGA
CACCTTGGAAGCAGTGTCACCTTCTTGATAGAAGAGGAAATGAATGTTCCTCACTCGTCC
ATTCTCATCGACTATC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL6432Contig1 1125 2 2 U
GGATATATTGATGAGTCGGAATGTTGGAAACACATAGAGTCTTCATCCTCTGCTTTTTGC
TCAGTCTCTTCACATCTCATTCTTTTGTCTCCCCTCTTCAAACCTTCCAGAAGATTCCTC
TGCCACCAGGAGTCTCTGGTCCCGAAGCTTTTGCTTTCGATTCTCACGGTGTAGGACCGT
ATACCGGAGTCTCCGGCGGCAAGATCTTAAAATACCAAGGACCAAAGCTAGGCTTTACAG
AGTTCGCCTATATTTCACCAATAGCGAACAAGTCACTATGTGATAAAGCAGTAGGGACTT
TTCTTGGTAACATATGTGGTAGACCAGTCGGTTTAGCTTTCAATGAGATAACCGGAGATT
TGTACATAGCCGATGCGTTCTTGGGACTGTACTTGGTTTCACGCCGCGGTGGCCAAGCCA
AGCGCCTAGCCGACAGCGCAGTTGGCTTACCTTTTAAATTCCTTGACGGTTTAGATGTAG
ATCCAGTGACTGGTTCGGTTTACTTCACATCTTTCAGCACACGATTTGGCCCCAGTCAAC
TTGTCTTGGCGGTTGCTGTTAATGATGCAACGGGGAGGTTCTTTAGGTACGACCCAAAGA
CGAAAAGCGTAACCGTTTTGTTAAGCGGTCTCAGTGGCTCAGCCGGATGCGCCGTGAACT
CCGACGGAGAGTTTGTTCTGGTGGGAGAGTTCTTGAGGAATCGTATCTTAAGGTATTGGA
TCAAGGGTCCAAAAGTCAACACGTGGGACGTTTTCGTACCTTCGATCCCTGGTCCGGACA
ACATAAGGAGAACAGACGGTGGAGATTTCTGGATCGCTTCCAACTCCGTGAAGCTTATAG
TGGTCCCCACCGAGCCGTCAGCGGTGAAGGTCAACGCCGGCGGTGAGATTATCCAGCGTA
TGTCTCTCGGAGAATATTATGGAGATACGTTAGTAAGTGAAGTGAATGAATATAGAGGTG
TTGTTTATGTCGGAACACTCACGACCAACTTTGTTGGTAACATGTAACAAAAGATGTCAA
AAATAATAGTTAATGCCTCCATATCAAAATGATTTGTTTTAAAAATACATTTTTGTATTT
TAATATATTTTATTAAACAATACTGGTAAATTGTAAGTTTTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B479TF U 1
AF RR2B479JQ C 302
BS 1 781 RR2B479TF
BS 782 1125 RR2B479JQ

RD RR2B479TF 781 0 0
GGATATATTGATGAGTCGGAATGTTGGAAACACATAGAGTCTTCATCCTCTGCTTTTTGC
TCAGTCTCTTCACATCTCATTCTTTTGTCTCCCCTCTTCAAACCTTCCAGAAGATTCCTC
TGCCACCAGGAGTCTCTGGTCCCGAAGCTTTTGCTTTCGATTCTCACGGTGTAGGACCGT
ATACCGGAGTCTCCGGCGGCAAGATCTTAAAATACCAAGGACCAAAGCTAGGCTTTACAG
AGTTCGCCTATATTTCACCAATAGCGAACAAGTCACTATGTGATAAAGCAGTAGGGACTT
TTCTTGGTAACATATGTGGTAGACCAGTCGGTTTAGCTTTCAATGAGATAACCGGAGATT
TGTACATAGCCGATGCGTTCTTGGGACTGTACTTGGTTTCACGCCGCGGTGGCCAAGCCA
AGCGCCTAGCCGACAGCGCAGTTGGCTTACCTTTTAAATTCCTTGACGGTTTAGATGTAG
ATCCAGTGACTGGTTCGGTTTACTTCACATCTTTCAGCACACGATTTGGCCCCAGTCAAC
TTGTCTTGGCGGTTGCTGTTAATGATGCAACGGGGAGGTTCTTTAGGTACGACCCAAAGA
CGAAAAGCGTAACCGTTTTGTTAAGCGGTCTCAGTGGCTCAGCCGGATGCGCCGTGAACT
CCGACGGAGAGTTTGTTCTGGTGGGAGAGTTCTTGAGGAATCGTATCTTAAGGTATTGGA
TCAAGGGTCCAAAAGTCAACACGTGGGACGTTTTCGTACCTTCGATCCCTGGTCCGGACA
A

QA 1 781 1 781
DS 

RD RR2B479JQ 824 0 0
TCTTGGTAACATATGTGGTAGACCAGTCGGTTTAGCTTTCAATGAGATAACCGGAGATTT
GTACATAGCCGATGCGTTCTTGGGACTGTACTTGGTTTCACGCCGCGGTGGCCAAGCCAA
GCGCCTAGCCGACAGCGCAGTTGGCTTACCTTTTAAATTCCTTGACGGTTTAGATGTAGA
TCCAGTGACTGGTTCGGTTTACTTCACATCTTTCAGCACACGATTTGGCCCCAGTCAACT
TGTCTTGGCGGTTGCTGTTAATGATGCAACGGGGAGGTTCTTTAGGTACGACCCAAAGAC
GAAAAGCGTAACCGTTTTGTTAAGCGGTCTCAGTGGCTCAGCCGGATGCGCCGTGAACTC
CGACGGAGAGTTTGTTCTGGTGGGAGAGTTCTTGAGGAATCGTATCTTAAGGTATTGGAT
CAAGGGTCCAAAAGTCAACACGTGGGACGTTTTCGTACCTTCGATCCCTGGTCCGGACAA
CATAAGGAGAACAGACGGTGGAGATTTCTGGATCGCTTCCAACTCCGTGAAGCTTATAGT
GGTCCCCACCGAGCCGTCAGCGGTGAAGGTCAACGCCGGCGGTGAGATTATCCAGCGTAT
GTCTCTCGGAGAATATTATGGAGATACGTTAGTAAGTGAAGTGAATGAATATAGAGGTGT
TGTTTATGTCGGAACACTCACGACCAACTTTGTTGGTAACATGTAACAAAAGATGTCAAA
AATAATAGTTAATGCCTCCATATCAAAATGATTTGTTTTAAAAATACATTTTTGTATTTT
AATATATTTTATTAAACAATACTGGTAAATTGTAAGTTTTGAGC

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

CO CL6433Contig1 675 2 1 U
GGCTCTCTCTCACCTCTCAAATCCCTCACTTTCGTCGACCCCCTCGGTACTCATTCTTCA
CCGATTAAGGGTTTCCACAGTCGCCATGTATCGCACAGCCGCTTCACGAGCCAAGGCTCT
AAAGGGATCTCTTAGCAGAAGTTTGACACCAGCGCGTTACGCTAGCTCCAGTGCCGTTGC
AACGACCTCCTCTTCTTCAGGTTTCTTCGGATGGTTGACTGGTGGATCCTCTGGTTCGAT
TGCTTCATTGGATATGCCACTACAGGGCGTATCTCTACCTCCGCCACTTGCTGACCACGT
CGAGCCTAGCAAACTCAAGATCACTACTCTTCCTAATGGTCTCAAAATCGCCTCAGAGAT
GTCTCCCAATCCAGCAGCTTCTATTGGTTTGTATGTTGATTGTGGTTCTATCTACGAGGC
TCCTTATTTCCATGGAGCAACTCATTTGCTTGAGAGGATGGCTTTCAAGAGCACGACTAA
CAGAAGCCATCTACGTCTTGTGAGGGAGATTGAAGCTATTGGAGGCAACACCTCCGCGTC
TGCGTCCCGGGAGCAAATGAGTTACACTGTTGATGCTCTCAAAACCTATCTCCCTGCTAT
GGTTGAAGTTCTTATAGACAGTGTGAGGAACCCTGCTTTCTTGGATTGGGAAGTTAATGA
AGAGCTACGTAAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F522TF U 10
AF RR2BF61TF U 1
BS 1 675 RR2BF61TF

RD RR2F522TF 614 0 0
GG
ACCTCTCAAATCCCTCACTTTCGTCGACCCCCTCGGTACTCATTCTTCACCGATTAAGGG
TTTCCACAGTCGCCATGTATCGCACAGCCGCTTCACGAGCCAAGGCTCTAAAGGGATCTC
TTAGCAGAAGTTTGACACCAGCGCGTTACGCTAGCTCCAGTGCCGTTGCAACGACCTCCT
CTTCTTCAGGTTTCTTCGGATGGTTGACTGGTGGATCCTCTGGTTCGATTGCTTCATTGG
ATATGCCACTACAGGGCGTATCTCTACCTCCGCCACTTGCTGACCACGTCGAGCCTAGCA
AACTCAAGATCACTACTCTTCCTAATGGTCTCAAA*TCTCCTCAGAGATGTCTCCCAATC
CAGCAGCTTCTATTGGTTTGTATGTTGATTGTGGTTCTATCTACGAGGCTCCTTATTTCC
ATGGAGCAACTCATTTGCTTGAGAGGATGGCTTTCAAGAGCACGACTAACAGAAGCCATC
TACGTCTTGTGAGGGAGATTGAAGCTATTGGAGGCAACACCTCCGCGTCTGCGTCCCGGG
AGCAAATGAGTTACACTGTTGATGCTCTCAAAACCTATCTCCCTGCTATGGTTGAAGTTC
TTATAGACAGTG

QA 3 614 3 614
DS 

RD RR2BF61TF 675 0 0
GGCTCTCTCTCACCTCTCAAATCCCTCACTTTCGTCGACCCCCTCGGTACTCATTCTTCA
CCGATTAAGGGTTTCCACAGTCGCCATGTATCGCACAGCCGCTTCACGAGCCAAGGCTCT
AAAGGGATCTCTTAGCAGAAGTTTGACACCAGCGCGTTACGCTAGCTCCAGTGCCGTTGC
AACGACCTCCTCTTCTTCAGGTTTCTTCGGATGGTTGACTGGTGGATCCTCTGGTTCGAT
TGCTTCATTGGATATGCCACTACAGGGCGTATCTCTACCTCCGCCACTTGCTGACCACGT
CGAGCCTAGCAAACTCAAGATCACTACTCTTCCTAATGGTCTCAAAATCGCCTCAGAGAT
GTCTCCCAATCCAGCAGCTTCTATTGGTTTGTATGTTGATTGTGGTTCTATCTACGAGGC
TCCTTATTTCCATGGAGCAACTCATTTGCTTGAGAGGATGGCTTTCAAGAGCACGACTAA
CAGAAGCCATCTACGTCTTGTGAGGGAGATTGAAGCTATTGGAGGCAACACCTCCGCGTC
TGCGTCCCGGGAGCAAATGAGTTACACTGTTGATGCTCTCAAAACCTATCTCCCTGCTAT
GGTTGAAGTTCTTATAGACAGTGTGAGGAACCCTGCTTTCTTGGATTGGGAAGTTAATGA
AGAGCTACGTAAGAT

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL6434Contig1 851 2 2 U
GGTTCCAGTTAACAAATTACAAATCGAGAGACCTCTCTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCTCTGTGCTTCCCTTCCGCCTGCCAATTCGTCTCAAGCTATAGCAGAGCTTGTC
TTGGAGGAGCCTGCGTGCTAGATTTTTTTCTCCTTGTCTCGATTCTGGATCTTGAGAGTT
AGAAGCAGCTGATTCCTGGAACTAACCAACCAACCATGATGTCCTTCGAAATGAATGACC
GCAAAAAAATCGGGTTAGGGCTGACTGCATTTGGAGTCTTTTTCTCCTTTTTGGATGTTG
TCTTTGTCTTTGATAAGGGTTTACTTGCCATGGGAAATATTCTTTTCATCTCTGGGGTTA
GTCTTACCATTGGCCTCAAGTCTACCATGCAGTTTTTCACCAAGCGTCAAAACTATAAGG
GAACAATCTCTTTTGGTGCTGGCTTCTTCTTTGTTGTCATTGGATGGCCTGTCCTTGGAA
TGATGTTGGAGACCTATGGCTTTTTTTGTACTCTTTAGCGGCTTCTGGCCAACCTTGGCA
GTTTTCGCACAAAAGATACCCTTTCTCGGTTGGATCATTCAGCAACCTTATATAAGATCG
TTCTTTGACAAGTACCGGGGCAAGCGTGTGCCCGTCTAGTCACCGCCCAAGTTGAGAGAA
AATTCACTGAGCTAGATGCAGCAGAGCAAACGATTAAAATATTTTGGAAGGAGAGGTTGG
TATACTTGTCCACAACTTTGGTATAAACGTAAACCCGTAGGAGAAATAAAATAGCGTGGA
GCAACTTGAAGATTTGTACTTTTAAAAGACTAACTCAGTGACTTAATGATGGATTATAAT
CGTTTTGGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO67TF U 1
AF RR2EO67JQ C 225
BS 1 622 RR2EO67TF
BS 623 851 RR2EO67JQ

RD RR2EO67TF 622 0 0
GGTTCCAGTTAACAAATTACAAATCGAGAGACCTCTCTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCTCTGTGCTTCCCTTCCGCCTGCCAATTCGTCTCAAGCTATAGCAGAGCTTGTC
TTGGAGGAGCCTGCGTGCTAGATTTTTTTCTCCTTGTCTCGATTCTGGATCTTGAGAGTT
AGAAGCAGCTGATTCCTGGAACTAACCAACCAACCATGATGTCCTTCGAAATGAATGACC
GCAAAAAAATCGGGTTAGGGCTGACTGCATTTGGAGTCTTTTTCTCCTTTTTGGATGTTG
TCTTTGTCTTTGATAAGGGTTTACTTGCCATGGGAAATATTCTTTTCATCTCTGGGGTTA
GTCTTACCATTGGCCTCAAGTCTACCATGCAGTTTTTCACCAAGCGTCAAAACTATAAGG
GAACAATCTCTTTTGGTGCTGGCTTCTTCTTTGTTGTCATTGGATGGCCTGTCCTTGGAA
TGATGTTGGAGACCTATGGCTTTTTTTGTACTCTTTAGCGGCTTCTGGCCAACCTTGGCA
GTTTTCGCACAAAAGATACCCTTTCTCGGTTGGATCATTCAGCAACCTTATATAAGATCG
TTCTTTGACAAGTACCGGGGCA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2EO67JQ 627 0 0
TTCGAAATGAATGACCGCAAAAAAATCGGGTTAGGGCTGACTGCATTTGGAGTCTTTTTC
TCCTTTTTGGATGTTGTCTTTGTCTTTGATAAGGGTTTACTTGCCATGGGAAATATTCTT
TTCATCTCTGGGGTTAGTCTTACCATTGGCCTCAAGTCTACCATGCAGTTTTTCACCAAG
CGTCAAAACTATAAGGGAACAATCTCTTTTGGTGCTGGCTTCTTCTTTGTTGTCATTGGA
TGGCCTGTCCTTGGAATGATGTTGGAGACCTATGGCTTTTTTTGTACTCTTTAGCGGCTT
CTGGCCAACCTTGGCAGTTTTCGCACAAAAGATACCCTTTCTCGGTTGGATCATTCAGCA
ACCTTATATAAGATCGTTCTTTGACAAGTACCGGGGCAAGCGTGTGCCCGTCTAGTCACC
GCCCAAGTTGAGAGAAAATTCACTGAGCTAGATGCAGCAGAGCAAACGATTAAAATATTT
TGGAAGGAGAGGTTGGTATACTTGTCCACAACTTTGGTATAAACGTAAACCCGTAGGAGA
AATAAAATAGCGTGGAGCAACTTGAAGATTTGTACTTTTAAAAGACTAACTCAGTGACTT
AATGATGGATTATAATCGTTTTGGTAC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL6435Contig1 681 2 3 U
GACAGTCAGCTCCGCTGTTGCCTCTACAACTCTCTCTCTATCTCCATGGCTCTCGCGTTT
CAGTTCTGCCGGTTATGCATCCGCCCGGATACCTTCACTCCCGGATCCGGATCCATCCGC
CGCCGGAAACCTTCATCGCTCCGTTGTTCATCTGCAAACGAGGAAACTCCTTCGCCATCG
GTGGTGATGGACTCGGACTTCGACGCCAAGACGTTCCGTAGGAACTTAACAAGAAGCGAT
AATTACAATCGCAAAGGGTTTGGTCACAAGGAGGAGACTCTCAAGCTCATGAATCGCGAG
TACACCAGTGATGTGTTGGAGACGCTGAAAGCAAATGGGTATACGTACTCTTGGGGAGAT
GTTACCGTGAAGCTAGCTAAAGCTTATGGGTTTTGCTGGGGTGTTGAGCGTGCTGTTCAG
ATTGCTTATGAAGCAAGAAGGCAGTTTCCAGAGGAGAAGCTTTGGATTACTAACGAGATT
ATTCATAACCCCACTGTCAATAAGAGGTTAGAAGAAATGGATGTTCAGATTATTCCCGTT
GAGGATTCGAAGAAGCAGTTTGATGTAGTGGATAAAGATGACGTGGTGATCCTTCCTGCC
TTTGGAGCTGGTGTTGATGAGATGTATGTTCTAAATGATAAGAAAGTTCAAATCGTCGAC
ACCACTTGTCCTTGGGTCACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK67TF U 6
AF RR2AF56TF U 1
BS 1 480 RR2AF56TF
BS 481 481 RR2BK67TF
BS 482 681 RR2AF56TF

RD RR2BK67TF 638 0 0
GG
AGCTCCGCTGTTGCCTCTACAACTCTCTCTCTATCTCCATGGCTCTCGCGTTTCAGTTCT
GCCGGTTATGCATCCGCCCGGATACTTTCACTCCCGGATCCGGATCCATCCGCCGCCGGA
AACCTTCATCGCTCCGTTGTTCATCTGCAAACGAGGAAACTCCTTCGCCATCGGTGGTGA
TGGACTCGGACTTCGACGCCAAGACGTTCCGTAGGAACTTAACAAGAAGCGATAATTACA
ATCGCAAAGGGTTTGGTCACAAGGAGGAGACTCTCAAGCTCATGAATCGCGAGTACACCA
GTGATGTGTTGGAGACGCTGAAAGCAAATGGGTATACGTACTCTTGGGGAGATGTTACCG
TGAAGCTAGCTAAAGCTTATGGGTTTTGCTGGGGTGTTGAGCGTGCTGTTCAGATTGCTT
ATGAAGCAAGAAGGCAGTTTCCAGAGGAGAAGCTTTGGATTACTAACGAGATTATTCATA
ACCCCACTGTCAATAAGAGGTTAGGAGAAATGGATGTTCAGATTATTCCCGTTGAGGATT
CGAAGAAGCAGTTTGATGTAGTGGATAAAGATGACGTGGTGATCCTTCCTGCCTTTGGAG
CTGGTGTTGATGAGATGTATGTTCTAAATGATAAGA

QA 3 638 3 638
DS 

RD RR2AF56TF 681 0 0
GACAGTCAGCTCCGCTGTTGCCTCTACAACTCTCTCTCTATCTCCATGGCTCTCGCGTTT
CAGTTCTGCCGGTTATGCATCCGCCCGGATACCTTCACTCCCGGATCCGGATCCATCCGC
CGCCGGAAACCTTCATCGCTCCGTTGTTCATCTGCAAACGAGGAAACTCCTTCGCCATCG
GTGGTGATGGACTCGGACTTCGACGCCAAGACGTTCCGTAGGAACTTAACAAGAAGCGAT
AATTACAATCGCAAAGGGTTTGGTCACAAGGAGGAGACTCTCAAGCTCATGAATCGCGAG
TACACCAGTGATGTGTTGGAGACGCTGAAAGCAAATGGGTATACGTACTCTTGGGGAGAT
GTTACCGTGAAGCTAGCTAAAGCTTATGGGTTTTGCTGGGGTGTTGAGCGTGCTGTTCAG
ATTGCTTATGAAGCAAGAAGGCAGTTTCCAGAGGAGAAGCTTTGGATTACTAACGAGATT
TTTCATAACCCCACTGTCAATAAGAGGTTAGAAGAAATGGATGTTCAGATTATTCCCGTT
GAGGATTCGAAGAAGCAGTTTGATGTAGTGGATAAAGATGACGTGGTGATCCTTCCTGCC
TTTGGAGCTGGTGTTGATGAGATGTATGTTCTAAATGATAAGAAAGTTCAAATCGTCGAC
ACCACTTGTCCTTGGGTCACA

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL6436Contig1 216 2 1 U
GGGTCAAGTGAAGAAGCGCATACGGTGGATGCCTTGGCAGTCAGAGGCGATGAAAGACGT
GGTAGCCTGCGAAAAGCTTCGGGAGTCGGCAAACAGACTCTGATCCGGAGATGTCTGAAT
GGGGGAACCCAGCCATCATAAGATGGTTATCTTGTACTGAATACATAGGTGCAAGAGGCG
AACCAGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCTGAGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D225JQ C 1
AF RR2D225TF U 1
BS 1 216 RR2D225TF

RD RR2D225JQ 216 0 0
GGGTCAAGTGAAGAAGCGCATACGGTGGATGCCTTGGCAGTCAGAGGCGATGAAAGACGT
GGTAGCCTGCGAAAAGCTTCGGGAGTCGGCAAACAGACTCTGATCCGGAGATGTCTGAAT
GGGGGAACCCAGCCATCATAAGATGGTTATCTTGTACTGAATACATAGGTGCAAGAGGCG
AACCAGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCTGAGCT

QA 1 216 1 216
DS 

RD RR2D225TF 216 0 0
GGGTCAAGTGAAGAAGCGCATACGGTGGATGCCTTGGCAGTCAGAGGCGATGAAAGACGT
GGTAGCCTGCGAAAAGCTTCGGGAGTCGGCAAACAGACTCTGATCCGGAGATGTCTGAAT
GGGGGAACCCAGCCATCATAAGATGGTTATCTTGTACTGAATACATAGGTGCAAGAGGCG
AACCAGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCTGAGCT

QA 1 216 1 216
DS 



AS 1 2

CO CL6437Contig1 725 2 1 U
GGCTCTCACTCACTCACCAATAAAACCTTCACTAAGATTTTCTCTCTCTACCTCCTTCCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTGGCGATGCAGAGGCTTTCAATTGACTCATCAGTT
TCGAAGCTTCATAGCTGCGGAGGACGGAAGGACGACACATATGATCTCGATGAGTCACTC
TCCTCTCCTCCTCCTTCTTCATCCGTTGCAGATTACGACGATCACGACCTCAAGGACCTT
AAACCCAGACGGTTATCGCTGCAATCGTCGACGCATCAGAATGCAGAGAAGTTCGTTCAC
TTCATCCCCGTCCTCACTCTTATCTGTTTCATCATCCTCTACCTCTCTTCTCACGCTCCG
TCGCAATCAGATTTAGCTCAGTTTAGCGGATTCATGCGTCATTCAAAGCATCTAGAATCC
GAAGAAATCTCGAGGTTGATGATCAGTGCCGACGCTCTGGCTATCCGTAGTAGCATAAGG
AACTTAAAAGAGACGGAAAGCTCCGCGTCGGAATCGCTTCCCCGTCGCCGTACTTCTCAC
CGGAAAATAGCCGACTTCTAGCCTTTTTTTTTTTTAATTCATCTCCTCTAGAATAATTTA
TCTTCGTGACTTGCATGTTGATTTGTTCGTTCAAACTCAAATCGCGTTATTCTTCTGTGA
ACTATAAATTCGAAATTAGCATCGCCGGTTTACAAATAAAACCGGCCGGCGATGGAATAA
CGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2AC78TF U 1
AF RR2AC78JQ C 107
BS 1 725 RR2AC78TF

RD RR2AC78TF 725 0 0
GGCTCTCACTCACTCACCAATAAAACCTTCACTAAGATTTTCTCTCTCTACCTCCTTCCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTGGCGATGCAGAGGCTTTCAATTGACTCATCAGTT
TCGAAGCTTCATAGCTGCGGAGGACGGAAGGACGACACATATGATCTCGATGAGTCACTC
TCCTCTCCTCCTCCTTCTTCATCCGTTGCAGATTACGACGATCACGACCTCAAGGACCTT
AAACCCAGACGGTTATCGCTGCAATCGTCGACGCATCAGAATGCAGAGAAGTTCGTTCAC
TTCATCCCCGTCCTCACTCTTATCTGTTTCATCATCCTCTACCTCTCTTCTCACGCTCCG
TCGCAATCAGATTTAGCTCAGTTTAGCGGATTCATGCGTCATTCAAAGCATCTAGAATCC
GAAGAAATCTCGAGGTTGATGATCAGTGCCGACGCTCTGGCTATCCGTAGTAGCATAAGG
AACTTAAAAGAGACGGAAAGCTCCGCGTCGGAATCGCTTCCCCGTCGCCGTACTTCTCAC
CGGAAAATAGCCGACTTCTAGCCTTTTTTTTTTTTAATTCATCTCCTCTAGAATAATTTA
TCTTCGTGACTTGCATGTTGATTTGTTCGTTCAAACTCAAATCGCGTTATTCTTCTGTGA
ACTATAAATTCGAAATTAGCATCGCCGGTTTACAAATAAAACCGGCCGGCGATGGAATAA
CGGCC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2AC78JQ 619 0 0
TTGACTCATCAGTTTCGAAGCTTCATAGCTGCGGAGGACGGAAGGACGACACATATGATC
TCGATGAGTCACTCTCCTCTCCTCCTCCTTCTTCATCCGTTGCAGATTACGACGATCACG
ACCTCAAGGACCTTAAACCCAGACGGTTATCGCTGCAATCGTCGACGCATCAGAATGCAG
AGAAGTTCGTTCACTTCATCCCCGTCCTCACTCTTATCTGTTTCATCATCCTCTACCTCT
CTTCTCACGCTCCGTCGCAATCAGATTTAGCTCAGTTTAGCGGATTCATGCGTCATTCAA
AGCATCTAGAATCCGAAGAAATCTCGAGGTTGATGATCAGTGCCGACGCTCTGGCTATCC
GTAGTAGCATAAGGAACTTAAAAGAGACGGAAAGCTCCGCGTCGGAATCGCTTCCCCGTC
GCCGTACTTCTCACCGGAAAATAGCCGACTTCTAGCCTTTTTTTTTTTTAATTCATCTCC
TCTAGAATAATTTATCTTCGTGACTTGCATGTTGATTTGTTCGTTCAAACTCAAATCGCG
TTATTCTTCTGTGAACTATAAATTCGAAATTAGCATCGCCGGTTTACAAATAAAACCGGC
CGGCGATGGAATAACGGCC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL6438Contig1 795 2 4 U
GGGAAACCAAATCCAAGAGTCCCCTCCCTCTCTACTCAAATCTTTCTCTCTCCAGTCTCC
ACTGTGCGATGGAAAGAGACGAAGACTGGGAACTATGTAACGAAGACGGTTTCGTTTACA
AGCGAATCCGTCGTATCTCTGACCCTGGAGAAACAACATCCAATCCGGTGGATCCGGGGT
TAGATCCCGCCGCGGAGGAGAGTAATCGAAGGAAGCGGAAGAAGAGAACGCTGGTGAAGC
TCAGAAGCAAGTACCAGAGAGAGATCCAGCAGTGGGAGATTCTGTCGAACAGCTTCAATG
CTATGCGAGAGAGAGCTGCTGGTGGATTTCAAACGACGTCGCAGCAGGAGGGAGATGAAG
ATAGGTTAAACGCGAACGAAGCGACGTCGTTTCAAGGAGAAGATGGTTCTTCCTCGGCGT
CTGTTTTGCTCGACGAACTTCTCTCTATGGCGGAAGCACGAGAAGTGATAATCAACGATG
TCTCAAACCTGTGTGAAGTTGTAGAAAACATAATTAGAGTGGAAGAAGAAGAAACGAAGC
AGTTATTATTTGATCTTGATGTTTGGAGTTCACCTAGGAATCTAATGGCCTCGCTCTGTG
CTGATTAATCACTAGCTTCCTCTACTCTGGTCGGTCCATCATTCTCTGTACATTCTTTTT
CTTGTGTTGGAACTGTACCAACGAGATGTGAATCTGCAGCATTAACTTAGAAATTATCAC
ACTGAGTTTAGTGTTATATGTATGTGTAACTATGTAACTATGTTTCAAACACAAGATGAA
GCAGGGAAAGTTATT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC71TF U 1
AF RR2CC71JQ C 2
BS 1 671 RR2CC71TF
BS 672 672 RR2CC71JQ
BS 673 690 RR2CC71TF
BS 691 795 RR2CC71JQ

RD RR2CC71TF 690 0 0
GGGAAACCAAATCCAAGAGTCCCCTCCCTCTCTACTCAAATCTTTCTCTCTCCAGTCTCC
ACTGTGCGATGGAAAGAGACGAAGACTGGGAACTATGTAACGAAGACGGTTTCGTTTACA
AGCGAATCCGTCGTATCTCTGACCCTGGAGAAACAACATCCAATCCGGTGGATCCGGGGT
TAGATCCCGCCGCGGAGGAGAGTAATCGAAGGAAGCGGAAGAAGAGAACGCTGGTGAAGC
TCAGAAGCAAGTACCAGAGAGAGATCCAGCAGTGGGAGATTCTGTCGAACAGCTTCAATG
CTATGCGAGAGAGAGCTGCTGGTGGATTTCAAACGACGTCGCAGCAGGAGGGAGATGAAG
ATAGGTTAAACGCGAACGAAGCGACGTCGTTTCAAGGAGAAGATGGTTCTTCCTCGGCGT
CTGTTTTGCTCGACGAACTTCTCTCTATGGCGGAAGCACGAGAAGTGATAATCAACGATG
TCTCAAACCTGTGTGAAGTTGTAGAAAACATAATTAGAGTGGAAGAAGAAGAAACGAAGC
AGTTATTATTTGATCTTGATGTTTGGAGTTCACCTAGGAATCTAATGGCCTCGCTCTGTG
CTGATTAATCACTAGCTTCCTCTACTCTGGTCGGTCCATCATTCTCTGTACATTCTTTTT
CTTGTGTTGGA*CTGTACCAACGAGATGTG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2CC71JQ 794 0 0
GGAAACCAAATCCAAGAGTCCCCTCCCTCTCTACTCAAATCTTTCTCTCTCCAGTCTCCA
CTGTGCGATGGAAAGAGACGAAGACTGGGAACTATGTAACGAAGACGGTTTCGTTTACAA
GCGAATCCGTCGTATCTCTGACCCTGGAGAAACAACATCCAATCCGGTGGATCCGGGGTT
AGATCCCGCCGCGGAGGAGAGTAATCGAAGGAAGCGGAAGAAGAGAACGCTGGTGAAGCT
CAGAAGCAAGTACCAGAGAGAGATCCAGCAGTGGGAGATTCTGTCGAACAGCTTCAATGC
TATGCGAGAGAGAGCTGCTGGTGGATTTCAAACGACGTCGCAGCAGGAGGGAGATGAAGA
TAGGTTAAACGCGAACGAAGCGACGTCGTTTCAAGGAGAAGATGGTTCTTCCTCGGCGTC
TGTTTTGCTCGACGAACTTCTCTCTATGGCGGAAGCACGAGAAGTGATAATCAACGATGT
CTCAAACCTGTGTGAAGTTGTAGAAAACATAATTAGAGTGGAAGAAGAAGAAACGAAGCA
GTTATTATTTGATCTTGATGTTTGGAGTTCACCTAGGAATCTAATGGCCTCGCTCTGTGC
TGATTAATCACTAGCTTCCTCTACTCTGGTCGGTCCATCATTCTCTGTACATTCTTTT*C
TTGTGTTGGAACTGTACCAACGAGATGTGAATCTGCAGCATTAACTTAGAAATTATCACA
CTGAGTTTAGTGTTATATGTATGTGTAACTATGTAACTATGTTTCAAACACAAGATGAAG
CAGGGAAAGTTATT

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL6439Contig1 590 2 3 U
GTAATATATTAGAAATGGATTGAAACATATATGAAACATAAAAGTGTCCTGATCACATTA
CATTTTCCATATTGGAATGACATAAGTCAATTACATAAAAACTGCTCCATTGCTTCTAGA
GAAGAATCCTTCAAGCTTTGACGCAGCAGTTGAAGCAGCTGAAAATGCTTCTCCTCCCGG
AAGGGGAATGTGGTTGGTGATGGTGGATTGGAAAAAAGTGATTTTGTTTCTCACTATGGA
CAGTGGTGAGCTTAGCGGTTGCTGTAGCTGACTCGGGTGGCGGCTTAACGAGTTCATCCT
CGTTGCCAAGACTGGCTCGAGAAGGGTCTCTCTTGTTCTGTTTCCTCATCTCCCTAATAT
TGGTGAAATCCATAAAGTAATCAGGAATAGTTCCTCCTCCTTTCTGGTCCCAATCACCAA
ACTGTGGCACTGATAGCCATGGAGAGTTCTTCTCTTTTCGATCATCCTCCATTTTGATTA
AAATCCCAAGAGGAGAAGGTATCAGATAGAGCAAGATATATATTAGTCCCTTCTGAATAC
TTCTGAGCCCCCAATCAAAGGCGAAGCTAGAGAAACGGACTCAATTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG60JQ U 121
AF RR2DG60TF C 1
BS 1 124 RR2DG60TF
BS 125 497 RR2DG60JQ
BS 498 590 RR2DG60TF

RD RR2DG60JQ 377 0 0
GAAA
AATCCTTCAAGCTTTGACGCAGCAGTTGAAGCAGCTGAAAATGCTTCTCCTCCCGGAAGG
GGAATGTGGTTGGTGATGGTGGATTGGAAAAAAGTGATTTTGTTTCTCACTATGGACAGT
GGTGAGCTTAGCGGTTGCTGTAGCTGACTCGGGTGGCGGCTTAACGAGTTCATCCTCGTT
GCCAAGACTGGCTCGAGAAGGGTCTCTCTTGTTCTGTTTCCTCATCTCCCTAATATTGGT
GAAATCCATAAAGTAATCAGGAATAGTTCCTCCTCCTTTCTGGTCCCAATCACCAAACTG
TGGCACTGATAGCCATGGAGAGTTCTTCTCTTTTCGATCATCCTCCATTTTGATTAAAAT
CCCAAGAGGAGAA

QA 5 377 5 377
DS 

RD RR2DG60TF 590 0 0
GTAATATATTAGAAATGGATTGAAACATATATGAAACATAAAAGTGTCCTGATCACATTA
CATTTTCCATATTGGAATGACATAAGTCAATTACATAAAAACTGCTCCATTGCTTCTAGA
GAAGAATCCTTCAAGCTTTGACGCAGCAGTTGAAGCAGCTGAAGATGCTTCTCCTCGCGG
AAGGGGAATGTGGTTGGTGATGGTGGATTGGAGAGAAGTGATTTTGTTTCTCACTATGGA
CAGTGGTGAGCTTAGCGGTTGCTGTAGCTGACTCGGGTGGCGGCTTAACGAGTTCATCCT
CGTTGCCAAGACTGGCTCGAGAAGGGTCTCTCTTGTTCTGTTTCCTCATCTCCCTAATAT
TGGTGAAATCCATAGAGTAATCAGGAATAGTTCCTCCTCCTTTCTGGTCCCAATCACCAA
ACTGTGGCACTGATAGCCATGGAGAGTTCTTCTCTTTTCGATCATCCTCCATTTTGATTA
AAATCCGAAGAGGAGAAGGTATCAGATAGAGCAAGATATATATTAGTCCCTTCTGAATAC
TTCTGAGCCCCCAATCAAAGGCGAAGCTAGAGAAACGGACTCAATTATCC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

CO CL6440Contig1 800 2 2 U
GCTCCAACGTTTCCGTCTCTTGGTGAAAATCGTGATAATAATAATCCATATGATCCAAGC
CATCATCATAACTACTGTTCCCTGAATATTCCCTCAAAAGATCATGATCTTGTTGATCAA
ACACGGAGTTACTTTCTTCACTCACCTGATACGTCGTCGTTGCTTCCGTACCTGACCAAG
TCACGTGACGCGGCTCGTTACTCACGTGATCATGATCATAACTCTTTCGATCTCTTGAGA
CCGGGAAGATAGCTTCTTTAGATATTGTAGTTGGAGAACCGAAGTCTAGAGTTACCGGAC
CCCTTCTACGGTTGGCTTCACCAGCAGCATAGCGTCCGGTGAATTTCTGAACCAGAGCTC
GGAAATTGCTAGGACTTGCATTCAAGAGAGTCGTTGGTACTGCTCTCCTCGAAGCCCTAG
ACCTTCTTCCGGCCGTTTCTTGCGCCACCACAATACCACCGTCTTCTCCGAGGGAAGATA
CGGATGATGACATCATGTTAATGCCATCTAAGCATGGACTAAGCTGTTGAACTTGCCGTG
GTTCATAGTGTTGTGACCACTGGCCTGCTCTCGACGAGTTGGTGTTCATTGGACCTTTTT
TTTTGTTTTCTATATTTATTTTATTTTTTTCTTTGGTGTACCGTGTATTCATTGCATATG
CTTTAGGATTAAGGTTAAGGTTGCTCTATATATGCGGAGGAGATGTAAGCCATGATGGTC
GTACTAACCCTACAATATTGTTTTTTTAAACAATTGATGGTCGTTGACTTGTACCTTCAA
TTTTAATATGTTTTTTAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV53TF U 1
AF RR2BV53JQ C 20
BS 1 662 RR2BV53TF
BS 663 800 RR2BV53JQ

RD RR2BV53TF 662 0 0
GCTCCAACGTTTCCGTCTCTTGGTGAAAATCGTGATAATAATAATCCATATGATCCAAGC
CATCATCATAACTACTGTTCCCTGAATATTCCCTCAAAAGATCATGATCTTGTTGATCAA
ACACGGAGTTACTTTCTTCACTCACCTGATACGTCGTCGTTGCTTCCGTACCTGACCAAG
TCACGTGACGCGGCTCGTTACTCACGTGATCATGATCATAACTCTTTCGATCTCTTGAGA
CCGGGAAGATAGCTTCTTTAGATATTGTAGTTGGAGAACCGAAGTCTAGAGTTACCGGAC
CCCTTCTACGGTTGGCTTCACCAGCAGCATAGCGTCCGGTGAATTTCTGAACCAGAGCTC
GGAAATTGCTAGGACTTGCATTCAAGAGAGTCGTTGGTACTGCTCTCCTCGAAGCCCTAG
ACCTTCTTCCGGCCGTTTCTTGCGCCACCACAATACCACCGTCTTCTCCGAGGGAAGATA
CGGATGATGACATCATGTTAATGCCATCTAAGCATGGACTAAGCTGTTGAACTTGCCGTG
GTTCATAGTGTTGTGACCACTGGCCTGCTCTCGACGAGTTGGTGTTCATTGGACCTTTTT
TTTTGTTTTCTATATTTATTTTATTTTTTTCTTTGGTGTACCGTGTATTCATTGCATATG
CT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2BV53JQ 781 0 0
TCTGGTG
AAATCGTGATAATAATAATCCATATGATCCAAGCCATCATCATAACTACTGTTCC*TGAA
TAT*CCCTCAAAAGATCATGATCTTGTTGATCAAACACGGAGTTACTTTCTTCACTCACC
TGATACGTCGTCGTTGCTTCCGTACCTGACCAAGTCACGTGACGCGGCTCGTTACTCACG
TGATCATGATCATAACTCTTTCGATCTCTTGAGACCGGGAAGATAGCTTCTTTAGATATT
GTAGTTGGAGAACCGAAGTCTAGAGTTACCGGACCCCTTCTACGGTTGGCTTCACCAGCA
GCATAGCGTCCGGTGAATTTCTGAACCAGAGCTCGGAAATTGCTAGGACTTGCATTCAAG
AGAGTCGTTGGTACTGCTCTCCTCGAAGCCCTAGACCTTCTTCCGGCCGTTTCTTGCGCC
ACCACAATACCACCGTCTTCTCCGAGGGAAGATACGGATGATGACATCATGTTAATGCCA
TCTAAGCATGGACTAAGCTGTTGAACTTGCCGTGGTTCATAGTGTTGTGACCACTGGCCT
GCTCTCGACGAGTTGGTGTTCATTGGACCTTTTTTTT*GTTTTCTATATTTATTTTATTT
TTTTCTTTGGTGTACCGTGTATTCATTGCATATGCTTTAGGATTAAGGTTAAGGTTGCTC
TATATATGCGGAGGAGATGTAAGCCATGATGGTCGTACTAACCCTACAATATTGTTTTTT
TAAACAATTGATGGTCGTTGACTTGTACCTTCAATTTTAATATGTTTTTTAGTT

QA 8 781 8 781
DS 



AS 1 2

CO CL6441Contig1 843 2 6 U
GGGTGCTGCAAGAGTCAGATAATAGAGAAAAGCCATCTATCTAGGACATGCCAATCATTA
TATCCAAAAACATGCATGCCCATTAGTCCATTACGCATCATCTCTAAAAAAATCAAACCG
GCAGCTAAACACGCATTATCATTTTTCCCTCTCTCAATCTTTTCTATAATTTTCTTTTAA
AATTTTTTAATATAAAATCACTAGATACCCGTCGTTTGTAACGGAGGAAGTTAATAAACC
GCGTACGACGTCATCCGGCAAATCGCCACCGCTCGAAGCTGAGGAGGAGATTGATTCAGC
TCTCTCTCTTTCTATCTAAATCGGAAACTCTTCCGCCGGAGAATCAACGTCTAGCGAAGG
ACTAATTTGCGTGTTGACGGAGCTGGAAGCAGCTGCTTTATTATCTTCTCCAGATCTCTA
ACCGATTCTCAAATCTCACACCTCTTCCTGTTTCACCGGTTGGTAAATCAAAGCAAATGG
TTATTGATGGGATTGTATCTTCACCATTGAGGAGACATCAGTCTCTAAAGAAGCAGTGGG
AAGATTTGGGAAGCTGCTCCACGGTTATTAACAGGCATCGATATCTCTTAACAGCATTGC
TTCTTTTGGGCTTCCTCTGCACTGTTTATCTTTATTTTGCTGTCACTTTAGGTGCTAGAC
ACTCCACGTGCTATGGCTTGACTGGGAACGACAAGGCTATCTGTCAAGCCATCTCTAAAG
GGAAACTCAAATTGTTTTAGTAAATTGTTTCTTGTGCATCTACTACATTCTTTTTCTTTT
ATTGGTTCTATAATGCCATTTGTGTGAATTGTTCCAAATACATGATGATTAACCAGAGAT
TTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2D273TF U 1
AF RR2D273JQ C 142
BS 1 651 RR2D273TF
BS 652 652 RR2D273JQ
BS 653 695 RR2D273TF
BS 696 696 RR2D273JQ
BS 697 763 RR2D273TF
BS 764 843 RR2D273JQ

RD RR2D273TF 763 0 0
GGGTGCTGCAAGAGTCAGATAATAGAGAAAAGCCATCTATCTAGGACATGCCAATCATTA
TATCCAAAAACATGCATGCCCATTAGTCCATTACGCATCATCTCTAAAAAAATCAAACCG
GCAGCTAAACACGCATTATCATTTTTCCCTCTCTCAATCTTTTCTATAATTTTCTTTTAA
AATTTTTTAATATAAAATCACTAGATACCCGTCGTTTGTAACGGAGGAAGTTAATAAACC
GCGTACGACGTCATCCGGCAAATCGCCACCGCTCGAAGCTGAGGAGGAGATTGATTCAGC
TCTCTCTCTTTCTATCTAAATCGGAAACTCTTCCGCCGGAGAATCAACGTCTAGCGAAGG
ACTAATTTGCGTGTTGACGGAGCTGGAAGCAGCTGCTTTATTATCTTCTCCAGATCTCTA
ACCGATTCTCAAATCTCACACCTCTTCCTGTTTCACCGGTTGGTAAATCAAAGCAAATGG
TTATTGATGGGATTGTATCTTCACCATTGAGGAGACATCAGTCTCTAAAGAAGCAGTGGG
AAGATTTGGGAAGCTGCTCCACGGTTATTAACAGGCATCGATATCTCTTAACAGCATTGC
TTCTTTTGGGCTTCCTCTGCACTGTTTATCTTTATTTTGCTGTCACTTTAG*TGCTAGAC
ACTCCACGTGCTATGGCTTGACTGGGAACGACAAG*CTATCTGTCAAGCCATCTCTAAAG
GGAAACTCAAATTGTTTTAGTAAATTGTTTCTTGTGCATCTAC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2D273JQ 702 0 0
TTTTTCCCTCTCTCAATCTTTTCTATAATTTTCTTTTAAAATTTTTTAATATAAAATCAC
TAGATACCCGTCGTTTGTAACGGAGGAAGTTAATAAACCGCGTACGACGTCATCCGGCAA
ATCGCCACCGCTCGAAGCTGAGGAGGAGATTGATTCAGCTCTCTCTCTTTCTATCTAAAT
CGGAAACTCTTCCGCCGGAGAATCAACGTCTAGCGAAGGACTAATTTGCGTGTTGACGGA
GCTGGAAGCAGCTGCTTTATTATCTTCTCCAGATCTCTAACCGATTCTCAAATCTCACAC
CTCTTCCTGTTTCACCGGTTGGTAAATCAAAGCAAATGGTTATTGATGGGATTGTATCTT
CACCATTGAGGAGACATCAGTCTCTAAAGAAGCAGTGGGAAGATTTGGGAAGCTGCTCCA
CGGTTATTAACAGGCATCGATATCTCTTAACAGCATTGCTTCTTTTGGGCTTCCTCTGCA
CTGTTTATCTTTATTTTGCTGTCACTTTAGGTGCTAGACACTCCACGTGCTATGGCTTGA
CTGGGAACGACAAGGCTATCTGTCAAGCCATCTCTAAAGGGAAACTCAAATTGTTTTAGT
AAATTGTTTCTTGTGCATCTACTACATTCTTTTTCTTTTATTGGTTCTATAATGCCATTT
GTGTGAATTGTTCCAAATACATGATGATTAACCAGAGATTTG

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL6442Contig1 748 2 4 U
GCAATGCGGCGGAGTTTGTCAGAGACAAACTTGAGCAACGTTCGGAAAATGATTAGCACC
TTTGAGGATACAAAACTTCAGACGGTGAAGAGTCAAACTGAGTCTTGTAAAGATATGAAT
TCACAACCAGAAAGCTCTGTGAATATAGAGAGAGCGGAAGAAAGGAAGATAATATCTGAG
GGTATGGAGAAGACAGTTTCTAGAGATGCCTCAGAGACATGTGATGATTTAGTAACTGTT
TCAAGAGAGGAAAGGCCACTGGTTATAGAGGAGAAGAGCCTTGAAGAGAGCACTAGAAGA
AGCGGCTCGTTAAGTAAGCAGAGGTTAAAGAGAAACTCAGTGGTGGAAGTAAGGAATGAT
GAGAAGAAACAGAGCAAACCTGTGCGTTTGAAGGATTCTCATCTTGAGAATGCACGAGGA
TCACGTCTCTGGATATTTCCTGATGAGGCAAAGGATGTGTTACAGAAGAAGATAGGAGAA
TCCAAGAAGGAAAACACCGGTGAGAGGGGATTGAGCTGCAGAAGCATTGAGAAAATGAAT
ATCAACAACAAGTGGAATAACATTGAGAGATCCAAGAAACAGAAGCCTCAGACTTCTTCT
GCAGATTCAGAAAGTTCAAGAGGACCTGTTGGACAGGTGATGCGTGCATTGATTGTGGTG
GGTTTTGCAGGCTTGGTGTTTTTGACACGTAAATGAACTTGAATAATGAAGCTTTCTGTA
TTTTTTTTCTCCATTTTCTTCTTATGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C636TF U 1
AF RR2C636JQ C 123
BS 1 636 RR2C636TF
BS 637 637 RR2C636JQ
BS 638 666 RR2C636TF
BS 667 748 RR2C636JQ

RD RR2C636TF 666 0 0
GCAATGCGGCGGAGTTTGTCAGAGACAAACTTGAGCAACGTTCGGAAAATGATTAGCACC
TTTGAGGATACAAAACTTCAGACGGTGAAGAGTCAAACTGAGTCTTGTAAAGATATGAAT
TCACAACCAGAAAGCTCTGTGAATATAGAGAGAGCGGAAGAAAGGAAGATAATATCTGAG
GGTATGGAGAAGACAGTTTCTAGAGATGCCTCAGAGACATGTGATGATTTAGTAACTGTT
TCAAGAGAGGAAAGGCCACTGGTTATAGAGGAGAAGAGCCTTGAAGAGAGCACTAGAAGA
AGCGGCTCGTTAAGTAAGCAGAGGTTAAAGAGAAACTCAGTGGTGGAAGTAAGGAATGAT
GAGAAGAAACAGAGCAAACCTGTGCGTTTGAAGGATTCTCATCTTGAGAATGCACGAGGA
TCACGTCTCTGGATATTTCCTGATGAGGCAAAGGATGTGTTACAGAAGAAGATAGGAGAA
TCCAAGAAGGAAAACACCGGTGAGAGGGGATTGAGCTGCAGAAGCATTGAGAAAATGAAT
ATCAACAACAAGTGGAATAACATTGAGAGATCCAAGAAACAGAAGCCTCAGACTTCTTCT
GCAGATTCAGAAAGTTCAAGAGGACCTGTTGGACAG*TGATGCGTGCATTGATTGTGGTG
GGTTTT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2C636JQ 626 0 0
ACAACCAGAAAGCTCTGTGAATATAGAGAGAGCGGAAGAAAGGAAGATAATATCTGAGGG
TATGGAGAAGACAGTTTCTAGAGATGCCTCAGAGACATGTGATGATTTAGTAACTGTTTC
AAGAGAGGAAAGGCCACTGGTTATAGAGGAGAAGAGCCTTGAAGAGAGCACTAGAAGAAG
CGGCTCGTTAAGTAAGCAGAGGTTAAAGAGAAACTCAGTGGTGGAAGTAAGGAATGATGA
GAAGAAACAGAGCAAACCTGTGCGTTTGAAGGATTCTCATCTTGAGAATGCACGAGGATC
ACGTCTCTGGATATTTCCTGATGAGGCAAAGGATGTGTTACAGAAGAAGATAGGAGAATC
CAAGAAGGAAAACACCGGTGAGAGGGGATTGAGCTGCAGAAGCATTGAGAAAATGAATAT
CAACAACAAGTGGAATAACATTGAGAGTTCCAAGAAACAGAAGCCTCAGACTTCTTCTGC
AGATTCAGAAAGTTCAAGAGGACCTGTTGGACAGGTGATGCGTGCATTGATTGTGGTGGG
TTTTGCAGGCTTGGTGTTTTTGACACGTAAATGAACTTGAATAATGAAGCTTTCTGTATT
TTTTTTCTCCATTTTCTTCTTATGGA

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL6443Contig1 624 2 1 U
GGGAGGACAAAAAACAAAAACAAAAGAAAACAAAACAAAAAGTCCCATCTCTCTTGCCTC
CATCAACCAAACGCAATGGCGAACGCGGCGTCGGGAATGGCGGTGGAAGACGAATGTAAG
CTCAAGTTTTTGGAGCTAAAATCGAAAAGAAACTATGGGTTCATAATATTCAGGATAGAC
GGACAACAAGTGGTGGTTGAAAAGCTGGGAAGTCCTGAGGAAAACTACGACGATTTCTCC
AATTCCCTACCTGCCAACGAGTGTCGCTATGCTGTCTTTGACTTTGACTTCACCACTGCT
GAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCATAGCATGGTCACCAGATTCATCGAGGGTG
AGGATGAAGATGGTGTATGCCAGCTCGAAGGACAGGTTCAAAAGAGAATTGGATGGAATA
CAAGTGGAGTTACAAGCCACGGACCCGAGCGAGATGAGTTTCGACATCATCAAAAGCCGA
GCTCTCTAGATTCATTTATGTCTGATTCTTATAATATATCCATTCATAAATGATACATCA
TCATCATTTAAATTAAAAAGCTGATCTCCATGAAATTTTGTAACTTTCTTGCATGGTTTC
ATTCATTCTTGTTCATCTTAAATA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A955JQ C 1
AF RR2A955TF U 1
BS 1 624 RR2A955TF

RD RR2A955JQ 624 0 0
GGGAGGACAAAAAACAAAAACAAAAGAAAACAAAACAAAAAGTCCCATCTCTCTTGCCTC
CATCAACCAAACGCAATGGCGAACGCGGCGTCGGGAATGGCGGTGGAAGACGAATGTAAG
CTCAAGTTTTTGGAGCTAAAATCGAAAAGAAACTATGGGTTCATAATATTCAGGATAGAC
GGACAACAAGTGGTGGTTGAAAAGCTGGGAAGTCCTGAGGAAAACTACGACGATTTCTCC
AATTCCCTACCTGCCAACGAGTGTCGCTATGCTGTCTTTGACTTTGACTTCACCACTGCT
GAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCATAGCATGGTCACCAGATTCATCGAGGGTG
AGGATGAAGATGGTGTATGCCAGCTCGAAGGACAGGTTCAAAAGAGAATTGGATGGAATA
CAAGTGGAGTTACAAGCCACGGACCCGAGCGAGATGAGTTTCGACATCATCAAAAGCCGA
GCTCTCTAGATTCATTTATGTCTGATTCTTATAATATATCCATTCATAAATGATACATCA
TCATCATTTAAATTAAAAAGCTGATCTCCATGAAATTTTGTAACTTTCTTGCATGGTTTC
ATTCATTCTTGTTCATCTTAAATA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2A955TF 624 0 0
GGGAGGACAAAAAACAAAAACAAAAGAAAACAAAACAAAAAGTCCCATCTCTCTTGCCTC
CATCAACCAAACGCAATGGCGAACGCGGCGTCGGGAATGGCGGTGGAAGACGAATGTAAG
CTCAAGTTTTTGGAGCTAAAATCGAAAAGAAACTATGGGTTCATAATATTCAGGATAGAC
GGACAACAAGTGGTGGTTGAAAAGCTGGGAAGTCCTGAGGAAAACTACGACGATTTCTCC
AATTCCCTACCTGCCAACGAGTGTCGCTATGCTGTCTTTGACTTTGACTTCACCACTGCT
GAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCATAGCATGGTCACCAGATTCATCGAGGGTG
AGGATGAAGATGGTGTATGCCAGCTCGAAGGACAGGTTCAAAAGAGAATTGGATGGAATA
CAAGTGGAGTTACAAGCCACGGACCCGAGCGAGATGAGTTTCGACATCATCAAAAGCCGA
GCTCTCTAGATTCATTTATGTCTGATTCTTATAATATATCCATTCATAAATGATACATCA
TCATCATTTAAATTAAAAAGCTGATCTCCATGAAATTTTGTAACTTTCTTGCATGGTTTC
ATTCATTCTTGTTCATCTTAAATA

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL6444Contig1 802 2 6 U
TTTTTAACTTAGCTCCCGTTGAAGATCTTGTTGTTTGTTGGCCAAATCCATCAACTTACT
CCATTTTTTGAGATCTCTACTTCGGGTCAGATGTGTTTATTGCTTCAGAAACTCTAAAAC
TGAGGCATCTTTGTTTGGATTTCAGTGTTATCTTACTTTGCCTTTGTTCTAGCTTCGGTG
TAAGTGGTGTGGGATGATGGTGTGGCAGTGTGTAGAAAGCAGAACATGTCTAACATCTTT
GAGAAGTGTCAGGGTGATTGTCCCACTCTAGGAGAGAGTAATTCTCGCAGCCTTTGAATA
GGTGTTTTATCTGGTCTATCTTCTGCTCTCGTGTTCCTTGATGGCTTTGTCTGGTTGAGT
CATTATAAAGAGGTCGAGGGCTTTTAGATTTCTGATGAAGGTTTGCTTGAGAAGGGAGCT
TGGTCCTGGTTGTTGTTCTTCTCTGTTTGGTTCCTGATGTTATTGCTATTGGTTATGGCT
TGGTACCGTGAACAGAAGGTTCAGATAATGTTTAGTTTGGTTTTGTTGTTATGGTCACTG
CAACTGCATTAATTGCTTCCTCTTTGTCAAGGGTTCCGGCTGCTCAAAACATAGAAAGAT
TGATATTGTTATCTCTTTTCAAGGATTGTCTTTAGCTTTAGTTATAATGGTCTAGAGTCC
TTTTGTGATTGTTGTGTTTCAAGTGTCACCCTTTGTTTGGGTTTAAGTCACCTGTCGTTT
GGGTTCTTGTCACCCTGATGTGGGTTCTAGGATTTCACGTTTGTATGTTTCTTCAAGATT
CATTAATCAAAAACCAGATGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA42TF U 1
AF RR2FA42JQ C 108
BS 1 678 RR2FA42TF
BS 679 679 RR2FA42JQ
BS 680 724 RR2FA42TF
BS 725 725 RR2FA42JQ
BS 726 745 RR2FA42TF
BS 746 802 RR2FA42JQ

RD RR2FA42TF 747 0 0
TTTTTAACTTAGCTCCCGTTGAAGATCTTGTTGTTTGTTGGCCAAATCCATCAACTTACT
CCATTTTTTGAGATCTCTACTTCGGGTCAGATGTGTTTATTGCTTCAGAAACTCTAAAAC
TGAGGCATCTTTGTTTGGATTTCAGTGTTATCTTACTTTGCCTTTGTTCTAGCTTCGGTG
TAAGTGGTGTGGGATGATGGTGTGGCAGTGTGTAGAAAGCAGAACATGTCTAACATCTTT
GAGAAGTGTCAGGGTGATTGTCCCACTCTAGGAGAGAGTAATTCTCGCAGCCTTTGAATA
GGTGTTTTATCTGGTCTATCTTCTGCTCTCGTGTTCCTTGATGGCTTTGTCTGGTTGAGT
CATTATAAAGAGGTCGAGGGCTTTTAGATTTCTGATGAAGGTTTGCTTGAGAAGGGAGCT
TGGTCCTGGTTGTTGTTCTTCTCTGTTTGGTTCCTGATGTTATTGCTATTGGTTATGGCT
TGGTACCGTGAACAGAAGGTTCAGATAATGTTTAGTTTGGTTTTGTTGTTATGGTCACTG
CAACTGCATTAATTGCTTCCTCTTTGTCAAGGGTTCCGGCTGCTCAAAACATAGAAAGAT
TGATATTGTTATCTCTTTTCAAGGATTGTCTTTAGCTTTAGTTATAATGGTCTAGAGTCC
TTTTGTGATTGTTGTGTT*CAAGTGTCACCCTTTGTTTGGGTTTAAGTCACCTGTCGTTT
GGGT*CTTGTCACCCTGATGTGGGT
CT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2FA42JQ 695 0 0
GAAACTCTAAAACTGAGGCATCTTTGTTTGGATTTCAGTGTTATCTTACTTTGCCTTTGT
TCTAGCTTCGGTGTAAGTGGTGTGGGATGATGGTGTGGCAGTGTGTAGAAAGCAGAACAT
GTCTAACATCTTTGAGAAGTGTCAGGGTGATTGTCCCACTCTAGGAGAGAGTAATTCTCG
CAGCCTTTGAATAGGTGTTTTATCTGGTCTATCTTCTGCTCTCGTGTTCCTTGATGGCTT
TGTCTGGTTGAGTCATTATAAAGAGGTCGAGGGCTTTTAGATTTCTGATGAAGGTTTGCT
TGAGAAGGGAGCTTGGTCCTGGTTGTTGTTCTTCTCTGTTTGGTTCCTGATGTTATTGCT
ATTGGTTATGGCTTGGTACCGTGAACAGAAGGTTCAGATAATGTTTAGTTTGGTTTTGTT
GTTATGGTCACTGCAACTGCATTAATTGCTTCCTCTTTGTCAAGGGTTCCGGCTGCTCAA
AACATAGAAAGATTGATATTGTTATCTCTTTTCAAGGATTGTCTTTAGCTTTAGTTATAA
TGGTCTAGAGTCCTTTTGTGATTGTTGTGTTTCAAGTGTCACCCTTTGTTTGGGTTTAAG
TCACCTGTCGTTTGGGTTCTTGTCACCCTGATGTGGGTTCTAGGATTTCACGTTTGTATG
TTTCTTCAAGATTCATTAATCAAAAACCAGATGGG

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL6445Contig1 685 2 1 U
GTGGTTTAGCATGGGCTATATGTGAGCATCTGGTTCAAGTGAAGAAAGCTCCTACTCTGT
TTGCTACTCACTTTCATGAACTTACTGCCTTGGCTCAAGCGAACTCTGAGGTTGCAGGTA
ACACCGTTGGTGTTGCAAACTTCCACGTCAGCGCACACATCGACACAGAAAGCCGCAAAC
TCACCATGCTTTACAAGGTTGAACCAGGGGCATGTGACCAGAGCTTTGGGATCCATGTGG
CTGAGTTTGCCAACTTCCCTGAAAGCGTAGTGGCGCTCGCAAGGGAGAAAGCTGCAGAAC
TGGAAGATTTCTCCCCCAGAGAGGAGAGTGGGAAGAGAAAGAGCAGAGAAGATGATGCAG
AGGAAGTATCAAGAGGGACATCACGAGCTCACAAGTTTCTGAAAGAATTTGCAGAGATAC
CAGTTGATAAAATGGAGCTTAAAGATTCACTTAAACGCCTATGCGAGTTGAAAGACGAGT
TAGAGAAAGATGCTGTGGACTGCCACTGGCTCAAGCAGGTCCTCTGAAACAGCCATGCAG
TTCACTTCAGTTGCTTTTTTTCCAGTTCCTTTTTTGTAAATTATCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCCGCTCTTGTAGACTTTTGTACTTGTTCTTTGGGATTACTGATTAGGCGGAT
GAAGACAAAACAACACATGATTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AC12JQ C 1
AF RR2AC12TF U 1
BS 1 685 RR2AC12TF

RD RR2AC12JQ 685 0 0
GTGGTTTAGCATGGGCTATATGTGAGCATCTGGTTCAAGTGAAGAAAGCTCCTACTCTGT
TTGCTACTCACTTTCATGAACTTACTGCCTTGGCTCAAGCGAACTCTGAGGTTGCAGGTA
ACACCGTTGGTGTTGCAAACTTCCACGTCAGCGCACACATCGACACAGAAAGCCGCAAAC
TCACCATGCTTTACAAGGTTGAACCAGGGGCATGTGACCAGAGCTTTGGGATCCATGTGG
CTGAGTTTGCCAACTTCCCTGAAAGCGTAGTGGCGCTCGCAAGGGAGAAAGCTGCAGAAC
TGGAAGATTTCTCCCCCAGAGAGGAGAGTGGGAAGAGAAAGAGCAGAGAAGATGATGCAG
AGGAAGTATCAAGAGGGACATCACGAGCTCACAAGTTTTTGAAAGAATTTGCAGAGATAC
CAGTTGATAAAATGGAGCTTAAAGATTCACTTAAACGCCTATGCGAGTTGAAAGACGAGT
TAGAGAAAGATGCTGTGGACTGCCACTGGCTCAAGCAGGTCCTCTGAAACAGCCATGCAG
TTCACTTCAGTTGCTTTTTTTCCAGTTCCTTTTTTGTAAATTATCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCCGCTCTTGTAGACTTTTGTACTTGTTCTTTGGGATTACTGATTAGGCGGAT
GAAGACAAAACAACACATGATTTTG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2AC12TF 685 0 0
GTGGTTTAGCATGGGCTATATGTGAGCATCTGGTTCAAGTGAAGAAAGCTCCTACTCTGT
TTGCTACTCACTTTCATGAACTTACTGCCTTGGCTCAAGCGAACTCTGAGGTTGCAGGTA
ACACCGTTGGTGTTGCAAACTTCCACGTCAGCGCACACATCGACACAGAAAGCCGCAAAC
TCACCATGCTTTACAAGGTTGAACCAGGGGCATGTGACCAGAGCTTTGGGATCCATGTGG
CTGAGTTTGCCAACTTCCCTGAAAGCGTAGTGGCGCTCGCAAGGGAGAAAGCTGCAGAAC
TGGAAGATTTCTCCCCCAGAGAGGAGAGTGGGAAGAGAAAGAGCAGAGAAGATGATGCAG
AGGAAGTATCAAGAGGGACATCACGAGCTCACAAGTTTCTGAAAGAATTTGCAGAGATAC
CAGTTGATAAAATGGAGCTTAAAGATTCACTTAAACGCCTATGCGAGTTGAAAGACGAGT
TAGAGAAAGATGCTGTGGACTGCCACTGGCTCAAGCAGGTCCTCTGAAACAGCCATGCAG
TTCACTTCAGTTGCTTTTTTTCCAGTTCCTTTTTTGTAAATTATCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCCGCTCTTGTAGACTTTTGTACTTGTTCTTTGGGATTACTGATTAGGCGGAT
GAAGACAAAACAACACATGATTTTG

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL6446Contig1 794 2 2 U
GGAAATAAGCAGCGATCGAAGGTAACAAACACAGAAAGAGCGAAACTTTCAGACATTCAA
ATCTGAGAGCGAGAGCTATACGAACAAAGCCCACAAAAAAAAAGAGATTTGATCCGACAG
CCGATAGAACACTGGTTTTGTCGGAAGAAGAAAGTTACATGCTTTTCTTTTGTTTTTGGT
TTTTTTTTTGTCATTTCTCTGAATTCTGGTCAATCTGAGCAAAGAAAAAAAAAGTTGCTC
AATTTCAATCTTCAAACACTTGTTTTTCTGCTTCGGGCCCCGCTTCTCATTGCCCGCTTC
CTCCTATCTTCAATTCGAATTCGTTGCTCTGTTCTCAAGCTCGAATTTTTTTTTTCTCAA
CTCCCGATTTGCTCCAGCTGAAATTTCCGGTAATTCTCAACTTCTTAGCTTCTGAATTGG
GCGTTGAACTGAACAAAAATGCTCTGATGCAGTTTCGAGTACTTACCCTCTCGTGAAGTT
GGTGGACTTGTCGCCTTCTGAGTGATTGATTTGGTAACTTTTGAGCTGGGGTTTGTATCC
TGAATCAGCCAAGGTGGAGAATTTAACCTTGTTGGTGTAAGCTAGTTTGTAAATGATGAT
CTCTAGGGTTTTGGTTTTGGTTTTGGGGGAGATGAGATTTGGCTTTTGCATTATATGGCC
TGTACTTGAAGCTTCAGCCAAGTTCTTGATATGCTCCTGGCTTTGAGTTTGAGAAGTTAT
AATATAAGTTAATGAGTTGGATTTATTGGTGTAAAAGATAAGGGTGCATCTTGTGCACTC
CTCTGACTGTTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP15TF U 1
AF RR2AP15JQ C 1
BS 1 744 RR2AP15TF
BS 745 794 RR2AP15JQ

RD RR2AP15TF 744 0 0
GGAAATAAGCAGCGATCGAAGGTAACAAACACAGAAAGAGCGAAACTTTCAGACATTCAA
ATCTGAGAGCGAGAGCTATACGAACAAAGCCCACAAAAAAAAAGAGATTTGATCCGACAG
CCGATAGAACACTGGTTTTGTCGGAAGAAGAAAGTTACATGCTTTTCTTTTGTTTTTGGT
TTTTTTTTTGTCATTTCTCTGAATTCTGGTCAATCTGAGCAAAGAAAAAAAAAGTTGCTC
AATTTCAATCTTCAAACACTTGTTTTTCTGCTTCGGGCCCCGCTTCTCATTGCCCGCTTC
CTCCTATCTTCAATTCGAATTCGTTGCTCTGTTCTCAAGCTCGAATTTTTTTTTTCTCAA
CTCCCGATTTGCTCCAGCTGAAATTTCCGGTAATTCTCAACTTCTTAGCTTCTGAATTGG
GCGTTGAACTGAACAAAAATGCTCTGATGCAGTTTCGAGTACTTACCCTCTCGTGAAGTT
GGTGGACTTGTCGCCTTCTGAGTGATTGATTTGGTAACTTTTGAGCTGGGGTTTGTATCC
TGAATCAGCCAAGGTGGAGAATTTAACCTTGTTGGTGTAAGCTAGTTTGTAAATGATGAT
CTCTAGGGTTTTGGTTTTGGTTTTGGGGGAGATGAGATTTGGCTTTTGCATTATATGGCC
TGTACTTGAAGCTTCAGCCAAGTTCTTGATATGCTCCTGGCTTTGAGTTTGAGAAGTTAT
AATATAAGTTAATGAGTTGGATTT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2AP15JQ 794 0 0
GGAAATAAGCAGCGATCGAAGGTAACAAACACAGAAAGAGCGAAACTTTCAGACATTCAA
ATCTGAGAGCGAGAGCTATACGAACAAAGCCCACAAAAAAAAAGAGATTTGATCCGACAG
CCGATAGAACACTGGTTTTGTCGGAAGAAGAAAGTTACATGCTTTTCTTTTGTTTTTGGT
TTTTTTTTTGTCATTTCTCTGAATTCTGGTCAATCTGAGCAAAGAAAAAAAAAGTTGCTC
AATTTCAATCTTCAAACACTTGTTTTTCTGCTTCGGGCCCCGCTTCTCATTGCCCGCTTC
CTCCTATCTTCAATTCGAATTCGTTGCTCTGTTCTCAAGCTCGAATTTTTTTTTTCTCAA
CTCCCGATTTGCTCCAGCTGAAATTTCCGGTAATTCTCAACTTCTTAGCTTCTGAATTGG
GCGTTGAACTGAACAAAAATGCTCTGATGCAGTTTCGAGTACTTACCCTCTCGTGAAGTT
GGTGGACTTGTCGCCTTCTGAGTGATTGATTTGGTAACTTTTGAGCTGGGGTTTGTATCC
TGAATCAGCCAAGGTGGAGAATTTAACCTTGTTGGTGTAAGCTAGTTTGTAAATGATGAT
CTCTAGGGTTTTGGTTTTGGTTTTGGGGGAGATGAGATTTGGCTTTTGCATTATATGGCC
TGTACTTGAAGCTTCAGCCAAGTTCTTGATATGCTCCTGGCTTTGAGTTTGAGAAGTTAT
AATATAAGTTAATGAGTTGGATTTATTGGTGTAAAAGATAAGGGTGCATCTTGTGCACTC
CTCTGACTGTTTGC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL6447Contig1 776 2 4 U
GGATGCCTAGAAACAGATTTTCATAATGGATTTTCATATATTCCGATTATTTCGTTTGAT
TAGCGTCGCAGTTTTCATCTTCCATGGCTCGTGTTATTCCGAGAAAGCTGGTCACTATAG
TTTTCTGAAAGATGCAACATCAGCACCAACGTTATCTCACTTCGACTACATAGTCATCGG
AGGAGGAACCGCCGGATGTGCACTAGCCGCAACGCTATCTAGAAACGCCACCGTTTTACT
CCTCGAACGCGGTGGGTCCCCTTACGAAAACCCCACGGCCACAGACATCGGAAACTTCTT
GACCACGTTCTTGAACACAACTCCAAACTCGTGGTCTCAGCTATTCATCTCCGAAGACGG
CGTTTTCAACACACGCGCACGCGTGCTCGGAGGAGGAACAGTGCTAAACGCTGGATTCTA
CTCACGTGCGGAAGATGATTACGTGGCGGAAGCTGGTTGGGTGAGAGAAGAGGTAGAAGC
TGCTTACGAGTGGGTCGAGAAGAAACTGGTGTTCGAACCACATATTAAAGGATGGCAAAC
GGCGTTTATAGATGGTCTTTTGGAGGCTGGAGTGACTCCTTACAATGGCTTCACGTACGA
ACATGTTCATGGGACGAAAGTTGGTGGTACGATATTTGATCCGGATGGTAGAGACACACG
CGGCGAATCTATTGGAGTATGCTGATCCGCAAAAGATACTGTCTACTTGCGCGCTTCTGT
TCATAAGATCTCTTCACCACCACAGAAATATGAGCCCAAGCAAATGGAGTGATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK21TF U 1
AF RR2H477TF U 22
BS 1 355 RR2EK21TF
BS 356 356 RR2H477TF
BS 357 648 RR2EK21TF
BS 649 776 RR2H477TF

RD RR2EK21TF 648 0 0
GGATGCCTAGAAACAGATTTTCATAATGGATTTTCATATATTCCGATTATTTCGTTTGAT
TAGCGTCGCAGTTTTCATCTTCCATGGCTCGTGTTATTCCGAGAAAGCTGGTCACTATAG
TTTTCTGAAAGATGCAACATCAGCACCAACGTTATCTCACTTCGACTACATAGTCATCGG
AGGAGGAACCGCCGGATGTGCACTAGCCGCAACGCTATCTAGAAACGCCACCGTTTTACT
CCTCGAACGCGGTGGGTCCCCTTACGAAAACCCCACGGCCACAGACATCGGAAACTTCTT
GACCACGTTCTTGAACACAACTCCAAACTCGTGGTCTCAGCTATTCATCTCCGAATACGG
CGTTTTCAACACACGCGCACGCGTGCTCGGAGGAGGAACAGTGCTAAACGCTGGATTCTA
CTCACGTGCGGAAGATGATTACGTGGCGGAAGCTGGTTGGGTGAGAGAAGAGGTAGAAGC
TGCTTACGAGTGGGTCGAGAAGAAACTGGTGTTCGAACCACATATTAAAGGATGGCAAAC
GGCGTTTATAGATGGTCTTTTGGAGGCTGGAGTGACTCCTTACAATGGCTTCACGTACGA
ACATGTTCATGGGACGAAAGTTGGTGGTACGATATTTGATCCGGATGG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2H477TF 755 0 0
CATAATGGATTTTCATATATTCCGATTATTTCGTTTGATTAGCGTCGCAGTTTTCATCTT
CCATGGCTCGTGTTATTCCGAGAAAGCTGGTCACTATAGTTTTCTGAAAGATGCAACATC
AGCACCAACGTTATCTCACTTCGACTACATAGTCATCGGAGGAGGAACCGCCGGATGTGC
ACTAGCCGCAACGCTATCTAGAAACGCCACCGTTTTACTCCTCGAACGCGGTGGGTCCCC
TTACGAAAACCCCACGGCCACAGACATCGGAAACTTCTTGACCACGTTCTTGAACACAAC
TCCAAACTCGTGGTCTCAGCTATTCATCTCCGAAGACGGCGTTTTCAACACACGCGCACG
CGTGCTCGGAGGAGGAACAGTGCTAAACGCTGGATTCTACTCACGTGCGGAAGATGATTA
CGTGGCGGAAGCTGGTTGGGTGAGAGAAGAGGTAGAATCTGCTTACGAGTGGGTCGAGAA
GAAACTGGTGTTCGAACCACATATTAAAGGATGGCAAACGGCGTTTATAGATGGTCTTTT
GGAGGCTGGAGTGACTCCTTACAATGGCTTCACGTACGAACATGTTCATGGGACGAAAGT
TGGTGGTACGATATTTGATCCGGATGGTAGAGACACACGCGGCGAATCTATTGGAGTATG
CTGATCCGCAAAAGATACTGTCTACTTGCGCGCTTCTGTTCATAAGATCTCTTCACCACC
ACAGAAATATGAGCCCAAGCAAATGGAGTGATCTT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL6448Contig1 452 2 1 U
GGATCAATCAAAAACAAAAATCACTCAATAATAAATAAATATATCGTTTTTTTATAAAAA
TGGCAGACAACAAGCAGAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCCGAGGAGAAGA
CTAATGTGCTGGTGGACAAGATCAAGGTTGCTGCTACCTCAGCTGGAGCTTCTGCGCAAA
CCGCGGGGCAGAAGATAACAGAGGCTACAGGAGGCGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGA
CCGGCATGAAGAAATAGCCCATTCGACATAAAACTGGGAGTTATAGTATCCCTTTTTAAA
AAATTAATCGTTGTGGTTTTAAATAAAAATTGGATGTTCTAATTGGTTCTCATCGTCATC
GTAGTTGTTGTTGTTGTTTTAGTGTTTGAATTAATGCTTTCTCCCTTCTAGGTGTAAGTT
TGGATGTTTATGTATTTAATTTCCCGTTAATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GM31JQ C 1
AF RR2GM31TF U 1
BS 1 452 RR2GM31TF

RD RR2GM31JQ 452 0 0
GGATCAATCAAAAACAAAAATCACTCAATAATAAATAAATATATCGTTTTTTTATAAAAA
TGGCAGACAACAAGCAGAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCCGAGGAGAAGA
CTAATGTGCTGGTGGACAAGATCAAGGTTGCTGCTACCTCAGCTGGAGCTTCTGCGCAAA
CCGCGGGGCAGAAGATAACAGAGGCTACAGGAGGCGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGA
CCGGCATGAAGAAATAGCCCATTCGACATAAAACTGGGAGTTATAGTATCCCTTTTTAAA
AAATTAATCGTTGTGGTTTTAAATAAAAATTGGATGTTCTAATTGGTTCTCATCGTCATC
GTAGTTGTTGTTGTTGTTTTAGTGTTTGAATTAATGCTTTCTCCCTTCTAGGTGTAAGTT
TGGATGTTTATGTATTTAATTTCCCGTTAATG

QA 1 452 1 452
DS 

RD RR2GM31TF 452 0 0
GGATCAATCAAAAACAAAAATCACTCAATAATAAATAAATATATCGTTTTTTTATAAAAA
TGGCAGACAACAAGCAGAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCCGAGGAGAAGA
CTAATGTGCTGGTGGACAAGATCAAGGTTGCTGCTACCTCAGCTGGAGCTTCTGCGCAAA
CCGCGGGGCAGAAGATAACAGAGGCTACAGGAGGCGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGA
CCGGCATGAAGAAATAGCCCATTCGACATAAAACTGGGAGTTATAGTATCCCTTTTTAAA
AAATTAATCGTTGTGGTTTTAAATAAAAATTGGATGTTCTAATTGGTTCTCATCGTCATC
GTAGTTGTTGTTGTTGTTTTAGTGTTTGAATTAATGCTTTCTCCCTTCTAGGTGTAAGTT
TGGATGTTTATGTATTTAATTTCCCGTTAATG

QA 1 452 1 452
DS 



AS 1 2

CO CL6449Contig1 765 2 1 U
GGATTGCAGGCAAGACCACTGAAATTGAGCAACTGGAAACACAAAACAGAGAAATGGTTG
CTAGAATCTCGGAACTTGAGAAGACAATGGACGAGAGAGGAACTGAACTCTCTGCTTTAA
CCCAAAAACTTGAGGATAACGAGAAGCAATCATCGTCCACAATCGAGAGTTTGACAGCTG
AGATCAATGGCCTAAGAGTAGCACTAGATTCAGTGTCTCTTCAAAAGGAAGAGTTAGAGA
AACTAATGGAGAGCAAAGGCAATGAAGCTTCAATTCAGAATAAGGGTTTGATGGATGAGA
TCAATGTTCTGGGCCAGAAAGTGACGTCACTTGAAAGCCAGAAAGCAGAACTTGAGATTC
AACTTGAAAGGAAGTCCGAGGAGAGCTCTGAATACATGAATCAGATTGCAAATCTAAAAG
AGGAGATCATAAGCAAGGTCAAAGATAACGATAATATTCTAGAAGAGAGAAATGGTTTAT
CTGAGAAGATCAAGGGTCTTGAAGTTGAGATAGAGACTCTACGGAAACAGAGAAGTGAGC
TTGATGAGGAGCTAAGAATTAAAACAGAAGAGATGGTTCAAATGCGCGATAAGATTAATG
AATCATCGGCTGAAACAGTGGCCTTAACGGAACAGATAAACAATCTGCAGCACGAACTTG
ATTCACTGCAGTGAAGAAGAGTGAAACCGAAGCTGAGCTTGATAGAGAGAGCAAGAGAAA
TCAGATTGTCTATCAGTTCACTGAAGTCAAAGAGCATTGGTAGAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G277TF U 1
AF RR2G265TF U 1
BS 1 765 RR2G265TF

RD RR2G277TF 174 0 0
GGATTGCAGGCAAGACCACTGAAATTGAGCAACTGGAAACACAAAACAGAGAAATGGTTG
CTAGAATCTCGGAACTTGAGAAGACAATGGACGAGAGAGGAACTGAACTCTCTGCTTTAA
CCCAAAAACTTGAGGATAACGAGAAGCAATCATCGTCCACGATCGAGAGTTTGA

QA 1 174 1 174
DS 

RD RR2G265TF 765 0 0
GGATTGCAGGCAAGACCACTGAAATTGAGCAACTGGAAACACAAAACAGAGAAATGGTTG
CTAGAATCTCGGAACTTGAGAAGACAATGGACGAGAGAGGAACTGAACTCTCTGCTTTAA
CCCAAAAACTTGAGGATAACGAGAAGCAATCATCGTCCACAATCGAGAGTTTGACAGCTG
AGATCAATGGCCTAAGAGTAGCACTAGATTCAGTGTCTCTTCAAAAGGAAGAGTTAGAGA
AACTAATGGAGAGCAAAGGCAATGAAGCTTCAATTCAGAATAAGGGTTTGATGGATGAGA
TCAATGTTCTGGGCCAGAAAGTGACGTCACTTGAAAGCCAGAAAGCAGAACTTGAGATTC
AACTTGAAAGGAAGTCCGAGGAGAGCTCTGAATACATGAATCAGATTGCAAATCTAAAAG
AGGAGATCATAAGCAAGGTCAAAGATAACGATAATATTCTAGAAGAGAGAAATGGTTTAT
CTGAGAAGATCAAGGGTCTTGAAGTTGAGATAGAGACTCTACGGAAACAGAGAAGTGAGC
TTGATGAGGAGCTAAGAATTAAAACAGAAGAGATGGTTCAAATGCGCGATAAGATTAATG
AATCATCGGCTGAAACAGTGGCCTTAACGGAACAGATAAACAATCTGCAGCACGAACTTG
ATTCACTGCAGTGAAGAAGAGTGAAACCGAAGCTGAGCTTGATAGAGAGAGCAAGAGAAA
TCAGATTGTCTATCAGTTCACTGAAGTCAAAGAGCATTGGTAGAG

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL6450Contig1 687 2 2 U
TTGGAGAAAACACACAAATCTTTACCCACTGATTTGCTTACAAGCTTCTAGTCAGAAAAT
GAGTTTTAGATAATCATCAAATACATAGGCATAACACAAAGAGATCCATCCTAAACAAAG
AGCTCTCTAGCGTCTTCTTTTATCAAACACAGACTCTCTCTCTCAAGAGATACTTAAAGA
AACAAATAAGTAAGGCGAGTGGTTAAGAATCTATTTCCTTGGCGGATTTGTTGATGAAAG
ACTTGTGGATATGAGGGATAACACCACCACCAGCTATAGTTCCTTTGATGAGAGTATCAA
GCTCTTCATCTCCACGAATCGCAAGCTGCAAGTGCCTGGGAGAGATACGTTTCACCTTGA
GATCCTTGCTAGCATTACCAGCCAACTCCAAAACTTCTGCAGTAAGATACTCAAGTATCG
CTGCGGTGTAGACAGCTGCAGTTGCTCCGACCCTTCCGTGAGCAGTGGACCTTGTCTTCA
ACAGCCTATGCACCCTTCCTACAGGGAACTGAAGACCAGCTCGAGCAGAACGGGTGATGG
GTTGTTTCTTCTTGTCCTTATCCTTCTCGCTACCGCTGGGTTTCCCCATTATCAATCCTT
TAGCTCCTTTCCCCGACATTTTTCCCGCCAAAAGTCTCACAATTTGCTGCGCTGATAGAG
AGAAGAGAGAGAGAGAGATCGCAGTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BO32TF C 1
AF RR2BO32JQ U 3
BS 1 2 RR2BO32TF
BS 3 687 RR2BO32JQ

RD RR2BO32TF 687 0 0
TTGGAGAAAACACACAAATCTTTACCCACTGATTTGCTTACAAGCTTCTAGTCAGAAAAT
GAGTTTTAGATAATCATCAAATACATAGGCATAACACAAAGAGATCCATCCTAAACAAAG
AGCTCTCTAGCGTCTTCTTTTATCAAACACAGACTCTCTCTCTCAAGAGATACTTAAAGA
AACAAATAAGTAAGGCGAGTGGTTAAGAATCTATTTCCTTGGCGGATTTGTTGATGAGAG
ACTTGTGGATATGAGGGATAACACCACCACCAGCTATAGTTCCTTTGATGAGAGTATCAA
GCTCTTCATCTCCACGAATCGCAAGCTGCAAGTGCCTGGGAGAGATACGTTTCACCTTGA
GATCCTTGCTAGCATTACCAGCCAACTCCAAAACTTCTGCAGTAAGATACTCAAGTATCG
CTGCGGTGTAGACAGCTGCAGTTGCTCCGACCCTTCCGTGAGCAGTGGACCTTGTCTTCA
ACAGCCTATGCACCCTTCCTACAGGGAACTGAAGACCAGCTCGAGCAGAACGGGTGATGG
GTTGTTTCTTCTTGTCCTTATCCTTCTCGCTACCGCTGGGTTTCCCCATTATCAATCCTT
TAGCTCCTTTCCCCGACATTTTTCCCGCCAAAAGTCTCACAATTTGCTGCGCTGATAGAG
AGAAGAGAGAGAGAGAGATCGCAGTCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2BO32JQ 685 0 0
GGAGAAAACACACAAATCTTTACCCACTGATTTGCTTACAAGCTTCTAGTCAGAAAATGA
GTTTTAGATAATCATCAAATACATAGGCATAACACAAAGAGATCCATCCTAAACAAAGAG
CTCTCTAGCGTCTTCTTTTATCAAACACAGACTCTCTCTCTCAAGAGATACTTAAAGAAA
CAAATAAGTAAGGCGAGTGGTTAAGAATCTATTTCCTTGGCGGATTTGTTGATGAAAGAC
TTGTGGATATGAGGGATAACACCACCACCAGCTATAGTTCCTTTGATGAGAGTATCAAGC
TCTTCATCTCCACGAATCGCAAGCTGCAAGTGCCTGGGAGAGATACGTTTCACCTTGAGA
TCCTTGCTAGCATTACCAGCCAACTCCAAAACTTCTGCAGTAAGATACTCAAGTATCGCT
GCGGTGTAGACAGCTGCAGTTGCTCCGACCCTTCCGTGAGCAGTGGACCTTGTCTTCAAC
AGCCTATGCACCCTTCCTACAGGGAACTGAAGACCAGCTCGAGCAGAACGGGTGATGGGT
TGTTTCTTCTTGTCCTTATCCTTCTCGCTACCGCTGGGTTTCCCCATTATCAATCCTTTA
GCTCCTTTCCCCGACATTTTTCCCGCCAAAAGTCTCACAATTTGCTGCGCTGATAGAGAG
AAGAGAGAGAGAGAGATCGCAGTCC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL6451Contig1 786 2 20 U
GGTTACACAAAGAAGAATCTCTGAAGATCGTCTCTGTTCCTCTCTCGATTCTTCGCAGCT
ATCGTTTTCTCGATCTTGGTTGGTTGGGTTAGCCATGACGAACACAGACGAAACGGAGAG
TTGCGGCAGCAGAGCCGTGGTGGCTTCGCCGTCCCAGGAAAACCCTAGACACTACCGGAT
GAAACTCGATGTCTACGGCGAAATCTTACAGCGGCTCCAAGAATCTAACTACGAGGAAGC
CACTCTTCCTGATTTCGAGGATCAGCTTTGGCAACATTTCAATCGTCTTCCCACTCGATA
TGCTCTGGATGTTAAAGTGGAGAGAGCAGAAGATGTTCTCACACATCAGAGATTACTAAA
ACTGGCGGAAGATCCTGCAACCAGGCCTGTGTTTGATGTTCATAGCGTACAGGTTGCTCC
CAGAAACGCTGCTGAGTCTGACCCTGCGTTGGAGGAAGATGCTCAAAGCTCTAGCCACAC
GAGAGGGCAGGGGGTTCTCGCACCTCCGACTTTTGGCTCTTCTCCAAATTTTGAGGCTAT
TACTCTTGGAAATAAAATTGTTGAAGATGTTGATAGTGCTGTTAATGCAACTCTCACTAC
TCGACCGATGCATGAGATCACCTTCTCAACCATCGACAAGCCTAAACTCCTTAGTCAGCT
TACTTCCCTGCTAGTGAGCTTGGATTGAATATTCAAGAGCTCATGCTTTCTCCACTGTCG
ATGGTTTTTCTTTGGATGTACTTGTTGTCGATGGTTGGTCTCAGAGAAACAGATGGCTTA
AAAGAC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT73TF U 1
AF RR2DC88TF U 3
BS 1 35 RR2CT73TF
BS 36 39 RR2DC88TF
BS 40 60 RR2CT73TF
BS 61 61 RR2DC88TF
BS 62 159 RR2CT73TF
BS 160 160 RR2DC88TF
BS 161 207 RR2CT73TF
BS 208 208 RR2DC88TF
BS 209 291 RR2CT73TF
BS 292 293 RR2DC88TF
BS 294 342 RR2CT73TF
BS 343 343 RR2DC88TF
BS 344 357 RR2CT73TF
BS 358 358 RR2DC88TF
BS 359 378 RR2CT73TF
BS 379 379 RR2DC88TF
BS 380 739 RR2CT73TF
BS 740 741 RR2DC88TF
BS 742 751 RR2CT73TF
BS 752 786 RR2DC88TF

RD RR2CT73TF 751 0 0
GGTTACACAAAGAAGAATCTCTGAAGATCGTCTCT****CTCTCTCGATTCTTCGCAGCT
GTCGTTTTCTCGATCTTGGTTGGTTGGGTTAGCCATGACGAACACAGACGAAACGGAGAG
TTGCGGCAGCAGAGCCGTGGTGGCTTCGCCGTCCCAGGAGAACCCTAGACACTACCGGAT
GAAACTCGATGTCTACGGCGAAATCTTGCAGCGGCTCCAAGAATCTAACTACGAGGAAGC
CACTCTTCCTGATTTCGAGGATCAGCTTTGGCAACATTTCAATCGTCTTCCTGCTCGATA
TGCTCTGGATGTTAAAGTGGAGAGAGCAGAAGATGTTCTCACGCATCAGAGATTACTGAA
ACTGGCGGAAGATCCTGCTACCAGGCCTGTGTTTGATGTTCATAGCGTACAGGTTGCTCC
CAGAAACGCTGCTGAGTCTGACCCTGCGTTGGAGGAAGATGCTCAAAGCTCTAGCCACAC
GAGAGGGCAGGGGGTTCTCGCACCTCCGACTTTTGGCTCTTCTCCAAATTTTGAGGCTAT
TACTCTTGGAAATAAAATTGTTGAAGATGTTGATAGTGCTGTTAATGCAACTCTCACTAC
TCGACCGATGCATGAGATCACCTTCTCAACCATCGACAAGCCTAAACTCCTTAGTCAGCT
TACTTCCCTGCTAGTGAGCTTGGATTGAATATTCAAGAGCTCATGCTTTCTCCACTGTCG
ATGGTTTTTCTTTGGATGTCTTTGTTGTCGA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2DC88TF 784 0 0
GG
ACACAAAGAAGAATCTCTGAAGATCGTCTCTGTTCCTCTCTCGATTCTTCGCAGCTATCG
TTTTCTCGATCTTGGTTGGTTGGGTTAGCCATGACGAACACAGATGAAACGGAGAGTTGC
GGCAGCAGAGCCGTGGTGGCTTCGCCGTCCCAGGAAAACCCTAGACACTACCGGATGAAA
CTCGATGTCTACGGCGAAATCTTACAGCGGCTCCAAGAATCTAACTACGAGGAAGCCACT
CTTCCTGATTTCGAGGATCAGCTTTGGCAACATTTCAATCGTCTTCCCACTCGATATGCT
CTGGATGTTAAAGTGGAGAGAGCAGAAGATGTTCTCACACATCAGAGATTACTAAAACTG
GCGGAAGATCCTGCAACCAGGCCTGTGTTTGATGTTCATAGCGTACAGGTTGCTCCCAGA
AACGCTGCTGAGTCTGACCCTGCGTTGGAGGAAGATGCTCAAAGCTCTAGCCACACGAGA
GGGCAGGGGGTTCTTGCACCTCCGACTTTTGGCTCTTCTCCAAATTTTGAGGCTATTACT
CTTGGAAATAAAATTGTTGAAGATGTTGATAGTGCTGTTAATGCAACTCTCACTACTCGA
CCGATGCATGAGATCACCTTCTCAACCATCGACAAGCCTAAACTCCTTAGTCAGCTTACT
TCCCTGCTAGTGAGCTTGGATTGAATATTCAAGAGCTCATGCTTTCTCCACTGTCGATGG
TTTTTCTTTGGATGTACTTGTTGTCGATGGTTGGTCTCAGAGAAACAGATGGCTTAAAAG
AC

QA 3 784 3 784
DS 



AS 1 2

CO CL6452Contig1 1015 2 4 U
GGTTTCCGGCTTCGTCCATGGCGGATGGGTACTGGAACCAGCAGAGACACCACCAGCCTC
CGATGTTGTCGAACTCCCACGGTGGTCCTCTCAAACGTCCCCGTTCTGACTTGGGTCATG
ATATGCATGGTTACGTGTCACGGGATGAGGATCGAGGTAACCCTCAAGATACAAGAACTA
TTGGCTCTGCTTATGACCTCTACCTCCAGAGTGTGCAAACGTCTTCTATGCCATCTGAAG
AAGTTGGTCGGTTTAATAGTGTTGGCATGGGAAAACGAGGAGGTGACAGCGTGATGCCTA
GTCCGTCGTCCATGGGTGACCTCATGTCTGGGCGTGGTGGAATCCTGCCTCCAGATTTTG
GGTCAAATGGTCGAGCTTTGGGCTTTGGTCAACAAGATTTAGCTGGTAGGCCTAGCCGGG
AGCTGCTTCGTCTACCTCCAGATGCATCCAACACTCTTTTTGTTGAAGGACTTCCTTCTA
ATTGCTCAAGGCGGGAAGTATCTCATATATTTAGGCCCTTTTTGGGATATAAAGAAGTGA
GACTTGTGACCAAAGATTCAAAGCAAAGGAATGGAGATCCTATTGTTCTTTGTTTTGTTG
ATTTTGAAAATCCTGCATGTGCAGCAACTGCTCGTACCGCCCTGCAAGGCTATAGAATGG
ATGAAAATGAACCTGATTCCAAGATTTTGCAAATCCAATTTTCAAGAAACCCAGGTCCAA
GACCAGGACAACGTGGAGGAAGGAGATGATGATGAGTCAGTGTCCTTAGGAGTACTCTCA
CTCAAAGCAATATAGATGTATGATAGACACAAGTGTTTAGGAGATGAGTTTGATTGGAAT
CTCAAGTCTTTCTCACACTCTCTCCTTTTTTCCACCACCTTGATAGATTTAGTGCATGAT
CTTACTACGGCTTTTTATCGAGCCCAAAAAAACTTGTTGCAGTCCTTTCCTTTGTATGTG
TGGGGATGATACGATAAATGATTTTGATAGTGTCCTCAAGGGATTGCATTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G944TF U 1
AF RR2G944JQ C 457
BS 1 568 RR2G944TF
BS 569 569 RR2G944JQ
BS 570 646 RR2G944TF
BS 647 1015 RR2G944JQ

RD RR2G944TF 652 0 0
GGTTTCCGGCTTCGTCCATGGCGGATGGGTACTGGAACCAGCAGAGACACCACCAGCCTC
CGATGTTGTCGAACTCCCACGGTGGTCCTCTCAAACGTCCCCGTTCTGACTTGGGTCATG
ATATGCATGGTTACGTGTCACGGGATGAGGATCGAGGTAACCCTCAAGATACAAGAACTA
TTGGCTCTGCTTATGACCTCTACCTCCAGAGTGTGCAAACGTCTTCTATGCCATCTGAAG
AAGTTGGTCGGTTTAATAGTGTTGGCATGGGAAAACGAGGAGGTGACAGCGTGATGCCTA
GTCCGTCGTCCATGGGTGACCTCATGTCTGGGCGTGGTGGAATCCTGCCTCCAGATTTTG
GGTCAAATGGTCGAGCTTTGGGCTTTGGTCAACAAGATTTAGCTGGTAGGCCTAGCCGGG
AGCTGCTTCGTCTACCTCCAGATGCATCCAACACTCTTTTTGTTGAAGGACTTCCTTCTA
ATTGCTCAAGGCGGGAAGTATCTCATATATTTAGGCCCTTTTTGGGATATAAAGAAGTGA
GACTTGTGACCAAAGATTCAAAGCAAAG*AATGGAGATCCTATTGTTCTTTGTTTTGTTG
ATTTTGAAAATCCTGCATGTGCAGCAACTGCTCGTACCGCCCTGCA
GCTATA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2G944JQ 559 0 0
TTTTTGTTGAAGGACTTCCTTCTAATTGCTCAAGGCGGGAAGTATCTCATATATTTAGGC
CCTTTTTGGGATATAAAGAAGTGAGACTTGTGACCAAAGATTCAAAGCAAAGGAATGGAG
ATCCTATTGTTCTTTGTTTTGTTGATTTTGAAAATCCTGCATGTGCAGCAACTGCTCGTA
CCGCCCTGCAAGGCTATAGAATGGATGAAAATGAACCTGATTCCAAGATTTTGCAAATCC
AATTTTCAAGAAACCCAGGTCCAAGACCAGGACAACGTGGAGGAAGGAGATGATGATGAG
TCAGTGTCCTTAGGAGTACTCTCACTCAAAGCAATATAGATGTATGATAGACACAAGTGT
TTAGGAGATGAGTTTGATTGGAATCTCAAGTCTTTCTCACACTCTCTCCTTTTTTCCACC
ACCTTGATAGATTTAGTGCATGATCTTACTACGGCTTTTTATCGAGCCCAAAAAAACTTG
TTGCAGTCCTTTCCTTTGTATGTGTGGGGATGATACGATAAATGATTTTGATAGTGTCCT
CAAGGGATTGCATTTGTTC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL6453Contig1 940 2 2 U
GGATAATCAACCGCTCTAATTTGAAATCTTCGATTCGATTTGATTGTTATGGAGGCAGAG
TTGCTCGATTGGGAGCTTGTGCATGGCTCCGACACCGAACCAACTGATTCAATCGCATTG
GAGAAGGAATCGTGGAGCTCAAGTGTAATCGACGATGGTATGATTCTCTCTCATCATTTC
TCTCCCGATAATCAGAGCCTGCCATCTGGTTTCAGTGATGAGAATCACGCCGAGATCGAT
GCTATTGAGTGTTTGTCGGAAACAGAACATCTCCAAGTTGCGGATGGTGGAGAACCTATT
GAGGATGGGAGCAACTCGAGCTCTGATTCAGGGGGAAAACAACTCGTTTCTAGAGATTCT
GGGATTGCTTATGGTGAAGAGGAGATTGGATCTGATAGGGAAAGTGGAGGGGGTGCTGTG
GGATGTGGTGATGAGAGTAAAAGCAGAGAGAGTGTTTGGTGGAAGATGCCATTTGTGCTT
GTCAACTACTCTGCTTTTAGGATTCGTCCTGTCTGGTCTCTCTCCATGGCTGCAGCTGTC
ATGGGTTTTCTACTCTTGGGACGCAGACTCTACAACATTAAAAACAAACCTCAAAGGATT
CATCTGAAAGTCGATATCGACTATACGAAGGTGTCCCAGGTGATGAGTCAGGCAGGTCGA
CTCAACGAAGCATTCACAGAGGTAAGAAGGGTCCCTGTGATCCGCCCTGCTCTGCCAGCT
CCTGGTGCATGGCCAGTTTTGAGCCTTAGATGAGAAGCTGGATCATACAATGTTTTCATC
TATCAAAAGAACAGAGATGCATGCCTGTACAGCGTCTTATCATGCTATGATACTCATACC
ATATGCTATATTGTTATACATAGTAGTTTACCAAGTTATGCAATCATTTTGTCAAATAGT
AGATACCATTTTCTTTGATCAAAAAATCCATTTGAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO64TF U 1
AF RR2EO64JQ C 31
BS 1 685 RR2EO64TF
BS 686 940 RR2EO64JQ

RD RR2EO64TF 685 0 0
GGATAATCAACCGCTCTAATTTGAAATCTTCGATTCGATTTGATTGTTATGGAGGCAGAG
TTGCTCGATTGGGAGCTTGTGCATGGCTCCGACACCGAACCAACTGATTCAATCGCATTG
GAGAAGGAATCGTGGAGCTCAAGTGTAATCGACGATGGTATGATTCTCTCTCATCATTTC
TCTCCCGATAATCAGAGCCTGCCATCTGGTTTCAGTGATGAGAATCACGCCGAGATCGAT
GCTATTGAGTGTTTGTCGGAAACAGAACATCTCCAAGTTGCGGATGGTGGAGAACCTATT
GAGGATGGGAGCAACTCGAGCTCTGATTCAGGGGGAAAACAACTCGTTTCTAGAGATTCT
GGGATTGCTTATGGTGAAGAGGAGATTGGATCTGATAGGGAAAGTGGAGGGGGTGCTGTG
GGATGTGGTGATGAGAGTAAAAGCAGAGAGAGTGTTTGGTGGAAGATGCCATTTGTGCTT
GTCAACTACTCTGCTTTTAGGATTCGTCCTGTCTGGTCTCTCTCCATGGCTGCAGCTGTC
ATGGGTTTTCTACTCTTGGGACGCAGACTCTACAACATTAAAAACAAACCTCAAAGGATT
CATCTGAAAGTCGATATCGACTATACGAAGGTGTCCCAGGTGATGAGTCAGGCAGGTCGA
CTCAACGAAGCATTCACAGAGGTAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2EO64JQ 910 0 0
TCGA
TCGATTTGATT*TTATGGAGGCAGAGTTGCTCGATTGGGAGCTTGTGCATG*CTC*GACA
CCGAACCAACTGATTCAATCGCAT*GGAGAGGGA*TCGTGGAGCTCAAGTGTAATCGACG
ATGGTATGAT*CTCTCTCATCATTTCTCTCCCGATAATCAGAGCCTGCCATCTGGTTTCA
GTGATGAGAATCACGCCGAGATCGATGCTATTGAGTGTTTGTCGGAAACAGAACATCTCC
AAGTTGCGGATGGTGGAGAACCTATTGAGGATGGGAGCAACTCGAGCTCTGATTCAGGGG
GAAAACAACTCGTTTCTAGAGATTCTGGGATTGCTTATGGTGAAGAGGAGATTGGATCTG
ATAGGGAAAGTGGAGGGGGTGCTGTGGGATGTGGTGATGAGAGTAAAAGCAGAGAGAGTG
TTTGGTGGAAGATGCCATTTGTGCTTGTCAACTACTCTGCTTTTAGGATTCGTCCTGTCT
GGTCTCTCTCCATGGCTGCAGCTGTCATGGGTTTTCTACTCTTGGGACGCAGACTCTACA
ACATTAAAAACAAACCTCAAAGGATTCATCTGAAAGTCGATATCGACTATACGAAGGTGT
CCCAGGTGATGAGTCAGGCAGGTCGACTCAACGAAGCATTCACAGAGGTAAGAAGGGTCC
CTGTGATCCGCCCTGCTCTGCCAGCTCCTGGTGCATGGCCAGTTTTGAGCCTTAGATGAG
AAGCTGGATCATACAATGTTTTCATCTATCAAAAGAACAGAGATGCATGCCTGTACAGCG
TCTTATCATGCTATGATACTCATACCATATGCTATATTGTTATACATAGTAGTTTACCAA
GTTATGCAATCATTTTGTCAAATAGTAGATACCATTTTCTTTGATCAAAAAATCCATTTG
AATTCC

QA 5 910 5 910
DS 



AS 1 2

CO CL6454Contig1 1084 2 2 U
GAGTCCACACACACCAAACCAACTCACACTGTAGCGAGCGAGCGAGCGAGATAGAGAAAG
AAAGAGAGAAACAAACTCTTGGACGAACGAAACTTTTCACTCAATTCTCAAGGCGAGAGA
ATCAATCCTCCATTGTATCGATCGATCGATCATGCCTCCCGGTGCGAAGAAGAGAAAGGC
GTTGAAGAAGCAGCAGCAGCAAGAAGCGATTGGAACAAGTACGAACAATAAGAGCTTCAA
TGGCGATAATCTCCACGGAAATGATGAACAAGGAAGCCAAGATGATAGGGAAAGTGATAG
CACTTTGAGTTCCCCTGTTTCTCAAGAGAATCAAGAATTTGGTGTCACCAAAGATCCATC
ACCTTCTTTGGCGGTGAAGGAGAAGGACACTACTGCTAAAGAGATATCAGATGTTACTCA
GGGACTAGGACCCAAAACTGGAAATGACGTCGCAGTTGAAAAAGGAACGGATGACAATGA
CAATATTGTGGAGAAATCTACCATTTCATCTAATGGCAATTCCACTCAGGATTCTTGTGG
TGATTCAGTTGAGGAAATCGCTCCTGTTGTCGATTCCGTCTCTAAAGTAGTGGTTCCTGA
TAAGAGTGAGCATGCTGAGACCTCAACACACTCAAATTTGGTCAAACAGAAGTCTGATGA
CAAGAAAGAGTATCAATCTCTGGAGAAAGAAAACGGTGAGGTGGTTACTCTTCCAGGGTC
TGCTGATGGAACAAGCAGAAATGTAGAGAGTGCAAGAGAATCTGAAGCTCCGGTATCCTC
TGAGGAAAATCGTCTTTTGTTGCCTGCCCCACCAGCTGTCAGAACTTCATGGTTAAGTTG
CTGCGGTTTGTTCGACGCAGTGAGAGGGTCTGACAGATAAACACAGGAGTTAGATAAAGA
TGGACGCTAATGACAGCAAAGCTCAAAGACAACCAAAAAAGTAGAACTTACAGTCGGTAC
ACTCTTCTTTGTACATCATCTTTGATAGATAATAATGTGGGCGGCTTTTAGCAACATAAA
TCCCATTTTTCCTTTCATTTTTGAAATACAGTCTTAATTTATCCATTAAATGGATTTTAG
ATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2DU81TF U 1
AF RR2DU81JQ C 457
BS 1 692 RR2DU81TF
BS 693 1084 RR2DU81JQ

RD RR2DU81TF 696 0 0
GAGTCCACACACACCAAACCAACTCACACTGTAGCGAGCGAGCGAGCGAGATAGAGAAAG
AAAGAGAGAAACAAACTCTTGGACGAACGAAACTTTTCACTCAATTCTCAAGGCGAGAGA
ATCAATCCTCCATTGTATCGATCGATCGATCATGCCTCCCGGTGCGAAGAAGAGAAAGGC
GTTGAAGAAGCAGCAGCAGCAAGAAGCGATTGGAACAAGTACGAACAATAAGAGCTTCAA
TGGCGATAATCTCCACGGAAATGATGAACAAGGAAGCCAAGATGATAGGGAAAGTGATAG
CACTTTGAGTTCCCCTGTTTCTCAAGAGAATCAAGAATTTGGTGTCACCAAAGATCCATC
ACCTTCTTTGGCGGTGAAGGAGAAGGACACTACTGCTAAAGAGATATCAGATGTTACTCA
GGGACTAGGACCCAAAACTGGAAATGACGTCGCAGTTGAAAAAGGAACGGATGACAATGA
CAATATTGTGGAGAAATCTACCATTTCATCTAATGGCAATTCCACTCAGGATTCTTGTGG
TGATTCAGTTGAGGAAATCGCTCCTGTTGTCGATTCCGTCTCTAAAGTAGTGGTTCCTGA
TAAGAGTGAGCATGCTGAGACCTCAACACACTCAAATTTGGTCAAACAGAAGTCTGATGA
CAAGAAAGAGTATCAATCTCTGGAGAAAGAAA
CGGT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2DU81JQ 628 0 0
TGAAAAAGGAACGGATGACAATGACAATATTGTGGAGAAATCTACCATTTCATCTAATGG
CAATTCCACTCAGGATTCTTGTGGTGATTCAGTTGAGGAAATCGCTCCTGTTGTCGATTC
CGTCTCTAAAGTAGTGGTTCCTGATAAGAGTGAGCATGCTGAGACCTCAACACACTCAAA
TTTGGTCAAACAGAAGTCTGATGACAAGAAAGAGTATCAATCTCTGGAGAAAGAAAACGG
TGAGGTGGTTACTCTTCCAGGGTCTGCTGATGGAACAAGCAGAAATGTAGAGAGTGCAAG
AGAATCTGAAGCTCCGGTATCCTCTGAGGAAAATCGTCTTTTGTTGCCTGCCCCACCAGC
TGTCAGAACTTCATGGTTAAGTTGCTGCGGTTTGTTCGACGCAGTGAGAGGGTCTGACAG
ATAAACACAGGAGTTAGATAAAGATGGACGCTAATGACAGCAAAGCTCAAAGACAACCAA
AAAAGTAGAACTTACAGTCGGTACACTCTTCTTTGTACATCATCTTTGATAGATAATAAT
GTGGGCGGCTTTTAGCAACATAAATCCCATTTTTCCTTTCATTTTTGAAATACAGTCTTA
ATTTATCCATTAAATGGATTTTAGATTC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL6455Contig1 1170 2 2 U
GGATCAGTTTCATGCACATTTCATCACTTCCGGTGGTACGAATCAGAACTCTGTTCTCGC
TAACATCCTCTTTGCTATCACCTCAATAACACCGTCTCCGACATCGACACATGCTTTATC
ATCCACTTCTGTCATCGTGCGTTACGCGAATTTAGTGTTCAGTTTGTTTACAAACCCATC
TACGTTCTGCTTCAACACGATCGTTAGAGTCTACACCCTTCACGCGCCGTCTCTCTCTCC
CCACCGTTTCTTCGTCCAGATGCGACGCCGTTCCGTTCCTCCCGACTTCCACACCTTCCC
TTTCGTGTTCAAGGCCGCTTGTGCGAAGAAGAAGAAGAACGTTAGCTTTGCCTTAGTCGA
GGCGCTGCATTGCCAAGCTCTGAGATTCGGGTTGCTGTCCGATTCGTTTTTAGCTACTGG
GTTGGTTGATTTCTATGCGAAATGTGGTTTCATCGAGACAGCGATGGAGATCTTTAGTTT
GTGTTCAGACAAGGCTTTGTTCACATGGAATGCTATGATCACCGGTCTTGCAATGCACGG
TTACGGCGAGGTAACTGTTGATTACTTCCGTAGGATGGTTGGCTCGGGTGTGAAACCTGA
TGGTGTAAGCTTCATAAGCGTGTTAGTGGGTTGCTGCCATGCTGGTCTAGTTGATGAAGC
CAAGAAGCTTTTCGACCAAATGGGGGTCGAAGTATGATGTCGACAGAGAGATGAAACATT
ACGGGTGCATGGCGGATTTGCTGGGAAGAGCGGGGTTGATAGAAGAAGCAGCGGAGATGA
TTGAGAAAATGCCTAGAGATGGAGGGAAGAGAGAGAAGCTGTTGGCGTGGAGCGGTCTGT
TGGGAGTGTGTAGAATCCACGGGAACATAGAGGTGGCGGAGAAAGCTGCGGAGAGAGTTA
GGGAGCTGAGTCCAGAGGATGGAGGAGTGTATAAAGTGATGGCGGAGATGTATGCAAATG
CTGAGAGATGGGAGGATGTGGTTAAGGTTAGGCAAGTAATGGAAAGAGATGAGAGAGTGA
ACAAGAGTGCTGGGTTTAGTAGAGTTATGTCCTAAGTCCTCATAACCATATCATCATTTG
GACTTGTATTAGTATTTACAAATTCAAAATTTTTTTATCAGAGTTGAATATTTGTATTTT
TAACTAATAAATCTTTGTATATTCGTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B207TF U 1
AF RR2B207JQ C 376
BS 1 804 RR2B207TF
BS 805 1170 RR2B207JQ

RD RR2B207TF 804 0 0
GGATCAGTTTCATGCACATTTCATCACTTCCGGTGGTACGAATCAGAACTCTGTTCTCGC
TAACATCCTCTTTGCTATCACCTCAATAACACCGTCTCCGACATCGACACATGCTTTATC
ATCCACTTCTGTCATCGTGCGTTACGCGAATTTAGTGTTCAGTTTGTTTACAAACCCATC
TACGTTCTGCTTCAACACGATCGTTAGAGTCTACACCCTTCACGCGCCGTCTCTCTCTCC
CCACCGTTTCTTCGTCCAGATGCGACGCCGTTCCGTTCCTCCCGACTTCCACACCTTCCC
TTTCGTGTTCAAGGCCGCTTGTGCGAAGAAGAAGAAGAACGTTAGCTTTGCCTTAGTCGA
GGCGCTGCATTGCCAAGCTCTGAGATTCGGGTTGCTGTCCGATTCGTTTTTAGCTACTGG
GTTGGTTGATTTCTATGCGAAATGTGGTTTCATCGAGACAGCGATGGAGATCTTTAGTTT
GTGTTCAGACAAGGCTTTGTTCACATGGAATGCTATGATCACCGGTCTTGCAATGCACGG
TTACGGCGAGGTAACTGTTGATTACTTCCGTAGGATGGTTGGCTCGGGTGTGAAACCTGA
TGGTGTAAGCTTCATAAGCGTGTTAGTGGGTTGCTGCCATGCTGGTCTAGTTGATGAAGC
CAAGAAGCTTTTCGACCAAATGGGGGTCGAAGTATGATGTCGACAGAGAGATGAAACATT
ACGGGTGCATGGCGGATTTGCTGGGAAGAGCGGGGTTGATAGAAGAAGCAGCGGAGATGA
TTGAGAAAATGCCTAGAGATGGAG

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2B207JQ 795 0 0
AGCTCTGAGATTCGGGTTGCTGTCCGATTCGTTTTTAGCTACTGGGTTGGTTGATTTCTA
TGCGAAATGTGGTTTCATCGAGACAGCGATGGAGATCTTTAGTTTGTGTTCAGACAAGGC
TTTGTTCACATGGAATGCTATGATCACCGGTCTTGCAATGCACGGTTACGGCGAGGTAAC
TGTTGATTACTTCCGTAGGATGGTTGGCTCGGGTGTGAAACCTGATGGTGTAAGCTTCAT
AAGCGTGTTAGTGGGTTGCTGCCATGCTGGTCTAGTTGATGAAGCCAAGAAGCTTTTCGA
CCAAATGGGG*TCGAAGTATGATGTCGACAGAGAGATGAAACATTACGGGTGCATGGCGG
ATTTGCTGGGAAGAGCGGGGTTGATAGAAGAAGCAGCGGAGATGATTGAGAAAATGCCTA
GAGATGGAGGGAAGAGAGAGAAGCTGTTGGCGTGGAGCGGTCTGTTGGGAGTGTGTAGAA
TCCACGGGAACATAGAGGTGGCGGAGAAAGCTGCGGAGAGAGTTAGGGAGCTGAGTCCAG
AGGATGGAGGAGTGTATAAAGTGATGGCGGAGATGTATGCAAATGCTGAGAGATGGGAGG
ATGTGGTTAAGGTTAGGCAAGTAATGGAAAGAGATGAGAGAGTGAACAAGAGTGCTGGGT
TTAGTAGAGTTATGTCCTAAGTCCTCATAACCATATCATCATTTGGACTTGTATTAGTAT
TTACAAATTCAAAATTTTTTTATCAGAGTTGAATATTTGTATTTTTAACTAATAAATCTT
TGTATATTCGTTGCC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

CO CL6456Contig1 804 2 16 U
GAGAGAGCGAGTATCTGTGAATCCAGTGAAGTCAAGATTATGTGAACTTCCTGGCTCTGG
AAGTTATTCCCCAAAGATTGGGTATATCAAGCTAACAACATTCAATCAAAATGCTTCTGG
TGCGGTCAAATAAGCAATTGAGACCTTGAGAGGCAACAATGTAAATGCATTCGTCTTGGA
TCTTCGAGACAATAGTGGGGGTTCTTTCCCAGGAGGAATCGAGATTGCTAAGTTTTGGTT
AGATAGAGGAGTGATTGTGTATATTTGCGATAGCCGAGGTGTTAGAGATATATATGATAC
TGATGGAAGCAATGCTATAGCAACCTCTGAGCCTCTTGCCGTCCTGGTTAACAAAGGCAC
CGCAAGTGCCAGTGAGATATTGGCAGGCGCCTTGAAAGATAACAAACGTGCTCTCGTTTA
TGGAGAACCCACTTACGGAAAAGGTAAGATACAGTCAGTGTTTCAGCTATCAGATGGCTC
GGGCTTGGCGGTAACAGTTGCTCGTTACGAAACACCAGCTCATACCGATATAGACAAGGT
CGGTGTTACTCCTGATCATCCGTTGCCAAAGTCATTTCCGAAAGACGAAGAGGCTTTCTG
TGGATGCCTCAAGGATCCAACAGCTGCTTGTTATCTCAATCAAGGCCTGCTTTTCTCTAG
ATGATATTTGATTTGTTCATACTTGGTTCTGAGAGCGTATGAGTAAAGAAAGATTCATTG
ACTCAAACCTATGTATACTCTTGAAGATTTACTTAGCATCATTGTCAGCTAATCGAGACA
AGGAATTTCACTTTCAAGAACAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT06JQ C 1
AF RR2DH47TF U 342
BS 1 343 RR2FT06JQ
BS 344 384 RR2DH47TF
BS 385 385 RR2FT06JQ
BS 386 579 RR2DH47TF
BS 580 580 RR2FT06JQ
BS 581 618 RR2DH47TF
BS 619 619 RR2FT06JQ
BS 620 632 RR2DH47TF
BS 633 633 RR2FT06JQ
BS 634 684 RR2DH47TF
BS 685 685 RR2FT06JQ
BS 686 716 RR2DH47TF
BS 717 717 RR2FT06JQ
BS 718 730 RR2DH47TF
BS 731 731 RR2FT06JQ
BS 732 804 RR2DH47TF

RD RR2FT06JQ 779 0 0
GAGAGAGCGAGTATCTGTGAATCCAGTGAAGTCAAGATTATGTGAACTTCCTGGCTCTGG
AAGTTATTCCCCAAAGATTGGGTATATCAAGCTAACAACATTCAATCAAAATGCTTCTGG
TGCGGTCAAATAAGCAATTGAGACCTTGAGAGGCAACAATGTAAATGCATTCGTCTTGGA
TCTTCGAGACAATAGTGGGGGTTCTTTCCCAGGAGGAATCGAGATTGCTAAGTTTTGGTT
AGATAGAGGAGTGATTGTGTATATTTGCGATAGCCGAGGTGTTAGAGATATATATGATAC
TGATGGAAGCAATGCTATAGCAACCTCTGAGCCTCTTGCCGTCCTGGTTAACAAAGGTAC
TGCAAGTGCCAGTGAGATATTGGCAGGCGCCTTGAAAGATAACAAACGTGCTCTGGTTTA
TGGAGAACCCACTTACGGAAAAGGTAAGATACAGTCAGTGTTTCAGCTATCAGATGGTTC
GGGCTTGGCGGTAACAGTTGCTCGTTACGAAACACCAGCTCATACCGATATAGACAAGGT
TGGTGTTACTCCTGATCATCCGTTGCCAAAGTCATTTCCGAAAGACGAAGAGGCTTTCTG
TGGATGCCTTAAGGATCCAACAGCTGCTTGTTATCTCAATCAAGGCCTTCTTTTCTCTAG
ATGATATTTGATTTGTTCATACTTGGTTCTGAGAGCGTATGAGTAAAGAAAGATTCATTG
ACTCAAACCTATGTATACTCTTGAAGATTTACTTAGCATCATTGTCAGCTAAT
GGGGAC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2DH47TF 463 0 0
GG
CTGGTTAACAAAGGCACCGCAAGTGCCAGTGAGATATTGGCCGGCGCCTTGAAAGATAAC
AAACGTGCTCTCGTTTATGGAGAACCCACTTACGGAAAAGGTAAGATACAGTCAGTGTTT
CAGCTATCAGATGGCTCGGGCTTGGCGGTAACAGTTGCTCGTTACGAAACACCAGCTCAT
ACCGATATAGACAAGGTCGGTGTTACTCCTGATCATCCGTTGCCAAAGTCATTTCCTAAA
GACGAAGAGGCTTTCTGTGGATGCCTCAAGGATCCTACAGCTGCTTGTTGTCTCAATCAA
GGCCTGCTTTTCTCTAGATGATATTTGATTTGTTCATACTTTGTTCTGAGAGCGTATGAG
TAAAGAAAGATTCTTTGACTCAAACCTTTGTATACTCTTGAAGATTTACTTAGCATCATT
GTCAGCTAATCGAGACAAGGAATTTCACTTTCAAGAACAAA

QA 3 463 3 463
DS 



AS 1 2

CO CL6457Contig1 634 2 2 U
TTTTTTTGTTTTTTGAAACAAAGGCCATCACTAAACTTTGGTATGAAGTCAAACAGGAAG
CAAATAGCTTTCAACTTTGATCTCAGCATAGTAATATCATTGTGAACCAATGAAGTTTTG
AGCACGAGAAATTTTATGTAGAGATGACTCTACTGATAAGTTCAATCTGACATTAAGCAG
AACAAATCTGAAGATTCTATAAGTGCAGAGATTTTATTAGAAAGATACTTTTTCTACTTG
TTACGCTTGGCAGCACGTCTTCCATGACCCTTTTTCGGTGGTCCTTTGTCACGACGCTTC
AACATCTCAAGCTTCGATAAGCGCTCTTTTTCTTCTCTAGCCAAGACATTGGGATCCTCA
TTCTTGATGTCGTATGGATACCATTCCGCAACCTTATCACCAAAAAGCTTCTTCCTTAAA
ATCTTATGAGGAGATCTCTGTCCTGTTGGGTTAAGCATATGTCCGAAGATCCTAGCTCTT
GCTTCTGTCACGCCAATAGTGACTGCTGAAGTTACAAGCCTTTTCAAGCTACCACTAGCC
ATCTTCCTTTTAAACCACACCGACAAGAAAAACAATAGCAACACGCCGACAGCGGTGGAG
AGATAGGGGACGGCGAGACTGTATAACGAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DQ21TF C 1
AF RR2DQ21JQ U 15
BS 1 14 RR2DQ21TF
BS 15 634 RR2DQ21JQ

RD RR2DQ21TF 634 0 0
TTTTTTTGTTTTTTGAAACAAAGGCCATCACTAAACTTTGGTATGAAGTCAAACAGGAAG
CAAATAGCTTTCAACTTTGATCTCAGCATAGTAATATCATTGTGAACCAATGAAGTTTTG
AGCACGAGAAATTTTATGTAGAGATGACTCTACTGATAAGTTCAATCTGACATTAAGCAG
AACAAATCTGAAGATTCTATAAGTGCAGAGATTTTATTAGAAAGATACTTTTTCTACTTG
TTACGCTTGGCAGCACGTCTTCCATGACCCTTTTTCGGTGGTCCTTTGTCACGACGCTTC
AACATCTCAAGCTTCGATAAGCGCTCTTTTTCTTCTCTAGCCAAGACATTGGGATCCTCA
TTCTTGATGTCGTATGGATACCATTCCGCAACCTTATCACCAAAAAGCTTCTTCCTTAAA
ATCTTATGAGGAGATCTCTGTCCTGTTGGGTTAAGCATATGTCCGAAGATCCTAGCTCTT
GCTTCTGTCACGCCAATAGTGACTGCTGAAGTTACAAGCCTTTTCAAGCTACCACTAGCC
ATCTTCCTTTTAAACCACACCGACAAGAAAAACAATAGCAACACGCCGACAGCGGTGGAG
AGATAGGGGACGGCGAGACTGTATAACGAGAGCC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2DQ21JQ 620 0 0
GAAACAAAGGCCATCACTAAACTTTGGTATGAAGTCAAACAGGAAGCAAATAGCTTTCAA
CTTTGATCTCAGCATAGTAATATCATTGTGAACCAATGAAGTTTTGAGCACGAGAAATTT
TATGTAGAGATGACTCTACTGATAAGTTCAATCTGACATTAAGCAGAACAAATCTGAAGA
TTCTATAAGTGCAGAGATTTTATTAGAAAGATACTTTTTCTACTTGTTACGCTTGGCAGC
ACGTCTTCCATGACCCTTTTTCGGTGGTCCTTTGTCACGACGCTTCAACATCTCAAGCTT
CGATAAGCGCTCTTTTTCTTCTCTAGCCAAGACATTGGGATCCTCATTCTTGATGTCGTA
TGGATACCATTCCGCAACCTTATCACCAAAAAGCTTCTTCCTTAAAATCTTATGAGGAGA
TCTCTGTCCTGTTGGGTTAAGCATATGTCCGAAGATCCTAGCTCTTGCTTCTGTCACGCC
AATAGTGACTGCTGAAGTTACAAGCCTTTTCAAGCTACCACTAGCCATCTTCCTTTTAAA
CCACACCGACAAGAAAAACAATAGCAACACGCCGACAGCGGTGGAGAGATAGGGGACGGC
GAGACTGTATAACGAGAGCC

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL6458Contig1 1115 2 2 U
AGGAATAAAATAGACAAAGCAGATTGGTGTTTGAAGCTGAGAGAGATCAAAAGAAAGAGA
GTGTCAGTGTTGTTTGAACATCTCTCTGTCGGTGTGATCTGACAATGGAGGCCAGTGCCG
GCTTGGTTGCTGGTTCCTACCGGAGAAACGAGCTCGTTCGGATCCGTCACGAATCTGACG
GCGGCGGGTCCAAGGCTTTGAAGAATATGGATCCACATACATGTCAGATCTGTGGTGATA
ACGCTGGGCTCACTGAAACTGGAGATCTTTTTGTGGCTCGCAATGAATGTGCCTTCCCTG
TGTGTCGTCCTTGCTATGAGTACGAGAGGAAAGATGGAACTCAGTGTTGCCCTCAATGCA
AGACTAGATACAGACGACTCAGGGGGAGTCCTCGTGTTGAAGGAGATGAAGATGAGGATG
ATGTTGATGATATCGAGAATGAGTTCAATTACACCCAGGGAGCTAACAAGGGAAGACGTC
AACGCCGTGGTGAAGAGTTCTCTTCTTCTTCTAGACATGAATCTCAAGGTTCTCGCGGGT
ATAGACACTAACTTCACTGTTACATCCAAGGCTTCAGACGAAGATGGGGACTTCGCGGAG
CTTTACATCTTCAAATGGACAGCTCTTCTCATTCCACCGACCACGGTGCTAGTTGTGAAC
CTCATAGGCATTGTGGCTGGTGTTTCTTACGCTGTGAACAGCGGGTACCAGTCATGGGGA
CCGCTCTTTGGGAAGCTTTTTTTCGCCTTGTGGGTCATTGCACATCTCTACCCTTTCTTG
AAAGGTCTAATGGGAAGACAGAACAGAACGCCAACCATTGTCATCGTCTGGTCTGTTCTT
TTGGCGTCCATCTTTTCGTTGCTTTGGGTCAGGATCAATCCCTTTGTTTCTGTCACTCCA
GGTGCCAACCCCAATGTCGTCCCAGGAGGTGTCTTTTAGACCCTATTTTTTTATATATTT
GTAAGCGGAAATACGCAATGGGACACTCTAAAGCCCCCAAAACCAAGGCGGTTAGCTTTC
TCTGAGTAGGCAGAGTTGTGAAGTTTTTGGTACTTTGTCACCGTTGTGATGATTTATCTC
TTTTGAAACAGAGACACAAGTGATATTTTGTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW40TF U 1
AF RR2GW40JQ C 341
BS 1 566 RR2GW40TF
BS 567 1115 RR2GW40JQ

RD RR2GW40TF 566 0 0
AGGAATAAAATAGACAAAGCAGATTGGTGTTTGAAGCTGAGAGAGATCAAAAGAAAGAGA
GTGTCAGTGTTGTTTGAACATCTCTCTGTCGGTGTGATCTGACAATGGAGGCCAGTGCCG
GCTTGGTTGCTGGTTCCTACCGGAGAAACGAGCTCGTTCGGATCCGTCACGAATCTGACG
GCGGCGGGTCCAAGGCTTTGAAGAATATGGATCCACATACATGTCAGATCTGTGGTGATA
ACGCTGGGCTCACTGAAACTGGAGATCTTTTTGTGGCTCGCAATGAATGTGCCTTCCCTG
TGTGTCGTCCTTGCTATGAGTACGAGAGGAAAGATGGAACTCAGTGTTGCCCTCAATGCA
AGACTAGATACAGACGACTCAGGGGGAGTCCTCGTGTTGAAGGAGATGAAGATGAGGATG
ATGTTGATGATATCGAGAATGAGTTCAATTACACCCAGGGAGCTAACAAGGGAAGACGTC
AACGCCGTGGTGAAGAGTTCTCTTCTTCTTCTAGACATGAATCTCAAGGTTCTCGCGGGT
ATAGACACTAACTTCACTGTTACATC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2GW40JQ 775 0 0
TCAGTGTTGCCCTCAATGCAAGACTAGATACAGACGACTCAGGGGGAGTCCTCGTGTTGA
AGGAGATGAAGATGAGGATGATGTTGATGATATCGAGAATGAGTTCAATTACACCCAGGG
AGCTAACAAGGGAAGACGTCAACGCCGTGGTGAAGAGTTCTCTTCTTCTTCTAGACATGA
ATCTCAAGGTTCTCGCGGGTATAGACACTAACTTCACTGTTACATCCAAGGCTTCAGACG
AAGATGGGGACTTCGCGGAGCTTTACATCTTCAAATGGACAGCTCTTCTCATTCCACCGA
CCACGGTGCTAGTTGTGAACCTCATAGGCATTGTGGCTGGTGTTTCTTACGCTGTGAACA
GCGGGTACCAGTCATGGGGACCGCTCTTTGGGAAGCTTTTTTTCGCCTTGTGGGTCATTG
CACATCTCTACCCTTTCTTGAAAGGTCTAATGGGAAGACAGAACAGAACGCCAACCATTG
TCATCGTCTGGTCTGTTCTTTTGGCGTCCATCTTTTCGTTGCTTTGGGTCAGGATCAATC
CCTTTGTTTCTGTCACTCCAGGTGCCAACCCCAATGTCGTCCCAGGAGGTGTCTTTTAGA
CCCTATTTTTTTATATATTTGTAAGCGGAAATACGCAATGGGACACTCTAAAGCCCCCAA
AACCAAGGCGGTTAGCTTTCTCTGAGTAGGCAGAGTTGTGAAGTTTTTGGTACTTTGTCA
CCGTTGTGATGATTTATCTCTTTTGAAACAGAGACACAAGTGATATTTTGTTACC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL6459Contig1 902 2 4 U
GGATTCACGTCTGAACCAAGCGAGAGAGTGGTTTTTCGGAGGTTTCAAGGAAGTAAAGTA
ACGATGGCGGAAGAGCACAAACACGAGGAATCAATCATGGAGAAGATAGCTGAGAAGATC
CATGGTCACGATTCCTCTTCTTCAGATTCAGATGACGAGAAGAAAGAATCCTCTATCAAG
ACGAAGATCTTCCGCCTCTTCGGAAGAGAAAAGCCTGTTCACAAGGTCTTCGGTGGCGGC
AAACCTGCCGACATATTCCTATGGAGAAACAAGAAGGTATCAGGAGGAGTGTTGGGTGCT
GCAACTCTCTCCTGGATCTTGTTCGAGTTGCTTCAGTACAACCTCCTCACTCTCTTCGGC
CACATCTCGATTCTCGCTCTCGCTGTGTTGTTCTTGTGGTCTAGTGCTACTACCTTCATT
CACAAGAAACCTCCTCATATCCCTGAAGTTCACATCCCCGAGGAAGTCGTTCTCCAGCTT
GCTTCTGGACTAAGGATCTTGCTCCTCACAATCCACTCGCAAAGTTCCTCTGCATCAAAG
GGATTGTCTTCTTCTGCTTCTGGCAGGGGATAGCACTAGACATTCTGGTGGCAATGGGAG
TGATCAAGTCTCACCATTTCTGGTTGGAGGTGGAACAGATCCAGGAGGCTATTCAGAATG
TGTTGGTGTGTTTAGAGATGGTTATCTTCGCTGCGGTTCAGAAGCATGCTTATCATGTTG
GTCCTTATAGCGGAGAGACCAAGAAGAAGCTCGACAAAAAGACAGAGTGATATCTTGTCC
CCGTGTTAGAACGGGAAATCGACTGTTTTTTTTTTTGTTCAGGTGTTTTGGAGACTTGAA
ACTTTTGCTTGTCACCACGATTGGGATAAGAGACGATAAAATAATGTTTTTGAGATATCA
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2AN49TF U 1
AF RR2AN49JQ C 193
BS 1 759 RR2AN49TF
BS 760 760 RR2AN49JQ
BS 761 815 RR2AN49TF
BS 816 902 RR2AN49JQ

RD RR2AN49TF 815 0 0
GGATTCACGTCTGAACCAAGCGAGAGAGTGGTTTTTCGGAGGTTTCAAGGAAGTAAAGTA
ACGATGGCGGAAGAGCACAAACACGAGGAATCAATCATGGAGAAGATAGCTGAGAAGATC
CATGGTCACGATTCCTCTTCTTCAGATTCAGATGACGAGAAGAAAGAATCCTCTATCAAG
ACGAAGATCTTCCGCCTCTTCGGAAGAGAAAAGCCTGTTCACAAGGTCTTCGGTGGCGGC
AAACCTGCCGACATATTCCTATGGAGAAACAAGAAGGTATCAGGAGGAGTGTTGGGTGCT
GCAACTCTCTCCTGGATCTTGTTCGAGTTGCTTCAGTACAACCTCCTCACTCTCTTCGGC
CACATCTCGATTCTCGCTCTCGCTGTGTTGTTCTTGTGGTCTAGTGCTACTACCTTCATT
CACAAGAAACCTCCTCATATCCCTGAAGTTCACATCCCCGAGGAAGTCGTTCTCCAGCTT
GCTTCTGGACTAAGGATCTTGCTCCTCACAATCCACTCGCAAAGTTCCTCTGCATCAAAG
GGATTGTCTTCTTCTGCTTCTGGCAGGGGATAGCACTAGACATTCTGGTGGCAATGGGAG
TGATCAAGTCTCACCATTTCTGGTTGGAGGTGGAACAGATCCAGGAGGCTATTCAGAATG
TGTTGGTGTGTTTAGAGATGGTTATCTTCGCTGCGGTTCAGAAGCATGCTTATCATGTTG
GTCCTTATAGCGGAGAGACCAAGAAGAAGCTCGACAAAA*GACAGAGTGATATCTTGTCC
CCGTGTTAGAACGGGAAATCGACTGTTTTTTTTTT

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR2AN49JQ 710 0 0
CGCCTCTTCGGAAGAGAAAAGCCTGTTCACAAGGTCTTCGGTGGCGGCAAACCTGCCGAC
ATATTCCTATGGAGAAACAAGAAGGTATCAGGAGGAGTGTTGGGTGCTGCAACTCTCTCC
TGGATCTTGTTCGAGTTGCTTCAGTACAACCTCCTCACTCTTTTCGGCCACATCTCGATT
CTCGCTCTCGCTGTGTTGTTCTTGTGGTCTAGTGCTACTACCTTCATTCACAAGAAACCT
CCTCATATCCCTGAAGTTCACATCCCCGAGGAAGTCGTTCTCCAGCTTGCTTCTGGACTA
AGGATCTTGCTCCTCACAATCCACTCGCAAAGTTCCTTTGCATCAAAGGGATTGTTTTTT
TTTGCTTCTGGCAGGGGATAGCACTAGACATTCTGGTGGCAATGGGAGTGATCAAGTCTC
ACCATTTCTGGTTGGAGGTGGAACAGATCCAGGAGGCTATTCAGAATGTGTTGGTGTGTT
TAGAGATGGTTATTTTCGCTGCGGTTCAGAAGCATGCTTATCATGTTGGTCCTTATAGCG
GAGAGACCAAGAAGAAGCTCGACAAAAAGACAGAGTGATATCTTGTCCCCGTGTTAGAAC
GGGAAATCGACTGTTTTTTTTTTTGTTCAGGTGTTTTGGAGACTTGAAACTTTTGCTTGT
CACCACGATTGGGATAAGAGACGATAAAATAATGTTTTTGAGATATCATC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL6460Contig1 760 2 3 U
GAATCCAGTGTAACAAATTGAGTATACGATGAAACACAAATCTTCAAGTGGGTGTCTAAC
TCTTCTTAAGACTGCCAAAGAATTTCGACAAAGGCACTGGACCATCATCCTCGACTTTAC
TTTTGCTCGAGTGTCTGCTGCCTTTAGATTTGTGTTTCTTCTCCCTTTTGGATCTTTTAG
AACTTGACCTTGACCTTCTAGATTCCTCTTCATCGCTGCTTGATGACTCGGAGGATGAGC
TCGAGGAGGAGGAGCTTGAGTCAGACGAATGCCTTCTCGAACGCTTTCCTTTTTGCTTCT
CTTTCTCTTCGAATCTCTGTCTTTTTTATCTGTGACATCTCTCTCCTTCCTATCTTTTCT
GGATTTATCGCTGGAAAAGTTCCTTCCCTTAGAGAGCTTCATTGCCCTTTCAGCATCCAG
CTGAGCTCTATACTCACGCATCAACTTATCAGTATCTGCTTCAAGTTCCCCCTTTTTCAT
TTCTTCTTCCTTTTGCTTCTTCTTGTATTCTTCCCAAGTAATAGTGTGGGTAGTCTGGAG
ACCAGCCAAACGAGCAGCATGCCGCTCTGGTGTATGATATGAACCATCCACCATGCCGTC
TTCGATCTCATCCGGCGCGGCGGAGCCGGAGCTAGAGCCAACTCTGGCTCTCTGCATAGC
CTTGTAACCTTGGTTCTTCCCCATCGCCGAGAGAAAGTTGGAGACTTTTCCTTTCGCGAG
TAGATGAAATTGAAACAAAGGGGCTAAAGCTCTGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA12JQ U 57
AF RR2AA12TF C 1
BS 1 56 RR2AA12TF
BS 57 675 RR2AA12JQ
BS 676 760 RR2AA12TF

RD RR2AA12JQ 619 0 0
TAACTCTTCTTAAGACTGCCAAAGAATTTCGACAAAGGCACTGGACCATCATCCTCGACT
TTACTTTTGCTCGAGTGTCTGCTGCCTTTAGATTTGTGTTTCTTCTCCCTTTTGGATCTT
TTAGAACTTGACCTTGACCTTCTAGATTCCTCTTCATCGCTGCTTGATGACTCGGAGGAT
GAGCTCGAGGAGGAGGAGCTTGAGTCAGACGAATGCCTTCTCGAACGCTTTCCTTTTTGC
TTCTCTTTCTCTTCGAATCTCTGTCTTTTTTATCTGTGACATCTCTCTCCTTCCTATCTT
TTCTGGATTTATCGCTGGAAAAGTTCCTTCCCTTAGAGAGCTTCATTGCCCTTTCAGCAT
CCAGCTGAGCTCTATACTCACGCATCAACTTATCAGTATCTGCTTCAAGTTCCCCCTTTT
TCATTTCTTCTTCCTTTTGCTTCTTCTTGTATTCTTCCCAAGTAATAGTGTGGGTAGTCT
GGAGACCAGCCAAACGAGCAGCATGCCGCTCTGGTGTATGATATGAACCATCCACCATGC
CGTCTTCGATCTCATCCGGCGCGGCGGAGCCGGAGCTAGAGCCAACTCTGGCTCTCTGCA
TAGCCTTGTAACCTTGGTT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2AA12TF 760 0 0
GAATCCAGTGTAACAAATTGAGTATACGATGAAACACAAATCTTCAAGTGGGTGTCTAAC
TCTTCTTAAGACTGCCAAAGAATTTCGACAAAGGCACTGGACCATCATCCTCGACTTTAC
TTTTGCTCGAGTGTCTGCTGCCTTTAGATTTGTGTTTCTTCTCCCTTTTGGATCTTTTAG
AACTTGACCTTGACCTTCTAGATTCCTCTTCATCGCTGCTTGATGACTCGGAGGATGAGC
TCGAGGAGGAGGAGCTTGAGTCAGACGAATGCCTTCTCGAACGCTTTCCTTTTTGCTTCT
CTTTCTCTTCGAATCTCTGTCTTTTTTATCTGTGACATCTCTCTCCTTCCTATCTTTTCT
GGATTTATCGCTGGAAAAGTTCCTTCCCTTAGAGAGCTTCATTGCCCTTTCAGCATCCAG
CTGAGCTCTATACTCACGCATCAACTTATCAGTATCTGCTTCAAGTTCCCCCTTTTTCAT
TTCTTCTTCCTTTTGCTTCTTCTTGTATTCTTCCCAAGTAATAGTGTGGGTAGTCTGGAG
ACCAGCCAAACGAGCAGCATGCCGCTCTGGTGTATGATATGAACCATCCACCATGCCGTC
TTCGATCTCATCCGGCGCGGCGGAGCCGGAGCTAGAGCCAACTCTGGCTCTCTGCATAGC
CTTGTAACCTTGGTTCTTCCCCATCGCCGAGAGAAAGTTGGAGACTTTTCCTTTCGCGAG
TAGATGAAATTGAAACAAAGGGGCTAAAGCTCTGTTTTCC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL6461Contig1 759 2 8 U
GGACACACCGCTACTCAATTCAGACAAATTCCATAGCTAATCTAGAGAGAGTGAAAAGAT
GTCGAAAGAAGTGAGCGAAGAGGGACAAGCAACACACAGCCATGGAAAAGACTACGTGGA
TCCTCCACCAGCTCCCCTTCTCGACATGGGAGAGCTCAAGTCTTGGTCTTTCTACAGAGC
TCTCATCGCCGAGTTCATCGCCACACTCCTCTTCCTCTACGTCACCATAGCCACCGTCAT
CGGCCACAAGAAACAAACCGGTCCTTGTGACGGCGTTGGTTTACTCGGTATCGCTTGGGC
CTTCGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTCTACTGCACCGCCGGTACCTCTGGTGGTCACAT
TAACCCAGCTGTGACTTTTGGTCTGTTCTTGGCACGTAAGGTGTCTTTGGTTAGAGCTGT
TGGTTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCCATTTGTGGTGTGGGTTTCGTGAAAGCTTT
CATGAAGACTCCTTACAACACTCTCGGTGGGGGAGCTAACACTGTCGCCCCTGGTTACAG
CACCGGAACTGCTCTCGGTGCTGAGATCATTGGAACTTTCGTCCTCGTTTACACCGTCTT
CTCTGCTACTGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACATCCCCGTTTTGGCTCCACT
CCCAATTGGATTTGCTGTGTTCATGGTGCATTTGGCACCATCCCCATCACTGGAACTGGA
ATTAACCCAGCGAGAAGCTTTGGTGCTGCTGTATCTACA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2E793TF U 1
AF RR2BV05TF U 2
BS 1 329 RR2E793TF
BS 330 330 RR2BV05TF
BS 331 344 RR2E793TF
BS 345 345 RR2BV05TF
BS 346 735 RR2E793TF
BS 736 736 RR2BV05TF
BS 737 757 RR2E793TF
BS 758 759 RR2BV05TF

RD RR2E793TF 757 0 0
GGACACACCGCTACTCAATTCAGACAAATTCCATAGCTAATCTAGAGAGAGTGAAAAGAT
GTCGAAAGAAGTGAGCGAAGAGGGACAAGCAACACACAGCCATGGAAAAGACTACGTGGA
TCCTCCACCAGCTCCCCTTCTCGACATGGGAGAGCTCAAGTCTTGGTCTTTCTACAGAGC
TCTCATCGCCGAGTTCATCGCCACACTCCTCTTCCTCTACGTCACCATAGCCACCGTCAT
CGGCCACAAGAAACAAACCGGTCCTTGTGACGGCGTTGGTTTACTCGGTATCGCTTGGGC
CTTCGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTCTGCTGCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACAT
TAACCCAGCTGTGACTTTTGGTCTGTTCTTGGCACGTAAGGTGTCTTTGGTTAGAGCTGT
TGGTTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCCATTTGTGGTGTGGGTTTCGTGAAAGCTTT
CATGAAGACTCCTTACAACACTCTCGGTGGGGGAGCTAACACTGTCGCCCCTGGTTACAG
CACCGGAACTGCTCTCGGTGCTGAGATCATTGGAACTTTCGTCCTCGTTTACACCGTCTT
CTCTGCTACTGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACATCCCCGTTTTGGCTCCACT
CCCAATTGGATTTGCTGTGTTCATGGTGCATTTGGCACCATCCCCATCACTGGAACTGGA
ATTAACCCAGCGAGA*GCTTTGGTGCTGCTGTATCTA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2BV05TF 758 0 0
GACACACCGCTACTCAATTCAGACAAATTCCATAGCTAATCTAGAGAGAGTGAAAAGATG
TCGAAAGAAGTGAGCGAAGAGGGACAAGCAACACACAGCCATGGAAAAGACTACGTGGAT
CCTCCACCAGCTCCCCTTCTCGACATGGGAGAGCTCAAGTCTTGGTCTTTCTACAGAGCT
CTCATCGCCGAGTTCATCGCCACACTCCTCTTCCTCTACGTCACCATAGCCACCGTCATC
GGCCACAAGAAACAAACCGGTCCTTGTGACGGCGTTGGTTTACTCGGTATCGCTTGGGCC
TTCGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTCTACTGCACCGCCGGTACCTCTGGTGGTCACATT
AACCCAGCTGTGACTTTTGGTCTGTTCTTGGCACGTAAGGTGTCTTTGGTTAGAGCTGTT
GGTTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCCATTTGTGGTGTGGGTTTCGTGAAAGCTTTC
ATGAAGACTCCTTACAACACTCTCGGTGGGGGAGCTAACACTGTCGCCCCTGGTTACAGC
ACCGGAACTGCTCTCGGTGCTGAGATCATTGGAACTTTCGTCCTCGTTTACACCGTCTTC
TCTGCTACTGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACATCCCCGTTTTGGCTCCACTT
CCAATTGGATTTGCTGTGTTCATGGTGCATTTGGCACCATCCCCATCACTGGAACTGGAA
T*AACCCAGCGAGAAGCTTTGGTGCTGCTGTATCTACA

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL6462Contig1 745 2 23 U
GATTCAGGTCTTGTTCAGACTTGTGGAACCGTCTGGTGGGAAGATAATCATCGATGGAAT
CGATATCTGCACTTTGGGACTTCATGATCTTAGGTCAAGATTCGGTATCATCCCTCAAGA
ACCTGTTCTCTTCGAAGGAACTGTAAGGAGCAACATTGATCCTACAGAGAAATACTCTGA
CGAAGAAATCTGGAAGAGTCTCGAGCGATGTCAACTTAAGGAGGTTGTTTCATCCAAGCC
CGGGAAGCTTGATTCTCTTGTGGCGGATAGTGGTGAGAATTGGAGTGTTGGTCAAAGACA
GTTACTCTGTTTGGGAAGGGTTATGCTGAAACGGTGCCGGATTCTGTTCTTGGATGAAGC
AACTGCTTCGGTTGATTCGCAGACTGATGCTATGATCCAGAAGATCATAAGGGAAGACTT
CTCGTCGTGTACCATCATCAGCATAGCTCATAGGATTCCAACGGTTATGGACTGTGATCG
TGTTCTTGTTATAGACGCAGGAAAAGCGAAAGAGTATGATAGTCCGGTTCGTTTGCTGGA
GAGACGGTCGTTGTTTGCTGCATTGGTTCAAGAGTATGCTCTCCGGTCTGCCGGAATATG
AAACCATTGTCTTCTTCATTTTGTTCCTGTTAAGCTAATATCAACATAAACAGACGTGTT
GTCTTTGTATTTTGATTCAGAATCTCTGACGCTTGATGTTGAATTTTCAATAAAACTTCT
AATAATAACAAGTTTCATTCGGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF26TF U 42
AF RR2CR11JQ C 1
BS 1 42 RR2CR11JQ
BS 43 180 RR2EF26TF
BS 181 181 RR2CR11JQ
BS 182 294 RR2EF26TF
BS 295 295 RR2CR11JQ
BS 296 408 RR2EF26TF
BS 409 409 RR2CR11JQ
BS 410 417 RR2EF26TF
BS 418 418 RR2CR11JQ
BS 419 426 RR2EF26TF
BS 427 427 RR2CR11JQ
BS 428 432 RR2EF26TF
BS 433 433 RR2CR11JQ
BS 434 617 RR2EF26TF
BS 618 618 RR2CR11JQ
BS 619 642 RR2EF26TF
BS 643 643 RR2CR11JQ
BS 644 668 RR2EF26TF
BS 669 669 RR2CR11JQ
BS 670 702 RR2EF26TF
BS 703 703 RR2CR11JQ
BS 704 709 RR2EF26TF
BS 710 745 RR2CR11JQ

RD RR2EF26TF 682 0 0
G
GATAATCATCGATGGAATCGATATCTGCACTTTGGGACTTCATGATCTTAGGTCAAGATT
CGGTATCATCCCTCAAGAACCTGTTCTCTTCGAAGGAACTGTAAGGAGCAACATTGATCC
TACAGAGAAATACTCTGATGAAGAAATCTGGAAGAGTCTCGAGCGATGTCAACTTAAGGA
GGTTGTTTCATCCAAGCCCGGGAAGCTTGATTCTCTTGTGGCGGATAGTGGTGAGAATTG
GAGTGTTGGTCAGAGACAGTTACTCTGTTTGGGAAGGGTTATGCTGAAACGGTGCCGGAT
TCTGTTCTTGGATGAAGCAACTGCTTCGGTTGATTCGCAGACTGATGCTATGATCCAGAA
GATCATCAGGGAAGATTTCTCGTCTTGTACTATCATCAGCATAGCTCATAGGATTCCAAC
GGTTATGGACTGTGATCGTGTTCTTGTTATAGACGCAGGAAAAGCGAAAGAGTATGATAG
TCCGGTTCGTTTGCTGGAGAGACGGTCGTTGTTTGCTGCATTGGTTCAAGAGTATGCTCT
CCGGTCTGCCGGAATATGAAACCATTGTCTTCTTCGTTTTGTTCCTGTTAAGCTAATATC
GACATAAACAGACGTGTTGTCTTTGTGTTTTGATTCAGAATCTCTGACGCTTGATGTTGA
TTTTTCA
TAAACTTCTAAATT

QA 2 668 2 668
DS 

RD RR2CR11JQ 745 0 0
GATTCAGGTCTTGTTCAGACTTGTGGAACCGTCTGGTGGGAAGATAATCATCGATGGAAT
CGATATCTGCACTTTGGGACTTCATGATCTTAGGTCAAGATTCGGTATCATCCCTCAAGA
ACCTGTTCTCTTCGAAGGAACTGTCAGGAGCAACATTGATCCTACAGAGAAATACTCTGA
CGAAGAAATCTGGAAGAGTCTTGAGCGATGTCAACTTAAGGAGGTTGTTTCATCCAAGCC
CGGGAAGCTTGATTCTCTTGTGGCGGATAGTGGTGAGAATTGGAGTGTTGGTCAAAGACA
GTTACTCTGTTTGGGAAGGGTTATGCTGAAACGGTGCCGGATTCTGTTTTTGGATGAAGC
AACTGCTTCGGTTGATTCGCAGACTGATGCTATGATCCAGAAGATTATAAGGGAGGACTT
CTCGTCGTGTACCATCATCAGCATAGCTCATAGGATTCCAACGGTTATGGACTGTGATCG
TGTTCTTGTTATAGACGCAGGAAAAGCGAAAGAGTATGATAGTCCGGTTCGTTTGCTGGA
GAGACGGTCGTTGTTTGCTGCATTGGTTCAAGAGTATGCTCTCCGGTCTGCCGGAATATG
AAACCATTGTCTTCTTCATTTTGTTTCTGTTA*GTTGATATCAACATAAACAGACGTGTT
GTCTTTGTATTTTGATTCAGAATCTCTGACGTTTGATGTTGAATTTTCAATAAAACTTCT
AATAATAACAAGTTTCATTCGGGCT

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL6463Contig1 659 2 4 U
GGGATTGTTTCTGTGCTCGACTAACTCCATTAGCTCTCTAATCTCTCTCTCTCTATCGCC
TCCTCTCAGATTTTGACTTCGCGATGGGAGACAACAGCGGGAACCTCGAGGCGTCGATAG
ATCGGCTTCTGAATGAAGAGAAGCAGATGAGACTCGCGGAGAACGTCGCCGGTACGAGGA
AAGCGGCTACTGAGATTCTGCAGCTCTGTTTCGAAGCCAAGGACTGGAAACTTCTCAATG
AGCAGATTCTCAATCTCTCGAAGAAGCGTGGTCAGCTTAAACAGGCTGTGCAATCCATGG
TGCAGCAAGCAATGCAGTACATCGATCAGACTCCTGATATAGAAACTCGGATTGAGCTTA
TCAAGACGCTGAACAATGTTTCTGCTGAAAAGATATATGTTGAAATTGAGAGGGCTCGGC
TCACAAGGAAGCTTGCTAAGATTAAGGAAGAACAGGGTCAGATTGCTGAGGCTACAGATC
TTATGCAAGAAGTTGCTGTGGAGACATTTGGCGCTATGGCAAAAACTGAGAAAATTGCAT
TTATACTTGAACAAGTCCGCTTGTGCTTGGATCGTCAAGATTATGTTCGTGCACAAATCT
TGTCTAGGAAGATCAATCCCTAGAGTTTTCGATGCAGATACAAAGAAAGACAAGAAAAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2AG59TF U 1
AF RR2FC34TF U 2
BS 1 473 RR2AG59TF
BS 474 474 RR2FC34TF
BS 475 654 RR2AG59TF
BS 655 659 RR2FC34TF

RD RR2AG59TF 654 0 0
GGGATTGTTTCTGTGCTCGACTAACTCCATTAGCTCTCTAATCTCTCTCTCTCTATCGCC
TCCTCTCAGATTTTGACTTCGCGATGGGAGACAACAGCGGGAACCTCGAGGCGTCGATAG
ATCGGCTTCTGAATGAAGAGAAGCAGATGAGACTCGCGGAGAACGTCGCCGGTACGAGGA
AAGCGGCTACTGAGATTCTGCAGCTCTGTTTCGAAGCCAAGGACTGGAAACTTCTCAATG
AGCAGATTCTCAATCTCTCGAAGAAGCGTGGTCAGCTTAAACAGGCTGTGCAATCCATGG
TGCAGCAAGCAATGCAGTACATCGATCAGACTCCTGATATAGAAACTCGGATTGAGCTTA
TCAAGACGCTGAACAATGTTTCTGCTGAAAAGATATATGTTGAAATTGAGAGGGCTCGGC
TCACAAGGAAGCTTGCTAAGATTAAGGAAGAACAGGGTCAGATTGCTGAGGCTGCAGATC
TTATGCAAGAAGTTGCTGTGGAGACATTTGGCGCTATGGCAAAAACTGAGAAAATTGCAT
TTATACTTGAACAAGTCCGCTTGTGCTTGGATCGTCAAGATTATGTTCGTGCACAAATCT
TGTCTAGGAAGATCAATCCCTAGAGTTTTCGATGCAGATACAAAGAAAGACAAG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2FC34TF 658 0 0
GGATTGTTTCTGTGCTCGACTAACTCCATTAGCTCTCTAATCTCTCTCTCTCTATCGCCT
CCTCTCAGATTTTGACTTCGCGATGGGAGACAACAGCGGGAACCTCGAGGCGTCGATAGA
TCGGCTTCTGAATGAGGAGAAGCAGATGAGGCTCGCGGAGAACGTCGCCGGTACGAGGAA
AGCGGCTACTGAGATTCTGCAGCTCTGTTTCGAAGCCAAGGACTGGAAACTTCTCAATGA
GCAGATTCTCAATCTCTCGAAGAAGCGTGGTCAGCTTAAACAGGCTGTGCAATCCATGGT
GCAGCAAGCAATGCAGTACATCGATCAGACTCCTGATATAGAAACTCGGATTGAGCTTAT
CAAGACGCTGAACAATGTTTCTGCTGGAAAGATATATGTTGAAATTGAGAGGGCTCGGCT
CACAAGGAAGCTTGCTAAGATTAAGGAAGAACAGGGTCAGATTGCTGAGGCTACAGATCT
TATGCAAGAAGTTGCTGTGGAGACATTTGGCGCTATGGCAAAAACTGAGAAAATTGCATT
TATACTTGAACAAGTCCGCTTGTGCTTGGATCGTCAAGATTATGTTCGTGCACAAATCTT
GTCTAGGAAGATCAATCC*TAGAGTTTTCGATGCAGATACAAAGAAAGACAAGAAAAA

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL6464Contig1 831 2 4 U
GAGTCCCGCCTCGCAAGGTTTCGCGGCGGGTGTGCTTAGGAACTTGGCTTTGTTTGGGGA
GAATAAAGAGAATTTCGTTGAGGAAGGTGCGGTTTCGGTTCTTGTTACGTTAGGTTGTTC
CGGTACGGCTTTGGCGCGAGAGAACGCTATTGGTTGTTTAGCTAATTTAACGTCTAGTGG
GGATGATGAGGAGGAGGAGATGGTGGTGTTGGTTGTTAGAGAAGGAGGGATTAAGTGTTT
AAAGAGTTTCTTGGATTCTTCTAACGCGAAGTCTCTCGAGGTGGGAGTTTTGCTTCTGAA
GAATCTTGCTACGTGTCGTGTTGTGAGAGAAGTTGCGGTTTCCGAAGGGTTTATCTCTCG
TTTGGTTCCGTTGTTGAGCTGCGGGGTTCTCGGTGTGAGAATCGCGGCCGCGGAGGCTGT
TGCTTCGCTAAGTTACACCACGAAAAGCAGGAAGGAGATTGGTGTAAGCATTGGTGGGTT
GATTGGTATGTTAGATGGTAAAGCTACGGAAGAGAGAGAAGCAGCATCGAAAGCTCTGTC
GACGTTGCTGGTGTGCGCAGGCAACAGGAAGATTTTCAAGAAGAGTGAACGGGGTATACT
AAGTCTTGTTCAGCTTTTGGACCCGAAGATTAAGAAGATTGATAAGAGGTACGTGGTCTC
CGCGTTGGAACTGCTTGTGGCTTGTAAGAAATGTAGGAAACGAGTCGTTGCTGCTGGTGC
TTGTTTGCATTTGCAGACGCTTGTGGAAATGGATGTTGAAGGAGCTAAGAAATTAGCTGA
GAATCTTGCTCGGAGTAAGATTTGGGGGCGTGTTCGCAAGGCCGTAGGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A268TF U 1
AF RR2A268JQ C 157
BS 1 265 RR2A268TF
BS 266 266 RR2A268JQ
BS 267 297 RR2A268TF
BS 298 831 RR2A268JQ

RD RR2A268TF 297 0 0
GAGTCCCGCCTCGCAAGGTTTCGCGGCGGGTGTGCTTAGGAACTTGGCTTTGTTTGGGGA
GAATAAAGAGAATTTCGTTGAGGAAGGTGCGGTTTCGGTTCTTGTTACGTTAGGTTGTTC
CGGTACGGCTTTGGCGCGAGAGAACGCTATTGGTTGTTTAGCTAATTTAACGTCTAGTGG
GGATGATGAGGAGGAGGAGATGGTGGTGTTGGTTGTTAGAGAAGGAGGGATTAAGTGTTT
AAAGAGTTTCTTGGATTCTTCTAACTCGAAGTCTCTCGAGGTGGGAGTTTTGCTTCT

QA 1 297 1 297
DS 

RD RR2A268JQ 675 0 0
TTTAGCTAATTTAACGTCTAGTGGGGATGATGAGGAGGAGGAGATGGTGGTGTTGGTTGT
TAGAGAAGGAGGGATTAAGTGTTTAAAGAGTTTCTTGGATTCTTCTAACGCGAAGTCTCT
CGAGGTGGGAGTTTTGCTTCTGAAGAATCTTGCTACGTGTCGTGTTGTGAGAGAAGTTGC
GGTTTCCGAAGGGTTTATCTCTCGTTTGGTTCCGTTGTTGAGCTGCGGGGTTCTCGGTGT
GAGAATCGCGGCCGCGGAGGCTGTTGCTTCGCTAAGTTACACCACGAAAAGCAGGAAGGA
GATTGGTGTAAGCATTGGTGGGTTGATTGGTATGTTAGATGGTAAAGCTACGGAAGAGAG
AGAAGCAGCATCGAAAGCTCTGTCGACGTTGCTGGTGTGCGCAGGCAACAGGAAGATTTT
CAAGAAGAGTGAACGGGGTATACTAAGTCTTGTTCAGCTTTTGGACCCGAAGATTAAGAA
GATTGATAAGAGGTACGTGGTCTCCGCGTTGGAACTGCTTGTGGCTTGTAAGAAATGTAG
GAAACGAGTCGTTGCTGCTGGTGCTTGTTTGCATTTGCAGACGCTTGTGGAAATGGATGT
TGAAGGAGCTAAGAAATTAGCTGAGAATCTTGCTCGGAGTAAGATTTGGGGGCGTGTTCG
CAAGGCCGTAGGAGG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL6465Contig1 1055 2 2 U
GGAAGGTTCTTGAATTTGCTTTTGTGTGTTCAAGACTCGCTCTCTCGCGGAGTAGCTCAA
GTGAAAGTCAACGCAGCAACCAAGTCTCTTAAAAATGGCTTCACATGACCATGATCATCA
CCATCACGAGCAAGGCCACAAGAAACAGGACGGCTGCGGCAGTGGGGACACGTCTTGGAT
AGGACCGGACGGGAGGGTGTACCATAGCCACGATGGACTCGCACCGCACTCACACGAACC
CATTTACTCTCCTGGCTACTTCAGCCGCCGAGCTCCTCCTCTTAACGACCGTAACTTCTC
CGAGAGAGCTTTCACCGTCGGTATTGGCGGTCCTGTTGGCACAGGGAAAACAGCATTGAT
GCTTGCTCTTTGTAGAGTCTTGAGGGACAAATACAGTCTTGCAGCAGTGACCAATGATAT
ATTCACCAAAGAGGACGGTGAGTTTCTGGTGAAGCATGGGGCTCTTCCTGAGGAAAGGAT
CAGGGCCGTTGAAACCGGTGGACGTCCACACGCAGCCATCCGTGAAGACATCAGTATCAA
TCTAGGTCCTCTTGAGGAGTTATCAAACTTGTTCAAGACTGATTTGCTTCTTTGTGAATC
TGGTGGAGATAATCTAGCTGCTAATTTCAGCAGAGAGCTAGCTGACTACATCATCTACAT
CATCGATGTATCGGCTGGTGATAAAATACCACGTAAAGGCGGTCCGGGCATCACTCAAGC
TGATTTTCTGGTGATAAACAAGACAGACCTCGCAGTAGCTGTTGGGGCTGACTTATCTGT
CATGGAAAGGGATGCACTACGCATGCGTGATGGAGGGCCTTTTGTCTTTGCTCAGGTGAA
GCATGGGATTGGGGTTGAGGAAATAGTGAACCATGTCATGAACTCATGGGAGCAAGCAAC
CGGGAACAAGCGCCACTAATGTTGTTCTTAAGCCCCACAAAAACAAAAAAACTGAATAAA
ACTATCTCGAACTTGGTTTATGTTTCGAAGCTTATGTAACTCTGTTTGTTGTTATTGTTG
TACTCAAAGACAGCAAGAGAAATAAGGGTTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD29TF U 1
AF RR2GD29JQ C 545
BS 1 696 RR2GD29TF
BS 697 1055 RR2GD29JQ

RD RR2GD29TF 696 0 0
GGAAGGTTCTTGAATTTGCTTTTGTGTGTTCAAGACTCGCTCTCTCGCGGAGTAGCTCAA
GTGAAAGTCAACGCAGCAACCAAGTCTCTTAAAAATGGCTTCACATGACCATGATCATCA
CCATCACGAGCAAGGCCACAAGAAACAGGACGGCTGCGGCAGTGGGGACACGTCTTGGAT
AGGACCGGACGGGAGGGTGTACCATAGCCACGATGGACTCGCACCGCACTCACACGAACC
CATTTACTCTCCTGGCTACTTCAGCCGCCGAGCTCCTCCTCTTAACGACCGTAACTTCTC
CGAGAGAGCTTTCACCGTCGGTATTGGCGGTCCTGTTGGCACAGGGAAAACAGCATTGAT
GCTTGCTCTTTGTAGAGTCTTGAGGGACAAATACAGTCTTGCAGCAGTGACCAATGATAT
ATTCACCAAAGAGGACGGTGAGTTTCTGGTGAAGCATGGGGCTCTTCCTGAGGAAAGGAT
CAGGGCCGTTGAAACCGGTGGACGTCCACACGCAGCCATCCGTGAAGACATCAGTATCAA
TCTAGGTCCTCTTGAGGAGTTATCAAACTTGTTCAAGACTGATTTGCTTCTTTGTGAATC
TGGTGGAGATAATCTAGCTGCTAATTTCAGCAGAGAGCTAGCTGACTACATCATCTACAT
CATCGATGTATCGGCTGGTGATAAAATACCACGTAA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2GD29JQ 511 0 0
GGTCCTCTTGAGGAGTTATCAAACTTGTTCAAGACTGATTTGCTTCTTTGTGAATCTGGT
GGAGATAATCTAGCTGCTAATTTCAGCAGAGAGCTAGCTGACTACATCATCTACATCATC
GATGTATCGGCTGGTGATAAAATACCACGTAAAGGCGGTCCGGGCATCACTCAAGCTGAT
TTTCTGGTGATAAACAAGACAGACCTCGCAGTAGCTGTTGGGGCTGACTTATCTGTCATG
GAAAGGGATGCACTACGCATGCGTGATGGAGGGCCTTTTGTCTTTGCTCAGGTGAAGCAT
GGGATTGGGGTTGAGGAAATAGTGAACCATGTCATGAACTCATGGGAGCAAGCAACCGGG
AACAAGCGCCACTAATGTTGTTCTTAAGCCCCACAAAAACAAAAAAACTGAATAAAACTA
TCTCGAACTTGGTTTATGTTTCGAAGCTTATGTAACTCTGTTTGTTGTTATTGTTGTACT
CAAAGACAGCAAGAGAAATAAGGGTTTTTGT

QA 1 511 1 511
DS 



AS 1 2

CO CL6466Contig1 953 2 2 U
GGATATAAACATCTATATATGAATTCTTTCTTCTTAACTTTTTCTCTCTAATCCTTTCCA
ATCCACGTCCAAGTAAAAACAACAAAGAAACAAAAAAGATGAACACTCCAATAAAACTCA
CTTTTCTCATTCTCTGCATCGCCCTAACCGCAACCGCTTTCGTAGTCCCAGCAAAACGTG
CCGATGTTACACCGGAACACGAAAAAACTGTGGCGGGAATCTGCAGCGTTGTGGAAGACA
AAAATCTTTGTAGCATAACCTTGAAAACCGTCCCAAGCAATGACCCAGCCTTCTTGGTCC
GTTACTTAGCCACAGCCGCAGAATCCTCTGTTAAAAGGGGGGAATCAAACCCAAGTACAA
AGGAAACGCATTCGCCACAAACTGCATCACCGGTTGCGAAAAACAGCTAAACAACGCCTT
GGAAGACTTTGCAGATTTCTGGAAAGCCGGGAGAAAACATAACCAGCATGGCTGATAATT
ACTTCACATGCAAGAAGAAGATGACTTCCATCTTCACGTACCAATCGACTTGTCTCGATG
ACATTTATGAAAAAAAGTTGTTGAAAGAGGTTCAAGGGGGGATAGGACTTGGGAAAAGAA
TTAGTGGTGAGTCATTGGATGTGTTCGCTGGAATGGACAAAGTCTTTAACACTTTAAACA
TTAAGACCAAACTTAACCAGCAAGATACCGATTCGTTGCTCCCACCACCTTTGTCGTTTT
ACTACAATTGATTTATTTATTAACATACATATTCTTATACACATATATAACAAAGAAAAA
TGTGCATCGACTGGGGTTTTTCAGATATTTTAGGAATCTTGTAAGGGTTCCTTTTTGATG
TATATTTGTAATTACTATGTTATAGGTGATAATCATGTATGGACCTCGTGGTTGGAAAGG
ATATGGGTAAAATGTGATTATTATCTAATAATAATAAACTTAATTTGTAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM75TF U 1
AF RR2AM75JQ C 77
BS 1 813 RR2AM75TF
BS 814 953 RR2AM75JQ

RD RR2AM75TF 819 0 0
GGATATAAACATCTATATATGAATTCTTTCTTCTTAACTTTTTCTCTCTAATCCTTTCCA
ATCCACGTCCAAGTAAAAACAACAAAGAAACAAAAAAGATGAACACTCCAATAAAACTCA
CTTTTCTCATTCTCTGCATCGCCCTAACCGCAACCGCTTTCGTAGTCCCAGCAAAACGTG
CCGATGTTACACCGGAACACGAAAAAACTGTGGCGGGAATCTGCAGCGTTGTGGAAGACA
AAAATCTTTGTAGCATAACCTTGAAAACCGTCCCAAGCAATGACCCAGCCTTCTTGGTCC
GTTACTTAGCCACAGCCGCAGAATCCTCTGTTAAAAGGGGGGAATCAAACCCAAGTACAA
AGGAAACGCATTCGCCACAAACTGCATCACCGGTTGCGAAAAACAGCTAAACAACGCCTT
GGAAGACTTTGCAGATTTCTGGAAAGCCGGGAGAAAACATAACCAGCATGGCTGATAATT
ACTTCACATGCAAGAAGAAGATGACTTCCATCTTCACGTACCAATCGACTTGTCTCGATG
ACATTTATGAAAAAAAGTTGTTGAAAGAGGTTCAAGGGGGGATAGGACTTGGGAAAAGAA
TTAGTGGTGAGTCATTGGATGTGTTCGCTGGAATGGACAAAGTCTTTAACACTTTAAACA
TTAAGACCAAACTTAACCAGCAAGATACCGATTCGTTGCTCCCACCACCTTTGTCGTTTT
ACTACAATTGATTTATTTATTAACATACATATTCTTATACACATATATAACAAAGAAAAA
TGTGCATCGACTGGGGTTTTTCAGATATTTTAG
AATCTT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2AM75JQ 877 0 0
AAACAACAAAGAAACAAAAAAGATGAACACTCCAATAAAACTCACTTTTCTCATTCTCTG
CATCGCCCTAACCGCAACCGCTTTCGTAGTCCCAGCAAAACGTGCCGATGTTACACCGGA
ACACGAAAAAACTGTGGCGGGAATCTGCAGCGTTGTGGAAGACAAAAATCTTTGTAGCAT
AACCTTGAAAACCGTCCCAAGCAATGACCCAGCCTTCTTGGTCCGTTACTTAGCCACAGC
CGCAGAATCCTCTGTTAAAAGGGGGGAATCAAACCCAAGTACAAAGGAAACGCATTCGCC
ACAAACTGCATCACCGGTTGCGAAAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACTTTGCAGAT
TTTTGGAAAGCCGGGAGAAAACATAACCAGCATGGCTGATAATTACTTCACATGCAAGAA
GAAGATGACTTCCATCTTCACGTACCAATCGACTTGTCTCGATGACATTTATGAAAAAAA
GTTGTTGAAAGAGGTTCAAGGGGGGATAGGACTTGGGAAAAGAATTAGTGGTGAGTCATT
GGATGTGTTCGCTGGAATGGACAAAGTCTTTAACACTTTAAACATTAAGACCAAACTTAA
CCAGCAAGATACCGATTCGTTGCTCCCACCACCTTTGTCGTTTTACTACAATTGATTTAT
TTATTAACATACATATTCTTATACACATATATAACAAAGAAAAATGTGCATCGACTGGGG
TTTTTCAGATATTTTAGGAATCTTGTAAGGGTTCCTTTTTGATGTATATTTGTAATTACT
ATGTTATAGGTGATAATCATGTATGGACCTCGTGGTTGGAAAGGATATGGGTAAAATGTG
ATTATTATCTAATAATAATAAACTTAATTTGTAACTG

QA 1 877 1 877
DS 



AS 1 2

CO CL6467Contig1 788 2 3 U
TTTGGACAAACAAACATAAGATCCATTTAGATGATTCATCTAAATGAGTCACTTGAATAA
ACAAACAAACATCCCATAAAATCTGAATGGATCATGTGGATGGGCCATACAAATGGATCA
TTTGAATGGAGATAGACAAATGGTGAAACGAACAGGCTCTAAAAAACAAATCCTTTGAAA
ATTAGGTTTATTATTACTGTGATATGATGACCAGATCACATGCTCTCTCAAGGAAAAAGA
TCCTGCATGTCGATGATGTCTGCAAGAACACCGGCTGCAGTTGTGTCGTTCCCGGCTCCA
GCACCTTGAATCACCAAAGGCTGCTCCTTGTAGCAACGGCTACGTATCTCTACTATATTG
TCACTGCTCTTAGTCGTCCTAATGGAGAATCTTTTGGAACTTCTCGAATGCCAACTTGAA
CGCTTGAGCCCTCAATCACACAAACATAACGAAGCACACACCCGTTTGATGAAGCTCTTT
TAACTCTCTCCTCAATGCTCTGATCAAGTTTTGCTATTCCATTTTCGAGGAAATCATCCA
CAGTCACGACTCCAGGTCTCATCTCTTCAGGGTACAAGCTCTCTATCTTAATGCTATCCA
TAATTATCCTCTTACCAAGAAGTCGAGCAAGAATCAAACCCTTTCTAGCAACATCCATGC
CACTAAGGTCATCCCGTGGATCTGGTTCAGTATACCCCAGCGTCTTAGCAGCTCGAACAA
CTTGGCTTAGAGGCCTTCCATCTTCAAGCTCACTCATTACATATCCCAAGGTACCGCTCA
AACTACCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G729JQ U 4
AF RR2G729TF C 1
BS 1 3 RR2G729TF
BS 4 620 RR2G729JQ
BS 621 788 RR2G729TF

RD RR2G729JQ 617 0 0
GGACAAACAAACATAAGATCCATTTAGATGATTCATCTAAATGAGTCACTTGAATAAACA
AACAAACATCCCATAAAATCTGAATGGATCATGTGGATGGGCCATACAAATGGATCATTT
GAATGGAGATAGACAAATGGTGAAACGAACAGGCTCTAAAAAACAAATCCTTTGAAAATT
AGGTTTATTATTACTGTGATATGATGACCAGATCACATGCTCTCTCAAGGAAAAAGATCC
TGCATGTCGATGATGTCTGCAAGAACACCGGCTGCAGTTGTGTCGTTCCCGGCTCCAGCA
CCTTGAATCACCAAAGGCTGCTCCTTGTAGCAACGGCTACGTATCTCTACTATATTGTCA
CTGCTCTTAGTCGTCCTAATGGAGAATCTTTTGGAACTTCTCGAATGCCAACTTGAACGC
TTGAGCCCTCAATCACACAAACATAACGAAGCACACACCCGTTTGATGAAGCTCTTTTAA
CTCTCTCCTCAATGCTCTGATCAAGTTTTGCTATTCCATTTTCGAGGAAATCATCCACAG
TCACGACTCCAGGTCTCATCTCTTCAGGGTACAAGCTCTCTATCTTAATGCTATCCATAA
TTATCCTCTTACCAAGA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2G729TF 788 0 0
TTTGGACAAACAAACATAAGATCCATT*AGATGAT*CATCTAAATGAGTCACTTGAATAA
ACAAACAAACATCCCATAAAATCTGAATGGATCATGTGGATGGGCCATACAAATGGATCA
TTTGAATGGAGATAGACAAATGGTGAAACGAACAGGCTCTAAAAAACAAATCCTTTGAAA
ATTAGGTTTATTATTACTGTGATATGATGACCAGATCACATGCTCTCTCAAGGAAAAAGA
TCCTGCATGTCGATGATGTCTGCAAGAACACCGGCTGCAGTTGTGTCGTTCCCGGCTCCA
GCACCTTGAATCACCAAAGGCTGCTCCTTGTAGCAACGGCTACGTATCTCTACTATATTG
TCACTGCTCTTAGTCGTCCTAATGGAGAATCTTTTGGAACTTCTCGAATGCCAACTTGAA
CGCTTGAGCCCTCAATCACACAAACATAACGAAGCACACACCCGTTTGATGAAGCTCTTT
TAACTCTCTCCTCAATGCTCTGATCAAGTTTTGCTATTCCATTTTCGAGGAAATCATCCA
CAGTCACGACTCCAGGTCTCATCTCTTCAGGGTACAAGCTCTCTATCTTAATGCTATCCA
TAATTATCCTCTTACCAAGAAGTCGAGCAAGAATCAAACCCTTTCTAGCAACATCCATGC
CACTAAGGTCATCCCGTGGATCTGGTTCAGTATACCCCAGCGTCTTAGCAGCTCGAACAA
CTTGGCTTAGAGGCCTTCCATCTTCAAGCTCACTCATTACATATCCCAAGGTACCGCTCA
AACTACCC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL6468Contig1 1042 2 2 U
GGACCCATGACCCCTCCCCCTTTCTTCCTCTTTTGCTTCTAATCTTCAACAAAAAATGCC
TTCTTTTGCTTTTGGATCTCATCACCATTTGGCCAATCCCACTGAGTCGCCGCCGTACAC
AGTCGAAATTAGCATCGACGGCGACTCCTCGGACTTGGATTCCTTGTCTGAGGTTGACTT
AGAGAGCGGCGGTGTGACTAAGCTACATTCTGGTGGTGGTAGGAAGAGGAGGGTGAGGAG
GAGAAAGAAGAAGAAGAAAAGGAAGAAGAAAGAGAGTAGAGATTGCAGGATCTGTCATCT
GCCTTTAGAGAGTAGCAAAGAAGGTGGAGAAGAGGATGATTCTGATGAACACGAAGTAGA
TAAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGATGCTGAAGAAGAGTATTATGGTTTGCCTTTGCAATT
GGGTTGTTCTTGTAAAGGTGATTTGGGTGTAGCTCACAGTAAGTGTGCTGAAACTTGGTT
CAAGATCAAAGGAAACATGACATGTGAGATATGCGGGGCAATGGCTATAAACGTAGCTGG
GGAACAGTCAAACCCAGAGAGCACTGCCTCTACAAATTCACAAGTGGTGGCTGCAGGACA
AACTCAGAGTCAGATAGAGCCCCGGGGAATCTGGCATGGTCGCCGTGTTATGAACTTCCT
ACTTGCCGCTATGGTCTTTGCCTTCATTGTTTCTTGGCTTTTTCACTTCAAAGTCCTCAA
GTGAAAAACAAGTTCTCTATCTCTTTGGCCCTCGCGCGCTCTTCTTCTCCTGTTCTTGAG
CCGCGTGCAATCACTACATCAAATCCCTCCTGTCGCTTGATTTGTTCGTTCACACGTTTT
GTAGCTGTAAAAACTTGTTAGTTTTTAGATTGTTTGTCACTTGTGAGCTTTTTTTTTTTT
ACATTTTGTATAATATTCATCTTCACTCCGGTTTGGTCAAAACTTCTATGCAACCAAGAG
GGTCTTGGCTCTTTTGGTTTCAGACACAAACATCCTTGTCTTTGAAGACTGGTATTTGGT
AATAGAATAGATAGCTGTGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC25TF U 1
AF RR2BC25JQ C 330
BS 1 848 RR2BC25TF
BS 849 1042 RR2BC25JQ

RD RR2BC25TF 848 0 0
GGACCCATGACCCCTCCCCCTTTCTTCCTCTTTTGCTTCTAATCTTCAACAAAAAATGCC
TTCTTTTGCTTTTGGATCTCATCACCATTTGGCCAATCCCACTGAGTCGCCGCCGTACAC
AGTCGAAATTAGCATCGACGGCGACTCCTCGGACTTGGATTCCTTGTCTGAGGTTGACTT
AGAGAGCGGCGGTGTGACTAAGCTACATTCTGGTGGTGGTAGGAAGAGGAGGGTGAGGAG
GAGAAAGAAGAAGAAGAAAAGGAAGAAGAAAGAGAGTAGAGATTGCAGGATCTGTCATCT
GCCTTTAGAGAGTAGCAAAGAAGGTGGAGAAGAGGATGATTCTGATGAACACGAAGTAGA
TAAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGATGCTGAAGAAGAGTATTATGGTTTGCCTTTGCAATT
GGGTTGTTCTTGTAAAGGTGATTTGGGTGTAGCTCACAGTAAGTGTGCTGAAACTTGGTT
CAAGATCAAAGGAAACATGACATGTGAGATATGCGGGGCAATGGCTATAAACGTAGCTGG
GGAACAGTCAAACCCAGAGAGCACTGCCTCTACAAATTCACAAGTGGTGGCTGCAGGACA
AACTCAGAGTCAGATAGAGCCCCGGGGAATCTGGCATGGTCGCCGTGTTATGAACTTCCT
ACTTGCCGCTATGGTCTTTGCCTTCATTGTTTCTTGGCTTTTTCACTTCAAAGTCCTCAA
GTGAAAAACAAGTTCTCTATCTCTTTGGCCCTCGCGCGCTCTTCTTCTCCTGTTCTTGAG
CCGCGTGCAATCACTACATCAAATCCCTCCTGTCGCTTGATTTGTTCGTTCACACGTTTT
GTAGCTGT

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR2BC25JQ 713 0 0
AAGAGGATGATTCTGATGAACACGAAGTAGATAAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGATGCTG
AAGAAGAGTATTATGGTTTGCCTTTGCAATTGGGTTGTTCTTGTAAAGGTGATTTGGGTG
TAGCTCACAGTAAGTGTGCTGAAACTTGGTTCAAGATCAAAGGAAACATGACATGTGAGA
TATGCGGGGCAATGGCTATAAACGTAGCTGGGGAACAGTCAAACCCAGAGAGCACTGCCT
CTACAAATTCACAAGTGGTGGCTGCAGGACAAACTCAGAGTCAGATAGAGCCCCGGGGAA
TCTGGCATGGTCGCCGTGTTATGAACTTCCTACTTGCCGCTATGGTCTTTGCCTTCATTG
TTTCTTGGCTTTTTCACTTCAAAGTCCTCAAGTGAAAAACAAGTTCTCTATCTCTTTGGC
CCTCGCGCGCTTTTTTTCTCCTGTTCTTGAGCCGCGTGCAATCACTACATCAAATCCCTC
CTGTCGCTTGATTTGTTCGTTCACACGTTTTGTAGCTGTAAAAACTTGTTAGTTTTTAGA
TTGTTTGTCACTTGTGAGCTTTTTTTTTTTTACATTTTGTATAATATTCATCTTCACTCC
GGTTTGGTCAAAACTTCTATGCAACCAAGAGGGTCTTGGCTCTTTTGGTTTCAGACACAA
ACATCCTTGTCTTTGAAGACTGGTATTTGGTAATAGAATAGATAGCTGTGTCG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL6469Contig1 417 2 1 U
GGGGTAACCTAAGAAAATCGACTCCTCTGCTTCTTCTCCCTCTTCGTCGTCGAGCAGAGT
CAGCTAATCTACAGAAATGGACCGTGACCTCGCAAACAACCCCCAGTTGATTCAATTCCT
CAGCCAAGAAAAAGAAAGGGCAATGGCGAACGAAGTGGTGGCGAAGATAACAAGCTCGTG
CTGGGACAAATGTGTGGACAAACCAGGAAGCAAATTCAGCTCAAGCGAGTCTTCTTGCCT
CAGTAACTGCGCCCTACGCTACATGGACATGACTATGCTCATCATGAAACGCTTTCAGCA
GTAGTGATTTCTTATATCCATCATCATGTTACTTCTTCCCTTTTATTTATTATTATGAAA
ACCTTCTTCTTTTTTTCTTATTCTCATGGCAACTTGGTGTTAAACCCCTGCAATAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GF54JQ C 1
AF RR2GF54TF U 1
BS 1 417 RR2GF54TF

RD RR2GF54JQ 417 0 0
GGGGTAACCTAAGAAAATCGACTCCTCTGCTTCTTCTCCCTCTTCGTCGTCGAGCAGAGT
CAGCTAATCTACAGAAATGGACCGTGACCTCGCAAACAACCCCCAGTTGATTCAATTCCT
CAGCCAAGAAAAAGAAAGGGCAATGGCGAACGAAGTGGTGGCGAAGATAACAAGCTCGTG
CTGGGACAAATGTGTGGACAAACCAGGAAGCAAATTCAGCTCAAGCGAGTCTTCTTGCCT
CAGTAACTGCGCCCTACGCTACATGGACATGACTATGCTCATCATGAAACGCTTTCAGCA
GTAGTGATTTCTTATATCCATCATCATGTTACTTCTTCCCTTTTATTTATTATTATGAAA
ACCTTCTTCTTTTTTTCTTATTCTCATGGCAACTTGGTGTTAAACCCCTGCAATAAT

QA 1 417 1 417
DS 

RD RR2GF54TF 417 0 0
GGGGTAACCTAAGAAAATCGACTCCTCTGCTTCTTCTCCCTCTTCGTCGTCGAGCAGAGT
CAGCTAATCTACAGAAATGGACCGTGACCTCGCAAACAACCCCCAGTTGATTCAATTCCT
CAGCCAAGAAAAAGAAAGGGCAATGGCGAACGAAGTGGTGGCGAAGATAACAAGCTCGTG
CTGGGACAAATGTGTGGACAAACCAGGAAGCAAATTCAGCTCAAGCGAGTCTTCTTGCCT
CAGTAACTGCGCCCTACGCTACATGGACATGACTATGCTCATCATGAAACGCTTTCAGCA
GTAGTGATTTCTTATATCCATCATCATGTTACTTCTTCCCTTTTATTTATTATTATGAAA
ACCTTCTTCTTTTTTTCTTATTCTCATGGCAACTTGGTGTTAAACCCCTGCAATAAT

QA 1 417 1 417
DS 



AS 1 2

CO CL6470Contig1 704 2 2 U
GGACAGACTTACACGAAAGCAATCGCTCCCTTACTTCTTCTCCCTATATCTATATATACT
TAACAAAAATTTAAAAAATCTTTTCTGAGACCATGTCAGGTGTTTGGGTGTTCAAAAACG
GAATCGTACGTCTAGTGGAGGACCCAAACAAGTCCGAAGGCGGCCCGTCCGGCGCCGGCG
CAAAGAAGGTTTTGGTTTACTTGCCGACCGGTGAAGTAGTATCTTCTTACACATCACTCG
AAGAGATCCTAACGAGCCTTGGGTGGGAGAAATACGAAGGTGGAGACACAGATCAACTCC
AGTTCTGCAAACCCTCCTCCACCATCCTCATCTCCTTACCAAAAGACTTCTCCAAGCTCA
AAGCCTTCACATGTACGACATCGTCATAAAAAACCGTGACTCTTTCCAAGTCCGTGATTC
AACATGAATAGTTCCACCGATTCATTTTCGACCGATAGGCCTAGTGTGCGTTTGTTTAAT
GTGTTCCAACCAATAAATTCAAGACAGGAATATCTGCAGTAATCATGACTGCGTTTTTTT
TTTCTCTTCCAATTTCCATCATCATTTTCTTTCTCCAGATTTGTTGCATGTGCTTGCTTC
TATCTTCATCATCTTTGTGAGGCTTAATGTGTCGCCGTCGTTTATTTGCCTTTTCTGCCT
TTTGTAAGTTGTGTTGATCGATGTAATAAAGGTGTTTCTTTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX16TF U 1
AF RR2GX16JQ C 222
BS 1 610 RR2GX16TF
BS 611 704 RR2GX16JQ

RD RR2GX16TF 610 0 0
GGACAGACTTACACGAAAGCAATCGCTCCCTTACTTCTTCTCCCTATATCTATATATACT
TAACAAAAATTTAAAAAATCTTTTCTGAGACCATGTCAGGTGTTTGGGTGTTCAAAAACG
GAATCGTACGTCTAGTGGAGGACCCAAACAAGTCCGAAGGCGGCCCGTCCGGCGCCGGCG
CAAAGAAGGTTTTGGTTTACTTGCCGACCGGTGAAGTAGTATCTTCTTACACATCACTCG
AAGAGATCCTAACGAGCCTTGGGTGGGAGAAATACGAAGGTGGAGACACAGATCAACTCC
AGTTCTGCAAACCCTCCTCCACCATCCTCATCTCCTTACCAAAAGACTTCTCCAAGCTCA
AAGCCTTCACATGTACGACATCGTCATAAAAAACCGTGACTCTTTCCAAGTCCGTGATTC
AACATGAATAGTTCCACCGATTCATTTTCGACCGATAGGCCTAGTGTGCGTTTGTTTAAT
GTGTTCCAACCAATAAATTCAAGACAGGAATATCTGCAGTAATCATGACTGCGTTTTTTT
TTTCTCTTCCAATTTCCATCATCATTTTCTTTCTCCAGATTTGTTGCATGTGCTTGCTTC
TATCTTCATC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2GX16JQ 483 0 0
TCTTCTTACACATCACTCGAAGAGATCCTAACGAGCCTTGGGTGGGAGAAATACGAAGGT
GGAGACACAGATCAACTCCAGTTCTGCAAACCCTCCTCCACCATCCTCATCTCCTTACCA
AAAGACTTCTCCAAGCTCAAAGCCTTCACATGTACGACATCGTCATAAAAAACCGTGACT
CTTTCCAAGTCCGTGATTCAACATGAATAGTTCCACCGATTCATTTTCGACCGATAGGCC
TAGTGTGCGTTTGTTTAATGTGTTCCAACCAATAAATTCAAGACAGGAATATTTGCAGTA
ATCATGACTGCGTTTTTTTTTTCTCTTCCAATTTCCATCATCATTTTCTTTCTCCAGATT
TGTTGCATGTGCTTGCTTCTATCTTCATCATCTTTGTGAGGCTTAATGTGTCGCCGTCGT
TTATTTGCCTTTTCTGCCTTTTGTAAGTTGTGTTGATCGATGTAATAAAGGTGTTTCTTT
GGG

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL6471Contig1 619 2 1 U
GGATTATTCTTCTTCTTCTTCCGGCGAGATATTTGGAAACCCGAAAGCGCGATTTAGCTG
GTTTCAACCCCTTTTCTTCGGACGAGCAGAGTTCGCTTAGAGCCAACATGAGTAGTAGGC
CAATGGAAGAGGATACCAACGGAAAGACCGAAGAGGAGGAGTTCAACACGGGACCCCTTT
CTGTTCTGATGATGAGTGTTAAGAACAACACTCAAGTCTTGATCAACTGCCGCAACAATA
GGAAACTCCTTGGCCGTGTTAGGGCTTTCGACAGGCACTGCAACATGGTTCTCGAAAATG
TCAGAGAAATGTGGACTGAGGTACCTAAAACTGGGAAAGGAAAGAAGAAAGCTCTTCCCG
TCAACAGAGATCGCTTTATCAGCAAGATGTTTCTCCGTGGTGACTCTGTCATTGTCGTCC
TCAGGAATCCCAAGTAAGACAGAAAGAAAGAGGAGTTTGAGATGTCTGTTCGGAGTTGTT
TCCTCTTCACGCTTCTCGTGACAGTCCTAATTGTTTGCATCAATGGAGATACATCTTTCA
TAATGAGTCTTAAAATCTAGTGTTCCCCTTGTATTTTTCACTTGTGTTCTCTCTTATGAC
TAATACGCAGCGTTGATCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AI28JQ C 1
AF RR2AI28TF U 1
BS 1 619 RR2AI28TF

RD RR2AI28JQ 619 0 0
GGATTATTCTTCTTCTTCTTCCGGCGAGATATTTGGAAACCCGAAAGCGCGATTTAGCTG
GTTTCAACCCCTTTTCTTCGGACGAGCAGAGTTCGCTTAGAGCCAACATGAGTAGTAGGC
CAATGGAAGAGGATACCAACGGAAAGACCGAAGAGGAGGAGTTCAACACGGGACCCCTTT
CTGTTCTGATGATGAGTGTTAAGAACAACACTCAAGTCTTGATCAACTGCCGCAACAATA
GGAAACTCCTTGGCCGTGTTAGGGCTTTCGACAGGCACTGCAACATGGTTCTCGAAAATG
TCAGAGAAATGTGGACTGAGGTACCTAAAACTGGGAAAGGAAAGAAGAAAGCTCTTCCCG
TCAACAGAGATCGCTTTATCAGCAAGATGTTTCTCCGTGGTGACTCTGTCATTGTCGTCC
TCAGGAATCCCAAGTAAGACAGAAAGAAAGAGGAGTTTGAGATGTCTGTTCGGAGTTGTT
TCCTCTTCACGCTTCTCGTGACAGTCCTAATTGTTTGCATCAATGGAGATACATCTTTCA
TAATGAGTCTTAAAATCTAGTGTTCCCCTTGTATTTTTCACTTGTGTTCTCTCTTATGAC
TAATACGCAGCGTTGATCG

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2AI28TF 619 0 0
GGATTATTCTTCTTCTTCTTCCGGCGAGATATTTGGAAACCCGAAAGCGCGATTTAGCTG
GTTTCAACCCCTTTTCTTCGGACGAGCAGAGTTCGCTTAGAGCCAACATGAGTAGTAGGC
CAATGGAAGAGGATACCAACGGAAAGACCGAAGAGGAGGAGTTCAACACGGGACCCCTTT
CTGTTCTGATGATGAGTGTTAAGAACAACACTCAAGTCTTGATCAACTGCCGCAACAATA
GGAAACTCCTTGGCCGTGTTAGGGCTTTCGACAGGCACTGCAACATGGTTCTCGAAAATG
TCAGAGAAATGTGGACTGAGGTACCTAAAACTGGGAAAGGAAAGAAGAAAGCTCTTCCCG
TCAACAGAGATCGCTTTATCAGCAAGATGTTTCTCCGTGGTGACTCTGTCATTGTCGTCC
TCAGGAATCCCAAGTAAGACAGAAAGAAAGAGGAGTTTGAGATGTCTGTTCGGAGTTGTT
TCCTCTTCACGCTTCTCGTGACAGTCCTAATTGTTTGCATCAATGGAGATACATCTTTCA
TAATGAGTCTTAAAATCTAGTGTTCCCCTTGTATTTTTCACTTGTGTTCTCTCTTATGAC
TAATACGCAGCGTTGATCG

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL6472Contig1 833 2 2 U
CCAGATTCCGCAGGTAGATACCAAAACGTACCTTGAGAGGTTTCTTCGCTATGGCAGCCA
ACGATTCTTCAAATGCTGTAGACACCGAAGTCAAACTCCACTCAGACGGTGACGATGATG
ATGGAACGGATAAAGATTCCTCGAAGACATTGACTATCCCTGCTCCCGCCGTTTGTTTTG
TCCGTTTCGCCGGAGATGCAGCTGGCGGCGCCGTCATGGGCTCTATCTTTGGATACGGTT
CAGGATTGTTCAAGAAGAAAGGCTTTAAAGGATCCTTCGCAGATGCAGGGCAGTCTGCAA
AGACTTTTGCTGTTTTGTCTGGAGTACACAGTTTGGTTGTTTGCCTTCTGAAGCAATTGC
GTGGGAAAGATGACGCCATTAATGTTGGGGTTGCTGGGTGCTGCACCGGCCTTGCTCTTA
GTTTCCCTGGTGCTCCACAGGCTCTTCTACAGAGTTGCCTCACTTTTGGTGCTTTCTCTT
TTATCCTTGAAGGACTCAACAAAAGACAAACAGCTTTGGCTCACTCCGTCTCCTTGAGAC
ACCAAACCGGAAACTTTCAAGATCACCATCGTCCTTTAACACTCTCTCTCGCCCTCCCCA
TCCATGAAGAGATCAGTGGAGCCTTCTCTTCTTTCTGCAAGTCTTTATCTAAACCCAAGA
AGATCTAATCTCCCTTGATTCTCCTTTACTTGTGCCTTAGGTTCCCTGTCTGTAGATCTC
TAAATCATTTCCTCCTTTTTGATGTACTGTGTGAGAGAGTGTTTTGTGAAACTCTTTTTG
AAAGAGACACTTTGTGTAACGTATTCTCTACTAATACAATGTTTTTGTAGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B164TF U 1
AF RR2B164JQ C 97
BS 1 731 RR2B164TF
BS 732 833 RR2B164JQ

RD RR2B164TF 731 0 0
CCAGATTCCGCAGGTAGATACCAAAACGTACCTTGAGAGGTTTCTTCGCTATGGCAGCCA
ACGATTCTTCAAATGCTGTAGACACCGAAGTCAAACTCCACTCAGACGGTGACGATGATG
ATGGAACGGATAAAGATTCCTCGAAGACATTGACTATCCCTGCTCCCGCCGTTTGTTTTG
TCCGTTTCGCCGGAGATGCAGCTGGCGGCGCCGTCATGGGCTCTATCTTTGGATACGGTT
CAGGATTGTTCAAGAAGAAAGGCTTTAAAGGATCCTTCGCAGATGCAGGGCAGTCTGCAA
AGACTTTTGCTGTTTTGTCTGGAGTACACAGTTTGGTTGTTTGCCTTCTGAAGCAATTGC
GTGGGAAAGATGACGCCATTAATGTTGGGGTTGCTGGGTGCTGCACCGGCCTTGCTCTTA
GTTTCCCTGGTGCTCCACAGGCTCTTCTACAGAGTTGCCTCACTTTTGGTGCTTTCTCTT
TTATCCTTGAAGGACTCAACAAAAGACAAACAGCTTTGGCTCACTCCGTCTCCTTGAGAC
ACCAAACCGGAAACTTTCAAGATCACCATCGTCCTTTAACACTCTCTCTCGCCCTCCCCA
TCCATGAAGAGATCAGTGGAGCCTTCTCTTCTTTCTGCAAGTCTTTATCTAAACCCAAGA
AGATCTAATCTCCCTTGATTCTCCTTTACTTGTGCCTTAGGTTCCCTGTCTGTAGATCTC
TAAATCATTTC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2B164JQ 737 0 0
TCCACTCAGACGGTGACGATGATGATGGAACGGATAAAGATTCCTCGAAGACATTGACTA
TCCCTGCTCCCGCCGTTTGTTTTGTCCGTTTCGCCGGAGATGCAGCTGGCGGCGCCGTCA
TGGGCTCTATCTTTGGATACGGTTCAGGATTGTTCAAGAAGAAAGGCTTTAAAGGATCCT
TCGCAGATGCAGGGCAGTCTGCAAAGACTTTTGCTGTTTTGTCTGGAGTACACAGTTTGG
TTGTTTGCCTTCTGAAGCAATTGCGTGGGAAAGATGACGCCATTAATGTTGGGGTTGCTG
GGTGCTGCCCCGGCCTTGCTCTTAGTTTCCCTGGTGCTCCACAGGCTCTTCTACAGAGTT
GCCTCACTTTTGGTGCTTTCTCTTTTATCCTTGAAGGACTCAACAAAAGACAAACAGCTT
TGGCTCACTCCGTCTCCTTGAGACACCAAACCGGAAACTTTCAAGATCACCATCGTCCTT
TAACACTCTCTCTCGCCCTCCCCATCCATGAAGAGATCAGTGGAGCCTTTTTTTCTTTTT
GCAAGTCTTTATCTAAACCCAAGAAGATCTAATCTCCCTTGATTCTCCTTTACTTGTGCC
TTAGGTTCCCTGTCTGTAGATCTCTAAATCATTTCCTCCTTTTTGATGTACTGTGTGAGA
GAGTGTTTTGTGAAACTCTTTTTGAAAGAGACACTTTGTGTAACGTATTCTCTACTAATA
CAATGTTTTTGTAGACT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL6473Contig1 848 2 2 U
GGAAACACGTTCCTTCACTTTCTTGGTTCTCTCTCTCTGTTCCTCCTGAATAAGGGCAGG
CTGAAAGCTACCGTTTGATTCGTATATTCCTCACATTGTAGCCATCTAGAGTTGTATATT
TGCCTTTGTAATCTCTATCTATACGTAAATGGGTCAGCAACTGCGTCGAGCCGTAGGGAG
AGTCAAAGAAGTTGAAAAGTTTCCATCAAGGGTCGATCGGAGATCTCTTCCTAAGGAAGA
ACTCAGCGCCGTGAAATCTCCGTCAACCGCCGCCATTAGTGATGTTTCTGATGAAGCTCG
AGGAAGCAGTGGTGATACTGTTTTAGAAGAAAGAGACCCACAATACGATACAATGTTGAA
CCAAATGGTTGGGAGAATAAAGTCTAAACCTGGAGGCAAAGCTGAGATGGGAGAGGCATC
GGTAGTGGAAACGTCGAAAAGGCCACTCCCAAAGCTCCGGAACACAACTCCTGAATCAAC
AAGGTACGAGGAAAAACCGGTGCCGCAAGGGACATTAAACGTGGCTCAAGTGAGACACAT
CATGCTTCTCTATCAGGGCAAGGCTCAGGATCACAACGGTCCAATGAGTGTGAACGAGAT
TGCCAAAAACTACAGGATTGACGTCTCCCAGGTCCAGAAAGTCACTCAGTTCCTATCTTT
GCCACCAGAGGCTACTGACAAGCAGAAGAAACGATACGAATAGAAGTAAAAGACTATGTT
TGTTCATCTAGATTCAAATTTTTTTTTCTCTAGCAATAATGTAAGAAGGATACAAAAGCT
TTACACACGTGTGACAACAATACCATAAGGATGAGTTTTGTGTTCAAGTTCTTTCTTACA
AGATAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H285TF U 1
AF RR2H285JQ C 128
BS 1 759 RR2H285TF
BS 760 848 RR2H285JQ

RD RR2H285TF 759 0 0
GGAAACACGTTCCTTCACTTTCTTGGTTCTCTCTCTCTGTTCCTCCTGAATAAGGGCAGG
CTGAAAGCTACCGTTTGATTCGTATATTCCTCACATTGTAGCCATCTAGAGTTGTATATT
TGCCTTTGTAATCTCTATCTATACGTAAATGGGTCAGCAACTGCGTCGAGCCGTAGGGAG
AGTCAAAGAAGTTGAAAAGTTTCCATCAAGGGTCGATCGGAGATCTCTTCCTAAGGAAGA
ACTCAGCGCCGTGAAATCTCCGTCAACCGCCGCCATTAGTGATGTTTCTGATGAAGCTCG
AGGAAGCAGTGGTGATACTGTTTTAGAAGAAAGAGACCCACAATACGATACAATGTTGAA
CCAAATGGTTGGGAGAATAAAGTCTAAACCTGGAGGCAAAGCTGAGATGGGAGAGGCATC
GGTAGTGGAAACGTCGAAAAGGCCACTCCCAAAGCTCCGGAACACAACTCCTGAATCAAC
AAGGTACGAGGAAAAACCGGTGCCGCAAGGGACATTAAACGTGGCTCAAGTGAGACACAT
CATGCTTCTCTATCAGGGCAAGGCTCAGGATCACAACGGTCCAATGAGTGTGAACGAGAT
TGCCAAAAACTACAGGATTGACGTCTCCCAGGTCCAGAAAGTCACTCAGTTCCTATCTTT
GCCACCAGAGGCTACTGACAAGCAGAAGAAACGATACGAATAGAAGTAAAAGACTATGTT
TGTTCATCTAGATTCAAATTTTTTTTTCTCTAGCAATAA

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2H285JQ 721 0 0
GTAATCTCTATCTATACGTAAATGGGTCAGCAACTGCGTCGAGCCGTAGGGAGAGTCAAA
GAAGTTGAAAAGTTTCCATCAAGGGTCGATCGGAGATCTCTTCCTAAGGAAGAACTCAGC
GCCGTGAAATCTCCGTCAACCGCCGCCATTAGTGATGTTTCTGATGAAGCTCGAGGAAGC
AGTGGTGATACTGTTTTAGAAGAAAGAGACCCACAATACGATACAATGTTGAACCAAATG
GTTGGGAGAATAAAGTCTAAACCTGGAGGCAAAGCTGAGATGGGAGAGGCATCGGTAGTG
GAAACGTCGAAAAGGCCACTCCCAAAGCTCCGGAACACAACTCCTGAATCAACAAGGTAC
GAGGAAAAACCGGTGCCGCAAGGGACATTAAACGTGGCTCAAGTGAGACACATCATGCTT
CTCTATCAGGGCAAGGCTCAGGATCACAACGGTCCAATGAGTGTGAACGAGATTGCCAAA
AACTACAGGATTGACGTCTCCCAGGTCCAGAAAGTCACTCAGTTCCTATCTTTGCCACCA
GAGGCTACTGACAAGCAGAAGAAACGATACGAATAGAAGTAAAAGACTATGTTTGTTCAT
CTAGATTCAAATTTTTTTTTCTCTAGCAATAATGTAAGAAGGATACAAAAGCTTTACACA
CGTGTGACAACAATACCATAAGGATGAGTTTTGTGTTCAAGTTCTTTCTTACAAGATAAG
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL6474Contig1 804 2 8 U
GGAAAAACGAAGTTACTTAAGGTAGAGAATATTTTCTTGCGTCTAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGATGGGGGGTGTGGTAGAGGAAGCTCACAACGTGAAGGTGATTGGCTCAGGAAATCA
AAGGACGATCGTGTTAGGTCACGGGTTTGGCACGGACCAGTCAGTGTGGAAACACTTGGT
TCCACATCTGGTCGATGATTACCGCATCGTGCTCTACGACAACATGGGAGCCGGTACGAC
CAATCCGGAATATTTCGACTTCGAACGTTACTCAACTCTCGAAGGTTTCTCTTTTGATTT
GATTGCAATTTTAGAGGATCTTCAAATCGAGTCTTGTATATTTGTTGGTCACTCTCTATC
TGCCATGGTTGGTGTCTTGGCTTCTCTTAACCGACCTGACCTCTTCTCCAAAATTGTCAT
GATATCTGCTTCCCCACGATACGTGAACGATGCTGATTACCAAGGTAGGTTCGAGCAAGA
CGACCTAAACCAACTTTTTGAAGCGATGCGAAGCAACTACAAAGCGTGGTGCTTAGGTTT
CGCTCCACTCGCGGTAGGTGGAGACTTAGACTCAGTAGCCGTTCAAGAATTCAGCAGAAC
GCTCTTCAACATGCGTCCGGACATAGCACTTTCCCTGGCCCAGACCATTTTCCAAAGCGA
CATGAGACAGTTGTTACCTTTTGTCTCTGTCCCTTGTCACATCGTCCAAAGCGTTAAAGA
TTTAGCCGTGCCGGTCGCCGTATCCGAGTATCTTCACAAAATCTCGGATGCGAATCTGTC
GTTGAGTATGTCTTCAGATGGTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK23TF U 1
AF RR2DI70TF U 17
BS 1 121 RR2EK23TF
BS 122 122 RR2DI70TF
BS 123 466 RR2EK23TF
BS 467 467 RR2DI70TF
BS 468 531 RR2EK23TF
BS 532 532 RR2DI70TF
BS 533 715 RR2EK23TF
BS 716 804 RR2DI70TF

RD RR2EK23TF 715 0 0
GGAAAAACGAAGTTACTTAAGGTAGAGAATATTTTCTTGCGTCTAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGATGGGGGGTGTGGTAGAGGAAGCTCACAACGTGAAGGTGATTGGCTCAGGAAATCA
AGGGACGATCGTGTTAGGTCACGGGTTTGGCACGGACCAGTCAGTGTGGAAACACTTGGT
TCCACATCTGGTCGATGATTACCGCATCGTGCTCTACGACAACATGGGAGCCGGTACGAC
CAATCCGGAATATTTCGACTTCGAACGTTACTCAACTCTCGAAGGTTTCTCTTTTGATTT
GATTGCAATTTTAGAGGATCTTCAAATCGAGTCTTGTATATTTGTTGGTCACTCTCTATC
TGCCATGGTTGGTGTCTTGGCTTCTCTTAACCGACCTGACCTCTTCTCCAAAATTGTCAT
GATATCTGCTTCCCCACGATACGTGAACGATGCTGATTACCAAGGTGGGTTCGAGCAAGA
CGACCTAAACCAACTTTTTGAAGCGATGCGAAGCAACTACAAAGCGTGGTGTTTAGGTTT
CGCTCCACTCGCGGTAGGTGGAGACTTAGACTCAGTAGCCGTTCAAGAATTCAGCAGAAC
GCTCTTCAACATGCGTCCGGACATAGCACTTTCCCTGGCCCAGACCATTTTCCAAAGCGA
CATGAGACAGTTGTTACCTTTTGTCTCTGTCCCTTGTCACATCGTCCAAAGCGTT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2DI70TF 788 0 0
GG
AAGGTAGAGAATATTTTCTTGCGTCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGGGGGTGTGGT
AGAGGAAGCTCACAACGTGAAGGTGATTGGCTCAGGAAATCAAAGGACGATCGTGTTAGG
TCACGGGTTTGGCACGGACCAGTCAGTGTGGAAACACTTGGTTCCACATCTGGTCGATGA
TTACCGCATCGTGCTCTACGACAACATGGGAGCCGGTACGACCAATCCGGAATATTTCGA
CTTCGAACGTTACTCAACTCTCGAAGGTTTCTCTTTTGATTTGATTGCAATTTTAGAGGA
TCTTCAAATCGAGTCTTGTATATTTGTTGGTCACTCTCTATCTGCCATGGTTGGTGTCTT
GGCTTCTCTTAACCGACCTGACCTCTTCTCCAAAATTGTCATGATATCTGCTTCCCCACG
ATACGTGAACGATGCTGATTACCAAGGTAGGTTCGAGCAAGACGACCTAAACCAACTTTT
TGAAGCGATGCGGAGCAACTACAAAGCGTGGTGCTTAGGTTTCGCTCCACTCGCGGTAGG
TGGAGACTTAGACTCAGTAGCCGTTCAAGAATTCAGCAGAACGCTCTTCAACATGCGTCC
GGACATAGCACTTTCCCTGGCCCAGACCATTTTCCAAAGCGACATGAGACAGTTGTTACC
TTTTGTCTCTGTCCCTTGTCACATCGTCCAAAGCGTTAAAGATTTAGCCGTGCCGGTCGC
CGTATCCGAGTATCTTCACAAAATCTCGGATGCGAATCTGTCGTTGAGTATGTCTTCAGA
TGGTCA

QA 3 788 3 788
DS 



AS 1 2

CO CL6475Contig1 944 2 2 U
GATGCACCTCGGACAACGCAGATTCTGCTTGGTACAAAGACTTGGAACCTTGCGTAACAC
CGTTACCAAATACAAACAATCCAGAGGAATCAGCAGGTGGTGCGCTCGAGGATTGGCCAG
ACCGAGCATTCGCGGTACCTCCTAGGATTATCAGAGGAACCATACAGGACATCAGCACCG
AGACGTTTAGAGAAGACAACGAGGTTTGGAAAGAGAGGATAGCTCATTACAAGAAGATAT
TCCCAGAGCTTTCACGTGGAAGATTCAGGAACATAATGGACATGAACGCTTACCTCGGTG
GATTCGCTGCGTCTATGCTTAAATACCCATCTTGGGTCATGAATGTTGTTCCCGTCGATG
CAGAGAAACAGACGTTAGGTGTGATCTTCGAGCGTGGATTGATTGGGACGTATCAAGATT
GGTGTGAAGGATTCTCTACTTATCCAAGAACTTATGATATGATTCATGCAGGAGGATTGT
TCAGTTTATATAAAAACAAGTGTGATTTGACGCTGATATTGTTGGAGATGGATAGAATAT
TGAGACCAGAAGGAACGGTTGTGTTGAGAGATAACGTGGAGATGTTGACGAAAGTAGAGA
GGATAGCGAAGGGAATGAAGTGGAACACTCAAATTGTGGATCATGAGAAAGGTCCGTACA
ATCCTGAGAAGATTCTTGTTGCTGTTAAAACTTATTGGACTGGTCAACCTTCTAACAACA
ATAAAAACAACTAGTGTGCCAACTCTCTTGGTTCCACTCTCCTTTGTGTTTATTTATTTA
TTTTGCTTTAAAATCATGTTTTGTACTTCTTCTCTAAAATCATATCTAATGACTATTAGG
TTTAGAATCAAACATTTTGATGGAAGTTTAACTTAAATATTTTATATATGTTTAGTTTTA
TGTATGAATGTAAAGAATCTATTAAGTGATACGAGTTTGACGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B096TF U 1
AF RR2B096JQ C 153
BS 1 771 RR2B096TF
BS 772 944 RR2B096JQ

RD RR2B096TF 771 0 0
GATGCACCTCGGACAACGCAGATTCTGCTTGGTACAAAGACTTGGAACCTTGCGTAACAC
CGTTACCAAATACAAACAATCCAGAGGAATCAGCAGGTGGTGCGCTCGAGGATTGGCCAG
ACCGAGCATTCGCGGTACCTCCTAGGATTATCAGAGGAACCATACAGGACATCAGCACCG
AGACGTTTAGAGAAGACAACGAGGTTTGGAAAGAGAGGATAGCTCATTACAAGAAGATAT
TCCCAGAGCTTTCACGTGGAAGATTCAGGAACATAATGGACATGAACGCTTACCTCGGTG
GATTCGCTGCGTCTATGCTTAAATACCCATCTTGGGTCATGAATGTTGTTCCCGTCGATG
CAGAGAAACAGACGTTAGGTGTGATCTTCGAGCGTGGATTGATTGGGACGTATCAAGATT
GGTGTGAAGGATTCTCTACTTATCCAAGAACTTATGATATGATTCATGCAGGAGGATTGT
TCAGTTTATATAAAAACAAGTGTGATTTGACGCTGATATTGTTGGAGATGGATAGAATAT
TGAGACCAGAAGGAACGGTTGTGTTGAGAGATAACGTGGAGATGTTGACGAAAGTAGAGA
GGATAGCGAAGGGAATGAAGTGGAACACTCAAATTGTGGATCATGAGAAAGGTCCGTACA
ATCCTGAGAAGATTCTTGTTGCTGTTAAAACTTATTGGACTGGTCAACCTTCTAACAACA
ATAAAAACAACTAGTGTGCCAACTCTCTTGGTTCCACTCTCCTTTGTGTTT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2B096JQ 792 0 0
AGAGGAACCATACAGGACATCAGCACCGAGACGTTTAGAGAAGACAACGAGGTTTGGAAA
GAGAGGATAGCTCATTACAAGAAGATATTCCCAGAGCTTTCACGTGGAAGATTCAGGAAC
ATAATGGACATGAACGCTTACCTCGGTGGATTCGCTGCGTCTATGCTTAAATACCCATCT
TGGGTCATGAATGTTGTTCCCGTCGATGCAGAGAAACAGACGTTAGGTGTGATCTTCGAG
CGTGGATTGATTGGGACGTATCAAGATTGGTGTGAAGGATTCTCTACTTATCCAAGAACT
TATGATATGATTCATGCAGGAGGATTGTTCAGTTTATATAAAAACAAGTGTGATTTGACG
CTGATATTGTTGGAGATGGATAGAATATTGAGACCAGAAGGAACGGTTGTGTTGAGAGAT
AACGTGGAGATGTTGACGAAAGTAGAGAGGATAGCGAAGGGAATGAAGTGGAACACTCAA
ATTGTGGATCATGAGAAAGGTCCGTACAATCCTGAGAAGATTCTTGTTGCTGTTAAAACT
TATTGGACTGGTCAACCTTCTAACAACAATAAAAACAACTAGTGTGCCAACTCTCTTGGT
TCCACTCTCCTTTGTGTTTATTTATTTATTTTGCTTTAAAATCATGTTTTGTACTTCTTC
TCTAAAATCATATCTAATGACTATTAGGTTTAGAATCAAACATTTTGATGGAAGTTTAAC
TTAAATATTTTATATATGTTTAGTTTTATGTATGAATGTAAAGAATCTATTAAGTGATAC
GAGTTTGACGCC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL6476Contig1 655 2 1 U
GGACGTTCAACCGGCAATCGTTTCTTCTTCTCACCGTCGCTGCTAAACATGGGGCTCGAT
GCTTATGCTTCGTCGAACCCTAATAAGGTTCACGAGGACGTTCTTCAGAAATCTAGAGAT
GCTTGCTACAAGGCAAGAGATGCTTTTTACACTTGTCTGGAGAAGGAATCTGGTAAGAAA
CCCACTGAGATCGCGTCCGTAGGTCTTCTCTACCCTAAAGAGTGCAGCCACTCCAGAACA
GAGTTCGTCAAGAACTGCCGCTCCTCCTGGGTGAAGCATTTCGATAGGGAGTACTGTCGG
AACAAGAGAGTCCAAAGGCTGTTAGATGATGGAGATGAGAGGAAAGGTCCAATGTCACTT
CCTCAGCCTTACACTTTCAAGCCTTCCCCTTCTTCTTAGATCCCTTCCTTTCCTGGAAGA
GGAAGATGACTGAGTAATCTCTTGGTAGCACTTACTACGTTCCTGAAGCATTAGGACTCA
TTATCTTTGCCGACTTTTTTTTTTTTATATCCCTTAAAGTCTCTCTTGTCTTTATTTGAG
TTGTAAGCCTACAACATGGGAATAAAGGTGTTGTGCTTTTGAAGGAACCTGGTTCTTTTG
CCTATTGTCTATTGCTCACAATCTGCAAGCATTAATATAAAATGATTACTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BA63TF U 1
AF RR2BA63JQ C 29
BS 1 655 RR2BA63TF

RD RR2BA63TF 655 0 0
GGACGTTCAACCGGCAATCGTTTCTTCTTCTCACCGTCGCTGCTAAACATGGGGCTCGAT
GCTTATGCTTCGTCGAACCCTAATAAGGTTCACGAGGACGTTCTTCAGAAATCTAGAGAT
GCTTGCTACAAGGCAAGAGATGCTTTTTACACTTGTCTGGAGAAGGAATCTGGTAAGAAA
CCCACTGAGATCGCGTCCGTAGGTCTTCTCTACCCTAAAGAGTGCAGCCACTCCAGAACA
GAGTTCGTCAAGAACTGCCGCTCCTCCTGGGTGAAGCATTTCGATAGGGAGTACTGTCGG
AACAAGAGAGTCCAAAGGCTGTTAGATGATGGAGATGAGAGGAAAGGTCCAATGTCACTT
CCTCAGCCTTACACTTTCAAGCCTTCCCCTTCTTCTTAGATCCCTTCCTTTCCTGGAAGA
GGAAGATGACTGAGTAATCTCTTGGTAGCACTTACTACGTTCCTGAAGCATTAGGACTCA
TTATCTTTGCCGACTTTTTTTTTTTTATATCCCTTAAAGTCTCTCTTGTCTTTATTTGAG
TTGTAAGCCTACAACATGGGAATAAAGGTGTTGTGCTTTTGAAGGAACCTGGTTCTTTTG
CCTATTGTCTATTGCTCACAATCTGCAAGCATTAATATAAAATGATTACTTTGTC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2BA63JQ 627 0 0
TCTCACCGTCGCTGCTAAACATGGGGCTCGATGCTTATGCTTCGTCGAACCCTAATAAGG
TTCACGAGGACGTTCTTCAGAAATCTAGAGATGCTTGCTACAAGGCAAGAGATGCTTTTT
ACACTTGTCTGGAGAAGGAATCTGGTAAGAAACCCACTGAGATCGCGTCCGTAGGTCTTC
TCTACCCTAAAGAGTGCAGCCACTCCAGAACAGAGTTCGTCAAGAACTGCCGCTCCTCCT
GGGTGAAGCATTTCGATAGGGAGTACTGTCGGAACAAGAGAGTCCAAAGGCTGTTAGATG
ATGGAGATGAGAGGAAAGGTCCAATGTCACTTCCTCAGCCTTACACTTTCAAGCCTTCCC
CTTTTTTTTAGATCCCTTCCTTTCCTGGAAGAGGAAGATGACTGAGTAATCTCTTGGTAG
CACTTACTACGTTCCTGAAGCATTAGGACTCATTATCTTTGCCGACTTTTTTTTTTTTAT
ATCCCTTAAAGTCTCTCTTGTCTTTATTTGAGTTGTAAGCCTACAACATGGGAATAAAGG
TGTTGTGCTTTTGAAGGAACCTGGTTCTTTTGCCTATTGTCTATTGCTCACAATCTGCAA
GCATTAATATAAAATGATTACTTTGTC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL6477Contig1 796 2 2 U
GGAACTCAAGAGTGGTGTAGTGAGAGAAAAGAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAATGGG
AGGAAAAGGTGCGATGATAGTGGCGATGCTCTGCCTTTGGGCACTCTCCGCAACAACAGA
AGCAGTTGTAATGGAGGAGGAGCCAGGCTTGATGATGAACTTCTACAAGGACACGTGTCC
TCAGGCTGAAGACATCATCCGTGAACAAGTCAAACTCCTCTACAAACGCCACAAGAACAC
CGCTTTCTCTTGGCTCCGTAACATCTTCCACGACTGCGCTGTCGAGTCATGCGATGCGTC
GCTTTTGCTGGATTCCACAAGAAGAGAGCTAGGAGAGAAAGAACATGACAGGAGCTTCGG
TCTGAGAAACTTCAGATACATTGAGGAGATCAAAGAAGCTCTCGAGAGGGAGTGCCCTGG
CGTTGTCTCATGTTCCGACATCCTCGTCTTGTCCGCAAGAGAAGGCATCGAAGCAGTGGG
AGGACCACATATTCCGTTGAAAACAGGAAGGAGAGATGGGCGTAAAAGCAGGACTGACAT
GCTTGAGTCTTACCTTCCCGACCACAACGAGAGTATCTCCGTCGTTCTTGAGAAGTTCAA
GTCCATCGGAATCGACACTCCCGGCCTTGTTGCCCTCCTCGGATCACACAGCGTGGGAAG
AACTCACTGCGTGAAGCTGGTTCACCGTTTGTACCCTGAGGTGGACCCATCCTTGAACCC
GGACACGTCCCTCACATGCTACACAAGTGTCCCGGCTCATCCTGACCAAAGCGGTCCAGT
ATGTGCGTAATGACGT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV82TF U 1
AF RR2FS68TF U 1
BS 1 751 RR2EV82TF
BS 752 796 RR2FS68TF

RD RR2EV82TF 751 0 0
GGAACTCAAGAGTGGTGTAGTGAGAGAAAAGAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAAAAAATGGG
AGGAAAAGGTGCGATGATAGTGGCGATGCTCTGCCTTTGGGCACTCTCCGCAACAACAGA
AGCAGTTGTAATGGAGGAGGAGCCAGGCTTGATGATGAACTTCTACAAGGACACGTGTCC
TCAGGCTGAAGACATCATCCGTGAACAAGTCAAACTCCTCTACAAACGCCACAAGAACAC
CGCTTTCTCTTGGCTCCGTAACATCTTCCACGACTGCGCTGTCGAGTCATGCGATGCGTC
GCTTTTGCTGGATTCCACAAGAAGAGAGCTAGGAGAGAAAGAACATGACAGGAGCTTCGG
TCTGAGAAACTTCAGATACATTGAGGAGATCAAAGAAGCTCTCGAGAGGGAGTGCCCTGG
CGTTGTCTCATGTTCCGACATCCTCGTCTTGTCCGCAAGAGAAGGCATCGAAGCAGTGGG
AGGACCACATATTCCGTTGAAAACAGGAAGGAGAGATGGGCGTAAAAGCAGGACTGACAT
GCTTGAGTCTTACCTTCCCGACCACAACGAGAGTATCTCCGTCGTTCTTGAGAAGTTCAA
GTCCATCGGAATCGACACTCCCGGCCTTGTTGCCCTCCTCGGATCACACAGCGTGGGAAG
AACTCACTGCGTGAAGCTGGTTCACCGTTTGTACCCTGAGGTGGACCCATCCTTGAACCC
GGACACGTCCCTCACATGCTACACAAGTGTC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2FS68TF 796 0 0
GGG
ACTCAAGAGTGGTGTAGTGAGAGAGAAGAAGAAAGAGAGAGAGAGA**AAAAATGGGAGG
AAAAGGTGCGATGATAGTGGCGATGCTCTGCCTTTGGGCACTCTCCGCAGCAACAGAAGC
AGTTGTAATGGAGGAGGAGCCAGGCTTGATGATGAACTTCTACAAGGACACGTGTCCTCA
GGCTGAAGACATCATCCGT*AACAAGTCAAACTCCTCTACAAACGCCACAAGAACACCGC
TTTCTCTTGGCTCCGTAACATCTTCCACGACTGCGCTGTCGAGTCATGCGATGCGTCGCT
TTTGCTGGATTCCACAAGAAGAGAGCTAGGAGAGAAAGAACATGACAGGAGCTTCGGTCT
GAGAAACTTCAGATACATTGAGGAGATCAAAGAAGCTCTCGAGAGGGAGTGCCCTGGTGT
TGTCTCATGTTCCGACATCCTCGTCTTGTCCGCAAGAGAAGGCATCGAAGCAGTGGGAGG
ACCACATATTCCGTTGAAAACAGGAAGGAGAGATGGGCGTAAAAGCAGGACTGACATGCT
TGAGTCTTACCTTCCCGACCACAACGAGAGTATCTCCGTCGTTCTTGAGAAGTTCAAGTC
CATCGGAATCGACACTCCCGGCCTTGTTGCCCTCCTCGGATCACACAGCGTGGGAAGAAC
TCACTGCGTGAAGCTGGTTCACCGTTTGTACCCTGAG*TGGACCCATCCTTGAACCCGGA
CACGTCCCTCACATGCTACGCAAGTGTCCCGGCTCATCCTGACCAAAGCGGTCCAGTATG
TGCGTAATGACGT

QA 4 796 4 796
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6479Contig1 621 2 1 U
GGACGTTTGATTTTATAATAAGAAGAGCTTTGGCTTTTATCCCTTGTTTGATTCGATTCA
ATTCATCTAACAAGAAGTTGGTCTTAAGGAGCTATCGAAAGAAACCCTTAATCGATCCAA
GAACAGGTCTCGAAGAACCCTAAATTCTTAGATCGACCGTTCACCCATTCGTACGCTGCG
CCAGAAGGGGATATGTTGTTAAACGGAGCATATTTCCGGCAGTCAGGTGCCGGAGCTTCA
TCGACATATGCAAGAGCTTCGAGCCTAAGTGCTAGGCCATCATCGCTTGTGGGTTCCATC
ACGACGACAGCAGGAACACTAAGTTGTCGGCGCGGTCGTCGCTGTTGATTATTCAGTTTT
ACCATGCTAATGGTATCGTTAAGAGAGAAAAAAGATATTAAAGGATCGTTGTTTATGCAA
TGGTTCGTATGCTCAATGAATGGTAAGAGACTTTTGCTTTTCTTGTTTGGTTTTGTTTTT
GTTTTTGTTTTTGTTTTAAGATTTTCAATGTAATGTTACATGTGTAATGCGTCTGCTATG
TCTCTGGACATTTGGAGGGATGATTTCTATATTTATAATTTTAAAGCTATATAAAACCAT
TTCAAATTTTGGTTTATTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GY14JQ C 1
AF RR2GY14TF U 1
BS 1 621 RR2GY14TF

RD RR2GY14JQ 621 0 0
GGACGTTTGATTTTATAATAAGAAGAGCTTTGGCTTTTATCCCTTGTTTGATTCGATTCA
ATTCATCTAACAAGAAGTTGGTCTTAAGGAGCTATCGAAAGAAACCCTTAATCGATCCAA
GAACAGGTCTCGAAGAACCCTAAATTCTTAGATCGACCGTTCACCCATTCGTACGCTGCG
CCAGAAGGGGATATGTTGTTAAACGGAGCATATTTCCGGCAGTCAGGTGCCGGAGCTTCA
TCGACATATGCAAGAGCTTCGAGCCTAAGTGCTAGGCCATCATCGCTTGTGGGTTCCATC
ACGACGACAGCAGGAACACTAAGTTGTCGGCGCGGTCGTCGCTGTTGATTATTCAGTTTT
ACCATGCTAATGGTATCGTTAAGAGAGAAAAAAGATATTAAAGGATCGTTGTTTATGCAA
TGGTTCGTATGCTCAATGAATGGTAAGAGACTTTTGCTTTTCTTGTTTGGTTTTGTTTTT
GTTTTTGTTTTTGTTTTAAGATTTTCAATGTAATGTTACATGTGTAATGCGTCTGCTATG
TCTCTGGACATTTGGAGGGATGATTTCTATATTTATAATTTTAAAGCTATATAAAACCAT
TTCAAATTTTGGTTTATTTGC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2GY14TF 621 0 0
GGACGTTTGATTTTATAATAAGAAGAGCTTTGGCTTTTATCCCTTGTTTGATTCGATTCA
ATTCATCTAACAAGAAGTTGGTCTTAAGGAGCTATCGAAAGAAACCCTTAATCGATCCAA
GAACAGGTCTCGAAGAACCCTAAATTCTTAGATCGACCGTTCACCCATTCGTACGCTGCG
CCAGAAGGGGATATGTTGTTAAACGGAGCATATTTCCGGCAGTCAGGTGCCGGAGCTTCA
TCGACATATGCAAGAGCTTCGAGCCTAAGTGCTAGGCCATCATCGCTTGTGGGTTCCATC
ACGACGACAGCAGGAACACTAAGTTGTCGGCGCGGTCGTCGCTGTTGATTATTCAGTTTT
ACCATGCTAATGGTATCGTTAAGAGAGAAAAAAGATATTAAAGGATCGTTGTTTATGCAA
TGGTTCGTATGCTCAATGAATGGTAAGAGACTTTTGCTTTTCTTGTTTGGTTTTGTTTTT
GTTTTTGTTTTTGTTTTAAGATTTTCAATGTAATGTTACATGTGTAATGCGTCTGCTATG
TCTCTGGACATTTGGAGGGATGATTTCTATATTTATAATTTTAAAGCTATATAAAACCAT
TTCAAATTTTGGTTTATTTGC

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

CO CL6480Contig1 779 2 9 U
TTTTTAGAGAGTTGAGATCGATGGAAAGCAATGGAACCCAAAGTCTCAATCAGAACCATC
ATCTCTGAACATCGGAATAATCAGAAGTGAGAAAAGAAAGAAAAACATGGAGCGGAGAGA
AGAGGAGCAACAAAAGCGCGACGATTCCAGATTCAACCAAACTCTCAAGAACGTCCAGGG
ATTTCTGAAAGGAAGGAGTATACCTGGTAAGGTATTGCTGACTAGGAGACAGGATCTTAC
TCCTGAACCAATCTCTCCTACTTATCACCGCAGCTTGTCTGAGAATGACGCCGGTAGAAA
CGAGCGTTCGGACAATCCCGTCGAGGCGGAAGATAATAATTCAAGCAAGAAACATGATAA
CACATACGCCGGTAAGCTACGGTCAAACTCCTCTAGTGGAGAGCAGCTTGCCAAACAAGT
CCAAAACCTCAAGATAGGAGGTAGATCAAGCGATTACGCTAGAGTTATGAAGTTCAACAA
AGTCCTTTCCGAAACTACTGTCATTTTAGAGAAGCTGCGTGAACTAGCGTGGAGTGGTGT
CCCCCACTATATGCGCCCTGATGTCTGGCGCCTTCTCTTGGGATATGCACCACCTAATTC
AGATAGACGGGAGGCTGTTCTGAGAAGAAAACGTCTTGAGTATCTTGAATCTGTTGGCCA
GTTTTATGACCTCCCAGATTCCGAACGTTCTGATGATGAGATCAATATGCTTCGCCAGAT
TGCTGTTGATGTCCAGGACTGTACCAGACGTCAGTTTCTTTCAGCAACACAGTGCAGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H309TF U 1
AF RR2DB28TF U 1
BS 1 105 RR2DB28TF
BS 106 106 RR2H309TF
BS 107 308 RR2DB28TF
BS 309 309 RR2H309TF
BS 310 442 RR2DB28TF
BS 443 443 RR2H309TF
BS 444 507 RR2DB28TF
BS 508 508 RR2H309TF
BS 509 779 RR2DB28TF

RD RR2H309TF 681 0 0
TTTTTAGAGAGTTGAGATCGATGGAAAGCAATGGAACCCAAAGTCTCAATCAGAACCATC
ATCTCTGAACATCGGAATAATCAGAAGTGAGAAAAGAAAGAAAAACATGGAGCGGAGAGA
AGAGGAGCAACAAAAGTGCGACGATTCCAGATTCAACCAAACTCTCAAGAACGTCCAGGG
ATTTCTGAAAGGAAGGAGTATACCTGGTAAGGTATTGCTGACTAGGAGACCGGATCTTAC
TCCTGAACCAATCTCTCCTACTTATCACCGCAGCTTGTCTGAGAATGACGCCGGTAGAAA
CGAGCGTTCGGACAATCCCGTCGAGGTGGAAGATAATAATTCTAGCAAGAAACATGATAA
TACATACGCGGGTAAGCTACGGTCAAACTCCTCTAGTGGGGAGCAGCTTTCCAAACAAGT
CCAAAACCTCAAGATAGGTGGTAGATCAAGCGATTACGCTAGAGTTATGAAGTTCAACAA
AGTTCTTTCCGAAACTACTGTCATTTTAGAGAAGCTGCGTGAACTAGCGTGGAGTGGTGT
CCCCCACTATATGCGCCCTGATGTCTGGCGCCTTCTCTTGGGATATGCACCACCTAATTC
AGATAGACGGGAGGCTGTTCTGAGAAGGAAACGTCTTGAGTATCTTGAATCTGTTGGCCA
GTTTTATGACCTCCCAGATTC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2DB28TF 779 0 0
TTTTTAGAGAGTTGAGATCGATGGAAAGCAATGGAACCCAAAGTCTCAATCAGAACCATC
ATCTCTGAACATCGGAATAATCAGAAGTGAGAAAAGAAAGAAAAAGATGGAGCGGAGAGA
AGAGGAGCAACAAAAGCGCGACGATTCCAGATTCAACCAAACTCTCAAGAACGTCCAGGG
ATTTCTGAAAGGAAGGAGTATACCTGGTAAGGTATTGCTGACTAGGAGACAGGATCTTAC
TCCTGAACCAATCTCTCCTACTTATCACCGCAGCTTGTCTGAGAATGACGCCGGTAGAAA
CGAGCGTTTGGACAATCCCGTCGAGGCGGAAGATAATAATTCAAGCAAGAAACATGATAA
CACATACGCCGGTAAGCTACGGTCAAACTCCTCTAGTGGAGAGCAGCTTGCCAAACAAGT
CCAAAACCTCAAGATAGGAGGTCGATCAAGCGATTACGCTAGAGTTATGAAGTTCAACAA
AGTCCTTTCCGAAACTACTGTCATTTTGGAGAAGCTGCGTGAACTAGCGTGGAGTGGTGT
CCCCCACTATATGCGCCCTGATGTCTGGCGCCTTCTCTTGGGATATGCACCACCTAATTC
AGATAGACGGGAGGCTGTTCTGAGAAGAAAACGTCTTGAGTATCTTGAATCTGTTGGCCA
GTTTTATGACCTCCCAGATTCCGAACGTTCTGATGATGAGATCAATATGCTTCGCCAGAT
TGCTGTTGATGTCCAGGACTGTACCAGACGTCAGTTTCTTTCAGCAACACAGTGCAGAA

QA 1 779 1 779
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6482Contig1 1082 2 6 U
TTTTTGCAGATTTCTGATATTGAAACCAAGCAGAGATGTGTAGTTTGGCGACAAATCTCT
TATTCCCATCAAAGATGAAACCAGCTTTTACAGAGAAACAGAACACTAGCTCACTCTTTG
TTACAAATAAAAGATCCTTGATGAAGAACAGATCCACTGTTCCAGTTGCAAGATTATTTG
GACCGGCGATTTTTGAAGCCTCCAAATTGAAAGTATCATTCTTAGGAGTTGATGAGAAGA
AGCATCCATCAAAGCTCCCAAGAACTTACACTCTTACTCACAGTGACATAACAGCTAAGT
TAACTTTAGCCATTTCCCAATCTATCAATAATTCTCAGTTGCAGGGATGGGCTAATAGAT
TATTTCGGGACGAAGTAGTGGCCGAGTGGAAGAAAGTGAAGGGTAAAATGTCCCTTCACG
TTCATTACCACATTAGTGGAGGCCACTTCCTTTTGGATCTCATAGCGAAGCTTCGGTACT
ACATATTTTGCAAGGAATTACCGGTGGTATTGAAAGCTTTTGTTCATGGGGATGGGAACT
TGTTGAATAGTTACCCTGAGCTACAAGAATCTCCTGTTTGGGTTTATTTCCACTCAAACA
TCCCGGAGTACAATAAAGTTGAATGTTGGGGGCCGCTTTGGGAGGCTGCGCAGCACAATC
ACGATGGAAATAGAATACGCAAAAAATGTGAAACTCTCCCGGAGCTAGCATGTCCCCATG
AGTGCGAATGTTGCTTTCCGTCGGTTAGCACGATCCCATGGTTTCATCGTCATTATCAAC
ATGGCAGAGGGGATGAGAATGAGAATTTCGGGGGTGGAGAGTTGGGAATATCTATCCCTA
ACTCTGAGAGATTGAAGTGAGATCTCGTGAGGATGTTACTTTTTTTTTCCTTTGGTGGTT
AGGAAAGTTGGAAGGAATATTAAAGTTATTTGTTTAGTGTTAACAGTAAGTAGATGAAAG
TTGTCCAACAGTGTTATCCTCTGTATTTTATATTTACGAAGTCTATGTAGAAATAGAAGA
CTTTGTTATGTGTGTTAAATGACTTTTTTTGGTTGCAACAACAAGAGACGATACTTTGAT
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2FS76TF U 1
AF RR2FS76JQ C 469
BS 1 644 RR2FS76TF
BS 645 645 RR2FS76JQ
BS 646 674 RR2FS76TF
BS 675 675 RR2FS76JQ
BS 676 685 RR2FS76TF
BS 686 1082 RR2FS76JQ

RD RR2FS76TF 685 0 0
TTTTTGCAGATTTCTGATATTGAAACCAAGCAGAGATGTGTAGTTTGGCGACAAATCTCT
TATTCCCATCAAAGATGAAACCAGCTTTTACAGAGAAACAGAACACTAGCTCACTCTTTG
TTACAAATAAAAGATCCTTGATGAAGAACAGATCCACTGTTCCAGTTGCAAGATTATTTG
GACCGGCGATTTTTGAAGCCTCCAAATTGAAAGTATCATTCTTAGGAGTTGATGAGAAGA
AGCATCCATCAAAGCTCCCAAGAACTTACACTCTTACTCACAGTGACATAACAGCTAAGT
TAACTTTAGCCATTTCCCAATCTATCAATAATTCTCAGTTGCAGGGATGGGCTAATAGAT
TATTTCGGGACGAAGTAGTGGCCGAGTGGAAGAAAGTGAAGGGTAAAATGTCCCTTCACG
TTCATTACCACATTAGTGGAGGCCACTTCCTTTTGGATCTCATAGCGAAGCTTCGGTACT
ACATATTTTGCAAGGAATTACCGGTGGTATTGAAAGCTTTTGTTCATGGGGATGGGAACT
TGTTGAATAGTTACCCTGAGCTACAAGAATCTCCTGTTTGGGTTTATTTCCACTCAAACA
TCCCGGAGTACAATAAAGTTGAATGTTGGGGGCCGCTTTGGGAG*CTGCGCAGCACAATC
ACGATGGAAATAGA*TACGCAAAAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2FS76JQ 614 0 0
AGCTTCGGTACTACATATTTTGCAAGGAATTACCGGTGGTATTGAAAGCTTTTGTTCATG
GGGATGGGAACTTGTTGAATAGTTACCCTGAGCTACAAGAATCTCCTGTTTGGGTTTATT
TCCACTCAAACATCCCGGAGTACAATAAGGTTGAATGTTGGGGGCCGCTTTGGGAGGCTG
CGCAGCACAATCACGATGGAAATAGAATACGCAAAAAATGTGAAACTCTCCCGGAGCTAG
CATGTCCCCATGAGTGCGAATGTTGCTTTCCGTCGGTTAGCACGATCCCATGGTTTCATC
GTCATTATCAACATGGCAGAGGGGATGAGAATGAGAATTTCGGGGGTGGAGAGTTGGGAA
TATCTATCCCTAACTCTGAGAGATTGAAGTGAGATCTCGTGAGGATGTTACTTTTTTTTT
CCTTTGGTGGTTAGGAAAGTTGGAAGGAATATTAAAGTTATTTGTTTAGTGTTAACAGTA
AGTAGATGAAAGTTGTCCAACAGTGTTATCCTCTGTATTTTATATTTACGAAGTCTATGT
AGAAATAGAAGACTTTGTTATGTGTGTTAAATGACTTTTTTTGGTTGCAACAACAAGAGA
CGATACTTTGATCC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL6483Contig1 635 2 2 U
GCTCTATGTTTACAAAAAAAAGACATCTTTAAATTTCGAGAAATGATGTGGAACAGAAGT
GAGTAGTCTTGAGTGGGAAGCTGTGAACATGAATCAAGAAGAAGAAGATTTGGTCTGTAG
AATGCATAAGCTTGTCGGCAACAGGTTTGATCATTTAAATTAATAAACTAGTTATTAATT
ACTTATTAACTGCATGCTACAAATTCAACATAATATATTGTAGAAGATTAATAAAAGTTT
TATCAAACAATTAAAAAGATCAATTTGTTTTCATTTCCTATATTGTTTGAAAGGTGGGAG
TTGATAGCTGGGAGGATCCCAGGAAGGACTGCAGAAGAAGTTGAGAGGTTTTGGGTCATG
AAGAAAAAATGAACGATCTCTGAAGTTCCACTGATTAGGTTTTAGCCTACCAACTTCGTA
ATACGATATTTTATTACGATAATTTAACGATCTTTTAGATTTGTTTAGGAAGTTATGTAG
TATCGCGCGCTTCTACTGTTTGTTTCGTTTTTTCTCAGTAGTTTTGAGAGTTTCTTTAAT
TTTCATGTGTTTGGATGGTTTGTTTCGGTTTCATATTTTTGTTTGGTTTGTTTTAGTTTG
GTTATGAAAGAGTAGATCATGTCGGTTTGAATTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL11JQ C 1
AF RR2CL11TF U 1
BS 1 621 RR2CL11TF
BS 622 635 RR2CL11JQ

RD RR2CL11JQ 635 0 0
GCTCTATGTTTACAAAAAAAAGACATCTTTAAATTTCGAGAAATGATGTGGAACAGAAGT
GAGTAGTCTTGAGTGGGAAGCTGTGAACATGAATCAAGAAGAAGAAGATTTGGTCTGTAG
AATGCATAAGCTTGTCGGCAACAGGTTTGATCATTTAAATTAATAAACTAGTTATTAATT
ACTTATTAACTGCATGCTACAAATTCAACATAATATATTGTAGAAGATTAATAAAAGTTT
TATCAAACAATTAAAAAGATCAATTTGTTTTCATTTCCTATATTGTTTGAAAGGTGGGAG
TTGATAGCTGGGAGGATCCCAGGAAGGACTGCAGAAGAAGTTGAGAGGTTTTGGGTCATG
AAGAAAAAATGAACGATCTCTGAAGTTCCACTGATTAGGTTTTAGCCTACCAACTTCGTA
ATACGATATTTTATTACGATAATTTAACGATCTTTTAGATTTGTTTAGGAAGTTATGTAG
TATCGCGCGCTTCTACTGTTTGTTTCGTTTTTTCTCAGTAGTTTTGAGAGTTTCTTTAAT
TTTCATGTGTTTGGATGGTTTGTTTCGGTTTCATATTTTTGTTTGGTTTGTTTTAGTTTG
GTTATGAAAGAGTAGATCATGTCGGTTTGAATTAT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2CL11TF 621 0 0
GCTCTATGTTTACAAAAAAAAGACATCTTTAAATTTCGAGAAATGATGTGGAACAGAAGT
GAGTAGTCTTGAGTGGGAAGCTGTGAACATGAATCAAGAAGAAGAAGATTTGGTCTGTAG
AATGCATAAGCTTGTCGGCAACAGGTTTGATCATTTAAATTAATAAACTAGTTATTAATT
ACTTATTAACTGCATGCTACAAATTCAACATAATATATTGTAGAAGATTAATAAAAGTTT
TATCAAACAATTAAAAAGATCAATTTGTTTTCATTTCCTATATTGTTTGAAAGGTGGGAG
TTGATAGCTGGGAGGATCCCAGGAAGGACTGCAGAAGAAGTTGAGAGGTTTTGGGTCATG
AAGAAAAAATGAACGATCTCTGAAGTTCCACTGATTAGGTTTTAGCCTACCAACTTCGTA
ATACGATATTTTATTACGATAATTTAACGATCTTTTAGATTTGTTTAGGAAGTTATGTAG
TATCGCGCGCTTCTACTGTTTGTTTCGTTTTTTCTCAGTAGTTTTGAGAGTTTCTTTAAT
TTTCATGTGTTTGGATGGTTTGTTTCGGTTTCATATTTTTGTTTGGTTTGTTTTAGTTTG
GTTATGAAAGAGTAGATCATG

QA 1 621 1 621
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6486Contig1 1029 2 2 U
GTTCATATTAGCCGTCACTTTTCAGACCGGGAGATTCATAGTGATCAGGTTACTTGGGGA
AGGATCTCTACGGTTGATGCTGAGAGACGGCTTCTAGCTAACGCTCTTGAGGATCCTGAT
AACCAACACTTTGTTCTTCTTTCAGAGAGCTGCATACCGTTGCATACGTTTGACTACACG
TATAGATACTTGATGCAGGGGAATGTCAGCTTCATTGACAGTTTTGAGGATCGTGGCCCT
CATGGGACAGGCAGACACATGGATCACATGTTACCTGAAATCCCTAGGCAAGATTTCAGA
AAAGGTGCTCAGTGGTTCACGATGAAGCGTCAACACGCTTTGATAGTGATGGCTGATAAT
CTCTACTACTCTAAATTCCGGCGGTACTGCAGACCTGGTGTAGAAGCAAACAAGAACTGC
ATCGCGGATGAACATTACCTGCCTACATTCTTTCATATGCTTGATCCGGGAGGAATCTCG
AACTGGTCAGTCACATATGTTGATTGGTCTGAGCGTAGATGGCATCCAAAGACATACCGA
GCTCGCGATATCTCACTCAAGTTCTTGAAAACCATCACGTCCGATGACGTGAGTGTACAC
GTGACAAGCGTTGGCAAGCGGGGAGAAGAGCTTCATTGGCCATGTACATGGAACGGTATA
AGAAGACCATGTTATCTGTTCGCAAGGAAGTTCCACTCAGATTCTGTTAACAAACTTGTC
AGACTCTTCCCAAACTACACCAGCACAGTGGTCTGAGAGAGAGAGAGAGAGGTAAAGACA
GACTCAAGTTCTTAAAGCTGAACCATACGAAAACAGGAACGAAACACTTCCTGATTATCT
CTGAGGTTGGATTGGATGGCAGATTACTGTAAATTTTCTGAAGAAACTAAAAAAACCTTT
TGGATGAGACAGGCTACATACTCTGCTGGTTAAGCTTTATTAGTATAACCAGAGATTTTT
TTGGTTATTGTGATGGTTAGAGTGTACCGGTTTATGTTGTTGTAACTTGAGCTATTAGCA
GTTAAGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO84TF U 1
AF RR2CO84JQ C 288
BS 1 758 RR2CO84TF
BS 759 1029 RR2CO84JQ

RD RR2CO84TF 758 0 0
GTTCATATTAGCCGTCACTTTTCAGACCGGGAGATTCATAGTGATCAGGTTACTTGGGGA
AGGATCTCTACGGTTGATGCTGAGAGACGGCTTCTAGCTAACGCTCTTGAGGATCCTGAT
AACCAACACTTTGTTCTTCTTTCAGAGAGCTGCATACCGTTGCATACGTTTGACTACACG
TATAGATACTTGATGCAGGGGAATGTCAGCTTCATTGACAGTTTTGAGGATCGTGGCCCT
CATGGGACAGGCAGACACATGGATCACATGTTACCTGAAATCCCTAGGCAAGATTTCAGA
AAAGGTGCTCAGTGGTTCACGATGAAGCGTCAACACGCTTTGATAGTGATGGCTGATAAT
CTCTACTACTCTAAATTCCGGCGGTACTGCAGACCTGGTGTAGAAGCAAACAAGAACTGC
ATCGCGGATGAACATTACCTGCCTACATTCTTTCATATGCTTGATCCGGGAGGAATCTCG
AACTGGTCAGTCACATATGTTGATTGGTCTGAGCGTAGATGGCATCCAAAGACATACCGA
GCTCGCGATATCTCACTCAAGTTCTTGAAAACCATCACGTCCGATGACGTGAGTGTACAC
GTGACAAGCGTTGGCAAGCGGGGAGAAGAGCTTCATTGGCCATGTACATGGAACGGTATA
AGAAGACCATGTTATCTGTTCGCAAGGAAGTTCCACTCAGATTCTGTTAACAAACTTGTC
AGACTCTTCCCAAACTACACCAGCACAGTGGTCTGAGA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2CO84JQ 742 0 0
GCAAGATTTCAGAAAAGGTGCTCAGTGGTTCACGATGAAGCGTCAACACGCTTTGATAGT
GATGGCTGATAATCTCTACTACTCTAAATTCCGGCGGTACTGCAGACCTGGTGTAGAAGC
AAACAAGAACTGCATCGCGGATGAACATTACCTGCCTACATTCTTTCATATGCTTGATCC
GGGAGGAATCTCGAACTGGTCAGTCACATATGTTGATTGGTCTGAGCGTAGATGGCATCC
AAAGACATACCGAGCTCGCGATATCTCACTCAAGTTCTTGAAAACCATCACGTCCGATGA
CGTGAGTGTACACGTGACAAGCGTTGGCAAGCGGGGAGAAGAGCTTCATTGGCCATGTAC
ATGGAACGGTATAAGAAGACCATGTTATCTGTTCGCAAGGAAGTTCCACTCAGATTCTGT
TAACAAACTTGTCAGACTCTTCCCAAACTACACCAGCACAGTGGTCTGAGAGAGAGAGAG
AGAGGTAAAGACAGACTCAAGTTCTTAAAGCTGAACCATACGAAAACAGGAACGAAACAC
TTCCTGATTATCTCTGAGGTTGGATTGGATGGCAGATTACTGTAAATTTTCTGAAGAAAC
TAAAAAAACCTTTTGGATGAGACAGGCTACATACTCTGCTGGTTAAGCTTTATTAGTATA
ACCAGAGATTTTTTTGGTTATTGTGATGGTTAGAGTGTACCGGTTTATGTTGTTGTAACT
TGAGCTATTAGCAGTTAAGCAT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL6487Contig1 823 2 4 U
GGGACAAACCCTAGCGGCCGTTACTCTCTCTCGATCTCTTGAGCGATTTCCGGTGAAGTC
AACCCGTCTCAGCCGCTTACACTGGTTGCTGTCTCGCTGCTGTTGCTATGTCTTCCCTCT
GGTAAGATCTTCTCTCCGCCGCGTCTCCTCTCCGCCTCTCTCCACCGCGTCTCCTCTTCG
CGTCTCTTTCTCTCACCGCAGTTCACTCTCCGCCTCTCTCTCAAGTGATCATATTCAGAT
ACAACTTCCATTTTCAATGACCTCTGTCCATGAAGGAGAAAGATTTCATCATCTCAGAGC
AGAAAAAAATCTGGTTGAGGTGAGTGATGCAGATCTTCTTTCATTGATAGAAAATTACTG
CAGAGAAGCAGGGGTTAGGAATCTCCAGAAATAAATCGAGAAGATTTACAAGAAGGCAGG
GTGAGAGACTATCATATTTCCGGAAGCAAACATGAGAGACTTTGAAGAGCTTTCGGAGGA
TGTGAAAGAAGGGCTTGATGTTCACTTTGTGGATGACTATTAAAAGATCTCCGACCTTGC
ATTTGTCTCTGAGAATAAGCAACATGACTGAGATAACTCAGAAGTCATTTTGACCTTCTT
TCCCTGTTGTCTCTGTCTAAACAAGAAGACCGACCATTCTTGATTCTTTTTTTTTTCTAT
ATACTTCTGTCCCTTCAAGAAGTGTCCTATTGTAACCTTTTTTTTTCATTAGGATAGTTT
ATTTATGTGGTTGGACTGTTGTGGTATATTTTCACAGCCAGATCATTATGAATCAAAATA
AAATTGTTCTCTGCTTGTTATACTATGAACAGATTGGTGTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H261TF U 1
AF RR2H261JQ C 131
BS 1 655 RR2H261TF
BS 656 656 RR2H261JQ
BS 657 705 RR2H261TF
BS 706 823 RR2H261JQ

RD RR2H261TF 707 0 0
GGGACAAACCCTAGCGGCCGTTACTCTCTCTCGATCTCTTGAGCGATTTCCGGTGAAGTC
AACCCGTCTCAGCCGCTTACACTGGTTGCTGTCTCGCTGCTGTTGCTATGTCTTCCCTCT
GGTAAGATCTTCTCTCCGCCGCGTCTCCTCTCCGCCTCTCTCCACCGCGTCTCCTCTTCG
CGTCTCTTTCTCTCACCGCAGTTCACTCTCCGCCTCTCTCTCAAGTGATCATATTCAGAT
ACAACTTCCATTTTCAATGACCTCTGTCCATGAAGGAGAAAGATTTCATCATCTCAGAGC
AGAAAAAAATCTGGTTGAGGTGAGTGATGCAGATCTTCTTTCATTGATAGAAAATTACTG
CAGAGAAGCAGGGGTTAGGAATCTCCAGAAATAAATCGAGAAGATTTACAAGAAGGCAGG
GTGAGAGACTATCATATTTCCGGAAGCAAACATGAGAGACTTTGAAGAGCTTTCGGAGGA
TGTGAAAGAAGGGCTTGATGTTCACTTTGTGGATGACTATTAAAAGATCTCCGACCTTGC
ATTTGTCTCTGAGAATAAGCAACATGACTGAGATAACTCAGAAGTCATTTTGACCTTCTT
TCCCTGTTGTCTCTGTCTAAACAAGAAGACCGACCATTCTTGATTCTTTTTTTTT*CTAT
ATACTTCTGTCCCTTCAAGAAGTGTCCTATTGTAACCTTTTTTTT
CA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2H261JQ 693 0 0
TCTCTCCGCCGCGTCTCCTCTCCGCCTCTCTCCACCGCGTCTCCTCTTCGCGTCTCTTTC
TCTCACCGCAGTTCACTCTCCGCCTCTCTCTCAAGTGATCATATTCAGATACAACTTCCA
TTTTCAATGACCTCTGTCCATGAAGGAGAAAGATTTCATCATCTCAGAGCAGAAAAAAAT
CTGGTTGAGGTGAGTGATGCAGATCTTCTTTCATTGATAGAAAATTACTGCAGAGAAGCA
GGGGTTAGGAATCTCCAGAAATAAATCGAGAAGATTTACAAGAAGGCAGGGTGAGAGACT
ATCATATTTCCGGAAGCAAACATGAGAGACTTTGAAGAGCTTTCGGAGGATGTGAAAGAA
GGGCTTGATGTTCACTTTGTGGATGACTATTAAAAGATCTCCGACCTTGCATTTGTCTCT
GAGAATAAGCAACATGACTGAGATAACTCAGAAGTCATTTTGACCTTCTTTCCCTGTTGT
CTCTGTCTAAACAAGAAGACCGACCATTCTTGATTCTTTTTTTTTTCTATATACTTCTGT
CCCTTCAAGAAGTGTCCTATTGTAACCTTTTTTTTTCATTAGGATAGTTTATTTATGTGG
TTGGACTGTTGTGGTATATTTTCACAGCCAGATCATTATGAATCAAAATAAAATTGTTCT
CTGCTTGTTATACTATGAACAGATTGGTGTATG

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL6488Contig1 816 2 9 U
GATATCTTCTTGAAAAAAAAGCAAATCTTGTATTCAATCAGACAGGCAGAGACTTAAAGT
AATATTCTTACAAACACCGTTAAATCAGATTTTGTATATTACAAAAAGTTAATGAAGTGT
TCTTGTCTGAAACAGAATCTGATAGAAGCTTTTGTTTAGGACGTTATTATTCCTCAACAA
TCTCAGGTTTCCCCTGAGAGAGGTTAGTGTGTTGAGAGGAGGAGCCTTTGGCTAGAAGAG
ATTGCAACTGGATAGACTTCGGTGAAGGAGTGGCTACAGGGTTTGAAGTGCCACCGTGAC
TGGAACCTGCATGAGTTGAGCCTTTCTTTTTAGCCAACTTTGCAGATTTTGCCCATCCAG
CAATCTGTTGTTGTGTCTGATCCGTGAATATTGCCCCTTTGAATGAACTTCCCATCTGAG
CGACGAGGGCGTATAGTGGTAAGGTACTGTAACTGCAGAGAAGCTGAACCAATACCCCAA
TGACTAGTCTTGGAATTATGAACTGGACTTGTCCCATGATGCAAGAATCAAAACCATATT
GAGCAAAGATAAAGAAGATGAAGGCCAGTTCAAATGAGTTTTGGAACAGAATGAAATGGA
TCAAGAAGAGAACTAGCCGTGGACTTTTAAACCAGAACAGATCATCTGATGGTCTCACTA
CCAAATCTCCCTCTACAGCAATGTGTTTCTCTGCAACTTCATGAGCCAATTCTGTGATGA
TATGCTCCAGCTTCATCCCCACGGCAAGCAAAAGAATCAAAGGAAGAAACGCTAGCCAGA
AGTAAACACGCCATGCAGCAATGTTTAGAAGCAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2BU76JQ U 1
AF RR2AO15JQ U 8
BS 1 143 RR2BU76JQ
BS 144 144 RR2AO15JQ
BS 145 561 RR2BU76JQ
BS 562 562 RR2AO15JQ
BS 563 752 RR2BU76JQ
BS 753 753 RR2AO15JQ
BS 754 800 RR2BU76JQ
BS 801 801 RR2AO15JQ
BS 802 816 RR2BU76JQ

RD RR2BU76JQ 816 0 0
GATATCTTCTTGAAAAAAAAGCAAATCTTGTATTCAATCAGACAGGCAGAGACTTAAAGT
AATATTCTTACAAACACCGTTAAATCAGATTTTGTATATTACAAAAAGTTAATGAAGTGT
TCTTGTCTGAAACAGAATCTGATGGAAGCTTTTGTTTAGGACGTTATTATTCCTCAACAA
TCTCAGGTTTCCCCTGAGAGAGGTTAGTGTGTTGAGAGGAGGAGCCTTTGGCTAGAAGAG
ATTGCAACTGGATAGACTTCGGTGAAGGAGTGGCTACAGGGTTTGAAGTGCCACCGTGAC
TGGAACCTGCATGAGTTGAGCCTTTCTTTTTAGCCAACTTTGCAGATTTTGCCCATCCAG
CAATCTGTTGTTGTGTCTGATCCGTGAATATTGCCCCTTTGAATGAACTTCCCATCTGAG
CGACGAGGGCGTATAGTGGTAAGGTACTGTAACTGCAGAGAAGCTGAACCAATACCCCAA
TGACTAGTCTTGGAATTATGAACTGGACTTGTCCCATGATGCAAGAATCAAAACCATATT
GAGCAAAGATAAAGAAGATGA*GGCCAGTTCAAATGAGTTTTGGAACAGAATGAAATGGA
TCAAGAAGAGAACTAGCCGTGGACTTTTAAACCAGAACAGATCATCTGATGGTCTCACTA
CCAAATCTCCCTCTACAGCAATGTGTTTCTCTGCAACTTCATGAGCCAATTCTGTGATGA
TATGCTCCAGCTTCATCCCCACGGCAAGCAAA*GAATCAAAGGAAGAAACGCTAGCCAGA
AGTAAACACGCCATGCAGCA*TGTTTAGAAGCAAGA

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR2AO15JQ 805 0 0
CGTGA
AAAAAAAAGCAAATCTTGTATTCAATCAGACAGGCAGAGACTTAAAGTAATATTCTTACA
AACACCGTTAAATCAGATTTTGTATATTACAAAAAGTTAATGAAGTGTTCTTGTCTGAAA
CAGAATCTGATAGAAGCTTTTGTTTAGGACGTTATTATTCCTCAACAATCTCAGGTTTCC
CCTGAGAGAGGTTAGTGTGTTGAGAGGAGGAGCCTTTGGCTAGAAGAGATTGCAACTGGA
TAGACTTCGGTGAAGGAGTGGCTACAGGGTTTGAAGTGCCACCGTGACTGGAACCTGCAT
GAGTTGAGCCTTTCTTTTTAGCCAACTTTGCAGATTTTGCCCATCCAGCAATCTGTTGTT
GTGTCTGATCCGTGAATATTGCCCCTTTGAATGAACTTCCCATCTGAGCGACGAGGGCGT
ATAGTGGTAAGGTACTGTAACTGCAGAGAAGCTGAACCAATACCCCAATGACTAGTCTTG
GAATTATGAACTGGATTTGTCCCATGATGCAAGAATCAAAACCATATTGAGCAAAGATAA
AGAAGATGAAGGCCAGTTCAAATGAGTTTTGGAACAGAATGAAATGGATCAAGAAGAGAA
CTAGCCGTGGACTTTTAAACCAGAACAGATCATCTGATGGTCTCACTACCAAATCTCCCT
CTACAGCAATGTGTTTCTCTGCAACTTCATGAGCCAATTCTGTGATGATATGCTCCAGCT
TCATCCCCACGGCAAGCAAAAGAATCAAAGGAAGAAACGCTAGCCAGAAGTAAACACGCC
ATGCAGCAATGTTTAGAAGC

QA 6 805 6 805
DS 



AS 1 2

CO CL6489Contig1 714 2 1 U
GGAATATTCCAAAAGATGGTGCATCGAGAATGGTGTACAGTTCTCGAAGATGGAGAATGC
CAAAGTCATACGCGAGAAACTGGAAAGTGATCTTGAGAAACTTGGTATCAAAGTTCACTC
CAAACGAAACGACCTTGCATGTATTAAAATGTGTATTGCCGAAGGATACTCCGAAACATG
CTCGAGATTCCAGAGTGATGGTTCGTATCAAAGAATAAGGTCTCCTTCTACAACAAAAAC
AATTCACCCTAGGTCTACAGTATACGAGCACCTCCCCATGTATGTCGTGCATTCTGACAC
GTCTGAAACGTACATGCGAGAGGTCACAGAGATCAAGCCCACCTGGTTTAGGCAGATAGC
GCCGCAGCTGTACCGACTACTAGAGGATCGTGTGACCAAAATGCCTAGAGCCATCGGCCG
TGCTCCGATATAGCGTCTCTCATCTTCTCTGGCAAGCAGCTTGAGGATGGTCACACCTTG
GCTGACTACAACATACAGAAAGAGTCCACTCTCCACTTGGTCCTGCGTCTCCGTGGTGGT
TTCTAAAAACTCCAGTCTTGCGTCTTTGTTATGGTTTTAAAAGTGTTGGTCTGACTTGTA
ATAAAAAAAGACCGTGGTGGTTTCTAAAAACTCCGGTCTTGCGTCTTTGTTATGGTTTAA
AACACTTTCCATGCCAAAAACTATAATCAATCTAATCGATAAAACCTTTAACAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BG66JQ C 1
AF RR2BG66TF U 1
BS 1 714 RR2BG66TF

RD RR2BG66JQ 714 0 0
GGAATATTCCAAAAGATGGTGCATCGAGAATGGTGTACAGTTCTCGAAGATGGAGAATGC
CAAAGTCATACGCGAGAAACTGGAAAGTGATCTTGAGAAACTTGGTATCAAAGTTCACTC
CAAACGAAACGACCTTGCATGTATTAAAATGTGTATTGCCGAAGGATACTCCGAAACATG
CTCGAGATTCCAGAGTGATGGTTCGTATCAAAGAATAAGGTCTCCTTCTACAACAAAAAC
AATTCACCCTAGGTCTACAGTATACGAGCACCTCCCCATGTATGTCGTGCATTCTGACAC
GTCTGAAACGTACATGCGAGAGGTCACAGAGATCAAGCCCACCTGGTTTAGGCAGATAGC
GCCGCAGCTGTACCGACTACTAGAGGATCGTGTGACCAAAATGCCTAGAGCCATCGGCCG
TGCTCCGATATAGCGTCTCTCATCTTCTCTGGCAAGCAGCTTGAGGATGGTCACACCTTG
GCTGACTACAACATACAGAAAGAGTCCACTCTCCACTTGGTCCTGCGTCTCCGTGGTGGT
TTCTAAAAACTCCAGTCTTGCGTCTTTGTTATGGTTTTAAAAGTGTTGGTCTGACTTGTA
ATAAAAAAAGACCGTGGTGGTTTCTAAAAACTCCGGTCTTGCGTCTTTGTTATGGTTTAA
AACACTTTCCATGCCAAAAACTATAATCAATCTAATCGATAAAACCTTTAACAG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2BG66TF 714 0 0
GGAATATTCCAAAAGATGGTGCATCGAGAATGGTGTACAGTTCTCGAAGATGGAGAATGC
CAAAGTCATACGCGAGAAACTGGAAAGTGATCTTGAGAAACTTGGTATCAAAGTTCACTC
CAAACGAAACGACCTTGCATGTATTAAAATGTGTATTGCCGAAGGATACTCCGAAACATG
CTCGAGATTCCAGAGTGATGGTTCGTATCAAAGAATAAGGTCTCCTTCTACAACAAAAAC
AATTCACCCTAGGTCTACAGTATACGAGCACCTCCCCATGTATGTCGTGCATTCTGACAC
GTCTGAAACGTACATGCGAGAGGTCACAGAGATCAAGCCCACCTGGTTTAGGCAGATAGC
GCCGCAGCTGTACCGACTACTAGAGGATCGTGTGACCAAAATGCCTAGAGCCATCGGCCG
TGCTCCGATATAGCGTCTCTCATCTTCTCTGGCAAGCAGCTTGAGGATGGTCACACCTTG
GCTGACTACAACATACAGAAAGAGTCCACTCTCCACTTGGTCCTGCGTCTCCGTGGTGGT
TTCTAAAAACTCCAGTCTTGCGTCTTTGTTATGGTTTTAAAAGTGTTGGTCTGACTTGTA
ATAAAAAAAGACCGTGGTGGTTTCTAAAAACTCCGGTCTTGCGTCTTTGTTATGGTTTAA
AACACTTTCCATGCCAAAAACTATAATCAATCTAATCGATAAAACCTTTAACAG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL6490Contig1 647 2 4 U
GTTCCGAGCTCTCGTGTCCTTTGTCTCAGGGAAAAACGCCAATAGGTTAGACCTTTTCTT
GTTCATGGATTCGCTGATGGGTAAACTCGTGATGGGTTTGGTCGTGGTGGTTGCGATCTT
CGGGGGCTTCTGGTGTCGACGCGTGGACTGGCGAGATTCGCGGCAGAGTAGTATGCGATG
TCTGTGCCGATTCTTCAATCGGACCAGAAGATCATGTCCTTGAAGGAGCTGAGGTTGCGG
TGCTTTGCATAACCAAATCTGGAGAAGTTGTGAACTACCAAGCTTTCACAAACACAAAAG
GTGTCTACACAGTAGCCGAGACAATGCCAGAGAGCGAACGTTGGGACGCGTGCCTTGCAA
GACCCATCAGCAGCTTCCACACTTCTTGCAACAACCTAAACCAGGCCAATAATGGGATCA
AATTCAGTTATAACCGCCCTTCCGGTTTCTTTCATGCCGTGAAACCATTTGTGTATCGAC
ACCAGTACGCACCTTCTTATTGCTGAATTGGAATAGCCTTTATACCCCTTTCTAAGTTGT
GTAAACTTGTAGTAATAATTGAAATATGAAATAGTTTGGATACTTGTGTATAATGTTAAT
ATTGGAGCATGGATGTCGATTCGGGTTGGTCCGGCCTAACCCAAATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV44JQ C 1
AF RR2AV44TF U 1
BS 1 125 RR2AV44TF
BS 126 126 RR2AV44JQ
BS 127 626 RR2AV44TF
BS 627 647 RR2AV44JQ

RD RR2AV44JQ 647 0 0
GTTCCGAGCTCTCGTGTCCTTTGTCTCAGGGAAAAACGCCAATAGGTTAGACCTTTTCTT
GTTCATGGATTCGCTGATGGGTAAACTCGTGATGGGTTTGGTCGTGGTGGTTGCGATCTT
CGGGGGCTTCTGGTGTCGACGCGTGGACTGGCGAGATTCGCGGCAGAGTAGTATGCGATG
TCTGTGCCGATTCTTCAATCGGACCAGAAGATCATGTCCTTGAAGGAGCTGAGGTTGCGG
TGCTTTGCATAACCAAATCTGGAGAAGTTGTGAACTACCAAGCTTTCACAAACACAAAAG
GTGTCTACACAGTAGCCGAGACAATGCCAGAGAGCGAACGTTGGGACGCGTGCCTTGCAA
GACCCATCAGCAGCTTCCACACTTCTTGCAACAACCTAAACCAGGCCAATAATGGGATCA
AATTCAGTTATAACCGCCCTTCCGGTTTCTTTCATGCCGTGAAACCATTTGTGTATCGAC
ACCAGTACGCACCTTCTTATTGCTGAATTGGAATAGCCTTTATACCCCTTTCTAAGTTGT
GTAAACTTGTAGTAATAATTGAAATATGAAATAGTTTGGATACTTGTGTATAATGTTAAT
ATTGGAGCATGGATGTCGATTCGGGTTGGTCCGGCCTAACCCAAATC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2AV44TF 626 0 0
GTTCCGAGCTCTCGTGTCCTTTGTCTCAGGGAAAAACGCCAATAGGTTAGACCTTTTCTT
GTTCATGGATTCGCTGATGGGTAAACTCGTGATGGGTTTGGTCGTGGTGGTTGCGATCTT
CGGGG*CTTCTGGTGTCGACGCGTGGACTGGCGAGATTCGCGGCAGAGTAGTATGCGATG
TCTGTGCCGATTCTTCAATCGGACCAGAAGATCATGTCCTTGAAGGAGCTGAGGTTGCGG
TGCTTTGCATAACCAAATCTGGAGAAGTTGTGAACTACCAAGCTTTCACAAACACAAAAG
GTGTCTACACAGTAGCCGAGACAATGCCAGAGAGCGAACGTTGGGACGCGTGCCTTGCAA
GACCCATCAGCAGCTTCCACACTTCTTGCAACAACCTAAACCAGGCCAATAATGGGATCA
AATTCAGTTATAACCGCCCTTCCGGTTTCTTTCATGCCGTGAAACCATTTGTGTATCGAC
ACCAGTACGCACCTTCTTATTGCTGAATTGGAATAGCCTTTATACCCCTTTCTAAGTTGT
GTAAACTTGTAGTAATAATTGAAATATGAAATAGTTTGGATACTTGTGTATAATGTTAAT
ATTGGAGCATGGATGTCGATTCGGGT

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL6491Contig1 654 2 7 U
AGGGACTCCCATCAAAGCAACTATCTCTCTCCTCCACATTCCATTTTCTCACTTCTCCAA
AAAGCTCTGCATTTTCTCTAACAGAATGTACATCGGAAGAATAGGTCTTTTGGGGATTTT
CCTGTTGGATTTTGCTGCAATGGCGTCCTCTGTTCACGGATATGATGCAGGATGGGTCAA
TGCTCATGCCACTTTCTATGGTGGAAGCGATGCTTCAGGAACAATGGGTGGAGCTTGTGG
GTACGGTAACCTCTACAGCCAAGGATACGGGACCAACACGGCTGCACTAAGTACTGCGCT
GTTCAACAACGGTCTTAGCTGCGGCGCGTGTTTTGAGATCCGGTGTCAGAGCGACGGCAC
GTGGTGTTTACCTGGTGCTATTGTGGTTACGGCAACCAACTTCTGTCCTCCCAACAACGC
TCTGCCTAACAACGCAGGTGGCTGGTGTAACCCTCCGCTTCACCATTTCGATCTCTCTCA
GCCTATTTTCCAGCGCATTGCTCATTACAAAGCTGGTGTTGTCCCTGTTTCTTACCGAAG
GGTTCCGTGTAAGAGAAGGGGAGGCATAAGATTTACAATCAACGGCCACTCTTACTTTAA
CCTTGTCTTGGTCACCAATGTTGGAGGCGCAGGAGATGTTCACTCTGTTGCGGT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2G704TF U 1
AF RR2G941TF U 3
BS 1 102 RR2G704TF
BS 103 103 RR2G941TF
BS 104 457 RR2G704TF
BS 458 458 RR2G941TF
BS 459 585 RR2G704TF
BS 586 586 RR2G941TF
BS 587 654 RR2G704TF

RD RR2G704TF 654 0 0
AGGGACTCCCATCAAAGCAACTATCTCTCTCCTCCACATTCCATTTTCTCACTTCTCCAA
AAAGCTCTGCATTTTCTCTAACAGAATGTACATCGGAAGAATGGGTCTTTTGGGGATTTT
CCTGTTGGATTTTGCTGCAATGGCGTCCTCTGTTCACGGATATGATGCAGGATGGGTCAA
TGCTCATGCCACTTTCTATGGTGGAAGCGATGCTTCAGGAACAATGGGTGGAGCTTGTGG
GTACGGTAACCTCTACAGCCAAGGATACGGGACCAACACGGCTGCACTAAGTACTGCGCT
GTTCAACAACGGTCTTAGCTGCGGCGCGTGTTTTGAGATCCGGTGTCAGAGCGACGGCAC
GTGGTGTTTACCTGGTGCTATTGTGGTTACGGCAACCAACTTCTGTCCTCCCAACAACGC
TCTGCCTAACAACGCAGGTGGCTGGTGTAACCCTCCGTTTCACCATTTCGATCTCTCTCA
GCCTATTTTCCAGCGCATTGCTCATTACAAAGCTGGTGTTGTCCCTGTTTCTTACCGAAG
GGTTCCGTGTAAGAGAAGGGGAGGCATAAGATTTACAATCAACGGTCACTCTTACTTTAA
CCTTGTCTTGGTCACCAATGTTGGAGGCGCAGGAGATGTTCACTCTGTTGCGGT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2G941TF 650 0 0
GGACTCCCATCAAAGCAGCTATCTCTCTCCTCCACATTCCATTTTCTCACTTCTCCAAAA
AGCTCTGCATTTTCTCTAACAGAATGTACATCGGAAGAATAGGTCTTTTGGGGATTTTCC
TGTTGGGTTTTGCTGCAATGGCGTCCTCTGTTCACGGATATGATGCAGGATGGGTCAATG
CTCATGCCACTTTCTATGGTGGAAGCGATGCTTCAGGAACAATGGGTGGAGCTTGTGGGT
ACGGTAACCTCTACAGCCAAGGATACGGGACCAACACGGCTGCACTAAGTACTGCGCTGT
TCAACAACGGTCTTAGCTGCGGCGCGTGTTTTGAGATCCGGTGTCAGAGCGACGGCGCGT
GGTGTTTACCTGGTGCTATTGTGGTTACGGCAACCAACTTCTGTCCTCCCAACAACGCTC
TGCCTAACAACGCAGGTGGCTGGTGTAACCCTCCGCTTCACCATTTCGATCTCTCTCAGC
CTATTTTCCAGCGCATTGCTCATTACAAAGCTGGTGTTGTCCCTGTTTCTTACCGAAGGG
TTCCGTGTAAGAGAAGGGGAGGCATAAGATTTACAATCAACGGCCACTCTTACTTTAACC
TTGTCTTGGTCACCAATGTTGGAGGCGCAG*AGATGTTCACTCTGTTGCG

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL6492Contig1 822 2 4 U
GGAGAAAGGTTTTCATTTTCAAGCTGCAAGTTGATATTCTGGTCAGAGGGTGGACTAATC
GGTTTCTCGAATCTCCCTCGCTTCCTCTCCATTCAGGACAATGGAGAAAAGAGACGAGGA
TCTGAAGAAGGCTCAGATGCTGGACGCTCGAGCAAGAAACATCAGCCACAATGTTCGGTG
CACCGAGTGTGGGAGTCAGTCAATTGAAGACTCACAGGCAGATGTTGCTATTCTCCTCAG
ACAGCTGATCCGTGATGAGATAGGAGCTGGAAAAACCGACAAAGAGATTTACAGTAAGCT
CGAGGATGAGTTTGGGGAGACGGTGCTTTATGCCCCCAAATTTGATATGCAGACCGCTGC
ATTGTGGCTAACTCCGGTTCTGATTGCTGGAGGTACTGCAGCAGGATTGGTTTACAGTAA
GCACAGGCAAAGGACAAACGTACACATCATGGCGTTGGACCTTATTAGAGGTGTTTCATT
GACTCCGAAAGAGAGGGTTACCATTCTCGATGTTCTTATTCCACCTCCCCCTCCTCCTCA
GGGAGTGGCTTCCCGGTTGAGGAGATTGCTAAACCGGTAGTTCCCGTGTCTTCCTAGCTC
TGTTGTTCTTGAGTCAAATATTATCGTCTTAGCCACACAAAAAAAAAGCAATGTGGAGGA
TGGATTGAGTATCACGACGTTGACTGTCTATGAGAAACTGATGGTTTGCATCTTTTACTA
GCAGTTTTCTTGGTATATTATTTGAACAAGCATAGTTGAACGTGTTTTTTGTTGGATCTT
TGCTGTGTAATTGAAAACAGAGAGTGGTCGTTTTGTTATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD45TF U 1
AF RR2CD45JQ C 45
BS 1 646 RR2CD45TF
BS 647 647 RR2CD45JQ
BS 648 759 RR2CD45TF
BS 760 822 RR2CD45JQ

RD RR2CD45TF 766 0 0
GGAGAAAGGTTTTCATTTTCAAGCTGCAAGTTGATATTCTGGTCAGAGGGTGGACTAATC
GGTTTCTCGAATCTCCCTCGCTTCCTCTCCATTCAGGACAATGGAGAAAAGAGACGAGGA
TCTGAAGAAGGCTCAGATGCTGGACGCTCGAGCAAGAAACATCAGCCACAATGTTCGGTG
CACCGAGTGTGGGAGTCAGTCAATTGAAGACTCACAGGCAGATGTTGCTATTCTCCTCAG
ACAGCTGATCCGTGATGAGATAGGAGCTGGAAAAACCGACAAAGAGATTTACAGTAAGCT
CGAGGATGAGTTTGGGGAGACGGTGCTTTATGCCCCCAAATTTGATATGCAGACCGCTGC
ATTGTGGCTAACTCCGGTTCTGATTGCTGGAGGTACTGCAGCAGGATTGGTTTACAGTAA
GCACAGGCAAAGGACAAACGTACACATCATGGCGTTGGACCTTATTAGAGGTGTTTCATT
GACTCCGAAAGAGAGGGTTACCATTCTCGATGTTCTTATTCCACCTCCCCCTCCTCCTCA
GGGAGTGGCTTCCCGGTTGAGGAGATTGCTAAACCGGTAGTTCCCGTGTCTTCCTAGCTC
TGTTGTTCTTGAGTCAAATATTATCGTCTTAGCCACACAAAAAAAA*GCAATGTGGAGGA
TGGATTGAGTATCACGACGTTGACTGTCTATGAGAAACTGATGGTTTGCATCTTTTACTA
GCAGTTTTCTTGGTATATTATTTGAACAAGCATAGTTGA
CGTGTTT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2CD45JQ 778 0 0
AGAGGGTGGACTAATCGGTTTCTCGAATCTCCCTCGCTTCCTCTCCATTCAGGACAATGG
AGAAAAGAGACGAGGATCTGAAGAAGGCTCAGATGCTGGACGCTCGAGCAAGAAACATCA
GCCACAATGTTCGGTGCACCGAGTGTGGGAGTCAGTCAATTGAAGACTCACAGGCAGATG
TTGCTATTCTCCTCAGACAGCTGATCCGTGATGAGATAGGAGCTGGAAAAACCGACAAAG
AGATTTACAGTAAGCTCGAGGATGAGTTTGGGGAGACGGTGCTTTATGCCCCCAAATTTG
ATATGCAGACCGCTGCATTGTGGCTAACTCCGGTTCTGATTGCTGGAGGTACTGCAGCAG
GATTGGTTTACAGTAAGCACAGGCAAAGGACAAACGTACACATCATGGCGTTGGACCTTA
TTAGAGGTGTTTCATTGACTCCGAAAGAGAGGGTTACCATTCTCGATGTTCTTATTCCAC
CTCCCCCTCCTCCTCAGGGAGTGGCTTCCCGGTTGAGGAGATTGCTAAACCGGTAGTTCC
CGTGTCTTCCTAGCTCTGTTGTTCTTGAGTCAAATATTATCGTCTTAGCCACACAAAAAA
AAAGCAATGTGGAGGATGGATTGAGTATCACGACGTTGACTGTCTATGAGAAACTGATGG
TTTGCATCTTTTACTAGCAGTTTTCTTGGTATATTATTTGAACAAGCATAGTTGAACGTG
TTTTTTGTTGGATCTTTGCTGTGTAATTGAAAACAGAGAGTGGTCGTTTTGTTATATT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL6493Contig1 769 2 4 U
GATGCACATATCTTCTGTCTCTTTCTCTCGCGCTCTGAATCTCCCAAGACAACAATGCCA
ACAGGTGGATCTGACCATCCTGCATCACTGATGAGCAAGCAAGACACGGCCACCTTTTCC
GACAAGATACCGTCGAGCAAACGAAGGTTATCTTCTCAGGCACCAGCTTGTCCTTCCTTT
AGAATCTACTACTACGACGGAACCGCCGGTTCCATCCCATTCGAATGGGAATCCCATCCC
GGCACTCCCAAGCACAAGCACCCCTCCTCCGAGCTACCTCCGCTGCCTCTCACCCCTCCG
CCGTGTCATTTGTCCTTCTCCAGCGAACAAATCCGTGGTAGTTCAAGAAAACCCATCAAG
AAAATCCTGGCACTAATCCATACCAGACTCTTGTGGTTATCATCAGGTGGTCACAAGAAG
AATAACAAGGTCATGAAACTGTCGGCTTCTTCACCGTCTCTGACGGAGAGGGTGCTGATG
GATGAGAATGAGTACCATCTGTTCAAGTGTCAGACAAAAGGGAAGGTCATTAGAAGATTT
TCATCCTTTGACTCTTCTATTGATCACTACCCCATTCGTAGATCACAATCCCCCTCTTGC
TTCGGAATCCGCGGATGTTTCATCTGGTAATAATATAGATGGGTTTCAGCATACAATCTG
GAAAATAAAACTTGAAAATTCTTATAAATTGTGTGTTTCCATAACATATTTGTAATCCCC
ATCGTCTTATTATATTTAATCAACCATGTCAGTAATAAGATAAAGCTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ93TF U 1
AF RR2CQ93JQ C 1
BS 1 629 RR2CQ93TF
BS 630 630 RR2CQ93JQ
BS 631 664 RR2CQ93TF
BS 665 769 RR2CQ93JQ

RD RR2CQ93TF 665 0 0
GATGCACATATCTTCTGTCTCTTTCTCTCGCGCTCTGAATCTCCCAAGACAACAATGCCA
ACAGGTGGATCTGACCATCCTGCATCACTGATGAGCAAGCAAGACACGGCCACCTTTTCC
GACAAGATACCGTCGAGCAAACGAAGGTTATCTTCTCAGGCACCAGCTTGTCCTTCCTTT
AGAATCTACTACTACGACGGAACCGCCGGTTCCATCCCATTCGAATGGGAATCCCATCCC
GGCACTCCCAAGCACAAGCACCCCTCCTCCGAGCTACCTCCGCTGCCTCTCACCCCTCCG
CCGTGTCATTTGTCCTTCTCCAGCGAACAAATCCGTGGTAGTTCAAGAAAACCCATCAAG
AAAATCCTGGCACTAATCCATACCAGACTCTTGTGGTTATCATCAGGTGGTCACAAGAAG
AATAACAAGGTCATGAAACTGTCGGCTTCTTCACCGTCTCTGACGGAGAGGGTGCTGATG
GATGAGAATGAGTACCATCTGTTCAAGTGTCAGACAAAAGGGAAGGTCATTAGAAGATTT
TCATCCTTTGACTCTTCTATTGATCACTACCCCATTCGTAGATCACAATCCCCCTCTTGC
TTCGGAATCCGCGGATGTTTCATCTGGTA*TAATATAGATGGGTTTCAGCATACAATCTG
GAAA
T

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2CQ93JQ 769 0 0
GATGCACATATCTTCTGTCTCTTTCTCTCGCGCTCTGAATCTCCCAAGACAACAATGCCA
ACAGGTGGATCTGACCATCCTGCATCACTGATGAGCAAGCAAGACACGGCCACCTTTTCC
GACAAGATACCGTCGAGCAAACGAAGGTTATCTTCTCAGGCACCAGCTTGTCCTTCCTTT
AGAATCTACTACTACGACGGAACCGCCGGTTCCATCCCATTCGAATGGGAATCCCATCCC
GGCACTCCCAAGCACAAGCACCCCTCCTCCGAGCTACCTCCGCTGCCTCTCACCCCTCCG
CCGTGTCATTTGTCCTTCTCCAGCGAACAAATCCGTGGTAGTTCAAGAAAACCCATCAAG
AAAATCCTGGCACTAATCCATACCAGACTCTTGTGGTTATCATCAGGTGGTCACAAGAAG
AATAACAAGGTCATGAAACTGTCGGCTTCTTCACCGTCTCTGACGGAGAGGGTGCTGATG
GATGAGAATGAGTACCATCTGTTCAAGTGTCAGACAAAAGGGAAGGTCATTAGAAGATTT
TCATCCTTTGACTCTTCTATTGATCACTACCCCATTCGTAGATCACAATCCCCCTCTTGC
TTCGGAATCCGCGGATGTTTCATCTGGTAATAATATAGATGGGTTTCAGCATACAATCTG
GAAAATAAAACTTGAAAATTCTTATAAATTGTGTGTTTCCATAACATATTTGTAATCCCC
ATCGTCTTATTATATTTAATCAACCATGTCAGTAATAAGATAAAGCTCT

QA 1 769 1 769
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6495Contig1 725 2 2 U
TTTAGTGAAAGTAATAATAATAATAACTGAAATAAATGTCATCAAGAGAGACGGACTGGA
CCGTTCGATTAAAAATATTATTTTGATTTTCCTTCCACATTAATATATTATCTGAAACCA
TAATTCATCAGTAATCATCAAGCCCGGATCAACGACGATGAACCGCCCAAAACCCTAAAA
TCTCAAGACGGATCAACAGTACGGCGACCATCATCTCCAGCGGCTGCTCTCGGCTGCTGA
AACTGACTGATCTGTCCAATCGCAAGAATCCCTCCGTCGTAGTTGTTACCGGTAGGAACA
TCTAACCCACCAAACATCTGTTCTCTAGGGAAAAACTGGTAGTGATGATAATGATGGTCT
CTCACTGTGGCCGTCGTCGATCCATCTGCGTTGGCGCCTGCGAGTAAGTTGATTCCAAGG
CTCTGATGCGTGGCGGCGAGTATACCGAGGCTTTGGTACTTGGAAAGCTCAAATTTGGCA
CAGCTGAAATCGATCTGAAGCTGGCGAAGCTGATGTTGGAGGAGAGAGATGACTCCCACG
CAGCCGTAGACCGGATCACGCAGACGCATGTCGGCTTCATAAGCTAAAGAGTTCACTGCG
TCTTCACGTTGCGAAGGGTGGAGCTCGTTGAGGAGCTTTGTGACGTTGCTTGCTCCAAAG
ACTTTGTGAACGTTTGCGAATTTTTGTGGTTGGTCAGGTGGGAAATATGGAGCGAATACG
CACTC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2B954TF C 1
AF RR2B954JQ U 4
BS 1 3 RR2B954TF
BS 4 725 RR2B954JQ

RD RR2B954TF 691 0 0
TTTAGTGAAAGTAATAATAATAATAACTGAAATAAATGTCATCAAGAGAGACGGACTGGA
CCGTTCGATTAAAAATATTATTTTGATTTTCCTTCCACATTAATATATTATCTGAAACCA
TAATTCATCAGTAATCATCAAGCCCGGATCAACGACGATGAACCGCCCAAAACCCTAAAA
TCTCAAGACGGATCAACAGTACGGCGACCATCATCTCCAGCGGCTGCTCTCGGCTGCTGA
AACTGACTGATCTGTCCAATCGCAAGAATCCCTCCGTCGTAGTTGTTACCGGTAGGAACA
TCTAACCCACCAAACATCTGTTCTCTAGGGAAAAACTGGTAGTGATGATAATGATGGTCT
CTCACTGTGGCCGTCGTCGATCCATCTGCGTTGGCGCCTGCGAGTAAGTTGATTCCAAGG
CTCTGATGCGTGGCGGCGAGTATACCGAGGCTTTGGTACTTGGAAAGCTCAGATTTGGCA
CAGCTGAGATCGATCTGAAGCTGGCGAAGCTGATGTTGGAGGAGAGAGATGACTCCCACG
CAGCCGTAGACCGGATCACGCAGACGCATGTCGGCTTCATAAGCTAAAGAGTTCACTGCG
TCTTCACGTTGCGAAGGGTGGAGCTCGTTGAGGAGCTTTGTGACGTTGCTTGCTCCAAAG
ACTTTGTGAACGTTTGCGAATTTTTGTGGTT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2B954JQ 722 0 0
AGTGAAAGTAATAATAATAATAACTGAAATAAATGTCATCAAGAGAGACGGACTGGACCG
TTCGATTAAAAATATTATTTTGATTTTCCTTCCACATTAATATATTATCTGAAACCATAA
TTCATCAGTAATCATCAAGCCCGGATCAACGACGATGAACCGCCCAAAACCCTAAAATCT
CAAGACGGATCAACAGTACGGCGACCATCATCTCCAGCGGCTGCTCTCGGCTGCTGAAAC
TGACTGATCTGTCCAATCGCAAGAATCCCTCCGTCGTAGTTGTTACCGGTAGGAACATCT
AACCCACCAAACATCTGTTCTCTAGGGAAAAACTGGTAGTGATGATAATGATGGTCTCTC
ACTGTGGCCGTCGTCGATCCATCTGCGTTGGCGCCTGCGAGTAAGTTGATTCCAAGGCTC
TGATGCGTGGCGGCGAGTATACCGAGGCTTTGGTACTTGGAAAGCTCAAATTTGGCACAG
CTGAAATCGATCTGAAGCTGGCGAAGCTGATGTTGGAGGAGAGAGATGACTCCCACGCAG
CCGTAGACCGGATCACGCAGACGCATGTCGGCTTCATAAGCTAAAGAGTTCACTGCGTCT
TCACGTTGCGAAGGGTGGAGCTCGTTGAGGAGCTTTGTGACGTTGCTTGCTCCAAAGACT
TTGTGAACGTTTGCGAATTTTTGTGGTTGGTCAGGTGGGAAATATGGAGCGAATACGCAC
TC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL6496Contig1 644 2 3 U
ATGTGCATAGTACATAGATGAGACACGTTGAACAATAGGATATAGTTCTGATTTGATATC
ACACAATCTTTTATACAACCATATTGCTCTTACTTCAACTTTCTTCATCGGTTTTCTTAG
TCTTCTCGATTTCTAGCAGATAAATCCTCTTAACTTCTGGTACAGCCTTGGTCGAAGCTT
GAAGCCTATGGTTCAAGTCATCAAGGTTGTTCATTAACCTATCGTTAGTGAACATTCCCA
TACAAACGCTCTTGATCGTTTCCCAGCTTTCAATCAAAGGCAAACCAATTATCACAATCG
ATCCTATAGTTCCCCAAGCTACAGCTACAATTGCCCAAAACCAGAAATATCCTCTGCTAA
ACACACGTGCTGGGAGAGAGAGAACTGGCCAGATGACAACAATGAGGAGAGTGAAGACAA
GACCCCATTTAACAATCCAAGCTTTGGCTCTTCTCAGCTTCTCTTCTTTTAGCTCCTCTA
CAGGAACATCGATATCGTTCCCTGGAGCCTCAGCTTCCACCACTTTGATTTCCTTCGTCG
TCGACCAATCGTAGTTCTGTGGCTGTACTAGACTACACACCGCATGGATCAACCCTCGTT
AGAATAGCAACGAGGTTACCAGCAAGCATGGGTGCATTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC32JQ U 138
AF RR2CC32TF C 1
BS 1 141 RR2CC32TF
BS 142 333 RR2CC32JQ
BS 334 644 RR2CC32TF

RD RR2CC32JQ 196 0 0
AAAA
AAATCCTCTTAACTTCTGGTACAGCCTTGGTCGAAGCTTGAAGCCTATGGTTCAAGTCAT
CAAGGTTGTTCATTAACCTATCGTTAGTGAACATTCCCATACAAACGCTCTTGATCGTTT
CCCAGCTTTCAATCAAAGGCAAACCAATTATCACAATCGATCCTATAGTTCCCCAAGCTA
CAGCTACAATTG

QA 5 196 5 196
DS 

RD RR2CC32TF 644 0 0
ATGTGCATAGTACATAGATGAGACACGTTGAACAATAGGATATAGTTCTGATTTGATATC
ACACAATCTTTTATACAACCATATTGCTCTTACTTCAACTTTCTTCATCGGTTTTCTTAG
TCTTCTCGATTTCTAGCAGATAAATCCTCTTAGCTTCTGGTACAGCCTTGGTCGAAGCTT
GAAGCCTATGGTTCAAGTCATCAAGGTTGTTCATTAACCTATCGTTAGTGAACATTCCCA
TACAAACGCTCTTGATCGTTTCCCAGCTTTCAATCAAAGGCAAACCAATTATCACAATCG
ATCCTATAGTTCCCCAAGCTACAGCTACAATTGCCCAAAACCAGAAATATCCTCTGCTAA
ACACACGTGCTGGGAGAGAGAGAACTGGCCAGATGACAACAATGAGGAGAGTGAAGACAA
GACCCCATTTAACAATCCAAGCTTTGGCTCTTCTCAGCTTCTCTTCTTTTAGCTCCTCTA
CAGGAACATCGATATCGTTCCCTGGAGCCTCAGCTTCCACCACTTTGATTTCCTTCGTCG
TCGACCAATCGTAGTTCTGTGGCTGTACTAGACTACACACCGCATGGATCAACCCTCGTT
AGAATAGCAACGAGGTTACCAGCAAGCATGGGTGCATTTCTCCC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL6497Contig1 704 2 5 U
GGACTTCAGGTTTTGCTCTATGTGAAAAAAAAAAAAAAGAGAAAAGATTCAAACTTTACT
TTCAATGGGGGAGACACAGAACCTGCACTTACCTCTGCGAACTCGGTCATCTCTAAAGAA
GCCCTTATTAGGTCGTTCTGTTACTCTGCATCACAAGCGTGCTCTTGGTCTGCACTTACA
TGTACCCGCAACACAACGTCAAGAGCCCCGCTTGTGAGGGTTTGTCAAGCAGAGGCTGCA
AAGCTGCGCTCTCCTGATGGCTTGATGTCCACGTCAGGAAACACACCGACGAAGAAGTCG
CTGCTCGTGTTGTGATCAGAGACATACTCAGAATACCTCCTGCTCTGACCTCCAGATCGA
AGATAGCTTTCATGTTCTTGTCTCCTGGTACTTTGCCTTTTGAGAAGCTATGGGATCAGT
TCTTCCAGGGTCAAGAAGGGAGATTCTCGATTTACATACATCCGTCGAGGCTGAGACCGG
TTCACATCAGCCGTCACTTTTCGGACCGTGAGATTCACAGCGACCATGTCACGTGGGGGG
AGGATCTCTATGGTTGATGCTGAGAGACGGCTTCTAGCTAACGCTCTTGAAGATCCTGAT
AACCAACACTTTGTTCTTCTCTCAGAGAGCTGCATACCGTTGCATACGTTTGACTACACC
TATAGGTATTTGATCCACGGGAATGTCAGCTTCATTGACAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2G437TF U 1
AF RR2G574TF U 12
BS 1 129 RR2G437TF
BS 130 130 RR2G574TF
BS 131 539 RR2G437TF
BS 540 540 RR2G574TF
BS 541 704 RR2G437TF

RD RR2G437TF 704 0 0
GGACTTCAGGTTTTGCTCTATGTGAAAAAAAAAAAAAAGAGAAAAGATTCAAACTTTACT
TTCAATGGGGGAGACACAGAACCTGCACTTACCTCTGCGAACTCGGTCATCTCTAAAGAA
GCCCTTATT*GGTCGTTCTGTTACTCTGCATCACAAGCGTGCTCTTGGTCTGCACTTACA
TGTACCCGCAACACAACGTCAAGAGCCCCGCTTGTGAGGGTTTGTCAAGCAGAGGCTGCA
AAGCTGCGCTCTCCTGATGGCTTGATGTCCACGTCAGGAAACACACCGACGAAGAAGTCG
CTGCTCGTGTTGTGATCAGAGACATACTCAGAATACCTCCTGCTCTGACCTCCAGATCGA
AGATAGCTTTCATGTTCTTGTCTCCTGGTACTTTGCCTTTTGAGAAGCTATGGGATCAGT
TCTTCCAGGGTCAAGAAGGGAGATTCTCGATTTACATACATCCGTCGAGGCTGAGACCGG
TTCACATCAGCCGTCACTTTTCGGACCGTGAGATTCACAGCGACCATGTCACGTGGGGG*
AGGATCTCTATGGTTGATGCTGAGAGACGGCTTCTAGCTAACGCTCTTGAAGATCCTGAT
AACCAACACTTTGTTCTTCTCTCAGAGAGCTGCATACCGTTGCATACGTTTGACTACACC
TATAGGTATTTGATCCACGGGAATGTCAGCTTCATTGACAACTT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2G574TF 692 0 0
TTTGCTCTATGTGAAAAAAAAAAAAAAGAGAAAAGATTCAAACTTTACTTTCAATGGGGG
AGACACAGAACCTGCACTTACCTCTGCGAACTCGGTCATCTCTAAAGAAGCCCTTATTAG
GTCGTTCTGTTACTCTGCATCACAAGCGTGCTCTTGGTCTGCACTTACATGTACCCGCAA
CACAACGTCAAGAGCCCCGCTTGTGAGGGTTTGTCAAGCAGAGGCTGCAAAGCTGCGCTC
TCCTGATGGCTTGATGTCCACGTCAGGAAACACACCGACGAAGAAGTCGCTGCTCGTGTT
GTGATCAGAGACATACTCAGAATACCTCCTGCTCTGACCTCCAGATCGAAGATAGCTTTC
ATGTTCTTGTCTCCTGGTACTTTGCCTTTTGAGAAGCTATGGGATCAGTTCTTCCAGGGT
CAAGAAGGGAGATTCTCGATTTACATACATCCGTCGAGGCTGAGACCGGTTCACATCAGC
CGTCACTTTTCGGACCGTGAGATTCACAGCGACCATGTCACGTGGGGGGAGGATCTCTAT
GGTTGATGCTGAGAGACGGCTTCTAGCTAACGCTCTTGAAGATCCTGATAACCAACACTT
TGTTCTTCTCTCAGAGAGCTGCATACCGTTGCATACGTTTGACTACACCTATAGGTATTT
GATCCACGGGAATGTCAGCTTCATTGACA
CTT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6499Contig1 739 2 2 U
GGCCAAAACCAAATCAACAGAGAAAGAAAGAGAAAGGTCAATATGACTCGGTCTAACGCC
GAAGACGGAGCAGTATCCACCGCAATGGCAGAGCCTCCTCTGAACAACGAAATGATGTTT
CATAGGAGCATGAGCACGAGCAGCTGTTTGTTCACGGAAGACGAGGATATGACTCGTACA
GTGCTTTCAGAGTTTAAAGCTAAAGAGAGTGAGATCGAGAGGAGAAAGATAGAGATTCGT
GAACGGGTCCAGGCTCAACTAGATAGGGTTGAAGAAGAAACCCGGCGCCTCGCCACAATA
CGCGAGGAGCTTGAATCTCTTGCCGATCCCACGAGGAAGGAAGTTTTGATGGTTCGTAAG
AAGATTGATAGCGTTTACAAGGAGCTCAGACCATTAAGCTATTCTGTTCAAAAGAAGCAA
AGGGAATACAAAGAAGCAGTTGATGCATTCAACGAGAAGAATTTGGAGAAAATTCAGCTG
ATCACCAAACTCATGGAGTTGGCTGGAGAAAGCGAGAGTCTGAGGTTGAAGAAGCTTGAA
GACTTGAGCAAGAGCATTTAGTGAATGTCTCAAAAACATAGATGACAAAGATCAGTCAAG
AACTTATTGGGTTTGGATTTTTGTTCACTGTGTGAATTATGATGTATCTTCTTGTAAAAT
GTGAAATTTATGGGTGTTTTCCTTTGTTTTTAATTTATATAAATCCTGTTTTGCTTATAA
AAAAGCTGCCACTCTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR18TF U 1
AF RR2FR18JQ C 104
BS 1 723 RR2FR18TF
BS 724 739 RR2FR18JQ

RD RR2FR18TF 723 0 0
GGCCAAAACCAAATCAACAGAGAAAGAAAGAGAAAGGTCAATATGACTCGGTCTAACGCC
GAAGACGGAGCAGTATCCACCGCAATGGCAGAGCCTCCTCTGAACAACGAAATGATGTTT
CATAGGAGCATGAGCACGAGCAGCTGTTTGTTCACGGAAGACGAGGATATGACTCGTACA
GTGCTTTCAGAGTTTAAAGCTAAAGAGAGTGAGATCGAGAGGAGAAAGATAGAGATTCGT
GAACGGGTCCAGGCTCAACTAGATAGGGTTGAAGAAGAAACCCGGCGCCTCGCCACAATA
CGCGAGGAGCTTGAATCTCTTGCCGATCCCACGAGGAAGGAAGTTTTGATGGTTCGTAAG
AAGATTGATAGCGTTTACAAGGAGCTCAGACCATTAAGCTATTCTGTTCAAAAGAAGCAA
AGGGAATACAAAGAAGCAGTTGATGCATTCAACGAGAAGAATTTGGAGAAAATTCAGCTG
ATCACCAAACTCATGGAGTTGGCTGGAGAAAGCGAGAGTCTGAGGTTGAAGAAGCTTGAA
GACTTGAGCAAGAGCATTTAGTGAATGTCTCAAAAACATAGATGACAAAGATCAGTCAAG
AACTTATTGGGTTTGGATTTTTGTTCACTGTGTGAATTATGATGTATCTTCTTGTAAAAT
GTGAAATTTATGGGTGTTTTCCTTTGTTTTTAATTTATATAAATCCTGTTTTGCTTATAA
AAA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2FR18JQ 636 0 0
ACAACGAAATGATGTTTCATAGGAGCATGAGCACGAGCAGCTGTTTGTTCACGGAAGACG
AGGATATGACTCGTACAGTGCTTTCAGAGTTTAAAGCTAAAGAGAGTGAGATCGAGAGGA
GAAAGATAGAGATTCGTGAACGGGTCCAGGCTCAACTAGATAGGGTTGAAGAAGAAACCC
GGCGCCTCGCCACAATACGCGAGGAGCTTGAATCTCTTGCCGATCCCACGAGGAAGGAAG
TTTTGATGGTTCGTAAGAAGATTGATAGCGTTTACAAGGAGCTCAGACCATTAAGCTATT
CTGTTCAAAAGAAGCAAAGGGAATACAAAGAAGCAGTTGATGCATTCAACGAGAAGAATT
TGGAGAAAATTCAGCTGATCACCAAACTCATGGAGTTGGCTGGAGAAAGCGAGAGTCTGA
GGTTGAAGAAGCTTGAAGACTTGAGCAAGAGCATTTAGTGAATGTCTCAAAAACATAGAT
GACAAAGATCAGTCAAGAACTTATTGGGTTTGGATTTTTGTTCACTGTGTGAATTATGAT
GTATCTTCTTGTAAAATGTGAAATTTATGGGTGTTTTCCTTTGTTTTTAATTTATATAAA
TCCTGTTTTGCTTATAAAAAAGCTGCCACTCTTACC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL6500Contig1 910 2 6 U
GCATTCTCTATTTTCTAATACTGAAGGCAGGATCAACATCCAGAGTGCAGAGAATGATAT
AATTTCAAACATTTTGGACTTTGACCCTTGGGATGAATCCTCGACTAATTTTGCAAAGTT
ACTTGGCCAGAGTGATCATTGGGGCGGTACTCTTGAACAGTCTAACCTTCAAAACCAGCG
TAACGACCAGTCCAGATTCTCTTTTGCTCGGCATGAAGAATCAAATAATCAAGCATATGA
CAATAATAATAATACCTACAGCATATATGGGCAGTCTACAAGAGGTCAGCCTGCCCAGGA
GTTTAGAATGAATCGGGATATCTATCAGGATAAGTTTGCGAGTCTTAATGGTTTTGCTTC
AAACTATTCTGGTGGATATGAACAGTTTGCTGCTAGTCCTGGATTCTCTTCTTACAAAAG
TCCTGCTGTGAGGTCCCAAGTTTCTGCTCCTCCTGGTTTTTCTGCTCCCAGTAAATTACC
TCCTCCCGGTTTCTCTTCGCATGATAGAGCGATCATGTCTTCTGATTTCGTATCAGGAAC
TCGTTTGCTTGACTCGTCCTCTCTGTTAAGGAACGCATATCATACACCACCTTCAAGTAG
CAATTTGAATACTGCAGGAGACATAGAGTTTATTGATCCAGCAATTTTAGCGGTTGGAAG
AGGAAGAATACAGAACGCGACGGAAAATGGAGCAGAGTTTGATATGAGATCAGGGTTCTA
TTTTCAGCTGAGTTCCTTTGAGAAGGATGCAAGGCTTCGTCAATTGTTGGCGCAGCAGAG
TTCTCAGGCTGCACAACAACAGCAACAACAAGTCAATGTTAACAACTTTACTCCTTCAGT
CTCGGATCATTATTTTTTACTAAACAATCAATGGCGTTAGGTCGCCTGAAACAAATTTGT
ACATTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL40TF U 1
AF RR2BL40JQ C 316
BS 1 568 RR2BL40TF
BS 569 569 RR2BL40JQ
BS 570 608 RR2BL40TF
BS 609 609 RR2BL40JQ
BS 610 634 RR2BL40TF
BS 635 910 RR2BL40JQ

RD RR2BL40TF 634 0 0
GCATTCTCTATTTTCTAATACTGAAGGCAGGATCAACATCCAGAGTGCAGAGAATGATAT
AATTTCAAACATTTTGGACTTTGACCCTTGGGATGAATCCTCGACTAATTTTGCAAAGTT
ACTTGGCCAGAGTGATCATTGGGGCGGTACTCTTGAACAGTCTAACCTTCAAAACCAGCG
TAACGACCAGTCCAGATTCTCTTTTGCTCGGCATGAAGAATCAAATAATCAAGCATATGA
CAATAATAATAATACCTACAGCATATATGGGCAGTCTACAAGAGGTCAGCCTGCCCAGGA
GTTTAGAATGAATCGGGATATCTATCAGGATAAGTTTGCGAGTCTTAATGGTTTTGCTTC
AAACTATTCTGGTGGATATGAACAGTTTGCTGCTAGTCCTGGATTCTCTTCTTACAAAAG
TCCTGCTGTGAGGTCCCAAGTTTCTGCTCCTCCTGGTTTTTCTGCTCCCAGTAAATTACC
TCCTCCCGGTTTCTCTTCGCATGATAGAGCGATCATGTCTTCTGATTTCGTATCAGGAAC
TCGTTTGCTTGACTCGTCCTCTCTGTTA*GGAACGCATATCATACACCACCTTCAAGTAG
CAATTTGA*TACTGCAGGAGACATAGAGTTTATT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2BL40JQ 595 0 0
GGATATCTATCAGGATAAGTTTGCGAGTCTTAATGGTTTTGCTTCAAACTATTCTGGTGG
ATATGAACAGTTTGCTGCTAGTCCTGGATTCTCTTCTTACAAAAGTCCTGCTGTGAGGTC
CCAAGTTTCTGCTCCTCCTGGTTTTTCTGCTCCCAGTAAATTACCTCCTCCCGGTTTCTC
TTCGCATGATAGAGCGATCATGTCTTCTGATTTCGTATCAGGAACTCGTTTGCTTGACTC
GTCCTCTCTGTTAAGGAACGCATATCATACACCACCTTCAAGTAGCAATTTGAATACTGC
AGGAGACATAGAGTTTATTGATCCAGCAATTTTAGCGGTTGGAAGAGGAAGAATACAGAA
CGCGACGGAAAATGGAGCAGAGTTTGATATGAGATCAGGGTTCTATTTTCAGCTGAGTTC
CTTTGAGAAGGATGCAAGGCTTCGTCAATTGTTGGCGCAGCAGAGTTCTCAGGCTGCACA
ACAACAGCAACAACAAGTCAATGTTAACAACTTTACTCCTTCAGTCTCGGATCATTATTT
TTTACTAAACAATCAATGGCGTTAGGTCGCCTGAAACAAATTTGTACATTAAAAA

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

CO CL6501Contig1 933 2 14 U
GAGAGCATGCTTTTCTCAGCGACTATGCCTACTTGGGTTAAGAAGCTGGCGAGGAAGTAC
CTTGACAATCCCTTGAATATCGATCTGGTTGGAGACCAAGATGAGAAGCTCGCAGAAGGG
ATCAAACTCTATGCAATCTCAGCCACATCAACATCAAAACGCACTATTCTAAGTGACCTT
ATCACAGTGTATGCGAAGGGTGGGAAGACCATTGTTTTCACCCAAACAAAAAGAGATGCA
GACGAGGTCTCTCTAGCGTTGTCAAACAGCATAGCTTCCGAGGCACTTCATGGAGATATC
TCTCAGCATCAAAGAGAGAGAACACTGAATGGTTTCCGCCAAGGGAAGTTCACTGTACTA
GTTGCCACTGATGTTGCATCACGTGGACTTGACATCCCGAACGTAGATCTAGTTATCCAC
TATGAACTTCCTAATGACCCAAAGACTTTTGTGCACCGTTCGGGTCGTACTGGGCGTGCA
GGGAAAGAAGGCTCTGCCATTCTCATGCACAGCAGCAGCCAGAAGAGAACCGTGAGGTCT
CTAGAGCGTGACGTGGGATGCAGATTTGAGTTTATTAGCCCACCAACCGTTGGAGACTTG
TTGGAAGCGTCTGCAGACCATGTGGTGGCCACTCTAAACGGTGTTCACCCCGAGTCTATT
AAGTTTTTCTCAGCAACTGCTCAGAAACTATTTGAGGAAAAGGGAACAGATGCTTTAGCT
GCAGCTCTGGCTCACCTTAGCGGTTTCTCTCAGCCACCTTCTTCGAGATCTCTCCTCAGT
CATGAACAGGGATGGGTGACTTTGCAGTTGATACGAGATCCAACAAACGCTAGAGGCTTC
TTGTCTGCAAGTCTGTGACTGGTTTTCTTTCCGATGTTTACCGTCCAGCTGCAGATAGAG
TTGGAAAATCTTCATGATCGCAGATGAGAGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F631TF U 1
AF RR2DW50TF U 245
BS 1 461 RR2F631TF
BS 462 462 RR2DW50TF
BS 463 510 RR2F631TF
BS 511 511 RR2DW50TF
BS 512 650 RR2F631TF
BS 651 651 RR2DW50TF
BS 652 705 RR2F631TF
BS 706 706 RR2DW50TF
BS 707 745 RR2F631TF
BS 746 746 RR2DW50TF
BS 747 774 RR2F631TF
BS 775 775 RR2DW50TF
BS 776 789 RR2F631TF
BS 790 933 RR2DW50TF

RD RR2F631TF 789 0 0
GAGAGCATGCTTTTCTCAGCGACTATGCCTACTTGGGTTAAGAAGCTGGCGAGGAAGTAC
CTTGACAATCCCTTGAATATCGATCTGGTTGGAGACCAAGATGAGAAGCTCGCAGAAGGG
ATCAAACTCTATGCAATCTCAGCCACATCAACATCAAAACGCACTATTCTAAGTGACCTT
ATCACAGTGTATGCGAAGGGTGGGAAGACCATTGTTTTCACCCAAACAAAAAGAGATGCA
GACGAGGTCTCTCTAGCGTTGTCAAACAGCATAGCTTCCGAGGCACTTCATGGAGATATC
TCTCAGCATCAAAGAGAGAGAACACTGAATGGTTTCCGCCAAGGGAAGTTCACTGTACTA
GTTGCCACTGATGTTGCATCACGTGGACTTGACATCCCGAACGTAGATCTAGTTATCCAC
TATGAACTTCCTAATGACCCAAAGACTTTTGTGCACCGTTCTGGTCGTACTGGGCGTGCA
GGGAAAGAAGGCTCTGCCATTCTCATGCACGGCAGCAGCCAGAAGAGAACCGTGAGGTCT
CTAGAGCGTGACGTGGGATGCAGATTTGAGTTTATTAGCCCACCAACCGTTGGAGACTTG
TTGGAAGCGTCTGCAGACCATGTGGTGGCCACTCTAAACGGTGTTCACCCTGAGTCTATT
AAGTTTTTCTCAGCAACTGCTCAGAAACTATTTGAGGAAAAGGGA*CAGATGCTTTAGCT
GCAGCTCTGGCTCACCTTAGCGGTT*CTCTCAGCCACCTTCTTCGAGATCTCTC*TCAGT
CATGAACAG

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2DW50TF 689 0 0
G
GGTCTCTCTAGCGTTGTCAAACAGCATAGCTTCCGAGGCACTTCATGGAGATATCTCTCA
GCATCAAAGAGAGAGAACACTGAATGGTTTCCGCCAAGGGGAGTTCACTGTACTAGTTGC
CACTGATGTTGCATCACGTGGACTTGACATCCCGAACGTAGATCTAGTTATCCACTATGA
ACTTCCTAATGACCCAGAGGCTTTTGTGCACCGTTCGGGTCGTACTGGGCGTGCAGGGAA
AGAAGGCTCTGCCATTCTCATGCACAGCAGCAGCCAGAAGAGAACCGTGAGGTCTCTAGA
GCGTGACGTGGGATGCAGATTTGAGTTTATTAGCCCACCAACCGTTGGAGACTTGTTGGA
AGCGTCTGCAGACCATGTGGTGGCCACTCTAAACGGTGTTCACCCCGAGTCTATTAAGTT
TTTCTCAGCAACTGCTCAGAAACTATTTGAGGAAAAGGGAACAGATGCTTTAGCTGCAGC
TCTGGCTCACCTTAGCGGTTTCTCTCAGCCACCTTCTTCGAGATCTCTCCTCAGTCATGA
ACAGGGATGGGTGACTTTGCAGTTGATACGAGATCCAACAAACGCTAGAGGCTTCTTGTC
TGCAAGTCTGTGACTGGTTTTCTTTCCGATGTTTACCGTCCAGCTGCAGATAGAGTTGGA
AAATCTTCATGATCGCAGATGAGAGGTG

QA 2 689 2 689
DS 



AS 1 2

CO CL6502Contig1 920 2 4 U
GGAGTTTCGAGTTTCTTCTTCTTCATCGGCGGATATTATATGGCTTCTTCGGCAGCCATC
AGATCTGAAATTTACGACCGAGAAGAACGCAAGCAGTAATACCAAGCGCATATTCGTGGC
CTAAACGCTTATGAACGGCATAAGAAGTTCTTGAAAGACTACGTTCGTTTTTATGGCAAG
GACAAGCCGACACAAGTCAATCTGCCGGTTAAAACGGACCACGACACACTTAGAGAAGGA
TACCGGTTTATACGTTCTGAAGAAGATGATTTAAACCCTTCTTGGGAGCAAAGGCTCGTG
AAGCGATACTATGATAAGCTTTTTAAGGAATACTGTATAGCTGACATGTCACGATACAAG
ACTGGCCAGATGGGTTTAAGATGGAGAACGGAAAAAGAAGTAATGTCAGGCAAAGGGCAG
TTTATGTGTGGAAGCAAACAGTGTCATGAAATAGAAGGGTTGGCGAGCTATGAGGTGAAT
TTTTCTTATCATGAAGCTGGTGAACACAAACAACCCCTTGTAAAACTCGTAACTTGTGAG
AGATGTGCTGAGAAGCTGTACTACAAAAGAAGAAAGGAGGGTGAAAGATCAGAGAGTAAA
GAAAAGAAAAAGCAGAAACGTAAACGGAATCGATCAAGCAGTGATGATGACACAGACGAA
GAGGAAAGGAGAAAAGGAAAAAAGAACAAGTCCAAGCTGGAGGGTGATGAGAGAGGAAAA
GTCAAGGATGATGAGAACTTCGACGAATTCATGGAAAGGAATGTTTCCGGGGAAGGGTGA
TAACTAAAGTTTAGAAAGCTGAACTATTTGATTTATGTCACAAGGATTACCCTTTTTGTA
TCATAACCTTAGACCGAGTCTGGGACCATGAATGTAAAAGCAATAGAACACAGACCATAA
CATGAAATACTTTTAATCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH33TF U 1
AF RR2AH33JQ C 81
BS 1 776 RR2AH33TF
BS 777 777 RR2AH33JQ
BS 778 824 RR2AH33TF
BS 825 920 RR2AH33JQ

RD RR2AH33TF 827 0 0
GGAGTTTCGAGTTTCTTCTTCTTCATCGGCGGATATTATATGGCTTCTTCGGCAGCCATC
AGATCTGAAATTTACGACCGAGAAGAACGCAAGCAGTAATACCAAGCGCATATTCGTGGC
CTAAACGCTTATGAACGGCATAAGAAGTTCTTGAAAGACTACGTTCGTTTTTATGGCAAG
GACAAGCCGACACAAGTCAATCTGCCGGTTAAAACGGACCACGACACACTTAGAGAAGGA
TACCGGTTTATACGTTCTGAAGAAGATGATTTAAACCCTTCTTGGGAGCAAAGGCTCGTG
AAGCGATACTATGATAAGCTTTTTAAGGAATACTGTATAGCTGACATGTCACGATACAAG
ACTGGCCAGATGGGTTTAAGATGGAGAACGGAAAAAGAAGTAATGTCAGGCAAAGGGCAG
TTTATGTGTGGAAGCAAACAGTGTCATGAAATAGAAGGGTTGGCGAGCTATGAGGTGAAT
TTTTCTTATCATGAAGCTGGTGAACACAAACAACCCCTTGTAAAACTCGTAACTTGTGAG
AGATGTGCTGAGAAGCTGTACTACAAAAGAAGAAAGGAGGGTGAAAGATCAGAGAGTAAA
GAAAAGAAAAAGCAGAAACGTAAACGGAATCGATCAAGCAGTGATGATGACACAGACGAA
GAGGAAAGGAGAAAAGGAAAAAAGAACAAGTCCAAGCTGGAGGGTGATGAGAGAGGAAAA
GTCAAGGATGATGAGAACTTCGACGAATTCATGGAAAGGAATGTTTCCGGGGAAGG*TGA
TAACTAAAGTTTAGAAAGCTGAACTATTTGATTTATGTCACAAG
ATT

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2AH33JQ 840 0 0
AGAAGAACGCAAGCAGTAATACCAAGCGCATATTCGTGGCCTAAACGCTTATGAACGGCA
TAAGAAGTTCTTGAAAGACTACGTTCGTTTTTATGGCAAGGACAAGCCGACACAAGTCAA
TCTGCCGGTTAAAACGGACCACGACACACTTAGAGAAGGATACCGGTTTATACGTTCTGA
AGAAGATGATTTAAACCCTTCTTGGGAGCAAAGGCTCGTGAAGCGATACTATGATAAGCT
TTTTAAGGAATACTGTATAGCTGACATGTCACGATACAAGACTGGCCAGATGGGTTTAAG
ATGGAGAACGGAAAAAGAAGTAATGTCAGGCAAAGGGCAGTTTATGTGTGGAAGCAAACA
GTGTCATGAAATAGAAGGGTTGGCGAGCTATGAGGTGAATTTTTCTTATCATGAAGCTGG
TGAACACAAACAACCCCTTGTAAAACTCGTAACTTGTGAGAGATGTGCTGAGAAGCTGTA
CTACAAAAGAAGAAAGGAGGGTGAAAGATCAGAGAGTAAAGAAAAGAAAAAGCAGAAACG
TAAACGGAATCGATCAAGCAGTGATGATGACACAGACGAAGAGGAAAGGAGAAAAGGAAA
AAAGAACAAGTCCAAGCTGGAGGGTGATGAGAGAGGAAAAGTCAAGGATGATGAGAACTT
CGACGAATTCATGGAA*GGAATGTTTCCGGGGAAGGGTGATAACTAAAGTTTAGAAAGCT
GAACTATTTGATTTATGTCACAAGGATTACCCTTTTTGTATCATAACCTTAGACCGAGTC
TGGGACCATGAATGTAAAAGCAATAGAACACAGACCATAACATGAAATACTTTTAATCGT

QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 2

CO CL6503Contig1 716 2 3 U
CCACCCATAGCAATATCTCAAGCTCTCTCAAACCCACATTTTCGTTTACTTAATCTGCTT
CTGCATAAGCTGTTTCAAGATGTGCTTGCTCTGCTTCTTTAACTTCTTTCTCAGTCTTCC
TTCCTTTCTTAGACTTATAGTAAACACTCATGAACGTTCCAACAGCTCTGTACTTCTTAC
GGCAATGCTCGTACAAGTCAGCATCAAACATCCTCCAGAAACTCTTCTCGTCCAGCTCAG
ACACAGCGTACTGAGGCTGGAACCCATGGTTCTCAATCAGCCACTTCTCCAACTTACGCA
CAGCTTCTGCTCCATCATACTCTTCACCTCTTAGGACAGGACCTGGTGCGTAGTAGACTC
CAACGTCAGTGTACATCTGAGCATCATCTGTGTCTCCTTGTCTCTTCTCATACTCAAACC
CTGGTTCTGGATAAATCTGTTGTCTGATTGGTGTCTTGTAGAGTTTGTGTGGGCAAAGCC
AAATGGGATAAACCTGAAAAGGATACACAACCGTTTGAGTGATGAATATATATTTATGTT
TTTATAAGTATAAATCTGATTTCTAACCATATAATCCATTTTATAATAGACAAATATAGT
TATGATTTTTTTTGGTATAAAACAAAATAAACTGAAAACCGATAGTAATACATCAGCCAA
ACCAAATTAGATATGGTTCTAAAATATGGCAGTTAATTTTTATAAACCGAAATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A330TF C 1
AF RR2A330JQ U 460
BS 1 463 RR2A330TF
BS 464 694 RR2A330JQ
BS 695 716 RR2A330TF

RD RR2A330TF 716 0 0
CCACCCATAGCAATATCTCAAGCTCTCTCAAACCCACATTTTCGTTTACTTAATCTGCTT
CTGCATAAGCTGTTTCAAGATGTGCTTGCTCTGCTTCTTTAACTTCTTTCTCAGTCTTCC
TTCCTTTCTTAGACTTATAGTAAACACTCATGAACGTTCCAACAGCTCTGTACTTCTTAC
GGCAATGCTCGTACAAGTCAGCATCAAACATCCTCCAGAAACTCTTCTCGTCCAGCTCAG
ACACAGCGTACTGAGGCTGGAACCCATGGTTCTCAATCAGCCACTTCTCCAACTTACGCA
CAGCTTCTGCTCCATCATACTCTTCACCTCTTAGGACAGGACCTGGTGCGTAGTAGACTC
CAACGTCAGTGTACATCTGAGCATCATCTGTGTCTCCTTGTCTCTTCTCATACTCAAACC
CTGGTTCTGGATAAATCTGTTGTCTGATTGGTGTCTTGTAGAGTTTGTGTGGGCAAAGCC
AAATGGGATAAACCTGAAAAGGATACACAACCGTTTGAGTGATGAATATATATTTATGTT
TT*ATAAGTATAAATCTGATTTCTAACCATATAATCCATTTTATAATAGACAAATATAGT
TATGATTTTTTTTGGTATAAAACAAAATAAACTGAAAACCGATAGTAATACATCAGCCAA
ACCAAATTAGATATGGTTCTAAAATATGGCAGTTAATTTTTATAAACCGAAATATC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2A330JQ 235 0 0
GAGT
TTTGTGTGGGCAAAGCCAAATGGGATAAACCTGAAAAGGATACACAACCGTTTGAGTGAT
GAATATATATTTATGTTTTTATAAGTATAAATCTGATTTCTAACCATATAATCCATTTTA
TAATAGACAAATATAGTTATGATTTTTTTTGGTATAAAACAAAATAAACTGAAAACCGAT
AGTAATACATCAGCCAAACCAAATTAGATATGGTTCTAAAATATGGCAGTT

QA 5 235 5 235
DS 



AS 1 2

CO CL6504Contig1 825 2 8 U
GGAAGCCATACAAAAACCGTTACCACGTTCCATACAGAGCCTCAATGAGCACTTCTCCGC
TTTGGTACTCAATTAAACGAGCCTCAGCGTACATCATCGTGCTCTCCTCTTACTCAGCTT
TTGACAAGTACACACCTCAAAACTCGTGGCTCGAGAGTGAACTGAAGAAAGTAAACAGAG
AGGAGACTCCATGGCTGATTGTTCTGGTTCACTCGCCGTGGTACAACAGCAACGGTTATC
ACTACATGGAAGGTGAAAGCATGAGAGTCACGTTTGAGCCATGGTTCGTCCAAAACAAAG
TTGATATTGTCTTCGCTGGTCATGTTCATGCCTACGAGCGATCAGAACGTGTCTCCAACA
TTAAGTACAATATCACTGATGGTTTGAGTTCTCCCGTGAAAGATCAATCTGCTCCAATTT
ACATCACCATTGGTGATGGTGGCAACATAGAAGGAATCGCTAACGATTACACGTACCCTC
AACCGAGTTACTCAGCATATAGAGAGGCTAGTTTTGGACATGCTCTTCTAGAAATAAAGA
ACAGGACTCACGCGCTTTACACTTGGCATAGGAACCAAGACAATGAGCCGGTTATCGCCG
ACTCTCTTTGGGTGAAGAACAGACACTTCTTGCCGGAGGAAGAATAGACAGTTTCAACGA
CTCAAGAATGTTTCAGTTTTTTTTTACTCATCTCTTTCTAATAATAAGATTAGTATTTCA
TGTTTTTTTGTTAGGTTTAATTTAATTTAATTTTTACGTTTTATCTACTTATTGTTGTGT
TGCTACTTTACACCTTTATTTAATTCATAAGGTGATAAGAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C207TF U 1
AF RR2C207JQ C 139
BS 1 684 RR2C207TF
BS 685 685 RR2C207JQ
BS 686 703 RR2C207TF
BS 704 704 RR2C207JQ
BS 705 728 RR2C207TF
BS 729 729 RR2C207JQ
BS 730 740 RR2C207TF
BS 741 825 RR2C207JQ

RD RR2C207TF 740 0 0
GGAAGCCATACAAAAACCGTTACCACGTTCCATACAGAGCCTCAATGAGCACTTCTCCGC
TTTGGTACTCAATTAAACGAGCCTCAGCGTACATCATCGTGCTCTCCTCTTACTCAGCTT
TTGACAAGTACACACCTCAAAACTCGTGGCTCGAGAGTGAACTGAAGAAAGTAAACAGAG
AGGAGACTCCATGGCTGATTGTTCTGGTTCACTCGCCGTGGTACAACAGCAACGGTTATC
ACTACATGGAAGGTGAAAGCATGAGAGTCACGTTTGAGCCATGGTTCGTCCAAAACAAAG
TTGATATTGTCTTCGCTGGTCATGTTCATGCCTACGAGCGATCAGAACGTGTCTCCAACA
TTAAGTACAATATCACTGATGGTTTGAGTTCTCCCGTGAAAGATCAATCTGCTCCAATTT
ACATCACCATTGGTGATGGTGGCAACATAGAAGGAATCGCTAACGATTACACGTACCCTC
AACCGAGTTACTCAGCATATAGAGAGGCTAGTTTTGGACATGCTCTTCTAGAAATAAAGA
ACAGGACTCACGCGCTTTACACTTGGCATAGGAACCAAGACAATGAGCCGGTTATCGCCG
ACTCTCTTTGGGTGAAGAACAGACACTTCTTGCCGGAGGAAGAATAGACAGTTTCAACGA
CTCAAGAATGTTTCAGTTTTTTTT*ACTCATCTCTTTCTAATA*TAAGATTAGTATTTCA
TGTTTTTT*GTTAGGTTTAA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2C207JQ 687 0 0
AAAACTCGTGGCTCGAGAGTGAACTGAAGAAAGTAAACAGAGAGGAGACTCCATGGCTGA
TTGTTCTGGTTCACTCGCCGTGGTACAACAGCAACGGTTATCACTACATGGAAGGTGAAA
GCATGAGAGTCACGTTTGAGCCATGGTTCGTCCAAAACAAAGTTGATATTGTCTTCGCTG
GTCATGTTCATGCCTACGAGCGATCAGAACGTGTCTCCAACATTAAGTACAATATCACTG
ATGGTTTGAGTTCTCCCGTGAAAGATCAATCTGCTCCAATTTACATCACCATTGGTGATG
GTGGCAACATAGAAGGAATCGCTAACGATTACACGTACCCTCAACCGAGTTACTCAGCAT
ATAGAGAGGCTAGTTTTGGACATGCTCTTCTAGAAATAAAGAACAGGACTCACGCGCTTT
ACACTTGGCATAGGAACCAAGACAATGAGCCGGTTATCGCCGACTCTCTTTGGGTGAAGA
ACAGACACTTCTTGCCGGAGGAAGAATAGACAGTTTCAACGACTCAAGAATGTTTCAGTT
TTTTTTTACTCATCTCTTTCTAATAATAAGATTAGTATTTCATGTTTTTTTGTTAGGTTT
AATTTAATTTAATTTTTACGTTTTATCTACTTATTGTTGTGTTGCTACTTTACACCTTTA
TTTAATTCATAAGGTGATAAGAGTTCC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL6505Contig1 428 2 1 U
GCGTACCAGACAATTTGGATTTCAACGTTGTTGATGAAATCATTCAAGTGACAAGCGTGG
AAGCTATTGAAACAGCCAGACTTCTTGCTCTAAAAGAAGGATTACTGGTGGGTATATCTT
CGGGAGCTGCTGCAGCCGCGGCTATTAAGGTGGCAAAACGGCCAGAAAACGCCGGGAAGC
TCATAGTTGTGGTTTTCCCTAGCGGTGGGGAACGTTATTTATCGACTCAATTATTCGACT
CCGTGAGACGTGAAGCAGAGAGTTTGACATTTGAATGAGGCTTACACACACACAACAAAC
ATGACCTGGCTTGGTTCGGTTTGGTATTTATTTCCTCTCTGGTTTAGTTTCCTTTAGACC
ATTGTTTCTTGATATTTCAAACGATTATCACCCAAACCATATTTATTTTTTCAAATATTT
TTTGAATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F640JQ C 1
AF RR2F640TF U 1
BS 1 428 RR2F640TF

RD RR2F640JQ 428 0 0
GCGTACCAGACAATTTGGATTTCAACGTTGTTGATGAAATCATTCAAGTGACAAGCGTGG
AAGCTATTGAAACAGCCAGACTTCTTGCTCTAAAAGAAGGATTACTGGTGGGTATATCTT
CGGGAGCTGCTGCAGCCGCGGCTATTAAGGTGGCAAAACGGCCAGAAAACGCCGGGAAGC
TCATAGTTGTGGTTTTCCCTAGCGGTGGGGAACGTTATTTATCGACTCAATTATTCGACT
CCGTGAGACGTGAAGCAGAGAGTTTGACATTTGAATGAGGCTTACACACACACAACAAAC
ATGACCTGGCTTGGTTCGGTTTGGTATTTATTTCCTCTCTGGTTTAGTTTCCTTTAGACC
ATTGTTTCTTGATATTTCAAACGATTATCACCCAAACCATATTTATTTTTTCAAATATTT
TTTGAATC

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR2F640TF 428 0 0
GCGTACCAGACAATTTGGATTTCAACGTTGTTGATGAAATCATTCAAGTGACAAGCGTGG
AAGCTATTGAAACAGCCAGACTTCTTGCTCTAAAAGAAGGATTACTGGTGGGTATATCTT
CGGGAGCTGCTGCAGCCGCGGCTATTAAGGTGGCAAAACGGCCAGAAAACGCCGGGAAGC
TCATAGTTGTGGTTTTCCCTAGCGGTGGGGAACGTTATTTATCGACTCAATTATTCGACT
CCGTGAGACGTGAAGCAGAGAGTTTGACATTTGAATGAGGCTTACACACACACAACAAAC
ATGACCTGGCTTGGTTCGGTTTGGTATTTATTTCCTCTCTGGTTTAGTTTCCTTTAGACC
ATTGTTTCTTGATATTTCAAACGATTATCACCCAAACCATATTTATTTTTTCAAATATTT
TTTGAATC

QA 1 428 1 428
DS 



AS 1 2

CO CL6506Contig1 750 2 2 U
GCTCTTGAATACGTGGCAGACTCTATTGAGAGGCTTGGACAAGCAGTTCCTCGTGCAGCA
AATGAATCTGAAGATAATAGCAGGAATCAAGCAACTTCTCCTAGGAATCTGGCATCATTT
GCTGATGAGTACAGAAAGCTTGCGACTGATTGCCTAAAGGTTCTTCGTGTTGAGATGCAA
TTGGAAACAGTCTTTCATCTTCAGGAAATGAAAAATCGAGAATACTTGGAGGATGACGAT
GCTGAAGAGCCCGACGACTTTGTGATTTCTCTTACTTCACAGATAACACGTAGGGACGAG
GGAATGGCGCCTTTCATCTCTGGTGAGAAGCGCAATTACGTTTTTGGTGGCATTTGTGGA
ATTGCAGCGAATGCGTCCATTAAGGCTTTAGCTGACATGAGATCAATAAACCTTTTTGGA
GTTCAACAAATTTGTCGGAACACTATTGCACTGGAACAGGCCATGACAGCTATTCCATAT
ATCGATGGTGAAAGCGTTCAACAGAACCTAGACCGTGTCCGTACTTATTTCGAACTACTA
AACATGCCATTCGAGGCGTTGCTTGCATTCATAGCGGAACATGACCAGATGTTTACACCC
ACAGAGTATTCTAATCTTCTAAAGGTGAATGTTCCTGGAAGAGATACTCCTACGGATGCT
CAGTCTCGCCTTTCCGAAATTCTTTCTCACTGATATCAACTCCTCGACCATTCGCTAATT
ACCATTGATAAACAAAGCTTCTTTTCTAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD15TF U 1
AF RR2GE47TF U 1
BS 1 620 RR2GD15TF
BS 621 750 RR2GE47TF

RD RR2GD15TF 620 0 0
GCTCTTGAATACGTGGCAGACTCTATTGAGAGGCTTGGACAAGCAGTTCCTCGTGCAGCA
AATGAATCTGAAGATAATAGCAGGAATCAAGCAACTTCTCCTAGGAATCTGGCATCATTT
GCTGATGAGTACAGAAAGCTTGCGACTGATTGCCTAAAGGTTCTTCGTGTTGAGATGCAA
TTGGAAACAGTCTTTCATCTTCAGGAAATGAAAAATCGAGAATACTTGGAGGATGACGAT
GCTGAAGAGCCCGACGACTTTGTGATTTCTCTTACTTCACAGATAACACGTAGGGACGAG
GGAATGGCGCCTTTCATCTCTGGTGAGAAGCGCAATTACGTTTTTGGTGGCATTTGTGGA
ATTGCAGCGAATGCGTCCATTAAGGCTTTAGCTGACATGAGATCAATAAACCTTTTTGGA
GTTCAACAAATTTGTCGGAACACTATTGCACTGGAACAGGCCATGACAGCTATTCCATAT
ATCGATGGTGAAAGCGTTCAACAGAACCTAGACCGTGTCCGTACTTATTTCGAACTACTA
AACATGCCATTCGAGGCGTTGCTTGCATTCATAGCGGAACATGACCAGATGTTTACACCC
ACAGAGTATTCTAATCTTCT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2GE47TF 750 0 0
GCTCTTGAATACGTGGCAGACTCTATTGAGAGGCTTGGACAAGCAGTTCCTCGTGCAGCA
AATGAATCTGAAGATAATAGCAGGAATCAAGCAACTTCTCCTAGGAATCTGGCATCATTT
GCTGATGAGTACAGAAAGCTTGCGACTGATTGCCTAAAGGTTCTTCGTGTTGAGATGCAA
TTGGAAACAGTCTTTCATCTTCAGGAAATGAAAAATCGAGAATACTTGGAGGATGACGAT
GCTGAAGAGCCCGACGACTTTGTGATTTCTCTTACTTCACAGATAACACGTAGGGACGAG
GGAATGGCGCCTTTCATCTCTGGTGAGAAGCGCAATTACGTTTTTGGTGGCATTTGTGGA
ATTGCAGCGAATGCGTCCATTAAGGCTTTAGCTGACATGAGATCAATAAACCTTTTTGGA
GTTCAACAAATTTGTCGGAACACTATTGCACTGGAACAGGCCATGACAGCTATTCCATAT
ATCGATGGTGAAAGCGTTCAACAGAACCTAGACCGTGTCCGTACTTATTTCGAACTACTA
AACATGCCATTCGAGGCGTTGCTTGCATTCATAGCGGAACATGACCAGATGTTTACACCC
ACAGAGTATTCTAATCTTCTAAAGGTGAATGTTCCTGGAAGAGATACTCCTACGGATGCT
CAGTCTCGCCTTTCCGAAATTCTTTCTCACTGATATCAACTCCTCGACCATTCGCTAATT
ACCATTGATAAACAAAGCTTCTTTTCTAGC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL6507Contig1 628 2 1 U
GGCTTCTCCGTCACTGCCTCTCGAGCTACCCAATCTAAGTTATTTAATCAGAGGCTTTGA
GTTCTTTTTGGGGAGAAAATGGTGAGAATCAGTGTACTCAACGATGCTCTCAAGAGCATG
TACAATGCCGAGAAACGTGGCAAGAGACAGGTCATGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATC
ATCAAGTTTCTCATCGTTATGCAGAAGCACGGTTACATCGGTGAGTTTGAGTATGTCGAT
GACCACCGATCCGGCAAAATCGTTGTCGAGTTGAACGGAAGGTTGAACAAGTGTGGTGTT
ATCAGCCCTCGTTTTGATGTTGGTGTTAAGGAGATTGAAAGTTGGACTGCCCGTCTTCTT
CCTTCCAGACAGTTTGGGTACATCGTGTTGACTACTTCTGCTGGTATTATGGACCATGAA
GAAGCTAGGAGAAAGAATGTCGGAGGCAAGGTTCTCGGCTTCTTCTATTGAGAGATCTTT
TTTATGGAAAGAGACTTCTTCTTTCAGTTTTTTTTTTTCAACTTTTGCCATCCATTTTCT
TGGAGACTTTTGTTTTTTTTATTTCGAATTTTGTGGTAACTTTTTGTTGGATAGTTCTTA
AATTTACTCTTTCTGGTCTCGAGTTCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BA59JQ C 1
AF RR2BA59TF U 1
BS 1 628 RR2BA59TF

RD RR2BA59JQ 628 0 0
GGCTTCTCCGTCACTGCCTCTCGAGCTACCCAATTTAAGTTATTTAATCAGAGGCTTTGA
GTTCTTTTTGGGGAGAAAATGGTGAGAATCAGTGTACTCAACGATGCTCTCAAGAGCATG
TACAATGCCGAGAAACGTGGCAAGAGACAGGTCATGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATC
ATCAAGTTTCTCATCGTTATGCAGAAGCACGGTTACATCGGTGAGTTTGAGTATGTCGAT
GACCACCGATCCGGCAAAATCGTTGTCGAGTTGAACGGAAGGTTGAACAAGTGTGGTGTT
ATCAGCCCTCGTTTTGATGTTGGTGTTAAGGAGATTGAAAGTTGGACTGCCCGTCTTCTT
CCTTCCAGACAGTTTGGGTACATCGTGTTGACTACTTCTGCTGGTATTATGGACCATGAA
GAAGCTAGGAGAAAGAATGTCGGAGGCAAGGTTTTCGGCTTCTTCTATTGAGAGATCTTT
TTTATGGAAAGAGACTTCTTCTTTCAGTTTTTTTTTTTCAACTTTTGCCATCCATTTTCT
TGGAGACTTTTGTTTTTTTTATTTCGAATTTTGTGGTAACTTTTTGTTGGATAGTTCTTA
AATTTACTCTTTCTGGTCTCGAGTTCTT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2BA59TF 628 0 0
GGCTTCTCCGTCACTGCCTCTCGAGCTACCCAATCTAAGTTATTTAATCAGAGGCTTTGA
GTTCTTTTTGGGGAGAAAATGGTGAGAATCAGTGTACTCAACGATGCTCTCAAGAGCATG
TACAATGCCGAGAAACGTGGCAAGAGACAGGTCATGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATC
ATCAAGTTTCTCATCGTTATGCAGAAGCACGGTTACATCGGTGAGTTTGAGTATGTCGAT
GACCACCGATCCGGCAAAATCGTTGTCGAGTTGAACGGAAGGTTGAACAAGTGTGGTGTT
ATCAGCCCTCGTTTTGATGTTGGTGTTAAGGAGATTGAAAGTTGGACTGCCCGTCTTCTT
CCTTCCAGACAGTTTGGGTACATCGTGTTGACTACTTCTGCTGGTATTATGGACCATGAA
GAAGCTAGGAGAAAGAATGTCGGAGGCAAGGTTCTCGGCTTCTTCTATTGAGAGATCTTT
TTTATGGAAAGAGACTTCTTCTTTCAGTTTTTTTTTTTCAACTTTTGCCATCCATTTTCT
TGGAGACTTTTGTTTTTTTTATTTCGAATTTTGTGGTAACTTTTTGTTGGATAGTTCTTA
AATTTACTCTTTCTGGTCTCGAGTTCTT

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL6508Contig1 917 2 8 U
GGAAGGCCATTCTTTCGAGCTATGGACAACTCCAGAAATGGTTATACTCATGTTCCAAAT
CAGTCTGATAGATATGACTCTGATACAAGATCATCAGGTTGGCGAAGAAGGCCTTCTTTC
TCTTTACAGAACCCTTGGTCCAGGAATGATTTGATTGTTAATAGGCGATTTCTCGATGAT
CCTCCATCTGCGTACTCAAGAACAAGAACAGAGATCTCATCAACTGTAGATTCAGTACCA
TCATCACCTCCTACTCCGCATCATGTTCCCATCGGAACCAGCAACAACGTGCGGAGGCAG
CACCTAGAGGCACTAAGGCAAGCCGTACACAACCGACATGATAGTACTAGACACGAGAGC
AACTCAAGATCAGCAGCAGCGTCACAAGCCAAAGAAGAAGTCAATGTTCTGAAATATCTA
ACAAAAGAGACATACAACCCTGTCCTAAAAAGCCAGCTTCTCAGAAACCTGAGCTTATAC
TACAAAAACAAGAACTCTGGCCTCAAAAGCTCAAGAAACCCTCAAGGTTACTCGGGAGGA
GAAGGGGAGAAAAGATGCGCAGTATGTTTAGAAGACTTTAAGCCCAAGGAAACAGTGATG
CTCACTCCATGCAAACATATGTTCCATGAGGAATGTATAGTCCCGTGGTTAAAAAGCAAA
GGACAGTGTCCTGTCTGTAGATTCGTCATTCTCACACCGACAAAACGAGACTCTTCTCCG
AGTATTAGCCCTGATCTCGCCGGTGACATGACAGTGAATGATCTCTTCACATTACAGCTT
ATCTCTATGGTACAAGCAATGGAGGAAACTTTCCTTTTTGGCTATCATCATCGCCATTAG
AATCATAACTTTGACATATCTATCTCTGTAACTCTGTTGTACCTTTAACTAACTCAAATA
ATACCCCTTCTTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB51TF U 1
AF RR2GB51JQ C 158
BS 1 654 RR2GB51TF
BS 655 655 RR2GB51JQ
BS 656 661 RR2GB51TF
BS 662 662 RR2GB51JQ
BS 663 704 RR2GB51TF
BS 705 705 RR2GB51JQ
BS 706 718 RR2GB51TF
BS 719 917 RR2GB51JQ

RD RR2GB51TF 725 0 0
GGAAGGCCATTCTTTCGAGCTATGGACAACTCCAGAAATGGTTATACTCATGTTCCAAAT
CAGTCTGATAGATATGACTCTGATACAAGATCATCAGGTTGGCGAAGAAGGCCTTCTTTC
TCTTTACAGAACCCTTGGTCCAGGAATGATTTGATTGTTAATAGGCGATTTCTCGATGAT
CCTCCATCTGCGTACTCAAGAACAAGAACAGAGATCTCATCAACTGTAGATTCAGTACCA
TCATCACCTCCTACTCCGCATCATGTTCCCATCGGAACCAGCAACAACGTGCGGAGGCAG
CACCTAGAGGCACTAAGGCAAGCCGTACACAACCGACATGATAGTACTAGACACGAGAGC
AACTCAAGATCAGCAGCAGCGTCACAAGCCAAAGAAGAAGTCAATGTTCTGAAATATCTA
ACAAAAGAGACATACAACCCTGTCCTAAAAAGCCAGCTTCTCAGAAACCTGAGCTTATAC
TACAAAAACAAGAACTCTGGCCTCAAAAGCTCAAGAAACCCTCAAGGTTACTCGGGAGGA
GAAGGGGAGAAAAGATGCGCAGTATGTTTAGAAGACTTTAAGCCCAAGGAAACAGTGATG
CTCACTCCATGCAAACATATGTTCCATGAGGAATGTATAGTCCCGTGGTTAAAA*GCAAA
G*ACAGTGTCCTGTCTGTAGATTCGTCATTCTCACACCGACAAA*CGAGACTCTTCTC
GAGTATT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2GB51JQ 760 0 0
TTAATAGGCGATTTCTCGATGATCCTCCATCTGCGTACTCAAGAACAAGAACAGAGATCT
CATCAACTGTAGATTCAGTACCATCATCACCTCCTACTCCGCATCATGTTCCCATCGGAA
CCAGCAACAACGTGCGGAGGCAGCACCTAGAGGCACTAAGGCAAGCCGTACACAACCGAC
ATGATAGTACTAGACACGAGAGCAACTCAAGATCAGCAGCAGCGTCACAAGCCAAAGAAG
AAGTCAATGTTCTGAAATATCTAACAAAAGAGACATACAACCCTGTCCTAAAAAGCCAGC
TTCTCAGAAACCTGAGCTTATACTACAAAAACAAGAACTCTGGCCTCAAAAGCTCAAGAA
ACCCTCAAGGTTACTCGGGAGGAGAAGGGGAGAAAAGATGCGCAGTATGTTTAGAAGACT
TTAAGCCCAAGGAAACAGTGATGCTCACTCCATGCAAACATATGTTCCATGAGGAATGTA
TAGTCCCGTGGTTAAAAAGCAAAGGACAGTGTCCTGTCTGTAGATTCGTCATTCTCACAC
CGACAAAACGAGACTCTTCTCCGAGTATTAGCCCTGATCTCGCCGGTGACATGACAGTGA
ATGATCTCTTCACATTACAGCTTATCTCTATGGTACAAGCAATGGAGGAAACTTTCCTTT
TTGGCTATCATCATCGCCATTAGAATCATAACTTTGACATATCTATCTCTGTAACTCTGT
TGTACCTTTAACTAACTCAAATAATACCCCTTCTTTTTAT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL6509Contig1 775 2 2 U
GAGGCTATTCTACCAACAATCAGAGTGGCGCAGCGGAAGCGTGGTGGGCCCATAACCCAC
AGGTCCCAGGATCGAAACCTGGCTCTGATAGAATATTCTATTTTTGTTTTTGTTTTTGTT
GTTTCCCGAATTATATGCCGTTATCTATTTGTTTCCATTTCTGACACAAATACAATTATA
GATGGCAAAAAAGATCACAAATGATGCTTAAATTGGTTGTGTGTGACCTGTAGTTGTGTT
TGAGGAGTGGATATCATCAGTAATACATGCGAGGAAAGCAGTAGCTGCGTTGGAAGAAAG
AAATGGGTTGTATCTTCTTTTCATGGACTGAGTGACAGGGGAATTAGCTAAACGAGTTGG
TCAAGTCACATCTTTCCGGGAGGTGGAGCCAGCCATTTTGGACAAAATCTTAGCCTACCC
AGAATGATACCTTCCCAGGTCATGTCGATGATGAAGTCGGTACCCCGAGCAAGCTTGGAG
TTTTCATAAGAAAAAGTAGAGGATTCGGATACAGAGGGCGGCCACACACCACCACCAGAT
CGGCTTCTGCAACACTTCTGCCAGGCTCCTTCCATGTTACTGCTTGCCTCGCCTCCTCTC
TCGTACTGTCTCTCCTTCTCTAGCTTGTTTATGTGTTTAGTCTGTGGTTTTCTATTTAAC
TTGCAAAATTGATGTAGTGGATAGTATTGTGCCTTTGTAGTGTCAACAAGTGCACTACGT
ATAGACGTCATGTAAGTGTGTACATTTTGAATGCTTAATATTGTGAACTTTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR24TF U 1
AF RR2BR24JQ C 165
BS 1 737 RR2BR24TF
BS 738 775 RR2BR24JQ

RD RR2BR24TF 737 0 0
GAGGCTATTCTACCAACAATCAGAGTGGCGCAGCGGAAGCGTGGTGGGCCCATAACCCAC
AGGTCCCAGGATCGAAACCTGGCTCTGATAGAATATTCTATTTTTGTTTTTGTTTTTGTT
GTTTCCCGAATTATATGCCGTTATCTATTTGTTTCCATTTCTGACACAAATACAATTATA
GATGGCAAAAAAGATCACAAATGATGCTTAAATTGGTTGTGTGTGACCTGTAGTTGTGTT
TGAGGAGTGGATATCATCAGTAATACATGCGAGGAAAGCAGTAGCTGCGTTGGAAGAAAG
AAATGGGTTGTATCTTCTTTTCATGGACTGAGTGACAGGGGAATTAGCTAAACGAGTTGG
TCAAGTCACATCTTTCCGGGAGGTGGAGCCAGCCATTTTGGACAAAATCTTAGCCTACCC
AGAATGATACCTTCCCAGGTCATGTCGATGATGAAGTCGGTACCCCGAGCAAGCTTGGAG
TTTTCATAAGAAAAAGTAGAGGATTCGGATACAGAGGGCGGCCACACACCACCACCAGAT
CGGCTTCTGCAACACTTCTGCCAGGCTCCTTCCATGTTACTGCTTGCCTCGCCTCCTCTC
TCGTACTGTCTCTCCTTCTCTAGCTTGTTTATGTGTTTAGTCTGTGGTTTTCTATTTAAC
TTGCAAAATTGATGTAGTGGATAGTATTGTGCCTTTGTAGTGTCAACAAGTGCACTACGT
ATAGACGTCATGTAAGT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2BR24JQ 611 0 0
CACAAATACAATTATAGATGGCAAAAAAGATCACAAATGATGCTTAAATTGGTTGTGTGT
GACCTGTAGTTGTGTTTGAGGAGTGGATATCATCAGTAATACATGCGAGGAAAGCAGTAG
CTGCGTTGGAAGAAAGAAATGGGTTGTATTTTCTTTTCATGGACTGAGTGACAGGGGAAT
TAGCTAAACGAGTTGGTCAAGTCACATCTTTCCGGGAGGTGGAGCCAGCCATTTTGGACA
AAATTTTAGCCTACCCAGAATGATACCTTCCCAGGTCATGTCGATGATGAAGTCGGTACC
CCGAGCAAGCTTGGAGTTTTCATAAGAAAAAGTAGAGGATTCGGATACAGAGGGCGGCCA
CACACCACCACCAGATCGGCTTTTGCAACACTTTTGCCAGGCTCCTTCCATGTTACTGCT
TGCCTCGCCTCCTCTCTCGTACTGTCTCTCCTTCTCTAGCTTGTTTATGTGTTTAGTCTG
TGGTTTTTTATTTAACTTGCAAAATTGATGTAGTGGATAGTATTGTGCCTTTGTAGTGTC
AACAAGTGCACTACGTATAGACGTCATGTAAGTGTGTACATTTTGAATGCTTAATATTGT
GAACTTTATTT

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL6510Contig1 674 2 2 U
GGATCTTTTATTTTGGCCAATATGCTATAAGGTAGATAATAATTAAGCCTCTTTTTTCGG
CGGCCGCCATCTTCTATGCGCGGTCGCCGGACTCTTCTCCGGTTTAATTTCTTCTCTTCT
CTTTCTTCTAGTTCCTTATGTCATATGTTTCATCTTCTACTCCGTTACGGTGGCTTTTGT
GCGAAGTTCGTCGTGGTCAATCCGGTGGCAGTAGAATGGTTATGTTGGTTTTAATAGTGG
TTCTTGGTGGCGTTTGTTACAAGAGTAGTGGCTCGTTTGTTATTGATGTTTCCTCTCACC
TTCTATTCGTCCAGCGTAGTTGTCCCATGTGCTTCATGCTGTCTTTTCTGCGCAGGTCTG
TTTCTTACCGATTTTATTCTCGGTTTTATCAAAGAGATTAGACCTTGCTTCGTGTTTCAT
GTCCTCTGCCATATTATGAAGCCATGAGTCTTTGTTATGGAGAGGTCTCTCATCAGTTTG
AGAGAAGATATGCATATTGTTTCTTGTCGTGAGAATCAGCTATGTATCAAACAAGGATCT
TACTTGGTTGGTTCTGTTACCTGAGAGAGATTGAAAGGCAATTCCATTGGTTTTTGTTTT
ATCTGATTCTTCTTCACAGTTTCACGATGCATTTACTATTAATACCCACATGTGTATGGG
GTTAATTCACGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ84TF U 1
AF RR2DJ84JQ C 449
BS 1 591 RR2DJ84TF
BS 592 674 RR2DJ84JQ

RD RR2DJ84TF 591 0 0
GGATCTTTTATTTTGGCCAATATGCTATAAGGTAGATAATAATTAAGCCTCTTTTTTCGG
CGGCCGCCATCTTCTATGCGCGGTCGCCGGACTCTTCTCCGGTTTAATTTCTTCTCTTCT
CTTTCTTCTAGTTCCTTATGTCATATGTTTCATCTTCTACTCCGTTACGGTGGCTTTTGT
GCGAAGTTCGTCGTGGTCAATCCGGTGGCAGTAGAATGGTTATGTTGGTTTTAATAGTGG
TTCTTGGTGGCGTTTGTTACAAGAGTAGTGGCTCGTTTGTTATTGATGTTTCCTCTCACC
TTCTATTCGTCCAGCGTAGTTGTCCCATGTGCTTCATGCTGTCTTTTCTGCGCAGGTCTG
TTTCTTACCGATTTTATTCTCGGTTTTATCAAAGAGATTAGACCTTGCTTCGTGTTTCAT
GTCCTCTGCCATATTATGAAGCCATGAGTCTTTGTTATGGAGAGGTCTCTCATCAGTTTG
AGAGAAGATATGCATATTGTTTCTTGTCGTGAGAATCAGCTATGTATCAAACAAGGATCT
TACTTGGTTGGTTCTGTTACCTGAGAGAGATTGAAAGGCAATTCCATTGGT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2DJ84JQ 226 0 0
TCTTTGTTATGGGGAGGTCTCTCATCAGTTTGAGAGAAGATATGCATATTGTTTCTTGTC
GTGAGAATCAGCTATGTATCAAACAAGGATCTTACTTGGTTGGTTCTGTTACCTGAGAGA
GATTGAAAGGCAATTCCATTGGTTTTTGTTTTATCTGATTCTTCTTCACAGTTTCACGAT
GCATTTACTATTAATACCCACATGTGTATGGGGTTAATTCACGGTG

QA 1 226 1 226
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6512Contig1 739 2 4 U
GGAAATCATCCAAAACTTTAAAATTCTTAACGTCAGAAACGAAAAAGATGAAAATCTTTA
ACCCATCCCAAAACCTAATCTTAGCCACAACCATTTTCCTACTGTCTATTGTTCCCCTAA
GAGCCCAAGACACGCGACAAGACTTCTTGGATGCTCATAACCAAGCCCGAGCCGAGGTTG
GGGTGGGTCCTTTAAGGTGGGACAACCAGGTGGCTGCTTATGCCCGTAACCATGCGAACC
AGCGTAAAAGCGTCGGCTGTTCCATGAAACACTCGAGTGGTGGGACCTATGGAGAGAACA
TCGCTTGGAGCAGCGGTGACATGTCAGGCGTCGAAGCAGTTGACATGTGGGTGAAGGAGC
AAAAAGACTACAATTATGATTTCAACACATGTGCTCCGAACGAAGTGTGCGGCCACTATA
CGCAGGTTGTGTGGAGAAACTCGGTGAAGTTGGGATGTGCAAAAGTAAGATGCAACAATG
GTAACACCTTTATTACTTGCAACTATGATCCTCCCGGTAACTGGAATGGTCAGTGGCCTT
ACTAAGACATCAAAATTAAAACCCTCGTTTGAATATGCTTCGAAATATATGTTATACACA
ACACATGTACTGTTTCTATGTTGTTTATCCATACCAATCTTCTGTTGTCAGCTAATAATG
ATTGGCTTGTCCGGTCCGGTTCTCTTTTGTACCATATATATACCTGGACTTTTATAATAG
AATAATAAAATGCAATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU62TF U 1
AF RR2FU62JQ C 221
BS 1 673 RR2FU62TF
BS 674 674 RR2FU62JQ
BS 675 724 RR2FU62TF
BS 725 739 RR2FU62JQ

RD RR2FU62TF 724 0 0
GGAAATCATCCAAAACTTTAAAATTCTTAACGTCAGAAACGAAAAAGATGAAAATCTTTA
ACCCATCCCAAAACCTAATCTTAGCCACAACCATTTTCCTACTGTCTATTGTTCCCCTAA
GAGCCCAAGACACGCGACAAGACTTCTTGGATGCTCATAACCAAGCCCGAGCCGAGGTTG
GGGTGGGTCCTTTAAGGTGGGACAACCAGGTGGCTGCTTATGCCCGTAACCATGCGAACC
AGCGTAAAAGCGTCGGCTGTTCCATGAAACACTCGAGTGGTGGGACCTATGGAGAGAACA
TCGCTTGGAGCAGCGGTGACATGTCAGGCGTCGAAGCAGTTGACATGTGGGTGAAGGAGC
AAAAAGACTACAATTATGATTTCAACACATGTGCTCCGAACGAAGTGTGCGGCCACTATA
CGCAGGTTGTGTGGAGAAACTCGGTGAAGTTGGGATGTGCAAAAGTAAGATGCAACAATG
GTAACACCTTTATTACTTGCAACTATGATCCTCCCGGTAACTGGAATGGTCAGTGGCCTT
ACTAAGACATCAAAATTAAAACCCTCGTTTGAATATGCTTCGAAATATATGTTATACACA
ACACATGTACTGTTTCTATGTTGTTTATCCATACCAATCTTCTGTTGTCAGCTAATAATG
ATTGGCTTGTCCG*TCCGGTTCTCTTTTGTACCATATATATACCTGGACTTTTATAATAG
AATA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2FU62JQ 519 0 0
TGCCCGTAACCATGCGAACCAGCGTAAAAGCGTCGGCTGTTCCATGAAACACTCGAGTGG
TGGGACCTATGGAGAGAACATCGCTTGGAGCAGCGGTGACATGTCAGGCGTCGAAGCAGT
TGACATGTGGGTGAAGGAGCAAAAAGACTACAATTATGATTTCAACACATGTGCTCCGAA
CGAAGTGTGCGGCCACTATACGCAGGTTGTGTGGAGAAACTCGGTGAAGTTGGGATGTGC
AAAAGTAAGATGCAACAATGGTAACACCTTTATTACTTGCAACTATGATCCTCCCGGTAA
CTGGAATGGTCAGTGGCCTTATTAAGACATCAAAATTAAAACCCTCGTTTGAATATGCTT
CGAAATATATGTTATACACAACACATGTACTGTTTCTATGTTGTTTATCCATACCAATCT
TCTGTTGTCAGCTAATAATGATTGGCTTGTCCGGTCCGGTTTTCTTTTGTACCATATATA
TACCTGGACTTTTATAATAGAATAATAAAATGCAATGCC

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 2

CO CL6513Contig1 885 2 12 U
GGATTCCTTTCTTCCAACAGCTTACCGGAATCAATGTCATTACATTTTATGCACCGGTTC
TGTTTCAGACACTAGGGTTCGGTAGTAAAGCCTCGCTCTTATCGGCTATGGTAACGGGGA
TCATCTAGCTCTTGTGTACCTTTGTCTCTGTTTTCACAGTGGATAGGTTTGGAAGAAGAG
TCTTGTTCCTCCAGGGAGGAATACAGATGCTTATCTCTCAGATCGCTATTGGAGTCATGA
TTGGAGTCAAATTTGGAACGGTTGGGACAGGGAACATAGGGAAAACAGATGCTAATCTGA
TCGTGGCGCTGATCTGCATCTATGTAGCGGGTTTCGCCTGGTCTTGGGGACCGTTGGGAT
GGCTGGTACCCAGTGAGATATCTCCACTAGAGATCCGATCAGCAGCGCAAGCTATAAACG
TAGCGGTCAACATGTTCTTCACATTCCTTGTAGCTCAGCTCTTCCTGACAATGCTCTGTC
ACATGAAGTTTGGATTATTCTTCTTCTTTGCGGTGTTTGTCTTCATAATGACGATATTTA
TCTACTTGATGTTGCCTGAGACGAAGAATGTACCCATTGAAGAGATGAACAGAGTGTGGA
AGGCACACTGGTTCTGGGGAAGGTTTATTCCTGATGAAGCTGTTGGTGTTAGTGCTGCTG
AGATGCAGCAAAAGTCTGTATGATGATGAGTAATGTTGTATTTGAGCAAAAAGACTTGTG
AGAAAATTTAAAAAGAAAATGCCAAAAATATGTTTATTCGTGAAAGAAAGCTGCTCTGCT
TTTTGATGCATAGACTTAGTTTGATATTTTCCTTGTTCAATGTCTCTGCTGCGATCCTAG
TTTGGACTAAAGAAAGCTAAGAAAACAAAAAAGTATTCAAAAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ31TF U 1
AF RR2EQ31JQ C 145
BS 1 711 RR2EQ31TF
BS 712 712 RR2EQ31JQ
BS 713 725 RR2EQ31TF
BS 726 726 RR2EQ31JQ
BS 727 733 RR2EQ31TF
BS 734 736 RR2EQ31JQ
BS 737 764 RR2EQ31TF
BS 765 767 RR2EQ31JQ
BS 768 783 RR2EQ31TF
BS 784 784 RR2EQ31JQ
BS 785 804 RR2EQ31TF
BS 805 885 RR2EQ31JQ

RD RR2EQ31TF 804 0 0
GGATTCCTTTCTTCCAACAGCTTACCGGAATCAATGTCATTACATTTTATGCACCGGTTC
TGTTTCAGACACTAGGGTTCGGTAGTAAAGCCTCGCTCTTATCGGCTATGGTAACGGGGA
TCATCTAGCTCTTGTGTACCTTTGTCTCTGTTTTCACAGTGGATAGGTTTGGAAGAAGAG
TCTTGTTCCTCCAGGGAGGAATACAGATGCTTATCTCTCAGATCGCTATTGGAGTCATGA
TTGGAGTCAAATTTGGAACGGTTGGGACAGGGAACATAGGGAAAACAGATGCTAATCTGA
TCGTGGCGCTGATCTGCATCTATGTAGCGGGTTTCGCCTGGTCTTGGGGACCGTTGGGAT
GGCTGGTACCCAGTGAGATATCTCCACTAGAGATCCGATCAGCAGCGCAAGCTATAAACG
TAGCGGTCAACATGTTCTTCACATTCCTTGTAGCTCAGCTCTTCCTGACAATGCTCTGTC
ACATGAAGTTTGGATTATTCTTCTTCTTTGCGGTGTTTGTCTTCATAATGACGATATTTA
TCTACTTGATGTTGCCTGAGACGAAGAATGTACCCATTGAAGAGATGAACAGAGTGTGGA
AGGCACACTGGTTCTGGGGAAGGTTTATTCCTGATGAAGCTGTTGGTGTTAGTGCTGCTG
AGATGCAGCAAAAGTCTGTATGATGATGAGTAATGTTGTATTTGAGCAAAA*GACTTGTG
AGAAA*TTTAAAAG**AAATGCCAAAAATATGTTTATTCGTGAAG**AAGCTGCTCTGCT
TTT*GATGCATAGACTTAGTTTGA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2EQ31JQ 741 0 0
TCTCTGTTTTCACAGTGGATAGGTTTGGAAGAAGAGTCTTGTTCCTCCAGGGAGGAATAC
AGATGCTTATCTCTCAGATCGCTATTGGAGTCATGATTGGAGTCAAATTTGGAACGGTTG
GGACAGGGAACATAGGGAAAACAGATGCTAATCTGATCGTGGCGCTGATCTGCATCTATG
TAGCGGGTTTCGCCTGGTCTTGGGGACCGTTGGGATGGCTGGTACCCAGTGAGATATCTC
CACTAGAGATCCGATCAGCAGCGCAAGCTATAAACGTAGCGGTCAACATGTTCTTCACAT
TCCTTGTAGCTCAGCTCTTCCTGACAATGCTCTGTCACATGAAGTTTGGATTATTCTTCT
TCTTTGCGGTGTTTGTCTTCATAATGACGATATTTATCTACTTGATGTTGCCTGAGACGA
AGAATGTACCCATTGAAGAGATGAACAGAGTGTGGAAGGCACACTGGTTCTGGGGAAGGT
TTATTCCTGATGAAGCTGTTGGTGTTAGTGCTGCTGAGATGCAGCAAAAGTCTGTATGAT
GATGAGTAATGTTGTATTTGAGCAAAAAGACTTGTGAGAAAATTTAAAAAGAAAATGCCA
AAAATATGTTTATTCGTGAAAGAAAGCTGCTCTGCTTTTTGATGCATAGACTTAGTTTGA
TATTTTCCTTGTTCAATGTCTCTGCTGCGATCCTAGTTTGGACTAAAGAAAGCTAAGAAA
ACAAAAAAGTATTCAAAAGTG

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL6514Contig1 482 2 2 U
GGGGAACCGACCTACCGACAGTTTCTCGATCATAAAGTTTCGATTTTTCTTTCTTTTTTA
ATTAAGCAAAAGCAAAACAATGGCGAAGACTGTGATCTCGATGGACCAGCTGAAAGCTTT
GTGGCACTCTGAGGTTCACGATGAACGAAAGTGGGCTGCTAACATGAAACTTGTGAGAGC
ACTTGGGGTGTTTGCTGGAGGAATCTTGCTCATGCGTAACTTTGGTGATCTCATGGCTGT
CTGAAGAAACCTCATAAACAATGGAGAGAAGCATCTCTTAGTTTTTCACTTTCTCAGTTT
TTTTTTTTGTATTATTTTCAGTGTCTCTACTCTATAGAACTGATGGTTTAGTCTCTGATT
CCACCTATGTGATACGAAAATAAACATTTTGTTTCTTCTTTTCAATGGCTGTGATTCTTA
TGTTAGCCAAGAGTTTATTAACCTTATTATGTCTATGGATAAACAAGATCGGCGTTGATG
CT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2CR34TF U 1
AF RR2CR34JQ C 1
BS 1 470 RR2CR34TF
BS 471 482 RR2CR34JQ

RD RR2CR34TF 470 0 0
GGGGAACCGACCTACCGACAGTTTCTCGATCATAAAGTTTCGATTTTTCTTTCTTTTTTA
ATTAAGCAAAAGCAAAACAATGGCGAAGACTGTGATCTCGATGGACCAGCTGAAAGCTTT
GTGGCACTCTGAGGTTCACGATGAACGAAAGTGGGCTGCTAACATGAAACTTGTGAGAGC
ACTTGGGGTGTTTGCTGGAGGAATCTTGCTCATGCGTAACTTTGGTGATCTCATGGCTGT
CTGAAGAAACCTCATAAACAATGGAGAGAAGCATCTCTTAGTTTTTCACTTTCTCAGTTT
TTTTTTTTGTATTATTTTCAGTGTCTCTACTCTATAGAACTGATGGTTTAGTCTCTGATT
CCACCTATGTGATACGAAAATAAACATTTTGTTTCTTCTTTTCAATGGCTGTGATTCTTA
TGTTAGCCAAGAGTTTATTAACCTTATTATGTCTATGGATAAACAAGATC

QA 1 470 1 470
DS 

RD RR2CR34JQ 482 0 0
GGGGAACCGACCTACCGACTGTTTCTCGATCATAAAGTTTCGATTTTTCTTTCTTTTTTA
ATTAAGCAAAAGCAAAACAATGGCGAAGACTGTGATCTCGATGGACCAGCTGAAAGCTTT
GTGGCACTTTGAGGTTCACGATGAACGAAAGTGGGCTGCTAACATGAAACTTGTGAGAGC
ACTTGGGGTGTTTGCTGGAGGAATCTTGCTCATGCGTAACTTTGGTGATCTCATGGCTGT
CTGAAGAAACCTCATAAACAATGGAGAGAAGCATCTTTTAGTTTTTCACTTTTTCAGTTT
TTTTTTTTGTATTATTTTCAGTGTCTCTACTCTATAGAACTGATGGTTTAGTCTCTGATT
CCACCTATGTGATACGAAAATAAACATTTTGTTTCTTCTTTTCAATGGCTGTGATTCTTA
TGTTAGCCAAGAGTTTATTAACCTTATTATGTCTATGGATAAACAAGATCGGCGTTGATG
CT

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL6515Contig1 1075 2 2 U
GGAGGCATAGAGGAGCTAAAGATGATGAGACAATAGTTAGAGAGGACCGCAATGTGCTGA
GGCGTTCAGAGGGTTCAGCTTTCTCAAGGTATAATCCAGCCTTAAACAACAATAAGATTT
CTGGCGGGAACTTGGGAAGCAATGCTCGTCATGATAATAATTGCCAAGAACTTATAAAAA
GGACTGAAGCGGCATGTGATTGTCACTCAAACATGAACGAGAGTCTCCCTGATAATCATC
ACTCACGCGTCGGTAGCAATAACGTGGAAATGAGTTCCACAACTGTGAACAACGCTTTCA
CAAAGCCTGGAGATCCAAAAGTAAGCCCAGCAGGATCTTCATCAGCAAAGCGTTCATTGT
TTCAGCCTCTACCCTGTGATCATCATCACTCCTCCTATAATCCGGTTCACGTCCCTGAGC
GGAAGTTACCACCACAATATGGATCCTCGAATGTGTACAATGAGACGGTTGAAGGTAACA
ACAACAACAACAACAACAACACAGTGAATTACAGTGTGAATGGAAGTGGATCAGGTAGTG
GTCATGGAAGCAATGACCCGTATGGAAGCAGTAATGGCATGAATGCTGGAGGAGTGAACA
TGGGAAGTGAAAATGGTGCTGGCAAAAGCGGAAGCGGAAGCGGCGATGGTAGTGGAAGTG
GAAGTGGAAGTGGAAGTGGGAATGTAGCAGATGAGAATAAGATCTCTCAAAGAGAAGCAG
CTTTGACAAAGTTCCGCCAGAAGAGAAAGGAGAGGTGCTTCAGAAAGAAGGTAAGATACC
AAAGCAGGAAAAAACTAGCGGAACAACGACCTCGTGTCCGTGGCCAGTTCGTCCGTAAAA
CAGCTGCTGCAACGGATGATAACGACATAAAAACACCGAGGGATAGCTAACGGGAAATTT
GCTAATGTCAGCAGGAAGAAAGAAAAAAACTTTGTGGTTTGTGGATTCAGGACACAAAGG
ATTTGGTTCATGAGTTGGAGGGTGTGGTTGTAGATGTTGTAAACTTTTGTAAAACAATAA
CCCACTGTTTGTATAAGCTATTGGTTTTGGATCATATATATTGTAGTTTACTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A339TF U 1
AF RR2A339JQ C 296
BS 1 760 RR2A339TF
BS 761 1075 RR2A339JQ

RD RR2A339TF 760 0 0
GGAGGCATAGAGGAGCTAAAGATGATGAGACAATAGTTAGAGAGGACCGCAATGTGCTGA
GGCGTTCAGAGGGTTCAGCTTTCTCAAGGTATAATCCAGCCTTAAACAACAATAAGATTT
CTGGCGGGAACTTGGGAAGCAATGCTCGTCATGATAATAATTGCCAAGAACTTATAAAAA
GGACTGAAGCGGCATGTGATTGTCACTCAAACATGAACGAGAGTCTCCCTGATAATCATC
ACTCACGCGTCGGTAGCAATAACGTGGAAATGAGTTCCACAACTGTGAACAACGCTTTCA
CAAAGCCTGGAGATCCAAAAGTAAGCCCAGCAGGATCTTCATCAGCAAAGCGTTCATTGT
TTCAGCCTCTACCCTGTGATCATCATCACTCCTCCTATAATCCGGTTCACGTCCCTGAGC
GGAAGTTACCACCACAATATGGATCCTCGAATGTGTACAATGAGACGGTTGAAGGTAACA
ACAACAACAACAACAACAACACAGTGAATTACAGTGTGAATGGAAGTGGATCAGGTAGTG
GTCATGGAAGCAATGACCCGTATGGAAGCAGTAATGGCATGAATGCTGGAGGAGTGAACA
TGGGAAGTGAAAATGGTGCTGGCAAAAGCGGAAGCGGAAGCGGCGATGGTAGTGGAAGTG
GAAGTGGAAGTGGAAGTGGGAATGTAGCAGATGAGAATAAGATCTCTCAAAGAGAAGCAG
CTTTGACAAAGTTCCGCCAGAAGAGAAAGGAGAGGTGCTT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2A339JQ 780 0 0
TTTCACAAAGCCTGGAGATCCAAAAGTAAGCCCAGCAGGATCTTCATCAGCAAAGCGTTC
ATTGTTTCAGCCTCTACCCTGTGATCATCATCACTCCTCCTATAATCCGGTTCACGTCCC
TGAGCGGAAGTTACCACCACAATATGGATCCTCGAATGTGTACAATGAGACGGTTGAAGG
TAACAACAACAACAACAACAACAACACAGTGAATTACAGTGTGAATGGAAGTGGATCAGG
TAGTGGTCATGGAAGCAATGACCCGTATGGAAGCAGTAATGGCATGAATGCTGGAGGAGT
GAACATGGGAAGTGAAAATGGTGCTGGCAAAAGCGGAAGCGGAAGCGGCGATGGTAGTGG
AAGTGGAAGTGGAAGTGGAAGTGGGAATGTAGCAGATGAGAATAAGATCTCTCAAAGAGA
AGCAGCTTTGACAAAGTTCCGCCAGAAGAGAAAGGAGAGGTGCTTCAGAAAGAAGGTAAG
ATACCAAAGCAGGAAAAAACTAGCGGAACAACGACCTCGTGTCCGTGGCCAGTTCGTCCG
TAAAACAGCTGCTGCAACGGATGATAACGACATAAAAACACCGAGGGATAGCTAACGGGA
AATTTGCTAATGTCAGCAGGAAGAAAGAAAAAAACTTTGTGGTTTGTGGATTCAGGACAC
AAAGGATTTGGTTCATGAGTTGGAGGGTGTGGTTGTAGATGTTGTAAACTTTTGTAAAAC
AATAACCCACTGTTTGTATAAGCTATTGGTTTTGGATCATATATATTGTAGTTTACTTAT

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL6516Contig1 856 2 2 U
AGTTGATACGCCGTCGTATTAACCTCTCCGTCGAGATTACTCCGGTCCATTACTCCGTCG
CCGCCGAGATCAATACAGATCGATACAGAGAGAGATGGCGATGTCTCAGGTGGTGAACAC
GTACCCTCTTTCGAACTACAGCTTCGGAACTAAAGAACCGAAGCTGGAGAGGGACACCTC
CGTCGCCGACCGACTCGCTCGTATGAAAGTCAACTATATGAAAGAGGGCATGAGGACTAG
CGTTGAAGGGATACTTCTGGTACAAGAACACAACCATCTCATATACTTCTCCTGCAAATT
GGTAACACATTCTGCAAACTTCCAGGTGGACGCCTGAAACCTGGAGAAAACGAAGTCGAA
GGACTGAAGAGAAAGTTGACCAGTAAGCTTGGAGGCAATTCGGCTGGTTTTGTACCTGAC
TGGAAGGTAGGAGAATGTGTTGCGACATGGTGGCGTCCAAACTTTGAAACCATGATGTAC
CCGTATTGCCCTCCACACATCCCCAAACCAAAGGAATGCAAGAGACTCTACATTGTTCAC
TTGTCTGAGAAAGAGTACTTTGCAGTCCCCAAAAACTCGAAACTCTTGGCCGTTCCTTTG
TTTGAACTCTATGACAACGTTCAGAGATATGGACCAGTTATATCGACCATTCCCCAACAG
CTCTCCAGATTCCATTTCAACATGATTAGTTTGTGATTCTACTCACTGTTCAAGAACAAA
ACCTATCAGATGATCAAGGTCAATTAGGCACGGTAGAGAGTTTAGAGAACCGAGTTCTGG
ATGATGCGTGTGGGTTTGTTACATTAGACTTGTTGGGATTATGAGGAACCGTTTCATTCA
TGTTTCAGGACAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW16TF U 1
AF RR2CW16JQ C 71
BS 1 664 RR2CW16TF
BS 665 856 RR2CW16JQ

RD RR2CW16TF 664 0 0
AGTTGATACGCCGTCGTATTAACCTCTCCGTCGAGATTACTCCGGTCCATTACTCCGTCG
CCGCCGAGATCAATACAGATCGATACAGAGAGAGATGGCGATGTCTCAGGTGGTGAACAC
GTACCCTCTTTCGAACTACAGCTTCGGAACTAAAGAACCGAAGCTGGAGAGGGACACCTC
CGTCGCCGACCGACTCGCTCGTATGAAAGTCAACTATATGAAAGAGGGCATGAGGACTAG
CGTTGAAGGGATACTTCTGGTACAAGAACACAACCATCTCATATACTTCTCCTGCAAATT
GGTAACACATTCTGCAAACTTCCAGGTGGACGCCTGAAACCTGGAGAAAACGAAGTCGAA
GGACTGAAGAGAAAGTTGACCAGTAAGCTTGGAGGCAATTCGGCTGGTTTTGTACCTGAC
TGGAAGGTAGGAGAATGTGTTGCGACATGGTGGCGTCCAAACTTTGAAACCATGATGTAC
CCGTATTGCCCTCCACACATCCCCAAACCAAAGGAATGCAAGAGACTCTACATTGTTCAC
TTGTCTGAGAAAGAGTACTTTGCAGTCCCCAAAAACTCGAAACTCTTGGCCGTTCCTTTG
TTTGAACTCTATGACAACGTTCAGAGATATGGACCAGTTATATCGACCATTCCCCAACAG
CTCT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2CW16JQ 786 0 0
TC
ATACAGATCGATACAGAGAGAGATGGCGATGTCTCAGGTGGTGAACACGTACCCTCTTTC
GAACTACAGCTTCGGAACTAAAGAACCGAAGCTGGAGAGGGACAC*TCCGTCGCCGACCG
ACTCGCTCGTATGAAAGTCAACTATATGAAAGAGGGCATGAGGACTAGCGTTGAAGGGAT
ACTTCTGGTACAAGAACACAACCATCTCATATACTTCTCCTGCAAATTGGTAACACATTC
TGCAAACTTCCAGGTGGACGCCTGAAACCTGGAGAAAACGAAGTCGAAGGACTGAAGAGA
AAGTTGACCAGTAAGCTTGGAGGCAATTCGGCTGGTTTTGTACCTGACTGGAAGGTAGGA
GAATGTGTTGCGACATGGTGGCGTCCAAACTTTGAAACCATGATGTACCCGTATTGCCCT
CCACACATCCCCAAACCAAAGGAATGCAAGAGACTCTACATTGTTCACTTGTTTGAGAAA
GAGTACTTTGCAGTCCCCAAAAACTCGAAACTCTTGGCCGTTCCTTTGTTTGAACTCTAT
GACAACGTTCAGAGATATGGACCAGTTATATCGACCATTCCCCAACAGCTCTCCAGATTC
CATTTCAACATGATTAGTTTGTGATTCTACTCACTGTTCAAGAACAAAACCTATCAGATG
ATCAAGGTCAATTAGGCACGGTAGAGAGTTTAGAGAACCGAGTTCTGGATGATGCGTGTG
GGTTTGTTACATTAGACTTGTTGGGATTATGAGGAACCGTTTCATTCATGTTTCAGGACA
AAAA

QA 3 786 3 786
DS 



AS 1 2

CO CL6517Contig1 593 2 1 U
GGACCCTAGCTTGTTTATCAAGCATCCTAGTTCTAGCTAGCTCAAGGATCTCTCATCCTT
TTACTGTTAAATTATCCAATTAGGCATGAAGAGATTATTCTCTCCAGTAGTGTTGGTGTC
TCTCTTCTTATCACTCTCATCAGCTATATGTTCAGCCACGGTTGAAAACGCGGCGGACTG
TGTAGCCGTCGGAACGCTGATATCCTCGTGCACCGAGTTTGTTAATTACGGCTACCCGGA
TCCTGTACCCGGTTCAAGCTGCTGCGACGCGATGACAGTCCTCGGAACTTACTCTGATTC
TTCTGACAAGAGACGCTGGCTCTGTAACTGCTTCATTGATCTCATCAATGTCTATACCTC
AAACGCCACCGCCATCTCCACCTTGTCTGGCTTCTGCGGCATCGTTTTGGGCTTCACCAT
CGACCCTAACACCGACTGCAACTTCATTGAGTGAAGAAGGCAAGGGACAAGACTTTGGTT
GTGGATCAAACTGACAGATTGTTTATGAGTGTCTTTAAATCTAAACAAAGATGTATTTAA
ACTCATAGTTCTTGTCTTGTTTAAAAACAGTAACATCGATTAGTTTAGAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E347TF U 1
AF RR2E347JQ C 264
BS 1 593 RR2E347TF

RD RR2E347TF 593 0 0
GGACCCTAGCTTGTTTATCAAGCATCCTAGTTCTAGCTAGCTCAAGGATCTCTCATCCTT
TTACTGTTAAATTATCCAATTAGGCATGAAGAGATTATTCTCTCCAGTAGTGTTGGTGTC
TCTCTTCTTATCACTCTCATCAGCTATATGTTCAGCCACGGTTGAAAACGCGGCGGACTG
TGTAGCCGTCGGAACGCTGATATCCTCGTGCACCGAGTTTGTTAATTACGGCTACCCGGA
TCCTGTACCCGGTTCAAGCTGCTGCGACGCGATGACAGTCCTCGGAACTTACTCTGATTC
TTCTGACAAGAGACGCTGGCTCTGTAACTGCTTCATTGATCTCATCAATGTCTATACCTC
AAACGCCACCGCCATCTCCACCTTGTCTGGCTTCTGCGGCATCGTTTTGGGCTTCACCAT
CGACCCTAACACCGACTGCAACTTCATTGAGTGAAGAAGGCAAGGGACAAGACTTTGGTT
GTGGATCAAACTGACAGATTGTTTATGAGTGTCTTTAAATCTAAACAAAGATGTATTTAA
ACTCATAGTTCTTGTCTTGTTTAAAAACAGTAACATCGATTAGTTTAGAGTTT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2E347JQ 330 0 0
GCGACGCGATGACAGTCCTCGGAACTTACTCTGATTCTTCTGACAAGAGACGCTGGCTCT
GTAACTGCTTCATTGATCTCATCAATGTCTATACCTCAAACGCCACCGCCATCTCCACCT
TGTCTGGCTTCTGCGGCATCGTTTTGGGCTTCACCATCGACCCTAACACCGACTGCAACT
TCATTGAGTGAAGAAGGCAAGGGACAAGACTTTGGTTGTGGATCAAACTGACAGATTGTT
TATGAGTGTCTTTAAATCTAAACAAAGATGTATTTAAACTCATAGTTCTTGTCTTGTTTA
AAAACAGTAACATCGATTAGTTTAGAGTTT

QA 1 330 1 330
DS 



AS 1 2

CO CL6518Contig1 732 2 8 U
GGATGTTCTTCTTCTTCTTATCCAGAGAACAAAACAGAGAAACCCACAGAGAAAGAGAGA
ACTCACAATGCCTGCGATGAGCACGAGGGCGAAATCTACAGTACCCGTAGTCACGAACCC
TCCTGATCCAACCTCAAACGTATCGATCTACGAGAAATGCAGACAAGAGAGGATCAAGGA
GAATCTCCAGCGTATGCAGAATCTCGGCATCATGGATCTCTCCCTCAAGCTCAAATCCGG
GACCCGACCCGCTAAAAGGCGCTACACCAAAGCTGCTGATTCGAATCCAGATCTTAGATC
CTCCGCTCGAAACACCCCTCCTCCTCCTCTTCAGCTCTCCGTCTCCACCAGACGATCCTC
AAGGTTGAAGAATGTATCGCCAGTTACCTACTTCGAGGAAGCGGAAAAGAAGAAGGGTAA
AGCATCTAAAGAGGTGGTTCTGTGGATCGGAGAAGGAGGGGAAAGGCCTGAGATTTACAC
TGATGAGCATGAGAAGCTGCTAGGTAACACAGAGCGGACATGGGAGCTTTTTGTCGATGG
TTACGCCCCTGATGGGAAACGGATTTATGATCCTGTTAGAGGAAAGACTTGCCACCAATG
CAGGCAGAAGACGCTTGGTTATCGTACACAATGCAGCAAGTGTCACCCATCGGTCACAGG
TCAATTCTGTGGAGATTGTTTGTACATGAGTATGGAGAACATGTGCTTGAGACTCTGGAG
AATCCGGAGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY37TF U 1
AF RR2CY95TF U 55
BS 1 651 RR2FY37TF
BS 652 652 RR2CY95TF
BS 653 659 RR2FY37TF
BS 660 660 RR2CY95TF
BS 661 693 RR2FY37TF
BS 694 694 RR2CY95TF
BS 695 721 RR2FY37TF
BS 722 732 RR2CY95TF

RD RR2FY37TF 721 0 0
GGATGTTCTTCTTCTTCTTATCCAGAGAACAAAACAGAGAAACCCACAGAGAAAGAGAGA
ACTCACAATGCCTGCGATGAGCACGAGGGCGAAATCTACAGTACCCGTAGTCACGAACCC
TCCTGATCCAACCTCAAACGTATCGATCTACGAGAAATGCAGACAAGAGAGGATCAAGGA
GAATCTCCAGCGTATGCAGAATCTCGGCATCATGGATCTCTCCCTCAAGCTCAAATCCGG
GACCCGACCCGCTAAAAGGCGCTACACCAAAGCTGCTGATTCGAATCCAGATCTTAGATC
CTCCGCTCGAAACACCCCTCCTCCTCCTCTTCAGCTCTCCGTCTCCACCAGACGATCCTC
AAGGTTGAAGAATGTATCGCCAGTTACCTACTTCGAGGAAGCGGAAAAGAAGAAGGGTAA
AGCATCTAAAGAGGTGGTTCTGTGGATCGGAGAAGGAGGGGAAAGGCCTGAGATTTACAC
TGATGAGCATGAGAAGCTGCTAGGTAACACAGAGCGGACATGGGAGCTTTTTGTCGATGG
TTACGCCCCTGATGGGAAACGGATTTATGATCCTGTTAGAGGAAAGACTTGCCACCAATG
CAGGCAGAAGACGCTTGGTTATCGTACACAATGCAGCAAGTGTCACCCATCTGTCACAG*
TCAATTCTGTGGAGATTGTTTGTACATGAGTATTGAGAACATGTGCTTGAGACTCTGGAG
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2CY95TF 678 0 0
GG
GAGAACTCACAATGCCTGCGATGAGCACGAGGGCGAAATCTACAGTACCCGTAGTCACGA
ACCCTCCTGATCCAACCTCAAACGTATCGATCTACGAGAAATGCAGACAAGAGAGGATCA
AGGAGAATCTCCAGCGTATGCAGAATCTCGGCATCATGGATCTCTCCCTCAAGCTCAAAT
CCGGGACCCGACCCGCTAAAAGGCGCTACACCAAAGCTGCTGATTCGAATCCAGATCTTA
GATCCTCCGCTCGAAACACCCCTCCTCCTCCTCTTCAGCTCTCCGTCTCCACCAGACGAT
CCTCAAGGTTGAAGAATGTATCGCCAGTTACCTACTTCGAGGAAGCGGAAAAGAAGAAGG
GTAAAGCATCTAAAGAGGTGGTTCTGTGGATCGGAGAAGGAGGGGAAAGGCCTGAGATTT
ACACTGATGAGCATGAGAAGCTGCTAGGTAACACAGAGCGGACATGGGAGCTTTTTGTCG
ATGGTTACGCCCCTGATGGGAAACGGATTTATGATCCTGTTAGAGGAAAGACTTGCCACC
AATGCAGGCAGAAGACGCTTGGTTATCGTACACAATGCAGCAAGTGTCACCCATCGGTCA
CAGGTCAATTCTGTGGAGATTGTTTGTACATGAGTATGGAGAACATGTGCTTGAGACTCT
GGAGAATCCGGAGTGG

QA 3 678 3 678
DS 



AS 1 2

CO CL6519Contig1 1042 2 2 U
TCATATGTAGATGTGCTGGTTAGAGCACTTCTGGTTCGATGGAAGAAGAAGAAGCAAATT
TTGAAGGTTTTGGTAACAAGATTGTCCAAATGGCTGAGACCGAGGCACAACAACTTGCAT
TACTTGCAAACGCATCACTGCTAGCTGATGAACTACTCCCTCGTGCTGCCATGAAACTCG
CTCCTCTTGATCAGACAAGTCAAAGGACAGACGACCTAAGGAGACCTTCAGACAGACAAA
ATCGTAATCCTGAACAGCGAGAATGGAAGCGGCGTTTACTTAGTACTGTTGACAAGTTAA
AAGATGCGTTTTGTCGCCAGCATGCCCTGGATCTCATATTTACCGAGGAAGGAGATAGCC
ATTTGTCCGCGGATATGTACATAAACATGGATGGAAATGGCGAAGAGGTGGACTGGTTCC
CATCTCTGATATTCCAGGAACTTTATGCGAAACTTAATAGGATGGCAAGTCTAGCAGCAG
ATATGTTTGAAGGAAGAGAAAGATTCGCCACTTCTTTGTTGATGCGATTAACAGAGACAG
TGATCTTATGGCTTTCCGGAGACCAGAGCTTCTGGGGATGACATTGAGGAAGGACCTAGA
CCTTTGGGGCCTCTTGGCCTCCGGCAGCTGTATTTGGACATGAGGTTTGTCATATGCTTT
GCATCCCAAGGTCGCTACCTATCGAGGAATTTGAACAGGGGAACTAATGAGATAATAACT
AAAGCCGTGGCAGCTTTCAGTGCAACAGGACTAGATCCATATAGTGAGCTGCCAGAAGAC
GACTGGTTCAACGAGATATGTCTGGATGGAATGGAAAGATTGAGTGGTAAAACAAAAGGC
AACAATGGGGAAGTCCACAGTCCGACTGCTTCATTGTCGGCTCAGTCTGTCTCATCAGCG
AGATCTCATGGCAGCTATTAAACCAATTGCATCTTTCACTTGTAAAGAAGGTGAGTGGTA
ATGACTTTTGATCTTCTCTTCTCAACTCTGCTTTACTTTTGTAGACTCGCAAATTATATG
ATGGGATGATTCTGGGATTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH42TF U 1
AF RR2EH42JQ C 256
BS 1 728 RR2EH42TF
BS 729 1042 RR2EH42JQ

RD RR2EH42TF 728 0 0
TCATATGTAGATGTGCTGGTTAGAGCACTTCTGGTTCGATGGAAGAAGAAGAAGCAAATT
TTGAAGGTTTTGGTAACAAGATTGTCCAAATGGCTGAGACCGAGGCACAACAACTTGCAT
TACTTGCAAACGCATCACTGCTAGCTGATGAACTACTCCCTCGTGCTGCCATGAAACTCG
CTCCTCTTGATCAGACAAGTCAAAGGACAGACGACCTAAGGAGACCTTCAGACAGACAAA
ATCGTAATCCTGAACAGCGAGAATGGAAGCGGCGTTTACTTAGTACTGTTGACAAGTTAA
AAGATGCGTTTTGTCGCCAGCATGCCCTGGATCTCATATTTACCGAGGAAGGAGATAGCC
ATTTGTCCGCGGATATGTACATAAACATGGATGGAAATGGCGAAGAGGTGGACTGGTTCC
CATCTCTGATATTCCAGGAACTTTATGCGAAACTTAATAGGATGGCAAGTCTAGCAGCAG
ATATGTTTGAAGGAAGAGAAAGATTCGCCACTTCTTTGTTGATGCGATTAACAGAGACAG
TGATCTTATGGCTTTCCGGAGACCAGAGCTTCTGGGGATGACATTGAGGAAGGACCTAGA
CCTTTGGGGCCTCTTGGCCTCCGGCAGCTGTATTTGGACATGAGGTTTGTCATATGCTTT
GCATCCCAAGGTCGCTACCTATCGAGGAATTTGAACAGGGGAACTAATGAGATAATAACT
AAAGCCGT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2EH42JQ 787 0 0
AGCGAGAATGGAAGCGGCGTTTACTTAGTACTGTTGACAAGTTAAAAGATGCGTTTTGTC
GCCAGCATGCCCTGGATCTCATATTTACCGAGGAAGGAGATAGCCATTTGTCCGCGGATA
TGTACATAAACATGGATGGAAATGGCGAAGAGGTGGACTGGTTCCCATCTCTGATATTCC
AGGAACTTTATGCGAAACTTAATAGGATGGCAAGTCTAGCAGCAGATATGTTTGAAGGAA
GAGAAAGATTCGCCACTTCTTTGTTGATGCGATTAACAGAGACAGTGATCTTATGGCTTT
CCGGAGACCAGAGCTTTTGGG*ATGACATTGAGGAAGGACCTAGACCTTTGGGGCCTCTT
GGCCTCCGGCAGCTGTATTTGGACATGAGGTTTGTCATATGCTTTGCATCCCAAGGTCGC
TACCTATCGAGGAATTTGAACAGGGGAACTAATGAGATAATAACTAAAGCCGTGGCAGCT
TTCAGTGCAACAGGACTAGATCCATATAGTGAGCTGCCAGAAGACGACTGGTTCAACGAG
ATATGTCTGGATGGAATGGAAAGATTGAGTGGTAAAACAAAAGGCAACAATGGGGAAGTC
CACAGTCCGACTGCTTCATTGTCGGCTCAGTCTGTCTCATCAGCGAGATCTCATGGCAGC
TATTAAACCAATTGCATCTTTCACTTGTAAAGAAGGTGAGTGGTAATGACTTTTGATCTT
CTCTTCTCAACTCTGCTTTACTTTTGTAGACTCGCAAATTATATGATGGGATGATTCTGG
GATTTGT

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL6520Contig1 745 2 6 U
GGATCTCCAAACTAGTTTTCTCACTGAGCCAAAAGTGTGAAGAAAATGTCGTCGTCGTCG
ACTCATCATCAGCTAGCTTCCTCGATAATCTCTTCTTCCTCCTCCACGTTCTTAGCTCCT
TCGCTTTTCAACCGCAGAACTCGAAATGCTTGCTTACCAATGGCAAAACGGGTCAATACG
TGCAAATGCGTTGCTACCCCGCAAGAAAAGATCGAATATAAGACAAATGTGTCACGGAAT
CCAAACATGTCAAAACTTCAGGCTGGCTACTTATTCCCTGAGATTGCAAGAAGAAGGTCT
GCACATTTGCTGAAACACCCAGATGCACAAATTATAAGTCTTGGAATAGGGGACACGACC
GAGCCTATTCCAGAAGTGATCACTTCTGCTATGGCAAAGAAAGCTCATGAGTTGTCCACA
ATAGAGGGATACAGCGGTTATGGTGCTGAACAAGGTGCAAAGCCACTGAGAGCTGCTCTT
GCGAAAACATACTACAGTGGCCTTGGCATAGGTGAAGACGACATTTTTGTATCTGATGGT
GCCAAATGTGATATCTCACGTCTTCAGGTTATGTTTGGTTCCAACGTTACAATTGCTGTT
CAGGATCCTTCATATCCGGCTTATGTCGACTCCAGTGTCATTATGGGTCAGACCGGACAG
TTTAACACAGATGTGCAGAAGTATGGAAACATACAGTACATGAGATGCACTCCAGAGAAT
GGCTTCTTCCAGACCTATCCACTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C489TF U 1
AF RR2D186TF U 1
BS 1 603 RR2C489TF
BS 604 604 RR2D186TF
BS 605 633 RR2C489TF
BS 634 634 RR2D186TF
BS 635 642 RR2C489TF
BS 643 745 RR2D186TF

RD RR2C489TF 642 0 0
GGATCTCCAAACTAGTTTTCTCACTGAGCCAAAAGTGTGAAGAAAATGTCGTCGTCGTCG
ACTCATCATCAGCTAGCTTCCTCGATAATCTCTTCTTCCTCCTCCACGTTCTTAGCTCCT
TCGCTTTTCAACCGCAGAACTCGAAATGCTTGCTTACCAATGGCAAAACGGGTCAATACG
TGCAAATGCGTTGCTACCCCGCAAGAAAAGATCGAATATAAGACAAATGTGTCACGGAAT
CCAAACATGTCAAAACTTCAGGCTGGCTACTTATTCCCTGAGATTGCAAGAAGAAGGTCT
GCACATTTGCTGAAACACCCAGATGCACAAATTATAAGTCTTGGAATAGGGGACACGACC
GAGCCTATTCCAGAAGTGATCACTTCTGCTATGGCAAAGAAAGCTCATGAGTTGTCCACA
ATAGAGGGATACAGCGGTTATGGTGCTGAACAAGGTGCAAAGCCACTGAGAGCTGCTCTT
GCGAAAACATACTACAGTGGCCTTGGCATAGGTGAAGACGACATTTTTGTATCTGATGGT
GCCAAATGTGATATCTCACGTCTTCAGGTTATGTTTGGTTCCAACGTTACAATTGCTGTT
CAG*ATCCTTCATATCCGGCTTATGTCGACTCCCGTGTCATT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2D186TF 745 0 0
GGATCTCCAAACTAGTTTTCTCACTGAGCCAAAAGTGTGAAGAAAATGTCGTCGTCGTCG
ACTCATCATCAGCTAGCTTCCTCGATAATCTCTTCTTCCTCCTCCACGTTCTTAGCTCCT
TCGCTTTTCAACCGCAGAACTCGAAATGCTTGCTTACCAATGGCAAAACGGGTCAATACG
TGCAAATGCGTTGCTACCCCGCAAGAAAAGATCGAATATAAGACAAATGTGTCACGGAAT
CCAAACATGTCAAAACTTCAGGCTGGCTACTTATTCCCTGAGATTGCAAGAAGAAGGTCT
GCACATTTGCTGAAACACCCAGATGCACAAATTATAAGTCTTGGAATAGGGGACACGACC
GAGCCTATTCCAGAAGTGATCACTTCTGCTATGGCAAAGAAAGCTCATGAGTTGTCCACA
ATAGAGGGATACAGCGGTTATGGTGCTGAACAAGGTGCAAAGCCGCTGAGAGCTGCTCTT
GCGAAAACATACTACAGTGGCCTTGGCATAGGTGAAGACGACATTTTTGTATCTGATGGT
GCCAAATGTGATATCTCACGTCTTCAGGTTATGTTTGGTTCCAACGTTACAATTGCTGTT
CAGGATCCTTCATATCCGGCTTATGTCGACTCCAGTGTCATTATGGGTCAGACCGGACAG
TTTAACACAGATGTGCAGAAGTATGGAAACATACAGTACATGAGATGCACTCCAGAGAAT
GGCTTCTTCCAGACCTATCCACTGT

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL6521Contig1 1187 2 2 U
GGACATCATACATTTAACAGATTCTCATTATGATCCTAAGTGTTTAACGTTCCTCGCTTG
CATTCGGTTTCTTTGAGAAAGAGAGAGGGAGAGTCTTTTGTTAATATTTTCTTTACAGTA
CCATTTCACTACTTCGAGAGAGATTAAGAAATAAAATGGCAGTTTCAGTAGCCGTCTTGC
GTACGGTCTTTGGCATTCTAGGGAATATCATCTCCTTTTTCGTGTGTCTTGCCCCTATAC
CGACGTTCGTGCGGATTTACAAGAGGAAGTCTTCAGAAGGCTATCAGTCTATCCCTTACG
TGATCGCATTGTTCAGTGCGATGCTATGGATATACTACGCAATGATCAAGAAGAATGTAA
TGGTTATGATCACTATCAACACCGTTTCCTTGGTCATACAAATCTTCTACATCTCCTTCT
ACCTCTTCTATGCTCCTAAAAAAGGAAAAGACTCTAACGGTGAAATTCGTCCTCTTTGTG
GATGTTTTTGCCTTCGGCCTTATCTTCTTCCTGACATACTTTCTGCTTCATGGAGAGAAA
CGGGTTCAAGTCCTCGGATATGTTTGTATGGTCTTCTCTCTATGTGTTTTTGTCGCCCCC
CTTGGCATCATTAGGAAAGTGATTAAAACCAGGAGTGCAGAGTTCATGCCATTCAGTCTA
TCCTTCTTCCTCACCTTATCGGCTGTCATGTGGTTCTTTTACGGTCTTCTCAGTAAAGAC
ATGAACATAGCTCTTCCAAATGTTTTGGGTTTCATTTTCGGAGTGCTTCAGATGATACTT
TACTTAATATACAAGAAACCTGGAACTAAGGTTTTGGAACCACCTGTGATTAACCTCCAG
GAAATATCTGACCATGTTGTTGATGTCGTGAGGCTTAGTTCGATGGTTTGTTCGTCGCAA
ATGAGAACTTTGGTGCCACAGGACAGTGCCGATATGGAAGACACCATAACCATTGATGAG
AAGATCAAAGGAGACATTGAGAAAATGAAGGAGAGCAAAGAAATGTTTTTTATATCCAAG
AATTGATCAGCTCTTAACTATCAACTGTCGAATTGTGTGTTTTAGTTTCTTGCGTGTTAA
ATTAATTTGAATCTCTCGCCCCTGTGTGACCTCTCTCTCTCTTTCTCTCATCTTGAATGT
AAAATAAGTTTGTATCAACTATTAAGTTAAATAAATGAATATGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU40TF U 1
AF RR2FU40JQ C 449
BS 1 700 RR2FU40TF
BS 701 1187 RR2FU40JQ

RD RR2FU40TF 700 0 0
GGACATCATACATTTAACAGATTCTCATTATGATCCTAAGTGTTTAACGTTCCTCGCTTG
CATTCGGTTTCTTTGAGAAAGAGAGAGGGAGAGTCTTTTGTTAATATTTTCTTTACAGTA
CCATTTCACTACTTCGAGAGAGATTAAGAAATAAAATGGCAGTTTCAGTAGCCGTCTTGC
GTACGGTCTTTGGCATTCTAGGGAATATCATCTCCTTTTTCGTGTGTCTTGCCCCTATAC
CGACGTTCGTGCGGATTTACAAGAGGAAGTCTTCAGAAGGCTATCAGTCTATCCCTTACG
TGATCGCATTGTTCAGTGCGATGCTATGGATATACTACGCAATGATCAAGAAGAATGTAA
TGGTTATGATCACTATCAACACCGTTTCCTTGGTCATACAAATCTTCTACATCTCCTTCT
ACCTCTTCTATGCTCCTAAAAAAGGAAAAGACTCTAACGGTGAAATTCGTCCTCTTTGTG
GATGTTTTTGCCTTCGGCCTTATCTTCTTCCTGACATACTTTCTGCTTCATGGAGAGAAA
CGGGTTCAAGTCCTCGGATATGTTTGTATGGTCTTCTCTCTATGTGTTTTTGTCGCCCCC
CTTGGCATCATTAGGAAAGTGATTAAAACCAGGAGTGCAGAGTTCATGCCATTCAGTCTA
TCCTTCTTCCTCACCTTATCGGCTGTCATGTGGTTCTTTT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2FU40JQ 739 0 0
AGACTCTAACGGTGAAATTCGTCCTCTTTGTGGATGTTTTTGCCTTCGGCCTTATCTTCT
TCCTGACATACTTTCTGCTTCATGGAGAGAAACGGGTTCAAGTCCTCGGATATGTTTGTA
TGGTCTTCTCTCTATGTGTTTTTGTCGCCCCCCTTGGCATCATTAGGAAAGTGATTAAAA
CCAGGAGTGCAGAGTTCATGCCATTCAGTCTATCCTTCTTCCTCACCTTATCGGCTGTCA
TGTGGTTCTTTTACGGTCTTCTCAGTAAAGACATGAACATAGCTCTTCCAAATGTTTTGG
GTTTCATTTTCGGAGTGCTTCAGATGATACTTTACTTAATATACAAGAAACCTGGAACTA
AGGTTTTGGAACCACCTGTGATTAACCTCCAGGAAATATCTGACCATGTTGTTGATGTCG
TGAGGCTTAGTTCGATGGTTTGTTCGTCGCAAATGAGAACTTTGGTGCCACAGGACAGTG
CCGATATGGAAGACACCATAACCATTGATGAGAAGATCAAAGGAGACATTGAGAAAATGA
AGGAGAGCAAAGAAATGTTTTTTATATCCAAGAATTGATCAGCTCTTAACTATCAACTGT
CGAATTGTGTGTTTTAGTTTCTTGCGTGTTAAATTAATTTGAATCTCTCGCCCCTGTGTG
ACCTCTCTCTCTCTTTCTCTCATCTTGAATGTAAAATAAGTTTGTATCAACTATTAAGTT
AAATAAATGAATATGTTTT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL6522Contig1 892 2 12 U
GGGTTCTTGTGGATTATGATGGGACTATGGTGCAGCCTGGGTCCATTAGGACGACGCCTA
GTGTCTCGACGATTGAGACGTTGAACAAGCTGGCTAGTGATCCCAAGAATATCGTTTATC
TCATCAGTGGGAAAGATAGAAAGACGTTAACCGAATGGTTCTCTTCTTGTGGTGGTCTTG
GTTTGGCAGCAGAGCATGGTTACTTTATAAGGCCTAATGATGGAACAGAGTGGGAAACAT
CGAGTGTAGTGTCGGCATTTGAGTGGAAACAAATAGCAGAGCCGGTGATGAGACTCTACA
CTGAGACTACAGATGGATCAACGATAGAGACTAAAGAGACTGCTCTTGTTTGGAACTACC
AGTTTGCTGATCCTGACTTTGGTTCTTGTCAAGCTAAAGAGCTTATGGAACACTTGGAAA
GCGTGCTCACGAATGATCCAGTCTCTGTCAAGACCGGACAGCAACTCGTTGAAGTTAAAC
CACAGGGCGTGAACAAGGGACTTGTGGCAGAGAGGCTTCTAACGACGATGCAAGAGCAAG
GGAAGCTTTTGGACTTCATTCTATGCGTGGGAGATGATAGGTCTGATGAGGATATGTTTG
AGGTGATAATGGGTGCAAAAGACGGACCAGCTTTGTCTCCAGTGGCTGAGATATTCGCTT
GCACCGTTGGACAAAAGCCAAGCAAAGCTAAATACTATTTAGACGACACTGCAGAGATCA
TCAGGATGCTTGAAGGTCTATCATCCACCTCCGCCGCAGCACCCGATCATCAAACCCCGG
ATGTTCCAACAACAAAAGATATCTTCTAAGGCTTTGTGTGAAACGTTGAGTTTTATTTAA
GAGTGTGACTTTGTGTATGGTTTTTCAAGTTTAGGAAATGTCTTTTCTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G781TF U 1
AF RR2G781JQ C 389
BS 1 624 RR2G781TF
BS 625 625 RR2G781JQ
BS 626 675 RR2G781TF
BS 676 676 RR2G781JQ
BS 677 691 RR2G781TF
BS 692 692 RR2G781JQ
BS 693 724 RR2G781TF
BS 725 725 RR2G781JQ
BS 726 735 RR2G781TF
BS 736 736 RR2G781JQ
BS 737 758 RR2G781TF
BS 759 892 RR2G781JQ

RD RR2G781TF 758 0 0
GGGTTCTTGTGGATTATGATGGGACTATGGTGCAGCCTGGGTCCATTAGGACGACGCCTA
GTGTCTCGACGATTGAGACGTTGAACAAGCTGGCTAGTGATCCCAAGAATATCGTTTATC
TCATCAGTGGGAAAGATAGAAAGACGTTAACCGAATGGTTCTCTTCTTGTGGTGGTCTTG
GTTTGGCAGCAGAGCATGGTTACTTTATAAGGCCTAATGATGGAACAGAGTGGGAAACAT
CGAGTGTAGTGTCGGCATTTGAGTGGAAACAAATAGCAGAGCCGGTGATGAGACTCTACA
CTGAGACTACAGATGGATCAACGATAGAGACTAAAGAGACTGCTCTTGTTTGGAACTACC
AGTTTGCTGATCCTGACTTTGGTTCTTGTCAAGCTAAAGAGCTTATGGAACACTTGGAAA
GCGTGCTCACGAATGATCCAGTCTCTGTCAAGACCGGACAGCAACTCGTTGAAGTTAAAC
CACAGGGCGTGAACAAGGGACTTGTGGCAGAGAGGCTTCTAACGACGATGCAAGAGCAAG
GGAAGCTTTTGGACTTCATTCTATGCGTGGGAGATGATAGGTCTGATGAGGATATGTTTG
AGGTGATAATGGGTGCAAAAGACG*ACCAGCTTTGTCTCCAGTGGCTGAGATATTCGCTT
GCACCGTTGGACAAA*GCCAAGCAAAGCTAA*TACTATTTAGACGACACTGCAGAGATCA
TCAG*ATGCTTGAAG*TCTATCATCCACCTCCGCCGCA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2G781JQ 504 0 0
TCAAGCTAAAGAGCTTATGGAACACTTGGAAAGCGTGCTCACGAATGATCCAGTCTCTGT
CAAGACCGGACAGCAACTCGTTGAAGTTAAACCACAGGGCGTGAACAAGGGACTTGTGGC
AGAGAGGCTTCTAACGACGATGCAAGAGCAAGGGAAGCTTTTGGACTTCATTCTATGCGT
GGGAGATGATAGGTCTGATGAGGATATGTTTGAGGTGATAATGGGTGCAAAAGACGGACC
AGCTTTGTCTCCAGTGGCTGAGATATTCGCTTGCACCGTTGGACAAAAGCCAAGCAAAGC
TAAATACTATTTAGACGACACTGCAGAGATCATCAGGATGCTTGAAGGTCTATCATCCAC
CTCCGCCGCAGCACCCGATCATCAAACCCCGGATGTTCCAACAACAAAAGATATCTTCTA
AGGCTTTGTGTGAAACGTTGAGTTTTATTTAAGAGTGTGACTTTGTGTATGGTTTTTCAA
GTTTAGGAAATGTCTTTTCTTTTC

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL6523Contig1 1092 2 2 U
CTTGATTAATGTCACTCTCTTCCTCTTCATCATCATCCTCGTCTTCTCAGAAGACATGGA
TTGTACACGGAATCTTAGCCGGAACAGCGATCGCAGCAGCGATTGGCGCACGTGCGTATC
TGGGTAGATCCAGGAAATTCCGGACCCGGGTCGTCGGAATCATCCCCGCCCGTTACGCCT
CCTCCCGATTCGAGGGCAAGCCTCTTGTGAAAATCCTCGGCAAACCCATGATCCAGAGAA
CCTGGGAGAGATCGAAGTTAGCTTCTACGCTTGATCACGTTGTTGTAGCAACGGACGATG
AAAGGATTGCGGATTGCTGTCGTGGGTTTGGTGCTGATGTCATCATGACTTCAGAGTCTT
GCAGAAATGGTACTGAGCGGTGCAATGAAGCGCTAGAAAAGCTAGAGAAGAAGTATGATG
TGGTTGTTAACATTCAAGGAGATGAACCACTCATTGAGCCTGAGATTATAGACGGTGTTG
TCAAAGCACTTCAGTTAGCACCTGATGCCGTGTTTAGCACAGCCGTGACGTCACTGAAAC
CAGAAGACGGACTTGATCCTAACCGAGTCAAATGCGTGGTGGACAACCGTGGCTACGCTA
TCTATTTCTCCAGGGGTTTGATTCCTTATAACAAGAGCGGTAAAGTCAATCCAGATTTTC
CTTACATGCTTCATCTTGGAATACAGAGCTTTGATTCAAAGTTTCTCAAAGTATATTCGG
AGCTTCAACCAACGCCACTGCAGCTAGAAGAGGATCTAGAGCAGCTCAAAGTCCTTGAAA
ATGGCTACAGAATGAAGGTTATCAAGGTAGATCATGAAGCTCATGGAGTTGATACACCTG
ATGATGTCGAAAAAATTGAATCTTTAATGCGGGAAAGAAACCTCCTCTAGACCACATAAT
ACAGAGATCTTGCTTTCAAACCTTATAATTGGATCGCCTTTCCTTGTTTTACTTTGCGAC
TTATCAATGAAATTTAGGGACTTCAGTAGATATTATATACTTTGTAATTCAATTCAATTC
AATTCTTTGCACACTTGTTAAATGCCAAGAAAACATAAGGATTAAGGAGTGAATATATGA
ATTAATCATACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM12TF U 1
AF RR2AM12JQ C 288
BS 1 676 RR2AM12TF
BS 677 1092 RR2AM12JQ

RD RR2AM12TF 676 0 0
CTTGATTAATGTCACTCTCTTCCTCTTCATCATCATCCTCGTCTTCTCAGAAGACATGGA
TTGTACACGGAATCTTAGCCGGAACAGCGATCGCAGCAGCGATTGGCGCACGTGCGTATC
TGGGTAGATCCAGGAAATTCCGGACCCGGGTCGTCGGAATCATCCCCGCCCGTTACGCCT
CCTCCCGATTCGAGGGCAAGCCTCTTGTGAAAATCCTCGGCAAACCCATGATCCAGAGAA
CCTGGGAGAGATCGAAGTTAGCTTCTACGCTTGATCACGTTGTTGTAGCAACGGACGATG
AAAGGATTGCGGATTGCTGTCGTGGGTTTGGTGCTGATGTCATCATGACTTCAGAGTCTT
GCAGAAATGGTACTGAGCGGTGCAATGAAGCGCTAGAAAAGCTAGAGAAGAAGTATGATG
TGGTTGTTAACATTCAAGGAGATGAACCACTCATTGAGCCTGAGATTATAGACGGTGTTG
TCAAAGCACTTCAGTTAGCACCTGATGCCGTGTTTAGCACAGCCGTGACGTCACTGAAAC
CAGAAGACGGACTTGATCCTAACCGAGTCAAATGCGTGGTGGACAACCGTGGCTACGCTA
TCTATTTCTCCAGGGGTTTGATTCCTTATAACAAGAGCGGTAAAGTCAATCCAGATTTTC
CTTACATGCTTCATCT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2AM12JQ 805 0 0
GCAACGGACGATGAAAGGATTGCGGATTGCTGTCGTGGGTTTGGTGCTGATGTCATCATG
ACTTCAGAGTCTTGCAGAAATGGTACTGAGCGGTGCAATGAAGCGCTAGAAAAGCTAGAG
AAGAAGTATGATGTGGTTGTTAACATTCAAGGAGATGAACCACTCATTGAGCCTGAGATT
ATAGACGGTGTTGTCAAAGCACTTCAGTTAGCACCTGATGCCGTGTTTAGCACAGCCGTG
ACGTCACTGAAACCAGAAGACGGACTTGATCCTAACCGAGTCAAATGCGTGGTGGACAAC
CGTGGCTACGCTATCTATTTCTCCAGGGGTTTGATTCCTTATAACAAGAGCGGTAAAGTC
AATCCAGATTTTCCTTACATGCTTCATCTTGGAATACAGAGCTTTGATTCAAAGTTTCTC
AAAGTATATTCGGAGCTTCAACCAACGCCACTGCAGCTAGAAGAGGATCTAGAGCAGCTC
AAAGTCCTTGAAAATGGCTACAGAATGAAGGTTATCAAGGTAGATCATGAAGCTCATGGA
GTTGATACACCTGATGATGTCGAAAAAATTGAATCTTTAATGCGGGAAAGAAACCTCCTC
TAGACCACATAATACAGAGATCTTGCTTTCAAACCTTATAATTGGATCGCCTTTCCTTGT
TTTACTTTGCGACTTATCAATGAAATTTAGGGACTTCAGTAGATATTATATACTTTGTAA
TTCAATTCAATTCAATTCTTTGCACACTTGTTAAATGCCAAGAAAACATAAGGATTAAGG
AGTGAATATATGAATTAATCATACG

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

CO CL6524Contig1 992 2 2 U
GGTCCGAAGGCTAGGAAGATGTCAGTGTTGCAGAGCCACCAATGTCTCTTCTCCTTCTCT
CCACCTCACCGTCTCCGTACGACGCGTCTTACCTCCCTCTATCGTCCACCGGAATCTATC
TCTCCGTTCCCTTCGCTCTCCGCTTTTACCCGGACCCGACCCGGTAGAATCCGAGTATCC
GCCGTCGAAGAAACCGCCGATGCACCGGAGTTGGAAGAAGACGGTCCTGTCGAGCTTCCT
CCGTCGGCCACGTCTCCGTTCTCGACAACGAACTCAATATTCGCCACTTCCGATGACCCC
TCTCCTCTCCAGTTAGCCACCAGCGTAATGCTAACCGGCGCCATCACCGTCTTCCTCTTC
CGATCGATTCGACGGCGAGCTAAACGCTCCAAAGAGCTGACGTTCAGATCGTCTGGAGCG
AAGAAGTCGCTGAAAGATGAAGCAATGGAGAAACTGAAAGCGATGGGGTCGGCTCCGATT
GAAGAAGGTAGTGGTAAGTCGACGACTCCATCGGCGGCTCAGGCGTTTCTTGGCGCGGTT
TCAGCAGGTGTCATTGCTGTTATTCTCTATAAGTTCACTCCTACCATTGAAGCAGGACTC
AATCGTCAGACTATTTCTGATAATTTCTCGGTTAGGCAAATCACAGTCACCGTGAGGACT
ATCATCAACGGTATATGCTATCTAGCAACCTTTGTTTTCGGCATCAATGCTGTCGGACTT
CTCCTTTACTCTGGTCAGCTAGCCTTCAACGAAGAGTCTGATGAAGCCATGCAAAAGGCC
ACAACAGAGCCTGGAGACTCCTCGGGTAACAACAACAACAGTGAAGTAAATAAAAGCAGT
GAGGACCAAAGTTCAGGAGATTAGTCCAGTCTTTGTACTATTGAAACATGTAATAATAAT
ATCATATTCGTTATTATAAATAAATGATTTTTAATTTGATTATCTTGTAACATTGTATCT
GTTTGTTGGGAAGTGATTTGATGTTGTTAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E310TF U 1
AF RR2E310JQ C 359
BS 1 660 RR2E310TF
BS 661 992 RR2E310JQ

RD RR2E310TF 660 0 0
GGTCCGAAGGCTAGGAAGATGTCAGTGTTGCAGAGCCACCAATGTCTCTTCTCCTTCTCT
CCACCTCACCGTCTCCGTACGACGCGTCTTACCTCCCTCTATCGTCCACCGGAATCTATC
TCTCCGTTCCCTTCGCTCTCCGCTTTTACCCGGACCCGACCCGGTAGAATCCGAGTATCC
GCCGTCGAAGAAACCGCCGATGCACCGGAGTTGGAAGAAGACGGTCCTGTCGAGCTTCCT
CCGTCGGCCACGTCTCCGTTCTCGACAACGAACTCAATATTCGCCACTTCCGATGACCCC
TCTCCTCTCCAGTTAGCCACCAGCGTAATGCTAACCGGCGCCATCACCGTCTTCCTCTTC
CGATCGATTCGACGGCGAGCTAAACGCTCCAAAGAGCTGACGTTCAGATCGTCTGGAGCG
AAGAAGTCGCTGAAAGATGAAGCAATGGAGAAACTGAAAGCGATGGGGTCGGCTCCGATT
GAAGAAGGTAGTGGTAAGTCGACGACTCCATCGGCGGCTCAGGCGTTTCTTGGCGCGGTT
TCAGCAGGTGTCATTGCTGTTATTCTCTATAAGTTCACTCCTACCATTGAAGCAGGACTC
AATCGTCAGACTATTTCTGATAATTTCTCGGTTAGGCAAATCACAGTCACCGTGAGGACT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2E310JQ 634 0 0
TCCGATCGATTCGACGGCGAGCTAAACGCTCCAAAGAGCTGACGTTCAGATCGTCTGGAG
CGAAGAAGTCGCTGAAAGATGAAGCAATGGAGAAACTGAAAGCGATGGGGTCGGCTCCGA
TTGAAGAAGGTAGTGGTAAGTCGACGACTCCATCGGCGGCTCAGGCGTTTCTTGGCGCGG
TTTCAGCAGGTGTCATTGCTGTTATTCTCTATAAGTTCACTCCTACCATTGAAGCAGGAC
TCAATCGTCAGACTATTTCTGATAATTTCTCGGTTAGGCAAATCACAGTCACCGTGAGGA
CTATCATCAACGGTATATGCTATCTAGCAACCTTTGTTTTCGGCATCAATGCTGTCGGAC
TTCTCCTTTACTCTGGTCAGCTAGCCTTCAACGAAGAGTCTGATGAAGCCATGCAAAAGG
CCACAACAGAGCCTGGAGACTCCTCGGGTAACAACAACAACAGTGAAGTAAATAAAAGCA
GTGAGGACCAAAGTTCAGGAGATTAGTCCAGTCTTTGTACTATTGAAACATGTAATAATA
ATATCATATTCGTTATTATAAATAAATGATTTTTAATTTGATTATCTTGTAACATTGTAT
CTGTTTGTTGGGAAGTGATTTGATGTTGTTAGTT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6526Contig1 599 2 1 U
GGAAGACATTTATGAGAATCCCTATCAATTCGATCCGTGGAGATGGGACAGAATAAGTGG
ATCGGTAAACAGTAATGTTTGCTTCACACCCTTGGTGTTGGACAAAGGCTATGTCCTGGT
TTAGAACTATCGAAGCTCGAAATCTCCATCTTTCTTCACCAACTCGTAACCCGATACAGC
TGGAGAGCCGAGGAAGACAAGATCGTGTCATTTCCAACAGTCAAGATGAAGCGGAGGCTT
CCCATCCGAGTGGCTCCCGTCGAGAGAACCTCTCATATCCCAGTTGGAGATCATTAGATA
ACAGATTCTTGAAAAGAACGAAAGTGTTTAGGCAAAAGGAGGCAGATAAGCAAACAAATA
TATTTTGTAAAATAGCAAAGAAGAGAAGCAAACAATATTGGTGGGTAAGGCAGAAAGAGC
CATACGTACAGCTAGTGATGGCTCAAAGATGAGGGATTCTAATTATTTTGTATATTTTGT
CATGTCAAATTATAAGCGTTGGTTAGGTTGTCCCTTTCTCTTTTATTTATAGTACTAAAG
CCAAACGCAACTTGAGATATGTATGTATGGATTGTATGTAAACTAATATAGTTCCTACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EL15JQ C 1
AF RR2EL15TF U 1
BS 1 599 RR2EL15TF

RD RR2EL15JQ 599 0 0
GGAAGACATTTATGAGAATCCCTATCAATTCGATCCGTGGAGATGGGACAGAATAAGTGG
ATCGGTAAACAGTAATGTTTGCTTCACACCCTTGGTGTTGGACAAAGGCTATGTCCTGGT
TTAGAACTATCGAAGCTCGAAATCTCCATCTTTCTTCACCAACTCGTAACCCGATACAGC
TGGAGAGCCGAGGAAGACAAGATCGTGTCATTTCCAACAGTCAAGATGAAGCGGAGGCTT
CCCATCCGAGTGGCTCCCGTCGAGAGAACCTCTCATATCCCAGTTGGAGATCATTAGATA
ACAGATTCTTGAAAAGAACGAAAGTGTTTAGGCAAAAGGAGGCAGATAAGCAAACAAATA
TATTTTGTAAAATAGCAAAGAAGAGAAGCAAACAATATTGGTGGGTAAGGCAGAAAGAGC
CATACGTACAGCTAGTGATGGCTCAAAGATGAGGGATTCTAATTATTTTGTATATTTTGT
CATGTCAAATTATAAGCGTTGGTTAGGTTGTCCCTTTCTCTTTTATTTATAGTACTAAAG
CCAAACGCAACTTGAGATATGTATGTATGGATTGTATGTAAACTAATATAGTTCCTACG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RR2EL15TF 599 0 0
GGAAGACATTTATGAGAATCCCTATCAATTCGATCCGTGGAGATGGGACAGAATAAGTGG
ATCGGTAAACAGTAATGTTTGCTTCACACCCTTGGTGTTGGACAAAGGCTATGTCCTGGT
TTAGAACTATCGAAGCTCGAAATCTCCATCTTTCTTCACCAACTCGTAACCCGATACAGC
TGGAGAGCCGAGGAAGACAAGATCGTGTCATTTCCAACAGTCAAGATGAAGCGGAGGCTT
CCCATCCGAGTGGCTCCCGTCGAGAGAACCTCTCATATCCCAGTTGGAGATCATTAGATA
ACAGATTCTTGAAAAGAACGAAAGTGTTTAGGCAAAAGGAGGCAGATAAGCAAACAAATA
TATTTTGTAAAATAGCAAAGAAGAGAAGCAAACAATATTGGTGGGTAAGGCAGAAAGAGC
CATACGTACAGCTAGTGATGGCTCAAAGATGAGGGATTCTAATTATTTTGTATATTTTGT
CATGTCAAATTATAAGCGTTGGTTAGGTTGTCCCTTTCTCTTTTATTTATAGTACTAAAG
CCAAACGCAACTTGAGATATGTATGTATGGATTGTATGTAAACTAATATAGTTCCTACG

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL6527Contig1 614 2 7 U
GGGGACGGTTTCTCGAACAAAAAGGACTAACCTTTCTGTTTGCATCGGCCATCGTCCCTA
ACGTTAGAGGATTGAGCGAAGATGCTGCGAGTTGCAGGGAGGAGGCTTTTGTCTGTTCAG
CAGAGATCAACGACTGCGACATCCGCCGTCCTTGCCCGAGATTATACCATCATCTCCAAT
GGAGGCGACTTATCTTCCACCCGTAGATCTGTTCCTTATGCAGATCTTTCATCTTTCAAT
TCTTACCACCGGAGCCTTATAAGAGGTTTCTCATCTCAAGTCCTTGCTCCAGGGAATGAG
ATAGGTTTTGCCTCTGAAGTCCCAGCCACCGTCGAGGCTGTCAAGACACCTAACTCCAAG
ATCCTCTACCATGACCATAACCATGAGCGTTACCCACCTGGAGACCCTAGCAAGCGTGCC
TTCGCCTACTTTGTCTTATCGGGTGGGAGGTTTGTTTATGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTT
GTTCTGAAGCTCATTGTCAGCACGTCCGCAACTAAAGACGTCCTTGCCCTCGCATCCCTC
GAGGTCGACCTCGGGAGCATCGAACCAGGAACCAATGTTACCGTGAAGTGGCGTGGTAAG
CCCGTGTTCATCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E291TF U 1
AF RR2EP41TF U 331
BS 1 369 RR2E291TF
BS 370 370 RR2EP41TF
BS 371 465 RR2E291TF
BS 466 466 RR2EP41TF
BS 467 574 RR2E291TF
BS 575 575 RR2EP41TF
BS 576 614 RR2E291TF

RD RR2E291TF 614 0 0
GGGGACGGTTTCTCGAACAAAAAGGACTAACCTTTCTGTTTGCATCGGCCATCGTCCCTA
ACGTTAGAGGATTGAGCGAAGATGCTGCGAGTTGCAGGGAGGAGGCTTTTGTCTGTTCAG
CAGAGATCAACGACTGCGACATCCGCCGTCCTTGCCCGAGATTATACCATCATCTCCAAT
GGAGGCGACTTATCTTCCACCCGTAGATCTGTTCCTTATGCAGATCTTTCATCTTTCAAT
TCTTACCACCGGAGCCTTATAAGAGGTTTCTCATCTCAAGTCCTTGCTCCAGGGAATGAG
ATAGGTTTTGCCTCTGAAGTCCCAGCCACCGTCGAGGCTGTCAAGACACCTAACTCCAAG
ATCCTCTACGATGACCATAACCATGAGCGTTACCCACCTGGAGACCCTAGCAAGCGTGCC
TTCGCCTACTTTGTCTTATCGGGTGGGAGGTTTGTTTATGCCTCTTTTCTCCGCCTTCTT
GTTCTGAAGCTCATTGTCAGCACGTCCGCAACTAAAGACGTCCTTGCCCTCGCATCCCTC
GAGGTCGACCTCGGGAGCATCGAACCAGGAACCACTGTTACCGTGAAGTGGCGTGGTAAG
CCCGTGTTCATCAG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2EP41TF 278 0 0
GTCGAGGCTGTCAAGACACCTAACTCCAAGATCCTCTACCATGACCATAACCATGAGCGT
TACCCACCTGGAGACCCTAGCAAGCGTGCCTTCGCCTACTTTGTCTTATCGGGTGGGAGG
TTTGTTTATGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTTGTTCTGAAGCTCATTGTCAGCATGTCCGCA
ACTAAGGACGTCCTTGCCCTCGCATCCCT*GAGGTCGACCTCGGGAGCATCGAACCAGGA
ACCAATGTTACCGTGAAGTGGCGTGGTAAGCCCGTGTT

QA 1 278 1 278
DS 



AS 1 2

CO CL6528Contig1 739 2 5 U
GGATTCTGATTCAAATAATTGTTCAAGCTTTGATTGTAGAAATGGCAGATGTGACTATAA
TTTCTTCAAGCATAGTTCTACCACAAAACATAAACCAATCAAGCCGGACAAAGATCCATC
TCACTCCGTTTGATCTTAACCTTCTCTACGTAGACTATCCTCAAAGAGGTCTTCTCTTTC
ACAAGCCCGACCCGGAAACCCATTTCATCTCTCGCTTAAAGACATCTCTTTCGACTGCCT
TGGAGATCTACTTCCCTTTCTCCGGTCGTCTTGTCAAAGTGGAGAATCTTGAAGACAACA
CGGTGTCGTTTTACATCGACTGCGAAGAGCACGGCTCCTCCGGTGGTGCTAAGTTCGTCC
ACGCCGAATCCAAATCTTTATCGTTGAGTGACATTCTCCAGCCTCACGGCTCTGTTCCAG
ATTTCATGAGTCGTTTCTTCCCCTCTCTCGGCGTTAATAGCACCAACGGCCTCACGGAGC
CCTTGCTTGCGCTGCAAGTCACCGAGATTAAAGATGGTGTTTTCATCAGTTTCGGTTATA
ATCACATGGTCGCTGATGGAGCTTCCATTTGGAACTTCTTTAATACTTGGTCCAAGATTT
GCTCCAATGATCTGAAGAACCATAACCCTCTTATGCTCAAAGGATGGTTCCTCGACGGAA
TCAGTTTCCCGATAGGTATTCCAGCTTCAGAGACGGTGGCCCCTTCTCCAAGCAAAGAAG
TTTCTTTGCCTCCCACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CV04TF U 1
AF RR2CV04JQ C 8
BS 1 695 RR2CV04TF
BS 696 696 RR2CV04JQ
BS 697 708 RR2CV04TF
BS 709 709 RR2CV04JQ
BS 710 739 RR2CV04TF

RD RR2CV04TF 739 0 0
GGATTCTGATTCAAATAATTGTTCAAGCTTTGATTGTAGAAATGGCAGATGTGACTATAA
TTTCTTCAAGCATAGTTCTACCACAAAACATAAACCAATCAAGCCGGACAAAGATCCATC
TCACTCCGTTTGATCTTAACCTTCTCTACGTAGACTATCCTCAAAGAGGTCTTCTCTTTC
ACAAGCCCGACCCGGAAACCCATTTCATCTCTCGCTTAAAGACATCTCTTTCGACTGCCT
TGGAGATCTACTTCCCTTTCTCCGGTCGTCTTGTCAAAGTGGAGAATCTTGAAGACAACA
CGGTGTCGTTTTACATCGACTGCGAAGAGCACGGCTCCTCCGGTGGTGCTAAGTTCGTCC
ACGCCGAATCCAAATCTTTATCGTTGAGTGACATTCTCCAGCCTCACGGCTCTGTTCCAG
ATTTCATGAGTCGTTTCTTCCCCTCTCTCGGCGTTAATAGCACCAACGGCCTCACGGAGC
CCTTGCTTGCGCTGCAAGTCACCGAGATTAAAGATGGTGTTTTCATCAGTTTCGGTTATA
ATCACATGGTCGCTGATGGAGCTTCCATTTGGAACTTCTTTAATACTTGGTCCAAGATTT
GCTCCAATGATCTGAAGAACCATAACCCTCTTATGCTCAAAGGATGGTTCCTCGACGGAA
TCAGTTTCCCGATAGGTATTCCAGCTTCAGAGACG*TGGCCCCTTCTC*AAGCAAAGAAG
TTTCTTTGCCTCCCACTAC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2CV04JQ 732 0 0
GATTCAAATAATTGTTCAAGCTTTGATTGTAGAAATGGCAGATGTGACTATAATTTCTTC
AAGCATAGTTCTACCACAAAACATAAACCAATCAAGCCGGACAAAGATCCATCTCACTCC
GTTTGATCTTAACCTTCTCTACGTAGACTATCCTCAAAGAGGTCTTCTCTTTCACAAGCC
CGACCCGGAAACCCATTTCATCTCTCGCTTAAAGACATCTCTTTCGACTGCCTTGGAGAT
CTACTTCCCTTTCTCCGGTCGTCTTGTCAAAGTGGAGAATCTTGAAGACAACACGGTGTC
GTTTTACATCGACTGCGAAGAGCACGGCTCCTCCGGTGGTGCTAAGTTCGTCCACGCCGA
ATCCAAATCTTTATCGTTGAGTGACATTCTCCAGCCTCACGGCTCTGTTCCAGATTTCAT
GAGTCGTTTCTTCCCCTCTCTCGGCGTTAATAGCACCAACGGCCTCACGGAGCCCTTGCT
TGCGCTGCAAGTCACCGAGATTAAAGATGGTGTTTTCATCAGTTTCGGTTATAATCACAT
GGTCGCTGATGGAGCTTCCATTTGGAACTTCTTTAATACTTGGTCCAAGATTTGCTCCAA
TGATCTGAAGAACCATAACCCTCTTATGCTCAAAGGATGGTTCCTCGACGGAATCAGTTT
CCCGATAGGTATTCCAGCTTCAGAGACGGTGGCCCCTTCTCCAAGCAAAGAAGTTTCTTT
GCCTCCCACTAC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL6529Contig1 1034 2 2 U
GGACAACCATCATTCTTGAACATCAAATAGAGATGATGAAAGTGGCTTCGCCTAGTGCAG
AGAATGATTCAATCACGCAGAAAGTTTTCAGGCGAGTCTACAGTAATTTTAGTTTCTCGA
CGGTCGACGATGACTACGACCATAATCGTTGGAGATCAAGATCGGGTGATTACGGGAAGG
AGAGTTTGAGGAAGAGAGGGTTTGAAGAATAAGAACAAGTTATGGAGATGGAGCAGATGG
GAGCTGAGAGGATCAAAACTGTTCTTATTCTGATGAGTGATACCGGCGGTGGCCACCGTG
CATCCGCTGAGGCTATACGTGACGCCTTCAATATCGAATTCGGAGATGACTACCGGATAA
TCATAAAAGACGTTTGGAAGGAATACACGGGATGGCCACTGAACGACATGGAGAGACAGT
ACAAGTTCATGGTGAAACATGTTGGTCTTTGGTCAGTCGCGTTTCATGGTACCTCTCCCA
AATGGATTCACAGAAGTTATCTCAGTGCTCTTGCCGCCTATTATGCCAAAGAAATAGAGG
CTGGTTTAATGGAGTATAAACCCGACATTATTATTAGCGTACATCATTACAAAGGCCGGT
CCAGGTACAATTGCGGAAGCATTGATTTGCGGCCTCCCTATTATCCTCAATGACTATATT
CCCGGACAGGAAAAAGGCAATGTGCCGTATGTTGTGGACAATGGGGCTGGAATTTTCACT
CGAAGTCCTAAAGAAACAGCGAAAACTGTGGCTGGTTGGTTCAGTAGCAAGAAAAACGAA
TTACATAAAATGTCAGAGAATGCTCTTAAGTTGGCGCAGCCTGAGGCAGTGTTCGACATT
GTTAAGGATATACACCATCTATCTCAACAGCAGCAACAACGTATTCAACTTGATAATGAT
TATTCCTACTGACTACTTCTACTTTTAGCCTTTATACTCCTCTTATTTCATGAATCGTTA
TGCTTGTATATTGTCTAGTGCACTGTCATTCTTTGAGCATCTTTTGTAATATTTATATAT
GCAATGTCATTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D763TF U 1
AF RR2D763JQ C 408
BS 1 623 RR2D763TF
BS 624 1034 RR2D763JQ

RD RR2D763TF 623 0 0
GGACAACCATCATTCTTGAACATCAAATAGAGATGATGAAAGTGGCTTCGCCTAGTGCAG
AGAATGATTCAATCACGCAGAAAGTTTTCAGGCGAGTCTACAGTAATTTTAGTTTCTCGA
CGGTCGACGATGACTACGACCATAATCGTTGGAGATCAAGATCGGGTGATTACGGGAAGG
AGAGTTTGAGGAAGAGAGGGTTTGAAGAATAAGAACAAGTTATGGAGATGGAGCAGATGG
GAGCTGAGAGGATCAAAACTGTTCTTATTCTGATGAGTGATACCGGCGGTGGCCACCGTG
CATCCGCTGAGGCTATACGTGACGCCTTCAATATCGAATTCGGAGATGACTACCGGATAA
TCATAAAAGACGTTTGGAAGGAATACACGGGATGGCCACTGAACGACATGGAGAGACAGT
ACAAGTTCATGGTGAAACATGTTGGTCTTTGGTCAGTCGCGTTTCATGGTACCTCTCCCA
AATGGATTCACAGAAGTTATCTCAGTGCTCTTGCCGCCTATTATGCCAAAGAAATAGAGG
CTGGTTTAATGGAGTATAAACCCGACATTATTATTAGCGTACATCATTACAAAGGCCGGT
CCAGGTACAATTGCGGAAGCATT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2D763JQ 627 0 0
ATGGAGAGACAGTACAAGTTCATGGTGAAACATGTTGGTCTTTGGTCAGTCGCGTTTCAT
GGTACCTCTCCCAAATGGATTCACAGAAGTTATCTCAGTGCTCTTGCCGCCTATTATGCC
AAAGAAATAGAGGCTGGTTTAATGGAGTATAAACCCGACATTATTATTAGCGTACATCAT
TACAAAGGCCGGTCCAGGTACAATTGCGGAAGCATTGATTTGCGGCCTCCCTATTATCCT
CAATGACTATATTCCCGGACAGGAAAAAGGCAATGTGCCGTATGTTGTGGACAATGGGGC
TGGAATTTTCACTCGAAGTCCTAAAGAAACAGCGAAAACTGTGGCTGGTTGGTTCAGTAG
CAAGAAAAACGAATTACATAAAATGTCAGAGAATGCTCTTAAGTTGGCGCAGCCTGAGGC
AGTGTTCGACATTGTTAAGGATATACACCATCTATCTCAACAGCAGCAACAACGTATTCA
ACTTGATAATGATTATTCCTACTGACTACTTCTACTTTTAGCCTTTATACTCCTCTTATT
TCATGAATCGTTATGCTTGTATATTGTCTAGTGCACTGTCATTCTTTGAGCATCTTTTGT
AATATTTATATATGCAATGTCATTCTT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL6530Contig1 750 2 3 U
GAAGTCTCTTTCTGTTCTTGATGAGATGCGTGGAGTCCTCGAAGTGAGACTAGCTGCAGC
CCTGGAGATTAAAAATGCTGCTGAGAAAGAGATACAAGAGAAAGAAGGTGCCGCACGCAA
GGAACTTGCTGAACAAGAAGCAATCATGGATAAGGTTGTCCAAGAATCAAAGCTTCTACA
GAAGGAGGCAGAGGAAAACTCCAAGCTGCGAGAGTTCCTTATGGAACGTGGTCGGGTTGT
TGATTCTCTACAAGGAGAGATCTATGTGATCTGTAAAGACATCCGGCTCTTGAAAGAGAA
ATTCGACAATGGTGTGCCGTTGAGCCAATCAATCACCTCAAGCCAGACAAGCTGTAAGCT
AGCTTCTTCTGTATCATCCATAAAGAGCTTGTTGCTTGAGAAGCCGCTTGACCTATCTTA
TGAAGCACCTGAAGCCTCAGGCAACATCAAGAGCCCAGAAGAAGCTTCGGTTAACGAGGA
AAAAGAGGACGAACGTAAGGAGCTCCTGGAAGATGGCTGGGACATCTTTGACAAAGAAAT
AGAACTCTAAGTGTCTTCTTTACAGGAGAAGATTCAATAATCTCTTTGTAGAAATAAATT
TGGTGTTAAGAATTAAAGAGATGTGAGATGGATTTTGGGTTCTACGTTTATTATCTACTT
TGCAGAGTTTGCAGAGCAAAACTATAACGTGAAAAGGGGAACATGAACAACTTTAAGTTT
TCTTGTGCATATTTCTTGTTATTTTCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A485TF U 1
AF RR2A485JQ C 85
BS 1 616 RR2A485TF
BS 617 617 RR2A485JQ
BS 618 750 RR2A485TF

RD RR2A485TF 750 0 0
GAAGTCTCTTTCTGTTCTTGATGAGATGCGTGGAGTCCTCGAAGTGAGACTAGCTGCAGC
CCTGGAGATTAAAAATGCTGCTGAGAAAGAGATACAAGAGAAAGAAGGTGCCGCACGCAA
GGAACTTGCTGAACAAGAAGCAATCATGGATAAGGTTGTCCAAGAATCAAAGCTTCTACA
GAAGGAGGCAGAGGAAAACTCCAAGCTGCGAGAGTTCCTTATGGAACGTGGTCGGGTTGT
TGATTCTCTACAAGGAGAGATCTATGTGATCTGTAAAGACATCCGGCTCTTGAAAGAGAA
ATTCGACAATGGTGTGCCGTTGAGCCAATCAATCACCTCAAGCCAGACAAGCTGTAAGCT
AGCTTCTTCTGTATCATCCATAAAGAGCTTGTTGCTTGAGAAGCCGCTTGACCTATCTTA
TGAAGCACCTGAAGCCTCAGGCAACATCAAGAGCCCAGAAGAAGCTTCGGTTAACGAGGA
AAAAGAGGACGAACGTAAGGAGCTCCTGGAAGATGGCTGGGACATCTTTGACAAAGAAAT
AGAACTCTAAGTGTCTTCTTTACAGGAGAAGATTCAATAATCTCTTTGTAGAAATAAATT
TGGTGTTAAGAATTAA*GAGATGTGAGATGGATTTTGGGTTCTACGTTTATTATCTACTT
TGCAGAGTTTGCAGAGCAAAACTATAACGTGAAAAGGGGAACATGAACAACTTTAAGTTT
TCTTGTGCATATTTCTTGTTATTTTCTGTT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2A485JQ 666 0 0
GAAAGAGATACAAGAGAAAGAAGGTGCCGCACGCAAGGAACTTGCTGAACAAGAAGCAAT
CATGGATAAGGTTGTCCAAGAATCAAAGCTTCTACAGAAGGAGGCAGAGGAAAACTCCAA
GCTGCGAGAGTTCCTTATGGAACGTGGTCGGGTTGTTGATTCTCTACAAGGAGAGATCTA
TGTGATCTGTAAAGACATCCGGCTCTTGAAAGAGAAATTCGACAATGGTGTGCCGTTGAG
CCAATCAATCACCTCAAGCCAGACAAGCTGTAAGCTAGCTTCTTCTGTATCATCCATAAA
GAGCTTGTTGCTTGAGAAGCCGCTTGACCTATCTTATGAAGCACCTGAAGCCTCAGGCAA
CATCAAGAGCCCAGAAGAAGCTTCGGTTAACGAGGAAAAAGAGGACGAACGTAAGGAGCT
CCTGGAAGATGGCTGGGACATCTTTGACAAAGAAATAGAACTCTAAGTGTCTTCTTTACA
GGAGAAGATTCAATAATCTCTTTGTAGAAATAAATTTGGTGTTAAGAATTAAAGAGATGT
GAGATGGATTTTGGGTTCTACGTTTATTATCTACTTTGCAGAGTTTGCAGAGCAAAACTA
TAACGTGAAAAGGGGAACATGAACAACTTTAAGTTTTCTTGTGCATATTTCTTGTTATTT
TCTGTT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6532Contig1 628 2 1 U
GGGAAGTCTCTCCCCTTCCGTCATCGTCGCCGATTTGCTAATCCCGTCTGTTCATCTTCG
TTTTCCCCTAAAACAGTCGCACTAGGGTTAGAGAAATTTGGAGAGAAGGAAGATGAGCAA
CACACCAGCAACGCCGGCGTCTTCGTCGAAATCTAAAGCTACTGGCAATTCTCAACCGCC
GGAAAAACGCAAACCCTTATTTCAAAAAGAATTGCAGCATATGATGTATGGGTTCGGTGA
TGAGCCAAACCCGCTTCCAGAGACTGTGGCGCTTGTAGAAGACATTGTTGTGGAATACGT
CACTGATTTGACACATAAGGCTCAAGAGATAGGCACAAAGCGAGGAAGGCTACTAGTTGA
TGACTTCTTGTATCTAATCCGCAAGGATTTGCCAAAACTTAACCGTTGTAGGGAACTCTT
GGCAATGCAAGAAGAGCTGAAACAAGCTCGTAAAGCTTTTGATGTTGACGAAGAGAAGAT
TACTTCTCTCGATTGATTAATAGTCCTTTTTTATGTGTGATAAACCTTTTGAAAGTTAGT
CAGTGACCTTTTGAATTCAAGACTGCAACTCAATGTAACAGCGAACTTATGTGCTCTGTT
TTATTGTGTTTTGTGGGTTGCAGAAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AZ11JQ C 1
AF RR2AZ11TFB U 1
BS 1 628 RR2AZ11TFB

RD RR2AZ11JQ 628 0 0
GGGAAGTCTCTCCCCTTCCGTCATCGTCGCCGATTTGCTAATCCCGTCTGTTCATCTTCG
TTTTCCCCTAAAACAGTCGCACTAGGGTTAGAGAAATTTGGAGAGAAGGAAGATGAGCAA
CACACCAGCAACGCCGGCGTCTTCGTCGAAATCTAAAGCTACTGGCAATTCTCAACCGCC
GGAAAAACGCAAACCCTTATTTCAAAAAGAATTGCAGCATATGATGTATGGGTTCGGTGA
TGAGCCAAACCCGCTTCCAGAGACTGTGGCGCTTGTAGAAGACATTGTTGTGGAATACGT
CACTGATTTGACACATAAGGCTCAAGAGATAGGCACAAAGCGAGGAAGGCTACTAGTTGA
TGACTTCTTGTATCTAATCCGCAAGGATTTGCCAAAACTTAACCGTTGTAGGGAACTCTT
GGCAATGCAAGAAGAGCTGAAACAAGCTCGTAAAGCTTTTGATGTTGACGAAGAGAAGAT
TACTTCTCTCGATTGATTAATAGTCCTTTTTTATGTGTGATAAACCTTTTGAAAGTTAGT
CAGTGACCTTTTGAATTCAAGACTGCAACTCAATGTAACAGCGAACTTATGTGCTCTGTT
TTATTGTGTTTTGTGGGTTGCAGAAACC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2AZ11TFB 628 0 0
GGGAAGTCTCTCCCCTTCCGTCATCGTCGCCGATTTGCTAATCCCGTCTGTTCATCTTCG
TTTTCCCCTAAAACAGTCGCACTAGGGTTAGAGAAATTTGGAGAGAAGGAAGATGAGCAA
CACACCAGCAACGCCGGCGTCTTCGTCGAAATCTAAAGCTACTGGCAATTCTCAACCGCC
GGAAAAACGCAAACCCTTATTTCAAAAAGAATTGCAGCATATGATGTATGGGTTCGGTGA
TGAGCCAAACCCGCTTCCAGAGACTGTGGCGCTTGTAGAAGACATTGTTGTGGAATACGT
CACTGATTTGACACATAAGGCTCAAGAGATAGGCACAAAGCGAGGAAGGCTACTAGTTGA
TGACTTCTTGTATCTAATCCGCAAGGATTTGCCAAAACTTAACCGTTGTAGGGAACTCTT
GGCAATGCAAGAAGAGCTGAAACAAGCTCGTAAAGCTTTTGATGTTGACGAAGAGAAGAT
TACTTCTCTCGATTGATTAATAGTCCTTTTTTATGTGTGATAAACCTTTTGAAAGTTAGT
CAGTGACCTTTTGAATTCAAGACTGCAACTCAATGTAACAGCGAACTTATGTGCTCTGTT
TTATTGTGTTTTGTGGGTTGCAGAAACC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL6533Contig1 877 2 6 U
GGCAATTGAGGAAGGAACACAGAGATCTCGATTCACAGATGTCGTCGTCGTCGTCGTCGT
CTTCTCCGAGTGGCGATTTGAGCGAGAGAAGAGGGATTCCCGCCGCTAAATTCATCCAAG
ATGTCGAGACTTACCTCTCTCAGTCCAGCCTCGATTCCAACTCTGCTCTCGCCTTCCATC
AAGAAAGGCTTCAGCAGTATAAAGTTGTTGAAATGAAGCTTCTTGCCCAGCAGAGGGATC
TTCAGGCTAAAATCCCAGATATTGAGAAGTGCTTAGAGGTTGTTGCCACTTTGGAAGCAA
GGAAGGGTACTGGTGAGGCCCTTCTGGCGGATTTTGAAGTGTCTGAAGGAATATATTCAC
GGGCCTGTATTGAAGACACCGACTCAGTGTGCTTGTGGTTGGGAGCAAATGTCATGCTGG
AATATTCCTGTGAAGAGGCTACAGCCCTTTTGAAAAACAATCTGGAAAATGCTAAAGCCG
GCCTGGAGGTTCTTGTGGCTGATTTGCAGTTCTTGAGGGATCAAGTCACAGTTACTCAGG
TGACTATTGCGCGTATCTATAACTATGATTCAGCAAAGGAGGGTTAAACAAGTTACCCCT
ACTGCTATTGCTGCTGCCGACTCATGAATCACAAAGTTCAAATCATGCTCTTGTGTCTTA
TAAGGAGGTAATATGATTTCTGCGACACCGTTTGGTTTGTAACTCTTGTTTTTTTTTTTG
CTTTCTTGATCGAGCTGTGTTTCCGAGACAAACCTATCAATAGAAACATTTAGCATTTTA
TTGTTACCTTTTGGAGTTTGGAGACCATCTTGTGTTTTTTTCCGATTGAAGTACTACTAC
TTGTTTAAGGATGTGGTCAGTATATCATAGTGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ47TFB U 1
AF RR2AZ47JQ C 118
BS 1 188 RR2AZ47TFB
BS 189 189 RR2AZ47JQ
BS 190 667 RR2AZ47TFB
BS 668 668 RR2AZ47JQ
BS 669 724 RR2AZ47TFB
BS 725 877 RR2AZ47JQ

RD RR2AZ47TFB 726 0 0
GGCAATTGAGGAAGGAACACAGAGATCTCGATTCACAGATGTCGTCGTCGTCGTCGTCGT
CTTCTCCGAGTGGCGATTTGAGCGAGAGAAGAGGGATTCCCGCCGCTAAATTCATCCAAG
ATGTCGAGACTTACCTCTCTCAGTCCAGCCTCGATTCCAACTCTGCTCTCGCCTTCCATC
AAGAAAGGGTTCAGCAGTATAAAGTTGTTGAAATGAAGCTTCTTGCCCAGCAGAGGGATC
TTCAGGCTAAAATCCCAGATATTGAGAAGTGCTTAGAGGTTGTTGCCACTTTGGAAGCAA
GGAAGGGTACTGGTGAGGCCCTTCTGGCGGATTTTGAAGTGTCTGAAGGAATATATTCAC
GGGCCTGTATTGAAGACACCGACTCAGTGTGCTTGTGGTTGGGAGCAAATGTCATGCTGG
AATATTCCTGTGAAGAGGCTACAGCCCTTTTGAAAAACAATCTGGAAAATGCTAAAGCCG
GCCTGGAGGTTCTTGTGGCTGATTTGCAGTTCTTGAGGGATCAAGTCACAGTTACTCAGG
TGACTATTGCGCGTATCTATAACTATGATTCAGCAAAGGAGGGTTAAACAAGTTACCCCT
ACTGCTATTGCTGCTGCCGACTCATGAATCACAAAGTTCAAATCATGCTCTTGTGTCTTA
TAAGGAG*TAATATGATTTCTGCGACACCGTTTGGTTTGTAACTCTTGTTTTTTTTTTTG
CTTT
TC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2AZ47JQ 760 0 0
AAGATGTCGAGACTTACCTCTCTCAGTCCAGCCTCGATTCCAACTCTGCTCTCGCCTTCC
ATCAAGAAAGGCTTCAGCAGTATAAAGTTGTTGAAATGAAGCTTCTTGCCCAGCAGAGGG
ATCTTCAGGCTAAAATCCCAGATATTGAGAAGTGCTTAGAGGTTGTTGCCACTTTGGAAG
CAAGGAAGGGTACTGGTGAGGCCCTTCTGGCGGATTTTGAAGTGTCTGAAGGAATATATT
CACGGGCCTGTATTGAAGACACCGACTCAGTGTGCTTGTGGTTGGGAGCAAATGTCATGC
TGGAATATTCCTGTGAAGAGGCTACAGCCCTTTTGAAAAACAATCTGGAAAATGCTAAAG
CCGGCCTGGAGGTTCTTGTGGCTGATTTGCAGTTCTTGAGGGATCAAGTCACAGTTACTC
AGGTGACTATTGCGCGTATCTATAACTATGATTCAGCAAAGGAGGGTTAAACAAGTTACC
CCTACTGCTATTGCTGCTGCCGACTCATGAATCACAAAGTTCAAATCATGCTCTTGTGTC
TTATAAGGAGGTAATATGATTTCTGCGACACCGTTTGGTTTGTAACTCTTGTTTTTTTTT
TTGCTTTCTTGATCGAGCTGTGTTTCCGAGACAAACCTATCAATAGAAACATTTAGCATT
TTATTGTTACCTTTTGGAGTTTGGAGACCATCTTGTGTTTTTTTCCGATTGAAGTACTAC
TACTTGTTTAAGGATGTGGTCAGTATATCATAGTGTTTGC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL6534Contig1 862 2 22 U
GGGCTCCTCCTTCCTTCTCTGAATAGAGAGAGAGAAATCAAACAACGAAGGGAGGAAGGA
GAGGGGAAAATTGATATAAAAGATAAGAAGGGAAAGGATCGTAAAAATCGGAAAGAGAGA
TAGAGAGATCAGATCAGATCTGTGGGTTGCGTGGGTTGGAATGATGTACGTGAGAGCGTT
GCCGACGACGGACGTGAATCGGAACACGAAGTGGTTCACGTATCCAGGGGTGTGGACGAC
TTACATCCTCATCCTATTCTTCTCATGGCTCCTCGTTCTATCCATCTTCAATTGTTCCCC
TGGCATGGCCTGGACCATCGTCCACCTCGCCCATTTCGCCGTAACGTATCATTTGTTTCA
CTGGAAGAAGGGAACACCGTTTGGGGATGACCAGGGGGTCTACAATAGGCTCACTTGGTG
GGAACAGATTGACAACGGCAAGCAACTCACTCGCAATCGCAAGTTCCTCACTCTCGTTCC
CGTTGTCTTGTACTTGATAGCATCGCACACTACAGACTATCAAAATCCCATGCTGTTTCT
GAACACGCTTGCTGTATTTATAATGGTTGTTGCAAAGTTCCCGCACATGCACAAGGTTCG
CATCTTTGGAATCAATGCCGAACAGTGAAAGCACCAAATGCGGTTGAGCTATGAGATATG
TTGTGGTAAATCAATCTGATCATGAAGCCTTGAAGTAGAAAATACATATGCCACTTTTGT
CTTCTTCTTCTTTTCCTTAGATTTTTCTTTTCCTTGTTTATGTAAAAACCAAATAAGCCA
TTAAGAGTGGGTTTGTAAGTCTGAACCCGTGGTTTAGTGATTTTTCTTCAAAATCATTTA
CTAATACTAATATACATAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 
0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E141TF U 1
AF RR2BJ03TF U 61
BS 1 75 RR2E141TF
BS 76 76 RR2BJ03TF
BS 77 91 RR2E141TF
BS 92 92 RR2BJ03TF
BS 93 118 RR2E141TF
BS 119 119 RR2BJ03TF
BS 120 120 RR2E141TF
BS 121 124 RR2BJ03TF
BS 125 135 RR2E141TF
BS 136 136 RR2BJ03TF
BS 137 279 RR2E141TF
BS 280 280 RR2BJ03TF
BS 281 474 RR2E141TF
BS 475 475 RR2BJ03TF
BS 476 595 RR2E141TF
BS 596 596 RR2BJ03TF
BS 597 701 RR2E141TF
BS 702 702 RR2BJ03TF
BS 703 733 RR2E141TF
BS 734 734 RR2BJ03TF
BS 735 745 RR2E141TF
BS 746 862 RR2BJ03TF

RD RR2E141TF 746 0 0
GGGCTCCTCCTTCCTTCTCTGAATAGAGAGAGAGAAATCAAACAACGAAGGGAGGAAGGA
GAGGGGAAAATTGATCTAAAAGATAAGAAGG*AAAGGATCGTAAAAATCGGAAAGAGATA
****GAGATCAGATCTGATCTGTGGGTTGCGTGGGTTGGAATGATGTACGTGAGAGCGTT
GCCGACGACGGACGTGAATCGGAACACGAAGTGGTTCACGTATCCAGGGGTGTGGACGAC
TTACATCCTCATCCTATTCTTCTCATGGCTCCTCGTTCTCTCCATCTTCAATTGTTCCCC
TGGCATGGCCTGGACCATCGTCCACCTCGCCCATTTCGCCGTAACGTATCATTTGTTTCA
CTGGAAGAAGGGAACACCGTTTGGGGATGACCAGGGGGTCTACAATAGGCTCACTTGGTG
GGAACAGATTGACAACGGCAAGCAACTCACTCGCAATCGCAAGTTCCTCACTCTTGTTCC
CGTTGTCTTGTACTTGATAGCATCGCACACTACAGACTATCAAAATCCCATGCTGTTTCT
GAACACGCTTGCTGTATTTATAATGGTTGTTGCAAAGTTCCCGCACATGCACAAG*TTCG
CATCTTTGGAATCAATGCCGAACAGTGAAAGCACCAAATGCGGTTGAGCTATGAGATATG
TTGTGGTAAATCAATCTGATCATGAAGCCTTGAAGTAGAAA*TACATATGCCACTTTTGT
CTTCTTCTTCTTT*CCTTAGATTTT
C

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2BJ03TF 802 0 0
AG
GGGGGAAATTGATATAAAAGATAAGAAGGGAAAGGATCGTAAAAATCGGAGAGAGAGATA
GAGAGATCAGATCAGATCTGTGGGTTGCGTGGGTTGGAATGATGTACGTGAGAGCGTTGC
CGACGACGGGCGTGAATCGGAACACGGAGTGGTTCACGTATCCAGGGGTGTGGACGACTT
ACATCCTCATCCTATTCTTCTCTTGGCTCCTCGTTCTATCCATCTTCAATTGTTCCCCTG
GCATGGCCTGGACCATCGTCCACCTCGCCCATTTCGCCGTTACGTATCATTTGTTTCACT
GGAAGAAGGGAACACCGTTTGGGGATGACCAGGGGGTCTACAATAGGCTGACTTGGTGGG
AACAGATTGACAACGGCAAGCAACTCACTCGCAATCGCAAGTTCCTCACTCTCGTTCCCG
TTGTCTTGTACTTGATAGCATCGCACACTACAGACTATCAAAATCCCATGCTGTTTCTGA
ACACGCTTGCTGTATTTATAATGGTTGTTGCAAAGTTCCCGCACATGCACAAGGTTCGCA
TCTTTGGAATCAATGCCGAACAGTGAAAGCACCAAATGCGGTTGAGCTATGAGATATGTT
GTGGTAAATCAATCTGATCATGAAGCCTTGAAGTAGAAAATACATATGCCACTTTTGTCT
TCTTCTTCTTTTCCTTAGATTTTTCTTTTCCTTGTTTATGTAAAAACCAAATAAGCCATT
AAGAGTGGGTTTGTAAGTCTGAACCCGTGGTTTAGTGATTTTTCTTCAAAATCATTTACT
AATACTAATATACATAATAT

QA 3 802 3 802
DS 



AS 1 2

CO CL6535Contig1 659 2 1 U
GGACATATCCAAACCTCATAAAAGCTCACAAGAATCCAAAACATGAAGAATCTAGCAATC
CTTCTTGCTATCATACTCGTCTCATGTTATCTCACGTCTCTAGTCACAGCAAGTGATTTG
GAGTCAATGCCATCATCGCGTAACGAAAAGCTCGAATGGTGGCATTACCATTCCTACCCT
TACTTTCACCCCAAGCCACCACATTGGCCGTTCCCATGTTCTTCCGAAAAAGCCTTTCCG
CCACTCCCCGCCGGCTACAACCATTTCCACCCTGTTCCATTCCATCCACCACCGGTAGTC
GCCAAGTGCTTGTCTGATTGCAAGGATGTAAAAACATGTATGGCGGATATCCGGAAAGCT
TTCTTCACCCACAAACCTGCTATTGGATCGGAATGTTGTGCTTCAATACAGAAGATGGAT
GAAGATTGTGACAAGACTGTCTTTGGAGCTTACCATAACCCTTTCTTTGACTGCTTTGTT
AAGCTACATTGTGCCACCAAAGCTGGATCTACTCCATCTGCTCCCTCGCCAGCTTAGAGG
TTTTAGTTAGTTATTAGAATTATAAATAATGAGTTTTAGTTGGTATTATAATTTTCCTTT
TTAATTATGCTTCTCCATATTAAGCTTCGAGGAAATAAAGCGCATCCTTCTTAATAATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FC48JQ C 1
AF RR2FC48TF U 1
BS 1 659 RR2FC48TF

RD RR2FC48JQ 659 0 0
GGACATATCCAAACCTCATAAAAGCTCACAAGAATCCAAAACATGAAGAATCTAGCAATC
CTTCTTGCTATCATACTCGTCTCATGTTATCTCACGTCTCTAGTCACAGCAAGTGATTTG
GAGTCAATGCCATCATCGCGTAACGAAAAGCTCGAATGGTGGCATTACCATTCCTACCCT
TACTTTCACCCCAAGCCACCACATTGGCCGTTCCCATGTTCTTCCGAAAAAGCCTTTCCG
CCACTCCCCGCCGGCTACAACCATTTCCACCCTGTTCCATTCCATCCACCACCGGTAGTC
GCCAAGTGCTTGTCTGATTGCAAGGATGTAAAAACATGTATGGCGGATATCCGGAAAGCT
TTCTTCACCCACAAACCTGCTATTGGATCGGAATGTTGTGCTTCAATACAGAAGATGGAT
GAAGATTGTGACAAGACTGTCTTTGGAGCTTACCATAACCCTTTCTTTGACTGCTTTGTT
AAGCTACATTGTGCCACCAAAGCTGGATCTACTCCATCTGCTCCCTCGCCAGCTTAGAGG
TTTTAGTTAGTTATTAGAATTATAAATAATGAGTTTTAGTTGGTATTATAATTTTCCTTT
TTAATTATGCTTCTCCATATTAAGCTTCGAGGAAATAAAGCGCATCCTTCTTAATAATG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2FC48TF 659 0 0
GGACATATCCAAACCTCATAAAAGCTCACAAGAATCCAAAACATGAAGAATCTAGCAATC
CTTCTTGCTATCATACTCGTCTCATGTTATCTCACGTCTCTAGTCACAGCAAGTGATTTG
GAGTCAATGCCATCATCGCGTAACGAAAAGCTCGAATGGTGGCATTACCATTCCTACCCT
TACTTTCACCCCAAGCCACCACATTGGCCGTTCCCATGTTCTTCCGAAAAAGCCTTTCCG
CCACTCCCCGCCGGCTACAACCATTTCCACCCTGTTCCATTCCATCCACCACCGGTAGTC
GCCAAGTGCTTGTCTGATTGCAAGGATGTAAAAACATGTATGGCGGATATCCGGAAAGCT
TTCTTCACCCACAAACCTGCTATTGGATCGGAATGTTGTGCTTCAATACAGAAGATGGAT
GAAGATTGTGACAAGACTGTCTTTGGAGCTTACCATAACCCTTTCTTTGACTGCTTTGTT
AAGCTACATTGTGCCACCAAAGCTGGATCTACTCCATCTGCTCCCTCGCCAGCTTAGAGG
TTTTAGTTAGTTATTAGAATTATAAATAATGAGTTTTAGTTGGTATTATAATTTTCCTTT
TTAATTATGCTTCTCCATATTAAGCTTCGAGGAAATAAAGCGCATCCTTCTTAATAATG

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL6536Contig1 1373 2 2 U
GGAACAACTCTGTTTCTCATCTTTACATCTTCACTTCGTTTAAGAAAAAAAAATCACTTC
TTCGAATCTCCACATCTACAAAAGTAACAGAGAGCGGAGAGAGAGAGAGAGTAGAGATGG
CGCGAAAATACTTTCAGAGAGAAGTGTTGCCGGTAATGGCGCTGGTGATAATGGAATGTG
CCAACGTTGGTTTAAACACTCTGTTCAAGGCAGCGACTTTGCAAGGCATGAGCTTCCATG
TCTTCATCGTTTACTCTTACGGTCTCGCTGCTCTTCTTCTCCTTCCTTCCATATTCTTTT
CCTCCAGATCAAGAACTCTCCCACCAATGAATTTCTCAATTCTCTACAAAATCGTGGTTC
TAGGGTTAATTGGATGCTGCTCAAACATAATGGGGTACACAGGAATTAATTATAGCTCTC
CAACACTTGCTTCTGCGATCAGCAACCTCACTCCTGCGTTTACCTTCTTGCTCGCCATCC
TTTTCAGGATGGAGAGTGTATCGTTCAAGAGAACAAGTAGTGTGGCTAAAATGTTAGGAA
CCGTAGTTTCCATCGGAGGAGCTTTTATAGTGACTCTTTACAATGGTCCTGTGGTGATCG
CTATGTCACCACCGTCTGTTTCTTTGAGATCACAGTCCACAAACCATAACTGGATCATTG
GCGCTGCGTTCCTTTCCGTCGAGTATTTCATGGTTCCTTTGTGGTACATTGTCCAGACTC
AAATCATGAGAGAGTATCCATCAGAGTTCACAGTTGTTTGTTACTATAGCTTAGGCGTGA
GCTTTTGGACCGGGCTTGTCACATTGTTCACTGAAGGGAATGACTTGAGTGCATGGAAGA
TAAAACCAAATATAGCTTTGGTGTCAATCGTTTGCTCGGGAGTTTTTGGATCTTGTATAA
ACAATACAATCCATACGTGGGCGTTGAGGATCAAGGGGCCTTTATTTGTTGCAATGTTCA
AGCCTCTGTCGATTGCGATTGCGGTTGCAATGGGTGTGATCTTCCTCCATGATTCTCTCT
ACATTGGCAGCTTGATCGGGGCAACGGTAATAACGACAGGGTTTTACACTGTTATGTGGG
GCAAAGCTAAGGAAGTGGCTATGGTCGAAGGTGACAATAAGGCTAACAACGAGGATGCCA
CCAACGAAGATGACCTTGATTCTCCATCAGCTTCACAGAAGGCTCCTCTCTTGGAAAGTT
ACAAGAACGATGAGCATGTCTAAGTATCATCTACTAGTCACGGTAGCTCTCTCTCTATAT
ATATGTATGTAAAAGTTTCATATGAATGTCTTTTTAATTTTATTTGAAGAGGCAATTGTG
ATCTTTAATTCTAGGAATCAAGTCTTAATATATCATCAAAATTTCTGAATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A172TF U 1
AF RR2A172JQ C 560
BS 1 770 RR2A172TF
BS 771 1373 RR2A172JQ

RD RR2A172TF 770 0 0
GGAACAACTCTGTTTCTCATCTTTACATCTTCACTTCGTTTAAGAAAAAAAAATCACTTC
TTCGAATCTCCACATCTACAAAAGTAACAGAGAGCGGAGAGAGAGAGAGAGTAGAGATGG
CGCGAAAATACTTTCAGAGAGAAGTGTTGCCGGTAATGGCGCTGGTGATAATGGAATGTG
CCAACGTTGGTTTAAACACTCTGTTCAAGGCAGCGACTTTGCAAGGCATGAGCTTCCATG
TCTTCATCGTTTACTCTTACGGTCTCGCTGCTCTTCTTCTCCTTCCTTCCATATTCTTTT
CCTCCAGATCAAGAACTCTCCCACCAATGAATTTCTCAATTCTCTACAAAATCGTGGTTC
TAGGGTTAATTGGATGCTGCTCAAACATAATGGGGTACACAGGAATTAATTATAGCTCTC
CAACACTTGCTTCTGCGATCAGCAACCTCACTCCTGCGTTTACCTTCTTGCTCGCCATCC
TTTTCAGGATGGAGAGTGTATCGTTCAAGAGAACAAGTAGTGTGGCTAAAATGTTAGGAA
CCGTAGTTTCCATCGGAGGAGCTTTTATAGTGACTCTTTACAATGGTCCTGTGGTGATCG
CTATGTCACCACCGTCTGTTTCTTTGAGATCACAGTCCACAAACCATAACTGGATCATTG
GCGCTGCGTTCCTTTCCGTCGAGTATTTCATGGTTCCTTTGTGGTACATTGTCCAGACTC
AAATCATGAGAGAGTATCCATCAGAGTTCACAGTTGTTTGTTACTATAGC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2A172JQ 814 0 0
AGCTTTTATAGTGACTCTTTACAATGGTCCTGTGGTGATCGCTATGTCACCACCGTCTGT
TTCTTTGAGATCACAGTCCACAAACCATAACTGGATCATTGGCGCTGCGTTCCTTTCCGT
CGAGTATTTCATGGTTCCTTTGTGGTACATTGTCCAGACTCAAATCATGAGAGAGTATCC
ATCAGAGTTCACAGTTGTTTGTTACTATAGCTTAGGCGTGAGCTTTTGGACCGGGCTTGT
CACATTGTTCACTGAAGGGAATGACTTGAGTGCATGGAAGATAAAACCAAATATAGCTTT
GGTGTCAATCGTTTGCTCGGGAGTTTTTGGATCTTGTATAAACAATACAATCCATACGTG
GGCGTTGAGGATCAAGGGGCCTTTATTTGTTGCAATGTTCAAGCCTCTGTCGATTGCGAT
TGCGGTTGCAATGGGTGTGATCTTCCTCCATGATTCTCTCTACATTGGCAGCTTGATCGG
GGCAACGGTAATAACGACAGGGTTTTACACTGTTATGTGGGGCAAAGCTAAGGAAGTGGC
TATGGTCGAAGGTGACAATAAGGCTAACAACGAGGATGCCACCAACGAAGATGACCTTGA
TTCTCCATCAGCTTCACAGAAGGCTCCTCTCTTGGAAAGTTACAAGAACGATGAGCATGT
CTAAGTATCATCTACTAGTCACGGTAGCTCTCTCTCTATATATATGTATGTAAAAGTTTC
ATATGAATGTCTTTTTAATTTTATTTGAAGAGGCAATTGTGATCTTTAATTCTAGGAATC
AAGTCTTAATATATCATCAAAATTTCTGAATGTT

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL6537Contig1 1206 2 2 U
GGGAATTGAAAAAGGAAAGCGAAAACCCTAGTAAAGGTTTTGTCTCTCTCTGTCTGGATC
AGATTTGTTCTTACCGATCGATCACAAACTCCATTGTCGCCAGCTCAAGTTCTAAAGCTT
TCTGATTCTCAAGATGCTACCAACTGATTCAAAGAAGGCCTTATCATTCAAAAGATGTAT
CGAAGACGGAGACTTGGTTATCGTTTACGAGAGACACGACGTGATGAAAGCGGTTAAAGT
AACCAAAGACGGTGTGCTTCAGAACCGTTTCGGATTCTACAAACACTCTGATTGGATCGG
GAAGCCGTTAGGAGCCAAAGTGTTCAGCAACAAGGGCAAATTCGTGTACCTCCTGGCTCC
CACTCCGGAGCTTTGGACGCTGGTGTTGAGCCACAGGACTCAGATTCTTTACATCGCGGA
TATCAGCTTCGTCGTGATGTATCTAGAAGTCGTGCCTGGATGTGTTGTTCTCGAGTCAGG
CACGGGAAGTGGTTCGCTTTCCACTTCGCTTGCTCGTGCTGTGGCTCCGACTGGTCATGT
GTATTCGTTTGATTTCCACGAGCAACGAGCTGTCTGTGCAAGGGAAGACTTTGAGAAGAC
GGGTGTCAGTAGTTTAGTGACCGTGGAGGTAAGAGATATTCAAGGACAAGGGTTTCCCGA
GAAACTAGAGGGTTTGGCTGATTCTGTGTTTCTAGACCTTCCACAGCCTTGGCTCGCGGT
TCCTTCTGCAGCGAAGATGTTAAAGGAGGATGGAGTTCTCTGCTCTTTCTCGCCTTGCAT
TGAGCAAGTTCAACGTACTTGCGAAGTCCTCAGATCAGATTTCATAGAGATACGAACGTT
TGAGGTGCTTCTCAGAACATACGAAGTGAAGGAAATGAAAGTGGAGACTGGTGCTGTGAT
TGGTGAGAAGCACGATGAGAGGGACAATGGAGGACAGAGACCAAGCAAGAGAAAGCACGT
TTCAAACGAAGACGACTACGCCGTTTCACACGACAACAACTCTTCTACTGCTGCTACTTC
TGTCGTTATGGCTAGGCCATGTAGCGAGGCAAGAGGTCACACTGGGTACTTAACGTTCGC
AAGACTACAGTGCCTATCTTAGATACTTCCAAGATTTTTATCATGTTGTCACTCACTAGC
ACAATTGTTTGTGATACTCAATGTTGTAATGCAAATTTTGAATTTCAATTTTGAACTCTA
CTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK09TF U 1
AF RR2GK09JQ C 581
BS 1 646 RR2GK09TF
BS 647 1206 RR2GK09JQ

RD RR2GK09TF 646 0 0
GGGAATTGAAAAAGGAAAGCGAAAACCCTAGTAAAGGTTTTGTCTCTCTCTGTCTGGATC
AGATTTGTTCTTACCGATCGATCACAAACTCCATTGTCGCCAGCTCAAGTTCTAAAGCTT
TCTGATTCTCAAGATGCTACCAACTGATTCAAAGAAGGCCTTATCATTCAAAAGATGTAT
CGAAGACGGAGACTTGGTTATCGTTTACGAGAGACACGACGTGATGAAAGCGGTTAAAGT
AACCAAAGACGGTGTGCTTCAGAACCGTTTCGGATTCTACAAACACTCTGATTGGATCGG
GAAGCCGTTAGGAGCCAAAGTGTTCAGCAACAAGGGCAAATTCGTGTACCTCCTGGCTCC
CACTCCGGAGCTTTGGACGCTGGTGTTGAGCCACAGGACTCAGATTCTTTACATCGCGGA
TATCAGCTTCGTCGTGATGTATCTAGAAGTCGTGCCTGGATGTGTTGTTCTCGAGTCAGG
CACGGGAAGTGGTTCGCTTTCCACTTCGCTTGCTCGTGCTGTGGCTCCGACTGGTCATGT
GTATTCGTTTGATTTCCACGAGCAACGAGCTGTCTGTGCAAGGGAAGACTTTGAGAAGAC
GGGTGTCAGTAGTTTAGTGACCGTGGAGGTAAGAGATATTCAAGGA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2GK09JQ 626 0 0
AGGGAAGACTTTGAGAAGACGGGTGTCAGTAGTTTAGTGACCGTGGAGGTAAGAGATATT
CAAGGACAAGGGTTTCCCGAGAAACTAGAGGGTTTGGCTGATTCTGTGTTTCTAGACCTT
CCACAGCCTTGGCTCGCGGTTCCTTCTGCAGCGAAGATGTTAAAGGAGGATGGAGTTCTC
TGCTCTTTCTCGCCTTGCATTGAGCAAGTTCAACGTACTTGCGAAGTCCTCAGATCAGAT
TTCATAGAGATACGAACGTTTGAGGTGCTTCTCAGAACATACGAAGTGAAGGAAATGAAA
GTGGAGACTGGTGCTGTGATTGGTGAGAAGCACGATGAGAGGGACAATGGAGGACAGAGA
CCAAGCAAGAGAAAGCACGTTTCAAACGAAGACGACTACGCCGTTTCACACGACAACAAC
TCTTCTACTGCTGCTACTTCTGTCGTTATGGCTAGGCCATGTAGCGAGGCAAGAGGTCAC
ACTGGGTACTTAACGTTCGCAAGACTACAGTGCCTATCTTAGATACTTCCAAGATTTTTA
TCATGTTGTCACTCACTAGCACAATTGTTTGTGATACTCAATGTTGTAATGCAAATTTTG
AATTTCAATTTTGAACTCTACTTCAC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL6538Contig1 795 2 2 U
GATCGAAAAGCAAGCCGGTATCAAATTCGAGCACGTTTCTGCACCGCAGCCTAACGATAT
CGCCAGAGCTGTTGGCATGGAAGCAGCCGAGAAGATCACGCAGGTCTGTGACAGTGTGGT
TCCTGCTTTTTTGGCTGCTGCCAAGGAGCTCTTGGAAAGCTCCGGTGTATCAGCAGAAGT
CCTCCTCGCTAAAGCTCTTGCCAAAACCGCGGGCTTCACTGAGATAAAGAAAAGGTCGCT
TTTAACATCGATGGAGAATCATGTCACGTTGCTTTTTGAAGCGGGGAAACCTATTTACAC
TCCATCATTTGTATGTGGTGTACTGAAGAGAATCTTACCGGATGACAAGGCTAATTCGAT
AGAAGGGTTGACTCTAACAGCAGATGGACAAGCTGCTGTGTTCGATGTTGCGCAGTCGGA
TGTAGACCAGTTTATTTCAGCTGCGCGGAAGAATGCGAGTGTGAGTTTGGAGGTTGTGAA
GGAGTTGCCTAAGCTTCAAGAGAGGGAGCCTGCGCAGAGAAGATTTGGCCGCCCGGGTGG
TGGTGGCCAAGGGTTTAATAACCGTGGCAGAGGAGGTAGTAGATTTGGTCGTGGTGGTGG
TCGTGGTGGTGGACAGAGATGGTGAAACACTTCTTAACACAACAACACCTAATCAAAAAA
ACTCTTTTATAATTTCTACTTTATAATAGTGTTTTTATGTGTGTTATGAACAACTTAAGA
GGGAAGGTAAGCGCTCTTGTGTGTGTTTCCTTTCAGTTTTGTGTAATTTTGATGACAATG
ATGATACAATTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D617TF U 1
AF RR2D617JQ C 157
BS 1 645 RR2D617TF
BS 646 795 RR2D617JQ

RD RR2D617TF 645 0 0
GATCGAAAAGCAAGCCGGTATCAAATTCGAGCACGTTTCTGCACCGCAGCCTAACGATAT
CGCCAGAGCTGTTGGCATGGAAGCAGCCGAGAAGATCACGCAGGTCTGTGACAGTGTGGT
TCCTGCTTTTTTGGCTGCTGCCAAGGAGCTCTTGGAAAGCTCCGGTGTATCAGCAGAAGT
CCTCCTCGCTAAAGCTCTTGCCAAAACCGCGGGCTTCACTGAGATAAAGAAAAGGTCGCT
TTTAACATCGATGGAGAATCATGTCACGTTGCTTTTTGAAGCGGGGAAACCTATTTACAC
TCCATCATTTGTATGTGGTGTACTGAAGAGAATCTTACCGGATGACAAGGCTAATTCGAT
AGAAGGGTTGACTCTAACAGCAGATGGACAAGCTGCTGTGTTCGATGTTGCGCAGTCGGA
TGTAGACCAGTTTATTTCAGCTGCGCGGAAGAATGCGAGTGTGAGTTTGGAGGTTGTGAA
GGAGTTGCCTAAGCTTCAAGAGAGGGAGCCTGCGCAGAGAAGATTTGGCCGCCCGGGTGG
TGGTGGCCAAGGGTTTAATAACCGTGGCAGAGGAGGTAGTAGATTTGGTCGTGGTGGTGG
TCGTGGTGGTGGACAGAGATGGTGAAACACTTCTTAACACAACAA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2D617JQ 639 0 0
AAGCTCCGGTGTATCAGCAGAAGTCCTCCTCGCTAAAGCTCTTGCCAAAACCGCGGGCTT
CACTGAGATAAAGAAAAGGTCGCTTTTAACATCGATGGAGAATCATGTCACGTTGCTTTT
TGAAGCGGGGAAACCTATTTACACTCCATCATTTGTATGTGGTGTACTGAAGAGAATCTT
ACCGGATGACAAGGCTAATTCGATAGAAGGGTTGACTCTAACAGCAGATGGACAAGCTGC
TGTGTTCGATGTTGCGCAGTCGGATGTAGACCAGTTTATTTCAGCTGCGCGGAAGAATGC
GAGTGTGAGTTTGGAGGTTGTGAAGGAGTTGCCTAAGCTTCAAGAGAGGGAGCCTGCGCA
GAGAAGATTTGGCCGCCCGGGTGGTGGTGGCCAAGGGTTTAATAACCGTGGCAGAGGAGG
TAGTAGATTTGGTCGTGGTGGTGGTCGTGGTGGTGGACAGAGATGGTGAAACACTTCTTA
ACACAACAACACCTAATCAAAAAAACTCTTTTATAATTTCTACTTTATAATAGTGTTTTT
ATGTGTGTTATGAACAACTTAAGAGGGAAGGTAAGCGCTCTTGTGTGTGTTTCCTTTCAG
TTTTGTGTAATTTTGATGACAATGATGATACAATTTCGC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL6539Contig1 934 2 4 U
GGGCTTATCCATTTTCTCTCTCTCTCTCTCAGACTTCCTTAAATCGATCCTCTCGAATCC
AAAAACAGAGCCCCTTTTGATTCAAACCCTCTCCCTTGGTCAAAATGACAGGCTTCTCCG
TATCCCTAATCGTGTCGAACTTATCAAACGTCGCATCGTATCTGTCTCCCATCTTCGAGA
CCATCCCGTCGACGAAGGTTGTTCCAGCGCAGATCGAGAAGGTCGTCTCTCTCGTCTCGC
GCACCGGTAGAGATTTGCAGCGTTACGATAACGCAGGCTATCGTCAAGTCGTCGGATGCG
TACCGTACAGATACAAGAAACAACAGGGCAGTGGGGCCGAGTCCAAAGAGATCGAACTTC
TCCTTATAAGTGCTCAAAAGGGTAAAGGAATGTTATTCCCGAAGGGAGGTTGGGAGATTG
ATGAGTCTATGGAGGAAGCAGCTTTGAGAGAGGCGATCGAGGAAGCCGGTGTGACGGGAG
AGCTAGAGGAAAGGCTTGGGAAATGGCAATACAAGAGTAAAAGCCAGAGCGTGATCCACG
AAGGTTACATGTTCGCGTTGCTTGTTGACCAAGAGTATGAGCGGTGGCCTGAAGCTGAGA
CTAGACAACGGAGATGGGTTGGTTTGGATGAAGCGAGAGAGGTGTGTCAGAATTGGTGGA
TGAGAGAAGCTCTCGAAGCATTCGTTAACCTGAAATGTGAGGCCGAGGAGGTTGAGATCT
GAAGCTGATGATGTTTAGTGTTTGGTGGAACAGAGGTTTTAGACTTAGAAACCTTGTCCA
CAGGGATCAGAAGAAGAAGCTTCCTGGTGGGGGGATTCATTTGGGCAACAGCATCTCTCT
GTCTCTTTGAGAGTTGTGTAAAAAGTTTTGATTGTTTGGAGATAACATGTCAACTATATT
CTAATTAATTTTTATCCAAAACTTTTTGTATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ64TF U 1
AF RR2FQ64JQ C 132
BS 1 651 RR2FQ64TF
BS 652 652 RR2FQ64JQ
BS 653 663 RR2FQ64TF
BS 664 934 RR2FQ64JQ

RD RR2FQ64TF 663 0 0
GGGCTTATCCATTTTCTCTCTCTCTCTCTCAGACTTCCTTAAATCGATCCTCTCGAATCC
AAAAACAGAGCCCCTTTTGATTCAAACCCTCTCCCTTGGTCAAAATGACAGGCTTCTCCG
TATCCCTAATCGTGTCGAACTTATCAAACGTCGCATCGTATCTGTCTCCCATCTTCGAGA
CCATCCCGTCGACGAAGGTTGTTCCAGCGCAGATCGAGAAGGTCGTCTCTCTCGTCTCGC
GCACCGGTAGAGATTTGCAGCGTTACGATAACGCAGGCTATCGTCAAGTCGTCGGATGCG
TACCGTACAGATACAAGAAACAACAGGGCAGTGGGGCCGAGTCCAAAGAGATCGAACTTC
TCCTTATAAGTGCTCAAAAGGGTAAAGGAATGTTATTCCCGAAGGGAGGTTGGGAGATTG
ATGAGTCTATGGAGGAAGCAGCTTTGAGAGAGGCGATCGAGGAAGCCGGTGTGACGGGAG
AGCTAGAGGAAAGGCTTGGGAAATGGCAATACAAGAGTAAAAGCCAGAGCGTGATCCACG
AAGGTTACATGTTCGCGTTGCTTGTTGACCAAGAGTATGAGCGGTGGCCTGAAGCTGAGA
CTAGACAACGGAGATGGGTTGGTTTGGATGAAGCGAGAGAGGTGTGTCAGA*TTGGTGGA
TGA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2FQ64JQ 803 0 0
GTGTCGAACTTATCAAACGTCGCATCGTATCTGTCTCCCATCTTCGAGACCATCCCGTCG
ACGAAGGTTGTTCCAGCGCAGATCGAGAAGGTCGTCTCTCTCGTCTCGCGCACCGGTAGA
GATTTGCAGCGTTACGATAACGCAGGCTATCGTCAAGTCGTCGGATGCGTACCGTACAGA
TACAAGAAACAACAGGGCAGTGGGGCCGAGTCCAAAGAGATCGAACTTCTCCTTATAAGT
GCTCAAAAGGGTAAAGGAATGTTATTCCCGAAGGGAGGTTGGGAGATTGATGAGTCTATG
GAGGAAGCAGCTTTGAGAGAGGCGATCGAGGAAGCCGGTGTGACGGGAGAGCTAGAGGAA
AGGCTTGGGAAATGGCAATACAAGAGTAAAAGCCAGAGCGTGATCCACGAAGGTTACATG
TTCGCGTTGCTTGTTGACCAAGAGTATGAGCGGTGGCCTGAAGCTGAGACTAGACAACGG
AGATGGGTTGGTTTGGATGAAGCGAGAGAGGTGTGTCAGAATTGGTGGATGAGAGAAGCT
CTCGAAGCATTCGTTAACCTGAAATGTGAGGCCGAGGAGGTTGAGATCTGAAGCTGATGA
TGTTTAGTGTTTGGTGGAACAGAGGTTTTAGACTTAGAAACCTTGTCCACAGGGATCAGA
AGAAGAAGCTTCCTGGTGGGGGGATTCATTTGGGCAACAGCATCTCTCTGTCTCTTTGAG
AGTTGTGTAAAAAGTTTTGATTGTTTGGAGATAACATGTCAACTATATTCTAATTAATTT
TTATCCAAAACTTTTTGTATTTG

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL6540Contig1 861 2 4 U
GTTCTGATCTTGGACAGGTTAAACAAGCTGAGGAAGTTACCAAAGATGTGATCAAGGGAG
ATGCCGTGAAGATAGAGGAACCAAATGGGAGTTCTCAAGCATCAAGAGAAGATCTTTGGC
CATTCATACCTGATCAGAGTCACAACCATTTGATGGTCATTACCATAAAAGAACCCAATG
CCTAAGAAGGTTCTTGGACAGGGTTAGCTACTAGGCAAGCTCCTTGTGTGTGCTCTTTTC
CTTGCTCTTGGTTTTGTCCCACGAGGTTTTCCAGGAGAAGGTTTTTAACGAGGCCACAAC
TAGCTTACAAGTCACCTTGAAGCATCTCGGTCCAAGACTAAGAAGAAACCATTTCTTCTT
TGTTTCCTTATTTGAACCATATTCTATTTTAAGTTATTTCATTTTGTGTGTCGACGAGGA
GCATGTTCCTTTAGTCTTTATATTGTTTGCAAAACTCATTGAGAAGGTTACACTTGATAT
TTTATAAAACTTTCTTTCAAAGAAAACCTAGAGCTCTCAACTGAACTCGCAGCCGCCTCC
TTGCCTTGTGAGGCCAGTACCTCCACGGCTTGAAGGTTCCCTTGTGTTGTATCACGAGCC
TTCCATCTCTCGTGTGGTGCACTTCAATCCACATTGTTCTTAGTCCACGGTTTCTCTTGG
TTGATTAGATCAAACAATAGAACCACCTCTTGATCTAGAACTGCTCCATCTCTCTTGCTT
GGATCATACAGCCTTTGTCAGCCTAGGCTCGTATCATTTCTGGTATCAGAGCTGAAGTTC
CTTCAGCATCAGGTTGTATCTATCCTCCTTAGTTGTTTCAAATCTTGTAGTTCATCTTGT
TTCATCCGTTTTGCTTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ09TF U 1
AF RR2BQ09JQ C 134
BS 1 746 RR2BQ09TF
BS 747 747 RR2BQ09JQ
BS 748 766 RR2BQ09TF
BS 767 861 RR2BQ09JQ

RD RR2BQ09TF 766 0 0
GTTCTGATCTTGGACAGGTTAAACAAGCTGAGGAAGTTACCAAAGATGTGATCAAGGGAG
ATGCCGTGAAGATAGAGGAACCAAATGGGAGTTCTCAAGCATCAAGAGAAGATCTTTGGC
CATTCATACCTGATCAGAGTCACAACCATTTGATGGTCATTACCATAAAAGAACCCAATG
CCTAAGAAGGTTCTTGGACAGGGTTAGCTACTAGGCAAGCTCCTTGTGTGTGCTCTTTTC
CTTGCTCTTGGTTTTGTCCCACGAGGTTTTCCAGGAGAAGGTTTTTAACGAGGCCACAAC
TAGCTTACAAGTCACCTTGAAGCATCTCGGTCCAAGACTAAGAAGAAACCATTTCTTCTT
TGTTTCCTTATTTGAACCATATTCTATTTTAAGTTATTTCATTTTGTGTGTCGACGAGGA
GCATGTTCCTTTAGTCTTTATATTGTTTGCAAAACTCATTGAGAAGGTTACACTTGATAT
TTTATAAAACTTTCTTTCAAAGAAAACCTAGAGCTCTCAACTGAACTCGCAGCCGCCTCC
TTGCCTTGTGAGGCCAGTACCTCCACGGCTTGAAGGTTCCCTTGTGTTGTATCACGAGCC
TTCCATCTCTCGTGTGGTGCACTTCAATCCACATTGTTCTTAGTCCACGGTTTCTCTTGG
TTGATTAGATCAAACAATAGAACCACCTCTTGATCTAGAACTGCTCCATCTCTCTTGCTT
GGATCATACAGCCTTTGTCAGCCTAG*CTCGTATCATTTCTGGTAT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2BQ09JQ 728 0 0
TCAGAGTCACAACCATTTGATGGTCATTACCATAAAAGAACCCAATGCCTAAGAAGGTTC
TTGGACAGGGTTAGCTACTAGGCAAGCTCCTTGTGTGTGCTCTTTTCCTTGCTCTTGGTT
TTGTCCCACGAGGTTTTCCAGGAGAAGGTTTTTAACGAGGCCACAACTAGCTTACAAGTC
ACCTTGAAGCATCTCGGTCCAAGACTAAGAAGAAACCATTTCTTCTTTGTTTCCTTATTT
GAACCATATTCTATTTTAAGTTATTTCATTTTGTGTGTCGACGAGGAGCATGTTCCTTTA
GTCTTTATATTGTTTGCAAAACTCATTGAGAAGGTTACACTTGATATTTTATAAAACTTT
CTTTCAAAGAAAACCTAGAGCTCTCAACTGAACTCGCAGCCGCCTCCTTGCCTTGTGAGG
CCAGTACCTCCACGGCTTGAAGGTTCCCTTGTGTTGTATCACGAGCCTTCCATCTCTCGT
GTGGTGCACTTCAATCCACATTGTTCTTAGTCCACGGTTTCTCTTGGTTGATTAGATCAA
ACAATAGAACCACCTCTTGATCTAGAACTGCTCCATCTCTCTTGCTTGGATCATACAGCC
TTTGTCAGCCTAGGCTCGTATCATTTCTGGTATCAGAGCTGAAGTTCCTTCAGCATCAGG
TTGTATCTATCCTCCTTAGTTGTTTCAAATCTTGTAGTTCATCTTGTTTCATCCGTTTTG
CTTTTATC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL6541Contig1 684 2 3 U
TTTGAAGATTTAACAGCTTAAACATAGGAGGAACAAAAAACAAGTAAGGAAACCTGTTGT
TACTTGTATAACTTCTTACATAAGTCTTTGTGAAAAGATGTTTGAAAATCTAAAAAAGAG
CAAAAAAGGTGAAGGGACTGATGATCATTGGAAACAAGAATTGTTTTCCTTCTCTTTGTT
TCCATACATATAAAAACACACACATTCATGTGTATAGATATTTCTCCTCTCACCCTTCTT
TCTCCACCTTTTCTTCATTCTGCATGACTTTTATTAACCTCTCCCTCACTACTCTTCGAT
TCCTCCTCACTACTCTTCGATGATTCATCAAACGCCATCAACGGTTTGATGACACCGTTC
CAAATGCAGTGAGAAGCTAGGAACCCAATGACGGCTGGGACAATGTATAACAAAGCAGGC
TGTGCTGCTTGAAACCAGTTCATGACTACAATAGTGAGGACAACGCCAGCAACGTATCCC
ACAAACGCACTTGTGAAGTACTGTGGTTTACTGCGTCTTGACACATCAAATCTTAGAGCC
AGTGCCACAAATATACCAGGAATGACAATATCACCAAGCCCAAGCATAGAGTAGGGTCTT
AGAGCATCACCCGTAGGGAATAAAAGCTTTATCGGAGCATCAAAAGATTTGGCAACACTA
ACCATAACCGGGGTGAAGAAAACC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED58JQ U 4
AF RR2ED58TF C 1
BS 1 3 RR2ED58TF
BS 4 640 RR2ED58JQ
BS 641 684 RR2ED58TF

RD RR2ED58JQ 637 0 0
GAAGATTTAACAGCTTAAACATAGGAGGAACAAAAAACAAGTAAGGAAACCTGTTGTTAC
TTGTATAACTTCTTACATAAGTCTTTGTGAAAAGATGTTTGAAAATCTAAAAAAGAGCAA
AAAAGGTGAAGGGACTGATGATCATTGGAAACAAGAATTGTTTTCCTTCTCTTTGTTTCC
ATACATATAAAAACACACACATTCATGTGTATAGATATTTCTCCTCTCACCCTTCTTTCT
CCACCTTTTCTTCATTCTGCATGACTTTTATTAACCTCTCCCTCACTACTCTTCGATTCC
TCCTCACTACTCTTCGATGATTCATCAAACGCCATCAACGGTTTGATGACACCGTTCCAA
ATGCAGTGAGAAGCTAGGAACCCAATGACGGCTGGGACAATGTATAACAAAGCAGGCTGT
GCTGCTTGAAACCAGTTCATGACTACAATAGTGAGGACAACGCCAGCAACGTATCCCACA
AACGCACTTGTGAAGTACTGTGGTTTACTGCGTCTTGACACATCAAATCTTAGAGCCAGT
GCCACAAATATACCAGGAATGACAATATCACCAAGCCCAAGCATAGAGTAGGGTCTTAGA
GCATCACCCGTAGGGAATAAAAGCTTTATCGGAGCAT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2ED58TF 684 0 0
TTTGAAGATTTAACAGCTTAAACATAGGAGGAACAAAAA*CAAGTAAGGAAAC*TGTTGT
TACTTGTATAACTTCTTACATAAGTCTTTGTGAAAAGATGTTTGAAAATCTAAAAAAGAG
CAAAAAAGGTGAAGGGACTGATGATCATTGGAAACAAGAATTGTTTTCCTTCTCTTTGTT
TCCATACATATAAAAACACACACATTCATGTGTATAGATATTTCTCCTCTCACCCTTCTT
TCTCCACCTTTTCTTCATTCTGCATGACTTTTATTAACCTCTCCCTCACTACTCTTCGAT
TCCTCCTCACTACTCTTCGATGATTCATCAAACGCCATCAACGGTTTGATGACACCGTTC
CAAATGCAGTGAGAAGCTAGGAACCCAATGACGGCTGGGACAATGTATAACAAAGCAGGC
TGTGCTGCTTGAAACCAGTTCATGACTACAATAGTGAGGACAACGCCAGCAACGTATCCC
ACAAACGCACTTGTGAAGTACTGTGGTTTACTGCGTCTTGACACATCAAATCTTAGAGCC
AGTGCCACAAATATACCAGGAATGACAATATCACCAAGCCCAAGCATAGAGTAGGGTCTT
AGAGCATCACCCGTAGGGAATAAAAGCTTTATCGGAGCATCAAAAGATTTGGCAACACTA
ACCATAACCGGGGTGAAGAAAACC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL6542Contig1 676 2 2 U
TTTTTCGGTTATTTATTTAGTCTAAGACCTCTAACTTGCTCTTTTCTCCTTGTTACAGGA
GATCGCAAGGTTTAGGAAAATCAGAACAGACAACAGCCAAGGCCTACCGACACCACCATG
GGTGATCACGGTCATCAGGATGATCTCGCTGCAGCAATGCAACTGATGCAACAGCAGATG
CTTCAAATGCAACAGCAGATGCTTCAAATGCAGCAGACCATCCAAGCTCAGCAAGCAGCG
CAAACTGTTCCAATCGGGGAGAGAAACCTTCCGCGGAACATTCCTACTACGCGCTCTGCC
ATTGTTCCTCCACTCTGCACCAGGAAGGACTTCGAGATCAAGCCTTGCTCTGATTGATCT
GGTGCAAAGAAAAGTGTTCTCTGGTCTCTCTGCAGAAATTCCAATGGAGCATATTGAGAA
TTTCGAAAAAGTCTGCAGTTTTACTCGTGCAAATGGTGTGCCACCAGACTATATCAAGTG
CATGCTATTCCCATTCTCTCTTGATGGAAAAGCTGCACGGTGGTTGAACTCCCTCCCAAC
AGGCTCTCTCACTTCATGGGAACAAGTCCGATCAGCGTTCCTCAACTATTTCTACTCTAA
GGCGAGAACAGCTGCATTGAGGAACAAGATCACTTCATTCAGACAGCTCCATGATGAGCC
TTTTTGTGACACATGT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EB21TF C 1
AF RR2EB21JQ U 6
BS 1 5 RR2EB21TF
BS 6 676 RR2EB21JQ

RD RR2EB21TF 676 0 0
TTTTTCGGTTATTTATTTAGTCTAAGACCTCTAACTTGCTCTTTTCTCCTTGTTACAGGA
GATCGCAAGGTTTAGGAAAATCAGAACAGACAACAGCCAAGGCCTACCGACACCACCATG
GGTGATCACGGTCATCAGGATGATCTCGCTGCAGCAATGCAACTGATGCAACAGCAGATG
CTTCAGATGCAACAGCAGATGCTTCAGATGCAGCAGACCATCCAAGCTCAGCAAGCAGCG
CAGACTGTTCCAATCGGGGAGAGAAACCTTCCGCGGAACATTCCTACTACGCGCTCTGCC
ATTGTTCCTCCACTCTGCACCAGGAAGGACTTCGAGATCAAGCCTTGCTCTGATTGATCT
GGTGCAAAGAAAAGTGTTCTCTGGTCTCTCTGCAGAAATTCCAATGGAGCATATTGAGAA
TTTCGAAAAAGTCTGCAGTTTTACTCGTGCAAATGGTGTGCCACCAGACTATATCAAGTG
CATGCTATTCCCATTCTCTCTTGATGGAAAAGCTGCACGGTGGTTGAACTCCCTCCCAAC
AGGCTCTCTCACTTCATGGGAACAAGTCCGATCAGCGTTCCTCAACTATTTCTACTCTAA
GGCGAGAACAGCTGCATTGAGGAACAAGATCACTTCATTCAGACAGCTCCATGATGAGCC
TTTTTGTGACACATGT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2EB21JQ 671 0 0
CGGTTATTTATTTAGTCTAAGACCTCTAACTTGCTCTTTTCTCCTTGTTACAGGAGATCG
CAAGGTTTAGGAAAATCAGAACAGACAACAGCCAAGGCCTACCGACACCACCATGGGTGA
TCACGGTCATCAGGATGATCTCGCTGCAGCAATGCAACTGATGCAACAGCAGATGCTTCA
AATGCAACAGCAGATGCTTCAAATGCAGCAGACCATCCAAGCTCAGCAAGCAGCGCAAAC
TGTTCCAATCGGGGAGAGAAACCTTCCGCGGAACATTCCTACTACGCGCTCTGCCATTGT
TCCTCCACTCTGCACCAGGAAGGACTTCGAGATCAAGCCTTGCTCTGATTGATCTGGTGC
AAAGAAAAGTGTTCTCTGGTCTCTCTGCAGAAATTCCAATGGAGCATATTGAGAATTTCG
AAAAAGTCTGCAGTTTTACTCGTGCAAATGGTGTGCCACCAGACTATATCAAGTGCATGC
TATTCCCATTCTCTCTTGATGGAAAAGCTGCACGGTGGTTGAACTCCCTCCCAACAGGCT
CTCTCACTTCATGGGAACAAGTCCGATCAGCGTTCCTCAACTATTTCTACTCTAAGGCGA
GAACAGCTGCATTGAGGAACAAGATCACTTCATTCAGACAGCTCCATGATGAGCCTTTTT
GTGACACATGT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL6543Contig1 433 2 2 U
AGGTATAAAACTAGCAGGCAAAAATTCAAGAATAAAGAAAAGTATCCAAACTCGAATAAA
CCATTGATTAACGGCCAAATGTAACAACGTCTTTGTGTCTTCAAAGACACAAGCATAATA
CTCCAAAACACAAATCCAAAAAACAAAAAACTCAAAAAGTTATTAAAAGTAAATTTTTTT
TTTAACCCTCGATCTGCTCTCTCAACCTCCTGAAAGTGCTTCTAACGGTGACGGCACTGG
CGGTGTTCATGGTGTAGGCACCACCGGCCTTGACCTTGCCACAGTCCTTGCATCCCCAAA
TACCAACAGCCTTTCCCTTTCCCGTCTCTCTAAAATTGCAGTCATGGTAAAATCCTTGGT
TTATTTAATCATCAGGGACTCCCAAGCACACAAATTCTCTAAAACTATAAGTAAATAGTT
GAAAGCTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F950TF C 1
AF RR2F950JQ U 105
BS 1 106 RR2F950TF
BS 107 433 RR2F950JQ

RD RR2F950TF 433 0 0
AGGTATAAAACTAGCAGGCAAAAATTCAAGAATAAAGAAAAGTATCCAAACTCGAATAAA
CCATTGATTAACGGCCAAATGTAACAACGTCTTTGTGTCTTCAAAGACACAAGCATAGTA
CTCCAAAACACAAATCCAAAAAACAAAGAACTCAAAAAGTTATTAAAAGTAGATTTTTTT
TTTAACCCTCGATCTGCTCTCTCAACCTCCTGATAGTGCTTCTAACGGTGACGGCACTGG
CGGTGTTCATGGTGTAGGCACCACCGGCCTTGACCTTGCCACAGTCCTTGCATCCCCAGA
TACCAACAGCCTTTCGCTTTCGCGTCTCTCTAAAATTGCAGTCATGGTAAAATCCTTGGT
TTATTTAATCATCAGGGACTCCCAAGCACACAAATTCTCTAAAACTATAAGTAGATAGTT
GAGAGCTTGTTCC

QA 1 433 1 433
DS 

RD RR2F950JQ 329 0 0
AA
ACACAAGCATAATACTCCAAAACACAAATCCAAAAAACAAAAAACTCAAAAAGTTATTAA
AAGTAAATTTTTTTTTTAACCCTCGATCTGCTCTCTCAACCTCCTGAAAGTGCTTCTAAC
GGTGACGGCACTGGCGGTGTTCATGGTGTAGGCACCACCGGCCTTGACCTTGCCACAGTC
CTTGCATCCCCAAATACCAACAGCCTTTCCCTTTCCCGTCTCTCTAAAATTGCAGTCATG
GTAAAATCCTTGGTTTATTTAATCATCAGGGACTCCCAAGCACACAAATTCTCTAAAACT
ATAAGTAAATAGTTGAAAGCTTGTTCC

QA 3 329 3 329
DS 



AS 1 2

CO CL6544Contig1 955 2 2 U
GATACCTGACCATAATGTCCAGCGTCGATTTTGAGGAAGCTGGTCACAAGTTGCTTAAGA
TTAAACTCGAACCAGGTCAAGAGATGGAGCTGTGCATAATGCTCCTGGAGTGTTGCTCTC
AGGAGAGAACGTATCTGCGCTACTACGGTTTGTTGGGTCAGCGTTTCTGCATGATCAACA
AAATTCACCAAGAGAATTTCGAGAAGTGTTTTGTTCAGCAGTACTCCATGATCCACCGTC
TTGAGACGAACAAGCTGCGTAACGTGGCTAAGTTTTTTGCTCATTTACTGGGCACAGATG
CTCTCCCGTGGCACGTGCTTGCCTACATTCGGTTAACCGAGGAGGACACTACTTCATCCT
CCCGAATCTTCATTAAGATCCTTTTCCAGGAATTGTCAGAACACTTGGGGATCAGGCTGC
TTAACGAGAGGCTTCAGGATCCAACAATGCAGGAATCACTTGAATCCATCTTCCCTAAAG
ATAATCCCAAGAACACGAGGTTTGCAATCAACTTCTTTACCTCCATTGGTCTTGGAGGGA
TCACAGAGTCTCTCAGAGAGTATCTGAAGAACATGCCACGCCTCATCATGCAACAACAGA
AGCAAGTTGAGGAATCAGAATCAGGATCATCATCCGGATCAGACAGTTCTGGTTCCGAGT
CTTCTGATTCAGATTCGTCGTCATCTTCTTCGTCTAGTTCAGATGAAAGTGACAGAGAGA
AGAGGAAGCGAAGAAGAAGATCTTGAGAGAGAGGAAGGATATGTTTTGTTTAGTCACTTG
AACCAAAATTCTTAAGATTTTCAAATCTGGTTTTGGTTAATTCAACTTGAATTTACATGA
GACCTCAATGAGAAAATCCTATTGGATTCTGTTCTTTCATAAGTTGATGGATGCATCATA
TGAGCTTGTTTCATGATATTTGTTTTTGGTTTTGGAAACCTCAGATCCTTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI74TF U 1
AF RR2BI74JQ C 184
BS 1 751 RR2BI74TF
BS 752 955 RR2BI74JQ

RD RR2BI74TF 751 0 0
GATACCTGACCATAATGTCCAGCGTCGATTTTGAGGAAGCTGGTCACAAGTTGCTTAAGA
TTAAACTCGAACCAGGTCAAGAGATGGAGCTGTGCATAATGCTCCTGGAGTGTTGCTCTC
AGGAGAGAACGTATCTGCGCTACTACGGTTTGTTGGGTCAGCGTTTCTGCATGATCAACA
AAATTCACCAAGAGAATTTCGAGAAGTGTTTTGTTCAGCAGTACTCCATGATCCACCGTC
TTGAGACGAACAAGCTGCGTAACGTGGCTAAGTTTTTTGCTCATTTACTGGGCACAGATG
CTCTCCCGTGGCACGTGCTTGCCTACATTCGGTTAACCGAGGAGGACACTACTTCATCCT
CCCGAATCTTCATTAAGATCCTTTTCCAGGAATTGTCAGAACACTTGGGGATCAGGCTGC
TTAACGAGAGGCTTCAGGATCCAACAATGCAGGAATCACTTGAATCCATCTTCCCTAAAG
ATAATCCCAAGAACACGAGGTTTGCAATCAACTTCTTTACCTCCATTGGTCTTGGAGGGA
TCACAGAGTCTCTCAGAGAGTATCTGAAGAACATGCCACGCCTCATCATGCAACAACAGA
AGCAAGTTGAGGAATCAGAATCAGGATCATCATCCGGATCAGACAGTTCTGGTTCCGAGT
CTTCTGATTCAGATTCGTCGTCATCTTCTTCGTCTAGTTCAGATGAAAGTGACAGAGAGA
AGAGGAAGCGAAGAAGAAGATCTTGAGAGAG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2BI74JQ 772 0 0
TTCACCAAGAGAATTTCGAGAAGTGTTTTGTTCAGCAGTACTCCATGATCCACCGTCTTG
AGACGAACAAGCTGCGTAACGTGGCTAAGTTTTTTGCTCATTTACTGGGCACAGATGCTC
TCCCGTGGCACGTGCTTGCCTACATTCGGTTAACCGAGGAGGACACTACTTCATCCTCCC
GAATCTTCATTAAGATCCTTTTCCAGGAATTGTCAGAACACTTGGGGATCAGGCTGCTTA
ACGAGAGGCTTCAGGATCCAACAATGCAGGAATCACTTGAATCCATCTTCCCTAAAGATA
ATCCCAAGAACACGAGGTTTGCAATCAACTTCTTTACCTCCATTGGTCTTGGAGGGATCA
CAGAGTCTCTCAGAGAGTATCTGAAGAACATGCCACGCCTCATCATGCAACAACAGAAGC
AAGTTGAGGAATCAGAATCAGGATCATCATCCGGATCAGACAGTTCTGGTTCCGAGTCTT
CTGATTCAGATTCGTCGTCATCTTCTTCGTCTAGTTCAGATGAAAGTGACAGAGAGAAGA
GGAAGCGAAGAAGAAGATCTTGAGAGAGAGGAAGGATATGTTTTGTTTAGTCACTTGAAC
CAAAATTCTTAAGATTTTCAAATCTGGTTTTGGTTAATTCAACTTGAATTTACATGAGAC
CTCAATGAGAAAATCCTATTGGATTCTGTTCTTTCATAAGTTGATGGATGCATCATATGA
GCTTGTTTCATGATATTTGTTTTTGGTTTTGGAAACCTCAGATCCTTAAACC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL6545Contig1 888 2 2 U
CATTATTGCTTTTCTAAGGAAACAACGAAAAACGATGCAAATGTATCGAATACAAAGTAG
TAGTCTGTTCAACAAAATTTGAAACACAAAAATTACGAGAGCTTATATAAGAAAACAAAC
AACAAAGGTAGACGTTATAAGACGCAAAACGCAAAAACAGAAACAATCAAAGGTAGAAGG
AAAAAGAATGAGCCAGATTATCATTATTATTACCTTGTTCTCGTTCAGACAAAAGCAGGC
ATGTCCTTGAGCCATGCATCAAGTGGCTTACCAATGGAGTAAACGATGAAACCAATCTCT
CTCAACTTGTCCACATTCAAAACGTTTCTCCCGTCGAAGATAAAAGCTGGTTTCTGCATG
TTGTCAAAGATCTTCTGGTAATCCAATGACTTGAACTCATCCCACTCGGTCAGAACGCAG
ACCGCGTGTGCGTCTTTTGTAGCTTCATACGCATCCCATTTCACACTCACTTGTTTCACC
GTGGTCGGGCTCATTGGCTGCAAGTGAAGCGGATGGTCCCAATCGAACTTTTTCATCGCA
AGGTCTCTCTGAATCTGTTCCTCAGTGACTTGAGGATCGTAGATGCTGATCTGCGCCTTG
TCCCCTAACAAACCTTTGCACACATCAATGGCTGGCGTTTCCCTAGTGTCACCGGTGTCT
TTCTTGAACGCGAAACCGAGGATCGCAACCTTCTTGTTGGAGACGGTGTTGAACATAGAA
GAGACGATTCTGTTCACAAACCGGTTCTTCTGGTAATCGTTGATCTTGATCACTTGTTTC
CAGACTCCGCCACTTCCGGAAGACCATTGCACTGACAGATGTAGACAAGGTTCAAAATGT
CCTTCTGGAAACAAGAACCTCCGAATCCGACACTAGCGTTCAAGCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD81JQ U 1
AF RR2AA17TF C 124
BS 1 774 RR2AD81JQ
BS 775 888 RR2AA17TF

RD RR2AD81JQ 774 0 0
CATTATTGCTTTTCTAAGGAAACAACGAAAAACGATGCAAATGTATCGAATACAAAGTAG
TAGTCTGTTCAACAAAATTTGAAACACAAAAATTACGAGAGCTTATATAAGAAAACAAAC
AACAAAGGTAGACGTTATAAGACGCAAAACGCAAAAACAGAAACAATCAAAGGTAGAAGG
AAAAAGAATGAGCCAGATTATCATTATTATTACCTTGTTCTCGTTCAGACAAAAGCAGGC
ATGTCCTTGAGCCATGCATCAAGTGGCTTACCAATGGAGTAAACGATGAAACCAATCTCT
CTCAACTTGTCCACATTCAAAACGTTTCTCCCGTCGAAGATAAAAGCTGGTTTCTGCATG
TTGTCAAAGATCTTCTGGTAATCCAATGACTTGAACTCATCCCACTCGGTCAGAACGCAG
ACCGCGTGTGCGTCTTTTGTAGCTTCATACGCATCCCATTTCACACTCACTTGTTTCACC
GTGGTCGGGCTCATTGGCTGCAAGTGAAGCGGATGGTCCCAATCGAACTTTTTCATCGCA
AGGTCTCTCTGAATCTGTTCCTCAGTGACTTGAGGATCGTAGATGCTGATCTGCGCCTTG
TCCCCTAACAAACCTTTGCACACATCAATGGCTGGCGTTTCCCTAGTGTCACCGGTGTCT
TTCTTGAACGCGAAACCGAGGATCGCAACCTTCTTGTTGGAGACGGTGTTGAACATAGAA
GAGACGATTCTGTTCACAAACCGGTTCTTCTGGTAATCGTTGATCTTGATCACT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2AA17TF 765 0 0
AAAGGTAGACGTTATAAGACGCAAAACGCAAAAACAGAAACAATCGAAGGTAGAAGGAAA
AAGAATGAGCCAGATTATCATTATTATTAC*TTGTTCTCGTTCAGACAAAAGCAGGCATG
TCCTTGAGCCATGCATCAAGTGGCTTACCAATGGAGTAAACGATGAAACCAATCTCTCTC
AACTTGTCCACATTCAAAACGTTTCTCCCGTCGAAGATAAAAGCTGGTTTCTGCATGTTG
TCAAAGATCTTCTGGTAGTCCAATGACTTGAACTCATCCCACTCGGTCAGAACGCAGACC
GCGTGTGCGTCTTTTGTAGCTTCATACGCATCCCATTTCACACTCACTTGTTTCACCGTG
GTCGGGCTCATTGGCTGCAAGTGAAGCGGATGGTCCCAATCGAACTTTTTGTTCGCAAGG
TCTCTCTGAATCTGTTCCTCAGTGACTTGAGGATCGTAGATGCTGATCTGCGCCTTGTCC
CCTAACAAACCTTTGCACACATCAATGGCTGGCGTTTCCCTAGTGTCACCGGTGTCTTTC
TTGAACGCGAAACCGAGGATCGCAACCTTCTTGTTGGAGACGGTGTTGAACATAGAAGAG
ACGATTCTGTTCACAAACCGGTTCTTCTGGTAATCGTTGATCTTGATCACTTGTTTCCAG
ACTCCGCCACTTCCGGAAGACCATTGCACTGACAGATGTAGACAAGGTTCAAAATGTCCT
TCTGGAAACAAGAACCTCCGAATCCGACACTAGCGTTCAAGCCCT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL6546Contig1 630 2 1 U
GGATTTTCGTCTAATCTCCGCCTCCCCCGAGAAACTGATTATCCTAAGCTTCACCAGACG
ACGACAATGGCTGAAGGACTCGTTCTGAAGGGCACCATGCGTGCACACACCGACATGGTC
ACCGCCATCGCCTCCCCCGAGAAGCTTTACTCTCTTGAGGCTAACTCTGTCATTCATGCT
CTTACCTTTAGCCCTAATAGGTATTGGCTATGTGCTGCTACTGAGCAGGGTATTAAGATT
TGGGATCTTGAGAGTAAGAGTGTTGTTGAGGACTTGAAGGTTGATCTCAAGGCTGAGGCT
GAGAAGTCTGATGGAAGTGGTAGTGCTGCCACCAGAAGGAAGGTTATCTACTGCACCAGC
CTGAACTGGAGTGCGGATGGAAGCACCTTGTTCAGTGGATATACCGATGGAGTTATCAGA
GTTTGGGGTATTGGACGTTACTAGTTTATCCCATCTCTTTGCTCTGTCTCTCTCCTTGGT
TGTGTTTTTATGTATCACTCTTTTCTTTTGTCAACAAACTGAGATTTTGCAATAATGTTT
GGTTTTATGTCAATTCTAGGTTTGGATCTTCTTATATTGTTTATGAAATTATGAGATCTT
GTTGTTTGAAGTTACTTCTGTTTTGTGGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CO68JQ C 1
AF RR2CO68TF U 1
BS 1 630 RR2CO68TF

RD RR2CO68JQ 630 0 0
GGATTTTCGTCTAATCTCCGCCTCCCCCGAGAAACTGATTATCCTAAGCTTCACCAGACG
ACGACAATGGCTGAAGGACTCGTTCTGAAGGGCACCATGCGTGCACACACCGACATGGTC
ACCGCCATCGCCTCCCCCGAGAAGCTTTACTCTCTTGAGGCTAACTCTGTCATTCATGCT
CTTACCTTTAGCCCTAATAGGTATTGGCTATGTGCTGCTACTGAGCAGGGTATTAAGATT
TGGGATCTTGAGAGTAAGAGTGTTGTTGAGGACTTGAAGGTTGATCTCAAGGCTGAGGCT
GAGAAGTCTGATGGAAGTGGTAGTGCTGCCACCAGAAGGAAGGTTATCTACTGCACCAGC
CTGAACTGGAGTGCGGATGGAAGCACCTTGTTCAGTGGATATACCGATGGAGTTATCAGA
GTTTGGGGTATTGGACGTTACTAGTTTATCCCATCTCTTTGCTCTGTCTCTCTCCTTGGT
TGTGTTTTTATGTATCACTCTTTTCTTTTGTCAACAAACTGAGATTTTGCAATAATGTTT
GGTTTTATGTCAATTCTAGGTTTGGATCTTCTTATATTGTTTATGAAATTATGAGATCTT
GTTGTTTGAAGTTACTTCTGTTTTGTGGCC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2CO68TF 630 0 0
GGATTTTCGTCTAATCTCCGCCTCCCCCGAGAAACTGATTATCCTAAGCTTCACCAGACG
ACGACAATGGCTGAAGGACTCGTTCTGAAGGGCACCATGCGTGCACACACCGACATGGTC
ACCGCCATCGCCTCCCCCGAGAAGCTTTACTCTCTTGAGGCTAACTCTGTCATTCATGCT
CTTACCTTTAGCCCTAATAGGTATTGGCTATGTGCTGCTACTGAGCAGGGTATTAAGATT
TGGGATCTTGAGAGTAAGAGTGTTGTTGAGGACTTGAAGGTTGATCTCAAGGCTGAGGCT
GAGAAGTCTGATGGAAGTGGTAGTGCTGCCACCAGAAGGAAGGTTATCTACTGCACCAGC
CTGAACTGGAGTGCGGATGGAAGCACCTTGTTCAGTGGATATACCGATGGAGTTATCAGA
GTTTGGGGTATTGGACGTTACTAGTTTATCCCATCTCTTTGCTCTGTCTCTCTCCTTGGT
TGTGTTTTTATGTATCACTCTTTTCTTTTGTCAACAAACTGAGATTTTGCAATAATGTTT
GGTTTTATGTCAATTCTAGGTTTGGATCTTCTTATATTGTTTATGAAATTATGAGATCTT
GTTGTTTGAAGTTACTTCTGTTTTGTGGCC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL6547Contig1 630 2 1 U
GGGAGTACAATCCAAACAACTTTGCATCATATGAAAAAACAGAGAACGGAACCAAACAGG
ATCCGAGGTTACTGAAGCAGTATGGAAAGTTTGAGAGAAAGTATGTAAAGAGTGGTCAGA
ACGAGCAACATCACAACACGCTTGCTGTTTTCGTTGTGGCGAGTGTTCTTGAAACAAAGA
ACAAACGTCTCTTGAAAGAAGCTAAAGGCCTAGACGACGTTGTTCAGATATTGGGTGGTA
TTGCGGGTAATTTGGACGCAAGAAAGGCGTGTAAAGAAGCGTTAAAGATTCATGAAAAGT
TTTTGAGAAAGGCTAATAAGCAATAGACATATTGCTTAACCATCAACCATATGTTATCCG
GTTTTATTAAACCGATTTCGGTATGATCTTGGCCTGGATTGGTTACCGTTGGACGCTGAT
AAATGTAGTAAAGATTGCGGGAGGGATCCCATGAGAACGTCTCTAGTTCACTTGTTCTCT
CATGTTGATATGATCTATACCTACGTGTGCCGTTTCTTGTTTAAAAGAAGGAACTTCGTG
TCGTTTTATTTTTTTTCATCTTCTGTGGAAAATGATGCAAGTGTAATCAACTAACTAATC
ATTCTTGAAATTCGATATATTTGTTTCGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CJ91JQ C 1
AF RR2CJ91TF U 1
BS 1 630 RR2CJ91TF

RD RR2CJ91JQ 630 0 0
GGGAGTACAATCCAAACAACTTTGCATCATATGAAAAAACAGAGAACGGAACCAAACAGG
ATCCGAGGTTACTGAAGCAGTATGGAAAGTTTGAGAGAAAGTATGTAAAGAGTGGTCAGA
ACGAGCAACATCACAACACGCTTGCTGTTTTCGTTGTGGCGAGTGTTCTTGAAACAAAGA
ACAAACGTCTCTTGAAAGAAGCTAAAGGCCTAGACGACGTTGTTCAGATATTGGGTGGTA
TTGCGGGTAATTTGGACGCAAGAAAGGCGTGTAAAGAAGCGTTAAAGATTCATGAAAAGT
TTTTGAGAAAGGCTAATAAGCAATAGACATATTGCTTAACCATCAACCATATGTTATCCG
GTTTTATTAAACCGATTTCGGTATGATCTTGGCCTGGATTGGTTACCGTTGGACGCTGAT
AAATGTAGTAAAGATTGCGGGAGGGATCCCATGAGAACGTCTCTAGTTCACTTGTTCTCT
CATGTTGATATGATCTATACCTACGTGTGCCGTTTCTTGTTTAAAAGAAGGAACTTCGTG
TCGTTTTATTTTTTTTCATCTTCTGTGGAAAATGATGCAAGTGTAATCAACTAACTAATC
ATTCTTGAAATTCGATATATTTGTTTCGTG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2CJ91TF 630 0 0
GGGAGTACAATCCAAACAACTTTGCATCATATGAAAAAACAGAGAACGGAACCAAACAGG
ATCCGAGGTTACTGAAGCAGTATGGAAAGTTTGAGAGAAAGTATGTAAAGAGTGGTCAGA
ACGAGCAACATCACAACACGCTTGCTGTTTTCGTTGTGGCGAGTGTTCTTGAAACAAAGA
ACAAACGTCTCTTGAAAGAAGCTAAAGGCCTAGACGACGTTGTTCAGATATTGGGTGGTA
TTGCGGGTAATTTGGACGCAAGAAAGGCGTGTAAAGAAGCGTTAAAGATTCATGAAAAGT
TTTTGAGAAAGGCTAATAAGCAATAGACATATTGCTTAACCATCAACCATATGTTATCCG
GTTTTATTAAACCGATTTCGGTATGATCTTGGCCTGGATTGGTTACCGTTGGACGCTGAT
AAATGTAGTAAAGATTGCGGGAGGGATCCCATGAGAACGTCTCTAGTTCACTTGTTCTCT
CATGTTGATATGATCTATACCTACGTGTGCCGTTTCTTGTTTAAAAGAAGGAACTTCGTG
TCGTTTTATTTTTTTTCATCTTCTGTGGAAAATGATGCAAGTGTAATCAACTAACTAATC
ATTCTTGAAATTCGATATATTTGTTTCGTG

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL6548Contig1 523 2 5 U
GGTAATACTTTCGTTTTTTCGTTTCTCTGTTGTAAAAGCTTTTACATTTTGAGTGTTGTT
CTGTTCTGTTCTCCCACCATACTGTAAGCTTTAAAAGAGTCCCAAAAAAATTTAAAAACA
TATTTTTAACTTCTTTGTTACCTTATGAAACAGAGCAGCGAACAACTTCCCAGTCTGATC
TCACTATCCGATCAAACTTAAAGCAGGGAAAGAAAAAAAAAAGAGATATAAAGCTTTTTC
CACACTATTTTGCTGCAGCTAGTCGAGAACTTTCTCTCCGGTTGCGAACAAGTTCCAGAC
CAGAGTTCCAATTAAATACAGTCCAACAGCTACTTTAAACACATCGTCCCATGAACCTCG
TTGGAGGATGTAGCCAGTGGCTGCAGTGCCAAAGACACCAGCGAGGACTCCTGCTGTGTT
TGAAAGTCCTAATAGTACACCAGCGTAGCGTGGGCCAATGTCTTGATGATTAGAGTAGAG
ACCCGACTGAGAGAATGCATCAGCGCCCTGACTGCATGCCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH95JQ U 123
AF RR2E034JQ U 1
BS 1 164 RR2E034JQ
BS 165 165 RR2AH95JQ
BS 166 169 RR2E034JQ
BS 170 170 RR2AH95JQ
BS 171 523 RR2E034JQ

RD RR2AH95JQ 178 0 0
TTTTTAACTTCTTTGTTACCTTATGAAACAGAGCAGCGAACAACTTCCCAGTCTGATCTC
ACTATCCGATCAAACTTAAAGCAGGGAAAGAAAAAAAAA*GAGATATAAAGCTTTTTCCA
CACTATTTTGCTGCAGCTAGTCGAGAACTTTCTCTCCGGTTGCGAACAAGTTCC
CGAC

QA 1 174 1 174
DS 

RD RR2E034JQ 523 0 0
GGTAATACTTTCGTTTTTTCGTTTCTCTGTTGTAAAAGCTTTTACATTTTGAGTGTTGTT
CTGTTCTGTTCTCCCACCATACTGTAAGCTTTAAAAGAGTCCCAAAAAAATTTAAAAACA
TATTTTTAACTTCTTTGTTACCTTATGAAACAGAGCAGCGAACACCTTCGCAGTCTGATC
TCACTATCCGATCAAACTTAAAGCAGGGAAAGAAAAAAAAAAGAGATATAAAGCTTTTTC
CACACTATTTTGCTGCAGCTAGTCGAGAACTTTCTCTCCGGTTGCGAACAAGTTCCAGAC
CAGAGTTCCAATTAAATACAGTCCAACAGCTACTTTAAACACATCGTCCCATGAACCTCG
TTGGAGGATGTAGCCAGTGGCTGCAGTGCCAAAGACACCAGCGAGGACTCCTGCTGTGTT
TGAAAGTCCTAATAGTACACCAGCGTAGCGTGGGCCAATGTCTTGATGATTAGAGTAGAG
ACCCGACTGAGAGAATGCATCAGCGCCCTGACTGCATGCCATG

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 2

CO CL6549Contig1 630 2 1 U
GGATGATAATGGAGAAAATAAGAGAGCATCTTAACCTGAGCGAAGACGTTGACGTCGGCG
ACGCACCGCGAAAAGTAGAGAAAGGAAGAAGCTTCTACGAGGATTTCAGCCTCAGAGGCA
TCCGAGTCAACCGAGTCGACCCTGGTTTCGTTTCCTGCTCTTTCAAGGTTCCTCTCCGTT
TGACGGACAGAGAAGGGTATCTAGCAAATGGTGCAATTGCAAATCTTGTTGATGAAGTTG
GTGGAGCGGTTGTTCATGTAGAAGGTTTACCCATGAATGTTTCGGTGGACATGTCCATTG
CTTTCCTTTCAAAAGCTAAGCTCGGTGAGGAGCTGGAGATAACATCGAGAGTGATGGGAG
AGAGAGGAGGTTATAAAGGAACGATTGTTGTTGTGAGAAACAAGATGACCGGAGAGATTA
TTGCTGAAGGTCGCCATTCTTTGTTTGGCAGACAACCTAGTAAGCTCTGAGGTTGAAGCT
TTCTCTGATTCTCCTCTTGGTACTGTATAAGATGATCTTAAAACTTGTTTGACTATTACC
TTTTTGTGTTAGGTCATTTTCTCTTTTTCTGATTGTGAAAAATAAAACCTTTGTATGTAG
ATAGTTTATAAAAGCTAAAACTTTTTGTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AS61JQ C 1
AF RR2AS61TF U 1
BS 1 630 RR2AS61TF

RD RR2AS61JQ 630 0 0
GGATGATAATGGAGAAAATAAGAGAGCATCTTAACCTGAGCGAAGACGTTGACGTCGGCG
ACGCACCGCGAAAAGTAGAGAAAGGAAGAAGCTTCTACGAGGATTTCAGCCTCAGAGGCA
TCCGAGTCAACCGAGTCGACCCTGGTTTCGTTTCCTGCTCTTTCAAGGTTCCTCTCCGTT
TGACGGACAGAGAAGGGTATCTAGCAAATGGTGCAATTGCAAATCTTGTTGATGAAGTTG
GTGGAGCGGTTGTTCATGTAGAAGGTTTACCCATGAATGTTTCGGTGGACATGTCCATTG
CTTTCCTTTCAAAAGCTAAGCTCGGTGAGGAGCTGGAGATAACATCGAGAGTGATGGGAG
AGAGAGGAGGTTATAAAGGAACGATTGTTGTTGTGAGAAACAAGATGACCGGAGAGATTA
TTGCTGAAGGTCGCCATTCTTTGTTTGGCAGACAACCTAGTAAGCTCTGAGGTTGAAGCT
TTCTCTGATTCTCCTCTTGGTACTGTATAAGATGATCTTAAAACTTGTTTGACTATTACC
TTTTTGTGTTAGGTCATTTTCTCTTTTTCTGATTGTGAAAAATAAAACCTTTGTATGTAG
ATAGTTTATAAAAGCTAAAACTTTTTGTGG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2AS61TF 630 0 0
GGATGATAATGGAGAAAATAAGAGAGCATCTTAACCTGAGCGAAGACGTTGACGTCGGCG
ACGCACCGCGAAAAGTAGAGAAAGGAAGAAGCTTCTACGAGGATTTCAGCCTCAGAGGCA
TCCGAGTCAACCGAGTCGACCCTGGTTTCGTTTCCTGCTCTTTCAAGGTTCCTCTCCGTT
TGACGGACAGAGAAGGGTATCTAGCAAATGGTGCAATTGCAAATCTTGTTGATGAAGTTG
GTGGAGCGGTTGTTCATGTAGAAGGTTTACCCATGAATGTTTCGGTGGACATGTCCATTG
CTTTCCTTTCAAAAGCTAAGCTCGGTGAGGAGCTGGAGATAACATCGAGAGTGATGGGAG
AGAGAGGAGGTTATAAAGGAACGATTGTTGTTGTGAGAAACAAGATGACCGGAGAGATTA
TTGCTGAAGGTCGCCATTCTTTGTTTGGCAGACAACCTAGTAAGCTCTGAGGTTGAAGCT
TTCTCTGATTCTCCTCTTGGTACTGTATAAGATGATCTTAAAACTTGTTTGACTATTACC
TTTTTGTGTTAGGTCATTTTCTCTTTTTCTGATTGTGAAAAATAAAACCTTTGTATGTAG
ATAGTTTATAAAAGCTAAAACTTTTTGTGG

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL6550Contig1 818 2 6 U
GGAGACTCATCATCCTCGGCTTCGACTCGATACTCATTCTCTCCGATTTAGGGATTCCAT
ACTCGCCATGTATCGCACGGCTCGTTATGCAAGCGCTAGTGCTGTTGCTACGACCTCTTC
TTCTTCTTCTTCTTCTCCAGGTTTCTTAGGCTGGTTGACTGGTGGATCCTCTGGCTCCCT
TGCTTCACTGGACATGCCACTACAGGGAGTATCTCTTCCTCCGCCGCTTCCTGACCGCGT
CGAGCCAAGCAAACTCAAGATCACTACTCTTCCTAATGGCCTCAAAATCGCCTCTGAGAT
GTCTCCCAATCCGGCAGCTTCTATTGGTTTGTATGTTGATTGTGGTTCGATCTATGAGGC
TCCTTATTTCCATGGAGCAACGCATTTGCTTGAAAGGATGGCTTTCAAGAGCACCACGAA
CAGAAGCCATCTACGTCTCGTCAGGGAAATAGAAGCGATTGGAGGGAACACCTCTGCGTC
TGCGTCTCGGGAGCAGATGAGTTACACTATTGATGCTCTTAAAACCTATGTCCCTGAAAT
GGTTGAGGTTCTTATCGACAGTGTTAGGAACCCTGCTTTCTTGGACTGGGAAGTCAATGA
AGAGCTACGTAAAATGAAGGTGGAGATAGCGGAACTTGCGAAGAACCCTATGGGGTTTCT
CATTGAGGCTGCTCATTCTGCTGGTTATTCTGGTGCATTGGCTAATCCTCTGTACGCACC
TGAGTCTGCCTTGCACAGATTGAATGGGGAACTCTTGGAAGAGTTTATGACTGAGAATTT
CACTGCTGCACGTATGGTGTTGGCGGCAAGTGGAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG45TF U 1
AF RR2B874TF U 109
BS 1 667 RR2EG45TF
BS 668 668 RR2B874TF
BS 669 671 RR2EG45TF
BS 672 672 RR2B874TF
BS 673 743 RR2EG45TF
BS 744 818 RR2B874TF

RD RR2EG45TF 758 0 0
GGAGACTCATCATCCTCGGCTTCGACTCGATACTCATTCTCTCCGATTTAGGGATTCCAT
ACTCGCCATGTATCGCACGGCTCGTTATGCAAGCGCTAGTGCTGTTGCTACGACCTCTTC
TTCTTCTTCTTCTTCTCCAGGTTTCTTAGGCTGGTTGACTGGTGGATCCTCTGGCTCCCT
TGCTTCACTGGACATGCCACTACAGGGAGTATCTCTTCCTCCGCCGCTTCCTGACCGCGT
CGAGCCAAGCAAACTCAAGATCACTACTCTTCCTAATGGCCTCAAAATCGCCTCTGAGAT
GTCTCCCAATCCGGCAGCTTCTATTGGTTTGTATGTTGATTGTGGTTCGATCTATGAGGC
TCCTTATTTCCATGGAGCAACGCATTTGCTTGAAAGGATGGCTTTCAAGAGCACCACGAA
CAGAAGCCATCTACGTCTCGTCAGGGAAATAGAAGCGATTGGAGGGAACACCTCTGCGTC
TGCGTCTCGGGAGCAGATGAGTTACACTATTGATGCTCTTAAAACCTATGTCCCTGAAAT
GGTTGAGGTTCTTATCGACAGTGTTAGGAACCCTGCTTTCTTGGACTGGGAAGTCAATGA
AGAGCTACGTAAAATGAAGGTGGAGATAGCGGAACTTGCGAAGAACCCTATGGGGTTTCT
CATTGAG*CTGTTCATTCTGCTGGTTATTCTGGTGCATTGGCTAATCCTCTGTACGCACC
TGAGTCTGCCTTGCACAGATTGA
TGGGGACTCTTGGAA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2B874TF 710 0 0
TACGACCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCAGGTTTCTTAGGCTGGTTGACTGGTGGATC
CTCTGGCTCCCTTGCTTCACTGGACATGCCACTACAGGGAGTATCTCTTCCTCCGCCGCT
TCCTGACCGCGTCGAGCCAAGCAAACTCAAGATCACTACTCTTCCTAATGGCCTCAAAAT
CGCCTCTGAGATGTCTCCCAATCCGGCAGCTTCTATTGGTTTGTATGTTGATTGTGGTTC
GATCTATGAGGCTCCTTATTTCCATGGAGCAACGCATTTGCTTGAAAGGATGGCTTTCAA
GAGCACCACGAACAGAAGCCATCTACGTCTCGTCAGGGAAATAGAAGCGATTGGAGGGAA
CACCTCTGCGTCTGCGTCTCGGGAGCAGATGAGTTACACTATTGATGCTCTTAAAACCTA
TGTCCCTGAAATGGTTGAGGTTCTTATCGACAGTGTTAGGAACCCTGCTTTCTTGGACTG
GGAAGTCAATGAAGAGCTACGTAAAATGAAGGTGGAGATAGCGGAACTTGCGAAGAACCC
TATGGGGTTTCTCATTGAGGCTGCTCATTCTGTTGGTTATTCTGGTGCATTGGCTAATCC
TCTGTACGCACCTGAGTCTGCCTTGCACAGATTGAATGGGGAACTCTTGGAAGAGTTTAT
GACTGAGAATTTCACTGCTGCACGTATGGTGTTGGCGGCAAGTGGAGTTG

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL6551Contig1 1564 2 2 U
GGACACACAAAGCCCCATAATATTAATTACTTTGTCTCTCTTTCTGAGCTTCGCAATTTG
TAAATCTCCTGGGGACTCTCACCTTAACCCCGAGATCTGACTCCCCCCTCCTCGCGTCTC
TAGATCCGTCGGCGATGGCGAATCTAGTCCCCGGCGTCCTCCTCAAGCTCCTCCAGCACA
TGAACACCGACGTCAAAATCGCCGGAGAGCACAGGTCATCCCTCCTGCAAGTAATCAGCA
TCGTCCCGGCGCTAGCCGGAGGCGAGCTGTTCCCGAACCAGGGCTTCTACCTCAAAGTCT
CCGACTCCTCCCACGCCACCTACGTCTCTCTCCCCGACGAGCACGACGATCTGATCCTGA
GCGATAAGCTCCAGCTAGGTCAGTTCATCCACGTGGACAGAGTCGAATCCTCTTCCCCCG
TCCGATCCTCCGCGGCGTTAGGCCCGTCCCCGGTAGGCATCCTTGTCTCGGCACTCCCGA
GGATATAGTCGCTGCTGATGCGTTAGGGTTCCTTACTGATGACAAGAAGGTTAAGTCGGT
TACTAGTGAGGTTGAGAGAGGAATAGGGAATAATAATAATAATAATAGTAGAGTGAGTGT
TAGTAGTAGCTCTAAAGATGAGTCTTCTAAGAAGGCTTTGGTACGAGCCAAGTCTGGTAA
GACGAGTTTGGTTTTGGATGTGAATGTGAAGAAAGAAGCGTTGGGGAAAGGTGAAGACCT
CTTCTTCTTCTGGTTCGAAGTCGATACCTTCTTCGCCAACTAGCTGTTACTCGCTGCCTA
CTTCTTTTGCAAAGTTTGCGAATGGGGTTAAGCAGCATCAGCAGCAGCATGTGAAGCCGA
AGGTGGCTTTGGAGAAAGGCTCTCCGAGGATGATGGGGTTGTTGTCGGAGAGAGGGAGGT
CTCCGCTTAGAGTGGAGAGTCCGAGCGTTGTTGGGAATTTGGATATTAGGGGTTCTGATA
GTTCGAGGTTGAAGGTTGCTAAACGTGATTCGACTCCTGATTCTCGGAGTTTAACTGGTC
CGAGGAAAAGCACATCTAGTGAGAAGCTGCCAAGCAAACAGGAAAGGGCAAACGCATTTG
CAAAATCATCCAAGGAGCAGAGTAAAACCCAGTCAGCTAAGAAGGTTGAGACAGCAGGAG
TAGTGGACACCAAGGATAAAACGAGTAAACCTAAATCTACAACCGTAGGCAAGAAATCTA
CTGGTGAGAATGGGTTGCCTGGGAATTTGGTCAAGGTCCCTGTTAATAGTAAAAGATTAG
CATCTGCCACTGTCCAATGGGGTTCACTCCCTTCATCTCTTTCAAGGCTAGGACAGGAAG
TCTTGAGGCATAGAGATGCTGCTCAAGTTGTTGCAATAGAAGCCATGCAAGAAGCATCTG
CTTCCGAGAGCTTACTTCAATGCCTCCTGTGCGTAAATTTCTAACAAAAGCTTTTCATTA
ATTCTGGCGTTGAATGCTGAATTTAGTTTTTTACTGCCTGGTTGTTGTTTCTAAAGCTTT
TCCATTTTGTAGTATGTACAACGATCTTATGTCAACGGCTAAGGAAGACGATCCATTGCC
TGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2BJ57TF U 1
AF RR2BJ57JQ C 749
BS 1 806 RR2BJ57TF
BS 807 1564 RR2BJ57JQ

RD RR2BJ57TF 806 0 0
GGACACACAAAGCCCCATAATATTAATTACTTTGTCTCTCTTTCTGAGCTTCGCAATTTG
TAAATCTCCTGGGGACTCTCACCTTAACCCCGAGATCTGACTCCCCCCTCCTCGCGTCTC
TAGATCCGTCGGCGATGGCGAATCTAGTCCCCGGCGTCCTCCTCAAGCTCCTCCAGCACA
TGAACACCGACGTCAAAATCGCCGGAGAGCACAGGTCATCCCTCCTGCAAGTAATCAGCA
TCGTCCCGGCGCTAGCCGGAGGCGAGCTGTTCCCGAACCAGGGCTTCTACCTCAAAGTCT
CCGACTCCTCCCACGCCACCTACGTCTCTCTCCCCGACGAGCACGACGATCTGATCCTGA
GCGATAAGCTCCAGCTAGGTCAGTTCATCCACGTGGACAGAGTCGAATCCTCTTCCCCCG
TCCGATCCTCCGCGGCGTTAGGCCCGTCCCCGGTAGGCATCCTTGTCTCGGCACTCCCGA
GGATATAGTCGCTGCTGATGCGTTAGGGTTCCTTACTGATGACAAGAAGGTTAAGTCGGT
TACTAGTGAGGTTGAGAGAGGAATAGGGAATAATAATAATAATAATAGTAGAGTGAGTGT
TAGTAGTAGCTCTAAAGATGAGTCTTCTAAGAAGGCTTTGGTACGAGCCAAGTCTGGTAA
GACGAGTTTGGTTTTGGATGTGAATGTGAAGAAAGAAGCGTTGGGGAAAGGTGAAGACCT
CTTCTTCTTCTGGTTCGAAGTCGATACCTTCTTCGCCAACTAGCTGTTACTCGCTGCCTA
CTTCTTTTGCAAAGTTTGCGAATGGG

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2BJ57JQ 816 0 0
TTCTTCGCCAACTAGCTGTTACTCGCTGCCTACTTCTTTTGCAAAGTTTGCGAATGGGGT
TAAGCAGCATCAGCAGCAGCATGTGAAGCCGAAGGTGGCTTTGGAGAAAGGCTCTCCGAG
GATGATGGGGTTGTTGTCGGAGAGAGGGAGGTCTCCGCTTAGAGTGGAGAGTCCGAGCGT
TGTTGGGAATTTGGATATTAGGGGTTCTGATAGTTCGAGGTTGAAGGTTGCTAAACGTGA
TTCGACTCCTGATTCTCGGAGTTTAACTGGTCCGAGGAAAAGCACATCTAGTGAGAAGCT
GCCAAGCAAACAGGAAAGGGCAAACGCATTTGCAAAATCATCCAAGGAGCAGAGTAAAAC
CCAGTCAGCTAAGAAGGTTGAGACAGCAGGAGTAGTGGACACCAAGGATAAAACGAGTAA
ACCTAAATCTACAACCGTAGGCAAGAAATCTACTGGTGAGAATGGGTTGCCTGGGAATTT
GGTCAAGGTCCCTGTTAATAGTAAAAGATTAGCATCTGCCACTGTCCAATGGGGTTCACT
CCCTTCATCTCTTTCAAGGCTAGGACAGGAAGTCTTGAGGCATAGAGATGCTGCTCAAGT
TGTTGCAATAGAAGCCATGCAAGAAGCATCTGCTTCCGAGAGCTTACTTCAATGCCTCCT
GTGCGTAAATTTCTAACAAAAGCTTTTCATTAATTCTGGCGTTGAATGCTGAATTTAGTT
TTTTACTGCCTGGTTGTTGTTTCTAAAGCTTTTCCATTTTGTAGTATGTACAACGATCTT
ATGTCAACGGCTAAGGAAGACGATCCATTGCCTGTC

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

CO CL6552Contig1 877 2 2 U
GGATTCGATAATCGGTCTATAGATGTTACGTGTCGGGGCAGGACTTACGTTCAATACACA
AACAAAGACTTATAGCAAAGAAAAAAAAGTACAAGCAATAAACATTTTTCGAGGGACAAA
GGGGAGATATAAAGAGCAGCGGAGAGGTTAGAGAAGCAAGGGTTTTGTGTGTGTGAAAAT
GGAGTCGAGTGAGGACGTTGAGGTTATGAGCAGAGCCATCGAGAAACTTCTTGATGAGAA
GAGGAAGAGAGAAGCTGCTGGTGACTCCTTCATCGAAGACGAGGACGACCAACTTCTCCT
CACTAAGCTTATATCCCAGCTGGAATCACCGAACCCATTCCAAAAGACACTTGTGACTGC
TAAAGAAGAAGAAGAATCATCACCAGATTCTTCACCATCCAAAGGAAAACACCAGGACGA
GAGACGATTGGAAGAGAGTATAGAAGAAATAGCTAAAGACATCAAGGAGGTGAAGAGACA
GAACAAAGTAACCCACATTCTCCTCTCGGCTTTGATCATCCTCACATTGACTTGGCAGCT
CTCTGAGTACTCCATGATTTACATGATGAAAGAGAGATTAACCCACCCAATCAGATCCAT
TGGAGGTATGTTCTCTGGGATGTTCAAAGGTAAGTTATTTCCAAACAAGAACAGACTTCA
AGGACTTCCAATGCCCAGGAGGAAAACAACCTTCACAATGGGAATGGAACAAACAATGGA
GTTCATATCCAAGTGCCCGAAATGTTGCGAGAATTTGGTTTTGACGATGATGACAAATGA
TATTTTTTTTTTGTTGCCTGTTTATATTATACAATCTGGAAACACACTTATAATTTGTTT
ACGTTCAGGACATATAAGATGTTTTAGCAAACTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D731TF U 1
AF RR2D731JQ C 392
BS 1 706 RR2D731TF
BS 707 877 RR2D731JQ

RD RR2D731TF 706 0 0
GGATTCGATAATCGGTCTATAGATGTTACGTGTCGGGGCAGGACTTACGTTCAATACACA
AACAAAGACTTATAGCAAAGAAAAAAAAGTACAAGCAATAAACATTTTTCGAGGGACAAA
GGGGAGATATAAAGAGCAGCGGAGAGGTTAGAGAAGCAAGGGTTTTGTGTGTGTGAAAAT
GGAGTCGAGTGAGGACGTTGAGGTTATGAGCAGAGCCATCGAGAAACTTCTTGATGAGAA
GAGGAAGAGAGAAGCTGCTGGTGACTCCTTCATCGAAGACGAGGACGACCAACTTCTCCT
CACTAAGCTTATATCCCAGCTGGAATCACCGAACCCATTCCAAAAGACACTTGTGACTGC
TAAAGAAGAAGAAGAATCATCACCAGATTCTTCACCATCCAAAGGAAAACACCAGGACGA
GAGACGATTGGAAGAGAGTATAGAAGAAATAGCTAAAGACATCAAGGAGGTGAAGAGACA
GAACAAAGTAACCCACATTCTCCTCTCGGCTTTGATCATCCTCACATTGACTTGGCAGCT
CTCTGAGTACTCCATGATTTACATGATGAAAGAGAGATTAACCCACCCAATCAGATCCAT
TGGAGGTATGTTCTCTGGGATGTTCAAAGGTAAGTTATTTCCAAACAAGAACAGACTTCA
AGGACTTCCAATGCCCAGGAGGAAAACAACCTTCACAATGGGAATG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2D731JQ 486 0 0
TCACCATCCAAAGGAAAACACCAGGACGAGAGACGATTGGAAGAGAGTATAGAAGAAATA
GCTAAAGACATCAAGGAGGTGAAGAGACAGAACAAAGTAACCCACATTCTCCTTTCGGCT
TTGATCATCCTCACATTGACTTGGCAGCTTTTTGAGTACTCCATGATTTACATGATGAAA
GAGAGATTAACCCACCCAATCAGATCCATTGGAGGTATGTTTTTTGGGATGTTCAAAGGT
AAGTTATTTCCAAACAAGAACAGACTTCAAGGACTTCCAATGCCCAGGAGGAAAACAACC
TTCACAATGGGAATGGAACAAACAATGGAGTTCATATCCAAGTGCCCGAAATGTTGCGAG
AATTTGGTTTTGACGATGATGACAAATGATATTTTTTTTTTGTTGCCTGTTTATATTATA
CAATCTGGAAACACACTTATAATTTGTTTACGTTCAGGACATATAAGATGTTTTAGCAAA
CTTTTC

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 2

CO CL6553Contig1 712 2 2 U
GGGGCGACACATTTTGTTCTTTCCAGATCTCATCATCGTTTCCGAAACTCACAAACCGAG
AGAGAGAGAGAGAAGGAGAAGGAAGGAAGGAATCATGATAACGATCCCATACCTAACGGC
GGTATCAACATACTTCAGCTACGGCTTGCTCTTCGCCTTTGGGCAGCTACGGGATTACAC
GCGCCTCATCTTCGATTGGTGCTCCACGAACAACCTCCACGGTTACGCCCCAATCTGCTT
GGCTCACGAGGATTTCTACATCCGTCGTTTGTATCACCGCATTCAGGATTGTTTTAATCG
ACCGATATCAAGTGCGCCTGATTCTTGGGTTGATGTTATCGAGAGGTACTCTAACGACAA
CAACAAGACCCTCAAGCGAACAGCAAAGAGCACAAGGTGCCTTAATCTGGGATCTTACAA
CTATCTTGGATTTGGTTCTTTCGATGAGTATTGCACCCCTCGTGTTATTGAGTCTTTGAA
GAAGTTCTCACCAAGTACATGTAGCTCTCGCGTTGACGCAGGAACCACATCTGTGCACGC
AGAGCTTGAGGAATGTGTTGCCAAGTATGTGGGAAAACCTGCTGCTATTGTCACTGGCAT
GGGCTTCGCTACTAACTCTGTCATCATTCCTGTCTTGATTGGAAAGGGAGGGTTGATAAT
AAGCGATTCTTTGAACCATACTTCAATTGTAAACGGTGCTCGAGGCTCACGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA79TF U 1
AF RR2AN41TF U 45
BS 1 706 RR2BA79TF
BS 707 712 RR2AN41TF

RD RR2BA79TF 706 0 0
GGGGCGACACATTTTGTTCTTTCCAGATCTCATCATCGTTTCCGAAACTCACAAACCGAG
AGAGAGAGAGAGAAGGAGAAGGAAGGAAGGAATCATGATAACGATCCCATACCTAACGGC
GGTATCAACATACTTCAGCTACGGCTTGCTCTTCGCCTTTGGGCAGCTACGGGATTACAC
GCGCCTCATCTTCGATTGGTGCTCCACGAACAACCTCCACGGTTACGCCCCAATCTGCTT
GGCTCACGAGGATTTCTACATCCGTCGTTTGTATCACCGCATTCAGGATTGTTTTAATCG
ACCGATATCAAGTGCGCCTGATTCTTGGGTTGATGTTATCGAGAGGTACTCTAACGACAA
CAACAAGACCCTCAAGCGAACAGCAAAGAGCACAAGGTGCCTTAATCTGGGATCTTACAA
CTATCTTGGATTTGGTTCTTTCGATGAGTATTGCACCCCTCGTGTTATTGAGTCTTTGAA
GAAGTTCTCACCAAGTACATGTAGCTCTCGCGTTGACGCAGGAACCACATCTGTGCACGC
AGAGCTTGAGGAATGTGTTGCCAAGTATGTGGGAAAACCTGCTGCTATTGTCACTGGCAT
GGGCTTCGCTACTAACTCTGTCATCATTCCTGTCTTGATTGGAAAGGGAGGGTTGATAAT
AAGCGATTCTTTGAACCATACTTCAATTGTAAACGGTGCTCGAGGC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2AN41TF 668 0 0
GG
ACTCACAAACCGAGAGAGAGAGAGAGAAGGAGAAGGAAGGAAGGAATCATGATAACGATC
CCATACCTAACGGCGGTATCAACATACTTCAGCTACGGCTTGCTCTTCGCCTTTGGGCAG
CTACGGGATTACACGCGCCTCATCTTCGATTGGTGCTCCACGAACAACCTCCACGGTTAC
GCCCCAATCTGCTTGGCTCACGAGGATTTCTACATCCGTCGTTTGTATCACCGCATTCAG
GATTGTTTTAATCGACCGATATCAAGTGCGCCTGATTCTTGGGTTGATGTTATCGAGAGG
TACTCTAACGACAACAACAAGACCCTCAAGCGAACAGCAAAGAGCACAAGGTGCCTTAAT
CTGGGATCTTACAACTATCTTGGATTTGGTTCTTTCGATGAGTATTGCACCCCTCGTGTT
ATTGAGTCTTTGAAGAAGTTCTCACCAAGTACATGTAGCTCTCGCGTTGACGCAGGAACC
ACATCTGTGCACGCAGAGCTTGAGGAATGTGTTGCCAAGTATGTGGGAAAACCTGCTGCT
ATTGTCACTGGCATGGGCTTCGCTACTAACTCTGTCATCATTCCTGTCTTGATTGGAAAG
GGAGGGTTGATAATAAGCGATTCTTTGAACCATACTTCAATTGTAAACGGTGCTCGAGGC
TCACGA

QA 3 668 3 668
DS 



AS 1 2

CO CL6554Contig1 704 2 7 U
GGATAGCACCGCCACTCGAATTACTTAACATAAAGAAAAGAATTAGTAGATTGGTAATAC
TCACTTGTTGTTAATATTTTCAAACAAAAATGCAGCGGCAAGTGGCACTCATCAAGCAGT
CCCTCTTTGATCAGGGATATCTCGATGAACAATTCATGGAGTTAGAAGAGCTCCAAGATG
ATGCAAACCCTAATTTTGTTGAAGAAGTGGCAACATTATACTTCAAAGATTCAGCTCGAT
TAATCAATAACATTGAGCAAGCCTTGGAAAGAGGATCATTTGATTTCAATCGGCTAGATA
ATTACATGCATCAGTTTAAGGGCAGCAGCACAAGCATCGGTGCGAGTAAGGTGAAAACTG
AATGCACTATGTTTAGGGAATACTGCAGAGCTGGAAATGCTGAAGGATGCTTGAGGACTT
TCAAGCAACTGAAGAAGGAGCACGCAACGTTGAGAAAGAAGCTTGAACAATATTTCCAGT
TGGCAAGACAGGCGGGGCCTAAGGAGATAGCACGTAGGCCCAAGTAATACAGGGACATAT
CAATGAGGAATCGTCAGCGAATTTTGTAGTAGAAAATGCTATAAATACATATATAGTTCC
TCAATGTATGTAATAAAGAAGATCTTGGATTTTTAATATTATGCATGTTAATAAACGGTC
CAAATTTCTCTCATGTTTTTTCCTATATGGCTAATATTCTCCTT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E875TF U 2
AF RR2GK86TF U 1
BS 1 87 RR2GK86TF
BS 88 89 RR2E875TF
BS 90 232 RR2GK86TF
BS 233 233 RR2E875TF
BS 234 296 RR2GK86TF
BS 297 297 RR2E875TF
BS 298 704 RR2GK86TF

RD RR2E875TF 652 0 0
GATAGCACCGCCACTCGAATTACTTAACATAAAGAAAAGAATTAGTAGATTGGTAATACT
CACTTGTTGTTAATATTTTCAAACAAAAATGCAGCGGCAAGTGGCACTCATCAAGCAGTC
CCTCTTTGATCAGGGATATCTCGATGAACAATTCATGGAGTTAGAAGAGCTCCAAGATGA
TGCAAACCCTAATTTTGTTGAAGAAGTGGCAACATTATACTTCAAAGATTCAGCTCGATT
AATCAATAACATTGAGCAAGCCTTGGAAAGAGGATCATTTGATTTCAATCGGCTGGATAA
TTACATGCATCAGTTTAAGGGCAGCAGCACAAGCATCGGTGCGAGTAAGGTGAAAACTGA
ATGCACTATGTTTAGGGAATACTGCAGAGCTGGAAATGCTGAAGGATGCTTGAGGACTTT
CAAGCAACTGAAGAAGGAGCACGCAACGTTGAGAAAGAAGCTTGAACAATATTTCCAGTT
GGCAAGACAGGCGGGGCCTAAGGAGATAGCACGTAGGCCCAAGTAATACAGGGACATATC
AATGAGGAATCGTCAGCGAATTTTGTAGTAGAAAATGCTATAAATACATATATAGTTCCT
CAATGTATGTAATAAAGAAGATCTTGGATTTTTAATATTATGCATGTTAATA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2GK86TF 704 0 0
GGATAGCACCGCCACTCGAATTACTTAACATAAAGAAAAGAATTAGTAGATTGGTAATAC
TCACTTGTTGTTAATATTTTCAAACAA**ATGCAGCGGCAAGTGGCACTCATCAAGCAGT
CCCTCTTTGATCAGGGATATCTCGATGAACAATTCATGGAGTTAGAAGAGCTCCAAGATG
ATGCAAACCCTAATTTTGTTGAAGAAGTGGCAACATTATACTTCAAAGATTC*GCTCGAT
TAATCAATAACATTGAGCAAGCCTTGGAAAGAGGATCATTTGATTTCAATCGGCTATATA
ATTACATGCATCAGTTTAAGGGCAGCAGCACAAGCATCGGTGCGAGTAAGGTGAAAACTG
AATGCACTATGTTTAGGGAATACTGCAGAGCTGGAAATGCTGAAGGATGCTTGAGGACTT
TCAAGCAACTGAAGAAGGAGCACGCAACGTTGAGAAAGAAGCTTGAACAATATTTCCAGT
TGGCAAGACAGGCGGGGCCTAAGGAGATAGCACGTAGGCCCAAGTAATACAGGGACATAT
CAATGAGGAATCGTCAGCGAATTTTGTAGTAGAAAATGCTATAAATACATATATAGTTCC
TCAATGTATGTAATAAAGAAGATCTTGGATTTTTAATATTATGCATGTTAATAAACGGTC
CAAATTTCTCTCATGTTTTTTCCTATATGGCTAATATTCTCCTT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL6555Contig1 772 2 8 U
GGTCAAGAAGAGGATGATTATTTCACTGCGGAGGAGAACATCCAAAGGAGGAAGCTTGAT
ATTGAGATCGAGGAGACTGAGGAGATCGCTAAGAAACGGGAGGTCCAAGCAGAACGTGAG
CTGAAGATTGAGAGCGATGTCAAAGAGATCCGCAAAACCTTCTATTGTGAACTCTGCAGC
AAGCAGTATAGAACTGTGATGGAGTTTGAAGGTCACTTGAGCTCGTATGATCACAACCAT
AAGAAGAGATTCAAAGAGATGAAAGAAATGCATGGTGCAAGCAGCCGCGATGATAGGAAG
AAGCGAGAGCAGCAGCGTCAAGAGAGGGAGCTGACTAAAATGGCTGATGCTCGTAAACAG
CAGCAGATGCAACAGCAGAACATGAAAGAAGACCCAGAGAATGACCCAGTTCCATTACCT
GCAAAGACCACTCTTGCACCACTTGTTGTCCAAGATCAGCGGAAGTCTTTGAAGTTTGGC
TTTTCTTCAAAAAGCGGCAGTACATCAAAGAACCAACCCAAGAACAGCATCAAGAAGCCT
AAAATAGCAATTGCATCGGTTTTTGGCAACGATAGCGACGAAGACTAAAGTTTACAAGCA
TCATCGAGAATATTGTACTAAATGTAATTCTATTTTGTTGTTCTTCCTTTCACACATTTA
AAACAGAACATGGCCTGAAAAAATCTTCACATGTCAGGACCACAACACAGCCTTGCAACT
TTTTGGGTTTATTAAAGGTTTTTGGGTTTGTTAAAGGAAATCTTAAAAGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX90TF U 1
AF RR2DX90JQ C 75
BS 1 287 RR2DX90TF
BS 288 288 RR2DX90JQ
BS 289 682 RR2DX90TF
BS 683 683 RR2DX90JQ
BS 684 697 RR2DX90TF
BS 698 698 RR2DX90JQ
BS 699 717 RR2DX90TF
BS 718 772 RR2DX90JQ

RD RR2DX90TF 732 0 0
GGTCAAGAAGAGGATGATTATTTCACTGCGGAGGAGAACATCCAAAGGAGGAAGCTTGAT
ATTGAGATCGAGGAGACTGAGGAGATCGCTAAGAAACGGGAGGTCCAAGCAGAACGTGAG
CTGAAGATTGAGAGCGATGTCAAAGAGATCCGCAAAACCTTCTATTGTGAACTCTGCAGC
AAGCAGTATAGAACTGTGATGGAGTTTGAAGGTCACTTGAGCTCGTATGATCACAACCAT
AAGAAGAGATTCAAAGAGATGAAAGAAATGCATGGTGCAAGCAGCCGGGATGATAGGAAG
AAGCGAGAGCAGCAGCGTCAAGAGAGGGAGCTGACTAAAATGGCTGATGCTCGTAAACAG
CAGCAGATGCAACAGCAGAACATGAAAGAAGACCCAGAGAATGACCCAGTTCCATTACCT
GCAAAGACCACTCTTGCACCACTTGTTGTCCAAGATCAGCGGAAGTCTTTGAAGTTTGGC
TTTTCTTCAAAAAGCGGCAGTACATCAAAGAACCAACCCAAGAACAGCATCAAGAAGCCT
AAAATAGCAATTGCATCGGTTTTTGGCAACGATAGCGACGAAGACTAAAGTTTACAAGCA
TCATCGAGAATATTGTACTAAATGTAATTCTATTTTGTTGTTCTTCCTTTCACACATTTA
AAACAGAACATGGCCTGAAAAA*TCTTCACATGTCAG*ACCACAACACAGCCTTGCA
CTTTTGGGTTTTTAA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2DX90JQ 698 0 0
GACTGAGGAGATCGCTAAGAAACGGGAGGTCCAAGCAGAACGTGAGCTGAAGATTGAGAG
CGATGTCAAAGAGATCCGCAAAACCTTCTATTGTGAACTCTGCAGCAAGCAGTATAGAAC
TGTGATGGAGTTTGAAGGTCACTTGAGCTCGTATGATCACAACCATAAGAAGAGATTCAA
AGAGATGAAAGAAATGCATGGTGCAAGCAGCCGCGATGATAGGAAGAAGCGAGAGCAGCA
GCGTCAAGAGAGGGAGCTGACTAAAATGGCTGATGCTCGTAAACAGCAGCAGATGCAACA
GCAGAACATGAAAGAAGACCCAGAGAATGACCCAGTTCCATTACCTGCAAAGACCACTCT
TGCACCACTTGTTGTCCAAGATCAGCGGAAGTCTTTGAAGTTTGGCTTTTCTTCAAAAAG
CGGCAGTACATCAAAGAACCAACCCAAGAACAGCATCAAGAAGCCTAAAATAGCAATTGC
ATCGGTTTTTGGCAACGATAGCGACGAAGACTAAGGTTTACAAGCATCATCGAGAATATT
GTACTAAATGTAATTCTATTTTGTTGTTCTTCCTTTCACACATTTAAAACAGAACATGGC
CTGAAAAAATCTTCACATGTCAGGACCACAACACAGCCTTGCAACTTTTTGGGTTTATTA
AAGGTTTTTGGGTTTGTTAAAGGAAATCTTAAAAGACG

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL6556Contig1 514 2 1 U
GTTGATGGACCTCATTGAGCAATATAACTCGGAGAAGCTACATTTCGAAAGTGTTTCTAT
GAAACATGTTGATGTGTTGTCCGCTTTTACGGGTTCTTACAAGATATTAGAGTCTCTTCG
TGATACATCACATAATCTGAGCAAACAGCTTACTGAAGTAAAGAAACAAGTGAAGCTATA
CGAAGCCAAGACCTCGGAATTTGCAGCGAGTCTTGAAGAAGTCTGCGGTGAAATGACGAG
ATCGCAGAATAAAATGGTGGAGACGGCAAGGAGAGTACTGAAGGAACTGAGTGGAAGGAA
AGTTGCTGCTCCGTAGACTACAAGAAGCGGAAAGGTACAAGGAAGTGAGGAATGGACCAC
TTATATATATCTTCCCCTTGAATGTTTATATAATGTTTACAACTAAATTAGAAAATAAAA
GACTGAAGATAAGATGTATAGTCCACTAATGGGTTGAACAAAAAAAAAAAGTCCACTAAT
GGATGTTCTATAAACTAAGCATTTCAGAACTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BS04JQ C 1
AF RR2BS04TF U 1
BS 1 514 RR2BS04TF

RD RR2BS04JQ 514 0 0
GTTGATGGACCTCATTGAGCAATATAACTCGGAGAAGCTACATTTCGAAAGTGTTTCTAT
GAAACATGTTGATGTGTTGTCCGCTTTTACGGGTTCTTACAAGATATTAGAGTCTCTTCG
TGATACATCACATAATCTGAGCAAACAGCTTACTGAAGTAAAGAAACAAGTGAAGCTATA
CGAAGCCAAGACCTCGGAATTTGCAGCGAGTCTTGAAGAAGTCTGCGGTGAAATGACGAG
ATCGCAGAATAAAATGGTGGAGACGGCAAGGAGAGTACTGAAGGAACTGAGTGGAAGGAA
AGTTGCTGCTCCGTAGACTACAAGAAGCGGAAAGGTACAAGGAAGTGAGGAATGGACCAC
TTATATATATCTTCCCCTTGAATGTTTATATAATGTTTACAACTAAATTAGAAAATAAAA
GACTGAAGATAAGATGTATAGTCCACTAATGGGTTGAACAAAAAAAAAAAGTCCACTAAT
GGATGTTCTATAAACTAAGCATTTCAGAACTTGC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2BS04TF 514 0 0
GTTGATGGACCTCATTGAGCAATATAACTCGGAGAAGCTACATTTCGAAAGTGTTTCTAT
GAAACATGTTGATGTGTTGTCCGCTTTTACGGGTTCTTACAAGATATTAGAGTCTCTTCG
TGATACATCACATAATCTGAGCAAACAGCTTACTGAAGTAAAGAAACAAGTGAAGCTATA
CGAAGCCAAGACCTCGGAATTTGCAGCGAGTCTTGAAGAAGTCTGCGGTGAAATGACGAG
ATCGCAGAATAAAATGGTGGAGACGGCAAGGAGAGTACTGAAGGAACTGAGTGGAAGGAA
AGTTGCTGCTCCGTAGACTACAAGAAGCGGAAAGGTACAAGGAAGTGAGGAATGGACCAC
TTATATATATCTTCCCCTTGAATGTTTATATAATGTTTACAACTAAATTAGAAAATAAAA
GACTGAAGATAAGATGTATAGTCCACTAATGGGTTGAACAAAAAAAAAAAGTCCACTAAT
GGATGTTCTATAAACTAAGCATTTCAGAACTTGC

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL6557Contig1 959 2 2 U
GCCATCGCAAACTCAATTCTCAAACAGTATGGAGTTGAGTTCACAGCGGAACATGTGCTT
ACCCTGATGATGCCTCTTCTCACTGCCCAACAACTTAACGTCCAGCGTGGGATGAAGATT
CTGCTATGGGAAATCATGCGTCTTCTCATCAAGTCACAAACAATCAGTTTAACAAATCCT
CAAACCAGTCACAGCCATCGACCATGTCTAGTTCGCAAAACAAGGCAACAGCGCCAACCA
CATGCCCTCCAGTGGATATTGAGTGGCCTCCAAGACAATCGTCAAGCCTCACTACTCCAG
CAATGGCTGATGAGACACAGCTAAACACAAGAACATCGTCTACTCCAGGTTTTGATGAAT
TAGATCCTTTTGCTAATTGGCCTCCACGTCCCAGTAACAACGGCGCTTCTGTTGCTTCTA
CCGGTCTCAACAATGGCACTGCGTCTGGTTTTAGCAGCAACTTAACAGCCGGCACTCCGT
TTCAGACAGCATACAGTGACAACTGGGCATTCAGTAATGCCTCCTTGTCTTCGCTGAACC
CACCTCAGCAAAAACAGAGCCAAGGAGTGCCATCTTTCTCCAGCAATTCTAACAATAACC
AAAAACCAGCAGACATCAGCTCTATATTCAGTTCAAGCAAAACCGGTCAGCCTGGAATGA
GACTTGTGCCACCACCTTCGACAGCAATGGGAAGAGGAAGGGGAAGAGGTAGAGGTGGCA
CCTCAAAGCCCAATGGTTCACAAACATTTTTATTGGATTTACTATGACCAAAGGCTCCCG
AGGTTACTGTTTGATCTTGCAGAGAAGAGAAAGCTTATACACATGGAGAGTGCGCGATGT
GCTTTGTGATAAAGAGAGAAAATTTCAGAAAAAAATGGAGATGTTTATGTAAGCATTTTT
TTGGATTAGTTCTGTTCACATATAAACCTAACTGCAGCTTCATGTTTTCAGGTTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E923TF U 1
AF RR2E923JQ C 448
BS 1 678 RR2E923TF
BS 679 959 RR2E923JQ

RD RR2E923TF 678 0 0
GCCATCGCAAACTCAATTCTCAAACAGTATGGAGTTGAGTTCACAGCGGAACATGTGCTT
ACCCTGATGATGCCTCTTCTCACTGCCCAACAACTTAACGTCCAGCGTGGGATGAAGATT
CTGCTATGGGAAATCATGCGTCTTCTCATCAAGTCACAAACAATCAGTTTAACAAATCCT
CAAACCAGTCACAGCCATCGACCATGTCTAGTTCGCAAAACAAGGCAACAGCGCCAACCA
CATGCCCTCCAGTGGATATTGAGTGGCCTCCAAGACAATCGTCAAGCCTCACTACTCCAG
CAATGGCTGATGAGACACAGCTAAACACAAGAACATCGTCTACTCCAGGTTTTGATGAAT
TAGATCCTTTTGCTAATTGGCCTCCACGTCCCAGTAACAACGGCGCTTCTGTTGCTTCTA
CCGGTCTCAACAATGGCACTGCGTCTGGTTTTAGCAGCAACTTAACAGCCGGCACTCCGT
TTCAGACAGCATACAGTGACAACTGGGCATTCAGTAATGCCTCCTTGTCTTCGCTGAACC
CACCTCAGCAAAAACAGAGCCAAGGAGTGCCATCTTTCTCCAGCAATTCTAACAATAACC
AAAAACCAGCAGACATCAGCTCTATATTCAGTTCAAGCAAAACCGGTCAGCCTGGAATGA
GACTTGTGCCACCACCTT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2E923JQ 512 0 0
GTTTTAGCAGCAACTTAACAGCCGGCACTCCGTTTCAGACAGCATACAGTGACAACTGGG
CATTCAGTAATGCCTCCTTGTTTTCGCTGAACCCACCTCAGCAAAAACAGAGCCAAGGAG
TGCCATCTTTTTCCAGCAATTTTAACAATAACCAAAAACCAGCAGACATCAGCTTTATAT
TCAGTTCAAGCAAAACCGGTCAGCCTGGAATGAGACTTGTGCCACCACCTTCGACAGCAA
TGGGAAGAGGAAGGGGAAGAGGTAGAGGTGGCACCTCAAAGCCCAATGGTTCACAAACAT
TTTTATTGGATTTACTATGACCAAAGGCTCCCGAGGTTACTGTTTGATCTTGCAGAGAAG
AGAAAGCTTATACACATGGAGAGTGCGCGATGTGCTTTGTGATAAAGAGAGAAAATTTCA
GAAAAAAATGGAGATGTTTATGTAAGCATTTTTTTGGATTAGTTCTGTTCACATATAAAC
CTAACTGCAGCTTCATGTTTTCAGGTTGTTTC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL6558Contig1 708 2 1 U
GGTCGAGAAGCCTTCGTTCCTGGCGATCGCATCTCCTCCTTCGCTCGCGGCTTCCCGCGG
CGCTTTCGAGTTTGGTGAAGAGTATAGCTGGATCCACGGCGGAGATTCTGTGCGGGTTGA
AGAGAGGGGAGACCGTCGAGCTTAGCGCTGTGATGGGGAATGGTTTCGATATGGGACAGG
TTGATCCTCCCGAGGAGTATCCCACGGTTTTGATTTTCGCCACTGGATCTGGAATCAGTC
CCATCCGCTCACTAATTGAGACAGGATTTGGCGCTGATAGAAGATCTGATGTAAGACTCT
ATTATGGGGCTAGGAACATGAAAAGAATGGCTTATCGGGAAAAGTTTAAAGAGTGGGAAT
CATCGGGTGTCAAAGTTGTGCCTGTATTATCACAGCCAGATGATGGGTGGACAGGGGAAA
CCGGATATGTCCAGGCTGCCTTTGCAAGGGCTAAACAAGTTTCAAAACCTGAGGCCACAG
GAGTGGTGCTGTGCGGACAGAGACAAATGGCTGAGGAGATAACCGCGATGCTTGTAGCTG
ATGGAGTCTCAGATGACAAGATGCTCAAAAACTTTTGACAGATAAATTTATTTGTATGTT
GTAGTAACTTATATACTGTGTCATCATCATATGATTCTTTTGCTACCAAAATCAAACACA
GATTTTTGTAATACCTTAAAGATGAATAATAGTACTGTGTTGATTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EI66TF U 1
AF RR2EI66JQ C 79
BS 1 708 RR2EI66TF

RD RR2EI66TF 708 0 0
GGTCGAGAAGCCTTCGTTCCTGGCGATCGCATCTCCTCCTTCGCTCGCGGCTTCCCGCGG
CGCTTTCGAGTTTGGTGAAGAGTATAGCTGGATCCACGGCGGAGATTCTGTGCGGGTTGA
AGAGAGGGGAGACCGTCGAGCTTAGCGCTGTGATGGGGAATGGTTTCGATATGGGACAGG
TTGATCCTCCCGAGGAGTATCCCACGGTTTTGATTTTCGCCACTGGATCTGGAATCAGTC
CCATCCGCTCACTAATTGAGACAGGATTTGGCGCTGATAGAAGATCTGATGTAAGACTCT
ATTATGGGGCTAGGAACATGAAAAGAATGGCTTATCGGGAAAAGTTTAAAGAGTGGGAAT
CATCGGGTGTCAAAGTTGTGCCTGTATTATCACAGCCAGATGATGGGTGGACAGGGGAAA
CCGGATATGTCCAGGCTGCCTTTGCAAGGGCTAAACAAGTTTCAAAACCTGAGGCCACAG
GAGTGGTGCTGTGCGGACAGAGACAAATGGCTGAGGAGATAACCGCGATGCTTGTAGCTG
ATGGAGTCTCAGATGACAAGATGCTCAAAAACTTTTGACAGATAAATTTATTTGTATGTT
GTAGTAACTTATATACTGTGTCATCATCATATGATTCTTTTGCTACCAAAATCAAACACA
GATTTTTGTAATACCTTAAAGATGAATAATAGTACTGTGTTGATTGTC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RR2EI66JQ 630 0 0
AGAGTATAGCTGGATCCACGGCGGAGATTCTGTGCGGGTTGAAGAGAGGGGAGACCGTCG
AGCTTAGCGCTGTGATGGGGAATGGTTTCGATATGGGACAGGTTGATCCTCCCGAGGAGT
ATCCCACGGTTTTGATTTTCGCCACTGGATCTGGAATCAGTCCCATCCGCTCACTAATTG
AGACAGGATTTGGCGCTGATAGAAGATCTGATGTAAGACTCTATTATGGGGCTAGGAACA
TGAAAAGAATGGCTTATCGGGAAAAGTTTAAAGAGTGGGAATCATCGGGTGTCAAAGTTG
TGCCTGTATTATCACAGCCAGATGATGGGTGGACAGGGGAAACCGGATATGTCCAGGCTG
CCTTTGCAAGGGCTAAACAAGTTTCAAAACCTGAGGCCACAGGAGTGGTGCTGTGCGGAC
AGAGACAAATGGCTGAGGAGATAACCGCGATGCTTGTAGCTGATGGAGTCTCAGATGACA
AGATGCTCAAAAACTTTTGACAGATAAATTTATTTGTATGTTGTAGTAACTTATATACTG
TGTCATCATCATATGATTCTTTTGCTACCAAAATCAAACACAGATTTTTGTAATACCTTA
AAGATGAATAATAGTACTGTGTTGATTGTC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL6559Contig1 1082 2 2 U
GGGAAACCATGATGCTTAGCCACGCAACTTTCGTCCGGAGAACACCACTCGTGTTCAATT
CTCTTGGTGTTTCCGGTAATGACAACCGAAGGAATGTAACTGGAGCTGGTTCAAGCAGGG
CTGCTTCGTTTTGGTTACAAAAACGGTTCACTGAATTTTGGCCGTACCAATTGGTCTGGA
CGTCCCGGGACTGGGTTCGGGCCTCTGGGTCGGGTCTCTTCGGTCTCAGGTGGAGGTTCA
GGTGATTCCGGCGGTATTGGTGGAGGTTCAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGAGGTGAAGAT
AGCGGCGGAAACGGAAACAAGTGGTCATTTCTGCCATGGTACTTGGCTCTCCTCTCGGAT
TATCCTGTTTTGACCAAATCTGTGACATCAGCACTTTTGACCCTCATTGGTGATTTGATC
TGTCAGCTTACAATCAATAAGACCTCATCTCTTGACAAGAAGAGGACACTCACGTTTACC
ATCTTGGGCTTAGGGCTTGTCGGTCCAGCTTTGCACTTCTGGTACTTGTATTTGAGCAAA
GTGGTGACAGCTTCCGGATTATCAGGCGCAGTTTTGCGACTTTTACTGGACCAGTTTGTT
TTTGCTCCAGTTTTTGTTGGAGTTTTCTTATCAGCTGTTGTGACACTTGAAGGAAAACCA
TCAAATGTCATACCGAAGCTAAAGCAGGAGTGGACTGGTGCAGTGCTAGCAAATTGGCAG
CTTTGGATTCCATTTCAGTTTCTTAACTTCAGATTTGTTCCACAAAACTTCCAGGTACTC
GCTTCCAACGTAGTTGCTTTGGCTTGGAATGTGATTTTATCATTCAAAGCTCACAAAGAA
GTTGTGACAAAGTAGGAATGTTTCATTCCCTACAGCTACATGTGTTGTTGGATTGTAATC
AGGCAGAGTTTTGGGGACAGAATTCTTGTTTGCTGATGCAAATGTTCGCACATTTTTCAT
GAATGTAGAAACAAGCTTTTGTCTTTAAACGTTTTGTCTTTAAACACAATGTCATAGCCC
CCACATTTCATGTTTAACTAACAGTTTCCAAATAATTTAAAATTTGGTTCAATTGCGTTG
GC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2B236TF U 1
AF RR2B236JQ C 319
BS 1 438 RR2B236TF
BS 439 1082 RR2B236JQ

RD RR2B236TF 438 0 0
GGGAAACCATGATGCTTAGCCACGCAACTTTCGTCCGGAGAACACCACTCGTGTTCAATT
CTCTTGGTGTTTCCGGTAATGACAACCGAAGGAATGTAACTGGAGCTGGTTCAAGCAGGG
CTGCTTCGTTTTGGTTACAAAAACGGTTCACTGAATTTTGGCCGTACCAATTGGTCTGGA
CGTCCCGGGACTGGGTTCGGGCCTCTGGGTCGGGTCTCTTCGGTCTCAGGTGGAGGTTCA
GGTGATTCCGGCGGTATTGGTGGAGGTTCAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGAGGTGAAGAT
AGCGGCGGAAACGGAAACAAGTGGTCATTTCTGCCATGGTACTTGGCTCTCCTCTCGGAT
TATCCTGTTTTGACCAAATCTGTGACATCAGCACTTTTGACCCTCATTGGTGATTTGATC
TGTCAGCTTACAATCAAT

QA 1 438 1 438
DS 

RD RR2B236JQ 764 0 0
AAGTGGTCATTTCTGCCATGGTACTTGGCTCTCCTCTCGGATTATCCTGTTTTGACCAAA
TCTGTGACATCAGCACTTTTGACCCTCATTGGTGATTTGATCTGTCAGCTTACAATCAAT
AAGACCTCATCTCTTGACAAGAAGAGGACACTCACGTTTACCATCTTGGGCTTAGGGCTT
GTCGGTCCAGCTTTGCACTTCTGGTACTTGTATTTGAGCAAAGTGGTGACAGCTTCCGGA
TTATCAGGCGCAGTTTTGCGACTTTTACTGGACCAGTTTGTTTTTGCTCCAGTTTTTGTT
GGAGTTTTCTTATCAGCTGTTGTGACACTTGAAGGAAAACCATCAAATGTCATACCGAAG
CTAAAGCAGGAGTGGACTGGTGCAGTGCTAGCAAATTGGCAGCTTTGGATTCCATTTCAG
TTTCTTAACTTCAGATTTGTTCCACAAAACTTCCAGGTACTCGCTTCCAACGTAGTTGCT
TTGGCTTGGAATGTGATTTTATCATTCAAAGCTCACAAAGAAGTTGTGACAAAGTAGGAA
TGTTTCATTCCCTACAGCTACATGTGTTGTTGGATTGTAATCAGGCAGAGTTTTGGGGAC
AGAATTCTTGTTTGCTGATGCAAATGTTCGCACATTTTTCATGAATGTAGAAACAAGCTT
TTGTCTTTAAACGTTTTGTCTTTAAACACAATGTCATAGCCCCCACATTTCATGTTTAAC
TAACAGTTTCCAAATAATTTAAAATTTGGTTCAATTGCGTTGGC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL6560Contig1 721 2 5 U
GGCAACGGTTCGAGAAGAGGTTCAGCATTCTCCACATCTCCAACACGATTCTCGCTATCG
GCAGCATGCTTTACCATGCCACTTTGCAGCACGTGCAACAGCAGAGCGATGAGACGCCGA
TGGTGTGGGAGATACTTCTCTACATGTATATCCTTTACTCACCGGACTGGCATTACGGAA
GCACCATGCCGACCTTTCTCTTCCTCTACGGTGCTGCCTTCGCTGTCGTCCACGCTTTCC
TCAGGTTTGGGATCGGTTTCAAGGTTCACTATGTGGTTCTTTGCCTGTTGTGTATTCCTC
GGATGTACAAGTACTACATTCACACGGAGGACACCGCGGCTAAAAGGATTGCGAAGTGGT
ACGTCGCCACGATTCTTGTGGGGAGTGTTTGCTGGTTCTGTGACCGTGTTTTCTGCAAGA
GGATATCTCAGCGGCCTGTGAACCCTCAGGGACATGCTCTGTGGCATGTGTTCATGAGTT
TCAACTCTTACTGTGCGAACACGTTCTTGATGTTCTGTCGAGCTCAGCAGCGTGGATGGA
ATCCGAAGGTTAAATACTTTCTGGGAGTTCTTCCTTACGTCAAGATCGAGAAGCCAAAAA
CACAATGAGGGGGGGAAAGAGCCCAGAAGATCATAAATATAGTTTTTTTTTTGTTCATCG
TTTTGTCAGAAATTTCGACGTTTGTTTTCATTTTTTGGATGCGAAAGTACTCTCAGAGTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2CV23TF U 24
AF RR2CV23JQ C 1
BS 1 23 RR2CV23JQ
BS 24 651 RR2CV23TF
BS 652 652 RR2CV23JQ
BS 653 700 RR2CV23TF
BS 701 721 RR2CV23JQ

RD RR2CV23TF 677 0 0
AGCATTCTCCACATCTCCAACACGATTCTCGCTATCGGCAGCATGCTTTACCATGCCACT
TTGCAGCACGTGCAACAGCAGAGCGATGAGACGCCGATGGTGTGGGAGATACTTCTCTAC
ATGTATATCCTTTACTCACCGGACTGGCATTACGGAAGCACCATGCCGACCTTTCTCTTC
CTCTACGGTGCTGCCTTCGCTGTCGTCCACGCTTTCCTCAGGTTTGGGATCGGTTTCAAG
GTTCACTATGTGGTTCTTTGCCTGTTGTGTATTCCTCGGATGTACAAGTACTACATTCAC
ACGGAGGACACCGCGGCTAAAAGGATTGCGAAGTGGTACGTCGCCACGATTCTTGTGGGG
AGTGTTTGCTGGTTCTGTGACCGTGTTTTCTGCAAGAGGATATCTCAGCGGCCTGTGAAC
CCTCAGGGACATGCTCTGTGGCATGTGTTCATGAGTTTCAACTCTTACTGTGCGAACACG
TTCTTGATGTTCTGTCGAGCTCAGCAGCGTGGATGGAATCCGAAGGTTAAATACTTTCTG
GGAGTTCTTCCTTACGTCAAGATCGAGAAGCCAAAAACACAATGAGGGGGGGAAAGAGCC
CAGAAGATCATAAATATAGTTTTTTTTT*GTTCATCGTTTTGTCAGAAATTTCGACGTTT
GTTTTCATTTTTTGGAT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2CV23JQ 721 0 0
GGCAACGGTTCGAGAAGAGGTTCAGCATTCTCCACATCTCCAACACGATTCTCGCTATCG
GCAGCATGCTTTACCATGCCACTTTGCAGCACGTGCAACAGCAGAGCGATGAGACGCCGA
TGGTGTGGGAGATACTTCTCTACATGTATATCCTTTACTCACCGGACTGGCATTACGGAA
GCACCATGCCGACCTTTCTCTTCCTTTACGGTGCTGCCTTCGCTGTCGTCCACGCTTTCC
TCAGGTTTGGGATCGGTTTCAAGGTTCACTATGTGGTTCTTTGCCTGTTGTGTATTCCTC
GGATGTACAAGTACTACATTCACACGGAGGACACCGCGGCTAAAAGGATTGCGAAGTGGT
ACGTCGCCACGATTCTTGTGGGGAGTGTTTGCTGGTTCTGTGACCGTGTTTTCTGCAAGA
GGATATTTCAGCGGCCTGTGAACCCTCAGGGACATGCTCTGTGGCATGTGTTCATGAGTT
TCAACTCTTACTGTGCGAACACGTTCTTGATGTTCTGTCGAGCTCAGCAGCGTGGATGGA
ATCCGAAGGTTAAATACTTTCTGGGAGTTCTTCCTTACGTCAAGATCGAGAAGCCAAAAA
CACAATGAGGGGGG*AAAGAGCCCAGAAGATCATAAATATAGTTTTTTTTTTGTTCATCG
TTTTGTCAGAAATTTCGACGTTTGTTTTCATTTTTTGGATGCGAAAGTACTCTCAGAGTC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL6561Contig1 765 2 2 U
GGATCGCCTGCACCATATCTCTGACCCGGCGAAGCAAGCCGTTCTCTCCAACACCAACCC
GCCGGAGAGTTGTAGTAGAGTCATGAAGAAGCTTATATCACTTGTCAGGAACCTTCATTC
ACGCCAATGCCACCAACCCAAAGCAAACTGGTCTGTGCAAGCGCGTTTCTTGCAGTAAGA
CTCTGTATCCAAACCCAAACCCAAGAAGTACAAGTACCCGTCATTCTACGATCCGTACGG
TCCTAGACCCCAGCCTTCGAGCAAGATCGTGGAGCTAGCCGAGCGTATCGCCGCGCTGTC
TCCAGAAGAGCGGAAACAGATCGGTCCCGCACTCAACGACCACCTGAGGCTTCCGAAACA
GCAGATGATCTCAGGGCAAGGCGTGAGTATGGGAGGGAAGCAGGAGGGTGGAGCAGGGAA
AGAAGTGGAGGAGAAGAAGGAGAAGACGTCTTTCGATGTGAAGCTGGGGAAGTTCGATAC
GGCTGCGAAGATCAAAGTGATCAAAGAAGTGAGAGCGTTCACGAGTTTGGGTCTCAAGGA
AGCGAAAGAGCTTGTGGAGAAAGTACCCGTCGTGATTAAACAAGGTCTGACAAAGGAAGA
AGCTAATGGAATCATAGAGAAGATCAAAGCTGTAGGTGGAGTCGCGGTTATGGAGTAAGT
GATTTTGAAACACACTTGTGTTTTGGTTTGTCTCTTGGTTATTGTGTTTGGTCACAATGT
AATAACAAATCAATTAAACCATCAAGTTTACAAGAACTTTGTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC87TF U 1
AF RR2AC87JQ C 1
BS 1 633 RR2AC87TF
BS 634 765 RR2AC87JQ

RD RR2AC87TF 633 0 0
GGATCGCCTGCACCATATCTCTGACCCGGCGAAGCAAGCCGTTCTCTCCAACACCAACCC
GCCGGAGAGTTGTAGTAGAGTCATGAAGAAGCTTATATCACTTGTCAGGAACCTTCATTC
ACGCCAATGCCACCAACCCAAAGCAAACTGGTCTGTGCAAGCGCGTTTCTTGCAGTAAGA
CTCTGTATCCAAACCCAAACCCAAGAAGTACAAGTACCCGTCATTCTACGATCCGTACGG
TCCTAGACCCCAGCCTTCGAGCAAGATCGTGGAGCTAGCCGAGCGTATCGCCGCGCTGTC
TCCAGAAGAGCGGAAACAGATCGGTCCCGCACTCAACGACCACCTGAGGCTTCCGAAACA
GCAGATGATCTCAGGGCAAGGCGTGAGTATGGGAGGGAAGCAGGAGGGTGGAGCAGGGAA
AGAAGTGGAGGAGAAGAAGGAGAAGACGTCTTTCGATGTGAAGCTGGGGAAGTTCGATAC
GGCTGCGAAGATCAAAGTGATCAAAGAAGTGAGAGCGTTCACGAGTTTGGGTCTCAAGGA
AGCGAAAGAGCTTGTGGAGAAAGTACCCGTCGTGATTAAACAAGGTCTGACAAAGGAAGA
AGCTAATGGAATCATAGAGAAGATCAAAGCTGT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2AC87JQ 765 0 0
GGATCGCCTGCACCATATCTCTGACCCGGCGAAGCAAGCCGTTCTCTCCAACACCAACCC
GCCGGAGAGTTGTAGTAGAGTCATGAAGAAGCTTATATCACTTGTCAGGAACCTTCATTC
ACGCCAATGCCACCAACCCAAAGCAAACTGGTCTGTGCAAGCGCGTTTCTTGCAGTAAGA
CTCTGTATCCAAACCCAAACCCAAGAAGTACAAGTACCCGTCATTTTACGATCCGTACGG
TCCTAGACCCCAGCCTTCGAGCAAGATCGTGGAGCTAGCCGAGCGTATCGCCGCGCTGTC
TCCAGAAGAGCGGAAACAGATCGGTCCCGCACTCAACGACCACCTGAGGCTTCCGAAACA
GCAGATGATCTCAGGGCAAGGCGTGAGTATGGGAGGGAAGCAGGAGGGTGGAGCAGGGAA
AGAAGTGGAGGAGAAGAAGGAGAAGACGTCTTTCGATGTGAAGCTGGGGAAGTTCGATAC
GGCTGCGAAGATCAAAGTGATCAAAGAAGTGAGAGCGTTCACGAGTTTGGGTCTCAAGGA
AGCGAAAGAGCTTGTGGAGAAAGTACCCGTCGTGATTAAACAAGGTCTGACAAAGGAAGA
AGCTAATGGAATCATAGAGAAGATCAAAGCTGTAGGTGGAGTCGCGGTTATGGAGTAAGT
GATTTTGAAACACACTTGTGTTTTGGTTTGTCTCTTGGTTATTGTGTTTGGTCACAATGT
AATAACAAATCAATTAAACCATCAAGTTTACAAGAACTTTGTTTC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL6562Contig1 995 2 4 U
GTACACAAAACAAGAAAGAAGAAGTAAAAAGCTCACCGCTTTAACCTTTCTAGAGTGAAA
GAACTCTGAAAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATATGG
AAGGCAAAGAAGAAGATGTGAGAGTTGGAGCTAACAAGTTCCCGGAGAGGCAGCCCATCG
GAACATCGGCTCAGTCCGACAAGGACTACAAAGAGCCACCACCTGCGCCACTGTTCGAGC
CGAGAGAGCTGAGCTCGTGGTCTTTCTGGAGAGCAGGAATCGCCGAGTTCATAGCTACTT
TCCTCTTCCTTTACATCACAGTGTTGACAGTCATGGGAGTGAAGAGAGCACCAAACATGT
GCGCCTCTGTTGGAATCCAAGGCATCGCTTGGGCTTTTGGTGGCATGATCTTTGCTCTCG
TCTACTGTACTGCTGGAATTTCAGGTGGACACATCAACCCCTGCGGTTACGTTCGGTCTG
TTCTTGGCTAGGAAGTTGTCTCTGACCAGAGCTGTTTTCTACGTGATTATGCAATGTCTC
GGAGCCATCTGTGGTGCCGGAGTCGTCAAGGGTTTCCAGCCAACGCCGTACCAGACTCTC
GGGTGGCGGTGCTAACACCGTCGCTCCCGGCTACTCCAAGGGATCTGGTCTCGGTGCTGA
GATTATTGGAACCTTCGTACTCGTCTACACGGTCTTTTCCGCCACCGACGCCAAGAGAAG
CGCCCGTGACTCACACGTCCCAATTTTGGCACCACTTCCAATCGGGTTTGCAGTGTTTTT
GGTACACTTGGCGACAATTCCGATAACCGGAACCGGAATCAACCCAGCTAGAAGTCTTGG
AGCTGCCATTATCTACAACAAGGAGCACTCCAGGGACGACCATTGGATTTTCTGGGTTGG
ACCATTCATTGGAGCAGCTCTAGCAGCACTCTATCACCAGCTTGTCATCAGAGTCATTCC
TTTCAAGAGCAAGAGCTGAACCATATGATGAACTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C975TF U 1
AF RR2C975JQ C 385
BS 1 460 RR2C975TF
BS 461 461 RR2C975JQ
BS 462 632 RR2C975TF
BS 633 995 RR2C975JQ

RD RR2C975TF 632 0 0
GTACACAAAACAAGAAAGAAGAAGTAAAAAGCTCACCGCTTTAACCTTTCTAGAGTGAAA
GAACTCTGAAAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATATGG
AAGGCAAAGAAGAAGATGTGAGAGTTGGAGCTAACAAGTTCCCGGAGAGGCAGCCCATCG
GAACATCGGCTCAGTCCGACAAGGACTACAAAGAGCCACCACCTGCGCCACTGTTCGAGC
CGAGAGAGCTGAGCTCGTGGTCTTTCTGGAGAGCAGGAATCGCCGAGTTCATAGCTACTT
TCCTCTTCCTTTACATCACAGTGTTGACAGTCATGGGAGTGAAGAGAGCACCAAACATGT
GCGCCTCTGTTGGAATCCAAGGCATCGCTTGGGCTTTTGGTGGCATGATCTTTGCTCTCG
TCTACTGTACTGCTGGAATTTCAGGTGGACACATCAACCC*TGCGGTTACGTTCGGTCTG
TTCTTGGCTAGGAAGTTGTCTCTGACCAGAGCTGTTTTCTACGTGATTATGCAATGTCTC
GGAGCCATCTGTGGTGCCGGAGTCGTCAAGGGTTTCCAGCCAACGCCGTACCAGACTCTC
GGGTGGCGGTGCTAACACCGTCGCTCCCGGCT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2C975JQ 611 0 0
TCGCTTGGGCTTTTGGTGGCATGATCTTTGCTCTCGTCTACTGTACTGCTGGAATTTCAG
GTGGACACATCAACCCCTGCGGTTACGTTCGGTCTGTTCTTGGCTAGGAAGTTGTCTCTG
ACCAGAGCTGTTTTCTACGTGATTATGCAATGTCTCGGAGCCATCTGTGGTGCCGGAGTC
GTCAAGGGTTTCCAGCCAACGCCGTACCAGACTCTCGG*TGGCGGTGCTAACACCGTCGC
TCCCGGCTACTCCAAGGGATCTGGTCTCGGTGCTGAGATTATTGGAACCTTCGTACTCGT
CTACACGGTCTTTTCCGCCACCGACGCCAAGAGAAGCGCCCGTGACTCACACGTCCCAAT
TTTGGCACCACTTCCAATCGGGTTTGCAGTGTTTTTGGTACACTTGGCGACAATTCCGAT
AACCGGAACCGGAATCAACCCAGCTAGAAGTCTTGGAGCTGCCATTATCTACAACAAGGA
GCACTCCAGGGACGACCATTGGATTTTCTGGGTTGGACCATTCATTGGAGCAGCTCTAGC
AGCACTCTATCACCAGCTTGTCATCAGAGTCATTCCTTTCAAGAGCAAGAGCTGAACCAT
ATGATGAACTA

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL6563Contig1 1107 2 4 U
GTCTGATTCTAAATTCTTTACTGTTCGGAATTTCATAAGATACTAGATGGCCTAAACCTG
ATTTTTCTTTATTAGAGGTGATATCTGTTTGAATAGTTTGCCTATTAAGGCACTGAAAGA
AACATTCAGAGACACGTTTGGGCGTGAGACGACTGTTAAGAACATGACTTGGCTGAAAAG
GAGGATTACAATGGGATTTATTAATTCATGTGACGTACCAACTACTAACCATGACAATTA
AAGATAACACGCTAGTTGGAAACCAAGAGAAGTCCAATGATGTGATATAAGGGTGATGAT
GTAAGAGCAACTAGCCTGAAAGATGCACCTTCTCTAGTACTGATTATTTCAATGAACATT
CAAATGCTTCTCTCAGTGTCAACCATTATTGCGCAATTGAAGAGAGGGCTGGGTTTGAAA
TTGAGGTTCCATATATGTTTCTCGTGTCCGGAGAAGCCGTCCAAGAGAGAACAGTATGTC
TCATATGGTATTTATCTTGGTTACTCATTCTTCTCAATATGCCACATATGAACAAAATAT
TTGTGTGTGTTCTCTGGGCCGTTAGTTAGCTTTGCTTTGAAGTTGGAAAGTGATCAAAGA
TAGTGAAATGTACGCATATCATTGCAGTTGCTTGGTAGCAAAAGCTAGTGCACGAGAGAG
TAACCTGTTAAACAGTGAGGTTGATAGTAGATATGGTCAAGAGTTTGATATTTTAGAAGA
ATTTGGTGTTGCAAATATGATACAGTTTCTCTTTGCATTCTTGGTTTTGCAAATGCAGTT
TGCTACAATCAAAACAACAACGAGGAGGACATTCTCACTGAGGTTGACCAAGAGATGATG
GAACCGAGCTTGGACGAGATTTAAGGTTACAAGATTAGTAGGTGTTTCCAAATATGGAGT
TGGGAAGTGGTCCGAGTAGGTAATTACAACTTATTAAATCTCTTGACATGATCCTATCAG
ACCAGGCCCTGTTTATGGTCATCTTGTAGTTTTCATATGCAAATGACAAAATCTTTTGAA
AGCAAGCTTTGCTAAGAGTTCTTCAAACAGCATATGGGAATGTTGGACTCTCCAATGCAG
TAGTTTCCAAGTATGGAGTCTTTCACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI83TF U 1
AF RR2GI83JQB C 517
BS 1 767 RR2GI83TF
BS 768 768 RR2GI83JQB
BS 769 785 RR2GI83TF
BS 786 1107 RR2GI83JQB

RD RR2GI83TF 785 0 0
GTCTGATTCTAAATTCTTTACTGTTCGGAATTTCATAAGATACTAGATGGCCTAAACCTG
ATTTTTCTTTATTAGAGGTGATATCTGTTTGAATAGTTTGCCTATTAAGGCACTGAAAGA
AACATTCAGAGACACGTTTGGGCGTGAGACGACTGTTAAGAACATGACTTGGCTGAAAAG
GAGGATTACAATGGGATTTATTAATTCATGTGACGTACCAACTACTAACCATGACAATTA
AAGATAACACGCTAGTTGGAAACCAAGAGAAGTCCAATGATGTGATATAAGGGTGATGAT
GTAAGAGCAACTAGCCTGAAAGATGCACCTTCTCTAGTACTGATTATTTCAATGAACATT
CAAATGCTTCTCTCAGTGTCAACCATTATTGCGCAATTGAAGAGAGGGCTGGGTTTGAAA
TTGAGGTTCCATATATGTTTCTCGTGTCCGGAGAAGCCGTCCAAGAGAGAACAGTATGTC
TCATATGGTATTTATCTTGGTTACTCATTCTTCTCAATATGCCACATATGAACAAAATAT
TTGTGTGTGTTCTCTGGGCCGTTAGTTAGCTTTGCTTTGAAGTTGGAAAGTGATCAAAGA
TAGTGAAATGTACGCATATCATTGCAGTTGCTTGGTAGCAAAAGCTAGTGCACGAGAGAG
TAACCTGTTAAACAGTGAGGTTGATAGTAGATATGGTCAAGAGTTTGATATTTTAGAAGA
ATTTGGTGTTGCAAATATGATACAGTTTCTCTTTGCATTCTTGGTTT*GCAAATGCAGTT
TGCTA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2GI83JQB 591 0 0
ATATGCCACATATGAACAAAATATTTGTGTGTGTTCTCTGGGCCGTTAGTTAGCTTTGCT
TTGAAGTTGGAAAGTGATCAAAGATAGTGAAATGTAGGCATATCATTGCAGTTGCTTGGT
AGCAAAAGCTAGTGCAGGAGAGAGTAACCTGTTAAACAGTGAGGTTGATAGTAGATATGG
TCAAGAGTTTGATATTTTAGAAGAATTTGGTGTTGCAAATATGATACAGTTTCTCTTTGC
ATTCTTGGTTTTGCAAATGCAGTTTGCTACAATCAAAACAACAACGAGGAGGACATTCTC
ACTGAGGTTGACCAAGAGATGATGGAACCGAGCTTGGACGAGATTTAAGGTTACAAGATT
AGTAGGTGTTTCCAAATATGGAGTTGGGAAGTGGTCCGAGTAGGTAATTACAACTTATTA
AATCTCTTGACATGATCCTATCAGACCAGGCCCTGTTTATGGTCATCTTGTAGTTTTCAT
ATGCAAATGACAAAATCTTTTGAAAGCAAGCTTTGCTAAGAGTTCTTCAAACAGCATATG
GGAATGTTGGACTCTCCAATGCAGTAGTTTCCAAGTATGGAGTCTTTCACA

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL6564Contig1 705 2 8 U
GGAAAACCACAAAGCTTCTTCTCACTTTCGCAATCACATAAAAACCTTTCTTTCTTCCTT
TCTATCCTATCCAGAAGAAGAAGATAAATCGTTTTTAAAATGGCGAAGAAAGGAGGAGGA
GCAACAACACTCGCCGAGGACGCACCGTGGCGTGTCTCCTCGGTAAAACCAGTACCTCGA
ATCAGCCGCTCACCGGTTCTCTCCATCTCTCAAAGTCCAGAGACCGATTACGCCATTGCC
GTCATGAAGCATCCGAATCCAGTGGGAGGTGGTTTGGCGATGGAAGCAGTGCTTGAATCT
GCAGGACCTGAATGCGTTGTTCCTGGTCAAGTCACGCCTCTTCGTCTTCTTGGTGTTAAG
GTGTGGCCTGTTGAGGTTGATCTCAAGTTCCTGGAACCAGTGGGGAAAGAGCTTAAGATG
CTTGGGAAGTTCATGGATAATGCTGTCGACCTGATGAATAAGTCTTTTATCGACCGTTAA
GCACCATGTAAAAGGGCGCTAAGGTATACGGCTAGAGTTTTGGAATGGGGAACTTATAAC
AGGCAGAGAAAGATATGATCTGAGAGCAAAGTTGAATATGGTGTGTGTGTGTGTCAGTGT
ATAGAGGATTATCTCCTTTCAAATATTATTACAGACAAAAATCTATATGCTATCAAATCA
TCATTGGTTTGAATTAAGGATATGCTTAAACTTTCTTCCAGTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ55JQ C 1
AF RR2BQ55TF U 1
BS 1 622 RR2BQ55TF
BS 623 623 RR2BQ55JQ
BS 624 640 RR2BQ55TF
BS 641 641 RR2BQ55JQ
BS 642 656 RR2BQ55TF
BS 657 657 RR2BQ55JQ
BS 658 674 RR2BQ55TF
BS 675 705 RR2BQ55JQ

RD RR2BQ55JQ 705 0 0
GGAAAACCACAAAGCTTCTTCTCACTTTCGCAATCACATAAAAACCTTTCTTTCTTCCTT
TCTATCCTATCCAGAAGAAGAAGATAAATCGTTTTTAAAATGGCGAAGAAAGGAGGAGGA
GCAACAACACTCGCCGAGGACGCACCGTGGCGTGTCTCCTCGGTAAAACCAGTACCTCGA
ATCAGCCGCTCACCGGTTCTCTCCATCTCTCAAAGTCCAGAGACCGATTACGCCATTGCC
GTCATGAAGCATCCGAATCCAGTGGGAGGTGGTTTGGCGATGGAAGCAGTGCTTGAATCT
GCAGGACCTGAATGCGTTGTTCCTGGTCAAGTCACGCCTCTTCGTCTTCTTGGTGTTAAG
GTGTGGCCTGTTGAGGTTGATCTCAAGTTCCTGGAACCAGTGGGGAAAGAGCTTAAGATG
CTTGGGAAGTTCATGGATAATGCTGTCGACCTGATGAATAAGTCTTTTATCGACCGTTAA
GCACCATGTAAAAGGGCGCTAAGGTATACGGCTAGAGTTTTGGAATGGGGAACTTATAAC
AGGCAGAGAAAGATATGATCTGAGAGCAAAGTTGAATATGGTGTGTGTGTGTGTCAGTGT
ATAGAGGATTATCTCCTTTCAAATATTATTACAGACAAAAATCTATATGCTATCAAATCA
TCATTGGTTTGAATTAAGGATATGCTTAAACTTTCTTCCAGTGTT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2BQ55TF 674 0 0
GGAAAACCACAAAGCTTCTTCTCACTTTCGCAATCACATAAAAACCTTTCTTTCTTCCTT
TCTATCCTATCCAGAAGAAGAAGATAAATCGTTTTTAAAATGGCGAAGAAAGGAGGAGGA
GCAACAACACTCGCCGAGGACGCACCGTGGCGTGTCTCCTCGGTAAAACCAGTACCTCGA
ATCAGCCGCTCACCGGTTCTCTCCATCTCTCAAAGTCCAGAGACCGATTACGCCATTGCC
GTCATGAAGCATCCGAATCCAGTGGGAGGTGGTTTGGCGATGGAAGCAGTGCTTGAATCT
GCAGGACCTGAATGCGTTGTTCCTGGTCAAGTCACGCCTCTTCGTCTTCTTGGTGTTAAG
GTGTGGCCTGTTGAGGTTGATCTCAAGTTCCTGGAACCAGTGGGGAAAGAGCTTAAGATG
CTTGGGAAGTTCATGGATAATGCTGTCGACCTGATGAATAAGTCTTTTATCGACCGTTAA
GCACCATGTAAAAGGGCGCTAAGGTATACGGCTAGAGTTTTGGAATGGGGAACTTATAAC
AGGCAGAGAAAGATATGATCTGAGAGCAAAGTTGAATATGGTGTGTGTGTGTGTCAGTGT
ATAGAGGATTATCTCCTTTCAA*TATTATTACAGACAAAA*TCTATATGCTATCAA*TCA
TCATTGGTTTGAAT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL6565Contig1 873 2 2 U
GGAGCGTTTCAGTGAGTCATAGACACTAAACTAAACCACCACTCTCTCTTCCTTATTCCT
CTTCCAAGAACCATGTCTAATAACACCAACGGAGTTATGATCTCAAACAGAGATATACTC
GAACGTCAGAGACAACAACAACAGCAACAGCAACCGTCAGAGGGAGCTCTCGTTGTGAAG
AAACCTCTAGCGAAAGATCGACACACCAAAGTCGACGGAAGAGGGAGGAGGATACGTATG
CCAATCATATGCGCAGCTCGTGTTTTCCATCTAACGCGAGAGCTCGGCCACAAATCCGAC
GGCCAGACCATCGAATGGCTCCTCCGTCAAGCTGAGCCTTCCATCATAGCCGCGACAGGA
ACCGGCACTACTCCGGCAAGCTTCTCCACCACCTCAACAAGTGATGTTCTTGCAACAACA
ACAACAACAACAAGAAGCTGCACTTTTTGTTCACCAGCAGCGACAGCAACAAGGTGCAAT
GGGTGAAGCTTCGGCACTAGAGTTGGTAGTCATCTTAACTTGCTAGCTTCTTTGTCTGGT
GGAGCTCCCGGGTCGGGTCGGAGAGAGGAAGACACACGTTGATGATGAAGTTGAGCTCCT
TTTTACTTTGGTACATATATATTTCTGTCTCTATATATGTTTGTGTTTTAGTTTTTAGAT
TGATCGATTGGTTCCAGGAGTGATGTAAGAGTATCTTTCGTGTTGAAGTTAAAACTAGGG
TTAGGGTTTAAGAATCTTGTCTTAAAGATTTGTTTCATGAAGTTTTTGTGTTTGTGGGAG
ATCAAGATTTACTACTGTTTATTGTTGTTGCTAATTGTGTAATGTGTTGCAATGAATGTG
GTTAGAAAATGCGTAAGCTGCCACGTTTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU58TF U 1
AF RR2EU58JQ C 77
BS 1 710 RR2EU58TF
BS 711 873 RR2EU58JQ

RD RR2EU58TF 710 0 0
GGAGCGTTTCAGTGAGTCATAGACACTAAACTAAACCACCACTCTCTCTTCCTTATTCCT
CTTCCAAGAACCATGTCTAATAACACCAACGGAGTTATGATCTCAAACAGAGATATACTC
GAACGTCAGAGACAACAACAACAGCAACAGCAACCGTCAGAGGGAGCTCTCGTTGTGAAG
AAACCTCTAGCGAAAGATCGACACACCAAAGTCGACGGAAGAGGGAGGAGGATACGTATG
CCAATCATATGCGCAGCTCGTGTTTTCCATCTAACGCGAGAGCTCGGCCACAAATCCGAC
GGCCAGACCATCGAATGGCTCCTCCGTCAAGCTGAGCCTTCCATCATAGCCGCGACAGGA
ACCGGCACTACTCCGGCAAGCTTCTCCACCACCTCAACAAGTGATGTTCTTGCAACAACA
ACAACAACAACAAGAAGCTGCACTTTTTGTTCACCAGCAGCGACAGCAACAAGGTGCAAT
GGGTGAAGCTTCGGCACTAGAGTTGGTAGTCATCTTAACTTGCTAGCTTCTTTGTCTGGT
GGAGCTCCCGGGTCGGGTCGGAGAGAGGAAGACACACGTTGATGATGAAGTTGAGCTCCT
TTTTACTTTGGTACATATATATTTCTGTCTCTATATATGTTTGTGTTTTAGTTTTTAGAT
TGATCGATTGGTTCCAGGAGTGATGTAAGAGTATCTTTCGTGTTGAAGTT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2EU58JQ 797 0 0
TCTAA
AACACCAACGGAGT*ATGATCTCAAACAGAGATATACTCGAACGTCAGAGACAACAACAA
CAGCAACAGCAACCGTCAGAGGGAGCTCTCGTTGTGAAGAAACCTCTAGCGAAAGATCGA
CACACCAAAGTCGACGGAAGAGGGAGGAGGATACGTATGCCAATCATATGCGCAGCTCGT
GTTTTCCATCTAACGCGAGAGCTCGGCCACAAATCCGACGGCCAGACCATCGAATGGCTC
CTCCGTCAAGCTGAGCCTTCCATCATAGCCGCGACAGGAACCGGCACTACTCCGGCAAGC
TTCTCCACCACCTCAACAAGTGATGTTCTTGCAACAACAACAACAACAACAAGAAGCTGC
ACTTTTTGTTCACCAGCAGCGACAGCAACAAGGTGCAATGGGTGAAGCTTCGGCACTAGA
GTTGGTAGTCATCTTAACTTGCTAGCTTCTTTGTCTGGTGGAGCTCCCGGGTCGGGTCGG
AGAGAGGAAGACACACGTTGATGATGAAGTTGAGCTCCTTTTTACTTTGGTACATATATA
TTTCTGTCTCTATATATGTTTGTGTTTTAGTTTTTAGATTGATCGATTGGTTCCAGGAGT
GATGTAAGAGTATCTTTCGTGTTGAAGTTAAAACTAGGGTTAGGGTTTAAGAATCTTGTC
TTAAAGATTTGTTTCATGAAGTTTTTGTGTTTGTGGGAGATCAAGATTTACTACTGTTTA
TTGTTGTTGCTAATTGTGTAATGTGTTGCAATGAATGTGGTTAGAAAATGCGTAAGCTGC
CACGTTTGTTTT

QA 6 797 6 797
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6567Contig1 607 2 2 U
GGAACCAAATCAATCAGACAAATAAAACAACAAAAAATGGGAAACTGCATATGTGTAATA
AACAAAACAACGACAGAGAGAAGAAGGAGAAGAGGATCCACCGTGTTCCATGATGACGAC
GTGGTAGAAGAGAAGCTGCTCGGAGAAACAAGTAACGTGTCGTCATCAGGCTCTTCTTCC
ATGTGTGGAGGAAGAGAGATTAAGATAAAGATGACGAGGAAAGAATTCGAAGATCTCATG
AGAAACATTAGTTTGGAGGGTTTGACGGCGGAAGAGGTTTTTTCTAATTTTCTTTCCGAC
GGTGGAGATCAAATCGGAACCGCCGCTGATATATCCAATGATCACCAACGGCCGTGGAGA
CCAGCGTTACAGAGCATCCCTGAGGTTGATTAATGTTTTTGGTGAATTGATTGGAAAATG
CTGAGTTTAATCGCTTAATCAGTGATTGTAGCTAATCCGAAGTTATGTACATGTTTGTTT
TTGTTATCTTTTCTTTAAAAACAAATTACTTTTGGATGAAACATCCGGATGCTAATATAT
TAGATGTTTTGTTTGGATAATCTAATATTTGTAATGGTTTCAGTTGTATATTGTAAATAA
TGTTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D685TF U 1
AF RR2D685JQ C 1
BS 1 538 RR2D685TF
BS 539 607 RR2D685JQ

RD RR2D685TF 538 0 0
GGAACCAAATCAATCAGACAAATAAAACAACAAAAAATGGGAAACTGCATATGTGTAATA
AACAAAACAACGACAGAGAGAAGAAGGAGAAGAGGATCCACCGTGTTCCATGATGACGAC
GTGGTAGAAGAGAAGCTGCTCGGAGAAACAAGTAACGTGTCGTCATCAGGCTCTTCTTCC
ATGTGTGGAGGAAGAGAGATTAAGATAAAGATGACGAGGAAAGAATTCGAAGATCTCATG
AGAAACATTAGTTTGGAGGGTTTGACGGCGGAAGAGGTTTTTTCTAATTTTCTTTCCGAC
GGTGGAGATCAAATCGGAACCGCCGCTGATATATCCAATGATCACCAACGGCCGTGGAGA
CCAGCGTTACAGAGCATCCCTGAGGTTGATTAATGTTTTTGGTGAATTGATTGGAAAATG
CTGAGTTTAATCGCTTAATCAGTGATTGTAGCTAATCCGAAGTTATGTACATGTTTGTTT
TTGTTATCTTTTCTTTAAAAACAAATTACTTTTGGATGAAACATCCGGATGCTAATAT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2D685JQ 607 0 0
GGAACCAAATCAATCAGACAAATAAAACAACAAAAAATGGGAAACTGCATATGTGTAATA
AACAAAACAACGACAGAGAGAAGAAGGAGAAGAGGATCCACCGTGTTCCATGATGACGAC
GTGGTAGAAGAGAAGCTGCTCGGAGAAACAAGTAACGTGTCGTCATCAGGCTCTTCTTCC
ATGTGTGGAGGAAGAGAGATTAAGATAAAGATGACGAGGAAAGAATTCGAAGATCTCATG
AGAAACATTAGTTTGGAGGGTTTGACGGCGGAAGAGGTTTTTTCTAATTTTCTTTCCGAC
GGTGGAGATCAAATCGGAACCGCCGCTGATATATCCAATGATCACCAACGGCCGTGGAGA
CCAGCGTTACAGAGCATCCCTGAGGTTGATTAATGTTTTTGGTGAATTGATTGGAAAATG
CTGAGTTTAATCGCTTAATCAGTGATTGTAGCTAATCCGAAGTTATGTACATGTTTGTTT
TTGTTATCTTTTCTTTAAAAACAAATTACTTTTGGATGAAACATCCGGATGCTAATATAT
TAGATGTTTTGTTTGGATAATCTAATATTTGTAATGGTTTCAGTTGTATATTGTAAATAA
TGTTTGC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6569Contig1 757 2 6 U
GGATGATGGTTCAGCAATGGTTATTCTGTTGTGTTAAAATTAACTTTTGCTCTACTGGCC
TCAATTTCTGTGCAAGTATCTAAAGAGCGAATTAGGATTGGCAAGGAACTCCTAGAAGCA
AAGCGGATAGAAGAAATAACGAAAGAAAACGTATAATCCTTTTGCGTAAAGCCGAGAAAG
AAGAAGAAAGACGGGCTAGGGAAAAGATCCGGCAAAAAGTTGAAGAAGACAAGGCTGAAA
GAAGGCGAAAACTAGGACTGCCTGCAGAAGATCCTGCCGCTTCTGCAAAACCCTCAGTGC
CAGTTGTGGAGGAGAAGAAGAGTTCATTGCCTATTAGACCCGCCACTAAGACTGAACAAA
TGAGAGAATGCTTGAGGTCGCTTAAGCAAGCCCACAAGGAGGATGATGCTAAAGTGAAGA
GAGCGTTCCAGACACTGCTGACTTACATGGGAAATGTCGCCAAGAATCCAGATGAAGAGA
AATTCCGGAAAATTAGACTTACCAACCAAACATTTCAGGAGAGGGTTGGTTCACTGAGAG
GAGGCATAGAGTTCATGGAGCTATGTGGGTTTGAGAAAATGGAAGGAGGAGAGTTCTTGT
TCTTGCCAAGGGACAAGATAGATTCAGCTGTTATCAACTCAGCTGGAACAGAGCTCAATT
CCGCTATCAACAACCCTTTCTTTGGTGTTCTTTAAACCGTTGCATTGTCTTCTTCTTCTT
TCTCTTTGGTATTGTGCCAAATGATGAAACTAATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F978TF U 1
AF RR2F978JQ C 64
BS 1 669 RR2F978TF
BS 670 672 RR2F978JQ
BS 673 688 RR2F978TF
BS 689 689 RR2F978JQ
BS 690 705 RR2F978TF
BS 706 757 RR2F978JQ

RD RR2F978TF 709 0 0
GGATGATGGTTCAGCAATGGTTATTCTGTTGTGTTAAAATTAACTTTTGCTCTACTGGCC
TCAATTTCTGTGCAAGTATCTAAAGAGCGAATTAGGATTGGCAAGGAACTCCTAGAAGCA
AAGCGGATAGAAGAAATAACGAAAGAAAACGTATAATCCTTTTGCGTAAAGCCGAGAAAG
AAGAAGAAAGACGGGCTAGGGAAAAGATCCGGCAAAAAGTTGAAGAAGACAAGGCTGAAA
GAAGGCGAAAACTAGGACTGCCTGCAGAAGATCCTGCCGCTTCTGCAAAACCCTCAGTGC
CAGTTGTGGAGGAGAAGAAGAGTTCATTGCCTATTAGACCCGCCACTAAGACTGAACAAA
TGAGAGAATGCTTGAGGTCGCTTAAGCAAGCCCACAAGGAGGATGATGCTAAAGTGAAGA
GAGCGTTCCAGACACTGCTGACTTACATGGGAAATGTCGCCAAGAATCCAGATGAAGAGA
AATTCCGGAAAATTAGACTTACCAACCAAACATTTCAGGAGAGGGTTGGTTCACTGAGAG
GAGGCATAGAGTTCATGGAGCTATGTGGGTTTGAGAAAATGGAAGGAGGAGAGTTCTTGT
TCTTGCCAAGGGACAAGATAGATTCAGCTGTTATCAACTCAGCTGGAACAGAGCTCAATT
CCGCTATCAC**ACCCTTTCTTTGGTGT*CTTTAAACCGTTGCAT
GTCT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2F978JQ 694 0 0
ATTTCTGTGCAAGTATCTAAAGAGCGAATTAGGATTGGCAAGGAACTCCTAGAAGCAAAG
CGGATAGAAGAAATAACGAAAGAAAACGTATAATCCTTTTGCGTAAAGCCGAGAAAGAAG
AAGAAAGACGGGCTAGGGAAAAGATCCGGCAAAAAGTTGAAGAAGACAAGGCTGAAAGAA
GGCGAAAACTAGGACTGCCTGCAGAAGATCCTGCCGCTTCTGCAAAACCCTCAGTGCCAG
TTGTGGAGGAGAAGAAGAGTTCATTGCCTATTAGACCCGCCACTAAGACTGAACAAATGA
GAGAATGCTTGAGGTCGCTTAAGCAAGCCCACAAGGAGGATGATGCTAAAGTGAAGAGAG
CGTTCCAGACACTGCTGACTTACATGGGAAATGTCGCCAAGAATCCAGATGAAGAGAAAT
TCCGGAAAATTAGACTTACCAACCAAACATTTCAGGAGAGGGTTGGTTCACTGAGAGGAG
GCATAGAGTTCATGGAGCTATGTGGGTTTGAGAAAATGGAAGGAGGAGAGTTCTTGTTCT
TGCCAAGGGACAAGATAGATTCAGCTGTTATCAACTCAGCTGGAACAGAGCTCAATTCCG
CTATCAACAACCCTTTCTTTGGTGTTCTTTAAACCGTTGCATTGTCTTCTTCTTCTTTCT
CTTTGGTATTGTGCCAAATGATGAAACTAATAAA

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL6570Contig1 730 2 2 U
GGGAACACAGACATCGCAGTTTCCTCTCTCTCAATCTATCTCTCTCTCTCTCTGCTTGAA
TCGATTCGTTCCAGGGATTGTGGAGCGGTTTGATTTGATATCGATCTGTGACAATGGTGG
CCGCTGGGATCGACATGGATGAAGGAGCTCTCGAGATCGGAATGGAGTACAGAACTGTGT
CAGGTGTTGCAGGACCATTGGTCATCCTTGAAAAAGTGAAGGGTCCAAAGTACCAGGAGA
TTGTTAACATTCGCTTAGGAGATGGATCTATGAGACGTGGTCAGGTCTTGGAGGTTGATG
GCGAGAAAGCTGTTGTCCAGGTTTTTGAAGGAACATCTGGAATTGACAACAAATTTACCA
CTGTGCAATTCACTGGAGAGGTTTTGAAAACTCCTGTATCACAAGACATGCTTGGCCGCA
TTTTTAACGGCTCGGGAAAGCCAATTGATAATGGTCCTCCTATTTTGCCAGAGGCATACC
TTGACATCTCTGGAAGTTCAATCAACCCCAGTGAAAGAACCTACCCTGAAGAGATGATTC
AGACTGGGATTTCTACCATTGATGTCATGAACTCCATCGCTCGTGGACAGAAAATCCCTC
TTTTCTCTGCTGCTGGTCTACCTCACAACGAAATCGCTGCTCAGATTTGTCGTCAGGCTG
GTCTTGTTAAGCGGTTGGAAAAGACTGAGAACCTAATTGAGGATCATGGAGAGGACAACT
TTGCAATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY65TF U 1
AF RR2EM82TF U 5
BS 1 652 RR2GY65TF
BS 653 730 RR2EM82TF

RD RR2GY65TF 652 0 0
GGGAACACAGACATCGCAGTTTCCTCTCTCTCAATCTATCTCTCTCTCTCTCTGCTTGAA
TCGATTCGTTCCAGGGATTGTGGAGCGGTTTGATTTGATATCGATCTGTGACAATGGTGG
CCGCTGGGATCGACATGGATGAAGGAGCTCTCGAGATCGGAATGGAGTACAGAACTGTGT
CAGGTGTTGCAGGACCATTGGTCATCCTTGAAAAAGTGAAGGGTCCAAAGTACCAGGAGA
TTGTTAACATTCGCTTAGGAGATGGATCTATGAGACGTGGTCAGGTCTTGGAGGTTGATG
GCGAGAAAGCTGTTGTCCAGGTTTTTGAAGGAACATCTGGAATTGACAACAAATTTACCA
CTGTGCAATTCACTGGAGAGGTTTTGAAAACTCCTGTATCACAAGACATGCTTGGCCGCA
TTTTTAACGGCTCGGGAAAGCCAATTGATAATGGTCCTCCTATTTTGCCAGAGGCATACC
TTGACATCTCTGGAAGTTCAATCAACCCCAGTGAAAGAACCTACCCTGAAGAGATGATTC
AGACTGGGATTTCTACCATTGATGTCATGAACTCCATCGCTCGTGGACAGAAAATCCCTC
TTTTCTCTGCTGCTGGTCTACCTCACAACGAAATCGCTGCTCAGATTTGTCG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2EM82TF 726 0 0
GG
ACAGACATCGCAGTTTTCTCTCTCTCAATCTATCTCTCTCTCTCT**GCTTGAATCGATT
CGTTCCAGGGATTGTGGAGCGGTTTGATTTGATATCGATCTGTGACAATGGTGGCCGCTG
GGATCGACATGGATGAAGGAGCTCTCGAGATCGGAATGGAGTACAGAACTGTGTCAGGTG
TTGCAGGACCATTGGTCATCCTTGAAAAAGTGAAGGGTCCAAAGTACCAGGAGATTGTTA
ACATTCGCTTAGGAGATGGATCTATGAGACGTGGTCAGGTCTTGGAGGTTGATGGCGAGA
AAGCTGTTGTCCAGGTTTTTGAAGGAACATCTGGAATTGACAACAAATTTACCACTGTGC
AATTCACTGGAGAGGTTTTGAAAACTCCTGTATCACAAGACATGCTTGGCCGCATTTTTA
ACGGCTCGGGAAAGCCAATTGATAATGGTCCTCCTATTTTGCCAGAGGCATACCTTGACA
TCTCTGGAAGTTCAATCGACCCCAGTGAAAGAACCTACCCTGAAGAGATGATTCAGACTG
GGATTTCTACCATTGATGTCATGAACTCCATCGCTCGTGGACAGAAAATCCCTCTTTTCT
CTGCTGCTGGTCTACCTCACAACGAAATCGCTGCTCAGATTTGTCGTCAGGCTGGTCTTG
TTAAGCGGTTGGAAAAGACTGAGAACCTAATTGAGGATCATGGAGAGGACAACTTTGCAA
TTGT

QA 3 726 3 726
DS 



AS 1 2

CO CL6571Contig1 863 2 14 U
GGAGGAGAGGGGTGAGTATCTTGGATTCGACGAGGGAGAGAGATGCCGAAGAGAACGACG
CATACGTACTCGAGCGAGGACGCGGCGCCGGAAGGACCCGACTCCGATCTCTTCGTTTAC
TACTGCAAGCACTGTGGCTCTCATGTCCTCATCACTGATACGCAATTGCAGAAGATGCCA
AAGAGGAAGACCGACAGATCCAGTGTGCTGGACAAGAAGAAGCACCTTGCTAGGCTGAAT
GTCAGCGAGGGAGGCAAAGTTTTATTAAAACGCGGCGAAGGGAAACTGGAGAGACAGTTT
AGAATGAACTGTATTGGTTGTGAGCTTTTTGTTTGTTATCGCGCTGAAGAGAGTCTGGAA
ACAGCATCCTTCGTTTACATTGTCGATGGTGCACTTAGCGCTGTTGCTGCAGAAACTAAC
CCACAGGATGCACCGGTACCTCCCTGCATTTCACAGCTCGATGGTGGACTTGTTCAGGTT
GCTATAGAAGTGGAAGACCGTGCGCAACGTTCAGCAATCACGAGAGTAAACGCTGATGAT
GTTCGTGTTACTATTGCCGCACCAGCAGCTCGTGGGGAAGCTAACAACGAGCTTCTGGAA
TTCATGGGAAGGGTGCTTGGTTTAAGGTTGAGCCAGATGACTCTCCAGAGAGGCTGGAAT
AGCAAATCGAAACTCCTCGTGGTCGAGGATTTATCTGCCAGACAGGTGTATGAGAAGCTT
CTTGAGGCCGTTGTACCATAAATTTTGAGGTCCGTGCATGTTGGTGAAAGACATTAACCG
AGAGCTCTGCAATGTAATTGGTTTGTCTCAGAGACGAAAGAGTCTAAATATTTTGCTTGG
GAAGATAGACAAAATTGCTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ39TF U 1
AF RR2BQ39JQ C 103
BS 1 599 RR2BQ39TF
BS 600 600 RR2BQ39JQ
BS 601 626 RR2BQ39TF
BS 627 627 RR2BQ39JQ
BS 628 665 RR2BQ39TF
BS 666 666 RR2BQ39JQ
BS 667 671 RR2BQ39TF
BS 672 672 RR2BQ39JQ
BS 673 698 RR2BQ39TF
BS 699 699 RR2BQ39JQ
BS 700 705 RR2BQ39TF
BS 706 706 RR2BQ39JQ
BS 707 719 RR2BQ39TF
BS 720 863 RR2BQ39JQ

RD RR2BQ39TF 719 0 0
GGAGGAGAGGGGTGAGTATCTTGGATTCGACGAGGGAGAGAGATGCCGAAGAGAACGACG
CATACGTACTCGAGCGAGGACGCGGCGCCGGAAGGACCCGACTCCGATCTCTTCGTTTAC
TACTGCAAGCACTGTGGCTCTCATGTCCTCATCACTGATACGCAATTGCAGAAGATGCCA
AAGAGGAAGACCGACAGATCCAGTGTGCTGGACAAGAAGAAGCACCTTGCTAGGCTGAAT
GTCAGCGAGGGAGGCAAAGTTTTATTAAAACGCGGCGAAGGGAAACTGGAGAGACAGTTT
AGAATGAACTGTATTGGTTGTGAGCTTTTTGTTTGTTATCGCGCTGAAGAGAGTCTGGAA
ACAGCATCCTTCGTTTACATTGTCGATGGTGCACTTAGCGCTGTTGCTGCAGAAACTAAC
CCACAGGATGCACCGGTACCTCCCTGCATTTCACAGCTCGATGGTGGACTTGTTCAGGTT
GCTATAGAAGTGGAAGACCGTGCGCAACGTTCAGCAATCACGAGAGTAAACGCTGATGAT
GTTCGTGTTACTATTGCCGCACCAGCAGCTCGTGGGGAAGCTAACAACGAGCTTCTGGA*
TTCATGGGAAGGGTGCTTGGTTTAAG*TTGAGCCAGATGACTCTCCAGAGAGGCTGGAAT
AGCAA*TCGAA*CTCCTCGTGGTCGAGGATTTATCTGC*AGACAG*TGTATGAGAAGCT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2BQ39JQ 761 0 0
TCCGATCTCTTCGTTTACTACTGCAAGCACTGTGGCTCTCATGTCCTCATCACTGATACG
CAATTGCAGAAGATGCCAAAGAGGAAGACCGACAGATCCAGTGTGCTGGACAAGAAGAAG
CACCTTGCTAGGCTGAATGTCAGCGAGGGAGGCAAAGTTTTATTAAAACGCGGCGAAGGG
AAACTGGAGAGACAGTTTAGAATGAACTGTATTGGTTGTGAGCTTTTTGTTTGTTATCGC
GCTGAAGAGAGTCTGGAAACAGCATCCTTCGTTTACATTGTCGATGGTGCACTTAGCGCT
GTTGCTGCAGAAACTAACCCACAGGATGCACCGGTACCTCCCTGCATTTCACAGCTCGAT
GGTGGACTTGTTCAGGTTGCTATAGAAGTGGAAGACCGTGCGCAACGTTCAGCAATCACG
AGAGTAAACGCTGATGATGTTCGTGTTACTATTGCCGCACCAGCAGCTCGTGGGGAAGCT
AACAACGAGCTTCTGGAATTCATGGGAAGGGTGCTTGGTTTAAGGTTGAGCCAGATGACT
CTCCAGAGAGGCTGGAATAGCAAATCGAAACTCCTCGTGGTCGAGGATTTATCTGCCAGA
CAGGTGTATGAGAAGCTTCTTGAGGCCGTTGTACCATAAATTTTGAGGTCCGTGCATGTT
GGTGAAAGACATTAACCGAGAGCTCTGCAATGTAATTGGTTTGTCTCAGAGACGAAAGAG
TCTAAATATTTTGCTTGGGAAGATAGACAAAATTGCTTTCT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL6572Contig1 599 2 4 U
GGAGTACCAGATATCAGACAACTTAATGTCCTCTCATTTCATAAAACCAATACTGGATGC
AGAGCCTAAACAAAGAACATAAAAGAGACTACAGATCCTAAACTCATTCGACCATAAAGT
AAGACACTTTCTCACTCAATTTCTGCTTAATCGAGCAACCTAAACACCAGATTCGTCGAT
CTTTTACAGGAAAAAGAAGAAACCCCTTGAGAGAGGAGAGCAATTTACCTAATGGTTTTA
GTTGAGGATAAGGTTGAGGAAGAAAGGGCGTGACATATTCTCAGGAGGTAATCAAATCAA
GTAAACAGAATAGATAAACGAAACGACGCCGGAGAATCCGATGGCCCGAAGAGAAAACAC
TTTTCAGATCTGAAGCCGATCTCTCTCTGTCTCTCTCACTGTCTGAGTGACCTTAAACAA
AATCAAAACAACATACAAAAACCCCAACTTGACCTCCTTCGTAAAGCTCGACTCGCTGAG
TTGACTCGTTTTTTGTTAACTAAAATTAAATATTGTTGTCATTTTTACTCTTACGTTTTT
TTTTTTGACAAAGGGTTTAACTTACGTTTCTTTTTTCCTTTTATAAAAAACTATTAGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA47TF U 1
AF RR2FA47JQ C 1
BS 1 406 RR2FA47TF
BS 407 407 RR2FA47JQ
BS 408 428 RR2FA47TF
BS 429 599 RR2FA47JQ

RD RR2FA47TF 430 0 0
GGAGTACCAGATATCAGACAACTTAATGTCCTCTCATTTCATAAAACCAATACTGGATGC
AGAGCCTAAACAAAGAACATAAAAGAGACTACAGATCCTAAACTCATTCGACCATAAAGT
AAGACACTTTCTCACTCAATTTCTGCTTAATCGAGCAACCTAAACACCAGATTCGTCGAT
CTTTTACAGGAAAAAGAAGAAACCCCTTGAGAGAGGAGAGCAATTTACCTAATGGTTTTA
GTTGAGGATAAGGTTGAGGAAGAAAGGGCGTGACATATTCTCAGGAGGTAATCAAATCAA
GTAAACAGAATAGATAAACGAAACGACGCCGGAGAATCCGATGGCCCGAAGAGAAAACAC
TTTTCAGATCTGAAGCCGATCTCTCTCTGTCTCTCTCACTGTCTGA*TGACCTTAAACAA
AATCAAAA
AA

QA 1 428 1 428
DS 

RD RR2FA47JQ 599 0 0
GGAGTACCAGATATCAGACAACTTAATGTCCTCTCATTTCATAAAACCAATACTGGATGC
AGAGCCTAAACAAAGAACATAAAAGAGACTACAGATCCTAAACTCATTCGACCATAAAGT
AAGACACTTTCTCACTCAATTTTTGCTTAATCGAGCAACCTAAACACCAGATTTGTCGAT
CTTTTACAGGAAAAAGAAGAAACCCCTTGAGAGAGGAGAGCAATTTACCTAATGGTTTTA
GTTGAGGATAAGGTTGAGGAAGAAAGGGCGTGACATATTTTCAGGAGGTAATCAAATCAA
GTAAACAGAATAGATAAACGAAACGACGCCGGAGAATCCGATGGCCCGAAGAGAAAACAC
TTTTCAGATTTGAAGCCGATCTCTTTCTGTCTCTCTCACTGTTTGAGTGACCTTAAACAA
AATCAAAACAACATACAAAAACCCCAACTTGACCTCCTTCGTAAAGCTCGACTCGCTGAG
TTGACTCGTTTTTTGTTAACTAAAATTAAATATTGTTGTCATTTTTACTCTTACGTTTTT
TTTTTTGACAAAGGGTTTAACTTACGTTTCTTTTTTCCTTTTATAAAAAACTATTAGTC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL6573Contig1 723 2 1 U
GGAGGCTTAGAAATGGTGGTGACGTCTTTCTCTTCAACGCCGCCTATCTTCTTCTTCTTC
TCCTTTGGAGCTGATTCTCAGCTTTCATCTTCCAATCTCCATGGACGCATCACGTTCCCT
TTGGCTTCCTCTTCCTCTTCTCTACTAAACGTACTAAGAAGACATCAAGATGCAAAGTTG
GTGGGAACAAGGGCCAGAGGTGGAGCAGTTCGTGTCCTAGCAAATCCAAATGGATCATCA
TCTCCTCCTCCAGGGAAAGTAGGCCAAAAAAGAAGTAATCATGGTAGACCCTCTCGAGGC
TAAGCGGCTAGCTGGTAAGCAAATGGAAGAGATCAAAGGCAGAGAGAGGCAACAGCGAAG
GCGTGAAATAGAGGCTATAAACGGAGCCTGGGCAATCATAGGCCTCCTGATAGGGCTTGT
GATCGAAGCTCAAACAGGAAAGGGTATTCTGGCTCAGTTGTCTGGCTATTGGTCTTCGGC
TCTGCATCTATTCCCTTCATCAACACAGAATCTCCCACCACAGTAAACAAAAAACCTTAG
ACTATGTTTTGTTGAGTTTCATTTTGGTTTATTGCACTCTCTACTGTGATGAAAATTGAT
GTTGTTTATGTTAAGTTATTAACAGTGTCTTCTCCTTGGCAAGCGCATTCAGCAAGACAT
AAACAGTTCAGTTTTATGTTAATAAGATACAAGGGATAAAGTAACTGTACATATTTTATT
TGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2BY06JQ C 1
AF RR2BY06TF U 1
BS 1 723 RR2BY06TF

RD RR2BY06JQ 723 0 0
GGAGGCTTAGAAATGGTGGTGACGTCTTTCTCTTCAACGCCGCCTATCTTCTTCTTCTTC
TCCTTTGGAGCTGATTCTCAGCTTTCATCTTCCAATCTCCATGGACGCATCACGTTCCCT
TTGGCTTCCTCTTCCTCTTCTCTACTAAACGTACTAAGAAGACATCAAGATGCAAAGTTG
GTGGGAACAAGGGCCAGAGGTGGAGCAGTTCGTGTCCTAGCAAATCCAAATGGATCATCA
TCTCCTCCTCCAGGGAAAGTAGGCCAAAAAAGAAGTAATCATGGTAGACCCTCTCGAGGC
TAAGCGGCTAGCTGGTAAGCAAATGGAAGAGATCAAAGGCAGAGAGAGGCAACAGCGAAG
GCGTGAAATAGAGGCTATAAACGGAGCCTGGGCAATCATAGGCCTCCTGATAGGGCTTGT
GATCGAAGCTCAAACAGGAAAGGGTATTCTGGCTCAGTTGTCTGGCTATTGGTCTTCGGC
TCTGCATCTATTCCCTTCATCAACACAGAATCTCCCACCACAGTAAACAAAAAACCTTAG
ACTATGTTTTGTTGAGTTTCATTTTGGTTTATTGCACTCTCTACTGTGATGAAAATTGAT
GTTGTTTATGTTAAGTTATTAACAGTGTCTTCTCCTTGGCAAGCGCATTCAGCAAGACAT
AAACAGTTCAGTTTTATGTTAATAAGATACAAGGGATAAAGTAACTGTACATATTTTATT
TGC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2BY06TF 723 0 0
GGAGGCTTAGAAATGGTGGTGACGTCTTTCTCTTCAACGCCGCCTATCTTCTTCTTCTTC
TCCTTTGGAGCTGATTCTCAGCTTTCATCTTCCAATCTCCATGGACGCATCACGTTCCCT
TTGGCTTCCTCTTCCTCTTCTCTACTAAACGTACTAAGAAGACATCAAGATGCAAAGTTG
GTGGGAACAAGGGCCAGAGGTGGAGCAGTTCGTGTCCTAGCAAATCCAAATGGATCATCA
TCTCCTCCTCCAGGGAAAGTAGGCCAAAAAAGAAGTAATCATGGTAGACCCTCTCGAGGC
TAAGCGGCTAGCTGGTAAGCAAATGGAAGAGATCAAAGGCAGAGAGAGGCAACAGCGAAG
GCGTGAAATAGAGGCTATAAACGGAGCCTGGGCAATCATAGGCCTCCTGATAGGGCTTGT
GATCGAAGCTCAAACAGGAAAGGGTATTCTGGCTCAGTTGTCTGGCTATTGGTCTTCGGC
TCTGCATCTATTCCCTTCATCAACACAGAATCTCCCACCACAGTAAACAAAAAACCTTAG
ACTATGTTTTGTTGAGTTTCATTTTGGTTTATTGCACTCTCTACTGTGATGAAAATTGAT
GTTGTTTATGTTAAGTTATTAACAGTGTCTTCTCCTTGGCAAGCGCATTCAGCAAGACAT
AAACAGTTCAGTTTTATGTTAATAAGATACAAGGGATAAAGTAACTGTACATATTTTATT
TGC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL6574Contig1 975 2 6 U
GGCAACTATGCTTATCTTTTGCACGATGAAGACACTGGCACGGTTGGAGTCGTTGATCCT
TCTGAGGCTGCACCTGTTATAGAGGCGTTGAGCAGGAGAAACTGGAACTTGACTTACATA
TTGAATACTCATCATCATCATGATCACATTGGTGGGAATGCTGAACTCAAAGCAAAGTAT
GGCGCAAAGGTGATTGGCTCAGCTGTGGATAAGGATAGGATTCCTGGAATTGACATACTT
TTGAAGGAGAGTGATAAGTGGATGTTTGCTGGCCATGAGGTTCGGGTTATTGACACTCCT
GGCCACACACAAGGTCATGTTAGCTTCTACTTCCCCGGATCAGCCACAGTATTCACAGGA
GATTTGATACATAGCTTATCTTGTGGTACCCTCACAGAAGGTACTCCCGAGCAGATGCTT
TCATCATTCCAAAAGATTGTGGCTTTACCAGATGATACAAATATATACTGCGGTCGCGAA
AACACAGCAGGCAATATCAAGTTTGCACTATCCATAGAACCAAGAATGAAACGCTCCAGT
CATATGCAACCCGAGTCGCTCATCTTCGCAGCCAGGGACTCCCATCTATTCCAACGAGTG
TTAAAGTCGAGAAAGCGTGTAACCCGTTCCTCAGAACATCTAGCAAAGAAATCCGCAGAT
CTTTAAGTATTCCAGACTCAGCAAACGAAGTGGAGGCACTGCGTCGTATACACAAAGCCA
GAGACCGTTTCTAAAAGAAGCTTTGAGGGTTATCTTACCTTGTTATTGTATAGATGGAAG
TCCACTCATCATCAGCGGAAAGGTTAATATTACATGTTTTGAGCTTTTTATGTAATCATT
TGAATATGTTATATTCAAAACAAAAAATCATTTTAAATATATAGTTGATCTCAGTTACTA
AAATATGAAATTTAAAATGTAATATATGATTTTGTGTTTTTAGTTTTGCTTATGTTAGCA
ATTACTATATGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV50TF U 1
AF RR2EV50JQ C 331
BS 1 695 RR2EV50TF
BS 696 696 RR2EV50JQ
BS 697 735 RR2EV50TF
BS 736 736 RR2EV50JQ
BS 737 748 RR2EV50TF
BS 749 975 RR2EV50JQ

RD RR2EV50TF 751 0 0
GGCAACTATGCTTATCTTTTGCACGATGAAGACACTGGCACGGTTGGAGTCGTTGATCCT
TCTGAGGCTGCACCTGTTATAGAGGCGTTGAGCAGGAGAAACTGGAACTTGACTTACATA
TTGAATACTCATCATCATCATGATCACATTGGTGGGAATGCTGAACTCAAAGCAAAGTAT
GGCGCAAAGGTGATTGGCTCAGCTGTGGATAAGGATAGGATTCCTGGAATTGACATACTT
TTGAAGGAGAGTGATAAGTGGATGTTTGCTGGCCATGAGGTTCGGGTTATTGACACTCCT
GGCCACACACAAGGTCATGTTAGCTTCTACTTCCCCGGATCAGCCACAGTATTCACAGGA
GATTTGATACATAGCTTATCTTGTGGTACCCTCACAGAAGGTACTCCCGAGCAGATGCTT
TCATCATTCCAAAAGATTGTGGCTTTACCAGATGATACAAATATATACTGCGGTCGCGAA
AACACAGCAGGCAATATCAAGTTTGCACTATCCATAGAACCAAGAATGAAACGCTCCAGT
CATATGCAACCCGAGTCGCTCATCTTCGCAGCCAGGGACTCCCATCTATTCCAACGAGTG
TTAAAGTCGAGAAAGCGTGTAACCCGTTCCTCAGAACATCTAGCAAAGAAATCCGCAGAT
CTTTAAGTATTCCAGACTCAGCAAACGAAGTGGAG*CACTGCGTCGTATACACAAAGCCA
GAGACCGTTTCTAAA*GAAGCTTTGAGG
TTA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2EV50JQ 645 0 0
TTCCCCGGATCAGCCACAGTATTCACAGGAGATTTGATACATAGCTTATCTTGTGGTACC
CTCACAGAAGGTACTCCCGAGCAGATGCTTTCATCATTCCAAAAGATTGTGGCTTTACCA
GATGATACAAATATATACTGCGGTCGGGAAAACACAGCAGGCAATATCAAGTTTGCACTA
TCCATAGAACCAAGAATGAAACGCTCCAGTCATATGCAACCCGAGTCGCTCATTTTCGCA
GCCAGGGACTCCCATTTATTCCAACGAGTGTTAAAGTCGAGAAAGCGTGTAACCCGTTCC
TCAGAACATCTAGCAAAGAAATCCGCAGATCTTTAAGTATTCCAGACTCAGCAAACGAAG
TGGAGGCACTGCGTCGTATACACAAAGCCAGAGACCGTTTTTAAAAGAAGCTTTGAGGGT
TATCTTACCTTGTTATTGTATAGATGGAAGTCCACTCATCATCAGCGGAAAGGTTAATAT
TACATGTTTTGAGCTTTTTATGTAATCATTTGAATATGTTATATTCAAAACAAAAAATCA
TTTTAAATATATAGTTGATCTCAGTTACTAAAATATGAAATTTAAAATGTAATATATGAT
TTTGTGTTTTTAGTTTTGCTTATGTTAGCAATTACTATATGTTTT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL6575Contig1 1330 2 2 U
GGAGGAAGACTTGAACATGGCAGCATCGAGTCGTCTTGATCACTTGTGCCTTCTTCAAGC
GTCGTCACGACATCTGTCACTTCCTCACCAAACGTTCTCGAGTTATCCACGAAATCCCGT
TAAAAATCTCACCTTTCGTCAAAAAATTTCCGAATCATCGAGCTTTCGGTTGTCCACGGT
TGCTGCAAAAGCTCTGAGTACAGTCGCGGTGGAGGACTCGCCGGAGAAGAAGATGGTGAA
AGGTATCAGAGTTTACGAGCACGGAGGTCCTGAGGTTCTGAAATGGGAAGATGTTGAAGT
TGGAGAGCCAAAGGAAGGTGAGATACGCGTGAAAAACAAGGCCATTGGGCTCAACTTCAT
CGATGTTTACTACAGGAAAGGTGTTTACAAGCCAGCCTCTATGCCCTTCACACCAGGTAT
GGAGGCTGTTGGAGAGGTGGTAGCTGTTGGGTCAGGATTGACTGGCAGAAAGATCGGTGA
TCTCGTTGCTTATGCTGGAAGTCCAATGGGTGCATATGCTGAAGAACAAGTACTTCCTGC
TGATAAAGTGGTTCCTGTTCCTTCATCTGTTGATCCTATCGTTGCAGCATCAATCATGCT
CAAGGGTATGACTGCACAGTTTCTCCTTCGCCGTTGCTTCAAGGTGGAACGTGGGCACAC
AATCCTTGTCCACGCTGCAGCAGTGGAGTTGGATCTCTGCTGTGTCAATGGGCAAACGCT
CTTGGAGCCACTGTTATTGGAACCGTCTCCACCAACGAGAAAGCAGCTCAAGCCAAAGAA
GACGGATGCCACCACGTTATCATGTACAAGAACGAGGACTTTGTCTCACGGGTCAAGGAC
ATTACATCAGGGAAAGGAGTCGATGTTGTTTACGACTCGGTGGGGAAAGACACCTTCAAG
GGATCGTTAGCGTGTTTAAAGAGCAGAGGATACATGGTGAGCTTCGGACAGTCCTCCGGA
ACTCCGGATCCTGTTCCTTTATCCGATCTTGCTCCGAAGTCGCTCTTCTTGACGAGGCCT
TCGATGATGCAATACAACGAGACTAGAGAAGAGCTGTTGGAGTGTGCGGGTGAGGTTTTC
GCCAGTGTTGCTTTAGGGGTTATAAAGGCTCGTGTGAACCACAAGTACCCGTTGTCTCGT
GTGGCTGATGCTCATGCAGACCTTGAGAATAGGATAACATCTGGCTCCGTTGTACTCTTG
CCGTGAAAACGTGTAATGTTGTTTCTTTTTTTTAGTCTTCCAATAAGAGCAATAAGATTC
CTTTGTAGTGTGGAAAGATACCAAATCTGTGTACTATTTATCTTCCAGTAAGAGCAGTAC
GGTTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F279TF U 1
AF RR2F279JQ C 682
BS 1 747 RR2F279TF
BS 748 1330 RR2F279JQ

RD RR2F279TF 747 0 0
GGAGGAAGACTTGAACATGGCAGCATCGAGTCGTCTTGATCACTTGTGCCTTCTTCAAGC
GTCGTCACGACATCTGTCACTTCCTCACCAAACGTTCTCGAGTTATCCACGAAATCCCGT
TAAAAATCTCACCTTTCGTCAAAAAATTTCCGAATCATCGAGCTTTCGGTTGTCCACGGT
TGCTGCAAAAGCTCTGAGTACAGTCGCGGTGGAGGACTCGCCGGAGAAGAAGATGGTGAA
AGGTATCAGAGTTTACGAGCACGGAGGTCCTGAGGTTCTGAAATGGGAAGATGTTGAAGT
TGGAGAGCCAAAGGAAGGTGAGATACGCGTGAAAAACAAGGCCATTGGGCTCAACTTCAT
CGATGTTTACTACAGGAAAGGTGTTTACAAGCCAGCCTCTATGCCCTTCACACCAGGTAT
GGAGGCTGTTGGAGAGGTGGTAGCTGTTGGGTCAGGATTGACTGGCAGAAAGATCGGTGA
TCTCGTTGCTTATGCTGGAAGTCCAATGGGTGCATATGCTGAAGAACAAGTACTTCCTGC
TGATAAAGTGGTTCCTGTTCCTTCATCTGTTGATCCTATCGTTGCAGCATCAATCATGCT
CAAGGGTATGACTGCACAGTTTCTCCTTCGCCGTTGCTTCAAGGTGGAACGTGGGCACAC
AATCCTTGTCCACGCTGCAGCAGTGGAGTTGGATCTCTGCTGTGTCAATGGGCAAACGCT
CTTGGAGCCACTGTTATTGGAACCGTC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2F279JQ 649 0 0
G
GTGGAGTTGGATCTCTGCTGTGTCAATGGGCAAACGCTCTTGGAGCCACTGTTATTGGAA
CCGTCTCCACCAACGAGAAAGCAGCTCAAGCCAAAGAAGACGGATGCCACCACGTTATCA
TGTACAAGAACGAGGACTTTGTCTCACGGGTCAAGGACATTACATCAGGGAAAGGAGTCG
ATGTTGTTTACGACTCGGTGGGGAAAGACACCTTCAAGGGATCGTTAGCGTGTTTAAAGA
GCAGAGGATACATGGTGAGCTTCGGACAGTCCTCCGGAACTCCGGATCCTGTTCCTTTAT
CCGATCTTGCTCCGAAGTCGCTCTTCTTGACGAGGCCTTCGATGATGCAATACAACGAGA
CTAGAGAAGAGCTGTTGGAGTGTGCGGGTGAGGTTTTCGCCAGTGTTGCTTTAGGGGTTA
TAAAGGCTCGTGTGAACCACAAGTACCCGTTGTCTCGTGTGGCTGATGCTCATGCAGACC
TTGAGAATAGGATAACATCTGGCTCCGTTGTACTCTTGCCGTGAAAACGTGTAATGTTGT
TTCTTTTTTTTAGTCTTCCAATAAGAGCAATAAGATTCCTTTGTAGTGTGGAAAGATACC
AAATCTGTGTACTATTTATCTTCCAGTAAGAGCAGTACGGTTTTTATT

QA 2 649 2 649
DS 



AS 1 2

CO CL6576Contig1 871 2 10 U
GAGGTCTCTGTTTCAGAAATGGAGATTCTTGGGAAAATCAGACATAGAAACGTGTTGAAG
CTCCACGCTTGTCTTGTCGGAAGAGGTTCTAGTTACTTGGTGTTTGAGTTCATGGAGAAT
GGGAACTTATATCAAGCTCTTCGCCGGAGTATTAAAGGTGGATTACCTGAACTGGATTGG
CACAAGAGGTATAAAATCGCGGTAGGGGCAGCTAAAGGAATCGCTTATTTGCATCATGAT
TGCTGTCCTCCGATCATTCACAGAGATATAAAGTCTAGTAACATTTTACTTGATGGAGAT
TATGAGTCGAAAATTGCGGATTTTGGAGTTGCAAAAGTTGCTGACAAGGGATATGAATGG
AGCTGTGTTGCTGGAACTCATGGCTATATGGCACCCGAGCTGGCTTACTCCTTCAAGGCA
ACCGAGAAGAGTGATGTGTACAGCTTTGGCGTGGTTCTTCTAGAGTTAGCTACCGGTCTT
CGGCCAGTGGAGGACGAGTTTGGAGAGGGAAAAGACATTGTTGACTATGTCTTCTTTAAG
ATTCAACAAGATCGGAGGAACCTTGGAAAAGTCTTGGACAAGCAAGTTTTGTCAACTTAC
GTAGAAGAAAGCATGGTTAAAGTTCTGAAAATGGGTCTTCTATGTACTACAAAGCTCCCG
AGTCTCAGGCCAAGCATGAGAGATGTCGTGAGAAAGCTTGAGGACGCTGATCCATGCGTC
TCCAATTCTCTAGACAGAACCGGAAAGATTACAGTATAGGTTAATGAGTTGGGTTAAGTT
GATTACCTGTTTTGGTGAGACTAGTTACAAAAGTGTCGGTTTGTTCACAACTACGAGAGA
CTAGTTCTTCGTATCTATTAAATTTGCAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ94TF U 1
AF RR2FQ94JQ C 128
BS 1 668 RR2FQ94TF
BS 669 669 RR2FQ94JQ
BS 670 724 RR2FQ94TF
BS 725 725 RR2FQ94JQ
BS 726 749 RR2FQ94TF
BS 750 750 RR2FQ94JQ
BS 751 759 RR2FQ94TF
BS 760 760 RR2FQ94JQ
BS 761 792 RR2FQ94TF
BS 793 871 RR2FQ94JQ

RD RR2FQ94TF 794 0 0
GAGGTCTCTGTTTCAGAAATGGAGATTCTTGGGAAAATCAGACATAGAAACGTGTTGAAG
CTCCACGCTTGTCTTGTCGGAAGAGGTTCTAGTTACTTGGTGTTTGAGTTCATGGAGAAT
GGGAACTTATATCAAGCTCTTCGCCGGAGTATTAAAGGTGGATTACCTGAACTGGATTGG
CACAAGAGGTATAAAATCGCGGTAGGGGCAGCTAAAGGAATCGCTTATTTGCATCATGAT
TGCTGTCCTCCGATCATTCACAGAGATATAAAGTCTAGTAACATTTTACTTGATGGAGAT
TATGAGTCGAAAATTGCGGATTTTGGAGTTGCAAAAGTTGCTGACAAGGGATATGAATGG
AGCTGTGTTGCTGGAACTCATGGCTATATGGCACCCGAGCTGGCTTACTCCTTCAAGGCA
ACCGAGAAGAGTGATGTGTACAGCTTTGGCGTGGTTCTTCTAGAGTTAGCTACCGGTCTT
CGGCCAGTGGAGGACGAGTTTGGAGAGGGAAAAGACATTGTTGACTATGTCTTCTTTAAG
ATTCAACAAGATCGGAGGAACCTTGGAAAAGTCTTGGACAAGCAAGTTTTGTCAACTTAC
GTAGAAGAAAGCATGGTTAAAGTTCTGAAAATGGGTCTTCTATGTACTACAAAGCTCCCG
AGTCTCAG*CCAAGCATGAGAGATGTCGTGAGAAAGCTTGAGGACGCTGATCCATGCGTC
TCCA*TTCTCTAGACAGAACCGGAAAGAT*ACAGTATAG*TTAATGAGTTGGGTTAAGTT
GATTACCTGTTT
GG

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2FQ94JQ 744 0 0
TATATCAAGCTCTTCGCCGGAGTATTAAAGGTGGATTACCTGAACTGGATTGGCACAAGA
GGTATAAAATCGCGGTAGGGGCAGCTAAAGGAATCGCTTATTTGCATCATGATTGCTGTC
CTCCGATCATTCACAGAGATATAAAGTCTAGTAACATTTTACTTGATGGAGATTATGAGT
CGAAAATTGCGGATTTTGGAGTTGCAAAAGTTGCTGACAAGGGATATGAATGGAGCTGTG
TTGCTGGAACTCATGGCTATATGGCACCCGAGCTGGCTTACTCCTTCAAGGCAACCGAGA
AGAGTGATGTGTACAGCTTTGGCGTGGTTTTTCTAGAGTTAGCTACCGGTCTTCGGCCAG
TGGAGGACGAGTTTGGAGAGGGAAAAGACATTGTTGACTATGTTTTCTTTAAGATTCAAC
AAGATCGGAGGAACCTTGGAAAAGTCTTGGACAAGCAAGTTTTGTCAACTTACGTAGAAG
AAAGCATGGTTAAGGTTCTGAAAATGGGTTTTCTATGTACTACAAAGCTCCCGAGTCTCA
GGCCAAGCATGAGAGATGTCGTGAGAAAGCTTGAGGACGCTGATCCATGCGTCTCCAATT
CTCTAGACAGAACCGGAAAGATTACAGTATAGGTTAATGAGTTGGGTTAAGTTGATTACC
TGTTTTGGTGAGACTAGTTACAAAAGTGTCGGTTTGTTCACAACTACGAGAGACTAGTTC
TTCGTATCTATTAAATTTGCAGCG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL6577Contig1 683 2 8 U
GGAAACACACACACACACACACAATCTTCTCGTTCTTACACTCACTGCAGTAACTTTTTT
TAAACACAAATGACAACTTCATCCGAATCAACTCGCAAGGGCCTGACCAAAATTGCCGCC
AATAGAGTCCAGAAAGAGTTCATGGAGTGGCAGACTAACCCTCCTTCTGGTTTCAAGCAC
AGAGTCTCTGATAATCTCCAAAGATGGACTATTGAAGTGAAGGGAGCTCCAGGAACTCTT
TATGCCAATGAAACTTACCAACTTCTGGTGGAATTTCCTGAGCATTATCCTATGGAAGCT
CCACAGGTTATCTTTCAGCATCCAGCTCCACTCCATCCTCATGTTTACAGCAACGGTCAC
ATTTGCTTGGATGTTTTGTATGGTTCATGGTCGCCTGCAATGAGACTAAGTTCAATCTGT
CTTAGCATTCTCTCAATGCTCTCAAGCTCTGCTGTGAAGCAAAAGCCGAAAGACAACGAC
CACTATTTGAAAAATTGCAAAAATGGAAGATCCCCAAAAGAAACTAGGTGGCGCTACCAT
GACGACAAAGTATAACATCTCCATGTGATCACTGTGATGTGTACTTTGATATTGTAATTA
GTAACTAAATTGTATGATCTCAAGTCGAGTTATTGACCTGTTTCAATCTTCAAAACAAGA
AGAGTTTCTCTCAGCCTTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C293TF U 1
AF RR2EG18TF U 7
BS 1 128 RR2C293TF
BS 129 129 RR2EG18TF
BS 130 399 RR2C293TF
BS 400 400 RR2EG18TF
BS 401 561 RR2C293TF
BS 562 562 RR2EG18TF
BS 563 651 RR2C293TF
BS 652 683 RR2EG18TF

RD RR2C293TF 651 0 0
GGAAACACACACACACACACACAATCTTCTCGTTCTTACACTCACTGCAGTAACTTTTTT
TAAACACAAATGACAACTTCATCCGAATCAACTCGCAAGGGCCTGACCAAAATTGCCGCC
AATAGAGTTCAGAAAGAGTTCATGGAGTGGCAGACTAACCCTCCTTCTGGTTTCAAGCAC
AGAGTCTCTGATAATCTCCAAAGATGGACTATTGAAGTGAAGGGAGCTCCAGGAACTCTT
TATGCCAATGAAACTTACCAACTTCTGGTGGAATTTCCTGAGCATTATCCTATGGAAGCT
CCACAGGTTATCTTTCAGCATCCAGCTCCACTCCATCCTCATGTTTACAGCAACGGTCAC
ATTTGCTTGGATGTTTTGTATGGTTCATGGTCGCCTGCAGTGAGACTAAGTTCAATCTGT
CTTAGCATTCTCTCAATGCTCTCAAGCTCTGCTGTGAAGCAAAAGCCGAAAGACAACGAC
CACTATTTGAAAAATTGCAAAAATGGAAGATCCCCAAAAGAAACTAGGTGGCGCTACCAT
GACGACAAAGTATAACATCTCTATGTGATCACTGTGATGTGTACTTTGATATTGTAATTA
GTAACTAAATTGTATGATCTCAAGTCGAGTTATTGACCTGTTTCAATCTTC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2EG18TF 677 0 0
GG
ACACACACACACACAATCTTCTCGTTCTTACACTCACTGCAGTAACTTTTTT*AAACACA
AATGACAACTTCATCCGAATCAACTCGCAAGGGCCTGACCAAAATTGCCGCCAATAGAGT
CCAGAAAGAGTTCATGGAGTGGCAGACTAACCCTCCTTCTGGTTTCAAGCACAGAGTCTC
TGATAATCTCCAAAGATGGACTATTGAAGTGAAGGGAGCTCCAGGAACTCTTTATGCCAA
TGAAACTTACCAACTTCTGGTGGAATTTCCTGAGCATTATCCTATGGAAGCTCCACAGGT
TATCTTTCAGCATCCAGCTCCACTCCATCCTCATGTTTACAGCAACGGTCACATTTGCTT
GGATGTTTTGTATGGTTCATGGTCGCCTGCAATGAGACTAAGTTCAATCTGTCTTAGCAT
TCTCTCAATGCTCTCAAGCTCTGCTGTGAAGCAAAAGCCGAAAGACAACGACCACTATTT
GAAAAATTGCAAAAATGGAAGATCCCCAAAAGAAACTAGGTGGCGCTACCATGACGACAA
AGTATAACATCTCCATGTGATCACTGTGATGTGTACTTTGATATTGTAATTAGTAACTAA
ATTGTATGATCTCAAGTCGAGTTATTGACCTGTTTCAATCTTCAAAACAAGAAGAGTTTC
TCTCAGCCTTTTATC

QA 3 677 3 677
DS 



AS 1 2

CO CL6578Contig1 701 2 3 U
GGATTCACGAGATATTCTGTCAAACAAATACCATAAACTGGGGTAAAACCTATCGCTCCA
ACCTCTCTCTAAGTTTTGTGACAAACCCTAGCTCCGGCCCGGGGAATCCGGTGCCGGAGG
CGTCTCTCCTTCCCCTTCTCTGTTTTTTCCTTTGCTCTCTCCCACTCTGCTCTAACCTCT
GTCGATATGCGTGTTTGTTCTGGGGCGCACCGTGACAGAGCCAATCTCTCACCTCGTGAG
TTATGGGTTCTTGCTCCGTCGAGTTTTTGGAACAACGGCGAGGCTTACGGGAGGATGGAT
TAGGAGAGAGTCGGCTTTTAGGGATTTCGGAGGAGTCGGATCTAGTTTTCCCTTTTCAGA
TCTCCGACGATTCCGTACTGATGGCAGCGCGTGACTTGGTAAGACACCTCATCCTCTGTC
GATCTATGTATCTGTGCAGCGGTGAGATAAACAAAGAAGAAAACAGCAAGAATGAGATCA
GAGATTCAACCCTGGATTTCTGGGTTGACACGAATCAATGATTGCGCTAATGGAGTTTCA
ATTGAAATATTTGCGGTGGTTCGTGGTGGTGGTTCTACACTCCGAAGTCGGAGAAGAACA
AAGTGGTTAAAGGCGATAGGGACCCTGCATCTCGGAGCCCTGTCTATGTGATACCAGTCC
GCTATGCTCTCAATCCCGTCTTTCAGTCTGGTCTTTGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR69TF U 1
AF RR2FL12TF U 28
BS 1 486 RR2FR69TF
BS 487 487 RR2FL12TF
BS 488 701 RR2FR69TF

RD RR2FR69TF 701 0 0
GGATTCACGAGATATTCTGTCAAACAAATACCATAAACTGGGGTAAAACCTATCGCTCCA
ACCTCTCTCTAAGTTTTGTGACAAACCCTAGCTCCGGCCCGGGGAATCCGGTGCCGGAGG
CGTCTCTCCTTCCCCTTCTCTGTTTTTTCCTTTGCTCTCTCCCACTCTGCTCTAACCTCT
GTCGATATGCGTGTTTGTTCTGGGGCGCACCGTGACAGAGCCAATCTCTCACCTCGTGAG
TTATGGGTTCTTGCTCCGTCGAGTTTTTGGAACAACGGCGAGGCTTACGGGAGGATGGAT
TAGGAGAGAGTCGGCTTTTAGGGATTTCGGAGGAGTCGGATCTAGTTTTCCCTTTTCAGA
TCTCCGACGATTCCGTACTGATGGCAGCGCGTGACTTGGTAAGACACCTCATCCTCTGTC
GATCTATGTATCTGTGCAGCGGTGAGATAAACAAAGAAGAAAACAGCAAGAATGAGATCA
GAGATT*AACCCTGGATTTCTGGGTTGACACGAATCAATGATTGCGCTAATGGAGTTTCA
ATTGAAATATTTGCGGTGGTTCGTGGTGGTGGTTCTACACTCCGAAGTCGGAGAAGAACA
AAGTGGTTAAAGGCGATAGGGACCCTGCATCTCGGAGCCCTGTCTATGTGATACCAGTCC
GCTATGCTCTCAATCCCGTCTTTCAGTCTGGTCTTTGTACC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2FL12TF 655 0 0
GG
ACCATAAACTGGGGTAAAACCTATCGCTCCAACCTCTCTCTAAGTTTTGTGACAAACCCT
AGCTCCGGCCCGGGGAATCCGGTGCCGGAGGCGTCTCTCCTTCCCCTTCTCTGTTTTTTC
CTTTGCTCTCTCCCACTCTGCTCTAACCTCTGTCGATATGCGT**TTGTTCTGGGGCGCA
CCGTGACAGAGCCAATCTCTCACCTCGTGAGTTATGGGTTCTTGCTCCGTCGAGTTTTTG
GAACAACGGCGAGGCTTACGGGAGGATGGATTAGGAGAGAGTCGGCTTTTAGGGATTTCG
GAGGAGTCGGATCTAGTTTTCCCTTTTCAGATCTCCGACGATTCCGTACTGATGGCAGCG
CGTGACTTGGTAAGACACCTCATCCTCTGTCGATCTATGTATCTGTGCAGCGGTGAGATA
AACAAAGAAGAAAACAGCAAGAATGAGATCAGAGATTCAACCCTGGATTTCTGGGTTGAC
ACGAATCAATGATTGCGCTAATGGAGTTTCAATTGAAATATTTGCGGTGGTTCGTGGTGG
TGGTTCTACACTCCGAAGTCGGAGAAGAACAAAGTGGTTAAAGGCGATAGGGACCCTGCA
TCTCGGAGCTCTGTCTATGTGATACCAGTCCGCTATGCTCTCAA
ATCCCGTCT

QA 3 646 3 646
DS 



AS 1 2

CO CL6579Contig1 637 2 2 U
AGTTCAGATATTAATGGGCTTCTTTAAAAACTTATTCTTTAATCACAAATTACAACTTCC
AGAGAATAAAAAAAGCTCTTACAAAACCACTCATACAATATATACACACACAAAAATCAT
ATCCTGCTTTACTCGCTCAATAGTTCTTTACAGTTCAGGCACCCCGTTGATGCAAACAAG
CTGGAGGAAGACGGTCTGAAGTACCCGGAGTCACAGGAGGGAAACTTCGAATATGAATGC
CTTGAGGATATAAACGATACTCTATATCAAGCTCTTTACAAGCTTTCCCAACTTCCTCTA
GCAATTGACTTCTCCTTATAAAACTCTCTCCCATGTCTTGAAAGTTCATTCTATGTGTCA
ACCACACCGCGATCTTCATGCTTTTCAAGTCATCCATGTTTAGGAACACAATCATAGGTG
CAGGATACCAGTGATCCTTCTTGAAGTCTATATAACTGATTATTCTCTGTTTGATAGCAG
CTATCTTTTCTGGAGGAGTTGCTATGTGAACAGAGAATTCAATCGCATCTCCCATATCAG
GACTTCGGAAGTAGTTAGCTATAGGTTTTGTACCAAGAACACTATTCGGGTATATGATCT
TTTGATTATCATATCGCAAGAAAACAGTCGTCAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2HA41TF C 1
AF RR2HA41JQ U 12
BS 1 11 RR2HA41TF
BS 12 637 RR2HA41JQ

RD RR2HA41TF 637 0 0
AGTTCAGATATTAATGGGCTTCTTTAAAAACTTATTCTTTAATCACAAATTACAACTTCC
AGAGAATAAAAAAAGCTCTTACAAAACCACTCATACAATATATACACACACAAAAATCAT
ATCCTGCTTTACTCGCTCAATAGTTCTTTACAGTTCAGGCACCCCGTTGATGCAAACAAG
CTGGAGGAAGACGGTCTGAAGTACCCGGAGTCACAGGAGGGAAACTTCGAATATGAATGC
CTTGAGGATATAAACGATACTCTATATCAAGCTCTTTACAAGCTTTCCCAACTTCCTCTA
GCAATTGACTTCTCCTTATAAAACTCTCTCCCATGTCTTGAAAGTTCATTCTATGTGTCA
ACCACACCGCGATCTTCATGCTTTTCAAGTCATCCATGTTTAGGAACACAATCATAGGTG
CAGGATACCAGTGATCCTTCTTGAAGTCTATATAACTGATTATTCTCTGTTTGATAGCAG
CTATCTTTTCTGGAGGAGTTGCTATGTGAACAGAGAATTCAATCGCATCTCCCATATCAG
GACTTCGGAAGTAGTTAGCTATAGGTTTTGTACCAAGAACACTATTCGGGTATATGATCT
TTTGATTATCATATCGCAAGAAAACAGTCGTCAATAT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2HA41JQ 626 0 0
TAATGGGCTTCTTTAAAAACTTATTCTTTAATCACAAATTACAACTTCCAGAGAATAAAA
AAAGCTCTTACAAAACCACTCATACAATATATACACACACAAAAATCATATCCTGCTTTA
CTCGCTCAATAGTTCTTTACAGTTCAGGCACCCCGTTGATGCAAACAAGCTGGAGGAAGA
CGGTCTGAAGTACCCGGAGTCACAGGAGGGAAACTTCGAATATGAATGCCTTGAGGATAT
AAACGATACTCTATATCAAGCTCTTTACAAGCTTTCCCAACTTCCTCTAGCAATTGACTT
CTCCTTATAAAACTCTCTCCCATGTCTTGAAAGTTCATTCTATGTGTCAACCACACCGCG
ATCTTCATGCTTTTCAAGTCATCCATGTTTAGGAACACAATCATAGGTGCAGGATACCAG
TGATCCTTCTTGAAGTCTATATAACTGATTATTCTCTGTTTGATAGCAGCTATCTTTTCT
GGAGGAGTTGCTATGTGAACAGAGAATTCAATCGCATCTCCCATATCAGGACTTCGGAAG
TAGTTAGCTATAGGTTTTGTACCAAGAACACTATTCGGGTATATGATCTTTTGATTATCA
TATCGCAAGAAAACAGTCGTCAATAT

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL6580Contig1 941 2 14 U
GCGGTGGTATGATTCGTGACTCGGAAGACCATTTCGGAATGAGGACTAGAGCCGATGGTG
ACGGGTTATCTATATACGGTTCGTCTAACATATGGATTGACCATGTTTCGATGTCAAAAT
GTCAAGATGGACTAATTGATGCAATTGTTGGATCCACTGCCATTACAATCTCCAACTCTC
ACTTCACTCACCACAACGACGTGATGCTGCTTGGTGCGCAGAACAATATGAATGAAGCGG
ACATGAAGATGCAAGTCACAGTGGCTTATAACCATTTTGGTAAGGGACTTGTACAGAGGA
TGCCAAGGGTTCGATGGGGATTTGTTCACGTTGTGAACAATGATTACACTCATTGGGAGC
TTTACGCTATCGGAGGTAGTCAAGGTCCGACTATTCTCAGCCATGGAAACCGATTCATAG
CTCCTCCACACTTACCTTATTACAAAGAGGTGACAAAGAGAGATTATGCTTCTGAGGACG
AGTGGAAACACTGGACATGGAGATCTGAGAAAGATATATTCATGAACGGAGCTTTTTTCA
GACAATCTGGGGATCCTCATTACAAAAGTGCTCACACGAGAAAACAAATGATTAAACCTA
AAAATGGATACGCTGTTTCTAAGCTGACCAAATACGCAGGAGCACTTGATTGCAGAGTCG
GTAGACGCTGTTAGAACATCTCCTTTTTGATTAATTACTTTAATGTCTGCTTGTTGTCTT
AATTAAAGACAATTTTTCACCATTTTGGTTTTTTTTTATTCTATCTAGTTTAGGATATAA
AGAATTAAGGGGTGAAAATGAAAAGCGTTTTAATTTGTATATTGTATTTTTGTCTTATGA
ACAAACGCAGCAAATGTATAAAAGAGTAAGTGAAATAGCTCATTCTTGTACTTTTATGAT
GTTGTATTTCAGCAAATTTATATAATCATTTTGGGTGACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED17TF U 1
AF RR2ED17JQ C 413
BS 1 639 RR2ED17TF
BS 640 640 RR2ED17JQ
BS 641 659 RR2ED17TF
BS 660 660 RR2ED17JQ
BS 661 691 RR2ED17TF
BS 692 692 RR2ED17JQ
BS 693 719 RR2ED17TF
BS 720 720 RR2ED17JQ
BS 721 736 RR2ED17TF
BS 737 737 RR2ED17JQ
BS 738 756 RR2ED17TF
BS 757 757 RR2ED17JQ
BS 758 770 RR2ED17TF
BS 771 941 RR2ED17JQ

RD RR2ED17TF 772 0 0
GCGGTGGTATGATTCGTGACTCGGAAGACCATTTCGGAATGAGGACTAGAGCCGATGGTG
ACGGGTTATCTATATACGGTTCGTCTAACATATGGATTGACCATGTTTCGATGTCAAAAT
GTCAAGATGGACTAATTGATGCAATTGTTGGATCCACTGCCATTACAATCTCCAACTCTC
ACTTCACTCACCACAACGACGTGATGCTGCTTGGTGCGCAGAACAATATGAATGAAGCGG
ACATGAAGATGCAAGTCACAGTGGCTTATAACCATTTTGGTAAGGGACTTGTACAGAGGA
TGCCAAGGGTTCGATGGGGATTTGTTCACGTTGTGAACAATGATTACACTCATTGGGAGC
TTTACGCTATCGGAGGTAGTCAAGGTCCGACTATTCTCAGCCATGGAAACCGATTCATAG
CTCCTCCACACTTACCTTATTACAAAGAGGTGACAAAGAGAGATTATGCTTCTGAGGACG
AGTGGAAACACTGGACATGGAGATCTGAGAAAGATATATTCATGAACGGAGCTTTTTTCA
GACAATCTGGGGATCCTCATTACAAAAGTGCTCACACGAGAAAACAAATGATTAAACCTA
AAAATGGATACGCTGTTTCTAAGCTGACCAAATACGCAG*AGCACTTGATTGCAGAGTCT
GTAGACGCTGTTAGAACATCTCCTTTTTGAT*AATTACTTTAATGTCTGCTTGTTGTCT*
AATTAAAGACAATTTT*CACCATTTTGGTTTTTTTT*ATTCTATCTAGTT
AG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2ED17JQ 529 0 0
ATTCATAGCTCCTCCACACTTACCTTATTACAAAGAGGTGACAAAGAGAGATTATGCTTC
TGAGGACGAGTGGAAACACTGGACATGGAGATCTGAGAAAGATATATTCATGAACGGAGC
TTTTTTCAGACAATCTGGGGATCCTCATTACAAAAGTGCTCACACGAGAAAACAAATGAT
TAAACCTAAAAATGGATACGCTGTTTTTAAGCTGACCAAATACGCAGGAGCACTTGATTG
CAGAGTCGGTAGACGCTGTTAGAACATCTCCTTTTTGATTAATTACTTTAATGTCTGCTT
GTTGTCTTAATTAAAGACAATTTTTCACCATTTTGGTTTTTTTTTATTCTATCTAGTTTA
GGATATAAAGAATTAAGGGGTGAAAATGAAAAGCGTTTTAATTTGTATATTGTATTTTTG
TCTTATGAACAAACGCAGCAAATGTATAAAAGAGTAAGTGAAATAGCTCATTCTTGTACT
TTTATGATGTTGTATTTCAGCAAATTTATATAATCATTTTGGGTGACAG

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL6581Contig1 792 2 5 U
TTCAAAGAAGCATAAAAATTAAAAGTCAAGAAAACAAAAGCAGTAACAAGAGAGCATAGA
TGATTGTCTAGACATATCTAACAAACAACTAAAACCAAAGGAATCTTTCATAAACGTATA
TGACCTTGGAATAGACCAGTGCCTCTCGGGTTAGCCAAGCACAAGAAGTCCATCTCAATG
GTTTCTTACAGCTCTGGCATGGTACTCATGCTTAAGAAGGTTGGCTCTCAACATCATTGA
CCTGACATCCCTATCGAACTCGTTACCCATCTGAAGCACCTTTTGGAAAGTTGCATTCCT
CTGATCCGCGTGCCTTGCATAGAGGATTTTGTTGTGTGAATCAATCCGTGCCTGTATTTG
GTTGTCTGTTATCAAGGCTTCCAGTTCCTTCTCTAGACCAGAGACACTCGTCTTGAACGC
ATCGGCCATCCTGCTCAAATCAACAGACACAAATGGCAGCGTGTACTGAATTAGAGCCTT
CTTCCTTATCTGATCATAGAGAATGTCAACGTGATCATGTAGATGGATGTCCAGTAACAG
ATTCCCCCTGAGACTTCCTAGATACTCAAGACAGGAAGCATAGCGGCTTGAATAAAAATC
GTTGATAAGTTCCCTCACTTCGGGTACTAACTCCAAGAAATCCCTGAAGTTGATGTTGCC
AATCACTTTTGCCTTCAATTCTGATCGATCAAAGCTAGCCAATGCACAAAGTCCTCCATA
GGTTGCAACGTCTTGTGGAGCAATGACCTCGTTATATGAATTCCCAAGTTCTGGACTAAC
ATCCAAAACTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB30JQ U 1
AF RR2BQ43JQ U 39
BS 1 544 RR2EB30JQ
BS 545 545 RR2BQ43JQ
BS 546 721 RR2EB30JQ
BS 722 722 RR2BQ43JQ
BS 723 792 RR2EB30JQ

RD RR2EB30JQ 792 0 0
TTCAAAGAAGCATAAAAATTAAAAGTCAAGAAAACAAAAGCAGTAACAAGAGAGCATAGA
TGATTGTCTAGACATATCTAACAAACAACTAAAACCAAAGGAATCTTTCATAAACGTATA
TGACCTTGGAATAGACCAGTGCCTCTCGGGTTAGCCAAGCACAAGAAGTCCATCTCAATG
GTTTCTTACAGCTCTGGCATGGTACTCATGCTTAAGAAGGTTGGCTCTCAACATCATTGA
CCTGACATCCCTATCGAACTCGTTACCCATCTGAAGCACCTTTTGGAAAGTTGCATTCCT
CTGATCCGCGTGCCTTGCATAGAGGATTTTGTTGTGTGAATCAATCCGTGCCTGTATTTG
GTTGTCTGTTATCAAGGCTTCCAGTTCCTTCTCTAGACCAGAGACACTCGTCTTGAACGC
ATCGGCCATCCTGCTCAAATCAACAGACACAAATGGCAGCGTGTACTGAATTAGAGCCTT
CTTCCTTATCTGATCATAGAGAATGTCAACGTGATCATGTAGATGGATGTCCAGTAACAG
ATTCGCCCTGAGACTTCCTAGATACTCAAGACAGGAAGCATAGCGGCTTGAATAAAAATC
GTTGATAAGTTCCCTCACTTCGGGTACTAACTCCAAGAAATCCCTGAAGTTGATGTTGCC
AATCACTTTTGCCTTCAATTCTGATCGATCAAAGCTAGCCAATGCACAAAGTCCTCCATA
G*TTGCAACGTCTTGTGGAGCAATGACCTCGTTATATGAATTCCCAAGTTCTGGACTAAC
ATCCAAAACTTA

QA 1 792 1 792
DS 

RD RR2BQ43JQ 745 0 0
AGCAGTAACAAGAGAGCATAGATGATTGTCTAGACATATCTAACAAACAACTAAAACCAA
AGGAATCTTTCATAAACGTATATGACCTTGGAATAGACCAGTGCCTCTCGGGTTAGCCAA
GCACAAGAAGTCCATCTCAATGGTTTCTTCCAGCTCTGGCATGGTACTCATGCTTAAGAA
GGTTGGCTCTCAACATCATTGACCTGACATCCCTATCGAACTCGTTACCCATCTGAAGCA
CCTTTTGGAAAGTTGCATTCCTCTGGTCCGCGTGCCTTGCATAGAGGATTTTGTTGTGTG
AATCAATCCGTGCCTGTATTTGGTTGTCTGTTATCAAGGCTTCCAGTTCCTTCTCTAGAC
CAGAGACACTCGTCTTGAACGCATCGGCCATCCTGCTCAAATCAACAGACACAAATGGCA
GCGTGTACTGAATTAGAGCCTTCTTCCTTATCTGATCATAGAGAATGTCAACGTGATCAT
GTAGATGGATGTCCAGTAACAGATTCCCCCTGAGACTTCCTAGATACTCAAGACAGGAAG
CATAGCGGCTTGAATAAAAATCGTTGATAAGTTCCCTCACTTCGGGTACTAACTCCAAGA
AATCCCTGAAGTTGATGTTGTCAATCACTTTTGCCTTCAATTCTGATCGATCAAAGCTAG
CCAATGCACAAAGTCCTCCATAGGTTGCAACGTCTTGTGGAGCAATGACCTCGTTATATG
AATTCCCAAGTTCTGGACTAACATC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL6582Contig1 816 2 3 U
ATCAAGAAAATTGTCATTTGCGTGTAGGTCATAAGTCACTGAAACACTCATGTATTGTCA
TGCATTCATTACACGGTAAGATCAATGGAAGTTAGGAGGAAGAAATAAAAATATAAACGA
CATTATCAAAGACATTGAAGCACTTTACCAGATACTAAGACCTTTGTAAGATTCAACTTC
AGTTGAGGTAGTGTTTGAAGCAAAAAACTCTTTGAACCCCTGAGAACTCAAGAGATCACT
GAACAGTAAAAGTCTACCAATATGCTCTATTGTATTGAATCCATTGTTGGAACACTGTTT
TGACCTACTGACTTGGCAAGTGGGGTTGGTGTAGCCCAATGATCATTACCAGCATCCTTG
CCACGAACGGGTACTTTTTTCTGATCAAGAAAACTCACACTTTTCTTGGCTCCCTCTCTC
GTAGGGATCTCCATTATCTCTTCTCTGGCGACATAAGGTAGATCAATAGTCCTTGAATTT
ATTATCTGTATAAGACGATCAGTGTCCGCCATGGATAGAGATTAAATACATCAATGTAAA
AATCGCCTATGTAAACAAAGTACAAACAGAACTGCAAAGAAAGATAATAGGAAGAACAGG
AAAGATAAGCAGCCGCTCAATCTAATGACCCAGACATGACTATAAGCATTAAAAAAGAGA
GAATCCATTGGCAGCTGAATGGCATCGTTTCGGGGCTATTTGGGATAGCATCTTTTGAAT
CACCAACCATAACTTCATTGTAGAATGACATTAAACAAAACTAAAGAAAGAAGGAATAAA
ATGCTAGAGCTTGATAGAAGAATCTCTTGTACCGTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP96JQ U 1
AF RR2BI25JQ U 1
BS 1 248 RR2BI25JQ
BS 249 249 RR2DP96JQ
BS 250 816 RR2BI25JQ

RD RR2DP96JQ 630 0 0
ATCAAGAAAATTGTCATTTGCGTGTAGGTCATAAGTCACTGAAACACTCATGTATTGTCA
TGCATTCATTACACGGTAAGATCAATGGAAGTTAGGAGGAAGAAATAAAAATATAAACGA
CATTATCAAAGACATTGAAGCACTTTACCAGATACTAAGACCTTTGTAAGATTCAACTTC
AGTTGAGGTAGTGTTTGAAGCAAAAAACTCTTTGAACCCCTGAGAACTCAAGAGATCACT
GAACAGTAAAAGTCTACCAATATGCTCTATTGTATTGAATCCATTGTTGGAACACTGTTT
TGACCTACTGACTTGGCAAGTGGGGTTGGTGTAGCCCAATGATCATTACCAGCATCCTTG
CCACGAACGGGTACTTTTTTCTGATCAAGAAAACTCACACTTTTCTTGGCTCCCTCTCTC
GTAGGGATCTCCATTATCTCTTCTCTGGCGACATAAGGTAGATCAATAGTCCTTGAATTT
ATTATCTGTATAAGACGATCAGTGTCCGCCATGGATAGAGATTAAATACATCAATGTAAA
AATCGCCTATGTAAACAAAGTACAAACAGAACTGCAAAGAAAGATAATAGGAAGAACAGG
AAAGATAAGCAGCCGCTCAATCTAATGACC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2BI25JQ 816 0 0
ATCAAGAAAATTGTCATTTGCGTGTAGGTCATAAGTCACTGAAACACTCATGTATTGTCA
TGCATTCATTACACGGTAAGATCAATGGAAGTTAGGAGGAAGAAATAAAAATATAAACGA
CATTATCAAAGACATTGAAGCACTTTACCAGATACTAAGACCTTTGTAAGATTCAACTTC
AGTTGAGGTAGTGTTTGAAGCAAAAAACTCTTTGAACCCCTGAGAACTCAAGAGATCACT
GAACAGTAGAAGTCTACCAATATGCTCTATTGTATTGAATCCATTGTTGGAACACTGTTT
TGACCTACTGACTTGGCAAGTGGGGTTGGTGTAGCCCAATGATCATTACCAGCATCCTTG
CCACGAACGGGTACTTTTTTCTGATCAAGAAAACTCACACTTTTCTTGGCTCCCTCTCTC
GTAGGGATCTCCATTATCTCTTCTCTGGCGACATAAGGTAGATCAATAGTCCTTGAATTT
ATTATCTGTATAAGACGATCAGTGTCCGCCATGGATAGAGATTAAATACATCAATGTAAA
AATCGCCTATGTAAACAAAGTACAAACAGAACTGCAAAGAAAGATAATAGGAAGAACAGG
AAAGATAAGCAGCCGCTCAATCTAATGACCCAGACATGACTATAAGCATTAAAAAAGAGA
GAATCCATTGGCAGCTGAATGGCATCGTTTCGGGGCTATTTGGGATAGCATCTTTTGAAT
CACCAACCATAACTTCATTGTAGAATGACATTAAACAAAACTAAAGAAAGAAGGAATAAA
ATGCTAGAGCTTGATAGAAGAATCTCTTGTACCGTA

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

CO CL6583Contig1 674 2 2 U
GGGCAGAGAAATAAACTTGCAATTCTACACACACACAAAAAAAGAAGATAACACTAAAGC
TTTCTCTCCCTTTATCAATAGAGAAAAAAATGATGGATTCATTAGCTAAATGCTTCAACG
GACTTCAAGAAAGATACGAGAGCGTTCTAGAAGCAAAATCAATCTTCAAAGACGACTTAA
CATCGCCTCTAAATGGATCAGAGTGTTCAGTAGCACCCATCAAAAAGTCTCGTTGCTTGC
AAAGAGCCAAGAGGATTGACAGATCCTTAAGGTTCGAAGATGAAGATGAAGAGATGGCAA
AGCCTTTGAAGCCACGTAAAGTTGTGAGGTTTCAGTTGGAGAAGAATAAGATTTTCGAAC
CTAACAAGCCAGTGAGGTATGGGTTCGAACCTGAGGAGAAGCCTCTGGATGAGAAAGAAG
GTTCGAATAAGGTTGAAGGGAAGGAGGAAGTTGTGAGGGTAAAGATCAAGATGACCAAGC
AAGAAGCTCAGAGACTATTAGCAAAATGCAAAGACGACAGCGTTTTGGATTTGGAGCATG
TAGTGGACCAGATTGCATACTTTTCGAATCATCAGCTTCAACTCGATGTGGTCGTGGTTG
CTTCTAAGTTGTAATGATGAGAGAAAAAGGAAATGGCTAAAATTTTTTAGTTTGTTTAAT
TTCAGGTTTATTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU15TF U 1
AF RR2BU15JQ C 1
BS 1 626 RR2BU15TF
BS 627 674 RR2BU15JQ

RD RR2BU15TF 626 0 0
GGGCAGAGAAATAAACTTGCAATTCTACACACACACAAAAAAAGAAGATAACACTAAAGC
TTTCTCTCCCTTTATCAATAGAGAAAAAAATGATGGATTCATTAGCTAAATGCTTCAACG
GACTTCAAGAAAGATACGAGAGCGTTCTAGAAGCAAAATCAATCTTCAAAGACGACTTAA
CATCGCCTCTAAATGGATCAGAGTGTTCAGTAGCACCCATCAAAAAGTCTCGTTGCTTGC
AAAGAGCCAAGAGGATTGACAGATCCTTAAGGTTCGAAGATGAAGATGAAGAGATGGCAA
AGCCTTTGAAGCCACGTAAAGTTGTGAGGTTTCAGTTGGAGAAGAATAAGATTTTCGAAC
CTAACAAGCCAGTGAGGTATGGGTTCGAACCTGAGGAGAAGCCTCTGGATGAGAAAGAAG
GTTCGAATAAGGTTGAAGGGAAGGAGGAAGTTGTGAGGGTAAAGATCAAGATGACCAAGC
AAGAAGCTCAGAGACTATTAGCAAAATGCAAAGACGACAGCGTTTTGGATTTGGAGCATG
TAGTGGACCAGATTGCATACTTTTCGAATCATCAGCTTCAACTCGATGTGGTCGTGGTTG
CTTCTAAGTTGTAATGATGAGAGAAA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2BU15JQ 674 0 0
GGGCAGAGAAATAAACTTGCAATTCTACACACACACAAAAAAAGAAGATAACACTAAAGC
TTTCTCTCCCTTTATCAATAGAGAAAAAAATGATGGATTCATTAGCTAAATGCTTCAACG
GACTTCAAGAAAGATACGAGAGCGTTCTAGAAGCAAAATCAATCTTCAAAGACGACTTAA
CATCGCCTCTAAATGGATCAGAGTGTTCAGTAGCACCCATCAAAAAGTCTCGTTGCTTGC
AAAGAGCCAAGAGGATTGACAGATCCTTAAGGTTCGAAGATGAAGATGAAGAGATGGCAA
AGCCTTTGAAGCCACGTAAAGTTGTGAGGTTTCAGTTGGAGAAGAATAAGATTTTCGAAC
CTAACAAGCCAGTGAGGTATGGGTTCGAACCTGAGGAGAAGCCTCTGGATGAGAAAGAAG
GTTCGAATAAGGTTGAAGGGAAGGAGGAAGTTGTGAGGGTAAAGATCAAGATGACCAAGC
AAGAAGCTCAGAGACTATTAGCAAAATGCAAAGACGACAGCGTTTTGGATTTGGAGCATG
TAGTGGACCAGATTGCATACTTTTCGAATCATCAGCTTCAACTCGATGTGGTCGTGGTTG
CTTCTAAGTTGTAATGATGAGAGAAAAAGGAAATGGCTAAAATTTTTTAGTTTGTTTAAT
TTCAGGTTTATTTC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6585Contig1 747 2 2 U
GGAAGCCCTAGGTGAAACATATTCAGAGCTGGTTAGTCGATTGGACGAAGCTCTTCTTAG
TTTCGACGAAGGTCCTCCATTTACACTGCAGAGACTCTGTGAGATCCTTTTGGCTGCAAG
GAGCATCTACCCAAAGCTCTCAAAGCTTGCTCTTGCATTAGAAAAGAATCTGTTGGTTAC
TTCTATGCTATCTATCAGTACGGAACCGCAATCACAAACCACTGAAGAAACAAACGCAGC
AACAGAAGACACAGAAACGGCTGCAGCAAACGGGACACAAGCAAATGGAATTGAAGCAGT
GGTGGGAGGTGACGACAAGGATGAGATAATGACAGAGGTAGAAGAAGAAGCAGATGTTGA
TGACGCAATGACTATTGACATGGAAACAATCGATGAACCATCAGAGACAATGACGACGAC
GAAGGCCAGTGAGAGCGAGACATCAAGCGAAATCACTGCTGCAAAACCATCACCGGATCC
AATGGCTGCAGAGGAGGGAGACCCACGGTTGCCTTGAATTGTATGCCTCAAGAGAGACAA
TTTAAACATGATAAAGCTTTTTGCTCAAAAAAAAAAAACATGGTAAAGCTTTGAAAACTG
TGATTGAAGATAATGTTTGTTCTGTGTGAGGAGACATTCTTGGATCATGATCTTTCACTA
TAATATTAGCCATCAAAAAGGTTTCTGTTTTGTATAAGTGAATTTTTTGATTATAAGGTT
GATGTGTCAAAGCAAAAGACTTAAAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS29TF U 1
AF RR2AS29JQ C 1
BS 1 627 RR2AS29TF
BS 628 747 RR2AS29JQ

RD RR2AS29TF 627 0 0
GGAAGCCCTAGGTGAAACATATTCAGAGCTGGTTAGTCGATTGGACGAAGCTCTTCTTAG
TTTCGACGAAGGTCCTCCATTTACACTGCAGAGACTCTGTGAGATCCTTTTGGCTGCAAG
GAGCATCTACCCAAAGCTCTCAAAGCTTGCTCTTGCATTAGAAAAGAATCTGTTGGTTAC
TTCTATGCTATCTATCAGTACGGAACCGCAATCACAAACCACTGAAGAAACAAACGCAGC
AACAGAAGACACAGAAACGGCTGCAGCAAACGGGACACAAGCAAATGGAATTGAAGCAGT
GGTGGGAGGTGACGACAAGGATGAGATAATGACAGAGGTAGAAGAAGAAGCAGATGTTGA
TGACGCAATGACTATTGACATGGAAACAATCGATGAACCATCAGAGACAATGACGACGAC
GAAGGCCAGTGAGAGCGAGACATCAAGCGAAATCACTGCTGCAAAACCATCACCGGATCC
AATGGCTGCAGAGGAGGGAGACCCACGGTTGCCTTGAATTGTATGCCTCAAGAGAGACAA
TTTAAACATGATAAAGCTTTTTGCTCAAAAAAAAAAAACATGGTAAAGCTTTGAAAACTG
TGATTGAAGATAATGTTTGTTCTGTGT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2AS29JQ 747 0 0
GGAAGCCCTAGGTGAAACATATTCAGAGCTGGTTAGTCGATTGGACGAAGCTCTTCTTAG
TTTCGACGAAGGTCCTCCATTTACACTGCAGAGACTCTGTGAGATCCTTTTGGCTGCAAG
GAGCATCTACCCAAAGCTCTCAAAGCTTGCTCTTGCATTAGAAAAGAATCTGTTGGTTAC
TTCTATGCTATCTATCAGTACGGAACCGCAATCACAAACCACTGAAGAAACAAACGCAGC
AACAGAAGACACAGAAACGGCTGCAGCAAACGGGACACAAGCAAATGGAATTGAAGCAGT
GGTGGGAGGTGACGACAAGGATGAGATAATGACAGAGGTAGAAGAAGAAGCAGATGTTGA
TGACGCAATGACTATTGACATGGAAACAATCGATGAACCATCAGAGACAATGACGACGAC
GAAGGCCAGTGAGAGCGAGACATCAAGCGAAATCACTGCTGCAAAACCATCACCGGATCC
AATGGCTGCAGAGGAGGGAGACCCACGGTTGCCTTGAATTGTATGCCTCAAGAGAGACAA
TTTAAACATGATAAAGCTTTTTGCTCAAAAAAAAAAAACATGGTAAAGCTTTGAAAACTG
TGATTGAAGATAATGTTTGTTCTGTGTGAGGAGACATTCTTGGATCATGATCTTTCACTA
TAATATTAGCCATCAAAAAGGTTTCTGTTTTGTATAAGTGAATTTTTTGATTATAAGGTT
GATGTGTCAAAGCAAAAGACTTAAAAT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL6586Contig1 898 2 4 U
GGATGTTTCCCGATTCAAACGATGTTGCAAAGGTCAAAGAAGATGTTTTGACGGCGACGA
AAATTGCTGACTCGTCGTGCCTCGGAAAGCGCAAGGCGGAGGAGGATAGTGAGTCGAGTA
TGGAGGAGACGGACGATGGAGGAAGCGACTCGAGTATGGTGGAGAGCGAAGAAGAAGAAG
AAGAAGAAGAAGAAAGCGAACCTGAAACCGAACCGGTGTGGGGTTACGACAGCTTCGAAG
ACAGAGACTACTTCTCCTTCTCCGAAGGCGAACTTGCTGAGGATTTCTCCGACCAAGAGT
CTTTAAAGCCTTACCTTGACTACAGTCGCCAGATTCACTTGACCAGGGGTTTTGAGGTGG
ATCCGGATAGCATTCCTGATGACATGATTACTGGTTACTTCCCTATTGACTTGAATGATA
CACGCTTTGGCTGGCCCAAATCACCAGATGGAACCGCTCGTTGCTACATGGAACGTATGG
TCCAAATGTGTCTCGATAAGTACAACAAAACACAGGGATTGGATGTGAAAATGGATCATG
TTGTGAGGGCCATCGCAATGAAATCTGCCGGAATCAAGTGCTATATCACCTTTATGGCAC
AAGAGATTCCAACTGGGCCTTTGGTAGAGTACCAAGCTAAAACCGAGTGGAAGATTCGTC
AAGTTCACACTTATCCTATCTTTTGCAGACCCTCTCCTCCACCAGTCGATCTTAAAGACA
AGGCACGCAAAAGCACCAGGGTCAGGCCAAGAAAATAATTAAATTAACTTAAATTTCGCT
TTGGGATTCTTACATATATATATATCAACTCTAGAAACAAAAAAGTTATGCTATTATGTA
AATATCGTTGACTTCTTATTGTTTGGATTATCAGTATGATTAAATCGATTTTGTGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT21TF U 1
AF RR2AT21JQ C 1
BS 1 722 RR2AT21TF
BS 723 723 RR2AT21JQ
BS 724 733 RR2AT21TF
BS 734 898 RR2AT21JQ

RD RR2AT21TF 733 0 0
GGATGTTTCCCGATTCAAACGATGTTGCAAAGGTCAAAGAAGATGTTTTGACGGCGACGA
AAATTGCTGACTCGTCGTGCCTCGGAAAGCGCAAGGCGGAGGAGGATAGTGAGTCGAGTA
TGGAGGAGACGGACGATGGAGGAAGCGACTCGAGTATGGTGGAGAGCGAAGAAGAAGAAG
AAGAAGAAGAAGAAAGCGAACCTGAAACCGAACCGGTGTGGGGTTACGACAGCTTCGAAG
ACAGAGACTACTTCTCCTTCTCCGAAGGCGAACTTGCTGAGGATTTCTCCGACCAAGAGT
CTTTAAAGCCTTACCTTGACTACAGTCGCCAGATTCACTTGACCAGGGGTTTTGAGGTGG
ATCCGGATAGCATTCCTGATGACATGATTACTGGTTACTTCCCTATTGACTTGAATGATA
CACGCTTTGGCTGGCCCAAATCACCAGATGGAACCGCTCGTTGCTACATGGAACGTATGG
TCCAAATGTGTCTCGATAAGTACAACAAAACACAGGGATTGGATGTGAAAATGGATCATG
TTGTGAGGGCCATCGCAATGAAATCTGCCGGAATCAAGTGCTATATCACCTTTATGGCAC
AAGAGATTCCAACTGGGCCTTTGGTAGAGTACCAAGCTAAAACCGAGTGGAAGATTCGTC
AAGTTCACACTTATCCTATCTTTTGCAGACCCTCTCCTCCACCAGTCGATCTTAAAGACA
AG*CACGCAAAAG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2AT21JQ 898 0 0
GGATGTTTCCCGATTCAAACGATGTTGCAAAGGTCAAAGAAGATGTTTTGACGGCGACGA
AAATTGCTGACTCGTCGTGCCTCGGAAAGCGCAAGGCGGAGGAGGATAGTGAGTCGAGTA
TGGAGGAGACGGACGATGGAGGAAGCGACTCGAGTATGGTGGAGAGCGAAGAAGAAGAAG
AAGAAGAAGAAGAAAGCGAACCTGAAACCGAACCGGTGTGGGGTTACGACAGCTTCGAAG
ACAGAGACTACTTCTCCTTCTCCGAAGGCGAACTTGCTGAGGATTTCTCCGACCAAGAGT
CTTTAAAGCCTTACCTTGACTACAGTCGCCAGATTCACTTGACCAGGGGTTTTGAGGTGG
ATCCGGATAGCATTCCTGATGACATGATTACTGGTTACTTCCCTATTGACTTGAATGATA
CACGCTTTGGCTGGCCCAAATCACCAGATGGAACCGCTCGTTGCTACATGGAACGTATGG
TCCAAATGTGTCTCGATAAGTACAACAAAACACAGGGATTGGATGTGAAAATGGATCATG
TTGTGAGGGCCATCGCAATGAAATCTGCCGGAATCAAGTGCTATATCACCTTTATGGCAC
AAGAGATTCCAACTGGGCCTTTGGTAGAGTACCAAGCTAAAACCGAGTGGAAGATTCGTC
AAGTTCACACTTATCCTATCTTTTGCAGACCCTCTCCTCCACCAGTCGATCTTAAGGACA
AGGCACGCAAAAGCACCAGGGTCAGGCCAAGAAAATAATTAAATTAACTTAAATTTCGCT
TTGGGATTCTTACATATATATATATCAACTCTAGAAACAAAAAAGTTATGCTATTATGTA
AATATCGTTGACTTCTTATTGTTTGGATTATCAGTATGATTAAATCGATTTTGTGTTT

QA 1 898 1 898
DS 



AS 1 2

CO CL6587Contig1 973 2 6 U
GGCTTCGAAAAGCCGATCGAGAGGAAAAATCATTCAACGGCCGGCCTGGTTTACTCTTTC
TATAATCCGTTCTGACGATTCATATCTCCGGGAGCAGATCTGTGATTCGTTTCTAGGCTT
TTAACTTGATATCTATTGATTCACGCGATGGCTGCTCCTCCTGCTAGAGCTCGCGCTGAT
TACGATTACCTCATAAAACTTCTCTTGATCGGAGACAGCGGTGTGGGTAAGAGTTGCCTC
CTCTTGCGTTTCTCAGATGGCTCCTTTACAACCAGTTTCATTACGACCATTGGGATTGAT
TTCAAGATACGGACTATTGAACTAGATGGGAAGAGAATTAAGCTGCAAATTTGGGATACT
GCTGGACAGGAACGGTTCCGGACTATCACAACTGCATACTACCGTGGAGCCATGGGCATT
TTGCTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAACATCAGGAACTGGATCCGT
AATATTGAGCAGCACGCTTCTGATAATGTCAACAAGATTCTCGTGGGGAACAAGGCAGAT
ATGGATGAAAGCAAAAGGGCTGTGCCAACAGCTAAGGGACAAGCTCTTGCAGATGAATAC
GGAATCAAGTTCTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACTTAAACGTAGAGGAAGTTTTCTTC
TCAATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTCGCAGATACGGATGCAAGGGCTGAGCCACAC
ACAATCAGAATCAACCAATCCGACCAAGGGCAGAGACATCTCAAGCTACTCAGAAATCAG
CATGCTGCGGTTCTTAGAGAATCAGGTTGAAGATATGAACATAGTATTTTCCTTTTCCAC
CTTTGGAAAGAATATAAAGAGTGAAAAATGTCTTCAATGCTTTTTTTCTACATGGGATGG
TGTTGTTTTCTACCGTATTCTTTAAAATCTTTAATGTTCCTCTTTGGAAAAAGTTGCTAT
AAATATTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AU93TF U 1
AF RR2AU93JQ C 165
BS 1 699 RR2AU93TF
BS 700 700 RR2AU93JQ
BS 701 749 RR2AU93TF
BS 750 750 RR2AU93JQ
BS 751 800 RR2AU93TF
BS 801 973 RR2AU93JQ

RD RR2AU93TF 806 0 0
GGCTTCGAAAAGCCGATCGAGAGGAAAAATCATTCAACGGCCGGCCTGGTTTACTCTTTC
TATAATCCGTTCTGACGATTCATATCTCCGGGAGCAGATCTGTGATTCGTTTCTAGGCTT
TTAACTTGATATCTATTGATTCACGCGATGGCTGCTCCTCCTGCTAGAGCTCGCGCTGAT
TACGATTACCTCATAAAACTTCTCTTGATCGGAGACAGCGGTGTGGGTAAGAGTTGCCTC
CTCTTGCGTTTCTCAGATGGCTCCTTTACAACCAGTTTCATTACGACCATTGGGATTGAT
TTCAAGATACGGACTATTGAACTAGATGGGAAGAGAATTAAGCTGCAAATTTGGGATACT
GCTGGACAGGAACGGTTCCGGACTATCACAACTGCATACTACCGTGGAGCCATGGGCATT
TTGCTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAACATCAGGAACTGGATCCGT
AATATTGAGCAGCACGCTTCTGATAATGTCAACAAGATTCTCGTGGGGAACAAGGCAGAT
ATGGATGAAAGCAAAAGGGCTGTGCCAACAGCTAAGGGACAAGCTCTTGCAGATGAATAC
GGAATCAAGTTCTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACTTAAACGTAGAGGAAGTTTTCTTC
TCAATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTCGCAGATACG*ATGCAAGGGCTGAGCCACAC
ACAATCAGAATCAACCAATCCGACCAAGG*CAGAGACATCTCAAGCTACTCAGAAATCAG
CATGCTGCGGTTCTTAGAGA
TCAGTT

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2AU93JQ 809 0 0
TAGAGCTCGCGCTGATTACGATTACCTCATAAAACTTCTCTTGATCGGAGACAGCGGTGT
GGGTAAGAGTTGCCTCCTCTTGCGTTTCTCAGATGGCTCCTTTACAACCAGTTTCATTAC
GACCATTGGGATTGATTTCAAGATACGGACTATTGAACTAGATGGGAAGAGAATTAAGCT
GCAAATTTGGGATACTGCTGGACAGGAACGGTTCCGGACTATCACAACTGCATACTACCG
TGGAGCCATGGGCATTTTGCTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAACAT
CAGGAACTGGATCCGTAATATTGAGCAGCACGCTTCTGATAATGTCAACAAGATTCTCGT
GGGGAACAAGGCAGATATGGATGAAAGCAAAAGGGCTGTGCCAACAGCTAAGGGACAAGC
TCTTGCAGATGAATACGGAATCAAGTTCTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACTTAAACGT
AGAGGAAGTTTTCTTCTCAATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTCGCAGATACGGATGC
AAGGGCTGAGCCACACACAATCAGAATCAACCAATCCGACCAAGGGCAGAGACATCTCAA
GCTACTCAGAAATCAGCATGCTGCGGTTCTTAGAGAATCAGGTTGAAGATATGAACATAG
TATTTTCCTTTTCCACCTTTGGAAAGAATATAAAGAGTGAAAAATGTCTTCAATGCTTTT
TTTCTACATGGGATGGTGTTGTTTTCTACCGTATTCTTTAAAATCTTTAATGTTCCTCTT
TGGAAAAAGTTGCTATAAATATTTTTATT

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

CO CL6588Contig1 774 2 12 U
GGATCATTCTCAAGAAGAGAATATAAATATAATAAATAGAGATATCTTCTTTCTCGCGAA
ACCCTAATCTTCGATTTCCGCCGCCTCCTTCCGAATCTCCGTCGGATCTCAAATTCGTTT
TTCTCAGTGCTGAAATCTCCGGGGAATGCAGAGAAGGTTTTGCTGCGAGGTGGACAACGG
CTGGAAGGAGTCCCTCTCTCAAGGGATTGTCATCGTCGGCCCTAAAGCAAGAACCAGGGA
CAAACCTTGGGATCATCTTCTCTAATCTTTCTACATGGCTCGGATCTTGGTTCAACGAGG
AAGTTCTTCCAATGCTACCCGCTCTACTTCCTCCTCCTCCTCTGCCTCCTCTTCTGGTTC
CTCTTCTGCCTCTGGAACAGAACCACCAGTGACTGTTTGTGAAGAAACTACGGATGAGGC
TACTGTAGTTGAAGAAGAAGCAGAGTGTTCTGATGCTAAGGATGTATCACTCCCCAGTGA
TGAACCTTTGGACAGAGAAGATGATGAAGGTTTGGTTGTTTCGGAAAACCTTGCTGTTGT
TGTTGAAGGTGAAGGTGTAGATTGTGATTCTCCAGTTAGTGGTGGCGATGACCCTGATTC
ACCATCACCACCCGTGCCTGTTCCTCCACCGAAGCCTTCTTCTAACGTTACAACCGGTGG
TAATAGGAGATCCATCTTGGGAAGTTTTGGTGATTTACAAATTGGAGCAACAACAAGAAG
AGGAGCTGGGCCTCGCTCTCTTGTATCCACTAGGGTTCGCCACTGGATCACGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK87TF U 1
AF RR2C241TF U 56
BS 1 81 RR2EK87TF
BS 82 82 RR2C241TF
BS 83 86 RR2EK87TF
BS 87 87 RR2C241TF
BS 88 419 RR2EK87TF
BS 420 420 RR2C241TF
BS 421 526 RR2EK87TF
BS 527 527 RR2C241TF
BS 528 695 RR2EK87TF
BS 696 696 RR2C241TF
BS 697 719 RR2EK87TF
BS 720 774 RR2C241TF

RD RR2EK87TF 719 0 0
GGATCATTCTCAAGAAGAGAATATAAATATAATAAATAGAGATATCTTCTTTCTCGCGAA
ACCCTAATCTTCGATTTCCGCTGCCTTCTTCCGAATCTCCGTCGGATCTCAAATTCGTTT
TTCTCAGTGCTGAAATCTCCGGGGAATGCAGAGAAGGTTTTGCTGCGAGGTGGACAACGG
CTGGAAGGAGTCCCTCTCTCAAGGGATTGTCATCGTCGGCCCTAAAGCAAGAACCAGGGA
CAAACCTTGGGATCATCTTCTCTAATCTTTCTACATGGCTCGGATCTTGGTTCAACGAGG
AAGTTCTTCCAATGCTACCCGCTCTACTTCCTCCTCCTCCTCTGCCTCCTCTTCTGGTTC
CTCTTCTGCCTCTGGAACAGAACCACCAGTGACTGTTTGTGAAGAAACTACGGATGAGGT
TACTGTAGTTGAAGAAGAAGCAGAGTGTTCTGATGCTAAGGATGTATCACTCCCCAGTGA
TGAACCTTTGGACAGAGAAGATGATGAAGGTTTGGTTGTTTCGGAAGACCTTGCTGTTGT
TGTTGAAGGTGAAGGTGTAGATTGTGATTCTCCAGTTAGTGGTGGCGATGACCCTGATTC
ACCATCACCACCCGTGCCTGTTCCTCCACCGAAGCCTTCTTCTAACGTTACAACCGGTGG
TAATAGGAGATCCATCTTGGGAAGTTTTGGTGATT*ACAAATTGGAGCAACAACAAGAA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2C241TF 719 0 0
GG
GAAACCCTAATCTTCGATTTCCGCCGCCTCCTTCCGAATCTCCGTCGGATCTCAAATTCG
TTTTTCTCAGTGCTGAAATCTCCG**********AGAAGGTTTTGCTGCGAGGTGGACAA
CGGCTGGAAGGAGTCCCTCTCTCAAGGGATTGTCATCGTCGGCCCTAAAGCAAGAACCAG
GGACAAACCTTGGGATCATCTTCTCTAATCTTTCTACATGGCTCGGATCTTGGTTCAACG
AGGAAGTTCTTCCAATGCTACCCGCTCTACTTCCTCCTCCTCCTCTGCCTCCTCTTCTGG
TTCCTCTTCTGCCTCTGGAACAGAACCACCAGTGACTGTTTGTGAAGAAACTACGGATGA
GGCTACTGTAGTTGAAGAAGAAGCAGAGTGTTCTGATGCTAAGGATGTATCACTCCCCAG
TGATGAACCTTTGGACAGAGAAGATGATGAAGGTTTGGTTGTTTCGGAAAACCTTGCTGT
TGTTGTTGAAGGTGAAGGTGTAGATTGTGATTCTCCAGTTAGTGGTGGCGATGACCCTGA
TTCACCATCACCACCCGTGCCTGTTCCTCCACCGAAGCCTTCTTCTAACGTTACAACCGG
TGGTAATAGGAGATCCATCTTGGGAAGTTTTGGTGATTTACAAATTGGAGCAACAACAAG
AAGAGGAGCTGGGCCTCGCTCTCTTGTATCCACTAGGGTTCGCCACTGGATCACGTC

QA 3 719 3 719
DS 



AS 1 2

CO CL6589Contig1 741 2 2 U
GCAGATAGAAGACAATACGGGAAGAGTAGTCGGAACCTAGTAAGTTTTGGTCTTCCAAAT
ATTGCTTCTGTGGAATATAATGTACTTATTATTAGCTCAACATTAAAGTTTTGTGGTAGT
GGTTACATGTCTCCCGAGTATGCGATGAACGGCCGTTTCTCCATGAAATCAGATATCTAT
AGCTTCGGGGTCTTAGTTCTTGAAATTATAAGCGGCAAACAGAACAGTAGTTTCTGTCAA
CTGGATGATAGTCCTAGCAACTTGGTTATATATACATGGAGACTGTGGAGAAATGGGTCG
CCATTAGAGCTTGTGGATCCATCCTTTCAGGGTAATTATCAAACAGACGAAGTTACAAGA
TGCATCCATATCGCTTTACTATGTGTTCAAGAAGATGTTGAAGATCGTCCAACTATGTCA
GCAATCGTCTATATGCTTACTACTAGGTCGACTCCTCTTGCTGTACCTCGACCACCTGGA
TTTCTCTTCGGAAGAAGGAGTGAACAAGTAGGGGGGGCAGGTCCATCTATGCATGCTTCT
GCTATATGTTCAGTCGACGATGCTTCCATTACTAGTGTAGCTCCTCGTTAGAGACAAACA
ATTCATAAATGTAAAAGTGGTGATTCTGGAGTATTAAGCATCAAACTGTTTTCATTATTC
ATTTACTTTATGTAAGAAGATGAAACTCTGTTATAATTTTTGATTCCTTAACCAAAGATT
CATCACAGTGATCTTTGACAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2BH02JQ C 1
AF RR2BH02TF U 1
BS 1 739 RR2BH02TF
BS 740 741 RR2BH02JQ

RD RR2BH02JQ 741 0 0
GCAGATAGAAGACAATACGGGAAGAGTAGTCGGAACCTAGTAAGTTTTGGTCTTCCAAAT
ATTGCTTCTGTGGAATATAATGTACTTATTATTAGCTCAACATTAAAGTTTTGTGGTAGT
GGTTACATGTCTCCCGAGTATGCGATGAACGGCCGTTTCTCCATGAAATCAGATATCTAT
AGCTTCGGGGTCTTAGTTCTTGAAATTATAAGCGGCAAACAGAACAGTAGTTTCTGTCAA
CTGGATGATAGTCCTAGCAACTTGGTTATATATACATGGAGACTGTGGAGAAATGGGTCG
CCATTAGAGCTTGTGGATCCATCCTTTCAGGGTAATTATCAAACAGACGAAGTTACAAGA
TGCATCCATATCGCTTTACTATGTGTTCAAGAAGATGTTGAAGATCGTCCAACTATGTCA
GCAATCGTCTATATGCTTACTACTAGGTCGACTCCTCTTGCTGTACCTCGACCACCTGGA
TTTCTCTTCGGAAGAAGGAGTGAACAAGTAGGGGGGGCAGGTCCATCTATGCATGCTTCT
GCTATATGTTCAGTCGACGATGCTTCCATTACTAGTGTAGCTCCTCGTTAGAGACAAACA
ATTCATAAATGTAAAAGTGGTGATTCTGGAGTATTAAGCATCAAACTGTTTTCATTATTC
ATTTACTTTATGTAAGAAGATGAAACTCTGTTATAATTTTTGATTCCTTAACCAAGGATT
CATCACAGTGATCTTTGACAC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2BH02TF 739 0 0
GCAGATAGAAGACAATACGGGAAGAGTAGTCGGAACCTAGTAAGTTTTGGTCTTCCAAAT
ATTGCTTCTGTGGAATATAATGTACTTATTATTAGCTCAACATTAAAGTTTTGTGGTAGT
GGTTACATGTCTCCCGAGTATGCGATGAACGGCCGTTTCTCCATGAAATCAGATATCTAT
AGCTTCGGGGTCTTAGTTCTTGAAATTATAAGCGGCAAACAGAACAGTAGTTTCTGTCAA
CTGGATGATAGTCCTAGCAACTTGGTTATATATACATGGAGACTGTGGAGAAATGGGTCG
CCATTAGAGCTTGTGGATCCATCCTTTCAGGGTAATTATCAAACAGACGAAGTTACAAGA
TGCATCCATATCGCTTTACTATGTGTTCAAGAAGATGTTGAAGATCGTCCAACTATGTCA
GCAATCGTCTATATGCTTACTACTAGGTCGACTCCTCTTGCTGTACCTCGACCACCTGGA
TTTCTCTTCGGAAGAAGGAGTGAACAAGTAGGGGGGGCAGGTCCATCTATGCATGCTTCT
GCTATATGTTCAGTCGACGATGCTTCCATTACTAGTGTAGCTCCTCGTTAGAGACAAACA
ATTCATAAATGTAAAAGTGGTGATTCTGGAGTATTAAGCATCAAACTGTTTTCATTATTC
ATTTACTTTATGTAAGAAGATGAAACTCTGTTATAATTTTTGATTCCTTAACCAAAGATT
CATCACAGTGATCTTTGAC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL6590Contig1 842 2 2 U
GACCTTCAGGTCTACGGAGTACCTGGAGCAGCAGTTAACACACCAGTTTATCAATACGGG
CAATTAAGTCAGACTGTTCCAGGTGGCCAGAGCTATACAACAGTTCAAGGGTACTCGGTT
CCAGGAAGCCATGTTCTGCAACTTGGTGGAGGACCAACTGTTAGTGCGATGGCTACTTCA
TCCATGCCTCCTGCTCTTCAACCTCCATACCCTCCAGGACCTGCTCCAGCACAGTCCCAT
ATCATTGTCCATCCCCCTCAGTTTATGCAGAGTAGCAGTTCTGACCAAACAACAAGTTAT
CCTTGAAAGACTGGAGGAGAAAGGAGCAGCGAAATTGCTAATTCAATGTGGCAGCAGAAG
GCTTCCTGTTTATTTTTAAGTCGTCAAGTTATTTATCTTGCATCTGAAAGGTTATATGAA
AAATAGTCTTTGCTCACTGGAAGGGCACAGAAGGAAAATGGGAGTCTCAGGGGTTGTGCT
TCCGTTTTTCTTACCTCATCCGTCAATGTGTATTTATCTAAAACACAGACAACAAAAAGA
TGCTGCTGGCTCAAGCTGGGGCTTGAGTATGCAGTCATGGTAACGGTTTTCTCCGAGGAG
GGGTAACCGTTTGGTAATAAGTTGGTGTACTATATAGTAGACACACATACACAAGCATAT
ATATACATATACTAGAATCAAAATCTGATTCTTTCTTTTTTCTTTTAGTCTAAAGTCGTA
TTACCACTACACTTTCTTCAGGTACAGGGGTGTAGTGAGTAAACATTCATAGGTATATAG
CCTCTGTTCCGCGTCCTGCATTGTAAGTAAAAGCATGTTTATATCCTAGGGTGTTTGTCT
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2B366TF U 1
AF RR2B366JQ C 195
BS 1 734 RR2B366TF
BS 735 842 RR2B366JQ

RD RR2B366TF 734 0 0
GACCTTCAGGTCTACGGAGTACCTGGAGCAGCAGTTAACACACCAGTTTATCAATACGGG
CAATTAAGTCAGACTGTTCCAGGTGGCCAGAGCTATACAACAGTTCAAGGGTACTCGGTT
CCAGGAAGCCATGTTCTGCAACTTGGTGGAGGACCAACTGTTAGTGCGATGGCTACTTCA
TCCATGCCTCCTGCTCTTCAACCTCCATACCCTCCAGGACCTGCTCCAGCACAGTCCCAT
ATCATTGTCCATCCCCCTCAGTTTATGCAGAGTAGCAGTTCTGACCAAACAACAAGTTAT
CCTTGAAAGACTGGAGGAGAAAGGAGCAGCGAAATTGCTAATTCAATGTGGCAGCAGAAG
GCTTCCTGTTTATTTTTAAGTCGTCAAGTTATTTATCTTGCATCTGAAAGGTTATATGAA
AAATAGTCTTTGCTCACTGGAAGGGCACAGAAGGAAAATGGGAGTCTCAGGGGTTGTGCT
TCCGTTTTTCTTACCTCATCCGTCAATGTGTATTTATCTAAAACACAGACAACAAAAAGA
TGCTGCTGGCTCAAGCTGGGGCTTGAGTATGCAGTCATGGTAACGGTTTTCTCCGAGGAG
GGGTAACCGTTTGGTAATAAGTTGGTGTACTATATAGTAGACACACATACACAAGCATAT
ATATACATATACTAGAATCAAAATCTGATTCTTTCTTTTTTCTTTTAGTCTAAAGTCGTA
TTACCACTACACTT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2B366JQ 648 0 0
TCTTCAACCTCCATACCCTCCAGGACCTGCTCCAGCACAGTCCCATATCATTGTCCATCC
CCCTCAGTTTATGCAGAGTAGCAGTTCTGACCAAACAACAAGTTATCCTTGAAAGACTGG
AGGAGAAAGGAGCAGCGAAATTGCTAATTCAATGTGGCAGCAGAAGGCTTCCTGTTTATT
TTTAAGTCGTCAAGTTATTTATCTTGCATCTGAAAGGTTATATGAAAAATAGTCTTTGCT
CACTGGAAGGGCACAGAAGGAAAATGGGAGTCTCAGGGGTTGTGCTTCCGTTTTTCTTAC
CTCATCCGTCAATGTGTATTTATCTAAAACACAGACAACAAAAAGATGCTGCTGGCTCAA
GCTGGGGCTTGAGTATGCAGTCATGGTAACGGTTTTTTCCGAGGAGGGGTAACCGTTTGG
TAATAAGTTGGTGTACTATATAGTAGACACACATACACAAGCATATATATACATATACTA
GAATCAAAATTTGATTCTTTCTTTTTTCTTTTAGTCTAAAGTCGTATTACCACTACACTT
TCTTCAGGTACAGGGGTGTAGTGAGTAAACATTCATAGGTATATAGCCTCTGTTCCGCGT
CCTGCATTGTAAGTAAAAGCATGTTTATATCCTAGGGTGTTTGTCTTT

QA 1 648 1 648
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6592Contig1 736 2 4 U
AATGAAATCTTAGCGTTAAATCAAATCTAGAAGCTTTTGATCAAAAAAAAGAGAAATCAA
ATCCAGAAGCTTCTTTCTACTAAAAGAAAAAGAGAGAGACGACCAGAGAAGATGATGATT
CGCTTTTCTTTGATGCGTTTTATGAAGGCTGCTTTGTTCGTTACCCTCTTCCTCTTCGAC
GTTGCTCGCAGCGAGGAGTGCACAAGAACCTGCATTGCCCAGAATTGCGACACACTTTCT
ATACGATATGGCAAGTATTGTGGGATTGGACACTTTGGATGTCCTGGTGAGGAACCTTGT
GATGATCTTGATGCTTGTTGTATGGCTCATGACAACTGCGTTGATTCTAAAGGTATGACT
AACATAAGCTGCCATAAGAAGTTCAAGCAATGCCTAAGCAGGCTTAGCAAATCGATTAAA
CAATCCAAAAACAAAAAGGTCGGCTTTTCCAAACAATGCCCTTACTCACAAGTCATACCA
ACTATGAATCAAGGAATGGATATCGGCATCATGTTCAGTCAACTAGGCAATGATCTGAAA
ACCGAGCTCTGAGTTTTGCTGCTTCATTTACTCTTGGCCTAAGAGGAGGCATCACCATTG
ATCCTTTGTAATTTTAGAAGATTCTTTGGTAGTGATGAGGATTACCTGTATAACTATTGC
CATTGCACGTCGCTGCTAGATTAGCTTAATTCAAAACACCTTTTGGATGATTTTATGACA
TGTTTTCTCGGAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2DX56TF U 1
AF RR2DX56JQ C 50
BS 1 695 RR2DX56TF
BS 696 696 RR2DX56JQ
BS 697 733 RR2DX56TF
BS 734 736 RR2DX56JQ

RD RR2DX56TF 735 0 0
AATGAAATCTTAGCGTTAAATCAAATCTAGAAGCTTTTGATCAAAAAAAAGAGAAATCAA
ATCCAGAAGCTTCTTTCTACTAAAAGAAAAAGAGAGAGACGACCAGAGAAGATGATGATT
CGCTTTTCTTTGATGCGTTTTATGAAGGCTGCTTTGTTCGTTACCCTCTTCCTCTTCGAC
GTTGCTCGCAGCGAGGAGTGCACAAGAACCTGCATTGCCCAGAATTGCGACACACTTTCT
ATACGATATGGCAAGTATTGTGGGATTGGACACTTTGGATGTCCTGGTGAGGAACCTTGT
GATGATCTTGATGCTTGTTGTATGGCTCATGACAACTGCGTTGATTCTAAAGGTATGACT
AACATAAGCTGCCATAAGAAGTTCAAGCAATGCCTAAGCAGGCTTAGCAAATCGATTAAA
CAATCCAAAAACAAAAAGGTCGGCTTTTCCAAACAATGCCCTTACTCACAAGTCATACCA
ACTATGAATCAAGGAATGGATATCGGCATCATGTTCAGTCAACTAGGCAATGATCTGAAA
ACCGAGCTCTGAGTTTTGCTGCTTCATTTACTCTTGGCCTAAGAGGAGGCATCACCATTG
ATCCTTTGTAATTTTAGAAGATTCTTTGGTAGTGATGAGGATTACCTGTATAACTATTGC
CATTGCACGTCGCTGCTAGATTAGCTTAATTCAAA*CACCTTTTGGATGATTTTATGACA
TGTTTTCTCGGAA
CT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2DX56JQ 687 0 0
AGAGAAATCAAATCCAGAAGCTTCTTTCTACTAAAAGAAAAAGAGAGAGACGACCAGAGA
AGATGATGATTCGCTTTTCTTTGATGCGTTTTATGAAGGCTGCTTTGTTCGTTACCCTCT
TCCTCTTCGACGTTGCTCGCAGCGAGGAGTGCACAAGAACCTGCATTGCCCAGAATTGCG
ACACACTTTCTATACGATATGGCAAGTATTGTGGGATTGGACACTTTGGATGTCCTGGTG
AGGAACCTTGTGATGATCTTGATGCTTGTTGTATGGCTCATGACAACTGCGTTGATTCTA
AAGGTATGACTAACATAAGCTGCCATAAGAAGTTCAAGCAATGCCTAAGCAGGCTTAGCA
AATCGATTAAACAATCCAAAAACAAAAAGGTCGGCTTTTCCAAACAATGCCCTTACTCAC
AAGTCATACCAACTATGAATCAAGGAATGGATATCGGCATCATGTTCAGTCAACTAGGCA
ATGATCTGAAAACCGAGCTCTGAGTTTTGCTGCTTCATTTACTCTTGGCCTAAGAGGAGG
CATCACCATTGATCCTTTGTAATTTTAGAAGATTCTTTGGTAGTGATGAGGATTACCTGT
ATAACTATTGCCATTGCACGTCGCTGCTAGATTAGCTTAATTCAAAACACCTTTTGGATG
ATTTTATGACATGTTTTCTCGGAAACT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL6593Contig1 773 2 1 U
GGAGGTATCGCCGACGAGTAACAGCATTAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTT
CATCATGATCAAGCCTGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTT
CGAGCAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTAAATCCATCATTTCACGATGTCAGAGTCTACT
TCATTAAGTTTGTAGCAGTGTAACTGATACTAGCCTAGCTAATGTAGCTTTAAGTTTGTA
TTTAAAGACTTAGATCTGGTCAGTATTGGATACACTCTAGTTGACGATAGTTTGGTTTGA
TTTGTAGCATTGTCTCAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAGAAAC
ACTGCCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATCTCTG
GCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGGAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAGATCA
TTGGAGCAACTAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCAATTG
ACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAGGAATGTG
CGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATCTACG
AATGATTCCATCATTCAAAACATGTTTCTCCACTGCTATTGCTGTTATTTCTGTTGCTTT
CCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACAAGACTTTGTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B448JQ C 1
AF RR2B448TF U 1
BS 1 773 RR2B448TF

RD RR2B448JQ 773 0 0
GGAGGTATCGCCGACGAGTAACAGCATTAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTT
CATCATGATCAAGCCTGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTT
CGAGCAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTAAATCCATCATTTCACGATGTCAGAGTCTACT
TCATTAAGTTTGTAGCAGTGTAACTGATACTAGCCTAGCTAATGTAGCTTTAAGTTTGTA
TTTAAAGACTTAGATCTGGTCAGTATTGGATACACTCTAGTTGACGATAGTTTGGTTTGA
TTTGTAGCATTGTCTCAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAGAAAC
ACTGCCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATCTCTG
GCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGGAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAGATCA
TTGGAGCAACTAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCAATTG
ACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAGGAATGTG
CGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATCTACG
AATGATTCCATCATTCAAAACATGTTTCTCCACTGCTATTGCTGTTATTTCTGTTGCTTT
CCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACAAGACTTTGTTTT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2B448TF 773 0 0
GGAGGTATCGCCGACGAGTAACAGCATTAAAAAAAAAGAATCGACAATGGAGCAAACTTT
CATCATGATCAAGCCTGACGGTGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTT
CGAGCAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTAAATCCATCATTTCACGATGTCAGAGTCTACT
TCATTAAGTTTGTAGCAGTGTAACTGATACTAGCCTAGCTAATGTAGCTTTAAGTTTGTA
TTTAAAGACTTAGATCTGGTCAGTATTGGATACACTCTAGTTGACGATAGTTTGGTTTGA
TTTGTAGCATTGTCTCAGGTCTAAAGTTGATCACTGTGGACCGTCCTTTTGCTGAGAAAC
ACTGCCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATCTCTG
GCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGGAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAGATCA
TTGGAGCAACTAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCAATTG
ACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAGGAATGTG
CGTTGTGGTTCCCTGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATCTACG
AATGATTCCATCATTCAAAACATGTTTCTCCACTGCTATTGCTGTTATTTCTGTTGCTTT
CCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACAAGACTTTGTTTT

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL6594Contig1 820 2 3 U
GGGATGCGGCTGTTGAGTTTGTCGTCAATGCTGGTGATCAGAAAGCCTCTTCTTTACCTC
GTAATGATTGGTACAGACTTAAGCGTAGCCTCGAGATACTCAAGACAACTGGAACTCCAC
CGTCTTCCTTTCGTGTTCCGTATGATTCATTTCGAGAAAGTTTAAACTCTCCTGACGCCA
ATGATGACTTCAGTGAGGATGGTTCATCGGCTGATATCTCTATACAAAACATACAGACGG
ATTTGGACTATGACTTCCTTTGTTTTTTCCTGTCAAGCCCACGGATTGATCTCTACAGAT
CTATTGATTTCAGATGTGAAGACATGCTCTCAGGGGTCAATGGAGTTTTATCTGAAGCTA
GATGGCTTCTTGATCTTGGTCTTCTTCCAAATACAAACTCCGCAACTAGGGCCATTGGTT
ACAGACAGGCCATGGAATATCTATCCAAATGTCGTCGACAAGGGGGTGTAAGTTCCCCTG
GAGAGTTCTATTGGTTTTTGAACAAGTTTCAGCAAGTTTCCAGGAACTTTGCAAAAAGGC
AAATGACATGGTTCAGGTGTGAGCCTATGTACCACTGGCTTAACGCTTCTAAACCTCTGG
ATACAATACTTGAGTTCATTTATGATGCTTACGAGAAGGAAGCAGAGACGCTTGTGGTGC
CTGATTCTATCAGGATGAACAAAGACATGAGAAACTCTCGAGAAGCTAATGCACTGAAGG
CGTACCGCCCTAGAAATAGGCATTTCGTTGGAAGAGAGGACTGTTCTTCGGTGTTAGAAT
GGTTCCGAAGTGAAGGATGTAAGAGCGAAGTTTCATGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A338TF U 41
AF RR2A338JQ C 1
BS 1 40 RR2A338JQ
BS 41 669 RR2A338TF
BS 670 820 RR2A338JQ

RD RR2A338TF 629 0 0
GAAAGCCTCTTCTTTACCTCGTAATGATTGGTACAGACTTAAGCGTAGCCTCGAGATACT
CAAGACAACTGGAACTCCACCGTCTTCCTTTCGTGTTCCGTATGATTCATTTCGAGAAAG
TTTAAACTCTCCTGACGCCAATGATGACTTCAGTGAGGATGGTTCATCGGCTGATATCTC
TATACAAAACATACAGACGGATTTGGACTATGACTTCCTTTGTTTTTTCCTGTCAAGCCC
ACGGATTGATCTCTACAGATCTATTGATTTCAGATGTGAAGACATGCTCTCAGGGGTCAA
TGGAGTTTTATCTGAAGCTAGATGGCTTCTTGATCTTGGTCTTCTTCCAAATACAAACTC
CGCAACTAGGGCCATTGGTTACAGACAGGCCATGGAATATCTATCCAAATGTCGTCGACA
AGGGGGTGTAAGTTCCCCTGGAGAGTTCTATTGGTTTTTGAACAAGTTTCAGCAAGTTTC
CAGGAACTTTGCAAAAAGGCAAATGACATGGTTCAGGTGTGAGCCTATGTACCACTGGCT
TAACGCTTCTAAACCTCTGGATACAATACTTGAGTTCATTTATGATGCTTACGAGAAGGA
AGCAGAGACGCTTGTGGTGCCTGATTCTA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2A338JQ 820 0 0
GGGATGCGGCTGTTGAGTTTGTCGTCAATGCTGGTGATCAGAAAGCCTCTTCTTTACCTC
GTAATGATTGGTACAGACTTAAGCGTAGCCTCGAGATACTCAAGACAACTGGATCTCCAC
CGTCTTCCTTTCGTGTTCCGTATGATTCATTTCGAGAAAGTTTAAACTCTCCTGACGCCA
ATGATGACTTCAGTGAGGATGGTTCATCGGCTGATATCTCTATACAAAACATACAGACGG
ATTTGGACTATGACTTCCTTTGTTTTTTCCTGTCAAGCCCACGGATTGATCTCTACAGAT
CTATTGATTTCAGATGTGAAGACATGCTCTCAGGGGTCAATGGAGTTTTATCTGAAGCTA
GATGGCTTCTTGATCTTGGTCTTCTTCCAAATACAAACTCCGCAACTAGGGCCATTGGTT
ACAGACAGGCCATGGAATATCTATCCAAATGTCGTCGACAAGGGGGTGTAAGTTCCCCTG
GAGAGTTCTATTGGTTTTTGAACAAGTTTCAGCAAGTTTCCAGGAACTTTGCAAAAAGGC
AAATGACATGGTTCAGGTGTGAGCCTATGTACCACTGGCTTAACGCTTCTAAACCTCTGG
ATACAATACTTGAGTTCATTTATGATGCTTACGAGAAGGAAGCAGAGACGCTTGTGGTGC
CTGATTCTATCAGGATGAACAAAGACATGAGAAACTCTCGAGAAGCTAATGCACTGAAGG
CGTACCGCCCTAGAAATAGGCATTTCGTTGGAAGAGAGGACTGTTCTTCGGTGTTAGAAT
GGTTCCGAAGTGAAGGATGTAAGAGCGAAGTTTCATGCGT

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 2

CO CL6595Contig1 796 2 10 U
TTTTTTTTGGGAACCCACTCATCTGTTTAATATTTTTTTTCTAGGCCACACACAATTTGA
ATCTTCTTGAGTCCTTCGCCAGACCAACAAGGAGGACGACAAAAGTTGAACTTTTTGAGG
GTTTAATTTCTCCAGAAGAGTCATAACAAAAGGAAGAACAGATTTGAATCTTCTTGGGTC
TTCAGAGAAGAAGCATAAACATTTAAAAAGACATGCAGGAGGGAGACGATGGGGGAAACA
ATGGCGGCTAGGTACTGGTTGAAAATGATTCTCAGCCGTGGAATTAGGATCATATGTTTT
GATCATCGAAAGTCAGCATTTCAAAGCTTAGCTCAGTAAAGAAGAAGAGGTTTAAGGTTA
ATGTTGATGTTGACAAGAGTAGCTCGAAGGCTGTGTGTGAATATTTCTCAAGTAAACTCG
CATCTTCAGAGGTCTTGTCTTAACCATTTGTTTAAGTTTGGTCACTCTCATTGTAATCGA
GGATGCTAGCTGCATCTGCATGTCTGTTTGCCAGTCTGAGAATCCAATCCTCACAGAAGA
GGAGCTTGAGTGGAAGAAGAAGAAGGATGACAAGCAAAATGAATGAAAATTAGATAGACG
ACTCAGAATCGATAAAAAGGGAATGTCACGGCGAGAACCACCTACCCAGGCCCAGGAAAA
CAACAGTCTACTCTTCATATCACCGAGCAAGAACTCAGTAATTCTTTCAACATTGTTCCT
GTATGTAACGGATATGGAAGCAATTGATCTGTAACTTCATATGATCTAATAGAAAGAAGT
ATGATTAGTGTAAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC81TF U 1
AF RR2EC81JQ C 132
BS 1 692 RR2EC81TF
BS 693 693 RR2EC81JQ
BS 694 709 RR2EC81TF
BS 710 710 RR2EC81JQ
BS 711 727 RR2EC81TF
BS 728 728 RR2EC81JQ
BS 729 753 RR2EC81TF
BS 754 754 RR2EC81JQ
BS 755 774 RR2EC81TF
BS 775 796 RR2EC81JQ

RD RR2EC81TF 774 0 0
TTTTTTTTGGGAACCCACTCATCTGTTTAATATTTTTTTTCTAGGCCACACACAATTTGA
ATCTTCTTGAGTCCTTCGCCAGACCAACAAGGAGGACGACAAAAGTTGAACTTTTTGAGG
GTTTAATTTCTCCAGAAGAGTCATAACAAAAGGAAGAACAGATTTGAATCTTCTTGGGTC
TTCAGAGAAGAAGCATAAACATTTAAAAAGACATGCAGGAGGGAGACGATGGGGGAAACA
ATGGCGGCTAGGTACTGGTTGAAAATGATTCTCAGCCGTGGAATTAGGATCATATGTTTT
GATCATCGAAAGTCAGCATTTCAAAGCTTAGCTCAGTAAAGAAGAAGAGGTTTAAGGTTA
ATGTTGATGTTGACAAGAGTAGCTCGAAGGCTGTGTGTGAATATTTCTCAAGTAAACTCG
CATCTTCAGAGGTCTTGTCTTAACCATTTGTTTAAGTTTGGTCACTCTCATTGTAATCGA
GGATGCTAGCTGCATCTGCATGTCTGTTTGCCAGTCTGAGAATCCAATCCTCACAGAAGA
GGAGCTTGAGTGGAAGAAGAAGAAGGATGACAAGCAAAATGAATGAAAATTAGATAGACG
ACTCAGAATCGATAAAAAGGGAATGTCACGGCGAGAACCACCTACCCAGGCCCAGGAAAA
CAACAGTCTACTCTTCATATCACCGAGCAAGA*CTCAGTAATTCTTTCA*CATTGTTCCT
GTATGTA*CGGATATGGAAGCAATTGATCTGTA*CTTCATATGATCTAATAGAA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2EC81JQ 665 0 0
CCAGAAGAGTCATAACAAAAGGAAGAACAGATTTGAATCTTCTTGGGTCTTCAGAGAAGA
AGCATAAACATTTAAAAAGACATGCAGGAGGGAGACGATGGGGGAAACAATGGCGGCTAG
GTACTGGTTGAAAATGATTCTCAGCCGTGGAATTAGGATCATATGTTTTGATCATCGAAA
GTCAGCATTTCAAAGCTTAGCTCAGTAAAGAAGAAGAGGTTTAAGGTTAATGTTGATGTT
GACAAGAGTAGCTCGAAGGCTGTGTGTGAATATTTCTCAAGTAAACTCGCATCTTCAGAG
GTCTTGTCTTAACCATTTGTTTAAGTTTGGTCACTCTCATTGTAATCGAGGATGCTAGCT
GCATCTGCATGTCTGTTTGCCAGTCTGAGAATCCAATCCTCACAGAAGAGGAGCTTGAGT
GGAAGAAGAAGAAGGATGACAAGCAAAATGAATGAAAATTAGATAGACGACTCAGAATCG
ATAAAAAGGGAATGTCACGGCGAGAACCACCTACCCAGGCCCAGGAAAACAACAGTCTAC
TCTTCATATCACCGAGCAAGAACTCAGTAATTCTTTCAACATTGTTCCTGTATGTAACGG
ATATGGAAGCAATTGATCTGTAACTTCATATGATCTAATAGAAAGAAGTATGATTAGTGT
AAATA

QA 1 665 1 665
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6597Contig1 1369 2 2 U
GGGAGAAAGAACGGTTATAAACCACTAACACAATTCGTTTCTTATCGCTGGCCAGTAAAG
ACGAAGCCTTTGCTCAAGATTTCAAGATTTCGATTTTTGAAGGATAACTGCAAAACCCAA
ATGGGAACAATGCACAGAAGTGGTGTAGCTCCTCGAAGAACAAACGAAAACGCAAAAGCT
GTCTTCACAACAATTCTAGGAATCGTGTTTGGCACTTTTATCGGCATTACATTACCCTCA
CTCTCTTTAAAGATTAACTTTCCCTCGGCACTTATATCATCTCTTGACGTAGCCTTATCA
GATGGTCACTTGTTGTCTAGTCACAAATCCCCTGAAGAGTTCGGCTCAAGAAAGTTTCCT
GAGATATATGTTCCTACGAATCCGCGTGGTGCAGAACTAATACCTCCAGGGATTGTTGTG
GCAAAAACTGATCTTTACTTGCGCAGGTTATGGGGAGAACCTAATGAAGATTTGAAGAAG
AAGCCAAAGTATCTTGTGACATTTACAGTTGGGTTTGAGCAGAGGAACCATATTAATACA
GTTGTTAAGAAGTTTTTTGAAGATTTTCAGATTTTGCTTTTCCATTATGATGGCCGGACG
ACTGAGTGGGACCAGTTTGAGTGGTCGAAGACCGCTATTCATATTAGTACAAGAAAGCAA
ACAAAATGGTGGTACGCGAAGAGGTTTTTGCATCCTGATGTTGTTTCTGCGTACGAGTAC
ATATTTATATGGGATGAAGATCTTGGTGTGGAGCACTTCAACGCTGATAAGTACATTGAG
TTAGTTAAGAAGCATGGTTTAGAGATTTCTCAACCAGGTCTAGAGCCCAACAATGGACTT
ACATGGGAAATGACAAAGAGGCGAGGTGACCGAGAGGTCCACAAAGATACTAAAGAAAAA
GCAGGATGGTGTAGCGACCCACATTTACCTCCCTGTGCTGCGTTTGTAGAAATAATGGCG
CCTGTCTTTTCCAGAGAAGCATGGCGATGTGTGTGGCATATGATTCAGAATGATCTGGTT
CATGGATGGGGTCTGGACTTTGCTCTTAGAAGATGCGTTGAGCCTGCTCATGAGAAGATT
GGAGTTGTAGATTCGCAATGGATCATTCATAAAGTGATACCTTCGCTTGGGAGTCAAGGT
AAGTCAGAGAATGGGAAAGCTCCTTGGCAAGGAGTGAGAGAGAGATGCAAAAAGGAATGG
GTAATGTTTCAGAACCGATTAGCAGAAGCTGAAAAGGAGTATCTTGGGAGGATGGTGGTG
AAAGAATAATATACATTTGTTTTCTTGTTTATAGTTAATTCTAAAAACATTTTTTGTATA
TCAAACATTTTACCTTATATAGGTTATGATGATATGGCGTGTGAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO57TF U 1
AF RR2GO57JQ C 621
BS 1 671 RR2GO57TF
BS 672 1369 RR2GO57JQ

RD RR2GO57TF 671 0 0
GGGAGAAAGAACGGTTATAAACCACTAACACAATTCGTTTCTTATCGCTGGCCAGTAAAG
ACGAAGCCTTTGCTCAAGATTTCAAGATTTCGATTTTTGAAGGATAACTGCAAAACCCAA
ATGGGAACAATGCACAGAAGTGGTGTAGCTCCTCGAAGAACAAACGAAAACGCAAAAGCT
GTCTTCACAACAATTCTAGGAATCGTGTTTGGCACTTTTATCGGCATTACATTACCCTCA
CTCTCTTTAAAGATTAACTTTCCCTCGGCACTTATATCATCTCTTGACGTAGCCTTATCA
GATGGTCACTTGTTGTCTAGTCACAAATCCCCTGAAGAGTTCGGCTCAAGAAAGTTTCCT
GAGATATATGTTCCTACGAATCCGCGTGGTGCAGAACTAATACCTCCAGGGATTGTTGTG
GCAAAAACTGATCTTTACTTGCGCAGGTTATGGGGAGAACCTAATGAAGATTTGAAGAAG
AAGCCAAAGTATCTTGTGACATTTACAGTTGGGTTTGAGCAGAGGAACCATATTAATACA
GTTGTTAAGAAGTTTTTTGAAGATTTTCAGATTTTGCTTTTCCATTATGATGGCCGGACG
ACTGAGTGGGACCAGTTTGAGTGGTCGAAGACCGCTATTCATATTAGTACAAGAAAGCAA
ACAAAATGGTG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2GO57JQ 749 0 0
GTGGTCGAAGACCGCTATTCATATTAGTACAAGAAAGCAAACAAAATGGTGGTACGCGAA
GAGGTTTTTGCATCCTGATGTTGTTTCTGCGTACGAGTACATATTTATATGGGATGAAGA
TCTTGGTGTGGAGCACTTCAACGCTGATAAGTACATTGAGTTAGTTAAGAAGCATGGTTT
AGAGATTTCTCAACCAGGTCTAGAGCCCAACAATGGACTTACATGGGAAATGACAAAGAG
GCGAGGTGACCGAGAGGTCCACAAAGATACTAAAGAAAAAGCAGGATGGTGTAGCGACCC
ACATTTACCTCCCTGTGCTGCGTTTGTAGAAATAATGGCGCCTGTCTTTTCCAGAGAAGC
ATGGCGATGTGTGTGGCATATGATTCAGAATGATCTGGTTCATGGATGGGGTCTGGACTT
TGCTCTTAGAAGATGCGTTGAGCCTGCTCATGAGAAGATTGGAGTTGTAGATTCGCAATG
GATCATTCATAAAGTGATACCTTCGCTTGGGAGTCAAGGTAAGTCAGAGAATGGGAAAGC
TCCTTGGCAAGGAGTGAGAGAGAGATGCAAAAAGGAATGGGTAATGTTTCAGAACCGATT
AGCAGAAGCTGAAAAGGAGTATCTTGGGAGGATGGTGGTGAAAGAATAATATACATTTGT
TTTCTTGTTTATAGTTAATTCTAAAAACATTTTTTGTATATCAAACATTTTACCTTATAT
AGGTTATGATGATATGGCGTGTGAAACCC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL6598Contig1 984 2 10 U
GCATCATTTGGATTTTCATATTTACTCATTCTTCTTTTTTAATGTTAGGTTAATTATACT
ATTACAGTTTATAAAAAGTATTACATAAAATGATTTTACACATGATAATTCTATTTATCC
TATTAAAATTCACGTCTTACTGTATCATCGATCTCAAGCTATTCCATAAAATCTACGTCC
GATAGTATTTCTTACACCATGCTGAAATCTTTTATAATCATTTTCTCCATAATATGTGTA
ATTTGCATTTTTTTGATTTGAACCCCTAAATTTTCCATAATTTGGCAAAACATTTGGGAA
CAAATGTTTGTTTTTAAAAAAGATGTCTCTTTCTGGATGAGAAGTTATCACGGCGATGCA
ACACAATGAAGATTCAAATGGTGGGAAGATAATGTCTGGGGGATTCGACCGAGGCCAAAA
AGACTCTTGGCAATTTAAAATGGCCACAATTTTCATTCGTCAAACACCAACCCCACATTG
CTCTCGACAATGCATAGTAGGGGTTGTCTAGGAATCATCCAAGGGCAGCTATCGACGAGA
TAGATAAAGCAATTGGAAGTATTAACTGTTCTGTCATGGATAATTTTCCTAATATTTCCT
TCACAATTGAGGGAAAGCTTTTTCCACTCACTCCAAAAGAGACAGTAGAACAATATGCTG
GAATCGTTTTGATGTGGCTCCACGCTGGTCAGAGATGCTCTAATTAGTACATAATTCATA
ATCAAGAAGTTGTTCATCGCCGGAATCTCATGAACAATTCTGGATGGAGAGATTGTGTAA
AAAGGCTCTGATGTTTTTTTTCTTCATTGATATGTTCATTTTATTATGTTTATGTTTTAT
TGTTACGTAAATTATGTATATGTTACACCCAAAAAAATGATGTGCATGTGTGCCGTTTGT
GGGTTATAAGAGTGGACGGGGTGATACTTTTTCCTTTTGTAATTCTCACGAGCCACCAAC
CTCTTCCATTTTGATTTTGGTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY42TF U 1
AF RR2EY42JQ C 284
BS 1 744 RR2EY42TF
BS 745 745 RR2EY42JQ
BS 746 753 RR2EY42TF
BS 754 754 RR2EY42JQ
BS 755 773 RR2EY42TF
BS 774 774 RR2EY42JQ
BS 775 782 RR2EY42TF
BS 783 784 RR2EY42JQ
BS 785 799 RR2EY42TF
BS 800 984 RR2EY42JQ

RD RR2EY42TF 812 0 0
GCATCATTTGGATTTTCATATTTACTCATTCTTCTTTTTTAATGTTAGGTTAATTATACT
ATTACAGTTTATAAAAAGTATTACATAAAATGATTTTACACATGATAATTCTATTTATCC
TATTAAAATTCACGTCTTACTGTATCATCGATCTCAAGCTATTCCATAAAATCTACGTCC
GATAGTATTTCTTACACCATGCTGAAATCTTTTATAATCATTTTCTCCATAATATGTGTA
ATTTGCATTTTTTTGATTTGAACCCCTAAATTTTCCATAATTTGGCAAAACATTTGGGAA
CAAATGTTTGTTTTTAAAAAAGATGTCTCTTTCTGGATGAGAAGTTATCACGGCGATGCA
ACACAATGAAGATTCAAATGGTGGGAAGATAATGTCTGGGGGATTCGACCGAGGCCAAAA
AGACTCTTGGCAATTTAAAATGGCCACAATTTTCATTCGTCAAACACCAACCCCACATTG
CTCTCGACAATGCATAGTAGGGGTTGTCTAGGAATCATCCAAGGGCAGCTATCGACGAGA
TAGATAAAGCAATTGGAAGTATTAACTGTTCTGTCATGGATAATTTTCCTAATATTTCCT
TCACAATTGAGGGAAAGCTTTTTCCACTCACTCCAAAAGAGACAGTAGAACAATATGCTG
GAATCGTTTTGATGTGGCTCCACGCTGGTCAGAGATGCTCTAATTAGTACATAATTCATA
ATCAAGAAGTTGTTCATCGCCGGA*TCTCATGA*CAATTCTGGATGGAGAGAT*GTGTAA
AA**GCTCTGATGTTTTTT
CTTCATGATATGT

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2EY42JQ 701 0 0
GGCAAAACATTTGGGAACAAATGTTTGTTTT*AAAAAAGATGTCTCTTTCTGGATGAGAA
GTTATCACGGCGATGCAACACAATGAAGATTCAAATGGTGGGAAGATAATGTCTGGGGGA
TTCGACCGAGGCCAAAAAGACTCTTGGCAATTTAAAATGGCCACAATTTTCATTCGTCAA
ACACCAACCCCACATTGCTCTCGACAATGCATAGTAGGGGTTGTCTAGGAATCATCCAAG
GGCAGCTATCGACGAGATAGATAAAGCAATTGGAAGTATTAACTGTTCTGTCATGGATAA
TTTTCCTAATATTTCCTTCACAATTGAGGGAAAGCTTTTTCCACTCACTCCAAAAGAGAC
GGTAGAACAATATGCTGGAATCGTTTTGATGTGGCTCCACGCTGGTCAGAGATGCTCTAA
TTAGTACATAATTCATAATCAAGAAGTTGTTCATCGCCGGAATCTCATGAACAATTCTGG
ATGGAGAGATTGTGTAAAAAGGCTCTGATGTTTTTTTTCTTCATTGATATGTTCATTTTA
TTATGTTTATGTTTTATTGTTACGTAAATTATGTATATGTTACACCCAAAAAAATGATGT
GCATGTGTGCCGTTTGTGGGTTATAAGAGTGGACGGGGTGATACTTTTTCCTTTTGTAAT
TCTCACGAGCCACCAACCTCTTCCATTTTGATTTTGGTGAT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL6599Contig1 636 2 2 U
GGGTCGAGGAGCAGAGTAACCCTAGCAGCAGACACACACCCAGCTTCTCAGCTCACGAGA
AAGAAGAAGAAGATGACTTTCAAGCGTAGGAACGGAGGGAGGAACAAGCACAACCGTGGC
CACGTGAACCCAATCAGATGCTCCAACTGCGGCAAATGTTGCCCAAAGGACAAGGCCATC
AAGAGGTTCATCGTGAGGAACATTGTGGAGCAGGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCT
AGCGTCTACGATGGGTACACATTGCCGAAGCTGTATGCTAAGACGCAATACTGTGTCTCA
TGTGCGATCCACTCTCACGTTGTTAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGTAGAGTTCGTACT
CCCCCGCCTCGTTTTGTTAGACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGACAACCTGGTCAG
GCTCCTCGTCCTGCTGGAGCTGGAGCTGCTGCACCTCGTGCCTGAAGCCTCTGCTTATCC
TAGTTTCATCCTTTTGTTTTGTTTTATGTTTGGTTGAGATTATTCATACTAGTACTATGA
GAATCTCGAAAGCTGTTTAGTAGTTCTTGTTTCGACTATGTTATATTTTGAAAGTCTTTG
TGCCTAAGTGGAGAACAACATATATGATTGGAGACT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AY16JQ C 1
AF RR2AY16TFB U 1
BS 1 4 RR2AY16JQ
BS 5 636 RR2AY16TFB

RD RR2AY16JQ 636 0 0
GGGTCGAGGAGCAGAGTAACCCTAGCAGCAGACACACACCCAGCTTCTCAGCTCACGAGA
AAGAAGAAGAAGATGACTTTCAAGCGTAGGAACGGAGGGAGGAACAAGCACAACCGTGGC
CACGTGAACCCAATCAGATGCTCCAACTGCGGCAAATGTTGCCCAAAGGACAAGGCCATC
AAGAGGTTCATCGTGAGGAACATTGTGGAGCAGGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCT
AGCGTCTACGATGGGTACACATTGCCGAAGCTGTATGCTAAGACGCAATACTGTGTCTCA
TGTGCGATCCACTCTCACGTTGTTAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGTAGAGTTCGTACT
CCCCCGCCTCGTTTTGTTAGACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGACAACCTGGTCAG
GCTCCTCGTCCTGCTGGAGCTGGAGCTGCTGCACCTCGTGCCTGAAGCCTCTGCTTATCC
TAGTTTCATCCTTTTGTTTTGTTTTATGTTTGGTTGAGATTATTCATACTAGTACTATGA
GAATCTCGAAAGCTGTTTAGTAGTTCTTGTTTCGACTATGTTATATTTTGAAAGTCTTTG
TGCCTAAGTGGAGAACAACATATATGATTGGAGACT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2AY16TFB 636 0 0
GGGG
CGAGGAGCAGAGTAACCCTAGCAGCAGACACACACCCAGCTTCTCAGCTCACGAGAAAGA
AGAAGAAGATGACTTTCAAGCGTAGGAACGGAGGGAGGAACAAGCACAACCGTGGCCACG
TGAACCCAATCAGATGCTCCAACTGCGGCAAATGTTGCCCAAAGGACAAGGCCATCAAGA
GGTTCATCGTGAGGAACATTGTGGAGCAGGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCTAGCG
TCTACGATGGGTACACATTGCCGAAGCTGTATGCTAAGACGCAATACTGTGTCTCATGTG
CGATCCACTCTCACGTTGTTAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGTAGAGTTCGTACTCCCC
CGCCTCGTTTTGTTAGACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGACAACCTGGTCAGGCTC
CTCGTCCTGCTGGAGCTGGAGCTGCTGCACCTCGTGCCTGAAGCCTCTGCTTATCCTAGT
TTCATCCTTTTGTTTTGTTTTATGTTTGGTTGAGATTATTCATACTAGTACTATGAGAAT
CTCGAAAGCTGTTTAGTAGTTCTTGTTTCGACTATGTTATATTTTGAAAGTCTTTGTGCC
TAAGTGGAGAACAACATATATGATTGGAGACT

QA 5 636 5 636
DS 



AS 1 2

CO CL6600Contig1 612 2 2 U
GGAAACCAAACCATCTCCGCAGCATTCCACATCAAGAAGAAGAAGAAGAAAGATGCACGA
TTTCTGCTTCACTATCCCGTACGGGATGCTCCTGATGGTCGGGGGATCTATGGGTTATTT
CAAGAAAGGAAGCATCGCGTCTCTGGCTGGAGGCGCAGGCACTGGATTCCTCGTCCTCCT
CGCTGGTTTTATCACCCTTAAGGCTTTCGAGAAGAAGAAGAAGTCTCCTGTTTTCGCTGT
CGTTCTGCAGACAGTGATTTCAGCTGGTCTCACATTCGTCATGGGACAACGGTACTTGAA
AACTCAGAAGATCATGCCGGCTGGTTTGGTTTCTGGGATCAGTGGTCTCATGACATGTTT
CTACCTGTACAAGATTGCAACTGGCGGCAACCACATACCAATAACAACGAAAGCTGAATG
ATTGTTATGCACTCTGGTTTTAGATATGGTATCCTCCACTTGTTGAGATTAAGTATATGA
ATTTTTCGATTTAATACACTATGTATGGTGTAGACAATGCTCTTGTGCTTACACAGCGGT
AAAGGTTTGTTTATCTTGGTCTTTAGGTGAACATGTTTTGTTTTATGCATCAGAGATTAT
AGTTTCCAATGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2B706JQ C 1
AF RR2B706TF U 1
BS 1 611 RR2B706TF
BS 612 612 RR2B706JQ

RD RR2B706JQ 612 0 0
GGAAACCAAACCATCTCCGCAGCATTCCACATCAAGAAGAAGAAGAAGAAAGATGCACGA
TTTTTGCTTCACTATCCCGTACGGGATGCTCCTGATGGTCGGGGGATTTATGGGTTATTT
CAAGAAAGGAAGCATCGCGTTTCTGGCTGGAGGCGCAGGCACTGGATTCCTCGTCCTCCT
CGCTGGTTTTATCACCCTTAAGGCTTTCGAGAAGAAGAAGAAGTTTCCTGTTTTCGCTGT
CGTTTTGCAGACAGTGATTTCAGCTGGTTTCACATTCGTCATGGGACAACGGTACTTGAA
AACTCAGAAGATCATGCCGGCTGGTTTGGTTTTTGGGATCAGTGGTTTCATGACATGTTT
TTACCTGTACAAGATTGCAACTGGCGGCAACCACATACCAATAACAACGAAAGCTGAATG
ATTGTTATGCACTCTGGTTTTAGATATGGTATCCTCCACTTGTTGAGATTAAGTATATGA
ATTTTTCGATTTAATACACTATGTATGGTGTAGACAATGCTTTTGTGCTTACACAGCGGT
AAAGGTTTGTTTATTTTGGTCTTTAGGTGAACATGTTTTGTTTTATGCATCAGAGATTAT
AGTTTCCAATGT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2B706TF 611 0 0
GGAAACCAAACCATCTCCGCAGCATTCCACATCAAGAAGAAGAAGAAGAAAGATGCACGA
TTTCTGCTTCACTATCCCGTACGGGATGCTCCTGATGGTCGGGGGATCTATGGGTTATTT
CAAGAAAGGAAGCATCGCGTCTCTGGCTGGAGGCGCAGGCACTGGATTCCTCGTCCTCCT
CGCTGGTTTTATCACCCTTAAGGCTTTCGAGAAGAAGAAGAAGTCTCCTGTTTTCGCTGT
CGTTCTGCAGACAGTGATTTCAGCTGGTCTCACATTCGTCATGGGACAACGGTACTTGAA
AACTCAGAAGATCATGCCGGCTGGTTTGGTTTCTGGGATCAGTGGTCTCATGACATGTTT
CTACCTGTACAAGATTGCAACTGGCGGCAACCACATACCAATAACAACGAAAGCTGAATG
ATTGTTATGCACTCTGGTTTTAGATATGGTATCCTCCACTTGTTGAGATTAAGTATATGA
ATTTTTCGATTTAATACACTATGTATGGTGTAGACAATGCTCTTGTGCTTACACAGCGGT
AAAGGTTTGTTTATCTTGGTCTTTAGGTGAACATGTTTTGTTTTATGCATCAGAGATTAT
AGTTTCCAATG

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL6601Contig1 746 2 1 U
AGGTCACCAGCTCCTTCTTCACTATTACTTTTGAATACATCATTGGTGTTTTGAGAGATT
GCTTGCGATGGCTTCTAAAGCTTTGCTTCTCTTAAGTCTCATTGTTGTTATCCTCATTGT
CTCTGAGGTGGCGGCCAGGGACCTAGCTGATAGCTCGGCAGAAAATAAGAACGATGAGAG
AGAAGAAGGAAAGCAAACTGACCAGTATGGAGGAAGGTACGGAGGATACCCTGGTGGTGG
GTATGGAGGAAACCGTGGGGGTGGATACGGCGGAAACCGCGGTGGTGGATATGGTGGTAG
TAGGGGCGGATACGGAGGACGTGGAAGAGGATACTGTCGCTATGGTTGTTGCTACAGAGG
CTACTACGGTGGCTGCTCTAGGTGCTGTGCTTATGCTGGTGAGGCTGTTCAAACTCAGCC
AGAGAGTACTGATCCAGCTCACTAGAAAATCATGCATATTGGATTCCTCATGCTGCAATG
GTTGTGAAGTATAAAAATAATGGTTGTGAAGTATAAGTCCCAAGTCAAATAATAAATTAA
GATATAGTGAAGTACCAGGTTTGAAAAGTTTATTACAATGGAATGTTTGAGGATTTTTTT
TTAATATGTGGTGTTATAATAAGATTACCAAAAAAAGTAGTGTTATAAACTTATAATAAA
TGTTGGTGTGATAAAGTATGTTTGATGTATTGGAATATGAACAATAGTATATTGATATGC
AACGCATCTGAAATGCAGTTATCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CU75TF U 1
AF RR2CU75JQ C 127
BS 1 746 RR2CU75TF

RD RR2CU75TF 746 0 0
AGGTCACCAGCTCCTTCTTCACTATTACTTTTGAATACATCATTGGTGTTTTGAGAGATT
GCTTGCGATGGCTTCTAAAGCTTTGCTTCTCTTAAGTCTCATTGTTGTTATCCTCATTGT
CTCTGAGGTGGCGGCCAGGGACCTAGCTGATAGCTCGGCAGAAAATAAGAACGATGAGAG
AGAAGAAGGAAAGCAAACTGACCAGTATGGAGGAAGGTACGGAGGATACCCTGGTGGTGG
GTATGGAGGAAACCGTGGGGGTGGATACGGCGGAAACCGCGGTGGTGGATATGGTGGTAG
TAGGGGCGGATACGGAGGACGTGGAAGAGGATACTGTCGCTATGGTTGTTGCTACAGAGG
CTACTACGGTGGCTGCTCTAGGTGCTGTGCTTATGCTGGTGAGGCTGTTCAAACTCAGCC
AGAGAGTACTGATCCAGCTCACTAGAAAATCATGCATATTGGATTCCTCATGCTGCAATG
GTTGTGAAGTATAAAAATAATGGTTGTGAAGTATAAGTCCCAAGTCAAATAATAAATTAA
GATATAGTGAAGTACCAGGTTTGAAAAGTTTATTACAATGGAATGTTTGAGGATTTTTTT
TTAATATGTGGTGTTATAATAAGATTACCAAAAAAAGTAGTGTTATAAACTTATAATAAA
TGTTGGTGTGATAAAGTATGTTTGATGTATTGGAATATGAACAATAGTATATTGATATGC
AACGCATCTGAAATGCAGTTATCATG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2CU75JQ 620 0 0
GGTGGCGGCCAGGGACCTAGCTGATAGCTCGGCAGAAAATAAGAACGATGAGAGAGAAGA
AGGAAAGCAAACTGACCAGTATGGAGGAAGGTACGGAGGATACCCTGGTGGTGGGTATGG
AGGAAACCGTGGGGGTGGATACGGCGGAAACCGCGGTGGTGGATATGGTGGTAGTAGGGG
CGGATACGGAGGACGTGGAAGAGGATACTGTCGCTATGGTTGTTGCTACAGAGGCTACTA
CGGTGGCTGCTCTAGGTGCTGTGCTTATGCTGGTGAGGCTGTTCAAACTCAGCCAGAGAG
TACTGATCCAGCTCACTAGAAAATCATGCATATTGGATTCCTCATGCTGCAATGGTTGTG
AAGTATAAAAATAATGGTTGTGAAGTATAAGTCCCAAGTCAAATAATAAATTAAGATATA
GTGAAGTACCAGGTTTGAAAAGTTTATTACAATGGAATGTTTGAGGATTTTTTTTTAATA
TGTGGTGTTATAATAAGATTACCAAAAAAAGTAGTGTTATAAACTTATAATAAATGTTGG
TGTGATAAAGTATGTTTGATGTATTGGAATATGAACAATAGTATATTGATATGCAACGCA
TCTGAAATGCAGTTATCATG

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL6602Contig1 980 2 6 U
GGGACAAACCCTAAACTGTCAAAATTCATTCCTTTTGCTTTCCTCTCTTCTTTCTTTCGA
TGGCAATTCGATAGCAGGAGAAGAGTAAAGAAACGAAATCGATAACCCAAAGAAGAATGA
GTTTCTAGAAATCGGGATTCGCCGTGGCTTAGCTCGGGATCCGTAGTGGCTGAGCTCAGG
GTATTGCGTTGGAGTTTTAGAGAGTGGATGAGCTCGGGATTCAGCGGCCAGTGAAGTAAT
GTCGCTTTGATAGGTCTGATTAACAAAACACAAAGGGCTTGCCATGTCCTCGGAAATCAC
GAGGTGAAGGAATGTCGCTTTGGGAAGCTCTCCCAACCGTAGCTGTCGTTGGTGCCCAGG
TTCGATCTCTCTCCGTAAACAAAAATACACTCTTCAGCTATTTCCAATGGAACGTGCCCC
ACCATCACCCATTACATGGCCAAGTGGAGGGACTCTCACCAATGAGTGGGTACATGGCTT
ATGTCCTTCTCAGTTACATTCAGCGATGCATGTCGACGTCTTCGACTCCCTCATCCTCAC
CGCTTCCAAAATCCTTCACAAAGATCGCAATATTGTCCATGTTGATCTTGACTGTGATTC
CAAAGTTTTTGTGGTTGGTGAGATTCATGGTTTCGAGTTCTTAATCATGGAGGGTCTCGA
GTTCTAGGAAGACCTTCGCACTTTGCTGCTCTTTCACCTGAATTGGAAATCTCGTTCCCA
AGATTCTGTCCACAAAAAGAGCATCCACGAATTGGAGGATAACACTGTCTTGGCTAATGA
GACTTAATAGAAGCTGTAAATCCATCAAGAGAAGCCGTAAGTTACCAAGAGCTCATTCAT
AAATAATTGTTTGACATGTTTAAAGTTATTAACTTGTTGGTCTGTTTAGCTTTTTTTTCA
TCACCCAACCTTTGTTTTTCTCAATGGACATGTACGTCGATTTTTTTGGTTTGAATTTAT
TAACTTGTTCAGAATTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C142TF U 1
AF RR2C142JQ C 190
BS 1 641 RR2C142TF
BS 642 642 RR2C142JQ
BS 643 667 RR2C142TF
BS 668 668 RR2C142JQ
BS 669 707 RR2C142TF
BS 708 980 RR2C142JQ

RD RR2C142TF 707 0 0
GGGACAAACCCTAAACTGTCAAAATTCATTCCTTTTGCTTTCCTCTCTTCTTTCTTTCGA
TGGCAATTCGATAGCAGGAGAAGAGTAAAGAAACGAAATCGATAACCCAAAGAAGAATGA
GTTTCTAGAAATCGGGATTCGCCGTGGCTTAGCTCGGGATCCGTAGTGGCTGAGCTCAGG
GTATTGCGTTGGAGTTTTAGAGAGTGGATGAGCTCGGGATTCAGCGGCCAGTGAAGTAAT
GTCGCTTTGATAGGTCTGATTAACAAAACACAAAGGGCTTGCCATGTCCTCGGAAATCAC
GAGGTGAAGGAATGTCGCTTTGGGAAGCTCTCCCAACCGTAGCTGTCGTTGGTGCCCAGG
TTCGATCTCTCTCCGTAAACAAAAATACACTCTTCAGCTATTTCCAATGGAACGTGCCCC
ACCATCACCCATTACATGGCCAAGTGGAGGGACTCTCACCAATGAGTGGGTACATGGCTT
ATGTCCTTCTCAGTTACATTCAGCGATGCATGTCGACGTCTTCGACTCCCTCATCCTCAC
CGCTTCCAAAATCCTTCACAAAGATCGCAATATTGTCCATGTTGATCTTGACTGTGATTC
CAAAGTTTTTGTGGTTGGTGAGATTCATGGTTTCGAGTTCT*AATCATGGAGGGTCTCGA
GTTCTAG*AAGACCTTCGCACTTTGCTGCTCTTTCACCTGAATTGGA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2C142JQ 791 0 0
TTGGAG
TTTAGAGAGTGGATGAGCTCGGGATTCAGCGGCCAGTGAAGTAATGTCGCTTTGATAGGT
CTGATTAACAAAACACAAAGGGCTTGCCATGTCCTCGGAAATCACGAGGTGAAGGAATGT
CGCTTTGGGAAGCTCTCCCAACCGTAGCTGTCGTTGGTGCCCAGGTTCGATCTCTCTCCG
TAAACAAAAATACACTCTTCAGCTATTTCCAATGGAACGTGCCCCACCATCACCCATTAC
ATGGCCAAGTGGAGGGACTCTCACCAATGAGTGGGTACATGGCTTATGTCCTTCTCAGTT
ACATTCAGCGATGCATGTCGACGTCTTCGACTCCCTCATCCTCACCGCTTCCAAAATCCT
TCACAAAGATCGCAATATTGTCCATGTTGATCTTGACTGTGATTCCAAAGTTTTTGTGGT
TGGTGAGATTCATGGTTTCGAGTTCTTAATCATGGAGGGTCTCGAGTTCTAGGAAGACCT
TCGCACTTTGCTGCTCTTTCACCTGAATTGGAAATCTCGTTCCCAAGATTCTGTCCACAA
AAAGAGCATCCACGAATTGGAGGATAACACTGTCTTGGCTAATGAGACTTAATAGAAGCT
GTAAATCCATCAAGAGAAGCCGTAAGTTACCAAGAGCTCATTCATAAATAATTGTTTGAC
ATGTTTAAAGTTATTAACTTGTTGGTCTGTTTAGCTTTTTTTTCATCACCCAACCTTTGT
TTTTCTCAATGGACATGTACGTCGATTTTTTTGGTTTGAATTTATTAACTTGTTCAGAAT
TTATC

QA 7 791 7 791
DS 



AS 1 2

CO CL6603Contig1 955 2 4 U
GGGCACAAAACTCGCAAACGTATAGAGAAGAAGAGAGACGAAAACCAAAACAGAACGAAG
GTAAAAAAAACAGTTGAAGCTTCCCATTCTCGATCCTCCTTCCGGCTTTGCTTTAAAACG
GTTGATCAGAAGCTAGGTAGGGTCTGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAATGGCGAATCGAAT
AGACAACGAGTACGACTACTTGTTCAAGATCGTCCTCATCGGCGACTCCGGCGTCGGCAA
ATCCAACATCCTCTCCCGATTCACCAGAAACGAGTTCTGCCTCGAATCCAAATCCACCAT
CGGCGTCGAATTCGCCACCCGAACTCTACAGGTAGAAGGCAAAACGGTTAAGGCTCAGAT
CTGGGACACAGCAGGACAAGAGCGTTACCGAGCCATCACGAGCGCATACTACAGAGGAGC
CGTCGGAGCTCTCCTCGTCTACGACATCACCAAGAGACAAACCTTCGAGAACTCTCTCAG
GTGGTTACGCGAGCTCAGGGACCACGCCGATTCCAACATTGTGATCATGATGGCGGGGAA
CAAATCCGATCTGAACCACCTGAGATCCGTTGCTGACGAGGACGGTAGGTCACTCGCTGA
GAAGGAAGGTCTGTCGTTTCTCGAGACGTCTGCTTTGGAAGCGAGTAATATTGAGAAAGC
GTTTCAGACGATTTTGTCTGAGATTTATCATATTATAAGTAAGAAAGCGTTGGCGGCGCA
GGAAGCTGCGGGTGGTCTTCCGGTTCCGGGGCAAGGGACTGCTATTAACATATCGGATTC
GTCTGGGACTAACAGGAAAGGATGTTGTTCTTCTACCTAATGATGATGACTAATCAAAAT
CACACGTTTGGTTTCATGACTTTTTGATCTTTTTGGTTTTTTTATTTATGTTAAAGAAAG
AAGTTCATTTAGCTAATTAGTTGTATTGAAACTGTGATCAATTCATTCACACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC88TF U 1
AF RR2CC88JQ C 479
BS 1 638 RR2CC88TF
BS 639 639 RR2CC88JQ
BS 640 656 RR2CC88TF
BS 657 955 RR2CC88JQ

RD RR2CC88TF 656 0 0
GGGCACAAAACTCGCAAACGTATAGAGAAGAAGAGAGACGAAAACCAAAACAGAACGAAG
GTAAAAAAAACAGTTGAAGCTTCCCATTCTCGATCCTCCTTCCGGCTTTGCTTTAAAACG
GTTGATCAGAAGCTAGGTAGGGTCTGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAATGGCGAATCGAAT
AGACAACGAGTACGACTACTTGTTCAAGATCGTCCTCATCGGCGACTCCGGCGTCGGCAA
ATCCAACATCCTCTCCCGATTCACCAGAAACGAGTTCTGCCTCGAATCCAAATCCACCAT
CGGCGTCGAATTCGCCACCCGAACTCTACAGGTAGAAGGCAAAACGGTTAAGGCTCAGAT
CTGGGACACAGCAGGACAAGAGCGTTACCGAGCCATCACGAGCGCATACTACAGAGGAGC
CGTCGGAGCTCTCCTCGTCTACGACATCACCAAGAGACAAACCTTCGAGAACTCTCTCAG
GTGGTTACGCGAGCTCAGGGACCACGCCGATTCCAACATTGTGATCATGATGGCGGGGAA
CAAATCCGATCTGAACCACCTGAGATCCGTTGCTGACGAGGACGGTAGGTCACTCGCTGA
GAAGGAAGGTCTGTCGTTTCTCGAGACGTCTGCTTTGGGAGCGAGTAATATTGAGA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2CC88JQ 477 0 0
AGGTGGTTACGCGAGCTCAGGGACCACGCCGATTCCAACATTGTGATCATGATGGCGGGG
AACAAATCCGATCTGAACCACCTGAGATCCGTTGCTGACGAGGACGGTAGGTCACTCGCT
GAGAAGGAAGGTCTGTCGTTTCTCGAGACGTCTGCTTTGGAAGCGAGTAATATTGAGAAA
GCGTTTCAGACGATTTTGTCTGAGATTTATCATATTATAAGTAAGAAAGCGTTGGCGGCG
CAGGAAGCTGCGGGTGGTCTTCCGGTTCCGGGGCAAGGGACTGCTATTAACATATCGGAT
TCGTCTGGGACTAACAGGAAAGGATGTTGTTCTTCTACCTAATGATGATGACTAATCAAA
ATCACACGTTTGGTTTCATGACTTTTTGATCTTTTTGGTTTTTTTATTTATGTTAAAGAA
AGAAGTTCATTTAGCTAATTAGTTGTATTGAAACTGTGATCAATTCATTCACACACC

QA 1 477 1 477
DS 



AS 1 2

CO CL6604Contig1 1003 2 2 U
GGATCGCCTCTCGATAAACCTAGCGCAGCAGTCTGCCATGAAAGGTCTGGAATTGAACGA
CGGTAGTGATGCAGAGATTCGAAAAAGCAGCATTAGGAGAATTTCCGTTGAAGGATATGA
CACCTCGCTTCGTATAGAGGATGTCGATGAGGCTTTGAGAAAACATTTTGCTTCATGTGG
AAAAATAATTCATGTTTATATTCCCGGAAACAATGAATGGACGATTCTCTGCAAATACGC
CTTCGTTTATTTTAATGAAGAAGATGAAGAAAAGGCGTTGAGGCTTGATGGACGTGACAT
GGGAGGACAGATTTTACAAATTAAGTCTTACCCGTTTCACGAAACTTACCTTAATGATGT
CGTGGACCCGATGAAAGATGATAATTTCATTATGTACCAATTCAAGGTCGAGGTTGCGGG
TTATGACAATTCCCTTCCTCTCGATGTTGTCGAGAAGGAGATAAAAGAATATTTCTCTGT
AAATCGTCCTTTTGCTCACCACCACAAAACCTCTTCTGCTGCTACCGAAATCAAATCTTA
CATTAATCTCACAGGACAAGAGGCTGTAGACAAGGCTCTGGAACGTAGTGGACGTTCTGT
GGGAGGCTTGAGTCTTGTAGTTACTAAGGTTTTTCCAATTCAATATAACCCACCGCCGAC
TGGCTACATTCCCCCACGTATCTACGACACCTTCACTCAGGAGCAGGAAGACGATCCTAA
TCTATATTACACTATTATTGAGAGACAGCAGAAGAAGAGTGAGCAGAAGAAGAGTGAGAC
GAAGAAGAAGAAGAAGACTAAGACCAGGGTGGGAAATCAGAAGAAGAGGAGTGAGACCAC
GGAGGGAAATCAGAAGAAGAAGAGCAAGACCAAGGAGGGAAATCAGAAAAAAAAGGGAGT
AGAAATCTGATTCTGAGGACAAGACATGTGGTTTTTGTGATATAACTTGTGTGCAATGCG
ACCCTTCTTTTCTTGTCTGGATACTTGAATGTTTTATGCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ08TF U 1
AF RR2EQ08JQ C 244
BS 1 696 RR2EQ08TF
BS 697 1003 RR2EQ08JQ

RD RR2EQ08TF 696 0 0
GGATCGCCTCTCGATAAACCTAGCGCAGCAGTCTGCCATGAAAGGTCTGGAATTGAACGA
CGGTAGTGATGCAGAGATTCGAAAAAGCAGCATTAGGAGAATTTCCGTTGAAGGATATGA
CACCTCGCTTCGTATAGAGGATGTCGATGAGGCTTTGAGAAAACATTTTGCTTCATGTGG
AAAAATAATTCATGTTTATATTCCCGGAAACAATGAATGGACGATTCTCTGCAAATACGC
CTTCGTTTATTTTAATGAAGAAGATGAAGAAAAGGCGTTGAGGCTTGATGGACGTGACAT
GGGAGGACAGATTTTACAAATTAAGTCTTACCCGTTTCACGAAACTTACCTTAATGATGT
CGTGGACCCGATGAAAGATGATAATTTCATTATGTACCAATTCAAGGTCGAGGTTGCGGG
TTATGACAATTCCCTTCCTCTCGATGTTGTCGAGAAGGAGATAAAAGAATATTTCTCTGT
AAATCGTCCTTTTGCTCACCACCACAAAACCTCTTCTGCTGCTACCGAAATCAAATCTTA
CATTAATCTCACAGGACAAGAGGCTGTAGACAAGGCTCTGGAACGTAGTGGACGTTCTGT
GGGAGGCTTGAGTCTTGTAGTTACTAAGGTTTTTCCAATTCAATATAACCCACCGCCGAC
TGGCTACATTCCCCCACGTATCTACGACACCTTCAC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2EQ08JQ 760 0 0
CGTTTATTTTAATGAAGAAGATGAAGAAAAGGCGTTGAGGCTTGATGGACGTGACATGGG
AGGACAGATTTTACAAATTAAGTCTTACCCGTTTCACGAAACTTACCTTAATGATGTCGT
GGACCCGATGAAAGATGATAATTTCATTATGTACCAATTCAAGGTCGAGGTTGCGGGTTA
TGACAATTCCCTTCCTCTCGATGTTGTCGAGAAGGAGATAAAAGAATATTTCTCTGTAAA
TCGTCCTTTTGCTCACCACCACAAAACCTCTTCTGCTGCTACCGAAATCAAATCTTACAT
TAATCTCACAGGACAAGAGGCTGTAGACAAGGCTCTGGAACGTAGTGGACGTTCTGTGGG
AGGCTTGAGTCTTGTAGTTACTAAGGTTTTTCCAATTCAATATAACCCACCGCCGACTGG
CTACATTCCCCCACGTATTTACGACACCTTCACTCAGGAGCAGGAAGACGATCCTAATCT
ATATTACACTATTATTGAGAGACAGCAGAAGAAGAGTGAGCAGAAGAAGAGTGAGACGAA
GAAGAAGAAGAAGACTAAGACCAGGGTGGGAAATCAGAAGAAGAGGAGTGAGACCACGGA
GGGAAATCAGAAGAAGAAGAGCAAGACCAAGGAGGGAAATCAGAAAAAAAAGGGAGTAGA
AATCTGATTCTGAGGACAAGACATGTGGTTTTTGTGATATAACTTGTGTGCAATGCGACC
CTTCTTTTCTTGTCTGGATACTTGAATGTTTTATGCTTGC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL6605Contig1 1132 2 4 U
GGGCTTTTGGTTGATTTGTTAAGACAAGCAAAGTCCAACTCCAACCTTGGTAGACGAGAA
AGTACTTTGAACAAAAGATTGACTCGTTCATTTTATTTTTTTCTTTCAGCTTTGAAAACA
CGCTTCCCTCAACAATCCCCAGATTCTCGGAATGATGAGCGGAGGAGCCTTGTTCAGAAA
CGTCGCCGCCCAGCTGATAAGGCGGAACGGTGCGGCATCGGATCCGTTTGGCAAAACCGG
AACAAGATTGCAATCGAGGCGGCCTTATTTTCCCGGGAGAGCAAAAGAAACAAGAAACCA
TCAAACCGGACTCTCACCTCCTCCTCCTCCTGCTCCTTCCTCGTCTGTTGGTATCGTGGG
ATGGTATCTTAGTATGGTGAAATCACGCCCCGTTCTCACCAAAGGAATCACTTCTTGCCT
TATCTACATCGCCGCCGATTTGTCCTCTCAGACCATTACGAAGGATAAAACTTCTTCAGA
ATCGTACGACCTGGTGAGAACAGCAAGGATGGGAGCATACGGTCTACTTATCTTGGGTCC
TGTACAGCACCAATGGTTCGGTCTCATGTCAAGACTCTTCCCTAAACAAGATATCATCAC
AACGCTTAAAAAAATGGCCATGGGACAGACTGTCTACGGTCCTACAATTATGGTGATTTT
CTTATCATTCAACGCGTTACTTCAGGGTGAAGGCGGTTCTGATATAGTTGCCCGATTGAA
AAGGGACCTTCTTCCCGTGATGTTAAACTGTGTCATGTATTGGCCTGTTTGTGATTTTAT
CACATTCAAGTTCTTCCCTGTTCATTTACAGCCTCTTGTAAGCAACTCGTTTTCATACGT
GTGGTCCATCTACATGACTTACATGGGAAATCGTGAAAAACCTGCGGCTATTTCAAGCTG
AAACACTCCGCTCATTGCCTGTGATTGAAGGTAGTGTATACAGAACACATACATGGCCTA
TTCTGTATTGTACTATTATTTTTGTTCCGCTCAGCACGGGGCAAACATTCTTAGTGTAAA
GTCAACTTGGCTTTGTCCACAGTCATTATTTGAACCCAATAATGTACTTTGCATTCTACA
AAGAGTGTAAAGAAGAATAGTTTGTATGATCTTAGATGAATACTACCAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV22TF U 1
AF RR2DV22JQ C 444
BS 1 638 RR2DV22TF
BS 639 639 RR2DV22JQ
BS 640 686 RR2DV22TF
BS 687 1132 RR2DV22JQ

RD RR2DV22TF 686 0 0
GGGCTTTTGGTTGATTTGTTAAGACAAGCAAAGTCCAACTCCAACCTTGGTAGACGAGAA
AGTACTTTGAACAAAAGATTGACTCGTTCATTTTATTTTTTTCTTTCAGCTTTGAAAACA
CGCTTCCCTCAACAATCCCCAGATTCTCGGAATGATGAGCGGAGGAGCCTTGTTCAGAAA
CGTCGCCGCCCAGCTGATAAGGCGGAACGGTGCGGCATCGGATCCGTTTGGCAAAACCGG
AACAAGATTGCAATCGAGGCGGCCTTATTTTCCCGGGAGAGCAAAAGAAACAAGAAACCA
TCAAACCGGACTCTCACCTCCTCCTCCTCCTGCTCCTTCCTCGTCTGTTGGTATCGTGGG
ATGGTATCTTAGTATGGTGAAATCACGCCCCGTTCTCACCAAAGGAATCACTTCTTGCCT
TATCTACATCGCCGCCGATTTGTCCTCTCAGACCATTACGAAGGATAAAACTTCTTCAGA
ATCGTACGACCTGGTGAGAACAGCAAGGATGGGAGCATACGGTCTACTTATCTTGGGTCC
TGTACAGCACCAATGGTTCGGTCTCATGTCAAGACTCTTCCCTAAACAAGATATCATCAC
AACGCTTAAAAAAATGGCCATGGGACAGACTGTCTACG*TCCTACAATTATGGTGATTTT
CTTATCATTCAACGCGTTACTTCAGG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2DV22JQ 689 0 0
CCTCTCAGACCATTACGAAGGATAAAACTTCTTCAGAATCGTACGACCTGGTGAGAACAG
CAAGGATGGGAGCATACGGTCTACTTATCTTGGGTCCTGTACAGCACCAATGGTTCGGTC
TCATGTCAAGACTCTTCCCTAAACAAGATATCATCACAACGCTTAAAAAAATGGCCATGG
GACAGACTGTCTACGGTCCTACAATTATGGTGATTTTCTTATCATTCAACGCGTTACTTC
AGGGTGAAGGCGGTTCTGATATAGTTGCCCGATTGAAAAGGGACCTTCTTCCCGTGATGT
TAAACTGTGTCATGTATTGGCCTGTTTGTGATTTTATCACATTCAAGTTCTTCCCTGTTC
ATTTACAGCCTCTTGTAAGCAACTCGTTTTCATACGTGTGGTCCATCTACATGACTTACA
TGGGAAATCGTGAAAAACCTGCGGCTATTTCAAGCTGAAACACTCCGCTCATTGCCTGTG
ATTGAAGGTAGTGTATACAGAACACATACATGGCCTATTCTGTATTGTACTATTATTTTT
GTTCCGCTCAGCACGGGGCAAACATTCTTAGTGTAAAGTCAACTTGGCTTTGTCCACAGT
CATTATTTGAACCCAATAATGTACTTTGCATTCTACAAAGAGTGTAAAGAAGAATAGTTT
GTATGATCTTAGATGAATACTACCAAACT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6607Contig1 851 2 2 U
GGGGTTGCCTCTGAGGTTGTTCATGGATGCTAAAAATCGCGACGATATGCGCAGGAAAAG
AGCAAACCTCAAGCTTAGAGAATCTGGAGTTGGCAGGAAAAACAAAAGACCACATAGAGA
AGAACATGATCCAAAGAGTTACGCTAAGCTGCCAATAAGACAGGACACGTTTGAGGACAA
GAACATAACAAATGAGGGTTCTCAAGCCACCACAACAACACATGGAAATTACTACAAACT
CTCTGACCTCCCAATGACGACAGGACCAGCCAGTGGTTTTTCGTGGGCTGTGAAAAGACG
AAAAGATCCTGATAATATCTCCACTCTTACTTACTATCAACCAAGCTCAAGGAGCCAATT
GAGCGAAACAAGTGTCGCCTTTGCCAAAAACACTTTCGGTTTGAACCTCAAACCCTAAAA
TGAATCAGTTTATGAGATTCAGGGAGACAACGATGATCAGATTATGGAGGAGTTACCCAG
TGAGGACAAGCTAAACCGTACTGGTAAGCGACACGGATCACTTGATGGCTCTGGTTTGGA
TTTATGCCAAAGAGAGGAGGATTCTCCATTAAAGAAGAACTTAGAGCATCTGCAGTTCGG
AAAACAGAGCATGTCAGGACCATTGTTATTTAAATCAGGCAAGATCGACGAAATTTTGCT
AAGGAACGAAAGTAACATCCGGCAAGCTGTCAGAAAATCCCACTTCAAAATGGAACAAGG
TGACAGATAAACCGGAAACTCAAAATTATCGAGATGGGAAAATTCCACTTTTCATCGTTG
TTAGAAAAGGAGGAAAAAATATGAAATAATGCGGAAAATTTATGAAACCCATTAATAATG
TTTCTGACCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG90TF U 1
AF RR2GG90JQB C 364
BS 1 614 RR2GG90TF
BS 615 851 RR2GG90JQB

RD RR2GG90TF 614 0 0
GGGGTTGCCTCTGAGGTTGTTCATGGATGCTAAAAATCGCGACGATATGCGCAGGAAAAG
AGCAAACCTCAAGCTTAGAGAATCTGGAGTTGGCAGGAAAAACAAAAGACCACATAGAGA
AGAACATGATCCAAAGAGTTACGCTAAGCTGCCAATAAGACAGGACACGTTTGAGGACAA
GAACATAACAAATGAGGGTTCTCAAGCCACCACAACAACACATGGAAATTACTACAAACT
CTCTGACCTCCCAATGACGACAGGACCAGCCAGTGGTTTTTCGTGGGCTGTGAAAAGACG
AAAAGATCCTGATAATATCTCCACTCTTACTTACTATCAACCAAGCTCAAGGAGCCAATT
GAGCGAAACAAGTGTCGCCTTTGCCAAAAACACTTTCGGTTTGAACCTCAAACCCTAAAA
TGAATCAGTTTATGAGATTCAGGGAGACAACGATGATCAGATTATGGAGGAGTTACCCAG
TGAGGACAAGCTAAACCGTACTGGTAAGCGACACGGATCACTTGATGGCTCTGGTTTGGA
TTTATGCCAAAGAGAGGAGGATTCTCCATTAAAGAAGAACTTAGAGCATCTGCAGTTCGG
AAAACAGAGCATGT

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2GG90JQB 488 0 0
CGAAACAAGTGTCGCCTTTGCCAAAAACACTTTCGGTTTGAACCTCAAACCCTAAAATGA
ATCAGTTTATGAGATTCAGGGAGACAACGATGATCAGATTATGGAGGAGTTACCCAGTGA
GGACAAGCTAAACCGTACTGGTAAGCGACACGGATCACTTGATGGCTCTGGTTTGGATTT
ATGCCAAAGAGAGGAGGATTCTCCATTAAAGAAGAACTTAGAGCATCTGCAGTTCGGAAA
ACAGAGCATGTCAGGACCATTGTTATTTAAATCAGGCAAGATCGACGAAATTTTGCTAAG
GAACGAAAGTAACATCCGGCAAGCTGTCAGAAAATCCCACTTCAAAATGGAACAAGGTGA
CAGATAAACCGGAAACTCAAAATTATCGAGATGGGAAAATTCCACTTTTCATCGTTGTTA
GAAAAGGAGGAAAAAATATGAAATAATGCGGAAAATTTATGAAACCCATTAATAATGTTT
CTGACCGC

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 2

CO CL6608Contig1 940 2 2 U
GGCACCGTACATCTTCAACCCATCTGGATTCGAATGGCAAAAGACCGTCGAGGATTTCGA
TAACTGGGTCAGTTGGCTGATGTACAAAGGTGGAGTTGGAGTGAAGGGAGAGCTGAGTTG
GGAGTCGTGGTGGGAGGAAGAACAGATGCATATCCAGACATTAAGAGGACGGATTCTGGA
GACCATTTTGAGCTTGAGGTTCTTCATGTTTCAGTATGGCGTTGTGTACAAGCTCAATCT
CACTGGGAAAAGACACCTCACTTGCGTTATATGGCTATTCGTGGATAGTGTTTGTTGCAG
TTGTGCTCCTGTTTAAGCTATTCTGGTATAGCCCCAGGAAGTTGAGCAACATTCTGCTGG
CTCTGCGTTTCCTGCAGGGAGTGGTTTCACTCACAGTCATCGCCCTCATCGCTTTAGCCA
TTGCATTTACAGAACTCTCCATTCCAGACATTTTTGCATGTGTACTCGGATTCATCCCTA
CAGGTTGGGCATTACTGTCTTTAGCCATCACATGGAAGTGGTTGATCAAGCTGTTTGGTT
TGTGGGAGACAGTCCGTGAGTTTGGACGCATCTATGATGCTGCGATGGGCATGCTCATAT
TTGCTCCCATTGCTCTCCTCTCCTGGTTCCCTTTCATCTCCACGTTCCAGTCTCGCCTCC
TCTTCAACCAAGCCTTCAGTCGTGACTCGAGATCTCCATTATCCTCGCAGGAAACAGAGC
GAATGTTGAGACTTAGAGAGGTTAGTGTGGAAGCAGAAGGAACTTATTTTGGTGAGAATG
TAAATGAGCTCTTGTAGAGTTTGTTAGAACGTCAGTGAAAGCTCCTCGACTTGGATTTTT
ACCTCTTTGGAATCTTATTTTTATGTATTTCTCTAAGCTTGGATACTTTGTGTTATTGAG
TTTTGACTATGCATTGATTGATGATCACTTGATTTTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B735TF U 1
AF RR2B735JQ C 120
BS 1 751 RR2B735TF
BS 752 940 RR2B735JQ

RD RR2B735TF 751 0 0
GGCACCGTACATCTTCAACCCATCTGGATTCGAATGGCAAAAGACCGTCGAGGATTTCGA
TAACTGGGTCAGTTGGCTGATGTACAAAGGTGGAGTTGGAGTGAAGGGAGAGCTGAGTTG
GGAGTCGTGGTGGGAGGAAGAACAGATGCATATCCAGACATTAAGAGGACGGATTCTGGA
GACCATTTTGAGCTTGAGGTTCTTCATGTTTCAGTATGGCGTTGTGTACAAGCTCAATCT
CACTGGGAAAAGACACCTCACTTGCGTTATATGGCTATTCGTGGATAGTGTTTGTTGCAG
TTGTGCTCCTGTTTAAGCTATTCTGGTATAGCCCCAGGAAGTTGAGCAACATTCTGCTGG
CTCTGCGTTTCCTGCAGGGAGTGGTTTCACTCACAGTCATCGCCCTCATCGCTTTAGCCA
TTGCATTTACAGAACTCTCCATTCCAGACATTTTTGCATGTGTACTCGGATTCATCCCTA
CAGGTTGGGCATTACTGTCTTTAGCCATCACATGGAAGTGGTTGATCAAGCTGTTTGGTT
TGTGGGAGACAGTCCGTGAGTTTGGACGCATCTATGATGCTGCGATGGGCATGCTCATAT
TTGCTCCCATTGCTCTCCTCTCCTGGTTCCCTTTCATCTCCACGTTCCAGTCTCGCCTCC
TCTTCAACCAAGCCTTCAGTCGTGACTCGAGATCTCCATTATCCTCGCAGGAAACAGAGC
GAATGTTGAGACTTAGAGAGGTTAGTGTGGA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2B735JQ 821 0 0
GGGAGTCGTGGTGGGAGGAAGAACAGATGCATATCCAGACATTAAGAGGACGGATTCTGG
AGACCATTTTGAGCTTGAGGTTCTTCATGTTTCAGTATGGCGTTGTGTACAAGCTCAATC
TCACTGGGAAAAGACACCTCACTTGCGTTATATGGCTATTCGTGGATAGTGTTTGTTGCA
GTTGTGCTCCTGTTTAAGCTATTCTGGTATAGCCCCAGGAAGTTGAGCAACATTCTGCTG
GCTCTGCGTTTCCTGCAGGGAGTGGTTTCACTCACAGTCATCGCCCTCATCGCTTTAGCC
ATTGCATTTACAGAACTCTCCATTCCAGACATTTTTGCATGTGTACTCGGATTCATCCCT
ACAGGTTGGGCATTACTGTCTTTAGCCATCACATGGAAGTGGTTGATCAAGCTGTTTGGT
TTGTGGGAGACAGTCCGTGAGTTTGGACGCATCTATGATGCTGCGATGGGCATGCTCATA
TTTGCTCCCATTGCTCTCCTCTCCTGGTTCCCTTTCATCTCCACGTTCCAGTCTCGCCTC
CTCTTCAACCAAGCCTTCAGTCGTGACTCGAGATCTCCATTATCCTCGCAGGAAACAGAG
CGAATGTTGAGACTTAGAGAGGTTAGTGTGGAAGCAGAAGGAACTTATTTTGGTGAGAAT
GTAAATGAGCTCTTGTAGAGTTTGTTAGAACGTCAGTGAAAGCTCCTCGACTTGGATTTT
TACCTCTTTGGAATCTTATTTTTATGTATTTCTCTAAGCTTGGATACTTTGTGTTATTGA
GTTTTGACTATGCATTGATTGATGATCACTTGATTTTGTGC

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 2

CO CL6609Contig1 727 2 2 U
GGATCGACCACCATTGCAGCTTTCTTCTCTTCCCTTTCTTCTCCTAAATCCCTAATTCCG
AAGAATCTAAAGCTCGACAGAAAGGTTTCGGAGATGGCATCGAAACGGATTTTGAAAGAG
TTGAAGGATCTCCAGAAGGATCCTCCTACTTCTTGTAGCGCAGGACCTGTAGCTGAAGAC
ATGTTTCATTGGCAAGCTGCGATAATGGGTCCATCCGACAGCCCTTACTCTGGTGGTGTT
TTTCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCTGATTATCCCTTTAAACCTCCTAAGGTGGCTTTT
AGGACGAAGGTGTTCCACCCAAACATTAACAGCAATGGGAGCATCTGTCTCGACATCTTG
AAGGAGCAGTGGAGTCCTGCCCTCACTATCTCCAAGGTGCTGCTATCGATCTGTTCGCTG
TTAACGGATCCAAACCCAGATGATCCCTTGGTTCCGGAGATAGCTCACATGTACAAGACA
GACAAGACCAAGTACGAGTCCACTGCTCGGACCTGGACCCAAAAGTACGCCATGGGCTGA
CGCTGTGTTATTATCTATCTGTCCGTGAGGATGGATTTTAATAATTAAAACTCTTCTTTA
TTTCTATGTAACGAAACTCTGTCCGTCTTATAAAAGTTTGTGAAGGACAGAATCAGTAAG
AAATCATATGATCTCCATTTTCATCACATTTCCTATAAAGCTTAAATCATCTCATTACTT
CTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH11TF U 1
AF RR2GH11JQB C 69
BS 1 659 RR2GH11TF
BS 660 727 RR2GH11JQB

RD RR2GH11TF 659 0 0
GGATCGACCACCATTGCAGCTTTCTTCTCTTCCCTTTCTTCTCCTAAATCCCTAATTCCG
AAGAATCTAAAGCTCGACAGAAAGGTTTCGGAGATGGCATCGAAACGGATTTTGAAAGAG
TTGAAGGATCTCCAGAAGGATCCTCCTACTTCTTGTAGCGCAGGACCTGTAGCTGAAGAC
ATGTTTCATTGGCAAGCTGCGATAATGGGTCCATCCGACAGCCCTTACTCTGGTGGTGTT
TTTCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCTGATTATCCCTTTAAACCTCCTAAGGTGGCTTTT
AGGACGAAGGTGTTCCACCCAAACATTAACAGCAATGGGAGCATCTGTCTCGACATCTTG
AAGGAGCAGTGGAGTCCTGCCCTCACTATCTCCAAGGTGCTGCTATCGATCTGTTCGCTG
TTAACGGATCCAAACCCAGATGATCCCTTGGTTCCGGAGATAGCTCACATGTACAAGACA
GACAAGACCAAGTACGAGTCCACTGCTCGGACCTGGACCCAAAAGTACGCCATGGGCTGA
CGCTGTGTTATTATCTATCTGTCCGTGAGGATGGATTTTAATAATTAAAACTCTTCTTTA
TTTCTATGTAACGAAACTCTGTCCGTCTTATAAAAGTTTGTGAAGGACAGAATCAGTAA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2GH11JQB 659 0 0
AAAGCTCGACAGAAAGGTTTCGGAGATGGCATCGAAACGGATTTTGAAAGAGTTGAAGGA
TCTCCAGAAGGATCCTCCTACTTCTTGTAGCGCAGGACCTGTAGCTGAAGACATGTTTCA
TTGGCAAGCTGCGATAATGGGTCCATCCGACAGCCCTTACTCTGGTGGTGTTTTTCTTGT
TACCATTCATTTCCCTCCTGATTATCCCTTTAAACCTCCTAAGGTGGCTTTTAGGACGAA
GGTGTTCCACCCAAACATTAACAGCAATGGGAGCATCTGTCTCGACATCTTGAAGGAGCA
GTGGAGTCCTGCCCTCACTATCTCCAAGGTGCTGCTATCGATCTGTTCGCTGTTAACGGA
TCCAAACCCAGATGATCCCTTGGTTCCGGAGATAGCTCACATGTACAAGACAGACAAGAC
CAAGTACGAGTCCACTGCTCGGACCTGGACCCAAAAGTACGCCATGGGCTGACGCTGTGT
TATTATCTATCTGTCCGTGAGGATGGATTTTAATAATTAAAACTCTTCTTTATTTCTATG
TAACGAAACTCTGTCCGTCTTATAAAAGTTTGTGAAGGACAGAATCAGTAAGAAATCATA
TGATCTCCATTTTCATCACATTTCCTATAAAGCTTAAATCATCTCATTACTTCTAAACC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL6610Contig1 917 2 6 U
GACCCGACGATTCATCCGCAGTGGCAGCCGGAGTATTTCGGCGACGCGATCATTGTGAAC
GGGAAAGCTTGGCCGAGGCTAACCGTCCGCCGCCGTAAATACCGGTTCAGAATCATAAAC
GCTAGCAACGCTAGATTCTTCCGGTTCTTCTTCTCCAACGGTCTCGATTTCATCGTCATC
GGTTCGGACTCGGCTTACCTAGCTAAACCGGTTTCGACCAAATCGGTTCTCCTCGCTCCA
TCGGAAATAGTCGACGTCGTCGTTGACTTCTCGAAGTCAACGTCGAAGACGGCGACCCTA
GCCAACAACGCACCTTATCCTTACCCATCGGGAGACAATGTGACGGACGAGAACAGCAAA
GTCATGAAGTTCATAATCAAACACAAATCAGAGACTGACACGTCAGTAATACCGAGAAAG
CTGATCCAATACCCGCGTGCTGACGTGTCAAAATCGGTCCGGACGCGTTACATAGCTATG
TTCGAGTACGTGTCGAGCACCGACGAGCCGACGCATCTATACATCAACGGATTGCCTTAT
AACGCTCCCGTGACGGAGACTCCGAAAATCGGCACGAGTGAGGTATGGGAAGTGATTAAT
CTGACGGAGGATAACCATCCGTTACACATTCACTTGGGACTGTTCAAAGTGTTGGAGCAG
ACGGCGTTGGTGGAGACCGAGAAGTTCAAAGACTGCATGACGGAGAAAATCGACGCGGTT
AAGTGCCAGATCAGCAAGTACGCACGTGGGAATAAGACGGCAGTTACGGCACACGAGCGG
GGATGGAAGAACGTGTTCAAGATGATGCCGGGACATGTGACGAAGATCCTCGTCAGTTCT
CTTACGTTCACTCCAACGAGTCTTACTCCTTCGACGCCACTCAAGAGCCAGGCTACGTCT
ACCATTGCCATATATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES04TF U 1
AF RR2BH19TF U 109
BS 1 405 RR2ES04TF
BS 406 406 RR2BH19TF
BS 407 504 RR2ES04TF
BS 505 505 RR2BH19TF
BS 506 579 RR2ES04TF
BS 580 917 RR2BH19TF

RD RR2ES04TF 579 0 0
GACCCGACGATTCATCCGCAGTGGCAGCCGGAGTATTTCGGCGACGCGATCATTGTGAAC
GGGAAAGCTTGGCCGAGGCTAACCGTCCGCCGCCGTAAATACCGGTTCAGAATCATAAAC
GCTAGCAACGCTAGATTCTTCCGGTTCTTCTTCTCCAACGGTCTCGATTTCATCGTCATC
GGTTCGGACTCGGCTTACCTAGCTAAACCGGTTTCGACCAAATCGGTTCTCCTCGCTCCA
TCGGAAATAGTCGACGTCGTCGTTGACTTCTCGAAGTCAACGTCGAAGACGGCGACCCTA
GCCAACAACGCACCTTATCCTTACCCATCGGGAGACAATGTGACGGACGAGAACAGCAAA
GTCATGAAGTTCATAATCAAACACAAATCAGAGACTGACACGTCATTAATACCGAGAAAG
CTGATCCAATACCCGCGTGCTGACGTGTCAAAATCGGTCCGGACGCGTTACATAGCTATG
TTCGAGTACGTGTCGAGCACCGACTAGCCGACGCATCTATACATCAACGGATTGCCTTAT
AACGCTCCCGTGACGGAGACTCCGAAAATCGGCACGAGT

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2BH19TF 809 0 0
G
GAATCATAAACGCTAGCAACGCTAGATTCTTCCGGTTCTTCTTCTCCAACGGTCTCGATT
TCATCGTCATCGGTTCGGACTCGGCTTACCTAGCTAAACCGGTTTCGACCAAATCGGTTC
TCCTCGCTCCATCGGAAATAGTCGATGTCGTCGTTGACTTCTCGAAGTCAACGTCGAAGA
CGGCGACCCTAGCCAACAACGCACCTTATCCTTACCCATCGGGAGACAATGTGACGGACG
AGAACAGCAAAGTCATGAAGTTCATAATCAAACACAAATCAGAGACTGACACGTCAGTAA
TACCGAGAAAGCTGATCCAATACCCGCGTGCTGACGTGTCAAAATCGGTCCGGACGCGTT
ACATAGCTATGTTCGAGTACGTGTCGAGCACCGACGAGCCGACGCATCTATACATCAACG
GTTTGCCTTATAACGCTCCCGTGACGGAGACTCCGAAAATCGGCACGAGTGAGGTATGGG
AAGTGATTAATCTGACGGAGGATAACCATCCGTTACACATTCACTTGGGACTGTTCAAAG
TGTTGGAGCAGACGGCGTTGGTGGAGACCGAGAAGTTCAAAGACTGCATGACGGAGAAAA
TCGACGCGGTTAAGTGCCAGATCAGCAAGTACGCACGTGGGAATAAGACGGCAGTTACGG
CACACGAGCGGGGATGGAAGAACGTGTTCAAGATGATGCCGGGACATGTGACGAAGATCC
TCGTCAGTTCTCTTACGTTCACTCCAACGAGTCTTACTCCTTCGACGCCACTCAAGAGCC
AGGCTACGTCTACCATTGCCATATATTG

QA 2 809 2 809
DS 



AS 1 2

CO CL6611Contig1 914 2 2 U
GGAGAAGTGTTGAATACATCTCTTTGCTTTCATCTCCTTCATCACCAAGCCAAGTCTCCT
CCTCAAGATCTGATCGTACGAGTTCGTTGACTTCGTCTCTAGAGAAATGAGTCAGCAGAA
AGGTTTGATTTACAGCTTCGTAGCCAAAGGAACCGTCGTTCTAGCCGAGCATACTCCTTA
CTCAGGAAACTTCAGCACCATCGCTGTTCAATGTCTCCGAAAGCTTCCCACTAACAGCAG
CAAGTATACTTACTCCTGCGATGGCCACACCTTCAACTTCCTTGTCGAAAACAATGGCTT
TGTGTTTCTTGTGGTTGCTGATGAGTCTACTGGAAGAAGTGTTCCTTTCGTGTTCCTTGA
ACGGGTCAAAGAAGATTTCAAGAAACGGTATGAGGCGAGTATAAAGAACGATGATGATGA
CGAAGACGATGATTTGTTTGGGGATCGGTTTAGCATCGCTTACAATCTTGACAGGGAGTT
CGGGCCTATACTTAAGGAGCATATGCAGTATTGTTGAGCCATCCTGAAGAGATGAGCAAA
CTTTCAAAGTTGAAGGCTCAAATAAATGATGTCAAGGGGATCATGATGGACAACATTGAG
AAGGTTCTGGACAGGGGAGAGAAGATAGAACTTCTGGTTGACAAAACGGAGAACCTTCAG
TTCCAGGCAGATAGCTTCCAGAGGCAAGGAAGGCAACTTAGAAGGAAGATGTGGATACAG
AGCCTGCAGATGAAGCTGATGGTGGGAGGTGCTGTTTTGTCCTTTATTCTCATCGTTTGG
GTTGTTGCTTGTGGTGGTTTTAAATGCTCGTCTTGATTGTCTGTATCTGTTTGATCGCCC
CCCCCTTGTTTTACCACGTAAAACGCATGCTCATGTTTGTACATGTTATGATCAATCATC
ATCATTCCCAGAAG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A563TF U 1
AF RR2A563JQ C 6
BS 1 684 RR2A563TF
BS 685 914 RR2A563JQ

RD RR2A563TF 684 0 0
GGAGAAGTGTTGAATACATCTCTTTGCTTTCATCTCCTTCATCACCAAGCCAAGTCTCCT
CCTCAAGATCTGATCGTACGAGTTCGTTGACTTCGTCTCTAGAGAAATGAGTCAGCAGAA
AGGTTTGATTTACAGCTTCGTAGCCAAAGGAACCGTCGTTCTAGCCGAGCATACTCCTTA
CTCAGGAAACTTCAGCACCATCGCTGTTCAATGTCTCCGAAAGCTTCCCACTAACAGCAG
CAAGTATACTTACTCCTGCGATGGCCACACCTTCAACTTCCTTGTCGAAAACAATGGCTT
TGTGTTTCTTGTGGTTGCTGATGAGTCTACTGGAAGAAGTGTTCCTTTCGTGTTCCTTGA
ACGGGTCAAAGAAGATTTCAAGAAACGGTATGAGGCGAGTATAAAGAACGATGATGATGA
CGAAGACGATGATTTGTTTGGGGATCGGTTTAGCATCGCTTACAATCTTGACAGGGAGTT
CGGGCCTATACTTAAGGAGCATATGCAGTATTGTTGAGCCATCCTGAAGAGATGAGCAAA
CTTTCAAAGTTGAAGGCTCAAATAAATGATGTCAAGGGGATCATGATGGACAACATTGAG
AAGGTTCTGGACAGGGGAGAGAAGATAGAACTTCTGGTTGACAAAACGGAGAACCTTCAG
TTCCAGGCAGATAGCTTCCAGAGG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2A563JQ 909 0 0
AGTGTTGAATACATCTCTTTGCTTTCATCTCCTTCATCACCAAGCCAAGTCTCCTCCTCA
AGATCTGATCGTACGAGTTCGTTGACTTCGTCTCTAGAGAAATGAGTCAGCAGAAAGGTT
TGATTTACAGCTTCGTAGCCAAAGGAACCGTCGTTCTAGCCGAGCATACTCCTTACTCAG
GAAACTTCAGCACCATCGCTGTTCAATGTCTCCGAAAGCTTCCCACTAACAGCAGCAAGT
ATACTTACTCCTGCGATGGCCACACCTTCAACTTCCTTGTCGAAAACAATGGCTTTGTGT
TTCTTGTGGTTGCTGATGAGTCTACTGGAAGAAGTGTTCCTTTCGTGTTCCTTGAACGGG
TCAAAGAAGATTTCAAGAAACGGTATGAGGCGAGTATAAAGAACGATGATGATGACGAAG
ACGATGATTTGTTTGGGGATCGGTTTAGCATCGCTTACAATCTTGACAGGGAGTTCGGGC
CTATACTTAAGGAGCATATGCAGTATTGTTGAGCCATCCTGAAGAGATGAGCAAACTTTC
AAAGTTGAAGGCTCAAATAAATGATGTCAAGGGGATCATGATGGACAACATTGAGAAGGT
TCTGGACAGGGGAGAGAAGATAGAACTTCTGGTTGACAAAACGGAGAACCTTCAGTTCCA
GGCAGATAGCTTCCAGAGGCAAGGAAGGCAACTTAGAAGGAAGATGTGGATACAGAGCCT
GCAGATGAAGCTGATGGTGGGAGGTGCTGTTTTGTCCTTTATTCTCATCGTTTGGGTTGT
TGCTTGTGGTGGTTTTAAATGCTCGTCTTGATTGTCTGTATCTGTTTGATCGCCCCCCCC
TTGTTTTACCACGTAAAACGCATGCTCATGTTTGTACATGTTATGATCAATCATCATCAT
TCCCAGAAG

QA 1 909 1 909
DS 



AS 1 2

CO CL6612Contig1 1114 2 2 U
GGAGGAACTCTCCTCCTTCCTTGCAAAATAAAACACACCCCATTTTTCTTCCCTACACAT
ATAAATCTTGAAGAAAAGAAGCCATTAATTGAAAAAAAGAAGCCACTAAAGAGAGAGACC
GAGATGGGAAGGTCACCATGCTGCGAGAAAGCTCACATGAACAAAGGAGCTTGGACTAAA
GAAGAAGATCAGCTTCTCGTTGATTACATCCGCAAACACGGCGAAGGTTGCTGGCGTTCT
CTCCCTCGAGCTGCCGGATTACAGAGATGTGGTAAGAGTTGTAGGTTGAGATGGATGAAT
TATCTAAGACCAGATCTCAAGAGAGGTAATTTCACTGAGGAAGAAGACGAACTCATCATC
AAACTCCACAGCTTATTTGGTAACAAATGGTCGTTGATTGCTGGGAGATTACCAGGAAGA
ACAGACAACGAGATCAAAAACTATTGGAACACTCATATAAAGAGGAAGCTTCTCAGCCGT
GGGATCGACCCAAACACCCACCGTTCGATCAACGGATCCGCAACCCCTCCTTCAAAAATG
ACGACTCCGTCTCTTCAAAACGACGAGCCGGTACGATTCGATTTCTCCGGACCGGATCAA
CAACGGACGGTTAAACCGGAACCGATTGTACTAGACCGAGAAGAGGCTAATAATAACATT
AATAACTGCACTAGCAGCGGAACGACGTTGGAGAAGGATATTAAGACGGACAATGATTGG
GTACTCAATTTGGGACTCTCCGTTGGTCCAGCGACGACCAAGAGTTATCGGTACGAGTTG
ACTCGCAAAGCGGATCCTCACTTGGCCGAGTCGACTAGACGGTGGAGCTTTGAGTTGTTA
GGGGCTCAGGCTGAGATGTGTTTGTGTTGTCGGATAGGGTCTCACAGCGAGTCGTGTCGG
AACTGTCGTACTTCCGATGTTTTAACTACTTGGGAATCGAAAATTATTTAGGATTTTATT
TATTTACCAGTTTGATTTGTGTTCTTTTTTTGTTCCTATACTTCTTGTAATGAATGCATC
CAGTAACAACTAGGTTTAATTACCAGATGGGACAGGGTAATTATTAGTGCTAATCTAGTA
GTATCAGTATTTGTTATCCGATCAAATCCGAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ14TF U 1
AF RR2GJ14JQB C 347
BS 1 642 RR2GJ14TF
BS 643 1114 RR2GJ14JQB

RD RR2GJ14TF 642 0 0
GGAGGAACTCTCCTCCTTCCTTGCAAAATAAAACACACCCCATTTTTCTTCCCTACACAT
ATAAATCTTGAAGAAAAGAAGCCATTAATTGAAAAAAAGAAGCCACTAAAGAGAGAGACC
GAGATGGGAAGGTCACCATGCTGCGAGAAAGCTCACATGAACAAAGGAGCTTGGACTAAA
GAAGAAGATCAGCTTCTCGTTGATTACATCCGCAAACACGGCGAAGGTTGCTGGCGTTCT
CTCCCTCGAGCTGCCGGATTACAGAGATGTGGTAAGAGTTGTAGGTTGAGATGGATGAAT
TATCTAAGACCAGATCTCAAGAGAGGTAATTTCACTGAGGAAGAAGACGAACTCATCATC
AAACTCCACAGCTTATTTGGTAACAAATGGTCGTTGATTGCTGGGAGATTACCAGGAAGA
ACAGACAACGAGATCAAAAACTATTGGAACACTCATATAAAGAGGAAGCTTCTCAGCCGT
GGGATCGACCCAAACACCCACCGTTCGATCAACGGATCCGCAACCCCTCCTTCAAAAATG
ACGACTCCGTCTCTTCAAAACGACGAGCCGGTACGATTCGATTTCTCCGGACCGGATCAA
CAACGGACGGTTAAACCGGAACCGATTGTACTAGACCGAGAA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2GJ14JQB 768 0 0
ACGAACTCATCATCAAACTCCACAGCTTATTTGGTAACAAATGGTCGTTGATTGCTGGGA
GATTACCAGGAAGAACAGACAACGAGATCAAAAACTATTGGAACACTCATATAAAGAGGA
AGCTTCTCAGCCGTGGGATCGACCCAAACACCCACCGTTCGATCAACGGATCCGCAACCC
CTCCTTCAAAAATGACGACTCCGTCTCTTCAAAACGACGAGCCGGTACGATTCGATTTCT
CCGGACCGGATCAACAACGGACGGTTAAACCGGAACCGATTGTACTAGACCGAGAAGAGG
CTAATAATAACATTAATAACTGCACTAGCAGCGGAACGACGTTGGAGAAGGATATTAAGA
CGGACAATGATTGGGTACTCAATTTGGGACTCTCCGTTGGTCCAGCGACGACCAAGAGTT
ATCGGTACGAGTTGACTCGCAAAGCGGATCCTCACTTGGCCGAGTCGACTAGACGGTGGA
GCTTTGAGTTGTTAGGGGCTCAGGCTGAGATGTGTTTGTGTTGTCGGATAGGGTCTCACA
GCGAGTCGTGTCGGAACTGTCGTACTTCCGATGTTTTAACTACTTGGGAATCGAAAATTA
TTTAGGATTTTATTTATTTACCAGTTTGATTTGTGTTCTTTTTTTGTTCCTATACTTCTT
GTAATGAATGCATCCAGTAACAACTAGGTTTAATTACCAGATGGGACAGGGTAATTATTA
GTGCTAATCTAGTAGTATCAGTATTTGTTATCCGATCAAATCCGAATT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL6613Contig1 772 2 16 U
GGACAAAACACTGGTCAGTAAACAGAGAAGAAGAACAAGCTATGTCGTCTCACTCATCTA
TCTTCTTCTTCTTCTCTGACCTTTAACCAAGCAAAAAAAAGAAACCCTAAAATCCCCAAA
TCCATAATATCAGTTCTTACAATGATGCTTCAAAGAAGCTGCATTGTACTTTTCTCACAT
TCTCTGTTTGTTCCACACATGGGTTTCGCCATGCTCAACAAAACTCTTCTTCTCATACCA
CATCCCGACCCAGAGCTAGTCGCTCATGATGTTCATAGGAGGGTAAATGCCTCTCTATGG
AGACGTCAAGCTATGGATACGACGGACCAGGCCGGTTCAAGCCCGTGCTTTACCGGAAAT
CCAATCGATGACTGTTAGAAATGTGACCCAAACTGGCCCAATAACCGACAAAGGCTGGCC
GATTGTGGAATCGGGTTCGGTCAGTACGCCTTGGGAGGCAAAGGCGGTCGGTTCTACTTC
GTCACTGATTCTTCCGACGACGATGTCGTCGAACCTAAACCGGGCACTCTCAGATATGCA
GTGATACAAGTAGAGCCACTGTGGATAGTGTTCCCAAGCAACATGATGATAAAATTAAAG
CATGAGCTAATATTCAACAGTTACAAGACTCTTGATGGAAGAGGAGCTAACGTTCATATT
GTTGGTGGTGGTTGCATCACTCTTCAATATGTCTCCAATGTCATCATTCACAACATCCAT
ATCCACCATTGTCACCCATCCGGAATACTAACATAAGTCAAGTCCGACGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D074TF U 1
AF RR2BV09TF U 17
BS 1 98 RR2D074TF
BS 99 100 RR2BV09TF
BS 101 114 RR2D074TF
BS 115 115 RR2BV09TF
BS 116 126 RR2D074TF
BS 127 127 RR2BV09TF
BS 128 135 RR2D074TF
BS 136 136 RR2BV09TF
BS 137 236 RR2D074TF
BS 237 237 RR2BV09TF
BS 238 294 RR2D074TF
BS 295 295 RR2BV09TF
BS 296 650 RR2D074TF
BS 651 651 RR2BV09TF
BS 652 756 RR2D074TF
BS 757 772 RR2BV09TF

RD RR2D074TF 771 0 0
GGACAAAACACTGGTCAGTAAACAGAGAAGAAGAACAAGCTATGTCGTCTCACTCATCTA
TCTTCTTCTTCTTCTCTGACCTTTAACCAAGCAAAAAA**GAAACCCTAAAATCTCCAAA
TCCATACTATCAGTTTTTACAATGATGCTTCAAAGAAGCTGCATTGTACTTTTCTCACAT
TCTCTGTTTGTTCCACACATGGGTTTCGCCATGCTCAACAAAACTCTTCTTCTCATCCCA
CATCCCGACCCAGAGCTAGTCGCTCATGATGTTCATAGGAGGGTAAATGCCTCTTTATGG
AGACGTCAAGCTATGGATACGACGGACCAGGCCGGTTCAAGCCCGTGCTTTACCGGAAAT
CCAATCGATGACTGTTAGAAATGTGACCCAAACTGGCCCAATAACCGACAAAGGCTGGCC
GATTGTGGAATCGGGTTCGGTCAGTACGCCTTGGGAGGCAAAGGCGGTCGGTTCTACTTC
GTCACTGATTCTTCCGACGACGATGTCGTCGAACCTAAACCGGGCACTCTCAGATATGCA
GTGATACAAGTAGAGCCACTGTGGATAGTGTTCCCAAGCAACATGATGATAAAATTAAAG
CATGAGCTAATATTCAACAGTTACAAGACTCTTGATGGAAGAGGAGCTAATGTTCATATT
GTTGGTGGTGGTTGCATCACTCTTCAATATGTCTCCAATGTCATCATTCACAACATCCAT
ATCCACCATTGTCACCCATCCGGAATACTAACATAA
CGTCAGTCCACGCAC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2BV09TF 756 0 0
GGA
AAACAGAGAAGAAGAACAAGCTATGTCGTCTCACTCATCTATCTTCTTCTTCTTCTCTGA
CCTTTAACCAAGCAAAAAAAAGAAACCCTAAAATCCCCAAATCCATAATATCAGTTCTTA
CAATGATGCTTCAAAGAAGCTGCATTGTACTTTTCTCACTTTCTCTGTTTGTTCCACATA
TGGGTTTTGCCATGCTCAACAAAACTCTTCTTCTCGTACCACATCCCGACCCAGAGCTAG
TCGCTCATGATGTTCATAGGAGGGTAAATGCCTCTCTATGGAGACGTCAAGCTATGGATA
CGACGGACCAGGCCGGTTCAAGCCCGTGCTTTACCGGAAATCCTATCGATGACTGTTGGA
AATGTGACCCAAACTGGCCCAATAACCGACAAAGGCTGGCCGATTGTGGAATCGGGTTCG
GTCAGTACGCCTTGGGAGGCAAAGGCGGTCGGTTCTACTTCGTCACTGATTCTTCCGACG
ACGATGTCGTCGAACCTAAACCGGGCACTCTCAGATATGCAGTGATACAAGTAGAGCCAC
TGTGGATAGTGTTCCCAAGCAACATGATGATAAAATTAAAGCATGAGCTAATATTCAACA
GTTACAAGACTCTTGATGGAAGAGGAGCTAACGTTCATATTGTTGGTGGTGGTTGCATCA
CTCTTCAATATGTCTCCAATGTCATCATTCACAACATCCATATCCACCATTGTCACCCAT
CCGGGATACTAACATAAGTCAAGTCCGACGCAC

QA 4 756 4 756
DS 



AS 1 2

CO CL6614Contig1 464 2 1 U
TTTTTTTTTCTTCAGCATGGCGAGAGTTTCTGTTTTGTTATGTTTGGTTCTATTGGTTAC
ATTAGGAGTCGTGGTAAGTTTCTCATTTGCGCACGACACGGAAACGACACAGTCGACACT
GCAACATCAGGAGAGCAGTAAGACAGCTACCACACTTGATCATAAGAGTGAACATAAAGT
GCAAGGAGGACAACAGGTCATGGGTGGTCAAGGTCAACATGACCATAAGAAGAAGGGTGA
TCATACCGATGATGATACTGATACAGATGATGATCATACCGATGATGATACTGATGATGA
TACCGATGATGATGATGATGACAAGGCAAAGAAGAAGACAGTAAAAGCTTTATAAATTAA
TAATGTTGATATTATAACAATTTTATTAATTTATAGAATTGTTAATTTTTATATTTTTAA
AATATCTTTATATTTAGATAAATAAAAGGAATACATCATTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ET05TF U 1
AF RR2ET05JQ C 13
BS 1 464 RR2ET05TF

RD RR2ET05TF 464 0 0
TTTTTTTTTCTTCAGCATGGCGAGAGTTTCTGTTTTGTTATGTTTGGTTCTATTGGTTAC
ATTAGGAGTCGTGGTAAGTTTCTCATTTGCGCACGACACGGAAACGACACAGTCGACACT
GCAACATCAGGAGAGCAGTAAGACAGCTACCACACTTGATCATAAGAGTGAACATAAAGT
GCAAGGAGGACAACAGGTCATGGGTGGTCAAGGTCAACATGACCATAAGAAGAAGGGTGA
TCATACCGATGATGATACTGATACAGATGATGATCATACCGATGATGATACTGATGATGA
TACCGATGATGATGATGATGACAAGGCAAAGAAGAAGACAGTAAAAGCTTTATAAATTAA
TAATGTTGATATTATAACAATTTTATTAATTTATAGAATTGTTAATTTTTATATTTTTAA
AATATCTTTATATTTAGATAAATAAAAGGAATACATCATTTCCC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2ET05JQ 452 0 0
CAGCATGGCGAGAGTTTCTGTTTTGTTATGTTTGGTTCTATTGGTTACATTAGGAGTCGT
GGTAAGTTTTTCATTTGCGCACGACACGGAAACGACACAGTCGACACTGCAACATCAGGA
GAGCAGTAAGACAGCTACCACACTTGATCATAAGAGTGAACATAAAGTGCAAGGAGGACA
ACAGGTCATGGGTGGTCAAGGTCAACATGACCATAAGAAGAAGGGTGATCATACCGATGA
TGATACTGATACAGATGATGATCATACCGATGATGATACTGATGATGATACCGATGATGA
TGATGATGACAAGGCAAAGAAGAAGACAGTAAAAGCTTTATAAATTAATAATGTTGATAT
TATAACAATTTTATTAATTTATAGAATTGTTAATTTTTATATTTTTAAAATATCTTTATA
TTTAGATAAATAAAAGGAATACATCATTTCCC

QA 1 452 1 452
DS 



AS 1 2

CO CL6615Contig1 631 2 1 U
GTGGTAAAACCGCGTTTGCGGTTGCGTTAGGCCATGCCACAACACTAGACCCATCCATCA
AGTTTTCAGCTCTTGTAGGAATAGATCCAGTTGCAGGAGTCAGCAAATGCATGAGAACCA
AGCCGGAAATCTTAACTTACAAACCGGAATCGTTCGACCTGGACATACCGGTTGCAGTGA
TCGGTACGGGTCTCGGACCGAAGAGTAACATGCTGATGCCACCATGCGCACCAGCGGAAG
TGAACCATGTGGAGTTTTATAATGAGTGTAAGCCTACGAAGGGACATTTCGTGGCTGCGG
ATTACGGACATATGGATATGTTGGACGATAATTTGCCTGGTTTTGTCGGGTTTATGGCGG
GTTGTATGTGTAAGAACGGGAAACGCAAAAAGAGTGAGATGAGGAGTTTTGTGGGTGGGA
TCGTGGTTGCGTTTTTAAAGTATAGTTTATTTGGTGAAAAGTCAGAGATTCGACAGATTG
TGAAGGATCCTTCGGTTTCCCCGGCGAGGCTTGATCCTTTGCCGGAGCTGGAAGAGGCTT
CTGGTCATCTCGTCTAGATTTGTGGCTATGTAACGTATTGGTATCCTCGGAGAGGCTCCA
AACTCGTAATAAACTTATTGCATGTTTCGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GW56JQ C 1
AF RR2GW56TF U 1
BS 1 631 RR2GW56TF

RD RR2GW56JQ 631 0 0
GTGGTAAAACCGCGTTTGCGGTTGCGTTAGGCCATGCCACAACACTAGACCCATCCATCA
AGTTTTCAGCTCTTGTAGGAATAGATCCAGTTGCAGGAGTCAGCAAATGCATGAGAACCA
AGCCGGAAATCTTAACTTACAAACCGGAATCGTTCGACCTGGACATACCGGTTGCAGTGA
TCGGTACGGGTCTCGGACCGAAGAGTAACATGCTGATGCCACCATGCGCACCAGCGGAAG
TGAACCATGTGGAGTTTTATAATGAGTGTAAGCCTACGAAGGGACATTTCGTGGCTGCGG
ATTACGGACATATGGATATGTTGGACGATAATTTGCCTGGTTTTGTCGGGTTTATGGCGG
GTTGTATGTGTAAGAACGGGAAACGCAAAAAGAGTGAGATGAGGAGTTTTGTGGGTGGGA
TCGTGGTTGCGTTTTTAAAGTATAGTTTATTTGGTGAAAAGTCAGAGATTCGACAGATTG
TGAAGGATCCTTCGGTTTCCCCGGCGAGGCTTGATCCTTTGCCGGAGCTGGAAGAGGCTT
CTGGTCATTTCGTCTAGATTTGTGGCTATGTAACGTATTGGTATCCTCGGAGAGGCTCCA
AACTCGTAATAAACTTATTGCATGTTTCGCC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2GW56TF 631 0 0
GTGGTAAAACCGCGTTTGCGGTTGCGTTAGGCCATGCCACAACACTAGACCCATCCATCA
AGTTTTCAGCTCTTGTAGGAATAGATCCAGTTGCAGGAGTCAGCAAATGCATGAGAACCA
AGCCGGAAATCTTAACTTACAAACCGGAATCGTTCGACCTGGACATACCGGTTGCAGTGA
TCGGTACGGGTCTCGGACCGAAGAGTAACATGCTGATGCCACCATGCGCACCAGCGGAAG
TGAACCATGTGGAGTTTTATAATGAGTGTAAGCCTACGAAGGGACATTTCGTGGCTGCGG
ATTACGGACATATGGATATGTTGGACGATAATTTGCCTGGTTTTGTCGGGTTTATGGCGG
GTTGTATGTGTAAGAACGGGAAACGCAAAAAGAGTGAGATGAGGAGTTTTGTGGGTGGGA
TCGTGGTTGCGTTTTTAAAGTATAGTTTATTTGGTGAAAAGTCAGAGATTCGACAGATTG
TGAAGGATCCTTCGGTTTCCCCGGCGAGGCTTGATCCTTTGCCGGAGCTGGAAGAGGCTT
CTGGTCATCTCGTCTAGATTTGTGGCTATGTAACGTATTGGTATCCTCGGAGAGGCTCCA
AACTCGTAATAAACTTATTGCATGTTTCGCC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL6616Contig1 837 2 2 U
GGCATCTCTCCAGGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCTGGACTCACGAGCAGGGA
CTGGAGCATCACAACAACTCAAGCTAAAGATGGGATATGGATAAGCTCTATCCCTGAAAC
ACACAACACTCACCTCGTCGCACTCTCACAACAGTCTGGAAACACATCTTACGTTTTGTC
AAATAACAACCAAACCATCACCATGGAAGTATCTCCCGCGCCAGGGACGCAAGCCGCCGT
TGCATCAACTTTCAGGCTCGTGACTGCTGATTCTAAAGCAAGGATGTCATCATCAGGTCC
AGAGGAGCTGATTGGAAGCCTAGTCATGATCGAACCGTTTGATTTCCCTGGAATGCTTGT
GATGCAAGCAACTGATAGCTCCCTTGCTGTTCAAGGTTCTTCTACTGACAAAGAAGCCTC
GAGGTTTCGTTTAGTAGCTGGAGTTGATGGGAAGCAGGGGAGTGTTTCTTTAATGCTAGA
GAGCAAGAAGGGTTGTTATGTGTGCAGCGATCAAACACTAAAGCCGGGGATGAAACTGAA
GCTCACATGTGATTCTGATGAGAAGTTTAAAGAGGCAGCAAGCTTTAGCTTAAGGAAAGG
AGTGAGTGAATACAATCCGATGAGCTTCGTGATGAACGGAGCACAGAGGAACTTTGTGTT
ATCGCCATTGTTCAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTTCAGTTTACAAACTTG
AAGAAAGATAATACTTAAAAAAAAAGCTTTTAAAAATAAGATAAGTGTTATGAAAATAGC
TGTAATTTAGATGTTTAGTCTGTTAGGTGGTTTGTCTTATGCAATTTAATTAATCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E658TF U 1
AF RR2E658JQ C 118
BS 1 571 RR2E658TF
BS 572 837 RR2E658JQ

RD RR2E658TF 571 0 0
GGCATCTCTCCAGGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCTGGACTCACGAGCAGGGA
CTGGAGCATCACAACAACTCAAGCTAAAGATGGGATATGGATAAGCTCTATCCCTGAAAC
ACACAACACTCACCTCGTCGCACTCTCACAACAGTCTGGAAACACATCTTACGTTTTGTC
AAATAACAACCAAACCATCACCATGGAAGTATCTCCCGCGCCAGGGACGCAAGCCGCCGT
TGCATCAACTTTCAGGCTCGTGACTGCTGATTCTAAAGCAAGGATGTCATCATCAGGTCC
AGAGGAGCTGATTGGAAGCCTAGTCATGATCGAACCGTTTGATTTCCCTGGAATGCTTGT
GATGCAAGCAACTGATAGCTCCCTTGCTGTTCAAGGTTCTTCTACTGACAAAGAAGCCTC
GAGGTTTCGTTTAGTAGCTGGAGTTGATGGGAAGCAGGGGAGTGTTTCTTTAATGCTAGA
GAGCAAGAAGGGTTGTTATGTGTGCAGCGATCAAACACTAAAGCCGGGGATGAAACTGAA
GCTCACATGTGATTCTGATGAGAAGTTTAAA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2E658JQ 720 0 0
AACACACAACACTCACCTCGTCGCACTCTCACAACAGTCTGGAAACACATCTTACGTTTT
GTCAAATAACAACCAAACCATCACCATGGAAGTATCTCCCGCGCCAGGGACGCAAGCCGC
CGTTGCATCAACTTTCAGGCTCGTGACTGCTGATTCTAAAGCAAGGATGTCATCATCAGG
TCCAGAGGAGCTGATTGGAAGCCTAGTCATGATCGAACCGTTTGATTTCCCTGGAATGCT
TGTGATGCAAGCAACTGATAGCTCCCTTGCTGTTCAAGGTTCTTCTACTGACAAAGAAGC
CTCGAGGTTTCGTTTAGTAGCTGGAGTTGATGGGAAGCAGGGGAGTGTTTCTTTAATGCT
AGAGAGCAAGAAGGGTTGTTATGTGTGCAGCGATCAAACACTAAAGCCGGGGATGAAACT
GAAGCTCACATGTGATTTTGATGAGAAGTTTAAAGAGGCAGCAAGCTTTAGCTTAAGGAA
AGGAGTGAGTGAATACAATCCGATGAGCTTCGTGATGAACGGAGCACAGAGGAACTTTGT
GTTATCGCCATTGTTCAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTTCAGTTTACAAAC
TTGAAGAAAGATAATACTTAAAAAAAAAGCTTTTAAAAATAAGATAAGTGTTATGAAAAT
AGCTGTAATTTAGATGTTTAGTCTGTTAGGTGGTTTGTCTTATGCAATTTAATTAATCCG

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL6617Contig1 780 2 2 U
TCTCTATATAAACTCCGGCTTTTATATGTATTACATACCTCTTATTACTATTCTCCGGGG
CCGCGGCAACCGCAGCTGCCACAGTTGTGAATGTACCGCTACCATCAGCCGCCACGGTAG
CATCGGCTTCCACTGTAGACCCTTGAAGAAGCCTCCTATCTCCTGCGGATAACCAAGTCG
GCCACTCCTCCGCGTCTAACTCTCCGACGCTAGCAATATCTGCGGCCACCGTAGTCTCCT
CCTCCTTGAGTTTACGGTTGTTTGAGGTGACTTTAGCTTTTAGCTCGAAATTGGCTATAT
CGGTATCAGTCATATTCTTGATCATTGCTAGTGCATTGCTGCACATGTGCTCTACGTGCA
TCAGACCCTTAAACAAGGCCTTGCGGACTTTCTTGTCGGCCCTGTCATGAGAAAAGCCGT
CTAGACAAGTCTCCTGGTTGGTAATGGCGGAGCTAAGTAGGGTTTTGAGATCGCCGGCGT
GTTCCCGGAGAGACTTCTTGTTAGGATACAAATGGAGATCTTCCACCGCCTCGTGAAGCT
CATCGCGCGTCTCATCAATAGTCTCCAAACAGTCATGAAGCGCCGTCTTCTCGCGAGTAG
TTAGTCCTTTCCTATTCTTGATCAGCTTCTTCACCGTGAAGTAGTTGTGTTCCACGGCAG
TTGTCGTGAGGTTAAGCGAAGCCTCGATGACATCTTTCTGCGACGTAAGCTTGACGCCTC
CGGAGGTGGATACTGCGGAGATGCAGAGCTCAGGGTAACGCGTGGAGCTGCATGCGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A303TF C 1
AF RR2A303JQ U 96
BS 1 95 RR2A303TF
BS 96 780 RR2A303JQ

RD RR2A303TF 769 0 0
TCTCTATATAAACTCCGGCTTTTATATGTATTACATACCTCTTATTACTATTCTCCGGGG
CCGCGGCAACCGCAGCTGCCACAGTTGTGAATGTACCGCTACCATCAGCCGCCACGGTAG
CATCGGCTTCCACTGTAGACCCTTGAAGAAGCCTCCTATCTCCTGCGGATAACCAAGTCG
GCCACTCCTCCGCGTCTAACTCTCCGACGCTAGCAATATCTGCGGCCACCGTAGTCTCCT
CCTCCTTGAGTTTACGGTTGTTTGAGGTGACTTTAGCTTTTAGCTCGAAATTGGCTATAT
CGGTATCAGTCATATTCTTGATCATTGCTAGTGCATTGCTGCACATGTGCTCTACGTGCA
TCAGACCCTTAAACAAGGCCTTGCGGACTTTCTTGTCGGCCCTGTCATGAGAAAAGCCGT
CTAGACAAGTCTCCTGGTTGGTAATGGCGGAGCTAAGTAGGGTTTTGAGATCGCCGGCGT
GTTCCCGGAGAGACTTCTTGTTAGGATACAAATGGAGATCTTCCACCGCCTCGTGAAGCT
CATCGCGCGTCTCATCAATAGTCTCCAAACAGTCATGAAGCGCCGTCTTCTCGCGAGTAG
TTAGTCCTTTCCTATTCTTGATCAGCTTCTTCACCGTGAAGTAGTTGTGTTCCACGGCAG
TTGTCGTGAGGTTAAGCGAAGCCTCGATGACATCTTTCTGCGACGTAAGCTTGACGCCTC
CGGAGGTGGATACTGCGGAGATGCAGAGCTCAGGGTAACGCGTGGAGCT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2A303JQ 685 0 0
CCGCTACCATCAGCCGCCACGGTAGCATCGGCTTCCACTGTAGACCCTTGAAGAAGCCTC
CTATCTCCTGCGGATAACCAAGTCGGCCACTCCTCCGCGTCTAACTCTCCGACGCTAGCA
ATATCTGCGGCCACCGTAGTCTCCTCCTCCTTGAGTTTACGGTTGTTTGAGGTGACTTTA
GCTTTTAGCTCGAAATTGGCTATATCGGTATCAGTCATATTCTTGATCATTGCTAGTGCA
TTGCTGCACATGTGCTCTACGTGCATCAGACCCTTAAACAAGGCCTTGCGGACTTTCTTG
TCGGCCCTGTCATGAGAAAAGCCGTCTAGACAAGTCTCCTGGTTGGTAATGGCGGAGCTA
AGTAGGGTTTTGAGATCGCCGGCGTGTTCCCGGAGAGACTTCTTGTTAGGATACAAATGG
AGATCTTCCACCGCCTCGTGAAGCTCATCGCGCGTCTCATCAATAGTCTCCAAACAGTCA
TGAAGCGCCGTCTTCTCGCGAGTAGTTAGTCCTTTCCTATTCTTGATCAGCTTCTTCACC
GTGAAGTAGTTGTGTTCCACGGCAGTTGTCGTGAGGTTAAGCGAAGCCTCGATGACATCT
TTCTGCGACGTAAGCTTGACGCCTCCGGAGGTGGATACTGCGGAGATGCAGAGCTCAGGG
TAACGCGTGGAGCTGCATGCGGATC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL6618Contig1 776 2 5 U
GGACATCACCAATCTTTCCTCCCTTGGTTGCAGAGAAGAGAGAACCACACTGTAATGGCA
ATCCCAATGGCAATGGCCACACCTACAGACTCCCTAAGCAGAGTTTGGAGCATGTCATCT
CTCAAATCATCTCTCCCCTCCGTAACTTGCCGTTTACCTTCCTCGTCTCCTCCCCGTCCT
GTTGTCACTCTTCGTCTCCCTTCATTCTCCGGTCTCTCTCCGGTCAACCCTCTCATCTCA
ACCGGACTTCCAGGCTGGCAAAGCTTCGAGGACGGGTTCAAGATCATGGACGGCGGTGGT
CGCGTGTACGCGATGAGACACGGGAGGAGAGTCCCGAAGCTGAACAGGCCACCGGACCAG
AGGAAAGCTCTGCTCCGCGGGCTCACGACGCAACTGCTGAAGCACGGGAGGATCAAGACG
ACGAGAGCTAGAGCCAGTGCGATGAGGAAGTTTGTGGATAAGATGATCACTCTCGCCAAG
GACGGGTCTCTGCACAAGCGGAGGCAAGCTCTGGGGTATATCTACGAGAAGCAGATTGTT
CACGCGCTGTTCGCTGAGGTTCCGGATAGGTACGGGGAGAGGAATGGTGGGTACACGAGG
ATCATTAGGACTCTTCCCAGGAGAGGTGACAATGCTCCTATGGCGTATATTGAGCTTGTT
TAAGAGGTTACCGTTTTGTTTTTTGTTTGTTCAAAAAAAAACTAGACTCTTTGCTTTTGT
AATCTTGAGCCAGTTGTTTATTCTGCAGATATGAGTGTTTATTGAGCTTTGATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AR68TF U 1
AF RR2AR68JQ C 191
BS 1 666 RR2AR68TF
BS 667 667 RR2AR68JQ
BS 668 700 RR2AR68TF
BS 701 701 RR2AR68JQ
BS 702 776 RR2AR68TF

RD RR2AR68TF 776 0 0
GGACATCACCAATCTTTCCTCCCTTGGTTGCAGAGAAGAGAGAACCACACTGTAATGGCA
ATCCCAATGGCAATGGCCACACCTACAGACTCCCTAAGCAGAGTTTGGAGCATGTCATCT
CTCAAATCATCTCTCCCCTCCGTAACTTGCCGTTTACCTTCCTCGTCTCCTCCCCGTCCT
GTTGTCACTCTTCGTCTCCCTTCATTCTCCGGTCTCTCTCCGGTCAACCCTCTCATCTCA
ACCGGACTTCCAGGCTGGCAAAGCTTCGAGGACGGGTTCAAGATCATGGACGGCGGTGGT
CGCGTGTACGCGATGAGACACGGGAGGAGAGTCCCGAAGCTGAACAGGCCACCGGACCAG
AGGAAAGCTCTGCTCCGCGGGCTCACGACGCAACTGCTGAAGCACGGGAGGATCAAGACG
ACGAGAGCTAGAGCCAGTGCGATGAGGAAGTTTGTGGATAAGATGATCACTCTCGCCAAG
GACGGGTCTCTGCACAAGCGGAGGCAAGCTCTGGGGTATATCTACGAGAAGCAGATTGTT
CACGCGCTGTTCGCTGAGGTTCCGGATAGGTACGGGGAGAGGAATGGTGGGTACACGAGG
ATCATTAGGACTCTTCCCAGGAGAGGTGACAATGCTCCTATGGCGTATATTGAGCTTGTT
TAAGAG*TTACCGTTTTGTTTTTTGTTTGTTCAAAAAAAA*CTAGACTCTTTGCTTTTGT
AATCTTGAGCCAGTTGTTTATTCTGCAGATATGAGTGTTTATTGAGCTTTGATACC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2AR68JQ 586 0 0
TTCGTCTCCCTTCATTCTCCGGTCTCTCTCCGGTCAACCCTCTCATCTCAACCGGACTTC
CAGGCTGGCAAAGCTTCGAGGACGGGTTCAAGATCATGGACGGCGGTGGTCGCGTGTACG
CGATGAGACACGGGAGGAGAGTCCCGAAGCTGAACAGGCCACCGGACCAGAGGAAAGTTC
TGCTCCGCGGGCTCACGACGCAACTGCTGAAGCACGGGAGGATCAAGACGACGAGAGCTA
GAGCCAGTGCGATGAGGAAGTTTGTGGATAAGATGATCACTCTCGCCAAGGACGGGTCTC
TGCACAAGCGGAGGCAAGCTTTGGGGTATATTTACGAGAAGCAGATTGTTCACGCGCTGT
TCGCTGAGGTTCCGGATAGGTACGGGGAGAGGAATGGTGGGTACACGAGGATCATTAGGA
CTCTTCCCAGGAGAGGTGACAATGCTCCTATGGCGTATATTGAGCTTGTTTAAGAGGTTA
CCGTTTTGTTTTTTGTTTGTTCAAAAAAAAACTAGACTCTTTGCTTTTGTAATCTTGAGC
CAGTTGTTTATTCTGCAGATATGAGTGTTTATTGAGCTTTGATACC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL6619Contig1 1086 2 2 U
GGACCGGAACAATGGTCTGTGTAGAGCTTGAAGAAGAGTTATGGAACAGAAGGAATCCAG
AGTTATCTAGTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCCCCTTTCTCTCATTCCCAATTCACGATT
TGAAAAAAACATTCGATGGGTAGCAAACGCGGGAGGTCGGTGATATCCACGATCTTCATC
TTCTTCTTCGCGATGTCATGCTTTGATTCCATCTCAACTACTCAGGTTGGAATGTCCGAT
TCGGACACGTTTTGTATCTCGGATCATTACATCATGCAGTCTTATTTCACGACACAGAGC
TCCTTAGACGAGTCAGAGTTTCGAACCTTCCTGCGTCTTCAACAATGTTCTGAGAACATT
TCTTATGAAGATGCTCCTCCTGCTGTAGCAATGCTACAACAAAGAGACATAACAGGTGAA
GGTTCGCATCGTCATCTACTCACATCCATCAAGCTTCGTCCTTTTCACTCACAGTCTCAG
TTTCACGAGCTTGTGATCGTCGAACGGTTGCCTTTGGGTGTTTTTGCTGATCCTTTTGAG
CTTCACAGTCTTCAACAACGCAGAGCTTTCAGAGATGTTTCTGTGTTTGGAGACACGGAT
CTCGAGCAGCCTTCGTTCAGATCAAACAGGTCTGTCGTTGAGATTCATGTCGAAATCAAT
GGAAAAGGTGAAATCGGCGTTAAGCTTCCTTTACATGCTCGGTATCAGCCTATTGGGGAG
AGCGGATACTCTAGAGTAGAGTTTGGAGAGCCAGACTTGTTCTTGTGCTCGAGACATGTA
CCAAAGGCGGAACATGAAGAGAGAAGATGTTTGGTTTTGTCAGTAGGCAGATCAAAGACC
CAAACCAGATCCGTTGTCTGGGAAATTCCTGCAGGAATCAGAAGTCATACCGAGTATGTT
TCTGTTGTTACCTTTGTGGCTGCGGTTTTATCCGCAGTTTCAATCCTCGTTGCATCTGTC
TTGAGCACAAAGGTTGAATCTTGTAAGAACACCAAGCAATTATGAATCAGCTTTTCGTCT
TCTTTGTGAATTGTGATACTCTTGCACAAACCGTTTTTGATTCCTCTCAACTCTCAATAC
CATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH80TF U 1
AF RR2BH80JQ C 253
BS 1 782 RR2BH80TF
BS 783 1086 RR2BH80JQ

RD RR2BH80TF 782 0 0
GGACCGGAACAATGGTCTGTGTAGAGCTTGAAGAAGAGTTATGGAACAGAAGGAATCCAG
AGTTATCTAGTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCCCCTTTCTCTCATTCCCAATTCACGATT
TGAAAAAAACATTCGATGGGTAGCAAACGCGGGAGGTCGGTGATATCCACGATCTTCATC
TTCTTCTTCGCGATGTCATGCTTTGATTCCATCTCAACTACTCAGGTTGGAATGTCCGAT
TCGGACACGTTTTGTATCTCGGATCATTACATCATGCAGTCTTATTTCACGACACAGAGC
TCCTTAGACGAGTCAGAGTTTCGAACCTTCCTGCGTCTTCAACAATGTTCTGAGAACATT
TCTTATGAAGATGCTCCTCCTGCTGTAGCAATGCTACAACAAAGAGACATAACAGGTGAA
GGTTCGCATCGTCATCTACTCACATCCATCAAGCTTCGTCCTTTTCACTCACAGTCTCAG
TTTCACGAGCTTGTGATCGTCGAACGGTTGCCTTTGGGTGTTTTTGCTGATCCTTTTGAG
CTTCACAGTCTTCAACAACGCAGAGCTTTCAGAGATGTTTCTGTGTTTGGAGACACGGAT
CTCGAGCAGCCTTCGTTCAGATCAAACAGGTCTGTCGTTGAGATTCATGTCGAAATCAAT
GGAAAAGGTGAAATCGGCGTTAAGCTTCCTTTACATGCTCGGTATCAGCCTATTGGGGAG
AGCGGATACTCTAGAGTAGAGTTTGGAGAGCCAGACTTGTTCTTGTGCTCGAGACATGTA
CC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2BH80JQ 834 0 0
TGTATCTCGGATCATTACATCATGCAGTCTTATTTCACGACACAGAGCTCCTTAGACGAG
TCAGAGTTTCGAACCTTCCTGCGTCTTCAACAATGTTCTGAGAACATTTCTTATGAAGAT
GCTCCTCCTGCTGTAGCAATGCTACAACAAAGAGACATAACAGGTGAAGGTTCGCATCGT
CATCTACTCACATCCATCAAGCTTCGTCCTTTTCACTCACAGTCTCAGTTTCACGAGCTT
GTGATCGTCGAACGGTTGCCTTTGGGTGTTTTTGCTGATCCTTTTGAGCTTCACAGTCTT
CAACAACGCAGAGCTTTCAGAGATGTTTCTGTGTTTGGAGACACGGATCTCGAGCAGCCT
TCGTTCAGATCAAACAGGTCTGTCGTTGAGATTCATGTCGAAATCAATGGAAAAGGTGAA
ATCGGCGTTAAGCTTCCTTTACATGCTCGGTATCAGCCTATTGGGGAGAGCGGATACTCT
AGAGTAGAGTTTGGAGAGCCAGACTTGTTCTTGTGCTCGAGACATGTACCAAAGGCGGAA
CATGAAGAGAGAAGATGTTTGGTTTTGTCAGTAGGCAGATCAAAGACCCAAACCAGATCC
GTTGTCTGGGAAATTCCTGCAGGAATCAGAAGTCATACCGAGTATGTTTCTGTTGTTACC
TTTGTGGCTGCGGTTTTATCCGCAGTTTCAATCCTCGTTGCATCTGTCTTGAGCACAAAG
GTTGAATCTTGTAAGAACACCAAGCAATTATGAATCAGCTTTTCGTCTTCTTTGTGAATT
GTGATACTCTTGCACAAACCGTTTTTGATTCCTCTCAACTCTCAATACCATTTG

QA 1 834 1 834
DS 



AS 1 2

CO CL6620Contig1 844 2 12 U
GATGTGGCAAACGGAACAAAATCTGAGCATGGAAATGCATCTCACATTGATTTTCAGGGG
AACAAAACCAAAACGAAGGATTATAAACGAAAATGCAAACTTGAGGAAGAGATCAGCAAT
AATGGCGATCCTACAACATCAGAAACGGCTACGCTTAAAAGAACGCGTAGGACTCGCCGT
AAAAGGTCGTCCACTTTTGGCGATTCACGAATTCCACCACTACCAGATACTGAAAGCCTG
AAACAGGAGAGGAGAAAGGGTCCGGTTTGGTTCTCACTTGTAGCTTCAAATAATCAGGAA
GGAGAAACATCACTGCCTCAGATTCCGGCAAATTACTTGAGAATAAGGGATGGAAATATT
CCAGTTTCGTTTATCCAAAAGTACCTCATGAGGAAGCTTGATCTCAAGAGTGAAACTGAG
ATAGAGATAAGATGTATGGGAGAAGCAGTGATCCCAACGTTGGAGCTTCACAGCTTAGTG
GAGCTATGGTTGGAAACAACTTCTAAGCATGAAAGAGTGGCTGCAACTATAGGTTCCTCC
GCAAAGGAATTTGTAATGGTGCTAGCTTATGCTCGGAAGGTCCCTGAATGCAACAACAAC
TAAAAGAAGTGATCAATAATGAAGTGAAGTGCAGGAGCAGGAGCAGTGGAATGTAATGTG
TAGTTTGTAATGATACATGTATATTTTCTTATAAATCTGAAAATGAATGGTCCGTGAGAC
GGACACTTTTGTTGTCTAAGGAGGGGATATTCAAGATTTGTTTTTTTTTTAAAAGGTGAT
TGTATGTCTTGTTGGACATTTGAATGTATGATTAGAGATAGAGGATGATGTTGTCATTTC
TATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2BM66TF U 1
AF RR2BM66JQ C 111
BS 1 634 RR2BM66TF
BS 635 635 RR2BM66JQ
BS 636 640 RR2BM66TF
BS 641 641 RR2BM66JQ
BS 642 669 RR2BM66TF
BS 670 670 RR2BM66JQ
BS 671 694 RR2BM66TF
BS 695 695 RR2BM66JQ
BS 696 702 RR2BM66TF
BS 703 703 RR2BM66JQ
BS 704 719 RR2BM66TF
BS 720 844 RR2BM66JQ

RD RR2BM66TF 719 0 0
GATGTGGCAAACGGAACAAAATCTGAGCATGGAAATGCATCTCACATTGATTTTCAGGGG
AACAAAACCAAAACGAAGGATTATAAACGAAAATGCAAACTTGAGGAAGAGATCAGCAAT
AATGGCGATCCTACAACATCAGAAACGGCTACGCTTAAAAGAACGCGTAGGACTCGCCGT
AAAAGGTCGTCCACTTTTGGCGATTCACGAATTCCACCACTACCAGATACTGAAAGCCTG
AAACAGGAGAGGAGAAAGGGTCCGGTTTGGTTCTCACTTGTAGCTTCAAATAATCAGGAA
GGAGAAACATCACTGCCTCAGATTCCGGCAAATTACTTGAGAATAAGGGATGGAAATATT
CCAGTTTCGTTTATCCAAAAGTACCTCATGAGGAAGCTTGATCTCAAGAGTGAAACTGAG
ATAGAGATAAGATGTATGGGAGAAGCAGTGATCCCAACGTTGGAGCTTCACAGCTTAGTG
GAGCTATGGTTGGAAACAACTTCTAAGCATGAAAGAGTGGCTGCAACTATAGGTTCCTCC
GCAAAGGAATTTGTAATGGTGCTAGCTTATGCTCGGAAGGTCCCTGAATGCAACAACAAC
TAAAAGAAGTGATCAATAATGAAGTGAAGTGCAG*AGCAG*AGCAGTGGAATGTAATGTG
TAGTTTGTA*TGATACATGTATATTTTCTTATAA*TCTGAAA*TGAATGGTCCGTGAGA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2BM66JQ 734 0 0
GATCAGCAATAATGGCGATCCTACAACATCAGAAACGGCTACGCTTAAAAGAACGCGTAG
GACTCGCCGTAAAAGGTCGTCCACTTTTGGCGATTCACGAATTCCACCACTACCAGATAC
TGAAAGCCTGAAACAGGAGAGGAGAAAGGGTCCGGTTTGGTTCTCACTTGTAGCTTCAAA
TAATCAGGAAGGAGAAACATCACTGCCTCAGATTCCGGCAAATTACTTGAGAATAAGGGA
TGGAAATATTCCAGTTTCGTTTATCCAAAAGTACCTCATGAGGAAGCTTGATCTCAAGAG
TGAAACTGAGATAGAGATAAGATGTATGGGAGAAGCAGTGATCCCAACGTTGGAGCTTCA
CAGCTTAGTGGAGCTATGGTTGGAAACAACTTCTAAGCATGAAAGAGTGGCTGCAACTAT
AGGTTCCTCCGCAAAGGAATTTGTAATGGTGCTAGCTTATGCTCGGAAGGTCCCTGAATG
CAACAACAACTAAAAGAAGTGATCAATAATGAAGTGAAGTGCAGGAGCAGGAGCAGTGGA
ATGTAATGTGTAGTTTGTAATGATACATGTATATTTTCTTATAAATCTGAAAATGAATGG
TCGGTGAGACGGACACTTTTGTTGTCTAAGGAGGGGATATTCAAGATTTGTTTTTTTTTT
AAAAGGTGATTGTATGTCTTGTTGGACATTTGAATGTATGATTAGAGATAGAGGATGATG
TTGTCATTTCTATG

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL6621Contig1 825 2 8 U
GGGAGGAGCTAAACCAAAAGAAAATGGCAGCTTCTTCTTCTCCGTCTCTCCTTCTACCAT
TAGGTTCATCATCATCTAGAAACGGTCCAACCATTAAGACTCCAAGATGTATATCTACAA
GAGTCATCATAGCTTCAGAGACAAGAGACAACAGCTGTAGAACCAATACTCTTTCTAGCC
GTAGAGACGCAATGCTATTGGTTCTCGGCGTGTCGGGACTCTCAACGAGCTACTCTCTTG
CTGCTTATGCAGCCGGTTTGCCTCCAGAGGATAAACCGAGGCTTTGTGAAGCAGAGTGCG
AGAAAGAGCTTGAAAATGTCCCAGTGGTAACTACAGAGTCAGGGCTTCAGTATAAAGATA
TCAAAGTTGGTAAAGGCCCTACTCCCCCTGTTGGTTTTCAGGTTGCTGCTAACTATGTAG
CTATGGTTCCTTCAGGGCAGATTTTCGACAGTTCTCTAGAGAAAGGTCTACCGTATCTGT
TCCGTGTTGGGTCTGGCCAGGTGATCAAGGGACTAGATGAAGGACTCTTGACTATGAAAG
CTGGTGGTAAACGCAGACTCTACATTCCAGGGCCTTTGGCGTTTCCAAAGGGTCTAGTCT
CAGCTCCGGGGAGGCCGAGAGTTGCACCGAACAGTCCAGTGGTATTTGACGTGAGCTTAG
AGTACATACCAGGGCTCGAGTCAGATGAAGAGTGAAACTATTTTTTTTTCAAAAGTTCAG
ATTATAATATGAAATACAACATTATGTGATGGTGTCTCATTTTTACCTACATTTCGTTGT
AAAAAGAAACCGTCAGCTATTCAGCTCCTTCACCATTAGGCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H826TF U 1
AF RR2H826JQ C 208
BS 1 696 RR2H826TF
BS 697 697 RR2H826JQ
BS 698 708 RR2H826TF
BS 709 711 RR2H826JQ
BS 712 733 RR2H826TF
BS 734 734 RR2H826JQ
BS 735 757 RR2H826TF
BS 758 825 RR2H826JQ

RD RR2H826TF 757 0 0
GGGAGGAGCTAAACCAAAAGAAAATGGCAGCTTCTTCTTCTCCGTCTCTCCTTCTACCAT
TAGGTTCATCATCATCTAGAAACGGTCCAACCATTAAGACTCCAAGATGTATATCTACAA
GAGTCATCATAGCTTCAGAGACAAGAGACAACAGCTGTAGAACCAATACTCTTTCTAGCC
GTAGAGACGCAATGCTATTGGTTCTCGGCGTGTCGGGACTCTCAACGAGCTACTCTCTTG
CTGCTTATGCAGCCGGTTTGCCTCCAGAGGATAAACCGAGGCTTTGTGAAGCAGAGTGCG
AGAAAGAGCTTGAAAATGTCCCAGTGGTAACTACAGAGTCAGGGCTTCAGTATAAAGATA
TCAAAGTTGGTAAAGGCCCTACTCCCCCTGTTGGTTTTCAGGTTGCTGCTAACTATGTAG
CTATGGTTCCTTCAGGGCAGATTTTCGACAGTTCTCTAGAGAAAGGTCTACCGTATCTGT
TCCGTGTTGGGTCTGGCCAGGTGATCAAGGGACTAGATGAAGGACTCTTGACTATGAAAG
CTGGTGGTAAACGCAGACTCTACATTCCAGGGCCTTTGGCGTTTCCAAAGGGTCTAGTCT
CAGCTCCGGGGAGGCCGAGAGTTGCACCGAACAGTCCAGTGGTATTTGACGTGAGCTTAG
AGTACATACCAGGGCTCGAGTCAGATGAAGAGTGAA*CTATTTTTTTT**CAAAGTTCAG
ATTATAATATGAA*TACAACATTATGTGATGGTGTCT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2H826JQ 618 0 0
GCGTGTCGGGACTCTCAACGAGCTACTCTCTTGCTGCTTATGCAGCCGGTTTGCCTCCAG
AGGATAAACCGAGGCTTTGTGAAGCAGAGTGCGAGAAAGAGCTTGAAAATGTCCCAGTGG
TAACTACAGAGTCAGGGCTTCAGTATAAAGATATCAAAGTTGGTAAAGGCCCTACTCCCC
CTGTTGGTTTTCAGGTTGCTGCTAACTATGTAGCTATGGTTCCTTCAGGGCAGATTTTCG
ACAGTTCTCTAGAGAAAGGTCTACCGTATCTGTTCCGTGTTGGGTCTGGCCAGGTGATCA
AGGGACTAGATGAAGGACTCTTGACTATGAAAGCTGGTGGTAAACGCAGACTCTACATTC
CAGGGCCTTTGGCGTTTCCAAAGGGTCTAGTTTCAGCTCCGGGGAGGCCGAGAGTTGCAC
CGAACAGTCCAGTGGTATTTGACGTGAGCTTAGAGTACATACCAGGGCTCGAGTCAGATG
AAGAGTGAAACTATTTTTTTTTCAAAAGTTCAGATTATAATATGAAATACAACATTATGT
GATGGTGTCTCATTTTTACCTACATTTCGTTGTAAAAAGAAACCGTCAGCTATTCAGCTC
CTTCACCATTAGGCCCCC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL6622Contig1 1417 2 4 U
GGAAGCCATATATATTTATTGGCCGTACTTTGTATCTTTGGCCAAACCTAAAAAACAAAA
ACAGACACCTTATATTTTGTAATTGATTCTTGTCGTATAGATGCCCCAATTCAGTTCATC
CCAAGCTCCCATTCTAATCCTCTCCCTTCTCATTATCCTGCTTTGTTCAGCGCAAACACA
ATGCCACACCAAAGGTCTACGATTACGACCAAGAAACCAGAAGACTGTGAACTCTACGAG
TCAGACACAAAACCCTGAAGACGAATTCTTGAAATGGGTTAGATACGTTGGGAGCCTCAA
GCACTCGGTGTTCAAGGCAGCCAAGAACAAACTCTTCCCTTCGTATACACTCACGGTCCA
TAAGAAACACAATAAAGGCGACTTCACTAAAATCCAAGACGCCATTGATTCTCTCCCTCT
CATCAATCTCGTTCGTGTCGTCATCAAAGTTCATGCTGGAGTTTACAAGGAAAAAGTGAA
CATCCCTCCAATGAAGGCATTCATAACAATAGAAGGAGAAGGAGCAGATAATACAATAGT
GCAATGGGGAGACACAGCACAAACGCATGACCCAAGAGGCAATCCCATGGGCACATTCAA
CTCTGCCTCGTTTGCCGTCAACTCTCCTTTCTTTGTCGCCAAGAACATCACTTTCAAGAA
CACGACCCCAGTTCCCTTGCCAGGCGCGGTTGGAAAACAAGCGGTGGCATTGAGAGTGTC
AGCAGACAATGCTGCATTTTTCGGGTGTAAAATGCTTGGTGCTCAAGACACTCTCTATGA
CCATTTGGGAAGACATTATTACAAAGACTGTTACATTGAAGGATCCGTTGACTTTATATT
TGGCAATGCCCTTTCTCTCTATGAGGGGTGTCACGTGCACGCGATAGCGGATAAGCTAGG
AGCAGTAACGGCGCAAGGGAGGAGCATTGTGCTAGAAGACACAGGATTCTCGTTCTTGAA
GTGTAAGGTGACAGGGACAGGAGTTTTGTACCTTGGGAGGGCATGGGGTCCCTTTTCGAG
AGTCGTATTTGCTTACACCTATATGGAAAACATCATCCTCCCTAAAGGCTGGTACAATTG
GGGCGACCCTTCACGCGAGATGACCGTGTTCTATGGGCAGTACAAGTGCACGGGAGCAGG
AGCAAACTATGCAGGGAGGGTGGCTTGGGCAAGAGAGCTCACCGACGAAGAAGCTAAGCC
TTTTATTTCTCTTACCTTCATCGACGGCTCTGAATGGATCAGACTCTAACCATTACTCTT
TTCTCTTCTTTTTTTTTGTCACTCTTCTTACCTAATTAATAATGTACATTTTATCAATAA
AATTAAAATACATTTTTAAAAATAGACCTCATCTTCTTGTACTGATAAACTCAACTTGAT
CCTACCCACACATTTTTAATACAATTTTTATGTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A743TF U 1
AF RR2A743JQ C 675
BS 1 821 RR2A743TF
BS 822 822 RR2A743JQ
BS 823 840 RR2A743TF
BS 841 1417 RR2A743JQ

RD RR2A743TF 840 0 0
GGAAGCCATATATATTTATTGGCCGTACTTTGTATCTTTGGCCAAACCTAAAAAACAAAA
ACAGACACCTTATATTTTGTAATTGATTCTTGTCGTATAGATGCCCCAATTCAGTTCATC
CCAAGCTCCCATTCTAATCCTCTCCCTTCTCATTATCCTGCTTTGTTCAGCGCAAACACA
ATGCCACACCAAAGGTCTACGATTACGACCAAGAAACCAGAAGACTGTGAACTCTACGAG
TCAGACACAAAACCCTGAAGACGAATTCTTGAAATGGGTTAGATACGTTGGGAGCCTCAA
GCACTCGGTGTTCAAGGCAGCCAAGAACAAACTCTTCCCTTCGTATACACTCACGGTCCA
TAAGAAACACAATAAAGGCGACTTCACTAAAATCCAAGACGCCATTGATTCTCTCCCTCT
CATCAATCTCGTTCGTGTCGTCATCAAAGTTCATGCTGGAGTTTACAAGGAAAAAGTGAA
CATCCCTCCAATGAAGGCATTCATAACAATAGAAGGAGAAGGAGCAGATAATACAATAGT
GCAATGGGGAGACACAGCACAAACGCATGACCCAAGAGGCAATCCCATGGGCACATTCAA
CTCTGCCTCGTTTGCCGTCAACTCTCCTTTCTTTGTCGCCAAGAACATCACTTTCAAGAA
CACGACCCCAGTTCCCTTGCCAGGCGCGGTTGGAAAACAAGCGGTGGCATTGAGAGTGTC
AGCAGACAATGCTGCATTTTTCGGGTGTAAAATGCTTGGTGCTCAAGACACTCTCTATGA
CCATTTGGGAAGACATTATTACAAAGACTGTTACATTGAAG*ATCCGTTGACTTTATATT

QA 1 840 1 840
DS 

RD RR2A743JQ 743 0 0
CCTTGCCAGGCGCGGTTGGAAAACAAGCGGTGGCATTGAGAGTGTCAGCAGACAATGCTG
CATTTTTCGGGTGTAAAATGCTTGGTGCTCAAGACACTCTCTATGACCATTTGGGAAGAC
ATTATTACAAAGACTGTTACATTGAAGGATCCGTTGACTTTATATTTGGCAATGCCCTTT
CTCTCTATGAGGGGTGTCACGTGCACGCGATAGCGGATAAGCTAGGAGCAGTAACGGCGC
AAGGGAGGAGCATTGTGCTAGAAGACACAGGATTCTCGTTCTTGAAGTGTAAGGTGACAG
GGACAGGAGTTTTGTACCTTGGGAGGGCATGGGGTCCCTTTTCGAGAGTCGTATTTGCTT
ACACCTATATGGAAAACATCATCCTCCCTAAAGGCTGGTACAATTGGGGCGACCCTTCAC
GCGAGATGACCGTGTTCTATGGGCAGTACAAGTGCACGGGAGCAGGAGCAAACTATGCAG
GGAGGGTGGCTTGGGCAAGAGAGCTCACCGACGAAGAAGCTAAGCCTTTTATTTCTCTTA
CCTTCATCGACGGCTCTGAATGGATCAGACTCTAACCATTACTCTTTTCTCTTCTTTTTT
TTTGTCACTCTTCTTACCTAATTAATAATGTACATTTTATCAATAAAATTAAAATACATT
TTTAAAAATAGACCTCATCTTCTTGTACTGATAAACTCAACTTGATCCTACCCACACATT
TTTAATACAATTTTTATGTCACT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL6623Contig1 1054 2 2 U
GCATACAGAGGAATGCTTCAATTAGGTTCAGTTGAAGAAGTGAGACAGCAGTTAATTGAC
TGGCTGGCTTTGTCCCTCAACCATTCAGTTCCATCATCCCTCTTAATTCTCTCTAGATCG
TTCTCCATGTCTGGGAAACTCAAGCCGGAAGAGGAAGTTAGAATACTTAGAAATGCAAGA
AGAATTAATCAAGGAGGAAGAGGATGAAGAAGAGGAGGAAATGGCAAAGATGAAAGAGTC
TGCTTCGAGCCAAAAAGATGTAGCGTTGGACGAGATGCTGGCATCTACAGCTAAGGATGC
TAATGAACAAGCGAAAGCGAAAACTCTTGAGAAACATGAGCAGCTCTGTGAGCTCAGCCG
TGCATTGGCAGTTTTAGCTTCCGCATCTTCTGTTAGCATGGAGCGTGAAGAGTTCCTCAA
ACTAGTTAAAAAGGAGGTAGATCTATACAACAGCATGGTAGAGAAAGGTGGTACAGATGA
TGAGGAAGAAGCTAGGAAAGCTTACTTAGCTGCCCGAGAAGATAGTGACCGAAGTGCGCA
GAAAGCAATCGCTGATAAAACTTCTTCTAGACTGTTAGATAGGGTTGAGTCAATGCTCCA
GAAACTGGAAAAGGAAATAGATGACGTCGATAACAAGATTGGTAACCGCTGGAGACTCCT
GGACAGAGACTATGATGGAAAGGTAAGTCCAGATGAAGTTGCATCGGCTGCGACGTACCT
AAAGGACACATTGGGCAAAGAGGGAATTCAAGAGCTTATTCAGAATCTTTCTAAAGATAA
AGATGGCAAAATTCTGGTGGAAGATTTGGTGAAGTTAGCGAGCGAGATTGAAGATGCTGA
AGAAGCAGCTGAGGAGGCGGCGAATGAGCCAACCAAGCCTTGAGAGATTGTTTGTTCTTT
GTGTGTTTTCACTTTTCACGATTCGTATTTTCTGTTTACTGGAAAGTAAATTTCATATAG
TATGACGAAATCTATCATAATAAGTTTCTTGACACATTTTTTTTGTTTTCGACATTATCG
GTTTCTTTAGAATGCTACGTTTTCTGTTTTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL40TF U 1
AF RR2FL40JQ C 245
BS 1 510 RR2FL40TF
BS 511 1054 RR2FL40JQ

RD RR2FL40TF 510 0 0
GCATACAGAGGAATGCTTCAATTAGGTTCAGTTGAAGAAGTGAGACAGCAGTTAATTGAC
TGGCTGGCTTTGTCCCTCAACCATTCAGTTCCATCATCCCTCTTAATTCTCTCTAGATCG
TTCTCCATGTCTGGGAAACTCAAGCCGGAAGAGGAAGTTAGAATACTTAGAAATGCAAGA
AGAATTAATCAAGGAGGAAGAGGATGAAGAAGAGGAGGAAATGGCAAAGATGAAAGAGTC
TGCTTCGAGCCAAAAAGATGTAGCGTTGGACGAGATGCTGGCATCTACAGCTAAGGATGC
TAATGAACAAGCGAAAGCGAAAACTCTTGAGAAACATGAGCAGCTCTGTGAGCTCAGCCG
TGCATTGGCAGTTTTAGCTTCCGCATCTTCTGTTAGCATGGAGCGTGAAGAGTTCCTCAA
ACTAGTTAAAAAGGAGGTAGATCTATACAACAGCATGGTAGAGAAAGGTGGTACAGATGA
TGAGGAAGAAGCTAGGAAAGCTTACTTAGC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RR2FL40JQ 810 0 0
TCGAGCCAAAAAGATGTAGCGTTGGACGAGATGCTGGCATCTACAGCTAAGGATGCTAAT
GAACAAGCGAAAGCGAAAACTCTTGAGAAACATGAGCAGCTCTGTGAGCTCAGCCGTGCA
TTGGCAGTTTTAGCTTCCGCATCTTCTGTTAGCATGGAGCGTGAAGAGTTCCTCAAACTA
GTTAAAAAGGAGGTAGATCTATACAACAGCATGGTAGAGAAAGGTGGTACAGATGATGAG
GAAGAAGCTAGGAAAGCTTACTTAGCTGCCCGAGAAGATAGTGACCGAAGTGCGCAGAAA
GCAATCGCTGATAAAACTTCTTCTAGACTGTTAGATAGGGTTGAGTCAATGCTCCAGAAA
CTGGAAAAGGAAATAGATGACGTCGATAACAAGATTGGTAACCGCTGGAGACTCCTGGAC
AGAGACTATGATGGAAAGGTAAGTCCAGATGAAGTTGCATCGGCTGCGACGTACCTAAAG
GACACATTGGGCAAAGAGGGAATTCAAGAGCTTATTCAGAATCTTTCTAAAGATAAAGAT
GGCAAAATTCTGGTGGAAGATTTGGTGAAGTTAGCGAGCGAGATTGAAGATGCTGAAGAA
GCAGCTGAGGAGGCGGCGAATGAGCCAACCAAGCCTTGAGAGATTGTTTGTTCTTTGTGT
GTTTTCACTTTTCACGATTCGTATTTTCTGTTTACTGGAAAGTAAATTTCATATAGTATG
ACGAAATCTATCATAATAAGTTTCTTGACACATTTTTTTTGTTTTCGACATTATCGGTTT
CTTTAGAATGCTACGTTTTCTGTTTTTAGC

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

CO CL6624Contig1 705 2 2 U
GGGATAGGAATGATGATTCCAATAGCAGCTAGTACGAGATCTCTTTGCCTTATTATAGCT
CCCTTTATTTTCCTTTTTCTTACGGTTCTTGCCTCCACCGAGCCACCTCCGACTCCCACA
TTGAGACATGACAACCAAAGCAGCGACCTAGTCTCTGCCATTGCCGACATGGTTAGGGAA
TCTTATAACGGTCTTGGCACCCTACTCCTTCTCCATGCCCTGAACGATACAAATTTCTAA
AAGAACCAAGAGATTACTTTCTTGATGCCTAGCGACGACCATCTTTCCCAAGCAGACATG
AGCCAAGAGAGTCTCGAGACATTTATACTAAAACATACGATCCCTGCGTGTCTTATGATC
AACCACATGCTTCGTTTCCCAAACAAAACTCTTGTTCCTTGTAGCATCCCTGATAAAATG
TTCATCATCACGAAATCTGGTAGGTCGGGGGGACTGTATGTGAACAATGCGAGGATCGTT
TCACCGAATATTTGTCGGAATTCTCGCGTAGCTTGCCATGGAGTGAGCAACGTTATTACA
TTCAACGAAGACGCATTTTCAAAGGCAATATTATCACCTGTGTTATCATCAGTTCGTGAA
AGAATCACATCGTCCAGGCACTGAAGCTCTCTCTGTCTTTACCACACAAATTTGAAAGGT
GTGGGGTAATCTTCTAAAGTCATAAAAAAGGTTGTAGATTTCTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B684JQ C 1
AF RR2B684TF U 1
BS 1 683 RR2B684TF
BS 684 705 RR2B684JQ

RD RR2B684JQ 705 0 0
GGGATAGGAATGATGATTCCAATAGCAGCTAGTACGAGATCTCTTTGCCTTATTATAGCT
CCCTTTATTTTCCTTTTTCTTACGGTTCTTGCCTCCACCGAGCCACCTCCGACTCCCACA
TTGAGACATGACAACCAAAGCAGCGACCTAGTCTCTGCCATTGCCGACATGGTTAGGGAA
TCTTATAACGGTCTTGGCACCCTACTCCTTCTCCATGCCCTGAACGATACAAATTTCTAA
AAGAACCAAGAGATTACTTTCTTGATGCCTAGCGACGACCATCTTTCCCAAGCAGACATG
AGCCAAGAGAGTCTCGAGACATTTATACTAAAACATACGATCCCTGCGTGTCTTATGATC
AACCACATGCTTCGTTTCCCAAACAAAACTCTTGTTCCTTGTAGCATCCCTGATAAAATG
TTCATCATCACGAAATTTGGTAGGTCGGGGGGACTGTATGTGAACAATGCGAGGATCGTT
TCACCGAATATTTGTCGGAATTCTCGCGTAGCTTGCCATGGAGTGAGCAACGTTATTACA
TTCAACGAAGACGCATTTTCAAAGGCAATATTATCACCTGTGTTATCATCAGTTCGTGAA
AGAATCACATCGTCCAGGCACTGAAGCTCTCTCTGTCTTTACCACACAAATTTGAAAGGT
GTGGGGTAATCTTCTAAAGTCATAAAAAAGGTTGTAGATTTCTCG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2B684TF 683 0 0
GGGATAGGAATGATGATTCCAATAGCAGCTAGTACGAGATCTCTTTGCCTTATTATAGCT
CCCTTTATTTTCCTTTTTCTTACGGTTCTTGCCTCCACCGAGCCACCTCCGACTCCCACA
TTGAGACATGACAACCAAAGCAGCGACCTAGTCTCTGCCATTGCCGACATGGTTAGGGAA
TCTTATAACGGTCTTGGCACCCTACTCCTTCTCCATGCCCTGAACGATACAAATTTCTAA
AAGAACCAAGAGATTACTTTCTTGATGCCTAGCGACGACCATCTTTCCCAAGCAGACATG
AGCCAAGAGAGTCTCGAGACATTTATACTAAAACATACGATCCCTGCGTGTCTTATGATC
AACCACATGCTTCGTTTCCCAAACAAAACTCTTGTTCCTTGTAGCATCCCTGATAAAATG
TTCATCATCACGAAATCTGGTAGGTCGGGGGGACTGTATGTGAACAATGCGAGGATCGTT
TCACCGAATATTTGTCGGAATTCTCGCGTAGCTTGCCATGGAGTGAGCAACGTTATTACA
TTCAACGAAGACGCATTTTCAAAGGCAATATTATCACCTGTGTTATCATCAGTTCGTGAA
AGAATCACATCGTCCAGGCACTGAAGCTCTCTCTGTCTTTACCACACAAATTTGAAAGGT
GTGGGGTAATCTTCTAAAGTCAT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL6625Contig1 702 2 1 U
GGATCGGAGTTTTCACCGACGAATCGAACTGTCTTTCTATTTCTCTCTACGATTCAGGTT
TTTCACTTGCATTCGAAACAGAAAATTGTACTTCTCTTCTTATAGATAATTAACTAGCGA
CAAAGATGGATGATTGGGAGACTGAAGACTTTCAACCAACTCCTGCAAAAGTCGAACTGA
AAAGTAATTGGGATGATGAGGATGTTGATGAGAATGACATCAAGGACTCTTGGGAGGAGG
AGGAGGAGGAGAATGATGAACCTACTCCGGCAGCTGTAGTAAAGCCTGCTCCAAATAAAG
CTGTTGAAAAGAAAGGTAAATCTGTTGAAGCTCCTCCAAAAGAACCATCATCAAAGGATG
AACCTTTTGATCCTGTTGCTGACAAACTTCGCATGCAGAGGCTAGTGGAGGAAGCTGATT
ATGAGGCAACTGCTGAACTCTTTGGAGCAAAGACTGATGAAAAAAGCGTTGATGTTTTCA
TTCCCAAGTCTGAAAGCGATTTCTTGGAGTATGCTGAGATGATATCTCGTAAACTTTTAC
CTTATGAGAAAAGCTTTCACTATATTGGGCTGCTCAAAGCAGTGATGAGACTTTCTGTGG
CCAATATGAAAGCAGCTGATGTTAAAGACGTTGCTTCCTCTGTTTCGGCAATAGGTAACG
AAAAACTCAAGCAGAGAAAGAAGCTGCTGCCGGCAAAAGAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH08TF U 1
AF RR2FH20TF U 1
BS 1 702 RR2FH08TF

RD RR2FH08TF 702 0 0
GGATCGGAGTTTTCACCGACGAATCGAACTGTCTTTCTATTTCTCTCTACGATTCAGGTT
TTTCACTTGCATTCGAAACAGAAAATTGTACTTCTCTTCTTATAGATAATTAACTAGCGA
CAAAGATGGATGATTGGGAGACTGAAGACTTTCAACCAACTCCTGCAAAAGTCGAACTGA
AAAGTAATTGGGATGATGAGGATGTTGATGAGAATGACATCAAGGACTCTTGGGAGGAGG
AGGAGGAGGAGAATGATGAACCTACTCCGGCAGCTGTAGTAAAGCCTGCTCCAAATAAAG
CTGTTGAAAAGAAAGGTAAATCTGTTGAAGCTCCTCCAAAAGAACCATCATCAAAGGATG
AACCTTTTGATCCTGTTGCTGACAAACTTCGCATGCAGAGGCTAGTGGAGGAAGCTGATT
ATGAGGCAACTGCTGAACTCTTTGGAGCAAAGACTGATGAAAAAAGCGTTGATGTTTTCA
TTCCCAAGTCTGAAAGCGATTTCTTGGAGTATGCTGAGATGATATCTCGTAAACTTTTAC
CTTATGAGAAAAGCTTTCACTATATTGGGCTGCTCAAAGCAGTGATGAGACTTTCTGTGG
CCAATATGAAAGCAGCTGATGTTAAAGACGTTGCTTCCTCTGTTTCGGCAATAGGTAACG
AAAAACTCAAGCAGAGAAAGAAGCTGCTGCCGGCAAAAGAAG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2FH20TF 665 0 0
GGATCGGAGTTTTCACCGACGAATCGAACTGTCTTTCTATTTCTCTCTACGATTCAGGTT
TTTCACTTGCATTCGAAACAGAAAATTGTACTTCTCTTCTTATAGATAATTAACTAGCGA
CAAAGATGGATGATTGGGAGACTGAAGACTTTCAACCAACTCCTGCAAAAGTCGAACTGA
AAAGTAATTGGGATGATGAGGATGTTGATGAGAATGACATCAAGGACTCTTGGGAGGAGG
AGGAGGAGGAGAATGATGAACCTACTCCGGCAGCTGTAGTAAAGCCTGCTCCAAATAAAG
CTGTTGAAAAGAAAGGTAAATCTGTTGAAGCTCCTCCAAAAGAACCATCATCAAAGGATG
AACCTTTTGATCCTGTTGCTGACAAACTTCGCATGCAGAGGCTAGTGGAGGAAGCTGATT
ATGAGGCAACTGCTGAACTCTTTGGAGCAAAGACTGATGAAAAAAGCGTTGATGTTTTCA
TTCCCAAGTCTGAAAGCGATTTCTTGGAGTATGCTGAGATGATATCTCGTAAACTTTTAC
CTTATGAGAAAAGCTTTCACTATATTGGGCTGCTCAAAGCAGTGATGAGACTTTCTGTGG
CCAATATGAAAGCAGCTGATGTTAAAGACGTTGCTTCCTCTGTTTCGGCA*TAGGTAACG
AAAA
C

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL6626Contig1 871 2 8 U
GGGGAACAGTTCATACTTAGGGTTCCACCCTCTGTTTCTGAGCGAATCGATCGTCTTTTG
AGCGACGAAGCTTCCACGTCCGACGAAATCCCTTTAGATTTGTGCTTTTCAGAGGATGGG
AGAAGTGGGACGTTTATGATTGGAAACGAAGAGTTCCCAGCTTCTCTGCTGGATCTTCCT
GCTGTTGTTGAGTCTTTTAAAACTTATGATGATTCTGCATTAGTCAAAACTGCTGATATT
GGGCAGATGATCATGGTTAGGGAGCCAGGTGATCCCTCGCCTAATACAGTAGAATACAGA
CATGGTCTAACTCCTCCAATGAAGGATGCTCGAAAGAGAAGATTCCGTCGAGAGCCTGAC
CTTAATCCGGAGCTTGTTCAGCGTGTTGAGAGAGACTTACTGAACATCTTGAGTGGCGGA
ACAATCGGAAACGTAAATGAGCAGCAAGAGGAAACAGTTGCGAACGAGAATACCAGTGAT
AATAATGCAAACAAGAAAGTGTCTTCTTCTTCACCTGCTGATGCACCTGGTGAAAAGCCT
GAAGAAGCTCTTGAGACAGCGACTAATAATAATAATAATAATGTAACCGAAGCTGAGCCG
GAGAGAAGTGAATCAGAAGATTCTGATGATTCAATGTGAGAGGTTATTTATGTAACGGCG
AAAGCTATATAGGATATTCCGAAGGGTTTTTAAAGAAACGTATCTAGGGAGTATGTCAAG
ATGTTGCCGCTATGTTTACCACTTATTATTTATTTGGTTCATTGTCAGCAAGAGAAGAGT
GTTCCGGTCCTGGTAATAATAACCTCTATGACTTTGTTGATTCTAGCTTTTGAGCCATAG
GCATCATATATAAGAAAGCACACTTACAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E743TF U 1
AF RR2E743JQ C 96
BS 1 672 RR2E743TF
BS 673 673 RR2E743JQ
BS 674 685 RR2E743TF
BS 686 686 RR2E743JQ
BS 687 708 RR2E743TF
BS 709 709 RR2E743JQ
BS 710 730 RR2E743TF
BS 731 871 RR2E743JQ

RD RR2E743TF 730 0 0
GGGGAACAGTTCATACTTAGGGTTCCACCCTCTGTTTCTGAGCGAATCGATCGTCTTTTG
AGCGACGAAGCTTCCACGTCCGACGAAATCCCTTTAGATTTGTGCTTTTCAGAGGATGGG
AGAAGTGGGACGTTTATGATTGGAAACGAAGAGTTCCCAGCTTCTCTGCTGGATCTTCCT
GCTGTTGTTGAGTCTTTTAAAACTTATGATGATTCTGCATTAGTCAAAACTGCTGATATT
GGGCAGATGATCATGGTTAGGGAGCCAGGTGATCCCTCGCCTAATACAGTAGAATACAGA
CATGGTCTAACTCCTCCAATGAAGGATGCTCGAAAGAGAAGATTCCGTCGAGAGCCTGAC
CTTAATCCGGAGCTTGTTCAGCGTGTTGAGAGAGACTTACTGAACATCTTGAGTGGCGGA
ACAATCGGAAACGTAAATGAGCAGCAAGAGGAAACAGTTGCGAACGAGAATACCAGTGAT
AATAATGCAAACAAGAAAGTGTCTTCTTCTTCACCTGCTGATGCACCTGGTGAAAAGCCT
GAAGAAGCTCTTGAGACAGCGACTAATAATAATAATAATAATGTAACCGAAGCTGAGCCG
GAGAGAAGTGAATCAGAAGATTCTGATGATTCAATGTGAGAGGTTATTTATGTAACGGCG
AAAGCTATATAG*ATATTCCGAAGG*TTTTTAAAGAAACGTATCTAGG*AGTATGTCAAG
ATGTTGCCGC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2E743JQ 776 0 0
AGATTTGTGCTTTTCAGAGGATGGGAGAAGTGGGACGTTTATGATTGGAAACGAAGAGTT
CCCAGCTTCTCTGCTGGATCTTCCTGCTGTTGTTGAGTCTTTTAAAACTTATGATGATTC
TGCATTAGTCAAAACTGCTGATATTGGGCAGATGATCATGGTTAGGGAGCCAGGTGATCC
CTCGCCTAATACAGTAGAATACAGACATGGTCTAACTCCTCCAATGAAGGATGCTCGAAA
GAGAAGATTCCGTCGAGAGCCTGACCTTAATCCGGAGCTTGTTCAGCGTGTTGAGAGAGA
CTTACTGAACATCTTGAGTGGCGGAACAATCGGAAACGTAAATGAGCAGCAAGAGGAAAC
AGTTGCGAACGAGAATACCAGTGATAATAATGCAAACAAGAAAGTGTCTTCTTCTTCACC
TGCTGATGCACCTGGTGAAAAGCCTGAAGAAGCTCTTGAGACAGCGACTAATAATAATAA
TAATAATGTAACCGAAGCTGAGCCGGAGAGAAGTGAATCAGAAGATTCTGATGATTCAAT
GTGAGAGGTTATTTATGTAACGGCGAAAGCTATATAGGATATTCCGAAGGGTTTTTAAAG
AAACGTATCTAGGGAGTATGTCAAGATGTTGCCGCTATGTTTACCACTTATTATTTATTT
GGTTCATTGTCAGCAAGAGAAGAGTGTTCCGGTCCTGGTAATAATAACCTCTATGACTTT
GTTGATTCTAGCTTTTGAGCCATAGGCATCATATATAAGAAAGCACACTTACAGAT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL6627Contig1 808 2 2 U
GGGGGAATGAACTATCTTCACGAGTGTAAACCAGAACCAGTAATCCACTGTGATCTAAAA
CCCAAAAATATTATGCTCGATCATGGAGGACATTTGAAGGTTGCGGGATTTGGTTTGATA
AGTTTTGAAAAGTTATCATCAGATAAATCAAAAGTCGTTAATCACGGGGCACATATAGAC
CCTTCAAATTACTGTGTGGCACCTGAGGTTTACAGAGATGAAATATTTGACAGAAGTGCG
GATTCATACTCTTTTGGTGTCGTGTTATATGAGATGATTGAAGGAGTACAACCATTCCAT
CCTAAGCCCCCGGAAGAGGCAGTGAAGCTAATGTGTTTAGAAGGACGAAGACCTTCGTTT
AAGACCAAGTCCAAAAGTTGTCCCGAAGAGATGAGAGAATTGATTGAAGAGTGTTGGGAT
GCGAAAGCTGTTGTTAGGCCGACTTTTTCTGAGATCATAGTTCGACTGGACAGAATCTTT
GTACAGTGCTCAAAACAAGGATGGTGGAAAGATACATTCAAATTTCCTTGGAAGTAGCAC
AGAGGACCAGGAGAGGTTTAAGCTCAGAAACAGGAGGAACTCAGCAATTCAAGAGCTCAC
TTCTCATCTTCACAATAAAATCGGCCGGTGCGGAGAATACAGAAAACATAAACGGCAGGT
GTCTCCCATTTTGTCAATGTCTTCTCGTGTAACAATGTATAAAGTACTTCAGCGAGCTAT
ATAAGACTTATGCCATGCACAGAACTTAGCACTTTGGGATACAATGTATCATATTTTGAT
ATAATAACTAGCAAGAAAGCTCTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H880TF U 1
AF RR2C411TF U 138
BS 1 633 RR2H880TF
BS 634 808 RR2C411TF

RD RR2H880TF 633 0 0
GGGGGAATGAACTATCTTCACGAGTGTAAACCAGAACCAGTAATCCACTGTGATCTAAAA
CCCAAAAATATTATGCTCGATCATGGAGGACATTTGAAGGTTGCGGGATTTGGTTTGATA
AGTTTTGAAAAGTTATCATCAGATAAATCAAAAGTCGTTAATCACGGGGCACATATAGAC
CCTTCAAATTACTGTGTGGCACCTGAGGTTTACAGAGATGAAATATTTGACAGAAGTGCG
GATTCATACTCTTTTGGTGTCGTGTTATATGAGATGATTGAAGGAGTACAACCATTCCAT
CCTAAGCCCCCGGAAGAGGCAGTGAAGCTAATGTGTTTAGAAGGACGAAGACCTTCGTTT
AAGACCAAGTCCAAAAGTTGTCCCGAAGAGATGAGAGAATTGATTGAAGAGTGTTGGGAT
GCGAAAGCTGTTGTTAGGCCGACTTTTTCTGAGATCATAGTTCGACTGGACAGAATCTTT
GTACAGTGCTCAAAACAAGGATGGTGGAAAGATACATTCAAATTTCCTTGGAAGTAGCAC
AGAGGACCAGGAGAGGTTTAAGCTCAGAAACAGGAGGAACTCAGCAATTCAAGAGCTCAC
TTCTCATCTTCACAATAAAATCGGCCGGTGCGG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2C411TF 671 0 0
GG
CAGATAAATCAAAAGTCGTTAATCACGGGGCACATATAGACCCTTCAAATTACTGTGTGG
CACCTGAGGTTTACAGAGATGAAATATTTGACAGAAGTGCGGATTCATACTCTTTTGGTG
TCGTGTTATATGAGATGATTGAAGGAGTACAACCATTCCATCCTAAGCCCCCGGAAGAGG
CAGTGAAGCTAATGTGTTTAGAAGGACGAAGACCTTCGTTTAAGACCAAGTCCAAAAGTT
GTCCCGAAGAGATGAGAGAATTGATTGAAGAGTGTTGGGATGCGAAAGCTGTTGTTAGGC
CGACTTTTTCTGAGATCATAGTTCGACTGGACAGAATCTTTGTACAGTGCTCAAAACAAG
GATGGTGGAAAGATACATTCAAATTTCCTTGGAAGTAGCACAGAGGACCAGGAGAGGTTT
AAGCTCAGAAACAGGAGGAACTCAGCAATTCAAGAGCTCACTTCTCATCTTCACAATAAA
ATCGGCCGGTGCGGAGAATACAGAAAACATAAACGGCAGGTGTCTCCCATTTTGTCAATG
TCTTCTCGTGTAACAATGTATAAAGTACTTCAGCGAGCTATATAAGACTTATGCCATGCA
CAGAACTTAGCACTTTGGGATACAATGTATCATATTTTGATATAATAACTAGCAAGAAAG
CTCTTTATT

QA 3 671 3 671
DS 



AS 1 2

CO CL6628Contig1 689 2 6 U
GGAAGGAGAACATTTCTGTTTACCTACAACACTTCGCAGCTAGAAATGTCCGGCGAATCG
GCGGTTACGGCTATGGAGACAACGGAGACGGGGAACCAAAGTTCCGTCAAGATTAACTCG
AACAACGCCGACACAACAGATATGGAGCTCCAGATTCTTGCAGCTATGCGATCCCGCGTA
ACCTACCTCAAAACCAAAGCAGACTCGGTGACCTTCGCGAGTGTGAGGAGGCTTCTGGAG
GAAGATATGGGATTGGAGAAATATGCGTTGGATGCGCATAAGAGCTTCGTCAAAGAGCAT
TTGGTTAAGTGCTTAGAGGATCCTGATGGCGCTTCAGATAACCCTCAGGAAACTGAGAAG
AAAGAAGTAGCAGTTGCATTGGAAGAGCAAGAGGTGAAGAAGGATGTAAGGGAAGAAACT
GTTGATGACGAGAAAACTGTGGGGAATACAGATGCCCTGATGAGTGATATAACGAGGGCT
CTTCGAAAAAGAGCGTCTTATGTTAAGGCTAACTCAGAGGAAATTACAATGGCTTCACTT
CGTCGACTTTTGGAGGAAGATCTTAAATTAAAGAAAGATTCTCTTGTTCCCTTCAAGAAG
TTCATCAATAAAGAACTAGATGATGTACTACAAATTCCTGACCCTCCTAAACAAACGACT
AAGCCTTCTGGGAAAAGTGTAAAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2B708TF U 1
AF RR2GL03TF U 50
BS 1 428 RR2B708TF
BS 429 429 RR2GL03TF
BS 430 489 RR2B708TF
BS 490 490 RR2GL03TF
BS 491 686 RR2B708TF
BS 687 689 RR2GL03TF

RD RR2B708TF 686 0 0
GGAAGGAGAACATTTCTGTTTACCTACAACACTTCGCAGCTAGAAATGTCCGGCGAATCG
GCGGTTACGGCTATGGAGACAACGGAGACGGGGAACCAAAGTTCCGTCAAGATTAACTCG
AACAACGCCGACACAACAGATATGGAGCTCCAGATTCTTGCAGCTATGCGATCCCGCGTA
ACCTACCTCAAAACCAAAGCAGACTCGGTGACCTTCGCGAGTGTGAGGAGGCTTCTGGAG
GAAGATATGGGATTGGAGAAATATGCGTTGGATGCGCATAAGAGCTTCGTCAAAGAGCAT
TTGGTTAAGTGCTTAGAGGATCCTGATGGCGCTTCAGATAACCCTCAGGAAACTGAGAAG
AAAGAAGTAGCAGTTGCATTGGAAGAGCAAGAGGTGAAGAAGGATGTAAGGGAAGAAACT
GTTGATGATGAGAAAACTGTGGGGAATACAGATGCCCTGATGAGTGATATAACGAGGGCT
CTTCGAAAAGGAGCGTCTTATGTTAAGGCTAACTCAGAGGAAATTACAATGGCTTCACTT
CGTCGACTTTTGGAGGAAGATCTTAAATTAAAGAAAGATTCTCTTGTTCCCTTCAAGAAG
TTCATCAATAAAGAACTAGATGATGTACTACAAATTCCTGACCCTCCTAAACAAACGACT
AAGCCTTCTGGGAAAAGTGTAAAGAA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2GL03TF 640 0 0
GG
GGCGAATCGGCGGTTACGGCTATGGAGACAACGGAGACGGGGAACCAAAGTTCCGTCAAG
ATTAGCTCGAACAGCGCCGACACAACAGATATGGAGCTCCAGATTCTTGCAGCTATGCGA
TCCCGCGTAACCTACCTCAAAACCAAAGCAGACTCGGTGACCTTCGCGAGTGTGAGGAGG
CTTCTGGAGGAAGATATGGGATTGGAGAAATATGCGTTGGATGCGCATAAGAGCTTCGTC
AAAGAGCATTTGGTTAAGTGCTTAGAGGATCCTGATGGCGCTTCAGATAACCCTCAGGAA
ACTGAGAAGAAAGAAGTAGCAGTTGCATTGGAAGAGCAAGAGGTGAAGAAGGATGTAAGG
GAAGAAACTGTTGATGACGAGAAAACTGTGGGGAATACAGATGCCCTGATGAGTGATATA
ACGAGGGCTCTTCGAAAAAGAGCGTCTTATGTTAAGGCTAACTCAGAGGAAATTACAATG
GCTTCACTTCGTCGACTTTTGGAGGAAGATCTTAAATTAAAGAAAGATTCTCTTGTTCCC
TTCAAGAAGTTCATCAATAAAGAACTAGATGATGTACTACAAATTCCTGACCCTCCTAAA
CAAACGACTAAGCCTTCTGGGAAAAGTGTAAAGAAAAA

QA 3 640 3 640
DS 



AS 1 2

CO CL6629Contig1 627 2 1 U
GGCCTTACATTTCAGTTTTCTTATCTTTCTGCTTCCACACCTTCAACAAAATATAATAAA
CCCTCTAGATATACTGGCTATATAGACTCCCATTTTTTTCACAAACTTAACTCCCTTATT
AAGTATTATAGCCTTTTTGTCTCTCGTTACTTCTCCAGAGAAAGAGAGAAAGTACACAGC
TTAAGTTTCACTTTCTTGCGACATAGTAGTTTTACAACTAAGCAACAAGTAATCTACAAA
AATGTCTAACAGAAGATCAAGACAATCTTCAAGTACTCTGAGGATTTCCGATGACCAGAT
GATCAACCTAGTAAGTAAGCTCCGTCTTCTTTTGCCTGAGATTCGTGAACGGCACCGTTC
TGATAAGGTGTCCGCATCGAAGGTACTACAAGAGACATGCAACTACATAAGAAAGCTGCA
TAGAGAAGTTGACAATCTCAGTGACCGTTTGTCCCAGCTGCTCGACTCGGTTGATGAAGA
TAGTCAAGAAGCTGCCGTCATTAGAAGCTTACTTATGTAACCTTCCAATATAATGATTTA
TTACAATTTGATATTATTTATATTAACTTATATGTAATATGTCGATCGTCCTTAATATAT
TATCAAGCGACGTATTTTTAATGAGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C130JQ C 1
AF RR2C130TF U 1
BS 1 627 RR2C130TF

RD RR2C130JQ 627 0 0
GGCCTTACATTTCAGTTTTCTTATCTTTCTGCTTCCACACCTTCAACAAAATATAATAAA
CCCTCTAGATATACTGGCTATATAGACTCCCATTTTTTTCACAAACTTAACTCCCTTATT
AAGTATTATAGCCTTTTTGTCTCTCGTTACTTCTCCAGAGAAAGAGAGAAAGTACACAGC
TTAAGTTTCACTTTCTTGCGACATAGTAGTTTTACAACTAAGCAACAAGTAATCTACAAA
AATGTCTAACAGAAGATCAAGACAATCTTCAAGTACTCTGAGGATTTCCGATGACCAGAT
GATCAACCTAGTAAGTAAGCTCCGTCTTCTTTTGCCTGAGATTCGTGAACGGCACCGTTC
TGATAAGGTGTCCGCATCGAAGGTACTACAAGAGACATGCAACTACATAAGAAAGCTGCA
TAGAGAAGTTGACAATCTCAGTGACCGTTTGTCCCAGCTGCTCGACTCGGTTGATGAAGA
TAGTCAAGAAGCTGCCGTCATTAGAAGCTTACTTATGTAACCTTCCAATATAATGATTTA
TTACAATTTGATATTATTTATATTAACTTATATGTAATATGTCGATCGTCCTTAATATAT
TATCAAGCGACGTATTTTTAATGAGCT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2C130TF 627 0 0
GGCCTTACATTTCAGTTTTCTTATCTTTCTGCTTCCACACCTTCAACAAAATATAATAAA
CCCTCTAGATATACTGGCTATATAGACTCCCATTTTTTTCACAAACTTAACTCCCTTATT
AAGTATTATAGCCTTTTTGTCTCTCGTTACTTCTCCAGAGAAAGAGAGAAAGTACACAGC
TTAAGTTTCACTTTCTTGCGACATAGTAGTTTTACAACTAAGCAACAAGTAATCTACAAA
AATGTCTAACAGAAGATCAAGACAATCTTCAAGTACTCTGAGGATTTCCGATGACCAGAT
GATCAACCTAGTAAGTAAGCTCCGTCTTCTTTTGCCTGAGATTCGTGAACGGCACCGTTC
TGATAAGGTGTCCGCATCGAAGGTACTACAAGAGACATGCAACTACATAAGAAAGCTGCA
TAGAGAAGTTGACAATCTCAGTGACCGTTTGTCCCAGCTGCTCGACTCGGTTGATGAAGA
TAGTCAAGAAGCTGCCGTCATTAGAAGCTTACTTATGTAACCTTCCAATATAATGATTTA
TTACAATTTGATATTATTTATATTAACTTATATGTAATATGTCGATCGTCCTTAATATAT
TATCAAGCGACGTATTTTTAATGAGCT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL6630Contig1 1157 2 2 U
GGGTAAGATCCACACACACACATAGACCCAAGTCGGCGACGGAGAGGGTTTTAGAAACTC
CATCAATCTCCTCTCCTCCCCCATCAGTCGAGTCAAAGGGCTTAGTCTCCAAATGTTTCC
GAGATTAGGTCGAGCTGTCACTCAAATCTCAAAGCTCCCATCTTTCTCCTCAAATGGATC
GCCTAAAAATCTCTCCTTTTTCTCCCGCTGTGGCTACGCGACTGTAGCTCACGCGGATGA
TGCTCCCTCGCCGAATGATTTCCCCAGCAAATCTCCGGTGAACTTGGATAAGATGTTTTG
GTCAAAGCCATCTTCACTTGCTCTGCCTAAACACTCTCCTCTCAGAATCGATGAGCCTGA
CTACCAAGGGATTCGTCGTTTTATACTAAAGATGCTTTTGTTCTACAGCAAACAGAGCAC
ATCTATCCGTGGTGCTAACGTTATCTACAAGCGCATCATTGCTCAAGTCGACACTCCTGC
CATTTATGATGTGTTCAACTTGGAGAAAACATTCAAAATAACATATTCGTTACTTGTCCT
TCATATGTGGCTTGTTTTGCGCCGCTTGAAGGCAGAGGGAAAGGAAGGTGTTGATCTTGG
TCAATATGTTTATGAGATCTACAATCATAATGTGGAAGTCAGGGTATCTAAAGCCGGGGT
TAACTTGCTTCTCTTGACATGGATGAAGGAATTGGAGAGAATATTCTATGGAAACGTTGT
TGCCTATGATGCGGCACTACTTCCTGACGCTAAACCAAATGATCTACAAATCAAATTATG
GAGGAATATATTTTCTGATGATGGAGCAACAACACCTGATGAAACGGAATTAAAAGAAGC
AAAGGCAATGGCAAGATATGTCCGGAGAGAAGTTGGTTCTCTTTCTTTAACAGATAAAGG
GTCCATATTCTCAGGCAACTTCTCCTTCACCCCCTTGGAGAACAAAGCCTCGATGACTTG
AAGGATCTGTGGCGCTTTAAGCATCAATCTTTTATTTGTTTCTTTTTTAAAAAATATTTT
CTTATAACCAACAAGAGAAACCTACACAAGAGAGTATGCTGGTTGGTAGCAGCCGGATAA
TCACGAAAACATGGTGAAAGTTGAATAAGATTACTGCTGTGTATTATTTGCTTTCGTTGG
TACTCCTTGTCTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ64TF U 1
AF RR2DQ64JQ C 301
BS 1 567 RR2DQ64TF
BS 568 1157 RR2DQ64JQ

RD RR2DQ64TF 567 0 0
GGGTAAGATCCACACACACACATAGACCCAAGTCGGCGACGGAGAGGGTTTTAGAAACTC
CATCAATCTCCTCTCCTCCCCCATCAGTCGAGTCAAAGGGCTTAGTCTCCAAATGTTTCC
GAGATTAGGTCGAGCTGTCACTCAAATCTCAAAGCTCCCATCTTTCTCCTCAAATGGATC
GCCTAAAAATCTCTCCTTTTTCTCCCGCTGTGGCTACGCGACTGTAGCTCACGCGGATGA
TGCTCCCTCGCCGAATGATTTCCCCAGCAAATCTCCGGTGAACTTGGATAAGATGTTTTG
GTCAAAGCCATCTTCACTTGCTCTGCCTAAACACTCTCCTCTCAGAATCGATGAGCCTGA
CTACCAAGGGATTCGTCGTTTTATACTAAAGATGCTTTTGTTCTACAGCAAACAGAGCAC
ATCTATCCGTGGTGCTAACGTTATCTACAAGCGCATCATTGCTCAAGTCGACACTCCTGC
CATTTATGATGTGTTCAACTTGGAGAAAACATTCAAAATAACATATTCGTTACTTGTCCT
TCATATGTGGCTTGTTTTGCGCCGCTT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2DQ64JQ 857 0 0
GTCAAAGCCATCTTCACTTGCTCTGCCTAAACACTCTC*TCTCAGAATCGATGAGC*TGA
CTACCAAGGGATTCGTCGTTTTATACTAAAGATGCTTTTGTTCTACAGCAAACAGAGCAC
ATCTATCCGTGGTGCTAACGTTATCTACAAGCGCATCATTGCTCAAGTCGACACTC*TGC
CATTTATGATGTGTTCAACTTGGAGAAAACATTCAAAATAACATATTCGTTACTTGTCCT
TCATATGTGGCTTGTTTTGCGCCGCTTGAAGGCAGAGGGAAAGGAAGGTGTTGATCTTGG
TCAATATGTTTATGAGATCTACAATCATAATGTGGAAGTCAGGGTATCTAAAGCCGGGGT
TAACTTGCTTCTCTTGACATGGATGAAGGAATTGGAGAGAATATTCTATGGAAACGTTGT
TGCCTATGATGCGGCACTACTTCCTGACGCTAAACCAAATGATCTACAAATCAAATTATG
GAGGAATATATTTTCTGATGATGGAGCAACAACACCTGATGAAACGGAATTAAAAGAAGC
AAAGGCAATGGCAAGATATGTCCGGAGAGAAGTTGGTTCTCTTTCTTTAACAGATAAAGG
GTCCATATTCTCAGGCAACTTCTCCTTCACCCCCTTGGAGAACAAAGCCTCGATGACTTG
AAGGATCTGTGGCGCTTTAAGCATCAATCTTTTATTTGTTTCTTTTTTAAAAAATATTTT
CTTATAACCAACAAGAGAAACCTACACAAGAGAGTATGCTGGTTGGTAGCAGCCGGATAA
TCACGAAAACATGGTGAAAGTTGAATAAGATTACTGCTGTGTATTATTTGCTTTCGTTGG
TACTCCTTGTCTTTTAT

QA 1 857 1 857
DS 



AS 1 2

CO CL6631Contig1 1033 2 20 U
ATGCTTCATCCAGATTTTCTTCTCGTTTATTTCAGGCGTTTCTGGAACCAGTCTTTTCAA
TTCGGTTAGCTTGATGGCTTATAACGTGTTCTACACCAGTGTTCCTGTTCTAGTTAGTGT
AATTGATAAAGATCTTAGTGAAACTACAGTAATGCAACATCCTCAAATTTTATTCTACTG
CCAAGCTGGGAGGCTTCTCAATCCAAGCACATTTGCGGGGTGGTTTGGTCGATCCCTTTT
TCACGCGATTGTTGTATTTGTAATAACAATTCACGCATATGCTTATGAGAAAAGTGAAAT
GGAGGAGCTTGGAATGGTAGCTCTCTCTGGATGTATATGGCTTCAGGCTGTCGCTCAAGA
AACCAACTCCTTTACGGTGTTGCAACACCTTTCCATTTGGGGAAATCTGGTCGGATTCTA
TGTCATAAACTTTCTCTTCAGCGCCATACCATCATCGGGAATGTACACGATCATGTTCCG
CCTCTGTTCTCAACCTTCTTACTGGATTACAATGTTTCTGATAGTTGGAGCAGGGATGGG
TCCTATATTCGCATTGAAGTACTACCGGTACACATACAGACCCAGCAAGATCAATATACT
CCAACAAGCTGAACGTATGGGCGGTCCAATACTGACTCTAGGTAACATAGAAACACAACC
GAGGACCATCATCGAGAAAGACGTGTCTCCAATATCCATAATGTCGACTCAGCCCAAGAA
CCGAAGCCCAGTTTACGAGCCTCTGTTATCAGAATCTCCAAACACAATTCGACGCTCATT
TGGCCCTGGAACTCCCTTCGAGTTTTTCCAGTCACAGTCAAGATTGTCATCATCATCTGG
TTATACCAGAAATTGCAAAGACAATTAAAAAGATTTGAGTTTTTTTCTCTCCTTTTTCCC
ACATTTTTAAAGTTCCGTGACATATTCTAACTCAACTGGAAATGCAGATGAAAACAAAAG
GCCAAAAAAACGATAGAAATGGGAAACTTTTATTAGAACAGTTGTATATAGACACTTTAC
CGGATTTATATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN08TF U 1
AF RR2CW05TF U 401
BS 1 426 RR2AN08TF
BS 427 427 RR2CW05TF
BS 428 441 RR2AN08TF
BS 442 442 RR2CW05TF
BS 443 567 RR2AN08TF
BS 568 568 RR2CW05TF
BS 569 621 RR2AN08TF
BS 622 622 RR2CW05TF
BS 623 729 RR2AN08TF
BS 730 730 RR2CW05TF
BS 731 790 RR2AN08TF
BS 791 791 RR2CW05TF
BS 792 806 RR2AN08TF
BS 807 808 RR2CW05TF
BS 809 820 RR2AN08TF
BS 821 821 RR2CW05TF
BS 822 824 RR2AN08TF
BS 825 825 RR2CW05TF
BS 826 839 RR2AN08TF
BS 840 1033 RR2CW05TF

RD RR2AN08TF 851 0 0
ATGCTTCATCCAGATTTTCTTCTCGTTTATTTCAGGCGTTTCTGGAACCAGTCTTTTCAA
TTCGGTTAGCTTGATGGCTTATAACGTGTTCTACACCAGTGTTCCTGTTCTAGTTAGTGT
AATTGATAAAGATCTTAGTGAAACTACAGTAATGCAACATCCTCAAATTTTATTCTACTG
CCAAGCTGGGAGGCTTCTCAATCCAAGCACATTTGCGGGGTGGTTTGGTCGATCCCTTTT
TCACGCGATTGTTGTATTTGTAATAACAATTCACGCATATGCTTATGAGAAAAGTGAAAT
GGAGGAGCTTGGAATGGTAGCTCTCTCTGGATGTATATGGCTTCAGGCTGTCGCTCAAGA
AACCAACTCCTTTACGGTGTTGCAACACCTTTCCATTTGGGGAAATCTGGTCGGATTCTA
TGTCATTAACTTTCTCTTCAGTGCCATACCATCATCGGGAATGTACACGATCATGTTCCG
CCTCTGTTCTCAACCTTCTTACTGGATTACAATGTTTCTGATAGTTGGAGCAGGGATGGG
TCCTATATTCGCATTGAAGTACTACCGTTACACATACAGACCCAGCAAGATCAATATACT
CCAACAAGCTGAACGTATGGGTGGTCCAATACTGACTCTAGGTAACATAGAAACACAACC
GAGGACCATCATCGAGAAAGACGTGTCTCCAATATCCATAATGTCGACTCAGCCCAAGAA
CCGAAGCCCGGTTTACGAGCCTCTGTTATCAGAATCTCCAAACACAATTCGACGCTCATT
TGGCCCTGGA*CTCCCTTCGAGTTTT**CAGTCACAGTCA*GAT*GTCATCATCATCTG
TATACAGAACTG

QA 1 839 1 839
DS 

RD RR2CW05TF 633 0 0
GGAAATCTGGTCGGATTCTATGTCATAAACTTTCTCTTCAGCGCCATACCATCATCGGGA
ATGTACACGATCATGTTCCGCCTCTGTTCTCAACCTTCTTACTGGATTACAATGTTTCTG
ATAGTTGGAGCGGGGATGGGTCCTATATTCGCATTGAAGTACTACCGGTACACATACAGA
CCCAGCAAGATCAATATACTCCAACAAGCTGAACGTATGGGCGGTCCAATACTGACTCTA
GGTAACATAGAAACTCAACCGAGGACCGTCATCGAGAAGGACGTGTCTCCAATATCCATA
ATGTCGACTCAGCCCAAGAACTGAAGCCCAGTTTACGAGCCTCTGTTATCAGAATCTCCA
AACGCAATTCGCCGCTCATTTGGCCCTGGAACTCCCTTCGAGTTTTTCCAGTCACAGTCA
AGATTGTCATCATCATCTGGTTATACCAGAAATTGCAAAGACAATTAAAAAGATTTGAGT
TTTTTTCTCTCCTTTTTCCCACATTTTTAAAGTTCCGTGACATATTCTAACTCAACTGGA
AATGCAGATGAAAACAAAAGGCCAAAAAAACGATAGAAATGGGAAACTTTTATTAGAACA
GTTGTATATAGACACTTTACCGGATTTATATTG

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL6632Contig1 632 2 2 U
TAAACCTTAATATCAGTTACTCTTTTATTCAACTTTCACATTCATTTTGCCCAAACAGGT
TTTTCGTATACATGTACCTTCCTCTGCTTCCTCCTGCTTATGTGTTTCTTTCTTTCACTG
CTTAGGTGCTTCAAATCTGCTAAAGAGTCTATAGGAAGAGATGAATGAGAGCGACACGTA
AAGAACACACACAAGGAGTGCTAATATAACTGAGACGAGTGCCTTGTGACAGAAGATTCC
ATAATAATCACAAGCAGAGCTCCAAGTGATGTTCAAGTTTCCTTTATATGCTAAGTATAC
CGTCTCTGCAGATACAGCCCCAGCCGCTAGAACCGCATACGTGACCACTTGGTCAAGCAA
GAACAATGTCCAGAGTCTGGGCTTGCTTATACGACACGGAATCGCTATTAAAAAAATAGC
AGAAAGAAGAGAATATGTAGCACAAACTCCATTAGCAGTCACCAAATACTTGAAAGCTCC
AAGAGTTGAGTAAGAAAGAGAGCCAAAGTCATTGGAGATAGAGTTTTTGATCATGATCAC
GAGACTCGCAATACTTAGAGCCATTGATGCGACTCGCAGGACCGTCTCTACCGTTCTCTC
CGTTCGGTTAACATTTTGATCAGTCTTGTCCA


BQ
10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AP72TF C 1
AF RR2AP72JQ U 2
BS 1 1 RR2AP72TF
BS 2 632 RR2AP72JQ

RD RR2AP72TF 632 0 0
TAAACTTTAATATCAGTTACTCTTTTATTCAACTTTCACATTCATTTTGCCCAAACAGGT
TTTTCGTATACATGTACCTTCCTCTGCTTCCTCCTGCTTATGTGTTTCTTTCTTTCACTG
CTTAGGTGCTTCAAATCTGCTAAAGAGTCTATAGGAAGAGATGAATGAGAGCGACACGTA
AAGAACACACACAAGGAGTGCTAATATAACTGAGACGAGTGCCTTGTGACAGAAGATTCC
ATAATAATCACAAGCAGAGCTCCAAGTGATGTTCAAGTTTCCTTTATATGCTAAGTATAC
CGTCTCTGCAGATACAGCCCCAGCCGCTAGAACCGCATACGTGACCACTTGGTCAAGCAA
GAACAATGTCCAGAGTCTGGGCTTGCTTATACGACACGGAATCGCTATTAAAAAAATAGC
AGAAAGAAGAGAATATGTAGCACAAACTCCATTAGCAGTCACCAAATACTTGAAAGCTCC
AAGAGTTGAGTAAGAAAGAGAGCCAAAGTCATTGGAGATAGAGTTTTTGATCATGATCAC
GAGACTCGCAATACTTAGAGCCATTGATGCGACTCGCAGGACCGTCTCTACCGTTCTCTC
CGTTCGGTTAACATTTTGATCAGTCTTGTCCA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2AP72JQ 631 0 0
AAACCTTAATATCAGTTACTCTTTTATTCAACTTTCACATTCATTTTGCCCAAACAGGTT
TTTCGTATACATGTACCTTCCTCTGCTTCCTCCTGCTTATGTGTTTCTTTCTTTCACTGC
TTAGGTGCTTCAAATCTGCTAAAGAGTCTATAGGAAGAGATGAATGAGAGCGACACGTAA
AGAACACACACAAGGAGTGCTAATATAACTGAGACGAGTGCCTTGTGACAGAAGATTCCA
TAATAATCACAAGCAGAGCTCCAAGTGATGTTCAAGTTTCCTTTATATGCTAAGTATACC
GTCTCTGCAGATACAGCCCCAGCCGCTAGAACCGCATACGTGACCACTTGGTCAAGCAAG
AACAATGTCCAGAGTCTGGGCTTGCTTATACGACACGGAATCGCTATTAAAAAAATAGCA
GAAAGAAGAGAATATGTAGCACAAACTCCATTAGCAGTCACCAAATACTTGAAAGCTCCA
AGAGTTGAGTAAGAAAGAGAGCCAAAGTCATTGGAGATAGAGTTTTTGATCATGATCACG
AGACTCGCAATACTTAGAGCCATTGATGCGACTCGCAGGACCGTCTCTACCGTTCTCTCC
GTTCGGTTAACATTTTGATCAGTCTTGTCCA

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL6633Contig1 789 2 4 U
GGATTCGATTTCTTCTTCTGGGTTTCTATTGATTGCTTGATAATAGATTCATGAATCAGA
ATTTGCGTGGCTGCTCAGAGCTCTGTTTTTTCCAGCTCAAGATGGATAGTAATAAGGATG
ATGATCTCACATTCTCAAAAGTTGTTCCACCAGATAGTGAAGTTGTTGTAGATGTAAAAG
ATCTTTCGAACCCTATTGCCCTTAAAGATCCTCAAAGCAAGTCTCTGAACCAAGTTTCTC
CAAAGGAAAACACAGTTGGTTCTCTGTCTTTCACGGTGGTTGATTCTTCTTCACCTGACA
TTCTCAAAGCTTCTTCAGCAAGAAAGCCTATAACTCGTACTAAAGTCCCGTTTGAAAAGG
GTTATAGCCAAATGGATTGGCTTAAACTTACACGAACACATCCCGATCTTGCAGGCCTGA
AGGGAGAGTCAAACAGGAGGCTTATATCAATGGATGAAGTTAAGAAACACAAATCAGGAG
ATTCGATGTGGACTGTGTTGAAAGGACGCGTGTACAACATATCGCCTTATATGAATTTTC
ATCCAGGAGGTGTTGATATGTTGATGAAAGCAGTTGGGAGAGACGGTACACTCTTGTTCA
ACAAATACCATGCTTGGGTTAATTTTGATATGTTACTTGAGAAATGCCTTGTTGGAGTTT
TGGATGACTCCAAAGTGAAGAGCAAATGCTAAAAGGTTGATATAATCATTTACTCGTCGT
ATAGATGATTCTTATGTCAAATAAGTGCTTACATTTTTGATTATTCAAATGAAAACGCTG
GTCACAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2B559TF U 1
AF RR2B559JQ C 11
BS 1 643 RR2B559TF
BS 644 644 RR2B559JQ
BS 645 788 RR2B559TF
BS 789 789 RR2B559JQ

RD RR2B559TF 788 0 0
GGATTCGATTTCTTCTTCTGGGTTTCTATTGATTGCTTGATAATAGATTCATGAATCAGA
ATTTGCGTGGCTGCTCAGAGCTCTGTTTTTTCCAGCTCAAGATGGATAGTAATAAGGATG
ATGATCTCACATTCTCAAAAGTTGTTCCACCAGATAGTGAAGTTGTTGTAGATGTAAAAG
ATCTTTCGAACCCTATTGCCCTTAAAGATCCTCAAAGCAAGTCTCTGAACCAAGTTTCTC
CAAAGGAAAACACAGTTGGTTCTCTGTCTTTCACGGTGGTTGATTCTTCTTCACCTGACA
TTCTCAAAGCTTCTTCAGCAAGAAAGCCTATAACTCGTACTAAAGTCCCGTTTGAAAAGG
GTTATAGCCAAATGGATTGGCTTAAACTTACACGAACACATCCCGATCTTGCAGGCCTGA
AGGGAGAGTCAAACAGGAGGCTTATATCAATGGATGAAGTTAAGAAACACAAATCAGGAG
ATTCGATGTGGACTGTGTTGAAAGGACGCGTGTACAACATATCGCCTTATATGAATTTTC
ATCCAGGAGGTGTTGATATGTTGATGAAAGCAGTTGGGAGAGACGGTACACTCTTGTTCA
ACAAATACCATGCTTGGGTTAATTTTGATATGTTACTTGAGAA*TGCCTTGTTGGAGTTT
TGGATGACTCCAAAGTGAAGAGCAAATGCTAAAAGGTTGATATAATCATTTACTCGTCGT
ATAGATGATTCTTATGTCAAATAAGTGCTTACATTTTTGATTATTCAAATGAAAACGCTG
GTCACAAC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2B559JQ 779 0 0
TCTTCTTCTGGGTTTCTATTGATTGCTTGATAATAGATTCATGAATCAGAATTTGCGTGG
CTGCTCAGAGCTCTGTTTTTTCCAGCTCAAGATGGATAGTAATAAGGATGATGATCTCAC
ATTCTCAAAAGTTGTTCCACCAGATAGTGAAGTTGTTGTAGATGTAAAAGATCTTTCGAA
CCCTATTGCCCTTAAAGATCCTCAAAGCAAGTCTCTGAACCAAGTTTCTCCAAAGGAAAA
CACAGTTGGTTCTCTGTCTTTCACGGTGGTTGATTCTTCTTCACCTGACATTCTCAAAGC
TTCTTCAGCAAGAAAGCCTATAACTCGTACTAAAGTCCCGTTTGAAAAGGGTTATAGCCA
AATGGATTGGCTTAAACTTACACGAACACATCCCGATCTTGCAGGCCTGAAGGGAGAGTC
AAACAGGAGGCTTATATCAATGGATGAAGTTAAGAAACACAAATCAGGAGATTCGATGTG
GACTGTGTTGAAAGGACGCGTGTACAACATATCGCCTTATATGAATTTTCATCCAGGAGG
TGTTGATATGTTGATGAAAGCAGTTGGGAGAGACGGTACACTCTTGTTCAACAAATACCA
TGCTTGGGTTAATTTTGATATGTTACTTGAGAAATGCCTTGTTGGAGTTTTGGATGACTC
CAAAGTGAAGAGCAAATGCTAAAAGGTTGATATAATCATTTACTCGTCGTATAGATGATT
CTTATGTCAAATAAGTGCTTACATTTTTGATTATTCAAATGAAAACGCTGGTCACAACT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6635Contig1 859 2 2 U
GGAAAGCTCTTGCACTTCACGCACTAGTGTCAGCAGAAACTTTGGTCAGCTCTTGGCTAG
TGATGATAATACATGGAAACCTTCTTCTGATGCTCCTCCTGTGGTTGCCGAGAAAACACT
CTATGTGGATACTGTGCATTCACTAGACAAGAAGGTACAAGAAGACTCCAAGGAGCTTTC
TTCACTTGATCTTGTTGTTCCTGTTAAAGAAGAAGTTCAGAACTTGATTGGACCCGGTGA
AGAAACCACCGAGCAAAGTGTCACAGGAGATGGGCTCTCACTGGATTCTCAAGTCCTGAT
CAAGCCAATGTGGTAGTGGAGATCACAAAGGAGAAGATTGATCTTGAAGCCAAGTTGCAG
AGGAAGTACACAGCGATGAATCACGAAAGTTCAAGGCTTCACCAACGTTCAAGTCATCAT
ATTGTGCCACCACCACCATTACCAAAAGCTCCTTCAGATTCTTGGTTGAAGCGTACGTTG
CCAACAATCCCAGCAAAGAACAACTCATTCACATGGTTACAGTCTCTTGGAGCTGATAAT
AATAAGATTAATCAAGCAAGTCCTAAGTGGGAAACTATGGTCAAAACCTCCAATTCACAG
CAAGGGGTTTGTGTGCTTCTCCAAGGAGACACTCAACCCTATACCAGAGGCGTAGCAAGA
TCTGTATGTTTTCCGCGCCAAATCACCTGTAAATTTCAACAATAAAGATGGGATGAGCCA
ATAAAGTTTGGGGATTTTTAGTTTAAGTCATGAAATAAAAGGTTCCTTAAAAGCTATGGA
TATAAATGTCTCATTTCACTTGTTGGGTTTGTACAGCTAACAGAGAATTTATGGCAATAA
TACTCCATAATTCCACGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA80TF U 1
AF RR2AA80JQ C 1
BS 1 729 RR2AA80TF
BS 730 859 RR2AA80JQ

RD RR2AA80TF 733 0 0
GGAAAGCTCTTGCACTTCACGCACTAGTGTCAGCAGAAACTTTGGTCAGCTCTTGGCTAG
TGATGATAATACATGGAAACCTTCTTCTGATGCTCCTCCTGTGGTTGCCGAGAAAACACT
CTATGTGGATACTGTGCATTCACTAGACAAGAAGGTACAAGAAGACTCCAAGGAGCTTTC
TTCACTTGATCTTGTTGTTCCTGTTAAAGAAGAAGTTCAGAACTTGATTGGACCCGGTGA
AGAAACCACCGAGCAAAGTGTCACAGGAGATGGGCTCTCACTGGATTCTCAAGTCCTGAT
CAAGCCAATGTGGTAGTGGAGATCACAAAGGAGAAGATTGATCTTGAAGCCAAGTTGCAG
AGGAAGTACACAGCGATGAATCACGAAAGTTCAAGGCTTCACCAACGTTCAAGTCATCAT
ATTGTGCCACCACCACCATTACCAAAAGCTCCTTCAGATTCTTGGTTGAAGCGTACGTTG
CCAACAATCCCAGCAAAGAACAACTCATTCACATGGTTACAGTCTCTTGGAGCTGATAAT
AATAAGATTAATCAAGCAAGTCCTAAGTGGGAAACTATGGTCAAAACCTCCAATTCACAG
CAAGGGGTTTGTGTGCTTCTCCAAGGAGACACTCAACCCTATACCAGAGGCGTAGCAAGA
TCTGTATGTTTTCCGCGCCAAATCACCTGTAAATTTCAACAATAAAGATGGGATGAGCCA
ATAAAGTTT
TGGG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2AA80JQ 859 0 0
GGAAAGCTCTTGCACTTCACGCACTAGTGTCAGCAGAAACTTTGGTCAGCTCTTGGCTAG
TGATGATAATACATGGAAACCTTCTTCTGATGCTCCTCCTGTGGTTGCCGAGAAAACACT
CTATGTGGATACTGTGCATTCACTAGACAAGAAGGTACAAGAAGACTCCAAGGAGCTTTC
TTCACTTGATCTTGTTGTTCCTGTTAAAGAAGAAGTTCAGAACTTGATTGGACCCGGTGA
AGAAACCACCGAGCAAAGTGTCACAGGAGATGGGCTCTCACTGGATTCTCAAGTCCTGAT
CAAGCCAATGTGGTAGTGGAGATCACAAAGGAGAAGATTGATCTTGAAGCCAAGTTGCAG
AGGAAGTACACAGCGATGAATCACGAAAGTTCAAGGCTTCACCAACGTTCAAGTCATCAT
ATTGTGCCACCACCACCATTACCAAAAGCTCCTTCAGATTCTTGGTTGAAGCGTACGTTG
CCAACAATCCCAGCAAAGAACAACTCATTCACATGGTTACAGTCTCTTGGAGCTGATAAT
AATAAGATTAATCAAGCAAGTCCTAAGTGGGAAACTATGGTCAAAACCTCCAATTCACAG
CAAGGG*TTTGTGTGCTTCTCCAAGGAGACACTCAACCCTATACCAGAGGCGTAGCAAGA
TCTGTATGTTTTCCGCGCCAAATCACCTGTAAATTTCAACAATAAAGATGGGATGAGCCA
ATAAAGTTTGGGGATTTTTAGTTTAAGTCATGAAATAAAAGGTTCCTTAAAAGCTATGGA
TATAAATGTCTCATTTCACTTGTTGGGTTTGTACAGCTAACAGAGAATTTATGGCAATAA
TACTCCATAATTCCACGTG

QA 1 859 1 859
DS 



AS 1 2

CO CL6636Contig1 726 2 1 U
GGGGTGGCAAATTCAGGATCATTATCCATCAAACTCAAATCAAAGCCAATTACACATAGA
GAGACAGAGAGAGATGGGCGTTACAGGAGGACTAGTTAGAAGCATTTTCTTCAGAAACAA
ATCATTTGGGGCTCATGACTACAACAACAATGGAAGAAGCAATCTAGGAGAGAAGAAAAG
ATGGAGCTCAGTAAGATCATACCTTTGTGGAGATGAATTCAACTCTGTTCTCGCTGTGGA
TGACTCAGGATCAATAAAAGATTCTTTAGACCCTCTTCTTACAATGTCCCAGCAACTGAG
TACAGAACCTTCTGATTCGGTTTTGGCAATCCAAGATTCAGCTTCTGTGAAACTACTACA
TCTGGAGGAGGAGGACTCTGTTTCAGGTCAGAACTCAGAGGTTTCAGTAACTCAGCCTTT
ACACAAAGAAGACCAAAGCGAAGGAACAGAGACGCACATACCAAAGAGGCATCATCAGAC
TACTCTAATCTCTAAGCTTTTCCTCGAAGAAGACGCTGCTATCATAATTCAATCAGCATT
CAGGAGTTACCTGGCAAAACGTGGGAGCAAAGAAGTAGAAGAACCGTCTGATAAGGAGGA
GAGCTTCTCACGAGAGGAATCACAAGTAAAGTATCCATGGGGACATCACTAGAAGTTCAG
ACATGCAGTTCCGTGAAAGCACCTCTCTTTAAAGAAAACGAGTATCAAGAACATTACACA
ACAAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2H874TF U 1
AF RR2G585TF U 1
BS 1 726 RR2G585TF

RD RR2H874TF 720 0 0
GGGGTGGCAAATTCAGGATCATTATCCATCAAACTCAAATCAAAGCCAATTACACATAGA
GAGACAGAGAGAGATGGGCGTTACAGGAGGACTAGTTAGAAGCATTTTCTTCAGAAACAA
ATCATTTGGGGCTCATGACTACAACAACAATGGAAGAAGCAATCTAGGAGAGAAGAAAAG
ATGGAGCTCAGTAAGATCATACCTTTGTGGAGATGAATTCAACTCTGTTCTCGCTGTGGA
TGACTCAGGATCAATAAAAGATTCTTTAGACCCTCTTCTTACAATGTCCCAGCAACTGAG
TACAGAACCTTCTGATTCGGTTTTGGCAATCCAAGATTCAGCTTCTGTGAAACTACTACA
TCTGGAGGAGGAGGACTCTGTTTCAGGTCAGAACTCAGAGGTTTCAGTAACTCAGCCTTT
ACACAAAGAAGACCAAAGCGAAGGAACAGAGACGCACATACCAAAGAGGCATCATCAGAC
TACTCTAATCTCTAAGCTTTTCCTCGAAGAAGACGCTGCTATCATAATTCAATCAGCATT
CAGGAGTTACCTGGCAAAACGTGGGAGCAAAGAAGTAGAAGAACCGTCTGATAAGGAGGA
GAGCTTCTCA*GAGAGGAATCACAAGTAAAGTATCCATGGGGACATCACTAGAAGTTCAG
ACATGCAGTTCCGTGAAAGCACCTCTCTTTAAAGAAA*CGAGTATCAAGAACATTACACA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2G585TF 726 0 0
GGGGTGGCAAATTCAGGATCATTATCCATCAAACTCAAATCAAAGCCAATTACACATAGA
GAGACAGAGAGAGATGGGCGTTACAGGAGGACTAGTTAGAAGCATTTTCTTCAGAAACAA
ATCATTTGGGGCTCATGACTACAACAACAATGGAAGAAGCAATCTAGGAGAGAAGAAAAG
ATGGAGCTCAGTAAGATCATACCTTTGTGGAGATGAATTCAACTCTGTTCTCGCTGTGGA
TGACTCAGGATCAATAAAAGATTCTTTAGACCCTCTTCTTACAATGTCCCAGCAACTGAG
TACAGAACCTTCTGATTCGGTTTTGGCAATCCAAGATTCAGCTTCTGTGAAACTACTACA
TCTGGAGGAGGAGGACTCTGTTTCAGGTCAGAACTCAGAGGTTTCAGTAACTCAGCCTTT
ACACAAAGAAGACCAAAGCGAAGGAACAGAGACGCACATACCAAAGAGGCATCATCAGAC
TACTCTAATCTCTAAGCTTTTCCTCGAAGAAGACGCTGCTATCATAATTCAATCAGCATT
CAGGAGTTACCTGGCAAAACGTGGGAGCAAAGAAGTAGAAGAACCGTCTGATAAGGAGGA
GAGCTTCTCACGAGAGGAATCACAAGTAAAGTATCCATGGGGACATCACTAGAAGTTCAG
ACATGCAGTTCCGTGAAAGCACCTCTCTTTAAAGAAAACGAGTATCAAGAACATTACACA
ACAAGA

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL6637Contig1 1226 2 2 U
GAAAGCTAATTCCCTTTGATCTCGCCCTCATCCATCGCTAGCTCCATAGTTTGCCCTACC
TAACGATTCGGATTCGAGGTGGGTGATCTTGATTCAACAACTTTTGTCAATCTCTTAGGT
AGTTCATTAGATCAGCTGCGATTTTATTTTGTTTGTGAATATGAATTTTGATTTTGTAGG
GAAAATGAACACATACAAGAACATGGCGAGGGAGCAGCATGAGGAGGAGAACGCGTTGGT
GATATGGAACATCAGCAACTGCCCGATTCCTGATGGTCATGATCCTCTCCTGGTGGTTCC
GCGAATACAAACGGCTCTGGAGAAGTCAAGACGCGATCGCCCCTATGGTCCTCTCACCAT
CACTGCCATTAGCAACAACCTAACAGAGATCCCTGGTGAAGACGTCATGAGGAAGCTTTC
TTCCACTGGAATCTCTCTTAAACATGATCACGGTTAATCTTCTTTCTTCTCTCTCTTTTT
ACTTTTTTTTTTTAAAGTTAGGGTTTGGATTCAGCATTGCCTTCCTTTTCTGAAGCAGGA
GTTCAAACGGATTTGTCTCACTGGGTCATTAGGAATCCTCCTCCGGCTACTATAATGGTT
ATAACCGGTCATGAGGAACTAGAACATTTCGCTTCCACATTTTCTGAACTTGAAGAGGAA
GGATACAGAATTATTCTTACATATCCTCAGCCAAACCCATCTCCACCCTCTCTGCCTAAA
CTCTGTTTCTTTGAAACTTTACTATCAGATGCCGATAATAAACTGGTGACAACATCAAGG
CTTATTTTTCATGGAAAGAGAGGATATCCCTGGTCTTGTTTAGTATGCTTTTTTGATGCC
CCAATGTTAGATGATTTCACAAAGCACCTCAAGAGTGAAACACATGCTTATTTTGAGTGG
GACAGGGTCGCAAGGGAAAACAATGTTGATCTCACCAACCCTGATAACTTGCAGCTTGGT
CGCTCACAGGGGTGGGACCTACACGCAAAAGCTGACATGATGCGACGCTCTGAAGCTCTG
AAACTCCGCGACGCTTTTGCTCCTCCTCGTTCGAAGCGAGTTGATGCCAACTCTTGTAAG
GAACCGTTCAAATCTGAAGTATAGGAGAAGAGTTATGGACTTTGCAATGAAATTCTTAGT
TTTATTTACAATAATGTTGGATGCCTGTATTTGAAACTTTATTATGCATGGTAAAATCAA
ACTAAAAGATGATATAGAATACTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA61TF U 1
AF RR2CA61JQ C 434
BS 1 628 RR2CA61TF
BS 629 1226 RR2CA61JQ

RD RR2CA61TF 628 0 0
GAAAGCTAATTCCCTTTGATCTCGCCCTCATCCATCGCTAGCTCCATAGTTTGCCCTACC
TAACGATTCGGATTCGAGGTGGGTGATCTTGATTCAACAACTTTTGTCAATCTCTTAGGT
AGTTCATTAGATCAGCTGCGATTTTATTTTGTTTGTGAATATGAATTTTGATTTTGTAGG
GAAAATGAACACATACAAGAACATGGCGAGGGAGCAGCATGAGGAGGAGAACGCGTTGGT
GATATGGAACATCAGCAACTGCCCGATTCCTGATGGTCATGATCCTCTCCTGGTGGTTCC
GCGAATACAAACGGCTCTGGAGAAGTCAAGACGCGATCGCCCCTATGGTCCTCTCACCAT
CACTGCCATTAGCAACAACCTAACAGAGATCCCTGGTGAAGACGTCATGAGGAAGCTTTC
TTCCACTGGAATCTCTCTTAAACATGATCACGGTTAATCTTCTTTCTTCTCTCTCTTTTT
ACTTTTTTTTTTTAAAGTTAGGGTTTGGATTCAGCATTGCCTTCCTTTTCTGAAGCAGGA
GTTCAAACGGATTTGTCTCACTGGGTCATTAGGAATCCTCCTCCGGCTACTATAATGGTT
ATAACCGGTCATGAGGAACTAGAACATT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2CA61JQ 793 0 0
TCTCTTAAACATGATCACGGTTAATCTTCTTTCTTCTCTCTCTTTTTACTTTTTTTTTT*
AAAGTTAGGGTTTGGATTCAGCATTGCCTTCCTTTTCTGAAGCAGGAGTTCAAACGGATT
TGTCTCACTGGGTCATTAGGAATCCTCCTCCGGCTACTATAATGGTTATAACCGGTCATG
AGGAACTAGAACATTTCGCTTCCACATTTTCTGAACTTGAAGAGGAAGGATACAGAATTA
TTCTTACATATCCTCAGCCAAACCCATCTCCACCCTCTCTGCCTAAACTCTGTTTCTTTG
AAACTTTACTATCAGATGCCGATAATAAACTGGTGACAACATCAAGGCTTATTTTTCATG
GAAAGAGAGGATATCCCTGGTCTTGTTTAGTATGCTTTTTTGATGCCCCAATGTTAGATG
ATTTCACAAAGCACCTCAAGAGTGAAACACATGCTTATTTTGAGTGGGACAGGGTCGCAA
GGGAAAACAATGTTGATCTCACCAACCCTGATAACTTGCAGCTTGGTCGCTCACAGGGGT
GGGACCTACACGCAAAAGCTGACATGATGCGACGCTCTGAAGCTCTGAAACTCCGCGACG
CTTTTGCTCCTCCTCGTTCGAAGCGAGTTGATGCCAACTCTTGTAAGGAACCGTTCAAAT
CTGAAGTATAGGAGAAGAGTTATGGACTTTGCAATGAAATTCTTAGTTTTATTTACAATA
ATGTTGGATGCCTGTATTTGAAACTTTATTATGCATGGTAAAATCAAACTAAAAGATGAT
ATAGAATACTGAA

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL6638Contig1 740 2 2 U
TGGTTCAGAATGCTTGGAAAGTGGACTACAAGCAATACTAATGGCTCTACAACATTGTTG
GATTCAAGGTCATACAAGACTAATCACATAAGGAGATTGCAAGAAGGATAAGCACGAGAT
AAAACGATAAGCAGAGTTTTACCAATAATAAAAGTCACGAACCAAAGACAAAAGAAGCAA
TTTAGAGAAGCAGAGTTACCAAAATAATAAAAAGTCACAAACCAAATCTGTACTTTTTTT
CACTTTGCCATCATAACTTTGACGAACTCATCATAGTTGATCTGACCATCGCCATCCACG
TCAGCCTCACGGATCATCTCATCCACTTCTTCGTCGGTCAGCTTCTCCCCGAGATTAGTC
ATGACGTGGCGGAGCTCAGCGGCGGAAATGAAACCGTTCTGGTCCTTGTCGAAAACCCTA
AAGGCTTCTTTAAGCTCTTCCTCCGAATCAGTGTCTTTCATCTTGCGGGCCATCAGGTTC
AGAAACTCCGGGAAATCTATTGTCCCGTTCCCGTCTGCGTCAACCTCGTTGATCATGTCT
TGGAGCTCCGCTTCTGTCGGGTTTTGCCCTAGCGATCTCATCACCGTCCCCAGCTCCTTT
GTCGTGATGCAGCCATCTCCGTCCTTGTCGAATAGGCTGAAGGCTTCCTTGAACTCGGAG
ATCTGGTCATCGGTAAGCTGATCCGCCATTGTTTTTTTTCTTCTAATTTAGTTCGCTGGT
ATTCGTTGTTTCTTCGATCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DF15TF C 1
AF RR2DF15JQ U 2
BS 1 1 RR2DF15TF
BS 2 740 RR2DF15JQ

RD RR2DF15TF 740 0 0
TGGTTCAGAATGCTTGGAAAGTGGACTACAAGCAATACTAATGGCTCTACAACATTGTTG
GATTCAAGGTCATACAAGACTAATCACATAAGGAGATTGCAAGAAGGATAAGCACGAGAT
AAAACGATAAGCAGAGTTTTACCAATAATAAAAGTCACGAACCAAAGACAAAAGAAGCAA
TTTAGAGAAGCAGAGTTACCAAAATAATAAAAAGTCACAAACCAAATCTGTACTTTTTTT
CACTTTGCCATCATAACTTTGACGAACTCATCATAGTTGATCTGACCATCGCCATCCACG
TCAGCCTCACGGATCATCTCATCCACTTCTTCGTCGGTCAGCTTCTCCCCGAGATTAGTC
ATGACGTGGCGGAGCTCAGCGGCGGAGATGAAACCGTTCTGGTCCTTGTCGAAAACCCTA
AAGGCTTCTTTAAGCTCTTCCTCCGAATCAGTGTCTTTCATCTTGCGGGCCATCAGGTTC
AGAAACTCCGGGAAATCTATTGTCCCGTTCCCGTCTGCGTCAACCTCGTTGATCATGTCT
TGGAGCTCCGCTTCTGTCGGGTTTTGCCCTAGCGATCTCATCACCGTCCCCAGCTCCTTT
GTCGTGATGCAGCCATCTCCGTCCTTGTCGAATAGGCTGAAGGCTTCCTTGAACTCGGAG
ATCTGGTCATCGGTAAGCTGATCCGCCATTGTTTTTTTTCTTCTAATTTAGTTCGCTGGT
ATTCGTTGTTTCTTCGATCC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2DF15JQ 739 0 0
GGTTCAGAATGCTTGGAAAGTGGACTACAAGCAATACTAATGGCTCTACAACATTGTTGG
ATTCAAGGTCATACAAGACTAATCACATAAGGAGATTGCAAGAAGGATAAGCACGAGATA
AAACGATAAGCAGAGTTTTACCAATAATAAAAGTCACGAACCAAAGACAAAAGAAGCAAT
TTAGAGAAGCAGAGTTACCAAAATAATAAAAAGTCACAAACCAAATCTGTACTTTTTTTC
ACTTTGCCATCATAACTTTGACGAACTCATCATAGTTGATCTGACCATCGCCATCCACGT
CAGCCTCACGGATCATCTCATCCACTTCTTCGTCGGTCAGCTTCTCCCCGAGATTAGTCA
TGACGTGGCGGAGCTCAGCGGCGGAAATGAAACCGTTCTGGTCCTTGTCGAAAACCCTAA
AGGCTTCTTTAAGCTCTTCCTCCGAATCAGTGTCTTTCATCTTGCGGGCCATCAGGTTCA
GAAACTCCGGGAAATCTATTGTCCCGTTCCCGTCTGCGTCAACCTCGTTGATCATGTCTT
GGAGCTCCGCTTCTGTCGGGTTTTGCCCTAGCGATCTCATCACCGTCCCCAGCTCCTTTG
TCGTGATGCAGCCATCTCCGTCCTTGTCGAATAGGCTGAAGGCTTCCTTGAACTCGGAGA
TCTGGTCATCGGTAAGCTGATCCGCCATTGTTTTTTTTCTTCTAATTTAGTTCGCTGGTA
TTCGTTGTTTCTTCGATCC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL6639Contig1 822 2 8 U
GGGAATTTTGTTATCTCTACAGCTTCGAAGAAGCCCTATCAAACACATAAGTCTCTCTCT
CCCCGCCGGCGGCAAAGAAAGACCAAATCAGTCAAGGATTCACAGCGGCGAATCTCAGTC
AAGCTTTCATCTAGATCACTATTCAATGGCAACCATGGCTAGGTCGTTTTTGCAGGCGAT
ATCGAAGGAAGAGGCGGTCGCTCCTCCGCTCAGAGTTGTTCAGATCGAAGGACTGGCTGT
GCTAAAGATAATCAAACACTGCAAGGAGTTTGCACCGACGCTTGTCACAGGGCAGCTTCT
TGGACTTGACGTTGGTAGTGTCCTTGAAGTCACCAATTGTTTTCCTTTCCCCGCGAGAGA
TGACGATGAAGAAATTGAAGCCGATGGTGCTAATTATCAGCTTGAAATGATGAGATGCCT
GAGAGAGGTTAATGTCGACAACAACACTGTCGGCTGGTATCAGTCCACAGTTCTTGGATC
CTATCAGACCGTTGAATTGATTGAGACCTTCATGAATTACCAGGAGAACATCAAGAGGTG
TGTGTGCATCATCTATGATCCCTCTAAAGCTGACCTAGGCGTCTTAGCTCTGAAAGCTTT
GAAGCTTTCCGATTCCTTTATGGAGCTATACCGGGGCGGAAACTTTACAGGCGAGAAGTT
GAGAGAGAAGAACTTCTCCTGGATGGATATTTTCGAGGAAATTCCCATCAAGGTTTCAAA
CTCTGCACTTGTCAGTGCCTTCATGACCGAGCTGGAGACTGATGCACCTGTTTCACAGGT
GATTATGATCGTCTACACTCATCCACCACTCCTTTCCTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G694TF U 1
AF RR2D474TF U 78
BS 1 353 RR2G694TF
BS 354 354 RR2D474TF
BS 355 578 RR2G694TF
BS 579 579 RR2D474TF
BS 580 650 RR2G694TF
BS 651 651 RR2D474TF
BS 652 693 RR2G694TF
BS 694 822 RR2D474TF

RD RR2G694TF 693 0 0
GGGAATTTTGTTATCTCTACAGCTTCGAAGAAGCCCTATCAAACACATAAGTCTCTCTCT
CCCCGCCGGCGGCAAAGAAAGACCAAATCAGTCAAGGATTCACAGCGGCGAATCTCAGTC
AAGCTTTCATCTAGATCACTATTCAATGGCAACCATGGCTAGGTCGTTTTTGCAGGCGAT
ATCGAAGGAAGAGGCGGTCGCTCCTCCGCTCAGAGTTGTTCAGATCGAAGGACTGGCTGT
GCTAAAGATAATCAAACACTGCAAGGAGTTTGCACCGACGCTTGTCACAGGGCAGCTTCT
TGGACTTGACGTTGGTAGTGTCCTTGAAGTCACCAATTGTTTTCCTTTCCCCGTGAGAGA
TGACGATGAAGAAATTGAAGCCGATGGTGCTAATTATCAGCTTGAAATGATGAGATGCCT
GAGAGAGGTTAATGTCGACAACAACACTGTCGGCTGGTATCAGTCCACAGTTCTTGGATC
CTATCAGACCGTTGAATTGATTGAGACCTTCATGAATTACCAGGAGAACATCAAGAGGTG
TGTGTGCATCATCTATGATCCCTCTAAAGCTGACCTAG*CGTCTTAGCTCTGAAAGCTTT
GAAGCTTTCCGATTCCTTTATGGAGCTATACCGGGGCGGAAACTTTACAG*CGAGAAGTT
GAGAGAGAAGAACTTCTCCTGGATGGATATTTT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2D474TF 745 0 0
GG
AGACCAAATCAGTCAAGGATTCACAGCGGCGAATCTCAGTCAAGCTTTCATCTAGATCAC
TATTCAATGGCAACCATGGCTAGGTCGTTTTTGCAGGCGATATCGAAGGAAGAGGCGGTC
GCTCCTCCGCTCAGAGTTGTTCAGATCGAAGGACTGGCTGTGCTAAAGATAATCAAACAC
TGCAAGGAGTTTGCACCGACGCTTGTCACAGGGCAGCTTCTTGGACTTGACGTTGGTAGT
GTCCTTGAAGTCACCAATTGTTTTCCTTTCCCCGCGAGAGATGACGATGAAGAAATTGAA
GCCGATGGTGCTAATTATCAGCTTGAAATGATGAGATGTCTGAGAGAGGTTAATGTCGAC
AACAACACTGTCGGCTGGTATCAGTCCACAGTTCTTGGATCCTATCAGACCGTTGAATTG
ATTGAGACCTTCATGAATTACCAGGAGAACATCAAGAGGTGTGTGTGCATCATCTATGAT
CCCTCTAAAGCTGACCTAGGCGTCTTAGCTCTGAAGGCTTTGAAGCTTTCTGATTCCTTT
ATGGAGCTATACCGGGGCGGAGACTTTACAGGCGAGAAGTTGAGAGAGAAGAACTTCTCC
TGGATGGATATTTTCGAGGAAATTCCCATCAAGGTTTCAAACTCTGCACTTGTCAGTGCC
TTCATGACCGAGCTGGAGACTGATGCACCTGTTTCACAGGTGATTATGATCGTCTACACT
CATCCACCACTCCTTTCCTTGAG

QA 3 745 3 745
DS 



AS 1 2

CO CL6640Contig1 659 2 1 U
GGCTCTTCGTAATTGCTATGTACCAAATGGCCTTAGGCTGGTTTACTTCGCTGCTTGCTG
ATCTGAGGGCTAGATCGTCAACTACAGATGCAGTGCCACGAATTCCTCAGCCTGTTCAGG
TCGGTGAGATCACGGAGAAGGAGCTTAGGCAGTACGATGGCTCTGATCCTAAGAAGCCCC
TTCTTATGGCCATCAAACATCAGATCTATGATGTAACTACAAGCAGGATGGCCTATGGAC
CAGGAGGACCATATGCTTTGTTTGGAGGGAGAGAGGTAAGCAGAGCTCTTGCAAAGATGT
CTTTTGAGGAGAAAGATTTGACTTGGGATATCTCTGGTCTTAGTCCTTTTGAGCTAGAAG
CTCTTCATGATTGGGAGGAGAAGTTCATGAGCAAGTATACCAAGGTTGGAACTGTCAAAG
TGACCGGTTCAAAAGCAGAGATCACATCTGTGACTGAACCCGCAGAGACTAGTGACAAAA
ATGCCCATGTAATCAAGCAAGAGACGATTGTCGTGGATAAGAATGATCTGACTTCCGTTT
CGGGGATTTACTCTGATATAGAGACCGGTTTAATTGTAAAAGTATAATCTCCAATGATGT
TGAAATTTCAATATCTATCTTTTTTTTTACAGCATTTCAATATTAATCTTCGTTTCATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BZ10JQ C 1
AF RR2BZ10TF U 1
BS 1 659 RR2BZ10TF

RD RR2BZ10JQ 659 0 0
GGCTCTTCGTAATTGCTATGTACCAAATGGCCTTAGGCTGGTTTACTTCGCTGCTTGCTG
ATCTGAGGGCTAGATCGTCAACTACAGATGCAGTGCCACGAATTCCTCAGCCTGTTCAGG
TCGGTGAGATCACGGAGAAGGAGCTTAGGCAGTACGATGGCTCTGATCCTAAGAAGCCCC
TTCTTATGGCCATCAAACATCAGATCTATGATGTAACTACAAGCAGGATGGCCTATGGAC
CAGGAGGACCATATGCTTTGTTTGGAGGGAGAGAGGTAAGCAGAGCTCTTGCAAAGATGT
CTTTTGAGGAGAAAGATTTGACTTGGGATATCTCTGGTCTTAGTCCTTTTGAGCTAGAAG
CTCTTCATGATTGGGAGGAGAAGTTCATGAGCAAGTATACCAAGGTTGGAACTGTCAAAG
TGACCGGTTCAAAAGCAGAGATCACATCTGTGACTGAACCCGCAGAGACTAGTGACAAAA
ATGCCCATGTAATCAAGCAAGAGACGATTGTCGTGGATAAGAATGATCTGACTTCCGTTT
CGGGGATTTACTCTGATATAGAGACCGGTTTAATTGTAAAAGTATAATCTCCAATGATGT
TGAAATTTCAATATCTATCTTTTTTTTTACAGCATTTCAATATTAATCTTCGTTTCATT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2BZ10TF 659 0 0
GGCTCTTCGTAATTGCTATGTACCAAATGGCCTTAGGCTGGTTTACTTCGCTGCTTGCTG
ATCTGAGGGCTAGATCGTCAACTACAGATGCAGTGCCACGAATTCCTCAGCCTGTTCAGG
TCGGTGAGATCACGGAGAAGGAGCTTAGGCAGTACGATGGCTCTGATCCTAAGAAGCCCC
TTCTTATGGCCATCAAACATCAGATCTATGATGTAACTACAAGCAGGATGGCCTATGGAC
CAGGAGGACCATATGCTTTGTTTGGAGGGAGAGAGGTAAGCAGAGCTCTTGCAAAGATGT
CTTTTGAGGAGAAAGATTTGACTTGGGATATCTCTGGTCTTAGTCCTTTTGAGCTAGAAG
CTCTTCATGATTGGGAGGAGAAGTTCATGAGCAAGTATACCAAGGTTGGAACTGTCAAAG
TGACCGGTTCAAAAGCAGAGATCACATCTGTGACTGAACCCGCAGAGACTAGTGACAAAA
ATGCCCATGTAATCAAGCAAGAGACGATTGTCGTGGATAAGAATGATCTGACTTCCGTTT
CGGGGATTTACTCTGATATAGAGACCGGTTTAATTGTAAAAGTATAATCTCCAATGATGT
TGAAATTTCAATATCTATCTTTTTTTTTACAGCATTTCAATATTAATCTTCGTTTCATT

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL6641Contig1 1160 2 2 U
GGGTGGAGTCTCCGGCAGGAGTTGGTTGGTCGTACTCCAACACAAGCTCTGATTACAACA
CCGGGGACGAAACTACTGCAAAAGATATGCTTGTGTTCTTGATGCGATGGTACAGCAAGT
TCCCAGAACTGAAAGCTCGTGACTTCTTTCTCACTGGGGAAAGCTACGCAGGACATTACA
TACCACAACTGGCTGATTCTATACTCAGCTATAATAGACAGTCAAGTGGTGGGTTCAAGA
TCAATGTCAAAGGAATTGCAATTGGGAACCCACTTCTAAATCTGAACACAGACACTTCAG
CTGTCTACGAGTACTTATGGTCTCATGGCGTTATTTCGGATGAACTTAGACTCGAAATCA
TCCAGCAATGCGATTTTAACGATATCCCTAAGGCTACACACATGAGCTTAGGGGTGGATG
TTTGCATGACTTACGAAAGGAAGTTCTACTTCAATCTCCCAGAGGTTCAACACGCTCTTC
ACGCCAACCGCACTCGTCTGCCTTACGAGTGGTCTATGTGCAGCACCCTGGTAAATTACA
GTGGCATTGACTGGAAAATCACCATGCTTCCGCTTCTTAAGAGAGTTATACAGAACAAAA
CTCCTGTTTGGATTTTCAGTGGCGATCAAGATTCAATAGTTCCATTTCTTGGTACAAGAA
CCATCATACGAGAACTTGCTCATGATCTTAACTTCAGTACCACACTTCCCTATGGACATT
GGTTCCACAAAGACCAAGTTGGCGGCTGGGTCACTGAGTATGGAAAGCTATTGACATTTG
CGACAGTGAGAGGAGCGGCTCATATGGTTCCCTATGGGCAGCCCGCACGAGCTCTCCATA
TGTTCAGTTTCTTTGTGCGTGGACGAAGATTGCCGAACAACACACATTACCCTTCTTAAC
AACCTATATAAAGAGCTAAAGACTGTTGATAAGCTTGGAGTAGCTTTAACTTCAAGCTAT
CTAAATTCCTATTAGGTTAAGTGTTTGAGATAAGGAAATAACGTGTGATACCTTTGTCAT
GTGAACTTTGGATATTTGTGGGTTATATATAGTGGGTGATATGTCGATGGAAACTTAACC
TTTGTGATTTACGGATTGAGTGCTTTGTTGTGTTGTTTACGAAGCTTTGATTGATTGAAT
AAGAGAACGACTTCTTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EZ45TF U 1
AF RR2EZ45JQ C 576
BS 1 734 RR2EZ45TF
BS 735 1160 RR2EZ45JQ

RD RR2EZ45TF 739 0 0
GGGTGGAGTCTCCGGCAGGAGTTGGTTGGTCGTACTCCAACACAAGCTCTGATTACAACA
CCGGGGACGAAACTACTGCAAAAGATATGCTTGTGTTCTTGATGCGATGGTACAGCAAGT
TCCCAGAACTGAAAGCTCGTGACTTCTTTCTCACTGGGGAAAGCTACGCAGGACATTACA
TACCACAACTGGCTGATTCTATACTCAGCTATAATAGACAGTCAAGTGGTGGGTTCAAGA
TCAATGTCAAAGGAATTGCAATTGGGAACCCACTTCTAAATCTGAACACAGACACTTCAG
CTGTCTACGAGTACTTATGGTCTCATGGCGTTATTTCGGATGAACTTAGACTCGAAATCA
TCCAGCAATGCGATTTTAACGATATCCCTAAGGCTACACACATGAGCTTAGGGGTGGATG
TTTGCATGACTTACGAAAGGAAGTTCTACTTCAATCTCCCAGAGGTTCAACACGCTCTTC
ACGCCAACCGCACTCGTCTGCCTTACGAGTGGTCTATGTGCAGCACCCTGGTAAATTACA
GTGGCATTGACTGGAAAATCACCATGCTTCCGCTTCTTAAGAGAGTTATACAGAACAAAA
CTCCTGTTTGGATTTTCAGTGGCGATCAAGATTCAATAGTTCCATTTCTTGGTACAAGAA
CCATCATACGAGAACTTGCTCATGATCTTAACTTCAGTACCACACTTCCCTATGGACATT
GGTTCCACAAAGAC
AAGTT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2EZ45JQ 585 0 0
CTTAAGAGAGTTATACAGAACAAAACTCCTGTTTGGATTTTCAGTGGCGATCAAGATTCA
ATAGTTCCATTTCTTGGTACAAGAACCATCATACGAGAACTTGCTCATGATCTTAACTTC
AGTACCACACTTCCCTATGGACATTGGTTCCACAAAGACCAAGTTGGCGGCTGGGTCACT
GAGTATGGAAAGCTATTGACATTTGCGACAGTGAGAGGAGCGGCTCATATGGTTCCCTAT
GGGCAGCCCGCACGAGCTCTCCATATGTTCAGTTTCTTTGTGCGTGGACGAAGATTGCCG
AACAACACACATTACCCTTCTTAACAACCTATATAAAGAGCTAAAGACTGTTGATAAGCT
TGGAGTAGCTTTAACTTCAAGCTATCTAAATTCCTATTAGGTTAAGTGTTTGAGATAAGG
AAATAACGTGTGATACCTTTGTCATGTGAACTTTGGATATTTGTGGGTTATATATAGTGG
GTGATATGTCGATGGAAACTTAACCTTTGTGATTTACGGATTGAGTGCTTTGTTGTGTTG
TTTACGAAGCTTTGATTGATTGAATAAGAGAACGACTTCTTATTG

QA 1 585 1 585
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6643Contig1 872 2 2 U
GATCAATACTTCTCTGCTGACTCACTCGATGACACCCAAAAGGTATATGTGGATGGATTG
GTGAAGAAGGCATATGATAACTGGAACCAAGTGGTAGAGTATGAAGGCAAAACTCTTTTG
AACTTCAATCAGCCTGAGATGGTGAATGTTTCTCAGACAGAACATGTAACGCTGCCGGCA
AATTACTCTCCCCTGCCTCCGTCTCCTATACTCGCTAGTCAGTTTCCTAGATTCTCATTT
GAAGGGTATAATAATCAAACGCTGCCAACAGCTCAGCTTCATAACTCACAAGCACCATTC
GATATTGTTTTGCAGCAAGATCAGTTTATGGGAATACATCAAGCTCAAACCACCACTGGG
ATGGCTCTTGGTCCTCCACAGCAATCCACAGGCGGATACCACCACGACATTGGCTCTTCT
TCTGTTCATCAGGCTAATATTGATCCCTTAGAAGACTGGTCACGCCAACATGCGAACGAG
ATTCAGCTAAGAAGTGATGAAATGCTGGAGAGTGAGGACATGCAGCAGCTGTTCCAGCTC
TGTACCAGCATGGGAGGGGATGGAGAAGGTGGATATGGTTTCCCGTCGTTTATTCAAAGT
ACACCGATGGTGAAAGGATATGAGGAGGAGCGAGTGAGATCAGGAAAAGCGGTTGTCGGG
TGGCTAAAGATTAAAGCAGCAATGAAATGGGGAATCTTCATAAGGAAGAAAGCTGCCAAG
AGAAGAGCTCAGATTGTTGAGCTTGATTAATATGTTTACTAATACATGATTTATTCAGGT
ACAGTATAGGTAAAACATACCAACAGATCACTTGGTTTCACATATTTTCATGTTTGCCTT
TGACATATTATAGGTTTTACTTACAATCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP88TF U 1
AF RR2AP88JQ C 70
BS 1 639 RR2AP88TF
BS 640 872 RR2AP88JQ

RD RR2AP88TF 639 0 0
GATCAATACTTCTCTGCTGACTCACTCGATGACACCCAAAAGGTATATGTGGATGGATTG
GTGAAGAAGGCATATGATAACTGGAACCAAGTGGTAGAGTATGAAGGCAAAACTCTTTTG
AACTTCAATCAGCCTGAGATGGTGAATGTTTCTCAGACAGAACATGTAACGCTGCCGGCA
AATTACTCTCCCCTGCCTCCGTCTCCTATACTCGCTAGTCAGTTTCCTAGATTCTCATTT
GAAGGGTATAATAATCAAACGCTGCCAACAGCTCAGCTTCATAACTCACAAGCACCATTC
GATATTGTTTTGCAGCAAGATCAGTTTATGGGAATACATCAAGCTCAAACCACCACTGGG
ATGGCTCTTGGTCCTCCACAGCAATCCACAGGCGGATACCACCACGACATTGGCTCTTCT
TCTGTTCATCAGGCTAATATTGATCCCTTAGAAGACTGGTCACGCCAACATGCGAACGAG
ATTCAGCTAAGAAGTGATGAAATGCTGGAGAGTGAGGACATGCAGCAGCTGTTCCAGCTC
TGTACCAGCATGGGAGGGGATGGAGAAGGTGGATATGGTTTCCCGTCGTTTATTCAAAGT
ACACCGATGGTGAAAGGATATGAGGAGGAGCGAGTGAGA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2AP88JQ 803 0 0
GCATATGATAACTGGAACCAAGTGGTAGAGTATGAAGGCAAAACTCTTTTGAACTTCAAT
CAGCCTGAGATGGTGAATGTTTCTCAGACAGAACATGTAACGCTGCCGGCAAATTACTCT
CCCCTGCCTCCGTCTCCTATACTCGCTAGTCAGTTTCCTAGATTCTCATTTGAAGGGTAT
AATAATCAAACGCTGCCAACAGCTCAGCTTCATAACTCACAAGCACCATTCGATATTGTT
TTGCAGCAAGATCAGTTTATGGGAATACATCAAGCTCAAACCACCACTGGGATGGCTCTT
GGTCCTCCACAGCAATCCACAGGCGGATACCACCACGACATTGGTTTTTTTTCTGTTCAT
CAGGCTAATATTGATCCCTTAGAAGACTGGTCACGCCAACATGCGAACGAGATTCAGCTA
AGAAGTGATGAAATGCTGGAGAGTGAGGACATGCAGCAGCTGTTCCAGCTCTGTACCAGC
ATGGGAGGGGATGGAGAAGGTGGATATGGTTTCCCGTCGTTTATTCAAAGTACACCGATG
GTGAAAGGATATGAGGAGGAGCGAGTGAGATCAGGAAAAGCGGTTGTCGGGTGGCTAAAG
ATTAAAGCAGCAATGAAATGGGGAATCTTCATAAGGAAGAAAGCTGCCAAGAGAAGAGCT
CAGATTGTTGAGCTTGATTAATATGTTTACTAATACATGATTTATTCAGGTACAGTATAG
GTAAAACATACCAACAGATCACTTGGTTTCACATATTTTCATGTTTGCCTTTGACATATT
ATAGGTTTTACTTACAATCTTCC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL6644Contig1 872 2 2 U
TTCTCGTTGACATTATCACCCTGATCGTTAGGGAGATAAGATGGCCATGGCAGGAGACTC
TGAAACTGCATCTTGGAGAAGTGATCTCGCCAAGGTTGACGTTTGGTATGCCTCTTTTGG
ATCCAACATGTGGAAACCGAGGTTCCTTTGCTATATCCAAGGAGGAAAAGCGGCGGGAAT
GAAGAAGGCATGTGTTGGTGCAATGGATAAAACTCCACCTAAAGAAACAATGTGGGGAAC
GTTTCCAAACAGGTTGTTCTTTGGCCGTGAATCCACAGTTACTTGGGGTAAAGGAGGATC
TGCTTTCCTCAACCCTCTTACTAGTCCCAGTCATCAATCTCACATGTGTTTCTACAGAAT
CACGCTTGAGCAGTTCAACGATGTTTTGTTTCAGGAAAACGGCATGAAAGTGGATTCTGA
GACTCCCCTCTTTGATCTATCTGCTCTGCAGTTAGTACAGAACAATGGATCCTTCCCACT
TGCTAAATCTGGTTGGTATGGTAACTTTGTCTGCGTGGGAAAAGAATCAGAGATACCTAT
ACTTACAATGACATGCACACTTTCTGTTCTTGAGAAGTTTAAATCCGGTGAAGTCCCATT
AAAACTTCCTGCAAGAGCCTATGCGAAAACATTGGTAATGGGACTTGTTGAAGGAAGAAG
ACTCTCTGAAGAAGAGGCTTGGGCTTACATAGACAATGCTGCTTCTAAACTTCTCTAAGA
TTGTTTGGAGCTTTGTTTGTTTACTACTAAAACCACATGGTTTAATAAAGATTGTGTCTT
CTCTTTCAGTGTGGTGTTATGCAAAACTATGTATGCATCTTTATTGTCATATCTATCAGA
CAACAACAGTAGCTGAAACAATCTCAAGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP66TF U 1
AF RR2EP66JQ C 149
BS 1 608 RR2EP66TF
BS 609 872 RR2EP66JQ

RD RR2EP66TF 608 0 0
TTCTCGTTGACATTATCACCCTGATCGTTAGGGAGATAAGATGGCCATGGCAGGAGACTC
TGAAACTGCATCTTGGAGAAGTGATCTCGCCAAGGTTGACGTTTGGTATGCCTCTTTTGG
ATCCAACATGTGGAAACCGAGGTTCCTTTGCTATATCCAAGGAGGAAAAGCGGCGGGAAT
GAAGAAGGCATGTGTTGGTGCAATGGATAAAACTCCACCTAAAGAAACAATGTGGGGAAC
GTTTCCAAACAGGTTGTTCTTTGGCCGTGAATCCACAGTTACTTGGGGTAAAGGAGGATC
TGCTTTCCTCAACCCTCTTACTAGTCCCAGTCATCAATCTCACATGTGTTTCTACAGAAT
CACGCTTGAGCAGTTCAACGATGTTTTGTTTCAGGAAAACGGCATGAAAGTGGATTCTGA
GACTCCCCTCTTTGATCTATCTGCTCTGCAGTTAGTACAGAACAATGGATCCTTCCCACT
TGCTAAATCTGGTTGGTATGGTAACTTTGTCTGCGTGGGAAAAGAATCAGAGATACCTAT
ACTTACAATGACATGCACACTTTCTGTTCTTGAGAAGTTTAAATCCGGTGAAGTCCCATT
AAAACTTC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2EP66JQ 724 0 0
TGCTATATCCAAGGAGGAAAAGCGGCGGGAATGAAGAAGGCATGTGTTGGTGCAATGGAT
AAAACTCCACCTAAAGAAACAATGTGGGGAACGTTTCCAAACAGGTTGTTCTTTGGCCGT
GAATCCACAGTTACTTGGGGTAAAGGAGGATCTGCTTTCCTCAACCCTCTTACTAGTCCC
AGTCATCAATCTCACATGTGTTTCTACAGAATCACGCTTGAGCAGTTCAACGATGTTTTG
TTTCAGGAAAACGGCATGAAAGTGGATTCTGAGACTCCCCTCTTTGATCTATCTGCTCTG
CAGTTAGTACAGAACAATGGATCCTTCCCACTTGCTAAATCTGGTTGGTATGGTAACTTT
GTCTGCGTGGGAAAAGAATCAGAGATACCTATACTTACAATGACATGCACACTTTCTGTT
CTTGAGAAGTTTAAATCCGGTGAAGTCCCATTAAAACTTCCTGCAAGAGCCTATGCGAAA
ACATTGGTAATGGGACTTGTTGAAGGAAGAAGACTCTCTGAAGAAGAGGCTTGGGCTTAC
ATAGACAATGCTGCTTCTAAACTTCTCTAAGATTGTTTGGAGCTTTGTTTGTTTACTACT
AAAACCACATGGTTTAATAAAGATTGTGTCTTCTCTTTCAGTGTGGTGTTATGCAAAACT
ATGTATGCATCTTTATTGTCATATCTATCAGACAACAACAGTAGCTGAAACAATCTCAAG
CTAC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL6645Contig1 734 2 1 U
GGAAAACGGCACAACTACAAAACCCTAATCTCCAGTTTCTGGTGTTTTTGTGCTCTTTTG
GTTTGTCAAAGTTTGGATCTTTTTCTTAAGGATTTGAGGTGAAAAGAGATGAACAGAGGA
AGGAGGAATCTGAAACAAGCGGCGTCAGAGCAGGAGTTCACGCTTGAGGAATGTCAGAGT
ATCGCTCAGGTCGTCTCTCTCAGAGGTTCCAATCAAATTGAGATAATGGATGCAAAAGGA
GAGAACTCATTAGCATTGTTTCCAGCCAAGTTTCGTGAGAGCATGTGGATCAGACGAGGA
AGCTTTGTGGTTATTGACCATACAGGAAAGGAAAAGGCGCAAGAATCTGGTAGCAAAGTC
ACATCTATCGTCTGTAAAGTTCTCTTCTTTGAGCAAATCCGTCTCCTCCAAAAGTCTCCT
GAATGGCCAGAAATTTTCAGGGATGCTAAGCCAATTCCAGCTGATGAAAGCTCTCAAATT
CCCATGGTAAAGCAAGACGGTGATGGTAAAGCAAACACAAACAGGTTGAGACCGTTTGGG
GTGCAGTGTGATGCAGAAACAGATTCTGAATCAGATTCTGACTCATAGAAACATCTGGCA
ACATGCTTTTCTCTTGTTTCTCAAAAGAGAGAAATGTCTCTTATTGAACAGTATGTAACC
AACTCACAGCTGCTTAAAAATGCAGAGTTTTGATTTTGCAATGAATTGTTTATTGATCTA
TTGATTTTGCAACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D421JQ C 1
AF RR2D421TF U 1
BS 1 734 RR2D421TF

RD RR2D421JQ 734 0 0
GGAAAACGGCACAACTACAAAACCCTAATCTCCAGTTTCTGGTGTTTTTGTGCTCTTTTG
GTTTGTCAAAGTTTGGATCTTTTTCTTAAGGATTTGAGGTGAAAAGAGATGAACAGAGGA
AGGAGGAATCTGAAACAAGCGGCGTCAGAGCAGGAGTTCACGCTTGAGGAATGTCAGAGT
ATCGCTCAGGTCGTCTCTCTCAGAGGTTCCAATCAAATTGAGATAATGGATGCAAAAGGA
GAGAACTCATTAGCATTGTTTCCAGCCAAGTTTCGTGAGAGCATGTGGATCAGACGAGGA
AGCTTTGTGGTTATTGACCATACAGGAAAGGAAAAGGCGCAAGAATCTGGTAGCAAAGTC
ACATCTATCGTCTGTAAAGTTCTCTTCTTTGAGCAAATCCGTCTCCTCCAAAAGTCTCCT
GAATGGCCAGAAATTTTCAGGGATGCTAAGCCAATTCCAGCTGATGAAAGCTCTCAAATT
CCCATGGTAAAGCAAGACGGTGATGGTAAAGCAAACACAAACAGGTTGAGACCGTTTGGG
GTGCAGTGTGATGCAGAAACAGATTCTGAATCAGATTCTGACTCATAGAAACATCTGGCA
ACATGCTTTTCTCTTGTTTCTCAAAAGAGAGAAATGTCTCTTATTGAACAGTATGTAACC
AACTCACAGCTGCTTAAAAATGCAGAGTTTTGATTTTGCAATGAATTGTTTATTGATCTA
TTGATTTTGCAACG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2D421TF 734 0 0
GGAAAACGGCACAACTACAAAACCCTAATCTCCAGTTTCTGGTGTTTTTGTGCTCTTTTG
GTTTGTCAAAGTTTGGATCTTTTTCTTAAGGATTTGAGGTGAAAAGAGATGAACAGAGGA
AGGAGGAATCTGAAACAAGCGGCGTCAGAGCAGGAGTTCACGCTTGAGGAATGTCAGAGT
ATCGCTCAGGTCGTCTCTCTCAGAGGTTCCAATCAAATTGAGATAATGGATGCAAAAGGA
GAGAACTCATTAGCATTGTTTCCAGCCAAGTTTCGTGAGAGCATGTGGATCAGACGAGGA
AGCTTTGTGGTTATTGACCATACAGGAAAGGAAAAGGCGCAAGAATCTGGTAGCAAAGTC
ACATCTATCGTCTGTAAAGTTCTCTTCTTTGAGCAAATCCGTCTCCTCCAAAAGTCTCCT
GAATGGCCAGAAATTTTCAGGGATGCTAAGCCAATTCCAGCTGATGAAAGCTCTCAAATT
CCCATGGTAAAGCAAGACGGTGATGGTAAAGCAAACACAAACAGGTTGAGACCGTTTGGG
GTGCAGTGTGATGCAGAAACAGATTCTGAATCAGATTCTGACTCATAGAAACATCTGGCA
ACATGCTTTTCTCTTGTTTCTCAAAAGAGAGAAATGTCTCTTATTGAACAGTATGTAACC
AACTCACAGCTGCTTAAAAATGCAGAGTTTTGATTTTGCAATGAATTGTTTATTGATCTA
TTGATTTTGCAACG

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL6646Contig1 1200 2 2 U
GGGACCTTGCACTGCAAGTAACCCTATCGATAAATGTTGGCGTTGCCAGCCCAATTGGGC
CAGCCGCCGCAAGAACCTCGCCAAATGTGTTCGTGGATTCGGTTACAGGACCACGGGAGG
CATACGCGGTCGAATCTACGTGGTCACTAGCAACAGAGACGATGATACGGTGAACCCTAG
ACCTGGAACACTGCGTCATGCCGTGATTCAGAACGAACCGCTATGGATCATTTTCAAGCA
CGATATGAGCATTAGGTTGAGCCAAGAGCTAATGATTAATAGTCACAAGACGATTGATGC
TCGTGGCACGAACGTGCACATCGCATATGGTGCTGGGATCACGATGCAGTACGTGCAAAA
TATCATCATCCATGGGCTTCACGTGCATCACATCGTCCCCGGCAGTGGAGGCATGATAAG
AAACTCTAATGACCACTTTGGGTTTAGAGGACAGGCCGATGGAGATGGTATCTCTATCTT
TGGAGCAACAAACATTTGGCTTGACCACATTTCTATGTCTAAATGCCAAGATGGTCTCAT
CGACGCTATAATGGGCTCCACCGGGATCACTATCTCTAACTCTCATTTCACCCACCACAA
CGATGTGATGTTGCTTGGTGCACAAAATGACAACCAAGCGGACAAGAAGATGCAAGTCAC
TGTGGCTTTCAACCACTTTGGTAAAGGACTTGTGCAGAGGATGCCGAGGATTCGGTGGGG
TTTCGTCCATGTTGTCAACAATGACTACACTCATTGGGAGCTTTACGCTATCGGCGGTAG
CCAAAGTCCTACCATTTTCAGCCACGGAAACCGTTTCATCGCTCCTCCTCACATACAACA
TTACAGAGAGGTGACAAAGAGGGATTATGCTCCAGAATCGGAGTGGAAAAATTGGAATTG
GAGATCCGACAAAGACATTTTCATGAACAATGCATATTTCAGACAATCTGGAAATCCAAG
GTTCATGTCTTCACACTCTAGACAACAGATGATAAAGCCCAAACACGGTTCGGCCGTTTC
AAAGCTTACCAAATACGCCGGAGCATTGGATTGCCGGGTCGGAAAACCATGCTAAACAAT
ATTAATCACTACTACTTTTCTCTCTTGTATCTAGGCCATGAACCAAAAAATATTAATGGG
GTAAAAATGAAAATAAGTCTAATTTATGAGGTTCTTTCTGTAAGGATACGTTGTAATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG47TF U 1
AF RR2DG47JQ C 567
BS 1 710 RR2DG47TF
BS 711 1200 RR2DG47JQ

RD RR2DG47TF 710 0 0
GGGACCTTGCACTGCAAGTAACCCTATCGATAAATGTTGGCGTTGCCAGCCCAATTGGGC
CAGCCGCCGCAAGAACCTCGCCAAATGTGTTCGTGGATTCGGTTACAGGACCACGGGAGG
CATACGCGGTCGAATCTACGTGGTCACTAGCAACAGAGACGATGATACGGTGAACCCTAG
ACCTGGAACACTGCGTCATGCCGTGATTCAGAACGAACCGCTATGGATCATTTTCAAGCA
CGATATGAGCATTAGGTTGAGCCAAGAGCTAATGATTAATAGTCACAAGACGATTGATGC
TCGTGGCACGAACGTGCACATCGCATATGGTGCTGGGATCACGATGCAGTACGTGCAAAA
TATCATCATCCATGGGCTTCACGTGCATCACATCGTCCCCGGCAGTGGAGGCATGATAAG
AAACTCTAATGACCACTTTGGGTTTAGAGGACAGGCCGATGGAGATGGTATCTCTATCTT
TGGAGCAACAAACATTTGGCTTGACCACATTTCTATGTCTAAATGCCAAGATGGTCTCAT
CGACGCTATAATGGGCTCCACCGGGATCACTATCTCTAACTCTCATTTCACCCACCACAA
CGATGTGATGTTGCTTGGTGCACAAAATGACAACCAAGCGGACAAGAAGATGCAAGTCAC
TGTGGCTTTCAACCACTTTGGTAAAGGACTTGTGCAGAGGATGCCGAGGA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2DG47JQ 634 0 0
TCACTATCTCTAACTCTCATTTCACCCACCACAACGATGTGATGTTGCTTGGTGCACAAA
ATGACAACCAAGCGGACAAGAAGATGCAAGTCACTGTGGCTTTCAACCACTTTGGTAAAG
GACTTGTGCAGAGGATGCCGAGGATTCGGTGGGGTTTCGTCCATGTTGTCAACAATGACT
ACACTCATTGGGAGCTTTACGCTATCGGCGGTAGCCAAAGTCCTACCATTTTCAGCCACG
GAAACCGTTTCATCGCTCCTCCTCACATACAACATTACAGAGAGGTGACAAAGAGGGATT
ATGCTCCAGAATCGGAGTGGAAAAATTGGAATTGGAGATCCGACAAAGACATTTTCATGA
ACAATGCATATTTCAGACAATCTGGAAATCCAAGGTTCATGTCTTCACACTCTAGACAAC
AGATGATAAAGCCCAAACACGGTTCGGCCGTTTCAAAGCTTACCAAATACGCCGGAGCAT
TGGATTGCCGGGTCGGAAAACCATGCTAAACAATATTAATCACTACTACTTTTCTCTCTT
GTATCTAGGCCATGAACCAAAAAATATTAATGGGGTAAAAATGAAAATAAGTCTAATTTA
TGAGGTTCTTTCTGTAAGGATACGTTGTAATTCT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL6647Contig1 763 2 9 U
AGTAACAACCTTGGCCGTAGTGTGACACAAGGCAATTTGCAACGTATAAGACATGCTTTC
ACTCTAGGAGCTCGTAAGCTGAAAGATGTGCTTTCAGTGCCTGGGGAAACCATGGGCTGG
AAACTGGAGAAGTTCTTTAGTAGCTCACTGGAGAGGAACGGTAAGGGACAGAGGCAAGAC
GTGGAGGAACCTGTCGTGGCGTTTGGCACCGGGAGATCAGAAGCATCTGATCTCAGAGGA
GATTTTGAAGGGAACTCTAAAAGTCTTGTGTATGAGAAATGGTTTCATGGAGAGGGTCAT
CAGCATAAGTGGATCCCTCAGGGGCAAGACGCGAGTTCTTGGGACATTGTTCGTTGGTTT
GTCACCGGACAGAAGGATGTTTTCTATAGGAGGAATCTGAATGGTTCATCATCATCATCA
GCCTCGTTGCAGAACATGCGGAGATCAAGAGGAACAGGCACTTACATTCCTGAAATGAGT
CAACAATCTTATACAGACAGGCTCAGTAACAAACCGAGCAAAGTGAAGAACTCACTGCCT
TCAGCATCTCAGTCTCAACTCGTCAAACAGCGTATTTGAGTTGGTCTCTTAGGTTCGTCT
CACATATTTACAAACAGAAGACAATGAGAGTTTTGTTTGCTATGTTGCTAAATGTGAAAA
AAGTTTCAGAGGTTCAAAGCATATGTTTCCCTTTTAGGACTTTCCTTTAGGATTTGTAAT
TCATTATCTTTTGACCGTCTGGAGATTAATGGTTTAGTTTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DJ45TF U 1
AF RR2DJ45JQ C 20
BS 1 661 RR2DJ45TF
BS 662 662 RR2DJ45JQ
BS 663 697 RR2DJ45TF
BS 698 698 RR2DJ45JQ
BS 699 710 RR2DJ45TF
BS 711 711 RR2DJ45JQ
BS 712 746 RR2DJ45TF
BS 747 747 RR2DJ45JQ
BS 748 763 RR2DJ45TF

RD RR2DJ45TF 763 0 0
AGTAACAACCTTGGCCGTAGTGTGACACAAGGCAATTTGCAACGTATAAGACATGCTTTC
ACTCTAGGAGCTCGTAAGCTGAAAGATGTGCTTTCAGTGCCTGGGGAAACCATGGGCTGG
AAACTGGAGAAGTTCTTTAGTAGCTCACTGGAGAGGAACGGTAAGGGACAGAGGCAAGAC
GTGGAGGAACCTGTCGTGGCGTTTGGCACCGGGAGATCAGAAGCATCTGATCTCAGAGGA
GATTTTGAAGGGAACTCTAAAAGTCTTGTGTATGAGAAATGGTTTCATGGAGAGGGTCAT
CAGCATAAGTGGATCCCTCAGGGGCAAGACGCGAGTTCTTGGGACATTGTTCGTTGGTTT
GTCACCGGACAGAAGGATGTTTTCTATAGGAGGAATCTGAATGGTTCATCATCATCATCA
GCCTCGTTGCAGAACATGCGGAGATCAAGAGGAACAGGCACTTACATTCCTGAAATGAGT
CAACAATCTTATACAGACAGGCTCAGTAACAAACCGAGCAAAGTGAAGAACTCACTGCCT
TCAGCATCTCAGTCTCAACTCGTCAAACAGCGTATTTGAGTTGGTCTCTTAGGTTCGTCT
CACATATTTACAAACAGAAGACAATGAGAGTTTTGTTTGCTATGTTGCTAAATGTGAAAA
A*GTTTCAGAGGTTCAAAGCATATGTTTCCCTTTTAG*ACTTTCCTTTAG*ATTTGTAAT
TCATTATCTTTTGACCGTCTGGAGAT*AATGGTTTAGTTTAGT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2DJ45JQ 744 0 0
GTGTGACACAAGGCAATTTGCAACGTATAAGACATGCTTTCACTCTAGGAGCTCGTAAGC
TGAAAGATGTGCTTTCAGTGCCTGGGGAAACCATGGGCTGGAAACTGGAGAAGTTCTTTA
GTAGCTCACTGGAGAGGAACGGTAAGGGACAGAGGCAAGACGTGGAGGAACCTGTCGTGG
CGTTTGGCACCGGGAGATCAGAAGCATCTGATCTCAGAGGAGATTTTGAAGGGAACTCTA
AAAGTCTTGTGTATGAGAAATGGTTTCATGGAGAGGGTCATCAGCATAAGTGGATCCCTC
AGGGGCAAGACGCGAGTTCTTGGGACATTGTTCGTTGGTTTGTCACCGGACAGAAGGATG
TTTTCTATAGGAGGAATCTGAATGGTTCATCATCATCATCAGCCTCGTTGCAGAACATGC
GGAGATCAAGAGGAACAGGCACTTACATTCCTGAAATGAGTCAACAATCTTATACAGACA
GGCTCAGTAACAAACCGAGCAAAGTGAAGAACTCACTGCCTTCAGCATCTCAGTCTCAAC
TCGTCAAACAGCGTATTTGAGTTGGTCTCTTAGGTTCGTCTCACATATTTACAAACAGAA
GACAATGAGAGTTTTGTTTGCTATGTTGCTAAATGTGAAAAAAGTTTCAGAGGTTCAAAG
CATATGTTTCCCTTTTAGGACTTTCCTTTAGGATTTGTAATTCATTATCTTTTGACCGTC
TGGAGATTAATGGTTTAGTTTAGT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL6648Contig1 540 2 1 U
TCTGATAGAAATGGTGATATTACCTTCCATAAGTTGGTAGGGAGGCTTGACAACAGCGCG
GTTTCGGAGGTGGGGGCAAGGCTTGCGTTTAAGTCCAACAAGGAAATAGCGGTCCAAGTG
AAATCCATACCTCTTGATGAACTCATCCCGCCTTCTCAGCCGATCCTTCTTGTCAAGATC
GATGTTCAGGGCTGGGAGAAGCATGTTTTAAACGGGGCGAAGAAGCTGCTCTCGAGGAAA
CCGGCGGAGGCTCCAAAGAGATACGAGATTTCCTGAGAAGCGTTGGATATAGCAAGTGTG
TGCAGCATGGCACAGATGCGCATTGCACTAAGGAGTAATAGAGACTGGAACTTAGCGAAA
AAGGGGCTAATAAAGATGCCATACGAGTTGAGGAGCATGAGAAAATGAGCCAATTGGTAT
TTGCTTAGAAAGACCATAAGTTGCTTATGTGGTCAGTCATGTTTGTTTCTCCTTGTAATA
TGTATTCAATTTTTTGTGATACCGGTTCTAACTAGTAAAGATATGTTATTGTTGATGTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C339JQ C 1
AF RR2C339TF U 1
BS 1 540 RR2C339TF

RD RR2C339JQ 540 0 0
TCTGATAGAAATGGTGATATTACCTTCCATAAGTTGGTAGGGAGGCTTGACAACAGCGCG
GTTTCGGAGGTGGGGGCAAGGCTTGCGTTTAAGTCCAACAAGGAAATAGCGGTCCAAGTG
AAATCCATACCTCTTGATGAACTCATCCCGCCTTTTCAGCCGATCCTTCTTGTCAAGATC
GATGTTCAGGGCTGGGAGAAGCATGTTTTAAACGGGGCGAAGAAGCTGCTCTCGAGGAAA
CCGGCGGAGGCTCCAAAGAGATACGAGATTTCCTGAGAAGCGTTGGATATAGCAAGTGTG
TGCAGCATGGCACAGATGCGCATTGCACTAAGGAGTAATAGAGACTGGAACTTAGCGAAA
AAGGGGCTAATAAAGATGCCATACGAGTTGAGGAGCATGAGAAAATGAGCCAATTGGTAT
TTGCTTAGAAAGACCATAAGTTGCTTATGTGGTCAGTCATGTTTGTTTCTCCTTGTAATA
TGTATTCAATTTTTTGTGATACCGGTTCTAACTAGTAAAGATATGTTATTGTTGATGTGC

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2C339TF 540 0 0
TCTGATAGAAATGGTGATATTACCTTCCATAAGTTGGTAGGGAGGCTTGACAACAGCGCG
GTTTCGGAGGTGGGGGCAAGGCTTGCGTTTAAGTCCAACAAGGAAATAGCGGTCCAAGTG
AAATCCATACCTCTTGATGAACTCATCCCGCCTTCTCAGCCGATCCTTCTTGTCAAGATC
GATGTTCAGGGCTGGGAGAAGCATGTTTTAAACGGGGCGAAGAAGCTGCTCTCGAGGAAA
CCGGCGGAGGCTCCAAAGAGATACGAGATTTCCTGAGAAGCGTTGGATATAGCAAGTGTG
TGCAGCATGGCACAGATGCGCATTGCACTAAGGAGTAATAGAGACTGGAACTTAGCGAAA
AAGGGGCTAATAAAGATGCCATACGAGTTGAGGAGCATGAGAAAATGAGCCAATTGGTAT
TTGCTTAGAAAGACCATAAGTTGCTTATGTGGTCAGTCATGTTTGTTTCTCCTTGTAATA
TGTATTCAATTTTTTGTGATACCGGTTCTAACTAGTAAAGATATGTTATTGTTGATGTGC

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 2

CO CL6649Contig1 670 2 2 U
GGACAACAGAAATATTCCATAAGAGAAAAAAAGAAAATATAACAAATAAGAAGAAAAATA
AACATGGCGAAACATGGAAATGTCGTTGATTTCACCTATCTTTTGTTGATTTTCTTGTTG
GTTTTGACAGGAGAAGCTCAGGCTCAAAGTAAGTATACTAAAGCCAAAAATGCGCCGGTT
GAAGTCTGCCTGGATCGTAATTCTGGTGATGCTGTATGCACTCAGCATTGCGTTGCAGAA
AAAAATCCTAAAAGATGTTCTGGAAAATGTTTCCCATATAAAATGTCGGGAAGGAAGGAA
TGCTACTGTCATCCATGCTAATAAATGACAATAGCTGGTTTTGATTGTTTGTGGGTTGTT
TAAATTTTTCTTTTCATGAAAAAAAATATATTTTTAACCGGCTAATATTTTGAAGTAGCT
TTTAAAAAAAGTTTTAAATGCCAGTTTTAAAAGTTTTCACCAAATAATAAGATAAAAACA
AAAACAATATTGTCTTGGGTTTCACCAAAAAATGCTTGTTTTTTCTCAGACGAGATTTTT
AGTATATTATATAATTATTTAGAAGTTCAAACATATTCTAAAAACTGCAAACAATCAAAG
CCAATAAGCATAAAAATACCACAAAGTGTAATAAGATAAGATCATAATGAAAATAAGATT
GTCTTTAATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC08TF U 1
AF RR2BC08JQ C 1
BS 1 611 RR2BC08TF
BS 612 670 RR2BC08JQ

RD RR2BC08TF 611 0 0
GGACAACAGAAATATTCCATAAGAGAAAAAAAGAAAATATAACAAATAAGAAGAAAAATA
AACATGGCGAAACATGGAAATGTCGTTGATTTCACCTATCTTTTGTTGATTTTCTTGTTG
GTTTTGACAGGAGAAGCTCAGGCTCAAAGTAAGTATACTAAAGCCAAAAATGCGCCGGTT
GAAGTCTGCCTGGATCGTAATTCTGGTGATGCTGTATGCACTCAGCATTGCGTTGCAGAA
AAAAATCCTAAAAGATGTTCTGGAAAATGTTTCCCATATAAAATGTCGGGAAGGAAGGAA
TGCTACTGTCATCCATGCTAATAAATGACAATAGCTGGTTTTGATTGTTTGTGGGTTGTT
TAAATTTTTCTTTTCATGAAAAAAAATATATTTTTAACCGGCTAATATTTTGAAGTAGCT
TTTAAAAAAAGTTTTAAATGCCAGTTTTAAAAGTTTTCACCAAATAATAAGATAAAAACA
AAAACAATATTGTCTTGGGTTTCACCAAAAAATGCTTGTTTTTTCTCAGACGAGATTTTT
AGTATATTATATAATTATTTAGAAGTTCAAACATATTCTAAAAACTGCAAACAATCAAAG
CCAATAAGCAT

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2BC08JQ 670 0 0
GGACAACAGAAATATTCCATAAGAGAAAAAAAGAAAATATAACAAATAAGAAGAAAAATA
AACATGGCGAAACATGGAAATGTCGTTGATTTCACCTATCTTTTGTTGATTTTCTTGTTG
GTTTTGACAGGAGAAGCTCAGGCTCAAAGTAAGTATACTAAAGCCAAAAATGCGCCGGTT
GAAGTCTGCCTGGATCGTAATTCTGGTGATGCTGTATGCACTCAGCATTGCGTTGCAGAA
AAAAATCCTAAAAGATGTTCTGGAAAATGTTTCCCATATAAAATGTCGGGAAGGAAGGAA
TGCTACTGTCATCCATGCTAATAAATGACAATAGCTGGTTTTGATTGTTTGTGGGTTGTT
TAAATTTTTCTTTTCATGAAAAAAAATATATTTTTAACCGGCTAATATTTTGAAGTAGCT
TTTAAAAAAAGTTTTAAATGCCAGTTTTAAAAGTTTTCACCAAATAATAAGATAAAAACA
AAAACAATATTGTCTTGGGTTTCACCAAAAAATGCTTGTTTTTTCTCAGACGAGATTTTT
AGTATATTATATAATTATTTAGAAGTTCAAACATATTCTAAAAACTGCAAACAATCAAAG
CCAATAAGCATAAAAATACCACAAAGTGTAATAAGATAAGATCATAATGAAAATAAGATT
GTCTTTAATC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL6650Contig1 619 2 1 U
GGAGGCTGCCAAGAACAATCCCTTCAAGCTTGGAGACCGTAAGCTTCGTGTAAAGGAGAA
GCAAGTTGAGTATGATGGAAGCAAACCGTCGGGTGGTAGAAAGACTGAGAATGGCTCTGC
AGATGGAAGCAAGCCTTCTGGTGTGAAAAGTGGAGGAGGAAGCAAGAGTGAGAATGGCTC
TACCTCTGCTATAGATGGAAGCAAGGCTGAGAATGGGTCTGCTGCAGATGCGGAAGATGA
CTTCAAGCCTATAAGAAGCCGTAGGAACAGAAGCGAGAAAAAGGGAAACGGTAACGAGAA
AAACAATGTGCAAACAACACCAAAACCAAAGGCTTGATTGATGCTCTTTCTGCCAGTGCC
AACAACAACACCAAAAAGAGTCAACTTGAGATTATTTTTCTATATTACAGATTCATCATC
TCTTTACTTCTTTAGGTCTTTTCTTGCATCTTATTGGGAGCCAACATGATTTTTTTCCTG
TTTTGTTTTCGTTTTTTTCAACAGACGAACTTTTCTACCGTCTTTGCTTTTTCTTCTATT
CCAATTTTATTTTTCGTCCGCACATTCATTCACCTTATACAGTGAAACCTCTATAAATTA
ATAATGTTGGGATTACACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DF42JQ C 1
AF RR2DF42TF U 1
BS 1 619 RR2DF42TF

RD RR2DF42JQ 619 0 0
GGAGGCTGCCAAGAACAATCCCTTCAAGCTTGGAGACCGTAAGCTTCGTGTAAAGGAGAA
GCAAGTTGAGTATGATGGAAGCAAACCGTCGGGTGGTAGAAAGACTGAGAATGGCTCTGC
AGATGGAAGCAAGCCTTCTGGTGTGAAAAGTGGAGGAGGAAGCAAGAGTGAGAATGGCTC
TACTTTTGCTATAGATGGAAGCAAGGCTGAGAATGGGTCTGCTGCAGATGCGGAAGATGA
CTTCAAGCCTATAAGAAGCCGTAGGAACAGAAGCGAGAAAAAGGGAAACGGTAACGAGAA
AAACAATGTGCAAACAACACCAAAACCAAAGGCTTGATTGATGCTCTTTCTGCCAGTGCC
AACAACAACACCAAAAAGAGTCAACTTGAGATTATTTTTCTATATTACAGATTCATCATC
TCTTTACTTCTTTAGGTCTTTTCTTGCATCTTATTGGGAGCCAACATGATTTTTTTCCTG
TTTTGTTTTCGTTTTTTTCAACAGACGAACTTTTCTACCGTCTTTGCTTTTTCTTCTATT
CCAATTTTATTTTTCGTCCGCACATTCATTCACCTTATACAGTGAAACCTCTATAAATTA
ATAATGTTGGGATTACACC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2DF42TF 619 0 0
GGAGGCTGCCAAGAACAATCCCTTCAAGCTTGGAGACCGTAAGCTTCGTGTAAAGGAGAA
GCAAGTTGAGTATGATGGAAGCAAACCGTCGGGTGGTAGAAAGACTGAGAATGGCTCTGC
AGATGGAAGCAAGCCTTCTGGTGTGAAAAGTGGAGGAGGAAGCAAGAGTGAGAATGGCTC
TACCTCTGCTATAGATGGAAGCAAGGCTGAGAATGGGTCTGCTGCAGATGCGGAAGATGA
CTTCAAGCCTATAAGAAGCCGTAGGAACAGAAGCGAGAAAAAGGGAAACGGTAACGAGAA
AAACAATGTGCAAACAACACCAAAACCAAAGGCTTGATTGATGCTCTTTCTGCCAGTGCC
AACAACAACACCAAAAAGAGTCAACTTGAGATTATTTTTCTATATTACAGATTCATCATC
TCTTTACTTCTTTAGGTCTTTTCTTGCATCTTATTGGGAGCCAACATGATTTTTTTCCTG
TTTTGTTTTCGTTTTTTTCAACAGACGAACTTTTCTACCGTCTTTGCTTTTTCTTCTATT
CCAATTTTATTTTTCGTCCGCACATTCATTCACCTTATACAGTGAAACCTCTATAAATTA
ATAATGTTGGGATTACACC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL6651Contig1 878 2 10 U
GGGGTAACAGATCAAATTGAGAGTAAACCCTAGAAAAAGAAGAGAGAGAATCATGACGAC
GGGAGATCTGGTGAATATCCATCCTACAGAGCTTAAGTTCCCTTTTGAGTTGAAGAAGCA
AAGCTCGTGCTCGTTGCAAATTAGCAACAAGACTGGTACTCAAGTTGTCGCATTTAAGGT
TAAGACAACCAATCCTCGCAAATACTGTGTCCGACCAAACACAGGTGTTGTCTTACCCGG
TGATTCCTGCAATGTTACAGTGACGATGCAAGCCCAGAAAGAGGCACCTCTCGATATGCA
ATGCAAAGACAAGTTCCTTGTTCAGTCTGTTATCGTCTCTGACGCTACTACTTCCAAAGA
TGTCCTCGCTGAAATGTTCAACAAGGAGCCTGGTAGAGTGATTGAGGATTTCAAATTGAG
GGTTGTTTACATCCCTGCTAATCCCCCTTCACCTGTCCCTGAAGGCTCTGAAGAAGGCAA
CTCTCCTAGGACCGACTTTCCTGCCTCTCAATTTGATGACCACGTGTCCAGAACGCTAGA
AGAAACTAATGAGAAATCCTCCGAGGCATGGTCCATGATTCACAAGTTGACGGAGGAGAA
GACTAGTGCTGTCCAGCTAAGTCAGAAGCTCCGACAGGAACTGGAGATGCTGAGGAGAGA
ATCAAGCAACAAGCAGTCTGGTGGTGGTCATTCCTTGGTGTTGCTGCTGTTGGTGGGTCT
ACTCGGCTGTGTGATTGGATACATCTTGAACGTCCGGTCCGGACATACTTAAACTGAATA
TGTGGGGTTAGGTTCATCATCCTATTTTCATTGTCTTATTTTCCCCAAATTTTCTTCTGT
TTTTTTCTTTTTTCTTTTCAAAATGATCATTTACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS29TF U 1
AF RR2BS29JQ C 142
BS 1 660 RR2BS29TF
BS 661 661 RR2BS29JQ
BS 662 671 RR2BS29TF
BS 672 672 RR2BS29JQ
BS 673 701 RR2BS29TF
BS 702 702 RR2BS29JQ
BS 703 735 RR2BS29TF
BS 736 736 RR2BS29JQ
BS 737 756 RR2BS29TF
BS 757 878 RR2BS29JQ

RD RR2BS29TF 774 0 0
GGGGTAACAGATCAAATTGAGAGTAAACCCTAGAAAAAGAAGAGAGAGAATCATGACGAC
GGGAGATCTGGTGAATATCCATCCTACAGAGCTTAAGTTCCCTTTTGAGTTGAAGAAGCA
AAGCTCGTGCTCGTTGCAAATTAGCAACAAGACTGGTACTCAAGTTGTCGCATTTAAGGT
TAAGACAACCAATCCTCGCAAATACTGTGTCCGACCAAACACAGGTGTTGTCTTACCCGG
TGATTCCTGCAATGTTACAGTGACGATGCAAGCCCAGAAAGAGGCACCTCTCGATATGCA
ATGCAAAGACAAGTTCCTTGTTCAGTCTGTTATCGTCTCTGACGCTACTACTTCCAAAGA
TGTCCTCGCTGAAATGTTCAACAAGGAGCCTGGTAGAGTGATTGAGGATTTCAAATTGAG
GGTTGTTTACATCCCTGCTAATCCCCCTTCACCTGTCCCTGAAGGCTCTGAAGAAGGCAA
CTCTCCTAGGACCGACTTTCCTGCCTCTCAATTTGATGACCACGTGTCCAGAACGCTAGA
AGAAACTAATGAGAAATCCTCCGAGGCATGGTCCATGATTCACAAGTTGACGGAGGAGAA
GACTAGTGCTGTCCAGCTAAGTCAGAAGCTCCGACAGGAACTGGAGATGCTGAGGAGAGA
*TCAAGCAACA*GCAGTCTGGTGGTGGTCATTCCTTGGTGT*GCTGCTGTTGGTGGGTCT
ACTCGGCTGTGTGAT*GGATACATCTTGAACGTCCG
TCCGACATACTAAACTGA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2BS29JQ 737 0 0
TAGCAACAAGACTGGTACTCAAGTTGTCGCATTTAAGGTTAAGACAACCAATCCTCGCAA
ATACTGTGTCCGACCAAACACAGGTGTTGTCTTACCCGGTGATTCCTGCAATGTTACAGT
GACGATGCAAGCCCAGAAAGAGGCACCTCTCGATATGCAATGCAAAGACAAGTTCCTTGT
TCAGTCTGTTATCGTCTCTGACGCTACTACTTCCAAAGATGTCCTCGCTGAAATGTTCAA
CAAGGAGCCTGGTAGAGTGATTGAGGATTTCAAATTGAGGGTTGTTTACATCCCTGCTAA
TCCCCCTTCACCTGTCCCTGAAGGCTCTGAAGAAGGCAACTCTCCTAGGACCGACTTTCC
TGCCTCTCAATTTGATGACCACGTGTCCAGAACGCTAGAAGAAACTAATGAGAAATCCTC
CGAGGCATGGTCCATGATTCACAAGTTGACGGAGGAGAAGACTAGTGCTGTCCAGCTAAG
TCAGAAGCTCCGACAGGAACTGGAGATGCTGAGGAGAGAATCAAGCAACAAGCAGTCTGG
TGGTGGTCATTCCTTGGTGTTGCTGCTGTTGGTGGGTCTACTCGGCTGTGTGATTGGATA
CATCTTGAACGTCCGGTCCGGACATACTTAAACTGAATATGTGGGGTTAGGTTCATCATC
CTATTTTCATTGTCTTATTTTCCCCAAATTTTCTTCTGTTTTTTTCTTTTTTCTTTTCAA
AATGATCATTTACTTTT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL6652Contig1 913 2 2 U
GGAAAAGCCCACAAAACAAAACGTTACACGAGTCTTCCTTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCT
CGCTCCCCGCTCTTTCTCTTTAGAGAAACAGTATTGGAAGAAGAGAGAAGATATGGAGGT
GGAGAAGAGGACAATGGTGAATGGAGGCATGAAATTACCAATTGGATACAGGTTTCATCC
AACGGACCAGGAGCTTATCCTTCATTACTTGCTCCCAAAAGCATTTGCTTCTCCTTTGCC
TTCCTCCATCATCCCTGTCTTTGACGTCTTCTCCTCTCATCCTCTTACTTTCCCAGGGGA
TCAAGAGGAGAATAAGAGGTACTTCTTCTGCAAGAAGAGAAGTGAAGTATCCAGTAATGC
ACATCGAATCAAGATTTCATCTGGTGATGGTTACTGGAAACCTATCAGGAAAGAGAGAGA
AATCATTGCTTGTGGTAGAAGAGTTGGGATTAGAAGAACACTTGCTTTCTATGAAACAAA
CAAATCATCTTCTAAATGTAACAAAACCAGATGGAGCATGACAGAGTACTGCCTTGCCGG
TTTTGCATCAACTAAGGTGTCTGGAGATTGGGCAGTGTACAATGTGTATGAGAGGAAAGC
ATCCAAAGGAAGAAGGCAGAGGAAATCAAGCGGGAGATATGATGGAGAGGAACTAAGTTG
CATAGACTTTACGATTGGGTCAGATCATGAAATCTGTCCTCCACCGCCCTCTCCTCCTAC
CTCAGCTGATGAGTCAGGGAGCATTATTTAAAACGTTGCTCCTTAACCCTAACCTACTCC
ACTTATGTTTCTTTCAAGCTATTTTAAAAAAAAAATACACGTCTTGATTCATTTTGATCC
GAAAGTGTTGTGTGAGTGGAGATTTGTTGAGCAAACCTAATATATGACAAACTTGTCAAC
TTTTTACAACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT37TF U 1
AF RR2FT37JQ C 326
BS 1 733 RR2FT37TF
BS 734 913 RR2FT37JQ

RD RR2FT37TF 733 0 0
GGAAAAGCCCACAAAACAAAACGTTACACGAGTCTTCCTTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCT
CGCTCCCCGCTCTTTCTCTTTAGAGAAACAGTATTGGAAGAAGAGAGAAGATATGGAGGT
GGAGAAGAGGACAATGGTGAATGGAGGCATGAAATTACCAATTGGATACAGGTTTCATCC
AACGGACCAGGAGCTTATCCTTCATTACTTGCTCCCAAAAGCATTTGCTTCTCCTTTGCC
TTCCTCCATCATCCCTGTCTTTGACGTCTTCTCCTCTCATCCTCTTACTTTCCCAGGGGA
TCAAGAGGAGAATAAGAGGTACTTCTTCTGCAAGAAGAGAAGTGAAGTATCCAGTAATGC
ACATCGAATCAAGATTTCATCTGGTGATGGTTACTGGAAACCTATCAGGAAAGAGAGAGA
AATCATTGCTTGTGGTAGAAGAGTTGGGATTAGAAGAACACTTGCTTTCTATGAAACAAA
CAAATCATCTTCTAAATGTAACAAAACCAGATGGAGCATGACAGAGTACTGCCTTGCCGG
TTTTGCATCAACTAAGGTGTCTGGAGATTGGGCAGTGTACAATGTGTATGAGAGGAAAGC
ATCCAAAGGAAGAAGGCAGAGGAAATCAAGCGGGAGATATGATGGAGAGGAACTAAGTTG
CATAGACTTTACGATTGGGTCAGATCATGAAATCTGTCCTCCACCGCCCTCTCCTCCTAC
CTCAGCTGATGAG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RR2FT37JQ 588 0 0
TTCTGCAAGAAGAGAAGTGAAGTATCCAGTAATGCACATCGAATCAAGATTTCATCTGGT
GATGGTTACTGGAAACCTATCAGGAAAGAGAGAGAAATCATTGCTTGTGGTAGAAGAGTT
GGGATTAGAAGAACACTTGCTTTCTATGAAACAAACAAATCATCTTCTAAATGTAACAAA
ACCAGATGGAGCATGACAGAGTACTGCCTTGCCGGTTTTGCATCAACTAAGGTGTCTGGA
GATTGGGCAGTGTACAATGTGTATGAGAGGAAAGCATCCAAAGGAAGAAGGCAGAGGAAA
TCAAGCGGGAGATATGATGGAGAGGAACTAAGTTGCATAGACTTTACGATTGGGTCAGAT
CATGAAATCTGTCCTCCACCGCCCTCTCCTCCTACCTCAGCTGATGAGTCAGGGAGCATT
ATTTAAAACGTTGCTCCTTAACCCTAACCTACTCCACTTATGTTTCTTTCAAGCTATTTT
AAAAAAAAAATACACGTCTTGATTCATTTTGATCCGAAAGTGTTGTGTGAGTGGAGATTT
GTTGAGCAAACCTAATATATGACAAACTTGTCAACTTTTTACAACATG

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL6653Contig1 820 2 14 U
GGAGTAAAAGCTGATATGCAATAATAACACTGTACACACCAATCCATTATTTTAATGTAA
GGAGATATAAACACAAACCCAATTCCATGTACAAGCAATCCTCTATGGTCTACTTATCAC
AAATTCAGAAACCACAAAATAAAAAAATGCAAGAAGACAAGTTCAAAGAATAGCAAAAAT
CTTAACAATCATTACACATTCTGGTTCACCCCACTTTGTCTTGTAACCTTGCACTGGAGG
CACTTTAAAAAGGATCTCAATATTGACAGATTACTAGGATTATTGTCTCTTGCTCTGTGA
TCTTGAAACTGGTGTATTCATGTCAATGTCTGAGTCCATGCTCCCCTCTCTCGTTCTTGA
ACGCCTACGTTCCTCTCTTGGAATGGGATATTCTTCGGACTCAAGCATCCGCACAACTTG
GCTCATTTTTGGCCTTTTATCGGAATCTGGATCGACGCATCTCAAAGCCGTCAAAAGGGC
TCGTTTCAATGATCTTGTAGGTGGTCTTACCTCTATGTTTGGATCCACCACTTCTTCTGA
TCTTCTCGTTCCTACCATCATCTTCAACCACTCCACTAGGTTCACCTCATGAGCAGGACG
GCCATAATCCACAGGGTCTCTTCCTGTGATTGCTTCTAAGAGCAAAACACCAAAGCTATA
GACGTCACTCTTTTCATTTAGCAACCCTGTATTTGCATATTCTGGAGCAACGTACCCAAA
TGTTCCCATTACTTGAGTTGTCACATGGCTTGTCCCAGCGCCAAGCAACTTAGCAAGCCC
AAATCTGAAACCTTTGCATTGAATCTCATTGATAGTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC47JQ U 1
AF RR2CG66JQ U 19
BS 1 136 RR2GC47JQ
BS 137 137 RR2CG66JQ
BS 138 141 RR2GC47JQ
BS 142 142 RR2CG66JQ
BS 143 175 RR2GC47JQ
BS 176 176 RR2CG66JQ
BS 177 211 RR2GC47JQ
BS 212 212 RR2CG66JQ
BS 213 250 RR2GC47JQ
BS 251 251 RR2CG66JQ
BS 252 275 RR2GC47JQ
BS 276 276 RR2CG66JQ
BS 277 463 RR2GC47JQ
BS 464 820 RR2CG66JQ

RD RR2GC47JQ 463 0 0
GGAGTAAAAGCTGATATGCAATAATAACACTGTACACACCAATCCATTATTTTAATGTAA
GGAGATATAAACACAAACCCAATTCCATGTACAAGCAATCCTCTATGGTCTACTTATCAC
AAATTCAGAAACCACAGAATAGAAAAATGCAAGAAGACAAGTTCAAAGAATAGCAGAAAT
CTTAACAATCATTACACATTCTGGTTCACCCTACTTTGTCTTGTAACCTTGCACTGGAGG
CACTTTAAAA*GGATCTCAATATTGACAGATTACTCGGATTATTGTCTCTTGCTCTGTGA
TCTTGAAACTGGTGTATTCATGTCAATGTCTGAGTCCATGCTCCCCTCTCTCGTTCTTGA
ACGCCTACGTTCCTCTCTTGGAATGGGATATTCTTCGGACTCAAGCATCCGCACAACTTG
GCTCATTTTTGGCCTTTTATCGGAATCTGGATCGACGCATCTC

QA 1 463 1 463
DS 

RD RR2CG66JQ 802 0 0
CG
ATAATAACACTGTACACACCAATCCATTATTTTAATGTAAGGAGATATAAATACAAACCC
AATTCCATGTACAAGCAATCCTCTGTGGTCTACTTATCACAAATTCAGAAACCACAAAAT
AAAAAAATGCAAGAAGGCAAGTTCAAAGAATAGCAAAAATCTTAGCAATCATTACACATT
CTGGTTCACTCCACTTTGTCTTGTAACCTTGCGCTGGAGGCACTTTAAAAAGGATCTCAA
TATTGACAGATTACTAGGATTATTGTCTCTTGCTCTGTGATCTTGAAACTGGTGTATTCA
TGTCAATGTCTGAGTCCATGCTCCCCTCTCTCGTTCTTGAACGCCTACGTTCCTCTCTTG
GAATGGGATATTCTTCGGACTCAAGCATCCGCACAACTTGGCTCATTTTTGGCCTTTTAT
CGGAATCTGGATCGACGCATCTCAAAGCCGTCAAAAGGGCTCGTTTCAATGATCTTGTAG
GTGGTCTTACCTCTATGTTTGGATCCACCACTTCTTCTGATCTTCTCGTTCCTACCATCA
TCTTCAACCACTCCACTAGGTTCACCTCATGAGCAGGACGGCCATAATCCACAGGGTCTC
TTCCTGTGATTGCTTCTAAGAGCAAAACACCAAAGCTATAGACGTCACTCTTTTCATTTA
GCAACCCTGTATTTGCATATTCTGGAGCAACGTACCCAAATGTTCCCATTACTTGAGTTG
TCACATGGCTTGTCCCAGCGCCAAGCAACTTAGCAAGCCCAAATCTGAAACCTTTGCATT
GAATCTCATTGATAGTATGT

QA 3 802 3 802
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6656Contig1 1116 2 4 U
GGTTGTACAGCTTGTTCAACACAAATGGACTGGTCAATTCTTTGCCTTGAAGGTCATTCA
ACTAAACGTTGATGAAGCGATTCGCAAGTCAATTGCACAAGAGCTTAAAATAAATCAGTC
TTCACAATGTCCATACCTTGTTACCTCATACCAATCGTTCTACGATAATGGCGCAATCTC
CCTCATCTTGGAGTACATGGACGGTGGATCTCTAGAGGACTTTCTCAAATCAGTCAAAAC
CATCCCTGAGTCCTATCTTTCTGCCATCTTTAAACAAGTGCTGCAGGGACTGATCTATCT
TCATCACGATAAGCACATCATCCACCGTGACTTGAAACCATCCAATCTGTTGATCAACCA
CAGGGGAGAGGTCAAGATCACTGACTTTGGTGTGAGTACCGTTATGACAAACACCGCGGG
TTTAGCAAACACCTTTGTTGGGACTTACAACTACATGTCTCCAGAGAGAATCGTTGGGAA
CAAGTACGGTAACAAAAGCGATATATGGAGCTTGGGATTAGTAGTGCTTGAATGCGCAAC
AGGGAAGTTTCCTTATTTGCCACCAGATGAAGAGGAAACATGGAGCAGTGTATTCGAGTT
GATGGAAGCAATTGTGGACCAACCACCACCAACTCTTCCTTCAGACAGTTTCTCCCCTGA
GTTATCTTCATTCATCTCCACTTGTTTGCAAAAGGATCCCAACAGTCGAAGCTCTGCAAG
GGAACTAATGTAACATCCTTTCGTGAAGAAGTACGACAACAACTCGGGGATCAATCTTGC
GTCATACTTCACAAATGCAGGGTCTCCGCTTGCAACGCTTAAGAATCTCTCTGGTACATT
CTCCGTTTAAGCTCTCCAGGTAGACATACAATATCGTCATCACCTGGTGGTTACTGTTAT
CATCTTCTTTGTTTTTAACTTCCGGTTAAAAAAAATAATCTGGATCATCTACAGTAGTAA
CTATAAATTTGTGCTGTATTTTCAAGATTATAGGATATATGAGCTACATGAGAGTGCTTA
TTCAGTTTTATCTTCTTTTTTTTCCACTTGGAGCTCTCATAAGCGATGAGATACTTTGGA
TTGGAATGTTATGTGGAAAAAGAAGATTCATTATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN33TF U 1
AF RR2EN33JQ C 440
BS 1 694 RR2EN33TF
BS 695 695 RR2EN33JQ
BS 696 715 RR2EN33TF
BS 716 1116 RR2EN33JQ

RD RR2EN33TF 715 0 0
GGTTGTACAGCTTGTTCAACACAAATGGACTGGTCAATTCTTTGCCTTGAAGGTCATTCA
ACTAAACGTTGATGAAGCGATTCGCAAGTCAATTGCACAAGAGCTTAAAATAAATCAGTC
TTCACAATGTCCATACCTTGTTACCTCATACCAATCGTTCTACGATAATGGCGCAATCTC
CCTCATCTTGGAGTACATGGACGGTGGATCTCTAGAGGACTTTCTCAAATCAGTCAAAAC
CATCCCTGAGTCCTATCTTTCTGCCATCTTTAAACAAGTGCTGCAGGGACTGATCTATCT
TCATCACGATAAGCACATCATCCACCGTGACTTGAAACCATCCAATCTGTTGATCAACCA
CAGGGGAGAGGTCAAGATCACTGACTTTGGTGTGAGTACCGTTATGACAAACACCGCGGG
TTTAGCAAACACCTTTGTTGGGACTTACAACTACATGTCTCCAGAGAGAATCGTTGGGAA
CAAGTACGGTAACAAAAGCGATATATGGAGCTTGGGATTAGTAGTGCTTGAATGCGCAAC
AGGGAAGTTTCCTTATTTGCCACCAGATGAAGAGGAAACATGGAGCAGTGTATTCGAGTT
GATGGAAGCAATTGTGGACCAACCACCACCAACTCTTCCTTCAGACAGTTTCTCCCCTGA
GTTATCTTCATTCATCTCCACTTGTTTGCAAAAG*ATCCCAACAGTCGAAGCTCT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2EN33JQ 677 0 0
GGGACTTACAACTACATGTCTCCAGAGAGAATCGTTGGGAACAAGTACGGTAACAAAAGC
GATATATGGAGCTTGGGATTAGTAGTGCTTGAATGCGCAACAGGGAAGTTTCCTTATTTG
CCACCAGATGAAGAGGAAACATGGAGCAGTGTATTCGAGTTGATGGAAGCAATTGTGGAC
CAACCACCACCAACTCTTCCTTCAGACAGTTTCTCCCCTGAGTTATCTTCATTCATCTCC
ACTTGTTTGCAAAAGGATCCCAACAGTCGAAGCTCTGCAAGGGAACTAATGTAACATCCT
TTCGTGAAGAAGTACGACAACAACTCGGGGATCAATCTTGCGTCATACTTCACAAATGCA
GGGTCTCCGCTTGCAACGCTTAAGAATCTCTCTGGTACATTCTCCGTTTAAGCTCTCCAG
GTAGACATACAATATCGTCATCACCTGGTGGTTACTGTTATCATCTTCTTTGTTTTTAAC
TTCCGGTTAAAAAAAATAATCTGGATCATCTACAGTAGTAACTATAAATTTGTGCTGTAT
TTTCAAGATTATAGGATATATGAGCTACATGAGAGTGCTTATTCAGTTTTATCTTCTTTT
TTTTCCACTTGGAGCTCTCATAAGCGATGAGATACTTTGGATTGGAATGTTATGTGGAAA
AAGAAGATTCATTATCT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL6657Contig1 1171 2 2 U
GGACAGAACTTTCAAGTAACAAAAATGGCTGTGATTAAGCTTATTCCTTATCTTGTGCTC
TTTGCGTTGTTTTCTTTTGATGTTGGTGTTGCTCATCCAGGTTTTGGGTTCGGATGGGGA
AGTAAAGGCCCCAGTATTGGAAGAACTTTCTCCTCGGGTCTCTTCCCACAATTCTACCAA
TTCTCCTGCCCACAAGCTGATGAAATTGTCATGACAGTGCTGGAAAAAGCCATAGCTAGA
AACGCAAGAATGGCAGCATCTTTACTCAGGCTTCACTTCCACGACTGCTTCGTCCAGGGC
TGTGATGCATCAATCTTGTTGGATGATAGTGCTACCATAAGAAGTGAAAAGAATGCAGGA
CCAAACAAGAACTCTATTAAGGGGTTTGAAGTAATAGACGAGATCAAAGCCAAACTAGAG
CAAGTTTGTCCTCAAATAGTCTCTTGCGCTGACATTCTAGCTCTTACCGCTCGTGGCTCA
ACTATTCTGAGTGGTGGTCCATCATGGGAGCTTCCACTAGGGAGGAGAGACTCGACGACT
GCGAGCCTCAATGGAGCAAACACGAACATTCCTGCACCTAATTCGACTATTCAGAATCTT
TTAACCATGTTCCAACGCAAAGGTTTGAACCAAGAAGACCTTGTTTCCCTCTCAGGAGGT
CATACAATTGGAGTAGCTAGGTGTACAACGTTCAAGCAAAGACTCTACAATCAAAACGGT
AATAACCAACCAGACGAGACGCTAGAGAGGTCTTACTACTATTGTCTGAGATCGATCTGT
CCACCTACTGGAGGCGATAACAATATTTCCCCACTAGACTTAGCCTCTCCTGCAAGATTC
GACAACACATACTTCAAGCTCATCCTCTGGGGAAAAGGCTTATTGACATCAGACCAAGTG
CTTCTCACTGGAAATGTAGGCAATATTGTTGAATTGGTGAAAGCTTATGCAGAAGACGAG
AGCCTTTTTTTCGAACAATTCGCGAAGTCCATGGTAAACATGGGGAACATTCAGCCTCTT
ACTGGAATCAATGGTGAGATCAGGAAAAACTGTCACGTGATTAACTAAAAGAACTTCAGT
TTTTGCATTGTAATATTTTATTATGGGAGATGAGGAATAACTCGTTTTATGCAATATATA
ATGTAATTGAATGGATATGGACTGTTCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E204TF U 1
AF RR2E204JQ C 593
BS 1 710 RR2E204TF
BS 711 1171 RR2E204JQ

RD RR2E204TF 710 0 0
GGACAGAACTTTCAAGTAACAAAAATGGCTGTGATTAAGCTTATTCCTTATCTTGTGCTC
TTTGCGTTGTTTTCTTTTGATGTTGGTGTTGCTCATCCAGGTTTTGGGTTCGGATGGGGA
AGTAAAGGCCCCAGTATTGGAAGAACTTTCTCCTCGGGTCTCTTCCCACAATTCTACCAA
TTCTCCTGCCCACAAGCTGATGAAATTGTCATGACAGTGCTGGAAAAAGCCATAGCTAGA
AACGCAAGAATGGCAGCATCTTTACTCAGGCTTCACTTCCACGACTGCTTCGTCCAGGGC
TGTGATGCATCAATCTTGTTGGATGATAGTGCTACCATAAGAAGTGAAAAGAATGCAGGA
CCAAACAAGAACTCTATTAAGGGGTTTGAAGTAATAGACGAGATCAAAGCCAAACTAGAG
CAAGTTTGTCCTCAAATAGTCTCTTGCGCTGACATTCTAGCTCTTACCGCTCGTGGCTCA
ACTATTCTGAGTGGTGGTCCATCATGGGAGCTTCCACTAGGGAGGAGAGACTCGACGACT
GCGAGCCTCAATGGAGCAAACACGAACATTCCTGCACCTAATTCGACTATTCAGAATCTT
TTAACCATGTTCCAACGCAAAGGTTTGAACCAAGAAGACCTTGTTTCCCTCTCAGGAGGT
CATACAATTGGAGTAGCTAGGTGTACAACGTTCAAGCAAAGACTCTACAA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2E204JQ 579 0 0
AGAATCTTTTAACCATGTTCCAACGCAAAGGTTTGAACCAAGAAGACCTTGTTTCCCTCT
CAGGAGGTCATACAATTGGAGTAGCTAGGTGTACAACGTTCAAGCAAAGACTCTACAATC
AAAACGGTAATAACCAACCAGACGAGACGCTAGAGAGGTCTTACTACTATTGTCTGAGAT
CGATCTGTCCACCTACTGGAGGCGATAACAATATTTCCCCACTAGACTTAGCCTCTCCTG
CAAGATTCGACAACACATACTTCAAGCTCATCCTCTGGGGAAAAGGCTTATTGACATCAG
ACCAAGTGCTTCTCACTGGAAATGTAGGCAATATTGTTGAATTGGTGAAAGCTTATGCAG
AAGACGAGAGCCTTTTTTTCGAACAATTCGCGAAGTCCATGGTAAACATGGGGAACATTC
AGCCTCTTACTGGAATCAATGGTGAGATCAGGAAAAACTGTCACGTGATTAACTAAAAGA
ACTTCAGTTTTTGCATTGTAATATTTTATTATGGGAGATGAGGAATAACTCGTTTTATGC
AATATATAATGTAATTGAATGGATATGGACTGTTCTTTG

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL6658Contig1 834 2 12 U
GCTATAATCTCAAATCGTTATTCAAGTGCAAGCATACATGAAGCATAGAACAACTACAAA
ACACACATATCAACGATTAATGACACAGTAAATTAAAACACCTATAACACAATGAATAAA
ATCATAATACATACATAAGCCTAAAAGATAATCAAACTGGAAAAAGAATCCAAAATTGCA
TAGAAGTAGAACAACCAAGTATAGAAAGAAAAGTGAAACTAGGCGTCTTGGTGATGCTGT
CTAGTGGTGCTAGCGGTACCATTGACGCCATTAGAGTACTTGTTTGAAATCGGTGCAGCA
ACTGTGTTTCCTCCACGGTTCTTACGGCGAAAAACGATAAACCAAGTAAGCGGCTCAAGA
ATCACAACGCAAGCACCAAGAAAAATGAGAATTCCAATATAAGCCCATCGCCATTTATCT
TCTGGATCCAAGATATCGAATCCTTTAAAAATGTTAATAATGGATAGGATAATTGTTGTG
TATCCCACTGTGTGATGATACACATTCCAGTAGAATCGATACTTGTGGTCTGGTTTAGGC
CTTAAAAGAAGAGCAAAGACTTGAAGTGTAGCGAAAGTGAAAAGTGCGATCCCAAGATTA
CGATGGGTTGAGTATGATGTGCCTGGTGAATCGTCGCCAAGCTTGATTCCGGTGGCCCAA
CCGGCAACACCAATGGCATAGCCGGAGACTTGGAACACGATGTGGAGGTAGAACCATGTT
GGGGCGGTGAAAACTTTCATGTACCGAGCCATCATTGCTCCCATTGGCAATAGCACTCCC
CAGCTTACCGCATTTAGTATCCCGTGTGTATTTCTCCTCCTCAGCCTGCTACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA41JQ U 1
AF RR2CZ04JQ U 43
BS 1 73 RR2AA41JQ
BS 74 74 RR2CZ04JQ
BS 75 97 RR2AA41JQ
BS 98 98 RR2CZ04JQ
BS 99 544 RR2AA41JQ
BS 545 545 RR2CZ04JQ
BS 546 634 RR2AA41JQ
BS 635 635 RR2CZ04JQ
BS 636 666 RR2AA41JQ
BS 667 667 RR2CZ04JQ
BS 668 823 RR2AA41JQ
BS 824 834 RR2CZ04JQ

RD RR2AA41JQ 823 0 0
GCTATAATCTCAAATCGTTATTCAAGTGCAAGCATACATGAAGCATAGAACAACTACAAA
ACACACATATCAATGATTAATGACACAGTAAATTAAACCACCTATAACACAATGAATAAA
ATCATAATACATACATAAGCCTAAAAGATAATCAAACTGGAAAAAGAATCCAAAATTGCA
TAGAAGTAGAACAACCAAGTATAGAAAGAAAAGTGAAACTAGGCGTCTTGGTGATGCTGT
CTAGTGGTGCTAGCGGTACCATTGACGCCATTAGAGTACTTGTTTGAAATCGGTGCAGCA
ACTGTGTTTCCTCCACGGTTCTTACGGCGAAAAACGATAAACCAAGTAAGCGGCTCAAGA
ATCACAACGCAAGCACCAAGAAAAATGAGAATTCCAATATAAGCCCATCGCCATTTATCT
TCTGGATCCAAGATATCGAATCCTTTAAAAATGTTAATAATGGATAGGATAATTGTTGTG
TATCCCACTGTGTGATGATACACATTCCAGTAGAATCGATACTTGTGGTCTGGTTTAGGC
CTTAGAAGAAGAGCAAAGACTTGAAGTGTAGCGAAAGTGAAAAGTGCGATCCCAAGATTA
CGATGGGTTGAGTATGATGTGCCTGGTGAATCGTTGCCAAGCTTGATTCCGGTGGCCCAA
CCGGCAGCACCAATGGCATAGCCGGAGACTTGGAACACGATGTGGAGGTAGAACCATGTT
GGGGCGGTGAAAACTTTCATGTACCGAGCCATCATTGCTCCCATTGGCAATAGCACTCCC
CAGCTTACCGCATTTAGTATCCCGTGTGTATTTCTCCTCCTCA

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR2CZ04JQ 792 0 0
GCATAGAACAACTACAAAACACACATATCAACGATTAATGACACAGTAAATTAAAACACC
TATAACACAATGAATAAAATCATAATACATACATAAGCCTAAAAGATAATCAAACTGGAA
AAAGAATCCAAAATTGCATAGAAGTAGAACAACCAAGTATAGAAAGAAAAGTGAAACTAG
GCGTCTTGGTGATGCTGTCTAGTGGTGCTAGTGGTACCATTGACGCCATTAGAGTACTTG
TTTGAAATCGGTGCAGCAACTGTGTTTCCTCCACGGTTCTTACGGCGAAAAACGATAAAC
CAAGTAAGTGGCTCAAGAATCACAACGCAAGCACCAAGAAAAATGAGAATTCCAATATAA
GCCCATCGCCATTTATCTTCTGGATCCAAGATATCGAATCCTTTAAAAATGTTAATAATG
GGTAGGATAATTGTTGTGTATCCCACTGTGTGATGATACACATTCCAGTAGAATCGATAC
TTGTGGTCTGGTTTAGGCCTTAAAAGAAGAGCAAAGACTTGAAGTGTAGCGAAAGTGAAA
AGTGCGATCCCAAGATTACGATGGGTTGAGTATGATGTGCCTGGTGAATCGTCGCCAAGC
TTGATTCCGGTGGCCCAACCGGCAACACCAATGGCATAGCCGGAGACTTGGAACACGATG
TGGAGGTAGAACCATGTTGGGGCGGTGAAAACTTTCATGTACCTAGCCATCATTGCTCCC
ATTGGCAATAGCACTCCCCAGCTTACCGCATTTAGTATCCCGTGTGTATTTCTCCTCCTC
AGCCTGCTACAG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL6659Contig1 845 2 10 U
AATTCTAGTGCCTGATCTTATCTTTGGTTTTGTTCTTGATTTCTCTTTTTCAGATTCTTG
AATTGCAATGAAGGGAATGAAGGAGAGATTGGCCAAGAAAATCAAACTCATCACCATTGT
TTCAACCTTGAAGCAAGGCCTAGCTCATCACAGGAACAACGTTGATCGGACAATCCATCA
TCTAAAAGAGGAAATAGTCGTTGAATCTGGTCAAAACAGAGGTTATGTTACACCAACGCT
ACTAGAGCTTGAAGATGTGGAAGAGCAAGCACAAGAACATGATCTTCAAGAAGAAGAAAG
AGGGATTCTTTTGGAGTTTGAAGAGAACTGCCCACCAGGAGGAGAAGATTCGGTCGTATT
CTACACCACGGGACTTCGAGGAGTGAGGAAAACGTTTGAAGCATGTAGAAAAGTAAGATT
CTTGTTGGAGAATCACAAGGTAGTGTATAAAGAGAGAGATGTATCGATGGATGCAGAGTT
TAGAGACGAGATGTGGAGGTTGCTTGGAGGTAAAGTTACCTCTCCGAGGCTGTTCATTAG
AGGTAGGTACATCGGAGGAGCAGATGAAGTTGTGGCATTAAACGAGAACGGGAAGCTCAA
GAAGCTTCTAGAAGGGATCTCACTGGTTCACTCGCCTTGTGAATGTTGCGAGAACGAAAG
GTTTCTGATATGTTCTAGTTGTAACGGAAGCTCTAAATTGATTGCAGATCATCATGATGA
AGGAGAGACTAGTAATAATGATAATAAGATGTGGACGAGATGCAGAGAGTGTAATGAGAA
TGGTCTTGTGAGATGTCCTCTTTGTAGTTGAGTTTGTTGTAATAACTACTTACTATCTGA
TTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2FN45TF U 1
AF RR2FN45JQ C 147
BS 1 683 RR2FN45TF
BS 684 684 RR2FN45JQ
BS 685 722 RR2FN45TF
BS 723 723 RR2FN45JQ
BS 724 734 RR2FN45TF
BS 735 737 RR2FN45JQ
BS 738 743 RR2FN45TF
BS 744 744 RR2FN45JQ
BS 745 764 RR2FN45TF
BS 765 845 RR2FN45JQ

RD RR2FN45TF 764 0 0
AATTCTAGTGCCTGATCTTATCTTTGGTTTTGTTCTTGATTTCTCTTTTTCAGATTCTTG
AATTGCAATGAAGGGAATGAAGGAGAGATTGGCCAAGAAAATCAAACTCATCACCATTGT
TTCAACCTTGAAGCAAGGCCTAGCTCATCACAGGAACAACGTTGATCGGACAATCCATCA
TCTAAAAGAGGAAATAGTCGTTGAATCTGGTCAAAACAGAGGTTATGTTACACCAACGCT
ACTAGAGCTTGAAGATGTGGAAGAGCAAGCACAAGAACATGATCTTCAAGAAGAAGAAAG
AGGGATTCTTTTGGAGTTTGAAGAGAACTGCCCACCAGGAGGAGAAGATTCGGTCGTATT
CTACACCACGGGACTTCGAGGAGTGAGGAAAACGTTTGAAGCATGTAGAAAAGTAAGATT
CTTGTTGGAGAATCACAAGGTAGTGTATAAAGAGAGAGATGTATCGATGGATGCAGAGTT
TAGAGACGAGATGTGGAGGTTGCTTGGAGGTAAAGTTACCTCTCCGAGGCTGTTCATTAG
AGGTAGGTACATCGGAGGAGCAGATGAAGTTGTGGCATTAAACGAGAACGGGAAGCTCAA
GAAGCTTCTAGAAGGGATCTCACTGGTTCACTCGCCTTGTGAATGTTGCGAGAACGAAAG
GTTTCTGATATGTTCTAGTTGTA*CGGAAGCTCTAAATTGATTGCAGATCATCATGATGA
AG*AGAGACTAGTAT**ATGATA*TAAGATGTGGACGAGATGCA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2FN45JQ 699 0 0
ATCACAGGAACAACGTTGATCGGACAATCCATCATCTAAAAGAGGAAATAGTCGTTGAAT
CTGGTCAAAACAGAGGTTATGTTACACCAACGCTACTAGAGCTTGAAGATGTGGAAGAGC
AAGCACAAGAACATGATCTTCAAGAAGAAGAAAGAGGGATTCTTTTGGAGTTTGAAGAGA
ACTGCCCACCAGGAGGAGAAGATTCGGTCGTATTCTACACCACGGGACTTCGAGGAGTGA
GGAAAACGTTTGAAGCATGTAGAAAAGTAAGATTCTTGTTGGAGAATCACAAGGTAGTGT
ATAAAGAGAGAGATGTATCGATGGATGCAGAGTTTAGAGACGAGATGTGGAGGTTGCTTG
GAGGTAAAGTTACCTCTCCGAGGCTGTTCATTAGAGGTAGGTACATCGGAGGAGCAGATG
AAGTTGTGGCATTAAACGAGAACGGGAAGCTCAAGAAGCTTCTAGAAGGGATCTCACTGG
TTCACTCGCCTTGTGAATGTTGCGAGAACGAAAGGTTTTTGATATGTTCTAGTTGTAACG
GAAGCTCTAAATTGATTGCAGATCATCATGATGAAGGAGAGACTAGTAATAATGATAATA
AGATGTGGACGAGATGCAGAGAGTGTAATGAGAATGGTCTTGTGAGATGTCCTCTTTGTA
GTTGAGTTTGTTGTAATAACTACTTACTATCTGATTTTT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6661Contig1 743 2 2 U
ACAGGCAACCAAGTCTCAAGAAAGGTAGAAAGCTAAGGTAGAATATGGCTATGGAGTTAG
AGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTCTCATCATGG
ATGAAGATGAACAGCTTAACTCTGTTTCACTCTCTTCCTCCTCCCCTCTCGGGTTCCAGG
GTATGTTCAGAGGAGGCTACCAAACGGCTCCATATATGTATCATCAAGAACAGAGCAAAG
GGACTGGTGTTTTCATCCCTAAATCTTCTCAGACCAGAAGGAGACCTCAGCATCCTAAGC
AAGGCAGGGTTAGTTCCTTCAACGCCAAGCAACAACGCTCTCTTCATCAAAACAGACAAC
AGTATCAGCAGAGTCATGACAACTTAAGAAGTTCCCTCACCACTCACAACAACAACAACA
ACAAGAGCAGCATGATCACTACTAATGTTAATGCTTCCATCCCAAGAAGAACTTACAGAG
ACGCAATCTACAATTGATTGATCTAACAAATATTTTGCAAGATTCATGATTTTCTATGGA
ATTCATTTATTATATTATTTTATAGATGCATAAGATTTATTTGTTTGTAAATCAGGAAGA
ATAAGAAGAATAATGATTCTATATAAGGAAGGAAGTTCTTGGAGATTTGTTTCAAGCTTG
TTCTTGTTTTAATATAACTCTCTCTTGGTGATTCTAGAGATGATAATATTTCACTGACTT
CTCTATTTGTAAAATATGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL27TF U 1
AF RR2BL27JQ C 29
BS 1 389 RR2BL27TF
BS 390 743 RR2BL27JQ

RD RR2BL27TF 389 0 0
ACAGGCAACCAAGTCTCAAGAAAGGTAGAAAGCTAAGGTAGAATATGGCTATGGAGTTAG
AGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTCTCATCATGG
ATGAAGATGAACAGCTTAACTCTGTTTCACTCTCTTCCTCCTCCCCTCTCGGGTTCCAGG
GTATGTTCAGAGGAGGCTACCAAACGGCTCCATATATGTATCATCAAGAACAGAGCAAAG
GGACTGGTGTTTTCATCCCTAAATCTTCTCAGACCAGAAGGAGACCTCAGCATCCTAAGC
AAGGCAGGGTTAGTTCCTTCAACGCCAAGCAACAACGCTCTCTTCATCAAAACAGACAAC
AGTATCAGCAGAGTCATGACAACTTAAGA

QA 1 389 1 389
DS 

RD RR2BL27JQ 715 0 0
AAAGCTAAGGTAGAATATGGCTATGGAGTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGA
CATAAGCAAACAGATCTCTCTTCTCATCATGGATGAAGATGAACAGCTTAACTCTGTTTC
ACTCTCTTCCTCCTCCCCTCTCGGGTTCCAGGGTATGTTCAGAGGAGGCTACCAAACGGC
TCCATATATGTATCATCAAGAACAGAGCAAAGGGACTGGTGTTTTCATCCCTAAATCTTC
TCAGACCAGAAGGAGACCTCAGCATCCTAAGCAAGGCAGGGTTAGTTCCTTCAACGCCAA
GCAACAACGCTTTTTTCATCAAAACAGACAACAGTATCAGCAGAGTCATGACAACTTAAG
AAGTTCCCTCACCACTCACAACAACAACAACAACAAGAGCAGCATGATCACTACTAATGT
TAATGCTTCCATCCCAAGAAGAACTTACAGAGACGCAATCTACAATTGATTGATCTAACA
AATATTTTGCAAGATTCATGATTTTCTATGGAATTCATTTATTATATTATTTTATAGATG
CATAAGATTTATTTGTTTGTAAATCAGGAAGAATAAGAAGAATAATGATTCTATATAAGG
AAGGAAGTTCTTGGAGATTTGTTTCAAGCTTGTTCTTGTTTTAATATAACTCTCTCTTGG
TGATTCTAGAGATGATAATATTTCACTGACTTCTCTATTTGTAAAATATGTTTTT

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL6662Contig1 742 2 4 U
CGCACACCGAAGACTCCCAATCATCTCCTTCCTTCTTCCTCTCCGAAACTAAATTTGATT
CAGCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCAGGCATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAAAT
TTCTCGAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAGGAGCAGC
AGAAACAAGTGGTCGTCTAGAAACTCGGCGAGCCTGGTCAATCCCACGACGACTTTGCAG
CTTGTCTCCCTGCCGATGAATGCCGTTACGCTGTTTTCGATTTCGATTTCGTCACTGCCG
AGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACAGCAAGAGTGA
GAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAGCGCGAGCTTGATGGAATTC
AAGTTGAGCTTCAAGCTACCGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGAG
CCAACTGAGGAGTTACATCCTCAATATTTGGTTGAATCCAACTACTATTACTGAATGATA
TGCTTGTTCTTTAAGTTTGCTGTGAAGGCACCCACCAACCAAAACAACTTCATTTCATTT
GGTCTTTGTCTTCCTATTGTCTTTTATATTTTTTCTTTTTGGTCCTTGCAGTGTTTTGCT
TAAAACTTGAGAGATTTGGCTTGTGCTCTTTTACCATTGTGTAAGAAACCCCCCAAACCC
TTTACCGAAAGATGAATCTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ07TF U 1
AF RR2GQ07JQ C 75
BS 1 664 RR2GQ07TF
BS 665 665 RR2GQ07JQ
BS 666 693 RR2GQ07TF
BS 694 742 RR2GQ07JQ

RD RR2GQ07TF 693 0 0
CGCACACCGAAGACTCCCAATCATCTCCTTCCTTCTTCCTCTCCGAAACTAAATTTGATT
CAGCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCAGGCATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAAAT
TTCTCGAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAGGAGCAGC
AGAAACAAGTGGTCGTCTAGAAACTCGGCGAGCCTGGTCAATCCCACGACGACTTTGCAG
CTTGTCTCCCTGCCGATGAATGCCGTTACGCTGTTTTCGATTTCGATTTCGTCACTGCCG
AGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACAGCAAGAGTGA
GAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAGCGCGAGCTTGATGGAATTC
AAGTTGAGCTTCAAGCTACCGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGAG
CCAACTGAGGAGTTACATCCTCAATATTTGGTTGAATCCAACTACTATTACTGAATGATA
TGCTTGTTCTTTAAGTTTGCTGTGAAGGCACCCACCAACCAAAACAACTTCATTTCATTT
GGTCTTTGTCTTCCTATTGTCTTTTATATTTTTTCTTTTTGGTCCTTGCAGTGTTTTGCT
TAAA*CTTGAGAGATTTGGCTTGTGCTCTTTTA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2GQ07JQ 668 0 0
AATGCAGCGTCAGGCATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAAATTTCTCGAGCTCAAG
GCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAACAAGTGGTC
GTCTAGAAACTCGGCGAGCCTGGTCAATCCCACGACGACTTTGCAGCTTGTCTCCCTGCC
GATGAATGCCGTTACGCTGTTTTCGATTTCGATTTCGTCACTGCCGAGAGCTGCCAGAAG
AGCAAGATCTTTTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACAGCAAGAGTGAGAAGCAAGATGATC
TACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAGCGCGAGCTTGATGGAATTCAAGTTGAGCTTCAA
GCTACCGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGAGCCAACTGAGGAGTT
ACATCCTCAATATTTGGTTGAATCCAACTACTATTACTGAATGATATGCTTGTTCTTTAA
GTTTGCTGTGAAGGCACCCACCAACCAAAACAACTTCATTTCATTTGGTCTTTGTCTTCC
TATTGTCTTTTATATTTTTTCTTTTTGGTCCTTGCAGTGTTTTGCTTAAAACTTGAGAGA
TTTGGCTTGTGCTCTTTTACCATTGTGTAAGAAACCCCCCAAACCCTTTACCGAAAGATG
AATCTCAT

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL6663Contig1 623 2 3 U
TTCTTCAAAACAAATTCCATGTAAAACTTTTATTAACCAAAAAAATACTCAAAATAAATA
GAAACACAAAATGGAAAAAGTGAATAAGAGGGTAACTTAATTATATATCATCGCCACCGT
AACGAGAGAAGTTAAAGGGATAAGCGATGCGATGGATAACAACGGAAGGAGAGACAAACA
AATCTGGCTCCGAGACAAGAACGCCATCGAGTGTGAAACCCGAAGCCGAGTTGTTGGTTA
CAACGATTGAGTTTCCAGAGAGAAGAGTTGGGATGCGAGAGAGAGGCTCCATGAGGCTTA
TGTTGTGGAAGTGAAGCAGTTGTGGGACTATGTGGTAAGCAGCTACGAGTGGTGAAGTGG
CGTTGATTCCTTCGACTGATGTTTTGGGAAGGAAGAGTGTTGAAGTGAGAACTTGACCGT
GTATCTCGTCGTTTGTTGCGAGGAAAGCTTCGCTCCAATCTTCGAAACTTCCTCCTGAGA
TCATTGCGTCTATGATTTTGATTACTAGTTTATTTTGATCGAATGCAAGCGAAGTGGAGG
ATGTAGTTGTGATGATGAGGAGAAGGAGAAGAGGGAGGTGTTTGTTGCTTGCCATGAAGG
AAAGTAGAAGGAATCTAAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL29JQ U 6
AF RR2CL29TF C 1
BS 1 5 RR2CL29TF
BS 6 345 RR2CL29JQ
BS 346 623 RR2CL29TF

RD RR2CL29JQ 340 0 0
CAAAACAAATTCCATGTAAAACTTTTATTAACCAAAAAAATACTCAAAATAAATAGAAAC
ACAAAATGGAAAAAGTGAATAAGAGGGTAACTTAATTATATATCATCGCCACCGTAACGA
GAGAAGTTAAAGGGATAAGCGATGCGATGGATAACAACGGAAGGAGAGACAAACAAATCT
GGCTCCGAGACAAGAACGCCATCGAGTGTGAAACCCGAAGCCGAGTTGTTGGTTACAACG
ATTGAGTTTCCAGAGAGAAGAGTTGGGATGCGAGAGAGAGGCTCCATGAGGCTTATGTTG
TGGAAGTGAAGCAGTTGTGGGACTATGTGGTAAGCAGCTA

QA 1 340 1 340
DS 

RD RR2CL29TF 623 0 0
TTCTTCAAAACAAATTCCATGTAAAACTTTTATTAACCAAAAAAATACTCAAAATAGATA
GAAACACAAAATGGAAAAAGTGAATAAGAGGGTAACTTAATTATATATCATCGCCACCGT
AACGAGAGAAGTTAAAGGGATAAGCGATGCGATGGATAACAACGGAAGGAGAGACAAACA
AATCTGGCTCCGAGACAAGAACGCCATCGAGTGTGAAACCCGAAGCCGAGTTGTTGGTTA
CAACGATTGAGTTTCCAGAGAGAAGAGTTGGGATGCGAGAGAGAGGCTCCATGAGGCTTA
TGTTGTGGAAGTGAAGCAGTTGTGGGACTATGTGGTAAGCAGCTACGAGTGGTGAAGTGG
CGTTGATTCCTTCGACTGATGTTTTGGGAAGGAAGAGTGTTGAAGTGAGAACTTGACCGT
GTATCTCGTCGTTTGTTGCGAGGAAAGCTTCGCTCCAATCTTCGAAACTTCCTCCTGAGA
TCATTGCGTCTATGATTTTGATTACTAGTTTATTTTGATCGAATGCAAGCGAAGTGGAGG
ATGTAGTTGTGATGATGAGGAGAAGGAGAAGAGGGAGGTGTTTGTTGCTTGCCATGAAGG
AAAGTAGAAGGAATCTAAGCTCC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL6664Contig1 1022 2 2 U
GGGGATTCGACAGAACCCAGAACCAAATCCGAAAATTTGAATGCCTAGGTCTACCGAGGG
TTTAGGAAAAACCATAAAGTAAAAAAAAAACAGCGCACGCGCGAACATTTGTACGTGCGA
ACCATAACACAGAATAAGACGGTGTTTTATTATCGTCTCCTCCTCCTTTCGCCGCTCTCA
CCAAACATCTCTCTAAAACAATTACTCTCTCTCTCTACAGTGAGTCAAAGGGAGGAGGAC
GATGATGAAGACTTCCGTCAAAGGCAAGTACGATGGCGGTAAGAGCACTGGAGTAGGCTC
AGTGGCCTTCAACGCCGGCGATATAAAGCTACGCGCCACCATGACCGATGCAACCTTCGT
CGCTGGTCCTACCTTGAACGGCCTCTCTCTAGCCGTGGAGAAGCCTGGTTTCTTCATCGT
CGAGTATAACGTCCCTAAGAAAGATGTTAGGTTTCAGTTCATGAACACAGTGAGGGTTGC
TGAGAAGCCATTGAATCTGACTTACATTCATAGCAGAGCTGATACCAGTAAGCTTAAGTA
TACTTATGCGCACGGAAGGATCGCTACATTCGAGCCTTGCTACGACTTTGCCAAGAACGC
TTGGGATTTTGCGGTTTCTAGGAGAGTTTATGGGGATGATGTTGTCAAGGCCACTTATCA
AACGTCTACTAAGTTGCTTGGTGTGGAATGGTCAAGGAGCTCCAAATCCACTGGATCTTT
CAAGGTATGTGCGTCTGTGAATTTGGCGGAGGAAGTGAAAACGCCGAAATTGATAGCAGA
AACAACTTGGAACCTTGAAATCTAATGTTCTTTACGATTATTCAAATTCAAGTTTCCACC
TGAATTGTTCGCTTGTTACCAACGATTTTAATTAGACCTTTTTGCCAACCTTTTTTGTTG
CAACATGACAACCCCCTTGTCGTTCTCATGTCTGGTCTCTCTTAAAAAATAATTTGTTGT
AAGGGAAAAATGTACCCTAAACCTCTCTTTTGAATGCGTAATAAAAATATGCAAATGGTT
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2AC49TF U 1
AF RR2AC49JQ C 178
BS 1 600 RR2AC49TF
BS 601 1022 RR2AC49JQ

RD RR2AC49TF 600 0 0
GGGGATTCGACAGAACCCAGAACCAAATCCGAAAATTTGAATGCCTAGGTCTACCGAGGG
TTTAGGAAAAACCATAAAGTAAAAAAAAAACAGCGCACGCGCGAACATTTGTACGTGCGA
ACCATAACACAGAATAAGACGGTGTTTTATTATCGTCTCCTCCTCCTTTCGCCGCTCTCA
CCAAACATCTCTCTAAAACAATTACTCTCTCTCTCTACAGTGAGTCAAAGGGAGGAGGAC
GATGATGAAGACTTCCGTCAAAGGCAAGTACGATGGCGGTAAGAGCACTGGAGTAGGCTC
AGTGGCCTTCAACGCCGGCGATATAAAGCTACGCGCCACCATGACCGATGCAACCTTCGT
CGCTGGTCCTACCTTGAACGGCCTCTCTCTAGCCGTGGAGAAGCCTGGTTTCTTCATCGT
CGAGTATAACGTCCCTAAGAAAGATGTTAGGTTTCAGTTCATGAACACAGTGAGGGTTGC
TGAGAAGCCATTGAATCTGACTTACATTCATAGCAGAGCTGATACCAGTAAGCTTAAGTA
TACTTATGCGCACGGAAGGATCGCTACATTCGAGCCTTGCTACGACTTTGCCAAGAACGC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RR2AC49JQ 845 0 0
TCACCAAACATCTCTCTAAAACAATTACTCTCTCTCTCTACAGTGAGTCAAAGGGAGGAG
GACGATGATGAAGACTTCCGTCAAAGGCAAGTACGATGGCGGTAAGAGCACTGGAGTAGG
CTCAGTGGCCTTCAACGCCGGCGATATAAAGCTACGCGCCACCATGACCGATGCAACCTT
CGTCGCTGGTCCTACCTTGAACGGCCTCTCTCTAGCCGTGGAGAAGCCTGGTTTCTTCAT
CGTCGAGTATAACGTCCCTAAGAAAGATGTTAGGTTTCAGTTCATGAACACAGTGAGGGT
TGCTGAGAAGCCATTGAATCTGACTTACATTCATAGCAGAGCTGATACCAGTAAGCTTAA
GTATACTTATGCGCACGGAAGGATCGCTACATTCGAGCCTTGCTACGACTTTGCCAAGAA
CGCTTGGGATTTTGCGGTTTCTAGGAGAGTTTATGGGGATGATGTTGTCAAGGCCACTTA
TCAAACGTCTACTAAGTTGCTTGGTGTGGAATGGTCAAGGAGCTCCAAATCCACTGGATC
TTTCAAGGTATGTGCGTCTGTGAATTTGGCGGAGGAAGTGAAAACGCCGAAATTGATAGC
AGAAACAACTTGGAACCTTGAAATCTAATGTTCTTTACGATTATTCAAATTCAAGTTTCC
ACCTGAATTGTTCGCTTGTTACCAACGATTTTAATTAGACCTTTTTGCCAACCTTTTTTG
TTGCAACATGACAACCCCCTTGTCGTTCTCATGTCTGGTCTCTCTTAAAAAATAATTTGT
TGTAAGGGAAAAATGTACCCTAAACCTCTCTTTTGAATGCGTAATAAAAATATGCAAATG
GTTCT

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

CO CL6665Contig1 614 2 1 U
TGAAGGTTGTGAGCTATTCTCGACGTCAACTAATCTTGGCAGCCCTTGTAGGAGCTCTCG
TTCTTCCCTCGAAGGCTCAAGACAGCCCACAAGACTATGTAAGGGCTCACAACATTGCAC
GAGCGGAGGTGGGCGTAGCCTTCATACAGTGGGACAATAGGGTTGCAGCTTTCGCTCAAA
GCTACCTTGACCGGCTAATTAGTGGCCCATGCAATCTCATACACTCCGGTGGGCCTTACG
GGGAAAACTTGGCCAAGAGTAACCGCGACTTATCAGGGGTCGATGCCGTTAGGCTTTGGG
TTAACGAGAAGGCTAACTACCACTACGCTTCGAACACTTGCAATGGAGTTTGCGGTCACT
ATATGCAGGTTGTTTGGAGAACTTCGGTGAGGCTTGGATGTGCCAAAGCGAGGTGTAACA
ATGGTGAAACCATCATCTCTTGCAACTATGATCCTCAGGGCAACTGTGTAAACGAGAGGC
CTTACTAAAAGTTATTATGCATACAGACATTAGGCATAAGCACATGCATATAGGACGGGT
ATACATATTCCTATTTGGAGCACAATATGCAGGATGTGTATAACTAATTATGAAATAATA
GTATTTTCGTCCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DO62JQ C 1
AF RR2DO62TF U 1
BS 1 614 RR2DO62TF

RD RR2DO62JQ 614 0 0
TGAAGGTTGTGAGCTATTCTCGACGTCAACTAATCTTGGCAGCCCTTGTAGGAGCTCTCG
TTCTTCCCTCGAAGGCTCAAGACAGCCCACAAGACTATGTAAGGGCTCACAACATTGCAC
GAGCGGAGGTGGGCGTAGCCTTCATACAGTGGGACAATAGGGTTGCAGCTTTCGCTCAAA
GCTACCTTGACCGGCTAATTAGTGGCCCATGCAATTTCATACACTCCGGTGGGCCTTACG
GGGAAAACTTGGCCAAGAGTAACCGCGACTTATCAGGGGTCGATGCCGTTAGGCTTTGGG
TTAACGAGAAGGCTAACTACCACTACGCTTCGAACACTTGCAATGGAGTTTGCGGTCACT
ATATGCAGGTTGTTTGGAGAACTTCGGTGAGGCTTGGATGTGCCAAAGCGAGGTGTAACA
ATGGTGAAACCATCATCTCTTGCAACTATGATCCTCAGGGCAACTGTGTAAACGAGAGGC
CTTACTAAAAGTTATTATGCATACAGACATTAGGCATAAGCACATGCATATAGGACGGGT
ATACATATTCCTATTTGGAGCACAATATGCAGGATGTGTATAACTAATTATGAAATAATA
GTATTTTCGTCCCC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2DO62TF 614 0 0
TGAAGGTTGTGAGCTATTCTCGACGTCAACTAATCTTGGCAGCCCTTGTAGGAGCTCTCG
TTCTTCCCTCGAAGGCTCAAGACAGCCCACAAGACTATGTAAGGGCTCACAACATTGCAC
GAGCGGAGGTGGGCGTAGCCTTCATACAGTGGGACAATAGGGTTGCAGCTTTCGCTCAAA
GCTACCTTGACCGGCTAATTAGTGGCCCATGCAATCTCATACACTCCGGTGGGCCTTACG
GGGAAAACTTGGCCAAGAGTAACCGCGACTTATCAGGGGTCGATGCCGTTAGGCTTTGGG
TTAACGAGAAGGCTAACTACCACTACGCTTCGAACACTTGCAATGGAGTTTGCGGTCACT
ATATGCAGGTTGTTTGGAGAACTTCGGTGAGGCTTGGATGTGCCAAAGCGAGGTGTAACA
ATGGTGAAACCATCATCTCTTGCAACTATGATCCTCAGGGCAACTGTGTAAACGAGAGGC
CTTACTAAAAGTTATTATGCATACAGACATTAGGCATAAGCACATGCATATAGGACGGGT
ATACATATTCCTATTTGGAGCACAATATGCAGGATGTGTATAACTAATTATGAAATAATA
GTATTTTCGTCCCC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL6666Contig1 649 2 3 U
ATAAAACAATAATATACTATTGTTTTTCTAATTATTGAGAAAAGAATCCATATAAACCAA
CACAACCCTGTCCAAATACCCAACACAAATACAAGTTTGAATATCAAGATAGGTTCTAAT
TAATGGGGACCAGATGATAAATCAAACCTTGTATTTGTGTTCCGGACGATGAGTGAACTC
AAAGTCAATATGAACGAAAGCTCTCTCAACCTCAAAAAGTTGCTCGAGCTTCTCCTGAAA
AGCCTCTCCAATGTTGTGAGCTTCATGCAGCCTCATGTCCTCTGGCAAAACAATGTCCAC
TTCGACAAAGTAGTGTGACCCAAACGTGTAGGCTCTCACTGTATCAATATGTTTAATCTT
CTCATGATGGTTCCATATCAAGAACGTTAGTTTCGCCAAGAAATCAGGCGGTGCAAAGCG
TCCAATAAGGGAATGAACATTCTCTAGTACCGTTCTAGCCCATGTGCTGATTGTATACAA
AGCAATCAGAATAGCACCAGAAGGATCAATCCACCAGTAGAATTTTACAGCCAAGACTGC
TGTTGCTAAACCGACCGAGTTGGTAACAACGTCAAAGAGGTGGTCTTGTGCATAGGCCCT
GACGATTTCGTTTTGAAAACTTCTGCAGTAAAGCATGAGAAGAAACTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GY09JQ U 1
AF RR2H016JQ U 1
BS 1 216 RR2GY09JQ
BS 217 217 RR2H016JQ
BS 218 649 RR2GY09JQ

RD RR2GY09JQ 649 0 0
ATAAAACAATAATATACTATTGTTTTTCTAATTATTGAGAAAAGAATCCATATAAACCAA
CACAACCCTGTCCAAATACCCAACACAAATACAAGTTTGAATATCAAGATAGGTTCTAAT
TAATGGGGACCAGATGATAAATCAAACCTTGTATTTGTGTTCCGGACGATGAGTGAACTC
AAAGTCAATATGAACGAAAGCTCTCTCAACCTCAAAGAGTTGCTCGAGCTTCTCCTGAAA
AGCCTCTCCAATGTTGTGAGCTTCATGCAGCCTCATGTCCTCTGGCAAAACAATGTCCAC
TTCGACAAAGTAGTGTGACCCAAACGTGTAGGCTCTCACTGTATCAATATGTTTAATCTT
CTCATGATGGTTCCATATCAAGAACGTTAGTTTCGCCAAGAAATCAGGCGGTGCAAAGCG
TCCAATAAGGGAATGAACATTCTCTAGTACCGTTCTAGCCCATGTGCTGATTGTATACAA
AGCAATCAGAATAGCACCAGAAGGATCAATCCACCAGTAGAATTTTACAGCCAAGACTGC
TGTTGCTAAACCGACCGAGTTGGTAACAACGTCAAAGAGGTGGTCTTGTGCATAGGCCCT
GACGATTTCGTTTTGAAAACTTCTGCAGTAAAGCATGAGAAGAAACTTG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2H016JQ 638 0 0
ATAAAACAATAATATACTATTGTTTTTCTAATTATTGAGAAAAGAATCCATATAAACCAA
CACAACCCTGTCCAAATACCCAACACAAATACAAGTTTGAATATCAAGATAGGTTCTAAT
TAATGGGGACCAGATGATAAATCAAACCTTGTATTTGTGTTCCGGACGATGAGTGAACTC
AAAGTCAATATGAACGAAAGCTCTCTCAACCTCAAAAAGTTGCTCGAGCTTCTCCTGAAA
AGCCTCTCCAATGTTGTGAGCTTCATGCAGCCTCATGTCCTCTGGCAAAACAATGTCCAC
TTCGACAAAGTAGTGTGACCCAAACGTGTAGGCTCTCACTGTATCAATATGTTTAATCTT
CTCATGATGGTTCCATATCAAGAACGTTAGTTTCGCCAAGAAATCAGGCGGTGCAAAGCG
TCCAATAAGGGAATGAACATTCTCTAGTACCGTTCTAGCCCATGTGCTGATTGTATACAA
AGCAATCAGAATAGCACCAGAAGGATCAATCCACCAGTAGAATTTTACAGCCAAGACTGC
TGTTGCTAAACCGACCGAGTTGGTAACAACGTCAAAGAGGTGGTCTTGTGCATAGGCCCT
GACGATTTCGTTTTGAAAACTTCTGCAGTAAAGCATGA

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL6667Contig1 936 2 4 U
GGAATCCCCATTCTACTTTGCTCCGACGACGACGACGACAACGATGATGAATAATAACTT
AACAGACGATTCCGAGTGGGAAGTGAGACCTGGTGGTATGCTCGTCCAACGAAGAGACGA
CGCTTCCTCCTCCGACCCACAACCTCTCCACCAAGATCCCACCTCTGCTTCCGCCGTTAA
TGCTCAGACCATCAGGATCAACGCTTCCCATGGCTCATCCCACCACGATCTTCACGTTTC
TCCCCTCGCCACTTTCGGGGATGTGAAGAAAGCCCTTGTCCAGAAAATTGGATTTGAGGC
TACTAGCAATGTGAAGATGTTGTTCAGGGGAGTTGAGAAAGATGACGCTGAGCAACTTCA
AGCTTCTGGTGTTAAGGATGGGTCTAAGCTTGTCCTTGTGGAGGAACCTAATAATAATAA
TAAGAGAGTAGTTGAACAGCAGCCTTCTCCAGTGATGACCCAAGAGATGGCTAAGTCTAT
TGCTGCAGTTAAAGCTGTCTCTGGAGAGATCGATAAGCTCTCTGATAAGGTTGTTGCTTT
AGAAGTTTCTGTTAATGGAGGGACGAAAGTTGCGGTGGAGGAGTTTGACATGACTGCTGA
GCTTCTCATGAGGCAGTTGCTTAAACTGGATGGTATCGAGGCAGAAGGAGAAGCTAGAGT
ACAGCGAAAGGCTGAGGTGCGTAGAGTGCAAAAGTTGCAGGAGGCTGTGGATACGTTGAA
GGGAAGATGTTCAAACCCGTTTGTGGATCAAACCAAAGCAGCGGCTGTAAGCACTGAGTG
GGAAACATTCGGAAACGGTGTTGGAAGCTTGAACCCTCCTCCTCCTGCTTCTCCTTCTGC
TAATGTAACTCAAGACTGGGAGAAATTTGACTGACCATTTTATTATTGTTATGTATCCAG
AAAAAGTAATAAAGAAAAATTCTCTTGTTCCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD06TF U 1
AF RR2BD06JQ C 182
BS 1 676 RR2BD06TF
BS 677 677 RR2BD06JQ
BS 678 696 RR2BD06TF
BS 697 936 RR2BD06JQ

RD RR2BD06TF 696 0 0
GGAATCCCCATTCTACTTTGCTCCGACGACGACGACGACAACGATGATGAATAATAACTT
AACAGACGATTCCGAGTGGGAAGTGAGACCTGGTGGTATGCTCGTCCAACGAAGAGACGA
CGCTTCCTCCTCCGACCCACAACCTCTCCACCAAGATCCCACCTCTGCTTCCGCCGTTAA
TGCTCAGACCATCAGGATCAACGCTTCCCATGGCTCATCCCACCACGATCTTCACGTTTC
TCCCCTCGCCACTTTCGGGGATGTGAAGAAAGCCCTTGTCCAGAAAATTGGATTTGAGGC
TACTAGCAATGTGAAGATGTTGTTCAGGGGAGTTGAGAAAGATGACGCTGAGCAACTTCA
AGCTTCTGGTGTTAAGGATGGGTCTAAGCTTGTCCTTGTGGAGGAACCTAATAATAATAA
TAAGAGAGTAGTTGAACAGCAGCCTTCTCCAGTGATGACCCAAGAGATGGCTAAGTCTAT
TGCTGCAGTTAAAGCTGTCTCTGGAGAGATCGATAAGCTCTCTGATAAGGTTGTTGCTTT
AGAAGTTTCTGTTAATGGAGGGACGAAAGTTGCGGTGGAGGAGTTTGACATGACTGCTGA
GCTTCTCATGAGGCAGTTGCTTAAACTGGATGGTATCGAGGCAGAAGGAGAAGCTAGAGT
ACAGCGAAAGGCTGAG*TGCGTAGAGTGCAAAAGTT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2BD06JQ 755 0 0
GCTCAGACCATCAGGATCAACGCTTCCCATGGCTCATCCCACCACGATCTTCACGTTTCT
CCCCTCGCCACTTTCGGGGATGTGAAGAAAGCCCTTGTCCAGAAAATTGGATTTGAGGCT
ACTAGCAATGTGAAGATGTTGTTCAGGGGAGTTGAGAAAGATGACGCTGAGCAACTTCAA
GCTTCTGGTGTTAAGGATGGGTCTAAGCTTGTCCTTGTGGAGGAACCTAATAATAATAAT
AAGAGAGTAGTTGAACAGCAGCCTTCTCCAGTGATGACCCAAGAGATGGCTAAGTCTATT
GCTGCAGTTAAAGCTGTCTCTGGAGAGATCGATAAGCTCTCTGATAAGGTTGTTGCTTTA
GAAGTTTCTGTTAATGGAGGGACGAAAGTTGCGGTGGAGGAGTTTGACATGACTGCTGAG
CTTCTCATGAGGCAGTTGCTTAAACTGGATGGTATCGAGGCAGAAGGAGAAGCTAGAGTA
CAGCGAAAGGCTGAGGTGCGTAGAGTGCAAAAGTTGCAGGAGGCTGTGGATACGTTGAAG
GGAAGATGTTCAAACCCGTTTGTGGATCAAACCAAAGCAGCGGCTGTAAGCACTGAGTGG
GAAACATTCGGAAACGGTGTTGGAAGCTTGAACCCTCCTCCTCCTGCTTCTCCTTCTGCT
AATGTAACTCAAGACTGGGAGAAATTTGACTGACCATTTTATTATTGTTATGTATCCAGA
AAAAGTAATAAAGAAAAATTCTCTTGTTCCTTTTT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL6668Contig1 772 2 3 U
GTTTGTCTAAAATCCATCCATCTAAAGCTACTTGAAGCTAAAACAGTGCGGGTTACAACA
GATTGCAAGATACCCTTTATTAGTTTAGAGGTATCTCATTTTAGAGATAACAGAAAACTG
AAGGCTACTTCTAATAAACTAGTTCGTTGATCTACTTCCAACTACATTTTAAAAATCTTA
AGATGAGAATCTATCTCCCATTTCGTTACATACTTCGTCTAGAGTAGACAGGAAGTCTCT
CACAGCCATGAAAACTCTCAGTGTGTGACCTTCTTCCTTGAAAGAACCTCCATGGAATAG
CTCTGTGACCTCTTCCAATGCAGACAGCGTTGAGCTCTCTTGTGTTTTGATCGTCAGAAT
CTCCCCTGCAGCAGTTTCCAAGAACCGAGCCATCTTAGCTCCAAACCTCAGCCACTGCTC
TCCACTACATCCACTCTCTTCGCTCAGCATCAGAAGCTCCTTGATGTTCTTGATTCCTTG
ACAAAGCTTCAACACACCGCTTGTTAGAACACCATACTCAACGTCAGCCGACTTCTTCAC
CGTCTCCATCTCTGAGCTCAGGTTTCTAATGCGGTCCAAAACTTTCACAGAGCCTTCTGA
TTTTATCATCTCCTGAACAACGAAATGCAAGACAGTGCTTCTTCCATCTAGCCCCTTGAC
CTCAGCGAGCTTGAGGAGCGTGTCGAATTTGAAAGCATGAGAGTTGGTTCCAACACTCAT
CTTGTTTCCTGTCTTGAGTATCACTTCAAGAAGTCTAGAGAACCCCCAGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK69TF C 1
AF RR2AK69JQ U 346
BS 1 345 RR2AK69TF
BS 346 759 RR2AK69JQ
BS 760 772 RR2AK69TF

RD RR2AK69TF 772 0 0
GTTTGTCTAAAATCCATCCATCTAAAGCTACTTGAAGCTAAAACAGTGCGGGTTACAACA
GATTGCAAGATACCCTTTATTAGTTTAGAGGTATCTCATTTTAGAGATAACAGAAAACTG
AAGGCTACTTCTAATAAACTAGTTCGTTGATCTACTTCCAACTACATTTTAAAAATCTTA
AGATGAGAATCTATCTCCCATTTCGTTACATACTTCGTCTAGAGTAGACAGGAAGTCTCT
CACAGCCATGAAAACTCTCAGTGTGTGACCTTCTTCCTTGAAAGAACCTCCATGGAATAG
CTCTGTGACCTCTTCCAATGCAGACAGCGTTGAGCTCTCTTGTGTTTTGATCGTCAGAAT
CTCCCCTGCAGCAGTTTCCAAGAACCGAGCCATCTTAGCTCCAAACCTCAGCCACTGCTC
TCCACTACATCCACTCTCTTCGCTCAGCATCAGAAGCTCCTTGATGTTCTTGATTCCTTG
ACAAAGCTTCAACACACCGCTTGTTAGAACACCATACTCAACGTCAGCCGACTTCTTCAC
CGTCTCCATCTCTGAGCTCAGGTTTCTAATGCGGTCCAAAACTTTCACAGAGCCTTCTGA
TTTTATCATCTCCTGAACAACGAAATGCAAGACAGTGCTTCTTCCATCTAGCCCCTTGAC
CTCAGCGAGCTTGAGGAGCGTGTCGAATTTGAAAGCATGAGAGTTGGTTCCAACACTCAT
CTTGTTTCCTGTCTTGAGTATCACTTCAAGAAGTCTAGAGAACCCCCAGCCG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2AK69JQ 414 0 0
TTTGATCGTCAGAATCTCCCCTGCAGCAGTTTCCAAGAACCGAGCCATCTTAGCTCCAAA
CCTCAGCCACTGCTCTCCACTACATCCACTCTCTTCGCTCAGCATCAGAAGCTCCTTGAT
GTTCTTGATTCCTTGACAAAGCTTCAACACACCGCTTGTTAGAACACCATACTCAACGTC
AGCCGACTTCTTCACCGTCTCCATCTCTGAGCTCAGGTTTCTAATGCGGTCCAAAACTTT
CACAGAGCCTTCTGATTTTATCATCTCCTGAACAACGAAATGCAAGACAGTGCTTCTTCC
ATCTAGCCCCTTGACCTCAGCGAGCTTGAGGAGCGTGTCGAATTTGAAAGCATGAGAGTT
GGTTCCAACACTCATCTTGTTTCCTGTCTTGAGTATCACTTCAAGAAGTCTAGA

QA 1 414 1 414
DS 



AS 1 2

CO CL6669Contig1 769 2 2 U
GGAAAACAGTCCCGACTTATTCAGCTCCGTCGCTAACGCCGCCTGTACCGTCGGCATCAC
ATCAACCTTCAAACGCCGTTGGTTTACTCTTCCCCACAGGGATTCTCATCTGAGAGAGAG
ACTAGGTAGGAGCAATGGGTTGGAAAGCTGCTGAGAAACTCATCAGACACTGGAAGATAC
TTCGCGGTGATAATGTAATGATCATCCGCGGGAAAGATAAGGGCGAGACGGGAACCATTA
AGCGTGTCATCAGATCCCAGAATCGTGTCATTGTTGAAGGCAAGAATCTGATCAAGAAGC
ATATAAAGGGAGGTCCTGATCACGAAGGTGGGATTTTCACGGTAGAGGCTCCGCTTCACG
CCTCAAATGTCCAAGTTGTTGATCCAGTCACCGGGAGGCCATGTAAGGTTGGTGTGAAGT
ACCTAGAGGATGGTACGAAAGTAAGAGTGGCCAGAGGCACTGGCACATCTGGTTCCATTA
TTCCTCGCCCAGAGATCCTAAAGATAAGGACAACACCAAGACCCACTACCGCTGGCCCTA
AAGACACCCCAATGGAGTTTGTTTGGGAGCAGACATATGATGCTAAAACAGGAAAGGGCA
TGCCTGATCTTTGATTAACCTTCTTCCTAGAATGTTGCTGCTCCCAGAAGATCCTTTACA
GTTTGATTTTGTTCAAAGATTTGAGATGCTGTTGAACAAGCTTTGATACTCTTTTTTTCC
TTTAGTCTTATGAACGTTTTCAAGGTGTCAAATAAAAAACCATATGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E679TF U 1
AF RR2E679JQ C 54
BS 1 667 RR2E679TF
BS 668 769 RR2E679JQ

RD RR2E679TF 667 0 0
GGAAAACAGTCCCGACTTATTCAGCTCCGTCGCTAACGCCGCCTGTACCGTCGGCATCAC
ATCAACCTTCAAACGCCGTTGGTTTACTCTTCCCCACAGGGATTCTCATCTGAGAGAGAG
ACTAGGTAGGAGCAATGGGTTGGAAAGCTGCTGAGAAACTCATCAGACACTGGAAGATAC
TTCGCGGTGATAATGTAATGATCATCCGCGGGAAAGATAAGGGCGAGACGGGAACCATTA
AGCGTGTCATCAGATCCCAGAATCGTGTCATTGTTGAAGGCAAGAATCTGATCAAGAAGC
ATATAAAGGGAGGTCCTGATCACGAAGGTGGGATTTTCACGGTAGAGGCTCCGCTTCACG
CCTCAAATGTCCAAGTTGTTGATCCAGTCACCGGGAGGCCATGTAAGGTTGGTGTGAAGT
ACCTAGAGGATGGTACGAAAGTAAGAGTGGCCAGAGGCACTGGCACATCTGGTTCCATTA
TTCCTCGCCCAGAGATCCTAAAGATAAGGACAACACCAAGACCCACTACCGCTGGCCCTA
AAGACACCCCAATGGAGTTTGTTTGGGAGCAGACATATGATGCTAAAACAGGAAAGGGCA
TGCCTGATCTTTGATTAACCTTCTTCCTAGAATGTTGCTGCTCCCAGAAGATCCTTTACA
GTTTGAT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2E679JQ 716 0 0
GCATCACATCAACCTTCAAACGCCGTTGGTTTACTCTTCCCCACAGGGATTCTCATCTGA
GAGAGAGACTAGGTAGGAGCAATGGGTTGGAAAGCTGCTGAGAAACTCATCAGACACTGG
AAGATACTTCGCGGTGATAATGTAATGATCATCCGCGGGAAAGATAAGGGCGAGACGGGA
ACCATTAAGCGTGTCATCAGATCCCAGAATCGTGTCATTGTTGAAGGCAAGAATCTGATC
AAGAAGCATATAAAGGGAGGTCCTGATCACGAAGGTGGGATTTTCACGGTAGAGGCTCCG
CTTCACGCCTCAAATGTCCAAGTTGTTGATCCAGTCACCGGGAGGCCATGTAAGGTTGGT
GTGAAGTACCTAGAGGATGGTACGAAAGTAAGAGTGGCCAGAGGCACTGGCACATCTGGT
TCCATTATTCCTCGCCCAGAGATCCTAAAGATAAGGACAACACCAAGACCCACTACCGCT
GGCCCTAAGGACACCCCAATGGAGTTTGTTTGGGAGCAGACATATGATGCTAAAACAGGA
AAGGGCATGCCTGATCTTTGATTAACCTTCTTCCTAGAATGTTGCTGCTCCCAGAAGATC
CTTTACAGTTTGATTTTGTTCAAAGATTTGAGATGCTGTTGAACAAGCTTTGATACTCTT
TTTTTCCTTTAGTCTTATGAACGTTTTCAAGGTGTCAAATAAAAAACCATATGGGG

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL6670Contig1 1263 2 6 U
GGACATCGCACTATCAATCCCCAAGAGTCCAAACATAAAAAATGGCTCGTTCTGTGATTT
TCTTACTGCTTTCACTGATCTTTCTCTACCAAGCAAGTACATCCCAGTCTTACCAACCAA
AGGTTCAAGCATTTCTGCACCCTATTTACAAAGACAAGACCACAAATCTCTACTCCTTGC
CTTTGACCATCGGCTCGAACCTACGCAGCCGGAACTTCCTTATTGACCTCAATGGAGAAG
CGCCGCTATTACAGAACTGCGCTGCCTCCACCAAATCCACAAGATGCAAATTCGCAAACC
CGAACTCTTCGTGTCCCAAGAACACGACCAGTAAGCCCATGTGCCGTAAATACGTCTCAA
CATCTTTTACGGATCGACCAGTCAACGCTAGGCTCCTCCGAGACACCGTTGGCTTATTAT
TCACTCCTAATGGAGTATACTCCATGGACGGTGAAAAGATCTCTACGTTGACTTTGACGT
GCACTGACGATGCTGCTGCCTTGAAACCTATCCCTAAGGCTTTCGGTGGATCCATCGGTC
TCGCTAACAACCACTTATCAGTTCCCTCGCAGCTCATCTCTATGTACAAGCTACCTCCAA
AGATGTCTATTTGCTTGCCTTCCACGGAAGGCATGAAGTCTTATCACAATGGTGATTTTT
GGATCGGTGGAGGTCCTTTTTTCTATTTCCCTTCCCTTAAAGATGCCTCTGAGCTCTTTT
CCTCCACGCCTCTGATTGGTAATAACAAAAGTGAGTACTTAATCGATGAAATCCATCCAA
GTCAGTGGAAAGACTGTTCCTATACTCCCTGGACCTACAAAGATCTGTACTCTGGCTCCT
TACACGGTATTGCAAAGTTCCATTTACAAGGCTCTGGTCACAGCCTTTGTTGGAAGTGTC
AAGATGGTTAAAGCTCCAACGGTGAAGCCTTTCAGTGCGTGCTTTCAGTCCAATGGAGGG
CGTGGAGTTCCAGAGATCGACCTGGTGATGAGTGGAGGGGCTAAGTGGAGAATCCACGGT
TCGAATTCTCTGGTGAAGGTTAACAAAGATGTGGTTTGTTTAGGGTTTGTGAACGGAGGT
GTGAACCCGAAGAACCCGATTTTGATCGGAGGTTTTCAGATGGAGGATAATTTGGTGCAG
TTTGATCTCGAAGCTTCCAAATTTTCGTTTTTTTTTTCTCTTTTGCTTTATAACACTTCT
TGCTCAGTTTTTAGGATGTTTGGTATGTAATGCATATTATCTATAATCGATGTTGTGCGG
CAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2G854TF U 1
AF RR2G854JQ C 515
BS 1 741 RR2G854TF
BS 742 744 RR2G854JQ
BS 745 749 RR2G854TF
BS 750 750 RR2G854JQ
BS 751 779 RR2G854TF
BS 780 1263 RR2G854JQ

RD RR2G854TF 784 0 0
GGACATCGCACTATCAATCCCCAAGAGTCCAAACATAAAAAATGGCTCGTTCTGTGATTT
TCTTACTGCTTTCACTGATCTTTCTCTACCAAGCAAGTACATCCCAGTCTTACCAACCAA
AGGTTCAAGCATTTCTGCACCCTATTTACAAAGACAAGACCACAAATCTCTACTCCTTGC
CTTTGACCATCGGCTCGAACCTACGCAGCCGGAACTTCCTTATTGACCTCAATGGAGAAG
CGCCGCTATTACAGAACTGCGCTGCCTCCACCAAATCCACAAGATGCAAATTCGCAAACC
CGAACTCTTCGTGTCCCAAGAACACGACCAGTAAGCCCATGTGCCGTAAATACGTCTCAA
CATCTTTTACGGATCGACCAGTCAACGCTAGGCTCCTCCGAGACACCGTTGGCTTATTAT
TCACTCCTAATGGAGTATACTCCATGGACGGTGAAAAGATCTCTACGTTGACTTTGACGT
GCACTGACGATGCTGCTGCCTTGAAACCTATCCCTAAGGCTTTCGGTGGATCCATCGGTC
TCGCTAACAACCACTTATCAGTTCCCTCGCAGCTCATCTCTATGTACAAGCTACCTCCAA
AGATGTCTATTTGCTTGCCTTCCACGGAAGGCATGAAGTCTTATCACAATGGTGATTTTT
GGATCGGTGGAGGTCCTTTTTTCTATTTCCCTTCCCTTAAAGATGCCTCTGAGCTCTTTT
CCTCCACGCCTCTGATTGGTAT**ACAAA*GTGAGTACTTAATCGATGAAATCCATCCA
GTCAG

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2G854JQ 749 0 0
TAAGGCTTTCGGTGGATCCATCGGTCTCGCTAACAACCACTTATCAGTTCCCTCGCAGCT
CATCTCTATGTACAAGCTACCTCCAAAGATGTCTATTTGCTTGCCTTCCACGGAAGGCAT
GAAGTCTTATCACAATGGTGATTTTTGGATCGGTGGAGGTCCTTTTTTCTATTTCCCTTC
CCTTAAAGATGCCTTTGAGCTCTTTTCCTCCACGCCTCTGATTGGTAATAACAAAAGTGA
GTACTTAATCGATGAAATCCATCCAAGTCAGTGGAAAGACTGTTCCTATACTCCCTGGAC
CTACAAAGATCTGTACTCTGGCTCCTTACACGGTATTGCAAAGTTCCATTTACAAGGCTC
TGGTCACAGCCTTTGTTGGAAGTGTCAAGATGGTTAAAGCTCCAACGGTGAAGCCTTTCA
GTGCGTGCTTTCAGTCCAATGGAGGGCGTGGAGTTCCAGAGATCGACCTGGTGATGAGTG
GAGGGGCTAAGTGGAGAATCCACGGTTCGAATTCTCTGGTGAAGGTTAACAAAGATGTGG
TTTGTTTAGGGTTTGTGAACGGAGGTGTGAACCCGAAGAACCCGATTTTGATCGGAGGTT
TTCAGATGGAGGATAATTTGGTGCAGTTTGATCTCGAAGCTTCCAAATTTTCGTTTTTTT
TTTCTCTTTTGCTTTATAACACTTCTTGCTCAGTTTTTAGGATGTTTGGTATGTAATGCA
TATTATCTATAATCGATGTTGTGCGGCAT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL6671Contig1 758 2 2 U
GGGACTACGATTCACTTACGAGAAGATTTCTCACAGGGAAAGAAGCTATGGACTTGGCTC
TTCATTTTCCTTCGTTGATCAAACAAGGATTCACCAGAGCCAATCATCTTCCTGTTCGAG
ATTCTCTTTCAACAAGCTTTGGGCAGAGTTTTTCGAGAACAGCGTTTGATGGTGATAGAA
GAAGCTGGCCTGGAGAGAAGGCTTGGTGGTCTTCCTCCCTAACTAGGAGATCCAAGAAAG
GATCTGTTGTTTGTTGCAAGAATCCGTCTGATGAACAGAGCTCAGACTCGAGTAAATCGA
AGCAAGAGGAGATCATTGCTCTCTTAAGTCGGATTCAAGCTTCAATCTCCAAAGGAGAGT
CTCAGGGAGCTGATGAGAAGAACAGCAATGACTCTTGTGGGAATGGGTCGCTGAGTAAAG
CTATTCTTGACGTTCTTGAGAAACCAAGAGAGAAAACTGAAGGAGATGCTGGTCTAAGGA
AAGAGCCACCTAAGAGACAAGTAGCTCGGCCACCGTTTAGTTTTGCCAAGAGAGCTCCTA
CTAGACCATCTGCTTCAGATCCAAGAGAGCTCAAAGAAGTTGCAAAGAACAGAGGACTCA
AAGGATACTCAAAGCTAAAGAAGAGTGAGATTCTGGAGCTACTCAGATCCTCCTAATTTT
AATGTTCAGTCCACATTCTCTCTGCTATGTAAATTAGAAACACAGATATGGCTTGGACTT
GTTTTTAAAATAGATAAAGAGTTTAAAATTGAAAACGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP90JQ C 1
AF RR2DP90TF U 1
BS 1 722 RR2DP90TF
BS 723 758 RR2DP90JQ

RD RR2DP90JQ 758 0 0
GGGACTACGATTCACTTACGAGAAGATTTCTCACAGGGAAAGAAGCTATGGACTTGGCTC
TTCATTTTCCTTCGTTGATCAAACAAGGATTCACCAGAGCCAATCATCTTCCTGTTCGAG
ATTCTCTTTCAACAAGCTTTGGGCAGAGTTTTTCGAGAACAGCGTTTGATGGTGATAGAA
GAAGCTGGCCTGGAGAGAAGGCTTGGTGGTCTTCCTCCCTAACTAGGAGATCCAAGAAAG
GATCTGTTGTTTGTTGCAAGAATCCGTCTGATGAACAGAGCTCAGACTCGAGTAAATCGA
AGCAAGAGGAGATCATTGCTCTCTTAAGTCGGATTCAAGCTTCAATCTCCAAAGGAGAGT
CTCAGGGAGCTGATGAGAAGAACAGCAATGACTCTTGTGGGAATGGGTCGCTGAGTAAAG
CTATTCTTGACGTTCTTGAGAAACCAAGAGAGAAAACTGAAGGAGATGCTGGTCTAAGGA
AAGAGCCACCTAAGAGACAAGTAGCTCGGCCACCGTTTAGTTTTGCCAAGAGAGCTCCTA
CTAGACCATCTGCTTCAGATCCAAGAGAGCTCAAAGAAGTTGCAAAGAACAGAGGACTCA
AAGGATACTCAAAGCTAAAGAAGAGTGAGATTCTGGAGCTACTCAGATCCTCCTAATTTT
AATGTTCAGTCCACATTCTCTCTGCTATGTAAATTAGAAACACAGATATGGCTTGGACTT
GTTTTTAAAATAGATAAAGAGTTTAAAATTGAAAACGC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RR2DP90TF 722 0 0
GGGACTACGATTCACTTACGAGAAGATTTCTCACAGGGAAAGAAGCTATGGACTTGGCTC
TTCATTTTCCTTCGTTGATCAAACAAGGATTCACCAGAGCCAATCATCTTCCTGTTCGAG
ATTCTCTTTCAACAAGCTTTGGGCAGAGTTTTTCGAGAACAGCGTTTGATGGTGATAGAA
GAAGCTGGCCTGGAGAGAAGGCTTGGTGGTCTTCCTCCCTAACTAGGAGATCCAAGAAAG
GATCTGTTGTTTGTTGCAAGAATCCGTCTGATGAACAGAGCTCAGACTCGAGTAAATCGA
AGCAAGAGGAGATCATTGCTCTCTTAAGTCGGATTCAAGCTTCAATCTCCAAAGGAGAGT
CTCAGGGAGCTGATGAGAAGAACAGCAATGACTCTTGTGGGAATGGGTCGCTGAGTAAAG
CTATTCTTGACGTTCTTGAGAAACCAAGAGAGAAAACTGAAGGAGATGCTGGTCTAAGGA
AAGAGCCACCTAAGAGACAAGTAGCTCGGCCACCGTTTAGTTTTGCCAAGAGAGCTCCTA
CTAGACCATCTGCTTCAGATCCAAGAGAGCTCAAAGAAGTTGCAAAGAACAGAGGACTCA
AAGGATACTCAAAGCTAAAGAAGAGTGAGATTCTGGAGCTACTCAGATCCTCCTAATTTT
AATGTTCAGTCCACATTCTCTCTGCTATGTAAATTAGAAACACAGATATGGCTTGGACTT
GT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL6672Contig1 443 2 1 U
GGACATCACAAAAACATCAACAAAATTAAAAGAGGATAAGATGGCGAGCAAGAAGGTGGG
AGTGATGGTGATGATGATAGTGGTGGTTATGGCTATTTTAGCGGAGAGGTCAGTGGCGAT
TGATATCTGTGGCATGACCCAGTCAGAGTTGAATGAGTGCAAACCAGCGGTGAGCAAGGA
GAATCCGACGAACCCATCAACGCTTTGCTGCGACTATCTGAAACACGCTGACTACAGCTG
TCTTTGCGGCTACAAGAACTCTCCATTGCTCGGTTATTACGGTATTGATCCGGCGCTCGC
TGCTGGACTCCCAAGCAAATGTAACATGCCCAACGCTCCAACTTGTTAAGCTTTATGTGT
GTGCTTTTGTCTTTGTCTAACAATCATGTGTTAATGTATTTCCATAAAAGTTCTCACCAA
TGGCGTTTATTGGTGTAAAACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FC27JQ C 1
AF RR2FC27TF U 1
BS 1 443 RR2FC27TF

RD RR2FC27JQ 443 0 0
GGACATCACAAAAACATCAACAAAATTAAAAGAGGATAAGATGGCGAGCAAGAAGGTGGG
AGTGATGGTGATGATGATAGTGGTGGTTATGGCTATTTTAGCGGAGAGGTCAGTGGCGAT
TGATATCTGTGGCATGACCCAGTCAGAGTTGAATGAGTGCAAACCAGCGGTGAGCAAGGA
GAATCCGACGAACCCATCAACGCTTTGCTGCGACTATCTGAAACACGCTGACTACAGCTG
TCTTTGCGGCTACAAGAACTCTCCATTGCTCGGTTATTACGGTATTGATCCGGCGCTCGC
TGCTGGACTCCCAAGCAAATGTAACATGCCCAACGCTCCAACTTGTTAAGCTTTATGTGT
GTGCTTTTGTCTTTGTCTAACAATCATGTGTTAATGTATTTCCATAAAAGTTCTCACCAA
TGGCGTTTATTGGTGTAAAACCC

QA 1 443 1 443
DS 

RD RR2FC27TF 443 0 0
GGACATCACAAAAACATCAACAAAATTAAAAGAGGATAAGATGGCGAGCAAGAAGGTGGG
AGTGATGGTGATGATGATAGTGGTGGTTATGGCTATTTTAGCGGAGAGGTCAGTGGCGAT
TGATATCTGTGGCATGACCCAGTCAGAGTTGAATGAGTGCAAACCAGCGGTGAGCAAGGA
GAATCCGACGAACCCATCAACGCTTTGCTGCGACTATCTGAAACACGCTGACTACAGCTG
TCTTTGCGGCTACAAGAACTCTCCATTGCTCGGTTATTACGGTATTGATCCGGCGCTCGC
TGCTGGACTCCCAAGCAAATGTAACATGCCCAACGCTCCAACTTGTTAAGCTTTATGTGT
GTGCTTTTGTCTTTGTCTAACAATCATGTGTTAATGTATTTCCATAAAAGTTCTCACCAA
TGGCGTTTATTGGTGTAAAACCC

QA 1 443 1 443
DS 



AS 1 2

CO CL6673Contig1 1352 2 2 U
GGGAAGTGGCCCCTTCTACTCTTCTCCGAGAAACAGTCACTGAGTCGAGTCACACTCTAA
AAACCTCTCCTCCGTCGAGCCAGCAACCGGAAAATCCTCGGAAGATTTATGTCTCAATCT
TCGCCGATGAACTTCAACACAGTTTATCAATCTCTCACGGCGTTATTTCCACAGATTGAT
GAAAGGATATTGAGAACTGTAGCAAGGGAGCACCCAACGGATGCTGGTGAAGCTGCCGCT
GTTGTTATCTCCGAGGTTGTTCCTTTGTTTCCTCAAGGATGGGAAGATCATGTTAAGAAA
AGGAAACTCCTTGATCTTCCTCTCTGCGAAGTAGAGCCTGAAATGCAGCATGAAGACGCT
CTCTCTCAATGGCTTCATCCGTCTCAGCTTCCACAGAGTTACCCTGCACTGCTCAACGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGTAGAAGAAGTAGAAGCAACACCTGTTGTAAAACCTAGTCTTGAC
TACGCTGTGAAGAAAGTGGTTCTTCCGAGTCGTGATGCAGCAGCAACTGGTGCACGACGA
GAAGTCCGGACCATATACTCAGCCTCCAACGGAACTGCTTCTTCCGTGGTGAAACCTTCT
ATCCGTGTACAAAGCTGCACCGATAATGAAGAACTCTACGGAAGCAGCAGCAAGGTTCCT
GTGGCTGGACGATCCTCACGCAAGGAGGTGGTGCCCCCGTGGTCTAACTACTCTGAGAAG
CTGAGAAGCTGGAAAAAACGAAGCAACAACCGTGACTTCTCACAGCTCCATGGCCAATGC
AAATATGAACCCTCTTGGCAATCTAACCAAAGCAAGTGCAGAAGTTATTACACTGAGCGT
GACCGGAAGCAGCGAATTGATGATAACATCAAGGCGTTGGCGAAATTGCTCCCGCATGAA
GTCAAGGAGGATAACTCTGAAGTGATACTGAATGAAATTGTTGATCATGTGAAGCTTCTC
CAGCTACAGATGAAGGAACTGAGTCTAAACAGGTTGGGAGGAGAACCAATATCTCATCCT
ATGACGTTCATTGAGGGATTTGGTCACTATATTCATCACGAGGAGATGATGACAAAGCCT
CTGGAGGAAGTGATGGAAGATCTGCTCTCAAATGATCCTGATACTGCAGCTCGTTTGTTG
GGGAGCAAAGGCCTTTACTTGATGCCTTTGTCCTCAGTTCAAGACTTTTGCTGAGTCAAA
CACATAAAGATAGTCTTAACAAAGTTTGTTTTGATCAATGGTAGTTATCTCAACCTAATA
ATTTCAGTACATGTTGTTTAGGTACGTTGATATCATCGTGTAACTCATCTCTATTTTATG
GTCCTCAAATCGAACAAGAACATACAATCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B540TF U 1
AF RR2B540JQ C 688
BS 1 863 RR2B540TF
BS 864 1352 RR2B540JQ

RD RR2B540TF 863 0 0
GGGAAGTGGCCCCTTCTACTCTTCTCCGAGAAACAGTCACTGAGTCGAGTCACACTCTAA
AAACCTCTCCTCCGTCGAGCCAGCAACCGGAAAATCCTCGGAAGATTTATGTCTCAATCT
TCGCCGATGAACTTCAACACAGTTTATCAATCTCTCACGGCGTTATTTCCACAGATTGAT
GAAAGGATATTGAGAACTGTAGCAAGGGAGCACCCAACGGATGCTGGTGAAGCTGCCGCT
GTTGTTATCTCCGAGGTTGTTCCTTTGTTTCCTCAAGGATGGGAAGATCATGTTAAGAAA
AGGAAACTCCTTGATCTTCCTCTCTGCGAAGTAGAGCCTGAAATGCAGCATGAAGACGCT
CTCTCTCAATGGCTTCATCCGTCTCAGCTTCCACAGAGTTACCCTGCACTGCTCAACGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGTAGAAGAAGTAGAAGCAACACCTGTTGTAAAACCTAGTCTTGAC
TACGCTGTGAAGAAAGTGGTTCTTCCGAGTCGTGATGCAGCAGCAACTGGTGCACGACGA
GAAGTCCGGACCATATACTCAGCCTCCAACGGAACTGCTTCTTCCGTGGTGAAACCTTCT
ATCCGTGTACAAAGCTGCACCGATAATGAAGAACTCTACGGAAGCAGCAGCAAGGTTCCT
GTGGCTGGACGATCCTCACGCAAGGAGGTGGTGCCCCCGTGGTCTAACTACTCTGAGAAG
CTGAGAAGCTGGAAAAAACGAAGCAACAACCGTGACTTCTCACAGCTCCATGGCCAATGC
AAATATGAACCCTCTTGGCAATCTAACCAAAGCAAGTGCAGAAGTTATTACACTGAGCGT
GACCGGAAGCAGCGAATTGATGA

QA 1 863 1 863
DS 

RD RR2B540JQ 665 0 0
GTGGTGCCCCCGTGGTCTAACTACTCTGAGAAGCTGAGAAGCTGGAAAAAACGAAGCAAC
AACCGTGACTTCTCACAGCTCCATGGCCAATGCAAATATGAACCCTCTTGGCAATCTAAC
CAAAGCAAGTGCAGAAGTTATTACACTGAGCGTGACCGGAAGCAGCGAATTGATGATAAC
ATCAAGGCGTTGGCGAAATTGCTCCCGCATGAAGTCAAGGAGGATAACTCTGAAGTGATA
CTGAATGAAATTGTTGATCATGTGAAGCTTCTCCAGCTACAGATGAAGGAACTGAGTCTA
AACAGGTTGGGAGGAGAACCAATATCTCATCCTATGACGTTCATTGAGGGATTTGGTCAC
TATATTCATCACGAGGAGATGATGACAAAGCCTCTGGAGGAAGTGATGGAAGATCTGCTC
TCAAATGATCCTGATACTGCAGCTCGTTTGTTGGGGAGCAAAGGCCTTTACTTGATGCCT
TTGTCCTCAGTTCAAGACTTTTGCTGAGTCAAACACATAAAGATAGTCTTAACAAAGTTT
GTTTTGATCAATGGTAGTTATCTCAACCTAATAATTTCAGTACATGTTGTTTAGGTACGT
TGATATCATCGTGTAACTCATCTCTATTTTATGGTCCTCAAATCGAACAAGAACATACAA
TCATC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL6674Contig1 789 2 2 U
GTGCTCGAATTGAAGGAACTTTTGATTCGGGAATCGTGGATATGAAAGCTAATAGCGTTG
AACTGCTGACCACTCCAAAGACCGTCCATGTCGATCAAATGTCTGGTGCATCCACTATGC
TCTTTACTTTCACTCTAGATCGTGGTATTAGCATTTGAGAGTACGGCCTCAGGGTTGTTT
AAGACCGTCCGTCCTGCGGTAGGAGAGTCGATCAGAGAGATGTCTCTTTCAGAGTTGAAA
ACTAAGTACCGAAAACTCTCATCCCTGGAGAAAGCTCGTAACGGTTGGGAAGACGAGTAC
GAAGTTTCTTCTAAACAGTGTATGCACGGACCAAAGTGTAAGCTGGGAGAGTATTGCACA
GTAGGAAGAAGAATACAGGAAGTAAATGTTGTGGGTGGCCTTATTCTTCCCATCTGGGGA
ACCATTGAGAAAGCTCTTTCCAAACAAGCCCGTCAAAGCCACAAGAGGATTAGAGTTATA
CGCATAGAGACTACGACGGATAATCAACGAATAGTGGGCCTCTCTATCCCTAATGCAGCT
GTAGAAACTGTGTTACAAGATTTAGCATGGGTTCAAGAGATAGATGATTGAGACAAAAAC
AAACATTATCCGTCTTATGTAAGAAGCAAAACCGACACCAACCCTCAAGTTTCCCCCCAT
GCCTATTCGTATTTTTATTTATTTTATTTTCAAAGGAGAAAAACACTATGACTTCCATTT
TTGTGTATATCACATGGCAATCTGGCAATAGTTGTATTACTACTACTATTATTATCTAAC
GTTTTGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP25TF U 1
AF RR2CP25JQ C 20
BS 1 653 RR2CP25TF
BS 654 789 RR2CP25JQ

RD RR2CP25TF 653 0 0
GTGCTCGAATTGAAGGAACTTTTGATTCGGGAATCGTGGATATGAAAGCTAATAGCGTTG
AACTGCTGACCACTCCAAAGACCGTCCATGTCGATCAAATGTCTGGTGCATCCACTATGC
TCTTTACTTTCACTCTAGATCGTGGTATTAGCATTTGAGAGTACGGCCTCAGGGTTGTTT
AAGACCGTCCGTCCTGCGGTAGGAGAGTCGATCAGAGAGATGTCTCTTTCAGAGTTGAAA
ACTAAGTACCGAAAACTCTCATCCCTGGAGAAAGCTCGTAACGGTTGGGAAGACGAGTAC
GAAGTTTCTTCTAAACAGTGTATGCACGGACCAAAGTGTAAGCTGGGAGAGTATTGCACA
GTAGGAAGAAGAATACAGGAAGTAAATGTTGTGGGTGGCCTTATTCTTCCCATCTGGGGA
ACCATTGAGAAAGCTCTTTCCAAACAAGCCCGTCAAAGCCACAAGAGGATTAGAGTTATA
CGCATAGAGACTACGACGGATAATCAACGAATAGTGGGCCTCTCTATCCCTAATGCAGCT
GTAGAAACTGTGTTACAAGATTTAGCATGGGTTCAAGAGATAGATGATTGAGACAAAAAC
AAACATTATCCGTCTTATGTAAGAAGCAAAACCGACACCAACCCTCAAGTTTC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RR2CP25JQ 770 0 0
TTTTGATTCGGGAATCGTGGATATGAAAGCTAATAGCGTTGAACTGCTGACCACTCCAAA
GACCGTCCATGTCGATCAAATGTCTGGTGCATCCACTATGCTCTTTACTTTCACTCTAGA
TCGTGGTATTAGCATTTGAGAGTACGGCCTCAGGGTTGTTTAAGACCGTCCGTCCTGCGG
TAGGAGAGTCGATCAGAGAGATGTCTCTTTCAGAGTTGAAAACTAAGTACCGAAAACTCT
CATCCCTGGAGAAAGCTCGTAACGGTTGGGAAGACGAGTACGAAGTTTCTTCTAAACAGT
GTATGCACGGACCAAAGTGTAAGCTGGGAGAGTATTGCACAGTAGGAAGAAGAATACAGG
AAGTAAATGTTGTGGGTGGCCTTATTCTTCCCATCTGGGGAACCATTGAGAAAGCTCTTT
CCAAACAAGCCCGTCAAAGCCACAAGAGGATTAGAGTTATACGCATAGAGACTACGACGG
ATAATCAACGAATAGTGGGCCTCTCTATCCCTAATGCAGCTGTAGAAACTGTGTTACAAG
ATTTAGCATGGGTTCAAGAGATAGATGATTGAGACAAAAACAAACATTATCCGTCTTATG
TAAGAAGCAAAACCGACACCAACCCTCAAGTTTCCCCCCATGCCTATTCGTATTTTTATT
TATTTTATTTTCAAAGGAGAAAAACACTATGACTTCCATTTTTGTGTATATCACATGGCA
ATCTGGCAATAGTTGTATTACTACTACTATTATTATCTAACGTTTTGGCT

QA 1 770 1 770
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6676Contig1 565 2 1 U
GGACACACAAATTGAATCGCTGCCCTAAGTCCGTTGCAACTGAATCTCGATGGTTTACAT
AGTTTCCTGGGACGAATTCGTTGATCGATCTGTTCAGCTTTTCCGAGCTGATCCCGATTC
TACTCGGTATGTGGTCAAGTACAGACACTGCGATGGCAAACTGGTTCTCAAGGTTACTGA
TAACAAAGAGTGTCTCAAGTTCAAGACAGACCAAGCACAAGAAGCGAAGAAGATGGAGAA
ACTGAATAACATATTTTTCACACTCATGGCCAGAGGACCTGATGTTGATCTCTCTGAAGT
CACCGGGAAAGAACCTATGGAGACGCAGCCTGCCAAGAAAGGAAGAGGAAGGAAGCAATA
AGTCCCTGTGAATCTGTTTTTTCTTTTCTTCTCCTCATATTTGGTGTCAAGATTTTTGAT
CCATTTTTTTGTTAAATATTTTGAGATGTTTTTTTTAATAGTTTTTTTTGCGTTTGAAAA
CCTTGCTATAATTTGCCAAATTAGACTTCAATCTCGTGAAAATGTTACTTACTCTTCAAT
GAGATTTGCCAAATCTCGAGGTACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BW13JQ C 1
AF RR2BW13TF U 1
BS 1 565 RR2BW13TF

RD RR2BW13JQ 565 0 0
GGACACACAAATTGAATCGCTGCCCTAGGTCCGTTGCAACTGAATCTCGATGGTTTACAT
AGTTTCCTGGGACGAATTCGTTGATCGATCTGTTCAGCTTTTCCGAGCTGATCCCGATTC
TACTCGGTATGTGGTCAAGTACAGACACTGCGATGGCAAACTGGTTCTCAAGGTTACTGA
TAACAAAGAGTGTCTCAAGTTCAAGACAGACCAAGCACAAGAAGCGAAGAAGATGGAGAA
ACTGAATAACATATTTTTCACACTCATGGCCAGAGGACCTGATGTTGATCTCTCTGAAGT
CACCGGGAAAGAACCTATGGAGACGCAGCCTGCCAAGAAAGGAAGAGGAAGGAAGCAATA
AGTCCCTGTGAATCTGTTTTTTCTTTTCTTCTCCTCATATTTGGTGTCAAGATTTTTGAT
CCATTTTTTTGTTAAATATTTTGAGATGTTTTTTTTAATAGTTTTTTTTGCGTTTGAAAA
CCTTGCTATAATTTGCCAAATTAGACTTCAATCTCGTGAAAATGTTACTTACTCTTCAAT
GAGATTTGCCAAATCTCGAGGTACC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2BW13TF 565 0 0
GGACACACAAATTGAATCGCTGCCCTAAGTCCGTTGCAACTGAATCTCGATGGTTTACAT
AGTTTCCTGGGACGAATTCGTTGATCGATCTGTTCAGCTTTTCCGAGCTGATCCCGATTC
TACTCGGTATGTGGTCAAGTACAGACACTGCGATGGCAAACTGGTTCTCAAGGTTACTGA
TAACAAAGAGTGTCTCAAGTTCAAGACAGACCAAGCACAAGAAGCGAAGAAGATGGAGAA
ACTGAATAACATATTTTTCACACTCATGGCCAGAGGACCTGATGTTGATCTCTCTGAAGT
CACCGGGAAAGAACCTATGGAGACGCAGCCTGCCAAGAAAGGAAGAGGAAGGAAGCAATA
AGTCCCTGTGAATCTGTTTTTTCTTTTCTTCTCCTCATATTTGGTGTCAAGATTTTTGAT
CCATTTTTTTGTTAAATATTTTGAGATGTTTTTTTTAATAGTTTTTTTTGCGTTTGAAAA
CCTTGCTATAATTTGCCAAATTAGACTTCAATCTCGTGAAAATGTTACTTACTCTTCAAT
GAGATTTGCCAAATCTCGAGGTACC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6678Contig1 637 2 2 U
TTTGTAACTGAAACTCTCTTCAATCAACAAACCAATCTTAAGTTTCACATTCTTTCTTCA
GATACAATAAACCACATTAATACATAACTCGCAAACAAAGCATGACTATGCTTCTGTCTG
CATCAGAATCTTTGTCTAGGAACATACAAGACGACGGCTTTGGCACCTGCAAGAGGGAAC
CAATGCCTTCGGAGACATAAACGTATGGCTCTCGGTGAATCCCTCTGATCAAACACCAAA
ACTGAGAGCTACCCTTTTGTAAGGGTAAGGAAATTTAAAAGTTTCTAGGTTCGTGGGCTC
TCGGACAAACAACAGCTTAAGCTTATCTAGTTCTTTGTTCTATGAAACGAGTTTCGCTGG
AGACGAACCAGAGCTGCTGCTGCTGCTTTCTCCATTAGTTGTAACTTCGGATTGAGCTGA
GGAGTTCATAGAACTCTGGTTGGTATTTGTGGATGGAGCTTGTCCTTCTTCAGCGAGTTT
CTTAAGGAGGTTCATGACCGTTGGAAGGAACTTGGTTGACAAAGAAAGGAGTCCAGGTAG
CGCTCCATTGCTGAACTCTCCTGAGATATTTAACTGCACCCACAAGGCTTTGGAAACAAG
GTATGCGACGAAAAGAACACCGAGCCATAGAGGATTT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EW62TF C 1
AF RR2EW62JQ U 4
BS 1 3 RR2EW62TF
BS 4 637 RR2EW62JQ

RD RR2EW62TF 637 0 0
TTTGTAACTGAAACTCTCTTCAATCAACAAACCAATCTTAAGTTTCACATTCTTTCTTCA
GATACAATAAACCACATTAATACATAACTCGCAAACAAAGCATGACTATGCTTCTGTCTG
CATCAGAATCTTTGTCTAGGAACATACAAGACGACGGCTTTGGCACCTGCAAGAGGGAAC
CAATGCCTTCGGAGACATAAACGTATGGCTCTCGGTGAATCCCTCTGATCAAACACCAAA
ACTGAGAGCTACCCTTTTGTAAGGGTAAGGAAATTTAAAAGTTTCTAGGTTCGTGGGCTC
TCGGACAAACAACAGCTTAAGCTTATCTAGTTCTTTGTTCTATGAAACGAGTTTCGCTGG
AGACGAACCAGAGCTGCTGCTGCTGCTTTCTCCATTAGTTGTAACTTCGGATTGAGCTGA
GGAGTTCATAGAACTCTGGTTGGTATTTGTGGATGGAGCTTGTCCTTCTTCAGCGAGTTT
CTTAAGGAGGTTCATGACCGTTGGAAGGAACTTGGTTGACAAAGAAAGGAGTCCAGGTAG
CGCTCCATTGCTGAACTCTCCTGAGATATTTAACTGCACCCACAAGGCTTTGGAAACAAG
GTATGCGACGAAAAGAACACCGAGCCATAGAGGATTT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2EW62JQ 634 0 0
GTAACTGAAACTCTCTTCAATCAACAAACCAATCTTAAGTTTCACATTCTTTCTTCAGAT
ACAATAAACCACATTAATACATAACTCGCAAACAAAGCATGACTATGCTTCTGTCTGCAT
CAGAATCTTTGTCTAGGAACATACAAGACGACGGCTTTGGCACCTGCAAGAGGGAACCAA
TGCCTTCGGAGACATAAACGTATGGCTCTCGGTGAATCCCTCTGATCAAACACCAAAACT
GAGAGCTACCCTTTTGTAAGGGTAAGGAAATTTAAAAGTTTCTAGGTTCGTGGGCTCTCG
GACAAACAACAGCTTAAGCTTATCTAGTTCTTTGTTCTATGAAACGAGTTTCGCTGGAGA
CGAACCAGAGCTGCTGCTGCTGCTTTCTCCATTAGTTGTAACTTCGGATTGAGCTGAGGA
GTTCATAGAACTCTGGTTGGTATTTGTGGATGGAGCTTGTCCTTCTTCAGCGAGTTTCTT
AAGGAGGTTCATGACCGTTGGAAGGAACTTGGTTGACAAAGAAAGGAGTCCAGGTAGCGC
TCCATTGCTGAACTCTCCTGAGATATTTAACTGCACCCACAAGGCTTTGGAAACAAGGTA
TGCGACGAAAAGAACACCGAGCCATAGAGGATTT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL6679Contig1 469 2 1 U
GGAGCGGCGAAAATGGTGCAGCGTCTTGTATACAGGTCACGACACAGCTACGCCACCAAA
TCGAACCAGCACCGTATCGTCAAGACTCCAGGAGGTAAATTGGTGTTTCAGACCACAAAG
AAGAGAGCCAATGGCCCCAAATGCCCTGTTACTGGCAAGCGTATCCATGGAATCCCTCAC
TTGAGGCCTACGGAATACAAGAGGTCTAGATTATCGAGAAACAAGAGGACTGTGAACCGT
GCTTATGGTGGAGTCTTGTCTGCTTTGGCTGTCAGGGAAAGGATCGTACGAGCATTCCTT
GTTGAAGAGCAGAAGATCGTGAAGAAAGTTTTGAAACTCCAAAAGGCCAAGGAGAAAGTA
GCTACCAAGGCTTGAGCGTTTTATGTTTTTTGATTTTAGCCTTGAAAGGATACACATCTT
TTTTTACTTTGTCTTTGACAATATGAATTACATATATTTTTACCTGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E014JQ C 1
AF RR2E014TF U 1
BS 1 469 RR2E014TF

RD RR2E014JQ 469 0 0
GGAGCGGCGAAAATGGTGCAGCGTTTTGTATACAGGTCACGACACAGTTACGCCACCAAA
TCGAACCAGCACCGTATCGTCAAGACTCCAGGAGGTAAATTGGTGTTTCAGACCACAAAG
AAGAGAGCCAATGGCCCCAAATGCCCTGTTACTGGCAAGCGTATCCATGGAATCCCTCAC
TTGAGGCCTACGGAATACAAGAGGTCTAGATTATCGAGAAACAAGAGGACTGTGAACCGT
GCTTATGGTGGAGTCTTGTCTGCTTTGGCTGTCAGGGAAAGGATCGTACGAGCATTCCTT
GTTGAAGAGCAGAAGATCGTGAAGAAAGTTTTGAAACTCCAAAAGGCCAAGGAGAAAGTA
GCTACCAAGGCTTGAGCGTTTTATGTTTTTTGATTTTAGCCTTGAAAGGATACACATCTT
TTTTTACTTTGTCTTTGACAATATGAATTACATATATTTTTACCTGTCC

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR2E014TF 469 0 0
GGAGCGGCGAAAATGGTGCAGCGTCTTGTATACAGGTCACGACACAGCTACGCCACCAAA
TCGAACCAGCACCGTATCGTCAAGACTCCAGGAGGTAAATTGGTGTTTCAGACCACAAAG
AAGAGAGCCAATGGCCCCAAATGCCCTGTTACTGGCAAGCGTATCCATGGAATCCCTCAC
TTGAGGCCTACGGAATACAAGAGGTCTAGATTATCGAGAAACAAGAGGACTGTGAACCGT
GCTTATGGTGGAGTCTTGTCTGCTTTGGCTGTCAGGGAAAGGATCGTACGAGCATTCCTT
GTTGAAGAGCAGAAGATCGTGAAGAAAGTTTTGAAACTCCAAAAGGCCAAGGAGAAAGTA
GCTACCAAGGCTTGAGCGTTTTATGTTTTTTGATTTTAGCCTTGAAAGGATACACATCTT
TTTTTACTTTGTCTTTGACAATATGAATTACATATATTTTTACCTGTCC

QA 1 469 1 469
DS 



AS 1 2

CO CL6680Contig1 789 2 2 U
GGGTTGTTCGTTTCACAAAAGAGGACAAAAACAAAACAAAACAAAACAAGAAGTCCAGTC
TCTCTAATCTCTTTGTTGTCTAAGGTTTACCTCCATCAACCAAAGGCAATGGCGAACGCA
GCGTCGGGAATGGCGGTGGTAGACGAATGTAAGCTCAAGTTTTTGGAGCTAAAAGCGAAA
AGAAACTATAGGTTCATAATATTCAGGATAGATGGACAACAAGTGGTTGTCGAAAAGCTT
GGAAGTCCCGAGGAGAACTACGACGATTTCTCCAATTCTCTTCCGGCCAACGAGTGCCGC
TATGCCGCCTATGACTTCGACTTCACCACTGTTGAGAATTGCCAGAAAAGCAAAATCTTC
TTCATAGCATGGTCACCGGATTCTTCGAGTGTGAGGATGAAGATGGTGTATGCCAGTTCA
AAGGACAGGTTCAAGAGAGAATTGGATGGTATTCAGGTGGAATTACAAGCCACGGACCCG
AGTAAGATGAGTTTTGACATCATCAAAAGTCGTGCTCTCTAGATTCATATGTGCCTGATT
TCTTATCATATATCCATAAGTGCTCCATCATCATTATTCAAAGAACTTCTCCATGTTATG
TTATGTAACTTTCTTGTTTTTTTGTAACTTTCTTGGTTTCATTCCTTCTTCCTCTTGACT
CTTTTTTATCTTTTTATTTACATTTTAAATTGACATGGATTCTATACTTGGGCTTTGGAC
ATGTTAAAACCATGTAGTTTTCCGTGTAATAGCTGCATATTTTTGTTGAAAAATAAAACA
TATTTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP72TF U 1
AF RR2EP72JQ C 16
BS 1 753 RR2EP72TF
BS 754 789 RR2EP72JQ

RD RR2EP72TF 753 0 0
GGGTTGTTCGTTTCACAAAAGAGGACAAAAACAAAACAAAACAAAACAAGAAGTCCAGTC
TCTCTAATCTCTTTGTTGTCTAAGGTTTACCTCCATCAACCAAAGGCAATGGCGAACGCA
GCGTCGGGAATGGCGGTGGTAGACGAATGTAAGCTCAAGTTTTTGGAGCTAAAAGCGAAA
AGAAACTATAGGTTCATAATATTCAGGATAGATGGACAACAAGTGGTTGTCGAAAAGCTT
GGAAGTCCCGAGGAGAACTACGACGATTTCTCCAATTCTCTTCCGGCCAACGAGTGCCGC
TATGCCGCCTATGACTTCGACTTCACCACTGTTGAGAATTGCCAGAAAAGCAAAATCTTC
TTCATAGCATGGTCACCGGATTCTTCGAGTGTGAGGATGAAGATGGTGTATGCCAGTTCA
AAGGACAGGTTCAAGAGAGAATTGGATGGTATTCAGGTGGAATTACAAGCCACGGACCCG
AGTAAGATGAGTTTTGACATCATCAAAAGTCGTGCTCTCTAGATTCATATGTGCCTGATT
TCTTATCATATATCCATAAGTGCTCCATCATCATTATTCAAAGAACTTCTCCATGTTATG
TTATGTAACTTTCTTGTTTTTTTGTAACTTTCTTGGTTTCATTCCTTCTTCCTCTTGACT
CTTTTTTATCTTTTTATTTACATTTTAAATTGACATGGATTCTATACTTGGGCTTTGGAC
ATGTTAAAACCATGTAGTTTTCCGTGTAATAGC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2EP72JQ 774 0 0
CAAAAGAGGACAAAAACAAAACAAAACAAAACAAGAAGTCCAGTCTCTCTAATCTCTTTG
TTGTCTAAGGTTTACCTCCATCAACCAAAGGCAATGGCGAACGCAGCGTCGGGAATGGCG
GTGGTAGACGAATGTAAGCTCAAGTTTTTGGAGCTAAAAGCGAAAAGAAACTATAGGTTC
ATAATATTCAGGATAGATGGACAACAAGTGGTTGTCGAAAAGCTTGGAAGTCCCGAGGAG
AACTACGACGATTTCTCCAATTTTCTTCCGGCCAACGAGTGCCGCTATGCCGCCTATGAC
TTCGACTTCACCACTGTTGAGAATTGCCAGAAAAGCAAAATCTTCTTCATAGCATGGTCA
CCGGATTCTTCGAGTGTGAGGATGAAGATGGTGTATGCCAGTTCAAAGGACAGGTTCAAG
AGAGAATTGGATGGTATTCAGGTGGAATTACAAGCCACGGACCCGAGTAAGATGAGTTTT
GACATCATCAAAAGTCGTGCTCTCTAGATTCATATGTGCCTGATTTCTTATCATATATCC
ATAAGTGCTCCATCATCATTATTCAAAGAACTTCTCCATGTTATGTTATGTAACTTTCTT
GTTTTTTTGTAACTTTCTTGGTTTCATTCCTTCTTCCTCTTGACTCTTTTTTATCTTTTT
ATTTACATTTTAAATTGACATGGATTCTATACTTGGGCTTTGGACATGTTAAAACCATGT
AGTTTTCCGTGTAATAGCTGCATATTTTTGTTGAAAAATAAAACATATTTTCAC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6682Contig1 941 2 2 U
GCTTATGCAAAGTTCCAAACACAGCAGCGAGCACTTTTATGCTTAATGGTTCGACGAGAT
TGCTTCACTTGTTGCCTAAGTCTTATTATCCTATCCACTGCAACATGGTTTCACCCAGCA
GTAGTACATTCGGGTTAGGTCCTCTCAAGCTGCACAACAAAGGCTTTCGTCTAAGGCCAT
GTAGAGTCAAACGGGAAGAGAACAACCAAACCGCTGATGTTGAAAGCATATCATTGGATG
AGAACACGTTGAAGCAAGATCTGGAGAGTGCGATCCAGGAAGAAAACTATGTTGAAGCAG
CTAAGATCCGGGATAGACTGAAAGAGCTTCAAGAAGACAGCAGAGCCTCTGTTCTGTCTG
CCAACACTCGGTTCTACCAAGCTTTCAGAAACGGGGATTTAGCTGCGATGCAGTCTTTAT
GGTTCAGATCAGGAAAGCCCTGCTGTGTCCATCCTGGAGCTAAAGGGATAACCGGGTACG
ACGACGTGGTGGAAAGCTGGGAAGTTGTGTGGATGAACTATGAGTTTCCGTTACTGATCG
AGCTGAAAGATGTTGAGGTTCATGTCTGAGGGGAAGTAGGGTATGTGACGTGTATGGAGT
TTGTGAAGACGAAAGGGAGTAGTAGCTGGGGAGCTCAGTTTGTGTCTAATGTGTTTGAAA
AGATCGATGGGGAATGGTTTATATGCATTCACCATGCTTCTCCTGTTGATATTTGATCCC
AAGAACCAGAGAAATGGCCGTGGGATATAGATTGGGGGTTGCTGAAATGAGATGAAGGGC
TGTTCTGTTTTTTTTATCTTTGCGGTTGGTTGATTGAGACCAAAGCATTAGAGGGAAACA
AGAAGAGGCATAAGTTCTGACGTTTGATGTTGTTGTCTTTGTAATCTGTATGATGTTTAT
TTTCTTGTAGGCGCAACAGTTTTTTTTTAATCTAACATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B563TF U 1
AF RR2B563JQ C 96
BS 1 833 RR2B563TF
BS 834 941 RR2B563JQ

RD RR2B563TF 833 0 0
GCTTATGCAAAGTTCCAAACACAGCAGCGAGCACTTTTATGCTTAATGGTTCGACGAGAT
TGCTTCACTTGTTGCCTAAGTCTTATTATCCTATCCACTGCAACATGGTTTCACCCAGCA
GTAGTACATTCGGGTTAGGTCCTCTCAAGCTGCACAACAAAGGCTTTCGTCTAAGGCCAT
GTAGAGTCAAACGGGAAGAGAACAACCAAACCGCTGATGTTGAAAGCATATCATTGGATG
AGAACACGTTGAAGCAAGATCTGGAGAGTGCGATCCAGGAAGAAAACTATGTTGAAGCAG
CTAAGATCCGGGATAGACTGAAAGAGCTTCAAGAAGACAGCAGAGCCTCTGTTCTGTCTG
CCAACACTCGGTTCTACCAAGCTTTCAGAAACGGGGATTTAGCTGCGATGCAGTCTTTAT
GGTTCAGATCAGGAAAGCCCTGCTGTGTCCATCCTGGAGCTAAAGGGATAACCGGGTACG
ACGACGTGGTGGAAAGCTGGGAAGTTGTGTGGATGAACTATGAGTTTCCGTTACTGATCG
AGCTGAAAGATGTTGAGGTTCATGTCTGAGGGGAAGTAGGGTATGTGACGTGTATGGAGT
TTGTGAAGACGAAAGGGAGTAGTAGCTGGGGAGCTCAGTTTGTGTCTAATGTGTTTGAAA
AGATCGATGGGGAATGGTTTATATGCATTCACCATGCTTCTCCTGTTGATATTTGATCCC
AAGAACCAGAGAAATGGCCGTGGGATATAGATTGGGGGTTGCTGAAATGAGATGAAGGGC
TGTTCTGTTTTTTTTATCTTTGCGGTTGGTTGATTGAGACCAAAGCATTAGAG

QA 1 833 1 833
DS 

RD RR2B563JQ 846 0 0
CACTGCAACATGGTTTCACCCAGCAGTAGTACATTCGGGTTAGGTCCTCTCAAGCTGCAC
AACAAAGGCTTTCGTCTAAGGCCATGTAGAGTCAAACGGGAAGAGAACAACCAAACCGCT
GATGTTGAAAGCATATCATTGGATGAGAACACGTTGAAGCAAGATCTGGAGAGTGCGATC
CAGGAAGAAAACTATGTTGAAGCAGCTAAGATCCGGGATAGACTGAAAGAGCTTCAAGAA
GACAGCAGAGCCTCTGTTCTGTCTGCCAACACTCGGTTCTACCAAGCTTTCAGAAACGGG
GATTTAGCTGCGATGCAGTCTTTATGGTTCAGATCAGGAAAGCCCTGCTGTGTCCATCCT
GGAGCTAAAGGGATAACCGGGTACGACGACGTGGTGGAAAGCTGGGAAGTTGTGTGGATG
AACTATGAGTTTCCGTTACTGATCGAGCTGAAAGATGTTGAGGTTCATGTCTGAGGGGAA
GTAGGGTATGTGACGTGTATGGAGTTTGTGAAGACGAAAGGGAGTAGTAGCTGGGGAGCT
CAGTTTGTGTTTAATGTGTTTGAAAAGATCGATGGGGAATGGTTTATATGCATTCACCAT
GCTTCTCCTGTTGATATTTGATCCCAAGAACCAGAGAAATGGCCGTGGGATATAGATTGG
GGGTTGCTGAAATGAGATGAAGGGCTGTTCTGTTTTTTTTATCTTTGCGGTTGGTTGATT
GAGACCAAAGCATTAGAGGGAAACAAGAAGAGGCATAAGTTCTGACGTTTGATGTTGTTG
TCTTTGTAATCTGTATGATGTTTATTTTCTTGTAGGCGCAACAGTTTTTTTTTAATCTAA
CATTCC

QA 1 846 1 846
DS 



AS 1 2

CO CL6683Contig1 648 2 6 U
GGTTTGGAAATCAATTGTTTATTACTCTGATCAGAAGAAAGTAAAAGAACTACACAACCA
AAAGTCCCATGTCTCCCACAAAAGGCTATTTTCCAAACACAACAGAGACTAATAGAAAGA
GAGTATTTACAAGTGAAACAGAGAGTTTTCTAATGAACGGCCAAGCGATCAGAGCCTAAA
GGAGACATCAGTGAAAAGAGTCGATGAAGTTTCTCAACAAAAATCTCCAACTCTTTTGCT
TCTTCTTCCCCAATCGCAAAGTTGGCTATGCATATGCTCAGCTCAAAAATCGCATCTCTA
CATTGCCTGACGTAGTAGTACATCATGCCAAGTTCTCTCCGAACTACCCAGTTATTAGGT
TCCAATATCAACAGCCTTTCTGCAGCCGCAATAGCCAACCTAAGATCTTGAGGCCGCAAC
AATGGAAAATTAGAAATCCTGAAGTTGTTAAGTTCACTAAGCGGAGCAGTCAGCATTTGT
CCAGGTGTTGGCTTCGAAGCACGTCTCCAATGAACCCTAATAAGATTGGAGAGAGCAATG
CTTATAATGTCTCTGTTTGTTGCAACAGCAAAGTCTAGAAGTGACTCTCCGGTTAACTCC
GATGCCATTGATTGAGGATCATCAACACACTCTCCATTGACAGTAGCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN72JQ U 1
AF RR2E090JQ U 1
BS 1 346 RR2DN72JQ
BS 347 347 RR2E090JQ
BS 348 576 RR2DN72JQ
BS 577 577 RR2E090JQ
BS 578 602 RR2DN72JQ
BS 603 648 RR2E090JQ

RD RR2DN72JQ 602 0 0
GGTTTGGAAATCAATTGTTTATTACTCTGATCAGAAGAAAGTAAAAGAACTACACAACCA
AAAGTCCCATGTCTCCCACAAAAGGCTATTTTCCAAACACAACAGAGACTAATAGAAAGA
GAGTATTTACAAGTGAAACAGAGAGTTTTCTAATGAACGGCCAAGCGATCAGAGCCTAAA
GGAGACATCAGTGAAAAGAGTCGATGAAGTTTCTCAACAAAAATCTCCAACTCTTTTGCT
TCTTCTTCCCCAATCGCAAAGTTGGCTATGCATATGCTCAGCTCAAAAATCGCATCTCTA
CATTGCCTGACGTAGTAGTACATCATGCCAAGTTCTCTCCGAACTATCCAGTTATTAGGT
TCCAATATCAACAGCCTTTCTGCAGCCGCAATAGCCAACCTAAGATCTTGAGGCCGCAAC
AATGGAAAATTAGAAATCCTGAAGTTGTTAAGTTCACTAAGCGGAGCAGTCAGCATTTGT
CCAGGTGTTGGCTTCGAAGCACGTCTCCAATGAACCCTAATAAGATTGGAGAGAGCAATG
CTTATAATGTCTCTGTTTGTTGCAACAGCAAAGTCTGGAAGTGACTCTCCGGTTAACTCC
GA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2E090JQ 648 0 0
GGTTTGGAAATCAATTGTTTATTACTCTGATCAGAAGAAAGTAAAAGAACTACACGACCA
AAAGTTCCATGTCTCCCACAAAAGGCTATTTTCCAAACACAACAGAGACTAATAGAAAGA
GAGTATTTACAAGTGAAACAGAGAGTTTTCTAATGAACGGCCAAGCGATCAGAGCCTAAA
GGAGACATCAGTGAAAAGAGTCGATGAAGTTTCTCAACAAAAATCTCCAACTCTTTTGCT
TCTTCTTCCCCAATCGCAAAGTTGGCTATGCATATGCTCAGCTCAAAAATCGCATCTCTA
CATTGCCTGACGTAGTAGTACATCATGCCAAGTTCTCTCCGAACTACCCAGTTATTAGGT
TCCAATATCAACAGCCTTTCTGCAGCCGCAATAGCCAACCTAAGATCTTGGGGCCGCAAC
AATGGAAAATTAGAAATCCTGAAGTTGTTAAGTTCACTAAGCGGAGCAGTCAGCATTTGT
CCAGGTGTTGGCTTCGAAGCACGTCTCCAATGAACCCTAATAAGATTGGAGAGAGCAATG
CTTATAATGTCTCTGTTTGTTGCAACAGCAAAGTCTAGAAGTGACTCTCCGGTTAACTCC
GATGCCATTGATTGAGGATCATCAACACACTCTCCATTGACAGTAGCG

QA 1 648 1 648
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6685Contig1 1280 2 2 U
GATCTCTCATGTCGCCCTTTATGACGGAAAGTTTATATGGGGAATGTGGAAGAAGGCAAC
GACAGCAACAAAGGACAAGTTCGGGGACGTGCATTCAAGATTGATGAAGAAGAACTACCA
AGCAGTGCCTCAATGGTGGTTCATCGCAATCCTCGTTATCTCCTTTGGTTTGGCACTCTA
CGCTTGTGAGGGCTTTGACAAGCAGCTTCAGCTTCCATGGTGGGGACTTGTACTCGCATG
TGCCATCGCCATGTTCTTCACATTACCAATCGGAGTTATCCAAGCAACCACCAACCAGCA
GATGGGTCTTAACGTTATAACCGAACTGATCATCGGTTACTTATACCCGGGAAAGCCACT
AGCCAACGTGTCTTTCAAGACCTACGGATACATCAGTATGTCCCAAGCCTTGTACTTCGT
TGGAGACTTCAAGCTTGGTCACTACATGAAGATCCCTCCAAGATCTATGTTCATCGTCCA
GCTTGTTGCGACCGTGGTCTCGTCGTCCGTCTGCTTCGGAACAACCTGGTGGCTCATTTC
CTCCGTGGAGAACATATGTAACACGGATCTGCTCCCGGTGGGTAGTCCATGGACTTGTCC
TGGAGATGAAGTGTTCTACAATGCATCCATCATATGGGGAGTGATCGGTCCGAGGAGAAT
GTTCACCAAAGAAGGTATCTACCCCGGGATGAACTGGTTCTTCCTCATCGGTATCCTGGC
ACCAGTTCCTTTCTGGTACCTATCCAAGAAGTTCCCAGAGAAGAAATGGCTCAAGCTTAT
CCACATTCCATTGATCTTCTCAGCAGTGAGCCCGATGCCACAAGCCAAGGCTGTGCATTA
CTGGTCATGGACCATCGTCGGGGTTGTTTTCAACTACTACATTTTCAGGAAGTTTAAAAC
TTGGTGGGCGAGGCACAACTACATCCTCTTTGCGACGCTTGATGCAGGTACCGCGATCAT
GGGGGTGTTGATATTCTTTGCGTTTCAGAACAATGATATAAGCATACCTGATTGGTGGGG
GCTTGAGAACTCGGACCATTGCCCTCTAGCGCATTGTCCCACAGCTAAAGGGGTTGTTGT
TGAAGGCTGTCCTGTGTTTTAAGGATTGATGCAGATCAAAGTGTTGTTGTTGCCCCAAAA
GGGTTAATGTTGATATTTTAAGAAAATGTAAAGCATTATACTTGGTTTCATGTTCTTTAG
GTTTTTAACCATGTACTTTTCAATCTTAAGAGCAAATCAAGCATAGCTTTCGTTCCAAAC
TATATAATCAAAATGCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY92TF U 1
AF RR2DY92JQ C 550
BS 1 644 RR2DY92TF
BS 645 1280 RR2DY92JQ

RD RR2DY92TF 644 0 0
GATCTCTCATGTCGCCCTTTATGACGGAAAGTTTATATGGGGAATGTGGAAGAAGGCAAC
GACAGCAACAAAGGACAAGTTCGGGGACGTGCATTCAAGATTGATGAAGAAGAACTACCA
AGCAGTGCCTCAATGGTGGTTCATCGCAATCCTCGTTATCTCCTTTGGTTTGGCACTCTA
CGCTTGTGAGGGCTTTGACAAGCAGCTTCAGCTTCCATGGTGGGGACTTGTACTCGCATG
TGCCATCGCCATGTTCTTCACATTACCAATCGGAGTTATCCAAGCAACCACCAACCAGCA
GATGGGTCTTAACGTTATAACCGAACTGATCATCGGTTACTTATACCCGGGAAAGCCACT
AGCCAACGTGTCTTTCAAGACCTACGGATACATCAGTATGTCCCAAGCCTTGTACTTCGT
TGGAGACTTCAAGCTTGGTCACTACATGAAGATCCCTCCAAGATCTATGTTCATCGTCCA
GCTTGTTGCGACCGTGGTCTCGTCGTCCGTCTGCTTCGGAACAACCTGGTGGCTCATTTC
CTCCGTGGAGAACATATGTAACACGGATCTGCTCCCGGTGGGTAGTCCATGGACTTGTCC
TGGAGATGAAGTGTTCTACAATGCATCCATCATATGGGGAGTGA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2DY92JQ 731 0 0
GAACATATGTAACACGGATCTGCTCCCGGTGGGTAGTCCATGGACTTGTCCTGGAGATGA
AGTGTTCTACAATGCATCCATCATATGGGGAGTGATCGGTCCGAGGAGAATGTTCACCAA
AGAAGGTATCTACCCCGGGATGAACTGGTTCTTCCTCATCGGTATCCTGGCACCAGTTCC
TTTCTGGTACCTATCCAAGAAGTTCCCAGAGAAGAAATGGCTCAAGCTTATCCACATTCC
ATTGATCTTCTCAGCAGTGAGCCCGATGCCACAAGCCAAGGCTGTGCATTACTGGTCATG
GACCATCGTCGGGGTTGTTTTCAACTACTACATTTTCAGGAAGTTTAAAACTTGGTGGGC
GAGGCACAACTACATCCTCTTTGCGACGCTTGATGCAGGTACCGCGATCATGGGGGTGTT
GATATTCTTTGCGTTTCAGAACAATGATATAAGCATACCTGATTGGTGGGGGCTTGAGAA
CTCGGACCATTGCCCTCTAGCGCATTGTCCCACAGCTAAAGGGGTTGTTGTTGAAGGCTG
TCCTGTGTTTTAAGGATTGATGCAGATCAAAGTGTTGTTGTTGCCCCAAAAGGGTTAATG
TTGATATTTTAAGAAAATGTAAAGCATTATACTTGGTTTCATGTTCTTTAGGTTTTTAAC
CATGTACTTTTCAATCTTAAGAGCAAATCAAGCATAGCTTTCGTTCCAAACTATATAATC
AAAATGCAACC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL6686Contig1 1201 2 2 U
GAAGGAGTGGCTGGCTGAGATTAACTTTCTTGGTAACCTTGTCCACCCAAGCCTGGTTAA
ATTGGTGGGATATTGCATGGAAGAAGATCAGAGGCTTCTTGTTTATGAGTTCATGCCTCG
AGGGAGTCTTGAGAATCATCTTTTCAGAAGGACTTTACCTCTCCCTTGGTCTGTGAGAAT
GAAAATAGCGCTTGGTGCAGCTAAAGGTCTTGCTTTCTTCATGAGGAAGCTGAGAAGCCT
GTCATTTACCGCGATTTCAAAACATTCAACATCTTACTAGACGCGGAATATAACTCAAAG
CTCTCTGATTTTGGGCTTGCCAAAGATGCACCAGACGAGAAGAAATCACATGTATCAACC
AGAGTCATGGGAACATATGGTTATGCAGCTCCTGAATATGTAATGACTGGACATTTGACA
ACGAAGAGTGATGTATACAGCTTCGGAGTAGTTCTACTTGAGATACTAACTGGACGAAGA
GCCGTTGATAAAAGCCGTCCCAACGGTGAACAGAACTTGGTGGAATGGGTGAAACCTCAT
CTTCTAGACAAAAAGAAGTTTTACAGACTGCTGGATCCTCGCTTAGAGGGTCATTTCTCG
ATCAAGGGAGCTCAGAAAGCCACGCAAGTAGCCGCACAGTGTCTTAACCGAGACTCTAAA
GCTAGACCGAAGATGAGTGAAGTTGTCGAAGCGTTAAAGCCGTTGCCAAGTCTTAAAGAC
TTTGCTAGCTTTTTTACATCTTTCCAGACGATGCAGCCTGTTGCCAAGAACGGTGTCAGG
ACACAGGGAGGAGGAGGGTTTGTGTCGAGAAATGGACAGCCTTTGAGGAGTTTGTTTAGT
TTAAACCTGCCTCAAGCTTCGCCTTATCGGAATGCGAGGCAATAACCAAAGCCTACTAAA
GGGAAAGAGCAATGACTCAAGTATAGGAATTAGTTTGTTTGACCCGGCTTGAAGCTGGAT
GTTCCAGGCTTCCAGGCTTCATGTTGCGTCGATTCTTTCTTGGTTCAAGAACAAAAAGAG
ATGGTCTGTGGATGGATCCTGGTTTGTGTTCTTTGAGTGGATGGAACTCAGGAAAAAATA
TCTTTGGTCCTGAAGGTCTAAAGATTTTGATGTGTGTGTTTTTTAATGTGTAGAAGAAAT
GTAAAGGTTGGGAGTGTAAAGTTCTTGCAAGGATAATATAAAACCTGTTTGTCTGTAAAA
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2CB18TF U 1
AF RR2CB18JQ C 428
BS 1 677 RR2CB18TF
BS 678 1201 RR2CB18JQ

RD RR2CB18TF 677 0 0
GAAGGAGTGGCTGGCTGAGATTAACTTTCTTGGTAACCTTGTCCACCCAAGCCTGGTTAA
ATTGGTGGGATATTGCATGGAAGAAGATCAGAGGCTTCTTGTTTATGAGTTCATGCCTCG
AGGGAGTCTTGAGAATCATCTTTTCAGAAGGACTTTACCTCTCCCTTGGTCTGTGAGAAT
GAAAATAGCGCTTGGTGCAGCTAAAGGTCTTGCTTTCTTCATGAGGAAGCTGAGAAGCCT
GTCATTTACCGCGATTTCAAAACATTCAACATCTTACTAGACGCGGAATATAACTCAAAG
CTCTCTGATTTTGGGCTTGCCAAAGATGCACCAGACGAGAAGAAATCACATGTATCAACC
AGAGTCATGGGAACATATGGTTATGCAGCTCCTGAATATGTAATGACTGGACATTTGACA
ACGAAGAGTGATGTATACAGCTTCGGAGTAGTTCTACTTGAGATACTAACTGGACGAAGA
GCCGTTGATAAAAGCCGTCCCAACGGTGAACAGAACTTGGTGGAATGGGTGAAACCTCAT
CTTCTAGACAAAAAGAAGTTTTACAGACTGCTGGATCCTCGCTTAGAGGGTCATTTCTCG
ATCAAGGGAGCTCAGAAAGCCACGCAAGTAGCCGCACAGTGTCTTAACCGAGACTCTAAA
GCTAGACCGAAGATGAG

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2CB18JQ 774 0 0
GTGATGTATACAGCTTCGGAGTAGT*CTACTTGAGATACTAACTGGACGAAGAGCCGTTG
ATAAAAGCCGTCCCAACGGTGAACAGAACTTGGTGGAATGGGTGAAACCTCATCTTCTAG
ACAAAAAGAAGTTTTACAGACTGCTGGATCCTCGCTTAGAGGGTCATTTCTCGATCAAGG
GAGCTCAGAAAGCCACGCAAGTAGCCGCACAGTGTCTTAACCGAGACTCTAAAGCTAGAC
CGAAGATGAGTGAAGTTGTCGAAGCGTTAAAGCCGTTGCCAAGTCTTAAAGACTTTGCTA
GCTTTTTTACATCTTTCCAGACGATGCAGCCTGTTGCCAAGAACGGTGTCAGGACACAGG
GAGGAGGAGGGTTTGTGTCGAGAAATGGACAGCCTTTGAGGAGTTTGTTTAGTTTAAACC
TGCCTCAAGCTTCGCCTTATCGGAATGCGAGGCAATAACCAAAGCCTACTAAAGGGAAAG
AGCAATGACTCAAGTATAGGAATTAGTTTGTTTGACCCGGCTTGAAGCTGGATGTTCCAG
GCTTCCAGGCTTCATGTTGCGTCGATTCTTTCTTGGTTCAAGAACAAAAAGAGATGGTCT
GTGGATGGATCCTGGTTTGTGTTCTTTGAGTGGATGGAACTCAGGAAAAAATATCTTTGG
TCCTGAAGGTCTAAAGATTTTGATGTGTGTGTTTTTTAATGTGTAGAAGAAATGTAAAGG
TTGGGAGTGTAAAGTTCTTGCAAGGATAATATAAAACCTGTTTGTCTGTAAAAA

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL6687Contig1 880 2 4 U
TTTTTACTTTGCCTTCTTCTCGCTCTCATTTCTCGTCTTCATCGCCGTCAATTCTGAAAT
GATCGGAGTATTCCGCAGATCTTCCTTGCCGTCGAGGCATACTATCTCCGCCGCGCTGAG
ATCTTGTGATTCCGGTCTCTCCCAGCATTTCACTTCAGCCGCTACCGGAGCCTCCGCGAA
GCTTGATCCGATTGTAAATGGATCTAATCTCTCCTCCGCATCGTCTCCGAGCTCGTTTGG
TATCAGAGCAAGAGACTTCCACATTAGTTCTGAGCCGTCTATGGTTTCCCCCGCGAGGAT
CTCGTTTCAAGGCTACGCCACTGAGCGTGAAACTAGCGTCGCAGATTCAATCAAAATCAC
TCCAGAGAATGTCAAACCATTGACCAAGAAGAAAGAAGGAGAAGAAAGCACATCGAAGAT
CAAAGGAACGAGGATCTGCATTGCGATCCGTTCCTTCGATAACCCGGAGAAGGAAGCTTG
GTGTCTCCCTCCTCACAGTCGCTACGCCGCGATGCCCGACACGAGGACCTTGTACACGGT
GCTTCGTTCCCCTCACGTCGACAAGAAGTCGAGGGAGCAGTTCGAGATGAGGTTCAAGAA
ACGGTTTCTTGTCATCAAAGCTCAGAGCCATGAGCTTAACAAGAAGCTGTTTTGGTTGAA
GCGTTACCGTATCCTCGGTGCTCAGTACGAGCTTCAGTTCCATTGCAAGACTCGGTTGGA
TATGTCTCCCGTGTTAGCCAGCATCAAAGGCTCCACCATTGGTGGTCAATGAGACAATGC
TTGAAGAGATCGTTTTTTGAGAAGTTGGGGTTTTGATCCGATCCTGTAATAATGCCTGAA
TCTTACGTCGGATTCAGTAAAGAATTCAGCTATACATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR10TF U 1
AF RR2CR10JQ C 274
BS 1 677 RR2CR10TF
BS 678 678 RR2CR10JQ
BS 679 695 RR2CR10TF
BS 696 880 RR2CR10JQ

RD RR2CR10TF 695 0 0
TTTTTACTTTGCCTTCTTCTCGCTCTCATTTCTCGTCTTCATCGCCGTCAATTCTGAAAT
GATCGGAGTATTCCGCAGATCTTCCTTGCCGTCGAGGCATACTATCTCCGCCGCGCTGAG
ATCTTGTGATTCCGGTCTCTCCCAGCATTTCACTTCAGCCGCTACCGGAGCCTCCGCGAA
GCTTGATCCGATTGTAAATGGATCTAATCTCTCCTCCGCATCGTCTCCGAGCTCGTTTGG
TATCAGAGCAAGAGACTTCCACATTAGTTCTGAGCCGTCTATGGTTTCCCCCGCGAGGAT
CTCGTTTCAAGGCTACGCCACTGAGCGTGAAACTAGCGTCGCAGATTCAATCAAAATCAC
TCCAGAGAATGTCAAACCATTGACCAAGAAGAAAGAAGGAGAAGAAAGCACATCGAAGAT
CAAAGGAACGAGGATCTGCATTGCGATCCGTTCCTTCGATAACCCGGAGAAGGAAGCTTG
GTGTCTCCCTCCTCACAGTCGCTACGCCGCGATGCCCGACACGAGGACCTTGTACACGGT
GCTTCGTTCCCCTCACGTCGACAAGAAGTCGAGGGAGCAGTTCGAGATGAGGTTCAAGAA
ACGGTTTCTTGTCATCAAAGCTCAGAGCCATGAGCTTAACAAGAAGCTGTTTTGGTTGAA
GCGTTACCGTATCCTCG*TGCTCAGTACGAGCTTC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2CR10JQ 607 0 0
GCCGTCTATGGTTTCCCCCGCGAGGATCTCGTTTCAAGGCTACGCCACTGAGCGTGAAAC
TAGCGTCGCAGATTCAATCAAAATCACTCCAGAGAATGTCAAACCATTGACCAAGAAGAA
AGAAGGAGAAGAAAGCACATCGAAGATCAAAGGAACGAGGATCTGCATTGCGATCCGTTC
CTTCGATAACCCGGAGAAGGAAGCTTGGTGTCTCCCTCCTCACAGTCGCTACGCCGCGAT
GCCCGACACGAGGACCTTGTACACGGTGCTTCGTTCCCCTCACGTCGACAAGAAGTCGAG
GGAGCAGTTCGAGATGAGGTTCAAGAAACGGTTTCTTGTCATCAAGGCTCAGAGCCATGA
GCTTAACAAGAAGCTGTTTTGGTTGAAGCGTTACCGTATCCTCGGTGCTCAGTACGAGCT
TCAGTTCCATTGCAAGACTCGGTTGGATATGTCTCCCGTGTTAGCCAGCATCAAAGGCTC
CACCATTGGTGGTCAATGAGACAATGCTTGAAGAGATCGTTTTTTGAGAAGTTGGGGTTT
TGATCCGATCCTGTAATAATGCCTGAATCTTACGTCGGATTCAGTAAAGAATTCAGCTAT
ACATCAC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL6688Contig1 868 2 4 U
GGTACCCTCTTTGTCAATATCATTGAACTGGAAGAAAGTTGAAGGCCAAGAAAGTGACTT
TAAGGATGCTGTTGGTGTCTGTTTACCTTTGATAAACGCAGCAATCAGAGACATTCAGAA
AGGAGTTTTCCCTAAAGATTGCTCTCTCAACGTAGAAATTCCAACATCACCCTCATCAAA
CAAGGGGTTTAAGGTAACAAAACAAAGCATGTGGAGGCAGAGTCCTAGCTGGCAAGCTGT
TTCAGCTAACCGTCATCCTGGTGCTGGAAATTTCATGTCCAACCAGCAAAGCCTAGGAGC
TCAACTTGCCCAGCTTGGTAGAGATGCTTCAGTTGCTGGGGCTGCTCGCCGTTTTACCAC
ACAGAGGAAGAGTATCGTCGAGATTGAATCGGTTGGTGTTGCTGGTAAAACTGATAGCCG
TGTTAAGAAACACTTCCGCCTAGAGTTTGTGGCCAAAGAACAAGAACATACAGATGACGA
TTTGGATATCAAGGCTCTAGAGGATGGTTTTGTTTCTGTGACTCCACTATCTCTACTTCC
AAACATAGATTCAGAAACTCAAGCCGCGGCATCAGAATGGATTTGCAAATACCTTAACGC
TCATCAATGAAAAAGGGTGATGTGGCCAAAACTCTGCCTACACATCTGGTAACTGGATTC
TCTGCATTTGTTTGTTCGTGTGGTCATGTTGTCATTTTAATCCTTTTAGTTTATTTGTTT
ATTTGATCCCCGCCTAGAAGTCTCGTGGAGTTTTTTTTTTGGCTCGTTTGTTTGTTTGTT
TGTTTTGTCAGTAGCTGTTTGGGAACGCTTACTTTTGTAATTGGCAAAAAGGGTTGGTCT
GGTTTGAATGTGAAACGGTGGCTATAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D722TF U 1
AF RR2D722JQ C 136
BS 1 730 RR2D722TF
BS 731 731 RR2D722JQ
BS 732 752 RR2D722TF
BS 753 868 RR2D722JQ

RD RR2D722TF 752 0 0
GGTACCCTCTTTGTCAATATCATTGAACTGGAAGAAAGTTGAAGGCCAAGAAAGTGACTT
TAAGGATGCTGTTGGTGTCTGTTTACCTTTGATAAACGCAGCAATCAGAGACATTCAGAA
AGGAGTTTTCCCTAAAGATTGCTCTCTCAACGTAGAAATTCCAACATCACCCTCATCAAA
CAAGGGGTTTAAGGTAACAAAACAAAGCATGTGGAGGCAGAGTCCTAGCTGGCAAGCTGT
TTCAGCTAACCGTCATCCTGGTGCTGGAAATTTCATGTCCAACCAGCAAAGCCTAGGAGC
TCAACTTGCCCAGCTTGGTAGAGATGCTTCAGTTGCTGGGGCTGCTCGCCGTTTTACCAC
ACAGAGGAAGAGTATCGTCGAGATTGAATCGGTTGGTGTTGCTGGTAAAACTGATAGCCG
TGTTAAGAAACACTTCCGCCTAGAGTTTGTGGCCAAAGAACAAGAACATACAGATGACGA
TTTGGATATCAAGGCTCTAGAGGATGGTTTTGTTTCTGTGACTCCACTATCTCTACTTCC
AAACATAGATTCAGAAACTCAAGCCGCGGCATCAGAATGGATTTGCAAATACCTTAACGC
TCATCAATGAAAAAGGGTGATGTGGCCAAAACTCTGCCTACACATCTGGTAACTGGATTC
TCTGCATTTGTTTGTTCGTGTGGTCATGTTGTCATTTTAATCCTTTTAGTTTATTTGTTT
ATTTGATCCC*GCCTAGAAGTCTCGTGGAGTT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2D722JQ 733 0 0
AGATTGCTCTCTCAACGTAGAAATTCCAACATCACCCTCATCAAACAAGGGGTTTAAGGT
AACAAAACAAAGCATGTGGAGGCAGAGTCCTAGCTGGCAAGCTGTTTCAGCTAACCGTCA
TCCTGGTGCTGGAAATTTCATGTCCAACCAGCAAAGCCTAGGAGCTCAACTTGCCCAGCT
TGGTAGAGATGCTTCAGTTGCTGGGGCTGCTCGCCGTTTTACCACACAGAGGAAGAGTAT
CGTCGAGATTGAATCGGTTGGTGTTGCTGGTAAAACTGATAGCCGTGTTAAGAAACACTT
CCGCCTAGAGTTTGTGGCCAAAGAACAAGAACATACAGATGACGATTTGGATATCAAGGC
TCTAGAGGATGGTTTTGTTTCTGTGACTCCACTATCTCTACTTCCAAACATAGATTCAGA
AACTCAAGCCGCGGCATCAGAATGGATTTGCAAATACCTTAACGCTCATCAATGAAAAAG
GGTGATGTGGCCAAAACTCTGCCTACACATCTGGTAACTGGATTCTCTGCATTTGTTTGT
TCGTGTGGTCATGTTGTCATTTTAATCCTTTTAGTTTATTTGTTTATTTGATCCCCGCCT
AGAAGTCTCGTGGAGTTTTTTTTTTGGCTCGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGTCAGTAGC
TGTTTGGGAACGCTTACTTTTGTAATTGGCAAAAAGGGTTGGTCTGGTTTGAATGTGAAA
CGGTGGCTATAGG

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL6689Contig1 789 2 4 U
GTCTGCAAACAGATGACAAACGCAGCGCTCATCACCGTGGCGAAAAACTGTCCAAACTTC
ATCCGGTTCAGGCTATGCATCCTAGAGCCGAACAAACCTGACCACATCACATCTCAGTCG
CTAGACGAAGGCTTTGGTGCGATAGTACAAGCCTGCAAGGGACTAAGAAGACTCTCTGTC
TCCGGTCTTTTAACAGACAAAGTCTTCCTCTACATCGGCATGTACGCAGAACAGCTTGAG
ATGTTGTCAATAGCCTTTGCGGGGGACACGGATAAAGGAATGTTGGATGTGTTGAACGGA
TGCAAGAAGCTGAGGAAGCTGGAGATTAGGGATAGTCCGTTTGGGAACGCTGCGCTTCTT
GCTGATGTCGGTAAGTACGAAACAATGCGGTCCCTTTGGATGTCGTCTTGTGAAGTAACG
CTCGGCGGATGCAAGAGGCCCGCGAGGAATGCGCCTTGGCTTAACGTGGAGATCATCAAT
GAGAATGAGAATGAGAATGGGAGGATGGAGAGGAATGAAGAAGATGAAAGAGAGAAGGTT
GATAGACTTTACCTTTACAGAACCGTGGTTGGGACCAGAAAGGACGCACCACCATGTGTT
ACCATTCTTTAGTCTCTCTCCCAACGTCTCACTCCATCTCTGCATCTCTCATGCTTCTTG
ATGTCGTTTAGTTAGCTCATTCTTCAATGTACTTTTTGTTTCAGACAAGAAGCAGTGTTT
TGGAACCTGTTTTTTTTTTGGGCAATTCTTAGTTGCGTGGTACTTGCTTGTTTTGATTTG
TGTTAATAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK51TF U 1
AF RR2EK51JQ C 1
BS 1 582 RR2EK51TF
BS 583 583 RR2EK51JQ
BS 584 617 RR2EK51TF
BS 618 789 RR2EK51JQ

RD RR2EK51TF 617 0 0
GTCTGCAAACAGATGACAAACGCAGCGCTCATCACCGTGGCGAAAAACTGTCCAAACTTC
ATCCGGTTCAGGCTATGCATCCTAGAGCCGAACAAACCTGACCACATCACATCTCAGTCG
CTAGACGAAGGCTTTGGTGCGATAGTACAAGCCTGCAAGGGACTAAGAAGACTCTCTGTC
TCCGGTCTTTTAACAGACAAAGTCTTCCTCTACATCGGCATGTACGCAGAACAGCTTGAG
ATGTTGTCAATAGCCTTTGCGGGGGACACGGATAAAGGAATGTTGGATGTGTTGAACGGA
TGCAAGAAGCTGAGGAAGCTGGAGATTAGGGATAGTCCGTTTGGGAACGCTGCGCTTCTT
GCTGATGTCGGTAAGTACGAAACAATGCGGTCCCTTTGGATGTCGTCTTGTGAAGTAACG
CTCGGCGGATGCAAGAGGCCCGCGAGGAATGCGCCTTGGCTTAACGTGGAGATCATCAAT
GAGAATGAGAATGAGAATGGGAGGATGGAGAGGAATGAAGAAGATGAAAGAGAGAAGGTT
GATAGACTTTACCTTTACAGAACCGTGGTTGGGACCAGAAAG*ACGCACCACCATGTGTT
ACCATTCTTTAGTCTCT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2EK51JQ 789 0 0
GTCTGCAAACAGATGACAAACGCAGCGCTCATCACCGTGGCGAAAAACTGTCCAAACTTC
ATCCGGTTCAGGCTATGCATCCTAGAGCCGAACAAACCTGACCACATCACATCTCAGTCG
CTAGACGAAGGCTTTGGTGCGATAGTACAAGCCTGCAAGGGACTAAGAAGACTCTCTGTC
TCCGGTCTTTTAACAGACAAAGTCTTCCTCTACATCGGCATGTACGCAGAACAGCTTGAG
ATGTTGTCAATAGCCTTTGCGGGGGACACGGATAAAGGAATGTTGGATGTGTTGAACGGA
TGCAAGAAGCTGAGGAAGCTGGAGATTAGGGATAGTCCGTTTGGGAACGCTGCGCTTCTT
GCTGATGTCGGTAAGTACGAAACAATGCGGTCCCTTTGGATGTCGTCTTGTGAAGTAACG
CTCGGCGGATGCAAGAGGCCCGCGAGGAATGCGCCTTGGCTTAACGTGGAGATCATCAAT
GAGAATGAGAATGAGAATGGGAGGATGGAGAGGAATGAAGAAGATGAAAGAGAGAAGGTT
GATAGACTTTACCTTTACAGAACCGTGGTTGGGACCAGAAAGGACGCACCACCATGTGTT
ACCATTCTTTAGTCTCTCTCCCAACGTCTCACTCCATCTCTGCATCTCTCATGCTTCTTG
ATGTCGTTTAGTTAGCTCATTCTTCAATGTACTTTTTGTTTCAGACAAGAAGCAGTGTTT
TGGAACCTGTTTTTTTTTTGGGCAATTCTTAGTTGCGTGGTACTTGCTTGTTTTGATTTG
TGTTAATAC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL6690Contig1 637 2 2 U
GGATAAACTTTCGTACGCTTCCCTCCCTCTCCGCTTTCAAATTCACAGAAGAAAAAAATG
GCGGGTCGTGGAAAGACTCTCGGATCTGGTGTTGCTAAGAAGGCAACATCTCGGAGTAGC
AAGGCGGGTCTCCAGTTCCCCGTCGGTCGTATCGCCCGGTTCTTGAAAAACGGCAAGTAC
GCCGAACGTGTCGGAGCCGGAGCTCCGGTTTACTTGGCCGCCGTACTCGAATACCTCGCC
GCAGAGGTTTTAGAATTGGCTGGTAACGCGGCGAGGGACAACAAGAAGACAAGAATCGTG
CCGCGTCATATTCAGTTGGCGGTGAGGAACGACGAGGAGCTGAGCAAGCTTCTTGGTGAC
GTGACGATTGCTAACGGAGGTGTGATGCCGAACATTCACAATCTTCTTCTTCCCAAGAAG
GCTGGTGGTGGTGCTTCCAAACCTTCCGGTGATGATGATGAATAGATCTCAGTTTCAGTA
TCTGTAATGTGTAGATTTAGATTAGTCTCTTTGTTTTCGTCCTCTTGTTGTAGATTGATT
AGTTATATCGCTTTTGTTTTGTAAACGTTTGCAGTGTGTTTCTGTTGTACTGTTGGATTA
AATCTGTCTGTGGTCTGAAAAGAGCGATCTTGAACTC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B001JQ C 1
AF RR2B001TF U 1
BS 1 3 RR2B001JQ
BS 4 637 RR2B001TF

RD RR2B001JQ 637 0 0
GGATAAACTTTCGTACGCTTCCCTCCCTCTCCGCTTTCAAATTCACAGAAGAAAAAAATG
GCGGGTCGTGGAAAGACTCTCGGATCTGGTGTTGCTAAGAAGGCAACATCTCGGAGTAGC
AAGGCGGGTCTCCAGTTCCCCGTCGGTCGTATCGCCCGGTTCTTGAAAAACGGCAAGTAC
GCCGAACGTGTCGGAGCCGGAGCTCCGGTTTACTTGGCCGCCGTACTCGAATACCTCGCC
GCAGAGGTTTTAGAATTGGCTGGTAACGCGGCGAGGGACAACAAGAAGACAAGAATCGTG
CCGCGTCATATTCAGTTGGCGGTGAGGAACGACGAGGAGCTGAGCAAGCTTCTTGGTGAC
GTGACGATTGCTAACGGAGGTGTGATGCCGAACATTCACAATCTTCTTCTTCCCAAGAAG
GCTGGTGGTGGTGCTTCCAAACCTTCCGGTGATGATGATGAATAGATCTCAGTTTCAGTA
TCTGTAATGTGTAGATTTAGATTAGTCTCTTTGTTTTCGTCCTCTTGTTGTAGATTGATT
AGTTATATCGCTTTTGTTTTGTAAACGTTTGCAGTGTGTTTCTGTTGTACTGTTGGATTA
AATCTGTCTGTGGTCTGAAAAGAGCGATCTTGAACTC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2B001TF 637 0 0
GGG
TAAACTTTCGTACGCTTCCCTCCCTCTCCGCTTTCAAATTCACAGAAGAAAAAAATGGCG
GGTCGTGGAAAGACTCTCGGATCTGGTGTTGCTAAGAAGGCAACATCTCGGAGTAGCAAG
GCGGGTCTCCAGTTCCCCGTCGGTCGTATCGCCCGGTTCTTGAAAAACGGCAAGTACGCC
GAACGTGTCGGAGCCGGAGCTCCGGTTTACTTGGCCGCCGTACTCGAATACCTCGCCGCA
GAGGTTTTAGAATTGGCTGGTAACGCGGCGAGGGACAACAAGAAGACAAGAATCGTGCCG
CGTCATATTCAGTTGGCGGTGAGGAACGACGAGGAGCTGAGCAAGCTTCTTGGTGACGTG
ACGATTGCTAACGGAGGTGTGATGCCGAACATTCACAATCTTCTTCTTCCCAAGAAGGCT
GGTGGTGGTGCTTCCAAACCTTCCGGTGATGATGATGAATAGATCTCAGTTTCAGTATCT
GTAATGTGTAGATTTAGATTAGTCTCTTTGTTTTCGTCCTCTTGTTGTAGATTGATTAGT
TATATCGCTTTTGTTTTGTAAACGTTTGCAGTGTGTTTCTGTTGTACTGTTGGATTAAAT
CTGTCTGTGGTCTGAAAAGAGCGATCTTGAACTC

QA 4 637 4 637
DS 



AS 1 2

CO CL6691Contig1 819 2 2 U
GGAGCCATGTCTTCCGCTCTTATCCTCCGACCTTTCTTCTCTTCACTCACTCAAACCTGT
CAGACACCAATCTCCGCTCGAACTTCCGACCATCCACGCACTCTCTCACGTCGCGACGCC
CTCTCTCTCTCCTCTATATCTGTCCTCCTCTTCACTCTCTCTCCAACCGATCCAGCTCTC
GCCTTCGGAATCTCAGGACCTAAGGAATGGTTGAAAGATCAGAAGAAGAAGTCGTCGAGG
TTCTTGTTAGCTCCCATTGATGCTTCTCGCGAAAGCCTCCGCTCTGTTTATCTTTCTCTC
TCAACTAGAGAATCTGATTATACGGACAAAGATTTGGAGAGCCTTCAGAACCTGTTGAGG
TCTTCTGCAAGAGATTGTGTTCCTAAAGAGAGAAGCTCTCTTGTCGATTTTCAGTCTAAA
ACCGGAGTGGAGGTTTGCACATTCAAGCTTGTTCTGAAGAATGCTGCTTCATTGCTAGAT
GATAAGGACCCTGTCATTCTTGAAGCAGAGAACATACTAAATGATCTTGTTAGGTCATTT
GGTTCTCTCATCGTGCTTACGAATGGGATTGATATGAATCTTCCTTCTGATAGAAAAAAG
ATTGCTGATGCAGTTATGGAGTCGATCTCTGTTCTTGACAAGTTTGAGAAGAGTGTCAAG
GACTGCCTTGAGATCTGAGAGATGAAGTGTGTCTGCTCTTCTCTTCTTTTAAGGCAAATG
TGAAATCGTTATGGCTGTCTAGGGGTATCAACATTTTGTTACAGTAAGTGAGAGACGACA
TCTCTCGTTTATATTATAATATAAATCATCTTCTTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY44TF U 1
AF RR2DY44JQ C 419
BS 1 530 RR2DY44TF
BS 531 819 RR2DY44JQ

RD RR2DY44TF 530 0 0
GGAGCCATGTCTTCCGCTCTTATCCTCCGACCTTTCTTCTCTTCACTCACTCAAACCTGT
CAGACACCAATCTCCGCTCGAACTTCCGACCATCCACGCACTCTCTCACGTCGCGACGCC
CTCTCTCTCTCCTCTATATCTGTCCTCCTCTTCACTCTCTCTCCAACCGATCCAGCTCTC
GCCTTCGGAATCTCAGGACCTAAGGAATGGTTGAAAGATCAGAAGAAGAAGTCGTCGAGG
TTCTTGTTAGCTCCCATTGATGCTTCTCGCGAAAGCCTCCGCTCTGTTTATCTTTCTCTC
TCAACTAGAGAATCTGATTATACGGACAAAGATTTGGAGAGCCTTCAGAACCTGTTGAGG
TCTTCTGCAAGAGATTGTGTTCCTAAAGAGAGAAGCTCTCTTGTCGATTTTCAGTCTAAA
ACCGGAGTGGAGGTTTGCACATTCAAGCTTGTTCTGAAGAATGCTGCTTCATTGCTAGAT
GATAAGGACCCTGTCATTCTTGAAGCAGAGAACATACTAAATGATCTTGT

QA 1 530 1 530
DS 

RD RR2DY44JQ 401 0 0
AAACCGGAGTGGAGGTTTGCACATTCAAGCTTGTTCTGAAGAATGCTGCTTCATTGCTAG
ATGATAAGGACCCTGTCATTCTTGAAGCAGAGAACATACTAAATGATCTTGTTAGGTCAT
TTGGTTCTCTCATCGTGCTTACGAATGGGATTGATATGAATCTTCCTTCTGATAGAAAAA
AGATTGCTGATGCAGTTATGGAGTCGATCTCTGTTCTTGACAAGTTTGAGAAGAGTGTCA
AGGACTGCCTTGAGATCTGAGAGATGAAGTGTGTCTGCTCTTCTCTTCTTTTAAGGCAAA
TGTGAAATCGTTATGGCTGTCTAGGGGTATCAACATTTTGTTACAGTAAGTGAGAGACGA
CATCTCTCGTTTATATTATAATATAAATCATCTTCTTCTTG

QA 1 401 1 401
DS 



AS 1 2

CO CL6692Contig1 612 2 1 U
GGAGGTATCGCCGACGAGTGAACTGTTACCAAAGATCTTACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATTAAGCCTGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGATCGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAA
AAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGCCGAG
AAACACTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGTCTTGTCGACTACATTATC
TCTGGACCAGTCGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCCGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCT
ATTGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGTGACTCCGTGGAGAGTGCTAACAAGGAA
GCTGCGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGATC
TACGAATGATTCTATCGTGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTTTCCTTCGGTTATGAA
ACTCAAAACATGTTTCTTCTGGCTTTGTTACTTCTGCCTTCTTTCGTGGTAATCTATGAA
GACCTATCTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FP47JQ C 1
AF RR2FP47TF U 1
BS 1 612 RR2FP47TF

RD RR2FP47JQ 612 0 0
GGAGGTATCGCCGACGAGTGAACTGTTACCAAAGATCTTACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATTAAGCCTGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGATCGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAA
AAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGCCGAG
AAACACTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGTCTTGTCGACTACATTATC
TCTGGACCAGTCGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCCGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCT
ATTGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGTGACTCCGTGGAGAGTGCTAACAAGGAA
GCTGCGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGATC
TACGAATGATTCTATCGTGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTTTCCTTCGGTTATGAA
ACTCAAAACATGTTTCTTCTGGCTTTGTTACTTCTGCCTTCTTTCGTGGTAATCTATGAA
GACCTATCTTGC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2FP47TF 612 0 0
GGAGGTATCGCCGACGAGTGAACTGTTACCAAAGATCTTACAATGGAGCAAACTTTCATC
ATGATTAAGCCTGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGATCGGTGAAATCATCTGCAGATTCGAA
AAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGATGATCACTGTTGACCGTCCTTTCGCCGAG
AAACACTACCAAGACTTGTCTGCCAAGCCATTCTTCAACGGTCTTGTCGACTACATTATC
TCTGGACCAGTCGTTGCTATGATCTGGGAGGGGAAGAATGTTGTCTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCGACCAACCCCGCTGCTTCCGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTATGCT
ATTGACATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGTGACTCCGTGGAGAGTGCTAACAAGGAA
GCTGCGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGATC
TACGAATGATTCTATCGTGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTTTCCTTCGGTTATGAA
ACTCAAAACATGTTTCTTCTGGCTTTGTTACTTCTGCCTTCTTTCGTGGTAATCTATGAA
GACCTATCTTGC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6695Contig1 633 2 7 U
GGGAGCCGACAGAGGAACGAACGAATCGAACTCAAAAGCTCTGCAGAGAGAGAGAGGGAT
CTTCGTTTAGATCCCCTGGAGGAATCGCGACAATGGCGGAAAAGGCAGTGACCATCAGAA
CCCGTAAATTCATGACCAACAGACTTCTCTCAAGGAAGCAGTTCGTTATTGATGTTCTTC
ACCCTGGAAGAGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTGAAGGAGAAGCTAGCAAGGATGTACG
AGGTCAAGGACCCAAACGCCATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACCCATTTCGGAGGTGGTA
AATCATCCGGGTTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGCGCTAAGAAGTTCGAACCCA
AGTACAGACTTATCAGGAATGGTCTTGACACCAAGATAGAGAAATCAAGGAAACAAATTA
AGGAAAGGAAGAACCGTGCCAAGAAGATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGATC
CCAAGAAGAAGTGAGAGATCACAAGCTAGTATCAACCATTTTCTGTTCTTCATAATCGAA
CTTTTATGTTCATCTTAAAGTTCTTTGTTTGCAATTAGATTTTCTCTGCAACTAAGACAT
CTAAACATAATCAAAGGTTTTTGTTCAATACTA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2EN42TF U 1
AF RR2F302TF U 2
BS 1 56 RR2EN42TF
BS 57 58 RR2F302TF
BS 59 278 RR2EN42TF
BS 279 279 RR2F302TF
BS 280 462 RR2EN42TF
BS 463 463 RR2F302TF
BS 464 633 RR2EN42TF

RD RR2EN42TF 633 0 0
GGGAGCCGACAGAGGAACGAACGAATCGAACTCAAAAGCTCTGCAGAGAGAGAGAG**AT
CTTCGTTTAGATCCCCTGGAGGAATCGCGACAATGGCGGAAAAGGCAGTGACCATCAGAA
CCCGTAAATTCATGACCAACAGACTTCTCTCAAGGAAGCAGTTCGTTATTGATGTTCTTC
ACCCTGGAAGAGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTGAAGGAGAAGCTAGCAAGGATGTACG
AGGTCAAGGACCCAAACGCCATCTTTGTTTTCAAATTCGGAACCCATTTCGGAGGTGGTA
AATCATCCGGGTTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGCGCTAAGAAGTTCGAACCCA
AGTACAGACTTATCAGGAATGGTCTTGACACCAAGATAGAGAAATCAAGGAAACAAATTA
AGGAAAGGAAGAACCGTGCCAAGAAGATCCGTGGTGTTAAGATGACCAAGGCTGGTGATC
CCAAGAAGAAGTGAGAGATCACAAGCTAGTATCAACCATTTTCTGTTCTTCATAATCGAA
CTTTTATGTTCATCTTAAAGTTCTTTGTTTGCAATTAGATTTTCTCTGCAACTAAGACAT
CTAAACATAATCAAAGGTTTTTGTTCAATACTA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2F302TF 628 0 0
GGAGCCGACAGAGGAACGAACGAATCGAACTCAAAAGCTCTGCAGAGAGAGAGAGGGATC
TTCGTTTAGATCCCCTGGAGGAATCGCGACAATGGCGGAAAAGGCAGTGACCATCAGAAC
CCGTAAATTCATGACCAACAGACTTCTCTCAAGGAAGCAGTTCGTTATTGATGTTCTTCA
CCCTGGAAGAGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTGAAGGAGAAGCTAGCAAGGATGTACGA
GGTCAAGGACCCAAACGCCATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACCCATTTCGGAGGTGGTAA
ATCATCCGGGTTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGCGCTAAGAAGTTCGAACCCAA
GTACAGACTTATCAGGAATGGTCTTGACACCAAGATAGAGAAATCAAGGAAACAAATTAA
GGAAAGGAAGAACCGTGCCAAGAAGATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGATCC
CAAGAAGAAGTGAGAGATCACAAGCTAGTATCAACCATTTTCTGTTCTTCATAATCGAAC
TTTTATGTTCATCTTAAAGTTCTTTGTTTGCAATTAGATTTTCTCTGCAACTAAGACATC
TAAACATAATCAAAGGTTTTTGTTCAAT

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL6696Contig1 751 2 2 U
AGGGGGATTCGGTGCTTCGTGCGTGCACCCTTCATCACCACCGTCCATTTCGCATCTCCA
CCATCCATCACCATCTCCGCATCTCATTCTCCATCGTCGTCAGTAGCAGCATCCAGAAGA
GAAATATCTCTATCCATTATAGCCGTCGCGTCTTCCATCATCTCCTCCTGTTACTTCTCT
TCTCCGGCCTCCGCTGAGTTCTCCGAAATCCCCGACTCCGGCGGAGTTAAGAGTCTCGAC
CTCCGTGTCGGCGACGGTGAAGTACCCATTGAAGGAGATCAGGTTGCAATACATTACTAT
GGGAGGTTGGCTGCGAAGCAAGGATGGAGATTTGATTCAACGTTATTCCGGGGATCGAAA
CAGCCGTGAGGTCGATGAAAGTAGGTGGGATTCGTCGGGTGGTTATACCTCCGTCTCAAG
GCTACCAGAATACATTACAAGAACCTCTCCCACCAAATTTCTTTGACAGACAAAGACTCT
TCACGACTATCTTTAACCCAACACGTCTTGCCAATGGAGAAGGTTCTACTCTTGGAACTC
TCGTTTTCGATATTGAACTTGTCAGTACCAGACGCCCTAACCGATGATTCATACAGCCAG
CCATTCATACTCTTCGGTTGTTTCTTGCTGGACGAGATATCACAAAATAAACAATTATAA
TTACACAAAGTCTTTAGTAAGCATTTGGATATGGTTAGTTGAATCTCGATGTGCACCTCA
CCCCCAATCTATGATTATAGTATTATCCACC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA57TF U 1
AF RR2EA57JQ C 2
BS 1 613 RR2EA57TF
BS 614 751 RR2EA57JQ

RD RR2EA57TF 613 0 0
AGGGGGATTCGGTGCTTCGTGCGTGCACCCTTCATCACCACCGTCCATTTCGCATCTCCA
CCATCCATCACCATCTCCGCATCTCATTCTCCATCGTCGTCAGTAGCAGCATCCAGAAGA
GAAATATCTCTATCCATTATAGCCGTCGCGTCTTCCATCATCTCCTCCTGTTACTTCTCT
TCTCCGGCCTCCGCTGAGTTCTCCGAAATCCCCGACTCCGGCGGAGTTAAGAGTCTCGAC
CTCCGTGTCGGCGACGGTGAAGTACCCATTGAAGGAGATCAGGTTGCAATACATTACTAT
GGGAGGTTGGCTGCGAAGCAAGGATGGAGATTTGATTCAACGTTATTCCGGGGATCGAAA
CAGCCGTGAGGTCGATGAAAGTAGGTGGGATTCGTCGGGTGGTTATACCTCCGTCTCAAG
GCTACCAGAATACATTACAAGAACCTCTCCCACCAAATTTCTTTGACAGACAAAGACTCT
TCACGACTATCTTTAACCCAACACGTCTTGCCAATGGAGAAGGTTCTACTCTTGGAACTC
TCGTTTTCGATATTGAACTTGTCAGTACCAGACGCCCTAACCGATGATTCATACAGCCAG
CCATTCATACTCT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2EA57JQ 750 0 0
A
GGGGATTCGGTGCTTCGTGCGTGCACCCTTCATCACCACCGTCCATTTCGCATCTCCACC
ATCCATCACCATCTCCGCATCTCATTCTCCATCGTCGTCAGTAGCAGCATCCAGAAGAGA
AATATCTCTATCCATTATAGCCGTCGCGTCTTCCATCATCTCCTCCTGTTACTTCTCTTC
TCCGGCCTCCGCTGAGTTCTCCGAAATCCCCGACTCCGGCGGAGTTAAGAGTCTCGACCT
CCGTGTCGGCGACGGTGAAGTACCCATTGAAGGAGATCAGGTTGCAATACATTACTATGG
GAGGTTGGCTGCGAAGCAAGGATGGAGATTTGATTCAACGTTATTCCGGGGATCGAAACA
GCCGTGAGGTCGATGAAAGTAGGTGGGATTCGTCGGGTGGTTATACCTCCGTCTCAAGGC
TACCAGAATACATTACAAGAACCTCTCCCACCAAATTTCTTTGACAGACAAAGACTCTTC
ACGACTATCTTTAACCCAACACGTCTTGCCAATGGAGAAGGTTCTACTCTTGGAACTCTC
GTTTTCGATATTGAACTTGTCAGTACCAGACGCCCTAACCGATGATTCATACAGCCAGCC
ATTCATACTCTTCGGTTGTTTCTTGCTGGACGAGATATCACAAAATAAACAATTATAATT
ACACAAAGTCTTTAGTAAGCATTTGGATATGGTTAGTTGAATCTCGATGTGCACCTCACC
CCCAATCTATGATTATAGTATTATCCACC

QA 2 750 2 750
DS 



AS 1 2

CO CL6697Contig1 682 2 2 U
TAACTTAATCTTTGTTAATACTAAAATAGTACAACAAGACTTTAGGCAGAGAACAAAGAT
CTCTGTTTCATGTTAGAAAATTTAATAAATAGAATATAATTTCAGATTCAAGTTTCTCTC
AAAAGAAGGCCCAGAATCCAACAACAAGCCCAACAACACCAATGAAGCTGGTGAGCTTAG
CAGCGCCACTAGTAGGCGCGACGGCGGGACTGTCAAACGGTGAAGGAGCCGGAGAGAAAG
CAGAGACATGAGGAATGTAAACGACAAGGCGAAGCTTCTGACCCTTTTGACAGTGACCTT
GCGTTCCACTGATGAAGTAGACCGGACCGGGTTGGTCTAGCTTCACCTTGGTGTTCCCAT
CTGCTGTGTAGCTGGCTTTCGGGCTCGTGGTGTTGCATTTCTCGTAAGCCTCTCTTGTCA
CTTGAAGAACTGAGTCTTTACCGGCTTCGTAGCTGAAAATGAGAAAGCCGCCGATTATGA
AACGAGACTTGTCGCCCCATTCGTTGAAAGAGTAGGAAGAGGAAGGAGGGATCTTCCAGC
CACCGGACTTTCCACCGACGGTGACCTCATTGGCGTTTACGGACAAGAAGAAAATGCAGA
GCAAGACAGTGACCAGAAGAGAAGAAGACATAGCTTACAAGTGAATTTAACACCTCAAAA
GTGTTAAGAGTGAGTTGAATCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AT87TF C 1
AF RR2AT87JQ U 2
BS 1 1 RR2AT87TF
BS 2 682 RR2AT87JQ

RD RR2AT87TF 682 0 0
TAACTTAATCTTTGTTAATACTAAAATAGTACAACAAGACTTTAGGCAGAGAACAAAGAT
CTCTGTTTCATGTTAGAAAATTTAATAAATAGAATATAATTTCAGATTCAAGTTTCTCTC
AGAAGAAGGCCCAGAATCCAACAACAAGCCCAACAACACCAATGAAGCTGGTGAGCTTAG
CAGCGCCACTAGTAGGCGCGACGGCGGGACTGTCAAACGGTGAAGGAGCCGGAGAGAAAG
CAGAGACATGAGGAATGTAAACGACAAGGCGAAGCTTCTGACCCTTTTGACAGTGACCTT
GCGTTCCACTGATGAAGTAGACCGGACCGGGTTGGTCTAGCTTCACCTTGGTGTTCCCAT
CTGCTGTGTAGCTGGCTTTCGGGCTCGTGGTGTTGCATTTCTCGTAAGCCTCTCTTGTCA
CTTGAAGAACTGAGTCTTTACCGGCTTCGTAGCTGAAAATGAGAAAGCCGCCGATTATGA
AACGAGACTTGTCGCCCCATTCGTTGAAAGAGTAGGAAGAGGAAGGAGGGATCTTCCAGC
CACCGGACTTTCCACCGACGGTGACCTCATTGGCGTTTACGGACAAGAAGAAAATGCAGA
GCAAGACAGTGACCAGAAGAGAAGAAGACATAGCTTACAAGTGAATTTAACACCTCAAAA
GTGTTAAGAGTGAGTTGAATCC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2AT87JQ 681 0 0
AACTTAATCTTTGTTAATACTAAAATAGTACAACAAGACTTTAGGCAGAGAACAAAGATC
TCTGTTTCATGTTAGAAAATTTAATAAATAGAATATAATTTCAGATTCAAGTTTCTCTCA
AAAGAAGGCCCAGAATCCAACAACAAGCCCAACAACACCAATGAAGCTGGTGAGCTTAGC
AGCGCCACTAGTAGGCGCGACGGCGGGACTGTCAAACGGTGAAGGAGCCGGAGAGAAAGC
AGAGACATGAGGAATGTAAACGACAAGGCGAAGCTTCTGACCCTTTTGACAGTGACCTTG
CGTTCCACTGATGAAGTAGACCGGACCGGGTTGGTCTAGCTTCACCTTGGTGTTCCCATC
TGCTGTGTAGCTGGCTTTCGGGCTCGTGGTGTTGCATTTCTCGTAAGCCTCTCTTGTCAC
TTGAAGAACTGAGTCTTTACCGGCTTCGTAGCTGAAAATGAGAAAGCCGCCGATTATGAA
ACGAGACTTGTCGCCCCATTCGTTGAAAGAGTAGGAAGAGGAAGGAGGGATCTTCCAGCC
ACCGGACTTTCCACCGACGGTGACCTCATTGGCGTTTACGGACAAGAAGAAAATGCAGAG
CAAGACAGTGACCAGAAGAGAAGAAGACATAGCTTACAAGTGAATTTAACACCTCAAAAG
TGTTAAGAGTGAGTTGAATCC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL6698Contig1 1115 2 2 U
GGGCATCTCTTCTTCTTCGTCGTCGTCTTCAACTTGCACCCGATTCCTTCCGGATCTTAC
GCGACGGCTCTGCTTCAGGGAGAGATGCTTGTATGATGTAGATCAAGGATATGTTATCAT
CTTCAGTGAGGTTTTAGTGTTGTGTTTAGAAGAAGAAGATCTGTTCCTCTGTTTTTCCTA
TTCACTGGTTTGGAATCCCCAGGTGAGCCTGAGAGTAGGTTTGGAGGAATTGATTTCAGA
ATCATGCCTTACTTTGCTCAGAGGCTTTACAATACCTGCAAGGCCTCATTCTCTTCAGAC
GGCCCAATCCCTGAGGAGGCTCTCCAGAAAGTTCGCAATGTCTTAGAGAAAATCAAGCCA
TCTGATGTTGGAATTGAGCAGGAAGCTCAACTGGCACGGACCAGGTCTGGTCCTCTCAAT
GGAAGTAGTAACCAGTCTCCCTCAGCAATTAAGTATCTTCATTTGCATGAGTGTGACAGT
TTCTCTATTGGAATTTTCTGTATGCCACCTTCCTCTATGATACCACTTCATAACCATCCG
GGAATGACTGTGGTAAGCAAGCTCATATATGGTTCAATGCATGTGAAGTCATATGACTGG
ATAGAGCCTGACAAGACCGAACCAGAAGATCCGTCACTAGGGAGACCCGCGAAACTGGTC
AAGGATACTGAGATGACGGCTCCAACCCCAGCAACAACGTTATACCCGAGAAGCGGGGGC
AACATTCATTGTTTCAAAGCAATCACCCATTGTGCTATTATTGATATCTTAGCTCCACCT
TACTCTTCAGACCATGATCGGCATTGTACTTACTTCCGGAAATCCAGAAGAGAAGACTTA
CCCGGTGAAGTAGAAGTGAATGGGGAAGTGGTAGCTGACGTGACTTGGCTTGAGGAATAT
CAACCGCCTGATGACTTTGTCATAAGACGAGTTCAGTACAGAGGTCCTGTTATTAGAACT
TGATTTCTATGTTGATTAATTCCTCTACATAATTGGTGAAGCAGGTTCAGATTTTTATTT
AGGGGGGGGTATTGAAACTAAAATTTGTGTGAAGTTTTAGAATTTTACAAGTTAAGAATT
TTTTAAAAGTTGAATGGATTTGATGAATCGGCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA79TF U 1
AF RR2GA79JQ C 514
BS 1 613 RR2GA79TF
BS 614 1115 RR2GA79JQ

RD RR2GA79TF 620 0 0
GGGCATCTCTTCTTCTTCGTCGTCGTCTTCAACTTGCACCCGATTCCTTCCGGATCTTAC
GCGACGGCTCTGCTTCAGGGAGAGATGCTTGTATGATGTAGATCAAGGATATGTTATCAT
CTTCAGTGAGGTTTTAGTGTTGTGTTTAGAAGAAGAAGATCTGTTCCTCTGTTTTTCCTA
TTCACTGGTTTGGAATCCCCAGGTGAGCCTGAGAGTAGGTTTGGAGGAATTGATTTCAGA
ATCATGCCTTACTTTGCTCAGAGGCTTTACAATACCTGCAAGGCCTCATTCTCTTCAGAC
GGCCCAATCCCTGAGGAGGCTCTCCAGAAAGTTCGCAATGTCTTAGAGAAAATCAAGCCA
TCTGATGTTGGAATTGAGCAGGAAGCTCAACTGGCACGGACCAGGTCTGGTCCTCTCAAT
GGAAGTAGTAACCAGTCTCCCTCAGCAATTAAGTATCTTCATTTGCATGAGTGTGACAGT
TTCTCTATTGGAATTTTCTGTATGCCACCTTCCTCTATGATACCACTTCATAACCATCCG
GGAATGACTGTGGTAAGCAAGCTCATATATGGTTCAATGCATGTGAAGTCATATGACTGG
ATAGAGCCTGACA
GACCGAA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2GA79JQ 602 0 0
TCTATGATACCACTTCATAACCATCCGGGAATGACTGTGGTAAGCAAGCTCATATATGGT
TCAATGCATGTGAAGTCATATGACTGGATAGAGCCTGACAAGACCGAACCAGAAGATCCG
TCACTAGGGAGACCCGCGAAACTGGTCAAGGATACTGAGATGACGGCTCCAACCCCAGCA
ACAACGTTATACCCGAGAAGCGGGGGCAACATTCATTGTTTCAAAGCAATCACCCATTGT
GCTATTATTGATATCTTAGCTCCACCTTACTCTTCAGACCATGATCGGCATTGTACTTAC
TTCCGGAAATCCAGAAGAGAAGACTTACCCGGTGAAGTAGAAGTGAATGGGGAAGTGGTA
GCTGACGTGACTTGGCTTGAGGAATATCAACCGCCTGATGACTTTGTCATAAGACGAGTT
CAGTACAGAGGTCCTGTTATTAGAACTTGATTTCTATGTTGATTAATTCCTCTACATAAT
TGGTGAAGCAGGTTCAGATTTTTATTTAGGGGGGGGTATTGAAACTAAAATTTGTGTGAA
GTTTTAGAATTTTACAAGTTAAGAATTTTTTAAAAGTTGAATGGATTTGATGAATCGGCG
CC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL6699Contig1 611 2 1 U
GAGAAAGAAGAGGGAAAGGAAAGGAGATGAGTTGGTTATAAGTGATGGGGTTTGTTTGGA
GGATATAGTGAGGGATTGTTTAAGCAAAGAAGCTATGTATTGTTATGATGATGGTGAAGG
TCATAGGAGCTCGTTTCTTCAGATGGTTTCGTGTGAAGACTGGTGGAAAGGGAAATCGAA
GATGAGTCAAAGACTTACACTCAAGGAAGTGTTGGAGAAAGATGTAGGGCTTGATGATGA
TTTGCCTATTTCTTACATAAAGGGTTGTGATGCGGTGGAAAGAAGAAGAGAGAAGATTAA
GGCGGCTAAGTTGAGGATTGATGCGATACAAGATCCTTGTGATGATGATGACAAAGTTAG
TAGAAGTGAGTTGTCTTTGGAGGTTGAAGATAGCAAGAAGAAGAAAAGGAAGAGAGGATG
TGAGATTGATTGGGAGGATTTGGTAATACAGGCTCTGGTCTTACACGATGTGAAGGACGA
AGAAATAGAGAAAGGGCATTACAATGCTTTGCTAGCTTTGCATGTTTTCAATTGTAGTAA
TAACTTGGGGGTAAAGAAGAGAGACTGTAAAAGCTGAAGCTGTTTATTTTTATTTTATTA
TAATTGAAGAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EE65JQ C 1
AF RR2EE65TF U 1
BS 1 611 RR2EE65TF

RD RR2EE65JQ 611 0 0
GAGAAAGAAGAGGGAAAGGAAAGGAGATGAGTTGGTTATAAGTGATGGGGTTTGTTTGGA
GGATATAGTGAGGGATTGTTTAAGCAAAGAAGCTATGTATTGTTATGATGATGGTGAAGG
TCATAGGAGCTCGTTTCTTCAGATGGTTTCGTGTGAAGACTGGTGGAAAGGGAAATCGAA
GATGAGTCAAAGACTTACACTCAAGGAAGTGTTGGAGAAAGATGTAGGGCTTGATGATGA
TTTGCCTATTTCTTACATAAAGGGTTGTGATGCGGTGGAAAGAAGAAGAGAGAAGATTAA
GGCGGCTAAGTTGAGGATTGATGCGATACAAGATCCTTGTGATGATGATGACAAAGTTAG
TAGAAGTGAGTTGTCTTTGGAGGTTGAAGATAGCAAGAAGAAGAAAAGGAAGAGAGGATG
TGAGATTGATTGGGAGGATTTGGTAATACAGGCTCTGGTCTTACACGATGTGAAGGACGA
AGAAATAGAGAAAGGGCATTACAATGCTTTGCTAGCTTTGCATGTTTTCAATTGTAGTAA
TAACTTGGGGGTAAAGAAGAGAGACTGTAAAAGCTGAAGCTGTTTATTTTTATTTTATTA
TAATTGAAGAA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RR2EE65TF 611 0 0
GAGAAAGAAGAGGGAAAGGAAAGGAGATGAGTTGGTTATAAGTGATGGGGTTTGTTTGGA
GGATATAGTGAGGGATTGTTTAAGCAAAGAAGCTATGTATTGTTATGATGATGGTGAAGG
TCATAGGAGCTCGTTTCTTCAGATGGTTTCGTGTGAAGACTGGTGGAAAGGGAAATCGAA
GATGAGTCAAAGACTTACACTCAAGGAAGTGTTGGAGAAAGATGTAGGGCTTGATGATGA
TTTGCCTATTTCTTACATAAAGGGTTGTGATGCGGTGGAAAGAAGAAGAGAGAAGATTAA
GGCGGCTAAGTTGAGGATTGATGCGATACAAGATCCTTGTGATGATGATGACAAAGTTAG
TAGAAGTGAGTTGTCTTTGGAGGTTGAAGATAGCAAGAAGAAGAAAAGGAAGAGAGGATG
TGAGATTGATTGGGAGGATTTGGTAATACAGGCTCTGGTCTTACACGATGTGAAGGACGA
AGAAATAGAGAAAGGGCATTACAATGCTTTGCTAGCTTTGCATGTTTTCAATTGTAGTAA
TAACTTGGGGGTAAAGAAGAGAGACTGTAAAAGCTGAAGCTGTTTATTTTTATTTTATTA
TAATTGAAGAA

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL6700Contig1 683 2 1 U
GGATCTTACTCATTTCTTCTCTATATACATATGCACGTTTGTTTTGGAAATAAGCTCCGC
TAAAGAAGAAGAAAAGAGAAGAAAACAAATGGCAGATGGAATATTCTGGCATCCATTTTG
GAGATTTCGTGAATGGTCAGGAGGATCAACAGCTCTGATTGATTGGATGGAATCTCCAAA
TGCTCATATCTTCAAAGCCAACGTTCCAGGATACAACAAAGAAGACATAAAAGTGCAAAT
TGAAGAAGGAAACGTTCTAAGCATTAAAGGAGAAGGACTGAAGAAGGAAGAGAAAGAGAA
GAAAGAGGATTTAGTGTGGCATGTAGCGGAGAGAGAAGCTTTTTCCGGTAAAGGCGAGTT
TCTCCGAAGGATTGAATTGCCAGAAAATGTGAAAATCGACCAAGTAAAAGCTTACGTGGA
GAACGGTCTCCTCACGGTGGTCGTTCCTAAAGATACGTCACCCAAATCCTCCAAAGTACG
GAATATCAATATCACTAGCAGGCTCTGAAATTTAAACTGGTTTGAACCGGCTTTTGGTTC
TCATTAGCCTAAAGTTTGAATAAAATGTAGACTGTAAAATAGTACTTCATGTATCAAACA
AAATTGCAAAATCAAATCCCGTTTTATTGGGTTTTGGTTTTCATGAGCCAAAACTTCAAA
TGAGATTGTACTCTCTACTTCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FO83JQ C 1
AF RR2FO83TF U 1
BS 1 683 RR2FO83TF

RD RR2FO83JQ 683 0 0
GGATCTTACTCATTTCTTCTCTATATACATATGCACGTTTGTTTTGGAAATAAGCTCCGC
TAAAGAAGAAGAAAAGAGAAGAAAACAAATGGCAGATGGAATATTCTGGCATCCATTTTG
GAGATTTCGTGAATGGTCAGGAGGATCAACAGCTCTGATTGATTGGATGGAATCTCCAAA
TGCTCATATCTTCAAAGCCAACGTTCCAGGATACAACAAAGAAGACATAAAAGTGCAAAT
TGAAGAAGGAAACGTTCTAAGCATTAAAGGAGAAGGACTGAAGAAGGAAGAGAAAGAGAA
GAAAGAGGATTTAGTGTGGCATGTAGCGGAGAGAGAAGCTTTTTCCGGTAAAGGCGAGTT
TCTCCGAAGGATTGAATTGCCAGAAAATGTGAAAATCGACCAAGTAAAAGCTTACGTGGA
GAACGGTCTCCTCACGGTGGTCGTTCCTAAAGATACGTCACCCAAATCCTCCAAAGTACG
GAATATCAATATCACTAGCAGGCTCTGAAATTTAAACTGGTTTGAACCGGCTTTTGGTTC
TCATTAGCCTAAAGTTTGAATAAAATGTAGACTGTAAAATAGTACTTCATGTATCAAACA
AAATTGCAAAATCAAATCCCGTTTTATTGGGTTTTGGTTTTCATGAGCCAAAACTTCAAA
TGAGATTGTACTCTCTACTTCAC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2FO83TF 683 0 0
GGATCTTACTCATTTCTTCTCTATATACATATGCACGTTTGTTTTGGAAATAAGCTCCGC
TAAAGAAGAAGAAAAGAGAAGAAAACAAATGGCAGATGGAATATTCTGGCATCCATTTTG
GAGATTTCGTGAATGGTCAGGAGGATCAACAGCTCTGATTGATTGGATGGAATCTCCAAA
TGCTCATATCTTCAAAGCCAACGTTCCAGGATACAACAAAGAAGACATAAAAGTGCAAAT
TGAAGAAGGAAACGTTCTAAGCATTAAAGGAGAAGGACTGAAGAAGGAAGAGAAAGAGAA
GAAAGAGGATTTAGTGTGGCATGTAGCGGAGAGAGAAGCTTTTTCCGGTAAAGGCGAGTT
TCTCCGAAGGATTGAATTGCCAGAAAATGTGAAAATCGACCAAGTAAAAGCTTACGTGGA
GAACGGTCTCCTCACGGTGGTCGTTCCTAAAGATACGTCACCCAAATCCTCCAAAGTACG
GAATATCAATATCACTAGCAGGCTCTGAAATTTAAACTGGTTTGAACCGGCTTTTGGTTC
TCATTAGCCTAAAGTTTGAATAAAATGTAGACTGTAAAATAGTACTTCATGTATCAAACA
AAATTGCAAAATCAAATCCCGTTTTATTGGGTTTTGGTTTTCATGAGCCAAAACTTCAAA
TGAGATTGTACTCTCTACTTCAC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL6701Contig1 821 2 12 U
GGGACTCTCTCTAACAGATCTCTGTTTAAATCTCCTCCAATGAATCAAAAGCCTCCTCCT
TCGCCGTACAGTTACGGCGGAGGACCTTCTTCCTCCTCCTCCCCTTCCAACACGACCATC
GGGACGTTGAGTGCACGCGCCAAGCAGACGACGCAATCGGTGATCGCCACGCTCCGTCCA
TGGCGAATGCTTCTGGATCTATCCGCGGTCTCTCTCCCTCACAATTACAACGAGGCCATG
GCCAACCTGAGGAACAACCTCTCTTACTTCCGCGCGAACTACGCGCTTGCCGTCCTCGGT
ATCGTTTTCCTCGGCCTCGTCTACCACCCGATCTCTATGGCCGCGTTTATCGTCGTCTTC
GTCGCGTGGATCCTCCTCTACTTCTCCCGCGACGGCAGCGATCCGATCGTGGTATCGGGG
AGAGAAGTCGATGACCGGGTCGTGTTGGCTGTGCTTAGCGTGGTGACGGTTTTGGCGTTG
GTTTATACAGATGTAGGCGAGAACGTTCTGGTTTCGCTCATCGTTGGTTTGCTCATGGTC
GGTGCTCACGCGGCTGTTCGTAATACCGGTGATTTGTTTCTTGATGAAGAATCTGCTCGC
CAAGGTGGGCTCGTCTCCGCCGGTTCAGTAAACCGGGGAACGGGAAGTTATACCCCGGTT
TAGTCACATTTCTTGTGGTTTGCTTTAAGGCTGAGGAAAGTTTCCACTGGTAACCAAATG
GAAACCAAGCTCGGTTATGTGTGTGTTGTATTTTGGTTAAACTTGTGTAAGACTTGTGGG
AAGTTTTGGTTTTATAATTGAGATTGGTAAATTAATATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ39TF U 1
AF RR2EQ39JQ C 90
BS 1 689 RR2EQ39TF
BS 690 690 RR2EQ39JQ
BS 691 695 RR2EQ39TF
BS 696 696 RR2EQ39JQ
BS 697 753 RR2EQ39TF
BS 754 754 RR2EQ39JQ
BS 755 760 RR2EQ39TF
BS 761 761 RR2EQ39JQ
BS 762 769 RR2EQ39TF
BS 770 770 RR2EQ39JQ
BS 771 786 RR2EQ39TF
BS 787 821 RR2EQ39JQ

RD RR2EQ39TF 802 0 0
GGGACTCTCTCTAACAGATCTCTGTTTAAATCTCCTCCAATGAATCAAAAGCCTCCTCCT
TCGCCGTACAGTTACGGCGGAGGACCTTCTTCCTCCTCCTCCCCTTCCAACACGACCATC
GGGACGTTGAGTGCACGCGCCAAGCAGACGACGCAATCGGTGATCGCCACGCTCCGTCCA
TGGCGAATGCTTCTGGATCTATCCGCGGTCTCTCTCCCTCACAATTACAACGAGGCCATG
GCCAACCTGAGGAACAACCTCTCTTACTTCCGCGCGAACTACGCGCTTGCCGTCCTCGGT
ATCGTTTTCCTCGGCCTCGTCTACCACCCGATCTCTATGGCCGCGTTTATCGTCGTCTTC
GTCGCGTGGATCCTCCTCTACTTCTCCCGCGACGGCAGCGATCCGATCGTGGTATCGGGG
AGAGAAGTCGATGACCGGGTCGTGTTGGCTGTGCTTAGCGTGGTGACGGTTTTGGCGTTG
GTTTATACAGATGTAGGCGAGAACGTTCTGGTTTCGCTCATCGTTGGTTTGCTCATGGTC
GGTGCTCACGCGGCTGTTCGTAATACCGGTGATTTGTTTCTTGATGAAGAATCTGCTCGC
CAAGGTGGGCTCGTCTCCGCCGGTTCAGTAAACCGGGGAACGGGAAGTTATACCCCGGTT
TAGTCACATTTCTTGTGGTTTGCTTTAAG*CTGAG*AAAGTTTCCACTGGTAACCAAATG
GAAACCAAGCTCGGTTATGTGTGTGTTGTATTT*GGTTAA*CTTGTGTA*GACTTGTGGG
AAGTTT
GGTTTATAATTGAGAT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2EQ39JQ 732 0 0
TTCCTCCTCCTCCCCTTCCAACACGACCATCGGGACGTTGAGTGCACGCGCCAAGCAGAC
GACGCAATCGGTGATCGCCACGCTCCGTCCATGGCGAATGCTTCTGGATCTATCCGCGGT
CTCTCTCCCTCACAATTACAACGAGGCCATGGCCAACCTGAGGAACAACCTCTCTTACTT
CCGCGCGAACTACGCGCTTGCCGTCCTCGGTATCGTTTTCCTCGGCCTCGTCTACCACCC
GATCTCTATGGCCGCGTTTATCGTCGTCTTCGTCGCGTGGATCCTCCTCTACTTCTCCCG
CGACGGCAGCGATCCGATCGTGGTATCGGGGAGAGAAGTCGATGACCGGGTCGTGTTGGC
TGTGCTTAGCGTGGTGACGGTTTTGGCGTTGGTTTATACAGATGTAGGCGAGAACGTTCT
GGTTTCGCTCATCGTTGGTTTGCTCATGGTCGGTGCTCACGCGGCTGTTCGTAATACCGG
TGATTTGTTTCTTGATGAAGAATCTGCTCGCCAAGGTGGGCTCGTCTCCGCCGGTTCAGT
AAACCGGGGAACGGGAAGTTATACCCCGGTTTAGTCACATTTCTTGTGGTTTGCTTTAAG
GCTGAGGAAAGTTTCCACTGGTAACCAAATGGAAACCAAGCTCGGTTATGTGTGTGTTGT
ATTTTGGTTAAACTTGTGTAAGACTTGTGGGAAGTTTTGGTTTTATAATTGAGATTGGTA
AATTAATATTGT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL6702Contig1 543 2 2 U
GTATTAAGGGAATTCAGTACATTTTTCCAAAAGCCCCACGCTCTACATATGTTTTTCTTC
ATATTTTAACTTTATAATTTACAACGTTTACCAACTATTTATAAAATTACAATCACACGG
TAAAATGAAAGAGGAGAAACTTAAAAAGACGCATGAAAAAAGAAAATAAGAGAACATTTT
CTTCTTCTTCTTCTTGATCACTAAATCGCCATGGGATCCGAAACTTTAGCAGAGCTTTTC
TTCACTCCTGGCTTTCCAACAAACCATCGTCCGAATCTTCTAGTCCCACTCTGTTTCGCC
GGTGTTTTCATGACCTCCCGGAGCTCTCCTCCGGCCATCTTTTCTTCTCCCTCGCCGGTA
ACCACCGCAGGTTTGGTAGGCTTCTTCATGCTCTCTCTATGGAACTTCCTCACCGTGTAT
ACATCTGCGATAGCTAGCGACATCTTTTTATCAAGGTAGAAAAGAAAAAAAAAGAAACTT
ACGTTTCCCCTTAATTATCTGAAAAAGCGGATGTATTTTGGAAAGGTGAGTGTTGTTGCA
TCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2BU45TF C 1
AF RR2BU45JQ U 6
BS 1 5 RR2BU45TF
BS 6 543 RR2BU45JQ

RD RR2BU45TF 543 0 0
GTATTAAGGGAATTCAGTACATTTTTCCAAAAGCCCCACGCTCTACATATGTTTTTCTTC
ATATTTTAACTTTATAATTTACAACGTTTACCAACTATTTATAAAATTACAATCACACGG
TAAAATGAAAGAGGAGAAACTTAAAAAGACGCATGAAAAAAGAAAATAAGAGAACATTTT
CTTCTTCTTCTTCTTGATCACTAAATCGCCATGGGATCCGAAACTTTAGCAGAGCTTTTC
TTCACTCCTGGCTTTCCAACAAACCATCGTCCGAATCTTCTAGTCCCACTCTGTTTCGCC
GGTGTTTTCATGACCTCCCGGAGCTCTCCTCCGGCCATCTTTTCTTCTCCCTCGCCGGTA
ACCACCGCAGGTTTGGTAGGCTTCTTCATGCTCTCTCTATGGAACTTCCTCACCGTGTAT
ACATCTGCGATAGCTAGCGACATCTTTTTATCAAGGTAGAAAAGAAAAAAAAAGAAACTT
ACGTTTCCCCTTAATTATCTGAAAAAGCGGATGTATTTTGGAAAGGTGAGTGTTGTTGCA
TCC

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2BU45JQ 538 0 0
AAGGGAATTCAGTACATTTTTCCAAAAGCCCCACGCTCTACATATGTTTTTCTTCATATT
TTAACTTTATAATTTACAACGTTTACCAACTATTTATAAAATTACAATCACACGGTAAAA
TGAAAGAGGAGAAACTTAAAAAGACGCATGAAAAAAGAAAATAAGAGAACATTTTCTTCT
TCTTCTTCTTGATCACTAAATCGCCATGGGATCCGAAACTTTAGCAGAGCTTTTCTTCAC
TCCTGGCTTTCCAACAAACCATCGTCCGAATCTTCTAGTCCCACTCTGTTTCGCCGGTGT
TTTCATGACCTCCCGGAGCTCTCCTCCGGCCATCTTTTCTTCTCCCTCGCCGGTAACCAC
CGCAGGTTTGGTAGGCTTCTTCATGCTCTCTCTATGGAACTTCCTCACCGTGTATACATC
TGCGATAGCTAGCGACATCTTTTTATCAAGGTAGAAAAGAAAAAAAAAGAAACTTACGTT
TCCCCTTAATTATCTGAAAAAGCGGATGTATTTTGGAAAGGTGAGTGTTGTTGCATCC

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

CO CL6703Contig1 895 2 10 U
GTTTTAACTCTTTACCTCGAAATGAAGGTCAGCGAGTGTTTTAGTGTCGTCTGGCTGTTT
TCGGTTCGGATAAGACATCGTCTGACCAACCTTTTTATCAATAAACAATCACAAGATCAG
TATCTTCCCATGAGTCCTTGCAAACATCACAAAGAACTAATAAAACGATAAACAAGCGAG
TCTGAAACCACCCCTTCCGAAAATCAAACTAATGCATTCTTATATATGATGTTCTGTTCT
CTCAACTCTCAAATCATAAGCATTGGAAGATGACTAGTTGATGCTACAATATGATCTGAG
CATACTTCATAAGCATAACAAAATGGCATGTTCAATATAGAGACTCTAAATCACCTATGA
GACTTTAAGAAAGTGGCATAAACACACACAGAAGAAACTCTAGCATGTATCAACAATCAT
GTGGTGGTTTGTGGTTATACCCTATCTTATCAAGAATGTGAAGAGAAAGAGGGTAAACTT
TACCTGTCTCACAATAAAGCGGCCATTCTTGTCTGGATAAACAAACGCAAAAGACAACCT
TGCATCTCTTCTCCTAGCTGCTATAGAGACTTCTTTGACCTGAAACACAAATAACTATCG
TTTTAACTTTGTGTGCTTGTTAAGAGTCAAGAAGAGAACATACATAGTGTAAAAAAACAC
ATACCAAATCAGTTAACTCGCGAAGATTAGCATCTTTCCAAGTGTAAATTTGAACTTCAT
CCTTTGGTTCTTTGCCTCTCACAGCATAATCCTCCTTCGTATGATGACCACCACTCTGCA
TTAATCTCCCAATTAACACAGTACACTTGCTAACAGAAAAGAAAAAAGTAACAGACTTGG
AGAAAAGCGTACCTTTGTAAAAACGCGAAGAAGCAGGGGACATGTCTGCAATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH40TF U 1
AF RR2CH40JQ C 96
BS 1 637 RR2CH40TF
BS 638 638 RR2CH40JQ
BS 639 683 RR2CH40TF
BS 684 684 RR2CH40JQ
BS 685 687 RR2CH40TF
BS 688 688 RR2CH40JQ
BS 689 697 RR2CH40TF
BS 698 698 RR2CH40JQ
BS 699 709 RR2CH40TF
BS 710 895 RR2CH40JQ

RD RR2CH40TF 709 0 0
GTTTTAACTCTTTACCTCGAAATGAAGGTCAGCGAGTGTTTTAGTGTCGTCTGGCTGTTT
TCGGTTCGGATAAGACATCGTCTGACCAACCTTTTTATCAATAAACAATCACAAGATCAG
TATCTTCCCATGAGTCCTTGCAAACATCACAAAGAACTAATAAAACGATAAACAAGCGAG
TCTGAAACCACCCCTTCCGAAAATCAAACTAATGCATTCTTATATATGATGTTCTGTTCT
CTCAACTCTCAAATCATAAGCATTGGAAGATGACTAGTTGATGCTACAATATGATCTGAG
CATACTTCATAAGCATAACAAAATGGCATGTTCAATATAGAGACTCTAAATCACCTATGA
GACTTTAAGAAAGTGGCATAAACACACACAGAAGAAACTCTAGCATGTATCAACAATCAT
GTGGTGGTTTGTGGTTATACCCTATCTTATCAAGAATGTGAAGAGAAAGAGGGTAAACTT
TACCTGTCTCACAATAAAGCGGCCATTCTTGTCTGGATAAACAAACGCAAAAGACAACCT
TGCATCTCTTCTCCTAGCTGCTATAGAGACTTCTTTGACCTGAAACACAAATAACTATCG
TTTTAACTTTGTGTGCTTGTTAAGAGTCAAGAAGAGA*CATACATAGTGTAAAAAAACAC
ATACCAAATCAGTTAACTCGCGA*GAT*AGCATCTTTTCAAGTGTAAAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2CH40JQ 800 0 0
TATCAATAAACAATCACAAGATCAGTATCTTCCCATGAGTCCTTGCAAACATCACAAAGA
ACTAATAAAACGATAAACAAGCGAGTCTGAAACCACCCCTTCCGAAAATCAAACTAATGC
ATTCTTATATATGATGTTCTGTTCTCTCAACTCTCAAATCATAAGCATTGGAAGATGACT
AGTTGATGCTACAATATGATCTGAGCATACTTCATAAGCATAACAAAATGGCATGTTCAA
TATAGAGACTTTAAATCACCTATGAGACTTTAAGAAAGTGGCATAAACACACACAGAAGA
AACTCTAGCATGTATCAACAATCATGTGGTGGTTTGTGGTTATACCCTATCTTATCAAGA
ATGTGAAGAGAAAGAGGGTAAACTTTACCTGTCTCACAATAAAGCGGCCATTCTTGTCTG
GATAAACAAACGCAAAAGACAACCTTGCATCTCTTCTCCTAGCTGCTATAGAGACTTCTT
TGACCTGAAACACAAATAACTATCGTTTTAACTTTGTGTGCTTGTTAAGAGTCAAGAAGA
GAACATACATAGTGTAAAAAAACACATACCAAATCAGTTAACTCGCGAAGATTAGCATCT
TTCCAAGTGTAAATTTGAACTTCATCCTTTGGTTCTTTGCCTCTCACAGCATAATCCTCC
TTCGTATGATGACCACCACTCTGCATTAATCTCCCAATTAACACAGTACACTTGCTAACA
GAAAAGAAAAAAGTAACAGACTTGGAGAAAAGCGTACCTTTGTAAAAACGCGAAGAAGCA
GGGGACATGTCTGCAATTCG

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL6704Contig1 732 2 1 U
GGCAGGAATATAAATTTCTGGTTTCAAAATCCAAGAATCATCAAGCCATCTGACATTACA
ATCTGCTTATAATGTTCTGAGAGAAAGGATTCCATTTCCTAAAACCAATCAAACCCAAAA
ATCAAAGAATAAACAAAACTTATTGTATGCATCTACCAATTGATGTCTCTAAACCTCTTT
CCTCATTGGTTTCTGATATTTGAAGCAGAAGATGCAGCGCATGCTGATCATTCCCCTGAT
TTTCCTATGGGTTATTGTGTGTACCAACATCTCAATCACAGCAAAGAAAAGTGTAGCCAT
GTGCATCGATAGAGTGAGGGAGAGTCACAATCACACCTAATCAAGGTCAAAAACCCATCT
GTCTTAAGGTATTGACAATGAGTCTAGAGGTAAAAGAAAAGGTTTTTACCAGAACATGTA
ATAATGTGAATGAGTCTTTTTGTGAAAGACCAATACTTGTGTGAATCGAACATAAGAAAG
CCAAAGAGATCACTGAAGAGACTTAACACACAGGCCTGCTCACACAAAGCTTTCCTTGAT
TGCAGACGATTTGCAGAAGCTCTTACTTGTTATAGCAATGTGTATAAGCCACCGAGAGAC
AGCAATCAACCAAGAAGTGGTCAAAGAAATGGGCTTTATTTTTCTCAAAAGGGAGATATT
TTGGTTACCATCATTTAGGCATTGCAGCCGATCTGATAGACCACTCAACGCTTTTGAGAG
ACTTACGTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ36JQ U 1
AF RR2C247JQ U 6
BS 1 732 RR2FQ36JQ

RD RR2FQ36JQ 732 0 0
GGCAGGAATATAAATTTCTGGTTTCAAAATCCAAGAATCATCAAGCCATCTGACATTACA
ATCTGCTTATAATGTTCTGAGAGAAAGGATTCCATTTCCTAAAACCAATCAAACCCAAAA
ATCAAAGAATAAACAAAACTTATTGTATGCATCTACCAATTGATGTCTCTAAACCTCTTT
CCTCATTGGTTTCTGATATTTGAAGCAGAAGATGCAGCGCATGCTGATCATTCCCCTGAT
TTTCCTATGGGTTATTGTGTGTACCAACATCTCAATCACAGCAAAGAAAAGTGTAGCCAT
GTGCATCGATAGAGTGAGGGAGAGTCACAATCACACCTAATCAAGGTCAAAAACCCATCT
GTCTTAAGGTATTGACAATGAGTCTAGAGGTAAAAGAAAAGGTTTTTACCAGAACATGTA
ATAATGTGAATGAGTCTTTTTGTGAAAGACCAATACTTGTGTGAATCGAACATAAGAAAG
CCAAAGAGATCACTGAAGAGACTTAACACACAGGCCTGCTCACACAAAGCTTTCCTTGAT
TGCAGACGATTTGCAGAAGCTCTTACTTGTTATAGCAATGTGTATAAGCCACCGAGAGAC
AGCAATCAACCAAGAAGTGGTCAAAGAAATGGGCTTTATTTTTCTCAAAAGGGAGATATT
TTGGTTACCATCATTTAGGCATTGCAGCCGATCTGATAGACCACTCAACGCTTTTGAGAG
ACTTACGTTCCT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2C247JQ 716 0 0
GG
ATATAAATTTCTGGTTTCAAAATCCAAGAATCATCAAGCCATCTGACATTACAATCTGCT
TATAATGTTCTGAGAGAAAGGATTCCATTTCCTAAAACCAATCAAACCCAAAAATCAAAG
AATAAACAAAACTTATTGTATGCATCTACCAATTGATGTCTCTAAACCTCTTTCCTCATT
GGTTTCTGATATTTGAAGCAGAAGATGCAGCGCATGCTGATCATTCCCCTGATTTTCCTA
TGGGTTATTGTGTGTACCAACATCTCAATCACAGCAAAGAAAAGTGTAGCCATGTGCATC
GATAGAGTGAGGGAGAGTCACAATCACACCTAATCAAGGTCAAAAACCCATCTGTCTTAA
GGTATTGACAATGAGTCTAGAGGTAAAAGAAAAGGTTTTTACCAGAACATGTAATAATGT
GAATGAGTCTTTTTGTGAAAGACCAATACTTGTGTGAATCGAACATAAGAAAGCCAAAGA
GATCACTGAAGAGACTTAACACACAGGCCTGCTCACACAAAGCTTTCCTTGATTGCAGAC
GATTTGCAGAAGCTCTTACTTGTTATAGCAATGTGTATAAGCCACCGAGAGACAGCAATC
AACCAAGAAGTGGTCAAAGAAATGGGCTTTATTTTTCTCAAAAGGGAGATATTTTGGTTA
CCATCATTTAGGCATTGCAGCCGATCTGATAGACCACTCAACGCTTTTGAGAGA

QA 3 716 3 716
DS 



AS 1 2

CO CL6705Contig1 610 2 2 U
CTTTACAGAATGAAAAAAAATATCCCAAAAAAAAAAACAGAATCAAATGTGGACAAAGAT
GCAAAGAAAACATATTTATGTATATGTTGAAAAATAGATTACATAATGGTACAAGCGTGT
GGATTATCATCACTAAACATCGAAGCCGCGATCTCATCGCTGGCTACGGCAACGGAGTAA
ACGGCTGGAGTGTGGAAGAAAGTGTGAACACCACCAGTGGGATCGGTACGGTGGGCATCG
GAGTAATAGTGGTTGGTCACATAAGATGGATATTTATAGAAAGACGCAAAGTGGCTATTA
CCTAAGCGGTATGGCCACGGTTCATCTGCCTTACCGGCCCGCCGTATTGCTTTCAATACC
TTCTTCTCCTCTAACCTGTATCCTCGAGCTGTCACTTTTTGGCTTTCCATCTCTACTTCC
ACTTCTTCCACTCCTTTGAGCTTGAGTAGAGTCTTCTTAAGCTTAGAAGCACATCCTTCA
CAATCCAAGTTTGGAACTCTTATCTCCACTGTCATCGACATGCTTACAAACTCTATTCAA
GCTCAATTTCTTAGAAAAAAAAGAACTCCCTCCAAGTGTACTCGGATATAGAGAATGAAG
TAGAATATCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AK49TF C 1
AF RR2AK49JQ U 5
BS 1 4 RR2AK49TF
BS 5 610 RR2AK49JQ

RD RR2AK49TF 610 0 0
CTTTACAGAATGAAAAAAAATATCCCAAAAAAAAAAACAGAATCAAATGTGGACAAAGAT
GCAAAGAAAACATATTTATGTATATGTTGAAAAATAGATTACATAATGGTACAAGCGTGT
GGATTATCATCACTAAACATCGAAGCCGCGATCTCATCGCTGGCTACGGCAACGGAGTAA
ACGGCTGGAGTGTGGAAGAAAGTGTGAACACCACCAGTGGGATCGGTACGGTGGGCATCG
GAGTAATAGTGGTTGGTCACATAAGATGGATATTTATAGAAAGACGCAAAGTGGCTATTA
CCTAAGCGGTATGGCCACGGTTCATCTGCCTTACCGGCCCGCCGTATTGCTTTCAATACC
TTCTTCTCCTCTAACCTGTATCCTCGAGCTGTCACTTTTTGGCTTTCCATCTCTACTTCC
ACTTCTTCCACTCCTTTGAGCTTGAGTAGAGTCTTCTTAAGCTTAGAAGCACATCCTTCA
CAATCCAAGTTTGGAACTCTTATCTCCACTGTCATCGACATGCTTACAAACTCTATTCAA
GCTCAATTTCTTAGAAAAAAAAGAACTCCCTCCAAGTGTACTCGGATATAGAGAATGAAG
TAGAATATCC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2AK49JQ 606 0 0
ACAGAATGAAAAAAAATATCCCAAAAAAAAAAACAGAATCAAATGTGGACAAAGATGCAA
AGAAAACATATTTATGTATATGTTGAAAAATAGATTACATAATGGTACAAGCGTGTGGAT
TATCATCACTAAACATCGAAGCCGCGATCTCATCGCTGGCTACGGCAACGGAGTAAACGG
CTGGAGTGTGGAAGAAAGTGTGAACACCACCAGTGGGATCGGTACGGTGGGCATCGGAGT
AATAGTGGTTGGTCACATAAGATGGATATTTATAGAAAGACGCAAAGTGGCTATTACCTA
AGCGGTATGGCCACGGTTCATCTGCCTTACCGGCCCGCCGTATTGCTTTCAATACCTTCT
TCTCCTCTAACCTGTATCCTCGAGCTGTCACTTTTTGGCTTTCCATCTCTACTTCCACTT
CTTCCACTCCTTTGAGCTTGAGTAGAGTCTTCTTAAGCTTAGAAGCACATCCTTCACAAT
CCAAGTTTGGAACTCTTATCTCCACTGTCATCGACATGCTTACAAACTCTATTCAAGCTC
AATTTCTTAGAAAAAAAAGAACTCCCTCCAAGTGTACTCGGATATAGAGAATGAAGTAGA
ATATCC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL6706Contig1 1529 2 4 U
GGGTGTGTGTGTTGATTGATCTGCGTGACGCCATACCAAAACTCAACACTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGCGGAATCAAATCGATTCAGATATTTTATCTTCAACCCCC
TTTCCGTGTGGTTGGACCTGAACGCCTGAATCGTACGCGACCTGCTTAAGAGAAGAAGGC
ACCACAAAGTCTCTTCCTTTATACCCCTCCCCACACGTTCCGCCCGAGACAAATCTCAAT
GCCCATGAGCGACGGGAACTAACTCTATATAAACCATACGAATCACGCGACCCAGTTCCC
CTCCATTACTTGGATCTCGCATTGGAAATTTTCGAGATTTAGATTCCTTCCTAGGGTTTT
AGATTCTGCTGAAGATGATTGATCACGGGAGCTCGACCTTTGATTACTGGAGCATTAGAG
AGGCCGCATGCAACGCCGGCGCCGGAGCCTCCGCAGGGGCAATTGCAGCGACTTTTGTTT
GTCCGTTAGATGTGATCAAAACGAGGTTACAGGTTCTTGGTCTCCCTGAAGCCCCACCTC
TGGAAAGAGAGGTAGTGTGATCATCACAAGCTTACAGAATATAGTGAAGAATGAAGGTTT
TAGAGGAATGTATCGAGGGCTTTCACCAACCATCATAGCTCTTCTTCCGAATTGGGCTGT
GTACTTCTCAGTGTATGGAAAGCTAAAGGATGTCCTGCAGTCAAGTGATGGCACACTTAG
TGTTGGGGCCAACATGGTAGCTGCTGCTGGCGCTGGAGCTTCCACATCTATTGCAACTAA
TCCACTTTGGGTTGTCAAGACAAGACTGATGACGCAAGGGATTAGGCCAGGCGTGGTACC
TTACAAAAGCGTAATGTCTGCTTTCAGTAGGATCTGTCAAGAAGAAGGATTCCGAGGGCT
GTACAGTGGCCTTTTGCCTTCGTTGGCGGGAATAAGCCATGTTGCAATCCAGTTTCCAGC
ATATGAAAAGATTAAGCAGTACATGGCAAAAATGGATAACACATCTGTGGAGAATCTTAG
TCCTGGGAATGTTGCTATCGCCTCTTCCATAGCGAAAGTACTCGCCTCTGTTTTGACTTA
CCCACACGAGGTAATTAGAGCTAAGCTTCAAGAACAAGGGCAGATGCGAAACTCTGAGAA
TAAGTATTCAGGAGTCGTTGATTGCATCAAGAAGGTGTTTAGAAGCGAAGGGATCCCTGG
AATGTACCGTGGATGCGCCACTAATCTACTGAGGACAACTCCATCGGCAGTTATTACATT
TACAACCTATGAGATGATGCTTAGATTTTTCCGACAAGTTGTTCCACCAGAGACTAGTAA
TAAGTCTGATGATGACGAAAGAAAGAGTTTAGTTAGCCGAGGAGGAGAAGAAGAGAAAGA
TTCTGCTTTGAGAGAATCACAAAGTCAAGCTAATAAGATCACTTCCCCTATCCCTCATGG
AAGCAAATAAAAAGATTTTGTAGACCATATGAGTCATGGCTACAATAGATTTTCTTTTAA
TTTGAAAGCCAAGTTCCAATTTTATGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR03TF U 1
AF RR2AR03JQ C 655
BS 1 802 RR2AR03TF
BS 803 803 RR2AR03JQ
BS 804 821 RR2AR03TF
BS 822 1529 RR2AR03JQ

RD RR2AR03TF 821 0 0
GGGTGTGTGTGTTGATTGATCTGCGTGACGCCATACCAAAACTCAACACTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGCGGAATCAAATCGATTCAGATATTTTATCTTCAACCCCC
TTTCCGTGTGGTTGGACCTGAACGCCTGAATCGTACGCGACCTGCTTAAGAGAAGAAGGC
ACCACAAAGTCTCTTCCTTTATACCCCTCCCCACACGTTCCGCCCGAGACAAATCTCAAT
GCCCATGAGCGACGGGAACTAACTCTATATAAACCATACGAATCACGCGACCCAGTTCCC
CTCCATTACTTGGATCTCGCATTGGAAATTTTCGAGATTTAGATTCCTTCCTAGGGTTTT
AGATTCTGCTGAAGATGATTGATCACGGGAGCTCGACCTTTGATTACTGGAGCATTAGAG
AGGCCGCATGCAACGCCGGCGCCGGAGCCTCCGCAGGGGCAATTGCAGCGACTTTTGTTT
GTCCGTTAGATGTGATCAAAACGAGGTTACAGGTTCTTGGTCTCCCTGAAGCCCCACCTC
TGGAAAGAGAGGTAGTGTGATCATCACAAGCTTACAGAATATAGTGAAGAATGAAGGTTT
TAGAGGAATGTATCGAGGGCTTTCACCAACCATCATAGCTCTTCTTCCGAATTGGGCTGT
GTACTTCTCAGTGTATGGAAAGCTAAAGGATGTCCTGCAGTCAAGTGATGGCACACTTAG
TGTTGGGGCCAACATGGTAGCTGCTGCTGGCGCTGGAGCTTCCACATCTATTGCAACTAA
TCCACTTTGGGTTGTCAAGACA*GACTGATGACGCAAGGGA

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR2AR03JQ 875 0 0
GGCTGTGTACTTCTCAGTGTATGGAAAGCTAAAGGATGTCCTGCAGTCAAGTGATGGCAC
ACTTAGTGTTGGGGCCAACATGGTAGCTGCTGCTGGCGCTGGAGCTTCCACATCTATTGC
AACTAATCCACTTTGGGTTGTCAAGACAAGACTGATGACGCAAGGGATTAGGCCAGGCGT
GGTACCTTACAAAAGCGTAATGTCTGCTTTCAGTAGGATCTGTCAAGAAGAAGGATTCCG
AGGGCTGTACAGTGGCCTTTTGCCTTCGTTGGCGGGAATAAGCCATGTTGCAATCCAGTT
TCCAGCATATGAAAAGATTAAGCAGTACATGGCAAAAATGGATAACACATCTGTGGAGAA
TCTTAGTCCTGGGAATGTTGCTATCGCCTCTTCCATAGCGAAAGTACTCGCCTCTGTTTT
GACTTACCCACACGAGGTAATTAGAGCTAAGCTTCAAGAACAAGGGCAGATGCGAAACTC
TGAGAATAAGTATTCAGGAGTCGTTGATTGCATCAAGAAGGTGTTTAGAAGCGAAGGGAT
CCCTGGAATGTACCGTGGATGCGCCACTAATCTACTGAGGACAACTCCATCGGCAGTTAT
TACATTTACAACCTATGAGATGATGCTTAGATTTTTCCGACAAGTTGTTCCACCAGAGAC
TAGTAATAAGTCTGATGATGACGAAAGAAAGAGTTTAGTTAGCCGAGGAGGAGAAGAAGA
GAAAGATTCTGCTTTGAGAGAATCACAAAGTCAAGCTAATAAGATCACTTCCCCTATCCC
TCATGGAAGCAAATAAAAAGATTTTGTAGACCATATGAGTCATGGCTACAATAGATTTTC
TTTTAATTTGAAAGCCAAGTTCCAATTTTATGTTT

QA 1 875 1 875
DS 



AS 1 2

CO CL6707Contig1 1023 2 4 U
CGAGTCCCGTTCAAGCCTCTTCTTCCTCCTCCACCATTGGTGAGACCAGTGATGGCTTGA
AGGTCCAGTCTCGTGTTTCAATTGGGGCAAACGATTTGCTGATTGTTGGACCAGGTGTTC
TTGGACGCTTAGTTGCAGAAAAATGGAGAGAGGAACATCCAGATTGTCAAATCTTTGGGC
AGACAGCAACAACAAACCATCATGATGAGTTGGAGAAGTTGGATATCAAACCACCTCTTA
AAGAAACCGAGTTTGATGGCAAGTTCTCCTATGTGATCTTTTGTGCTCCGCCCTCACAAA
GCCCAGATTACGCCGCTGAGCTCAGGATGGGCAGCATCAAAGTGGAACGGTGAAGGGATC
ATTCTTATTCACATCTAGCTCTGCACCTTATGATTTGCTTTGATAATGGGGAATGCAATG
AGGATTCTCCAGTGGGTGCCACTAGGAAAGAGTCCAAGAACAGATGTGCTTTTGAGAGCT
GAACAAGTAGTGTTGGAAAGTGGAGGGACTGTCCTTAGACTAGCAGGGCTTTACACAGAG
ACAAGAGGTGCACATACTTACTGGTTGAGTAAGGAGACAGTTGATGCTCGTCCTGATCAT
ATCCTGAATCTCATTCACTATGAGGATGCAGCATCGTTGGCAGTTGCAATCATGAATAAG
AAGGCTGGTGGTCGGATTTTCTTGGGTTGTGACAACCATCCTTTGTCAAGGCAAGAAGTG
ATGGACCTGATGGATCAAAGCGGAAAATATGATAAGAAGTTCAAAGGTTTCACAAGCACC
AGTGGTGCTTTAGGGAAGAAACTGAACAACTTTCGGACACGAGAGGAAATAGGATGGGAG
CCGAAGTATCCAAGCTTTGCTCAGTTTCTTGGAATATCCAAGTAATGTTTTAATCTGGTC
GAGCAAGAAGTGTAGTACCTCTAGAGCTGTGAATTATCTACAAATGTGAAGCATTTTTTT
ATGCTTGGTTCAAACTTATATGTATACTCCAAGATCGCTATCGGTATGGTCATGTTAACC
GAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2DI65TF U 1
AF RR2DI65JQ C 297
BS 1 624 RR2DI65TF
BS 625 625 RR2DI65JQ
BS 626 648 RR2DI65TF
BS 649 1023 RR2DI65JQ

RD RR2DI65TF 656 0 0
CGAGTCCCGTTCAAGCCTCTTCTTCCTCCTCCACCATTGGTGAGACCAGTGATGGCTTGA
AGGTCCAGTCTCGTGTTTCAATTGGGGCAAACGATTTGCTGATTGTTGGACCAGGTGTTC
TTGGACGCTTAGTTGCAGAAAAATGGAGAGAGGAACATCCAGATTGTCAAATCTTTGGGC
AGACAGCAACAACAAACCATCATGATGAGTTGGAGAAGTTGGATATCAAACCACCTCTTA
AAGAAACCGAGTTTGATGGCAAGTTCTCCTATGTGATCTTTTGTGCTCCGCCCTCACAAA
GCCCAGATTACGCCGCTGAGCTCAGGATGGGCAGCATCAAAGTGGAACGGTGAAGGGATC
ATTCTTATTCACATCTAGCTCTGCACCTTATGATTTGCTTTGATAATGGGGAATGCAATG
AGGATTCTCCAGTGGGTGCCACTAGGAAAGAGTCCAAGAACAGATGTGCTTTTGAGAGCT
GAACAAGTAGTGTTGGAAAGTGGAGGGACTGTCCTTAGACTAGCAGGGCTTTACACAGAG
ACAAGAGGTGCACATACTTACTGGTTGAGTAAGGAGACAGTTGATGCTCGTCCTGATCAT
ATCCTGAATCTCATTCACTATGAG*ATGCAGCATCGTTGGCAGTTGCA
TCATGATA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2DI65JQ 727 0 0
CAAAGCCCAGATTACGCCGCTGAGCTCAGGATGG*CAGCATCAAAGTGGAACGGTGAAGG
*ATCATTCTTATTCACATCTAGCTCTGCACCTTATGATT*GCTTTGATAATGGGGAATGC
AATGAGGATTCTCCAGTGG*TGCCACTAGGAAAGAGTCCAAGAACAGATGTGCTTTTGAG
AGCTGAACAAGTAGTGTTGGAAAGTGGAGGGACTGTCCTTAGACTAGCAGGGCTTTACAC
AGAGACAAGAGGTGCACATACTTACTGGTTGAGTAAGGAGACAGTTGATGCTCGTCCTGA
TCATATCCTGAATCTCATTCACTATGAGGATGCAGCATCGTTGGCAGTTGCAATCATGAA
TAAGAAGGCTGGTGGTCGGATTTTCTTGGGTTGTGACAACCATCCTTTGTCAAGGCAAGA
AGTGATGGACCTGATGGATCAAAGCGGAAAATATGATAAGAAGTTCAAAGGTTTCACAAG
CACCAGTGGTGCTTTAGGGAAGAAACTGAACAACTTTCGGACACGAGAGGAAATAGGATG
GGAGCCGAAGTATCCAAGCTTTGCTCAGTTTCTTGGAATATCCAAGTAATGTTTTAATCT
GGTCGAGCAAGAAGTGTAGTACCTCTAGAGCTGTGAATTATCTACAAATGTGAAGCATTT
TTTTATGCTTGGTTCAAACTTATATGTATACTCCAAGATCGCTATCGGTATGGTCATGTT
AACCGAG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL6708Contig1 718 2 7 U
GGACACTTCTCTCTCCCAGATCTGTCTCAAACACCTCTTTTTCCGATCCAATCTCAAAAC
CTCAGAGCTATGGCTACCAACTGGAAACTCGATGACCATCCCAAGCTCCCCAAGGGCAAG
ACCGTCGCCATGATCGTCTTAGATGGCTGGGGTGAATCTGCCCCTGATGAGTACAACTGC
ATCCACACCGCTCCAACTCCCACCATGGATTCTCTTAAAAACGGACGTCCTGATACATGG
ACGTTGATCAAAGCTCATGGAACAGCTGTTGGGCTCCCCAGCGAGGACGATATGGGAAAC
AGTGAGGTTGGTCACAACGCTCTCGGTGCTGGTCGTATCTTCGCTCAAGGTGCTAAGCTT
TGCGACATTGCTCTTGCTTCCGGCAAAATCTTTGACGGTGAAGGTTTCAAGTACGTCTCT
GAATCTTTCGAGAAGAACACTTTGCACTTCGTTGGTCTTCTCAGCGACGGTGGAGTTCAC
TCTCGTCTCGACCAGCTCCAATTGCTGATCAAGGGTTCTGCTGAACGTGGTGCTAAGAGA
ATCCGTGTCCACATTCTCACTGACGGTCGTGATGTTTTGGATGGTTCAAGTGTCGGGTTT
GTGGAGACTCTTGAAGCCGACCTCGCTAAGTTGCGTGAGAACGGTGTGGATGCTCAGATT
GCTTCCGGTGGAGGTCGTATGTACGTGACCTTGGACCGGTACGAGAACGACTGGGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI56TF U 1
AF RR2BV26TF U 38
BS 1 112 RR2BI56TF
BS 113 113 RR2BV26TF
BS 114 223 RR2BI56TF
BS 224 224 RR2BV26TF
BS 225 586 RR2BI56TF
BS 587 587 RR2BV26TF
BS 588 718 RR2BI56TF

RD RR2BI56TF 718 0 0
GGACACTTCTCTCTCCCAGATCTGTCTCAAACACCTCTTTTTCCGATCCAATCTCAAAAC
CTCAGAGCTATGGCTACCAACTGGAAACTCGATGACCATCCCAAGCTCCCCAGGGGCAAG
ACCGTCGCCATGATCGTCTTAGATGGCTGGGGTGAATCTGCCCCTGATGAGTACAACTGC
ATCCACACCGCTCCAACTCCCACCATGGATTCTCTTAAAAACGTACGTCCTGATACATGG
ACGTTGATCAAAGCTCATGGAACAGCTGTTGGGCTCCCCAGCGAGGACGATATGGGAAAC
AGTGAGGTTGGTCACAACGCTCTCGGTGCTGGTCGTATCTTCGCTCAAGGTGCTAAGCTT
TGCGACATTGCTCTTGCTTCCGGCAAAATCTTTGACGGTGAAGGTTTCAAGTACGTCTCT
GAATCTTTCGAGAAGAACACTTTGCACTTCGTTGGTCTTCTCAGCGACGGTGGAGTTCAC
TCTCGTCTCGACCAGCTCCAATTGCTGATCAAGGGTTCTGCTGAACGTGGTGCTAAGAGA
ATCCGTGTCCACATTCTCACTGACGGTCGTGATGTTTTGGATGGTTTAAGTGTCGGGTTT
GTGGAGACTCTTGAAGCCGACCTCGCTAAGTTGCGTGAGAACGGTGTGGATGCTCAGATT
GCTTCCGGTGGAGGTCGTATGTACGTGACCTTGGACCGGTACGAGAACGACTGGGGTG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2BV26TF 624 0 0
TTTTTCCGATCCAATCTCAAAACCTCAGAGCTATGGCTACCAACTGGAAACTCGATGACC
ATCCCAAGCTCCCCAAGGGCAAGACCGTCGCCATGATCGTCTTAGATGGCTGGGGTGAAT
CTGCCCCTGATGAGTACAACTGCATCCACACCGCTCCAACTCCCACCATGGATTCTCTTA
AAAACGGACGTCCTGATACATGGACGTTGATCAAAGCTCATGGAACAGCTGTTGGGCTCC
CCAGCGAGGACGATATGGGAAACAGTGAGGTTGGTCACAACGCTCTCGGTGCTGGTCGTA
TCTTCGCTCAAGGTGCTAAGCTTTGCGACATTGCTCTTGCTTCCGGCAAAATCTTTGACG
GTGAAGGTTTCAAGTACGTCTCTGAATCTTTCGAGAAGAACACTTTGCACTTCGTTGGTC
TTCTCAGCGACGGTGGAGTTCACTCTCGTCTCGACCAGCTCCAATTGCTGATCAAGGGTT
CTGCTGAACGTGGTGCTAAGAGAATCCGTGTCCACATTCTCACTGACGGTCGTGATGTTT
TGGATGGTTCAAGTGTCGGGTTTGTGGAGACTCTTGAAGCCGACCTCGCTAAGTTGCGTG
AGAACGGTGTGGATGCTCAGATTG

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL6709Contig1 608 2 1 U
GAGCGCTAGCAGTCTGCAACTTGCTACGTCATTGTCTTGAACACGCTGATAAGAATCTTC
GGTTTTTTTCCCAAAAGGAACTTCACCATATCCAAGGTGGAAGGGGGCGGCAAAAACAAG
ACCAGGATGACTATGTTTTCAATTGCTCTGACTCCATTCCTAGCCTTGGTGATATTTTGG
TTTAATCATGGACAAGGCGGACAAAACGTGGCGCATGAGGCTCGCCATGAACTTAATGTA
TTCCAAAGTCCACGCTTATACAACCTTACGCATGAGGTCCAGCCCAAACCTACCATCAGT
GTTCAGAATTCTGAGTCTGAGTCCGAGGCTGTTCCAAATGGTGAGCCTAGCATTGATTGG
CGTACAGCGCGACGCTTGTGGTTCCATGAAGGGAAAGTGGCTAAGGCCGAGGCTGAACCT
ACCTTTGATTGGCGAACCACTCGACGCTTGTGGTACGTTGAGTGAAATGTATGCAAGCGC
CATCAATATATTGTATGTAAAAAAAAATATAGTATATGGTTTGAAAACTAAACATAAAAC
ACGATGTTTTGTAAACTGGACTGCATGAACTTTTAGGTGATTAATTATAACTTCAACAAC
TTTCATCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CG22JQ C 1
AF RR2CG22TF U 1
BS 1 608 RR2CG22TF

RD RR2CG22JQ 608 0 0
GAGCGCTAGCAGTCTGCAACTTGCTACGTCATTGTCTTGAACACGCTGATAAGAATCTTC
GGTTTTTTTCCCAAAAGGAACTTCACCATATCCAAGGTGGAAGGGGGCGGCAAAAACAAG
ACCAGGATGACTATGTTTTCAATTGCTCTGACTCCATTCCTAGCCTTGGTGATATTTTGG
TTTAATCATGGACAAGGCGGACAAAACGTGGCGCATGAGGCTCGCCATGAACTTAATGTA
TTCCAAAGTCCACGCTTATACAACCTTACGCATGAGGTCCAGCCCAAACCTACCATCAGT
GTTCAGAATTCTGAGTCTGAGTCCGAGGCTGTTCCAAATGGTGAGCCTAGCATTGATTGG
CGTACAGCGCGACGCTTGTGGTTCCATGAAGGGAAAGTGGCTAAGGCCGAGGCTGAACCT
ACCTTTGATTGGCGAACCACTCGACGCTTGTGGTACGTTGAGTGAAATGTATGCAAGCGC
CATCAATATATTGTATGTAAAAAAAAATATAGTATATGGTTTGAAAACTAAACATAAAAC
ACGATGTTTTGTAAACTGGACTGCATGAACTTTTAGGTGATTAATTATAACTTCAACAAC
TTTCATCT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2CG22TF 608 0 0
GAGCGCTAGCAGTCTGCAACTTGCTACGTCATTGTCTTGAACACGCTGATAAGAATCTTC
GGTTTTTTTCCCAAAAGGAACTTCACCATATCCAAGGTGGAAGGGGGCGGCAAAAACAAG
ACCAGGATGACTATGTTTTCAATTGCTCTGACTCCATTCCTAGCCTTGGTGATATTTTGG
TTTAATCATGGACAAGGCGGACAAAACGTGGCGCATGAGGCTCGCCATGAACTTAATGTA
TTCCAAAGTCCACGCTTATACAACCTTACGCATGAGGTCCAGCCCAAACCTACCATCAGT
GTTCAGAATTCTGAGTCTGAGTCCGAGGCTGTTCCAAATGGTGAGCCTAGCATTGATTGG
CGTACAGCGCGACGCTTGTGGTTCCATGAAGGGAAAGTGGCTAAGGCCGAGGCTGAACCT
ACCTTTGATTGGCGAACCACTCGACGCTTGTGGTACGTTGAGTGAAATGTATGCAAGCGC
CATCAATATATTGTATGTAAAAAAAAATATAGTATATGGTTTGAAAACTAAACATAAAAC
ACGATGTTTTGTAAACTGGACTGCATGAACTTTTAGGTGATTAATTATAACTTCAACAAC
TTTCATCT

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL6710Contig1 941 2 4 U
GGGGAAACCATTTCACAAGTGAACGGATGAGCAGCTGACAGTGTCAGTCCCTTCATCTCT
CTCTAAAATCATCTCTCTAAAATCCTGTCAACTAAGCTAAGCTTTGTCAATTCCGGTGAC
TGGCTCCGGTGGCTTTCTTAGCACCGGAGCTGGGTTCTCATCTTATTTAAGCTTTAGTTT
GTGTTTCCGGTGGTGCGAAGGGTCAAGCTTCAAAGATGAATCGGTGCATGCAAGTTTTCT
CTTCAAATCTAGCTGTGTTCTGTTCTTGTGCAGATCAAGGTTCATCTTTTGCCTTGATTT
TGCTTCTTCTGTTCTAGATCTATCTGCATGTTCTCTGATTCGTAGTCAGCTTTGATTGAG
CGGTTGTGATTGTAACTCCTCTCTAAGCATGCATGTCACCGGATTCCATGGTGTTCGCCT
TTGGGTTCTCCTCGGTTTCGTTCCTTCACTATTTTGGTTTGTGAGATTAGTCTTGGCCGG
GTTGAATCGATTCGGTCCTTGTCGTTTCCCAAGAGACTTGTTCGAGGTCTCCCCTCATGA
TCTAGCTTGTTTATTGGCGTTCCTAAAGTGGCTTCTCGGCTGACTCCGCCGTTGCCGGTA
CGTACCGGTCACATAGCTATGGTCTCCGTGCTTATTTCTCTGCGCTATTCACTATAGGAG
GTTTCAGTTACCATTGATTGTGGTAAGTTTCTATCAAAGGCGTTTGGAGTTTAGGTGTTC
TTGCTTGTTTCTGGGTTGGTGTTCTTTGTTTGGCTCTTATTGCTTTCTACAGTTTTTGTT
CTTGGTCATGATGGTGTAGCTTCGCTTTGTTTTCTTTGGTTTCCCGATCATCGGGCTATG
TCTCTCCTTTGTTGGAGCTTTGTTTCTGGAGATTTTTAGAATCTGCCAGCTTTATGTATC
ACAAATGTAATCCTAAAAGAATGAATGAAATTCTAGTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AB39TF U 1
AF RR2AB39JQ C 151
BS 1 714 RR2AB39TF
BS 715 715 RR2AB39JQ
BS 716 757 RR2AB39TF
BS 758 941 RR2AB39JQ

RD RR2AB39TF 757 0 0
GGGGAAACCATTTCACAAGTGAACGGATGAGCAGCTGACAGTGTCAGTCCCTTCATCTCT
CTCTAAAATCATCTCTCTAAAATCCTGTCAACTAAGCTAAGCTTTGTCAATTCCGGTGAC
TGGCTCCGGTGGCTTTCTTAGCACCGGAGCTGGGTTCTCATCTTATTTAAGCTTTAGTTT
GTGTTTCCGGTGGTGCGAAGGGTCAAGCTTCAAAGATGAATCGGTGCATGCAAGTTTTCT
CTTCAAATCTAGCTGTGTTCTGTTCTTGTGCAGATCAAGGTTCATCTTTTGCCTTGATTT
TGCTTCTTCTGTTCTAGATCTATCTGCATGTTCTCTGATTCGTAGTCAGCTTTGATTGAG
CGGTTGTGATTGTAACTCCTCTCTAAGCATGCATGTCACCGGATTCCATGGTGTTCGCCT
TTGGGTTCTCCTCGGTTTCGTTCCTTCACTATTTTGGTTTGTGAGATTAGTCTTGGCCGG
GTTGAATCGATTCGGTCCTTGTCGTTTCCCAAGAGACTTGTTCGAGGTCTCCCCTCATGA
TCTAGCTTGTTTATTGGCGTTCCTAAAGTGGCTTCTCGGCTGACTCCGCCGTTGCCGGTA
CGTACCGGTCACATAGCTATGGTCTCCGTGCTTATTTCTCTGCGCTATTCACTATAGGAG
GTTTCAGTTACCATTGATTGTGGTAAGTTTCTATCAAAGGCGTTTGGAGTTTAG*TGTTC
TTGCTTGTTTCTGGGTTGGTGTTCTTTGTTTGGCTCT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2AB39JQ 791 0 0
TGGGTTCTCATCTTATTTAAGCTTTAGTTTGTGTTTCCGGTGGTGCGAAGGGTCAAGCTT
CAAAGATGAATCGGTGCATGCAAGTTTTCTCTTCAAATCTAGCTGTGTTCTGTTCTTGTG
CAGATCAAGGTTCATCTTTTGCCTTGATTTTGCTTCTTCTGTTCTAGATCTATCTGCATG
TTCTCTGATTCGTAGTCAGCTTTGATTGAGCGGTTGTGATTGTAACTCCTCTCTAAGCAT
GCATGTCACCGGATTCCATGGTGTTCGCCTTTGGGTTCTCCTCGGTTTCGTTCCTTCACT
ATTTTGGTTTGTGAGATTAGTCTTGGCCGGGTTGAATCGATTCGGTCCTTGTCGTTTCCC
AAGAGACTTGTTCGAGGTCTCCCCTCATGATCTAGCTTGTTTATTGGCGTTCCTAAAGTG
GCTTCTCGGCTGACTCCGCCGTTGCCGGTACGTACCGGTCACATAGCTATGGTCTCCGTG
CTTATTTCTCTGCGCTATTCACTATAGGAGGTTTCAGTTACCATTGATTGTGGTAAGTTT
CTATCAAAGGCGTTTGGAGTTTAGGTGTTCTTGCTTGTTTCTGGGTTGGTGTTCTTTGTT
TGGCTCTTATTGCTTTCTACAGTTTTTGTTCTTGGTCATGATGGTGTAGCTTCGCTTTGT
TTTCTTTGGTTTCCCGATCATCGGGCTATGTCTCTCCTTTGTTGGAGCTTTGTTTCTGGA
GATTTTTAGAATCTGCCAGCTTTATGTATCACAAATGTAATCCTAAAAGAATGAATGAAA
TTCTAGTGTTC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL6711Contig1 608 2 1 U
GGACAACACTGTCTTGTCTCGTTGTCATCATCATTCAAACAATGACTATCATAGAAGAAC
CCATTCTTTCGAGACTAGATCGTATTGATATCGTGGTGAGGAAGCTAGAAGAGATGAAAG
GAAGCTCACGGAGAAGCTCGAGCCCATCTACTCCATCGTCTAGTGGGACTAAGCCGTCGT
CGTCACTGGATCTGTCTTCGCCTAGGAGTACATGGAAGGTTCGGTGCCGTTCGATGGAGC
AAGTGATGGAAGAGACTGAGAGGAAAGGAAGTTTGCTAGAGAGACTAAACAATGTGGAGG
AGCAAGTTCTTAAGCTGTGTTTGCGGTTTGAAAAAGAGGTCGAAGAAGAGAGAAAGAAAG
AGGATAAGTCGATGGAGAAGGAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGGGGTTGAGAAAGTTCGTAG
ATAAAGTAGTTGGATCTTCTTCTCCGACGAAGAGCCATTCCAAGAGCTGGCGTTGCTGAA
CCACTTTACTTTGAATAATTCAAGTATTCAACAAGCTTTTCATCTTTTAATTTTCTTTGA
AGATTTTGGTTTTTATTCTCTCTTATTAGACTGTTTGTAACTGGATTTTGATGAAAATAT
ACTTCTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DL85JQ C 1
AF RR2DL85TF U 1
BS 1 608 RR2DL85TF

RD RR2DL85JQ 608 0 0
GGACAACACTGTCTTGTCTCGTTGTCATCATCATTCAAACAATGACTATCATAGAAGAAC
CCATTCTTTCGAGACTAGATCGTATTGATATCGTGGTGAGGAAGCTAGAAGAGATGAAAG
GAAGCTCACGGAGAAGCTCGAGCCCATCTACTCCATCGTCTAGTGGGACTAAGCCGTCGT
CGTCACTGGATCTGTCTTCGCCTAGGAGTACATGGAAGGTTCGGTGCCGTTCGATGGAGC
AAGTGATGGAAGAGACTGAGAGGAAAGGAAGTTTGCTAGAGAGACTAAACAATGTGGAGG
AGCAAGTTCTTAAGCTGTGTTTGCGGTTTGAAAAAGAGGTCGAAGAAGAGAGAAAGAAAG
AGGATAAGTCGATGGAGAAGGAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGGGGTTGAGAAAGTTCGTAG
ATAAAGTAGTTGGATCTTCTTCTCCGACGAAGAGCCATTCCAAGAGCTGGCGTTGCTGAA
CCACTTTACTTTGAATAATTCAAGTATTCAACAAGCTTTTCATCTTTTAATTTTCTTTGA
AGATTTTGGTTTTTATTCTCTCTTATTAGACTGTTTGTAACTGGATTTTGATGAAAATAT
ACTTCTCG

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2DL85TF 608 0 0
GGACAACACTGTCTTGTCTCGTTGTCATCATCATTCAAACAATGACTATCATAGAAGAAC
CCATTCTTTCGAGACTAGATCGTATTGATATCGTGGTGAGGAAGCTAGAAGAGATGAAAG
GAAGCTCACGGAGAAGCTCGAGCCCATCTACTCCATCGTCTAGTGGGACTAAGCCGTCGT
CGTCACTGGATCTGTCTTCGCCTAGGAGTACATGGAAGGTTCGGTGCCGTTCGATGGAGC
AAGTGATGGAAGAGACTGAGAGGAAAGGAAGTTTGCTAGAGAGACTAAACAATGTGGAGG
AGCAAGTTCTTAAGCTGTGTTTGCGGTTTGAAAAAGAGGTCGAAGAAGAGAGAAAGAAAG
AGGATAAGTCGATGGAGAAGGAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGGGGTTGAGAAAGTTCGTAG
ATAAAGTAGTTGGATCTTCTTCTCCGACGAAGAGCCATTCCAAGAGCTGGCGTTGCTGAA
CCACTTTACTTTGAATAATTCAAGTATTCAACAAGCTTTTCATCTTTTAATTTTCTTTGA
AGATTTTGGTTTTTATTCTCTCTTATTAGACTGTTTGTAACTGGATTTTGATGAAAATAT
ACTTCTCG

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL6712Contig1 846 2 2 U
GGACACCAACAACACACTAACCTCAATATCATATCTCTCTTCTCATCTCTTTTTATCTTC
TCCCGCTATGAAGCTCACCGCTAGCCTCAGCTCCAAGTTCCTCAGCCTCAGCCCTAAACG
TCTCTTCCGCTCCAAGTCCAAGTCCTCCGTCTCAAGATCCGAGCCTTCCTCCTTCAGCTC
CGGCGCTTCATCATCCGACGGCTCGTACAGTGACCTCAAGGCAGGTCCCGCGGCTACTCC
CGTCAGCGTCCTCCCCGGAGACCAAGATTTTTACTCCGAGCTGGTCCAAGCCTTTAAGCT
CATAGACCGTGACGACGACGGCGTGGTCTCGAGAAGAGACCTAGCCGCACTGCTTAGCAG
GCTTAGCCCTGAGCCTCCGAGTCAAGAAGAGGTTACTCTGATGCTTCAAGAAGTCGATGG
AGGAGACCAAGACGGTTGTATCAGCCTCGAGGAGCTTGCTAGCCACGTGGCGGGAACCTC
CTCTGACTCTGATGAAGGCTCTGTTGCTGAGATGAGAGAGGTGTTTGAGTTTTTCGACGC
GGACCACGACGGGAGGATATCGGCGGAGGAGTTGCATAGAGTTTTTGGAGTTATCGGAGA
CGAGCGGTGCACGTTGGATGAGTGTGTGCGTATGATAGCGACCGTTGACGGGAACGGTGA
CGGTTTTGTTTGCTTCCGTGACTTTTGCCGCATGATGCAGCTTCAAGGTCCAGCGATGAG
TGAATGATCGAATCATTGAGTCATGTTTGTATGATTGATGATGATAATGACATCGTTACG
CATTATTTTATATTACTGTAATAATTTCTATTTTGCGGTGTGGGTATAATTTTGTCACGG
CAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2B475TF U 1
AF RR2B475JQ C 55
BS 1 786 RR2B475TF
BS 787 846 RR2B475JQ

RD RR2B475TF 786 0 0
GGACACCAACAACACACTAACCTCAATATCATATCTCTCTTCTCATCTCTTTTTATCTTC
TCCCGCTATGAAGCTCACCGCTAGCCTCAGCTCCAAGTTCCTCAGCCTCAGCCCTAAACG
TCTCTTCCGCTCCAAGTCCAAGTCCTCCGTCTCAAGATCCGAGCCTTCCTCCTTCAGCTC
CGGCGCTTCATCATCCGACGGCTCGTACAGTGACCTCAAGGCAGGTCCCGCGGCTACTCC
CGTCAGCGTCCTCCCCGGAGACCAAGATTTTTACTCCGAGCTGGTCCAAGCCTTTAAGCT
CATAGACCGTGACGACGACGGCGTGGTCTCGAGAAGAGACCTAGCCGCACTGCTTAGCAG
GCTTAGCCCTGAGCCTCCGAGTCAAGAAGAGGTTACTCTGATGCTTCAAGAAGTCGATGG
AGGAGACCAAGACGGTTGTATCAGCCTCGAGGAGCTTGCTAGCCACGTGGCGGGAACCTC
CTCTGACTCTGATGAAGGCTCTGTTGCTGAGATGAGAGAGGTGTTTGAGTTTTTCGACGC
GGACCACGACGGGAGGATATCGGCGGAGGAGTTGCATAGAGTTTTTGGAGTTATCGGAGA
CGAGCGGTGCACGTTGGATGAGTGTGTGCGTATGATAGCGACCGTTGACGGGAACGGTGA
CGGTTTTGTTTGCTTCCGTGACTTTTGCCGCATGATGCAGCTTCAAGGTCCAGCGATGAG
TGAATGATCGAATCATTGAGTCATGTTTGTATGATTGATGATGATAATGACATCGTTACG
CATTAT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2B475JQ 792 0 0
ATCTTCTCCCGCTATGAAGCTCACCGCTAGC*TCAGCTCCAAGTTCCTCAGCCTCAGCCC
TAAACGTCTCTTCCGCTCCAAGTCCAAGTCCTCCGTCTCAAGATCCGAGCCTTCCTCCTT
CAGCTCCGGCGCTTCATCATCCGACGGCTCGTACAGTGACCTCAAGGCAGGTCCCGCGGC
TACTCCCGTCAGCGTCCTCCCCGGAGACCAAGATTTTTACTCCGAGCTGGTCCAAGCCTT
TAAGCTCATAGACCGTGACGACGACGGCGTGGTCTCGAGAAGAGACCTAGCCGCACTGCT
TAGCAGGCTTAGCCCTGAGCCTCCGAGTCAAGAAGAGGTTACTCTGATGCTTCAAGAAGT
CGATGGAGGAGACCAAGACGGTTGTATCAGCCTCGAGGAGCTTGCTAGCCACGTGGCGGG
AACCTCCTCTGACTCTGATGAAGGCTCTGTTGCTGAGATGAGAGAGGTGTTTGAGTTTTT
CGACGCGGACCACGACGGGAGGATATCGGCGGAGGAGTTGCATAGAGTTTTTGGAGTTAT
CGGAGACGAGCGGTGCACGTTGGATGAGTGTGTGCGTATGATAGCGACCGTTGACGGGAA
CGGTGACGGTTTTGTTTGCTTCCGTGACTTTTGCCGCATGATGCAGCTTCAAGGTCCAGC
GATGAGTGAATGATCGAATCATTGAGTCATGTTTGTATGATTGATGATGATAATGACATC
GTTACGCATTATTTTATATTACTGTAATAATTTCTATTTTGCGGTGTGGGTATAATTTTG
TCACGGCAAAGC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL6713Contig1 1119 2 10 U
GGAGGCGAAGAAATCTCCCTTCTCCGTTAAGGTCGGTCTGGCTCAGATGCTCCGCGGTGG
AGTTATCATGGACGTCGTCAACGCCGAGCAGGCTCGCATCGCGGAGGAAGCAGGTGCTTG
CGCCGTCATGGCTCTGGAGCGTGTCCCCGCCGATATCCGCGCGCAGGGAGGCGTTGCACG
GATGAGCGATCCACAGATGATAAAGGAGATCAAGCAGGCCGTTACGATTCCGGTGATGGC
GAAGGCTAGGATCGGTCATTTCGTGGAGGCGCAGATCCTCGAGGCGATAGGGATCGATTA
CATCGACGAGAGCGAGGTCCTGACTCTCGCCGACGAAGACAACCACATCAACAAGCATAA
TTTCAGGATCCCTTTCGTCTGCGGCTGCCGGAACCTCGGTGAGGCTCTCAGGAGGATCCG
CGAAGGCGCGGCGATGATTAGGACTAAAGGCGAGGCTGGGACTGGGAACATTGTGGAGGC
CGTTAGGCACGTGAGGTCCGTTATGGGTGACATTAGGGTTTTGAGGAACATGGATGACGA
CGAGGTCTTCACTTTCGCCAAGAAACTAGCTGCTCCTTACGACCTCGTGATGCAGACCAA
ACAGCTTGGCCGTCTTCCCGTGGTTCAGTTCGCGGCAGGTGGAGTGGCTACTCCGGCAGA
TGCGGCCCTCATGATGCAGCTTGGGTGCGACGGTGTCTTCGTGGGTTCCGGTATCTTCAA
GAGTGGTGACCCGGCTCGTAGGGCGCGTGCGATTGTGCAGGCTGTGACTCATTACAGTGA
CCCTGAGATGCTTGTGGAGGTGAGCTGTGGGCTTGGAGAAGCCATGGTTGGGATCAATCT
CAATGATGCCAAGGTTGAGAGGTTCGCTAACCGCTCCGAGTGATACCAAAACATAAGGTA
AAAGTTTCAGACAGAAATGGTTTCAGACCATTTTGCAGTCATCTTAAAAAAAGAAAAAAG
AAAAGACGATATTATGATAGTTTGTTGTATCCTTTTGTGTTTGCCTTTATTTATCTTTGG
TTAGTGATTGTAATCGATTTCTTCTACTTGCAAGAACAAGTTGTCGTCAGTTATCATAAT
AATAATAATAAAATGTACTACTCTCTTTGATCTGTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD84TF U 1
AF RR2DD84JQ C 407
BS 1 638 RR2DD84TF
BS 639 639 RR2DD84JQ
BS 640 719 RR2DD84TF
BS 720 720 RR2DD84JQ
BS 721 742 RR2DD84TF
BS 743 743 RR2DD84JQ
BS 744 760 RR2DD84TF
BS 761 761 RR2DD84JQ
BS 762 782 RR2DD84TF
BS 783 1119 RR2DD84JQ

RD RR2DD84TF 782 0 0
GGAGGCGAAGAAATCTCCCTTCTCCGTTAAGGTCGGTCTGGCTCAGATGCTCCGCGGTGG
AGTTATCATGGACGTCGTCAACGCCGAGCAGGCTCGCATCGCGGAGGAAGCAGGTGCTTG
CGCCGTCATGGCTCTGGAGCGTGTCCCCGCCGATATCCGCGCGCAGGGAGGCGTTGCACG
GATGAGCGATCCACAGATGATAAAGGAGATCAAGCAGGCCGTTACGATTCCGGTGATGGC
GAAGGCTAGGATCGGTCATTTCGTGGAGGCGCAGATCCTCGAGGCGATAGGGATCGATTA
CATCGACGAGAGCGAGGTCCTGACTCTCGCCGACGAAGACAACCACATCAACAAGCATAA
TTTCAGGATCCCTTTCGTCTGCGGCTGCCGGAACCTCGGTGAGGCTCTCAGGAGGATCCG
CGAAGGCGCGGCGATGATTAGGACTAAAGGCGAGGCTGGGACTGGGAACATTGTGGAGGC
CGTTAGGCACGTGAGGTCCGTTATGGGTGACATTAGGGTTTTGAGGAACATGGATGACGA
CGAGGTCTTCACTTTCGCCAAGAAACTAGCTGCTCCTTACGACCTCGTGATGCAGACCAA
ACAGCTTGGCCGTCTTCCCGTGGTTCAGTTCGCGGCAG*TGGAGTGGCTACTCCGGCAGA
TGCGGCCCTCATGATGCAGCTTGGGTGCGACGGTGTCTTCGTGGGTTCCGGTATCTTCA*
GAGTGGTGACCCGGCTCGTAGG*CGCGTGCGATTGTGCAG*CTGTGACTCATTACAGTGA
CC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2DD84JQ 713 0 0
CTCAGGAGGATCCGCGAAGGCGCGGCGATGATTAGGACTAAAGGCGAGGCTGGGACTGGG
AACATTGTGGAGGCCGTTAGGCACGTGAGGTCCGTTATGGGTGACATTAGGGTTTTGAGG
AACATGGATGACGACGAGGTCTTCACTTTCGCCAAGAAACTAGCTGCTCCTTACGACCTC
GTGATGCAGACCAAACAGCTTGGCCGTCTTCCCGTGGTTCAGTTCGCGGCAGGTGGAGTG
GCTACTCCGGCAGATGCGGCCCTCATGATGCAGCTTGGGTGCGACGGTGTCTTCGTGGGT
TCCGGTATCTTCAAGAGTGGTGACCCGGCTCGTAGGGCGCGTGCGATTGTGCAGGCTGTG
ACTCATTACAGTGACCCTGAGATGCTTGTGGAGGTGAGCTGTGGGCTTGGAGAAGCCATG
GTTGGGATCAATCTCAATGATGCCAAGGTTGAGAGGTTCGCTAACCGCTCCGAGTGATAC
CAAAACATAAGGTAAAAGTTTCAGACAGAAATGGTTTCAGACCATTTTGCAGTCATCTTA
AAAAAAGAAAAAAGAAAAGACGATATTATGATAGTTTGTTGTATCCTTTTGTGTTTGCCT
TTATTTATCTTTGGTTAGTGATTGTAATCGATTTCTTCTACTTGCAAGAACAAGTTGTCG
TCAGTTATCATAATAATAATAATAAAATGTACTACTCTCTTTGATCTGTTTTC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL6714Contig1 725 2 1 U
GGGTGTTCTGTCGGAAAGAAACGATGATGAAGCTGCAAGGAGGACTTCTCCAATGGAGTC
CAAGCAGCTTAATTCCGTCGGCAATCAGAACAACAACGCGTCTCTCTATCTCCGCCTGCG
TCGTGGAGCGTAACCACCAGCTGACGGCGAGGGAGAGGCGGCAGCTCCGGAACGAGCGGA
GGGAGAGCAGATCGGGGTACAGCTGGAAGGAAGAAGTGGAGGAGCGTCTGATCAAGAAAC
CGAAGAAACGGTACCAGTCGTGGACGGAGGAGCTGAATCTGGACACTTTGGCTGAGTCGG
GTCAGCAGTGGTGGGTGGTCAGAGTCTCGAGAGTAAGGGGTCACGAGACTGCTCAAGTGC
TAGCTCGAGCTCTCGCTCGTCAGTTCCCTGAGATGGAATTCACGGTATATGCTCCAGCTG
TTCAGGTGAAGAGGAAGCTGAAGAACGGTTCAATATCCGTTAAACCGAGACCCGTGTTCC
CCGGTTGTATTTTCATTAGATGTATATTGAACAAAGAGATTCATGACGCTATAAGAGAAG
TTGAGGGAGTTGGAGGTTTCATAGGTTCAAAAGTTGGAAACACCAAGAGGCAGATTAATG
AGCCGAGACCTGTGGACGACAGTGACTTGGAAGCCATTTTCAAACAAGCGAAAGAAGAGC
AAGAGAAAGCAGACAGCGAGTTTGATGAGGGAGAACGAGCCGAGGAAGAAGCGAGTTTAG
CATTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2DJ10TF U 1
AF RR2B201TF U 1
BS 1 725 RR2B201TF

RD RR2DJ10TF 685 0 0
GGGTGTTCTGTCGGAAAGAAACGATGATGAAGCTGCAAGGAGGACTTCTCCAATGGAGTC
CAAGCAGCTTAATTCCGTCGGCAATCAGAACAACAACGCGTCTCTCTATCTCCGCCTGCG
TCGTGGAGCGTAACCACCAGCTGACGGCGAGGGAGAGGCGGCAGCTCCGGAACGAGCGGA
GGGAGAGCAGATCGGGGTACAGCTGGAAGGAAGAAGTGGAGGAGCGTCTGATCAAGAAAC
CGAAGAAACGGTACCAGTCGTGGACGGAGGAGCTGAATCTGGACACTTTGGCTGAGTCGG
GTCAGCAGTGGTGGGTGGTCAGAGTCTCGAGAGTAAGGGGTCACGAGACTGCTCAAGTGC
TAGCTCGAGCTCTCGCTCGTCAGTTCCCTGAGATGGAATTCACGGTATATGCTCCAGCTG
TTCAGGTGAAGAGGAAGCTGAAGAACGGTTCAATATCCGTTAAACCGAGACCCGTGTTCC
CCGGTTGTATTTTCATTAGATGTATATTGAACAAAGAGATTCATGACGCTATAAGAGAAG
TTGAGGGAGTTGGAGGTTTCATAGGTTCAAAAGTTGGAAACACCAAGAGGCAGATTAATG
AGCCGAGACCTGTGGACGACAGTGACTTGGAAGCCATTTTCAAACAAGCGAAAGAAGAGC
AAGAGAAAGCAGACAGCGAGTTTGA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2B201TF 725 0 0
GGGTGTTCTGTCGGAAAGAAACGATGATGAAGCTGCAAGGAGGACTTCTCCAATGGAGTC
CAAGCAGCTTAATTCCGTCGGCAATCAGAACAACAACGCGTCTCTCTATCTCCGCCTGCG
TCGTGGAGCGTAACCACCAGCTGACGGCGAGGGAGAGGCGGCAGCTCCGGAACGAGCGGA
GGGAGAGCAGATCGGGGTACAGCTGGAAGGAAGAAGTGGAGGAGCGTCTGATCAAGAAAC
CGAAGAAACGGTACCAGTCGTGGACGGAGGAGCTGAATCTGGACACTTTGGCTGAGTCGG
GTCAGCAGTGGTGGGTGGTCAGAGTCTCGAGAGTAAGGGGTCACGAGACTGCTCAAGTGC
TAGCTCGAGCTCTCGCTCGTCAGTTCCCTGAGATGGAATTCACGGTATATGCTCCAGCTG
TTCAGGTGAAGAGGAAGCTGAAGAACGGTTCAATATCCGTTAAACCGAGACCCGTGTTCC
CCGGTTGTATTTTCATTAGATGTATATTGAACAAAGAGATTCATGACGCTATAAGAGAAG
TTGAGGGAGTTGGAGGTTTCATAGGTTCAAAAGTTGGAAACACCAAGAGGCAGATTAATG
AGCCGAGACCTGTGGACGACAGTGACTTGGAAGCCATTTTCAAACAAGCGAAAGAAGAGC
AAGAGAAAGCAGACAGCGAGTTTGATGAGGGAGAACGAGCCGAGGAAGAAGCGAGTTTAG
CATTG

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL6715Contig1 1084 2 2 U
CATGGACGATCGGGCTGAGAAGGCGATGGTCAACGACGAAACGGAGAAGAAGAAGAAGAA
TCGTGAATTGACACGTGAGAATGGGGAACTGAAGGAGAAGGCAGCGAGATTATCGGGAGA
GATCGAGGAGATGAAAGGCGTGGAAGCCGAGATGAAACAGAGCTTCGAAGAGATGGAGAC
GGAGATCAAGCAGCTGGAGGAAGAAAAGAAGGTTTTGGAGACTGTGTCGGCTCGAGCCGT
GGAGCTCGAGAGCGAGGTGGAGAAGATTCAGGAAGATCTCGTCGGCGCGTTGAGACACGG
AGACGAGAGGGAGCTGGAGTTGGAGGAGCTGAAGAGAGAGTTGGCGGAGAAAGGAGCGAG
CTTTGAGAGGTGCGGGAAGGAAGCGGGTAGTTTGAGGAAAGAGAGAGGCGAGATGGAGAA
GAAAGGTAGGGACTTGGAGAGGAAAGTAGGGGTTTTGGAAGTGAGGTTGATGGAGGAGAG
GAGCAAGAAAGTTAGGGTAGAGGAGGAGATGAGGGAGAAGGGTAACCAGAAAGAGGGAGA
GATCGAGGAGCTGAAGAGGAAAGTCTCTGACTTTAAAATGGGTTTGGTGAAGGGTATGAT
GGAGCTGGAGAGATGGGAGGTCGAGAAGAAGCTAATAGAGGAAGATTTGAGTGAGTCGCA
AATAAAGGAAACGGAGTTGGAGCTGAGGAAGGAGGAGTTGTTGAAGATGGTTGATGAAGC
TGAGAAAACGCTGCTTGTGTTGAACGAGAGGATCATGGAGCCTACTACTAATGGAGTCAG
AGACATAAAGGATGGTGGTGGCCAAAAATGTTCCTTGGAAGGACAATTGCATTGGCCAGT
GGTTGGAGCTTTGGGTTTGGTAGCAGCAGCGACAGTGTTTGTATGCTACTCTAAATGGAC
TTGATTCAGTAATATTGAGGAGCTGAAGGCCCATAACTTTTTGCAGTTCCGCAGTCATAT
AGGTGCCCATAACTTTTTTGGTCTCGAGTTTGTGATGTTTTTGGTTTGTTGGATATGTTT
TGTTTGTTTGAGAGATGATTGATGAATCTTTGGCTTTGGGGCTATGAATGCATTTGATAT
CACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2BA02TF U 1
AF RR2BA02JQ C 359
BS 1 722 RR2BA02TF
BS 723 1084 RR2BA02JQ

RD RR2BA02TF 722 0 0
CATGGACGATCGGGCTGAGAAGGCGATGGTCAACGACGAAACGGAGAAGAAGAAGAAGAA
TCGTGAATTGACACGTGAGAATGGGGAACTGAAGGAGAAGGCAGCGAGATTATCGGGAGA
GATCGAGGAGATGAAAGGCGTGGAAGCCGAGATGAAACAGAGCTTCGAAGAGATGGAGAC
GGAGATCAAGCAGCTGGAGGAAGAAAAGAAGGTTTTGGAGACTGTGTCGGCTCGAGCCGT
GGAGCTCGAGAGCGAGGTGGAGAAGATTCAGGAAGATCTCGTCGGCGCGTTGAGACACGG
AGACGAGAGGGAGCTGGAGTTGGAGGAGCTGAAGAGAGAGTTGGCGGAGAAAGGAGCGAG
CTTTGAGAGGTGCGGGAAGGAAGCGGGTAGTTTGAGGAAAGAGAGAGGCGAGATGGAGAA
GAAAGGTAGGGACTTGGAGAGGAAAGTAGGGGTTTTGGAAGTGAGGTTGATGGAGGAGAG
GAGCAAGAAAGTTAGGGTAGAGGAGGAGATGAGGGAGAAGGGTAACCAGAAAGAGGGAGA
GATCGAGGAGCTGAAGAGGAAAGTCTCTGACTTTAAAATGGGTTTGGTGAAGGGTATGAT
GGAGCTGGAGAGATGGGAGGTCGAGAAGAAGCTAATAGAGGAAGATTTGAGTGAGTCGCA
AATAAAGGAAACGGAGTTGGAGCTGAGGAAGGAGGAGTTGTTGAAGATGGTTGATGAAGC
TG

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2BA02JQ 726 0 0
AGCTTTGAGAGGTGCGGGAAGGAAGCGGGTAGTTTGAGGAAAGAGAGAGGCGAGATGGAG
AAGAAAGGTAGGGACTTGGAGAGGAAAGTAGGGGTTTTGGAAGTGAGGTTGATGGAGGAG
AGGAGCAAGAAAGTTAGGGTAGAGGAGGAGATGAGGGAGAAGGGTAACCAGAAAGAGGGA
GAGATCGAGGAGCTGAAGAGGAAAGTTTCTGACTTTAAAATGGGTTTGGTGAAGGGTATG
ATGGAGCTGGAGAGATGGGAGGTCGAGAAGAAGCTAATAGAGGAAGATTTGAGTGAGTCG
CAAATAAAGGAAACGGAGTTGGAGCTGAGGAAGGAGGAGTTGTTGAAGATGGTTGATGAA
GCTGAGAAAACGCTGCTTGTGTTGAACGAGAGGATCATGGAGCCTACTACTAATGGAGTC
AGAGACATAAAGGATGGTGGTGGCCAAAAATGTTCCTTGGAAGGACAATTGCATTGGCCA
GTGGTTGGAGCTTTGGGTTTGGTAGCAGCAGCGACAGTGTTTGTATGCTACTCTAAATGG
ACTTGATTCAGTAATATTGAGGAGCTGAAGGCCCATAACTTTTTGCAGTTCCGCAGTCAT
ATAGGTGCCCATAACTTTTTTGGTCTCGAGTTTGTGATGTTTTTGGTTTGTTGGATATGT
TTTGTTTGTTTGAGAGATGATTGATGAATCTTTGGCTTTGGGGCTATGAATGCATTTGAT
ATCACT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL6716Contig1 545 2 1 U
GGAAACATAAATGGAGGGTCTAATTCCGTTTGTTTACCGAGCCGTCATGCAGATCCGTTA
TGGCCACGAGCGTTCTTCTTCTTACTATGTTCGTCTTTCGGGCGATTCAGGCCGGTTTGG
GAGAACCGGTTTGGAAGTGTCGGGTTTTGGATCTTCCTCTAATATGGCGTCGTCGAAGAC
CACGAGCACGAAGACCACGTTTTCTGTTTCCAAGGGAGACCAGTCACCAGTTCATCGTCA
GGTTGTGATGTGATGCACACGGGCTCCAAAGGGAACGTGAAGATGCTCGCAAGGGAAAGG
GTTGGTTTGTAACGTTGTGATTACTGTTATAGGCTTAGTGATTGATATGTGTTTATGATT
ATATAGACTCGGACCGGTCGAATAAACCTGATGTAATAATTCGGGTGGGGAGATTAATTC
TCTAAGCGTGGGCTTTTAACCCAAAGGGTAACCTCATGGGTTTTTTTGTGTGCTTGTGTG
TTTCTACCAAGGAACTTTAACTGTATAAAAATTATATGAATCTCTTGGTTTGTTCGTGAG
AAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2FV22JQ C 1
AF RR2FV22TF U 1
BS 1 545 RR2FV22TF

RD RR2FV22JQ 545 0 0
GGAAACATAAATGGAGGGTCTAATTCCGTTTGTTTACCGAGCCGTCATGCAGATCCGTTA
TGGCCACGAGCGTTCTTCTTCTTACTATGTTCGTCTTTCGGGCGATTCAGGCCGGTTTGG
GAGAACCGGTTTGGAAGTGTCGGGTTTTGGATCTTCCTCTAATATGGCGTCGTCGAAGAC
CACGAGCACGAAGACCACGTTTTCTGTTTCCAAGGGAGACCAGTCACCAGTTCATCGTCA
GGTTGTGATGTGATGCACACGGGCTCCAAAGGGAACGTGAAGATGCTCGCAAGGGAAAGG
GTTGGTTTGTAACGTTGTGATTACTGTTATAGGCTTAGTGATTGATATGTGTTTATGATT
ATATAGACTCGGACCGGTCGAATAAACCTGATGTAATAATTCGGGTGGGGAGATTAATTC
TCTAAGCGTGGGCTTTTAACCCAAAGGGTAACCTCATGGGTTTTTTTGTGTGCTTGTGTG
TTTCTACCAAGGAACTTTAACTGTATAAAAATTATATGAATCTCTTGGTTTGTTCGTGAG
AAACC

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2FV22TF 545 0 0
GGAAACATAAATGGAGGGTCTAATTCCGTTTGTTTACCGAGCCGTCATGCAGATCCGTTA
TGGCCACGAGCGTTCTTCTTCTTACTATGTTCGTCTTTCGGGCGATTCAGGCCGGTTTGG
GAGAACCGGTTTGGAAGTGTCGGGTTTTGGATCTTCCTCTAATATGGCGTCGTCGAAGAC
CACGAGCACGAAGACCACGTTTTCTGTTTCCAAGGGAGACCAGTCACCAGTTCATCGTCA
GGTTGTGATGTGATGCACACGGGCTCCAAAGGGAACGTGAAGATGCTCGCAAGGGAAAGG
GTTGGTTTGTAACGTTGTGATTACTGTTATAGGCTTAGTGATTGATATGTGTTTATGATT
ATATAGACTCGGACCGGTCGAATAAACCTGATGTAATAATTCGGGTGGGGAGATTAATTC
TCTAAGCGTGGGCTTTTAACCCAAAGGGTAACCTCATGGGTTTTTTTGTGTGCTTGTGTG
TTTCTACCAAGGAACTTTAACTGTATAAAAATTATATGAATCTCTTGGTTTGTTCGTGAG
AAACC

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 2

CO CL6717Contig1 864 2 16 U
GGGTTACACCGGATCGAGTTTCATTTTATTATTCTTTAAATCTGCAAAAAAAGATGGAGA
AAGCGATCGAGAGGCAACGAGTTCTTCTTGAACATCTCCGTCCTTCTTCCTCCTCCTCAC
ACAGCTTCGAAGGCTCTCTCTCTGCATCTGCTTGCGTGGCTGGAGACAGTGCTGCGTACC
AGAGGACCTCTCTCTATGGAGATGATGTTGTCATCGTCGCGGCGCATAGGACAGCACTTT
GCAAGGCCAAACGTGGCAACTTCAAGGATACTTATCCTGATGATCTCCTTGCACCTGTTT
TGAGGGCATTGATTGAGAAGACAAACCTAGACCCAAGTGAAGTTAGTGACATTGTTGTGG
GTACTGTTTTGGCTCCGGGGTCTCAGAGAGCCAGCGAATGCAGGATGTCTGCTTTCTACG
CTGGTTTCCCCGAAACCGTGGCCGTAAGAACCGTGAATAGACAGTGCTCCTCTGGGCTTC
AGGCTGTCGCTGATGTGGCTGCTGCCATCAAAGCTGGATTTTATGATATCGGTATTGGGG
CTGGATTGGAGTCCATGACTACCAATCCCATGGCATGGGAAGGGTCAGTCAACCCAGCGG
TGAAGAAGTTTGCGCAAGCACAGAGTTGTCTTCTCCCTATGGGTGTTACTTCCGAAAATG
TAGCACACCGCTTTGGTGTTTCAAGGCACGAGCAAGATCAAGCTGCTGTCGACTCGCACA
GGAAGGCAGCTGCTGCTACTGCTGCTGGTAAATTCAAGATGAGATCATTCCTGTCAACTA
AGCTGGTTGACCCAAGACAGGTGACGAGATCCCATCACAGTTTCTGTTGATGATGGGATC
CGTCCAAGTACTACTCTGCACTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F536TF U 1
AF RR2A152TF U 7
BS 1 118 RR2F536TF
BS 119 119 RR2A152TF
BS 120 328 RR2F536TF
BS 329 329 RR2A152TF
BS 330 358 RR2F536TF
BS 359 359 RR2A152TF
BS 360 391 RR2F536TF
BS 392 392 RR2A152TF
BS 393 466 RR2F536TF
BS 467 467 RR2A152TF
BS 468 517 RR2F536TF
BS 518 518 RR2A152TF
BS 519 529 RR2F536TF
BS 530 530 RR2A152TF
BS 531 675 RR2F536TF
BS 676 864 RR2A152TF

RD RR2F536TF 675 0 0
GGGTTACACCGGATCGAGTTTCATTTTATTATTCTTTAAATCTGCAAAAAAAGATGGAGA
AAGCGATCGAGAGGCAACGAGTTCTTCTTGAACATCTCCGTCCTTCTTCCTCCTCCTCCC
ACAGCTTCGAAGGCTCTCTCTCTGCATCTGCTTGCGTGGCTGGAGACAGTGCTGCGTACC
AGAGGACCTCTCTCTATGGAGATGATGTTGTCATCGTCGCGGCGCATAGGACAGCACTTT
GCAAGGCCAAACGTGGCAACTTCAAGGATACTTATCCTGATGATCTCCTTGCACCTGTTT
TGAGGGCATTGATTGAGAAGACAAACCTTGACCCAAGTGAAGTTAGTGACATTGTTGTTG
GTACTGTTTTGGCTCCGGGGTCTCAGAGAGCTAGCGAATGCAGGATGTCTGCTTTCTACG
CTGGTTTCCCCGAAACCGTGGCCGTAAGAACCGTGAATAGACAGTGTTCCTCTGGGCTTC
AGGCTGTCGCTGATGTGGCTGCTGCCATCAAAGCTGGGTTTTATGATATTGGTATTGGGG
CTGGATTGGAGTCCATGACTACCAATCCCATGGCATGGGAAGGGTCAGTCAACCCAGCGG
TGAAGAAGTTTGCGCAAGCACAGAGTTGTCTTCTCCCTATGGGTGTTACTTCCGAAAATG
TAGCACACCGCTTTG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2A152TF 858 0 0
CACCGGATCGAGTTTCATTTTATTATTCTTTAAATCTGCAAAAAAAGATGGAGAAAGCGA
TCGAGAGGCAACGAGTTCTTCTTGAACATCTCCGTCCTTCTTCTTCCTCCTCACACAGCT
TCGAAGGCTCTCTCTCTGCATCTGCTTGCGTGGCTGGAGACAGTGCTGCGTACCAGAGGA
CCTCTCTCTATGGAGATGATGTTGTCATCGTCGCGGCGCATAGGACAGCACTTTGCAAGG
CTAAACGTGGCAACTTCAAGGATACTTATCCTGATGATCTCCTTGCACCTGTTTTGAGGG
CATTGATTGAGAAGACAAATCTAGACCCAAGTGAAGTTAGTGACATTGTTGTGGGTACTG
TTTTGGCTCCGGGGTCTCAGAGAGCCAGCGAATGCAGGATGTCTGCTTTCTACGCTGGTT
TCCCTGAAACCGTGGCTGTAAGAACCGTGAATAGACAGTGCTCCTCTGGGCTTCAGGCTG
TTGCTGATGTGGCTGCTGCCATCAAAGCTGGATTTTATGATATCGGTATTGGGGCTGGAT
TGGAGTCCATGACTACCAATCCGATGGCATGGGAAGGGTCAGTCAACCCAGCGGTGAAGA
AGTTTGCGCAAGCACAGAGTTTTCTTCTCCCTATGGGTGTTACTTCCGAAAATGTAGCAC
ACCGCTTTGGTGTTTCAAGGCACGAGCAAGATCAAGCTGCTGTCGACTCGCACAGGAAGG
CAGCTGCTGCTACTGCTGCTGGTAAATTCAAGATGAGATCATTCCTGTCAACTAAGCTGG
TTGACCCAAGACAGGTGACGAGATCCCATCACAGTTTCTGTTGATGATGGGATCCGTCCA
AGTACTACTCTGCACTCT

QA 1 858 1 858
DS 



AS 1 2

CO CL6718Contig1 601 2 1 U
GGATTCCATATCAAAGCTTAAAACACTTTATACGACAACCACCCCCAAAAAGAAAAAACA
ACCGCCGCTTTCAAAATGGGTTTCAAATTGGTTTCGAGTCTTTCGACATTTGAAGACACT
ATAAAAGGACAGTTAATGGTTCGCAGAAACACACACTTCGTGCTGGTTGATGGAATGTCT
AAACTGATGACTCGCAAAGGCAATCATTTTTGGTCATCGGATTTCCATATTGCTGGTCTC
CAGTGGAGGTTGATTATTGGTTGGAAAAAAGCCCAAAATGACAATTTATATCTTCATCTC
CGGATCATCGGTGAAAAGTGTACCGGTCCTAATTGGAGTGCAAGAATCATTGCATTAACC
TTGAGGGAGCAGACGATGGCACTTGCGCCTCTCGCTCTCCTACTGCTAAATGTAACTGTT
ACTTCCCATGCTCTCCCAAGTCTTAAATGTATTGGTTACTTTTGATGCGATTAATCTACC
AAAACTCTATGGTGCTTATTTGTGTGTGATTTTCTATAAAATAAGTCTGTACTTCATGAG
TGGCCTAATGACATGTATACCTATGTTTATGTTGGATTGGTTATAATATAAACTTTAATG
C


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2H142JQ C 1
AF RR2H142TF U 1
BS 1 601 RR2H142TF

RD RR2H142JQ 601 0 0
GGATTCCATATCAAAGCTTAAAACACTTTATACGACAACCACCCCCAAAAAGAAAAAACA
ACCGCCGCTTTCAAAATGGGTTTCAAATTGGTTTCGAGTCTTTCGACATTTGAAGACACT
ATAAAAGGACAGTTAATGGTTCGCAGAAACACACACTTCGTGCTGGTTGATGGAATGTCT
AAACTGATGACTCGCAAAGGCAATCATTTTTGGTCATCGGATTTCCATATTGCTGGTCTC
CAGTGGAGGTTGATTATTGGTTGGAAAAAAGCCCAAAATGACAATTTATATCTTCATCTC
CGGATCATCGGTGAAAAGTGTACCGGTCCTAATTGGAGTGCAAGAATCATTGCATTAACC
TTGAGGGAGCAGACGATGGCACTTGCGCCTCTCGCTCTCCTACTGCTAAATGTAACTGTT
ACTTCCCATGCTCTCCCAAGTCTTAAATGTATTGGTTACTTTTGATGCGATTAATCTACC
AAAACTCTATGGTGCTTATTTGTGTGTGATTTTCTATAAAATAAGTCTGTACTTCATGAG
TGGCCTAATGACATGTATACCTATGTTTATGTTGGATTGGTTATAATATAAACTTTAATG
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2H142TF 601 0 0
GGATTCCATATCAAAGCTTAAAACACTTTATACGACAACCACCCCCAAAAAGAAAAAACA
ACCGCCGCTTTCAAAATGGGTTTCAAATTGGTTTCGAGTCTTTCGACATTTGAAGACACT
ATAAAAGGACAGTTAATGGTTCGCAGAAACACACACTTCGTGCTGGTTGATGGAATGTCT
AAACTGATGACTCGCAAAGGCAATCATTTTTGGTCATCGGATTTCCATATTGCTGGTCTC
CAGTGGAGGTTGATTATTGGTTGGAAAAAAGCCCAAAATGACAATTTATATCTTCATCTC
CGGATCATCGGTGAAAAGTGTACCGGTCCTAATTGGAGTGCAAGAATCATTGCATTAACC
TTGAGGGAGCAGACGATGGCACTTGCGCCTCTCGCTCTCCTACTGCTAAATGTAACTGTT
ACTTCCCATGCTCTCCCAAGTCTTAAATGTATTGGTTACTTTTGATGCGATTAATCTACC
AAAACTCTATGGTGCTTATTTGTGTGTGATTTTCTATAAAATAAGTCTGTACTTCATGAG
TGGCCTAATGACATGTATACCTATGTTTATGTTGGATTGGTTATAATATAAACTTTAATG
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL6719Contig1 808 2 2 U
GGAGAGTCGTTAACTAGAAAGATAATCAAACTGCAGAGAGGAAGAAGGAAGAATCTTTGA
TTCTTGAAAATGGAGAAACCAAAAAAGAGACGAGTGATTCTCTTCCCGTTACCATTACAA
GGCTGCATAAACCCTATGCTTCAGCTAGCAAAGATACTATTCTCAAGAGGCTTCTCAATC
ACCATCATCCACACGCGCTTCAACGCGCCCAAATCATCAGACCACCCTCTCTTCACTTTC
CTACAGCTCCCCAAGGCAGAGAGTGGATCGAGTCATTACCATTAGGGTTCATGGAGGGTC
TTAACGGGAAGGGAAAGATAGTGAGTGAAATGGGCACCGCAGATAGATGTTCTCGCGCAT
AGAGCCACGGGTGGGTTTTTGAGTCATAATGGATGGAACTCGACGCTAGAGAGTATATGC
GAAGGGGTTCCTATGATCAGCTTGCCTTTTGTGTGGGACCAGTGGCTCAACGCGAGGTTC
GTTAGTGATGTATGGAGGATAGGGAGTCACTTGGAAGGTCGCATAGAGAGAAGAGTGATC
GAGAGAGCCGTGACAAGACTAATGGTTGAACCCGATGGGGAAGAGATTCGGGAGAGAGTT
AAAGTGCTGCGAGATGAAGTAAGAAGATCGGTTCAACGAGGAGGGTCGTCATCTCGGCAT
CTAGATGATCTGGTTGATCGTATTACATCCTTCTAGCTTCATAGTTTGAATAGAGTGTGA
TCACTATTCATTAGAAAAAAAAGAATGTGACCGTTATATGTTGTATATGTGACTCATGAA
CTTCTTAATAAAACTATTTGCTCTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ21TF U 1
AF RR2FZ21JQ C 61
BS 1 661 RR2FZ21TF
BS 662 808 RR2FZ21JQ

RD RR2FZ21TF 661 0 0
GGAGAGTCGTTAACTAGAAAGATAATCAAACTGCAGAGAGGAAGAAGGAAGAATCTTTGA
TTCTTGAAAATGGAGAAACCAAAAAAGAGACGAGTGATTCTCTTCCCGTTACCATTACAA
GGCTGCATAAACCCTATGCTTCAGCTAGCAAAGATACTATTCTCAAGAGGCTTCTCAATC
ACCATCATCCACACGCGCTTCAACGCGCCCAAATCATCAGACCACCCTCTCTTCACTTTC
CTACAGCTCCCCAAGGCAGAGAGTGGATCGAGTCATTACCATTAGGGTTCATGGAGGGTC
TTAACGGGAAGGGAAAGATAGTGAGTGAAATGGGCACCGCAGATAGATGTTCTCGCGCAT
AGAGCCACGGGTGGGTTTTTGAGTCATAATGGATGGAACTCGACGCTAGAGAGTATATGC
GAAGGGGTTCCTATGATCAGCTTGCCTTTTGTGTGGGACCAGTGGCTCAACGCGAGGTTC
GTTAGTGATGTATGGAGGATAGGGAGTCACTTGGAAGGTCGCATAGAGAGAAGAGTGATC
GAGAGAGCCGTGACAAGACTAATGGTTGAACCCGATGGGGAAGAGATTCGGGAGAGAGTT
AAAGTGCTGCGAGATGAAGTAAGAAGATCGGTTCAACGAGGAGGGTCGTCATCTCGGCAT
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2FZ21JQ 748 0 0
TTCTTGAAAATGGAGAAACCAAAAAAGAGACGAGTGATTCTCTTCCCGTTACCATTACAA
GGCTGCATAAACCCTATGCTTCAGCTAGCAAAGATACTATTCTCAAGAGGCTTCTCAATC
ACCATCATCCACACGCGCTTCAACGCGCCCAAATCATCAGACCACCCTCTCTTCACTTTC
CTACAGCTCCCCAAGGCAGAGAGTGGATCGAGTCATTACCATTAGGGTTCATGGAGGGTC
TTAACGGGAAGGGAAAGATAGTGAGTGAAATGGGCACCGCAGATAGATGTTCTCGCGCAT
AGAGCCACGGGTGGGTTTTTGAGTCATAATGGATGGAACTCGACGCTAGAGAGTATATGC
GAAGGGGTTCCTATGATCAGCTTGCCTTTTGTGTGGGACCAGTGGCTCAACGCGAGGTTC
GTTAGTGATGTATGGAGGATAGGGAGTCACTTGGAAGGTCGCATAGAGAGAAGAGTGATC
GAGAGAGCCGTGACAAGACTAATGGTTGAACCCGATGGGGAAGAGATTCGGGAGAGAGTT
AAAGTGCTGCGAGATGAAGTAAGAAGATCGGTTCAACGAGGAGGGTCGTCATCTCGGCAT
CTAGATGATCTGGTTGATCGTATTACATCCTTCTAGCTTCATAGTTTGAATAGAGTGTGA
TCACTATTCATTAGAAAAAAAAGAATGTGACCGTTATATGTTGTATATGTGACTCATGAA
CTTCTTAATAAAACTATTTGCTCTGTTC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL6720Contig1 716 2 8 U
GCGATAATCTAAATCCACTAGATTATAACATTTGTAAATTAACAGAACCAATTAGCTTTT
TTTCTTCTAAAAAGAATCAAGCTTTGAATAGCGATCATGCACCATTTATCATCAGAGACT
GAAATGGAACTTTCTTAATCTCCACAAACGTTGAGTACTCAGGATTCATAGGTTGCTTCC
ATGGCTCTCCATCCATTTGCAAGAAGGCATCTTTCCAGTCACCTCCTCTTAGCTCAAATC
TAACAGCAGCAGCCTGAGCTATGTGCTTGGCTGAAATGAGCTCTGTCATGACAAATGACG
CATGCCATCCATGCTTGAAAGCAAAGATCTCTATCAAACCATCATCAGAATGCGCCTCAA
CAAATCCTCTCTTCTCTAGGTAGTCTGGTTTTAAGTTACCCCATGGATGACTTCCACTTC
CATAGCTTTGGAGATTCAATGCCACAACTGATCTCACATTTTTAGGGACTGCGATCTCTT
CCCATTGAGAGCAGTTAACCTTCTTGATGTGGATTTTCAATATATTCCTAAGTCCCCTTA
AGCCTGGATCACTGACACAAGGTGTGCAAAACCAACCCTGAGTGCAACTAAAGCCAGAAT
AAATAAGCTTGTTTGAGATAGGGCCTTGAGCAAGATATGGTTTAGTGTTGCGAAGATGAT
GGAAGCCATACGCAACTTGAGCATCCATACCTATGCTTAAGTAATTGTAGAACACT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC58JQ U 1
AF RR2GP27JQ U 1
BS 1 15 RR2GC58JQ
BS 16 16 RR2GP27JQ
BS 17 63 RR2GC58JQ
BS 64 64 RR2GP27JQ
BS 65 523 RR2GC58JQ
BS 524 524 RR2GP27JQ
BS 525 620 RR2GC58JQ
BS 621 716 RR2GP27JQ

RD RR2GC58JQ 620 0 0
GCGATAATCTAAATCTACTAGATTATAACATTTGTAAATTAACAGAACCAATTAGCTTTT
TTT*TTCTAAAAAGAATCAAGCTTTGAATAGCGATCATGCACCATTTATCATCAGAGACT
GAAATGGAACTTTCTTAATCTCCACAAACGTTGAGTACTCAGGATTCATAGGTTGCTTCC
ATGGCTCTCCATCCATTTGCAAGAAGGCATCTTTCCAGTCACCTCCTCTTAGCTCAAATC
TAACAGCAGCAGCCTGAGCTATGTGCTTGGCTGAAATGAGCTCTGTCATGACAAATGACG
CATGCCATCCATGCTTGAAAGCAAAGATCTCTATCAAACCATCATCAGAATGCGCCTCAA
CAAATCCTCTCTTCTCTAGGTAGTCTGGTTTTAAGTTACCCCATGGATGACTTCCACTTC
CATAGCTTTGGAGATTCAATGCCACAACTGATCTCACATTTTTAGGGACTGCGATCTCTT
CCCATTGAGAGCAGTTAACCTTCTTGATGTGGATTTTCAATATGTTCCTAAGTCCCCTTA
AGCCTGGATCACTGACACAAGGTGTGCAAAACCAACCCTGAGTGCAACTAAAGCCAGAAT
AAATAAGCTTGTTTGAGATA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2GP27JQ 716 0 0
GG
GATAATCTAAATCCACTAGATTATAACATTTGTAAATTAACAGAACCAATTAGCTTTTTT
TCTTCTAAAAAGAATCCAGCTTTGAATAGCGATCATGCACCATTTATCATCAGAGACTGA
AATGGAACTTTCTTAATCTCCACAAACGTTGAGTACTCAGGATTCATAGGTTGCTTCCAT
GGCTCTCCATCCATTTGCAAGAAGGCATCTTTCCAGTCACCTCCTCTTAGCTCAAATCTA
ACAGCAGCAGCCTGAGCTATGTGCTTGGCTGAAATGAGCTCTGTCATGACAAATGACGCA
TGCCATCCATGCTTGAAAGCAAAGATCTCTATCAAACCATCATCAGAATGCGCCTCAACA
AATCCTCTCTTCTCTAGGTAGTCTGGTTTTAAGTTACCCCATGGATGACTTCCACTTCCA
TAGCTTTGGAGATTCAATGCCACAACTGATCTCACATTTTTAGGGACTGCGATCTCTTCC
CATTGAGAGCAGTTAACCTTCTTGATGTGGATTTTCAATATATTCCTAAGTCCCCTTAAG
CCTGGATCACTGACACAAGGTGTGCAAAACCAACCCTGAGTGCAACTAAAGCCAGAATAA
ATAAGCTTGTTTGAGATAGGGCCTTGAGCAAGATATGGTTTAGTGTTGCGAAGATGATGG
AAGCCATACGCAACTTGAGCATCCATACCTATGCTTAAGTAATTGTAGAACACT

QA 3 716 3 716
DS 



AS 1 2

CO CL6721Contig1 1264 2 2 U
GACCCACTTTTCAGATTATAGTAATTGATTTTCAGAAATGGCGGAGGGAATGTTCAAGGT
ATTGCTCTGGGTTTTTGCGGCAACGGTGTTTGCAGTGGCCGAAGGACAGCGCGTGCCTTG
CTATTTCGTTTTCGGAGACTCAGTTTTCGACAACGGTAACAACAATGCCTTGAACACCTC
CGCTAAAGTTAACTATTCACCTTATGGTATGGATTTTGTTAGAGGTCCCACCGGCCGGTT
CAGCAATGGCCGTAATATTCCCGACTTTATCGCTGAACTAATGGGATTCAGTGATTACAT
TCCACCTTTCACCGGAGCATCGCCGGAACAAGCTCACATCGGCTTAAATTACGCTTCTGG
CGGCGCGGGAATTCTCGAAGATACTAGCTACCATCTGGGTGGTAGAATCAGTTTTAAAAC
GCAAATAAAGAATCACCGGACGGCGATTATGACTGCAAATGTGCCCCCGGAGAAGCTGAA
TCAATGTCTATACACTATTAATATAGGAAGCAATGATTATCTTAACAACTACTTCATGCA
AGGTGATAAGTACAATACACAACGCAAATACACTTACGATCAATTTGCTGATTCCCTCAT
TCGACGTTATCGCTCTTTTCTGAAGTTGTTGTATGTCCAAGGAGCAAGGAGGGTGGCGTT
GTTTGGGGTCAGTAAACTAGGGTGCACGCCGCGGATGATTGCCTCCCATGGTGGGGGTAT
GGGCTGTGCCGCTGAAGTGAACAAAGCAGTTGAACCTTTCAACATGAAAATTAAAGCTCT
GGTCAGAGAGTTCAACACTGACTTCGGCGATGCTAAGTTCACTTTTGTAGATATGTACTC
CGGGCAAACTCCTTTTGCGTATGCTTCCTTAGGGTTTGCTGTAACACAAAAGAGTTGTTG
TACCGTCGAATCAGGGGAAGAACTATGTGCGGCGGATAAACCGGTTTGTGCGTTTCGAAA
CCAGTACGTGTACTGGGACAATGTCCACAGCACTGAGAGGGCCAACATGTTTTTGGCAAA
GGCTGCTTTTGTCGGAATCGTTGCTTCTCCTTACAGCATTGCCTTGCTTGGTAGAGTATA
GGGATAATATATACTCGAAACCATTCATTTTCTTTTGTTGATATATCAATACTATTAAAA
CTGGACCATGACCAATTGATAAAAAGTTATGTCCAATTATTATTTTCAGCTAAAATAATT
TTAACAAATTATATTACAGAATTGTGTAACTTTCTTTTCAAATTTTATGGTACCAACTTC
TTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2BE82TF U 1
AF RR2BE82JQ C 600
BS 1 676 RR2BE82TF
BS 677 1264 RR2BE82JQ

RD RR2BE82TF 676 0 0
GACCCACTTTTCAGATTATAGTAATTGATTTTCAGAAATGGCGGAGGGAATGTTCAAGGT
ATTGCTCTGGGTTTTTGCGGCAACGGTGTTTGCAGTGGCCGAAGGACAGCGCGTGCCTTG
CTATTTCGTTTTCGGAGACTCAGTTTTCGACAACGGTAACAACAATGCCTTGAACACCTC
CGCTAAAGTTAACTATTCACCTTATGGTATGGATTTTGTTAGAGGTCCCACCGGCCGGTT
CAGCAATGGCCGTAATATTCCCGACTTTATCGCTGAACTAATGGGATTCAGTGATTACAT
TCCACCTTTCACCGGAGCATCGCCGGAACAAGCTCACATCGGCTTAAATTACGCTTCTGG
CGGCGCGGGAATTCTCGAAGATACTAGCTACCATCTGGGTGGTAGAATCAGTTTTAAAAC
GCAAATAAAGAATCACCGGACGGCGATTATGACTGCAAATGTGCCCCCGGAGAAGCTGAA
TCAATGTCTATACACTATTAATATAGGAAGCAATGATTATCTTAACAACTACTTCATGCA
AGGTGATAAGTACAATACACAACGCAAATACACTTACGATCAATTTGCTGATTCCCTCAT
TCGACGTTATCGCTCTTTTCTGAAGTTGTTGTATGTCCAAGGAGCAAGGAGGGTGGCGTT
GTTTGGGGTCAGTAAA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2BE82JQ 665 0 0
TTCGACGTTATCGCTCTTTTCTGAAGTTGTTGTATGTCCAAGGAGCAAGGAGGGTGGCGT
TGTTTGGGGTCAGTAAACTAGGGTGCACGCCGCGGATGATTGCCTCCCATGGTGGGGGTA
TGGGCTGTGCCGCTGAAGTGAACAAAGCAGTTGAACCTTTCAACATGAAAATTAAAGCTC
TGGTCAGAGAGTTCAACACTGACTTCGGCGATGCTAAGTTCACTTTTGTAGATATGTACT
CCGGGCAAACTCCTTTTGCGTATGCTTCCTTAGGGTTTGCTGTAACACAAAAGAGTTGTT
GTACCGTCGAATCAGGGGAAGAACTATGTGCGGCGGATAAACCGGTTTGTGCGTTTCGAA
ACCAGTACGTGTACTGGGACAATGTCCACAGCACTGAGAGGGCCAACATGTTTTTGGCAA
AGGCTGCTTTTGTCGGAATCGTTGCTTCTCCTTACAGCATTGCCTTGCTTGGTAGAGTAT
AGGGATAATATATACTCGAAACCATTCATTTTCTTTTGTTGATATATCAATACTATTAAA
ACTGGACCATGACCAATTGATAAAAAGTTATGTCCAATTATTATTTTCAGCTAAAATAAT
TTTAACAAATTATATTACAGAATTGTGTAACTTTCTTTTCAAATTTTATGGTACCAACTT
CTTCC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL6722Contig1 1026 2 2 U
GGACTACATTACACAAAAGAAAAAACACTAAACGCGTCTTTCAAAACTGGTTTAGTCTCT
CCTTGTTCTCTACTTCTCTCCTCAAAACCTTTTGACTCTCCTAATTCTCCCCCCCAAATA
AATTAAACAATGCCCCTACGGTTTATGCAAGTGTAGTAGTGCTCTGCTATTAATCTACTA
TTTTTCTCCTCATTTTCCTACCCGACCAATCTAGTTTCATTACCTCCCCCAGTTCCCTCT
GTTTTTTTTTTTGTTCTTGTCTGGGGTGGTTTGGTTTCTCTGTTTTGGGTTCTTTCAATT
CACAAACTTTCCATTACCCTTTTTGATCTTACTTGCTATTCAATAGACCCAAGCAGTGTT
TATCAAGTTCATCTGTATAGAAAATCTGAAAGCTTTTCGATTTGATTCGTCAACTTCGAG
GTGGTCTTACTTTGCATTGAAAGGCTCTGACTTTCTTCAATGACACCATTAGGATTGAGA
TTTTTTTAGATATGTTTTGACCGTTTTGTGATCAGATCTTGATGCTCTATTTCTAGAGAA
CGAGATTAAGACTTAAGTGTTTAGTTAGTGGTTTTTTTATGGGTAATACATGTGTTGGAC
CAAGCAGAAATGGTTTCCTTCACTCTGTTTCCGCTGCTATGTGGCGTCCTCGAGATGCAT
CAGATGATTCCGTTTCCCAGAGCAATGGACGAGACACTGCAAGTGAAGCTGCTGTTTCAG
GAGAGCTTCGTTCTCCATCCTCATCATCTGATCAAGTCCACAACAAACCTCCTCAACACC
TCACAATGCCAAAGCCAGTCGAGATAGAGATCCATCCCGAAACGCAAGAGGAGGAGGTCA
AGTGAAGATAGGACTAGAGAAAAGCTTTAGCATTGCTCTTAAACTCTAATAGATTCTCAA
TCTCTCTTTTTCTTTTCTCTTAAAGTTACAAAACCAAAAGACAAAGACAAAGAGTATCTT
CTGATAATAGATATGATTGATTTTGTTGTGTTGAAGACAAATGCACATAGTATTCTCTTT
TGGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG36TF U 1
AF RR2DG36JQ C 375
BS 1 650 RR2DG36TF
BS 651 1026 RR2DG36JQ

RD RR2DG36TF 650 0 0
GGACTACATTACACAAAAGAAAAAACACTAAACGCGTCTTTCAAAACTGGTTTAGTCTCT
CCTTGTTCTCTACTTCTCTCCTCAAAACCTTTTGACTCTCCTAATTCTCCCCCCCAAATA
AATTAAACAATGCCCCTACGGTTTATGCAAGTGTAGTAGTGCTCTGCTATTAATCTACTA
TTTTTCTCCTCATTTTCCTACCCGACCAATCTAGTTTCATTACCTCCCCCAGTTCCCTCT
GTTTTTTTTTTTGTTCTTGTCTGGGGTGGTTTGGTTTCTCTGTTTTGGGTTCTTTCAATT
CACAAACTTTCCATTACCCTTTTTGATCTTACTTGCTATTCAATAGACCCAAGCAGTGTT
TATCAAGTTCATCTGTATAGAAAATCTGAAAGCTTTTCGATTTGATTCGTCAACTTCGAG
GTGGTCTTACTTTGCATTGAAAGGCTCTGACTTTCTTCAATGACACCATTAGGATTGAGA
TTTTTTTAGATATGTTTTGACCGTTTTGTGATCAGATCTTGATGCTCTATTTCTAGAGAA
CGAGATTAAGACTTAAGTGTTTAGTTAGTGGTTTTTTTATGGGTAATACATGTGTTGGAC
CAAGCAGAAATGGTTTCCTTCACTCTGTTTCCGCTGCTATGTGGCGTCCT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2DG36JQ 652 0 0
GTATAGAAAATCTGAAAGCTTTTCGATTTGATTCGTCAACTTCGAGGTGGTCTTACTTTG
CATTGAAAGGCTCTGACTTTCTTCAATGACACCATTAGGATTGAGATTTTTTTAGATATG
TTTTGACCGTTTTGTGATCAGATCTTGATGCTCTATTTCTAGAGAACGAGATTAAGACTT
AAGTGTTTAGTTAGTGGTTTTTTTATGGGTAATACATGTGTTGGACCAAGCAGAAATGGT
TTCCTTCACTCTGTTTCCGCTGCTATGTGGCGTCCTCGAGATGCATCAGATGATTCCGTT
TCCCAGAGCAATGGACGAGACACTGCAAGTGAAGCTGCTGTTTCAGGAGAGCTTCGTTCT
CCATCCTCATCATCTGATCAAGTCCACAACAAACCTCCTCAACACCTCACAATGCCAAAG
CCAGTCGAGATAGAGATCCATCCCGAAACGCAAGAGGAGGAGGTCAAGTGAAGATAGGAC
TAGAGAAAAGCTTTAGCATTGCTCTTAAACTCTAATAGATTCTCAATCTCTCTTTTTCTT
TTCTCTTAAAGTTACAAAACCAAAAGACAAAGACAAAGAGTATCTTCTGATAATAGATAT
GATTGATTTTGTTGTGTTGAAGACAAATGCACATAGTATTCTCTTTTGGATG

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL6723Contig1 808 2 4 U
GAAGGAGCATCCGCCCGACAGATCTCGCCGGCGTTTCACAATGGATAATCCTATTCAAGA
GATTCTGTAGAAGCAGCTTCTGACGGTGGCGAAAGCGATGGAGGATAAGCTCGACGAGGA
GATCGCGTCGCTGGAGAAGCCCGACGAGGACGATCTGGAGGTTCTGAGGGAGAGGAGGCT
GCAGCAGATGAAGAGAATGGCGGAGAAAAAGAAACGCTGGATGAGTCATGGACACGGAGA
GTACACCGAGATCCCATCGGAGAAAGACTTCTTCGCCGCCGTTAAGGCCAGCGAACGCGT
CGTCTGCCATTTCTACCGCGAGAATTGGCCTTGCAAAGTGGTGGATAAGCACTTGGGTAT
ATTGGCAAAACAGCACATTGAGACACGTTTTGTGAAGATTCAAGCTGAGAAAAGTCCCTT
CTTGGCTGAGAGGCTCAAGATTGTCGTTCTTCCCACTCTTGCACTCATCAAGAACACTAA
AGTGGATGATTATGTGGTTGGGTTCAATGAGCTGGGAGGGAAAGACGATTTCAGCACAGA
GGATCTGGAAGAGAGATTAGCTAGAGCTCAAGTCATCCATTACGAGGGAGAATCATCTCA
TAAACCAAAGTCTACCACACAAACCAGGAGGAGCGTCAGGCAGAGTGCTCGTTCAGATTC
TGACTCTGGTGAATAAATCCCAAGTCACAATCTTCACCTTTTCTTGTGTCTCTGCTATAT
GTAAAAGAGGAATATATACGCTCTTGCTCCTGAGTTGTATTGAACGCATTAAGTTGTGAT
CTGTAATTTGATTCTATGGATTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR55TF U 1
AF RR2BR55JQ C 111
BS 1 639 RR2BR55TF
BS 640 640 RR2BR55JQ
BS 641 719 RR2BR55TF
BS 720 808 RR2BR55JQ

RD RR2BR55TF 719 0 0
GAAGGAGCATCCGCCCGACAGATCTCGCCGGCGTTTCACAATGGATAATCCTATTCAAGA
GATTCTGTAGAAGCAGCTTCTGACGGTGGCGAAAGCGATGGAGGATAAGCTCGACGAGGA
GATCGCGTCGCTGGAGAAGCCCGACGAGGACGATCTGGAGGTTCTGAGGGAGAGGAGGCT
GCAGCAGATGAAGAGAATGGCGGAGAAAAAGAAACGCTGGATGAGTCATGGACACGGAGA
GTACACCGAGATCCCATCGGAGAAAGACTTCTTCGCCGCCGTTAAGGCCAGCGAACGCGT
CGTCTGCCATTTCTACCGCGAGAATTGGCCTTGCAAAGTGGTGGATAAGCACTTGGGTAT
ATTGGCAAAACAGCACATTGAGACACGTTTTGTGAAGATTCAAGCTGAGAAAAGTCCCTT
CTTGGCTGAGAGGCTCAAGATTGTCGTTCTTCCCACTCTTGCACTCATCAAGAACACTAA
AGTGGATGATTATGTGGTTGGGTTCAATGAGCTGGGAGGGAAAGACGATTTCAGCACAGA
GGATCTGGAAGAGAGATTAGCTAGAGCTCAAGTCATCCATTACGAGGGAGAATCATCTCA
TAAACCAAAGTCTACCACACAAACCAGGAGGAGCGTCAG*CAGAGTGCTCGTTCAGATTC
TGACTCTGGTGAATAAATCCCAAGTCACAATCTTCACCTTTTCTTGTGTCTCTGCTATA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2BR55JQ 698 0 0
TCGACGAGGAGATCGCGTCGCTGGAGAAGCCCGACGAGGACGATCTGGAGGTTCTGAGGG
AGAGGAGGCTGCAGCAGATGAAGAGAATGGCGGAGAAAAAGAAACGCTGGATGAGTCATG
GACACGGAGAGTACACCGAGATCCCATCGGAGAAAGACTTCTTCGCCGCCGTTAAGGCCA
GCGAACGCGTCGTCTGCCATTTCTACCGCGAGAATTGGCCTTGCAAAGTGGTGGATAAGC
ACTTGGGTATATTGGCAAAACAGCACATTGAGACACGTTTTGTGAAGATTCAAGCTGAGA
AAAGTCCCTTCTTGGCTGAGAGGCTCAAGATTGTCGTTCTTCCCACTCTTGCACTCATCA
AGAACACTAAAGTGGATGATTATGTGGTTGGGTTCAATGAGCTGGGAGGGAAAGACGATT
TCAGCACAGAGGATCTGGAAGAGAGATTAGCTAGAGCTCAAGTCATCCATTACGAGGGAG
AATCATCTCATAAACCAAAGTCTACCACACAAACCAGGAGGAGCGTCAGGCAGAGTGCTC
GTTCAGATTCTGACTCTGGTGAATAAATCCCAAGTCACAATCTTCACCTTTTCTTGTGTT
TCTGCTATATGTAAAAGAGGAATATATACGCTCTTGCTCCTGAGTTGTATTGAACGCATT
AAGTTGTGATCTGTAATTTGATTCTATGGATTTTGACC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL6724Contig1 924 2 8 U
GGACTTTCATCATCTCTCTCTAGTCTCTCTGAAGACAGAAAAGAGTTTTAAGAGAGAGAG
AAAGTCATTTTGTATCAAAGTCTCTGTGATTGCGAGATGGGAAACTGTTCAACCAAGCCA
AAGGTTCTCAAATATACCGAGGAAGATCTGGTTCCGGTTGAGCGAGAGACGACGGCTCCT
ACTGATCATAACAAGTTCCCGGTGGAAAAAAGCGTGAACAATGCTCCGAGTGTGGCGGAT
GAAGCAGAGGCTGTGGCGGCACGACGGTGTGAGAAAGGAAAAGAGATTCTCATTGAAGAC
GATGTGGAGGAAGAACACAGCAAACGTCAATCCCTGATCAGTCTCTTGTTTCATGAGGAC
AAGGCAATAGAAAAGGAAATAACCAATCTATTTCGTAACAAAAGCGTCACTTCTTCAGAA
GCTTCAAAGCTTGATACTTCTGCTTCTAATGTAAAAGCTCCAGTAACATTCGACATTCAG
ACTCGAAATGATCTTGAAGTTAAGATTCCAAAAGATTCCGAGGTAAAGACTCCTGAAAAG
CCTAAAGCTAAGGAAGCTGATGAAGACCAAGAAGTTAATTTTTCAGAGAACTGGGAAGCC
AAGTTTCCAGAGGAGTTGGAAGCTGCAAAAACATCTGAAGTTGTCAAGGTTGCAGAAGAG
TCGAAACTTCCACAAGTTACAAAAGAGCCAGATGTTCCTGAGGTCTTGAAAGATAAGAAT
GTTATGGATGTTTCAGAGGTTCTTTCTCCTCCTGAATTGTCTCAAATCAAGGTTACGAAA
GAGTCAGGTGTTCTTGAGGTCTTGGAGAATTCTATTTTCATGTCACCATTTGTGTACGTA
TAAAAGTAGTTAGTGGGACAAAAAAAGAAAGTAAACTCATTATTGACAGTGAACACTATT
AGTAATAAACCTAATCTTTACCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H838TF U 1
AF RR2H838JQ C 192
BS 1 683 RR2H838TF
BS 684 684 RR2H838JQ
BS 685 702 RR2H838TF
BS 703 703 RR2H838JQ
BS 704 718 RR2H838TF
BS 719 719 RR2H838JQ
BS 720 734 RR2H838TF
BS 735 924 RR2H838JQ

RD RR2H838TF 734 0 0
GGACTTTCATCATCTCTCTCTAGTCTCTCTGAAGACAGAAAAGAGTTTTAAGAGAGAGAG
AAAGTCATTTTGTATCAAAGTCTCTGTGATTGCGAGATGGGAAACTGTTCAACCAAGCCA
AAGGTTCTCAAATATACCGAGGAAGATCTGGTTCCGGTTGAGCGAGAGACGACGGCTCCT
ACTGATCATAACAAGTTCCCGGTGGAAAAAAGCGTGAACAATGCTCCGAGTGTGGCGGAT
GAAGCAGAGGCTGTGGCGGCACGACGGTGTGAGAAAGGAAAAGAGATTCTCATTGAAGAC
GATGTGGAGGAAGAACACAGCAAACGTCAATCCCTGATCAGTCTCTTGTTTCATGAGGAC
AAGGCAATAGAAAAGGAAATAACCAATCTATTTCGTAACAAAAGCGTCACTTCTTCAGAA
GCTTCAAAGCTTGATACTTCTGCTTCTAATGTAAAAGCTCCAGTAACATTCGACATTCAG
ACTCGAAATGATCTTGAAGTTAAGATTCCAAAAGATTCCGAGGTAAAGACTCCTGAAAAG
CCTAAAGCTAAGGAAGCTGATGAAGACCAAGAAGTTAATTTTTCAGAGAACTGGGAAGCC
AAGTTTCCAGAGGAGTTGGAAGCTGCAAAAACATCTGAAGTTGTCAAGGTTGCAGAAGAG
TCGAAACTTCCACAAGTTACAAA*GAGCCAGATGTTCCTGAG*TCTTGAAAGATAAGA*T
GTTATGGATGTTTC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2H838JQ 733 0 0
CAAGTTCCCGGTGGAAAAAAGCGTGAACAATGCTCCGAGTGTGGCGGATGAAGCAGAGGC
TGTGGCGGCACGACGGTGTGAGAAAGGAAAAGAGATTCTCATTGAAGACGATGTGGAGGA
AGAACACAGCAAACGTCAATCCCTGATCAGTCTCTTGTTTCATGAGGACAAGGCAATAGA
AAAGGAAATAACCAATTTATTTCGTAACAAAAGCGTCACTTCTTCAGAAGCTTCAAAGCT
TGATACTTCTGCTTTTAATGTAAAAGCTCCAGTAACATTCGACATTCAGACTCGAAATGA
TCTTGAAGTTAAGATTCCAAAAGATTCCGAGGTAAAGACTCCTGAAAAGCCTAAAGCTAA
GGAAGCTGATGAAGACCAAGAAGTTAATTTTTCAGAGAACTGGGAAGCCAAGTTTCCAGA
GGAGTTGGAAGCTGCAAAAACATCTGAAGTTGTCAAGGTTGCAGAAGAGTCGAAACTTCC
ACAAGTTACAAAAGAGCCAGATGTTCCTGAGGTCTTGAAAGATAAGAATGTTATGGATGT
TTCAGAGGTTCTTTCTCCTCCTGAATTGTCTCAAATCAAGGTTACGAAAGAGTCAGGTGT
TCTTGAGGTCTTGGAGAATTCTATTTTCATGTCACCATTTGTGTACGTATAAAAGTAGTT
AGTGGGACAAAAAAAGAAAGTAAACTCATTATTGACAGTGAACACTATTAGTAATAAACC
TAATCTTTACCAC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL6725Contig1 768 2 19 U
GGGATCTCTGCGTGTTCATCATCTCTCTCTCAATCTCTCTTCTCGTCGAGACTTTTGGGA
TCAAGCATGGATGAAGAGTACGAGGTTATCGTTCTCGGCACCGGTCTCAAGGAGTGTATC
CTCAGCGGTCTCCTCTCCGTCGATGGTGTCAAGGTGCTTCACATGGACAGGAATGATTAC
TATGGTGGTGAATCAACATCTCTTAATCTCAACCAGCTTTGGAAGAAGTTCAAGGGAGAA
GACAAGGCTCCCGAGCATTTAGGCGCCAGCAGGGACTACAATGTTGACATGATGCCTAAG
TTTATGATGGGAAATGGCAAGCTTGTGCGTACCCTTATTCACACAGACGTTACAAAGTAC
TTGTCCTTTAAAGCCGTTGATGGAAGCTATGTCTTCGTTAAAGGCAAGGTTCAAAAGGTG
CCAGTGACTCCTATGGAGGCCCTGAAGTCTCCGCTCATGGGTATTTTTGAGAAACGTCGT
GCTGGCAAGTTCTTCAGTTATGTTCAGGATTACGACGAGAAGGACCCCAAGACACACAAC
GGAATGGATTTGACCAGACTTACAACCAAGGAACTGATTGCGAAATTTGGTCTTGACGAG
AACACTATTGACTTTATTGGTCACGCAGTGGCACTTCACACCAATGACCAACATCTCAAT
CAACCCGCCTTGGATACTGTGATGAGAATGAAGCTCTATGCGGAGTCTCTTGCACGTTTC
CAAGGAACCTCTCCATATATTTATCCTCTCTATGGGTTGGGAGAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW47TF U 8
AF RR2F961TF U 1
BS 1 197 RR2F961TF
BS 198 198 RR2CW47TF
BS 199 251 RR2F961TF
BS 252 252 RR2CW47TF
BS 253 275 RR2F961TF
BS 276 276 RR2CW47TF
BS 277 344 RR2F961TF
BS 345 345 RR2CW47TF
BS 346 365 RR2F961TF
BS 366 366 RR2CW47TF
BS 367 422 RR2F961TF
BS 423 423 RR2CW47TF
BS 424 452 RR2F961TF
BS 453 453 RR2CW47TF
BS 454 536 RR2F961TF
BS 537 537 RR2CW47TF
BS 538 626 RR2F961TF
BS 627 627 RR2CW47TF
BS 628 768 RR2F961TF

RD RR2CW47TF 678 0 0
GG
GCGTGTTCATCATCTCTCTCTCAATCTCTCTTCTCGTCGAGACTTTTGGGATCAAGCATG
GATGAAGAGTACGAGGTTATCGTTCTCGGCACCGGTCTCAAGGAGTGTATCCTTAGCGGT
CTCCTCTCCGTCGATGGTGTCAAGGTGCTTCACATGGACAGGAATGATTACTATGGTGGT
GAATCAACATCTCTTAATCTCAACCAGCTTTGGAAGAAGTTCAAGGGAGAAGACAAGGCT
CCCGAGCATTTAGGTGCTAGCAGGGACTACAATGTTGACATGATGCCTAAGTTTATGATG
GGAAATGGCAAGCTTGTGCGTACCCTTATTCACACAGACGTTACAAAGTACTTGTCCTTT
AAAGCCGTTGATGGAAGCTATGTCTTCGTTAAAGGCAAGGTTCAAAAGGTGCCAGTGACT
CCTATGGAGGCCCTGAAGTCTCCGCTCATGGGTATTTTTGAGAAACGTCGTGCTGGGAAG
TTTTTCAGTTATGTTCAGGATTACGACGAGAAGGACCCCAAGACACACAACGGGATGGAT
TTGACCAGACTTACAACCAAGGAACTGATTGCGAAATTTGGTCTTGATGAGAACACTATT
GACTTTATTGGTCACGCAGTGGCACTTCACACCAATGACCAACATCTCAATCAACCCGCC
TTGGATACTGTTATGA

QA 3 678 3 678
DS 

RD RR2F961TF 768 0 0
GGGATCTCTGCGTGTTCATCATCTCTCTCTCAATCTCTCTTCTCGTCGAGACTTTTGGGA
TCAAGCATGGATGAAGAGTACGAGGTTATCGTTCTCGGCACCGGTCTCAAGGAGTGTATC
CTCAGCGGTCTCCTCTCCGTCGATGGTGTCAAGGTGCTTCACATGGACAGGAATGATTAC
TATGGTGGTGAATCAACCTCTCTTAATCTCAACCAGCTTTGGAAGAAGTTCAAGGGAGAA
GACAAGGCTCCTGAGCATTTAGGCGCCAGCAGGGATTACAATGTTGACATGATGCCTAAG
TTTATGATGGGAAATGGCAAGCTTGTGCGTACCCTTATTCACACGGACGTTACAAAGTAC
TTGTCGTTTAAAGCCGTTGATGGAAGCTATGTCTTCGTTAAAGGCAAGGTTCAAAAGGTG
CCGGTGACTCCTATGGAGGCCCTGAAGTCTCCTCTCATGGGTATTTTTGAGAAACGTCGT
GCTGGCAAGTTCTTCAGTTATGTTCAGGATTACGACGAGAAGGACCCCAAGACACATAAC
GGAATGGATTTGACCAGACTTACAACCAAGGAACTGATTGCGAAATTTGGTCTTGACGAG
AACACTATTGACTTTATTGGTCACGCTGTGGCACTTCACACCAATGACCAACATCTCAAT
CAACCCGCCTTGGATACTGTGATGAGAATGAAGCTCTATGCGGAGTCTCTTGCACGTTTC
CAAGGAACCTCTCCATATATTTATCCTCTCTATGGGTTGGGAGAACTC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL6726Contig1 659 2 2 U
GGATTCACAGACTTAACATTCGATTCTCTCTCAATCTCTAAAACTTTCTCACGTCTCTTA
AAAAAAGTCACCGATAATGGCTCCCAAGGCGGCAGAGAAGAAACCGGCGGAGAAGAAGCC
AGCAGAGAAGGCCCCGGCGGAGAAGCGACCAAAGGCGGAGAAGAAGATCTCGAAGGAAGG
CGGGAGCGACAAGAAGAAGAAGAAGTCTAAGAAGAGCGTTGAGACGTACAAGATCTACAT
CTTCAAGGTCCTGAATCAGGTCCATCCCGACATCGGAATCTCCGGGAAAGCCATGGGGAT
CATGAACAGTTTCATCAACGACATCTTCGAGAAACTCGCCCAGGAATCCTCGAAGCTCGC
GAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACGTCAAGGGAGATCCAGACGGCAGCTAGGCTCGT
GTTGCCCGGATAGCTCGCGAAGCACGCCGTTTCTGAAGGGACTAAGGCGGTTACCAAATT
CACAAGCACTTAGGGTTTCGTTTTTTTTTTCTTATAATTTCTGATTCGATCTGGTTTGCA
TGTTTAGATATATAATGGATTCTCTGTCTTGGATCTTTGGTTTCTGGATTGTATTCAGTT
AGTGAGATGGTTGAATGAACAGGTTTTTCTATGTTAATGAATATCACCTTCCTTTGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G947TF U 1
AF RR2G947JQ C 1
BS 1 597 RR2G947TF
BS 598 659 RR2G947JQ

RD RR2G947TF 597 0 0
GGATTCACAGACTTAACATTCGATTCTCTCTCAATCTCTAAAACTTTCTCACGTCTCTTA
AAAAAAGTCACCGATAATGGCTCCCAAGGCGGCAGAGAAGAAACCGGCGGAGAAGAAGCC
AGCAGAGAAGGCCCCGGCGGAGAAGCGACCAAAGGCGGAGAAGAAGATCTCGAAGGAAGG
CGGGAGCGACAAGAAGAAGAAGAAGTCTAAGAAGAGCGTTGAGACGTACAAGATCTACAT
CTTCAAGGTCCTGAATCAGGTCCATCCCGACATCGGAATCTCCGGGAAAGCCATGGGGAT
CATGAACAGTTTCATCAACGACATCTTCGAGAAACTCGCCCAGGAATCCTCGAAGCTCGC
GAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACGTCAAGGGAGATCCAGACGGCAGCTAGGCTCGT
GTTGCCCGGATAGCTCGCGAAGCACGCCGTTTCTGAAGGGACTAAGGCGGTTACCAAATT
CACAAGCACTTAGGGTTTCGTTTTTTTTTTCTTATAATTTCTGATTCGATCTGGTTTGCA
TGTTTAGATATATAATGGATTCTCTGTCTTGGATCTTTGGTTTCTGGATTGTATTCA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2G947JQ 659 0 0
GGATTCACAGACTTAACATTCGATTCTCTCTCAATCTCTAAAACTTTCTCACGTCTCTTA
AAAAAAGTCACCGATAATGGCTCCCAAGGCGGCAGAGAAGAAACCGGCGGAGAAGAAGCC
AGCAGAGAAGGCCCCGGCGGAGAAGCGACCAAAGGCGGAGAAGAAGATCTCGAAGGAAGG
CGGGAGCGACAAGAAGAAGAAGAAGTCTAAGAAGAGCGTTGAGACGTACAAGATCTACAT
CTTCAAGGTCCTGAATCAGGTCCATCCCGACATCGGAATCTCCGGGAAAGCCATGGGGAT
CATGAACAGTTTCATCAACGACATCTTCGAGAAACTCGCCCAGGAATCCTCGAAGCTCGC
GAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACGTCAAGGGAGATCCAGACGGCAGCTAGGCTCGT
GTTGCCCGGATAGCTCGCGAAGCACGCCGTTTCTGAAGGGACTAAGGCGGTTACCAAATT
CACAAGCACTTAGGGTTTCGTTTTTTTTTTCTTATAATTTCTGATTCGATCTGGTTTGCA
TGTTTAGATATATAATGGATTCTCTGTCTTGGATCTTTGGTTTCTGGATTGTATTCAGTT
AGTGAGATGGTTGAATGAACAGGTTTTTCTATGTTAATGAATATCACCTTCCTTTGTTT

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL6727Contig1 610 2 2 U
GAATCCCAAAGTAGAACAGAACACGAGAGTTTTCTTTTAAACAAAAGAAACTAAAATACT
GAAAAGTGCTTATGACATCAAAATAATTCAAAAGCTTTGAAGGATGTGTTTAAGACCTTG
GCTTCTCCTTCTTGCCCTTGTAGAGAGCAGAGAGTGAAACACCAGCAACTATGACAACCT
TGTACCTTACTCCTGGAATATCTCCCACAGCATGACCCTTACGCCCAAATCCAGAGATCA
ACACCTCGTCATTTGGCTCAATGAGGTTCAAACAACCATCGTTGGGGACAAAAGCAGCAA
CTTTCTTTCCATTCTTGACAAGCTGTACTCTAACACACTTACGGATAGCAGAGTTTGGCT
GCTTAGCCTCCATTCCTATGAGCTCAAGGACGATTCCTTTGGCGTGAGAAGATCCAGCCA
AAGGCTTATTCCATTCATTTCCTAGGTGAGCCTTCTTGTAGCTCTTGTCTGACCACCTCT
GTTTTTTCCTATGCACTTTTTGAACACGTGCAGATACCATACCCCTTGTCTTTCCCATGT
TTGTGGATGGAGGAGAAGATTAACAGCAACGATGCTTTTGCAACACGCAAACAATATGAG
ATTAAAAAAA


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BY38TF C 1
AF RR2BY38JQ U 4
BS 1 3 RR2BY38TF
BS 4 610 RR2BY38JQ

RD RR2BY38TF 610 0 0
GAATCCCAAAGTAGAACAGAACACGAGAGTTTTCTTTTAAACAAAAGAAACTAAAATACT
GAAAAGTGCTTATGACATCAAAATAATTCAAAAGCTTTGAAGGATGTGTTTAAGACCTTG
GCTTCTCCTTCTTGCCCTTGTAGAGAGCAGAGAGTGAAACACCAGCAACTATGACAACCT
TGTACCTTACTCCTGGAATATCTCCCACAGCATGACCCTTACGCCCAAATCCAGAGATCA
ACACCTCGTCATTTGGCTCAATGAGGTTCAAACAACCATCGTTGGGGACAAAAGCAGCAA
CTTTCTTTCCATTCTTGACAAGCTGTACTCTAACACACTTACGGATAGCAGAGTTTGGCT
GCTTAGCCTCCATTCCTATGAGCTCAAGGACGATTCCTTTGGCGTGAGAAGATCCAGCCA
AAGGCTTATTCCATTCATTTCCTAGGTGAGCCTTCTTGTAGCTCTTGTCTGACCACCTCT
GTTTTTTCCTATGCACTTTTTGAACACGTGCAGATACCATACCCCTTGTCTTTCCCATGT
TTGTGGATGGAGGAGAAGATTAACAGCAACGATGCTTTTGCAACACGCAAACAATATGAG
ATTAAAAAAA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2BY38JQ 607 0 0
TCCCAAAGTAGAACAGAACACGAGAGTTTTCTTTTAAACAAAAGAAACTAAAATACTGAA
AAGTGCTTATGACATCAAAATAATTCAAAAGCTTTGAAGGATGTGTTTAAGACCTTGGCT
TCTCCTTCTTGCCCTTGTAGAGAGCAGAGAGTGAAACACCAGCAACTATGACAACCTTGT
ACCTTACTCCTGGAATATCTCCCACAGCATGACCCTTACGCCCAAATCCAGAGATCAACA
CCTCGTCATTTGGCTCAATGAGGTTCAAACAACCATCGTTGGGGACAAAAGCAGCAACTT
TCTTTCCATTCTTGACAAGCTGTACTCTAACACACTTACGGATAGCAGAGTTTGGCTGCT
TAGCCTCCATTCCTATGAGCTCAAGGACGATTCCTTTGGCGTGAGAAGATCCAGCCAAAG
GCTTATTCCATTCATTTCCTAGGTGAGCCTTCTTGTAGCTCTTGTCTGACCACCTCTGTT
TTTTCCTATGCACTTTTTGAACACGTGCAGATACCATACCCCTTGTCTTTCCCATGTTTG
TGGATGGAGGAGAAGATTAACAGCAACGATGCTTTTGCAACACGCAAACAATATGAGATT
AAAAAAA

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL6728Contig1 733 2 2 U
GGGTACTTGTCCACAACGAAAAACTAGAAGCTTCGTCGTCGCCGAAGATTACAACCAGGT
CTCGTCGATGGCCGCTAGGTTTCTTAGTCTGAGACGCGCCTTATCTCTCTACCTCACTAA
GCAACAGCCTCGGCTTCCTCTGTTCAAAGCAGGTAAGCTTTCACAATCAAAGTCACTATT
GAGCAGAGATCATGCGTATTTGGGATTACTTCATAGGCAGTTCTGTGGATCCCGTGAGAC
TAGTGAAGCTGCTGCAGTAACCAAGTCTTCAAACTCCGTTGCTGAACTCTCCAAAGCTCC
TTCCACTCCCCCTGCAACGGCCTCCGAGGAACTGATTGTGAAATACAAGTCCCAGTTGAA
AATAAACCCGAGGCATGACTTCATGATGGTGTTCACCTGCAAGGTATGCGAGACGAGGTC
CATAAAGATGGCGAGCCGAGAATCATACGAGAAGGGCGTTGTGGTGGTTCGATGCGAGGA
GCTTCTAGCTGCTCGTGGGGATGAATTCAAGAAAGGATCCATGGATTCTCTTAGTCTTAC
AGTTGATGATTTGGCTGGGAAAAAGATGTCCGATGAATAGAGCAAGAAGCTCTTCGTTGC
TCCACTACTAGGACTTGAACCCTGCGGAAAACATAAAATATTTTCTGTCTTTTAATATTA
ATTTTCGTAACCATATTTGGTATTATAGGTGTAATGTGAATCCACTAAGCTTTGATCTTT
TAAGCGGTTTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E639TF U 1
AF RR2E639JQ C 1
BS 1 607 RR2E639TF
BS 608 733 RR2E639JQ

RD RR2E639TF 607 0 0
GGGTACTTGTCCACAACGAAAAACTAGAAGCTTCGTCGTCGCCGAAGATTACAACCAGGT
CTCGTCGATGGCCGCTAGGTTTCTTAGTCTGAGACGCGCCTTATCTCTCTACCTCACTAA
GCAACAGCCTCGGCTTCCTCTGTTCAAAGCAGGTAAGCTTTCACAATCAAAGTCACTATT
GAGCAGAGATCATGCGTATTTGGGATTACTTCATAGGCAGTTCTGTGGATCCCGTGAGAC
TAGTGAAGCTGCTGCAGTAACCAAGTCTTCAAACTCCGTTGCTGAACTCTCCAAAGCTCC
TTCCACTCCCCCTGCAACGGCCTCCGAGGAACTGATTGTGAAATACAAGTCCCAGTTGAA
AATAAACCCGAGGCATGACTTCATGATGGTGTTCACCTGCAAGGTATGCGAGACGAGGTC
CATAAAGATGGCGAGCCGAGAATCATACGAGAAGGGCGTTGTGGTGGTTCGATGCGAGGA
GCTTCTAGCTGCTCGTGGGGATGAATTCAAGAAAGGATCCATGGATTCTCTTAGTCTTAC
AGTTGATGATTTGGCTGGGAAAAAGATGTCCGATGAATAGAGCAAGAAGCTCTTCGTTGC
TCCACTA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2E639JQ 733 0 0
GGGTACTTGTCCACAACGAAAAACTAGAAGCTTCGTCGTCGCCGAAGATTACAACCAGGT
CTCGTCGATGGCCGCTAGGTTTCTTAGTCTGAGACGCGCCTTATCTCTCTACCTCACTAA
GCAACAGCCTCGGCTTCCTCTGTTCAAAGCAGGTAAGCTTTCACAATCAAAGTCACTATT
GAGCAGAGATCATGCGTATTTGGGATTACTTCATAGGCAGTTCTGTGGATCCCGTGAGAC
TAGTGAAGCTGCTGCAGTAACCAAGTCTTCAAACTCCGTTGCTGAACTCTCCAAAGCTCC
TTCCACTCCCCCTGCAACGGCCTCCGAGGAACTGATTGTGAAATACAAGTCCCAGTTGAA
AATAAACCCGAGGCATGACTTCATGATGGTGTTCACCTGCAAGGTATGCGAGACGAGGTC
CATAAAGATGGCGAGCCGAGAATCATACGAGAAGGGCGTTGTGGTGGTTCGATGCGAGGA
GCTTCTAGCTGCTCGTGGGGATGAATTCAAGAAAGGATCCATGGATTCTCTTAGTCTTAC
AGTTGATGATTTGGCTGGGAAAAAGATGTCCGATGAATAGAGCAAGAAGCTCTTCGTTGC
TCCACTACTAGGACTTGAACCCTGCGGAAAACATAAAATATTTTCTGTCTTTTAATATTA
ATTTTCGTAACCATATTTGGTATTATAGGTGTAATGTGAATCCACTAAGCTTTGATCTTT
TAAGCGGTTTGTT

QA 1 733 1 733
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6730Contig1 1098 2 4 U
GGGAGGGTTACATTGAAAACAGTTGAGGAGATTACACTAGTAACGTGAGGACGAAACCTC
TTATCTTTGTAACTGCTGTAGACATGGCTCTACCTTCATCTCTCATCATTCAAGGAGGAT
CTTCTTTACTATTCTCTTCTTCGAACCAAGTCACAGAACCTAACTGTCGACTTGTGGTTA
CATCTGGAAAACGCTCTCTTGTTCGTTGCTTGGCTAAGAAGAAAATCAGTTTTGTGGATC
AAATCCTCGATTACATCGAAGGCGGTCCTAAGCTTAGGAAATGGTACGGAGCGCCTGACC
TTTTGCCTAAGGATGGATCTTCAAGTGAAGAAGACGATGAAGCAGAGGAACAAGAAGAAG
ACTTCAAGTGATGGAGACAAAACCACTGTTTTTGTAACGGACGGAGACAGTGATGTTGGT
CAGATGATTATACTGCAACTGATAGTGAAAGGGACTCGTGTCAAAGCACTTGTGAAGGAC
AAACGAAAGGCTATGGAAGCCTTTGGAGCTTATGTTGAGTTGACGTCTGGAGATGCAAGT
GACGAGCGTTTCTTAAAGAAGGCCTTTAGAGGCGTTGGTGCAATCATATCCCCAACTGAG
GGTTTCTTATCAAATGTCAAGAGTTTAAAAGGTGTAAAACATGTAGTTATCTTGTCTCAG
TTGTCTGTTTATGAAAGCAGCGGTGGAATTGAAGCTATGATGAATAGCAAAGCGAAAAAA
CTGGCTGAGGGAGATGAGAAAGCAGTTATATCTTCCAATGTCCCTTATACAATCATAAGA
ACAGCAAAGCTTGACAACAGTCCTGGAGGGAACCAAGGGTTCAACTTTATCACGGGGGCT
GCAGCCAGCGGTAGCTTAAGCAAGGAAGACGCTGCACGTATATGTATTGAAGCACTAAGC
GTGATCCCACCAACAGAATTGGTATTTGAGGTTTCAACTGGAGAGGAGGCTGTTTCTGAC
TGGGAAGGACAGTTGATGAAACTGATGCAGAGACAGAGTCAAAACAAGTAAAAAAACTTT
TGAAGTTGAGATGAACAGAACAGAACATTAGAGTTCATCATCATTGTCTATACCTAAAAA
AGCATCATTCTTCCAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN79TF U 1
AF RR2BN79JQ C 400
BS 1 631 RR2BN79TF
BS 632 632 RR2BN79JQ
BS 633 690 RR2BN79TF
BS 691 1098 RR2BN79JQ

RD RR2BN79TF 690 0 0
GGGAGGGTTACATTGAAAACAGTTGAGGAGATTACACTAGTAACGTGAGGACGAAACCTC
TTATCTTTGTAACTGCTGTAGACATGGCTCTACCTTCATCTCTCATCATTCAAGGAGGAT
CTTCTTTACTATTCTCTTCTTCGAACCAAGTCACAGAACCTAACTGTCGACTTGTGGTTA
CATCTGGAAAACGCTCTCTTGTTCGTTGCTTGGCTAAGAAGAAAATCAGTTTTGTGGATC
AAATCCTCGATTACATCGAAGGCGGTCCTAAGCTTAGGAAATGGTACGGAGCGCCTGACC
TTTTGCCTAAGGATGGATCTTCAAGTGAAGAAGACGATGAAGCAGAGGAACAAGAAGAAG
ACTTCAAGTGATGGAGACAAAACCACTGTTTTTGTAACGGACGGAGACAGTGATGTTGGT
CAGATGATTATACTGCAACTGATAGTGAAAGGGACTCGTGTCAAAGCACTTGTGAAGGAC
AAACGAAAGGCTATGGAAGCCTTTGGAGCTTATGTTGAGTTGACGTCTGGAGATGCAAGT
GACGAGCGTTTCTTAAAGAAGGCCTTTAGAGGCGTTGGTGCAATCATATCCCCAACTGAG
GGTTTCTTATCAAATGTCAAGAGTTTAAAAG*TGTAAAACATGTAGTTATCTTGTCTCAG
TTGTCTGTTTATGAAAGCAGCGGTGGAATT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2BN79JQ 699 0 0
GACGGAGACAGTGATGTTGGTCAGATGATTATACTGCAACTGATAGTGAAAGGGACTCGT
GTCAAAGCACTTGTGAAGGACAAACGAAAGGCTATGGAAGCCTTTGGAGCTTATGTTGAG
TTGACGTCTGGAGATGCAAGTGACGAGCGTTTCTTAAAGAAGGCCTTTAGAGGCGTTGGT
GCAATCATATCCCCAACTGAGGGTTTCTTATCAAATGTCAAGAGTTTAAAAGGTGTAAAA
CATGTAGTTATCTTGTCTCAGTTGTCTGTTTATGAAAGCAGCGGTGGAATTGAAGCTATG
ATGAATAGCAAAGCGAAAAAACTGGCTGAGGGAGATGAGAAAGCAGTTATATCTTCCAAT
GTCCCTTATACAATCATAAGAACAGCAAAGCTTGACAACAGTCCTGGAGGGAACCAAGGG
TTCAACTTTATCACGGGGGCTGCAGCCAGCGGTAGCTTAAGCAAGGAAGACGCTGCACGT
ATATGTATTGAAGCACTAAGCGTGATCCCACCAACAGAATTGGTATTTGAGGTTTCAACT
GGAGAGGAGGCTGTTTCTGACTGGGAAGGACAGTTGATGAAACTGATGCAGAGACAGAGT
CAAAACAAGTAAAAAAACTTTTGAAGTTGAGATGAACAGAACAGAACATTAGAGTTCATC
ATCATTGTCTATACCTAAAAAAGCATCATTCTTCCAGCC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL6731Contig1 591 2 1 U
GGACCAAAGCATCACATACACTCTTACTTCTCTTCTCATTTTCTTTATATTTTTCCTCTT
TACCTTTGTCATTTAGAAATGGCCGACGTTAAGGTTGATCAAGTCATTACTCCAGCAGTA
GAGAACGTTGAGGTACCAACCAAGACAGTGGAGGAGCCAGTTGTGGTTACCGAACAGGCG
GAAGAAGTCGTGGCCACCACGGAGTCTGCTCCTGCTCCAGCCGCCGTTACTGAACAAGAA
TCCGAAGCATCAGTCGAAGAAACAAGCAAAGAAGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGAAAAAA
GATGAAGAAAATGAGAAGAAACCAGAGGAGCCAAAGGTAGAGGAGGAAGAAGAGAAGACA
GAAACTCCGGTCGTTGAGAAGGAGGCAAAGACAGAAGAGAAGGACGAGGTGACTGAAGCT
CCGGCGGTTGTGGAGGAGGAGAAGAAGGCTGAGGTAGAGGAAGTTGTGGCTGCTGGTGAA
GTCGCCGCCGAGAAGGCTGACGAGTAAAGAGAAAGAAACTATATATGAATCTTTGGTCTC
ATTTGGTTGTCTTTTAAAATATTATATTTTATCAACAGTTCATAAGTTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G754JQ C 1
AF RR2G754TF U 1
BS 1 591 RR2G754TF

RD RR2G754JQ 591 0 0
GGACCAAAGCATCACATACACTCTTACTTCTCTTCTCATTTTCTTTATATTTTTCCTCTT
TACCTTTGTCATTTAGAAATGGCCGACGTTAAGGTTGATCAAGTCATTACTCCAGCAGTA
GAGAACGTTGAGGTACCAACCAAGACAGTGGAGGAGCCAGTTGTGGTTACCGAACAGGCG
GAAGAAGTCGTGGCCACCACGGAGTCTGCTCCTGCTCCAGCCGCCGTTACTGAACAAGAA
TCCGAAGCATCAGTCGAAGAAACAAGCAAAGAAGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGAAAAAA
GATGAAGAAAATGAGAAGAAACCAGAGGAGCCAAAGGTAGAGGAGGAAGAAGAGAAGACA
GAAACTCCGGTCGTTGAGAAGGAGGCAAAGACAGAAGAGAAGGACGAGGTGACTGAAGCT
CCGGCGGTTGTGGAGGAGGAGAAGAAGGCTGAGGTAGAGGAAGTTGTGGCTGCTGGTGAA
GTCGCCGCCGAGAAGGCTGACGAGTAAAGAGAAAGAAACTATATATGAATCTTTGGTCTC
ATTTGGTTGTCTTTTAAAATATTATATTTTATCAACAGTTCATAAGTTTCT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2G754TF 591 0 0
GGACCAAAGCATCACATACACTCTTACTTCTCTTCTCATTTTCTTTATATTTTTCCTCTT
TACCTTTGTCATTTAGAAATGGCCGACGTTAAGGTTGATCAAGTCATTACTCCAGCAGTA
GAGAACGTTGAGGTACCAACCAAGACAGTGGAGGAGCCAGTTGTGGTTACCGAACAGGCG
GAAGAAGTCGTGGCCACCACGGAGTCTGCTCCTGCTCCAGCCGCCGTTACTGAACAAGAA
TCCGAAGCATCAGTCGAAGAAACAAGCAAAGAAGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGAAAAAA
GATGAAGAAAATGAGAAGAAACCAGAGGAGCCAAAGGTAGAGGAGGAAGAAGAGAAGACA
GAAACTCCGGTCGTTGAGAAGGAGGCAAAGACAGAAGAGAAGGACGAGGTGACTGAAGCT
CCGGCGGTTGTGGAGGAGGAGAAGAAGGCTGAGGTAGAGGAAGTTGTGGCTGCTGGTGAA
GTCGCCGCCGAGAAGGCTGACGAGTAAAGAGAAAGAAACTATATATGAATCTTTGGTCTC
ATTTGGTTGTCTTTTAAAATATTATATTTTATCAACAGTTCATAAGTTTCT

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL6732Contig1 949 2 2 U
GTGAAAACTTATTTTTAAAATATAGAAACCTTCACTATATTTTTCTCACAAAACATAAAT
ACAATCACTCTGTTTGAAACATCAAGATCCTTATGTGTAGATGTTCCTTATACGGCAGGT
TATGTTGTACCGTGAGAATTGGAACTTATGTTGAATCATTACACAATTTAAAGAATTTAT
TTTACACAGTGGCTGTTATGGTAGTGATATGAAGTTTTTTTAATATCTCACATTGACCAC
GCTTCAGGGAACCTACTGTTTGTTTGAGTGTTTTTGATGGTCTCGCAATTCTCCTTCATG
ACACACTGGTCGTCTCAGGCGTTGAGCCAAAAGTGGAGTAAATCAACTCCACTTACTGAC
TCTTATGTGGTTAATTTCCTCCTTTTCACAGGTCGTCTCTTCCTGACAAGAACTCATTTT
TACTTGACAATAATGAATGTGCTGTTGCACTAATCATCTTTCAGTTCAGGCGTAAGAAAA
CTAATCATATTCACATGAATACAATCCCTGCTTATCTATTCATTCTGTTTGACATTGTAT
CCAACAGAAAATGTGTCAGATATGTGAAAACTACCTCCGGTTCAACAAAGTACGAAGGTG
TTCATAAGATAGGGACTGTACAGTTGCTGAGCTCAATGCATAAGTTCTTTACTCTGACCC
ACAGCTGCAGCCATTAACTTATCTCATGATATATTACTGCTTGCTGTTTGTAATTTCAGG
GTGCAGAACTTGCGGAGGAAGGGCACACCGTGAAAAAGGCTCGCGTAGCTTTCCAGCTTA
GGGAGTGGCCAAGACCAATGCCTACTACTGCTTTCCTTAAGATTTATATTTTTGTACGGT
TGAATAAATAGTTTGGTAGTCTTTCGTATTTGTTTTTCTTAATTCCCTTACTCCTGGAGT
TATTTTCGTATTTGTTTTTTAATTCGTATATATACAAAAAAAATCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO58TF U 1
AF RR2AO58JQ C 119
BS 1 717 RR2AO58TF
BS 718 949 RR2AO58JQ

RD RR2AO58TF 717 0 0
GTGAAAACTTATTTTTAAAATATAGAAACCTTCACTATATTTTTCTCACAAAACATAAAT
ACAATCACTCTGTTTGAAACATCAAGATCCTTATGTGTAGATGTTCCTTATACGGCAGGT
TATGTTGTACCGTGAGAATTGGAACTTATGTTGAATCATTACACAATTTAAAGAATTTAT
TTTACACAGTGGCTGTTATGGTAGTGATATGAAGTTTTTTTAATATCTCACATTGACCAC
GCTTCAGGGAACCTACTGTTTGTTTGAGTGTTTTTGATGGTCTCGCAATTCTCCTTCATG
ACACACTGGTCGTCTCAGGCGTTGAGCCAAAAGTGGAGTAAATCAACTCCACTTACTGAC
TCTTATGTGGTTAATTTCCTCCTTTTCACAGGTCGTCTCTTCCTGACAAGAACTCATTTT
TACTTGACAATAATGAATGTGCTGTTGCACTAATCATCTTTCAGTTCAGGCGTAAGAAAA
CTAATCATATTCACATGAATACAATCCCTGCTTATCTATTCATTCTGTTTGACATTGTAT
CCAACAGAAAATGTGTCAGATATGTGAAAACTACCTCCGGTTCAACAAAGTACGAAGGTG
TTCATAAGATAGGGACTGTACAGTTGCTGAGCTCAATGCATAAGTTCTTTACTCTGACCC
ACAGCTGCAGCCATTAACTTATCTCATGATATATTACTGCTTGCTGTTTGTAATTTC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2AO58JQ 831 0 0
GTTATGTTGTACCGTGAGAATTGGAACTTATGTTGAATCATTACACAATTTAAAGAATTT
ATTTTACACAGTGGCTGTTATGGTAGTGATATGAAGTTTTTTTAATATCTCACATTGACC
ACGCTTCAGGGAACCTACTGTTTGTTTGAGTGTTTTTGATGGTCTCGCAATTCTCCTTCA
TGACACACTGGTCGTCTCAGGCGTTGAGCCAAAAGTGGAGTAAATCAACTCCACTTACTG
ACTCTTATGTGGTTAATTTCCTCCTTTTCACAGGTCGTCTCTTCCTGACAAGAACTCATT
TTTACTTGACAATAATGAATGTGCTGTTGCACTAATCATCTTTCAGTTCAGGCGTAAGAA
AACTAATCATATTCACATGAATACAATCCCTGCTTATCTATTCATTCTGTTTGACATTGT
ATCCAACAGAAAATGTGTCAGATATGTGAAAACTACCTCCGGTTCAACAAAGTACGAAGG
TGTTCATAAGATAGGGACTGTACAGTTGCTGAGCTCAATGCATAAGTTCTTTACTCTGAC
CCACAGCTGCAGCCATTAACTTATCTCATGATATATTACTGCTTGCTGTTTGTAATTTCA
GGGTGCAGAACTTGCGGAGGAAGGGCACACCGTGAAAAAGGCTCGCGTAGCTTTCCAGCT
TAGGGAGTGGCCAAGACCAATGCCTACTACTGCTTTCCTTAAGATTTATATTTTTGTACG
GTTGAATAAATAGTTTGGTAGTCTTTCGTATTTGTTTTTCTTAATTCCCTTACTCCTGGA
GTTATTTTCGTATTTGTTTTTTAATTCGTATATATACAAAAAAAATCGTCC

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 2

CO CL6733Contig1 909 2 4 U
GGGATTCAACACATCTACTTACCCATCTCTTCTTCATCATCTCCCAGAAAATATTAATCA
CTATTCATAATCTTAAATCCTAATCCTCTGTTCCGGAAGCTCCCCTGTTCTGCTATTCTG
TGTTCGTTGGATGAGGAGCAGAAGAAAGTGAAAGTTGTAAAATATATAAAGTTTCATGGG
CAATTCATGTCGTGGTTCTTTCAAGGACAGAGTCTACGAGGGGAATAACACTCGTCCTGT
AAAAGAACCTTTTGTACGGCGTAACATGGACAATCAAGCTCACTACGTTCTCGGTCACAA
GACTCCCAACATCCGCGATCTATACACCTTGAGCTGCAAGTTAGGGCAAGGACAGTTCGG
GACGACCTATCTCTGCACCGAGATCGCCACAGGCGTTGACTACGCTTGCAAATCTATATC
CAAGAGGAAACTCATATCCAAAGCAGACGTCGAGGATGTCAGGAGGGAGATTCAGATAAT
GCACCACTTGGCGGGTCACAAGAACATTGTTACGATCAAAGGAGCTTATGAGGACCCTTT
GTATGTTCACATTGTGATGGAGGCTGCAAACGTTTGCAATCACAGAGAAGTCTGAAGAGA
AGATTGGATTCATAGGTGCAAGACAGCTGGCTGAATCCCTTGAAGGTTTGAGTTTAAAAT
GTAAAAGAAAAACAACTGTTTCATCAGTAGCTGTGAGGACTGTTTCTATTGTCTCTCTGT
TTTGTTTGTAACAATTGTTAAAAGTTTGGTGAGCTTTGTTTCATCTTTGTTGTTTAAAGC
TTTGACCCTCTTTTGGGTTTTTGAGAGATCAATCATCTTCCATTAGATAACAAGTGTGAT
TTCTAATGCATACTTCTAAATGTTATGACACGACAACGAGACTAATATAAAGTATAAACA
CTTTGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU85TF U 1
AF RR2CU85JQ C 159
BS 1 643 RR2CU85TF
BS 644 644 RR2CU85JQ
BS 645 770 RR2CU85TF
BS 771 909 RR2CU85JQ

RD RR2CU85TF 771 0 0
GGGATTCAACACATCTACTTACCCATCTCTTCTTCATCATCTCCCAGAAAATATTAATCA
CTATTCATAATCTTAAATCCTAATCCTCTGTTCCGGAAGCTCCCCTGTTCTGCTATTCTG
TGTTCGTTGGATGAGGAGCAGAAGAAAGTGAAAGTTGTAAAATATATAAAGTTTCATGGG
CAATTCATGTCGTGGTTCTTTCAAGGACAGAGTCTACGAGGGGAATAACACTCGTCCTGT
AAAAGAACCTTTTGTACGGCGTAACATGGACAATCAAGCTCACTACGTTCTCGGTCACAA
GACTCCCAACATCCGCGATCTATACACCTTGAGCTGCAAGTTAGGGCAAGGACAGTTCGG
GACGACCTATCTCTGCACCGAGATCGCCACAGGCGTTGACTACGCTTGCAAATCTATATC
CAAGAGGAAACTCATATCCAAAGCAGACGTCGAGGATGTCAGGAGGGAGATTCAGATAAT
GCACCACTTGGCGGGTCACAAGAACATTGTTACGATCAAAGGAGCTTATGAGGACCCTTT
GTATGTTCACATTGTGATGGAGGCTGCAAACGTTTGCAATCACAGAGAAGTCTGAAGAGA
AGATTGGATTCATAGGTGCAAGACAGCTGGCTGAATCCCTTGA*GGTTTGAGTTTAAAAT
GTAAAAGAAAAACAACTGTTTCATCAGTAGCTGTGAGGACTGTTTCTATTGTCTCTCTGT
TTTGTTTGTAACAATTGTTAAAAGTTTGGTGAGCTTTGTTTCATCTTTGT
G

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2CU85JQ 751 0 0
AAAATATATAAAGTTTCATGGGCAATTCATGTCGTGGTTCTTTCAAGGACAGAGTCTACG
AGGGGAATAACACTCGTCCTGTAAAAGAACCTTTTGTACGGCGTAACATGGACAATCAAG
CTCACTACGTTCTCGGTCACAAGACTCCCAACATCCGCGATCTATACACCTTGAGCTGCA
AGTTAGGGCAAGGACAGTTCGGGACGACCTATCTCTGCACCGAGATCGCCACAGGCGTTG
ACTACGCTTGCAAATCTATATCCAAGAGGAAACTCATATCCAAAGCAGACGTCGAGGATG
TCAGGAGGGAGATTCAGATAATGCACCACTTGGCGGGTCACAAGAACATTGTTACGATCA
AAGGAGCTTATGAGGACCCTTTGTATGTTCACATTGTGATGGAGGCTGCAAACGTTTGCA
ATCACAGAGAAGTCTGAAGAGAAGATTGGATTCATAGGTGCAAGACAGCTGGCTGAATCC
CTTGAAGGTTTGAGTTTAAAATGTAAAAGAAAAACAACTGTTTCATCAGTAGCTGTGAGG
ACTGTTTCTATTGTCTCTCTGTTTTGTTTGTAACAATTGTTAAAAGTTTGGTGAGCTTTG
TTTCATCTTTGTTGTTTAAAGCTTTGACCCTCTTTTGGGTTTTTGAGAGATCAATCATCT
TCCATTAGATAACAAGTGTGATTTCTAATGCATACTTCTAAATGTTATGACACGACAACG
AGACTAATATAAAGTATAAACACTTTGCTAC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL6734Contig1 877 2 2 U
CAGACATCTAAAATGGCTTTCTCCACCAAACTCGCCGTCTTACAACAAAACACAAGTGTT
TCACTGACATCAATGCTCGGTTCACTCCGTTACATTTCCACAAAGCTCTTCGTTGGTGGC
CTATCACCCGGAACTGACGACAGTTCCTTGAAGGACGCTTTCTCTACCTTCAGCGAAGTG
TCAGATGCAAGAGTGATGACAAACAAAGTGACTGGGAGGTCTCGAGGTTATGGATTCGTT
AACTTCATGAGCGTGGATTCTGCTAAATCTGCTATTTCAGCTATGGATGGACAGGAGTTG
AATGGGTTTAACATCCGTGTGGATGCTGCGAAAGAATGGCCAAGCTTGCCTTTGGGAGAG
AGTGTAGAGGATGAGAAGAAAGGCAATAAGGTGGTGGTGAGCCGATCTGTATGGAAAGAT
CCGTTCGTTGACGCGTTCTTGATGAAGAAGAAAAACGCTGCACTGAACAGGAAGATATGG
TCGAGAAGATCGACAATTCTGCCAGAGTATGTTGATTCGTCTGTGAGGATCTACAATGGG
AAGACTCATGTGCGTTGTAAGATCACAGAGGGGAAAGTTGGGCATAAGTTTGGGGAGTTT
GCGTTTACGAGAAAAGTGACCAAGCATCCTAGAGCAAAGTAACTGTAGTGAAGTGAAGTA
AGTTCTTGAGAATTATCTTTAGGATGCTCATTTTTCGAAAGTTGAGAAACTTTTGTAAGC
CATTGATCATTGAAAGTGTTTTCTGTTGTTGTTGTTCATGATTCTTTGGTAGTGATTTTT
CGAGATGTGGAAAATCAACTTTAAATCCATCATTTCATCTACATGAAGATAGTTTTTTGA
CCGTGATTTCAATTAGTAAATAAAAATTCGAAGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B174TF U 1
AF RR2B174JQ C 134
BS 1 741 RR2B174TF
BS 742 877 RR2B174JQ

RD RR2B174TF 741 0 0
CAGACATCTAAAATGGCTTTCTCCACCAAACTCGCCGTCTTACAACAAAACACAAGTGTT
TCACTGACATCAATGCTCGGTTCACTCCGTTACATTTCCACAAAGCTCTTCGTTGGTGGC
CTATCACCCGGAACTGACGACAGTTCCTTGAAGGACGCTTTCTCTACCTTCAGCGAAGTG
TCAGATGCAAGAGTGATGACAAACAAAGTGACTGGGAGGTCTCGAGGTTATGGATTCGTT
AACTTCATGAGCGTGGATTCTGCTAAATCTGCTATTTCAGCTATGGATGGACAGGAGTTG
AATGGGTTTAACATCCGTGTGGATGCTGCGAAAGAATGGCCAAGCTTGCCTTTGGGAGAG
AGTGTAGAGGATGAGAAGAAAGGCAATAAGGTGGTGGTGAGCCGATCTGTATGGAAAGAT
CCGTTCGTTGACGCGTTCTTGATGAAGAAGAAAAACGCTGCACTGAACAGGAAGATATGG
TCGAGAAGATCGACAATTCTGCCAGAGTATGTTGATTCGTCTGTGAGGATCTACAATGGG
AAGACTCATGTGCGTTGTAAGATCACAGAGGGGAAAGTTGGGCATAAGTTTGGGGAGTTT
GCGTTTACGAGAAAAGTGACCAAGCATCCTAGAGCAAAGTAACTGTAGTGAAGTGAAGTA
AGTTCTTGAGAATTATCTTTAGGATGCTCATTTTTCGAAAGTTGAGAAACTTTTGTAAGC
CATTGATCATTGAAAGTGTTT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2B174JQ 744 0 0
CTGACGACAGTTCCTTGAAGGACGCTTTCTCTACCTTCAGCGAAGTGTCAGATGCAAGAG
TGATGACAAACAAAGTGACTGGGAGGTCTCGAGGTTATGGATTCGTTAACTTCATGAGCG
TGGATTCTGCTAAATCTGCTATTTCAGCTATGGATGGACAGGAGTTGAATGGGTTTAACA
TCCGTGTGGATGCTGCGAAAGAATGGCCAAGCTTGCCTTTGGGAGAGAGTGTAGAGGATG
AGAAGAAAGGCAATAAGGTGGTGGTGAGCCGATCTGTATGGAAAGATCCGTTCGTTGACG
CGTTCTTGATGAAGAAGAAAAACGCTGCACTGAACAGGAAGATATGGTCGAGAAGATCGA
CAATTCTGCCAGAGTATGTTGATTCGTCTGTGAGGATCTACAATGGGAAGACTCATGTGC
GTTGTAAGATCACAGAGGGGAAAGTTGGGCATAAGTTTGGGGAGTTTGCGTTTACGAGAA
AAGTGACCAAGCATCCTAGAGCAAAGTAACTGTAGTGAAGTGAAGTAAGTTCTTGAGAAT
TATCTTTAGGATGCTCATTTTTCGAAAGTTGAGAAACTTTTGTAAGCCATTGATCATTGA
AAGTGTTTTCTGTTGTTGTTGTTCATGATTCTTTGGTAGTGATTTTTCGAGATGTGGAAA
ATCAACTTTAAATCCATCATTTCATCTACATGAAGATAGTTTTTTGACCGTGATTTCAAT
TAGTAAATAAAAATTCGAAGTTGC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL6735Contig1 738 2 3 U
AAAAATGTAAAAAATTCAAATTCAAAAAGCATGATCTAATTAGTGAGGATGATCCACAAG
GCCTAGAGACTGTTGAGCCAAGCTTTCCACCTCCCAGAGATCTTCCTCATTGTTGTTGTC
TCCACAGAGTCTCCAAGGCTTTGAGCTTCTGACTTCTTCGACAAAACGAAGTTCCTCGAT
CCGGTTGACCCGATTTTCCCCCACGGATTGAATGCTTCAGCGGCACAATAAGGACAGTAA
AGAATGAAAAAGCTGGAATCTGATCCGAGAAGGGGAAGCCTGCCCTCACGGGCGTAGCAT
TTGAGAGCATACTCAATCACATTTGATACAGTTTCATCTTCTTTGACAACAAAACGAATC
GGTCCAGCACTTCCTACGAAACTGATGCTAACGAGGAACCTTTTTATCTTCGATTTAGAG
TCTTTCATCTGCTTGTTGTACACCATCTTTACAATTATACCAACAAAAGGAATCAGAAAC
TCTGATGAAGGCCTTTTTTTTTTATTCAAGGGTGGACGCCCATGCAACGTAAGTACCAAG
ATTTTTTGAAAGAGACAAATGTGAAAGAAGATGGGGGTGGAGACAGGGAGGAGAAAGCTC
GCCCTAGCGGTTGTGCAATGGGAGAGCATAAAATCTCTGATAGTCGGAGTTGTTTCTACC
ATTCAAGACGCTAAGCAATCTGATTTAAAAAAAACGAGTCTGAGTAGTTTCCGATCGATA
ATAGAGTTTTTGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL63JQ U 548
AF RR2AL63TF C 1
BS 1 547 RR2AL63TF
BS 548 683 RR2AL63JQ
BS 684 738 RR2AL63TF

RD RR2AL63JQ 136 0 0
GAAAGAGACAAATGTGAAAGAAGATGGGGGTGGAGACAGGGAGGAGAAAGCTCGCCCTAG
CGGTTGTGCAATGGGAGAGCATAAAATCTCTGATAGTCGGAGTTGTTTCTACCATTCAAG
ACGCTAAGCAATCTGA

QA 1 136 1 136
DS 

RD RR2AL63TF 738 0 0
AAAAATGTAAAAAATTCAAATTCAAAAAGCATGATCTAATTAGTGAGGATGATCCACAAG
GCCTAGAGACTGTTGAGCCAAGCTTTCCACCTCCCAGAGATCTTCCTCATTGTTGTTGTC
TCCACAGAGTCTCCAAGGCTTTGAGCTTCTGACTTCTTCGACAAAACGAAGTTCCTCGAT
CCGGTTGACCCGATTTTCCCCCACGGATTGAATGCTTCAGCGGCACAATAAGGACAGTAA
AGAATGAAAAAGCTGGAATCTGATCCGAGAAGGGGAAGCCTGCCCTCACGGGCGTAGCAT
TTGAGAGCATACTCAATCACATTTGATACAGTTTCATCTTCTTTGACAACAAAACGAATC
GGTCCAGCACTTCCTACGAAACTGATGCTAACGAGGAACCTTTTTATCTTCGATTTAGAG
TCTTTCATCTGCTTGTTGTACACCATCTTTACAATTATACCAACAAAAGGAATCAGAAAC
TCTGATGAAGGCCTTTTTTTTTTATTCAAGGGTGGACGCCCATGCAACGTAAGTACCAAG
ATTTTTTGAAAGAGACAAATGTGAAAGAAGATGGGG*TGGAGACAGGGAGGAGAAAGCTC
GCCCTAGCGGTTGTGCAATGGGAGAGCATAAAATCTCTGATAGTCGGAGTTGTTTCTACC
ATTCAAGACGCTAAGCAATCTGATTTAAAAAAAACGAGTCTGAGTAGTTTCCGATCGATA
ATAGAGTTTTTGAGATCC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL6736Contig1 924 2 2 U
GGACACAAACATATCTCTCTCTCTCTCAGATATCGTAAACACTCGCACAAACAATTAACA
TTTGTTTCCCGAGTCTGACATTGTGAATTGATGCAGCAGAGAGGCCGATCCGTAAACCGT
AGATCAAGAAGCTTCTCTAGATCCAGACTCGCCGTCGAAGGACACAAACATATCGATCTC
TCCGTCAACATGATCTCGTTCGCACTGGAACGTGCTATTGGGCTCAACTGCCCGGTTGAG
TTTGAGGTCGCGGATTGCACCAAAAAACATTACCCGGAGAATTCGTTCGATGTGATTTAC
AGCCGTGACACTATTCTGCACATCCAAGACAAACCAGCTTTGTTCAGGACTTTCTTCAAG
TGGCTTAAACCGGGAGGCAAAGTGCTCATCAGCGACTACTGTAAGAGCTCGGAAACTCCA
TCTCCTGAGTTTTCTGAGTACATTAAACAGAGAGGATATGATCTCCATGATGTTCAAGCT
TATGGGCAGATGCTAAAAGACGCAGGCTTTAACGATGTGATCGCAGAAGACCGTACTGAT
CAGTTTATGCAAGTCCTGAGACGTGAACTAGAGAGGGTGGAGAAAGAAAAGGAAGAGTTC
ATCTCCGACTTCTCCAAAGAGGACTACGAGGACATAGTTGGAGGATGGAAGGCTAAGCTG
GAGAGAAGTGCTTCGGGTGAGCAGAAGTGGGGACTTTTCATCGCCAACAAGAACTAATAA
TAACCTCTTTTACTTTTTAAATGCGTTTTTTGCTTCTTCAATAATAAAAAACATCATTTC
CGTTTGGCAATGATGTTATGTGGACTTGTGTGTTGTTTGTTTCTGTTTTCGGTTAGATAC
ATAAACCGAATTTCGTTTGGTTCAATCTTTGTTTCCTATCACAATTTGTTTTAAGAAGAA
TTATAATATTTGGATTTTCAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT02TF U 1
AF RR2AT02JQ C 122
BS 1 685 RR2AT02TF
BS 686 924 RR2AT02JQ

RD RR2AT02TF 685 0 0
GGACACAAACATATCTCTCTCTCTCTCAGATATCGTAAACACTCGCACAAACAATTAACA
TTTGTTTCCCGAGTCTGACATTGTGAATTGATGCAGCAGAGAGGCCGATCCGTAAACCGT
AGATCAAGAAGCTTCTCTAGATCCAGACTCGCCGTCGAAGGACACAAACATATCGATCTC
TCCGTCAACATGATCTCGTTCGCACTGGAACGTGCTATTGGGCTCAACTGCCCGGTTGAG
TTTGAGGTCGCGGATTGCACCAAAAAACATTACCCGGAGAATTCGTTCGATGTGATTTAC
AGCCGTGACACTATTCTGCACATCCAAGACAAACCAGCTTTGTTCAGGACTTTCTTCAAG
TGGCTTAAACCGGGAGGCAAAGTGCTCATCAGCGACTACTGTAAGAGCTCGGAAACTCCA
TCTCCTGAGTTTTCTGAGTACATTAAACAGAGAGGATATGATCTCCATGATGTTCAAGCT
TATGGGCAGATGCTAAAAGACGCAGGCTTTAACGATGTGATCGCAGAAGACCGTACTGAT
CAGTTTATGCAAGTCCTGAGACGTGAACTAGAGAGGGTGGAGAAAGAAAAGGAAGAGTTC
ATCTCCGACTTCTCCAAAGAGGACTACGAGGACATAGTTGGAGGATGGAAGGCTAAGCTG
GAGAGAAGTGCTTCGGGTGAGCAGA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2AT02JQ 803 0 0
GATCAAGAAGCTTCTCTAGATCCAGACTCGCCGTCGAAGGACACAAACATATCGATCTCT
CCGTCAACATGATCTCGTTCGCACTGGAACGTGCTATTGGGCTCAACTGCCCGGTTGAGT
TTGAGGTCGCGGATTGCACCAAAAAACATTACCCGGAGAATTCGTTCGATGTGATTTACA
GCCGTGACACTATTCTGCACATCCAAGACAAACCAGCTTTGTTCAGGACTTTCTTCAAGT
GGCTTAAACCGGGAGGCAAAGTGCTCATCAGCGACTACTGTAAGAGCTCGGAAACTCCAT
CTCCTGAGTTTTCTGAGTACATTAAACAGAGAGGATATGATCTCCATGATGTTCAAGCTT
ATGGGCAGATGCTAAAAGACGCAGGCTTTAACGATGTGATCGCAGAAGACCGTACTGATC
AGTTTATGCAAGTCCTGAGACGTGAACTAGAGAGGGTGGAGAAAGAAAAGGAAGAGTTCA
TCTCCGACTTCTCCAAAGAGGACTACGAGGACATAGTTGGAGGATGGAAGGCTAAGCTGG
AGAGAAGTGCTTCGGGTGAGCAGAAGTGGGGACTTTTCATCGCCAACAAGAACTAATAAT
AACCTCTTTTACTTTTTAAATGCGTTTTTTGCTTCTTCAATAATAAAAAACATCATTTCC
GTTTGGCAATGATGTTATGTGGACTTGTGTGTTGTTTGTTTCTGTTTTCGGTTAGATACA
TAAACCGAATTTCGTTTGGTTCAATCTTTGTTTCCTATCACAATTTGTTTTAAGAAGAAT
TATAATATTTGGATTTTCAATTT

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL6737Contig1 802 2 4 U
GGCTCAATAACATTCGGTTCGCATTGATAATCTTGGGGTCCAAAACGATATTTTTTTTTA
CTTGTTGGCCATTGTGAGAAAAAAATGTGAAACTTCATAACTAACAGAAAAGAACAACGT
TGAGAACTAGGGTTGCCTTTAAGCCAAGTTTTGTTCCTTGAGGTTGTCTTCTGCTGTTTA
CATGGAGAACTTCTGCGGGACTGTATCAAAATCCTCTCCAAAGTCATACCTTTGCCTTTC
CCTTCCAACCTTTCCCAAGTACGAAGGATCACATGACAAGCTCTCATCCATGGCTATGAG
ATTCTTCGACAGCCTAATAGTCCTTTGGATGACAGAGTCCATGACCTCAATCATCTCACT
GGTTTTGTACTGCTCAGGATCCTCCAAGAATCTGACCATTCCATCTTTCTGATTGATAAG
AGCATGTATCTGACCATCCTGGATCATCTGAAGCACATGCATTTCAGCCTCCTTAGCATT
GGCAAGTTGAACCATGTTGGCTATATCTTGAAGCGACAAGGTCAAGTACTTCTGAGTCAA
TCTCAGAATGTTCCGTTCGTAAAGGGATGACACTGCTTGCTTAACTAATCCAAGGTTATT
GTCCTTTTCAAAATCTGAGCCGTGGGCTACAACCACTGCCTCTAGTTCACTCATCTTCCC
TTCGTTGAAGCAATTTCCCACTTCAGTGTAAGCTGTAGACCAGCTCTTGAGGTTCCTCTG
AGCTGCTGTAGAAGCGCACTTGGGGAGACTGACACTAAACTGCCCGGAGTGAATAAGAGA
CACCAATATGTACTTTTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP35JQ U 1
AF RR2AG84JQ U 35
BS 1 557 RR2GP35JQ
BS 558 558 RR2AG84JQ
BS 559 622 RR2GP35JQ
BS 623 802 RR2AG84JQ

RD RR2GP35JQ 622 0 0
GGCTCAATAACATTCGGTTCGCATTGATAATCTTGGGGTCCAAAACGATATTTTTTTTTA
CTTGTTGGCCATTGTGAGAAAAAAATGTGAAACTTCATAACTAACAGAAAAGAACAACGT
TGAGAACTAGGGTTGCCTTTAAGCCAAGTTTTGTTCCTTGAGGTTGTCTTCTGCTGTTTA
CATGGAGAACTTCTGCGGGACTGTATCAAAATCCTCTCCAAAGTCATACCTTTGCCTTTC
CCTTCCAACCTTTCCCAAGTACGAAGGATCACATGACAAGCTCTCATCCATGGCTATGAG
ATTCTTCGACAGCCTAATAGTCCTTTGGATGACAGAGTCCATGACCTCAATCATCTCACT
GGTTTTGTACTGCTCAGGATCCTCCAAGAATCTGACCATTCCATCTTTCTGATTGATAAG
AGCATGTATCTGACCATCCTGGATCATCTGAAGCACATGCATTTCAGCCTCCTTAGCATT
GGCAAGTTGAACCATGTTGGCTATATCTTGAAGCGACAAGGTCAAGTACTTCTGAGTCAA
TCTCAGAATGTTCCGTTTGTAAAGGGATGACACTGCTTGCTTAACTAATCCAAGGTTATT
GTCCTTTTCAAAATCTGAGCCG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2AG84JQ 768 0 0
GT
GGTCCAAAACGATATTTTTTTTTACTTGTTGGCCATTGTGAGAAAAAAATGTGAAACTTC
ATAACTAACAGAAAAGAACAACGTTGAGAACTAGGGTTGCCTTTAAGCCAAGTTTTGTTC
CTTGAGGTTGTCTTCTGCTGTTTACATGGAGAACTTCTGCGGGAC*GTATCAAAATCCTC
TCCAAAGTCATACCTTTGCCTTTCCCTTCCAACCTTTCCCAAGTACGAAGGATCACATGA
CAAGCTCTCATCCATGGCTATGAGATTCTTCGACAGCCTAATAGTCCTTTGGATGACAGA
GTCCATGACCTCAATCATCTCACTGGTTTTGTACTGCTCAGGATCCTCCAAGAATCTGAC
CATTCCATCTTTCTGATTGATAAGAGCATGTATCTGACCATCCTGGATCATCTGAAGCAC
ATGCATTTCAGCCTCCTTAGCATTGGCAAGTTGAACCATGTTGGCTATATCTTGAAGCGA
CAAGGTCAAGTACTTCTGAGTCAATCTCAGAATGTTCCGTTCGTAAAGGGATGACACTGC
TTGCTTAACTAATCCAAGGTTATTGTCCTTTTCAAAATCTGAGCCGTGGGCTACAACCAC
TGCCTCTAGTTCACTCATCTTCCCTTCGTTGAAGCAATTTCCCACTTCAGTGTAAGCTGT
AGACCAGCTCTTGAGGTTCCTCTGAGCTGCTGTAGAAGCGCACTTGGGGAGACTGACACT
AAACTGCCCGGAGTGAATAAGAGACACCAATATGTACTTTTTATAC

QA 3 768 3 768
DS 



AS 1 2

CO CL6738Contig1 711 2 2 U
GGGCCAAATGTGAAGTCTCTCATCACTTCGCTCACCCCGCTCCAGAAGGAAACTGACGTG
CCTTCATATGATCTTATGGGTATACCACATGAAACCGATCAGGCCGAGGAAGAGCAGCAG
CTTTCTTTGACACCCTTTGGTGACGCGTGTTTAAGAGTAGATCTTACGGCCATACACGAA
ATACTAAGTAGGATGGGATACAAGGATGATGAAGGAATCGCTAACGAGCTGTCGTTTCAA
ATGTGGACCAACCAGATGCAAGAATCTCTCAACTCGAAGAAGCAAGGCGATGTAGCTTTC
CGTGCAAAAGATTATACTACCGCAGTCCATTGCTACACTCAGTTCATAGATGGAGGAACA
ATGGTGTCACCAACTGTTCACGCAAGGCGTTGCCTGTCATATCTGATGAACGATAACCCA
CAAGAGGCTCTAACCGATGCACTGCAAGCACAGGTTGTGTCTCCAGAATGGCCAACCGCA
TTGTATCTACAAGCGGCTTGCTTGTTCAAGCTCGGCATGGAAACCGATGCACAGCAAGCT
CTTAAGGACGGTACTACATTGGAAGCCAAGAAGACCAATAGACGCTAATAAAATGTTTTC
TAAAAGAGCTCTGTATAGGCTTGTTTTATTTCCTCTCTCACTCATATCTCTCCATCTCTA
TGCATATTCTTCTTCTTTGTATTTATTATGAATTATGATGATAATGATTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO32JQ C 1
AF RR2CO32TF U 1
BS 1 703 RR2CO32TF
BS 704 711 RR2CO32JQ

RD RR2CO32JQ 711 0 0
GGGCCAAATGTGAAGTCTCTCATCACTTCGCTCACCCCGCTCCAGAAGGAAACTGACGTG
CCTTCATATGATCTTATGGGTATACCACATGAAACCGATCAGGCCGAGGAAGAGCAGCAG
CTTTCTTTGACACCCTTTGGTGACGCGTGTTTAAGAGTAGATCTTACGGCCATACACGAA
ATACTAAGTAGGATGGGATACAAGGATGATGAAGGAATCGCTAACGAGCTGTCGTTTCAA
ATGTGGACCAACCAGATGCAAGAATCTCTCAACTCGAAGAAGCAAGGCGATGTAGCTTTC
CGTGCAAAAGATTATACTACCGCAGTCCATTGCTACACTCAGTTCATAGATGGAGGAACA
ATGGTGTCACCAACTGTTCACGCAAGGCGTTGCCTGTCATATTTGATGAACGATAACCCA
CAAGAGGCTCTAACCGATGCACTGCAAGCACAGGTTGTGTTTCCAGAATGGCCAACCGCA
TTGTATTTACAAGCGGCTTGCTTGTTCAAGCTCGGCATGGAAACCGATGCACAGCAAGCT
TTTAAGGACGGTACTACATTGGAAGCCAAGAAGACCAATAGACGCTAATAAAATGTTTTT
TAAAAGAGCTCTGTATAGGCTTGTTTTATTTCCTCTCTCACTCATATCTCTCCATCTCTA
TGCATATTTTTTTTCTTTGTATTTATTATGAATTATGATGATAATGATTGG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2CO32TF 711 0 0
GGGCCAAATGTGAAGTCTCTCATCACTTCGCTCACCCCGCTCCAGAAGGAAACTGACGTG
CCTTCATATGATCTTATGGGTATACCACATGAAACCGATCAGGCCGAGGAAGAGCAGCAG
CTTTCTTTGACACCCTTTGGTGACGCGTGTTTAAGAGTAGATCTTACGGCCATACACGAA
ATACTAAGTAGGATGGGATACAAGGATGATGAAGGAATCGCTAACGAGCTGTCGTTTCAA
ATGTGGACCAACCAGATGCAAGAATCTCTCAACTCGAAGAAGCAAGGCGATGTAGCTTTC
CGTGCAAAAGATTATACTACCGCAGTCCATTGCTACACTCAGTTCATAGATGGAGGAACA
ATGGTGTCACCAACTGTTCACGCAAGGCGTTGCCTGTCATATCTGATGAACGATAACCCA
CAAGAGGCTCTAACCGATGCACTGCAAGCACAGGTTGTGTCTCCAGAATGGCCAACCGCA
TTGTATCTACAAGCGGCTTGCTTGTTCAAGCTCGGCATGGAAACCGATGCACAGCAAGCT
CTTAAGGACGGTACTACATTGGAAGCCAAGAAGACCAATAGACGCTAATAAAATGTTTTC
TAAAAGAGCTCTGTATAGGCTTGTTTTATTTCCTCTCTCACTCATATCTCTCCATCTCTA
TGCATATTCTTCTTCTTTGTATTTATTATGAATTATGATGATA
TGATTGTG

QA 1 703 1 703
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6740Contig1 383 2 1 U
ACTGTCAAGCTCTGGGAACTCAGATCCGTTGCATAATCGATTAAAATGGATCAAGAGGCA
GCTGAAACTGCGAGGGAGTCGCTGGAGCTTGTGTTTCGGATGTCGAACATCTTGGACACT
GGTCTCGATCGACATACATTGTCTGTTTTAATAGCTCTCTGCGATCTTGGTCTTAACCCT
GAGGCTCTAGCTGCTGTCGTCAAGGAGCTTCGACAGGATTCTGGCAACAACCGTGGCGGC
AGCTTAAGATAATAGTTCAATACTGAAACATCTGCGAACTGTTTTTTTTTTCTTTTTCCT
TTTATGTTTCGGTTTTATTCTGCCATTAACTTATCGAGTGTTTCTTGAGCTATAGAGTCT
TATGAGGGGCCTTCTTGAATCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BY57JQ C 1
AF RR2BY57TF U 1
BS 1 383 RR2BY57TF

RD RR2BY57JQ 383 0 0
ACTGTCAAGCTCTGGGAACTCAGATCCGTTGCATAATCGATTAAAATGGATCAAGAGGCA
GCTGAAACTGCGAGGGAGTCGCTGGAGCTTGTGTTTCGGATGTCGAACATCTTGGACACT
GGTCTCGATCGACATACATTGTCTGTTTTAATAGCTCTCTGCGATCTTGGTCTTAACCCT
GAGGCTCTAGCTGCTGTCGTCAAGGAGCTTCGACAGGATTCTGGCAACAACCGTGGCGGC
AGCTTAAGATAATAGTTCAATACTGAAACATCTGCGAACTGTTTTTTTTTTCTTTTTCCT
TTTATGTTTCGGTTTTATTCTGCCATTAACTTATCGAGTGTTTCTTGAGCTATAGAGTCT
TATGAGGGGCCTTCTTGAATCAC

QA 1 383 1 383
DS 

RD RR2BY57TF 383 0 0
ACTGTCAAGCTCTGGGAACTCAGATCCGTTGCATAATCGATTAAAATGGATCAAGAGGCA
GCTGAAACTGCGAGGGAGTCGCTGGAGCTTGTGTTTCGGATGTCGAACATCTTGGACACT
GGTCTCGATCGACATACATTGTCTGTTTTAATAGCTCTCTGCGATCTTGGTCTTAACCCT
GAGGCTCTAGCTGCTGTCGTCAAGGAGCTTCGACAGGATTCTGGCAACAACCGTGGCGGC
AGCTTAAGATAATAGTTCAATACTGAAACATCTGCGAACTGTTTTTTTTTTCTTTTTCCT
TTTATGTTTCGGTTTTATTCTGCCATTAACTTATCGAGTGTTTCTTGAGCTATAGAGTCT
TATGAGGGGCCTTCTTGAATCAC

QA 1 383 1 383
DS 



AS 1 2

CO CL6741Contig1 508 2 2 U
AAAAAAAAATATCAATATCAGATTTTCATTATTCCAGCGTCAAAACAGCCAACAAATGAT
GAAGAAACAGAGACAAAATATACTTTTTACCATAACGGTAAGACTTTGTATAAGATTTCA
AAAGAAGCAAGAAACTTTCTCTTGCACAAGCAAAAGTTTTGAGAAAATCATAAAAATTAA
AAGGAACAAGAGCAGCGCCATGAGAGAGAAAGACTCTTTAACCAGATGCGGTCTTCCTTT
GCTGGAAGACAACAGCAAAGATGGGAACACCAACACCGATGCTGAAAGCGGTGAAGACAC
CGAGAGACATCTTGAGACCTTGGTACTTCATGCGGTCCAGATTGTACATGTGCTTAGCGT
GGAGGTAGTAAGGCTCGTCATGCCCATGTCCTCCGCTCATCTTCTTTGCTCCAGTCGAGT
GGAAGCTTCTGCTCACAGATCTGGAGATTGATGATTCGGATGAAGCTATGATCCTTGACA
CAGATCTGATCCCTGTGTTCAACGCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FN89TF C 1
AF RR2FN89JQ U 42
BS 1 41 RR2FN89TF
BS 42 508 RR2FN89JQ

RD RR2FN89TF 508 0 0
AAAAAAAAATATCAATATCAGATTTTCATTATTCCAGCGTCAAAACAGCCAACAAATGAT
GAAGAAACAGAGACAAAATATACTTTTTACCATAACGGTAAGACTTTGTATAAGATTTCA
AAAGAAGCAAGAAACTTTCTCTTGCACAAGCAAAAGTTTTGAGAAAATCATAAAAATTAA
AAGGAACAAGAGCAGCGCCATGAGAGAGAAAGACTCTTTAACCAGATGCGGTCTTCCTTT
GCTGGAAGACAACAGCAAAGATGGGAACACCAACACCGATGCTGAAAGCGGTGAAGACAC
CGAGAGACATCTTGAGACCTTGGTACTTCATGCGGTCCAGATTGTACATGTGCTTAGCGT
GGAGGTAGTAAGGCTCGTCATGCCCATGTCCTCCGCTCATCTTCTTTGCTCCAGTCGAGT
GGAAGCTTCTGCTCACAGATCTGGAGATTGATGATTCGGATGAAGCTATGATCCTTGACA
CAGATCTGATCCCTGTGTTCAACGCCCC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2FN89JQ 467 0 0
AAAACAGCCAACAAATGATGAAGAAACAGAGACAAAATATACTTTTTACCATAACGGTAA
GACTTTGTATAAGATTTCAAAAGAAGCAAGAAACTTTCTCTTGCACAAGCAAAAGTTTTG
AGAAAATCATAAAAATTAAAAGGAACAAGAGCAGCGCCATGAGAGAGAAAGACTCTTTAA
CCAGATGCGGTCTTCCTTTGCTGGAAGACAACAGCAAAGATGGGAACACCAACACCGATG
CTGAAAGCGGTGAAGACACCGAGAGACATCTTGAGACCTTGGTACTTCATGCGGTCCAGA
TTGTACATGTGCTTAGCGTGGAGGTAGTAAGGCTCGTCATGCCCATGTCCTCCGCTCATC
TTCTTTGCTCCAGTCGAGTGGAAGCTTCTGCTCACAGATCTGGAGATTGATGATTCGGAT
GAAGCTATGATCCTTGACACAGATCTGATCCCTGTGTTCAACGCCCC

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 2

CO CL6742Contig1 888 2 2 U
CTGCAAAACGAAATCCAAAAACAATAGATAATAATTAAAGCCAGACATAAATGGGAAAAA
AAAGAACAAATAGCTATATTCAGTAACACTGAAATAAAACTTTCTGGCACAGCTCTTGAG
GCTATGGTTTCATTTCGATTCAAATCTCAAATTCTTGTTAGATAATAAAATATCACCGTA
GGGAATAACACCAGAAGCAAGGAGATTTGAAATCGAGAATCACAATCAGATCCAAGAAGA
ATGGATATGTAACGATACCTCGATTTGGGAAGACGAAGAATGTGAATCTCGGCTTTCAGG
TTAACCGGAGTCACATTAATACGGTAAATATCAACACATAACGATCGATACAAAAAACAA
AATCAGAAAAAACACTCACATTTACATCAACCAGGAGAAAATCCATCCATATAAGCTTTC
ACAGAGAAAACATCAAAACATATTTATACCTGATTTCGCCGCAATCAAAAGTTTTGAAGT
GGGTTTGCGAATTAAGAGGACTAAGGACGATTGATCACCGCGGGTTGAACGCTTAAAGTG
TGAATTGTTGTGCTGGATGCTGATGTGGCGCGCCCAAGAGAGAGTAAACTGTCTTTTATA
TAAATAGATTTTATGTTTTTACATGTTATGAAATTTAATTATTTTACTTTTACAAAAAAA
TAAGAACCTTAATGAAGTTCTACCATTGGACAAAGAAAAATTAAATTAGGAAAACAGAGG
TCCTAAACCTTTCAAATCATTGTTTTTAATACTAAACTATTGATTAGGAACCATAAGGAG
TCCTTGTTGATGGAGGTGGTCTTAGAACGTGCAACATAATATATGTAACTAATTCTCTTT
CGGTGTTAAGAAGAAAAAACTAATTTTCTTTCTCACTCAAAAAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AW34TFB U 1
AF RR2AW34JQ C 62
BS 1 695 RR2AW34TFB
BS 696 888 RR2AW34JQ

RD RR2AW34TFB 695 0 0
CTGCAAAACGAAATCCAAAAACAATAGATAATAATTAAAGCCAGACATAAATGGGAAAAA
AAAGAACAAATAGCTATATTCAGTAACACTGAAATAAAACTTTCTGGCACAGCTCTTGAG
GCTATGGTTTCATTTCGATTCAAATCTCAAATTCTTGTTAGATAATAAAATATCACCGTA
GGGAATAACACCAGAAGCAAGGAGATTTGAAATCGAGAATCACAATCAGATCCAAGAAGA
ATGGATATGTAACGATACCTCGATTTGGGAAGACGAAGAATGTGAATCTCGGCTTTCAGG
TTAACCGGAGTCACATTAATACGGTAAATATCAACACATAACGATCGATACAAAAAACAA
AATCAGAAAAAACACTCACATTTACATCAACCAGGAGAAAATCCATCCATATAAGCTTTC
ACAGAGAAAACATCAAAACATATTTATACCTGATTTCGCCGCAATCAAAAGTTTTGAAGT
GGGTTTGCGAATTAAGAGGACTAAGGACGATTGATCACCGCGGGTTGAACGCTTAAAGTG
TGAATTGTTGTGCTGGATGCTGATGTGGCGCGCCCAAGAGAGAGTAAACTGTCTTTTATA
TAAATAGATTTTATGTTTTTACATGTTATGAAATTTAATTATTTTACTTTTACAAAAAAA
TAAGAACCTTAATGAAGTTCTACCATTGGACAAAG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2AW34JQ 827 0 0
AAGAACAAATAGCTATATTCAGTAACACTGAAATAAAACTTTCTGGCACAGCTCTTGAGG
CTATGGTTTCATTTCGATTCAAATCTCAAATTCTTGTTAGATAATAAAATATCACCGTAG
GGAATAACACCAGAAGCAAGGAGATTTGAAATCGAGAATCACAATCAGATCCAAGAAGAA
TGGATATGTAACGATACCTCGATTTGGGAAGACGAAGAATGTGAATCTCGGCTTTCAGGT
TAACCGGAGTCACATTAATACGGTAAATATCAACACATAACGATCGATACAAAAAACAAA
ATCAGAAAAAACACTCACATTTACATCAACCAGGAGAAAATCCATCCATATAAGCTTTCA
CAGAGAAAACATCAAAACATATTTATACCTGATTTCGCCGCAATCAAAAGTTTTGAAGTG
GGTTTGCGAATTAAGAGGACTAAGGACGATTGATCACCGCGGGTTGAACGCTTAAAGTGT
GAATTGTTGTGCTGGATGCTGATGTGGCGCGCCCAAGAGAGAGTAAACTGTCTTTTATAT
AAATAGATTTTATGTTTTTACATGTTATGAAATTTAATTATTTTACTTTTACAAAAAAAT
AAGAACCTTAATGAAGTTCTACCATTGGACAAAGAAAAATTAAATTAGGAAAACAGAGGT
CCTAAACCTTTCAAATCATTGTTTTTAATACTAAACTATTGATTAGGAACCATAAGGAGT
CCTTGTTGATGGAGGTGGTCTTAGAACGTGCAACATAATATATGTAACTAATTCTCTTTC
GGTGTTAAGAAGAAAAAACTAATTTTCTTTCTCACTCAAAAAATCCC

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 2

CO CL6743Contig1 637 2 1 U
GTTCTTTCGCTCCACTGGTGGTCCCTGTAGGCGCGGTTTACTTTGGTTACAGATACATTG
TTGACAAATACAACTTCCTATACGTGTACAGAGTCCGCGGCTTCCCTGCTGGCAACGAAG
GAAAGCTAATGGACACGGTTTTGTGCATCATGCGGTTCTGCATCGACCTGTACATCGTCT
CCATGCTGTTTTTCTTCTCTGTCAAAGGAGATTCGACAAAGCTTCAAGCCATTCACACTT
GGGTTGCTTGTGATGTACAAGCTTTTGCCTTCGGATACAGAACGGTTTCACCCGGCTCTT
CTCCGAAGTATTCAGACCGTCGATAGCATCGTCGACGGGCCAGTGGATTACGAAGCTTAT
TCTCAACCCAACTTTGACTGGGACACTTACAACAGATGATGTTTCTACGACCTTATGACT
TATTAGTTTTTGGTCTTTTTGACCATATCGAGTTTTAGAATCTGTTTCTCGAAGTTACGG
GTTCTCTTTGTAAGTTTGTATATTCCCTTTTTGTGTATAATCCATCTTTTGAGAGCATTA
CGTTTGTTGCAGTCAGCATCTCTTGCAATTTGTCAACAGGATCTCTTTTATGTATTAATT
AATATCCCATTCTTTTAAAAATGTGATTAAGAGGTCG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EH22TF U 1
AF RR2EH22JQ C 5
BS 1 637 RR2EH22TF

RD RR2EH22TF 637 0 0
GTTCTTTCGCTCCACTGGTGGTCCCTGTAGGCGCGGTTTACTTTGGTTACAGATACATTG
TTGACAAATACAACTTCCTATACGTGTACAGAGTCCGCGGCTTCCCTGCTGGCAACGAAG
GAAAGCTAATGGACACGGTTTTGTGCATCATGCGGTTCTGCATCGACCTGTACATCGTCT
CCATGCTGTTTTTCTTCTCTGTCAAAGGAGATTCGACAAAGCTTCAAGCCATTCACACTT
GGGTTGCTTGTGATGTACAAGCTTTTGCCTTCGGATACAGAACGGTTTCACCCGGCTCTT
CTCCGAAGTATTCAGACCGTCGATAGCATCGTCGACGGGCCAGTGGATTACGAAGCTTAT
TCTCAACCCAACTTTGACTGGGACACTTACAACAGATGATGTTTCTACGACCTTATGACT
TATTAGTTTTTGGTCTTTTTGACCATATCGAGTTTTAGAATCTGTTTCTCGAAGTTACGG
GTTCTCTTTGTAAGTTTGTATATTCCCTTTTTGTGTATAATCCATCTTTTGAGAGCATTA
CGTTTGTTGCAGTCAGCATCTCTTGCAATTTGTCAACAGGATCTCTTTTATGTATTAATT
AATATCCCATTCTTTTAAAAATGTGATTAAGAGGTCG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2EH22JQ 633 0 0
TTTCGCTCCACTGGTGGTCCCTGTAGGCGCGGTTTACTTTGGTTACAGATACATTGTTGA
CAAATACAACTTCCTATACGTGTACAGAGTCCGCGGCTTCCCTGCTGGCAACGAAGGAAA
GCTAATGGACACGGTTTTGTGCATCATGCGGTTTTGCATCGACCTGTACATCGTCTCCAT
GCTGTTTTTTTTTTCTGTCAAAGGAGATTCGACAAAGCTTCAAGCCATTCACACTTGGGT
TGCTTGTGATGTACAAGCTTTTGCCTTCGGATACAGAACGGTTTCACCCGGCTTTTTTCC
GAAGTATTCAGACCGTCGATAGCATCGTCGACGGGCCAGTGGATTACGAAGCTTATTCTC
AACCCAACTTTGACTGGGACACTTACAACAGATGATGTTTTTACGACCTTATGACTTATT
AGTTTTTGGTCTTTTTGACCATATCGAGTTTTAGAATCTGTTTCTCGAAGTTACGGGTTC
TCTTTGTAAGTTTGTATATTCCCTTTTTGTGTATAATCCATCTTTTGAGAGCATTACGTT
TGTTGCAGTCAGCATCTCTTGCAATTTGTCAACAGGATCTCTTTTATGTATTAATTAATA
TCCCATTCTTTTAAAAATGTGATTAAGAGGTCG

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL6744Contig1 618 2 1 U
GGATCGTCTGTCTACTACTTCTTTCTCTCGAGTCGGCGCAGATGGATCCCGATGCTGTGG
CGAAGGCCTTTGTCGAACACTACTACTCAACCTTCGACACAAACCGTGCCGGTCTAGCCG
GTCTCTACCAGGAAGCTTCCATGCTCACCTTCGAGGGTCAGAAGATCCAAGGAGTCCAGA
GCATCGTAGCCAAGCTCACTTCTCTCCCTTTCCAGCAGTGTAAGCACAATATCTCCACTG
TTGATTGCCAGCCTTCTGGTCCCGCCTCCGGTATGCTCGTTTTCGTCTCCGGTAACCTCC
AGCTCGCCGGCGAGGAGCACGCCCTCAAGTTCAGCCAGATGTTTCACTTGATGCCGACAC
CACAAGGAAGCTTTTACGTGTTCAACGATATCTTCAGGCTCAACTACTCCTGAACATCTA
TCAGATTGTTGCATTCCTTTACTACACTATTTGTGCAATCCCGTTTGTCTTTCTTTTTTT
TCTTCATTCATATATGATTTGTCTTGGAAACAGAAGAAAACTCTTTGTCTGTTTGAGTAT
TTGCGTTGCTCATTTGTTATTTCTAATCTATTGGCTTTGATCAGACAATTTGAAATTGTT
TCCATTGTCACTTGCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GN54TF U 1
AF RR2GN54JQ C 10
BS 1 618 RR2GN54TF

RD RR2GN54TF 618 0 0
GGATCGTCTGTCTACTACTTCTTTCTCTCGAGTCGGCGCAGATGGATCCCGATGCTGTGG
CGAAGGCCTTTGTCGAACACTACTACTCAACCTTCGACACAAACCGTGCCGGTCTAGCCG
GTCTCTACCAGGAAGCTTCCATGCTCACCTTCGAGGGTCAGAAGATCCAAGGAGTCCAGA
GCATCGTAGCCAAGCTCACTTCTCTCCCTTTCCAGCAGTGTAAGCACAATATCTCCACTG
TTGATTGCCAGCCTTCTGGTCCCGCCTCCGGTATGCTCGTTTTCGTCTCCGGTAACCTCC
AGCTCGCCGGCGAGGAGCACGCCCTCAAGTTCAGCCAGATGTTTCACTTGATGCCGACAC
CACAAGGAAGCTTTTACGTGTTCAACGATATCTTCAGGCTCAACTACTCCTGAACATCTA
TCAGATTGTTGCATTCCTTTACTACACTATTTGTGCAATCCCGTTTGTCTTTCTTTTTTT
TCTTCATTCATATATGATTTGTCTTGGAAACAGAAGAAAACTCTTTGTCTGTTTGAGTAT
TTGCGTTGCTCATTTGTTATTTCTAATCTATTGGCTTTGATCAGACAATTTGAAATTGTT
TCCATTGTCACTTGCGCC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2GN54JQ 609 0 0
GTCTACTACTTCTTTCTCTCGAGTCGGCGCAGATGGATCCCGATGCTGTGGCGAAGGCCT
TTGTCGAACACTACTACTCAACCTTCGACACAAACCGTGCCGGTCTAGCCGGTCTCTACC
AGGAAGCTTCCATGCTCACCTTCGAGGGTCAGAAGATCCAAGGAGTCCAGAGCATCGTAG
CCAAGCTCACTTCTCTCCCTTTCCAGCAGTGTAAGCACAATATCTCCACTGTTGATTGCC
AGCCTTCTGGTCCCGCCTCCGGTATGCTCGTTTTCGTCTCCGGTAACCTCCAGCTCGCCG
GCGAGGAGCACGCCCTCAAGTTCAGCCAGATGTTTCACTTGATGCCGACACCACAAGGAA
GCTTTTACGTGTTCAACGATATCTTCAGGCTCAACTACTCCTGAACATCTATCAGATTGT
TGCATTCCTTTACTACACTATTTGTGCAATCCCGTTTGTCTTTCTTTTTTTTCTTCATTC
ATATATGATTTGTCTTGGAAACAGAAGAAAACTCTTTGTCTGTTTGAGTATTTGCGTTGC
TCATTTGTTATTTCTAATCTATTGGCTTTGATCAGACAATTTGAAATTGTTTCCATTGTC
ACTTGCGCC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL6745Contig1 707 2 2 U
GAAGAGGAGCAGACTGTGACAAAGGAGTTTCTTCAGTTACTTGAGGATGAAGAATCCGAG
AATCTCAAATTCTACCAGCACAAAATGGAGATCTCCGAGCTGCGGTCTGGTGAATCAGTA
GACGACGAATCTGAGAATTACCTCTCGGATCTTGGGAAAGGCATCGGTTGTGTTGTTCAG
ACAAGGGACGGTGGATACTTGGTTTCTATGAACCCTTTTGATACGGTGGTCATGAGGAAG
GACACTCCTAAGCTCGTAATGCAAATCTCGAGACAGATTGTGGTACTGCCTGAAGCCGGA
TCGGCGACTGGATTCGAACTGTTTCATAGAATGGCGGGTTCGGGTAAGGAACTTGACGCA
AAGATGTGTTCGCTTATGGCGATGGACGAGCTCATGGGGAAAACAGGGGAACAAGTGGCT
TTCGAAGGTATAGCGTCAGCGATCATACAAGGGAGGAATAAAGAGCGGGCGAACACAAGC
GCAGCGCGAACTGTTGCAGCTGTTAAAACGATGGCTAAAATCTATAAGGAACCCTGATGT
GAAGCTGCATAGTTGAGGTGCAGAATTTCACATTACAGAATAAGATGCATATGTGTATAC
TAAAGATTATTTTCGCTTTGTTATTTATAGCTATTTGAGCAGAACTTGGCTAGTTTCGAA
ATTTGATCTTTCTTTGTCAACTGGTAAAGACAAACACTACCTTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E164TF U 1
AF RR2E164JQ C 293
BS 1 598 RR2E164TF
BS 599 707 RR2E164JQ

RD RR2E164TF 598 0 0
GAAGAGGAGCAGACTGTGACAAAGGAGTTTCTTCAGTTACTTGAGGATGAAGAATCCGAG
AATCTCAAATTCTACCAGCACAAAATGGAGATCTCCGAGCTGCGGTCTGGTGAATCAGTA
GACGACGAATCTGAGAATTACCTCTCGGATCTTGGGAAAGGCATCGGTTGTGTTGTTCAG
ACAAGGGACGGTGGATACTTGGTTTCTATGAACCCTTTTGATACGGTGGTCATGAGGAAG
GACACTCCTAAGCTCGTAATGCAAATCTCGAGACAGATTGTGGTACTGCCTGAAGCCGGA
TCGGCGACTGGATTCGAACTGTTTCATAGAATGGCGGGTTCGGGTAAGGAACTTGACGCA
AAGATGTGTTCGCTTATGGCGATGGACGAGCTCATGGGGAAAACAGGGGAACAAGTGGCT
TTCGAAGGTATAGCGTCAGCGATCATACAAGGGAGGAATAAAGAGCGGGCGAACACAAGC
GCAGCGCGAACTGTTGCAGCTGTTAAAACGATGGCTAAAATCTATAAGGAACCCTGATGT
GAAGCTGCATAGTTGAGGTGCAGAATTTCACATTACAGAATAAGATGCATATGTGTAT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2E164JQ 415 0 0
AAGCCGGATCGGCGACTGGATTCGAACTGTTTCATAGAATGGCGGGTTCGGGTAAGGAAC
TTGACGCAAAGATGTGTTCGCTTATGGCGATGGACGAGCTCATGGGGAAAACAGGGGAAC
AAGTGGCTTTCGAAGGTATAGCGTCAGCGATCATACAAGGGAGGAATAAAGAGCGGGCGA
ACACAAGCGCAGCGCGAACTGTTGCAGCTGTTAAAACGATGGCTAAAATCTATAAGGAAC
CCTGATGTGAAGCTGCATAGTTGAGGTGCAGAATTTCACATTACAGAATAAGATGCATAT
GTGTATACTAAAGATTATTTTCGCTTTGTTATTTATAGCTATTTGAGCAGAACTTGGCTA
GTTTCGAAATTTGATCTTTCTTTGTCAACTGGTAAAGACAAACACTACCTTCACC

QA 1 415 1 415
DS 



AS 1 2

CO CL6746Contig1 713 2 3 U
GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTA
GAATTCTGAAGATGAGTACGAGAGGAAGCAAAGCGGAAGGGAAGAAGATTTTAAGAGACA
TGAGTGAGGAAGAGGAGGATACATCTGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAAGTGGCTTTGG
AAAAGAAGCAGAAAGGCAAAGCTACTACTACTACAAGTAGTAGCAGTGGTACTACTGGAG
CTTGTCAAGTGGAGAGATGTACTGCAGATATGAGCAGAGCCAAACAATACCACAAACGAC
ACAAAGTCTGCGAGTTTCATGCCAAAGCTCCTATTGTTCGGATCTCTGGTCTTTACCAAC
GTTTCTGCCAACAATGTAGCAGGTTTCACGAGCTAGGTGAGTTTGATGACACAAAGCGGA
GTTGCAGGAGACGCTTAGCTGGACACAATCAGAGAAGGCGTAGAAACACAACTCAATAAA
AAAAAGACATTTGAAACGTCTCATGAACTACTAGGCTTTGCTTGCTCTCTTCTGTCAGTC
TCTTTGTAATCTCTGTGTTTCTCCATATTTGCTTGTAATCTCTAGCTATCTGCTAAAACC
TAAGACATCAATAAATGCATTGAGGCTATCTGTATCTGTTTTGCAACCCATTGAGGAGAC
AGCTAATAATAAGCTAAGAAGAAAAAAATATAATCTGCTAGAAACTTTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CI11TF U 1
AF RR2CI11JQ C 70
BS 1 687 RR2CI11TF
BS 688 688 RR2CI11JQ
BS 689 713 RR2CI11TF

RD RR2CI11TF 713 0 0
GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTA
GAATTCTGAAGATGAGTACGAGAGGAAGCAAAGCGGAAGGGAAGAAGATTTTAAGAGACA
TGAGTGAGGAAGAGGAGGATACATCTGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAAGTGGCTTTGG
AAAAGAAGCAGAAAGGCAAAGCTACTACTACTACAAGTAGTAGCAGTGGTACTACTGGAG
CTTGTCAAGTGGAGAGATGTACTGCAGATATGAGCAGAGCCAAACAATACCACAAACGAC
ACAAAGTCTGCGAGTTTCATGCCAAAGCTCCTATTGTTCGGATCTCTGGTCTTTACCAAC
GTTTCTGCCAACAATGTAGCAGGTTTCACGAGCTAGGTGAGTTTGATGACACAAAGCGGA
GTTGCAGGAGACGCTTAGCTGGACACAATCAGAGAAGGCGTAGAAACACAACTCAATAAA
AAAAAGACATTTGAAACGTCTCATGAACTACTAGGCTTTGCTTGCTCTCTTCTGTCAGTC
TCTTTGTAATCTCTGTGTTTCTCCATATTTGCTTGTAATCTCTAGCTATCTGCTAAAACC
TAAGACATCAATAAATGCATTGAGGCTATCTGTATCTGTTTTGCAACCCATTGAGGAGAC
AGCTAATAATAAGCTAAGAAGAAAAAA*TATAATCTGCTAGAAACTTTTGATT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2CI11JQ 644 0 0
AGATGAGTACGAGAGGAAGCAAAGCGGAAGGGAAGAAGATTTTAAGAGACATGAGTGAGG
AAGAGGAGGATACATCTGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAAGTGGCTTTGGAAAAGAAGC
AGAAAGGCAAAGCTACTACTACTACAAGTAGTAGCAGTGGTACTACTGGAGCTTGTCAAG
TGGAGAGATGTACTGCAGATATGAGCAGAGCCAAACAATACCACAAACGACACAAAGTTT
GCGAGTTTCATGCCAAAGCTCCTATTGTTCGGATCTCTGGTCTTTACCAACGTTTCTGCC
AACAATGTAGCAGGTTTCACGAGCTAGGTGAGTTTGATGACACAAAGCGGAGTTGCAGGA
GACGCTTAGCTGGACACAATCAGAGAAGGCGTAGAAACACAACTCAATAAAAAAAAGACA
TTTGAAACGTCTCATGAACTACTAGGCTTTGCTTGCTCTCTTCTGTCAGTCTCTTTGTAA
TCTCTGTGTTTCTCCATATTTGCTTGTAATCTCTAGCTATCTGCTAAAACCTAAGACATC
AATAAATGCATTGAGGCTATCTGTATCTGTTTTGCAACCCATTGAGGAGACAGCTAATAA
TAAGCTAAGAAGAAAAAAATATAATCTGCTAGAAACTTTTGATT

QA 1 644 1 644
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6748Contig1 658 2 2 U
CCAGCAAACGCAATGTTTTTTTATTGATCATTTGAAACTCATTACCTTAATTGGGAAGTA
CCAAACAACGGATACTAAAACATAACAACACCTTGCCATGACTTGGTGTCGGTAATGATC
AGGAACGTTTTGAAGGTAGTGGAGTGGAAGAAAGGAAGTGAGAGAATAAGGAAAGAGATT
GGGCCGGAGCAAAGACCGGAACCTGATGACCGGCTCCTCTCACGGTGGCAAAAGTTAATC
CTCCTGCGTAAGTTTCAACCCATCCAGCCACTTGACTCTTGTGGAACCATGACCTCCACG
GTGACTCCACCTTAGGTCCCATCTTCTTTATGCTATAACGTGTTGATGTTACTGGTACTC
TTCCATCCGTATCTCCACTATAGATCCAAATGCGGAGGCCGCCTGCCAAAAGCTTCTGGA
TGATGGGAATCATGGTGGGAGGAGCATCATTCCACCTCTTTATGACTCCGCTGCAAGGAG
AATACGGATAAGGAAGGTTTGTAACGTTCGCATGAAGTGCAACCTGCACATCTTTCCGGT
TAAAATATTTTTCAGCATAACCTTCAGTACATGGATCGTAACCGGCCGGCAAGCTATCCC
ACAAGTCGTGTGAAGTTAGTAGACGAGGAGACACGATGAGTTTAGGTTTTCTTGGAGA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH01JQ U 1
AF RR2DR57JQ U 2
BS 1 652 RR2CH01JQ
BS 653 658 RR2DR57JQ

RD RR2CH01JQ 652 0 0
CCAGCAAACGCAATGTTTTTTTATTGATCATTTGAAACTCATTACCTTAATTGGGAAGTA
CCAAACAACGGATACTAAAACATAACAACACCTTGCCATGACTTGGTGTCGGTAATGATC
AGGAACGTTTTGAAGGTAGTGGAGTGGAAGAAAGGAAGTGAGAGAATAAGGAAAGAGATT
GGGCCGGAGCAAAGACCGGAACCTGATGACCGGCTCCTCTCACGGTGGCAAAAGTTAATC
CTCCTGCGTAAGTTTCAACCCATCCAGCCACTTGACTCTTGTGGAACCATGACCTCCACG
GTGACTCCACCTTAGGTCCCATCTTCTTTATGCTATAACGTGTTGATGTTACTGGTACTC
TTCCATCCGTATCTCCACTATAGATCCAAATGCGGAGGCCGCCTGCCAAAAGCTTCTGGA
TGATGGGAATCATGGTGGGAGGAGCATCATTCCACCTCTTTATGACTCCGCTGCAAGGAG
AATACGGATAAGGAAGGTTTGTAACGTTCGCATGAAGTGCAACCTGCACATCTTTCCGGT
TAAAATATTTTTCAGCATAACCTTCAGTACATGGATCGTAACCGGCCGGCAAGCTATCCC
ACAAGTCGTGTGAAGTTAGTAGACGAGGAGACACGATGAGTTTAGGTTTTCT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2DR57JQ 657 0 0
CAGCAAACGCAATGTTTTTTTATTGATCATTTGAAACTCATTACCTTAATTGGGAAGTAC
CAAACAACGGATACTAAAACATAACAACACCTTGCCATGACTTGGTGTCGGTAATGATCA
GGAACGTTTTGAAGGTAGTGGAGTGGAAGAAAGGAAGTGAGAGAATAAGGAAAGAGATTG
GGCCGGAGCAAAGACCGGAACCTGATGACCGGCTCCTCTCACGGTGGCAAAAGTTAATCC
TCCTGCGTAAGTTTCAACCCATCCAGCCACTTGACTCTTGTGGAACCATGACCTCCACGG
TGACTCCACCTTAGGTCCCATCTTCTTTATGCTATAACGTGTTGATGTTACTGGTACTCT
TCCATCCGTATCTCCACTATAGATCCAGATGCGGAGGTCGCCTGCCAAAAGCTTCTGGAT
GATGGGAATCGTGGTGGGAGGAGCATCATTCCATCTCTTTATGACTCCGCTGCAAGGAGA
ATACGGATAAGGAAGGTTTGTAACGTTCGCATGAAGTGCAACCTGCACATCTTTCCGGTT
AAAATATTTTTCAGCATAACCTTCAGTACATGGATCGTAACCGGCCGGCAAGCTATCCCA
CAAGTCGTGTGAAGTTAGTAGACGAGGAGACACGATGAGTTTAGGTTTTCTTGGAGA

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL6749Contig1 577 2 2 U
CATAGCACCAAGACTTAACTATAAATAACAAGATTGAATACATCTGCCAAGGTAAACTAA
GCGAATCCATCTTTACACCATACGTAGATTGTACAAGTACGAATGTGATTTACACATTCA
GGATACAAGAAGAGTGCAACACTGATAAGTTTGGGTAAAGCTAATAAAGGCTAAGGTCTT
CTCCACTTGTCGATTTCTTTTGAAGTAGCTTTGACAAGTTTCTTGGTGTGGACAACGAGT
TCATCAATAAGAGAATCAACTTCATCTAGAGAAGGCTTCCCGACGTTGTAATAAGAGCGA
GAGTGATCATAAGCCGCGCCTCTTCCCACGCCATACCCAAACCCTACACCGATTCCACAA
CCAGCTCCAAACCCGAGACCAAACTGTAGTCCAGGAACTCCTGGTCCGAATCCTACACCT
CCGATAAGACCGGCGCCGAAACCGAATCCGCAACCGAAACCGAGTCCAAAGGCGGGACCA
ACTTTGCCGATGTCTTTGATCCTAACCTGAGGAAGTTTCCACAGTAATCCCTTGTCATCG
TCTCCGGTGCTCCTCCTTCTGTTGCTCATTGTCTCTC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BY71TF C 1
AF RR2BY71JQ U 2
BS 1 2 RR2BY71TF
BS 3 577 RR2BY71JQ

RD RR2BY71TF 577 0 0
CATAGCACCAAGACTTAACTATAAATAACAAGATTGAATACATCTGCCAAGGTAAACTAA
GCGAATCCATCTTTACACCATACGTAGATTGTACAAGTACGAATGTGATTTACACATTCA
GGATACAAGAAGAGTGCAACACTGATAAGTTTGGGTAAAGCTAATAAAGGCTAAGGTCTT
CTCCACTTGTCGATTTCTTTTGAAGTAGCTTTGACAAGTTTCTTGGTGTGGACAACGAGT
TCATCAATAAGAGAATCAACTTCATCTAGAGAAGGCTTCCCGACGTTGTAATAAGAGCGA
GAGTGATCATAAGCCGCGCCTCTTCCCACGCCATACCCAAACCCTACACCGATTCCACAA
CCAGCTCCAAACCCGAGACCAAACTGTAGTCCAGGAACTCCTGGTCCGAATCCTACACCT
CCGATAAGACCGGCGCCGAAACCGAATCCGCAACCGAAACCGAGTCCAAAGGCGGGACCA
ACTTTGCCGATGTCTTTGATCCTAACCTGAGGAAGTTTCCACAGTAATCCCTTGTCATCG
TCTCCGGTGCTCCTCCTTCTGTTGCTCATTGTCTCTC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2BY71JQ 576 0 0
C
TAGCACCAAGACTTAACTATAAATAACAAGATTGAATACATCTGCCAAGGTAAACTAAGC
GAATCCATCTTTACACCATACGTAGATTGTACAAGTACGAATGTGATTTACACATTCAGG
ATACAAGAAGAGTGCAACACTGATAAGTTTGGGTAAAGCTAATAAAGGCTAAGGTCTTCT
CCACTTGTCGATTTCTTTTGAAGTAGCTTTGACAAGTTTCTTGGTGTGGACAACGAGTTC
ATCAATAAGAGAATCAACTTCATCTAGAGAAGGCTTCCCGACGTTGTAATAAGAGCGAGA
GTGATCATAAGCCGCGCCTCTTCCCACGCCATACCCAAACCCTACACCGATTCCACAACC
AGCTCCAAACCCGAGACCAAACTGTAGTCCAGGAACTCCTGGTCCGAATCCTACACCTCC
GATAAGACCGGCGCCGAAACCGAATCCGCAACCGAAACCGAGTCCAAAGGCGGGACCAAC
TTTGCCGATGTCTTTGATCCTAACCTGAGGAAGTTTCCACAGTAATCCCTTGTCATCGTC
TCCGGTGCTCCTCCTTCTGTTGCTCATTGTCTCTC

QA 2 576 2 576
DS 



AS 1 2

CO CL6750Contig1 915 2 2 U
GGGACTCAGAGAAAAAAAAGAGTGCAAAAGCTTCATCAATGGAGAAGGAAGGATGTGAGA
TCGAAGCTTTAGATATTGATTACAACATCACTGAAGGGAAGATTAATGTTAATCCATTCA
GAATCTTTACAAGGAAGCTGGTTCTGGAAGCTGACCAACCGGTTAAGACAGAGGAGACAT
GGAAGCTGGAGGATGGAACCTGCAAGAAAGTCAAGCATGTACTAAAAGGAGTGACCTGCA
GAGCCAAACCATGGGAGATTCTCGCTATCGTTGGTCCAAGTGGTGCAGGGAAGTCTTCTC
TGCTTGAAATTCTAGCTGGAAGACTCATCCCTCAAACCGGATCGGTTATTGTCAATCAGA
GACCGGTTGACAGAGCCAATTTCAAGAAAATCTCTGGTTGTGTGCTTTAGTGCACTGGTT
CCCAACTTCATCGTTGGGAACTCGGTGATTTCCGGTGTGATGGGTTCCTTCTTTCTCTTC
TCAGGCTACTTCATATCGAAGAATGAGATCCCTGGTTACTGGATTTTCATGCACTACATC
TCTCTGTTCAAGTACCCTTTTGAAGGGTTTTTGATAAACGAGTTCTCTAAGTCGAGCAAG
TGTTTGGAGTATGGTTTGGGAAAATGTTTGATGACAGAGGAGGGTCTACTGAAAGAAGAA
AGGTATGGTGAGGAAAACAGGTGGAGAAATGTTGTGATCATGCTATGTTTTGTCTTGCTC
TACAGGTTCGTTTCCTATGTGATTCTGAGGTGTAGATGTTCACAAAGAAGTTTCAAAACC
ACTCTTGTTTAGATGTGGTACAATAATGTCTTTTTTTCTGTAAAACGTTGGGTTATAAGT
TTGTTCAAATGTTTAATTTACTTAAAAAAATGTGAAAGAAAGTTTATTAATGCAAACATT
GATTCTATCATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC15TF U 1
AF RR2GC15JQ C 167
BS 1 635 RR2GC15TF
BS 636 915 RR2GC15JQ

RD RR2GC15TF 635 0 0
GGGACTCAGAGAAAAAAAAGAGTGCAAAAGCTTCATCAATGGAGAAGGAAGGATGTGAGA
TCGAAGCTTTAGATATTGATTACAACATCACTGAAGGGAAGATTAATGTTAATCCATTCA
GAATCTTTACAAGGAAGCTGGTTCTGGAAGCTGACCAACCGGTTAAGACAGAGGAGACAT
GGAAGCTGGAGGATGGAACCTGCAAGAAAGTCAAGCATGTACTAAAAGGAGTGACCTGCA
GAGCCAAACCATGGGAGATTCTCGCTATCGTTGGTCCAAGTGGTGCAGGGAAGTCTTCTC
TGCTTGAAATTCTAGCTGGAAGACTCATCCCTCAAACCGGATCGGTTATTGTCAATCAGA
GACCGGTTGACAGAGCCAATTTCAAGAAAATCTCTGGTTGTGTGCTTTAGTGCACTGGTT
CCCAACTTCATCGTTGGGAACTCGGTGATTTCCGGTGTGATGGGTTCCTTCTTTCTCTTC
TCAGGCTACTTCATATCGAAGAATGAGATCCCTGGTTACTGGATTTTCATGCACTACATC
TCTCTGTTCAAGTACCCTTTTGAAGGGTTTTTGATAAACGAGTTCTCTAAGTCGAGCAAG
TGTTTGGAGTATGGTTTGGGAAAATGTTTGATGAC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2GC15JQ 749 0 0
GACAGAGGAGACATGGAAGCTGGAGGATGGAACCTGCAAGAAAGTCAAGCATGTACTAAA
AGGAGTGACCTGCAGAGCCAAACCATGGGAGATTCTCGCTATCGTTGGTCCAAGTGGTGC
AGGGAAGTCTTCTCTGCTTGAAATTCTAGCTGGAAGACTCATCCCTCAAACCGGATCGGT
TATTGTCAATCAGAGACCGGTTGACAGAGCCAATTTCAAGAAAATCTCTGGTTGTGTGCT
TTAGTGCACTGGTTCCCAACTTCATCGTTGGGAACTCGGTGATTTCCGGTGTGATGGGTT
CCTTCTTTCTCTTCTCAGGCTACTTCATATCGAAGAATGAGATCCCTGGTTACTGGATTT
TCATGCACTACATCTCTCTGTTCAAGTACCCTTTTGAAGGGTTTTTGATAAACGAGTTCT
TTAAGTCGAGCAAGTGTTTGGAGTATGGTTTGGGAAAATGTTTGATGACAGAGGAGGGTC
TACTGAAAGAAGAAAGGTATGGTGAGGAAAACAGGTGGAGAAATGTTGTGATCATGCTAT
GTTTTGTCTTGCTCTACAGGTTCGTTTCCTATGTGATTCTGAGGTGTAGATGTTCACAAA
GAAGTTTCAAAACCACTCTTGTTTAGATGTGGTACAATAATGTCTTTTTTTCTGTAAAAC
GTTGGGTTATAAGTTTGTTCAAATGTTTAATTTACTTAAAAAAATGTGAAAGAAAGTTTA
TTAATGCAAACATTGATTCTATCATTTCC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL6751Contig1 634 2 1 U
GGACTTCTAACTTAAGATGCAAACTTACTTTTGCCGAAAGATGTCTCTTTCTGGATGAGA
AGTTATCACGGCGATGCAACACAATGAAGATTCAAATGGTGGGAAGATAATGTCTGGGGG
ATTCGACCGAGGCCAAAAAGACTCTTGGCAATTTAAAATGGCCACAATTTTCATTCGTCA
AACACCAACCCCACATTGCTCTCGACAATGCATAGTAGGGGTTGTCTAGGAATCATCCAA
GGGCAGCTATCGACGAGATAGATAAAGCAATTGGAAGTATTAACTGTTCTGTCATGGATA
ATTTTCCTAATATTTCCTTCACAATTGAGGGAAAGCTTTTTCCACTCACTCCAAAAGAGA
CGGTAGAACAATATGCTGGAATCGTTTTGATGTGGCTCCACGCTGAATTAGGAAATTTGT
GAGTGAAACAATACTTCTTGTTCCTTATAGCCGTGTTGCAGATGGTGGCTAAGTAACTTA
AAATCAAATATTAATATGTGATATACATGAAAATGATAATGATATTTATCACCAAGTCTA
TTTTAAGAAAAAAATTAAAGTTGTACTCTTCAAAATATTAAAATATAAGAATATTGCGAC
AAAATTTTATCACTACAATTATAAATGGAGTAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EN07JQ C 1
AF RR2EN07TF U 1
BS 1 634 RR2EN07TF

RD RR2EN07JQ 634 0 0
GGACTTCTAACTTAAGATGCAAACTTACTTTTGCCGAAAGATGTCTCTTTCTGGATGAGA
AGTTATCACGGCGATGCAACACAATGAAGATTCAAATGGTGGGAAGATAATGTCTGGGGG
ATTCGACCGAGGCCAAAAAGACTCTTGGCAATTTAAAATGGCCACAATTTTCATTCGTCA
AACACCAACCCCACATTGCTCTCGACAATGCATAGTAGGGGTTGTCTAGGAATCATCCAA
GGGCAGCTATCGACGAGATAGATAAAGCAATTGGAAGTATTAACTGTTCTGTCATGGATA
ATTTTCCTAATATTTCCTTCACAATTGAGGGAAAGCTTTTTCCACTCACTCCAAAAGAGA
CGGTAGAACAATATGCTGGAATCGTTTTGATGTGGCTCCACGCTGAATTAGGAAATTTGT
GAGTGAAACAATACTTCTTGTTCCTTATAGCCGTGTTGCAGATGGTGGCTAAGTAACTTA
AAATCAAATATTAATATGTGATATACATGAAAATGATAATGATATTTATCACCAAGTCTA
TTTTAAGAAAAAAATTAAAGTTGTACTCTTCAAAATATTAAAATATAAGAATATTGCGAC
AAAATTTTATCACTACAATTATAAATGGAGTAAT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2EN07TF 634 0 0
GGACTTCTAACTTAAGATGCAAACTTACTTTTGCCGAAAGATGTCTCTTTCTGGATGAGA
AGTTATCACGGCGATGCAACACAATGAAGATTCAAATGGTGGGAAGATAATGTCTGGGGG
ATTCGACCGAGGCCAAAAAGACTCTTGGCAATTTAAAATGGCCACAATTTTCATTCGTCA
AACACCAACCCCACATTGCTCTCGACAATGCATAGTAGGGGTTGTCTAGGAATCATCCAA
GGGCAGCTATCGACGAGATAGATAAAGCAATTGGAAGTATTAACTGTTCTGTCATGGATA
ATTTTCCTAATATTTCCTTCACAATTGAGGGAAAGCTTTTTCCACTCACTCCAAAAGAGA
CGGTAGAACAATATGCTGGAATCGTTTTGATGTGGCTCCACGCTGAATTAGGAAATTTGT
GAGTGAAACAATACTTCTTGTTCCTTATAGCCGTGTTGCAGATGGTGGCTAAGTAACTTA
AAATCAAATATTAATATGTGATATACATGAAAATGATAATGATATTTATCACCAAGTCTA
TTTTAAGAAAAAAATTAAAGTTGTACTCTTCAAAATATTAAAATATAAGAATATTGCGAC
AAAATTTTATCACTACAATTATAAATGGAGTAAT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL6752Contig1 1010 2 6 U
GAATCTAGCCCGTGAAACACTGGAAGGCCTAATGGGTCATTGGCTGGCAAAGAAGAAGCA
CAAACCAAAACCCCAAGCTTCTACCTCTGGAGACATTCTATCCGCAAAAGATACCAAAAA
GAATCTGACTGCGTCCAAAAGTGAAGACATCAGTGCTGCAAATGACCCGGTGTATCCTCC
CTTTGAGTTTCCTTCTGTCTCTCCTCCGTCCATCATCACCGAGGGCTCCCAAGGAGGTCC
TTGGAGGAAGAAGATAACCGAGTTTACCGGAACTGAAGATGATAAGGACTTCCCCTTGTG
GTGCCTGGATGCCGTCTTGAACAATCGCCTTCCACCTAGAGAAAATACAAAATTAAGCTT
CTTCCTGCATCCATGTGAAGGCTCGAATGTGCAGGTGGTCACACTAGGGAAACTTAGTGC
ACCCCGGATCTTAAGAGTTCACAAGGTTACCAATTACGTTGTGGAAAAGATGGTTCTTGA
CAGTCCGTTGGATAGTTTACCTCTTGATGGAGGACCACAGCCTCTGTTTGCAGGAAATGG
ACTGCTACCCTCTGGATCAAGCCTTGGCAGAAACTCAAACCTTCCATTGAGATCTTATGC
AATAACCAGGTCTTAGCTCCAGAGATGAGTTTGGCAACTGTGCGGGTATATATATGGAAG
AAACCTGAGGATCTAATCCTCAACTACAGGGTGGCTATAGCTAGATGAACTTTTGAGATT
TGTCACCGGGCAAGTTTCTGAGTGTCGTCCAAATTGGAATCTGCTGGTTCATTTAAACGC
ATGGGAAGTCTGTTTATAGCTTTTCAATGTTTGTTCATTCCGAAAACATACAAATCTTTG
GTTTAGTCTTACTCAGCTTCACGCTGGAGAATAAGTCTGCTTTAAAGAGTTGGGTTGGGA
CTCATGGGAAGTGGGGAATGCAGTGCTATCGATAAAAGGTCCAAGATCTTTAGATGTGAT
GGTGTCGAAAACTTTTACTAATCTTTGTACATTAGGTTTGAGCTTTGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL59TF U 1
AF RR2FL59JQ C 556
BS 1 669 RR2FL59TF
BS 670 670 RR2FL59JQ
BS 671 720 RR2FL59TF
BS 721 721 RR2FL59JQ
BS 722 732 RR2FL59TF
BS 733 1010 RR2FL59JQ

RD RR2FL59TF 734 0 0
GAATCTAGCCCGTGAAACACTGGAAGGCCTAATGGGTCATTGGCTGGCAAAGAAGAAGCA
CAAACCAAAACCCCAAGCTTCTACCTCTGGAGACATTCTATCCGCAAAAGATACCAAAAA
GAATCTGACTGCGTCCAAAAGTGAAGACATCAGTGCTGCAAATGACCCGGTGTATCCTCC
CTTTGAGTTTCCTTCTGTCTCTCCTCCGTCCATCATCACCGAGGGCTCCCAAGGAGGTCC
TTGGAGGAAGAAGATAACCGAGTTTACCGGAACTGAAGATGATAAGGACTTCCCCTTGTG
GTGCCTGGATGCCGTCTTGAACAATCGCCTTCCACCTAGAGAAAATACAAAATTAAGCTT
CTTCCTGCATCCATGTGAAGGCTCGAATGTGCAGGTGGTCACACTAGGGAAACTTAGTGC
ACCCCGGATCTTAAGAGTTCACAAGGTTACCAATTACGTTGTGGAAAAGATGGTTCTTGA
CAGTCCGTTGGATAGTTTACCTCTTGATGGAGGACCACAGCCTCTGTTTGCAGGAAATGG
ACTGCTACCCTCTGGATCAAGCCTTGGCAGAAACTCAAACCTTCCATTGAGATCTTATGC
AATAACCAGGTCTTAGCTCCAGAGATGAGTTTGGCAACTGTGCGGGTATATATATGGAAG
AAACCTGAG*ATCTAATCCTCAACTACAGGGTGGCTATAGCTAGATGAACTTTTGAGATT
*GTCACCGGGCA
GT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2FL59JQ 455 0 0
TCA
AAGCCTTGGCAGAAACTCAAACCTTCCATTGAGATCTTATGCAATAACCAGGTCTTAGCT
CCAGAGATGAGTTTGGCAACTGTGCGGGTATATATATGGAAGAAACCTGAGGATCTAATC
CTCAACTACAGGGTGGCTATAGCTAGATGAACTTTTGAGATTTGTCACCGGGCAAGTTTC
TGAGTGTCGTCCAAATTGGAATCTGCTGGTTCATTTAAACGCATGGGAAGTCTGTTTATA
GCTTTTCAATGTTTGTTCATTCCGAAAACATACAAATCTTTGGTTTAGTCTTACTCAGCT
TCACGCTGGAGAATAAGTCTGCTTTAAAGAGTTGGGTTGGGACTCATGGGAAGTGGGGAA
TGCAGTGCTATCGATAAAAGGTCCAAGATCTTTAGATGTGATGGTGTCGAAAACTTTTAC
TAATCTTTGTACATTAGGTTTGAGCTTTGGGT

QA 4 455 4 455
DS 



AS 1 2

CO CL6753Contig1 732 2 1 U
GGGTTCTTCAATCTCCGTCGTGCTCTCCACCGACTTTCGGTCGTCTTAGGCGAAAAAACA
AATGGCGGGAGAAGGTGAGGAAGATGTGCCAAGAGACGCCAAGATTGTCAAGTCTCTGCT
TAAGTCGATGGGGGTGGAGGACTACGAGCCTCGCGTGGTGCACCAGTTTCTCGAATTATG
GTACCGTTATGTGGTCGAAGTGTTGACAGATGCTCAGGTTTACTCGGAGCATGCTAGCAA
ATCCACCATTGATTGTGACGATGTGAAGCTCGCTATTCAATCCAAAGTTAGTTTCGGCTT
CTCTCAGCCTCCTCCAAGAGAGGTACTGCTAGAGCTTGCTGCGAGCAGGAACAAGATTCC
TTTGCCTAAATCGATAGCAGGACCAGGCATTCCTCTCCCGCCTGAACAGGACACATTGCT
TAGCCCAAACTACCAGCTCGTTATACCGAAGAAGTCAGCTTCGACAGAACCTGAAGAGAC
AGAGGACGATGAAGAAATGACAGATCCTGCACAATCATCATCTCAAGAACAACAAACATC
GGATCTTCCAAGCCAAACTCCTCAAAGGGTGTCTTTTCCTCTCTCTAGACGACCCAAATA
AGTAGAGAGAGACAACAGTAACAATTATGTTATGTGTATCAAGATGTAGAAAATGTTTCG
TGAATGACCAGATTATCTTTCTTTATCTGGAAGTGAAATCTCTTAATCTATTTCATCGTG
AATTATCAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AR05TF U 1
AF RR2AR05JQ C 119
BS 1 732 RR2AR05TF

RD RR2AR05TF 732 0 0
GGGTTCTTCAATCTCCGTCGTGCTCTCCACCGACTTTCGGTCGTCTTAGGCGAAAAAACA
AATGGCGGGAGAAGGTGAGGAAGATGTGCCAAGAGACGCCAAGATTGTCAAGTCTCTGCT
TAAGTCGATGGGGGTGGAGGACTACGAGCCTCGCGTGGTGCACCAGTTTCTCGAATTATG
GTACCGTTATGTGGTCGAAGTGTTGACAGATGCTCAGGTTTACTCGGAGCATGCTAGCAA
ATCCACCATTGATTGTGACGATGTGAAGCTCGCTATTCAATCCAAAGTTAGTTTCGGCTT
CTCTCAGCCTCCTCCAAGAGAGGTACTGCTAGAGCTTGCTGCGAGCAGGAACAAGATTCC
TTTGCCTAAATCGATAGCAGGACCAGGCATTCCTCTCCCGCCTGAACAGGACACATTGCT
TAGCCCAAACTACCAGCTCGTTATACCGAAGAAGTCAGCTTCGACAGAACCTGAAGAGAC
AGAGGACGATGAAGAAATGACAGATCCTGCACAATCATCATCTCAAGAACAACAAACATC
GGATCTTCCAAGCCAAACTCCTCAAAGGGTGTCTTTTCCTCTCTCTAGACGACCCAAATA
AGTAGAGAGAGACAACAGTAACAATTATGTTATGTGTATCAAGATGTAGAAAATGTTTCG
TGAATGACCAGATTATCTTTCTTTATCTGGAAGTGAAATCTCTTAATCTATTTCATCGTG
AATTATCAACTG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2AR05JQ 614 0 0
CTTAAGTCGATGGGGGTGGAGGACTACGAGCCTCGCGTGGTGCACCAGTTTCTCGAATTA
TGGTACCGTTATGTGGTCGAAGTGTTGACAGATGCTCAGGTTTACTCGGAGCATGCTAGC
AAATCCACCATTGATTGTGACGATGTGAAGCTCGCTATTCAATCCAAAGTTAGTTTCGGC
TTCTTTCAGCCTCCTCCAAGAGAGGTACTGCTAGAGCTTGCTGCGAGCAGGAACAAGATT
CCTTTGCCTAAATCGATAGCAGGACCAGGCATTCCTCTCCCGCCTGAACAGGACACATTG
CTTAGCCCAAACTACCAGCTCGTTATACCGAAGAAGTCAGCTTCGACAGAACCTGAAGAG
ACAGAGGACGATGAAGAAATGACAGATCCTGCACAATCATCATCTCAAGAACAACAAACA
TCGGATCTTCCAAGCCAAACTCCTCAAAGGGTGTCTTTTCCTCTCTCTAGACGACCCAAA
TAAGTAGAGAGAGACAACAGTAACAATTATGTTATGTGTATCAAGATGTAGAAAATGTTT
CGTGAATGACCAGATTATCTTTCTTTATCTGGAAGTGAAATCTCTTAATCTATTTCATCG
TGAATTATCAACTG

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL6754Contig1 415 2 1 U
GCTTATTTCATTGCCCTTCAGAGGAAATCAGGAGTCCTCTTTTCAGACCAAACATTATCC
AACACTCCAGCGACTAGGAATATCGTTAATGGCTATGCCTTTAACCAAGCTAAGTTTTTC
TTTGACTTCCAAATGGCCATGCAAAAGATGAGCAATCTTGATGTTAAACTTGCCTCTCAA
GGTGAAGTCCGTAAAAATTGTCGCATTCTTAACTAAGCATATGCCAAATGTATTTTGTAT
GATATTTGTATTAGTGCTCCTACCTTTAGTTATGTCTCTACTCTCATCATATGATTCATG
ATGAATCTCTTCTGCTACCATATATAAAATTGGTGTTTGTAATATGTAATTGTCCACTTG
TTGTTTGTGGGTTTTAGAATAATATATCTATAAAATATGGTCGAGACTTTATTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FY71JQ C 1
AF RR2FY71TF U 1
BS 1 415 RR2FY71TF

RD RR2FY71JQ 415 0 0
GCTTATTTCATTGCCCTTCAGAGGAAATCAGGAGTCCTCTTTTCAGACCAAACATTATCC
AACACTCCAGCGACTAGGAATATCGTTAATGGCTATGCCTTTAACCAAGCTAAGTTTTTT
TTTGACTTCCAAATGGCCATGCAAAAGATGAGCAATCTTGATGTTAAACTTGCCTCTCAA
GGTGAAGTCCGTAAAAATTGTCGCATTTTTAACTAAGCATATGCCAAATGTATTTTGTAT
GATATTTGTATTAGTGCTCCTACCTTTAGTTATGTCTCTACTCTCATCATATGATTCATG
ATGAATCTCTTTTGCTACCATATATAAAATTGGTGTTTGTAATATGTAATTGTCCACTTG
TTGTTTGTGGGTTTTAGAATAATATATCTATAAAATATGGTCGAGACTTTATTGT

QA 1 415 1 415
DS 

RD RR2FY71TF 415 0 0
GCTTATTTCATTGCCCTTCAGAGGAAATCAGGAGTCCTCTTTTCAGACCAAACATTATCC
AACACTCCAGCGACTAGGAATATCGTTAATGGCTATGCCTTTAACCAAGCTAAGTTTTTC
TTTGACTTCCAAATGGCCATGCAAAAGATGAGCAATCTTGATGTTAAACTTGCCTCTCAA
GGTGAAGTCCGTAAAAATTGTCGCATTCTTAACTAAGCATATGCCAAATGTATTTTGTAT
GATATTTGTATTAGTGCTCCTACCTTTAGTTATGTCTCTACTCTCATCATATGATTCATG
ATGAATCTCTTCTGCTACCATATATAAAATTGGTGTTTGTAATATGTAATTGTCCACTTG
TTGTTTGTGGGTTTTAGAATAATATATCTATAAAATATGGTCGAGACTTTATTGT

QA 1 415 1 415
DS 



AS 1 2

CO CL6755Contig1 693 2 2 U
TTTTTTTTTATCAGTACTAGAAAACTATTAAAGCAATGTGCATACGAATTGACAAGTTCG
ACAAATCACAACACTCATTTTCAGGACATACAAGATAAGGTTTATTAAACTTTCAAAAAT
ATTATCAGAATTATTTAGGGAGTAGAAATATTATTGGCATGGCTGCATCGTCCTCAGTTT
CTTCTTCGCTCGCGCTTTGCCTCGCCGGTCGAGTAGCTATAGTCACGGGATCGTCCCGAG
GAATAGGCCGTGGCATAGCCATCCACCTTGCGGAGCTTGGAGCTAGGATCGTTATTAATT
ACTCCACTAACTTTACTGAGGCCGACAAGGTTGCAGAGGCTATTACCACCAACTTTCCAA
ACAACGATGCAGTAGGAGAAGTAACAGGAAAACGTCCACGTGTCATCGTTGTCAAGGCTG
ATATATCGGAGCCTAGTCAGGTGAAGTCGCTTTTCGATGAGGCGGAACGAGTCTTCGGAT
CGCCGGTTCATATCCTGGTTAACTCTGCCGCTATTGCTGATCCTAATCATTCGAGTATTT
CAGACGCATCAGAAGAACTCTTTGACCGCATTTTCAGGTCAGATATAGTTTTTGTTTTAT
TTTTTTATAACCATTTATTTATGTCAATAGTGAAGAACAGAGAAGAAGAGACTAATGAAG
AAGATAACTCAAACTTATTGTTATTCAACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DC64TF C 1
AF RR2DC64JQ U 10
BS 1 9 RR2DC64TF
BS 10 693 RR2DC64JQ

RD RR2DC64TF 693 0 0
TTTTTTTTTATCAGTACTAGAAAACTATTAAAGCAATGTGCATACGAATTGACAAGTTCG
ACAAATCACAACACTCATTTTCAGGACATACAAGATAAGGTTTATTAAACTTTCAAAAAT
ATTATCAGAATTATTTAGGGAGTAGAAATATTATTGGCATGGCTGCATCGTCCTCAGTTT
CTTCTTCGCTCGCGCTTTGCCTCGCCGGTCGAGTAGCTATAGTCACGGGATCGTCCCGAG
GAATAGGCCGTGGCATAGCCATCCACCTTGCGGAGCTTGGAGCTAGGATCGTTATTAATT
ACTCCACTAACTTTACTGAGGCCGACAAGGTTGCAGAGGCTATTACCACCAACTTTCCAA
ACAACGATGCAGTAGGAGAAGTAACAGGAAAACGTCCACGTGTCATCGTTGTCAAGGCTG
ATATATCGGAGCCTAGTCAGGTGAAGTCGCTTTTCGATGAGGCGGAACGAGTCTTCGGAT
CGCCGGTTCATATCCTGGTTAACTCTGCCGCTATTGCTGATCCTAATCATTCGAGTATTT
CAGACGCATCAGAAGAACTCTTTGACCGCATTTTCAGGTCAGATATAGTTTTTGTTTTAT
TTTTTTATAACCATTTATTTATGTCAATAGTGAAGAACAGAGAAGAAGAGACTAATGAAG
AAGATAACTCAAACTTATTGTTATTCAACTTCC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2DC64JQ 684 0 0
ATCAGTACTAGAAAACTATTAAAGCAATGTGCATACGAATTGACAAGTTCGACAAATCAC
AACACTCATTTTCAGGACATACAAGATAAGGTTTATTAAACTTTCAAAAATATTATCAGA
ATTATTTAGGGAGTAGAAATATTATTGGCATGGCTGCATCGTCCTCAGTTTCTTCTTCGC
TCGCGCTTTGCCTCGCCGGTCGAGTAGCTATAGTCACGGGATCGTCCCGAGGAATAGGCC
GTGGCATAGCCATCCACCTTGCGGAGCTTGGAGCTAGGATCGTTATTAATTACTCCACTA
ACTTTACTGAGGCCGACAAGGTTGCAGAGGCTATTACCACCAACTTTCCAAACAACGATG
CAGTAGGAGAAGTAACAGGAAAACGTCCACGTGTCATCGTTGTCAAGGCTGATATATCGG
AGCCTAGTCAGGTGAAGTCGCTTTTCGATGAGGCGGAACGAGTCTTCGGATCGCCGGTTC
ATATCCTGGTTAACTCTGCCGCTATTGCTGATCCTAATCATTCGAGTATTTCAGACGCAT
CAGAAGAACTCTTTGACCGCATTTTCAGGTCAGATATAGTTTTTGTTTTATTTTTTTATA
ACCATTTATTTATGTCAATAGTGAAGAACAGAGAAGAAGAGACTAATGAAGAAGATAACT
CAAACTTATTGTTATTCAACTTCC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL6756Contig1 610 2 1 U
GGCCGCATGAAGATTGCCAAGATGAAGGGTCGTCACTCTGGATATGGTAAGAGGAAGGGT
ACGCGTGAGGCTAGGTTGCCGACAAAGGTACTGTGGATGCGCAGGATGCGTGTGCTAAGG
CGTCTCCTGAAGAAGTACAGAGAGTCGAAGAATATTGACAAGCACATGTACCATGACATG
TACATGCGTGTTAAGGGTAACGTGTTCAAGAACAAGCGTGTCTTGATGGAGAGTATCCAC
AAGTCCAAGGCCGAGAAGGCCAGAGAGAAGACTCTCTCTGATCAGTTTGAGGCTAAGAGG
GCTAAGAACAAGGCTAGCCGTCAAAGGAAGCATGCTAGGAGAGAAGAGCGTCTTGCTAAG
GGTCCTGGAGGAGATGTTGCCCCTGCAACTGCACCACCACCAGCTGCTGCTGCTACTACT
ACCGCTCCGACTGAAACTGCTGCGGTACCGAAGAAGAAGTCTAAGAAGTGAAGAGGAGGA
TAAAGTGATCAAGCTATATAGAGATCATCTCACTTACTTGACTTGAAAGAATCTTTTGAA
TGTTTTATGAAGTTGGGTTTGTTGAAATACTTTTTTTGCGCAAAAAACATAAATTATGTC
TGTTTATCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A692JQ C 1
AF RR2A692TF U 1
BS 1 610 RR2A692TF

RD RR2A692JQ 610 0 0
GGCCGCATGAAGATTGCCAAGATGAAGGGTCGTCACTCTGGATATGGTAAGAGGAAGGGT
ACGCGTGAGGCTAGGTTGCCGACAAAGGTACTGTGGATGCGCAGGATGCGTGTGCTAAGG
CGTCTCCTGAAGAAGTACAGAGAGTCGAAGAATATTGACAAGCACATGTACCATGACATG
TACATGCGTGTTAAGGGTAACGTGTTCAAGAACAAGCGTGTCTTGATGGAGAGTATCCAC
AAGTCCAAGGCCGAGAAGGCCAGAGAGAAGACTCTCTCTGATCAGTTTGAGGCTAAGAGG
GCTAAGAACAAGGCTAGCCGTCAAAGGAAGCATGCTAGGAGAGAAGAGCGTCTTGCTAAG
GGTCCTGGAGGAGATGTTGCCCCTGCAACTGCACCACCACCAGCTGCTGCTGCTACTACT
ACCGCTCCGACTGAAACTGCTGCGGTACCGAAGAAGAAGTCTAAGAAGTGAAGAGGAGGA
TAAAGTGATCAAGCTATATAGAGATCATCTCACTTACTTGACTTGAAAGAATCTTTTGAA
TGTTTTATGAAGTTGGGTTTGTTGAAATACTTTTTTTGCGCAAAAAACATAAATTATGTC
TGTTTATCTC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2A692TF 610 0 0
GGCCGCATGAAGATTGCCAAGATGAAGGGTCGTCACTCTGGATATGGTAAGAGGAAGGGT
ACGCGTGAGGCTAGGTTGCCGACAAAGGTACTGTGGATGCGCAGGATGCGTGTGCTAAGG
CGTCTCCTGAAGAAGTACAGAGAGTCGAAGAATATTGACAAGCACATGTACCATGACATG
TACATGCGTGTTAAGGGTAACGTGTTCAAGAACAAGCGTGTCTTGATGGAGAGTATCCAC
AAGTCCAAGGCCGAGAAGGCCAGAGAGAAGACTCTCTCTGATCAGTTTGAGGCTAAGAGG
GCTAAGAACAAGGCTAGCCGTCAAAGGAAGCATGCTAGGAGAGAAGAGCGTCTTGCTAAG
GGTCCTGGAGGAGATGTTGCCCCTGCAACTGCACCACCACCAGCTGCTGCTGCTACTACT
ACCGCTCCGACTGAAACTGCTGCGGTACCGAAGAAGAAGTCTAAGAAGTGAAGAGGAGGA
TAAAGTGATCAAGCTATATAGAGATCATCTCACTTACTTGACTTGAAAGAATCTTTTGAA
TGTTTTATGAAGTTGGGTTTGTTGAAATACTTTTTTTGCGCAAAAAACATAAATTATGTC
TGTTTATCTC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL6757Contig1 634 2 1 U
GGAAGCGAGAACCCGGAAACCAAAAGAAATGGCGGATCAGCTAACGGACGAACAGATCTC
CGAGTTCAAGGAAGCTTTTAGCCTCTTCGACAAGGATGGCGATGGTTGCATCACCACCAA
GGAGCTGGGAACAGTTATGAGGTCCCTAGGGCAGAACCCAACAGAAGCCGAGCTCCAGGA
CGTGATCAACGAAGTGGACGCCGACGGCAACGGCACCATTAACTTCCCTGAGTTCCTGAA
CCTCATGGCTAAAAAGATGAAAGACACGGACTCGGAGGAAGAGCTCAAAGAAGCTTTCAG
GGTGTTCGACAAAGACCAGAACGGGTTCATATCCGCTGCAGAGCTCCGCCATGTCATGAC
GAATCTAGGTGAGAAACTGACTGATGAAGAAGTTGACGAGATGGTCCGTGAAGCTGATGT
TGATGGAGATGGTCAGATAAACTACGAGGAGTTTGTCAAGATTATGATGGCTAAGTAATG
TATATGGTAAGGTAAGAAGAAACTAAAAGGTGGTAGTCATATAACCTTTTATTATCTAGA
ACAAAAAAGATCGATCTGTTGAGTTTAGTAGTTTTCAAAGTTTTAGCAAACTTTGTTGTT
AACGAATATCTTTTTATTTTGTGGGTTTTTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EA28JQ C 1
AF RR2EA28TF U 1
BS 1 634 RR2EA28TF

RD RR2EA28JQ 634 0 0
GGAAGCGAGAACCCGGAAACCAAAAGAAATGGCGGATCAGCTAACGGACGAACAGATCTC
CGAGTTCAAGGAAGCTTTTAGCCTCTTCGACAAGGATGGCGATGGTTGCATCACCACCAA
GGAGCTGGGAACAGTTATGAGGTCCCTAGGGCAGAACCCAACAGAAGCCGAGCTCCAGGA
CGTGATCAACGAAGTGGACGCCGACGGCAACGGCACCATTAACTTCCCTGAGTTCCTGAA
CCTCATGGCTAAAAAGATGAAAGACACGGACTCGGAGGAAGAGCTCAAAGAAGCTTTCAG
GGTGTTCGACAAAGACCAGAACGGGTTCATATCCGCTGCAGAGCTCCGCCATGTCATGAC
GAATCTAGGTGAGAAACTGACTGATGAAGAAGTTGACGAGATGGTCCGTGAAGCTGATGT
TGATGGAGATGGTCAGATAAACTACGAGGAGTTTGTCAAGATTATGATGGCTAAGTAATG
TATATGGTAAGGTAAGAAGAAACTAAAAGGTGGTAGTCATATAACCTTTTATTATCTAGA
ACAAAAAAGATCGATCTGTTGAGTTTAGTAGTTTTCAAAGTTTTAGCAAACTTTGTTGTT
AACGAATATCTTTTTATTTTGTGGGTTTTTTTCC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2EA28TF 634 0 0
GGAAGCGAGAACCCGGAAACCAAAAGAAATGGCGGATCAGCTAACGGACGAACAGATCTC
CGAGTTCAAGGAAGCTTTTAGCCTCTTCGACAAGGATGGCGATGGTTGCATCACCACCAA
GGAGCTGGGAACAGTTATGAGGTCCCTAGGGCAGAACCCAACAGAAGCCGAGCTCCAGGA
CGTGATCAACGAAGTGGACGCCGACGGCAACGGCACCATTAACTTCCCTGAGTTCCTGAA
CCTCATGGCTAAAAAGATGAAAGACACGGACTCGGAGGAAGAGCTCAAAGAAGCTTTCAG
GGTGTTCGACAAAGACCAGAACGGGTTCATATCCGCTGCAGAGCTCCGCCATGTCATGAC
GAATCTAGGTGAGAAACTGACTGATGAAGAAGTTGACGAGATGGTCCGTGAAGCTGATGT
TGATGGAGATGGTCAGATAAACTACGAGGAGTTTGTCAAGATTATGATGGCTAAGTAATG
TATATGGTAAGGTAAGAAGAAACTAAAAGGTGGTAGTCATATAACCTTTTATTATCTAGA
ACAAAAAAGATCGATCTGTTGAGTTTAGTAGTTTTCAAAGTTTTAGCAAACTTTGTTGTT
AACGAATATCTTTTTATTTTGTGGGTTTTTTTCC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL6758Contig1 824 2 4 U
GGATGTCAAGAGAGATTTCGGTTTTCCGAATGATTTTTTGGTTAGGTTGGTTAAGAAATA
CCCGAATTATTCCCGGTTAACCGGTTTAGTTGGAGAAGAGGGGAATAATAAGTCCTTTCT
CGAGCTTGTCGATTGGAACCCTGATTTCGCCAAATCGGCGATTGAGTTAAGAGCCGAAGA
AGAGACCGTTAGAACCGGTGTTCGTGTGCGTCCCAATTTCGATGTGAAACTTCCGCCTGG
TTTTTTCTTAAGGAAGGAGATGAGAGAGTGGACTAGGGATTGGTTGGAGCGAGACTACAT
ATCACCTTACGAGGATGCGTCTCGTTTCGACCAGGCTTCTAAGGAGATGGAGAAACGAAC
CGTTGGTGTTTTTCACGAGCTGTTGTCTCTCTCGCTGCTGAAGAGAGTCCCTGTGCCTAT
ACTCGGCAAGTTCTGCGATGAGTTTAGGTTTTCGAACGCGTTTTCGAGTGTTTTCACGAG
GCATTCGGGTATATTCTACTTGTCGTTGAAGGGAGGGATCAAGACTGCGGTGCTGAGACA
AGCGTATAGAGACGAGGTGTTGGTGGATAGGGACCCTTTGCTGGCTGTTAAGGAGAAGTT
TTCGAGGTTGTTGGAGGAAGGATGGCAAGAGAGGAAAGATAGATTGAAGATGCAGAGGGA
ACAAGTTGAGAAAGATAGGGAGGTTTTGTTGGCAGATAAAAAGCAGCAGGAACCAGAGGA
GCGTCTCTGTGATTGATTAACTTGTAAACAGGCCTCTCACTGTAATGAGAGAGATATGTA
TGTATGATCAATCATCCATCCTCTGATCTTGGTCTTTTCTCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS80TF U 1
AF RR2CS80JQ C 101
BS 1 672 RR2CS80TF
BS 673 673 RR2CS80JQ
BS 674 701 RR2CS80TF
BS 702 824 RR2CS80JQ

RD RR2CS80TF 712 0 0
GGATGTCAAGAGAGATTTCGGTTTTCCGAATGATTTTTTGGTTAGGTTGGTTAAGAAATA
CCCGAATTATTCCCGGTTAACCGGTTTAGTTGGAGAAGAGGGGAATAATAAGTCCTTTCT
CGAGCTTGTCGATTGGAACCCTGATTTCGCCAAATCGGCGATTGAGTTAAGAGCCGAAGA
AGAGACCGTTAGAACCGGTGTTCGTGTGCGTCCCAATTTCGATGTGAAACTTCCGCCTGG
TTTTTTCTTAAGGAAGGAGATGAGAGAGTGGACTAGGGATTGGTTGGAGCGAGACTACAT
ATCACCTTACGAGGATGCGTCTCGTTTCGACCAGGCTTCTAAGGAGATGGAGAAACGAAC
CGTTGGTGTTTTTCACGAGCTGTTGTCTCTCTCGCTGCTGAAGAGAGTCCCTGTGCCTAT
ACTCGGCAAGTTCTGCGATGAGTTTAGGTTTTCGAACGCGTTTTCGAGTGTTTTCACGAG
GCATTCGGGTATATTCTACTTGTCGTTGAAGGGAGGGATCAAGACTGCGGTGCTGAGACA
AGCGTATAGAGACGAGGTGTTGGTGGATAGGGACCCTTTGCTGGCTGTTAAGGAGAAGTT
TTCGAGGTTGTTGGAGGAAGGATGGCAAGAGAGGAAAGATAGATTGAAGATGCAGAGGGA
ACAAGTTGAGAAGGATAGGGAGGTTTTGTTGGCAGATAAAA
GCAGCAGAACC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2CS80JQ 724 0 0
GGGAATAATAAGTCCTTTCTCGAGCTTGTCGATTGGAACCCTGATTTCGCCAAATCGGCG
ATTGAGTTAAGAGCCGAAGAAGAGACCGTTAGAACCGGTGTTCGTGTGCGTCCCAATTTC
GATGTGAAACTTCCGCCTGGTTTTTTCTTAAGGAAGGAGATGAGAGAGTGGACTAGGGAT
TGGTTGGAGCGAGACTACATATCACCTTACGAGGATGCGTCTCGTTTCGACCAGGCTTCT
AAGGAGATGGAGAAACGAACCGTTGGTGTTTTTCACGAGCTGTTGTCTCTCTCGCTGCTG
AAGAGAGTCCCTGTGCCTATACTCGGCAAGTTCTGCGATGAGTTTAGGTTTTCGAACGCG
TTTTCGAGTGTTTTCACGAGGCATTCGGGTATATTCTACTTGTCGTTGAAGGGAGGGATC
AAGACTGCGGTGCTGAGACAAGCGTATAGAGACGAGGTGTTGGTGGATAGGGACCCTTTG
CTGGCTGTTAAGGAGAAGTTTTCGAGGTTGTTGGAGGAAGGATGGCAAGAGAGGAAAGAT
AGATTGAAGATGCAGAGGGAACAAGTTGAGAAAGATAGGGAGGTTTTGTTGGCAGATAAA
AAGCAGCAGGAACCAGAGGAGCGTCTCTGTGATTGATTAACTTGTAAACAGGCCTCTCAC
TGTAATGAGAGAGATATGTATGTATGATCAATCATCCATCCTCTGATCTTGGTCTTTTCT
CTAG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL6759Contig1 882 2 2 U
GGAAGGAAGCATCATCAATGGTGGAAAGCTTGTGATAGCCAAAATCGAGATCTGATCCCC
TAAATGGAGAGCGAGAAGAAGCAGTCATCTGTCTCGGACGTGGGAGCATGGGGTATGAAC
ATCGTCAGCTCCGTGGGGATCATCATGGCTAACAAACAGCTCATGTCTTCCTCTGGCTTC
GGATTCAGCTTCGCGACAACACTAACGGGATTCCACTTCGCACTCACGGCGCTTGTTGGT
ATGGTGTCAAACGCTACGGGACTCTCTGCGTCGAAGCACATTCCTCTTTGGGAGCTTCTT
TGGTTCTCTATTGTAGCTAACGTCTCCATCGCTGCTATGAACTTCAGCCTCATGCTCAAC
TCTGCTGGCTTCTACCAGATATCGAAGTTGAGTATGATTCCGGTTGTATGCGTGATGGAA
TGGATACTACATAGCAAGCACTACTCTAGAGAAGTGAAAGCGTCTGTTATGGTTGTGGTT
GTCGGTGTTGGCATCTGTACTGTCACTGATGTCAAAGTTAATGCCAAGGGATTCATTTGT
GCTTGTGCTGCCGTCTTCTCTTTGATTCGGAGATGACTTTCAAGAACATCTCCGGTATGG
TCGTAGCTGTTGTCGGAATGGTGATCTATAGTTGGGCGGTTGATCTAGAGAAACAGAGAA
ACGCAAAGTCAACTTCTCAAGGGAAAAACAGTGTGGCAGAAGATGAGATTAAGCCACTCA
AGGAAGGAATAGAGCATATCGATTTGAAAGATGTTGAGCTCGGTGGTGAGACTAAAGTAT
AGATAGATACAACAATGTGTGCTTTTTTATCAAGTTTCAAATTACACGTCGAATACTTAT
TTTTTTTTAAGGCTATAAAAGTATAAACAGTTTCTCCTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B638TF U 1
AF RR2B638JQ C 29
BS 1 818 RR2B638TF
BS 819 882 RR2B638JQ

RD RR2B638TF 818 0 0
GGAAGGAAGCATCATCAATGGTGGAAAGCTTGTGATAGCCAAAATCGAGATCTGATCCCC
TAAATGGAGAGCGAGAAGAAGCAGTCATCTGTCTCGGACGTGGGAGCATGGGGTATGAAC
ATCGTCAGCTCCGTGGGGATCATCATGGCTAACAAACAGCTCATGTCTTCCTCTGGCTTC
GGATTCAGCTTCGCGACAACACTAACGGGATTCCACTTCGCACTCACGGCGCTTGTTGGT
ATGGTGTCAAACGCTACGGGACTCTCTGCGTCGAAGCACATTCCTCTTTGGGAGCTTCTT
TGGTTCTCTATTGTAGCTAACGTCTCCATCGCTGCTATGAACTTCAGCCTCATGCTCAAC
TCTGCTGGCTTCTACCAGATATCGAAGTTGAGTATGATTCCGGTTGTATGCGTGATGGAA
TGGATACTACATAGCAAGCACTACTCTAGAGAAGTGAAAGCGTCTGTTATGGTTGTGGTT
GTCGGTGTTGGCATCTGTACTGTCACTGATGTCAAAGTTAATGCCAAGGGATTCATTTGT
GCTTGTGCTGCCGTCTTCTCTTTGATTCGGAGATGACTTTCAAGAACATCTCCGGTATGG
TCGTAGCTGTTGTCGGAATGGTGATCTATAGTTGGGCGGTTGATCTAGAGAAACAGAGAA
ACGCAAAGTCAACTTCTCAAGGGAAAAACAGTGTGGCAGAAGATGAGATTAAGCCACTCA
AGGAAGGAATAGAGCATATCGATTTGAAAGATGTTGAGCTCGGTGGTGAGACTAAAGTAT
AGATAGATACAACAATGTGTGCTTTTTTATCAAGTTTC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2B638JQ 854 0 0
CTTGTGATAGCCAAAATCGAGATCTGATCCCCTAAATGGAGAGCGAGAAGAAGCAGTCAT
CTGTCTCGGACGTGGGAGCATGGGGTATGAACATCGTCAGCTCCGTGGGGATCATCATGG
CTAACAAACAGCTCATGTCTTCCTCTGGCTTCGGATTCAGCTTCGCGACAACACTAACGG
GATTCCACTTCGCACTCACGGCGCTTGTTGGTATGGTGTCAAACGCTACGGGACTCTCTG
CGTCGAAGCACATTCCTCTTTGGGAGCTTCTTTGGTTCTCTATTGTAGCTAACGTCTCCA
TCGCTGCTATGAACTTCAGCCTCATGCTCAACTCTGCTGGCTTCTACCAGATATCGAAGT
TGAGTATGATTCCGGTTGTATGCGTGATGGAATGGATACTACATAGCAAGCACTACTCTA
GAGAAGTGAAAGCGTCTGTTATGGTTGTGGTTGTCGGTGTTGGCATCTGTACTGTCACTG
ATGTCAAAGTTAATGCCAAGGGATTCATTTGTGCTTGTGCTGCCGTCTTCTCTTTGATTC
GGAGATGACTTTCAAGAACATCTCCGGTATGGTCGTAGCTGTTGTCGGAATGGTGATCTA
TAGTTGGGCGGTTGATCTAGAGAAACAGAGAAACGCAAAGTCAACTTCTCAAGGGAAAAA
CAGTGTGGCAGAAGATGAGATTAAGCCACTCAAGGAAGGAATAGAGCATATCGATTTGAA
AGATGTTGAGCTCGGTGGTGAGACTAAAGTATAGATAGATACAACAATGTGTGCTTTTTT
ATCAAGTTTCAAATTACACGTCGAATACTTATTTTTTTTTAAGGCTATAAAAGTATAAAC
AGTTTCTCCTCACC

QA 1 854 1 854
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6761Contig1 729 2 11 U
TTAGTGCTAAAAGCCGGGAGACACTGTCTGACTGGTTTAGTCCTTGTGAGAAGCTTGGGA
TAGCTGCTGAACATGGCTACTTTCTGAGGCTGAAGAAGGCTGTGGAATGGGAAAACTGCG
TGGCGGCAGCAGATTGTTCTTGGAAACAAATTGCAGAGCCTGTGATGGAGCTTTACACCG
AGACAACAGATGGATCAACGATAGAAGACAAGGAGACGGCTCTGGTGTGGAGCTATGAGG
ATGCTGACCCTGATTTCGGCTCATGTCAAGCTAAAGAGCTTCTAGACCATCTTGAAAGTG
TACTTGCCAATGAACCTGTAACAGTCAAGAGAGGACAGAACTATGTTGAGGTCAAGCCCC
AGGGGGTGAGCAAAGGACTTATAGCGAGAAGGATGCTTTCGATGATGCAAGAAAAAGGAA
CACCTCCTGAGTTTGTTCTGTGTATTGGAGATGATCGGTCTGATGAAGACATGTTTGAAG
TGATATGCAGTTCCACTGAAGGCCCTTGGATTGCCCCTAGAGCTGAGGTCTTCGCCTGTA
CCGTTGGTCAGAAGCCTAGCAAGGCTAAGTATTACCTGGATGACATTACTGAGATTGTCA
GGTTAATGCATGGTTTGGCTTCTGTTTCAGAACAGACCATGTCTGTTTAAAAAAAGCCAG
AGAGAAGTATCAGAAAGGTCTTTTGTTTGTATATTACCACGGAAACCTTGTAACGGAGAT
ATGTAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF58TF U 108
AF RR2F304JQ C 1
BS 1 108 RR2F304JQ
BS 109 112 RR2DF58TF
BS 113 113 RR2F304JQ
BS 114 124 RR2DF58TF
BS 125 125 RR2F304JQ
BS 126 268 RR2DF58TF
BS 269 269 RR2F304JQ
BS 270 301 RR2DF58TF
BS 302 302 RR2F304JQ
BS 303 416 RR2DF58TF
BS 417 729 RR2F304JQ

RD RR2DF58TF 309 0 0
G
GGGAGAACTGCGTGGCTGCAGCAGATTGTTCTTGGAAACAAATTGCAGAGCCTGTGATGG
AGCTTTACACCGAGACAACAGATGGATCAACGATAGAAGACAAGGAGACGGCTCTGGTGT
GGAGCTATGAGGATGCTGACCCTGATTTCGGCTCATGTCAGGCTAAAGAGCTTCTAGACC
ATCTTGAAAGTGTCCTTGCCAATGAACCTGTAACAGTCAAGAGAGGACAGAACTATGTTG
AGGTCAAGCCCCAGGGGGTGAGCAAAGGACTTATAGCGAGAAGGATGCTTTCGATGATGC
AAGAAAAA

QA 2 309 2 309
DS 

RD RR2F304JQ 729 0 0
TTAGTGCTAAAAGCCGGGAGACACTGTCTGACTGGTTTAGTCCTTGTGAGAAGCTTGGGA
TAGCTGCTGAACATGGCTACTTTCTGAGGCTGAAGAAGGCTGTGGAATGGGAAAACTGTG
TGGCGGCAGCAGATTGTTCTTGGAAACAAATTGCAGAGCCTGTGATGGAGCTTTACACCG
AGACAACAGATGGATCAACGATAGAAGACAAGGAGACGGCTCTGGTGTGGAGCTATGAGG
ATGCTGACCCTGATTTCGGCTCATGTCAAGCTAAAGAGCTTCTAGACCATCTTGAAAGTG
TACTTGCTAATGAACCTGTAACAGTCAAGAGAGGACAGAACTATGTTGAGGTCAAGCCGC
AGGGGGTGAGCAAAGGACTTATAGCGAGAAGGATGCTTTCGATGATGCAAGAAAAAGGAA
CACCTCCTGAGTTTGTTCTGTGTATTGGAGATGATCGGTCTGATGAAGACATGTTTGAAG
TGATATGCAGTTCCACTGAAGGCCCTTGGATTGCCCCTAGAGCTGAGGTCTTCGCCTGTA
CCGTTGGTCAGAAGCCTAGCAAGGCTAAGTATTACCTGGATGACATTACTGAGATTGTCA
GGTTAATGCATGGTTTGGCTTCTGTTTCAGAACAGACCATGTCTGTTTAAAAAAAGCCAG
AGAGAAGTATCAGAAAGGTCTTTTGTTTGTATATTACCACGGAAACCTTGTAACGGAGAT
ATGTAATTT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6763Contig1 601 2 1 U
GCATTCAGAACCTAACAAAGTTGGAAGATTTATGGCTTAATGATAACCAGATAGAATCAC
TTGAAGCAATCGCAGAAGCTGTTGCAGGCTCAAAAGAGAAGCTCACCACTATCTACCTCG
AAAATAACCCTTGTGCCAAGTCTTCCGATTACGTTGCTGTGCTCAGACAAATCTTCCCAA
ATGTGGAGCAAATAGACTCTAACTTATTTGCTTGAAGATGGACGTTTCTCGTTTTATGAG
AGCTTGCTTCCTCATATAGTTTAGAAGACTTCAGAGCATGGTCATCAAATCCAAGAAATC
AGGCAAAAAACACAGATATCTGGAAATACACACGTGTCTGCTGTTTATCATAAAGAAGTG
CAAAGGAGCAAATCAAATCGAATCGTTGTCTTCATCGATATTTTATCAAAACAGTTCTCG
TGCTCCCTTGCAAGCAAAGCCTGTTTTTGGTCTGTAAGCAGTATTAGGACTTTGTAAGTC
TGAGGTTTTCTTTGTTTTCCCCTGACATTCTTATTTTTTTCTTCTTTTTTTTTGGGCTTC
ATATTTGAGTGTTAAGTACTGGAAAGTTGCTATGTTGAGATTTTACTACTTCTTGGTTAC
T


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2GZ64JQ C 1
AF RR2GZ64TF U 1
BS 1 601 RR2GZ64TF

RD RR2GZ64JQ 601 0 0
GCATTCAGAACCTAACAAAGTTGGAAGATTTATGGCTTAATGATAACCAGATAGAATCAC
TTGAAGCAATCGCAGAAGCTGTTGCAGGCTCAAAAGAGAAGCTCACCACTATCTACCTCG
AAAATAACCCTTGTGCCAAGTCTTCCGATTACGTTGCTGTGCTCAGACAAATCTTCCCAA
ATGTGGAGCAAATAGACTCTAACTTATTTGCTTGAAGATGGACGTTTCTCGTTTTATGAG
AGCTTGCTTCCTCATATAGTTTAGAAGACTTCAGAGCATGGTCATCAAATCCAAGAAATC
AGGCAAAAAACACAGATATCTGGAAATACACACGTGTCTGCTGTTTATCATAAAGAAGTG
CAAAGGAGCAAATCAAATCGAATCGTTGTCTTCATCGATATTTTATCAAAACAGTTCTCG
TGCTCCCTTGCAAGCAAAGCCTGTTTTTGGTCTGTAAGCAGTATTAGGACTTTGTAAGTC
TGAGGTTTTCTTTGTTTTCCCCTGACATTCTTATTTTTTTCTTCTTTTTTTTTGGGCTTC
ATATTTGAGTGTTAAGTACTGGAAAGTTGCTATGTTGAGATTTTACTACTTCTTGGTTAC
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2GZ64TF 601 0 0
GCATTCAGAACCTAACAAAGTTGGAAGATTTATGGCTTAATGATAACCAGATAGAATCAC
TTGAAGCAATCGCAGAAGCTGTTGCAGGCTCAAAAGAGAAGCTCACCACTATCTACCTCG
AAAATAACCCTTGTGCCAAGTCTTCCGATTACGTTGCTGTGCTCAGACAAATCTTCCCAA
ATGTGGAGCAAATAGACTCTAACTTATTTGCTTGAAGATGGACGTTTCTCGTTTTATGAG
AGCTTGCTTCCTCATATAGTTTAGAAGACTTCAGAGCATGGTCATCAAATCCAAGAAATC
AGGCAAAAAACACAGATATCTGGAAATACACACGTGTCTGCTGTTTATCATAAAGAAGTG
CAAAGGAGCAAATCAAATCGAATCGTTGTCTTCATCGATATTTTATCAAAACAGTTCTCG
TGCTCCCTTGCAAGCAAAGCCTGTTTTTGGTCTGTAAGCAGTATTAGGACTTTGTAAGTC
TGAGGTTTTCTTTGTTTTCCCCTGACATTCTTATTTTTTTCTTCTTTTTTTTTGGGCTTC
ATATTTGAGTGTTAAGTACTGGAAAGTTGCTATGTTGAGATTTTACTACTTCTTGGTTAC
T

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL6764Contig1 567 2 2 U
TTTGAGAACAAAAGAATATTACAGAAAGGTCGTTTTTCTTTTTCTTCTACACATGAAACA
TTGATTCTCATGTCTTTGGCCTTTCTACCACAACAAACACAACTCATCCCACAAAACTAA
TACAGGACACAGACAGCACAAATCACCAAAAAATAGAAAGTCAAAGAACGAAGGATTTAC
AAAAAAAGATTGATTCCGAGTCCCAAGCTGTTTGTCTTCACTTGGCTTAATACTTGACGT
GGAGGAGAAGGTGACGTGAGAGACGAACTCTTAACAAAATCTAGTGCAGCTTACTCACTT
TGTTTGCTGTATTATTCATTGCCTAGGTTCAGAGACCCGTCCTTCATTAGCTTGATGCTT
AAGCTATTGAACCTCCCTCTCGAGTAATGACGAGAAGCCTTTCTCCAATCAGTTCCTGTT
TTCATCATTGCTGCAAACTCTTCGTAGCTTATTCTCCCATCCTTGTCAGTGTCAACTTCT
TGGAATATATCATTGGCGACATCCACACAGTCATCCCCTCCATCTTCCTTCAAGGCTTCA
CAAAGCTCTTGGGGCAGAATGTACCCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EY80TF C 1
AF RR2EY80JQ U 4
BS 1 3 RR2EY80TF
BS 4 567 RR2EY80JQ

RD RR2EY80TF 567 0 0
TTTGAGAACAAAAGAATATTACAGAAAGGTCGTTTTTCTTTTTCTTCTACACATGAAACA
TTGATTCTCATGTCTTTGGCCTTTCTACCACAACAAACACAACTCATCCCACAAAACTAA
TACAGGACACAGACAGCACAAATCACCAAAAAATAGAAAGTCAAAGAACGAAGGATTTAC
AAAAAAAGATTGATTCCGAGTCCCAAGCTGTTTGTCTTCACTTGGCTTAATACTTGACGT
GGAGGAGAAGGTGACGTGAGAGACGAACTCTTAACAAAATCTAGTGCAGCTTACTCACTT
TGTTTGCTGTATTATTCATTGCCTAGGTTCAGAGACCCGTCCTTCATTAGCTTGATGCTT
AAGCTATTGAACCTCCCTCTCGAGTAATGACGAGAAGCCTTTCTCCAATCAGTTCCTGTT
TTCATCATTGCTGCAAACTCTTCGTAGCTTATTCTCCCATCCTTGTCAGTGTCAACTTCT
TGGAATATATCATTGGCGACATCCACACAGTCATCCCCTCCATCTTCCTTCAAGGCTTCA
CAAAGCTCTTGGGGCAGAATGTACCCC

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2EY80JQ 564 0 0
GAGAACAAAAGAATATTACAGAAAGGTCGTTTTTCTTTTTCTTCTACACATGAAACATTG
ATTCTCATGTCTTTGGCCTTTCTACCACAACAAACACAACTCATCCCACAAAACTAATAC
AGGACACAGACAGCACAAATCACCAAAAAATAGAAAGTCAAAGAACGAAGGATTTACAAA
AAAAGATTGATTCCGAGTCCCAAGCTGTTTGTCTTCACTTGGCTTAATACTTGACGTGGA
GGAGAAGGTGACGTGAGAGACGAACTCTTAACAAAATCTAGTGCAGCTTACTCACTTTGT
TTGCTGTATTATTCATTGCCTAGGTTCAGAGACCCGTCCTTCATTAGCTTGATGCTTAAG
CTATTGAACCTCCCTCTCGAGTAATGACGAGAAGCCTTTCTCCAATCAGTTCCTGTTTTC
ATCATTGCTGCAAACTCTTCGTAGCTTATTCTCCCATCCTTGTCAGTGTCAACTTCTTGG
AATATATCATTGGCGACATCCACACAGTCATCCCCTCCATCTTCCTTCAAGGCTTCACAA
AGCTCTTGGGGCAGAATGTACCCC

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

CO CL6765Contig1 1157 2 2 U
GGAGGAAGAAGGATCTCTGTTGTCCAAAAAAAAAGAAAAAAAGGAAGAAGGATCTGATCA
AAATCTCGATTGAAGAAGATGTCGACTCTATCGGCTGCGAGGGCAGACAACTTTTACTAT
CCCCCAGAATGGACTCCCGATCAAGGTTCCTTGAACAAGTTCCAAGGACAACATCCTCTC
AGAGAGAGGGCTAGGAAACTAGGCGAGGGGATTCTCATCATAAGGTTCGAGATGCCGTAT
AATATATGGTGCGGTGGCTGCAATTCGATGATTGCCAAGGGTGTTCGATTCAATGCTGAA
AAGAAGCAAGTTGGCAACTATTACTCTACAAAGATATGGAGCTTTGCCATGAAAGCACCG
TGCTGCAAACAGGAGATAGTCATTCAGACTGATCCTCAGAACTGCGAGTATGTGATTACT
AGTGGGGCTCAAAAGAAGGTTGAGGAATATGACGTTGAAGACGCTGAAACCATGGAACTC
ACTGCTGAGGAAGAGAAGGGGAAGCTTGCAGACCCATTTTATCGTTTAGAGCACCAAGAA
GTTGAATTGCAGAAGAAGAAAGCAGCAGAACCGCTGTTGGTCCGTCTTCAGCGAGTCTCA
GATGCAAGACATGCAGATGACTACTCCCTGAACAAAGCTCTACGCGCACAGATTAGGGGA
CAAAGGAAACGCGTAGCTGAAGAAGAGGCTGCTTCAAGGAAGTTAGGCTTGGGGATAAGA
CTTCTCCCCAAGAGCGAAGAAGATATTGCAGCTGCGTCACACGTGAAGTTCAAGACCAAG
TTTGATAAGAACCGAAAGGATAAACGAGCGCTGATACATTCATTTTCCATCTTTCCCGAG
TCATCTTACTTTATGTCATCGTCCAGCAAGAAAAGATTGGAGCTAGAAGCTAAGAGAAGG
AAGATATGCGCAGGGTCAGCGTCAAGTTTATTGAGTGGAGGATTCAAACCTTCATCATTG
TCTAAAACCCCATCATCATCAAGCAAGTTCAAGAGCTCAACAGTTTCTGTAAGGAAGCTG
TAGTTTATCAACTGTGCTTGAATCTTTGAGAAAGTTAAATCAGTGTAAGGTCAACTTATT
GTCGGTGATGATCTTTGTACGTGTGGTCTTGTGAACTATATTGTATTTAAGTTGAGAAAG
ATTATTGAAATGAGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP12TF U 1
AF RR2DP12JQ C 432
BS 1 515 RR2DP12TF
BS 516 1157 RR2DP12JQ

RD RR2DP12TF 515 0 0
GGAGGAAGAAGGATCTCTGTTGTCCAAAAAAAAAGAAAAAAAGGAAGAAGGATCTGATCA
AAATCTCGATTGAAGAAGATGTCGACTCTATCGGCTGCGAGGGCAGACAACTTTTACTAT
CCCCCAGAATGGACTCCCGATCAAGGTTCCTTGAACAAGTTCCAAGGACAACATCCTCTC
AGAGAGAGGGCTAGGAAACTAGGCGAGGGGATTCTCATCATAAGGTTCGAGATGCCGTAT
AATATATGGTGCGGTGGCTGCAATTCGATGATTGCCAAGGGTGTTCGATTCAATGCTGAA
AAGAAGCAAGTTGGCAACTATTACTCTACAAAGATATGGAGCTTTGCCATGAAAGCACCG
TGCTGCAAACAGGAGATAGTCATTCAGACTGATCCTCAGAACTGCGAGTATGTGATTACT
AGTGGGGCTCAAAAGAAGGTTGAGGAATATGACGTTGAAGACGCTGAAACCATGGAACTC
ACTGCTGAGGAAGAGAAGGGGAAGCTTGCAGACCC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2DP12JQ 726 0 0
AAAGAAGGTTGAGGAATATGACGTTGAAGACGCTGAAACCATGGAACTCACTGCTGAGGA
AGAGAAGGGGAAGCTTGCAGACCCATTTTATCGTTTAGAGCACCAAGAAGTTGAATTGCA
GAAGAAGAAAGCAGCAGAACCGCTGTTGGTCCGTCTTCAGCGAGTCTCAGATGCAAGACA
TGCAGATGACTACTCCCTGAACAAAGCTCTACGCGCACAGATTAGGGGACAAAGGAAACG
CGTAGCTGAAGAAGAGGCTGCTTCAAGGAAGTTAGGCTTGGGGATAAGACTTCTCCCCAA
GAGCGAAGAAGATATTGCAGCTGCGTCACACGTGAAGTTCAAGACCAAGTTTGATAAGAA
CCGAAAGGATAAACGAGCGCTGATACATTCATTTTCCATCTTTCCCGAGTCATCTTACTT
TATGTCATCGTCCAGCAAGAAAAGATTGGAGCTAGAAGCTAAGAGAAGGAAGATATGCGC
AGGGTCAGCGTCAAGTTTATTGAGTGGAGGATTCAAACCTTCATCATTGTCTAAAACCCC
ATCATCATCAAGCAAGTTCAAGAGCTCAACAGTTTCTGTAAGGAAGCTGTAGTTTATCAA
CTGTGCTTGAATCTTTGAGAAAGTTAAATCAGTGTAAGGTCAACTTATTGTCGGTGATGA
TCTTTGTACGTGTGGTCTTGTGAACTATATTGTATTTAAGTTGAGAAAGATTATTGAAAT
GAGTCG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL6766Contig1 729 2 3 U
GGACACTTAAATCTCCAACAATGCTCCATCCTTTCTCTTCTTCCTCTGTTTTCTCGAGAA
TCCTCGAGACTTTCTTGGTTTAAAGAATCACAGAACATCCCATTCTTGTTTGCTTTCTTC
TCATTGTTTGCTATGGAACTTGGTAAATCTCAATTCTACCTCTGCAATTCCTTTTCTCTT
TCTAGACTTTCCGATTATTCTATAGCTGGAAGTGATTATCCAGACGCCATACCCAAACCT
TCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTCTTGTGTCATCGTTGACGATTGTTCTTGTTTATAATCA
CAAACAAACACAAACAATGTTGTGTTCTTCATCTTCCTTTGCTCCTCATGCATCAGCTGC
TATGACCATGGCTGCTTCTTCACCAGTCTCCAGGTTTGCTGGACTCGCTCACCGTACTAC
TCTCAGGTATGATCAACGTCGTCTTCCTTGTTCTTCGACTGGGATTCAAAAGAAGATGAG
GTACCCGATTACAACTGCCTCTGCTGACTCACCAAGACCCAAATCTTACAAAGAGGTCAT
TAAGCCCTTCCGCCAACTGTTTGCTCGAGAGATCTCCACTCAATCTAAAGACTCTGATAT
TTCCATTGCTAAAGTCCTCTTGTACATTGCTGCTGAAGACGAAGCCTTCTTGGCTTTTAA
TCGGGAGATAGATGCTCTGTCTTTCCTCAGAGAGAGGGGAAACATCCAGACCAGTCTGAT
CCGAGCGAG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E090TF U 5
AF RR2DN72TF U 1
BS 1 576 RR2DN72TF
BS 577 577 RR2E090TF
BS 578 729 RR2DN72TF

RD RR2E090TF 630 0 0
ACTTAAATCTCCAACAATGCTCCATCCTTTCTCTTCTTCCT*TGTTTTCTCGAGAATCCT
CGAGACTTTCTTGGTTTAAAGAATCACAGAACATCCCATTCTTGTTTGCTTTCTTCTCAT
TGTTTGCTATGGAACTTGGTAAATCTCAATTCTACCTCTGCAATTCCTTTTCTCTTTCTA
GACTTTCCGATTATTCTATAGCTGGAAGTGATTATCCAGACGCCATACCCAAACCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTCTTTCTTGTGTCATCGTTGACGATTGTTCTTGTTTATAATCACAAA
CAAACACAAACAATGTTGTGTTCTTCATCTTCCTTTGCTCCTCATGCATCAGCTGTTATG
ACCATGGCTGCTTCTTCACCAGTCTCCGGGTTTGCTGGACTCGCTCACCGTACTACTCTC
AGGTATGATCAACGTCGTCTTCCTTGTTCTTCGACTGGTATTCAAAAGAAGATGAGGTAC
CCGATTACAACTGCCTCTGCTGACTCACCAAGACCCAAATCTTACAAAGAGGTCATTAAG
CCCTTCCGCCAACTGTTTGCTCGAGAGATCTCCACTCAATCTAAAGACTCTGATATTTCC
ATTGCTAAAGTCCTCTTGTACATTGCTGCT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2DN72TF 729 0 0
GGACACTTAAATCTCCAACAATGCTCCATCCTTTCTCTTCTTCCTCTGTTTTCTCGAGAA
TCCTCGAGACTTTCTTGGTTTAAAGAATCACAGAACATCCCATTCTTGTTTGCTTTCTTC
TCATTGTTTGCTATGGAACTTGGTAAATCTCAATTCTACCTCTGCAATTCCTTTTCTCTT
TCTAGACTTTCCGATTATTCTATAGCTGGAAGTGATTATCCAGACGCCATACCCAAACCT
TCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTCTTGTGTCATCGTTGACGATTGTTCTTGTTTATAATCA
CAAACAAACACAAACAATGTTGTGTTCTTCATCTTCCTTTGCTCCTCATGCATCAGCTGC
TATGACCATGGCTGCTTCTTCACCAGTCTCCAGGTTTGCTGGACTCGCTCACCGTACTAC
TCTCAGGTATGATCAACGTCGTCTTCCTTGTTCTTCGACTGGGATTCAAAAGAAGATGAG
GTACCCGATTACAACTGCCTCTGCTGACTCACCAAGACCCAAATCTTACAAAGAGGTCAT
TAAGCCCTTCCGCCAACTGTTTGCTCGAGAGATCTCTACTCAATCTAAAGACTCTGATAT
TTCCATTGCTAAAGTCCTCTTGTACATTGCTGCTGAAGACGAAGCCTTCTTGGCTTTTAA
TCGGGAGATAGATGCTCTGTCTTTCCTCAGAGAGAGGGGAAACATCCAGACCAGTCTGAT
CCGAGCGAG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL6767Contig1 618 2 4 U
GGAGCTTTGCTTGTTTCGCTGTCCGAAGGAGAAAATAAAAGCTTAGGGTTCAATCTCCCT
CACTCGCCATGTCCGGAGAAGAAGAAGAAGAGAACGCCGCCGAGCTCAAGATCGGAGACG
AGTTTTTGAAGGCAAAGTGTTTAATGAACTGTGAGGTCTCATTGATCCTTGAGCACAAGT
ATGAACAGCTTCAGCAGGTCTCCGAGGATCCTATGAATCAAGTTTCTCAAGTGTTTGAGA
AGTCCTTGCAGTATGTGAAGCGGTTTAGCCGGTACAAGAATCCAGATGCTGTTAGACAAG
TTCGAGAAATACTGAGTAGACATCAACTCACTGAGTTTGAGCTCTGTGTTCTTGGCAATC
TCTGTCCTGAAACTGCTGAAGAAGCAGTGGCTATGGTTCCTTCTCTCAAGACAAAAGGAA
GAGCTCATAGTGATGAAGCAATTGAGAAGATGCTCAATGATCTCTCCCTTGTCAAGAGAT
TCGAGTAGTGCAAAACATTCTCAATATCTAACATATTATAAACATAAATCTTTTTTAGCT
GATGATGTCTGGAGTTGATTTTTCATGTCTGAAATTATAAAAGCTTCGTATCAGTATTTC
CGGAGTTATACCTTCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DE70TF U 1
AF RR2DE70JQ C 123
BS 1 265 RR2DE70TF
BS 266 266 RR2DE70JQ
BS 267 386 RR2DE70TF
BS 387 618 RR2DE70JQ

RD RR2DE70TF 388 0 0
GGAGCTTTGCTTGTTTCGCTGTCCGAAGGAGAAAATAAAAGCTTAGGGTTCAATCTCCCT
CACTCGCCATGTCCGGAGAAGAAGAAGAAGAGAACGCCGCCGAGCTCAAGATCGGAGACG
AGTTTTTGAAGGCAAAGTGTTTAATGAACTGTGAGGTCTCATTGATCCTTGAGCACAAGT
ATGAACAGCTTCAGCAGGTCTCCGAGGATCCTATGAATCAAGTTTCTCAAGTGTTTGAGA
AGTCCTTGCAGTATGTGAAGCGGTT*AGCCGGTACAAGAATCCAGATGCTGTTAGACAAG
TTCGAGAAATACTGAGTAGACATCAACTCACTGAGTTTGAGCTCTGTGTTCTTGGCAATC
TCTGTCCTGAAACTGCTGAAGAAGCA
TG

QA 1 386 1 386
DS 

RD RR2DE70JQ 496 0 0
TTTTTGAAGGCAAAGTGTTTAATGAACTGTGAGGTCTCATTGATCCTTGAGCACAAGTAT
GAACAGCTTCAGCAGGTCTCCGAGGATCCTATGAATCAAGTTTCTCAAGTGTTTGAGAAG
TCCTTGCAGTATGTGAAGCGGTTTAGCCGGTACAAGAATCCAGATGCTGTTAGACAAGTT
CGAGAAATACTGAGTAGACATCAACTCACTGAGTTTGAGCTCTGTGTTCTTGGCAATCTC
TGTCCTGAAACTGCTGAAGAAGCAGTGGCTATGGTTCCTTCTCTCAAGACAAAAGGAAGA
GCTCATAGTGATGAAGCAATTGAGAAGATGCTCAATGATCTCTCCCTTGTCAAGAGATTC
GAGTAGTGCAAAACATTCTCAATATCTAACATATTATAAACATAAATCTTTTTTAGCTGA
TGATGTCTGGAGTTGATTTTTCATGTCTGAAATTATAAAAGCTTCGTATCAGTATTTCCG
GAGTTATACCTTCATG

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 2

CO CL6768Contig1 988 2 2 U
GGGAAACCACAAACCAAGTTCGCATCTCTTTAAACTCAAACAATGGGTTCTGCTTCCAAC
CATCTCGTCACTCCCTCCGCCGTCGACTCCTCCTCGCCGCTCCCCTCGAACCTCACCCAA
GACGACCTCAAGAAACTCGCCGCCTACAAAGCCGTCGAGTACGTCAAATCCGGAATGGTC
GTCGGCCTCGGCACCGGCTCCACCGCCAAACACGCCGTGTCCCGCATCAGCGAGCTCCTC
CGCGAAGGCAAGCTCCGCGACGTGATCGGCATCCCCACCTCCACCACCACGCACGACCAG
GCGGTCTCCCTCGGGATACCGCTCTCCGATCTCGACTCCCACCCGGTGGTGGATCTCTCC
ATCGACGGCGCCGACGAGGTCGATCCATCTCTCAACCTCGTCAAGGGACGCGGCGGGTCG
CTGCTGAGGGAGAAGATGGTGGAGGGAGCGTCGAAGAAGTTCGTGGTGATCGTCGACGAG
TCGAAGCTCGTGAAGCATCTCGGAGGGAGCGGGCTCGCCGTTCCGGTGGAGGTCGTGCCG
TTCTGCTGCGACTTCACGAGGAGGAAGCTTGAGGAGCTTTTTAAAGAAGCGGGGTGCACG
GCGAAGCTTAGGGTGACGACGAGCGGCGGCGGAGAGACGGCCCCCCCGGCTGTGACGGAC
AATGGGAACTACGTGGTGGATCTGTATTTGGAGAGGGATATGGGAGATTTGGAGGCGGCG
AGTGAGAAGATATTGAGGTTGCCCGGAGTGGTGGAGCACGGGATGTTTTTTGGGATCGCG
ACGACCTTGATCGTCGCCGGGAAAGCCGGTATGACGGTTAGGGATAGGTTTGGGTAAAAG
AGTAATTTCGTTGGGGGGAAATTAGGGTTTATGGTTTGGTTTTTGGTTTAAGATGGATCT
TTGCTTCTGTAAACCCTTTGACTTATTCTTGTGGTCTAGTATGTGTAAGAGTTTGACTCT
TGAATGAACAAGTTCCGTTGAAATTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BU91TF U 1
AF RR2BU91JQ C 393
BS 1 607 RR2BU91TF
BS 608 988 RR2BU91JQ

RD RR2BU91TF 607 0 0
GGGAAACCACAAACCAAGTTCGCATCTCTTTAAACTCAAACAATGGGTTCTGCTTCCAAC
CATCTCGTCACTCCCTCCGCCGTCGACTCCTCCTCGCCGCTCCCCTCGAACCTCACCCAA
GACGACCTCAAGAAACTCGCCGCCTACAAAGCCGTCGAGTACGTCAAATCCGGAATGGTC
GTCGGCCTCGGCACCGGCTCCACCGCCAAACACGCCGTGTCCCGCATCAGCGAGCTCCTC
CGCGAAGGCAAGCTCCGCGACGTGATCGGCATCCCCACCTCCACCACCACGCACGACCAG
GCGGTCTCCCTCGGGATACCGCTCTCCGATCTCGACTCCCACCCGGTGGTGGATCTCTCC
ATCGACGGCGCCGACGAGGTCGATCCATCTCTCAACCTCGTCAAGGGACGCGGCGGGTCG
CTGCTGAGGGAGAAGATGGTGGAGGGAGCGTCGAAGAAGTTCGTGGTGATCGTCGACGAG
TCGAAGCTCGTGAAGCATCTCGGAGGGAGCGGGCTCGCCGTTCCGGTGGAGGTCGTGCCG
TTCTGCTGCGACTTCACGAGGAGGAAGCTTGAGGAGCTTTTTAAAGAAGCGGGGTGCACG
GCGAAGC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2BU91JQ 596 0 0
CAACCTCGTCAAGGGACGCGGCGGGTCGCTGCTGAGGGAGAAGATGGTGGAGGGAGCGTC
GAAGAAGTTCGTGGTGATCGTCGACGAGTCGAAGCTCGTGAAGCATCTCGGAGGGAGCGG
GCTCGCCGTTCCGGTGGAGGTCGTGCCGTTCTGCTGCGACTTCACGAGGAGGAAGCTTGA
GGAGCTTTTTAAAGAAGCGGGGTGCACGGCGAAGCTTAGGGTGACGACGAGCGGCGGCGG
AGAGACGGCCCCCCCGGCTGTGACGGACAATGGGAACTACGTGGTGGATCTGTATTTGGA
GAGGGATATGGGAGATTTGGAGGCGGCGAGTGAGAAGATATTGAGGTTGCCCGGAGTGGT
GGAGCACGGGATGTTTTTTGGGATCGCGACGACCTTGATCGTCGCCGGGAAAGCCGGTAT
GACGGTTAGGGATAGGTTTGGGTAAAAGAGTAATTTCGTTGGGGGGAAATTAGGGTTTAT
GGTTTGGTTTTTGGTTTAAGATGGATCTTTGCTTCTGTAAACCCTTTGACTTATTCTTGT
GGTCTAGTATGTGTAAGAGTTTGACTCTTGAATGAACAAGTTCCGTTGAAATTGCC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL6769Contig1 684 2 1 U
GGCCGGAAAAAGATGGGGGGAAGCGAGTCTCAGATCTATCACGAGCGACAGCGACTCCAA
TTTTGCCTCTTGCACTCCCTCAACAATCTCTTTCAGGACAAGAACGCATTCACGCGGGAA
AGCTTGAACTCGATCGCGGAGAAGCTCGTGGCCGATGATCCGAACAGAGAAACGTGGAAG
ACGACGCTTCCTCTGTCTTTACTCCTCATCAAGCCTCACCACAACACGCTCACAGGGAAC
TACGACGTGAACGTGATGATGGCAGCTCTGGAAGGGAAAGGGAAGAGTGCTGTGTGGCAT
GATAAGCGTCATGGTGCTTCTTCTGTTGATCTTGGTGCAGATGCTCTTATGGGGGTTGTG
CTGAATGTTCCGGTGAAACGATACGGTGGGCTTTGGAGAAGCAGGCATTGGGTTGTGGTG
AGGAAGATCAGTGGAGTATGGTATAACTTGGATAGTGATCTCGTTGTTCCAAGGCCGTTT
AAAGACGAAGTTGAAGTTAGGGGGTTTTTGGATCAAAGTCTGAGTTCAGGTTCAGAGGTT
TTGCTAGTGAACAATGCTTGAAGATCAACAATCTTGAGTTTTTTTCTTTGTATAATAATC
AAATACTCATCAAGTGTGAAAAATGTACATATACAGCCTGTTGTAGTTTTCGTTCCGATA
GAGTTGAATACTTTCTTGATTATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F766JQ C 1
AF RR2F766TF U 1
BS 1 684 RR2F766TF

RD RR2F766JQ 684 0 0
GGCCGGAAAAAGATGGGGGGAAGCGAGTCTCAGATCTATCACGAGCGACAGCGACTCCAA
TTTTGCCTCTTGCACTCCCTCAACAATCTCTTTCAGGACAAGAACGCATTCACGCGGGAA
AGCTTGAACTCGATCGCGGAGAAGCTCGTGGCCGATGATCCGAACAGAGAAACGTGGAAG
ACGACGCTTCCTCTGTCTTTACTCCTCATCAAGCCTCACCACAACACGCTCACAGGGAAC
TACGACGTGAACGTGATGATGGCAGCTCTGGAAGGGAAAGGGAAGAGTGCTGTGTGGCAT
GATAAGCGTCATGGTGCTTCTTCTGTTGATCTTGGTGCAGATGCTCTTATGGGGGTTGTG
CTGAATGTTCCGGTGAAACGATACGGTGGGCTTTGGAGAAGCAGGCATTGGGTTGTGGTG
AGGAAGATCAGTGGAGTATGGTATAACTTGGATAGTGATCTCGTTGTTCCAAGGCCGTTT
AAAGACGAAGTTGAAGTTAGGGGGTTTTTGGATCAAAGTCTGAGTTCAGGTTCAGAGGTT
TTGCTAGTGAACAATGCTTGAAGATCAACAATCTTGAGTTTTTTTCTTTGTATAATAATC
AAATACTCATCAAGTGTGAAAAATGTACATATACAGCCTGTTGTAGTTTTCGTTCCGATA
GAGTTGAATACTTTCTTGATTATT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2F766TF 684 0 0
GGCCGGAAAAAGATGGGGGGAAGCGAGTCTCAGATCTATCACGAGCGACAGCGACTCCAA
TTTTGCCTCTTGCACTCCCTCAACAATCTCTTTCAGGACAAGAACGCATTCACGCGGGAA
AGCTTGAACTCGATCGCGGAGAAGCTCGTGGCCGATGATCCGAACAGAGAAACGTGGAAG
ACGACGCTTCCTCTGTCTTTACTCCTCATCAAGCCTCACCACAACACGCTCACAGGGAAC
TACGACGTGAACGTGATGATGGCAGCTCTGGAAGGGAAAGGGAAGAGTGCTGTGTGGCAT
GATAAGCGTCATGGTGCTTCTTCTGTTGATCTTGGTGCAGATGCTCTTATGGGGGTTGTG
CTGAATGTTCCGGTGAAACGATACGGTGGGCTTTGGAGAAGCAGGCATTGGGTTGTGGTG
AGGAAGATCAGTGGAGTATGGTATAACTTGGATAGTGATCTCGTTGTTCCAAGGCCGTTT
AAAGACGAAGTTGAAGTTAGGGGGTTTTTGGATCAAAGTCTGAGTTCAGGTTCAGAGGTT
TTGCTAGTGAACAATGCTTGAAGATCAACAATCTTGAGTTTTTTTCTTTGTATAATAATC
AAATACTCATCAAGTGTGAAAAATGTACATATACAGCCTGTTGTAGTTTTCGTTCCGATA
GAGTTGAATACTTTCTTGATTATT

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL6770Contig1 935 2 2 U
GGGATCGAATCTGAAACTGAACGAAGATCGGAGAAGATGACAGAAGCGAGCCTCGATCTA
CAGGAATCCGGCTGGGAGGAGCTCCGTAGAGAAGCTCGTAAAATCGAAGGCGATCTCGAC
GTCAAACTCTCCTCTTACGCTAAGCTCGGCGCCAGATTCAACCAAGGCGGGTATGGTGTT
GAGGGTGGATCTCCAGGAGGATCATGGAAGTCAATGGAGATTGAGATTCAATCTTCGCTT
GAGAAGTTGTTGGACATTAATGATTCCATGAGTAGATGTGCTGCCTCTGCTACACCAACA
ACCTCTGTTACTCAAAAGCTTGCAAGGCACAGAGACATTCTTCACGAATACACTCAGGAG
TTTCGAAGGATAAAAGGGAATATAAACTCGATGAGGGAACATGCGGAGCTTTTGAGTTCT
GTCAGGGATGACATCAGTGAATATAAGGCTTCTGGTAGTATGTCACCAGGTGTGCAGGTG
TTAAGGGAGAGAGCTTCAATCCATGGAAGTATATCCCATATTGATGAAGTCATTGGCCAA
GCTCAAGCGACAAGGGCAGTTCTTGGCTCTCAACGGTCTCTGTTTTTCGGATGTTCAAGG
GAAAGTGAAAAATCTCGGAGACAAGTTCCCGGTGATTCGTGGCTTACTTGGCTCAATTAG
AAGGAGACGTTCTCGGGACACACTTATCCTCTCCGCTGTCATCGCTGCGTGTACCTTGTT
TATAATCATCTACTGGCTCTCGAAATAAACAGTATTGTTCATACACCTAAAGCCTGTTAA
GACGATCCCTATATCGATTTTTCCAAGGTTTTTCTTGCCATTTGGTTGAGTTATGTGTTC
GTAGGATGTAATGTCACACTCCTAATCATAAAACAGCTTAAAAATTCAAAACAAATTATT
CGCAACATCAAGATCAATAATATCCTTACGACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F370TF U 1
AF RR2F370JQ C 171
BS 1 784 RR2F370TF
BS 785 935 RR2F370JQ

RD RR2F370TF 784 0 0
GGGATCGAATCTGAAACTGAACGAAGATCGGAGAAGATGACAGAAGCGAGCCTCGATCTA
CAGGAATCCGGCTGGGAGGAGCTCCGTAGAGAAGCTCGTAAAATCGAAGGCGATCTCGAC
GTCAAACTCTCCTCTTACGCTAAGCTCGGCGCCAGATTCAACCAAGGCGGGTATGGTGTT
GAGGGTGGATCTCCAGGAGGATCATGGAAGTCAATGGAGATTGAGATTCAATCTTCGCTT
GAGAAGTTGTTGGACATTAATGATTCCATGAGTAGATGTGCTGCCTCTGCTACACCAACA
ACCTCTGTTACTCAAAAGCTTGCAAGGCACAGAGACATTCTTCACGAATACACTCAGGAG
TTTCGAAGGATAAAAGGGAATATAAACTCGATGAGGGAACATGCGGAGCTTTTGAGTTCT
GTCAGGGATGACATCAGTGAATATAAGGCTTCTGGTAGTATGTCACCAGGTGTGCAGGTG
TTAAGGGAGAGAGCTTCAATCCATGGAAGTATATCCCATATTGATGAAGTCATTGGCCAA
GCTCAAGCGACAAGGGCAGTTCTTGGCTCTCAACGGTCTCTGTTTTTCGGATGTTCAAGG
GAAAGTGAAAAATCTCGGAGACAAGTTCCCGGTGATTCGTGGCTTACTTGGCTCAATTAG
AAGGAGACGTTCTCGGGACACACTTATCCTCTCCGCTGTCATCGCTGCGTGTACCTTGTT
TATAATCATCTACTGGCTCTCGAAATAAACAGTATTGTTCATACACCTAAAGCCTGTTAA
GACG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2F370JQ 765 0 0
GTATGGTGTTGAGGGTGGATCTCCAGGAGGATCATGGAAGTCAATGGAGATTGAGATTCA
ATCTTCGCTTGAGAAGTTGTTGGACATTAATGATTCCATGAGTAGATGTGCTGCCTCTGC
TACACCAACAACCTCTGTTACTCAAAAGCTTGCAAGGCACAGAGACATTCTTCACGAATA
CACTCAGGAGTTTCGAAGGATAAAAGGGAATATAAACTCGATGAGGGAACATGCGGAGCT
TTTGAGTTCTGTCAGGGATGACATCAGTGAATATAAGGCTTCTGGTAGTATGTCACCAGG
TGTGCAGGTGTTAAGGGAGAGAGCTTCAATCCATGGAAGTATATCCCATATTGATGAAGT
CATTGGCCAAGCTCAAGCGACAAGGGCAGTTCTTGGCTCTCAACGGTCTCTGTTTT*CGG
ATGTTCAAGGGAAAGTGAAAAATCTCGGAGACAAGTTCCCGGTGATTCGTGGCTTACTTG
GCTCAATTAGAAGGAGACGTTCTCGGGACACACTTATCCTCTCCGCTGTCATCGCTGCGT
GTACCTTGTTTATAATCATCTACTGGCTCTCGAAATAAACAGTATTGTTCATACACCTAA
AGCCTGTTAAGACGATCCCTATATCGATTTTTCCAAGGTTTTTCTTGCCATTTGGTTGAG
TTATGTGTTCGTAGGATGTAATGTCACACTCCTAATCATAAAACAGCTTAAAAATTCAAA
ACAAATTATTCGCAACATCAAGATCAATAATATCCTTACGACACC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL6771Contig1 609 2 1 U
GGGTAAGAGAAAAGAGGGAGACAGAACATAAGCTTTGTTCTTCATTTTTTTGAGAAAGTA
AAGATCTTTGTGTGTTAAATTCAAGTATTGGATTATTAAAGTTTCGATCTTTTCACGAAT
CTTAAACTTTGTTTTCAGATATTGCTAAGATGTCTACTCCCAGTCCAATTCCCGCCGGCA
TTACCAAGGATCAGGCGTTTAACATGGCACAAACGGAGATGGAATATCGTGTGGAACTCT
TCAACAAGCTTGCTCAAACATGCTTTGTTAAATGTGTGGATAAAAGGTACAAGGAAGCTG
AGTTAAACATGGGTGAAAACAGTTGTATTGACCGTTGTGTTCCCAAGTACTGGCAGGTAA
ATGGAATGGTCGGACAGCTCCTAAGTGTTGGCAAGCCTCCACAACAGTGAGTCTCCGTTA
TAGACCAAAAGCTCATGGAGAATCAAAAACGCTCTTCTTTCTTCTTCTTAAAGTTTTAAG
CCAATCTTAATTGTTTTTGTTGTCAAACAAAGAAAGTTGCATCATATTTTTTTGGCGTTT
ATTTGGATAAATTATGCAATTCTCTGAGACTTTATTTATAAGAGATGAGATGAAAGGAAA
TAACAGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B466JQ C 1
AF RR2B466TF U 1
BS 1 609 RR2B466TF

RD RR2B466JQ 609 0 0
GGGTAAGAGAAAAGAGGGAGACAGAACATAAGCTTTGTTCTTCATTTTTTTGAGAAAGTA
AAGATCTTTGTGTGTTAAATTCAAGTATTGGATTATTAAAGTTTCGATCTTTTCACGAAT
CTTAAACTTTGTTTTCAGATATTGCTAAGATGTCTACTCCCAGTCCAATTCCCGCCGGCA
TTACCAAGGATCAGGCGTTTAACATGGCACAAACGGAGATGGAATATCGTGTGGAACTCT
TCAACAAGCTTGCTCAAACATGCTTTGTTAAATGTGTGGATAAAAGGTACAAGGAAGCTG
AGTTAAACATGGGTGAAAACAGTTGTATTGACCGTTGTGTTCCCAAGTACTGGCAGGTAA
ATGGAATGGTCGGACAGCTCCTAAGTGTTGGCAAGCCTCCACAACAGTGAGTCTCCGTTA
TAGACCAAAAGCTCATGGAGAATCAAAAACGCTCTTCTTTCTTCTTCTTAAAGTTTTAAG
CCAATCTTAATTGTTTTTGTTGTCAAACAAAGAAAGTTGCATCATATTTTTTTGGCGTTT
ATTTGGATAAATTATGCAATTCTCTGAGACTTTATTTATAAGAGATGAGATGAAAGGAAA
TAACAGATT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2B466TF 609 0 0
GGGTAAGAGAAAAGAGGGAGACAGAACATAAGCTTTGTTCTTCATTTTTTTGAGAAAGTA
AAGATCTTTGTGTGTTAAATTCAAGTATTGGATTATTAAAGTTTCGATCTTTTCACGAAT
CTTAAACTTTGTTTTCAGATATTGCTAAGATGTCTACTCCCAGTCCAATTCCCGCCGGCA
TTACCAAGGATCAGGCGTTTAACATGGCACAAACGGAGATGGAATATCGTGTGGAACTCT
TCAACAAGCTTGCTCAAACATGCTTTGTTAAATGTGTGGATAAAAGGTACAAGGAAGCTG
AGTTAAACATGGGTGAAAACAGTTGTATTGACCGTTGTGTTCCCAAGTACTGGCAGGTAA
ATGGAATGGTCGGACAGCTCCTAAGTGTTGGCAAGCCTCCACAACAGTGAGTCTCCGTTA
TAGACCAAAAGCTCATGGAGAATCAAAAACGCTCTTCTTTCTTCTTCTTAAAGTTTTAAG
CCAATCTTAATTGTTTTTGTTGTCAAACAAAGAAAGTTGCATCATATTTTTTTGGCGTTT
ATTTGGATAAATTATGCAATTCTCTGAGACTTTATTTATAAGAGATGAGATGAAAGGAAA
TAACAGATT

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL6772Contig1 801 2 6 U
AGATGTTCAGAAGAACAATTGATGAGTTTCGATCTATTGCTCATAGATACATACATACAC
ACATCGTTCAAAAAAAAACATACATACACACAAATATATTATTACACATTCAAAACAAAA
ACAAAAACAAAATCAGAAAAAAGCCAAATAAAAGCAAGTGCTTCCATCTACTATGTCTCT
CCTCGCAATCAAACTTAACCAGCAGTTTCAAGTTTTGACGCTTAGTAAAACGGATATGAT
GTTGCTAATGACAGCCATAAAGAGGATGAAGCCTATGATCATGTTCATGAGATAGATATA
CGGTGGATTCTTGCGGGTTCTTCTGTCCACTGGTTCCTCTGTAATAAACCAGCCCATCTT
CTCTGTCTTCAACATAGATAATGATGCTGATGACTTCTTCTCCATGGATGCATTAATGAC
TTTAGACTTGCCTTCTTTCACCTCTAGTTTTGATGGTATGGTGCGCCGAGATTTCCGGGT
CTTTCCAATAATAGAAGTTTCTGCCGGAGGTTGAATATCTGTGACAGAGTCTTTCCTCAA
AGATGGAATCTCGTCTGCACTAGAGTGGAACTTCCCACTCAAACTATGAAAGCTATCTGG
ACTTGATGTTCCTTGGTAACTCGTTGCAGATATGGATTCAGCATCATCGCTATCACTGCT
ACAACCAACAATGATCCCTGTCAAAGCTTTCTTTGGCCTGCGATCGTTGCGGTGCTCTTG
CATTGTGATGTCTGGATCGCGTAGCACATCATCATAGTTCCCTCCGTTAAACTCAGCAGT
TCATTGATATGATCATCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F831JQ U 1
AF RR2D479JQ U 8
BS 1 233 RR2F831JQ
BS 234 234 RR2D479JQ
BS 235 487 RR2F831JQ
BS 488 488 RR2D479JQ
BS 489 700 RR2F831JQ
BS 701 801 RR2D479JQ

RD RR2F831JQ 701 0 0
AGATGTTCAGAAGAACAATTGATGAGTTTCGATCTATTGCTCATAGATACATACATACAC
ACATCGTTCAAAAAAAAACATACATACACACAAATATATTATTACACATTCAAAACAAAA
ACAAAAACAAAATCAGAAAAAAGCCAAATAAAAGCAAGTGCTTCCATCTACTATGTCTCT
CCTCGCAATCAAACTTAACCAGCAGTTTCAAGTTTTGACGCTTAGTAAAACGGGTATGAT
GTTGCTAATGACAGCCATAAAGAGGATGAAGCCTATGATCATGTTCATGAGATAGATATA
CGGTGGATTCTTGCGGGTTCTTCTGTCCACTGGTTCCTCTGTAATAAACCAGCCCATCTT
CTCTGTCTTCAACATAGATAATGATGCTGATGACTTCTTCTCCATGGATGCATTAATGAC
TTTAGACTTGCCTTCTTTCACCTCTAGTTTTGATGGTATGGTGCGCCGAGATTTCCGGGT
CTTTCCATTAATAGAAGTTTCTGCCGGAGGTTGAATATCTGTGACAGAGTCTTTCCTCAA
AGATGGAATCTCGTCTGCACTAGAGTGGAACTTCCCACTCAAACTATGAAAGCTATCTGG
ACTTGATGTTCCTTGGTAACTCGTTGCAGATATGGATTCAGCATCATCGCTATCACTGCT
ACAACCAACAATGATCCCTGTCAAAGCTTTCTTTGGCCTG
T

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2D479JQ 794 0 0
CAGAAGAACAATTGATGAGTTTCGATCTATTGCTCATAGATACATACATACACACATCGT
TCAAAAAAAAACATACATACACACAAATATATTATTACACATTCAAAACAAAAACAAAAA
CAAAATCAGAAAAAAGCCAAATAAAAGCAAGTGCTTCCATCTACTATGTCTCTCCTCGCA
ATCAAACTTCACCAGCAGTTTCAAGTTTTGACGCTTAGTAAAACGGATATGATGTTGCTA
ATGACAGCCATAAAGAGGATGAAGCCTATGATCATGTTCATGAGATAGATATACGGTGGA
TTCTTGCGGGTTCTTCTGTCCACTGGTTCCTCTGTAATAAACCAGTCCATCTTCTCTGTC
TTCAACATAGATAATGATGCTGATGACTTCTTCTCCATGGATGCATTAATGACTTTAGAC
TTGCCTTCTTTCACCTCTAGTTTTGATGGTATGGTGCGCCGAGATTTCCGGGTCTTTCCA
ATAATAGAAGTTTCTGCCGGAGGTTGAATATCTGTGACAGAGTCTTTCCTCAAAGATGGA
ATCTCGTCTGCACTAGAGTGGAACTTCCCACTCAAACTATGAAAGCTATCTGGACTTGAT
GTTCCTTGGTAACTCGTTGCAGATATGGATTCAGCATCATCGCTATCACTGCTACAACCA
ACAATGATCCCTGTCAAAGCTTTCTTTGGCCTGCGATCGTTGCGGTGCTCTTGCATTGTG
ATGTCTGGATCGCGTAGCACATCATCATAGTTCCCTCCGTTAAACTCAGCAGTTCATTGA
TATGATCATCATCC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL6773Contig1 781 2 4 U
GGACAGAACTCTCTAATATAGGGGAAAAAAATCAAAAGAAAGTGAAAGAAGTAGTATTAA
TTAAAGAGAGAGATGGGAAACAGTCTAAGGTGTTGTCTAGCTTGTGTTCTTCCATGTGGA
GCGCTGGACTTGATCAGGTTCGTCCATCTAAACGGCCACGTTGACGAGATCACACGGTCA
ATAACCGCCGGAGAGATCCTCCAAGCAAACCCAAACCATGTCCTAAGCAAACCATGTTCT
CAAGGAGTTGTCCGCAAGATCTTGATCTTGTCGCCTGAATCCGAGCTCAAGCGAGGAAGT
ATCTATTTTCTCATCCCTGATTCTTCCTTGCCGGAGAAGAAAAGAAGGAGAAAAGACGGT
CACAAGACTCTCAACAACAACCCTAGCGCTCCCCTCGGACAAGTTAAACATGGTGATCAG
CAGTGTGTGAAACTGAATGAGAAGTACTTAGAAGAAGTTGCGTCGTCGACGTCAAATGGT
AAAGAACACCGTCATCGCCAGCGGCACAGCAGATCGGCGTCGGTATCCTCGTGGCGGCCT
CACCTTGACAGTATCACTGAGGATCTTAATTAATTACTCTTCCCTTTACCTCTCTCTCGC
TCTTTTTTTTTCTAACCAATGGCCAGATTCTTATTTTGGAGAGATTTTTTTTTTTTGTGT
GTGGAAAATCTCACGAGAGGAATTATATAATGTGGATAAGTTACATATGTGTTAAAATGG
TGGTGTAATTTCGTGTCACGAAGCATGATTATTTTCAATGGATAAACATCGATTCATCGT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2GU27TF U 1
AF RR2GU27JQB C 468
BS 1 610 RR2GU27TF
BS 611 611 RR2GU27JQB
BS 612 697 RR2GU27TF
BS 698 781 RR2GU27JQB

RD RR2GU27TF 697 0 0
GGACAGAACTCTCTAATATAGGGGAAAAAAATCAAAAGAAAGTGAAAGAAGTAGTATTAA
TTAAAGAGAGAGATGGGAAACAGTCTAAGGTGTTGTCTAGCTTGTGTTCTTCCATGTGGA
GCGCTGGACTTGATCAGGTTCGTCCATCTAAACGGCCACGTTGACGAGATCACACGGTCA
ATAACCGCCGGAGAGATCCTCCAAGCAAACCCAAACCATGTCCTAAGCAAACCATGTTCT
CAAGGAGTTGTCCGCAAGATCTTGATCTTGTCGCCTGAATCCGAGCTCAAGCGAGGAAGT
ATCTATTTTCTCATCCCTGATTCTTCCTTGCCGGAGAAGAAAAGAAGGAGAAAAGACGGT
CACAAGACTCTCAACAACAACCCTAGCGCTCCCCTCGGACAAGTTAAACATGGTGATCAG
CAGTGTGTGAAACTGAATGAGAAGTACTTAGAAGAAGTTGCGTCGTCGACGTCAAATGGT
AAAGAACACCGTCATCGCCAGCGGCACAGCAGATCGGCGTCGGTATCCTCGTGGCGGCCT
CACCTTGACAGTATCACTGAGGATCTTAATTAATTACTCTTCCCTTTACCTCTCTCTCGC
TCTTTTTTTT*CTAACCAATGGCCAGATTCTTATTTTGGAGAGATTTTTTTTTTTTGTGT
GTGGAAAATCTCACGAGAGGAATTATATAATGTGGAT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2GU27JQB 314 0 0
GACGTCAAATGGTAAAGAACACCGTCATCGCCAGCGGCACAGCAGATCGGCGTCGGTATC
CTCGTGGCGGCCTCACCTTGACAGTATCACTGAGGATCTTAATTAATTACTCTTCCCTTT
ACCTCTCTCTCGCTCTTTTTTTTTCTAACCAATGGCCAGATTCTTATTTTGGAGAGATTT
TTTTTTTTTGTGTGTGGAAAATCTCACGAGAGGAATTATATAATGTGGATAAGTTACATA
TGTGTTAAAATGGTGGTGTAATTTCGTGTCACGAAGCATGATTATTTTCAATGGATAAAC
ATCGATTCATCGTC

QA 1 314 1 314
DS 



AS 1 2

CO CL6774Contig1 832 2 4 U
GGATAGAGTAAGTTTCTTGTACTCTCCAATCTCTTCTTCCCACAAAAATGATAACACCAC
AATCAACAGCAATAATACCAATTACGGTCCTGGTTACAATAATACTCATAACAACAATCA
TCAACAACACATGTTATTCCCACATATGAGCTCTCTTCTTCCTCAAACGACGACTGAGAA
TTGTTTCCGATCCGATCATGATCAGCCTCCCAACGCATCTGTTAAATCAGAAGCAAGCTC
CTCAAGAATCAATCACTACTCTATGTTGATGAAAGCAATCCACAATACTCAAGAAGATAA
CAACAACAACAACAATGATACGGAATCCATGAAAGCTAAGATAATCGCTCATCCCCACTA
CCCCACCCTCCTACACGCCTACTTAGACTGCCAGAAGATTGGAGCACCACCTGAGGTAGT
TGATAAAATTACGGCGGCAAGGAAAGAGTTCGAGGCGAGGCAGCAGCGGCCAATAGCGTC
CGTGACTGCGCTGTCTAGAGACCCTGAATTGGATCAATTTATGGAAGCATACTGTGACAT
GCTGGTCAAATATCAAGAGGAGCTAACACGGCCCATTGAAGAAGCAATGGAGTATATACG
ACGTATTGAATCTCAAATTAGCATGTTGTGTCAGGGTCCCATTCACATCCTCAACAATCC
TGATGGGAAAAGTGAAGGAATGGAATCATCAGACGAAGAGCAAGAGAATAATAACAGTGG
AGGGGAAGCAGAATTACCGGAAATAGACCCGAGGGCGGAAGATCGGGAACTCAAGAATCA
CTTGCTGAAGAAGTATAGTGGATACTTGAGCAGTCTAAAGCAAGAACTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR43TF U 1
AF RR2GR43JQ C 384
BS 1 653 RR2GR43TF
BS 654 654 RR2GR43JQ
BS 655 667 RR2GR43TF
BS 668 832 RR2GR43JQ

RD RR2GR43TF 667 0 0
GGATAGAGTAAGTTTCTTGTACTCTCCAATCTCTTCTTCCCACAAAAATGATAACACCAC
AATCAACAGCAATAATACCAATTACGGTCCTGGTTACAATAATACTCATAACAACAATCA
TCAACAACACATGTTATTCCCACATATGAGCTCTCTTCTTCCTCAAACGACGACTGAGAA
TTGTTTCCGATCCGATCATGATCAGCCTCCCAACGCATCTGTTAAATCAGAAGCAAGCTC
CTCAAGAATCAATCACTACTCTATGTTGATGAAAGCAATCCACAATACTCAAGAAGATAA
CAACAACAACAACAATGATACGGAATCCATGAAAGCTAAGATAATCGCTCATCCCCACTA
CCCCACCCTCCTACACGCCTACTTAGACTGCCAGAAGATTGGAGCACCACCTGAGGTAGT
TGATAAAATTACGGCGGCAAGGAAAGAGTTCGAGGCGAGGCAGCAGCGGCCAATAGCGTC
CGTGACTGCGCTGTCTAGAGACCCTGAATTGGATCAATTTATGGAAGCATACTGTGACAT
GCTGGTCAAATATCAAGAGGAGCTAACACGGCCCATTGAAGAAGCAATGGAGTATATACG
ACGTATTGAATCTCAAATTAGCATGTTGTGTCAGGGTCCCATTCACATCCTCA*CAATCC
TGATGGG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2GR43JQ 449 0 0
TAGACTGCCAGAAGATTGGAGCACCACCTGAGGTAGTTGATAAAATTACGGCGGCAAGGA
AAGAGTTCGAGGCGAGGCAGCAGCGGCCAATAGCGTCCGTGACTGCGCTGTCTAGAGACC
CTGAATTGGATCAATTTATGGAAGCATACTGTGACATGCTGGTCAAATATCAAGAGGAGC
TAACACGGCCCATTGAAGAAGCAATGGAGTATATACGACGTATTGAATCTCAAATTAGCA
TGTTGTGTCAGGGTCCCATTCACATCCTCAACAATCCTGATGGGAAAAGTGAAGGAATGG
AATCATCAGACGAAGAGCAAGAGAATAATAACAGTGGAGGGGAAGCAGAATTACCGGAAA
TAGACCCGAGGGCGGAAGATCGGGAACTCAAGAATCACTTGCTGAAGAAGTATAGTGGAT
ACTTGAGCAGTCTAAAGCAAGAACTCTCC

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 2

CO CL6775Contig1 705 2 3 U
TTTTTTTTTGTAAAATAAAATTTATTTATTCATTAAGGTTAAATATGGTTTACAAATATG
AATCAGTTTACAATAAACCAAAGTTAAAAAGTAAACCCAAAAAAAAATTCTAAACCTAAT
GTCTCCGCCGCTAATGACCACCACCAATCTCTGTCGCTCTCCACCACGACCACAACTTCT
TCTTCTTCTCCACTGTGCTTGTCATCTGCCGTATCCAACCATGAATTTCGTCGTCTTCTT
CTTCTCCTAGCCCAGCTTCCGTTACTACACCTTCGGCTTCACCGCCTCCACCGTAGCCTC
AGCGCTGTCTCCACTTCTGGCTTCACCTTGTCACCACTCTCTATGATTCCGACTTCTCCG
CTTCCAGCCAATCTCTCATTCCTCGCATCAGATCCTGAATTGATGGTGGTCCTTGAGAAA
ACTCCATCTTCTTCATGAATCTGCATCAGAAAAAGAAGAAGCTTTGATAAGAGAATAGAT
AAGAAAGGTTGAGACAGATTTGGTGGTGATGGTTGAAACAGAGTTCATTAGCGGAGATAG
ATAACGAGGAGGTGGGGATTAAGATGATGGTGGCAGCGATGGAGGTTATGGTGATGGTGG
CTGAGACAGATTTATTGGCCGAGGTAGAGAATGAGGAGACAGATATGATGATGATGGTGG
TGGCTGTGAGAGATTTTGTTTATGGGATAATTTTTTTAAAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF46TF C 1
AF RR2EF46JQ U 10
BS 1 9 RR2EF46TF
BS 10 691 RR2EF46JQ
BS 692 705 RR2EF46TF

RD RR2EF46TF 705 0 0
TTTTTTTTTGTAAAATAAAATTTATTTATTCATTAAGGTTAAATATGGTTTACAAATATG
AATCAGTTTACAATAAACCAAAGTTAAAAAGTAAACCCAAAAAAAAATTCTAAACCTAAT
GTCTCCGCCGCTAATGACCACCACCAATCTCTGTCGCTCTCCACCACGACCACAACTTCT
TCTTCTTCTCCACTGTGCTTGTCATCTGCCGTATCCAACCATGAATTTCGTCGTCTTCTT
CTTCTCCTAGCCCAGCTTCCGTTACTACACCTTCGGCTTCACCGCCTCCACCGTAGCCTC
AGCGCTGTCTCCACTTCTGGCTTCACCTTGTCACCACTCTCTATGATTCCGACTTCTCCG
CTTCCAGCCAATCTCTCATTCCTCGCATCAGATCCTGAATTGATGGTGGTCCTTGAGAAA
ACTCCATCTTCTTCATGAATCTGCATCAGAAAAAGAAGAAGCTTTGATAAGAGAATAGAT
AAGAAAGGTTGAGACAGATTTGGTGGTGATGGTTGAAACAGAGTTCATTAGCGGAGATAG
ATAACGAGGAGGTGGGGATTAAGATGATGGTGGCAGCGATGGAGGTTATGGTGATGGTGG
CTGAGACAGATTTATTGGCCGAGGTAGAGAATGAGGAGACAGATATGATGATGATGGTGG
TGGCTGTGAGAGATTTTGTTTATGGGATAATTTTTTTAAAGATCC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2EF46JQ 682 0 0
GTAAAATAAAATTTATTTATTCATTAAGGTTAAATATGGTTTACAAATATGAATCAGTTT
ACAATAAACCAAAGTTAAAAAGTAAACCCAAAAAAAAATTCTAAACCTAATGTCTCCGCC
GCTAATGACCACCACCAATCTCTGTCGCTCTCCACCACGACCACAACTTCTTCTTCTTCT
CCACTGTGCTTGTCATCTGCCGTATCCAACCATGAATTTCGTCGTCTTCTTCTTCTCCTA
GCCCAGCTTCCGTTACTACACCTTCGGCTTCACCGCCTCCACCGTAGCCTCAGCGCTGTC
TCCACTTCTGGCTTCACCTTGTCACCACTCTCTATGATTCCGACTTCTCCGCTTCCAGCC
AATCTCTCATTCCTCGCATCAGATCCTGAATTGATGGTGGTCCTTGAGAAAACTCCATCT
TCTTCATGAATCTGCATCAGAAAAAGAAGAAGCTTTGATAAGAGAATAGATAAGAAAGGT
TGAGACAGATTTGGTGGTGATGGTTGAAACAGAGTTCATTAGCGGAGATAGATAACGAGG
AGGTGGGGATTAAGATGATGGTGGCAGCGATGGAGGTTATGGTGATGGTGGCTGAGACAG
ATTTATTGGCCGAGGTAGAGAATGAGGAGACAGATATGATGATGATGGTGGTGGCTGTGA
GAGATTTTGTTTATGGGATAAT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6777Contig1 655 2 4 U
TTTTTTGGAGCTCTAGGTACTATGGACGACCTTAATATTCTTGATCGATCACCTGTTTTT
GATGACATTATTAACGGAATAGCTCCGCAAGTCAACTTCTACGTCAACGGAAGGGAGTGT
CATTTGGCTTACTATCTCACAGATGATATTTATCCAAAATGGGCGAATTTTATTTAATCT
ATCCAACTACCACAGGGTCCGAAAAATTCATTATTTGCTAAAACCCAAGAATATGTGCGA
AAAGATGTTGAGTGTGCCTTTGTAGTCCTGCAAGCTAGATTCGCCGTTGTTAAAAATCCA
TCTAATTTATGGGATAAAAAATAGCAAATATTATGAAAGCATGTATCATACTCCATAATA
TGATTATCGAAGATGAACGAGGATCATACACTCTCCGTAACATTTCAGAATTTAATGAAG
GAGTAGGAGAAGGAGAAGGTGTGGAGCGTTCATATTCCGTCGGTTCGGGTTCAAATCTCG
GCAATACAATTGATCCTCGGAAAAGAATTCGGGATAAACAAGCCCATCAGCGATTAAAAA
ATGATTTGATCGAAAATATATGGAATAAATTTGGACATCCTCCAAATAACATATAATTTA
TTTTTAAGTTTGTAATTTTCATATGTTTTCAATTTTAATGTTAAACTTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM60TF U 1
AF RR2FM60JQ C 370
BS 1 635 RR2FM60TF
BS 636 636 RR2FM60JQ
BS 637 648 RR2FM60TF
BS 649 655 RR2FM60JQ

RD RR2FM60TF 655 0 0
TTTTTTGGAGCTCTAGGTACTATGGACGACCTTAATATTCTTGATCGATCACCTGTTTTT
GATGACATTATTAACGGAATAGCTCCGCAAGTCAACTTCTACGTCAACGGAAGGGAGTGT
CATTTGGCTTACTATCTCACAGATGATATTTATCCAAAATGGGCGAATTTTATTTAATCT
ATCCAACTACCACAGGGTCCGAAAAATTCATTATTTGCTAAAACCCAAGAATATGTGCGA
AAAGATGTTGAGTGTGCCTTTGTAGTCCTGCAAGCTAGATTCGCCGTTGTTAAAAATCCA
TCTAATTTATGGGATAAAAAATAGCAAATATTATGAAAGCATGTATCATACTCCATAATA
TGATTATCGAAGATGAACGAGGATCATACACTCTCCGTAACATTTCAGAATTTAATGAAG
GAGTAGGAGAAGGAGAAGGTGTGGAGCGTTCATATTCCGTCGGTTCGGGTTCAAATCTCG
GCAATACAATTGATCCTCGGAAAAGAATTCGGGATAAACAAGCCCATCAGCGATTAAAAA
ATGATTTGATCGAAAATATATGGAATAAATTTGGACATCCTCCAAATAACATATAATTTA
TTTTTAAGTTTGTAATTTTCATATGTTTTCAATTT*AATGTTAAACTT
CTCTTTT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2FM60JQ 286 0 0
AAGATGAACGAGGATCATACACTTTCCGTAACATTTCAGAATTTAATGAAGGAGTAGGAG
AAGGGGAAGGTGTGGGGCGTTCATATTCCGTCGGTTGGGGTTCAAATTTCGGCAATACAA
TTGATCCTCGGAAAAGAATTCGGGATAAACAAGCCCCTCAGGGATTAAAAAATGATTTGA
TCGAAAATATATGGAATAAATTTGGACATCCTCCAAATAACATATAATTTATTTTTAAGT
TTGTAATTTTCATATGTTTTCAATTTTAATGTTAAACTTTTTTTTT

QA 1 286 1 286
DS 



AS 1 2

CO CL6778Contig1 886 2 2 U
GGAAGTTAGAAGCAGAGAAAGATGCACTGAGACTTGAGCTTGAAGGCATAGTTTGTGCCA
AAGTGGAGGTGGAGAACAAGTTGGAGAAGGTGGAGGTTGAGAAAGCTGAGCTGCAGATAT
CTTATGACGTAATCAAAGACAAGTACAAAGAATCTCAAGTTTGTCTACAAGATATTGAGA
CAAAGCTAGATAGATACAGAAAGAGATGAAACTGGCTAATGAGTTAAAAACAGAAGTTGA
GACACAGATAGAATCCATGGAAGCAGAGGCAGAGGGTAATCAGGCGAAGATTGAGTGTTT
GGAAGAAGAGGTGAGGAAGGAGAGGTTAGCTTCTGATGAGCTTAGAAGAAAATGTGAGGC
TCTTGAAGAAGAAGTCACTCTCCATCAAGAAAACGCTATAGAACCACCCAAGATCAAACA
GGAAGACATGGCAACAGCTGCAGGGAAACTAGCGAACTGTCAGAAGACAATAGCTTCGTT
GGGGAAACAGTTACAGTCTCTGGCAACGCTTGAAGACTTCTTGGTCGATACAGCGAGCAT
TCCAGTGGCTGCTACTAATGGTGTAAGCAACAGCACAGAGAGTTGGAGAGTACACAAGAA
TGATACTTACATGGCAAGCATGAAACCTACCAAAGAAACATCATCTTCTGATGCTGCTTC
ATCAATGAACAGAGGGAGTTCTGAGAAGAACCGGAATGGATTTGCCAAAGTGTTTACTCG
GAGTAAAGATGGGATACATTTGGTGATTTAGCAATAACTTTCGTTGGCACTAGGCAAGAG
GAAACAATCTGTTAGGTTTAAAAAGAGTTAAAAACACCTCTTTTGTATGTTCCATTTCCA
GATTTTGAAATTGGTTTTGTAGTTTAATGATAGTGTTATGCAGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F770TF U 1
AF RR2F770JQ C 152
BS 1 771 RR2F770TF
BS 772 886 RR2F770JQ

RD RR2F770TF 771 0 0
GGAAGTTAGAAGCAGAGAAAGATGCACTGAGACTTGAGCTTGAAGGCATAGTTTGTGCCA
AAGTGGAGGTGGAGAACAAGTTGGAGAAGGTGGAGGTTGAGAAAGCTGAGCTGCAGATAT
CTTATGACGTAATCAAAGACAAGTACAAAGAATCTCAAGTTTGTCTACAAGATATTGAGA
CAAAGCTAGATAGATACAGAAAGAGATGAAACTGGCTAATGAGTTAAAAACAGAAGTTGA
GACACAGATAGAATCCATGGAAGCAGAGGCAGAGGGTAATCAGGCGAAGATTGAGTGTTT
GGAAGAAGAGGTGAGGAAGGAGAGGTTAGCTTCTGATGAGCTTAGAAGAAAATGTGAGGC
TCTTGAAGAAGAAGTCACTCTCCATCAAGAAAACGCTATAGAACCACCCAAGATCAAACA
GGAAGACATGGCAACAGCTGCAGGGAAACTAGCGAACTGTCAGAAGACAATAGCTTCGTT
GGGGAAACAGTTACAGTCTCTGGCAACGCTTGAAGACTTCTTGGTCGATACAGCGAGCAT
TCCAGTGGCTGCTACTAATGGTGTAAGCAACAGCACAGAGAGTTGGAGAGTACACAAGAA
TGATACTTACATGGCAAGCATGAAACCTACCAAAGAAACATCATCTTCTGATGCTGCTTC
ATCAATGAACAGAGGGAGTTCTGAGAAGAACCGGAATGGATTTGCCAAAGTGTTTACTCG
GAGTAAAGATGGGATACATTTGGTGATTTAGCAATAACTTTCGTTGGCACT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2F770JQ 735 0 0
ATCTCAAGTTTGTCTACAAGATATTGAGACAAAGCTAGATAGATACAGAAAGAGATGAAA
CTGGCTAATGAGTTAAAAACAGAAGTTGAGACACAGATAGAATCCATGGAAGCAGAGGCA
GAGGGTAATCAGGCGAAGATTGAGTGTTTGGAAGAAGAGGTGAGGAAGGAGAGGTTAGCT
TCTGATGAGCTTAGAAGAAAATGTGAGGCTCTTGAAGAAGAAGTCACTCTCCATCAAGAA
AACGCTATAGAACCACCCAAGATCAAACAGGAAGACATGGCAACAGCTGCAGGGAAACTA
GCGAACTGTCAGAAGACAATAGCTTCGTTGGGGAAACAGTTACAGTCTCTGGCAACGCTT
GAAGACTTCTTGGTCGATACAGCGAGCATTCCAGTGGCTGCTACTAATGGTGTAAGCAAC
AGCACAGAGAGTTGGAGAGTACACAAGAATGATACTTACATGGCAAGCATGAAACCTACC
AAAGAAACATCATCTTCTGATGCTGCTTCATCAATGAACAGAGGGAGTTTTGAGAAGAAC
CGGAATGGATTTGCCAAAGTGTTTACTCGGAGTAAAGATGGGATACATTTGGTGATTTAG
CAATAACTTTCGTTGGCACTAGGCAAGAGGAAACAATCTGTTAGGTTTAAAAAGAGTTAA
AAACACCTCTTTTGTATGTTCCATTTCCAGATTTTGAAATTGGTTTTGTAGTTTAATGAT
AGTGTTATGCAGAGG

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL6779Contig1 958 2 2 U
GGGGTCGCCGTTTGATCTTCCGCTTCTTCTCGGCGCATCTCTGGAAGAAAGAAAGGAAAA
AAATGGCGACTTCGCGGTTACAGATGGAAGGAGATGACTCTGTACTTTTGCACGTTACTC
ACTCCAACCTCAAGAGCTTCGCTGCCGATGTTCGTTTCTCTCCGCAAATGAATGTGGAAG
CTGTGAAAGAAAAGCTATGGAAAAAATGTGGGACATCTGTGAATGCTATGGCTTTAGAGC
TTTATGATGAAAGTGGGTCAAAGGTTGCACTTCTCAGTGATGATTCAAGACCACTCGGTT
TCTACTCCCCTTTTGATGGGTTTCGGTTGCACATAGTTGATCTTGACCCCTCCTCTGTCA
CAACTGGAGGATGGCTTGAAGATACTTCATTGGTTGAGAAGTATACTATCTCAGAAGAGG
ACTATGCTAAACGAACTGACAGCTTTAGGAAATTCAAAGAAAAACGGGTGTCTCAGAATC
CTGCTGCTTCTGAGGTTAAGACCAAGGAGGACTTCATGGAAGATCTCTGTGCAAATATTA
AGGTGGGAGATAGATGCCAAGTTGAGCCCGGGGAGAAAAGAGGAGTGGTCAAATACGTTG
GACGAGCAGAGTCGTTGGGTCCTGGCTATTGGTTTGGAATCCAGTATGATGAACCCCTTG
GCAAACACGATGGCATGGTGAAAGGAACAAGATTATTTGAATGCCCTCAGCTTCATGGTG
GTGTGGTCCGGCCAGACAAAGTAAAGGTTGGCGATTATCCCGAAAGAGACCCCTTCGAGG
AAGATGAAATATAAGACAGCTTTCAAACCACAGCGAAATGAGTTTGCAAGATTTGCTTTG
TATTTGCTTTTGTACCTCTTTGTTTTGGATTTCAAAAGATTTGGTGAAACACTAAAATAC
AACAACAGTTTTAAGTATTCAACTTTGATGAAGATTAAATAACTAATAAGATTCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE80TF U 1
AF RR2CE80JQ C 141
BS 1 680 RR2CE80TF
BS 681 958 RR2CE80JQ

RD RR2CE80TF 680 0 0
GGGGTCGCCGTTTGATCTTCCGCTTCTTCTCGGCGCATCTCTGGAAGAAAGAAAGGAAAA
AAATGGCGACTTCGCGGTTACAGATGGAAGGAGATGACTCTGTACTTTTGCACGTTACTC
ACTCCAACCTCAAGAGCTTCGCTGCCGATGTTCGTTTCTCTCCGCAAATGAATGTGGAAG
CTGTGAAAGAAAAGCTATGGAAAAAATGTGGGACATCTGTGAATGCTATGGCTTTAGAGC
TTTATGATGAAAGTGGGTCAAAGGTTGCACTTCTCAGTGATGATTCAAGACCACTCGGTT
TCTACTCCCCTTTTGATGGGTTTCGGTTGCACATAGTTGATCTTGACCCCTCCTCTGTCA
CAACTGGAGGATGGCTTGAAGATACTTCATTGGTTGAGAAGTATACTATCTCAGAAGAGG
ACTATGCTAAACGAACTGACAGCTTTAGGAAATTCAAAGAAAAACGGGTGTCTCAGAATC
CTGCTGCTTCTGAGGTTAAGACCAAGGAGGACTTCATGGAAGATCTCTGTGCAAATATTA
AGGTGGGAGATAGATGCCAAGTTGAGCCCGGGGAGAAAAGAGGAGTGGTCAAATACGTTG
GACGAGCAGAGTCGTTGGGTCCTGGCTATTGGTTTGGAATCCAGTATGATGAACCCCTTG
GCAAACACGATGGCATGGTG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2CE80JQ 818 0 0
GCTGCCGATGTTCGTTTCTCTCCGCAAATGAATGTGGAAGCTGTGAAAGAAAAGCTATGG
AAAAAATGTGGGACATCTGTGAATGCTATGGCTTTAGAGCTTTATGATGAAAGTGGGTCA
AAGGTTGCACTTCTCAGTGATGATTCAAGACCACTCGGTTTCTACTCCCCTTTTGATGGG
TTTCGGTTGCACATAGTTGATCTTGACCCCTCCTCTGTCACAACTGGAGGATGGCTTGAA
GATACTTCATTGGTTGAGAAGTATACTATCTCAGAAGAGGACTATGCTAAACGAACTGAC
AGCTTTAGGAAATTCAAAGAAAAACGGGTGTTTCAGAATCCTGCTGCTTCTGAGGTTAAG
ACCAAGGAGGACTTCATGGAAGATCTCTGTGCAAATATTAAGGTGGGAGATAGATGCCAA
GTTGAGCCCGGGGAGAAAAGAGGAGTGGTCAAATACGTTGGACGAGCAGAGTCGTTGGGT
CCTGGCTATTGGTTTGGAATCCAGTATGATGAACCCCTTGGCAAACACGATGGCATGGTG
AAAGGAACAAGATTATTTGAATGCCCTCAGCTTCATGGTGGTGTGGTCCGGCCAGACAAA
GTAAAGGTTGGCGATTATCCCGAAAGAGACCCCTTCGAGGAAGATGAAATATAAGACAGC
TTTCAAACCACAGCGAAATGAGTTTGCAAGATTTGCTTTGTATTTGCTTTTGTACCTCTT
TGTTTTGGATTTCAAAAGATTTGGTGAAACACTAAAATACAACAACAGTTTTAAGTATTC
AACTTTGATGAAGATTAAATAACTAATAAGATTCTTAC

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL6780Contig1 823 2 2 U
GAGACATGTCGAAGCCAAATGCAAGGAACTACCATTCAGCAGCTTTGTCTATCCAGAAGA
AGTACCGTGGCTATAAAGGTCGAAAGAGTTTCTGACAAAGCGCGAGGAAGCTGTCATAAT
ACAGGCGCATGTTCGAGGTTACCAAACGAGGAAGCAGTACAAGGTGATCTGCTGGGCGGT
AGGGGTTCTAGATAAGGTAATACTGAGGTGGAGAAGAAAAGTTGTTGGACTAAAAGGGTT
CAGGCAAGACGTAGAAAGTGGAGAGGAGAGCGAAGATGAGGACATTCTGAGAGTGTTTCG
TAAGCAGAAAGTAGATGGTACAGTGAACGAGGCTTTCTCTCGTGTTCTGTCTATGACTCG
TTCTCAAGAGTCTCGCCAGCAGTACCACCGTGTGCTCACGGGATACTGTAAAAAAAAGGC
TGAGCTTGGGAAAACAGAGACATTAGGAACAGGTGGAAGTGGTGGTGGTTATGAGGATGA
TGATGATGAAGATGCGTTATTCGACATAGCTGATATGGAATATGATCATTTGTTTGCACT
GCCTTGAGAGGGAAAGCCATGCAACAACAAGGACAAATGTGGATTTAGAGATTTTAATAA
TTAAGTCTGTAGATTTGTAAAGTTTCAAGAGTGGAAGTAGTTTTATAGAATTGCAATGGG
AGAAGAAGAAGCTGTTATTAGTAGTGAGCGGACTGTAAGTGATCTCTATTGTGGCCAACT
TTGATACAAATTTGGAAGCATTGTTTCTTTTTGTAAAAGAAAAAAAAAAACAAAGTAAAC
GCAAAAGAAATTGCTTAAAATACAAGTTCCTGTGACTGTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV95TF U 1
AF RR2GV95JQB C 354
BS 1 751 RR2GV95TF
BS 752 823 RR2GV95JQB

RD RR2GV95TF 753 0 0
GAGACATGTCGAAGCCAAATGCAAGGAACTACCATTCAGCAGCTTTGTCTATCCAGAAGA
AGTACCGTGGCTATAAAGGTCGAAAGAGTTTCTGACAAAGCGCGAGGAAGCTGTCATAAT
ACAGGCGCATGTTCGAGGTTACCAAACGAGGAAGCAGTACAAGGTGATCTGCTGGGCGGT
AGGGGTTCTAGATAAGGTAATACTGAGGTGGAGAAGAAAAGTTGTTGGACTAAAAGGGTT
CAGGCAAGACGTAGAAAGTGGAGAGGAGAGCGAAGATGAGGACATTCTGAGAGTGTTTCG
TAAGCAGAAAGTAGATGGTACAGTGAACGAGGCTTTCTCTCGTGTTCTGTCTATGACTCG
TTCTCAAGAGTCTCGCCAGCAGTACCACCGTGTGCTCACGGGATACTGTAAAAAAAAGGC
TGAGCTTGGGAAAACAGAGACATTAGGAACAGGTGGAAGTGGTGGTGGTTATGAGGATGA
TGATGATGAAGATGCGTTATTCGACATAGCTGATATGGAATATGATCATTTGTTTGCACT
GCCTTGAGAGGGAAAGCCATGCAACAACAAGGACAAATGTGGATTTAGAGATTTTAATAA
TTAAGTCTGTAGATTTGTAAAGTTTCAAGAGTGGAAGTAGTTTTATAGAATTGCAATGGG
AGAAGAAGAAGCTGTTATTAGTAGTGAGCGGACTGTAAGTGATCTCTATTGTGGCCAACT
TTGATACAAATTTGGAAGCATTGTTTCTTTT
GT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2GV95JQB 470 0 0
TGACTCGTTCTCAAGAGTCTCGCCAGCAGTACCCCCGTGTGCTCACGGGATACTGTAAAA
AAAAGGCTGAGCTTGGGAAAACAGAGACATTAGGAACAGGTGGAAGTGGTGGTGGTTATG
AGGATGATGATGATGAAGATGCGTTATTCGACATAGCTGATATGGAATATGATCATTTGT
TTGCACTGCCTTGAGAGGGAAAGCCATGCAACAACAAGGACAAATGTGGATTTAGAGATT
TTAATAATTAAGTCTGTAGATTTGTAAAGTTTCAAGAGTGGAAGTAGTTTTATAGAATTG
CAATGGGAGAAGAAGAAGCTGTTATTAGTAGTGAGCGGACTGTAAGTGATCTCTATTGTG
GCCAACTTTGATACAAATTTGGAAGCATTGTTTCTTTTTGTAAAAGAAAAAAAAAAACAA
AGTAAACGCAAAAGAAATTGCTTAAAATACAAGTTCCTGTGACTGTTGCG

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 2

CO CL6781Contig1 490 2 2 U
CCAAGGTAACAGCTGCTGCTGAACCAAACTTCCCACCTTTCATCTCCGGACGCATCTGCG
CACTTCCAGACGAAGAAGAAGTACCTAACTCGCCGCTGAATTGCAGCTGTAAGCAGCGTT
CGAGACCTGAGACTGAATCTCCGACGGAATCGATAAGAGAAGAGGAGGAGGAAGCTCTGA
TGAAGCAGCCGCTACGACGGAGCTTACAAGGGAGAGTGGAGATAGGGCGAGGAGGGATGG
GTAAAGAGGGTTTGAGTGGAGATAAGGGTTTTGGAGCGACGACGCTGCTCTGAAACACCA
TATGAGACATGGCTTTCCCAGTTTGAAGACTCAACCTTTGAATTCTGTTTTGGGTGGTTA
TTTTCTTGGAAGAAAAAGGCGGCAGAAAGCCTTTTCTTCTCTCTTTGGGGATGTCAGAAA
GATGAGAAAGGAGAAAAGGAGGTATCGCCCAATGAGACGACGATTATACAGAGAGCAAAC
CCAATCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CO65TF C 1
AF RR2CO65JQ U 82
BS 1 81 RR2CO65TF
BS 82 490 RR2CO65JQ

RD RR2CO65TF 490 0 0
CCAAGGTAACAGCTGCTGCTGAACCAAACTTCCCACCTTTCATCTCCGGACGCATCTGCG
CACTTCCAGACGAAGAAGAAGTACCTAACTCGCCGCTGAATTGCAGCTGTAAGCAGCGTT
CGAGACCTGAGACTGAATCTCCGACGGAATCGATAAGAGAAGAGGAGGAGGAAGCTCTGA
TGAAGCAGCCGCTACGACGGAGCTTACAAGGGAGAGTGGAGATAGGGCGAGGAGGGATGG
GTAAAGAGGGTTTGAGTGGAGATAAGGGTTTTGGAGCGACGACGCTGCTCTGAAACACCA
TATGAGACATGGCTTTCCCAGTTTGAAGACTCAACCTTTGAATTCTGTTTTGGGTGGTTA
TTTTCTTGGAAGAGAAAGGCGGCAGAGAGCCTTTTCTTCTCTCTTTGGGGATGTCAGAGA
GATGAGAAAGGAGAAGAGGAGGTATCGCCCAATGAGACGACGATTATACAGAGAGCAAAC
CCAATCTTCC

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR2CO65JQ 409 0 0
TACCTAACTCGCCGCTGAATTGCAGCTGTAAGCAGCGTTCGAGACCTGAGACTGAATCTC
CGACGGAATCGATAAGAGAAGAGGAGGAGGAAGCTCTGATGAAGCAGCCGCTACGACGGA
GCTTACAAGGGAGAGTGGAGATAGGGCGAGGAGGGATGGGTAAAGAGGGTTTGAGTGGAG
ATAAGGGTTTTGGAGCGACGACGCTGCTCTGAAACACCATATGAGACATGGCTTTCCCAG
TTTGAAGACTCAACCTTTGAATTCTGTTTTGGGTGGTTATTTTCTTGGAAGAAAAAGGCG
GCAGAAAGCCTTTTCTTCTCTCTTTGGGGATGTCAGAAAGATGAGAAAGGAGAAAAGGAG
GTATCGCCCAATGAGACGACGATTATACAGAGAGCAAACCCAATCTTCC

QA 1 409 1 409
DS 



AS 1 2

CO CL6782Contig1 1085 2 4 U
GGATACGAAATTGTCATAAAATAACGAGAATAGGAAAAGTCGAGAGCTCAAGAACAGCCG
TCAGTGTGCGTTACGTTCTCCGATGGTGGGCGCTTCTCGCCGCCACCGGAGTGATTTGTC
CTCTTGTATTTTGTTTCTTCTTCTCCTCTTTTTCATCTCCTCTTTGTTTTTCAACAGATC
TAGAAATTTTGGGGTTGGAACTTTTTAGATCTACAGATCTTGAATTGTTTCCCTTTTAGA
TTTCTGTTTCAGATGGTGCTGTTTTGGGTCAGTCTGGTTTGCTTTGGCTTGGCTTGTGCT
TCATCTTTTTATCCCATTTGTTGTCTGTTCCTTGACAGAGAGGTTGAAAATCTGAGACTT
TCTTGTTGGGTTTTTGTTTGTTCTCTGGGTTTTATTTCAGGAACGGTCTAAGTTGTGGTG
TGTTGATGGTGCGGTGGTGTTGATGGTGTAGTGGTGTGTGGTGTGTGGTAAGCAGAACAG
GTCAAACACCTTTGAGAAGAGAAGATTCAGGTTTCTTGTCGCCTCCATCTCTCTGCTATG
AGTTCTTCTCCTGGCCTTTTAATAAGTGTGTTTTCCGGGTTGTCGTTTGCGTCTCTCGTT
CCTCGGTGGCTTCTGTTGATGGAAGCATTATAAAGAGGTTGAGGCTTTTAGATTGTCCGA
TGAAGGTTCAGTTGAGAAGAGAGCTTTAGTCACAGGCGCTTGCTTGTTTGCTTCTCAAGT
TGGTTTTGGTGTTGGTCATTGTGGTTCTGGCTTGGTACCTGGAACTGAAGGTTCGGGTAA
GTTTAGCCTTGTTGCTGTGAAGGCTATTGCATCGTTACTATCTCTTGTCTGGCTCTCGGA
AGAGTTCCGGCTGGTTAAAACCAAGAGGTATCAGCACTATTCTCATTACCAAGGATTGTT
CATGGATTTGGATGTAAGAGTGAAGATTATTCTAGTGATCTTAGTAGTTGATGTATGGTA
CCTGTTGTTTAGGTTTGTGATTCCCTTTTGTGGGCTATGTTTCCAGGGATGTTAAGTTGT
TTCCGTCGGCATTTGGATTTCACCCTTGTATGTTTTTAAATTTCATCAATCAAATATCAG
TTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2BN88TF U 1
AF RR2BN88JQ C 237
BS 1 643 RR2BN88TF
BS 644 644 RR2BN88JQ
BS 645 664 RR2BN88TF
BS 665 1085 RR2BN88JQ

RD RR2BN88TF 668 0 0
GGATACGAAATTGTCATAAAATAACGAGAATAGGAAAAGTCGAGAGCTCAAGAACAGCCG
TCAGTGTGCGTTACGTTCTCCGATGGTGGGCGCTTCTCGCCGCCACCGGAGTGATTTGTC
CTCTTGTATTTTGTTTCTTCTTCTCCTCTTTTTCATCTCCTCTTTGTTTTTCAACAGATC
TAGAAATTTTGGGGTTGGAACTTTTTAGATCTACAGATCTTGAATTGTTTCCCTTTTAGA
TTTCTGTTTCAGATGGTGCTGTTTTGGGTCAGTCTGGTTTGCTTTGGCTTGGCTTGTGCT
TCATCTTTTTATCCCATTTGTTGTCTGTTCCTTGACAGAGAGGTTGAAAATCTGAGACTT
TCTTGTTGGGTTTTTGTTTGTTCTCTGGGTTTTATTTCAGGAACGGTCTAAGTTGTGGTG
TGTTGATGGTGCGGTGGTGTTGATGGTGTAGTGGTGTGTGGTGTGTGGTAAGCAGAACAG
GTCAAACACCTTTGAGAAGAGAAGATTCAGGTTTCTTGTCGCCTCCATCTCTCTGCTATG
AGTTCTTCTCCTGGCCTTTTAATAAGTGTGTTTTCCGGGTTGTCGTTTGCGTCTCTCGTT
CCTCGGTGGCTTCTGTTGATGGAAGCATTATAAAGAGGTTGAG*CTTTTAGATTGTCCGA
TGAA
TGTT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2BN88JQ 849 0 0
TTTAGATTCTG
TTCAGATGGTGCTGTTTTGGGTCAGTCTGGTTTGCTTTGGCTTGGCTTGTGCTTCATCTT
TTTATCCCATTTGTTGTCTGTTCCTTGACAGAGAGGTTGAAAATCTGAGACTTTCTTGTT
GGGTTTTTGTTTGTTCTCTGGGTTTTATTTCAGGAACGGTCTAAGTTGTGGTGTGTTGAT
GGTGCGGTGGTGTTGATGGTGTAGTGGTGTGTGGTGTGTGGTAAGCAGAACAGGTCAAAC
ACCTTTGAGAAGAGAAGATTCAGGTTTCTTGTCGCCTCCATCTCTCTGCTATGAGTTCTT
CTCCTGGCCTTTTAATAAGTGTGTTTTCCGGGTTGTCGTTTGCGTCTCTCGTTCCTCGGT
GGCTTCTGTTGATGGAAGCATTATAAAGAGGTTGAGGCTTTTAGATTGTCCGATGAAGGT
TCAGTTGAGAAGAGAGCTTTAGTCACAGGCGCTTGCTTGTTTGCTTCTCAAGTTGGTTTT
GGTGTTGGTCATTGTGGTTCTGGCTTGGTACCTGGAACTGAAGGTTCGGGTAAGTTTAGC
CTTGTTGCTGTGAAGGCTATTGCATCGTTACTATCTCTTGTCTGGCTCTCGGAAGAGTTC
CGGCTGGTTAAAACCAAGAGGTATCAGCACTATTCTCATTACCAAGGATTGTTCATGGAT
TTGGATGTAAGAGTGAAGATTATTCTAGTGATCTTAGTAGTTGATGTATGGTACCTGTTG
TTTAGGTTTGTGATTCCCTTTTGTGGGCTATGTTTCCAGGGATGTTAAGTTGTTTCCGTC
GGCATTTGGATTTCACCCTTGTATGTTTTTAAATTTCATCAATCAAATATCAGTTGGC

QA 12 849 12 849
DS 



AS 1 2

CO CL6783Contig1 919 2 2 U
GGACCAACAAGATACTAACCTCTTCTCATCTCCTCCTTCTTCTTCTCAGTTATCATGAAG
CTCGCCGCTAGCCTCAAACGCATGTTCCGCTCCGAGTCCAAAGCCTCTTCCTCCGTCTCC
AGATCCGAACCTTCTTCCTTCAGCTCCTCCTCTTCCTCCGACGGTGTCCTCAAGCCAGGC
CCCGCCGCTACTCCCATCAGCGTCCTCCCACAAAACTCAGGTGACTTCTACTCCGAGTTG
GTCCAGGCCTTTAAGCTGATAGACCGGGACGACGACGGTGTGGTTTCGAGGAGGGATCTC
GCGTCGCTTCTTAGCAGGCTCAGCCCCGAACCGCCGAGTCCCGAAGAGGTGAGCATGATG
CTGAGAGAAGTAGACGCTGCTGAGGGTTGTATCAGCCTCGAGGAGCTGGCTAGCCGCGTG
GCTGCTGGGACATCCACGGGAGAAGGGTGTATAGAGACGGAGGAGATGAGGGAGGTGTTC
GAGTTTTTCGACGCGGACCGCGACGGGAGAATCTCGGCGGAGGAGTTGCATAGAGTTTTT
GGAGTTATCGGAGACGAGCGGTGCACGATAGAAGAGTGTGTGCGTATGATAGCGACTGTT
GATAGGAACGGGGATGGTTTTGTTCGGTTCGATGACTTTTGCCGTATGATGGGAGCTTCC
AGGCTCCAAGCGATGAATGATCATCATTGAGTCATGCTTGTATGATTGAAATGATAATGA
CATCGTGCCATGCTCTCTCTTTTTCTTTTTGCCTTTTATTTTACACATTATTTTATATTA
CTGTAATTTCTATTTTGCGTTGGGTTTTAAATTCGTGACGGCAAGCAAGTTAACCGTCGG
TTTCTCTAAAATTATACTCATAATATGCACATGTGTCACTCTCCGGTTGATCAAAAGAGT
TTACTCATCATATTTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF19TF U 1
AF RR2BF19JQ C 42
BS 1 823 RR2BF19TF
BS 824 919 RR2BF19JQ

RD RR2BF19TF 833 0 0
GGACCAACAAGATACTAACCTCTTCTCATCTCCTCCTTCTTCTTCTCAGTTATCATGAAG
CTCGCCGCTAGCCTCAAACGCATGTTCCGCTCCGAGTCCAAAGCCTCTTCCTCCGTCTCC
AGATCCGAACCTTCTTCCTTCAGCTCCTCCTCTTCCTCCGACGGTGTCCTCAAGCCAGGC
CCCGCCGCTACTCCCATCAGCGTCCTCCCACAAAACTCAGGTGACTTCTACTCCGAGTTG
GTCCAGGCCTTTAAGCTGATAGACCGGGACGACGACGGTGTGGTTTCGAGGAGGGATCTC
GCGTCGCTTCTTAGCAGGCTCAGCCCCGAACCGCCGAGTCCCGAAGAGGTGAGCATGATG
CTGAGAGAAGTAGACGCTGCTGAGGGTTGTATCAGCCTCGAGGAGCTGGCTAGCCGCGTG
GCTGCTGGGACATCCACGGGAGAAGGGTGTATAGAGACGGAGGAGATGAGGGAGGTGTTC
GAGTTTTTCGACGCGGACCGCGACGGGAGAATCTCGGCGGAGGAGTTGCATAGAGTTTTT
GGAGTTATCGGAGACGAGCGGTGCACGATAGAAGAGTGTGTGCGTATGATAGCGACTGTT
GATAGGAACGGGGATGGTTTTGTTCGGTTCGATGACTTTTGCCGTATGATGGGAGCTTCC
AGGCTCCAAGCGATGAATGATCATCATTGAGTCATGCTTGTATGATTGAAATGATAATGA
CATCGTGCCATGCTCTCTCTTTTTCTTTTTGCCTTTTATTTTACACATTATTTTATATTA
CTGTAATTTCTATTTTGCGTTGGGTTTTAAATTCGTGACGGCA
GCAGTTAACC

QA 1 823 1 823
DS 

RD RR2BF19JQ 878 0 0
CTTCTCAGTTATCATGAAGCTCGCCGCTAGCCTCAAACGCATGTTCCGCTCCGAGTCCAA
AGCCTCTTCCTCCGTCTCCAGATCCGAACCTTCTTCCTTCAGCTCCTCCTCTTCCTCCGA
CGGTGTCCTCAAGCCAGGCCCCGCCGCTACTCCCATCAGCGTCCTCCCACAAAACTCAGG
TGACTTCTACTCCGAGTTGGTCCAGGCCTTTAAGCTGATAGACCGGGACGACGACGGTGT
GGTTTCGAGGAGGGATCTCGCGTCGCTTCTTAGCAGGCTCAGCCCCGAACCGCCGAGTCC
CGAAGAGGTGAGCATGATGCTGAGAGAAGTAGACGCTGCTGAGGGTTGTATCAGCCTCGA
GGAGCTGGCTAGCCGCGTGGCTGCTGGGACATCCACGGGAGAAGGGTGTATAGAGACGGA
GGAGATGAGGGAGGTGTTCGAGTTTTTCGACGCGGACCGCGACGGGAGAATCTCGGCGGA
GGAGTTGCATAGAGTTTTTGGAGTTATCGGAGACGAGCGGTGCACGATAGAAGAGTGTGT
GCGTATGATAGCGACTGTTGATAGGAACGGGGATGGTTTTGTTCGGTTCGATGACTTTTG
CCGTATGATGG*AGCTTCCAGGCTCCAAGCGATGAATGATCATCATTGAGTCATGCTTGT
ATGATTGAAATGATAATGACATCGTGCCATGCTCTCTCTTTTTCTTTTTGCCTTTTATTT
TACACATTATTTTATATTACTGTAATTTCTATTTTGCGTTGGGTTTTAAATTCGTGACGG
CAAGCAAGTTAACCGTCGGTTTCTCTAAAATTATACTCATAATATGCACATGTGTCACTC
TCCGGTTGATCAAAAGAGTTTACTCATCATATTTTGGT

QA 1 878 1 878
DS 



AS 1 2

CO CL6784Contig1 784 2 2 U
TTTGGAAGGCTGAGAACAGTCGAAGTTTCAGATACGGCGACATACATATAAGCCAACACA
ATACATCTAACGTTACAAGAGTCTATATGAACAAATTATAACAACAACAACAACAACATT
TTTATATGGTTTATACCCCAACAGTAAGTTTGTTTGTTTAAACCTTGTCGAAATCGGAGT
TCTGCTGCTGCTTGGGAGCATCTGCAGGAGGAGAAGCAGCAGTCATGCCAATCCCATCGT
CACGATGCTTCTCCCATCCACCAGTGTCAGCCTTGGAATGAGCCAAGAGGTACAAAACGG
TTGCAATCAAAGACATGAGAGTCAGAGCAGCTCCAGCAGCGAATACACCAACGGGTAAGA
CCGCACACGAAAGCGTTTTGCCTTCTTGGTACACGCCTTTGCTTTTGGTGTGGTAAGCGT
TCTTCGCCGATCCAGCCAACAAACACGCCTCCGCACCTAAGAAGCTTACCCAAGAGACGA
CGAAGAAGACGATAGCGCAGACGGTGTAAGAAGCGCCGGTGACGAGACCCTTTCCGCAGC
AGAGACACTTGGTGACGCCGTTAACCACCGCTTGGCTCACGAGGAGCAGCACGAACGCGG
ACATGCCGTACACCGTCGACGCGGCTGTTCCGTACTTGCAGAAGGTCTGGTCGTCGTACT
GGTCGGGCGCTATTAGAGCGGTGCTACGGCGTCGTTCGGCGCCGAAGGCGAATACGAAGG
CGAGGAGGTGAAGGGAAGTGACGACGGCGAGGATGGGAACGGAAACCGCCATTGATTTCG
TTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2BG52TF C 1
AF RR2BG52JQ U 4
BS 1 3 RR2BG52TF
BS 4 784 RR2BG52JQ

RD RR2BG52TF 784 0 0
TTTGGAAGGCTGAGAACAGTCGAAGTTTCAGATACGGCGACATACATATAAGCCAACACA
ATACATCTAACGTTACAAGAGTCTATATGAACAAATTATAACAACAACAACAACAACATT
TTTATATGGTTTATACCCCAACAGTAAGTTTGTTTGTTTAAACCTTGTCGAAATCGGAGT
TCTGCTGCTGCTTGGGAGCATCTGCAGGAGGAGAAGCAGCAGTCATGCCAATCCCATCGT
CACGATGCTTCTCCCATCCACCAGTGTCAGCCTTGGAATGAGCCAAGAGGTACAAAACGG
TTGCAATCAAAGACATGAGAGTCAGAGCAGCTCCAGCAGCGAATACACCAACGGGTAAGA
CCGCACACGAAAGCGTTTTGCCTTCTTGGTACACGCCTTTGCTTTTGGTGTGGTAAGCGT
TCTTCGCCGATCCAGCCAACAAACACGCCTCCGCACCTAAGAAGCTTACCCAAGAGACGA
CGAAGAAGACGATAGCGCAGACGGTGTAAGAAGCGCCGGTGACGAGACCCTTTCCGCAGC
AGAGACACTTGGTGACGCCGTTAACCACCGCTTGGCTCACGAGGAGCAGCACGAACGCGG
ACATGCCGTACACCGTCGACGCGGCTGTTCCGTACTTGCAGAAGGTCTGGTCGTCGTACT
GGTCGGGCGCTATTAGAGCGGTGCTACGGCGTCGTTCGGCGCCGAAGGCGAATACGAAGG
CGAGGAGGTGAAGGGAAGTGACGACGGCGAGGATGGGAACGGAAACCGCCATTGATTTCG
TTCC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2BG52JQ 781 0 0
GGAAGGCTGAGAACAGTCGAAGTTTCAGATACGGCGACATACATATAAGCCAACACAATA
CATCTAACGTTACAAGAGTCTATATGAACAAATTATAACAACAACAACAACAACATTTTT
ATATGGTTTATACCCCAACAGTAAGTTTGTTTGTTTAAACCTTGTCGAAATCGGAGTTCT
GCTGCTGCTTGGGAGCATCTGCAGGAGGAGAAGCAGCAGTCATGCCAATCCCATCGTCAC
GATGCTTCTCCCATCCACCAGTGTCAGCCTTGGAATGAGCCAAGAGGTACAAAACGGTTG
CAATCAAAGACATGAGAGTCAGAGCAGCTCCAGCAGCGAATACACCAACGGGTAAGACCG
CACACGAAAGCGTTTTGCCTTCTTGGTACACGCCTTTGCTTTTGGTGTGGTAAGCGTTCT
TCGCCGATCCAGCCAACAAACACGCCTCCGCACCTAAGAAGCTTACCCAAGAGACGACGA
AGAAGACGATAGCGCAGACGGTGTAAGAAGCGCCGGTGACGAGACCCTTTCCGCAGCAGA
GACACTTGGTGACGCCGTTAACCACCGCTTGGCTCACGAGGAGCAGCACGAACGCGGACA
TGCCGTACACCGTCGACGCGGCTGTTCCGTACTTGCAGAAGGTCTGGTCGTCGTACTGGT
CGGGCGCTATTAGAGCGGTGCTACGGCGTCGTTCGGCGCCGAAGGCGAATACGAAGGCGA
GGAGGTGAAGGGAAGTGACGACGGCGAGGATGGGAACGGAAACCGCCATTGATTTCGTTC
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL6785Contig1 661 2 1 U
GGATATACGGACAACAAAGTGAGATAATATTCCCACATTTTGTTTTTGCGAGCGTTCTTA
ACAATCAAATGGCTTACATTAACAAGGTCTCAGTGGCTGCGGCCGTTCTATTTCTAGCGG
TTGCTATTGCTCTCCTGTTAGCTGAGGCACAGACACCAATGTTTCCAAAGATGGATCCTG
TATGTGCCTCGGTGATGCCTGACCTCCTCGAAAAGTGTTTCTCAACCGTTAGAGAAACGC
CAACGGTAGATTGCTGCAACGATCTCAAATCCGCGACCAAAACGCAAGTGACTTGCCTAT
GTGATAATTACATTGCGAACCCGGCGGTTGTGGAATTCACGGGTCCTTACTCCGCAGGCA
TCACAACCAAATGTGACGTTTTTGACAAATACTCTTGTAAAGGTACTACTAAAGGAGGAG
AAGAAGCAAGCAGTAGCAGCAATGGCAAAGACAATAGCACAAGTGAAGGTAATGGAGGAC
GAGCGAACACGGTTGCTGCAATGGCTGTTTTTGGTTTTGTTGCAAGTCTAGTCTGCGTTA
TGTTTTGATTTCAATTCTCGTTCGTTTTATTTTTGAACAGACCAGTTTCCATGTGATTGT
TTTCCTTCTCATTTTTTGTTTGTTTTGAAACTGAGAATTCAAAATATTTTGATTTCATAG
C


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2GI70JQB C 1
AF RR2GI70TF U 1
BS 1 661 RR2GI70TF

RD RR2GI70JQB 661 0 0
GGATATACGGACAACAAAGTGAGATAATATTCCCACATTTTGTTTTTGCGAGCGTTCTTA
ACAATCAAATGGCTTACATTAACAAGGTCTCAGTGGCTGCGGCCGTTCTATTTCTAGCGG
TTGCTATTGCTCTCCTGTTAGCTGAGGCACAGACACCAATGTTTCCAAAGATGGATCCTG
TATGTGCCTCGGTGATGCCTGACCTCCTCGAAAAGTGTTTCTCAACCGTTAGAGAAACGC
CAACGGTAGATTGCTGCAACGATCTCAAATCCGCGACCAAAACGCAAGTGACTTGCCTAT
GTGATAATTACATTGCGAACCCGGCGGTTGTGGAATTCACGGGTCCTTACTCCGCAGGCA
TCACAACCAAATGTGACGTTTTTGACAAATACTCTTGTAAAGGTACTACTAAAGGAGGAG
AAGAAGCAAGCAGTAGCAGCAATGGCAAAGACAATAGCACAAGTGAAGGTAATGGAGGAC
GAGCGAACACGGTTGCTGCAATGGCTGTTTTTGGTTTTGTTGCAAGTCTAGTCTGCGTTA
TGTTTTGATTTCAATTCTCGTTCGTTTTATTTTTGAACAGACCAGTTTCCATGTGATTGT
TTTCCTTCTCATTTTTTGTTTGTTTTGAAACTGAGAATTCAAAATATTTTGATTTCATAG
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2GI70TF 661 0 0
GGATATACGGACAACAAAGTGAGATAATATTCCCACATTTTGTTTTTGCGAGCGTTCTTA
ACAATCAAATGGCTTACATTAACAAGGTCTCAGTGGCTGCGGCCGTTCTATTTCTAGCGG
TTGCTATTGCTCTCCTGTTAGCTGAGGCACAGACACCAATGTTTCCAAAGATGGATCCTG
TATGTGCCTCGGTGATGCCTGACCTCCTCGAAAAGTGTTTCTCAACCGTTAGAGAAACGC
CAACGGTAGATTGCTGCAACGATCTCAAATCCGCGACCAAAACGCAAGTGACTTGCCTAT
GTGATAATTACATTGCGAACCCGGCGGTTGTGGAATTCACGGGTCCTTACTCCGCAGGCA
TCACAACCAAATGTGACGTTTTTGACAAATACTCTTGTAAAGGTACTACTAAAGGAGGAG
AAGAAGCAAGCAGTAGCAGCAATGGCAAAGACAATAGCACAAGTGAAGGTAATGGAGGAC
GAGCGAACACGGTTGCTGCAATGGCTGTTTTTGGTTTTGTTGCAAGTCTAGTCTGCGTTA
TGTTTTGATTTCAATTCTCGTTCGTTTTATTTTTGAACAGACCAGTTTCCATGTGATTGT
TTTCCTTCTCATTTTTTGTTTGTTTTGAAACTGAGAATTCAAAATATTTTGATTTCATAG
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL6786Contig1 689 2 2 U
GGAAGCCGGATCCGTGCCCGCCGCTAAGAGCTAACCACTTCGAGGTACAGTCTCCACTGC
CAAAGAAGGGTTCTAGGGTTTCGCAGCTCCTTCTTCGCAAACCCAAAGATGAAGCTCGTC
AGGTTTTTGATGAAGCTGAACAACGAAACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAACGGGACTGTG
GTCCATGGAACCATCACTGGTAAAGTTCTATTTAGCTTTAGATTCATTCGCCGGAAGTTT
TGTTAAGCTTTTTGGTGATTTTGTGTGTGTTTAGGTGTTGATGTGAGCATGAACACTCAC
TTGAAGACGGTTAAAATGACTCTCAAGGGGAAGAACCCTGTGACGATGGATCATCTGAGC
TTGAGGGGTAACAACATCCGCTACTACATTCTTCCTGATAGCTTGAACCTCGAGACATTG
CTTGTTGAAGACACTCCTCGACTTAAACCTAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGA
AGAGGTCGTGGACGTGGTGGTCGTGGGCGTGGTGGTGCCGGTCGTGGCAGAGGTCGTTAA
ATGCAGCGACAAGTTTAAGGTGTGTGCGTTTAATTGAATCTGTAGGAAGAAGAACCCTTT
GGTGTCTCGGTTATGTATTTAGAAACTCTTGCAGAGGAAGTTAATGTGTAATGCAACTCT
ATGGATTTAAAGGATTAAGCTTTTCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV82TF U 1
AF RR2GV82JQB C 11
BS 1 529 RR2GV82TF
BS 530 689 RR2GV82JQB

RD RR2GV82TF 529 0 0
GGAAGCCGGATCCGTGCCCGCCGCTAAGAGCTAACCACTTCGAGGTACAGTCTCCACTGC
CAAAGAAGGGTTCTAGGGTTTCGCAGCTCCTTCTTCGCAAACCCAAAGATGAAGCTCGTC
AGGTTTTTGATGAAGCTGAACAACGAAACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAACGGGACTGTG
GTCCATGGAACCATCACTGGTAAAGTTCTATTTAGCTTTAGATTCATTCGCCGGAAGTTT
TGTTAAGCTTTTTGGTGATTTTGTGTGTGTTTAGGTGTTGATGTGAGCATGAACACTCAC
TTGAAGACGGTTAAAATGACTCTCAAGGGGAAGAACCCTGTGACGATGGATCATCTGAGC
TTGAGGGGTAACAACATCCGCTACTACATTCTTCCTGATAGCTTGAACCTCGAGACATTG
CTTGTTGAAGACACTCCTCGACTTAAACCTAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGA
AGAGGTCGTGGACGTGGTGGTCGTGGGCGTGGTGGTGCCGGTCGTGGCA

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2GV82JQB 679 0 0
TCCGTGCCCGCCGCTAAGAGCTAACCACTTCGAGGTACAGTCTCCACTGCCAAAGAAGGG
TTCTAGGGTTTCGCAGCTCCTTCTTCGCAAACCCAAAGATGAAGCTCGTCAGGTTTTTGA
TGAAGCTGAACAACGAAACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAACGGGACTGTGGTCCATGGAA
CCATCACTGGTAAAGTTCTATTTAGCTTTAGATTCATTCGCCGGAAGTTTTGTTAAGCTT
TTTGGTGATTTTGTGTGTGTTTAGGTGTTGATGTGAGCATGAACACTCACTTGAAGACGG
TTAAAATGACTCTCAAGGGGAAGAACCCTGTGACGATGGATCATCTGAGCTTGAGGGGTA
ACAACATCCGCTACTACATTCTTCCTGATAGCTTGAACCTCGAGACATTGCTTGTTGAAG
ACACTCCTCGACTTAAACCTAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGAAGAGGTCGTG
GACGTGGTGGTCGTGGGCGTGGTGGTGCCGGTCGTGGCAGAGGTCGTTAAATGCAGCGAC
AAGTTTAAGGTGTGTGCGTTTAATTGAATCTGTAGGAAGAAGAACCCTTTGGTGTCTCGG
TTATGTATTTAGAAACTCTTGCAGAGGAAGTTAATGTGTAATGCAACTCTATGGATTTAA
AGGATTAAGCTTTTCATGC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL6787Contig1 1308 2 2 U
GGGTGGTATGCTGCATACATCCTAAGCTATCTGGGATACTATGGCTTCCAAGATAAGCTG
GGGAAAAGACTCATGAGAGCTTATGAAGATGAGGAATGTAGTGACATGCGACTCCTTTTC
GCTAATGGGAATAACGCGAGTGTGAACAAAGTTATTCTCGCTGTCAGGTGTCCAACGCTA
CTGCCCCCTGAGGAGGTAGCTCACCGTGGTGGCTCGGTTCAAGAAATTCGCATGTCTGCC
AATGTGGATACTTTGGCGCTGGTTAAGTTACTAGAATTTGCTTACTCTGGGTATGTGGAA
GTAGAAAGTACGACGCTGAAGAAGCTGAAAACATTGGCGAGACATTGCAAGTCAAAGGTT
CTGCTTCAGATGCTCTGCAGAGGAAGACCCAAGTGGGGTTCTTCGATACCAAGAATTGGT
CTACCCCTTGCACTCACTCCTAAACTCATCCATTTCTCGGATGTTATATTAGTACCTAAA
GAAACAAACATGGCTGGATTCAACTGCCGTTTGTGTTCCTCAGCATCTCCTCACGCCCAC
TGTCACCGGGTTATACTATCGTCAGGCTGTGAATACCTACGTGCCTTGTTCCGGTCCGGA
ATGCAAGAGAGCAATTTGGATAGACTAAACGTCCCTGTGAGCTGGTTGGGGTTAACCAAG
CTCGTAAACTGGTTCTACTGTGATGAATTGCCAAAGCCTCCGTCGGGTTGCAGATGGAGC
AACATGGACACCGATGCAAAGCTACAGGAGCTTCAAGCTTACGTGGAGATATACTCTCTT
ACCGAATGGTGGATAATGGAAGATCTGCAAAACGACTGTGCCAAAGTGATTCTCTCTTGC
TTGGAATCAGCTAGAGAGCTATCGATCAAAACGATCGAATTAGCTGCGAGTTTCTCGATG
TGGCAACTGGTGGAAGCGGCTGCTGAGCATGCGGCTCCTATATACCATCAGCTTCGTGAC
TCGGGTGAGCTCGACGAGTTGGATGATGAGCTGGTTAACTTGATCCGAACCGCTGCTGTT
CAGTTTTCTCAACAGGGTGGTTGAGAACTCTGAGAAGTGTGGACTCTTTGGTTCTTTATG
GAGAGAGGATAGTGCGTGGTCGCATCAGCTACCAAGTATATAGGATCCGAGATGGTTTGG
TTATAGCCATTTATACTGATTCCTTTTGGAGATTAATGTTCATGGTTTTCGATAGGGAGC
ATCTGTTGTGTGATTTTTTTTGTTATTTTCTCAAAAAGACTGTTTTGTAAGGTAAACAAC
GGTTATGTACAAAGTAAATTCTGTAAACTATATGAACAATTTTGAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX69TF U 1
AF RR2BX69JQ C 639
BS 1 690 RR2BX69TF
BS 691 1308 RR2BX69JQ

RD RR2BX69TF 690 0 0
GGGTGGTATGCTGCATACATCCTAAGCTATCTGGGATACTATGGCTTCCAAGATAAGCTG
GGGAAAAGACTCATGAGAGCTTATGAAGATGAGGAATGTAGTGACATGCGACTCCTTTTC
GCTAATGGGAATAACGCGAGTGTGAACAAAGTTATTCTCGCTGTCAGGTGTCCAACGCTA
CTGCCCCCTGAGGAGGTAGCTCACCGTGGTGGCTCGGTTCAAGAAATTCGCATGTCTGCC
AATGTGGATACTTTGGCGCTGGTTAAGTTACTAGAATTTGCTTACTCTGGGTATGTGGAA
GTAGAAAGTACGACGCTGAAGAAGCTGAAAACATTGGCGAGACATTGCAAGTCAAAGGTT
CTGCTTCAGATGCTCTGCAGAGGAAGACCCAAGTGGGGTTCTTCGATACCAAGAATTGGT
CTACCCCTTGCACTCACTCCTAAACTCATCCATTTCTCGGATGTTATATTAGTACCTAAA
GAAACAAACATGGCTGGATTCAACTGCCGTTTGTGTTCCTCAGCATCTCCTCACGCCCAC
TGTCACCGGGTTATACTATCGTCAGGCTGTGAATACCTACGTGCCTTGTTCCGGTCCGGA
ATGCAAGAGAGCAATTTGGATAGACTAAACGTCCCTGTGAGCTGGTTGGGGTTAACCAAG
CTCGTAAACTGGTTCTACTGTGATGAATTG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2BX69JQ 670 0 0
GAGCTGGTTGGGGTTAACCAAGCTCGTAAACTGGTTCTACTGTGATGAATTGCCAAAGCC
TCCGTCGGGTTGCAGATGGAGCAACATGGACACCGATGCAAAGCTACAGGAGCTTCAAGC
TTACGTGGAGATATACTCTCTTACCGAATGGTGGATAATGGAAGATCTGCAAAACGACTG
TGCCAAAGTGATTCTCTCTTGCTTGGAATCAGCTAGAGAGCTATCGATCAAAACGATCGA
ATTAGCTGCGAGTTTCTCGATGTGGCAACTGGTGGAAGCGGCTGCTGAGCATGCGGCTCC
TATATACCATCAGCTTCGTGACTCGGGTGAGCTCGACGAGTTGGATGATGAGCTGGTTAA
CTTGATCCGAACCGCTGCTGTTCAGTTTTCTCAACAGGGTGGTTGAGAACTCTGAGAAGT
GTGGACTCTTTGGTTCTTTATGGAGAGAGGATAGTGCGTGGTCGCATCAGCTACCAAGTA
TATAGGATCCGAGATGGTTTGGTTATAGCCATTTATACTGATTCCTTTTGGAGATTAATG
TTCATGGTTTTCGATAGGGAGCATCTGTTGTGTGATTTTTTTTGTTATTTTCTCAAAAAG
ACTGTTTTGTAAGGTAAACAACGGTTATGTACAAAGTAAATTCTGTAAACTATATGAACA
ATTTTGAAGG

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL6788Contig1 693 2 2 U
GGAAATTCATCAAACACTCCCATGCCAAACTCTATTCGTCATCTTTTCACACCAGACTTC
TTTGGAGTCAATGGTCGATTTTAGCGTTTCTAAACTTGGCAACTATCACGTCCGTGCTGT
TCCCACTGAGGTGGCTGAGAAGGATGCACCGATGCAGAAGTACAAAATAGCGGCAGCCGG
GATAAAGAAATTGTCGGACGACAAGTCAGTGGTGTGCCACAAACAGAAGTACCCATTCGC
GGTGTTCTACTGCCACAAGGCCATGATGACGAGCGCTTATGCTGTTCCGCTCGAAGGAGA
GAACGGGCTAAGGGCTAAAGCGGTTGCGGTATGCCACAAGAACACCTCGGCTTGGAACCC
AAACCACATGGCCTTCAAAGTGCTTAAGGTGAAGCCTGGGACTGTTCCGGTCTGCCATTT
CCTCCCTGAGACCCATGTTGTTTGGTTCAGCTATTAGATAGATAGCTTTCATATATTGTG
GGTTATGTAATATATAATAATGTTTGACACACTCTTTATCTTTTGCTTTGTTTTGATTAT
GAATATACATATACGCATAGTAATGCGTGGCTTCCATATAGTCAAAGAAGAATGAAGGCA
TCTATATGTTTTCACTTTGCATAGTTGATTTGTGGCCTGTTTTTTTTTCTTGTTGTCTTG
CAAGAATGTACTGTATAATAAAAACTAGGGTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER65TF U 1
AF RR2ER65JQ C 1
BS 1 633 RR2ER65TF
BS 634 693 RR2ER65JQ

RD RR2ER65TF 633 0 0
GGAAATTCATCAAACACTCCCATGCCAAACTCTATTCGTCATCTTTTCACACCAGACTTC
TTTGGAGTCAATGGTCGATTTTAGCGTTTCTAAACTTGGCAACTATCACGTCCGTGCTGT
TCCCACTGAGGTGGCTGAGAAGGATGCACCGATGCAGAAGTACAAAATAGCGGCAGCCGG
GATAAAGAAATTGTCGGACGACAAGTCAGTGGTGTGCCACAAACAGAAGTACCCATTCGC
GGTGTTCTACTGCCACAAGGCCATGATGACGAGCGCTTATGCTGTTCCGCTCGAAGGAGA
GAACGGGCTAAGGGCTAAAGCGGTTGCGGTATGCCACAAGAACACCTCGGCTTGGAACCC
AAACCACATGGCCTTCAAAGTGCTTAAGGTGAAGCCTGGGACTGTTCCGGTCTGCCATTT
CCTCCCTGAGACCCATGTTGTTTGGTTCAGCTATTAGATAGATAGCTTTCATATATTGTG
GGTTATGTAATATATAATAATGTTTGACACACTCTTTATCTTTTGCTTTGTTTTGATTAT
GAATATACATATACGCATAGTAATGCGTGGCTTCCATATAGTCAAAGAAGAATGAAGGCA
TCTATATGTTTTCACTTTGCATAGTTGATTTGT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2ER65JQ 693 0 0
GGAAATTCATCAAACACTCCCATGCCAAACTCTATTCGTCATCTTTTCACACCAGACTTC
TTTGGAGTCAATGGTCGATTTTAGCGTTTCTAAACTTGGCAACTATCACGTCCGTGCTGT
TCCCACTGAGGTGGCTGAGAAGGATGCACCGATGCAGAAGTACAAAATAGCGGCAGCCGG
GATAAAGAAATTGTCGGACGACAAGTCAGTGGTGTGCCACAAACAGAAGTACCCATTCGC
GGTGTTCTACTGCCACAAGGCCATGATGACGAGCGCTTATGCTGTTCCGCTCGAAGGAGA
GAACGGGCTAAGGGCTAAAGCGGTTGCGGTATGCCACAAGAACACCTCGGCTTGGAACCC
AAACCACATGGCCTTCAAAGTGCTTAAGGTGAAGCCTGGGACTGTTCCGGTCTGCCATTT
CCTCCCTGAGACCCATGTTGTTTGGTTCAGCTATTAGATAGATAGCTTTCATATATTGTG
GGTTATGTAATATATAATAATGTTTGACACACTCTTTATCTTTTGCTTTGTTTTGATTAT
GAATATACATATACGCATAGTAATGCGTGGCTTCCATATAGTCAAAGAAGAATGAAGGCA
TCTATATGTTTTCACTTTGCATAGTTGATTTGTGGCCTGTTTTTTTTTCTTGTTGTCTTG
CAAGAATGTACTGTATAATAAAAACTAGGGTTG

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL6789Contig1 741 2 3 U
GACCTTTACAAGAAAAGAGATAAACTTTACATTGTAGGAGACGTCAGGCTTCTCAGATTG
GCTAAGAAGGGAGATGCTCGAATCAGCCTCAGGCGGCAAGACATCAACAAGGGCATTAGA
GTGACGGTGAAGGGCCACGGAAGCAGAAGGCTTTAAGTCTTCTCTGTTGATGGTGCTGAG
AATCCTGACATAGTAATTGGAGCCCGTGGTGGATCCAACGATGCCGTTGTTCTGATCGAC
CATCTCCATGAACTGGCCAATCACTAAGGGCACGGATTGGATTCGTCGACCTCTTCTTGA
GCGCGCAAGAGCTCGCGCTTGAGATTCTTCTGCTCGTCTTTCACGTATTCCTCTTGGATG
TCGGTGAACTCTAGCTGCCGCTCGAGCGATTTGAGACGGGAGTAGGGATCTTCCTCGTCG
GGGGACGTGGAGAGATCCATCAGTGGGGGAGATGATGATTTGGGGTCGAGAACCATCGCT
GCGGCCATTGTCGGAGAGAGATCTGTGGGATGAGTTCTTGGAGTAGAGAGAAAGAAAAGA
GATTGCTAACAAATAAAATAAATTTTATCTCTGGGTGGTCCCTTTAAAAAGGCCGAAAGA
TTTGAGTTTTGGGCCCTTTTAATTTCCTTTTTTCTTTGTTGGCCTTTGGTATTTTCCTTT
AGGCTTCCATTTAGGCTCCAATAAATTAACAATTTAGCATTTGCCTATTTGGTGGAGAAA
AGGAAAGAGGAAATGTGTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AG71JQ C 1
AF RR2AG71TF U 1
BS 1 674 RR2AG71TF
BS 675 675 RR2AG71JQ
BS 676 741 RR2AG71TF

RD RR2AG71JQ 741 0 0
GACCTTTACAAGAAAAGAGATAAACTTTACATTGTAGGAGACGTCAGGCTTCTCAGATTG
GCTAAGAAGGGAGATGCTCGAATCAGCCTCAGGCGGCAAGACATCAACAAGGGCATTAGA
GTGACGGTGAAGGGCCACGGAAGCAGAAGGCTTTAAGTCTTCTCTGTTGATGGTGCTGAG
AATCCTGACATAGTAATTGGAGCCCGTGGTGGATCCAACGATGCCGTTGTTCTGATCGAC
CATCTCCATGAACTGGCCAATCACTAAGGGCACGGATTGGATTCGTCGACCTCTTCTTGA
GCGCGCAAGAGCTCGCGCTTGAGATTCTTCTGCTCGTCTTTCACGTATTCCTCTTGGATG
TCGGTGAACTCTAGCTGCCGCTCGAGCGATTTGAGACGGGAGTAGGGATCTTCCTCGTCG
GGGGACGTGGAGAGATCCATCAGTGGGGGAGATGATGATTTGGGGTCGAGAACCATCGCT
GCGGCCATTGTCGGAGAGAGATCTGTGGGATGAGTTCTTGGAGTAGAGAGAAAGAAAAGA
GATTGCTAACAAATAAAATAAATTTTATCTCTGGGTGGTCCCTTTAAAAAGGCCGAAAGA
TTTGAGTTTTGGGCCCTTTTAATTTCCTTTTTTCTTTGTTGGCCTTTGGTATTTTCCTTT
AGGCTTCCATTTAGGCTCCAATAAATTAACAATTTAGCATTTGCCTATTTGGTGGAGAAA
AGGAAAGAGGAAATGTGTTAC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2AG71TF 741 0 0
GACCTTTACAAGAAAAGAGATAAACTTTACATTGTAGGAGACGTCAGGCTTCTCAGATTG
GCTAAGAAGGGAGATGCTCGAATCAGCCTCAGGCGGCAAGACATCAACAAGGGCATTAGA
GTGACGGTGAAGGGCCACGGAAGCAGAAGGCTTTAAGTCTTCTCTGTTGATGGTGCTGAG
AATCCTGACATAGTAATTGGAGCCCGTGGTGGATCCAACGATGCCGTTGTTCTGATCGAC
CATCTCCATGAACTGGCCAATCACTAAGGGCACGGATTGGATTCGTCGACCTCTTCTTGA
GCGCGCAAGAGCTCGCGCTTGAGATTCTTCTGCTCGTCTTTCACGTATTCCTCTTGGATG
TCGGTGAACTCTAGCTGCCGCTCGAGCGATTTGAGACGGGAGTAGGGATCTTCCTCGTCG
GGGGACGTGGAGAGATCCATCAGTGGGGGAGATGATGATTTGGGGTCGAGAACCATCGCT
GCGGCCATTGTCGGAGAGAGATCTGTGGGATGAGTTCTTGGAGTAGAGAGAAAGAAAAGA
GATTGCTAACAAATAAAATAAATTTTATCTCTGGGTGGTCCCTTTAAAAAGGCCGAAAGA
TTTGAGTTTTGGGCCCTTTTAATTTCCTTTTTTCTTTGTTGGCCTTTGGTATTTTCCTTT
AGGCTTCCATTTAG*CTCCAATAAATTAACAATTTAGCATTTGCCTATTTGGTGGAGAAA
AGGAAAGAGGAAATGTGTTAC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL6790Contig1 670 2 2 U
GTGCAGAATCAGAAACTTCCGATGTATAATGTACAAAGAGAGAGAGAGAGGGGTTTGGTT
TATAGCCACCACCGCCGACTCAACAGAGAGATATGCCTATGAGAGGTCGAACGATCCCTG
CCCTTCGTTGATGGCGTAAAGCAGTTTCTTGTACATGATTTCCTTAGTAGAATAAGGAGG
GAGCTTAAGGTAGTTGGCGCAAGTCATGACGCTGGGAAGATCGTCGTCTGCTGTTTCCGT
AGCCCCTGTCTCATTAGCTGCTGCATTTGAGGTTGATGAGAGCTTTCTCACAATCGTCAG
CTTCGGGTTCAGAACAGCTAAGCCACCAGGAGGAAGCCTAGGAGCTCCAGTTACAAACTG
GCAGAAAGCCCGCTGTTGATCCGCTGTAAGCTCTCCCATGATCTCCAGTAAGTTAACGAT
TGCCGGACTTTTTGCAGTATAACCGTGATCAAACTTGATATGTTCGACAAGAGTCTCCGC
CTCCCACAACTCTATACGACCACACAACAAGTAGTCCAGCTCGGAAGGGGTGAATATTTG
TAGAGACTTTATGTCAAAGACCTGATTGAATCCAGATCTGAAGGCTTCGATCTGCCGGGC
AACTCCTCTCTTGACAGTAGCATCAACGACCAAGGATATATAGTCCTCAAGACTATTAAT
ATCAACAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CW77TF C 1
AF RR2CW77JQ U 34
BS 1 33 RR2CW77TF
BS 34 670 RR2CW77JQ

RD RR2CW77TF 670 0 0
GTGCAGAATCAGAAACTTCCGATGTATAATGTACAAAGAGAGAGAGAGAGGGGTTTGGTT
TATAGCCACCACCGCCGACTCAACAGAGAGATATGCCTATGAGAGGTCGAACGATCCCTG
CCCTTCGTTGATGGCGTAGAGCAGTTTCTTGTACATGATTTCCTTAGTAGAATAAGGAGG
GAGCTTAAGGTAGTTGGCGCAAGTCATGACGCTGGGAAGATCGTCGTCTGCTGTTTCCGT
AGCCCCTGTCTCATTAGCTGCTGCATTTGAGGTTGATGAGAGCTTTCTCACAATCGTCAG
CTTCGGGTTCAGAACAGCTAAGCCACCAGGAGGAAGCCTAGGAGCTCCAGTTACAAACTG
GCAGAAAGCCCGCTGTTGATCCGCTGTAAGCTCTCCCATGATCTCCAGTAAGTTAACGAT
TGCCGGACTTTTTGCAGTATAACCGTGATCAAACTTGATATGTTCGACAAGAGTCTCCGC
CTCCCACAACTCTATACGACCACACAACAAGTAGTCCAGCTCGGAAGGGGTGAATATTTG
TAGAGACTTTATGTCAAAGACCTGATTGAATCCAGATCTGAAGGCTTCGATCTGCCGGGC
AACTCCTCTCTTGACAGTAGCATCAACGACCAAGGATATATAGTCCTCAAGACTATTAAT
ATCAACAATC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2CW77JQ 637 0 0
CAAAGAGAGAGAGAGAGGGGTTTGGTTTATAGCCACCACCGCCGACTCAACAGAGAGATA
TGCCTATGAGAGGTCGAACGATCCCTGCCCTTCGTTGATGGCGTAAAGCAGTTTCTTGTA
CATGATTTCCTTAGTAGAATAAGGAGGGAGCTTAAGGTAGTTGGCGCAAGTCATGACGCT
GGGAAGATCGTCGTCTGCTGTTTCCGTAGCCCCTGTCTCATTAGCTGCTGCATTTGAGGT
TGATGAGAGCTTTCTCACAATCGTCAGCTTCGGGTTCAGAACAGCTAAGCCACCAGGAGG
AAGCCTAGGAGCTCCAGTTACAAACTGGCAGAAAGCCCGCTGTTGATCCGCTGTAAGCTC
TCCCATGATCTCCAGTAAGTTAACGATTGCCGGACTTTTTGCAGTATAACCGTGATCAAA
CTTGATATGTTCGACAAGAGTCTCCGCCTCCCACAACTCTATACGACCACACAACAAGTA
GTCCAGCTCGGAAGGGGTGAATATTTGTAGAGACTTTATGTCAAAGACCTGATTGAATCC
AGATCTGAAGGCTTCGATCTGCCGGGCAACTCCTCTCTTGACAGTAGCATCAACGACCAA
GGATATATAGTCCTCAAGACTATTAATATCAACAATC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL6791Contig1 860 2 2 U
TAAATTGGAATATGTTTCATTCAAACTCATGTTTCCAGCGTAAAGAACAAACCAAGAAAA
TCCAAATAGCAAAGACAACAAACATTCAGCACGTACTGTGAAGGATCCTCCTAGAATTTA
AAAACAAGTATGATCTGAAAATGAACAAACATTATCTGAAAGTAGGGTCATATCCGAGCC
ACGTACGAATTGGCCTGTGTCACATATCTCACCCAACGATATGGATTGTAACTACTTGAT
TTCTTTGCTATCTGCAAGTACTTGACCTGGAGTTTAAAAACATTGTACATCGGTATGGTG
AAGGTCATGCTAACCGGCCCTGCTTCCTTTGTGAGATTACCATGAAACTCCTGTGAAAAT
GTCAGCTTTGCACGCAGTGTATGTTCAGCTCCACCAACAATCTTTTTCAAATTCCATTCA
AACATTTTGCTGGTTTCCTTGAAATCTGTCTTCTGTCCAGCTGCACCGGGTTCTAACTCA
AAACTAGCCCTGGAAGTGTAATTTGGCAAAGGCATCTGGACCGTAATCGTGTTTGCAATT
ATGTCTGAAGGGAACTCAGCGCGTATTTTAATAATCACTTCAGCCTTAAGGCGTCCGGCC
TCTTCAATCAAGGTATTAACATGAAAAGGAGGCTTGAACTCCTGGGTCATACGGTAATTC
ATAACTGGAAATTCACCATCTGGTGGAACCAGGGACAAAGTTCTATCCGAATCGAAGCTA
TCAAGACGAACAGACTCATGAAAGTTACAATCATCAAGTATCACCCCTGAACCTGAAGAA
CTCCTATAGTCATATACTGATCTCCCTCCTCTTCTATGTTAGTCTTCATTAAGAGCTATA
CGAATTTCTGGATACAGAAG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD25JQ U 1
AF RR2G013JQ U 2
BS 1 646 RR2GD25JQ
BS 647 860 RR2G013JQ

RD RR2GD25JQ 646 0 0
TAAATTGGAATATGTTTCATTCAAACTCATGTTTCCAGCGTAAAGAACAAACCAAGAAAA
TCCAAATAGCAAAGACAACAAACATTCAGCACGTACTGTGAAGGATCCTCCTAGAATTTA
AAAACAAGTATGATCTGAAAATGAACAAACATTATCTGAAAGTAGGGTCATATCCGAGCC
ACGTACGAATTGGCCTGTGTCACATATCTCACCCAACGATATGGATTGTAACTACTTGAT
TTCTTTGCTATCTGCAAGTACTTGACCTGGAGTTTAAAAACATTGTACATCGGTATGGTG
AAGGTCATGCTAACCGGCCCTGCTTCCTTTGTGAGATTACCATGAAACTCCTGTGAAAAT
GTCAGCTTTGCACGCAGTGTATGTTCAGCTCCACCAACAATCTTTTTCAAATTCCATTCA
AACATTTTGCTGGTTTCCTTGAAATCTGTCTTCTGTCCAGCTGCACCGGGTTCTAACTCA
AAACTAGCCCTGGAAGTGTAATTTGGCAAAGGCATCTGGACCGTAATCGTGTTTGCAATT
ATGTCTGAAGGGAACTCAGCGCGTATTTTAATAATCACTTCAGCCTTAAGGCGTCCGGCC
TCTTCAATCAAGGTATTAACATGAAAAGGAGGCTTGAACTCCTGGG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2G013JQ 859 0 0
C
AATTGGAATATGTTTCATTCAGACTCATGTTTCCAGCGTAGAGAACAAACCAAGAAAATC
CAAATAGCAAAGACAACAAACATTCAGCACGTACTGTGAAGGGTCCTCTTAGAATTTAAG
AACAAGTATGATCTGAAAATGAACAAACATTATCTGAAAGTAGGGTCATATCCGAGCCAC
GTACGAATTGGCCTGTGTCACATATCTCACCCAACGATATGGATTGTAACTACTTGATTT
CTTTGCTATCTGCAAGTACTTGACCTGGAGTTTAGAAACATTGTACATCGGTATGGTGAA
GGTCATGCTAACCGGCCCTGCTTCCTTTGTGAGATTACCATGAAACTCCTGTGAAAATGT
CAGCTTTGCACGCAGTGTATGTTCAGCTCCACCAACAATCTTTTTCAAATTCCATTCAAG
CATTTTGCTGGTTTCCTTGAAATCTGTCTTCTGTCCAGCTGCACCGGGTTCTAACTCAAA
ACTAGCCCTGGAAGTGTAATTTGGCAAAGGCATCTGGACCGTAATCGTGTTTGCAATTAT
GTCTGAAGGGAACTCAGCGCGTATTTTAATAATCACTTCAGCCTTAAGGCGTCCGGCCTC
TTCAATCAAGGTATTAACATGAAAAGGAGGCTTGAACTCCTGGGTCATACGGTAATTCAT
AACTGGAAATTCACCATCTGGTGGAACCAGGGACAAAGTTCTATCCGAATCGAAGCTATC
AAGACGAACAGACTCATGAAAGTTACAATCATCAAGTATCACCCCTGAACCTGAAGAACT
CCTATAGTCATATACTGATCTCCCTCCTCTTCTATGTTAGTCTTCATTAAGAGCTATACG
AATTTCTGGATACAGAAG

QA 2 859 2 859
DS 



AS 1 2

CO CL6792Contig1 624 2 3 U
GGAGACGCCGATTGATTCACAGTGATTCTGGTTTCTTTCTAGATCGTTTCGTTTCACCAT
TGATTGATATCGATCCACGGAGCTGTGGGCAAATGGCGTACGTGGACCACGCGTTCTCGA
TATCAGACGAGGACATGATGTTCGAGACCTCATACACCGTGAACAACCGACCTCCGGTTA
AGGAGATCGCACTCGCGGTGGCTCTCCTCGTGTTCGGAGCCTTAGGAATCGTCTCCGGCT
TCTTCATGGCGTACAATCGAGTCGGCGGCGATCGAGGCCACGGGATTTTCTTCATCGTCC
TCGGGTGTCTTCTGTTCATCCCTGGGTTTTACTACACACGGATCGCGTATTATGCTTACA
AAGGATACCAAGGTTTCTCCTTCTCTAACATACCCCCTGTTTAGTAGCACTCCCCCCTTT
TGGTTCTCGATGTATAGAGATGTTTTTATTAAGCAAATGGGCAGACTTTGTTTTGCTCTC
TAGTCTAGTTTTAGAGGAGTCTGTCTAAGTGAGTGAGTCCCATGTTTGATATAATGTATC
ACTTCTTCTTTTCTCCTTCCACTTGTTAAATAATTACGCCGTCTATGACGATTTGTCATA
TCCATATATACCCCTGTTCACACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BN86JQ C 1
AF RR2BN86TF U 1
BS 1 612 RR2BN86TF
BS 613 613 RR2BN86JQ
BS 614 624 RR2BN86TF

RD RR2BN86JQ 624 0 0
GGAGACGCCGATTGATTCACAGTGATTCTGGTTTCTTTCTAGATCGTTTCGTTTCACCAT
TGATTGATATCGATCCACGGAGCTGTGGGCAAATGGCGTACGTGGACCACGCGTTCTCGA
TATCAGACGAGGACATGATGTTCGAGACCTCATACACCGTGAACAACCGACCTCCGGTTA
AGGAGATCGCACTCGCGGTGGCTCTCCTCGTGTTCGGAGCCTTAGGAATCGTTTCCGGCT
TCTTCATGGCGTACAATCGAGTCGGCGGCGATCGAGGCCACGGGATTTTCTTCATCGTCC
TCGGGTGTCTTCTGTTCATCCCTGGGTTTTACTACACACGGATCGCGTATTATGCTTACA
AAGGATACCAAGGTTTCTCCTTCTCTAACATACCCCCTGTTTAGTAGCACTCCCCCCTTT
TGGTTCTCGATGTATAGAGATGTTTTTATTAAGCAAATGGGCAGACTTTGTTTTGCTCTC
TAGTCTAGTTTTAGAGGAGTCTGTCTAAGTGAGTGAGTCCCATGTTTGATATAATGTATC
ACTTCTTCTTTTCTCCTTCCACTTGTTAAATAATTACGCCGTCTATGACGATTTGTCATA
TCCATATATACCCCTGTTCACACG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2BN86TF 624 0 0
GGAGACGCCGATTGATTCACAGTGATTCTGGTTTCTTTCTAGATCGTTTCGTTTCACCAT
TGATTGATATCGATCCACGGAGCTGTGGGCAAATGGCGTACGTGGACCACGCGTTCTCGA
TATCAGACGAGGACATGATGTTCGAGACCTCATACACCGTGAACAACCGACCTCCGGTTA
AGGAGATCGCACTCGCGGTGGCTCTCCTCGTGTTCGGAGCCTTAGGAATCGTCTCCGGCT
TCTTCATGGCGTACAATCGAGTCGGCGGCGATCGAGGCCACGGGATTTTCTTCATCGTCC
TCGGGTGTCTTCTGTTCATCCCTGGGTTTTACTACACACGGATCGCGTATTATGCTTACA
AAGGATACCAAGGTTTCTCCTTCTCTAACATACCCCCTGTTTAGTAGCACTCCCCCCTTT
TGGTTCTCGATGTATAGAGATGTTTTTATTAAGCAAATGGGCAGACTTTGTTTTGCTCTC
TAGTCTAGTTTTAGAGGAGTCTGTCTAAGTGAGTGAGTCCCATGTTTGATATAATGTATC
ACTTCTTCTTTTCTCCTTCCACTTGTTAAATAATTACGCCGTCTATGACGATTTGTCATA
TCCATATATACCTCTGTTCACACG

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL6793Contig1 776 2 11 U
GCGTCGAATCTTTTTTCTTGGTCCTTGATTAAATTGGTAAGTTCACGTTACAACAACATG
GACAAATATAATATCATATCGAACATGAAAGCTATAACAATAACCGAGAAAGATAACCGG
TTAGTTAAACCGGTGCCAGACATTTCATCGGTGTAGTCATTATAAGAATCTAAACCGCCA
CTACCTTCGGATCCAGTAGTAGTCCACATCCCCAAATTGTTATTCCTGCCACCAACGCCA
AGAACGCCGCAATGAAATGTGATTTGGTCGATGAACGAGGCAGATTTAGGGTCGACGCTA
TACGCCTTCTCGTACCTCATCTCCGCACCTTCTCCAGATGCCACGAAAAACGCTCCGTTA
ACCAAAATGTCTCCCTCCGATCTCCAGTTCCACCCTTTCCAATCACCATCTGGCGTTTCT
ACTCTTTTAGTCACCTCTTTGGCAAACGGGTTGGTTGGGGCAGTATAACGGTTACCCTGA
CTATTAATGGTTGGGTTACCGCTACCGCCAATCGCATACATTTCCCATTGAGTAAAATCA
TTGTTAACCACATGGATATAACCACGTCTACATCTAGGCATCCTTTGCACCAACTTCTCT
CCGAAGTGATTAAACGCAATGGTTACCTGCATGCCACTGTCTGGCTCGTAGTGATCGCTG
TGACCAAGAAGCATGACTTCATTGTGGTGTGAGAAGAAGTTGTTCGATATTGTAATCCCT
GTGGACCCCATCACAGCATCTATCAAACCATCTCTACATCTTGATAGAGAACAATG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D074JQ U 1
AF RR2BV09JQ U 1
BS 1 69 RR2BV09JQ
BS 70 70 RR2D074JQ
BS 71 461 RR2BV09JQ
BS 462 462 RR2D074JQ
BS 463 497 RR2BV09JQ
BS 498 498 RR2D074JQ
BS 499 563 RR2BV09JQ
BS 564 564 RR2D074JQ
BS 565 587 RR2BV09JQ
BS 588 588 RR2D074JQ
BS 589 776 RR2BV09JQ

RD RR2D074JQ 646 0 0
GA
GTCGAATCTTTTTTCTTGTTCCTTGATTAAATTGGTAAGTTCACGTTACAACAACATGGA
CAAATATAATATCATATCGAACATGAAAGCTATAACAATAACCGAGAAAGATAACCGGTT
AGTTAAACCGGTGCCAGACATTTCATCGGTGTAGTCATTATAAGAATCTAAACCGCCACT
ACCTTCGGATCCAGTAGTAGTCCACATCCCCAAATTGTTATTCCTGCCACCAACGCCAAG
AACGCCGCAATGAAATGTGATTTGGTCGATGAACGAGGCAGATTTAGGGTCGACGCTATA
CGCCTTCTCGTACCTCATCTCCGCACCTTCTCCAGATGCCACGAAAAACGCTCCGTTAAC
CAAAATGTCTCCCTCCGATCTCCAGTTCCACCCTTTCCAATCACCATCTGGCGTTTCTAC
TCTTTTAGTCACCTCTTTGGCAAACGGGTTGGTTGGGGCAGTATAGCGGTTACCCTGACT
ATTAATGGTTGGGTTACCGCTACCGCCAATCGCATACATTTCCCATTGAGTAAAATCATT
GTTAACCACATGGATATAACCACGTCTACATCTAGGCATCCTTTGCACCAACTTCTCTCC
GAAGTGATTAAACGCAATGGTTACCTGCATGCCACTGTCTGGCT

QA 3 646 3 646
DS 

RD RR2BV09JQ 776 0 0
GCGTCGAATCTTTTTTCTTGGTCCTTGATTAAATTGGTAAGTTCACGTTACAACAACATG
GACAAATATGATATCATATCGAACATGAAAGCTATAACAATAACCGAGAAAGATAACCGG
TTAGTTAAACCGGTGCCAGACATTTCATCGGTGTAGTCATTATAAGAATCTAAACCGCCA
CTACCTTCGGATCCAGTAGTAGTCCACATCCCCAAATTGTTATTCCTGCCACCAACGCCA
AGAACGCCGCAATGAAATGTGATTTGGTCGATGAACGAGGCAGATTTAGGGTCGACGCTA
TACGCCTTCTCGTACCTCATCTCCGCACCTTCTCCAGATGCCACGAAAAACGCTCCGTTA
ACCAAAATGTCTCCCTCCGATCTCCAGTTCCACCCTTTCCAATCACCATCTGGCGTTTCT
ACTCTTTTAGTCACCTCTTTGGCAAACGGGTTGGTTGGGGCGGTATAACGGTTACCCTGA
CTATTAATGGTTGGGTTCCCGCTACCGCCAATCGCATACATTTCCCATTGAGTAAAATCA
TTGTTAACCACATGGATATAACCGCGTCTACATCTAGGCATCCTTTGTACCAACTTCTCT
CCGAAGTGATTAAACGCAATGGTTACCTGCATGCCACTGTCTGGCTCGTAGTGATCGCTG
TGACCAAGAAGCATGACTTCATTGTGGTGTGAGAAGAAGTTGTTCGATATTGTAATCCCT
GTGGACCCCATCACAGCATCTATCAAACCATCTCTACATCTTGATAGAGAACAATG

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL6794Contig1 921 2 8 U
GGACGTATATTGAGCTCTCCTCATTTCCTTTGTTTTAAAAAGAACGTAAGGGCTTCACAT
ATTTGGTTTAAGTGGGCTACGTACATTAGGCTTTATCATAGATTAATATACATTAGGGCA
TTCACCGTCTTCTTCGTCGCGAACCTTCTTATCTGGCGCTCCCTCTACCGGCGCTCATCT
CCGTTGCTGCGCTCTTTATGACTATTGATTATGCACGTCGCTTCCTCATCCTGTAACGCC
TTCTGCTGTCTCTATTTATAGTGTCTTCCTGCTCCTCCAGTCGCTAACGCCGCCGCTGCA
TATTCCACGTTCGCCTCTCTCCGTCTCGGAAGGACCTCTCAGACCGTCGTCGGTCGGCTT
ATCCATTTTTGGGATTCCGAAAACATTAACAAAAATGGGGAGTTCATGGGAATAACACTC
CTCCTGCTCGATGAGTTGGACTCGGTGATTCATGATTTCATTCCCGCTAAACGGGCTAGC
CAGTACCGGTCATCTTTGAAAGCCGGTTCAATCATGAGATTGGACCGTTTTGAAGTTGCA
CGGGTCAGCCACACGTACAAGATAACCGAGCATCAATTCCTGATATGTTTCATAAATAAA
CAGGAAAAAAAAGAAACTACACACCCGTTATGCATAAATACTATTTTACAAGCAAACACT
ATTTTACATTTGGAACTCCTTTTGAAAACTGCCGACCACAAAATCTGAATCTTGATGGGC
CAATCTGAACTAAACTACACCAAAGTCTGTACTTGAGGACTCACATATCTGTGTTCATAA
ATCATGAATCAAACTCTTACATTGGCCACAGTTAGTTAAGCAAAATTAATGAAATTTCTA
TATTTTGGTGTAGTATCATCCACGTTATAGTGGGCTGGATCAGAAATGAAAATTTGTTAT
ATTTATATATTTAAAGTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX87TF U 1
AF RR2BX87JQ C 175
BS 1 611 RR2BX87TF
BS 612 612 RR2BX87JQ
BS 613 687 RR2BX87TF
BS 688 688 RR2BX87JQ
BS 689 702 RR2BX87TF
BS 703 703 RR2BX87JQ
BS 704 726 RR2BX87TF
BS 727 921 RR2BX87JQ

RD RR2BX87TF 726 0 0
GGACGTATATTGAGCTCTCCTCATTTCCTTTGTTTTAAAAAGAACGTAAGGGCTTCACAT
ATTTGGTTTAAGTGGGCTACGTACATTAGGCTTTATCATAGATTAATATACATTAGGGCA
TTCACCGTCTTCTTCGTCGCGAACCTTCTTATCTGGCGCTCCCTCTACCGGCGCTCATCT
CCGTTGCTGCGCTCTTTATGACTATTGATTATGCACGTCGCTTCCTCATCCTGTAACGCC
TTCTGCTGTCTCTATTTATAGTGTCTTCCTGCTCCTCCAGTCGCTAACGCCGCCGCTGCA
TATTCCACGTTCGCCTCTCTCCGTCTCGGAAGGACCTCTCAGACCGTCGTCGGTCGGCTT
ATCCATTTTTGGGATTCCGAAAACATTAACAAAAATGGGGAGTTCATGGGAATAACACTC
CTCCTGCTCGATGAGTTGGACTCGGTGATTCATGATTTCATTCCCGCTAAACGGGCTAGC
CAGTACCGGTCATCTTTGAAAGCCGGTTCAATCATGAGATTGGACCGTTTTGAAGTTGCA
CGGGTCAGCCACACGTACAAGATAACCGAGCATCAATTCCTGATATGTTTCATAAATAAA
CAGGAAAAAAA*GAAACTACACACCCGTTATGCATAAATACTATTTTACAAGCAAACACT
ATTTTACATTTGGAACTCCTTTTGAAA*CTGCCGACCACAAA*TCTGAATCTTGATGGGC
CAATCT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2BX87JQ 747 0 0
TCATCTCCGTTGCTGCGCTCTTTATGACTATTGATTATGCACGTCGCTTCCTCATCCTGT
AACGCCTTCTGCTGTCTCTATTTATAGTGTCTTCCTGCTCCTCCAGTCGCTAACGCCGCC
GCTGCATATTCCACGTTCGCCTCTCTCCGTCTCGGAAGGACCTCTCAGACCGTCGTCGGT
CGGCTTATCCATTTTTGGGATTCCGAAAACATTAACAAAAATGGGGAGTTCATGGGAATA
ACACTCCTCCTGCTCGATGAGTTGGACTCGGTGATTCATGATTTCATTCCCGCTAAACGG
GCTAGCCAGTACCGGTCATCTTTGAAAGCCGGTTCAATCATGAGATTGGACCGTTTTGAA
GTTGCACGGGTCAGCCACACGTACAAGATAACCGAGCATCAATTCCTGATATGTTTCATA
AATAAACAGGAAAAAAAAGAAACTACACACCCGTTATGCATAAATACTATTTTACAAGCA
AACACTATTTTACATTTGGAACTCCTTTTGAAAACTGCCGACCACAAAATCTGAATCTTG
ATGGGCCAATCTGAACTAAACTACACCAAAGTCTGTACTTGAGGACTCACATATCTGTGT
TCATAAATCATGAATCAAACTCTTACATTGGCCACAGTTAGTTAAGCAAAATTAATGAAA
TTTCTATATTTTGGTGTAGTATCATCCACGTTATAGTGGGCTGGATCAGAAATGAAAATT
TGTTATATTTATATATTTAAAGTTTCT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL6795Contig1 961 2 2 U
GGTGGAGATAGGTTTGTGAAGATTGAGCAGCCTCCCACTTCTTTTCTACAAGCAATGGAA
GAGTATGTGAAAGAAGCACCATTAGCAGCAGGTGCCAAGAAGGAGCAGGTAATGGAGAAG
CTTGCAGCTCCCAAAGAAATCTTGGCCATAGAGTACGAAAAGCCACCAAAAGAAGTTGAA
GAGAAACCGGAATCACCTGAACCTCCGGTTAAAGCAGAAGCAGAAGCAGAAGCAGAGAAG
CCTGCCCCTGTTGAGAAACAACCTGATTTGCTGTCTATGGATGATCCAGCTCCAGTGGTC
TCTCAACTTGAAGAGAAGAATGCTTTGGCTTTGGCTATTGTCCCTGTTAGCGTTGAGCAT
CCAGTTTCCACAACTGATTTCACAAATGGGAATTCTTCTGGCTGGGAATTGGCACTTGTG
ACTGCCCCAAGCTCTAATGAAGTTGCTGCTGCTAATAGCAAATTGGCGGGTGGATTGGAC
AAGCTGACACTTGACAGCCTATACGAGGATGCACCAGCCTTTCTTTGCGTCTAATGGAGT
CTCAGCTCCTCCTCCTTTTCAAATGGCAAATCAATATCATCAGCCGTATGGTGGGTTTCA
GCATCAGAACTCAGGGATGATGATGGGACCTGTGCAGCCTTATCAGCAGCATCAGCAGCA
ACAGCAACAACAACAGAACATGAATCCCTTCGGAAACCCGTTTGTCGCGAATGGTAATCC
ACACCAACCGTATGGCTCGGTTCAAGGAGGTTACAATCCATATTCTAGCCTTATGTGAGA
TTTGATACTAATGTATGTTTGTGTACAATCTTATATATACAGATATATGTTGTGAGGTGA
TTGTAGCTAGAGAGATTCTTTTTTTATTTTTGTTGTTGTTGAGTAAATACATACATTACG
TCTCTGTATGTGTGTGTGGATGTATCTGTAAGCGAGAGAATATATGATTCTTGAGGACAC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2A564TF U 1
AF RR2A564JQ C 149
BS 1 821 RR2A564TF
BS 822 961 RR2A564JQ

RD RR2A564TF 821 0 0
GGTGGAGATAGGTTTGTGAAGATTGAGCAGCCTCCCACTTCTTTTCTACAAGCAATGGAA
GAGTATGTGAAAGAAGCACCATTAGCAGCAGGTGCCAAGAAGGAGCAGGTAATGGAGAAG
CTTGCAGCTCCCAAAGAAATCTTGGCCATAGAGTACGAAAAGCCACCAAAAGAAGTTGAA
GAGAAACCGGAATCACCTGAACCTCCGGTTAAAGCAGAAGCAGAAGCAGAAGCAGAGAAG
CCTGCCCCTGTTGAGAAACAACCTGATTTGCTGTCTATGGATGATCCAGCTCCAGTGGTC
TCTCAACTTGAAGAGAAGAATGCTTTGGCTTTGGCTATTGTCCCTGTTAGCGTTGAGCAT
CCAGTTTCCACAACTGATTTCACAAATGGGAATTCTTCTGGCTGGGAATTGGCACTTGTG
ACTGCCCCAAGCTCTAATGAAGTTGCTGCTGCTAATAGCAAATTGGCGGGTGGATTGGAC
AAGCTGACACTTGACAGCCTATACGAGGATGCACCAGCCTTTCTTTGCGTCTAATGGAGT
CTCAGCTCCTCCTCCTTTTCAAATGGCAAATCAATATCATCAGCCGTATGGTGGGTTTCA
GCATCAGAACTCAGGGATGATGATGGGACCTGTGCAGCCTTATCAGCAGCATCAGCAGCA
ACAGCAACAACAACAGAACATGAATCCCTTCGGAAACCCGTTTGTCGCGAATGGTAATCC
ACACCAACCGTATGGCTCGGTTCAAGGAGGTTACAATCCATATTCTAGCCTTATGTGAGA
TTTGATACTAATGTATGTTTGTGTACAATCTTATATATACA

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR2A564JQ 813 0 0
TAGAGTACGAAAAGCCACCAAAAGAAGTTGAAGAGAAACCGGAATCACCTGAACCTCCGG
TTAAAGCAGAAGCAGAAGCAGAAGCAGAGAAGCCTGCCCCTGTTGAGAAACAACCTGATT
TGCTGTCTATGGATGATCCAGCTCCAGTGGTCTCTCAACTTGAAGAGAAGAATGCTTTGG
CTTTGGCTATTGTCCCTGTTAGCGTTGAGCATCCAGTTTCCACAACTGATTTCACAAATG
GGAATTCTTCTGGCTGGGAATTGGCACTTGTGACTGCCCCAAGCTCTAATGAAGTTGCTG
CTGCTAATAGCAAATTGGCGGGTGGATTGGACAAGCTGACACTTGACAGCCTATACGAGG
ATGCACCAGCCTTTCTTTGCGTCTAATGGAGTTTCAGCTCCTCCTCCTTTTCAAATGGCA
AATCAATATCATCAGCCGTATGGTGGGTTTCAGCATCAGAACTCAGGGATGATGATGGGA
CCTGTGCAGCCTTATCAGCAGCATCAGCAGCAACAGCAACAACAACAGAACATGAATCCC
TTCGGAAACCCGTTTGTCGCGAATGGTAATCCACACCAACCGTATGGCTCGGTTCAAGGA
GGTTACAATCCATATTCTAGCCTTATGTGAGATTTGATACTAATGTATGTTTGTGTACAA
TCTTATATATACAGATATATGTTGTGAGGTGATTGTAGCTAGAGAGATTCTTTTTTTATT
TTTGTTGTTGTTGAGTAAATACATACATTACGTCTCTGTATGTGTGTGTGGATGTATCTG
TAAGCGAGAGAATATATGATTCTTGAGGACACC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

CO CL6796Contig1 847 2 2 U
GGGAGCCCTAACTGTGTGTGAACTCAGTAGCTTGAGACTCGGCGGAGGAAGAGGAACTCG
AAGATGAAGCTGAAGCAATTAGAAGGCTTGTTGGGTGATCTTCAACAGTTCTCTAACCCT
AAAGTTGAATTGGAGCAGTACCCAACTGGTCCTCATATTGCTTCTCGCATGCTTTTCACC
GCAGAGAATTCATATGGAGACATAACTGATAAAGTCGTTGCGGATTTTGGCTGTGGCTGC
GGTACTTTAAGTACTGCTGCTTCTCTTCTAGATGCTGCCTGTGTGATTGGAGACGATATC
GACCTTCAGTCTCTTGAAACAGCAACACTTAACGCTGAGGAACTTGAGGTGGAGATAGAT
TTAGTTCAATGTGACATTACAAAGTTAGAGTTAAAAGGCCACCAGATTGTGGATACTGTT
GTAATGAATCCTCCCTTTGGAACACGAAAGAAAGGAGCTGACATGGAGTTCCTCTCTGCG
GCTATGAAGGTCGCCTCTCAAGCTGTTTACTCCTTGCATAAGACATCTACCAGAGAACAC
ACTAAAAGGGCAGCGTTGCGTGATTTTAATGCGAAAAGTGCCGAAGTTATATGTGAGCTC
CGATATGACTTGCCGAAACTCTACAAGTTCCACAAACGAAAAGAAGTCGATATTGCAGTT
GATCTCTGGCGTTTTGAGCCTAGACAGAACTAGACCCGCCACGTTCTTGCAATGTTTAGC
TTTGAGTTGACATTTGGTTATAATGTGGGATGTTTCATGATATGAACTCAAGTTTCATAA
ATGTTTGCTGATTTGAACTAAGAAGATGAATCTGAAGCAGTTAGAAAGCAGGGTGATCTT
GAACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF12TF U 1
AF RR2CF12JQ C 55
BS 1 629 RR2CF12TF
BS 630 847 RR2CF12JQ

RD RR2CF12TF 629 0 0
GGGAGCCCTAACTGTGTGTGAACTCAGTAGCTTGAGACTCGGCGGAGGAAGAGGAACTCG
AAGATGAAGCTGAAGCAATTAGAAGGCTTGTTGGGTGATCTTCAACAGTTCTCTAACCCT
AAAGTTGAATTGGAGCAGTACCCAACTGGTCCTCATATTGCTTCTCGCATGCTTTTCACC
GCAGAGAATTCATATGGAGACATAACTGATAAAGTCGTTGCGGATTTTGGCTGTGGCTGC
GGTACTTTAAGTACTGCTGCTTCTCTTCTAGATGCTGCCTGTGTGATTGGAGACGATATC
GACCTTCAGTCTCTTGAAACAGCAACACTTAACGCTGAGGAACTTGAGGTGGAGATAGAT
TTAGTTCAATGTGACATTACAAAGTTAGAGTTAAAAGGCCACCAGATTGTGGATACTGTT
GTAATGAATCCTCCCTTTGGAACACGAAAGAAAGGAGCTGACATGGAGTTCCTCTCTGCG
GCTATGAAGGTCGCCTCTCAAGCTGTTTACTCCTTGCATAAGACATCTACCAGAGAACAC
ACTAAAAGGGCAGCGTTGCGTGATTTTAATGCGAAAAGTGCCGAAGTTATATGTGAGCTC
CGATATGACTTGCCGAAACTCTACAAGTT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2CF12JQ 793 0 0
AACTCGAAGATGAAGCTGAAGCAATTAGAAGGCTTGTTGGGTGATCTTCAACAGTTCTCT
AACCCTAAAGTTGAATTGGAGCAGTACCCAACTGGTCCTCATATTGCTTCTCGCATGCTT
TTCACCGCAGAGAATTCATATGGAGACATAACTGATAAAGTCGTTGCGGATTTTGGCTGT
GGCTGCGGTACTTTAAGTACTGCTGCTTCTCTTCTAGATGCTGCCTGTGTGATTGGATAC
GATATCGACCTTCAGTCTCTTGAAACAGCAACACTTAACGCTGAGGAACTTGAGGTGGAG
ATAGATTTAGTTCAATGTGACATTACAAAGTTAGAGTTAAAAGGCCACCAGATTGTGGAT
ACTGTTGTAATGAATCCTCCCTTTGGAACACGAAAGAAAGGAGCTGACATGGAGTTCCTC
TCTGCGGCTATGAAGGTCGCCTCTCAAGCTGTTTACTCCTTGCATAAGACATCTACCAGA
GAACACACTAAAAGGGCAGCGTTGCGTGATTTTAATGCGAAAAGTGCCGAAGTTATATGT
GAGCTCCGATATGACTTGCCGAAACTCTACAAGTTCCACAAACGAAAAGAAGTCGATATT
GCAGTTGATCTCTGGCGTTTTGAGCCTAGACAGAACTAGACCCGCCACGTTCTTGCAATG
TTTAGCTTTGAGTTGACATTTGGTTATAATGTGGGATGTTTCATGATATGAACTCAAGTT
TCATAAATGTTTGCTGATTTGAACTAAGAAGATGAATCTGAAGCAGTTAGAAAGCAGGGT
GATCTTGAACATC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL6797Contig1 703 2 1 U
GCCTCGGTGTGCTAATCAAAGGTAAAGAACTGAATACCTAGATTTCTCTTATCCTTCCTT
AGGTCCTCATGAATTAGAATAAAGTAAGGGAGCACACCGATCGAAACCTGTTTACTTTCG
AAAGTTGACTCGCCACCTACTACTTGTAGTCAACCAAAATTGCTTCGCTAGGAGTGTGCT
ATTAAAAGCTGTTGATCGGCCTATGGCACTTTACTAAACCTAGGAGAGGAGAACTGCTAC
TATCTATTGCATGGGTGCCTGCGTGTAAGAGGTGTAAGAGAAAGAAAGAAATTTCCGTCA
ACAGGATGAATCCCAGCGAAAAGAAGGCGGAAAGCCTATGAAAGGTGGAAAGCCCTAGCG
GAGCAATCTTAAAGATGGAAAGCTCTTAAAGGTGGAAAGCCAGCACAAGCACACTACTGT
GAAAGCTAAGAGTACTTCTATATTAGGAATTTTGCTAGTGGCGGATACGTACTATCTTCT
TTATATTGACATTCTGCTACCCGGGAATCCAGTTCGTAAAACTCGGAGATATCAAACGGA
AGTAAAAAAAGCAGAGAAGGATTAAGACTAACCACTTTTTCGACATCCCTTCATGAAGCG
CAGCAACATTTCGGAAGACTGCTAAAAGCGAGAAGTCCTGACCTTCGTTACTAGAGCACA
GAAAAAGCAACAGTGTGCTGTACAGAGAACTTGCTTCGATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FF14TF U 1
AF RR2FF14JQ C 22
BS 1 703 RR2FF14TF

RD RR2FF14TF 703 0 0
GCCTCGGTGTGCTAATCAAAGGTAAAGAACTGAATACCTAGATTTCTCTTATCCTTCCTT
AGGTCCTCATGAATTAGAATAAAGTAAGGGAGCACACCGATCGAAACCTGTTTACTTTCG
AAAGTTGACTCGCCACCTACTACTTGTAGTCAACCAAAATTGCTTCGCTAGGAGTGTGCT
ATTAAAAGCTGTTGATCGGCCTATGGCACTTTACTAAACCTAGGAGAGGAGAACTGCTAC
TATCTATTGCATGGGTGCCTGCGTGTAAGAGGTGTAAGAGAAAGAAAGAAATTTCCGTCA
ACAGGATGAATCCCAGCGAAAAGAAGGCGGAAAGCCTATGAAAGGTGGAAAGCCCTAGCG
GAGCAATCTTAAAGATGGAAAGCTCTTAAAGGTGGAAAGCCAGCACAAGCACACTACTGT
GAAAGCTAAGAGTACTTCTATATTAGGAATTTTGCTAGTGGCGGATACGTACTATCTTCT
TTATATTGACATTCTGCTACCCGGGAATCCAGTTCGTAAAACTCGGAGATATCAAACGGA
AGTAAAAAAAGCAGAGAAGGATTAAGACTAACCACTTTTTCGACATCCCTTCATGAAGCG
CAGCAACATTTCGGAAGACTGCTAAAAGCGAGAAGTCCTGACCTTCGTTACTAGAGCACA
GAAAAAGCAACAGTGTGCTGTACAGAGAACTTGCTTCGATAGC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2FF14JQ 682 0 0
GTAAAGAACTGAATACCTAGATTTCTCTTATCCTTCCTTAGGTCCTCATGAATTAGAATA
AAGTAAGGGAGCACACCGATCGAAACCTGTTTACTTTCGAAAGTTGACTCGCCACCTACT
ACTTGTAGTCAACCAAAATTGCTTCGCTAGGAGTGTGCTATTAAAAGCTGTTGATCGGCC
TATGGCACTTTACTAAACCTAGGAGAGGAGAACTGCTACTATCTATTGCATGGGTGCCTG
CGTGTAAGAGGTGTAAGAGAAAGAAAGAAATTTCCGTCAACAGGATGAATCCCAGCGAAA
AGAAGGCGGAAAGCCTATGAAAGGTGGAAAGCCCTAGCGGAGCAATCTTAAAGATGGAAA
GCTCTTAAAGGTGGAAAGCCAGCACAAGCACACTACTGTGAAAGCTAAGAGTACTTCTAT
ATTAGGAATTTTGCTAGTGGCGGATACGTACTATCTTCTTTATATTGACATTCTGCTACC
CGGGAATCCAGTTCGTAAAACTCGGAGATATCAAACGGAAGTAAAAAAAGCAGAGAAGGA
TTAAGACTAACCACTTTTTCGACATCCCTTCATGAAGCGCAGCAACATTTCGGAAGACTG
CTAAAAGCGAGAAGTCCTGACCTTCGTTACTAGAGCACAGAAAAAGCAACAGTGTGCTGT
ACAGAGAACTTGCTTCGATAGC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL6798Contig1 710 2 2 U
GTCCTCAGAGGGCAAGTTCGCGAATCAAGTCTTCAGAGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCA
TTTTCTCGGCGCTGTGTTCACTGGTACGCTCATTGACTCCAGATATGCTCCAAACGGCGA
GAAGATCCGGCTTGATATTCCGCACGGATTGTACGACGGGGCACAAGTCACCTTCTCGTG
GAAACGGACTACTGACTGGGAGGGAGTCAAGAATAGACCTGAAGCCACGTATGGTCGTAT
TAAATTGAACGCCGGTACACCCACAGGGTTTGGATTGTCCAGCCGCAAGGGTGCTGCCGG
ATGGGACGGTTATGACTTTTCGGGTCATGTAAACTCCAAGGACCAAATCATAGCTACAAC
CACAATCCATAATAGAAAAACTCAGATTGTCTTCAACAGGTTGGCCGGAACTTGATTTCG
GCATTCCAAGTATACAAGCACCTGAACCTGGCCCTTTCAACAGCGAGACCCTATATACTA
AATAATTTCTCGTTGTTTTTTCATATTCAGTACTTGAAAAATAATGCTAATAGATAGACA
ACGGATTTTCCGTTGTTTATTTGGATTTAGCTTAGTATCTTTAAAATTCGTAATATCATT
ATATTAATAAAAGTCTGGTCGGTCTGGATCCTCTTGTTGAGGTATGATTCAACCCAGCCC
AGACTCTATCCCTATGTAATCCACTTCTCTTTTTCCGGTTTATATCATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH28TF U 1
AF RR2DH28JQ C 8
BS 1 689 RR2DH28TF
BS 690 710 RR2DH28JQ

RD RR2DH28TF 689 0 0
GTCCTCAGAGGGCAAGTTCGCGAATCAAGTCTTCAGAGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCA
TTTTCTCGGCGCTGTGTTCACTGGTACGCTCATTGACTCCAGATATGCTCCAAACGGCGA
GAAGATCCGGCTTGATATTCCGCACGGATTGTACGACGGGGCACAAGTCACCTTCTCGTG
GAAACGGACTACTGACTGGGAGGGAGTCAAGAATAGACCTGAAGCCACGTATGGTCGTAT
TAAATTGAACGCCGGTACACCCACAGGGTTTGGATTGTCCAGCCGCAAGGGTGCTGCCGG
ATGGGACGGTTATGACTTTTCGGGTCATGTAAACTCCAAGGACCAAATCATAGCTACAAC
CACAATCCATAATAGAAAAACTCAGATTGTCTTCAACAGGTTGGCCGGAACTTGATTTCG
GCATTCCAAGTATACAAGCACCTGAACCTGGCCCTTTCAACAGCGAGACCCTATATACTA
AATAATTTCTCGTTGTTTTTTCATATTCAGTACTTGAAAAATAATGCTAATAGATAGACA
ACGGATTTTCCGTTGTTTATTTGGATTTAGCTTAGTATCTTTAAAATTCGTAATATCATT
ATATTAATAAAAGTCTGGTCGGTCTGGATCCTCTTGTTGAGGTATGATTCAACCCAGCCC
AGACTCTATCCCTATGTAATCCACTTCTC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2DH28JQ 703 0 0
GAGGGCAAGTTCGCGAATCAAGTCTTCAGAGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCATTTTCTC
GGCGCTGTGTTCACTGGTACGCTCATTGACTCCAGATATGCTCCAAACGGCGAGAAGATC
CGGCTTGATATTCCGCACGGATTGTACGACGGGGCACAAGTCACCTTCTCGTGGAAACGG
ACTACTGACTGGGAGGGAGTCAAGAATAGACCTGAAGCCACGTATGGTCGTATTAAATTG
AACGCCGGTACACCCACAGGGTTTGGATTGTCCAGCCGCAAGGGTGCTGCCGGATGGGAC
GGTTATGACTTTTCGGGTCATGTAAACTCCAAGGACCAAATCATAGCTACAACCACAATC
CATAATAGAAAAACTCAGATTGTCTTCAACAGGTTGGCCGGAACTTGATTTCGGCATTCC
AAGTATACAAGCACCTGAACCTGGCCCTTTCAACAGCGAGACCCTATATACTAAATAATT
TCTCGTTGTTTTTTCATATTCAGTACTTGAAAAATAATGCTAATAGATAGACAACGGATT
TTCCGTTGTTTATTTGGATTTAGCTTAGTATCTTTAAAATTCGTAATATCATTATATTAA
TAAAAGTCTGGTCGGTCTGGATCCTCTTGTTGAGGTATGATTCAACCCAGCCCAGACTCT
ATCCCTATGTAATCCACTTCTCTTTTTCCGGTTTATATCATAT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6800Contig1 1365 2 4 U
GGACGCTCTCTTCTTTCTCTCTCTCTGACACATATCTCTCTCTCTTTCCTTTTCTCTCTC
TTCTGTTGTGAAAGCCAAACAGTGATGGTACTACTTCTTTTGAGGGATTTAGTTTAATGC
CCACGAAGAAGAGCTAGTTTAAGTAGTAGAAGAGATTGTCTTCTTCTTCTTTCATTCTCC
ACAAAGATCTCGCGACAAGGGGGTCCTTTTGGTAGCTCAATGTGTAGTAGTATTCAAGAT
TTGAAGATGATGAAAAACAACTTATTCTGCTGGTTTTAAGACATAAAAAATGGGGTTTAT
TCAGTTTGCTGGGTTCTTGGGGTTTATGGTAATAATAAGCTTTGTCTAAGTCCTGATGGT
TGTGGGGGAGGGGGACAAGGGAGATGGAGAAAGACGAGTTTGTGCTTCTTCTTGACATGC
CTCTCCAGGATCTGCTGGACAACATGGCAGCAATCTCTTGAACTTCTCTATAACCGGTCA
GTCTGTACTGCCTGAGCAGTTAATGGGAGAAGGTTGGTCTCCAAAAGCATCCAACACGTT
TTCTGAACCGTTGTCACTTCCACAAGCGTACGCTGGTGGGAAAAGTCTTGCGCTGGAACC
TGCAAGTGCCAACGTGAATCCCTCTGTATTTGGTGTTGATCCTGGCTCTTCTGGACTTTT
CCTCCCAAGTACGGTTCCTCGGTTTGCTTCTTCATCAGGAGGAGAAGCGGAAGCTTACCC
AATTTCACTAGCAGATTCAGGGTTTGAGAATTCCTTATACAACAGCTGCATGCAAGACAC
AACTCATGAGTTATTGCATGGAGTTGGACAGATTAACTCGTCCAACCAAACCAAGAACTT
TGTAAAGGTTTATAAATCAGGTTCGGTAGGGCGTTCACTAGACATCTCCCGATTCAGCAG
CTATCATGAGCTGCGAGAAGAGTTAGGGAAGATGTTTGCTATCGAAGGGTTGTTGGAAGA
CCCCCTTAGATCAGGCTGGCAGCTTGTATTCGTTGACAAGGAAAATGATATTTTTCTCCT
CGGCGATGACCCTTGGGAGTCATTTGTGAGTAACGTTTGGTACATAAAGATACTATCCCC
GGAAGATGTGCAGGAAATGGGGGATCATGGTGAAGGCAGTGGTGGGTCTCTCCCGCAAAA
CCCGACCCATCTTTAAAACCTGAAGTCGCTTCATTCCACTGATCTTTATATGTCATTCGT
CGCATCTCCCTCTCTCTTTCTCTACTTTTGACGTTGGTAGAAAGAAACATAATCAAATCA
TATCTGTGAGTATGTGTCCTGAAACTTGAGGGCGTACTTTGGCTGTGTATTAGACACTCT
GGTCATAAACATAAGAACCTCTCTAGGCTCTTTGCTTTTTCTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR90TF U 1
AF RR2FR90JQ C 632
BS 1 673 RR2FR90TF
BS 674 674 RR2FR90JQ
BS 675 694 RR2FR90TF
BS 695 1365 RR2FR90JQ

RD RR2FR90TF 694 0 0
GGACGCTCTCTTCTTTCTCTCTCTCTGACACATATCTCTCTCTCTTTCCTTTTCTCTCTC
TTCTGTTGTGAAAGCCAAACAGTGATGGTACTACTTCTTTTGAGGGATTTAGTTTAATGC
CCACGAAGAAGAGCTAGTTTAAGTAGTAGAAGAGATTGTCTTCTTCTTCTTTCATTCTCC
ACAAAGATCTCGCGACAAGGGGGTCCTTTTGGTAGCTCAATGTGTAGTAGTATTCAAGAT
TTGAAGATGATGAAAAACAACTTATTCTGCTGGTTTTAAGACATAAAAAATGGGGTTTAT
TCAGTTTGCTGGGTTCTTGGGGTTTATGGTAATAATAAGCTTTGTCTAAGTCCTGATGGT
TGTGGGGGAGGGGGACAAGGGAGATGGAGAAAGACGAGTTTGTGCTTCTTCTTGACATGC
CTCTCCAGGATCTGCTGGACAACATGGCAGCAATCTCTTGAACTTCTCTATAACCGGTCA
GTCTGTACTGCCTGAGCAGTTAATGGGAGAAGGTTGGTCTCCAAAAGCATCCAACACGTT
TTCTGAACCGTTGTCACTTCCACAAGCGTACGCTGGTGGGAAAAGTCTTGCGCTGGAACC
TGCAAGTGCCAACGTGAATCCCTCTGTATTTGGTGTTGATCCTGGCTCTTCTGGACTTTT
CCTCCCAAGTACG*TTCCTCGGTTTGCTTCTTCA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2FR90JQ 734 0 0
GGTGTTGATCCTGGCTCTTCTGGACTTTTCCTCCCAAGTACGGTTCCTCGGTTTGCTTCT
TCATCAGGAGGAGAAGCGGAAGCTTACCCAATTTCACTAGCAGATTCAGGGTTTGAGAAT
TCCTTATACAACAGCTGCATGCAAGACACAACTCATGAGTTATTGCATGGAGTTGGACAG
ATTAACTCGTCCAACCAAACCAAGAACTTTGTAAAGGTTTATAAATCAGGTTCGGTAGGG
CGTTCACTAGACATCTCCCGATTCAGCAGCTATCATGAGCTGCGAGAAGAGTTAGGGAAG
ATGTTTGCTATCGAAGGGTTGTTGGAAGACCCCCTTAGATCAGGCTGGCAGCTTGTATTC
GTTGACAAGGAAAATGATATTTTTCTCCTCGGCGATGACCCTTGGGAGTCATTTGTGAGT
AACGTTTGGTACATAAAGATACTATCCCCGGAAGATGTGCAGGAAATGGGGGATCATGGT
GAAGGCAGTGGTGGGTCTCTCCCGCAAAACCCGACCCATCTTTAAAACCTGAAGTCGCTT
CATTCCACTGATCTTTATATGTCATTCGTCGCATCTCCCTCTCTCTTTCTCTACTTTTGA
CGTTGGTAGAAAGAAACATAATCAAATCATATCTGTGAGTATGTGTCCTGAAACTTGAGG
GCGTACTTTGGCTGTGTATTAGACACTCTGGTCATAAACATAAGAACCTCTCTAGGCTCT
TTGCTTTTTCTAGT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL6801Contig1 616 2 1 U
GGGAACATACAGATCACTGAAAGTAGAACAACCACAAAGACAGAGAATCAAAGAAGAAGA
AACATGGTGAAGGTGATGTGGGGTTCCATTTTAGCTCTCGCTGCAGCGCTTCTCCTGGTG
ACGGTGGAAAACATTCCGATGGCGGAGGGAGTGACGTGCTCGCCGACGGAACTGACTTCA
TGTTCGTCGGCGTTTATGTCTGCTTCCCCGCCGTCGGCAACGTGCTGCGCCAAGCTGAGA
GAGCAGAAGCCATGCCTTTGTGGGTATCTGAGGAACCCTGCCCTTCGCCAATACGTTAAC
TCTCCAAACGCCAAAAAAGTCGCCAGCAGTTGCAATGTTGCAACCCCAAACTGTTAATCA
CGATTATTTAGTGACAAGTTTCGCTGATCATGAGTGTTTAATTACTAGTTAAAATGGGTC
AGGTCCTCGACACTACTGTTTAGAATAATAGTGTGTGGTGATTATGATGATCATCATCAT
GCTTTAATGTTATGTCATGTTATGCTACGTATATTATGTTATGTATGTTTCTATCTTTTG
AAACATTTTCCAAATATGATTACTCTGTCTCTGTGCTAATCCTACATTTCAATTTCTAGC
TATCAATTTTCACACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B426JQ C 1
AF RR2B426TF U 1
BS 1 616 RR2B426TF

RD RR2B426JQ 616 0 0
GGGAACATACAGATCACTGAAAGTAGAACAACCACAAAGACAGAGAATCAAAGAAGAAGA
AACATGGTGAAGGTGATGTGGGGTTCCATTTTAGCTCTCGCTGCAGCGCTTCTCCTGGTG
ACGGTGGAAAACATTCCGATGGCGGAGGGAGTGACGTGCTCGCCGACGGAACTGACTTCA
TGTTCGTCGGCGTTTATGTCTGCTTCCCCGCCGTCGGCAACGTGCTGCGCCAAGCTGAGA
GAGCAGAAGCCATGCCTTTGTGGGTATCTGAGGAACCCTGCCCTTCGCCAATACGTTAAC
TCTCCAAACGCCAAAAAAGTCGCCAGCAGTTGCAATGTTGCAACCCCAAACTGTTAATCA
CGATTATTTAGTGACAAGTTTCGCTGATCATGAGTGTTTAATTACTAGTTAAAATGGGTC
AGGTCCTCGACACTACTGTTTAGAATAATAGTGTGTGGTGATTATGATGATCATCATCAT
GCTTTAATGTTATGTCATGTTATGCTACGTATATTATGTTATGTATGTTTCTATCTTTTG
AAACATTTTCCAAATATGATTACTCTGTCTCTGTGCTAATCCTACATTTCAATTTCTAGC
TATCAATTTTCACACC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2B426TF 616 0 0
GGGAACATACAGATCACTGAAAGTAGAACAACCACAAAGACAGAGAATCAAAGAAGAAGA
AACATGGTGAAGGTGATGTGGGGTTCCATTTTAGCTCTCGCTGCAGCGCTTCTCCTGGTG
ACGGTGGAAAACATTCCGATGGCGGAGGGAGTGACGTGCTCGCCGACGGAACTGACTTCA
TGTTCGTCGGCGTTTATGTCTGCTTCCCCGCCGTCGGCAACGTGCTGCGCCAAGCTGAGA
GAGCAGAAGCCATGCCTTTGTGGGTATCTGAGGAACCCTGCCCTTCGCCAATACGTTAAC
TCTCCAAACGCCAAAAAAGTCGCCAGCAGTTGCAATGTTGCAACCCCAAACTGTTAATCA
CGATTATTTAGTGACAAGTTTCGCTGATCATGAGTGTTTAATTACTAGTTAAAATGGGTC
AGGTCCTCGACACTACTGTTTAGAATAATAGTGTGTGGTGATTATGATGATCATCATCAT
GCTTTAATGTTATGTCATGTTATGCTACGTATATTATGTTATGTATGTTTCTATCTTTTG
AAACATTTTCCAAATATGATTACTCTGTCTCTGTGCTAATCCTACATTTCAATTTCTAGC
TATCAATTTTCACACC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL6802Contig1 808 2 4 U
GGTTTAACATCCAGGTTAAGACTCATTCAATACAATTGAATCAACGACGAAGCCACAACA
ATAACATACAGGATCCTAACTATTTTTGGCACCAATTCAGTTTCAACCTTATATACATAC
ATGCACTCAAAATCTTCGTTTGCAACTGAAGACAGCTTTAACAACAGTGAGACAGAAAAA
ACCGCCATTTTTACGGTTCCTGTCGATTCAAAATCTTATCAGAGAGCTTCTGTTTGAGTC
CAAGGAAAGAAGATGCAACACACAGAAACATCAAACATATTTTTTTTTTACTTTTCTAAA
TGGTACTGCTGAGTGTAGAAACAGCAGTAGATGATGAAGCCCCTGACGAGTAAGCATTTG
AGCTATCTCTAGTCCCGGTGCTAGACGAGGCATTATCTGAAGAAAGATTCGTGTAGTTGT
TGTTGACTCTGTTCACTTCCTCTGGCTTTTTCTCTTTCACTTTCAAGTCCATGAAATCAG
AAATCAAACCCGGCCTGGTTATGCTCCTGTTCTCTACATCCTTCTCCCCTGTTAACAGCT
TCACCACTGGGGACATACTCGGCCTTAGCTTAGGATCGTCTTGCGTGCACAGAAGACCGA
TCTTTAGGTACCTGCAAGCTTCATCCGCGTCAAAGACTCCGTTTAACCCTGTGTCAACAA
GATCCACGAGCTGATTCCGCTCATAAAGATCCCAAGCTCTTTCTAGAAGATATTGATACC
CTATGGGTAACCGTAAGTTTTTGTTGCTTCTTGCACTGACTATCTCCATCAGAAGACTCC
ATAGCTGTAAATGTCAGCTTTACGCGTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GB09JQ U 1
AF RR2GE20JQ U 1
BS 1 741 RR2GB09JQ
BS 742 742 RR2GE20JQ
BS 743 764 RR2GB09JQ
BS 765 808 RR2GE20JQ

RD RR2GB09JQ 764 0 0
GGTTTAACATCCAGGTTAAGACTCATTCAATACAATTGAATCAACGACGAAGCCACAACA
ATAACATACAGGATCCTAACTATTTTTGGCACCAATTCAGTTTCAACCTTATATACATAC
ATGCACTCAAAATCTTCGTTTGCAACTGAAGACAGCTTTAACAACAGTGAGACAGAAAAA
ACCGCCATTTTTACGGTTCCTGTCGATTCAAAATCTTATCAGAGAGCTTCTGTTTGAGTC
CAAGGAAAGAAGATGCAACACACAGAAACATCAAACATATTTTTTTTTTACTTTTCTAAA
TGGTACTGCTGAGTGTAGAAACAGCAGTAGATGATGAAGCCCCTGACGAGTAAGCATTTG
AGCTATCTCTAGTCCCGGTGCTAGACGAGGCATTATCTGAAGAAAGATTCGTGTAGTTGT
TGTTGACTCTGTTCACTTCCTCTGGCTTTTTCTCTTTCACTTTCAAGTCCATGAAATCAG
AAATCAAACCCGGCCTGGTTATGCTCCTGTTCTCTACATCCTTCTCCCCTGTTAACAGCT
TCACCACTGGGGACATACTCGGCCTTAGCTTAGGATCGTCTTGCGTGCACAGAAGACCGA
TCTTTAGGTACCTGCAAGCTTCATCCGCGTCAAAGACTCCGTTTAACCCTGTGTCAACAA
GATCCACGAGCTGATTCCGCTCATAAAGATCCCAAGCTCTTTCTAGAAGATATTGATACC
CTATGGGTAACCGTAAGTTTT*GTTGCTTCTTGCACTGACTATC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2GE20JQ 808 0 0
GGTTTAACATCCAGGTTAAGACTCATTCAATACAATTGAATCAACGACGAAGCCACAACA
ATAACATACAGGATCCTAACTATTTTTGGCACCAATTCAGTTTCAACCTTATATACATAC
ATGCACTCAAAATCTTCGTTTGCAACTGAAGACAGCTTTAACAACAGTGAGACAGAAAAA
ACCGCCATTTTTACGGTTCCTGTCGATTCAAAATCTTATCAGAGAGCTTCTGTTTGAGTC
CAAGGAAAGAAGATGCAACACACAGAAACATCAAACATATTTTTTTTTTACTTTTCTAAA
TGGTACTGCTGAGTGTAGAAACAGCAGTAGATGATGAAGCCCCTGACGAGTAAGCATTTG
AGCTATCTCTAGTCCCGGTGCTAGACGAGGCATTATCTGAAGAAAGATTCGTGTAGTTGT
TGTTGACTCTGTTCACTTCCTCTGGCTTTTTCTCTTTCACTTTCAAGTCCATGAAATCAG
AAATCAAACCCGGCCTGGTTATGCTCCTGTTCTCTACATCCTTCTCCCCTGTTAACAGCT
TCACCACTGGGGACATACTCGGCCTTAGCTTAGGATCGTCTTGCGTGCACAGAAGACCGA
TCTTTAGGTACCTGCAAGCTTCATCCGCGTCAAAGACTCCGTTTAACCCTGTGTCAACAA
GATCCACGAGCTGATTCCGCTCATAAAGATCCCAAGCTCTTTCTAGAAGATATTGATACC
CTATGGGTAACCGTAAGTTTTTGTTGCTTCTTGCACTGACTATCTCCATCAGAAGACTCC
ATAGCTGTAAATGTCAGCTTTACGCGTA

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL6803Contig1 923 2 2 U
GGAAAACAGCAGAAACAGCTTCTTCTTCTTCTTACAAACAAAAAAAATGGAATTGGCCAT
GAGTTTTGTGTATCCACCACCTCCGTCAATGTTGCTCAACACTATGAGCGTAGTGGGCTT
AGCCGCTCTTGCTCAGATCGGTTGGTCTGAAGTGAGAGGAAACCATCTCAAATACTCCAA
ATTCGCATCATCATCACCACAGCAACCACAAAAGCACCGATTCGGCAGCTTCTCCAGTCG
AATCGGGATGCTTTTGCTCTACACACCAGCCTTCCTAGCCGCCGCAGCTTCTTTCTTCGT
CTTACCTTCCGATGATCTCAGGTTTCTCCTCCCCAAATCCGCACTCGCCCTCCATTTCCT
CAAAAGAATCTTCGAGGTTCTGTGCATCCACAAGTACAGCGGAGAGATGGCTGTAGACTC
AGCCTTCATCATAACCAGCAGCTACTTCTCATCCACGGTGTTGATGCTATACAGCCAAAG
CTTCACACTAGGACTAACCGAGCCCGCTTTCGATACGAAACTCATCGGGGTTGTCATGTT
TGTGGTGGGAATCGTTGGGAATCTGTATCACCATGTTCTGCTAGCTAAGCTAAGGAACGA
AGAAGGCGGGAAGAAAGTGTACAAGATACCAAAAGGTGGTCTGTTCGACACGATCATATG
CCCTCACTACCGTTCGAGATCATTGTGTTTTGGAGCTTCTTTATGGTTTCTCAGACCATT
TACTCGTTTTCTTTCGCCATGGGAACCACTTTCTATCTCGTTGGTTGGAGCTACGCTACG
AGAAGATGGTATCTTTCCAAGTTCGATGACTTCCCGAAGCATGTCAAGGCTCTTATTCCT
TTTGTATTCTAGACATATTTGTTGTATGTTTGTTTCTATTACAAAATTCTTGTTGGTCTT
TTGATTATTTTGTTGTTAAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F041TF U 1
AF RR2F041JQ C 89
BS 1 778 RR2F041TF
BS 779 923 RR2F041JQ

RD RR2F041TF 778 0 0
GGAAAACAGCAGAAACAGCTTCTTCTTCTTCTTACAAACAAAAAAAATGGAATTGGCCAT
GAGTTTTGTGTATCCACCACCTCCGTCAATGTTGCTCAACACTATGAGCGTAGTGGGCTT
AGCCGCTCTTGCTCAGATCGGTTGGTCTGAAGTGAGAGGAAACCATCTCAAATACTCCAA
ATTCGCATCATCATCACCACAGCAACCACAAAAGCACCGATTCGGCAGCTTCTCCAGTCG
AATCGGGATGCTTTTGCTCTACACACCAGCCTTCCTAGCCGCCGCAGCTTCTTTCTTCGT
CTTACCTTCCGATGATCTCAGGTTTCTCCTCCCCAAATCCGCACTCGCCCTCCATTTCCT
CAAAAGAATCTTCGAGGTTCTGTGCATCCACAAGTACAGCGGAGAGATGGCTGTAGACTC
AGCCTTCATCATAACCAGCAGCTACTTCTCATCCACGGTGTTGATGCTATACAGCCAAAG
CTTCACACTAGGACTAACCGAGCCCGCTTTCGATACGAAACTCATCGGGGTTGTCATGTT
TGTGGTGGGAATCGTTGGGAATCTGTATCACCATGTTCTGCTAGCTAAGCTAAGGAACGA
AGAAGGCGGGAAGAAAGTGTACAAGATACCAAAAGGTGGTCTGTTCGACACGATCATATG
CCCTCACTACCGTTCGAGATCATTGTGTTTTGGAGCTTCTTTATGGTTTCTCAGACCATT
TACTCGTTTTCTTTCGCCATGGGAACCACTTTCTATCTCGTTGGTTGGAGCTACGCTA

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2F041JQ 835 0 0
AATG
TGCTCAACACTATGAGCGTAGTGGGCTTAGCCGCTCT*GCTCAGATCGGTTGGTCTGAAG
TGAGAGGAAACCATCTCAAATACTCCAAATTCGCATCATCATCACCACAGCAACCACAAA
AGCACCGATTCGGCAGCTTCTCCAGTCGAATCGGGATGCTTTTGCTCTACACACCAGCCT
TCCTAGCCGCCGCAGCTTCTTTCTTCGTCTTACCTTCCGATGATCTCAGGTTTCTCCTCC
CCAAATCCGCACTCGCCCTCCATTTCCTCAAAAGAATCTTCGAGGTTCTGTGCATCCACA
AGTACAGCGGAGAGATGGCTGTAGACTCAGCCTTCATCATAACCAGCAGCTACTTCTCAT
CCACGGTGTTGATGCTATACAGCCAAAGCTTCACACTAGGACTAACCGAGCCCGCTTTCG
ATACGAAACTCATCGGGGTTGTCATGTTTGTGGTGGGAATCGTTGGGAATCTGTATCACC
ATGTTCTGCTAGCTAAGCTAAGGAACGAAGAAGGCGGGAAGAAAGTGTACAAGATACCAA
AAGGTGGTCTGTTCGACACGATCATATGCCCTCACTACCGTTCGAGATCATTGTGTTTTG
GAGCTTCTTTATGGTTTCTCAGACCATTTACTCGTTTTCTTTCGCCATGGGAACCACTTT
CTATCTCGTTGGTTGGAGCTACGCTACGAGAAGATGGTATCTTTCCAAGTTCGATGACTT
CCCGAAGCATGTCAAGGCTCTTATTCCTTTTGTATTCTAGACATATTTGTTGTATGTTTG
TTTCTATTACAAAATTCTTGTTGGTCTTTTGATTATTTTGTTGTTAAATTT

QA 5 835 5 835
DS 



AS 1 2

CO CL6804Contig1 748 2 4 U
GAGGAGCTGCGAGAGCGATTAGTTACTTGCATTCGCGCGATTCGACGACTTCTCATGGAA
ACATCAAGTCTTCGAACATTCTATTGTCTAATTCCTATGAAGCTAAGGTCTCTGATTACG
GTCTAGCGCCTATTATCAGCTCCACATCTGCGCCTAACCGTATAGATGGCTACCGTGCAC
CTGAAGTCACCGATGCGCGCAAAATCTCTCAGAAAGCTGATGTTTACAGCTTTGGTGTCT
TGATACTTGAGCTACTAACAGGGAAGTCTCCAACACATCAGCAACTGAACGAAGAAGGCG
TAGATTTGCCAAGATGGGTCCAGTCCATTACTGATCAACAATCACCGTCTGTTGTGTTTG
ATCCAGAGCTCACAAGGTACGAGTTTGAGGACAATGAGAACATTATCCGGCTCTTGAAGA
TAGGTATGAGCTGTACGGCTCAGTACCCTGATAGCCGTCCTACCATGGCCGATGTAACCA
GACTCATCGAGGAAGTCTCGCAGCACTCGTCAGGCTCTCCAAACCCGGTATCTGACTGAT
TTTAGTTGGGGGTCTAAATTGATCGAGGTCAAATTGTTTGGGGCTAAATTGCAATTTCTT
GAATAGTTTATACGCATTTCCCCCGCCTTTTTATTTTTCTTCTTTGTACGTGTTCTAGTG
TGTTGTTCGTTAATTATTGAGCCTCAAATTGAGATGAGACTATTCAGATTTTTTCCTTTT
ATATTTTTCATAATTTTAAAAAATGTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR54JQ C 1
AF RR2FR54TF U 1
BS 1 715 RR2FR54TF
BS 716 717 RR2FR54JQ
BS 718 742 RR2FR54TF
BS 743 748 RR2FR54JQ

RD RR2FR54JQ 748 0 0
GAGGAGCTGCGAGAGCGATTAGTTACTTGCATTCGCGCGATTCGACGACTTCTCATGGAA
ACATCAAGTCTTCGAACATTCTATTGTCTAATTCCTATGAAGCTAAGGTCTCTGATTACG
GTCTAGCGCCTATTATCAGCTCCACATCTGCGCCTAACCGTATAGATGGCTACCGTGCAC
CTGAAGTCACCGATGCGCGCAAAATCTCTCAGAAAGCTGATGTTTACAGCTTTGGTGTCT
TGATACTTGAGCTACTAACAGGGAAGTCTCCAACACATCAGCAACTGAACGAAGAAGGCG
TAGATTTGCCAAGATGGGTCCAGTCCATTACTGATCAACAATCACCGTCTGTTGTGTTTG
ATCCAGAGCTCACAAGGTACGAGTTTGAGGACAATGAGAACATTATCCGGCTCTTGAAGA
TAGGTATGAGCTGTACGGCTCAGTACCCTGATAGCCGTCCTACCATGGCCGATGTAACCA
GACTCATCGAGGAAGTCTCGCAGCACTCGTCAGGCTCTCCAAACCCGGTATCTGACTGAT
TTTAGTTGGGGGTCTAAATTGATCGAGGTCAAATTGTTTGGGGCTAAATTGCAATTTCTT
GAATAGTTTATACGCATTTCCCCCGCCTTTTTATTTTTCTTCTTTGTACGTGTTCTAGTG
TGTTGTTCGTTAATTATTGAGCCTCAAATTGAGATGAGACTATTCAGATTTTTTTCTTTT
ATATTTTTCATAATTTTAAAAAATGTTC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2FR54TF 747 0 0
GAGGAGCTGCGAGAGCGATTAGTTACTTGCATTCGCGCGATTCGACGACTTCTCATGGAA
ACATCAAGTCTTCGAACATTCTATTGTCTAATTCCTATGAAGCTAAGGTCTCTGATTACG
GTCTAGCGCCTATTATCAGCTCCACATCTGCGCCTAACCGTATAGATGGCTACCGTGCAC
CTGAAGTCACCGATGCGCGCAAAATCTCTCAGAAAGCTGATGTTTACAGCTTTGGTGTCT
TGATACTTGAGCTACTAACAGGGAAGTCTCCAACACATCAGCAACTGAACGAAGAAGGCG
TAGATTTGCCAAGATGGGTCCAGTCCATTACTGATCAACAATCACCGTCTGTTGTGTTTG
ATCCAGAGCTCACAAGGTACGAGTTTGAGGACAATGAGAACATTATCCGGCTCTTGAAGA
TAGGTATGAGCTGTACGGCTCAGTACCCTGATAGCCGTCCTACCATGGCCGATGTAACCA
GACTCATCGAGGAAGTCTCGCAGCACTCGTCAGGCTCTCCAAACCCGGTATCTGACTGAT
TTTAGTTGGGGGTCTAAATTGATCGAGGTCAAATTGTTTGGGGCTAAATTGCAATTTCTT
GAATAGTTTATACGCATTTCCCCCGCCTTTTTATTTTTCTTCTTTGTACGTGTTCTAGTG
TGTTGTTCGTTAATTATTGAGCCTCAAATTGAGATGAGACTATTCAGATTTTTTC**TTT
ATATTTTTCATAATTTTAAAAA
TGTTC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6806Contig1 619 2 2 U
TTTGTAGGGATTCAACAAACATTATATCCGTGTCTGAAGACAAAATCTTCTACTCTTGTT
TGATTGAAAACTAACACAAACCACAAAATGATGTAATCATACATCCAAGTCAAACTTATT
GAGAAGCATATCCAAAATCTATCACCAAACAATCAAGGTTCTCCATAGAGTAAACAAAGA
AAAAAAAGGAGATCATTTCGACTTCTTCCCAACCTTCTTCTTGACGACTTCGTCAATGTA
CATTATACCTTTGCCCTTATAAACCTCAGGAGGTTTGCAACTCCTGACAGTGGCAGCAAA
CTGATGCACCCTATCCTTGTCGATCCCGGTGCAGCAAACCACATTGTTCTTGAAACAGAA
GACCCTGACCGCCGGAGGAACTGCCAGCTCGACCTCATGACTGTAACCTAACTTGAGGTA
CAAGAAACGCCCTGCTTCCTCAGCTCTGGCTTTGTATCCAACTCCAACAATCTTCAAGAA
CCGAAAGAACTTGGCTTCCATATCTTCCCTTCTTGCCACACAGAATGTTTCACCTGTCTT
TATTGCTTTCCGGCGAAAAGAAAAGAGGACTAATGTGTCAGTGCTACTTCTTCGCCGGCG
GATCCAGATCACTCCCCCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BS26TF C 1
AF RR2BS26JQ U 4
BS 1 3 RR2BS26TF
BS 4 619 RR2BS26JQ

RD RR2BS26TF 619 0 0
TTTGTAGGGATTCAACAAACATTATATCCGTGTCTGAAGACAAAATCTTCTACTCTTGTT
TGATTGAAAACTAACACAAACCACAAAATGATGTAATCATACATCCAAGTCAAACTTATT
GAGAAGCATATCCAAAATCTATCACCAAACAATCAAGGTTCTCCATAGAGTAAACAAAGA
AAAAAAAGGAGATCATTTCGACTTCTTCCCAACCTTCTTCTTGACGACTTCGTCAATGTA
CATTATACCTTTGCCCTTATAAACCTCAGGAGGTTTGCAACTCCTGACAGTGGCAGCAAA
CTGATGCACCCTATCCTTGTCGATCCCGGTGCAGCAAACCACATTGTTCTTGAAACAGAA
GACCCTGACCGCCGGAGGAACTGCCAGCTCGACCTCATGACTGTAACCTAACTTGAGGTA
CAAGAAACGCCCTGCTTCCTCAGCTCTGGCTTTGTATCCAACTCCAACAATCTTCAAGAA
CCGAAAGAACTTGGCTTCCATATCTTCCCTTCTTGCCACACAGAATGTTTCACCTGTCTT
TATTGCTTTCCGGCGAAAAGAAAAGAGGACTAATGTGTCAGTGCTACTTCTTCGCCGGCG
GATCCAGATCACTCCCCCC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2BS26JQ 616 0 0
GTAGGGATTCAACAAACATTATATCCGTGTCTGAAGACAAAATCTTCTACTCTTGTTTGA
TTGAAAACTAACACAAACCACAAAATGATGTAATCATACATCCAAGTCAAACTTATTGAG
AAGCATATCCAAAATCTATCACCAAACAATCAAGGTTCTCCATAGAGTAAACAAAGAAAA
AAAAGGAGATCATTTCGACTTCTTCCCAACCTTCTTCTTGACGACTTCGTCAATGTACAT
TATACCTTTGCCCTTATAAACCTCAGGAGGTTTGCAACTCCTGACAGTGGCAGCAAACTG
ATGCACCCTATCCTTGTCGATCCCGGTGCAGCAAACCACATTGTTCTTGAAACAGAAGAC
CCTGACCGCCGGAGGAACTGCCAGCTCGACCTCATGACTGTAACCTAACTTGAGGTACAA
GAAACGCCCTGCTTCCTCAGCTCTGGCTTTGTATCCAACTCCAACAATCTTCAAGAACCG
AAAGAACTTGGCTTCCATATCTTCCCTTCTTGCCACACAGAATGTTTCACCTGTCTTTAT
TGCTTTCCGGCGAAAAGAAAAGAGGACTAATGTGTCAGTGCTACTTCTTCGCCGGCGGAT
CCAGATCACTCCCCCC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL6807Contig1 791 2 2 U
TTGACGTAGTGACTCACCATATATACAATCTTGGTTCAGGGAATGATCCACAGCTAGTGA
AGAAGATACTGGATCCTAGTTACTTAAGCAAAGGAGCCGAAACATTCAAGAACGTGAACA
AGACGATTCAAGAACATGGACCGTGGGCTTCTCCTTGGGTTGGCGAGTCCGGTGGAGCTT
ACAATAGTGGTGGTCGTCATGTCTCTGATACATTCATAGACAGCTTCTGGTATTTAGACC
AGCTTGGAATGTCGTCAAAACACAACACTAAAGTGTACTGCAGACAGACTTTGGTCGGAG
GGTTTTACGGTCTGCTCGAAAAGGGAACTTTTGTTCCAAATCCAGATTACTATAGTGCAC
TGCTTTGGCATCGGTTAATGGGTAAAGGTGTTCTTGCGGTTCAGACAGATGGACCACCTC
AGCTACGTGTTTACGCTCACTGTTCAAAAGGAAGAGAGGGTGTAACGTTGCTTCTGATCA
ATTTAAGCAACCAATCAGACTTTACGGTTAGTGTGAGCAACGGTGTGAACGTGGCTTTGA
ACGTAGAGTCGAAGCCGAAGAAGAAGTCGTTGTTGGATACTTTGAAGAAACCATTTGCTT
GGATTGGAAACAAAGCTTCGGATGGTTATCTGAACAGAGAAGAGTATCATCTAACACCAG
AGAAGGGTGAGTTGCGTAGCAAGACAATGGTCTTGAATGGTAAACCGTTGAAACCGACAG
AAACCGGAGATATCCCGAACCTTGAACCGGTCATCCGTGGAGTGAACTCTCCGGTTTCTG
TCTCGTCGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A038TF U 1
AF RR2A038JQ C 157
BS 1 494 RR2A038TF
BS 495 791 RR2A038JQ

RD RR2A038TF 494 0 0
TTGACGTAGTGACTCACCATATATACAATCTTGGTTCAGGGAATGATCCACAGCTAGTGA
AGAAGATACTGGATCCTAGTTACTTAAGCAAAGGAGCCGAAACATTCAAGAACGTGAACA
AGACGATTCAAGAACATGGACCGTGGGCTTCTCCTTGGGTTGGCGAGTCCGGTGGAGCTT
ACAATAGTGGTGGTCGTCATGTCTCTGATACATTCATAGACAGCTTCTGGTATTTAGACC
AGCTTGGAATGTCGTCAAAACACAACACTAAAGTGTACTGCAGACAGACTTTGGTCGGAG
GGTTTTACGGTCTGCTCGAAAAGGGAACTTTTGTTCCAAATCCAGATTACTATAGTGCAC
TGCTTTGGCATCGGTTAATGGGTAAAGGTGTTCTTGCGGTTCAGACAGATGGACCACCTC
AGCTACGTGTTTACGCTCACTGTTCAAAAGGAAGAGAGGGTGTAACGTTGCTTCTGATCA
ATTTAAGCAACCAA

QA 1 494 1 494
DS 

RD RR2A038JQ 635 0 0
GGGTTGGCGAGTCCGGTGGAGCTTACAATAGTGGTGGTCGTCATGTCTCTGATACATTCA
TAGACAGCTTCTGGTATTTAGACCAGCTTGGAATGTCGTCAAAACACAACACTAAAGTGT
ACTGCAGACAGACTTTGGTCGGAGGGTTTTACGGTCTGCTCGAAAAGGGAACTTTTGTTC
CAAATCCAGATTACTATAGTGCACTGCTTTGGCATCGGTTAATGGGTAAAGGTGTTCTTG
CGGTTCAGACAGATGGACCACCTCAGCTACGTGTTTACGCTCACTGTTCAAAAGGAAGAG
AGGGTGTAACGTTGCTTCTGATCAATTTAAGCAACCAATCAGACTTTACGGTTAGTGTGA
GCAACGGTGTGAACGTGGCTTTGAACGTAGAGTCGAAGCCGAAGAAGAAGTCGTTGTTGG
ATACTTTGAAGAAACCATTTGCTTGGATTGGAAACAAAGCTTCGGATGGTTATCTGAACA
GAGAAGAGTATCATCTAACACCAGAGAAGGGTGAGTTGCGTAGCAAGACAATGGTCTTGA
ATGGTAAACCGTTGAAACCGACAGAAACCGGAGATATCCCGAACCTTGAACCGGTCATCC
GTGGAGTGAACTCTCCGGTTTCTGTCTCGTCGTTG

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL6808Contig1 685 2 1 U
GCGATTGGTAAATCTTATGTCACCTCAAAAATAAAGCATTACCCAAAGTTTCAAGCTGTT
TCCGTTGCAATTCAAAGATCTGGCTTCAAGATAGTTTTTCTCCTACGTGTTGTTCCCCTT
CTGCCCTTCAATATGTTGAATTACCTGCTATCAGTCACCCCTGTTCGGTTAGGGGAATAC
ATGCTGGCCACTTGGTTGGGAATGATGCCCATTACGTTTGCGCTAGTTTATGTTGGAACA
ACTCTGAAAGATCTTTCTGATATTACACATGGGTGGCACGAGGTGTCAATTTTTCGTTGG
GTACTAATGATGGTTGGCATTGCTCTAGCTGTAATTCTGATAGTATGCATTACAAGAGTG
GCGAAGTCATCATTGGAGAAAGCATTGGCTGAAAATGCAGCAGATGTATTAGATGGGAAG
AAGAATGATGACACATCCATGCTACCCATAGCAGAACCACCGCCACCACCGGATCATCTA
CACGAGCCTCTCGACATCAGAATCGACCCATAAGAAAACGACAAACAAAAGAAACCAAAC
CTCTTGAGTTTGTAAATTTTTCAAAGATTTTTGTTTTACTGAGGGAGAATATTATTAGAT
AACGTTCTGTATAGCCCATAATAATACATAAATTCACGTTTAAGTCGTTCCTTTTCTCAA
TTGGTTATTTCTATTTACTTGAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GQ80JQ C 1
AF RR2GQ80TF U 1
BS 1 685 RR2GQ80TF

RD RR2GQ80JQ 685 0 0
GCGATTGGTAAATCTTATGTCACCTCAAAAATAAAGCATTACCCAAAGTTTCAAGCTGTT
TCCGTTGCAATTCAAAGATCTGGCTTCAAGATAGTTTTTCTCCTACGTGTTGTTCCCCTT
CTGCCCTTCAATATGTTGAATTACCTGCTATCAGTCACCCCTGTTCGGTTAGGGGAATAC
ATGCTGGCCACTTGGTTGGGAATGATGCCCATTACGTTTGCGCTAGTTTATGTTGGAACA
ACTCTGAAAGATCTTTCTGATATTACACATGGGTGGCACGAGGTGTCAATTTTTCGTTGG
GTACTAATGATGGTTGGCATTGCTCTAGCTGTAATTCTGATAGTATGCATTACAAGAGTG
GGGAAGTCATCATTGGAGAAAGCATTGGCTGAAAATGCAGCAGATGTATTAGATGGGAAG
AAGAATGATGACACATCCATGCTACCCATAGCAGAACCACCGCCACCACCGGATCATCTA
CACGAGCCTCTCGACATCAGAATCGACCCATAAGAAAACGACAAACAAAAGAAACCAAAC
CTCTTGAGTTTGTAAATTTTTCAAAGATTTTTGTTTTACTGAGGGAGAATATTATTAGAT
AACGTTCTGTATAGCCCATAATAATACATAAATTCACGTTTAAGTCGTTCCTTTTCTCAA
TTGGTTATTTCTATTTACTTGAGCC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2GQ80TF 685 0 0
GCGATTGGTAAATCTTATGTCACCTCAAAAATAAAGCATTACCCAAAGTTTCAAGCTGTT
TCCGTTGCAATTCAAAGATCTGGCTTCAAGATAGTTTTTCTCCTACGTGTTGTTCCCCTT
CTGCCCTTCAATATGTTGAATTACCTGCTATCAGTCACCCCTGTTCGGTTAGGGGAATAC
ATGCTGGCCACTTGGTTGGGAATGATGCCCATTACGTTTGCGCTAGTTTATGTTGGAACA
ACTCTGAAAGATCTTTCTGATATTACACATGGGTGGCACGAGGTGTCAATTTTTCGTTGG
GTACTAATGATGGTTGGCATTGCTCTAGCTGTAATTCTGATAGTATGCATTACAAGAGTG
GCGAAGTCATCATTGGAGAAAGCATTGGCTGAAAATGCAGCAGATGTATTAGATGGGAAG
AAGAATGATGACACATCCATGCTACCCATAGCAGAACCACCGCCACCACCGGATCATCTA
CACGAGCCTCTCGACATCAGAATCGACCCATAAGAAAACGACAAACAAAAGAAACCAAAC
CTCTTGAGTTTGTAAATTTTTCAAAGATTTTTGTTTTACTGAGGGAGAATATTATTAGAT
AACGTTCTGTATAGCCCATAATAATACATAAATTCACGTTTAAGTCGTTCCTTTTCTCAA
TTGGTTATTTCTATTTACTTGAGCC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL6809Contig1 898 2 6 U
GAAGGACGATCTTTCTTCTTCCTCGACTCGCTGCCATCAACCCCCAAAACTTGGATACGA
TCTTTCAGCTCTAAAATCTCATCAATTCTACAATATAGAGATAAGCTATGGGATGTGCTG
CTTCTCTTCCAGATAGGAACTCAGGAGCTTTAAACGGTCTTACCAGCTCAGAGAATGCAG
CTCCAGCAGATGCTAAGAATCTACGCGTGAAGTTAGTTCTATTAGGAGATTCTGGTGTGG
GTAAAAGCTGTATTGTCCTCCAGTTTGTCCGTGGTCAGTTTGACGCAACATCTAAGGTAA
CTGTTGGAGCTTCATTCTTGTCCCAGACAATAACCTTGCAAGACTCTACCACAGTGAAGT
TTGAAATATGGGATACAGCAGGGCAAGAGAGGTATTCTGCGCTTGCTCCACTATACTACC
GTGGAGCTGGAGTTGCTGTTATTGTGTATGATATTACAAGCCCTGAGTCGTTCAAGAAAG
CTCAGTATTGGGTTAAGGAACTGCAGAAGCATGGAAGCCCAGACATTGTTATGGCTTTGG
TTGGTAACAAAGCTGATCTACATGAAAAAAGAGAGTCCCCTCCGAGGATGGGATGGAGCT
TGCAGAGAAGAACGGCATGTTCTTTATTGAAACGTCAGCTAAGACGGCAGATAACATAAA
TGAACTGTTTGAGGAAATTGGAAAGAGGTTACCTCGTCCTTTTCAACCATCATGATTGGA
GTGTTTGGATCAACCCCATTTTCAGCGGAAAGACCTTTCTCCTGGTTACTAATCTACTTT
CATACTTTCATGTAATGTTTACTAAACGGTATTTCTATATATTGTTAAAAGTGTGTTGTG
TAATGTGAAGATTTGAGAAGCCAAATTAAATTTTAAGCAATGATGGGGGATGATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN78TF U 1
AF RR2EN78JQ C 221
BS 1 673 RR2EN78TF
BS 674 674 RR2EN78JQ
BS 675 687 RR2EN78TF
BS 688 688 RR2EN78JQ
BS 689 701 RR2EN78TF
BS 702 898 RR2EN78JQ

RD RR2EN78TF 711 0 0
GAAGGACGATCTTTCTTCTTCCTCGACTCGCTGCCATCAACCCCCAAAACTTGGATACGA
TCTTTCAGCTCTAAAATCTCATCAATTCTACAATATAGAGATAAGCTATGGGATGTGCTG
CTTCTCTTCCAGATAGGAACTCAGGAGCTTTAAACGGTCTTACCAGCTCAGAGAATGCAG
CTCCAGCAGATGCTAAGAATCTACGCGTGAAGTTAGTTCTATTAGGAGATTCTGGTGTGG
GTAAAAGCTGTATTGTCCTCCAGTTTGTCCGTGGTCAGTTTGACGCAACATCTAAGGTAA
CTGTTGGAGCTTCATTCTTGTCCCAGACAATAACCTTGCAAGACTCTACCACAGTGAAGT
TTGAAATATGGGATACAGCAGGGCAAGAGAGGTATTCTGCGCTTGCTCCACTATACTACC
GTGGAGCTGGAGTTGCTGTTATTGTGTATGATATTACAAGCCCTGAGTCGTTCAAGAAAG
CTCAGTATTGGGTTAAGGAACTGCAGAAGCATGGAAGCCCAGACATTGTTATGGCTTTGG
TTGGTAACAAAGCTGATCTACATGAAAAAAGAGAGTCCCCTCCGAGGATGGGATGGAGCT
TGCAGAGAAGAACGGCATGTTCTTTATTGAAACGTCAGCTAAGACGGCAGATAACATAAA
TGAACTGTTTGAG*AAATTGGAAAGAG*TTACCTCGTCCTT
CTCACATCAT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2EN78JQ 678 0 0
ATTAGGAGATTCTGGTGTGGGTAAAAGCTGTATTGTCCTCCAGTTTGTCCGTGGTCAGTT
TGACGCAACATCTAAGGTAACTGTTGGAGCTTCATTCTTGTCCCAGACAATAACCTTGCA
AGACTCTACCACAGTGAAGTTTGAAATATGGGATACAGCAGGGCAAGAGAGGTATTCTGC
GCTTGCTCCACTATACTACCGTGGAGCTGGAGTTGCTGTTATTGTGTATGATATTACAAG
CCCTGAGTCGTTCAAGAAAGCTCAGTATTGGGTTAAGGAACTGCAGAAGCATGGAAGCCC
AGACATTGTTATGGCTTTGGTTGGTAACAAAGCTGATCTACATGAAAAAAGAGAGTCCCC
TCCGAGGATGGGATGGAGCTTGCAGAGAAGAACGGCATGTTCTTTATTGAAACGTCAGCT
AAGACGGCAGATAACATAAATGAACTGTTTGAGGAAATTGGAAAGAGGTTACCTCGTCCT
TTTCAACCATCATGATTGGAGTGTTTGGATCAACCCCATTTTCAGCGGAAAGACCTTTCT
CCTGGTTACTAATCTACTTTCATACTTTCATGTAATGTTTACTAAACGGTATTTCTATAT
ATTGTTAAAAGTGTGTTGTGTAATGTGAAGATTTGAGAAGCCAAATTAAATTTTAAGCAA
TGATGGGGGATGATTATC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL6810Contig1 767 2 4 U
GGGCTCATAGTCGCTCTTCTCCCCCCAAACTCTCCTCCCCTCTTCCCGGCGATCTCTGTT
TCTCTCCGATTTGGCTATTAAATGGCAACCCCCATGGTAGAAGACACGTCAAGCTTCGAA
GAGGACCAGCTCGCTTCCATGTCCACCGAAGATATCATCAGAGCTGCTCGCCTCCTCGAA
AACGAGATTCGAATCCTCAAGGAAGACGCACAAAGAACGAATCTTGAATGCGATTCTTAC
AAGGAGAAGATAAAGGAGAATCAGGAGAAGATTAAACTCAACAAGCAGCTTCCTTACCTG
GTTGGCAACATTGTCGAGATATTGGAGATGAATCCGGAAGATGATGCTGAGGAAGACGGT
GCTAATATTGACCTTGACTCTCAACGGAAAGGAAAGTGTGTTGTGTTGAAAACCTCTACA
CGACAGACTATCTTTCTACCAGTTGTTGGTCTCGTGGACCCTGATAGCTTGAAGCCTGGG
GACTTGGTGGGAGTTAATAAAGACAGTTACTTGATTCTGGATACCTTGCCGTCTGAGTAT
GACTCTAGGGTTAAAGCCATGGAGGTCGATGAGAAGCCTACGGAAGATTACAATGACATC
GGAGGACTGGAGAAGCAGATCCAAGAGCTTGTTGAGGCTATTGTGCTCCCCATGACGCAC
AAAGAGCGTTTCGAAAAGCTAGGTGTTCGTCCACCAAAGGGAGTGCTCTTGTATGGTCCT
CCAGGGACTGGTAAAACTTTAATGGCTCGTGCTTGTGCAGCACAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RR2B311TF U 1
AF RR2FO72TF U 5
BS 1 662 RR2B311TF
BS 663 663 RR2FO72TF
BS 664 762 RR2B311TF
BS 763 767 RR2FO72TF

RD RR2B311TF 762 0 0
GGGCTCATAGTCGCTCTTCTCCCCCCAAACTCTCCTCCCCTCTTCCCGGCGATCTCTGTT
TCTCTCCGATTTGGCTATTAAATGGCAACCCCCATGGTAGAAGACACGTCAAGCTTCGAA
GAGGACCAGCTCGCTTCCATGTCCACCGAAGATATCATCAGAGCTGCTCGCCTCCTCGAA
AACGAGATTCGAATCCTCAAGGAAGACGCACAAAGAACGAATCTTGAATGCGATTCTTAC
AAGGAGAAGATAAAGGAGAATCAGGAGAAGATTAAACTCAACAAGCAGCTTCCTTACCTG
GTTGGCAACATTGTCGAGATATTGGAGATGAATCCGGAAGATGATGCTGAGGAAGACGGT
GCTAATATTGACCTTGACTCTCAACGGAAAGGAAAGTGTGTTGTGTTGAAAACCTCTACA
CGACAGACTATCTTTCTACCAGTTGTTGGTCTCGTGGACCCTGATAGCTTGAAGCCTGGG
GACTTGGTGGGAGTTAATAAAGACAGTTACTTGATTCTGGATACCTTGCCGTCTGAGTAT
GACTCTAGGGTTAAAGCCATGGAGGTCGATGAGAAGCCTACGGAAGATTACAATGACATC
GGAGGACTGGAGAAGCAGATCCAAGAGCTTGTTGAGGCTATTGTGCTCCCCATGACGCAC
AAGGAGCGTTTCGAAAAGCTAGGTGTTCGTCCACCAAAGGGAGTGCTCTTGTATGGTCCT
CCAGGGACTGGTAAAACTTTAATGGCTCGTGCTTGTGCAGCA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2FO72TF 763 0 0
GG
ATAGTCGCTCTTCTCCCCCCAAACTCTCCTCCCCTCTTCCCGGCGATCTCTGTTTCTCTC
CGATTTGGCTATTAAATGGCAACCCCCATGGTAGAAGACACGTCAAGCTTCGAAGAGGAC
CAGCTCGCTTCCATGTCCACGGAAGATATCATCAGAGCTGCTCGCCTCCTCGAAAACGAG
ATTCGAATCCTCAAGGAAGACGCACAAAGAACGAATCTTGAATGCGATTCTTACAAGGAG
AAGATAAAGGAGAATCAGGAGAAGATTAAACTCAACAAGCAGCTTCCTTACCTGGTTGGC
AACATTGTCGAGATATTGGAGATGAATCCGGAAGATGATGCTGAGGAAGACGGTGCTAAT
ATTGACCTTGACTCTCAACGGAAAGGAAAGTGTGTTGTGTTGAAAACCTCTACACGACAG
ACTATCTTTCTACCAGTTGTTGGTCTCGTGGACCCTGATAGCTTGAAGCCTGGGGACTTG
GTGGGAGTTAATAAATACAGTTACTTGATTCTGGATACCTTGCCGTCTGAGTATGACTCT
AGGGTTAAAGCCATGGAGGTCGATGAGAAGCCTACGGAAGATTACAATGACATCGGAGGA
CTGGAGAAGCAGATCCAAGAGCTTGTTGAGGCTATTGTGCTCCCCATGACGCACAAAGAG
CGTTTCGAAAAGCTAGGTGTTCGTCCACCAAAGGGAGTGCTCTTGTATGGTCCTCCAGGG
ACTGGTAAAACTTTAATGGCTCGTGCTTGTGCAGCACAGAC

QA 3 763 3 763
DS 



AS 1 2

CO CL6811Contig1 780 2 2 U
GGGAGAGAGAGGATCGTGAGAGAGATTACCATCACAATCAGAAATCGCTTTGCAGAACCT
CCGATTTTGTAAATTCCTCACCCGATTTCAATTGATTTTTTCTTTTTTCGTATTGATCGG
GATCTAGTTCTTGATAGATCCATTGATCTTTTTGTTGTTGTTAAAATATGGATTGTGAGA
ATATTGTTTGCGTGGTTGACAGTTTGTGAAATTGACTAAGATTTCATATGTTTTAAACTC
TGGAATTTGAGTGCTTTCTTGTGTTAACATAAGGGTTTGGGTATGTGGTTGAAAGTTTCA
CGGTTAGATTTGTATTTATGTTTAGGAATAAGGAATCTGATTTCTAAATGATTTAAACTT
TGCTTTCTAATCCTAGCCAAACTCTCTAGTGTCTTTCTGTTTTCTTACTAATCCCTAATG
TCTCAAGTAGTAAACAAATTGTCATGGTTTTAGGATTCTCTATTGTTAATTAACAACCAT
GCTATTGCAATGTTTGATGGCTGCTTCTCTTTTCTTTTTCTTTGGGGGGATGCAGGTTTT
AGGACACAAACAAAATAGTGGTTTACTTATTTATATGCTGTATTTGTGGTTTTGTTCAGA
AAAAAAGTGATCTTCAAGTTAAAGCCCTCAAATAGTAACAAAGTAGATTTTCAACAGCCT
CCTAATAAAGATTGATTGATCTCTTTCGGTAAGTTTATTTTCATCTAATTATCTTGCCTA
TATATATGTTATGTTTTTCACTTGGTTCTTGAATCTTGGCAAAAGCATTACTTCTTTTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2B309JQ C 1
AF RR2B309TF U 1
BS 1 777 RR2B309TF
BS 778 780 RR2B309JQ

RD RR2B309JQ 780 0 0
GGGAGAGAGAGGATCGTGAGAGAGATTACCATCACAATCAGAAATCGCTTTGCAGAACCT
CCGATTTTGTAAATTCCTCACCCGATTTCAATTGATTTTTTCTTTTTTCGTATTGATCGG
GATCTAGTTCTTGATAGATCCATTGATCTTTTTGTTGTTGTTAAAATATGGATTGTGAGA
ATATTGTTTGCGTGGTTGACAGTTTGTGAAATTGACTAAGATTTCATATGTTTTAAACTC
TGGAATTTGAGTGCTTTCTTGTGTTAACATAAGGGTTTGGGTATGTGGTTGAAAGTTTCA
CGGTTAGATTTGTATTTATGTTTAGGAATAAGGAATCTGATTTCTAAATGATTTAAACTT
TGCTTTCTAATCCTAGCCAAACTCTCTAGTGTCTTTCTGTTTTCTTACTAATCCCTAATG
TCTCAAGTAGTAAACAAATTGTCATGGTTTTAGGATTCTCTATTGTTAATTAACAACCAT
GCTATTGCAATGTTTGATGGCTGCTTCTCTTTTCTTTTTCTTTGGGGGGATGCAGGTTTT
AGGACACAAACAAAATAGTGGTTTACTTATTTATATGCTGTATTTGTGGTTTTGTTCAGA
AAAAAAGTGATCTTCAAGTTAAAGCCCTCAAATAGTAACAAAGTAGATTTTCAACAGCCT
CCTAATAAAGATTGATTGATCTCTTTCGGTAAGTTTATTTTCATCTAATTATCTTGCCTA
TATATATGTTATGTTTTTCACTTGGTTCTTGAATCTTGGCAAAAGCATTACTTCTTTTGT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2B309TF 777 0 0
GGGAGAGAGAGGATCGTGAGAGAGATTACCATCACAATCAGAAATCGCTTTGCAGAACCT
CCGATTTTGTAAATTCCTCACCCGATTTCAATTGATTTTTTCTTTTTTCGTATTGATCGG
GATCTAGTTCTTGATAGATCCATTGATCTTTTTGTTGTTGTTAAAATATGGATTGTGAGA
ATATTGTTTGCGTGGTTGACAGTTTGTGAAATTGACTAAGATTTCATATGTTTTAAACTC
TGGAATTTGAGTGCTTTCTTGTGTTAACATAAGGGTTTGGGTATGTGGTTGAAAGTTTCA
CGGTTAGATTTGTATTTATGTTTAGGAATAAGGAATCTGATTTCTAAATGATTTAAACTT
TGCTTTCTAATCCTAGCCAAACTCTCTAGTGTCTTTCTGTTTTCTTACTAATCCCTAATG
TCTCAAGTAGTAAACAAATTGTCATGGTTTTAGGATTCTCTATTGTTAATTAACAACCAT
GCTATTGCAATGTTTGATGGCTGCTTCTCTTTTCTTTTTCTTTGGGGGGATGCAGGTTTT
AGGACACAAACAAAATAGTGGTTTACTTATTTATATGCTGTATTTGTGGTTTTGTTCAGA
AAAAAAGTGATCTTCAAGTTAAAGCCCTCAAATAGTAACAAAGTAGATTTTCAACAGCCT
CCTAATAAAGATTGATTGATCTCTTTCGGTAAGTTTATTTTCATCTAATTATCTTGCCTA
TATATATGTTATGTTTTTCACTTGGTTCTTGAATCTTGGCAAAAGCATTACTTCTTT

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL6812Contig1 617 2 1 U
GTGTCCAGAATCGAGTTTAAAGGGGACATGGTTGTCGCAACACCGGATATCTACCAAGTA
CCTCTTACATCGGATGTGGAGTTCATTATTTTAGCTTCTGATGGATTGTAGGACTACATG
AAGAGCAAAGATGTGGTTAGTTTCGTAAGGGAACAGCTCCGAGAACATGGAAATGTCCAG
CTTGCTTGTGAAGCTCTTGCACAAGTTGCTTTGGACCGGAGATCAGAGGACAACATCAGC
ATCATCATCGCTGATCTAGGGTAGGTCTTTCAAATTCGTAACTTATTCCAAGGATCCAAT
TCATAGAGACTTTGTTTCGATGAAAACAGAAGAACAGAGTGGAAGAAACTCCCAGTGCAG
CGACAAAACATGGTGGTTGAACTTGTTCAGGCGGCAGCCACTGTGGGTATAGTTACCGTT
GGCATATGGATGACTTCTCTTCTCTCTTAGAGTGAAATAAACACATCCAAATCTCCTTTC
CTTAGTGTATATACAACATGTAACTATTGTCAAACTCTCTATTAGCCTTCCCATAGAGAT
GGAAATGTGATGATACCTCACAGTTGGGGGTAACTCACCAAAGTACATGTAAAATCTATG
GAGTATATGCTTAGTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FH79JQ C 1
AF RR2FH79TF U 1
BS 1 617 RR2FH79TF

RD RR2FH79JQ 617 0 0
GTGTCCAGAATCGAGTTTAAAGGGGACATGGTTGTCGCAACACCGGATATCTACCAAGTA
CCTCTTACATCGGATGTGGAGTTCATTATTTTAGCTTCTGATGGATTGTAGGACTACATG
AAGAGCAAAGATGTGGTTAGTTTCGTAAGGGAACAGCTCCGAGAACATGGAAATGTCCAG
CTTGCTTGTGAAGCTCTTGCACAAGTTGCTTTGGACCGGAGATCAGAGGACAACATCAGC
ATCATCATCGCTGATCTAGGGTAGGTCTTTCAAATTCGTAACTTATTCCAAGGATCCAAT
TCATAGAGACTTTGTTTCGATGAAAACAGAAGAACAGAGTGGAAGAAACTCCCAGTGCAG
CGACAAAACATGGTGGTTGAACTTGTTCAGGCGGCAGCCACTGTGGGTATAGTTACCGTT
GGCATATGGATGACTTCTCTTCTCTCTTAGAGTGAAATAAACACATCCAAATCTCCTTTC
CTTAGTGTATATACAACATGTAACTATTGTCAAACTCTCTATTAGCCTTCCCATAGAGAT
GGAAATGTGATGATACCTCACAGTTGGGGGTAACTCACCAAAGTACATGTAAAATCTATG
GAGTATATGCTTAGTGT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2FH79TF 617 0 0
GTGTCCAGAATCGAGTTTAAAGGGGACATGGTTGTCGCAACACCGGATATCTACCAAGTA
CCTCTTACATCGGATGTGGAGTTCATTATTTTAGCTTCTGATGGATTGTAGGACTACATG
AAGAGCAAAGATGTGGTTAGTTTCGTAAGGGAACAGCTCCGAGAACATGGAAATGTCCAG
CTTGCTTGTGAAGCTCTTGCACAAGTTGCTTTGGACCGGAGATCAGAGGACAACATCAGC
ATCATCATCGCTGATCTAGGGTAGGTCTTTCAAATTCGTAACTTATTCCAAGGATCCAAT
TCATAGAGACTTTGTTTCGATGAAAACAGAAGAACAGAGTGGAAGAAACTCCCAGTGCAG
CGACAAAACATGGTGGTTGAACTTGTTCAGGCGGCAGCCACTGTGGGTATAGTTACCGTT
GGCATATGGATGACTTCTCTTCTCTCTTAGAGTGAAATAAACACATCCAAATCTCCTTTC
CTTAGTGTATATACAACATGTAACTATTGTCAAACTCTCTATTAGCCTTCCCATAGAGAT
GGAAATGTGATGATACCTCACAGTTGGGGGTAACTCACCAAAGTACATGTAAAATCTATG
GAGTATATGCTTAGTGT

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL6813Contig1 834 2 8 U
ACTATTGCAAAGAAATTCAATGCTATGAGCTCGGTTGTACGAGTCCCCTCTTTAGACCCC
AAGTACAAGATTGCTCTTTTACTCTCCAAACAGGACCATTGTCTGGTTGAAATGTTACAT
AAATGGCAGGACGGAAAGCTTCCTGTTGATATAACATGTGTCATAAGTAATCATGAAAGA
GCTCCAAACACACATATTATGCGGTTTCTCCAGAGGCATGGCATCTCCTATCATTATTTG
CCAACAACCGATCAGAACAAGATAGAGGAGGAGATTTTTGAGTTGGTCAAGGATACTGAT
TTTATTGTTCTCGCTAGATACATGCAGGTACTGTCTGGTAACTTCTTGAAAGCTTATGGA
AAAGATGTTATCAACATACACCATGGCCTCTTACCATCATTCAAAGGGAGAAGCCCCGCC
AAACAGGCATTTGATGCAGGTGTGAAACTAATTGGTGCAACCACTCACTTTGTTACTGAG
GAACTTGATTCAGGTCCTATCATTGAACAAATGGTTGAGAGAGTTTCCCACCGAGACAAC
TTGACGAGCTTTGTCCAAAAATCAGAGGACCTCGAGAAGAAGTGCCTAATGAAAGCTATA
AAATCTTACTGCGAACTCCGAGTATTGCCTTACGGTACACACAAGACTGTTGTATTCTGA
TACCCCCACAAATTCAAAAAACTCTCACATGATTCTTCATCATACAAGCAAGGTCATACA
TACCAACCACTCTTTAAGATTTCTGATTTTTCATAGCTTACACGTCCATTGTCTTGTATT
TAGCAAATCAAAAACTCTTTCACTGGAAATAAAAAGTTTAACAGAGATCAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT54TF U 1
AF RR2FT54JQ C 135
BS 1 680 RR2FT54TF
BS 681 681 RR2FT54JQ
BS 682 712 RR2FT54TF
BS 713 713 RR2FT54JQ
BS 714 750 RR2FT54TF
BS 751 751 RR2FT54JQ
BS 752 765 RR2FT54TF
BS 766 834 RR2FT54JQ

RD RR2FT54TF 765 0 0
ACTATTGCAAAGAAATTCAATGCTATGAGCTCGGTTGTACGAGTCCCCTCTTTAGACCCC
AAGTACAAGATTGCTCTTTTACTCTCCAAACAGGACCATTGTCTGGTTGAAATGTTACAT
AAATGGCAGGACGGAAAGCTTCCTGTTGATATAACATGTGTCATAAGTAATCATGAAAGA
GCTCCAAACACACATATTATGCGGTTTCTCCAGAGGCATGGCATCTCCTATCATTATTTG
CCAACAACCGATCAGAACAAGATAGAGGAGGAGATTTTTGAGTTGGTCAAGGATACTGAT
TTTATTGTTCTCGCTAGATACATGCAGGTACTGTCTGGTAACTTCTTGAAAGCTTATGGA
AAAGATGTTATCAACATACACCATGGCCTCTTACCATCATTCAAAGGGAGAAGCCCCGCC
AAACAGGCATTTGATGCAGGTGTGAAACTAATTGGTGCAACCACTCACTTTGTTACTGAG
GAACTTGATTCAGGTCCTATCATTGAACAAATGGTTGAGAGAGTTTCCCACCGAGACAAC
TTGACGAGCTTTGTCCAAAAATCAGAGGACCTCGAGAAGAAGTGCCTAATGAAAGCTATA
AAATCTTACTGCGAACTCCGAGTATTGCCTTACGGTACACACAAGACTGTTGTATTCTGA
TACCCCCACAAATTCAAAAA*CTCTCACATGATTCTTCATCATACAAGCAAG*TCATACA
TACCAACCACTCTTTAAGATTTCTGATTTT*CATAGCTTACACGT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2FT54JQ 700 0 0
AAAGCTTCCTGTTGATATAACATGTGTCATAAGTAATCATGAAAGAGCTCCAAACACACA
TATTATGCGGTTTCTCCAGAGGCATGGCATCTCCTATCATTATTTGCCAACAACCGATCA
GAACAAGATAGAGGAGGAGATTTTTGAGTTGGTCAAGGATACTGATTTTATTGTTCTCGC
TAGATACATGCAGGTACTGTCTGGTAACTTCTTGAAAGCTTATGGAAAAGATGTTATCAA
CATACACCATGGCCTCTTACCATCATTCAAAGGGAGAAGCCCCGCCAAACAGGCATTTGA
TGCAGGTGTGAAACTAATTGGTGCAACCACTCACTTTGTTACTGAGGAACTTGATTCAGG
TCCTATCATTGAACAAATGGTTGAGAGAGTTTCCCACCGAGACAACTTGACGAGCTTTGT
CCAAAAATCAGAGGACCTCGAGAAGAAGTGCCTAATGAAAGCTATAAAATCTTACTGCGA
ACTCCGAGTATTGCCTTACGGTACACACAAGACTGTTGTATTCTGATACCCCCACAAATT
CAAAAAACTCTCACATGATTCTTCATCATACAAGCAAGGTCATACATACCAACCACTCTT
TAAGATTTCTGATTTTTCATAGCTTACACGTCCATTGTCTTGTATTTAGCAAATCAAAAA
CTCTTTCACTGGAAATAAAAAGTTTAACAGAGATCAATCC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL6814Contig1 864 2 6 U
GGGAGAAAAAAAGCCTCGACCTTTATTCTTCTCTCCCTCTACCCTTCTCTCTTCTGCTGG
ATCTCTCCAGCAGACGGAACGATCTTCTTCGGAGAGATTAATTAGGGGACCGACCTATCG
ATCGATCAAGGCTTCTCGGGCAAAACAGAAATGGACCACGACAAGACAGGATGCCAAAGC
CCACCCGAAGGTCCCAAGCTATGCATCAACAACTGCGGTTTCTTCGGAAGTGCTGCCACA
ATGAACATGTGTTCCAAGTGTCACAAGACTATGTTGTTTCAACAGGAACAGGGGGCTAAG
CTAGCATCTGCAGTGTCTGGATCACCTAGCAACATCATCAAGGAAACCTTCACTGCTGCG
TTGCTTGATGCTGAAACCAAATCCATTGAGCCAATGGCTGTCTCTGTACAAGCTGTTGCA
GAGGTAGTAGCACCAGAAGAAGCTGCAGCAAAACCAAAGGAAGGACCAAGCCGATGTACT
ACTTGCAATAAACGGGTTGGTTTGACTGGATTCAAATGTCGCTGTGGTGACCTCTTCTGC
GGAACGCACCGCTATGCAGACGTACACAACTGCTCTTTCGATTACCATGCTGCTGGGCAA
GAAGCTATAGCTAAAGCGAACCCGGTTGTGAAGGCAGATAAGCTTGACAAGATCTGAAAC
TCAAAACTCTGTTTCCTTCTTCCTGTTTGTATCTGGTTCAAGCATGTGTTGATCTTTAGC
TTCTTCCATTCTCTCTGTGTGCTCTTAAATATATAATATATATGCTTTGAAGTGTTTCCC
TTTCATATTATTTATGAGCACTATGGTTTGGTTATGTTTACTCCTCTTTGAGTCTGTATC
ATATTAAGATTTGTAACTTTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH86TF U 1
AF RR2GH86JQB C 88
BS 1 726 RR2GH86TF
BS 727 727 RR2GH86JQB
BS 728 748 RR2GH86TF
BS 749 749 RR2GH86JQB
BS 750 777 RR2GH86TF
BS 778 864 RR2GH86JQB

RD RR2GH86TF 777 0 0
GGGAGAAAAAAAGCCTCGACCTTTATTCTTCTCTCCCTCTACCCTTCTCTCTTCTGCTGG
ATCTCTCCAGCAGACGGAACGATCTTCTTCGGAGAGATTAATTAGGGGACCGACCTATCG
ATCGATCAAGGCTTCTCGGGCAAAACAGAAATGGACCACGACAAGACAGGATGCCAAAGC
CCACCCGAAGGTCCCAAGCTATGCATCAACAACTGCGGTTTCTTCGGAAGTGCTGCCACA
ATGAACATGTGTTCCAAGTGTCACAAGACTATGTTGTTTCAACAGGAACAGGGGGCTAAG
CTAGCATCTGCAGTGTCTGGATCACCTAGCAACATCATCAAGGAAACCTTCACTGCTGCG
TTGCTTGATGCTGAAACCAAATCCATTGAGCCAATGGCTGTCTCTGTACAAGCTGTTGCA
GAGGTAGTAGCACCAGAAGAAGCTGCAGCAAAACCAAAGGAAGGACCAAGCCGATGTACT
ACTTGCAATAAACGGGTTGGTTTGACTGGATTCAAATGTCGCTGTGGTGACCTCTTCTGC
GGAACGCACCGCTATGCAGACGTACACAACTGCTCTTTCGATTACCATGCTGCTGGGCAA
GAAGCTATAGCTAAAGCGAACCCGGTTGTGAAGGCAGATAAGCTTGACAAGATCTGAAAC
TCAAAACTCTGTTTCCTTCTTCCTGTTTGTATCTGGTTCAAGCATGTGTTGATCTTTAGC
TTCTTC*ATTCTCTCTGTGTGCTCTTAA*TATATAATATATATGCTTTGAAGTGTTT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2GH86JQB 777 0 0
TTCGGAGAGATTAATTAGGGGACCGACCTATCGATCGATCAAGGCTTCTCGGGCAAAACA
GAAATGGACCACGACAAGACAGGATGCCAAAGCCCACCCGAAGGTCCCAAGCTATGCATC
AACAACTGCGGTTTCTTCGGAAGTGCTGCCACAATGAACATGTGTTCCAAGTGTCACAAG
ACTATGTTGTTTCAACAGGAACAGGGGGCTAAGCTAGCATCTGCAGTGTCTGGATCACCT
AGCAACATCATCAAGGAAACCTTCACTGCTGCGTTGCTTGATGCTGAAACCAAATCCATT
GAGCCAATGGCTGTCTCTGTACAAGCTGTTGCAGAGGTAGTAGCACCAGAAGAAGCTGCA
GCAAAACCAAAGGAAGGACCAAGCCGATGTACTACTTGCAATAAACGGGTTGGTTTGACT
GGATTCAAATGTCGCTGTGGTGACCTCTTCTGCGGAACGCACCGCTATGCAGACGTACAC
AACTGCTCTTTCGATTACCATGCTGCTGGGCAAGAAGCTATAGCTAAAGCGAACCCGGTT
GTGAAGGCAGATAAGCTTGACAAGATCTGAAACTCAAAACTCTGTTTCCTTCTTCCTGTT
TGTATCTGGTTCAAGCATGTGTTGATCTTTAGCTTCTTCCATTCTCTCTGTGTGCTCTTA
AATATATAATATATATGCTTTGAAGTGTTTCCCTTTCATATTATTTATGAGCACTATGGT
TTGGTTATGTTTACTCCTCTTTGAGTCTGTATCATATTAAGATTTGTAACTTTAGCC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6816Contig1 625 2 4 U
TTTAGAATACACCAAACTCTCTTAAAAGAAATAAAATAAAACTTTGTTGACACTTTTACA
AGATCATAACCCCCAACAATGATTCACTCTTTTCTCTACTCACTACAACAAACAAGGGGT
TACAAATACTTGATGTGATATAGCAGATAACTCACAAACCGAGCCATGGACACTGCTTTC
TTGCATGTTCCGGTACTAACTTAGCCACCATCTCCACAGGCACACTTTTAAGCTCATGAG
GCTTGAAGTTGAAAAGTGGTGGAAAGAAACGTCCATTGGGCAACCGTGCATTAGGATCTC
TAAGCTCGTCAAAGAACGGGTGTACCAATGCATCAACAGCACCACAACGGAGATTAGGAG
AGTATTGAAGAAGCCTTGAGACTAAATCAACAGCTTCTGGAGGCATCCTCTTGTGGAAAA
TCTTATGCCATGGATGAGCTTTAATCTGAGGGAACTTGAACTCAGTGTAGTTCGGGTTCA
TGCATTTGATCTCTTCCCTTGTTGGTGTCCCCAAAACCTTAATAATCTCAACAAGTTGAT
CAACGCCACTCTCACCAGGGAACAATGGCTGACCGAGAAGAAGCTCGGCGAGAACACATC
CAGCAGACCAGACATCAATGGCTGC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E487TF C 1
AF RR2E487JQ U 4
BS 1 3 RR2E487TF
BS 4 336 RR2E487JQ
BS 337 337 RR2E487TF
BS 338 625 RR2E487JQ

RD RR2E487TF 625 0 0
TTTAGAATACACCAAACTCTCTTAAAAGAAATAAAATAAAACTTTGTTGACACTTTTACA
AGATCATAACCCCCAACAATGATTCACTCTTTTCTCTACTCACTACAACAAACAAGGGGT
TACAAATACTTGATGTGATATAGCAGATAACTCACAAACCGAGCCATGGACACTGCTTTC
TTGCATGTTCCGGTACTAACTTAGCCACCATCTCCACAGGCACACTTTTAAGCTCATGAG
GCTTGAAGTTGAAAAGTGGTGGAAAGAAACGTCCATTGGGCAACCGTGCATTAGGATCTC
TAAGCTCGTCAAAGAACGGGTGTACCAATGCATCAACAGCACCACAACGGAGATTAGGAG
AGTATTGAAGAAGCCTTGAGACTAAATCAACAGCTTCTGGAGGCATCCTCTTGTGGAAAA
TCTTATGCCATGGATGAGCTTTAATCTGAGGGAACTTGAACTCAGTGTAGTTCGGGTTCA
TGCATTTGATCTCTTCCCTTGTTGGTGTCCCCAAAACCTTAATAATCTCAACAAGTTGAT
CAACGCCACTCTCACCAGGGAACAATGGCTGACCGAGAAGAAGCTCGGCGAGAACACATC
CAGCAGACCAGACATCAATGGCTGC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2E487JQ 622 0 0
AGAATACACCAAACTCTCTTAAAAGAAATAAAATAAAACTTTGTTGACACTTTTACAAGA
TCATAACCCCCAACAATGATTCACTCTTTTCTCTACTCACTACAACAAACAAGGGGTTAC
AAATACTTGATGTGATATAGCAGATAACTCACAAACCGAGCCATGGACACTGCTTTCTTG
CATGTTCCGGTACTAACTTAGCCACCATCTCCACAGGCACACTTTTAAGCTCATGAGGCT
TGAAGTTGAAAAGTGGTGGAAAGAAACGTCCATTGGGCAACCGTGCATTAGGATCTCTAA
GCTCGTCAAAGAACGGGTGTACCAATGCATCAAGAGCACCACAACGGAGATTAGGAGAGT
ATTGAAGAAGCCTTGAGACTAAATCAACAGCTTCTGGAGGCATCCTCTTGTGGAAAATCT
TATGCCATGGATGAGCTTTAATCTGAGGGAACTTGAACTCAGTGTAGTTCGGGTTCATGC
ATTTGATCTCTTCCCTTGTTGGTGTCCCCAAAACCTTAATAATCTCAACAAGTTGATCAA
CGCCACTCTCACCAGGGAACAATGGCTGACCGAGAAGAAGCTCGGCGAGAACACATCCAG
CAGACCAGACATCAATGGCTGC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL6817Contig1 1068 2 4 U
TTTTTTTTTGAACTAAAGTACTTAAGTACATACATGTTTTGTTAATCTGCTTGTAGGAAA
TTCATGAACAAACTTGAAAAAGGCACTAAGAGTTAGCATGCATTTGTTTGGTTAAAGTTG
AAAAGAATACCAGCCCAAATGCATAAAAACAATAATATAAACTTTCTTCATTATGAATGT
TTGGTATATTGATTCACGTAAATAGATTCTTCAAACGTAGTGATATTACGTACGTATGAT
TTTTTTTTTCTTGTGGTAAAACCAGAAACAATAATTAAGAAAAAATCATTAAAGATGGTG
CATATTCACGAAGAAGAAAATTTATGGATAGTTGCACCTTTTGGTTAATATGTTCTGTAA
TTTTATTTGTGTATGCACGAAAGGTTGCATACTAAATTCAAGAATTATAGAAACAGTTTT
TTTTATAGAAACAGTTATTAGATAAATTGTTTGTGAAAGGTGACAATTTAGGATGCTAAG
AGGTGTCAAGTAAAAAAAGTTTTTGAGTGGATGTTAGATATTTTTTTCACTTATTATGAC
AAAATTTAATTGTTAATTTTCTGAATATATGCATATCTTTTTATCATGAAAGGATTAGTG
AAAAGGTTCAGTCATTATTTTTCTGAAAAACACAACTTTCCAATAAATAAACATTTTTTT
TTTTGCTTAATTGAATGAGTTTCTAAAAAATTTTTATTATAAAAAAAAATTAATGGTTAA
ACTTCTGAAAATATACAATTTCCTATTATGAAAAGATTCAATGAAAAGGTTCATTGGTTA
AGTTTTTGAAAATATAAATTTTTCAAAAAAATGTTTTTTGCTTAGTGAAACCATAATGTC
ATACTGTTCACGGAAACGATACAAATGGAAATTAATATATATTGATTATAAAATATCTGA
TATAAACAACTTGGAAATAAATATTTAAATATTTTGAAGACTCAAAACATATAAATATTT
TAATGCCTTTTTGAAGTGCTAGGAATCAACCGACCTTTGTCATGCATATGGATGCAGAGT
TACCTGTTTGGTTTACAGAGTCATTTTAAGTCTGTAAAAGTCGATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ88TF U 1
AF RR2FQ88JQ C 364
BS 1 663 RR2FQ88TF
BS 664 664 RR2FQ88JQ
BS 665 689 RR2FQ88TF
BS 690 1068 RR2FQ88JQ

RD RR2FQ88TF 689 0 0
TTTTTTTTTGAACTAAAGTACTTAAGTACATACATGTTTTGTTAATCTGCTTGTAGGAAA
TTCATGAACAAACTTGAAAAAGGCACTAAGAGTTAGCATGCATTTGTTTGGTTAAAGTTG
AAAAGAATACCAGCCCAAATGCATAAAAACAATAATATAAACTTTCTTCATTATGAATGT
TTGGTATATTGATTCACGTAAATAGATTCTTCAAACGTAGTGATATTACGTACGTATGAT
TTTTTTTTTCTTGTGGTAAAACCAGAAACAATAATTAAGAAAAAATCATTAAAGATGGTG
CATATTCACGAAGAAGAAAATTTATGGATAGTTGCACCTTTTGGTTAATATGTTCTGTAA
TTTTATTTGTGTATGCACGAAAGGTTGCATACTAAATTCAAGAATTATAGAAACAGTTTT
TTTTATAGAAACAGTTATTAGATAAATTGTTTGTGAAAGGTGACAATTTAGGATGCTAAG
AGGTGTCAAGTAAAAAAAGTTTTTGAGTGGATGTTAGATATTTTTTTCACTTATTATGAC
AAAATTTAATTGTTAATTTTCTGAATATATGCATATCTTTTTATCATGAAAGGATTAGTG
AAAAGGTTCAGTCATTATTTTTCTGAAAAACACAACTTTCCAATAAATAAACATTTTTTT
TTT*GCTTAATTGAATGAGTTTCTAAAAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2FQ88JQ 705 0 0
TATTTGTGTATGCACGAAAGGTTGCATACTAAATTCAAGAATTATAGAAACAGTTTTTTT
TATAGAAACAGTTATTAGATAAATTGTTTGTGAAAGGTGACAATTTAGGATGCTAAGAGG
TGTCAAGTAAAAAAAGTTTTTGAGTGGATGTTAGATATTTTTTTCACTTATTATGACAAA
ATTTAATTGTTAATTTTCTGAATATATGCATATCTTTTTATCATGAAAGGATTAGTGAAA
AGGTTCAGTCATTATTTTTTTGAAAAACACAACTTTCCAATAAATAAACATTTTTTTTTT
TGCTTAATTGAATGAGTTTCTAAAAAATTTTTATTATAAAAAAAAATTAATGGTTAAACT
TCTGAAAATATACAATTTCCTATTATGAAAAGATTCAATGAAAAGGTTCATTGGTTAAGT
TTTTGAAAATATAAATTTTTCAAAAAAATGTTTTTTGCTTAGTGAAACCATAATGTCATA
CTGTTCACGGAAACGATACAAATGGAAATTAATATATATTGATTATAAAATATCTGATAT
AAACAACTTGGAAATAAATATTTAAATATTTTGAAGACTCAAAACATATAAATATTTTAA
TGCCTTTTTGAAGTGCTAGGAATCAACCGACCTTTGTCATGCATATGGATGCAGAGTTAC
CTGTTTGGTTTACAGAGTCATTTTAAGTCTGTAAAAGTCGATGAC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL6818Contig1 1205 2 2 U
GGAAACACCACTAGAAAGAGTAAAAAAAAACGTTATCTATCCCCTTGCGAACGAGATACG
AGACGTTAGTGAAGAAGACCGCAATGGGAGACGACAGGCTGGATCTCGAGCTCTCCGATG
AGGTTCTGTCGGTGATTCCGATGGATCCTTTCGAGCAGCTGGATCTCGCGAGGAAGATCA
CCTCAATGACGATAGCTTCGAGGGTCTCGAATCTCGACTCAGAGGTGGTTGAATTGAGAC
AGAAGCTTCAGGGTAAAGAAACTGTTGTCCGCGAGCTCGAGGAGAAGGCGTCTCGCCTCG
AGAGAGACCGTCGCGAAGCTGATTCGAGGCTAAAGACCGTCCTCGAAGAGAATATGATTC
TGACAAAGGAGAAGGATTCACTGGCAATGACTGTAACAAAACTCACTCGTGATTTGGCTA
AGCTGGAGACATTCAAGCGGCAGTTAATCAAATCTTTGAGCGACGAGAGTGCTCCTCCTC
AAACAGAGGCTGTTGATATAAAGGCATGCGACCAGTCAAGTATTGTATCAACTGGTTCAT
ATACAGGCAAAGATGAAAGGACCAACGTACACTCATCACACCGTTCTTACAGTGGATCTT
CCGACATGAACAAATTCTCAATGACACCATACATCTCTCCACGCCTCACCCCATCCGCAA
CACCCAAGATCATCTCCACAAGCGTATCCCCTCGAGGCTATTCTGCAGCTGGTTCTCCCA
AAAGAACATCCGGAGCAGTTTCTCCCTCGAAGACGACAATCTGGTACCCTTCGAGTCAGC
AGTCATCAGCTGCTAATTCTCCACCTCGCAACCGTACACTCCCAGCTCGTACACCTCGTA
TGGACGGTAAGGAGTTCTTCAGACAAGCCAGGAGCCGATTATCATATGAGCAATTCAGTG
CCTTTTTAGCTAACATTAAGGAACTCAACGCTCAGAAGCAAACCCGAGAGGAAACGTTGA
GGAAAGCAGATGAAATATTTGGGGAAGATAACAAAGATCTCTACTTATCTTTCCAAGGTC
TTCTCAACAGAAACATGCGTTAAACTTAACGAGTCTTGAATCTCTCGACCAATGTTATAT
GAGCATAACCATTGTAGTATGTGTATTCTCGACCATATCTAGTGACATGGAATGTGTTTT
TTCTTTTCACAACAACAAACAGTGAAAAATCTCGCTTTGGCAAGTGTTTAGTGCATTCCT
GATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2BB12TF U 1
AF RR2BB12JQ C 481
BS 1 780 RR2BB12TF
BS 781 1205 RR2BB12JQ

RD RR2BB12TF 780 0 0
GGAAACACCACTAGAAAGAGTAAAAAAAAACGTTATCTATCCCCTTGCGAACGAGATACG
AGACGTTAGTGAAGAAGACCGCAATGGGAGACGACAGGCTGGATCTCGAGCTCTCCGATG
AGGTTCTGTCGGTGATTCCGATGGATCCTTTCGAGCAGCTGGATCTCGCGAGGAAGATCA
CCTCAATGACGATAGCTTCGAGGGTCTCGAATCTCGACTCAGAGGTGGTTGAATTGAGAC
AGAAGCTTCAGGGTAAAGAAACTGTTGTCCGCGAGCTCGAGGAGAAGGCGTCTCGCCTCG
AGAGAGACCGTCGCGAAGCTGATTCGAGGCTAAAGACCGTCCTCGAAGAGAATATGATTC
TGACAAAGGAGAAGGATTCACTGGCAATGACTGTAACAAAACTCACTCGTGATTTGGCTA
AGCTGGAGACATTCAAGCGGCAGTTAATCAAATCTTTGAGCGACGAGAGTGCTCCTCCTC
AAACAGAGGCTGTTGATATAAAGGCATGCGACCAGTCAAGTATTGTATCAACTGGTTCAT
ATACAGGCAAAGATGAAAGGACCAACGTACACTCATCACACCGTTCTTACAGTGGATCTT
CCGACATGAACAAATTCTCAATGACACCATACATCTCTCCACGCCTCACCCCATCCGCAA
CACCCAAGATCATCTCCACAAGCGTATCCCCTCGAGGCTATTCTGCAGCTGGTTCTCCCA
AAAGAACATCCGGAGCAGTTTCTCCCTCGAAGACGACAATCTGGTACCCTTCGAGTCAGC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2BB12JQ 725 0 0
AAACAGAGGCTGTTGATATAAAGGCATGCGACCAGTCAAGTATTGTATCAACTGGTTCAT
ATACAGGCAAAGATGAAAGGACCAACGTACACTCATCACACCGTTCTTACAGTGGATCTT
CCGACATGAACAAATTCTCAATGACACCATACATCTCTCCACGCCTCACCCCATCCGCAA
CACCCAAGATCATCTCCACAAGCGTATCCCCTCGAGGCTATTCTGCAGCTGGTTCTCCCA
AAAGAACATCCGGAGCAGTTTCTCCCTCGAAGACGACAATCTGGTACCCTTCGAGTCAGC
AGTCATCAGCTGCTAATTCTCCACCTCGCAACCGTACACTCCCAGCTCGTACACCTCGTA
TGGACGGTAAGGAGTTCTTCAGACAAGCCAGGAGCCGATTATCATATGAGCAATTCAGTG
CCTTTTTAGCTAACATTAAGGAACTCAACGCTCAGAAGCAAACCCGAGAGGAAACGTTGA
GGAAAGCAGATGAAATATTTGGGGAAGATAACAAAGATCTCTACTTATCTTTCCAAGGTC
TTCTCAACAGAAACATGCGTTAAACTTAACGAGTCTTGAATCTCTCGACCAATGTTATAT
GAGCATAACCATTGTAGTATGTGTATTCTCGACCATATCTAGTGACATGGAATGTGTTTT
TTCTTTTCACAACAACAAACAGTGAAAAATCTCGCTTTGGCAAGTGTTTAGTGCATTCCT
GATGG

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL6819Contig1 639 2 2 U
TTTTTTTGACTATGAACTTAGGTGCTCTTTCTTGGCATTTAAAAAAAACACAAAGGTTTT
GTTGCAATGTTGAAGTGTTTGTCGGATATAAAATGTTATATGGATAAGAAGACTAGAGGA
AACAAAACAAAAAAAAGACAAAGAGGTGAGAGATCGAATCAATCTTATGCTCAACGTCCT
AAGAGCAACGCGATCAGACTGAACAGCTTGAGTGAGGTTGATGTCGAAAAGCTCGCAACG
AATAGGCATCTCAATCTCATAGAAAGGGTTCTTCAAGACGTAGTCAGTGTAGAGTTCGTA
AATGTATCTAAGAAGGTTCTCCATGTGAGGAGCTCCAGGTTCACAAACCACAAAGAACTT
TGTTCCTGGGAGAGACTGGAAACAATGGAGATCAAAGGTATCAGCTTGGAGAAGCTCGAT
GCCAGAGCAGCCATTAACAGGAGAAAGCTGCTGAGAAATGGCGTGCATTGAGTGCCATAA
ACTAGCTACCCTCAAGCTATCATTCGTATCCATTCTTCCCTTCGTTCCACAATCCTTGTA
AAAGATCAAACCACCAGATTTGTTGATTATGTAAAGACTGTAGATCGCTGCCATTTTTCC
CCCAAAAGATCCAGAACAAATCTCTCCGCGAGACGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GA86TF C 1
AF RR2GA86JQ U 8
BS 1 7 RR2GA86TF
BS 8 639 RR2GA86JQ

RD RR2GA86TF 639 0 0
TTTTTTTGACTATGAACTTAGGTGCTCTTTCTTGGCATTTAAAAAAAACACAAAGGTTTT
GTTGCAATGTTGAAGTGTTTGTCGGATATAAAATGTTATATGGATAAGAAGACTAGAGGA
AACAAAACAAAAAAAAGACAAAGAGGTGAGAGATCGAATCAATCTTATGCTCAACGTCCT
AAGAGCAACGCGATCAGACTGAACAGCTTGAGTGAGGTTGATGTCGAAAAGCTCGCAACG
AATAGGCATCTCAATCTCATAGAAAGGGTTCTTCAAGACGTAGTCAGTGTAGAGTTCGTA
AATGTATCTAAGAAGGTTCTCCATGTGAGGAGCTCCAGGTTCACAAACCACAAAGAACTT
TGTTCCTGGGAGAGACTGGAAACAATGGAGATCAAAGGTATCAGCTTGGAGAAGCTCGAT
GCCAGAGCAGCCATTAACAGGAGAAAGCTGCTGAGAAATGGCGTGCATTGAGTGCCATAA
ACTAGCTACCCTCAAGCTATCATTCGTATCCATTCTTCCCTTCGTTCCACAATCCTTGTA
AAAGATCAAACCACCAGATTTGTTGATTATGTAAAGACTGTAGATCGCTGCCATTTTTCC
CCCAAAAGATCCAGAACAAATCTCTCCGCGAGACGATCC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2GA86JQ 632 0 0
GACTATGAACTTAGGTGCTCTTTCTTGGCATTTAAAAAAAACACAAAGGTTTTGTTGCAA
TGTTGAAGTGTTTGTCGGATATAAAATGTTATATGGATAAGAAGACTAGAGGAAACAAAA
CAAAAAAAAGACAAAGAGGTGAGAGATCGAATCAATCTTATGCTCAACGTCCTAAGAGCA
ACGCGATCAGACTGAACAGCTTGAGTGAGGTTGATGTCGAAAAGCTCGCAACGAATAGGC
ATCTCAATCTCATAGAAAGGGTTCTTCAAGACGTAGTCAGTGTAGAGTTCGTAAATGTAT
CTAAGAAGGTTCTCCATGTGAGGAGCTCCAGGTTCACAAACCACAAAGAACTTTGTTCCT
GGGAGAGACTGGAAACAATGGAGATCAAAGGTATCAGCTTGGAGAAGCTCGATGCCAGAG
CAGCCATTAACAGGAGAAAGCTGCTGAGAAATGGCGTGCATTGAGTGCCATAAACTAGCT
ACCCTCAAGCTATCATTCGTATCCATTCTTCCCTTCGTTCCACAATCCTTGTAAAAGATC
AAACCACCAGATTTGTTGATTATGTAAAGACTGTAGATCGCTGCCATTTTTCCCCCAAAA
GATCCAGAACAAATCTCTCCGCGAGACGATCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL6820Contig1 658 2 1 U
GCATGAGAGGTGTTAGGGACACCTTTTCTGTTGTTTATGGACCAAAGGAAAACACGTGGG
AGTCTAACGAGGTGTTGAACTCTAAGAACTGGGAGGGTGGGTGTGTGGTTGATGATGTCC
TCTACTTTCTTGATTGTTCAGGGAAGGCGTTGAGAGCGTTTGATCCAAAGCAGGGATGCT
GGAGTGTCGTCAACGGTTTGGAAGAGTTTCTGGCTGTCGAGACTGCCCAGTCACAGTGGC
CTAATGCGGTGAAGTGCGGTGAGAAGAAGCTGGCTCTCTTCTTTCCTAAGAAACAAGACG
GCAAGGAGGTCATTTGCTGTGCAGAGGTAACTTTGGAAAGGCGCCAAGGAGGAGAGATTT
GGGGTAAGTTGGAGTCTTGTGATGTTGTCGTTGAGGATGGGCTGTTTGACATGGCCAAAT
GTGTGGCTGTGACCGTTTGATGCAGAGTAATAATAATCATCTCTATTTAGATCCCTTCGT
ATTTTAATTATCCTAAATGCCACGGTCTAGTGTGTGGTTTTACGTTTGCTTAACATCGTT
AGTGTAGAGACCAAGACTTGAGAGCGTGTTGTTGTTTAATGTTGTCGTTTCAAACTTGTT
TAATGTTGTCGTTTCAAACTTGTGTTATGTTCTGTTAAATTTGCTATGTTTTATTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G518TF U 1
AF RR2G518JQ C 27
BS 1 658 RR2G518TF

RD RR2G518TF 658 0 0
GCATGAGAGGTGTTAGGGACACCTTTTCTGTTGTTTATGGACCAAAGGAAAACACGTGGG
AGTCTAACGAGGTGTTGAACTCTAAGAACTGGGAGGGTGGGTGTGTGGTTGATGATGTCC
TCTACTTTCTTGATTGTTCAGGGAAGGCGTTGAGAGCGTTTGATCCAAAGCAGGGATGCT
GGAGTGTCGTCAACGGTTTGGAAGAGTTTCTGGCTGTCGAGACTGCCCAGTCACAGTGGC
CTAATGCGGTGAAGTGCGGTGAGAAGAAGCTGGCTCTCTTCTTTCCTAAGAAACAAGACG
GCAAGGAGGTCATTTGCTGTGCAGAGGTAACTTTGGAAAGGCGCCAAGGAGGAGAGATTT
GGGGTAAGTTGGAGTCTTGTGATGTTGTCGTTGAGGATGGGCTGTTTGACATGGCCAAAT
GTGTGGCTGTGACCGTTTGATGCAGAGTAATAATAATCATCTCTATTTAGATCCCTTCGT
ATTTTAATTATCCTAAATGCCACGGTCTAGTGTGTGGTTTTACGTTTGCTTAACATCGTT
AGTGTAGAGACCAAGACTTGAGAGCGTGTTGTTGTTTAATGTTGTCGTTTCAAACTTGTT
TAATGTTGTCGTTTCAAACTTGTGTTATGTTCTGTTAAATTTGCTATGTTTTATTCTT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2G518JQ 632 0 0
TCTGTTGTTTATGGACCAAAGGAAAACACGTGGGAGTCTAACGAGGTGTTGAACTCTAAG
AACTGGGAGGGTGGGTGTGTGGTTGATGATGTCCTCTACTTTCTTGATTGTTCAGGGAAG
GCGTTGAGAGCGTTTGATCCAAAGCAGGGATGCTGGAGTGTCGTCAACGGTTTGGAAGAG
TTTCTGGCTGTCGAGACTGCCCAGTCACAGTGGCCTAATGCGGTGAAGTGCGGTGAGAAG
AAGCTGGCTCTCTTCTTTCCTAAGAAACAAGACGGCAAGGAGGTCATTTGCTGTGCAGAG
GTAACTTTGGAAAGGCGCCAAGGAGGAGAGATTTGGGGTAAGTTGGAGTCTTGTGATGTT
GTCGTTGAGGATGGGCTGTTTGACATGGCCAAATGTGTGGCTGTGACCGTTTGATGCAGA
GTAATAATAATCATCTCTATTTAGATCCCTTCGTATTTTAATTATCCTAAATGCCACGGT
CTAGTGTGTGGTTTTACGTTTGCTTAACATCGTTAGTGTAGAGACCAAGACTTGAGAGCG
TGTTGTTGTTTAATGTTGTCGTTTCAAACTTGTTTAATGTTGTCGTTTCAAACTTGTGTT
ATGTTCTGTTAAATTTGCTATGTTTTATTCTT

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL6821Contig1 683 2 2 U
GACTTGAAACTCTTCTCCTTGATGCAAAAGGCTGCTTATACTGTTGGAGGGCATTCATAT
ACTGCAGCGGCAATGGAGTATGTGATACTGAAGATGAAACCTCCTACGCACAGGCCACAG
ATTGCTCTGCTTCTTGCCATCCACAAGCTGAAAGTATCAGAAGAGCAACGCAAGGCAAGC
ATTGATACTCATGAACCTCTTCTCGCCTTTGCCTTAAGCTGTGGAATGTACTCTTCCCCT
GCGGTGAGGATCTACACAGCCAAAGGAGTGAAGGAAGAGCTACTAGAAGCTCAAAGGGAG
TTCATACAAGCATCTGTAGGGCTGAGCAGCAAAGGGAAGCTCTTGGTACCCAAAATGGTC
CATTGTTACGCCAAGAGTTTGGTGGAGGATTCGAACTTGGGGGTCTGGATAGCGAAGTAC
CTCCCGCCACATCAAGCAGCTTTTGTGGAACAGTGCATCTCCCAGAGAAGACAAAGCCTT
CTCGCTTCACGTAACTGTGGAATACTTCCCTTTGATTCTCGTTTTAGATATCTGTTTCTC
CCCGACGACAACAACAACTACTCGTCTAAGTAATAACCTTTTAAGAGCTCTGTTTTGTCT
GTAAAAAGCCTGTTTGACTTCATAAGAACCAAGAGCCATAAGGAGCCGTGTTCAGCAACA
TGATCATATTATTATTCCCAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ75TF U 1
AF RR2DJ75JQ C 22
BS 1 639 RR2DJ75TF
BS 640 683 RR2DJ75JQ

RD RR2DJ75TF 639 0 0
GACTTGAAACTCTTCTCCTTGATGCAAAAGGCTGCTTATACTGTTGGAGGGCATTCATAT
ACTGCAGCGGCAATGGAGTATGTGATACTGAAGATGAAACCTCCTACGCACAGGCCACAG
ATTGCTCTGCTTCTTGCCATCCACAAGCTGAAAGTATCAGAAGAGCAACGCAAGGCAAGC
ATTGATACTCATGAACCTCTTCTCGCCTTTGCCTTAAGCTGTGGAATGTACTCTTCCCCT
GCGGTGAGGATCTACACAGCCAAAGGAGTGAAGGAAGAGCTACTAGAAGCTCAAAGGGAG
TTCATACAAGCATCTGTAGGGCTGAGCAGCAAAGGGAAGCTCTTGGTACCCAAAATGGTC
CATTGTTACGCCAAGAGTTTGGTGGAGGATTCGAACTTGGGGGTCTGGATAGCGAAGTAC
CTCCCGCCACATCAAGCAGCTTTTGTGGAACAGTGCATCTCCCAGAGAAGACAAAGCCTT
CTCGCTTCACGTAACTGTGGAATACTTCCCTTTGATTCTCGTTTTAGATATCTGTTTCTC
CCCGACGACAACAACAACTACTCGTCTAAGTAATAACCTTTTAAGAGCTCTGTTTTGTCT
GTAAAAAGCCTGTTTGACTTCATAAGAACCAAGAGCCAT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2DJ75JQ 662 0 0
ATGCAAAAGGCTGCTTATACTGTTGGAGGGCATTCATATACTGCAGCGGCAATGGAGTAT
GTGATACTGAAGATGAAACCTCCTACGCACAGGCCACAGATTGCTCTGCTTCTTGCCATC
CACAAGCTGAAAGTATCAGAAGAGCAACGCAAGGCAAGCATTGATACTCATGAACCTCTT
CTCGCCTTTGCCTTAAGCTGTGGAATGTACTCTTCCCCTGCGGTGAGGATCTACACAGCC
AAAGGAGTGAAGGAAGAGCTACTAGAAGCTCAAAGGGAGTTCATACAAGCATCTGTAGGG
CTGAGCAGCAAAGGGAAGCTCTTGGTACCCAAAATGGTCCATTGTTACGCCAAGAGTTTG
GTGGAGGATTCGAACTTGGGGGTCTGGATAGCGAAGTACCTCCCGCCACATCAAGCAGCT
TTTGTGGAACAGTGCATCTCCCAGAGAAGACAAAGCCTTCTCGCTTCACGTAACTGTGGA
ATACTTCCCTTTGATTCTCGTTTTAGATATCTGTTTCTCCCCGACGACAACAACAACTAC
TCGTCTAAGTAATAACCTTTTAAGAGCTCTGTTTTGTCTGTAAAAAGCCTGTTTGACTTC
ATAAGAACCAAGAGCCATAAGGAGCCGTGTTCAGCAACATGATCATATTATTATTCCCAG
CT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL6822Contig1 618 2 1 U
GAAGAGAAACTCGTTGAAAGATCAGCAAGTCTTGGAGAAGAACTGAGGATTCAACTGAAT
GAAATCAAGAAACAGTTTCCTAATCACATTAAAGAAGTACGAGGAAGAGGATTGTTCAAT
GCTGTTGAGTTCAACAGTGAAAGCTTATCTCCTGTTTCAGCTTATGATATTTGCTTGAGC
TTGAAGGAGAGAGGAGTGTTGGCTAAACCGACTCATAACACAATTGTCCGGTTAACTCCA
CCACTCTCCATAAGCTCTGATGAACTCCGAGAAGGATCTAAGGCTCTTCGTGATGTTCTT
GAGGTCGATCTTCCAAATCTGCAGAAAATCAATGCGGGTAAAACCCCGGTTTCTCACTTA
ACCGAGTGTGATCGCTGCGGAAGAAACCTCTATGCTTGAACCAGGCCGGAACATGATTTG
GATTTGGTTTAGTTTTATTGTTTTTATTTTAAAGAATGTGTGGTGTATTTGTGACTTGTT
AGTTCAGAAGACAACTCTGGTTCGGTATAGCAAAGATAAATACGTCAAAGACCGAACCGG
ATTGCACCGGACTCGGTAGAAATAACTCTGGGTTATTTCTGGTTTGGCATTTAATAAAAT
CGAGTTTGTTGTTTCCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GD84JQ C 1
AF RR2GD84TF U 1
BS 1 618 RR2GD84TF

RD RR2GD84JQ 618 0 0
GAAGAGAAACTCGTTGAAAGATCAGCAAGTCTTGGAGAAGAACTGAGGATTCAACTGAAT
GAAATCAAGAAACAGTTTCCTAATCACATTAAAGAAGTACGAGGAAGAGGATTGTTCAAT
GCTGTTGAGTTCAACAGTGAAAGCTTATCTCCTGTTTCAGCTTATGATATTTGCTTGAGC
TTGAAGGAGAGAGGAGTGTTGGCTAAACCGACTCATAACACAATTGTCCGGTTAACTCCA
CCACTCTCCATAAGCTCTGATGAACTCCGAGAAGGATCTAAGGCTCTTCGTGATGTTCTT
GAGGTCGATCTTCCAAATCTGCAGAAAATCAATGCGGGTAAAACCCCGGTTTCTCACTTA
ACCGAGTGTGATCGCTGCGGAAGAAACCTCTATGCTTGAACCAGGCCGGAACATGATTTG
GATTTGGTTTAGTTTTATTGTTTTTATTTTAAAGAATGTGTGGTGTATTTGTGACTTGTT
AGTTCAGAAGACAACTCTGGTTCGGTATAGCAAAGATAAATACGTCAAAGACCGAACCGG
ATTGCACCGGACTCGGTAGAAATAACTCTGGGTTATTTCTGGTTTGGCATTTAATAAAAT
CGAGTTTGTTGTTTCCAC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2GD84TF 618 0 0
GAAGAGAAACTCGTTGAAAGATCAGCAAGTCTTGGAGAAGAACTGAGGATTCAACTGAAT
GAAATCAAGAAACAGTTTCCTAATCACATTAAAGAAGTACGAGGAAGAGGATTGTTCAAT
GCTGTTGAGTTCAACAGTGAAAGCTTATCTCCTGTTTCAGCTTATGATATTTGCTTGAGC
TTGAAGGAGAGAGGAGTGTTGGCTAAACCGACTCATAACACAATTGTCCGGTTAACTCCA
CCACTCTCCATAAGCTCTGATGAACTCCGAGAAGGATCTAAGGCTCTTCGTGATGTTCTT
GAGGTCGATCTTCCAAATCTGCAGAAAATCAATGCGGGTAAAACCCCGGTTTCTCACTTA
ACCGAGTGTGATCGCTGCGGAAGAAACCTCTATGCTTGAACCAGGCCGGAACATGATTTG
GATTTGGTTTAGTTTTATTGTTTTTATTTTAAAGAATGTGTGGTGTATTTGTGACTTGTT
AGTTCAGAAGACAACTCTGGTTCGGTATAGCAAAGATAAATACGTCAAAGACCGAACCGG
ATTGCACCGGACTCGGTAGAAATAACTCTGGGTTATTTCTGGTTTGGCATTTAATAAAAT
CGAGTTTGTTGTTTCCAC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL6823Contig1 663 2 2 U
TTTTTCATCATATCAATAGTCTGTCTTTCTAAAACAGGAGGAGACAGTTTATAGCGATGA
ATATGAACGCACTTTGGCTACTCTGCGTCCTGGTGTTACCGGCAATAGCCTGTGGTAGGA
ATCCGGAGAATAAGAAGGTAAGGGCTTCGCCTGGGAGGAAGGAAGATGACCTGGTAACCG
GTTTGCCTGGCCAACCACCGGCTAACTTCAGACATTACGCCGGCTACGTGAATCTCGGTC
CACGACAGATGCAAAAGGCACTTTTCTACTGGTTCTTCGAAGCCCAACAAAACTCCTCCG
GTCGTCCTCTTGTCCTTTGGCTCAACGGAGGACCTGGTTGTTCATCGATAGCCTATGGAG
CTGCACAAGAACTAGGCCCTTTCCTTATTCACACCAGCGGTGGCAACCTTACCTTCAATG
ACTTCTCTTGGAACAAAGAGGCCAATATGTTGTTCTTGGAAGCACCAGTTGGGGTTGGGT
TCTCGTATACCAATAACTCAATGGATCTTCATAAGCTCGGAGATCAAGTTACTGCAGATG
ACTCTCTTGCTTTCTTGATCAACTGGTTCATGAAATTTCCTGAGTTCCGATCCAACGAGT
TTTATATCGCCGGAGAGAGTTATGCTGGTCACTATGTTCCACAACTTGCGAATGCCATTT
ACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2DR57TF U 1
AF RR2CH01TF U 10
BS 1 488 RR2DR57TF
BS 489 663 RR2CH01TF

RD RR2DR57TF 488 0 0
TTTTTCATCATATCAATAGTCTGTCTTTCTAAAACAGGAGGAGACAGTTTATAGCGATGA
ATATGAACGCACTTTGGCTACTCTGCGTCCTGGTGTTACCGGCAATAGCCTGTGGTAGGA
ATCCGGAGAATAAGAAGGTAAGGGCTTCGCCTGGGAGGAAGGAAGATGACCTGGTAACCG
GTTTGCCTGGCCAACCACCGGCTAACTTCAGACATTACGCCGGCTACGTGAATCTCGGTC
CACGACAGATGCAAAAGGCACTTTTCTACTGGTTCTTCGAAGCCCAACAAAACTCCTCCG
GTCGTCCTCTTGTCCTTTGGCTCAACGGAGGACCTGGTTGTTCATCGATAGCCTATGGAG
CTGCACAAGAACTAGGCCCTTTCCTTATTCACACCAGCGGTGGCAACCTTACCTTCAATG
ACTTCTCTTGGAACAAAGAGGCCAATATGTTGTTCTTGGAAGCACCAGTTGGGGTTGGGT
TCTCGTAT

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2CH01TF 654 0 0
GG
ATCAATAGTCTGTCTTTCTAAAGCAGGAGGAGACAGTTTATAGCGATGAATATGAACGCA
CTTTGGCTACTCTGCGTCCTGGTGTTACCGGCAATAGCCTGTGGTAGGAATCCGGAGAAT
AAGAAGGTAAGGGCTTCGCCTGGGAGGAAGGAAGATGACCTGGTAACCGGTTTGCCTGGC
CAACCACCGGCTAACTTCAGACATTACGCCGGCTACGTGAATCTCGGTCCACGACAGATG
CAAAAGGCACTTTTCTACTGGTTCTTCGAAGCCCAACAAAACTCCTCCGGTCGTCCTCTT
GTCCTTTGGCTCAACGGAGGACCTGGTTGTTCATCGATAGCCTATGGAGCTGCACAAGAA
CTAGGCCCTTTCCTTATTCACACCAGCGGTGGCAACCTTACCTTCAATGACTTCTCTTGG
AACAAAGAGGCCAATATGTTGTTCTTGGAAGCACCAGTTGGGGTTGGGTTCTCGTATACC
AATAACTCAATGGATCTTCATAAGCTCGGAGATCAAGTTACTGCAGATGACTCTCTTGCT
TTCTTGATCAACTGGTTCATGAAATTTCCTGAGTTCCGATCCAACGAGTTTTATATCGCC
GGAGAGAGTTATGCTGGTCACTATGTTCCACAACTTGCGAATGCCATTTACG

QA 3 654 3 654
DS 



AS 1 2

CO CL6824Contig1 617 2 1 U
TTTTTTCTTTTTTGTTGGGTGGCTTGAAGGAGCAAAAATGGCGTCGAATCTCGTGAAAGC
TCTCATCCGATCGCAGATTCTTCCATCTTCGAGGAGGAACTTTAGTGTGGCGGCGGCGGC
TAGCACTCAGCTCGGCATTCCAATAGACGATTTAGTCGGAAACCACACGGTCAAATGGAT
GCAGGATAGAAGCAAGAAGTCACCAATGGAACTGATCAATGAGGTTCCACCTATCAAGGT
CGTTGGAAGAACTGCTGCTTGTGAAGGAGACACCAATCCAGCACTAGGTCATCCAATTGA
GTTCATTTGCCTCGACCTACACGAGCCTGCCATCTGCAAGTACTGTGGCCTTCGTTATGT
TCAAGATCATCATCACTAAACGCAACATTCCGCAAGTGGAAGCATCTCTAGTCTCTCTCT
CCGTTTTTTTATTGCATTGTCAAGTTTGTGTTTCACTTATTTGATGCTCCGACATCTTCA
GATTTAAATATCTAATAAAGGATTCGATCACATTCGGGCAAGTGTGACTTTGTTTGATCA
CACTTGTCAGGTTGTAACATCCAATATTTGATACTCTTTTCCATGCCAATGAGCTCAGCC
AAGGCTTTGGGTTTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BY44JQ C 1
AF RR2BY44TF U 1
BS 1 617 RR2BY44TF

RD RR2BY44JQ 617 0 0
TTTTTTCTTTTTTGTTGGGTGGCTTGAAGGAGCAAAAATGGCGTCGAATCTCGTGAAAGC
TCTCATCCGATCGCAGATTCTTCCATCTTCGAGGAGGAACTTTAGTGTGGCGGCGGCGGC
TAGCACTCAGCTCGGCATTCCAATAGACGATTTAGTCGGAAACCACACGGTCAAATGGAT
GCAGGATAGAAGCAAGAAGTCACCAATGGAACTGATCAATGAGGTTCCACCTATCAAGGT
CGTTGGAAGAACTGCTGCTTGTGAAGGAGACACCAATCCAGCACTAGGTCATCCAATTGA
GTTCATTTGCCTCGACCTACACGAGCCTGCCATCTGCAAGTACTGTGGCCTTCGTTATGT
TCAAGATCATCATCACTAAACGCAACATTCCGCAAGTGGAAGCATCTCTAGTCTCTCTCT
CCGTTTTTTTATTGCATTGTCAAGTTTGTGTTTCACTTATTTGATGCTCCGACATCTTCA
GATTTAAATATCTAATAAAGGATTCGATCACATTCGGGCAAGTGTGACTTTGTTTGATCA
CACTTGTCAGGTTGTAACATCCAATATTTGATACTCTTTTCCATGCCAATGAGCTCAGCC
AAGGCTTTGGGTTTTGC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2BY44TF 617 0 0
TTTTTTCTTTTTTGTTGGGTGGCTTGAAGGAGCAAAAATGGCGTCGAATCTCGTGAAAGC
TCTCATCCGATCGCAGATTCTTCCATCTTCGAGGAGGAACTTTAGTGTGGCGGCGGCGGC
TAGCACTCAGCTCGGCATTCCAATAGACGATTTAGTCGGAAACCACACGGTCAAATGGAT
GCAGGATAGAAGCAAGAAGTCACCAATGGAACTGATCAATGAGGTTCCACCTATCAAGGT
CGTTGGAAGAACTGCTGCTTGTGAAGGAGACACCAATCCAGCACTAGGTCATCCAATTGA
GTTCATTTGCCTCGACCTACACGAGCCTGCCATCTGCAAGTACTGTGGCCTTCGTTATGT
TCAAGATCATCATCACTAAACGCAACATTCCGCAAGTGGAAGCATCTCTAGTCTCTCTCT
CCGTTTTTTTATTGCATTGTCAAGTTTGTGTTTCACTTATTTGATGCTCCGACATCTTCA
GATTTAAATATCTAATAAAGGATTCGATCACATTCGGGCAAGTGTGACTTTGTTTGATCA
CACTTGTCAGGTTGTAACATCCAATATTTGATACTCTTTTCCATGCCAATGAGCTCAGCC
AAGGCTTTGGGTTTTGC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL6825Contig1 1393 2 2 U
GCAGTATCTTGATAAGATGGTCGAAGACGGGTTATCTCCAAACGTTGTGTTGTATACTTC
ACTCATTGGTCATTTCTTGAAGAAGGGAGACTTCAAGTTTTCTTTTACGTTGTTTGGTTT
AATGGGAGAAAATGAGGTGAAACATGATCACGTTGCGTACATCACACTGCTTAGCGGTTT
GTGGAGAGCATTGGAGCGACGAAAGAGACAAGTGTTTGTTGGGCCTGGTAAAGAACAGCT
TCTCCGACGTCTTCTTCAGACAAATCCCGTACCATCGATCCCCTCTTCTACATGCAACTA
CAGATCAAAAAGCTTTGCGATGGAAGTGATTGGGAAAGTGAAAACGTCTGTCGTCCCTAA
CTTATACCTCCACAACGCCATTATAACAGGATACTGTGCTGCAGGAAGGCTTGATGAAGC
TTATAACCATCTCCAATCAATGCAAAAGGAAGGAGTTGTTCCAAATAAGGTGACTTTCAC
TATCCTCATGAAAGCTCATATCAAAGCAGGCGACGTTGAGTCTGCTATAGCTTTGTTTGA
GGACTCGGATTGCGAGGCAGATCAAGTCATGTACAGTACTCTGCTTAAGGGTCTCTGTAA
AAGTGAAAGACCTCGGGATGCTTTAGCGCTGATGGTAGAAATGCAGAAAGATGGTGTGTA
TCCAAACAGAGACTCTTATGAAACGCTGCTTCAGTGTCTCTGTTACTCTAGATTGACCAT
GGAAGCGGTTAAAGTAGTTAAAGACATGGGTGCTCTTGGTTTTTGGCCTCGTTCGATTAG
TCCCACATAGTCATTCTTTGAGATTCTTTCTCTACAGCTTATCGCGGTTTTGCTTAGAAT
ACACACATTAAGATGTCGTTGAGGCAACATAGAGGTGTCGGCTTCCAAGAGTTTGTTCTC
AAAGAAATGGACTTTCTTGCTCTGTATCGGATTCTTCTGCGCGGGAACTATCTTTTCCGA
CAGAACGTTTCCTGAGTTTGAAGCCATTGTTGTATCAAGGGAAGCTTCAAATGAACGGCT
GCATTTAGTGTCAGAGGACACTGTGATTCATCAAAAAACGATTTGAAGCGTGAATCAAAA
GAGTCCAGATGCAATTTAAACACTTGACAAAACGACATAGACGCTGGAAATCGAATTGGC
GGCTGCAAGAGCAGCTCAAGAACTTACGTGAATGAGGATGTCTCTTTAGGATCATGGTTT
CTTGGAATGGATGGCATGTAGATGATCGTAGGTTATATGATGTGGGGTACAGATAACACA
AGAGAACTCATTGAGGAAGAAGTGTACAGTGATAAGTCCGCTAAAAAACATTTTTGTAGT
AAAGACACGCACACACGCCTTTGAGTCTGTTCAACAGTGTATATATGTATGCCTGTATGT
ATCTTTTGAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB02TF U 1
AF RR2EB02JQ C 646
BS 1 717 RR2EB02TF
BS 718 1393 RR2EB02JQ

RD RR2EB02TF 720 0 0
GCAGTATCTTGATAAGATGGTCGAAGACGGGTTATCTCCAAACGTTGTGTTGTATACTTC
ACTCATTGGTCATTTCTTGAAGAAGGGAGACTTCAAGTTTTCTTTTACGTTGTTTGGTTT
AATGGGAGAAAATGAGGTGAAACATGATCACGTTGCGTACATCACACTGCTTAGCGGTTT
GTGGAGAGCATTGGAGCGACGAAAGAGACAAGTGTTTGTTGGGCCTGGTAAAGAACAGCT
TCTCCGACGTCTTCTTCAGACAAATCCCGTACCATCGATCCCCTCTTCTACATGCAACTA
CAGATCAAAAAGCTTTGCGATGGAAGTGATTGGGAAAGTGAAAACGTCTGTCGTCCCTAA
CTTATACCTCCACAACGCCATTATAACAGGATACTGTGCTGCAGGAAGGCTTGATGAAGC
TTATAACCATCTCCAATCAATGCAAAAGGAAGGAGTTGTTCCAAATAAGGTGACTTTCAC
TATCCTCATGAAAGCTCATATCAAAGCAGGCGACGTTGAGTCTGCTATAGCTTTGTTTGA
GGACTCGGATTGCGAGGCAGATCAAGTCATGTACAGTACTCTGCTTAAGGGTCTCTGTAA
AAGTGAAAGACCTCGGGATGCTTTAGCGCTGATGGTAGAAATGCAGAAAGATGGTGTGTA
TCCAAACAGAGACTCTTATGAAACGCTGCTTCAGTGTCTCTGTTACTCTAGATTGAC
ATG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2EB02JQ 748 0 0
GAAG
GATGGTGTGTATCCAAACAGAGACTCTTATGAAACGCTGCTTCAGTGTCTCTGTTACTCT
AGATTGACCATGGAAGCGGTTAAAGTAGTTAAAGACATGGGTGCTCTTGGTTTTTGGCCT
CGTTCGATTAGTCCCACATAGTCATTCTTTGAGATTCTTTCTCTACAGCTTATCGCGGTT
TTGCTTAGAATACACACATTAAGATGTCGTTGAGGCAACATAGAGGTGTCGGCTTCCAAG
AGTTTGTTCTCAAAGAAATGGACTTTCTTGCTCTGTATCGGATTCTTCTGCGCGGGAACT
ATCTTTTCCGACAGAACGTTTCCTGAGTTTGAAGCCATTGTTGTATCAAGGGAAGCTTCA
AATGAACGGCTGCATTTAGTGTCAGAGGACACTGTGATTCATCAAAAAACGATTTGAAGC
GTGAATCAAAAGAGTCCAGATGCAATTTAAACACTTGACAAAACGACATAGACGCTGGAA
ATCGAATTGGCGGCTGCAAGAGCAGCTCAAGAACTTACGTGAATGAGGATGTCTCTTTAG
GATCATGGTTTCTTGGAATGGATGGCATGTAGATGATCGTAGGTTATATGATGTGGGGTA
CAGATAACACAAGAGAACTCATTGAGGAAGAAGTGTACAGTGATAAGTCCGCTAAAAAAC
ATTTTTGTAGTAAAGACACGCACACACGCCTTTGAGTCTGTTCAACAGTGTATATATGTA
TGCCTGTATGTATCTTTTGAACTG

QA 5 748 5 748
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6827Contig1 1088 2 2 U
GGATCACACAAGTCTTGTGAGTGATTTTCAAGTAGCTGTCTCAGTGACCAAAAAAAGATC
ATCATTTAGTTGAGGCCTTTCGCTGAGCAGAGAGATCAGATAGAGCTCTTGCTTTTGCTT
TGACTGAGATTAAAATGTCTGGGTCGCACAAAATTGTGGAACTCTATACACGTCATGTTT
ATAATGCTAACGAGATGAGAGTACGTAGGCAAGAGTACTCCTCAGTTGGAGTTGAAGGTA
AAAAATTCAGCAGAACGATTTTCCGTACCAACGACGATGGACCAGACATTCTGGTTGATC
AAGTTGTTCAGAGTGAGGGAACATTTTATTATAACCTTCGTCTTCCGGCTATACGGTCCA
GAAGGACGTTTCGTGAGTACATTTCAACTAACCCGTCGGCGCAGCAAGAGTTGGATAGGG
TGACTCCGCTAAGATGGGTGCACAATAGTTTGGTTAACGAATGGAGCTGGTCTAACGTGA
CTAACAATATCGTTAGACATGTCAGCGATAGTATTGACTTTAGTACTTTAAGACGGGGGG
ACTATTTCGCTTGTTATTGTGATGAAGCTTTGGGCGATCTCTTCATCGTGGATGAAGAAA
CGAATAGGTCGGGCCAAGAAATACCCCCGTTTGAGGAGATAGAGGTGGACGATCCTTGTC
CATTATGTCACAAAAACTACTTGTTGGACTATGCGCCTGCTCATCAGAATCGTGCATATG
AAGATTACCTCAGATTCTTTTGCTGCACAACGATCTACCATAGAAGGTGTATTCTTCCGT
GGCTCTGGATTGAGAGGGAGAACCACTTTCGGACATTTTCGTCTTGTCCCGAATGCACCA
ATGCAATCTGAGGTCATTTGGCGGTGTGTGTTCTTCTTTTAGGTCAACTAAATCGCTTTT
AGTATTATTTGAATGTGTTTTATGTTGTTTCGGTTCTTCTGCAGTTTGAATTTGTGTGTT
TATGTAGTTTCACTTAGTTATGCTAAGTATAGTAGCTGTCTGTTTAGTTTAATTTATGCC
TTGTTCGCTACTAGTTCCTTTATGTAAAATAAAAAAATATATATATATGCTCTTATGATA
CTTTCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL96TF U 1
AF RR2BL96JQ C 369
BS 1 671 RR2BL96TF
BS 672 1088 RR2BL96JQ

RD RR2BL96TF 671 0 0
GGATCACACAAGTCTTGTGAGTGATTTTCAAGTAGCTGTCTCAGTGACCAAAAAAAGATC
ATCATTTAGTTGAGGCCTTTCGCTGAGCAGAGAGATCAGATAGAGCTCTTGCTTTTGCTT
TGACTGAGATTAAAATGTCTGGGTCGCACAAAATTGTGGAACTCTATACACGTCATGTTT
ATAATGCTAACGAGATGAGAGTACGTAGGCAAGAGTACTCCTCAGTTGGAGTTGAAGGTA
AAAAATTCAGCAGAACGATTTTCCGTACCAACGACGATGGACCAGACATTCTGGTTGATC
AAGTTGTTCAGAGTGAGGGAACATTTTATTATAACCTTCGTCTTCCGGCTATACGGTCCA
GAAGGACGTTTCGTGAGTACATTTCAACTAACCCGTCGGCGCAGCAAGAGTTGGATAGGG
TGACTCCGCTAAGATGGGTGCACAATAGTTTGGTTAACGAATGGAGCTGGTCTAACGTGA
CTAACAATATCGTTAGACATGTCAGCGATAGTATTGACTTTAGTACTTTAAGACGGGGGG
ACTATTTCGCTTGTTATTGTGATGAAGCTTTGGGCGATCTCTTCATCGTGGATGAAGAAA
CGAATAGGTCGGGCCAAGAAATACCCCCGTTTGAGGAGATAGAGGTGGACGATCCTTGTC
CATTATGTCAC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2BL96JQ 720 0 0
TTTCGTGAGTACATTTCAACTAACCCGTCGGCGCAGCAAGAGTTGGATAGGGTGACTCCG
CTAAGATGGGTGCACAATAGTTTGGTTAACGAATGGAGCTGGTCTAACGTGACTAACAAT
ATCGTTAGACATGTCAGCGATAGTATTGACTTTAGTACTTTAAGACGGGGGGACTATTTC
GCTTGTTATTGTGATGAAGCTTTGGGCGATCTCTTCATCGTGGATGAAGAAACGAATAGG
TCGGGCCAAGAAATACCCCCGTTTGAGGAGATAGAGGTGGACGATCCTTGTCCATTATGT
CACAAAAACTACTTGTTGGACTATGCGCCTGCTCATCAGAATCGTGCATATGAAGATTAC
CTCAGATTCTTTTGCTGCACAACGATCTACCATAGAAGGTGTATTCTTCCGTGGCTCTGG
ATTGAGAGGGAGAACCACTTTCGGACATTTTCGTCTTGTCCCGAATGCACCAATGCAATC
TGAGGTCATTTGGCGGTGTGTGTTCTTCTTTTAGGTCAACTAAATCGCTTTTAGTATTAT
TTGAATGTGTTTTATGTTGTTTCGGTTCTTCTGCAGTTTGAATTTGTGTGTTTATGTAGT
TTCACTTAGTTATGCTAAGTATAGTAGCTGTCTGTTTAGTTTAATTTATGCCTTGTTCGC
TACTAGTTCCTTTATGTAAAATAAAAAAATATATATATATGCTCTTATGATACTTTCGAC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6829Contig1 1070 2 2 U
GGGTCTTTCAACTCGCGCGACGATGAGTGCATCCGACAGTACATCTCGTACTATTACGAG
GGTTTCGAGATTGAGTGGGATAAACTGGACTACCTGTTCGACACGATGCCTATGATTGAT
CCATATCGTGCCAGTGAATATAAGACCAACGATGAAATAATCCGTGAAGGGACCTGTCTT
GCCATTGCCCGACACAATTCCGACAAGGGAACTAGGCTTGTTTTCCTCGACCACGTTTCA
GCAAGTTACAGGTGCTGTGCTGGTGTGCTTTACTATGTTACATTCTGGGCCATGGATTTG
GCTTCATCCAGTCCCCTGCCAAAACTTTATCAATCAAACTTTCGCCGGTGTGGACCCACA
TTTTGTGAGGTTTGTCTCTTCAGGCTTAAACCAACGGACCAAGAGATTGCTGCTGTTCAG
GTGGATCCTCCTCCTCCATTGAATGAAGATATCCCAGAACGACCCACTGTATTGCTCACT
GTAACGGGTCCAGGGTCTGGGTTCATACCCAACGTTGTCTTCACTAGGATTCCTGCTCAA
GTGTCTGTCTCGTTGCCAGAATCATCCTCACCATCCCTTCTTGTTACCTAACTACGCAAG
TTTGTTCCATTCCAAGGAGAAACCTCATCCCCATAATCATCATCACAAAGAAACTCATGG
AAGGAGTGATGATATCGATGAGAACACGAATGTAGATGAAGTGAAGGCTCCCAATGTTTT
CGAGAGAGCCAAGGAAGAGACTCTTCGAGGCCGTCATCGGCACCATCCATCCCAAGAAGA
ATGAGACTGACGGTTCTGATTCTCCTAAGCGTTCTCGGTCTGTCTCACCGGAGAAGGAGA
GAGCTGGATTCGGATGCTCTCTTGGAAAGGGGTTGGAAAAGATTTGTGCTCCTTGGGGGA
ATAATAAAGAAGATTGAGTTATTCATTATGCTTGATGATCATAAACTTGTTTGCTAATTG
TTGTGATCTAATTTGGTTGAGTTTCAATGAGTTTGTTGATTTATAGGTACTCAATTGTTA
TCTTAACAGATTAAAACTTGTTATTCATATTCCAGAAGCTTTGTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA38TF U 1
AF RR2HA38JQ C 438
BS 1 523 RR2HA38TF
BS 524 1070 RR2HA38JQ

RD RR2HA38TF 523 0 0
GGGTCTTTCAACTCGCGCGACGATGAGTGCATCCGACAGTACATCTCGTACTATTACGAG
GGTTTCGAGATTGAGTGGGATAAACTGGACTACCTGTTCGACACGATGCCTATGATTGAT
CCATATCGTGCCAGTGAATATAAGACCAACGATGAAATAATCCGTGAAGGGACCTGTCTT
GCCATTGCCCGACACAATTCCGACAAGGGAACTAGGCTTGTTTTCCTCGACCACGTTTCA
GCAAGTTACAGGTGCTGTGCTGGTGTGCTTTACTATGTTACATTCTGGGCCATGGATTTG
GCTTCATCCAGTCCCCTGCCAAAACTTTATCAATCAAACTTTCGCCGGTGTGGACCCACA
TTTTGTGAGGTTTGTCTCTTCAGGCTTAAACCAACGGACCAAGAGATTGCTGCTGTTCAG
GTGGATCCTCCTCCTCCATTGAATGAAGATATCCCAGAACGACCCACTGTATTGCTCACT
GTAACGGGTCCAGGGTCTGGGTTCATACCCAACGTTGTCTTCA

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2HA38JQ 633 0 0
ATTGAATGAAGATATCCCAGAACGACCCACTGTATTGCTCACTGTAACGGGTCCAGGGTC
TGGGTTCATACCCAACGTTGTCTTCACTAGGATTCCTGCTCAAGTGTCTGTCTCGTTGCC
AGAATCATCCTCACCATCCCTTCTTGTTACCTAACTACGCAAGTTTGTTCCATTCCAAGG
AGAAACCTCATCCCCATAATCATCATCACAAAGAAACTCATGGAAGGAGTGATGATATCG
ATGAGAACACGAATGTAGATGAAGTGAAGGCTCCCAATGTTTTCGAGAGAGCCAAGGAAG
AGACTCTTCGAGGCCGTCATCGGCACCATCCATCCCAAGAAGAATGAGACTGACGGTTCT
GATTCTCCTAAGCGTTCTCGGTCTGTCTCACCGGAGAAGGAGAGAGCTGGATTCGGATGC
TCTCTTGGAAAGGGGTTGGAAAAGATTTGTGCTCCTTGGGGGAATAATAAAGAAGATTGA
GTTATTCATTATGCTTGATGATCATAAACTTGTTTGCTAATTGTTGTGATCTAATTTGGT
TGAGTTTCAATGAGTTTGTTGATTTATAGGTACTCAATTGTTATCTTAACAGATTAAAAC
TTGTTATTCATATTCCAGAAGCTTTGTTGATCC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL6830Contig1 722 2 3 U
GGATCCTCTTTAGCTGCAACTTCTTTTATTCAAATCTTTCTTCTCAAATCATCAAACAAT
GGAATTCTGGGGAGTTGAAGTTCTCGCAGGGAAGTCAGTTAAAGTGAAGCCTGATTTTGA
AACACTCATCCATGTTTCCCAGGCATCACTTGATAAAGGGAAAAAGGGAGAAACCGCTTT
GTTGTATGTGACGGTTGATGGGAAGAAGCTTGTGATGGGAACACTCTCTCAAGGCAACAT
TCCTCAGATTAGCTTCGATCTCGTCTTTGAGAAGGAGTTCGAGCTTTCCCACAGTTTGGA
GAGCGGAAGTGTCCACTTTGTCGGATACAAGTCCCCCAACATGCCCGAAGACGAGGAGGA
CTTCTCTGACTCAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGCTGCAGCAGTTCCTGCGACAGCTGTCAC
TGTCAAGGCTGACTCGAAACCAAAGGCCAAGCCTGCGGAGGAAGTGAAGCCTGAATCAGA
TGATGATGATGATGAGGATGAGGAGGAGGATGATTCTGAAGAGGATGGATCCGACTCTGA
GAAAGGAATGGATGTTGACGAGGATGATTCAGAGGATGAGGAGGATGATTCTGAAGATGA
AGATGATGAGACCCCTAAGAAGCCTGAGGTGGTGTCGAACAAAAAGAGGCCGAATGAATC
TGCTGCTTCCAAAGCAGCTATTTCAGCAAAGAAAGCAAAACCAGCTACACCACACCCAGC
TA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2C224TF U 3
AF RR2B161TF U 1
BS 1 594 RR2B161TF
BS 595 595 RR2C224TF
BS 596 722 RR2B161TF

RD RR2C224TF 642 0 0
GGG
CTCTTTAGCTGCAACTTCTTTTATTCAAATCTTTCTTCTCAAATCATCAAACAATGGAAT
TCTGGGGAGTTGAAGTTCTCGCAGGGAAGTCAGTTAAAGTGAAGCCTGATTTTGAAACAC
TCATCCATGTTTCCCAGGCATCACTTGATAAAGGGAAAAAGGGAGAAACCGCTTTGTTGT
ATGTGACGGTTGATGGGAAGAAGCTTGTGATGGGAACACTCTCTCAAGGCAACATTCCTC
AGATTAGCTTCGATCTCGTCTTTGAGAAGGAGTTTGAGCTTTCCCACAGTTTGGAGAGCG
GAAGTGTCCACTTTGTCGGATACAAGTCCCCCAACATGCCCGAAGACGAGGAGGACTTCT
CTGACTCAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGCTGCAGCAGTTCCTGCGACAGCTGTCACTGTCA
AGGCTGACTCGAAACCAAAGGCCAAGCCTGCGGAGGAAGTGAAGCCTGAATCAGATGATG
ATGATGA***GGATGAGGAGGAGGATGATTCTGAAGAGGATGGATCCGACTCTGAGAAAG
GAATGGATGTTGACGAGGATGATTCAGAGGATGAGGAGGATGATTCTGAAGATGAAGATG
ATGAGACCCCTAAGAAGCCTGAGGTGGTGTCGAACAAAA

QA 4 642 4 642
DS 

RD RR2B161TF 722 0 0
GGATCCTCTTTAGCTGCAACTTCTTTTATTCAAATCTTTCTTCTCAAATCATCAAACAAT
GGAATTCTGGGGAGTTGAAGTTCTCGCAGGGAAGTCAGTTAAAGTGAAGCCTGATTTTGA
AACACTCATCCATGTTTCCCAGGCATCACTTGATAAAGGGAAAAAGGGAGAAACCGCTTT
GTTGTATGTGACGGTTGATGGGAAGAAGCTTGTGATGGGAACACTCTCTCAAGGCAACAT
TCCTCAGATTAGCTTCGATCTCGTCTTTGAGAAGGAGTTCGAGCTTTCCCACAGTTTGGA
GAGCGGAAGTGTCCACTTTGTCGGATACAAGTCCCCCAACATGCCCGAAGACGAGGAGGA
CTTCTCTGACTCAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGCTGCAGCAGTTCCTGCGACAGCTGTCAC
TGTCAAGGCTGACTCGAAACCAAAGGCCAAGCCTGCGGAGGAAGTGAAGCCTGAATCAGA
TGATGATGATGATGAGGATGAGGAGGAGGATGATTCTGAAGAGGATGGATCCGACTCTGA
GAAAGGAATGGATGTTGACGAGGATGATTCAGAGGATGAGGAGGATGATTCTGAGGATGA
AGATGATGAGACCCCTAAGAAGCCTGAGGTGGTGTCGAACAAAAAGAGGCCGAATGAATC
TGCTGCTTCCAAAGCAGCTATTTCAGCAAAGAAAGCAAAACCAGCTACACCACACCCAGC
TA

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL6831Contig1 682 2 1 U
GCTACCGATCGCTAATTTTACACACAAACAAAATATCATACATCAATGGTCAGAAAAGAA
TTCTAAACAATATGTAAAATAGATGAGACAATCTATTTACCATCCATTGATTTTAGATTA
CAAGTACATTTAGTTTAACATGGTATCCATACATTTTAATCCGATCCACATTGGTCTTGT
TAGTCTATTGATCATTGCCCGAATATTCTGAGTTTTATTTTTTTCAAAGAAATGTTCTTG
GAATGAAAAAACTATCTGACTATTTTTTCTTTTTTTCAAAAAAAACTATTTGACTAAATA
AACTGAAAATGTAGATTACTAACAAAGGAAGCTAATTTATTTATTTTGTTGGGGGTACAA
ACTATAAAGTCTAAGAGTGTACAATTATTTGTTTCTGGTGATTAGAATATATAATCTACT
AAAAGGACATGAAAAAATAGAAGAAACTGCATATTTGCCTATATGGTAATTTAACGTAAC
TTATGCTATAAGTTTGCACATCTCGCTCAAATTGTCAAGTTGAGCGTGTGGGGACGGACC
GTAAGGATTTCTAGTTCTAGTCTCAGTGAGGAGGACCACAACTAGCTCTTTCTCGATGAT
TGATAAGCAGTATTTCGCCTTGATTTAAAAGACCTATTGGGCCTTGTTGATGGGGCTTTA
CCAGCCCATAACAGTAATAAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EC63JQ C 1
AF RR2EC63TF U 1
BS 1 682 RR2EC63TF

RD RR2EC63JQ 682 0 0
GCTACCGATCGCTAATTTTACACACAAACAAAATATCATACATCAATGGTCAGAAAAGAA
TTCTAAACAATATGTAAAATAGATGAGACAATCTATTTACCATCCATTGATTTTAGATTA
CAAGTACATTTAGTTTAACATGGTATCCATACATTTTAATCCGATCCACATTGGTCTTGT
TAGTCTATTGATCATTGCCCGAATATTCTGAGTTTTATTTTTTTCAAAGAAATGTTCTTG
GAATGAAAAAACTATCTGACTATTTTTTCTTTTTTTCAAAAAAAACTATTTGACTAAATA
AACTGAAAATGTAGATTACTAACAAAGGAAGCTAATTTATTTATTTTGTTGGGGGTACAA
ACTATAAAGTCTAAGAGTGTACAATTATTTGTTTCTGGTGATTAGAATATATAATCTACT
AAAAGGACATGAAAAAATAGAAGAAACTGCATATTTGCCTATATGGTAATTTAACGTAAC
TTATGCTATAAGTTTGCACATCTCGCTCAAATTGTCAAGTTGAGCGTGTGGGGACGGACC
GTAAGGATTTCTAGTTCTAGTCTCAGTGAGGAGGACCACAACTAGCTCTTTCTCGATGAT
TGATAAGCAGTATTTCGCCTTGATTTAAAAGACCTATTGGGCCTTGTTGATGGGGCTTTA
CCAGCCCATAACAGTAATAAGT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2EC63TF 682 0 0
GCTACCGATCGCTAATTTTACACACAAACAAAATATCATACATCAATGGTCAGAAAAGAA
TTCTAAACAATATGTAAAATAGATGAGACAATCTATTTACCATCCATTGATTTTAGATTA
CAAGTACATTTAGTTTAACATGGTATCCATACATTTTAATCCGATCCACATTGGTCTTGT
TAGTCTATTGATCATTGCCCGAATATTCTGAGTTTTATTTTTTTCAAAGAAATGTTCTTG
GAATGAAAAAACTATCTGACTATTTTTTCTTTTTTTCAAAAAAAACTATTTGACTAAATA
AACTGAAAATGTAGATTACTAACAAAGGAAGCTAATTTATTTATTTTGTTGGGGGTACAA
ACTATAAAGTCTAAGAGTGTACAATTATTTGTTTCTGGTGATTAGAATATATAATCTACT
AAAAGGACATGAAAAAATAGAAGAAACTGCATATTTGCCTATATGGTAATTTAACGTAAC
TTATGCTATAAGTTTGCACATCTCGCTCAAATTGTCAAGTTGAGCGTGTGGGGACGGACC
GTAAGGATTTCTAGTTCTAGTCTCAGTGAGGAGGACCACAACTAGCTCTTTCTCGATGAT
TGATAAGCAGTATTTCGCCTTGATTTAAAAGACCTATTGGGCCTTGTTGATGGGGCTTTA
CCAGCCCATAACAGTAATAAGT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL6832Contig1 808 2 8 U
GAGCGGAGAGCAGAACCCTCATGAATTTGGTGAAGAGGAACAACAACAAGCTCTTGCTTC
ACGTGGGGCTTTGCTGCTTCGAACCGCTCTTGCTAACAAGTCAGTGCAGGAGACTAATGA
TAAAGAAGGAGCCAAAAGAACAAGAAAACCTCTGTCAGACATAGGAAACACAACGGGTAA
ATCAAATGTACCAAAGCCAAGCCAAAAGAAGACACTGAAGAAGCCTGTCCTTCAGCTTGT
TGTGGATTCATCAACAACAACTTCATCTCAGGAGGAAGCTCATCCAGTGGTTATGGATGA
AGGAAACGGTATGAAACTGAAGCTACCGAGGGCGATGACGTCAGTGTCTTCTAATGGCAG
CAACTTGCTGATGGAAAGAAATGCCGACCAAAGTGTAGGTGAGTCAGTCAGTAATGGTGA
TAGGCCAAGTGTTAGTAGAAGTTCGGATGAAAAAGAGAACCAAACTAGCCGGATCTAACC
AAAAAAGAAAAGAAAACAAGAGACGTTGCTTGAGGAACAAGGGAAGATGTGTGTGTTTGG
ATCTTTTTCCTCGTTAACCGAACAGAAAGAAACCTATCCGGTTTCAAATGTACAAATGGT
TTAAGTTGTTATGGTATTCCAACATTAAGAGCACAGCTCGGTTTGGAATGTTGTCTTTAT
TTTGGATCATTTTGGATAATGATAATCATTCTAGTGATCCAAAATGAATGATTAAATTGA
AATTAAGTCATTTTCTCTCCATCGACAACATAAAACACTTGTCAATAGCTCATGTTTACA
TTTTCATTCTATAAAAACTATTAAGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP88TF U 1
AF RR2CP88JQ C 47
BS 1 703 RR2CP88TF
BS 704 704 RR2CP88JQ
BS 705 747 RR2CP88TF
BS 748 748 RR2CP88JQ
BS 749 764 RR2CP88TF
BS 765 765 RR2CP88JQ
BS 766 783 RR2CP88TF
BS 784 808 RR2CP88JQ

RD RR2CP88TF 786 0 0
GAGCGGAGAGCAGAACCCTCATGAATTTGGTGAAGAGGAACAACAACAAGCTCTTGCTTC
ACGTGGGGCTTTGCTGCTTCGAACCGCTCTTGCTAACAAGTCAGTGCAGGAGACTAATGA
TAAAGAAGGAGCCAAAAGAACAAGAAAACCTCTGTCAGACATAGGAAACACAACGGGTAA
ATCAAATGTACCAAAGCCAAGCCAAAAGAAGACACTGAAGAAGCCTGTCCTTCAGCTTGT
TGTGGATTCATCAACAACAACTTCATCTCAGGAGGAAGCTCATCCAGTGGTTATGGATGA
AGGAAACGGTATGAAACTGAAGCTACCGAGGGCGATGACGTCAGTGTCTTCTAATGGCAG
CAACTTGCTGATGGAAAGAAATGCCGACCAAAGTGTAGGTGAGTCAGTCAGTAATGGTGA
TAGGCCAAGTGTTAGTAGAAGTTCGGATGAAAAAGAGAACCAAACTAGCCGGATCTAACC
AAAAAAGAAAAGAAAACAAGAGACGTTGCTTGAGGAACAAGGGAAGATGTGTGTGTTTGG
ATCTTTTTCCTCGTTAACCGAACAGAAAGAAACCTATCCGGTTTCAAATGTACAAATGGT
TTAAGTTGTTATGGTATTCCAACATTAAGAGCACAGCTCGGTTTGGAATGTTGTCTTTAT
TTTGGATCATTTTGGATAATGATAATCATTCTAGTGATCCAAA*TGAATGATTAAATTGA
AATTAAGTCATTTTCTCTCCATCGACA*CATAAAACACTTGTCA*TAGCTCATGTTTACA
TTT
CAT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2CP88JQ 762 0 0
CAAGCTCTTGCTTCACGTGGGGCTTTGCTGCTTCGAACCGCTCTTGCTAACAAGTCAGTG
CAGGAGACTAATGATAAAGAAGGAGCCAAAAGAACAAGAAAACCTCTGTCAGACATAGGA
AACACAACGGGTAAATCAAATGTACCAAAGCCAAGCCAAAAGAAGACACTGAAGAAGCCT
GTCCTTCAGCTTGTTGTGGATTCATCAACAACAACTTCATCTCAGGAGGAAGCTCATCCA
GTGGTTATGGATGAAGGAAACGGTATGAAACTGAAGCTACCGAGGGCGATGACGTCAGTG
TCTTCTAATGGCAGCAACTTGCTGATGGAAAGAAATGCCGACCAAAGTGTAGGTGAGTCA
GTCAGTAATGGTGATAGGCCAAGTGTTAGTAGAAGTTCGGATGAAAAAGAGAACCAAACT
AGCCGGATCTAACCAAAAAAGAAAAGAAAACAAGAGACGTTGCTTGAGGAACAAGGGAAG
ATGTGTGTGTTTGGATCTTTTTCCTCGTTAACCGAACAGAAAGAAACCTATCCGGTTTCA
AATGTACAAATGGTTTAAGTTGTTATGGTATTCCAACATTAAGAGCACAGCTCGGTTTGG
AATGTTGTCTTTATTTTGGATCATTTTGGATAATGATAATCATTCTAGTGATCCAAAATG
AATGATTAAATTGAAATTAAGTCATTTTCTCTCCATCGACAACATAAAACACTTGTCAAT
AGCTCATGTTTACATTTTCATTCTATAAAAACTATTAAGTAT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL6833Contig1 687 2 5 U
TTTTTGGATTGTGTTAATTGCTCCTTTCAAGATGGAGAAGAATGTGAAGACCTCGGATTT
GAAATCCTCTGTCAATGGTGGTGTTGTTGATGTCTATGGAGAAGATTCAGCCACCGTTGA
GCACAGCATAACTCCATGGTCTCTCTCTGTTTCTAGTGGTTATTCCTTGCTGAGAGATCC
TCGCTACAACAAAGGACTTTCATTCACCGAGAAAGAGAGAGACACACATTACTTGCGTGG
CCTTCTTCCTCCAGCTGTTGTTGATCAAAACCTTCAGGAGAAGAGGCTGATCAATAACAT
CCGACAGTATCAACATCCATTACAAAAATACATGGCCCTGACAGAACTTCAGGAAAGAAA
CGAGAGGCTGTTTTACAAATTGTTGATAGATCATGTTGAAGAGCTTCCACCTATCGTTTA
TACTCCAACTGTTGGTGAAGCTTGTCAGAAATATGGAAGTATTTTCAGGCGTCCTCAGGG
TCTGTTCATCAGTTTAAAAGAGAAGGGAAAGATTCTGGATGTGTTAAAGAACTGGCCTGA
AAGGAACATACAGGTTATAGTTGTTACAGACGGTGAAAGGATTTTGGGATTAGGAGATCT
TGGATGCCAAGGGATGGGCATACCCGTTGGTAAACTGGCGTTATATTCAGCACTAGGAGG
TGTTCGTCCTTCTGCGTGTTTACCTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX52TF U 1
AF RR2BK35TF U 1
BS 1 201 RR2BK35TF
BS 202 202 RR2GX52TF
BS 203 606 RR2BK35TF
BS 607 607 RR2GX52TF
BS 608 687 RR2BK35TF

RD RR2GX52TF 629 0 0
TTTTTGGATTGTGTTAATTGCTCCTTTCAAGATGGAGAAGAATGTGAAGACCTCGGATTT
GAAATCCTCTGTCAATGGTGGTGTTGTTGATGTCTATGGAGAAGATTCAGCCACCGTTGA
GCACAGCATAACTCCATGGTCTCTCTCTGTTTCTAGTGGTTATTCCTTGCTGAGAGATCC
TCGCTACAACAAAGGACTTTCATTCACCGAGAAAGAGAGAGACACACATTACTTGCGTGG
CCTTCTTCCTCCAGCTGTTGTTGATCAAAACCTTCAGGAGAAGAGGCTGATCAATAACAT
CCGACAGTATCAACATCCATTACAAAAATACATGGCCCTGACAGAACTTCAGGAAAGAAA
CGAGAGGCTGTTTTACAAATTGTTGATAGATCATGTTGAAGAGCTTCTACCTATCGTTTA
TACTCCAACTGTTGGTGAAGCTTGTCAGAAATATGGAAGTATTTTCAGGCGTCCTCAGGG
TCTGTTCATCAGTTTAAAAGAGAAGGGAAAGATTCTGGATGTGTTAAAGAACTGGCCTGA
AAGGAACATACAGGTTATAGTTGTTACAGACG*TGAAAGGATTTTGGGATTAGGAGATCT
TGGATGCCAAGGGATGGGCATACCTGTTG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2BK35TF 687 0 0
TTTTTGGATTGTGTTAATTGCTCCTTTCAAGATGGAGAAGAATGTGAAGACCTCGGATTT
GAAATCCTCTGTCAATGGTGGTGTTGTTGATGTCTATGGAGAAGATTCAGCCACCGTTGA
GCACAGCATAACTCCATGGTCTCTCTCTGTTTCTAGTGGTTATTCCTTGCTGAGAGATCC
TCGCTACAACAAAGGACTTTCTTTCACCGAGAAAGAGAGAGACACACATTACTTGCGTGG
CCTTCTTCCTCCAGCTGTTGTTGATCAAAACCTTCAGGAGAAGAGGCTGATCAATAACAT
CCGACAGTATCAACATCCATTACAAAAATACATGGCCCTGACAGAACTTCAGGAAAGAAA
CGAGAGGCTGTTTTACAAATTGTTGATAGATCATGTTGAAGAGCTTCCACCTATCGTTTA
TACTCCAACTGTTGGTGAAGCTTGTCAGAAATATGGAAGTATTTTCAGGCGTCCTCAGGG
TCTGTTCATCAGTTTAAAAGAGAAGGGAAAGATTCTGGATGTGTTAAAGAACTGGCCTGA
AAGGAACATACAGGTTATAGTTGTTACAGACGGTGAAAGGATTTTGGGATTAGGAGATCT
TGGATGTCAAGGGATGGGCATACCCGTTGGTAAACTGGCGTTATATTCAGCACTAGGAGG
TGTTCGTCCTTCTGCGTGTTTACCTGT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL6834Contig1 672 2 2 U
GGAGTGACGGAACATAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGGCGGCGACTCTTGTGAACAG
AGTAATCTCCAGAACCGAAACTTTCGGTGCTTTCAGACTATCGCTCAATCTCCTGAGGAA
TTTCTCTGCGCCGGCGGCATCTCCTAGCTCCGATCCGATTAAACCTAAAGGAAGGAAGAA
GAAGAATAAGAAGAAGAACCTAATAGAGGTGGCTCAGTTCTTACCAAATTGGGGAATTGG
ATACCATATGGCTAAAGCTCACTGGAACGGAGTCTCTTACGAGATCACTAAGATCAATCT
CTACAAGGATGGTAGGCATGGCAAAGCGTGGGGGATTGTTCACAAAGATGGCTTGCCAGC
TGCTGAAGCTCCAAAGAAGATAAGTGGAGTACACAAGCGCTGCTGGAAGTATATCGCTAA
CCTGTCAAAGACCACGCCTGCAACCGCCTCCCAAGTCCAAGCTGCCTGATCTGTTTTACT
TTCCTTGTTTGTGGGGTACTTTTTCAGATATATTATCTGTTTGCAGTTTCTTCTCCTTTG
GAAGATAGATCTCTTGTTACTTGATGATATCTCCCTTTGAATTCGTCGATAAATTTTTAG
GGATCCGTAATCTTCGGATGATGATCTGTTTTAGGTTCGTATTATTAAAGACTTTTGCGC
TTCTTGGGATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DK60TF U 1
AF RR2DK60JQ C 15
BS 1 631 RR2DK60TF
BS 632 672 RR2DK60JQ

RD RR2DK60TF 631 0 0
GGAGTGACGGAACATAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGGCGGCGACTCTTGTGAACAG
AGTAATCTCCAGAACCGAAACTTTCGGTGCTTTCAGACTATCGCTCAATCTCCTGAGGAA
TTTCTCTGCGCCGGCGGCATCTCCTAGCTCCGATCCGATTAAACCTAAAGGAAGGAAGAA
GAAGAATAAGAAGAAGAACCTAATAGAGGTGGCTCAGTTCTTACCAAATTGGGGAATTGG
ATACCATATGGCTAAAGCTCACTGGAACGGAGTCTCTTACGAGATCACTAAGATCAATCT
CTACAAGGATGGTAGGCATGGCAAAGCGTGGGGGATTGTTCACAAAGATGGCTTGCCAGC
TGCTGAAGCTCCAAAGAAGATAAGTGGAGTACACAAGCGCTGCTGGAAGTATATCGCTAA
CCTGTCAAAGACCACGCCTGCAACCGCCTCCCAAGTCCAAGCTGCCTGATCTGTTTTACT
TTCCTTGTTTGTGGGGTACTTTTTCAGATATATTATCTGTTTGCAGTTTCTTCTCCTTTG
GAAGATAGATCTCTTGTTACTTGATGATATCTCCCTTTGAATTCGTCGATAAATTTTTAG
GGATCCGTAATCTTCGGATGATGATCTGTTT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2DK60JQ 658 0 0
TAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGGCGGCGACTCTTGTGAACAGAGTAATCTCCAGAA
CCGAAACTTTCGGTGCTTTCAGACTATCGCTCAATCTCCTGAGGAATTTCTCTGCGCCGG
CGGCATCTCCTAGCTCCGATCCGATTAAACCTAAAGGAAGGAAGAAGAAGAATAAGAAGA
AGAACCTAATAGAGGTGGCTCAGTTCTTACCAAATTGGGGAATTGGATACCATATGGCTA
AAGCTCACTGGAACGGAGTCTCTTACGAGATCACTAAGATCAATCTCTACAAGGATGGTA
GGCATGGCAAAGCGTGGGGGATTGTTCACAAAGATGGCTTGCCAGCTGCTGAAGCTCCAA
AGAAGATAAGTGGAGTACACAAGCGCTGCTGGAAGTATATCGCTAACCTGTCAAAGACCA
CGCCTGCAACCGCCTCCCAAGTCCAAGCTGCCTGATCTGTTTTACTTTCCTTGTTTGTGG
GGTACTTTTTCAGATATATTATCTGTTTGCAGTTTCTTCTCCTTTGGAAGATAGATCTCT
TGTTACTTGATGATATCTCCCTTTGAATTCGTCGATAAATTTTTAGGGATCCGTAATCTT
CGGATGATGATCTGTTTTAGGTTCGTATTATTAAAGACTTTTGCGCTTCTTGGGATGG

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL6835Contig1 799 2 2 U
GGACACTTCGTGACAGCTCTGCTCCTCTCCACCTATCTTTTTCTTCTTCTCTGCTCTTCT
CCAGACTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACATCTGTTCTTCTCTTTCCTCAGATCTC
TGCTCATGTTTCCATCTCAACTACCGGTTGAAGAATCTAAGGGTGAGGACGAATCAGAGG
ACCGATGTGGTGATGGCAAAGGAGGAGGGGATTTGGTTTCTAATGGTGGACGCTTGTCAC
AGATGTCTACTCGGCGGTGGTTGAGTGATATGTTTTGCGGTTCACGGCAGCAGAAAGGGA
TATACAGAAAAAGAAAAATGGAAAGTGAAGCCATACCAGAGCATTTGATCAAACTCTTCC
CTGTTGCACAGCCTGAAGCATTTGATCTGGTGGGTTATGTCATCTACGACAGTGGAAATA
ACTAAATATCAAGATACGACTCACAGAAGCTCAACAGCAGAAGACTGCTCCCAAAGACCT
AAAGCCAGAGCAACTGGAGAAGTTCTCTAAGTTGGAGGAATGGAGGCAAGAACTCAAGGC
TTTGGAGGATAAGGAGGAGGCGTAGCACTCTGCAGCATCTGACATGTAACTGTCTAGCTT
TCAGACAGGTTGTAGCTTTTTCTCATGAAATTTGTTGGAACCAATCCAAATTTTGTATGA
ATTGAAAAGGATGCTGTTTTTTGAGCTTTTTGTCAGAAGTCTGGTTAATGAACTTGGCTC
AATGCCTAAGTCCTCATGGGCATTGATGCCGTTTTGTGTATTGGTGTTTGGTTTGCAACT
AAAGCATGTGCTTACAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH89TF U 1
AF RR2AH89JQ C 1
BS 1 777 RR2AH89TF
BS 778 799 RR2AH89JQ

RD RR2AH89TF 777 0 0
GGACACTTCGTGACAGCTCTGCTCCTCTCCACCTATCTTTTTCTTCTTCTCTGCTCTTCT
CCAGACTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACATCTGTTCTTCTCTTTCCTCAGATCTC
TGCTCATGTTTCCATCTCAACTACCGGTTGAAGAATCTAAGGGTGAGGACGAATCAGAGG
ACCGATGTGGTGATGGCAAAGGAGGAGGGGATTTGGTTTCTAATGGTGGACGCTTGTCAC
AGATGTCTACTCGGCGGTGGTTGAGTGATATGTTTTGCGGTTCACGGCAGCAGAAAGGGA
TATACAGAAAAAGAAAAATGGAAAGTGAAGCCATACCAGAGCATTTGATCAAACTCTTCC
CTGTTGCACAGCCTGAAGCATTTGATCTGGTGGGTTATGTCATCTACGACAGTGGAAATA
ACTAAATATCAAGATACGACTCACAGAAGCTCAACAGCAGAAGACTGCTCCCAAAGACCT
AAAGCCAGAGCAACTGGAGAAGTTCTCTAAGTTGGAGGAATGGAGGCAAGAACTCAAGGC
TTTGGAGGATAAGGAGGAGGCGTAGCACTCTGCAGCATCTGACATGTAACTGTCTAGCTT
TCAGACAGGTTGTAGCTTTTTCTCATGAAATTTGTTGGAACCAATCCAAATTTTGTATGA
ATTGAAAAGGATGCTGTTTTTTGAGCTTTTTGTCAGAAGTCTGGTTAATGAACTTGGCTC
AATGCCTAAGTCCTCATGGGCATTGATGCCGTTTTGTGTATTGGTGTTTGGTTTGCA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2AH89JQ 799 0 0
GGACACTTCGTGACAGCTCTGCTCCTCTCCACCTATCTTTTTCTTCTTCTCTGCTCTTCT
CCAGACTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACATCTGTTCTTCTCTTTCCTCAGATCTC
TGCTCATGTTTCCATCTCAACTACCGGTTGAAGAATCTAAGGGTGAGGACGAATCAGAGG
ACCGATGTGGTGATGGCAAAGGAGGAGGGGATTTGGTTTCTAATGGTGGACGCTTGTCAC
AGATGTCTACTCGGCGGTGGTTGAGTGATATGTTTTGCGGTTCACGGCAGCAGAAAGGGA
TATACAGAAAAAGAAAAATGGAAAGTGAAGCCATACCAGAGCATTTGATCAAACTCTTCC
CTGTTGCACAGCCTGAAGCATTTGATCTGGTGGGTTATGTCATCTACGACAGTGGAAATA
ACTAAATATCAAGATACGACTCACAGAAGCTCAACAGCAGAAGACTGCTCCCAAAGACCT
AAAGCCAGAGCAACTGGAGAAGTTCTCTAAGTTGGAGGAATGGAGGCAAGAACTCAAGGC
TTTGGAGGATAAGGAGGAGGCGTAGCACTCTGCAGCATCTGACATGTAACTGTCTAGCTT
TCAGACAGGTTGTAGCTTTTTCTCATGAAATTTGTTGGAACCAATCCAAATTTTGTATGA
ATTGAAAAGGATGCTGTTTTTTGAGCTTTTTGTCAGAAGTCTGGTTAATGAACTTGGCTC
AATGCCTAAGTCCTCATGGGCATTGATGCCGTTTTGTGTATTGGTGTTTGGTTTGCAACT
AAAGCATGTGCTTACAACT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL6836Contig1 725 2 4 U
CTAGTAGAATTAGTGGAATAAAATTTAGTAAAATAGAGTTAAGTGAAATAGAAAAACAAA
AGTTTGTACTTTAGGACAACGGGGGATACAACATCTGCCGGAAATAGGATAGATTTGAAT
TGTAAATGATACGAGAATTCAAATCAAGCAAGATTTAAAACCCTTCTCTAGCTCCTCACG
GTTCAAATTCTTGCCAATGAAGACCAGCTTGTTGACTCTAGCCTCGTCTTTGCCCCATAA
CCGGTCTGGGGATCCTTGAAAGATGTCATGGACTCCTTGAAACACGAATCTCTCCTCCAT
GGTGTGGACCGAGAGCAGACCTTTCATCCTGTAGATATCCTCACTTCGTTCCATCAGTAA
CGTCCCTAGCCACATGTTTGCCTTCTCAAGGTCTAAGCTCCCTTCGCAAACTATACTGAC
TGAAGAAACACCAGGATCATGGGTGTGATCATGATCATGAGAATGATTATGCTCATGTTC
ATTGTGGTGATGGTGATCATGGTGATGTTCGTCGTGACACTCATTATGGCCTTCCTTAAC
ATCTTCGGTGGTCACAGAGCTTTCGATTCTCTCCAGATCAAAACCTCCAATTCCAAGAAC
ATAATCCAAGTCAACGTTTCCGTAATTTGTCCTCGTCATCTGAGCCATGCTGTTTATTGT
CTTTATGCGTTGCACCACTGAACCTAACTCTGACTCACCAACAAGATCAGTCTTATTAAC
TATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2GY74JQ U 1
AF RR2EV79JQ U 13
BS 1 384 RR2GY74JQ
BS 385 385 RR2EV79JQ
BS 386 661 RR2GY74JQ
BS 662 725 RR2EV79JQ

RD RR2GY74JQ 661 0 0
CTAGTAGAATTAGTGGAATAAAATTTAGTAAAATAGAGTTAAGTGAAATAGAAAAACAAA
AGTTTGTACTTTAGGACAACGGGGGATACAACATCTGCCGGAAATAGGATAGATTTGAAT
TGTAAATGATACGAGAATTCAAATCAAGCAAGATTTAAAACCCTTCTCTAGCTCCTCACG
GTTCAAATTCTTGCCAATGAAGACCAGCTTGTTGACTCTAGCCTCGTCTTTGCCCCATAA
CCGGTCTGGGGATCCTTGAAAGATGTCATGGACTCCTTGAAACACGAATCTCTCCTCCAT
GGTGTGGACCGAGAGCAGACCTTTCATCCTGTAGATATCCTCACTTCGTTCCATCAGTAA
CGTCCCTAGCCACATGTTTGCCTTGTCAAGGTCTAAGCTCCCTTCGCAAACTATACTGAC
TGAAGAAACACCAGGATCATGGGTGTGATCATGATCATGAGAATGATTATGCTCATGTTC
ATTGTGGTGATGGTGATCATGGTGATGTTCGTCGTGACACTCATTATGGCCTTCCTTAAC
ATCTTCGGTGGTCACAGAGCTTTCGATTCTCTCCAGATCAAAACCTCCAATTCCAAGAAC
ATAATCCAAGTCAACGTTTCCGTAATTTGTCCTCGTCATCTGAGCCATGCTGTTTATTGT
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2EV79JQ 713 0 0
GTGGAATAAAATTTAGTAGAATATAGTTAAGTGAAATAGAAAAACAAAAGTTTGTACTTT
GGGACAACGGGGGATACAACATCTGCCGGAAATAGGATAGATTTGAATTGTAAATGATAC
GAGAATTCAAATCAAGCAAGATTTAAAACCCTTCTCTAGCTCCTCACGGTTCAGATTCTT
GCCAATGAAGACGAGCTTGTTGACTCTAGCCTCGTCTTTGCCCCATAACCGGTCTGGGGA
TCCTTGAAAGATGTCATGGACTCCTTGAAACACGAATCTCTCCTCCATGGTGTGGACCGA
GAGCAGACCTTTCATCCTGTAGATATCCTCACTTCGTTCCATCAGTAACGTCCCTGGCCA
CATGTTTGCCTTCTCAAGGTCTAAGCTCTCTTCGCAAACTATACTGACTGAAGAAACACC
AGGATCATGGGTGTGATCATGATCATGAGAATGATTATGCTCATGTTCATTGTGGTGATG
GTGATCATGGTGATGTTCGTCGTGACACTCATTATGGCCTTCCTTAACATCTTCGGTGGT
CACAGAGCTTTCGATTCTCTCCAGATCAAAACCTCCAATTCCAAGAACATAATCCAAGTC
AACGTTTCCGTAATTTGTCCTCGTCATCTGAGCCATGCTGTTTATTGTCTTTATGCGTTG
CACCACTGAACCTAACTCTGACTCACCAACAAGATCAGTCTTATTAACTATGA

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL6837Contig1 753 2 2 U
TGTACAGAGGAGCTCTTTATTCCAAAAGAGAGAGAAAGGACCCGACAACCCGGAAAAAAA
AATTATCGAAAAATGGGAAAGGACGGTCTGAGCGACGACCAGGTCTCGTCGATGAAGGAG
GCCTTCATGCTCTTCGACACCGACGGCGACGGCAAAATCGCTCCCTCCGAGCTCGGGATC
CTGATGCGATCCCTGGGCGGGAACCCGACCCAAGCCCAGCTGAAATCCATAACCGCCTCC
GAGAGCCTGACCGCCCCGTTCGATTTCAACCGATTCCTGGATCTCATGGCGAAGCACCTG
AAGACGGAGCCCTTCGATCGCCAGCTCCGCGACGCCTTCAAGGTGCTCGACAAGGAAGGG
ACCGGGTTCGTGGCCGTGGCGGATCTGAGGCATATTCTCACCAGCATCGGGGAGAAGCTG
GAGCCTAACGAGTTCGATGAGTGGATCAAGGAGGTGGATGTGGGATCCGATGGGAAGATC
CGGTATGAGGATTTCATTGCCAGGATGGTCGCCAAGTGAGATCTGCTTTTTGTTTCAAAG
TTTGAATTTTTTTAATTTCAAGTATGTTTTTAATTTTTTTTTTACATAAAGTGTCACTCT
TTATGCTCTTGTGGTGGTTTTGGGATCAATTAATCTGATTGATACCAATATGTTTTTACT
GTTTGTTCTTTTTGTTATTTTGTTTTACTAACTCTATTGTTGTGTGGTGGTGATTCCTAC
TTTTTTTTATTCCAAGGATGTTTAATCTAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI16TF U 1
AF RR2BI16JQ C 107
BS 1 732 RR2BI16TF
BS 733 753 RR2BI16JQ

RD RR2BI16TF 732 0 0
TGTACAGAGGAGCTCTTTATTCCAAAAGAGAGAGAAAGGACCCGACAACCCGGAAAAAAA
AATTATCGAAAAATGGGAAAGGACGGTCTGAGCGACGACCAGGTCTCGTCGATGAAGGAG
GCCTTCATGCTCTTCGACACCGACGGCGACGGCAAAATCGCTCCCTCCGAGCTCGGGATC
CTGATGCGATCCCTGGGCGGGAACCCGACCCAAGCCCAGCTGAAATCCATAACCGCCTCC
GAGAGCCTGACCGCCCCGTTCGATTTCAACCGATTCCTGGATCTCATGGCGAAGCACCTG
AAGACGGAGCCCTTCGATCGCCAGCTCCGCGACGCCTTCAAGGTGCTCGACAAGGAAGGG
ACCGGGTTCGTGGCCGTGGCGGATCTGAGGCATATTCTCACCAGCATCGGGGAGAAGCTG
GAGCCTAACGAGTTCGATGAGTGGATCAAGGAGGTGGATGTGGGATCCGATGGGAAGATC
CGGTATGAGGATTTCATTGCCAGGATGGTCGCCAAGTGAGATCTGCTTTTTGTTTCAAAG
TTTGAATTTTTTTAATTTCAAGTATGTTTTTAATTTTTTTTTTACATAAAGTGTCACTCT
TTATGCTCTTGTGGTGGTTTTGGGATCAATTAATCTGATTGATACCAATATGTTTTTACT
GTTTGTTCTTTTTGTTATTTTGTTTTACTAACTCTATTGTTGTGTGGTGGTGATTCCTAC
TTTTTTTTATTC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2BI16JQ 647 0 0
CGTCGATGAAGGAGGCCTTCATGCTCTTCGACACCGACGGCGACGGCAAAATCGCTCCCT
CCGAGCTCGGGATCCTGATGCGATCCCTGGGCGGGAACCCGACCCAAGCCCAGCTGAAAT
CCATAACCGCCTCCGAGAGCCTGACCGCCCCGTTCGATTTCAACCGATTCCTGGATCTCA
TGGCGAAGCACCTGAAGACGGAGCCCTTCGATCGCCAGCTCCGCGACGCCTTCAAGGTGC
TCGACAAGGAAGGGACCGGGTTCGTGGCCGTGGCGGATTTGAGGCATATTCTCACCAGCA
TCGGGGAGAAGCTGGAGCCTAACGAGTTCGATGAGTGGATCAAGGAGGTGGATGTGGGAT
CCGATGGGAAGATCCGGTATGAGGATTTCATTGCCAGGATGGTCGCCAAGTGAGATCTGC
TTTTTGTTTCAAAGTTTGAATTTTTTTAATTTCAAGTATGTTTTTAATTTTTTTTTTACA
TAAAGTGTCACTCTTTATGCTCTTGTGGTGGTTTTGG*ATCAATTAATCTGATTGATACC
AATATGTTTTTACTGTTTGTTCTTTTTGTTATTTTGTTTTACTAACTCTATTGTTGTGTG
GTGGTGATTCCTACTTTTTTTTATTCCAAGGATGTTTAATCTAAGTT

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL6838Contig1 1043 2 2 U
GGACAGACACACAACCCCTACACAAAACACAGTTCCACATGTCTCGTCCTCTTGTCTTCT
TCTTCTTCCTCTTTCTTGTCTTGGTCGTCCCTTGCCTCTCCCATGGAGGCGGAGGAGACC
ACGACGACGACGATGCTCCGCACGCCAAGAGTACCGATCTCAAATCAAAATCCTTAGTCA
CTGTCAAAATAGCGTGTCTTGTCATCATCTTCGTGCTCACGTTCGTCAGCGGCGTATCTC
CTTATTTCCTGAAATGGAGCCAAGGGTTTTTGGTTCTGGGAACACAGTTCGCAGGAGGAG
TGTTTCTCGCGACCGCCCTGATGCATTTCTTGCCAGATGCCGACGAGACGTTTCGGGATT
TGCTGACCAAGGAAGGAGAGTCGGAGCCGTCTCCGGCTTACCCATTCGCGTTCATGCTGG
CCTGTGCTGGTTATATGCTGACCATGCTCGCTGATTCCGTCATCGCTCATGTCTACTCCA
AGACCCCATCCAAAGACGTGGAGCTTCAAGGAGAAGAGAAACCGAACCAGGGTTCAGGGA
TAGGAGATAGCATTCTACTGATCGTGGCTCTCTGTTTCCACTCTGTATTCGAAGGGATAG
CCATAGGGATCTCAGAGACCAAAGCAGATGCGTGGAGAGCTCTATGGACAATAACACTCC
ACAAGATATTCGCAGCGATAAATGGGGATAGCTCTTCTCCGTATGATCCCTGACCGTCCT
CTCTTCTCCACCATCATCTATTCTTTCGCATTCGCCATCTCGAGCCCAATAGGTGTTGGG
ATCGGAATAGTGATAGACGCGACGACGCAAGGGACGGTGGCTGATTGGATATTCGCAGTG
TCTATGAGCTTGGCGTGCGGGGTGTTCGTTTACGTGTCAGTGAATCATTTGTTGGCTAAA
GGGTATATTCCGAACAAAAAGGTTAACGTGGATCAGCCTAGCTTTAAGTTTTTGGCTGTT
TTGTCTGGGGTTGTTGTCATCGCCATTGTTATGATCTGGGACACTTGAATTGTCTACTCA
AAAAGTACTACGGATTTAGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH40TF U 1
AF RR2DH40JQ C 426
BS 1 728 RR2DH40TF
BS 729 1043 RR2DH40JQ

RD RR2DH40TF 729 0 0
GGACAGACACACAACCCCTACACAAAACACAGTTCCACATGTCTCGTCCTCTTGTCTTCT
TCTTCTTCCTCTTTCTTGTCTTGGTCGTCCCTTGCCTCTCCCATGGAGGCGGAGGAGACC
ACGACGACGACGATGCTCCGCACGCCAAGAGTACCGATCTCAAATCAAAATCCTTAGTCA
CTGTCAAAATAGCGTGTCTTGTCATCATCTTCGTGCTCACGTTCGTCAGCGGCGTATCTC
CTTATTTCCTGAAATGGAGCCAAGGGTTTTTGGTTCTGGGAACACAGTTCGCAGGAGGAG
TGTTTCTCGCGACCGCCCTGATGCATTTCTTGCCAGATGCCGACGAGACGTTTCGGGATT
TGCTGACCAAGGAAGGAGAGTCGGAGCCGTCTCCGGCTTACCCATTCGCGTTCATGCTGG
CCTGTGCTGGTTATATGCTGACCATGCTCGCTGATTCCGTCATCGCTCATGTCTACTCCA
AGACCCCATCCAAAGACGTGGAGCTTCAAGGAGAAGAGAAACCGAACCAGGGTTCAGGGA
TAGGAGATAGCATTCTACTGATCGTGGCTCTCTGTTTCCACTCTGTATTCGAAGGGATAG
CCATAGGGATCTCAGAGACCAAAGCAGATGCGTGGAGAGCTCTATGGACAATAACACTCC
ACAAGATATTCGCAGCGATAAATGGGGATAGCTCTTCTCCGTATGATCCCTGACCGTCCT
CTCTTCTC
A

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2DH40JQ 618 0 0
GCTGGTTATATGCTGACCATGCTCGCTGATTCCGTCATCGCTCATGTCTACTCCAAGACC
CCATCCAAAGACGTGGAGCTTCAAGGAGAAGAGAAACCGAACCAGGGTTCAGGGATAGGA
GATAGCATTCTACTGATCGTGGCTCTCTGTTTCCACTCTGTATTCGAAGGGATAGCCATA
GGGATCTCAGAGACCAAAGCAGATGCGTGGAGAGCTCTATGGACAATAACACTCCACAAG
ATATTCGCAGCGATAAATGGGGATAGCTCTTCTCCGTATGATCCCTGACCGTCCTCTCTT
CTCCACCATCATCTATTCTTTCGCATTCGCCATCTCGAGCCCAATAGGTGTTGGGATCGG
AATAGTGATAGACGCGACGACGCAAGGGACGGTGGCTGATTGGATATTCGCAGTGTCTAT
GAGCTTGGCGTGCGGGGTGTTCGTTTACGTGTCAGTGAATCATTTGTTGGCTAAAGGGTA
TATTCCGAACAAAAAGGTTAACGTGGATCAGCCTAGCTTTAAGTTTTTGGCTGTTTTGTC
TGGGGTTGTTGTCATCGCCATTGTTATGATCTGGGACACTTGAATTGTCTACTCAAAAAG
TACTACGGATTTAGAATC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL6839Contig1 612 2 1 U
GGAGGTGTCCTAAGATGAGCTCAATGAGAACAGAAATCTCGTGTGGAACAAAAGGGTAAA
AGCTCGTTTGATTCTGATTTTCAGTACGAATACGAACCGTGTATACAGAAACTGATGCCA
TGTCAGCCTTATCTTCACTCGGTGACTCCTCCACCTCCTGCGTCGTGTTGCCTGCCGTTG
AATGAGATCGTGGCGAAAGACGCGACGTGTCTTTGCTCCGTATTCAACAATGTCGACATG
CTCAGATCGCTTAACCTCACTAAAGAAAACGCTCTCGTTCTCCCTAAAGCTTGTGGCGCC
AAGGCTGACATCTCGCTATGCAAAGCCAGCAATGGCACCACTACACCTTCGACCTCGCCG
GCAACTACCACAACTCCTCCGGCATCTTCCACTGGAACCGGAGCTTCTTCAACTGCCAAA
CCAACAAACTCGGCTCCGGCCATCAACTTCGCCGGAGCTAGCTTCGCATCAGCTTTTGTG
GCCTTGGCTACAATCTTCTTCTGACCTACTACTATATTGCATTATGTCTTTTTATTCATT
GTTCTGTAGGTTTGCAATTGAAAATTGTTTGGTTATTTATTATTAATATGCACTTGAAAT
TTCTAATAAAAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AP47JQ C 1
AF RR2AP47TF U 1
BS 1 612 RR2AP47TF

RD RR2AP47JQ 612 0 0
GGAGGTGTCCTAAGATGAGCTCAATGAGAACAGAAATCTCGTGTGGAACAAAAGGGTAAA
AGCTCGTTTGATTCTGATTTTCAGTACGAATACGAACCGTGTATACAGAAACTGATGCCA
TGTCAGCCTTATCTTCACTCGGTGACTCCTCCACCTCCTGCGTCGTGTTGCCTGCCGTTG
AATGAGATCGTGGCGAAAGACGCGACGTGTCTTTGCTCCGTATTCAACAATGTCGACATG
CTCAGATCGCTTAACCTCACTAAAGAAAACGCTCTCGTTCTCCCTAAAGCTTGTGGCGCC
AAGGCTGACATCTCGCTATGCAAAGCCAGCAATGGCACCACTACACCTTCGACCTCGCCG
GCAACTACCACAACTCCTCCGGCATCTTCCACTGGAACCGGAGCTTCTTCAACTGCCAAA
CCAACAAACTCGGCTCCGGCCATCAACTTCGCCGGAGCTAGCTTCGCATCAGCTTTTGTG
GCCTTGGCTACAATCTTCTTCTGACCTACTACTATATTGCATTATGTCTTTTTATTCATT
GTTCTGTAGGTTTGCAATTGAAAATTGTTTGGTTATTTATTATTAATATGCACTTGAAAT
TTCTAATAAAAC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RR2AP47TF 612 0 0
GGAGGTGTCCTAAGATGAGCTCAATGAGAACAGAAATCTCGTGTGGAACAAAAGGGTAAA
AGCTCGTTTGATTCTGATTTTCAGTACGAATACGAACCGTGTATACAGAAACTGATGCCA
TGTCAGCCTTATCTTCACTCGGTGACTCCTCCACCTCCTGCGTCGTGTTGCCTGCCGTTG
AATGAGATCGTGGCGAAAGACGCGACGTGTCTTTGCTCCGTATTCAACAATGTCGACATG
CTCAGATCGCTTAACCTCACTAAAGAAAACGCTCTCGTTCTCCCTAAAGCTTGTGGCGCC
AAGGCTGACATCTCGCTATGCAAAGCCAGCAATGGCACCACTACACCTTCGACCTCGCCG
GCAACTACCACAACTCCTCCGGCATCTTCCACTGGAACCGGAGCTTCTTCAACTGCCAAA
CCAACAAACTCGGCTCCGGCCATCAACTTCGCCGGAGCTAGCTTCGCATCAGCTTTTGTG
GCCTTGGCTACAATCTTCTTCTGACCTACTACTATATTGCATTATGTCTTTTTATTCATT
GTTCTGTAGGTTTGCAATTGAAAATTGTTTGGTTATTTATTATTAATATGCACTTGAAAT
TTCTAATAAAAC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL6840Contig1 621 2 2 U
GCCACTTAAACAAGCTTCAAATCCAAAATCCAAGCGAGAGACAATTCAATAACATAACAG
AACAAAAGCCAAAGAATTTGAATATGGTTGGTTAATAAAAAGACTACAGACAAAGGCTTT
CACTAACGGCTTCTAGGATGTCTTGTTTTCACCAAACTGGCCACTAACAACAGTCAACAA
CAATCTTCAGTCTTTTGTTGAGGGAGACTCAAGATCAGGCAATGTCACACTCTCTTTCTG
ACCACCCGAAGAAGAAGACATCGGCCTTCTCGGCTCCGCCACCACACCGCTTTGTTGTTC
CTGCTGTTGAATCCGCTGCTGCTGAAGCTGAAGCTGATACAGTTGCTGCTGCTGCTGCTG
ATACTGAAACTGCTGCTGTTGTTGTTTCTGTGAATGGATCTGGAGCTGCTGGAACTGTTG
TGCAGCTTGCATAGTGTGGATCGACTGATTATTGGGATAGAATTGCTGATTCGATCCAAA
AGAACCATAGTTCATTACTGATGATGCACCACCATTCGAACCACCTTGCCCCGTTAATAC
CTTAAGATGTTGGACTTCCTCCTTCAGTGCGTCATTTAATGCATCCTGAAGGTGAACTTG
TTGCTCCACTGTTTGTACTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C313TF C 1
AF RR2C313JQ U 5
BS 1 4 RR2C313TF
BS 5 621 RR2C313JQ

RD RR2C313TF 621 0 0
GCCACTTAAACAAGCTTCAAATCCAAAATCCAAGCGAGAGACAATTCAATAACATAACAG
AACAAAAGCCAAAGAATTTGAATATGGTTGGTTAATAAAAAGACTACAGACAAAGGCTTT
CACTAACGGCTTCTAGGATGTCTTGTTTTCACCAAACTGGCCACTAACAACAGTCAACAA
CAATCTTCAGTCTTTTGTTGAGGGAGACTCAAGATCAGGCAATGTCACACTCTCTTTCTG
ACCACCCGAAGAAGAAGACATCGGCCTTCTCGGCTCCGCCACCACACCGCTTTGTTGTTC
CTGCTGTTGAATCCGCTGCTGCTGAAGCTGAAGCTGATACAGTTGCTGCTGCTGCTGCTG
ATACTGAAACTGCTGCTGTTGTTGTTTCTGTGAATGGATCTGGAGCTGCTGGAACTGTTG
TGCAGCTTGCATAGTGTGGATCGACTGATTATTGGGATAGAATTGCTGATTCGATCCAAA
AGAACCATAGTTCATTACTGATGATGCACCACCATTCGAACCACCTTGCCCCGTTAATAC
CTTAAGATGTTGGACTTCCTCCTTCAGTGCGTCATTTAATGCATCCTGAAGGTGAACTTG
TTGCTCCACTGTTTGTACTCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2C313JQ 617 0 0
CTTAAACAAGCTTCAAATCCAAAATCCAAGCGAGAGACAATTCAATAACATAACAGAACA
AAAGCCAAAGAATTTGAATATGGTTGGTTAATAAAAAGACTACAGACAAAGGCTTTCACT
AACGGCTTCTAGGATGTCTTGTTTTCACCAAACTGGCCACTAACAACAGTCAACAACAAT
CTTCAGTCTTTTGTTGAGGGAGACTCAAGATCAGGCAATGTCACACTCTCTTTCTGACCA
CCCGAAGAAGAAGACATCGGCCTTCTCGGCTCCGCCACCACACCGCTTTGTTGTTCCTGC
TGTTGAATCCGCTGCTGCTGAAGCTGAAGCTGATACAGTTGCTGCTGCTGCTGCTGATAC
TGAAACTGCTGCTGTTGTTGTTTCTGTGAATGGATCTGGAGCTGCTGGAACTGTTGTGCA
GCTTGCATAGTGTGGATCGACTGATTATTGGGATAGAATTGCTGATTCGATCCAAAAGAA
CCATAGTTCATTACTGATGATGCACCACCATTCGAACCACCTTGCCCCGTTAATACCTTA
AGATGTTGGACTTCCTCCTTCAGTGCGTCATTTAATGCATCCTGAAGGTGAACTTGTTGC
TCCACTGTTTGTACTCC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL6841Contig1 846 2 2 U
CGGGGATCTGAAGTCATCAAATCTATTGGTTGATCGAAACTGGACAGTGAAGGTTGCTGA
CTTTGGTCTCTCGCGTATCAAGCATGAGACATACCTCACTACGAAGACCGGAAGGGGAAC
GCCTCAATGGATGGCACCAGAGGTTCTTCGAAATGAAGCTGCTGATGAAAAGTCTGACGT
TTACAGCTTTGGAGTAGTACTATGGGAGCTTGTGACTGAGAAGATTCCGTGGGAAAATTT
AAATGCTATGCAGAATACTTGCAGGTGATTGGAGCTGTGGGGTTTATGAACCAGAGACTC
GAAGTCCCAAAGGATGTTGATCCTCTGTGGATTCCTCTAATGGAAAGCTGCTGGCATAGT
GAACCACAGTGCAGACCGACATTCCAACAAGTTATGGAGAAACTGAGAGAGCTTCAAAGG
AAATACACTATACAGTTTCAGGCAGCTCGTGCTACATCGATAGACAACTCTTCCCTCAAG
GAAAAATAAAACCCTTAAACCCCAGAGCAGGATCTGATTCGCATTGAAGAAGAAGCTTAG
CTACAGAAGAAAGATCAACGACGAGAAAGCAGCAAGCAAGAAGAAGCTTTGGTAAAAGCT
GTTAAGCTCCATCGATAATCTCTCTCTCTCATTACGAGAGGTAGATTCGTTTCAAATATG
ACATGTGCTTGCTTGCGAGTTGAGCTAGAGAGGATATATATAATTATATGCATGAGGTAG
ACCAAGTTCTTTTTCCTTGAAAGAATAGATTGTACAGATAAAAAAACGAGAATGAACCAA
AAGATTTGGAGTAAATTTTGTTACATTTTATTGGATGATGCGCCTTTGTTATTGTTGTGT
GTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2A283TF U 1
AF RR2A283JQ C 147
BS 1 829 RR2A283TF
BS 830 846 RR2A283JQ

RD RR2A283TF 844 0 0
CGGGGATCTGAAGTCATCAAATCTATTGGTTGATCGAAACTGGACAGTGAAGGTTGCTGA
CTTTGGTCTCTCGCGTATCAAGCATGAGACATACCTCACTACGAAGACCGGAAGGGGAAC
GCCTCAATGGATGGCACCAGAGGTTCTTCGAAATGAAGCTGCTGATGAAAAGTCTGACGT
TTACAGCTTTGGAGTAGTACTATGGGAGCTTGTGACTGAGAAGATTCCGTGGGAAAATTT
AAATGCTATGCAGAATACTTGCAGGTGATTGGAGCTGTGGGGTTTATGAACCAGAGACTC
GAAGTCCCAAAGGATGTTGATCCTCTGTGGATTCCTCTAATGGAAAGCTGCTGGCATAGT
GAACCACAGTGCAGACCGACATTCCAACAAGTTATGGAGAAACTGAGAGAGCTTCAAAGG
AAATACACTATACAGTTTCAGGCAGCTCGTGCTACATCGATAGACAACTCTTCCCTCAAG
GAAAAATAAAACCCTTAAACCCCAGAGCAGGATCTGATTCGCATTGAAGAAGAAGCTTAG
CTACAGAAGAAAGATCAACGACGAGAAAGCAGCAAGCAAGAAGAAGCTTTGGTAAAAGCT
GTTAAGCTCCATCGATAATCTCTCTCTCTCATTACGAGAGGTAGATTCGTTTCAAATATG
ACATGTGCTTGCTTGCGAGTTGAGCTAGAGAGGATATATATAATTATATGCATGAGGTAG
ACCAAGTTCTTTTTCCTTGAAAGAATAGATTGTACAGATAAAAAAACGAGAATGAACCAA
AAGATTTGGAGTAAATTTTGTTACATTTTATTGGATGATGCGCCTTTGT
ATGTGTGTGTTTGTG

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2A283JQ 700 0 0
TTCGAAATGAAGCTGCTGATGAAAAGTCTGACGTTTACAGCTTTGGAGTAGTACTATGGG
AGCTTGTGACTGAGAAGATTCCGTGGGAAAATTTAAATGCTATGCAGAATACTTGCAGGT
GATTGGAGCTGTGGGGTTTATGAACCAGAGACTCGAAGTCCCAAAGGATGTTGATCCTCT
GTGGATTCCTTTAATGGAAAGCTGCTGGCATAGTGAACCACAGTGCAGACCGACATTCCA
ACAAGTTATGGAGAAACTGAGAGAGCTTCAAAGGAAATACACTATACAGTTTCAGGCAGC
TCGTGCTACATCGATAGACAACTCTTCCCTCAAGGAAAAATAAAACCCTTAAACCCCAGA
GCAGGATTTGATTCGCATTGAAGAAGAAGCTTAGCTACAGAAGAAAGATCAACGACGAGA
AAGCAGCAAGCAAGAAGAAGCTTTGGTAAAAGCTGTTAAGCTCCATCGATAATCTCTCTC
TCTCATTACGAGAGGTAGATTCGTTTCAAATATGACATGTGCTTGCTTGCGAGTTGAGCT
AGAGAGGATATATATAATTATATGCATGAGGTAGACCAAGTTCTTTTTCCTTGAAAGAAT
AGATTGTACAGATAAAAAAACGAGAATGAACCAAAAGATTTGGAGTAAATTTTGTTACAT
TTTATTGGATGATGCGCCTTTGTTATTGTTGTGTGTTTGG

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL6842Contig1 802 2 2 U
GACAACACAACACATACATCAACATATTAACCATGAAGCTTCTTGGGCTCGCTTTAGTTT
TACTATTAGCTGCTGCCAGTTGCAAAGCTGGTGAAGAAATTACTTGCGAAGAGAACGAAC
CATTCACATGTAGTAACACTGCTAAATTAAACAGTAAAAGCTTTGGAAAAGACTTCATCT
TCGGTGTTGCATCTTCTGCTTACCAGATCGAAGGAGGGAGAGGTCGCGGTGTTAACATTT
GGGATGGCTTCAGTCACCGATACCCAGAGAAATCTGGGTCAGATTTGAAGAATGGAGACA
CTACTTGTGAGTCATATACAAGATGGCAGAAAGATGTAGACGTGATGGGCGAACTCAATG
CTACTGGCTACAGATTCTCCTTTGCGTGGTCAAGAATCATTCCAAAAGGAAAGGTGAGTA
GGGGAGTGAACCAAGGAGGTCTTGAATACTATCACAAACTCATAGATGCACTCCTCGAAA
AGAATATAACACCTTTTGTTACTCTCTTTCACTGGGACCTTCCTCAAACACTCCAAGATG
AGTATGAAGGTTTCTTGGACCGCCAGATCATCCAAGATTTCAAAGATTACGCGAATCCTG
CAAAACAAGATTTCCTCCGCTCAAGCCTCTTTTCCCAGAGTCAGAAGAGGCTTGCCGATG
CATGAAACACTTTTAATCCTCAAGATCGTCTCCATGTCTCTCTCACTCTTTCTACTTGCT
CCATAGATAAGGAGCTTCTTCTACCTATAATAATGTAATAAATAAAAAGTCTAAATAAAA
AGATGATCAACTCATGAAGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH83TF U 1
AF RR2BH83JQ C 59
BS 1 672 RR2BH83TF
BS 673 802 RR2BH83JQ

RD RR2BH83TF 672 0 0
GACAACACAACACATACATCAACATATTAACCATGAAGCTTCTTGGGCTCGCTTTAGTTT
TACTATTAGCTGCTGCCAGTTGCAAAGCTGGTGAAGAAATTACTTGCGAAGAGAACGAAC
CATTCACATGTAGTAACACTGCTAAATTAAACAGTAAAAGCTTTGGAAAAGACTTCATCT
TCGGTGTTGCATCTTCTGCTTACCAGATCGAAGGAGGGAGAGGTCGCGGTGTTAACATTT
GGGATGGCTTCAGTCACCGATACCCAGAGAAATCTGGGTCAGATTTGAAGAATGGAGACA
CTACTTGTGAGTCATATACAAGATGGCAGAAAGATGTAGACGTGATGGGCGAACTCAATG
CTACTGGCTACAGATTCTCCTTTGCGTGGTCAAGAATCATTCCAAAAGGAAAGGTGAGTA
GGGGAGTGAACCAAGGAGGTCTTGAATACTATCACAAACTCATAGATGCACTCCTCGAAA
AGAATATAACACCTTTTGTTACTCTCTTTCACTGGGACCTTCCTCAAACACTCCAAGATG
AGTATGAAGGTTTCTTGGACCGCCAGATCATCCAAGATTTCAAAGATTACGCGAATCCTG
CAAAACAAGATTTCCTCCGCTCAAGCCTCTTTTCCCAGAGTCAGAAGAGGCTTGCCGATG
CATGAAACACTT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2BH83JQ 744 0 0
TTTACTATTAGCTGCTGCCAGTTGCAAAGCTGGTGAAGAAATTACTTGCGAAGAGAACGA
ACCATTCACATGTAGTAACACTGCTAAATTAAACAGTAAAAGCTTTGGAAAAGACTTCAT
CTTCGGTGTTGCATCTTCTGCTTACCAGATCGAAGGAGGGAGAGGTCGCGGTGTTAACAT
TTGGGATGGCTTCAGTCACCGATACCCAGAGAAATCTGGGTCAGATTTGAAGAATGGAGA
CACTACTTGTGAGTCATATACAAGATGGCAGAAAGATGTAGACGTGATGGGCGAACTCAA
TGCTACTGGCTACAGATTCTCCTTTGCGTGGTCAAGAATCATTCCAAAAGGAAAGGTGAG
TAGGGGAGTGAACCAAGGAGGTCTTGAATACTATCACAAACTCATAGATGCACTCCTCGA
AAAGAATATAACACCTTTTGTTACTCTCTTTCACTGGGACCTTCCTCAAACACTCCAAGA
TGAGTATGAAGGTTTCTTGGACCGCCAGATCATCCAAGATTTCAAAGATTACGCGAATCC
TGCAAAACAAGATTTCCTCCGCTCAAGCCTCTTTTCCCAGAGTCAGAAGAGGCTTGCCGA
TGCATGAAACACTTTTAATCCTCAAGATCGTCTCCATGTCTCTCTCACTCTTTCTACTTG
CTCCATAGATAAGGAGCTTCTTCTACCTATAATAATGTAATAAATAAAAAGTCTAAATAA
AAAGATGATCAACTCATGAAGAAT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL6843Contig1 762 2 2 U
GGGTTGGTGTTGGATTTTGAGGCGCAGTAGTATCGATTTTGGCATCCAGAGAAAAACGAA
GAGGTGCTTCAGATCGGGCTTGCGAGCCGTATCGGGTTAAGTATGAGTCGTAGTAAATCA
GGGGATGAATCGCCGGAGGATAGCTCATCGTCGTCGATCGGAGAGATCAGCGAAAACGAG
GAGGAGGAAGACGACGCCGTTTCGTCCCAAGGAGAAGGAGGAGCCCTTGATTCGTTTAGT
TCCTCTTTGGAAGACTCTCTACCGATTAAGAGAGGGTTATCGAACCATTACGTGGGTAAA
TCAAAATCTTTTGGGAATTTAATGGAAGCGAGCAACATCAAGGCGAAGGATCTGGAAAAA
GTAGAAAACCCGTTTAATAAGAAGCGGAGGTTGATTATTGCTAACAAGCTGAGGAGCAGA
GGAAGATCTATGTCAGTTTCCAGTTTCTACACTTGGCAAAACCCTAATTCTATGCCTTTA
CTTGCACTCCAAGAACCCAATAAAGTGGATGGTACTCAAACTGTTAGTTTGTTTGAGAGG
AGGAAGATGATGATGAAGAGTAAGAAAGATTTGATGGCTCAGACTCAAAGTTGTTTCTGT
CTTAGTAGTTTGCAGTAGGAAGATGAGATGGTGGTAGTGGTAGTGGTGATGATAATGAGT
GAGATATATTTCTCGTTTTTAATTACAGAAAAATTTGGTGGTGGAAGATTTGATTTGTGA
AGAATATTATTATTTATTGGTAACACATTAAGACCTTTTTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY47TF U 1
AF RR2CY47JQ C 1
BS 1 614 RR2CY47TF
BS 615 762 RR2CY47JQ

RD RR2CY47TF 614 0 0
GGGTTGGTGTTGGATTTTGAGGCGCAGTAGTATCGATTTTGGCATCCAGAGAAAAACGAA
GAGGTGCTTCAGATCGGGCTTGCGAGCCGTATCGGGTTAAGTATGAGTCGTAGTAAATCA
GGGGATGAATCGCCGGAGGATAGCTCATCGTCGTCGATCGGAGAGATCAGCGAAAACGAG
GAGGAGGAAGACGACGCCGTTTCGTCCCAAGGAGAAGGAGGAGCCCTTGATTCGTTTAGT
TCCTCTTTGGAAGACTCTCTACCGATTAAGAGAGGGTTATCGAACCATTACGTGGGTAAA
TCAAAATCTTTTGGGAATTTAATGGAAGCGAGCAACATCAAGGCGAAGGATCTGGAAAAA
GTAGAAAACCCGTTTAATAAGAAGCGGAGGTTGATTATTGCTAACAAGCTGAGGAGCAGA
GGAAGATCTATGTCAGTTTCCAGTTTCTACACTTGGCAAAACCCTAATTCTATGCCTTTA
CTTGCACTCCAAGAACCCAATAAAGTGGATGGTACTCAAACTGTTAGTTTGTTTGAGAGG
AGGAAGATGATGATGAAGAGTAAGAAAGATTTGATGGCTCAGACTCAAAGTTGTTTCTGT
CTTAGTAGTTTGCA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2CY47JQ 762 0 0
GGGTTGGTGTTGGATTTTGAGGCGCAGTAGTATCGATTTTGGCATCCAGAGAAAAACGAA
GAGGTGCTTCAGATCGGGCTTGCGAGCCGTATCGGGTTAAGTATGAGTCGTAGTAAATCA
GGGGATGAATCGCCGGAGGATAGCTCATCGTCGTCGATCGGAGAGATCAGCGAAAACGAG
GAGGAGGAAGACGACGCCGTTTCGTCCCAAGGAGAAGGAGGAGCCCTTGATTCGTTTAGT
TCCTCTTTGGAAGACTCTCTACCGATTAAGAGAGGGTTATCGAACCATTACGTGGGTAAA
TCAAAATCTTTTGGGAATTTAATGGAAGCGAGCAACATCAAGGCGAAGGATCTGGAAAAA
GTAGAAAACCCGTTTAATAAGAAGCGGAGGTTGATTATTGCTAACAAGCTGAGGAGCAGA
GGAAGATCTATGTCAGTTTCCAGTTTCTACACTTGGCAAAACCCTAATTCTATGCCTTTA
CTTGCACTCCAAGAACCCAATAAAGTGGATGGTACTCAAACTGTTAGTTTGTTTGAGAGG
AGGAAGATGATGATGAAGAGTAAGAAAGATTTGATGGCTCAGACTCAAAGTTGTTTCTGT
CTTAGTAGTTTGCAGTAGGAAGATGAGATGGTGGTAGTGGTAGTGGTGATGATAATGAGT
GAGATATATTTCTCGTTTTTAATTACAGAAAAATTTGGTGGTGGAAGATTTGATTTGTGA
AGAATATTATTATTTATTGGTAACACATTAAGACCTTTTTCG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL6844Contig1 787 2 5 U
GGAGCAACGCGTTTGTGTGGAGAAAAAAAAAAGAGGGAGAAGCGGCTGTAGATGTGATTT
TGATCAGATTATCTTTCGTTCGAGTCTCTCTGATCCCTTATCACCTTCTTCCTCTCTAGA
TTGGTCATTCGAAAACATGGCGCCGAAATTCGATACGGAGAAGATGCAGGAACGCCAGAA
CTTCCGCAACGTCTGGCACACGGATCTCACCCACAGCATCCAGGGCGATACTCCTTATTG
CTGCTTTGCGTTGTGGTGTGCCCCTTGTGCATCATACTTGCTTCGAAAGCGTGCGCTTTA
CAATGACATGTCAAGGTACACTTGCTGCGCCGGTTACATGCCTTATAGTGGCAGGTGTGG
AGAAACCAAATGTCCTCAACTCTGTCTTGCCACTGAGGTCTTTTGCTGCTTTGGAACCTC
TGTCGCATCCACTCGTTTTCTTCCTCAAGATGAGTTCCAAATTCAGACGACGCAATGTGA
CAACTGCATCATCGGATTTATGGTTTGCCTCAGCCAAGTGGCTTGCATATTCTCCATTGT
TGCATGTATCGTCGGCATTGATGAGCTTTCTGAAGCTTCTCAGCTGCTCTCTTGCTTAGC
TGACATGGTTTACTGCACGGTTTGCGCTTGTATGCAGACACAACACAAGGTGGAAATGGA
CAAGAGAGATGGTAAGTTCGGTCCACAGCCAATGGCAGTGCCTCCCCCTCAGTAATGTCA
CGGATTGATCAAGCGACTCCACCCGCCATCGGTTACCCTCCACAAGCTACCCACCTTCCG
GTATCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A671TF U 54
AF RR2BF90TF U 1
BS 1 102 RR2BF90TF
BS 103 103 RR2A671TF
BS 104 682 RR2BF90TF
BS 683 683 RR2A671TF
BS 684 787 RR2BF90TF

RD RR2A671TF 655 0 0
GG
GATTTTGATCAGATTATCTTTCGTTCGAGTCTCTCTGATCCCTTATCACCTTCTTCCTCT
CTAGATTGGTCATTCGAAAACATGGCGCCGAAATTCGATACGGAGAAGATGCAGGAACGC
CAGAACTTCCGCAACGTCTGGCACACGGATCTCACCCACAGCATCCAGGGCGATACTCCT
TATTGCTGCTTTGCGTTGTGGTGTGCCCCTTGTGCATCATACTTGCTTCGAAAGCGTGCG
CTTTACAATGACATGTCAAGGTACACTTGCTGCGCCGGTTATATGCCTTGTAGTGGCAGG
TGTGGAGAAACCAAATGTCCTCAACTCTGTCTTGCCACTGAGGTCTTTTGCTGCTTTGGA
ACCTCTGTCGCATCCACTCGTTTTCTTCTTCAAGATGAGTTCCAAATTCAGACGACGCAA
TGTGACAACTGCATCATCGGATTTATGGTTTGCCTCAGCCAAGTGGCTTGCATATTCTCC
ATTGTTGCATGTATCGTCGGCATTGATGAGCTTTCTGAAGCTTCTCAGCTGCTCTCTTGC
TTAGCTGACATGGTTTACTGCACGGTTTGCGCTTGTATGCAGACACAACACAAGGTGGAA
ATGGACAAGAGAGATGGTAAGTTCGGTCCACAGCCAATGGCAGTGCCTCCCCC

QA 3 655 3 655
DS 

RD RR2BF90TF 787 0 0
GGAGCAACGCGTTTGTGTGGAGAAAAAAAAAAGAGGGAGAAGCGGCTGTAGATGTGATTT
TGATCAGATTATCTTTCGTTCGAGTCTCTCTGATCCCTTATCGCCTTCTTCCTCTCTAGA
TTGGTCATTCGAAAACATGGCGCCGAAATTCGATACGGAGAAGATGCAGGAACGCCAGAA
CTTCCGCAACGTCTGGCACACGGATCTCACCCACAGCATCCAGGGCGATACTCCTTATTG
CTGCTTTGCGTTGTGGTGTGCCCCTTGTGCATCATACTTGCTTCGAAAGCGTGCGCTTTA
CAATGACATGTCAAGGTACACTTGCTGCGCCGGTTACATGCCTTATAGTGGCAGGTGTGG
AGAAACCAAATGTCCTCAACTCTGTCTTGCCACTGAGGTCTTTTGCTGCTTTGGAACCTC
TGTCGCATCCACTCGTTTTCTTCCTCAAGATGAGTTCCAAATTCAGACGACGCAATGTGA
CAACTGCATCATCGGATTTATGGTTTGCCTCAGCCAAGTGGCTTGCATATTCTCCATTGT
TGCATGTATCGTCGGCATTGATGAGCTTTCTGAAGCTTCTCAGCTGCTCTCTTGCTTAGC
TGACATGGTTTACTGCACGGTTTGCGCTTGTATGCAGACACAACACAAGGTGGAAATGGA
CAAGAGAGATGGTAAGTTCGGTTCACAGCCAATGGCAGTGCCTCCCCCTCAGTAATGTCA
CGGATTGATCAAGCGACTCCACCCGCCATCGGTTACCCTCCACAAGCTACCCACCTTCCG
GTATCCG

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL6845Contig1 1300 2 4 U
GGGCCGTTCTCTGAGATTCTTCTCTCTAATAAGGGGAGATGTTGAAACTAGGGTTTAGGT
TATCGATTGGCATTCAACACCGCGTCCTCGTGATCCCATGGATGAATAGACACTCTGTGA
CGCCAAGAATCTTGTGTTCATCGGAGAAGCGGGATTACAATTCCTCTGGACTGAGTAGGT
ATGTTCCGAATAAGTCTCGGGAGATTAGTGAACAAGTGACATCTGAGAAGAGTGTAAATG
CTAGTGTATCGGAGTCTATTAAAGCCAAGGGTAACACGAAACAGGCTAAGGAGGAGGACA
TGTATATGGATCTGCCAGACAGAAACGATGCTGGAGGAAGTTACATAAATGTGTCTTTTG
ATGGCTCTAATGAAGGTACTACTATGAGTTTGGAGAAGGGTATGTCTGCTGGTAGATGGG
ATCATTGTGTACCGGAGGGGCCTGAAGGTGACTTTAGAGAGTCTGATGCTGGCACGTATT
CTCACCTGAATGTTAAAAACGGTGCTGGAACGTTCAGGAATGTGTCTTCTGATGATGACT
CTGGAGAAGAGTTGGAAGAAAGCAGTGACGATCTTAGATCAATGAGACAACACAAACAAG
CTTATGATGAAATCAAGCGATATATGGATGCTGAGACGGCCAAGAGTAGCAAAGAAGCCC
AAGAGGCAGAGAACATGGCTATTCGTTATCTTGGTTTAAGAGCATATACAGCAGTTGAGC
TGAAGAAGAAGCTCGTTGCAAAGAAATATCCTCTTGAAATCGTTGACAGTGTGATCAATG
ACTTTCAGCACCGAGGTTTCATCAATGATAACTTCTACGCGGAAGCATTCACACGGTCTA
GATGGTCTTCCTTAAGTTGGGGACCTAGACGGATCAAGCAAGCATTGTTTAAGAAAGGCG
TAAGCAACGAAGACTCAGATGCGGCCATAAAGCTTGTTTTTGAGAAAGACAACCAATGCA
AAGAAACAGAACTTAGTCACGGGATGTCCAAGGAAGCTATGGATCAGCTTTATGTTCAGG
CGTCAAAGCGGTGGCTCCAAGGCAGAGACTTGCCTATAGAAAACCGTAAAGCTAGAGTTA
TACGGTGGCTTCAGTACAGGGGATTCAACTGGGGTGTTGTCTCTCAGCTTATCAAGAGGC
TAGAATCTCCACTCTCCTGAGTCTAAGATCAAGTTTTTACACTTTTACGGTTTTGGTCCC
TAGATTTTCTATTTGTTTTGAATTTCTTCCTATTCTTTATGTTTGACTGGAGTTTGGCCC
ACAATTCCTGTGAAAAAAATAAAAGCACTAGCCGTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GF10TF U 1
AF RR2GF10JQ C 633
BS 1 698 RR2GF10TF
BS 699 699 RR2GF10JQ
BS 700 722 RR2GF10TF
BS 723 1300 RR2GF10JQ

RD RR2GF10TF 722 0 0
GGGCCGTTCTCTGAGATTCTTCTCTCTAATAAGGGGAGATGTTGAAACTAGGGTTTAGGT
TATCGATTGGCATTCAACACCGCGTCCTCGTGATCCCATGGATGAATAGACACTCTGTGA
CGCCAAGAATCTTGTGTTCATCGGAGAAGCGGGATTACAATTCCTCTGGACTGAGTAGGT
ATGTTCCGAATAAGTCTCGGGAGATTAGTGAACAAGTGACATCTGAGAAGAGTGTAAATG
CTAGTGTATCGGAGTCTATTAAAGCCAAGGGTAACACGAAACAGGCTAAGGAGGAGGACA
TGTATATGGATCTGCCAGACAGAAACGATGCTGGAGGAAGTTACATAAATGTGTCTTTTG
ATGGCTCTAATGAAGGTACTACTATGAGTTTGGAGAAGGGTATGTCTGCTGGTAGATGGG
ATCATTGTGTACCGGAGGGGCCTGAAGGTGACTTTAGAGAGTCTGATGCTGGCACGTATT
CTCACCTGAATGTTAAAAACGGTGCTGGAACGTTCAGGAATGTGTCTTCTGATGATGACT
CTGGAGAAGAGTTGGAAGAAAGCAGTGACGATCTTAGATCAATGAGACAACACAAACAAG
CTTATGATGAAATCAAGCGATATATGGATGCTGAGACGGCCAAGAGTAGCAAAGAAGCCC
AAGAGGCAGAGAACATGGCTATTCGTTATCTTGGTTTA*GAGCATATACAGCAGTTGAGC
TG

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2GF10JQ 668 0 0
GAGACGGCCAAGAGTAGCAAAGAAGCCCAAGAGGCAGAGAACATGGCTATTCGTTATCTT
GGTTTAAGAGCATATACAGCAGTTGAGCTGAAGAAGAAGCTCGTTGCAAAGAAATATCCT
CTTGAAATCGTTGACAGTGTGATCAATGACTTTCAGCACCGAGGTTTCATCAATGATAAC
TTCTACGCGGAAGCATTCACACGGTCTAGATGGTCTTCCTTAAGTTGGGGACCTAGACGG
ATCAAGCAAGCATTGTTTAAGAAAGGCGTAAGCAACGAAGACTCAGATGCGGCCATAAAG
CTTGTTTTTGAGAAAGACAACCAATGCAAAGAAACAGAACTTAGTCACGGGATGTCCAAG
GAAGCTATGGATCAGCTTTATGTTCAGGCGTCAAAGCGGTGGCTCCAAGGCAGAGACTTG
CCTATAGAAAACCGTAAAGCTAGAGTTATACGGTGGCTTCAGTACAGGGGATTCAACTGG
GGTGTTGTCTCTCAGCTTATCAAGAGGCTAGAATCTCCACTCTCCTGAGTCTAAGATCAA
GTTTTTACACTTTTACGGTTTTGGTCCCTAGATTTTCTATTTGTTTTGAATTTCTTCCTA
TTCTTTATGTTTGACTGGAGTTTGGCCCACAATTCCTGTGAAAAAAATAAAAGCACTAGC
CGTTTATC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL6846Contig1 888 2 4 U
GGCTCGCCGCGTTTGTTTCTAGCGTCGTCGTTTCAGCTTCTCTCTCTCAGGTTGGAGATA
GAAAGAGTGCAAAAAAAAATCATGTCGGCCCTTGTGGCGTTATGCAGAGCTCGAGCTTCT
TCTTCTTCTTCTGTGTTTAATAGCCTTGTTCGTCCAGCATTTCGCAGCTTCTCCACAGGT
TTTGGCGATGTGCAGAACAAAACACTGGTGGCGGAAATGGAAGAAAAGATGCTCCACATG
GACATCAACTCAATGATAGGAAGTTCCATGCCCCTAGGAATGATGCGCATAGGAACAATC
ATCCACAACATCGAGATGAACCCTGGTCAAGGCGCCAAGCTAGTACGAGCTGCGGGAACA
AACGCCAAGATCCTCAAGGAGCCTGCTTCTGGGAGGTGCTTGATCAAGCTTCCTTCAGGT
GACACCAGGTGGATCAACGCCAGGTGCCGTGCTACCATTGGTACAGTGTCGAACCCGTCT
CATGGAGTGAAGAAGCTGTATAAAGCAGGACAGAGTAGGTGGCTGGGGATAAGACCGAAA
GTGAGAGGTGTGGCGATGAATCCGTGTGATCATCCACATGGTGGTGGTGAAGGGAGGAGC
AAAAGTAGTGGAAGCAGAGGAAGGACATCGGTTAGCCCTTGGGGGAAGCCGTGCAAAGGT
GGTTACAAGTCTGCTAGTGTCAAGAAGAAGAAGAAGAGATTGGCTGCTAGAGAAGCCAAG
ATGTGATCTTGATAGAACAAGTTACAATAATGTCTTCAAATGCTTCTTTTTTTTTTTGAG
AGAGTTGGTTCTGAATGTTGTTACGTGTTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTGGAACCGAAATC
AAACGTTTTGATCGTCATAAACGTTTTTAATAAACGCGTTTTTCAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET26TF U 1
AF RR2ET26JQ C 153
BS 1 694 RR2ET26TF
BS 695 695 RR2ET26JQ
BS 696 770 RR2ET26TF
BS 771 888 RR2ET26JQ

RD RR2ET26TF 770 0 0
GGCTCGCCGCGTTTGTTTCTAGCGTCGTCGTTTCAGCTTCTCTCTCTCAGGTTGGAGATA
GAAAGAGTGCAAAAAAAAATCATGTCGGCCCTTGTGGCGTTATGCAGAGCTCGAGCTTCT
TCTTCTTCTTCTGTGTTTAATAGCCTTGTTCGTCCAGCATTTCGCAGCTTCTCCACAGGT
TTTGGCGATGTGCAGAACAAAACACTGGTGGCGGAAATGGAAGAAAAGATGCTCCACATG
GACATCAACTCAATGATAGGAAGTTCCATGCCCCTAGGAATGATGCGCATAGGAACAATC
ATCCACAACATCGAGATGAACCCTGGTCAAGGCGCCAAGCTAGTACGAGCTGCGGGAACA
AACGCCAAGATCCTCAAGGAGCCTGCTTCTGGGAGGTGCTTGATCAAGCTTCCTTCAGGT
GACACCAGGTGGATCAACGCCAGGTGCCGTGCTACCATTGGTACAGTGTCGAACCCGTCT
CATGGAGTGAAGAAGCTGTATAAAGCAGGACAGAGTAGGTGGCTGGGGATAAGACCGAAA
GTGAGAGGTGTGGCGATGAATCCGTGTGATCATCCACATGGTGGTGGTGAAGGGAGGAGC
AAAAGTAGTGGAAGCAGAGGAAGGACATCGGTTAGCCCTTGGGGGAAGCCGTGCAAAGGT
GGTTACAAGTCTGCTAGTGTCAAGAAGAAGAAGA*GAGATTGGCTGCTAGAGAAGCCAAG
ATGTGATCTTGATAGAACAAGTTACAATAATGTCTTCAAATGCTTCTTTT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2ET26JQ 736 0 0
TCCAGCATTTCGCAGCTTCTCCACAGGTTTTGGCGATGTGCAGAACAAAACACTGGTGGC
GGAAATGGAAGAAAAGATGCTCCACATGGACATCAACTCAATGATAGGAAGTTCCATGCC
CCTAGGAATGATGCGCATAGGAACAATCATCCACAACATCGAGATGAACCCTGGTCAAGG
CGCCAAGCTAGTACGAGCTGCGGGAACAAACGCCAAGATCCTCAAGGAGCCTGCTTCTGG
GAGGTGCTTGATCAAGCTTCCTTCAGGTGACACCAGGTGGATCAACGCCAGGTGCCGTGC
TACCATTGGTACAGTGTCGAACCCGTCTCATGGAGTGAAGAAGCTGTATAAAGCAGGACA
GAGTAGGTGGCTGGGGATAAGACCGAAAGTGAGAGGTGTGGCGATGAATCCGTGTGATCA
TCCACATGGTGGTGGTGAAGGGAGGAGCAAAAGTAGTGGAAGCAGAGGAAGGACATCGGT
TAGCCCTTGGGGGAAGCCGTGCAAAGGTGGTTACAAGTCTGCTAGTGTCAAGAAGAAGAA
GAAGAGATTGGCTGCTAGAGAAGCCAAGATGTGATCTTGATAGAACAAGTTACAATAATG
TCTTCAAATGCTTCTTTTTTTTTTTGAGAGAGTTGGTTCTGAATGTTGTTACGTGTTTTC
TTTTTCTTTTTTTCTTGGAACCGAAATCAAACGTTTTGATCGTCATAAACGTTTTTAATA
AACGCGTTTTTCAGTT

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL6847Contig1 743 2 8 U
GTTTTAAAAAAAACAATAACCACTAGCAGGATTATTCGTTTTGGTTGTCTTTTGGTTCCG
GTTAAAAAACACCCTGACCTCTGAATGATCCTCTAGTTTACCACAAAAACAAAAAAAACC
CAATAGAAACAGAAACCTTAAGTAAATCATAATCAATCTCAAGCTTGAGAGGCAAAATCG
CTAGTGTTGTTAGTTTCTTTTTGCTTTCTTTCGGCTTGAAGTGATCTGCAAAGCGATTCA
AGCTTATCTTTCTGATTCTTTGTCTTCTCCAACTGTTTCTTCAGTCTTTCACGCTCTTCA
ACGAGTTCTATGAGAGTAAGATCCGATCTCTCTGTTTTGCTCTTCAGGAATGCGTTTTCT
TTCCTCAGTTCTTTTATCGCTTTTGACATCTTATCGATTTCTTGTTTGAATGTTTCAAAC
ACTTCGTTGCTCTTCACCAACGCATCCTGAAACTGCTGGAACTTCTCTCCATCAGATGTT
AGCTGCACCCTCAAGTTTTTCTCGGTTGCTAAAAGCTGAGAAACTTGATCTGCGTAAACC
TTCATCTGAGACTGCTCATGGATGAGTTTCTCCTCGTGCTGTTTGATTTTTAATTCAGAT
ATCTGTAGCTCCAGTGTTTTCTGCTTCAACCTTTGCTCATGTTGTTGTTCTGAAAGCATA
TATTGATCGGCCAGGTGCTTCAACTTCGTCCTTAACATCTCATTTTCTTTTAGTTGTGTG
AGACTTTCATCTTTTTGCTCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG22JQ U 1
AF RR2CA51JQ U 323
BS 1 554 RR2BG22JQ
BS 555 555 RR2CA51JQ
BS 556 557 RR2BG22JQ
BS 558 558 RR2CA51JQ
BS 559 592 RR2BG22JQ
BS 593 593 RR2CA51JQ
BS 594 657 RR2BG22JQ
BS 658 743 RR2CA51JQ

RD RR2BG22JQ 657 0 0
GTTTTAAAAAAAACAATAACCACTAGCAGGATTATTCGTTTTGGTTGTCTTTTGGTTCCG
GTTAAAAAACACCCTGACCTCTGAATGATCCTCTAGTTTACCACAAAAACAAAAAAAACC
CAATAGAAACAGAAACCTTAAGTAAATCATAATCAATCTCAAGCTTGAGAGGCAAAATCG
CTAGTGTTGTTAGTTTCTTTTTGCTTTCTTTCGGCTTGAAGTGATCTGCAAAGCGATTCA
AGCTTATCTTTCTGATTCTTTGTCTTCTCCAACTGTTTCTTCAGTCTTTCACGCTCTTCA
ACGAGTTCTATGAGAGTAAGATCCGATCTCTCTGTTTTGCTCTTCAGGAATGCGTTTTCT
TTCCTCAGTTCTTTTATCGCTTTTGACATCTTATCGATTTCTTGTTTGAATGTTTCAAAC
ACTTCGTTGCTCTTCACCAACGCATCCTGAAACTGCTGGAACTTCTCTCCATCAGATGTT
AGCTGCACCCTCAAGTTTTTCTCGGTTGCTAAAAGCTGAGAAACTTGATCTGCGTAAACC
TTCATCTGAGACTGTTCGTGGATGAGTTTCTCCTCGTGCTGTTTGATTTTTAGTTCAGAT
ATCTGTAGCTCCAGTGTTTTCTGCTTCAACCTTTGCTCATGTTGTTGTTCTGAAAGC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2CA51JQ 421 0 0
CCGATCTCTCTGTTTTGCTCTTCAGGAATGCGTTTTCTTTCCTCAGTTCTTTTATCGCTT
TTGACATCTTATCGATTTCTTGTTTGAATGTTTCAAACACTTCGTTGCTTTTCACCAACG
CATCCTGGAACTGCTGGAACTTCTCTCCATCAGATGTTAGCTGCACCCTCAAGTTTTTCT
CGGTTGCTAAAAGCTGAGAAACTTGATCTGCGTAAACCTTCATCTGAGACTGCTCATGGC
TGAGTTTCTCCTCGTGCTGTTTGATTTTTAATTCAGATATCTGTAGCTCCAGTGTTTTCT
GCTTCAACCTTTGCTCATGTTGTTGTTCTGAAAGCATATATTGATCGGCCAGGTGCTTCA
ACTTCGTCCTTAACATCTCATTTTCTTTTAGTTGTGTGAGACTTTCATCTTTTTGCTCGT
C

QA 1 421 1 421
DS 



AS 1 2

CO CL6848Contig1 967 2 2 U
GTGGTCACACCATCAACATGTAAAGGCCAACAATAACTTATAAATGTCTTAAAAAGTAAA
GGGGTGTCAGCGGAGATTATATTTATAATGATTTTTAGAATTTTCAAGTTTGGTGTTATT
GGTTTATAAATTTTCGTATTCTCGTTAAAATCTTATGTTATTGGTTCACTGATTCTCTAG
TTCGGTAGACAATCATTTATTATTCAAAAAAATTTAGATATTAATAATTCTACAAATCTA
TTAAATTAAGTGTTATTGGAAATTGAAGTTTTGATATTTTAACTCATAAAATAAAATTTT
AAGAATAATACATGTTTCTCTTGGATTCTTGAAATCATTACATTACTTTATTTTCATAGA
TTTTCACAATATACAAAATTCTCTACAATTCTTTCTAAATTTAACGAATTTCTCAATTTT
TAGAACCAACAAACTCTATATAAATATAAGTCTCACTAACATCCCTAATTTTATTTCTGA
GTCTAAGTTTAACATTAAAAAGGATATGAGACGGTGAGTAAAGACAGGAACATGCTGTTG
TTCAAATAAAAAAAAGGGAAAACAAGAAAGCAATGCGCTAGTATATAGTTTACCTAGGAG
ATGAGTGTTACGTTTCATCTGTCATCAAATCAGGAAAATGGTTGACATTTCGCTTCTCTC
ACTTCTGTTCCTCATCTTTCTTCTTCTCGCCGCTATCAAATACAAGAACCGGCGGCTACA
TCAACGGAGACCACCTTCTCCTCCTGGCTTTCCTATCATAGGTAACTTACACCAGATTGG
AGAGTTGCCACATCAGTCTCTATGGAGGCTATCAAAGAAGTATGGTCCTGTCATGCTTTT
GAAGCTTGGAAAAGTCCCAACAGTCATAGTTTCCACCTCTGAAACAGCAAGACAAGCCCT
GAAAATCCATGACCTCCACTGTTGTAGCCGCCCAGGCTTGGCAGGTACACAAGTTTTGAC
TTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF65TF U 1
AF RR2AF65JQ C 202
BS 1 629 RR2AF65TF
BS 630 967 RR2AF65JQ

RD RR2AF65TF 629 0 0
GTGGTCACACCATCAACATGTAAAGGCCAACAATAACTTATAAATGTCTTAAAAAGTAAA
GGGGTGTCAGCGGAGATTATATTTATAATGATTTTTAGAATTTTCAAGTTTGGTGTTATT
GGTTTATAAATTTTCGTATTCTCGTTAAAATCTTATGTTATTGGTTCACTGATTCTCTAG
TTCGGTAGACAATCATTTATTATTCAAAAAAATTTAGATATTAATAATTCTACAAATCTA
TTAAATTAAGTGTTATTGGAAATTGAAGTTTTGATATTTTAACTCATAAAATAAAATTTT
AAGAATAATACATGTTTCTCTTGGATTCTTGAAATCATTACATTACTTTATTTTCATAGA
TTTTCACAATATACAAAATTCTCTACAATTCTTTCTAAATTTAACGAATTTCTCAATTTT
TAGAACCAACAAACTCTATATAAATATAAGTCTCACTAACATCCCTAATTTTATTTCTGA
GTCTAAGTTTAACATTAAAAAGGATATGAGACGGTGAGTAAAGACAGGAACATGCTGTTG
TTCAAATAAAAAAAAGGGAAAACAAGAAAGCAATGCGCTAGTATATAGTTTACCTAGGAG
ATGAGTGTTACGTTTCATCTGTCATCAAA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2AF65JQ 766 0 0
ATTCAAAAAAATTTAGATATTAATAATTCTACAAATCTATTAAATTAAGTGTTATTGGAA
ATTGAAGTTTTGATATTTTAACTCATAAAATAAAATTTTAAGAATAATACATGTTTCTCT
TGGATTCTTGAAATCATTACATTACTTTATTTTCATAGATTTTCACAATATACAAAATTC
TCTACAATTCTTTCTAAATTTAACGAATTTCTCAATTTTTAGAACCAACAAACTCTATAT
AAATATAAGTCTCACTAACATCCCTAATTTTATTTCTGAGTCTAAGTTTAACATTAAAAA
GGATATGAGACGGTGAGTAAAGACAGGAACATGCTGTTGTTCAAATAAAAAAAAGGGAAA
ACAAGAAAGCAATGCGCTAGTATATAGTTTACCTAGGAGATGAGTGTTACGTTTCATCTG
TCATCAAATCAGGAAAATGGTTGACATTTCGCTTCTCTCACTTCTGTTCCTCATCTTTCT
TCTTCTCGCCGCTATCAAATACAAGAACCGGCGGCTACATCAACGGAGACCACCTTCTCC
TCCTGGCTTTCCTATCATAGGTAACTTACACCAGATTGGAGAGTTGCCACATCAGTCTCT
ATGGAGGCTATCAAAGAAGTATGGTCCTGTCATGCTTTTGAAGCTTGGAAAAGTCCCAAC
AGTCATAGTTTCCACCTCTGAAACAGCAAGACAAGCCCTGAAAATCCATGACCTCCACTG
TTGTAGCCGCCCAGGCTTGGCAGGTACACAAGTTTTGACTTTTTTC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL6849Contig1 716 2 2 U
GGACATCCACCACAAGAAATCAAAGTCAGCAAACAAAGAAAAAAAAACGAAAGATGAACT
TCCTCTCCGACCAGGTAAAGAAATTCTCCGACTCCAAACCAGAGGAGCCAGACCACAACA
AGCCCGCCGAAGGAACCGAAACAACCAACAGACCAGCTTCATCCTCCGAGCTCATGGCTA
GTGCCAAGGTCGTAGCCGAAGCTGCTCAAGCCGCTGCTCGTAACGAGTCAGACAAACTCG
ACAAGGCTAAAGTCGCTGGAGCCAGCGCTGATATCTTAGATGCCGCCCAGAAATACGGAA
AGCTCGATGAGAAGAGCGGCACTGGTCAGTACCTGGAGAAGGCCGAGAAGTATCTAAACG
ACTTCGAGTCCTCACATTCCTCCGGCGCCGCCGGTACTCCTCCCCCGGCTTCCGCCGGTG
CTCCTCCTCCGGCAAGTGAGGCTGAACCAGAAGCTAAGAAGCCCGAAGAGGAGTCTGGTG
GTGGCTTGGGAGGTTATGCTAAGATGGCTCAAGGTTTCATGAAGTGATTATTGATCTTTA
TTATATACTGTGTATTAATAAATTTAAATAAGTGCGTACTAAACGTTGTTGTCTTTAATC
TACCTATATATTTGTTGATGTAATATTTCCTTGTCATTGTTATGTCCTTAATCTACCTAT
ATATTTGTTGTGATTATGCTAAACGTTTTGGTGTTTATAAACCAAATCAGGGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL65TF U 1
AF RR2EL65JQ C 363
BS 1 690 RR2EL65TF
BS 691 716 RR2EL65JQ

RD RR2EL65TF 690 0 0
GGACATCCACCACAAGAAATCAAAGTCAGCAAACAAAGAAAAAAAAACGAAAGATGAACT
TCCTCTCCGACCAGGTAAAGAAATTCTCCGACTCCAAACCAGAGGAGCCAGACCACAACA
AGCCCGCCGAAGGAACCGAAACAACCAACAGACCAGCTTCATCCTCCGAGCTCATGGCTA
GTGCCAAGGTCGTAGCCGAAGCTGCTCAAGCCGCTGCTCGTAACGAGTCAGACAAACTCG
ACAAGGCTAAAGTCGCTGGAGCCAGCGCTGATATCTTAGATGCCGCCCAGAAATACGGAA
AGCTCGATGAGAAGAGCGGCACTGGTCAGTACCTGGAGAAGGCCGAGAAGTATCTAAACG
ACTTCGAGTCCTCACATTCCTCCGGCGCCGCCGGTACTCCTCCCCCGGCTTCCGCCGGTG
CTCCTCCTCCGGCAAGTGAGGCTGAACCAGAAGCTAAGAAGCCCGAAGAGGAGTCTGGTG
GTGGCTTGGGAGGTTATGCTAAGATGGCTCAAGGTTTCATGAAGTGATTATTGATCTTTA
TTATATACTGTGTATTAATAAATTTAAATAAGTGCGTACTAAACGTTGTTGTCTTTAATC
TACCTATATATTTGTTGATGTAATATTTCCTTGTCATTGTTATGTCCTTAATCTACCTAT
ATATTTGTTGTGATTATGCTAAACGTTTTG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2EL65JQ 354 0 0
TTG
GAGTCCTCACATTCCTCCGGCGCCGCCGGTACTCCTCCCCCGGCTTCCGCCGGTGCTCCT
CCTCCGGCAAGTGAGGCTGAACCAGAAGCTAAGAAGCCCGAAGAGGAGTCTGGTGGTGGC
TTGGGAGGTTATGCTAAGATGGCTCAAGGTTTCATGAAGTGATTATTGATCTTTATTATA
TACTGTGTATTAATAAATTTAAATAAGTGCGTACTAAACGTTGTTGTCTTTAATCTACCT
ATATATTTGTTGATGTAATATTTCCTTGTCATTGTTATGTCCTTAATCTACCTATATATT
TGTTGTGATTATGCTAAACGTTTTGGTGTTTATAAACCAAATCAGGGAGCC

QA 4 354 4 354
DS 



AS 1 2

CO CL6850Contig1 847 2 16 U
GGAGATTCATATATTTTCTGATATACACCGCCTCTCTAAACTCTCTCTCTCTCAAAGACC
GAACCTTCGATCTCATTATCTGGAGAATATATCTGGAGGATCTCATTAATCCTTTTTTTG
ATTCAGCAATGGCGAAGAACGTAGGGATATTGGCTATGGATATCTACTTCCCTCCCACAT
GTGCGCAACAGGAAGCTTTGGAAGCTCATGATGGAGCAAGCAAAGGCAAATACACCATTG
GACTTGGCCAAGATTGTTTAGCTTTTTGCACTGAGCTTGAAGATGTCATCTCAATGAGTT
TCAATGCGGTGACATCTCTTCTTGAAAAGTACAAGATTGACCCCAAGCAAATTGGGCGTC
TTGAAGTAGGAAGTGAGACTGTCATTGACAAAAACAAGTCCATCAAAACCTTCTTGATGC
AACTCTTTGAGAAATGTGGAAACACTGATGTAGAAGGTGTTGACTCGACCAATGCATGTT
ATGGTGGAACCGCAGCTTTGCTAAACTGTGTCAATTGGGTTGAGAGTAACTCCTGGGATG
GACGCTATGGCCTCGTCATTTGTACTGACAGTGCGGTCTATGCTGAAGGACCTGCAAGGC
CCACTGGAGGAGCAGCTGCCATCGCTATGTTGATAGGACCAAATGCTCCTATTGTTTTCG
AGAGCAAATTGAGAGGAAGCCACAAGGCTCACGTCTATGACTTCTACAAGCCAAATCTTT
CTAGCGAGTACCCGGTTGTTGATGGTAAGCTTTCCCAGACATACTACCTTATGGCACTTG
ACTCTTGCTACAACATTTATGCACAGTTTGAGAACTTGAGGGCAGAGAGTCTCATCATGA
TGCTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F633TF U 1
AF RR2DD29TF U 52
BS 1 183 RR2F633TF
BS 184 184 RR2DD29TF
BS 185 311 RR2F633TF
BS 312 312 RR2DD29TF
BS 313 327 RR2F633TF
BS 328 328 RR2DD29TF
BS 329 747 RR2F633TF
BS 748 748 RR2DD29TF
BS 749 755 RR2F633TF
BS 756 756 RR2DD29TF
BS 757 762 RR2F633TF
BS 763 763 RR2DD29TF
BS 764 808 RR2F633TF
BS 809 809 RR2DD29TF
BS 810 821 RR2F633TF
BS 822 847 RR2DD29TF

RD RR2F633TF 821 0 0
GGAGATTCATATATTTTCTGATATACACCGCCTCTCTAAACTCTCTCTCTCTCAAAGACC
GAACCTTCGATCTCATTATCTGGAGAATATATCTGGAGGATCTCATTAATCCTTTTTTTG
ATTCAGCAATGGCGAAGAACGTAGGGATATTGGCTATGGATATCTACTTCCCTCCCACAT
GTGTGCAACAGGAAGCTTTGGAAGCTCATGATGGAGCAAGCAAAGGCAAATACACCATTG
GACTTGGCCAAGATTGTTTAGCTTTTTGCACTGAGCTTGAAGATGTCATCTCAATGAGTT
TCAATGCGGTGGCATCTCTTCTTGAAA*GTACAAGATTGACCCCAAGCAAATTGGGCGTC
TTGAAGTAGGAAGTGAGACTGTCATTGACAAAAACAAGTCCATCAAAACCTTCTTGATGC
AACTCTTTGAGAAATGTGGAAACACTGATGTAGAAGGTGTTGACTCGACCAATGCATGTT
ATGGTGGAACCGCAGCTTTGCTAAACTGTGTCAATTGGGTTGAGAGTAACTCCTGGGATG
GACGCTATGGCCTCGTCATTTGTACTGACAGTGCGGTCTATGCTGAAGGACCTGCAAGGC
CCACTGGAGGAGCAGCTGCCATCGCTATGTTGATAGGACCAAATGCTCCTATTGTTTTCG
AGAGCAAATTGAGAGGAAGCCACAAGGCTCACGTCTATGACTTCTACAAGCCAAATCTTT
CTAGCGAGTACCCGGTTGTTGATGGTA*GCTTTCC*AGACATGCTACCTTATGGCACTTG
ACTCTTGCTACAACATTTATGCACAGTT*GAGAACTTGAGG

QA 1 821 1 821
DS 

RD RR2DD29TF 796 0 0
GG
AAAGACCGAACCTTCGATCTCATTATCTGGAGAATATATCTGGAGGATCTCATTAATCCT
TTTTTTGATTCAGCAATGGCGAAGAACGTAGGGATATTGGCTATGGATATCTACTTCCCT
CCCACATGTGCGCAACAGGAAGCTTTGGAAGCTCATGATGGAGCAAGCAAAGGCAAATAC
ACCATTGGACTTGGCCAAGATTGTTTAGCTTTTTGCACTGAGCTTGAAGATGTCATCTCA
ATGAGTTTCAATGCGGTGACATCTCTTCTTGAAAAGTACAAGATTGACCCCAAGCAAATT
GGGCGTCTTGAAGTAGGAAGTGAGACTGTCATTGACAAAAGCAAGTCCATCAAAACCTTC
TTGATGCAACTCTTTGAGAAATGTGGAAACACTGATGTAGAAGGTGTTGACTCGACCAAT
GCATGTTATGGTGGAACCGCAGCTTTGCTAAACTGTGTCAATTGGGTTGAGAGTAACTCC
TGGGATGGACGCTATGGCCTCGTCATTTGTACTGACAGTGCGGTCTATGCTGAAGGACCT
GCAAGGCCCACTGGAGGAGCAGCTGCCATTGCTATGTTGATAGGACCAAATGCTCCTATT
GTTTTCGAGAGCAAATTGAGAGGAAGCCACATGGCTCACGTCTATGACTTCTACAAGCCA
AATCTTTCTAGCGAGTACCCGGTTGTTGATGGTAAGCTTTCCCAGACATACTACCTTATG
GCACTTGACTCTTGCTACAACATTTATGCACAGTTTGAGAACTTGAGGGCAGAGAGTCTC
ATCATGATGCTGAT

QA 3 796 3 796
DS 



AS 1 2

CO CL6851Contig1 889 2 2 U
GGAAGCAAAGTGTTGTTCCTCCTTCTCCAGGCGAGAGAAGAGGAAGCAAAGCCATGGTTG
GACCAGGTAGACCTCAAATCGTCCCCTTCGGTTCTTCAATCGTTCAGTACAGTTTCAGCA
ATGGTGGCTGGGGAGCCACTCTCGCTGACGTCTACTCTCGCACGGCTGATGTTATCCTTC
GTGGATACGGTGGTTGGAACTCAAGATTTGCCTTAAAGGTTCTTGAACAAGTCTTCCCAA
AGGATGCTGTAGTACAACCTTCTTTGGTGATAGTTTACTTCGGTGGGAATGATTCAATGC
CTCCTCATCCATCAGGGAAAGGAGCTCATGTTCCTATCCCTGAGTTCATTGACAACATGA
GGAACATTGGGGAGCATCTTCTGAGCCTTTCAGACAAGACCCGTGTTATTTTTCTCTCTC
CACCACCAATGAACGAGAGACAGATCCAGCTAGTATTTGGAGATGCAATAAAAGGCCGGA
GAAACGAAGCTTGCCGTCCATATGCAGAAGCGTTGTTGAACCTATGCAATGAGATGGATG
TCAAATGTGTTGATATCTGGAACGTTATGCAGCAACAAGATGATTGGTTGAACACCTGCT
TCACAGATGGGATCCATTTCACAGCCAAGGCAAGCGAGCTTGTGGCGAAGGAGGTGTTGA
AGGTAGTGAGAGAAGCTGAGTGGAAACCTAGTCTTTACTGGAAGTCCCTACCTATTGAGT
TTCCTTTAGATTATGGTGTACCAGACTCGCTAAGCCTTAGTGAGCTAGAGTTATTCAGAA
ACGAACAGTTGGAGCTACTAACTAGTACGGCTCTACTGTAAAACGTTTAGAGAACATGCT
AGTGGATGGTATAACATTTAATTCTCTCCTGTGTGCATCAGATATACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ20TFB U 1
AF RR2AZ20JQ C 77
BS 1 624 RR2AZ20TFB
BS 625 889 RR2AZ20JQ

RD RR2AZ20TFB 624 0 0
GGAAGCAAAGTGTTGTTCCTCCTTCTCCAGGCGAGAGAAGAGGAAGCAAAGCCATGGTTG
GACCAGGTAGACCTCAAATCGTCCCCTTCGGTTCTTCAATCGTTCAGTACAGTTTCAGCA
ATGGTGGCTGGGGAGCCACTCTCGCTGACGTCTACTCTCGCACGGCTGATGTTATCCTTC
GTGGATACGGTGGTTGGAACTCAAGATTTGCCTTAAAGGTTCTTGAACAAGTCTTCCCAA
AGGATGCTGTAGTACAACCTTCTTTGGTGATAGTTTACTTCGGTGGGAATGATTCAATGC
CTCCTCATCCATCAGGGAAAGGAGCTCATGTTCCTATCCCTGAGTTCATTGACAACATGA
GGAACATTGGGGAGCATCTTCTGAGCCTTTCAGACAAGACCCGTGTTATTTTTCTCTCTC
CACCACCAATGAACGAGAGACAGATCCAGCTAGTATTTGGAGATGCAATAAAAGGCCGGA
GAAACGAAGCTTGCCGTCCATATGCAGAAGCGTTGTTGAACCTATGCAATGAGATGGATG
TCAAATGTGTTGATATCTGGAACGTTATGCAGCAACAAGATGATTGGTTGAACACCTGCT
TCACAGATGGGATCCATTTCACAG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2AZ20JQ 813 0 0
AATCGTCCCCTTCGGTTCTTCAATCGTTCAGTACAGTTTCAGCAATGGTGGCTGGGGAGC
CACTCTCGCTGACGTCTACTCTCGCACGGCTGATGTTATCCTTCGTGGATACGGTGGTTG
GAACTCAAGATTTGCCTTAAAGGTTCTTGAACAAGTCTTCCCAAAGGATGCTGTAGTACA
ACCTTCTTTGGTGATAGTTTACTTCGGTGGGAATGATTCAATGCCTCCTCATCCATCAGG
GAAAGGAGCTCATGTTCCTATCCCTGAGTTCATTGACAACATGAGGAACATTGGGGAGCA
TCTTCTGAGCCTTTCAGACAAGACCCGTGTTATTTTTCTCTCTCCACCACCAATGAACGA
GAGACAGATCCAGCTAGTATTTGGAGATGCAATAAAAGGCCGGAGAAACGAAGCTTGCCG
TCCATATGCAGAAGCGTTGTTGAACCTATGCAATGAGATGGATGTCAAATGTGTTGATAT
CTGGAACGTTATGCAGCAACAAGATGATTGGTTGAACACCTGCTTCACAGATGGGATCCA
TTTCACAGCCAAGGCAAGCGAGCTTGTGGCGAAGGAGGTGTTGAAGGTAGTGAGAGAAGC
TGAGTGGAAACCTAGTCTTTACTGGAAGTCCCTACCTATTGAGTTTCCTTTAGATTATGG
TGTACCAGACTCGCTAAGCCTTAGTGAGCTAGAGTTATTCAGAAACGAACAGTTGGAGCT
ACTAACTAGTACGGCTCTACTGTAAAACGTTTAGAGAACATGCTAGTGGATGGTATAACA
TTTAATTCTCTCCTGTGTGCATCAGATATACAG

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

CO CL6852Contig1 775 2 23 U
GGAAAGATAACACATTCGATAACCATGGCGACGGCTTCAGTTGCTTTCAAGTCTAGGGAA
GACCATAGGAAGCAAATCGAGTTAGAGGAGGCTCGTAAAGCCGGGCTTGCACCAGCTGAG
GTAGATGAGGATGGAAAGGAAATCAATCCTCACATTCCCCAGTACATGCCCTCTGCTCCA
TGGTATCTCAACTCTGAGAAACCGAGTCTGAAGCATCAAAGGAAATGGAAGAGTGATCCC
AATTACACTAAGTCATGGTATGACAGAGGTGCAAAGATCTACCAAGCTGAAAAGTACCGC
AAGGGAGCATGTCAAAACCGTGGTGCGATGACGCATACTGCGAAGGCCTGCATGGATAGA
CCTCGCAAGATTGGAGCGAAGTACACGAACAAGAACATTGCACCTGATGAGAAAATCGAG
AGTTTTGAACTCGACTATGACGGCAAGAGGGACAGATGGAATGGGTACGATACTTCAACC
TACCACCGTGTGATAGACCTTTACGAAGCAAAAGAGGATGCACGGAAGAAGTATCTCAAG
GAGCAGCAGATTAAGAAACTAGAGGACAAGAACAATAACCAGGAAGGTAATGATGCTGCA
ACCAGTGATGGGGACGAAGAAGAAGATGACTTGAGGGTCGATGAAGCTAAGTTGATGAGA
GCAGTCAGATGGACTTTGCAAAGGTTGAGAAACGTGTCGACAACTGGTGGTGGTAGTACA
GGACTGTAAGGATCTGCGTATCAGAGAGACACAGCGAATACCTGTTGAACTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE45TF U 10
AF RR2H153TF U 1
BS 1 101 RR2H153TF
BS 102 102 RR2GE45TF
BS 103 122 RR2H153TF
BS 123 123 RR2GE45TF
BS 124 168 RR2H153TF
BS 169 169 RR2GE45TF
BS 170 284 RR2H153TF
BS 285 285 RR2GE45TF
BS 286 318 RR2H153TF
BS 319 319 RR2GE45TF
BS 320 347 RR2H153TF
BS 348 348 RR2GE45TF
BS 349 350 RR2H153TF
BS 351 351 RR2GE45TF
BS 352 416 RR2H153TF
BS 417 417 RR2GE45TF
BS 418 503 RR2H153TF
BS 504 504 RR2GE45TF
BS 505 664 RR2H153TF
BS 665 665 RR2GE45TF
BS 666 683 RR2H153TF
BS 684 684 RR2GE45TF
BS 685 775 RR2H153TF

RD RR2GE45TF 685 0 0
GG
ACATTCGATAACCATGGCGACGGCTTCAGTTGCTTTCAAGTCTAGGGAAGACCATAGGAA
GCAAATCGAGTTAGAGGAGGCTCGTAAAGCCGGGCTTGCACCAGCTGAGGTAGATGAGGA
TGGGGAGGAAATCAATCCTCACATTCCCCAGTACATGCCCTCTGCTCCATGGTATCTCAA
CTCTGAGAAACCGAGTCTGAAGCATCAAAGGAAATGGAAGAGTTATCCCAATTACACTAA
GTCATGGTATGACAGAGGTGCAAAGATCTACCAAGCTGAAAAGTACCGCAAGGTAGCATG
TCAAAACCGTGGTGCGATGACGCATACTGCTAAGGCCTGCATGGATAGGCCTCGCAAGAT
TGGAGCGAAGTACACGAACAAGAACATTGCACCTGATGAGAAAATCGAGAGTTTTGAACT
CGACTATGACGGCAAGAGGGACAGATGGAATGGGTACGATACTTCAACCTACCACCGTGT
GATAGACCTTTACGAAGCAAAAGAGGATGCACGGAAGAAGTATCTCAAGGAGCAGCAGAT
TAAGAAACTAGAGGACAAGAACAATAACCAGGAAGGTAATGATGCTGCAACCAGTGATGG
GGACGAAGAAGAAGATGACTTGAGGGTCGATGAAGCTAAGTTGATGAGAGCAGTCAGATG
GACTTTGCAAAGGTTGAGAAACG

QA 3 685 3 685
DS 

RD RR2H153TF 775 0 0
GGAAAGATAACACATTCGATAACCATGGCGACGGCTTCAGTTGCTTTCAAGTCTAGGGAA
GACCATAGGAAGCAAATCGAGTTAGAGGAGGCTCGTAAAGCTGGGCTTGCACCAGCTGAG
GTGGATGAGGATGGAAAGGAAATCAATCCTCACATTCCCCAGTACATGTCCTCTGCTCCA
TGGTATCTCAACTCTGAGAAACCGAGTCTGAAGCATCAAAGGAAATGGAAGAGTGATCCC
AATTACACTAAGTCATGGTATGACAGAGGTGCAAAGATCTACCAGGCTGAAAAGTACCGC
AAGGGAGCATGTCAAAACTGTGGTGCGATGACGCATACTGCGAAGGCGTGTATGGATAGA
CCTCGCAAGATTGGAGCGAAGTACACGAACAAGAACATTGCACCTGATGAGAAAATTGAG
AGTTTTGAACTCGACTATGACGGCAAGAGGGACAGATGGAATGGGTACGATACTTCAACC
TACCACCGTGTGATAGACCTTTATGAAGCAAAAGAGGATGCACGGAAGAAGTATCTCAAG
GAGCAGCAGATTAAGAAACTAGAGGACAAGAACAATAACCAGGAAGGTAATGATGCTGCA
ACCAGTGATGGGGACGAAGAAGAAGATGACTTGAGGGTCGATGAAGCTAAGTTGATGAGA
GCAG*CAGATGGACTTTGCAAAG*TTGAGAAACGTGTCGACAACTGGTGGTGGTAGTACA
GGACTGTAAGGATCTGCGTATCAGAGAGACACAGCGAATACCTGTTGAACTTGAT

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL6853Contig1 1223 2 2 U
GTGATATGGCCACTTCAACTCTCATTCCTGGATCTTATGTCTTCTTCGAAGACGGTACAA
AGATCTCTGAGTACATCAACTCCACCAAAAATCCTCAAGCTGTTATCTTTAAAACGCGAA
CATCCAAAATGGTTGCTCCTGCCATTGCTTCCTTTTCAGCAAGAGGACCTCAAAGAATCA
GCCCTAACATTCTCAAGCCTGACATATCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGT
ATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTA
CCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTG
TCAATAAATAACAATACCGGGCTCTTTGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAAT
CCCTTAACGAGGGTCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCAGCTGCAGCAGCTTAT
GTCAAATCATTCCATCCTGATTGGTCTCCAGCCGCAATCAAATCAGCCCTAATGACAACA
GCTACTCCAATGAGAACCAAAGACATCGAGGCGGAGCTAAGCTACGGATCGGGTCAAATA
AACCCGAGAAGAGCCATTCACCCGGGTCTAGTCTACGACATTACAGAGAGCGCTTACTTA
AGTTTTCTATGTAAAGAAGGATATAACAGCACAAGCATTGGACTTTTACTTGGCGGTAGC
AACGAGACTAAGAAGGAATACAGATGCGTGGATCACAAGCAAGGGTTAGGATCTGACGGG
TTAAATTATCCGTCTATGCATAAGCAGGTGGGTTCCACGGCAACGAATGTGTCAGAGGTT
TTTTACAGGACGGTGAGGAGTGTGGGATACGGACCGTCGACCTACGTGGCTAAGGTTTGG
GCGCCGAAGGGAGTGAGAGTTGAAGTGGAGCCTAGGGTTATGAGTTTCGTTAAGCCTGGA
GAGGAGAAGCACTTTAAGGTTGTGATTAATGGAGTCATGGAAGAGAATCTGAGAGGTATT
TTGTCGGCTTCAGTTGAATGGGATGATTCAAGAGGTCATCTTGTGAGGAGTCCCATCTTG
CTGTTTCAAGCGGGCCGGTAGAGAGAGAGAGAGCTTTTGTTAATCACCGTTTGTTTTTAA
TTTTTAGTGTTTGAGTTTTTCTTTTATTTAATATTAGTGTTGTTGAGCCAATTAAATTTG
AACCAAATAGGAAAATAATTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B693TF U 1
AF RR2B693JQ C 481
BS 1 800 RR2B693TF
BS 801 1223 RR2B693JQ

RD RR2B693TF 800 0 0
GTGATATGGCCACTTCAACTCTCATTCCTGGATCTTATGTCTTCTTCGAAGACGGTACAA
AGATCTCTGAGTACATCAACTCCACCAAAAATCCTCAAGCTGTTATCTTTAAAACGCGAA
CATCCAAAATGGTTGCTCCTGCCATTGCTTCCTTTTCAGCAAGAGGACCTCAAAGAATCA
GCCCTAACATTCTCAAGCCTGACATATCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGT
ATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTA
CCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTG
TCAATAAATAACAATACCGGGCTCTTTGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAAT
CCCTTAACGAGGGTCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCAGCTGCAGCAGCTTAT
GTCAAATCATTCCATCCTGATTGGTCTCCAGCCGCAATCAAATCAGCCCTAATGACAACA
GCTACTCCAATGAGAACCAAAGACATCGAGGCGGAGCTAAGCTACGGATCGGGTCAAATA
AACCCGAGAAGAGCCATTCACCCGGGTCTAGTCTACGACATTACAGAGAGCGCTTACTTA
AGTTTTCTATGTAAAGAAGGATATAACAGCACAAGCATTGGACTTTTACTTGGCGGTAGC
AACGAGACTAAGAAGGAATACAGATGCGTGGATCACAAGCAAGGGTTAGGATCTGACGGG
TTAAATTATCCGTCTATGCA

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2B693JQ 743 0 0
GTCAAATCATTCCATCCTGATTGGTCTCCAGCCGCAATCAAATCAGCCCTAATGACAACA
GCTACTCCAATGAGAACCAAAGACATCGAGGCGGAGCTAAGCTACGGATCGGGTCAAATA
AACCCGAGAAGAGCCATTCACCCGGGTCTAGTCTACGACATTACAGAGAGCGCTTACTTA
AGTTTTCTATGTAAAGAAGGATATAACAGCACAAGCATTGGACTTTTACTTGGCGGTAGC
AACGAGACTAAGAAGGAATACAGATGCGTGGATCACAAGCAAGGGTTAGGATCTGACGGG
TTAAATTATCCGTCTATGCATAAGCAGGTGGGTTCCACGGCAACGAATGTGTCAGAGGTT
TTTTACAGGACGGTGAGGAGTGTGGGATACGGACCGTCGACCTACGTGGCTAAGGTTTGG
GCGCCGAAGGGAGTGAGAGTTGAAGTGGAGCCTAGGGTTATGAGTTTCGTTAAGCCTGGA
GAGGAGAAGCACTTTAAGGTTGTGATTAATGGAGTCATGGAAGAGAATCTGAGAGGTATT
TTGTCGGCTTCAGTTGAATGGGATGATTCAAGAGGTCATCTTGTGAGGAGTCCCATCTTG
CTGTTTCAAGCGGGCCGGTAGAGAGAGAGAGAGCTTTTGTTAATCACCGTTTGTTTTTAA
TTTTTAGTGTTTGAGTTTTTCTTTTATTTAATATTAGTGTTGTTGAGCCAATTAAATTTG
AACCAAATAGGAAAATAATTAGT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL6854Contig1 823 2 6 U
GAGAAATATTTTGCTGAGAAATGTTTTCTCATCTTGACATTTATGAACCATCTTTTCTTT
TGTCTCTGTCACCAAAACACCAATGAAGTATAGCAGCTCTCTTCATTCACCAGATTTAAT
ACATGATACAGCTTTTGTGTTTGCAATAGGAGAAAAAAAATGAATACTTGTAGATATGCA
AACAAAAAAACTCTATCAAGTTTTTATTTGATAGACAAATAAACAAATGGTAAGAACACC
CTTTGACGAGAGAGGACATTAGACTAACAAGTGAAGGAATATCGTGGACCAAACAGTGAG
AGCAAGAATGGCGATCAAGTATGTCCAAAGCATGAGCACTGAGCACTCGTCTTGGCCAAC
ATTATACAGCTGAGTCATGGTACCGATATTCATGGCAGGCGGGAGTGTGAACTGAAGCAT
TAAAACATATTGAAACAGAGGATCTGCTGGGAGAAACCCGAAACTCGCAGCTGTTCTTAC
AACGCCTATGCCAATGATTGGGAGAATAATGTACCGAACACACACTATTCCAAGAACAAC
CACTGGTCTGACTGCCGAAGAACGTAAACCTTGTATGAGGTTGCCTCCAAATATAATTGT
CATACAAGGAATGGTCCCATCGCCAAGAAGTTTTGCTGTGGCTTGGACTATTCTTAAAGG
AGCATCATCACCAGTGATAAGATTTCTGAGCCATGTAACAGCACCGAATATGAAACCAAT
AATTGCACCAACTGTAGGTGGTGCGCGAAGCTCCTCTAATATCTCATGGAAGAAGTCTAT
TCCTTTTCTCCAAAACCCTGTCTCTTCCTTTACCAGCTCGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G507JQ U 1
AF RR2EK38JQ U 85
BS 1 492 RR2G507JQ
BS 493 493 RR2EK38JQ
BS 494 590 RR2G507JQ
BS 591 591 RR2EK38JQ
BS 592 646 RR2G507JQ
BS 647 823 RR2EK38JQ

RD RR2G507JQ 646 0 0
GAGAAATATTTTGCTGAGAAATGTTTTCTCATCTTGACATTTATGAACCATCTTTTCTTT
TGTCTCTGTCACCAAAACACCAATGAAGTATAGCAGCTCTCTTCATTCACCAGATTTAAT
ACATGATACAGCTTTTGTGTTTGCAATAGGAGAAAAAAAATGAATACTTGTAGATATGCA
AACAAAAAAACTCTATCAAGTTTTTATTTGATAGACAAATAAACAAATGGTAAGAACACC
CTTTGACGAGAGAGGACATTAGACTAACAAGTGAAGGAATATCGTGGACCAAACAGTGAG
AGCAAGAATGGCGATCAAGTATGTCCAAAGCATGAGCACTGAGCACTCGTCTTGGCCAAC
ATTATACAGCTGAGTCATGGTACCGATATTCATGGCAGGCGGGAGTGTGAACTGAAGCAT
TAAAACATATTGAAACAGAGGATCTGCTGGGAGAAACCCGAAACTCGCAGCTGTTCTTAC
AACGCCTATGCCGATGATTGGGAGAATAATGTACCGAACACACACTATTCCAAGAACAAC
CACTGGTCTGACTGCCGAAGAACGTAAACCTTGTATGAGGTTGCCTCCAAGTATAATTGT
CATACAAGGAATGGTCCCATCGCCAAGAAGTTTTGCTGTGGCTTGG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2EK38JQ 739 0 0
GG
AGTATAGCAGCTCTTTTCATTCACCAGATTTAATACATGATACAGCTTTTGTGTTTGCAA
TAGGAGAAAAAAA*TGAATACTTGTAGATATGCAAA*AAAAAAACTCTATCAAGTTTTTA
TTTGATAGACAAATAAACAAATGGTAAGAACACCCTTTGACGAGAGAGGACATTAGACTA
ACAAGTGAAGGAATATTGTGGACCAAACAGTGAGAGCAAGAATGGCGATCAAGTATGTCC
AAAGCATGAGCACTGAGCACTCGTCTTGTCCAACATTATACAGCTGAGTCATGGTACCGA
TATTCATGGCAGGCGGGAGTGTGAATTGAAGCATTAAAACATATTGAAACAGAGGATCTG
CTGGGAGAAACCCGAAACTCGCAGCTGTTCTTACAACGCCTATGCCAATGATTGGGAGAA
TAATGTACCGAACACACACTATTCCAAGAACAACCACTGGTCTGACTGCCGAAGAACGTA
AACCTTGTATGAGGTTGCCTCCTAATATAATTGTCATACAAGGAATGGTCCCATCGCCAA
GAAGTTTTGCTGTGGCTTGGACTATTCTTAAAGGAGCATCATCACCAGTGATAAGATTTC
TGAGCCATGTAACAGCACCGAATATGAAACCAATAATTGCACCAACTGTAGGTGGTGCGC
GAAGCTCCTCTAATATCTCATGGAAGAAGTCTATTCCTTTTCTCCAAAACCCTGTCTCTT
CCTTTACCAGCTCGTCT

QA 3 739 3 739
DS 



AS 1 2

CO CL6855Contig1 929 2 8 U
GAAGCTCGCCTCCTCTGTTGCCTGATGCAAGCATTGTTCCCTTCACAGCGATGCAATCTG
CGGTTTCCAAAAACATGATCGAGAGCCTCTCTGTTCCAACGTTCCGCGTTGGTTATCCTG
TCAACACTGATGCTCTCGATGCACTCTACGAGAAGGTGAAGCCGAAGGGTGTAACAATGA
CTGCGTTATTGGCCAAAGCTGCAGGGATGGCTCTTGCACAGCATCCTGTGGTGAACGCGA
GCTGCAAAGATGGCAAGAGTTTTAGTTACAATAGTAACATTAACATTGCGGTTGCCGTTG
CTATCAATGGCGGGTTGATTACTCCTGTTCTGCAAGATGCTGATAAGCTGGATTTATACT
TGTTGTCTCAAAAATGGAAAGAGCTGGTGGGGAAAGCTAGGAGCAAGCAATTGCAACCTC
ATGAGTACAACTCTGGAACTTTCACTTTATCGAATCTCGGTATGTTTGGAGTGGATAGAT
TTGATGCCATTCTTCCTCCAGGACAGGGTGCTATAATGGCTGTTGGAGCGTCAAAACCAA
CTGTAGTTGCTGATAAAGATGGTTTCTTCAGTGTGAAAAACAAAATGCTGGTGAATGTTA
CAGCAGATCATCGCATTGTGTATGGAGCTGACTTGGCTGCTTTCCTTCAGACCTTTGCAA
AGATTGTCGAGAATCCAGATAGCTTGACCTTGTAGACATCACCAATGTCTTAAACCAACA
AACGAACACGAGGGGAACAGTTCAAAACTTCCTGATCCACTATTTCCTCGAGTAAAAGAA
ATGTTTAGTCTTTAATTGTTACACTGGTCTTGTTCTTTCTTTTTGCAGATTTGTTCACTT
GTTTTGTTGCCTCCATTTTTGAACTTTTGATGTGTCTTGTTTCCCGGAAATTCTGATTCT
GGCTTTTACACAAATAATTATTTTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ01TF U 1
AF RR2EQ01JQ C 168
BS 1 736 RR2EQ01TF
BS 737 737 RR2EQ01JQ
BS 738 746 RR2EQ01TF
BS 747 747 RR2EQ01JQ
BS 748 776 RR2EQ01TF
BS 777 777 RR2EQ01JQ
BS 778 795 RR2EQ01TF
BS 796 929 RR2EQ01JQ

RD RR2EQ01TF 795 0 0
GAAGCTCGCCTCCTCTGTTGCCTGATGCAAGCATTGTTCCCTTCACAGCGATGCAATCTG
CGGTTTCCAAAAACATGATCGAGAGCCTCTCTGTTCCAACGTTCCGCGTTGGTTATCCTG
TCAACACTGATGCTCTCGATGCACTCTACGAGAAGGTGAAGCCGAAGGGTGTAACAATGA
CTGCGTTATTGGCCAAAGCTGCAGGGATGGCTCTTGCACAGCATCCTGTGGTGAACGCGA
GCTGCAAAGATGGCAAGAGTTTTAGTTACAATAGTAACATTAACATTGCGGTTGCCGTTG
CTATCAATGGCGGGTTGATTACTCCTGTTCTGCAAGATGCTGATAAGCTGGATTTATACT
TGTTGTCTCAAAAATGGAAAGAGCTGGTGGGGAAAGCTAGGAGCAAGCAATTGCAACCTC
ATGAGTACAACTCTGGAACTTTCACTTTATCGAATCTCGGTATGTTTGGAGTGGATAGAT
TTGATGCCATTCTTCCTCCAGGACAGGGTGCTATAATGGCTGTTGGAGCGTCAAAACCAA
CTGTAGTTGCTGATAAAGATGGTTTCTTCAGTGTGAAAAACAAAATGCTGGTGAATGTTA
CAGCAGATCATCGCATTGTGTATGGAGCTGACTTGGCTGCTTTCCTTCAGACCTTTGCAA
AGATTGTCGAGAATCCAGATAGCTTGACCTTGTAGACATCACCAATGTCTTAAACCAACA
AACGAACACGAGGGGA*CAGTTCAAA*CTTCCTGATCCACTATTTCCTCGAGTAAA*GAA
ATGTTTAGTCTTTAA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2EQ01JQ 762 0 0
GGTGTAACAATGACTGCGTTATTGGCCAAAGCTGCAGGGATGGCTCTTGCACAGCATCCT
GTGGTGAACGCGAGCTGCAAAGATGGCAAGAGTTTTAGTTACAATAGTAACATTAACATT
GCGGTTGCCGTTGCTATCAATGGCGGGTTGATTACTCCTGTTCTGCAAGATGCTGATAAG
CTGGATTTATACTTGTTGTCTCAAAAATGGAAAGAGCTGGTGGGGAAAGCTAGGAGCAAG
CAATTGCAACCTCATGAGTACAACTCTGGAACTTTCACTTTATCGAATCTCGGTATGTTT
GGAGTGGATAGATTTGATGCCATTCTTCCTCCAGGACAGGGTGCTATAATGGCTGTTGGA
GCGTCAAAACCAACTGTAGTTGCTGATAAAGATGGTTTCTTCAGTGTGAAAAACAAAATG
CTGGTGAATGTTACAGCAGATCATCGCATTGTGTATGGAGCTGACTTGGCTGCTTTCCTT
CAGACCTTTGCAAAGATTGTCGAGAATCCAGATAGCTTGACCTTGTAGACATCACCAATG
TCTTAAACCAACAAACGAACACGAGGGGAACAGTTCAAAACTTCCTGATCCACTATTTCC
TCGAGTAAAAGAAATGTTTAGTCTTTAATTGTTACACTGGTCTTGTTCTTTCTTTTTGCA
GATTTGTTCACTTGTTTTGTTGCCTCCATTTTTGAACTTTTGATGTGTCTTGTTTCCCGG
AAATTCTGATTCTGGCTTTTACACAAATAATTATTTTGTTTC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL6856Contig1 844 2 6 U
GGAAACATTCATACATCCAACTCTAAGTTCGAGCTTATGTCCGAAGCTTCTTCCTTGCTG
ATACCCAAAGAAAACTCTCCAGCTTCATCAGAATCAATGGCAAACAAATCTCTCACAGGC
CTCGAGAGTCTCATAAAGCTTCTCCCAACAGGAACACTCTTCATTTACCTCTTACTCAAC
CCGGTCCTCACAAACGACGGTGAATGCTCCACATCTAACAAAGTCATGTCAAGCATTCTC
GTCGCTCTTTGCAGCTTCTCATGCGTTTTCTCATGCTTCACCGATAGTTTCAAAGGCGGA
TGGGTCAAGAAAGTATGGTATAGTCACCAGAAAGGGTCTTTGGACTTACGCTGATCCAGG
ATCCGTGGATTTGTCTAAGTACAAGCTTAGGATTGCTGATTTCGTTCACGCGGGTTTCGT
GGTGGCTGTGTTTGGAACGCTTGTGTTACTTGACGCTAATACCGCAAGCTGCTTTTATCC
GCGGTTTCGAGAAACGCAAAAGACTTTGGTCATGGTTTTGCCTGTGGCTGTGGGCGTTGC
CTCGGCAGGTATCTTCGCTATTTTTCCTAGCAAACGGAATGGACTCGGGTATGCTCCAAG
TGGTGAGGAGGAGGAGGAGGAGACCAAGAAAGATTCTGGCTATGCATGAAGCGTATAGTT
GCTTTTGTTGTTTGTGGTCTTGTTCAATATTCATTGTAGAATATAAAAGAAAACGATTGT
ATGCTTAAAATTTTTATTTATTTAAAATGCTTAAAATTTATTTAGTTCTTTTGTAAGTTG
TGACCACAAATGTATATTGTATGGAATCATATAGTATTTCAGAATAAAATACGACGTTAC
CATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2BK61TF U 1
AF RR2BK61JQ C 84
BS 1 686 RR2BK61TF
BS 687 687 RR2BK61JQ
BS 688 707 RR2BK61TF
BS 708 708 RR2BK61JQ
BS 709 729 RR2BK61TF
BS 730 844 RR2BK61JQ

RD RR2BK61TF 730 0 0
GGAAACATTCATACATCCAACTCTAAGTTCGAGCTTATGTCCGAAGCTTCTTCCTTGCTG
ATACCCAAAGAAAACTCTCCAGCTTCATCAGAATCAATGGCAAACAAATCTCTCACAGGC
CTCGAGAGTCTCATAAAGCTTCTCCCAACAGGAACACTCTTCATTTACCTCTTACTCAAC
CCGGTCCTCACAAACGACGGTGAATGCTCCACATCTAACAAAGTCATGTCAAGCATTCTC
GTCGCTCTTTGCAGCTTCTCATGCGTTTTCTCATGCTTCACCGATAGTTTCAAAGGCGGA
TGGGTCAAGAAAGTATGGTATAGTCACCAGAAAGGGTCTTTGGACTTACGCTGATCCAGG
ATCCGTGGATTTGTCTAAGTACAAGCTTAGGATTGCTGATTTCGTTCACGCGGGTTTCGT
GGTGGCTGTGTTTGGAACGCTTGTGTTACTTGACGCTAATACCGCAAGCTGCTTTTATCC
GCGGTTTCGAGAAACGCAAAAGACTTTGGTCATGGTTTTGCCTGTGGCTGTGGGCGTTGC
CTCGGCAGGTATCTTCGCTATTTTTCCTAGCAAACGGAATGGACTCGGGTATGCTCCAAG
TGGTGAGGAGGAGGAGGAGGAGACCAAGAAAGATTCTGGCTATGCATGAAGCGTATAGTT
GCTTTTGTTGTTTGTGGTCTTGTTCA*TATTCATTGTAGAATATAAA*GAAAACGATTGT
ATGCTTAAA
T

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2BK61JQ 761 0 0
TTCATCAGAATCAATGGCAAACAAATCTCTCACAGGCCTCGAGAGTCTCATAAAGCTTCT
CCCAACAGGAACACTCTTCATTTACCTCTTACTCAACCCGGTCCTCACAAACGACGGTGA
ATGCTCCACATCTAACAAAGTCATGTCAAGCATTCTCGTCGCTCTTTGCAGCTTCTCATG
CGTTTTCTCATGCTTCACCGATAGTTTCAAAGGCGGATGGGTCAAGAAAGTATGGTATAG
TCACCAGAAAGGGTCTTTGGACTTACGCTGATCCAGGATCCGTGGATTTGTCTAAGTACA
AGCTTAGGATTGCTGATTTCGTTCACGCGGGTTTCGTGGTGGCTGTGTTTGGAACGCTTG
TGTTACTTGACGCTAATACCGCAAGCTGCTTTTATCCGCGGTTTCGAGAAACGCAAAAGA
CTTTGGTCATGGTTTTGCCTGTGGCTGTGGGCGTTGCCTCGGCAGGTATCTTCGCTATTT
TTCCTAGCAAACGGAATGGACTCGGGTATGCTCCAAGTGGTGAGGAGGAGGAGGAGGAGA
CCAAGAAGGATTCTGGCTATGCATGAAGCGTATAGTTGCTTTTGTTGTTTGTGGTCTTGT
TCAATATTCATTGTAGAATATAAAAGAAAACGATTGTATGCTTAAAATTTTTATTTATTT
AAAATGCTTAAAATTTATTTAGTTCTTTTGTAAGTTGTGACCACAAATGTATATTGTATG
GAATCATATAGTATTTCAGAATAAAATACGACGTTACCATT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL6857Contig1 432 2 2 U
CCATTAACGAGAGTAAAAATATAATCCTAAAAGGTGGTTTAGATTTGATTCCACCACAAT
ATTCCAAACCCTTAAAGACAAATCCAAAACCAAAAGAAAAGCTTTTGATGAGCACACAGA
TTCATCTGCTGCTTCTTCTTACCTTCTCTCTCTCTCTCTTAGCTTAGGATAGAAATTAAT
TTCTAAGATACATAAAAACGCAGGAGAGATGAATCATAGCATCTCTTGCGATCTTCTCAC
ACAGCGACTCACTTTCTTCCTAAACTCTGCTCTGTTGTCTCTCCATTCTTTTGCTGCTTC
CACATTCGCCGGTGACTCGTCGTTGGGACCCGAGAGCATCGATATGATACTCAACACAAT
GCTCTCTACCGTGTGAACAGGGTTCCAACGTTCAGAGGCAAGTTCGTATCCATTAGGATC
ATTACCAGGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CW57TF C 1
AF RR2CW57JQ U 48
BS 1 47 RR2CW57TF
BS 48 432 RR2CW57JQ

RD RR2CW57TF 432 0 0
CCATTAACGAGAGTAAAAATATAATCCTAAAAGGTGGTTTAGATTTGATTCCACCACAAT
ATTCCAAACCCTTAAAGACAAATCCAAAACCAAAAGAAAAGCTTTTGATGAGCACACAGA
TTCATCTGCTGCTTCTTCTTACCTTCTCTCTCTCTCTCTTAGCTTAGGATAGAAATTAAT
TTCTAAGATACATAAAAACGCAGGAGAGATGAATCATAGCATCTCTTGCGATCTTCTCAC
ACAGCGACTCACTTTCTTCCTAAACTCTGCTCTGTTGTCTCTCCATTCTTTTGCTGCTTC
CACATTCGCCGGTGACTCGTCGTTGGGACCCGAGAGCATCGATATGATACTCAACACAAT
GCTCTCTACCGTGTGAACAGGGTTCCAACGTTCAGAGGCAAGTTCGTATCCATTAGGATC
ATTACCAGGAGC

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR2CW57JQ 385 0 0
ATTCCACCACAATATTCCAAACCCTTAAAGACAAATCCAAAACCAAAAGAAAAGCTTTTG
ATGAGCACACAGATTCATCTGCTGCTTCTTCTTACCTTCTCTCTCTCTCTCTTAGCTTAG
GATAGAAATTAATTTCTAAGATACATAAAAACGCAGGAGAGATGAATCATAGCATCTCTT
GCGATCTTCTCACACAGCGACTCACTTTCTTCCTAAACTCTGCTCTGTTGTCTCTCCATT
CTTTTGCTGCTTCCACATTCGCCGGTGACTCGTCGTTGGGACCCGAGAGCATCGATATGA
TACTCAACACAATGCTCTCTACCGTGTGAACAGGGTTCCAACGTTCAGAGGCAAGTTCGT
ATCCATTAGGATCATTACCAGGAGC

QA 1 385 1 385
DS 



AS 1 2

CO CL6858Contig1 675 2 1 U
CTGCTGCTTGCTTTACACACAGACAGGAAAGCTCAACAAAAATGGTGCGGTGCGAGGAGA
TTTGCCTCTCCGGTGGACTCGTCCGCCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTCCGCAAGC
GTATGAACACCAAACCTTCCCACGGGCCCATTCACTTCCGTGCTCCTTCCAAAATCTTCT
GGCGCACTGTTCGCTGTATGATTCCACACAAAACGAAGCGTGGAGCTGCGGCACTTGCCC
GGATGAAGGTTTTCGAAGGTGTGCCTCCACCATATGACAAGGTCAAGAGGATGGTTATCC
CCGATGCTCTCAAGGTGTTGAGGCTTCAAGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGTCGCC
TTTCTTCTGAAGTCGGGTGGAACCACTATGACACCATCAAAGAGCTGGAGACGAAGAGGA
AGGAGAGATCTCAAGTGGTCTACGAGAGAAAGAAGCAACTTAACAAACTTAGAGCCAAGG
CTGAGAAGGTTGCCGAAGAGAAGCTCGGTGCACAGCTCCAAATTCTTGCACTAGTTAAGT
ACTGAGAGAATCATCATCATCATCATCACTAGTTGTGTTGTACTCTTCGCATGTTTTTGA
ACCGACCTATCACACTTTATTATTACTTAGGGTGTTGTATGAGATTTTGTCCTGATATTA
TCTTTCTCGAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CK35TF U 1
AF RR2CK35JQ C 55
BS 1 675 RR2CK35TF

RD RR2CK35TF 675 0 0
CTGCTGCTTGCTTTACACACAGACAGGAAAGCTCAACAAAAATGGTGCGGTGCGAGGAGA
TTTGCCTCTCCGGTGGACTCGTCCGCCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTCCGCAAGC
GTATGAACACCAAACCTTCCCACGGGCCCATTCACTTCCGTGCTCCTTCCAAAATCTTCT
GGCGCACTGTTCGCTGTATGATTCCACACAAAACGAAGCGTGGAGCTGCGGCACTTGCCC
GGATGAAGGTTTTCGAAGGTGTGCCTCCACCATATGACAAGGTCAAGAGGATGGTTATCC
CCGATGCTCTCAAGGTGTTGAGGCTTCAAGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGTCGCC
TTTCTTCTGAAGTCGGGTGGAACCACTATGACACCATCAAAGAGCTGGAGACGAAGAGGA
AGGAGAGATCTCAAGTGGTCTACGAGAGAAAGAAGCAACTTAACAAACTTAGAGCCAAGG
CTGAGAAGGTTGCCGAAGAGAAGCTCGGTGCACAGCTCCAAATTCTTGCACTAGTTAAGT
ACTGAGAGAATCATCATCATCATCATCACTAGTTGTGTTGTACTCTTCGCATGTTTTTGA
ACCGACCTATCACACTTTATTATTACTTAGGGTGTTGTATGAGATTTTGTCCTGATATTA
TCTTTCTCGAGTTCC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2CK35JQ 621 0 0
AGGAGATTTGCCTCTCCGGTGGACTCGTCCGCCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTCC
GCAAGCGTATGAACACCAAACCTTCCCACGGGCCCATTCACTTCCGTGCTCCTTCCAAAA
TCTTCTGGCGCACTGTTCGCTGTATGATTCCACACAAAACGAAGCGTGGAGCTGCGGCAC
TTGCCCGGATGAAGGTTTTCGAAGGTGTGCCTCCACCATATGACAAGGTCAAGAGGATGG
TTATCCCCGATGCTCTCAAGGTGTTGAGGCTTCAAGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGG
GTCGCCTTTTTTCTGAAGTCGGGTGGAACCACTATGACACCATCAAAGAGCTGGAGACGA
AGAGGAAGGAGAGATCTCAAGTGGTTTACGAGAGAAAGAAGCAACTTAACAAACTTAGAG
CCAAGGCTGAGAAGGTTGCCGAAGAGAAGCTCGGTGCACAGCTCCAAATTCTTGCACTAG
TTAAGTACTGAGAGAATCATCATCATCATCATCACTAGTTGTGTTGTACTCTTCGCATGT
TTTTGAACCGACCTATCACACTTTATTATTACTTAGGGTGTTGTATGAGATTTTGTCCTG
ATATTATCTTTCTCGAGTTCC

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

CO CL6859Contig1 710 2 6 U
CTCTCAAACCCGAGTCTTGTCTGAAGAAAGCAGAATCAATCCATGTCTTTCCGAGGAGTT
CGCAAGCCAAATGCAACATCTGGAATGGGTGTTGCGGATCAGAGCAAGACCACATACCAC
GAGCTCCAGAGGAAGAAGACTCATCGCTACGTCGTGTTCAAGATCGATGAGCTCAAAAAT
CAAGTGGTGGTTGAGAAAACAGGGAACCCAGCAGAGAGCTACGACGACTTCTTAGCTTCT
CTCCCCGACAATGATTGCAGATACGCTGTTTACGACTTTGATTTCGCCACCTCTGAGAAT
TGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCGTCGCTTGGTCTCCATCGACTTCTAGAATAAGAGCG
AAGATGCTTTACGCGACATCTAAAGAGAGGTTTAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCACTAC
GAGATTCAGGCTACTGATCCTACTGAGGTTGATCTTGATGTCCTTCGCGAACGAGCCAAC
TGAGGGATATTTATTTGTTCTCTATTTAAGAAAAAAAAATACTTTTTATGGTGTAATGTA
ATGAAAATAATCATTCGGATTTCTCGTAATTCTCGTGGGTACATTTGTGTAACCACAGTT
TCTTGTTCTATGGACAAGTGTATTATTAAACTCCAGTTGATGTTTCAGATTACTCATCTA
TAAACAAGCCTCTTTGTAACTTAGTGTGTTATAACCTGACCGGTGTTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY31TFB U 1
AF RR2AZ56TFB U 1
BS 1 30 RR2AY31TFB
BS 31 31 RR2AZ56TFB
BS 32 149 RR2AY31TFB
BS 150 150 RR2AZ56TFB
BS 151 646 RR2AY31TFB
BS 647 710 RR2AZ56TFB

RD RR2AY31TFB 646 0 0
CTCTCAAACCCGAGTCTTGTCTGAAGAAAGTAGAATCAATCCATGTCTTTCCGAGGAGTT
CGCAAGCCAAATGCAACATCTGGAATGGGTGTTGCGGATCAGAGCAAGACCACATACCAC
GAGCTCCAGAGGAAGAAGACTCATCGCTATGTCGTGTTCAAGATCGATGAGCTCAAAAAT
CAAGTGGTGGTTGAGAAAACAGGGAACCCAGCAGAGAGCTACGACGACTTCTTAGCTTCT
CTCCCCGACAATGATTGCAGATACGCTGTTTACGACTTTGATTTCGCCACCTCTGAGAAT
TGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCGTCGCTTGGTCTCCATCGACTTCTAGAATAAGAGCG
AAGATGCTTTACGCGACATCTAAAGAGAGGTTTAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCACTAC
GAGATTCAGGCTACTGATCCTACTGAGGTTGATCTTGATGTCCTTCGCGAACGAGCCAAC
TGAGGGATATTTATTTGTTCTCTATTTAAGAAAAAAAAATACTTTTTATGGTGTAATGTA
ATGAAAATAATCATTCGGATTTCTCGTAATTCTCGTGGGTACATTTGTGTAACCACAGTT
TCTTGTTCTATGGACAAGTGTATTATTAAACTCCAGTTGATGTTTC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2AZ56TFB 710 0 0
CTCTCAAACCCGAGTCTTGTCTGAAGAAAGCAGAATCAATCCATGTCTTTCCGAGGAGTT
CGCAAGCCAAATGCAACATCTGGAATGGGTGTTGCGGATCAGAGCAAGACCACATACCAC
GAGCTCCAGAGGAAGAAGACTCATCGCTACGTCGTGTTCAAGATCGATGAGCTCAAAAAT
CAAGTGGTGGTTGAGAAAACAGGGAACCCAGCAGAGAGCTACGACGACTTCTTAGCTTCT
CTCCCCGACAATGATTGCAGATACGCTGTTTACGACTTTGATTTCGTCACCTCTGAGAAT
TGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCGTCGCTTGGTCTCCATCGACTTCTAGAATAAGAGCG
AAGATGCTTTACGCGACATCTAAAGAGAGGTTTAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCACTAC
GAGATTCAGGCTACTGATCCTACTGAGGTTGATCTTGATGTCCTTCGCGAACGAGCCAAC
TGAGGGATATTTATTTGTTCTCTATTTAAGAAAAAAAAATACTTTTTATGGTGTAATGTA
ATGAAAATAATCATTCGGATTTCTCGTAATTCTCGTGGGTACATTTGTGTAACCACAGTT
TCTTGTTCTATGGACAAGTGTATTATTAAACTCCAGTTGATGTTTCAGATTACTCATCTA
TAAACAAGCCTCTTTGTAACTTAGTGTGTTATAACCTGACCGGTGTTTTT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL6860Contig1 652 2 3 U
GGGGTACTTTCATTTGCTGAAGAATTTAGTAAGCAAGTTAGTATGTTGGATTCAAAATTG
TACCTTATCTTGTTTCATGTGAGAAGCCGAGCTGTGCTCAGCTCGTTTGATATCGTCGAC
GAACATTATCAAGGTTGGGTGGACTTGTTGTTGTTTCATCAAGTTATTGAACACGCCGCC
AGGTTCGCCGATTTTGCCACTGTCTACGATACGTGGGTGTTGTTCAGGGATAGACTCCTT
CCCGATGAATACTTCGCAGACGCAACGTATGAAAATACGTATTGTCCATCTGCTGAAGCT
TACGGGTATGATGATATAGACGTGGACTATACCACTATCGATTACGCGAGCATTTGTGCA
GCCGTTGACAGTGATGCCACTATAAATAGTGAGATTCCCGAACCAACAGATTACCAGTTG
ACATGTAATGAATATTTCATGCCATCTGGGGAGGTCTGGAAGTCGGATGACAGTGATAAA
TCATCCGTGAATGAGGAGCTTCAGGGAGTTCCTCTTCGAGATTTGGATGTTTCCACCATA
GAAGATATTCCTGTCTGTGAAGATCAGGAAGACTTCGATGGTGATGATAGGGAGTTGTCC
TGGATAAATCCGGACGATCCCACCGATGATAATATCGTTGCAGATGCCGATC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2AQ27TF U 1
AF RR2F962TF U 2
BS 1 629 RR2AQ27TF
BS 630 631 RR2F962TF
BS 632 652 RR2AQ27TF

RD RR2AQ27TF 652 0 0
GGGGTACTTTCATTTGCTGAAGAATTTAGTAAGCAAGTTAGTATGTTGGATTCAAAATTG
TACCTTATCTTGTTTCATGTGAGAAGCCGAGCTGTGCTCAGCTCGTTTGATATCGTCGAC
GAACATTATCAAGGTTGGGTGGACTTGTTGTTGTTTCATCAAGTTATTGAACACGCCGCC
AGGTTCGCCGATTTTGCCACTGTCTACGATACGTGGGTGTTGTTCAGGGATAGACTCCTT
CCCGATGAATACTTCGCAGACGCAACGTATGAAAATACGTATTGTCCATCTGCTGAAGCT
TACGGGTATGATGATATAGACGTGGACTATACCACTATCGATTACGCGAGCATTTGTGCA
GCCGTTGACAGTGATGCCACTATAAATAGTGAGATTCCCGAACCAACAGATTACCAGTTG
ACATGTAATGAATATTTCATGCCATCTGGGGAGGTCTGGAAGTCGGATGACAGTGATAAA
TCATCCGTGAATGAGGAGCTTCAGGGAGTTCCTCTTCGAGATTTGGATGTTTCCACCATA
GAAGATATTCCTGTCTGTGAAGATCAGGAAGACTTCGATGGTGATGATAGGGAGTTGTCC
TGGATAAATCCGGACGATCCCACCGATGA**ATATCGTTGCAGATGCCGATC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RR2F962TF 651 0 0
GGGTACTTTCATTTGCTGAAGAATTTAGTAAGCAAGTTAGTATGTTGGATTCAAAATTGT
ACCTTATCTTGTTTCATGTGAGAAGCCGAGCTGTGCTCAGCTCGTTTGATATCGTCGACG
AACATTATCAAGGTTGGGTGGACTTGTTGTTGTTTCATCAAGTTATTGAACACGCCGCCA
GGTTCGCCGATTTTGCCACTGTCTACGATACGTGGGTGTTGTTCAGGGATATACTCCTTC
CCGATGAATACTTCGCAGACGCAACGTATGAAAATACGTATTGTCCATCTGCTGAAGCTT
ACGGGTATGATGATCTAGACGTGGACTATACCACTATCGATTACGCGAGCATTTGTGCAG
CCGTTGACAGTGATGCCACTATAAATAGTGAGATTCCCGAACCAACAGATTACCAGTTGA
CATGTAATGAATATTTCATGCCATCTGGGGAGGTCTGGAAGTCGGATGACAGTGATAAAT
CATCCGTGAATGAGGAGCTTCAGGGAGTTCCTCTTCGAGATTTGGATGTTTCCACCATAG
AAGATATTCCTGTCTGTGAAGATCAGGAAGACTTCGATGGTGATGATAGGGAGTTGTCCT
GGATAAATCCGGACGATCCCACCGATGATAATATCGTTGCAGATGCCGATC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL6861Contig1 885 2 10 U
GGATCCATATAAAAACACTAAGACAAATATATACATATATTAAGAAAAATGCTTGACACA
CTTGTCGGTGGGTACGGGCACGGGTTCGGCCGCAAGGATCACATAAGCAGTGGTTACGGC
TTCGAGGGGCACAATGAGTTTGTGTCGCATGAGGACTCAGGAAGTGGCCACTTTGATCGT
CAATCCCGCTACGACCACCAAATGAGCCTTCCGGCTAACCACGGCCGTCCACCCAGTGGC
GGACCCAGGAATATTTTTTACCTGGGTCATGATTTTTATTGTAAATCCAACAGTAACAAA
AAGCCCAGACAATAGCATGGTTTTCTTTTTGAAAAACTTAAAAATGGGTGCAGCAGGGGG
TTTGAACCCGTGTTAGGGGTGTCAAAGTGTTAAGAGTCCGAACCAGTTGAGCTGCTTTAG
AATACAAAATTAGGCTTACCATTCAATTTCTTAAATTTAACCTGTTGCAGTTGACCCCCC
TTTTCTCTACGTGGGTCCGCCACTGCGTCCACCCATGGCTCGCATGCCTCCCTGTGATGA
AGAATACTCAGACGATGATGAGTTCATTAAGAGAAGCAGTAGCCACCAGACTACTGTGTT
GTCGCATCACCAGCAGAAACCCCATATGAACTTGGCTCAGCCTCACCACAACGTAAGCTA
TCTTCTCTGGTGTTGAGACCTTACTAGTCATGTTATGTTGAATATATTCTTTCCAAGTGC
CTTCAAACATTTTAAAAGGAAACATGCACTATGGGAGTTTTGCCCGTGGCGACACAATGA
AAACATTAGTACACACCACTAGTAAAAAGGTTCCATGTTTTGTTGGTATATTTATGATTG
ATGTTGTAAATTTAGGGTTTTAAAAAGAAAATTAATGACAGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM65TF U 1
AF RR2FM65JQ C 496
BS 1 679 RR2FM65TF
BS 680 680 RR2FM65JQ
BS 681 726 RR2FM65TF
BS 727 727 RR2FM65JQ
BS 728 738 RR2FM65TF
BS 739 740 RR2FM65JQ
BS 741 760 RR2FM65TF
BS 761 761 RR2FM65JQ
BS 762 771 RR2FM65TF
BS 772 885 RR2FM65JQ

RD RR2FM65TF 771 0 0
GGATCCATATAAAAACACTAAGACAAATATATACATATATTAAGAAAAATGCTTGACACA
CTTGTCGGTGGGTACGGGCACGGGTTCGGCCGCAAGGATCACATAAGCAGTGGTTACGGC
TTCGAGGGGCACAATGAGTTTGTGTCGCATGAGGACTCAGGAAGTGGCCACTTTGATCGT
CAATCCCGCTACGACCACCAAATGAGCCTTCCGGCTAACCACGGCCGTCCACCCAGTGGC
GGACCCAGGAATATTTTTTACCTGGGTCATGATTTTTATTGTAAATCCAACAGTAACAAA
AAGCCCAGACAATAGCATGGTTTTCTTTTTGAAAAACTTAAAAATGGGTGCAGCAGGGGG
TTTGAACCCGTGTTAGGGGTGTCAAAGTGTTAAGAGTCCGAACCAGTTGAGCTGCTTTAG
AATACAAAATTAGGCTTACCATTCAATTTCTTAAATTTAACCTGTTGCAGTTGACCCCCC
TTTTCTCTACGTGGGTCCGCCACTGCGTCCACCCATGGCTCGCATGCCTCCCTGTGATGA
AGAATACTCAGACGATGATGAGTTCATTAAGAGAAGCAGTAGCCACCAGACTACTGTGTT
GTCGCATCACCAGCAGAAACCCCATATGAACTTGGCTCAGCCTCACCACAACGTAAGCTA
TCTTCTCTGGTGTTGAGAC*TTACTAGTCATGTTATGTTGAATATATTCTTTCCAAGTGC
CTTCAA*CATTTTAAAAG**AACATGCACTATGGGAGTTT*GCCCGTGGCG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2FM65JQ 390 0 0
TCCGCCACTGCGTCCACCCATGGCTCGCATGCCTCCCTGTGATGAAGAATACTCAGACGA
TGATGAGTTCATTAAGAGAAGCAGTAGCCACCAGACTACTGTGTTGTCGCATCACCAGCA
GAAACCCCATATGAACTTGGTTCAGCCTCACCACAACGTAAGCTATCTTTTCTGGTGTTG
AGACCTTACTAGTCATGTTATGTTGAATATATTCTTTCCAAGTGCCTTCAAACATTTTAA
AAGGAAACATGCACTATGGGAGTTTTGCCCGTGGCGACACAATGAAAACATTAGTACACA
CCACTAGTAAAAAGGTTCCATGTTTTGTTGGTATATTTATGATTGATGTTGTAAATTTAG
GGTTTTAAAAAGAAAATTAATGACAGTGAC

QA 1 390 1 390
DS 



AS 1 2

CO CL6862Contig1 757 2 5 U
GACATGGACTGTCCACTACAGAGGAGGCTTAGCTCTTTCCTCCGATAACAAAGATCTCAT
CTTCAATGTTCATCCAGTTTTGATGGTGATTGGGCTCGTACTCTTCAATGGTGAAGCTAT
GCTAGCATACAAGTCAGTTCAAGGTACAAAGAACTTGAAGAAACTGGTTCATCTTACACT
GCAATTCGCAGCTTTTATCCTAAGTTTAGTCGGAGTCTGGGCTGCTCTTAAGTTCCATAT
CGACAAAGGGATTGAAAATTTCTACAGTCTGCATTCATGGCTCGGCTTAGCTTGTCTCTT
TCTCTTCGCTTTTCAGTGGGCTTCAGGGTTTGTGACTTACTGGTACCCGGGTGGTTCAAG
AAACAGCCGAGCCAGCTTAATGCCTTGGCACGTGTTCTTTAGGGGTTGCCATCTATGCAT
TGGCACTGGTGACTGTAACTACAGGGATACTGGAGAAGTTGACGTTCCTGCAAGTGAACC
AGGTGATAACTCGGTATTCTACAGAGGCCATGTTAGTTAACACGATGGGTGTTCTGATTC
TTGTTCTCGGCGGTTTCGTGGTGCTCGGTGTGTTTACTCCACTCCACGGCAAAGACCAAG
TCCTTACTCAATAGAGAGAACAAATACTTTTCGTTTTTTTTTGTGCACCAAATACTTTTC
TTACAATCGCAATTTTCTTTCAACATTTGGACCTTTTTCGAATCATCTGCGATAAAAACT
TGTTACATATATTTAATCAGAGCCCTTATTAAGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G153TF U 358
AF RR2G153JQ C 1
BS 1 357 RR2G153JQ
BS 358 482 RR2G153TF
BS 483 483 RR2G153JQ
BS 484 506 RR2G153TF
BS 507 757 RR2G153JQ

RD RR2G153TF 152 0 0
AAGAAACAGCCGAGCCAGCTTAATGCCTTGGCACGTGTTCTTTAGGGGTTGCCATCTATG
CATTGGCACTGGTGACTGTAACTACAGGGATACTGGAGAAGTTGACGTTCCTGCAAGTGA
ACCAG*TGATAACTCGGTATTCTACAGAG
CCA

QA 1 149 1 149
DS 

RD RR2G153JQ 757 0 0
GACATGGACTGTCCACTACAGAGGAGGCTTAGCTCTTTCCTCCGATAACAAAGATCTCAT
CTTCAATGTTCATCCAGTTTTGATGGTGATTGGGCTCGTACTCTTCAATGGTGAAGCTAT
GCTAGCATACAAGTCAGTTCAAGGTACAAAGAACTTGAAGAAACTGGTTCATCTTACACT
GCAATTCGCAGCTTTTATCCTAAGTTTAGTCGGAGTCTGGGCTGCTCTTAAGTTCCATAT
CGACAAAGGGATTGAAAATTTCTACAGTCTGCATTCATGGCTCGGCTTAGCTTGTCTCTT
TCTCTTCGCTTTTCAGTGGGCTTCAGGGTTTGTGACTTACTGGTACCCGGGTGGTTCAAG
AAACAGCCGAGCCAGCTTAATGCCTTGGCACGTGTTCTT*AGGGGTTGCCATCTATGCAT
TGGCACTGGTGACTGTAACTACAGGGATACTGGAGAAGTTGACGTTCCTGCAAGTGAACC
AGGTGATAACTCGGTATTCTACAGAGGCCATGTTAGTTAACACGATGGGTGTTCTGATTC
TTGTTCTCGGCGGTTTCGTGGTGCTCGGTGTGTTTACTCCACTCCACGGCAAAGACCAAG
TCCTTACTCAATAGAGAGAACAAATACTTTTCGTTTTTTTTTGTGCACCAAATACTTTTC
TTACAATCGCAATTTTCTTTCAACATTTGGACCTTTTTCGAATCATCTGCGATAAAAACT
TGTTACATATATTTAATCAGAGCCCTTATTAAGAACC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL6863Contig1 1103 2 2 U
GGAAAGCTATGTCTTAATATCCATCCCCTCTCTTCTTCTTCGGTTCTGTAATAGTGTTAT
ATGGATTTAGCTTTAAGCAAAAACGGTTTTAATTTCGCTCTAAGAAACAAAAAGTGGATT
CTTCTCGCAGCCACTGGTTATGGCGCCTTTAAGGTTTATCATTCCCAGAAAAGGAAGCGA
ATCTCTAACCTCTTCGCTCTCCTCTTCAACCTCGTCGAAGCAGCCTCTCGCTCCGCCGAA
GCCGTTAGCGTAATCGCCAAGGATCTCACGGAGTTCCTCAGATCCGACTCCGACCAGATC
CCGAACAGCTTCAAGCAGGTCTCCAAGCTCGCCAAATCCGACGAGCTCAGTTCTTCTCTG
ATCAGACTCACTCAAGCCGTCACCGTCGGATTGCTCAGAGGATCCGGTGATGATTCCGGG
TCGGGTTTCGCGGATCGGGTTATGGATAAGCTGTTCACGAAACCCGGTACGGGTTTCGCT
TCGGCGATCGGAAGCTTCGCTAGAAACTTAGTCCTCGCGCTCTCTTCCTCCTCTGGTGAA
TCTTCGAAACTGCGCGACGCGGTTTGCTCCGACGACGGTAGAAAGCTGATCGGCGATTGC
GTTCAGCGTTTCGTCAGCACTGCGGTTTCGGTTTATTTGGACGAGACGAGGGGCGTCAAC
GTGTTCGACGATTTATTCGCCGGTTTAACTAACCCGAAACACGAGGATAAGGTTATGCAA
ACACTGGTAACGGTATGCAACGCTGCGGTCGAAACGTTTGTGAGAGCGTCGAGAAGACGA
GCGACGGAACCGGGATCGGACCGGTCGTTAACCGTTGGATCTAAACCGATACCTACGTGG
ATCGACCGGGTTTCGTCGTCGTTGGCTGTACCGAGTAACCGGAAATACGTGGTGGATTTA
ACCGGGAGGGTGACGTTTGAGACGGTTAGATCGCTTTTAGAAGTGTTGGTGGAGAGAGCG
AATGGTAAAGTAGAGAGTTACGTGGAGAAAGTGAGAGAGAGAGGGAACGAGACGAGGAGA
TTCGTGAGAGTTAAATCATCGCTTCTGCATAGTTTATGTTTGTCTATGTGTTTACAGATT
GTTGAAGCTCCTTGGATACTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A256TF U 1
AF RR2A256JQ C 342
BS 1 782 RR2A256TF
BS 783 1103 RR2A256JQ

RD RR2A256TF 782 0 0
GGAAAGCTATGTCTTAATATCCATCCCCTCTCTTCTTCTTCGGTTCTGTAATAGTGTTAT
ATGGATTTAGCTTTAAGCAAAAACGGTTTTAATTTCGCTCTAAGAAACAAAAAGTGGATT
CTTCTCGCAGCCACTGGTTATGGCGCCTTTAAGGTTTATCATTCCCAGAAAAGGAAGCGA
ATCTCTAACCTCTTCGCTCTCCTCTTCAACCTCGTCGAAGCAGCCTCTCGCTCCGCCGAA
GCCGTTAGCGTAATCGCCAAGGATCTCACGGAGTTCCTCAGATCCGACTCCGACCAGATC
CCGAACAGCTTCAAGCAGGTCTCCAAGCTCGCCAAATCCGACGAGCTCAGTTCTTCTCTG
ATCAGACTCACTCAAGCCGTCACCGTCGGATTGCTCAGAGGATCCGGTGATGATTCCGGG
TCGGGTTTCGCGGATCGGGTTATGGATAAGCTGTTCACGAAACCCGGTACGGGTTTCGCT
TCGGCGATCGGAAGCTTCGCTAGAAACTTAGTCCTCGCGCTCTCTTCCTCCTCTGGTGAA
TCTTCGAAACTGCGCGACGCGGTTTGCTCCGACGACGGTAGAAAGCTGATCGGCGATTGC
GTTCAGCGTTTCGTCAGCACTGCGGTTTCGGTTTATTTGGACGAGACGAGGGGCGTCAAC
GTGTTCGACGATTTATTCGCCGGTTTAACTAACCCGAAACACGAGGATAAGGTTATGCAA
ACACTGGTAACGGTATGCAACGCTGCGGTCGAAACGTTTGTGAGAGCGTCGAGAAGACGA
GC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RR2A256JQ 762 0 0
CGAGCTCAGTTCTTCTCTGATCAGACTCACTCAAGCCGTCACCGTCGGATTGCTCAGAGG
ATCCGGTGATGATTCCGGGTCGGGTTTCGCGGATCGGGTTATGGATAAGCTGTTCACGAA
ACCCGGTACGGGTTTCGCTTCGGCGATCGGAAGCTTCGCTAGAAACTTAGTCCTCGCGCT
CTCTTCCTCCTCTGGTGAATCTTCGAAACTGCGCGACGCGGTTTGCTCCGACGACGGTAG
AAAGCTGATCGGCGATTGCGTTCAGCGTTTCGTCAGCACTGCGGTTTCGGTTTATTTGGA
CGAGACGAGGGGCGTCAACGTGTTCGACGATTTATTCGCCGGTTTAACTAACCCGAAACA
CGAGGATAAGGTTATGCAAACACTGGTAACGGTATGCAACGCTGCGGTCGAAACGTTTGT
GAGAGCGTCGAGAAGACGAGCGACGGAACCGGGATCGGACCGGTCGTTAACCGTTGGATC
TAAACCGATACCTACGTGGATCGACCGGGTTTCGTCGTCGTTGGCTGTACCGAGTAACCG
GAAATACGTGGTGGATTTAACCGGGAGGGTGACGTTTGAGACGGTTAGATCGCTTTTAGA
AGTGTTGGTGGAGAGAGCGAATGGTAAAGTAGAGAGTTACGTGGAGAAAGTGAGAGAGAG
AGGGAACGAGACGAGGAGATTCGTGAGAGTTAAATCATCGCTTCTGCATAGTTTATGTTT
GTCTATGTGTTTACAGATTGTTGAAGCTCCTTGGATACTGAC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL6864Contig1 604 2 1 U
GGACAGACAGAAGGTGAAGCAAAAATGGTGTCGGGATCAGGTATATGCTCGAAGCGCGTG
GTCGTGGACGCGCGCCACCACATGCTGGGGCGTCTGGCGTCGATCGTGGCCAAGGAGCTG
CTCAACGGGCAGAAGGTCGTCATCGTTAGATGCGAGGAGATTTGCCTCTCCGGTGGACTC
GTCCGCCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTTCGCAAACGTATGAACACCAAGCCTTCT
CACGGACCCATTCACTTCCGTGCTCCTTCCAAGATCTTCTGGCGTACTGTTCGCGGTATG
ATTCCACACAAAACGAAGCGTGGAGCAGCTGCACTTGCACGCATGAAGGTGTTTGAAGGT
GTGCCTCCACCGTATGACAAGGTCAAGAGGATGGTCATCCCCGATGCTCTGAAGAGAAGC
TTGGAGCACAGCTCGAGATTCTTGCACCAGTCAAGTACTGAGATGATCACTAGTAGTTTG
TCTTTGCATGTTTTGTGCCGACCTTCAATACTTTTTTCACTTTCACTTAGGTGTTGTATC
GGATTTTGCCCTAATGTTTTCTTTCCTGAGTTACAATCTATTTATATTTCATGTCTTTCT
ACAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2B470JQ C 1
AF RR2B470TF U 1
BS 1 604 RR2B470TF

RD RR2B470JQ 604 0 0
GGACAGACAGAAGGTGAAGCAAAAATGGTGTCGGGATCAGGTATATGCTCGAAGCGCGTG
GTCGTGGACGCGCGCCACCACATGCTGGGGCGTCTGGCGTCGATCGTGGCCAAGGAGCTG
CTCAACGGGCAGAAGGTCGTCATCGTTAGATGCGAGGAGATTTGCCTCTCCGGTGGACTC
GTCCGCCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTTCGCAAACGTATGAACACCAAGCCTTCT
CACGGACCCATTCACTTCCGTGCTCCTTCCAAGATCTTCTGGCGTACTGTTCGCGGTATG
ATTCCACACAAAACGAAGCGTGGAGCAGCTGCACTTGCACGCATGAAGGTGTTTGAAGGT
GTGCCTCCACCGTATGACAAGGTCAAGAGGATGGTCATCCCCGATGCTCTGAAGAGAAGC
TTGGAGCACAGCTCGAGATTCTTGCACCAGTCAAGTACTGAGATGATCACTAGTAGTTTG
TCTTTGCATGTTTTGTGCCGACCTTCAATACTTTTTTCACTTTCACTTAGGTGTTGTATC
GGATTTTGCCCTAATGTTTTCTTTCCTGAGTTACAATCTATTTATATTTCATGTCTTTCT
ACAC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2B470TF 604 0 0
GGACAGACAGAAGGTGAAGCAAAAATGGTGTCGGGATCAGGTATATGCTCGAAGCGCGTG
GTCGTGGACGCGCGCCACCACATGCTGGGGCGTCTGGCGTCGATCGTGGCCAAGGAGCTG
CTCAACGGGCAGAAGGTCGTCATCGTTAGATGCGAGGAGATTTGCCTCTCCGGTGGACTC
GTCCGCCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTTCGCAAACGTATGAACACCAAGCCTTCT
CACGGACCCATTCACTTCCGTGCTCCTTCCAAGATCTTCTGGCGTACTGTTCGCGGTATG
ATTCCACACAAAACGAAGCGTGGAGCAGCTGCACTTGCACGCATGAAGGTGTTTGAAGGT
GTGCCTCCACCGTATGACAAGGTCAAGAGGATGGTCATCCCCGATGCTCTGAAGAGAAGC
TTGGAGCACAGCTCGAGATTCTTGCACCAGTCAAGTACTGAGATGATCACTAGTAGTTTG
TCTTTGCATGTTTTGTGCCGACCTTCAATACTTTTTTCACTTTCACTTAGGTGTTGTATC
GGATTTTGCCCTAATGTTTTCTTTCCTGAGTTACAATCTATTTATATTTCATGTCTTTCT
ACAC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL6865Contig1 1020 2 2 U
GGAACCTCATCAAGAAAGGTAAAAGAAACATGAAAACTAACGATCATATCCCCTTGAGCT
TAGTCTTCATATTTTCACTTCTTTACTTCCCCTACTTAGCCATATCCGAAACGCCCTGTC
CGTACCCGTGTTATCCGCCGCCCATTGGCGGTGGTTCCTCCACGAACCAACCACCACCAT
ATCCTCCTCCAGCTTTTAACTACCCTTATCCAGCTGAAAATTTACCAAATTACCCTTCAC
CACCGTACGCTGGTGAAGGCGGAGGCGGTGATAGCAGTATCTATGGTCCTCCACCGCCGG
ATGCTACCTTGCCTTACTTCCCCTACTACTTTAGAAAACCTCCTCACCAGACGGATCAAA
CGTCCTCGTCTCCACTTGTAGCGGTTTCAGGAAAATTGACGGTCATGGATCCTAGTGAAG
AGATGAGAGCTATGAAGGCGCAGAAGGACCACTACGATTCCCTGCATTTTGTAACCGACT
CGATGCAAGGAATTCAAGAACGCTGTGTTTGTGGGCAACGCTTAGTGCGCGAGAGAGCTC
CAGCAGAAGTCTATGACTACCTACCAGGGAAGAGGTTCTTCACTTGCAAGGAGTACAAAG
ATGATGGGATGCATTACAGGCAGCCCTGGGTGTGTGCAGTCGAGGAAGAGATAGGGTTCT
TGAAAACAAGGGTGGAAAAAAAATGAGGAGCATAAATCGCTGGTGATAAAGCTGGAAGTC
AAGAATCTGGTGTTGAAGGCAGAGGTGGAGAAGCTCATAGAACGAGTGTCTGAGCTTGAG
AGGTGGAGAAGCTCATAAGCCGAGTGTCTGATGAGCTTGAGTATGGCAGCTCACAAGGTG
GAATAGAAGAGCACGGGAGCAGAGAGGATTCTGCTATCTTTTGTTGTTTTATGTCATGTG
AACCTATCTATCCCTTGTTGTTTTATGTCATGTGAACCTATGTTTTTATTTCTGTTGTCA
TGTGAACTTATATTTCTCTATTTAAAACCTATGTAAACTTCTGTTTGTTTATCTCTATTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK56TF U 1
AF RR2BK56JQ C 493
BS 1 651 RR2BK56TF
BS 652 1020 RR2BK56JQ

RD RR2BK56TF 651 0 0
GGAACCTCATCAAGAAAGGTAAAAGAAACATGAAAACTAACGATCATATCCCCTTGAGCT
TAGTCTTCATATTTTCACTTCTTTACTTCCCCTACTTAGCCATATCCGAAACGCCCTGTC
CGTACCCGTGTTATCCGCCGCCCATTGGCGGTGGTTCCTCCACGAACCAACCACCACCAT
ATCCTCCTCCAGCTTTTAACTACCCTTATCCAGCTGAAAATTTACCAAATTACCCTTCAC
CACCGTACGCTGGTGAAGGCGGAGGCGGTGATAGCAGTATCTATGGTCCTCCACCGCCGG
ATGCTACCTTGCCTTACTTCCCCTACTACTTTAGAAAACCTCCTCACCAGACGGATCAAA
CGTCCTCGTCTCCACTTGTAGCGGTTTCAGGAAAATTGACGGTCATGGATCCTAGTGAAG
AGATGAGAGCTATGAAGGCGCAGAAGGACCACTACGATTCCCTGCATTTTGTAACCGACT
CGATGCAAGGAATTCAAGAACGCTGTGTTTGTGGGCAACGCTTAGTGCGCGAGAGAGCTC
CAGCAGAAGTCTATGACTACCTACCAGGGAAGAGGTTCTTCACTTGCAAGGAGTACAAAG
ATGATGGGATGCATTACAGGCAGCCCTGGGTGTGTGCAGTCGAGGAAGAGA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2BK56JQ 528 0 0
TTCAAGAACGCTGTGTTTGTGGGCAACGCTTAGTGCGCGAGAGAGCTCCAGCAGAAGTTT
ATGACTACCTACCAGGGAAGAGGTTTTTCACTTGCAAGGAGTACAAAGATGATGGGATGC
ATTACAGGCAGCCCTGGGTGTGTGCAGTCGAGGAAGAGATAGGGTTCTTGAAAACAAGGG
TGGAAAAAAAATGAGGAGCATAAATCGCTGGTGATAAAGCTGGAAGTCAAGAATCTGGTG
TTGAAGGCAGAGGTGGAGAAGCTCATAGAACGAGTGTCTGAGCTTGAGAGGTGGAGAAGC
TCATAAGCCGAGTGTCTGATGAGCTTGAGTATGGCAGCTCACAAGGTGGAATAGAAGAGC
ACGGGAGCAGAGAGGATTCTGCTATCTTTTGTTGTTTTATGTCATGTGAACCTATCTATC
CCTTGTTGTTTTATGTCATGTGAACCTATGTTTTTATTTCTGTTGTCATGTGAACTTATA
TTTCTCTATTTAAAACCTATGTAAACTTCTGTTTGTTTATCTCTATTA

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL6866Contig1 827 2 2 U
GGGCCGGCGATTAGCGTTATTTATTACAAGAAAGAGAGAGGTTGACTACAGACAATGGCG
GTTCCGAGGGGAGACAATGGTTTGATGGAAGAAGACGACGTTGACGCTGTTATCGAGGAA
AACGGTGTTGACTACTAAAGCGATCCCGAGCTTTCCTCAAACCTCCGTGACTTAGCCGCC
GCATCTCAGTCTGGTGACGTCGTCGCCTTGCGCACCGCCATTGACAAGTTGAATGGGAGA
GTTGATGAGCCCCTTGAGGATAACGACTCTGCACTTCACCTGGCGTGTCTCTACGGTCAC
CTCCCTTGCGTTCAGCTTCTCCTGGAAAGAGGTGCTAATATGGAGGTCAAAGATGAAGAT
GAAGCGATTCCTCTACATGATGCTTGTGCTGGAGGATACTTAGAGATAGTAGAGCTTCTT
TTCAGCCGAGCTAGTTGTCCTGAAAGTGTGAAGAGGATGATTGAAACAATCGATGTAGAA
GGCGACACTCCTCTCCATCATGCAGCGAGAGGTGAGCACGTCAACGTGATTAGTTTTTTG
CTGAGTTCAGGTGCTTCACCAACAGTCAAAAACTCGTATGGGAAGACACCAGGTGAGTTA
GCTGATGTAAACACCGATGCCAGGAGGATCCTCGAAGCTGCCACTGGCGACTCAACTTAG
CTCCCAATGTTTCTGCAAAGTTCTTGAGCCAGTTTTTGCGTGTCAGTGAAGTTAGGGAAT
ATTTTTCAAAATGTTCTCAGTTATATCTTTTGACTGTTTTTATACAAAGGATTATAACCT
AAGAGTTTTAGAACGTTGTGTCGGTTTCGAATATCAAATTTGTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B059TF U 1
AF RR2B059JQ C 57
BS 1 747 RR2B059TF
BS 748 827 RR2B059JQ

RD RR2B059TF 747 0 0
GGGCCGGCGATTAGCGTTATTTATTACAAGAAAGAGAGAGGTTGACTACAGACAATGGCG
GTTCCGAGGGGAGACAATGGTTTGATGGAAGAAGACGACGTTGACGCTGTTATCGAGGAA
AACGGTGTTGACTACTAAAGCGATCCCGAGCTTTCCTCAAACCTCCGTGACTTAGCCGCC
GCATCTCAGTCTGGTGACGTCGTCGCCTTGCGCACCGCCATTGACAAGTTGAATGGGAGA
GTTGATGAGCCCCTTGAGGATAACGACTCTGCACTTCACCTGGCGTGTCTCTACGGTCAC
CTCCCTTGCGTTCAGCTTCTCCTGGAAAGAGGTGCTAATATGGAGGTCAAAGATGAAGAT
GAAGCGATTCCTCTACATGATGCTTGTGCTGGAGGATACTTAGAGATAGTAGAGCTTCTT
TTCAGCCGAGCTAGTTGTCCTGAAAGTGTGAAGAGGATGATTGAAACAATCGATGTAGAA
GGCGACACTCCTCTCCATCATGCAGCGAGAGGTGAGCACGTCAACGTGATTAGTTTTTTG
CTGAGTTCAGGTGCTTCACCAACAGTCAAAAACTCGTATGGGAAGACACCAGGTGAGTTA
GCTGATGTAAACACCGATGCCAGGAGGATCCTCGAAGCTGCCACTGGCGACTCAACTTAG
CTCCCAATGTTTCTGCAAAGTTCTTGAGCCAGTTTTTGCGTGTCAGTGAAGTTAGGGAAT
ATTTTTCAAAATGTTCTCAGTTATATC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2B059JQ 771 0 0
GGCGGTTCCGAGGGGAGACAATGGTTTGATGGAAGAAGACGACGTTGACGCTGTTATCGA
GGAAAACGGTGTTGACTACTAAAGCGATCCCGAGCTTTCCTCAAACCTCCGTGACTTAGC
CGCCGCATCTCAGTCTGGTGACGTCGTCGCCTTGCGCACCGCCATTGACAAGTTGAATGG
GAGAGTTGATGAGCCCCTTGAGGATAACGACTCTGCACTTCACCTGGCGTGTCTCTACGG
TCACCTCCCTTGCGTTCAGCTTCTCCTGGAAAGAGGTGCTAATATGGAGGTCAAAGATGA
AGATGAAGCGATTCCTCTACATGATGCTTGTGCTGGAGGATACTTAGAGATAGTAGAGCT
TCTTTTCAGCCGAGCTAGTTGTCCTGAAAGTGTGAAGAGGATGATTGAAACAATCGATGT
AGAAGGCGACACTCCTCTCCATCATGCAGCGAGAGGTGAGCACGTCAACGTGATTAGTTT
TTTGCTGAGTTCAGGTGCTTCACCAACAGTCAAAAACTCGTATGGGAAGACACCAGGTGA
GTTAGCTGATGTAAACACCGATGCCAGGAGGATCCTCGAAGCTGCCACTGGCGACTCAAC
TTAGCTCCCAATGTTTTTGCAAAGTTCTTGAGCCAGTTTTTGCGTGTCAGTGAAGTTAGG
GAATATTTTTCAAAATGTTTTCAGTTATATCTTTTGACTGTTTTTATACAAAGGATTATA
ACCTAAGAGTTTTAGAACGTTGTGTCGGTTTCGAATATCAAATTTGTTATC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL6867Contig1 617 2 2 U
GGGAAGAAAAAAAAGGACAAATGGCGGTTTCTCTCCCAACTCATTTCTCCAGATCAATCA
ATTTTCTCCTTCTCTCGTAGTCAAAAAGCCGGTTAAGGCGGCATCATTTGGCGCGAACCG
AGGAACTAAACCGTTAAGAAGCTACCCTTCGTTGGTTCGAGTAACGTGCAGGAAGAAGGA
TCTACACCCGGAGTTTCACGAGGACGCCAAGGTTTACTGCAACGGAGAGCTCGTGATGAC
GACCGGAGGGACCAAGAAAGAGTACGTCGTTGATGTTTGGTCCGGTAACCATCCGTTTTA
CCTCGGGAACCGGTCGGCTTTGATGGTCGACGCTGACCAAGTTGAGAAGTTCCGGAAGAG
GTTCGCGGGGTTGTCGGAGATTATGGAGATTCCGGTTCTGAAAGGAGAGATCGTCTTGCC
CACGAAGAAAAGCAAAGGTGCTGGCAAAGGGAAGAAGAAATGATGTGAGACTTTCTGGAA
AAGGTTTTAAGTTTGTCTTTGCTTTGCTTGGGCTGTTTGAATTGTATGTTATGTTTCTTC
TTGAATGCAAATGATTATGATTTCATTCTAAGATTGTGTTTGGTTTCCTGGAGAATTGTA
GAGATTATAAATTTTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2DP70JQ C 1
AF RR2DP70TF U 1
BS 1 613 RR2DP70TF
BS 614 617 RR2DP70JQ

RD RR2DP70JQ 617 0 0
GGGAAGAAAAAAAAGGACAAATGGCGGTTTCTCTCCCAACTCATTTCTCCAGATCAATCA
ATTTTCTCCTTCTCTCGTAGTCAAAAAGCCGGTTAAGGCGGCATCATTTGGCGCGAACCG
AGGAACTAAACCGTTAAGAAGCTACCCTTCGTTGGTTCGAGTAACGTGCAGGAAGAAGGA
TCTACACCCGGAGTTTCACGAGGACGCCAAGGTTTACTGCAACGGAGAGCTCGTGATGAC
GACCGGAGGGACCAAGAAAGAGTACGTCGTTGATGTTTGGTCCGGTAACCATCCGTTTTA
CCTCGGGAACCGGTCGGCTTTGATGGTCGACGCTGACCAAGTTGAGAAGTTCCGGAAGAG
GTTCGCGGGGTTGTCGGAGATTATGGAGATTCCGGTTCTGAAAGGAGAGATCGTCTTGCC
CACGAAGAAAAGCAAAGGTGCTGGCAAAGGGAAGAAGAAATGATGTGAGACTTTCTGGAA
AAGGTTTTAAGTTTGTCTTTGCTTTGCTTGGGCTGTTTGAATTGTATGTTATGTTTCTTC
TTGAATGCAAATGATTATGATTTCATTCTAAGATTGTGTTTGGTTTCCTGGAGAATTGTA
GAGATTATAAATTTTAG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2DP70TF 613 0 0
GGGAAGAAAAAAAAGGACAAATGGCGGTTTCTCTCCCAACTCATTTCTCCAGATCAATCA
ATTTTCTCCTTCTCTCGTAGTCAAAAAGCCGGTTAAGGCGGCATCATTTGGCGCGAACCG
AGGAACTAAACCGTTAAGAAGCTACCCTTCGTTGGTTCGAGTAACGTGCAGGAAGAAGGA
TCTACACCCGGAGTTTCACGAGGACGCCAAGGTTTACTGCAACGGAGAGCTCGTGATGAC
GACCGGAGGGACCAAGAAAGAGTACGTCGTTGATGTTTGGTCCGGTAACCATCCGTTTTA
CCTCGGGAACCGGTCGGCTTTGATGGTCGACGCTGACCAAGTTGAGAAGTTCCGGAAGAG
GTTCGCGGGGTTGTCGGAGATTATGGAGATTCCGGTTCTGAAAGGAGAGATCGTCTTGCC
CACGAAGAAAAGCAAAGGTGCTGGCAAAGGGAAGAAGAAATGATGTGAGACTTTCTGGAA
AAGGTTTTAAGTTTGTCTTTGCTTTGCTTGGGCTGTTTGAATTGTATGTTATGTTTCTTC
TTGAATGCAAATGATTATGATTTCATTCTAAGATTGTGTTTGGTTTCCTGGAGAATTGTA
GAGATTATAAATT

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

CO CL6868Contig1 854 2 2 U
GAAGAAAGAATTGACAAGCGGATAAGTTTTCTAGTTGGCGCAGTTGGAAGTTGCTTGGAA
GGATCTGTGCTGGTTGGTAGACTTGCTAGAGTGGTTGCTTTTGGTTGACATAGATCCATA
GATATGTGCTCGCAGTCGTCTCATAGAGCACTGCGGAAATCGAAGTCAAGGGGTAAGGTG
TAGTCAGCTTCCCCGCTCACGTTTCGGGTTGCTAAGGTCAGATTCTTGAAACAACAGTCC
TAGGAGGGCCGATTGATTGACCGAGATGGGAATCAATGCCTAGTCAAATCAAAGTCAAGT
AGGGGCGAAGCCGTTGCTTGTTTGCTCCTTCGTATAGGTTCCGTGTAGGCGTCTTTCCAT
ACGATCAATTGGATATTGGAAAAATCAAATCCGGTGGGTTTTTATCGTGAGCTCCTTTCG
CGAGTCGAGGAACGCCAGTTAGTCGACTAAAAGGTCTGCAAGCCTTGTCTCGCCATTATT
ATAATGGCGGGAACCATATTCCTTTTCCCTTTCAAACTCAAAAGGAAAAAGATGCTATCT
ATTCCATTATGTGGCAATACCGCCGCGAGGAGTAGAATGAGTCCATGCTTCCTAATTTTC
TGACTGAAAAGTCTTTTGGCTCGATGCGCTTAACGAAAGGGAACTCTCTAGATTAAGAAT
GAATTTCCTTCTCCATTAAGCCGGACCGGCGACGAATAATAAATAGGTACGTACCCCCAC
CCCAGGCAGAGTTAGTGAGCCGTGTAATAGGCGACCATTTCGCGCGGTTCGGGGGGCACT
TGAGTAAGCCGCCGGCGCCCGACTGCGTCTTGACCCCTATCCAATTTTTGGGCCAATTCC
CCCCTCGTACTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H777TF U 1
AF RR2H777JQB C 460
BS 1 663 RR2H777TF
BS 664 854 RR2H777JQB

RD RR2H777TF 663 0 0
GAAGAAAGAATTGACAAGCGGATAAGTTTTCTAGTTGGCGCAGTTGGAAGTTGCTTGGAA
GGATCTGTGCTGGTTGGTAGACTTGCTAGAGTGGTTGCTTTTGGTTGACATAGATCCATA
GATATGTGCTCGCAGTCGTCTCATAGAGCACTGCGGAAATCGAAGTCAAGGGGTAAGGTG
TAGTCAGCTTCCCCGCTCACGTTTCGGGTTGCTAAGGTCAGATTCTTGAAACAACAGTCC
TAGGAGGGCCGATTGATTGACCGAGATGGGAATCAATGCCTAGTCAAATCAAAGTCAAGT
AGGGGCGAAGCCGTTGCTTGTTTGCTCCTTCGTATAGGTTCCGTGTAGGCGTCTTTCCAT
ACGATCAATTGGATATTGGAAAAATCAAATCCGGTGGGTTTTTATCGTGAGCTCCTTTCG
CGAGTCGAGGAACGCCAGTTAGTCGACTAAAAGGTCTGCAAGCCTTGTCTCGCCATTATT
ATAATGGCGGGAACCATATTCCTTTTCCCTTTCAAACTCAAAAGGAAAAAGATGCTATCT
ATTCCATTATGTGGCAATACCGCCGCGAGGAGTAGAATGAGTCCATGCTTCCTAATTTTC
TGACTGAAAAGTCTTTTGGCTCGATGCGCTTAACGAAAGGGAACTCTCTAGATTAAGAAT
GAA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2H777JQB 395 0 0
AAGCCTTGTCTCGCCATTATTATAATGGCGGGAACCATATTCCTTTTCCCTTTCAAACTC
AAAAGGAAAAAGATGCTATCTATTCCATTATGTGGCAATACCGCCGCGAGGAGTAGAATG
AGTCCATGCTTCCTAATTTTCTGACTGAAAAGTCTTTTGGCTCGATGCGCTTAACGAAAG
GGAACTCTCTAGATTAAGAATGAATTTCCTTCTCCATTAAGCCGGACCGGCGACGAATAA
TAAATAGGTACGTACCCCCACCCCAGGCAGAGTTAGTGAGCCGTGTAATAGGCGACCATT
TCGCGCGGTTCGGGGGGCACTTGAGTAAGCCGCCGGCGCCCGACTGCGTCTTGACCCCTA
TCCAATTTTTGGGCCAATTCCCCCCTCGTACTACC

QA 1 395 1 395
DS 



AS 1 2

CO CL6869Contig1 824 2 8 U
GGATTCCATCAAAAGCAAAAACGTTTTCGATTCTTGGAACCACCAGCTTCGTGTCTAATC
TCTATTCATTTTGACGGAGCCAACACTTCCTGTGGCGGCGATTCCGTGTTATTCCTTTAT
TTCCTATCTTCCACGCTTTAGCTTCTGCATAGTCTCTGAGTTTATCTCCGACCCTTTTTT
CTGATCTTTCAGTCCGATACGAACGAGGAGCAAGCAATCCTAGACGATGACGATCACTTC
TAACATCTCTGTCCAAAACGACAACCTTGTTGTCCAAGGGAAGACTATCCTCACCAAAAT
CCCCGACAACGTTATCCTCACTCCGGTCACCGGCGCCGGATCAGATTCCGGCGCTTTTTA
TAGGCGCAACTTTTGAACAGAGCAAGAGTCTCCATGTCTTCCCCATCGGTGTGTTGGAGT
AAGTTACCAAACTCTCTTTTTCTTTTTGGTTTTCTATCTGTTACTGAGGCATTTTTTGCT
GGTTGGTTAAAGCTTTATTGTTTGTGTGAATCTTCTCTAGGGGTCTTCGGTTTATGTGCT
GTTTCCGGTTTAAACTATGGTGGATGACTCAGAGAATGGGAACCTGTGGAAAAGACATTC
CTTTGGAGACACAGTTCATGTTACTAGAGAGCAAAGATGGCATGTTAAGATTCTGGTGTA
AGCGAAAGAGAAGCTTGGTGTAACTTGCTGGATCGGGTTATTATTCTTTTTACTACCATT
TTGCCATTGTATTGTCGTTATAGACGTTTTGTAGTAGTCGACTAGTAGTATCTTCGCTTG
TAATAAAATGTAATCTCGTTCTGTCTCTGTAGTTCTTTTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E232TF U 1
AF RR2E232JQ C 175
BS 1 682 RR2E232TF
BS 683 683 RR2E232JQ
BS 684 710 RR2E232TF
BS 711 711 RR2E232JQ
BS 712 782 RR2E232TF
BS 783 785 RR2E232JQ
BS 786 809 RR2E232TF
BS 810 824 RR2E232JQ

RD RR2E232TF 809 0 0
GGATTCCATCAAAAGCAAAAACGTTTTCGATTCTTGGAACCACCAGCTTCGTGTCTAATC
TCTATTCATTTTGACGGAGCCAACACTTCCTGTGGCGGCGATTCCGTGTTATTCCTTTAT
TTCCTATCTTCCACGCTTTAGCTTCTGCATAGTCTCTGAGTTTATCTCCGACCCTTTTTT
CTGATCTTTCAGTCCGATACGAACGAGGAGCAAGCAATCCTAGACGATGACGATCACTTC
TAACATCTCTGTCCAAAACGACAACCTTGTTGTCCAAGGGAAGACTATCCTCACCAAAAT
CCCCGACAACGTTATCCTCACTCCGGTCACCGGCGCCGGATCAGATTCCGGCGCTTTTTA
TAGGCGCAACTTTTGAACAGAGCAAGAGTCTCCATGTCTTCCCCATCGGTGTGTTGGAGT
AAGTTACCAAACTCTCTTTTTCTTTTTGGTTTTCTATCTGTTACTGAGGCATTTTTTGCT
GGTTGGTTAAAGCTTTATTGTTTGTGTGAATCTTCTCTAGGGGTCTTCGGTTTATGTGCT
GTTTCCGGTTTAAACTATGGTGGATGACTCAGAGAATGGGAACCTGTGGAAAAGACATTC
CTTTGGAGACACAGTTCATGTTACTAGAGAGCAAAGATGGCATGTTAAGATTCTGGTGTA
AGCGAAAGAGAAGCTTGGTGTA*CTTGCTGGATCGGGTTATTATTCTTTT*ACTACCATT
TTGCCATTGTATTGTCGTTATAGACGTTTTGTAGTAGTCGACTAGTAGTATCTTCGCTTG
TAT**AAATGTAATCTCGTTCTGTCTCTG

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2E232JQ 650 0 0
TTTTTTCTGATCTTTCAGTCCGATACGAACGAGGAGCAAGCAATCCTAGACGATGACGAT
CACTTCTAACATCTCTGTCCAAAACGACAACCTTGTTGTCCAAGGGAAGACTATCCTCAC
CAAAATCCCCGACAACGTTATCCTCACTCCGGTCACCGGCGCCGGATCAGATTCCGGCGC
TTTTTATAGGCGCAACTTTTGAACAGAGCAAGAGTCTCCATGTCTTCCCCATCGGTGTGT
TGGAGTAAGTTACCAAACTCTCTTTTTCTTTTTGGTTTTCTATCTGTTACTGAGGCATTT
TTTGCTGGTTGGTTAAAGCTTTATTGTTTGTGTGAATCTTCTCTAGGGGTCTTCGGTTTA
TGTGCTGTTTCCGGTTTAAACTATGGTGGATGACTCAGAGAATGGGAACCTGTGGAAAAG
ACATTCCTTTGGAGACACAGTTCATGTTACTAGAGAGCAAAGATGGCATGTTAAGATTTT
GGTGTAAGCGAAAGAGAAGCTTGGTGTAACTTGCTGGATCGGGTTATTATTCTTTTTACT
ACCATTTTGCCATTGTATTGTCGTTATAGACGTTTTGTAGTAGTCGACTAGTAGTATCTT
CGCTTGTAATAAAATGTAATCTCGTTCTGTCTCTGTAGTTCTTTTGTTTC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL6870Contig1 578 2 9 U
TCAAGAATAGATTACGCAATTATCATAGCTTTCTTTATTTTCAAGTGTTAGCCACCTTAA
AAGTTATGCAAACGAATGATCTAATATCCATTTGACGCAAAAAAATCATAAGCAAAGGCA
GAAACAGGAATCTGAAATCTAATTAGTAAACCTTTTTTGTTGTCCTCTGCCACTTGGAAA
ACCTAAAAGTTTCCTTCTTAATCGATTCTTCATCGATCTTCATACAAGGATTGAAACCTA
TTCTCAGGGGTTGAAAAGGGTCGACGCCACCTTGACATGATGTGGCATGATCTCGATATC
GTAAGGCACGTGAAGCCAAGCTTCGGGCCTGTAAAACATAAAGTTCTCAGGCTTGCTGGT
GTAAACGTCTGCGTACTGGTGGATGTGATAAAAAAATGCTGATTCTTGACCAGTGTCTGT
CACAAATGTAGCTCCCAACGATCTGTTAAACATTTGTTTCATCCCCTCTCGTGCTTTCTG
TCTCGCCATGTTCAGCTCATCCAAGAGAGATTGGCACGCCTCACTTCTCTCATTGTTTGA
TACACTCGCATGAAATTTACCCAGCAATTCTTGGATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH14JQ U 14
AF RR2AO75TF C 1
BS 1 14 RR2AO75TF
BS 15 268 RR2CH14JQ
BS 269 269 RR2AO75TF
BS 270 293 RR2CH14JQ
BS 294 294 RR2AO75TF
BS 295 306 RR2CH14JQ
BS 307 307 RR2AO75TF
BS 308 504 RR2CH14JQ
BS 505 578 RR2AO75TF

RD RR2CH14JQ 493 0 0
G
CGCAATTATCATAGCTTTCTTTATTTTCAAGTGTTAGCCACCTTAAAAGTTATGCAAACG
AATGATCTAATATCCATTTGACGCAAAAAAATCATAAGCAAAGGCAGAAACAGGAATCTG
AAATCTAATTAGTAAACCTTTTTTGTTGTCCTCTGCCACTTGGAAAACCTAAAAGTTTCC
TTCTTAATCGATTCTTCATCGATCTTCATACAAGGATTGAAACCTATTCTCAGGGGTTGA
AAAGGGTCGACGCCCCCTTGACATGATGTGGCATGATCTTGATATCGTAAGGGACGTGAA
GCCAAGCTTCGGGCCTGTAAAACATAAAGTTCTCAGGCTTGCTGGTGTAAACGTCTGCGT
ACTGGTGGATGTGATAAAAAAATGCTGATTCTTGACCAGTGTCTGTCACAAATGTAGCTC
CCAACGATCTGTTAAACATTTGTTTCATCCCCTCTCGTGCTTTCTGTCTCGCCATGTTCA
GCTCATCCAA
AA

QA 2 491 2 491
DS 

RD RR2AO75TF 578 0 0
TCAAGAATAGATTACGCAATTATCATAGCTTTCTTTATTTTCAAGTGTTAGCCACCTTAG
AAGTTATGCAAACGAATGATCTAATATCCATTTGACGCAAAAGAATCATAAGCAAAGGCA
GAAACAGGAATCTGAGATCTAATTAGTAAACCTTTTTTGTTGTCCTCTGCCACTTGGAAA
ACCTAAAAGTTTCCTTCTTAATCGATTCTTCATCGATCTTCATACAAGGATTGAAACCTA
TTCTCAGGTGTTGAAAAGGGTCGACGCCACCTTGACATGATGTGGCATGATCTCGATATC
GTAAGGCACGTGAAGCCAAGCTTCGGGCCTGTAGAACATAAAGTTCTCAGGCTTGCTGGT
GTAAACGTCTGCGTACTGGTGGATGTGATAAGAGAATGCTGATTCTTGACCAGTGTCTGT
CACAAATGTAGCTCCGAACGATCTGTTAAACATTTGTTTCATCGCCTCTCGTGCTTTCTG
TCTCGCCATGTTCAGCTCATCCAAGAGAGATTGGCACGCCTCACTTCTCTCATTGTTTGA
TACACTCGCATGAAATTTACCCAGCAATTCTTGGATAC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL6871Contig1 922 2 6 U
GGATCCATCTATCATTAAACAGACCTAGCTCAGCATTGTATATAAACACCATAGAGCACA
TTGATCTCTGCAAGTCTCCAACTTCCATCAGATTGATTCACACAGAAGAAAAGGAGGAGA
AGAAAGATTATTTTTTCTTGGGCATTTCCCAAGTTTTCTTTTTTCTTCTACAAACCTTTT
TTTGTGGGCATTTCCCAAAAAAATTTCATTTTGCTTTTTGTTTCAAAATTTTCTTTAATA
TTTTATAAAAATGGGAAACTGTTTGAATGGAGGAAGCAACCTTAAAAGAATGGTTCAAGA
AGAAGAAAAAGAAGTGAAGAAAGATTACAACAGAAAAGATAGGAAGGTGAAGATTGTTCT
AAGGAGAGACGAGTTAGAGAAACTCATTCTCTTCCAGTTAAACGCCGGCGGTGACGTCCA
AGGCAAAGGAGAAACAACTTTGGCTTCCTTCGGCGACTTTCTCAGGGAACTAGAGGCGGA
GAGATTTGCCGGAGAAGCTGCAGCAAAGGCTGCTGAGGAAGAGGAGGAGTCTCGCCGGAG
ATGTCGAAAATGGAGGCCTTCATTGGACAGGATCATTGAATGGCCTGAAGAAACACTTGC
GTAATTGCTTTTCTTAATCCTTTTATTTTAGATTATTAAGTTTTTTTTTAAATTTGTTTA
AGATGGGATTTTTTTGTGGGAGAATTTGCTTTTGCCTATTTTTTCCTACCTTTTTCCCGA
TGGATTTTTTTTCACTTGAGAAATGTTATGTTCTCAAAGTGAGATATATCTTCGGTGTTT
TGAAACTGGCAGACGCTTATTTTACCACAGAGAAATCCCAAAGAAGTAAAAAGTACGAAA
CTATGTATTTTGTTTTCGTCTTTCATGTGTAACGTTCAATGTGTCGAGTGTTAAAACATA
AATAAACTTGTGTTGCTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN91TF U 1
AF RR2DN91JQ C 267
BS 1 648 RR2DN91TF
BS 649 649 RR2DN91JQ
BS 650 703 RR2DN91TF
BS 704 704 RR2DN91JQ
BS 705 728 RR2DN91TF
BS 729 922 RR2DN91JQ

RD RR2DN91TF 728 0 0
GGATCCATCTATCATTAAACAGACCTAGCTCAGCATTGTATATAAACACCATAGAGCACA
TTGATCTCTGCAAGTCTCCAACTTCCATCAGATTGATTCACACAGAAGAAAAGGAGGAGA
AGAAAGATTATTTTTTCTTGGGCATTTCCCAAGTTTTCTTTTTTCTTCTACAAACCTTTT
TTTGTGGGCATTTCCCAAAAAAATTTCATTTTGCTTTTTGTTTCAAAATTTTCTTTAATA
TTTTATAAAAATGGGAAACTGTTTGAATGGAGGAAGCAACCTTAAAAGAATGGTTCAAGA
AGAAGAAAAAGAAGTGAAGAAAGATTACAACAGAAAAGATAGGAAGGTGAAGATTGTTCT
AAGGAGAGACGAGTTAGAGAAACTCATTCTCTTCCAGTTAAACGCCGGCGGTGACGTCCA
AGGCAAAGGAGAAACAACTTTGGCTTCCTTCGGCGACTTTCTCAGGGAACTAGAGGCGGA
GAGATTTGCCGGAGAAGCTGCAGCAAAGGCTGCTGAGGAAGAGGAGGAGTCTCGCCGGAG
ATGTCGAAAATGGAGGCCTTCATTGGACAGGATCATTGAATGGCCTGAAGAAACACTTGC
GTAATTGCTTTTCTTAATCCTTTTATTTTAGATTATTAAGTTTTTTTT*AAATTTGTTTA
AGATGGGATTTTTTTGTGGGAGAATTTGCTTTTGCCTATTTTT*CCTACCTTTTTCCCGA
TGGATTTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2DN91JQ 656 0 0
ATGGAGGAAGCAACCTTAAAAGAATGGTTCAAGAAGAAGAAAAAGAAGTGAAGAAAGATT
ACAACAGAAAAGATAGGAAGGTGAAGATTGTTCTAAGGAGAGACGAGTTAGAGAAACTCA
TTCTCTTCCAGTTAAACGCCGGCGGTGACGTCCAAGGCAAAGGAGAAACAACTTTGGCTT
CCTTCGGCGACTTTCTCAGGGAACTAGAGGCGGAGAGATTTGCCGGAGAAGCTGCAGCAA
AGGCTGCTGAGGAAGAGGAGGAGTCTCGCCGGAGATGTCGAAAATGGAGGCCTTCATTGG
ACAGGATCATTGAATGGCCTGAAGAAACACTTGCGTAATTGCTTTTCTTAATCCTTTTAT
TTTAGATTATTAAGTTTTTTTTTAAATTTGTTTAAGATGGGATTTTTTTGTGGGAGAATT
TGCTTTTGCCTATTTTTTCCTACCTTTTTCCCGATGGATTTTTTTTCACTTGAGAAATGT
TATGTTCTCAAAGTGAGATATATCTTCGGTGTTTTGAAACTGGCAGACGCTTATTTTACC
ACAGAGAAATCCCAAAGAAGTAAAAAGTACGAAACTATGTATTTTGTTTTCGTCTTTCAT
GTGTAACGTTCAATGTGTCGAGTGTTAAAACATAAATAAACTTGTGTTGCTTTGTC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL6872Contig1 804 2 13 U
GGAACCAATCTAAATTCCAAAAGGGTTTAGTTGATTTTATCTTCTTTTTTCATCACCTGG
CCTAATTAACAGTGATGATGTCTTCCTCGCCTTCGTGTTCTTGGCCTCTGGTACTGTTAT
TAGTATTGTTGTGCATGGTGGCCAAAGAATCAAACGGAGCTTCCAACAATGTAAAAGTGG
GAAGCATTTCAAAGGTAGAAGATGCAGATAATTTCCATATATATTATGGACAAACCTTCA
AAGTCATCAAGAATGCTATTGATGGCAAGAGTTACCTCCTTATTCAGAATACCTCGAGAA
TGGCGGTTCGGACAAAGTATTGTACTTCTAGGATAAAGTCCTATGTGATTCCACTTCTTA
ACTACTCAGTAGACACCCAGTCTTCTCAAGGAGGCATTCCGGTTTCTTTCTTCGAGCTAC
TTGGATTACTCGGGAGCTTGAAGGGAATAACATCAGACGCGGTGGCTTCACCGTGTGTTC
TGAAACTGCTCGAGGCAGGGGAAGTAGTTAAGCTTCAAAAAGGTGCAGAAGAAGTGTCTC
AATTTGCAGCGCACTTCATCAGTGACACTGATCAACTTCAGACATGCAATTTTGCAAACT
TTTTTCCACTCAGCGAAGGCACACCTCTTCAGCGAGCCGAGTGGATCAAATTCCTTGGTG
CTTTTGCCAATCTTGAAACTAAAGCCAACCAAGTCTATGATGCGGTCAAAGCAAGCTATA
CTTGCTTGTCTCAAATGGCAGCTAAAGGAGGACATCCTTCAAACCCATTGTAGCCTGGAT
GGAGTACGATATAATGGAGGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG06TF U 5
AF RR2BE79TF U 1
BS 1 205 RR2BE79TF
BS 206 206 RR2EG06TF
BS 207 292 RR2BE79TF
BS 293 293 RR2EG06TF
BS 294 372 RR2BE79TF
BS 373 373 RR2EG06TF
BS 374 379 RR2BE79TF
BS 380 380 RR2EG06TF
BS 381 734 RR2BE79TF
BS 735 735 RR2EG06TF
BS 736 750 RR2BE79TF
BS 751 751 RR2EG06TF
BS 752 804 RR2BE79TF

RD RR2EG06TF 762 0 0
GG
AATCTAAATTCCAAAAGGGTTTAGTTGATTTTATCTTCTTTTTTCATCACCTGGCCTAAT
TAACAGTGATGATGTCTTCCTCGCCTTTGTGTTCTTGGCCTCTGGTACTGTTATTAGTAT
TGTTGTGCATGGTGGCCAAAGAATCAAACGGAGCTTCCAACAATGTAAAAGTGGGAAGCA
TTTCAAAGGTAGAAGATGCAGATAATTTCCATATATATTATGGACAAACCTTCAAAGTCA
TCAAGAATGCTATTGATGGCAAGAGTTACCTCCTTATTCAGAATACCTCGAGAATGGCGG
TTCGGACAAAGTATTGTACTTCTAGGATAAAGTCCTATGTGATTCCACTTCTTAACTACT
CAGTAGACACCCAGTCTTCTCAAGGAGGCATTCCGGTTTCTTTCTTCGAGCTACTTGGAT
TACTCGGGAGCTTGAAGGGAATAACATCAGACGCGGTGGCTTCACCGTGTGTTCTGAAAC
TGCTTGAGGCAGGGGAAGTAGTTAAGCTTCAAAAAGGTGCAGAAGAAGTGTCTCAATTTG
CAGCGCACTTCATCAGTGACACTGATCAACTTCAGACATGCAATTTTGCAAACTTTTTTC
CACTCAGCGAAGGCACACCTCTTCAGCGAGCCGAGTGGATCAAATTCCTTGGTGCTTTTG
CCAATCTTGAAACTAAAGCCAACCAAGTCTATGATGCGGTCAAAGCAAGCTATACTTGCT
TGTCTCAAATGGCAGCTAAAGGAGGACATCCTTCAAACC
A

QA 3 761 3 761
DS 

RD RR2BE79TF 804 0 0
GGAACCAATCTAAATTCCAAAAGGGTTTAGTTGATTTTATCTTCTTTTTTCATCACCTGG
CCTAATTAACAGTGATGATGTCTTCCTCGCCTTCGTGTTCTTGGCCTCTGGTACTGTTAT
TAGTATTGTTGTGCATGGTGGCCAAAGAATCAAACGGAGCTTCCAACAATGTAAAAGTGG
GAAGCATTTCAAAGGTAGAAGATGCTGATAATTTCCATATATATTATGGACAAACCTTCA
AAGTCATCAAGAATGCTATTGATGGCAAGAGTTACCTCCTTATTCAGAATACTTCGAGAA
TGGCGGTTCGGACAAAGTATTGTACTTCTAGGATAAAGTCCTATGTGATTCCACTTCTTA
ACTACTCAGTAGGCACCCATTCTTCTCAAGGAGGCATTCCGGTTTCTTTCTTCGAGCTAC
TTGGATTACTCGGGAGCTTGAAGGGAATAACATCAGACGCGGTGGCTTCACCGTGTGTTC
TGAAACTGCTCGAGGCAGGGGAAGTAGTTAAGCTTCAAAAAGGTGCAGAAGAAGTGTCTC
AATTTGCAGCGCACTTCATCAGTGACACTGATCAACTTCAGACATGCAATTTTGCAAACT
TTTTTCCACTCAGCGAAGGCACACCTCTTCAGCGAGCCGAGTGGATCAAATTCCTTGGTG
CTTTTGCCAATCTTGAAACTAAAGCCAACCAAGTCTATGATGCGGTCAAAGCAAGCTATA
CTTGCTTGTCTCAA*TGGCAGCTAAAGGAG*ACATCCTTCAAACCCATTGTAGCCTGGAT
GGAGTACGATATAATGGAGGTGTT

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL6873Contig1 861 2 2 U
GAGTTTGAGAATTCAGTTAGGCACTTGCTGCATCAGAAGATTCGGGATTCTTACATGCAC
CCTCAGTTTGTGTCGGACGTAATGAAACCACTGCAGATTGAGCAGCTGATGGATCAACAA
GTTGTCAATCTCTCAGGAGGAGAGTTGCAAAGGGTTGCTTTAGCTCTGTGCCTCGGAAAG
CCTGCGGATATATACCTGATTGATGAGCCAAGTGCATATCTCGATTCAGAGCAGCGTATT
GTGGCTTCTAAAGTCATCAAGCGATTCATTCTCCATGCGAAGAAAACCGCATTTGTAGTT
GAGCATGACTTTATAATGGCAACCTATCTGGCAGACCGAGTCATCGTCTATGAAGGACAA
CCATTCATTGATTGTGTTGCGAACTGTCCTCAGTCACTGCTCACTGGGATGAATCTCTTT
TTATCCCATCTGAACATCACCTTCAGAAGGGATCCCACAAATTTCAGACCAAGAATCAAC
AAATTAGAGTCGACTAAAGACAGGGAGCAAAAGTCTGCAGGCTCGTACTACTACTTGGAC
GATTAAGACAACTACCATGAGAACATAGGACATGATCACAAATCATTGCGAGTTACATGA
AAGTGTTTTGATGTGAGGAAGTTGATCTAAATGAGCTCGAGATGATATATTTTGCGATGT
TTTCTGAGTTCCTTAGGAGATGTTACTCCTCTCAAATCTTTTGATTGTTGTTCATCAGTT
TTTGAGCAATAATAAGAGTTTCTGAATCCTTTTTTTTTAACCTTTGTTTCTTTTGGCTTT
TCTACTTTCTGAGCTGTTAATTTACTTTTGTATTTGAATTTCATAAGGAATGCACTGCCT
ATTATTTATTTTCCTTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D696TF U 1
AF RR2D696JQ C 200
BS 1 691 RR2D696TF
BS 692 861 RR2D696JQ

RD RR2D696TF 691 0 0
GAGTTTGAGAATTCAGTTAGGCACTTGCTGCATCAGAAGATTCGGGATTCTTACATGCAC
CCTCAGTTTGTGTCGGACGTAATGAAACCACTGCAGATTGAGCAGCTGATGGATCAACAA
GTTGTCAATCTCTCAGGAGGAGAGTTGCAAAGGGTTGCTTTAGCTCTGTGCCTCGGAAAG
CCTGCGGATATATACCTGATTGATGAGCCAAGTGCATATCTCGATTCAGAGCAGCGTATT
GTGGCTTCTAAAGTCATCAAGCGATTCATTCTCCATGCGAAGAAAACCGCATTTGTAGTT
GAGCATGACTTTATAATGGCAACCTATCTGGCAGACCGAGTCATCGTCTATGAAGGACAA
CCATTCATTGATTGTGTTGCGAACTGTCCTCAGTCACTGCTCACTGGGATGAATCTCTTT
TTATCCCATCTGAACATCACCTTCAGAAGGGATCCCACAAATTTCAGACCAAGAATCAAC
AAATTAGAGTCGACTAAAGACAGGGAGCAAAAGTCTGCAGGCTCGTACTACTACTTGGAC
GATTAAGACAACTACCATGAGAACATAGGACATGATCACAAATCATTGCGAGTTACATGA
AAGTGTTTTGATGTGAGGAAGTTGATCTAAATGAGCTCGAGATGATATATTTTGCGATGT
TTTCTGAGTTCCTTAGGAGATGTTACTCCTC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2D696JQ 662 0 0
TTGATGAGCCAAGTGCATATCTCGATTCAGAGCAGCGTATTGTGGCTTCTAAAGTCATCA
AGCGATTCATTCTCCATGCGAAGAAAACCGCATTTGTAGTTGAGCATGACTTTATAATGG
CAACCTATCTGGCAGACCGAGTCATCGTCTATGAAGGACAACCATTCATTGATTGTGTTG
CGAACTGTCCTCAGTCACTGCTCACTGGGATGAATCTCTTTTTATCCCATCTGAACATCA
CCTTCAGAAGGGATCCCACAAATTTCAGACCAAGAATCAACAAATTAGAGTCGACTAAAG
ACAGGGAGCAAAAGTCTGCAGGCTCGTACTACTACTTGGACGATTAAGACAACTACCATG
AGAACATAGGACATGATCACAAATCATTGCGAGTTACATGAAGGTGTTTTGATGTGAGGA
AGTTGATCTAAATGAGCTCGAGATGATATATTTTGCGATGTTTTCTGAGTTCCTTAGGAG
ATGTTACTCCTCTCAAATCTTTTGATTGTTGTTCATCAGTTTTTGAGCAATAATAAGAGT
TTCTGAATCCTTTTTTTTTAACCTTTGTTTCTTTTGGCTTTTCTACTTTCTGAGCTGTTA
ATTTACTTTTGTATTTGAATTTCATAAGGAATGCACTGCCTATTATTTATTTTCCTTGTG
TT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL6874Contig1 646 2 2 U
GTGTAGAGCTGTTTACGAATGTGCGCATCTTTACTGGGCTGAGGAAGGCGAGAACCTAAA
AGATGGAGAGAGGGTTGTCAATTGTCTGAAGAGATCACAAAAAATTGCAGATGCGGTTCA
ACAAATGTCCAACGCATCCCGTGGTGCCAGTAGCACCGGGTCTGTGTCTCTGTATGTCGA
ACTGCTGAACAAGTATCTCTACTTCTTGGAGAAAGGAAATCCACAAGTAACAGGCGAAAC
AATCCAGAGCTTAGCTGAATTAATCAGAAGCGAGACGAAGAAAGCTGAGTCAGGCGCAGG
GTCATTCATAACCACCACTCTGCGTTACATGGAGTTTCAGAGACAACAGGAGGATGGTGG
CATGAGTGAGAAATACCAGAAAATCAAAATGGAATGGTTCGAGTGATCACTCTTTTCTTC
TGCATTATTTTAGACTCACTATGAACAGTCATGGCTTCTTGTCTCGTTGGAGAACAATGA
AAGAGTAACAAAACTTGTATCATCACTTTTCCTTTCCCAGATCGGACAGGTGATTGAACC
GGATTCAACCATGATATTATTTTTAACCCAGTCGAACCCGATTGGGACGAACTTCTCTCT
GGTTCGATTGTCAGTCCGGTTTTAATTGATGTCAGACAAAGGTGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO17JQ C 1
AF RR2DO17TF U 1
BS 1 615 RR2DO17TF
BS 616 646 RR2DO17JQ

RD RR2DO17JQ 646 0 0
GTGTAGAGCTGTTTACGAATGTGCGCATCTTTACTGGGCTGAGGAAGGCGAGAACCTAAA
AGATGGAGAGAGGGTTGTCAATTGTCTGAAGAGATCACAAAAAATTGCAGATGCGGTTCA
ACAAATGTCCAACGCATCCCGTGGTGCCAGTAGCACCGGGTCTGTGTCTCTGTATGTCGA
ACTGCTGAACAAGTATCTCTACTTCTTGGAGAAAGGAAATCCACAAGTAACAGGCGAAAC
AATCCAGAGCTTAGCTGAATTAATCAGAAGCGAGACGAAGAAAGCTGAGTCAGGCGCAGG
GTCATTCATAACCACCACTCTGCGTTACATGGAGTTTCAGAGACAACAGGAGGATGGTGG
CATGAGTGAGAAATACCAGAAAATCAAAATGGAATGGTTCGAGTGATCACTCTTTTCTTC
TGCATTATTTTAGACTCACTATGAACAGTCATGGCTTCTTGTCTCGTTGGAGAACAATGA
AAGAGTAACAAAACTTGTATCATCACTTTTCCTTTCCCAGATCGGACAGGTGATTGAACC
GGATTCAACCATGATATTATTTTTAACCCAGTCGAACCCGATTGGGACGAACTTCTCTCT
GGTTCGATTGTCAGTCCGGTTTTAATTGATGTCAGACAAAGGTGTC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2DO17TF 615 0 0
GTGTAGAGCTGTTTACGAATGTGCGCATCTTTACTGGGCTGAGGAAGGCGAGAACCTAAA
AGATGGAGAGAGGGTTGTCAATTGTCTGAAGAGATCACAAAAAATTGCAGATGCGGTTCA
ACAAATGTCCAACGCATCCCGTGGTGCCAGTAGCACCGGGTCTGTGTCTCTGTATGTCGA
ACTGCTGAACAAGTATCTCTACTTCTTGGAGAAAGGAAATCCACAAGTAACAGGCGAAAC
AATCCAGAGCTTAGCTGAATTAATCAGAAGCGAGACGAAGAAAGCTGAGTCAGGCGCAGG
GTCATTCATAACCACCACTCTGCGTTACATGGAGTTTCAGAGACAACAGGAGGATGGTGG
CATGAGTGAGAAATACCAGAAAATCAAAATGGAATGGTTCGAGTGATCACTCTTTTCTTC
TGCATTATTTTAGACTCACTATGAACAGTCATGGCTTCTTGTCTCGTTGGAGAACAATGA
AAGAGTAACAAAACTTGTATCATCACTTTTCCTTTCCCAGATCGGACAGGTGATTGAACC
GGATTCAACCATGATATTATTTTTAACCCAGTCGAACCCGATTGGGACGAACTTCTCTCT
GGTTCGATTGTCAGT

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL6875Contig1 615 2 1 U
GGACAACCAAATCTCACATTCAACACTCTCCAGAAGAAGAAACTAACCCTAACCATTTGA
TTCCGATATGGCTCGCACCAAGCAAACCGCTAGAAAGTCCACCGGAGGCAAAGCCCCGAG
GAAGCAGCTCGCGACGAAAGCCGCGAGGAAATCAGCTCCGGCCACCGGAGGAGTGAAGAA
GCCGCACAGGTTTCGTCCCGGAACCGTCGCGTTGAGAGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAG
CACCGAGCTTCTGATCCGCAAGCTTCCCTTCCAGCGTCTGGTCCGTGAGATCGCTCAGGA
TTTCAAGACCGATCTGAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCCGCGCTACAAGAGGCTGCTGA
GGCTTACCTCGTTGGGTTGTTTGAAGACACGAATCTTTGCGCGATTCACGCTAAGAGAGT
CACGATCATGCCTAAGGATATCCAGCTCGCGAGGAGGATCCGTGGTGAAAGAGCTTGAAG
ACACTCTCGTGATCTCTGTTTAGCTCGTTAATGGTGACTTGTTATGTGTAATGTTTAGCC
TTTGTTATAATAGTCTTGAAGGTGTTCGACGAAATGTCAAAGTTTGTTAAGTTTAATATA
AATCGTATTTTGCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EW13JQ C 1
AF RR2EW13TF U 1
BS 1 615 RR2EW13TF

RD RR2EW13JQ 615 0 0
GGACAACCAAATCTCACATTCAACACTCTCCAGAAGAAGAAACTAACCCTAACCATTTGA
TTCCGATATGGCTCGCACCAAGCAAACCGCTAGAAAGTCCACCGGAGGCAAAGCCCCGAG
GAAGCAGCTCGCGACGAAAGCCGCGAGGAAATCAGCTCCGGCCACCGGAGGAGTGAAGAA
GCCGCACAGGTTTCGTCCCGGAACCGTCGCGTTGAGAGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAG
CACCGAGCTTCTGATCCGCAAGCTTCCCTTCCAGCGTCTGGTCCGTGAGATCGCTCAGGA
TTTCAAGACCGATCTGAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCCGCGCTACAAGAGGCTGCTGA
GGCTTACCTCGTTGGGTTGTTTGAAGACACGAATCTTTGCGCGATTCACGCTAAGAGAGT
CACGATCATGCCTAAGGATATCCAGCTCGCGAGGAGGATCCGTGGTGAAAGAGCTTGAAG
ACACTCTCGTGATCTCTGTTTAGCTCGTTAATGGTGACTTGTTATGTGTAATGTTTAGCC
TTTGTTATAATAGTCTTGAAGGTGTTCGACGAAATGTCAAAGTTTGTTAAGTTTAATATA
AATCGTATTTTGCCC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2EW13TF 615 0 0
GGACAACCAAATCTCACATTCAACACTCTCCAGAAGAAGAAACTAACCCTAACCATTTGA
TTCCGATATGGCTCGCACCAAGCAAACCGCTAGAAAGTCCACCGGAGGCAAAGCCCCGAG
GAAGCAGCTCGCGACGAAAGCCGCGAGGAAATCAGCTCCGGCCACCGGAGGAGTGAAGAA
GCCGCACAGGTTTCGTCCCGGAACCGTCGCGTTGAGAGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAG
CACCGAGCTTCTGATCCGCAAGCTTCCCTTCCAGCGTCTGGTCCGTGAGATCGCTCAGGA
TTTCAAGACCGATCTGAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCCGCGCTACAAGAGGCTGCTGA
GGCTTACCTCGTTGGGTTGTTTGAAGACACGAATCTTTGCGCGATTCACGCTAAGAGAGT
CACGATCATGCCTAAGGATATCCAGCTCGCGAGGAGGATCCGTGGTGAAAGAGCTTGAAG
ACACTCTCGTGATCTCTGTTTAGCTCGTTAATGGTGACTTGTTATGTGTAATGTTTAGCC
TTTGTTATAATAGTCTTGAAGGTGTTCGACGAAATGTCAAAGTTTGTTAAGTTTAATATA
AATCGTATTTTGCCC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL6876Contig1 638 2 2 U
TTTTTAAAAGTTCAGGCAGCTCAAATGGCGAAAGAAGTGAAGGATATGAAACAGAGACAG
ATCGCATCTTTTCTCAACACAATAGAGAGAGGAGTGAGCAAGAAGCTTCAGGAGAAAGAC
CACGAGATTGATATCATGAACAAGAAGAATAAAGAGCTCGTGGAGAGGATAAAGCAAATA
GCAATGGAGGCTCAAAATTGGCATTACAGAGCAAAGTACAATGAGTCTGTGGTTAACGTC
TTAAAGACAAATCTACAACAAGCAATGTCCCACAACAACAACAACAATGTGGTTGCTGGT
GCAGATCATGGTATAGAAGGGTTTGGAGACAGTGAAATAGATGATGCAGCTTCATCACAC
ATTGATCCAAACAACAACAACAACAACATGGGGAGTCAGAGGATGAGATGCAAGATGTGT
CATGGGAAAGAAGTATCGGTGTTGCTAGTGCCGTGTAGGCACTTGTGTTTGTGTAAGGAA
TGTGATGTATTCACTGGGTTTTGTCCTGTATGCAAGTCTTTGAAAACTTCTAGCGTTCAG
GTCTTCTTTTCCTGAAACAAAACAGAAAAGAATTGGGATACATTATATGAATCTTCCAAC
TTTTAAAAGCTTATTATTAATATTATTTCAAATTGTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG48JQB C 1
AF RR2GG48TF U 1
BS 1 627 RR2GG48TF
BS 628 638 RR2GG48JQB

RD RR2GG48JQB 638 0 0
TTTTTAAAAGTTCAGGCAGCTCAAATGGCGAAAGAAGTGAAGGATATGAAACAGAGACAG
ATCGCATCTTTTCTCAACACAATAGAGAGAGGAGTGAGCAAGAAGCTTCAGGAGAAAGAC
CACGAGATTGATATCATGAACAAGAAGAATAAAGAGCTCGTGGAGAGGATAAAGCAAATA
GCAATGGAGGCTCAAAATTGGCATTACAGAGCAAAGTACAATGAGTCTGTGGTTAACGTT
TTAAAGACAAATTTACAACAAGCAATGTCCCACAACAACAACAACAATGTGGTTGCTGGT
GCAGATCATGGTATAGAAGGGTTTGGAGACAGTGAAATAGATGATGCAGCTTCATCACAC
ATTGATCCAAACAACAACAACAACAACATGGGGAGTCAGAGGATGAGATGCAAGATGTGT
CATGGGAAAGAAGTATCGGTGTTGCTAGTGCCGTGTAGGCACTTGTGTTTGTGTAAGGAA
TGTGATGTATTCACTGGGTTTTGTCCTGTATGCAAGTCTTTGAAAACTTCTAGCGTTCAG
GTTTTCTTTTCCTGAAACAAAACAGAAAAGAATTGGGATACATTATATGAATCTTCCAAC
TTTTAAAAGCTTATTATTAATATTATTTCAAATTGTAT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2GG48TF 627 0 0
TTTTTAAAAGTTCAGGCAGCTCAAATGGCGAAAGAAGTGAAGGATATGAAACAGAGACAG
ATCGCATCTTTTCTCAACACAATAGAGAGAGGAGTGAGCAAGAAGCTTCAGGAGAAAGAC
CACGAGATTGATATCATGAACAAGAAGAATAAAGAGCTCGTGGAGAGGATAAAGCAAATA
GCAATGGAGGCTCAAAATTGGCATTACAGAGCAAAGTACAATGAGTCTGTGGTTAACGTC
TTAAAGACAAATCTACAACAAGCAATGTCCCACAACAACAACAACAATGTGGTTGCTGGT
GCAGATCATGGTATAGAAGGGTTTGGAGACAGTGAAATAGATGATGCAGCTTCATCACAC
ATTGATCCAAACAACAACAACAACAACATGGGGAGTCAGAGGATGAGATGCAAGATGTGT
CATGGGAAAGAAGTATCGGTGTTGCTAGTGCCGTGTAGGCACTTGTGTTTGTGTAAGGAA
TGTGATGTATTCACTGGGTTTTGTCCTGTATGCAAGTCTTTGAAAACTTCTAGCGTTCAG
GTCTTCTTTTCCTGAAACAAAACAGAAAAGAATTGGGATACATTATATGAATCTTCCAAC
TTTTAAAAGCTTATTATTAATATTATT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL6877Contig1 1039 2 2 U
GCAACAGAGGACGCTTCTTCTCTTTCCACCGGCGACGTCGCCGATGATTACTATGCCGTT
CTCGGACTGCTTCCGGATGCGACGCCAGAGGAGATTAAGAAAGCATACTATAACTGTATG
AAGTCTTGCCATCTTGACTTGAGTGGCAATGACCCTGAAACCACAAACTTCTGCATGTTC
ATTAACGATGTCTATGAGATTCTTAGTGACCCTGTACAGAGAATGGTTTACGATGAGATT
CATGGGTATGCAGTGACTGCTACCAATCCTTTTCTTGATGACTCTAGCCCTAAGGATCAC
GTTTTTGTTGATGAGTTTGCTTGTATAGGCTGCAAAAACTGTGCCAATGTGGCTCCAGAT
ATATTTGAAATTGAGGAGGACTTTGGAAGAGCAAGGGCTTGTAACCAGCGTGGCAACCCT
GATTTACTTCAACAAGCAGTTGAAACATGCCCGGTTGATTGTATCTATCAGACTTCTGCG
GCACAGTTGTCTTTGCTTGAAGATGAAATGCGTAGGGTTGAAAGAGTGAATGTTGCTCTG
ATGCTTTCTGGAATGGGGTCAGGAGCCGTTGATGTTTTCAGAATGGCGAGATCTCGATGG
GAAAAAAGGCAAGCAAAAGTCTTGAATCAAGCTAGAAGTAGAATGATGAAGCGGAAAAGC
ACAGATGAAACACCTTCCTATTGGGATAACCTCTGGGGCCAAGACAATCAATACCAGAAA
AGCGAGGAAGAAGTACAAGAACGAGCTCAACGAGCCGCTGCAGCAGCCAGAAGATGGAGG
GAGTACTCACGAAGAGGCGTGGATAAGCGCCCCACGTTCAAACTCCCTGACTCCTCATCC
TCCAGAGGAAACAACTGAAAACCACCCTCCAGACATGAATCTTAATGGTAGTAAAGTATA
TATGTAATAACTTCACCGTTCCTAGACTTGTATAGCTCTCTTCCCATATCGATTTGTGGA
AGAATAAAAACTAAGTGTATTAAACGTTTTCATTTTCATGTATGATATACTCTTATGTAT
ATAAGTCTCTCTCCAAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN40TF U 1
AF RR2AN40JQ C 86
BS 1 777 RR2AN40TF
BS 778 1039 RR2AN40JQ

RD RR2AN40TF 777 0 0
GCAACAGAGGACGCTTCTTCTCTTTCCACCGGCGACGTCGCCGATGATTACTATGCCGTT
CTCGGACTGCTTCCGGATGCGACGCCAGAGGAGATTAAGAAAGCATACTATAACTGTATG
AAGTCTTGCCATCTTGACTTGAGTGGCAATGACCCTGAAACCACAAACTTCTGCATGTTC
ATTAACGATGTCTATGAGATTCTTAGTGACCCTGTACAGAGAATGGTTTACGATGAGATT
CATGGGTATGCAGTGACTGCTACCAATCCTTTTCTTGATGACTCTAGCCCTAAGGATCAC
GTTTTTGTTGATGAGTTTGCTTGTATAGGCTGCAAAAACTGTGCCAATGTGGCTCCAGAT
ATATTTGAAATTGAGGAGGACTTTGGAAGAGCAAGGGCTTGTAACCAGCGTGGCAACCCT
GATTTACTTCAACAAGCAGTTGAAACATGCCCGGTTGATTGTATCTATCAGACTTCTGCG
GCACAGTTGTCTTTGCTTGAAGATGAAATGCGTAGGGTTGAAAGAGTGAATGTTGCTCTG
ATGCTTTCTGGAATGGGGTCAGGAGCCGTTGATGTTTTCAGAATGGCGAGATCTCGATGG
GAAAAAAGGCAAGCAAAAGTCTTGAATCAAGCTAGAAGTAGAATGATGAAGCGGAAAAGC
ACAGATGAAACACCTTCCTATTGGGATAACCTCTGGGGCCAAGACAATCAATACCAGAAA
AGCGAGGAAGAAGTACAAGAACGAGCTCAACGAGCCGCTGCAGCAGCCAGAAGATGG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2AN40JQ 954 0 0
CAGAGGAGATTAAGAAAGCATACTATAACTGTATGAAGTCTTGCCATCTTGACTTGAGTG
GCAATGACC*TGAAACCACAAACTTCTGCATGT*CATTAACGATGTCTATGAGATTCTTA
GTGACCCTGTACAGAGAATGGTTTACGATGAGATTCATGGGTATGCAGTGACTGCTACCA
ATCCTTTTCTTGATGACTCTAGCCCTAAGGATCACGTTTTTGTTGATGAGTTTGCTTGTA
TAGGCTGCAAAAACTGTGCCAATGTGGCTCCAGATATATTTGAAATTGAGGAGGACTTTG
GAAGAGCAAGGGCTTGTAACCAGCGTGGCAACCCTGATTTACTTCAACAAGCAGTTGAAA
CATGCCCGGTTGATTGTATCTATCAGACTTCTGCGGCACAGTTGTCTTTGCTTGAAGATG
AAATGCGTAGGGTTGAAAGAGTGAATGTTGCTCTGATGCTTTCTGGAATGGGGTCAGGAG
CCGTTGATGTTTTCAGAATGGCGAGATCTCGATGGGAAAAAAGGCAAGCAAAAGTCTTGA
ATCAAGCTAGAAGTAGAATGATGAAGCGGAAAAGCACAGATGAAACACCTTCCTATTGGG
ATAACCTCTGGGGCCAAGACAATCAATACCAGAAAAGCGAGGAAGAAGTACAAGAACGAG
CTCAACGAGCCGCTGCAGCAGCCAGAAGATGGAGGGAGTACTCACGAAGAGGCGTGGATA
AGCGCCCCACGTTCAAACTCCCTGACTCCTCATCCTCCAGAGGAAACAACTGAAAACCAC
CCTCCAGACATGAATCTTAATGGTAGTAAAGTATATATGTAATAACTTCACCGTTCCTAG
ACTTGTATAGCTCTCTTCCCATATCGATTTGTGGAAGAATAAAAACTAAGTGTATTAAAC
GTTTTCATTTTCATGTATGATATACTCTTATGTATATAAGTCTCTCTCCAAGGT

QA 1 954 1 954
DS 



AS 1 2

CO CL6878Contig1 708 2 4 U
GGGAGAAGGGATCGATTAGGGTTCGTTTTCGTCGGAATATTCTATAACAATCGGAGGCAT
GAGCTCGACGGAGGGCGTGATAAAGTCGATCCAGGGCCTATCAGGGAGCTCCGGGGACTT
ATCTGCACTCCACCGTATTCTGAAAGGAGCTGAGGAGACGCTCCGAACCGACTCGGATCT
TCAACTCTCTACTCTCGACCAGCTCCACCCTTCCAAGCATTCTCTCGGCTACCTCTATCT
CCTAGATGTTCTTACGTGTGGTTCAGTGTCCAAGGAGAAAGCTTTGCTAATTTCTCGGTT
CATTACTTGTTGCGATGCTGAGCAGATTCGTTTAGCAAGCGACAAATTTGTGTCTCTTTG
TAAGAGATTCAAAGACATAGTTTTGGAGCTCAGAGATCCCTTACGAGGGGTGGCGCCACT
GTTGACAGCTGTTCGTAAGGTTCAGGTCTCCACCAAACGTTTGACTGCATTGCATCCGGA
TTGTCTTCAACTATGTCTGCAGGCTAAGTTCTATAAAGCGGGTTTATCCGTTCTTAGTGA
CGATATCTTGGAGGTTGACCTGCCTAGGGATTTCTATCTCTATTGCTATTATGGGGGGAA
TGATATGCATTGGACTGAAGAAATTCCAGAAAGCATTGGAGCTTCTTTTACAATGTTGTC
ACTGCTCCAATGCCTACTCTCAACGCCATAGCTCTTGAGGCGTATAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2AG84TF U 1
AF RR2GP35TF U 449
BS 1 648 RR2AG84TF
BS 649 649 RR2GP35TF
BS 650 705 RR2AG84TF
BS 706 708 RR2GP35TF

RD RR2AG84TF 705 0 0
GGGAGAAGGGATCGATTAGGGTTCGTTTTCGTCGGAATATTCTATAACAATCGGAGGCAT
GAGCTCGACGGAGGGCGTGATAAAGTCGATCCAGGGCCTATCAGGGAGCTCCGGGGACTT
ATCTGCACTCCACCGTATTCTGAAAGGAGCTGAGGAGACGCTCCGAACCGACTCGGATCT
TCAACTCTCTACTCTCGACCAGCTCCACCCTTCCAAGCATTCTCTCGGCTACCTCTATCT
CCTAGATGTTCTTACGTGTGGTTCAGTGTCCAAGGAGAAAGCTTTGCTAATTTCTCGGTT
CATTACTTGTTGCGATGCTGAGCAGATTCGTTTAGCAAGCGACAAATTTGTGTCTCTTTG
TAAGAGATTCAAAGACATAGTTTTGGAGCTCAGAGATCCCTTACGAGGGGTGGCGCCACT
GTTGACAGCTGTTCGTAAGGTTCAGGTCTCCACCAAACGTTTGACTGCATTGCATCCGGA
TTGTCTTCAACTATGTCTGCAGGCTAAGTTCTATAAAGCGGGTTTATCCGTTCTTAGTGA
CGATATCTTGGAGGTTGACCTGCCTAGGGATTTCTATCTCTATTGCTATTATGGGGGGAA
TGATATGCATTGGACTGAAGAAATTCCAGAAAGCATTGGAGCTTCTTT*ACAATGTTGTC
ACTGCTCCAATGCCTACTCTCAACGCCATAGCTCTTGAGGCGTAT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2GP35TF 260 0 0
TCCACCAAATGTTTGACTGCATTGCATCCGGATTGTCTTCAACTATGTCTGCAGGCTAAG
TTCTTTAAAGCGGGTTTATCCGTTCTTAGTGACGATATCTTGGAGGTTGACTTGCCTAGG
GATTTCTATCTCTATTGCTATTATGGGGG*AATGATATGCATTGGACTGAAGAAATTCCA
GAAAGCATTGGAGCTTCTTTTACAATGTTGTCACTGCTCCAATGCCTACTCTCAACGCCA
TAGCTCTTGAGGCGTATAAG

QA 1 260 1 260
DS 



AS 1 2

CO CL6879Contig1 595 2 1 U
GGGCACAAATGATAAACCGATAGCTAATGCTGCAGCTATATCCGCCGTGCCTCTCATGAT
CCTCACCGGTTTAGCACTTGCCGGTACAGCCGTGGTGTTAATGGTTATGACGCCGGTTTT
TTTAGTTCTTAGTCCGATTCTCGTAACGGCGGTTATCACTTCGAGTTTCTTGGTCACGGG
GTTCTTAGCTTCTGGTAGGCTTGGAGCATCGGCGATCGCCCTCTTCGTCTGGCTCTACAA
GGAGTTAATTAAGTAATCAAGATTTTTATCGTGAAAATATTAACTAAGCAGCTCTTCTTA
ATTAAACAACTTGAAACATTCATCGATTCGTGACATGCTTGGTTAGGCTGATACATTACG
TACAGACGACGGACAACAAACATATGTATTGATATGGAATCATATAAATTTATACGTACT
TATCAAAATAAATAAATAGATTTGTACATAGATTTTGATTTCTAAAGATTTAAATAGATA
TAATTAATAAAATAGGTAGAAGTAAACTAAGTTTTCTTAGGTACAACAACATTCATTTTT
ATTTTCGTTTGTTAGACTTTGCTTTGTTATAGCAACAAATAATGGTTTGAGAAAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AV88JQ C 1
AF RR2AV88TF U 1
BS 1 595 RR2AV88TF

RD RR2AV88JQ 595 0 0
GGGCACAAATGATAAACCGATAGCTAATGCTGCAGCTATATCCGCCGTGCCTCTCATGAT
CCTCACCGGTTTAGCACTTGCCGGTACAGCCGTGGTGTTAATGGTTATGACGCCGGTTTT
TTTAGTTCTTAGTCCGATTCTCGTAACGGCGGTTATCACTTCGAGTTTCTTGGTCACGGG
GTTCTTAGCTTCTGGTAGGCTTGGAGCATCGGCGATCGCCCTCTTCGTCTGGCTCTACAA
GGAGTTAATTAAGTAATCAAGATTTTTATCGTGAAAATATTAACTAAGCAGCTCTTCTTA
ATTAAACAACTTGAAACATTCATCGATTCGTGACATGCTTGGTTAGGCTGATACATTACG
TACAGACGACGGACAACAAACATATGTATTGATATGGAATCATATAAATTTATACGTACT
TATCAAAATAAATAAATAGATTTGTACATAGATTTTGATTTCTAAAGATTTAAATAGATA
TAATTAATAAAATAGGTAGAAGTAAACTAAGTTTTCTTAGGTACAACAACATTCATTTTT
ATTTTCGTTTGTTAGACTTTGCTTTGTTATAGCAACAAATAATGGTTTGAGAAAC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2AV88TF 595 0 0
GGGCACAAATGATAAACCGATAGCTAATGCTGCAGCTATATCCGCCGTGCCTCTCATGAT
CCTCACCGGTTTAGCACTTGCCGGTACAGCCGTGGTGTTAATGGTTATGACGCCGGTTTT
TTTAGTTCTTAGTCCGATTCTCGTAACGGCGGTTATCACTTCGAGTTTCTTGGTCACGGG
GTTCTTAGCTTCTGGTAGGCTTGGAGCATCGGCGATCGCCCTCTTCGTCTGGCTCTACAA
GGAGTTAATTAAGTAATCAAGATTTTTATCGTGAAAATATTAACTAAGCAGCTCTTCTTA
ATTAAACAACTTGAAACATTCATCGATTCGTGACATGCTTGGTTAGGCTGATACATTACG
TACAGACGACGGACAACAAACATATGTATTGATATGGAATCATATAAATTTATACGTACT
TATCAAAATAAATAAATAGATTTGTACATAGATTTTGATTTCTAAAGATTTAAATAGATA
TAATTAATAAAATAGGTAGAAGTAAACTAAGTTTTCTTAGGTACAACAACATTCATTTTT
ATTTTCGTTTGTTAGACTTTGCTTTGTTATAGCAACAAATAATGGTTTGAGAAAC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

CO CL6880Contig1 1488 2 2 U
AGAATCTTGATTCTTGAAAGTGGAGAAACGAAACAAGAGACGAGTGATACTCTTCCCTCT
ACCATTACAAGGCTGCATAAACCCTATGCTTCAGCTAGCAAAGATCCTGTTCTCAAGAGG
CTTCTCAATCACCATCATCCACACGCGCTTCAACGCGCCCAAATCGTCAGACCACCCTCT
CTTCACTTTCCTACAGCTCCCCGACGGCTTGTCCGAAAGCCAGACGCAGTCTCGCGACGT
CCTGCTTCAGCTTACCCTTCTCAACAACAACTGCGGGAACCCGTTAAGACAGTGTTTGGC
TAACCTCATCAAACCTGAGGAAGGTTGTGAGATCAGCTGTTTGATCGATGATTCTGGTTG
GGTTTTCACACAGTCCGTTGCGGATAGTTTCAATCTTCCGAGATTCGTCCTCTGTGCCTA
TAAGTTCACGTTCTTTCTCCTTGTCCCTCAGCTTCGCCGTGAAGGGTTTCTTCCGTTTCC
AGATTCCGAAGCAGAGGACTCTGTTCCGCTGTTTCAACCGCTTCGAAAGAAAGATCTCGC
GAGAATCATGGGAAACAAAGATCAGGCTGAGCCGCTGGATGCTTACTTGGTCAAGATACT
CGAAACGATTAACTCAGCTTCAGGCCTCATAGTCATGTCCTGCGAAGAGCTCGACAGAGA
TTCGATCGACGAGTCCCACAGAGTCTTCACCTTTCCTATATACCCCATAGGCCCACCTCA
CATCCATGACGTCCCAGCCTCGTCTAGCAGCTTGTTCGAACCAGACCAAAGCTGCATTCC
ATGGTTGGATAAGCAAGAAACGAGATCAGTGATCTACGTGAGCTTAGGGAGCATTGTGAG
TGTAACCGAGTCTCAGTTCTTGGAGATTGCTTGTGGCTTACGCCAAACAAACCTATCTTT
CTTGTGGGTTGTCAGGCCTGGTTCTGTCCAAGGCAGTGACTGGATCGAGTCGTTACCATT
AGGGTTCATGGAAGGTCTTAACGGGAAGGGAAAGATAGTGAAATGGGCACCGCAGATAGA
TGTTCTCGCGCATATAGCCACGGGTGGGTTTTTGACTCATAATGGATGGAACTCGACGCT
AGAGAGTATATGCGAAGGGGTTCCTATGATCAGCTTGCCTTTTGTGTGGGACCAGTGGCT
TAACGCGAGATTCGTTAGTGATGTATGGAGGATAGGGATTCACTTGGAAGATTGCATAGA
GAGAAGAGTAATCGAGAGAGCCGTGACAAGACTAATGGCTCAACCCGAAGGGGAAGAGAT
TCGAGGGAGAGTTAAAGTGCTGCGAGATGAAGCAAGAAGATCGGTTCAACGAGGAGGGTC
GTCATCTCGGCATCTAGATGATCTGGTTGATCGTATTACATCCTTCTAGCTTCGTAGTTT
GAATAGAGTGTGATCACTAATTCACTATTCATTAGAAAAAAAAGAATGTGACTGTTATAT
GTTGTATATTGTGACTCATGAACTTCTTAAAAAACTATTTGCTCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F423TF U 1
AF RR2F423JQ C 648
BS 1 756 RR2F423TF
BS 757 1488 RR2F423JQ

RD RR2F423TF 756 0 0
AGAATCTTGATTCTTGAAAGTGGAGAAACGAAACAAGAGACGAGTGATACTCTTCCCTCT
ACCATTACAAGGCTGCATAAACCCTATGCTTCAGCTAGCAAAGATCCTGTTCTCAAGAGG
CTTCTCAATCACCATCATCCACACGCGCTTCAACGCGCCCAAATCGTCAGACCACCCTCT
CTTCACTTTCCTACAGCTCCCCGACGGCTTGTCCGAAAGCCAGACGCAGTCTCGCGACGT
CCTGCTTCAGCTTACCCTTCTCAACAACAACTGCGGGAACCCGTTAAGACAGTGTTTGGC
TAACCTCATCAAACCTGAGGAAGGTTGTGAGATCAGCTGTTTGATCGATGATTCTGGTTG
GGTTTTCACACAGTCCGTTGCGGATAGTTTCAATCTTCCGAGATTCGTCCTCTGTGCCTA
TAAGTTCACGTTCTTTCTCCTTGTCCCTCAGCTTCGCCGTGAAGGGTTTCTTCCGTTTCC
AGATTCCGAAGCAGAGGACTCTGTTCCGCTGTTTCAACCGCTTCGAAAGAAAGATCTCGC
GAGAATCATGGGAAACAAAGATCAGGCTGAGCCGCTGGATGCTTACTTGGTCAAGATACT
CGAAACGATTAACTCAGCTTCAGGCCTCATAGTCATGTCCTGCGAAGAGCTCGACAGAGA
TTCGATCGACGAGTCCCACAGAGTCTTCACCTTTCCTATATACCCCATAGGCCCACCTCA
CATCCATGACGTCCCAGCCTCGTCTAGCAGCTTGTT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2F423JQ 841 0 0
AGCTCGACAGAGATTCGATCGACGAGTCCCACAGAGTCTTCACCTTTCCTATATACCCCA
TAGGCCCACCTCACATCCATGACGTCCCAGCCTCGTCTAGCAGCTTGTTCGAACCAGACC
AAAGCTGCATTCCATGGTTGGATAAGCAAGAAACGAGATCAGTGATCTACGTGAGCTTAG
GGAGCATTGTGAGTGTAACCGAGTCTCAGTTCTTGGAGATTGCTTGTGGCTTACGCCAAA
CAAACCTATCTTTCTTGTGGGTTGTCAGGCCTGGTTCTGTCCAAGGCAGTGACTGGATCG
AGTCGTTACCATTAGGGTTCATGGAAGGTCTTAACGGGAAGGGAAAGATAGTGAAATGGG
CACCGCAGATAGATGTTCTCGCGCATATAGCCACGGGTGGGTTTTTGACTCATAATGGAT
GGAACTCGACGCTAGAGAGTATATGCGAAGGGGTTCCTATGATCAGCTTGCCTTTTGTGT
GGGACCAGTGGCTTAACGCGAGATTCGTTAGTGATGTATGGAGGATAGGGATTCACTTGG
AAGATTGCATAGAGAGAAGAGTAATCGAGAGAGCCGTGACAAGACTAATGGCTCAACCCG
AAGGGGAAGAGATTCGAGGGAGAGTTAAAGTGCTGCGAGATGAAGCAAGAAGATCGGTTC
AACGAGGAGGGTCGTCATCTCGGCATCTAGATGATCTGGTTGATCGTATTACATCCTTCT
AGCTTCGTAGTTTGAATAGAGTGTGATCACTAATTCACTATTCATTAGAAAAAAAAGAAT
GTGACTGTTATATGTTGTATATTGTGACTCATGAACTTCTTAAAAAACTATTTGCTCTGT
T

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 2

CO CL6881Contig1 402 2 1 U
GGTGGCACGTGAGTTTTCTAGGGAAGGTGGCAACACAGCTAAAAAGACGCTCCCTACAGC
ATTACCTTCTCAAGTGGAGAAACAAAACAATGAGACAAGCAGGTCAAGTAGTTCAAGCAG
CTCTTCCAGTAGTTCCAGCTCTTCTAGTGATTCGGACAGCGATAGCTCTTCGTCATCTGG
ATCATGATCAAGACCTAGAGACTTTGGTGGAGAAAAATATGTAAGGTCATCCAAAGATCC
ATCTCATATCATCCATTGTTGATCTGTTAATAAGAAGCTTCTGTTGACTGTTTGCTAAAC
AACACACGTGTTAATGGAATCTTTTTCAACGGATCTTACTTGTTGTCTCTGTTTTGGTAT
GGTTGTAAACTTGTAATATTTTTATGTGATTGGTCTTGTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DX30JQ C 1
AF RR2DX30TF U 1
BS 1 402 RR2DX30TF

RD RR2DX30JQ 402 0 0
GGTGGCACGTGAGTTTTCTAGGGAAGGTGGCAACACAGCTAAAAAGACGCTCCCTACAGC
ATTACCTTCTCAAGTGGAGAAACAAAACAATGAGACAAGCAGGTCAAGTAGTTCAAGCAG
CTCTTCCAGTAGTTCCAGCTCTTCTAGTGATTCGGACAGCGATAGCTCTTCGTCATCTGG
ATCATGATCAAGACCTAGAGACTTTGGTGGAGAAAAATATGTAAGGTCATCCAAAGATCC
ATCTCATATCATCCATTGTTGATCTGTTAATAAGAAGCTTCTGTTGACTGTTTGCTAAAC
AACACACGTGTTAATGGAATCTTTTTCAACGGATCTTACTTGTTGTCTCTGTTTTGGTAT
GGTTGTAAACTTGTAATATTTTTATGTGATTGGTCTTGTTCC

QA 1 402 1 402
DS 

RD RR2DX30TF 402 0 0
GGTGGCACGTGAGTTTTCTAGGGAAGGTGGCAACACAGCTAAAAAGACGCTCCCTACAGC
ATTACCTTCTCAAGTGGAGAAACAAAACAATGAGACAAGCAGGTCAAGTAGTTCAAGCAG
CTCTTCCAGTAGTTCCAGCTCTTCTAGTGATTCGGACAGCGATAGCTCTTCGTCATCTGG
ATCATGATCAAGACCTAGAGACTTTGGTGGAGAAAAATATGTAAGGTCATCCAAAGATCC
ATCTCATATCATCCATTGTTGATCTGTTAATAAGAAGCTTCTGTTGACTGTTTGCTAAAC
AACACACGTGTTAATGGAATCTTTTTCAACGGATCTTACTTGTTGTCTCTGTTTTGGTAT
GGTTGTAAACTTGTAATATTTTTATGTGATTGGTCTTGTTCC

QA 1 402 1 402
DS 



AS 1 2

CO CL6882Contig1 740 2 2 U
GGAAATTAACAAGGCCAGTTTTGAATTCGTTAGCATCGAAGGAACACATCCAGGTAAATA
GAAAAAACAAGTTCTCTGTCAAGAAGCAACCAAGAGAAAAAAAAAAGCTTGTTGGAATTC
AAGTTTCTAAGAAGCACACATCATCTGAGTGCTTAAGTTACTGAGGCAGCTCGAGATCAG
GTCTACGATCAAAAGCATCACTGGTGGACTCATCTGGAAATGCGTCTGGATAGGTAGCCA
GAATCTTACTCTTTATGCTCCTGAAACATGAAGAGGACTCCTTTGTAAGTAAGAAACAAA
CAAGTCCTCGAGTCAGAGCTGAAACTGAGACAAGAAGGGGCATAACCTAAGTTTCAAGAA
GATGTAATCGAGGTCAGCTTTCATGGATTTCAAAAGCCGAGTGTTTCTAGAGAAGTCCAA
TGATACATCAGCGAAGCAATTCTCTGCAAAGTCGTTGTAATGGGACAGAACTGCATTGCT
ATCCTGTAGCCTCCCCAATCTTTACCAAATCAAATAATCAAGCAAGCGTTGTGAATCAAA
TAATCATCAACCATATCGAACGATGATGATTATAAAAAGACATTTTTTAACATACATGAG
GTGCTGCAAGTGTCTGAGAGAATTGAGATCTTGTGCATTAACAAGAGTTTTGAACTCTTC
AGATACTTGTTCTGAAGCTTCTCTTATTGGTTCTTCCATCTTCTCAGAGTTTTTTCAAAT
AAAAAAACAAGCACAGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E176TF U 1
AF RR2E176JQ C 95
BS 1 709 RR2E176TF
BS 710 740 RR2E176JQ

RD RR2E176TF 709 0 0
GGAAATTAACAAGGCCAGTTTTGAATTCGTTAGCATCGAAGGAACACATCCAGGTAAATA
GAAAAAACAAGTTCTCTGTCAAGAAGCAACCAAGAGAAAAAAAAAAGCTTGTTGGAATTC
AAGTTTCTAAGAAGCACACATCATCTGAGTGCTTAAGTTACTGAGGCAGCTCGAGATCAG
GTCTACGATCAAAAGCATCACTGGTGGACTCATCTGGAAATGCGTCTGGATAGGTAGCCA
GAATCTTACTCTTTATGCTCCTGAAACATGAAGAGGACTCCTTTGTAAGTAAGAAACAAA
CAAGTCCTCGAGTCAGAGCTGAAACTGAGACAAGAAGGGGCATAACCTAAGTTTCAAGAA
GATGTAATCGAGGTCAGCTTTCATGGATTTCAAAAGCCGAGTGTTTCTAGAGAAGTCCAA
TGATACATCAGCGAAGCAATTCTCTGCAAAGTCGTTGTAATGGGACAGAACTGCATTGCT
ATCCTGTAGCCTCCCCAATCTTTACCAAATCAAATAATCAAGCAAGCGTTGTGAATCAAA
TAATCATCAACCATATCGAACGATGATGATTATAAAAAGACATTTTTTAACATACATGAG
GTGCTGCAAGTGTCTGAGAGAATTGAGATCTTGTGCATTAACAAGAGTTTTGAACTCTTC
AGATACTTGTTCTGAAGCTTCTCTTATTGGTTCTTCCATCTTCTCAGAG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2E176JQ 646 0 0
AGAAAAAAAAAAGCTTGTTGGAATTCAAGTTTCTAAGAAGCACACATCATCTGAGTGCTT
AAGTTACTGAGGCAGCTCGAGATCAGGTCTACGATCAAAAGCATCACTGGTGGACTCATC
TGGAAATGCGTCTGGATAGGTAGCCAGAATCTTACTCTTTATGCTCCTGAAACATGAAGA
GGACTCCTTTGTAAGTAAGAAACAAACAAGTCCTCGAGTCAGAGCTGAAACTGAGACAAG
AAGGGGCATAACCTAAGTTTCAAGAAGATGTAATCGAGGTCAGCTTTCATGGATTTCAAA
AGCCGAGTGTTTCTAGAGAAGTCCAATGATACATCAGCGAAGCAATTCTCTGCAAAGTCG
TTGTAATGGGACAGAACTGCATTGCTATCCTGTAGCCTCCCCAATCTTTACCAAATCAAA
TAATCAAGCAAGCGTTGTGAATCAAATAATCATCAACCATATCGAACGATGATGATTATA
AAAAGACATTTTTTAACATACATGAGGTGCTGCAAGTGTCTGAGAGAATTGAGATCTTGT
GCATTAACAAGAGTTTTGAACTCTTCAGATACTTGTTCTGAAGCTTCTCTTATTGGTTCT
TCCATCTTCTCAGAGTTTTTTCAAATAAAAAAACAAGCACAGATTC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL6883Contig1 788 2 2 U
TGCATGGTATTGTACTCCATGTGAGGTGTACATGTGTACGTGGAGTGAATTAAGAAAATA
GTAGTGGTTACACAAATCAAATAAAATATTGAAATTGTTACAAGTATATACAAGGAATTG
TCGATGTGTACAAATTTCTATCTAGAAAACCACACGTAAATCAGTTCTTCTGTACATTGC
ACAATTTATAATAATTTTTGTAATATTTTGTAAACAGTCAGAAGTTACGAGGACCAATTG
TGAAAATAATTAAAAATTCACCATTGAAGGAGCTTCTGAGCTTCTAGTTCTGAAGATAGC
CTCGCGAGAAGCGACTACTCCGAAGCTTCAAGAGAAACTGTCACGGCTCGAAATGAAGTC
ACACCGGTGATATATTCGAGCACAGCCGCGACTTGATTATGAACCGCGGCGAGTAAAGCT
TTTCAAGGACGAGCGCTCATCCGGTGGTCCAAATAAGTATTGTCGCCAGAGTGAACCTAT
CATAACTCTCGCTGGAAAAAGTCAAACATTAAATCACTGGATTGTATCGAGATGACTAAC
GACGAAGAAGACATAAAGCTCGACATAAAATTTTATTTTCCACTGCTACAAGCTTCTACG
GCGGCTCTCCCCTATATCTCATGCTCACCGTTCTTCATCTTGAAGCTTAGGGATTTTGTT
CTGCTTGATGTCGGATCAAGCAAAGAAGTTCTTGTCATCAGATTTATCAGCTTATAGATT
TTGAAAATTTTAATATGAAATAGTGATAGCTGAATCAAGAGAGATGGTGAAAATTCAATA
TGATCTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AF57TF C 1
AF RR2AF57JQ U 2
BS 1 1 RR2AF57TF
BS 2 788 RR2AF57JQ

RD RR2AF57TF 788 0 0
TGCATGGTATTGTACTCCATGTGAGGTGTACATGTGTACGTGGAGTGAATTAAGAAAATA
GTAGTGGTTACACAAATCAAATAAAATATTGAAATTGTTACAAGTATATACAAGGAATTG
TCGATGTGTACAAATTTCTATCTAGAAAACCACACGTAAATCAGTTCTTCTGTACATTGC
ACAATTTATAATAATTTTTGTAATATTTTGTAAACAGTCAGAAGTTACGAGGACCAATTG
TGAAAATAATTAAAAATTCACCATTGAAGGAGCTTCTGAGCTTCTAGTTCTGAAGATAGC
CTCGCGAGAAGCGACTACTCCGAAGCTTCAAGAGAAACTGTCACGGCTCGAAATGAAGTC
ACACCGGTGATATATTCGAGCACAGCCGCGACTTGATTATGAACCGCGGCGAGTAAAGCT
TTTCAAGGACGAGCGCTCATCCGGTGGTCCAAATAAGTATTGTCGCCAGAGTGAACCTAT
CATAACTCTCGCTGGAAAAAGTCAAACATTAAATCACTGGATTGTATCGAGATGACTAAC
GACGAAGAAGACATAAAGCTCGACATAAAATTTTATTTTCCACTGCTACAAGCTTCTACG
GCGGCTCTCCCCTATATCTCATGCTCACCGTTCTTCATCTTGAAGCTTAGGGATTTTGTT
CTGCTTGATGTCGGATCAAGCAAAGAAGTTCTTGTCATCAGATTTATCAGCTTATAGATT
TTGAAAATTTTAATATGAAATAGTGATAGCTGAATCAAGAGAGATGGTGAAAATTCAATA
TGATCTCC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RR2AF57JQ 787 0 0
GCATGGTATTGTACTCCATGTGAGGTGTACATGTGTACGTGGAGTGAATTAAGAAAATAG
TAGTGGTTACACAAATCAAATAAAATATTGAAATTGTTACAAGTATATACAAGGAATTGT
CGATGTGTACAAATTTCTATCTAGAAAACCACACGTAAATCAGTTCTTCTGTACATTGCA
CAATTTATAATAATTTTTGTAATATTTTGTAAACAGTCAGAAGTTACGAGGACCAATTGT
GAAAATAATTAAAAATTCACCATTGAAGGAGCTTCTGAGCTTCTAGTTCTGAAGATAGCC
TCGCGAGAAGCGACTACTCCGAAGCTTCAAGAGAAACTGTCACGGCTCGAAATGAAGTCA
CACCGGTGATATATTCGAGCACAGCCGCGACTTGATTATGAACCGCGGCGAGTAAAGCTT
TTCAAGGACGAGCGCTCATCCGGTGGTCCAAATAAGTATTGTCGCCAGAGTGAACCTATC
ATAACTCTCGCTGGAAAAAGTCAAACATTAAATCACTGGATTGTATCGAGATGACTAACG
ACGAAGAAGACATAAAGCTCGACATAAAATTTTATTTTCCACTGCTACAAGCTTCTACGG
CGGCTCTCCCCTATATCTCATGCTCACCGTTCTTCATCTTGAAGCTTAGGGATTTTGTTC
TGCTTGATGTCGGATCAAGCAAAGAAGTTCTTGTCATCAGATTTATCAGCTTATAGATTT
TGAAAATTTTAATATGAAATAGTGATAGCTGAATCAAGAGAGATGGTGAAAATTCAATAT
GATCTCC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL6884Contig1 806 2 2 U
GGGATCCATGTCAAAACCACAACCATGAACGTTCCAATAAAACTAGCCTTTCTCTTCTTA
ACCGTCACCTCAGCCGCAACGGCTAAACCAGCCAAACGCACAGACTATCTTTCCACAGTG
CACGCAAAAACAATCGCGGGAATATGCACCGTTATCGAATCAGACACAAGTCTATGCACC
ACAACCCTCAAAGAAGTTCCTAGCGATGACCCCATCACATTAATCCAAGCATTACCTACT
GCGGCTGAATCTTCCGTCAAAAAAAGCGTGACTTTCCTCATCGGAATCAAACCAAAACAC
ACATCAAACGCAGTCGCAACTGCAGCGATCAACAGCTGCGAGAAAAACTTGAATAACGCG
TTAGAAGATTTCGCTGAGTTTTGGAAAGCTACGGGGAAAGATGTAACAACGTTGGCTCGT
AACTATTTCACGTGTAAGAAAACGTTAACGTCGATCATGGGGTATCATTCAACGTGTTTG
GATGATATTGAAGATAAGGATCTGAAGAAGGAAGTGGGGAGTGGGGATTGGTGTTGGCAA
GAACCTAAGCAGTGACTCGTTTGATGTGTTCAATGGTTTGCCTACTATTTTCAAGACTTT
TAGTATTAACGTGAAGCTTAACGAGAAGACACTTCGCCCCGACCGCCACCTTTGTCGGAT
TATTATTACTGATTAAAGGATTTGTAAATAATAACTCATTACTATCGTATAATGCTTAAA
GCGATACTTGTAGAGATACTTATCATGTAGGGTACTATTGTAACCATTGATTCTAATATA
GTGAAATATAATATTGGAATTGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO81TF U 1
AF RR2CO81JQ C 73
BS 1 661 RR2CO81TF
BS 662 806 RR2CO81JQ

RD RR2CO81TF 661 0 0
GGGATCCATGTCAAAACCACAACCATGAACGTTCCAATAAAACTAGCCTTTCTCTTCTTA
ACCGTCACCTCAGCCGCAACGGCTAAACCAGCCAAACGCACAGACTATCTTTCCACAGTG
CACGCAAAAACAATCGCGGGAATATGCACCGTTATCGAATCAGACACAAGTCTATGCACC
ACAACCCTCAAAGAAGTTCCTAGCGATGACCCCATCACATTAATCCAAGCATTACCTACT
GCGGCTGAATCTTCCGTCAAAAAAAGCGTGACTTTCCTCATCGGAATCAAACCAAAACAC
ACATCAAACGCAGTCGCAACTGCAGCGATCAACAGCTGCGAGAAAAACTTGAATAACGCG
TTAGAAGATTTCGCTGAGTTTTGGAAAGCTACGGGGAAAGATGTAACAACGTTGGCTCGT
AACTATTTCACGTGTAAGAAAACGTTAACGTCGATCATGGGGTATCATTCAACGTGTTTG
GATGATATTGAAGATAAGGATCTGAAGAAGGAAGTGGGGAGTGGGGATTGGTGTTGGCAA
GAACCTAAGCAGTGACTCGTTTGATGTGTTCAATGGTTTGCCTACTATTTTCAAGACTTT
TAGTATTAACGTGAAGCTTAACGAGAAGACACTTCGCCCCGACCGCCACCTTTGTCGGAT
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2CO81JQ 734 0 0
GCCGCAACGGCTAAACCAGCCAAACGCACAGACTATCTTTCCACAGTGCACGCAAAAACA
ATCGCGGGAATATGCACCGTTATCGAATCAGACACAAGTCTATGCACCACAACCCTCAAA
GAAGTTCCTAGCGATGACCCCATCACATTAATCCAAGCATTACCTACTGCGGCTGAATCT
TCCGTCAAAAAAAGCGTGACTTTCCTCATCGGAATCAAACCAAAACACACATCAAACGCA
GTCGCAACTGCAGCGATCAACAGCTGCGAGAAAAACTTGAATAACGCGTTAGAAGATTTC
GCTGAGTTTTGGAAAGCTACGGGGAAAGATGTAACAACGTTGGCTCGTAACTATTTCACG
TGTAAGAAAACGTTAACGTCGATCATGGGGTATCATTCAACGTGTTTGGATGATATTGAA
GATAAGGATCTGAAGAAGGAAGTGGGGAGTGGG*ATTGGTGTTGGCAAGAACCTAAGCAG
TGACTCGTTTGATGTGTTCAATGGTTTGCCTACTATTTTCAAGACTTTTAGTATTAACGT
GAAGCTTAACGAGAAGACACTTCGCCCCGACCGCCACCTTTGTCGGATTATTATTACTGA
TTAAAGGATTTGTAAATAATAACTCATTACTATCGTATAATGCTTAAAGCGATACTTGTA
GAGATACTTATCATGTAGGGTACTATTGTAACCATTGATTCTAATATAGTGAAATATAAT
ATTGGAATTGAATC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL6885Contig1 786 2 8 U
GAACCCTAAGAAGGGTGACATTGTCCTTGCACAGTTTAGCCTCGATAACTCCTGGAACCG
TGCAATGATTTAGTGTACCACGAGGAGCAGTTCAATCTCCAGATGAAAAATTCGAAGTGT
TCTACATCGATTATGGAAACCAAGAAACAGTTCCATACAGCGCAGTTCGCCCTATCGAGC
CATCAGTATCCTCAGCACCAGGACTCGCGCAGCTCTGTAGACTTGCCTACATAAAAGTTC
CAAGCCTGGAAGACGACTTCGGTCCTGAAGCGGGAGAGTATTTACATACGGTAACACTGG
GAAGTGGTAAAGAGTTCAAGGCAGTGGTAGAGGAAAGAGATACTTCAGGAGGGAAAACGA
AAGGCCAAGGAACTGGAACCGAGCTTGCTGTTACTCTCATCGCTGTTGATGATGACATCT
CTGTCAATGCGGCAATGCTTCAGGAAGGAATAGCGAGGATGGAGAAACGTAAGAAATGGG
AGCATAAAGACAAGCAAGCCGCTCTTGATGCTCTTGAGAAGTTCCAAGACGAAGCTCGCA
AATCTAGGACCGGAATCTGGCAGTACGGAGACATACAATCTGATGATGAGGACAGTGGTC
CGGTCAGGAAACCTGGTCGCGGGTAAAGTGTTTGTCCACCGGCGATCAATGGTGGTTGCA
AAGAGGGAACAGAGAAGCGTCGGTCTCTATTTAAAGAAGGGAGAGATGTTGCTTGCAAAG
CATCAAACTTTTTGTAACGTTTAGAAATACTCTTTTTCGTTATACTTTTTCTAAAATTTA
ATTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK80TF U 1
AF RR2AK80JQ C 30
BS 1 607 RR2AK80TF
BS 608 608 RR2AK80JQ
BS 609 682 RR2AK80TF
BS 683 683 RR2AK80JQ
BS 684 700 RR2AK80TF
BS 701 701 RR2AK80JQ
BS 702 726 RR2AK80TF
BS 727 786 RR2AK80JQ

RD RR2AK80TF 727 0 0
GAACCCTAAGAAGGGTGACATTGTCCTTGCACAGTTTAGCCTCGATAACTCCTGGAACCG
TGCAATGATTTAGTGTACCACGAGGAGCAGTTCAATCTCCAGATGAAAAATTCGAAGTGT
TCTACATCGATTATGGAAACCAAGAAACAGTTCCATACAGCGCAGTTCGCCCTATCGAGC
CATCAGTATCCTCAGCACCAGGACTCGCGCAGCTCTGTAGACTTGCCTACATAAAAGTTC
CAAGCCTGGAAGACGACTTCGGTCCTGAAGCGGGAGAGTATTTACATACGGTAACACTGG
GAAGTGGTAAAGAGTTCAAGGCAGTGGTAGAGGAAAGAGATACTTCAGGAGGGAAAACGA
AAGGCCAAGGAACTGGAACCGAGCTTGCTGTTACTCTCATCGCTGTTGATGATGACATCT
CTGTCAATGCGGCAATGCTTCAGGAAGGAATAGCGAGGATGGAGAAACGTAAGAAATGGG
AGCATAAAGACAAGCAAGCCGCTCTTGATGCTCTTGAGAAGTTCCAAGACGAAGCTCGCA
AATCTAGGACCGGAATCTGGCAGTACGGAGACATACAATCTGATGATGAGGACAGTGGTC
CGGTCAG*AAACCTGGTCGCGGGTAAAGTGTTTGTCCACCGGCGATCAATGGTGGTTGCA
AAGAGGGAACAGAGAAGCGTCG*TCTCTATTTAAAGAAGG*AGAGATGTTGCTTGCAAAG
CATCAA
C

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2AK80JQ 757 0 0
CACAGTTTAGCCTCGATAACTCCTGGAACCGTGCAATGATTTAGTGTACCACGAGGAGCA
GTTCAATCTCCAGATGAAAAATTCGAAGTGTTCTACATCGATTATGGAAACCAAGAAACA
GTTCCATACAGCGCAGTTCGCCCTATCGAGCCATCAGTATCCTCAGCACCAGGACTCGCG
CAGCTCTGTAGACTTGCCTACATAAAAGTTCCAAGCCTGGAAGACGACTTCGGTCCTGAA
GCGGGAGAGTATTTACATACGGTAACACTGGGAAGTGGTAAAGAGTTCAAGGCAGTGGTA
GAGGAAAGAGATACTTCAGGAGGGAAAACGAAAGGCCAAGGAACTGGAACCGAGCTTGCT
GTTACTCTCATCGCTGTTGATGATGACATCTCTGTCAATGCGGCAATGCTTCAGGAAGGA
ATAGCGAGGATGGAGAAACGTAAGAAATGGGAGCATAAAGACAAGCAAGCCGCTCTTGAT
GCTCTTGAGAAGTTCCAAGACGAAGCTCGCAAATCTAGGACCGGAATCTGGCAGTACGGA
GACATACAATCTGATGATGAGGACAGTGGTCCGGTCAGGAAACCTGGTCGCGGGTAAAGT
GTTTGTCCACCGGCGATCAATGGTGGTTGCAAAGAGGGAACAGAGAAGCGTCGGTCTCTA
TTTAAAGAAGGGAGAGATGTTGCTTGCAAAGCATCAAACTTTTTGTAACGTTTAGAAATA
CTCTTTTTCGTTATACTTTTTCTAAAATTTAATTTAT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6887Contig1 764 2 6 U
GGAAACTCATAATCAATCTAGGAGAGGCACGATGGAGAAAGAATTTCCAGGGGAGGAAGA
ATTTGCAGAGATGAGTTTTTATCAGCTGGAGGATGTCTTGTTCGGATTGATGATGGGGCC
CGATGGTTACTGTGTCCAGGCGCTAAGCCGCTGTGAGTATAAAGGGACTAAATCCCTTAC
CATGGACGAAGAGTATCGCCTCATGAAGAAACAAGTCGAGGAGACCGAGGGCTTCGACAT
GGATTTCAGTCAGTTTCGCTATGCTTTTAATTACAAACCCGTTAGTTTCGATGATAACAA
GTTGCCCATACGGACGATGGAGAAACCATTAGAGAGTTATTGGACAGGCTCTCTCGTAAA
TCCCTTGAGCTATACAATATTAAGGAGACGAAAACGTCATCATATGGGTTGTTTGTGGAG
GTTAGCAAAGCCAACTATCACGTGGCTGGTGCTGGCGTCATGTTTTTCATTACGTTTCTT
GCTAAACAAGATTCTTCTGATAATGAGCCAAAAACATTCCAAGCTAAGGTCCACTATTCC
TGCGTTGACCACAACAAGTACCTCACCTGCGATCTCAAACCACCACCAAAAAATGTTCAC
TCCATTGATACTGCGGTGAAAGAAGATGCAAGAAACCAAAGTTGACTCAGGAGAAGGATG
CAAGCAAGCACTGATACACGAGTCTTGTTATATATAACGATGACTTGCAACAATTTTTAG
ACTAGAAAAGTTTTATTAATTTATAGTGTTTGTTAATTTTTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED45TF U 1
AF RR2ED45JQ C 82
BS 1 650 RR2ED45TF
BS 651 651 RR2ED45JQ
BS 652 656 RR2ED45TF
BS 657 657 RR2ED45JQ
BS 658 709 RR2ED45TF
BS 710 764 RR2ED45JQ

RD RR2ED45TF 711 0 0
GGAAACTCATAATCAATCTAGGAGAGGCACGATGGAGAAAGAATTTCCAGGGGAGGAAGA
ATTTGCAGAGATGAGTTTTTATCAGCTGGAGGATGTCTTGTTCGGATTGATGATGGGGCC
CGATGGTTACTGTGTCCAGGCGCTAAGCCGCTGTGAGTATAAAGGGACTAAATCCCTTAC
CATGGACGAAGAGTATCGCCTCATGAAGAAACAAGTCGAGGAGACCGAGGGCTTCGACAT
GGATTTCAGTCAGTTTCGCTATGCTTTTAATTACAAACCCGTTAGTTTCGATGATAACAA
GTTGCCCATACGGACGATGGAGAAACCATTAGAGAGTTATTGGACAGGCTCTCTCGTAAA
TCCCTTGAGCTATACAATATTAAGGAGACGAAAACGTCATCATATGGGTTGTTTGTGGAG
GTTAGCAAAGCCAACTATCACGTGGCTGGTGCTGGCGTCATGTTTTTCATTACGTTTCTT
GCTAAACAAGATTCTTCTGATAATGAGCCAAAAACATTCCAAGCTAAGGTCCACTATTCC
TGCGTTGACCACAACAAGTACCTCACCTGCGATCTCAAACCACCACCAAAAAATGTTCAC
TCCATTGATACTGCGGTGAAAGAAGATGCAAGAAACCAAAGTTGACTCAG*AGAAG*ATG
CAAGCAAGCACTGATACACGAGTCTTGTTATATATAACGATGACTTGCA
CA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2ED45JQ 683 0 0
TCAGCTGGAGGATGTCTTGTTCGGATTGATGATGGGGCCCGATGGTTACTGTGTCCAGGC
GCTAAGCCGCTGTGAGTATAAAGGGACTAAATCCCTTACCATGGACGAAGAGTATCGCCT
CATGAAGAAACAAGTCGAGGAGACCGAGGGCTTCGACATGGATTTCAGTCAGTTTCGCTA
TGCTTTTAATTACAAACCCGTTAGTTTCGATGATAACAAGTTGCCCATACGGACGATGGA
GAAACCATTAGAGAGTTATTGGACAGGCTCTCTCGTAAATCCCTTGAGCTATACAATATT
AAGGAGACGAAAACGTCATCATATGGGTTGTTTGTGGAGGTTAGCAAAGCCAACTATCAC
GTGGCTGGTGCTGGCGTCATGTTTTTCATTACGTTTCTTGCTAAACAAGATTCTTCTGAT
AATGAGCCAAAAACATTCCAAGCTAAGGTCCACTATTCCTGCGTTGACCACAACAAGTAC
CTCACCTGCGATCTCAAACCACCACCAAAAAATGTTCACTCCATTGATACTGCGGTGAAA
GAAGATGCAAGAAACCAAGGTTGACTCAGGAGAAGGATGCAAGCAAGCACTGATACACGA
GTCTTGTTATATATAACGATGACTTGCAACAATTTTTAGACTAGAAAAGTTTTATTAATT
TATAGTGTTTGTTAATTTTTCGT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL6888Contig1 740 2 2 U
GGACACAGACAGATCTACTGATCAAATAAATTTAAAAGACTATTGGAAAAAAGACCAAGA
GCAAATGGGTTCTTTAATGTCCGGATGGGACTCTCCAACAAAGGATCCCAACCCAGTGAA
AAGGCGCAAGTCACTAACAAGAGAAGAAATTGACGCTTTCTGGAAGACGAAGAAGAAGAC
TGAAGAGGAACATGTTCAAGCCGTTTCCAAGTTGGTTGCTGAGGAAGTTGCGGAAAATCA
AGGGATAGAGGATCCTTACGAAAACCAAAGCAAGAAGAGTGGATGGTGGAGAAGAAGCAA
CTGGGCGTTCTTGAATGAGCCGAGGGAGGAAGAGGGTCGACCCAACAATTACGTTCCGCA
GTTCCAGGTGGCTCACATCGCCAAAATCGCGGGCTAATTAATAGCGCTACAGTCACCAGC
TAGTCAGAGGTCACCTATGTGAATTGTGATTTTAGTTTTCTTTTGTGGTGGTTTCGGGCA
GTCACATGTATACATATGATATTGTGGTTACTTTTAAGGTGTTGGCCGTATAGTATCCGG
ATGGGAGTATACAACATGTAACAGAGGTGTGGGGTTTTAAATTTTTTCTCTCTCTTTTGT
TATGTGCCGTGTATATTTTTTTGGTTGTGTGGGTAAGGTAAGTAATCCGAAATGTGGATT
TGTATATTTGTCGTATGAGCTGGCTGCGTGGGTGCGTGGCCATCTTCTGGTAGTAATGAA
ATGAACTCTCCTTTTATGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F708TF U 1
AF RR2F708JQ C 1
BS 1 633 RR2F708TF
BS 634 740 RR2F708JQ

RD RR2F708TF 633 0 0
GGACACAGACAGATCTACTGATCAAATAAATTTAAAAGACTATTGGAAAAAAGACCAAGA
GCAAATGGGTTCTTTAATGTCCGGATGGGACTCTCCAACAAAGGATCCCAACCCAGTGAA
AAGGCGCAAGTCACTAACAAGAGAAGAAATTGACGCTTTCTGGAAGACGAAGAAGAAGAC
TGAAGAGGAACATGTTCAAGCCGTTTCCAAGTTGGTTGCTGAGGAAGTTGCGGAAAATCA
AGGGATAGAGGATCCTTACGAAAACCAAAGCAAGAAGAGTGGATGGTGGAGAAGAAGCAA
CTGGGCGTTCTTGAATGAGCCGAGGGAGGAAGAGGGTCGACCCAACAATTACGTTCCGCA
GTTCCAGGTGGCTCACATCGCCAAAATCGCGGGCTAATTAATAGCGCTACAGTCACCAGC
TAGTCAGAGGTCACCTATGTGAATTGTGATTTTAGTTTTCTTTTGTGGTGGTTTCGGGCA
GTCACATGTATACATATGATATTGTGGTTACTTTTAAGGTGTTGGCCGTATAGTATCCGG
ATGGGAGTATACAACATGTAACAGAGGTGTGGGGTTTTAAATTTTTTCTCTCTCTTTTGT
TATGTGCCGTGTATATTTTTTTGGTTGTGTGGG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2F708JQ 740 0 0
GGACACAGACAGATCTACTGATCAAATAAATTTAAAAGACTATTGGAAAAAAGACCAAGA
GCAAATGGGTTCTTTAATGTCCGGATGGGACTCTCCAACAAAGGATCCCAACCCAGTGAA
AAGGCGCAAGTCACTAACAAGAGAAGAAATTGACGCTTTCTGGAAGACGAAGAAGAAGAC
TGAAGAGGAACATGTTCAAGCCGTTTCCAAGTTGGTTGCTGAGGAAGTTGCGGAAAATCA
AGGGATAGAGGATCCTTACGAAAACCAAAGCAAGAAGAGTGGATGGTGGAGAAGAAGCAA
CTGGGCGTTCTTGAATGAGCCGAGGGAGGAAGAGGGTCGACCCAACAATTACGTTCCGCA
GTTCCAGGTGGCTCACATCGCCAAAATCGCGGGCTAATTAATAGCGCTACAGTCACCAGC
TAGTCAGAGGTCACCTATGTGAATTGTGATTTTAGTTTTCTTTTGTGGTGGTTTCGGGCA
GTCACATGTATACATATGATATTGTGGTTACTTTTAAGGTGTTGGCCGTATAGTATCCGG
ATGGGAGTATACAACATGTAACAGAGGTGTGGGGTTTTAAATTTTTTCTCTCTCTTTTGT
TATGTGCCGTGTATATTTTTTTGGTTGTGTGGGTAAGGTAAGTAATCCGAAATGTGGATT
TGTATATTTGTCGTATGAGCTGGCTGCGTGGGTGCGTGGCCATCTTCTGGTAGTAATGAA
ATGAACTCTCCTTTTATGTT

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL6889Contig1 720 2 2 U
GGGAACAGAGAGAGAGAGAAGATGAGCGAGAGAAATCGCAACAGCAAGCGAGAATCGCGA
GAGCTTGAAGCTTCCACAACAAGCGTCACGCCACTCAAGAAAAAGAAGCTCGACGATTCT
TCTTCTTCAGCGGACTCTCATGCCGTCGTCCTCGCGATTCCTTTTCCTCCCGTGGCTTCG
ACGCAAGGTAGATGCTCTGTCACCTCCGAAGACGATGATAAGAGCTCCATCATCAGCTCC
GGCTGTTTCAGCGGCGAATCGAACGAAACCGTGAGGAACAATCCATCCTCTGGTGTAGAT
CTGGAGGAGATAGCGAGCGAGGCTTTGGGAGAAACAACAGAATCATCGTCATCGGCGTTA
GAGAGGGATAAACCACCACCGGAAGTGAGCAAGATTCCGTCGGCGGAGGAGATTGAAGCG
TTCTTATCGGAGCTAGAAGGTGGTGACGACGATAAACAGAAGCGATTCATTGAGAAGTAC
AACTTCGATATCGTCAATGACAAACCGCTTCAAGGTCGTTACATGTGGGATCGACTCAAG
CCATGAATCGCATGAATTGGTTGGATGGAGAAAAAAAATAAAGTAGGTTTATTATCATCT
ACTTACATTCCACTTGACTTGTACAGCTCTCGTTTTACTTTTTGCTAATCAGTTTTAGCC
TATGTTAGTTCCTTCCTATAAACAAAGGAAAGTTGGTTCTTGAACCGTTTATCAAGTAAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN05JQ C 1
AF RR2AN05TF U 1
BS 1 683 RR2AN05TF
BS 684 720 RR2AN05JQ

RD RR2AN05JQ 720 0 0
GGGAACAGAGAGAGAGAGAAGATGAGCGAGAGAAATCGCAACAGCAAGCGAGAATCGCGA
GAGCTTGAAGCTTCCACAACAAGCGTCACGCCACTCAAGAAAAAGAAGCTCGACGATTCT
TCTTCTTCAGCGGACTCTCATGCCGTCGTCCTCGCGATTCCTTTTCCTCCCGTGGCTTCG
ACGCAAGGTAGATGCTCTGTCACCTCCGAAGACGATGATAAGAGCTCCATCATCAGCTCC
GGCTGTTTCAGCGGCGAATCGAACGAAACCGTGAGGAACAATCCATCCTCTGGTGTAGAT
CTGGAGGAGATAGCGAGCGAGGCTTTGGGAGAAACAACAGAATCATCGTCATCGGCGTTA
GAGAGGGATAAACCACCACCGGAAGTGAGCAAGATTCCGTCGGCGGAGGAGATTGAAGCG
TTCTTATCGGAGCTAGAAGGTGGTGACGACGATAAACAGAAGCGATTCATTGAGAAGTAC
AACTTCGATATCGTCAATGACAAACCGCTTCAAGGTCGTTACATGTGGGATCGACTCAAG
CCATGAATCGCATGAATTGGTTGGATGGAGAAAAAAAATAAAGTAGGTTTATTATCATCT
ACTTACATTCCACTTGACTTGTACAGCTCTCGTTTTACTTTTTGCTAATCAGTTTTAGCC
TATGTTAGTTCCTTCCTATAAACAAAGGAAAGTTGGTTCTTGAACCGTTTATCAAGTAAC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2AN05TF 683 0 0
GGGAACAGAGAGAGAGAGAAGATGAGCGAGAGAAATCGCAACAGCAAGCGAGAATCGCGA
GAGCTTGAAGCTTCCACAACAAGCGTCACGCCACTCAAGAAAAAGAAGCTCGACGATTCT
TCTTCTTCAGCGGACTCTCATGCCGTCGTCCTCGCGATTCCTTTTCCTCCCGTGGCTTCG
ACGCAAGGTAGATGCTCTGTCACCTCCGAAGACGATGATAAGAGCTCCATCATCAGCTCC
GGCTGTTTCAGCGGCGAATCGAACGAAACCGTGAGGAACAATCCATCCTCTGGTGTAGAT
CTGGAGGAGATAGCGAGCGAGGCTTTGGGAGAAACAACAGAATCATCGTCATCGGCGTTA
GAGAGGGATAAACCACCACCGGAAGTGAGCAAGATTCCGTCGGCGGAGGAGATTGAAGCG
TTCTTATCGGAGCTAGAAGGTGGTGACGACGATAAACAGAAGCGATTCATTGAGAAGTAC
AACTTCGATATCGTCAATGACAAACCGCTTCAAGGTCGTTACATGTGGGATCGACTCAAG
CCATGAATCGCATGAATTGGTTGGATGGAGAAAAAAAATAAAGTAGGTTTATTATCATCT
ACTTACATTCCACTTGACTTGTACAGCTCTCGTTTTACTTTTTGCTAATCAGTTTTAGCC
TATGTTAGTTCCTTCCTATAAAC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL6890Contig1 1176 2 2 U
GGGCGGTTGTGGATTTTAAGATGCCTGGGAAGGTTTATAGAACAGCCATGTCTTCTTTGG
CTATGTCTCACACGCTTATTGCTGCTGGCACTGAGGATGTTCAGGTTCGCCTTTGTGATA
TAGCTTCTGGAGCTTTCTCTCATACCTTATCTGGTCACCGTGATGGTGTTATGTCGGTGG
AATGGTCTACTTCCAGCGAGTGGGTTTTGTACACTGGGGGATGTGATGGTGCTATACGTT
TCTGGGACATCGGACGTGCTGGATGCTTCCGTGTTTTAGATCAATCAGTTACACAACTTG
GGGTTCGACCACCGATTTTAAAGCATACAGCGGTTAGTAGTAAGGTTTCAGCTGAAAAAT
CTTCTTCAGGGGGCAAAAATAGGCTGAAGACGCTGCAGAGTAAACACACGGGAAGCCACA
ATATGAAGGGATCATCTAGCGGTAAACCTTCAGTGGAGAAGCCTAGACAGAAGAGACTTC
ATCCTGGAATGTTGTCTACTCTAGATCGTGCCACGGCTCATTATGGTGTTGTTACTGGAC
TAAAGGCAACTAACGATGGGATGTATCTTCTTAGCGCTGGGTCTGATTCAAGAATAAGAC
TGTGGGATACTCAATCTGGATGCAATACCCTTTTGAACTTTGAAACTGGGCGTCTTCAGA
CCAGCAAAGCGATTCAGTTAGCTACAAGCGATGATCCAGCTCTTGTATTTGTTCCATGCA
TGAAGACTGTGAAGGCTTTTGGCATGTGGTCGGGTAGAACAACACTGATGTTTCGTGGAC
ACTACGAAAGCGTCCACACTTGCTGCTTTAATTCCACTGATCAGGAGCTATACACAAGTG
GTGCAGATAGACAAATACTCGTGTGGTCACCGGGTGGATCCATGGAAGACGAAATGGTGC
AAGATGAAGAAGTTGCCGAAGATAAAGACAATTGGAGCGACTAAGAAGCAAAAGTTGGCA
GTCTTCTGACTTTCTTCCATGTTCGTTGTGCCGAGTTTAATCTTGGCAAACTCATAGTGC
TCTATTATGCGGTTTGTTGTGTAAAACGATATGTTTGCTAGTTAAATAGAGTTTGTTCAT
ACTACTACAATGCAGTTTATGAGACCTATGGACATTAAAACTCAATGAAAAACAAAAAAC
AAGTGTGTTCAAGAACAAAGATGCAGTTTATGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX14TF U 1
AF RR2DX14JQ C 629
BS 1 694 RR2DX14TF
BS 695 1176 RR2DX14JQ

RD RR2DX14TF 694 0 0
GGGCGGTTGTGGATTTTAAGATGCCTGGGAAGGTTTATAGAACAGCCATGTCTTCTTTGG
CTATGTCTCACACGCTTATTGCTGCTGGCACTGAGGATGTTCAGGTTCGCCTTTGTGATA
TAGCTTCTGGAGCTTTCTCTCATACCTTATCTGGTCACCGTGATGGTGTTATGTCGGTGG
AATGGTCTACTTCCAGCGAGTGGGTTTTGTACACTGGGGGATGTGATGGTGCTATACGTT
TCTGGGACATCGGACGTGCTGGATGCTTCCGTGTTTTAGATCAATCAGTTACACAACTTG
GGGTTCGACCACCGATTTTAAAGCATACAGCGGTTAGTAGTAAGGTTTCAGCTGAAAAAT
CTTCTTCAGGGGGCAAAAATAGGCTGAAGACGCTGCAGAGTAAACACACGGGAAGCCACA
ATATGAAGGGATCATCTAGCGGTAAACCTTCAGTGGAGAAGCCTAGACAGAAGAGACTTC
ATCCTGGAATGTTGTCTACTCTAGATCGTGCCACGGCTCATTATGGTGTTGTTACTGGAC
TAAAGGCAACTAACGATGGGATGTATCTTCTTAGCGCTGGGTCTGATTCAAGAATAAGAC
TGTGGGATACTCAATCTGGATGCAATACCCTTTTGAACTTTGAAACTGGGCGTCTTCAGA
CCAGCAAAGCGATTCAGTTAGCTACAAGCGATGA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2DX14JQ 548 0 0
CCTTTTGAACTTTGAAACTGGGCGTCTTCAGACCAGCAAAGCGATTCAGTTAGCTACAAG
CGATGATCCAGCTCTTGTATTTGTTCCATGCATGAAGACTGTGAAGGCTTTTGGCATGTG
GTCGGGTAGAACAACACTGATGTTTCGTGGACACTACGAAAGCGTCCACACTTGCTGCTT
TAATTCCACTGATCAGGAGCTATACACAAGTGGTGCAGATAGACAAATACTCGTGTGGTC
ACCGGGTGGATCCATGGAAGACGAAATGGTGCAAGATGAAGAAGTTGCCGAAGATAAAGA
CAATTGGAGCGACTAAGAAGCAAAAGTTGGCAGTCTTCTGACTTTCTTCCATGTTCGTTG
TGCCGAGTTTAATCTTGGCAAACTCATAGTGCTCTATTATGCGGTTTGTTGTGTAAAACG
ATATGTTTGCTAGTTAAATAGAGTTTGTTCATACTACTACAATGCAGTTTATGAGACCTA
TGGACATTAAAACTCAATGAAAAACAAAAAACAAGTGTGTTCAAGAACAAAGATGCAGTT
TATGTTTC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 2

CO CL6891Contig1 697 2 2 U
GGGTGTTTTCTCATTTCCTCACAGCCAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATC
AATGGCGAAATCAGCGGCGACGGCGGCTTCCTCCCTCGTGCAAACCCTCAGGCGATACAT
CAAGAAGCCATGGGAGATCACCGGACCTTGCGCCCACCCGGAGTACCTCGAATCTGTGCC
CAAGGCGACGGAGTATCGCATCCGATGCCCCGCCACGATCGATGAAGAGGCGATCGTGCC
CACCGCGGATCCGGAGAACGTGTACAACATCCTGTACCACGCGAGGGATCAGCGCCGAAA
TCGCCCGCCGATAAGGCGATACGTGTGGAAGAAGGAGGATGTTGTTCAGATGATGAATGA
GAAGAAGACGTTCGAGGAGTCGGACTTCCCTAGGGTTTACTTGACGACCACTGTGGAAGA
GGATGAGAACGCTCGTGGCGGAGGCTACGAGTGAAAAAAACAGGTTTTTTTCTCCTGTAA
TCTGCGTGGTGGGAGACAGACTGCGTGTGAAAATTCTCACTAGTTTTGCATTATTATCTA
ATAATAAGGTTTGTAGTGGCTTTACAAAACACTTTGAGTTTGTTCCTCCACAAGAACTTG
ATTTGTTGTTCAGTTGTATTCCCTTTTGTTTTACTCACATGACAATTATATGTTTCTTTT
ACTTCCTATGGTGAGTGAACTCATCAAATATTATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2BD79TF U 1
AF RR2BD79JQ C 82
BS 1 696 RR2BD79TF
BS 697 697 RR2BD79JQ

RD RR2BD79TF 696 0 0
GGGTGTTTTCTCATTTCCTCACAGCCAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATC
AATGGCGAAATCAGCGGCGACGGCGGCTTCCTCCCTCGTGCAAACCCTCAGGCGATACAT
CAAGAAGCCATGGGAGATCACCGGACCTTGCGCCCACCCGGAGTACCTCGAATCTGTGCC
CAAGGCGACGGAGTATCGCATCCGATGCCCCGCCACGATCGATGAAGAGGCGATCGTGCC
CACCGCGGATCCGGAGAACGTGTACAACATCCTGTACCACGCGAGGGATCAGCGCCGAAA
TCGCCCGCCGATAAGGCGATACGTGTGGAAGAAGGAGGATGTTGTTCAGATGATGAATGA
GAAGAAGACGTTCGAGGAGTCGGACTTCCCTAGGGTTTACTTGACGACCACTGTGGAAGA
GGATGAGAACGCTCGTGGCGGAGGCTACGAGTGAAAAAAACAGGTTTTTTTCTCCTGTAA
TCTGCGTGGTGGGAGACAGACTGCGTGTGAAAATTCTCACTAGTTTTGCATTATTATCTA
ATAATAAGGTTTGTAGTGGCTTTACAAAACACTTTGAGTTTGTTCCTCCACAAGAACTTG
ATTTGTTGTTCAGTTGTATTCCCTTTTGTTTTACTCACATGACAATTATATGTTTCTTTT
ACTTCCTATGGTGAGTGAACTCATCAAATATTATTT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2BD79JQ 616 0 0
GGCGGCTTCCTCCCTCGTGCAAACCCTCAGGCGATACATCAAGAAGCCATGGGAGATCAC
CGGACCTTGCGCCCACCCGGAGTACCTCGAATCTGTGCCCAAGGCGACGGAGTATCGCAT
CCGATGCCCCGCCACGATCGATGAAGAGGCGATCGTGCCCACCGCGGATCCGGAGAACGT
GTACAACATCCTGTACCACGCGAGGGATCAGCGCCGAAATCGCCCGCCGATAAGGCGATA
CGTGTGGAAGAAGGAGGATGTTGTTCAGATGATGAATGAGAAGAAGACGTTCGAGGAGTC
GGACTTCCCTAGGGTTTACTTGACGACCACTGTGGAAGAGGATGAGAACGCTCGTGGCGG
AGGCTACGAGTGAAAAAAACAGGTTTTTTTCTCCTGTAATCTGCGTGGTGGGAGACAGAC
TGCGTGTGAAAATTCTCACTAGTTTTGCATTATTATCTAATAATAAGGTTTGTAGTGGCT
TTACAAAACACTTTGAGTTTGTTCCTCCACAAGAACTTGATTTGTTGTTCAGTTGTATTC
CCTTTTGTTTTACTCACATGACAATTATATGTTTCTTTTACTTCCTATGGTGAGTGAACT
CATCAAATATTATTTC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL6892Contig1 619 2 1 U
GGACGAACTCTTTACTAGTTACGGGGTAGGAGAGCAGAGAAAAGTGTCCATGGCGACAAT
AGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCCACCCTCAATTCCAAATTCAAAGTCCTTTCTCTACT
GGAGCTTCACCAGCTGCGCCGTCATTCTCAATTCCGTTTGGCAGATCTGCGGCGGATCTA
CCAATTGCAAGGAGGAATTCACTTCAAAGATTCCTCGAGAAGAGAAGGGACAGATTGGTC
AACAAAAACCCTTACCCTACTTCAGACGTCAAGAAGACAGATGTCCCAAAGGACACTGCC
TCTATTAAGGAGGAGTATCCCATTGCTTAGCAGAAGATCAACCTTCAAGGCTACAATAAG
TGAAACGTTTATGATAATGTATCATATGTGCTCTTGTGTGTGTAGTATATGCTAGTGTTA
GACAAACCGAAGATTTGTTTGCATGGTCCGACATGTTCTATCATATTACATCTTCTCCAA
GGATGAAGAAGAGAGTATTATTGTATACTGAAGACAAAAACTATTGTGGTTCTGAAAACA
GTGTCCTAGAGAGTCTTATCTCTTAACTAATAACTCTTGATGTTTATATGTTCTTGAACT
TGTTATCTCTTTCAGATAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CN21JQ C 1
AF RR2CN21TF U 1
BS 1 619 RR2CN21TF

RD RR2CN21JQ 619 0 0
GGACGAACTCTTTACTAGTTACGGGGTAGGAGAGCAGAGAAAAGTGTCCATGGCGACAAT
AGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCCACCCTCAATTCCAAATTCAAAGTCCTTTCTCTACT
GGAGCTTCACCAGCTGCGCCGTCATTCTCAATTCCGTTTGGCAGATTTGCGGCGGATCTA
CCAATTGCAAGGAGGAATTCACTTCAAAGATTCCTCGAGAAGAGAAGGGACAGATTGGTC
AACAAAAACCCTTACCCTACTTCAGACGTCAAGAAGACAGATGTCCCAAAGGACACTGCC
TCTATTAAGGAGGAGTATCCCATTGCTTAGCAGAAGATCAACCTTCAAGGCTACAATAAG
TGAAACGTTTATGATAATGTATCATATGTGCTCTTGTGTGTGTAGTATATGCTAGTGTTA
GACAAACCGAAGATTTGTTTGCATGGTCCGACATGTTCTATCATATTACATCTTCTCCAA
GGATGAAGAAGAGAGTATTATTGTATACTGAAGACAAAAACTATTGTGGTTCTGAAAACA
GTGTCCTAGAGAGTCTTATCTCTTAACTAATAACTCTTGATGTTTATATGTTCTTGAACT
TGTTATCTCTTTCAGATAG

QA 1 619 1 619
DS 

RD RR2CN21TF 619 0 0
GGACGAACTCTTTACTAGTTACGGGGTAGGAGAGCAGAGAAAAGTGTCCATGGCGACAAT
AGTCCAGTGTCTTTCGTCATGTGCCACCCTCAATTCCAAATTCAAAGTCCTTTCTCTACT
GGAGCTTCACCAGCTGCGCCGTCATTCTCAATTCCGTTTGGCAGATCTGCGGCGGATCTA
CCAATTGCAAGGAGGAATTCACTTCAAAGATTCCTCGAGAAGAGAAGGGACAGATTGGTC
AACAAAAACCCTTACCCTACTTCAGACGTCAAGAAGACAGATGTCCCAAAGGACACTGCC
TCTATTAAGGAGGAGTATCCCATTGCTTAGCAGAAGATCAACCTTCAAGGCTACAATAAG
TGAAACGTTTATGATAATGTATCATATGTGCTCTTGTGTGTGTAGTATATGCTAGTGTTA
GACAAACCGAAGATTTGTTTGCATGGTCCGACATGTTCTATCATATTACATCTTCTCCAA
GGATGAAGAAGAGAGTATTATTGTATACTGAAGACAAAAACTATTGTGGTTCTGAAAACA
GTGTCCTAGAGAGTCTTATCTCTTAACTAATAACTCTTGATGTTTATATGTTCTTGAACT
TGTTATCTCTTTCAGATAG

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL6893Contig1 438 2 4 U
GGTGAACAAGAAACACAAACATTGTTTATGCTCTCTCTTATCAGATATTGAACCATGAAG
TCTCATGCTTTATTTATTGTCTTTTGTGTTGTTTTATTGCTCATTTTGAGTTATCCTAAA
TAAGCAGAAGCTGCTCCCAACAGGTGCCCGGCTAAAAGCTATTTTCCTGGAAAATGCGGA
AATGATGGAATACAAAGTTGTCTAAGGGATTTCAAGAAAAAAACCAAGAAAAGCCACATT
ATTGATCAGTGTAGTAAATGTCAGGACGCTAAATCCCCAAATGGGGTAGTTAGACGTGAT
TGTCACTGCAGTTACCATTTTACTGTACCTTGCTTATAAATTCATTGCTGGAGTCAATTA
TGATATTTGATATAAAAATATATTTTAATTTTGTTTTATTAATAATTATAGAGAAATAAA
TTTTATAATTTTTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DW29TF U 1
AF RR2DW29JQ C 154
BS 1 253 RR2DW29TF
BS 254 254 RR2DW29JQ
BS 255 282 RR2DW29TF
BS 283 438 RR2DW29JQ

RD RR2DW29TF 282 0 0
GGTGAACAAGAAACACAAACATTGTTTATGCTCTCTCTTATCAGATATTGAACCATGAAG
TCTCATGCTTTATTTATTGTCTTTTGTGTTGTTTTATTGCTCATTTTGAGTTATCCTAAA
TAAGCAGAAGCTGCTCCCAACAGGTGCCCGGCTAAAAGCTATTTTCCTGGAAAATGCGGA
AATGATGGAATACAAAGTTGTCTAAGGGATTTCAAGAAAAAAACCAAGAAAAGCCACATT
ATTGATCAGTGTA*TAAATGTCAGGACGCTAAATCCCCAAAT

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR2DW29JQ 285 0 0
AAAAGCTATTTTCCTGGAAAATGCGGAAATGATGGAATACAAAGTTGTTTAAGGGATTTC
AAGAAAAAAACCAAGAAAAGCCCCATTATTGATCAGTGTAGTAAATGTCAGGACGCTAAA
TCCCCAAATGGGGTAGTTAGACGTGATTGTCACTGCAGTTACCATTTTACTGTACCTTGC
TTATAAATTCATTGCTGGAGTCAATTATGATATTTGATATAAAAATATATTTTAATTTTG
TTTTATTAATAATTATAGAGAAATAAATTTTATAATTTTTTGGTT

QA 1 285 1 285
DS 



AS 1 2

CO CL6894Contig1 716 2 6 U
GGGTAGACTTACCGACTCTGTCGTTCATCGGAGATTTTATAATAATTCGCCAATGGACAG
ATCACAATTGCTCTTGATAGGTTTACCGATTTTCTTGTTCTGCTCGGATCTCTTCAACCT
TTTCACTCCTCCGCCTCCGAAACCTCCGAGTCACCGTCCCAATCATCCACCGCACATCCC
TCACCAGCAGCGTCCGCCTGTGGTCGTTCCCGGAACCCTAGATTTTCCTTCACAGAAGCA
GGCAAGTGGCTTAGGAGGAGCAGTTGGATATGGAAACACTGTGGAGATCAACTTCTGCGT
CTCCTGTTCTTTCAAGGGAACTGCAGTGACTATGAAGAAGATGTTAGAGACGGCTCTCCC
CGGTTTAGATGTGGTTCTTGCAAACTACCCACCACCACCACCAAAACGCCTTCTAGCTAA
GGTTGTGCCTGTTGCTCAGATGGGAGTCATTGGGATGATAGTTGCGGGTGATCGTGTCTT
TCCCATGATTGGTATTGCGCAGCCACCTGCATGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGGTT
TGGATCCATGGCTTCCACTTGGCTTATCGGAAACTTTCTGCAGTCTTACCTTCAAAGCTC
TGGCGCCTTTGAAGTTCTCTGCAACGGTGAACTGGTGTTCTCTAAGTTGAAAGAGGGTAG
ATTCCCGGGAGAGATCGAGCTGAGAGATCTCATCAGTAAACTTTGACAAACCTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA92TF U 1
AF RR2CA86TF U 8
BS 1 290 RR2EA92TF
BS 291 291 RR2CA86TF
BS 292 355 RR2EA92TF
BS 356 356 RR2CA86TF
BS 357 633 RR2EA92TF
BS 634 716 RR2CA86TF

RD RR2EA92TF 633 0 0
GGGTAGACTTACCGACTCTGTCGTTCATCGGAGATTTTATAATAATTCGCCAATGGACAG
ATCACAATTGCTCTTGATAGGTTTACCGATTTTCTTGTTCTGCTCGGATCTCTTCAACCT
TTTCACTCCTCCGCCTCCGAAACCTCCGAGTCACCGTCCCAATCATCCACCGCACATCCC
TCACCAGCAGCGTCCGCCTGTGGTCGTTCCCGGAACCCTAGATTTTCCTTCACAGAAGCA
GGCAAGTGGCTTAGGAGGAGCAGTTGGATATGGAAACACTGTGGAGATCAGCTTCTGCGT
CTCCTGTTCTTTCAAGGGAACTGCAGTGACTATGAAGAAGATGTTAGAGACGGCTTTCCC
CGGTTTAGATGTGGTTCTTGCAAACTACCCACCACCACCACCAAAACGCCTTCTAGCTAA
GGTTGTGCCTGTTGCTCAGATGGGAGTCATTGGGATGATAGTTGCGGGTGATCGTGTCTT
TCCCATGATTGGTATTGCGCAGCCACCTGCATGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGGTT
TGGATCCATGGCTTCCACTTGGCTTATCGGAAACTTTCTGCAGTCTTACCTTCAAAGCTC
TGGCGCCTTTGAAGTTCTCTGCAACGGTGAACT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2CA86TF 709 0 0
GGG
ACCGACTCTGTCGTTCATCGGAGATTTTATAATAATTCGCCAATGGACAGATCACAATTG
CTCTTGATAGGTTTACCGATTTTCTTGTTCTGCTCGGATCTCTTCAACCTTTTCACTCCT
CCGCCTCCGAAACCTCCGAGTCACCGTCCCAATCATCCACCGCACATCCCTCACCAGCAG
CGTCCGCCTGTGGTCGTTCCCGGAACCCTAGATTTTCCTTCACAGAAGCAGGCAAGTGGC
TTAGGAGGAGCAGTTGGATATGGAAACACTGTGGAGATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCT
TTCAAGGGAACTGCAGTGACTATGAAGAAGATGTTAGAGACGGCTCTCCCCGGTTTAGAT
GTGGTTCTTGCAAACTACCCACCACCACCACCAAAACGCCTTCTAGCTAAGGTTGTGCCT
GTTGCTCAGATGGGAGTCATTGGGATGATAGTTGCGGGTGATCGTGTCTTTCCCATGATT
GGTATTGCGCAGCCACCTGCATGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGGTTTGGATCCATG
GCTTCCACTTGGCTTATCGGAAACTTTCTGCAGTCTTACCTTCAAAGCTCTGGCGCCTTT
GAAGTTCTCTGCAACGGTGAACTGGTGTTCTCTAAGTTGAAAGAGGGTAGATTCCCGGGA
GAGATCGAGCTGAGAGATCTCATCAGTAAACTTTGACAAACCTAGC

QA 4 709 4 709
DS 



AS 1 2

CO CL6895Contig1 740 2 7 U
GGAAAGCTTATCTCCACTGTTGCAGATTCCGGCAGATCAGACCACAAACACATAGTCTCG
GAGTAAGCAGGCATGGATTCTGGAGCCAAAGTGAAGAAAGGAGCGGGTGCGGGTGGACGA
AGAGGTGGCGGTCCGAAGAAGAAACCTGTTTCCAGCTCTGTTAAAGCCGGTTTACAGTTT
CCTGTCGGTAGGATCGGTCGGTATCTAAAGAAAGGTCGCTACTCGAAGCGTGTTGGAACC
GGAGCTCCGGTGTATCTCGCCGCCGTGCTAGAGTATCTTGCCGCTGAGGTTCTTGAGCTT
GCTGGTAACGCTGCAAGAGATAACAAGAAGAATCGTATCATACCACGCCATGTTCTGTTA
GCTGTGAGGAACGACGAGGAGCTAGGAAAGCTGCTCAAAGGGGTAACAATTGCACACGGA
GGAGTTTTACCTAACATAAACCCAGTTCTCCTCCCAAAGAAGTCTGAGAAAGCAGCTTCA
ACTGCAAAGGGAACCAAGTCACCATCAAAGGCTACCAAATCCCCTAAGAATGCATAGTTC
TCATCAACATCCCGTCTCCTTCTTTCTCTTACTCTCTGTATAACTTGTAATCTCTTTCCA
TCTCTCTGTTGTTGTGTGAAGACAGAACACCTCTTACCTTTTTTCATCAGTTGTAAACAA
TGTGTAACGTTAAAACAAGTCTGGTTAGTCGATGTAATTGATACAATGTTCAGTTTGTAA
TAAGAGATGGTGCGTTGTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BP17JQ C 1
AF RR2BP17TF U 1
BS 1 674 RR2BP17TF
BS 675 675 RR2BP17JQ
BS 676 696 RR2BP17TF
BS 697 697 RR2BP17JQ
BS 698 719 RR2BP17TF
BS 720 720 RR2BP17JQ
BS 721 740 RR2BP17TF

RD RR2BP17JQ 740 0 0
GGAAAGCTTATCTCCACTGTTGCAGATTCCGGCAGATCAGACCACAAACACATAGTCTCG
GAGTAAGCAGGCATGGATTCTGGAGCCAAAGTGAAGAAAGGAGCGGGTGCGGGTGGACGA
AGAGGTGGCGGTCCGAAGAAGAAACCTGTTTCCAGCTCTGTTAAAGCCGGTTTACAGTTT
CCTGTCGGTAGGATCGGTCGGTATCTAAAGAAAGGTCGCTACTCGAAGCGTGTTGGAACC
GGAGCTCCGGTGTATCTCGCCGCCGTGCTAGAGTATCTTGCCGCTGAGGTTCTTGAGCTT
GCTGGTAACGCTGCAAGAGATAACAAGAAGAATCGTATCATACCACGCCATGTTCTGTTA
GCTGTGAGGAACGACGAGGAGCTAGGAAAGCTGCTCAAAGGGGTAACAATTGCACACGGA
GGAGTTTTACCTAACATAAACCCAGTTCTCCTCCCAAAGAAGTCTGAGAAAGCAGCTTCA
ACTGCAAAGGGAACCAAGTCACCATCAAAGGCTACCAAATCCCCTAAGAATGCATAGTTC
TCATCAACATCCCGTCTCCTTCTTTCTCTTACTCTCTGTATAACTTGTAATCTCTTTCCA
TCTCTCTGTTGTTGTGTGAAGACAGAACACCTCTTACCTTTTTTCATCAGTTGTAAACAA
TGTGTAACGTTAAAACAAGTCTGGTTAGTCGATGTAATTGATACAATGTTCAGTTTGTAA
TAAGAGATGGTGCGTTGTAC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2BP17TF 740 0 0
GGAAAGCTTATCTCCACTGTTGCAGATTCCGGCAGATCAGACCACAAACACATAGTCTCG
GAGTAAGCAGGCATGGATTCTGGAGCCAAAGTGAAGAAAGGAGCGGGTGCGGGTGGACGA
AGAGGTGGCGGTCCGAAGAAGAAACCTGTTTCCAGCTCTGTTAAAGCCGGTTTACAGTTT
CCTGTCGGTAGGATCGGTCGGTATCTAAAGAAAGGTCGCTACTCGAAGCGTGTTGGAACC
GGAGCTCCGGTGTATCTCGCCGCCGTGCTAGAGTATCTTGCCGCTGAGGTTCTTGAGCTT
GCTGGTAACGCTGCAAGAGATAACAAGAAGAATCGTATCATACCACGCCATGTTCTGTTA
GCTGTGAGGAACGACGAGGAGCTAGGAAAGCTGCTCAAAGGGGTAACAATTGCACACGGA
GGAGTTTTACCTAACATAAACCCAGTTCTCCTCCCAAAGAAGTCTGAGAAAGCAGCTTCA
ACTGCAAAGGGAACCAAGTCACCATCAAAGGCTACCAAATCCCCTAAGAATGCATAGTTC
TCATCAACATCCCGTCTCCTTCTTTCTCTTACTCTCTGTATAACTTGTAATCTCTTTCCA
TCTCTCTGTTGTTGTGTGAAGACAGAACACCTCTTACCTTTTTTCATCAGTTGTAAACAA
TGTGTAACGTTAAA*CAAGTCTGGTTAGTCGATGTA*TTGATACAATGTTCAGTTTGTA*
TAAGAGATGGTGCGTTGTAC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL6896Contig1 739 2 3 U
ATTAGTCTCCTTGTCCTCCTCTAATCATCATCTCAAACTCCGAAAAAAAAAAACCTATTC
TTTCTGCTCCGAGAATCTATCAATCATGTCGAGATTTGCTCTAGCTATCTCTTGTCTTCT
CTTCGTCTCGACGATTGTTAGAGCAACCGATGTCAGTTACTGTGATGAAAACGAACAGTA
TGAAGTAAAGGTAAAAGGAGTTGATATATCGCCTGATCCTATAGCTCGTGGCGGGCCAGC
CACCTTCAGCATCTCTGCTAACACAGATAATGTGATCTCAAAAGGAAAGCTGGTGATAGA
AGTTTCATATTTTGGGTGGCATATTCATTCTGAGACACATGATCTTTGTGATGAGACAAC
ATGTCCAGTGGCAGTTGGAGATTTCTTGGTAACACACTCGCAAGTTCTACCTGGTTATAC
TCCTCCTGGTTCATACTCGCTTAAGATGAAGATGCTTGATGGACACAAGAAGGAGCTAAC
ATGCATCAAATTCTCATTCATGATTGGATTGGGATCATCGTCATCCGTGGCCGACATGTA
GAGCTATTTTGCTCGCTGGGATATACCCATGCGATCACTCCATTTGCTTTGTATAAAAAA
AGAAAACAACATTTCTCTTTACCAACATTGTTGATCAAAAATCATTTGAAATTTTCTCAA
TCTTGTTCCCCATGTTAGACCATTTGATAAAATCCCTTTTATAGATAATTAGATAAATAA
TACTCCCTCCGTTTCAATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BB68JQ C 1
AF RR2BB68TF U 1
BS 1 52 RR2BB68TF
BS 53 53 RR2BB68JQ
BS 54 739 RR2BB68TF

RD RR2BB68JQ 739 0 0
ATTAGTCTCCTTGTCCTCCTCTAATCATCATCTCAAACTCCGAAAAAAAAAAACCTATTC
TTTCTGCTCCGAGAATCTATCAATCATGTCGAGATTTGCTCTAGCTATCTCTTGTCTTCT
CTTCGTCTCGACGATTGTTAGAGCAACCGATGTCAGTTACTGTGATGAAAACGAACAGTA
TGAAGTAAAGGTAAAAGGAGTTGATATATCGCCTGATCCTATAGCTCGTGGCGGGCCAGC
CACCTTCAGCATCTTTGCTAACACAGATAATGTGATCTCAAAAGGAAAGCTGGTGATAGA
AGTTTCATATTTTGGGTGGCATATTCATTTTGAGACACATGATCTTTGTGATGAGACAAC
ATGTCCAGTGGCAGTTGGAGATTTCTTGGTAACACACTCGCAAGTTCTACCTGGTTATAC
TCCTCCTGGTTCATACTCGCTTAAGATGAAGATGCTTGATGGACACAAGAAGGAGCTAAC
ATGCATCAAATTCTCATTCATGATTGGATTGGGATCATCGTCATCCGTGGCCGACATGTA
GAGCTATTTTGCTCGCTGGGATATACCCATGCGATCACTCCATTTGCTTTGTATAAAAAA
AGAAAACAACATTTCTCTTTACCAACATTGTTGATCAAAAATCATTTGAAATTTTCTCAA
TCTTGTTCCCCATGTTAGACCATTTGATAAAATCCCTTTTATAGATAATTAGATAAATAA
TACTCCCTCCGTTTCAATG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2BB68TF 739 0 0
ATTAGTCTCCTTGTCCTCCTCTAATCATCATCTCAAACTCCGAAAAAAAAAA*CCTATTC
TTTCTGCTCCGAGAATCTATCAATCATGTCGAGATTTGCTCTAGCTATCTCTTGTCTTCT
CTTCGTCTCGACGATTGTTAGAGCAACCGATGTCAGTTACTGTGATGAAAACGAACAGTA
TGAAGTAAAGGTAAAAGGAGTTGATATATCGCCTGATCCTATAGCTCGTGGCGGGCCAGC
CACCTTCAGCATCTCTGCTAACACAGATAATGTGATCTCAAAAGGAAAGCTGGTGATAGA
AGTTTCATATTTTGGGTGGCATATTCATTCTGAGACACATGATCTTTGTGATGAGACAAC
ATGTCCAGTGGCAGTTGGAGATTTCTTGGTAACACACTCGCAAGTTCTACCTGGTTATAC
TCCTCCTGGTTCATACTCGCTTAAGATGAAGATGCTTGATGGACACAAGAAGGAGCTAAC
ATGCATCAAATTCTCATTCATGATTGGATTGGGATCATCGTCATCCGTGGCCGACATGTA
GAGCTATTTTGCTCGCTGGGATATACCCATGCGATCACTCCATTTGCTTTGTATAAAAAA
AGAAAACAACATTTCTCTTTACCAACATTGTTGATCAAAAATCATTTGAAATTTTCTCAA
TCTTGTTCCCCATGTTAGACCATTTGATAAAATCCCTTTTATAGATAATTAGATAAATAA
TACTCCCTCCGTTTCAATG

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL6897Contig1 644 2 1 U
GTAGCAGAAGAAGAAAGAAAGAGGTTGAAAACATGGCTTATGCAGCAATGAAGCCCACGA
AGGCTGGTTTAGAAGAGCCACTCGAGCAAATTCATAAGATCAGGATTACTCTCTCATCAA
AAAATGTGAAGAACCTAGAGAAAGTGTGTGCTGATTTGGTTCGTGGAGCAAAGGACAAGA
GACTTAGAACCAAGGGACCAGTTAGAATGCCCACCAAGGTTCTTAAGATCACCACCCGAA
AAGCTCCTTGTGGTGAAGGAACCAATACATGGGACAGATTCGAACTTAGGGTGCACAAGC
GAGTGATTGATCTCTTCAGCTCTCCCGATGTGGTCAAGCAAATCACTTCCATCACCATTG
AACCTGGTGTTGAAGTCGAAGTCACCATCGCCGACTCTTAGATTTTCTTTGCCTGCAAGA
AACAAGAATATCTTACTTTGTCTCTCCGGTTGATCTGGATGAAACCAATGTTTTTGTTGT
AGTGAAACTTAGCTGAGATATTTATCTTTCCAGAGATTTGTTATTTACATCTATCAAAGT
TGAGATCATAATAACGCTCTTGTACACCAAATTGTATGATTCTGTTACTTGTTAAAAGGC
TGTCAAGCAAACAAGAACTTAACCCTCACTCGATATATTTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A751TF U 1
AF RR2A751JQ C 30
BS 1 644 RR2A751TF

RD RR2A751TF 644 0 0
GTAGCAGAAGAAGAAAGAAAGAGGTTGAAAACATGGCTTATGCAGCAATGAAGCCCACGA
AGGCTGGTTTAGAAGAGCCACTCGAGCAAATTCATAAGATCAGGATTACTCTCTCATCAA
AAAATGTGAAGAACCTAGAGAAAGTGTGTGCTGATTTGGTTCGTGGAGCAAAGGACAAGA
GACTTAGAACCAAGGGACCAGTTAGAATGCCCACCAAGGTTCTTAAGATCACCACCCGAA
AAGCTCCTTGTGGTGAAGGAACCAATACATGGGACAGATTCGAACTTAGGGTGCACAAGC
GAGTGATTGATCTCTTCAGCTCTCCCGATGTGGTCAAGCAAATCACTTCCATCACCATTG
AACCTGGTGTTGAAGTCGAAGTCACCATCGCCGACTCTTAGATTTTCTTTGCCTGCAAGA
AACAAGAATATCTTACTTTGTCTCTCCGGTTGATCTGGATGAAACCAATGTTTTTGTTGT
AGTGAAACTTAGCTGAGATATTTATCTTTCCAGAGATTTGTTATTTACATCTATCAAAGT
TGAGATCATAATAACGCTCTTGTACACCAAATTGTATGATTCTGTTACTTGTTAAAAGGC
TGTCAAGCAAACAAGAACTTAACCCTCACTCGATATATTTTCGC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2A751JQ 615 0 0
AACATGGCTTATGCAGCAATGAAGCCCACGAAGGCTGGTTTAGAAGAGCCACTCGAGCAA
ATTCATAAGATCAGGATTACTCTCTCATCAAAAAATGTGAAGAACCTAGAGAAAGTGTGT
GCTGATTTGGTTCGTGGAGCAAAGGACAAGAGACTTAGAACCAAGGGACCAGTTAGAATG
CCCACCAAGGTTCTTAAGATCACCACCCGAAAAGCTCCTTGTGGTGAAGGAACCAATACA
TGGGACAGATTCGAACTTAGGGTGCACAAGCGAGTGATTGATCTCTTCAGCTCTCCCGAT
GTGGTCAAGCAAATCACTTCCATCACCATTGAACCTGGTGTTGAAGTCGAAGTCACCATC
GCCGACTCTTAGATTTTCTTTGCCTGCAAGAAACAAGAATATCTTACTTTGTCTCTCCGG
TTGATCTGGATGAAACCAATGTTTTTGTTGTAGTGAAACTTAGCTGAGATATTTATCTTT
CCAGAGATTTGTTATTTACATCTATCAAAGTTGAGATCATAATAACGCTCTTGTACACCA
AATTGTATGATTCTGTTACTTGTTAAAAGGCTGTCAAGCAAACAAGAACTTAACCCTCAC
TCGATATATTTTCGC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL6898Contig1 951 2 4 U
GGAGAAACAAAAGAATCTAAAAAAGGGTAAACAAAAGAATCTAAAAAAAAGTGAGAGATA
AAGTCTGGTAAAATTTGAGAGGCAGATTCTTTGTTTTGGGTAATGTCGAATCACAATATA
TACAAAGCTCGTGAGTGGATGTACAAACGTGTAGATGAAGTCACCCGGTGAAATCAAGAT
GGAATACAAGGAAGGTCTTACCGGGTTTATGCAATTTGCTACAAATCAAGATATCTCTCG
TGAACAAGATTTTGCTAAAGATTATATGCATGAAGAAAATCTAGCACCGGGATCTTATTA
CGAAATTCAGAAAATGGTTTCTGGACTAGGATTACCATACGAAATGATAGACGTATGCAG
AGATAATTGCATGACTTTTTGGAGAGATGACAGCAACTTGGAAACATGCAAGTGGTGTGG
AAAGCAAAGATATAAGGAAACTTTCTGACTTTACTTTTCATATTCTCATTTATAGGAGGT
TAAAGTAACAAAAAATGGTCGCCGTTTTGGATATGGAACAATGGATATCGGTGAACCAAG
TGGTCCAAGTTATGCAACTCAATCTCCAGATTACAAAGCACTTTATCTCGAGACACAAAC
AAAGCTCGTCCAAGTTACCACTAAGTGTGATGAGTTGTCTTTTCAAGTTGAAGATGCTCA
GTATTGGAGTACTGTCATGCCAAACATGTTCCCTGATCATGTCCCACCCTCTCAAGCTGC
AAGACAAGCTGCAAGACAAGCTGCTACAGCTAATAACACCGTCCAAGCCTAAGTGGTATT
TGCAGAAATTTTTTGTTTGTTAAATATGGCTTTTAACATATGCTATGTCAAAATATGGGT
TGTAAATTTTTTGTTTCAAGGATGTGGTTTGTAAGATGTTGAAAGTTATGTTTTCTGGAT
GTTGTAAGATATTTGAAATCATGGTCTGTAAAATATTTTATGTTTCAATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM88TF U 1
AF RR2GM88JQ C 139
BS 1 165 RR2GM88TF
BS 166 166 RR2GM88JQ
BS 167 714 RR2GM88TF
BS 715 951 RR2GM88JQ

RD RR2GM88TF 727 0 0
GGAGAAACAAAAGAATCTAAAAAAGGGTAAACAAAAGAATCTAAAAAAAAGTGAGAGATA
AAGTCTGGTAAAATTTGAGAGGCAGATTCTTTGTTTTGGGTAATGTCGAATCACAATATA
TACAAAGCTCGTGAGTGGATGTACAAACGTGTAGATGAAGTCACC*GGTGAAATCAAGAT
GGAATACAAGGAAGGTCTTACCGGGTTTATGCAATTTGCTACAAATCAAGATATCTCTCG
TGAACAAGATTTTGCTAAAGATTATATGCATGAAGAAAATCTAGCACCGGGATCTTATTA
CGAAATTCAGAAAATGGTTTCTGGACTAGGATTACCATACGAAATGATAGACGTATGCAG
AGATAATTGCATGACTTTTTGGAGAGATGACAGCAACTTGGAAACATGCAAGTGGTGTGG
AAAGCAAAGATATAAGGAAACTTTCTGACTTTACTTTTCATATTCTCATTTATAGGAGGT
TAAAGTAACAAAAAATGGTCGCCGTTTTGGATATGGAACAATGGATATCGGTGAACCAAG
TGGTCCAAGTTATGCAACTCAATCTCCAGATTACAAAGCACTTTATCTCGAGACACAAAC
AAAGCTCGTCCAAGTTACCACTAAGTGTGATGAGTTGTCTTTTCAAGTTGAAGATGCTCA
GTATTGGAGTACTGTCATGCCAAACATGTTCCCTGATCATGTCCCACCCTCTCA
GCTGCAGACAAGC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2GM88JQ 813 0 0
ATGTACAAACGTGTAGATGAAGTCACCCGGTGAAATCAAGATGGAATACAAGGAAGGTCT
TACCGGGTTTATGCAATTTGCTACAAATCAAGATATCTCTCGTGAACAAGATTTTGCTAA
AGATTATATGCATGAAGAAAATCTAGCACCGGGATCTTATTACGAAATTCAGAAAATGGT
TTCTGGACTAGGATTACCATACGAAATGATAGACGTATGCAGAGATAATTGCATGACTTT
TTGGAGAGATGACAGCAACTTGGAAACATGCAAGTGGTGTGGAAAGCAAAGATATAAGGA
AACTTTCTGACTTTACTTTTCATATTCTCATTTATAGGAGGTTAAAGTAACAAAAAATGG
TCGCCGTTTTGGATATGGAACAATGGATATCGGTGAACCAAGTGGTCCAAGTTATGCAAC
TCAATCTCCAGATTACAAAGCACTTTATCTCGAGACACAAACAAAGCTCGTCCAAGTTAC
CACTAAGTGTGATGAGTTGTCTTTTCAAGTTGAAGATGCTCAGTATTGGAGTACTGTCAT
GCCAAACATGTTCCCTGATCATGTCCCACCCTCTCAAGCTGCAAGACAAGCTGCAAGACA
AGCTGCTACAGCTAATAACACCGTCCAAGCCTAAGTGGTATTTGCAGAAATTTTTTGTTT
GTTAAATATGGCTTTTAACATATGCTATGTCAAAATATGGGTTGTAAATTTTTTGTTTCA
AGGATGTGGTTTGTAAGATGTTGAAAGTTATGTTTTCTGGATGTTGTAAGATATTTGAAA
TCATGGTCTGTAAAATATTTTATGTTTCAATCG

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

CO CL6899Contig1 1423 2 2 U
GGGAACCACTTTCCTCTGCACCCACAGAAAGACAGGCCAAAAGCTCGCCTGCAAATCCAT
ACCCAAAAGGAAGCTCCTCTGCCAAGAAGACTACGACGACGTTTTGAGGGAGATTCAGAT
AATGCACCACTTGTCTGAGTTCTCCAACGTTGTCCGGATAGAAGGCGCCTACGAGGATAC
CAGCAGCGTCCATATCGTGATGGAGCTCTGCGAAGGTGGCGAGCTGTTTGATAGGATCGT
GAAGAGAGGTCATTACAGTGAGAGAGAAGCGGCTAGGCTTATCAAGACGATTGTTGGTGT
TGTGGAGGCTTGTCACTCTTTTGGTGTTATGCACAGAGATCTTAAGCCTGAGAATTTTCT
CTTTGCTTCTTGTGATGAAGATGCTTCTCTTAAGTCTACAGACTTTGGCCTCTCTGTTTT
CTGCAAACCAGGGGCAACGTTTTCAGAACTTGTTGGGAGTGCCTACTATGTAGCACCTGA
GGTTTTACATAAGCATTACAGTCATGAATGTGATGTATGGAGTGCTGGAGTTATCCTCTA
CATTCTATTATGTGGTTTCCCTCCTTTCTGGGATGAGAGCGAGTTTGGCATCTTCAGAAA
GATTCTACAGGGAAAGTTGGACTTTGAGATCAGTCCCTGGCCTAGCATCTCAGAGAGTGC
TAAAGATCTTATAGTGAAAATGCTCGAGAAAGATCCAAAGAAAAGGCTTACTGCTCATCA
AGTGTTGTGTCACCCGTGGATTGTGGATGATAAGGTTGCTCCAGACAAACCTCTGGACTG
TGCAGTACTGTCACGCCTGAAAAACTTCTCTGCAATGAACAAACTTAAGAAGATGGCTTT
CCGAGTGATTGCAGAGAGACTATCTGAGGAAGAGATCGGTGGGCTCAAGGAACTGTTCAG
AATGATAGACACGGATAACAGTGGCACCATCACATTTGAAGAGTTGAAAGACGCTGTGAA
GCGCGTTGGTGCAGACCTTGGAATCAGAGATCCAAGAACTCTTGCGCTCAGCTGATGTCG
ATGAGAATGGATCTATAGACTATGGAGAGTTTTTAGCGGCAACAATCCATTTAAACAAGC
TGGAGAGAGAGGAGAATCTAGTGGCTGCATTCTCTTTCTTTGACAAAGATGGAAGTGGTT
ACATCACTGTGGATGAGCTCCAACAGGCTTTGAAGGAGTTTGGTATAAACGATTCACATC
TTGATGAAATGATCAAAGACATTGATCAAGACAATGATGGACAAATAGACTATGGAGAGT
TTGTGGCAATGATGAGGAAAGGGAATGGCAGTGGAGGGATTGGTAGGAGAACAATGAGGA
ACACTGTCAACTTTGCAAATTGGAAATCATGTTCCTGATGAAGTCAATGATGAATGGCTA
AATACTTGAGTGAAAAGTTGATATTAATAATTTAAACAAACCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH34TF U 1
AF RR2AH34JQ C 623
BS 1 702 RR2AH34TF
BS 703 1423 RR2AH34JQ

RD RR2AH34TF 702 0 0
GGGAACCACTTTCCTCTGCACCCACAGAAAGACAGGCCAAAAGCTCGCCTGCAAATCCAT
ACCCAAAAGGAAGCTCCTCTGCCAAGAAGACTACGACGACGTTTTGAGGGAGATTCAGAT
AATGCACCACTTGTCTGAGTTCTCCAACGTTGTCCGGATAGAAGGCGCCTACGAGGATAC
CAGCAGCGTCCATATCGTGATGGAGCTCTGCGAAGGTGGCGAGCTGTTTGATAGGATCGT
GAAGAGAGGTCATTACAGTGAGAGAGAAGCGGCTAGGCTTATCAAGACGATTGTTGGTGT
TGTGGAGGCTTGTCACTCTTTTGGTGTTATGCACAGAGATCTTAAGCCTGAGAATTTTCT
CTTTGCTTCTTGTGATGAAGATGCTTCTCTTAAGTCTACAGACTTTGGCCTCTCTGTTTT
CTGCAAACCAGGGGCAACGTTTTCAGAACTTGTTGGGAGTGCCTACTATGTAGCACCTGA
GGTTTTACATAAGCATTACAGTCATGAATGTGATGTATGGAGTGCTGGAGTTATCCTCTA
CATTCTATTATGTGGTTTCCCTCCTTTCTGGGATGAGAGCGAGTTTGGCATCTTCAGAAA
GATTCTACAGGGAAAGTTGGACTTTGAGATCAGTCCCTGGCCTAGCATCTCAGAGAGTGC
TAAAGATCTTATAGTGAAAATGCTCGAGAAAGATCCAAAGAA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2AH34JQ 801 0 0
TTTGAGATCAGTCCCTGGCCTAGCATCTCAGAGAGTGCTAAGGATCTTATAGTGAAAATG
CTCGAGAAAGATCCAAAGAAAAGGCTTACTGCTCATCAAGTGTTGTGTCACCCGTGGATT
GTGGATGATAAGGTTGCTCCAGACAAACCTCTGGACTGTGCAGTACTGTCACGCCTGAAA
AACTTCTCTGCAATGAACAAACTTAAGAAGATGGCTTTCCGAGTGATTGCAGAGAGACTA
TCTGAGGAAGAGATCGGTGGGCTCAAGGAACTGTTCAGAATGATAGACACGGATAACAGT
GGCACCATCACATTTGAAGAGTTGAAAGACGCTGTGAAGCGCGTTGGTGCAGACCTTGGA
ATCAGAGATCCAAGAACTCTTGCGCTCAGCTGATGTCGATGAGAATGGATCTATAGACTA
TGGAGAGTTTTTAGCGGCAACAATCCATTTAAACAAGCTGGAGAGAGAGGAGAATCTAGT
GGCTGCATTCTCTTTCTTTGACAAAGATGGAAGTGGTTACATCACTGTGGATGAGCTCCA
ACAGGCTTTGAAGGAGTTTGGTATAAACGATTCACATCTTGATGAAATGATCAAAGACAT
TGATCAAGACAATGATGGACAAATAGACTATGGAGAGTTTGTGGCAATGATGAGGAAAGG
GAATGGCAGTGGAGGGATTGGTAGGAGAACAATGAGGAACACTGTCAACTTTGCAAATTG
GAAATCATGTTCCTGATGAAGTCAATGATGAATGGCTAAATACTTGAGTGAAAAGTTGAT
ATTAATAATTTAAACAAACCA

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL6900Contig1 1055 2 6 U
GGCCGGAAAATGACATCATCATCTCCAAGAACACAATTCCGGAGATGTCTCCCCAAGAAC
CAGCGTCACGGCAGCCACCACCGGCTAGCAGAGGGAAGAAACGGCGGAGGAGGAAGCCTA
GGGTTTGCAAAAACGAAGAAGAAGCTGAGAATCAGCGAATAACTCACATCGCGGTAGAAA
GAAATCGAAGAAGACAAATGAATCAGCATCTCTCTGTCTTAAGATCTCTCATGCCTCAAC
CTTTTTCTCAAAAGGGTGATCAAGCTTCAATAGTTGGTGGAGCCATAGATTTCATCAAAG
AACTTGAACATGAATTACTATCTCTTGAAGCTCAAAAGCTTCAAAAGGATAAACTAAACC
AGACGGTTACTTCTTCAACAAGTCAAGACTCAAACTGCGAGCCTGAGAATCCTCACCTGT
CTCTATCACAGTTCTTTCTTCACTCGTACGATCCAAGCCAGGAGAATAGAAATGGGTCAA
CAAGCTCGGTGAAAACCGCTATGGAGGATCTTGAAGTGACTCTAATAGAAACTCATGCTA
ACATCAGAATCCTGTCAAGAAGAAGAGGTTTCCAATGGACCTCGGTGGTGGCTACCACCG
GACCACCGCAACTTTCAAAATTAGTGGCTGCTCTACAGACACTCTCCCTCTCCGTGCTTC
ACCTCAGTGTCACAACATTGGAAACTTTTGCCATTTACTCAATCAGCACTAAAGTGGAAG
AGAGTTGCCAGCTAAGTTCAGTAGATGACATTGCAGGAGCAGTTCATCACATGCTAAGTA
TCATTGAAGAGGAACCTTTTTGTTGTTCAACAATGCCAGAGTTACCCTTTACTTTCCCCT
TAAATCACACTAATGTCACTCATTCTCTCTGAGAATTCTCCTTTCCTTTTTAATTCTTTT
ATCACATATCACATCTTTGATAGTTTTTTCTTTCAGAATAAAGAAGGTTTATTGCTTTCT
TTTTTATTTCCTAGGTTTTTTCTGACTCTGTAAAGGCTAAATGTGAAACCATGTGGAGAG
TAATGGCACGTAATATAAAAGTAGTTGTTTTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FK71TF U 1
AF RR2FK71JQ C 447
BS 1 718 RR2FK71TF
BS 719 719 RR2FK71JQ
BS 720 756 RR2FK71TF
BS 757 757 RR2FK71JQ
BS 758 779 RR2FK71TF
BS 780 1055 RR2FK71JQ

RD RR2FK71TF 779 0 0
GGCCGGAAAATGACATCATCATCTCCAAGAACACAATTCCGGAGATGTCTCCCCAAGAAC
CAGCGTCACGGCAGCCACCACCGGCTAGCAGAGGGAAGAAACGGCGGAGGAGGAAGCCTA
GGGTTTGCAAAAACGAAGAAGAAGCTGAGAATCAGCGAATAACTCACATCGCGGTAGAAA
GAAATCGAAGAAGACAAATGAATCAGCATCTCTCTGTCTTAAGATCTCTCATGCCTCAAC
CTTTTTCTCAAAAGGGTGATCAAGCTTCAATAGTTGGTGGAGCCATAGATTTCATCAAAG
AACTTGAACATGAATTACTATCTCTTGAAGCTCAAAAGCTTCAAAAGGATAAACTAAACC
AGACGGTTACTTCTTCAACAAGTCAAGACTCAAACTGCGAGCCTGAGAATCCTCACCTGT
CTCTATCACAGTTCTTTCTTCACTCGTACGATCCAAGCCAGGAGAATAGAAATGGGTCAA
CAAGCTCGGTGAAAACCGCTATGGAGGATCTTGAAGTGACTCTAATAGAAACTCATGCTA
ACATCAGAATCCTGTCAAGAAGAAGAGGTTTCCAATGGACCTCGGTGGTGGCTACCACCG
GACCACCGCAACTTTCAAAATTAGTGGCTGCTCTACAGACACTCTCCCTCTCCGTGCTTC
ACCTCAGTGTCACAACATTGGAAACTTTTGCCATTTACTCAATCAGCACTAAAGTGGA*G
AGAGTTGCCAGCTAAGTTCAGTAGATGACATTGCAG*AGCAGTTCATCACATGCTAAGT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2FK71JQ 609 0 0
TACGATCCAAGCCAGGAGAATAGAAATGGGTCAACAAGCTCGGTGAAAACCGCTATGGAG
GATCTTGAAGTGACTCTAATAGAAACTCATGCTAACATCAGAATCCTGTCAAGAAGAAGA
GGTTTCCAATGGACCTCGGTGGTGGCTACCACCGGACCACCGCAACTTTCAAAATTAGTG
GCTGCTCTACAGACACTCTCCCTCTCCGTGCTTCACCTCAGTGTCACAACATTGGAAACT
TTTGCCATTTACTCAATCAGCACTAAGGTGGAAGAGAGTTGCCAGCTAAGTTCAGTAGAT
GACATTGCAGGAGCAGTTCATCACATGTTAAGTATCATTGAAGAGGAACCTTTTTGTTGT
TCAACAATGCCAGAGTTACCCTTTACTTTCCCCTTAAATCACACTAATGTCACTCATTCT
CTCTGAGAATTCTCCTTTCCTTTTTAATTCTTTTATCACATATCACATCTTTGATAGTTT
TTTCTTTCAGAATAAAGAAGGTTTATTGCTTTCTTTTTTATTTCCTAGGTTTTTTCTGAC
TCTGTAAAGGCTAAATGTGAAACCATGTGGAGAGTAATGGCACGTAATATAAAAGTAGTT
GTTTTACTC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL6901Contig1 779 2 6 U
GGACAAAGGAGCCATCGCCCAGAGGAAACGATGTCGTTTTGGTCTCTAGTTCCTCCTCCA
TCTTCTCCTTGTCTGTCTGCTAATCTCGTCAAGCCTCTCAATGGCTACGGAAGGCTCGAT
CGTCACCTCGTTCGAGCTTCTTCTTCCGATGTTCCCGATTTCCTCTCTGCGGATTGGCTG
GAGAGTCGTAGGAAGCGTCCTTTCGGCCCAAGACTTGATTTTAGTGCGGAAGATGCTGTT
CAACACCAGCTTGATGCATTAAAGTATAACGACCATCCTCGTTATGATTATGGCATCGAG
GTCATGTATCGGTTTGCTGGATTCGACCCGTTTGAGAGATCCACCTATTTTGGTCCTTTT
TTTGATCTAGGACAGTTTGAAAGGTTTCGGCGTATTTTTCACCACTCGTCTTACCGTGTG
CTGCTTGGTCACAAAGATAGAAAGATCTTAAGCAGTTTGCTCGTTGAAGAGAACCGTTTC
AAGCAGAGGATTTGGATTCAAGGAACTCGGCCTGAGGAAGAAGAGATATTTGAATTCACA
ATGTTCCAGCGGATAGGCGGTTCATGGGATGGTTATTGGTTGACAGAGAGCTTGCTTCAT
GATGGAGATGTGTTTTCAGGAGGGATGGCTTACTGATTCAGTTGCCTTGAGCTTCATTTC
CTTTTCAGGTTATCGGTATTTCTTCGGCCAGATCATGTTCATATACGTAGATATTTGGGA
CACAACTCTGTAAACTTATGTTAATATTATACGCAATTAGTAACATATGTTATTCATCT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FV88TF U 1
AF RR2FV88JQ C 2
BS 1 668 RR2FV88TF
BS 669 669 RR2FV88JQ
BS 670 743 RR2FV88TF
BS 744 744 RR2FV88JQ
BS 745 770 RR2FV88TF
BS 771 779 RR2FV88JQ

RD RR2FV88TF 771 0 0
GGACAAAGGAGCCATCGCCCAGAGGAAACGATGTCGTTTTGGTCTCTAGTTCCTCCTCCA
TCTTCTCCTTGTCTGTCTGCTAATCTCGTCAAGCCTCTCAATGGCTACGGAAGGCTCGAT
CGTCACCTCGTTCGAGCTTCTTCTTCCGATGTTCCCGATTTCCTCTCTGCGGATTGGCTG
GAGAGTCGTAGGAAGCGTCCTTTCGGCCCAAGACTTGATTTTAGTGCGGAAGATGCTGTT
CAACACCAGCTTGATGCATTAAAGTATAACGACCATCCTCGTTATGATTATGGCATCGAG
GTCATGTATCGGTTTGCTGGATTCGACCCGTTTGAGAGATCCACCTATTTTGGTCCTTTT
TTTGATCTAGGACAGTTTGAAAGGTTTCGGCGTATTTTTCACCACTCGTCTTACCGTGTG
CTGCTTGGTCACAAAGATAGAAAGATCTTAAGCAGTTTGCTCGTTGAAGAGAACCGTTTC
AAGCAGAGGATTTGGATTCAAGGAACTCGGCCTGAGGAAGAAGAGATATTTGAATTCACA
ATGTTCCAGCGGATAGGCGGTTCATGGGATGGTTATTGGTTGACAGAGAGCTTGCTTCAT
GATGGAGATGTGTTTTCAGGAGGGATGGCTTACTGATTCAGTTGCCTTGAGCTTCATTTC
CTTTTCAG*TTATCGGTATTTCTTCGGCCAGATCATGTTCATATACGTAGATATTTGGGA
CACAACTCTGTAAACTTATGTTA*TATTATACGCAATTAGTAACATATGT
A

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2FV88JQ 778 0 0
GACAAAGGAGCCATCGCCCAGAGGAAACGATGTCGTTTTGGTCTCTAGTTCCTCCTCCAT
CTTCTCCTTGTCTGTCTGCTAATCTCGTCAAGCCTCTCAATGGCTACGGAAGGCTCGATC
GTCACCTCGTTCGAGCTTCTTCTTCCGATGTTCCCGATTTCCTCTCTGCGGATTGGCTGG
AGAGTCGTAGGAAGCGTCCTTTCGGCCCAAGACTTGATTTTAGTGCGGAAGATGCTGTTC
AACACCAGCTTGATGCATTAAAGTATAACGACCATCCTCGTTATGATTATGGCATCGAGG
TCATGTATCGGTTTGCTGGATTCGACCCGTTTGAGAGATCCACCTATTTTGGTCCTTTTT
TTGATCTAGGACAGTTTGAAAGGTTTCGGCGTATTTTTCACCACTCGTCTTACCGTGTGC
TGCTTGGTCACAAAGATAGAAAGATCTTAAGCAGTTTGCTCGTTGAAGAGAACCGTTTCA
AGCAGAGGATTTGGATTCAAGGAACTCGGCCTGAGGAAGAAGAGATATTTGAATTCACAA
TGTTCCAGCGGATAGGCGGTTCATGGGATGGTTATTGGTTGACAGAGAGCTTGCTTCATG
ATGGAGATGTGTTTTCAGGAGGGATGGCTTACTGATTCAGTTGCCTTGAGCTTCATTTCC
TTTTCAGGTTATCGGTATTTCTTCGGCCAGATCATGTTCATATACGTAGATATTTGGGAC
ACAACTCTGTAAACTTATGTTAATATTATACGCAATTAGTAACATATGTTATTCATCT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL6902Contig1 1099 2 4 U
GTAACCGCTCCGGCGAGTAACGCCGATTTCTTGTTCGGATCGGAGAAAGTAGTCGTAGCT
CCGCCGTCTCCGCCGGCGGCAGTGACGGTGGCTCAACAGATTCAGGATCCGCAGATGTTC
CTTAACCAACAGGTGATAACACCGGAGCAGGAGATTCAACGACAGATCCATGAGTTTCAG
AGGATTCAAATTAGAGATCAAGAACAACAGCAACAACATCAACAGATACAGCAGCTTCAA
CAGCAAGAGGCTATGTACAGAAGAAACAGCCAAGACGGACGTTACTTCACTCCAACCTAC
GCTCAAAATCCTCCTCAGCAGCAGCCGCCACCGACGACGACGACGGTGTCTCAGACGAAT
CAACAACAGATTCAGGATCCGCAGATGTTCCTTAACCAACAGGTGATAACACCGGAGCAG
GAGATTCAACGACAGATCCATGAGTTTCAGAGGATTCAAATTAGAGATCAAGAACAACAA
CAACAACAACAACGTTCCGGGGAACAACATTTACACAACGACGGAGCAGCAGCAAGTATA
CATGATCCCAGCTCAGTCTCAAGCACCAGGGACGTTATACCACAGCGTGATGAGACCACC
ACCACCGACACAAGGAAGCCAAGGGTATTACCCACCTGTTCAACGTATCCAACAGCATCA
TCCTGATCCTTACATGGAGCAGCAGAACCAGCAAGGTGGTTACAACGTGGTTCAACCACC
ACAACAGCCAACGTATTCAGGTGGTCCACAGGTTATGAGTAGTGGTCCAATGGGATTACA
CGAAACGCCGCCGTATTCACAGATGGGGAATCCTGTGTACTATACAGTGGCTGGGGATGG
TGTGATGGTGCCGCCGCAACCGCATCAGCCTCAGTACCAGGGAATGGGTCAGCCGGTTAG
TGGCATGACCGGACCGGATGGGAAAGTGGTGGTTAACACGGGGCCTAAAGTATCGCAGAG
TGCAGATTCGGTGTGAGTGTGAGATGAAGCTGACGTGAATGTCATGATCACATTATTATC
ATTATTATCCATTTACAGGTGCTTTTGTAATATTATTATGTATAAGCGTTTGAGATCAAA
GTGGAGTCTGGATGTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM72TF U 1
AF RR2AM72JQ C 574
BS 1 650 RR2AM72TF
BS 651 651 RR2AM72JQ
BS 652 691 RR2AM72TF
BS 692 1099 RR2AM72JQ

RD RR2AM72TF 691 0 0
GTAACCGCTCCGGCGAGTAACGCCGATTTCTTGTTCGGATCGGAGAAAGTAGTCGTAGCT
CCGCCGTCTCCGCCGGCGGCAGTGACGGTGGCTCAACAGATTCAGGATCCGCAGATGTTC
CTTAACCAACAGGTGATAACACCGGAGCAGGAGATTCAACGACAGATCCATGAGTTTCAG
AGGATTCAAATTAGAGATCAAGAACAACAGCAACAACATCAACAGATACAGCAGCTTCAA
CAGCAAGAGGCTATGTACAGAAGAAACAGCCAAGACGGACGTTACTTCACTCCAACCTAC
GCTCAAAATCCTCCTCAGCAGCAGCCGCCACCGACGACGACGACGGTGTCTCAGACGAAT
CAACAACAGATTCAGGATCCGCAGATGTTCCTTAACCAACAGGTGATAACACCGGAGCAG
GAGATTCAACGACAGATCCATGAGTTTCAGAGGATTCAAATTAGAGATCAAGAACAACAA
CAACAACAACAACGTTCCGGGGAACAACATTTACACAACGACGGAGCAGCAGCAAGTATA
CATGATCCCAGCTCAGTCTCAAGCACCAGGGACGTTATACCACAGCGTGATGAGACCACC
ACCACCGACACAAGGAAGCCAAGGGTATTACCCACCTGTTCAACGTATCCCACAGCATCA
TCCTGATCCTTACATGGAGCAGCAGAACCAG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2AM72JQ 526 0 0
GTTATACCACAGCGTGATGAGACCACCACCACCGACACAAGGAAGCCAAGGGTATTACCC
ACCTGTTCAACGTATCCAACAGCATCATCCTGATCCTTACATGGAGCAGCAGAACCAGCA
AGGTGGTTACAACGTGGTTCAACCACCACAACAGCCAACGTATTCAGGTGGTCCACAGGT
TATGAGTAGTGGTCCAATGGGATTACACGAAACGCCGCCGTATTCACAGATGGGGAATCC
TGTGTACTATACAGTGGCTGGGGATGGTGTGATGGTGCCGCCGCAACCGCATCAGCCTCA
GTACCAGGGAATGGGTCAGCCGGTTAGTGGCATGACCGGACCGGATGGGAAAGTGGTGGT
TAACACGGGGCCTAAAGTATCGCAGAGTGCAGATTCGGTGTGAGTGTGAGATGAAGCTGA
CGTGAATGTCATGATCACATTATTATCATTATTATCCATTTACAGGTGCTTTTGTAATAT
TATTATGTATAAGCGTTTGAGATCAAAGTGGAGTCTGGATGTGCTT

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 2

CO CL6903Contig1 889 2 8 U
GGAAACGTTTTCTGACTGATACCTTACAATGGATAGCCGGTGGAGTCTTCAAGGTATGAC
CGCTCTTGTAACTGGTGGAACCAAGGGGATTGGGTATGCGATAGTGGAGGAACTTGCTGG
TTTTGGTGCAAGAGTTCACACGTGTGCTAGAGACCAGACTCTGCTTGGTGAATGCTTAAA
TGAATGGAAAGTGAAAGGGTTTCAAGTCACTGGCTCAGTGTGTGATGTTTCCTCTCGACC
TCAGAGAGATGAGTTGATAAATACTGTCTCTTCTCTATTCAGTGGCAAACTCAACATCCT
TATCAACAATGTTGGTTTCCTTATTTCAAAGCCGGCTGCAGAGTTTACAGCACAAGATTT
CTCAGGTCAAGTAGCTACAAATTTGGAGTCTGCATATCATTTATCTCAACTGGCCCATCC
TTTACTTAAGGCCTCTGGATTTGGTAGCATTGTGTTCTTGTCTTCAGTATGTGGGGTTGT
CTCAGCTGGTTTAGTATCCATATACAGCTTAACAAAAGGAGGTATGAATCAACTGGCAAG
AAACTTGGCATGTGAATGGGCAAGTGATGGCATAAGGGCTAACTCTGTAGCTCCTTGGGT
GACTAGAACTCCTCTTGTCCAAACACGTCTTGACGACAGGAAATATGCTGAAGCTATCTA
TTCAAGAACACCATTAGGCCGTGCGTGTGAGCCGTGTGAGGTTGCCTCGCTGGTTACGCT
TCTTTGTCTCCCTGCAGCTTCTTATATAACAGGACAAACCATTTGTATTGATGGAGGTTT
CACTGTTAATGGCTTCTCCTACAAGCCAGAGGTTTAAACTCTATAAACACTTCCTAAACA
ACAATGATGTAATAGTGTATGAAAAGTTATGTTATTGATTTTGCTGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV26TF U 1
AF RR2EV26JQ C 94
BS 1 700 RR2EV26TF
BS 701 701 RR2EV26JQ
BS 702 752 RR2EV26TF
BS 753 753 RR2EV26JQ
BS 754 759 RR2EV26TF
BS 760 760 RR2EV26JQ
BS 761 779 RR2EV26TF
BS 780 889 RR2EV26JQ

RD RR2EV26TF 787 0 0
GGAAACGTTTTCTGACTGATACCTTACAATGGATAGCCGGTGGAGTCTTCAAGGTATGAC
CGCTCTTGTAACTGGTGGAACCAAGGGGATTGGGTATGCGATAGTGGAGGAACTTGCTGG
TTTTGGTGCAAGAGTTCACACGTGTGCTAGAGACCAGACTCTGCTTGGTGAATGCTTAAA
TGAATGGAAAGTGAAAGGGTTTCAAGTCACTGGCTCAGTGTGTGATGTTTCCTCTCGACC
TCAGAGAGATGAGTTGATAAATACTGTCTCTTCTCTATTCAGTGGCAAACTCAACATCCT
TATCAACAATGTTGGTTTCCTTATTTCAAAGCCGGCTGCAGAGTTTACAGCACAAGATTT
CTCAGGTCAAGTAGCTACAAATTTGGAGTCTGCATATCATTTATCTCAACTGGCCCATCC
TTTACTTAAGGCCTCTGGATTTGGTAGCATTGTGTTCTTGTCTTCAGTATGTGGGGTTGT
CTCAGCTGGTTTAGTATCCATATACAGCTTAACAAAAGGAGGTATGAATCAACTGGCAAG
AAACTTGGCATGTGAATGGGCAAGTGATGGCATAAGGGCTAACTCTGTAGCTCCTTGGGT
GACTAGAACTCCTCTTGTCCAAACACGTCTTGACGACAGGAAATATGCTGAAGCTATCTA
TTCAAGAACACCATTAGGCCGTGCGTGTGAGCCGTGTGAG*TTGCCTCGCTGGTTACGCT
TCTTTGTCTCCCTGCAGCTTCTTATATAACAG*ACAAAC*ATTTGTATTGATGGAGGTT
CACTGTTA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2EV26JQ 796 0 0
GTATGCGATAGTGGAGGAACTTGCTGGTTTTGGTGCAAGAGTTCACACGTGTGCTAGAGA
CCAGACTCTGCTTGGTGAATGCTTAAATGAATGGAAAGTGAAAGGGTTTCAAGTCACTGG
CTCAGTGTGTGATGTTTCCTCTCGACCTCAGAGAGATGAGTTGATAAATACTGTCTCTTC
TCTATTCAGTGGCAAACTCAACATCCTTATCAACAATGTTGGTTTCCTTATTTCAAAGCC
GGCTGCAGAGTTTACAGCACAAGATTTCTCAGGTCAAGTAGCTACAAATTTGGAGTCTGC
ATATCATTTATCTCAACTGGCCCATCCTTTACTTAAGGCCTCTGGATTTGGTAGCATTGT
GTTCTTGTCTTCAGTATGTGGGGTTGTCTCAGCTGGTTTAGTATCCATATACAGCTTAAC
AAAAGGAGGTATGAATCAACTGGCAAGAAACTTGGCATGTGAATGGGCAAGTGATGGCAT
AAGGGCTAACTCTGTAGCTCCTTGGGTGACTAGAACTCCTCTTGTCCAAACACGTCTTGA
CGACAGGAAATATGCTGAAGCTATCTATTCAAGAACACCATTAGGCCGTGCGTGTGAGCC
GTGTGAGGTTGCCTCGCTGGTTACGCTTCTTTGTCTCCCTGCAGCTTCTTATATAACAGG
ACAAACCATTTGTATTGATGGAGGTTTCACTGTTAATGGCTTCTCCTACAAGCCAGAGGT
TTAAACTCTATAAACACTTCCTAAACAACAATGATGTAATAGTGTATGAAAAGTTATGTT
ATTGATTTTGCTGGAG

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL6904Contig1 1213 2 6 U
GAAGTATCCATTAGCTAAAACGGGTATTCGGGCTTGGATCGGATCCGGTGGCCCCCCTTT
TGTTGCTGTTCGGGCTGATATGGATGCGCTTCCTATTCAGGAAGCAGTGGAATGGAAACA
CAAAAGCAAAGTGGCAGGCAAAATGCACGCTTGTGGTCATGATGCACATGTCACTATGCT
TCTTGGTGCTGCTCAGATTCTTAAGTCTCGTGAACATCTTCTCAAGGGAACAGTGGTTCT
ACTATTCCAACCAGCAGAAGAGGCTGGAAACGGTGCCAAGAAGATGATTGAAGACGGAGC
CTTGGATGACGTGGAGGCTATCTTTGCAGTCCATGTGTCCCACGAGCATCCAACGGGTGT
CATTGGATCTAGGAGCGGTCCTCTGCTCGCTGGATGTGGATTTTTCCGGGCAATCATTAC
TTCGGAAGAGACCGGCAGCTCTGCTGATCTTATTATCGCAGCTTCTTCCGCCGTCATAAG
CCTTCAAGGCATTGTATCACGTGAAGCTAGTCCTCTTGATGCTCAGGTTGTGTCGGTGAC
TTCGTTTGATGGCGGTCACAGTCTCGATGCGGTGCCGGATATGGGTGGTTCTTGGGGGCA
CTTTCAGAGCTTTTTCCAACTCAAGCTTCTACTACCTTATGAAGCGTATTCGAGAGGTAC
TAGTGGAACAGGTCGGGGTTTTCGGTTGCACAGCGACTCTGAATTTCTTTGAGGAGCAGA
ACGCAATATACCCGCCAACCACAAACGACGACGGAATGTACACTCACTTGAAAAAAGTCA
CCGTTGATTTGTTGGGAGACAACCACTTCGCGGTGACTCCACGAGTTATGGGAGCTGAAG
ATTTTGCATTCTACTCAGAGGTCATCCCGGCCGCATTTTACTTCATTGGCATAAGAAATG
AGGAACTTGGATCAGTCCATATTGGTCATTCACCGCATTTTATGATCGATGAAGATAGTT
TACCGGTTGGAGCAGCTGTTCACGCCGCCGTGGCTGAGAGATACTTAAATGATAAATGTT
CGTAAGAATAAAGACAATCTTCCCGACTTTTTGGATGATTTTGTTTTAGGTTTTGCATAA
AATTATTATTTATCATTGCATCGCTAGTATTTGTCAACCTTTTTTCCTTTTTCTTTTAAA
CTTGTAGACCGCATATATAAGAATACTGGTACAAAATGTAGCGAATTTTATATCTAATCT
ATTAAAACATAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD51TF U 1
AF RR2CD51JQ C 432
BS 1 575 RR2CD51TF
BS 576 576 RR2CD51JQ
BS 577 656 RR2CD51TF
BS 657 657 RR2CD51JQ
BS 658 667 RR2CD51TF
BS 668 1213 RR2CD51JQ

RD RR2CD51TF 667 0 0
GAAGTATCCATTAGCTAAAACGGGTATTCGGGCTTGGATCGGATCCGGTGGCCCCCCTTT
TGTTGCTGTTCGGGCTGATATGGATGCGCTTCCTATTCAGGAAGCAGTGGAATGGAAACA
CAAAAGCAAAGTGGCAGGCAAAATGCACGCTTGTGGTCATGATGCACATGTCACTATGCT
TCTTGGTGCTGCTCAGATTCTTAAGTCTCGTGAACATCTTCTCAAGGGAACAGTGGTTCT
ACTATTCCAACCAGCAGAAGAGGCTGGAAACGGTGCCAAGAAGATGATTGAAGACGGAGC
CTTGGATGACGTGGAGGCTATCTTTGCAGTCCATGTGTCCCACGAGCATCCAACGGGTGT
CATTGGATCTAGGAGCGGTCCTCTGCTCGCTGGATGTGGATTTTTCCGGGCAATCATTAC
TTCGGAAGAGACCGGCAGCTCTGCTGATCTTATTATCGCAGCTTCTTCCGCCGTCATAAG
CCTTCAAGGCATTGTATCACGTGAAGCTAGTCCTCTTGATGCTCAGGTTGTGTCGGTGAC
TTCGTTTGATGGCGGTCACAGTCTCGATGCGGTGC*GGATATGGGTGGTTCTTGGGGGCA
CTTTCAGAGCTTTTTCCAACTCAAGCTTCTACTACCTTATGAAGCGTATTCGAGAG*TAC
TAGTGGA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2CD51JQ 782 0 0
A
CGGCAGCTCTGCTGATCTTATTATCGCAGCTTCTTCCGCCGTCATAAGC*TTCAAGGCAT
TGTATCACGTGAAGCTAGTCCTCTTGATGCTCAGGTTGTGTCGGTGACTTCGTTTGATGG
CGGTCACAGTCTCGATGCGGTGCCGGATATGG*TGGTTCTTGGGGGCACTTTCAGAGCTT
TTTCCAACTCAAGCTTCTACTACCTTATGAAGCGTATTCGAGAGGTACTAGTGGAACAGG
TCGGGGTTTTCGGTTGCACAGCGACTCTGAATTTCTTTGAGGAGCAGAACGCAATATACC
CGCCAACCACAAACGACGACGGAATGTACACTCACTTGAAAAAAGTCACCGTTGATTTGT
TGGGAGACAACCACTTCGCGGTGACTCCACGAGTTATGGGAGCTGAAGATTTTGCATTCT
ACTCAGAGGTCATCCCGGCCGCATTTTACTTCATTGGCATAAGAAATGAGGAACTTGGAT
CAGTCCATATTGGTCATTCACCGCATTTTATGATCGATGAAGATAGTTTACCGGTTGGAG
CAGCTGTTCACGCCGCCGTGGCTGAGAGATACTTAAATGATAAATGTTCGTAAGAATAAA
GACAATCTTCCCGACTTTTTGGATGATTTTGTTTTAGGTTTTGCATAAAATTATTATTTA
TCATTGCATCGCTAGTATTTGTCAACCTTTTTTCCTTTTTCTTTTAAACTTGTAGACCGC
ATATATAAGAATACTGGTACAAAATGTAGCGAATTTTATATCTAATCTATTAAAACATAG
T

QA 2 782 2 782
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6906Contig1 746 2 2 U
GCAATTGTCCTTCCGTTTTCTCATCCTCTCCTTCTGCTTCTCGACGATGTCAACAATCCC
GATCAGATTTGTATATAGGTGCAGGAGGAGGGTACGAGGATCTGGAAGGAGAAGACGATT
TAAAATCGGAGTTCATCTGCCCGTTTTGCGCTGAAGTCTTCGACATCGTCGGGCTATGCT
GTCACATTGACGAAGAGCATCCTGTTGAGGCCAAGAATGGGGTCTGTCCTGTATGCACAA
AGAGGGTGGATACAGCTCTGCTTATCTCGCCTTGAAGAAAGAGCTCCAATTTAGATTCTG
ATCCGTTGCTGTCGTCTTTTATGTTTAGTTCTCCTTCAAGCAAATCTGCTACACCTGTTG
TAGCAGGTACCTCAGATACAAAACTCTTGCAGAAAGAATCTCTCAAAAGAGACGTTAGAG
AAGCTCCACTTTCAGGGGAAGATCGAGAGAAGGCGAAGAAGAGCGAGTTTGTGAGAGGTT
TGTTCTTGTCAACCATGCTTGGTGAGGATTACTAATGAAGGCTACTCGCCTTTTGTTGTG
GGTGATTTTATGAGAAAGTGAGCAAACTTGTGAGGTTAAAAATTGTTAGAGCTTGTAAGT
TTAACGAGGGGAGGCAGAGTTAAATCCATATGTTATTGTCATCGTACTTACCACCTTATA
ATGTTTATAAACGGAAACAAAGTACTGTACTTTCTTTTCATTGAGACATTCATAGATTCG
AATAAAAACATTTAACACGTTTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH30TF U 1
AF RR2GH30JQB C 16
BS 1 656 RR2GH30TF
BS 657 746 RR2GH30JQB

RD RR2GH30TF 656 0 0
GCAATTGTCCTTCCGTTTTCTCATCCTCTCCTTCTGCTTCTCGACGATGTCAACAATCCC
GATCAGATTTGTATATAGGTGCAGGAGGAGGGTACGAGGATCTGGAAGGAGAAGACGATT
TAAAATCGGAGTTCATCTGCCCGTTTTGCGCTGAAGTCTTCGACATCGTCGGGCTATGCT
GTCACATTGACGAAGAGCATCCTGTTGAGGCCAAGAATGGGGTCTGTCCTGTATGCACAA
AGAGGGTGGATACAGCTCTGCTTATCTCGCCTTGAAGAAAGAGCTCCAATTTAGATTCTG
ATCCGTTGCTGTCGTCTTTTATGTTTAGTTCTCCTTCAAGCAAATCTGCTACACCTGTTG
TAGCAGGTACCTCAGATACAAAACTCTTGCAGAAAGAATCTCTCAAAAGAGACGTTAGAG
AAGCTCCACTTTCAGGGGAAGATCGAGAGAAGGCGAAGAAGAGCGAGTTTGTGAGAGGTT
TGTTCTTGTCAACCATGCTTGGTGAGGATTACTAATGAAGGCTACTCGCCTTTTGTTGTG
GGTGATTTTATGAGAAAGTGAGCAAACTTGTGAGGTTAAAAATTGTTAGAGCTTGTAAGT
TTAACGAGGGGAGGCAGAGTTAAATCCATATGTTATTGTCATCGTACTTACCACCT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2GH30JQB 731 0 0
TTTTCTCATCCTCTCCTTCTGCTTCTCGACGATGTCAACAATCCCGATCAGATTTGTATA
TAGGTGCAGGAGGAGGGTACGAGGATCTGGAAGGAGAAGACGATTTAAAATCGGAGTTCA
TCTGCCCGTTTTGCGCTGAAGTCTTCGACATCGTCGGGCTATGCTGTCACATTGACGAAG
AGCATCCTGTTGAGGCCAAGAATGGGGTCTGTCCTGTATGCACAAAGAGGGTGGATACAG
CTCTGCTTATCTCGCCTTGAAGAAAGAGCTCCAATTTAGATTCTGATCCGTTGCTGTCGT
CTTTTATGTTTAGTTCTCCTTCAAGCAAATTTGCTACACCTGTTGTAGCAGGTACCTCAG
ATACAAAACTCTTGCAGAAAGAATCTCTCAAAAGAGACGTTAGAGAAGCTCCACTTTCAG
GGGAAGATCGAGAGAAGGCGAAGAAGAGCGAGTTTGTGAGAGGTTTGTTCTTGTCAACCA
TGCTTGGTGAGGATTACTAATGAAGGCTACTCGCCTTTTGTTGTGGGTGATTTTATGAGA
AAGTGAGCAAACTTGTGAGGTTAAAAATTGTTAGAGCTTGTAAGTTTAAGGAGGGGAGGC
AGAGTTAAATCCATATGTTATTGTCATCGTACTTACCACCTTATAATGTTTATAAACGGA
AACAAAGTACTGTACTTTCTTTTCATTGAGACATTCATAGATTCGAATAAAAACATTTAA
CACGTTTTATG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL6907Contig1 609 2 2 U
GGATACACTAAACCTACAAAACTTACAAAAAAGGGAAAGAGAATGGAACTTCATGGAGTT
TCTTCTGGTGACCTGGAAGTTAAGTCTCCGGCTGAAAAGTTCTTTAGATCTGTCACCGAC
GACATAAACGGCCCCTTTGACAACATAGAGGATAAGATGGAGACGATGAATTTGGAGGAT
AGAACATTGACGGTGAGAATGAGTGGCTGTCTTATCTCGGAAAGTTACAAGACGGTCAAA
GCAACCATCACGGTCAGTCCTAAGGAAGATGGGGGCGGTAGCTGCGTGGCGTGGAAGGTT
GAGTTCGAGAAGATTCGTCATGACATCGAAGATCCACACTTGATTATCGACACTCTTATC
GACGTTCTTGTCAATTACCTAAAGGAGACCGATGGGAATCTTCTTCTATAAGCGTTTCTA
AATCACAAGGTTCGACTTTATGGAATGATGAATAATCTAATTAACAAACTTAAAAATTGA
ATTTAAATGGAACATATATGTGCGTGTGTCTACGATCATTGCAGTATCTTTTATTACGTT
TGGTACTTTAAATTAAGGTTTATGAGCTCGTATGACTTTCCAGTTTAATAAATCTTCGAG
TTTCATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DA70JQ C 1
AF RR2DA70TF U 72
BS 1 71 RR2DA70JQ
BS 72 609 RR2DA70TF

RD RR2DA70JQ 609 0 0
GGATACACTAAACCTACAAAACTTACAAAAAAGGGAAAGAGAATGGAACTTCATGGAGTT
TCTTCTGGTGACCTGGAAGTTAAGTCTCCGGCTGAAAAGTTCTTTAGATCTGTCACCGAC
GACATAAACGGCCCCTTTGACAACATAGAGGATAAGATGGAGACGATGAATTTGGAGGAT
AGAACATTGACGGTGAGAATGAGTGGCTGTCTTATCTCGGAAAGTTACAAGACGGTCAAA
GCAACCATCACGGTCAGTCCTAAGGAAGATGGGGGCGGTAGCTGCGTGGCGTGGAAGGTT
GAGTTCGAGAAGATTCGTCATGACATCGAAGATCCACACTTGATTATCGACACTCTTATC
GACGTTCTTGTCAATTACCTAAAGGAGACCGATGGGAATCTTCTTCTATAAGCGTTTCTA
AATCACAAGGTTCGACTTTATGGAATGATGAATAATCTAATTAACAAACTTAAAAATTGA
ATTTAAATGGAACATATATGTGCGTGTGTCTACGATCATTGCAGTATCTTTTATTACGTT
TGGTACTTTAAATTAAGGTTTATGAGCTCGTATGACTTTCCAGTTTAATAAATCTTCGAG
TTTCATATT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2DA70TF 538 0 0
CCTGGAAGTTAAGTCTCCGGCTGAAAAGTTCTTTAGATCTGTCACCGACGACATAAACGG
CCCCTTTGACAACATAGAGGATAAGATGGAGACGATGAATTTGGAGGATAGAACATTGAC
GGTGAGAATGAGTGGCTGTCTTATCTCGGAAAGTTACAAGACGGTCAAAGCAACCATCAC
GGTCAGTCCTAAGGAAGATGGGGGCGGTAGCTGCGTGGCGTGGAAGGTTGAGTTCGAGAA
GATTCGTCATGACATCGAAGATCCACACTTGATTATCGACACTCTTATCGACGTTCTTGT
CAATTACCTAAAGGAGACCGATGGGAATCTTCTTCTATAAGCGTTTCTAAATCACAAGGT
TCGACTTTATGGAATGATGAATAATCTAATTAACAAACTTAAAAATTGAATTTAAATGGA
ACATATATGTGCGTGTGTCTACGATCATTGCAGTATCTTTTATTACGTTTGGTACTTTAA
ATTAAGGTTTATGAGCTCGTATGACTTTCCAGTTTAATAAATCTTCGAGTTTCATATT

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

CO CL6908Contig1 277 2 1 U
GACCATCATCATCACAGACACAGAGAGGAGACGTATGCAGAGCAAGAGTGCTGCAAGTGG
CTGAAGCAAATGGACAACGAGTGCGTGTGCGACCTTCTGGTTAGGCTGCCGCCATTGCTA
GCGAAACCTGCTCATAACTATACGGTCTTTGTGGATGAGTCCTGCATCGTCACTTTCACC
TGTGGAGGCAGACTCATTCACTGATCATACACTCTCACTCTCATTGTCTTCTTCTTCTTC
AAATATCGTTTTGTTTACGTCTTTTCTTTAGCGGTAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GL81JQ C 1
AF RR2GL81TF U 1
BS 1 277 RR2GL81TF

RD RR2GL81JQ 277 0 0
GACCATCATCATCACAGACACAGAGAGGAGACGTATGCAGAGCAAGAGTGCTGCAAGTGG
CTGAAGCAAATGGACAACGAGTGCGTGTGCGACCTTCTGGTTAGGCTGCCGCCATTGCTA
GCGAAACCTGCTCATAACTATACGGTCTTTGTGGATGAGTCCTGCATCGTCACTTTCACC
TGTGGAGGCAGACTCATTCACTGATCATACACTCTCACTCTCATTGTCTTCTTCTTCTTC
AAATATCGTTTTGTTTACGTCTTTTCTTTAGCGGTAA

QA 1 277 1 277
DS 

RD RR2GL81TF 277 0 0
GACCATCATCATCACAGACACAGAGAGGAGACGTATGCAGAGCAAGAGTGCTGCAAGTGG
CTGAAGCAAATGGACAACGAGTGCGTGTGCGACCTTCTGGTTAGGCTGCCGCCATTGCTA
GCGAAACCTGCTCATAACTATACGGTCTTTGTGGATGAGTCCTGCATCGTCACTTTCACC
TGTGGAGGCAGACTCATTCACTGATCATACACTCTCACTCTCATTGTCTTCTTCTTCTTC
AAATATCGTTTTGTTTACGTCTTTTCTTTAGCGGTAA

QA 1 277 1 277
DS 



AS 1 2

CO CL6909Contig1 996 2 8 U
GCTCCTCCTCTGGAAATCCCTAAACTTCGTCTTCTTCTTCTCCGATCGTCGATCGATTTT
CTCAGTCTCCAAAGATTCTACTCTCTTCCGCCACCGCCGCATTCGCAATCCTGTGTAGAA
AATGATGGGACTGCCGAGGACGCCCGCAAGCAAGATAAACAGGGCGAATCCGTCGACACC
TGGCGGATCCAGAGTCACAGAGGAGAATATACTCGTCACTGTGCGGATGAGACCGTTGAA
CTCGAGGGAGCATGCCAAATATGACCTCATTGCTTGGGATTGCCCAGATGATCACACCAT
TGTTTTTAAAAACCCCAATCCTGAGAGAGGTTCAGCGAAATATTCATATGACAAAGTATA
TGAGCCCACGTGTGCAACTCAGGAGGTTTACGAAGGTGGTTCAAGGGATGTCGCACTTTC
TGCTTTAGCAGGAACCAACGCAACCATTTTTGCTTATGGTCAGACCAGCAGTGGAGAGAC
CTTTACAATGAGAGGGGTCACCGACAGTGTAGTTAAGGATATATACGAGCATATAAGTAA
AACTCAAGAAAGGGGCTTTGTCTTGAAAGTTTCAGCTTTGGAGATCTATAATGAGACTGT
GGTTGACCTTTTAAATCGTGATACTGGGCCCCTTAGGCTGTTAGATGATCCTGAGAAAGG
AACCATTGTAGAAAATCTGGTTGAGGAAGTGGTTGAAAGCAGGCAACATTTACAGCATTT
AATTAGCATTTGTGAAGGTCAAAGGCAAGTGGGTGAAACTGCTTTGAACGACAAAAGTTC
AAGATCTCATCAGATTATTCGGCTGACCATTCAGAGCAGTTTAAGGGAAATAGCAGGCCG
TGTGCAGTCTTTCATGGCAACTTTGAATCTTGTTGATCTTGCTGGAAGCGAACGTGCTTT
TCAAACACGCGCAGATGGTTTTAGATTTAAGGAAGGGAATCATATTAACCGAAGCTTACT
AACACTTACGACAGTTATTAGAAAGCTGAGTTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO71TF U 1
AF RR2FO71JQ C 242
BS 1 636 RR2FO71TF
BS 637 637 RR2FO71JQ
BS 638 661 RR2FO71TF
BS 662 662 RR2FO71JQ
BS 663 687 RR2FO71TF
BS 688 688 RR2FO71JQ
BS 689 697 RR2FO71TF
BS 698 996 RR2FO71JQ

RD RR2FO71TF 697 0 0
GCTCCTCCTCTGGAAATCCCTAAACTTCGTCTTCTTCTTCTCCGATCGTCGATCGATTTT
CTCAGTCTCCAAAGATTCTACTCTCTTCCGCCACCGCCGCATTCGCAATCCTGTGTAGAA
AATGATGGGACTGCCGAGGACGCCCGCAAGCAAGATAAACAGGGCGAATCCGTCGACACC
TGGCGGATCCAGAGTCACAGAGGAGAATATACTCGTCACTGTGCGGATGAGACCGTTGAA
CTCGAGGGAGCATGCCAAATATGACCTCATTGCTTGGGATTGCCCAGATGATCACACCAT
TGTTTTTAAAAACCCCAATCCTGAGAGAGGTTCAGCGAAATATTCATATGACAAAGTATA
TGAGCCCACGTGTGCAACTCAGGAGGTTTACGAAGGTGGTTCAAGGGATGTCGCACTTTC
TGCTTTAGCAGGAACCAACGCAACCATTTTTGCTTATGGTCAGACCAGCAGTGGAGAGAC
CTTTACAATGAGAGGGGTCACCGACAGTGTAGTTAAGGATATATACGAGCATATAAGTAA
AACTCAAGAAAGGGGCTTTGTCTTGAAAGTTTCAGCTTTGGAGATCTATAATGAGACTGT
GGTTGACCTTTTAAATCGTGATACTGGGCCCCTTAG*CTGTTAGATGATCCTGAGAAAGG
A*CCATTGTAGAAAATCTGGTTGAGGA*GTGGTTGAA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2FO71JQ 755 0 0
TCGAGGGAGCATGCCAAATATGACCTCATTGCTTGGGATTGCCCAGATGATCACACCATT
GTTTTTAAAAACCCCAATCCTGAGAGAGGTTCAGCGAAATATTCATATGACAAAGTATAT
GAGCCCACGTGTGCAACTCAGGAGGTTTACGAAGGTGGTTCAAGGGATGTCGCACTTTCT
GCTTTAGCAGGAACCAACGCAACCATTTTTGCTTATGGTCAGACCAGCAGTGGAGAGACC
TTTACAATGAGAGGGGTCACCGACAGTGTAGTTAAGGATATATACGAGCATATAAGTAAA
ACTCAAGAAAGGGGCTTTGTCTTGAAAGTTTCAGCTTTGGAGATCTATAATGAGACTGTG
GTTGACCTTTTAAATCGTGATACTGGGCCCCTTAGGCTGTTAGATGATCCTGAGAAAGGA
ACCATTGTAGAAAATTTGGTTGAGGAAGTGGTTGAAAGCAGGCAACATTTACAGCATTTA
ATTAGCATTTGTGAAGGTCAAAGGCAAGTGGGTGAAACTGCTTTGAACGACAAAAGTTCA
AGATCTCATCAGATTATTCGGCTGACCATTCAGAGCAGTTTAAGGGAAATAGCAGGCCGT
GTGCAGTCTTTCATGGCAACTTTGAATCTTGTTGATCTTGCTGGAAGCGAACGTGCTTTT
CAAACACGCGCAGATGGTTTTAGATTTAAGGAAGGGAATCATATTAACCGAAGCTTACTA
ACACTTACGACAGTTATTAGAAAGCTGAGTTTTGG

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL6910Contig1 836 2 2 U
GGATCCGTTAAAGCTCTCTGCTTTAACATCATCTCTTTCTCTTTTCGCTCGCGCTATACG
AGAAGAACTCCGTTCTCGAGAAAGCCAGTAGCTTCAAACGATTTCATCGAAAGATCTTGA
TCAGTCTCTTCCTATTTCTCCCCTGCTTCGCAAACCCTAGGGAAAGACAATGAAGTTTGA
TTTCACTCTTCAATCTTGATCTGTTTTGTCGGAGCTAACCAAAGAGAGAGAAGGAAAAAA
AAAGATGTCGAGGCCGATCATGCTTGTCTTTCTACTGGTTATACTTATAGTCACTTCTCA
GTTTGAGTGGAGGCAACCGCTGCTTGAGCTCGATGCTGCTCCTAGCTTGTCTCAGAAACA
CCAGCAGATTGCAAAGAGGGAAGATGCTGTCAAAGAGAAGATCATCTTGTCACAAGAGAG
ACATATCCAGAGGCTAAATGAGCTTGTACGAACTCTTCAAATGCAGTTGCTGCGTTGCAA
AGGACAAGAGAACCAGACAAGAAACGCCACTGAAACCCCCCGTCTCAGCAAACAGTTCAT
TGAGCTCGAGAGGAAACACATTGTGGAAGACTAGTTTTTCATCCCATTACAACAACTCTT
ATAAATAACGTGAATGGTGCACGTAAACGCTGTAGGAAAAAAAAAACTGAAAATTCCTCT
TTAAAGTTCCAAACTGCAAACTGTTGTATTTTATTTATGTTGTGTTAACATGTTCCTGCA
AATTTGATCACAAGGATTGTCTTAATCTTATGATGAAGGTTGAGATATTCAAATTGTAAT
CAGAGAATTTGGGTACTTGTAGTATCTTTTCATATGGCTTGATGGTATTATTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE04TF U 1
AF RR2CE04JQ C 173
BS 1 645 RR2CE04TF
BS 646 836 RR2CE04JQ

RD RR2CE04TF 645 0 0
GGATCCGTTAAAGCTCTCTGCTTTAACATCATCTCTTTCTCTTTTCGCTCGCGCTATACG
AGAAGAACTCCGTTCTCGAGAAAGCCAGTAGCTTCAAACGATTTCATCGAAAGATCTTGA
TCAGTCTCTTCCTATTTCTCCCCTGCTTCGCAAACCCTAGGGAAAGACAATGAAGTTTGA
TTTCACTCTTCAATCTTGATCTGTTTTGTCGGAGCTAACCAAAGAGAGAGAAGGAAAAAA
AAAGATGTCGAGGCCGATCATGCTTGTCTTTCTACTGGTTATACTTATAGTCACTTCTCA
GTTTGAGTGGAGGCAACCGCTGCTTGAGCTCGATGCTGCTCCTAGCTTGTCTCAGAAACA
CCAGCAGATTGCAAAGAGGGAAGATGCTGTCAAAGAGAAGATCATCTTGTCACAAGAGAG
ACATATCCAGAGGCTAAATGAGCTTGTACGAACTCTTCAAATGCAGTTGCTGCGTTGCAA
AGGACAAGAGAACCAGACAAGAAACGCCACTGAAACCCCCCGTCTCAGCAAACAGTTCAT
TGAGCTCGAGAGGAAACACATTGTGGAAGACTAGTTTTTCATCCCATTACAACAACTCTT
ATAAATAACGTGAATGGTGCACGTAAACGCTGTAGGAAAAAAAAA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2CE04JQ 664 0 0
AAGTTTGATTTCACTCTTCAATCTTGATCTGTTTTGTCGGAGCTAACCAAAGAGAGAGAA
GGAAAAAAAAAGATGTCGAGGCCGATCATGCTTGTCTTTCTACTGGTTATACTTATAGTC
ACTTCTCAGTTTGAGTGGAGGCAACCGCTGCTTGAGCTCGATGCTGCTCCTAGCTTGTTT
CAGAAACACCAGCAGATTGCAAAGAGGGAAGATGCTGTCAAAGAGAAGATCATCTTGTCA
CAAGAGAGACATATCCAGAGGCTAAATGAGCTTGTACGAACTCTTCAAATGCAGTTGCTG
CGTTGCAAAGGACAAGAGAACCAGACAAGAAACGCCACTGAAACCCCCCGTTTCAGCAAA
CAGTTCATTGAGCTCGAGAGGAAACACATTGTGGAAGACTAGTTTTTCATCCCATTACAA
CAACTCTTATAAATAACGTGAATGGTGCACGTAAACGCTGTAGGAAAAAAAAAACTGAAA
ATTCCTCTTTAAAGTTCCAAACTGCAAACTGTTGTATTTTATTTATGTTGTGTTAACATG
TTCCTGCAAATTTGATCACAAGGATTGTCTTAATCTTATGATGAAGGTTGAGATATTCAA
ATTGTAATCAGAGAATTTGGGTACTTGTAGTATCTTTTCATATGGCTTGATGGTATTATT
AGCT

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL6911Contig1 813 2 2 U
AGTGAGGATTATCGGTTGATTGAGAAGTATCTTAACACAACCCATGCCCCAACACATACG
GAGTGGAGCCTTGAACTGGAGGAAGTTTTTGCCCTCGAAAGAGAAGGAGAGTTTGATAAA
TATGCTCCTCACAGGGAAAAACTTGGCAATAAGATGCTCCTATGGCATGGTTCTCGGTTA
ACGAATTTTGTTGGAATTCTGAACCAAGGACTGAGAATTGCGCCTCCGAAGCTCCTGCTA
CTGGATACATGTTTGGCAAGGGGATCTACTTTGCTGACCTTGTAAGTAAAAGTGCCCAGT
ACTGCTACACATCTAAGGAAAACCCGGTGGGTCTAATGCTTCTGAGTGAAGTTGCATTGG
GAGAAATACATGAGCTAACAAAAGCCAAGTACATGGATAAACCTCCGAGGGGGAAACACT
CGACCAAGGGGCTTGGCAAGAAAGTGCCTCAGGATTCAGAGTTTGCCAAGTGGAGAGATG
ATGTGACAGTTCCCTGTGGAAAACCTGTTCCATCGAAGGCCAAGGCTTCTGAGCTTATGT
ACAACGAGTATATCGTCTACAATACAGCCCAGGTGAAGTTGCAGTTCTTGTTGAAAGTAC
GGTTCAAGCACAAGAGATGAGCTCGAAACAAACAGGAAGACCAACCTTTTGTTAACTACT
GTCTTTTAGGAGATCAAAAACCAACATGAAGACAAAATTTTGTAACTAAATCGGATTGTC
TCTCTGTCTTTGTAGTTGTGTCTGGTTGGAAAACATCCATTACATTTTGTTAAGATCTTT
CTCAGTAAACACTCTTTTCTTTCACTTGTTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX13TF U 1
AF RR2DX13JQ C 183
BS 1 449 RR2DX13TF
BS 450 813 RR2DX13JQ

RD RR2DX13TF 449 0 0
AGTGAGGATTATCGGTTGATTGAGAAGTATCTTAACACAACCCATGCCCCAACACATACG
GAGTGGAGCCTTGAACTGGAGGAAGTTTTTGCCCTCGAAAGAGAAGGAGAGTTTGATAAA
TATGCTCCTCACAGGGAAAAACTTGGCAATAAGATGCTCCTATGGCATGGTTCTCGGTTA
ACGAATTTTGTTGGAATTCTGAACCAAGGACTGAGAATTGCGCCTCCGAAGCTCCTGCTA
CTGGATACATGTTTGGCAAGGGGATCTACTTTGCTGACCTTGTAAGTAAAAGTGCCCAGT
ACTGCTACACATCTAAGGAAAACCCGGTGGGTCTAATGCTTCTGAGTGAAGTTGCATTGG
GAGAAATACATGAGCTAACAAAAGCCAAGTACATGGATAAACCTCCGAGGGGGAAACACT
CGACCAAGGGGCTTGGCAAGAAAGTGCCT

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2DX13JQ 631 0 0
GAATTTTGTTGGAATTCTGAACCAAGGACTGAGAATTGCGCCTCCGAAGCTCCTGCTACT
GGATACATGTTTGGCAAGGGGATCTACTTTGCTGACCTTGTAAGTAAAAGTGCCCAGTAC
TGCTACACATCTAAGGAAAACCCGGTGGGTCTAATGCTTCTGAGTGAAGTTGCATTGGGA
GAAATACATGAGCTAACAAAAGCCAAGTACATGGATAAACCTCCGAGGGGGAAACACTCG
ACCAAGGGGCTTGGCAAGAAAGTGCCTCAGGATTCAGAGTTTGCCAAGTGGAGAGATGAT
GTGACAGTTCCCTGTGGAAAACCTGTTCCATCGAAGGCCAAGGCTTCTGAGCTTATGTAC
AACGAGTATATCGTCTACAATACAGCCCAGGTGAAGTTGCAGTTCTTGTTGAAAGTACGG
TTCAAGCACAAGAGATGAGCTCGAAACAAACAGGAAGACCAACCTTTTGTTAACTACTGT
CTTTTAGGAGATCAAAAACCAACATGAAGACAAAATTTTGTAACTAAATCGGATTGTCTC
TCTGTCTTTGTAGTTGTGTCTGGTTGGAAAACATCCATTACATTTTGTTAAGATCTTTCT
CAGTAAACACTCTTTTCTTTCACTTGTTTAG

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL6912Contig1 1112 2 2 U
GAAACGGCGACCAGTGTTTTCGAAACTGTCTCTCCTTACCTGCGAGACAATGGCATCTTC
CACCGTCGCCGGAGCTCTGCTTACCGGAGGTTCTCGATTACCATGTTCGTCCTCTCAAAT
ACCTAGAAAGCTTTCTTCATCGTCTTCTTCATCACCACTCTTATGCCTCAACAATGGAGA
CCTCACCGCACCGTACAAATCCCCTCTGCGACTATCTAGACGCAGAGTTCAGACAACTCT
CAGTAACTCGAAGAGCTTCGCTGTGGGAAAGGGAGCTGAAGATGGCTTCCTCTCGGATGT
AAGTGAAGATACTGATGAGATGTTCGACGACTTGTTCAACAAATATGGGAAGGTTGTTTA
CAAGAGCGACGATGTAAAGTCTCCATCAGCTGAGGTTGATGATGACGCTGAAAGTTTAGC
ATTTGCTGTTGAAATGGCTAAGGTTGCTAGTGAAGTGAAAGCCGGAGACATTAAGGTTCT
CTTTGTGAAGCCTCTCGTCTACTGGACTCGTTTTTTCATCATCACCACTGCATTTTCCCG
CCCTCAAATCGATGCAATCGGGTCTAGGATGAGAGACCTGGCTGAGAAGAAGTATGGGAG
AGTTGCTAATGGAGATGTAAAGCCAAATGCATGGACATTGTTGGACTATGGGGATGTGGT
GATCCATATTTTCTTACCTCCACAAAGAACCTTCTATAACTTGGAAGATTTCTACGGAAA
TGCCATGTCAGTTCCACTTCCATTCCAAGATGAACCACCACTTCGAAGTTGATGCTATAT
TTGCTCCAGAAACAAAACAAAAGGCAAATAGTTTGTAAGAACTCTGTTGATCAGTGGCAT
TGTTTTCTGATGCTTTTACACAGCTCTCGGCTTAAGGTGTTGATGGGTTTTGCTGCCTAA
GATGGTTCTACAACTCTCAGGGGATCTCGAACATGTTTTGTAGTTTCTATATAGATTAGA
GTGAGACCATCTTTCTTTAAGGCTGGCTTGGCTCTTCATGGTGTTATGTACTCCAGCTGT
GTATTTTAGCCTATTAGATTGAATTTTTTAGTTGAAATATGTTCAAATGAAATGAATTCA
AATCTTATTTAATCACAACATTGGACGCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG21TF U 1
AF RR2BG21JQ C 262
BS 1 799 RR2BG21TF
BS 800 1112 RR2BG21JQ

RD RR2BG21TF 799 0 0
GAAACGGCGACCAGTGTTTTCGAAACTGTCTCTCCTTACCTGCGAGACAATGGCATCTTC
CACCGTCGCCGGAGCTCTGCTTACCGGAGGTTCTCGATTACCATGTTCGTCCTCTCAAAT
ACCTAGAAAGCTTTCTTCATCGTCTTCTTCATCACCACTCTTATGCCTCAACAATGGAGA
CCTCACCGCACCGTACAAATCCCCTCTGCGACTATCTAGACGCAGAGTTCAGACAACTCT
CAGTAACTCGAAGAGCTTCGCTGTGGGAAAGGGAGCTGAAGATGGCTTCCTCTCGGATGT
AAGTGAAGATACTGATGAGATGTTCGACGACTTGTTCAACAAATATGGGAAGGTTGTTTA
CAAGAGCGACGATGTAAAGTCTCCATCAGCTGAGGTTGATGATGACGCTGAAAGTTTAGC
ATTTGCTGTTGAAATGGCTAAGGTTGCTAGTGAAGTGAAAGCCGGAGACATTAAGGTTCT
CTTTGTGAAGCCTCTCGTCTACTGGACTCGTTTTTTCATCATCACCACTGCATTTTCCCG
CCCTCAAATCGATGCAATCGGGTCTAGGATGAGAGACCTGGCTGAGAAGAAGTATGGGAG
AGTTGCTAATGGAGATGTAAAGCCAAATGCATGGACATTGTTGGACTATGGGGATGTGGT
GATCCATATTTTCTTACCTCCACAAAGAACCTTCTATAACTTGGAAGATTTCTACGGAAA
TGCCATGTCAGTTCCACTTCCATTCCAAGATGAACCACCACTTCGAAGTTGATGCTATAT
TTGCTCCAGAAACAAAACA

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2BG21JQ 851 0 0
TGTGGGAAAGGGAGCTGAAGATGGCTTCCTCTCGGATGTAAGTGAAGATACTGATGAGAT
GTTCGACGACTTGTTCAACAAATATGGGAAGGTTGTTTACAAGAGCGACGATGTAAAGTC
TCCATCAGCTGAGGTTGATGATGACGCTGAAAGTTTAGCATTTGCTGTTGAAATGGCTAA
GGTTGCTAGTGAAGTGAAAGCCGGAGACATTAAGGTTCTCTTTGTGAAGCCTCTCGTCTA
CTGGACTCGTTTTTTCATCATCACCACTGCATTTTCCCGCCCTCAAATCGATGCAATCGG
GTCTAGGATGAGAGACCTGGCTGAGAAGAAGTATGGGAGAGTTGCTAATGGAGATGTAAA
GCCAAATGCATGGACATTGTTGGACTATGGGGATGTGGTGATCCATATTTTCTTACCTCC
ACAAAGAACCTTCTATAACTTGGAAGATTTCTACGGAAATGCCATGTCAGTTCCACTTCC
ATTCCAAGATGAACCACCACTTCGAAGTTGATGCTATATTTGCTCCAGAAACAAAACAAA
AGGCAAATAGTTTGTAAGAACTCTGTTGATCAGTGGCATTGTTTTCTGATGCTTTTACAC
AGCTCTCGGCTTAAGGTGTTGATGGGTTTTGCTGCCTAAGATGGTTCTACAACTCTCAGG
GGATCTCGAACATGTTTTGTAGTTTCTATATAGATTAGAGTGAGACCATCTTTCTTTAAG
GCTGGCTTGGCTCTTCATGGTGTTATGTACTCCAGCTGTGTATTTTAGCCTATTAGATTG
AATTTTTTAGTTGAAATATGTTCAAATGAAATGAATTCAAATCTTATTTAATCACAACAT
TGGACGCTACC

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 2

CO CL6913Contig1 844 2 4 U
GGACCACACCACCATATAATATCAAAGATCCAACATGGCAACTCCCCAAGATAAACTTTC
CTCCAAATCTTTTAAGTGGTTTTCCACCAAAGCCCTAAAACTAAACCTAGGTTTCCAAAA
CCGACGAGGTTCATCACCAAAATCCAATTCTTCTTCAAGCCTAAACTCTCCAAGAAGCAA
CACCGACGACAACAACAGCAACATAAAAAGTCGCCACTCCCATGACGAGCTCCGTCGAGT
CTTCAGCCACTTCGACGTTAACAGCGACGGTAAGATCTCAGCCTTTGAGCTCAGAGACTA
CTTCGGATCCGTAGGTGAGTATATAACTCACGAGGCAGCTCAAGAGGCGATAAACGAAGT
CGATACTGACGCTGATGGATCTTTAGGGTTTGAGGATTTTGTTGGATTGATGACAAGAAG
AGATCTTGACGCTAACGGTGATGGCGGCGGAGAATTGAAGACGGCGTTTGAGATGTTTGA
GGTGGAGAAAGGGTCGGGATGCATAACACCAAAGGGTTTGCAAAATATGCTTACGAAGTT
AGGGGAATCAAGAACGTATGGAGAGTGTGAAGCAATGATAAATTATTACGATATTGATGG
TAATGGGGTTCTTGATTATCATGAGTTTCGGCAAATGATGACCGTTTAATTTAATTAATT
TATGTTTGTTTCATATTATCATGTTATTTTGATCGAAATGTTTATGAAGTGTTTTCTTTT
AAAAATATTAATGTTTATGAACTATGAAGTGTGTGTGTGTGTAGGTTGAAGGTTCTATAT
TACGAAGTGAGCTTAATTACTTGTGTGGACGACTACTAATAAATTATATGAATGATAGAT
TTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2E613TF U 1
AF RR2E613JQ C 165
BS 1 697 RR2E613TF
BS 698 698 RR2E613JQ
BS 699 707 RR2E613TF
BS 708 844 RR2E613JQ

RD RR2E613TF 707 0 0
GGACCACACCACCATATAATATCAAAGATCCAACATGGCAACTCCCCAAGATAAACTTTC
CTCCAAATCTTTTAAGTGGTTTTCCACCAAAGCCCTAAAACTAAACCTAGGTTTCCAAAA
CCGACGAGGTTCATCACCAAAATCCAATTCTTCTTCAAGCCTAAACTCTCCAAGAAGCAA
CACCGACGACAACAACAGCAACATAAAAAGTCGCCACTCCCATGACGAGCTCCGTCGAGT
CTTCAGCCACTTCGACGTTAACAGCGACGGTAAGATCTCAGCCTTTGAGCTCAGAGACTA
CTTCGGATCCGTAGGTGAGTATATAACTCACGAGGCAGCTCAAGAGGCGATAAACGAAGT
CGATACTGACGCTGATGGATCTTTAGGGTTTGAGGATTTTGTTGGATTGATGACAAGAAG
AGATCTTGACGCTAACGGTGATGGCGGCGGAGAATTGAAGACGGCGTTTGAGATGTTTGA
GGTGGAGAAAGGGTCGGGATGCATAACACCAAAGGGTTTGCAAAATATGCTTACGAAGTT
AGGGGAATCAAGAACGTATGGAGAGTGTGAAGCAATGATAAATTATTACGATATTGATGG
TAATGGGGTTCTTGATTATCATGAGTTTCGGCAAATGATGACCGTTTAATTTAATTAATT
TATGTTTGTTTCATATTATCATGTTATTTTGATCGAA*TGTTTATGA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2E613JQ 680 0 0
ACTCTCCAAGAAGCAACACCGACGACAACAACAGCAACATAAAAAGTCGCCACTCCCATG
ACGAGCTCCGTCGAGTCTTCAGCCACTTCGACGTTAACAGCGACGGTAAGATCTCAGCCT
TTGAGCTCAGAGACTACTTCGGATCCGTAGGTGAGTATATAACTCACGAGGCAGCTCAAG
AGGCGATAAACGAAGTCGATACTGACGCTGATGGATCTTTAGGGTTTGAGGATTTTGTTG
GATTGATGACAAGAAGAGATCTTGACGCTAACGGTGATGGCGGCGGAGAATTGAAGACGG
CGTTTGAGATGTTTGAGGTGGAGAAAGGGTCGGGATGCATAACACCAAAGGGTTTGCAAA
ATATGCTTACGAAGTTAGGGGAATCAAGAACGTATGGAGAGTGTGAAGCAATGATAAATT
ATTACGATATTGATGGTAATGGGGTTCTTGATTATCATGAGTTTCGGCAAATGATGACCG
TTTAATTTAATTAATTTATGTTTGTTTCATATTATCATGTTATTTTGATCGAAATGTTTA
TGAAGTGTTTTCTTTTAAAAATATTAATGTTTATGAACTATGAAGTGTGTGTGTGTGTAG
GTTGAAGGTTCTATATTACGAAGTGAGCTTAATTACTTGTGTGGACGACTACTAATAAAT
TATATGAATGATAGATTTGT

QA 1 680 1 680
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6915Contig1 863 2 4 U
GGATTTAATGCCATAAGTCTTATTTGTATTTTACTTTTTATTGGTGCTGTTGGGAAATCT
GCACAGATAGGATTGCATACTTGGTTACCCGATGCTATGGAGGGTCCCACTCCAGTATCC
GCTTTGATTCATGCAGCTACTATGGTAACAGCTGGCGTTTTCATGATAGCAAGGTGCTCC
CCTTTATTTGAATACTCACCTACGGCTTTGATTGTTATTACTTTTGCAGGAGCTATGACG
TCATTCCTTGCGGCAACCACTGGAATATTACAGAACGATCTAAAGAGGGTCATCGCTTAT
TCAACTTGTAGTCAATTAGGCTATATGATCTTTGCTTGCGGCATCTCTAACTATTCGGTT
AGCGTCTTTCACTTAATGAATCACGCCTTTTTCAAAGCATTACCATTCCTGAGTGCTGGT
TCGGTGATTCATGCCATGTCGGATGAGCAAGATATGCGGAAGATGGGGGGGCTTGCCTCC
TCCTTCCCTTTGACCTATGCCATGATGCTCATAGGCAGCTTATCTCTAATTGGATTTCCT
TTTCTAACTGGATTTTATTCCAAAGATGTGATCTTAGAGCTCGCTTACACTAAGTATACC
ATCAGTGGGAACTTTGCTTTCTGGTTGGGAAGTATTTCTGTCCTTTTCACTTCTTATTAC
TCTTTTCGTTTACTTTTTCTCACATTTCTAGTACCAACTAATTCGTTCGGGCGAGACATC
TCACGATGTCATGATGCGCCCATTCCTATGGCCATTCCTTTAATACTTCTGGCTCTCGGG
AGTCTCTTTGTAGGATACTTGGCCAAAGATATGATGATTGGTTTAGGTACCAATTTTTGG
GCCAATTCCCTCCTCGTACTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG73TF U 1
AF RR2CG73JQ C 191
BS 1 677 RR2CG73TF
BS 678 678 RR2CG73JQ
BS 679 734 RR2CG73TF
BS 735 863 RR2CG73JQ

RD RR2CG73TF 734 0 0
GGATTTAATGCCATAAGTCTTATTTGTATTTTACTTTTTATTGGTGCTGTTGGGAAATCT
GCACAGATAGGATTGCATACTTGGTTACCCGATGCTATGGAGGGTCCCACTCCAGTATCC
GCTTTGATTCATGCAGCTACTATGGTAACAGCTGGCGTTTTCATGATAGCAAGGTGCTCC
CCTTTATTTGAATACTCACCTACGGCTTTGATTGTTATTACTTTTGCAGGAGCTATGACG
TCATTCCTTGCGGCAACCACTGGAATATTACAGAACGATCTAAAGAGGGTCATCGCTTAT
TCAACTTGTAGTCAATTAGGCTATATGATCTTTGCTTGCGGCATCTCTAACTATTCGGTT
AGCGTCTTTCACTTAATGAATCACGCCTTTTTCAAAGCATTACCATTCCTGAGTGCTGGT
TCGGTGATTCATGCCATGTCGGATGAGCAAGATATGCGGAAGATGGGGGGGCTTGCCTCC
TCCTTCCCTTTGACCTATGCCATGATGCTCATAGGCAGCTTATCTCTAATTGGATTTCCT
TTTCTAACTGGATTTTATTCCAAAGATGTGATCTTAGAGCTCGCTTACACTAAGTATACC
ATCAGTGGGAACTTTGCTTTCTGGTTGGGAAGTATTTCTGTCCTTTTCACTTCTTATTAC
TCTTTTCGTTTACTTTT*CTCACATTTCTAGTACCAACTAATTCGTTCGGGCGAGACATC
TCACGATGTCATGA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2CG73JQ 673 0 0
AATACTCACCTACGGCTTTGATTGTTATTACTTTTGCAGGAGCTATGACGTCATTCCTTG
CGGCAACCACTGGAATATTACAGAACGATCTAAAGAGGGTCATCGCTTATTCAACTTGTA
GTCAATTAGGCTATATGATCTTTGCTTGCGGCATCTCTAACTATTCGGTTAGCGTCTTTC
ACTTAATGAATCACGCCTTTTTCAAAGCATTACCATTCCTGAGTGCTGGTTCGGTGATTC
ATGCCATGTCGGATGAGCAAGATATGCGGAAGATGGGGGGGCTTGCCTCCTCCTTCCCTT
TGACCTATGCCATGATGCTCATAGGCAGCTTATCTCTAATTGGATTTCCTTTTCTAACTG
GATTTTATTCCAAAGATGTGATCTTAGAGCTCGCTTACACTAAGTATACCATCAGTGGGA
ACTTTGCTTTCTGGTTGGGAAGTATTTCTGTCCTTTTCACTTCTTATTACTCTTTTCGTT
TACTTTTTCTCACATTTCTAGTACCAACTAATTCGTTCGGGCGAGACATCTCACGATGTC
ATGATGCGCCCATTCCTATGGCCATTCCTTTAATACTTCTGGCTCTCGGGAGTCTCTTTG
TAGGATACTTGGCCAAAGATATGATGATTGGTTTAGGTACCAATTTTTGGGCCAATTCCC
TCCTCGTACTACC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6917Contig1 720 2 1 U
GGAGTCTACACCATTGATTCTGTCCATCATCATAGTGGTGGAACCGAGCAGAAGAAGCTT
GAGGCGGAGACTTCAGATGGCAATGTGGTTTTCCCGAGAGAAGAAGAGATGGAGGATCTT
GGTGGTGATCCTGATATAACGAAACTCTACATGAGGCTTCAAGCGCTGGAAGCTGACAGG
GAATCGATGAAGCAGGCGCTTGTTTCTATGAGGACCGAGAAGGCTCAGATGGTGCTGTTG
AAAGAGATTGCTCAGCATTTGTCAAAGGAAGTTGTCCCTCAACGGAGGTTGCCTCTACGG
AAAGCATCAGCTGATGGGACATTGCCTTTCACGCCAGTCTTTAAGTGGATCACATCTTTT
GTTTCCTGGAGAAGAAAGGCTCGTCGAAGCAAGTACATGTATGGGATGTCAGCAAACAAC
ATGGGACTGCAAATGCTACTAGAGAAGGTCCCTAGATCAAGGAAATGGCGATGTCTCAGG
AGCAGCAAGTATGAAAACAGATCCAGTCCTCTACAAAGCCAAAATCATTAATCTCCTGAC
ACTCTAGATTTCCAAAACCACATAAGTATCAGTTACTGATGAATTACATTTCGTGAAGTG
TGTTGTGTTTTTCTCCAACTCGAATATGGGTTCCTGTTCTTGGGTTGCTGAGAAAAATGT
TTGTCCTATGCGGTTTTTTTATTCATTCTGTTTTCCCTCCAATGTTTTAATTGTTTGTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BA06JQ C 1
AF RR2BA06TF U 1
BS 1 720 RR2BA06TF

RD RR2BA06JQ 720 0 0
GGAGTCTACACCATTGATTCTGTCCATCATCATAGTGGTGGAACCGAGCAGAAGAAGCTT
GAGGCGGAGACTTCAGATGGCAATGTGGTTTTCCCGAGAGAAGAAGAGATGGAGGATCTT
GGTGGTGATCCTGATATAACGAAACTCTACATGAGGCTTCAAGCGCTGGAAGCTGACAGG
GAATCGATGAAGCAGGCGCTTGTTTCTATGAGGACCGAGAAGGCTCAGATGGTGCTGTTG
AAAGAGATTGCTCAGCATTTGTCAAAGGAAGTTGTCCCTCAACGGAGGTTGCCTCTACGG
AAAGCATCAGCTGATGGGACATTGCCTTTCACGCCAGTCTTTAAGTGGATCACATCTTTT
GTTTCCTGGAGAAGAAAGGCTCGTCGAAGCAAGTACATGTATGGGATGTCAGCAAACAAC
ATGGGACTGCAAATGCTACTAGAGAAGGTCCCTAGATCAAGGAAATGGCGATGTCTCAGG
AGCAGCAAGTATGAAAACAGATCCAGTCCTCTACAAAGCCAAAATCATTAATCTCCTGAC
ACTCTAGATTTCCAAAACCACATAAGTATCAGTTACTGATGAATTACATTTCGTGAAGTG
TGTTGTGTTTTTCTCCAACTCGAATATGGGTTCCTGTTCTTGGGTTGCTGAGAAAAATGT
TTGTCCTATGCGGTTTTTTTATTCATTCTGTTTTCCCTCCAATGTTTTAATTGTTTGTAT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2BA06TF 720 0 0
GGAGTCTACACCATTGATTCTGTCCATCATCATAGTGGTGGAACCGAGCAGAAGAAGCTT
GAGGCGGAGACTTCAGATGGCAATGTGGTTTTCCCGAGAGAAGAAGAGATGGAGGATCTT
GGTGGTGATCCTGATATAACGAAACTCTACATGAGGCTTCAAGCGCTGGAAGCTGACAGG
GAATCGATGAAGCAGGCGCTTGTTTCTATGAGGACCGAGAAGGCTCAGATGGTGCTGTTG
AAAGAGATTGCTCAGCATTTGTCAAAGGAAGTTGTCCCTCAACGGAGGTTGCCTCTACGG
AAAGCATCAGCTGATGGGACATTGCCTTTCACGCCAGTCTTTAAGTGGATCACATCTTTT
GTTTCCTGGAGAAGAAAGGCTCGTCGAAGCAAGTACATGTATGGGATGTCAGCAAACAAC
ATGGGACTGCAAATGCTACTAGAGAAGGTCCCTAGATCAAGGAAATGGCGATGTCTCAGG
AGCAGCAAGTATGAAAACAGATCCAGTCCTCTACAAAGCCAAAATCATTAATCTCCTGAC
ACTCTAGATTTCCAAAACCACATAAGTATCAGTTACTGATGAATTACATTTCGTGAAGTG
TGTTGTGTTTTTCTCCAACTCGAATATGGGTTCCTGTTCTTGGGTTGCTGAGAAAAATGT
TTGTCCTATGCGGTTTTTTTATTCATTCTGTTTTCCCTCCAATGTTTTAATTGTTTGTAT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL6918Contig1 705 2 1 U
GGATTTTGAAAAACCTAATTCATAGGCGCCCGTCTCAGAGAGCTTCTTTGTCCTCTTCTT
CGTCTGTACGTAAATTAATCAGCTAGATATATTGAAATATGGCGGATGGTGAAGATATTC
AGCCCCTTGTTTGCGACAACGGGACCGGAATGGTCAAGGCCGGTTTTGCAGGTGACGATG
CTCCAAGAGCTGTATTCCCAAGTATCGTTGGCCGTCCACGTCACACGGGAGTGATGGTTG
GAATGGGACAAAAGGACGCTTACGTTGGAGACGAGGCTCAGTCCAAACGTGGTATTTTGA
CTCTCAAATATCCAATCGAGCATGGTATTGTCAACAACTGGGATGACATGGAGAAGATAT
GGCATCACACTTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCTCCGGAAGAACACCCGGTTCTGCTAA
CCGAAGCCCCGCTGAATCCAAAGGCAAATAGGGAGAAGATGACTCAGATCATGTTTGAGA
CGTTCAACGCTCCTGCTATGTATGTTGCCATTCAAGCCGTTCTATCCCTCTATGCCAGTG
GCCGTACTACTGGTATTGTTTTGGACTCTGGAGATGGTGTAAGCCACACGGTTCCAATCT
ACGAGGGTTATGCTCTACCACACGCAATCCTGCGTCTGGACCTTGCAGGTCGTGATCTGA
CTGACTACCTCATGAAAATCCTAACAGAGCGTGGTTACTCTTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU73TF U 48
AF RR2B324TF U 1
BS 1 705 RR2B324TF

RD RR2CU73TF 539 0 0
TTGTCCTCTTCTTCGTCTGTACGTAAATTAATCAGCTAGATATATTGAAATATGGCGGAT
GGTGAAGATATTCAGCCCCTTGTTTGCGACAACGGGACCGGAATGGTCAAGGCCGGTTTT
GCAGGTGACGATGCTCCAAGAGCTGTATTCCCAAGTATCGTTGGCCGTCCACGTCACACG
GGAGTGATGGTTGGAATGGGACAAAAGGACGCTTACGTTGGAGACGAGGCTCAGTCCAAA
CGTGGTATTTTGACTCTCAAATATCCAATCGAGCATGGTATTGTCAACAACTGGGATGAC
ATGGAGAAGATATGGCATCACACTTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCTCCGGAAGAACAC
CCGGTTCTGCTAACCGAAGCCCCGCTGAATCCAAAGGCAAATAGGGAGAAGATGACTCAG
ATCATGTTTGAGACGTTCAACGCTCCTGCTATGTATGTTGCCATTCAAGCCGTTCTATCC
CTCTATGCCAGTGGCCGTACTACTGGTATTGTTTTGGACTCTGGAGATGGTGTAAGCCA

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2B324TF 705 0 0
GGATTTTGAAAAACCTAATTCATAGGCGCCCGTCTCAGAGAGCTTCTTTGTCCTCTTCTT
CGTCTGTACGTAAATTAATCAGCTAGATATATTGAAATATGGCGGATGGTGAAGATATTC
AGCCCCTTGTTTGCGACAACGGGACCGGAATGGTCAAGGCCGGTTTTGCAGGTGACGATG
CTCCAAGAGCTGTATTCCCAAGTATCGTTGGCCGTCCACGTCACACGGGAGTGATGGTTG
GAATGGGACAAAAGGACGCTTACGTTGGAGACGAGGCTCAGTCCAAACGTGGTATTTTGA
CTCTCAAATATCCAATCGAGCATGGTATTGTCAACAACTGGGATGACATGGAGAAGATAT
GGCATCACACTTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCTCCGGAAGAACACCCGGTTCTGCTAA
CCGAAGCCCCGCTGAATCCAAAGGCAAATAGGGAGAAGATGACTCAGATCATGTTTGAGA
CGTTCAACGCTCCTGCTATGTATGTTGCCATTCAAGCCGTTCTATCCCTCTATGCCAGTG
GCCGTACTACTGGTATTGTTTTGGACTCTGGAGATGGTGTAAGCCACACGGTTCCAATCT
ACGAGGGTTATGCTCTACCACACGCAATCCTGCGTCTGGACCTTGCAGGTCGTGATCTGA
CTGACTACCTCATGAAAATCCTAACAGAGCGTGGTTACTCTTTCA

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL6919Contig1 886 2 1 U
AATTATTAACTCTCTTCTTTCTTTCTTTTTTTGACAACAGGAGTACTAACTCAAATGTTA
ACAAACGAACAATATATAACAATTAATCGAATAGAATAAATACCCCAAAAGTGCAAAAAC
AAACAAAAAAACAAATTATATAGCCGTGACTAATCCAAGAAGAATAAGTCCAGCGACAAT
GAATCTTCCGAACACAAAGCTGATCCTGAAATCGTCACTTCCACTAACGATCTGAATAGG
GAACAAGCAACTTCCGACGGATGCATTGTTCTTAGTAATCATAGCAGATCCTCTGAAATC
ACAAGCCCTAACGTCTTGGCCCGGAATCTGGAAAAACATGTTAAATGCGTACGATATGTT
TTGGATTTTGTCGAGGTTACTACATGTGGACCCGTAAAGCATCGAGGTGCAGTCGCCATG
GTAACACGCATAATCTAGGTCCGGACCAACTTCATCTAGATTGATCGTGTCTTTGTTCAC
AACGCACCATTGCTTATCTAAGTATTGCACACCTTTGGCTGCCACGGGTACGATCTTGCG
TTCTTGTCCCGTGAAATCTAGCATAAACTTCGGTGTTCCATCGTATCTGAAGATTCCCCA
ATGTCTTTCGAATGGTCCAGGAAGAATACTCTTCATGTCTTCGTCGAGTAAACCAAAGAG
ATAAACTTCTAATTTCTCAGGTCTCAATGGAGTCCCAACATCCTTAGCAAGTCTTTTCAT
AAGTCCTGCATAGAACTTCTCTGCTAGTTTCGGCGTCGCATATTTATGACCATCCGTTGG
CCACCCAACCTCTCCAACGATAATCTTCATATCTTTAATCCCAGCTTTATTCAACGCGTA
AACCAGCGTGTCGTAATTCGCATCAAACACGTTATCGTAATTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO30JQ U 74
AF RR2AO01JQ U 1
BS 1 886 RR2AO01JQ

RD RR2BO30JQ 210 0 0
ATATAACAATTAATCGAATAGAATAAATACCCCAAAAGTGCAAAAACAAACAAACAAACA
AATTATATAGCCGTGACTAATCCAAGAAGAATAATTCCAGCGACAATGAATCTTCCGAAC
ACAAAGCTGATCCTGAAATCGTCACTTCCACTAACGATCTGAATAGGGAACAAGCAACTT
CCGACGGATGCATTGTTCTTAGTAATCATA

QA 1 210 1 210
DS 

RD RR2AO01JQ 886 0 0
AATTATTAACTCTCTTCTTTCTTTCTTTTTTTGACAACAGGAGTACTAACTCAAATGTTA
ACAAACGAACAATATATAACAATTAATCGAATAGAATAAATACCCCAAAAGTGCAAAAAC
AAACAAAAAAACAAATTATATAGCCGTGACTAATCCAAGAAGAATAAGTCCAGCGACAAT
GAATCTTCCGAACACAAAGCTGATCCTGAAATCGTCACTTCCACTAACGATCTGAATAGG
GAACAAGCAACTTCCGACGGATGCATTGTTCTTAGTAATCATAGCAGATCCTCTGAAATC
ACAAGCCCTAACGTCTTGGCCCGGAATCTGGAAAAACATGTTAAATGCGTACGATATGTT
TTGGATTTTGTCGAGGTTACTACATGTGGACCCGTAAAGCATCGAGGTGCAGTCGCCATG
GTAACACGCATAATCTAGGTCCGGACCAACTTCATCTAGATTGATCGTGTCTTTGTTCAC
AACGCACCATTGCTTATCTAAGTATTGCACACCTTTGGCTGCCACGGGTACGATCTTGCG
TTCTTGTCCCGTGAAATCTAGCATAAACTTCGGTGTTCCATCGTATCTGAAGATTCCCCA
ATGTCTTTCGAATGGTCCAGGAAGAATACTCTTCATGTCTTCGTCGAGTAAACCAAAGAG
ATAAACTTCTAATTTCTCAGGTCTCAATGGAGTCCCAACATCCTTAGCAAGTCTTTTCAT
AAGTCCTGCATAGAACTTCTCTGCTAGTTTCGGCGTCGCATATTTATGACCATCCGTTGG
CCACCCAACCTCTCCAACGATAATCTTCATATCTTTAATCCCAGCTTTATTCAACGCGTA
AACCAGCGTGTCGTAATTCGCATCAAACACGTTATCGTAATTCTTT

QA 1 886 1 886
DS 



AS 1 2

CO CL6920Contig1 540 2 3 U
TAGCGAATTATTATCACTCGAGCCGCTCTGCGAAAGCATTTTCGATCCTAGTCTAAGAAA
GAAAAAAAGAATGTCGACGGTCGGAGAGCTTGCTTGCAGCTACGCTGTTATGATCCTCGA
GGACGAGGGTATTGCTATCACGGCCGACAAGATCGCTACTTTGGTCAAATCTGCTGGTGT
GGAGATTGAGTCATACTGGCCAATGCTATTCGCCAAGATGGCCGAGAAGCGTAACGTTAC
TGACCTCATCATGAACGTTGGTGCTGGTGGCGGAGGTGGTGCTCCAGTTTCAGCTGCTGC
CCCAGCTGCCGGTGGTGGTGCTGCCGCGGCTGCACCTGCCGCTGAGGAGAAGAAGAAGGA
AGAAGTAGCAGAAGAGAGTGATGGTGATTTGGGTTTCGGCTTGTTCGACTAAGCTTGAGC
GATTTGCCTTTGTTATTTCTTGTTCGTAGTTGTTGGTTGATTAATCGTTCTGAGTTGAGA
CCATCTTTTGTTTAGTTACTTCTTCGTTTCGTCTTGGCTTAAAAAAGTCTTCGTTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BM41TF U 1
AF RR2BM41JQ C 31
BS 1 67 RR2BM41TF
BS 68 68 RR2BM41JQ
BS 69 540 RR2BM41TF

RD RR2BM41TF 540 0 0
TAGCGAATTATTATCACTCGAGCCGCTCTGCGAAAGCATTTTCGATCCTAGTCTAAGAAA
GAAAAAA*GAATGTCGACGGTCGGAGAGCTTGCTTGCAGCTACGCTGTTATGATCCTCGA
GGACGAGGGTATTGCTATCACGGCCGACAAGATCGCTACTTTGGTCAAATCTGCTGGTGT
GGAGATTGAGTCATACTGGCCAATGCTATTCGCCAAGATGGCCGAGAAGCGTAACGTTAC
TGACCTCATCATGAACGTTGGTGCTGGTGGCGGAGGTGGTGCTCCAGTTTCAGCTGCTGC
CCCAGCTGCCGGTGGTGGTGCTGCCGCGGCTGCACCTGCCGCTGAGGAGAAGAAGAAGGA
AGAAGTAGCAGAAGAGAGTGATGGTGATTTGGGTTTCGGCTTGTTCGACTAAGCTTGAGC
GATTTGCCTTTGTTATTTCTTGTTCGTAGTTGTTGGTTGATTAATCGTTCTGAGTTGAGA
CCATCTTTTGTTTAGTTACTTCTTCGTTTCGTCTTGGCTTAAAAAAGTCTTCGTTGTTTT

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2BM41JQ 510 0 0
CGAAAGCATTTTCGATCCTAGTCTAAGAAAGAAAAAAAGAATGTCGACGGTCGGAGAGCT
TGCTTGCAGCTACGCTGTTATGATCCTCGAGGACGAGGGTATTGCTATCACGGCCGACAA
GATCGCTACTTTGGTCAAATCTGCTGGTGTGGAGATTGAGTCATACTGGCCAATGCTATT
CGCCAAGATGGCCGAGAAGCGTAACGTTACTGACCTCATCATGAACGTTGGTGCTGGTGG
CGGAGGTGGTGCTCCAGTTTCAGCTGCTGCCCCAGCTGCCGGTGGTGGTGCTGCCGCGGC
TGCACCTGCCGCTGAGGAGAAGAAGAAGGAAGAAGTAGCAGAAGAGAGTGATGGTGATTT
GGGTTTCGGCTTGTTCGACTAAGCTTGAGCGATTTGCCTTTGTTATTTCTTGTTCGTAGT
TGTTGGTTGATTAATCGTTCTGAGTTGAGACCATCTTTTGTTTAGTTACTTCTTCGTTTC
GTCTTGGCTTAAAAAAGTCTTCGTTGTTTT

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL6921Contig1 837 2 2 U
GGATAATTAATAGTATCATTAGATGCCCTTAATAGGGACTTATTATTTACATGGCACCAC
CACCACCGGTTTCTTTAAGGGTAGTAATACTTTTCCTTCGGGTTTTAACGGCGGTTTTTC
TAGTTATAACGGTGATCATCCTCAGCACCAACAGCGTCACTATTGAATCTCAAGGAACCG
CTTTGAAATTTCATTTCAAAGATGTTTATGCCTATAGATACATGTTCTCAGCCGCCATCG
TCGGACTAGTTTACGCTGTCATACAACTGTTCTTCACAATCTCTGAACTGGCCACCAGAA
TCAAGAACCCTATTAATTATCAACTCGATTTTTATGGTGACAAGATAATATCATATTTAT
TGGCAACTGGTTCGGCGGCTGGATTTGGAGTGAGCAAAGACTTGAAAGACGCACTTCTAG
TATTAGTTGCATTAGATTCAACTGATCCTGTGGACAAGTTCTTCAGCCGAGGATACGCAT
CAGCTAGTATGCTTCTCTTTGCTTTCGTCTGTCTAGCCGTTTTATCCGTTTTATCATCCT
ACGCCATTTCCAAACACTAGTTTAGTTTAAGTCTCTTTTCCACTGTTGAACTTATACTCT
TTCCAATGCGATTTGATCATATAGCTTTGTCGCTATGTTATGTGTTGGTGCAATTCTGTA
AATATTTCTAGATTGTATTTGTTATGAAACACATGTCTTAATGTTGGATAAAGAGAAAAG
ATAGTTTAGTTTGTTTATACTCAATGGAAGTTTGGATTTGTGATTATATCTATACGTTCG
AGTTCAAGTGTGAAGATTTTCGTCTGTAATGTTGCTAATGTATTTATTACGGAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ08TF U 1
AF RR2GZ08JQ C 115
BS 1 723 RR2GZ08TF
BS 724 837 RR2GZ08JQ

RD RR2GZ08TF 723 0 0
GGATAATTAATAGTATCATTAGATGCCCTTAATAGGGACTTATTATTTACATGGCACCAC
CACCACCGGTTTCTTTAAGGGTAGTAATACTTTTCCTTCGGGTTTTAACGGCGGTTTTTC
TAGTTATAACGGTGATCATCCTCAGCACCAACAGCGTCACTATTGAATCTCAAGGAACCG
CTTTGAAATTTCATTTCAAAGATGTTTATGCCTATAGATACATGTTCTCAGCCGCCATCG
TCGGACTAGTTTACGCTGTCATACAACTGTTCTTCACAATCTCTGAACTGGCCACCAGAA
TCAAGAACCCTATTAATTATCAACTCGATTTTTATGGTGACAAGATAATATCATATTTAT
TGGCAACTGGTTCGGCGGCTGGATTTGGAGTGAGCAAAGACTTGAAAGACGCACTTCTAG
TATTAGTTGCATTAGATTCAACTGATCCTGTGGACAAGTTCTTCAGCCGAGGATACGCAT
CAGCTAGTATGCTTCTCTTTGCTTTCGTCTGTCTAGCCGTTTTATCCGTTTTATCATCCT
ACGCCATTTCCAAACACTAGTTTAGTTTAAGTCTCTTTTCCACTGTTGAACTTATACTCT
TTCCAATGCGATTTGATCATATAGCTTTGTCGCTATGTTATGTGTTGGTGCAATTCTGTA
AATATTTCTAGATTGTATTTGTTATGAAACACATGTCTTAATGTTGGATAAAGAGAAAAG
ATA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2GZ08JQ 723 0 0
TTTTTCTAGTTATAACGGTGATCATCCTCAGCACCAACAGCGTCACTATTGAATCTCAAG
GAACCGCTTTGAAATTTCATTTCAAAGATGTTTATGCCTATAGATACATGTTCTCAGCCG
CCATCGTCGGACTAGTTTACGCTGTCATACAACTGTTCTTCACAATCTCTGAACTGGCCA
CCAGAATCAAGAACCCTATTAATTATCAACTCGATTTTTATGGTGACAAGATAATATCAT
ATTTATTGGCAACTGGTTCGGCGGCTGGATTTGGAGTGAGCAAAGACTTGAAAGACGCAC
TTCTAGTATTAGTTGCATTAGATTCAACTGATCCTGTGGACAAGTTCTTCAGCCGAGGAT
ACGCATCAGCTAGTATGCTTCTCTTTGCTTTCGTCTGTCTAGCCGTTTTATCCGTTTTAT
CATCCTACGCCATTTCCAAACACTAGTTTAGTTTAAGTCTCTTTTCCACTGTTGAACTTA
TACTCTTTCCAATGCGATTTGATCATATAGCTTTGTCGCTATGTTATGTGTTGGTGCAAT
TCTGTAAATATTTCTAGATTGTATTTGTTATGAAACACATGTCTTAATGTTGGATAAAGA
GAAAAGATAGTTTAGTTTGTTTATACTCAATGGAAGTTTGGATTTGTGATTATATCTATA
CGTTCGAGTTCAAGTGTGAAGATTTTCGTCTGTAATGTTGCTAATGTATTTATTACGGAG
CTC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL6922Contig1 1158 2 2 U
GGACCAACTTATCTTTGATCTCTTAACGCACTACTCTCTATATCCTTTTTAGTTTCAGGA
AGAGAGTTTATTACTTTGCAATGGAGCAAACCAAGAAGCTCAAAATTTCTTCTGAGTTGT
CCTTATCTGATGAATCCTCAGCTTCTTCTTCTATCAGGTTTTTAGGCTTTGAAAATGAAT
AGTTTCAAGCTTTTTCGTTGTTTCATTTGCATTTTTTTCTCTCCAGGCCTGAGAAAATGT
TGGAAGTGAAGAAAGAGTCAGTTTCTCGCCGGAATATTCATAAGGCAGACCGAGAGAAGA
TACGTAGAGATAAGCTCAACGAACAGTTTCTTGAGCTCGGAAATGCACTTGATCCTAACA
GGCCTAAGAGTGACAAAGCTTCGATTCTCATTGACACAATACAAACACTGAAAGATTTAA
TGACTCAAGTAGATAGACTAAAGGCTGAGCATGTCACACTTTCTCAAGAGTCTTGTGAGG
TAGTGATGACTGCTTGCTTTAACTTCTCCAATGCTCTTTTTATTATTAGATTCTACTTGT
TTTCATAATCTTCCACTTTGTTTTGAACCATTGCTAAGCAGCTAGTACAAGAGAAGAGTG
AGCCGAGAGAGGAGAAAACATCTCTTAAATCCGACATAGAGATTCTTAATGCTCAATATC
AGCATAGAGTCAGAAGCATGGTCCCATGGATTCCACATTACACTTATCCTGTCCCTTTAG
TTGCCACTCTGCCTTTTCCACTCCATGGAACTCAAAATCCTGCACCGTCATCATGCTCTA
CCTATATGCCCTATTCAGCCTCACTCAGTCCTAAAACCGAACAAAAAGATAATGTTGGTT
TAGAGCTTGAGCTTAACATCCATGCCTCCTCTTCAGCTCAACAGGTGAGTGATTTCTTCA
ATAGTGTTACCATTGACCAACAAGCTCTTTCTGTGGCATGACCAAAGTTGCTTCCATTCA
GGATGTTTCTGGAAAAGTAAAAAAAGGAAACTTGACAATCACGGCAAGCCCATCTAATAG
TTACTACTCATCATCTCAAGCTGTTCAAGATAGTTCCCTTGGTAATGTAAATAACATCTT
CAAGTCATAAACTCTGTAATTCTCAGTCAAGTAAAACTCTGTGAACTATCTGTATGTATT
TTATCATCACAAGCAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE64TF U 1
AF RR2AE64JQ C 277
BS 1 815 RR2AE64TF
BS 816 1158 RR2AE64JQ

RD RR2AE64TF 818 0 0
GGACCAACTTATCTTTGATCTCTTAACGCACTACTCTCTATATCCTTTTTAGTTTCAGGA
AGAGAGTTTATTACTTTGCAATGGAGCAAACCAAGAAGCTCAAAATTTCTTCTGAGTTGT
CCTTATCTGATGAATCCTCAGCTTCTTCTTCTATCAGGTTTTTAGGCTTTGAAAATGAAT
AGTTTCAAGCTTTTTCGTTGTTTCATTTGCATTTTTTTCTCTCCAGGCCTGAGAAAATGT
TGGAAGTGAAGAAAGAGTCAGTTTCTCGCCGGAATATTCATAAGGCAGACCGAGAGAAGA
TACGTAGAGATAAGCTCAACGAACAGTTTCTTGAGCTCGGAAATGCACTTGATCCTAACA
GGCCTAAGAGTGACAAAGCTTCGATTCTCATTGACACAATACAAACACTGAAAGATTTAA
TGACTCAAGTAGATAGACTAAAGGCTGAGCATGTCACACTTTCTCAAGAGTCTTGTGAGG
TAGTGATGACTGCTTGCTTTAACTTCTCCAATGCTCTTTTTATTATTAGATTCTACTTGT
TTTCATAATCTTCCACTTTGTTTTGAACCATTGCTAAGCAGCTAGTACAAGAGAAGAGTG
AGCCGAGAGAGGAGAAAACATCTCTTAAATCCGACATAGAGATTCTTAATGCTCAATATC
AGCATAGAGTCAGAAGCATGGTCCCATGGATTCCACATTACACTTATCCTGTCCCTTTAG
TTGCCACTCTGCCTTTTCCACTCCATGGAACTCAAAATCCTGCACCGTCATCATGCTCTA
CCTATATGCCCTATTCAGCCTCACTCAGTCCTAAA
CCG

QA 1 815 1 815
DS 

RD RR2AE64JQ 882 0 0
TTCATAAGGCAGACCGAGAGAAGATACGTAGAGATAAGCTCAACGAACAGTTTCTTGAGC
TCGGAAATGCACTTGATCCTAACAGGCCTAAGAGTGACAAAGCTTCGATTCTCATTGACA
CAATACAAACACTGAAAGATTTAATGACTCAAGTAGATAGACTAAAGGCTGAGCATGTCA
CACTTTCTCAAGAGTCTTGTGAGGTAGTGATGACTGCTTGCTTTAACTTCTCCAATGCTC
TTTTTATTATTAGATTCTACTTGTTTTCATAATCTTCCACTTTGTTTTGAACCATTGCTA
AGCAGCTAGTACAAGAGAAGAGTGAGCCGAGAGAGGAGAAAACATCTCTTAAATCCGACA
TAGAGATTCTTAATGCTCAATATCAGCATAGAGTCAGAAGCATGGTCCCATGGATTCCAC
ATTACACTTATCCTGTCCCTTTAGTTGCCACTCTGCCTTTTCCACTCCATGGAACTCAAA
ATCCTGCACCGTCATCATGCTCTACCTATATGCCCTATTCAGCCTCACTCAGTCCTAAAA
CCGAACAAAAAGATAATGTTGGTTTAGAGCTTGAGCTTAACATCCATGCCTCCTCTTCAG
CTCAACAGGTGAGTGATTTCTTCAATAGTGTTACCATTGACCAACAAGCTCTTTCTGTGG
CATGACCAAAGTTGCTTCCATTCAGGATGTTTCTGGAAAAGTAAAAAAAGGAAACTTGAC
AATCACGGCAAGCCCATCTAATAGTTACTACTCATCATCTCAAGCTGTTCAAGATAGTTC
CCTTGGTAATGTAAATAACATCTTCAAGTCATAAACTCTGTAATTCTCAGTCAAGTAAAA
CTCTGTGAACTATCTGTATGTATTTTATCATCACAAGCAAAT

QA 1 882 1 882
DS 



AS 1 2

CO CL6923Contig1 604 2 2 U
GGGAGTAGCAGCAGCGGTGGTGGGATCAGAATTCGGATACCGACGGGAGTGAGTATAGCG
CAGCCGGGTCCGAGGTTTCCCGGTAAGATCGATCCGAAATACACGGCGAGTGGAAGTTCG
AGACTTGGTCGTGTCGGAGCAGGATCCAGTTATGGAGGTAGGGGTGTGAGAATTGAAGGG
GGAACAGGAAAACGTGGGAGGGAGATGATGATGATGACTACAGAGGAGGAGGAGGGGGAG
AGGGAGGAGACTGATGATCCAATGGTGGAGATAGCGAGTGCGATCAAGCAACTTGGAGAT
ACGTTGTTGAGAACAGAGGAGAGGAAAATGGAGATGACGAGAGAGATCGAAGCGATGAGG
ATGGATATGGAGATGAAGAGGACGAAGATGATATTGGAATCTCAACAACGAATCGTTGAG
GCTTTTGCTAAGAGCATGTCTGAAAATTTGGAGGAGAAGAAGAAATCAAGAAGACTATCT
TCCTTACCCAACGACTCTTGAACATCATCAACGAATAGTTGAGGCTTTATGTACTCATGT
TTTTTTTTAAACATCATTAATGTATGTTGAACTTATGTTATAAAGTAGGGAGTTTTTAAA
GCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2AW39JQ C 1
AF RR2AW39TFB U 67
BS 1 66 RR2AW39JQ
BS 67 604 RR2AW39TFB

RD RR2AW39JQ 604 0 0
GGGAGTAGCAGCAGCGGTGGTGGGATCAGAATTCGGATACCGACGGGAGTGAGTATAGCG
CAGCCGGGTCCGAGGTTTCCCGGTAAGATCGATCCGAAATACACGGCGAGTGGAAGTTCG
AGACTTGGTCGTGTCGGAGCAGGATCCAGTTATGGAGGTAGGGGTGTGAGAATTGAAGGG
GGAACAGGAAAACGTGGGAGGGAGATGATGATGATGACTACAGAGGAGGAGGAGGGGGAG
AGGGAGGAGACTGATGATCCAATGGTGGAGATAGCGAGTGCGATCAAGCAACTTGGAGAT
ACGTTGTTGAGAACAGAGGAGAGGAAAATGGAGATGACGAGAGAGATCGAAGCGATGAGG
ATGGATATGGAGATGAAGAGGACGAAGATGATATTGGAATCTCAACAACGAATCGTTGAG
GCTTTTGCTAAGAGCATGTCTGAAAATTTGGAGGAGAAGAAGAAATCAAGAAGACTATCT
TCCTTACCCAACGACTCTTGAACATCATCAACGAATAGTTGAGGCTTTATGTACTCATGT
TTTTTTTTAAACATCATTAATGTATGTTGAACTTATGTTATAAAGTAGGGAGTTTTTAAA
GCTC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2AW39TFB 538 0 0
GGTCCGAGGTTTCCCGGTAAGATCGATCCGAAATACACGGCGAGTGGAAGTTCGAGACTT
GGTCGTGTCGGAGCAGGATCCAGTTATGGAGGTAGGGGTGTGAGAATTGAAGGGGGAACA
GGAAAACGTGGGAGGGAGATGATGATGATGACTACAGAGGAGGAGGAGGGGGAGAGGGAG
GAGACTGATGATCCAATGGTGGAGATAGCGAGTGCGATCAAGCAACTTGGAGATACGTTG
TTGAGAACAGAGGAGAGGAAAATGGAGATGACGAGAGAGATCGAAGCGATGAGGATGGAT
ATGGAGATGAAGAGGACGAAGATGATATTGGAATCTCAACAACGAATCGTTGAGGCTTTT
GCTAAGAGCATGTCTGAAAATTTGGAGGAGAAGAAGAAATCAAGAAGACTATCTTCCTTA
CCCAACGACTCTTGAACATCATCAACGAATAGTTGAGGCTTTATGTACTCATGTTTTTTT
TTAAACATCATTAATGTATGTTGAACTTATGTTATAAAGTAGGGAGTTTTTAAAGCTC

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

CO CL6924Contig1 938 2 2 U
GGAATAGCATTTGTTTGTGTAAGATTGTGAAATTAATCTCTCTGATCGGGGAAGATGTGG
AACCAGAAGTATGATTTGGAGTCGGCACAGACGCCTCTGTATCCGATGATGATGGAGAGC
CCCGAGCTCCGATGGTCTTTCATCCGTAAGGTGTATTCCATCATCTCCATCCAGCTCCTC
GCCACTATCGCCGTGGCCGCCACCGTCGTTAAAGTTGAACCGATATCGGTCTTCTTCACA
ACCACCAACGCAGGCCTCGCCCTCTACATCCTTCTTATCATCACTCCTTTGATTGTGATG
TGTCCCTTGTATTACTACCACCAGAAGCATCCTGTCAACTATCTGTTACTCGCCATTTTT
ACCGTCTCTATTGCCTTTGCTGTTGGCTTGACCTGCGCCTTTACCAGCGGAAAAGTGATC
CTGGAGGCTGTGATTTTGACGGCTGTTGTGGTGGTTTCCCTCACTCTCTATACTTTCTGG
GCTGTCAAGAGAGGCCATGACTTCAACTTCCTCGGTCCCTTCTTGTTCGGTGCTCTCATT
GTCCTTGTCGTCTTTTCCTTCATCCAGATTTTCTTCCCTCTAGGAAAGATCTCGGTGATG
ATCTATGGTTGTGTAGCATCCATCATCTTTTGTGGCTACATTGTATATGATACCGACAAC
TTGATCAAGAGGCACTCCTATGACGAGTACATCTGGGCTGCTGTTTCGCTTTACCTTGAC
GTCATTAACCTCTTCCTATCTTTGCTCTCTCTCTTGAGGGCTGCTGATAGTTAAAATATA
CCTCTTCTCAAGACTACTTATGTAATTGCTATCTTACTTATTCCTCTTTTATATTGAAAT
CTGTGTTTGTTTGATATGCTGTAACATATTCTAGTGTGAAAAAAATTTGTTAGCTTTAGA
AGTCATCTCTTCAATTAATGGAATAAAAAGCATATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL68TF U 1
AF RR2GL68JQ C 398
BS 1 666 RR2GL68TF
BS 667 938 RR2GL68JQ

RD RR2GL68TF 666 0 0
GGAATAGCATTTGTTTGTGTAAGATTGTGAAATTAATCTCTCTGATCGGGGAAGATGTGG
AACCAGAAGTATGATTTGGAGTCGGCACAGACGCCTCTGTATCCGATGATGATGGAGAGC
CCCGAGCTCCGATGGTCTTTCATCCGTAAGGTGTATTCCATCATCTCCATCCAGCTCCTC
GCCACTATCGCCGTGGCCGCCACCGTCGTTAAAGTTGAACCGATATCGGTCTTCTTCACA
ACCACCAACGCAGGCCTCGCCCTCTACATCCTTCTTATCATCACTCCTTTGATTGTGATG
TGTCCCTTGTATTACTACCACCAGAAGCATCCTGTCAACTATCTGTTACTCGCCATTTTT
ACCGTCTCTATTGCCTTTGCTGTTGGCTTGACCTGCGCCTTTACCAGCGGAAAAGTGATC
CTGGAGGCTGTGATTTTGACGGCTGTTGTGGTGGTTTCCCTCACTCTCTATACTTTCTGG
GCTGTCAAGAGAGGCCATGACTTCAACTTCCTCGGTCCCTTCTTGTTCGGTGCTCTCATT
GTCCTTGTCGTCTTTTCCTTCATCCAGATTTTCTTCCCTCTAGGAAAGATCTCGGTGATG
ATCTATGGTTGTGTAGCATCCATCATCTTTTGTGGCTACATTGTATATGATACCGACAAC
TTGATC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2GL68JQ 541 0 0
CCTTTACCAGCGGAAAAGTGATCCTGGAGGCTGTGATTTTGACGGCTGTTGTGGTGGTTT
CCCTCACTCTCTATACTTTCTGGGCTGTCAAGAGAGGCCATGACTTCAACTTCCTCGGTC
CCTTCTTGTTCGGTGCTCTCATTGTCCTTGTCGTCTTTTCCTTCATCCAGATTTTCTTCC
CTCTAGGAAAGATCTCGGTGATGATCTATGGTTGTGTAGCATCCATCATCTTTTGTGGCT
ACATTGTATATGATACCGACAACTTGATCAAGAGGCACTCCTATGACGAGTACATCTGGG
CTGCTGTTTCGCTTTACCTTGACGTCATTAACCTCTTCCTATCTTTGCTCTCTCTCTTGA
GGGCTGCTGATAGTTAAAATATACCTCTTCTCAAGACTACTTATGTAATTGCTATCTTAC
TTATTCCTCTTTTATATTGAAATCTGTGTTTGTTTGATATGCTGTAACATATTCTAGTGT
GAAAAAAATTTGTTAGCTTTAGAAGTCATCTCTTCAATTAATGGAATAAAAAGCATATTA
C

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 2

CO CL6925Contig1 880 2 2 U
GGACACACAGCTGTTTCTCATCTCTTAGGGTTTTGTTCTTTACTTAACCTCAATCTCTAC
AATCGACTCTGTATCTCTTAGATTGTAACCTTCTGGGTCCCTTTCTTGTTCCGTTAATGG
TGTGAAAGCTCAAGCTTTCCTCCTCTCTCTCTCAACAATGGCTGAGATCAAGATCACAAA
AGCAGAGCAAGGACAAACCAAGATCAGGACTGTCCTAGTAGCTGTAACTCCTGAAGGCTT
CTGGTGTTGCCCTTCCCCTGTTGCTTTCCAGAAGACCCTCAAATCTCACAACTTCCTCCA
CAAACCCAAACACTCTCCTCCAACAGCGGATAAGAAGCCTGCCGAGAAGGAGAAGAGACA
ACCCTCCTCCACCACTATAACTGGCTGCAGCACGGTTGCAGATCGTTTGATGGGAAGCTT
GTGGAGGAAGGGATAGGGAGGACGATACTGACGTTGCCGCTGGAAGATCAGCAGAGGATA
TTGATGTCTTGGCTTGGGAGTTTCTTGAACGGAGGAGATGGGTGTCCGAATCTACAGAGA
GCTTTTGAGGTTTGGTGGAGGAGATCGTTTGTTAGACCTTACTCGGATCGTCAGGGTAGT
AGTAGTGGGGTGTCTCAGACAGATTCGACTTCAAAAGAGTGATCTTATAAAAACATGATG
AGTAAGCTTTGTTAGATTTGTACAGTGAATAACGTTAGCTTTTGGAAACTGGAAAGTGTT
TGGTTTTGCTTATCTTTGATTTTCGGCTTTGGTTGCTTTGTGGTTTTGGTTTGGTTTATA
TCATACCATGGAGAGGCTAGGCTTTAGTGGTCTTGTTTTTTTTTTCTTGATGTTTTTGTA
TCTTTCCATTTTTCATAAAAGTATTGATGTTACTGGATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX02TF U 1
AF RR2DX02JQ C 234
BS 1 590 RR2DX02TF
BS 591 880 RR2DX02JQ

RD RR2DX02TF 590 0 0
GGACACACAGCTGTTTCTCATCTCTTAGGGTTTTGTTCTTTACTTAACCTCAATCTCTAC
AATCGACTCTGTATCTCTTAGATTGTAACCTTCTGGGTCCCTTTCTTGTTCCGTTAATGG
TGTGAAAGCTCAAGCTTTCCTCCTCTCTCTCTCAACAATGGCTGAGATCAAGATCACAAA
AGCAGAGCAAGGACAAACCAAGATCAGGACTGTCCTAGTAGCTGTAACTCCTGAAGGCTT
CTGGTGTTGCCCTTCCCCTGTTGCTTTCCAGAAGACCCTCAAATCTCACAACTTCCTCCA
CAAACCCAAACACTCTCCTCCAACAGCGGATAAGAAGCCTGCCGAGAAGGAGAAGAGACA
ACCCTCCTCCACCACTATAACTGGCTGCAGCACGGTTGCAGATCGTTTGATGGGAAGCTT
GTGGAGGAAGGGATAGGGAGGACGATACTGACGTTGCCGCTGGAAGATCAGCAGAGGATA
TTGATGTCTTGGCTTGGGAGTTTCTTGAACGGAGGAGATGGGTGTCCGAATCTACAGAGA
GCTTTTGAGGTTTGGTGGAGGAGATCGTTTGTTAGACCTTACTCGGATCG

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2DX02JQ 647 0 0
AAGGCTTCTGGTGTTGCCCTTCCCCTGTTGCTTTCCAGAAGACCCTCAAATCTCACAACT
TCCTCCACAAACCCAAACACTCTCCTCCAACAGCGGATAAGAAGCCTGCCGAGAAGGAGA
AGAGACAACCCTCCTCCACCACTATAACTGGCTGCAGCACGGTTGCAGATCGTTTGATGG
GAAGCTTGTGGAGGAAGGGATAGGGAGGACGATACTGACGTTGCCGCTGGAAGATCAGCA
GAGGATATTGATGTCTTGGCTTGGGAGTTTCTTGAACGGAGGAGATGGGTGTCCGAATCT
ACAGAGAGCTTTTGAGGTTTGGTGGAGGAGATCGTTTGTTAGACCTTACTCGGATCGTCA
GGGTAGTAGTAGTGGGGTGTCTCAGACAGATTCGACTTCAAAAGAGTGATCTTATAAAAA
CATGATGAGTAAGCTTTGTTAGATTTGTACAGTGAATAACGTTAGCTTTTGGAAACTGGA
AAGTGTTTGGTTTTGCTTATCTTTGATTTTCGGCTTTGGTTGCTTTGTGGTTTTGGTTTG
GTTTATATCATACCATGGAGAGGCTAGGCTTTAGTGGTCTTGTTTTTTTTTTCTTGATGT
TTTTGTATCTTTCCATTTTTCATAAAAGTATTGATGTTACTGGATGT

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL6926Contig1 995 2 4 U
GGGTTAGTAAATGGAGAAACAGCTCTCCAATGCTCTCTCTCCTTGCTTTAGCCGACGACG
AAGATGGTCTCCCCTCGTCTTCTTCTTCCTCCTCCGCTGGGAAACAAGGAGAAAGAGTAG
TAGAGGATGTCGGAAACTATAAGCAACCACTTGTCTGGATTGACTTGGAGATGACTGGTC
TTAATGTTGAAGTTGACAGGATATTGGAGATTGCTTGTATAATTACTGATGGACAATTAA
CCAAATCAGTGGAGGGTCCAGATTTAGTTGTACTTCAAACGAAAGACTGCATGGATAAAA
TGGGTGATTGGTGTCAAACTCATCATGGAGACAGTGGTTTGACAAAGAAAGTGCTCTCTA
GTACTATAAGTGAAAGGCAAGCTGAACAAGAGGTCATCAAATTTGTAAAAAAGCATGTTG
GTAATGAAAATCCACAATTAGCTGGAAACTCTATCTACGTGGATTTCCTTTTCCTAAAGA
AGTACATGCCAGATTTGGCTGCCCTTTTCCCTCATGTACTTGTCGATGTCAGTAGTGTCA
AGTCTCTATGCAACCGATGGTTTCCAAGAGGTAAATAATTATATTTAAAAGAAATATCTT
TGTAAGTGTATGTCTGTTATGAAAACATAAAAGTTGCATTGTGTATAACAATGATACTTG
TTTTGTTTGTTGAGCATTAGACAGAAACAGAGCTCCTGCAAAGAAAAACAATCACAGAGC
CATGGATGATATAAGAGAAAGCATCGAAGAGCTTAAGTACTACAAAGAAACCATATTTAA
AGCAAACAAAGGCAGGAGGTGAGGTGAGGTTGGAGCGAAATCTCCTCTGATTAACCTTCT
TGATTAGAAGATATCATTGTATTTTTTGTTTAGGGAAAGGGGATATCGACATTGTCGTTT
AGGAGTCATTCTCTTGAATGTTTTTGTATTATGATACCTAGTTACATGATGATCTTTAGT
TATTCAGACTGGTACTAAATCTATTATCTTAATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F612TF U 1
AF RR2F612JQ C 216
BS 1 707 RR2F612TF
BS 708 708 RR2F612JQ
BS 709 731 RR2F612TF
BS 732 995 RR2F612JQ

RD RR2F612TF 731 0 0
GGGTTAGTAAATGGAGAAACAGCTCTCCAATGCTCTCTCTCCTTGCTTTAGCCGACGACG
AAGATGGTCTCCCCTCGTCTTCTTCTTCCTCCTCCGCTGGGAAACAAGGAGAAAGAGTAG
TAGAGGATGTCGGAAACTATAAGCAACCACTTGTCTGGATTGACTTGGAGATGACTGGTC
TTAATGTTGAAGTTGACAGGATATTGGAGATTGCTTGTATAATTACTGATGGACAATTAA
CCAAATCAGTGGAGGGTCCAGATTTAGTTGTACTTCAAACGAAAGACTGCATGGATAAAA
TGGGTGATTGGTGTCAAACTCATCATGGAGACAGTGGTTTGACAAAGAAAGTGCTCTCTA
GTACTATAAGTGAAAGGCAAGCTGAACAAGAGGTCATCAAATTTGTAAAAAAGCATGTTG
GTAATGAAAATCCACAATTAGCTGGAAACTCTATCTACGTGGATTTCCTTTTCCTAAAGA
AGTACATGCCAGATTTGGCTGCCCTTTTCCCTCATGTACTTGTCGATGTCAGTAGTGTCA
AGTCTCTATGCAACCGATGGTTTCCAAGAGGTAAATAATTATATTTAAAAGAAATATCTT
TGTAAGTGTATGTCTGTTATGAAAACATAAAAGTTGCATTGTGTATAACAATGATACTTG
TTTTGTTTGTTGAGCATTAGACAGAAACAGAGCTCCTGCAAAGAAAA*CAATCACAGAGC
CATGGATGATA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2F612JQ 780 0 0
TGTATAATTACTGATGGACAATTAACCAAATCAGTGGAGGGTCCAGATTTAGTTGTACTT
CAAACGAAAGACTGCATGGATAAAATGGGTGATTGGTGTCAAACTCATCATGGAGACAGT
GGTTTGACAAAGAAAGTGCTCTCTAGTACTATAAGTGAAAGGCAAGCTGAACAAGAGGTC
ATCAAATTTGTAAAAAAGCATGTTGGTAATGAAAATCCACAATTAGCTGGAAACTCTATC
TACGTGGATTTCCTTTTCCTAAAGAAGTACATGCCAGATTTGGCTGCCCTTTTCCCTCAT
GTACTTGTCGATGTCAGTAGTGTCAAGTCTCTATGCAACCGATGGTTTCCAAGAGGTAAA
TAATTATATTTAAAAGAAATATCTTTGTAAGTGTATGTCTGTTATGAAAACATAAAAGTT
GCATTGTGTATAACAATGATACTTGTTTTGTTTGTTGAGCATTAGACAGAAACAGAGCTC
CTGCAAAGAAAAACAATCACAGAGCCATGGATGATATAAGAGAAAGCATCGAAGAGCTTA
AGTACTACAAAGAAACCATATTTAAAGCAAACAAAGGCAGGAGGTGAGGTGAGGTTGGAG
CGAAATCTCCTCTGATTAACCTTCTTGATTAGAAGATATCATTGTATTTTTTGTTTAGGG
AAAGGGGATATCGACATTGTCGTTTAGGAGTCATTCTCTTGAATGTTTTTGTATTATGAT
ACCTAGTTACATGATGATCTTTAGTTATTCAGACTGGTACTAAATCTATTATCTTAATCT

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL6927Contig1 629 2 4 U
CGATAAATGATCCTTAACAACAGAAATCTCAATAACAACATTCCACCTGGTAAAAGATAT
TAACATTCAATAGCCAAAGACTTGTCTAAAAAGATCATCACAGTTCCATTTTCTATAAAA
AAAATATAAAACTAGCCTCAGCAAAATAAAAAGACCAAACTCAAACCAGGCTCAAATCTC
ATAATCTATATCCGTTGCATTCTGTGAATCAAAATGCTTCACCAACTGTTCCTGTTCATC
ATACCGATCAAGATTCTCACAAGGAGCCGGGAAGATGGTGCCCATCACACGCCCCTGCAC
ATACGCACACTGGAATATATGCTTCTTCTTGTACGTTATCCCCACCGACATGTCCCTGAA
CGTTACGTTTTTAACCGGAATCTCTTTGCTCCCCTGCATACGCACCGGTACACGCACTCC
CTGACCGTATATCCCCGTGTAGTTGATGTTCTCGAGCACCGGGAAGGCTTGCGGGTTGAA
TCCACCGTCCGGATGCTCGTTGTAGTCGGTTTTGACCACGATGCCAACTCTCAGCTCATC
CAGCGTGACGTTCCTGAACGTTATGTCACGGACGTAGCCGCCTCTTCCCGGTGCGGTTTT
GATCCTGACTCCACGCCGTGAGCTCCATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ14TF C 1
AF RR2ED93JQ U 49
BS 1 48 RR2FQ14TF
BS 49 282 RR2ED93JQ
BS 283 283 RR2FQ14TF
BS 284 629 RR2ED93JQ

RD RR2FQ14TF 608 0 0
CGATAAATGATCCTTAACAACAGAAATCTCAATAACAACATTCCACCTGGTAAAAGATAT
TAACATTCAATAGCCAAAGACTTGTCTAAAAAGATCATCACAGTTCCATTTTCTATAAAA
AAA*TATAAAACTAGCCTCAGCAAAATAAAAAGACCAAACTCAAACCAGGCTCAGATCTC
ATAATCTATATCCGTTGCATTCTGTGAATCAGAATGCTTCACCAACTGTTCCTGTTCATC
ATACCGATCAAGATTCTCACAAGGAGCCGGGAAGATGGTGCCCATCGCACGCCCCTGCAC
ATACGCACACTGGAATATATGCTTCTTCTTGTACGTTATCCCCACCGACATGTCCCTGAA
CGTTACGTTTTTAACCGGAATCTCTTTGCTCCCCTGCATACGCACCGGTACACGCACTCC
CTGACCGTATATCCCCGTGTAGTTGATGTTCTCGAGCACCGGGAAGGCTTGCGGGTTGAA
TCCACCGTCCGGATGCTCGTTGTAGTCGGTTTTGACCACGATGCCAACTCTCAGCTCATC
CAGCGTGACGTTCCTGAACGTTATGTCACGGACGTAGCCGCCTCTTCCCGGTGCGGTTTT
GATCCT
CC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2ED93JQ 581 0 0
GGTAAAAGATATTAACATTCAATAGCCAAAGACTTGTCTAAAAAGATCATCACAGTTCCA
TTTTCTATAAAAAAAATATAAAACTAGCCTCAGCAAAATAAAAAGACCAAACTCAAACCA
GGCTCAAATCTCATAATCTATATCCGTTGCATTCTGTGAATCAAAATGCTTCACCAACTG
TTCCTGTTCATCATACCGATCAAGATTCTCACAAGGAGCCGGGAAGATGGTGCCTATCAC
ACGCCCCTGCACATACGCACACTGGAATATATGCTTCTTCTTGTACGTTATCCCCACCGA
CATGTCCCTGAACGTTACGTTTTTAACCGGAATCTCTTTGCTCCCCTGCATACGCACCGG
TACACGCACTCCCTGACCGTATATCCCCGTGTAGTTGATGTTCTCGAGCACCGGGAAGGC
TTGCGGGTTGAATCCACCGTCCGGATGCTCGTTGTAGTCGGTTTTGACCACGATGCCAAC
TCTCAGCTCATCCAGCGTGACGTTCCTGAACGTTATGTCACGGACGTAGCCGCCTCTTCC
CGGTGCGGTTTTGATCCTGACTCCACGCCGTGAGCTCCATA

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL6928Contig1 537 2 1 U
GGGCAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAGAGAGATGAGTGCAGCGAGCATCGCTTCGAGGTCA
ACCTCCATCTTAAGATCCGCTACCAGGAGAAGCCTGATCTCACCACCTAGACCTAGAATC
TCATCCCCAAATCCTAATTCCTCATCTTCGCCTCTTCGCCAGACTCGAATCGAACCTTCT
TCCCCTCCCAGGTTTATGCTACGGAGAGAACTAAGCACGCATCAGCCATTTCACAGCGTC
GTTGCGGCAGCTTGCCTCGTTTCCAAGCTCCCTTCTGATCTCACCTCTTATGAAGGTAGG
TTTGCTAACTATGTCAGTCCCATCTAAGAGGCAGCACCACCTCAGGTAGTTGGATGGATG
GCTTTTTGCTATGATTGTTTTTTTTTTACTCAAGAAATTCCAGGTTCTTTAAGTTAAAAT
TTTCCAACCGCTTTTGCAATCTTTCAGTTTAGATGGAACCCTGATACATGTTTTGGTAGA
CGTTATCAACTTACTTTTCTTTGGGTTCTTATCTTTATTAGTCAAATGGTTATTGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B690JQ C 1
AF RR2B690TF U 1
BS 1 537 RR2B690TF

RD RR2B690JQ 537 0 0
GGGCAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAGAGAGATGAGTGCAGCGAGCATCGCTTCGAGGTCA
ACCTCCATCTTAAGATCCGCTACCAGGAGAAGCCTGATCTCACCACCTAGACCTAGAATC
TCATCCCCAAATCCTAATTCCTCATCTTCGCCTCTTCGCCAGACTCGAATCGAACCTTCT
TCCCCTCCCAGGTTTATGCTACGGAGAGAACTAAGCACGCATCAGCCATTTCACAGCGTC
GTTGCGGCAGCTTGCCTCGTTTCCAAGCTCCCTTCTGATCTCACCTCTTATGAAGGTAGG
TTTGCTAACTATGTCAGTCCCATCTAAGAGGCAGCACCACCTCAGGTAGTTGGATGGATG
GCTTTTTGCTATGATTGTTTTTTTTTTACTCAAGAAATTCCAGGTTCTTTAAGTTAAAAT
TTTCCAACCGCTTTTGCAATCTTTCAGTTTAGATGGAACCCTGATACATGTTTTGGTAGA
CGTTATCAACTTACTTTTCTTTGGGTTCTTATCTTTATTAGTCAAATGGTTATTGTC

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2B690TF 537 0 0
GGGCAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAGAGAGATGAGTGCAGCGAGCATCGCTTCGAGGTCA
ACCTCCATCTTAAGATCCGCTACCAGGAGAAGCCTGATCTCACCACCTAGACCTAGAATC
TCATCCCCAAATCCTAATTCCTCATCTTCGCCTCTTCGCCAGACTCGAATCGAACCTTCT
TCCCCTCCCAGGTTTATGCTACGGAGAGAACTAAGCACGCATCAGCCATTTCACAGCGTC
GTTGCGGCAGCTTGCCTCGTTTCCAAGCTCCCTTCTGATCTCACCTCTTATGAAGGTAGG
TTTGCTAACTATGTCAGTCCCATCTAAGAGGCAGCACCACCTCAGGTAGTTGGATGGATG
GCTTTTTGCTATGATTGTTTTTTTTTTACTCAAGAAATTCCAGGTTCTTTAAGTTAAAAT
TTTCCAACCGCTTTTGCAATCTTTCAGTTTAGATGGAACCCTGATACATGTTTTGGTAGA
CGTTATCAACTTACTTTTCTTTGGGTTCTTATCTTTATTAGTCAAATGGTTATTGTC

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

CO CL6929Contig1 924 2 2 U
GCTAGTAATATGAAATCTGGGACTGTGGATGATGCTAGAGACGGTGGAAAGAAGAGGAGT
AAAGGATGGAGCTCATGGGCATTGGCACTCCACGTTATCGCGATGCACCCAGAGAAACAC
GAGAATGTCGTGCTAGAATCTTCAGACGACATTGTTGTGATAAACGACCAGTACCCAAAG
GCGCGGAAACACGTGCTAGTAGTGGCGAGGCAGGAGAATGTAGATGGGCTTGAAGACGTT
GGCAGAGAAAATATTAAACTTGTTGAGGAAATGCACAACGTTGGTATGAAATGGGTTAAG
AGGTTCCAGGACGAGGATGCATCTCTTATCTTCCGCCTTGGATATCACTCGGTTAGTACT
TATCCTTCTTTTTTCATATCTGCTGCACTTTGATGTTTGTTTTCACACATCACAGGTTCC
TTCAATGCGACAACTACATCTACACGTCATGAGCCAAGACTTTGAATCCGATCACTTGAA
GAACAAGAAACACTGGAACTCTTTCACAACCTCCTTCTTCCGTGACTCGGTGGATGTGCT
TGAAGAGGTCAAGAGCCAAGGCAGGGCCAATGTGGAGAGTGAAGCTGTTTTGAAAGGTGA
GTTGCGTTGCCATCGGTGTAGAAGCGCACACCCGACTATCCCCAAACTCAAATCGCATAT
CAGATCCTGTTCTTCTCACTTCCCTCACCATTTACTCCAAACCAGTCGTCTTTTGGCTCG
ACCAGGGACTTTAAATTAACTGACCGGTTAGATTTCGGTTTTGGATCGTTATTTTTTGTG
GTTTTAAGAATTGGAGAAGCTAGTCATTTTGTCTTGGGAGTTGTTAAACTCGCCGGCTTT
TGTTGTTAATTTCTTGTAACTTCCAGTGAAAAAAAAGGAGGCTAGTCAAGTGTTATTCTA
ATGGAATTGTTATTTTAGTCTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A864TF U 1
AF RR2A864JQ C 122
BS 1 770 RR2A864TF
BS 771 924 RR2A864JQ

RD RR2A864TF 770 0 0
GCTAGTAATATGAAATCTGGGACTGTGGATGATGCTAGAGACGGTGGAAAGAAGAGGAGT
AAAGGATGGAGCTCATGGGCATTGGCACTCCACGTTATCGCGATGCACCCAGAGAAACAC
GAGAATGTCGTGCTAGAATCTTCAGACGACATTGTTGTGATAAACGACCAGTACCCAAAG
GCGCGGAAACACGTGCTAGTAGTGGCGAGGCAGGAGAATGTAGATGGGCTTGAAGACGTT
GGCAGAGAAAATATTAAACTTGTTGAGGAAATGCACAACGTTGGTATGAAATGGGTTAAG
AGGTTCCAGGACGAGGATGCATCTCTTATCTTCCGCCTTGGATATCACTCGGTTAGTACT
TATCCTTCTTTTTTCATATCTGCTGCACTTTGATGTTTGTTTTCACACATCACAGGTTCC
TTCAATGCGACAACTACATCTACACGTCATGAGCCAAGACTTTGAATCCGATCACTTGAA
GAACAAGAAACACTGGAACTCTTTCACAACCTCCTTCTTCCGTGACTCGGTGGATGTGCT
TGAAGAGGTCAAGAGCCAAGGCAGGGCCAATGTGGAGAGTGAAGCTGTTTTGAAAGGTGA
GTTGCGTTGCCATCGGTGTAGAAGCGCACACCCGACTATCCCCAAACTCAAATCGCATAT
CAGATCCTGTTCTTCTCACTTCCCTCACCATTTACTCCAAACCAGTCGTCTTTTGGCTCG
ACCAGGGACTTTAAATTAACTGACCGGTTAGATTTCGGTTTTGGATCGTT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2A864JQ 803 0 0
AGAATGTCGTGCTAGAATCTTCAGACGACATTGTTGTGATAAACGACCAGTACCCAAAGG
CGCGGAAACACGTGCTAGTAGTGGCGAGGCAGGAGAATGTAGATGGGCTTGAAGACGTTG
GCAGAGAAAATATTAAACTTGTTGAGGAAATGCACAACGTTGGTATGAAATGGGTTAAGA
GGTTCCAGGACGAGGATGCATCTCTTATCTTCCGCCTTGGATATCACTCGGTTAGTACTT
ATCCTTCTTTTTTCATATCTGCTGCACTTTGATGTTTGTTTTCACACATCACAGGTTCCT
TCAATGCGACAACTACATCTACACGTCATGAGCCAAGACTTTGAATCCGATCACTTGAAG
AACAAGAAACACTGGAACTCTTTCACAACCTCCTTCTTCCGTGACTCGGTGGATGTGCTT
GAAGAGGTCAAGAGCCAAGGCAGGGCCAATGTGGAGAGTGAAGCTGTTTTGAAAGGTGAG
TTGCGTTGCCATCGGTGTAGAAGCGCACACCCGACTATCCCCAAACTCAAATCGCATATC
AGATCCTGTTCTTCTCACTTCCCTCACCATTTACTCCAAACCAGTCGTCTTTTGGCTCGA
CCAGGGACTTTAAATTAACTGACCGGTTAGATTTCGGTTTTGGATCGTTATTTTTTGTGG
TTTTAAGAATTGGAGAAGCTAGTCATTTTGTCTTGGGAGTTGTTAAACTCGCCGGCTTTT
GTTGTTAATTTCTTGTAACTTCCAGTGAAAAAAAAGGAGGCTAGTCAAGTGTTATTCTAA
TGGAATTGTTATTTTAGTCTCGG

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL6930Contig1 648 2 8 U
GTAAGAAGGGGTTCTTTTATTGAATAAAACCATCCATCGAAACTAATGATGGATGCAACG
TTCCTAGGATTAAATCACCTAAATCCAGCAGAAAACAAAGTCTACATAATTTGAAAATAA
AAATAAGGAAAAACACCGCAAATCTAGAAGAAACCTAGCAAAGAGCTTCCACTGCAAGAC
TTCTAGTAGCACCATCGCATTCAGGTACTCCGAATTTCTCTGGGGAAACATTAACGGAAC
ATTTTTCTTTTCCAACACATTCTACACTGAGAATATTAACAACATCTTTGCTTGCTTCAC
AAGTTCCTTTCTCAAATGATCCACATTTGCCTCGTGGGTTACCGAAAGAGGCGAATTTGA
TAGCAGAAATAGGCCTTCCATTGCAGGAAAGTTCAAGAACATTCTTCTCATAGACATTTG
CACAGACACCTCCCACTCCAACAGTTTGGAAATTGACAAATGATGGGTTTTCCTCCAATC
TCTTCAAACAAAACTAATATGTTATCTCCTTTTTGGATTCAAGAAAGAACGAGGAACATG
GTACCATCGTTGGGTAGGTTCTCCACAATTAGTTTGACACTTTTCCGCATAGTACGCCCC
TCTATAATTACATTCAGTAGAACAACCATCTTCAGTTGAAAGAAACGC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT32JQ U 1
AF RR2DR86JQ U 1
BS 1 183 RR2AT32JQ
BS 184 184 RR2DR86JQ
BS 185 263 RR2AT32JQ
BS 264 264 RR2DR86JQ
BS 265 519 RR2AT32JQ
BS 520 520 RR2DR86JQ
BS 521 580 RR2AT32JQ
BS 581 648 RR2DR86JQ

RD RR2AT32JQ 580 0 0
GTAAGAAGGGGTTCTTTTATTGAATAAAACCATCCATCGAAACTAATGATGGATGCAACG
TTCCTAGGATTAAATCACCTAAATCCAGCAGAAAACAAAGTCTACATAATTTGAAAATAA
AAATAAGGAAAAACACCGCAAATCTAGAAGAAACCTAGCAAAGAGCTTCCACTGCAAGAC
TTC*AGTAGCACCATCGCATTCAGGTACTCCGAATTTCTCTGGGGAAACATTAACGGAAC
ATTTTTCTTTTCCAACACATTCTGCACTGAGAATATTAACAACATCTTTGCTTGCTTCAC
AAGTTCCTTTCTCAAATGATCCACATTTGCCTCGTGGGTTACCGAAAGAGGCGAATTTGA
TAGCAGAAATAGGCCTTCCATTGCAGGAAAGTTCAAGAACATTCTTCTCATAGACATTTG
CACAGACACCTCCCACTCCAACAGTTTGGAAATTGACAAATGATGGGTTTTCCTCCAATC
TCTTCAAACAAAACTAATATGTTATCTCCTTTTTGGATTTAAGAAAGAACGAGGAACATG
GTACCATCGTTGGGTAGGTTCTCCACAATTAGTTTGACAC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2DR86JQ 648 0 0
A
TAAGAAGGTGTTCTTTTATTGAATAAAACCATCCATCGAAACTAATGGTGGATGCAACGT
TCCTAGGATTAAATCACCTAAATCCAGCAGAAAACAAAGTCTACATAATTTGAAAATAAA
AATAAGGAAAAACACCGCAAATCTAGAAGAAACCTAGCAAAGAGCTTCCACTGCAAGACT
TCTAGTAGCACCATCGCATTCAGGTACTCCGAATTTCTCTGTGGAAACATTAACGGAACA
TTTTTCTTTTCCAACACATTCTACACTGAGAATATTAACAACATCTTTGCTTGCTTCACA
AGTTCCTTTCTCAAATGGTCCACATTTGCCTCGTGGGTTACCGAAAGAGGCGAATTTGAT
AGCAGAAATAGGCCTTCCATTGCAGGAAAGTTCAAGAACATTCTTCTCATAGACATTTGC
ACAGACACCTCCCACTCCAACAGTTTGGAAATTGGCAAATGATGGGTTT*CCTCCAATCT
CTTCAAACAAAACTAATATGTTATCTCCTTTT*GGATTCAAGAAAGAACGAGGAACATGG
TACCATCGTTGGGTAGGTTCTCCACAATTAGTTTGACACTTTTCCGCATAGTACGCCCCT
CTATAATTACATTCAGTAGAACAACCATCTTCAGTTGAAAGAAACGC

QA 2 648 2 648
DS 



AS 1 2

CO CL6931Contig1 732 2 4 U
GACAGCTGCAACTACGGATAGAAGCACAAGGGAAGTACTTGAAGAAGATAATTGAAGAGC
AACAGCGACTCAGTGGAGCTCTTGGCGAGCCCTCAGGCCCAGTAACAGGCGAATCAGATC
CTGCCACACCTGCCCCAACATCCGAGTCTCCCTTACAAGATAAATCTGGCAAGGAATGTG
GGCCAGACAAAAGCCTTTCAGTTGACGAGTCGCTTTCATCTTACCGGGAGCCATTGGCAC
CAGACTCTGGGTGTAACGTTGGGTCTCAAGACGAGAGCGCAGGAGAAGAGAGATCATCAA
AGAGGCCTAGATTGGCGAGAGGAGGTGCAGCTGGTTATACACCTGAGATGTTAGTGGCGC
ACCCAATTCTAGAATCAGGCTTGAACGCTTCTTACCATCAGCCAGACCATGCTCTCGGCT
TTGACCGTCCCTCTACATCACTGCTTGGGGCTGAAAATGGATTGGACAAGGTTTCAGGAG
ACGATCTATGAGTTTGTGTGTATCAGGTGGCATCTGTAGTTGAGTGTATCACATGTAGTT
TTATTTGTCTATGCTTATTCCTAATAGTTAGGAGTTTCCTCTTAGTGAGGTGATCACAAC
TCTCTAATTATAGACACTGCCACTAGCATGAACAATGAATATATGTCGTGTTGTGCTGTA
ATTTGGTAAAAATACAAAACAAATGTACTTTCTTATACCCAACCACAGTGAAGATTCTTG
TGAAGCTATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED05TF U 1
AF RR2ED05JQ C 150
BS 1 671 RR2ED05TF
BS 672 672 RR2ED05JQ
BS 673 695 RR2ED05TF
BS 696 732 RR2ED05JQ

RD RR2ED05TF 695 0 0
GACAGCTGCAACTACGGATAGAAGCACAAGGGAAGTACTTGAAGAAGATAATTGAAGAGC
AACAGCGACTCAGTGGAGCTCTTGGCGAGCCCTCAGGCCCAGTAACAGGCGAATCAGATC
CTGCCACACCTGCCCCAACATCCGAGTCTCCCTTACAAGATAAATCTGGCAAGGAATGTG
GGCCAGACAAAAGCCTTTCAGTTGACGAGTCGCTTTCATCTTACCGGGAGCCATTGGCAC
CAGACTCTGGGTGTAACGTTGGGTCTCAAGACGAGAGCGCAGGAGAAGAGAGATCATCAA
AGAGGCCTAGATTGGCGAGAGGAGGTGCAGCTGGTTATACACCTGAGATGTTAGTGGCGC
ACCCAATTCTAGAATCAGGCTTGAACGCTTCTTACCATCAGCCAGACCATGCTCTCGGCT
TTGACCGTCCCTCTACATCACTGCTTGGGGCTGAAAATGGATTGGACAAGGTTTCAGGAG
ACGATCTATGAGTTTGTGTGTATCAGGTGGCATCTGTAGTTGAGTGTATCACATGTAGTT
TTATTTGTCTATGCTTATTCCTAATAGTTAGGAGTTTCCTCTTAGTGAGGTGATCACAAC
TCTCTAATTATAGACACTGCCACTAGCATGAACAATGAATATATGTCGTGTTGTGCTGTA
ATTTGGTAAAA*TACAAAACAAATGTACTTTCTTA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2ED05JQ 583 0 0
CCCTTACAAGATAAATCTGGCAAGGAATGTGGGCCAGACAAAAGCCTTTCAGTTGACGAG
TCGCTTTCATCTTACCGGGAGCCATTGGCACCAGACTCTGGGTGTAACGTTGGGTCTCAA
GACGAGAGCGCAGGAGAAGAGAGATCATCAAAGAGGCCTAGATTGGCGAGAGGAGGTGCA
GCTGGTTATACACCTGAGATGTTAGTGGCGCACCCAATTCTAGAATCAGGCTTGAACGCT
TCTTACCATCAGCCAGACCATGCTTTCGGCTTTGACCGTCCCTCTACATCACTGCTTGGG
GCTGAAAATGGATTGGACAAGGTTTCAGGAGACGATCTATGAGTTTGTGTGTATCAGGTG
GCATCTGTAGTTGAGTGTATCACATGTAGTTTTATTTGTCTATGCTTATTCCTAATAGTT
AGGAGTTTCCTCTTAGTGAGGTGATCACAACTCTCTAATTATAGACACTGCCACTAGCAT
GAACAATGAATATATGTCGTGTTGTGCTGTAATTTGGTAAAAATACAAAACAAATGTACT
TTCTTATACCCAACCACAGTGAAGATTCTTGTGAAGCTATCAC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL6932Contig1 900 2 2 U
GCACCACACCGACCTTCATGCTCCACTTCAAGCCGCGGTTCGGCGACTTCTCGATCAAAA
AGTCCCATTCTTCGTCGTCGGGATTCATCTCCGGTGAGGAGGATTCGTCGATCGAGGTCG
TGGATTCGCCGGGGCTCAGGAAAGTCACCGTCTTGCCGTCGACGTCCGCCGGAGATATCG
CCGGTTTGTTTTCCGGCGTGGAGGTTGCGGCGAGGACGTCGATGCCGGCGAGGGGACGCG
CGGTGGTGAATTTTCGGTGGGGGGTTAGGGTTCCGACGGGGATCAGGGGAGGTTTCGATC
CGACGGCTGAGATTTCGCTGCGGAGGTTTCCGTTTCTGGTGTTGGATAAGGTAGGGATCG
AACACGTGGACGGGTCTGATTGTAAAGAGATAAAGTCAAAGAGCGATCCGGTTAAAGCTT
CGGGTCAGAGGACGAGTGATGACGTGTGTTTGGTGTTGGAGGAGCTTCGGTCGGAGAATT
AGAGTTGAAGAGAGCTGTTGAAGATCTACGTGGAGTGATGATATCGAACGTCAGGCCGTT
CTCGCCGGCGATGATAGATTACGGTTCGCATTCGAAGTACCGTGAAGCCGAGAGGAGCAA
TAACAACAACAACAGCAGCAGCAATGGTAGAGCTAGAGGTGATAGGTGGAGTAGTGAGAG
AACGACGTCGGATTACGGAGGGAAGAAGAGCAAGGAAGAGGGTGACGTGGCGGAGGAGTT
GAAGAAAGCCTTGAAAGGAGCTGCTTGAAATGGTATTTGGTAACTCTGCCTCCCATGAAA
GCTTTATTCGTCTTCTTGATTTAGCTATGGCTTTTGTGTATATATATGCGTTACACTACT
GCTGCGTTGAAAGAACATCTTTATAACATTTCAATGGAATTGCTAGAAGTTTACTTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA57TF U 1
AF RR2AA57JQ C 131
BS 1 668 RR2AA57TF
BS 669 900 RR2AA57JQ

RD RR2AA57TF 668 0 0
GCACCACACCGACCTTCATGCTCCACTTCAAGCCGCGGTTCGGCGACTTCTCGATCAAAA
AGTCCCATTCTTCGTCGTCGGGATTCATCTCCGGTGAGGAGGATTCGTCGATCGAGGTCG
TGGATTCGCCGGGGCTCAGGAAAGTCACCGTCTTGCCGTCGACGTCCGCCGGAGATATCG
CCGGTTTGTTTTCCGGCGTGGAGGTTGCGGCGAGGACGTCGATGCCGGCGAGGGGACGCG
CGGTGGTGAATTTTCGGTGGGGGGTTAGGGTTCCGACGGGGATCAGGGGAGGTTTCGATC
CGACGGCTGAGATTTCGCTGCGGAGGTTTCCGTTTCTGGTGTTGGATAAGGTAGGGATCG
AACACGTGGACGGGTCTGATTGTAAAGAGATAAAGTCAAAGAGCGATCCGGTTAAAGCTT
CGGGTCAGAGGACGAGTGATGACGTGTGTTTGGTGTTGGAGGAGCTTCGGTCGGAGAATT
AGAGTTGAAGAGAGCTGTTGAAGATCTACGTGGAGTGATGATATCGAACGTCAGGCCGTT
CTCGCCGGCGATGATAGATTACGGTTCGCATTCGAAGTACCGTGAAGCCGAGAGGAGCAA
TAACAACAACAACAGCAGCAGCAATGGTAGAGCTAGAGGTGATAGGTGGAGTAGTGAGAG
AACGACGT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2AA57JQ 770 0 0
GGGGCTCAGGAAAGTCACCGTCTTGCCGTCGACGTCCGCCGGAGATATCGCCGGTTTGTT
TTCCGGCGTGGAGGTTGCGGCGAGGACGTCGATGCCGGCGAGGGGACGCGCGGTGGTGAA
TTTTCGGTGGGGGGTTAGGGTTCCGACGGGGATCAGGGGAGGTTTCGATCCGACGGCTGA
GATTTCGCTGCGGAGGTTTCCGTTTCTGGTGTTGGATAAGGTAGGGATCGAACACGTGGA
CGGGTCTGATTGTAAAGAGATAAAGTCAAAGAGCGATCCGGTTAAAGCTTCGGGTCAGAG
GACGAGTGATGACGTGTGTTTGGTGTTGGAGGAGCTTCGGTCGGAGAATTAGAGTTGAAG
AGAGCTGTTGAAGATCTACGTGGAGTGATGATATCGAACGTCAGGCCGTTCTCGCCGGCG
ATGATAGATTACGGTTCGCATTCGAAGTACCGTGAAGCCGAGAGGAGCAATAACAACAAC
AACAGCAGCAGCAATGGTAGAGCTAGAGGTGATAGGTGGAGTAGTGAGAGAACGACGTCG
GATTACGGAGGGAAGAAGAGCAAGGAAGAGGGTGACGTGGCGGAGGAGTTGAAGAAAGCC
TTGAAAGGAGCTGCTTGAAATGGTATTTGGTAACTCTGCCTCCCATGAAAGCTTTATTCG
TCTTCTTGATTTAGCTATGGCTTTTGTGTATATATATGCGTTACACTACTGCTGCGTTGA
AAGAACATCTTTATAACATTTCAATGGAATTGCTAGAAGTTTACTTTGAG

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL6933Contig1 586 2 2 U
GGAGAAATACAAACTTATTATATATGGTCTTTTTAGTAATACAAACTTGCACATGAAAGA
AACAAGACGTAAAACTTACAAACATTTATAAGACTACAGACTGCGTGCATGAAGGACCAT
TAGTTGATCAACACACACATGTTTCAAATTTATTGCAAACAAAAAGTAAAAATACGCTGA
AGATGCTGAGAAAGCTTAATATTACATAAGGACTCTGTCTTTCACTCTATGTTTCTCTTT
ATTATGGATTCCGTCTTGACTTGTCATCTTGTGCACATCGTGTTCTCCGTGACAGAGAAT
TCTAATAGTGGTATGGAGGAGGAGGAGATTTGTAGAGGTAAGGATGGTGTGGGGGAGAGT
AGCGATGGACTGGAGGAGGAGGAGGTGATTTATATACGTACTTTTCCTTTGGTGGTGGTG
GGGAATGGTAAACTGGAGGAGGAGAATAGTGCTTGACCGGAGGAGGAGGGGATTTGTATA
CGTAATGTTCCTTTGGTGGTGGTGGAGAGTGGTAAACCGGAGGAGGAGAGTAGTGCTTCA
TCGGAGGAGGAGGGGATTTGTAGACGTAATGTTTCTTTGGTGGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CX58TF C 1
AF RR2CX58JQ U 188
BS 1 190 RR2CX58TF
BS 191 586 RR2CX58JQ

RD RR2CX58TF 586 0 0
GGAGAAATACAAACTTATTATATATGGTCTTTTTAGTAATACAAACTTGCACATGAAAGA
AACAAGACGTAAAACTTACAAACATTTATAAGACTACAGACTGCGTGCATGAAGGACCAT
TAGTTGATCAACACACACATGTTTCAAATTTATTGCAAACAAAAAGTAAAAATACGCTGA
AGATGCTGAGAAAGCTTAATATTACATAAGGACTCTGTCTTTCACTCTATGTTTCTCTTT
ATTATGGATTCCGTCTTGACTTGTCATCTTGTGCACATCGTGTTCTCCGTGACAGAGAAT
TCTAATAGTGGTATGGAGGAGGAGGAGATTTGTAGAGGTAAGGATGGTGTGGGGGAGAGT
AGCGATGGACTGGAGGAGGAGGAGGTGATTTATATACGTACTTTTCCTTTGGTGGTGGTG
GGGAATGGTAAACTGGAGGAGGAGAATAGTGCTTGACCGGAGGAGGAGGGGATTTGTATA
CGTAATGTTCCTTTGGTGGTGGTGGAGAGTGGTAAACCGGAGGAGGAGAGTAGTGCTTCA
TCGGAGGAGGAGGGGATTTGTAGACGTAATGTTTCTTTGGTGGTGC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2CX58JQ 399 0 0
GAA
AAAGCTTAATATTACATAAGGACTCTGTCTTTCACTCTATGTTTCTCTTTATTATGGATT
CCGTCTTGACTTGTCATCTTGTGCACATCGTGTTCTCCGTGACAGAGAATTCTAATAGTG
GTATGGAGGAGGAGGAGATTTGTAGAGGTAAGGATGGTGTGGGGGAGAGTAGCGATGGAC
TGGAGGAGGAGGAGGTGATTTATATACGTACTTTTCCTTTGGTGGTGGTGGGGAATGGTA
AACTGGAGGAGGAGAATAGTGCTTGACCGGAGGAGGAGGGGATTTGTATACGTAATGTTC
CTTTGGTGGTGGTGGAGAGTGGTAAACCGGAGGAGGAGAGTAGTGCTTCATCGGAGGAGG
AGGGGATTTGTAGACGTAATGTTTCTTTGGTGGTGC

QA 4 399 4 399
DS 



AS 1 2

CO CL6934Contig1 560 2 2 U
GGACCTGTGAAAAAAAAGAACTCTCAAAGCGCTTTCACAAACTCTCTAGACTTTTCTTCA
TAATTCTACATCTCTCTTCAGAAAAGCAGAAATGGCAGACGATTTCGACATGGAGCTTCC
GGCAGAGGAGGCGGAGGAGATGGATTTGGATCTCGCGGACGATGCTGAATCGGATCCTTC
CTTGAAAGTGGGCGAGGAGAAGGAGATCGGGAAATCGGGGTTGAAGAAGAAGCTCGTCAA
GGAAGGAGAAAAATGGGACACTCCTGAGAGCGGAGACGAAGTTGAAGTGCACTATACCGG
AACTTTGTTAGATGGGACCAAGTTTGATTCAAGCCGTGACAGAGGAACTCCTTTCAAATT
CACGCTTGGCCAAGGGCAAGTGATCAAAGGATGGGACATTGGGATCAAGACGATGAAGAA
AGGCGAGAACGCCGTTTTCACTATTCCTCCCGAGCTGGCTTATGGTGAAACCGGTTCCCC
GCCGACAATCCCTCCGAATGCTACTCTTCAGTTCGATGTGGAGCTGTTATCGTGGAGGAG
TGTTAAGGATATTTGTGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ63TF U 1
AF RR2D019TF U 5
BS 1 544 RR2GJ63TF
BS 545 560 RR2D019TF

RD RR2GJ63TF 544 0 0
GGACCTGTGAAAAAAAAGAACTCTCAAAGCGCTTTCACAAACTCTCTAGACTTTTCTTCA
TAATTCTACATCTCTCTTCAGAAAAGCAGAAATGGCAGACGATTTCGACATGGAGCTTCC
GGCAGAGGAGGCGGAGGAGATGGATTTGGATCTCGCGGACGATGCTGAATCGGATCCTTC
CTTGAAAGTGGGCGAGGAGAAGGAGATCGGGAAATCGGGGTTGAAGAAGAAGCTCGTCAA
GGAAGGAGAAAAATGGGACACTCCTGAGAGCGGAGACGAAGTTGAAGTGCACTATACCGG
AACTTTGTTAGATGGGACCAAGTTTGATTCAAGCCGTGACAGAGGAACTCCTTTCAAATT
CACGCTTGGCCAAGGGCAAGTGATCAAAGGATGGGACATTGGGATCAAGACGATGAAGAA
AGGCGAGAACGCCGTTTTCACTATTCCTCCCGAGCTGGCTTATGGTGAAACCGGTTCCCC
GCCGACAATCCCTCCGAATGCTACTCTTCAGTTCGATGTGGAGCTGTTATCGTGGAGGAG
TGTT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2D019TF 556 0 0
GG
GTGAAAAAAAAGAACTCTCAAAGCGCTTTCACAAACTCTCTAGACTTTTCTTCATAATTC
TACATCTCTCTTCAGAAAAGCAGAAATGGCAGACGATTTCGACATGGAGCTTCCGGCAGA
GGAGGCGGAGGAGATGGATTTGGATCTCGCGGACGATGCTGAATCGGATCCTTCCTTGAA
AGTGGGCGAGGAGAAGGAGATCGGGAAATCGGGGTTGAAGAAGAAGCTCGTCAAGGAAGG
AGAAAAATGGGACACTCCTGAGAGCGGAGACGAAGTTGAAGTGCACTATACCGGAACTTT
GTTAGATGGGACCAAGTTTGATTCAAGCCGTGACAGAGGAACTCCTTTCAAATTCACGCT
TGGCCAAGGGCAAGTGATCAAAGGATGGGACATTGGGATCAAGACGATGAAGAAAGGCGA
GAACGCCGTTTTCACTATTCCTCCCGAGCTGGCTTATGGTGAAACCGGTTCCCCGCCGAC
AATCCCTCCGAATGCTACTCTTCAGTTCGATGTGGAGCTGTTATCGTGGAGGAGTGTTAA
GGATATTTGTGGTG

QA 3 556 3 556
DS 



AS 1 2

CO CL6935Contig1 720 2 1 U
GCTTTAGTGGAAGTAGTAGTGGTACCACATTTCAATATGAGTTAGGAAAGCTTAAGGGCT
CTCTCTCCGGAAGCACACATGAAAAGGACGGTGCAAAGGCTGTTTCCTCTTTTGGAGGCG
AGCCGGCGAATCTGCCCAAACCACCATCTCATTCACTGGGGAATAATAATAAAAGAGCAC
TTTCATCGATCTCAGTAGCCAAGCCTAACCAAAGATGGGCATTTCCTTCCGGTTCAAACG
CAAGCTTCACATTCCCAGTCTCTTCATCTGATGGAGCAACAACATCAGAGCCTCCAACTC
CATCCATCATGCCATTCACAACAAGCACAACACCAAGTGGTGGTGTTGCCACTACAAGTC
ATCATGATGAAGCAACAAAAGATGATGAAATTCCACAGTTTAGTTTCGGGGGTAACAGAA
GAGGAGATAAGTCGCCTCTAGTGTTCAATTTTCCATCTGTGAGCGAAGAAGTGATGAATG
AGGATGATGAGAAGTTAGGTATCAAATATACATTCGGGTCTAGAAAGCCCGAGAGAATAT
CATTCAGCTCAGCAGGAAATGATGGTGTTTGCTGCTAAAACAAGGACGGTGATGTTCTTC
TTTCTCTTTTTTTTCCTTTTCCAGTCAGTCTTTTTGTACCACAGGTTGTTTTTTTATTTT
TAGTTTGGGAAACTAAAAAGTTGTGAAATATTAACACTTGTTAAATTATTGGCTGAACTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BI31JQ C 1
AF RR2BI31TF U 1
BS 1 720 RR2BI31TF

RD RR2BI31JQ 720 0 0
GCTTTAGTGGAAGTAGTAGTGGTACCACATTTCAATATGAGTTAGGAAAGCTTAAGGGCT
CTCTCTCCGGAAGCACACATGAAAAGGACGGTGCAAAGGCTGTTTCCTCTTTTGGAGGCG
AGCCGGCGAATCTGCCCAAACCACCATCTCATTCACTGGGGAATAATAATAAAAGAGCAC
TTTCATCGATCTCAGTAGCCAAGCCTAACCAAAGATGGGCATTTCCTTCCGGTTCAAACG
CAAGCTTCACATTCCCAGTCTCTTCATCTGATGGAGCAACAACATCAGAGCCTCCAACTC
CATCCATCATGCCATTCACAACAAGCACAACACCAAGTGGTGGTGTTGCCACTACAAGTC
ATCATGATGAAGCAACAAAAGATGATGAAATTCCACAGTTTAGTTTCGGGGGTAACAGAA
GAGGAGATAAGTCGCCTCTAGTGTTCAATTTTCCATCTGTGAGCGAAGAAGTGATGAATG
AGGATGATGAGAAGTTAGGTATCAAATATACATTCGGGTCTAGAAAGCCCGAGAGAATAT
CATTCAGCTCAGCAGGAAATGATGGTGTTTGCTGCTAAAACAAGGACGGTGATGTTCTTC
TTTCTCTTTTTTTTCCTTTTCCAGTCAGTCTTTTTGTACCACAGGTTGTTTTTTTATTTT
TAGTTTGGGAAACTAAAAAGTTGTGAAATATTAACACTTGTTAAATTATTGGCTGAACTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2BI31TF 720 0 0
GCTTTAGTGGAAGTAGTAGTGGTACCACATTTCAATATGAGTTAGGAAAGCTTAAGGGCT
CTCTCTCCGGAAGCACACATGAAAAGGACGGTGCAAAGGCTGTTTCCTCTTTTGGAGGCG
AGCCGGCGAATCTGCCCAAACCACCATCTCATTCACTGGGGAATAATAATAAAAGAGCAC
TTTCATCGATCTCAGTAGCCAAGCCTAACCAAAGATGGGCATTTCCTTCCGGTTCAAACG
CAAGCTTCACATTCCCAGTCTCTTCATCTGATGGAGCAACAACATCAGAGCCTCCAACTC
CATCCATCATGCCATTCACAACAAGCACAACACCAAGTGGTGGTGTTGCCACTACAAGTC
ATCATGATGAAGCAACAAAAGATGATGAAATTCCACAGTTTAGTTTCGGGGGTAACAGAA
GAGGAGATAAGTCGCCTCTAGTGTTCAATTTTCCATCTGTGAGCGAAGAAGTGATGAATG
AGGATGATGAGAAGTTAGGTATCAAATATACATTCGGGTCTAGAAAGCCCGAGAGAATAT
CATTCAGCTCAGCAGGAAATGATGGTGTTTGCTGCTAAAACAAGGACGGTGATGTTCTTC
TTTCTCTTTTTTTTCCTTTTCCAGTCAGTCTTTTTGTACCACAGGTTGTTTTTTTATTTT
TAGTTTGGGAAACTAAAAAGTTGTGAAATATTAACACTTGTTAAATTATTGGCTGAACTT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6937Contig1 1079 2 10 U
GGAGAGAGATAAAAAATAAAACTCAGCGCAAAATTCAAGAAGAAGAAGAAAGAAAGAAAA
AACAGAGAAAAGCTTTCTTCTTTTTGACCTTTTCTTCTCCCCCCAGAGACTAAAGTTTCT
GTAATGGAGTCTCCACAATCTGTGGCCTCAACCTTCAATGGTATCCACTTGAACGGCAGT
GCTGAAAAGAAAGCTGTAATCTCGTCTGATTCAGACAGCTTCATCGGTGTGCTTGAGGTT
TTTGTTCACCAAGCCAGGGACATCCACAACATCTGCATCTATCACAAACAAGACGTGTAT
GCTAAGCTCTCTCTCACAAGCCATCCGGAGAGCTCCTTGTCCACGAAGATCATCAACGGT
GGAGGGAGAAACCCTGTCTTCGACGATACTCTTCAGTTCGATGTGAAGAGTGTTGATTGC
TCGCTGAAATGTGAGATATACATGATGAGCCGCGTGAAGAACTATCTCGAGGACCAGTTG
CTTGGTTTCGCTCTTGCCCCTTTGTCTGAAGTGATTGTGAGGAACGGGAAGCTAGAGAAA
GAGTTCTCTCTTTCTTCAACCGATTTGTTTCACTCTCCTGCAGGTTTTGTTGAGTTGTCT
CTCTCCTACGCAGGAGAGTTCCCTGAGGTGATGCACATCCCTGCGGTGGTTCCAACGGTG
GATGAGGCAGAGATGGGTTCTATAGAGGTTGATGAGTCTGAGTTCATGGATCCGAAGATT
ATCTGTGAGAACAATCAGATGGTGTCTAGTTACTTGGCCGCTACTCCTTGTACTGATTCT
GATGAGTTTGTGAGCTCTGAAACCGCCTTTGTGGAAGTAAACAGTGCTCAGACTGCAGTT
GTTGAAGAAGCAGCAGCAGCTCCAACAAGTACTGACTTCACAAGCGGAATCTCTTCTCCA
TCCATTGCAGTTAGCTCCGGTTCCTCGGGCACTCATGATGATTTAGTACTATCAAGCAAA
GTCAACTCAGGTTCAGACCAAGAAGTGAAGAAGAAGAAGCTACCAAGCGAAGAAAACAAC
TCAGGTTCAGACCAAGGAGAGAAGAAGGCAGCAGATACCATCAAGAATGGGGATGGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA05TF U 1
AF RR2AL62TF U 432
BS 1 474 RR2AA05TF
BS 475 475 RR2AL62TF
BS 476 533 RR2AA05TF
BS 534 534 RR2AL62TF
BS 535 655 RR2AA05TF
BS 656 656 RR2AL62TF
BS 657 672 RR2AA05TF
BS 673 673 RR2AL62TF
BS 674 704 RR2AA05TF
BS 705 1079 RR2AL62TF

RD RR2AA05TF 707 0 0
GGAGAGAGATAAAAAATAAAACTCAGCGCAAAATTCAAGAAGAAGAAGAAAGAAAGAAAA
AACAGAGAAAAGCTTTCTTCTTTTTGACCTTTTCTTCTCCCCCCAGAGACTAAAGTTTCT
GTAATGGAGTCTCCACAATCTGTGGCCTCAACCTTCAATGGTATCCACTTGAACGGCAGT
GCTGAAAAGAAAGCTGTAATCTCGTCTGATTCAGACAGCTTCATCGGTGTGCTTGAGGTT
TTTGTTCACCAAGCCAGGGACATCCACAACATCTGCATCTATCACAAACAAGACGTGTAT
GCTAAGCTCTCTCTCACAAGCCATCCGGAGAGCTCCTTGTCCACGAAGATCATCAACGGT
GGAGGGAGAAACCCTGTCTTCGACGATACTCTTCAGTTCGATGTGAAGAGTGTTGATTGC
TCGCTGAAATGTGAGATATACATGATGAGCCGCGTGAAGAACTATCTCGAGGACTAGTTG
CTTGGTTTCGCTCTTGCCCCTTTGTCTGAAGTGATTGTGAGGAACGGGAAGCTGGAGAAA
GAGTTCTCTCTTTCTTCAACCGATTTGTTTCACTCTCCTGCAGGTTTTGTTGAGTTGTCT
CTCTCCTACGCAGGAGAGTTCCCTGAGGTGATGCACATCCCTGCGGTGGTTCCAATGGTG
GATGAGGCAGAGTTGGGTTCTATAGAGGTTGATGAGTCTGAGTT
TAT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2AL62TF 648 0 0
G
GAGATATACATGATGAGCCGCGTGAAGAACTATCTCGAGGACCAGTTGCTTGGTTTCGCT
CTTGTCCCTTTGTCTGAAGTGATTGTGAGGAACGGGAAGCTAGAGAAAGAGTTCTCTCTT
TCTTCAACCGATTTGTTTCACTCTCCTGCAGGTTTTGTTGAGTTGTCTCTCTCCTACGCA
GGAGAGTTCCCTGAGGTGATGCACATCCCTGCGGTGGTTCCAACGGTGGATGAGGCAGAG
ATGGGTTCTATAGAGGTTGATGAGTCTGAGTTCATGGATCCGAAGATTATCTGTGAGAAC
AATCAGATGGTGTCTAGTTACTTGGCCGCTACTCCTTGTACTGATTCTGATGAGTTTGTG
AGCTCTGAAACCGCCTTTGTGGAAGTAAACAGTGCTCAGACTGCAGTTGTTGAAGAAGCA
GCAGCAGCTCCAACAAGTACTGACTTCACAAGCGGAATCTCTTCTCCATCCATTGCAGTT
AGCTCCGGTTCCTCGGGCACTCATGATGATTTAGTACTATCAAGCAAAGTCAACTCAGGT
TCAGACCAAGAAGTGAAGAAGAAGAAGCTACCAAGCGAAGAAAACAACTCAGGTTCAGAC
CAAGGAGAGAAGAAGGCAGCAGATACCATCAAGAATGGGGATGGTGA

QA 2 648 2 648
DS 



AS 1 2

CO CL6938Contig1 711 2 2 U
GGAGGAATTATCGGAGGATAGTTCATCGTCGATCGGAGAGTGCAGTGAAAACGAGGAGGA
AGAAGAAGACGACGCCGTTTCAGTCCAGAGAGGTGGAGGAGGAACACTTGTTTCGTTTAG
TTCCTCTTTAGAAGACTCTCTGCCGATTAAGAGAGGATTATCAAACCATTACGTAGGGAA
ATCGAAATCTTTTGGGAACTTAATGGAACCGATGATGAACATCAACGCGAAAGATATTGA
GAAAGGAGAGAATCCATTCAACAAGAGGAGGAGATTGCTTATTGCTAATAAGCTGAGGAG
CAGAGGAAGATCCATTTCGGTTTCGAATTTTTACTCTTGGCAAAACCCTAATTCTATGTC
GTTACTTGCAGTCCAAGAACACAATGAAGTGAATCATCATAATGATGATAACTATGAGGA
AAATGAAGGTGATGATCATCAAACTATAAAGAGGAATATGTTGATGAAAAATAAGAGAGA
TTTGATGGCTCAGACTCAAAGTTGTTTCTGTCTTAGTAGTTTGCAAGAAGAAGATGATGA
TGAGGGTGAAGTTGATGAGTGATTAATCAGTTACATGGTTTAGTGATACTTGTTCTTCAA
TTTGTTCTTCTCTTGTGAATTTGATTAGATGAAGTTTCAGTGGTCACACAAGTGGTCGAA
GGTTTGATTTGTTAGAATATTATTATTTATTAGTAGACTTTTTCCTATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY90TF U 1
AF RR2EY90JQ C 103
BS 1 655 RR2EY90TF
BS 656 711 RR2EY90JQ

RD RR2EY90TF 655 0 0
GGAGGAATTATCGGAGGATAGTTCATCGTCGATCGGAGAGTGCAGTGAAAACGAGGAGGA
AGAAGAAGACGACGCCGTTTCAGTCCAGAGAGGTGGAGGAGGAACACTTGTTTCGTTTAG
TTCCTCTTTAGAAGACTCTCTGCCGATTAAGAGAGGATTATCAAACCATTACGTAGGGAA
ATCGAAATCTTTTGGGAACTTAATGGAACCGATGATGAACATCAACGCGAAAGATATTGA
GAAAGGAGAGAATCCATTCAACAAGAGGAGGAGATTGCTTATTGCTAATAAGCTGAGGAG
CAGAGGAAGATCCATTTCGGTTTCGAATTTTTACTCTTGGCAAAACCCTAATTCTATGTC
GTTACTTGCAGTCCAAGAACACAATGAAGTGAATCATCATAATGATGATAACTATGAGGA
AAATGAAGGTGATGATCATCAAACTATAAAGAGGAATATGTTGATGAAAAATAAGAGAGA
TTTGATGGCTCAGACTCAAAGTTGTTTCTGTCTTAGTAGTTTGCAAGAAGAAGATGATGA
TGAGGGTGAAGTTGATGAGTGATTAATCAGTTACATGGTTTAGTGATACTTGTTCTTCAA
TTTGTTCTTCTCTTGTGAATTTGATTAGATGAAGTTTCAGTGGTCACACAAGTGG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2EY90JQ 609 0 0
AACACTTGTTTCGTTTAGTTCCTCTTTAGAAGACTCTCTGCCGATTAAGAGAGGATTATC
AAACCATTACGTAGGGAAATCGAAATCTTTTGGGAACTTAATGGAACCGATGATGAACAT
CAACGCGAAAGATATTGAGAAAGGAGAGAATCCATTCAACAAGAGGAGGAGATTGCTTAT
TGCTAATAAGCTGAGGAGCAGAGGAAGATCCATTTCGGTTTCGAATTTTTACTCTTGGCA
AAACCCTAATTTTATGTCGTTACTTGCAGTCCAAGAACACAATGAAGTGAATCATCATAA
TGATGATAACTATGAGGAAAATGAAGGTGATGATCATCAAACTATAAAGAGGAATATGTT
GATGAAAAATAAGAGAGATTTGATGGCTCAGACTCAAAGTTGTTTCTGTTTTAGTAGTTT
GCAAGAAGAAGATGATGATGAGGGTGAAGTTGATGAGTGATTAATCAGTTACATGGTTTA
GTGATACTTGTTTTTCAATTTGTTCTTTTCTTGTGAATTTGATTAGATGAAGTTTCAGTG
GTCACACAAGTGGTCGAAGGTTTGATTTGTTAGAATATTATTATTTATTAGTAGACTTTT
TCCTATATC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6940Contig1 759 2 2 U
GGTGGTTGATGACGTCATACACGTAATCCGGCACAGCAGTTTCCGAGTAGGGAGTGACCA
GCCGGTCATGGAAAGCGTTGAGGTCGGTGTCCAGAACGTCGACGTTGGGAAACTCATAAA
CGTTGTGAGAGATGAACTCGAAGTGAGGAAAGTAGTAGCCACTCCCTCCTCTGATACAAC
CACCCCGGAGCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCTGCTGAAGGACCACCAGACCCTATCAC
TAACTATTCAGAGACCAAGAGCTTTAACTCATGCTCTGATTTCTCACCACCCGAGACGAG
ACCAAACTCGTTCATGCCTGAAGAGGAAACGACTCCGGTTCCAGCTGTGAAAGAGACGTT
GGACATCAAGTCGTTCAGACAGAGAGCAGAGGCGCTTGAAGGTCTCTTGGAACTATCCGC
GGATTTGCTGGAACAGAGTAGGCTGGAAGAGCTGGCCATCGTGTTGCAGCCGTTTGGGAA
GAACAAAGTTTCGCCTAGAGAAACTGCTATTTGGTTGGCAAAGAGCTTAAAAGGAATGAT
GATCGATGGCATCAATAATAACAACAGTGGCTGTTCCAGGAATTGTTCTTGAAGGTAACG
ATTTGTATTTATACCACCACCCACCTTCTTCAAACCAAACTCTTTTCTGTTCCCTTTTTT
TTTTCTTCCTGTAACGTTTGAATTTGCACAAAGCAATAATTCCTTCTTTTATTAGAAAAA
AAAAGAATCATTAAAAACCATATATTCTTTTTTTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH43TF U 1
AF RR2EH43JQ C 219
BS 1 595 RR2EH43TF
BS 596 759 RR2EH43JQ

RD RR2EH43TF 595 0 0
GGTGGTTGATGACGTCATACACGTAATCCGGCACAGCAGTTTCCGAGTAGGGAGTGACCA
GCCGGTCATGGAAAGCGTTGAGGTCGGTGTCCAGAACGTCGACGTTGGGAAACTCATAAA
CGTTGTGAGAGATGAACTCGAAGTGAGGAAAGTAGTAGCCACTCCCTCCTCTGATACAAC
CACCCCGGAGCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCTGCTGAAGGACCACCAGACCCTATCAC
TAACTATTCAGAGACCAAGAGCTTTAACTCATGCTCTGATTTCTCACCACCCGAGACGAG
ACCAAACTCGTTCATGCCTGAAGAGGAAACGACTCCGGTTCCAGCTGTGAAAGAGACGTT
GGACATCAAGTCGTTCAGACAGAGAGCAGAGGCGCTTGAAGGTCTCTTGGAACTATCCGC
GGATTTGCTGGAACAGAGTAGGCTGGAAGAGCTGGCCATCGTGTTGCAGCCGTTTGGGAA
GAACAAAGTTTCGCCTAGAGAAACTGCTATTTGGTTGGCAAAGAGCTTAAAAGGAATGAT
GATCGATGGCATCAATAATAACAACAGTGGCTGTTCCAGGAATTGTTCTTGAAGG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2EH43JQ 541 0 0
AAGGACCACCAGACCCTATCACTAACTATTCAGAGACCAAGAGCTTTAACTCATGCTCTG
ATTTCTCACCACCCGAGACGAGACCAAACTCGTTCATGCCTGAAGAGGAAACGACTCCGG
TTCCAGCTGTGAAAGAGACGTTGGACATCAAGTCGTTCAGACAGAGAGCAGAGGCGCTTG
AAGGTCTCTTGGAACTATCCGCGGATTTGCTGGAACAGAGTAGGCTGGAAGAGCTGGCCA
TCGTGTTGCAGCCGTTTGGGAAGAACAAAGTTTCGCCTAGAGAAACTGCTATTTGGTTGG
CAAAGAGCTTAAAAGGAATGATGATCGATGGCATCAATAATAACAACAGTGGCTGTTCCA
GGAATTGTTCTTGAAGGTAACGATTTGTATTTATACCACCACCCACCTTCTTCAAACCAA
ACTCTTTTCTGTTCCCTTTTTTTTTTCTTCCTGTAACGTTTGAATTTGCACAAAGCAATA
ATTCCTTCTTTTATTAGAAAAAAAAAGAATCATTAAAAACCATATATTCTTTTTTTTGTT
C

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 2

CO CL6941Contig1 795 2 2 U
GATGATCACTGTGACCCTAAGATCATCCACCGTGACGTTAAAGCAGCGAACATTCTACTG
GACGAGGACTTCGAAGCTATTGTTGGTGACTTCGGGCTAGCGAAGCTCATGGACTACAAA
GACACTCACGCGACAACAGCGGTACGTGGCACGATAGGCCACATCGCTCCAGAGTATCTC
TCCACAGGAAAGTCCTCAGAGAAAACAGATGTGTTCGGTTACGGTATCATGCTTTTGGAG
CTCATCACAGGACAAAGAGCCTTTGATCTCGCTAGGCTAGCTAACGACGATGACGTCATG
TTGCTTGACTGGGTGAAAGGGTTGTTGAAGGAGAAGAAGCTGGAGATGTTGGTGGATCCT
GATCTTCAGACGAACTACGAGGAGAGGGAGCTGGAACAGGTGATACAAGTGGCGTTGCTT
TGCACGCAAGGGTCGCCTATGGAAAGACCAAAGATGTCGGAAGTTGTGAGGATGCTTGAA
GGAGATGGGCTTGCGGAGAGATGGGATGAGTGGCAGAAAGTTGAGATATTGAGGGAAGAT
GTTGATTTGAGTCCTAATCTTCACTCTGATTGGATCGTTGATTCTACTTATAATTTGCAT
GCTGTTGAGTTATCTGGTCCTAGGTAACCAACCCCCACAGGAAAATAAACTATTTGAGAG
GGAACAAAAAATCATATTTTTATAAGGTTAGGTAGCTTTTGTTACAAGTTGTTTTTTTTA
CATTGAAAAGATATGTGATTTTGTGAAAGTTTGTGCTACGGTTCTATAAAAGGAATGAAG
AAAAAATCATTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AY40TFB U 1
AF RR2AY40JQ C 107
BS 1 651 RR2AY40TFB
BS 652 795 RR2AY40JQ

RD RR2AY40TFB 651 0 0
GATGATCACTGTGACCCTAAGATCATCCACCGTGACGTTAAAGCAGCGAACATTCTACTG
GACGAGGACTTCGAAGCTATTGTTGGTGACTTCGGGCTAGCGAAGCTCATGGACTACAAA
GACACTCACGCGACAACAGCGGTACGTGGCACGATAGGCCACATCGCTCCAGAGTATCTC
TCCACAGGAAAGTCCTCAGAGAAAACAGATGTGTTCGGTTACGGTATCATGCTTTTGGAG
CTCATCACAGGACAAAGAGCCTTTGATCTCGCTAGGCTAGCTAACGACGATGACGTCATG
TTGCTTGACTGGGTGAAAGGGTTGTTGAAGGAGAAGAAGCTGGAGATGTTGGTGGATCCT
GATCTTCAGACGAACTACGAGGAGAGGGAGCTGGAACAGGTGATACAAGTGGCGTTGCTT
TGCACGCAAGGGTCGCCTATGGAAAGACCAAAGATGTCGGAAGTTGTGAGGATGCTTGAA
GGAGATGGGCTTGCGGAGAGATGGGATGAGTGGCAGAAAGTTGAGATATTGAGGGAAGAT
GTTGATTTGAGTCCTAATCTTCACTCTGATTGGATCGTTGATTCTACTTATAATTTGCAT
GCTGTTGAGTTATCTGGTCCTAGGTAACCAACCCCCACAGGAAAATAAACT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2AY40JQ 689 0 0
TCATGGACTACAAAGACACTCACGCGACAACAGCGGTACGTGGCACGATAGGCCACATCG
CTCCAGAGTATCTCTCCACAGGAAAGTCCTCAGAGAAAACAGATGTGTTCGGTTACGGTA
TCATGCTTTTGGAGCTCATCACAGGACAAAGAGCCTTTGATCTCGCTAGGCTAGCTAACG
ACGATGACGTCATGTTGCTTGACTGGGTGAAAGGGTTGTTGAAGGAGAAGAAGCTGGAGA
TGTTGGTGGATCCTGATCTTCAGACGAACTACGAGGAGAGGGAGCTGGAACAGGTGATAC
AAGTGGCGTTGCTTTGCACGCAAGGGTCGCCTATGGAAAGACCAAAGATGTCGGAAGTTG
TGAGGATGCTTGAAGGAGATGGGCTTGCGGAGAGATGGGATGAGTGGCAGAAAGTTGAGA
TATTGAGGGAAGATGTTGATTTGAGTCCTAATCTTCACTCTGATTGGATCGTTGATTCTA
CTTATAATTTGCATGCTGTTGAGTTATCTGGTCCTAGGTAACCAACCCCCCCAGGAAAAT
AAACTATTTGAGAGGGAACAAAAAATCATATTTTTATAAGGTTAGGTAGCTTTTGTTACA
AGTTGTTTTTTTTACATTGAAAAGATATGTGATTTTGTGAAAGTTTGTGCTACGGTTCTA
TAAAAGGAATGAAGAAAAAATCATTAGCC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL6942Contig1 850 2 2 U
GTGAACAAACAATGGGAGAGGAGAGACTACTTCGGAGTCCACCCTCAGAAACAAGAAGGT
CTTAGCTACATTGGCCTTCACGTTCCGGTCGGTAGGCTACAAGCGGATGACATGGACGAG
CTTGCTCGGTTAGCTGACACCTACGGCACAGGCGAGCTCAGACTCACGGTAGAGCAAAAC
ATCATCATCCCAAACGTGGAAACCTCCAAAACCCAAGCTTTGCTTCAAGAACCGTTTCTC
AAGAACAGGTTCTCTCCTGAGCCATCTATCTTGATGAAAGGCTTAGTCGCTTGTACCGGA
AACCAGTTTTGTGGACAAGCTATAATCGAGACCAAACTAAGAGCGCTAAAAGTGACAGAA
GAAGTGGAGAGACTTGTAGCTGTGCCAAAGCCAATAAGGATGCATTGGACAGGATGTCCC
AACACTTGCGGGCAAGTCCAGGTGGCAGATATCGGATTCATGGGATGCTTGACACGTGGT
GAGAACGGGAAGCCTGTCGAGGGTGCTGACGTGTACGTTGGAGGACGGATAGGAAGCGAC
TCGCATCTTGGAGAGATTTATAAGAAAGGTGTTCGTGTTACGGAGTTGGTTCCCTTGGTG
GCTGAGATTCTAGTCAAAGAATTTGGCGCTGTGCCTAGAGAAAGACAAGAGAATGAAGAC
TGATTCAAAGCCTTTGGATCTTTAATAAGTTGAGGAACAACAATGGTTCTCTCATTCTCG
TTTCAGACATTGATACTTTGTGTTTTGTGCCCATAAATTTTGGGTTTTCTAGCTCTTGTT
GAAACTTGTAACTTGTTGTTGATCGTTTTGTAATATCCTTTTTTATAATGTAGTTATAAT
TCCGATGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI39TF U 1
AF RR2BI39JQ C 36
BS 1 808 RR2BI39TF
BS 809 850 RR2BI39JQ

RD RR2BI39TF 817 0 0
GTGAACAAACAATGGGAGAGGAGAGACTACTTCGGAGTCCACCCTCAGAAACAAGAAGGT
CTTAGCTACATTGGCCTTCACGTTCCGGTCGGTAGGCTACAAGCGGATGACATGGACGAG
CTTGCTCGGTTAGCTGACACCTACGGCACAGGCGAGCTCAGACTCACGGTAGAGCAAAAC
ATCATCATCCCAAACGTGGAAACCTCCAAAACCCAAGCTTTGCTTCAAGAACCGTTTCTC
AAGAACAGGTTCTCTCCTGAGCCATCTATCTTGATGAAAGGCTTAGTCGCTTGTACCGGA
AACCAGTTTTGTGGACAAGCTATAATCGAGACCAAACTAAGAGCGCTAAAAGTGACAGAA
GAAGTGGAGAGACTTGTAGCTGTGCCAAAGCCAATAAGGATGCATTGGACAGGATGTCCC
AACACTTGCGGGCAAGTCCAGGTGGCAGATATCGGATTCATGGGATGCTTGACACGTGGT
GAGAACGGGAAGCCTGTCGAGGGTGCTGACGTGTACGTTGGAGGACGGATAGGAAGCGAC
TCGCATCTTGGAGAGATTTATAAGAAAGGTGTTCGTGTTACGGAGTTGGTTCCCTTGGTG
GCTGAGATTCTAGTCAAAGAATTTGGCGCTGTGCCTAGAGAAAGACAAGAGAATGAAGAC
TGATTCAAAGCCTTTGGATCTTTAATAAGTTGAGGAACAACAATGGTTCTCTCATTCTCG
TTTCAGACATTGATACTTTGTGTTTTGTGCCCATAAATTTTGGGTTTTCTAGCTCTTGTT
GAAACTTGTAACTTGTTGTTGATCGTTT
GTATATCCT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2BI39JQ 815 0 0
AGTCCACCCTCAGAAACAAGAAGGTCTTAGCTACATTGGCCTTCACGTTCCGGTCGGTAG
GCTACAAGCGGATGACATGGACGAGCTTGCTCGGTTAGCTGACACCTACGGCACAGGCGA
GCTCAGACTCACGGTAGAGCAAAACATCATCATCCCAAACGTGGAAACCTCCAAAACCCA
AGCTTTGCTTCAAGAACCGTTTCTCAAGAACAGGTTCTCTCCTGAGCCATCTATCTTGAT
GAAAGGCTTAGTCGCTTGTACCGGAAACCAGTTTTGTGGACAAGCTATAATCGAGACCAA
ACTAAGAGCGCTAAAAGTGACAGAAGAAGTGGAGAGACTTGTAGCTGTGCCAAAGCCAAT
AAGGATGCATTGGACAGGATGTCCCAACACTTGCGGGCAAGTCCAGGTGGCAGATATCGG
ATTCATGGGATGCTTGACACGTGGTGAGAACGGGAAGCCTGTCGAGGGTGCTGACGTGTA
CGTTGGAGGACGGATAGGAAGCGACTCGCATCTTGGAGAGATTTATAAGAAAGGTGTTCG
TGTTACGGAGTTGGTTCCCTTGGTGGCTGAGATTCTAGTCAAAGAATTTGGCGCTGTGCC
TAGAGAAAGACAAGAGAATGAAGACTGATTCAAAGCCTTTGGATCTTTAATAAGTTGAGG
AACAACAATGGTTCTCTCATTCTCGTTTCAGACATTGATACTTTGTGTTTTGTGCCCCTA
AATTTTGGGTTTTCTAGCTCTTGTTGAAACTTGTAACTTGTTGTTGATCGTTTTGTAATA
TCCTTTTTTATAATGTAGTTATAATTCCGATGAAG

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL6943Contig1 715 2 4 U
GGATCCTCTTCTTCCTCTAGCCAAGCCGGAAACTACAGAAGCAAGAAGTGACCTTGCTGG
ATCCTTCTTAACAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCCAAGGAGGAGACAGTGACACT
TGGACCAGCTGTTCGTGATGGAGAGCAAGTCTTCGGTGTTGTCCACATCTTCGCTTCCTT
CAACGACACTTTCATTCACGTTACTGATCTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTTCGGATCAC
TGGTGGGATGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTTGC
TGCACAAGATGTTGCTCAGCGATGCAAGGAGCTTGGAATCACTGCTATGCACGTGAAGCT
CCGTGCCACTGGTGGAAACAAGACCAAGACACCCGGTCCTGGTGCTCAGTCCGCTCTTAG
AGCTCTTGCTCGTTCCGGCATGAAAATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCGATCCCAAC
GGACAGTACCCGCAGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAACAATTGTGTTTCA
TTTTGTCAGAACAATGTTTGTTGAGTTTAGCTCGTGTTTTGCCATTTAAGCTCATTTGTT
TCATTTTGTCAGAACAATGTTTCTTGTGAACGAGTTTCCAAGTTGAATGTTTTTTTTTTG
TTAAATTTGAACAACATTTTATCTACTATGATTTAGCCTATGGCCTTGTCGACTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL47JQ C 1
AF RR2GL47TF U 1
BS 1 613 RR2GL47TF
BS 614 614 RR2GL47JQ
BS 615 676 RR2GL47TF
BS 677 715 RR2GL47JQ

RD RR2GL47JQ 715 0 0
GGATCCTCTTCTTCCTCTAGCCAAGCCGGAAACTACAGAAGCAAGAAGTGACCTTGCTGG
ATCCTTCTTAACAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCCAAGGAGGAGACAGTGACACT
TGGACCAGCTGTTCGTGATGGAGAGCAAGTCTTCGGTGTTGTCCACATCTTCGCTTCCTT
CAACGACACTTTCATTCACGTTACTGATCTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTTCGGATCAC
TGGTGGGATGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTTGC
TGCACAAGATGTTGCTCAGCGATGCAAGGAGCTTGGAATCACTGCTATGCACGTGAAGCT
CCGTGCCACTGGTGGAAACAAGACCAAGACACCCGGTCCTGGTGCTCAGTCCGCTCTTAG
AGCTCTTGCTCGTTCCGGCATGAAAATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCGATCCCAAC
GGACAGTACCCGCAGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAACAATTGTGTTTCA
TTTTGTCAGAACAATGTTTGTTGAGTTTAGCTCGTGTTTTGCCATTTAAGCTCATTTGTT
TCATTTTGTCAGAACAATGTTTCTTGTGAACGAGTTTCCAAGTTGAATGTTTTTTTTTTG
TTAAATTTGAACAACATTTTATCTACTATGATTTAGCCTATGGCCTTGTCGACTT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2GL47TF 676 0 0
GGATCCTCTTCTTCCTCTAGCCAAGCCGGAAACTACAGAAGCAAGAAGTGACCTTGCTGG
ATCCTTCTTAACAATGTCGAGGAGAAAGACGAGAGAGCCCAAGGAGGAGACAGTGACACT
TGGACCAGCTGTTCGTGATGGAGAGCAAGTCTTCGGTGTTGTCCACATCTTCGCTTCCTT
CAACGACACTTTCATTCACGTTACTGATCTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTTCGGATCAC
TGGTGGGATGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTTGC
TGCACAAGATGTTGCTCAGCGATGCAAGGAGCTTGGAATCACTGCTATGCACGTGAAGCT
CCGTGCCACTGGTGGAAACAAGACCAAGACACCCGGTCCTGGTGCTCAGTCCGCTCTTAG
AGCTCTTGCTCGTTCCGGCATGAAAATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCGATCCCAAC
GGACAGTACCCGCAGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAACAATTGTGTTTCA
TTTTGTCAGAACAATGTTTGTTGAGTTTAGCTCGTGTTTTGCCATTTAAGCTCATTTGTT
TCATTTTGTCAGA*CAATGTTTCTTGTGAACGAGTTTCCAAGTTGAATGTTTTTTTTTTG
TTAAATTTGAACAACA

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL6944Contig1 908 2 10 U
GGACAATTCGTTTTATGAAACAAATCTTGCTTAAGTTCCAGCAAGAAGAAAGTAATAATA
ACATAGTATCAGCAAATGGAGTTTTTCCAAGACGCTAAAGCCGTTAGGATGCGTAGCGCC
CACGAAAAGTATCTTATGGCGGACGAGGACGAGGAGACGGTGACTCAAGAAAGGAATGGT
TCCGACAAGAGAGCTCGATGGACCGTCGAACCAGTTCGTGGTTCCTTTGAAGTGATCCGT
TTGAAGAGTTGCTACGGTAACTACCTCACCGCTTCGAACGAGCGGTTCTTGCTCGGTGCC
ACGGGACGTAAAGTGGTTTTGTCGAAACCGAGTGGGCTTGACTCGTCCGTAGAGTGGGAG
TCGGTGAGAGAAGGATCAAAAGTAGAGCTCAAGACTAGGCACGGTCGCTTCCTCCGAGCC
AATGGTGGACTTCCTCCGTGGCGTAACTCAGTCACTCATAACTCTCGTCAGAGTTCGGAC
TCGTCCTTGTGGGATGTTGATGTCATCGAGATCTTGGTCGAAACGACGTCTCCGGCTTCA
CCTCTGGCGACTACTCCTCCGCAACATATGAGGCTGTCAGGTTCTCCCATGTCTAAGACC
ACTTCAGAGAAATCCGTGGAAGAGTTGGCTAACTCGCGGCCGAAATCTGAAGGGTGGAAC
AGTTGACGCAGTTGACGCAGTCGCCGAGGGAAGAGACTAGCATGGATGTTGTTGTTGCGT
GTACAGACGCAATCCAATAAACGGCATGCTGCGTGTTGTATATGCAATAGGGGTCAAAGT
ATTAGCTCACATTGAGATATGGTGTTGACCAAAAGGTTAATGACTGGTCCTCGGTTCCAT
TAGATAAGGGCGTTAAATATAAAATGTATTGGTATATTATTAGTGTTAATCTTTCATTTT
ATTGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM25TF U 1
AF RR2FM25JQ C 241
BS 1 756 RR2FM25TF
BS 757 757 RR2FM25JQ
BS 758 766 RR2FM25TF
BS 767 767 RR2FM25JQ
BS 768 772 RR2FM25TF
BS 773 773 RR2FM25JQ
BS 774 782 RR2FM25TF
BS 783 783 RR2FM25JQ
BS 784 798 RR2FM25TF
BS 799 908 RR2FM25JQ

RD RR2FM25TF 798 0 0
GGACAATTCGTTTTATGAAACAAATCTTGCTTAAGTTCCAGCAAGAAGAAAGTAATAATA
ACATAGTATCAGCAAATGGAGTTTTTCCAAGACGCTAAAGCCGTTAGGATGCGTAGCGCC
CACGAAAAGTATCTTATGGCGGACGAGGACGAGGAGACGGTGACTCAAGAAAGGAATGGT
TCCGACAAGAGAGCTCGATGGACCGTCGAACCAGTTCGTGGTTCCTTTGAAGTGATCCGT
TTGAAGAGTTGCTACGGTAACTACCTCACCGCTTCGAACGAGCGGTTCTTGCTCGGTGCC
ACGGGACGTAAAGTGGTTTTGTCGAAACCGAGTGGGCTTGACTCGTCCGTAGAGTGGGAG
TCGGTGAGAGAAGGATCAAAAGTAGAGCTCAAGACTAGGCACGGTCGCTTCCTCCGAGCC
AATGGTGGACTTCCTCCGTGGCGTAACTCAGTCACTCATAACTCTCGTCAGAGTTCGGAC
TCGTCCTTGTGGGATGTTGATGTCATCGAGATCTTGGTCGAAACGACGTCTCCGGCTTCA
CCTCTGGCGACTACTCCTCCGCAACATATGAGGCTGTCAGGTTCTCCCATGTCTAAGACC
ACTTCAGAGAAATCCGTGGAAGAGTTGGCTAACTCGCGGCCGAAATCTGAAGGGTGGAAC
AGTTGACGCAGTTGACGCAGTCGCCGAGGGAAGAGACTAGCATGGATGTTGTTGTTGCGT
GTACAGACGCAATCCAATAAACGGCATGCTGCGTGT*GTATATGCA*TAGGG*TCAAAGT
AT*AGCTCACATTGAGAT

QA 1 798 1 798
DS 

RD RR2FM25JQ 668 0 0
TTGAAGAGTTGCTACGGTAACTACCTCACCGCTTCGAACGAGCGGTTCTTGCTCGGTGCC
ACGGGACGTAAAGTGGTTTTGTCGAAACCGAGTGGGCTTGACTCGTCCGTAGAGTGGGAG
TCGGTGAGAGAAGGATCAAAAGTAGAGCTCAAGACTAGGCACGGTCGCTTCCTCCGAGCC
AATGGTGGACTTCCTCCGTGGCGTAACTCAGTCACTCATAACTCTCGTCAGAGTTCGGAC
TCGTCCTTGTGGGATGTTGATGTCATCGAGATCTTGGTCGAAACGACGTCTCCGGCTTCA
CCTCTGGCGACTACTCCTCCGCAACATATGAGGCTGTCAGGTTCTCCCATGTCTAAGACC
ACTTCAGAGAAATCCGTGGAAGAGTTGGCTAACTCGCGGCCGAAATCTGAAGGGTGGAAC
AGTTGACGCAGTTGACGCAGTCGCCGAGGGAAGAGACTAGCATGGATGTTGTTGTTGCGT
GTACAGACGCAATCCAATAAACGGCATGCTGCGTGTTGTATATGCAATAGGGGTCAAAGT
ATTAGCTCACATTGAGATATGGTGTTGACCAAAAGGTTAATGACTGGTCCTCGGTTCCAT
TAGATAAGGGCGTTAAATATAAAATGTATTGGTATATTATTAGTGTTAATCTTTCATTTT
ATTGTACC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL6945Contig1 1050 2 2 U
GGGGAAGCTTACCGTGGCAGGGACTAAAAGCTGGGACAAAGAAGCAGAAGTATGATGTAA
TAAGTGAGAAGAAAGTATCAACTCCTATAGAGGTGCTGTGTAGAAATTGCCCCTCTGAAT
TCGTATCATACTTCCATTACTGCCGATCTTTACGGTTTGATGACAAACCTGATTACTCTT
ACCTCAAGCGTCTTTTCCGCGACTTGTTCATCCGAGAAGGTTACCAATTCGATTACGTGT
TTGACTGGACAGTCTTAAAGTATCCTCAAATCGGTTCCAGTTCTGGTTCTACCTCACGTA
CAAGGCATCAAACAACGACGAAACCAGGATTCAACGCGGGTCCTTCTACAAGTAGGCAAG
AGAGGCACGCTGGTGAGGAAACAACCAGAGTCTCGGGTGCAGTGGAAGCCTTCTCCCGAA
GACACCCAACGAACTCTGCTACGCTACGTGATCATTCAAGATCAAGAAACTCTGATGACG
GACCTTTCACTAAGCATATACATGGAGAGAGAGGAAGCAGTTCGTCAAGACAGGGAACAT
CAACATCAAGGAAAGCAGTTGGTGGTGGTTCAAGCTCTAGGCCAAGTTCTGCAGGTGGTG
GACCAAGTGGTAGCCGAGTTTCAAGCCGTCTGGTATCATCAAGCGGGTGGTGGTGGCAGT
GGGCGTCCATCGAGCAGTCAGAGAGTCCAAGCTGGATATGAGTCGAAGACACTGTCTTTC
GCTCGTGCAACGGCTTCAAGAAACGCTAGGGAAGATCAGTTGAGAAGCTTCGAGCTTCTG
TCTCTTCGGAAATAAATAAATAAAAAGAATGAAAAAGAGAGGGAGGGGGATAGAGAGACT
CCATGAAAACCCAACCGAAAAGATCTTTACAGGTGATTTCAGCTTGAGCTGCAGAGATCT
TCTGCCAGCACTCTTGCTCGTTTGTATATTTTTAAATGGTGATGTATTGGAGAAAAGAGA
GAGAGTCAAAAATGTAGAAAGTTTCAAATTGTAAAAGAGGTGAACTTGTATTCCTCCTAT
TATTATCCTATATATACTCCCATTACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B306TF U 1
AF RR2B306JQ C 247
BS 1 791 RR2B306TF
BS 792 1050 RR2B306JQ

RD RR2B306TF 793 0 0
GGGGAAGCTTACCGTGGCAGGGACTAAAAGCTGGGACAAAGAAGCAGAAGTATGATGTAA
TAAGTGAGAAGAAAGTATCAACTCCTATAGAGGTGCTGTGTAGAAATTGCCCCTCTGAAT
TCGTATCATACTTCCATTACTGCCGATCTTTACGGTTTGATGACAAACCTGATTACTCTT
ACCTCAAGCGTCTTTTCCGCGACTTGTTCATCCGAGAAGGTTACCAATTCGATTACGTGT
TTGACTGGACAGTCTTAAAGTATCCTCAAATCGGTTCCAGTTCTGGTTCTACCTCACGTA
CAAGGCATCAAACAACGACGAAACCAGGATTCAACGCGGGTCCTTCTACAAGTAGGCAAG
AGAGGCACGCTGGTGAGGAAACAACCAGAGTCTCGGGTGCAGTGGAAGCCTTCTCCCGAA
GACACCCAACGAACTCTGCTACGCTACGTGATCATTCAAGATCAAGAAACTCTGATGACG
GACCTTTCACTAAGCATATACATGGAGAGAGAGGAAGCAGTTCGTCAAGACAGGGAACAT
CAACATCAAGGAAAGCAGTTGGTGGTGGTTCAAGCTCTAGGCCAAGTTCTGCAGGTGGTG
GACCAAGTGGTAGCCGAGTTTCAAGCCGTCTGGTATCATCAAGCGGGTGGTGGTGGCAGT
GGGCGTCCATCGAGCAGTCAGAGAGTCCAAGCTGGATATGAGTCGAAGACACTGTCTTTC
GCTCGTGCAACGGCTTCAAGAAACGCTAGGGAAGATCAGTTGAGAAGCTTCGAGCTTCTG
TCTCTTCGGAA
TA

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2B306JQ 804 0 0
GGACAGTCTTAAAGTATCCTCAAATCGGTTCCAGTTCTGGTTCTACCTCACGTACAAGGC
ATCAAACAACGACGAAACCAGGATTCAACGCGGGTCCTTCTACAAGTAGGCAAGAGAGGC
ACGCTGGTGAGGAAACAACCAGAGTCTCGGGTGCAGTGGAAGCCTTCTCCCGAAGACACC
CAACGAACTCTGCTACGCTACGTGATCATTCAAGATCAAGAAACTCTGATGACGGACCTT
TCACTAAGCATATACATGGAGAGAGAGGAAGCAGTTCGTCAAGACAGGGAACATCAACAT
CAAGGAAAGCAGTTGGTGGTGGTTCAAGCTCTAGGCCAAGTTCTGCAGGTGGTGGACCAA
GTGGTAGCCGAGTTTCAAGCCGTCTGGTATCATCAAGCGG*TGGTGGTGGCAGTGGGCGT
CCATCGAGCAGTCAGAGAGTCCAAGCTGGATATGAGTCGAAGACACTGTCTTTCGCTCGT
GCAACGGCTTCAAGAAACGCTAGGGAAGATCAGTTGAGAAGCTTCGAGCTTCTGTCTCTT
CGGAAATAAATAAATAAAAAGAATGAAAAAGAGAGGGAGGGGGATAGAGAGACTCCATGA
AAACCCAACCGAAAAGATCTTTACAGGTGATTTCAGCTTGAGCTGCAGAGATCTTCTGCC
AGCACTCTTGCTCGTTTGTATATTTTTAAATGGTGATGTATTGGAGAAAAGAGAGAGAGT
CAAAAATGTAGAAAGTTTCAAATTGTAAAAGAGGTGAACTTGTATTCCTCCTATTATTAT
CCTATATATACTCCCATTACTTCC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL6946Contig1 1168 2 4 U
GGGGGCGGAAGATGGAAGGAGGCAGACCGGGAGTTGTCGTCGTCGGTTCCCCTGGTGTCG
GCAAGCGCACTCTTCTCTCTCGATTGCTCTCTGTCGATTTTGAGGATTCATCATCATCTC
AAACACAACAAGTTCATGACTGGACGATTAACACCAAGTACTACACTGCGGATGTATCTG
TACGGATATCAAATATTTGCGACGACAATGACTACTCTCTCCCTCACTCACATCATCCAC
TTGTGGCGTTAGTTATGGTCTTCGACTTGAGTCAGATGTCAACTCTCGTTGCTCTTCAGG
ACTGGGTTTCTCATGCGGACATCACCATCAACAGTTTTGATATATTGTTGTGCATTGGGA
ACAAAGTTGATCTTCTCCCCACCTCATGATAGTGCATCACTGGATGTCAGGGGTACATGT
CTTGACTGGTGCCGCGACAACAACATTGAGTTCATTGAGGCTTGTGCATCTAATCCTGAT
TTTGACAAGTGCTTGTCAGTGGATGGGGATACTCAAGGGGTTGAACGTCTCTTTGGTGCA
CTTTCGGCACATATGTGGCCTGGAATGATTCTTCTCTGGTGATAAGATTACTGAACCTGT
GTTGTTACCTCATCATGGCCAAGAGTTTTCAGAAGAAGAATCCGAATATGAATTGGAGTA
TGAAGTGCTATCATCACGCTCAGCTACCGATCTATGTGAAGCGCATTCATACGACGCAGA
TGCTGGCGGATCCAACACCTCATCAGATGTAGAAAATAATAATATGGTGAATCCAATGAA
AGTTGAGCTTCGGTCTTCAGGGTCACAGAGTGAGGAGACTGACAGAGCAGATGAGAAAAC
TTTGGGCACAGAAGACGACAAATCCTGTGAGTTGGAAGAAGTGGAACAGTTGATGTCAGA
AATAGGGAACATCCGTGACAGCTTGCGGTTGATGCCTGATTTCCAGAGGAGGGAAATAGC
TGCAAATCTAGCCATGAAAATGGCTTCCATGTTTGGAGGAGGAGGAGGCGACGACAGTGA
TAACGAGGAAGTATCTGAGTGGAGCCCGTTTGTATCTTCAAGTATTTCAGCATGAACCAC
ATGAGTGCAAAGAGCGCATTGTTTAGCCGACCGAACTTTGTGTCTTTGATTCGTTTAGAC
TTGAAAGATGAAATAAGAAACTTCGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM66TF U 1
AF RR2AM66JQ C 240
BS 1 379 RR2AM66TF
BS 380 380 RR2AM66JQ
BS 381 797 RR2AM66TF
BS 798 1168 RR2AM66JQ

RD RR2AM66TF 797 0 0
GGGGGCGGAAGATGGAAGGAGGCAGACCGGGAGTTGTCGTCGTCGGTTCCCCTGGTGTCG
GCAAGCGCACTCTTCTCTCTCGATTGCTCTCTGTCGATTTTGAGGATTCATCATCATCTC
AAACACAACAAGTTCATGACTGGACGATTAACACCAAGTACTACACTGCGGATGTATCTG
TACGGATATCAAATATTTGCGACGACAATGACTACTCTCTCCCTCACTCACATCATCCAC
TTGTGGCGTTAGTTATGGTCTTCGACTTGAGTCAGATGTCAACTCTCGTTGCTCTTCAGG
ACTGGGTTTCTCATGCGGACATCACCATCAACAGTTTTGATATATTGTTGTGCATTGGGA
ACAAAGTTGATCTTCTCCC*ACCTCATGATAGTGCATCACTGGATGTCAGGGGTACATGT
CTTGACTGGTGCCGCGACAACAACATTGAGTTCATTGAGGCTTGTGCATCTAATCCTGAT
TTTGACAAGTGCTTGTCAGTGGATGGGGATACTCAAGGGGTTGAACGTCTCTTTGGTGCA
CTTTCGGCACATATGTGGCCTGGAATGATTCTTCTCTGGTGATAAGATTACTGAACCTGT
GTTGTTACCTCATCATGGCCAAGAGTTTTCAGAAGAAGAATCCGAATATGAATTGGAGTA
TGAAGTGCTATCATCACGCTCAGCTACCGATCTATGTGAAGCGCATTCATACGACGCAGA
TGCTGGCGGATCCAACACCTCATCAGATGTAGAAAATAATAATATGGTGAATCCAATGAA
AGTTGAGCTTCGGTCTT

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2AM66JQ 929 0 0
ACTTGT
GCGTTAGTTATGGTCT*CGACTTGAGTCAGATGTCAACTCTCGTTGCTCTTCAGGACTGG
GTTTCTCATGCGGACATCACCATCAACAGTTTTGATATATTGTTGTGCATTGGGAACAAA
GTTGATCTTCTCCCCACCTCATGATAGTGCATCACTGGATGTCAGGGGTACATGTCTTGA
CTGGTGCCGCGACAACAACATTGAGTTCATTGAGGCTTGTGCATCTAATCCTGATTTTGA
CAAGTGCTTGTCAGTGGATGGGGATACTCAAGGGGTTGAACGTCTCTTTGGTGCACTTTC
GGCACATATGTGGCCTGGAATGATTCTTCTCTGGTGATAAGATTACTGAACCTGTGTTGT
TACCTCATCATGGCCAAGAGTTTTCAGAAGAAGAATCCGAATATGAATTGGAGTATGAAG
TGCTATCATCAGGCTCAGCTACCGATCTATGTGAAGCGCATTCATACGACGCAGATGCTG
GCGGATCCAACACCTCATCAGATGTAGAAAATAATAATATGGTGAATCCAATGAAAGTTG
AGCTTCGGTCTTCAGGGTCACAGAGTGAGGAGACTGACAGAGCAGATGAGAAAACTTTGG
GCACAGAAGACGACAAATCCTGTGAGTTGGAAGAAGTGGAACAGTTGATGTCAGAAATAG
GGAACATCCGTGACAGCTTGCGGTTGATGCCTGATTTCCAGAGGAGGGAAATAGCTGCAA
ATCTAGCCATGAAAATGGCTTCCATGTTTGGAGGAGGAGGAGGCGACGACAGTGATAACG
AGGAAGTATCTGAGTGGAGCCCGTTTGTATCTTCAAGTATTTCAGCATGAACCACATGAG
TGCAAAGAGCGCATTGTTTAGCCGACCGAACTTTGTGTCTTTGATTCGTTTAGACTTGAA
AGATGAAATAAGAAACTTCGGTT

QA 7 929 7 929
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6948Contig1 536 2 5 U
AAATAACAATATCCCTTTTATTTTTCTTATTATAAAACGAGGATTATCTCTTTCTTTCAC
TCGTTCACGAACATCTACTAGTCCAAATTTCAATTGGTTACCCAAAAAAAAAAAAAAAAA
GCAATTACAATAACCGAAGCAAACCAAACCGGTCTAACAATATATATCACTTAATTATTA
TAAAACTAGTTAGTACCGAAACTGCCCTCCGGGGTAGGTCTGGCCAAAGGACCAACTGGG
AGGAGCAACATTGTACGACACGACACTTCGGCGATCACTTGTGGTGACAACAAACGACAG
ACTTTGGCCATTGAGATAAAAGTTGCTTTGCCAATTTTGCCCCCAACTTCTTGACATTAA
CTGCCATTTTGACCTTGACCCTCTCATCGACACAGAGTGTACGTCCCCGGCTCCACCCAC
GTTTGTGACCAGCACCAAGTTAAAGTACGAGTGACCGTTGATCGTGAACCTTATTCCGCC
TCTTCTATTGCACCGTACCCTTCTGTACATAACCGGAATGATACCGGACTTGTAGC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL22JQ U 2
AF RR2FL22TF C 1
BS 1 4 RR2FL22TF
BS 5 80 RR2FL22JQ
BS 81 81 RR2FL22TF
BS 82 255 RR2FL22JQ
BS 256 536 RR2FL22TF

RD RR2FL22JQ 254 0 0
AAA
AACAATATCCCTTTTATTTTTCTTATTATAAAACGAGGATTATCTCTTTCTTTCACTCGT
TCACGAACATCTACTATTCCAAATTTCAATTGGTTACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAA
TTACAATAACCGAAGCAAACCAAACCGGTCTAACAATATATATCACTTAATTATTATAAA
ACTAGTTAGTACCGAAACTGCCCTCCGGGGTAGGTCTGGCCAAAGGACCAACTGGGAGGA
GCAACATTGTA

QA 4 254 4 254
DS 

RD RR2FL22TF 536 0 0
AAATAACAATATCCCTTTTATTTTTCTTATTATAAAACGAGGATTATCTCTTTCTTTCAC
TCGTTCACGAACATCTACTAGTCCAAATTTCAATTGGTTACCCAAAAAAAAAAAAAAGAA
GCAATTACAATAACCGAAGCAAACCAAACCGGTCTAACAATATATATCACTTAATTATTA
TAGAACTAGTTAGTACCGAAACTGCCCTCCGGTGTAGGTCTGGCCAAAGGACCAACTGGG
AGGAGCAACATTGTACGACACGACACTTCGGCGATCACTTGTGGTGACAACAAACGACAG
ACTTTGGCCATTGAGATAAAAGTTGCTTTGCCAATTTTGCCCCCAACTTCTTGACATTAA
CTGCCATTTTGACCTTGACCCTCTCATCGACACAGAGTGTACGTCCCCGGCTCCACCCAC
GTTTGTGACCAGCACCAAGTTAAAGTACGAGTGACCGTTGATCGTGAACCTTATTCCGCC
TCTTCTATTGCACCGTACCCTTCTGTACATAACCGGAATGATACCGGACTTGTAGC

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 2

CO CL6949Contig1 864 2 4 U
AACATGAAAAGTGGTTTTTAGTTTCTTAAGAAGATGGTACAGAAACTGTCTCAAATATTT
GAAGAATGATACAAATCTCAAAGCTTGTCCAGACAAAGAAAAAGACAAAAGAAAGAACAC
ATGTTTCAAATATAAACTAAACAAGAAACAATAAGAGAATCATCCAAATAGTTCAAAAAA
AATCAAACTCAAGATAATTGCTCTGGTCAGATCTCACGCTTGTGGATGCAGCAAAAGCAG
GTGTAGCAGGAGCATGTTTCACCGCCGGTTCAAGATCAACAGGCTTAGGAACTTCAGGTG
GAGTGGCACACCGAACCAGAGCCCAATTCACTCCTTCAAAGAAAGGATGTTGCTTCATCT
CCGTTGCTCCACGCTTGTAAGCTAACCTATGCTGTGGCTCCTTCACAAGCAAACTCCTTA
TCAAATCTCTAGCCGCAAAGCTAACAACCGGAGACTCAGGGAACCTCAGAGGCTGACCAA
CCACATTGAACAGCGTTGCTCTATTCCCTGAGCCTTTAAACGGTGTTTTACCGAACAACA
ACTCATAAAGAAAGATCCCAAATGTCCACCAGTCAACCGCGCTTCCATGCCCTTCGCCTT
TGATGATCTCTGGAGCTAAGTACTCGTGCGTCCCCACAAATGACATGGAACGGGCGCTTG
TTGGCTCTGCAACGAGCTCTGGTAATGGAGTTACTTGGTGGTTTCCGTTATCCGTCTTTG
CCTTCTTGTCCTTCTTAGACTTGGATGAGAAGAACCGAGGACCAAAGCAAGAGGTTGGAG
CCATTGAGATGCAAGATGGCTGCTGGATGCAAGCGGGTTGTTGAGAGCAAGAAACTGAGT
TCTTTGACAGCCTTCGGATCCAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G517JQ U 1
AF RR2FN18JQ U 39
BS 1 106 RR2G517JQ
BS 107 107 RR2FN18JQ
BS 108 710 RR2G517JQ
BS 711 864 RR2FN18JQ

RD RR2G517JQ 710 0 0
AACATGAAAAGTGGTTTTTAGTTTCTTAAGAAGATGGTACAGAAACTGTCTCAAATATTT
GAAGAATGATACAAATCTCAAAGCTTGTCCAGACAAAGAAAAAGACGAAAGAAAGAACAC
ATGTTTCAAATATAAACTAAACAAGAAACAATAAGAGAATCATCCAAATAGTTCAAAAAA
AATCAAACTCAAGATAATTGCTCTGGTCAGATCTCACGCTTGTGGATGCAGCAAAAGCAG
GTGTAGCAGGAGCATGTTTCACCGCCGGTTCAAGATCAACAGGCTTAGGAACTTCAGGTG
GAGTGGCACACCGAACCAGAGCCCAATTCACTCCTTCAAAGAAAGGATGTTGCTTCATCT
CCGTTGCTCCACGCTTGTAAGCTAACCTATGCTGTGGCTCCTTCACAAGCAAACTCCTTA
TCAAATCTCTAGCCGCAAAGCTAACAACCGGAGACTCAGGGAACCTCAGAGGCTGACCAA
CCACATTGAACAGCGTTGCTCTATTCCCTGAGCCTTTAAACGGTGTTTTACCGAACAACA
ACTCATAAAGAAAGATCCCAAATGTCCACCAGTCAACCGCGCTTCCATGCCCTTCGCCTT
TGATGATCTCTGGAGCTAAGTACTCGTGCGTCCCCACAAATGACATGGAACGGGCGCTTG
TTGGCTCTGCAACGAGCTCTGGTAATGGAGTTACTTGGTGGTTTCCGTTA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2FN18JQ 826 0 0
ACAGAAACTGTCTCAGATATTTGAAGAATGATACAAATCTCAGAGCTTGTCCAGACAAAG
AAAAAGACAAAAGAAAGAACACATGTTTCAAATATAAACTAAACAAGAAACAATAAGAGA
ATCATCCAAATAGTTCAGAAGAAATCAAACTCAAGATAATTGCTCTGGTCAGATCTCACG
CTTGTGGATGCAGCAGAAGCAGGTGTAGCAGGAGCATGTTTCACCGCCGGTTCAAGATCA
ACAGGCTTAGGAACTTCAGGTGGAGTGGCACACCGAACCAGAGCCCAATTCACTCCTTCA
AAGAAAGGATGTTGCTTCATCTCCGTTGCTCCACGCTTGTAAGCTAACCTATGCTGTGGC
TCCTTCACAAGCAAACTCCTTATCAAATCTCTAGCCGCAAAGCTAACAACCGGAGACTCA
GGGAACCTCAGAGGCTGACCAACCACATTGAACAGCGTTGCTCTATTCCCTGAGCCTTTA
AACGGTGTTTTACCGAACAACAACTCATAAAGAAAGATCCCAAATGTCCACCAGTCAACC
GCGCTTCCATGCCCTTCGCCTTTGATGATCTCTGGAGCTAAGTACTCGTGCGTCCCCACA
AATGACATGGAACGGGCGCTTGTTGGCTCTGCAACGAGCTCTGGTAATGGAGTTACTTGG
TGGTTTCCGTTATCCGTCTTTGCCTTCTTGTCCTTCTTAGACTTGGATGAGAAGAACCGA
GGACCAAAGCAAGAGGTTGGAGCCATTGAGATGCAAGATGGCTGCTGGATGCAAGCGGGT
TGTTGAGAGCAAGAAACTGAGTTCTTTGACAGCCTTCGGATCCAGG

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL6950Contig1 828 2 12 U
GGGATGCTTACTTTATCTCTCTCTCTATGATTGGAAATTCCAGGAAGAAGAACCAACACG
TACCGATTTCATTTTGAATCACTATCGTGGCAAAGGTAATTGAGTTCAGTGGCGGAGCCA
GCCAAATCTTTGGCAAGGGTCAGTTCAATAGTTAACATAAATATCACAAGGGTCAAGAAG
GCTATTTTACTATATTTTCTCAGTTTTTTTAGTAAAAGTACAAGTAAAAAATGATTTTTT
TTTAATTTTTACATGGGTCATATGACCACTTCCCTCTAACCTGCCTCCGCCACTGATTGA
GTTTCATTATTTATTTTCTCTTTGCTTTTGAATATACACTCTAAATCGAATTGTATTATT
GTTTGGAATCTAATTGATTTACCTAAAATCTCAATTTGTTTCATTTTTTGGATGCATGTC
GTTAGTTTGATATGCATGGAATTTACTGGGATAGAAGTTATAAGAGATGTATTTGCTACT
GAACATGCATTAATACTATTCAACTTGTTCTGGTTAAGTTTGAGGAATTGCCACTGCAGG
GAGAGCAGGTACGTGTGACTTCTATTGATTGTAATCTTGTTAGTTTTGCCATTGCTTAAG
TTTCTGTTATGTTTCCTATTTATCTGAGTGACAAGTAAATTAATGGGCTAAAGTTTGTGG
ACTGGGTAATAAGTATTTACCCTAATCTAAGTTGTAACTAGTATATAAGGAAGTGTAAGA
ATTAGAGAGAGCTTTATCTAAAATTTAGATCACTCATGATCATGGAGAGGTGAGATTACT
CTCTAGCAATTCTCTCAAGTTTGTAAACACTTTTATTACCAATACAAT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD42TF U 1
AF RR2DD42JQ C 4
BS 1 696 RR2DD42TF
BS 697 697 RR2DD42JQ
BS 698 709 RR2DD42TF
BS 710 710 RR2DD42JQ
BS 711 717 RR2DD42TF
BS 718 718 RR2DD42JQ
BS 719 742 RR2DD42TF
BS 743 744 RR2DD42JQ
BS 745 776 RR2DD42TF
BS 777 777 RR2DD42JQ
BS 778 797 RR2DD42TF
BS 798 828 RR2DD42JQ

RD RR2DD42TF 805 0 0
GGGATGCTTACTTTATCTCTCTCTCTATGATTGGAAATTCCAGGAAGAAGAACCAACACG
TACCGATTTCATTTTGAATCACTATCGTGGCAAAGGTAATTGAGTTCAGTGGCGGAGCCA
GCCAAATCTTTGGCAAGGGTCAGTTCAATAGTTAACATAAATATCACAAGGGTCAAGAAG
GCTATTTTACTATATTTTCTCAGTTTTTTTAGTAAAAGTACAAGTAAAAAATGATTTTTT
TTTAATTTTTACATGGGTCATATGACCACTTCCCTCTAACCTGCCTCCGCCACTGATTGA
GTTTCATTATTTATTTTCTCTTTGCTTTTGAATATACACTCTAAATCGAATTGTATTATT
GTTTGGAATCTAATTGATTTACCTAAAATCTCAATTTGTTTCATTTTTTGGATGCATGTC
GTTAGTTTGATATGCATGGAATTTACTGGGATAGAAGTTATAAGAGATGTATTTGCTACT
GAACATGCATTAATACTATTCAACTTGTTCTGGTTAAGTTTGAGGAATTGCCACTGCAGG
GAGAGCAGGTACGTGTGACTTCTATTGATTGTAATCTTGTTAGTTTTGCCATTGCTTAAG
TTTCTGTTATGTTTCCTATTTATCTGAGTGACAAGTAAATTAATGGGCTAAAGTTTGTGG
ACTGGGTAATAAGTATTTACCCTAATCTAAGTTGTA*CTAGTATATAAG*AAGTGTA*GA
ATTAGAGAGAGCTTTATCTAAA**TTAGATCACTCATGATCATGGAGAGGTGAGAT*ACT
CTCTAGCAATTCTCTCA
GTTTGTAA

QA 1 797 1 797
DS 

RD RR2DD42JQ 825 0 0
ATGCTTACTTTATCTCTCTCTCTATGATTGGAAATTCCAGGAAGAAGAACCAACACGTAC
CGATTTCATTTTGAATCACTATCGTGGCAAAGGTAATTGAGTTCAGTGGCGGAGCCAGCC
AAATCTTTGGCAAGGGTCAGTTCAATAGTTAACATAAATATCACAAGGGTCAAGAAGGCT
ATTTTACTATATTTTCTCAGTTTTTTTAGTAAAAGTACAAGTAAAAAATGATTTTTTTTT
AATTTTTACATGGGTCATATGACCACTTCCCTCTAACCTGCCTCCGCCACTGATTGAGTT
TCATTATTTATTTTCTCTTTGCTTTTGAATATACACTCTAAATCGAATTGTATTATTGTT
TGGAATCTAATTGATTTACCTAAAATCTCAATTTGTTTCATTTTTTGGATGCATGTCGTT
AGTTTGATATGCATGGAATTTACTGGGATAGAAGTTATAAGAGATGTATTTGCTACTGAA
CATGCATTAATACTATTCAACTTGTTCTGGTTAAGTTTGAGGAATTGCCACTGCAGGGAG
AGCAGGTACGTGTGACTTCTATTGATTGTAATCTTGTTAGTTTTGCCATTGCTTAAGTTT
CTGTTATGTTTCCTATTTATCTGAGTGACAAGTAAATTAATGGGCTAAAGTTTGTGGACT
GGGTAATAAGTATTTACCCTAATCTAAGTTGTAACTAGTATATAAGGAAGTGTAAGAATT
AGAGAGAGCTTTATCTAAAATTTAGATCACTCATGATCATGGAGAGGTGAGATTACTCTC
TAGCAATTCTCTCAAGTTTGTAAACACTTTTATTACCAATACAAT

QA 1 825 1 825
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6952Contig1 823 2 2 U
GGACATATACCAATAAACAGTTTCTTTCTCTCGATCTTTATAGTAATTCTTCCCCAAAAA
GTATATTATTATAAAGAAAAATGGGTATTTCCCGACAGAACCGGGTTGAAGTCAAGTCGA
TGCTAACCGCGATATCAAGCAAGCCATCTCGATCGGGCCAGGTACACACGTTTTCCGCTT
TAGACAACGCTGTGACTCCCCATACGGTCCATGTCATCTTCTACTATCCTCGTAGTCCAT
TCAAATCCTTTGACCTTGACTCGGTTCGGATTCCGTTGTCGGAGCTCCTCTCGATGTACC
CGCCCGTAATTGGTCGGGTCAATAAAACCCAGGAAGGGATCTTGGAGGTCAAGTGTAACG
ATGCTGGACTTCGAGTCTTGAAAGCCAAAGTTTCTGTTGGTATTGATGAGTGGCTGAGAT
CAGCTGATGGACATGAGGAATCTGATCTAACGGCTTGGGAAGACATGCCAAAAGATCCTA
GTACTTGGTCGCCGTTTCGCATGCAGATCAATGAATTCGAAGGAGGAGGTGTGGCTATAG
GTCTGAGCTGTCCACACATGCATGCAGACGCAACAACCTTAACAGTTCTCTTAAAGTCAT
GGACGGAAGCTCAACGCCGTCAGTGTATTATCCATCCTCCTTCCTTTTCACCTCTGCCCT
ACCACTTAACGGATACTGACGCCGTTAATTCCAACCGCGACTCCTTCTCCAAGCCCATCG
CTGGGCCCGTATCAACCAAAACAGCCACCGCCACATTTAGATTCTCTGGCTCCGCCTTCA
CGAGATGTATCAAGGAACACTCCATCCACGAGATATCCCCCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F320TF U 1
AF RR2B436TF U 5
BS 1 750 RR2F320TF
BS 751 823 RR2B436TF

RD RR2F320TF 750 0 0
GGACATATACCAATAAACAGTTTCTTTCTCTCGATCTTTATAGTAATTCTTCCCCAAAAA
GTATATTATTATAAAGAAAAATGGGTATTTCCCGACAGAACCGGGTTGAAGTCAAGTCGA
TGCTAACCGCGATATCAAGCAAGCCATCTCGATCGGGCCAGGTACACACGTTTTCCGCTT
TAGACAACGCTGTGACTCCCCATACGGTCCATGTCATCTTCTACTATCCTCGTAGTCCAT
TCAAATCCTTTGACCTTGACTCGGTTCGGATTCCGTTGTCGGAGCTCCTCTCGATGTACC
CGCCCGTAATTGGTCGGGTCAATAAAACCCAGGAAGGGATCTTGGAGGTCAAGTGTAACG
ATGCTGGACTTCGAGTCTTGAAAGCCAAAGTTTCTGTTGGTATTGATGAGTGGCTGAGAT
CAGCTGATGGACATGAGGAATCTGATCTAACGGCTTGGGAAGACATGCCAAAAGATCCTA
GTACTTGGTCGCCGTTTCGCATGCAGATCAATGAATTCGAAGGAGGAGGTGTGGCTATAG
GTCTGAGCTGTCCACACATGCATGCAGACGCAACAACCTTAACAGTTCTCTTAAAGTCAT
GGACGGAAGCTCAACGCCGTCAGTGTATTATCCATCCTCCTTCCTTTTCACCTCTGCCCT
ACCACTTAACGGATACTGACGCCGTTAATTCCAACCGCGACTCCTTCTCCAAGCCCATCG
CTGGGCCCGTATCAACCAAAACAGCCACCG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2B436TF 819 0 0
GG
ATACCAATAAACAGTTTCTTTCTCTCGATCTTTATAGTAATTCTTCCCCAAAAAGTATAT
TATTATAAAGAAAAATGGGTATTTCCCGACAGAACCGGGTTGAAGTCAAGTCGATGCTAA
CCGCGATATCAAGCAAGCCATCTCGATCGGGCCAGGTACACACGTTTTCCGCTTTAGACA
ACGCTGTGACTCCCCATACGGTCCATGTCATCTTCTACTATCCTCGTAGTCCATTCAAAT
CCTTTGACCTTGACTCGGTTCGGATTCCGTTGTCGGAGCTCCTCTCGATGTACCCGCCCG
TAATTGGTCGGGTCAATAAAACCCAGGAAGGGATCTTGGAGGTCAAGTGTAACGATGCTG
GACTTCGAGTCTTGAAAGCCAAAGTTTCTGTTGGTATTGATGAGTGGCTGAGATCAGCTG
ATGGACATGAGGAATCTGATCTAACGGCTTGGGAAGACATGCCAAAAGATCCTAGTACTT
GGTCGCCGTTTCGCATGCAGATCAATGAATTCGAAGGAGGAGGTGTGGCTATAGGTCTGA
GCTGTCCACACATGCATGCAGACGCAACAACCTTAACAGTTCTCTTAAAGTCATGGACGG
AAGCTCAACGCCGTCAGTGTATTATCCATCCTCCTTCCTTTTCACCTCTGCCCTACCACT
TAACGGATACTGACGCCGTTAATTCCAACCGCGACTCCTTCTCCAAGCCCATCGCTGGGC
CCGTATCAACCAAAACAGCCACCGCCACATTTAGATTCTCTGGCTCCGCCTTCACGAGAT
GTATCAAGGAACACTCCATCCACGAGATATCCCCCAA

QA 3 819 3 819
DS 



AS 1 2

CO CL6953Contig1 822 2 4 U
AGAAGAAGCAAATCAGAGCTATGGCGGAGGAAGAGAACGGGAGCGTAGCGAAACCAAGAG
CCAAGAAAGACGTTGCTGCAGGGAGGTTGATCGATACCTATGCGGCACAATGCGAAAACT
GTCACCAGTGGAGAGTCATTGATAGCCAGGAGGAGTACGAGGATATCAGAAGTCGTATGA
TCGATGACCCTTTCACCTGCGACAAGAAGAAACAAGTCTCTTGTGAAGACCCTGCGGATC
TTGACTATGACTCCTCTCGTACCTGGGTCATCGACAAGCCTGGCCTCCCCAAAACCCCGA
AAGGTTTCAAGAGGAGCCTTGTCCTCAGAAAAGACTACTCTAAGATGGATACTTACTACT
TCACTCCCACCGGTAAAAAGCTTAGGAGCCGCAATGAAGTCGCTTCCTACGTTGAAGCCA
ATCCTGAGTTCAAGGGTGCGCCTCTTGGAGACTTCTCTTTCACCGTGCCCAAGGTGATGG
AGGACACCTTTCCTCCTGATCCTAAAGTTGCCTCTCCTCCTGTTGCTGCTAAAGTTGTAT
CTCCTGTTTCTACACCTTGTGATGATGTTTCAGACAAGAGCACCAAATCGAAGCAGATCA
AAGGAAAATTCAAGCTTGAAGAAGAGACCCTCTCCGGTTCTCCACACGTCTCTCCTGCTC
CCTAGTCTTAATGCATTGCTGAGTTTGTTTGTAGATTTGTTTTTTTTTTTTGGTCTCAGA
CTGTTATGATATATGTCTACTAAGTTGGATATTTATTTTTACTTTTTTGCAAAGAAGCTA
AGTCGCCTCTCTGACTCTCTCTAATAAGAAGTCGTAGTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C368TF U 1
AF RR2C368JQ C 67
BS 1 607 RR2C368TF
BS 608 608 RR2C368JQ
BS 609 632 RR2C368TF
BS 633 822 RR2C368JQ

RD RR2C368TF 632 0 0
AGAAGAAGCAAATCAGAGCTATGGCGGAGGAAGAGAACGGGAGCGTAGCGAAACCAAGAG
CCAAGAAAGACGTTGCTGCAGGGAGGTTGATCGATACCTATGCGGCACAATGCGAAAACT
GTCACCAGTGGAGAGTCATTGATAGCCAGGAGGAGTACGAGGATATCAGAAGTCGTATGA
TCGATGACCCTTTCACCTGCGACAAGAAGAAACAAGTCTCTTGTGAAGACCCTGCGGATC
TTGACTATGACTCCTCTCGTACCTGGGTCATCGACAAGCCTGGCCTCCCCAAAACCCCGA
AAGGTTTCAAGAGGAGCCTTGTCCTCAGAAAAGACTACTCTAAGATGGATACTTACTACT
TCACTCCCACCGGTAAAAAGCTTAGGAGCCGCAATGAAGTCGCTTCCTACGTTGAAGCCA
ATCCTGAGTTCAAGGGTGCGCCTCTTGGAGACTTCTCTTTCACCGTGCCCAAGGTGATGG
AGGACACCTTTCCTCCTGATCCTAAAGTTGCCTCTCCTCCTGTTGCTGCTAAAGTTGTAT
CTCCTGTTTCTACACCTTGTGATGATGTTTCAGACAAGAGCACCAAATCGAAGCAGATCA
AAGGAAA*TTCAAGCTTGAAGAAGAGACCCTC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2C368JQ 756 0 0
AAGACGTTGCTGCAGGGAGGTTGATCGATACCTATGCGGCACAATGCGAAAACTGTCACC
AGTGGAGAGTCATTGATAGCCAGGAGGAGTACGAGGATATCAGAAGTCGTATGATCGATG
ACCCTTTCACCTGCGACAAGAAGAAACAAGTCTCTTGTGAAGACCCTGCGGATTTTGACT
ATGACTCCTCTCGTACCTGGGTCATCGACAAGCCTGGCCTCCCCAAAACCCCGAAAGGTT
TCAAGAGGAGCCTTGTCCTCAGAAAAGACTACTTTAAGATGGATACTTACTACTTCACTC
CCACCGGTAAAAAGCTTAGGAGCCGCAATGAAGTCGCTTCCTACGTTGAAGCCAATCCTG
AGTTCAAGGGTGCGCCTCTTGGAGACTTTTCTTTCACCGTGCCCAAGGTGATGGAGGACA
CCTTTCCTCCTGATCCTAAAGTTGCCTCTCCTCCTGTTGCTGCTAAGGTTGTATCTCCTG
TTTTTACACCTTGTGATGATGTTTCAGACAAGAGCACCAAATCGAAGCAGATCAAAGGAA
AATTCAAGCTTGAAGAAGAGACCCTCTCCGGTTCTCCACACGTCTCTCCTGCTCCCTAGT
CTTAATGCATTGCTGAGTTTGTTTGTAGATTTGTTTTTTTTTTTTGGTCTCAGACTGTTA
TGATATATGTCTACTAAGTTGGATATTTATTTTTACTTTTTTGCAAAGAAGCTAAGTCGC
CTCTCTGACTCTCTCTAATAAGAAGTCGTAGTTTTG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL6954Contig1 912 2 2 U
GGATCTTCGATGGGTTTCTCCACCGAGGCTAGGAACCCTCTTCTTGTCGTCTCGTCACCT
CCATCTCCGACAGTCCCTTTTCCGTCCACAACCAGCTTCGTCTCCGTTACCTCTACCGTA
ACTCAACTTTCTCTCCGGCATCCTCCACGAGAACTCACCTTCGTCTCTGTGTTTCTCGAC
AATTCCGAGATCGATTTCACCTCAGTCATATCTGGATTCAATTGCAAGATACTCTAATAT
GCGTGGGAAAAACCATCATTGATCTGATGAAAAGGGGAGCTTTGAATCTATCGAAGGTTC
AGTTTATGGTTCTTGATGAAGCTGGTCGATTGATCTCGTTCATGGTAAAGGAGGAAAACT
CTTTGTCGTTCAAGTGGTTATGGTGGTGGTGGTAGTGGTAGATATGGTGGTGATCGTTTA
GGAGGATCAGACAACCGTTATTCTGGTGGCTGTTCTTCCAGTTACATGGGCTTTGGTTCA
GGAGGCTCAAATTGTTCATCAGGTTTTAGGGGATTTGGTTCAGACCGTTCACAGTCAAGT
GGAAAGAGCAGCTTTGGTGGTTTTGTATTAAAAGATCTTAACATATCTTACTGAGAAGTG
CTGCGTGAGGGCTTGGTGACTTGAGACTTTGAGTAGAGTTTAGTTATAAGCTATATATAA
ATATGTAGCTCTGTGCCTCGTAGAAAAACATGTTTTATTTTGAAGTTGTTGTCATCACTA
ATTTATTTTCTACACTGGTAGAAAAATATAATTGTTCCTTTCTATTTGTATTTGGCCACT
TCGATAAACTTGTAACAATTCTTTCGTCCGTCAGAAAGACAAGAGTATAAACCAAATCAA
CTCTTTGGATTTGATTTAATTTGGTTTGTTCTCAACTTATCTCAATGGTAAGCCAGAAGA
ACCGTATGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DC91TF U 1
AF RR2DC91JQ C 177
BS 1 454 RR2DC91TF
BS 455 912 RR2DC91JQ

RD RR2DC91TF 454 0 0
GGATCTTCGATGGGTTTCTCCACCGAGGCTAGGAACCCTCTTCTTGTCGTCTCGTCACCT
CCATCTCCGACAGTCCCTTTTCCGTCCACAACCAGCTTCGTCTCCGTTACCTCTACCGTA
ACTCAACTTTCTCTCCGGCATCCTCCACGAGAACTCACCTTCGTCTCTGTGTTTCTCGAC
AATTCCGAGATCGATTTCACCTCAGTCATATCTGGATTCAATTGCAAGATACTCTAATAT
GCGTGGGAAAAACCATCATTGATCTGATGAAAAGGGGAGCTTTGAATCTATCGAAGGTTC
AGTTTATGGTTCTTGATGAAGCTGGTCGATTGATCTCGTTCATGGTAAAGGAGGAAAACT
CTTTGTCGTTCAAGTGGTTATGGTGGTGGTGGTAGTGGTAGATATGGTGGTGATCGTTTA
GGAGGATCAGACAACCGTTATTCTGGTGGCTGTT

QA 1 454 1 454
DS 

RD RR2DC91JQ 736 0 0
CGACAATTCCGAGATCGATTTCACCTCAGTCATATCTGGATTCAATTGCAAGATACTCTA
ATATGCGTGGGAAAAACCATCATTGATCTGATGAAAAGGGGAGCTTTGAATCTATCGAAG
GTTCAGTTTATGGTTCTTGATGAAGCTGGTCGATTGATCTCGTTCATGGTAAAGGAGGAA
AACTCTTTGTCGTTCAAGTGGTTATGGTGGTGGTGGTAGTGGTAGATATGGTGGTGATCG
TTTAGGAGGATCAGACAACCGTTATTCTGGTGGCTGTTCTTCCAGTTACATGGGCTTTGG
TTCAGGAGGCTCAAATTGTTCATCAGGTTTTAGGGGATTTGGTTCAGACCGTTCACAGTC
AAGTGGAAAGAGCAGCTTTGGTGGTTTTGTATTAAAAGATCTTAACATATCTTACTGAGA
AGTGCTGCGTGAGGGCTTGGTGACTTGAGACTTTGAGTAGAGTTTAGTTATAAGCTATAT
ATAAATATGTAGCTCTGTGCCTCGTAGAAAAACATGTTTTATTTTGAAGTTGTTGTCATC
ACTAATTTATTTTCTACACTGGTAGAAAAATATAATTGTTCCTTTCTATTTGTATTTGGC
CACTTCGATAAACTTGTAACAATTCTTTCGTCCGTCAGAAAGACAAGAGTATAAACCAAA
TCAACTCTTTGGATTTGATTTAATTTGGTTTGTTCTCAACTTATCTCAATGGTAAGCCAG
AAGAACCGTATGAACC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6956Contig1 594 2 2 U
GCGAACCCGCCTGAGCTCGGATCTTCCCCTCCTGCCCCACCCGGCTCATCATCACCAAAC
CCATCTCTTCCAATCACCTCCCCAACTCCTCCGGCGCCGATCGTAAACCCGAATTCGCCT
CCGCCTCCGCCTCCGTCTAGTCTGAATCCTCCGCCGCAGTTTTCACCTCCTCCGCCGGAT
TCGGATACAACCGCCGCACCTCCTCCGCCTGCATCGCAGTCAACAATCGCGCCGCCACCT
CCAGCAGAAGAATCGGCGTCACCGCCGCTAAATCCGCCGAGCTCCGTAGTGAATACTCCC
GCGCCAGTGCATGCGAAAGCTGGTGAACGACTAAAGTAGAGACCATACATTCCAGTTCTT
GAACTTGATTCGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGATTAATTAGATCAAATGTTCTAATCTT
TAAATCAAGGTTAAACTGCATGTCCATACTTATTCCAATGGTCTAATCTTCGTGGAGTGT
GAGTTGTCAAAACATCTTTATCATAGGTTTTATGACAGCAAATAAATTTTAATTTTGTTT
CGATCTACAATTGTAAAGTTAAATTTTCCTCTCAAAATAAATTTTTATTGATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FV90JQ C 1
AF RR2FV90TF U 51
BS 1 50 RR2FV90JQ
BS 51 594 RR2FV90TF

RD RR2FV90JQ 594 0 0
GCGAACCCGCCTGAGCTCGGATCTTCCCCTCCTGCCCCACCCGGCTCATCATCACCAAAC
CCATCTCTTCCAATCACCTCCCCAACTCCTCCGGCGCCGATCGTAAACCCGAATTCGCCT
CCGCCTCCGCCTCCGTCTAGTTTGAATCCTCCGCCGCAGTTTTCACCTCCTCCGCCGGAT
TCGGATACAACCGCCGCACCTCCTCCGCCTGCATCGCAGTCAACAATCGCGCCGCCACCT
CCAGCAGAAGAATCGGCGTCACCGCCGCTAAATCCGCCGAGCTCCGTAGTGAATACTCCC
GCGCCAGTGCATGCGAAAGCTGGTGAACGACTAAAGTAGAGACCATACATTCCAGTTCTT
GAACTTGATTCGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGATTAATTAGATCAAATGTTCTAATCTT
TAAATCAAGGTTAAACTGCATGTCCATACTTATTCCAATGGTCTAATCTTCGTGGAGTGT
GAGTTGTCAAAACATCTTTATCATAGGTTTTATGACAGCAAATAAATTTTAATTTTGTTT
CGATCTACAATTGTAAAGTTAAATTTTCCTCTCAAAATAAATTTTTATTGATTG

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2FV90TF 544 0 0
ATCACCAAACCCATCTCTTCCAATCACCTCCCCAACTCCTCCGGCGCCGATCGTAAACCC
GAATTCGCCTCCGCCTCCGCCTCCGTCTAGTCTGAATCCTCCGCCGCAGTTTTCACCTCC
TCCGCCGGATTCGGATACAACCGCCGCACCTCCTCCGCCTGCATCGCAGTCAACAATCGC
GCCGCCACCTCCAGCAGAAGAATCGGCGTCACCGCCGCTAAATCCGCCGAGCTCCGTAGT
GAATACTCCCGCGCCAGTGCATGCGAAAGCTGGTGAACGACTAAAGTAGAGACCATACAT
TCCAGTTCTTGAACTTGATTCGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGATTAATTAGATCAAATG
TTCTAATCTTTAAATCAAGGTTAAACTGCATGTCCATACTTATTCCAATGGTCTAATCTT
CGTGGAGTGTGAGTTGTCAAAACATCTTTATCATAGGTTTTATGACAGCAAATAAATTTT
AATTTTGTTTCGATCTACAATTGTAAAGTTAAATTTTCCTCTCAAAATAAATTTTTATTG
ATTG

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 2

CO CL6957Contig1 824 2 4 U
TGAGTTCCGTACATACCACACTCCACTTAACACACAAGGTGACTATGTTAATTCACTACG
AGCTGCCCGGGAGTTCAGTTCAAGAATGTCTAATTTGTTGAAGATTGACATCTTTCCATA
TTCTGTGTCCTACATTTTCTTTGAGCAATATCTGAATATCTGGACCGTAGCTTTGTCAAA
CCTGGCTATAGCAATCGGTGCTATATTTGTTGTTTGTTTATTAATCACTTCCAGTGCCTG
GAGTTCAGCCATCATTGTTCTTGTGTTAGTGATGATACTCGCGGACCTCATGGGTGTAAT
GGTGGTTTTGGGAATTCAACTCAATGCAGTTTCTGCTGTGAATTTGATAATGTCAATCGG
GATTGCTGTAGAATTCTGCGTTCACATATCACATGCCTTCCTGATGAGTAATGGGAACAG
AGAACAAAGAGCGAGGCAGGCACTGGAAACCATGGGAGCTTCGGTTTTCAGTGGGATCAC
ACTCACAAAACTTGTTGGAGTGATGGTGCTTTGCTTCGCACGATCGGAGATATTTGTGGT
GTATTACTTTCAAATGTACTTGGCTTTGGTTATAATCGGCTTCTTGCATGGGCTCGTTTT
CTTACCTGTCATACTAAGTTTAGCTGGGCCACCACAGATACACTTGGACACGGAGGAGGA
GCAGCAGAGGAGAGACGAAGCTTCTTCTTCCCTATTGAACTGAGTAACTCGACAGACTTA
TCAAGTCTGAAAAACTTTAACATGTACTCTTATGATTCAAATAAGTCTTAGACAGTGTCG
AGAACACTAAAGAAGCAATACTGTATGCTCTGTATCAAAGTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA32TF U 1
AF RR2CA32JQ C 134
BS 1 669 RR2CA32TF
BS 670 670 RR2CA32JQ
BS 671 682 RR2CA32TF
BS 683 824 RR2CA32JQ

RD RR2CA32TF 682 0 0
TGAGTTCCGTACATACCACACTCCACTTAACACACAAGGTGACTATGTTAATTCACTACG
AGCTGCCCGGGAGTTCAGTTCAAGAATGTCTAATTTGTTGAAGATTGACATCTTTCCATA
TTCTGTGTCCTACATTTTCTTTGAGCAATATCTGAATATCTGGACCGTAGCTTTGTCAAA
CCTGGCTATAGCAATCGGTGCTATATTTGTTGTTTGTTTATTAATCACTTCCAGTGCCTG
GAGTTCAGCCATCATTGTTCTTGTGTTAGTGATGATACTCGCGGACCTCATGGGTGTAAT
GGTGGTTTTGGGAATTCAACTCAATGCAGTTTCTGCTGTGAATTTGATAATGTCAATCGG
GATTGCTGTAGAATTCTGCGTTCACATATCACATGCCTTCCTGATGAGTAATGGGAACAG
AGAACAAAGAGCGAGGCAGGCACTGGAAACCATGGGAGCTTCGGTTTTCAGTGGGATCAC
ACTCACAAAACTTGTTGGAGTGATGGTGCTTTGCTTCGCACGATCGGAGATATTTGTGGT
GTATTACTTTCAAATGTACTTGGCTTTGGTTATAATCGGCTTCTTGCATGGGCTCGTTTT
CTTACCTGTCATACTAAGTTTAGCTGGGCCACCACAGATACACTTGGACACGGAGGAGGA
GCAGCAGAG*AGAGACGAAGCT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2CA32JQ 691 0 0
ATTTTCTTTGAGCAATATCTGAATATCTGGACCGTAGCTTTGTCAAACCTGGCTATAGCA
ATCGGTGCTATATTTGTTGTTTGTTTATTAATCACTTCCAGTGCCTGGAGTTCAGCCATC
ATTGTTCTTGTGTTAGTGATGATACTCGCGGACCTCATGGGTGTAATGGTGGTTTTGGGA
ATTCAACTCAATGCAGTTTCTGCTGTGAATTTGATAATGTCAATCGGGATTGCTGTAGAA
TTTTGCGTTCACATATCACATGCCTTCCTGATGAGTAATGGGAACAGAGAACAAAGAGCG
AGGCAGGCACTGGAAACCATGGGAGCTTCGGTTTTCAGTGGGATCACACTCACAAAACTT
GTTGGAGTGATGGTGCTTTGCTTCGCACGATCGGAGATATTTGTGGTGTATTACTTTCAA
ATGTACTTGGCTTTGGTTATAATCGGCTTCTTGCATGGGCTCGTTTTCTTACCTGTCATA
CTAAGTTTAGCTGGGCCACCACAGATACACTTGGACACGGAGGAGGAGCAGCAGAGGAGA
GACGAAGCTTCTTCTTCCCTATTGAACTGAGTAACTCGACAGACTTATCAAGTCTGAAAA
ACTTTAACATGTACTCTTATGATTCAAATAAGTCTTAGACAGTGTCGAGAACACTAAAGA
AGCAATACTGTATGCTCTGTATCAAAGTTTA

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL6958Contig1 695 2 2 U
TGAATTCAAACATAACATATGTAACATTCAGAGTAAACAGAAACTGAAGTAAATACATAT
GTAAAAATGGTGTGGAAGTAACTCAGTGTTTAGTCTCTCAGTCAATGATATTGCGGCTGT
TCAACTGGTCCTCGAATCTACTACAAGAACCAACTCTCATCTCAGTGCTCATATCATTCT
CAGGCGCTGGGTAATAGTCTTCTCTAAGTTGCACATCCCTTAAGTTAGGGATCCTCAACA
AAAAATTCATGAAATGCTCATGAGCCGTTCCATGGATGAAAAGCTTCCTCAGAGTTAAAC
ATTCTTGCAACAAACCTGCACCGGGAAGCGAAAGACTCCTCTGGTTAACATCTCTATCCT
GTGGCGGCCAATAGTCTAGCTCGCTCAAGCTCAAGTTTCCGATTCCAGTCAAGAAGAATC
TCTCCCACAAGCTCAGATCCATCTGCAAGGGAGGTGCGGTCAATGCGTAACCGATCGTGT
CACCGCAGTCTAGTTGCATCTTGGTGAGCTTTGGATAGAGGGCAAGACAGCTTAGGCCTA
GCTCAGGCTCTGACGGCTTGCGTTTGCCTCTGCAGTCTCCTTCTATCTTGATCCTAATCT
CTTCCAAGTTCGGACAGTCATCTAGTCCTGTCATAGGTAATGGTGTTAGAAACTCACCAA
CACTGATCCATAAAGAAAGATACTCTAGCTTCTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DM78TF C 1
AF RR2DM78JQ U 2
BS 1 1 RR2DM78TF
BS 2 695 RR2DM78JQ

RD RR2DM78TF 695 0 0
TGAATTCAAACATAACATATGTAACAT*CAGAGTAAACAGAAACTGAAGTAAATACATAT
GTAAAAATGGTGTGGAAGTAACTCAGTGTTTAGTCTCTCAGTCAATGATATTGCGGCTGT
TCAACTGGTCCTCGAATCTACTACAAGAACCAACTCTCATCTCAGTGCTCATATCATTCT
CAGGCGCTGGGTAATAGTCTTCTCTAAGTTGCACATCCCTTAAGTTAGGGATCCTCAACA
AAAAATTCATGAAATGCTCATGAGCCGTTCCATGGATGAAAAGCTTCCTCAGAGTTAAAC
ATTCTTGCAACAAACCTGCACCGGGAAGCGAAAGACTCCTCTGGTTAACATCTCTATCCT
GTGGCGGCCAATAGTCTAGCTCGCTCAAGCTCAAGTTTCCGATTCCAGTCAAGAAGAATC
TCTCCCACAAGCTCAGATCCATCTGCAAGGGAGGTGCGGTCAATGCGTAACCGATCGTGT
CACCGCAGTCTAGTTGCATCTTGGTGAGCTTTGGATAGAGGGCAAGACAGCTTAGGCCTA
GCTCAGGCTCTGACGGCTTGCGTTTGCCTCTGCAGTCTCCTTCTATCTTGATCCTAATCT
CTTCCAAGTTCGGACAGTCATCTAGTCCTGTCATAGGTAATGGTGTTAGAAACTCACCAA
CACTGATCCATAAAGAAAGATACTCTAGCTTCTCC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2DM78JQ 694 0 0
GAATTCAAACATAACATATGTAACATTCAGAGTAAACAGAAACTGAAGTAAATACATATG
TAAAAATGGTGTGGAAGTAACTCAGTGTTTAGTCTCTCAGTCAATGATATTGCGGCTGTT
CAACTGGTCCTCGAATCTACTACAAGAACCAACTCTCATCTCAGTGCTCATATCATTCTC
AGGCGCTGGGTAATAGTCTTCTCTAAGTTGCACATCCCTTAAGTTAGGGATCCTCAACAA
AAAATTCATGAAATGCTCATGAGCCGTTCCATGGATGAAAAGCTTCCTCAGAGTTAAACA
TTCTTGCAACAAACCTGCACCGGGAAGCGAAAGACTCCTCTGGTTAACATCTCTATCCTG
TGGCGGCCAATAGTCTAGCTCGCTCAAGCTCAAGTTTCCGATTCCAGTCAAGAAGAATCT
CTCCCACAAGCTCAGATCCATCTGCAAGGGAGGTGCGGTCAATGCGTAACCGATCGTGTC
ACCGCAGTCTAGTTGCATCTTGGTGAGCTTTGGATAGAGGGCAAGACAGCTTAGGCCTAG
CTCAGGCTCTGACGGCTTGCGTTTGCCTCTGCAGTCTCCTTCTATCTTGATCCTAATCTC
TTCCAAGTTCGGACAGTCATCTAGTCCTGTCATAGGTAATGGTGTTAGAAACTCACCAAC
ACTGATCCATAAAGAAAGATACTCTAGCTTCTCC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL6959Contig1 540 2 1 U
CAAACAAACTTCCCATTTCTCTCATTTCTGCATCTCTAAGCTAATATTGCAACCAAACCC
AAACCCAAACCCTTTTGGATTACGACAAGTCTCCTTCACGATCTCAGGGTTTTAGATTTG
GGGGAAACGATGGAGGAAAGAGGATATGCGTTCGAGGTTAACAATGGCCGGAGTGAGTTT
GGGAGTTCTCGGAGAAACTCTTCGCCGCAGCGACCGTCGTCATTGACGAAGTCGTCGTCG
GTTCGGGAAGGAGGAGGAAGCAAAGGACGGAGGTCAGTGAAGCCGAGTGCCGCCGCCGAC
GACGAGTTCATTACGTTACTCCATGTCTCAGATCCGGTGAGAATCGAGCTCAGTAGGCTC
GAGAATGAAGTCAGAGATAAAGATCGGGAATTGTCTGAATCCCAAGCGGAGATCAAGGCT
TTGAGGTTGTCTGAACGCCAAAGAGAGAAGGCTGTTGAAGAGCTTACCGAAGAGTTGGGA
AAGATGTCGGAGAAGCTCAAACTGGCTGAGAACCTTGTCCAGAGTAAAAACCTTGAAATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AB17JQ C 1
AF RR2AB17TF U 1
BS 1 540 RR2AB17TF

RD RR2AB17JQ 540 0 0
CAAACAAACTTCCCATTTCTCTCATTTCTGCATCTCTAAGCTAATATTGCAACCAAACCC
AAACCCAAACCCTTTTGGATTACGACAAGTCTCCTTCACGATCTCAGGGTTTTAGATTTG
GGGGAAACGATGGAGGAAAGAGGATATGCGTTCGAGGTTAACAATGGCCGGAGTGAGTTT
GGGAGTTCTCGGAGAAACTCTTCGCCGCAGCGACCGTCGTCATTGACGAAGTCGTCGTCG
GTTCGGGAAGGAGGAGGAAGCAAAGGACGGAGGTCAGTGAAGCCGAGTGCCGCCGCCGAC
GACGAGTTCATTACGTTACTCCATGTCTCAGATCCGGTGAGAATCGAGCTCAGTAGGCTC
GAGAATGAAGTCAGAGATAAAGATCGGGAATTGTCTGAATCCCAAGCGGAGATCAAGGCT
TTGAGGTTGTCTGAACGCCAAAGAGAGAAGGCTGTTGAAGAGCTTACCGAAGAGTTGGGA
AAGATGTCGGAGAAGCTCAAACTGGCTGAGAACCTTGTCCAGAGTAAAAACCTTGAAATC

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2AB17TF 540 0 0
CAAACAAACTTCCCATTTCTCTCATTTCTGCATCTCTAAGCTAATATTGCAACCAAACCC
AAACCCAAACCCTTTTGGATTACGACAAGTCTCCTTCACGATCTCAGGGTTTTAGATTTG
GGGGAAACGATGGAGGAAAGAGGATATGCGTTCGAGGTTAACAATGGCCGGAGTGAGTTT
GGGAGTTCTCGGAGAAACTCTTCGCCGCAGCGACCGTCGTCATTGACGAAGTCGTCGTCG
GTTCGGGAAGGAGGAGGAAGCAAAGGACGGAGGTCAGTGAAGCCGAGTGCCGCCGCCGAC
GACGAGTTCATTACGTTACTCCATGTCTCAGATCCGGTGAGAATCGAGCTCAGTAGGCTC
GAGAATGAAGTCAGAGATAAAGATCGGGAATTGTCTGAATCCCAAGCGGAGATCAAGGCT
TTGAGGTTGTCTGAACGCCAAAGAGAGAAGGCTGTTGAAGAGCTTACCGAAGAGTTGGGA
AAGATGTCGGAGAAGCTCAAACTGGCTGAGAACCTTGTCCAGAGTAAAAACCTTGAAATC

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 2

CO CL6960Contig1 984 2 2 U
GGGAAATGGCTTTTGTTTGGTTCAACGCCTTCGCCAATTCATCTTCCTTTTTCTAAAAGG
CCACTCTTCTGCTTCACCAGTCCGTACGTTGAGGTTTGACTCTAAGGATTCTTCACAAAA
ATTGATCCTTTCGTTCACTGTCCGATCAATACGGCGACGCATTGTTGTCAATTTAGGATG
TCGTCATCGACACGTCACCACCACCCAGAGCAGACATCCTTGTCAACAAAGCTACTCGCG
AACCTAATACTCGATCAGGTCCGGAAAGGAAACACAGTGAACAACAAGAGCTCCTCCTTA
TCCAACAAAGCTTGGAACTTTATAACCCACGAGTTCCACACGAGAAGTGGCGGCGGCGTC
AGACGCGACAAAGAACATCTCAAGAACAGGTTCGCTCTCCTCGCGCGCGAATTCTCTCTC
GTCAAGCTCATCCTATCTCGAGACGACTTCGTTTTCGACGAATCCACCGGTTGTATCATC
GCCTCTGATGAATCTTGGGACCAATACGTAAGGAGTGTCCTGACGCAGAGGCTGTGAGAA
GAGACGGCTGTCCAGTTTACACTCAGCTCTCTCAGATATTCGGAGTTGTTCATCTCTAGG
AGGAGGAGGAAACTGTGTTACCTCCTCCATGCTCGCCCAAGAGAAGGCCTAGCAGAGGCG
TGGAGGCAGCTATTGCCAATGCTATAGGTGAAATGGCGGCTGCTTCGAGGCTAAGGACTA
GTTCCTTGACGCAGAGCAGGTTCACTCTTGCTGAGTGTATCGGAGAGCTGGATGGGATTA
ATGGCGTAGCGGAGAATGTTTATTTTGCTGCACTCGAGATCTTCAACAACCCAAGTGCAA
GAGGGACGTTCTTGTCTTTGAGAAGTGACATGCGTTTGGCTTGGCTTCAGTGGAAATGCG
CTACTTGTTTCTCCTACTAGCTAAGATAGAGGTGAAAGTGTACTTAAAACATCTCTAATA
ATCAATGGAAAAGTTCAGTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE08TF U 1
AF RR2GE08JQ C 301
BS 1 635 RR2GE08TF
BS 636 984 RR2GE08JQ

RD RR2GE08TF 635 0 0
GGGAAATGGCTTTTGTTTGGTTCAACGCCTTCGCCAATTCATCTTCCTTTTTCTAAAAGG
CCACTCTTCTGCTTCACCAGTCCGTACGTTGAGGTTTGACTCTAAGGATTCTTCACAAAA
ATTGATCCTTTCGTTCACTGTCCGATCAATACGGCGACGCATTGTTGTCAATTTAGGATG
TCGTCATCGACACGTCACCACCACCCAGAGCAGACATCCTTGTCAACAAAGCTACTCGCG
AACCTAATACTCGATCAGGTCCGGAAAGGAAACACAGTGAACAACAAGAGCTCCTCCTTA
TCCAACAAAGCTTGGAACTTTATAACCCACGAGTTCCACACGAGAAGTGGCGGCGGCGTC
AGACGCGACAAAGAACATCTCAAGAACAGGTTCGCTCTCCTCGCGCGCGAATTCTCTCTC
GTCAAGCTCATCCTATCTCGAGACGACTTCGTTTTCGACGAATCCACCGGTTGTATCATC
GCCTCTGATGAATCTTGGGACCAATACGTAAGGAGTGTCCTGACGCAGAGGCTGTGAGAA
GAGACGGCTGTCCAGTTTACACTCAGCTCTCTCAGATATTCGGAGTTGTTCATCTCTAGG
AGGAGGAGGAAACTGTGTTACCTCCTCCATGCTCG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2GE08JQ 684 0 0
TCCAACAAAGCTTGGAACTTTATAACCCACGAGTTCCACACGAGAAGTGGCGGCGGCGTC
AGACGCGACAAAGAACATCTCAAGAACAGGTTCGCTCTCCTCGCGCGCGAATTCTCTCTC
GTCAAGCTCATCCTATCTCGAGACGACTTCGTTTTCGACGAATCCACCGGTTGTATCATC
GCCTCTGATGAATCTTGGGACCAATACGTAAGGAGTGTCCTGACGCAGAGGCTGTGAGAA
GAGACGGCTGTCCAGTTTACACTCAGCTCTCTCAGATATTCGGAGTTGTTCATCTCTAGG
AGGAGGAGGAAACTGTGTTACCTCCTCCATGCTCGCCCAAGAGAAGGCCTAGCAGAGGCG
TGGAGGCAGCTATTGCCAATGCTATAGGTGAAATGGCGGCTGCTTCGAGGCTAAGGACTA
GTTCCTTGACGCAGAGCAGGTTCACTCTTGCTGAGTGTATCGGAGAGCTGGATGGGATTA
ATGGCGTAGCGGAGAATGTTTATTTTGCTGCACTCGAGATCTTCAACAACCCAAGTGCAA
GAGGGACGTTCTTGTCTTTGAGAAGTGACATGCGTTTGGCTTGGCTTCAGTGGAAATGCG
CTACTTGTTTCTCCTACTAGCTAAGATAGAGGTGAAAGTGTACTTAAAACATCTCTAATA
ATCAATGGAAAAGTTCAGTTTTCT

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL6961Contig1 720 2 2 U
TTTTTGAGAAATCCAAAGGGTCAGAAAATAAATAACAGTCGCCATGGCAGTCTCGGCAGC
ATTCAACACTTCGAAACTTGCATCTTCGTCTTCTCTAGATTCGATTCCTTCAATCTCTCC
TTCTTCTTCTTCTTATTCGTTGTTTCCGGCAAGCATCGGCATCAGAAACTCCGTCGGATC
TCCTTTCAAGAGATGTCTAAAGCAGTCGTGTTCTTCTGTTCGAGCCATGTCTTCTTCTTC
TTCGGCTGCTTCTTCTTCGTCTTCTTCTTTTGGATCGAGAATGGAGGAGAGCGTGAGGAA
GACGGTTACTGAGAACATTGTCGTTGTTTACTCCAAAACTTGGTGCTCATACTGTACTGA
AGTGAAGACATTATTCAAGAGACTTGGAGTTCAGCCACTGGTGATTGAATTGGATCAACT
TGGTCCACAAGGGCCACAACTGCAGAAGGTACTGGAAAGACTTACTGGCCAACACACTGT
TCCTAATGTTTTCGTTGGAGGAAAGCACATTGGTGGCCGCACAGATACAGTGAAGCTGAA
CAGGAAAGGAGAACTTGAACTGATGTTAGCTGAAGCCAACGCTAAAACCGATCAAACTTA
AGTAGATGTTGGAAACTGGTAATGGATGGAGATTTTGCATACGGAGTTTGGAAGAGTTTT
TTTCTCTTTTGTAAACCATTGAACCCTCACTTTCTTTTGTCAATGCATTTATCACCATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL89TF U 1
AF RR2EL89JQ C 1
BS 1 539 RR2EL89TF
BS 540 720 RR2EL89JQ

RD RR2EL89TF 539 0 0
TTTTTGAGAAATCCAAAGGGTCAGAAAATAAATAACAGTCGCCATGGCAGTCTCGGCAGC
ATTCAACACTTCGAAACTTGCATCTTCGTCTTCTCTAGATTCGATTCCTTCAATCTCTCC
TTCTTCTTCTTCTTATTCGTTGTTTCCGGCAAGCATCGGCATCAGAAACTCCGTCGGATC
TCCTTTCAAGAGATGTCTAAAGCAGTCGTGTTCTTCTGTTCGAGCCATGTCTTCTTCTTC
TTCGGCTGCTTCTTCTTCGTCTTCTTCTTTTGGATCGAGAATGGAGGAGAGCGTGAGGAA
GACGGTTACTGAGAACATTGTCGTTGTTTACTCCAAAACTTGGTGCTCATACTGTACTGA
AGTGAAGACATTATTCAAGAGACTTGGAGTTCAGCCACTGGTGATTGAATTGGATCAACT
TGGTCCACAAGGGCCACAACTGCAGAAGGTACTGGAAAGACTTACTGGCCAACACACTGT
TCCTAATGTTTTCGTTGGAGGAAAGCACATTGGTGGCCGCACAGATACAGTGAAGCTGA

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2EL89JQ 720 0 0
TTTTTGAGAAATCCAAAGGGTCAGAAAATAAATAACAGTCGCCATGGCAGTCTCGGCAGC
ATTCAACACTTCGAAACTTGCATCTTCGTCTTCTCTAGATTCGATTCCTTCAATCTCTCC
TTCTTCTTCTTCTTATTCGTTGTTTCCGGCAAGCATCGGCATCAGAAACTCCGTCGGATC
TCCTTTCAAGAGATGTCTAAAGCAGTCGTGTTCTTCTGTTCGAGCCATGTCTTCTTCTTC
TTCGGCTGCTTCTTCTTCGTCTTCTTCTTTTGGATCGAGAATGGAGGAGAGCGTGAGGAA
GACGGTTACTGAGAACATTGTCGTTGTTTACTCCAAAACTTGGTGCTCATACTGTACTGA
AGTGAAGACATTATTCAAGAGACTTGGAGTTCAGCCACTGGTGATTGAATTGGATCAACT
TGGTCCACAAGGGCCACAACTGCAGAAGGTACTGGAAAGACTTACTGGCCAACACACTGT
TCCTAATGTTTTCGTTGGAGGAAAGCACATTGGTGGCCGCACAGATACAGTGAAGCTGAA
CAGGAAAGGAGAACTTGAACTGATGTTAGCTGAAGCCAACGCTAAAACCGATCAAACTTA
AGTAGATGTTGGAAACTGGTAATGGATGGAGATTTTGCATACGGAGTTTGGAAGAGTTTT
TTTCTCTTTTGTAAACCATTGAACCCTCACTTTCTTTTGTCAATGCATTTATCACCATTC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL6962Contig1 893 2 10 U
CATGGGTCTCACTTCTGTAAAACATGTCGCCGTTACTGGACCAAAGGCGGCACTCTAAGG
AATATTCCCGTCGGTGGTGGCTGCCGGAAAAACAAGAAACCCTCTTCCTCTAATTCCTCA
TCCTCCACTTCTTCCGGGAAAAAGCCGTCCAACATTGTTACCACTAATACCAATGACCTT
ATGGCTTTAGCACAATCTCATCAGAATTACCAAAATGCCTCTCTGGGGTTCTCACATTTT
GGTGGGAATGGGATGATGGGGTCTTACACAGCTCTCGGTCATAGTAACGTTGGTTTCTTG
GAGAGCAAGTATGGCGGTTTGCTTTCACCAAGCCCTAGACCTATTGAATTTTTGGACAGT
AAGTTTGATCTCATGGGAGTGAACAATGACAATCTGGTCATGGTTGATCATGGAATTAAC
TGTGATCATCATCATCATCATCACATGGGTATGAATCACGGATTAGGTCTTAACAACAAT
AACCATGATGGGTTTCAGGGGATTTCTCCGGCAAACAACGGAAATGGTGGTGGTGGTCTC
ATGGATATATCTATAAGCCAGAGACTTATGCTAGCTAATTATGAACATCATCATGAAGAT
AATCAAAGAGTAACATCAATAATGGATGTGAAACCAAGTCCAAAGCTGTTATCTCTTGAT
TGGCAACAAGGTCAAGGCTACTCAGATGGTAGCGGCAACGGAGGCGGTGGAAGATCTGAC
GGAGGTAGCGGTTATATCAACGGCTTAGGTTCGACGTGGAATGGTTTGATGAATGGCTAT
GGATCCTCTACTAAAACTAACTCCATGGTTTAATAAATTAATATCAGAACTTTATTTCTT
GTCGTTATCAACTGGTATTACAGAAGCAATTATATTAGTATATGGGTTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE49TF U 1
AF RR2CE49JQ C 184
BS 1 670 RR2CE49TF
BS 671 671 RR2CE49JQ
BS 672 676 RR2CE49TF
BS 677 677 RR2CE49JQ
BS 678 703 RR2CE49TF
BS 704 704 RR2CE49JQ
BS 705 724 RR2CE49TF
BS 725 725 RR2CE49JQ
BS 726 740 RR2CE49TF
BS 741 893 RR2CE49JQ

RD RR2CE49TF 740 0 0
CATGGGTCTCACTTCTGTAAAACATGTCGCCGTTACTGGACCAAAGGCGGCACTCTAAGG
AATATTCCCGTCGGTGGTGGCTGCCGGAAAAACAAGAAACCCTCTTCCTCTAATTCCTCA
TCCTCCACTTCTTCCGGGAAAAAGCCGTCCAACATTGTTACCACTAATACCAATGACCTT
ATGGCTTTAGCACAATCTCATCAGAATTACCAAAATGCCTCTCTGGGGTTCTCACATTTT
GGTGGGAATGGGATGATGGGGTCTTACACAGCTCTCGGTCATAGTAACGTTGGTTTCTTG
GAGAGCAAGTATGGCGGTTTGCTTTCACCAAGCCCTAGACCTATTGAATTTTTGGACAGT
AAGTTTGATCTCATGGGAGTGAACAATGACAATCTGGTCATGGTTGATCATGGAATTAAC
TGTGATCATCATCATCATCATCACATGGGTATGAATCACGGATTAGGTCTTAACAACAAT
AACCATGATGGGTTTCAGGGGATTTCTCCGGCAAACAACGGAAATGGTGGTGGTGGTCTC
ATGGATATATCTATAAGCCAGAGACTTATGCTAGCTAATTATGAACATCATCATGAAGAT
AATCAAAGAGTAACATCAATAATGGATGTGAAACCAAGTCCAAAGCTGTTATCTCTTGAT
TGGCAACAAG*TCAAG*CTACTCAGATGGTAGCGGCAACGGAG*CGGTGGAAGATCTGAC
GGAG*TAGCGGTTATATCAA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2CE49JQ 710 0 0
GCTTTAGCACAATCTCATCAGAATTACCAAAATGCCTCTCTGGGGTTCTCACATTTTGGT
GGGAATGGGATGATGGGGTCTTACACAGCTCTCGGTCATAGTAACGTTGGTTTCTTGGAG
AGCAAGTATGGCGGTTTGCTTTCACCAAGCCCTAGACCTATTGAATTTTTGGACAGTAAG
TTTGATCTCATGGGAGTGAACAATGACAATCTGGTCATGGTTGATCATGGAATTAACTGT
GATCATCATCATCATCATCACATGGGTATGAATCACGGATTAGGTCTTAACAACAATAAC
CATGATGGGTTTCAGGGGATTTTTCCGGCAAACAACGGAAATGGTGGTGGTGGTCTCATG
GATATATCTATAAGCCAGAGACTTATGCTAGCTAATTATGAACATCATCATGAAGATAAT
CAAAGAGTAACATCAATAATGGATGTGAAACCAAGTCCAAAGCTGTTATCTCTTGATTGG
CAACAAGGTCAAGGCTACTCAGATGGTAGCGGCAACGGAGGCGGTGGAAGATCTGACGGA
GGTAGCGGTTATATCAACGGCTTAGGTTCGACGTGGAATGGTTTGATGAATGGCTATGGA
TCCTCTACTAAAACTAACTCCATGGTTTAATAAATTAATATCAGAACTTTATTTCTTGTC
GTTATCAACTGGTATTACAGAAGCAATTATATTAGTATATGGGTTTGTTC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL6963Contig1 1108 2 2 U
GATTCGCGTCTCTCGTCTCTAAATCACAGTTCCGTGAAAAAAACAACAAAATGGGTCAAG
TTCTAGGATGTGTCCAAGTCGATCAGTCGACTGTTGCAATCAAAGAGACGTTCGGGAAGT
TCGACGGCGTTCTCGAGCCAGGTTGTCACTGTTTGCCCTGGTGCATAGGGAGTCAAGTGC
TGGCCACCTTTCCCTGCGTGTTCAACAGCTCGATGTTCGCTGCGAGACCAAAACTAAAGA
TAATGTGTTTGTCACCGTCGTTGCTTCCATTCAGTACCGTGCTTTAGCTGAGAGTGCTCA
AGATGCTTTTTACAAGCTCAGCAACACCAGGAACCAGATTCAAGCTTATGTCTTTGACGT
GATCCGAGCAAGTGTGCCTAAGCTGGATCTAGACTCAACCTTTGAGCAGAAGAACGACAT
TGCTAAAACCGTTGAGAGTGAGCTCGAAAAGGCTATGTCGCATTACGGGTATGAGATAGT
CCAGACGCTTATTGTGGATATCGAGCCTGATGTGCATGTCAAGAGGGCTATGAATGAGAT
CAATGCTGCTTCAAGAATGAGAGAGGCAGCTAGTGAGAAAGCAGAGGCGGAGAAGATACT
TCAGATCAAGAGAGCCGAAGGAGAAGCTGAGTCCAAGTACCTTTCAGGTCTCGGTATAGC
ACGTCAGAGACAAGCCATCGTGGACGGTCTGAGGAACAGCGTGCTGGCCTTCTCCGAGTC
TGTTCCAGGGACGTCTTCCAAGGACGTCATGGACATGGTTCTGGTCACTCAGTACTTTGA
TACTTTGAAGGAGATTGGTGCGTCTTCCAAGTCGAACTCGGTGTTCATACCGCACGGTCC
GGGTGCTGTTAAGGACATTGCTTCGCAGATAAGGGATGGTCTTCTTCAGGGAAACGCTGC
TGGTGAGTGATATGAGTGAGTGGTGAGAGATTTTAATAAGTACAAAAAGCCTTTTCTTCA
GGGTGGTTTAGTTGGTGTTGCTACTTATTTATTTTTCTTTTAGCGGTTGGGCTTTTCTAG
TATTGAAGTCCTTATGGATTGCTTATCGTTGGTAGACTGGATCATGTTTATGGTTTTGGG
CTTGATAGTATATGACGCAATTTGGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G543TF U 1
AF RR2G543JQ C 388
BS 1 689 RR2G543TF
BS 690 1108 RR2G543JQ

RD RR2G543TF 689 0 0
GATTCGCGTCTCTCGTCTCTAAATCACAGTTCCGTGAAAAAAACAACAAAATGGGTCAAG
TTCTAGGATGTGTCCAAGTCGATCAGTCGACTGTTGCAATCAAAGAGACGTTCGGGAAGT
TCGACGGCGTTCTCGAGCCAGGTTGTCACTGTTTGCCCTGGTGCATAGGGAGTCAAGTGC
TGGCCACCTTTCCCTGCGTGTTCAACAGCTCGATGTTCGCTGCGAGACCAAAACTAAAGA
TAATGTGTTTGTCACCGTCGTTGCTTCCATTCAGTACCGTGCTTTAGCTGAGAGTGCTCA
AGATGCTTTTTACAAGCTCAGCAACACCAGGAACCAGATTCAAGCTTATGTCTTTGACGT
GATCCGAGCAAGTGTGCCTAAGCTGGATCTAGACTCAACCTTTGAGCAGAAGAACGACAT
TGCTAAAACCGTTGAGAGTGAGCTCGAAAAGGCTATGTCGCATTACGGGTATGAGATAGT
CCAGACGCTTATTGTGGATATCGAGCCTGATGTGCATGTCAAGAGGGCTATGAATGAGAT
CAATGCTGCTTCAAGAATGAGAGAGGCAGCTAGTGAGAAAGCAGAGGCGGAGAAGATACT
TCAGATCAAGAGAGCCGAAGGAGAAGCTGAGTCCAAGTACCTTTCAGGTCTCGGTATAGC
ACGTCAGAGACAAGCCATCGTGGACGGTC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2G543JQ 721 0 0
TCTAGACTCAACCTTTGAGCAGAAGAACGACATTGCTAAAACCGTTGAGAGTGAGCTCGA
AAAGGCTATGTCGCATTACGGGTATGAGATAGTCCAGACGCTTATTGTGGATATCGAGCC
TGATGTGCATGTCAAGAGGGCTATGAATGAGATCAATGCTGCTTCAAGAATGAGAGAGGC
AGCTAGTGAGAAAGCAGAGGCGGAGAAGATACTTCAGATCAAGAGAGCCGAAGGAGAAGC
TGAGTCCAAGTACCTTTCAGGTCTCGGTATAGCACGTCAGAGACAAGCCATCGTGGACGG
TCTGAGGAACAGCGTGCTGGCCTTCTCCGAGTCTGTTCCAGGGACGTCTTCCAAGGACGT
CATGGACATGGTTCTGGTCACTCAGTACTTTGATACTTTGAAGGAGATTGGTGCGTCTTC
CAAGTCGAACTCGGTGTTCATACCGCACGGTCCGGGTGCTGTTAAGGACATTGCTTCGCA
GATAAGGGATGGTCTTCTTCAGGGAAACGCTGCTGGTGAGTGATATGAGTGAGTGGTGAG
AGATTTTAATAAGTACAAAAAGCCTTTTCTTCAGGGTGGTTTAGTTGGTGTTGCTACTTA
TTTATTTTTCTTTTAGCGGTTGGGCTTTTCTAGTATTGAAGTCCTTATGGATTGCTTATC
GTTGGTAGACTGGATCATGTTTATGGTTTTGGGCTTGATAGTATATGACGCAATTTGGGC
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL6964Contig1 1047 2 2 U
GGCTCTTCCAACTTGTATAAACCTGAGCATCTTCCCCAGATTTTCACCTCTTTCTGCTCT
CATGGATTCTTCGAATCTCGGTTCTTCCAGCAAACCTGCCTTCTCTTCCTTCTCTCAATC
CAGCAGAAGCGGCGGTAGAGGAAGAGGAAACGAGAGAGATAATGATCGTCGGAGACCTCA
GGGTCGTGACGGAGGCAGGGGAGGAGGAGGCAAAGATAAAATCGATGCACTTGGAAGACT
CTTGACGAGAATCTTGCGACACATGGCGACTGAGCTGAGATTGAACATGAGAGGTGATGG
TTTTGTTAAAGTCGAAGACTTGCTTAACCTGAATCTGAAAACATCCGCAAACATTCAGTT
GAAGTCTCATACCATTGATGAGATCAGAGAGGCAGTGAGAAGGGATAATAAGCAACGTTT
TAGCCTCGTTGAAGAGAATGGAGAGCTCTTTATTCGCGCTAACCAAGGCCACTCTGTCAC
GACGGTTGAATCTGAAAAGTTACTTAAACCAATACTGTCACCGGAAGAAGCTCCAGTGTG
TGTGCATGGAACTTATAAGAAGAATTTGGAATCCATCTTGGCATCTGGCTTGAAGCGTAT
GGATAGACTCCATGTTCACTTTTCTTGTGGTTTACCTACGGATGGTGAAGTGATAAGTGG
CATGAGAAGGAATGTTAATGTCTTGATCTTCCTTGACATCAAGAAAGCTCTTGAAGATGG
GATCGCGTTCTACATTTCAGACAACAAGGTGATTTTGACTGAAGGTGTTGATGGTGTAGT
GCCTGTTGAGTACTTCCAAAAGATCGAGTCTTGGCCTAGTCGGCAACCAATTCCTTTCTG
ATTTATTATTATGGACGACACAACAGTGACTTGTGAGATATACAATTATCACCACTTAAT
CACATTTCTGCAATTGTTTTCTTTTTTTATAAAACAATGATGTTTTTTATTTGTTCTTTT
AACCAGTCTCATCGGTTTGATACATTAGCATTTGATCATTGCGAGGGTAACCTATGTTTG
CGGAAACTTTGTAACTAATGAATGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT82TF U 1
AF RR2AT82JQ C 338
BS 1 743 RR2AT82TF
BS 744 1047 RR2AT82JQ

RD RR2AT82TF 743 0 0
GGCTCTTCCAACTTGTATAAACCTGAGCATCTTCCCCAGATTTTCACCTCTTTCTGCTCT
CATGGATTCTTCGAATCTCGGTTCTTCCAGCAAACCTGCCTTCTCTTCCTTCTCTCAATC
CAGCAGAAGCGGCGGTAGAGGAAGAGGAAACGAGAGAGATAATGATCGTCGGAGACCTCA
GGGTCGTGACGGAGGCAGGGGAGGAGGAGGCAAAGATAAAATCGATGCACTTGGAAGACT
CTTGACGAGAATCTTGCGACACATGGCGACTGAGCTGAGATTGAACATGAGAGGTGATGG
TTTTGTTAAAGTCGAAGACTTGCTTAACCTGAATCTGAAAACATCCGCAAACATTCAGTT
GAAGTCTCATACCATTGATGAGATCAGAGAGGCAGTGAGAAGGGATAATAAGCAACGTTT
TAGCCTCGTTGAAGAGAATGGAGAGCTCTTTATTCGCGCTAACCAAGGCCACTCTGTCAC
GACGGTTGAATCTGAAAAGTTACTTAAACCAATACTGTCACCGGAAGAAGCTCCAGTGTG
TGTGCATGGAACTTATAAGAAGAATTTGGAATCCATCTTGGCATCTGGCTTGAAGCGTAT
GGATAGACTCCATGTTCACTTTTCTTGTGGTTTACCTACGGATGGTGAAGTGATAAGTGG
CATGAGAAGGAATGTTAATGTCTTGATCTTCCTTGACATCAAGAAAGCTCTTGAAGATGG
GATCGCGTTCTACATTTCAGACA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2AT82JQ 710 0 0
AAAACATCCGCAAACATTCAGTTGAAGTCTCATACCATTGATGAGATCAGAGAGGCAGTG
AGAAGGGATAATAAGCAACGTTTTAGCCTCGTTGAAGAGAATGGAGAGCTCTTTATTCGC
GCTAACCAAGGCCACTCTGTCACGACGGTTGAATCTGAAAAGTTACTTAAACCAATACTG
TCACCGGAAGAAGCTCCAGTGTGTGTGCATGGAACTTATAAGAAGAATTTGGAATCCATC
TTGGCATCTGGCTTGAAGCGTATGGATAGACTCCATGTTCACTTTTCTTGTGGTTTACCT
ACGGATGGTGAAGTGATAAGTGGCATGAGAAGGAATGTTAATGTCTTGATCTTCCTTGAC
ATCAAGAAAGCTCTTGAAGATGGGATCGCGTTCTACATTTCAGACAACAAGGTGATTTTG
ACTGAAGGTGTTGATGGTGTAGTGCCTGTTGAGTACTTCCAAAAGATCGAGTCTTGGCCT
AGTCGGCAACCAATTCCTTTCTGATTTATTATTATGGACGACACAACAGTGACTTGTGAG
ATATACAATTATCACCACTTAATCACATTTCTGCAATTGTTTTCTTTTTTTATAAAACAA
TGATGTTTTTTATTTGTTCTTTTAACCAGTCTCATCGGTTTGATACATTAGCATTTGATC
ATTGCGAGGGTAACCTATGTTTGCGGAAACTTTGTAACTAATGAATGAAT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL6965Contig1 780 2 2 U
GCATCCATCACAGGAAAAGTAAGATAAAAAGAAACCTTTTCACTAATGTCCAAAGACTGT
GAGAAGCACGGGGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCAGGAGAATATGCGGAGTGATCATCGGC
TTCATCATCATCGTCTTGACAACAATCTTCCTCGTCTGGGTAATCCTCCAACCAACAAAA
CCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCCTTCAACCTCACGCAACCTAACCTC
CTCACCTCAAACTTCCAAGTCACTTTCCCTACGGCCATTCCACCGAGCTACCAAGGCCAT
AAAGAAGACAGTGTTTGGTCTCCTATTATCTATGGCAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTAT
AACGCCGTCGCTCTCGGTGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGATTATACGCGCT
GATGGGCGCGTGAGGTGGAAGGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTT
CGTTGTCATACTTTTATCAATCTTGCGGATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGAGAAAAT
ATCGTTAAGTACACTGTGGACAATCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGACGAAATGG
GATACAGCTCTGACGCCGTTAAGTTTGCCTTTTTTTTTCTTTATTCACTCGTTTTTCTGC
TACTCTTTGCTTCTGTATCGTTTAATTTGTCTATTTTTATCATTATCTCGTAAACTATAC
CACTCATGACATTACAGTGTCGCTAAATTATTTTAAATGAACTATAACTACATTTCACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK95TF U 1
AF RR2EK95JQ C 209
BS 1 748 RR2EK95TF
BS 749 780 RR2EK95JQ

RD RR2EK95TF 748 0 0
GCATCCATCACAGGAAAAGTAAGATAAAAAGAAACCTTTTCACTAATGTCCAAAGACTGT
GAGAAGCACGGGGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCAGGAGAATATGCGGAGTGATCATCGGC
TTCATCATCATCGTCTTGACAACAATCTTCCTCGTCTGGGTAATCCTCCAACCAACAAAA
CCAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCCTTCAACCTCACGCAACCTAACCTC
CTCACCTCAAACTTCCAAGTCACTTTCCCTACGGCCATTCCACCGAGCTACCAAGGCCAT
AAAGAAGACAGTGTTTGGTCTCCTATTATCTATGGCAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTAT
AACGCCGTCGCTCTCGGTGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATTTGATTATACGCGCT
GATGGGCGCGTGAGGTGGAAGGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTT
CGTTGTCATACTTTTATCAATCTTGCGGATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGAGAAAAT
ATCGTTAAGTACACTGTGGACAATCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGACGAAATGG
GATACAGCTCTGACGCCGTTAAGTTTGCCTTTTTTTTTCTTTATTCACTCGTTTTTCTGC
TACTCTTTGCTTCTGTATCGTTTAATTTGTCTATTTTTATCATTATCTCGTAAACTATAC
CACTCATGACATTACAGTGTCGCTAAAT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2EK95JQ 572 0 0
TCTTCGCCTTCAACCTCACGCAACCTAACCTCCTCACCTCAAACTTCCAAGTCACTTTCC
CTACGGCCATTCCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGTTTGGTCTCCTATTA
TCTATGGCAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCTCGGTGACGAGCAGA
GTCGTGGGTTTGTTGATTTGATTATACGCGCTGATGGGCGCGTGAGGTGGAAGGTCGGGA
CTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTTTTATCAATCTTGCGG
ATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGAGAAAATATCGTTAAGTACACTGTGGACAATCAAT
GCAGTGTCGACGTTTAGATGACGACGAAATGGGATACAGCTCTGACGCCGTTAAGTTTGC
CTTTTTTTTTCTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACTCTTTGCTTCTGTATCGTTTAATTT
GTCTATTTTTATCATTATCTCGTAAACTATACCACTCATGACATTACAGTGTCGCTAAAT
TATTTTAAATGAACTATAACTACATTTCACAT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL6966Contig1 922 2 8 U
GGGGTACGTGGTTGCGGAGGGGAAAGAGAGTTCAGCTACACAAAATGATGCTGATGCTGG
TGAAGAAGATGAATCCCCATTTGAATTCCGTGCACTGGAAGTTTTCTTGGAAGCTATGTG
TAGCTTCTTAGCTGCAAGGACAACGGAGCTAGAAACAGCTGCTTACCCTACTTTGGATGA
GCTTGCCTCAAAGATTAGTAGCCATAACTTGGATAGAGTTCGGAAGTTGAAGAGTGTCAC
CACTCGGTTGACAGCTCGAGTTCAAAAGGTAAGAGATGAGCTTGAACATTTGCTGGATGA
TGACGATGATATGGCTGATCTTTACCTTTCAAGGAAACTCTCTAGTGCTTCCTCAGCAGC
TAGTAGTCCAAATTTCTATCTTACTTCCCCAACAATAGGTTCTAAGATCTCAAAAGCTAG
TGTAGCCACAGTTCGTGAGGATGAAAACGATGTTGAACAACTTGAAATGTTGCTAGAGGC
ATACTTCATGCAAATCGACAGCACTTTTAACAAATTAACAACGCTACGTGAGTATATCGA
TGATACGGATGATTACATTAGCATTCAGATGGACAATCATCGTAATGAGCTGATTAAGTT
GGAGATTTTGTTAAGTTCTGGAACCGTTTGCTCAGCATTTTACTCTCTAGTCGCAGGAAT
TTTCGGGATGAACATTCCATACACGTGGAACGATAACCACGGATACATGTTCAAATGGGT
TTGTATCGTGACGGGGGCAATTTGTGTGATCTCGTTAGTATTCATAATGTCGTACGCTCG
GTTCAAAGGGCTTGTGGGATCTTGATAGGTCTAGAGAGAGCTTTTTAGCATTGAGAAATT
GAGACTTCGAATTGTTTAAGAGGAGCTTTACTCTACACAATCTTATTATTAGAGCTTTTA
AACCGAAATTTTTTTATAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY73TF U 1
AF RR2DY73JQ C 199
BS 1 656 RR2DY73TF
BS 657 657 RR2DY73JQ
BS 658 701 RR2DY73TF
BS 702 702 RR2DY73JQ
BS 703 736 RR2DY73TF
BS 737 737 RR2DY73JQ
BS 738 752 RR2DY73TF
BS 753 922 RR2DY73JQ

RD RR2DY73TF 752 0 0
GGGGTACGTGGTTGCGGAGGGGAAAGAGAGTTCAGCTACACAAAATGATGCTGATGCTGG
TGAAGAAGATGAATCCCCATTTGAATTCCGTGCACTGGAAGTTTTCTTGGAAGCTATGTG
TAGCTTCTTAGCTGCAAGGACAACGGAGCTAGAAACAGCTGCTTACCCTACTTTGGATGA
GCTTGCCTCAAAGATTAGTAGCCATAACTTGGATAGAGTTCGGAAGTTGAAGAGTGTCAC
CACTCGGTTGACAGCTCGAGTTCAAAAGGTAAGAGATGAGCTTGAACATTTGCTGGATGA
TGACGATGATATGGCTGATCTTTACCTTTCAAGGAAACTCTCTAGTGCTTCCTCAGCAGC
TAGTAGTCCAAATTTCTATCTTACTTCCCCAACAATAGGTTCTAAGATCTCAAAAGCTAG
TGTAGCCACAGTTCGTGAGGATGAAAACGATGTTGAACAACTTGAAATGTTGCTAGAGGC
ATACTTCATGCAAATCGACAGCACTTTTAACAAATTAACAACGCTACGTGAGTATATCGA
TGATACGGATGATTACATTAGCATTCAGATGGACAATCATCGTAATGAGCTGATTAAGTT
GGAGATTTTGTTAAGTTCTGGAACCGTTTGCTCAGCATTTTACTCTCTAGTCGCAG*AAT
TTTCGGGATGAACATTCCATACACGTGGAACGATAACCACG*ATACATGTTCAAATGGGT
TTGTATCGTGACGGGG*CAATTTGTGTGATCT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2DY73JQ 724 0 0
TAGCCATAACTTGGATAGAGTTCGGAAGTTGAAGAGTGTCACCACTCGGTTGACAGCTCG
AGTTCAAAAGGTAAGAGATGAGCTTGAACATTTGCTGGATGATGACGATGATATGGCTGA
TCTTTACCTTTCAAGGAAACTCTCTAGTGCTTCCTCAGCAGCTAGTAGTCCAAATTTCTA
TCTTACTTCCCCAACAATAGGTTCTAAGATCTCAAAAGCTAGTGTAGCCACAGTTCGTGA
GGATGAAAACGATGTTGAACAACTTGAAATGTTGCTAGAGGCATACTTCATGCAAATCGA
CAGCACTTTTAACAAATTAACAACGCTACGTGAGTATATCGATGATACGGATGATTACAT
TAGCATTCAGATGGACAATCATCGTAATGAGCTGATTAAGTTGGAGATTTTGTTAAGTTC
TGGAACCGTTTGCTCAGCATTTTACTCTCTAGTCGCAGGAATTTTCGGGATGAACATTCC
ATACACGTGGAACGATAACCACGGATACATGTTCAAATGGGTTTGTATCGTGACGGGGGC
AATTTGTGTGATCTCGTTAGTATTCATAATGTCGTACGCTCGGTTCAAAGGGCTTGTGGG
ATCTTGATAGGTCTAGAGAGAGCTTTTTAGCATTGAGAAATTGAGACTTCGAATTGTTTA
AGAGGAGCTTTACTCTACACAATCTTATTATTAGAGCTTTTAAACCGAAATTTTTTTATA
AGCC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL6967Contig1 1132 2 2 U
GGACCACCAAATATCAGAGATTTTCGATTAATTGAGAGAGAAAGCGACGAGGGAGGGACT
TAGCTTCGCCGCTGCAGCAGCAGCTAAGATTCGCTTAACCGAAAAACCAGAGCATGAAGA
GACGAAGAGCGGCGAGGAAATCATCATCGGCGACGGTGGCGGTTAGCGATTCGAAAATGG
GGGGAGGGAGGAGGTTGATGAAGTTCGAGGAGTTGCCTGGGTATTTGCAGGATAACGAGT
TTATACACGACCATTATCGATGCCAATGGTCTCTCAGAGATACCTTCCTTAGTGCCTTCT
CTTGGCATAACGAGACTCTCAACATCTGGACGCACTTGATTGGGTTTCTGATATTTATGT
GGATGATGGTGGTGAGCTCCTTAGAGACGACGGAGCTTAGCCTTGCAGGACTCTTCAACG
GCATGTCCGGAGCGTGGATTCGCCTCTCCAGCAATCAGACTCTGCTTCGTCATGATTCCA
ACGTGACAGAACACATCCCACTTCTCAACTCTCGAGAAGTAAACCACCAAAACCACCAAG
AAGCTGTTCCGAAATGGCCATGGCTCCTGTACTTAGCCGGAGCAATGGGTTGCTTAATCT
GTAGCTCTGTTTCACACCTCTTCGCTTGCCACTCAAAGCGTTTCAACCTCTTTTTCTGGC
GTTTGGACTACGCAGGAATCTCACTGATGATCGTCTCCTCTTTCTTCGCGCCTATCTACT
ACGCATTCTCCTGCCACCCTAACTTCCGTCTCATCTACCTCTCCTCAATCTCAATCCTCG
GTCTCCTCGCCATCATCACTCTCCTCGCTCCAGCTCTCTCGGCGCCGCGTTTCAGACCAT
TCAGGGCTTATCTTTTCCTTGCGATGGGATTCTGTAGCGTGGTACCAGCTTCACATGTGC
TTTGCCTTTACTGGGGCCACCCTAACGTGTTATTCGCTCTAGCTTGCGAGCTTGCCACTG
GTCTGTCTTATGCTGTGGGAGCAGTGTTTTATGTTAGCCGTGTGCCTGAGAGATGGAAGC
CTGGAGCGTTTGACATTGCCGGGCACAGCCATCAGATATTCCATGTGTTTGTTGTTTTGG
GAGCTCTTGTTCATTGTGTTGCCACTCTGTCATTGTGGATTTCGACGAGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR94TF U 1
AF RR2H281TF U 383
BS 1 675 RR2GR94TF
BS 676 1132 RR2H281TF

RD RR2GR94TF 679 0 0
GGACCACCAAATATCAGAGATTTTCGATTAATTGAGAGAGAAAGCGACGAGGGAGGGACT
TAGCTTCGCCGCTGCAGCAGCAGCTAAGATTCGCTTAACCGAAAAACCAGAGCATGAAGA
GACGAAGAGCGGCGAGGAAATCATCATCGGCGACGGTGGCGGTTAGCGATTCGAAAATGG
GGGGAGGGAGGAGGTTGATGAAGTTCGAGGAGTTGCCTGGGTATTTGCAGGATAACGAGT
TTATACACGACCATTATCGATGCCAATGGTCTCTCAGAGATACCTTCCTTAGTGCCTTCT
CTTGGCATAACGAGACTCTCAACATCTGGACGCACTTGATTGGGTTTCTGATATTTATGT
GGATGATGGTGGTGAGCTCCTTAGAGACGACGGAGCTTAGCCTTGCAGGACTCTTCAACG
GCATGTCCGGAGCGTGGATTCGCCTCTCCAGCAATCAGACTCTGCTTCGTCATGATTCCA
ACGTGACAGAACACATCCCACTTCTCAACTCTCGAGAAGTAAACCACCAAAACCACCAAG
AAGCTGTTCCGAAATGGCCATGGCTCCTGTACTTAGCCGGAGCAATGGGTTGCTTAATCT
GTAGCTCTGTTTCACACCTCTTCGCTTGCCACTCAAAGCGTTTCAACCTCTTTTTCTGGC
GTTTGGACTACGCAG
AATC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2H281TF 750 0 0
AGAGACGACGGAGCTTAGCCTTGCAGGACTCTTCAACGGCATGTCCGGAGCGTGGATTCG
CCTCTCCAGCAATCAGACTCTGCTTCGTCATGATTCCAACGTGACAGAACACATCCCACT
TCTCAACTCTCGAGAAGTAAACCACCAAAACCACCAAGAAGCTGTTCCGAAATGGCCATG
GCTCCTGTACTTAGCCGGAGCAATGGGTTGCTTAATCTGTAGCTCTGTTTCACACCTCTT
CGCTTGCCACTCAAAGCGTTTCAACCTCTTTTTCTGGCGTTTGGACTACGCAGGAATCTC
ACTGATGATCGTCTCCTCTTTCTTCGCGCCTATCTACTACGCATTCTCCTGCCACCCTAA
CTTCCGTCTCATCTACCTCTCCTCAATCTCAATCCTCGGTCTCCTCGCCATCATCACTCT
CCTCGCTCCAGCTCTCTCGGCGCCGCGTTTCAGACCATTCAGGGCTTATCTTTTCCTTGC
GATGGGATTCTGTAGCGTGGTACCAGCTTCACATGTGCTTTGCCTTTACTGGGGCCACCC
TAACGTGTTATTCGCTCTAGCTTGCGAGCTTGCCACTGGTCTGTCTTATGCTGTGGGAGC
AGTGTTTTATGTTAGCCGTGTGCCTGAGAGATGGAAGCCTGGAGCGTTTGACATTGCCGG
GCACAGCCATCAGATATTCCATGTGTTTGTTGTTTTGGGAGCTCTTGTTCATTGTGTTGC
CACTCTGTCATTGTGGATTTCGACGAGCGT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL6968Contig1 728 2 3 U
CTGTAAAAACATAGAAACTCTCCATGATTGTAATCTGTTTCTTACATAGACTGGACAAAG
CTTAATGAACAGTTAAACAGAAAAAAACAAATTGCAAGCAGAAACTTCTCCAGCACTATC
TCAGTTGTTCTACCAGTGTATAATAAGTAAATAAAAACACGAAATGAGCACCGAGCAGCA
TATTCACGCCAACAATCTGGTTTTCAACTTTAAGGCGAGTTATAGCCATGATGTGGATTC
CAGCACTGGAGTGGAAACCAGTGGGAAGGATAAAGCAAAGTGGTGGATAGTTCCTTGAAC
TATAATAAAAACCTCATCTTCATACACTCTTCTGGCTCGAGATGACGATCGCCTTCATTC
TCTATCAATGAAAACCAAAGCAAGGGTTTTGAAAGCACTTTATAAACTTAGATGAAGATT
AAAAGAGCTAAAGAAAACATTTTTGATATCTCTGAAGAACATTACTTTTTCATCAGAGGC
GGAGGAGACAGGGGATTTCCCATTTGGTTTCATCGCCATGGATTGAGCTTTGAGCGGTTC
TAAGGTTTTGGTTTGTAGAAAGGAAAGAAGATCGGTATATAAAGAAGGAGATGAAACGAA
TTCATTAAAAAGGTATTGATTGATGGAAATAAAGTAGAATATTGATGATTTAGAAGTGGC
TCGATCAAAACTCAGTTTTGATGGTTTTCAATTGAAGAAGACGAACTGTTAGAGACGATA
AGACATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD27JQ U 18
AF RR2GD27TF C 1
BS 1 18 RR2GD27TF
BS 19 470 RR2GD27JQ
BS 471 728 RR2GD27TF

RD RR2GD27JQ 453 0 0
T
TCTCCATGATTGTAATCTGTTTCTTACATAGACTGGACAAAGCTTAATGAACAGTTAAAC
AGAAAAAAACAAATTGCAAGCAGAAACTTCTCCAGCACTATCTCAGTTGTTCTACCAGTG
TATAATAAGTAAATAAAAACACGAAATGAGCACCGAGCAGCATATTCACGCCAACAATCT
GGTTTTCAACTTTAAGGCGAGTTATAGCCATGATGTGGATTCCAGCACTGGAGTGGAAAC
CAGTGGGAAGGATAAAGCAAAGTGGTGGATAGTTCCTTGAACTATAATAAAAACCTCATC
TTCATACACTCTTCTGGCTCGAGATGACGATCGCCTTCATTCTCTATCAATGAAAACCAA
AGCAAGGGTTTTGAAAGCACTTTATAAACTTAGATGAAGATTAAAAGAGCTAAAGAAAAC
ATTTTTGATATCTCTGAAGAACATTACTTTTT

QA 2 453 2 453
DS 

RD RR2GD27TF 728 0 0
CTGTAAAAACATAGAAACTCTCCATGAT*GTAATCTGTT*CTTACATAGACTGGACAAAG
CTTAATGAACAGTTAAACAGAAGAAAACAAATTGCAAGCAGAAACTTCTCCAGCACTATC
TCAGTTGTTCTACCAGTGTATAATAAGTAAATAAGAACACGAAATGAGCACCGAGCAGCA
TATTCACGCCAACAATCTGGTTTTCAACTTTAAGGCGAGTTATAGCCATGATGTGGATTC
GAGCACTGGAGTGGAAACCAGTGGGAAGGATAAAGCAAAGTGGTGGATAGTTCCTTGAAC
TATAATAAGAACCTCATCTTCATACACTCTTCTGGCTCGAGATGACGATCGCCTTCATTC
TCTATCAATGAAAACCAAAGCAAGGGTTTTGAAAGCACTTTATAAACTTAGATGAAGATT
AAAAGAGCTAAAGAAAACATTTTTGATATCTCTGAAGAACATTACTTTTTCATCAGAGGC
GGAGGAGACAGGGGATTTCCCATTTGGTTTCATCGCCATGGATTGAGCTTTGAGCGGTTC
TAAGGTTTTGGTTTGTAGAAAGGAAAGAAGATCGGTATATAAAGAAGGAGATGAAACGAA
TTCATTAAAAAGGTATTGATTGATGGAAATAAAGTAGAATATTGATGATTTAGAAGTGGC
TCGATCAAAACTCAGTTTTGATGGTTTTCAATTGAAGAAGACGAACTGTTAGAGACGATA
AGACATCC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6970Contig1 973 2 2 U
AGGGATCGTACCGTTCGAGCCTTTTTTTCATGCTTTTCCCGGGGGTCTGGAGAAAGCTGC
AATCAATAGGATTTTCCTAATCCTCCCTTCCCGAAAGGAAGAACGTGAAATTCTTTTTCC
TTTCCGCCTCGAAATGGGAGCAGGTTTGAAAAAGGATCTTAGAGTGTCTAGGGTTAGGCC
AGTAGGGTCTCTTAACGCCCTCTTTTTTCTTCTCATCGAAGTTATTTCGCAAATACTTCC
TATGGTAAGGAAGAGGGGGGGAACAAGTACACTTGGAGAGCGCAGTACAACGGAGAGTTG
TATGCTGCGTTCGGGAAGGATGAATCGCTCCCGAAAAGGAACCTATTGATTCTCTCCCAA
TTGGTTGGACCATAGGTGCGATGATTTACTTCACGGGCGAGGTCTCTGGTTCAAATCCAG
GATGGCCAGCTGCGCCAAGGAAAAGAATATAAGAAGGATCTGACTCCTTCATGCATGCTC
CACTTGGCTCGGGGGGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCTCCGCTCTTGCAATTGGGTCGTT
GCGATTACGGGTTGGGTGTCTAATTGTCCAGGCGGTAATGATAGTATCTTGTACCTGAAC
CGGTGGCTCACTTTTTCTAAGTAATGGGGAAAAGGACCGAAACATGCCACTGAAAGACTC
TACTGAGACAAAGATGGGCTGTCAAGAACGTAGAGGAGGTAGGATGGTCAGTTGGTCAGA
TCTAGTATGGATCGTACATGGACGGTAGTTGGAGTCGGCGGCTCTCCTAGGGTTCCCTCG
TCTGGGATTGATCCCTGGGGAAGAGGATCAAGTTGGCCCTTGCGAACAGCTTGATACACT
ATCTCCCTTCAACCCTTTGAGCGAAATGCGGCAAAAGGAAAAAATCCATGGACCGACCCC
ATCGTCTCCACCCCGTAGGAACTACGAGATCACCCCAAGGACGCCTTCGGTATCCAGGGG
TCGCGGACCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE42TF U 1
AF RR2GE42JQ C 252
BS 1 684 RR2GE42TF
BS 685 973 RR2GE42JQ

RD RR2GE42TF 687 0 0
AGGGATCGTACCGTTCGAGCCTTTTTTTCATGCTTTTCCCGGGGGTCTGGAGAAAGCTGC
AATCAATAGGATTTTCCTAATCCTCCCTTCCCGAAAGGAAGAACGTGAAATTCTTTTTCC
TTTCCGCCTCGAAATGGGAGCAGGTTTGAAAAAGGATCTTAGAGTGTCTAGGGTTAGGCC
AGTAGGGTCTCTTAACGCCCTCTTTTTTCTTCTCATCGAAGTTATTTCGCAAATACTTCC
TATGGTAAGGAAGAGGGGGGGAACAAGTACACTTGGAGAGCGCAGTACAACGGAGAGTTG
TATGCTGCGTTCGGGAAGGATGAATCGCTCCCGAAAAGGAACCTATTGATTCTCTCCCAA
TTGGTTGGACCATAGGTGCGATGATTTACTTCACGGGCGAGGTCTCTGGTTCAAATCCAG
GATGGCCAGCTGCGCCAAGGAAAAGAATATAAGAAGGATCTGACTCCTTCATGCATGCTC
CACTTGGCTCGGGGGGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCTCCGCTCTTGCAATTGGGTCGTT
GCGATTACGGGTTGGGTGTCTAATTGTCCAGGCGGTAATGATAGTATCTTGTACCTGAAC
CGGTGGCTCACTTTTTCTAAGTAATGGGGAAAAGGACCGAAACATGCCACTGAAAGACTC
TACTGAGACAAAGATGGGCTGTCA
GAC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2GE42JQ 722 0 0
AGAGGGGGGGAACAAGTACACTTGGAGAGCGCAGTACAACGGAGAGTTGTATGCTGCGTT
CGGGAAGGATGAATCGCTCCCGAAAAGGAACCTATTGATTCTCTCCCAATTGGTTGGACC
ATAGGTGCGATGATTTACTTCACGGGCGAGGTCTCTGGTTCAAATCCAGGATGGCCAGCT
GCGCCAAGGAAAAGAATATAAGAAGGATCTGACTCCTTCATGCATGCTCCACTTGGCTCG
GGGGGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCTCCGCTCTTGCAATTGGGTCGTTGCGATTACGGG
TTGGGTGTCTAATTGTCCAGGCGGTAATGATAGTATCTTGTACCTGAACCGGTGGCTCAC
TTTTTTTAAGTAATGGGGAAAAGGACCGAAACATGCCACTGAAAGACTCTACTGAGACAA
AGATGGGCTGTCAAGAACGTAGAGGAGGTAGGATGGTCAGTTGGTCAGATCTAGTATGGA
TCGTACATGGACGGTAGTTGGAGTCGGCGGCTCTCCTAGGGTTCCCTCGTCTGGGATTGA
TCCCTGGGGAAGAGGATCAAGTTGGCCCTTGCGAACAGCTTGATACACTATCTCCCTTCA
ACCCTTTGAGCGAAATGCGGCAAAAGGAAAAAATCCATGGACCGACCCCATCGTCTCCAC
CCCGTAGGAACTACGAGATCACCCCAAGGACGCCTTCGGTATCCAGGGGTCGCGGACCGA
CC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL6971Contig1 792 2 2 U
CCTTGTCTCTCTCTCTCTCTGATCATGGCTTCCTCTGCATCACCTGGAGTGAAATTTGTG
CCAGAAGAGGATAACTTCTTGCAGAGACATGTGGCCTTCTTTGACCGGAACAAAGATGGC
ATCGTTTATCCCTCGGAGACATATCAAGGATTTAGAGCAATCGGATGTGGATATCTCTTG
TCGGCATTTGCTTCTCTGTTCATCAACATGGGTCTAAGCAGCAAAACTCGCCCGGGTAAA
GGTTTCTCCTTCTCATTTCCCATAGAGGTTAAGAATATACACCTTGCCAAACACGGCAGC
GATTCAGGCGTTTACGATAAGGATGGAAGTTTTGTGGCATCGAAGTTCGAGGAGGTATTC
GCGAAGCATTCAAAAACACATCCCGATGCTTTGACGGGGGAGGAACTCAAACAACTCCTC
AACGCAAACAAAGAGCCTAATGATCGCAAAGGAGCGATTGCTGGATATACAGAGTGGAAG
ACGTTGCATTATTTGTGTAAAGACAAGAACGGTCTGTTGCACAAAGAGACGGTGAGAGCT
GCGTACGATGGTTCTCTTTTCGAACAACTCGAGAGACAGACAGCTTCTAAGAAGCATCCA
TAAACACCCGCTTCAAACAAACTCTTATTTGCTTGTGAATCTGTTTATTTATTCAAACTT
TCAGTACATTAATGTTATCGTGGACAATGTCGTGAAGATTGCAATGCGTTTAGTTTTTCT
TTTATTTGATTAATTGTGTATGTACTTGTATCGTTTGGGGCAATTTATTCAAATTGAAGG
CAAACATATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE55TF U 1
AF RR2BE55JQ C 43
BS 1 774 RR2BE55TF
BS 775 792 RR2BE55JQ

RD RR2BE55TF 774 0 0
CCTTGTCTCTCTCTCTCTCTGATCATGGCTTCCTCTGCATCACCTGGAGTGAAATTTGTG
CCAGAAGAGGATAACTTCTTGCAGAGACATGTGGCCTTCTTTGACCGGAACAAAGATGGC
ATCGTTTATCCCTCGGAGACATATCAAGGATTTAGAGCAATCGGATGTGGATATCTCTTG
TCGGCATTTGCTTCTCTGTTCATCAACATGGGTCTAAGCAGCAAAACTCGCCCGGGTAAA
GGTTTCTCCTTCTCATTTCCCATAGAGGTTAAGAATATACACCTTGCCAAACACGGCAGC
GATTCAGGCGTTTACGATAAGGATGGAAGTTTTGTGGCATCGAAGTTCGAGGAGGTATTC
GCGAAGCATTCAAAAACACATCCCGATGCTTTGACGGGGGAGGAACTCAAACAACTCCTC
AACGCAAACAAAGAGCCTAATGATCGCAAAGGAGCGATTGCTGGATATACAGAGTGGAAG
ACGTTGCATTATTTGTGTAAAGACAAGAACGGTCTGTTGCACAAAGAGACGGTGAGAGCT
GCGTACGATGGTTCTCTTTTCGAACAACTCGAGAGACAGACAGCTTCTAAGAAGCATCCA
TAAACACCCGCTTCAAACAAACTCTTATTTGCTTGTGAATCTGTTTATTTATTCAAACTT
TCAGTACATTAATGTTATCGTGGACAATGTCGTGAAGATTGCAATGCGTTTAGTTTTTCT
TTTATTTGATTAATTGTGTATGTACTTGTATCGTTTGGGGCAATTTATTCAAAT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2BE55JQ 750 0 0
CCTGGAGTGAAATTTGTGCCAGAAGAGGATAACTTCTTGCAGAGACATGTGGCCTTCTTT
GACCGGAACAAAGATGGCATCGTTTATCCCTCGGAGACATATCAAGGATTTAGAGCAATC
GGATGTGGATATCTCTTGTCGGCATTTGCTTCTCTGTTCATCAACATGGGTCTAAGCAGC
AAAACTCGCCCGGGTAAAGGTTTCTCCTTCTCATTTCCCATAGAGGTTAAGAATATACAC
CTTGCCAAACACGGCAGCGATTCAGGCGTTTACGATAAGGATGGAAGTTTTGTGGCATCG
AAGTTCGAGGAGGTATTCGCGAAGCATTCAAAAACACATCCCGATGCTTTGACGGGGGAG
GAACTCAAACAACTCCTCAACGCAAACAAAGAGCCTAATGATCGCAAAGGAGCGATTGCT
GGATATACAGAGTGGAAGACGTTGCATTATTTGTGTAAAGACAAGAACGGTCTGTTGCAC
AAAGAGACGGTGAGAGCTGCGTACGATGGTTCTCTTTTCGAACAACTCGAGAGACAGACA
GCTTCTAAGAAGCATCCATAAACACCCGCTTCAAACAAACTCTTATTTGCTTGTGAATCT
GTTTATTTATTCAAACTTTCAGTACATTAATGTTATCGTGGACAATGTCGTGAAGATTGC
AATGCGTTTAGTTTTTCTTTTATTTGATTAATTGTGTATGTACTTGTATCGTTTGGGGCA
ATTTATTCAAATTGAAGGCAAACATATCCC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL6972Contig1 1079 2 2 U
GTCTATGGATGAGGATAACTACAAGGAAGCCATTGAAGCTGCTTTCAAAGTTTTTGCTCC
TCGTGGAATCAGCTCAGAGATTCAACAAATTTGCAATGATAGTTGTGCTGAACCGAGTTC
AAGCTCCTCAGATTTTTGGGTGATGGTTGCGGCTCTGAAGGAGTTTGTCTCAAACGAAGG
TGAGGGAGAGGCACCCCTTGAAGGCTCCATACCGGATATGACGTCTTCAACAGAACACTA
TATCAATTTGCAGAAAATCTATCTAGCAAAAGCCGAGGCTGATGCTCTTGTCATGGAGAA
ACGAGTTAAAAACATTTTGAAGAAAATCGGTCGAGATCCGAGCAGCATCTCAAAACCAAC
AATCAAGAGCTTCTGTAAGAATGCAAGAAAACTTAAAGTATGCAGATATCGTATGGTAGA
AGACGAGTTCAGCAATCCTTCTGTAACCGAAATTCAAAAGTGTTTAGCGGACGAGGATTA
CAGTGGTGCAATGGGATTTTATGTTCTTCTTAGAGCTGTGGACAGATTTACTGCCAACTA
CAACAAGTTTCCTGGCCAGTTTGATGGAGGAATGGATGAAGACATTTCTCGGTTAAAAAC
TACGGCATTGAGTCTTCTTGCCGACTTGGGGTGTAACGGCTCGGTACTGCCCGATGACCT
TATCAATGAGATGTGTCGCCTTGGTGCCTCGGAGCTTCATGTGGTTGCTGCCTTTGTTGG
AGGAATCGCATCTCAAGAAGTCATCAAGCTTGTCACAAAACAGTTTGTGCCGATGTTGGG
GACTTACATCTTCAACGGCATTGATCACAAGTCTCAGTTGTTGACACTGTAGGAGATCTC
TCCTTGGACATTGGTGGCTTGAAACAGAGAGAATAGCGTTATATTATGTTTTTTTATTCT
TCACTGAGTTTTAAAAGAATCTTTTCGCGGGTGTACCTGTTCAAGGATATGATTTTAACC
GGCACAAGATTATGCCCTGAGTGTTTAGCTTTTATATCAATGGTCACATGAATCGTATTG
ATGGTCCATGTTATAACCGCATCAACCAAGCATGTGATTATTGAAAACTTCAGTTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C225TF U 1
AF RR2C225JQ C 250
BS 1 718 RR2C225TF
BS 719 1079 RR2C225JQ

RD RR2C225TF 718 0 0
GTCTATGGATGAGGATAACTACAAGGAAGCCATTGAAGCTGCTTTCAAAGTTTTTGCTCC
TCGTGGAATCAGCTCAGAGATTCAACAAATTTGCAATGATAGTTGTGCTGAACCGAGTTC
AAGCTCCTCAGATTTTTGGGTGATGGTTGCGGCTCTGAAGGAGTTTGTCTCAAACGAAGG
TGAGGGAGAGGCACCCCTTGAAGGCTCCATACCGGATATGACGTCTTCAACAGAACACTA
TATCAATTTGCAGAAAATCTATCTAGCAAAAGCCGAGGCTGATGCTCTTGTCATGGAGAA
ACGAGTTAAAAACATTTTGAAGAAAATCGGTCGAGATCCGAGCAGCATCTCAAAACCAAC
AATCAAGAGCTTCTGTAAGAATGCAAGAAAACTTAAAGTATGCAGATATCGTATGGTAGA
AGACGAGTTCAGCAATCCTTCTGTAACCGAAATTCAAAAGTGTTTAGCGGACGAGGATTA
CAGTGGTGCAATGGGATTTTATGTTCTTCTTAGAGCTGTGGACAGATTTACTGCCAACTA
CAACAAGTTTCCTGGCCAGTTTGATGGAGGAATGGATGAAGACATTTCTCGGTTAAAAAC
TACGGCATTGAGTCTTCTTGCCGACTTGGGGTGTAACGGCTCGGTACTGCCCGATGACCT
TATCAATGAGATGTGTCGCCTTGGTGCCTCGGAGCTTCATGTGGTTGCTGCCTTTGTT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2C225JQ 830 0 0
GCAGAAAATCTATCTAGCAAAAGCCGAGGCTGATGCTCTTGTCATGGAGAAACGAGTTAA
AAACATTTTGAAGAAAATCGGTCGAGATCCGAGCAGCATCTCAAAACCAACAATCAAGAG
CTTCTGTAAGAATGCAAGAAAACTTAAAGTATGCAGATATCGTATGGTAGAAGACGAGTT
CAGCAATCCTTCTGTAACCGAAATTCAAAAGTGTTTAGCGGACGAGGATTACAGTGGTGC
AATGGGATTTTATGTTCTTCTTAGAGCTGTGGACAGATTTACTGCCAACTACAACAAGTT
TCCTGGCCAGTTTGATGGAGGAATGGATGAAGACATTTCTCGGTTAAAAACTACGGCATT
GAGTCTTCTTGCCGACTTGGGGTGTAACGGCTCGGTACTGCCCGATGACCTTATCAATGA
GATGTGTCGCCTTGGTGCCTCGGAGCTTCATGTGGTTGCTGCCTTTGTTGGAGGAATCGC
ATCTCAAGAAGTCATCAAGCTTGTCACAAAACAGTTTGTGCCGATGTTGGGGACTTACAT
CTTCAACGGCATTGATCACAAGTCTCAGTTGTTGACACTGTAGGAGATCTCTCCTTGGAC
ATTGGTGGCTTGAAACAGAGAGAATAGCGTTATATTATGTTTTTTTATTCTTCACTGAGT
TTTAAAAGAATCTTTTCGCGGGTGTACCTGTTCAAGGATATGATTTTAACCGGCACAAGA
TTATGCCCTGAGTGTTTAGCTTTTATATCAATGGTCACATGAATCGTATTGATGGTCCAT
GTTATAACCGCATCAACCAAGCATGTGATTATTGAAAACTTCAGTTTACT

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 2

CO CL6973Contig1 1015 2 6 U
GGGCGGAGATCGTGAGTATCGGGAGGATGAGTCACCGGAACTTGGTTCCTTTGTTGGGGT
ACTGTCGCAGGAGAGGAGAGCTTCTTCTTGTTTACGATTACATGCCCAACGGGAGCTTGG
ATAAGTATCTATACAATAATCCGGAGAGGACGTTGGATTGGAGACAGAGGTCTAAGATCG
TCAAAGGAGTTGCCTCTGGATTGTTCTATCTCCACGAGGAGTGGGAACAGGTGGTTATCC
ACCGTGACGTGAAAGCTAGTAACGTTTTGTTAGACGCGGACTTCAACGGTAGACTCGGGG
ATTTCGGGTTGGCCCGGTTGTACGATCACGGGTCGGATCCTCAGACCACTCACGTCGTTG
GTACGTTGGGTTACTTAGCACCTGAACATTCTCGTACGGGACGTGCCACAACGGCTACCG
ATGTCTATGCGTTTGGTGCGTTTCTTCTAGAAGTTGTTTCGGGTAGGAGACCCATCGAGC
TGCACAGCGAGAGCGATGATACGTTCTTGCTTGTGGAGTGGGTTTTCGGTTTGTGGGTTA
GAGGGAACATAGTGGAAGCGAAAGATCCGAATCTTGGGTGTGATGATGGGTACGATCTTG
AAGAGGTTGAGATGGTTTTGAAGCTCGGTCTGTTGTGTTCTCATTCGGACCCTCGGGCTA
GGCCGAGTATGAGGCTGGTGTTACAGTATCTGAGGGGAGACATGAGCTTGCCGGAACTGA
CGCCGTTGGACTTGTCGGCGGGGAATGGGATGAGCTTGGGAGGGAGAGACGGTTTTAGCG
GTGTTGCCATGTCGTATTCTTCCTCGGTGTTTAGAGGGTTTACCGGTGTGTCTTCGATCG
CTGATTCTCTACTCTCTGGTGGGAGGTGATTGATGATGTTACAACCACATTAGCAACGTA
TGATGATGCTCTTGCTTTATTTATTTATAATTTTTTATGAATGTATATACAGTTTTGCGT
AGATGTAAGACTTTCTTACGTAAACTTTGATTATATATAAGATTATGATTGTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC44TF U 1
AF RR2AC44JQ C 110
BS 1 661 RR2AC44TF
BS 662 662 RR2AC44JQ
BS 663 742 RR2AC44TF
BS 743 743 RR2AC44JQ
BS 744 767 RR2AC44TF
BS 768 1015 RR2AC44JQ

RD RR2AC44TF 767 0 0
GGGCGGAGATCGTGAGTATCGGGAGGATGAGTCACCGGAACTTGGTTCCTTTGTTGGGGT
ACTGTCGCAGGAGAGGAGAGCTTCTTCTTGTTTACGATTACATGCCCAACGGGAGCTTGG
ATAAGTATCTATACAATAATCCGGAGAGGACGTTGGATTGGAGACAGAGGTCTAAGATCG
TCAAAGGAGTTGCCTCTGGATTGTTCTATCTCCACGAGGAGTGGGAACAGGTGGTTATCC
ACCGTGACGTGAAAGCTAGTAACGTTTTGTTAGACGCGGACTTCAACGGTAGACTCGGGG
ATTTCGGGTTGGCCCGGTTGTACGATCACGGGTCGGATCCTCAGACCACTCACGTCGTTG
GTACGTTGGGTTACTTAGCACCTGAACATTCTCGTACGGGACGTGCCACAACGGCTACCG
ATGTCTATGCGTTTGGTGCGTTTCTTCTAGAAGTTGTTTCGGGTAGGAGACCCATCGAGC
TGCACAGCGAGAGCGATGATACGTTCTTGCTTGTGGAGTGGGTTTTCGGTTTGTGGGTTA
GAGGGAACATAGTGGAAGCGAAAGATCCGAATCTTGGGTGTGATGATGGGTACGATCTTG
AAGAGGTTGAGATGGTTTTGAAGCTCGGTCTGTTGTGTTCTCATTCGGACCCTCGGGCTA
G*CCGAGTATGAGGCTGGTGTTACAGTATCTGAGGGGAGACATGAGCTTGCCGGAACTGA
CGCCGTTGGACTTGTCGGCGGG*AATGGGATGAGCTTGGGAGGGAGA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2AC44JQ 906 0 0
CGGGAGCTTGGATAAGTATCTATACAATAATCCGGAGAGGACGTTGGATTGGAGACAGAG
GTCTAAGATCGTCAAAGGAGTTGCCTCTGGATTGTTCTATCTCCACGAGGAGTGGGAACA
GGTGGTTATCCACCGTGACGTGAAAGCTAGTAACGTTTTGTTAGACGCGGACTTCAACGG
TAGACTCGGGGATTTCGGGTTGGCCCGGTTGTACGATCACGGGTCGGATCCTCAGACCAC
TCACGTCGTTGGTACGTTGGGTTACTTAGCACCTGAACATTCTCGTACGGGACGTGCCAC
AACGGCTACCGATGTCTATGCGTTTGGTGCGTTTCTTCTAGAAGTTGTTTCGGGTAGGAG
ACCCATCGAGCTGCACAGCGAGAGCGATGATACGTTCTTGCTTGTGGAGTGGGTTTTCGG
TTTGTGGGTTAGAGGGAACATAGTGGAAGCGAAAGATCCGAATCTTGGGTGTGATGATGG
GTACGATCTTGAAGAGGTTGAGATGGTTTTGAAGCTCGGTCTGTTGTGTTCTCATTCGGA
CCCTCGGGCTAGGCCGAGTATGAGGCTGGTGTTACAGTATCTGAGGGGAGACATGAGCTT
GCCGGAACTGACGCCGTTGGACTTGTCGGCGGGGAATGGGATGAGCTTGGGAGGGAGAGA
CGGTTTTAGCGGTGTTGCCATGTCGTATTCTTCCTCGGTGTTTAGAGGGTTTACCGGTGT
GTCTTCGATCGCTGATTCTCTACTCTCTGGTGGGAGGTGATTGATGATGTTACAACCACA
TTAGCAACGTATGATGATGCTCTTGCTTTATTTATTTATAATTTTTTATGAATGTATATA
CAGTTTTGCGTAGATGTAAGACTTTCTTACGTAAACTTTGATTATATATAAGATTATGAT
TGTGAT

QA 1 906 1 906
DS 



AS 1 2

CO CL6974Contig1 813 2 2 U
GATTGCAGGAAAAGAGAAGCTTATATTATATGAATTTATGGCTACTGGCGACCTTCACCG
ATGGCTTCACGAGCTCCCAACAGGAGAAGTCAACGTGGAAGATTGGAGCGCCGATACATG
GGAGAGTCACGTCGGAGATTCATCACCAGAGAAAACAAACTGGCTAATACGTCACCGTAT
CGCTATTGGAGTTGCACGTGGTCTAGCCTATCTACATCATGTTGGTACCACTCATGGTCA
CTTAGTTGCTACCAACATCCTCCTAACCGAAACCCTAGAGCCACGAATCTCTGATTTTGG
TATCAACAACATCGCAAAAACAGGAAACGATGCTAATAATAACAATTTAGACTTCGATGT
GTATTGTTTTGGAGTGATTTTGTTTGAGCTCTTGACCGGTAAGCAAGGGAGTGAGGAACA
TGTGAAATCAGTTCGACGGTTGTTTAAGGAGAGGAGAGGAGAGGAAGCACTTGACTCGAG
ATTGCGGTTAGCTTATGGAGAATCGGTTAATGAGATGGTCGAGAGTCTTAGAATTGGTCA
CTTCTGTACGGCGGAGACACCAGGGAAACGGCCAACAATGCAACAAGTGTACGGTCTGCT
TAAAGACATTCGTACCGTTTCTCGTTGAGTTAGGAAACAAAGTGTAATAGATTTTCGGAT
GTTGTTAATTATGGACATATTGTGCGAGATAAATGCGTTTTGTCAAGCTATTATATGTTT
TTGAGCCTATGTTTTTGTTTGAAACTATAGGAAACACGTTGTACCAAACGCAGAAAAATA
TTTGCCAAAAAAAACTATAGGAAACAAATGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO35TF U 1
AF RR2FO35JQ C 58
BS 1 746 RR2FO35TF
BS 747 813 RR2FO35JQ

RD RR2FO35TF 746 0 0
GATTGCAGGAAAAGAGAAGCTTATATTATATGAATTTATGGCTACTGGCGACCTTCACCG
ATGGCTTCACGAGCTCCCAACAGGAGAAGTCAACGTGGAAGATTGGAGCGCCGATACATG
GGAGAGTCACGTCGGAGATTCATCACCAGAGAAAACAAACTGGCTAATACGTCACCGTAT
CGCTATTGGAGTTGCACGTGGTCTAGCCTATCTACATCATGTTGGTACCACTCATGGTCA
CTTAGTTGCTACCAACATCCTCCTAACCGAAACCCTAGAGCCACGAATCTCTGATTTTGG
TATCAACAACATCGCAAAAACAGGAAACGATGCTAATAATAACAATTTAGACTTCGATGT
GTATTGTTTTGGAGTGATTTTGTTTGAGCTCTTGACCGGTAAGCAAGGGAGTGAGGAACA
TGTGAAATCAGTTCGACGGTTGTTTAAGGAGAGGAGAGGAGAGGAAGCACTTGACTCGAG
ATTGCGGTTAGCTTATGGAGAATCGGTTAATGAGATGGTCGAGAGTCTTAGAATTGGTCA
CTTCTGTACGGCGGAGACACCAGGGAAACGGCCAACAATGCAACAAGTGTACGGTCTGCT
TAAAGACATTCGTACCGTTTCTCGTTGAGTTAGGAAACAAAGTGTAATAGATTTTCGGAT
GTTGTTAATTATGGACATATTGTGCGAGATAAATGCGTTTTGTCAAGCTATTATATGTTT
TTGAGCCTATGTTTTTGTTTGAAACT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2FO35JQ 756 0 0
CCGATGGCTTCACGAGCTCCCAACAGGAGAAGTCAACGTGGAAGATTGGAGCGCCGATAC
ATGGGAGAGTCACGTCGGAGATTCATCACCAGAGAAAACAAACTGGCTAATACGTCACCG
TATCGCTATTGGAGTTGCACGTGGTCTAGCCTATCTACATCATGTTGGTACCACTCATGG
TCACTTAGTTGCTACCAACATCCTCCTAACCGAAACCCTAGAGCCACGAATCTCTGATTT
TGGTATCAACAACATCGCAAAAACAGGAAACGATGCTAATAATAACAATTTAGACTTCGA
TGTGTATTGTTTTGGAGTGATTTTGTTTGAGCTCTTGACCGGTAAGCAAGGGAGTGAGGA
ACATGTGAAATCAGTTCGACGGTTGTTTAAGGAGAGGAGAGGAGAGGAAGCACTTGACTC
GAGATTGCGGTTAGCTTATGGAGAATCGGTTAATGAGATGGTCGAGAGTCTTAGAATTGG
TCACTTCTGTACGGCGGAGACACCAGGGAAACGGCCAACAATGCAACAAGTGTACGGTCT
GCTTAAAGACATTCGTACCGTTTCTCGTTGAGTTAGGAAACAAAGTGTAATAGATTTTCG
GATGTTGTTAATTATGGACATATTGTGCGAGATAAATGCGTTTTGTCAAGCTATTATATG
TTTTTGAGCCTATGTTTTTGTTTGAAACTATAGGAAACACGTTGTACCAAACGCAGAAAA
ATATTTGCCAAAAAAAACTATAGGAAACAAATGTTG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL6975Contig1 759 2 2 U
GGGTGCTATGTAATGTGGTAAACATTATATCACATATATAAGTAATAACCAATGGAAGGT
GGTTTTATGGCTACGTCGCAGTCGTATTACGAAGTTCTTGGCGTCGCAGTTGATTCCTCG
GCGGAGGAGATACGACGAGCTTATCGGAAACTGGCTATGAAATGGCATCCTGATCGATGG
ACGAAAGATCCTTTTAGGTCTGGAGAAGCGAAACGAAGGTTTCAGCAGATTCAAGAAGCT
TATTCAGTACTGTCGGATCAGAAGAAACGAAGTTTGTACGATGTGGGACTCTATGATACT
CAAGAAGATGAGGGATATTACGACTTCGTTGAGGAGATGGTTTCTCTTATGGCGCAGACG
AGAAGAGAGGAAAAGCAATACAGCTTGCAGGAGTTGCAGACAATGGTCGATGATATGGTC
CTCGCATATGTCTCTTCCGGTTTCAAGCTTCGAGTTCTGTTCTCAGAGCAGCTACTGTAA
CTAGATCTTACGGAATAACGATTGAAGAACCACGGTCCTTGGCCTCAGAGTCTCATGACA
GTACAGTCTTTTACTTGTGGGGCAAGAATCTCATGCTCTGGGAGTTTTCACGTTTTGCTG
TTGTCGACAAGTAGCCCTCGAAATGTTGCCAGGGCTGTGTGAATAATGTTTGTAATGTTT
CAGAAAGCGTTGGTCTGTAATTGCGTTTTCTTCTAGTGCTTTTGTACTTTTGAACTGTCA
CCGGACAGAGAAGTTGAAAACAATGGAATATCTTGGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM33TF U 1
AF RR2EM33JQ C 103
BS 1 751 RR2EM33TF
BS 752 759 RR2EM33JQ

RD RR2EM33TF 751 0 0
GGGTGCTATGTAATGTGGTAAACATTATATCACATATATAAGTAATAACCAATGGAAGGT
GGTTTTATGGCTACGTCGCAGTCGTATTACGAAGTTCTTGGCGTCGCAGTTGATTCCTCG
GCGGAGGAGATACGACGAGCTTATCGGAAACTGGCTATGAAATGGCATCCTGATCGATGG
ACGAAAGATCCTTTTAGGTCTGGAGAAGCGAAACGAAGGTTTCAGCAGATTCAAGAAGCT
TATTCAGTACTGTCGGATCAGAAGAAACGAAGTTTGTACGATGTGGGACTCTATGATACT
CAAGAAGATGAGGGATATTACGACTTCGTTGAGGAGATGGTTTCTCTTATGGCGCAGACG
AGAAGAGAGGAAAAGCAATACAGCTTGCAGGAGTTGCAGACAATGGTCGATGATATGGTC
CTCGCATATGTCTCTTCCGGTTTCAAGCTTCGAGTTCTGTTCTCAGAGCAGCTACTGTAA
CTAGATCTTACGGAATAACGATTGAAGAACCACGGTCCTTGGCCTCAGAGTCTCATGACA
GTACAGTCTTTTACTTGTGGGGCAAGAATCTCATGCTCTGGGAGTTTTCACGTTTTGCTG
TTGTCGACAAGTAGCCCTCGAAATGTTGCCAGGGCTGTGTGAATAATGTTTGTAATGTTT
CAGAAAGCGTTGGTCTGTAATTGCGTTTTCTTCTAGTGCTTTTGTACTTTTGAACTGTCA
CCGGACAGAGAAGTTGAAAACAATGGAATAT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2EM33JQ 657 0 0
GTCGCAGTTGATTCCTCGGCGGAGGAGATACGACGAGCTTATCGGAAACTGGCTATGAAA
TGGCATCCTGATCGATGGACGAAAGATCCTTTTAGGTCTGGAGAAGCGAAACGAAGGTTT
CAGCAGATTCAAGAAGCTTATTCAGTACTGTCGGATCAGAAGAAACGAAGTTTGTACGAT
GTGGGACTCTATGATACTCAAGAAGATGAGGGATATTACGACTTCGTTGAGGAGATGGTT
TCTCTTATGGCGCAGACGAGAAGAGAGGAAAAGCAATACAGCTTGCAGGAGTTGCAGACA
ATGGTCGATGATATGGTCCTCGCATATGTCTCTTCCGGTTTCAAGCTTCGAGTTCTGTTC
TCAGAGCAGCTACTGTAACTAGATCTTACGGAATAACGATTGAAGAACCACGGTCCTTGG
CCTCAGAGTCTCATGACAGTACAGTCTTTTACTTGTGGGGCAAGAATCTCATGCTCTGGG
AGTTTTCACGTTTTGCTGTTGTCGACAAGTAGCCCTCGAAATGTTGCCAGGGCTGTGTGA
ATAATGTTTGTAATGTTTCAGAAAGCGTTGGTCTGTAATTGCGTTTTCTTCTAGTGCTTT
TGTACTTTTGAACTGTCACCGGACAGAGAAGTTGAAAACAATGGAATATCTTGGCCT

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL6976Contig1 1152 2 2 U
GGGGAGAACCGATCCAGATGGGACAGAGGGTGGCCTCTTTTCGTCTGGAGATGCGGAACG
TTGAGAGCGGCGAGTGGGAGAGAGTTGTGAGCGGCACGACCGTTGGTTTCAAAAGGCTTT
TGAGGTTTCCGAGATGTGAGTCTCGGTCTCTGAAGCTTGTGGTGGAGAAAGCGAGGGCCG
ACCCGCTTATATCGTACGTTGGAGTATACATGGATAAGTTTTCGGATCCGGGGAGGGACG
CATCATCTAAGATAACAGTCACAAGGACACTTCGGGAGGAGATTGTAATGAATGATTCCA
AGAAATAACTTCTCTGAAGAAGTGTTAGGTGCTTCGTTAAATGATATAATCATGTTGTTA
TATTATCATTTGTGACTTCTATCTAAATAAAATAAAATGATCCACGTTGTGTGTATAAAG
GCTCTAATTTTCTCTCTTTTGTAGGTCATAGTTTTACCTCTTAGGTGTATTTAATTTTGT
CCAATGTAGTGTCAAGAAATATTCTTTTGCTGAATGTGTCGAATCTCCTTTGAGCTGTGT
TCTGAATTTGTGTTGTTTGTTAATCTAGCAGATTAATGTGTTGACAACAGATACATCAGT
TTAAACCGTGATATGCTTTGAAAGAGCTGCGACAGTTCTCTTCGGTTGCTCAGATGATGC
GTTTTTGGACTTCACTAAACCCAATCCTTAAGCTGCATCTTTAAGCTAGTCACGTCTGTG
ATGGAGAAATGCTTCGGATGCAATTATTTCGGCCTTGAAACCTTAAGCTCAACACATGAG
AGTGACTTAACTTGTTCCACTAAGATCAGTGTTTCAGCCAGCTATAGTAACACTGATACA
ACTCTGTTGCACAAAGAGTGCTTCTTTGGGGGATTGTTCCACAAGAAATCTCAATTTCTA
ATGTTGGAGTCAAACATATGGATGTTACCAACAGTAGTAAGTCGTTTGATATCGTGTTTA
TACTTGATTTGTGTCGGTGAAATAGTCTGCCTCTTCGTTAAGTTCACCTCTTCGGTTAAT
CAAATGCAGACTGTTTAACTGCACATGCAAGTGGAACGATCGATTGAAAAATTAAGAATT
TTTAAAAATAAATATATAATTTATGATGTAAAAATTTAAACTTTGAAATATAGTTCTAAA
TTTAGAGCTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX84TF U 1
AF RR2CX84JQ C 447
BS 1 543 RR2CX84TF
BS 544 1152 RR2CX84JQ

RD RR2CX84TF 543 0 0
GGGGAGAACCGATCCAGATGGGACAGAGGGTGGCCTCTTTTCGTCTGGAGATGCGGAACG
TTGAGAGCGGCGAGTGGGAGAGAGTTGTGAGCGGCACGACCGTTGGTTTCAAAAGGCTTT
TGAGGTTTCCGAGATGTGAGTCTCGGTCTCTGAAGCTTGTGGTGGAGAAAGCGAGGGCCG
ACCCGCTTATATCGTACGTTGGAGTATACATGGATAAGTTTTCGGATCCGGGGAGGGACG
CATCATCTAAGATAACAGTCACAAGGACACTTCGGGAGGAGATTGTAATGAATGATTCCA
AGAAATAACTTCTCTGAAGAAGTGTTAGGTGCTTCGTTAAATGATATAATCATGTTGTTA
TATTATCATTTGTGACTTCTATCTAAATAAAATAAAATGATCCACGTTGTGTGTATAAAG
GCTCTAATTTTCTCTCTTTTGTAGGTCATAGTTTTACCTCTTAGGTGTATTTAATTTTGT
CCAATGTAGTGTCAAGAAATATTCTTTTGCTGAATGTGTCGAATCTCCTTTGAGCTGTGT
TCT

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2CX84JQ 706 0 0
CATAGTTTTACCTCTTAGGTGTATTTAATTTTGTCCAATGTAGTGTCAAGAAATATTCTT
TTGCTGAATGTGTCGAATCTCCTTTGAGCTGTGTTCTGAATTTGTGTTGTTTGTTAATCT
AGCAGATTAATGTGTTGACAACAGATACATCAGTTTAAACCGTGATATGCTTTGAAAGAG
CTGCGACAGTTCTCTTCGGTTGCTCAGATGATGCGTTTTTGGACTTCACTAAACCCAATC
CTTAAGCTGCATCTTTAAGCTAGTCACGTCTGTGATGGAGAAATGCTTCGGATGCAATTA
TTTCGGCCTTGAAACCTTAAGCTCAACACATGAGAGTGACTTAACTTGTTCCACTAAGAT
CAGTGTTTCAGCCAGCTATAGTAACACTGATACAACTCTGTTGCACAAAGAGTGCTTCTT
TGGGGGATTGTTCCACAAGAAATCTCAATTTCTAATGTTGGAGTCAAACATATGGATGTT
ACCAACAGTAGTAAGTCGTTTGATATCGTGTTTATACTTGATTTGTGTCGGTGAAATAGT
CTGCCTCTTCGTTAAGTTCACCTCTTCGGTTAATCAAATGCAGACTGTTTAACTGCACAT
GCAAGTGGAACGATCGATTGAAAAATTAAGAATTTTTAAAAATAAATATATAATTTATGA
TGTAAAAATTTAAACTTTGAAATATAGTTCTAAATTTAGAGCTGAT

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL6977Contig1 532 2 1 U
GGAATCATTCGTTTTCTCGATTTGCGATCTAATTCATAATCCAAATTCTTATTCATTGCC
ATGGCTCTCTCAACTCCTCTTTCTCAGGTCTTTTCTTGTTCTTTTTTGCTATTATTATAT
ACTCTTTAACTTCCCTTTGCTGATTTAACGAAAAGTTTTGGCTTTTTGATTTCAGATGTC
TGTTGCACTTCCTATTGGAATTGATGGGTCGAGCCGATCTATGATTAAGGTAACCAATAC
TGATCTTTATTTATCAATTTTAAACGAACTAATGTTGTGTTTCAGATGCTTTACTTGTAC
TATGTTTATTTGTAGTGAATAAAACTGATCTTGATCAATCAATTTTTACAGAAATATGTT
GTTTCAGATGCTTTAGATGGTCCTGAAATGTTGTTGTCTTTGTGGGGTTTTGTACTAATG
CTAACTTGTAGTGAACTGGGTATTGAAAGGTACAGTCTTTAGTAGCAGAAAGATAACAAA
ATCTGTTTTTTTGTATCTATTTAGTAGTCTTTCTCTTTAGCATCTCATGTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F758JQ C 1
AF RR2F758TF U 1
BS 1 532 RR2F758TF

RD RR2F758JQ 532 0 0
GGAATCATTCGTTTTCTCGATTTGCGATCTAATTCATAATCCAAATTCTTATTCATTGCC
ATGGCTCTCTCAACTCCTCTTTCTCAGGTCTTTTCTTGTTCTTTTTTGCTATTATTATAT
ACTCTTTAACTTCCCTTTGCTGATTTAACGAAAAGTTTTGGCTTTTTGATTTCAGATGTC
TGTTGCACTTCCTATTGGAATTGATGGGTCGAGCCGATCTATGATTAAGGTAACCAATAC
TGATCTTTATTTATCAATTTTAAACGAACTAATGTTGTGTTTCAGATGCTTTACTTGTAC
TATGTTTATTTGTAGTGAATAAAACTGATCTTGATCAATCAATTTTTACAGAAATATGTT
GTTTCAGATGCTTTAGATGGTCCTGAAATGTTGTTGTCTTTGTGGGGTTTTGTACTAATG
CTAACTTGTAGTGAACTGGGTATTGAAAGGTACAGTCTTTAGTAGCAGAAAGATAACAAA
ATCTGTTTTTTTGTATCTATTTAGTAGTCTTTCTCTTTAGCATCTCATGTAG

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2F758TF 532 0 0
GGAATCATTCGTTTTCTCGATTTGCGATCTAATTCATAATCCAAATTCTTATTCATTGCC
ATGGCTCTCTCAACTCCTCTTTCTCAGGTCTTTTCTTGTTCTTTTTTGCTATTATTATAT
ACTCTTTAACTTCCCTTTGCTGATTTAACGAAAAGTTTTGGCTTTTTGATTTCAGATGTC
TGTTGCACTTCCTATTGGAATTGATGGGTCGAGCCGATCTATGATTAAGGTAACCAATAC
TGATCTTTATTTATCAATTTTAAACGAACTAATGTTGTGTTTCAGATGCTTTACTTGTAC
TATGTTTATTTGTAGTGAATAAAACTGATCTTGATCAATCAATTTTTACAGAAATATGTT
GTTTCAGATGCTTTAGATGGTCCTGAAATGTTGTTGTCTTTGTGGGGTTTTGTACTAATG
CTAACTTGTAGTGAACTGGGTATTGAAAGGTACAGTCTTTAGTAGCAGAAAGATAACAAA
ATCTGTTTTTTTGTATCTATTTAGTAGTCTTTCTCTTTAGCATCTCATGTAG

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL6978Contig1 550 2 1 U
GGGTCTTCTCCGTCTTCCTCTCAGTAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGTCTTGCGAAAATGGT
GAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTCAGAGGAACCATCTTGGGATACAA
AAGGTCGAAGTCAAACCAGTATCCAAACACATCCCTGATCCAGATCGAGGGAGTCAACAC
TACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAAGATGGCTTACATCTACAAGGCCAAGAC
CAAGAAGAACGGTAGCCTCTACCGTTGCATCTGGGGAAAGGTTACAAGGCCTCATGGTAA
CAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACTTCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAG
GGTGAGAGTCTTCATGTATCCGAGTAACATTTGAAGCAAAGTAGAACAGCATAAACATTG
ATTTAGCTGTTGTTTTTTTGCCCACTAGTTCTTCGTTTTGTATTTGATACTGAACGCATT
TTCATTTGTTTGTTTAAGTGCTTGGAGACTTTGAATCATTGATCTGGTTTTTAATCTCAA
ATTAGAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G043TF U 1
AF RR2G043JQ C 10
BS 1 550 RR2G043TF

RD RR2G043TF 550 0 0
GGGTCTTCTCCGTCTTCCTCTCAGTAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGTCTTGCGAAAATGGT
GAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTCAGAGGAACCATCTTGGGATACAA
AAGGTCGAAGTCAAACCAGTATCCAAACACATCCCTGATCCAGATCGAGGGAGTCAACAC
TACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAAGATGGCTTACATCTACAAGGCCAAGAC
CAAGAAGAACGGTAGCCTCTACCGTTGCATCTGGGGAAAGGTTACAAGGCCTCATGGTAA
CAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACTTCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAG
GGTGAGAGTCTTCATGTATCCGAGTAACATTTGAAGCAAAGTAGAACAGCATAAACATTG
ATTTAGCTGTTGTTTTTTTGCCCACTAGTTCTTCGTTTTGTATTTGATACTGAACGCATT
TTCATTTGTTTGTTTAAGTGCTTGGAGACTTTGAATCATTGATCTGGTTTTTAATCTCAA
ATTAGAAACC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2G043JQ 541 0 0
CCGTCTTCCTCTCAGTAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGTCTTGCGAAAATGGTGAAGGGACG
CCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTCAGAGGAACCATCTTGGGATACAAAAGGTGGAA
GTCAAACCAGTATCCAAACACATCCCTGATCCAGATCGAGGGAGTCAACACTACAGAGGA
GGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCCAAGACCAAGAAGAA
CGGTAGCCTCTACCGTTGCATCTGGGGAAAGGTTACAAGGCCTCATGGTAACAGCGGTGT
TGTCCGTGCCAAATTCACTTCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAGGGTGAGAGT
CTTCATGTATCCGAGTAACATTTGAAGCAAAGTAGAACAGCATAAACATTGATTTAGCTG
TTGTTTTTTTGCCCACTAGTTCTTCGTTTTGTATTTGATACTGAACGCATTTTCATTTGT
TTGTTTAAGTGCTTGGAGACTTTGAATCATTGATCTGGTTTTTAATCTCAAATTAGAAAC
C

QA 1 541 1 541
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6980Contig1 970 2 4 U
GGGAAGGAAGTATGCAGTGAAAGAGATAGATTCTTCACTGTTAGGCAAAGGGAATCAAGC
AGAGTTCTCACACATAGTGGCAAACATCTCCAGCATTCACCACCCCAACATGGCTGAGCT
CGTTGGTTATTGTTCAGAACAAGGAAGGAACATGCTTGTTTATGAGTACTTCACAGGTGG
ATCACTTAACAGATTTCTTCACCAGACTGATGGTTTCAGCAGACCATTAACTTGGAACAC
ATGAATCCGAATCGCTCTAGGAACTGCTCAAGCTATAGAGTACCTTCATGAGGTTTGCTC
GCCTCCATTAGTTCACAAGAACATCAAGTCATCAAACATTTTACTCGACAGTGAGCTAAA
CCCTCATCTCTCAGACTATGGCTTGGCAAACTTTCACCATCGCACAAGTCAGAATCTTGG
TGTTGGATACAATGCTCCAGAATGCGCAGATCCATCGGCTTACACACTAAAGAGCGATGT
CTACAGCTTCGGTGTGGTGATGCTGGAGCTTCTAACCGGTCGAATGCCTTATAACAGTGA
TAGGCCTAAACAAGAACAGTCTCTAGTTCTTTGGGCAAAGCCAAAGCTTAAAGACATGGA
CACTCTGGAGGAGATGGTTGATCCAGCTTTGTGTGGACTCTACGCTCCAGAATCTGTGTC
GACATTCGCACATATAGTTTCCATCTGTGTAATGTTTGAGCCTGGACTTCGGCCACCAGT
GTCAAATGTGGTGGAGGCACTGAAGAGGCTAGTGTAGTTTTAGTGCCTCAAGTTGTGTAT
GCCCTGAAGAAGAAAGGAGAAGAAGAATAATAACTTTGGGAGCTCAAGAAGCTATTGGAT
ACAGGTTTGTATAGAGAGATAGGTGGTAAAGATGGTGGAGGAAAACAGAGAGACAGTAGA
TTTTATTGTTTTTTTTTTCTGTTTCAGATCATGATGTCTTAACATGTAGGTGTATCTTTT
ATACATTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN43TF U 1
AF RR2FN43JQ C 288
BS 1 665 RR2FN43TF
BS 666 666 RR2FN43JQ
BS 667 691 RR2FN43TF
BS 692 970 RR2FN43JQ

RD RR2FN43TF 705 0 0
GGGAAGGAAGTATGCAGTGAAAGAGATAGATTCTTCACTGTTAGGCAAAGGGAATCAAGC
AGAGTTCTCACACATAGTGGCAAACATCTCCAGCATTCACCACCCCAACATGGCTGAGCT
CGTTGGTTATTGTTCAGAACAAGGAAGGAACATGCTTGTTTATGAGTACTTCACAGGTGG
ATCACTTAACAGATTTCTTCACCAGACTGATGGTTTCAGCAGACCATTAACTTGGAACAC
ATGAATCCGAATCGCTCTAGGAACTGCTCAAGCTATAGAGTACCTTCATGAGGTTTGCTC
GCCTCCATTAGTTCACAAGAACATCAAGTCATCAAACATTTTACTCGACAGTGAGCTAAA
CCCTCATCTCTCAGACTATGGCTTGGCAAACTTTCACCATCGCACAAGTCAGAATCTTGG
TGTTGGATACAATGCTCCAGAATGCGCAGATCCATCGGCTTACACACTAAAGAGCGATGT
CTACAGCTTCGGTGTGGTGATGCTGGAGCTTCTAACCGGTCGAATGCCTTATAACAGTGA
TAGGCCTAAACAAGAACAGTCTCTAGTTCTTTGGGCAAAGCCAAAGCTTAAAGACATGGA
CACTCTGGAGGAGATGGTTGATCCAGCTTTGTGTGGACTCTACGCTCCAGAATCTGTGTC
GACAT*CGCACATATAGTTTCCATCTGTGTA
TGTCTGAGCTGGAC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2FN43JQ 683 0 0
ATGAGGTTTGCTCGCCTCCATTAGTTCACAAGAACATCAAGTCATCAAACATTTTACTCG
ACAGTGAGCTAAACCCTCATCTCTCAGACTATGGCTTGGCAAACTTTCACCATCGCACAA
GTCAGAATCTTGGTGTTGGATACAATGCTCCAGAATGCGCAGATCCATCGGCTTACACAC
TAAAGAGCGATGTTTACAGCTTCGGTGTGGTGATGCTGGAGCTTCTAACCGGTCGAATGC
CTTATAACAGTGATAGGCCTAAACAAGAACAGTCTCTAGTTCTTTGGGCAAAGCCAAAGC
TTAAAGACATGGACACTTTGGAGGAGATGGTTGATCCAGCTTTGTGTGGACTTTACGCTC
CAGAATCTGTGTCGACATTCGCACATATAGTTTCCATCTGTGTAATGTTTGAGCCTGGAC
TTCGGCCACCAGTGTCAAATGTGGTGGAGGCACTGAAGAGGCTAGTGTAGTTTTAGTGCC
TCAAGTTGTGTATGCCCTGAAGAAGAAAGGAGAAGAAGAATAATAACTTTGGGAGCTCAA
GAAGCTATTGGATACAGGTTTGTATAGAGAGATAGGTGGTAAAGATGGTGGAGGAAAACA
GAGAGACAGTAGATTTTATTGTTTTTTTTTTCTGTTTCAGATCATGATGTCTTAACATGT
AGGTGTATCTTTTATACATTGAG

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL6981Contig1 873 2 2 U
GACTCACAGTATTAAAGGGATCTTTTGTTTGTACTTTCTAAGGAATGCCGTGAAGCTGTT
GGAGGTCAAGGTGTGAAAACAGAAAATCTAGTTGGTCAGTTGAAAGGTGAATTTGATGTG
CAGACTACATTTGAGGGTGACAATAATGTATTGATGCAGCAGGTGAGCAAAGCTCTGTTT
GCTGAATATGTGTCTTGTAAGAAGAGAAACAAACCTTTCAAAGGGTTGGGATTGGAGCAC
ATGAACAATGCTCGTCCTGAATTGCCAACTCAGCTCACATCTTCTACCCTCAGATGCAGC
CAGTTTCAGAAAAATGTGTTCTGCTTAAGAGAGCGAGATCTTCTAGAAAGATTCACTTCT
GAAGTTGCGCAGCTTCAAGGGAGGGGAGAGAGCCGAGAGTCCTCTTTCCTCGTGAATCAT
GAACTCGCTGAGGACTTAGGTAAAGCTTTCACTGAGAAAGCAATACTGCAAACTGATTTG
GATGCTGAGGCCAAACTACCTACTGGCTCATTGAAGGATGTGTTGGGTCTTGTAAGATCA
ATGTACGCTTTGATCAGCATTGAAGAAGATCCATCGTTCTTGAGATACGGCTACCTCTCG
AGGGACAACGTTGGAGATGTGAGGGAGAGAGGTTTCTAAGCTCTGCGGAGAGCTTAGACC
ACACGCGCTTGGACTTGTCACTTCATTCGGGATTCCTGACGCGTTCTTGGGTCCGATTGC
ACTCAACTGGGTCGAAGCCAACGCTTGGTCTTCAGTTTAGTTACTTCAAGTAAACTCTTC
CAATAATAATCCACGTCTCTTATGTGTTCTTTAATATTTTCTGAAGCTCATGTTGTTGAA
TGCTCTTGGTAATAAAAGGGGTATGTGATATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H893TF U 1
AF RR2H893JQ C 148
BS 1 685 RR2H893TF
BS 686 873 RR2H893JQ

RD RR2H893TF 685 0 0
GACTCACAGTATTAAAGGGATCTTTTGTTTGTACTTTCTAAGGAATGCCGTGAAGCTGTT
GGAGGTCAAGGTGTGAAAACAGAAAATCTAGTTGGTCAGTTGAAAGGTGAATTTGATGTG
CAGACTACATTTGAGGGTGACAATAATGTATTGATGCAGCAGGTGAGCAAAGCTCTGTTT
GCTGAATATGTGTCTTGTAAGAAGAGAAACAAACCTTTCAAAGGGTTGGGATTGGAGCAC
ATGAACAATGCTCGTCCTGAATTGCCAACTCAGCTCACATCTTCTACCCTCAGATGCAGC
CAGTTTCAGAAAAATGTGTTCTGCTTAAGAGAGCGAGATCTTCTAGAAAGATTCACTTCT
GAAGTTGCGCAGCTTCAAGGGAGGGGAGAGAGCCGAGAGTCCTCTTTCCTCGTGAATCAT
GAACTCGCTGAGGACTTAGGTAAAGCTTTCACTGAGAAAGCAATACTGCAAACTGATTTG
GATGCTGAGGCCAAACTACCTACTGGCTCATTGAAGGATGTGTTGGGTCTTGTAAGATCA
ATGTACGCTTTGATCAGCATTGAAGAAGATCCATCGTTCTTGAGATACGGCTACCTCTCG
AGGGACAACGTTGGAGATGTGAGGGAGAGAGGTTTCTAAGCTCTGCGGAGAGCTTAGACC
ACACGCGCTTGGACTTGTCACTTCA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2H893JQ 726 0 0
GTATTGATGCAGCAGGTGAGCAAAGCTCTGTTTGCTGAATATGTGTCTTGTAAGAAGAGA
AACAAACCTTTCAAAGGGTTGGGATTGGAGCACATGAACAATGCTCGTCCTGAATTGCCA
ACTCAGCTCACATCTTCTACCCTCAGATGCAGCCAGTTTCAGAAAAATGTGTTCTGCTTA
AGAGAGCGAGATCTTCTAGAAAGATTCACTTCTGAAGTTGCGCAGCTTCAAGGGAGGGGA
GAGAGCCGAGAGTCCTCTTTCCTCGTGAATCATGAACTCGCTGAGGACTTAGGTAAAGCT
TTCACTGAGAAAGCAATACTGCAAACTGATTTGGATGCTGAGGCCAAACTACCTACTGGC
TCATTGAAGGATGTGTTGGGTCTTGTAAGATCAATGTACGCTTTGATCAGCATTGAAGAA
GATCCATCGTTCTTGAGATACGGCTACCTCTCGAGGGACAACGTTGGAGATGTGAGG*AG
AGAGGTTTCTAAGCTCTGCGGAGAGCTTAGACCACACGCGCTTGGACTTGTCACTTCATT
CGGGATTCCTGACGCGTTCTTGGGTCCGATTGCACTCAACTGGGTCGAAGCCAACGCTTG
GTCTTCAGTTTAGTTACTTCAAGTAAACTCTTCCAATAATAATCCACGTCTCTTATGTGT
TCTTTAATATTTTCTGAAGCTCATGTTGTTGAATGCTCTTGGTAATAAAAGGGGTATGTG
ATATGT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6983Contig1 546 2 3 U
GGACTACCAAAAACCATACTCAAGAACAAAAAAAGAGCTAAAAAGTTTTCATTTGAAGAA
GAATGACACTTGGAAACTACTCTAACCACCAATCTCATCATAATCCTCGTTACCATCATC
ACCGGGACTCCACCAAGGAGTTTCGAGTTACCTTTGCCGCTGAAGAACCTATCCATGTCT
TGGAGTGTACAGATATGAGGAGGACGAAGAGGGAGGCTATAAAAGAAGTGGATGTTGACA
AGGAAGCAGATGAATTCATCAAGTTTGAGCATAGGAAGTTCTGTAAGTGGACGACGACTA
ATTAAGAGCGTCTAGAGCCGTCTAGACTCTAGTCCATTGTGGCTGAATAATTAAAAAATA
AAAACAATAAGGACATATACCATATTTTATAAAGATTGTATTAAACGATATTTGATATGT
TGTGCTCGTCTTCTTCCTTTTTCTGTATTAAACCATCTTCTGGTTTTTACTGTGGTCTTT
GTAAGAAATGGATATTGTTTGTTTCCTTTACCTAAAAGGATGCATGGAAATAAAAATTTA
TTAACT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 

AF RR2BT88TF U 1
AF RR2DN77TF U 1
BS 1 440 RR2BT88TF
BS 441 442 RR2DN77TF
BS 443 546 RR2BT88TF

RD RR2BT88TF 546 0 0
GGACTACCAAAAACCATACTCAAGAACAAAAAAAGAGCTAAAAAGTTTTCATTTGAAGAA
GAATGACACTTGGAAACTACTCTAACCACCAATCTCATCATAATCCTCGTTACCATCATC
ACCGGGACTCCACCAAGGAGTTTCGAGTTACCTTTGCCGCTGAAGAACCTATCCATGTCT
TGGAGTGTACAGATATGAGGAGGACGAAGAGGGAGGCTATAAAAGAAGTGGATGTTGACA
AGGAAGCAGATGAATTCATCAAGTTTGAGCATAGGAAGTTCTGTAAGTGGACGACGACTA
ATTAAGAGCGTCTAGAGCCGTCTAGACTCTAGTCCATTGTGGCTGAATAATTAAAAAATA
AAAACAATAAGGACATATACCATATTTTATAAAGATTGTATTAAACGATATTTGATATGT
TGTGCTCGTCTTCTTCCTTT**CTGTATTAAACCATCTTCTGGTTTTTACTGTGGTCTTT
GTAAGAAATGGATATTGTTTGTTTCCTTTACCTAAAAGGATGCATGGAAATAAAAATTTA
TTAACT

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2DN77TF 546 0 0
GA
ACTACCAAAAACCATACTCAAGAACAAAAAAAGAGCTAAAAAGTTTTCATTTGAAGAAGA
ATGACACTTGGAAACTACTCTAACCACCAATCTCATCATAATCCTCGTTACCATCATCAC
CGGGACTCCACCAAGGAGTTTCGAGTTACCTTTGCCGCTGAAGAACCTATCCATGTCTTG
GAGTGTACAGATATGAGGAGGACGAAGAGGGAGGCTATAAAAGAAGTGGATGTTGACAAG
GAAGCAGATGAATTCATCAAGTTTGAGCATAGGAAGTTCTGTAAGTGGACGACGACTAAT
TAAGAGCGTCTAGAGCCGTCTAGACTCTAGTCCATTGTGGCTGAATAATTAAAAAATAAA
AACAATAAGGACATATACCATATTTTATAAAGATTGTATTAAACGATATTTGATATGTTG
TGCTCGTCTTCTTCCTTTTTCTGTATTAAACCATCTTCTGGTTTTTACTGTGGTCTTTGT
AAGAAATGGATATTGTTTGTTTCCTTTACCTAAAAGGATGCATGGAAATAAAAATTTATT
AAC
G

QA 3 545 3 545
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6985Contig1 772 2 3 U
TTTCGGAGATAATCAATAAGAGGTTCCAAGAAGTTAGTGATTGTTTGGATCTTTATTTAC
AGGAGGAGAAGTTGAATAATTTGGGTATTGATAGTCAAAACGCCAGAGATTTTCAGAGGC
CGTACAAGTTCTCAGGCCAGCTCGAGGAAGACCATAATGTCCAGGAGAATCATACTGGTG
ATTCATCTTCTGAGGAGACGCAATAAGCTTTTGTAAATATAGCTTTGATAGTCACACTTG
CGTTCCAAGAAACTGAAGATATTTTTTTTGTAACAAACCTTTTTAAAAAAACCCTAAGTC
TCTATTTTTTTTTTCATATGCTTTTCCATGAAGTTAAAAAAGAGTTGGAATCTCAAATCT
TCAAGATTGAATAGTTTAGTTATTCGAACAAAGGAGACAAAAAACGAAATGAGAGGTATC
TCAGTACACAGAAGCAAATGAAGAAGAAGCAAAACGTTACAAAAATCAAGCAGTATCCTT
AGAAGGAGCAGAAGAAGCTTGAGCTCCAAAGGCAAAGTAGTCTGTGATGACCTCCAAAGG
CATCCCTTTAGTCTCCGGAACCTTCATATAAACAAACACCCACGAGATCACACAAACTGC
AGCGTAGATGCTGAAGACACCAACGAGTCCTATCGAGCTGAGGAGAACAGGGAGCGAGTA
AGTGACTATAATGTCGCAAATCCAGAACACCATAGCGCAGATGGCTATGCAGAGACCACG
GGCTCTCGTCGGGAAGATTTCGGAACAGAGTATGTTTGGAATGGGACCGTAC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ02TFB C 1
AF RR2AZ02JQ U 4
BS 1 3 RR2AZ02TFB
BS 4 741 RR2AZ02JQ
BS 742 772 RR2AZ02TFB

RD RR2AZ02TFB 772 0 0
TTTCGGAGATAATCAATAAGAGGTTCCAAGAAGTTAGTGATTGTTTGGATCTTTATTTAC
AGGAGGAGAAGTTGAATAATTTGGGTATTGATAGTCAAAACGCCAGAGATTTTCAGAGGC
CGTACAAGTTCTCAGGCCAGCTCGAGGAAGACCATAATGTCCAGGAGAATCATACTGGTG
ATTCATCTTCTGAGGAGACGCAATAAGCTTTTGTAAATATAGCTTTGATAGTCACACTTG
CGTTCCAAGAAACTGAAGATATTTTTTTTGTAACAAACCTTTTTAAAAAAACCCTAAGTC
TCTATTTTTTTTTTCATATGCTTTTCCATGAAGTTAAAAAAGAGTTGGAATCTCAAATCT
TCAAGATTGAATAGTTTAGTTATTCGAACAAAGGAGACAAAAAACGAAATGAGAGGTATC
TCAGTACACAGAAGCAAATGAAGAAGAAGCAAAACGTTACAAAAATCAAGCAGTATCCTT
AGAAGGAGCAGAAGAAGCTTGAGCTCCAAAGGCAAAGTAGTCTGTGATGACCTCCAAAGG
CATCCCTTTAGTCTCCGGAACCTTCATATAAACAAACACCCACGAGATCACACAAACTGC
AGCGTAGATGCTGAAGACACCAACGAGTCCTATCGAGCTGAGGAGAACAGGGAGCGAGTA
AGTGACTATAATGTCGCAAATCCAGAACACCATAGCGCAGATGGCTATGCAGAGACCACG
GGCTCTCGTCGGGAAGATTTCGGAACAGAGTATGTTTGGAATGGGACCGTAC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2AZ02JQ 738 0 0
CGGAGATAATCAATAAGAGGTTCCAAGAAGTTAGTGATTGTTTGGATCTTTATTTACAGG
AGGAGAAGTTGAATAATTTGGGTATTGATAGTCAAAACGCCAGAGATTTTCAGAGGCCGT
ACAAGTTCTCAGGCCAGCTCGAGGAAGACCATAATGTCCAGGAGAATCATACTGGTGATT
CATCTTCTGAGGAGACGCAATAAGCTTTTGTAAATATAGCTTTGATAGTCACACTTGCGT
TCCAAGAAACTGAAGATATTTTTTTTGTAACAAACCTTTTTAAAAAAACCCTAAGTCTCT
ATTTTTTTTTTCATATGCTTTTCCATGAAGTTAAAAAAGAGTTGGAATCTCAAATCTTCA
AGATTGAATAGTTTAGTTATTCGAACAAAGGAGACAAAAAACGAAATGAGAGGTATCTCA
GTACACAGAAGCAAATGAAGAAGAAGCAAAACGTTACAAAAATCAAGCAGTATCCTTAGA
AGGAGCAGAAGAAGCTTGAGCTCCAAAGGCAAAGTAGTCTGTGATGACCTCCAAAGGCAT
CCCTTTAGTCTCCGGAACCTTCATATAAACAAACACCCACGAGATCACACAAACTGCAGC
GTAGATGCTGAAGACACCAACGAGTCCTATCGAGCTGAGGAGAACAGGGAGCGAGTAAGT
GACTATAATGTCGCAAATCCAGAACACCATAGCGCAGATGGCTATGCAGAGACCACGGGC
TCTCGTCGGGAAGATTTC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL6986Contig1 527 2 1 U
GGGAGGATGATTCGGTGGTATCTTATTCTCGCCATCTGAAACGGTCATGGCTTTGTGTTT
ACTCCCGTTAATAGCGTTCTTTACTCCTTAGATCTACGCCACCCACGATCTTTCATTCAA
TACTTTTGATATATCTTACAGACGGTGAAACTCCACCTATAAAGTGTTTTTGTTTCGTTG
ATCGACTGTACGAAGTTTCAACTTGGTGTTTGTGGTTACAACGTTAGAAGAAAGAACAAG
CGCTCTTCGGTGGCGTGTATTCAGGTCAGATCAATACACACTCTATTGCGGAAGCTACTA
AGAGATTTGGGTTCTGGTGTTGGCTGAAGAACACAGGTCTTGAAAAAGTGAAAACTATGA
GATGGTGTCAATTAATGGAAGGATGCAGGAATATACATCGAGAAACTATGAACTCAAATG
TTTTCCTACAGGGTATGCCATGAGAATACCTTTTGAACTGAGGTTTATCCATATGTAATG
TATTTTTATCATTTTGTCTTATACAGTATATTTTCTTAAAGAAAAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H979JQ C 1
AF RR2H979TF U 1
BS 1 527 RR2H979TF

RD RR2H979JQ 527 0 0
GGGAGGATGATTCGGTGGTATCTTATTCTCGCCATCTGAAACGGTCATGGCTTTGTGTTT
ACTCCCGTTAATAGCGTTCTTTACTCCTTAGATCTACGCCACCCACGATCTTTCATTCAA
TACTTTTGATATATCTTACAGACGGTGAAACTCCACCTATAAAGTGTTTTTGTTTCGTTG
ATCGACTGTACGAAGTTTCAACTTGGTGTTTGTGGTTACAACGTTAGAAGAAAGAACAAG
CGCTCTTCGGTGGCGTGTATTCAGGTCAGATCAATACACACTCTATTGCGGAAGCTACTA
AGAGATTTGGGTTCTGGTGTTGGCTGAAGAACACAGGTCTTGAAAAAGTGAAAACTATGA
GATGGTGTCAATTAATGGAAGGATGCAGGAATATACATCGAGAAACTATGAACTCAAATG
TTTTCCTACAGGGTATGCCATGAGAATACCTTTTGAACTGAGGTTTATCCATATGTAATG
TATTTTTATCATTTTGTCTTATACAGTATATTTTCTTAAAGAAAAAT

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2H979TF 527 0 0
GGGAGGATGATTCGGTGGTATCTTATTCTCGCCATCTGAAACGGTCATGGCTTTGTGTTT
ACTCCCGTTAATAGCGTTCTTTACTCCTTAGATCTACGCCACCCACGATCTTTCATTCAA
TACTTTTGATATATCTTACAGACGGTGAAACTCCACCTATAAAGTGTTTTTGTTTCGTTG
ATCGACTGTACGAAGTTTCAACTTGGTGTTTGTGGTTACAACGTTAGAAGAAAGAACAAG
CGCTCTTCGGTGGCGTGTATTCAGGTCAGATCAATACACACTCTATTGCGGAAGCTACTA
AGAGATTTGGGTTCTGGTGTTGGCTGAAGAACACAGGTCTTGAAAAAGTGAAAACTATGA
GATGGTGTCAATTAATGGAAGGATGCAGGAATATACATCGAGAAACTATGAACTCAAATG
TTTTCCTACAGGGTATGCCATGAGAATACCTTTTGAACTGAGGTTTATCCATATGTAATG
TATTTTTATCATTTTGTCTTATACAGTATATTTTCTTAAAGAAAAAT

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 2

CO CL6987Contig1 743 2 3 U
AGGGGAAAACACTACAAACAATAAAGTTCTTAGAAGCCATCACAGATTAAGCATGAAGAT
ATTCATACTCTCCATCCTACTTCTAAGCATCACCACGTTAATCAATGGTGGAATAACAAG
CAAATACGTGCGACAAGCCCAACCAGCAAACGAGATGTCTCTCGAAACATTCCCTTCTCC
ACCCGGTCACAATGCTCCAGAACAGGTTCATCTAACGCAAGGAGATCGCGATGGCCGTGG
CATGATCATCTCGTGGGTGACACCGTTAAACCTAGCTGGTTCTGACGTAATTACTTACTG
GATCGCCGATAATGGAAGTGACGCGAAGCGGAGAAAGAAGAAAGCCCCCACGTCGTCTTA
CAAATTTTATGACTATTCTTCTGGATTTCTTCATCACGCCACCATTAAAAATCTCGAGTA
CGATACTAAATACATCTATGAGGTTGGTACTGATAAATCAGTTAGGCAATTCTCCTTCAC
AACTCCCCCGAAGGTTGGACCTGATGTTCCATACACATTCGGGATTATTGGTGATCTTGG
ACAAACCTATGCTTCTAACGAAACCTTGTACCAATACATGTCTAACCCTAAAGGCCAAAC
CATTCTCTTTCCCGGAGACTTGGCTTACCAAGACAACCATCCGAACCATGACCAGAGAAA
ATGGGATACTTATGGAAGATTCATGGAGCCTTGCGCTGCTTACCAGCCCATTATCTATGC
CGCCGAGAATCACGAGATTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H510TF U 1
AF RR2EL82TF U 12
BS 1 346 RR2H510TF
BS 347 347 RR2EL82TF
BS 348 743 RR2H510TF

RD RR2H510TF 743 0 0
AGGGGAAAACACTACAAACAATAAAGTTCTTAGAAGCCATCACAGATTAAGCATGAAGAT
ATTCATACTCTCCATCCTACTTCTAAGCATCACCACGTTAATCAATGGTGGAATAACAAG
CAAATACGTGCGACAAGCCCAACCAGCAAACGAGATGTCTCTCGAAACATTCCCTTCTCC
ACCCGGTCACAATGCTCCAGAACAGGTTCATCTAACGCAAGGAGATCGCGATGGCCGTGG
CATGATCATCTCGTGGGTGACACCGTTAAACCTAGCTGGTTCTGACGTAATTACTTACTG
GATCGCCGATAATGGAAGTGACGCGAAGCGGAGAAAGAAGAAAGCCTCCACGTCGTCTTA
CAAATTTTATGACTATTCTTCTGGATTTCTTCATCACGCCACCATTAAAAATCTCGAGTA
CGATACTAAATACATCTATGAGGTTGGTACTGATAAATCAGTTAGGCAATTCTCCTTCAC
AACTCCCCCGAAGGTTGGACCTGATGTTCCATACACATTCGGGATTATTGGTGATCTTGG
ACAAACCTATGCTTCTAACGAAACCTTGTACCAATACATGTCTAACCCTAAAGGCCAAAC
CATTCTCTTTCCCGGAGACTTGGCTTACCAAGACAACCATCCGAACCATGACCAGAGAAA
ATGGGATACTTATGGAAGATTCATGGAGCCTTGCGCTGCTTACCAGCCCATTATCTATGC
CGCCGAGAATCACGAGATTGATT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2EL82TF 711 0 0
GG
ACAAACAATAAAGTTCTTAGAAGCCATCACAGATTAAGCATGAAGATATTCATACTCTCC
ATCCTACTTCTAAGCATCACCACGTTAATCAATGGTGGAATAACAAGCAAATACGTGCGA
CAAGCCCAACCAGCAAACGAGATGTCTCTCGAAACATTCCCTTCTCCACCCGGTCACAAT
GCTCCAGAACAGGTTCATCTAACGCAAGGAGATCGCGATGGCCGTGGCATGATCATCTCG
TGGGTGACACCGTTAAACCTAGCTGGTTCTGACGTGGTTACTTACTGGATCGCCGATAAT
GGAAGTGACGTGAAGCGGAGAAAGAAGAAAGCCCCCACGTCGTCTTACAAATTTTATGAC
TATTCTTCTGGATTTCTTCATCACGCCACCATTAAAAATCTCGAGTACGATACTAAATAC
ATCTATGAGGTTGGTACTGATAAATCAGTTAGGCAATTCTCCTTCACAACTCCCCCGAAG
GTTGGACCTGATGTTCCATACACATTCGGGATTATTGGTGATCTTGGACAAACCTATGCT
TCTAACGAAACCTTGTACCAATACATGTCTAACCCTAAAGGCCAAACCATTCTCTTTCCC
GGAGACTTGGCTTACCAAGACAACCATCCGAACCATGACCAGAGAAAATGGGATACTTAT
GGAAGATTCATGGAGCCTTGCGCTGCTTATCAGCCCATTATCTATGCCG

QA 3 711 3 711
DS 



AS 1 2

CO CL6988Contig1 541 2 1 U
GGGTTATTGTTTTGACAGTAATACACATTCGCTCATCTCCGTTGTCTCGTCGCTTTTCTC
TTCTCCATAGTTCTCCGTCGTCCGACCAGACAGAAAAACCCTAAAATGGATGGGCATGAC
TCTGAGGATACTAAGCAGAGCACTGCTGATATGACTGCTTTTGTCCAAAATCTTCTGCAG
CAGATGCAATCCAGGTTCCAGACAATGTCCGACTCCATCATCACAAAGATCGATGACATG
GGAGGTAGAATCAATGAGCTGGAGCAAAGCATCAATGACCTTAGAGCCGAGATGGGAGTT
GAAGGCACTCCTCCTGCTGCCTCCAAATCTGGCGATGATCCCAAAACACCCCCTAGTTCC
ACTTGAACTGTTAAGGGTCACATGTTCTTTCTGCGCAGAAACGCTCTTAAGTTTGTTAAG
AATCAGTATTGTTTACTTTTACATTTCCGTTTCAAAGGACATGAATATGCTATTGAGTTC
ATACAATAGATTGATGGAGGATGTGGGTAAATTACATTATCATGCACTTATGATGACTTG
G


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2AI80JQ C 1
AF RR2AI80TF U 1
BS 1 541 RR2AI80TF

RD RR2AI80JQ 541 0 0
GGGTTATTGTTTTGACAGTAATACACATTCGCTCATCTCCGTTGTCTCGTCGCTTTTCTC
TTCTCCATAGTTCTCCGTCGTCCGACCAGACAGAAAAACCCTAAAATGGATGGGCATGAC
TCTGAGGATACTAAGCAGAGCACTGCTGATATGACTGCTTTTGTCCAAAATTTTTTGCAG
CAGATGCAATCCAGGTTCCAGACAATGTCCGACTCCATCATCACAAAGATCGATGACATG
GGAGGTAGAATCAATGAGCTGGAGCAAAGCATCAATGACCTTAGAGCCGAGATGGGAGTT
GAAGGCACTCCTCCTGCTGCCTCCAAATCTGGCGATGATCCCAAAACACCCCCTAGTTCC
ACTTGAACTGTTAAGGGTCACATGTTCTTTCTGCGCAGAAACGCTCTTAAGTTTGTTAAG
AATCAGTATTGTTTACTTTTACATTTCCGTTTCAAAGGACATGAATATGCTATTGAGTTC
ATACAATAGATTGATGGAGGATGTGGGTAAATTACATTATCATGCACTTATGATGACTTG
G

QA 1 541 1 541
DS 

RD RR2AI80TF 541 0 0
GGGTTATTGTTTTGACAGTAATACACATTCGCTCATCTCCGTTGTCTCGTCGCTTTTCTC
TTCTCCATAGTTCTCCGTCGTCCGACCAGACAGAAAAACCCTAAAATGGATGGGCATGAC
TCTGAGGATACTAAGCAGAGCACTGCTGATATGACTGCTTTTGTCCAAAATCTTCTGCAG
CAGATGCAATCCAGGTTCCAGACAATGTCCGACTCCATCATCACAAAGATCGATGACATG
GGAGGTAGAATCAATGAGCTGGAGCAAAGCATCAATGACCTTAGAGCCGAGATGGGAGTT
GAAGGCACTCCTCCTGCTGCCTCCAAATCTGGCGATGATCCCAAAACACCCCCTAGTTCC
ACTTGAACTGTTAAGGGTCACATGTTCTTTCTGCGCAGAAACGCTCTTAAGTTTGTTAAG
AATCAGTATTGTTTACTTTTACATTTCCGTTTCAAAGGACATGAATATGCTATTGAGTTC
ATACAATAGATTGATGGAGGATGTGGGTAAATTACATTATCATGCACTTATGATGACTTG
G

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 2

CO CL6989Contig1 565 2 4 U
TCTTAGCTTGACGAAACAATGCGATAAGAGTTCTCTTTCTAACAGGCAGTAATCAACAGC
TACACACAAAGAAGCAAAAAGAAGTCCCCTCACAAAGTCGAACTAATGAAACGGAAACTT
ACAACAGCAACGAAACAATCAAAGCTATGAACTTAGAAGCTCCAACGGTCGAGTTGTTGC
TTGGCTGTGGCCATGTCTTTTTGTGCTTTCATTCTCCGGTAAAATATTGGACAATCTCGA
CTGGTGCACAAGACATCTTGGTGAAGAGAGCCTTGGCATTCCTGACACTGTGTCCACAGC
CTCCCAAAGAGCTCCTCTAGGTCTGACACCTGAGACACGTTTTTGCAGTATAACTCGGCT
TCTCTTCCCTTGCAACGTGCACACAATGTTCCAGTGCTGATCGGCACTTTGCAGCCAACA
CAGCTCAGTTGTTTCTTGGCAAATCTCATTATGCCGCTGTTTGAAGGAGTACTAATTGAT
ATTGACCTCGTGTGATCTCCACGGAGAAGTTCACTACTAGCATTTTTTAAGACCGGCTCA
AAAATCCTAAGAAGCGGCTGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CZ46TF C 1
AF RR2CZ46JQ U 25
BS 1 24 RR2CZ46TF
BS 25 46 RR2CZ46JQ
BS 47 47 RR2CZ46TF
BS 48 565 RR2CZ46JQ

RD RR2CZ46TF 565 0 0
TCTTAGCTTGACGAAACAATGCGATAAGAGTTCTCTTTCTAACAGGCAGTAATCAACAGC
TACACACAAAGAAGCAAAAAGAAGTCCCCTCACAAAGTCGATCTAATGAAACGGAAACTT
ACAACAGCAACGAAACAATCAAAGCTATGAACTTAGAAGCTCCAACGGTCGAGTTGTTGC
TTGGCTGTGGCCATGTCTTTTTGTGCTTTCATTCTCCGGTAAAATATTGGACAATCTCGA
CTGGTGCACAAGACATCTTGGTGAAGAGAGCCTTGGCATTCCTGACACTGTGTCCACAGC
CTCCCAAAGAGCTCCTCTAGGTCTGACACCTGAGACACGTTTTTGCAGTATAACTCGGCT
TCTCTTCCCTTGCAACGTGCACACAATGTTCCAGTGCTGATCGGCACTTTGCAGCCAACA
CAGCTCAGTTGTTTCTTGGCAAATCTCATTATGCCGCTGTTTGAAGGAGTACTAATTGAT
ATTGACCTCGTGTGATCTCCACGGAGAAGTTCACTACTAGCATTTTTTAAGACCGGCTCA
AAAATCCTAAGAAGCGGCTGAAAAA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2CZ46JQ 541 0 0
TAAGAGTTCTCTTTCTAACAGGGAGTAATCAACAGCTACACACAAAGAAGCAAAAAGAAG
TCCCCTCACAAAGTCGAACTAATGAAACGGAAACTTACAACAGCAACGAAACAATCAAAG
CTATGAACTTAGAAGCTCCAACGGTCGAGTTGTTGCTTGGCTGTGGCCATGTCTTTTTGT
GCTTTCATTCTCCGGTAAAATATTGGACAATCTCGACTGGTGCACAAGACATCTTGGTGA
AGAGAGCCTTGGCATTCCTGACACTGTGTCCACAGCCTCCCAAAGAGCTCCTCTAGGTCT
GACACCTGAGACACGTTTTTGCAGTATAACTCGGCTTCTCTTCCCTTGCAACGTGCACAC
AATGTTCCAGTGCTGATCGGCACTTTGCAGCCAACACAGCTCAGTTGTTTCTTGGCAAAT
CTCATTATGCCGCTGTTTGAAGGAGTACTAATTGATATTGACCTCGTGTGATCTCCACGG
AGAAGTTCACTACTAGCATTTTTTAAGACCGGCTCAAAAATCCTAAGAAGCGGCTGAAAA
A

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 2

CO CL6990Contig1 1082 2 8 U
GGATCACTCTCAATCTCCTTCCCTTCTCTCTTCCTGTAATAAGCTACTTTATACCTATCA
AGATCTCGTTAGGATCTGCAGAGTCTGCAGATGCGAGTCGCTGCGGAAGATCGTCGAGAA
GGAGCTGGTTCACCAGAAGTATGCCGAGTACAAGACGCATAGGGATCTTGATAACTCCAT
GAAACGGTTTATTTTGCAGGGTGTATCCCTTCCGGAGGAAGACAGGCTTCCTGCTTCCTT
GCGTAGGATTCTTGGAGTGGAGAGCCTTGCTGATGTTTGTGTTAGAGTAGATAAAAAGAG
TTATTATTGCCATCAAGTGATACTAGCGTCGAGATCAGAGTACTTCAGAGCGAGGTTGTC
CCGAGTTAATGATTTCCATGAGGGCAAGAATGGTTTTCCGGGTCTTCCGTTTCTAGAAGA
ACATGATCTGAGCGCTGAGGCTTTCGAGAAGATGATTGAGTATATGTACACTGATGGCTT
GAAGGAGATCAGTCCAGATCAGGCTGAGGAGATCTTTGATGTTGCATCTCGCTACTTACT
GTTTCCTCTCAAACGTGCTGTGGCTGACGCCTTGTTGCCTCACTTGGAAACTGCCACACC
TGCTGAGCTCTGTCATTGGCTTGTTTTGTCTGATATGTACGGCGTGTTGAAGATAAGAGA
GTACTGCCTAGACTTGGTTGCTTGTAATTTCGAGGCGTTTGTGGAAACCAGAGAGTTCAG
GGCAATGCTATTAACGTTGCCTCCACCGTCAGGGGACTCTTCGCTTCGAACCACTGTTCC
AAGTGCACCAGGTGCAACGATGACGGCAGACCAAGGGAATGTGCTCGATGATCTGAGAGA
GAAGTGGCTTGAAGCAGAGGCTTTAGAGCTTGACATGAGAGACGAGAGTGCTTTGGTTTT
CGATAAGCGTCTCAGAATGCTTGTGGAAATGGCCGAGCAAGAGAAATCAGAGTCAGAAGC
TGAGGACAACTAAGACACCGGTTCTTCTTAAGAGTCTGGTGAAGACGAGTTTTGAGTCTG
TTTTGTTTTCATATATATACTTTCACTTCTTTCTCGTAATCTTATATAGAACCTTTCTAA
GC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2F264TF U 1
AF RR2F264JQ C 253
BS 1 686 RR2F264TF
BS 687 687 RR2F264JQ
BS 688 721 RR2F264TF
BS 722 722 RR2F264JQ
BS 723 771 RR2F264TF
BS 772 772 RR2F264JQ
BS 773 802 RR2F264TF
BS 803 1082 RR2F264JQ

RD RR2F264TF 802 0 0
GGATCACTCTCAATCTCCTTCCCTTCTCTCTTCCTGTAATAAGCTACTTTATACCTATCA
AGATCTCGTTAGGATCTGCAGAGTCTGCAGATGCGAGTCGCTGCGGAAGATCGTCGAGAA
GGAGCTGGTTCACCAGAAGTATGCCGAGTACAAGACGCATAGGGATCTTGATAACTCCAT
GAAACGGTTTATTTTGCAGGGTGTATCCCTTCCGGAGGAAGACAGGCTTCCTGCTTCCTT
GCGTAGGATTCTTGGAGTGGAGAGCCTTGCTGATGTTTGTGTTAGAGTAGATAAAAAGAG
TTATTATTGCCATCAAGTGATACTAGCGTCGAGATCAGAGTACTTCAGAGCGAGGTTGTC
CCGAGTTAATGATTTCCATGAGGGCAAGAATGGTTTTCCGGGTCTTCCGTTTCTAGAAGA
ACATGATCTGAGCGCTGAGGCTTTCGAGAAGATGATTGAGTATATGTACACTGATGGCTT
GAAGGAGATCAGTCCAGATCAGGCTGAGGAGATCTTTGATGTTGCATCTCGCTACTTACT
GTTTCCTCTCAAACGTGCTGTGGCTGACGCCTTGTTGCCTCACTTGGAAACTGCCACACC
TGCTGAGCTCTGTCATTGGCTTGTTTTGTCTGATATGTACGGCGTGTTGAAGATAAGAGA
GTACTGCCTAGACTTGGTTGCTTGTA*TTTCGAGGCGTTTGTGGAAACCAGAGAGTTCAG
G*CAATGCTATTAACGTTGCCTCCACCGTCAGGGGACTCTTCGCTTCGAAC*ACTGTTCC
AAGTGCACCAGGTGCAACGATG

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2F264JQ 830 0 0
TGGAGTGGAGAGC*TTGCTGATGTTTGTGTTAGAGTAGATAAAAAGAGTTATTATTGCCA
TCAAGTGATACTAGCGTCGAGATCAGAGTACTTCAGAGCGAGGTTGTCCCGAGTTAATGA
TTTCCATGAGGGCAAGAATGGTTTTCCGGGTCTTCCGTTTCTAGAAGAACATGATCTGAG
CGCTGAGGCTTTCGAGAAGATGATTGAGTATATGTACACTGATGGCTTGAAGGAGATCAG
TCCAGATCAGGCTGAGGAGATCTTTGATGTTGCATCTCGCTACTTACTGTTTCCTCTCAA
ACGTGCTGTGGCTGACGCCTTGTTGCCTCACTTGGAAACTGCCACACCTGCTGAGCTCTG
TCATTGGCTTGTTTTGTCTGATATGTACGGCGTGTTGAAGATAAGAGAGTACTGCCTAGA
CTTGGTTGCTTGTAATTTCGAGGCGTTTGTGGAAACCAGAGAGTTCAGGGCAATGCTATT
AACGTTGCCTCCACCGTCAGGGGACTCTTCGCTTCGAACCACTGTTCCAAGTGCACCAGG
TGCAACGATGACGGCAGACCAAGGGAATGTGCTCGATGATCTGAGAGAGAAGTGGCTTGA
AGCAGAGGCTTTAGAGCTTGACATGAGAGACGAGAGTGCTTTGGTTTTCGATAAGCGTCT
CAGAATGCTTGTGGAAATGGCCGAGCAAGAGAAATCAGAGTCAGAAGCTGAGGACAACTA
AGACACCGGTTCTTCTTAAGAGTCTGGTGAAGACGAGTTTTGAGTCTGTTTTGTTTTCAT
ATATATACTTTCACTTCTTTCTCGTAATCTTATATAGAACCTTTCTAAGC

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 2

CO CL6991Contig1 1096 2 2 U
GGATTACAAACAGATCACCAAAAAGTATAACCCTCTTCAATTGGTATAATCAACAACATG
GCTAGATCTTTGGTGCTCTCGCTAACCCTCGCATTCCTCTTCATAGGAATGGTCTCAGCT
CGTGACTGGAACATCCTAAACCAGTTTAAGGGACTCAAGCCATCCACAACCACCAACCAG
AACGGTGTCGCCTCATTGAAAGGACCAAACCTAAACGGATACTGCGAGAGCTGGAGAGTC
AACGTGGAGCTTCAGAACATCAGAGACTTCACAGTGGTGCCACAGGAGTGCGTGTGGTTC
GTCCAACAGTACATGACGTCATCTCAGTACGATGATGACGTCGAGAGAGCCGTTGAGGAA
GCCATCCTCTACCTCGGGAAAAGTTGTTGCGGAAAGAAGGAATGTGATGACATGGATGCT
TGGATCTTTGACATTGATGACACTCTGCTCTCCACCATCCCGTACCACAAGAGCAACGGC
TGTTTCGGTGGTGAGCAACTAAACACGACCAAGTTCGAGGAATGGCAGAGTTGGGGAAAG
GCACCAGCTGTTCCAAACATGGTGAAGCTATTCCATGAGATCCGGGAGAGGGGTTTCAAG
ATCTTTTTGGTTTCTTCTCGCAAGGAGTACCTCAGATCCGCCACCGTCGAGAACCTTATT
GAAGCCGGTTACCACAGCGGGTCTAACCTCCTTCTCAGAGGAGAAGAGGAAGAGAAGAAG
AGTGTGACCCAATACAAAGCAGATGTGAGGACGTGGCTTACAAGTCTCGGATACAGAGTT
TGGGGAGTGATGGGTGCACAATGGAACAGCTTCGCAGGTTGTCCAGTTCCCAAGAGAACC
TTCAAGCTCCCTAACTCCATCTACTATGTCGCTTGATCAAATCATTTTCCGAATAATATT
CTAACCAATGAATAAGATCAGAGTTCCAATCTGATTATTGAGTCTTTTCTATCCCTTTTC
CATTTCCGGTTTATATAACCAATTCAAATGCTTATGAGTGATATATGAACCATGATCATC
TTTGCTTGTTTTGAATTCAGCTGTTTCTTTGTATGACTATTTTGGGCCTTTATGAAATTA
ATTTTGGGCTTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT67TF U 1
AF RR2CT67JQ C 285
BS 1 667 RR2CT67TF
BS 668 1096 RR2CT67JQ

RD RR2CT67TF 670 0 0
GGATTACAAACAGATCACCAAAAAGTATAACCCTCTTCAATTGGTATAATCAACAACATG
GCTAGATCTTTGGTGCTCTCGCTAACCCTCGCATTCCTCTTCATAGGAATGGTCTCAGCT
CGTGACTGGAACATCCTAAACCAGTTTAAGGGACTCAAGCCATCCACAACCACCAACCAG
AACGGTGTCGCCTCATTGAAAGGACCAAACCTAAACGGATACTGCGAGAGCTGGAGAGTC
AACGTGGAGCTTCAGAACATCAGAGACTTCACAGTGGTGCCACAGGAGTGCGTGTGGTTC
GTCCAACAGTACATGACGTCATCTCAGTACGATGATGACGTCGAGAGAGCCGTTGAGGAA
GCCATCCTCTACCTCGGGAAAAGTTGTTGCGGAAAGAAGGAATGTGATGACATGGATGCT
TGGATCTTTGACATTGATGACACTCTGCTCTCCACCATCCCGTACCACAAGAGCAACGGC
TGTTTCGGTGGTGAGCAACTAAACACGACCAAGTTCGAGGAATGGCAGAGTTGGGGAAAG
GCACCAGCTGTTCCAAACATGGTGAAGCTATTCCATGAGATCCGGGAGAGGGGTTTCAAG
ATCTTTTTGGTTTCTTCTCGCAAGGAGTACCTCAGATCCGCCACCGTCGAGAACCTTATT
GAAGCCG
TTA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2CT67JQ 812 0 0
GGAGTGCGTGTG*TTCGTCCAACAGTACATGACGTCATCTCAGTACGATGATGACGTCGA
GAGAGC*GTTGAGGAAGCCATCCTCTACCTCGGGAAAAGTTGTTGCGGAAAGAAGGAATG
TGATGACATGGATGCTTGGATCTTTGACATTGATGACACTCTGCTCTCCACCATCCCGTA
CCACAAGAGCAACGGCTGTTTCGGTGGTGAGCAACTAAACACGACCAAGTTCGAGGAATG
GCAGAGTTGGGGAAAGGCACCAGCTGTTCCAAACATGGTGAAGCTATTCCATGAGATCCG
GGAGAGGGGTTTCAAGATCTTTTTGGTTTCTTCTCGCAAGGAGTACCTCAGATCCGCCAC
CGTCGAGAACCTTATTGAAGCCGGTTACCACAGCGGGTCTAACCTCCTTCTCAGAGGAGA
AGAGGAAGAGAAGAAGAGTGTGACCCAATACAAAGCAGATGTGAGGACGTGGCTTACAAG
TCTCGGATACAGAGTTTGGGGAGTGATGGGTGCACAATGGAACAGCTTCGCAGGTTGTCC
AGTTCCCAAGAGAACCTTCAAGCTCCCTAACTCCATCTACTATGTCGCTTGATCAAATCA
TTTTCCGAATAATATTCTAACCAATGAATAAGATCAGAGTTCCAATCTGATTATTGAGTC
TTTTCTATCCCTTTTCCATTTCCGGTTTATATAACCAATTCAAATGCTTATGAGTGATAT
ATGAACCATGATCATCTTTGCTTGTTTTGAATTCAGCTGTTTCTTTGTATGACTATTTTG
GGCCTTTATGAAATTAATTTTGGGCTTTTGTT

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

CO CL6992Contig1 699 2 1 U
GGATCACACGGCCAACCAGCCCGACCAGCCCGCATGCGTCCTTATCCTTACTGCCATGGA
CCCGATCATCATGGATGCACCTGGACGCTTGGACGAATCTTGACCAATCTACATCAGAGT
CCGCGCCCTTGACCAAGACTGCATAAAAATCACCACTTTGACTGGTCTTCCATCATTTTC
CACACAATTGACTCATTAATAAATTTCTAGTCAATTGTTGTCATTTTCTATGCATTCTAT
GCATTGTTTTCCCCATTTTCTTTTATTTCTCTTTGCCTACAAACCTTATAAATATGTAAT
ATCTGCGATGAAATAAAAATCAGATTGTTTTCCCCTTTTTATGAGTTTTCACTCTTTGTT
CTTTGTTAGAACATTTCTTAGTTTCTTGGTGAGATTATCTCCAAGTTTCGATCCTTCTTT
TGTTGGACCGGTGCGTCACATCCAGCAACGATCTAAGTCTGGTAGAATCATTGGGCCTTC
CGCAACCCTTTGTGACACCATTCATTCCATCAGTTCTCAATCCATCCGGATCTGAGTTCA
TATCTCCCCTTACCGGTCGAGTGCCTTTCCTTGGGTATATCATTTGGTATCAGATCCACT
CTTCCGGTAACTCTATTTCATTCCATATTTTCTCATCTTCCATTTCTTAAACACTTCTTC
TATCTATCTTGAATCTGGGCCCCTCATTACCATCCATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FC83TF U 1
AF RR2FC83JQ C 168
BS 1 699 RR2FC83TF

RD RR2FC83TF 699 0 0
GGATCACACGGCCAACCAGCCCGACCAGCCCGCATGCGTCCTTATCCTTACTGCCATGGA
CCCGATCATCATGGATGCACCTGGACGCTTGGACGAATCTTGACCAATCTACATCAGAGT
CCGCGCCCTTGACCAAGACTGCATAAAAATCACCACTTTGACTGGTCTTCCATCATTTTC
CACACAATTGACTCATTAATAAATTTCTAGTCAATTGTTGTCATTTTCTATGCATTCTAT
GCATTGTTTTCCCCATTTTCTTTTATTTCTCTTTGCCTACAAACCTTATAAATATGTAAT
ATCTGCGATGAAATAAAAATCAGATTGTTTTCCCCTTTTTATGAGTTTTCACTCTTTGTT
CTTTGTTAGAACATTTCTTAGTTTCTTGGTGAGATTATCTCCAAGTTTCGATCCTTCTTT
TGTTGGACCGGTGCGTCACATCCAGCAACGATCTAAGTCTGGTAGAATCATTGGGCCTTC
CGCAACCCTTTGTGACACCATTCATTCCATCAGTTCTCAATCCATCCGGATCTGAGTTCA
TATCTCCCCTTACCGGTCGAGTGCCTTTCCTTGGGTATATCATTTGGTATCAGATCCACT
CTTCCGGTAACTCTATTTCATTCCATATTTTCTCATCTTCCATTTCTTAAACACTTCTTC
TATCTATCTTGAATCTGGGCCCCTCATTACCATCCATAT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2FC83JQ 532 0 0
TTCCATCATTTTCCACACAATTGACTCATTAATAAATTTCTAGTCAATTGTTGTCATTTT
CTATGCATTCTATGCATTGTTTTCCCCATTTTCTTTTATTTCTCTTTGCCTACAAACCTT
ATAAATATGTAATATCTGCGATGAAATAAAAATCAGATTGTTTTCCCCTTTTTATGAGTT
TTCACTCTTTGTTCTTTGTTAGAACATTTCTTAGTTTCTTGGTGAGATTATCTCCAAGTT
TCGATCCTTCTTTTGTTGGACCGGTGCGTCACATCCAGCAACGATCTAAGTCTGGTAGAA
TCATTGGGCCTTCCGCAACCCTTTGTGACACCATTCATTCCATCAGTTCTCAATCCATCC
GGATCTGAGTTCATATCTCCCCTTACCGGTCGAGTGCCTTTCCTTGGGTATATCATTTGG
TATCAGATCCACTCTTCCGGTAACTCTATTTCATTCCATATTTTCTCATCTTCCATTTCT
TAAACACTTCTTCTATCTATCTTGAATCTGGGCCCCTCATTACCATCCATAT

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL6993Contig1 699 2 5 U
GGCTCCTCCACAAGCTCCACGAGAAAGGATCGGAATCCATCAGTACTCTCGCCGCCGGTG
ATTCGCTGGCGTAATCAGCAAACTGAAAAATCGTTAGTCGGTCCGAGAAAAGGAATAGAT
TGTTGTTTACTGATGCGTAGAAGCGGTTAGTTTCTGAACGATAAAGAATGTCTCTGAGGA
TTAAATTAGTGGTGGATAAGTTCGTGGAGGAGCTAAAGCAAGCCCTCGACGCCGACATAC
AAGATCGGATCATGAAGGAGAGGGAGATGCAGAGCTACATCGAGGAGCGAGAGCGCGAAG
TCGCTGAGCGAGAAGCCGCCTGGAAAGCCGAGCTCTCTCGCCGCGAGACGGAGATTGCAA
GACAGGAAGCGAGGCTGAAGGTGGAGAGGGAGAATCTGGAGAAGGAGAAGAGCGTTCTCA
TGGGGACGGCGTCGAACCAGGATAATCAAGACGGTGCTCTGGAGATTACTGTGAGTGGTG
AGAAGTATCGCTGCCTTAGATTCTCCAAGGCCAAGAAATGAGTCCACAAATCACTTTACG
GTGCTTCCTGCTTAGGGTTTGTTTGATTGATGTGTCTTTGCTATAACTTTACTATTCTGA
ATCTCTTTTACTTAGGGCCTTTCTAGTGGAACACAACATTTAGGGCTCGGTGTTGGTTTG
GAGATCTTATGTTCTTGGAAGATGTATTCTTTTGTGGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CX14JQ C 1
AF RR2CX14TF U 1
BS 1 644 RR2CX14TF
BS 645 645 RR2CX14JQ
BS 646 653 RR2CX14TF
BS 654 654 RR2CX14JQ
BS 655 699 RR2CX14TF

RD RR2CX14JQ 699 0 0
GGCTCCTCCACAAGCTCCACGAGAAAGGATCGGAATCCATCAGTACTCTCGCCGCCGGTG
ATTCGCTGGCGTAATCAGCAAACTGAAAAATCGTTAGTCGGTCCGAGAAAAGGAATAGAT
TGTTGTTTACTGATGCGTAGAAGCGGTTAGTTTCTGAACGATAAAGAATGTCTCTGAGGA
TTAAATTAGTGGTGGATAAGTTCGTGGAGGAGCTAAAGCAAGCCCTCGACGCCGACATAC
AAGATCGGATCATGAAGGAGAGGGAGATGCAGAGCTACATCGAGGAGCGAGAGCGCGAAG
TCGCTGAGCGAGAAGCCGCCTGGAAAGCCGAGCTCTCTCGCCGCGAGACGGAGATTGCAA
GACAGGAAGCGAGGCTGAAGGTGGAGAGGGAGAATCTGGAGAAGGAGAAGAGCGTTCTCA
TGGGGACGGCGTCGAACCAGGATAATCAAGACGGTGCTCTGGAGATTACTGTGAGTGGTG
AGAAGTATCGCTGCCTTAGATTCTCCAAGGCCAAGAAATGAGTCCACAAATCACTTTACG
GTGCTTCCTGCTTAGGGTTTGTTTGATTGATGTGTCTTTGCTATAACTTTACTATTCTGA
ATCTCTTTTACTTAGGGCCTTTCTAGTGGAACACAACATTTAGGGCTCGGTGTTGGTTTG
GAGATCTTATGTTCTTGGAAGATGTATTCTTTTGTGGTC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2CX14TF 699 0 0
GGCTCCTCCACAAGCTCCACGAGAAAGGATCGGAATCCATCAGTACTCTCGCCGCCGGTG
ATTCGCTGGCGTAATCAGCAAACTGAAAAATCGTTAGTCGGTCCGAGAAAAGGAATAGAT
TGTTGTTTACTGATGCGTAGAAGCGGTTAGTTTCTGAACGATAAAGAATGTCTCTGAGGA
TTAAATTAGTGGTGGATAAGTTCGTGGAGGAGCTAAAGCAAGCCCTCGACGCCGACATAC
AAGATCGGATCATGAAGGAGAGGGAGATGCAGAGCTACATCGAGGAGCGAGAGCGCGAAG
TCGCTGAGCGAGAAGCCGCCTGGAAAGCCGAGCTCTCTCGCCGCGAGACGGAGATTGCAA
GACAGGAAGCGAGGCTGAAGGTGGAGAGGGAGAATCTGGAGAAGGAGAAGAGCGTTCTCA
TGGGGACGGCGTCGAACCAGGATAATCAAGACGGTGCTCTGGAGATTACTGTGAGTGGTG
AGAAGTATCGCTGCCTTAGATTCTCCAAGGCCAAGAAATGAGTCCACAAATCACTTTACG
GTGCTTCCTGCTTAGGGTTTGTTTGATTGATGTGTCTTTGCTATAACTTTACTATTCTGA
ATCTCTTTTACTTAGGGCCTTTCTAGTGGAACACAACATTTAGG*CTCGGTGT*GGTTTG
GAGATCTTATGTTCTTGGAAGATGTATTCTTTTGTGGTC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL6994Contig1 686 2 2 U
GGATCTCTAAAAACTAATCTCAAGTTTGATCAAGAAAATCAAGAAAGATGCCTAAAGACA
GGAAGATCGGAATCGCGATGGACTTCTCGGAGAGCAGCAAGAATGCACTGAAATGGGCGT
TTGAGAACTTAGCTGATAAAGGAGACACACTTTACATCATCCACACGTTATCAACCTCTG
ACGTTGACTCTCATAACTCTGCCTGGCTCGAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGG
AGTTTAGGGAACCGGAGATCATGGAGAAATATGGTGTCAAGATTGATATCCCAGTTCTTG
ACATGCTTGACACTTGTTCAAGGCAGAAAGAGGTGCATGTAGTGACAAAATTATACTGGG
GAGATGCAAGAGAGACGCTGGTCGATGCTGTTGAAGATCTCAAACTTGATTCTATTGTCA
TGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCTCTTCGAAGGATAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTCG
TGATTCAGCATGCTCCTTGCCCTGTCACCGTTGTCAAGGATAACGACTCCCTCTAAATTA
TGATGTCTTTATCTCATATGTTTTTACCAAAACCATCATCGCTGCTTATGCTTTTTTTTT
GAAACTTTGCTTATGCTTTTAATTAAAGAATAAAATAACCTTTTTCACGGTTGTATTTTG
TTTTTCTATTCGAATTCATATGAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H413TF U 1
AF RR2H413JQB C 133
BS 1 568 RR2H413TF
BS 569 686 RR2H413JQB

RD RR2H413TF 568 0 0
GGATCTCTAAAAACTAATCTCAAGTTTGATCAAGAAAATCAAGAAAGATGCCTAAAGACA
GGAAGATCGGAATCGCGATGGACTTCTCGGAGAGCAGCAAGAATGCACTGAAATGGGCGT
TTGAGAACTTAGCTGATAAAGGAGACACACTTTACATCATCCACACGTTATCAACCTCTG
ACGTTGACTCTCATAACTCTGCCTGGCTCGAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGG
AGTTTAGGGAACCGGAGATCATGGAGAAATATGGTGTCAAGATTGATATCCCAGTTCTTG
ACATGCTTGACACTTGTTCAAGGCAGAAAGAGGTGCATGTAGTGACAAAATTATACTGGG
GAGATGCAAGAGAGACGCTGGTCGATGCTGTTGAAGATCTCAAACTTGATTCTATTGTCA
TGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCTCTTCGAAGGATAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTCG
TGATTCAGCATGCTCCTTGCCCTGTCACCGTTGTCAAGGATAACGACTCCCTCTAAATTA
TGATGTCTTTATCTCATATGTTTTTACC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2H413JQB 554 0 0
CTGATAAAGGAGACACACTTTACATCATCCACACGTTATCAACCTCTGACGTTGACTCTC
ATAACTCTGCCTGGCTGGAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTTTAGGGAAC
CGGAGATCATGGAGAAATATGGTGTCAAGATTGATATCCCAGTTCTTGACATGCTTGACA
CTTGTTCAAGGCAGAAAGAGGTGCATGTAGTGACAAAATTATACTGGGGAGATGCAAGAG
AGACGCTGGTCGATGCTGTTGAAGATCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAG
GACTCAGTGCTCTTCGAAGGATAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTCGTGATTCAGCATG
CTCCTTGCCCTGTCACCGTTGTCAAGGATAACGACTCCCTCTAAATTATGATGTCTTTAT
CTCATATGTTTTTACCAAAACCATCATCGCTGCTTATGCTTTTTTTTTGAAACTTTGCTT
ATGCTTTTAATTAAAGAATAAAATAACCTTTTTCACGGTTGTATTTTGTTTTTCTATTCG
AATTCATATGAATA

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 2

CO CL6995Contig1 984 2 4 U
GGGAGGAAAGTTGTAAAGAAATGAAAAAAAGTTGACTAGAAGCGGAGAAGTTGAATTTGG
TTCCTCTTCATTCAATCAATTGTAATTGGCATTTGGGGAAGTCGGAGAGTTTGGTTAATT
TCGGGGTTTTGGTATCCTCCGATGGACAGTTCGAGTGACATCGATGGTGATTCCGAGGGA
AGAAATGAAGGAGGAGGATCCACGTCGGATTATCGATTGCTGGGTCGGCAAGTTACGGTT
CATCAGTTCATGGGCGGTGGCAAAGCTGCTGACTTGCTCTTATGGAGGAGAAGAAACCAT
TCCTTAGGGGTTATCGTTTTATCAACCGCAGCTTGGCTTACTTTCGAGCTTTCCGGATTG
CCTTTCTTATCTGTTTCTTCGGATGTTTTACTTATTGGGATCGTTATATCATTCCTTCAT
GCCCAGGTTTCTGCTTTTAGGAATAGACAGGCGGATTCGTTGCCAGAGCTTGTTCTATCC
GAGGAAATGGTTCATAGTGCTGCTGCTTCCTTCCGTGTAAAACTCAACCACTTGCTTGTG
ATGACTCATGATGTCACAGTTGGCAACGATTTTCGGCTCTTCTTCAAGGTGGTGATTTGT
CTGTGGCTTCTCTCTGCCATTGGTAGCTATATTTCCTTCTGCACTCTTGTTTATATCGGG
ACCATCCTATCTGTAACAGTACCGGCTTTGTACAGCAAATATCAAAGCAAAGTAGACAAG
TGTTGCGGGTTGATTCACAGGCAATTGTCTCATCAATACAAGTTAGTTGACGAAAATGTT
ATAAGCAAACTCTCGTGGAGCTTATCCAAGGATAAAGATTCCTGAGGTTTTTAACTTTGG
TGATTTTGAAAATGCCTTTTACTTGTCTTCCTTCATAGTTTTCACTAGTTTGGGTTTCTT
CTAATTTACCATTGTGGAGTATTATTATGTAACTAAAAGACGATATCAAGGATGAATATA
TAAAGATGGTTCCACTGTTCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D565TF U 1
AF RR2D565JQ C 195
BS 1 710 RR2D565TF
BS 711 711 RR2D565JQ
BS 712 734 RR2D565TF
BS 735 984 RR2D565JQ

RD RR2D565TF 736 0 0
GGGAGGAAAGTTGTAAAGAAATGAAAAAAAGTTGACTAGAAGCGGAGAAGTTGAATTTGG
TTCCTCTTCATTCAATCAATTGTAATTGGCATTTGGGGAAGTCGGAGAGTTTGGTTAATT
TCGGGGTTTTGGTATCCTCCGATGGACAGTTCGAGTGACATCGATGGTGATTCCGAGGGA
AGAAATGAAGGAGGAGGATCCACGTCGGATTATCGATTGCTGGGTCGGCAAGTTACGGTT
CATCAGTTCATGGGCGGTGGCAAAGCTGCTGACTTGCTCTTATGGAGGAGAAGAAACCAT
TCCTTAGGGGTTATCGTTTTATCAACCGCAGCTTGGCTTACTTTCGAGCTTTCCGGATTG
CCTTTCTTATCTGTTTCTTCGGATGTTTTACTTATTGGGATCGTTATATCATTCCTTCAT
GCCCAGGTTTCTGCTTTTAGGAATAGACAGGCGGATTCGTTGCCAGAGCTTGTTCTATCC
GAGGAAATGGTTCATAGTGCTGCTGCTTCCTTCCGTGTAAAACTCAACCACTTGCTTGTG
ATGACTCATGATGTCACAGTTGGCAACGATTTTCGGCTCTTCTTCAAGGTGGTGATTTGT
CTGTGGCTTCTCTCTGCCATTGGTAGCTATATTTCCTTCTGCACTCTTGTTTATATCGGG
ACCATCCTATCTGTAACAGTACCGGCTTTGTACAGCAAATATCAAAGCAA*GTAGACAAG
TGTTGCGGGTTGAT
CA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2D565JQ 790 0 0
GAGGAT
CACGTCGGATTATCGATTGCTGGGTCGGCAAGTTACGGTTCATCAGTTCATGGGCGGTGG
CAAAGCTGCTGACTTGCTCTTATGGAGGAGAAGAAACCATTCCTTAGGGGTTATCGTTTT
ATCAACCGCAGCTTGGCTTACTTTCGAGCTTTCCGGATTGCCTTTCTTATCTGTTTCTTC
GGATGTTTTACTTATTGGGATCGTTATATCATTCCTTCATGCCCAGGTTTCTGCTTTTAG
GAATAGACAGGCGGATTCGTTGCCAGAGCTTGTTCTATCCGAGGAAATGGTTCATAGTGC
TGCTGCTTCCTTCCGTGTAAAACTCAACCACTTGCTTGTGATGACTCATGATGTCACAGT
TGGCAACGATTTTCGGCTCTTCTTCAAGGTGGTGATTTGTCTGTGGCTTCTCTCTGCCAT
TGGTAGCTATATTTCCTTCTGCACTCTTGTTTATATCGGGACCATCCTATCTGTAACAGT
ACCGGCTTTGTACAGCAAATATCAAAGCAAAGTAGACAAGTGTTGCGGGTTGATTCACAG
GCAATTGTCTCATCAATACAAGTTAGTTGACGAAAATGTTATAAGCAAACTCTCGTGGAG
CTTATCCAAGGATAAAGATTCCTGAGGTTTTTAACTTTGGTGATTTTGAAAATGCCTTTT
ACTTGTCTTCCTTCATAGTTTTCACTAGTTTGGGTTTCTTCTAATTTACCATTGTGGAGT
ATTATTATGTAACTAAAAGACGATATCAAGGATGAATATATAAAGATGGTTCCACTGTTC
AACC

QA 7 790 7 790
DS 



AS 1 2

CO CL6996Contig1 713 2 2 U
GGATGAGAGACAAAAAAACAAAGATGATGAAACCCACAGCGAAATCAATCGAGAGAGTTG
GTCGTTTCTTAAGGAAGAGCCTTGGGAGCATCAAGTCCACTATTTGCTTTGGCAAATACC
ACAACTTACCTAACAACAACACTCCACTCTTGAGCCCCTTCTCATGCAGTCTTCACCGTA
GCTGTCCACAAGATTCCCAAACTGAAGAAACCTACAGCGTTATCTCCTGCGAGAGCGCGG
CTGTTGCAGAAACCAGAGATGAGAGCCTCATCAATAAGGTCCAACATAAAAAGAAACCGA
AGAAGAAGGTTGCAGAGCCATTGGAAGAAGCTAAGAGGAGAGGTGACATGTTGGCGCAAA
AGATGAAAGATTTCAACATGGTGGATCTTAGAGACGTGGAGCATGCTTCGGATGTACAGG
AAGCGCTTAGATGCTATTCAAGCATTAGAAGCCCTGTGTACCTGGACATTGTTGACAATT
TCTTCACTGACATGTACTACGAGTTCTCTGATCCGCTCACAAATTCCAGTATCAAGGGTT
CAAGGAGAAAAGCAGGCTCTTTCAGGCTCTAAGACTCCTCTGGATCAGCCTTCTTTCAGG
GCAGGGTGAATGCTATTTCTTTTATAGTACGCAGTTCTTATCAATTACGCAGCTTTAGTA
TTTCACTTACAACTTCGCTAAGAAAGAAACATGTCACCCTCAGTTACTACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT72TF U 1
AF RR2AT72JQ C 65
BS 1 596 RR2AT72TF
BS 597 713 RR2AT72JQ

RD RR2AT72TF 596 0 0
GGATGAGAGACAAAAAAACAAAGATGATGAAACCCACAGCGAAATCAATCGAGAGAGTTG
GTCGTTTCTTAAGGAAGAGCCTTGGGAGCATCAAGTCCACTATTTGCTTTGGCAAATACC
ACAACTTACCTAACAACAACACTCCACTCTTGAGCCCCTTCTCATGCAGTCTTCACCGTA
GCTGTCCACAAGATTCCCAAACTGAAGAAACCTACAGCGTTATCTCCTGCGAGAGCGCGG
CTGTTGCAGAAACCAGAGATGAGAGCCTCATCAATAAGGTCCAACATAAAAAGAAACCGA
AGAAGAAGGTTGCAGAGCCATTGGAAGAAGCTAAGAGGAGAGGTGACATGTTGGCGCAAA
AGATGAAAGATTTCAACATGGTGGATCTTAGAGACGTGGAGCATGCTTCGGATGTACAGG
AAGCGCTTAGATGCTATTCAAGCATTAGAAGCCCTGTGTACCTGGACATTGTTGACAATT
TCTTCACTGACATGTACTACGAGTTCTCTGATCCGCTCACAAATTCCAGTATCAAGGGTT
CAAGGAGAAAAGCAGGCTCTTTCAGGCTCTAAGACTCCTCTGGATCAGCCTTCTTT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RR2AT72JQ 649 0 0
TTTCTTAAGGAAGAGCCTTGGGAGCATCAAGTCCACTATTTGCTTTGGCAAATACCACAA
CTTACCTAACAACAACACTCCACTCTTGAGCCCCTTCTCATGCAGTCTTCACCGTAGCTG
TCCACAAGATTCCCAAACTGAAGAAACCTACAGCGTTATCTCCTGCGAGAGCGCGGCTGT
TGCAGAAACCAGAGATGAGAGCCTCATCAATAAGGTCCAACATAAAAAGAAACCGAAGAA
GAAGGTTGCAGAGCCATTGGAAGAAGCTAAGAGGAGAGGTGACATGTTGGCGCAAAAGAT
GAAAGATTTCAACATGGTGGATCTTAGAGACGTGGAGCATGCTTCGGATGTACAGGAAGC
GCTTAGATGCTATTCAAGCATTAGAAGCCCTGTGTACCTGGACATTGTTGACAATTTCTT
CACTGACATGTACTACGAGTTCTCTGATCCGCTCACAAATTCCAGTATCAAGGGTTCAAG
GAGAAAAGCAGGCTCTTTCAGGCTCTAAGACTCCTCTGGATCAGCCTTCTTTCAGGGCAG
GGTGAATGCTATTTCTTTTATAGTACGCAGTTCTTATCAATTACGCAGCTTTAGTATTTC
ACTTACAACTTCGCTAAGAAAGAAACATGTCACCCTCAGTTACTACCCC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL6997Contig1 771 2 7 U
GGAGAAAACAAATAAAAAATAAAATAAATAAATAAATAAAAATGGGTTCATATTTAGGAA
TATATACAATTTTGGTTCTATGTTTGCTAGGATATTCAGCCAATGCCGAGGTGTTTAACG
CTGGTGGTCCTCCAAATTCTGATATTACCGCGGCAGTTCTTAAAGCATTCACATCGGCAT
GCCAAGCTCCGGCACCAAGCCAGGTGCTGATCCCAAAAGGTGACTTCAAGCTTGGTGAGA
TCGCTATGACTGGTCCATGCAAATCTCCAATCGAGTTCACCTTGCAAGGCAACGTCAAAG
CTGACGGTGGCTCTACCCAGGGAAAGGATAGATGGGTTGTGTTCGAAAAAATTAATGGTT
TTAAGTTGAACGGAGGTGGAACATTTGACGGTGAAGGCAATGCAGCAAGGGACATCCATG
TGAGAATGTTGAGATTGGAGACATTAACATTGAGTACAAAGGACCTGATGGTCCACCCAT
TTTCGAATGCACAAACGTCACACCTAAGCTTGTGGGAACCCAGAACCCAAAGGCTTGCGT
TGGACCTGTCGTCAAGGCACCTGGTCAAGCGTAAATTGTTGAAGCTCAGATCAACACACT
AGGGCTTTCACATCCAATTTTGTTTTTCCTTTTCTCTAACCCTTTTTCAAGTCGCATATG
GGTGAGTTTTAGAAAACTGTAACAAAAAAAAATGTATATTCGATGCCAACACATATGTGT
GGGTGCATAATGATGTAATTAATAAAACTAAATTATATGTTCTGCGTATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C344JQ C 1
AF RR2C344TF U 244
BS 1 243 RR2C344JQ
BS 244 691 RR2C344TF
BS 692 692 RR2C344JQ
BS 693 708 RR2C344TF
BS 709 709 RR2C344JQ
BS 710 742 RR2C344TF
BS 743 771 RR2C344JQ

RD RR2C344JQ 771 0 0
GGAGAAAACAAATAAAAAATAAAATAAATAAATAAATAAAAATGGGTTCATATTTAGGAA
TATATACAATTTTGGTTCTATGTTTGCTAGGATATTCAGCCAATGCCGAGGTGTTTAACG
CTGGTGGTCCTCCAAATTCTGATATTACCGCGGCAGTTCTTAAAGCATTCACATCGGCAT
GCCAAGCTCCGGCACCAAGCCAGGTGCTGATCCCAAAAGGTGACTTCAAGCTTGGTGAGA
TCGCTATGACTGGTCCATGCAAATCTCCAATCGAGTTCACCTTGCAAGGCAACGTCAAAG
CTGACGGTGGCTCTACCCAGGGAAAGGATAGATGGGTTGTGTTCGAAAAAATTAATGGTT
TTAAGTTGAACGGAGGTGGAACATTTGACGGTGAAGGCAATGCAGCAAGGGACATCCATG
TGAGAATGTTGAGATTGGAGACATTAACATTGAGTACAAAGGACCTGATGGTCCACCCAT
TTTCGAATGCACAAACGTCACACCTAAGCTTGTGGGAACCCAGAACCCAAAGGCTTGCGT
TGGACCTGTCGTCAAGGCACCTGGTCAAGCGTAAATTGTTGAAGCTCAGATCAACACACT
AGGGCTTTCACATCCAATTTTGTTTTTCCTTTTCTCTAACCCTTTTTCAAGTCGCATATG
GGTGAGTTTTAGAAAACTGTAACAAAAAAAAATGTATATTCGATGCCAACACATATGTGT
GGGTGCATAATGATGTAATTAATAAAACTAAATTATATGTTCTGCGTATGA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2C344TF 503 0 0
CTATGACTGGTCCATGCAAATCTCCAATCGAGTTCACCTTGCAAGGCAACGTCAAAGCTG
ACGGTGGCTCTACCCAGGGAAAGGATAGATGGGTTGTGTTCGAAAAAATTAATGGTTTTA
AGTTGAACGGAGGTGGAACATTTGACGGTGAAGGCAATGCAGCAAGGGACATCCATGTGA
GAATGTTGAGATTGGAGACATTAACATTGAGTACAAAGGACCTGATGGTCCACCCATTTT
CGAATGCACAAACGTCACACCTAAGCTTGTGGGAACCCAGAACCCAAAGGCTTGCGTTGG
ACCTGTCGTCAAGGCACCTGGTCAAGCGTAAATTGTTGAAGCTCAGATCAACACACTAGG
GCTTTCACATCCAATTTTGTTTTTCCTTTTCTCTAACCCTTTTTCAAGTCGCATATGGGT
GAGTTTTAGAAAACTGTAACAAAAAAAA*TGTATATTCGATGCCA*CACATATGTGTGGG
TGCATAATGATGTAATTAA
AAAA

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

CO CL6998Contig1 1043 2 4 U
GGAGGAAGAGACTTTCGTGGTGGGTTTTCCGAGACTTGAAAGAGATGAGTTTTCGAGATT
TAGAGGCGGGAAGAGGAAGATCATTAGCTTCGTCACGGAACATCAATGGAGGAGGAGGAC
AAGACACGACGCAAGCCGTAGCTTCCGGTATTTTTCAGATCAACACAAGCGTCTCTAGCT
TCCAACGACTCGTCAACACTCTCGGTACTCCCAAAGACACCCCCGAGCTCCGAGATAAGC
TGCACAAGACAAGACTATATATCGGACAGTTAGTGAAAGACACAGCAGCTAAACTTAAAG
AAGCTAGTGAAACTGATCATCAAAGAGGTGTCAATCAAAAGAAGAAGATAGTGGATGCTA
AGCTTGCAAAAGACTTTCAATCTGTTTTGAAAGAGTTTCAAAAGGCTCAGCGTCTCGCTG
CTGAAAGAGAAACCCTTTATGCTCCTCTTGTGACCCTACCATCTCCTCCGTCTAGCTATA
CAGCCAGTGAGATAGATGTGAATGCAGATAAGCATCAAGAGCAGCGTGCGCCTCTTGTTG
AATCAAAAAGACAAGAAATCCAGCAGCAAATCGGCGAGGTGCATGAAATCTTCAAAGACT
TGGCAGTGTTGGTACATGATCAAAGAACCATGATTGATGATATCAGTACTCACATTGATA
ACTCCCACGCTGCAACTGCACAAGGAAAATCCCATCTCGCAAAAGCCTCAAGGACGCAAA
GATCGAACTCTTCCCTGACGTGCTTGCTCTTGGTGATTTTTGGTATCGTGCTCCTGATTG
TTATCATAGTGCTCGCGGTTTGAGTGCTGCATCATCAATCAAGAAAGCATTGATGAGTGC
CTGGTTGTTCAATTGTCTCCTCATGGCTCTATCCGTTGCTACCATTTAGTCTGTTTGGTC
TTTTTGTCTCTTGTTATCGAGTATATAGAGCAAGTCCGTTTGGTTTGGTTTGGTTTTTGG
GTATTGGGTTTTGTAAGAAAGTGTTACTCAGCGTTGTCTCTGTAAGATAATTCTTCTGTT
GAAGACCAAAGTGAATGATAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ58TF U 1
AF RR2CZ58JQ C 267
BS 1 682 RR2CZ58TF
BS 683 683 RR2CZ58JQ
BS 684 712 RR2CZ58TF
BS 713 1043 RR2CZ58JQ

RD RR2CZ58TF 722 0 0
GGAGGAAGAGACTTTCGTGGTGGGTTTTCCGAGACTTGAAAGAGATGAGTTTTCGAGATT
TAGAGGCGGGAAGAGGAAGATCATTAGCTTCGTCACGGAACATCAATGGAGGAGGAGGAC
AAGACACGACGCAAGCCGTAGCTTCCGGTATTTTTCAGATCAACACAAGCGTCTCTAGCT
TCCAACGACTCGTCAACACTCTCGGTACTCCCAAAGACACCCCCGAGCTCCGAGATAAGC
TGCACAAGACAAGACTATATATCGGACAGTTAGTGAAAGACACAGCAGCTAAACTTAAAG
AAGCTAGTGAAACTGATCATCAAAGAGGTGTCAATCAAAAGAAGAAGATAGTGGATGCTA
AGCTTGCAAAAGACTTTCAATCTGTTTTGAAAGAGTTTCAAAAGGCTCAGCGTCTCGCTG
CTGAAAGAGAAACCCTTTATGCTCCTCTTGTGACCCTACCATCTCCTCCGTCTAGCTATA
CAGCCAGTGAGATAGATGTGAATGCAGATAAGCATCAAGAGCAGCGTGCGCCTCTTGTTG
AATCAAAAAGACAAGAAATCCAGCAGCAAATCGGCGAGGTGCATGAAATCTTCAAAGACT
TGGCAGTGTTGGTACATGATCAAAGAACCATGATTGATGATATCAGTACTCACATTGATA
ACTCCCACGCTGCAACTGCACA*GGAAAATCCCATCTCGCAAAAGCCTCAAG
ACGCAAGATC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2CZ58JQ 777 0 0
CAGTTAGTGAAAGACACAGCAGCTAAACTTAAAGAAGCTAGTGAAACTGATCATCAAAGA
GGTGTCAATCAAAAGAAGAAGATAGTGGATGCTAAGCTTGCAAAAGACTTTCAATCTGTT
TTGAAAGAGTTTCAAAAGGCTCAGCGTCTCGCTGCTGAAAGAGAAACCCTTTATGCTCCT
CTTGTGACCCTACCATCTCCTCCGTCTAGCTATACAGCCAGTGAGATAGATGTGAATGCA
GATAAGCATCAAGAGCAGCGTGCGCCTCTTGTTGAATCAAAAAGACAAGAAATCCAGCAG
CAAATCGGCGAGGTGCATGAAATCTTCAAAGACTTGGCAGTGTTGGTACATGATCAAGGA
ACCATGATTGATGATATCAGTACTCACATTGATAACTCCCACGCTGCAACTGCACAAGGA
AAATCCCATCTCGCAAAAGCCTCAAGGACGCAAAGATCGAACTCTTCCCTGACGTGCTTG
CTCTTGGTGATTTTTGGTATCGTGCTCCTGATTGTTATCATAGTGCTCGCGGTTTGAGTG
CTGCATCATCAATCAAGAAAGCATTGATGAGTGCCTGGTTGTTCAATTGTCTCCTCATGG
CTCTATCCGTTGCTACCATTTAGTCTGTTTGGTCTTTTTGTCTCTTGTTATCGAGTATAT
AGAGCAAGTCCGTTTGGTTTGGTTTGGTTTTTGGGTATTGGGTTTTGTAAGAAAGTGTTA
CTCAGCGTTGTCTCTGTAAGATAATTCTTCTGTTGAAGACCAAAGTGAATGATAAAA

QA 1 777 1 777
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7000Contig1 810 2 4 U
GCTAACGCTGCAACCACAACCCCAAGCGGCTCAGCTGCTTCAGGTACCTCCTCCTCCACG
GGCACAAGTGGTGCTGGCTCGGTTTCTCCATCAGCTGCTCCTGTTTCTCAAGCAGCTGCC
CCAGTTTCTTCAGCAACTGTCCCAGTTGTTTCTCCAGCAGCCGCCCCAGTTGTTTCTCCA
GCAGCTGCCCCGGAAGGTTCTTTGAAGATGGCTTCAACAGGGTCAAGTGGTGCGGGCTCG
GTTTCTCCAGCATCTGCCCCGGAAGGTTCTATCATGATGGCTTCAATGGAGAGACCTGGT
GCTGCTGGCTCAGTTTCTCCAGCAGCTGCTCCGGAAGGTTCTATCATGATGGCTTCAATG
GAGAGACCTGGTGCTGCTGCCCCAGTTTCTTCAGCAGCTGCCCCAGAAGTTTCTATCATG
ATGGCTTCAATTGAAAGACCTGGTGCTGGCTCAGTTTCTCCGGTAGCTGCCCCAGAAGTT
TCCATCAAGGTGGCTTCATCGGAGACAACTCAGACAAGTGAAGTTTCTATCATGATGGCT
TCAATGGAGAGACCTGGTGCTGCTGCCCCGGTTTGTCCACCACCTCCCCCATTTTATCCT
GACATTGCATTGTCTAACTAAAAGATCCATAAAAATGCCATATAATGTCTTTTTTTTCTT
TACTAAAACCTGGATACAAAAAACATTTGCATAACCTTGAAGAATTCAGGATTATTGATC
TATCCCAAATTGTTTTGAGATTAATGTCTTCTATTACCGCAGTAATTTAAATATGTTGTT
TATAATTCTATAATTTTATGACAATTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D769TF U 1
AF RR2D769JQ C 132
BS 1 660 RR2D769TF
BS 661 661 RR2D769JQ
BS 662 677 RR2D769TF
BS 678 810 RR2D769JQ

RD RR2D769TF 677 0 0
GCTAACGCTGCAACCACAACCCCAAGCGGCTCAGCTGCTTCAGGTACCTCCTCCTCCACG
GGCACAAGTGGTGCTGGCTCGGTTTCTCCATCAGCTGCTCCTGTTTCTCAAGCAGCTGCC
CCAGTTTCTTCAGCAACTGTCCCAGTTGTTTCTCCAGCAGCCGCCCCAGTTGTTTCTCCA
GCAGCTGCCCCGGAAGGTTCTTTGAAGATGGCTTCAACAGGGTCAAGTGGTGCGGGCTCG
GTTTCTCCAGCATCTGCCCCGGAAGGTTCTATCATGATGGCTTCAATGGAGAGACCTGGT
GCTGCTGGCTCAGTTTCTCCAGCAGCTGCTCCGGAAGGTTCTATCATGATGGCTTCAATG
GAGAGACCTGGTGCTGCTGCCCCAGTTTCTTCAGCAGCTGCCCCAGAAGTTTCTATCATG
ATGGCTTCAATTGAAAGACCTGGTGCTGGCTCAGTTTCTCCGGTAGCTGCCCCAGAAGTT
TCCATCAAGGTGGCTTCATCGGAGACAACTCAGACAAGTGAAGTTTCTATCATGATGGCT
TCAATGGAGAGACCTGGTGCTGCTGCCCCGGTTTGTCCACCACCTCCCCCATTTTATCCT
GACATTGCATTGTCTAACTAAAAGATCCATAAAAATGCCATATAATGTCTTTTTTTTCTT
*ACTAAAACCTGGATAC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2D769JQ 679 0 0
AGCAACTGTCCCAGTTGTTTCTCCAGCAGCCGCCCCAGTTGTTTCTCCAGCAGCTGCCCC
GGAAGGTTCTTTGAAGATGGCTTCAACAGGGTCAAGTGGTGCGGGCTCGGTTTCTCCAGC
ATCTGCCCCGGAAGGTTCTATCATGATGGCTTCAATGGAGAGACCTGGTGCTGCTGGCTC
AGTTTCTCCAGCAGCTGCTCCGGAAGGTTCTATCATGATGGCTTCAATGGAGAGACCTGG
TGCTGCTGCCCCAGTTTCTTCAGCAGCTGCCCCAGAAGTTTCTATCATGATGGCTTCAAT
TGAAAGACCTGGTGCTGGCTCAGTTTTTCCGGTAGCTGCCCCAGAAGTTTCCATCAAGGT
GGCTTCATCGGAGACAACTCAGACAAGTGAAGTTTCTATCATGATGGCTTCAATGGAGAG
ACCTGGTGCTGCTGCCCCGGTTTGTCCACCACCTCCCCCATTTTATCCTGACATTGCATT
GTCTAACTAAAAGATCCATAAAAATGCCATATAATGTCTTTTTTTTTTTTACTAAAACCT
GGATACAAAAAACATTTGCATAACCTTGAAGAATTCAGGATTATTGATCTATCCCAAATT
GTTTTGAGATTAATGTCTTCTATTACCGCAGTAATTTAAATATGTTGTTTATAATTCTAT
AATTTTATGACAATTCATT

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL7001Contig1 666 2 1 U
GGGATGATCCAGTGGTCAGGATATATCATATGGCTACTGCATTATCTAAGACGTTTAAGT
CTCCTGTAGTTGACAATATTCAGCCTCTTCCTCAACACCAACAAATCATAATATGTTCTG
CTGCAAAGGCTTTTCGAGGGGCCAAAAAGGGTGCAACCGTTAGAGAGGTTAATAAATTAT
ACCTGGAAATCTGTAAATCTTGGGTGATTTCTCCTGCCGGAATTACAGAGTTCACTAACA
TGTGTACAGTGCTAAATGATCAGGGGATTTTAAAATTCGGCCAAGCTCGTAGAGATAATG
TAAAGAGAGTAAGCCTGAGAGTAGACGAATCAGACATTACATTTGCTCTTCAGTAAACAC
TTCCCTTAAATATAAAATCAACAGGGAATACGAACTTTTAGGAACTGTCTTCTGTGAGAA
GAACGTCATCCCTACAAAGATGAACAATCTTGTGCACACAATAGCCGACTAAGTTGTGAA
ACAAGGATACAATACTTTTACTTTTATTAGAGTATTCCAATGTATTTGCTTACACTTGCA
AATTGTACAGCCATGGATAGGAGTGTATTAGGTCAATCGTGTTGCTATATTATTTGTCTG
TGGCATGGAGCCAGAGAACATTAACTAAAGCACGTACAAATATTAGTCAAGTACTTAACT
TGTACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2D539JQ C 1
AF RR2D539TF U 1
BS 1 666 RR2D539TF

RD RR2D539JQ 666 0 0
GGGATGATCCAGTGGTCAGGATATATCATATGGCTACTGCATTATCTAAGACGTTTAAGT
CTCCTGTAGTTGACAATATTCAGCCTCTTCCTCAACACCAACAAATCATAATATGTTCTG
CTGCAAAGGCTTTTCGAGGGGCCAAAAAGGGTGCAACCGTTAGAGAGGTTAATAAATTAT
ACCTGGAAATCTGTAAATCTTGGGTGATTTCTCCTGCCGGAATTACAGAGTTCACTAACA
TGTGTACAGTGCTAAATGATCAGGGGATTTTAAAATTCGGCCAAGCTCGTAGAGATAATG
TAAAGAGAGTAAGCCTGAGAGTAGACGAATCAGACATTACATTTGCTCTTCAGTAAACAC
TTCCCTTAAATATAAAATCAACAGGGAATACGAACTTTTAGGAACTGTCTTCTGTGAGAA
GAACGTCATCCCTACAAAGATGAACAATCTTGTGCACACAATAGCCGACTAAGTTGTGAA
ACAAGGATACAATACTTTTACTTTTATTAGAGTATTCCAATGTATTTGCTTACACTTGCA
AATTGTACAGCCATGGATAGGAGTGTATTAGGTCAATCGTGTTGCTATATTATTTGTCTG
TGGCATGGAGCCAGAGAACATTAACTAAAGCAGGTACAAATATTAGTCAAGTACTTAACT
TGTACC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2D539TF 666 0 0
GGGATGATCCAGTGGTCAGGATATATCATATGGCTACTGCATTATCTAAGACGTTTAAGT
CTCCTGTAGTTGACAATATTCAGCCTCTTCCTCAACACCAACAAATCATAATATGTTCTG
CTGCAAAGGCTTTTCGAGGGGCCAAAAAGGGTGCAACCGTTAGAGAGGTTAATAAATTAT
ACCTGGAAATCTGTAAATCTTGGGTGATTTCTCCTGCCGGAATTACAGAGTTCACTAACA
TGTGTACAGTGCTAAATGATCAGGGGATTTTAAAATTCGGCCAAGCTCGTAGAGATAATG
TAAAGAGAGTAAGCCTGAGAGTAGACGAATCAGACATTACATTTGCTCTTCAGTAAACAC
TTCCCTTAAATATAAAATCAACAGGGAATACGAACTTTTAGGAACTGTCTTCTGTGAGAA
GAACGTCATCCCTACAAAGATGAACAATCTTGTGCACACAATAGCCGACTAAGTTGTGAA
ACAAGGATACAATACTTTTACTTTTATTAGAGTATTCCAATGTATTTGCTTACACTTGCA
AATTGTACAGCCATGGATAGGAGTGTATTAGGTCAATCGTGTTGCTATATTATTTGTCTG
TGGCATGGAGCCAGAGAACATTAACTAAAGCACGTACAAATATTAGTCAAGTACTTAACT
TGTACC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL7002Contig1 855 2 2 U
GAGAGTAGACCATGTTGGTTTCGGTCTCGTCAATGGAGAAGATGGCAAGCGATTAAGAAC
GCGGTCTTCGGAGGTACGCCGCCTAGTCGATTTGCTAGATGAGGCCAAGACTCGCAGCAA
AACCGCCCTTATTGAGCGAGGTAAGGACAAAGAATTGACTCCCGAAGAGCTGGACCAAAC
AGCTGAGGCAGTAGGGTGCGGTGTTGTGAAGTATGCTGACCTGAAGAACAACAGATGGAC
AAGTTATACTCTCAACTTCGATCAAATGCTTAGTGACAAGGGAAACACAGCCGTTTACCT
TCTTTACGCTCATGCTCGGATCTGTTCAATCATCAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGA
GCTGAAAAAGACAGGGAAGCTAGCATTGGATCATCCTGAAGAACGAGCACTGGGGCTTCA
CTTGCTTCGATTTGCTGAGACGGTTGAGGCAGCTTGCGCCAACTTGTTGCCACACGTGCT
GTGCGAGTACCTCTACGAGTTATCTGAACGTTACACCACATTCTATTCGGTTCATCAGGT
CGTTGGTTCAGCAGAAGAGGCAAGCCGTCTCCTACTATGTGAAGCAACGGCTATAGTGAT
GCGGAAATGCTTCTACCTTCTTGGAATCACTCCTGTTTACAAGATTTAAATTCGCTTCTG
TTGTAAACCGAATGGCGGATAGCTATAACCGGACCAACCAAAGAGATAATGATTATCGAC
TAATGTATTTATCCATTTAGGATAAAGATTACTTTTTATGTTTATCATTATCTATTTAGG
ATTTATGTATTTGTATGTATTTTTATTTATCTGTAACTCTATATATATATGGAATTTGGT
TGATGACAATAATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F768TF U 1
AF RR2F768JQ C 150
BS 1 685 RR2F768TF
BS 686 855 RR2F768JQ

RD RR2F768TF 685 0 0
GAGAGTAGACCATGTTGGTTTCGGTCTCGTCAATGGAGAAGATGGCAAGCGATTAAGAAC
GCGGTCTTCGGAGGTACGCCGCCTAGTCGATTTGCTAGATGAGGCCAAGACTCGCAGCAA
AACCGCCCTTATTGAGCGAGGTAAGGACAAAGAATTGACTCCCGAAGAGCTGGACCAAAC
AGCTGAGGCAGTAGGGTGCGGTGTTGTGAAGTATGCTGACCTGAAGAACAACAGATGGAC
AAGTTATACTCTCAACTTCGATCAAATGCTTAGTGACAAGGGAAACACAGCCGTTTACCT
TCTTTACGCTCATGCTCGGATCTGTTCAATCATCAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGA
GCTGAAAAAGACAGGGAAGCTAGCATTGGATCATCCTGAAGAACGAGCACTGGGGCTTCA
CTTGCTTCGATTTGCTGAGACGGTTGAGGCAGCTTGCGCCAACTTGTTGCCACACGTGCT
GTGCGAGTACCTCTACGAGTTATCTGAACGTTACACCACATTCTATTCGGTTCATCAGGT
CGTTGGTTCAGCAGAAGAGGCAAGCCGTCTCCTACTATGTGAAGCAACGGCTATAGTGAT
GCGGAAATGCTTCTACCTTCTTGGAATCACTCCTGTTTACAAGATTTAAATTCGCTTCTG
TTGTAAACCGAATGGCGGATAGCTA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2F768JQ 706 0 0
AAGAATTGACTCCCGAAGAGCTGGACCAAACAGCTGAGGCAGTAGGGTGCGGTGTTGTGA
AGTATGCTGACCTGAAGAACAACAGATGGACAAGTTATACTCTCAACTTCGATCAAATGC
TTAGTGACAAGGGAAACACAGCCGTTTACCTTCTTTACGCTCATGCTCGGATCTGTTCAA
TCATCAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGAGCTGAAAAAGACAGGGAAGCTAGCATTGG
ATCATCCTGAAGAACGAGCACTGGGGCTTCACTTGCTTCGATTTGCTGAGACGGTTGAGG
CAGCTTGCGCCAACTTGTTGCCACACGTGCTGTGCGAGTACCTTTACGAGTTATCTGAAC
GTTACACCACATTCTATTCGGTTCATCAGGTCGTTGGTTCAGCAGAAGAGGCAAGCCGTC
TCCTACTATGTGAAGCAACGGCTATAGTGATGCGGAAATGCTTCTACCTTCTTGGAATCA
CTCCTGTTTACAAGATTTAAATTCGCTTCTGTTGTAAACCGAATGGCGGATAGCTATAAC
CGGACCAACCAAAGAGATAATGATTATCGACTAATGTATTTATCCATTTAGGATAAAGAT
TACTTTTTATGTTTATCATTATCTATTTAGGATTTATGTATTTGTATGTATTTTTATTTA
TCTGTAACTCTATATATATATGGAATTTGGTTGATGACAATAATAC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL7003Contig1 1197 2 2 U
GGAGAAAACCCTAATTACTCAGATGGCGCTAGAGAATCAATCGGCGGCGGTGAGATTTAC
CGGGAAGGTGAATTGGTTCAGCGATTCCAAGGGATACGGTTTCATCACCCCCGACGATGA
GAGCGAGGAGCTTTTCGTCCACCAGTCCTCCATCGTCTCCGAAGGCTACAGGAGCCTCGC
CGTCGACGATCTGGTCGAGTTCGAGATCGCTCAGGGGACCGACGGCAAGACCAAAGCTGT
CGAGGTCACCGCTCCGGGCGGCGCTCCTCTCAAAAAGAAGGAGACCAGCTCTCGCGGGAG
AACCGGTGGTCGCGGCGGCGGTTGTTACAACTGCGGCAAGGCTGGTCATGTCGCCAAGGA
TTGCAGCGGCGAGCGAGGGGAGTGTTACACTTGTGGTGATACTGGTCACTTGGCTAGGGA
TTGCCTTCAGAAACCGAGCGGAGGAGGTGAACGTGTTGGAGGAGGAGGACGTGGAGATGG
GTGCTACACTTGCGGTGACACTGGTCACATGGCTAGGGATTGTGTTAAGAAGTCTGGTGG
TGAGCGTGTAAGCAGCGGCGCGGTTGGAACTTGCTATACGTGTGGAGGAACTGGTCACAT
GGCTAGAGATTGTCCGAGCAAGAGACAGACTGGTGGTGGTTGTTACGAGTGTGGTGGTGC
TGGTCACATGGCTCGTGATTGTGAGAGGAGAGGAAGTGGTGGAGGAGGAGGAGGAGGTAG
AAGCTCTGGTGGTTGTTACGAGTGCGGTGTTGCTGGTCACATGGCTCGTGATTGTGACAG
GAGAGGAAGCGGTGGTGGCGGTAGGAAGGCTGGTGGAGGTGGTGGCGAGTGCTACAAGTG
CGGTGAAAGTGGTCACTTTGCAAGGGAGTGTTCTGTTGCTTGATTACTTCCTATTCAACG
AACAATAAGATGATTATGAATTTGAGTATATTTACTCTTCGTTTTCGTTTTATATCTTTT
GCTGATGGGAATGATGAATTCGCCTGGTCCTTTTTTTGTGTTTTCTTTTTGAGTTTTTAA
GTACTACCATTATTATACAATCCTAGCTAGATTTGGTTTCAGATATGGATGTTGTCCTTT
TTGATCTTTATTTGCTTATGTCACTTTTGAGTTTCGTGTTTTGTCCTTTCTGTTTCAGTT
TATTGCTTTCTTTGTACGGGATGAACTGAAAGTGAAACCCAAGTTTGGTTGGTCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU71TF U 1
AF RR2GU71JQB C 549
BS 1 615 RR2GU71TF
BS 616 1197 RR2GU71JQB

RD RR2GU71TF 615 0 0
GGAGAAAACCCTAATTACTCAGATGGCGCTAGAGAATCAATCGGCGGCGGTGAGATTTAC
CGGGAAGGTGAATTGGTTCAGCGATTCCAAGGGATACGGTTTCATCACCCCCGACGATGA
GAGCGAGGAGCTTTTCGTCCACCAGTCCTCCATCGTCTCCGAAGGCTACAGGAGCCTCGC
CGTCGACGATCTGGTCGAGTTCGAGATCGCTCAGGGGACCGACGGCAAGACCAAAGCTGT
CGAGGTCACCGCTCCGGGCGGCGCTCCTCTCAAAAAGAAGGAGACCAGCTCTCGCGGGAG
AACCGGTGGTCGCGGCGGCGGTTGTTACAACTGCGGCAAGGCTGGTCATGTCGCCAAGGA
TTGCAGCGGCGAGCGAGGGGAGTGTTACACTTGTGGTGATACTGGTCACTTGGCTAGGGA
TTGCCTTCAGAAACCGAGCGGAGGAGGTGAACGTGTTGGAGGAGGAGGACGTGGAGATGG
GTGCTACACTTGCGGTGACACTGGTCACATGGCTAGGGATTGTGTTAAGAAGTCTGGTGG
TGAGCGTGTAAGCAGCGGCGCGGTTGGAACTTGCTATACGTGTGGAGGAACTGGTCACAT
GGCTAGAGATTGTCC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2GU71JQB 649 0 0
TAAGCAGCGGCGCGGTTGGAACTTGCTATACGTGTGGAGGAACTGGTCACATGGCTAGAG
ATTGTCCGAGCAAGAGACAGACTGGTGGTGGTTGTTACGAGTGTGGTGGTGCTGGTCACA
TGGCTCGTGATTGTGAGAGGAGAGGAAGTGGTGGAGGAGGAGGAGGAGGTAGAAGCTCTG
GTGGTTGTTACGAGTGCGGTGTTGCTGGTCACATGGCTCGTGATTGTGACAGGAGAGGAA
GCGGTGGTGGCGGTAGGAAGGCTGGTGGAGGTGGTGGCGAGTGCTACAAGTGCGGTGAAA
GTGGTCACTTTGCAAGGGAGTGTTCTGTTGCTTGATTACTTCCTATTCAACGAACAATAA
GATGATTATGAATTTGAGTATATTTACTCTTCGTTTTCGTTTTATATCTTTTGCTGATGG
GAATGATGAATTCGCCTGGTCCTTTTTTTGTGTTTTCTTTTTGAGTTTTTAAGTACTACC
ATTATTATACAATCCTAGCTAGATTTGGTTTCAGATATGGATGTTGTCCTTTTTGATCTT
TATTTGCTTATGTCACTTTTGAGTTTCGTGTTTTGTCCTTTCTGTTTCAGTTTATTGCTT
TCTTTGTACGGGATGAACTGAAAGTGAAACCCAAGTTTGGTTGGTCGCC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL7004Contig1 508 2 1 U
GCACGCACAAATCGAGAAATGGTCCAATTAAAAACTCTCGAGGAACCCTAGAGAATTCAC
AGTCACCTCCGAAAGAAATGATGAAGCGTCTGGTGCCAACGTTCAACCGCATCCTGGTGA
AGAGAGTGATCCAGCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTTCCAGAGAAAGCCTCCT
CTCTGAACTCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGGTTCAAGGGATAAGGACGGGAATT
TGATTCCGGTCCCTGTCAAGGAAGGCGACACCGTTCTTCTTCCAGAGTACGGTGGTACTC
AGGTCAAACTCGGCGATAACGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGAACCT
TGCACGAGGATTGACAAAGGCTAAACTCAACTACGAGCGTTCCTTTGTCTTGTGGGTGAA
AAAGAGTCATTTTTCTTTTTTATCTTTTTTATATGAGGTTGGACTTTGTTGATTATCACT
GGAATTTAAACATCTTCTGATTCCAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AQ56JQ C 1
AF RR2AQ56TF U 1
BS 1 508 RR2AQ56TF

RD RR2AQ56JQ 508 0 0
GCACGCACAAATCGAGAAATGGTCCAATTAAAAACTCTCGAGGAACCCTAGAGAATTCAC
AGTCACCTCCGAAAGAAATGATGAAGCGTCTGGTGCCAACGTTCAACCGCATCCTGGTGA
AGAGAGTGATCCAGCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTTCCAGAGAAAGCCTCCT
CTCTGAACTCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGGTTCAAGGGATAAGGACGGGAATT
TGATTCCGGTCCCTGTCAAGGAAGGCGACACCGTTCTTCTTCCAGAGTACGGTGGTACTC
AGGTCAAACTCGGCGATAACGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGAACCT
TGCACGAGGATTGACAAAGGCTAAACTCAACTACGAGCGTTCCTTTGTCTTGTGGGTGAA
AAAGAGTCATTTTTCTTTTTTATCTTTTTTATATGAGGTTGGACTTTGTTGATTATCACT
GGAATTTAAACATCTTCTGATTCCAACC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RR2AQ56TF 508 0 0
GCACGCACAAATCGAGAAATGGTCCAATTAAAAACTCTCGAGGAACCCTAGAGAATTCAC
AGTCACCTCCGAAAGAAATGATGAAGCGTCTGGTGCCAACGTTCAACCGCATCCTGGTGA
AGAGAGTGATCCAGCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTTCCAGAGAAAGCCTCCT
CTCTGAACTCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGGTTCAAGGGATAAGGACGGGAATT
TGATTCCGGTCCCTGTCAAGGAAGGCGACACCGTTCTTCTTCCAGAGTACGGTGGTACTC
AGGTCAAACTCGGCGATAACGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGAACCT
TGCACGAGGATTGACAAAGGCTAAACTCAACTACGAGCGTTCCTTTGTCTTGTGGGTGAA
AAAGAGTCATTTTTCTTTTTTATCTTTTTTATATGAGGTTGGACTTTGTTGATTATCACT
GGAATTTAAACATCTTCTGATTCCAACC

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 2

CO CL7005Contig1 813 2 2 U
GGGTGTAGTAAAAGGTCTCATCAATAACCTCCTGAGATGAAGCGTGAAGGCAAGCAACAC
GGTATGGTTAGAACCTACAGGATCCTGCCTCCGTCGCTGAATCCAAGACCGCAAGCCAAG
TTGGTCAACCCTTTGACCTGTCGTCCAACCGCCGGGCTATTCACCAAAGTGTCACCTAAG
CCGACCAATCACTCCAAGTTCACCGGAAAATGTGGCCAGGCAAGGTGCCTTGAGTGCCAT
ATGTATCCCATCACCAAGTCCAAAGTCAAAAGTAAAGGCTCTTCTAAGGTGAGATCAAAT
GATATCACTTACAAGATGCTGACTTGGCAGGTTGCTTCTGGTGGGTCAAGACCCGGTTTG
AAGCTTTCCGGGTTCTCGGCTACTGGACTTCTTGATCTTATGTCTGATGATTATGATTAT
GATCATGATTATGAATCTGATGAAGAAGAAGAAGAGGGAGAAGAATACACAGGATGTGTT
GTAGAGGAAATAGTGAATATACAGAGTGATGGTGATGGTGAAAAGGAAGAAGATGGGTCT
CTTGATGATGATGTTGATGATGATGATGATGATGATGGAAGGATGAGTTTTTGTGATGTG
GGGTGATGATGATGGTTGATCAAGTGGAAGTATTTGATGAAGGATGGTGTTTGGTTGAAG
AAATGATGACTTAACTGATCTCTTTGATTTATTCCCCCAAATCATTGTATTTCCTTTTGC
TTTTGTAAATTGTTTTAATAAATTTGGGGATGAATGATTATTATCTATGTAAATGTGATT
TATTATTTAAATCAAAAACTATGATTTGTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE85TF U 1
AF RR2EE85JQ C 101
BS 1 632 RR2EE85TF
BS 633 813 RR2EE85JQ

RD RR2EE85TF 632 0 0
GGGTGTAGTAAAAGGTCTCATCAATAACCTCCTGAGATGAAGCGTGAAGGCAAGCAACAC
GGTATGGTTAGAACCTACAGGATCCTGCCTCCGTCGCTGAATCCAAGACCGCAAGCCAAG
TTGGTCAACCCTTTGACCTGTCGTCCAACCGCCGGGCTATTCACCAAAGTGTCACCTAAG
CCGACCAATCACTCCAAGTTCACCGGAAAATGTGGCCAGGCAAGGTGCCTTGAGTGCCAT
ATGTATCCCATCACCAAGTCCAAAGTCAAAAGTAAAGGCTCTTCTAAGGTGAGATCAAAT
GATATCACTTACAAGATGCTGACTTGGCAGGTTGCTTCTGGTGGGTCAAGACCCGGTTTG
AAGCTTTCCGGGTTCTCGGCTACTGGACTTCTTGATCTTATGTCTGATGATTATGATTAT
GATCATGATTATGAATCTGATGAAGAAGAAGAAGAGGGAGAAGAATACACAGGATGTGTT
GTAGAGGAAATAGTGAATATACAGAGTGATGGTGATGGTGAAAAGGAAGAAGATGGGTCT
CTTGATGATGATGTTGATGATGATGATGATGATGATGGAAGGATGAGTTTTTGTGATGTG
GGGTGATGATGATGGTTGATCAAGTGGAAGTA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RR2EE85JQ 713 0 0
ATCCAAGACCGCAAGCCAAGTTGGTCAACCCTTTGACCTGTCGTCCAACCGCCGGGCTAT
TCACCAAAGTGTCACCTAAGCCGACCAATCACTCCAAGTTCACCGGAAAATGTGGCCAGG
CAAGGTGCCTTGAGTGCCATATGTATCCCATCACCAAGTCCAAAGTCAAAAGTAAAGGCT
CTTCTAAGGTGAGATCAAATGATATCACTTACAAGATGCTGACTTGGCAGGTTGCTTCTG
GTGGGTCAAGACCCGGTTTGAAGCTTTCCGGGTTCTCGGCTACTGGACTTCTTGATCTTA
TGTCTGATGATTATGATTATGATCATGATTATGAATCTGATGAAGAAGAAGAAGAGGGAG
AAGAATACACAGGATGTGTTGTAGAGGAAATAGTGAATATACAGAGTGATGGTGATGGTG
AAAAGGAAGAAGATGGGTCTCTTGATGATGATGTTGATGATGATGATGATGATGATGGAA
GGATGAGTTTTTGTGATGTGGGGTGATGATGATGGTTGATCAAGTGGAAGTATTTGATGA
AGGATGGTGTTTGGTTGAAGAAATGATGACTTAACTGATCTCTTTGATTTATTCCCCCAA
ATCATTGTATTTCCTTTTGCTTTTGTAAATTGTTTTAATAAATTTGGGGATGAATGATTA
TTATCTATGTAAATGTGATTTATTATTTAAATCAAAAACTATGATTTGTAATT

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL7006Contig1 540 2 1 U
GGAACTCAGGATTTGGCCGAAGACAGACAGCAATGGCGAAGAAGAAAGAGCTCTTATCCA
AAGCCCCCTGGAGAGGCGACGACGATGACTCGGACAAGTTCAGCGGCGCAAAGCTCAAGG
TCACCAAGGAATCTGACGGTATGTCGAAGATGCACGTCCCTAGCCGTGGAACCAATAAAG
GTAGTCTCGCCGCCGATGACGATGATTCCCTCGAAATCGATCCTCAGCTTCGATACAGCT
TCAATCGAAACTATCAGTTCCTGCAAAGAGTGTTCACTGTAGACACTTTGGTGAAGCCTC
TTCCTCCTACCATGGCTTACAATGTCTCTCGCAACTTGAGCTTCTTCACCCGCATTTTCA
CTCAGTTTTTGATCCTGAAGGCATTGCAAATGCACAGAAGTCTCTTGGGTTGGGACAGGA
AGACAAAGCGCGTCGTGTGAGTTGAGATTTGAATGGACGCATCATTCTTGTTATGTTATC
TAAAACAAAGATAATTTGTATGCTTTTCTTTCAAAGTACGATGAAGATTCCAAGTTAAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FW34JQ C 1
AF RR2FW34TF U 1
BS 1 540 RR2FW34TF

RD RR2FW34JQ 540 0 0
GGAACTCAGGATTTGGCCGAAGACAGACAGCAATGGCGAAGAAGAAAGAGCTCTTATCCA
AAGCCCCCTGGAGAGGCGACGACGATGATTCGGACAAGTTCAGCGGCGCAAAGCTCAAGG
TCACCAAGGAATCTGACGGTATGTCGAAGATGCACGTCCCTAGCCGTGGAACCAATAAAG
GTAGTCTCGCCGCCGATGACGATGATTCCCTCGAAATCGATCCTCAGCTTCGATACAGCT
TCAATCGAAACTATCAGTTCCTGCAAAGAGTGTTCACTGTAGACACTTTGGTGAAGCCTC
TTCCTCCTACCATGGCTTACAATGTCTCTCGCAACTTGAGCTTCTTCACCCGCATTTTCA
CTCAGTTTTTGATCCTGAAGGCATTGCAAATGCACAGAAGTCTCTTGGGTTGGGACAGGA
AGACAAAGCGCGTCGTGTGAGTTGAGATTTGAATGGACGCATCATTCTTGTTATGTTATC
TAAAACAAAGATAATTTGTATGCTTTTCTTTCAAAGTACGATGAAGATTCCAAGTTAAGC

QA 1 540 1 540
DS 

RD RR2FW34TF 540 0 0
GGAACTCAGGATTTGGCCGAAGACAGACAGCAATGGCGAAGAAGAAAGAGCTCTTATCCA
AAGCCCCCTGGAGAGGCGACGACGATGACTCGGACAAGTTCAGCGGCGCAAAGCTCAAGG
TCACCAAGGAATCTGACGGTATGTCGAAGATGCACGTCCCTAGCCGTGGAACCAATAAAG
GTAGTCTCGCCGCCGATGACGATGATTCCCTCGAAATCGATCCTCAGCTTCGATACAGCT
TCAATCGAAACTATCAGTTCCTGCAAAGAGTGTTCACTGTAGACACTTTGGTGAAGCCTC
TTCCTCCTACCATGGCTTACAATGTCTCTCGCAACTTGAGCTTCTTCACCCGCATTTTCA
CTCAGTTTTTGATCCTGAAGGCATTGCAAATGCACAGAAGTCTCTTGGGTTGGGACAGGA
AGACAAAGCGCGTCGTGTGAGTTGAGATTTGAATGGACGCATCATTCTTGTTATGTTATC
TAAAACAAAGATAATTTGTATGCTTTTCTTTCAAAGTACGATGAAGATTCCAAGTTAAGC

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 2

CO CL7007Contig1 625 2 3 U
GAATAATCTTTTTTTTTCTAGCTTTCAATTCTGTGCTCTGATGATTAGTATCAAAGGCCA
TTACAAACATAAACGTCCGCACAAAAAGAAAAAAAATGCCAACACAAACTTTGCTCAAAG
TGTAGCTAGTCTCTTATCTTGTAAAGTCATGAACATGGGTCTTCTATCTTGAGCTTTTGG
ATTGTCTGCTTCTTCTTTGTTGCAACTATGAATTGACTTTTTTTTTCTTACATGTTGCAA
CTCAACCAGATGGAGATCCACCAAATTCGCATGACCATCCAATGCCACAGGGATGATGGA
AAAGCTGTCTGTAATATTAATGGTGTTTGGTTGGTCTGTCATCAACCCAAGGACTCGGGA
TGTAGAAATAAAAATTTGTGCTCATCTGTGACCATTTTTGACCCCATTGTAAATCTCCCT
GAGCACATGTGTTTGACCTCATTTGTTAATTTGCATTGATCTTCGATCTGGAATTGTCAT
CAGTTTTGTTGATTGTGCTTACTGAATTGAAATCATCTAAAACTTGCGAACATGACCAGT
TTGCTGCGGTTATATCTGGAGAATGGAGAAGCCGGCTTAGAGAATTGAGGGGATTGATTG
GGAGAGCGAAGGGAGGATGTATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FH87JQ U 35
AF RR2FH87TF C 1
BS 1 34 RR2FH87TF
BS 35 578 RR2FH87JQ
BS 579 625 RR2FH87TF

RD RR2FH87JQ 544 0 0
GCTCTGATGATTAGTATCAAAGGCCATTACAAACATAAACGTCCGCACAAAAAGAAAAAA
AATGCCAACACAAACTTTGCTCAAAGTGTAGCTAGTCTCTTATCTTGTAAAGTCATGAAC
ATGGGTCTTCTATCTTGAGCTTTTGGATTGTCTGCTTCTTCTTTGTTGCAACTATGAATT
GACTTTTTTTTTCTTACATGTTGCAACTCAACCAGATGGAGATCCACCAAATTCGCATGA
CCATCCAATGCCACAGGGATGATGGAAAAGCTGTCTGTAATATTAATGGTGTTTGGTTGG
TCTGTCATCAACCCAAGGACTCGGGATGTAGAAATAAAAATTTGTGCTCATCTGTGACCA
TTTTTGACCCCATTGTAAATCTCCCTGAGCACATGTGTTTGACCTCATTTGTTAATTTGC
ATTGATCTTCGATCTGGAATTGTCATCAGTTTTGTTGATTGTGCTTACTGAATTGAAATC
ATCTAAAACTTGCGAACATGACCAGTTTGCTGCGGTTATATCTGGAGAATGGAGAAGCCG
GCTT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2FH87TF 625 0 0
GAATAATCTTTTTTTTTCTAGCTTTCAATTCTGTGCTCTGATGATTAGTATCAAAGGCCA
TTACAAACATAAACGTCCGCACAAAAAGAAAAAAAATGCCAACACAAACTTTGCTCAGAG
TGTAGCTAGTCTCTTATCTTGTAAAGTCATGAACATGGGTCTTCTATCTTGAGCTTTTGG
ATTGTCTGCTTCTTCTTTGTTGCAACTATGAATTGACTTTTTTTTTCTTACATGTTGCAA
CTCAACCAGATGGAGATCCACCAGATTCGCATGACCATCCAATGCCACAGGGATGATGGA
AAAGCTGTCTGTAATATTAATGGTGTTTGGTTGGTCTGTCATCAACCCAAGGACTCGGGA
TGTAGAAATAAAAATTTGTGCTCATCTGTGACCATTTTTGACCCCATTGTAAATCTCCCT
GAGCACATGTGTTTGACCTCATTTGTTAATTTGCATTGATCTTCGATCTGGAATTGTCAT
CAGTTTTGTTGATTGTGCTTACTGAATTGAAATCATCTAAAACTTGCGAACATGACCAGT
TTGCTGCGGTTATATCTGGAGAATGGAGAAGCCGGCTTAGAGAATTGAGGGGATTGATTG
GGAGAGCGAAGGGAGGATGTATGTC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL7008Contig1 902 2 2 U
GGGAGGAACACAAAATCAGGAGAAGAAAACGTGAAGAATCTAAAGTCTAACAAAAATGAT
AATGATTTTTCTCTTATGCTTAATACTCTTCGTTACCATTCTCTTCTTCAGAAAAAGCAG
CACAATTCCATCACCACTGAGACTCCCGTTGATCGGGAACCTTCATCAACTCGGCCACCA
TCCTCATCGATCACTATGCTCCCTCAGCCACCGCTACGGACCTCTCATGCTCGTTCACTT
TGGCGTTGTCCCTGTTCTTGTAATCTCTTCAGCGGAAGTTGCTCGAGACGTTTTGAAGAC
GCATGACCGCGTCTTTGCAAGTCGTCCACGGTCGAAAGTCTACGAAAAGGTTCTTTATGG
GGACCTTCATATTGGTTCGGCTCCATATGGAGATTATTGGAGAAAAACAAGGAGTGTGTT
TGTCACGCATCTACTCAGCAACAAACTGGTACAGTCCTTTCGAGACGTGAGACAAGAAGA
GGTCAGTCTACTCATGGAAAAGATCCGTAAATCGGATTCTTCTTTGCCGGTGAATCTAAG
CGAACTCTTCTCAAGATTAACTAATGATGTGGTGAGTAGAGTTGCTTTGGGAAGGAAATT
CAGTGGTGCTGGAACAGATTTTAAAGAGTTAACAGAAAGGCTCCTAAGGCTAGCGGGTGC
GTTTACTGTCGGGACTTTCGTACCATGGCTTGCGTGGGTTGATTGGATCCGGGGTTTGGA
TGGTCAACGGGAAAAGACTAAAAATGAATTTGATGAGCTCTTCGAGAAAATTATTCAGGA
TCATGAAGATGGAGACGGTCACGGGACTGATTTCGTCGATGTATTACTCGCCGTTCAGAG
AGACAAGAGCATCGGGGTTGAAATCGAACGTATAAATATAAAGGCAATAATCATGGTAAA
GG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2ED12TF U 1
AF RR2ED12JQ C 166
BS 1 635 RR2ED12TF
BS 636 902 RR2ED12JQ

RD RR2ED12TF 635 0 0
GGGAGGAACACAAAATCAGGAGAAGAAAACGTGAAGAATCTAAAGTCTAACAAAAATGAT
AATGATTTTTCTCTTATGCTTAATACTCTTCGTTACCATTCTCTTCTTCAGAAAAAGCAG
CACAATTCCATCACCACTGAGACTCCCGTTGATCGGGAACCTTCATCAACTCGGCCACCA
TCCTCATCGATCACTATGCTCCCTCAGCCACCGCTACGGACCTCTCATGCTCGTTCACTT
TGGCGTTGTCCCTGTTCTTGTAATCTCTTCAGCGGAAGTTGCTCGAGACGTTTTGAAGAC
GCATGACCGCGTCTTTGCAAGTCGTCCACGGTCGAAAGTCTACGAAAAGGTTCTTTATGG
GGACCTTCATATTGGTTCGGCTCCATATGGAGATTATTGGAGAAAAACAAGGAGTGTGTT
TGTCACGCATCTACTCAGCAACAAACTGGTACAGTCCTTTCGAGACGTGAGACAAGAAGA
GGTCAGTCTACTCATGGAAAAGATCCGTAAATCGGATTCTTCTTTGCCGGTGAATCTAAG
CGAACTCTTCTCAAGATTAACTAATGATGTGGTGAGTAGAGTTGCTTTGGGAAGGAAATT
CAGTGGTGCTGGAACAGATTTTAAAGAGTTAACAG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2ED12JQ 737 0 0
TCAACTCGGCCACCATCCTCATCGATCACTATGCTCCCTCAGCCACCGCTACGGACCTCT
CATGCTCGTTCACTTTGGCGTTGTCCCTGTTCTTGTAATCTCTTCAGCGGAAGTTGCTCG
AGACGTTTTGAAGACGCATGACCGCGTCTTTGCAAGTCGTCCACGGTCGAAAGTCTACGA
AAAGGTTCTTTATGGGGACCTTCATATTGGTTCGGCTCCATATGGAGATTATTGGAGAAA
AACAAGGAGTGTGTTTGTCACGCATCTACTCAGCAACAAACTGGTACAGTCCTTTCGAGA
CGTGAGACAAGAAGAGGTCAGTCTACTCATGGAAAAGATCCGTAAATCGGATTCTTCTTT
GCCGGTGAATCTAAGCGAACTCTTCTCAAGATTAACTAATGATGTGGTGAGTAGAGTTGC
TTTGGGAAGGAAATTCAGTGGTGCTGGAACAGATTTTAAAGAGTTAACAGAAAGGCTCCT
AAGGCTAGCGGGTGCGTTTACTGTCGGGACTTTCGTACCATGGCTTGCGTGGGTTGATTG
GATCCGGGGTTTGGATGGTCAACGGGAAAAGACTAAAAATGAATTTGATGAGCTCTTCGA
GAAAATTATTCAGGATCATGAAGATGGAGACGGTCACGGGACTGATTTCGTCGATGTATT
ACTCGCCGTTCAGAGAGACAAGAGCATCGGGGTTGAAATCGAACGTATAAATATAAAGGC
AATAATCATGGTAAAGG

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL7009Contig1 1153 2 4 U
GGGAGGAAAATCATTAACCATAAAAAATACAGAAACAATGTCTGAGTTTCTCCCGGAAGT
GTTAGTCGTTGAGATACTCGCAAGACTATCCATGAAGGATCTGGCTCGATACAGATGCGT
ATGCAAGACATGGAGATCTCTCATCAACCACCGTGGCTTTGCAGAAAGGTACCGAGACAT
TTCTCCGGTCCGGTTTGTGTCATTTTACGACAAGGGTTTCTACTTGCTTGACGTGGAGGG
GGAGAATTTAGTTATCCAAAATCCACATAAGCTTGAGTTTCCTTTGGATGAGTCCATGAT
CGATGAATCCACATGTGTACTTCATTGTCATGGGACGTTATGTGTGACCTTACAGAATCA
CACATTAATCGTTTGGAATCCATATTCCAACCAATTCAAGACCGTACCAAATCCCGGTAT
ATACCGTGATTCAAACATTCTTGGTTTCGGTTATGATCCGGTTTCCAACGATTACAAACT
CGTAACATTTATCGACCAGCTTGGTTCTTCCACGGCGCATGTTTTCGAATTCAGAACCGG
TTCTTGGAGAGGGAGTGTAACGATTCCTAATCCGGATTGGCATTACAGGGAGAGAGTAGG
TACCTTCTTGGATCAATACCTCTATTGGATTGCATACCGGTCTAATATCAACACGTTCAT
CCTATGCTTTAATCTCCCAACCTATGAATACCGGAAATTAGATCTCCCGGTTTACAACCA
AGGTGTCACCTGTTCTTGGTTAGGCGTTACAAAAGAAAAGCTTTGCGTTATAGATTATGT
AACGTGCGAGAAGGAGATTCGGGTTTCGGTTATGGAGAAAACCGGATCATGGAACAAAAT
CATAAGCCTTTCAGTGTTGGACTTTATCTACGTGCAAGATCGTAAATGCGATTATCCAGT
CGAGTTCGTGTCGTTTACGAGAAAGAACGACTTATTCATAACGTTCACTGGGTACTACGA
TGATTTCGAGACGGAAGCTGAAGATCGTGAGAAGAAGAAGATGTTCTTATACAAAACCGG
TGATAATACAATCGAACAAGTCCGGTTATGTAACTCTTTACCCGGGTTTCGGTTTCTTGG
TGAATATGTGTAGACTCTTGTGATCGTTGATCGTATCTTTACTTGAACTAAGAAAACAAC
AATAGCTTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D929TF U 1
AF RR2D929JQ C 581
BS 1 722 RR2D929TF
BS 723 723 RR2D929JQ
BS 724 747 RR2D929TF
BS 748 1153 RR2D929JQ

RD RR2D929TF 756 0 0
GGGAGGAAAATCATTAACCATAAAAAATACAGAAACAATGTCTGAGTTTCTCCCGGAAGT
GTTAGTCGTTGAGATACTCGCAAGACTATCCATGAAGGATCTGGCTCGATACAGATGCGT
ATGCAAGACATGGAGATCTCTCATCAACCACCGTGGCTTTGCAGAAAGGTACCGAGACAT
TTCTCCGGTCCGGTTTGTGTCATTTTACGACAAGGGTTTCTACTTGCTTGACGTGGAGGG
GGAGAATTTAGTTATCCAAAATCCACATAAGCTTGAGTTTCCTTTGGATGAGTCCATGAT
CGATGAATCCACATGTGTACTTCATTGTCATGGGACGTTATGTGTGACCTTACAGAATCA
CACATTAATCGTTTGGAATCCATATTCCAACCAATTCAAGACCGTACCAAATCCCGGTAT
ATACCGTGATTCAAACATTCTTGGTTTCGGTTATGATCCGGTTTCCAACGATTACAAACT
CGTAACATTTATCGACCAGCTTGGTTCTTCCACGGCGCATGTTTTCGAATTCAGAACCGG
TTCTTGGAGAGGGAGTGTAACGATTCCTAATCCGGATTGGCATTACAGGGAGAGAGTAGG
TACCTTCTTGGATCAATACCTCTATTGGATTGCATACCGGTCTAATATCAACACGTTCAT
CCTATGCTTTAATCTCCCAACCTATGAATACCGGAAATTAGATCTCCCGGTTTACAACCA
AG*TGTCACCTGTTCTTGGTTAGGCGT
ACAAAGAAA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2D929JQ 573 0 0
CATTACAGGGAGAGAGTAGGTACCTTCTTGGATCAATACCTCTATTGGATTGCATACCGG
TCTAATATCAACAGGTTCATCCTATGCTTTAATCTCCCAACCTATGAATACCGGAAATTA
GATCTCCCGGTTTACAACCAAGGTGTCACCTGTTCTTGGTTAGGCGTTACAAAAGAAAAG
CTTTGCGTTATAGATTATGTAACGTGCGAGAAGGAGATTCGGGTTTCGGTTATGGAGAAA
ACCGGATCATGGAACAAAATCATAAGCCTTTCAGTGTTGGACTTTATCTACGTGCAAGAT
CGTAAATGCGATTATCCAGTCGAGTTCGTGTCGTTTACGAGAAAGAACGACTTATTCATA
ACGTTCACTGGGTACTACGATGATTTCGAGACGGAAGCTGAAGATCGTGAGAAGAAGAAG
ATGTTCTTATACAAAACCGGTGATAATACAATCGAACAAGTCCGGTTATGTAACTCTTTA
CCCGGGTTTCGGTTTCTTGGTGAATATGTGTAGACTCTTGTGATCGTTGATCGTATCTTT
ACTTGAACTAAGAAAACAACAATAGCTTTGCCC

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL7010Contig1 1382 2 2 U
GGATAGAGGCATCTCTCAAAACAGTTTTCTCTGCAAGACTAACATAAACAACCACACAAA
AAAAAAGTCAGAGAAACCAAGAAAGAAATAGAAGAATGGGAAGTGTAGAAGCTGGAGAAA
AGAAAGCTTTAGGATGGGCTGCAAGAGATCCTTCTGGTGTTCTCTCTCCTTACTCCTACA
CTCTGAGGAGCACAGGGCCAGCTGATGTGTACATAAAGGTTATATGCTGTGGAATCTGCC
ATACTGATATTCACCAGATCAAAAATGATCTTGGAATGTCCAACTATCCTATGGTTCCTG
GACACGAGGTGGTAGGTGAAGTGGTTGAAGTGGGATCAGATGTGAGCAAGTTCACCGTAG
GTGATGTGGTCGGAGTCGGCGTCATCGTCGGCTGCTGCGGTAGCTGCAACCCCTGCAGCT
CAGATCTTGAACAGTACTGTAACAAGAGGATCTGGAGTTACAACGATGTCTACACCGACG
GCAAACCAACTCAAGGTGGCTTCGCAGACACTATGGTCGTCAATCAGAAGTTTGTCGTGA
GGATTCCCGAAGGTATGCCAGTGGAACAGGCTGCCCCGCTGCTCTGCGCGGGAGTAACTG
TGTACAGTCCGTTGAGCCACTTTGGTCTAATGTCAAGCGGGCTCAAAGGAGGGATTCTAG
GGTTAGGAGGAGTAGGGCACATGGGTGTGAAGATAGCTAAAGCAATGGGACATCACGTGA
CAGTGATAAGCTCTTCAGAGAAGAAAAGAGAAGAAGCAATGGATCATCTAGGAGCTGACG
ACTACGTAGTGAGTTCTGATCAAGCAGAGATGCAAAGAATCGCAGATTCTCTTGACTATA
TCATCGATACCGTACCGGTGTTTCACCCACTGGAGCCTTACTTGGCTTGTCTTAAACTCG
ACGGGAAGTTGATTCTCATGGGTGTTACTAACACTCCTCTGCAGTTCCTCACCCCTCTCA
TCATTCTTGGGAGGAAAGTGATATCAGGAAGCTTTATTGGGAGCATTAAAGAGACAGAAG
AAGTGTCGGCTTTCTGCAAAGAGAAAGGTCTTACGTCGACAATTGAGGTGGTGAAGATTG
GTGAGCTCAACACTGCGTTTGAGAGGCTTCACAAGAACGATGTTCGTTACAGGTTTGTGG
TTGATGTTGCCGGAAGCGATCTGGTCGAGGAGGCTGCAACCGCTACAAAATGAAACAGAG
TAACTAAGTAATGTGATATGGGTCCTATCACTATGTATGTTTTGTTGTGTCTTATTCAAT
GGTTCAGAAGTGAATGCTTTGGTCATTTGATATTTACTTTTGCTTTAAATGTGGATTTTA
TGTCATTGTCTTTTTCACCTATAGATAAAGAATAAATATTAGTATGAGCATTTACATGTT
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2B906TF U 1
AF RR2B906JQ C 489
BS 1 898 RR2B906TF
BS 899 1382 RR2B906JQ

RD RR2B906TF 898 0 0
GGATAGAGGCATCTCTCAAAACAGTTTTCTCTGCAAGACTAACATAAACAACCACACAAA
AAAAAAGTCAGAGAAACCAAGAAAGAAATAGAAGAATGGGAAGTGTAGAAGCTGGAGAAA
AGAAAGCTTTAGGATGGGCTGCAAGAGATCCTTCTGGTGTTCTCTCTCCTTACTCCTACA
CTCTGAGGAGCACAGGGCCAGCTGATGTGTACATAAAGGTTATATGCTGTGGAATCTGCC
ATACTGATATTCACCAGATCAAAAATGATCTTGGAATGTCCAACTATCCTATGGTTCCTG
GACACGAGGTGGTAGGTGAAGTGGTTGAAGTGGGATCAGATGTGAGCAAGTTCACCGTAG
GTGATGTGGTCGGAGTCGGCGTCATCGTCGGCTGCTGCGGTAGCTGCAACCCCTGCAGCT
CAGATCTTGAACAGTACTGTAACAAGAGGATCTGGAGTTACAACGATGTCTACACCGACG
GCAAACCAACTCAAGGTGGCTTCGCAGACACTATGGTCGTCAATCAGAAGTTTGTCGTGA
GGATTCCCGAAGGTATGCCAGTGGAACAGGCTGCCCCGCTGCTCTGCGCGGGAGTAACTG
TGTACAGTCCGTTGAGCCACTTTGGTCTAATGTCAAGCGGGCTCAAAGGAGGGATTCTAG
GGTTAGGAGGAGTAGGGCACATGGGTGTGAAGATAGCTAAAGCAATGGGACATCACGTGA
CAGTGATAAGCTCTTCAGAGAAGAAAAGAGAAGAAGCAATGGATCATCTAGGAGCTGACG
ACTACGTAGTGAGTTCTGATCAAGCAGAGATGCAAAGAATCGCAGATTCTCTTGACTATA
TCATCGATACCGTACCGGTGTTTCACCCACTGGAGCCTTACTTGGCTTGTCTTAAACT

QA 1 898 1 898
DS 

RD RR2B906JQ 894 0 0
ACTCAAGGTGGCTTCGCAGACACTATGGTCGTCAATCAGAAGTTTGTCGTGAGGATTCCC
GAAGGTATGCCAGTGGAACAGGCTGCCCCGCTGCTCTGCGCGGGAGTAACTGTGTACAGT
CCGTTGAGCCACTTTGGTCTAATGTCAAGCGGGCTCAAAGGAGGGATTCTAGGGTTAGGA
GGAGTAGGGCACATGGGTGTGAAGATAGCTAAAGCAATGGGACATCACGTGACAGTGATA
AGCTCTTCAGAGAAGAAAAGAGAAGAAGCAATGGATCATCTAGGAGCTGACGACTACGTA
GTGAGTTCTGATCAAGCAGAGATGCAAAGAATCGCAGATTCTCTTGACTATATCATCGAT
ACCGTACCGGTGTTTCACCCACTGGAGCCTTACTTGGCTTGTCTTAAACTCGACGGGAAG
TTGATTCTCATGGGTGTTACTAACACTCCTCTGCAGTTCCTCACCCCTCTCATCATTCTT
GGGAGGAAAGTGATATCAGGAAGCTTTATTGGGAGCATTAAAGAGACAGAAGAAGTGTCG
GCTTTCTGCAAAGAGAAAGGTCTTACGTCGACAATTGAGGTGGTGAAGATTGGTGAGCTC
AACACTGCGTTTGAGAGGCTTCACAAGAACGATGTTCGTTACAGGTTTGTGGTTGATGTT
GCCGGAAGCGATCTGGTCGAGGAGGCTGCAACCGCTACAAAATGAAACAGAGTAACTAAG
TAATGTGATATGGGTCCTATCACTATGTATGTTTTGTTGTGTCTTATTCAATGGTTCAGA
AGTGAATGCTTTGGTCATTTGATATTTACTTTTGCTTTAAATGTGGATTTTATGTCATTG
TCTTTTTCACCTATAGATAAAGAATAAATATTAGTATGAGCATTTACATGTTCC

QA 1 894 1 894
DS 



AS 1 2

CO CL7011Contig1 730 2 4 U
GTCATCTGATCTTTTAATTTAGGAAGAACACAACACTACAGACCCATGGCAATGGAGTTT
ACAACTCCAAACAAAAGAAGTAGAACCTAAGACATGATACACAAGCCGGCGGTTGTAATA
TAATCAACCCCAGAGCCAAAACTAACATAAGCCAAGTTCCTAACTACACTAAATGAGAAT
CAAACCCAGTCCTGGAGAATCGACACCAGCTCGTTAGCTTTAGGACAACCGTTGCTGTAG
GCTTCACCTTCTTCTAGCTTCTGCTCCACTGAAGCCTTCTCTTCTCGCTTCTTCTCTCTT
CTGTTCACCACACGCTTTTAAGCGTTTTATCTCCATTTATTCCTCGAGCTCCAACTAAAA
ACTGGCCATTGGACTCTGAAAGTTTCACCATGCGCCTTCTAGGTATCTCCGATCAAAAGA
CTCCCTCTAGATCCAACTAAGACTCGCCATCGGACTCTACGAGGGTTCACCACGCGCCAT
CTATGCGTCTCTTGGTCTCCACACCACAACAAGACCAAACCTGCAATACTAGACACGGTA
AAGCTCACTACAGCCGGTAACCATAAACTAACCACCACAACCCATAGATCTAACAAGATC
GAGTATGTGGAGTCCGGATTCGAATCTCTCCACTTTAGTCCGAAAAACTGAAGCTTTTGC
CCAGATCTAAACTCATCTAGCCTAAGAAAGAAGTCTGAAGCAAGTACTAAAATGACTCTA
CCTTCTCCCG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF95JQ U 1
AF RR2G895JQ U 4
BS 1 35 RR2EF95JQ
BS 36 36 RR2G895JQ
BS 37 696 RR2EF95JQ
BS 697 730 RR2G895JQ

RD RR2EF95JQ 696 0 0
GTCATCTGATCTTTTAATTTAGGAAGAACACAACATTACAGACCCATGGCAATGGAGTTT
ACAACTCCAAACAAAAGAAGTAGAACCTAAGACATGATACACAAGCCGGCGGTTGTAATA
TAATCAACCCCAGAGCCAAAACTAACATAAGCCAAGTTCCTAACTACACTAAATGAGAAT
CAAACCCAGTCCTGGAGAATCGACACCAGCTCGTTAGCTTTAGGACAACCGTTGCTGTAG
GCTTCACCTTCTTCTAGCTTCTGCTCCACTGAAGCCTTCTCTTCTCGCTTCTTCTCTCTT
CTGTTCACCACACGCTTTTAAGCGTTTTATCTCCATTTATTCCTCGAGCTCCAACTAAAA
ACTGGCCATTGGACTCTGAAAGTTTCACCATGCGCCTTCTAGGTATCTCCGATCAAAAGA
CTCCCTCTAGATCCAACTAAGACTCGCCATCGGACTCTACGAGGGTTCACCACGCGCCAT
CTATGCGTCTCTTGGTCTCCACACCACAACAAGACCAAACCTGCAATACTAGACACGGTA
AAGCTCACTACAGCCGGTAACCATAAACTAACCACCACAACCCATAGATCTAACAAGATC
GAGTATGTGGAGTCCGGATTCGAATCTCTCCACTTTAGTCCGAAAAACTGAAGCTTTTGC
CCAGATCTAAACTCATCTAGCCTAAGAAAGAAGTCT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2G895JQ 727 0 0
ATCTGATCTTTTAATTTAGGAAGAACACAACACTACAGACCCATGGCAATGGAGTTTACA
ACTCCAAACAAAAGAAGTAGAACCTAAGACATGATACACAAGCCGGCGGTTGTAATATAA
TCAACCCCAGAGCCAAAACTAACATAAGCCAAGTTCCTAACTACACTAAATGAGAATCAA
ACCCAGTCCTGGAGAATCGACACCAGCTCGTTAGCTTTAGGACAACCGTTGCTGTAGGCT
TCACCTTCTTCTAGCTTCTGCTCCACTGAAGCCTTCTCTTCTCGCTTCTTCTCTCTTCTG
TTCACCACACGCTTTTAAGCGTTTTATCTCCATTTATTCCTCGAGCTCCAACTAAAAACT
GGCCATTGGACTCTGAAAGTTTCACCATGCGCCTTCTAGGTATCTCCGATCAAAAGACTC
CCTCTAGATCCAACTAAGACTCGCCATCGGACTCTACGAGGGTTCACCACGCGCCATCTA
TGCGTCTCTTGGTCTCCACACCACAACAAGACCAAACCTGCAATACTAGACACGGTAAAG
CTCACTACAGCCGGTAACCATAAACTAACCACCACAACCCATAGATCTAACAAGATCGAG
TATGTGGAGTCCGGATTCGAATCTCTCCACTTTAGTCCGAAAAACTGAAGCTTTTGCCCA
GATCTAAACTCATCTAGCCTAAGAAAGAAGTCTGAAGCAAGTACTAAAATGACTCTACCT
TCTCCCG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL7012Contig1 1276 2 6 U
TTCAAGCAAAAAATAGAGTTTCCCTTCGAATCTCCCCTCCTCTGTAGCTCTCACTTCTCG
CCAACACATTTAAGAAAAGCTGTGTGCGTCAAACCAAAACCAGCGATCTTAAACTCATAA
CCACCAAATCTCTGACAATGTCGAACGCTATCAGATTCTTTGAGCTCAACACCGGTGCTA
AGATCCCGTCTGTGGGTCTTGGAACATGACAGGCCTCTCCTGGCGTTGTTGGTGATGCCG
TAGCTGCCGCTGTTAAGATCGGCTATCGTCATATTGATTGTGCTCAGTTGTATGGCAACG
AAAAAGAGATTGGGACAGCTTTGAAAAAATTGTGTGAAAAGGGTGTAGTGAAACGCGAGG
AGTTGTTCATCACCTCCAAACTCTGGTGTACCGATCATGACCCTCAAGATGTACCCGAGG
CACTAAGCAGAACTATACAGAGTCTGCAACTTGACTACGTTGATCTGTATTTGATTCACT
GGCCTGTACGGATGAAGAAAGGTTCTGTTGGAGTGAGTCCAGAAAACCTTTTGCCTGTAG
ATATTCCTAACACATGGAAGTCAATGGAAGCACTCTATGATTCGGGTAAGGCACGAGCGA
TAGGAGTAAGCAACTTCTCCCACCAAGAAACTAGGCAATCTCTTGGATGTAGCTCGTGTT
CCTCCAGCTGTTAATCACGTCGAATGTCATCCTTCTTGGCGACAAGCTAAGCTACGAGAG
TTTTGCAGATCCAAAGGAGTTCACCTCAGTGTAAGCATCACTCATCTCACCAATAGATGT
ACATATCTATGTGTGCCTTACCTTATACATTGATTGAACATATATTATTGCAAGGCATAC
TTCCCATTAGGTTCTCCAGGATGGTTCAAGAGCGAGGTTCTGAAGAACCCAATACTGAAT
ATGGTTGCGGAAAAGCTTGAGAAATCTCCTGCTCAAGTTGCACTCCGTTGGGGACTCCAA
ATGGGTCACAGTGTACTTCCCAAAAGTACCAATGAAGGGGGGATCAGAGAGAACTTGGAT
ATTTTCGACTGGTCTATACCCAATGATTTGTTTGCCAAGTTTTCCGATATTGAACAGACT
AGGCTATTGAATGCTTCCTTCTTTGCTCACGAGACACTGAGCCCTTATAAGTCTGTGGAA
GAGTTATGGGACGGCGAGGAGTGATATTCAGCTAATTTGTTTCTTCTGTGGGAGATTTTG
CCCTTTTGAACTTGTCCGTTTGTTCATGAATGTTACTGACAGACATGTCTCTATATAATT
TACAGTCATTTATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD79TF U 1
AF RR2AD79JQ C 396
BS 1 620 RR2AD79TF
BS 621 621 RR2AD79JQ
BS 622 803 RR2AD79TF
BS 804 804 RR2AD79JQ
BS 805 814 RR2AD79TF
BS 815 1276 RR2AD79JQ

RD RR2AD79TF 827 0 0
TTCAAGCAAAAAATAGAGTTTCCCTTCGAATCTCCCCTCCTCTGTAGCTCTCACTTCTCG
CCAACACATTTAAGAAAAGCTGTGTGCGTCAAACCAAAACCAGCGATCTTAAACTCATAA
CCACCAAATCTCTGACAATGTCGAACGCTATCAGATTCTTTGAGCTCAACACCGGTGCTA
AGATCCCGTCTGTGGGTCTTGGAACATGACAGGCCTCTCCTGGCGTTGTTGGTGATGCCG
TAGCTGCCGCTGTTAAGATCGGCTATCGTCATATTGATTGTGCTCAGTTGTATGGCAACG
AAAAAGAGATTGGGACAGCTTTGAAAAAATTGTGTGAAAAGGGTGTAGTGAAACGCGAGG
AGTTGTTCATCACCTCCAAACTCTGGTGTACCGATCATGACCCTCAAGATGTACCCGAGG
CACTAAGCAGAACTATACAGAGTCTGCAACTTGACTACGTTGATCTGTATTTGATTCACT
GGCCTGTACGGATGAAGAAAGGTTCTGTTGGAGTGAGTCCAGAAAACCTTTTGCCTGTAG
ATATTCCTAACACATGGAAGTCAATGGAAGCACTCTATGATTCGGGTAAGGCACGAGCGA
TAGGAGTAAGCAACTTCTCC*ACCAAGAAACTAGGCAATCTCTTGGATGTAGCTCGTGTT
CCTCCAGCTGTTAATCACGTCGAATGTCATCCTTCTTGGCGACAAGCTAAGCTACGAGAG
TTTTGCAGATCCAAAGGAGTTCACCTCAGTGTAAGCATCACTCATCTCACCAATAGATGT
ACATATCTATGTGTGCCTTACCT*ATACATTGAT
GACATATATTATT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR2AD79JQ 881 0 0
CATGACCCTCAAGATGTACCCGAGGCACTAAGCAGAACTATACAGAGTCTGCAACTTGAC
TACGTTGATCTGTATTTGATTCACTGGCCTGTACGGATGAAGAAAGGTTCTGTTGGAGTG
AGTCCAGAAAACCTTTTGCCTGTAGATATTCCTAACACATGGAAGTCAATGGAAGCACTC
TATGATTCGGGTAAGGCACGAGCGATAGGAGTAAGCAACTTCTCCCACCAAGAAACTAGG
CAATCTCTTGGATGTAGCTCGTGTTCCTCCAGCTGTTAATCAGGTCGAATGTCATCCTTC
TTGGCGACAAGCTAAGCTACGAGAGTTTTGCAGATCCAAAGGAGTTCACCTCAGTGTAAG
CATCACTCATCTCACCAATAGATGTACATATCTATGTGTGCCTTACCTTATACATTGATT
GAACATATATTATTGCAAGGCATACTTCCCATTAGGTTCTCCAGGATGGTTCAAGAGCGA
GGTTCTGAAGAACCCAATACTGAATATGGTTGCGGAAAAGCTTGAGAAATCTCCTGCTCA
AGTTGCACTCCGTTGGGGACTCCAAATGGGTCACAGTGTACTTCCCAAAAGTACCAATGA
AGGGGGGATCAGAGAGAACTTGGATATTTTCGACTGGTCTATACCCAATGATTTGTTTGC
CAAGTTTTCCGATATTGAACAGACTAGGCTATTGAATGCTTCCTTCTTTGCTCACGAGAC
ACTGAGCCCTTATAAGTCTGTGGAAGAGTTATGGGACGGCGAGGAGTGATATTCAGCTAA
TTTGTTTCTTCTGTGGGAGATTTTGCCCTTTTGAACTTGTCCGTTTGTTCATGAATGTTA
CTGACAGACATGTCTCTATATAATTTACAGTCATTTATGCC

QA 1 881 1 881
DS 



AS 1 2

CO CL7013Contig1 763 2 1 U
GTATAAAGATTCCCATTTTAAATAGAATGAAACTATCACAACGATATGGTAAAAATAAAA
TAGATTTAGAGACTTAAAAAAAAACACAGTGCAGAAAAGCCAAAAGCAATAAGAGATGAG
ACAGTAGTCTACTAATAAGTAGGACATTTTATTGGTAAAGAGAATGTATTTGGTTTTCAT
TTTCAAGCACCCATGGTGATGATGCAACGGACACTCTCTCCCTTCAACATGTAGTCAAAG
GCCTTGTTGATCTCAGAGAAGGGCACTGTGTGAGTGATGAACTTCTCAAGCTCCAGCTCC
TTGTTCATGTACTTCTCTACCACCCCAGGAATGTCAGTTTTGGGTTTGTAGTTCCCAAAG
AAAGTTCCCTTGAGCGTCCTCTCGTTCAGCAAGTTCATCGGATGAGTCTTGAACGCATCG
TCTTTGCTCGGCACACCTACCAGCACCGCAACACCCCACCCATCGTGAACACATTCAAAT
GCTTGAATCATAGCTTGAACACTTCCAGTGCACTCCACACTCCTGTCCACACCACCGTCC
GTCATCTCAGCTATGACTTGCTGAACCGGTTTATCATGTTCCCTAGGGTTCACAAACTCC
GTCACACCGAACTTCTTAGCTTCCTCGAATCTCTTGGGGTTAAGATCGACACCGATGATC
CTACCAGCACCAGCCATCCTAGCACCTTCCGCAGCGGCTAAACCAACAGCACCGAGACCG
AAAACCGCAACGCTCTGACCTTTCTTCGGTTTCGCCACGTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ90JQ U 1
AF RR2EK91JQ U 63
BS 1 763 RR2FQ90JQ

RD RR2FQ90JQ 763 0 0
GTATAAAGATTCCCATTTTAAATAGAATGAAACTATCACAACGATATGGTAAAAATAAAA
TAGATTTAGAGACTTAAAAAAAAACACAGTGCAGAAAAGCCAAAAGCAATAAGAGATGAG
ACAGTAGTCTACTAATAAGTAGGACATTTTATTGGTAAAGAGAATGTATTTGGTTTTCAT
TTTCAAGCACCCATGGTGATGATGCAACGGACACTCTCTCCCTTCAACATGTAGTCAAAG
GCCTTGTTGATCTCAGAGAAGGGCACTGTGTGAGTGATGAACTTCTCAAGCTCCAGCTCC
TTGTTCATGTACTTCTCTACCACCCCAGGAATGTCAGTTTTGGGTTTGTAGTTCCCAAAG
AAAGTTCCCTTGAGCGTCCTCTCGTTCAGCAAGTTCATCGGATGAGTCTTGAACGCATCG
TCTTTGCTCGGCACACCTACCAGCACCGCAACACCCCACCCATCGTGAACACATTCAAAT
GCTTGAATCATAGCTTGAACACTTCCAGTGCACTCCACACTCCTGTCCACACCACCGTCC
GTCATCTCAGCTATGACTTGCTGAACCGGTTTATCATGTTCCCTAGGGTTCACAAACTCC
GTCACACCGAACTTCTTAGCTTCCTCGAATCTCTTGGGGTTAAGATCGACACCGATGATC
CTACCAGCACCAGCCATCCTAGCACCTTCCGCAGCGGCTAAACCAACAGCACCGAGACCG
AAAACCGCAACGCTCTGACCTTTCTTCGGTTTCGCCACGTTCA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2EK91JQ 684 0 0
GATTTAGAGACTTAAAAAAAA*CACAGTGCAGAAAAGCCAAAAGCAATAAGAGATGAGAC
AGTAGTCTACTAATAAGTAGGACATTTTATTGGTAAAGAGAATGTATTTGGTTTTCATTT
TCAAGCACCCATGGTGATGATGCAACGGATACTCTCTCCCTTCAACATGTAGTCAAAGGC
CTTGTTGATCTCAGAGAAGGGCACTGTGTGAGTGATGAACTTCTCAAGCTCCAGCTCCTT
GTTCATGTACTTCTCTACCACCCCAGGAATGTCAGTTTTGGGTTTGTAGTTCCCAAAGAA
AGTTCCCTTGAGCGTCCTCTCGTTCAGCAAGTTCATCGGATGAGTCTTGAACGCATCGTC
TTTGCTCGGCACACCTACCAGCACCGCAACACCCCACCCATCGTGAACACATTCAAATGC
TTGAATCATAGCTTGAACACTTCCAGTGCACTCCACACTCCTGTCCACACCACCGTCCGT
CATCTCAGCTATGACTTGCTGAACCGGTTTATCATGTTCCCTAGGGTTCACAAACTCCGT
CACGCCGAACTTCTTAGCTTCCTCGAATCTCTTGGGGTTAAGATCGACACCGATGATCCT
ACCAGCACCAGCCATCCTAGCACCTTCCGCAGCGGCTAAACCAACAGCACCGAGACCGAA
AACCGCAACGCTCTGACCTTTCTT

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL7014Contig1 537 2 1 U
GGACAAACGATAAGGTGCAAAATAAGAAAAAAGTTGTTTACCAATCGATGGCGAAGAGAA
TCGGTGGAGCCGGGAAATCAGGCGGCGGAGATTCAAACATCTTGGCTCGGATCTCTAACT
CCGAGATCGTATCTCAAGGGAGACGCGCAGCTGTAGATGCCGTGGGAGTGTCGAAGAAAC
TGATCTGGAGCACGGGAAAAGCGGCGTGGATCGCTGGTACCACTTTTCTCATCCTCGTTG
TTCCGTTGATCATCGAGATGGATCGTGAAGCCCAGCTCAACGAATTAGATCTTCAGCAGG
CAAGCCTCCTCGGAGCTCCCGCGTCTCCTGCGCAAAGGGGAATGTAGAAAAACCCTAGAT
GGGCCAACTTCGAGGCTTTTGCAATTAGGGTGGTTTATCTGTTTGTTTAATCTGTTTATG
TTATGTTTTTGTCGGATACGAGTTCTTACACACGGACACGGTGGATTCTCATTAAAGTTT
CGAGCTTGTTTTTATCTTCAGATTGGTTTTTGCAATCGATAGTTCTACTTTCAGTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ES75JQ C 1
AF RR2ES75TF U 1
BS 1 537 RR2ES75TF

RD RR2ES75JQ 537 0 0
GGACAAACGATAAGGTGCAAAATAAGAAAAAAGTTGTTTACCAATCGATGGCGAAGAGAA
TCGGTGGAGCCGGGAAATCAGGCGGCGGAGATTCAAACATCTTGGCTCGGATCTCTAACT
CCGAGATCGTATCTCAAGGGAGACGCGCAGCTGTAGATGCCGTGGGAGTGTCGAAGAAAC
TGATCTGGAGCACGGGAAAAGCGGCGTGGATCGCTGGTACCACTTTTCTCATCCTCGTTG
TTCCGTTGATCATCGAGATGGATCGTGAAGCCCAGCTCAACGAATTAGATCTTCAGCAGG
CAAGCCTCCTCGGAGCTCCCGCGTCTCCTGCGCAAAGGGGAATGTAGAAAAACCCTAGAT
GGGCCAACTTCGAGGCTTTTGCAATTAGGGTGGTTTATCTGTTTGTTTAATCTGTTTATG
TTATGTTTTTGTCGGATACGAGTTCTTACACACGGACACGGTGGATTCTCATTAAAGTTT
CGAGCTTGTTTTTATCTTCAGATTGGTTTTTGCAATCGATAGTTCTACTTTCAGTGC

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2ES75TF 537 0 0
GGACAAACGATAAGGTGCAAAATAAGAAAAAAGTTGTTTACCAATCGATGGCGAAGAGAA
TCGGTGGAGCCGGGAAATCAGGCGGCGGAGATTCAAACATCTTGGCTCGGATCTCTAACT
CCGAGATCGTATCTCAAGGGAGACGCGCAGCTGTAGATGCCGTGGGAGTGTCGAAGAAAC
TGATCTGGAGCACGGGAAAAGCGGCGTGGATCGCTGGTACCACTTTTCTCATCCTCGTTG
TTCCGTTGATCATCGAGATGGATCGTGAAGCCCAGCTCAACGAATTAGATCTTCAGCAGG
CAAGCCTCCTCGGAGCTCCCGCGTCTCCTGCGCAAAGGGGAATGTAGAAAAACCCTAGAT
GGGCCAACTTCGAGGCTTTTGCAATTAGGGTGGTTTATCTGTTTGTTTAATCTGTTTATG
TTATGTTTTTGTCGGATACGAGTTCTTACACACGGACACGGTGGATTCTCATTAAAGTTT
CGAGCTTGTTTTTATCTTCAGATTGGTTTTTGCAATCGATAGTTCTACTTTCAGTGC

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

CO CL7015Contig1 744 2 3 U
TTTTTTTGTATCAAAATAAACATATAAAATATATAATTAAGTTAAAATTTTAAATAGAAA
ACTCAGGCGTAACCCAGGCCAACCCTAGTAATTAATAAAACAATAAGCAGAATAATATAA
CTAGTAAATATCATTCAACTACACGATCCAAACAAAAAAAATAACACACAAACAAAATTA
TTAACGAGAACTAACTATATTTTTCATAACTGTTGCTCAGTAGAACTCACGTAGCACCCT
TTTATTTAACTGGACGCTAGTCTGGCTGAGCATCTTCACAAACCTAATTTATTTCCAACG
AGATACTCCACTAGTTTGTTTCTTCCTTTTTGTTTTTATTATTTCTTTGTTCGTACGAGA
CGTCCCGAGCAAACGTCTTAGGAATTTGGAACATTGTTATGAGAAAAATATTCTCTTCTC
TCACAGGAGATATTTGTTGATTGTCGCCGTTAAATTTCAATCCGCAAAATACTGGCCCAT
CCTCATAGTCAAATCACCGAGACTTCTTGCTTTTTGGCTCTTCAGATTCTCTTTGAGAGA
TGCAATGCAAACTTCTTCGAAATGTGGAATCATGTCCGGACCTGGAGACTTTGAAGCGTT
TTTACAAGAATTTTGAATCAAAGAATCTGCCACTTTGTTGGCTGTGCAACCATTGAAAAG
AAAAGCAAACACAATGAGGTATATCATTTTGTTATTTTGAAACATCTTCATTGTGGTGTC
ATATATTGTAACTTATGATCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2C393TF C 1
AF RR2C393JQ U 8
BS 1 7 RR2C393TF
BS 8 739 RR2C393JQ
BS 740 744 RR2C393TF

RD RR2C393TF 744 0 0
TTTTTTTGTATCAAAATAAACATATAAAATATATAATTAAGTTAAAATTTTAAATAGAAA
ACTCAGGCGTAACCCAGGCCAACCCTAGTAATTAATAAAACAATAAGCAGAATAATATAA
CTAGTAAATATCATTCAACTACACGATCCAAACAAAAAAAATAACACACAAACAAAATTA
TTAACGAGAACTAACTATATTTTTCATAACTGTTGCTCAGTAGAACTCACGTAGCACCCT
TTTATTTAACTGGACGCTAGTCTGGCTGAGCATCTTCACAAACCTAATTTATTTCCAACG
AGATACTCCACTAGTTTGTTTCTTCCTTTTTGTTTTTATTATTTCTTTGTTCGTACGAGA
CGTCCCGAGCAAACGTCTTAGGAATTTGGAACATTGTTATGAGAAAAATATTCTCTTCTC
TCACAGGAGATATTTGTTGATTGTCGCCGTTAAATTTCAATCCGCAAAATACTGGCCCAT
CCTCATAGTCAAATCACCGAGACTTCTTGCTTTTTGGCTCTTCAGATTCTCTTTGAGAGA
TGCAATGCAAACTTCTTCGAAATGTGGAATCATGTCCGGACCTGGAGACTTTGAAGCGTT
TTTACAAGAATTTTGAATCAAAGAATCTGCCACTTTGTTGGCTGTGCAACCATTGAAAAG
AAAAGCAAACACAATGAGGTATATCATTTTGTTATTTTGAAACATCTTCATTGTGGTGTC
ATATATTGTAACTTATGATCCCCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2C393JQ 732 0 0
GTATCAAAATAAACATATAAAATATATAATTAAGTTAAAATTTTAAATAGAAAACTCAGG
CGTAACCCAGGCCAACCCTAGTAATTAATAAAACAATAAGCAGAATAATATAACTAGTAA
ATATCATTCAACTACACGATCCAAACAAAAAAAATAACACACAAACAAAATTATTAACGA
GAACTAACTATATTTTTCATAACTGTTGCTCAGTAGAACTCACGTAGCACCCTTTTATTT
AACTGGACGCTAGTCTGGCTGAGCATCTTCACAAACCTAATTTATTTCCAACGAGATACT
CCACTAGTTTGTTTCTTCCTTTTTGTTTTTATTATTTCTTTGTTCGTACGAGACGTCCCG
AGCAAACGTCTTAGGAATTTGGAACATTGTTATGAGAAAAATATTCTCTTCTCTCACAGG
AGATATTTGTTGATTGTCGCCGTTAAATTTCAATCCGCAAAATACTGGCCCATCCTCATA
GTCAAATCACCGAGACTTCTTGCTTTTTGGCTCTTCAGATTCTCTTTGAGAGATGCAATG
CAAACTTCTTCGAAATGTGGAATCATGTCCGGACCTGGAGACTTTGAAGCGTTTTTACAA
GAATTTTGAATCAAAGAATCTGCCACTTTGTTGGCTGTGCAACCATTGAAAAGAAAAGCA
AACACAATGAGGTATATCATTTTGTTATTTTGAAACATCTTCATTGTGGTGTCATATATT
GTAACTTATGAT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL7016Contig1 856 2 2 U
GGATGGTCAGAACGATATCTTCTACATCACCGGCGAGAGCAAGAAGGCAGTTGAGAACTC
TCCCTTCCTAGAGAAGCTCAAGAAGAAGGGATATGAAGTTCTGTACATGGTTGATGCAAT
CGACGAGTATGCTATTGGCCAGCTCAAGGAGTTCGAAGGGAAGAAGCTTGTATCCGCAAC
CAAGGAAGGATTGAAACTGGACGAGTCAGAGGACGAGAAGAAGAAGGAGGAAGAGCTAAA
GGAGAAGTTTGAAGGGCTGTGCAAAGTGATCAAGGACGTTTTGGGGGACAAAGTGGAGAA
GGTTATCGTATCTGACCGTGTGGTTGACTCACCCTGCTGTCTTGTGACGGGAGAATACGG
CTGGACAGCCAACATGGAGAGGATCATGAAAGCGCAAGCTTTGAGAGACAGCAGCATGGC
TGGATACATGTCGAGCAAGAAGACGATGGAGATTAATCCGGAGAATGCCATCATGGAGGA
GCTAAGGAAAAGAGCTGAGGCTGATAAGAATGACAAGTCTGTGAAGGATCTCGTTCTTCT
CCTCTTTGAGACTGCCCTTCTCACCTCTGGTTTCAGCTTGGACGAGCCCAACACGTTCGG
GAGCAGGATCCACAGGATGTTGAAGCTCGGACTGAGCATTGATGAAGATGAATCTGCCGA
TGCTGATGCGGAGATGCCTCCTCTTGAAGATGATGCGGACGCTGAGGGTAGCAAGATGGA
AGAAGTGGATTAAGAATTGACCAAGGATTGTAGTTAATAATAACAATGGTGTTTCTTGAT
TTTTCTCTTGTTTTTTTTTATCATTTGGAACTATTATGTAGTTTTCTCTCTTCTTCTATT
ATTAATGGTTTTTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D773TF U 1
AF RR2D773JQ C 72
BS 1 604 RR2D773TF
BS 605 856 RR2D773JQ

RD RR2D773TF 604 0 0
GGATGGTCAGAACGATATCTTCTACATCACCGGCGAGAGCAAGAAGGCAGTTGAGAACTC
TCCCTTCCTAGAGAAGCTCAAGAAGAAGGGATATGAAGTTCTGTACATGGTTGATGCAAT
CGACGAGTATGCTATTGGCCAGCTCAAGGAGTTCGAAGGGAAGAAGCTTGTATCCGCAAC
CAAGGAAGGATTGAAACTGGACGAGTCAGAGGACGAGAAGAAGAAGGAGGAAGAGCTAAA
GGAGAAGTTTGAAGGGCTGTGCAAAGTGATCAAGGACGTTTTGGGGGACAAAGTGGAGAA
GGTTATCGTATCTGACCGTGTGGTTGACTCACCCTGCTGTCTTGTGACGGGAGAATACGG
CTGGACAGCCAACATGGAGAGGATCATGAAAGCGCAAGCTTTGAGAGACAGCAGCATGGC
TGGATACATGTCGAGCAAGAAGACGATGGAGATTAATCCGGAGAATGCCATCATGGAGGA
GCTAAGGAAAAGAGCTGAGGCTGATAAGAATGACAAGTCTGTGAAGGATCTCGTTCTTCT
CCTCTTTGAGACTGCCCTTCTCACCTCTGGTTTCAGCTTGGACGAGCCCAACACGTTCGG
GAGC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2D773JQ 785 0 0
AGAAGCTCAAGAAGAAGGGATATGAAGTTCTGTACATGGTTGATGCAATCGACGAGTATG
CTATTGGCCAGCTCAAGGAGTTCGAAGGGAAGAAGCTTGTATCCGCAACCAAGGAAGGAT
TGAAACTGGACGAGTCAGAGGACGAGAAGAAGAAGGAGGAAGAGCTAAAGGAGAAGTTTG
AAGGGCTGTGCAAAGTGATCAAGGACGTTTTGGGGGACAAAGTGGAGAAGGTTATCGTAT
CTGACCGTGTGGTTGACTCACCCTGCTGTCTTGTGACGGGAGAATACGGCTGGACAGCCA
ACATGGAGAGGATCATGAAAGCGCAAGCTTTGAGAGACAGCAGCATGGCTGGATACATGT
CGAGCAAGAAGACGATGGAGATTAATCCGGAGAATGCCATCATGGAGGAGCTAAGGAAAA
GAGCTGAGGCTGATAAGAATGACAAGTCTGTGAAGGATCTCGTTCTTCTCCTCTTTGAGA
CTGCCCTTCTCACCTCTGGTTTCAGCTTGGACGAGCCCAACACGTTCGGGAGCAGGATCC
ACAGGATGTTGAAGCTCGGACTGAGCATTGATGAAGATGAATCTGCCGATGCTGATGCGG
AGATGCCTCCTCTTGAAGATGATGCGGACGCTGAGGGTAGCAAGATGGAAGAAGTGGATT
AAGAATTGACCAAGGATTGTAGTTAATAATAACAATGGTGTTTCTTGATTTTTCTCTTGT
TTTTTTTTATCATTTGGAACTATTATGTAGTTTTCTCTCTTCTTCTATTATTAATGGTTT
TTCGG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL7017Contig1 874 2 12 U
GGACACCTCACTATTTTATAACAGCTTCTTTCTCCCCCTCTTTTTCTTGAATACAATGGC
TGAAACAACTCCATTAAAGCGCCACCGAGAAGAAGAATGCCTAGCTGAAGAAGAAACCAA
TAAAAGACAAAAGCCCTCTACATCATCCTTTTCCTCACACAACGACAAGATCCTCAGTCT
CCTCAACGATTCAGACGAACTTAACCAACCTAACAATGACCTAACTTCATTTTTAAACTC
TCTCCAGCAAGATATCTCATCAGATGACCAAAACGGTGTCCTTTCTAGAGTCTCTAACGT
GGAAGATTCGTCGACTTCGTGTGTTTCCTCGAAGGAAGACGATGTTGATGAAGAGACCAA
GGAGACAGTGATGCAGCATCTTTTGGAAGCTTCTGACGACGAACTTGGGCTCCCTAACAA
CGAATTTGGCGAGAGTCATTATGAGATGATTAAGAATGAAATTAGTCAAGATTATGTTTA
TGGAGATAGTTTGTTAGATGGGTTTGGTGATGCGTTTTGGGAGCTTGAAGATGAAGCTGC
TAATTATTACGCGTTGCTCCAATCTGAACTGTTCTTGTAGAAATCTTAAGGATAAATCTG
GGGGAAAAAGGAAAAGGCCAATTAAAAAGTTAAAATAAGTGCGTCGGTTTTTTATATGAA
AATTTAATTTCATTTTTAAGGCACACTTTGGTTTCGGCGGAGCTACAAAATAGTTTCATT
TTAAGTATTTGATTAGATATGTAGGGGACAAATGGTAATGGTATTTTTTTACTCTTCTTG
CATTTTGGTTCGTCGAAAGATCGTAAGGACTACAGATGGGGTTTCGTATCTTTCAGTTTA
TTGTGAATGAATAAGAAATTTGGCATATTGATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ54TF U 1
AF RR2DZ54JQ C 177
BS 1 627 RR2DZ54TF
BS 628 628 RR2DZ54JQ
BS 629 652 RR2DZ54TF
BS 653 653 RR2DZ54JQ
BS 654 678 RR2DZ54TF
BS 679 679 RR2DZ54JQ
BS 680 696 RR2DZ54TF
BS 697 697 RR2DZ54JQ
BS 698 709 RR2DZ54TF
BS 710 710 RR2DZ54JQ
BS 711 740 RR2DZ54TF
BS 741 874 RR2DZ54JQ

RD RR2DZ54TF 740 0 0
GGACACCTCACTATTTTATAACAGCTTCTTTCTCCCCCTCTTTTTCTTGAATACAATGGC
TGAAACAACTCCATTAAAGCGCCACCGAGAAGAAGAATGCCTAGCTGAAGAAGAAACCAA
TAAAAGACAAAAGCCCTCTACATCATCCTTTTCCTCACACAACGACAAGATCCTCAGTCT
CCTCAACGATTCAGACGAACTTAACCAACCTAACAATGACCTAACTTCATTTTTAAACTC
TCTCCAGCAAGATATCTCATCAGATGACCAAAACGGTGTCCTTTCTAGAGTCTCTAACGT
GGAAGATTCGTCGACTTCGTGTGTTTCCTCGAAGGAAGACGATGTTGATGAAGAGACCAA
GGAGACAGTGATGCAGCATCTTTTGGAAGCTTCTGACGACGAACTTGGGCTCCCTAACAA
CGAATTTGGCGAGAGTCATTATGAGATGATTAAGAATGAAATTAGTCAAGATTATGTTTA
TGGAGATAGTTTGTTAGATGGGTTTGGTGATGCGTTTTGGGAGCTTGAAGATGAAGCTGC
TAATTATTACGCGTTGCTCCAATCTGAACTGTTCTTGTAGAAATCTTAAGGATAAATCTG
GGGGAAAAAGGAAAAGGCCAATTAAAA*GTTAAAATAAGTGCGTCGGTTTTT*ATATGAA
AATTTAATTTCATTTTTA*GGCACACTTTGGTTTCG*CGGAGCTACAAA*TAGTTTCATT
TTAAGTATTTGATTAGATAT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RR2DZ54JQ 698 0 0
GTCTCCTCAACGATTCAGACGAACTTAACCAACCTAACAATGACCTAACTTCATTTTTAA
ACTCTCTCCAGCAAGATATCTCATCAGATGACCAAAACGGTGTCCTTTCTAGAGTCTCTA
ACGTGGAAGATTCGTCGACTTCGTGTGTTTCCTCGAAGGAAGACGATGTTGATGAAGAGA
CCAAGGAGACAGTGATGCAGCATCTTTTGGAAGCTTCTGACGACGAACTTGGGCTCCCTA
ACAACGAATTTGGCGAGAGTCATTATGAGATGATTAAGAATGAAATTAGTCAAGATTATG
TTTATGGAGATAGTTTGTTAGATGGGTTTGGTGATGCGTTTTGGGAGCTTGAAGATGAAG
CTGCTAATTATTACGCGTTGCTCCAATTTGAACTGTTCTTGTAGAAATCTTAAGGATAAA
TCTGGGGGAAAAAGGAAAAGGCCAATTAAAAAGTTAAAATAAGTGCGTCGGTTTTTTATA
TGAAAATTTAATTTCATTTTTAAGGCACACTTTGGTTTCGGCGGAGCTACAAAATAGTTT
CATTTTAAGTATTTGATTAGATATGTAGGGGACAAATGGTAATGGTATTTTTTTACTCTT
CTTGCATTTTGGTTCGTCGAAAGATCGTAAGGACTACAGATGGGGTTTCGTATCTTTCAG
TTTATTGTGAATGAATAAGAAATTTGGCATATTGATGG

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL7018Contig1 588 2 1 U
GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCGACCACGTCCACGAAACTCAAGCCTCGCCGGATTTGGTG
TTATACGGAAATCCTTCCAATTTTCTTGTGAAGCTCTGTGTATGTAGATGTGAAATCACA
AAGTTACTTACCATCCGCCGCTGAAACGCTTAAGGAAGAATTGTTAAGGAATGGGTGAGA
ACATATTGGTGGATTCTCATGTTTGGGTGGAAGACCCAGCGACTGCTTGGACTCATGGGG
TTGTGCTTAATATCAAGGGAGACGAAGCTGAGGTTAAAACCAATGATGGTACACAGGTTA
TTGCTAAACTATCAAAACTCTATCCAAAAGACGATGAAGCTCCTTCTGAGGGAGTAGAGG
ACATGACAAGATTATCTTATCTCCATGAGCCTGCAGTTCTCAACAACTTGGCTACCAGAT
ATGAGCTGAATGAAATTTATACTTATACAGGAAACATTCTTATTGCTGTCAATCCCTTTC
AAGGACTCCCTCATCTCTATGATGCTGAGGTTATGTAGAAGTACAAGGAAGCCTCCTTCA
AAGAATTGAGTCCTCATGTTTTTGCAATTGGTGGCATTGCATATAGGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AT44JQ C 1
AF RR2AT44TF U 1
BS 1 588 RR2AT44TF

RD RR2AT44JQ 588 0 0
GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCGACCACGTCCACGAAACTCAAGCCTCGCCGGATTTGGTG
TTATACGGAAATCCTTCCAATTTTCTTGTGAAGCTCTGTGTATGTAGATGTGAAATCACA
AAGTTACTTACCATCCGCCGCTGAAACGCTTAAGGAAGAATTGTTAAGGAATGGGTGAGA
ACATATTGGTGGATTCTCATGTTTGGGTGGAAGACCCAGCGACTGCTTGGACTCATGGGG
TTGTGCTTAATATCAAGGGAGACGAAGCTGAGGTTAAAACCAATGATGGTACACAGGTTA
TTGCTAAACTATCAAAACTCTATCCAAAAGACGATGAAGCTCCTTCTGAGGGAGTAGAGG
ACATGACAAGATTATCTTATCTCCATGAGCCTGCAGTTCTCAACAACTTGGCTACCAGAT
ATGAGCTGAATGAAATTTATACTTATACAGGAAACATTCTTATTGCTGTCAATCCCTTTC
AAGGACTCCCTCATCTCTATGATGCTGAGGTTATGTAGAAGTACAAGGAAGCCTCCTTCA
AAGAATTGAGTCCTCATGTTTTTGCAATTGGTGGCATTGCATATAGGG

QA 1 588 1 588
DS 

RD RR2AT44TF 588 0 0
GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCGACCACGTCCACGAAACTCAAGCCTCGCCGGATTTGGTG
TTATACGGAAATCCTTCCAATTTTCTTGTGAAGCTCTGTGTATGTAGATGTGAAATCACA
AAGTTACTTACCATCCGCCGCTGAAACGCTTAAGGAAGAATTGTTAAGGAATGGGTGAGA
ACATATTGGTGGATTCTCATGTTTGGGTGGAAGACCCAGCGACTGCTTGGACTCATGGGG
TTGTGCTTAATATCAAGGGAGACGAAGCTGAGGTTAAAACCAATGATGGTACACAGGTTA
TTGCTAAACTATCAAAACTCTATCCAAAAGACGATGAAGCTCCTTCTGAGGGAGTAGAGG
ACATGACAAGATTATCTTATCTCCATGAGCCTGCAGTTCTCAACAACTTGGCTACCAGAT
ATGAGCTGAATGAAATTTATACTTATACAGGAAACATTCTTATTGCTGTCAATCCCTTTC
AAGGACTCCCTCATCTCTATGATGCTGAGGTTATGTAGAAGTACAAGGAAGCCTCCTTCA
AAGAATTGAGTCCTCATGTTTTTGCAATTGGTGGCATTGCATATAGGG

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL7019Contig1 944 2 6 U
GGAAAAAGAGGAGGAACCAGAACCACAAGAAGAAGAACAGCCTGAAGAACCTGCAGAAGA
CGAAAACCAAAACACAGAAACTGATCAGCCTCTTGTCGAAGAAGAGGAAGAAGAACCTGA
AGAGGAGAAAGTAGAGGAAGAAGTTAAACCTTCACCATTGATAGACACTGATGACTTACT
AGGTCTTAATGAAATAAACCCACAAGCCGCAGAGATTGAAGAGAAAAACGCATTGGCTCT
TGCCATTTATCCACCAGGACATGAAACTTCAGGCCCATCTAATAGTCTTAGCTTGATAGA
AGCTGGAGGAAGTGGTTGGGAGCTTGCATTAGTCACACCACAAAACAACAACAATAACAA
CAATACTCGTCCCACAATAGCAACAAAACTCGGAGGAGGATTTGACAATCTTCTACTAGA
CAGTCTTTACGAAGACGACACAGCGAGAAGACAGATCCAACTAACCAATGCTGGTTACGG
ATTTGGAGCCACGGCTACACACGTAGAACCACACTCATCAACTGCGAACCCGTTTGGGAT
GCAACATGATCCTTTTGCAATGTCTAGTAACATGGCTCCACCAACCAATGTTCAAATGGC
AATGCAACAACAGCAAATGATGATGATGAATAATAATAATCAGAATCCATATAACAACAA
CTATTCACCTTATCATCAACAATATCAGCACTTCTCACCAAATCCTTCATCCTCTTCTGC
TAACCCTTTTGGTGATACTTTCCTTGCTTTACCAGCTCCTCCTTCATCTTCTACTCAGCA
GCAGCACAATAATCATATGCTCCTTTAGGAAAGGTCATCTCAATAACTTCTCTCTCTGTC
TTTTGTTTTTCTAACTTTGATTTAATCCAGCTTATTATTATTCTTTAATTATTTTATAGT
ACAAAGACGTTCTATATTGTTGGGACTTGCTCCTCTTTCCCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY76TF U 1
AF RR2BY76JQ C 238
BS 1 701 RR2BY76TF
BS 702 702 RR2BY76JQ
BS 703 752 RR2BY76TF
BS 753 753 RR2BY76JQ
BS 754 786 RR2BY76TF
BS 787 944 RR2BY76JQ

RD RR2BY76TF 786 0 0
GGAAAAAGAGGAGGAACCAGAACCACAAGAAGAAGAACAGCCTGAAGAACCTGCAGAAGA
CGAAAACCAAAACACAGAAACTGATCAGCCTCTTGTCGAAGAAGAGGAAGAAGAACCTGA
AGAGGAGAAAGTAGAGGAAGAAGTTAAACCTTCACCATTGATAGACACTGATGACTTACT
AGGTCTTAATGAAATAAACCCACAAGCCGCAGAGATTGAAGAGAAAAACGCATTGGCTCT
TGCCATTTATCCACCAGGACATGAAACTTCAGGCCCATCTAATAGTCTTAGCTTGATAGA
AGCTGGAGGAAGTGGTTGGGAGCTTGCATTAGTCACACCACAAAACAACAACAATAACAA
CAATACTCGTCCCACAATAGCAACAAAACTCGGAGGAGGATTTGACAATCTTCTACTAGA
CAGTCTTTACGAAGACGACACAGCGAGAAGACAGATCCAACTAACCAATGCTGGTTACGG
ATTTGGAGCCACGGCTACACACGTAGAACCACACTCATCAACTGCGAACCCGTTTGGGAT
GCAACATGATCCTTTTGCAATGTCTAGTAACATGGCTCCACCAACCAATGTTCAAATGGC
AATGCAACAACAGCAAATGATGATGATGAATAATAATAATCAGAATCCATATAACAACAA
CTATTCACCTTATCATCAACAATATCAGCACTTCTCACCAA*TCCTTCATCCTCTTCTGC
TAACCCTTTTGGTGATACTTTCCTTGCTTTAC*AGCTCCTCCTTCATCTTCTACTCAGCA
GCAGCA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2BY76JQ 707 0 0
TCTTGCCATTTATCCACCAGGACATGAAACTTCAGGCCCATCTAATAGTCTTAGCTTGAT
AGAAGCTGGAGGAAGTGGTTGGGAGCTTGCATTAGTCACACCACAAAACAACAACAATAA
CAACAATACTCGTCCCACAATAGCAACAAAACTCGGAGGAGGATTTGACAATCTTCTACT
AGACAGTCTTTACGAAGACGACACAGCGAGAAGACAGATCCAACTAACCAATGCTGGTTA
CGGATTTGGAGCCACGGCTACACACGTAGAACCACACTCATCAACTGCGAACCCGTTTGG
GATGCAACATGATCCTTTTGCAATGTCTAGTAACATGGCTCCACCAACCAATGTTCAAAT
GGCAATGCAACAACAGCAAATGATGATGATGAATAATAATAATCAGAATCCATATAACAA
CAACTATTCACCTTATCATCAACAATATCAGCACTTCTCACCAAATCCTTCATCCTCTTT
TGCTAACCCTTTTGGTGATACTTTCCTTGCTTTACCAGCTCCTCCTTCATCTTCTACTCA
GCAGCAGCACAATAATCATATGCTCCTTTAGGAAAGGTCATCTCAATAACTTCTCTCTCT
GTCTTTTGTTTTTCTAACTTTGATTTAATCCAGCTTATTATTATTCTTTAATTATTTTAT
AGTACAAAGACGTTCTATATTGTTGGGACTTGCTCCTCTTTCCCCCT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL7020Contig1 929 2 6 U
AAAAAAGAACAATGACTTGTTCAATTCGATTTTCTTGCAGCGCTCTCCCACACGACATAA
TCTTCAAGATCGGATCTTATCTTCAGGCGACTGATCTTTGCGCACTCAGTAGCTGTTCTA
GGTTCTGGAGAGACCTTTGTGGTTCTGATATCTTATGGGAACCTCTGTTTAAAGAAAGAT
GGCCCTTGTTGTCCACTTTTGATGGGGATAATACTCTGTTTCCTGATGCACAAACCCATG
ATGAAACTTCTCAGAAATGGAGAAGAGTTTACATGATGCAGCACATGGAAATGGCATCTA
GAGCTTCCGAGGTGATTGCGTTTGTTACCGAGTGGCCTGCCGCGTTATCTCTAGAGGCCA
GCGAGTATCTCCACGCTGTCGAAACCATGAGCTCGATGCGGTTAGGGTTTCAAGACGTGG
AGATTTTTCTCTTCAAACCAAACTTGAGCGTTCTGCTCAACCTGGTCGGGCTCATCTACT
GTATAAAACACCTGAAACCGAGGGAGCAAGTTTTGGATGCGATGAGACGATGCGGAGTCT
CGGAGCAGCTGGTTTGGGTGAAATGGTTGACGTTAGGTCGATGGTCACGCGGGAGACGAA
TGAGGGACGAGACTGTTTCGCGTCAGGTGTGTCTGGCTGATGTTGTGACGGGGAAAGAAG
AAACGGTTCTTCGAGTGCTGCAACGAGGAGTTGTTCATGAAGTTCTTCGTGTTTGTGTCT
CAACGGTTGATCTTGTTTGCACCCCTTGCACCAGTAGCACCATCAGAAACTACTAAACCC
GGTTTGAAATGGAGCTTCCTCTTTTCAGCTTCTGGGGGTTTCATATTAATGCAGTGTGTA
AACCGGTTTGGGTTTGTTGGAAACTGAAAATGTGGTAAATGTATGTAACTCTATGATTGA
AACTCAAATGATTAAGGACTTGGACTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ88TF U 1
AF RR2EQ88JQ C 227
BS 1 626 RR2EQ88TF
BS 627 627 RR2EQ88JQ
BS 628 742 RR2EQ88TF
BS 743 743 RR2EQ88JQ
BS 744 776 RR2EQ88TF
BS 777 929 RR2EQ88JQ

RD RR2EQ88TF 778 0 0
AAAAAAGAACAATGACTTGTTCAATTCGATTTTCTTGCAGCGCTCTCCCACACGACATAA
TCTTCAAGATCGGATCTTATCTTCAGGCGACTGATCTTTGCGCACTCAGTAGCTGTTCTA
GGTTCTGGAGAGACCTTTGTGGTTCTGATATCTTATGGGAACCTCTGTTTAAAGAAAGAT
GGCCCTTGTTGTCCACTTTTGATGGGGATAATACTCTGTTTCCTGATGCACAAACCCATG
ATGAAACTTCTCAGAAATGGAGAAGAGTTTACATGATGCAGCACATGGAAATGGCATCTA
GAGCTTCCGAGGTGATTGCGTTTGTTACCGAGTGGCCTGCCGCGTTATCTCTAGAGGCCA
GCGAGTATCTCCACGCTGTCGAAACCATGAGCTCGATGCGGTTAGGGTTTCAAGACGTGG
AGATTTTTCTCTTCAAACCAAACTTGAGCGTTCTGCTCAACCTGGTCGGGCTCATCTACT
GTATAAAACACCTGAAACCGAGGGAGCAAGTTTTGGATGCGATGAGACGATGCGGAGTCT
CGGAGCAGCTGGTTTGGGTGAAATGGTTGACGTTAGGTCGATGGTCACGCGGGAGACGAA
TGAGGGACGAGACTGTTTCGCGTCAG*TGTGTCTGGCTGATGTTGTGACGGGGAAAGAAG
AAACGGTTCTTCGAGTGCTGCAACGAGGAGTTGTTCATGAAGTTCTTCGTGTTTGTGTCT
CAACGGTTGATCTTGTTTGCACGCCTTGCACCAGTAGCACCATCAGAAACTACTAA
CC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RR2EQ88JQ 703 0 0
TGCACAAACCCATGATGAAACTTCTCAGAAATGGAGAAGAGTTTACATGATGCAGCACAT
GGAAATGGCATCTAGAGCTTCCGAGGTGATTGCGTTTGTTACCGAGTGGCCTGCCGCGTT
ATCTCTAGAGGCCAGCGAGTATCTCCACGCTGTCGAAACCATGAGCTCGATGCGGTTAGG
GTTTCAAGACGTGGAGATTTTTCTCTTCAAACCAAACTTGAGCGTTCTGCTCAACCTGGT
CGGGCTCATTTACTGTATAAAACACCTGAAACCGAGGGAGCAAGTTTTGGATGCGATGAG
ACGATGCGGAGTCTCGGAGCAGCTGGTTTGGGTGAAATGGTTGACGTTAGGTCGATGGTC
ACGCGGGAGACGAATGAGGGACGAGACTGTTTCGCGTCAGGTGTGTCTGGCTGATGTTGT
GACGGGGAAAGAAGAAACGGTTCTTCGAGTGCTGCAACGAGGAGTTGTTCATGAAGTTCT
TCGTGTTTGTGTCTCAACGGTTGATCTTGTTTGCACCCCTTGCACCAGTAGCACCATCAG
AAACTACTAAACCCGGTTTGAAATGGAGCTTCCTCTTTTCAGCTTCTGGGGGTTTCATAT
TAATGCAGTGTGTAAACCGGTTTGGGTTTGTTGGAAACTGAAAATGTGGTAAATGTATGT
AACTCTATGATTGAAACTCAAATGATTAAGGACTTGGACTGAT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL7021Contig1 1361 2 4 U
GAACAATTACCGGAAACAAAAGCACACGAATTTTCAAATCTCCTCCTCTCTCTCTCTGTT
TTCCTCGTAGATCCCTCTGTTTCCCTTTCTGTCTTTCGAATCTAAAGATCATTTGTGAGA
ACGCCATGTCAGGTCATCTCAAGAAACTAACGATCGACACAGGACGTTCAGAGACTCTCG
TGGTCTGTTTCGGTGAAATGCTGATCGACTTTGTGCCAACGGTGGGAGGTGTTTCGCTGG
CCGAAGCACCAGCTTTCAAGAAAGCTCCAGGAGGTGCACCTGCTAATGTAGCTGTTGGTG
TCTCTAGACTCGGTGGCTCCTCTGCTTTCATTGGAAAGGTTGGTGATGATGAGTTTGGAA
AAATGTTAGCTGAGATTCTAAGGCTGAACAACGTGGATAACTCTGGGATGAGATTCGACC
ACAAAGCACGTACTGCTCTCGCCTTTGTTACGTTAAGAGGTGATGGAGAGAGGGAGTTTC
TGTTCTTCAGACACCCGAGTGCTGATATGCTTCTTACGGAAGCTGAGCTTGACAAGAACT
TAATCCAAAAGGCCAAGATCTTTCATTACGGATCAATCAGTTTGATCAAGGAACCTTGCC
GATCGACTCATCTTGCAGCTATGAAAATCGCTAAAGCCGCAGGGAGTCTCTTGTCGTATG
ACCCAAACTTGAGGTTACCATTGTGGCCATCAGAGGAAGCTGCAAGGAAAGAGATCATGA
GTATCTGGGATCTAGCAGATGTTATAAAGATCAGTGAGGATGAGATTACATTCCTGACTG
GTGGAGATGATCCTTACAGCGATGAAGTTGTGTTGCAAAAGCTGTTTCATCCAAATCTTA
AGCTTCTCGTTGTTTCAGAAGGACCTAATGGGTGTAGATACTACACTAAGGCGTTTAAAG
GTAGAGTTGGTGGAGTGAAAGTGAAAGCGGTTGACACAACAGGTGCAGGAGATGCATTCG
TGAGCGGTCTATTGAACAGCTTAGCTTCTGATCTCACTCTTCTCACTGATGAGAAGAAGC
TTAGAGAGGCGCTTCTATTTGCAAACGCTTGTGGAGCCATTACTGTTACAGAGAGAGGAG
CGATTCCAGCGATGCCGACCATGGATGCTGTTCAAGAACTTGTCAAATCTTCTCGCTCCT
GAAAATGCTCATAAAGAGTCTCTTTTGAGTGAAATCAGTTCTTTCCCTTTCTCGCTGTAT
CTTTCTTTGTTTCTTTTTTTTTCTCTTTTTCCGAATTTGTAGGAACGCAAGTATGTTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGTTTTAGTTTGTTGAACTTCTGGAGTTTTGATTTGGTTTTAAACT
GCTTGTCGTTTATTGTTTCGGAGGAAGGATATTTTAGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD44TF U 1
AF RR2BD44JQ C 448
BS 1 673 RR2BD44TF
BS 674 674 RR2BD44JQ
BS 675 819 RR2BD44TF
BS 820 1361 RR2BD44JQ

RD RR2BD44TF 822 0 0
GAACAATTACCGGAAACAAAAGCACACGAATTTTCAAATCTCCTCCTCTCTCTCTCTGTT
TTCCTCGTAGATCCCTCTGTTTCCCTTTCTGTCTTTCGAATCTAAAGATCATTTGTGAGA
ACGCCATGTCAGGTCATCTCAAGAAACTAACGATCGACACAGGACGTTCAGAGACTCTCG
TGGTCTGTTTCGGTGAAATGCTGATCGACTTTGTGCCAACGGTGGGAGGTGTTTCGCTGG
CCGAAGCACCAGCTTTCAAGAAAGCTCCAGGAGGTGCACCTGCTAATGTAGCTGTTGGTG
TCTCTAGACTCGGTGGCTCCTCTGCTTTCATTGGAAAGGTTGGTGATGATGAGTTTGGAA
AAATGTTAGCTGAGATTCTAAGGCTGAACAACGTGGATAACTCTGGGATGAGATTCGACC
ACAAAGCACGTACTGCTCTCGCCTTTGTTACGTTAAGAGGTGATGGAGAGAGGGAGTTTC
TGTTCTTCAGACACCCGAGTGCTGATATGCTTCTTACGGAAGCTGAGCTTGACAAGAACT
TAATCCAAAAGGCCAAGATCTTTCATTACGGATCAATCAGTTTGATCAAGGAACCTTGCC
GATCGACTCATCTTGCAGCTATGAAAATCGCTAAAGCCGCAGGGAGTCTCTTGTCGTATG
ACCCAAACTTGAG*TTACCATTGTGGCCATCAGAGGAAGCTGCAAGGAAAGAGATCATGA
GTATCTGGGATCTAGCAGATGTTATAAAGATCAGTGAGGATGAGATTACATTCCTGACTG
GTGGAGATGATCCTTACAGCGATGAAGTTGTGTTGCAAA
GCT

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2BD44JQ 914 0 0
TTACGTTAAGAGGTGATGGAGAGAGGGAGTTTCTGTTCTTCAGACACCCGAGTGCTGATA
TGCTTCTTACGGAAGCTGAGCTTGACAAGAACTTAATCCAAAAGGCCAAGATCTTTCATT
ACGGATCAATCAGTTTGATCAAGGAACCTTGCCGATCGACTCATCTTGCAGCTATGAAAA
TCGCTAAAGCCGCAGGGAGTCTCTTGTCGTATGACCCAAACTTGAGGTTACCATTGTGGC
CATCAGAGGAAGCTGCAAGGAAAGAGATCATGAGTATCTGGGATCTAGCAGATGTTATAA
AGATCAGTGAGGATGAGATTACATTCCTGACTGGTGGAGATGATCCTTACAGCGATGAAG
TTGTGTTGCAAAAGCTGTTTCATCCAAATCTTAAGCTTCTCGTTGTTTCAGAAGGACCTA
ATGGGTGTAGATACTACACTAAGGCGTTTAAAGGTAGAGTTGGTGGAGTGAAAGTGAAAG
CGGTTGACACAACAGGTGCAGGAGATGCATTCGTGAGCGGTCTATTGAACAGCTTAGCTT
CTGATCTCACTCTTCTCACTGATGAGAAGAAGCTTAGAGAGGCGCTTCTATTTGCAAACG
CTTGTGGAGCCATTACTGTTACAGAGAGAGGAGCGATTCCAGCGATGCCGACCATGGATG
CTGTTCAAGAACTTGTCAAATCTTCTCGCTCCTGAAAATGCTCATAAAGAGTCTCTTTTG
AGTGAAATCAGTTCTTTCCCTTTCTCGCTGTATCTTTCTTTGTTTCTTTTTTTTTCTCTT
TTTCCGAATTTGTAGGAACGCAAGTATGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTAGTTTGT
TGAACTTCTGGAGTTTTGATTTGGTTTTAAACTGCTTGTCGTTTATTGTTTCGGAGGAAG
GATATTTTAGTTTT

QA 1 914 1 914
DS 



AS 1 2

CO CL7022Contig1 480 2 1 U
GGGGTTTAGTTTAGTTTGCTTCAAAAAACCATTTGCGGAGTCGTCGTCTTCTTCCTCTTC
CCAGATTCACTTCCTTCTAGAAGATTCACATCAGAAATGGATTGGCAAGGACAGAAACTA
GCGGAGCAGTTGATGCAGATCCTGCTCTTGATCGCCGCCGTTGTGGCGTTCGTCGTTGGT
TACACGACGGCTTCGTTTAGGACGATGATGTTGATTTATGCAGGAGGTGTGGGTGTCACG
ACGTTGATCACGGTGCCAAACTGGCCTTTTTTCAACCGTCATCCTCTCAAGTGGTTGGAT
CCAAGTGAAGCAGAGAAGCATCCTAAACCCGAAGTCGTTGTTAGCTCCAAGAAGAAGTCA
TCTAAAAAGTAGCTAATCTTCTTTTGTAATCTCTCATTTTTCTAGATCTTTGATATAAAA
AAAAAGACATGTTCCGGATTTTGCTTATAAAACTATTGAATAAGATAGTCTAAATGACAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EK92JQ C 1
AF RR2EK92TF U 1
BS 1 480 RR2EK92TF

RD RR2EK92JQ 480 0 0
GGGGTTTAGTTTAGTTTGCTTCAAAAAACCATTTGCGGAGTCGTCGTCTTCTTCCTCTTC
CCAGATTCACTTCCTTCTAGAAGATTCACATCAGAAATGGATTGGCAAGGACAGAAACTA
GCGGAGCAGTTGATGCAGATCCTGCTCTTGATCGCCGCCGTTGTGGCGTTCGTCGTTGGT
TACACGACGGCTTCGTTTAGGACGATGATGTTGATTTATGCAGGAGGTGTGGGTGTCACG
ACGTTGATCACGGTGCCAAACTGGCCTTTTTTCAACCGTCATCCTCTCAAGTGGTTGGAT
CCAAGTGAAGCAGAGAAGCATCCTAAACCCGAAGTCGTTGTTAGCTCCAAGAAGAAGTCA
TCTAAAAAGTAGCTAATCTTCTTTTGTAATCTCTCATTTTTCTAGATCTTTGATATAAAA
AAAAAGACATGTTCCGGATTTTGCTTATAAAACTATTGAATAAGATAGTCTAAATGACAT

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2EK92TF 480 0 0
GGGGTTTAGTTTAGTTTGCTTCAAAAAACCATTTGCGGAGTCGTCGTCTTCTTCCTCTTC
CCAGATTCACTTCCTTCTAGAAGATTCACATCAGAAATGGATTGGCAAGGACAGAAACTA
GCGGAGCAGTTGATGCAGATCCTGCTCTTGATCGCCGCCGTTGTGGCGTTCGTCGTTGGT
TACACGACGGCTTCGTTTAGGACGATGATGTTGATTTATGCAGGAGGTGTGGGTGTCACG
ACGTTGATCACGGTGCCAAACTGGCCTTTTTTCAACCGTCATCCTCTCAAGTGGTTGGAT
CCAAGTGAAGCAGAGAAGCATCCTAAACCCGAAGTCGTTGTTAGCTCCAAGAAGAAGTCA
TCTAAAAAGTAGCTAATCTTCTTTTGTAATCTCTCATTTTTCTAGATCTTTGATATAAAA
AAAAAGACATGTTCCGGATTTTGCTTATAAAACTATTGAATAAGATAGTCTAAATGACAT

QA 1 480 1 480
DS 



AS 1 2

CO CL7023Contig1 1186 2 6 U
GGGAGGGCTCCGACGGCGAAGGTAGACAACGATGATGAGCTCCGTCGACTCAAAGATGTT
AACAAGGACGAAGCTCCGGCGCGCCGTCACGTTCGCGATTCCTTTAAAGATATTCAGCTT
AATCTCGATCATATCCTCTTCAAGACACCAGGAGATGGGATTAAGACAAAGGAGTCTTAT
GAGGTGAATTCAAGAGGAGTTGAGATCTTCTCAAAAAGCTGGCTTCCTGAAGCTTCTAAG
CCCAGAGCTCTTGTTTGTTTCTGCCATGGTTATGGAGATACCTGCACGTTTTTCTTCGAA
GGGATTGCAAGGAGACTGGCATTGTCTGGATACGGAGTTTTCGCTATGGATTATCCTGGA
TTCGGCTTATCAGAAGGCTTGCACGGCTACATCCCTAGCTTTGATCTTCTTGTTGAAGAT
GTCATTGAACACTACTCCAACATCAAAGGGAATCCCGAGTTTAGTTCTCTGCCGAGCTTT
CTCTTTGGGCAGTCAATGGGTGGAGCCGTGTCGCTCAAAATTCATTTCAAGCAACCAAAT
GCTTGGACCGGTGCGGTCTTGGTAGCACCCATGTGCAAAATTGCAGATGATATGGTTCCA
CCACCAGTATTGAAGCAGATTTTGATCGGTCTAGCTAATGTTCTACCTAAACATAAGCTG
GTTCCCCAAAAGGATTTAGCAGAAGCAAGTTTTAGAGATGTCAGGAAGAGAAAATTGACA
CCATACAACGTCATTTGTTACAGTGCCAAGCCGCGTCTACGGACCGCTGTAGAGATGCTT
AGAACAACTCAGGAGATTGAGCAACAATTGGAAAAGGTGTGTTTGCCAATACTGATACTA
CACGGAGAGGCCGATAGAGTGACGGACCTATCAGTGAGCAAAGAGCTTTATGAGAAAGCG
AAAAGTTCAGACAAGAAGATAGTTGTGTATAAAGATGCTTATCATTCTCTGCTCGAAGGC
GAGCCAGACGAAATGATTATCCGTGTCTTGTCTGATGTTATCTCCCGGCTTGACGACCAT
AGCTTGCAAGTTGAGGAGGGATCATAAAGTTACTTCTGTGTAGATTCTGATCATTTGTTT
CCTTCCATTTTGTAGGTGAAAAGTATTTTTCAACAAAGAAATTCTTTTTTATTTTTTGAC
ATTTTGCAAATTTGATGTGTTCTTATCTTCGGATGGAAAATAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN57TF U 1
AF RR2AN57JQ C 436
BS 1 704 RR2AN57TF
BS 705 705 RR2AN57JQ
BS 706 745 RR2AN57TF
BS 746 746 RR2AN57JQ
BS 747 786 RR2AN57TF
BS 787 1186 RR2AN57JQ

RD RR2AN57TF 788 0 0
GGGAGGGCTCCGACGGCGAAGGTAGACAACGATGATGAGCTCCGTCGACTCAAAGATGTT
AACAAGGACGAAGCTCCGGCGCGCCGTCACGTTCGCGATTCCTTTAAAGATATTCAGCTT
AATCTCGATCATATCCTCTTCAAGACACCAGGAGATGGGATTAAGACAAAGGAGTCTTAT
GAGGTGAATTCAAGAGGAGTTGAGATCTTCTCAAAAAGCTGGCTTCCTGAAGCTTCTAAG
CCCAGAGCTCTTGTTTGTTTCTGCCATGGTTATGGAGATACCTGCACGTTTTTCTTCGAA
GGGATTGCAAGGAGACTGGCATTGTCTGGATACGGAGTTTTCGCTATGGATTATCCTGGA
TTCGGCTTATCAGAAGGCTTGCACGGCTACATCCCTAGCTTTGATCTTCTTGTTGAAGAT
GTCATTGAACACTACTCCAACATCAAAGGGAATCCCGAGTTTAGTTCTCTGCCGAGCTTT
CTCTTTGGGCAGTCAATGGGTGGAGCCGTGTCGCTCAAAATTCATTTCAAGCAACCAAAT
GCTTGGACCGGTGCGGTCTTGGTAGCACCCATGTGCAAAATTGCAGATGATATGGTTCCA
CCACCAGTATTGAAGCAGATTTTGATCGGTCTAGCTAATGTTCTACCTAAACATAAGCTG
GTTCCCCAAAAGGATTTAGCAGAAGCAAGTTTTAGAGATGTCAG*AAGAGAAAATTGACA
CCATACAACGTCATTTGTTACAGTGGCAAGCCGCGTCTACGGACCGCTGTAGAGATGCTT
AGAACA
CT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RR2AN57JQ 751 0 0
C
CCAACATCAAAGGGAATCCCGAGTTTAGTTCTCTGCCGAGCTTTCTCTTTGGGCAGTCAA
TGGGTGGAGCCGTGTCGCTCAAAATTCATTTCAAGCAACCAAATGCTTGGACCGGTGCGG
TCTTGGTAGCACCCATGTGCAAAATTGCAGATGATATGGTTCCACCACCAGTATTGAAGC
AGATTTTGATCGGTCTAGCTAATGTTCTACCTAAACATAAGCTGGTTCCCCAAAAGGATT
TAGCAGAAGCAAGTTTTAGAGATGTCAGGAAGAGAAAATTGACACCATACAACGTCATTT
GTTACAGTGCCAAGCCGCGTTTACGGACCGCTGTAGAGATGCTTAGAACAACTCAGGAGA
TTGAGCAACAATTGGAAAAGGTGTGTTTGCCAATACTGATACTACACGGAGAGGCCGATA
GAGTGACGGACCTATCAGTGAGCAAAGAGCTTTATGAGAAAGCGAAAAGTTCAGACAAGA
AGATAGTTGTGTATAAAGATGCTTATCATTCTCTGCTCGAAGGCGAGCCAGACGAAATGA
TTATCCGTGTCTTGTCTGATGTTATCTCCCGGCTTGACGACCATAGCTTGCAAGTTGAGG
AGGGATCATAAAGTTACTTCTGTGTAGATTCTGATCATTTGTTTCCTTCCATTTTGTAGG
TGAAAAGTATTTTTCAACAAAGAAATTCTTTTTTATTTTTTGACATTTTGCAAATTTGAT
GTGTTCTTATCTTCGGATGGAAAATAATGT

QA 2 751 2 751
DS 



AS 1 2

CO CL7024Contig1 765 2 5 U
GGGTTAATCATCTTCTTCGTCTTCCGCCAGCGCTCCTCTCTCCAATCGAATTGAAGTTGT
TTTAAGCAAGGGGAGGGAAGAAAATGGTTTCTGGATTAATCAACGAGAACCCGATCGTGT
ACGAGGTAAAACATCGTCGTGATGTTCGTGCCGATTCCAGCAGCAGTACCAATGAGCTCT
CAGCAGATGCAATCGATCATCTCGAAGTTTTCGATCATATAAGAGATATAAAAGATCCAG
AGCATCCTTACTCTCTGGAACAACTCAAAGTCCTTACAGAAGACTCTGTTGAAGTTGATG
ATACCAAGAGTCATGTTAGGGTTACGTTCACTCCAACGGTGGAACATTGTAGCATGGCAA
CTATTATTGGTCTCTGTGTCCGTGTGAAGCTTATGCGAAGCCTTCCTCGTCGTTACAAGA
TTGATATAAGGGTAGCCCCCGGTACTCATGCAACTGAGGCTGCAGTCAATAAACAACTAA
ACGACAAAGAGCGTGTGGCGGCTGCACTAGAGAATCCGAACCTTGTGGAGATGGCCGATG
AATGTCTATCTTCATCACTTGAATGATGCCCTTGATGCTCTCAAGATACACTTTCATATA
TATATATGTCTCTGCTTTGTCTGCAAATATTTTGATCAGCTAGGGCTTACTTTGTGTTTA
GTGTCATGTTCAATGAATGTATTTGATTTGATCCACTATGATTATTTCAGATACTCTCCA
ACCGAACTTGTTGCACGCTTGTCTTTCACACATTTGTTCCGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F257TF U 13
AF RR2FJ19TF U 1
BS 1 42 RR2FJ19TF
BS 43 43 RR2F257TF
BS 44 188 RR2FJ19TF
BS 189 189 RR2F257TF
BS 190 765 RR2FJ19TF

RD RR2F257TF 668 0 0
TTT
TTCGTCTTCCGCCAGCGCTCCTCTCTCCAATCGAATTGAAGTTGTTTTAAGCAAGGGGAG
GGAAGAAAATGGTTTCTGGATTAATCAACGAGAACCCGATCGTGTACGAGGTAAAACATC
GTCGTGATGTTCGTGCCGATTCCAGCAGCAGTACCAATGAGCTCTCAGCAGATGCAATCG
ATCATCTCGAAGTTTTCGATCATATAAGAGATATAAAAGATCCAGAGCATCCTTACTCTC
TGGAACAACTCAAAGTCCTTACAGAAGACTCTGTTGAAGTTGATGATACCAAGAGTCATG
TTAGGGTTACGTTCACTCCAACGGTGGAACATTGTAGCATGGCAACTATTATTGGTCTCT
GTGTCCGTGTGAAGCTTATGCGAAGCCTTCCTCGTCGTTACAAGATTGATATAAGGGTAG
CCCCCGGTACTCATGCAACTGAGGCTGCAGTCAATAAACAACTAAACGACAAAGAGCGTG
TGGCGGCTGCACTAGAGAATCCGAACCTTGTGGAGATGGTCGATGAATGTCTATCTTCAT
CACTTGAATGATGCCCTTGATGCTCTCAAGATACACTTTCATATATATATATGTCTCTGC
TTTGTCTGCAAATATTTTGATCAGCTAGGGCTTACTTTGTGTTTAGTGTCATGTTTAATG
AATGT

QA 4 668 4 668
DS 

RD RR2FJ19TF 765 0 0
GGGTTAATCATCTTCTTCGTCTTCCGCCAGCGCTCCTCTCTCTAATCGAATTGAAGTTGT
TTTAAGCAAGGGGAGGGAAGAAAATGGTTTCTGGATTAATCAACGAGAACCCGATCGTGT
ACGAGGTAAAACATCGTCGTGATGTTCGTGCCGATTCCAGCAGCAGTACCAATGAGCTCT
CAGCAGATTCAATCGATCATCTCGAAGTTTTCGATCATATAAGAGATATAAAAGATCCAG
AGCATCCTTACTCTCTGGAACAACTCAAAGTCCTTACAGAAGACTCTGTTGAAGTTGATG
ATACCAAGAGTCATGTTAGGGTTACGTTCACTCCAACGGTGGAACATTGTAGCATGGCAA
CTATTATTGGTCTCTGTGTCCGTGTGAAGCTTATGCGAAGCCTTCCTCGTCGTTACAAGA
TTGATATAAGGGTAGCCCCCGGTACTCATGCAACTGAGGCTGCAGTCAATAAACAACTAA
ACGACAAAGAGCGTGTGGCGGCTGCACTAGAGAATCCGAACCTTGTGGAGATGGCCGATG
AATGTCTATCTTCATCACTTGAATGATGCCCTTGATGCTCTCAAGATACACTTTCATATA
TATATATGTCTCTGCTTTGTCTGCAAATATTTTGATCAGCTAGGGCTTACTTTGTGTTTA
GTGTCATGTTCAATGAATGTATTTGATTTGATCCACTATGATTATTTCAGATACTCTCCA
ACCGAACTTGTTGCACGCTTGTCTTTCACACATTTGTTCCGTTGT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL7025Contig1 823 2 4 U
GAAAGTCTTAGAAGACTATTCTTCATTGCTAATTGGTGCGTCTGTGTCTGTCGGTGTCGT
TTCGTATTTGATTCTTATCCTCACAGGCATTACAAGTACATTATTCAACATCATTAAAGA
GTTATTTACTCTTTCACCCCACTACAACCACGACCACACATTCAATGTCTCTCTCCCTAT
TCCAAGCAGTGGATCTCCATCTATAAAAAGATCGTGAAAGGTACTCACATCATTGTGTAC
AAGGCAAAGATTTATTGACTAAAATGGTAGCTTCGAAGAAAGTTAGATTTGATTACGTGG
AAGCATAAAGAGTTAAGTTCATGGCGAGAAAGAATCTTATGCTGCAGGGGCTAAACCATC
CTAAAGTTTACATCATTTTCAGTCTATGGAACATGATTTCCCTGGCCTTCTCTAACTCAA
GAAGACAAGACGATTAATTACAGGAGAAGTTAATGTTCAAGTCTTCATCTGCAGTATGGG
CAGTGATGACGATGGAGATGATATGCATGGAATGGACTCAGTCTCTGCTAAAGTGGACGT
TTGTGGTAGTACTCTTTAGGGGGCGCCGACTACATGAGCAGGTCCAAGTGGTCTCGATAC
TAAGAAGCCTACGGCACGAGCATCTTTGAAGATGGCTGAGGAAGCACGCATGGCATAGGT
GAAGATAATGAGAGCTCTGAGCACAGTATTTTCTATTTGAATAATGCTAACGGATCAATA
TTGCTTAACGAGTTCTTTACTTTCATTTTATCCCTCTGGGTATGCTATGTTTTGTTCAGA
CGATGTTTAAAAATATTTCTAAAATTAATTAAATTAGTGTATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC22TF U 1
AF RR2AC22JQ C 1
BS 1 640 RR2AC22TF
BS 641 641 RR2AC22JQ
BS 642 654 RR2AC22TF
BS 655 823 RR2AC22JQ

RD RR2AC22TF 654 0 0
GAAAGTCTTAGAAGACTATTCTTCATTGCTAATTGGTGCGTCTGTGTCTGTCGGTGTCGT
TTCGTATTTGATTCTTATCCTCACAGGCATTACAAGTACATTATTCAACATCATTAAAGA
GTTATTTACTCTTTCACCCCACTACAACCACGACCACACATTCAATGTCTCTCTCCCTAT
TCCAAGCAGTGGATCTCCATCTATAAAAAGATCGTGAAAGGTACTCACATCATTGTGTAC
AAGGCAAAGATTTATTGACTAAAATGGTAGCTTCGAAGAAAGTTAGATTTGATTACGTGG
AAGCATAAAGAGTTAAGTTCATGGCGAGAAAGAATCTTATGCTGCAGGGGCTAAACCATC
CTAAAGTTTACATCATTTTCAGTCTATGGAACATGATTTCCCTGGCCTTCTCTAACTCAA
GAAGACAAGACGATTAATTACAGGAGAAGTTAATGTTCAAGTCTTCATCTGCAGTATGGG
CAGTGATGACGATGGAGATGATATGCATGGAATGGACTCAGTCTCTGCTAAAGTGGACGT
TTGTGGTAGTACTCTTTAGGGGGCGCCGACTACATGAGCAGGTCCAAGTGGTCTCGATAC
TAAGAAGCCTACGGCACGAGCATCTTTGAAGATGGCTGAG*AAGCACGCATGGC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2AC22JQ 823 0 0
GAAAGTCTTAGAAGACTATTCTTCATTGCTAATTGGTGCGTCTGTGTCTGTCGGTGTCGT
TTCGTATTTGATTCTTATCCTCACAGGCATTACAAGTACATTATTCAACATCATTAAAGA
GTTATTTACTCTTTCACCCCACTACAACCACGACCACACATTCAATGTCTCTCTCCCTAT
TCCAAGCAGTGGATCTCCATCTATAAAAAGATCGTGAAAGGTACTCACATCATTGTGTAC
AAGGCAAAGATTTATTGACTAAAATGGTAGCTTCGAAGAAAGTTAGATTTGATTACGTGG
AAGCATAAAGAGTTAAGTTCATGGCGAGAAAGAATCTTATGCTGCAGGGGCTAAACCATC
CTAAAGTTTACATCATTTTCAGTCTATGGAACATGATTTCCCTGGCCTTCTCTAACTCAA
GAAGACAAGACGATTAATTACAGGAGAAGTTAATGTTCAAGTCTTCATCTGCAGTATGGG
CAGTGATGACGATGGAGATGATATGCATGGAATGGACTCAGTCTCTGCTAAAGTGGACGT
TTGTGGTAGTACTCTTTAGGGGGCGCCGACTACATGAGCAGGTCCAAGTGGTCTCGATAC
TAAGAAGCCTACGGCACGAGCATCTTTGAAGATGGCTGAGGAAGCACGCATGGCATAGGT
GAAGATAATGAGAGCTCTGAGCACAGTATTTTCTATTTGAATAATGCTAACGGATCAATA
TTGCTTAACGAGTTCTTTACTTTCATTTTATCCCTCTGGGTATGCTATGTTTTGTTCAGA
CGATGTTTAAAAATATTTCTAAAATTAATTAAATTAGTGTATT

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL7026Contig1 769 2 2 U
TTTTTTTGCAAGAAAATCAGATTCCGACAAAGCTTGGCTTATCTTTATCTTTTCACATGG
GGTCTGAGGTCAATTCCTGAGCTCTTTTACTGTCTCTTGCCTGCTTATTGTGTACTCCAC
AGTTCTCCCTTATTTCCCAAGGGAGTTTGTTTAGGTATAGTCGTCGCACTTGTGGGGATG
CACTGCCTCTATACTTTGTGGGAGTTTATGAGCCTTGGGTTTTCCGTACATTCATGGTAT
GCCTCCCAATCGTTTTCGAGAATAAAAACAACTGGTAGTTGGCTATTGAGCATCCCTGAT
ATCATACTTAAGCTTCTTGGAGTTTCCAATACTGTCTTTGTAGTTAGTAAAAAGACTATT
TCCAAGACAAAGCTAGAGTCCGGGGATACACCAACTCAAAAAGAAGAAGATGGTCCAAAC
CCTGATTCAGATAAATTTGAATTCGATGGTTCACTTTATTTCTTGCCCGGCACATTCATT
CTATGGGTGAATTTAACCGCTATAGCCGGTTTTTCATTGGGGCTACAACGGTCGACGCAT
AGCTATGGAGGAAGTGGTTCGAGTTCGATAGAGGCTTGTGGATGTATTTTGGTGGTTGTG
TTGTTCCTTCCATTTCTAACTGGTTTGTTTGAGAAGGGAAAATATGGTATCCCATTGTCT
ACGCTTTTTAAAGCTGCCTTTTTAGCAGTTTTATTTGTTGTTTTCTCTGTAAGAAACTAG
TGTATTGATATGGATTTGCCAGGGGAAGTATTATAAGTTTATCATGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D123TF U 1
AF RR2D123JQ C 105
BS 1 569 RR2D123TF
BS 570 769 RR2D123JQ

RD RR2D123TF 569 0 0
TTTTTTTGCAAGAAAATCAGATTCCGACAAAGCTTGGCTTATCTTTATCTTTTCACATGG
GGTCTGAGGTCAATTCCTGAGCTCTTTTACTGTCTCTTGCCTGCTTATTGTGTACTCCAC
AGTTCTCCCTTATTTCCCAAGGGAGTTTGTTTAGGTATAGTCGTCGCACTTGTGGGGATG
CACTGCCTCTATACTTTGTGGGAGTTTATGAGCCTTGGGTTTTCCGTACATTCATGGTAT
GCCTCCCAATCGTTTTCGAGAATAAAAACAACTGGTAGTTGGCTATTGAGCATCCCTGAT
ATCATACTTAAGCTTCTTGGAGTTTCCAATACTGTCTTTGTAGTTAGTAAAAAGACTATT
TCCAAGACAAAGCTAGAGTCCGGGGATACACCAACTCAAAAAGAAGAAGATGGTCCAAAC
CCTGATTCAGATAAATTTGAATTCGATGGTTCACTTTATTTCTTGCCCGGCACATTCATT
CTATGGGTGAATTTAACCGCTATAGCCGGTTTTTCATTGGGGCTACAACGGTCGACGCAT
AGCTATGGAGGAAGTGGTTCGAGTTCGAT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2D123JQ 665 0 0
TTATTGTGTACTCCACAGTTCTCCCTTATTTCCCAAGGGAGTTTGTTTAGGTATAGTCGT
CGCACTTGTGGGGATGCACTGCCTCTATACTTTGTGGGAGTTTATGAGCCTTGGGTTTTC
CGTACATTCATGGTATGCCTCCCAATCGTTTTCGAGAATAAAAACAACTGGTAGTTGGCT
ATTGAGCATCCCTGATATCATACTTAAGCTTCTTGGAGTTTCCAATACTGTCTTTGTAGT
TAGTAAAAAGACTATTTCCAAGACAAAGCTAGAGTCCGGGGATACACCAACTCAAAAAGA
AGAAGATGGTCCAAACCCTGATTCAGATAAATTTGAATTCGATGGTTCACTTTATTTCTT
GCCCGGCACATTCATTCTATGGGTGAATTTAACCGCTATAGCCGGTTTTTCATTGGGGCT
ACAACGGTCGACGCATAGCTATGGAGGAAGTGGTTCGAGTTCGATAGAGGCTTGTGGATG
TATTTTGGTGGTTGTGTTGTTCCTTCCATTTCTAACTGGTTTGTTTGAGAAGGGAAAATA
TGGTATCCCATTGTCTACGCTTTTTAAAGCTGCCTTTTTAGCAGTTTTATTTGTTGTTTT
CTCTGTAAGAAACTAGTGTATTGATATGGATTTGCCAGGGGAAGTATTATAAGTTTATCA
TGACG

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL7027Contig1 794 2 2 U
GGATCCTCTAACAGTATCATCGTCACCTACTTGATTTAGCAAAAGGAGACTCTGAGGAGA
TGTCTTCATCGTACAACAACTCAATTTCATCATCTTCCACTCAGTCTTTTCTACTGGCCA
GCGCCGCCACCGGAGCAAACAACTTTAACCGTGAAGAGACGGCGATGACGATGATTCAAC
AACCCAACTCCGTTGCTCCACTACCACCACCCAAGAAACGAAGAAACCAACCCGGAAACC
CAAATCCAGATGCTGAAGTGATAGCGTTATCTCCAAAGACGATAATGGCGACGAACAGAT
TCCTATGTGAAGTGTGCAACAAAGGGTTTCAAAGAGAACAGAATCTACAGCTTCACCGAA
GAGGACACAACCTTCCATGGAAGCTGAAACAAAAGTCTAAACAAGAAGTGACCAGGAGGA
AGGTGTATCTGTGTCCAGAGCCCACGTGCGTTCACCATGACCCTTCACGTGCTCTCGGAC
ACCTCACCGGAATCAAGAAGCATTATTACCGGAAGCACGGTGAGAAAAAGTTTAAATGTG
AGAAATGCTCTAAGCGTTACGCTGTTCAATCTGATTGGAAAGCTCACTCTAAGACTTGTG
GTACCAAAGGGTATCGCTGTGACTGTGGTACCATCTTCTCTAGGTAAATTATATATCGTC
TTTCTTAGTTCCATTTTCAATGAACTTTTTTCTTCTTTTCTTTGATAATTTTCTTTCAGT
AATATCAAATGAGAATCGGTTATACATACTAAAGTGTGACAAGAACATATGATAATAAAC
AAAAACGTTTTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY82TF U 1
AF RR2DY82JQ C 106
BS 1 639 RR2DY82TF
BS 640 794 RR2DY82JQ

RD RR2DY82TF 639 0 0
GGATCCTCTAACAGTATCATCGTCACCTACTTGATTTAGCAAAAGGAGACTCTGAGGAGA
TGTCTTCATCGTACAACAACTCAATTTCATCATCTTCCACTCAGTCTTTTCTACTGGCCA
GCGCCGCCACCGGAGCAAACAACTTTAACCGTGAAGAGACGGCGATGACGATGATTCAAC
AACCCAACTCCGTTGCTCCACTACCACCACCCAAGAAACGAAGAAACCAACCCGGAAACC
CAAATCCAGATGCTGAAGTGATAGCGTTATCTCCAAAGACGATAATGGCGACGAACAGAT
TCCTATGTGAAGTGTGCAACAAAGGGTTTCAAAGAGAACAGAATCTACAGCTTCACCGAA
GAGGACACAACCTTCCATGGAAGCTGAAACAAAAGTCTAAACAAGAAGTGACCAGGAGGA
AGGTGTATCTGTGTCCAGAGCCCACGTGCGTTCACCATGACCCTTCACGTGCTCTCGGAC
ACCTCACCGGAATCAAGAAGCATTATTACCGGAAGCACGGTGAGAAAAAGTTTAAATGTG
AGAAATGCTCTAAGCGTTACGCTGTTCAATCTGATTGGAAAGCTCACTCTAAGACTTGTG
GTACCAAAGGGTATCGCTGTGACTGTGGTACCATCTTCT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2DY82JQ 689 0 0
CTTTTCTACTGGCCAGCGCCGCCACCGGAGCAAACAACTTTAACCGTGAAGAGACGGCGA
TGACGATGATTCAACAACCCAACTCCGTTGCTCCACTACCACCACCCAAGAAACGAAGAA
ACCAACCCGGAAACCCAAATCCAGATGCTGAAGTGATAGCGTTATCTCCAAAGACGATAA
TGGCGACGAACAGATTCCTATGTGAAGTGTGCAACAAAGGGTTTCAAAGAGAACAGAATC
TACAGCTTCACCGAAGAGGACACAACCTTCCATGGAAGCTGAAACAAAAGTCTAAACAAG
AAGTGACCAGGAGGAAGGTGTATCTGTGTCCAGAGCCCACGTGCGTTCACCATGACCCTT
CACGTGCTCTCGGACACCTCACCGGAATCAAGAAGCATTATTACCGGAAGCACGGTGAGA
AAAAGTTTAAATGTGAGAAATGCTCTAAGCGTTACGCTGTTCAATCTGATTGGAAAGCTC
ACTCTAAGACTTGTGGTACCAAAGGGTATCGCTGTGACTGTGGTACCATCTTCTCTAGGT
AAATTATATATCGTCTTTCTTAGTTCCATTTTCAATGAACTTTTTTCTTCTTTTCTTTGA
TAATTTTCTTTCAGTAATATCAAATGAGAATCGGTTATACATACTAAAGTGTGACAAGAA
CATATGATAATAAACAAAAACGTTTTGGG

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL7028Contig1 538 2 3 U
GGATCTTAATTTCTGACAATTTGTGTGGATAGATGTAGCTTTCATCTTTCTTTCTTTTTT
CCTTAAACTAGCTTTCATCTCTTGCAAATTGTTAAAAAAGATTCAGTTTACTTTTGTTAG
TTTAAGAGTTTCATTTTCTTTGAACAAATCGAGATTCTCCCTAATGTGAAGATTCTTTCT
ATAAACAAGTGCTCGAAGAATCTTTCAACTATCACTCCCTACATATTTCAGGAGAGACAT
CTACATTTCCATTCACAACAACATAAAGTGCGAAGAAGAAGAAAGAAGATATGGCCACTT
GTCCTCCATTCGACTTCTCGGCGAAATATTACAACGGTGGCGGAATCGTATGCGAGAGGC
AGAGCAGCTTCTTCGGAGATACGACGGTGCTCGACCAAGGCGTTGGGTACGCCGTTATTC
TCGGTTTTGGTGCTTTCTTTGTCGTCTTCACATCTGTTTTGGTTAGTCTTCGGTTTTTTT
TCTCCCAAAAGGGCCAAAACCAAAAATATTACTTTACAAAAAACCAAATATTATTATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BU11JQ C 1
AF RR2BU11TF U 1
BS 1 288 RR2BU11TF
BS 289 289 RR2BU11JQ
BS 290 538 RR2BU11TF

RD RR2BU11JQ 538 0 0
GGATCTTAATTTCTGACAATTTGTGTGGATAGATGTAGCTTTCATCTTTCTTTCTTTTTT
CCTTAAACTAGCTTTCATCTCTTGCAAATTGTTAAAAAAGATTCAGTTTACTTTTGTTAG
TTTAAGAGTTTCATTTTCTTTGAACAAATCGAGATTCTCCCTAATGTGAAGATTCTTTCT
ATAAACAAGTGCTCGAAGAATCTTTCAACTATCACTCCCTACATATTTCAGGAGAGACAT
CTACATTTCCATTCACAACAACATAAAGTGCGAAGAAGAAGAAAGAAGATATGGCCACTT
GTCCTCCATTCGACTTCTCGGCGAAATATTACAACGGTGGCGGAATCGTATGCGAGAGGC
AGAGCAGCTTCTTCGGAGATACGACGGTGCTCGACCAAGGCGTTGGGTACGCCGTTATTC
TCGGTTTTGGTGCTTTCTTTGTCGTCTTCACATCTGTTTTGGTTAGTCTTCGGTTTTTTT
TCTCCCAAAAGGGCCAAAACCAAAAATATTACTTTACAAAAAACCAAATATTATTATG

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2BU11TF 538 0 0
GGATCTTAATTTCTGACAATTTGTGTGGATAGATGTAGCTTTCATCTTTCTTTCTTTTTT
CCTTAAACTAGCTTTCATCTCTTGCAAATTGTTAAAAAAGATTCAGTTTACTTTTGTTAG
TTTAAGAGTTTCATTTTCTTTGAACAAATCGAGATTCTCCCTAATGTGAAGATTCTTTCT
ATAAACAAGTGCTCGAAGAATCTTTCAACTATCACTCCCTACATATTTCAGGAGAGACAT
CTACATTTCCATTCACAACAACATAAAGTGCGAAGAAGAAGAAAGAAGGTATGGCCACTT
GTCCTCCATTCGACTTCTCGGCGAAATATTACAACGGTGGCGGAATCGTATGCGAGAGGC
AGAGCAGCTTCTTCGGAGATACGACGGTGCTCGACCAAGGCGTTGGGTACGCCGTTATTC
TCGGTTTTGGTGCTTTCTTTGTCGTCTTCACATCTGTTTTGGTTAGTCTTCGGTTTTTTT
TCTCCCAAAAGGGCCAAAACCAAAAATATTACTTTACAAAAAACCAAATATTATTATG

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

CO CL7029Contig1 720 2 4 U
GCTGATGAGGAGAACCAGGACCAGAACCAGAAACAGAGAGATACACCAGGAGAGCCAGCT
AGTGTGTGGATTGGACCAATGACTAGATCAAGGCTGAAAGCACAAGAGAAGAGTCTCCAA
GACTTAGCCAAATTCGTGGGAGCAAGTTCTAAAGGGGAAGACCAAGACAAACCAGCTTGT
TGGTTCAATTTGATTTCAATGTAATTAAGTTGGTTTATTTGGTTTTCATTTATTTCAAAC
CAAGACAAATTAGGATTAGTTAAACCAGTTTTAATTAGGATTAGATGTCCTGTCGATTTG
GTTTAGTTCTCATAAACCAAATTGGTTAAGGATTAGGTTAGACATCGTTTTCTCTTTTAC
TTAAAGACCACGCAGCTTGTTCTTCTTCTTCAACTTTGAATCTAAGAATTTTACAGCAAC
CTGTTTGCCTTGTCTCAAGCTTTCTCTGTTCAGCTCAAGAACATTGATCACACTTAAAGG
AAGGAATTCCTAGTGAACCCCATCTTAGACAATACAAGGTAATCTTGTGTCTTTGAGTAG
CAAACCATCCTTGTCGCCAATCCATAGGCTCAGAGAGACGTCCATAGTTCAAAGGAGTGC
TAGTAGCCTCTTAGAACAACCCATATCCATCCACCTTCAAGTGATCCAGAGTTTAAGCCA
TACCCAGGCTGCACCAAGTGGTATCAGAGCCACTTGAAGGTTAGGGTTCTGGTTTGTCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BZ17TF U 1
AF RR2BZ17JQ C 34
BS 1 658 RR2BZ17TF
BS 659 659 RR2BZ17JQ
BS 660 695 RR2BZ17TF
BS 696 720 RR2BZ17JQ

RD RR2BZ17TF 695 0 0
GCTGATGAGGAGAACCAGGACCAGAACCAGAAACAGAGAGATACACCAGGAGAGCCAGCT
AGTGTGTGGATTGGACCAATGACTAGATCAAGGCTGAAAGCACAAGAGAAGAGTCTCCAA
GACTTAGCCAAATTCGTGGGAGCAAGTTCTAAAGGGGAAGACCAAGACAAACCAGCTTGT
TGGTTCAATTTGATTTCAATGTAATTAAGTTGGTTTATTTGGTTTTCATTTATTTCAAAC
CAAGACAAATTAGGATTAGTTAAACCAGTTTTAATTAGGATTAGATGTCCTGTCGATTTG
GTTTAGTTCTCATAAACCAAATTGGTTAAGGATTAGGTTAGACATCGTTTTCTCTTTTAC
TTAAAGACCACGCAGCTTGTTCTTCTTCTTCAACTTTGAATCTAAGAATTTTACAGCAAC
CTGTTTGCCTTGTCTCAAGCTTTCTCTGTTCAGCTCAAGAACATTGATCACACTTAAAGG
AAGGAATTCCTAGTGAACCCCATCTTAGACAATACAAGGTAATCTTGTGTCTTTGAGTAG
CAAACCATCCTTGTCGCCAATCCATAGGCTCAGAGAGACGTCCATAGTTCAAAGGAGTGC
TAGTAGCCTCTTAGAACAACCCATATCCATCCACCTTCAAGTGATCCAGAGTTTAAGC*A
TACCCAGGCTGCACCAAGTGGTATCAGAGCCACTT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2BZ17JQ 687 0 0
CAGAGAGATACACCAGGAGAGCCAGCTAGTGTGTGGATTGGACCAATGACTAGATCAAGG
CTGAAAGCACAAGAGAAGAGTCTCCAAGACTTAGCCAAATTCGTGGGAGCAAGTTCTAAA
GGGGAAGACCAAGACAAACCAGCTTGTTGGTTCAATTTGATTTCAATGTAATTAAGTTGG
TTTATTTGGTTTTCATTTATTTCAAACCAAGACAAATTAGGATTAGTTAAACCAGTTTTA
ATTAGGATTAGATGTCCTGTCGATTTGGTTTAGTTCTCATAAACCAAATTGGTTAAGGAT
TAGGTTAGACATCGTTTTTTCTTTTACTTAAAGACCACGCAGCTTGTTCTTTTTCTTCAA
CTTTGAATCTAAGAATTTTACAGCAACCTGTTTGCCTTGTCTCAAGCTTTCTCTGTTCAG
CTCAAGAACATTGATCACACTTAAAGGAAGGAATTCCTAGTGAACCCCATCTTAGACAAT
ACAAGGTAATCTTGTGTCTTTGAGTAGCAAACCATCCTTGTCGCCAATCCATAGGCTCAG
AGAGACGTCCATAGTTCAAAGGAGTGCTAGTAGCCTCTTAGAACAACCCATATCCATCCA
CCTTCAAGTGATCCAGAGTTTAAGCCATACCCAGGCTGCACCAAGTGGTATCAGAGCCAC
TTGAAGGTTAGGGTTCTGGTTTGTCTA

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL7030Contig1 830 2 4 U
GGGGTGAGGATTCTGATAAGGTGATTGATAAACCTCTAGTGGAAGCATGTTCTCAAGCCG
AACCTCATGATGATGATGATGTCAGTTTGGCCGCTGATAAGAGCGTTATTCAATCTGTAC
AAGTACCTTTGGTTCAAGATGATGGGAACGCTATTGTAGGCGACAAGTCTGTGGAAGTAC
GCTCCAAAACTCAAGACGATGTCAATACAGTGGTTGTCGATGAGAACTCTATAAAGGAAC
CTCCTGAAAGCCTTGCCCAAGAAGAAGATGTTACTACCGTGGTTGTTGTTGATAAGAAGG
CTATTGAAGCACCTTCTCGAACCCTATCCGTGGAAGATATCAACACTGTGGTTGTTGACA
AGAATCTCATTGAAGTGTCTTCTGGAGAGCATGTCCACGTGGTAGATGGATTAAAAGAAG
CTCATCCTGAAAACCTTCCGGAGAGAGATGCCCCTGATGCCCAACAGCCAGTAGGGCTTA
CCTCTGATTCTGCCGGTGAAAGCATGCCAATGGAGGAGGACCTAGATGGACGCATAAAGA
TACATGTAGCCTCCAAATCTAAGCAACAGAAAGAGGAGATTAGGAAGAAGCTTGAAGATC
AGCTTGACGTGGTCAGAGGTCTGGTAAAGAAGATAGAGGATAAAGAGGGCGAGATTGGTG
CATATAACGACTCTCGTCTTTTGGCTAACACTGGTATTACTAACGGAGGAGGAAGGATTC
TCTCAGGTTTTGCGTCAGCCGGTCTTCCTCGTGAGGTCATCAGAACACCAAGGCCTCAAC
TAAGTATATCCTTGTTGGAGAATACTCAGGGTTTCAATGAGCATTTGGAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ29TFB U 1
AF RR2AZ29JQ C 1
BS 1 726 RR2AZ29TFB
BS 727 727 RR2AZ29JQ
BS 728 737 RR2AZ29TFB
BS 738 830 RR2AZ29JQ

RD RR2AZ29TFB 737 0 0
GGGGTGAGGATTCTGATAAGGTGATTGATAAACCTCTAGTGGAAGCATGTTCTCAAGCCG
AACCTCATGATGATGATGATGTCAGTTTGGCCGCTGATAAGAGCGTTATTCAATCTGTAC
AAGTACCTTTGGTTCAAGATGATGGGAACGCTATTGTAGGCGACAAGTCTGTGGAAGTAC
GCTCCAAAACTCAAGACGATGTCAATACAGTGGTTGTCGATGAGAACTCTATAAAGGAAC
CTCCTGAAAGCCTTGCCCAAGAAGAAGATGTTACTACCGTGGTTGTTGTTGATAAGAAGG
CTATTGAAGCACCTTCTCGAACCCTATCCGTGGAAGATATCAACACTGTGGTTGTTGACA
AGAATCTCATTGAAGTGTCTTCTGGAGAGCATGTCCACGTGGTAGATGGATTAAAAGAAG
CTCATCCTGAAAACCTTCCGGAGAGAGATGCCCCTGATGCCCAACAGCCAGTAGGGCTTA
CCTCTGATTCTGCCGGTGAAAGCATGCCAATGGAGGAGGACCTAGATGGACGCATAAAGA
TACATGTAGCCTCCAAATCTAAGCAACAGAAAGAGGAGATTAGGAAGAAGCTTGAAGATC
AGCTTGACGTGGTCAGAGGTCTGGTAAAGAAGATAGAGGATAAAGAGGGCGAGATTGGTG
CATATAACGACTCTCGTCTTTTGGCTAACACTGGTATTACTAACGGAGGAGGAAGGATTC
TCTCAG*TTTTGCGTCA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RR2AZ29JQ 830 0 0
GGGGTGAGGATTCTGATAAGGTGATTGATAAACCTCTAGTGGAAGCATGTTCTCAAGCCG
AACCTCATGATGATGATGATGTCAGTTTGGCCGCTGATAAGAGCGTTATTCAATCTGTAC
AAGTACCTTTGGTTCAAGATGATGGGAACGCTATTGTAGGCGACAAGTCTGTGGAAGTAC
GCTCCAAAACTCAAGACGATGTCAATACAGTGGTTGTCGATGAGAACTCTATAAAGGAAC
CTCCTGAAAGCCTTGCCCAAGAAGAAGATGTTACTACCGTGGTTGTTGTTGATAAGAAGG
CTATTGAAGCACCTTCTCGAACCCTATCCGTGGAAGATATCAACACTGTGGTTGTTGACA
AGAATCTCATTGAAGTGTCTTCTGGAGAGCATGTCCACGTGGTAGATGGATTAAAAGAAG
CTCATCCTGAAAACCTTCCGGAGAGAGATGCCCCTGATGCCCAACAGCCAGTAGGGCTTA
CCTCTGATTCTGCCGGTGAAAGCATGCCAATGGAGGAGGACCTAGATGGACGCATAAAGA
TACATGTAGCCTCCAAATCTAAGCAACAGAAAGAGGAGATTAGGAAGAAGCTTGAAGATC
AGCTTGACGTGGTCAGAGGTCTGGTAAAGAAGATAGAGGATAAAGAGGGCGAGATTGGTG
CATATAACGACTCTCGTCTTTTGGCTAACACTGGTATTACTAACGGAGGAGGAAGGATTC
TCTCAGGTTTTGCGTCAGCCGGTCTTCCTCGTGAGGTCATCAGAACACCAAGGCCTCAAC
TAAGTATATCCTTGTTGGAGAATACTCAGGGTTTCAATGAGCATTTGGAG

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 2

CO CL7031Contig1 1095 2 2 U
GCTCTCTTGGTCCAACATGCTTCTGCAACAAAGATTCAATCAGCTTTCAGAGGTTACACG
GCAAGGAGGAGTTTCAGAGCTCTCAAAGGTCTATCCAGGCTTCAAGGAGTGGTGAAAGGA
TACAGCGCGAAGCGTCAGACAGTAAATGCAATGAAGTACATGCAGAAACTGGTCCGTGTT
CAATCCAAAATTCAGTCACACCGCACAAACATATCGGAAAACCAAACACAATTTGAGAAA
GACAAAGCAAAACGGTCTGCATCTGAAGCTGGTAATGATCACTGGGACGATAGTGTGCTG
ACAAAAGAAGAAAGGGATGCGAGATCACAGAGGAAAACTGATGCAATCATCAAGAGGGAA
AGATCCATGGCCTATGCATACTCCCACAAGGTAACACCCAAGTCTGCTCAGGACGTTGGA
ACTTCAGGTGGGCTCTCTCTATGGTGGAACTGGGGGGATCAACAGCTTCCTCTGCGCCAT
TATATGCTAACACCAACAAGACTAAGCCCAAGCCCTCTATTTCAGTCATCAAGCAACCAA
CACCGTTTCAAACTTGACAACAACAACTTCGACAGTTCCACACCAAAATCATCGAGGTCT
ACACTATCCAGACCCTTCCACACATCAAGATATTCAAGAGGAAGACTAAGAGATTCTCCT
TTCAAGGATGATGACAGCCTCACAAGCTGCCCTCCATTCCCGAGCTACATGGCTCCAACT
GTCTCTGCCAAGGCCAAAGTTAGACCAAACAGCAACCCAAAAGAGAGAGTGATGGGTACA
CCATCATCGGCCAGCAGCGAGAAGAGGAGAGTGTCGTATCCACAAGCGCAACAAGGTAAA
GATATGTTTAGATGGAACAAAGGATCATTGCTCATGAGCAACAAAGGTCCTGGTTCACCT
GTGAGTGTGGTTCTTGAAAAGCACAAGACAGTTAAATCAGTAGGGAATTTGAGCATTGAT
TCTACAGTTGGTAGGAAACCGTTTAACAAATATGTGTGATTTCTTTTTGATGAAACATGT
TCTTTTTTATGTTACCTTTGTTTTATTTGTGGGTGGTGTTGATTTTGAGTGCTACAGTCT
GTAACATAATGACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H442TF U 1
AF RR2H442JQB C 405
BS 1 639 RR2H442TF
BS 640 1095 RR2H442JQB

RD RR2H442TF 642 0 0
GCTCTCTTGGTCCAACATGCTTCTGCAACAAAGATTCAATCAGCTTTCAGAGGTTACACG
GCAAGGAGGAGTTTCAGAGCTCTCAAAGGTCTATCCAGGCTTCAAGGAGTGGTGAAAGGA
TACAGCGCGAAGCGTCAGACAGTAAATGCAATGAAGTACATGCAGAAACTGGTCCGTGTT
CAATCCAAAATTCAGTCACACCGCACAAACATATCGGAAAACCAAACACAATTTGAGAAA
GACAAAGCAAAACGGTCTGCATCTGAAGCTGGTAATGATCACTGGGACGATAGTGTGCTG
ACAAAAGAAGAAAGGGATGCGAGATCACAGAGGAAAACTGATGCAATCATCAAGAGGGAA
AGATCCATGGCCTATGCATACTCCCACAAGGTAACACCCAAGTCTGCTCAGGACGTTGGA
ACTTCAGGTGGGCTCTCTCTATGGTGGAACTGGGGGGATCAACAGCTTCCTCTGCGCCAT
TATATGCTAACACCAACAAGACTAAGCCCAAGCCCTCTATTTCAGTCATCAAGCAACCAA
CACCGTTTCAAACTTGACAACAACAACTTCGACAGTTCCACACCAAAATCATCGAGGTCT
ACACTATCCAGACCCTTCCACACATCAAGATATTCAAGA
CGA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RR2H442JQB 691 0 0
TGCTCAGGACGTTGGAACTTCAGGTGGGCTCTCTCTATGGTGGAACTGGGGGGATCAACA
GCTTCCTCTGCGCCATTATATGCTAACACCAACAAGACTAAGCCCAAGCCCTCTATTTCA
GTCATCAAGCAACCAACACCGTTTCAAACTTGACAACAACAACTTCGACAGTTCCACACC
AAAATCATCGAGGTCTACACTATCCAGACCCTTCCACACATCAAGATATTCAAGAGGAAG
ACTAAGAGATTCTCCTTTCAAGGATGATGACAGCCTCACAAGCTGCCCTCCATTCCCGAG
CTACATGGCTCCAACTGTCTCTGCCAAGGCCAAAGTTAGACCAAACAGCAACCCAAAAGA
GAGAGTGATGGGTACACCATCATCGGCCAGCAGCGAGAAGAGGAGAGTGTCGTATCCACA
AGCGCAACAAGGTAAAGATATGTTTAGATGGAACAAAGGATCATTGCTCATGAGCAACAA
AGGTCCTGGTTCACCTGTGAGTGTGGTTCTTGAAAAGCACAAGACAGTTAAATCAGTAGG
GAATTTGAGCATTGATTCTACAGTTGGTAGGAAACCGTTTAACAAATATGTGTGATTTCT
TTTTGATGAAACATGTTCTTTTTTATGTTACCTTTGTTTTATTTGTGGGTGGTGTTGATT
TTGAGTGCTACAGTCTGTAACATAATGACAG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL7032Contig1 757 2 1 U
GGACTCCCTCATCTTAAGGCATAACAATCTCTCCGGTCCAGCTCCTGAAAACATCGGCGA
GCTCAAAGGCCTAACTTTCTTGGACCTTTCCTATAACCAGTTTACCGGTCCTATTCCCGG
TTCGCTTTCTCAGATGCCGGTGCTTGAGACCATTAAAATCGACCACAATAAGCTGACCGG
TTCTATACCGAACTCATTCGGCTCCTTTGTAGGCAGAGTCCCCAATCTCTACTTGTCTAA
CAATAAGCTCTCAGGAAAAATACCGGAGTCGTTGTCAAAGAACGACTTTAACGGAGTATT
TCTGTCAAAAAACAGATTCACAGGAGACGGTTCGATGTTTTTCGGACTGAACAAAACAAC
AATATCAATGGATCTATCGAGGAATTTGTTTGAATCTGATCTCTCCAAGGTTAAGTTCGC
TAGAAGCATAGTTGATTTGGATCTGAGCCATAACCGAATCTTCGGGAACCTTCCTAGGGA
GCTGATCAAGCTACGTGATCTCAAGCTTTTCAACGTTAGTTACAATCGTCTCTGCGGGAA
AATCCCACGTGGTGGTCTCCTTCAGACTTCTAAATCATATGAGTTCGCTCACAACCGCTG
TCTCTGTGGAACTCCTCTCAAGGCTTGTTAAATGGTCTGAGAACAAATAATTATGTCTTT
ATCTGTATGATGATGATCAGGTGTTAATTTCAGTCAAATGAATTGTTGCTTTTAATAAGT
TAATGTTAAGAAATTGGTAATAAGAATGTTTGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A305TF U 1
AF RR2A305JQ C 16
BS 1 757 RR2A305TF

RD RR2A305TF 757 0 0
GGACTCCCTCATCTTAAGGCATAACAATCTCTCCGGTCCAGCTCCTGAAAACATCGGCGA
GCTCAAAGGCCTAACTTTCTTGGACCTTTCCTATAACCAGTTTACCGGTCCTATTCCCGG
TTCGCTTTCTCAGATGCCGGTGCTTGAGACCATTAAAATCGACCACAATAAGCTGACCGG
TTCTATACCGAACTCATTCGGCTCCTTTGTAGGCAGAGTCCCCAATCTCTACTTGTCTAA
CAATAAGCTCTCAGGAAAAATACCGGAGTCGTTGTCAAAGAACGACTTTAACGGAGTATT
TCTGTCAAAAAACAGATTCACAGGAGACGGTTCGATGTTTTTCGGACTGAACAAAACAAC
AATATCAATGGATCTATCGAGGAATTTGTTTGAATCTGATCTCTCCAAGGTTAAGTTCGC
TAGAAGCATAGTTGATTTGGATCTGAGCCATAACCGAATCTTCGGGAACCTTCCTAGGGA
GCTGATCAAGCTACGTGATCTCAAGCTTTTCAACGTTAGTTACAATCGTCTCTGCGGGAA
AATCCCACGTGGTGGTCTCCTTCAGACTTCTAAATCATATGAGTTCGCTCACAACCGCTG
TCTCTGTGGAACTCCTCTCAAGGCTTGTTAAATGGTCTGAGAACAAATAATTATGTCTTT
ATCTGTATGATGATGATCAGGTGTTAATTTCAGTCAAATGAATTGTTGCTTTTAATAAGT
TAATGTTAAGAAATTGGTAATAAGAATGTTTGTTTAC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2A305JQ 742 0 0
AAGGCATAACAATCTCTCCGGTCCAGCTCCTGAAAACATCGGCGAGCTCAAAGGCCTAAC
TTTCTTGGACCTTTCCTATAACCAGTTTACCGGTCCTATTCCCGGTTCGCTTTCTCAGAT
GCCGGTGCTTGAGACCATTAAAATCGACCACAATAAGCTGACCGGTTCTATACCGAACTC
ATTCGGCTCCTTTGTAGGCAGAGTCCCCAATCTCTACTTGTCTAACAATAAGCTCTCAGG
AAAAATACCGGAGTCGTTGTCAAAGAACGACTTTAACGGAGTATTTCTGTCAAAAAACAG
ATTCACAGGAGACGGTTCGATGTTTTTCGGACTGAACAAAACAACAATATCAATGGATCT
ATCGAGGAATTTGTTTGAATCTGATCTCTCCAAGGTTAAGTTCGCTAGAAGCATAGTTGA
TTTGGATTTGAGCCATAACCGAATCTTCGGGAACCTTCCTAGGGAGCTGATCAAGCTACG
TGATCTCAAGCTTTTCAACGTTAGTTACAATCGTCTCTGCGGGAAAATCCCACGTGGTGG
TCTCCTTCAGACTTCTAAATCATATGAGTTCGCTCACAACCGCTGTCTCTGTGGAACTCC
TCTCAAGGCTTGTTAAATGGTCTGAGAACAAATAATTATGTCTTTATCTGTATGATGATG
ATCAGGTGTTAATTTCAGTCAAATGAATTGTTGCTTTTAATAAGTTAATGTTAAGAAATT
GGTAATAAGAATGTTTGTTTAC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL7033Contig1 634 2 3 U
GGAAACCAGAAATAATCTCCTTTCAAAGAAAAGTGGAGTGAATTCCATCAAGCTTGTACC
ATTAAAAAGAATTTAAAGCGAGAGATGGTAAGAAAGAGTGTGATCCTAGGATTTTTACTT
ACTGTTTTAACGACAGTAATAAAAGCTGAGGATCCTTACTTATTTTTTACGTGGAAAGTA
ACGTATGGCACGATTTCACCCCTCGGAGTTCCTCAGAAAGCTATTATGATCAACGATAAA
TTTCCCGGCCCCAATCTTAACACAACTACCAACAATAACATCGTCATTAATGTCATCAAC
AATCTCGACGAGCCTTTCCTCTTCACTTGGAGCGGAATGCAACATAGGAAAAATTCTTGG
CAAGATGGAATGCCAGGAACAACATGTCCGATCCCGCCGGGTAAAAACTTTACATACCAT
TTCCAAGCTAAGGAGCCAGATCGGTAGTTACTTCTACTACCCAAGCTTAGGTCTTCAACG
TGCGGCCGGTGGATTCGGTGGCCTCCGAATCAACAGTAGACCGCTCATTCCTGTCCCATA
TGCTGATCCTGAGGATGACTACACCGTTCTTATAGGCGATTGGTACACTAAATCACATGT
AGCTCTCAAGGACAATCTTGATAGTGGCCGGTCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GO91TF U 1
AF RR2BM52TF U 1
BS 1 434 RR2BM52TF
BS 435 435 RR2GO91TF
BS 436 634 RR2BM52TF

RD RR2GO91TF 486 0 0
GGAAACCAGAAATAATCTCCTTTCAAAGAAAAGTGGAGTGAATTCCATCAAGCTTGTACC
ATTAAAAAGAATTTAAAGCGAGAGATGGTAAGAAAGAGTGTGATCCTAGGATTTTTACTT
ACTGTTTTAACGACAGTAATAAAAGCTGAGGATCCTTACTTATTTTTTACGTGGAAAGTA
ACGTATGGCACGATTTCACCCCTCGGAGTTCCTCAGAAAGCTATTATGATCAACGATAAA
TTTCCCGGCCCCAATCTTAACACAACTACCAACAATAACATCGTCATTAATGTCATCAAC
AATCTCGACGAGCCTTTCCTCTTCACTTGGAGCGGAATGCAACATAGGAAAAATTCTTGG
CAAGATGGAATGCCAGGAACAACATGTCCGATCCCGCCGGGTAAAAACTTTACATACCAT
TTCCAAGCTAAGGGGCCAGATCGGTAGTTACTTCTACTACCCAAGCTTAGGTCTTCAACG
TGCGGC

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR2BM52TF 634 0 0
GGAAACCAGAAATAATCTCCTTTCAAAGAAAAGTGGAGTGAATTCCATCAAGCTTGTACC
ATTAAAAAGAATTTAAAGCGAGAGATGGTAAGAAAGAGTGTGATCCTAGGATTTTTACTT
ACTGTTTTAACGACAGTAATAAAAGCTGAGGATCCTTACTTATTTTTTACGTGGAAAGTA
ACGTATGGCACGATTTCACCCCTCGGAGTTCCTCAGAAAGCTATTATGATCAACGATAAA
TTTCCCGGCCCCAATCTTAACACAACTACCAACAATAACATCGTCATTAATGTCATCAAC
AATCTCGACGAGCCTTTCCTCTTCACTTGGAGCGGAATGCAACATAGGAAAAATTCTTGG
CAAGATGGAATGCCAGGAACAACATGTCCGATCCCGCCGGGTAAAAACTTTACATACCAT
TTCCAAGCTAAGGA*CCAGATCGGTAGTTACTTCTACTACCCAAGCTTAGGTCTTCAACG
TGCGGCCGGTGGATTCGGTGGCCTCCGAATCAACAGTAGACCGCTCATTCCTGTCCCATA
TGCTGATCCTGAGGATGACTACACCGTTCTTATAGGCGATTGGTACACTAAATCACATGT
AGCTCTCAAGGACAATCTTGATAGTGGCCGGTCA

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL7034Contig1 647 2 1 U
GGGCTTTACAAAGAAGCAGTAGTCCCAGAGGCTCCGAAGCAAAAGACTTCAAAGAGGTCA
AAGTCAGATGAACAAGAGAGTCTCTCTGGTCCAGCAAAGAATCAGCATCAGACTGCTGTA
GACCAAAAGAATGACAAACGTGGCACTGAACCACCAGTATCTGATCTGCTTAAGCAAAAG
ACTTCAAAGAGCCGTCTGAAGGAGACACAGAAAGTGAAACACAGCGACATCCCTGTGAGG
GAGATTCAAGATGCAAAACTCGGCTTCGTCTCTGACAAATCTATGAGCGATATTCTAAAA
GTTCTTGTGAACCCAAGCCAACAAGCGTCAGGCAAAGAGGAGAAGAGCAATTCGTTACCA
TCATCGGAGAAGACAAAGAAACCGAGAAAACTCTCAAGTCTCTTCAGGTGAAGCTGTACC
CCATACAAATATTTGAGGACTTAAAGCCAAGTCGGAGACCTTCTCCAGAAGGTATACATA
CAGTGGCAGTCTCGCTCCGCAATTTTAACATGTGTACCATGTAAGCTTGAACCAATTCGT
CTTTCATCTTGTTTTTGATCTTGAGGCCGTTACATGATGTTGCATAATTTGTAAGGAACT
AAATCATACGGTAATATAGAAGAAGAGATGATGATAAATCGAATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FP37TF U 1
AF RR2FP37JQ C 89
BS 1 647 RR2FP37TF

RD RR2FP37TF 647 0 0
GGGCTTTACAAAGAAGCAGTAGTCCCAGAGGCTCCGAAGCAAAAGACTTCAAAGAGGTCA
AAGTCAGATGAACAAGAGAGTCTCTCTGGTCCAGCAAAGAATCAGCATCAGACTGCTGTA
GACCAAAAGAATGACAAACGTGGCACTGAACCACCAGTATCTGATCTGCTTAAGCAAAAG
ACTTCAAAGAGCCGTCTGAAGGAGACACAGAAAGTGAAACACAGCGACATCCCTGTGAGG
GAGATTCAAGATGCAAAACTCGGCTTCGTCTCTGACAAATCTATGAGCGATATTCTAAAA
GTTCTTGTGAACCCAAGCCAACAAGCGTCAGGCAAAGAGGAGAAGAGCAATTCGTTACCA
TCATCGGAGAAGACAAAGAAACCGAGAAAACTCTCAAGTCTCTTCAGGTGAAGCTGTACC
CCATACAAATATTTGAGGACTTAAAGCCAAGTCGGAGACCTTCTCCAGAAGGTATACATA
CAGTGGCAGTCTCGCTCCGCAATTTTAACATGTGTACCATGTAAGCTTGAACCAATTCGT
CTTTCATCTTGTTTTTGATCTTGAGGCCGTTACATGATGTTGCATAATTTGTAAGGAACT
AAATCATACGGTAATATAGAAGAAGAGATGATGATAAATCGAATTCG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2FP37JQ 559 0 0
GTCCAGCAAAGAATCAGCATCAGACTGCTGTAGACCAAAAGAATGACAAACGTGGCACTG
AACCACCAGTATTTGATTTGCTTAAGCAAAAGACTTCAAAGAGCCGTTTGAAGGAGACAC
AGAAAGTGAAACACAGCGACATCCCTGTGAGGGAGATTCAAGATGCAAAACTCGGCTTCG
TTTTTGACAAATCTATGAGCGATATTTTAAAAGTTCTTGTGAACCCAAGCCAACAAGCGT
CAGGCAAAGAGGAGAAGAGCAATTCGTTACCATCATCGGAGAAGACAAAGAAACCGAGAA
AACTCTCAAGTCTCTTCAGGTGAAGCTGTACCCCATACAAATATTTGAGGACTTAAAGCC
AAGTCGGAGACCTTCTCCAGAAGGTATACATACAGTGGCAGTCTCGCTCCGCAATTTTAA
CATGTGTACCATGTAAGCTTGAACCAATTCGTCTTTCATCTTGTTTTTGATCTTGAGGCC
GTTACATGATGTTGCATAATTTGTAAGGAACTAAATCATACGGTAATATAGAAGAAGAGA
TGATGATAAATCGAATTCG

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL7035Contig1 898 2 2 U
GATAAGGGACAGGAACATTCAGATGTTGATGGATTCATGCTTAGAGGGTCAGTTTTCAAG
CAGTGACGGAACTGAACTAATACGGTTAGCGTCTAGATGCTTGCAGGATGAGCCTCGTGA
ACGGCCTAACCCAAAATCTCTAGTCACTGCAATGATCCCTCTTCAAAAGGATCTTGAGGC
TCCTTCACATCAGCTGATGGGAATACCAAGCAGTGCCTCAACAACTCCTCTTTCACCGCT
TGGAGAGGCGTGTCTAAGAACTGATCTAACTGCCATACATTAGATTGTTGAGAAACTTGG
ATATAAAGATGACGAGGGAGCAGCCACAGAGCTTTCGTTCCAGATGTGGACCAACCAGAT
GCAGGACTCGCTCAACTTCAAGAAAAAGGGTGATGTTGCTTTCAGGCATAAAGACTTTGC
AAACGCTGCCGAATGTTATTCTCAGTTTATAGAGGGCGGGACAATGGTTTCACCAACTGT
GTATGCAAGGAGAAGTCTGTGTTACCTAATGAACGATATGCCACAAGAGGCACTGAACGA
TGCAATGCAAGCCCAAGTGATATCTCCTGCTTGGCACATCGCGTCTTATCTTCAAGCTGT
TGCTCTCTCGGCTCTAGGACAAGAGAACGAAGCTCACGCTGCTCTTAAGGACGGATCAAT
GCTCGAGAGCAAAAGAAACGCCCTATGATGATGATAACAAGAAAGCACAAAGATTGTTTA
TCTATCTTTCTTACATTAACCGAAACACACCGCATAGGGTTTGCAGAATCAGATCAAAAC
CCACTATCATCCTCATAAGTAGATAAGCTACCAAACAGTTATCATCACCATCATCCCCAT
CGCTCTAGTTGTTCCCTTTACCTTGTTCTTTCTTTCTTTCCAAGTACTTGAAGCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP75TF U 1
AF RR2DP75JQ C 186
BS 1 483 RR2DP75TF
BS 484 898 RR2DP75JQ

RD RR2DP75TF 483 0 0
GATAAGGGACAGGAACATTCAGATGTTGATGGATTCATGCTTAGAGGGTCAGTTTTCAAG
CAGTGACGGAACTGAACTAATACGGTTAGCGTCTAGATGCTTGCAGGATGAGCCTCGTGA
ACGGCCTAACCCAAAATCTCTAGTCACTGCAATGATCCCTCTTCAAAAGGATCTTGAGGC
TCCTTCACATCAGCTGATGGGAATACCAAGCAGTGCCTCAACAACTCCTCTTTCACCGCT
TGGAGAGGCGTGTCTAAGAACTGATCTAACTGCCATACATTAGATTGTTGAGAAACTTGG
ATATAAAGATGACGAGGGAGCAGCCACAGAGCTTTCGTTCCAGATGTGGACCAACCAGAT
GCAGGACTCGCTCAACTTCAAGAAAAAGGGTGATGTTGCTTTCAGGCATAAAGACTTTGC
AAACGCTGCCGAATGTTATTCTCAGTTTATAGAGGGCGGGACAATGGTTTCACCAACTGT
GTA

QA 1 483 1 483
DS 

RD RR2DP75JQ 713 0 0
CACATCAGCTGATGGGAATACCAAGCAGTGCCTCAACAACTCCTCTTTCACCGCTTGGAG
AGGCGTGTCTAAGAACTGATCTAACTGCCATACATTAGATTGTTGAGAAACTTGGATATA
AAGATGACGAGGGAGCAGCCACAGAGCTTTCGTTCCAGATGTGGACCAACCAGATGCAGG
ACTCGCTCAACTTCAAGAAAAAGGGTGATGTTGCTTTCAGGCATAAAGACTTTGCAAACG
CTGCCGAATGTTATTCTCAGTTTATAGAGGGCGGGACAATGGTTTCACCAACTGTGTATG
CAAGGAGAAGTCTGTGTTACCTAATGAACGATATGCCACAAGAGGCACTGAACGATGCAA
TGCAAGCCCAAGTGATATCTCCTGCTTGGCACATCGCGTCTTATCTTCAAGCTGTTGCTC
TCTCGGCTCTAGGACAAGAGAACGAAGCTCACGCTGCTCTTAAGGACGGATCAATGCTCG
AGAGCAAAAGAAACGCCCTATGATGATGATAACAAGAAAGCACAAAGATTGTTTATCTAT
CTTTCTTACATTAACCGAAACACACCGCATAGGGTTTGCAGAATCAGATCAAAACCCACT
ATCATCCTCATAAGTAGATAAGCTACCAAACAGTTATCATCACCATCATCCCCATCGCTC
TAGTTGTTCCCTTTACCTTGTTCTTTCTTTCTTTCCAAGTACTTGAAGCATCC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL7036Contig1 948 2 2 U
GGAAACCCAAACTGTACACACAAGAGGGAGACTGGAGCTTAACGTCGTGCTGCTTCATCT
GAAAGGCTAGGAGCAAATCTGAACCCTATCGAAAGAAGCCCCGAGAAGTTCTCTTATCAT
GATGTCATTCACCCTATTCAGCCGTTCCAAGAACCTTAATCAGTTCGCGTCTAGTAAGCT
GACAGTGGTAGCAACATATGAACATGTAGTCAGTCATTCACACCCCCAAAATGGATCTGA
AAGAAACTTTTGTTTATATTCTTTCAGTCGACTTAGAAAATATAATTTCAATACCTCTGA
GGTCTTTTGTTAATGATTCATAAAGTTGTGGACTAAATAAAAATAATGTATCTCTCGCTT
CGGTCATCAACTCTTTCGAATATAAAGTTATAAACACATTTAACGCGGCGGCGGAGATTA
CATACGCTGTGCCCTAGTTTCCGCCGGAGAAGGAACAAAGTTTTTCAAACTTCGGAGGGA
TGTCGTACGACGATGTGGAGATAGAGGATATGGAGTGGAACGAAGAGATGAAGGCGTACA
CGTACCCTTGCCCCTGTGGCGATCTGTTCCAGATCACCAAGGAGGATCTACGTCTCGGCG
AAGAGATCGCCAATTGCCCAAGCTGCTCCCTCTATATCACAGTCATCTACAACATGGAGG
ATTTTCAGAACGATACCAAGAAGAATAATAACCAGCCTAAAAGTAGCCAACCCGTCGCCG
TCGCTTGAGGTAAAAATCTTCCAATCTGAATTTTTTTTTTAGATTTAGCGATTTTGAAAT
TGTGTGTTAAAGTAGGAAACTTTGATTCGAATAGTTGAGTTGTTTGATTTGATTGTTATC
TGTTTTTTATGCTTGAGCTTGTTTGTATTGGTACTAATATTTTTCTGCAATTAAGAGGTG
TAAATGAGTAGACTTGTTGTTGAAGTTATAGCAATTTCAGAACTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ79TF U 1
AF RR2CQ79JQ C 262
BS 1 655 RR2CQ79TF
BS 656 948 RR2CQ79JQ

RD RR2CQ79TF 655 0 0
GGAAACCCAAACTGTACACACAAGAGGGAGACTGGAGCTTAACGTCGTGCTGCTTCATCT
GAAAGGCTAGGAGCAAATCTGAACCCTATCGAAAGAAGCCCCGAGAAGTTCTCTTATCAT
GATGTCATTCACCCTATTCAGCCGTTCCAAGAACCTTAATCAGTTCGCGTCTAGTAAGCT
GACAGTGGTAGCAACATATGAACATGTAGTCAGTCATTCACACCCCCAAAATGGATCTGA
AAGAAACTTTTGTTTATATTCTTTCAGTCGACTTAGAAAATATAATTTCAATACCTCTGA
GGTCTTTTGTTAATGATTCATAAAGTTGTGGACTAAATAAAAATAATGTATCTCTCGCTT
CGGTCATCAACTCTTTCGAATATAAAGTTATAAACACATTTAACGCGGCGGCGGAGATTA
CATACGCTGTGCCCTAGTTTCCGCCGGAGAAGGAACAAAGTTTTTCAAACTTCGGAGGGA
TGTCGTACGACGATGTGGAGATAGAGGATATGGAGTGGAACGAAGAGATGAAGGCGTACA
CGTACCCTTGCCCCTGTGGCGATCTGTTCCAGATCACCAAGGAGGATCTACGTCTCGGCG
AAGAGATCGCCAATTGCCCAAGCTGCTCCCTCTATATCACAGTCATCTACAACAT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2CQ79JQ 687 0 0
TTTCAGTCGACTTAGAAAATATAATTTCAATACCTCTGAGGTCTTTTGTTAATGATTCAT
AAAGTTGTGGACTAAATAAAAATAATGTATCTCTCGCTTCGGTCATCAACTCTTTCGAAT
ATAAAGTTATAAACACATTTAACGCGGCGGCGGAGATTACATACGCTGTGCCCTAGTTTC
CGCCGGAGAAGGAACAAAGTTTTTCAAACTTCGGAGGGATGTCGTACGACGATGTGGAGA
TAGAGGATATGGAGTGGAACGAAGAGATGAAGGCGTACACGTACCCTTGCCCCTGTGGCG
ATCTGTTCCAGATCACCAAGGAGGATTTACGTCTCGGCGAAGAGATCGCCAATTGCCCAA
GCTGCTCCCTCTATATCACAGTCATTTACAACATGGAGGATTTTCAGAACGATACCAAGA
AGAATAATAACCAGCCTAAAAGTAGCCAACCCGTCGCCGTCGCTTGAGGTAAAAATCTTC
CAATCTGAATTTTTTTTTTAGATTTAGCGATTTTGAAATTGTGTGTTAAAGTAGGAAACT
TTGATTCGAATAGTTGAGTTGTTTGATTTGATTGTTATCTGTTTTTTATGCTTGAGCTTG
TTTGTATTGGTACTAATATTTTTCTGCAATTAAGAGGTGTAAATGAGTAGACTTGTTGTT
GAAGTTATAGCAATTTCAGAACTTCTT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL7037Contig1 665 2 3 U
TTTTTTGGGATGTGAAGTTTTTTTGTTTACGTAAAACCATAGTTTTATTACAACTTGAAA
AACAGTTCCGTAAGCAACAACCTGACGAACTCTAACATTATTACATAAGCATGTAGACAA
CTCATAAGGACCGGATCCAAAGTCCATAGAATCATCAACCTCACAAAGGAGTAGAACTGG
CCTAACCGCGGATGAGAGTGACACCAAAGGAGATGGTACAGAACATGAGACCAAACAATC
CCATGAAACTGTATTTCCCGATGGTGAGGCGCTTCGTGGGATCTCCAGTAGAGTAACCTT
TGAAGTAGAAGAATCGAGAAATATTGTAGACCAAACCCAAGCCAGTACAGATGCAAGGGT
GTTTCATCCCACCAAGTATCATTAGTATAAAGTACATTGGCATCATCTCTAGAGCGTTTT
GGTGTCCTCTCTGAACACAGTTGAAGAGCTTAACATCTTTGTTTTCTGATTCTATAGCAT
ATAATGTTGGAAACTGCACATTGTACCTTTTGCGAGCTTTGCCGACTTGAAAGCCCATCC
AAAAGTTGATGAAGCAGTAGAAGACGAGGACAAGAACGACATATCCGTACTCTTTAGGCA
GAAACTCGGTGATTGTCATTCATTTGCTTTGAAGAAGGTTTTGAATGTGAGCTTCTGAGA
TTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2BX78JQ U 19
AF RR2BX78TF C 1
BS 1 25 RR2BX78TF
BS 26 562 RR2BX78JQ
BS 563 665 RR2BX78TF

RD RR2BX78JQ 544 0 0
TTTTTGT
TTTACGTAAAACCATAGTTTTATTACAACTTGAAAAACAGTTCCGTAAGCAACAACCTGA
CGAACTCTAACATTATTACATAAGCATGTAGACAACTCATAAGGACCGGATCCAAAGTCC
ATAGAATCATCAACCTCACAAAGGAGTAGAACTGGCCTAACCGCGGATGAGAGTGACACC
AAAGGAGATGGTACAGAACATGAGACCAAACAATCCCATGAAACTGTATTTCCCGATGGT
GAGGCGCTTCGTGGGATCTCCAGTAGAGTAACCTTTGAAGTAGAAGAATCGAGAAATATT
GTAGACCAAACCCAAGCCAGTACAGATGCAAGGGTGTTTCATCCCACCAAGTATCATTAG
TATAAAGTACATTGGCATCATCTCTAGAGCGTTTTGGTGTCCTCTCTGAACACAGTTGAA
GAGCTTAACATCTTTGTTTTCTGATTCTATAGCATATAATGTTGGAAACTGCACATTGTA
CCTTTTGCGAGCTTTGCCGACTTGAAAGCCCATCCAAAAGTTGATGAAGCAGTAGAA

QA 8 544 8 544
DS 

RD RR2BX78TF 665 0 0
TTTTTTGGGATGTGAAGTTTTTTTGTTTACGTAAAACCATAGTTTTATTACAACTTGAAA
AACAGTTCCGTAAGCAACAACCTGACGAACTCTAACATTATTACATAAGCATGTAGACAA
CTCATAAGGACCGGATCCAAAGTCCATAGAATCATCAACCTCACAAAGGAGTAGAACTGG
CCTAACCGCGGATGAGAGTGACACCAAAGGAGATGGTACAGAACATGAGACCAAACAATC
CCATGAAACTGTATTTCCCGATGGTGAGGCGCTTCGTGGGATCTCCAGTAGAGTAACCTT
TGAAGTAGAAGAATCGAGAAATATTGTAGACCAAACCCAAGCCAGTACAGATGCAAGGGT
GTTTCATCCCACCAAGTATCATTAGTATAAAGTACATTGGCATCATCTCTAGAGCGTTTT
GGTGTCCTCTCTGAACACAGTTGAAGAGCTTAGCATCTTTGTTTTCTGATTCTATAGCAT
ATAATGTTGGAAACTGCACATTGTACCTTTTGCGAGCTTTGCCGACTTGAAAGCCCATCC
AAAAGTTGATGAAGCAGTAGAAGACGAGGACAAGAACGACATATCCGTACTCTTTAGGCA
GAAACTCGGTGATTGTCATTCATTTGCTTTGAAGAAGGTTTTGAATGTGAGCTTCTGAGA
TTTCC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL7038Contig1 552 2 2 U
GGACCACTCAAAACAAAAACACTCAAAAGTTCATAACTGTTTATAAGTAATTAAAATGAA
GTCGACCGTCGTGATTTTTCTCATGTACCTTCTCCTTGTTGTGCCTTGCTTGGTCGCTAT
AGGATCGGAAAATACGGATTCGGAGGTGTACGAGATCGATTACAGGGGGCCAGAGACACA
TAACTCTAGACCTTCGCCGGAAACCTCGCACCGCAAGCCACCTTTCATCCACCATAAAAC
CTCCACCGCTGGATCCGCCAGTGCTCATGTTGGAGGGCAGAACTAGAGAGTGACTTTTTC
TTTAAGGAGAGTGACTTTTTCTTAAGGAGAAAGGAGGGTCTCAGAAGCTTCAGTTTCAAG
AGGAAGTATATGATGAGTAAGTGATAAGATTAATGATGCGGTACACCATTATTTATATAT
TAATACATTAATACATATTTTATCATATGATCAACGAGACATATAATGTCCAGTATTTTC
TTTCCTTTTTTCCATGTACCGACGTACCGTTACGTTTTTATATTTTTCGGTCTGAATCTC
TTGGAAGAATGA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV02TF U 1
AF RR2C136TF U 5
BS 1 544 RR2AV02TF
BS 545 552 RR2C136TF

RD RR2AV02TF 544 0 0
GGACCACTCAAAACAAAAACACTCAAAAGTTCATAACTGTTTATAAGTAATTAAAATGAA
GTCGACCGTCGTGATTTTTCTCATGTACCTTCTCCTTGTTGTGCCTTGCTTGGTCGCTAT
AGGATCGGAAAATACGGATTCGGAGGTGTACGAGATCGATTACAGGGGGCCAGAGACACA
TAACTCTAGACCTTCGCCGGAAACCTCGCACCGCAAGCCACCTTTCATCCACCATAAAAC
CTCCACCGCTGGATCCGCCAGTGCTCATGTTGGAGGGCAGAACTAGAGAGTGACTTTTTC
TTTAAGGAGAGTGACTTTTTCTTAAGGAGAAAGGAGGGTCTCAGAAGCTTCAGTTTCAAG
AGGAAGTATATGATGAGTAAGTGATAAGATTAATGATGCGGTACACCATTATTTATATAT
TAATACATTAATACATATTTTATCATATGATCAACGAGACATATAATGTCCAGTATTTTC
TTTCCTTTTTTCCATGTACCGACGTACCGTTACGTTTTTATATTTTTCGGTCTGAATCTC
TTGG

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2C136TF 548 0 0
G
ACTCAAAACAAAAACACTCAAAAGTTCATAACTGTTTATAAGTAATTAAAATGAAGTCGA
CCGTCGTGATTTTTCTCATGTACCTTCTCCTTGTTGTGCCTTGCTTGGTCGCTATAGGAT
CGGAAAATACGGATTCGGAGGTGTACGAGATCGATTACAGGGGGCCAGAGACACATAACT
CTAGACCTTCGCCGGAAACCTCGCACCGCAAGCCACCTTTCATCCACCATAAAACCTCCA
CCGCTGGATCCGCCAGTGCTCATGTTGGAGGGCAGAACTAGAGAGTGACTTTTTCTTTAA
GGAGAGTGACTTTTTCTTAAGGAGAAAGGAGGGTCTCAGAAGCTTCAGTTTCAAGAGGAA
GTATATGATGAGTATGTGATAAGATTAATGATGCGGTACACCATTATTTATATATTAATA
CATTAATACATATTTTATCATATGATCAACGAGACATATAATGTCCAGTATTTTCTTTCC
TTTTTTCCATGTACCGACGTACCGTTACGTTTTTATATTTTTCGGTCTGAATCTCTTGGA
AGAATGA

QA 2 548 2 548
DS 



AS 1 2

CO CL7039Contig1 816 2 2 U
GGATGGTCACAGCATTCGATTTTGAAGGCTTAAGCTTTTTGTAACTCTGTCGCAGAGGAG
AAATCGCCATGTGGCCTTCTTCTGGAAACTCTTCGCAGCCTCAAGCTAAGAAACAGGAGG
GGAAATCGATATCTGGGAGTTTTAAGGTGGAGAATCTGATACCAGGGGTTGTGATAGGTT
TCATCATTGGTATGTTGTTGGATTTTTCACAGCAAGTCAAGTTACCTGTGAAAAAGAGCA
GACTCTTGTCAAGTAAGACCCAGAACCAGACTTCTCTGACAAGCAGTGGCACTGAGAAAG
AGCTTAAAATGGTTTTAGTAGTTAGGCAAGACTTAAAGATGAGAACAGGCAAAATTGCTT
CACAGTGTGCACATGCTGCCACTGGCATGTATGCAGAGTTAATGAATAGCGACCGGTACC
GTCTGAGGCAATGGGAGGAATGCGGGCAACCAAAGATAGTCGTCACTTGTAAAAACCAGC
AAGAAATGAATAAGATTGCAGAAGCGGCTGAGTGCGTTGGCCTCCCGACTTTTGTTGTGG
CTGATGCGGGAAGAACAGAGGTTGCAGCTGGATCAAGAACGGTTCTTGCAGTTGGACCAG
GACCAAAACAGTTGGTTGATTCCATAACCGGTAAGCTGGCGTTACTCTGAATCTCTGATG
CCGGAGCTTTTTCCTGGATAATGTTGGTCCAGGCAAGTTAATTGTTGTTCTGTAATGACT
AAACTTAAGGTATCTTATTGGTTAATTTTTGATATAGTTTTGTAAATCATTCGAATGAGT
TATGATATTATCAAGTTTTTTTTTACCGTGGTAACC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B371TF U 1
AF RR2B371JQ C 2
BS 1 725 RR2B371TF
BS 726 816 RR2B371JQ

RD RR2B371TF 725 0 0
GGATGGTCACAGCATTCGATTTTGAAGGCTTAAGCTTTTTGTAACTCTGTCGCAGAGGAG
AAATCGCCATGTGGCCTTCTTCTGGAAACTCTTCGCAGCCTCAAGCTAAGAAACAGGAGG
GGAAATCGATATCTGGGAGTTTTAAGGTGGAGAATCTGATACCAGGGGTTGTGATAGGTT
TCATCATTGGTATGTTGTTGGATTTTTCACAGCAAGTCAAGTTACCTGTGAAAAAGAGCA
GACTCTTGTCAAGTAAGACCCAGAACCAGACTTCTCTGACAAGCAGTGGCACTGAGAAAG
AGCTTAAAATGGTTTTAGTAGTTAGGCAAGACTTAAAGATGAGAACAGGCAAAATTGCTT
CACAGTGTGCACATGCTGCCACTGGCATGTATGCAGAGTTAATGAATAGCGACCGGTACC
GTCTGAGGCAATGGGAGGAATGCGGGCAACCAAAGATAGTCGTCACTTGTAAAAACCAGC
AAGAAATGAATAAGATTGCAGAAGCGGCTGAGTGCGTTGGCCTCCCGACTTTTGTTGTGG
CTGATGCGGGAAGAACAGAGGTTGCAGCTGGATCAAGAACGGTTCTTGCAGTTGGACCAG
GACCAAAACAGTTGGTTGATTCCATAACCGGTAAGCTGGCGTTACTCTGAATCTCTGATG
CCGGAGCTTTTTCCTGGATAATGTTGGTCCAGGCAAGTTAATTGTTGTTCTGTAATGACT
AAACT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2B371JQ 815 0 0
GATGGTCACAGCATTCGATTTTGAAGGCTTAAGCTTTTTGTAACTCTGTCGCAGAGGAGA
AATCGCCATGTGGCCTTCTTCTGGAAACTCTTCGCAGCCTCAAGCTAAGAAACAGGAGGG
GAAATCGATATCTGGGAGTTTTAAGGTGGAGAATCTGATACCAGGGGTTGTGATAGGTTT
CATCATTGGTATGTTGTTGGATTTTTCACAGCAAGTCAAGTTACCTGTGAAAAAGAGCAG
ACTCTTGTCAAGTAAGACCCAGAACCAGACTTTTCTGACAAGCAGTGGCACTGAGAAAGA
GCTTAAAATGGTTTTAGTAGTTAGGCAAGACTTAAAGATGAGAACAGGCAAAATTGCTTC
ACAGTGTGCACATGCTGCCACTGGCATGTATGCAGAGTTAATGAATAGCGACCGGTACCG
TCTGAGGCAATGGGAGGAATGCGGGCAACCAAAGATAGTCGTCACTTGTAAAAACCAGCA
AGAAATGAATAAGATTGCAGAAGCGGCTGAGTGCGTTGGCCTCCCGACTTTTGTTGTGGC
TGATGCGGGAAGAACAGAGGTTGCAGCTGGATCAAGAACGGTTCTTGCAGTTGGACCAGG
ACCAAAACAGTTGGTTGATTCCATAACCGGTAAGCTGGCGTTACTCTGAATCTCTGATGC
CGGAGCTTTTTCCTGGATAATGTTGGTCCAGGCAAGTTAATTGTTGTTCTGTAATGACTA
AACTTAAGGTATCTTATTGGTTAATTTTTGATATAGTTTTGTAAATCATTCGAATGAGTT
ATGATATTATCAAGTTTTTTTTTACCGTGGTAACC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL7040Contig1 1222 2 2 U
AGGAGGGTTTCTGGATTCCGATTGAAAAACCGTTCCTTTTTCTCGATTCCAGCGGATTGA
GTGTGCAATCCATCCTCACCCTGAAAAGGTAGCAGAGAAACGAGGTGGAGGATGACGGAT
TCGAGCGCGACGATGCCGTTGGAGATGGCACAAATCTTCGCGACGGCTACGACAAATTGG
TGGGACGAGGTGAATGAGTCAACTCAGTGGCAAGATGGGATCTTCTTCTCTCTATGTGGA
GCTTATGCTCTTGTCTCAGCCATCGCTCTCGTCCAATTGGTGAGGATCCAGATGAGAGTG
CCTGAGTATGGCTGGACCACTCAGAAGGTGTTTCATCTTATGAACTTTGTCGTCAATGGA
GTTCGTGCGGTTCTATTTGGATTTCACCATCAAGTCTTTCTCGTGCATCCCAAGGCTCTT
TGCTGGATATTATTGGATCTTCCGGGCCTCCTCTTTTTCTCGGCATACACCCTGCTTGTT
CTCTTCTGGGCTGAGATATATCACCAGGCAAGAAGTTTACCAACTGATAAACTGCGGATA
ACATATATTGCAGTCAACGTGGCTGTATATTTGGCTCAGGTTGTTATTTGGGTATGCATC
TGGGTGAATGATAACAGCACTGTGGAACTAGTTGGGAAGATATTTATGGCAGTTGTGTCT
TTCATCGCTGCTTTACGCTTCTTGCTTTACGGAGGAAGATTGTTTATTATGTTAAGAAGG
TTCCCTATTGAATCAAAAGGAAGAAGGAAGAAGCTCCATGAGGTTGGATCTGTGACAGCG
ATATGTTTCACCTGCTTCCTCATAAGATGCATTGTGGTGGGTGTATCAGCTTTTGACAGA
GATCTAACGCTGGATGTTCTTGATCATCCAGTTTTGAACTTAATTTACTATATGGTGGTA
GAAGTACTTCCATCGGCACTAGTGCTTTTCATCCTCCGGAAGCTACCTCCAAAGAGAGTA
TCAGCTCAGTACCATCCTATCCAGTAGACTTTTTTTTAGCTGAAGCCATCACACGGCGAC
TCTGATGATGTTGCAAGAGAGACGGTAAAGATTCAGTAAAGAAAATATGGTCAGGACAAG
AATTTTTAAGAGTTGCTGGCGGATGTTTGATTGTCATGTTATGTCTGGTTGAAAATAATA
ACCAATTGTTTTACCTTTTTTTTTTTTTCTGTTTCGCAAATGACACACTGTTCTAACCAT
CTTAAACCGAGCATTGGGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A223TF U 1
AF RR2A223JQ C 602
BS 1 689 RR2A223TF
BS 690 1222 RR2A223JQ

RD RR2A223TF 689 0 0
AGGAGGGTTTCTGGATTCCGATTGAAAAACCGTTCCTTTTTCTCGATTCCAGCGGATTGA
GTGTGCAATCCATCCTCACCCTGAAAAGGTAGCAGAGAAACGAGGTGGAGGATGACGGAT
TCGAGCGCGACGATGCCGTTGGAGATGGCACAAATCTTCGCGACGGCTACGACAAATTGG
TGGGACGAGGTGAATGAGTCAACTCAGTGGCAAGATGGGATCTTCTTCTCTCTATGTGGA
GCTTATGCTCTTGTCTCAGCCATCGCTCTCGTCCAATTGGTGAGGATCCAGATGAGAGTG
CCTGAGTATGGCTGGACCACTCAGAAGGTGTTTCATCTTATGAACTTTGTCGTCAATGGA
GTTCGTGCGGTTCTATTTGGATTTCACCATCAAGTCTTTCTCGTGCATCCCAAGGCTCTT
TGCTGGATATTATTGGATCTTCCGGGCCTCCTCTTTTTCTCGGCATACACCCTGCTTGTT
CTCTTCTGGGCTGAGATATATCACCAGGCAAGAAGTTTACCAACTGATAAACTGCGGATA
ACATATATTGCAGTCAACGTGGCTGTATATTTGGCTCAGGTTGTTATTTGGGTATGCATC
TGGGTGAATGATAACAGCACTGTGGAACTAGTTGGGAAGATATTTATGGCAGTTGTGTCT
TTCATCGCTGCTTTACGCTTCTTGCTTTA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2A223JQ 621 0 0
GGGTGAATGATAACAGCACTGTGGAACTAGTTGGGAAGATATTTATGGCAGTTGTGTCTT
TCATCGCTGCTTTAGGCTTCTTGCTTTACGGAGGAAGATTGTTTATTATGTTAAGAAGGT
TCCCTATTGAATCAAAAGGAAGAAGGAAGAAGCTCCATGAGGTTGGATCTGTGACAGCGA
TATGTTTCACCTGCTTCCTCATAAGATGCATTGTGGTGGGTGTATCAGCTTTTGACAGAG
ATCTAACGCTGGATGTTCTTGATCATCCAGTTTTGAACTTAATTTACTATATGGTGGTAG
AAGTACTTCCATCGGCACTAGTGCTTTTCATCCTCCGGAAGCTACCTCCAAAGAGAGTAT
CAGCTCAGTACCATCCTATCCAGTAGACTTTTTTTTAGCTGAAGCCATCACACGGCGACT
CTGATGATGTTGCAAGAGAGACGGTAAAGATTCAGTAAAGAAAATATGGTCAGGACAAGA
ATTTTTAAGAGTTGCTGGCGGATGTTTGATTGTCATGTTATGTCTGGTTGAAAATAATAA
CCAATTGTTTTACCTTTTTTTTTTTTTCTGTTTCGCAAATGACACACTGTTCTAACCATC
TTAAACCGAGCATTGGGTACC

QA 1 621 1 621
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7042Contig1 655 2 2 U
GGATATCCAAAAAAATGCTCTCTCGTCTCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCGGGTTGTTA
GTGCTGTCATTGTAACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCTCAG
TCGTGGGATTAATCGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTACCAG
CAACTATTAGCCACCAATCTCTCGGCCGGTGCCTTATTTGGAGTGACGGCGGGTGCTCTC
ATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCCACCTCCAGCA
GGAGTTCCACCCACCGAAGCAGTTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAAACCAAATGAT
AAACCAGCTGGAGGAGCAACAAGTAAGCCAAATGATAAACCAGCTGGAGGAGCAACCGAT
AAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGCTGGA
CCAGCAGATAAGCCAGGAGGCAAATCCCTAGAATATGTGTTATATTTTTTTTTTGTAATT
GAGTCTTGTGGCTCAGCGCAAAATAGGAATTCGATTTTTGCCAATATATTGCATATTCAT
ATTTGAATATACCACGTTCCTAATAACGTTTTAAATGATTTCGTTTGGTGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA12TF U 1
AF RR2DA12JQ C 118
BS 1 552 RR2DA12TF
BS 553 655 RR2DA12JQ

RD RR2DA12TF 552 0 0
GGATATCCAAAAAAATGCTCTCTCGTCTCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCGGGTTGTTA
GTGCTGTCATTGTAACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCTCAG
TCGTGGGATTAATCGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTACCAG
CAACTATTAGCCACCAATCTCTCGGCCGGTGCCTTATTTGGAGTGACGGCGGGTGCTCTC
ATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCCACCTCCAGCA
GGAGTTCCACCCACCGAAGCAGTTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAAACCAAATGAT
AAACCAGCTGGAGGAGCAACAAGTAAGCCAAATGATAAACCAGCTGGAGGAGCAACCGAT
AAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGCTGGA
CCAGCAGATAAGCCAGGAGGCAAATCCCTAGAATATGTGTTATATTTTTTTTTTGTAATT
GAGTCTTGTGGC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2DA12JQ 538 0 0
CAGTCGTGGGATTAATCGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTAC
CAGCAACTATTAGCCACCAATCTTTCGGCCGGTGCCTTATTTGGAGTGACGGCGGGTGCT
CTCATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCCACCTCCA
GCAGGAGTTCCACCCACCGAAGCAGTTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAAACCAAAT
GATAAACCAGCTGGAGGAGCAACAAGTAAGCCAAATGATAAACCAGCTGGAGGAGCAACC
GATAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGCT
GGACCAGCAGATAAGCCAGGAGGCAAATCCCTAGAATATGTGTTATATTTTTTTTTTGTA
ATTGAGTCTTGTGGCTCAGCGCAAAATAGGAATTCGATTTTTGCCAATATATTGCATATT
CATATTTGAATATACCACGTTCCTAATAACGTTTTAAATGATTTCGTTTGGTGATTCC

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

CO CL7043Contig1 688 2 1 U
GGAACTCCCATCAATGGTGGCGGTCTTCAATTCTTCATGATCTAAAGAAGAAGAAGACAG
AGAGGTCTGATTCTACTCACGTCTCCCACACTCTCATCGCGCTTCTTCTCCGGTTTGGTT
TGGTTTGTTGTAGCAATGATGGACCTAACGAAGATGAAGCCACCGCAGATCACTTTTTAC
TGCTCGGCGTTTTCTGTATTGATCACACTTCATCTGACGATTCAGCTCGTGTCTCAGCAT
CTCTTTCACTGGAAGAATCCCAAGGAACAGAAGGCTATACTCGTCATTGTTCTCATGGCT
CCTATCTACGCCGTTGTTTCCTTTGTTGGTTTGTTAGATGTCAAAGGAAGTGAAACCTTC
TTCTTGTTTCTTGAGTCCATCAAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCATTGCTAAGTTCTTG
GCGTTGATGTATAGTTACTTGAACATATCTATCAGCAAAAACATTGTTCCTGATGGAATC
AAAGGAAGGGAGATTCACCATTCTTTCCCTATGACTCTCTTCCAGCCTCATGTAGTCCGT
CTGGATCATCGCACTCTGAGGCTCTTGAAGTACTGGACATGGCAGTTTGTGGTGATCAGA
CCAGTGTGCTCTATAAAATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGT
GTCTTGTATCTGTTTGCTTTATGAATAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BT09JQ C 1
AF RR2BT09TF U 1
BS 1 688 RR2BT09TF

RD RR2BT09JQ 688 0 0
GGAACTCCCATCAATGGTGGCGGTCTTCAATTCTTCATGATCTAAAGAAGAAGAAGACAG
AGAGGTCTGATTCTACTCACGTCTCCCACACTCTCATCGCGCTTCTTCTCCGGTTTGGTT
TGGTTTGTTGTAGCAATGATGGACCTAACGAAGATGAAGCCACCGCAGATCACTTTTTAC
TGCTCGGCGTTTTCTGTATTGATCACACTTCATCTGACGATTCAGCTCGTGTCTCAGCAT
CTCTTTCACTGGAAGAATCCCAAGGAACAGAAGGCTATACTCGTCATTGTTCTCATGGCT
CCTATCTACGCCGTTGTTTCCTTTGTTGGTTTGTTAGATGTCAAAGGAAGTGAAACCTTC
TTCTTGTTTCTTGAGTCCATCAAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCATTGCTAAGTTCTTG
GCGTTGATGTATAGTTACTTGAACATATCTATCAGCAAAAACATTGTTCCTGATGGAATC
AAAGGAAGGGAGATTCACCATTCTTTCCCTATGACTCTCTTCCAGCCTCATGTAGTCCGT
CTGGATCATCGCACTCTGAGGCTCTTGAAGTACTGGACATGGCAGTTTGTGGTGATCAGA
CCAGTGTGCTCTATAAAATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGT
GTCTTGTATCTGTTTGCTTTATGAATAA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2BT09TF 688 0 0
GGAACTCCCATCAATGGTGGCGGTCTTCAATTCTTCATGATCTAAAGAAGAAGAAGACAG
AGAGGTCTGATTCTACTCACGTCTCCCACACTCTCATCGCGCTTCTTCTCCGGTTTGGTT
TGGTTTGTTGTAGCAATGATGGACCTAACGAAGATGAAGCCACCGCAGATCACTTTTTAC
TGCTCGGCGTTTTCTGTATTGATCACACTTCATCTGACGATTCAGCTCGTGTCTCAGCAT
CTCTTTCACTGGAAGAATCCCAAGGAACAGAAGGCTATACTCGTCATTGTTCTCATGGCT
CCTATCTACGCCGTTGTTTCCTTTGTTGGTTTGTTAGATGTCAAAGGAAGTGAAACCTTC
TTCTTGTTTCTTGAGTCCATCAAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCATTGCTAAGTTCTTG
GCGTTGATGTATAGTTACTTGAACATATCTATCAGCAAAAACATTGTTCCTGATGGAATC
AAAGGAAGGGAGATTCACCATTCTTTCCCTATGACTCTCTTCCAGCCTCATGTAGTCCGT
CTGGATCATCGCACTCTGAGGCTCTTGAAGTACTGGACATGGCAGTTTGTGGTGATCAGA
CCAGTGTGCTCTATAAAATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGT
GTCTTGTATCTGTTTGCTTTATGAATAA

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL7044Contig1 888 2 4 U
CTAATTCGACTTGGGTTTCAAATTTCATTTGCCACAGAATCATAATGATAGTTAAAACTT
AAAAGTACAAAATAAAAGGAACAAAATGTCACTAAAGTACAGCAAATACAGATCTAAGCT
AGAATGGATGATGGATTTCTTACAGTAAAACACTTGTAAACATACAAATCATTCGCTTTC
CTCTTCACCATCATCCTCGTTGTTTGATTCTTCTTCGCTTTGGCTTCCTCCCTCGGCTTC
TTCATTACCTTCCTCTTCCTCTTCTTCGTTATCCTCTCCATTCTCAAACTCTTCTTCATC
ACTCTCACTTTCACTTGTTATTTTCGGCTTTGGAGGAGGTGCAAAGCTTGTGGTAAATCT
TCTTCTTGAACTCGATACAATGTTGCTTGTATCAATACCCTCGAGCTCCTTTGATATTTC
TTTCTGTTTCTTAACTTCTTTGATATCTTTCTCTGAAGGATCTGAAAACAGCCCTTCTTT
GGCAAGTATCTGCTCAAGTTCTTCTATTAAAGTAGCCTCACGTTTGTCTTCAGGAGCCTG
CTTGACTTTCCTGTATATGACAGGGGGAATACTCATCCCACAAGATTTGATGACTGATCT
GAGATGCTCCACACGCTTTCCATACACAGTTGTTGCAGTCACCTTTCCCTGCTTCAACTT
CTTTTCTGCCTTCATTTCACTATCTTCTGCATCACTATCGCTCTCGGAATCTGCTTCGGT
ATGTTTTGCTTTCTTTTTCCCAGCCACTGGTTTGCCACTTTCAGTTTTTCGTTTTCTTTT
CTGGGTCAGAGTCTTCTTCACAGCCACTTCCTCAGCATCTGAATCAGATCATCTTCACTG
TCTACCTTCTTAGATGGCGTGCTCTTGACCTTTTTCTTTACACTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B708JQ U 1
AF RR2GL03JQ U 7
BS 1 415 RR2B708JQ
BS 416 416 RR2GL03JQ
BS 417 822 RR2B708JQ
BS 823 888 RR2GL03JQ

RD RR2B708JQ 822 0 0
CTAATTCGACTTGGGTTTCAAATTTCATTTGCCACAGAATCATAATGATAGTTAAAACTT
AAAAGTACAAAATAAAAGGAACAAAATGTCACTAAAGTACAGCAAATACAGATCTAAGCT
AGAATGGATGATGGATTTCTTACAGTAAAACACTTGTAAACATACAAATCATTCGCTTTC
CTCTTCACCATCATCCTCGTTGTTTGATTCTTCTTCGCTTTGGCTTCCTCCCTCGGCTTC
TTCATTACCTTCCTCTTCCTCTTCTTCGTTATCCTCTCCATTCTCAAACTCTTCTTCATC
ACTCTCACTTTCACTTGTTATTTTCGGCTTTGGAGGAGGTGCAAAGCTTGTGGTAAATCT
TCTTCTTGAACTCGATACAATGTTGCTTGTATCAATACCCTCGAGCTCCTTTGATCTTTC
TTTCTGTTTCTTAACTTCTTTGATATCTTTCTCTGAAGGATCTGAAAACAGCCCTTCTTT
GGCAAGTATCTGCTCAAGTTCTTCTATTAAAGTAGCCTCACGTTTGTCTTCAGGAGCCTG
CTTGACTTTCCTGTATATGACAGGGGGAATACTCATCCCACAAGATTTGATGACTGATCT
GAGATGCTCCACACGCTTTCCATACACAGTTGTTGCAGTCACCTTTCCCTGCTTCAACTT
CTTTTCTGCCTTCATTTCACTATCTTCTGCATCACTATCGCTCTCGGAATCTGCTTCGGT
ATGTTTTGCTTTCTTTTTCCCAGCCACTGGTTTGCCACTTTCAGTTTTTCGTTTTCTTTT
CTGGGTCAGAGTCTTCTTCACAGCCACTTCCTCAGCATCTGA

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR2GL03JQ 882 0 0
CA
ACTTGGGTTTCAAATTTCATTTGCCACAGAATCATAATGATAGTTAAAACTTAAAAGTAC
AAAATAAAAGGAACAAAATGTCACTAAAGTACAGCAGATACAGATCTAAGCTAGAATGGA
TGATGGATTTCTTACAGTAGAACACTTGTAAACATACAAATCATTCGCTTTCCTCTTCAC
CATCATCCTCGTTGTTTGATTCTTCTTCGCTTTGGCTTCCTCCCTCGGCTTCTTCATTAC
CTTCCTCTTCCTCTTCTTCGTTATCCTCTCCATTCTCAGACTCTTCTTCATCACTCTCAC
TTTCACTTGTTATTTTCGGCTTTGGAGGAGGTGCAAAGCTTGTGGTAGATCTTCTTCTTG
AACTCGATACAATGTTGCTTGTATCAATACCCTCGAGCTCCTTTGATATTTCTTTCTGTT
TCTTAACTTCTTTGATATCTTTCTCTGAAGGATCTGAAGACAGCCCTTCTTTGGCAAGTA
TCTGCTCAAGTTCTTCTATTAAAGTAGCCTCACGTTTGTCTTCAGGAGCCTGCTTGACTT
TCCTGTATATGACAGGGGGAATACTCATCCCACAAGATTTGATGACTGATCTGAGATGCT
CCACACGCTTTCCATACACAGTTGTTGCAGTCACCTTTCCCTGCTTCAACTTCTTTTCTG
CCTTCATTTCACTATCTTCTGCATCACTATCGCTCTCGGAATCTGCTTCGGTATGTTTTG
CTTTCTTTTTCCCAGCCACTGGTTTGCCACTTTCAGTTTTTCGTTTTCTTTTCTGGGTCA
GAGTCTTCTTCACAGCCACTTCCTCAGCATCTGAATCAGATCATCTTCACTGTCTACCTT
CTTAGATGGCGTGCTCTTGACCTTTTTCTTTACACTTTTC

QA 3 882 3 882
DS 



AS 1 2

CO CL7045Contig1 609 2 2 U
AGGGTTTGACGGCCAACGATTCCGGTGGCTCTCACAGCACCGGAGTCGAGTTTTTACTTG
CTTTGTTTTCTGTTCTTTTCCCTCTTCGTTAGTCTAGATGGTCTTAAATCCGAACAGAAG
CTTCATGTTTTCGGATTGAAGTGAAGAGGTTCAGATCTGGAAGCTATGGACATAGATCTC
GACAGATCTATTGCCTGTGGTGGTTGGCTAACGGTTACCGGCTGTATGGAGAAGATTCGT
GTTGAGTAAGGCTCGGGAGCCTTGTCGTAGAGTGGAGGCGCGTTGAAGGCGTGTGATGAG
TCCTTTCAAGGTCCAATTGCGAGTTTAAATTGGAGTTGGAGGAGATTAGTGGAGTACATG
CGCATAGGAAGTGGAGGCGCATCTACAGCAGCAACGGTTCTCTATTAGCTAACAGTCCGA
TCTGTTTCTTTTATGTTTGGGTCTGAGTCGTGTGTTTTAGCTTTTGTGTTGTTCTTTCCT
GTTTTTTTTTTTTTTAACTTGGCTCCGGGTAGTATTGTTTACTACGCTGGCTTTTTGCTT
CGGAAGACTTGTTGTCTTGCCGGTTTGATGTATCCTATGTTTAAAATTGAATATAATCTA
TCAGATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CF50JQ C 1
AF RR2CF50TF U 179
BS 1 178 RR2CF50JQ
BS 179 609 RR2CF50TF

RD RR2CF50JQ 609 0 0
AGGGTTTGACGGCCAACGATTCCGGTGGCTCTCACAGCACCGGAGTCGAGTTTTTACTTG
CTTTGTTTTCTGTTCTTTTCCCTCTTCGTTAGTCTAGATGGTCTTAAATCCGAACAGAAG
CTTCATGTTTTCGGATTGAAGTGAAGAGGTTCAGATCTGGAAGCTATGGACATAGATCTC
GACAGATCTATTGCCTGTGGTGGTTGGCTAACGGTTACCGGCTGTATGGAGAAGATTCGT
GTTGAGTAAGGCTCGGGAGCCTTGTCGTAGAGTGGAGGCGCGTTGAAGGCGTGTGATGAG
TCCTTTCAAGGTCCAATTGCGAGTTTAAATTGGAGTTGGAGGAGATTAGTGGAGTACATG
CGCATAGGAAGTGGAGGCGCATCTACAGCAGCAACGGTTCTCTATTAGCTAACAGTCCGA
TCTGTTTCTTTTATGTTTGGGTCTGAGTCGTGTGTTTTAGCTTTTGTGTTGTTCTTTCCT
GTTTTTTTTTTTTTTAACTTGGCTCCGGGTAGTATTGTTTACTACGCTGGCTTTTTGCTT
CGGAAGACTTGTTGTCTTGCCGGTTTGATGTATCCTATGTTTAAAATTGAATATAATCTA
TCAGATGAC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2CF50TF 431 0 0
TCGACAGATCTATTGCCTGTGGTGGTTGGCTAACGGTTACCGGCTGTATGGAGAAGATTC
GTGTTGAGTAAGGCTCGGGAGCCTTGTCGTAGAGTGGAGGCGCGTTGAAGGCGTGTGATG
AGTCCTTTCAAGGTCCAATTGCGAGTTTAAATTGGAGTTGGAGGAGATTAGTGGAGTACA
TGCGCATAGGAAGTGGAGGCGCATCTACAGCAGCAACGGTTCTCTATTAGCTAACAGTCC
GATCTGTTTCTTTTATGTTTGGGTCTGAGTCGTGTGTTTTAGCTTTTGTGTTGTTCTTTC
CTGTTTTTTTTTTTTTTAACTTGGCTCCGGGTAGTATTGTTTACTACGCTGGCTTTTTGC
TTCGGAAGACTTGTTGTCTTGCCGGTTTGATGTATCCTATGTTTAAAATTGAATATAATC
TATCAGATGAC

QA 1 431 1 431
DS 



AS 1 2

CO CL7046Contig1 434 2 2 U
GTTCTACAAAGCTGTATCGTTTTATTCATCTATATACAATACGAAGGAAGTTTGTTACAA
GCAGAATAGATCAATAGTCTATCAGAACAAGCTAGCTACCTGGATGAGAAACTCTTCTCT
CCAGTTGTTGAGATTTTCAATGACTTCATGGAGTTGACATCGTATACAAGAACACAGCAA
TCGGCATCACGGTAGAAAGCTATACCAAGGCTCTGAAACCTTTCTTGTCCAGCTGTATCC
CAGATCTGCAAAGTGAAAAGTCGGTCTTCAAACTGAACTTCCTTAGTCAAGAAGTCAGCA
CCAATGGTGGCCTTGTACTGGTTGCTGAACTTTTTATTAACATATTGATTCATCAAAGAC
GTTTTCCCCACCCCGCTATCGCCGAGGATTATGACTTTGAGGAGGGTACGTCTCCGTGAA
GGCATCGAATTGGC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CA10TF C 1
AF RR2CA10JQ U 4
BS 1 3 RR2CA10TF
BS 4 434 RR2CA10JQ

RD RR2CA10TF 434 0 0
GTTCTACAAAGCTGTATCGTTTTATTCATCTATATACAATACGAAGGAAGTTTGTTACAA
GCAGAATAGATCAATAGTCTATCAGAACAAGCTAGCTACCTGGATGAGAAACTCTTCTCT
CCAGTTGTTGAGATTTTCAATGACTTCATGGAGTTGACATCGTATACAAGAACACAGCAA
TCGGCATCACGGTAGAAAGCTATACCAAGGCTCTGAAACCTTTCTTGTCCAGCTGTATCC
CAGATCTGCAAAGTGAAAAGTCGGTCTTCAAACTGAACTTCCTTAGTCAAGAAGTCAGCA
CCAATGGTGGCCTTGTACTGGTTGCTGAACTTTTTATTAACATATTGATTCATCAAAGAC
GTTTTCCCCACCCCGCTATCGCCGAGGATTATGACTTTGAGGAGGGTACGTCTCCGTGAA
GGCATCGAATTGGC

QA 1 434 1 434
DS 

RD RR2CA10JQ 431 0 0
CTACAAAGCTGTATCGTTTTATTCATCTATATACAATACGAAGGAAGTTTGTTACAAGCA
GAATAGATCAATAGTCTATCAGAACAAGCTAGCTACCTGGATGAGAAACTCTTCTCTCCA
GTTGTTGAGATTTTCAATGACTTCATGGAGTTGACATCGTATACAAGAACACAGCAATCG
GCATCACGGTAGAAAGCTATACCAAGGCTCTGAAACCTTTCTTGTCCAGCTGTATCCCAG
ATCTGCAAAGTGAAAAGTCGGTCTTCAAACTGAACTTCCTTAGTCAAGAAGTCAGCACCA
ATGGTGGCCTTGTACTGGTTGCTGAACTTTTTATTAACATATTGATTCATCAAAGACGTT
TTCCCCACCCCGCTATCGCCGAGGATTATGACTTTGAGGAGGGTACGTCTCCGTGAAGGC
ATCGAATTGGC

QA 1 431 1 431
DS 



AS 1 2

CO CL7047Contig1 1110 2 4 U
GGGGATATTCGAAAGGGAAACCTTGAGAATATTCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCTTATCA
AACACATCACTTAATATCTCTAACCGCATCCTCCTGCCTTCTTCATTTTCATCTTCCCAG
AAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGACAAATGAAGTTTGGTAAGAGTCTGAGCAATCAGATCG
AGCAGACACTCCCTGAATGGCGCGACAAGTTCTTGTCTTACAAAGACCTCAAGAAGCGTC
TCAAACTCATCGCCTCCAAATCCATCGATCGTCCCGCCAAACGTCTCCGACTAGACTCCT
CCTCCGGCGGAGAAATGTCGAAAGAAGAGATGAGTTTCGTCCAGTTGCTAGAGGACGAGT
TGGAGAAATTCAATAATTTCTTCGTCGAGAAGGAGGAAGAGTACATCATCAGACTAAAGG
AATTGAGAGATAGGATTATCAAAGCAAAGGAGAAGATGATGAGCATCAGGAGAGAGATTG
TTGATCTCCACGGAGAGATGGTTCTCCTCGAGAACTACAGTGCTCTCAACTACACAGGAT
TGGTTAAGATACTGAAGAAGTACGACAAGCGTACCGGCGATCTCATGCGTTTGCCTTACA
TCCAGAAAGTTCTTCGGCAACCTTTTTACACTACAGACTTGTTGTACAAGCTCATCAAAG
AATCCGAGGCAATGCTTGACCGCTACTTCCCCGATGGAACAGAGTCTTCTTCTTCTTCTT
CTTCTGCCAACAACGCCCAAGCAGAGCACAAGTTGGTGGAGAGCCTCCACATGAAAAGTA
CAATCGCTGCCTTGCGTGTTTTGCAAGAGATCAGGAGTAAAAGCTCTACGGTGAGTGTCT
TCTCGCTCCCGCCGCTCCAGTTAGATGGAGTGGATGACACGTGGAAGAAGATTCCCTTGA
TGGAGCAAGAAGCCAAATAGAAAGACAGAGAGTGAGAGGGATGCGTTTATTCTCCACTTG
TGTGTTTTTACAGTAGATGCTAACAGATTGTTAAAAAAAAAGGTACATTATCAATGTGCA
CACACACAGAAAAGAAAGGTATCTTTGAAGTCATTAGCGGTTGTAACTGTGTTTCTGTGT
AGTAATTGATATGATGGTACACCAATTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CN91TF U 1
AF RR2CN91JQ C 310
BS 1 729 RR2CN91TF
BS 730 730 RR2CN91JQ
BS 731 750 RR2CN91TF
BS 751 1110 RR2CN91JQ

RD RR2CN91TF 762 0 0
GGGGATATTCGAAAGGGAAACCTTGAGAATATTCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCTTATCA
AACACATCACTTAATATCTCTAACCGCATCCTCCTGCCTTCTTCATTTTCATCTTCCCAG
AAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGACAAATGAAGTTTGGTAAGAGTCTGAGCAATCAGATCG
AGCAGACACTCCCTGAATGGCGCGACAAGTTCTTGTCTTACAAAGACCTCAAGAAGCGTC
TCAAACTCATCGCCTCCAAATCCATCGATCGTCCCGCCAAACGTCTCCGACTAGACTCCT
CCTCCGGCGGAGAAATGTCGAAAGAAGAGATGAGTTTCGTCCAGTTGCTAGAGGACGAGT
TGGAGAAATTCAATAATTTCTTCGTCGAGAAGGAGGAAGAGTACATCATCAGACTAAAGG
AATTGAGAGATAGGATTATCAAAGCAAAGGAGAAGATGATGAGCATCAGGAGAGAGATTG
TTGATCTCCACGGAGAGATGGTTCTCCTCGAGAACTACAGTGCTCTCAACTACACAGGAT
TGGTTAAGATACTGAAGAAGTACGACAAGCGTACCGGCGATCTCATGCGTTTGCCTTACA
TCCAGAAAGTTCTTCGGCAACCTTTTTACACTACAGACTTGTTGTACAAGCTCATCAAAG
AATCCGAGGCAATGCTTGACCGCTACTTCCCCGATGGAACAGAGTCTTCTTCTTCTTCTT
CTTCTGCCA*CAACGCCCAAGCAGAGCACA
GTGGTGAGAGCT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2CN91JQ 801 0 0
GAGAAATGTCGAAAGAAGAGATGAGTT*CGTCCAGTTGCTAGAGGACGAGTTGGAGAAAT
TCAATAATTTCTTCGTCGAGAAGGAGGAAGAGTACATCATCAGACTAAAGGAATTGAGAG
ATAGGATTATCAAAGCAAAGGAGAAGATGATGAGCATCAGGAGAGAGATTGTTGATCTCC
ACGGAGAGATGGTTCTCCTCGAGAACTACAGTGCTCTCAACTACACAGGATTGGTTAAGA
TACTGAAGAAGTACGACAAGCGTACCGGCGATCTCATGCGTTTGCCTTACATCCAGAAAG
TTCTTCGGCAACCTTTTTACACTACAGACTTGTTGTACAAGCTCATCAAAGAATCCGAGG
CAATGCTTGACCGCTACTTCCCCGATGGAACAGAGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGCCA
ACAACGCCCAAGCAGAGCACAAGTTGGTGGAGAGCCTCCACATGAAAAGTACAATCGCTG
CCTTGCGTGTTTTGCAAGAGATCAGGAGTAAAAGCTCTACGGTGAGTGTCTTCTCGCTCC
CGCCGCTCCAGTTAGATGGAGTGGATGACACGTGGAAGAAGATTCCCTTGATGGAGCAAG
AAGCCAAATAGAAAGACAGAGAGTGAGAGGGATGCGTTTATTCTCCACTTGTGTGTTTTT
ACAGTAGATGCTAACAGATTGTTAAAAAAAAAGGTACATTATCAATGTGCACACACACAG
AAAAGAAAGGTATCTTTGAAGTCATTAGCGGTTGTAACTGTGTTTCTGTGTAGTAATTGA
TATGATGGTACACCAATTCAG

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL7048Contig1 439 2 2 U
GGAATTGCAGTTTTGTTCTCATGCTTCGTAGTCTATGTCTCCCTTAGGAATTTTGCAGTA
CAAAATGATAACTCCATCGCTGCCTTCCTTCTCTTTCTCTTGCATTTTGTTGGGGGCATC
TGGCATGAAAAGCATGGAACCACCTAAAAGGCTTACCACGTTTGGTTTCAAATTTCTAAG
ACGTAACAAAACCTATATGCTGCTTCACCTCTGATTCTGTTGGCTTTCCTCCAAAGTTCG
ACATTACCGAAGACTGTTCAATCTGTCTATGTGTCATTTGTTACCATGTTTTTTTTGGAA
TTAACACAACTTATTTACAGACGCTTTAGATCGCAAGCCTTTCTGTTGTATTTCCCAATC
TCTTTGAAACATGGCCAAACCAATACTAACAATGATTGTGGATGTTTTGTAACTAATGAA
TACTCTACTTATCATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B077JQ C 1
AF RR2B077TF U 17
BS 1 16 RR2B077JQ
BS 17 439 RR2B077TF

RD RR2B077JQ 439 0 0
GGAATTGCAGTTTTGTTCTCATGCTTCGTAGTCTATGTCTCCCTTAGGAATTTTGCAGTA
CAAAATGATAACTCCATCGCTGCCTTCCTTCTCTTTCTCTTGCATTTTGTTGGGGGCATC
TGGCATGAAAAGCATGGAACCACCTAAAAGGCTTACCACGTTTGGTTTCAAATTTCTAAG
ACGTAACAAAACCTATATGCTGCTTCACCTCTGATTCTGTTGGCTTTCCTCCAAAGTTCG
ACATTACCGAAGACTGTTCAATCTGTCTATGTGTCATTTGTTACCATGTTTTTTTTGGAA
TTAACACAACTTATTTACAGACGCTTTAGATCGCAAGCCTTTCTGTTGTATTTCCCAATC
TCTTTGAAACATGGCCAAACCAATACTAACAATGATTGTGGATGTTTTGTAACTAATGAA
TACTCTACTTATCATTTTC

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2B077TF 423 0 0
TCTCATGCTTCGTAGTCTATGTCTCCCTTAGGAATTTTGCAGTACAAAATGATAACTCCA
TCGCTGCCTTCCTTCTCTTTCTCTTGCATTTTGTTGGGGGCATCTGGCATGAAAAGCATG
GAACCACCTAAAAGGCTTACCACGTTTGGTTTCAAATTTCTAAGACGTAACAAAACCTAT
ATGCTGCTTCACCTCTGATTCTGTTGGCTTTCCTCCAAAGTTCGACATTACCGAAGACTG
TTCAATCTGTCTATGTGTCATTTGTTACCATGTTTTTTTTGGAATTAACACAACTTATTT
ACAGACGCTTTAGATCGCAAGCCTTTCTGTTGTATTTCCCAATCTCTTTGAAACATGGCC
AAACCAATACTAACAATGATTGTGGATGTTTTGTAACTAATGAATACTCTACTTATCATT
TTC

QA 1 423 1 423
DS 



AS 1 2

CO CL7049Contig1 798 2 4 U
GATGTGCTAGCTGTCGTGAACACAAAGCTCCTGCGGGACTACTCGCAGATAGATGGCCGT
CTAAGGCAATTAGCTTTCATTGTCAAACACTGGGCGAAATCGAGAAAGGTCAATGAAACT
TATCAAGGAACACTCTCCAGCTATGCGTATGTTCTTATGTGCATTCATTACTTACAACAA
CGTAGCCCACCGATCCTTCCTTGCTTACAGGAGATGGAGCCGACATACTCAGTTCGGGTA
GATAACATCCTGTGTGCATACTTTGATAATGTTGAAAGACTGAGTTCATTCGGATCAAAT
AACAGAGAGACCATAGCTGAGCTGGTGTGGGGATTTTTCAACTACTGGGCTTACAGGCAT
GACTATGCCAATACCGTTGTATCTGTCCGCACCGGTTCCATACTTGGGAAGCGAGAGAAG
GACTGGACGAGGAGGGTTGGGAACGATAGGCACTTGATATGCATAGAGGATCCGTTTGAG
ACGAGCCATGATCTGGGTCGGGTGGTGGATAAGTTTAGTATCAGAGTGTTGAGGGAAGAG
TTCGAGCGAGCTGCAAAGATTATGCATCAGGATCCTAACCCATCTGCCAAGCTATTCGAA
CCGTATGATCCTGGAGATAATAATAATATTAGCAATGGCCAAGGCCACAATTAAGTTTCA
CAAAAATTGAATCAGGTTCGTGTGTTGTTGGCTTGTATATATCTATGTTTAGATTCTCTC
TGTCCCTCCACTTGTTTTTTTTTTGTTGTTTCGGATGGTTGCTTGCGACACTATCAAATA
GTATTTGTTTGATTATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL16TF U 1
AF RR2GL16JQ C 157
BS 1 643 RR2GL16TF
BS 644 644 RR2GL16JQ
BS 645 666 RR2GL16TF
BS 667 798 RR2GL16JQ

RD RR2GL16TF 666 0 0
GATGTGCTAGCTGTCGTGAACACAAAGCTCCTGCGGGACTACTCGCAGATAGATGGCCGT
CTAAGGCAATTAGCTTTCATTGTCAAACACTGGGCGAAATCGAGAAAGGTCAATGAAACT
TATCAAGGAACACTCTCCAGCTATGCGTATGTTCTTATGTGCATTCATTACTTACAACAA
CGTAGCCCACCGATCCTTCCTTGCTTACAGGAGATGGAGCCGACATACTCAGTTCGGGTA
GATAACATCCTGTGTGCATACTTTGATAATGTTGAAAGACTGAGTTCATTCGGATCAAAT
AACAGAGAGACCATAGCTGAGCTGGTGTGGGGATTTTTCAACTACTGGGCTTACAGGCAT
GACTATGCCAATACCGTTGTATCTGTCCGCACCGGTTCCATACTTGGGAAGCGAGAGAAG
GACTGGACGAGGAGGGTTGGGAACGATAGGCACTTGATATGCATAGAGGATCCGTTTGAG
ACGAGCCATGATCTGGGTCGGGTGGTGGATAAGTTTAGTATCAGAGTGTTGAGGGAAGAG
TTCGAGCGAGCTGCAAAGATTATGCATCAGGATCCTAACCCATCTGCCAAGCTATTCGAA
CCGTATGATCCTGGAGATAATAATAATATTAGCAATGGCCAAG*CCACAATTAAGTTTCA
CAAAAA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2GL16JQ 642 0 0
ATGTGCATTCATTACTTACAACAACGTAGCCCACCGATCCTTCCTTGCTTACAGGAGATG
GAGCCGACATACTCAGTTCGGGTAGATAACATCCTGTGTGCATACTTTGATAATGTTGAA
AGACTGAGTTCATTCGGATCAAATAACAGAGAGACCATAGCTGAGCTGGTGTGGGGATTT
TTCAACTACTGGGCTTACAGGCATGACTATGCCAATACCGTTGTATCTGTCCGCACCGGT
TCCATACTTGGGAAGCGAGAGAAGGACTGGACGAGGAGGGTTGGGAACGATAGGCACTTG
ATATGCATAGAGGATCCGTTTGAGACGAGCCATGATTTGGGTCGGGTGGTGGATAAGTTT
AGTATCAGAGTGTTGAGGGAAGAGTTCGAGCGAGCTGCAAAGATTATGCATCAGGATCCT
AACCCATTTGCCAAGCTATTCGAACCGTATGATCCTGGAGATAATAATAATATTAGCAAT
GGCCAAGGCCACAATTAAGTTTCACAAAAATTGAATCAGGTTCGTGTGTTGTTGGCTTGT
ATATATCTATGTTTAGATTCTCTCTGTCCCTCCACTTGTTTTTTTTTTGTTGTTTCGGAT
GGTTGCTTGCGACACTATCAAATAGTATTTGTTTGATTATAG

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL7050Contig1 341 2 5 U
GGAAAACTCTGCTTGGATTTATTGGAAATGAATCAATTAAAAAAGAAATCAACATTAAAG
ACTCTTTTTTTTTGTTACAGTTTCCATTCTTCTTCTTCTCCTCTTCTCGCCTGCAGATTC
TCACATCTTGTTGGCTTATTCCCCTGAAAAAAGTAACCAAGCACCAACACCTAAGCAAAA
CCCAAACGCCTAGACTTTTCTTCTTAAACCTCCTTGACATAGGTCTCTCCACTTCCTCCA
ATAACAGCATCATCTGGGATGTAACGTTTCCAGAACGGATGAGCCTTCCACACCCTCCCC
ATCTCTTCAATAGGAACCCCTCTCGTCTCCGGCAACAAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ55JQ U 1
AF RR2BF70JQ U 170
BS 1 296 RR2GQ55JQ
BS 297 297 RR2BF70JQ
BS 298 317 RR2GQ55JQ
BS 318 318 RR2BF70JQ
BS 319 341 RR2GQ55JQ

RD RR2GQ55JQ 341 0 0
GGAAAACTCTGCTTGGATTTATTGGAAATGAATCAATTAAAAAAGAAATCAACATTAAAG
ACTCTTTTTTTTTGTTACAGTTTCCATTCTTCTTCTTCTCCTCTTCTCGCCTGCAGATTC
TCACATCTTGTTGGCTTATTCCCCTGAAAAAAGTAACCAAGCACCAACACCTAAGCAAAA
CCCAAACGCCTAGACTTTTCTTCTTAAACCTCCTTGACATAGGTCTCTCCACTTCCTCCA
ATAACAGCATCATCTGGGATGTAACGTTTCCAGAACGGATGAGCCTTCCACACCCTTCCC
ATCTCTTCAATAGGAACTCCTCTCGTCTCCGGCAACAAGAA

QA 1 341 1 341
DS 

RD RR2BF70JQ 166 0 0
CCCCTAAGCAAAACCAAAT
CCTAGACTTTTCTTCTTAAACCTCCTTGACATAGGTCTCTCCACTTCCTCCAATAACAGC
ATCATCTGGGATGTAACGTTTCCAGAACGGATGAGCCTTCCACACCCTCCCCATCTCTTC
AATAGGAACCCCTCTCGTCTCCGGCAA

QA 20 166 20 166
DS 



AS 1 2

CO CL7051Contig1 1105 2 4 U
CGTAGATATTGCCGGCGCCGGAGAAGTAGACGCCGAGGGGTGGCCTACTTGGTTATCGGT
AGGAGATAGGAGGCTTCTTCAAGGGTCTAGAGTGACAGCCGATGCTACCGTGGCTGCTGA
CGGTAGCGGAAAATTCAAGACTATTGCGGCTGCGGTTGCAGCGGCCCCGGATAATAGTAA
GAAGAGGTATGTGATACATATAAAAGCAGGTGTTTATAGAGAGAATGTGGAAGTGTCGAA
GAAGAAAAAGAATATAATGTTTATGGGTGATGGTCGGACAAGAACTATTATTACTGGAAA
TAGAAACGTCGTCGATGGTAGCGCCACCTTCCACTCCAAAACACAGCGGGTCCATCGAAG
CACCAAGCGGTGGCACTCCGCGTCGGTTCTGACTTCTCCGCTTTTTATCAATGCGACATA
TTAGCTTACCAAGACACTCTCTACGTCCACTCTAACCGTCAGTACTTCGTCAAGTGTCTC
ATTGCCGGAACCGTCGACTTCATCTTTGGAAACGCCGCTGTCGTTCTCCAAGACTGCGAC
ATCCACGCTCGCCGGCCAAACTCCGGCCAAAAAAATATGGTCACAGCTCAAGGAAGAACC
GATCCTAACCAGAACACAGGGATCGTTATCCAAAAATGTAGGATCGGTGCCACATCGGAT
TTGCAGCCCGTGAAAAGTAGTTTCCCGACATATCTTGGTCGACCGTGGAAAGAGTATTTT
CAGACAGTGATCATGCAGTCGGATATTTCCGACGTGATCCGACCAGAAGGGTAGTCCGAG
TGGACCGGGACTTTTGCGTTGAACACTTTGACATATAGAGAGTATGCGAACAAAGGAGCA
GGGGCTGGAACTGCAAGGAGAGTGAAGTGGAGAGGCTTTAAGGTAATCACTGCTGCTGCT
GAAGCCCAGAGATATACTGCTGGTCAGTTTATCGGTGGTGGGGGCTGGTTAGGTTCGACC
GGTTTCCCTTTCTTGCTCGGTCTTTGAGATGTTCTTGTTGTAAGTGTAACCTACATGTTG
TTGGTCGAATAATTATTGATTTTATCAATAAATTCAGATGTGTCTGTTTTGTGTATTTTC
ATATCTTTAGTTGAGATTGATCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ51TF U 1
AF RR2CQ51JQ C 500
BS 1 574 RR2CQ51TF
BS 575 575 RR2CQ51JQ
BS 576 615 RR2CQ51TF
BS 616 1105 RR2CQ51JQ

RD RR2CQ51TF 615 0 0
CGTAGATATTGCCGGCGCCGGAGAAGTAGACGCCGAGGGGTGGCCTACTTGGTTATCGGT
AGGAGATAGGAGGCTTCTTCAAGGGTCTAGAGTGACAGCCGATGCTACCGTGGCTGCTGA
CGGTAGCGGAAAATTCAAGACTATTGCGGCTGCGGTTGCAGCGGCCCCGGATAATAGTAA
GAAGAGGTATGTGATACATATAAAAGCAGGTGTTTATAGAGAGAATGTGGAAGTGTCGAA
GAAGAAAAAGAATATAATGTTTATGGGTGATGGTCGGACAAGAACTATTATTACTGGAAA
TAGAAACGTCGTCGATGGTAGCGCCACCTTCCACTCCAAAACACAGCGGGTCCATCGAAG
CACCAAGCGGTGGCACTCCGCGTCGGTTCTGACTTCTCCGCTTTTTATCAATGCGACATA
TTAGCTTACCAAGACACTCTCTACGTCCACTCTAACCGTCAGTACTTCGTCAAGTGTCTC
ATTGCCGGAACCGTCGACTTCATCTTTGGAAACGCCGCTGTCGTTCTCCAAGACTGCGAC
ATCCACGCTCGCCGGCCAAACTCCGGCCAAAAAA*TATGGTCACAGCTCAAGGAAGAACC
GATCCTAACCAGAAC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2CQ51JQ 606 0 0
TCATCTTTGGAAACGCCGCTGTCGTTCTCCAAGACTGCGACATCCACGCTCGCCGGCCAA
ACTCCGGCCAAAAAAATATGGTCACAGCTCAAGGAAGAACCGATCCTAACCAGAACACAG
GGATCGTTATCCAAAAATGTAGGATCGGTGCCACATCGGATTTGCAGCCCGTGAAAAGTA
GTTTCCCGACATATCTTGGTCGACCGTGGAAAGAGTATTTTCAGACAGTGATCATGCAGT
CGGATATTTCCGACGTGATCCGACCAGAAGGGTAGTCCGAGTGGACCGGGACTTTTGCGT
TGAACACTTTGACATATAGAGAGTATGCGAACAAAGGAGCAGGGGCTGGAACTGCAAGGA
GAGTGAAGTGGAGAGGCTTTAAGGTAATCACTGCTGCTGCTGAAGCCCAGAGATATACTG
CTGGTCAGTTTATCGGTGGTGGGGGCTGGTTAGGTTCGACCGGTTTCCCTTTCTTGCTCG
GTCTTTGAGATGTTCTTGTTGTAAGTGTAACCTACATGTTGTTGGTCGAATAATTATTGA
TTTTATCAATAAATTCAGATGTGTCTGTTTTGTGTATTTTCATATCTTTAGTTGAGATTG
ATCACC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL7052Contig1 1249 2 2 U
GGACTCCCGAAGAATCCTCCACTCACATCTGTTTGTGTATCAGTCAAATTAGGGTTTGAT
TAGATTCCACTTAATTAGGGCTTCTCTATATATACACAAACGCGCCGACGGTTACCTCAA
CCAACAAACCCTAATCACTCAAAAAATCTTCAATCCGATGGCGTCAGAGGATCAATCGGC
GGCGAGATCTACCGGGAAGGTGAACTGGTTCAACGACTCCAAGGGATACGGTTTCATCAC
CCCCGACGGCGGCGGAGAAGAGCTTTTCGTTCACCAATCCTCCATCGTCTCCGACGGTTA
CAGGAGTCTAGCCATCGACGATTTGGTCGAGTTCTCCGTCGTAGAGGGAACCGACGGGAA
GACCAAAGCCGTCGACGTCACTGCTCCTGGAGGTGCTCCTCTCCGTAAGAAGGAGACTAG
CTCTCGCGGCGGCGGTGGTGTTAGACGCGTCGGCGGAGGAGGAAGTTGTTATAATTGCGG
CGAGGCTGGTCATCTTGCTAAGGATTGCCGTGATGAAGACGGCGGTGAGCGTGGAGCGTC
TTGTTACAGTTGTGGTGAGTCTGGTCACTTGGCTAGGGATTGCGTTCAGAAATCAAGCGG
CGGCGGTGAACGTGGAGGAGCCTCCGGTGGGTGCTACACTTGCGGTGAAGCTGGTCACTT
TGCTAGGGATTGCGTTCAGAAAGGAACCGGAGGAGGTGAACGTGGAAGCGGCGGAGGTGG
TGGTGGTGGTGGTACTTGTTACACGTGTGGTGGAGTCGGACACATGGCTAGGGATTTTGC
GACGAAGAGACAGTCTGGTGCTTGTTACGAGTGTGGTGGTACTGGTCACTTGGCTCGTGA
TTGTGACCGGAGAGGAAGTGGTGGAGGTGGCGGTAGGAACGCAGGTGGAGGTGGTGGAGA
GTGTTACAAGTGTGGTGAAAAAGGTCACTTTGCGAGGGAATGTTCTGTTGCTTGATTTAC
TTTCCCAATCAACAAAACAAAAGGACGAAGATGAATTTGAGTAATCAATCTTCGTTTTAT
CTTTTTACTGGTCGGAATGATGAATTTGCTTGGTCCTTTTGATGTTTTTTTTTTGTTTTA
TTATTGTTATTATACAAAAAGGGTTTTAATCCTTTTTCTCTGTGGTAATAACTATGTAAG
TTTAACTGGATTTGGTTTCTGATATGGATACTGTACTTTTTCTTTTTTTTTGCTTATGTC
ACTTTTGAGTTTTGTTCTTTTTGTTGAGTTGTGCTGGGTTTCAGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B728TF U 1
AF RR2B728JQ C 370
BS 1 801 RR2B728TF
BS 802 1249 RR2B728JQ

RD RR2B728TF 801 0 0
GGACTCCCGAAGAATCCTCCACTCACATCTGTTTGTGTATCAGTCAAATTAGGGTTTGAT
TAGATTCCACTTAATTAGGGCTTCTCTATATATACACAAACGCGCCGACGGTTACCTCAA
CCAACAAACCCTAATCACTCAAAAAATCTTCAATCCGATGGCGTCAGAGGATCAATCGGC
GGCGAGATCTACCGGGAAGGTGAACTGGTTCAACGACTCCAAGGGATACGGTTTCATCAC
CCCCGACGGCGGCGGAGAAGAGCTTTTCGTTCACCAATCCTCCATCGTCTCCGACGGTTA
CAGGAGTCTAGCCATCGACGATTTGGTCGAGTTCTCCGTCGTAGAGGGAACCGACGGGAA
GACCAAAGCCGTCGACGTCACTGCTCCTGGAGGTGCTCCTCTCCGTAAGAAGGAGACTAG
CTCTCGCGGCGGCGGTGGTGTTAGACGCGTCGGCGGAGGAGGAAGTTGTTATAATTGCGG
CGAGGCTGGTCATCTTGCTAAGGATTGCCGTGATGAAGACGGCGGTGAGCGTGGAGCGTC
TTGTTACAGTTGTGGTGAGTCTGGTCACTTGGCTAGGGATTGCGTTCAGAAATCAAGCGG
CGGCGGTGAACGTGGAGGAGCCTCCGGTGGGTGCTACACTTGCGGTGAAGCTGGTCACTT
TGCTAGGGATTGCGTTCAGAAAGGAACCGGAGGAGGTGAACGTGGAAGCGGCGGAGGTGG
TGGTGGTGGTGGTACTTGTTACACGTGTGGTGGAGTCGGACACATGGCTAGGGATTTTGC
GACGAAGAGACAGTCTGGTGC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RR2B728JQ 880 0 0
T
GTCGACGTCACTGCTCCTGGAGGTGCTCCTCTCCGTAAGAAGGAGACTAGCTCTCGCGGC
GGCGGTGGTGTTAGACGCGTCGGCGGAGGAGGAAGTTGTTATAATTGCGGCGAGGCTGGT
CATCTTGCTAAGGATTGCCGTGATGAAGACGGCGGTGAGCGTGGAGCGTCTTGTTACAGT
TGTGGTGAGTCTGGTCACTTGGCTAGGGATTGCGTTCAGAAATCAAGCGGCGGCGGTGAA
CGTGGAGGAGCCTCCGGTGGGTGCTACACTTGCGGTGAAGCTGGTCACTTTGCTAGGGAT
TGCGTTCAGAAAGGAACCGGAGGAGGTGAACGTGGAAGCGGCGGAGGTGGTGGTGGTGGT
GGTACTTGTTACACGTGTGGTGGAGTCGGACACATGGCTAGGGATTTTGCGACGAAGAGA
CAGTCTGGTGCTTGTTACGAGTGTGGTGGTACTGGTCACTTGGCTCGTGATTGTGACCGG
AGAGGAAGTGGTGGAGGTGGCGGTAGGAACGCAGGTGGAGGTGGTGGAGAGTGTTACAAG
TGTGGTGAAAAAGGTCACTTTGCGAGGGAATGTTCTGTTGCTTGATTTACTTTCCCAATC
AACAAAACAAAAGGACGAAGATGAATTTGAGTAATCAATCTTCGTTTTATCTTTTTACTG
GTCGGAATGATGAATTTGCTTGGTCCTTTTGATGTTTTTTTTTTGTTTTATTATTGTTAT
TATACAAAAAGGGTTTTAATCCTTTTTCTCTGTGGTAATAACTATGTAAGTTTAACTGGA
TTTGGTTTCTGATATGGATACTGTACTTTTTCTTTTTTTTTGCTTATGTCACTTTTGAGT
TTTGTTCTTTTTGTTGAGTTGTGCTGGGTTTCAGTTTAC

QA 2 880 2 880
DS 



AS 1 2

CO CL7053Contig1 1357 2 2 U
GGGAAACCAGTATCTCTTTCTCTCCTCTTCTTCGCGCATTCTCTCTCTTACCGGATAAGG
TTTGTCTAGAGAGATGGCTAGAGTTTGTGTAATGATTATGATGATGGTAGCTATGGTCTT
GAAGATGGCTATAGGTGAGCCTATAGCACCATGCTACTTCATATTTGGAGATTCTTTGGT
TGACAGTGGAAACAACAATCAGCTTCAGTCCTTAGCAAGAGCTTATTACTTCCCTTACGG
CATCGACTTCCAGTTTGGTCCAACCGGAAGGTTCTGTAATGGAAAAACAACCGTAGATGT
CATCACCGAGCTTCTTGGTTTCGATGACTACATTACACCATACTCTCAAGCAAGCGGAGA
AGACATTCTAAGAGGAGTAAACTACGCTTCTGCAGCTGCTGGTGTTCGAGAAGAAACCGG
TCGTCAGCTGGGAGCTAGAATAACGTTTGCAGGGCAAGTAGCTAACCACGTGAACACAGT
GTCACAAGTGGTGAACATACTCGGTGATGAGAATGAAGCTGCTAATTACCTAAGTAAATG
CATCTACTCTATAGGGTTAGGCAGTAACGACTATCTCAATAACTACTTTATGCCTCTCTA
TTACTCCACTGGGAACCAGTACTCCCCAGACTCCTTTGCCAATGACCTCATCAACCGATA
CACAGAGCAACTCAGGATATTGTATAACAACGGAGCGAGGAAGTTTGCGCTAATTGGTAT
CGGTGCAATAGGATGTAGCCCTAACGAGCTGGCGCAGAACAGCAGAGACGGGAGGACATG
TGACGAAAGGATCAATTCAGCAAACAGGATCTTTAACAGCAAGCTCGTGTCTCTGGTCGA
CTATTTCAACCAAAACACACCGGATGCTAAGTTCACTTACATCAATGCTTATGGTATCTT
CCAGGACATGGTAGCTAATCCTTCTCGCTATGGGTTTAGGGTGACAAACGCGGGGTGTTG
TGGAGTTGGGAGGAACAATGGACAGATAACTCGTCTTCCAGGTCAAGCTCCATGTCTGAA
CAGAGATGAGTTTGTGTTTTGGGATGCGTTTCATCCAGGGGAAGCAGCGAATGTCGTGAT
CGGTAGTCGATCTTTTATGAGAGAATCTCCATCTGATGCTCACCCTTATGATATCCAGCA
GCTTGCTTTGCTCTAGTTCATGAAAGTTCTTCCACACACAGACAAAGAGAGAAAGAGAGA
GAGATTTAATCTTTTGCTTTGTTTGATACTTGTTTTTTTTTTTGGTTGCAGAAGAACTGT
TTCTGGTGTGGTCCGTTGAGCTGATGTATTATTGTTCTATATGATGACATGAATTTGCTG
TTCTTACATATGATTAAGAACGTGGAATGTTTTGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B919TF U 1
AF RR2B919JQ C 532
BS 1 767 RR2B919TF
BS 768 1357 RR2B919JQ

RD RR2B919TF 767 0 0
GGGAAACCAGTATCTCTTTCTCTCCTCTTCTTCGCGCATTCTCTCTCTTACCGGATAAGG
TTTGTCTAGAGAGATGGCTAGAGTTTGTGTAATGATTATGATGATGGTAGCTATGGTCTT
GAAGATGGCTATAGGTGAGCCTATAGCACCATGCTACTTCATATTTGGAGATTCTTTGGT
TGACAGTGGAAACAACAATCAGCTTCAGTCCTTAGCAAGAGCTTATTACTTCCCTTACGG
CATCGACTTCCAGTTTGGTCCAACCGGAAGGTTCTGTAATGGAAAAACAACCGTAGATGT
CATCACCGAGCTTCTTGGTTTCGATGACTACATTACACCATACTCTCAAGCAAGCGGAGA
AGACATTCTAAGAGGAGTAAACTACGCTTCTGCAGCTGCTGGTGTTCGAGAAGAAACCGG
TCGTCAGCTGGGAGCTAGAATAACGTTTGCAGGGCAAGTAGCTAACCACGTGAACACAGT
GTCACAAGTGGTGAACATACTCGGTGATGAGAATGAAGCTGCTAATTACCTAAGTAAATG
CATCTACTCTATAGGGTTAGGCAGTAACGACTATCTCAATAACTACTTTATGCCTCTCTA
TTACTCCACTGGGAACCAGTACTCCCCAGACTCCTTTGCCAATGACCTCATCAACCGATA
CACAGAGCAACTCAGGATATTGTATAACAACGGAGCGAGGAAGTTTGCGCTAATTGGTAT
CGGTGCAATAGGATGTAGCCCTAACGAGCTGGCGCAGAACAGCAGAG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2B919JQ 826 0 0
AAGTAAATGCATCTACTCTATAGGGTTAGGCAGTAACGACTATCTCAATAACTACTTTAT
GCCTCTCTATTACTCCACTGGGAACCAGTACTCCCCAGACTCCTTTGCCAATGACCTCAT
CAACCGATACACAGAGCAACTCAGGATATTGTATAACAACGGAGCGAGGAAGTTTGCGCT
AATTGGTATCGGTGCAATAGGATGTAGCCCTAACGAGCTGGCGCAGAACAGCAGAGACGG
GAGGACATGTGACGAAAGGATCAATTCAGCAAACAGGATCTTTAACAGCAAGCTCGTGTC
TCTGGTCGACTATTTCAACCAAAACACACCGGATGCTAAGTTCACTTACATCAATGCTTA
TGGTATCTTCCAGGACATGGTAGCTAATCCTTCTCGCTATGGGTTTAGGGTGACAAACGC
GGGGTGTTGTGGAGTTGGGAGGAACAATGGACAGATAACTCGTCTTCCAGGTCAAGCTCC
ATGTCTGAACAGAGATGAGTTTGTGTTTTGGGATGCGTTTCATCCAGGGGAAGCAGCGAA
TGTCGTGATCGGTAGTCGATCTTTTATGAGAGAATCTCCATCTGATGCTCACCCTTATGA
TATCCAGCAGCTTGCTTTGCTCTAGTTCATGAAAGTTCTTCCACACACAGACAAAGAGAG
AAAGAGAGAGAGATTTAATCTTTTGCTTTGTTTGATACTTGTTTTTTTTTTTGGTTGCAG
AAGAACTGTTTCTGGTGTGGTCCGTTGAGCTGATGTATTATTGTTCTATATGATGACATG
AATTTGCTGTTCTTACATATGATTAAGAACGTGGAATGTTTTGACG

QA 1 826 1 826
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7055Contig1 445 2 1 U
GAGCTCGAGATGGTCAATGTACAGCATGCCAGCAAAGGAAGAGCTAAGGCCAAGGCTAAA
CCAGACACCTGTAAGCGATCTGAAATGCAAGCTGAAGATGGGAGATGTGGTGGAGCTGAC
TCCAGCCATACCCGATGAGTCTCTGCCTGAATACAGAGAGGAGATTCAGCGGATGTATGA
TCGAGGGCTTGCCTTTTCGCGCCCTCAACGTACAGCTGCTGGCACAATGGTTGGCTGGGG
AAGCTAACAGATTCTTCTGTTTCTTAGTCCAAAAAAGAGAAAAAAAAACAGTCCTTGTTT
CTCATGTATGTAAGTTGTTATATATGTAATGCTTTCAAAAAGATTGTTGTACGCCATAGA
GGTTGTTGTACCTTTGAACTCGTTGATTCCAAGAAAACAATGTAAATAATATTATAGGCT
ACGAAGAAACTGACTCTTGGTCATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E311JQ C 1
AF RR2E311TF U 1
BS 1 445 RR2E311TF

RD RR2E311JQ 445 0 0
GAGCTCGAGATGGTCAATGTACAGCATGCCAGCAAAGGAAGAGCTAAGGCCAAGGCTAAA
CCAGACACCTGTAAGCGATTTGAAATGCAAGCTGAAGATGGGAGATGTGGTGGAGCTGAC
TCCAGCCATACCCGATGAGTTTCTGCCTGAATACAGAGAGGAGATTCAGCGGATGTATGA
TCGAGGGCTTGCCTTTTCGCGCCCTCAACGTACAGCTGCTGGCACAATGGTTGGCTGGGG
AAGCTAACAGATTTTTCTGTTTTTTAGTCCAAAAAAGAGAAAAAAAAACAGTCCTTGTTT
TTCATGTATGTAAGTTGTTATATATGTAATGCTTTCAAAAAGATTGTTGTACGCCATAGA
GGTTGTTGTACCTTTGAACTCGTTGATTCCAAGAAAACAATGTAAATAATATTATAGGCT
ACGAAGAAACTGACTCTTGGTCATT

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR2E311TF 445 0 0
GAGCTCGAGATGGTCAATGTACAGCATGCCAGCAAAGGAAGAGCTAAGGCCAAGGCTAAA
CCAGACACCTGTAAGCGATCTGAAATGCAAGCTGAAGATGGGAGATGTGGTGGAGCTGAC
TCCAGCCATACCCGATGAGTCTCTGCCTGAATACAGAGAGGAGATTCAGCGGATGTATGA
TCGAGGGCTTGCCTTTTCGCGCCCTCAACGTACAGCTGCTGGCACAATGGTTGGCTGGGG
AAGCTAACAGATTCTTCTGTTTCTTAGTCCAAAAAAGAGAAAAAAAAACAGTCCTTGTTT
CTCATGTATGTAAGTTGTTATATATGTAATGCTTTCAAAAAGATTGTTGTACGCCATAGA
GGTTGTTGTACCTTTGAACTCGTTGATTCCAAGAAAACAATGTAAATAATATTATAGGCT
ACGAAGAAACTGACTCTTGGTCATT

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 2

CO CL7056Contig1 575 2 1 U
GAAGGCATGACCGTGTTTGCACCAACAGACAACGCTTTCCAAAACCTTAAACCCGGAACC
CTAAACAAACTAAGCTACGACGACCAAGTCAAACTCATTCTTTACCATGTTAGTCCCAAA
TTCTACACATTGGATGATCTTCTCTCCGTAAGTAACCCGGTAAGGACTCAAGCTTCAGGA
CGAGACGGTGCGGTTTATGGACTTAATTTCACCAGTCAAGGGAACCAAGTCAACGTATCA
ACCGGTGTCGTTGAAACACGTGTTAGCAATGCATTAATGAAAGAACGTCCTCTTGCGGTT
TACGTGGTGGACATGGTATTGTTGCCGGAAGAGATGTTTGGAGAAAACAAGGTCTCGCCA
GCGGCACCTGGTCCAAAATCAAATTCTCCTGATGTCTCCGATGACTCAGACAAAGCAGGG
GCTCCGTCGGATAAGTCTGGCTCCAATCTGATGAAGGCTGGATTACGGTTTGGTCTTGGA
CTTGTTTTCTTATGTTTGAAGCTCATCTTTTGATTTGGTTTCTATATGCTTTTTTCTTTG
TTTTCATATATTTATTTTATTGTGTGGGTTGTTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BQ08JQ C 1
AF RR2BQ08TF U 1
BS 1 575 RR2BQ08TF

RD RR2BQ08JQ 575 0 0
GAAGGCATGACCGTGTTTGCACCAACAGACAACGCTTTCCAAAACCTTAAACCCGGAACC
CTAAACAAACTAAGGTACGACGACCAAGTCAAACTCATTCTTTACCATGTTAGTCCCAAA
TTTTACACATTGGATGATTTTCTTTCCGTAAGTAACCCGGTAAGGACTCAAGCTTCAGGA
CGAGACGGTGCGGTTTATGGACTTAATTTCACCAGTCAAGGGAACCAAGTCAACGTATCA
ACCGGTGTCGTTGAAACACGTGTTAGCAATGCATTAATGAAAGAACGTCCTCTTGCGGTT
TACGTGGTGGACATGGTATTGTTGCCGGAAGAGATGTTTGGAGAAAACAAGGTCTCGCCA
GCGGCACCTGGTCCAAAATCAAATTCTCCTGATGTTTCCGATGACTCAGACAAAGCAGGG
GCTCCGTCGGATAAGTCTGGCTCCAATTTGATGAAGGCTGGATTACGGTTTGGTCTTGGA
CTTGTTTTTTTATGTTTGAAGCTCATCTTTTGATTTGGTTTCTATATGCTTTTTTCTTTG
TTTTCATATATTTATTTTATTGTGTGGGTTGTTAT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2BQ08TF 575 0 0
GAAGGCATGACCGTGTTTGCACCAACAGACAACGCTTTCCAAAACCTTAAACCCGGAACC
CTAAACAAACTAAGCTACGACGACCAAGTCAAACTCATTCTTTACCATGTTAGTCCCAAA
TTCTACACATTGGATGATCTTCTCTCCGTAAGTAACCCGGTAAGGACTCAAGCTTCAGGA
CGAGACGGTGCGGTTTATGGACTTAATTTCACCAGTCAAGGGAACCAAGTCAACGTATCA
ACCGGTGTCGTTGAAACACGTGTTAGCAATGCATTAATGAAAGAACGTCCTCTTGCGGTT
TACGTGGTGGACATGGTATTGTTGCCGGAAGAGATGTTTGGAGAAAACAAGGTCTCGCCA
GCGGCACCTGGTCCAAAATCAAATTCTCCTGATGTCTCCGATGACTCAGACAAAGCAGGG
GCTCCGTCGGATAAGTCTGGCTCCAATCTGATGAAGGCTGGATTACGGTTTGGTCTTGGA
CTTGTTTTCTTATGTTTGAAGCTCATCTTTTGATTTGGTTTCTATATGCTTTTTTCTTTG
TTTTCATATATTTATTTTATTGTGTGGGTTGTTAT

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL7057Contig1 547 2 1 U
GACGATTAAAATCAGAAGTTCTGAATTGTGAGGGTTTCGATTGTTCTCTCTAAGTTTTCT
ATATTCTCAGAGTACTACAAGAGTTACGATGCATTTGTTGATGCTCTCTTCAAAACTGGC
CGAAGTGCTGATCCACAGTGGAAAAACGGGAAAAGAAGAGGCAGATCAATGCAAAAATGT
GAAAGAAGCAGCAGATGCAGTGAAGGGGAGCGAAGCAAGTGAAGGAAACCACCGAGTATA
TCCAAGATGTCGCTCCCACTACGTCTGGCCGGGTAAGTAAGATGACAAAAGATGTGACAG
AAAAGGTTACTGAAACGACGGATTCTGTCACTGAAAAGGCTAAAGGATCTGTATCTGGAG
TCGTGGATACAGTTAAAAATGCTACTAATATCATTAAGAACAAGACTAGTCGCGATTAGT
TACTAGCACATCCAAATATTTGATATATTTATATATATATGTTTCAATAAATTAAATAGT
ATTCAAAGTAATGATCGGATTAGTAATAGTCTGACTAAATTTTGAATATAAACTAAAACC
TTAATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BO45JQ C 1
AF RR2BO45TF U 1
BS 1 547 RR2BO45TF

RD RR2BO45JQ 547 0 0
GACGATTAAAATCAGAAGTTCTGAATTGTGAGGGTTTCGATTGTTCTCTCTAAGTTTTCT
ATATTCTCAGAGTACTACAAGAGTTACGATGCATTTGTTGATGCTCTCTTCAAAACTGGC
CGAAGTGCTGATCCACAGTGGAAAAACGGGAAAAGAAGAGGCAGATCAATGCAAAAATGT
GAAAGAAGCAGCAGATGCAGTGAAGGGGAGCGAAGCAAGTGAAGGAAACCACCGAGTATA
TCCAAGATGTCGCTCCCACTACGTCTGGCCGGGTAAGTAAGATGACAAAAGATGTGACAG
AAAAGGTTACTGAAACGACGGATTCTGTCACTGAAAAGGCTAAAGGATCTGTATCTGGAG
TCGTGGATACAGTTAAAAATGCTACTAATATCATTAAGAACAAGACTAGTCGCGATTAGT
TACTAGCACATCCAAATATTTGATATATTTATATATATATGTTTCAATAAATTAAATAGT
ATTCAAAGTAATGATCGGATTAGTAATAGTCTGACTAAATTTTGAATATAAACTAAAACC
TTAATTT

QA 1 547 1 547
DS 

RD RR2BO45TF 547 0 0
GACGATTAAAATCAGAAGTTCTGAATTGTGAGGGTTTCGATTGTTCTCTCTAAGTTTTCT
ATATTCTCAGAGTACTACAAGAGTTACGATGCATTTGTTGATGCTCTCTTCAAAACTGGC
CGAAGTGCTGATCCACAGTGGAAAAACGGGAAAAGAAGAGGCAGATCAATGCAAAAATGT
GAAAGAAGCAGCAGATGCAGTGAAGGGGAGCGAAGCAAGTGAAGGAAACCACCGAGTATA
TCCAAGATGTCGCTCCCACTACGTCTGGCCGGGTAAGTAAGATGACAAAAGATGTGACAG
AAAAGGTTACTGAAACGACGGATTCTGTCACTGAAAAGGCTAAAGGATCTGTATCTGGAG
TCGTGGATACAGTTAAAAATGCTACTAATATCATTAAGAACAAGACTAGTCGCGATTAGT
TACTAGCACATCCAAATATTTGATATATTTATATATATATGTTTCAATAAATTAAATAGT
ATTCAAAGTAATGATCGGATTAGTAATAGTCTGACTAAATTTTGAATATAAACTAAAACC
TTAATTT

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 2

CO CL7058Contig1 738 2 5 U
AAAAAATCAAAAGCCAGTAGATACAAATACAAATGCAACATGAATGTTTGTAGTATTCTG
AATCAGAAATTCTGATAAAATCAGAAAACATAAAACCTCTTCTTTCTTTTTTCTCTCGAC
CGTGTGATTACTGTATAAAAATGAACCCGTACTTTGTATATATATACACTTTCGACCGGA
CCATAACCCGGTTCATCAATAAACCGGTCTCTGCCCACAGTTCGGTTCAATCTCAGGGTT
TTTGTCCAAAAAAATAAAAAGTGCTCTGTTTCTTTTGCTCCTTCCTCTTCCAGCTTCTTT
CAACAACGCAGCTAGCCTCTGCTTCTCGTCCTCAACCTCCGGATTTGCCGTCCCAAGCTT
CTCCTCTCTTGTCCCAACAACATATTCTAGTATCTCTATAGCATCCTCTAACCTTCCCAT
TGCATCGTATGTTCCGGCAAGGTTACTGTAAACCGCCAACGTGTCTGGATGGTAAGGTCC
ACACTCACTCTCCAAAATCCCTTTCGCTTCTTCAAACAAATCCGCAGCTTCATTGATCGC
GTAACGTTGGACGCACGCAAGTCCCATCTGGTTCAAAGCAATCCAAAGAGAGCCGTCTTC
TTCTCTCCGCTGTTCCGAAACTTTGAAACCGCGCTCTTGAAGATGCTGTAAGACTCGGGA
TAGTTCCCCATCATGTAAGAGATCACACCCATCTGAGCCTCGATACCAGCAACCGTGTTC
TGTTGCCCCGGAGCGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F018JQ U 129
AF RR2F018TF C 1
BS 1 128 RR2F018TF
BS 129 216 RR2F018JQ
BS 217 217 RR2F018TF
BS 218 422 RR2F018JQ
BS 423 738 RR2F018TF

RD RR2F018JQ 294 0 0
TACTGTATAAAAATGAACCCGTACTTTGTATATATATACACTTTCGACCGGACCATAACC
CGGTTCATCAATAAACCGGTCTCTGCCCCCAGTTCGGTTCAATCTCAGGGTTTTTGTCCA
AAAAAATAAAAAGTGCTCTGTTTCTTTTGCTCCTTCCTCTTCCAGCTTCTTTCAACAACG
CAGCTAGCCTCTGCTTCTCGTCCTCAACCTCCGGATTTGCCGTCCCAAGCTTCTCCTCTC
TTGTCCCAACAACATATTCTAGTATCTCTATAGCATCCTCTAACCTTCCCATTG

QA 1 294 1 294
DS 

RD RR2F018TF 738 0 0
AAAAAATCAAAAGCCAGTAGATACAAATACAAATGCAACATGAATGTTTGTAGTATTCTG
AATCAGAAATTCTGATAAAATCAGAAAACATAAAACCTCTTCTTTCTTTTTTCTCTCGAC
CGTGTGATTACTGTATAATAATGAACTCGTACTTTGTATATATATACACTTTCGACCGGA
CCATAACCCGGTTCATCAATAAACCGGTCTCTGCCCACAGTTCGGTTCAATCTCAGGGTT
TTTGTCCAAAAGAGTAAGAAGTGCTCTGTTTCTTTTGCTCCTTCCTCTTCCAGCTTCTTT
CAACAACGCAGCTAGCCTCTGCTTCTCGTCCTCAACCTCCGGATTTGCCGTCCCAAGCTT
CTCCTCTCTTGTCCCAACAACATATTCTAGTATCTCTATAGCATCCTCTAACCTTCCCAT
TGCATCGTATGTTCCGGCAAGGTTACTGTAAACCGCCAACGTGTCTGGATGGTAAGGTCC
ACACTCACTCTCCAAAATCCCTTTCGCTTCTTCAAACAAATCCGCAGCTTCATTGATCGC
GTAACGTTGGACGCACGCAAGTCCCATCTGGTTCAAAGCAATCCAAAGAGAGCCGTCTTC
TTCTCTCCGCTGTTCCGAAACTTTGAAACCGCGCTCTTGAAGATGCTGTAAGACTCGGGA
TAGTTCCCCATCATGTAAGAGATCACACCCATCTGAGCCTCGATACCAGCAACCGTGTTC
TGTTGCCCCGGAGCGTTC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL7059Contig1 1034 2 4 U
GAAGAATTTTGAATGCTGCTTGTTTTACTGACAAAAATGGTGAAAGTTTCTTGTTTAGCT
CTCTACTTAAAGTTTGAACAAGCCTTGCAGTGCATCCTTCAAGCTTTGGGTTCTTATAAA
AGTAGCGTTTATCTGGTGTCCTAGAGTGCCTCTTTGCTTGAAAGGCATATAATTTGAATC
GATGAAAACAGTATGAAAGTAGAAACGTGCAGTATATTAGTGTGTTTTTGTTGCATCTTG
GGCGCTCTGGAATGTCTTTTTAGTTTAAAGATAAGCATAGCTGTTGTGTGATAGTGAATT
ATACGCATTCGAAATGTGTCTTTTCTTTACTCAGAAATGCTTTCAGGCTTTGAACGACTG
GGTTGTGTATTTAATTGTGGAATCAAGTGCTATTTACGACTAGTTCAATGTTGAGTTGAG
ATTCATGATAATCAGTGGATAGTTTCACTATCTCTTTAGGTTTCCTTTAGACGACTACTT
CGTAAAATTTGTATTTTACTAATGAAACCTAATTGAACACTTGATTCTTGAGAGATCTCT
GTTAGCTACAGAAAGGATATATGTGTTAAGACACAGAAAGGATAGAGTCTGTGTGTTGTT
CTTCTCTCTGTGACAGGATCAAACAGGATTCACTGTTCATCATATGTTCTCATCGAGTTC
ACCAAAAGGAGCACACTCTTGATTCTCCTAATCTTTGTTACACTGATGAAATGCATTTGG
GATCTAGTCATACATAAAGAAAGGAAAGATAAGGGGGAAGCAGAAACACGTGGGAGAACA
TCCCGAAGAGGAAGCACACGCGGATCTTCATGCAAACCATCCCCGATTCTCTTCACACAC
CAACCATCCATGTGGTCCCTTCCTCCCTTTGTCCCCTTCCTCCTTTTACGTGATTATATA
ATAAGTAAGAGTACCTTGAATATTTGTTAGATAAACCCAATGTACAAGGTTTACTAAGCA
CTTGATATCACGTTTCCCTTGAGGACTATTGCTTCTTCCTTTTCCGGTATAATCTCAAAA
GTAGCTTTGAATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM73TF U 1
AF RR2AM73JQ C 269
BS 1 765 RR2AM73TF
BS 766 766 RR2AM73JQ
BS 767 777 RR2AM73TF
BS 778 1034 RR2AM73JQ

RD RR2AM73TF 781 0 0
GAAGAATTTTGAATGCTGCTTGTTTTACTGACAAAAATGGTGAAAGTTTCTTGTTTAGCT
CTCTACTTAAAGTTTGAACAAGCCTTGCAGTGCATCCTTCAAGCTTTGGGTTCTTATAAA
AGTAGCGTTTATCTGGTGTCCTAGAGTGCCTCTTTGCTTGAAAGGCATATAATTTGAATC
GATGAAAACAGTATGAAAGTAGAAACGTGCAGTATATTAGTGTGTTTTTGTTGCATCTTG
GGCGCTCTGGAATGTCTTTTTAGTTTAAAGATAAGCATAGCTGTTGTGTGATAGTGAATT
ATACGCATTCGAAATGTGTCTTTTCTTTACTCAGAAATGCTTTCAGGCTTTGAACGACTG
GGTTGTGTATTTAATTGTGGAATCAAGTGCTATTTACGACTAGTTCAATGTTGAGTTGAG
ATTCATGATAATCAGTGGATAGTTTCACTATCTCTTTAGGTTTCCTTTAGACGACTACTT
CGTAAAATTTGTATTTTACTAATGAAACCTAATTGAACACTTGATTCTTGAGAGATCTCT
GTTAGCTACAGAAAGGATATATGTGTTAAGACACAGAAAGGATAGAGTCTGTGTGTTGTT
CTTCTCTCTGTGACAGGATCAAACAGGATTCACTGTTCATCATATGTTCTCATCGAGTTC
ACCAAAAGGAGCACACTCTTGATTCTCCTAATCTTTGTTACACTGATGAAATGCATTTGG
GATCTAGTCATACATAAAGAAAGGAAAGATAAGGGGGAAGCAGAA*CACGTGGGAGA
CATC

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2AM73JQ 766 0 0
AGATAAGCATAGCTGTTGTGTGATAGTGAATTATACGCATTCGAAATGTGTCTTTTCTTT
ACTCAGAAATGCTTTCAGGCTTTGAACGACTGGGTTGTGTATTTAATTGTGGAATCAAGT
GCTATTTACGACTAGTTCAATGTTGAGTTGAGATTCATGATAATCAGTGGATAGTTTCAC
TATCTCTTTAGGTTTCCTTTAGACGACTACTTCGTAAAATTTGTATTTTACTAATGAAAC
CTAATTGAACACTTGATTCTTGAGAGATCTCTGTTAGCTACAGAAAGGATATATGTGTTA
AGACACAGAAAGGATAGAGTCTGTGTGTTGTTTTTCTCTCTGTGACAGGATCAAACAGGA
TTCACTGTTCATCATATGTTCTCATCGAGTTCACCAAAAGGAGCACACTCTTGATTCTCC
TAATCTTTGTTACACTGATGAAATGCATTTGGGATCTAGTCATACATAAAGAAAGGAAAG
ATAAGGGGGAAGCAGAAACACGTGGGAGAACATCCCGAAGAGGAAGCACACGCGGATCTT
CATGCAAACCATCCCCGATTCTCTTCACACACCAACCATCCATGTGGTCCCTTCCTCCCT
TTGTCCCCTTCCTCCTTTTACGTGATTATATAATAAGTAAGAGTACCTTGAATATTTGTT
AGATAAACCCAATGTACAAGGTTTACTAAGCACTTGATATCACGTTTCCCTTGAGGACTA
TTGCTTCTTCCTTTTCCGGTATAATCTCAAAAGTAGCTTTGAATTG

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL7060Contig1 1250 2 2 U
GGACTCATCACCCGTCATGACGATGCTCACTGTATTCTTCTCAGCAGCGATTGTAACGAT
CATCGCAGTCCTTGCCTCTTTGAGTAGCCAAAAAGGTTCGGGAATCTTCGCGCCGCCCAA
AATCGCCGGCTCGCGTGATGTTTTCCCGTCGGCGAAGGTTGGTAACCTCACCGGAGCCAC
CGGTCCGGAGAGCATAGCTTTCGATCCGTCGGGTGAAGGTCCGTACGTTGGCGTCTCCGA
CGGTCGTGTCTTGAAATGGCGCGGGGAATCGCTTGGATGGTCTGATTTCGCCTACACATC
GGCTAATAGGCAGACGTGTGTACGCCCGTTTGCACCAGAGTTGGAGCATGTGTGTGGAAG
GCCATTAGGATTGCGTTTCGATCGGAAAACCGGTGACCTTTACACCGCGGATGCCTACTT
TGGCCTAATGATTGTTGGTCCTTCTGGTGGTTTAGCCAAACCGTTGGTTACGGAAGCTGA
AGGGAAACCGTTTCGTTTCACTAATGATTTGGACATCGATGAGCATCAAGATGTGATTTA
CTTCACAGACACCAGCACCACATTCCAGAGAACGCAATTCTTGGCTGCTGTTTTGAACCT
GGATAAGACAGGGAGGCTGATGAAGTACGACAGATCAAGCAAGAAAGTGACGGTTTTAGT
ACAAGGCATTGCGTTTGCAAACGGCGTTGCGCTGAGCAAAGACCTGTCTTTTGTACTGGT
AGCCGAGACAACCACTTGCAAGATCCTAAGGCTTTGGCTGTCTGGTCCAAACGCGGGAAC
ACAAGACGTCTTTGCTGAGCTTCCGGGTTTCCCCGACAACATCAGAAGAAACTCAAATGG
AGAGTTTTGGGTCGCTCTTCACTCGAAGAAAGGTCTTTTCGCTAAACTCTCGCTCTCTCA
GGCTTGGTTTAGAGATTTGTTGCTGAGACTTCCGATAAGTGGGCCGCGTCTGCACTCGCT
GTTCACTGGAGGAAGACCTCATGCGACGGCCATGAAGCTGAGTGAATCAGGAGAGGTTTT
GGAGGTGCTTGAGGATAAAGAAGGGAAGAGATTGAGGTTTATAAGTGAAGTGGAGGAGAA
AGATGGTAAGCTTTGGATTGGTTCTGTGCTTATGCCTTTTCTCGGTGTTTATGACTTGTA
GTTTTCTAACACTGTTGAGACTCTGTAAACCGACACGTTGTTAAGTATGTCTATGTGACT
TAGCTGTGATAATAATATTTGAGTTGATAAAGAGTTGGCTTTTAGTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA17TF U 1
AF RR2EA17JQ C 430
BS 1 607 RR2EA17TF
BS 608 1250 RR2EA17JQ

RD RR2EA17TF 607 0 0
GGACTCATCACCCGTCATGACGATGCTCACTGTATTCTTCTCAGCAGCGATTGTAACGAT
CATCGCAGTCCTTGCCTCTTTGAGTAGCCAAAAAGGTTCGGGAATCTTCGCGCCGCCCAA
AATCGCCGGCTCGCGTGATGTTTTCCCGTCGGCGAAGGTTGGTAACCTCACCGGAGCCAC
CGGTCCGGAGAGCATAGCTTTCGATCCGTCGGGTGAAGGTCCGTACGTTGGCGTCTCCGA
CGGTCGTGTCTTGAAATGGCGCGGGGAATCGCTTGGATGGTCTGATTTCGCCTACACATC
GGCTAATAGGCAGACGTGTGTACGCCCGTTTGCACCAGAGTTGGAGCATGTGTGTGGAAG
GCCATTAGGATTGCGTTTCGATCGGAAAACCGGTGACCTTTACACCGCGGATGCCTACTT
TGGCCTAATGATTGTTGGTCCTTCTGGTGGTTTAGCCAAACCGTTGGTTACGGAAGCTGA
AGGGAAACCGTTTCGTTTCACTAATGATTTGGACATCGATGAGCATCAAGATGTGATTTA
CTTCACAGACACCAGCACCACATTCCAGAGAACGCAATTCTTGGCTGCTGTTTTGAACCT
GGATAAG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2EA17JQ 821 0 0
TGATTGTT
GTCCTTCTGGTGGTTTAGCCAAACCGTTGGTTACGGAAGCTGAAGGGAAACCGTTTCGTT
TCACTAATGATTTGGACATCGATGAGCATCAAGATGTGATTTACTTCACAGACACCAGCA
CCACATTCCAGAGAAGGCAATTCTTGGCTGCTGTTTTGAACCTGGATAAGACAGGGAGGC
TGATGAAGTACGACAGATCAAGCAAGAAAGTGACGGTTTTAGTACAAGGCATTGCGTTTG
CAAACGGCGTTGCGCTGAGCAAAGACCTGTCTTTTGTACTGGTAGCCGAGACAACCACTT
GCAAGATCCTAAGGCTTTGGCTGTCTGGTCCAAACGCGGGAACACAAGACGTCTTTGCTG
AGCTTCCGGGTTTCCCCGACAACATCAGAAGAAACTCAAATGGAGAGTTTTGGGTCGCTC
TTCACTCGAAGAAAGGTCTTTTCGCTAAACTCTCGCTCTCTCAGGCTTGGTTTAGAGATT
TGTTGCTGAGACTTCCGATAAGTGGGCCGCGTCTGCACTCGCTGTTCACTGGAGGAAGAC
CTCATGCGACGGCCATGAAGCTGAGTGAATCAGGAGAGGTTTTGGAGGTGCTTGAGGATA
AAGAAGGGAAGAGATTGAGGTTTATAAGTGAAGTGGAGGAGAAAGATGGTAAGCTTTGGA
TTGGTTCTGTGCTTATGCCTTTTCTCGGTGTTTATGACTTGTAGTTTTCTAACACTGTTG
AGACTCTGTAAACCGACACGTTGTTAAGTATGTCTATGTGACTTAGCTGTGATAATAATA
TTTGAGTTGATAAAGAGTTGGCTTTTAGTTCTG

QA 9 821 9 821
DS 



AS 1 2

CO CL7061Contig1 732 2 2 U
GCAATAATCACAATCAAACAAACTTAATTTACCCTTATATAAAAGATGTGATGGCAATAC
CTTAAAAACACTTAAGACCACAAACAAAAAAATACATCAATATATTTCTCTAACAAGTTT
TCCTTAAGACACTGACTGACCAATAAAAATCTAACTTTAAAACATCCTTAGTGTGTATGC
TTATAGCAGAGCTAGAGGGATAAAACTCCGGTTCAATTTCATTAACGACAGGTACACGGT
TCGATCCATGGCGAAATCAAATTCAGAAACAAATCGACACGATCGCCACATGATCACCGG
CAGCTACCGTTACAAATAGAAAAAAAAAAGAGGATTGTAAACCTTGACGACGAGAGAAGT
AGTAGAATCCATCGCGAAAAGTGATCGAGGCTGGGATTGAATCAGAAAGGTGAATCCTTT
TTTAAGGGAGAAGCGCACCAGTTATCCGCTTATGTCGTCAACTACCCCAAATATCTAGAT
AGATACCGTCTCGCTTTATATATATGATCGGATGGTGCTTTTGTTTAAATGGGAATTTAA
TTACGTGTTTTGACCTTTCCAACAACAAGATATTATTTGACTTTTTCTTTATCATATTAC
TCCGTAATAGCAAGAGATGTTTAATACTTACCCAGGTATTATGGTTGTGAACTTGTGATA
TAATGATATACTAAATTTATAGCAAAAGATATTTAATACACTTACCCAACTAGGTATTAT
GGCGGTTAATCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AA09TF U 1
AF RR2AA09JQ C 1
BS 1 720 RR2AA09TF
BS 721 732 RR2AA09JQ

RD RR2AA09TF 720 0 0
GCAATAATCACAATCAAACAAACTTAATTTACCCTTATATAAAAGATGTGATGGCAATAC
CTTAAAAACACTTAAGACCACAAACAAAAAAATACATCAATATATTTCTCTAACAAGTTT
TCCTTAAGACACTGACTGACCAATAAAAATCTAACTTTAAAACATCCTTAGTGTGTATGC
TTATAGCAGAGCTAGAGGGATAAAACTCCGGTTCAATTTCATTAACGACAGGTACACGGT
TCGATCCATGGCGAAATCAAATTCAGAAACAAATCGACACGATCGCCACATGATCACCGG
CAGCTACCGTTACAAATAGAAAAAAAAAAGAGGATTGTAAACCTTGACGACGAGAGAAGT
AGTAGAATCCATCGCGAAAAGTGATCGAGGCTGGGATTGAATCAGAAAGGTGAATCCTTT
TTTAAGGGAGAAGCGCACCAGTTATCCGCTTATGTCGTCAACTACCCCAAATATCTAGAT
AGATACCGTCTCGCTTTATATATATGATCGGATGGTGCTTTTGTTTAAATGGGAATTTAA
TTACGTGTTTTGACCTTTCCAACAACAAGATATTATTTGACTTTTTCTTTATCATATTAC
TCCGTAATAGCAAGAGATGTTTAATACTTACCCAGGTATTATGGTTGTGAACTTGTGATA
TAATGATATACTAAATTTATAGCAAAAGATATTTAATACACTTACCCAACTAGGTATTAT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2AA09JQ 732 0 0
GCAATAATCACAATCAAACAAACTTAATTTACCCTTATATAAAAGATGTGATGGCAATAC
CTTAAAAACACTTAAGACCACAAACAAAAAAATACATCAATATATTTCTCTAACAAGTTT
TCCTTAAGACACTGACTGACCAATAAAAATCTAACTTTAAAACATCCTTAGTGTGTATGC
TTATAGCAGAGCTAGAGGGATAAAACTCCGGTTCAATTTCATTAACGACAGGTACACGGT
TCGATCCATGGCGAAATCAAATTCAGAAACAAATCGACACGATCGCCACATGATCACCGG
CAGCTACCGTTACAAATAGAAAAAAAAAAGAGGATTGTAAACCTTGACGACGAGAGAAGT
AGTAGAATCCATCGCGAAAAGTGATCGAGGCTGGGATTGAATCAGAAAGGTGAATCCTTT
TTTAAGGGAGAAGCGCACCAGTTATCCGCTTATGTCGTCAACTACCCCAAATATCTAGAT
AGATACCGTCTCGCTTTATATATATGATCGGATGGTGCTTTTGTTTAAATGGGAATTTAA
TTACGTGTTTTGACCTTTCCAACAACAAGATATTATTTGACTTTTTCTTTATCATATTAC
TCCGTAATAGCAAGAGATGTTTAATACTTACCCAGGTATTATGGTTGTGAACTTGTGATA
TAATGATATACTAAATTTATAGCAAAAGATATTTAATACACTTACCCAACTAGGTATTAT
GGCGGTTAATCG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL7062Contig1 1018 2 2 U
GGAGCTTCAGTGGCTCTTCTAGCTATGGCGGCCGAGAATTCTCCAGACGTCGATACGAGT
CTCGATTCCGATTCAAACCCTAACACTAACGTCAATGCTGATGTGATCAGTCACGACTCT
TCCAATGCGTTGGCAATCCCTTCTCCCGCCGTTTGTCTCGTCCGTTTCGCCGGAGATGCT
GCTGGCGGCGCCGTCATGGGCTCTGTATTCGGATATGGTTCCGGATTGTTTAAGAAGAAA
GGGTTTAAGGGATCGTTTGCTGATGCGGGTCAGTCTGCTAAGACTTTTGCGGTTTTATCA
GGAGTACACACTTTGGTTGTTTGCCTTCTGAAGAAACTGCGTGGGAAAGATGATGCGATT
AACGTTGGAGTTGCTGGGTGCTGCACTGGACTTGCTCTTAGTTTCCCCGGTAAGAACTGT
ACCCGTTTCTGAATTCATAATCCCTGAGATTTTTGCAAGTATATTTTATCGGCACCTGTT
CCTTTGCAATCAAGACGATGAAACTATCTGAGCTAATTTACTTTGACAGAGATCTCTTAA
AAAGTACATTTGCTACGCATTTGATGATCGTGTATGTGTTGCAGGTCCACCACAAGCAAT
GCTACAAAGCTGTATCACTTTTGGTGCCTTTTCTTTCATCCTCGAAAGACTCAACCAAAG
GCAAACAGCTTTGGCTCACTCTGTATCGTTGAGACATGATCAAAGCAGAAGTTTCAAAGA
TGATTTACCACTCTCTTTGGCTATCCCAATCCATGAAGAAATCAAAGGAGCTTTCTCTTC
TTGCTGCAGCTCTTTAACAAAACCCAGGAAGGTCGCAATTCCCCGCGCACGTTGAATTTT
GTTTCTTTACAACCTGTTTTTTTCAGACTTTTTGTAGATGTTGAAAACATGTGAAAATGG
TTTTGCGGCTTGAGCCAATGAGAAATGGAGATATATGTCTTAATCGAACTGTATAGCAAA
TAGTACTCGGATATACTACCATTGGTTATTACCATAACGAGTGACAAATTATACAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX37TF U 1
AF RR2EX37JQ C 402
BS 1 651 RR2EX37TF
BS 652 1018 RR2EX37JQ

RD RR2EX37TF 651 0 0
GGAGCTTCAGTGGCTCTTCTAGCTATGGCGGCCGAGAATTCTCCAGACGTCGATACGAGT
CTCGATTCCGATTCAAACCCTAACACTAACGTCAATGCTGATGTGATCAGTCACGACTCT
TCCAATGCGTTGGCAATCCCTTCTCCCGCCGTTTGTCTCGTCCGTTTCGCCGGAGATGCT
GCTGGCGGCGCCGTCATGGGCTCTGTATTCGGATATGGTTCCGGATTGTTTAAGAAGAAA
GGGTTTAAGGGATCGTTTGCTGATGCGGGTCAGTCTGCTAAGACTTTTGCGGTTTTATCA
GGAGTACACACTTTGGTTGTTTGCCTTCTGAAGAAACTGCGTGGGAAAGATGATGCGATT
AACGTTGGAGTTGCTGGGTGCTGCACTGGACTTGCTCTTAGTTTCCCCGGTAAGAACTGT
ACCCGTTTCTGAATTCATAATCCCTGAGATTTTTGCAAGTATATTTTATCGGCACCTGTT
CCTTTGCAATCAAGACGATGAAACTATCTGAGCTAATTTACTTTGACAGAGATCTCTTAA
AAAGTACATTTGCTACGCATTTGATGATCGTGTATGTGTTGCAGGTCCACCACAAGCAAT
GCTACAAAGCTGTATCACTTTTGGTGCCTTTTCTTTCATCCTCGAAAGACT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2EX37JQ 617 0 0
TTTCCCCGGTAAGAACTGTACCCGTTTCTGAATTCATAATCCCTGAGATTTTTGCAAGTA
TATTTTATCGGCACCTGTTCCTTTGCAATCAAGACGATGAAACTATCTGAGCTAATTTAC
TTTGACAGAGATCTCTTAAAAAGTACATTTGCTACGCATTTGATGATCGTGTATGTGTTG
CAGGTCCACCACAAGCAATGCTACAAAGCTGTATCACTTTTGGTGCCTTTTCTTTCATCC
TCGAAGGACTCAACCAAAGGCAAACAGCTTTGGCTCACTCTGTATCGTTGAGACATGATC
AAAGCAGAAGTTTCAAAGATGATTTACCACTCTCTTTGGCTATCCCAATCCATGAAGAAA
TCAAAGGAGCTTTCTCTTCTTGCTGCAGCTCTTTAACAAAACCCAGGAAGGTCGCAATTC
CCCGCGCACGTTGAATTTTGTTTCTTTACAACCTGTTTTTTTCAGACTTTTTGTAGATGT
TGAAAACATGTGAAAATGGTTTTGCGGCTTGAGCCAATGAGAAATGGAGATATATGTCTT
AATCGAACTGTATAGCAAATAGTACTCGGATATACTACCATTGGTTATTACCATAACGAG
TGACAAATTATACAGTC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL7063Contig1 533 2 2 U
GGAAACAGCACTAGCCAAGAAACCAAGAAATTTCTCCCAGAAAAAAAATAAGAAGAAAAT
GAAGCTTTGGAGTTCAAGATTATCGTTTATACTCGTGGTGATCTTTTTCTTCGCTGGACT
TCATATCTTCTCTGACGCCCGCAAGCTTCCTAGCATGACGGCTGTGGAGGAGTTCCAAGA
ACAGTTTCGGCAGGCAAGATTTGACGGTGAGCGAATATTATCGGAAGGGAACACCGGCAA
GAAGAACGATGAGATCTACGGAGTTTCAGTTAGAGAAGTTCCCGACGGTCCAAACCCGCT
TCACAACAAATGATACGTTTCATGTTATTTAACTTATGCTAGGTTTTTATTTGAGAAAGA
AATTCTCAGTTTTCTTGTCTCAACAAATGATCTCATGTATGACAGACACACACACACACA
TAGAAACTTTGTAGTATTTTTGTATTTAAATTTATTACATACAGCGTTCTTCAAATCATG
TATCAGTTGATTTTCGTTTCGTGGTAAGTAAATAAGGAAAAGATAAGATAGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F551JQ C 1
AF RR2F551TF U 1
BS 1 511 RR2F551TF
BS 512 533 RR2F551JQ

RD RR2F551JQ 533 0 0
GGAAACAGCACTAGCCAAGAAACCAAGAAATTTCTCCCAGAAAAAAAATAAGAAGAAAAT
GAAGCTTTGGAGTTCAAGATTATCGTTTATACTCGTGGTGATCTTTTTTTTCGCTGGACT
TCATATCTTTTCTGACGCCCGCAAGCTTCCTAGCATGACGGCTGTGGAGGAGTTCCAAGA
ACAGTTTCGGCAGGCAAGATTTGACGGTGAGCGAATATTATCGGAAGGGAACACCGGCAA
GAAGAACGATGAGATTTACGGAGTTTCAGTTAGAGAAGTTCCCGACGGTCCAAACCCGCT
TCACAACAAATGATACGTTTCATGTTATTTAACTTATGCTAGGTTTTTATTTGAGAAAGA
AATTTTCAGTTTTCTTGTCTCAACAAATGATTTCATGTATGACAGACACACACACACACA
TAGAAACTTTGTAGTATTTTTGTATTTAAATTTATTACATACAGCGTTCTTCAAATCATG
TATCAGTTGATTTTCGTTTCGTGGTAAGTAAATAAGGAAAAGATAAGATAGTT

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2F551TF 511 0 0
GGAAACAGCACTAGCCAAGAAACCAAGAAATTTCTCCCAGAAAAAAAATAAGAAGAAAAT
GAAGCTTTGGAGTTCAAGATTATCGTTTATACTCGTGGTGATCTTTTTCTTCGCTGGACT
TCATATCTTCTCTGACGCCCGCAAGCTTCCTAGCATGACGGCTGTGGAGGAGTTCCAAGA
ACAGTTTCGGCAGGCAAGATTTGACGGTGAGCGAATATTATCGGAAGGGAACACCGGCAA
GAAGAACGATGAGATCTACGGAGTTTCAGTTAGAGAAGTTCCCGACGGTCCAAACCCGCT
TCACAACAAATGATACGTTTCATGTTATTTAACTTATGCTAGGTTTTTATTTGAGAAAGA
AATTCTCAGTTTTCTTGTCTCAACAAATGATCTCATGTATGACAGACACACACACACACA
TAGAAACTTTGTAGTATTTTTGTATTTAAATTTATTACATACAGCGTTCTTCAAATCATG
TATCAGTTGATTTTCGTTTCGTGGTAAGTAA

QA 1 511 1 511
DS 



AS 1 2

CO CL7064Contig1 1115 2 14 U
GGAGAGCTCAAAGATCTTCCTGCATGGATTCTCTCGACTTGCCTCAAGCTTCATCATTCA
AGGGAGGAAGTGAAAAATTTCTCCGGGATGTGCTTGAAGGTATACTCAAAACATATTTGA
GGAAGAATCCGATGGCAAATACGGTATGGGAACTAGTTCAGTCAGTGGACAACGAAAAGA
TCTCCTACGACCACTTCTTCTTCAGGACAATCAAGGTCGATGGTTATGGAATAGATTTTC
TGTCGAGCTTTCTCATGGATTATGGATATCAAGTTGGAGGCAGACTTGATTTTCCAAAGA
AGCATGTACACGTTCTCTGGCTTTCTCCTCCGGATATTAACGTCCCTGGTGAAGGACACG
GTCTAGGCAACGGCCCCTTGCCACGAATTGTTATAGCTGAGCTTCTTGTGGACGAATTAA
GCCAAGAATCACAGGAGATAATAAGGAAGTATTTGAAACCAGAAGGTGGTAAGCAAGCCA
TTCTTTCAAGTACGTTGGGGTCTTTAATTTGGGAGAAGCCAACATCAGCCGACTTTAATC
AACTTGCCAAAGAGAGTGAATATGGGGCATGGGCGCTTTTCCACGGCTACACAATGAACC
ATCTTGCTTTTGCGGTCCATCGACTTAAACATCGTTTCAGTGACATTAAATGTGTCGAAG
AGTACTTCAAAGAAAAGGGATTCGAACTCAACAAAGACGGAGGAGATGTTCTCAAAGTGA
GTGAAGATGGTTTACTATTACAAGTGTCGTTAATGTCGGAGAAACATGAGGTTGAGTTTG
CAGATGGGGTAACTGAAACCATCACGGCTTCATACATTGAGTTCGTCCAACGTCTAGTTC
TTCCAGAGTTCAAAGATGTACCCGGTGATGAGATCAAAGAATTTCATAGACGCGAGGGCC
TCGAGCAAGCTAGCGCTTACCACATAATGGAAAGCACCCGTTTCACAGCGCAAGATTAAA
ACCAGCTGGCTTGTCTTGTTCTGCTCACTATGCCAGTGTTGTGTATCTGTAAAGCAAGAG
TGTTCTGAATATTTCTGTGTGTTTCATTAGGCTCAAGGCCAATCGTATATATACATCACA
TGAGATGCCGATAAGGCTTATCTCTATAACCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV50TF U 1
AF RR2DV50JQ C 419
BS 1 678 RR2DV50TF
BS 679 679 RR2DV50JQ
BS 680 702 RR2DV50TF
BS 703 703 RR2DV50JQ
BS 704 715 RR2DV50TF
BS 716 716 RR2DV50JQ
BS 717 724 RR2DV50TF
BS 725 725 RR2DV50JQ
BS 726 732 RR2DV50TF
BS 733 733 RR2DV50JQ
BS 734 742 RR2DV50TF
BS 743 743 RR2DV50JQ
BS 744 752 RR2DV50TF
BS 753 1115 RR2DV50JQ

RD RR2DV50TF 761 0 0
GGAGAGCTCAAAGATCTTCCTGCATGGATTCTCTCGACTTGCCTCAAGCTTCATCATTCA
AGGGAGGAAGTGAAAAATTTCTCCGGGATGTGCTTGAAGGTATACTCAAAACATATTTGA
GGAAGAATCCGATGGCAAATACGGTATGGGAACTAGTTCAGTCAGTGGACAACGAAAAGA
TCTCCTACGACCACTTCTTCTTCAGGACAATCAAGGTCGATGGTTATGGAATAGATTTTC
TGTCGAGCTTTCTCATGGATTATGGATATCAAGTTGGAGGCAGACTTGATTTTCCAAAGA
AGCATGTACACGTTCTCTGGCTTTCTCCTCCGGATATTAACGTCCCTGGTGAAGGACACG
GTCTAGGCAACGGCCCCTTGCCACGAATTGTTATAGCTGAGCTTCTTGTGGACGAATTAA
GCCAAGAATCACAGGAGATAATAAGGAAGTATTTGAAACCAGAAGGTGGTAAGCAAGCCA
TTCTTTCAAGTACGTTGGGGTCTTTAATTTGGGAGAAGCCAACATCAGCCGACTTTAATC
AACTTGCCAAAGAGAGTGAATATGGGGCATGGGCGCTTTTCCACGGCTACACAATGAACC
ATCTTGCTTTTGCGGTCCATCGACTTAAACATCGTTTCAGTGACATTAAATGTGTCGAAG
AGTACTTCAAAGAAAAGG*ATTCGAACTCAACAAAGACGGAG*AGATGTTCTCAA*GTGA
GTGA*GATGGTT*ACTATTACA*GTGTCGTTA
TGTCGAGAA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2DV50JQ 697 0 0
AAGCCAAGAATCACAGGAGATAATAAGGAAGTATTTGAAACCAGAAGGTGGTAAGCAAGC
CATTCTTTCAAGTACGTTGGGGTCTTTAATTTGGGAGAAGCCAACATCAGCCGACTTTAA
TCAACTTGCCAAAGAGAGTGAATATGGGGCATGGGCGCTTTTCCACGGCTACACAATGAA
CCATCTTGCTTTTGCGGTCCATCGACTTAAACATCGTTTCAGTGACATTAAATGTGTCGA
AGAGTACTTCAAAGAAAAGGGATTCGAACTCAACAAAGACGGAGGAGATGTTCTCAAAGT
GAGTGAAGATGGTTTACTATTACAAGTGTCGTTAATGTCGGAGAAACATGAGGTTGAGTT
TGCAGATGGGGTAACTGAAACCATCACGGCTTCATACATTGAGTTCGTCCAACGTCTAGT
TCTTCCAGAGTTCAAAGATGTACCCGGTGATGAGATCAAAGAATTTCATAGACGCGAGGG
CCTCGAGCAAGCTAGCGCTTACCACATAATGGAAAGCACCCGTTTCACAGCGCAAGATTA
AAACCAGCTGGCTTGTCTTGTTCTGCTCACTATGCCAGTGTTGTGTATCTGTAAAGCAAG
AGTGTTCTGAATATTTCTGTGTGTTTCATTAGGCTCAAGGCCAATCGTATATATACATCA
CATGAGATGCCGATAAGGCTTATCTCTATAACCGACT

QA 1 697 1 697
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7066Contig1 439 2 1 U
CTCTCTCATGATCAGAAAGAGAAAAAAGGAAGAAAACACCATTCAAAACAAAAGAGAGCA
GATCAAGTTTGATTTGTCTCAGATAAACCTTTTTTTGTGCACCTGTCTCAGATCAAACCA
AGAAGCTGTATGTCTATCTTTTAGCTCAGTCAGATATAGACAAAGCTGTATACGTGTGAT
TCGAACAGTGGATGCTCTTGTCACGGGTCCACTTTGTTCTCGGTTCAGAATTTTCAAGCC
CATATCAGAGTTACACTAGAAGAAGAGCAGAAGATAGAAAACACCATTCAACAAAAGACA
GAATCTTTTGTGATAAATTTGATTCGGCTTTAGCATTACAAGTAGAGGAGCATTGGTTTG
GTAGGATCTGTCGCTTATAGCAGTCTTTGAGAACTTGAGGGTTTGGTAGGATCTGTCGGA
TGCTAGATTAGAAAGAACC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AB64TF U 1
AF RR2AB64JQ C 3
BS 1 439 RR2AB64TF

RD RR2AB64TF 439 0 0
CTCTCTCATGATCAGAAAGAGAAAAAAGGAAGAAAACACCATTCAAAACAAAAGAGAGCA
GATCAAGTTTGATTTGTCTCAGATAAACCTTTTTTTGTGCACCTGTCTCAGATCAAACCA
AGAAGCTGTATGTCTATCTTTTAGCTCAGTCAGATATAGACAAAGCTGTATACGTGTGAT
TCGAACAGTGGATGCTCTTGTCACGGGTCCACTTTGTTCTCGGTTCAGAATTTTCAAGCC
CATATCAGAGTTACACTAGAAGAAGAGCAGAAGATAGAAAACACCATTCAACAAAAGACA
GAATCTTTTGTGATAAATTTGATTCGGCTTTAGCATTACAAGTAGAGGAGCATTGGTTTG
GTAGGATCTGTCGCTTATAGCAGTCTTTGAGAACTTGAGGGTTTGGTAGGATCTGTCGGA
TGCTAGATTAGAAAGAACC

QA 1 439 1 439
DS 

RD RR2AB64JQ 437 0 0
CTT
TCATGATCAGAAAGAGAAAAAAGGAAGAAAACACCATTCAAAACAAAAGAGAGCAGATCA
AGTTTGATTTGTTTCAGATAAACCTTTTTTTGTGCACCTGTCTCAGATCAAACCAAGAAG
CTGTATGTCTATCTTTTAGCTCAGTCAGATATAGACAAAGCTGTATACGTGTGATTCGAA
CAGTGGATGCTCTTGTCACGGGTCCACTTTGTTCTCGGTTCAGAATTTTCAAGCCCATAT
CAGAGTTACACTAGAAGAAGAGCAGAAGATAGAAAACACCATTCAACAAAAGACAGAATC
TTTTGTGATAAATTTGATTCGGCTTTAGCATTACAAGTAGAGGAGCATTGGTTTGGTAGG
ATCTGTCGCTTATAGCAGTCTTTGAGAACTTGAGGGTTTGGTAGGATCTGTCGGATGCTA
GATTAGAAAGAACC

QA 4 437 4 437
DS 



AS 1 2

CO CL7067Contig1 516 2 1 U
GGGAGTGGTGCCAGATGGAGGCTCTGTGGGCGACGTTTCATACCCTTACGGTGGTGCTGC
AACGAGTGTAACCGACCCGGGAACTCAGAGGGCAGTTCCTCTAACGGCAGCGGAGAGAGA
GGCGAGAGTAATGAGGTACAGGGAGAAGAGGAAGAACAGGAAGTTCGAGAAGACGATAAG
GTATGCTTCGAGGAAAGCGTATGCGGAGATGAGATCTAGGATCAAGGGAAGGTTTGCAAA
GCGGACTGATTCGAATGAGAGCAGCAACGACGTGGTTGTTGGTGGTCATGGCGGTGGTAT
CTTTAGCGGGTTTGGACTTGTACCTACATTTTAGAGGGATTGCTGAGTGAGTGAGAGGCT
CTTAATATGTGGGTACTTTGTTTGGTGTCGTTTTAGTAATAATGTTTTATTAACAAACTT
TTGTCTTTTAAGAGTTGTTTTGTTTTATTTATGTTGATGTAATGTTTTATATTTTCGTGT
ATATATGATTATGTGATTTTGAACAAGTTTTTGTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F005JQ C 1
AF RR2F005TF U 1
BS 1 516 RR2F005TF

RD RR2F005JQ 516 0 0
GGGAGTGGTGCCAGATGGAGGCTCTGTGGGCGACGTTTCATACCCTTACGGTGGTGCTGC
AACGAGTGTAACCGACCCGGGAACTCAGAGGGCAGTTCCTCTAACGGCAGCGGAGAGAGA
GGCGAGAGTAATGAGGTACAGGGAGAAGAGGAAGAACAGGAAGTTCGAGAAGACGATAAG
GTATGCTTCGAGGAAAGCGTATGCGGAGATGAGATCTAGGATCAAGGGAAGGTTTGCAAA
GCGGACTGATTCGAATGAGAGCAGCAACGACGTGGTTGTTGGTGGTCATGGCGGTGGTAT
CTTTAGCGGGTTTGGACTTGTACCTACATTTTAGAGGGATTGCTGAGTGAGTGAGAGGCT
CTTAATATGTGGGTACTTTGTTTGGTGTCGTTTTAGTAATAATGTTTTATTAACAAACTT
TTGTCTTTTAAGAGTTGTTTTGTTTTATTTATGTTGATGTAATGTTTTATATTTTCGTGT
ATATATGATTATGTGATTTTGAACAAGTTTTTGTGC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2F005TF 516 0 0
GGGAGTGGTGCCAGATGGAGGCTCTGTGGGCGACGTTTCATACCCTTACGGTGGTGCTGC
AACGAGTGTAACCGACCCGGGAACTCAGAGGGCAGTTCCTCTAACGGCAGCGGAGAGAGA
GGCGAGAGTAATGAGGTACAGGGAGAAGAGGAAGAACAGGAAGTTCGAGAAGACGATAAG
GTATGCTTCGAGGAAAGCGTATGCGGAGATGAGATCTAGGATCAAGGGAAGGTTTGCAAA
GCGGACTGATTCGAATGAGAGCAGCAACGACGTGGTTGTTGGTGGTCATGGCGGTGGTAT
CTTTAGCGGGTTTGGACTTGTACCTACATTTTAGAGGGATTGCTGAGTGAGTGAGAGGCT
CTTAATATGTGGGTACTTTGTTTGGTGTCGTTTTAGTAATAATGTTTTATTAACAAACTT
TTGTCTTTTAAGAGTTGTTTTGTTTTATTTATGTTGATGTAATGTTTTATATTTTCGTGT
ATATATGATTATGTGATTTTGAACAAGTTTTTGTGC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL7068Contig1 825 2 9 U
GTCAAAAAAGAAACACGGATTGATACTGTAAATCGTCAAGATTGTCATGTTTTTGAGCTA
ACAAACTTAAACCTTACAATTATCAATCAGAAGCTTCATCACAAGAGTCATCATCACCAC
TCTCATCCACATCATCATCATCGTTATCACCATCGGATAAAACTTCCTCGGCATGTTCAC
AGCCCGTTTCTTCTACCATAACCAAAGGAAACTTCAGAGGTTCCTCTGGCGACTCCTTGA
AGAATGAGTTCATTTCCATGAAGCGGAGGACCTGTAACAACTGGATCTTGTCTTTCTTTA
TGTCAGCGCTCAGGAGCTACTCAAGCAATGTAGGTTCTCTCGTCGTGATGGTAGAAGATT
CTTCAAATGAATCTTTGTCTTGGAACTTCCGTCTTTTATCGAACTTGTCTTTACCACCAT
ATCTTCTCTTGTTATGTCTAAATCTTCCCTTCCTGCCATCCTTGTTTTGGAACTGTACAC
TGTTGTCTCCATTAACTTGCTCAACTGGATTGGATAAATAGTGTGAAGGGACTTCTGCTA
CTTCAACGCCTAGCTCACGCTACTTTGCTAACACTTCCCGGAGTTGCTGACGACGCAGTT
TTGCTTCATCGTCAAGGCTGGAGTTTGAATCATTTTTCTTTATTTTCTTTTCAACGTTGA
GTTTCGTTGGAAAATTCTTACGCCGAGCTTGACGCCATTGCTGAACTTCTTTTGGAGGAT
AGTTCGGAATGTTCGGTCTTTTCGTATCTTCAGCGATACCAGCATCAGATCCATAAATCC
TAGTGCCATCTTATTATTCTTCCCTTTTCACTTATGAGCCTTGTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA11JQ U 1
AF RR2BU57JQ U 1
BS 1 318 RR2BU57JQ
BS 319 319 RR2FA11JQ
BS 320 365 RR2BU57JQ
BS 366 366 RR2FA11JQ
BS 367 561 RR2BU57JQ
BS 562 562 RR2FA11JQ
BS 563 570 RR2BU57JQ
BS 571 571 RR2FA11JQ
BS 572 825 RR2BU57JQ

RD RR2FA11JQ 725 0 0
GTCAAAAAAGAAACACGGATTGATGCTGTAAATCGTCAAGATTGTCATGTTTTTGAGCTA
ACAAACTTAAACCTTACAATTATCAATCAGAAGCTTCATCACAAGAGTCATCATCACCAC
TCTCATCCACATCATCATCATCGTTATCACCATCGGATAAAACTTCCTCGGCATGTTCAC
AGCCCGTTTCTTCTACCATAACCAAAGGGAACTTCAGAGGTTCCTCTGGCGACTCCTTGA
AGAATGAGTTCATTTCCATGAAGCGGAGGACCTGTAACAACTGGATCTTGTCTTTCTTTA
TGTCAGCGCTCAGGAGCTACTCAAGCAATGTAGGTTCTCTCGTCGTGATGGTAGAAGATT
CTTCAAATGAATCTTTGTCTTGGAACTTCCGTCTTTTATCGAACTTGTCTTTACCACCAT
ATCTTCTCTTGTTATGTCTAAATCTTCCCTTCCTGCCATCCTTGTTTTGGAACTGTCCAC
TGTTGTCTCCATTAACTTGCTCAACTGGATTGGATAAATAGTGTGAAGGGACTTCTGCTA
CTTCAACGCCTAGCTCACGCTACTTTGCTAACACTTCCCGGAGTTGCTGACGACGCAGTT
TTGCTTCATCGTCAAGGCTGGAGTTTGAAT*ATTTTTCTTTATTTTCTTTTCAACGTTGA
GTTTCGTTGGAAAATTCTTACGCCGAGCTTGACGCCATTGCTGAACTTCTTTTGGAGGAT
AGTTC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2BU57JQ 825 0 0
GTCAAAAAAGAAACACGGATTGATACTGTAAATCGTCAAGATTGTCATGTTTTTGAGCTA
ACAAACTTAAACCTTACAATTATCAATCAGAAGCTTCATCACAAGAGTCATCATCACCAC
TCTCATCCACATCATCATCATCGTTATCACCATCGGATAAAACTTCCTCGGCATGTTCAC
AGCCCGTTTCTTCTACCATAACCAAAGGAAACTTCAGAGGTTCCTCTGGCGACTCCTTGA
AGAATGAGTTCATTTCCATGAAGCGGAGGACCTGTAACAACTGGATCTTGTCTTTCTTTA
TGTCAGCGCTCAGGAGCTTCTCAAGCAATGTAGGTTCTCTCGTCGTGATGGTAGAAGATT
CTTCAGATGAATCTTTGTCTTGGAACTTCCGTCTTTTATCGAACTTGTCTTTACCACCAT
ATCTTCTCTTGTTATGTCTAAATCTTCCCTTCCTGCCATCCTTGTTTTGGAACTGTACAC
TGTTGTCTCCATTAACTTGCTCAACTGGATTGGATAAATAGTGTGAAGGGACTTCTGCTA
CTTCAACGCCTAGCTCACGCTGCTTTGCTAGCACTTCCCGGAGTTGCTGACGACGCAGTT
TTGCTTCATCGTCAAGGCTGGAGTTTGAATCATTTTTCTTTATTTTCTTTTCAACGTTGA
GTTTCGTTGGAAAATTCTTACGCCGAGCTTGACGCCATTGCTGAACTTCTTTTGGAGGAT
AGTTCGGAATGTTCGGTCTTTTCGTATCTTCAGCGATACCAGCATCAGATCCATAAATCC
TAGTGCCATCTTATTATTCTTCCCTTTTCACTTATGAGCCTTGTT

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

CO CL7069Contig1 553 2 2 U
GGTTACGCAGCAATTGCAGATTCAACTGTCTTACGCAGATGCAGTGATTGGGACATCAGG
TTCAAACATAAGCTACACTCGACGTCTTAGTGGAGCAACAGTAACCATTCAGGAAACCAG
AGGAGTACCTGGTGAAATGACCGTTGAGGTTAGCGGAACTAGCTCACAAGTCCAAACCGC
TATTCAGCTTATCCAGAACTTCATGGCTGAAGCTGGAGCCCCAGCACCAGCACAGCCGCA
AACTGTAGCGCCAGAGCAGCAAGGCTATAACCCTTACGCAACTCATGGCTCAGTCTATGC
AGCGGCTCCAACGAACCCGCCTGGAGGATATGCTACGGATTACAGCTCAGGCTATGGTTA
CTGATCAAGGATCATTATCAAGTTACTTTTGTTTAGAATGTTCTACTAGTGACAAGCAAG
AGTGAGCGAACCCTAATCGAGTATATGTTTTTATAAGCAAGCACTCTGTTTCTTGAATCA
GTTGTCATTTGTTTTCCAGGCATGGTGTTGTGTACCGTTCAGTATTTGTCTTTATGAATT
TGAACTAGTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CS81JQ C 1
AF RR2CS81TF U 7
BS 1 6 RR2CS81JQ
BS 7 553 RR2CS81TF

RD RR2CS81JQ 553 0 0
GGTTACGCAGCAATTGCAGATTCAACTGTCTTACGCAGATGCAGTGATTGGGACATCAGG
TTCAAACATAAGCTACACTCGACGTCTTAGTGGAGCAACAGTAACCATTCAGGAAACCAG
AGGAGTACCTGGTGAAATGACCGTTGAGGTTAGCGGAACTAGCTCACAAGTCCAAACCGC
TATTCAGCTTATCCAGAACTTCATGGCTGAAGCTGGAGCCCCAGCACCAGCACAGCCGCA
AACTGTAGCGCCAGAGCAGCAAGGCTATAACCCTTACGCAACTCATGGCTCAGTCTATGC
AGCGGCTCCAACGAACCCGCCTGGAGGATATGCTACGGATTACAGCTCAGGCTATGGTTA
CTGATCAAGGATCATTATCAAGTTACTTTTGTTTAGAATGTTCTACTAGTGACAAGCAAG
AGTGAGCGAACCCTAATCGAGTATATGTTTTTATAAGCAAGCACTCTGTTTCTTGAATCA
GTTGTCATTTGTTTTCCAGGCATGGTGTTGTGTACCGTTCAGTATTTGTCTTTATGAATT
TGAACTAGTAGCC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2CS81TF 547 0 0
GCAGCAATTGCAGATTCAACTGTCTTACGCAGATGCAGTGATTGGGACATCAGGTTCAAA
CATAAGCTACACTCGACGTCTTAGTGGAGCAACAGTAACCATTCAGGAAACCAGAGGAGT
ACCTGGTGAAATGACCGTTGAGGTTAGCGGAACTAGCTCACAAGTCCAAACCGCTATTCA
GCTTATCCAGAACTTCATGGCTGAAGCTGGAGCCCCAGCACCAGCACAGCCGCAAACTGT
AGCGCCAGAGCAGCAAGGCTATAACCCTTACGCAACTCATGGCTCAGTCTATGCAGCGGC
TCCAACGAACCCGCCTGGAGGATATGCTACGGATTACAGCTCAGGCTATGGTTACTGATC
AAGGATCATTATCAAGTTACTTTTGTTTAGAATGTTCTACTAGTGACAAGCAAGAGTGAG
CGAACCCTAATCGAGTATATGTTTTTATAAGCAAGCACTCTGTTTCTTGAATCAGTTGTC
ATTTGTTTTCCAGGCATGGTGTTGTGTACCGTTCAGTATTTGTCTTTATGAATTTGAACT
AGTAGCC

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 2

CO CL7070Contig1 677 2 3 U
GGATTCTGTTTGATCCAGCTGCATCGCTCTCCTTCTCCGTTAACGGCGACACACCAGTAG
AATAGAATCTCCGCCGCCGGCGACATAAGGAAGAGTTGTCTATCTAGAGATGGCGTCAAA
GTTACTACAACTGAAATCGAAGGCCTGTGAAGCATCCAAGTTTGTGTCGAAGCACGGCAC
GACTTACTACAAACAGTTACTGGAGAAGAACAAGCAGTATATCCAGGAGCCAGCCACTGT
CGAGAAATGCAATGAGTTGTCTAAGCAGCTTCTCTACACTCGTCTTGCTAGCATTCCTGG
ACGTACTGAGTTGTTCTGGAAGGAAGTGGATCACGTGAAAGGCTTGTGGAAGAATAGGGC
GGATTTGAAGGTGAAGATGCTGGAATCGCAGCACTTTTCGGTCTGGAATGCTTTGCCTGG
TACTGTGCAGGTGAGATCGTTGGAAGAGGCTTCACTTTCACCGGCTACTACCCTTGAAAG
AAAACAAAAGCAAATCATTGAAACGCTGAAAAACAGCCTTTTTTTAAATCCATAAACTGG
CGGTTTATCATCGCATTAGATCCAAAAGTTGATTTCTTTTTCTCTGTCTTTGGATAATTT
AATACACACAAGTTTTGAAGCTGAGGCGTCATCACTCATGCTAGCTCTTAATAATATCAA
AGGACAACATGTTTGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GY44JQ C 1
AF RR2GY44TF U 1
BS 1 662 RR2GY44TF
BS 663 663 RR2GY44JQ
BS 664 677 RR2GY44TF

RD RR2GY44JQ 677 0 0
GGATTCTGTTTGATCCAGCTGCATCGCTCTCCTTCTCCGTTAACGGCGACACACCAGTAG
AATAGAATCTCCGCCGCCGGCGACATAAGGAAGAGTTGTCTATCTAGAGATGGCGTCAAA
GTTACTACAACTGAAATCGAAGGCCTGTGAAGCATCCAAGTTTGTGTCGAAGCACGGCAC
GACTTACTACAAACAGTTACTGGAGAAGAACAAGCAGTATATCCAGGAGCCAGCCACTGT
CGAGAAATGCAATGAGTTGTCTAAGCAGCTTCTCTACACTCGTCTTGCTAGCATTCCTGG
ACGTACTGAGTTGTTCTGGAAGGAAGTGGATCACGTGAAAGGCTTGTGGAAGAATAGGGC
GGATTTGAAGGTGAAGATGCTGGAATCGCAGCACTTTTCGGTCTGGAATGCTTTGCCTGG
TACTGTGCAGGTGAGATCGTTGGAAGAGGCTTCACTTTCACCGGCTACTACCCTTGAAAG
AAAACAAAAGCAAATCATTGAAACGCTGAAAAACAGCCTTTTTTTAAATCCATAAACTGG
CGGTTTATCATCGCATTAGATCCAAAAGTTGATTTCTTTTTCTCTGTCTTTGGATAATTT
AATACACACAAGTTTTGAAGCTGAGGCGTCATCACTCATGCTAGCTCTTAATAATATCAA
AGGACAACATGTTTGCC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2GY44TF 677 0 0
GGATTCTGTTTGATCCAGCTGCATCGCTCTCCTTCTCCGTTAACGGCGACACACCAGTAG
AATAGAATCTCCGCCGCCGGCGACATAAGGAAGAGTTGTCTATCTAGAGATGGCGTCAAA
GTTACTACAACTGAAATCGAAGGCCTGTGAAGCATCCAAGTTTGTGTCGAAGCACGGCAC
GACTTACTACAAACAGTTACTGGAGAAGAACAAGCAGTATATCCAGGAGCCAGCCACTGT
CGAGAAATGCAATGAGTTGTCTAAGCAGCTTCTCTACACTCGTCTTGCTAGCATTCCTGG
ACGTACTGAGTTGTTCTGGAAGGAAGTGGATCACGTGAAAGGCTTGTGGAAGAATAGGGC
GGATTTGAAGGTGAAGATGCTGGAATCGCAGCACTTTTCGGTCTGGAATGCTTTGCCTGG
TACTGTGCAGGTGAGATCGTTGGAAGAGGCTTCACTTTCACCGGCTACTACCCTTGAAAG
AAAACAAAAGCAAATCATTGAAACGCTGAAAAACAGCCTTTTTTTAAATCCATAAACTGG
CGGTTTATCATCGCATTAGATCCAAAAGTTGATTTCTTTTTCTCTGTCTTTGGATAATTT
AATACACACAAGTTTTGAAGCTGAGGCGTCATCACTCATGCTAGCTCTTAATAATATCAA
AG*ACAACATGTTTGCC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL7071Contig1 941 2 2 U
GGGTTAGACTAAGTTCAGTGAACACTCACATGATTTATTGTCGTAGACCTGGACTTTTGC
TAGCAACGAGGAAAGCCTTGGATAATCTTGGATTTGGATGTCATCAAGCGGTGATTAGCT
GTTTCAACGGGTTTTCCGTTGATGTTTTCCGTGCGCTGAAGTGAGAACAATAACATTATT
TACCTTTCACTTAAAACAGTTTGGATTCTTACAAGAACTTTGTAGTTCCTTATTTCTTTG
TTTGTGAATATCAGCAATACCAAGGACATGAGATATTGCTTGATAGAATCAAAGCAGTCC
TTTCCGATACAGTGGGATACGCTGGTATGATCTTGAGCTAATCCTGAGTCAAGGTCCTTG
AGCATTTGATGATGTCGAGCTGTAAGAGCAAGGCCTTTAAATTTGCAATTTTCTTCTCTT
TTTCCTTTTTATTTACAAAGCCTGTTTGAACCAAGCATGACTTTCAAACCTTTTCACAAA
TTCATTATGTTTCATGTCCTCAAGCTATGATTCATAGATTTTAATAAATATGGTTGAGTT
TTCTTTTTATGAGTAATCTTCTCAAAAGAGGTGCAAAAGATGATTCGATCATATGATTTA
AGCTAGCTTTTTCACATATACGATCTCTGACAGAATCTAATATATCATACAAATCAATCC
CAAGTTACGAGATAGTTTGGGCTAAGCAGATGCATTAGATTTTGGAGTTTTTTCGATAAT
GATGATGATGATAAAGATGTTAGAAAGAAGTTCACGTTGTGATTTGAGGAATGAACATTA
AAACTACAAAATTGTGGACACAATTAGCAATTCAAGTTTCTTAATTTACAACATAAAAAA
CCAAAAATAATTACGCAGACGTAAAAAATAAATATTTTGAAGTATTGTGAACACGAAATG
TAAGGTAATTATGTTTAATGAAATTATAAAATATTATGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG92TF U 1
AF RR2CG92JQ C 234
BS 1 672 RR2CG92TF
BS 673 941 RR2CG92JQ

RD RR2CG92TF 672 0 0
GGGTTAGACTAAGTTCAGTGAACACTCACATGATTTATTGTCGTAGACCTGGACTTTTGC
TAGCAACGAGGAAAGCCTTGGATAATCTTGGATTTGGATGTCATCAAGCGGTGATTAGCT
GTTTCAACGGGTTTTCCGTTGATGTTTTCCGTGCGCTGAAGTGAGAACAATAACATTATT
TACCTTTCACTTAAAACAGTTTGGATTCTTACAAGAACTTTGTAGTTCCTTATTTCTTTG
TTTGTGAATATCAGCAATACCAAGGACATGAGATATTGCTTGATAGAATCAAAGCAGTCC
TTTCCGATACAGTGGGATACGCTGGTATGATCTTGAGCTAATCCTGAGTCAAGGTCCTTG
AGCATTTGATGATGTCGAGCTGTAAGAGCAAGGCCTTTAAATTTGCAATTTTCTTCTCTT
TTTCCTTTTTATTTACAAAGCCTGTTTGAACCAAGCATGACTTTCAAACCTTTTCACAAA
TTCATTATGTTTCATGTCCTCAAGCTATGATTCATAGATTTTAATAAATATGGTTGAGTT
TTCTTTTTATGAGTAATCTTCTCAAAAGAGGTGCAAAAGATGATTCGATCATATGATTTA
AGCTAGCTTTTTCACATATACGATCTCTGACAGAATCTAATATATCATACAAATCAATCC
CAAGTTACGAGA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2CG92JQ 708 0 0
TTCTTTGTTTGTGAATATCAGCAATACCAAGGACATGAGATATTGCTTGATAGAATCAAA
GCAGTCCTTTCCGATACAGTGGGATACGCTGGTATGATCTTGAGCTAATCCTGAGTCAAG
GTCCTTGAGCATTTGATGATGTCGAGCTGTAAGAGCAAGGCCTTTAAATTTGCAATTTTC
TTCTCTTTTTCCTTTTTATTTACAAAGCCTGTTTGAACCAAGCATGACTTTCAAACCTTT
TCACAAATTCATTATGTTTCATGTCCTCAAGCTATGATTCATAGATTTTAATAAATATGG
TTGAGTTTTCTTTT*ATGAGTAATCTTCTCAAAAGAGGTGCAAAAGATGATTCGATCATA
TGATTTAAGCTAGCTTTTTCACATATACGATTTCTGACAGAATCTAATATATCATACAAA
TCAATCCCAAGTTACGAGATAGTTTGGGCTAAGCAGATGCATTAGATTTTGGAGTTTTTT
CGATAATGATGATGATGATAAAGATGTTAGAAAGAAGTTCACGTTGTGATTTGAGGAATG
AACATTAAAACTACAAAATTGTGGACACAATTAGCAATTCAAGTTTCTTAATTTACAACA
TAAAAAACCAAAAATAATTACGCAGACGTAAAAAATAAATATTTTGAAGTATTGTGAACA
CGAAATGTAAGGTAATTATGTTTAATGAAATTATAAAATATTATGTAC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL7072Contig1 723 2 3 U
GGACAAAAGATGAAGCAACACTCTTATTTATCATATAGTCTTAAGCATTCCACAGACCAC
AAGTGCGTTAACTAAGATGAAGCATACGTGCATGAAATTCAAATCAAAGCTAAGATGAAG
CAACACTCTTATTTATCAGATAGTCTTAAGTATTCCACAAACCACAAGTGCGTTAACTAA
GAAAACAAAGTCAAAGGAAAATAAGAAACGATAGTTATATGGGTTTCATCTAGATCATGG
AAAGAGCCTCCTCGAGTATGCCATCTTCCAAAACAGACATGAAACTTTCAGTGTTTCTGG
CGGAACAGTTTGCACGAATCTCTCCTTGTGACCCCGTCAAAACACTCATCTGACCCATCT
TGATCATCCCCACCACAAAATGATCAAAAAACAGCTTCTGGTCGATCGCAAAGCTCTCCA
CGATACCACGTGTCCTCTTGTCCGTGAACAGGTCCTGGTCGGATGTGAATAGCCCTTGTC
GGTTCATGAGATCAACGTAGTACTTGTTGTCAAACACGTCAGGGCTCCTTATGTCATTCA
CTTGCGTGTTGCTCGAGTTAGCAGTGGGGCAAGTGCGTTTGAGGTTGTTGGCGAAAGACT
TGTTCATTGTTGGGTCTTGGTTCGGGTAGAGCCTGTCTGTGAAAGACGGACAATGCCCGA
TCCCGATGGTGTGTCCACCAGAAAGTGCTACTAAGTCGGTGATGTTGAGGTTTCTATTGG
CGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2CA18JQ U 239
AF RR2FQ69JQ U 1
BS 1 656 RR2FQ69JQ
BS 657 657 RR2CA18JQ
BS 658 723 RR2FQ69JQ

RD RR2CA18JQ 447 0 0
GGAAAGAGTCTCCTCGAGTATGCCATCTTCCAAAACAGACATGAAACTTTCAGTGTTTCT
GGCGGAACAGTTTGCACGAATCTCTCCTTGTGACCCCGTCAAAACACTCATCTGACCCAT
CTTGATCATCCCCACCACAAAATGATCAAAAAACAGCTTCTGGTCGATCGCAAAGCTCTC
CACGATACCACGTGTCCTCTTGTCCGTGAACAGGTCCTGGTCGGATGTGAATAGCCCTTG
TCGGTTCATGAGATCAACGTAGTACTTGTTGTCAAACACGTCAGGGCTCCTTATGTCATT
CACTTGCGTGTTGCTCGAGTTAGCAGTGGGGCAAGTGCGTTTGAGGTTGTTGGCGAAAGA
CTTGTTCATTGTTGGGTCTTGGTTCGGGTAGAGCCTGTCTGTGAAAGACGGACAATGCCC
GATCCCGATGGTGTGTCCACCATAAAG

QA 1 447 1 447
DS 

RD RR2FQ69JQ 723 0 0
GGACAAAAGATGAAGCAACACTCTTATTTATCATATAGTCTTAAGCATTCCACAGACCAC
AAGTGCGTTAACTAAGATGAAGCATACGTGCATGAAATTCAAATCAAAGCTAAGATGAAG
CAACACTCTTATTTATCAGATAGTCTTAAGTATTCCACAAACCACAAGTGCGTTAACTAA
GAAAACAAAGTCAAAGGAAAATAAGAAACGATAGTTATATGGGTTTCATCTAGATCATGG
AAAGAGCCTCCTCGAGTATGCCATCTTCCAAAACAGACATGAAACTTTCAGTGTTTCTGG
CGGAACAGTTTGCACGAATCTCTCCTTGTGACCCCGTCAAAACACTCATCTGACCCATCT
TGATCATCCCCACCACAAAATGATCAAAAAACAGCTTCTGGTCGATCGCAAAGCTCTCCA
CGATACCACGTGTCCTCTTGTCCGTGAACAGGTCCTGGTCGGATGTGAATAGCCCTTGTC
GGTTCATGAGATCAACGTAGTACTTGTTGTCAAACACGTCAGGGCTCCTTATGTCATTCA
CTTGCGTGTTGCTCGAGTTAGCAGTGGGGCAAGTGCGTTTGAGGTTGTTGGCGAAAGACT
TGTTCATTGTTGGGTCTTGGTTCGGGTAGAGCCTGTCTGTGAAAGACGGACAATGCGCGA
TCCCGATGGTGTGTCCACCAGAAAGTGCTACTAAGTCGGTGATGTTGAGGTTTCTATTGG
CGA

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL7073Contig1 875 2 1 U
GGAGATCGTTCACAGCGACACACTGTAGAGAGAAGAAAGAAGCTTACAGAAGTTACAATG
GCGTCAAGAAGAGTATCTTCACTGCTCTCTCGCTCCTTCATGTCCTCCTCGCCTTCTCTT
TTCGCCCTCAGAGGCGAGGACCCTGTCATGATGAACAGAGGAGGTAACAGATACAGCAAC
CACGCTGAAGACACGATCACTCCGCCTGTGAAAGTGGAGCACACACAGCTCTTAATCAAC
GGAAAGTTCGTTGATGCCGCCTCAGGAAAGACGTTCCCCACTTTGGATCCAAGAAGTGGA
GAACTCATCGCTCAGGTTGCTGAAGGTGACGTGGAAGACGTGAACCGTGCCGTTTCAGCT
GCACGCAAGGCCTTTGATGAGGGTCCATGGCCTAGAATGACTGCTTATGAGAGATCAAAG
ATACTACTTCGTTTCGCTGACTTGGTCGACAAACACAACGACGAGATTGCTGCTCTTGAG
ACTTGGGACAATGGGAAGCCTTTTGAACAGTCTGCCAAGGTTGAAGTCCCTATGCTCGCT
AGGGTGTTCCGTTACTATGCTGGTTGGGCAGACAAGATCCATGGATTGACGGTTCCAGGA
GATGGTTCACACCATGTTCAGACACTCCATGAGCCTATTGGAGTCGCTGGACAGATCATC
CCTTGGAACTTCCCTCTTCTCATGCTTTCTTGGAAACTTGGACCAGCTTTGGCTTGCGGT
AACACCGTTGTTCTCAAGACGGCTGAGCAAACTCCTCTCTCTGCTCTTCTTGTTGGAAGA
TTACTTTACGAGGCTGGACTTCCCGAGGGAGTTGTCAATATAGTTTCTGGATTTGGTCCT
ACATCTGGTCAGCCATAGCTAGTCACATGGACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ92TF U 293
AF RR2B443TF U 1
BS 1 875 RR2B443TF

RD RR2DZ92TF 443 0 0
GAAGTGGAGAACTCATCGCTCAGGTTGCTGAAGGTGACGTGGAAGACGTGAACCGTGCCG
TTTCAGCTGCACGCAAGGCCTTTGATGAGGGTCCATGGCCTAGAATGACTGCTTATGAGA
GATCAAAGATACTACTTCGTTTCGCTGACTTGGTCGACAAACACAACGACGAGATTGCTG
CTCTTGAGACTTGGGACAATGGGAAGCCTTTTGAACAGTCTGCCAAGGTTGAAGTCCCTA
TGCTCGCTAGGGTGTTCCGTTACTATGCTGGTTGGGCAGACAAGATCCATGGATTGACGG
TTCCAGGAGATGGTTCACACCATGTTCAGACACTCCATGAGCCTATTGGGGTCGCTGGAC
AGATCATCCCTTGGAACTTCCCTCTTCTCATGCTTTCTTGGAAACTTGGACCAGCTTTGG
CTTGCGGTAACACCGT
GTTCTCA

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR2B443TF 875 0 0
GGAGATCGTTCACAGCGACACACTGTAGAGAGAAGAAAGAAGCTTACAGAAGTTACAATG
GCGTCAAGAAGAGTATCTTCACTGCTCTCTCGCTCCTTCATGTCCTCCTCGCCTTCTCTT
TTCGCCCTCAGAGGCGAGGACCCTGTCATGATGAACAGAGGAGGTAACAGATACAGCAAC
CACGCTGAAGACACGATCACTCCGCCTGTGAAAGTGGAGCACACACAGCTCTTAATCAAC
GGAAAGTTCGTTGATGCCGCCTCAGGAAAGACGTTCCCCACTTTGGATCCAAGAAGTGGA
GAACTCATCGCTCAGGTTGCTGAAGGTGACGTGGAAGACGTGAACCGTGCCGTTTCAGCT
GCACGCAAGGCCTTTGATGAGGGTCCATGGCCTAGAATGACTGCTTATGAGAGATCAAAG
ATACTACTTCGTTTCGCTGACTTGGTCGACAAACACAACGACGAGATTGCTGCTCTTGAG
ACTTGGGACAATGGGAAGCCTTTTGAACAGTCTGCCAAGGTTGAAGTCCCTATGCTCGCT
AGGGTGTTCCGTTACTATGCTGGTTGGGCAGACAAGATCCATGGATTGACGGTTCCAGGA
GATGGTTCACACCATGTTCAGACACTCCATGAGCCTATTGGAGTCGCTGGACAGATCATC
CCTTGGAACTTCCCTCTTCTCATGCTTTCTTGGAAACTTGGACCAGCTTTGGCTTGCGGT
AACACCGTTGTTCTCAAGACGGCTGAGCAAACTCCTCTCTCTGCTCTTCTTGTTGGAAGA
TTACTTTACGAGGCTGGACTTCCCGAGGGAGTTGTCAATATAGTTTCTGGATTTGGTCCT
ACATCTGGTCAGCCATAGCTAGTCACATGGACATT

QA 1 875 1 875
DS 



AS 1 2

CO CL7074Contig1 656 2 1 U
GGGAGCATTTCGCATGTTTCATCGACCTTTTGAGCCGTTCCGGTGATCTGAAAGAAGCAT
ACAGAACCATCAAGGAGATGCCCTTCCTAGCCGATGCTAGCGTCTGGGGCTCTCTGGTCA
ATGGGTGCAGAATCCATCAGAGAATGGATATCATCAGAGCCATAAAGAAAGATCTTTCGG
ACATTGTAACCGACGACACGGGGTATCACACGCTCTTGTCCAATATATATGCTGAAGAAG
GCGAATGGGAAGAGTTCAGGAGAATGAGATCGGCTATGAAGAGTTTGAACCTTAAGAAAG
TTCCTGGCTACAGCTCGGTTGAGATTGACCAAAAACTTTACAGATTTGGAGCTGGGGAAG
AACCCTGTTTCGGAACAGAGGAGATCTACAGGTTTCTTAGGAATCTTCTTCAACACGTAA
CTCAGGAAGCAGATTATTTACAGATCAACATGTCATAAGATTCTTAGCAACATTGATGAG
TTAGAGACAGAGCCATGTAGGATTTTGTAATAACCAACCAGTCTAATATATAACACAATC
ATGTAATTCCTTTTTTTCTTTAGCCCTTGTAAGAGAGGACAAGATATACAAAGGGCAACC
AATACCCACAAACATGGGGATGGTCGAGAATAATAAAACATCTGTCTGTTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C802TF U 1
AF RR2C802JQ C 116
BS 1 656 RR2C802TF

RD RR2C802TF 656 0 0
GGGAGCATTTCGCATGTTTCATCGACCTTTTGAGCCGTTCCGGTGATCTGAAAGAAGCAT
ACAGAACCATCAAGGAGATGCCCTTCCTAGCCGATGCTAGCGTCTGGGGCTCTCTGGTCA
ATGGGTGCAGAATCCATCAGAGAATGGATATCATCAGAGCCATAAAGAAAGATCTTTCGG
ACATTGTAACCGACGACACGGGGTATCACACGCTCTTGTCCAATATATATGCTGAAGAAG
GCGAATGGGAAGAGTTCAGGAGAATGAGATCGGCTATGAAGAGTTTGAACCTTAAGAAAG
TTCCTGGCTACAGCTCGGTTGAGATTGACCAAAAACTTTACAGATTTGGAGCTGGGGAAG
AACCCTGTTTCGGAACAGAGGAGATCTACAGGTTTCTTAGGAATCTTCTTCAACACGTAA
CTCAGGAAGCAGATTATTTACAGATCAACATGTCATAAGATTCTTAGCAACATTGATGAG
TTAGAGACAGAGCCATGTAGGATTTTGTAATAACCAACCAGTCTAATATATAACACAATC
ATGTAATTCCTTTTTTTCTTTAGCCCTTGTAAGAGAGGACAAGATATACAAAGGGCAACC
AATACCCACAAACATGGGGATGGTCGAGAATAATAAAACATCTGTCTGTTTTCTCC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2C802JQ 541 0 0
GGTCAATGGGTGCAGAATCCATCAGAGAATGGATATCATCAGAGCCATAAAGAAAGATCT
TTCGGACATTGTAACCGACGACACGGGGTATCACACGCTCTTGTCCAATATATATGCTGA
AGAAGGCGAATGGGAAGAGTTCAGGAGAATGAGATCGGCTATGAAGAGTTTGAACCTTAA
GAAAGTTCCTGGCTACAGCTCGGTTGAGATTGACCAAAAACTTTACAGATTTGGAGCTGG
GGAAGAACCCTGTTTCGGAACAGAGGAGATCTACAGGTTTTTTAGGAATCTTCTTCAACA
CGTAACTCAGGAAGCAGATTATTTACAGATCAACATGTCATAAGATTTTTAGCAACATTG
ATGAGTTAGAGACAGAGCCATGTAGGATTTTGTAATAACCAACCAGTTTAATATATAACA
CAATCATGTAATTCCTTTTTTTCTTTAGCCCTTGTAAGAGAGGACAAGATATACAAAGGG
CAACCAATACCCACAAACATGGGGATGGTCGAGAATAATAAAACATCTGTCTGTTTTCTC
C

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 2

CO CL7075Contig1 824 2 2 U
GGGAGGTGGTCTATGATTCAGAACCAGTCTAGAAGAGAGATGCAAGATCAGCACAGTGAC
GTATATGGAGGTGGAGCAAGTTCGGATTCTAAAAGTAGAGTGTTTCCGGAGATTGTTAGG
AAGCAGAGTGCTGATGAGTCTTGGAAAGTTACTAAGAAAGGAAAGGCGGCTCGTGGGGAG
GATAGGCTTCAGATGTACATGTCTGAAGCAGAACTGCAAATGTATCAGCCGACAACTCAG
TTACCCTTATGGGGAAGGAGAAATTTTAGGTTTCAAGAGTGGGTGTTGGGTGTGGATGAA
GAAGAGAGTAATGGTGGTGGAGGAGGGGGAGAATGGAGATTGAAGGAATCCAAACAAGAA
CGGTCGAAGGAAGAACAAGAGGTTTGGTTCCAGTGTGGAGTTATCTCCAGTCTCCAAAAC
CCCAACAAGTGATGAGAGAATCATTCCAGAGTCCAAGGAACACTACACAAGGTGATCACG
TGGCTCCTCTAGAGGTTCATGGAACAGAGACCGAGTTTGGAGTTATACATAGCAAGGAAG
AGAACTTGAGATCAGAAGAAGAGAGCCTGAGGTCTGAAGAAGGTAGCTCGCTATCAGAAG
AAGAAGAGACCTAAAGCACGTCTGAAAACGATGAAGAAGGGTGATGTTGTTATTCGTTTA
TTTATTATTTCACCACAAACTCAGCTTCAACTCCAACAACAACAAAAATAAACAGTGGAA
AAAAAATTGTATAGAAAAAGGAAAAGAAGTTGTAAATAGAAGTTGTATACTACTTTTCTT
TTGTTACGGATGTTCATTGATTCATGAATTATATCTTAGCATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK89TF U 1
AF RR2BK89JQ C 125
BS 1 568 RR2BK89TF
BS 569 824 RR2BK89JQ

RD RR2BK89TF 568 0 0
GGGAGGTGGTCTATGATTCAGAACCAGTCTAGAAGAGAGATGCAAGATCAGCACAGTGAC
GTATATGGAGGTGGAGCAAGTTCGGATTCTAAAAGTAGAGTGTTTCCGGAGATTGTTAGG
AAGCAGAGTGCTGATGAGTCTTGGAAAGTTACTAAGAAAGGAAAGGCGGCTCGTGGGGAG
GATAGGCTTCAGATGTACATGTCTGAAGCAGAACTGCAAATGTATCAGCCGACAACTCAG
TTACCCTTATGGGGAAGGAGAAATTTTAGGTTTCAAGAGTGGGTGTTGGGTGTGGATGAA
GAAGAGAGTAATGGTGGTGGAGGAGGGGGAGAATGGAGATTGAAGGAATCCAAACAAGAA
CGGTCGAAGGAAGAACAAGAGGTTTGGTTCCAGTGTGGAGTTATCTCCAGTCTCCAAAAC
CCCAACAAGTGATGAGAGAATCATTCCAGAGTCCAAGGAACACTACACAAGGTGATCACG
TGGCTCCTCTAGAGGTTCATGGAACAGAGACCGAGTTTGGAGTTATACATAGCAAGGAAG
AGAACTTGAGATCAGAAGAAGAGAGCCT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2BK89JQ 700 0 0
AGAGTGCTGATGAGTCTTGGAAAGTTACTAAGAAAGGAAAGGCGGCTCGTGGGGAGGATA
GGCTTCAGATGTACATGTCTGAAGCAGAACTGCAAATGTATCAGCCGACAACTCAGTTAC
CCTTATGGGGAAGGAGAAATTTTAGGTTTCAAGAGTGGGTGTTGGGTGTGGATGAAGAAG
AGAGTAATGGTGGTGGAGGAGGGG*AGA*TGGAGATTGAAGGAATCCAAACAAGAACGGT
CGAAGGAAGAACAAGAGGTTTGGTTCCAGTGTGGAGTTATCTCCAGTCTCCAAAACCCCA
ACAAGTGATGAGAGAATCATTCCAGAGTCCAAGGAACACTACACAAGGTGATCACGTGGC
TCCTCTAGAGGTTCATGGAACAGAGACCGAGTTTGGAGTTATACATAGCAAGGAAGAGAA
CTTGAGATCAGAAGAAGAGAGCCTGAGGTCTGAAGAAGGTAGCTCGCTATCAGAAGAAGA
AGAGACCTAAAGCACGTCTGAAAACGATGAAGAAGGGTGATGTTGTTATTCGTTTATTTA
TTATTTCACCACAAACTCAGCTTCAACTCCAACAACAACAAAAATAAACAGTGGAAAAAA
AATTGTATAGAAAAAGGAAAAGAAGTTGTAAATAGAAGTTGTATACTACTTTTCTTTTGT
TACGGATGTTCATTGATTCATGAATTATATCTTAGCATGT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL7076Contig1 958 2 6 U
TTTTTAATTTTAATAAGTTTAGGGGCCGATCTATTAAACAAAACACGAAACAGCTGTACT
GGTATGTCAGACATAGAAGATCACATGTACAATTCGTTGAGGAGTGTTTTTCAAAATAAT
ATTTAGAATCAACAGCTAATGATCCATACATATTTTATGTGCTTGGGGCCTATACATAAT
CAGGGTCGGTATGTAATTTACAGAGAAATACACGTAACTTTTTTAACTTTAATTTATCCT
TATTTTGATTTATTTTTATGGACTATTACTAGTATTTTCTCATATTCACAATGCCATGCA
CGACACGAGATACTTATATAATAGTGAATATCAACGTTGTCAAAATAGTTTTTAGAATCA
ACAGCTAATGATCCATACATATTTTATGTGCTTGGTATATAATTTAGAAATACACTTAAT
TTTTTTACTTTAATTTCTCCTTATTTTGATTTATTTTTTATGGACTATTACTAGTATTTT
CTCAAATTCACAATGCCATGCACGACACGAGATACTTATATAATAGTGAATATCAACGTT
GTCTTACCTTATCTTCCAAGGTCAAACTTTTGTTGTTTCCAAACTTGCTCCAAAGAGGAG
GAAAAAGAATCAGAAGAGAGCAAAAAAGTCATGGAGGTGGGGAGAGACCAAACTGAATCC
TCACCAACGATCCCTATCATTGATCTAAGCAACCTCGACAAAGAGCAAGTAGCTGGTGAG
GTTGTTAAGGCGAGCCAAGAGTGGGGAGTTTTTCAAGTGGTGAATCATGAGATCCCCAAG
GAACTTATCATGAATTTAAAGATGGTTGGGACACAGTTCTTTGAGCTCTCATCAGAGGCG
GAGAAGGAAGCCGTGGCGACGCCAGTAAACTCCAAAGACATCCAAGGATACGTTACAAAC
ATCCAAAAAGATGTTGAGGACAAGGTCGATCGAGTTGACCATCTCTTCCACAATTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D103TF U 1
AF RR2D103JQ C 262
BS 1 626 RR2D103TF
BS 627 627 RR2D103JQ
BS 628 701 RR2D103TF
BS 702 702 RR2D103JQ
BS 703 720 RR2D103TF
BS 721 958 RR2D103JQ

RD RR2D103TF 724 0 0
TTTTTAATTTTAATAAGTTTAGGGGCCGATCTATTAAACAAAACACGAAACAGCTGTACT
GGTATGTCAGACATAGAAGATCACATGTACAATTCGTTGAGGAGTGTTTTTCAAAATAAT
ATTTAGAATCAACAGCTAATGATCCATACATATTTTATGTGCTTGGGGCCTATACATAAT
CAGGGTCGGTATGTAATTTACAGAGAAATACACGTAACTTTTTTAACTTTAATTTATCCT
TATTTTGATTTATTTTTATGGACTATTACTAGTATTTTCTCATATTCACAATGCCATGCA
CGACACGAGATACTTATATAATAGTGAATATCAACGTTGTCAAAATAGTTTTTAGAATCA
ACAGCTAATGATCCATACATATTTTATGTGCTTGGTATATAATTTAGAAATACACTTAAT
TTTTTTACTTTAATTTCTCCTTATTTTGATTTATTTTTTATGGACTATTACTAGTATTTT
CTCAAATTCACAATGCCATGCACGACACGAGATACTTATATAATAGTGAATATCAACGTT
GTCTTACCTTATCTTCCAAGGTCAAACTTTTGTTGTTTCCAAACTTGCTCCAAAGAGGAG
GAAAAAGAATCAGAAGAGAGCAAAAA*GTCATGGAGGTGGGGAGAGACCAAACTGAATCC
TCACCAACGATCCCTATCATTGATCTAAGCAACCTCGACAA*GAGCAAGTAGCTGGTGAG
TTGT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2D103JQ 697 0 0
ACTATTACTAGTATTTTCTCATATTCACAATGCCATGCACGACACGAGATACTTATATAA
TAGTGAATATCAACGTTGTCAAAATAGTTTTTAGAATCAACAGCTAATGATCCATACATA
TTTTATGTGCTTGGTATATAATTTAGAAATACACTTAATTTTTTTACTTTAATTTCTCCT
TATTTTGATTTATTTTTTATGGACTATTACTAGTATTTTCTCAAATTCACAATGCCATGC
ACGACACGAGATACTTATATAATAGTGAATATCAACGTTGTTTTACCTTATTTTCCAAGG
TCAAACTTTTGTTGTTTCCAAACTTGCTCCAAAGAGGAGGAAAAAGAATCAGAAGAGAGC
AAAAAAGTCATGGAGGTTGGGAGAGACCAAACTGAATCCTCACCAACGATCCCTATCATT
GATTTAAGCAACCTCGACAAAGAGCAAGTAGCTGGTGAGGTTGTTAAGGCGAGCCAAGAG
TGGGGAGTTTTTCAAGTGGTGAATCATGAGATCCCCAAGGAACTTATCATGAATTTAAAG
ATGGTTGGGACACAGTTCTTTGAGCTCTCATCAGAGGCGGAGAAGGAAGCCGTGGCGACG
CCAGTAAACTCCAAAGACATCCAAGGATACGTTACAAACATCCAAAAAGATGTTGAGGAC
AAGGTCGATCGAGTTGACCATCTCTTCCACAATTTAT

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL7077Contig1 779 2 4 U
GAACTAACACATTTGATTGCATTCAAAAATAAACTTGTCTTTCAATCTAACATCGATAAT
AAACAATAGCCAAGAAAACAAAATAATGGAATTACTACATCAAATCTTTTACTGGTATGA
TCTTTCTGTTCGCATTGTTGCATGCTATATATTACCTTATGTAACCTTAAAAGTCTTTTT
CTTCTCTCTGTCTCCATTACTGAATCCAGAACGTGCTTGCTATATAGATTATTTCATCAA
ATGTTGAGAGGATCATCTTCTGTGTTTCTTTCATTAAGAGGTGTCCAATCATTTGTCTTT
GGCTTGTCAGTAATCATCATGAGCCTTCTTTGCAGGAGACTTGCAATAAAGAGGAAGACG
GAGCACATCCCAAACATGACAGTCATAGGGAACGCATTCACATTGTACAAGACAACACAG
ACAAAGATGTTCAAAGGAATCCGGAAAAAGTTCATGATTGTGCTTCTGGCTTCCTCAGGG
ATGTATTGAGATCTCATCTTCATTATGGATGGCCAAAACAGACCTACACACGCCTCAAAG
ACACAGAACCCAAGAAGCTGAAAGCAACCCGAGAAAGAGATTCCTCCACCTTTTACCTTG
GAAGGTGCTACCAATGAAGCCATTATAATTGGAAGCAATAGTGAGGCTGCAGAGACTAGG
AAGACGATCTGCATGTAGCTCTCTACTTTGGGAGATGAGCGAGACAATAGACGAGAAGCA
AGTGAACTACCGAGCATAGAAGCGAGCATAAATGTAGCAAAATGAAACCATGGGGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B282JQ U 1
AF RR2CX69JQ U 37
BS 1 551 RR2B282JQ
BS 552 552 RR2CX69JQ
BS 553 748 RR2B282JQ
BS 749 779 RR2CX69JQ

RD RR2B282JQ 748 0 0
GAACTAACACATTTGATTGCATTCAAAAATAAACTTGTCTTTCAATCTAACATCGATAAT
AAACAATAGCCAAGAAAACAAAATAATGGAATTACTACATCAAATCTTTTACTGGTATGA
TCTTTCTGTTCGCATTGTTGCATGCTATATATTACCTTATGTAACCTTAAAAGTCTTTTT
CTTCTCTCTGTCTCCATTACTGAATCCAGAACGTGCTTGCTATATAGATTATTTCATCAA
ATGTTGAGAGGATCATCTTCTGTGTTTCTTTCATTAAGAGGTGTCCAATCATTTGTCTTT
GGCTTGTCAGTAATCATCATGAGCCTTCTTTGCAGGAGACTTGCAATAAAGAGGAAGACG
GAGCACATCCCAAACATGACAGTCATAGGGAACGCATTCACATTGTACAAGACAACACAG
ACAAAGATGTTCAAAGGAATCCGGAAAAAGTTCATGATTGTGCTTCTGGCTTCCTCAGGG
ATGTATTGAGATCTCATCTTCATTATGGATGGCCAAAACAGACCTACACACGCCTCAAAG
ACACAGAACCCGAGAAGCTGAAAGCAACCCGAGAAAGAGATTCCTCCACCTTTTACCTTG
GAAGGTGCTACCAATGAAGCCATTATAATTGGAAGCAATAGTGAGGCTGCAGAGACTAGG
AAGACGATCTGCATGTAGCTCTCTACTTTGGGAGATGAGCGAGACAATAGACGAGAAGCA
AGTGAACTACCGAGCATAGAAGCGAGCA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2CX69JQ 743 0 0
GTCTTTCAATCTAACATCGATAATAAACAATAGCCAAGAAAACAAAATAATGGAATTACT
ACATCAAATCTTTTACTGGTATGATCTTTCTGTTCGCATTGTTGCATGCTATATATTACC
TTATGTAACCTTAAAAGTCTTTTTCTTCTCTCTGTCTCCATTACTGAATCCAGAACGTGC
TTGCTATATAGATTATTTCATCAAATGTTGAGAGGATCATCTTCTGTGTTTCTTTCATTA
AGAGGTGTCCAATCATTTGTCTTTGGCTTGTCTGTAATCATCATGAGCCTTCTTTGCAGG
AGACTTGCAATAAAGAGGAAGACGGAGCACATCCCAAACATGACGGTCATAGGGAACGCA
TTCACATTGTACAAGACAACACAGACAAAGATGTTCAAAGGAATCCGGAGAAAGTTCATG
ATTGTGCTTCTGGCTTCCTCAGGGATGTATTGAGATCTCATCTTCATTATGGATGGCCAA
AACAGACCTACACACGCCTCAAAGACACAGAACCCAAGAAGCTGAAAGCAACCCGAGAAA
GAGATTCCTCCACCTTTTACCTTGGAAGGTGCTACCAATGAAGCCATTATAATTGGAAGC
AATAGTGAGGCTGCGGAGACTAGGAAGACGATCTGCATGTAGCTCTCTACTTTGGGAGAT
GAGCGAGACAATAGACGAGAAGCAAGTGAACTACCGAGCATAGAAGCGAGCATAAATGTA
GCAAAATGAAACCATGGGGATCT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7079Contig1 856 2 2 U
GGCTTTCCAATCCACGTCCAAGTAAAAACAACAAAGAAACAAAAAAGATGAACACTCCAA
TAAAACTCACTTTTCTCATTCTCTGCATCGCCCTAACCGCAACCGCATTCGTAGTCCCAG
CAAAACGTGCCGATGTTACACCGGAACACGAAAAAACTGTGGCAGGAATCTGCAGCGTTG
TGGAAGACAAAAATCTTTGTAGCATAACCTTGAAAACCGTCCCAAGCAATGACCCAGCCT
TCTTGGTCCGTTACTTAGCCACAGCCGCAGAATCCTCTGTTAAAAAGGGTTTGAACTTCC
TCTCCGAAATCAAACCCAAATACAAAGGAAACGCCTTCGCCACAAACTGCATCACCGGTT
GCGAAAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACTTTTCAGATTTTTGGAAAGCCGTGGGGA
AAAACGTAACCAGCATGGCGGATAATTACTTCACGTGCAAGAAGAAGATGAATTCTATCT
TCACGTACCAGTCGACTTGTCTTGATGACATTTACGACAAAACGTTATTGAAAGAGGTTC
AAGGAGGAATAGGGCTTGGGAAAAGAATCAGTGGTGAGTCAGTGGATGTGTTCGCTGGAA
TGGACAAAGTCTTTAACACTTTAAACATTAAGACCAAACTTAACCAGCAAGATACCGATT
CGTTGCTCCCACCACCTTTGTCGTTTTACTACCATTGATTTATTTATTAACATTATACAT
ATATAACAAAGAAAAATGTGCATCGACTGGGGGTTTTCAGATATTTTAGGAATCTTGTAA
GGGTTCCTTTTTGATGTATATTTGTAATTACGATGTTATAGGTGATAATCATGTATGGAC
CTCGTGGTTGGAAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG57TF U 1
AF RR2EG57JQ C 283
BS 1 557 RR2EG57TF
BS 558 856 RR2EG57JQ

RD RR2EG57TF 557 0 0
GGCTTTCCAATCCACGTCCAAGTAAAAACAACAAAGAAACAAAAAAGATGAACACTCCAA
TAAAACTCACTTTTCTCATTCTCTGCATCGCCCTAACCGCAACCGCATTCGTAGTCCCAG
CAAAACGTGCCGATGTTACACCGGAACACGAAAAAACTGTGGCAGGAATCTGCAGCGTTG
TGGAAGACAAAAATCTTTGTAGCATAACCTTGAAAACCGTCCCAAGCAATGACCCAGCCT
TCTTGGTCCGTTACTTAGCCACAGCCGCAGAATCCTCTGTTAAAAAGGGTTTGAACTTCC
TCTCCGAAATCAAACCCAAATACAAAGGAAACGCCTTCGCCACAAACTGCATCACCGGTT
GCGAAAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACTTTTCAGATTTTTGGAAAGCCGTGGGGA
AAAACGTAACCAGCATGGCGGATAATTACTTCACGTGCAAGAAGAAGATGAATTCTATCT
TCACGTACCAGTCGACTTGTCTTGATGACATTTACGACAAAACGTTATTGAAAGAGGTTC
AAGGAGGAATAGGGCTT

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2EG57JQ 574 0 0
AAAAGGGTTTGAACTTCCTCTCCGAAATCAAACCCAAATACAAAGGAAACGCCTTCGCCA
CAAACTGCATCACCGGTTGCGAAAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACTTTTCAGATT
TTTGGAAAGCCGTGGGGAAAAACGTAACCAGCATGGCGGATAATTACTTCACGTGCAAGA
AGAAGATGAATTCTATCTTCACGTACCAGTCGACTTGTCTTGATGACATTTACGACAAAA
CGTTATTGAAAGAGGTTCAAGGAGGAATAGGGCTTGGGAAAAGAATCAGTGGTGAGTCAG
TGGATGTGTTCGCTGGAATGGACAAAGTCTTTAACACTTTAAACATTAAGACCAAACTTA
ACCAGCAAGATACCGATTCGTTGCTCCCACCACCTTTGTCGTTTTACTACCATTGATTTA
TTTATTAACATTATACATATATAACAAAGAAAAATGTGCATCGACTGGGGGTTTTCAGAT
ATTTTAGGAATCTTGTAAGGGTTCCTTTTTGATGTATATTTGTAATTACGATGTTATAGG
TGATAATCATGTATGGACCTCGTGGTTGGAAAGG

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL7080Contig1 814 2 4 U
GGCAATGAAGAAACCTGTTGGATTGCTTAATGTGAAAGTCATCAAGGCAATAAAGCTTAA
GAAGAAAGATCTTCTCGGTGGATCAGACCCTTATGTGAAACTAACACTCTCTGGTGACAA
AGTTCCAGGTAAGAAGACAGTTGTCAAACACAGCAATCTAAACCCTGAGTGGAACGAAGA
GTTCGATTTAGTTGTCAAAGAACCAGAGAGCCAAGAACTGCAGCTCATTGTATATGATTG
GGAACAGGTTGGTAAACATGATAAGATAGGAATGAATGTGATCCTACTAAAAGACCTTAC
TCCAGAGGAACCAAAGCTCATGACACTTGAGCTTTTAAAATCCATGGAACCAAATGAACC
AGTTAGCGAGAAATCCCGCGGACAACTCGTTGTTGAAGTGGAATATAAACCCTTTAAAGA
AGATGACATTCCAGACAACTTAGAGGATCCAAATGCAGTAGAGAAAGCACCTGAAGGCAC
ACCTTCTGGTGGTGGATTGCTTGTGGTTATTGTTCACGAAGCTGAAGATTTAGAAGGCAA
ATATCACACAAACCCTTCTGTTCGTTTGATGTTTAAAGGAGAAGAGCGTAAAACAAAGCG
TGTGAAGAAAAACAGAGAGCCAAGATGGGATGAAGATTTTCAGCTTCCATTAAATGAGCC
TCCCATAAACGATAAGCTTCACGTTGAAGTCATAAGTACTACTTCACGAATAGGTTTAAA
TATGCATCCTAAGGAAACTCTTGGATATGTGGTGATAAATCTTGGTGATGTTGTGAGTAA
CCGGAGAATCAATGATAAATATCACCTGATTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI16TF U 1
AF RR2DV83TF U 262
BS 1 652 RR2CI16TF
BS 653 653 RR2DV83TF
BS 654 707 RR2CI16TF
BS 708 814 RR2DV83TF

RD RR2CI16TF 707 0 0
GGCAATGAAGAAACCTGTTGGATTGCTTAATGTGAAAGTCATCAAGGCAATAAAGCTTAA
GAAGAAAGATCTTCTCGGTGGATCAGACCCTTATGTGAAACTAACACTCTCTGGTGACAA
AGTTCCAGGTAAGAAGACAGTTGTCAAACACAGCAATCTAAACCCTGAGTGGAACGAAGA
GTTCGATTTAGTTGTCAAAGAACCAGAGAGCCAAGAACTGCAGCTCATTGTATATGATTG
GGAACAGGTTGGTAAACATGATAAGATAGGAATGAATGTGATCCTACTAAAAGACCTTAC
TCCAGAGGAACCAAAGCTCATGACACTTGAGCTTTTAAAATCCATGGAACCAAATGAACC
AGTTAGCGAGAAATCCCGCGGACAACTCGTTGTTGAAGTGGAATATAAACCCTTTAAAGA
AGATGACATTCCAGACAACTTAGAGGATCCAAATGCAGTAGAGAAAGCACCTGAAGGCAC
ACCTTCTGGTGGTGGATTGCTTGTGGTTATTGTTCACGAAGCTGAAGATTTAGAAGGCAA
ATATCACACAAACCCTTCTGTTCGTTTGATGTTTAAAGGAGAAGAGCGTAAAACAAAGCG
TGTGAAGAAAAACAGAGAGCCAAGATGGGATGAAGATTTTCAGCTTCCATTAGATGAGCC
TCCCATAAACGATAAGCTTCACGTTGAAGTCATAAGTACTACTTCAC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2DV83TF 553 0 0
G
AAGATAGGAATGAATGTGATCCTACTAAAAGACCTTACTCCAGAGGAACCAAAGCTCATG
ACACTTGAGCTTTTAAAATCCATGGAACCAAATGAACCAGTTAGCGAGAAATCCCGCGGA
CAACTCGTTGTTGAAGTGGAATATAAACCCTTTAAAGAAGATGACATTCCAGACAACTTA
GAGGATCCAAATGCAGTAGAGAAAGCACCTGAAGGCACACCTTCTGGTGGTGGATTGCTT
GTGGTTATTGTTCACGAAGCTGAAGATTTAGAAGGCAAATATCACACAAACCCTTCTGTT
CGTTTGATGTTTAAAGGAGAAGAGCGTAAAACAAAGCGTGTGAAGAAAAACAGAGAGCCA
AGATGGGATGAAGATTTTCAGTTTCCATTAAATGAGCCTCCCATAAACGATAAGCTTCAC
GTTGAAGTCATAAGTACTACTTCACGAATAGGTTTAAATATGCATCCTAAGGAAACTCTT
GGATATGTGGTGATAAATCTTGGTGATGTTGTGAGTAACCGGAGAATCAATGATAAATAT
CACCTGATTGAT

QA 2 553 2 553
DS 



AS 1 2

CO CL7081Contig1 647 2 1 U
GGGCTTGCGCAGACACTGCTTTGAGGCTTTCTCGATTTGTAGGGTTTCAAGAATCTGAAC
AATGGCGGATGCAGTTCCTGCGGCTGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAGTTCTC
TTACAAAGGAGTTGATCTCGATGCTCTTCTCGACATGTCTACGGATGATCTTGTCAAGCT
CTTCAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACGAGAAAGCCTATGGCTTT
GATCAAAAAATTGCGCAAAGCGAAAAGGGATGCACCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAGCAGT
GAGAACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGTGTCATTGGTGT
GTACAATGGAAAGACATTTAACCAAGTCGAGATCAAACCTGAGGTGATTGGTCATTACTT
GGCTGAGTTTTCAATCTCGTATAAGCCTGTTAAGCACGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCCAC
TAACTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAATAATCAATCTACTCTAGTCTGTCTTATTCTCC
AAAATAAGATTTTCGTTGGTTTTTTTTCTCTTTATAACGTTTTGTCTTTGTTTCTCTGTT
CTCCTCTAGATTTTTTTGTCTAAGAACAATTCTTCATGCTTTTAAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EA26JQ C 1
AF RR2EA26TF U 1
BS 1 647 RR2EA26TF

RD RR2EA26JQ 647 0 0
GGGCTTGCGCAGACACTGCTTTGAGGCTTTCTCGATTTGTAGGGTTTCAAGAATCTGAAC
AATGGCGGATGCAGTTCCTGCGGCTGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAGTTCTC
TTACAAAGGAGTTGATCTCGATGCTCTTCTCGACATGTCTACGGATGATCTTGTCAAGCT
CTTCAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACGAGAAAGCCTATGGCTTT
GATCAAAAAATTGCGCAAAGCGAAAAGGGATGCACCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAGCAGT
GAGAACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGTGTCATTGGTGT
GTACAATGGAAAGACATTTAACCAAGTCGAGATCAAACCTGAGGTGATTGGTCATTACTT
GGCTGAGTTTTCAATCTCGTATAAGCCTGTTAAGCACGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCCAC
TAACTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAATAATCAATCTACTCTAGTCTGTCTTATTCTCC
AAAATAAGATTTTCGTTGGTTTTTTTTCTCTTTATAACGTTTTGTCTTTGTTTCTCTGTT
CTCCTCTAGATTTTTTTGTCTAAGAACAATTCTTCATGCTTTTAAAT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2EA26TF 647 0 0
GGGCTTGCGCAGACACTGCTTTGAGGCTTTCTCGATTTGTAGGGTTTCAAGAATCTGAAC
AATGGCGGATGCAGTTCCTGCGGCTGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAGTTCTC
TTACAAAGGAGTTGATCTCGATGCTCTTCTCGACATGTCTACGGATGATCTTGTCAAGCT
CTTCAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACGAGAAAGCCTATGGCTTT
GATCAAAAAATTGCGCAAAGCGAAAAGGGATGCACCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAGCAGT
GAGAACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGTGTCATTGGTGT
GTACAATGGAAAGACATTTAACCAAGTCGAGATCAAACCTGAGGTGATTGGTCATTACTT
GGCTGAGTTTTCAATCTCGTATAAGCCTGTTAAGCACGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCCAC
TAACTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAATAATCAATCTACTCTAGTCTGTCTTATTCTCC
AAAATAAGATTTTCGTTGGTTTTTTTTCTCTTTATAACGTTTTGTCTTTGTTTCTCTGTT
CTCCTCTAGATTTTTTTGTCTAAGAACAATTCTTCATGCTTTTAAAT

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL7082Contig1 694 2 2 U
TAGAACTTGCACATTGTCATATATTCACTTCGCCAAGATGATTGAAAAAAAAAAACCAAA
GGATCAAATCAGAAATGAGACATCAAGGCATCCAAAGCCGAAGCTTATACACCAAAACAA
ATTGTATTCAGAAAAGAAGTTGTTTCCCCAAAGAGAGAGAGAGAGCAATGATTCATGTTT
TGTTGTTTCTCTCCTAGAGAAGAAAAGATAGTAAAGAATGCACAAATACCAACTAACCTT
TCCAACCTACAAAATGTTTGGGACCTGCGAGTCCAATCTCCGCTGCAACTCTTGCACCTT
CTCTGAAAGCTCCATCTTCTGCTCTTTATAGTTCCTAAGTAGATACTCTTTCCCATCTAT
GACTTCTTTAAGCTCACTCACTTCCTTCCTCAACATCTCTACTCTCTCTCCATCCTTTGA
TCCCTTTTCCGGTGACTCGTAGTTGCTTTCGCTGTCCATAAACCCGTTTGCTGCCCCGTT
CCAGCCGCTGCTACCAGCCTGTCCCACGCAGTGATCAGCTATTGCCTTTCTCAGTCTCAG
CACTTCTCTCTCTGATTCATACAGATCCCTGTTTGTTGCGTCAAGCTGAGCTTGGAGATG
GCTAGAGTGTGACATTTGCGAGTTAAGCGAGTTCTGTAGCTCTAGAATCTGTTCCTGCAT
TTCAAGTATCATGTCGTCTCGTCTCTTCAGCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EQ71TF C 1
AF RR2EQ71JQ U 48
BS 1 47 RR2EQ71TF
BS 48 694 RR2EQ71JQ

RD RR2EQ71TF 694 0 0
TAGAACTTGCACATTGTCATATATTCACTTCGCCAAGATGATTGAAAAAAAAAAACCAAA
GGATCAAATCAGAAATGAGACATCAAGGCATCCAAAGCCGAAGCTTATACACCAAAACAA
ATTGTATTCAGAAAAGAAGTTGTTTCCCCAAAGAGAGAGAGAGAGCAATGATTCATGTTT
TGTTGTTTCTCTCCTAGAGAAGAAAAGATAGTAAAGAATGCACAAATACCAACTAACCTT
TCCAACCTACAAAATGTTTGGGACCTGCGAGTCCAATCTCCGCTGCAACTCTTGCACCTT
CTCTGAAAGCTCCATCTTCTGCTCTTTATAGTTCCTAAGTAGATACTCTTTCCCATCTAT
GACTTCTTTAAGCTCACTCACTTCCTTCCTCAACATCTCTACTCTCTCTCCATCCTTTGA
TCCCTTTTCCGGTGACTCGTAGTTGCTTTCGCTGTCCATAAACCCGTTTGCTGCCCCGTT
CCAGCCGCTGCTACCAGCCTGTCCCACGCAGTGATCAGCTATTGCCTTTCTCAGTCTCAG
CACTTCTCTCTCTGATTCATACAGATCCCTGTTTGTTGCGTCAAGCTGAGCTTGGAGATG
GCTAGAGTGTGACATTTGCGAGTTAAGCGAGTTCTGTAGCTCTAGAATCTGTTCCTGCAT
TTCAAGTATCATGTCGTCTCGTCTCTTCAGCTGC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2EQ71JQ 647 0 0
AAAAAAAACCAAAGGATCAAATCAGAAATGAGACATCAAGGCATCCAAAGCCGAAGCTTA
TACACCAAAACAAATTGTATTCAGAAAAGAAGTTGTTTCCCCAAAGAGAGAGAGAGAGCA
ATGATTCATGTTTTGTTGTTTCTCTCCTAGAGAAGAAAAGATAGTAAAGAATGCACAAAT
ACCAACTAACCTTTCCAACCTACAAAATGTTTGGGACCTGCGAGTCCAATCTCCGCTGCA
ACTCTTGCACCTTCTCTGAAAGCTCCATCTTCTGCTCTTTATAGTTCCTAAGTAGATACT
CTTTCCCATCTATGACTTCTTTAAGCTCACTCACTTCCTTCCTCAACATCTCTACTCTCT
CTCCATCCTTTGATCCCTTTTCCGGTGACTCGTAGTTGCTTTCGCTGTCCATAAACCCGT
TTGCTGCCCCGTTCCAGCCGCTGCTACCAGCCTGTCCCACGCAGTGATCAGCTATTGCCT
TTCTCAGTCTCAGCACTTCTCTCTCTGATTCATACAGATCCCTGTTTGTTGCGTCAAGCT
GAGCTTGGAGATGGCTAGAGTGTGACATTTGCGAGTTAAGCGAGTTCTGTAGCTCTAGAA
TCTGTTCCTGCATTTCAAGTATCATGTCGTCTCGTCTCTTCAGCTGC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL7083Contig1 760 2 31 U
GGGACAACACCCAACTTTCACTCTTCCAATTTCTAAACTCTAAAAAGTTGATTTTCTCAG
ATCTGAAGACTTTTCGTTGCTTGATTGATTGATCGGAGGAGTTATGGCGGCGCAGGGAAA
CTCCACGGACACACTTTTCTCTCCTTACAAGATGGGAAGATTCGATCTCTCTCACAGAGT
GGTTCTGGCGCCGATGACACGTTGCAGGGCGTTGAACGGAGTTCCAAACGCGGCGTTGGC
GGAGTATTACGCTCAACGCACCACTCCCGGCGGCTTTCTCATCTCCGAAGGCACCATGAT
CTCTCCCGGATCCGCAGGGTTTCCACATGTACCAGGAATCTACTCGGAAGAACAAGTAGA
AGCATGGAAGCCCGTTGTGGAAGCAGTTCACTCCAAAGGAGGTCTCATATTCTGCCAATT
ATGGCATGTTGGACGAGCTTCTCATCCGTTGTATCAACCTAATGGTGGATCACCAATATC
TTCAACTGACAAACCCATCTCAGAAAGATGGCGAGTTCTGTTGCCTGACGGATCACACGC
GAAATACCCTAAACCTCGACCTCTACACGCTTCCGAGATACCTCGAGTGGTGGAAGATTA
TTGCAACTCGGCTTTGAACGCAATCCGAGCTGGTTTTGATGGGATTGAGATCCATGGAGC
GCACGGTTACCTCATTGATCAGTTTATGAAAATGGGATCAATGACCGTACTGACCATTAT
GGAGCTCATTGAAACCGTTGCAGATCTTACTCAGGTAGTG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F667TF U 2
AF RR2ED14TF U 1
BS 1 66 RR2ED14TF
BS 67 67 RR2F667TF
BS 68 86 RR2ED14TF
BS 87 90 RR2F667TF
BS 91 120 RR2ED14TF
BS 121 121 RR2F667TF
BS 122 205 RR2ED14TF
BS 206 206 RR2F667TF
BS 207 239 RR2ED14TF
BS 240 240 RR2F667TF
BS 241 342 RR2ED14TF
BS 343 343 RR2F667TF
BS 344 351 RR2ED14TF
BS 352 352 RR2F667TF
BS 353 408 RR2ED14TF
BS 409 409 RR2F667TF
BS 410 414 RR2ED14TF
BS 415 415 RR2F667TF
BS 416 468 RR2ED14TF
BS 469 469 RR2F667TF
BS 470 558 RR2ED14TF
BS 559 559 RR2F667TF
BS 560 566 RR2ED14TF
BS 567 567 RR2F667TF
BS 568 573 RR2ED14TF
BS 574 574 RR2F667TF
BS 575 660 RR2ED14TF
BS 661 661 RR2F667TF
BS 662 663 RR2ED14TF
BS 664 664 RR2F667TF
BS 665 760 RR2ED14TF

RD RR2F667TF 670 0 0
GGACAACACCCAACTTTCAGTCTTCCAATTTCTGAACTCTAAAAAGTTGATTT*CTCAGA
TCTGAAGACTTTTCGTTGCTTGATTGATTGATCGGAGGAGTTATGGCGGCGCAGGGAAAC
TCCACGGACACACTTTTCTCTCCTTACAAGATGGGAAGATTCGATCTCTCTCACAGAGTG
GTTCTGGCGCCGATGACACGTTGCAGGGCGTTGAACGGCGTTCCAAACGCGGCGTTGGCG
GAGTATTACGCTCAACGCACCACTCCCGGCGGTTTTCTCATCTCCGAAGGCACCATGATC
TCTCCCGGATCCGCTGGGTTTCCACATGTCCCAGGAATCTACTCTGAGGAACAAGTAGAG
GCATGGAAGCCCGTTGTGGAAGCAGTTCACTCCAAAGGAGGTTTCATATTCTGCCAATTA
TGGCATGTTGGACGAGCTTCTCATCCGTTGTATCAACCTAATGGTGGATCACCAATATCT
TCAACTGACAAACCCATCTCAGAAAGATGGCGAGTTCTGTTGCCTGATGGATCACACGCG
AAATACCCTAAACCTCGACCTCTACACGCTTCCGAGATACCTCGAGTGGTGGAAGATTAT
TGCAACTCGGCTTTGAACGCAATCCGAGCTGGTTTTGATGGGATTGAGATCCATGGAGCG
CACGGTTACC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2ED14TF 760 0 0
GGGACAACACCCAACTTTCACTCTTCCAATTTCTAAACTCTAAAAAGTTGATTTTCTCAG
ATCTGA*GACTTTTCGTTGCTTGATT****GATCGGAGGAGTTATGGCGGCGCAGGGAAA
GTCCACGGACACACTTTTCTCTCCTTACAAGATGGGAAGATTCGATCTCTCTCACAGAGT
GGTTCTGGCGCCGATGACACGTTGCTGGGCGTTGAACGGAGTTCCAAACGCGGCGTTGGG
GGAGTATTACGCTCAACGCACCACTCCCGGCGGCTTTCTCATCTCCGAAGGCACCATGAT
CTCTCCCGGATCCGCAGGGTTTCCACATGTACCAGGAATCTATTCGGAAGAGCAAGTAGA
AGCATGGAAGCCCGTTGTGGAAGCAGTTCACTCCAAAGGAGGTCTCATCTTCTGTCAATT
ATGGCATGTTGGACGAGCTTCTCATCCGTTGTATCAACCTAATGGTGGGTCACCAATATC
TTCAACTGACAAACCCATCTCAGAAAGATGGCGAGTTCTGTTGCCTGACGGATCACACGC
GAAATACCCTAAACCTCGGCCTCTACGCGCTTCGGAGATACCTCGAGTGGTGGAAGATTA
TTGCAACTCGGCTTTGAACGCAATCCGAGCTGGTTTTGATGGGATTGAGATCCATGGAGC
TCATGGTTACCTCATTGATCAGTTTATGAAAATGGGATCAATGACCGTACTGACCATTAT
GGAGCTCATTGAAACCGTTGCAGATCTTACTCAGGTAGTG

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL7084Contig1 984 2 8 U
GGCGACGAAGTAACCGACGAAGATATCAGATTCCGCCCTGCTTTCACCATCCCCGATTGC
CCCTGCGGTTCTGGACCTTCCCGGAGAGTCATAGCTGATTCTGGACGAGCTTACTTGCAA
TGCGGCGTTAGAAAGGGTTTTGGGGCTTGTGGATTCTTCAAATGGGTTGATGACGTTGAG
ATGCCTCTGAGATGTGATGATGATGCAGTAGCTGATGAGATTGGTTTCTGGGCGGAAGCT
GATCTTGTTTTGAGTGACGTGGAAAGCAGCTTCCTGGCTGCTGGTGTGCCGGAGAATACA
GAGGAGGACTCCTCTGTTTCTGATGTACACTCTGCTGCTGCTGTGAACCAAGGTATCCTT
ATGTATGATCCAGTTGTGATTGAACCTGGAGAGCAACTACATGGTGATTGTGCTCTTTCC
AAGTTGCGTGCGGATGAAGCAACGAGTGGTTTGGGCAGAGATACGGTTTCTAGGAAACGT
GAGATGATATGCTATGAGCAGCCTGTTGATAGAACTGGCGAAGTAGGTGAGTGGTCATTA
CCCAATTTGCAGGACCTGATGGAGCAATACAACTCAGAGAAGCTTCAGCTAGAGAGTGTT
TCGGGGAAACATGCACAAGTGTTGAGTGCGTTTATGAGTTCGTACAGTCGACTGAGGCTA
CTTCATGAGAAGACTGGTCAACTCAGGAAACTGTTACTTGAGACGGAGAAGGAGATGGTT
TGCTGTGAGTCCGAGACGTTAGAGCTTGGAGCGAGTTGCCGGGAAGTGGCTGGAGAGATG
GCTGAGTCTCAGAATAGGATGCAGGTGATGGCAGCGATACTAGGGGATGATGTGGAATTG
TTGAAGCGGAAAGAGTTTGTTGGTATGAAGAGAAGAAGATGCTGAGATAGACTGCATGGT
AGTGTCATTGTAAGAGTTGGAATGTAACTATTACTGGTTACACTTATTTTAGCCAAGTAA
TTAATAAACTTAGTTAACTCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB04TF U 1
AF RR2HB04JQ C 253
BS 1 656 RR2HB04TF
BS 657 657 RR2HB04JQ
BS 658 680 RR2HB04TF
BS 681 681 RR2HB04JQ
BS 682 686 RR2HB04TF
BS 687 687 RR2HB04JQ
BS 688 705 RR2HB04TF
BS 706 984 RR2HB04JQ

RD RR2HB04TF 708 0 0
GGCGACGAAGTAACCGACGAAGATATCAGATTCCGCCCTGCTTTCACCATCCCCGATTGC
CCCTGCGGTTCTGGACCTTCCCGGAGAGTCATAGCTGATTCTGGACGAGCTTACTTGCAA
TGCGGCGTTAGAAAGGGTTTTGGGGCTTGTGGATTCTTCAAATGGGTTGATGACGTTGAG
ATGCCTCTGAGATGTGATGATGATGCAGTAGCTGATGAGATTGGTTTCTGGGCGGAAGCT
GATCTTGTTTTGAGTGACGTGGAAAGCAGCTTCCTGGCTGCTGGTGTGCCGGAGAATACA
GAGGAGGACTCCTCTGTTTCTGATGTACACTCTGCTGCTGCTGTGAACCAAGGTATCCTT
ATGTATGATCCAGTTGTGATTGAACCTGGAGAGCAACTACATGGTGATTGTGCTCTTTCC
AAGTTGCGTGCGGATGAAGCAACGAGTGGTTTGGGCAGAGATACGGTTTCTAGGAAACGT
GAGATGATATGCTATGAGCAGCCTGTTGATAGAACTGGCGAAGTAGGTGAGTGGTCATTA
CCCAATTTGCAGGACCTGATGGAGCAATACAACTCAGAGAAGCTTCAGCTAGAGAGTGTT
TCGGGGAAACATGCACAAGTGTTGAGTGCGTTTATGAGTTCGTACAGTCGACTGAG*CTA
CTTCATGAGAAGACTGGTCA*CTCAG*AAACTGTTACTTGAGACG
AGA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2HB04JQ 732 0 0
AGTGACGTGGAAAGCAGCTTCCTGGCTGCTGGTGTGCCGGAGAATACAGAGGAGGACTCC
TCTGTTTCTGATGTACACTCTGCTGCTGCTGTGAACCAAGGTATCCTTATGTATGATCCA
GTTGTGATTGAACCTGGAGAGCAACTACATGGTGATTGTGCTCTTTCCAAGTTGCGTGCG
GATGAAGCAACGAGTGGTTTGGGCAGAGATACGGTTTTTAGGAAACGTGAGATGATATGC
TATGAGCAGCCTGTTGATAGAACTGGCGAAGTAGGTGAGTGGTCATTACCCAATTTGCAG
GACCTGATGGAGCAATACAACTCAGAGAAGCTTCAGCTAGAGAGTGTTTCGGGGAAACAT
GCACAAGTGTTGAGTGCGTTTATGAGTTCGTACAGTCGACTGAGGCTACTTCATGAGAAG
ACTGGTCAACTCAGGAAACTGTTACTTGAGACGGAGAAGGAGATGGTTTGCTGTGAGTCC
GAGACGTTAGAGCTTGGAGCGAGTTGCCGGGAAGTGGCTGGAGAGATGGCTGAGTCTCAG
AATAGGATGCAGGTGATGGCAGCGATACTAGGGGATGATGTGGAATTGTTGAAGCGGAAA
GAGTTTGTTGGTATGAAGAGAAGAAGATGCTGAGATAGACTGCATGGTAGTGTCATTGTA
AGAGTTGGAATGTAACTATTACTGGTTACACTTATTTTAGCCAAGTAATTAATAAACTTA
GTTAACTCCTTC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL7085Contig1 829 2 3 U
GGATCTCTAAAGAGTGTAAGCCTTTTCGACGGAGGAGTTGGCGACAAACCTGCTGGAAAT
TACAGTGGAGGTATGAAAAAGGCGGCTTAGTGTCGCTATATCACTTATTGGGAACCCCAA
GGTAGTTTATTTGGATGAGCCAAGCACAGGACTTGATCCAGCCTCGAGGAAGAACTTATG
GGATGTGATTCAGCGTGCAAAACAAAACACAGCAATTATCCTCACAACTCACTCGATGGA
AGAAGCAGAGTTTCTATGCGATCGATTGGGAATATTCGTAGACGGGGCCTTGCAATGCAT
AGGAAACTCCAAGGAACTAAAGAGCAGATACGGTGGATCGTATGGGTTCACGATGACAAC
ATCTTCAGAACATGAGGAAGGTGTTGAGAGATTGGTATCAACTGTGTCTCCCAACGCCAA
GAAAGTATATCATCTCGCTGGTACACAGAAGTTCGAGCTCCCAAAGAACGAAGTTAGGAT
TGCTGAGGTGTTTAGGGCTGTAGAAAAGGCTAAATCCAACTTCACAGTCTTTGCTTGGGG
ACTTGCCGACACAACTCTCGAAGATGTCTTCATCAAAGTCGCTAAATCTGCTCAAGCCTT
CATTTCCTTGTCTTGATGAAGCCTGATTTTTCAAGTTAGGGTTTCTATTTTTTTGAGTCA
AAGATGTGTCTTCGGGCGCGCGCAACCAACTTCCTAATACTTCTCATGCAATTTGTATAT
ACTATTAGCTGTACACGTTTTTTACATAGAAGCTTCAGCCTATGTTGAGATGTCCCATAA
TTATTCGTTGTTACATACTCTCTATGTATTACAAATTAATATGAACATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B743JQ C 1
AF RR2B743TF U 1
BS 1 79 RR2B743TF
BS 80 80 RR2B743JQ
BS 81 829 RR2B743TF

RD RR2B743JQ 829 0 0
GGATCTCTAAAGAGTGTAAGCCTTTTCGACGGAGGAGTTGGCGACAAACCTGCTGGAAAT
TACAGTGGAGGTATGAAAAAGGCGGCTTAGTGTCGCTATATCACTTATTGGGAACCCCAA
GGTAGTTTATTTGGATGAGCCAAGCACAGGACTTGATCCAGCCTCGAGGAAGAACTTATG
GGATGTGATTCAGCGTGCAAAACAAAACACAGCAATTATCCTCACAACTCACTCGATGGA
AGAAGCAGAGTTTCTATGCGATCGATTGGGAATATTCGTAGACGGGGCCTTGCAATGCAT
AGGAAACTCCAAGGAACTAAAGAGCAGATACGGTGGATCGTATGGGTTCACGATGACAAC
ATCTTCAGAACATGAGGAAGGTGTTGAGAGATTGGTATCAACTGTGTCTCCCAACGCCAA
GAAAGTATATCATCTCGCTGGTACACAGAAGTTCGAGCTCCCAAAGAACGAAGTTAGGAT
TGCTGAGGTGTTTAGGGCTGTAGAAAAGGCTAAATCCAACTTCACAGTCTTTGCTTGGGG
ACTTGCCGACACAACTCTCGAAGATGTCTTCATCAAAGTCGCTAAATCTGCTCAAGCCTT
CATTTCCTTGTCTTGATGAAGCCTGATTTTTCAAGTTAGGGTTTCTATTTTTTTGAGTCA
AAGATGTGTCTTCGGGCGCGCGCAACCAACTTCCTAATACTTCTCATGCAATTTGTATAT
ACTATTAGCTGTACACGTTTTTTACATAGAAGCTTCAGCCTATGTTGAGATGTCCCATAA
TTATTCGTTGTTACATACTCTCTATGTATTACAAATTAATATGAACATG

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2B743TF 829 0 0
GGATCTCTAAAGAGTGTAAGCCTTTTCGACGGAGGAGTTGGCGACAAACCTGCTGGAAAT
TACAGTGGAGGTATGAAAA*GGCGGCTTAGTGTCGCTATATCACTTATTGGGAACCCCAA
GGTAGTTTATTTGGATGAGCCAAGCACAGGACTTGATCCAGCCTCGAGGAAGAACTTATG
GGATGTGATTCAGCGTGCAAAACAAAACACAGCAATTATCCTCACAACTCACTCGATGGA
AGAAGCAGAGTTTCTATGCGATCGATTGGGAATATTCGTAGACGGGGCCTTGCAATGCAT
AGGAAACTCCAAGGAACTAAAGAGCAGATACGGTGGATCGTATGGGTTCACGATGACAAC
ATCTTCAGAACATGAGGAAGGTGTTGAGAGATTGGTATCAACTGTGTCTCCCAACGCCAA
GAAAGTATATCATCTCGCTGGTACACAGAAGTTCGAGCTCCCAAAGAACGAAGTTAGGAT
TGCTGAGGTGTTTAGGGCTGTAGAAAAGGCTAAATCCAACTTCACAGTCTTTGCTTGGGG
ACTTGCCGACACAACTCTCGAAGATGTCTTCATCAAAGTCGCTAAATCTGCTCAAGCCTT
CATTTCCTTGTCTTGATGAAGCCTGATTTTTCAAGTTAGGGTTTCTATTTTTTTGAGTCA
AAGATGTGTCTTCGGGCGCGCGCAACCAACTTCCTAATACTTCTCATGCAATTTGTATAT
ACTATTAGCTGTACACGTTTTTTACATAGAAGCTTCAGCCTATGTTGAGATGTCCCATAA
TTATTCGTTGTTACATACTCTCTATGTATTACAAATTAATATGAACATG

QA 1 829 1 829
DS 



AS 1 2

CO CL7086Contig1 969 2 8 U
GGACAGAAGATAAACATGAACACAAACCGTCGCAACAAATCCATTTGACACCTTAAATTT
CCCCTGATCAAAAGAAAATAAAAACCCATTTGAAACAAGAAGAAAAGCGTGAAATGACAT
AAAAATGGTCACGGAATAAGCAAAAAAGGTAGAACAGGCAAAGGGCATGGAAGACAGTCG
TAGAGGATTATCTTCAACACCACAATCACGCAAGATCATGGTGATCGCTGACCCGACCCG
TGAATCTGCAGCTGCTCTTCAATACACTCTTTCACACGCCGTGCTCGAGCAGGACGAGCT
CATCCTTGTCCATGTTGAAAACAATGGTGGCTCGTGGAAAAACGCTTTCTCAAGTTTCTT
GAGATTACCAAGCTCCATTTCCTCCTCCTCCTCTAGCAACAGCGGGTCCTCACCGGGAGT
TGTTAATGCTAACGCTAACACTACAATCGCAGCTTCATCTTTGGCATCTGAGATTGGTCA
AGGAGAAGGGAATTTCCTTGAACAGATGAAACGGATATGTGAAATCGCTCAGCCGAAGGT
GCGTGTGCACACCGAGTGTATTACCACGGAAGGAAACAAAGCTGCATCTATTCTTCTTCA
TGGAGACAAACTTGGGATGGATGTTATCATCATTGGCCAACGCAGGACAATCTCAGCCTC
CCTTTTAGGATCTAGGAGACCTGGAGGGTCTATTAGAGGACCAAAAGGAGTAGACACTGC
TGAATATTTAATCGAAAACAGCAAATGCACCTGTGTTGGCGTACAGAAGAAAGGTCAAAA
CGGAGGCTATGTTTTAAACACCAAGACTCATAAGAACTTTTGGCTCTTGGCATGATCATG
CGCATATTGCGCCTAGTCAGTTTTATAATACTTACATGTAGCTAAAAATACAAAAAAAGA
AGAAGTTTACCAGTCATCTTCACTTGTTTCGTTCATGATCTTCAATTCTAGCAATGAAGT
GTTCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A676TF U 1
AF RR2A676JQ C 179
BS 1 773 RR2A676TF
BS 774 774 RR2A676JQ
BS 775 847 RR2A676TF
BS 848 848 RR2A676JQ
BS 849 867 RR2A676TF
BS 868 868 RR2A676JQ
BS 869 887 RR2A676TF
BS 888 969 RR2A676JQ

RD RR2A676TF 890 0 0
GGACAGAAGATAAACATGAACACAAACCGTCGCAACAAATCCATTTGACACCTTAAATTT
CCCCTGATCAAAAGAAAATAAAAACCCATTTGAAACAAGAAGAAAAGCGTGAAATGACAT
AAAAATGGTCACGGAATAAGCAAAAAAGGTAGAACAGGCAAAGGGCATGGAAGACAGTCG
TAGAGGATTATCTTCAACACCACAATCACGCAAGATCATGGTGATCGCTGACCCGACCCG
TGAATCTGCAGCTGCTCTTCAATACACTCTTTCACACGCCGTGCTCGAGCAGGACGAGCT
CATCCTTGTCCATGTTGAAAACAATGGTGGCTCGTGGAAAAACGCTTTCTCAAGTTTCTT
GAGATTACCAAGCTCCATTTCCTCCTCCTCCTCTAGCAACAGCGGGTCCTCACCGGGAGT
TGTTAATGCTAACGCTAACACTACAATCGCAGCTTCATCTTTGGCATCTGAGATTGGTCA
AGGAGAAGGGAATTTCCTTGAACAGATGAAACGGATATGTGAAATCGCTCAGCCGAAGGT
GCGTGTGCACACCGAGTGTATTACCACGGAAGGAAACAAAGCTGCATCTATTCTTCTTCA
TGGAGACAAACTTGGGATGGATGTTATCATCATTGGCCAACGCAGGACAATCTCAGCCTC
CCTTTTAGGATCTAGGAGACCTGGAGGGTCTATTAGAGGACCAAAAGGAGTAGACACTGC
TGAATATTTAATCGAAAACAGCAAATGCACCTGTGTTGGCGTACAGAAGAAAG*TCAAAA
CGGAGGCTATGTTTTAAACACCAAGACTCATAAGAACTTTTGGCTCTTGGCATGATCATG
CGCATAT*GCGCCTAGTCAGTTTTATA*TACTTACATGTAGCTAAAA
TAC

QA 1 887 1 887
DS 

RD RR2A676JQ 791 0 0
CGTAGAGGATTATCTTCAACACCACAATCACGCAAGATCATGGTGATCGCTGACCCGACC
CGTGAATCTGCAGCTGCTCTTCAATACACTCTTTCACACGCCGTGCTCGAGCAGGACGAG
CTCATCCTTGTCCATGTTGAAAACAATGGTGGCTCGTGGAAAAACGCTTTCTCAAGTTTC
TTGAGATTACCAAGCTCCATTTCCTCCTCCTCCTCTAGCAACAGCGGGTCCTCACCGGGA
GTTGTTAATGCTAACGCTAACACTACAATCGCAGCTTCATCTTTGGCATCTGAGATTGGT
CAAGGAGAAGGGAATTTCCTTGAACAGATGAAACGGATATGTGAAATCGCTCAGCCGAAG
GTGCGTGTGCACACCGAGTGTATTACCACGGAAGGAAACAAAGCTGCATCTATTTTTCTT
CATGGAGACAAACTTGGGATGGATGTTATCATCATTGGCCAACGCAGGACAATTTCAGCC
TCCCTTTTAGGATCTAGGAGACCTGGAGGGTCTATTAGAGGACCAAAAGGAGTAGACACT
GCTGAATATTTAATCGAAAACAGCAAATGCACCTGTGTTGGCGTACAGAAGAAAGGTCAA
AACGGAGGCTATGTTTTAAACACCAAGACTCATAAGAACTTTTGGCTCTTGGCATGATCA
TGCGCATATTGCGCCTAGTCAGTTTTATAATACTTACATGTAGCTAAAAATACAAAAAAA
GAAGAAGTTTACCAGTCATCTTCACTTGTTTCGTTCATGATCTTCAATTCTAGCAATGAA
GTGTTCTTTTT

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL7087Contig1 436 2 1 U
GGGTGTTCTTCCAGCTAAACAGAATGCCATCCCAAAAAAAAAAGATATTTAAGTAATAAA
AAACTTCATTTAACAAGCTGCAGAGGAACTGGTACAAGGGTTGAAGAAGTGAGGCTTTGA
CGAGATGGAGAAAGCTCCCTTCGACGTACCTCCATCCACAACCACCGTGGTAGCCACGCT
GTTGCCGCCTCCGACTCCTTCTCCTCCGGTATCGCCGCCGCTTCTGCCACCGATTCTCTC
ACATGAAGGACACATCGTGAGAGTAGATACAGGCATGTGCATGTAAAAGGGCTGATGAGT
CAATTTTAGGGTTTTGAGTTCTTGAATCTCTTTCTGAAGTCTTATGTTCTCATCTGTTAA
TGTTTCACAACATTTCTTCAAAAACTCACAATCTACTTCTGTTTGCTTCAGCTTTGTTCT
GTTCAAATTTCATTAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FC74JQ C 1
AF RR2FC74TF U 1
BS 1 436 RR2FC74TF

RD RR2FC74JQ 436 0 0
GGGTGTTCTTCCAGCTAAACAGAATGCCATCCCAAAAAAAAAAGATATTTAAGTAATAAA
AAACTTCATTTAACAAGCTGCAGAGGAACTGGTACAAGGGTTGAAGAAGTGAGGCTTTGA
CGAGATGGAGAAAGCTCCCTTCGACGTACCTCCATCCACAACCACCGTGGTAGCCACGCT
GTTGCCGCCTCCGACTCCTTCTCCTCCGGTATCGCCGCCGCTTCTGCCACCGATTCTCTC
ACATGAAGGACACATCGTGAGAGTAGATACAGGCATGTGCATGTAAAAGGGCTGATGAGT
CAATTTTAGGGTTTTGAGTTCTTGAATCTCTTTCTGAAGTCTTATGTTCTCATCTGTTAA
TGTTTCACAACATTTCTTCAAAAACTCACAATCTACTTCTGTTTGCTTCAGCTTTGTTCT
GTTCAAATTTCATTAA

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR2FC74TF 436 0 0
GGGTGTTCTTCCAGCTAAACAGAATGCCATCCCAAAAAAAAAAGATATTTAAGTAATAAA
AAACTTCATTTAACAAGCTGCAGAGGAACTGGTACAAGGGTTGAAGAAGTGAGGCTTTGA
CGAGATGGAGAAAGCTCCCTTCGACGTACCTCCATCCACAACCACCGTGGTAGCCACGCT
GTTGCCGCCTCCGACTCCTTCTCCTCCGGTATCGCCGCCGCTTCTGCCACCGATTCTCTC
ACATGAAGGACACATCGTGAGAGTAGATACAGGCATGTGCATGTAAAAGGGCTGATGAGT
CAATTTTAGGGTTTTGAGTTCTTGAATCTCTTTCTGAAGTCTTATGTTCTCATCTGTTAA
TGTTTCACAACATTTCTTCAAAAACTCACAATCTACTTCTGTTTGCTTCAGCTTTGTTCT
GTTCAAATTTCATTAA

QA 1 436 1 436
DS 



AS 1 2

CO CL7088Contig1 644 2 2 U
GGATCAACGCTAATCTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCCCTGATTTGAAGAAGTTTCTTGATT
ATCGATATCCCCTTAATCGTCCAAGATCATGGCAACATTGGCACCAGTCCATGCAACTTC
GTTCAAATCCATGGAATCTCGCAAGAGGAGAATTCCTTTACCGTATTTGATCCGACCCTG
TAAGAGACAGCCCGTTTACGACACCTACGCACTCTACAACGATTTCATTGCCTATTCATC
TCTCGAGGATGGGTTCGACTCTGAGAGTGATGACGAAGAATCATCTGTCAAGGCTGTTAG
AACCTCTCTGGAGAAAGTCGATTTATCCGAAACAGCATCTGCGGGTTCGCTGACTGATGA
AGAATACGTGGTTGTGGACGATGTTGAAACTCCTAAAATTGAGAGAGCAGGCGCGATTCA
AATGATGGAACTCGCAAAAGGTGTTGAAGAGTTGGACCTCGAAGATGCAGGATCCGACAG
TGATGCTTGGGTGGTTGTGTAACTAACAAGTTTATGCTTGGGTGGGGTTTTAGGATAATG
GAATCAGTTTATTTCTCTGCCTTCTTGTTTTCTGGACCAGTTGACATTTTTGCGAAGCTT
TCTTTTTTTATGATCAGTACATATGACAAGATGGTTTCCGATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY04TF U 1
AF RR2DY04JQ C 66
BS 1 499 RR2DY04TF
BS 500 644 RR2DY04JQ

RD RR2DY04TF 499 0 0
GGATCAACGCTAATCTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCCCTGATTTGAAGAAGTTTCTTGATT
ATCGATATCCCCTTAATCGTCCAAGATCATGGCAACATTGGCACCAGTCCATGCAACTTC
GTTCAAATCCATGGAATCTCGCAAGAGGAGAATTCCTTTACCGTATTTGATCCGACCCTG
TAAGAGACAGCCCGTTTACGACACCTACGCACTCTACAACGATTTCATTGCCTATTCATC
TCTCGAGGATGGGTTCGACTCTGAGAGTGATGACGAAGAATCATCTGTCAAGGCTGTTAG
AACCTCTCTGGAGAAAGTCGATTTATCCGAAACAGCATCTGCGGGTTCGCTGACTGATGA
AGAATACGTGGTTGTGGACGATGTTGAAACTCCTAAAATTGAGAGAGCAGGCGCGATTCA
AATGATGGAACTCGCAAAAGGTGTTGAAGAGTTGGACCTCGAAGATGCAGGATCCGACAG
TGATGCTTGGGTGGTTGTG

QA 1 499 1 499
DS 

RD RR2DY04JQ 579 0 0
TATCCCCTTAATCGTCCAAGATCATGGCAACATTGGCACCAGTCCATGCAACTTCGTTCA
AATCCATGGAATCTCGCAAGAGGAGAATTCCTTTACCGTATTTGATCCGACCCTGTAAGA
GACAGCCCGTTTACGACACCTACGCACTCTACAACGATTTCATTGCCTATTCATCTCTCG
AGGATGGGTTCGACTCTGAGAGTGATGACGAAGAATCATCTGTCAAGGCTGTTAGAACCT
CTCTGGAGAAAGTCGATTTATCCGAAACAGCATCTGCGGGTTCGCTGACTGATGAAGAAT
ACGTGGTTGTGGACGATGTTGAAACTCCTAAAATTGAGAGAGCAGGCGCGATTCAAATGA
TGGAACTCGCAAAAGGTGTTGAAGAGTTGGACCTCGAAGATGCAGGATCCGACAGTGATG
CTTGGGTGGTTGTGTAACTAACAAGTTTATGCTTGGGTGGGGTTTTAGGATAATGGAATC
AGTTTATTTCTCTGCCTTCTTGTTTTCTGGACCAGTTGACATTTTTGCGAAGCTTTCTTT
TTTTATGATCAGTACATATGACAAGATGGTTTCCGATTG

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL7089Contig1 655 2 2 U
TTTTCTCCTGTAAACACCCTTATAAAATTAATAAATTCATGGAAAACACAACAAGCAAGC
CCCACCCATCATCATCACCACTTGCTAGCTTTTATTAGTTTTGTCACGGCTGCTCTCTTT
AGAATAGTGCTTCTTGCATTGCTTCTGCTTCTGTCTGCGCCTGCCCTAGTCCATGACCCT
CAGGTTCAAGTTCAAATCCATGGTGTTGTTCACCTGGCTGCACTTCTTCCATGTGCTGTG
GCTCCTCAGTTGTTGTAACTGTTAGCTCTTCCAGAGCCTGTATAGCTTGAACCACTGCTT
GATTTCCACTTCCTCCGACCTCGGCTTTCAACGCATTAACAATTTCTCTAGCTTTCTCTT
GAAACAAATCAAACTTCTTCTTGGATGCGGCTGCGGCGGTTGGAAGAACTGGTTGTTGTT
GTGGTTGTTAGGCGGCGCGACGGGGGAGGAGTTAACGGTGTTGCTGTAAAAGGGGTGTTG
GGTGACAGGGAAGGGGTTTGGGAAAGTGGTGAAGGGAGGAGGATGGTGAGGATCGTTGGG
TGCAGAGAAAGAAGGATCCATGGATTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAGGTGATGA
GTTTTCTGATTTTTGGGATTTTAATTAAATTTTTTTCCTGTTTTAATTTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EK82TF C 1
AF RR2EK82JQ U 5
BS 1 4 RR2EK82TF
BS 5 655 RR2EK82JQ

RD RR2EK82TF 655 0 0
TTTTCTCCTGTAAACACCCTTATAAAATTAATAAATTCATGGAAAACACAACAAGCAAGC
CCCACCCATCATCATCACCACTTGCTAGCTTTTATTAGTTTTGTCACGGCTGCTCTCTTT
AGAATAGTGCTTCTTGCATTGCTTCTGCTTCTGTCTGCGCCTGCCCTAGTCCATGACCCT
CAGGTTCAAGTTCAAATCCATGGTGTTGTTCACCTGGCTGCACTTCTTCCATGTGCTGTG
GCTCCTCAGTTGTTGTAACTGTTAGCTCTTCCAGAGCCTGTATAGCTTGAACCACTGCTT
GATTTCCACTTCCTCCGACCTCGGCTTTCAACGCATTAACAATTTCTCTAGCTTTCTCTT
GAAACAAATCAAACTTCTTCTTGGATGCGGCTGCGGCGGTTGGAAGAACTGGTTGTTGTT
GTGGTTGTTAGGCGGCGCGACGGGGGAGGAGTTAACGGTGTTGCTGTAGAAGGGGTGTTG
GGTGACAGGGAAGGGGTTTGGGAAAGTGGTGAAGGGAGGAGGATGGTGAGGATCGTTGGG
TGCAGAGAAAGAAGGATCCATGGATTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAGGTGATGA
GTTTTCTGATTTTTGGGATTTTAATTAAATTTTTTTCCTGTTTTAATTTCTTTCC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2EK82JQ 651 0 0
CTCCTGTAAACACCCTTATAAAATTAATAAATTCATGGAAAACACAACAAGCAAGCCCCA
CCCATCATCATCACCACTTGCTAGCTTTTATTAGTTTTGTCACGGCTGCTCTCTTTAGAA
TAGTGCTTCTTGCATTGCTTCTGCTTCTGTCTGCGCCTGCCCTAGTCCATGACCCTCAGG
TTCAAGTTCAAATCCATGGTGTTGTTCACCTGGCTGCACTTCTTCCATGTGCTGTGGCTC
CTCAGTTGTTGTAACTGTTAGCTCTTCCAGAGCCTGTATAGCTTGAACCACTGCTTGATT
TCCACTTCCTCCGACCTCGGCTTTCAACGCATTAACAATTTCTCTAGCTTTCTCTTGAAA
CAAATCAAACTTCTTCTTGGATGCGGCTGCGGCGGTTGGAAGAACTGGTTGTTGTTGTGG
TTGTTAGGCGGCGCGACGGGGGAGGAGTTAACGGTGTTGCTGTAAAAGGGGTGTTGGGTG
ACAGGGAAGGGGTTTGGGAAAGTGGTGAAGGGAGGAGGATGGTGAGGATCGTTGGGTGCA
GAGAAAGAAGGATCCATGGATTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAGGTGATGAGTTT
TCTGATTTTTGGGATTTTAATTAAATTTTTTTCCTGTTTTAATTTCTTTCC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL7090Contig1 440 2 1 U
GGATAACACAAATCCCGAGAAAGAGAGATCGAAAGGAGAGAGATAAACAAGAATGGTTTC
ATCGCTTCTTACGTCGTTTGCTCCGGCCACCGTGAGGGTTTACGCCACAACCGCAAAAGG
AGCTTCAGGCGGCGCCAAGGAGGAGAAGAATCCCCTCGACTTTGTGCTTGGTTATTTGAC
AAAGCAAGATCAGTTCTACGAGACTGATCCAATCCTCAAGAAGGTGGAAGGCACCACTGG
AGGAGGCCGAGGAACCGTTCGTGGCGGTGGTAAAAGCTCCGCTCCTGTGCCTGTGGCGCC
GAAGAAGAACGATGGTGGTGGTGGGCTCGGCGGCTTAGCTGGTCTCTTCAACAAAAAATG
ATTGAAATCTGCATTATCTATTGCTGCTTCTGTGTTTATTCTCTAATACATTCTTCAGAT
TTCAGTTATATATGAACTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G406JQ C 1
AF RR2G406TF U 1
BS 1 440 RR2G406TF

RD RR2G406JQ 440 0 0
GGATAACACAAATCCCGAGAAAGAGAGATCGAAAGGAGAGAGATAAACAAGAATGGTTTC
ATCGCTTCTTACGTCGTTTGCTCCGGCCACCGTGAGGGTTTACGCCACAACCGCAAAAGG
AGCTTCAGGCGGCGCCAAGGAGGAGAAGAATCCCCTCGACTTTGTGCTTGGTTATTTGAC
AAAGCAAGATCAGTTTTACGAGACTGATCCAATCCTCAAGAAGGTGGAAGGCACCACTGG
AGGAGGCCGAGGAACCGTTCGTGGCGGTGGTAAAAGCTCCGCTCCTGTGCCTGTGGCGCC
GAAGAAGAACGATGGTGGTGGTGGGCTCGGCGGCTTAGCTGGTCTCTTCAACAAAAAATG
ATTGAAATCTGCATTATCTATTGCTGCTTCTGTGTTTATTCTTTAATACATTCTTCAGAT
TTCAGTTATATATGAACTGC

QA 1 440 1 440
DS 

RD RR2G406TF 440 0 0
GGATAACACAAATCCCGAGAAAGAGAGATCGAAAGGAGAGAGATAAACAAGAATGGTTTC
ATCGCTTCTTACGTCGTTTGCTCCGGCCACCGTGAGGGTTTACGCCACAACCGCAAAAGG
AGCTTCAGGCGGCGCCAAGGAGGAGAAGAATCCCCTCGACTTTGTGCTTGGTTATTTGAC
AAAGCAAGATCAGTTCTACGAGACTGATCCAATCCTCAAGAAGGTGGAAGGCACCACTGG
AGGAGGCCGAGGAACCGTTCGTGGCGGTGGTAAAAGCTCCGCTCCTGTGCCTGTGGCGCC
GAAGAAGAACGATGGTGGTGGTGGGCTCGGCGGCTTAGCTGGTCTCTTCAACAAAAAATG
ATTGAAATCTGCATTATCTATTGCTGCTTCTGTGTTTATTCTCTAATACATTCTTCAGAT
TTCAGTTATATATGAACTGC

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 2

CO CL7091Contig1 767 2 4 U
GATAGCGAGTTTGGAGAGGGCTAAAGCGATTATCAGTGGATTGACAATGGTTCCAGCTGT
TGGTGATATCTATAGGAATTGTGAAATCAAATCAATGGCTCCTTATGGTGCCTTTGTAGA
GATTGCACCTGGGAGAGAAGGACTTTGCCATGTCAGTGAGCTAAGTGCTGAATGGCTTGC
AAAACCAGAAGATGCCTATAATATCGGAGACCGCATTGATGTCAAACTAATAGAGGTGAA
TGAAAAAGGTCAGCTTCGGCTTAGTGTACGAGCTTTACTTCCGGAATCAGAGTCAGACAA
AGACGGTCAGAAACAACCACCAACCCCAACTGGTGATTCTGCCAAGGGTTCACCGAGGAA
GTATGTAAATCCTTCGTTGAAGGACCGTGCGTCTACAGGAGCATCTGGGGATGAACTTGT
CTGGAAGAAGAAAGATGTCAGGAGAACATCAGGTGGTGAGAAGCCAATGAAAAGCAGTAG
TAATGAAGAAGATAGAGGCAACTTAGTCAATGGTGAAGCTACAATCAGCTAGTAAATGCA
GACAGGATCACTATCCATATCTGTTTCTTTGTGATAAGAGTTTATTACAACGTAACCACA
AGTGATGAGACTTGATGAATCTTGATTCTTGTTTTTGTTTGGGAACTGCAAGGTGTGACG
CAAGTAGCAGATAGCTTTTCTTAATGTTTTATAGATATATATGTTGGCAAGTCCCTGTGT
CAGTGTGGAGGAGTATAACATTTTGTTGGGAGATTCTCAGACATGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G579TF U 1
AF RR2G579JQ C 106
BS 1 652 RR2G579TF
BS 653 653 RR2G579JQ
BS 654 757 RR2G579TF
BS 758 767 RR2G579JQ

RD RR2G579TF 757 0 0
GATAGCGAGTTTGGAGAGGGCTAAAGCGATTATCAGTGGATTGACAATGGTTCCAGCTGT
TGGTGATATCTATAGGAATTGTGAAATCAAATCAATGGCTCCTTATGGTGCCTTTGTAGA
GATTGCACCTGGGAGAGAAGGACTTTGCCATGTCAGTGAGCTAAGTGCTGAATGGCTTGC
AAAACCAGAAGATGCCTATAATATCGGAGACCGCATTGATGTCAAACTAATAGAGGTGAA
TGAAAAAGGTCAGCTTCGGCTTAGTGTACGAGCTTTACTTCCGGAATCAGAGTCAGACAA
AGACGGTCAGAAACAACCACCAACCCCAACTGGTGATTCTGCCAAGGGTTCACCGAGGAA
GTATGTAAATCCTTCGTTGAAGGACCGTGCGTCTACAGGAGCATCTGGGGATGAACTTGT
CTGGAAGAAGAAAGATGTCAGGAGAACATCAGGTGGTGAGAAGCCAATGAAAAGCAGTAG
TAATGAAGAAGATAGAGGCAACTTAGTCAATGGTGAAGCTACAATCAGCTAGTAAATGCA
GACAGGATCACTATCCATATCTGTTTCTTTGTGATAAGAGTTTATTACAACGTAACCACA
AGTGATGAGACTTGATGAATCTTGATTCTTGTTTTTGTTTGGGAACTGCAAG*TGTGACG
CAAGTAGCAGATAGCTTTTCTTAATGTTTTATAGATATATATGTTGGCAAGTCCCTGTGT
CAGTGTGGAGGAGTATAACATTTTGTTGGGAGATTCT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2G579JQ 662 0 0
TGGTGCCTTTGTAGAGATTGCACCTGGGAGAGAAGGACTTTGCCATGTCAGTGAGCTAAG
TGCTGAATGGCTTGCAAAACCAGAAGATGCCTATAATATCGGAGACCGCATTGATGTCAA
ACTAATAGAGGTGAATGAAAAAGGTCAGCTTCGGCTTAGTGTACGAGCTTTACTTCCGGA
ATCAGAGTCAGACAAAGACGGTCAGAAACAACCACCAACCCCAACTGGTGATTCTGCCAA
GGGTTCACCGAGGAAGTATGTAAATCCTTCGTTGAAGGACCGTGCGTCTACAGGAGCATC
TGGGGATGAACTTGTCTGGAAGAAGAAAGATGTCAGGAGAACATCAGGTGGTGAGAAGCC
AATGAAAAGCAGTAGTAATGAAGAAGATAGAGGCAACTTAGTCAATGGTGAAGCTACAAT
CAGCTAGTAAATGCAGACAGGATCACTATCCATATCTGTTTCTTTGTGATAAGAGTTTAT
TACAACGTAACCACAAGTGATGAGACTTGATGAATCTTGATTCTTGTTTTTGTTTGGGAA
CTGCAAGGTGTGACGCAAGTAGCAGATAGCTTTTCTTAATGTTTTATAGATATATATGTT
GGCAAGTCCCTGTGTCAGTGTGGAGGAGTATAACATTTTGTTGGGAGATTCTCAGACATG
AA

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL7092Contig1 1058 2 2 U
GGGACTGAACATCACCCGGAGATGGACAGAGAAGAAACTTCAGGCGAGTCTTCGACTTCG
TCTTCAAATCAGCTAGAGAACTGGACAGAAGAACAGGATCAGCTGAAGAAGAAACTGATC
ACGCACGATGACTTCCCCTGGAAGCTACCTTCATCAACAGTGGAACTCCCTCAGGGATCA
GAGACCCTTAAGTACGTCGGAGGTGTGGACATAAGCTTCTCCAAAGACGATTCCTCCGTG
GCGTGCGCTTGTCTCGTCGTTCTCGAGATACCTTCTCTCCGTGTGGTTCACAACGAGCTC
TCTCTCCTTCGCCTCCAAGTTCCTTACGTTCCTGGGTTTCTCGCCTTTCGTGAGGCTCCG
GTTCTGTTGCAGATTCTTGAGAAGATGAGGGATGAGGAGCATCCTTTCTTTCCTCAGGTA
CTGATGGTGGATGGGAATGGGATTCTTCATCCACGAGGATTTGGCTTGGCGTGTCATTTA
GGTGTTCTTGCTCACATTCCTACCATTGGGGTCGGAAAGAACCTGCATCATGTGGATGGT
CTGGATCATTCTGAGGTTAGAAGTTTGTTTCAGCTCAAAGAAAATGAGGATGAGCGGGTT
ATCAAGTTGGTTGGGGACTCTGGTTTTACGTGGGGAGTAGGATTTAGGCCAACTCTGAGT
TCTCTGAAGCCCATATATGTTTCGGTTGGCCATCGCATATCACTTGACTCTGCGGTTGAG
GTTGTCAAGATGACCTGCAAGTACCGCGTGCCTGAACCTATTAGACAGGCAGATATAAGA
TCAAGAGCATATCTTCAAAAGCACCAACTTCGTCTCTTAAAAGATTTGGGACCACTCGGA
ATGGACTGAACACATAGTCATTAAAACAAGCTGTGAACACTTTTCCACATTACAGAGAAG
CTCCACACAAGTTTTTCCTTTATTTATCTCAGAGACTCTAACTAAGATTGTTTCGAAGAA
ATGAGTCTTGTTATAACATGTTTGTATCCAATATTCATTGTATGTATTTTGCGTTAAGCT
ATGCAAAAAATTTCATATATCCATGTCACATTTACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD22TF U 1
AF RR2CD22JQ C 244
BS 1 680 RR2CD22TF
BS 681 1058 RR2CD22JQ

RD RR2CD22TF 680 0 0
GGGACTGAACATCACCCGGAGATGGACAGAGAAGAAACTTCAGGCGAGTCTTCGACTTCG
TCTTCAAATCAGCTAGAGAACTGGACAGAAGAACAGGATCAGCTGAAGAAGAAACTGATC
ACGCACGATGACTTCCCCTGGAAGCTACCTTCATCAACAGTGGAACTCCCTCAGGGATCA
GAGACCCTTAAGTACGTCGGAGGTGTGGACATAAGCTTCTCCAAAGACGATTCCTCCGTG
GCGTGCGCTTGTCTCGTCGTTCTCGAGATACCTTCTCTCCGTGTGGTTCACAACGAGCTC
TCTCTCCTTCGCCTCCAAGTTCCTTACGTTCCTGGGTTTCTCGCCTTTCGTGAGGCTCCG
GTTCTGTTGCAGATTCTTGAGAAGATGAGGGATGAGGAGCATCCTTTCTTTCCTCAGGTA
CTGATGGTGGATGGGAATGGGATTCTTCATCCACGAGGATTTGGCTTGGCGTGTCATTTA
GGTGTTCTTGCTCACATTCCTACCATTGGGGTCGGAAAGAACCTGCATCATGTGGATGGT
CTGGATCATTCTGAGGTTAGAAGTTTGTTTCAGCTCAAAGAAAATGAGGATGAGCGGGTT
ATCAAGTTGGTTGGGGACTCTGGTTTTACGTGGGGAGTAGGATTTAGGCCAACTCTGAGT
TCTCTGAAGCCCATATATGT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2CD22JQ 815 0 0
TGCGCTTGTCTCGTCGTTCTCGAGATAC*TTCTCTCCGTGTGGTTCACAACGAGCTCTCT
CTCCTTCGCCTCCAAGTTCCTTACGTTCCTGGGTTTCTCGCCTTTCGTGAGGCTCCGGTT
CTGTTGCAGATTCTTGAGAAGATGAGGGATGAGGAGCATCCTTTCTTTCCTCAGGTACTG
ATGGTGGATGGGAATGGGATTCTTCATCCACGAGGATTTGGCTTGGCGTGTCATTTAGGT
GTTCTTGCTCACATTCCTACCATTGGGGTCGGAAAGAACCTGCATCATGTGGATGGTCTG
GATCATTCTGAGGTTAGAAGTTTGTTTCAGCTCAAAGAAAATGAGGATGAGCGGGTTATC
AAGTTGGTTGGGGACTCTGGTTTTACGTGGGGAGTAGGATTTAGGCCAACTCTGAGTTCT
CTGAAGCCCATATATGTTTCGGTTGGCCATCGCATATCACTTGACTCTGCGGTTGAGGTT
GTCAAGATGACCTGCAAGTACCGCGTGCCTGAACCTATTAGACAGGCAGATATAAGATCA
AGAGCATATCTTCAAAAGCACCAACTTCGTCTCTTAAAAGATTTGGGACCACTCGGAATG
GACTGAACACATAGTCATTAAAACAAGCTGTGAACACTTTTCCACATTACAGAGAAGCTC
CACACAAGTTTTTCCTTTATTTATCTCAGAGACTCTAACTAAGATTGTTTCGAAGAAATG
AGTCTTGTTATAACATGTTTGTATCCAATATTCATTGTATGTATTTTGCGTTAAGCTATG
CAAAAAATTTCATATATCCATGTCACATTTACTTC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL7093Contig1 1019 2 4 U
GCTATCAACCCTGACGAGGCCGTTGCTTATGGTGCTGCAGTTCAGGGAGCTATTCTCAGC
GGTGAAGGAAACGAGAAGGTCCAAGATCTTCTCTTGCTTGATGTCACTCCTCTCTCACTC
GGTCTTGAAACCGCCGGTGGTGTCATGACCACTTTGGTCGCAAGGAACACCACCATTCCG
ACCAAAAAGGAGCAAGTGTTCTCAACCTACTCAGACAACCAGCCAGGTGTGTTGATCCAG
GTGTTCTAGGGTGAGAGAGCCAGAACCAAGGACAACAACTTACTCGGGAAGTTTGAACTC
TCTGGAATCCCTCCAGCCCCACGTGGTGTCCCTCAGATCACTGTCTGTTTTGACATCGAC
GCCAATGGTATCCTCAACGTGTCTGCTGAGGACAAGACCACTGGACAGAAGAACAAGATC
ACCATCACCAACGACAAGGGTCGTTTGTCCAAGGACGATATTGAGAAGATGGTCCAGGAG
GCTGAGAAGTACAAGTCTGAGGACGAGGAGCACAAGAAGAAGGTGGAAGCCAAGAACGCT
CTCGAGAACTACGCTTACAACATGAGGAACACGATCCAGGACGAGAAGATTGGTGAGAAG
CTACCGGCTGCAGACAAGAAGAAGATCGAGGACTCGATTGAGCAGGCGATTCAGTGGCTA
GAGAACAACCAGTTGGGTGAGGCTGATGAGTTTGAGGACAAGATGAAGGAGTTGGAGAGC
ATCTGCAACCCAATCATTGCCAAGATGTACCAAGGAGCTGGCGGTGAAGCCGCAGGAATG
GACGATGATGCTCCTCCTGCCTCAGGCGGTGCTGGTCCTAAGATCGAAGAGGTCGACTAA
TCTGTTGATTCCTGACGGCTCTCTATCTCTTTCACTGCTTATTTCGATTTCTTAAGAACT
TTTCTATGTTGGGCCTTTTTGATAGGCCCGTTTTGCTATTATTTTTGTTACAACTTTTTG
AACTCTGGATTTTCTGTCCAGCTATGATGACGGATAAGTAAAACGTTTTGGCCTTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR23TF U 1
AF RR2FR23JQ C 315
BS 1 645 RR2FR23TF
BS 646 646 RR2FR23JQ
BS 647 751 RR2FR23TF
BS 752 1019 RR2FR23JQ

RD RR2FR23TF 751 0 0
GCTATCAACCCTGACGAGGCCGTTGCTTATGGTGCTGCAGTTCAGGGAGCTATTCTCAGC
GGTGAAGGAAACGAGAAGGTCCAAGATCTTCTCTTGCTTGATGTCACTCCTCTCTCACTC
GGTCTTGAAACCGCCGGTGGTGTCATGACCACTTTGGTCGCAAGGAACACCACCATTCCG
ACCAAAAAGGAGCAAGTGTTCTCAACCTACTCAGACAACCAGCCAGGTGTGTTGATCCAG
GTGTTCTAGGGTGAGAGAGCCAGAACCAAGGACAACAACTTACTCGGGAAGTTTGAACTC
TCTGGAATCCCTCCAGCCCCACGTGGTGTCCCTCAGATCACTGTCTGTTTTGACATCGAC
GCCAATGGTATCCTCAACGTGTCTGCTGAGGACAAGACCACTGGACAGAAGAACAAGATC
ACCATCACCAACGACAAGGGTCGTTTGTCCAAGGACGATATTGAGAAGATGGTCCAGGAG
GCTGAGAAGTACAAGTCTGAGGACGAGGAGCACAAGAAGAAGGTGGAAGCCAAGAACGCT
CTCGAGAACTACGCTTACAACATGAGGAACACGATCCAGGACGAGAAGATTGGTGAGAAG
CTACCGGCTGCAGACAAGAAGAAGATCGAGGACTCGATTGAGCAG*CGATTCAGTGGCTA
GAGAACAACCAGTTGGGTGAGGCTGATGAGTTTGAGGACAAGATGAAGGAGTTGGAGAGC
ATCTGCAACCCAATCATTGCCAAGATGTACC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2FR23JQ 705 0 0
AGCCCCACGTGGTGTCCCTCAGATCACTGTCTGTTTTGACATCGACGCCAATGGTATCCT
CAACGTGTCTGCTGAGGACAAGACCACTGGACAGAAGAACAAGATCACCATCACCAACGA
CAAGGGTCGTTTGTCCAAGGACGATATTGAGAAGATGGTCCAGGAGGCTGAGAAGTACAA
GTCTGAGGACGAGGAGCACAAGAAGAAGGTGGAAGCCAAGAACGCTCTCGAGAACTACGC
TTACAACATGAGGAACACGATCCAGGACGAGAAGATTGGTGAGAAGCTACCGGCTGCAGA
CAAGAAGAAGATCGAGGACTCGATTGAGCAGGCGATTCAGTGGCTAGAGAACAACCAGTT
GGGTGAGGCTGATGAGTTTGAGGACAAGATGAAGGAGTTGGAGAGCATCTGCAACCCAAT
CATTGCCAAGATGTACCAAGGAGCTGGCGGTGAAGCCGCAGGAATGGACGATGATGCTCC
TCCTGCCTCAGGCGGTGCTGGTCCTAAGATCGAAGAGGTCGACTAATCTGTTGATTCCTG
ACGGCTCTCTATCTCTTTCACTGCTTATTTCGATTTCTTAAGAACTTTTCTATGTTGGGC
CTTTTTGATAGGCCCGTTTTGCTATTATTTTTGTTACAACTTTTTGAACTCTGGATTTTC
TGTCCAGCTATGATGACGGATAAGTAAAACGTTTTGGCCTTTCCG

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL7094Contig1 928 2 4 U
GATCAACTAGAAGCGTCTGCCTCCGGAACTTCTTACGGTTTAGATGGCGGTGAAAACAGC
AGACAACAAAATTTCTTGTCTCCAAACTTCGGTCTGGACGGTGACTCAAGAAACAGTTTG
TTTGGTGGAGCCAATGTGGAGAATGGCTTTGTACCTGACACGTTGCTCTCGAGGGGATAC
GACTCCCAGAAAGATCTCCAGAACATGCTTTCAAACTATGGAGGAGTGACCAATGACATT
GGTACAGAGATGTCTACTTCAGCTGTAAGAACTCAATCTTTTGGCATCCCTAATGTGCCG
GCCATATCAAACGATCTAGCTGTCAACGATGCTGGAGTTCTTGGTGGCGGTTTATGGCCA
ACTCAGGGGATGCGAACTTATACAAAGGTGCAAAAGCGAGGTTCAGTGGGGAGATCAATA
GACGTCAACCGTTACAGAGGTTATGATGAGCTGAGGCATGACCTAGCACGGATGTTTGGG
ATCGAAGGACAGCTTGAAGATCCGCTAACATCAGATTGGAAGCTTGTCTACGTAGATCAC
GAAAACGACATCCTTCTTGTCGGTGATGACCCGTGGGAGGAATTTGTGAATTGTGTTCAG
AGCATAAAGATCCTTTCATCAGCTGAGGTTCAACAGATGAGTTTAGACGGTAACTTTGCA
GGTTTACCAGCTACTAATCAAGCTTGTAGTGGCGGTGACAATGGCAATGGTTGGAGAGGT
CAGTATGATGATAACTCGGCCAACTCGTTTAACCGGTGAAGGCAAAAAAAGAACATCCTC
TCAGAGAGTCAAAGACAATGATTCTTTCTTTTGTAATATAATCTTTTCCTCCGTTTGATA
ACACGTACCAAGTTTCCAATGGGCACTGTAGAGCACTTACCTGTAAAATACAATCTTCAA
ACTACGTTTACACGAAGAATTTATTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F875TF U 1
AF RR2F875JQ C 343
BS 1 661 RR2F875TF
BS 662 662 RR2F875JQ
BS 663 742 RR2F875TF
BS 743 928 RR2F875JQ

RD RR2F875TF 747 0 0
GATCAACTAGAAGCGTCTGCCTCCGGAACTTCTTACGGTTTAGATGGCGGTGAAAACAGC
AGACAACAAAATTTCTTGTCTCCAAACTTCGGTCTGGACGGTGACTCAAGAAACAGTTTG
TTTGGTGGAGCCAATGTGGAGAATGGCTTTGTACCTGACACGTTGCTCTCGAGGGGATAC
GACTCCCAGAAAGATCTCCAGAACATGCTTTCAAACTATGGAGGAGTGACCAATGACATT
GGTACAGAGATGTCTACTTCAGCTGTAAGAACTCAATCTTTTGGCATCCCTAATGTGCCG
GCCATATCAAACGATCTAGCTGTCAACGATGCTGGAGTTCTTGGTGGCGGTTTATGGCCA
ACTCAGGGGATGCGAACTTATACAAAGGTGCAAAAGCGAGGTTCAGTGGGGAGATCAATA
GACGTCAACCGTTACAGAGGTTATGATGAGCTGAGGCATGACCTAGCACGGATGTTTGGG
ATCGAAGGACAGCTTGAAGATCCGCTAACATCAGATTGGAAGCTTGTCTACGTAGATCAC
GAAAACGACATCCTTCTTGTCGGTGATGACCCGTGGGAGGAATTTGTGAATTGTGTTCAG
AGCATAAAGATCCTTTCATCAGCTGAGGTTCAACAGATGAGTTTAGACGGTAACTTTGCA
G*TTTACCAGCTACTAATCAAGCTTGTAGTGGCGGTGACAATGGCAATGGTTGGAGAGGT
CAGTATGATGATAACTCGGCCA
CTCGT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2F875JQ 586 0 0
GGTGGCGGTTTATGGCCAACTCAGGGGATGCGAACTTATACAAAGGTGCAAAAGCGAGGT
TCAGTGGGGAGATCAATAGACGTCAACCGTTACAGAGGTTATGATGAGCTGAGGCATGAC
CTAGCACGGATGTTTGGGATCGAAGGACAGCTTGAAGATCCGCTAACATCAGATTGGAAG
CTTGTCTACGTAGATCACGAAAACGACATCCTTCTTGTCGGTGATGACCCGTGGGAGGAA
TTTGTGAATTGTGTTCAGAGCATAAAGATCCTTTCATCAGCTGAGGTTCAACAGATGAGT
TTAGACGGTAACTTTGCAGGTTTACCAGCTACTAATCAAGCTTGTAGTGGCGGTGACAAT
GGCAATGGTTGGAGAGGTCAGTATGATGATAACTCGGCCAACTCGTTTAACCGGTGAAGG
CAAAAAAAGAACATCCTCTCAGAGAGTCAAAGACAATGATTCTTTCTTTTGTAATATAAT
CTTTTCCTCCGTTTGATAACACGTACCAAGTTTCCAATGGGCACTGTAGAGCACTTACCT
GTAAAATACAATCTTCAAACTACGTTTACACGAAGAATTTATTATG

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL7095Contig1 436 2 1 U
GATCCTCAGTGTGAGGGTTGACCAAGAGTCAAAGGTGGTGCAGCAGGATATAGTCGACAT
GTACATGAAAAGCATGCAACAGTTTACTGATTCACTGGCTAAAATGAAGCTTCCTCTGGA
CATTGATAGCCCAACAAAATCAGAGAACTCAAGCTCTGATTCTCAGAAGCTTCCTACACC
TAAGAGCGACAACAGCGGATCTCGTGTGTACTATGGGAGCAGGGCTTTCTTCTGAGCATC
TGTTTTACCAAGTTCAGAGGAAAGAACTCAGGCCACTCCTAGACTTTTACTGATGAAGAA
AGACTAATCTCCTAATAATGTAATTTTATGATGTACTGTTTGATGTTGTTTCTCCCATCT
GGTCAGCTTTATGTTTAAGTTGAAGTGAAGTTGTGTAATATATCACTAGACTTTGTATTA
TTAGAACTATCTTCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BM61JQ C 1
AF RR2BM61TF U 1
BS 1 436 RR2BM61TF

RD RR2BM61JQ 436 0 0
GATCCTCAGTGTGAGGGTTGACCAAGAGTCAAAGGTGGTGCAGCAGGATATAGTCGACAT
GTACATGAAAAGCATGCAACAGTTTACTGATTCACTGGCTAAAATGAAGCTTCCTCTGGA
CATTGATAGCCCAACAAAATCAGAGAACTCAAGCTCTGATTCTCAGAAGCTTCCTACACC
TAAGAGCGACAACAGCGGATCTCGTGTGTACTATGGGAGCAGGGCTTTTTTCTGAGCATC
TGTTTTACCAAGTTCAGAGGAAAGAACTCAGGCCACTCCTAGACTTTTACTGATGAAGAA
AGACTAATCTCCTAATAATGTAATTTTATGATGTACTGTTTGATGTTGTTTCTCCCATCT
GGTCAGCTTTATGTTTAAGTTGAAGTGAAGTTGTGTAATATATCACTAGACTTTGTATTA
TTAGAACTATCTTCAC

QA 1 436 1 436
DS 

RD RR2BM61TF 436 0 0
GATCCTCAGTGTGAGGGTTGACCAAGAGTCAAAGGTGGTGCAGCAGGATATAGTCGACAT
GTACATGAAAAGCATGCAACAGTTTACTGATTCACTGGCTAAAATGAAGCTTCCTCTGGA
CATTGATAGCCCAACAAAATCAGAGAACTCAAGCTCTGATTCTCAGAAGCTTCCTACACC
TAAGAGCGACAACAGCGGATCTCGTGTGTACTATGGGAGCAGGGCTTTCTTCTGAGCATC
TGTTTTACCAAGTTCAGAGGAAAGAACTCAGGCCACTCCTAGACTTTTACTGATGAAGAA
AGACTAATCTCCTAATAATGTAATTTTATGATGTACTGTTTGATGTTGTTTCTCCCATCT
GGTCAGCTTTATGTTTAAGTTGAAGTGAAGTTGTGTAATATATCACTAGACTTTGTATTA
TTAGAACTATCTTCAC

QA 1 436 1 436
DS 



AS 1 2

CO CL7096Contig1 886 2 2 U
GAATTTTGCGCCGAAAAAAAATGTTTTCTTCGCTTGCGTTATCAACGGCACCAATGCCCT
TGAAGATTATCTCCGTCACGAGACGGTCCCGAGTCACGCAACTTAACGCAAAGAAAACAA
AGCTAGAGAAGAAGCTGCCAACGACGACGACGTCCACGAGCGGTTTCTCCGGCAGAACAT
CGAAGGAGCTGACGTGGCAGTGCATAGAAGGCTGCGGAGCTTGCTGTAAGTTTGCAAAGG
ACTTCGCTTTCGCCACCCCTGACGAAATCTTCGACTACCCTGATGACGTAGAGCTGTATA
GAAGCATGATTGGAGATGATGGGTGGTGCATAAACTACGACAAACCTACACGCAAATGCT
CCATTTATGCTGATCGACCATATTTCTGCCGGGTTGAGCCAGAGGTTTTCAAGACTCCCT
ACGGGATCGAAGAAAAGAAATTCAACAAGGAAGCTTGCAGCTGTTGCATTGATACCATTA
AAACAATACACGGCTCCGATTCCAAAGAACTAGATAATTTCAACCGTGCAATCAGAAGCA
GTCCGAGTTCGAGTTAACAGCCTGATGAACTCTAAGGAAACTGATAGGTTCAAATATACA
TACAAGAGGAACAAAGGGAAGAAGGTGGTTTAGAAGACTCGGGAAGAGGGAGAAGTTTTG
CAGTTACAAATTCAAATTAATAAAAGAAGGAGAAGACTTGTATTACAGATAGTATAAATA
GTAGCTGATCATTGTTTAGATCTTTATCGAGAAATTACAATCTAGAATCTTAGCGATGAG
CTTTGGTCTACTCAGGTGATAGAGTAGAAGAGGTACTCAGGTGATAGAGTCCTCCTGGTT
GTAATTCTCGTATTAATTCAGTAATAAAGCGCATTTCTAGTCGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET48TF U 1
AF RR2ET48JQ C 189
BS 1 620 RR2ET48TF
BS 621 886 RR2ET48JQ

RD RR2ET48TF 620 0 0
GAATTTTGCGCCGAAAAAAAATGTTTTCTTCGCTTGCGTTATCAACGGCACCAATGCCCT
TGAAGATTATCTCCGTCACGAGACGGTCCCGAGTCACGCAACTTAACGCAAAGAAAACAA
AGCTAGAGAAGAAGCTGCCAACGACGACGACGTCCACGAGCGGTTTCTCCGGCAGAACAT
CGAAGGAGCTGACGTGGCAGTGCATAGAAGGCTGCGGAGCTTGCTGTAAGTTTGCAAAGG
ACTTCGCTTTCGCCACCCCTGACGAAATCTTCGACTACCCTGATGACGTAGAGCTGTATA
GAAGCATGATTGGAGATGATGGGTGGTGCATAAACTACGACAAACCTACACGCAAATGCT
CCATTTATGCTGATCGACCATATTTCTGCCGGGTTGAGCCAGAGGTTTTCAAGACTCCCT
ACGGGATCGAAGAAAAGAAATTCAACAAGGAAGCTTGCAGCTGTTGCATTGATACCATTA
AAACAATACACGGCTCCGATTCCAAAGAACTAGATAATTTCAACCGTGCAATCAGAAGCA
GTCCGAGTTCGAGTTAACAGCCTGATGAACTCTAAGGAAACTGATAGGTTCAAATATACA
TACAAGAGGAACAAAGGGAA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2ET48JQ 698 0 0
CTGACGTGGCAGTGCATAGAAGGCTGCGGAGCTTGCTGTAAGTTTGCAAAGGACTTCGCT
TTCGCCACCCCTGACGAAATCTTCGACTACCCTGATGACGTAGAGCTGTATAGAAGCATG
ATTGGAGATGATGGGTGGTGCATAAACTACGACAAACCTACACGCAAATGCTCCATTTAT
GCTGATCGACCATATTTCTGCCGGGTTGAGCCAGAGGTTTTCAAGACTCCCTACGGGATC
GAAGAAAAGAAATTCAACAAGGAAGCTTGCAGCTGTTGCATTGATACCATTAAAACAATA
CACGGCTCCGATTCCAAAGAACTAGATAATTTCAACCGTGCAATCAGAAGCAGTCCGAGT
TCGAGTTAACAGCCTGATGAACTCTAAGGAAACTGATAGGTTCAAATATACATACAAGAG
GAACAAAGGGAAGAAGGTGGTTTAGAAGACTCGGGAAGAGGGAGAAGTTTTGCAGTTACA
AATTCAAATTAATAAAAGAAGGAGAAGACTTGTATTACAGATAGTATAAATAGTAGCTGA
TCATTGTTTAGATCTTTATCGAGAAATTACAATCTAGAATCTTAGCGATGAGCTTTGGTC
TACTCAGGTGATAGAGTAGAAGAGGTACTCAGGTGATAGAGTCCTCCTGGTTGTAATTCT
CGTATTAATTCAGTAATAAAGCGCATTTCTAGTCGAAA

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL7097Contig1 445 2 3 U
GGCCGAAACAGCCCCCGGAGAGCCGAGAAGGTGAAACCCAAAAAGGTGAAGAGAAGTACA
ACCTGGAGGCAATTCCTGGTCTTTAGAAGCAAAGATATCTGATAGTTTCAACAGCTGTAT
TAGCATCATGGTTTTGATTAAACTCCCCTGGAAGAAAAGGGTTCATTGACAGGAAAAAAG
AACTTGAGAGATTAAAGTGGTTTTTATAGGACTTTAGGAGTCTTTTTAAGTGTCTTTGTT
TTATATTTGACTATCTTCCCAAAATAACAACAACAAAAATGTATCTTCTTAATTACAATG
AGAAGATGCAGAACGGAGAAGATTTATGGAATTTCGTACATTCATAAGCTTCCTGAAACA
GATATGTATAGTCTCAGTGATGCATGTTCTCGCTTATGGATGATGGACCAGCAATTTATT
ATGTTGAAATTATGATATCTGATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FL87JQ C 1
AF RR2FL87TF U 1
BS 1 13 RR2FL87TF
BS 14 14 RR2FL87JQ
BS 15 445 RR2FL87TF

RD RR2FL87JQ 445 0 0
GGCCGAAACAGCTCCCGGAGAGCCGAGAAGGTGAAACCCAAAAAGGTGAAGAGAAGTACA
ACCTGGAGGCAATTCCTGGTCTTTAGAAGCAAAGATATCTGATAGTTTCAACAGCTGTAT
TAGCATCATGGTTTTGATTAAACTCCCCTGGAAGAAAAGGGTTCATTGACAGGAAAAAAG
AACTTGAGAGATTAAAGTGGTTTTTATAGGACTTTAGGAGTCTTTTTAAGTGTCTTTGTT
TTATATTTGACTATCTTCCCAAAATAACAACAACAAAAATGTATCTTTTTAATTACAATG
AGAAGATGCAGAACGGAGAAGATTTATGGAATTTCGTACATTCATAAGCTTCCTGAAACA
GATATGTATAGTCTCAGTGATGCATGTTCTCGCTTATGGATGATGGACCAGCAATTTATT
ATGTTGAAATTATGATATCTGATCC

QA 1 445 1 445
DS 

RD RR2FL87TF 445 0 0
GGCCGAAACAGCCTCCGGAGAGCCGAGAAGGTGAAACCCAAAAAGGTGAAGAGAAGTACA
ACCTGGAGGCAATTCCTGGTCTTTAGAAGCAAAGATATCTGATAGTTTCAACAGCTGTAT
TAGCATCATGGTTTTGATTAAACTCCCCTGGAAGAAAAGGGTTCATTGACAGGAAAAAAG
AACTTGAGAGATTAAAGTGGTTTTTATAGGACTTTAGGAGTCTTTTTAAGTGTCTTTGTT
TTATATTTGACTATCTTCCCAAAATAACAACAACAAAAATGTATCTTCTTAATTACAATG
AGAAGATGCAGAACGGAGAAGATTTATGGAATTTCGTACATTCATAAGCTTCCTGAAACA
GATATGTATAGTCTCAGTGATGCATGTTCTCGCTTATGGATGATGGACCAGCAATTTATT
ATGTTGAAATTATGATATCTGATCC

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 2

CO CL7098Contig1 742 2 2 U
GGGTTTCATGGGGTATGGAACTATTACATCCCATTCACTGATGGGTTTGGAAGCTCGTGG
AACTCTCTTTGTGTCTCCAGGGCTGGACTCATACGATGGCATGATTATCGGTGAGCACTC
ACGAGATACAGATCTTGATGTTAACCCGGTTAAGGCCAAAGAGCTTACCAACATTCGATC
TGCTAACAAAGACGAAAATGTGAAGCTATCTCCACCTCGCCTCATGACACTTGAGGAAGC
TATAGGATATGTTGCCTCAGATGAACTTATTGAGGTCACTCCAAAGAGGATTCGGTTGAG
GAAGAGATGTCTAGACGTTACCAAGCGTAAATCCCAGAGCAAACGAGCCAAAGACTAACC
CTTTTCACACTTGATTTTCCGGTTCAGATTTTTTTAGTAAAAGCTGGTTTGGTTCTGGCT
CTGTCTCTGTCCTCACAATCATACAAAAAGAAAATTATTGAATATGTACGAGTAACATTC
AGATTATTTAGACTCGTAACTTATACGCAAGAAGATGTGTTCTTGTATTGAATAACAAAA
GGAAGATAAAGATCCATCATGATGTTGCTGTCATTGTGAATCAGCGGATGTATCGTTACA
AAGAGTTCTGTTAGGTGGCTATGTCAGGAGTCACTTCCTCGGGTCTTAAGTTCTATTTTC
AGTTTGCAAGTGTTGTATACTTAACACTCTAGTATTTGCAAGTTTGCAAGTGTTGTATAC
TTAACACACTAGTATTTGGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2BZ35JQ C 1
AF RR2BZ35TF U 1
BS 1 741 RR2BZ35TF
BS 742 742 RR2BZ35JQ

RD RR2BZ35JQ 742 0 0
GGGTTTCATGGGGTATGGAACTATTACATCCCATTCACTGATGGGTTTGGAAGCTCGTGG
AACTCTCTTTGTGTCTCCAGGGCTGGACTCATACGATGGCATGATTATCGGTGAGCACTC
ACGAGATACAGATCTTGATGTTAACCCGGTTAAGGCCAAAGAGCTTACCAACATTCGATC
TGCTAACAAAGACGAAAATGTGAAGCTATCTCCACCTCGCCTCATGACACTTGAGGAAGC
TATAGGATATGTTGCCTCAGATGAACTTATTGAGGTCACTCCAAAGAGGATTCGGTTGAG
GAAGAGATGTCTAGACGTTACCAAGCGTAAATCCCAGAGCAAACGAGCCAAAGACTAACC
CTTTTCACACTTGATTTTCCGGTTCAGATTTTTTTAGTAAAAGCTGGTTTGGTTCTGGCT
CTGTCTCTGTCCTCACAATCATACAAAAAGAAAATTATTGAATATGTACGAGTAACATTC
AGATTATTTAGACTCGTAACTTATACGCAAGAAGATGTGTTCTTGTATTGAATAACAAAA
GGAAGATAAAGATCCATCATGATGTTGCTGTCATTGTGAATCAGCGGATGTATCGTTACA
AAGAGTTCTGTTAGGTGGCTATGTCAGGAGTCACTTCCTCGGGTCTTAAGTTCTATTTTC
AGTTTGCAAGTGTTGTATACTTAACACTCTAGTATTTGCAAGTTTGCAAGTGTTGTATAC
TTAACCCACTAGTATTTGGATT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RR2BZ35TF 741 0 0
GGGTTTCATGGGGTATGGAACTATTACATCCCATTCACTGATGGGTTTGGAAGCTCGTGG
AACTCTCTTTGTGTCTCCAGGGCTGGACTCATACGATGGCATGATTATCGGTGAGCACTC
ACGAGATACAGATCTTGATGTTAACCCGGTTAAGGCCAAAGAGCTTACCAACATTCGATC
TGCTAACAAAGACGAAAATGTGAAGCTATCTCCACCTCGCCTCATGACACTTGAGGAAGC
TATAGGATATGTTGCCTCAGATGAACTTATTGAGGTCACTCCAAAGAGGATTCGGTTGAG
GAAGAGATGTCTAGACGTTACCAAGCGTAAATCCCAGAGCAAACGAGCCAAAGACTAACC
CTTTTCACACTTGATTTTCCGGTTCAGATTTTTTTAGTAAAAGCTGGTTTGGTTCTGGCT
CTGTCTCTGTCCTCACAATCATACAAAAAGAAAATTATTGAATATGTACGAGTAACATTC
AGATTATTTAGACTCGTAACTTATACGCAAGAAGATGTGTTCTTGTATTGAATAACAAAA
GGAAGATAAAGATCCATCATGATGTTGCTGTCATTGTGAATCAGCGGATGTATCGTTACA
AAGAGTTCTGTTAGGTGGCTATGTCAGGAGTCACTTCCTCGGGTCTTAAGTTCTATTTTC
AGTTTGCAAGTGTTGTATACTTAACACTCTAGTATTTGCAAGTTTGCAAGTGTTGTATAC
TTAACACACTAGTATTTGGAT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7100Contig1 660 2 1 U
GGATCATAAACTAGAAAATAAAATAAAAATCAGAGAAAACAAGAATGGCTGCAAATTTAA
TGACAAATGCATTCTTGTCTTCTTTTATATTTCTTTTCTTAATCGGTTCCTCGTATGCGA
TTACAAGTTCAGAGATGAGCACAATCTGTGACAAAACTTTAGATCCATCTTTCTGTCTTG
ACTTTCTCAACACAGAATTTTCATCTCCTAATCTTCAAGCCTTGGCGAATTCTACACTTG
ATGCTGCACAAGCAAAAGCAACACAAACATTCAAAAGACTTCAATCTATTATCGATGGAG
GAGTCGACCCACGATCGAAACTAGCTTACAGATCATGCTTAGATGAATACGAGAATGCTA
TTGGAAACCTCGAAGAAGCTTTTGAGCATTTAGCTTCCGGTGAGGGTGAGGGGCTGAACA
CTAAAGTTTCTGCTGTATTGGATGGAGCTGATACATGTCTAGATTATGTGAAGAGACTGA
GATCTATAGATGATTCTGTTTTGAATAATAGTAAGGAAATTAAAAATCTTTGTGGTATTA
CTCTTGTTATCTCCAACATCCTACCACGCAAATATTAATTTGGAACCATCATCATGTGTT
TGACTGATTAAGTTGTATTATTGATAAGATAATAATTACATTTATCATATACTAATTATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GX32JQ C 1
AF RR2GX32TF U 1
BS 1 660 RR2GX32TF

RD RR2GX32JQ 660 0 0
GGATCATAAACTAGAAAATAAAATAAAAATCAGAGAAAACAAGAATGGCTGCAAATTTAA
TGACAAATGCATTCTTGTCTTCTTTTATATTTCTTTTCTTAATCGGTTCCTCGTATGCGA
TTACAAGTTCAGAGATGAGCACAATCTGTGACAAAACTTTAGATCCATCTTTCTGTCTTG
ACTTTCTCAACACAGAATTTTCATCTCCTAATCTTCAAGCCTTGGCGAATTCTACACTTG
ATGCTGCACAAGCAAAAGCAACACAAACATTCAAAAGACTTCAATCTATTATCGATGGAG
GAGTCGACCCACGATCGAAACTAGCTTACAGATCATGCTTAGATGAATACGAGAATGCTA
TTGGAAACCTCGAAGAAGCTTTTGAGCATTTAGCTTCCGGTGAGGGTGAGGGGCTGAACA
CTAAAGTTTTTGCTGTATTGGATGGAGCTGATACATGTCTAGATTATGTGAAGAGACTGA
GATCTATAGATGATTCTGTTTTGAATAATAGTAAGGAAATTAAAAATCTTTGTGGTATTA
CTCTTGTTATCTCCAACATCCTACCACGCAAATATTAATTTGGAACCATCATCATGTGTT
TGACTGATTAAGTTGTATTATTGATAAGATAATAATTACATTTATCATATACTAATTATT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2GX32TF 660 0 0
GGATCATAAACTAGAAAATAAAATAAAAATCAGAGAAAACAAGAATGGCTGCAAATTTAA
TGACAAATGCATTCTTGTCTTCTTTTATATTTCTTTTCTTAATCGGTTCCTCGTATGCGA
TTACAAGTTCAGAGATGAGCACAATCTGTGACAAAACTTTAGATCCATCTTTCTGTCTTG
ACTTTCTCAACACAGAATTTTCATCTCCTAATCTTCAAGCCTTGGCGAATTCTACACTTG
ATGCTGCACAAGCAAAAGCAACACAAACATTCAAAAGACTTCAATCTATTATCGATGGAG
GAGTCGACCCACGATCGAAACTAGCTTACAGATCATGCTTAGATGAATACGAGAATGCTA
TTGGAAACCTCGAAGAAGCTTTTGAGCATTTAGCTTCCGGTGAGGGTGAGGGGCTGAACA
CTAAAGTTTCTGCTGTATTGGATGGAGCTGATACATGTCTAGATTATGTGAAGAGACTGA
GATCTATAGATGATTCTGTTTTGAATAATAGTAAGGAAATTAAAAATCTTTGTGGTATTA
CTCTTGTTATCTCCAACATCCTACCACGCAAATATTAATTTGGAACCATCATCATGTGTT
TGACTGATTAAGTTGTATTATTGATAAGATAATAATTACATTTATCATATACTAATTATT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL7101Contig1 723 2 10 U
GAACACGACTTACACGACAAAACGAGACAAGAATCCAAGAGAGCACACGACGTTAATTAG
AAAAAATGTCCATATTCGTCCTGTCACTCTTTCTTTTTGCCACTTCTTTGTACGTCTCCT
GCACAAACCTAACAGCTTACGATGTTGTCCAAAAATACAAGTTACCACGAGGAATATTAC
CAGAAGGTGTCATTGACTACGACCTAAACCACAAAACTGGCTTTTTCAAAGTCTATTTCA
ACAACACGTGTCGGTTCCCAATCGAGGGACACAAGGTCAAGTACCAACCTATCGTCTCTG
GCTTCATAAAAAACGGACGGATCAGTAGGCTGATGGGCGTAAGCGTCAAATTACTTTACT
TCTGGCTCAGCATCGGGGAGATGACTAGTGACGGCCAAGAACTCGAACTCTCAGTTGGTG
CTGCTTCGGAAGAATTCTCGGTGCATCATTTCGACAGGAGCCCACAGTGTGGTTGTGGGT
TTTATTGTCGTGAGCTCAAATTTTCCTTCTAAAGCTAATGGGCCTCCAAGTTGTTATGAA
TAAAATAAATAAATAACCAGTTTACCCAATAGATTAGACTAAAACTCGAGTGGTTTGTGG
TGCTATGGATTGGTGACTGAATAAATTGCAGTACTAAAACTTTATCCATGTCAAACTGAT
GCAAATTTCGAGCTTTTACATATTTTATTAGATTATACTATTAAATTCTCAGCTATATAT
ACA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2BX46TF U 1
AF RR2EC55TF U 1
BS 1 269 RR2BX46TF
BS 270 270 RR2EC55TF
BS 271 380 RR2BX46TF
BS 381 381 RR2EC55TF
BS 382 567 RR2BX46TF
BS 568 569 RR2EC55TF
BS 570 654 RR2BX46TF
BS 655 655 RR2EC55TF
BS 656 673 RR2BX46TF
BS 674 723 RR2EC55TF

RD RR2BX46TF 673 0 0
GAACACGACTTACACGACAAAACGAGACAAGAATCCAAGAGAGCACACGACGTTAATTAG
AAAAAATGTCCATATTCGTCCTGTCACTCTTTCTTTTTGCCACTTCTTTGTACGTCTCCT
GCACAAACCTAACAGCTTACGATGTTGTCCAAAAATACAAGTTACCACGAGGAATATTAC
CAGAAGGTGTCATTGACTACGACCTAAACCACAAAACTGGCTTTTTCAAAGTCTATTTCA
ACAACACGTGTCGGTTCCCAATCGAGGGATACAAGGTCAAGTACCAACCTATCGTCTCTG
GCTTCATAAAAAACGGACGGATCAGTAGGCTGATGGGCGTAAGCGTCAAATTACTTTACT
TCTGGCTCAGCATCGGGGAGGTGACTAGTGACGGCCAAGAACTCGAACTCTCAGTTGGTG
CTGCTTCGGAAGAATTCTCGGTGCATCATTTCGACAGGAGCCCACAGTGTGGTTGTGGGT
TTTATTGTCGTGAGCTCAAATTTTCCTTCTAAAGCTAATGGGCCTCCAAGTTGTTATGAA
TAAAATAAATAAATAACCAGTTTACCC**TAGATTAGACTAAAACTCGAGTGGTTTGTGG
TGCTATGGATTGGTGACTGAATAAATTGCAGTACTAAAACTTTATCCATGTCAA*CTGAT
GCAAATTTCGAGC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2EC55TF 723 0 0
GAACACGACTTACACGACAAAACGAGACAAGAATCCAAGAGAGCACACGACGTTAATTAG
AAAAAATGTCCATATTCGTCCTGTCACTCTTTCTTTTTGCCACTTCTTTGTACGTCTCCT
GCACAAACCTAACAGCTTACGATGTTGTCCAAAAATACAAGTTACCACGAGGAATATTAC
CAGAAGGTGTCATTGACTACGACCTAAACCACAAAACTGGCTTTTTCAAAGTCTATTTCA
ACAACACGTGTCGGTTCCCAATCGAGGGACACAAGGTCAAGTACCAACCTATCGTCTCTG
GCTTCATAAAAAACGGACGGATCAGTAGGCTGATGGGCGTAAGCGTCAAATTACTTTACT
TCTGGCTCAGCATCGGGGAGATGACTAGTGACGGCCAAGAACTCGAACTCTCAGTTGGTG
CTGCTTCGGAAGAATTCTCGGTGCATCATTTCGACAGGAGCCCACAGTGTGGTTGTGGGT
TTTATTGTCGTGAGCTCAAATTTTCCTTCTAAAGCTAATGGGCCTCCAAGTTGTTATGAA
TAAAATAAATAAATAACCAGTTTACCTAATAGATTAGACTAAAACTCGAGTGGTTTGTGG
TGCTATGGATTGGTGACTGAATAAATTGCAGTACTAAAACTTTATCCATGTCAAACTGAT
GCAAATTTCGAGCTTTTACATATTTTATTAGATTATACTATTAAATTCTCAGCTATATAT
ACA

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL7102Contig1 850 2 2 U
GGACAGAAAACCCATCTTGGGTTCGAAAACCATCACTGTCTCTGTCTCTAACTCTCCCCT
GCTCTCTTCTCCTCCCACTCACTTTACATTTCCTCGTCGTAAGTTCTTGTAACTTCTGGA
AGCAGCTGACAAAAACAGCAACAAGAACAATCTTGGTGCTGGTAAGATTGCATCTTGGGT
CGACTCCATGCGTGATTCTTCTCCTACACGTCTCAGATCCTCTTCTCGTGGCTCTGTCTC
AGATAACAACCATAAAACATCTTGGATCGTTCGATTTCCTTCGGCTTTAAATATGTTTGA
TGAGATTGTCAATGCTGCTAAAGGGAAAAAAATTGTTATGTTTCTTGATTACGATGGGAC
ACTTTCTCCCATAGTTGAAGATCCTGAAAAAGCTTACATAACACATGAGATGCGAGAGGT
TGTAAAGAATGTGGCTCTAAACTTTCCAACAGCTATAGTTACTGGAAGATCCATTGATAA
GGTTCGTAGTTTTGTCAAACTCGACGAGATATTCTACGCTGGAAGCCATGGCATGGACAT
TGAAGGTCCGACCAAAAACACTTACGGCGAGAGTGATCAAGGAGTGCTGTTTCAACCTGC
TAGTGAATTTGTACCCATGATCGAGAAGGTGGTTAATATTTTAGAGGAAAAGACAAAATG
GATCCCTGGAGCTATGGTGGAGAACAACAAGTTTTGTCTGTCCGTACATTTTCGACGTGT
TGATGAGAAAGTAAGAATAAAAACGATGATGAAAACAAAAGGACTTTTCTCTTCTTTTAA
CAAGGGTCCAAATTGCTTATTGTAATTTTTTACCCAAAGTACTTCAACAAATTAAAAGTC
TTGTTTCTTG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL38TF U 1
AF RR2EL38JQ C 2
BS 1 615 RR2EL38TF
BS 616 850 RR2EL38JQ

RD RR2EL38TF 615 0 0
GGACAGAAAACCCATCTTGGGTTCGAAAACCATCACTGTCTCTGTCTCTAACTCTCCCCT
GCTCTCTTCTCCTCCCACTCACTTTACATTTCCTCGTCGTAAGTTCTTGTAACTTCTGGA
AGCAGCTGACAAAAACAGCAACAAGAACAATCTTGGTGCTGGTAAGATTGCATCTTGGGT
CGACTCCATGCGTGATTCTTCTCCTACACGTCTCAGATCCTCTTCTCGTGGCTCTGTCTC
AGATAACAACCATAAAACATCTTGGATCGTTCGATTTCCTTCGGCTTTAAATATGTTTGA
TGAGATTGTCAATGCTGCTAAAGGGAAAAAAATTGTTATGTTTCTTGATTACGATGGGAC
ACTTTCTCCCATAGTTGAAGATCCTGAAAAAGCTTACATAACACATGAGATGCGAGAGGT
TGTAAAGAATGTGGCTCTAAACTTTCCAACAGCTATAGTTACTGGAAGATCCATTGATAA
GGTTCGTAGTTTTGTCAAACTCGACGAGATATTCTACGCTGGAAGCCATGGCATGGACAT
TGAAGGTCCGACCAAAAACACTTACGGCGAGAGTGATCAAGGAGTGCTGTTTCAACCTGC
TAGTGAATTTGTACC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RR2EL38JQ 849 0 0
GACAGAAAACCCATCTTGGGT*CGAAA*CCATCACTGTCTCTGTCTCTA*CTCTCCC*TG
CTCTCTTCTCCTCCCACTCACTTTACATTTCCTCGTCGTAAGTTCTTGTAACTTCTGGAA
GCAGCTGACAAAAACAGCAACAAGAACAATCTTGGTGCTGGTAAGATTGCATCTTGGGTC
GACTCCATGCGTGATTCTTCTCCTACACGTCTCAGATCCTCTTCTCGTGGCTCTGTCTCA
GATAACAACCATAAAACATCTTGGATCGTTCGATTTCCTTCGGCTTTAAATATGTTTGAT
GAGATTGTCAATGCTGCTAAAGGGAAAAAAATTGTTATGTTTCTTGATTACGATGGGACA
CTTTCTCCCATAGTTGAAGATCCTGAAAAAGCTTACATAACACATGAGATGCGAGAGGTT
GTAAAGAATGTGGCTTTAAACTTTCCAACAGCTATAGTTACTGGAAGATCCATTGATAAG
GTTCGTAGTTTTGTCAAACTCGACGAGATATTTTACGCTGGAAGCCATGGCATGGACATT
GAAGGTCCGACCAAAAACACTTACGGCGAGAGTGATCAAGGAGTGCTGTTTCAACCTGCT
AGTGAATTTGTACCCATGATCGAGAAGGTGGTTAATATTTTAGAGGAAAAGACAAAATGG
ATCCCTGGAGCTATGGTGGAGAACAACAAGTTTTGTCTGTCCGTACATTTTCGACGTGTT
GATGAGAAAGTAAGAATAAAAACGATGATGAAAACAAAAGGACTTTTCTCTTCTTTTAAC
AAGGGTCCAAATTGCTTATTGTAATTTTTTACCCAAAGTACTTCAACAAATTAAAAGTCT
TGTTTCTTG

QA 1 849 1 849
DS 



AS 1 2

CO CL7103Contig1 974 2 2 U
GGGGTTCGTGAAGTTTGCTGAGGAGAGTGAGAGGAACCGTGCGATGGCTGAGATGAATGG
GTTGTATTGCTCGACGAGGCCTATGCGTATCAGCGCGGCGACGCCGAAGAAAACCGTTGG
CTTGCAGCAACCATATGCCGCCAAAGCTGCTTACACTGTTCCAGCTCCGTCTGCAGTTGC
TGCAGCAGCTCCAGCATACGTTGCGCAACCAGCACAGGTCATTGCACCTGAAAATGACAT
CACCTGTACAACGGTCTCAGTTGCGGATTTGGACCCTAATGTTACAGAGGAAGAGCTGAA
GAAAGCATTTTCGTCGCTAGGAGAGATTGTTTATGTCAACATACCTGAAACAAAGGGATA
CGGTTATGTTCAATTCAAAACCAGGCCGTCAGCAGAAGAAGCCATGCAGAAAATGCAGGG
ACATGTGATTGGTCAACAAGCAGTACGCATCTCTTGGAGCAAAAATCCAGGACAGGATGG
TTACGTCACACAAGCGGATCCCAACCAGTGGAGTGGGTACTATGGTTATGGGCAAGGCTA
TGATGCATATGCATATGGGGCAGCTCAAGACCCATCCTTGTACGCATATGGTGGGTATAG
CTATCCCCAGTATCCGCAACAGGGAGACGGTACACAAGAAGTTACAAACTCTGGGGCAGA
GCAAGACTTATATGACCCTATGGCCACTCCTGATGTAGACAAGTTAAATGCTGGTTACTT
TTCGGTTCACGCAAGTGCCATACTAGGACGTCTATCGTGGCATCGTACCTCACCCCTCGC
ATCATAATTGACCAAATGATCACGAAGAGAAGAATAGAGAATGGTGGACTCTTTGAGATG
TTTAATGTGTTCATTGTACAAGTCGCTGCTCTTTGTTTGATTGTTTTGCCTGTATTAAAT
CTTTTCTTTCTTCTCTGTAATCCACAATTGTTGGGGATGGATTTACATCCTTCTTCAAGG
CCCATTAGACAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER78TF U 1
AF RR2ER78JQ C 248
BS 1 684 RR2ER78TF
BS 685 974 RR2ER78JQ

RD RR2ER78TF 689 0 0
GGGGTTCGTGAAGTTTGCTGAGGAGAGTGAGAGGAACCGTGCGATGGCTGAGATGAATGG
GTTGTATTGCTCGACGAGGCCTATGCGTATCAGCGCGGCGACGCCGAAGAAAACCGTTGG
CTTGCAGCAACCATATGCCGCCAAAGCTGCTTACACTGTTCCAGCTCCGTCTGCAGTTGC
TGCAGCAGCTCCAGCATACGTTGCGCAACCAGCACAGGTCATTGCACCTGAAAATGACAT
CACCTGTACAACGGTCTCAGTTGCGGATTTGGACCCTAATGTTACAGAGGAAGAGCTGAA
GAAAGCATTTTCGTCGCTAGGAGAGATTGTTTATGTCAACATACCTGAAACAAAGGGATA
CGGTTATGTTCAATTCAAAACCAGGCCGTCAGCAGAAGAAGCCATGCAGAAAATGCAGGG
ACATGTGATTGGTCAACAAGCAGTACGCATCTCTTGGAGCAAAAATCCAGGACAGGATGG
TTACGTCACACAAGCGGATCCCAACCAGTGGAGTGGGTACTATGGTTATGGGCAAGGCTA
TGATGCATATGCATATGGGGCAGCTCAAGACCCATCCTTGTACGCATATGGTGGGTATAG
CTATCCCCAGTATCCGCAACAGGGAGACGGTACACAAGAAGTTACAAACTCTGGGGCAGA
GCAAGACTTATATGACCCTATGGC
ACTCT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2ER78JQ 727 0 0
ACAACGGTCTCAGTTGCGGATTTGGACCCTAATGTTACAGAGGAAGAGCTGAAGAAAGCA
TTTTCGTCGCTAGGAGAGATTGTTTATGTCAACATACCTGAAACAAAGGGATACGGTTAT
GTTCAATTCAAAACCAGGCCGTCAGCAGAAGAAGCCATGCAGAAAATGCAGGGACATGTG
ATTGGTCAACAAGCAGTACGCATCTCTTGGAGCAAAAATCCAGGACAGGATGGTTACGTC
ACACAAGCGGATCCCAACCAGTGGAGTGGGTACTATGGTTATGGGCAAGGCTATGATGCA
TATGCATATGGGGCAGCTCAAGACCCATCCTTGTACGCATATGGTGGGTATAGCTATCCC
CAGTATCCGCAACAGGGAGACGGTACACAAGAAGTTACAAACTTTGGGGCAGAGCAAGAC
TTATATGACCCTATGGCCACTCCTGATGTAGACAAGTTAAATGCTGGTTACTTTTCGGTT
CACGCAAGTGCCATACTAGGACGTCTATCGTGGCATCGTACCTCACCCCTCGCATCATAA
TTGACCAAATGATCACGAAGAGAAGAATAGAGAATGGTGGACTCTTTGAGATGTTTAATG
TGTTCATTGTACAAGTCGCTGCTCTTTGTTTGATTGTTTTGCCTGTATTAAATCTTTTCT
TTCTTCTCTGTAATCCACAATTGTTGGGGATGGATTTACATCCTTCTTCAAGGCCCATTA
GACAACG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL7104Contig1 522 2 1 U
AGGGGACCTAATACATATCTGGAGACGAAACCCTAGATTTTGTCAAGCTCGAAGAAGAAG
AAGAAGAAGACGAAATCATGGCAGGAGTTGGACCGCTGACACAAGATTGGGAGCCGGTGG
TGATCCGCAAGAAAGCCCCTAACTCCGCCGCCAAACGCGACGAGAAAACCGTCAACGCTG
CTCGTCGATCCGGCGCCGATATCGAATCCGTCAGAAAATACAATGCTGGAACCAACAAGG
CAGCATCAAGCGGCACATCTCTCAACACTAAGAGGGCACTTGGAGCTAAACTCCGTGGTA
AGAAGTGATCATCATCAAGTCCTGAAGATAAACAAACTTTAATCGCAGTTTCACTCTTCT
TAACAACGGTGTAGTAACAACAATCAGTGCTTTGATGTAATGTCGTAACTTTTCTAAAGA
ATAATCTTTTCTCATGTAAGAAAGATAAAACCGTTTGAATGTTTGGTTGATGAATCACTC
TTTTCATAAACATATATCAATGTATAAAAGTAAGTTTGGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BE69TF U 1
AF RR2BE69JQ C 185
BS 1 522 RR2BE69TF

RD RR2BE69TF 522 0 0
AGGGGACCTAATACATATCTGGAGACGAAACCCTAGATTTTGTCAAGCTCGAAGAAGAAG
AAGAAGAAGACGAAATCATGGCAGGAGTTGGACCGCTGACACAAGATTGGGAGCCGGTGG
TGATCCGCAAGAAAGCCCCTAACTCCGCCGCCAAACGCGACGAGAAAACCGTCAACGCTG
CTCGTCGATCCGGCGCCGATATCGAATCCGTCAGAAAATACAATGCTGGAACCAACAAGG
CAGCATCAAGCGGCACATCTCTCAACACTAAGAGGGCACTTGGAGCTAAACTCCGTGGTA
AGAAGTGATCATCATCAAGTCCTGAAGATAAACAAACTTTAATCGCAGTTTCACTCTTCT
TAACAACGGTGTAGTAACAACAATCAGTGCTTTGATGTAATGTCGTAACTTTTCTAAAGA
ATAATCTTTTCTCATGTAAGAAAGATAAAACCGTTTGAATGTTTGGTTGATGAATCACTC
TTTTCATAAACATATATCAATGTATAAAAGTAAGTTTGGGTT

QA 1 522 1 522
DS 

RD RR2BE69JQ 338 0 0
TCGATCCGGCGCCGATATCGAATCCGTCAGAAAATACAATGCTGGAACCAACAAGGCAGC
ATCAAGCGGCACATCTCTCAACACTAAGAGGGCACTTGGAGCTAAACTCCGTGGTAAGAA
GTGATCATCATCAAGTCCTGAAGATAAACAAACTTTAATCGCAGTTTCACTTTTTTTAAC
AACGGTGTAGTAACAACAATCAGTGCTTTGATGTAATGTCGTAACTTTTTTAAAGAATAA
TTTTTTTTCATGTAAGAAAGATAAAACCGTTTGAATGTTTGGTTGATGAATCACTCTTTT
CATAAACATATATCAATGTATAAAAGTAAGTTTGGGTT

QA 1 338 1 338
DS 



AS 1 2

CO CL7105Contig1 744 2 8 U
GGATTCTCACAATCATCACCACTTTTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAATCGATTCTTTGCTT
TGTCTTCAAATCTCATCAAACCAAATCTCATCGATCACCTTCCATCGCCGTTATCTCTTT
CCTTTTTGTTGAATCTCAATATCTCGAAATCGCATCTTTGATTTAGAGGGTACTGATTGG
TTTCTTGTGTTTTTTTTTTGGGATTTCAATTGTCGTGTTTTTTTTAAGCTCATAGGGCAT
CATTTCCAACTTAGTTGCAACGAGGAATTGTTGTAATAAGGGTTGTTGGGGGTTTTGTTA
GACGAGAGGGAGATCATGGAAAAGTACGAGCTGGTGAAAGACATAGGAGCAGGGAATTTC
GGAGTGGCGAGGCTCATGAAGGTCAAAAACTCTAAAGAACTTGTTGCCATGAAATACATC
GAGCGTGGTCCCAAGATTGATGAGAATGTGGCGAGAGAGATCATTAATCACAGATCACTT
CGCCATCCTAATATCATCCGATTTAAGGAGGTGGTGTTGACTCCAACTCATCTTGCTATT
GCTATGGAATATGCTGCCGGTGGTGAACTTTTCGAGCGTATTTGCAGTGCTGGCAGATTC
GGTGAGGATGAGGCGAGATACTTCTTCCAGCAGCTTATATCACGTGTTAGCTATTGCCAT
GCTATGCAAATATGCCATAGAGATTTGAAGCTCGAGAATACACTCTTGGATGGAAGTCCT
GCTCCACGTCTCAAAATCTGTGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E842TF U 1
AF RR2F723TF U 1
BS 1 198 RR2E842TF
BS 199 199 RR2F723TF
BS 200 494 RR2E842TF
BS 495 495 RR2F723TF
BS 496 548 RR2E842TF
BS 549 549 RR2F723TF
BS 550 577 RR2E842TF
BS 578 744 RR2F723TF

RD RR2E842TF 577 0 0
GGATTCTCACAATCATCACCACTTTTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAATCGATTCTTTGCTT
TGTCTTCAAATCTCATCAAACCAAATCTCATCGATCACCTTCCATCGCCGTTATCTCTTT
CCTTTTTGTTGAATCTCAATATCTCGAAATCGCATCTTTGATTTAGAGGGTACTGATTGG
TTTCTTGTGTTTTTTTTT*GGGATTTCAATTGTCGTGTTTTTTTTAAGCTCATAGGGCAT
CATTTCCAACTTAGTTGCAACGAGGAATTGTTGTAATAAGGGTTGTTGGGGGTTTTGTTA
GACGAGAGGGAGATCATGGAAAAGTACGAGCTGGTGAAAGACATAGGAGCAGGGAATTTC
GGAGTGGCGAGGCTCATGAAGGTCAAAAACTCTAAAGAACTTGTTGCCATGAAATACATC
GAGCGTGGTCCCAAGATTGATGAGAATGTGGCGAGAGAGATCATTAATCACAGATCACTT
CGCCATCCTAATATTATCCGATTTAAGGAGGTGGTGTTGACTCCAACTCATCTTGCTATT
GCTATGGA*TATGCTGCCGGTGGTGAACTTTTCGAGC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2F723TF 744 0 0
GGATTCTCACAATCATCACCACTTTTGCAAAAAAAAAAAAAAAAA*TCGATTCTTTGCTT
TGTCTTCAAATCTCATCAAACCAAATCTCATCGATCACCTTCCATCGTCGTTATCTCTTT
CCTTTTTGTTGAATCTCAATATCTCGAAATCGCATCTTTGATTTAGGGGGTACTGATTGG
TTTCTTGTGTTTTTTTTTTGGGATTTCAGTTGTCGTGTTTTTTTTAAGCTCATAGGGCAT
CATTTGCAACTTAGTTGCAACGAGGAATTGTTGTAATAAGGGTTGTTGGGGGTTTTGTTA
GACGAGAGGGAGATCATGGAAAAGTACGAGCTGGTGAAAGACATAGGAGCAGGGAATTTC
GGAGTGGCGAGGCTCATGAAGGTCAAAAACTCTAAAGAACTTGTTGCCATGAAATACATC
GAGCGTGGTCCCAAGATTGATGAGAATGTGGCGAGAGAGATCATTAATCACAGATCACTT
CGCCATCCTAATATCATCCGATTTAAGGAGGTGGTGTTGACTCCAACTCATCTTGCTATT
GCTATGGAATATGCTGCCGGTGGTGAACTTTTCGAGCGTATTTGCAGTGCTGGCAGATTC
GGTGAGGATGAGGCGAGATACTTCTTCCAGCAGCTTATATCACGTGTTAGCTATTGCCAT
GCTATGCAAATATGCCATAGAGATTTGAAGCTCGAGAATACACTCTTGGATGGAAGTCCT
GCTCCACGTCTCAAAATCTGTGAT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL7106Contig1 866 2 6 U
GGACTCAAGGGTCCAAAAAGTGTTTTCTCTTTGGGGTTCTTCTCTTTTGTCTTTTTTTTG
AGAGAAGAGATGGGAAGGGCTCCTTGTTGTGAGAAGATAGGACTCAAGAGAGTGAGGACA
ATGAGGGAGGGAACAGCTGGAACTACGAAGGAAAGTCTTTGGGAGCATATGAGTGGTTGG
ATGGTGAGATAGAGCGGCTCATGAGTACTTTCGTCTGGGAATGTACTAGTGAAGAGGCTG
TGACTAGAGTGAATGATGATGACTCTGATCAGAACAAGGTGTGTGAGAGTGGGGACACTA
GTAGTTGTTGTGTGGATTTGTTTGATGAAGAACAGGGAAAGCTTGGTAGCCTACAGGTTG
ATCAAGACATGAATATTGAAAAGAAAAGAGAGGAGAGTATTTTAAGTTCGAATTCAAATG
AAAATGGTGATAAAGACTGGTGGGTTGGTCTATGTGATTCTTCGGAAGTTGGATTTGGGA
TTGGTGATGAGTTGCTTAGTTGGGAGTTTCAAGGTGGTTTGACTTGTCAAAGTGATGATC
TCTGGGATCTCTCAGATTTTGGAGAAATGCAGCAAGTGGATAGTAGCCTAGTGGATAGCA
TATGAGACCGAGTATAACCTGAAAAAATCTTTTGATTGTAAAGTCTAGTGTTTTGTTTGG
TTAAAATGGGTCTTGAGGTTGTGTATTAGCTTATGGAGTGTTTTAAGGGAGTCAATTAGG
ATATAGCCTCTAGTTTAGACCAGTTTGAAGCACATTATGTTCGTGTTGTCGTGACTTTTA
CTCTGTTTTGTTGTTGTTTATAGTGTTTGGTTTTGTTTGTTGGTAGGTTCTATTAATAAT
ATTGTGAAATAATAATGAAGATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EN87TF U 1
AF RR2EN87JQ C 152
BS 1 626 RR2EN87TF
BS 627 627 RR2EN87JQ
BS 628 679 RR2EN87TF
BS 680 680 RR2EN87JQ
BS 681 703 RR2EN87TF
BS 704 866 RR2EN87JQ

RD RR2EN87TF 703 0 0
GGACTCAAGGGTCCAAAAAGTGTTTTCTCTTTGGGGTTCTTCTCTTTTGTCTTTTTTTTG
AGAGAAGAGATGGGAAGGGCTCCTTGTTGTGAGAAGATAGGACTCAAGAGAGTGAGGACA
ATGAGGGAGGGAACAGCTGGAACTACGAAGGAAAGTCTTTGGGAGCATATGAGTGGTTGG
ATGGTGAGATAGAGCGGCTCATGAGTACTTTCGTCTGGGAATGTACTAGTGAAGAGGCTG
TGACTAGAGTGAATGATGATGACTCTGATCAGAACAAGGTGTGTGAGAGTGGGGACACTA
GTAGTTGTTGTGTGGATTTGTTTGATGAAGAACAGGGAAAGCTTGGTAGCCTACAGGTTG
ATCAAGACATGAATATTGAAAAGAAAAGAGAGGAGAGTATTTTAAGTTCGAATTCAAATG
AAAATGGTGATAAAGACTGGTGGGTTGGTCTATGTGATTCTTCGGAAGTTGGATTTGGGA
TTGGTGATGAGTTGCTTAGTTGGGAGTTTCAAGGTGGTTTGACTTGTCAAAGTGATGATC
TCTGGGATCTCTCAGATTTTGGAGAAATGCAGCAAGTGGATAGTAGCCTAGTGGATAGCA
TATGAGACCGAGTATAACCTGAAAAA*TCTTTTGATTGTAAAGTCTAGTGTTTTGTTTGG
TTAAAATGGGTCTTGAGGT*GTGTATTAGCTTATGGAGTGTTT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2EN87JQ 715 0 0
AAAGTCTTTGGGAGCATATGAGTGGTTGGATGGTGAGATAGAGCGGCTCATGAGTACTTT
CGTCTGGGAATGTACTAGTGAAGAGGCTGTGACTAGAGTGAATGATGATGACTCTGATCA
GAACAAGGTGTGTGAGAGTGGGGACACTAGTAGTTGTTGTGTGGATTTGTTTGATGAAGA
ACAGGGAAAGCTTGGTAGCCTACAGGTTGATCAAGACATGAATATTGAAAAGAAAAGAGA
GGAGAGTATTTTAAGTTCGAATTCAAATGAAAATGGTGATAAAGACTGGTGGGTTGGTCT
ATGTGATTCTTCGGAAGTTGGATTTGGGATTGGTGATGAGTTGCTTAGTTGGGAGTTTCA
AGGTGGTTTGACTTGTCAAAGTGATGATCTCTGGGATCTCTCAGATTTTGGAGAAATGCA
GCAAGTGGATAGTAGCCTAGTGGATAGCATATGAGACCGAGTATAACCTGAAAAAATCTT
TTGATTGTAAAGTCTAGTGTTTTGTTTGGTTAAAATGGGTCTTGAGGTTGTGTATTAGCT
TATGGAGTGTTTTAAGGGAGTCAATTAGGATATAGCCTCTAGTTTAGACCAGTTTGAAGC
ACATTATGTTCGTGTTGTCGTGACTTTTACTCTGTTTTGTTGTTGTTTATAGTGTTTGGT
TTTGTTTGTTGGTAGGTTCTATTAATAATATTGTGAAATAATAATGAAGATTTTG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL7107Contig1 902 2 2 U
GCCAATGTTGCAAAATATAACGGATCTAGATACCCGTACGTACCCAGCACATCTTCAGCT
TCTATCTGTGATTTTCCTTCCTCGAGCGATATTGAGAAAGACATATCCGACAGCTTTGCG
GTCCAGTTCTTGTCCAAGAAAACGTGCATCGGTTTAACGTCTCTATATATGATGATCTTA
GGGAAGGCCATGTGAAGATAAGCCAAAGCGTTCGCAATCTCCTTTGCAATCTTTAGCCTC
AAACTCAAAGGCAGTAAAGATTCCTCCCCGTTAACGGTGGTAACACCTCCTCGAGGATTC
AAGACTCCATGCTCTGCATGTTCAAAAACAAGAACTTGAAAAGGGAACTCGAGACAAGAT
CCTAGTAGTTTAAGGAAGTTGCTGTGGCTGCTCATCCGAGCAGACAAGACTATGTCTTTG
TAAACCTCTCCTACTCTGCGATCAGTAACTTTATACTCGGAGAATCTTTTGATCATGTAA
GATCTATCTTCGATGACGCCTCTGTACCATATGTAGAACCCTTCTTGGGCGATAGAGCAA
CTGGTAGCTTTAAGGATCTGAGAAGAGGAAAAACTGCGTATAGGAATGGTTTTACCGTTG
CAATCAGCGATGAGTTCTTTGAGTAAGATGCTTCCATTCTCCAAGAATCTCGTTTGTTTC
TTTATGCTTCTTTCCTTACTCTTCCGGAACGAGCCAGAACTCAGATTGTTCTTTAACTTC
TTCACCATTGAATCCATTGAACAGTTGATTAGTTGTCGTAGCAGAGATGTTCAGCTTTAC
TCGGTTTGTTTTTGTTTCTTTGTTTATTCGGTTTGACTAGAGAAACCCTCCGTTGAAAAG
TCATAAACTTCGTCCGGAGTTGTAGACTAAACGCATATAAATACAAACGTTATGTTCTCA
CG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2BV87TF U 1
AF RR2BV87JQ C 191
BS 1 688 RR2BV87TF
BS 689 902 RR2BV87JQ

RD RR2BV87TF 692 0 0
GCCAATGTTGCAAAATATAACGGATCTAGATACCCGTACGTACCCAGCACATCTTCAGCT
TCTATCTGTGATTTTCCTTCCTCGAGCGATATTGAGAAAGACATATCCGACAGCTTTGCG
GTCCAGTTCTTGTCCAAGAAAACGTGCATCGGTTTAACGTCTCTATATATGATGATCTTA
GGGAAGGCCATGTGAAGATAAGCCAAAGCGTTCGCAATCTCCTTTGCAATCTTTAGCCTC
AAACTCAAAGGCAGTAAAGATTCCTCCCCGTTAACGGTGGTAACACCTCCTCGAGGATTC
AAGACTCCATGCTCTGCATGTTCAAAAACAAGAACTTGAAAAGGGAACTCGAGACAAGAT
CCTAGTAGTTTAAGGAAGTTGCTGTGGCTGCTCATCCGAGCAGACAAGACTATGTCTTTG
TAAACCTCTCCTACTCTGCGATCAGTAACTTTATACTCGGAGAATCTTTTGATCATGTAA
GATCTATCTTCGATGACGCCTCTGTACCATATGTAGAACCCTTCTTGGGCGATAGAGCAA
CTGGTAGCTTTAAGGATCTGAGAAGAGGAAAAACTGCGTATAGGAATGGTTTTACCGTTG
CAATCAGCGATGAGTTCTTTGAGTAAGATGCTTCCATTCTCCAAGAATCTCGTTTGTTTC
TTTATGCTTCTTTCCTTACTCTTCCGGA
CGAG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2BV87JQ 712 0 0
TGTGAAGATAAGCCAAAGCGTTCGCAATCTCCTTTGCAATCTTTAGCCTCAAACTCAAAG
GCAGTAAAGATTCCTCCCCGTTAACGGTGGTAACACCTCCTCGAGGATTCAAGACTCCAT
GCTCTGCATGTTCAAAAACAAGAACTTGAAAAGGGAACTCGAGACAAGATCCTAGTAGTT
TAAGGAAGTTGCTGTGGCTGCTCATCCGAGCAGACAAGACTATGTCTTTGTAAACCTCTC
CTACTCTGCGATCAGTAACTTTATACTCGGAGAATCTTTTGATCATGTAAGATCTATCTT
CGATGACGCCTCTGTACCATATGTAGAACCCTTCTTGGGCGATAGAGCAACTGGTAGCTT
TAAGGATCTGAGAAGAGGAAAAACTGCGTATAGGAATGGTTTTACCGTTGCAATCAGCGA
TGAGTTCTTTGAGTAAGATGCTTCCATTCTCCAAGAATCTCGTTTGTTTCTTTATGCTTC
TTTCCTTACTCTTCCGGAACGAGCCAGAACTCAGATTGTTCTTTAACTTCTTCACCATTG
AATCCATTGAACAGTTGATTAGTTGTCGTAGCAGAGATGTTCAGCTTTACTCGGTTTGTT
TTTGTTTCTTTGTTTATTCGGTTTGACTAGAGAAACCCTCCGTTGAAAAGTCATAAACTT
CGTCCGGAGTTGTAGACTAAACGCATATAAATACAAACGTTATGTTCTCACG

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL7108Contig1 672 2 5 U
CACCAATGGGAGTGTTCTAATAGTTAAAAATCTAAAAAGTTTACATGATTTCAAATATAA
GTACACAAAACCAAAATAAGAATACCGCATAAAGGTTTATTCTAACTTATTAAATTTTAA
TAATTCATAAATTTAACGGACTTAGTTTTTAAAAGAAAACACAACATACAAAATAAGCTT
GAGAAAGCAAATCAATAGTGAAAAAAGAAGAAGATAAAGAGTGGATGAGCGAAGGCCATC
TTGCAAGTGATTTAGTGTCCATTGGCTATGGATCCATCGTCTCCTTTCTTGCCACAAAAT
CTCCGGTACAATGAATCAACCTCTTTCAGATAGTAAGTCCCCGGAGCCAAAAGCTCTAAG
ATACCTTCCTTGCTCGTCACAAACTCCTTTGCTCCGTACCTATGCTCCATTAGCTTCATT
GTCTCCACAAACTTCTCAGGTGCATACTCATGTCTAGCCTTCAATTTACCGCCAACATCC
ATTACAGAAGCGATGTTTGATAAGCTGAAAGGAGACTGGTTCTCGCAGAAACGCAATGAG
AACATTGTTGCGGTTGAACCACTTCCATATGAGAACATAACCACCCGTTTTCCCACCAAA
TCGCTGTGTTTATTGTGGATGAGGGAAGTAAATGCTGCGTAGAGAGAAGCGGTGTACATG
TTACCCACTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DD29JQ U 78
AF RR2F633JQ U 1
BS 1 296 RR2F633JQ
BS 297 297 RR2DD29JQ
BS 298 529 RR2F633JQ
BS 530 530 RR2DD29JQ
BS 531 672 RR2F633JQ

RD RR2DD29JQ 563 0 0
AG
GAATACCGCATAAAGGTTTATTCTAACTTATTAAATTTTAATAATTCATAAATTTAACGG
ACTTAGTTTTTAAAAGAAAACACAACATACAAAATAAGCTTGAGAAAGCAAATCAATAGT
GAAAAAAGAAGAAGATAAAGAGTGGATGAGCGAAGGCCATCTTGCAAGTGATTTAGTGTC
CATTGGCTATGGATCCATCGTCTCCTTTCTTGCCATAAAATCTCCGGTACAATGAATCAA
CCTCTTTCAGATAGTAAGTCCCCGGAGCCAAA*GCTCTAAGATACCTTCCTTGCTCGTCA
CAAACTCCTTTGCTCCGTACCTATGCTCCATTAGCTTCATTGTCTCCACAAACTTCTCAG
GTGCATACTCATGTCTAGCCTTCAATTTACCGCCAACATCCATTACAGAAGCGATGTTTG
ATAAGCTGAAAGGAGACTGGTTCTCGCAGAAACGCAATGAGAACATTGTTGCGGTTGAAC
CACTTCCATATGAGAACATAACCACCCGTTTTCCCACCAAATCGCTGTGTTTATTGTGGA
TGAGGGAAGTAAATGCTGCGT

QA 3 563 3 563
DS 

RD RR2F633JQ 672 0 0
CACCAATGGGAGTGTTCTAATAGTTAAAAATCTAAAAAGTTTACATGATTTCAAATATAA
GTACACAAAACCAAAATAAGAATACCGCATAAAGGTTTATTCTAACTTATTAAATTTTAA
TAATTCATAAATTTAACGGACTTAGTTTTTAAAAGAAAACACAACATACAAAATAAGCTT
GAGAAAGCAAATCAATAGTGAAAAAAGAAGAAGATAAAGAGTGGATGAGCGAAGGCCATC
TTGCAAGTGATTTAGTGTCCATTGGCTATGGATCCATCGTCTCCTTTCTTGCCACAGAAT
CTCCGGTACAATGAATCAACCTCTTTCAGATAGTAAGTCCCCGGAGCCAAAAGCTCTAAG
ATACCTTCCTTGCTCGTCACAAACTCCTTTGCTCCGTACCTATGCTCCATTAGCTTCATT
GTCTCCACAAACTTCTCAGGTGCATACTCATGTCTAGCCTTCAATTTACCGCCAACATCC
ATTACAGAAGCGATGTTTGATAAGCTGAAAGGAGACTGGTTCTCGCAGAGACGCAATGAG
AACATTGTTGCGGTTGAACCACTTCCATATGAGAACATAACCACCCGTTTTCCCACCAAA
TCGCTGTGTTTATTGTGGATGAGGGAAGTAAATGCTGCGTAGAGAGAAGCGGTGTACATG
TTACCCACTTCT

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL7109Contig1 660 2 2 U
GGGGCTGAGGAAGTGACGAGAAGAGAGAGGGGTTTTCTCGATCCGCTAGGGTCTTTTCAA
GGAGTTAAAAAGGAGAATCTAAATGGCGGGAGTTGGAACATCGATGATTGGCTCTATTCT
TCTGTTCACAGTGGTGCTCTCGCTGCAAGAAGTGTACCGAGGGAAACTAGCTTCTTCGGA
GCTGTTCACCATCCTTGGAGGCTTCACTAGCTCCCTCCTCTTTCTCTTCCCTCTCACTTT
CATTGGGAATCTCCAAGAGTCTTCTGGTGGGAAGAGTAGCTGGGGTGCTGTGATTGTTGC
GGAAATCACAGCTCTTGTTGCTGCTAGCACGGTGCATCGAGTTTGTATTACAACCTGTTT
CTTGTTCTCTGCTGGGCTGTTGTACGAGATGAACAAGATCTCAGGTTACATGCTCTCCAA
AGCTGAGTCCAAATCTAAAAGGCACTGAATCAGAAGAGCATGGGGTTACTAAGCACATGA
GATCTTATATCTTGTTTAGCACTAAAAGACTCAAAAGATACTTCCAACTTCATGAATTTT
AGAATTTTCCTCGAACTTATTTATACTCGACTTTGTAGTTGTGTGTTATGACTTTGTGTT
CTTAGACGAATGGTCAGGTTTAGGCCCATCTATAAAGTTAGGCTTATAAAAAAGCCAGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DB27JQ C 1
AF RR2DB27TF U 1
BS 1 652 RR2DB27TF
BS 653 660 RR2DB27JQ

RD RR2DB27JQ 660 0 0
GGGGCTGAGGAAGTGACGAGAAGAGAGAGGGGTTTTCTCGATCCGCTAGGGTCTTTTCAA
GGAGTTAAAAAGGAGAATCTAAATGGCGGGAGTTGGAACATCGATGATTGGCTCTATTCT
TCTGTTCACAGTGGTGCTCTCGCTGCAAGAAGTGTACCGAGGGAAACTAGCTTCTTCGGA
GCTGTTCACCATCCTTGGAGGCTTCACTAGCTCCCTCCTCTTTCTCTTCCCTCTCACTTT
CATTGGGAATCTCCAAGAGTCTTCTGGTGGGAAGAGTAGCTGGGGTGCTGTGATTGTTGC
GGAAATCACAGCTCTTGTTGCTGCTAGCACGGTGCATCGAGTTTGTATTACAACCTGTTT
CTTGTTTTCTGCTGGGCTGTTGTACGAGATGAACAAGATCTCAGGTTACATGCTCTCCAA
AGCTGAGTCCAAATCTAAAAGGCACTGAATCAGAAGAGCATGGGGTTACTAAGCACATGA
GATCTTATATCTTGTTTAGCACTAAAAGACTCAAAAGATACTTCCAACTTCATGAATTTT
AGAATTTTCCTCGAACTTATTTATACTCGACTTTGTAGTTGTGTGTTATGACTTTGTGTT
CTTAGACGAATGGTCAGGTTTAGGCCCATCTATAAAGTTAGGCTTATAAAAAAGCCAGAT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2DB27TF 652 0 0
GGGGCTGAGGAAGTGACGAGAAGAGAGAGGGGTTTTCTCGATCCGCTAGGGTCTTTTCAA
GGAGTTAAAAAGGAGAATCTAAATGGCGGGAGTTGGAACATCGATGATTGGCTCTATTCT
TCTGTTCACAGTGGTGCTCTCGCTGCAAGAAGTGTACCGAGGGAAACTAGCTTCTTCGGA
GCTGTTCACCATCCTTGGAGGCTTCACTAGCTCCCTCCTCTTTCTCTTCCCTCTCACTTT
CATTGGGAATCTCCAAGAGTCTTCTGGTGGGAAGAGTAGCTGGGGTGCTGTGATTGTTGC
GGAAATCACAGCTCTTGTTGCTGCTAGCACGGTGCATCGAGTTTGTATTACAACCTGTTT
CTTGTTCTCTGCTGGGCTGTTGTACGAGATGAACAAGATCTCAGGTTACATGCTCTCCAA
AGCTGAGTCCAAATCTAAAAGGCACTGAATCAGAAGAGCATGGGGTTACTAAGCACATGA
GATCTTATATCTTGTTTAGCACTAAAAGACTCAAAAGATACTTCCAACTTCATGAATTTT
AGAATTTTCCTCGAACTTATTTATACTCGACTTTGTAGTTGTGTGTTATGACTTTGTGTT
CTTAGACGAATGGTCAGGTTTAGGCCCATCTATAAAGTTAGGCTTATAAAAA

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL7110Contig1 752 2 8 U
GGATACCACCACCAATGAGCTTGGGGAAGGAGTAAAGATTCGAACTCTCTCCACTTTCTG
CAAGTTAAGACCAACTCTTCGGAACGTAAGAGGAAGAAACGAGGATGGATCCAACAGAGG
AGGAGGTGGAGAAGAAGGTGAGAGAGAGAATCAGACACAAAGTCAACCAAGTCAGTTCTG
TCTCGCAGTCTCTTCTCTCTCCATTACAAGACCACATCAACTTCACCCTTCAGAAAGCCT
ACTTCAAATGTGCGTACGAGTGCTTTGATAGGACAAGAACACACGCTGAGATTAGCCAAT
GCGCAGAGACTTGCAGTGTTCCCATCACAAACGCGCAGAATCATTTTGATAGTGAGATGT
CTGTGTTCCAAGAGAGGTTGAATAGATCTCTTGTGGCTTGTCAAGATAAGTTTGAGGCTG
CCAAGCTCCACAAGACGAGGAATGAAGCTGTGACTGGTTTAGAGCAGTGCGTGAACCAAA
CTGTTGACGATGCGGTGAGAACGCTGCCTAGTCTCGTGTCGAAGATGAAGAAAGCTTTGT
CCATCCCTGACTGAGGAGCTCTGCTTTGAAACTCAGTTACAGCATTATTAGTAACAGAGG
TTTTTTGGTCAAAGGCTGAGTGACTATGGGGAAGATTAGGCTAATCCAGAATGAGTAGTA
AAACATGTAAGAGAACAGCATCAGTTAAGAGTACTAATCACTTGAATAACTACAATGCAC
ACGGTCTTCCAGAGCTCTTTTATAATGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI27TF U 1
AF RR2DI27JQ C 99
BS 1 605 RR2DI27TF
BS 606 606 RR2DI27JQ
BS 607 614 RR2DI27TF
BS 615 615 RR2DI27JQ
BS 616 639 RR2DI27TF
BS 640 640 RR2DI27JQ
BS 641 655 RR2DI27TF
BS 656 752 RR2DI27JQ

RD RR2DI27TF 655 0 0
GGATACCACCACCAATGAGCTTGGGGAAGGAGTAAAGATTCGAACTCTCTCCACTTTCTG
CAAGTTAAGACCAACTCTTCGGAACGTAAGAGGAAGAAACGAGGATGGATCCAACAGAGG
AGGAGGTGGAGAAGAAGGTGAGAGAGAGAATCAGACACAAAGTCAACCAAGTCAGTTCTG
TCTCGCAGTCTCTTCTCTCTCCATTACAAGACCACATCAACTTCACCCTTCAGAAAGCCT
ACTTCAAATGTGCGTACGAGTGCTTTGATAGGACAAGAACACACGCTGAGATTAGCCAAT
GCGCAGAGACTTGCAGTGTTCCCATCACAAACGCGCAGAATCATTTTGATAGTGAGATGT
CTGTGTTCCAAGAGAGGTTGAATAGATCTCTTGTGGCTTGTCAAGATAAGTTTGAGGCTG
CCAAGCTCCACAAGACGAGGAATGAAGCTGTGACTGGTTTAGAGCAGTGCGTGAACCAAA
CTGTTGACGATGCGGTGAGAACGCTGCCTAGTCTCGTGTCGAAGATGAAGAAAGCTTTGT
CCATCCCTGACTGAGGAGCTCTGCTTTGAAACTCAGTTACAGCATTATTAGTAACAGAGG
TTTTT*GGTCAAAG*CTGAGTGACTATGGGGAAGATTAG*CTAATCCAGAATGAG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2DI27JQ 654 0 0
ACGAGGATGGATCCAACAGAGGAGGAGGTGGAGAAGAAGGTGAGAGAGAGAATCAGACAC
AAAGTCAACCAAGTCAGTTCTGTCTCGCAGTCTCTTCTCTCTCCATTACAAGACCACATC
AACTTCACCCTTCAGAAAGCCTACTTCAAATGTGCGTACGAGTGCTTTGATAGGACAAGA
ACACACGCTGAGATTAGCCAATGCGCAGAGACTTGCAGTGTTCCCATCACAAACGCGCAG
AATCATTTTGATAGTGAGATGTCTGTGTTCCAAGAGAGGTTGAATAGATCTCTTGTGGCT
TGTCAAGATAAGTTTGAGGCTGCCAAGCTCCACAAGACGAGGAATGAAGCTGTGACTGGT
TTAGAGCAGTGCGTGAACCAAACTGTTGACGATGCGGTGAGAACGCTGCCTAGTCTCGTG
TCGAAGATGAAGAAAGCTTTGTCCATCCCTGACTGAGGAGCTCTGCTTTGAAACTCAGTT
ACAGCATTATTAGTAACAGAGGTTTTTTGGTCAAAGGCTGAGTGACTATGGGGAAGATTA
GGCTAATCCAGAATGAGTAGTAAAACATGTAAGAGAACAGCATCAGTTAAGAGTACTAAT
CACTTGAATAACTACAATGCACACGGTCTTCCAGAGCTCTTTTATAATGTTTTT

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL7111Contig1 759 2 2 U
GGACTGATCATCCTTCTAATATTCCCAAAAACCATCTCACAAACTCTCACTCCTCAAATC
TCTCTCTCATCTCCAAGCCCCTCCGACCAATGGCGGCGACAATGGCAACATCAGCCAAAT
GCATGTCCTTAAACCCATCTCCTCCTAAGCCTCTAAACCAAACCAAACCCACCTCCTCAA
AACCCTTCATCTCCCTCCCCACACCACCAAAACCCGCCGTCTCTCTCGCCGTCACAAGCA
CCGCCCTCGCCGGCGCTTTCTTCTCCACGCTCAGCTACTCCGAGCCCGCTTTGGCTGCCC
ATCAGATCGCTGAGCTCGCGGCGGCGGCTGCGGGAGGTAGCGACAACCGAGGACTAGCTC
TTCTCCTCCCGATCGTCCCGGCGATCGGATGGGTGCTCTTCAACATCCTCCAGCCAGCTC
TCAACCAGATCAACAAGATGCGCGAGAGCAAAGGAGTTGTCGTGGGTCTTGGCATCGGTG
GTGGTCTCGCAGCGTCAGGGCTTTTGACTATGCCGCCGGAGGCCTCGGCTGGTATGGTTA
ACGAGATGGCGGCGGTGGCGGAAGCAGCGGTGAAAGGTGGAGACAACAGGGGACAGTTGT
TGTTGTTCGTGGTTGCACCGTCTCTGCTTTGGGTTCTTTACAATATATTGCAGCCTGCTT
TGAACCAACTCAATAAAATGAGGTCTGAGCAATAATAATCATCGTTGGGATTCACATGTA
AAATTAATCCTTTGTTTTATGTATAAATTTTGAACAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET95TF U 1
AF RR2ET95JQ C 180
BS 1 722 RR2ET95TF
BS 723 759 RR2ET95JQ

RD RR2ET95TF 722 0 0
GGACTGATCATCCTTCTAATATTCCCAAAAACCATCTCACAAACTCTCACTCCTCAAATC
TCTCTCTCATCTCCAAGCCCCTCCGACCAATGGCGGCGACAATGGCAACATCAGCCAAAT
GCATGTCCTTAAACCCATCTCCTCCTAAGCCTCTAAACCAAACCAAACCCACCTCCTCAA
AACCCTTCATCTCCCTCCCCACACCACCAAAACCCGCCGTCTCTCTCGCCGTCACAAGCA
CCGCCCTCGCCGGCGCTTTCTTCTCCACGCTCAGCTACTCCGAGCCCGCTTTGGCTGCCC
ATCAGATCGCTGAGCTCGCGGCGGCGGCTGCGGGAGGTAGCGACAACCGAGGACTAGCTC
TTCTCCTCCCGATCGTCCCGGCGATCGGATGGGTGCTCTTCAACATCCTCCAGCCAGCTC
TCAACCAGATCAACAAGATGCGCGAGAGCAAAGGAGTTGTCGTGGGTCTTGGCATCGGTG
GTGGTCTCGCAGCGTCAGGGCTTTTGACTATGCCGCCGGAGGCCTCGGCTGGTATGGTTA
ACGAGATGGCGGCGGTGGCGGAAGCAGCGGTGAAAGGTGGAGACAACAGGGGACAGTTGT
TGTTGTTCGTGGTTGCACCGTCTCTGCTTTGGGTTCTTTACAATATATTGCAGCCTGCTT
TGAACCAACTCAATAAAATGAGGTCTGAGCAATAATAATCATCGTTGGGATTCACATGTA
AA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2ET95JQ 580 0 0
AAACCCTTCATCTCCCTCCCCACACCACCAAAACCCGCCGTCTCTCTCGCCGTCACAAGC
ACCGCCCTCGCCGGCGCTTTCTTCTCCACGCTCAGCTACTCCGAGCCCGCTTTGGCTGCC
CATCAGATCGCTGAGCTCGCGGCGGCGGCTGCGGGAGGTAGCGACAACCGAGGACTAGCT
CTTCTCCTCCCGATCGTCCCGGCGATCGGATGGGTGCTCTTCAACATCCTCCAGCCAGCT
CTCAACCAGATCAACAAGATGCGCGAGAGCAAAGGAGTTGTCGTGGGTCTTGGCATCGGT
GGTGGTCTCGCAGCGTCAGGGCTTTTGACTATGCCGCCGGAGGCCTCGGCTGGTATGGTT
AACGAGATGGCGGCGGTGGCGGAAGCAGCGGTGAAAGGTGGAGACAACAGGGGACAGTTG
TTGTTGTTCGTGGTTGCACCGTCTCTGCTTTGGGTTCTTTACAATATATTGCAGCCTGCT
TTGAACCAACTCAATAAAATGAGGTCTGAGCAATAATAATCATCGTTGGGATTCACATGT
AAAATTAATCCTTTGTTTTATGTATAAATTTTGAACAATC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 2

CO CL7112Contig1 1140 2 2 U
GAGGGACAAAAAGAACAGAGTTGGCTCTGATTGTGAATCCAGTAATAAAAAGAACAGAGT
TGAATAAAGACTAAAATGGAAGAGTACTTGGTAACCGGAGGGACAAGCTTCATAGCCTCT
CACGTTGTAAAGGCACTTCTCGACTTGGGCCATTCCGTAAGAACAACTGTTAGAGACTCC
TCAGATGAAGAGAAGGTTAGGTTTCTGTGGGAGTTGAAAGGAGCAAAAGAAAGGCTGAAG
ATCCTCGAAGCCGATCTAACGGTGGATGGAAGCTTTGACGAAGCAGTCAAAGGTGTTGAT
GGTGTCTTCCACGTCGCCTCTCGTGTTACTGTTTCTCTGAACAACAATGATCTGGAAAAG
TTGGTGGACCGAGATATAAATGGGACAAGGAACTTGATGAACTCTTGCGAAAAATCAAGA
AACACGGTGAAAAGGATTGTTCTCACATCTTCTTCGACAGCTGTTCGGTACCGTTATGAT
GCCAGAGAAGCCTCTCCACTTAACGAATCGCATTTTAGCGATCTTGACTACTGCAGAAGC
TTCAAAATATGGTATGCTTATGCAAAGACTATGGGAGAGAAAGAAGCTTGGACCATAGCA
GCCGAAAAGAATCTAGACCTAGTGGTGGTAATCCCTTCGTTCTGTATCGGTCCACTACTT
AGTCCAAACCCCACAAGCACCCCTTCAATTCTTCTCTCCATACTCAAAGGTGTTCGTGGA
TATTACCCTAATTTCAGAGGAGGGTATGTGCACATAGAGGATGTAGCTGCTGCACAAGTC
TTGGCAATGAAAGAGCCTAAAGCATCAGGAAGATTCATATGTTCGAGTTCAGTGGCTCAT
TGGTCAGAGATCATTGAGATGCTTAGACCCAAATACCCACAGTATCCATTCGAGACCAAG
TGCAGTAGTGAAGAAGGGAAAGATATGCCTCATAGCTTGGACACAACAAAGATACGTGAA
CTTGGCTTACCGCCCTTCAAGTCATTGTCTGAGATGTTTGATGACTGCATCAAGTGTTTC
CAAGACAAGGGTCTACTCTGAAACTCCCACTGTTATCAGAAAATCAAAGTGATCTAAGCT
TATGTTGATCTTGTTGAAGTTTATTTCAAACTCCAATAATCTACCTTCCTATCATTCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F374TF U 1
AF RR2F374JQ C 506
BS 1 780 RR2F374TF
BS 781 1140 RR2F374JQ

RD RR2F374TF 780 0 0
GAGGGACAAAAAGAACAGAGTTGGCTCTGATTGTGAATCCAGTAATAAAAAGAACAGAGT
TGAATAAAGACTAAAATGGAAGAGTACTTGGTAACCGGAGGGACAAGCTTCATAGCCTCT
CACGTTGTAAAGGCACTTCTCGACTTGGGCCATTCCGTAAGAACAACTGTTAGAGACTCC
TCAGATGAAGAGAAGGTTAGGTTTCTGTGGGAGTTGAAAGGAGCAAAAGAAAGGCTGAAG
ATCCTCGAAGCCGATCTAACGGTGGATGGAAGCTTTGACGAAGCAGTCAAAGGTGTTGAT
GGTGTCTTCCACGTCGCCTCTCGTGTTACTGTTTCTCTGAACAACAATGATCTGGAAAAG
TTGGTGGACCGAGATATAAATGGGACAAGGAACTTGATGAACTCTTGCGAAAAATCAAGA
AACACGGTGAAAAGGATTGTTCTCACATCTTCTTCGACAGCTGTTCGGTACCGTTATGAT
GCCAGAGAAGCCTCTCCACTTAACGAATCGCATTTTAGCGATCTTGACTACTGCAGAAGC
TTCAAAATATGGTATGCTTATGCAAAGACTATGGGAGAGAAAGAAGCTTGGACCATAGCA
GCCGAAAAGAATCTAGACCTAGTGGTGGTAATCCCTTCGTTCTGTATCGGTCCACTACTT
AGTCCAAACCCCACAAGCACCCCTTCAATTCTTCTCTCCATACTCAAAGGTGTTCGTGGA
TATTACCCTAATTTCAGAGGAGGGTATGTGCACATAGAGGATGTAGCTGCTGCACAAGTC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RR2F374JQ 635 0 0
AATCGCATTTTAGCGATCTTGACTACTGCAGAAGCTTCAAAATATGGTATGCTTATGCAA
AGACTATGGGAGAGAAAGAAGCTTGGACCATAGCAGCCGAAAAGAATCTAGACCTAGTGG
TGGTAATCCCTTCGTTCTGTATCGGTCCACTACTTAGTCCAAACCCCACAAGCACCCCTT
CAATTCTTCTCTCCATACTCAAAGGTGTTCGTGGATATTACCCTAATTTCAGAGGAGGGT
ATGTGCACATAGAGGATGTAGCTGCTGCACAAGTCTTGGCAATGAAAGAGCCTAAAGCAT
CAGGAAGATTCATATGTTCGAGTTCAGTGGCTCATTGGTCAGAGATCATTGAGATGCTTA
GACCCAAATACCCACAGTATCCATTCGAGACCAAGTGCAGTAGTGAAGAAGGGAAAGATA
TGCCTCATAGCTTGGACACAACAAAGATACGTGAACTTGGCTTACCGCCCTTCAAGTCAT
TGTCTGAGATGTTTGATGACTGCATCAAGTGTTTCCAAGACAAGGGTCTACTCTGAAACT
CCCACTGTTATCAGAAAATCAAAGTGATCTAAGCTTATGTTGATCTTGTTGAAGTTTATT
TCAAACTCCAATAATCTACCTTCCTATCATTCCAC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL7113Contig1 836 2 4 U
GGACAAAACATAGTGAGTAAAAACAACAAAAAAAGTGGTAAATCAAAAACAAAAAAAAAT
TGTATAAGTGATACAAATTTCTTCAGTGGAGAAAGCTCATCATAAGAATAAAGCTGAAAA
GGAACTCAATAAATAGACAAATAGGGAAATCATACAAGAAAACTGAATTAGTCAAGGAGA
TGGATCGGGTCATAACTCAGGGTTTTGTTCTGATATTCCTTCTTCAAGGTGTTCATTCCC
GAACGTTGCGAAGCGAATCAAATACTGCAGAATCGGGACAAAAGGTTACGGTTAACACAG
CTGGCGAACAAGTGGTTGTTGATAATGGTATCATCCAACTCACCTTCTCGAATCCAGCCG
GCTTAGTAACTGCAATCAAGTATAAGGGCTTTGACAATGTGTTGAACGAAAGAACTAAGA
ATCGTGTGTATTGGGATATAGTATGGTATGAACCAGGACAAGTATCGCAAACAGATTTTT
TAATAGGAGGAAAGTTCAAGATAATAAGCCAAACAAGTGAGCAAGTCGAAATTTCATTTT
CAAAAACATGGGATACCTCTAAACGCGGCTCGACAATTCCACTAAACGTAGATAAAAGAT
ATATTATTCGACGCGGTGTAAGTGGAGTGTATATGTACGGTGTGGGTAGAGAGGTTAAAA
AGTTGGCCGACGGTAACAATGGACCAAACCAGAATAGTCTACAAGCTTAACGCTACAAAG
TTCGATTATATGGCTGTAGACGATCATCGACAGAATCTAATGCCTTTAGAGGCAGATCGA
AATCTTACCGATGGTAGTGCAGCTCCATTGGAATACAAAGAAGCGGTTCGGATGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EX45TF U 1
AF RR2EX45JQ C 354
BS 1 781 RR2EX45TF
BS 782 782 RR2EX45JQ
BS 783 804 RR2EX45TF
BS 805 836 RR2EX45JQ

RD RR2EX45TF 804 0 0
GGACAAAACATAGTGAGTAAAAACAACAAAAAAAGTGGTAAATCAAAAACAAAAAAAAAT
TGTATAAGTGATACAAATTTCTTCAGTGGAGAAAGCTCATCATAAGAATAAAGCTGAAAA
GGAACTCAATAAATAGACAAATAGGGAAATCATACAAGAAAACTGAATTAGTCAAGGAGA
TGGATCGGGTCATAACTCAGGGTTTTGTTCTGATATTCCTTCTTCAAGGTGTTCATTCCC
GAACGTTGCGAAGCGAATCAAATACTGCAGAATCGGGACAAAAGGTTACGGTTAACACAG
CTGGCGAACAAGTGGTTGTTGATAATGGTATCATCCAACTCACCTTCTCGAATCCAGCCG
GCTTAGTAACTGCAATCAAGTATAAGGGCTTTGACAATGTGTTGAACGAAAGAACTAAGA
ATCGTGTGTATTGGGATATAGTATGGTATGAACCAGGACAAGTATCGCAAACAGATTTTT
TAATAGGAGGAAAGTTCAAGATAATAAGCCAAACAAGTGAGCAAGTCGAAATTTCATTTT
CAAAAACATGGGATACCTCTAAACGCGGCTCGACAATTCCACTAAACGTAGATAAAAGAT
ATATTATTCGACGCGGTGTAAGTGGAGTGTATATGTACGGTGTGGGTAGAGAGGTTAAAA
AGTTGGCCGACGGTAACAATGGACCAAACCAGAATAGTCTACAAGCTTAACGCTACAAAG
TTCGATTATATGGCTGTAGACGATCATCGACAGAATCTAATGCCTTTAGAGGCAGATCGA
A*TCTTACCGATGGTAGTGCAGCT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2EX45JQ 483 0 0
CCAGCCGGCTTAGTAACTGCAATCAAGTATAAGGGCTTTGACAATGTGTTGAACGAAAGA
ACTAAGAATCGTGTGTATTGGGATATAGTATGGTATGAACCAGGACAAGTATCGCAAACA
GATTTTTTAATAGGAGGAAAGTTCAAGATAATAAGCCAAACAAGTGAGCAAGTCGAAATT
TCATTTTCAAAAACATGGGATACCTCTAAACGCGGCTCGACAATTCCACTAAACGTAGAT
AAAAGATATATTATTCGACGCGGTGTAAGTGGAGTGTATATGTACGGTGTGG*TAGAGAG
GTTAAAAAGTTGGCCGACGGTAACAATGGACCAAACCAGAATAGTCTACAAGCTTAACGC
TACAAAGTTCGATTATATGGCTGTAGACGATCATCGACAGAATCTAATGCCTTTAGAGGC
AGATCGAAATCTTACCGATGGTAGTGCAGCTCCATTGGAATACAAAGAAGCGGTTCGGAT
GGT

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL7114Contig1 567 2 2 U
GACCGTCGGTACGGGTCTCGTCGGAGCTCCCGCCTGCGGTGATGTCATGAAGCTCCAAAT
CAAGGTGGATGAGAAGACCGGTCAGATCGTCGATGCTCGCTTCAAGACCTTTGGTTGTGG
CTCCGCCATCGCCTCTTCGTCTGTCGCCACTGAATGGGTGAAAGGCAAAGCTATGGAGGA
GGTCCTGACCATCAAGAACACTGAAATCGCGAAGCATCTCTCTTTGCCACCGGTGAAGCT
CCACTGCAGTATGTTGGCGGAGGACGCTATCAAGGCAGCTGTGAAAGACTACAAGGAGAA
GCGTGTGAAGACAAACGGTGCTTGAGAAACCCACACAGGCTTGAATTCCTTCTGTTAATG
TTTATACCATTATGTGTGTATGATGGTGAAAACTGGGGAGGTGTAAAAGAGGACTATATG
GTATGTTCTCTTAAAGGTTCAAGTTTGAATAAACTCTGTTTGACAAAAAACATGTGAGAA
GAATGATTTGCTTTTTTTTGCCCTTCAGTTTTTGATGTTTTGTAATGGTTTTTCCTTTAT
TTATATCATATGGAGTATTGATAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2GK49TF U 1
AF RR2GK49JQ C 23
BS 1 566 RR2GK49TF
BS 567 567 RR2GK49JQ

RD RR2GK49TF 566 0 0
GACCGTCGGTACGGGTCTCGTCGGAGCTCCCGCCTGCGGTGATGTCATGAAGCTCCAAAT
CAAGGTGGATGAGAAGACCGGTCAGATCGTCGATGCTCGCTTCAAGACCTTTGGTTGTGG
CTCCGCCATCGCCTCTTCGTCTGTCGCCACTGAATGGGTGAAAGGCAAAGCTATGGAGGA
GGTCCTGACCATCAAGAACACTGAAATCGCGAAGCATCTCTCTTTGCCACCGGTGAAGCT
CCACTGCAGTATGTTGGCGGAGGACGCTATCAAGGCAGCTGTGAAAGACTACAAGGAGAA
GCGTGTGAAGACAAACGGTGCTTGAGAAACCCACACAGGCTTGAATTCCTTCTGTTAATG
TTTATACCATTATGTGTGTATGATGGTGAAAACTGGGGAGGTGTAAAAGAGGACTATATG
GTATGTTCTCTTAAAGGTTCAAGTTTGAATAAACTCTGTTTGACAAAAAACATGTGAGAA
GAATGATTTGCTTTTTTTTGCCCTTCAGTTTTTGATGTTTTGTAATGGTTTTTCCTTTAT
TTATATCATATGGAGTATTGATAGAT

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2GK49JQ 545 0 0
GGAGCTCCCGCCTGCGGTGATGTCATGAAGCTCCAAATCAAGGTGGATGAGAAGACCGGT
CAGATCGTCGATGCTCGCTTCAAGACCTTTGGTTGTGGCTCCGCCATCGCCTCTTCGTCT
GTCGCCACTGAATGGGTGAAAGGCAAAGCTATGGAGGAGGTCCTGACCATCAAGAACACT
GAAATCGCGAAGCATCTCTCTTTGCCACCGGTGAAGCTCCACTGCAGTATGTTGGCGGAG
GACGCTATCAAGGCAGCTGTGAAAGACTACAAGGAGAAGCGTGTGAAGACAAACGGTGCT
TGAGAAACCCACACAGGCTTGAATTCCTTCTGTTAATGTTTATACCATTATGTGTGTATG
ATGGTGAAAACTGGGGAGGTGTAAAAGAGGACTATATGGTATGTTCTCTTAAAGGTTCAA
GTTTGAATAAACTCTGTTTGACAAAAAACATGTGAGAAGAATGATTTGCTTTTTTTTGCC
CTTCAGTTTTTGATGTTTTGTAATGGTTTTTCCTTTATTTATATCATATGGAGTATTGAT
AGATC

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 2

CO CL7115Contig1 544 2 1 U
GCCACTTTTACAAGAGAGGACGAGGAAGAAAGTTCATGTGTTATCTGGTTGCGGAAGGGA
TGAATTATTGAAGATTATGGACTTCACATCGCTCCCACATTTCTGTAGAAGAGGAAGCTC
TGGGTCATCTCACCACACTGAGGGTGTAGATTGTTTTTCTTTTGATCATCCTTTCCATCA
ACAGCTATACAACTATGTGAAGCATCATTATGAGACCCAGGGACAAGCAGAACCTGCAAA
GCAAGGATCATTCCACGTGGGGTTTCCTGAGCCTGAACCTGAGCGTGTTCAGATAGCCAA
AACCATTGAATCTGAACTCCACAAGTTTGAGAACTGCAATGGTCAATGCAAGCACTGAGC
TCTGTCAGCTCCCTAGCCATATCTAAAGTGAAGAAAAGAAAATAAATCTTTAACTGAATA
TCCTCCTGGCTTCCTGTATAGTGTTATTTTGATCCTCTGGATTAGACATTTGTAGCAAAT
TTATCTGTGGTGTTGTAAAATGTAAAACAGAGGCTGAAGAAATCCACTTCTCAATTCCCT
AAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2GK54JQ C 1
AF RR2GK54TF U 1
BS 1 544 RR2GK54TF

RD RR2GK54JQ 544 0 0
GCCACTTTTACAAGAGAGGACGAGGAAGAAAGTTCATGTGTTATCTGGTTGCGGAAGGGA
TGAATTATTGAAGATTATGGACTTCACATCGCTCCCACATTTCTGTAGAAGAGGAAGCTC
TGGGTCATCTCACCACACTGAGGGTGTAGATTGTTTTTCTTTTGATCATCCTTTCCATCA
ACAGCTATACAACTATGTGAAGCATCATTATGAGACCCAGGGACAAGCAGAACCTGCAAA
GCAAGGATCATTCCACGTGGGGTTTCCTGAGCCTGAACCTGAGCGTGTTCAGATAGCCAA
AACCATTGAATCTGAACTCCACAAGTTTGAGAACTGCAATGGTCAATGCAAGCACTGAGC
TCTGTCAGCTCCCTAGCCATATCTAAAGTGAAGAAAAGAAAATAAATCTTTAACTGAATA
TCCTCCTGGCTTCCTGTATAGTGTTATTTTGATCCTCTGGATTAGACATTTGTAGCAAAT
TTATCTGTGGTGTTGTAAAATGTAAAACAGAGGCTGAAGAAATCCACTTCTCAATTCCCT
AAGC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2GK54TF 544 0 0
GCCACTTTTACAAGAGAGGACGAGGAAGAAAGTTCATGTGTTATCTGGTTGCGGAAGGGA
TGAATTATTGAAGATTATGGACTTCACATCGCTCCCACATTTCTGTAGAAGAGGAAGCTC
TGGGTCATCTCACCACACTGAGGGTGTAGATTGTTTTTCTTTTGATCATCCTTTCCATCA
ACAGCTATACAACTATGTGAAGCATCATTATGAGACCCAGGGACAAGCAGAACCTGCAAA
GCAAGGATCATTCCACGTGGGGTTTCCTGAGCCTGAACCTGAGCGTGTTCAGATAGCCAA
AACCATTGAATCTGAACTCCACAAGTTTGAGAACTGCAATGGTCAATGCAAGCACTGAGC
TCTGTCAGCTCCCTAGCCATATCTAAAGTGAAGAAAAGAAAATAAATCTTTAACTGAATA
TCCTCCTGGCTTCCTGTATAGTGTTATTTTGATCCTCTGGATTAGACATTTGTAGCAAAT
TTATCTGTGGTGTTGTAAAATGTAAAACAGAGGCTGAAGAAATCCACTTCTCAATTCCCT
AAGC

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 2

CO CL7116Contig1 538 2 3 U
GGTTCAAACTCGGTTAACATAACACTTATCAAGCTGATCATACACAGCCTTTTCATTACA
ACTTCATGACATAAACACGACTCAAAAAAAAAAACACACTTGGCGGGTGGTGAAATACCA
TCTCTGCCCTACCCACTTCTGCTTTTTAACCGGTTTAAACCAAAAGACAGAAGCTTAAAA
AAAAGACAATAAAAAGTGATAAAACAAAGGAAACCATTGGTGAAACATAGAGGACCCTTT
GCTAAAAGATGCACACCACTCTACTCAATTGTCACTTACTAAAACCCTAATTTTTAAAAT
GACTAAAAAGCCCTTAAAATTAGCTCTTTTTCCATTTTACCCTCTGAGATGAAAGAAGTT
TAATGGCTCTCAAAATAAAACCCTAAAAAGCCATATAACCTCTTTTCTTTCTCTCCACCA
CCTGACACTACCACAAACCCTAAACTATATAAACCGAAGCTGACACACATTCAACGAAAC
TGGCGGCCGGTGAAAGTTTGTCCGAAGGACCAACTAGCAGGAGCGACGTTGTTGGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2G941JQ U 1
AF RR2G704JQ U 38
BS 1 127 RR2G941JQ
BS 128 128 RR2G704JQ
BS 129 538 RR2G941JQ

RD RR2G941JQ 538 0 0
GGTTCAAACTCGGTTAACATAACACTTATCAAGCTGATCATACACAGCCTTTTCATTACA
ACTTCATGACATAAACACGACTCAAAAAAAAAAACACACTTGGCGGGTGGTGAAATACCA
TCTCTGCTCTACCCACTTCTGCTTTTTAACCGGTTTAAACCAAAAGACAGAAGCTTAAAA
AAAAGACAATAAAAAGTGATAAAACAAAGGAAACCATTGGTGAAACATAGAGGACCCTTT
GCTAAAAGATGCACACCACTCTACTCAATTGTCACTTACTAAAACCCTAATTTTTAAAAT
GACTAAAAAGCCCTTAAAATTAGCTCTTTTTCCATTTTACCCTCTGAGATGAAAGAAGTT
TAATGGCTCTCAAAATAAAACCCTAAAAAGCCATATAACCTCTTTTCTTTCTCTCCACCA
CCTGACACTACCACAAACCCTAAACTATATAAACCGAAGCTGACACACATTCAACGAAAC
TGGCGGCCGGTGAAAGTTTGTCCGAAGGACCAACTAGCAGGAGCGACGTTGTTGGAGA

QA 1 538 1 538
DS 

RD RR2G704JQ 501 0 0
TCATACACAGCCTTTTCATTACAACTTCATGACATAAACACGACTCAAAAAAAAAA*CAC
ACTTGGCGGGTGGTGAAATACCATCTCTGCCCTACCCACTTCTGCTTTTTAACCGGTTTA
AACCAAAAGACAGAAGCTTAAAAAAAAGACAATAAAAAGTGATAAAACAAAGGAAACCAT
TGGTGAAACATAGAGGACCCTTTGCTAAAAGATGCACACCACTCTACTCAATTGTCACTT
ACTAAAACCCTAATTTTTAAAATGACTAAAAAGCCCTTAAAATTAGCTCTTTTTCCATTT
TACCCTCTGAGATGAAAGAAGTTTAATGGCTCTCAAAATAAAACCCTAAAAAGCCATATA
ACCTCTTTTCTTTCTCTCCACCACCTGACACTACCACAAACCCTAAACTATATAAACCGA
AGCTGACACACATTCAACGAAACTGGCGGCCGGTGAAAGTTTGTCCGAAGGACCAACTAG
CAGGAGCGACGTTGTTGGAGA

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL7117Contig1 901 2 6 U
GGAGCCATATCAAGGGAAAAAGGTGGAGCACAATGGTGTTAAAGTTGAGCTCCTTGGTCA
AATAGAAATGTACTTTGACAGAGGAAACTTCTACGACTTCACTTCCTTGGTGCGTGAGCT
TGATGTACCGGGAGAGATATATGAAAAGAAGGCATACCCTTTTGAGTTTTCGACTGTTGA
GATGCCACATGAGACATACAATGGCGTAAATGTGCGACTAAGGTATGTCCTCAAAGTAAC
AGTTACGCGTGGCTATGGTGGAAGCATCGTGGAGTATCAGGACTTTGTGGTCCGTAACTA
TTCTCCACTACCTCCAATCAACAACAGCATCAAGATGGAAGTTGAAATCGAGGACTGCCT
GCATATCGAGTTTGAGTACAACAAAAGCAAGTACCACCTGAAAGATGTTATCCTTGGGAA
AATATACTTTCTTCTGGTGAGAATCAAGATAAAGAATATGGATCTTGAGATCAGAAGGCG
AGAATCAACAGGAGCAGGAGCTAATACTCACGTCGAGACAGAAACACTAGCCAAGTTTGA
GTTAATGGATGGCGCTCCCGTTAGAGGTGAATCGATACCTGTGAGACTATTCTTGACACC
ATACGATCTGACACCAACGCTTACGAACATAAACAACAAATTCAGCGTTAAGTATTATCT
GAATCTTGTTCTGGTGGACGAGGAGGATCGCCGTTACATCAAGCAGCAAGAGATTACGCT
GTACAGGCTCAAGGAGGAGACATCTTGATGTTAACAAAAGGGGAAGAGAGAAGTGATAAA
TTTTTCAGAACTTTGTAAAGTTTTTTTTCTGTATGCAATTGGTTTGAGGACTTGGAGTGA
TGAAAAGTTAAATCATGTAGTTTGTTCAACGACCATAATGTTGTTTGCTTCGTGTTGAGC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2FK11TF U 1
AF RR2FK11JQ C 89
BS 1 726 RR2FK11TF
BS 727 727 RR2FK11JQ
BS 728 771 RR2FK11TF
BS 772 772 RR2FK11JQ
BS 773 785 RR2FK11TF
BS 786 901 RR2FK11JQ

RD RR2FK11TF 785 0 0
GGAGCCATATCAAGGGAAAAAGGTGGAGCACAATGGTGTTAAAGTTGAGCTCCTTGGTCA
AATAGAAATGTACTTTGACAGAGGAAACTTCTACGACTTCACTTCCTTGGTGCGTGAGCT
TGATGTACCGGGAGAGATATATGAAAAGAAGGCATACCCTTTTGAGTTTTCGACTGTTGA
GATGCCACATGAGACATACAATGGCGTAAATGTGCGACTAAGGTATGTCCTCAAAGTAAC
AGTTACGCGTGGCTATGGTGGAAGCATCGTGGAGTATCAGGACTTTGTGGTCCGTAACTA
TTCTCCACTACCTCCAATCAACAACAGCATCAAGATGGAAGTTGAAATCGAGGACTGCCT
GCATATCGAGTTTGAGTACAACAAAAGCAAGTACCACCTGAAAGATGTTATCCTTGGGAA
AATATACTTTCTTCTGGTGAGAATCAAGATAAAGAATATGGATCTTGAGATCAGAAGGCG
AGAATCAACAGGAGCAGGAGCTAATACTCACGTCGAGACAGAAACACTAGCCAAGTTTGA
GTTAATGGATGGCGCTCCCGTTAGAGGTGAATCGATACCTGTGAGACTATTCTTGACACC
ATACGATCTGACACCAACGCTTACGAACATAAACAACAAATTCAGCGTTAAGTATTATCT
GAATCTTGTTCTGGTGGACGAGGAGGATCGCCGTTACATCAAGCAGCAAGAGATTACGCT
GTACAG*CTCAAGGAGGAGACATCTTGATGTTAACAAAAGGGGAAGAGAGA*GTGATAAA
TTTTT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2FK11JQ 813 0 0
TTCTACGACTTCACTTCCTTGGTGCGTGAGCTTGATGTACCGGGAGAGATATATGAAAAG
AAGGCATACCCTTTTGAGTTTTCGACTGTTGAGATGCCACATGAGACATACAATGGCGTA
AATGTGCGACTAAGGTATGTCCTCAAAGTAACAGTTACGCGTGGCTATGGTGGAAGCATC
GTGGAGTATCAGGACTTTGTGGTCCGTAACTATTCTCCACTACCTCCAATCAACAACAGC
ATCAAGATGGAAGTTGAAATCGAGGACTGCCTGCATATCGAGTTTGAGTACAACAAAAGC
AAGTACCACCTGAAAGATGTTATCCTTGGGAAAATATACTTTCTTCTGGTGAGAATCAAG
ATAAAGAATATGGATCTTGAGATCAGAAGGCGAGAATCAACAGGAGCAGGAGCTAATACT
CACGTCGAGACAGAAACACTAGCCAAGTTTGAGTTAATGGATGGCGCTCCCGTTAGAGGT
GAATCGATACCTGTGAGACTATTCTTGACACCATACGATCTGACACCAACGCTTACGAAC
ATAAACAACAAATTCAGCGTTAAGTATTATCTGAATCTTGTTCTGGTGGACGAGGAGGAT
CGCCGTTACATCAAGCAGCAAGAGATTACGCTGTACAGGCTCAAGGAGGAGACATCTTGA
TGTTAACAAAAGGGGAAGAGAGAAGTGATAAATTTTTCAGAACTTTGTAAAGTTTTTTTT
CTGTATGCAATTGGTTTGAGGACTTGGAGTGATGAAAAGTTAAATCATGTAGTTTGTTCA
ACGACCATAATGTTGTTTGCTTCGTGTTGAGCC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

CO CL7118Contig1 544 2 1 U
GGATCCAAACCAAGAATCATATTCCCGAATCACACAATCACAATCTCCTTTTGTGTGTTT
CCACTTGCGAACTGAAAGAGCCAACACAAAGAGAAGAGCTTCTTCTGTAAGAAAAGATGC
AGAAAGACATGGGAACCGCAAAGGATCAACATCTTCCACAAGCTGCAGAAAAAGTCTCTG
AACAACCAGGACAAGACGAGAAGAAGAAGCCAAGGTTTTTCGAGACAGAGCAGAAAGGAG
ACAGAGGCTTCATTGAAGGATGTCTCGCTGCACTATGCTGCTGCTGGATTTGTGAAATGT
GTTTCTAAGGTAAAGAAGAACACTACAGTGTGTCGAGCTACCTTGTGTATCTATTAGTGT
GAGAGATTGCAGGACTATATAGTAGATCAATCTGAAACTTTCTATACTATGTGTGTGGCG
TTTGTATGCATTGTAAGATTGCAGGACTCTATAGTAGCTTAATCTGAAACTTCCTGTACT
GTATGTGGTGTTTGTATGTATTGAAAGATGATTATTATACTAATAATGTAAAGGTGGTCA
TATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2AC20JQ C 1
AF RR2AC20TF U 1
BS 1 544 RR2AC20TF

RD RR2AC20JQ 544 0 0
GGATCCAAACCAAGAATCATATTCCCGAATCACACAATCACAATCTCCTTTTGTGTGTTT
CCACTTGCGAACTGAAAGAGCCAACACAAAGAGAAGAGCTTCTTCTGTAAGAAAAGATGC
AGAAAGACATGGGAACCGCAAAGGATCAACATCTTCCACAAGCTGCAGAAAAAGTCTCTG
AACAACCAGGACAAGACGAGAAGAAGAAGCCAAGGTTTTTCGAGACAGAGCAGAAAGGAG
ACAGAGGCTTCATTGAAGGATGTCTCGCTGCACTATGCTGCTGCTGGATTTGTGAAATGT
GTTTCTAAGGTAAAGAAGAACACTACAGTGTGTCGAGCTACCTTGTGTATCTATTAGTGT
GAGAGATTGCAGGACTATATAGTAGATCAATCTGAAACTTTCTATACTATGTGTGTGGCG
TTTGTATGCATTGTAAGATTGCAGGACTCTATAGTAGCTTAATCTGAAACTTCCTGTACT
GTATGTGGTGTTTGTATGTATTGAAAGATGATTATTATACTAATAATGTAAAGGTGGTCA
TATT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2AC20TF 544 0 0
GGATCCAAACCAAGAATCATATTCCCGAATCACACAATCACAATCTCCTTTTGTGTGTTT
CCACTTGCGAACTGAAAGAGCCAACACAAAGAGAAGAGCTTCTTCTGTAAGAAAAGATGC
AGAAAGACATGGGAACCGCAAAGGATCAACATCTTCCACAAGCTGCAGAAAAAGTCTCTG
AACAACCAGGACAAGACGAGAAGAAGAAGCCAAGGTTTTTCGAGACAGAGCAGAAAGGAG
ACAGAGGCTTCATTGAAGGATGTCTCGCTGCACTATGCTGCTGCTGGATTTGTGAAATGT
GTTTCTAAGGTAAAGAAGAACACTACAGTGTGTCGAGCTACCTTGTGTATCTATTAGTGT
GAGAGATTGCAGGACTATATAGTAGATCAATCTGAAACTTTCTATACTATGTGTGTGGCG
TTTGTATGCATTGTAAGATTGCAGGACTCTATAGTAGCTTAATCTGAAACTTCCTGTACT
GTATGTGGTGTTTGTATGTATTGAAAGATGATTATTATACTAATAATGTAAAGGTGGTCA
TATT

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 2

CO CL7119Contig1 698 2 3 U
GGGCATCTCTCTTTCTTCGTGTTCGTCGTCTTCGGTTCTCTCTAGCCGGCGAATTTCTCT
TGACAAAGCCGATAATCATACCGAAGACGCTTCTCCCTCGACGGCGCATCTCCCTCGACG
TCGCTTCTCCATAGACCGCACCTCTCTCTTCGTCTTCGCTTCTCTCTCGACGGTTCTTCT
CCCCTTGATTTCGATCTCTTTGACTGCTGGATGCGATCTGTTCATCAGATACGTGGCGAG
GACGTCTGCTTTGGAGTACGAGGATTTTAACTCGGCTAAGTCGCGTCTCCTTGAACGGGC
TGAGAAGTTTGGTGAAATCTCTTGCAGGGTAAGTTGCAGGATCTACAGGACGAAAGCACA
TATTTTAGGTTTGTTTAAATAAAAGCTCGACGTTTCTGTGAAGCTGCTGCTTGATTCAGC
TGTGGCGTATAGCATGGACGAGGTGGACATGGTGTTTGTGGGAGCAGATGGAGTTGTAGA
AAGTGGCGGTGTTATCAACATGATGGGAATTTATCAGATGGCGCTAGTCGCGCACAGTAT
GAACAAGCCGGTCTATGTTGCAGCCGAGAGTTACAAGGTAGTTTTGATTTGTTATGGAAG
ATCGAATAGAGCGAGAGAGTCTAGTTAATGATAATGAAAGCTGTTTTGTGTATGAATGTT
TGTTATGTTCATTTCATTTAAGAGAAAAGATGGCCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H554TF U 1
AF RR2H554JQB C 150
BS 1 687 RR2H554TF
BS 688 688 RR2H554JQB
BS 689 698 RR2H554TF

RD RR2H554TF 698 0 0
GGGCATCTCTCTTTCTTCGTGTTCGTCGTCTTCGGTTCTCTCTAGCCGGCGAATTTCTCT
TGACAAAGCCGATAATCATACCGAAGACGCTTCTCCCTCGACGGCGCATCTCCCTCGACG
TCGCTTCTCCATAGACCGCACCTCTCTCTTCGTCTTCGCTTCTCTCTCGACGGTTCTTCT
CCCCTTGATTTCGATCTCTTTGACTGCTGGATGCGATCTGTTCATCAGATACGTGGCGAG
GACGTCTGCTTTGGAGTACGAGGATTTTAACTCGGCTAAGTCGCGTCTCCTTGAACGGGC
TGAGAAGTTTGGTGAAATCTCTTGCAGGGTAAGTTGCAGGATCTACAGGACGAAAGCACA
TATTTTAGGTTTGTTTAAATAAAAGCTCGACGTTTCTGTGAAGCTGCTGCTTGATTCAGC
TGTGGCGTATAGCATGGACGAGGTGGACATGGTGTTTGTGGGAGCAGATGGAGTTGTAGA
AAGTGGCGGTGTTATCAACATGATGGGAATTTATCAGATGGCGCTAGTCGCGCACAGTAT
GAACAAGCCGGTCTATGTTGCAGCCGAGAGTTACAAGGTAGTTTTGATTTGTTATGGAAG
ATCGAATAGAGCGAGAGAGTCTAGTTAATGATAATGAAAGCTGTTTTGTGTATGAATGTT
TGTTATGTTCATTTCATTTAAGAGAAA*GATGGCCATG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2H554JQB 549 0 0
TCGTCTTCGCTTCTCTCTCGACGGTTCTTCTCCCCTTGATTTCGATCTCTTTGACTGCTG
GATGCGATCTGTTCATCAGATACGTGGCGAGGACGTCTGCTTTGGAGTACGAGGATTTTA
ACTCGGCTAAGTCGCGTCTCCTTGAACGGGCTGAGAAGTTTGGTGAAATCTCTTGCAGGG
TAAGTTGCAGGATCTACAGGACGAAAGCACATATTTTAGGTTTGTTTAAATAAAAGCTCG
ACGTTTCTGTGAAGCTGCTGCTTGATTCAGCTGTGGCGTATAGCATGGACGAGGTGGACA
TGGTGTTTGTGGGAGCAGATGGAGTTGTAGAAAGTGGCGGTGTTATCAACATGATGGGAA
TTTATCAGATGGCGCTAGTCGCGCACAGTATGAACAAGCCGGTCTATGTTGCAGCCGAGA
GTTACAAGGTAGTTTTGATTTGTTATGGAAGATCGAATAGAGCGAGAGAGTCTAGTTAAT
GATAATGAAAGCTGTTTTGTGTATGAATGTTTGTTATGTTCATTTCATTTAAGAGAAAAG
ATGGCCATG

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

CO CL7120Contig1 544 2 1 U
TGGTTACTTGTCGTTTGCTCTTGTAGAGAATTCGGAACCTCAAAAAATTAGGGTTTCCTA
ACTTTCCTTAGTTTACGGAAATCGACAGTGCGAATTTTGGTTTCCACATTTAGTTTCTCT
AAATTTAGTTAGTAAAATAATTATGAAAGAGTGAAATAAAAAAGAAAGTAAGAAGAAAGA
AGATAGAATAATTATAAAGTTGTCATTTTATAATTCGTTCAACATATTTATATTTAAAAG
TTATTCGAAGCGGTACAATGTTGTTTATGTGATTGTTTCAAAACATTGTCAATTGCTATC
AATTGCAAAACGTTTGCGGATAGTAATAGGAAAACCAATCAGCCCTTTAATCTCGTTTAA
GAACTTTGGTTAACATTTTAGATGTTGCATTTTACAGATGACAATTTATAACAGCTAAAC
TTTTTAAAACATAAATTAAAATTCTGTTATACAATAAAATATCAATATCAATTTACTGAG
ATATTCATTTGGGCATGTTAACCGATAAGGTGCTCTTAGGATAATTGAAAAGAAAACAGA
ATGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2DB05JQ C 1
AF RR2DB05TF U 1
BS 1 544 RR2DB05TF

RD RR2DB05JQ 544 0 0
TGGTTACTTGTCGTTTGCTCTTGTAGAGAATTCGGAACCTCAAAAAATTAGGGTTTCCTA
ACTTTCCTTAGTTTACGGAAATCGACAGTGCGAATTTTGGTTTCCACATTTAGTTTCTCT
AAATTTAGTTAGTAAAATAATTATGAAAGAGTGAAATAAAAAAGAAAGTAAGAAGAAAGA
AGATAGAATAATTATAAAGTTGTCATTTTATAATTCGTTCAACATATTTATATTTAAAAG
TTATTCGAAGCGGTACAATGTTGTTTATGTGATTGTTTCAAAACATTGTCAATTGCTATC
AATTGCAAAACGTTTGCGGATAGTAATAGGAAAACCAATCAGCCCTTTAATCTCGTTTAA
GAACTTTGGTTAACATTTTAGATGTTGCATTTTACAGATGACAATTTATAACAGCTAAAC
TTTTTAAAACATAAATTAAAATTCTGTTATACAATAAAATATCAATATCAATTTACTGAG
ATATTCATTTGGGCATGTTAACCGATAAGGTGCTCTTAGGATAATTGAAAAGAAAACAGA
ATGC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2DB05TF 544 0 0
TGGTTACTTGTCGTTTGCTCTTGTAGAGAATTCGGAACCTCAAAAAATTAGGGTTTCCTA
ACTTTCCTTAGTTTACGGAAATCGACAGTGCGAATTTTGGTTTCCACATTTAGTTTCTCT
AAATTTAGTTAGTAAAATAATTATGAAAGAGTGAAATAAAAAAGAAAGTAAGAAGAAAGA
AGATAGAATAATTATAAAGTTGTCATTTTATAATTCGTTCAACATATTTATATTTAAAAG
TTATTCGAAGCGGTACAATGTTGTTTATGTGATTGTTTCAAAACATTGTCAATTGCTATC
AATTGCAAAACGTTTGCGGATAGTAATAGGAAAACCAATCAGCCCTTTAATCTCGTTTAA
GAACTTTGGTTAACATTTTAGATGTTGCATTTTACAGATGACAATTTATAACAGCTAAAC
TTTTTAAAACATAAATTAAAATTCTGTTATACAATAAAATATCAATATCAATTTACTGAG
ATATTCATTTGGGCATGTTAACCGATAAGGTGCTCTTAGGATAATTGAAAAGAAAACAGA
ATGC

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 2

CO CL7121Contig1 543 2 1 U
GGGACAGCGCAAGCTCGATCCCACCTTGCGTACAATCAAAGCCTCATCGGTGGAGAGATC
GAAAGAGGCAGAGGAAGAGATTACAGGTACAAAAGAGAAAGATGAGAGAGACCTCGGCGA
GTTGTCTTTCATGGCGTCGCCTGCTTGTATTCTTCGCTTCGATTGCTCTGCAGTTCGTCG
TAGGTCAATCCGGTGATTCCAAGAATGCAAATACAGGAGCTAAGGCAGAGTCTCACACCT
CTTCCAGCAGAACAGGGACAAAAGTAATCCTCATACTGGTCGGACTTGTGGCTGTAGCTA
TGTTCTCCTTCTTCCTGTACAAGTTATGGCAGAAGAAGAAAAGAGACGAGCAGTATGCTA
GACTGTTGAAACTCTTTGAGGAAGATGATGAACTGGAGGTTGAATTAGGCCTTCGAGATT
AAACACAAAAATATATGTATATTTGGTCGTGTCTTTTACATGTAAGAAAAATAGATTCAT
TCAAACTCCAAAGACTCGAATTGAAATCAATATTCGTTTCAAACTTAAAAAAAAGGTTAC
ATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2AM80JQ C 1
AF RR2AM80TF U 1
BS 1 543 RR2AM80TF

RD RR2AM80JQ 543 0 0
GGGACAGCGCAAGCTCGATCCCACCTTGCGTACAATCAAAGCCTCATCGGTGGAGAGATC
GAAAGAGGCAGAGGAAGAGATTACAGGTACAAAAGAGAAAGATGAGAGAGACCTCGGCGA
GTTGTCTTTCATGGCGTCGCCTGCTTGTATTCTTCGCTTCGATTGCTCTGCAGTTCGTCG
TAGGTCAATCCGGTGATTCCAAGAATGCAAATACAGGAGCTAAGGCAGAGTCTCACACCT
CTTCCAGCAGAACAGGGACAAAAGTAATCCTCATACTGGTCGGACTTGTGGCTGTAGCTA
TGTTCTCCTTCTTCCTGTACAAGTTATGGCAGAAGAAGAAAAGAGACGAGCAGTATGCTA
GACTGTTGAAACTCTTTGAGGAAGATGATGAACTGGAGGTTGAATTAGGCCTTCGAGATT
AAACACAAAAATATATGTATATTTGGTCGTGTCTTTTACATGTAAGAAAAATAGATTCAT
TCAAACTCCAAAGACTCGAATTGAAATCAATATTCGTTTCAAACTTAAAAAAAAGGTTAC
ATG

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2AM80TF 543 0 0
GGGACAGCGCAAGCTCGATCCCACCTTGCGTACAATCAAAGCCTCATCGGTGGAGAGATC
GAAAGAGGCAGAGGAAGAGATTACAGGTACAAAAGAGAAAGATGAGAGAGACCTCGGCGA
GTTGTCTTTCATGGCGTCGCCTGCTTGTATTCTTCGCTTCGATTGCTCTGCAGTTCGTCG
TAGGTCAATCCGGTGATTCCAAGAATGCAAATACAGGAGCTAAGGCAGAGTCTCACACCT
CTTCCAGCAGAACAGGGACAAAAGTAATCCTCATACTGGTCGGACTTGTGGCTGTAGCTA
TGTTCTCCTTCTTCCTGTACAAGTTATGGCAGAAGAAGAAAAGAGACGAGCAGTATGCTA
GACTGTTGAAACTCTTTGAGGAAGATGATGAACTGGAGGTTGAATTAGGCCTTCGAGATT
AAACACAAAAATATATGTATATTTGGTCGTGTCTTTTACATGTAAGAAAAATAGATTCAT
TCAAACTCCAAAGACTCGAATTGAAATCAATATTCGTTTCAAACTTAAAAAAAAGGTTAC
ATG

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL7122Contig1 713 2 2 U
GGACATATAAACCTAAAAGAAAACAAGTTTCAATCCTCCCACCAAACTTTCTGCTGGTAC
TCCCTCATTTAGGTTTTCCCACAAGCTGATTGATGAATATGTCAATGAGCTTGTGTGGAA
ACCTTTGATATTCTTTATTGAATGTTGGTATGATCGAATTTATTTCGTAAAGGAATGATC
ATTCGACTGAATCACATCAATGGAGCTTTTTACTGCAAACTGTCCGTCCACGGAAAACAA
ACCTCTTGAGCTTTCAAAACTGGTCATAGAAGATAAAAGCTCGGTTAAAAAGAACACTGA
AAGCACCATTACACCGGTGAATCATGGTGTAAAGGTGTGGCAAGAGAACAGAGAAAAATG
GGTGGGAGATCAATCTCGACAAAGAAAAAAAACTACAAAGGATCAGATTATAAGTTGGTC
TACTACATATGAAGATCTTCTCTCAACTCATGAACCTTTCTCTGAGTCGATTCCTTTACC
CGAGATGGTGGACTTTCTGGTCGATATATGGTATGACGAAGGCCTTTACGATTAGAAGAA
GAATCTAACAATGCCATCAAATCGACAAAGAACAAAGAAAAAAAAGAGATTCAATTAAAA
ATCATTAGGAGTTGCGAAAACATCTACTCATAAAACTATCTTTTGTGACCACTCACATAC
TCCATTTGTAACACTTGTATGATTGTTAAATGAGAACAAAACTGATTCCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2GK63TF U 1
AF RR2GK63JQ C 157
BS 1 710 RR2GK63TF
BS 711 713 RR2GK63JQ

RD RR2GK63TF 712 0 0
GGACATATAAACCTAAAAGAAAACAAGTTTCAATCCTCCCACCAAACTTTCTGCTGGTAC
TCCCTCATTTAGGTTTTCCCACAAGCTGATTGATGAATATGTCAATGAGCTTGTGTGGAA
ACCTTTGATATTCTTTATTGAATGTTGGTATGATCGAATTTATTTCGTAAAGGAATGATC
ATTCGACTGAATCACATCAATGGAGCTTTTTACTGCAAACTGTCCGTCCACGGAAAACAA
ACCTCTTGAGCTTTCAAAACTGGTCATAGAAGATAAAAGCTCGGTTAAAAAGAACACTGA
AAGCACCATTACACCGGTGAATCATGGTGTAAAGGTGTGGCAAGAGAACAGAGAAAAATG
GGTGGGAGATCAATCTCGACAAAGAAAAAAAACTACAAAGGATCAGATTATAAGTTGGTC
TACTACATATGAAGATCTTCTCTCAACTCATGAACCTTTCTCTGAGTCGATTCCTTTACC
CGAGATGGTGGACTTTCTGGTCGATATATGGTATGACGAAGGCCTTTACGATTAGAAGAA
GAATCTAACAATGCCATCAAATCGACAAAGAACAAAGAAAAAAAAGAGATTCAATTAAAA
ATCATTAGGAGTTGCGAAAACATCTACTCATAAAACTATCTTTTGTGACCACTCACATAC
TCCATTTGTAACACTTGTATGATTGTTAAATGAGAACAAAACTGATTCCA
GC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2GK63JQ 557 0 0
AATTTATTTCGTAAAGGAATGATCATTCGACTGAATCACATCAATGGAGCTTTTTACTGC
AAACTGTCCGTCCACGGAAAACAAACCTCTTGAGCTTTCAAAACTGGTCATAGAAGATAA
AAGCTCGGTTAAAAAGAACACTGAAAGCACCATTACACCGGTGAATCATGGTGTAAAGGT
GTGGCAAGAGAACAGAGAAAAATGGGTGGGAGATCAATCTCGACAAAGAAAAAAAACTAC
AAAGGATCAGATTATAAGTTGGTTTACTACATATGAAGATCTTCTCTCAACTCATGAACC
TTTTTTTGAGTCGATTCCTTTACCCGAGATGGTGGACTTTCTGGTCGATATATGGTATGA
CGAAGGCCTTTACGATTAGAAGAAGAATCTAACAATGCCATCAAATCGACAAAGAACAAA
GAAAAAAAAGAGATTCAATTAAAAATCATTAGGAGTTGCGAAAACATCTACTCATAAAAC
TATCTTTTGTGACCACTCACATACTCCATTTGTAACACTTGTATGATTGTTAAATGAGAA
CAAAACTGATTCCAAGC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL7123Contig1 1068 2 14 U
GGGAGAGACCTAAACCCGATCTGCACCCGAACAAGAATGGCGTCTTCTTCGCTCTCCGTC
ACGTCTCCGGCTGCTTCCGTCGTCACCCAAACATCATCACACTTACCTCTCCCACCAACC
TCCCGCCCTCGCAGAGTCTCCTTCCGTCTCTCCGCCAAGCCTAAGCTCCGCTTTCTCTCC
AAGCCTAGTCGCAGTAGCTACCCTGTGGTGAAAGCCCAATCTAACCAGGCTGTTAGCAGT
GACTCATCAAATGCTCATCCAGCTTCTTCATCAACTGATTTAGCTACAGAAGAGTCTATC
TCTGAGTTTCTTACCCAAGTAACAACTCTTGTCAAGCTTGTTGATTCGAGAGACATCGTC
GAGTTGCAGTTGAAACAACTCGACTGTGAACTTGTCATTCGCAAAAAGGAAGCCTTGCCG
CAACCCGAGTCCCCTGCACAATATGTTATGATGCAGCAGCAACCAAACCAATCATCTTAT
GTGCAGTCTGTGGCTCCTCCTCCTCCACCTGCTGCTGCCTCACCAGCAGCGCCTTCTACT
CCTGCCTCTTTGCCTCCACCATCTCCACCTGCTCCAGCTAAATCGTCGCTTCCTACTGTA
AAAAGCCCCATGGCTGGCACTTTCTACCGTAGTCCTGGACCTGGCGAACCACCCTTTATC
AAGGTTGGAGATAAAGTGCAGAAGGGGCAAGTTCTATGCATCGTTGAAGCCATGAAGTTA
ATGAATGAAATAGAGTCTGACCAAACGGGAACCGTAGTGGATATCGTTGCAGAAGATGGC
AAACCTGTTAGCCTCGACACTCCTCTGTTTGTGGTTCAACCGTAGAATCGGCACCATGAG
AAGTGGAGAAAAGAGGCTATTAAAATTCAATCTCTGTGCTTTTTGGTAAAACTACTTCTT
GAGACTCATGTGTCTTCTTCGTTTGTTACTGTTGAAAATCTGTTAGCTTTTTTTTCTTTT
GTTAGTTTGATGAGTGAGTTGGTTAAAGATGAGAGCTCTGTTTTATCTACACACGAATTC
TTGGTTCTGTTTTATTGCAATTTTCCTATCAAAAATATATAGCTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL18TF U 1
AF RR2BL18JQ C 214
BS 1 663 RR2BL18TF
BS 664 664 RR2BL18JQ
BS 665 686 RR2BL18TF
BS 687 687 RR2BL18JQ
BS 688 720 RR2BL18TF
BS 721 721 RR2BL18JQ
BS 722 724 RR2BL18TF
BS 725 725 RR2BL18JQ
BS 726 741 RR2BL18TF
BS 742 742 RR2BL18JQ
BS 743 750 RR2BL18TF
BS 751 751 RR2BL18JQ
BS 752 784 RR2BL18TF
BS 785 1068 RR2BL18JQ

RD RR2BL18TF 793 0 0
GGGAGAGACCTAAACCCGATCTGCACCCGAACAAGAATGGCGTCTTCTTCGCTCTCCGTC
ACGTCTCCGGCTGCTTCCGTCGTCACCCAAACATCATCACACTTACCTCTCCCACCAACC
TCCCGCCCTCGCAGAGTCTCCTTCCGTCTCTCCGCCAAGCCTAAGCTCCGCTTTCTCTCC
AAGCCTAGTCGCAGTAGCTACCCTGTGGTGAAAGCCCAATCTAACCAGGCTGTTAGCAGT
GACTCATCAAATGCTCATCCAGCTTCTTCATCAACTGATTTAGCTACAGAAGAGTCTATC
TCTGAGTTTCTTACCCAAGTAACAACTCTTGTCAAGCTTGTTGATTCGAGAGACATCGTC
GAGTTGCAGTTGAAACAACTCGACTGTGAACTTGTCATTCGCAAAAAGGAAGCCTTGCCG
CAACCCGAGTCCCCTGCACAATATGTTATGATGCAGCAGCAACCAAACCAATCATCTTAT
GTGCAGTCTGTGGCTCCTCCTCCTCCACCTGCTGCTGCCTCACCAGCAGCGCCTTCTACT
CCTGCCTCTTTGCCTCCACCATCTCCACCTGCTCCAGCTAAATCGTCGCTTCCTACTGTA
AAAAGCCCCATGGCTGGCACTTTCTACCGTAGTCCTGGACCTGGCGAACCACCCTTTATC
AAG*TTGGAGATAAAGTGCAGAAGGG*CAAGTTCTATGCATCGTTGAAGCCATGAAGTTA
*TGA*TGAAATAGAGTCTGAC*AAACGGGA*CCGTAGTGGATATCGTTGCAGAAGATGGC
AAAC
TGTAGCTCG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RR2BL18JQ 855 0 0
AGCCC
ATCTAACCAGGCTGTTAGCAGTGACTCATCAAATGCTCATCCAGCTTCTTCATCAACTGA
TTTAGCTACAGAAGAGTCTATCTCTGAGTTTCTTACCCAAGTAACAACTCTTGTCAAGCT
TGTTGATTCGAGAGACATCGTCGAGTTGCAGTTGAAACAACTCGACTGTGAACTTGTCAT
TCGCAAAAAGGAAGCCTTGCCGCAACCCGAGTCCCCTGCACAATATGTTATGATGCAGCA
GCAACCAAACCAATCATCTTATGTGCAGTCTGTGGCTCCTCCTCCTCCACCTGCTGCTGC
CTCACCAGCAGCGCCTTCTACTCCTGCCTCTTTGCCTCCACCATCTCCACCTGCTCCAGC
TAAATCGTCGCTTCCTACTGTAAAAAGCCCCATGGCTGGCACTTTCTACCGTAGTCCTGG
ACCTGGCGAACCACCCTTTATCAAGGTTGGAGATAAAGTGCAGAAGGGGCAAGTTCTATG
CATCGTTGAAGCCATGAAGTTAATGAATGAAATAGAGTCTGACCAAACGGGAACCGTAGT
GGATATCGTTGCAGAAGATGGCAAACCTGTTAGCCTCGACACTCCTCTGTTTGTGGTTCA
ACCGTAGAATCGGCACCATGAGAAGTGGAGAAAAGAGGCTATTAAAATTCAATCTCTGTG
CTTTTTGGTAAAACTACTTCTTGAGACTCATGTGTCTTCTTCGTTTGTTACTGTTGAAAA
TCTGTTAGCTTTTTTTTCTTTTGTTAGTTTGATGAGTGAGTTGGTTAAAGATGAGAGCTC
TGTTTTATCTACACACGAATTCTTGGTTCTGTTTTATTGCAATTTTCCTATCAAAAATAT
ATAGCTAATT

QA 6 855 6 855
DS 



AS 1 2

CO CL7124Contig1 691 2 1 U
GTCTCAAGGCAAAACTTGAAGAAAAGGTCAAGGAACCTCAGCTTGATCAAGAGGAGTTGA
ACAAGAAAGCTTTAGCTCCTGAAGATGAAGAAGAAGCTGTGGTGGGTCCAATGCCTTTGC
CTAAAGCTGAAGAACACATCAGCAACTACCACGGTCGTGCTTTAAGACCTGGTGAAGGAG
ACGCTATAGCACAGTATGTGCAGCAAGGGAAACGTATCCCACGTAGAGGAGAAGTTGGTC
TTAACGCTGATGAGATTCAGAGGTTTGAGGATCTTGGGTACGTCATGAGTGGGAGTAGGC
ATCAAAGGATGAATGCCATTCGTATCAGAAAGGAGAACCAGGTTTACAGTGCTGAAGACA
AACGGGCCTTGGCTATGTTTAACTATGAGGAGAAGGCCAAGCGTGAGGCTAAGGTCATGT
CTGATCTTTCCAGGCTTGTGCAGCGCCATATGGGACAAGAGTTGGGTCCCAATCATGACC
CTTTTGGTTCTGGAAAGACTGATGGACCTGATGACTGAATTGGGACATACAGAAGCTGCT
GCTCCGCTCTGCTTTTGATGCTTCATCCTACTTCTTTCTCTCTAATCTACCTTTGGTTAT
GCTGTTTTGTCTAAAACTTGTCACACATACAGAAGCAGCTGCTCCCCTCTCATTTTATTT
GCACTATTTTATATATTAATATAATTTAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E045TF U 1
AF RR2E045JQ C 150
BS 1 691 RR2E045TF

RD RR2E045TF 691 0 0
GTCTCAAGGCAAAACTTGAAGAAAAGGTCAAGGAACCTCAGCTTGATCAAGAGGAGTTGA
ACAAGAAAGCTTTAGCTCCTGAAGATGAAGAAGAAGCTGTGGTGGGTCCAATGCCTTTGC
CTAAAGCTGAAGAACACATCAGCAACTACCACGGTCGTGCTTTAAGACCTGGTGAAGGAG
ACGCTATAGCACAGTATGTGCAGCAAGGGAAACGTATCCCACGTAGAGGAGAAGTTGGTC
TTAACGCTGATGAGATTCAGAGGTTTGAGGATCTTGGGTACGTCATGAGTGGGAGTAGGC
ATCAAAGGATGAATGCCATTCGTATCAGAAAGGAGAACCAGGTTTACAGTGCTGAAGACA
AACGGGCCTTGGCTATGTTTAACTATGAGGAGAAGGCCAAGCGTGAGGCTAAGGTCATGT
CTGATCTTTCCAGGCTTGTGCAGCGCCATATGGGACAAGAGTTGGGTCCCAATCATGACC
CTTTTGGTTCTGGAAAGACTGATGGACCTGATGACTGAATTGGGACATACAGAAGCTGCT
GCTCCGCTCTGCTTTTGATGCTTCATCCTACTTCTTTCTCTCTAATCTACCTTTGGTTAT
GCTGTTTTGTCTAAAACTTGTCACACATACAGAAGCAGCTGCTCCCCTCTCATTTTATTT
GCACTATTTTATATATTAATATAATTTAGCG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2E045JQ 542 0 0
CACGGTCGTGCTTTAAGACCTGGTGAAGGAGACGCTATAGCACAGTATGTGCAGCAAGGG
AAACGTATCCCACGTAGAGGAGAAGTTGGTCTTAACGCTGATGAGATTCAGAGGTTTGAG
GATCTTGGGTACGTCATGAGTGGGAGTAGGCATCAAAGGATGAATGCCATTCGTATCAGA
AAGGAGAACCAGGTTTACAGTGCTGAAGACAAACGGGCCTTGGCTATGTTTAACTATGAG
GAGAAGGCCAAGCGTGAGGCTAAGGTCATGTCTGATCTTTCCAGGCTTGTGCAGCGCCAT
ATGGGACAAGAGTTGGGTCCCAATCATGACCCTTTTGGTTCTGGAAAGACTGATGGACCT
GATGACTGAATTGGGACATACAGAAGCTGCTGCTCCGCTCTGCTTTTGATGCTTCATCCT
ACTTCTTTCTCTCTAATCTACCTTTGGTTATGCTGTTTTGTCTAAAACTTGTCACACATA
CAGAAGCAGCTGCTCCCCTCTCATTTTATTTGCACTATTTTATATATTAATATAATTTAG
CG

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

CO CL7125Contig1 820 2 2 U
GGATAGTTTCGAGTTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCGGCGGATATTATATGGCTTCGTCCG
CAGCCATCAGATCTGAAATTTACGACCGAGAAGAACGCAAGCAGCAATACCAAGCGCATA
TTCGTGGCCTAAACGCTTATGAACGGCATAAGAAGTTCTTGAAAGACTACGTTCGTTTCT
ATGGCAAGGACAAGCCGACACAAGTCAAGCTGCCCGTTAAAACGGACCACGACACACTTA
GAGAAGGATACCGGTTTATACGATCTGAAGAAGATGATTTAAACCCTTCTTGGGAGCAAA
GACTGGTGAAGCGATACTATGATAAACTTTTTAAGGAGTATCCTTTTGATACATTAAGAT
GCTTCCGATACATTTAACACCCCTGTTAGATAACTTATTCAAGTTACAACTACTTTTGTT
TTTTTATTTTGCGTTGAGAGTGTGTGGATGAGTTCATGTCTTTGTATCTCCTTGACTGAT
TTAAGATACTGTATAGCTGACATGTCACGATACAAGACTGGCCAGATGGGTTTAAGATGG
AGAACGGAAAAGGAAGTAATGTCAGGCAAAGGGCAGTTTATGTGTGGAAGCAAACAGTGT
CATTAAATAGAAGGGTTGGCGAGCTATGAGGTGAATTTTTCTTATCATGAAGCTGGTGAA
CAAAAACAAGCCCTTGTAAAACTCGTAACTTGTGAGAGATGTGCTGAGAAGCTGTATTAC
AAAAGAAGAAAGGAGGGTGAAAGATCAGAGAGTAAAGAAAAGAAAAAGCAGAAACGTAAA
CGGAATCGATCAAGCAGTGAAGATGACACAGACGAAGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F702TF U 1
AF RR2F702JQ C 134
BS 1 561 RR2F702TF
BS 562 820 RR2F702JQ

RD RR2F702TF 561 0 0
GGATAGTTTCGAGTTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCGGCGGATATTATATGGCTTCGTCCG
CAGCCATCAGATCTGAAATTTACGACCGAGAAGAACGCAAGCAGCAATACCAAGCGCATA
TTCGTGGCCTAAACGCTTATGAACGGCATAAGAAGTTCTTGAAAGACTACGTTCGTTTCT
ATGGCAAGGACAAGCCGACACAAGTCAAGCTGCCCGTTAAAACGGACCACGACACACTTA
GAGAAGGATACCGGTTTATACGATCTGAAGAAGATGATTTAAACCCTTCTTGGGAGCAAA
GACTGGTGAAGCGATACTATGATAAACTTTTTAAGGAGTATCCTTTTGATACATTAAGAT
GCTTCCGATACATTTAACACCCCTGTTAGATAACTTATTCAAGTTACAACTACTTTTGTT
TTTTTATTTTGCGTTGAGAGTGTGTGGATGAGTTCATGTCTTTGTATCTCCTTGACTGAT
TTAAGATACTGTATAGCTGACATGTCACGATACAAGACTGGCCAGATGGGTTTAAGATGG
AGAACGGAAAAGGAAGTAATG

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2F702JQ 687 0 0
CGCTTATGAACGGCATAAGAAGTTCTTGAAAGACTACGTTCGTTTCTATGGCAAGGACAA
GCCGACACAAGTCAAGCTGCCCGTTAAAACGGACCACGACACACTTAGAGAAGGATACCG
GTTTATACGATCTGAAGAAGATGATTTAAACCCTTCTTGGGAGCAAAGACTGGTGAAGCG
ATACTATGATAAACTTTTTAAGGAGTATCCTTTTGATACATTAAGATGCTTCCGATACAT
TTAACACCCCTGTTAGATAACTTATTCAAGTTACAACTACTTTTGTTTTTTTATTTTGCG
TTGAGAGTGTGTGGATGAGTTCATGTCTTTGTATCTCCTTGACTGATTTAAGATACTGTA
TAGCTGACATGTCACGATACAAGACTGGCCAGATGGGTTTAAGATGGAGAACGGAAAAGG
AAGTAATGTCAGGCAAAGGGCAGTTTATGTGTGGAAGCAAACAGTGTCATTAAATAGAAG
GGTTGGCGAGCTATGAGGTGAATTTTTCTTATCATGAAGCTGGTGAACAAAAACAAGCCC
TTGTAAAACTCGTAACTTGTGAGAGATGTGCTGAGAAGCTGTATTACAAAAGAAGAAAGG
AGGGTGAAAGATCAGAGAGTAAAGAAAAGAAAAAGCAGAAACGTAAACGGAATCGATCAA
GCAGTGAAGATGACACAGACGAAGAGG

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL7126Contig1 774 2 2 U
GGAGGGGCCAGATTTCGTGTGCATCATCTTACCTACTCGCACCTTCTTCCCAACTTATTG
CTGCCGCCTGCGATCGATCTGAGCTTAGTTTCGCCGGAGGATCGGTCACTGCTACGAGAA
TTTTGACGGAGAAGAGAAGATGAAGATATTTGTGAAAACTCTCAAGGGGACTCACTTCGC
GATCGAAGTAAAACCTGAGGATTCGGTAGCTGATGTGAAGAAGAACATAGAGACTGTGCA
GGGAGCAGACGTTTATCCTGCTGCCAAACTGATGCTTATTCACCAAGGGAAAGTGCTTAA
AGATGAGACCACCATTGAGGAGAACAAGGTTGCTGAGAACAGTTTTATTGTCATTATGAT
GGCCAAGAGTAAACCTGCCTCAGCTGGAGCGTCTAGTGCATCTGCTGCCACTTCAGTGCT
GGCTAAGTCGTTGCCTACCTCATCAACTCAGCCTTCAGCTTCCCCTCAGCCTCCAGCTTC
TGTAGCAATTCCAGTTGCAACTGCACCAACGCCTGCAGCTGCCACTGAAACTGTGGCTGC
ACCTGAATCTGTTTCTGCTACTCCACCAGCAAGCACTCCCGCACCCGAATCAACTCCTGC
AGGATCTCAGGGTGATGTCTACGGACAAGCAGCATCCAACCTGGCCGCTGGGAGTAATTT
AGAGAGTACCATTCTGCAGATTCTGGACATGGGCGGAGGAGCCTGGGATCGGGACACTGT
TGTCCGTGCACTCCGTGCTGCATTTAACAACCCTGAAAGAGCTGTGGAATATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D021TF U 1
AF RR2GR11TF U 55
BS 1 598 RR2D021TF
BS 599 774 RR2GR11TF

RD RR2D021TF 598 0 0
GGAGGGGCCAGATTTCGTGTGCATCATCTTACCTACTCGCACCTTCTTCCCAACTTATTG
CTGCCGCCTGCGATCGATCTGAGCTTAGTTTCGCCGGAGGATCGGTCACTGCTACGAGAA
TTTTGACGGAGAAGAGAAGATGAAGATATTTGTGAAAACTCTCAAGGGGACTCACTTCGC
GATCGAAGTAAAACCTGAGGATTCGGTAGCTGATGTGAAGAAGAACATAGAGACTGTGCA
GGGAGCAGACGTTTATCCTGCTGCCAAACTGATGCTTATTCACCAAGGGAAAGTGCTTAA
AGATGAGACCACCATTGAGGAGAACAAGGTTGCTGAGAACAGTTTTATTGTCATTATGAT
GGCCAAGAGTAAACCTGCCTCAGCTGGAGCGTCTAGTGCATCTGCTGCCACTTCAGTGCT
GGCTAAGTCGTTGCCTACCTCATCAACTCAGCCTTCAGCTTCCCCTCAGCCTCCAGCTTC
TGTAGCAATTCCAGTTGCAACTGCACCAACGCCTGCAGCTGCCACTGAAACTGTGGCTGC
ACCTGAATCTGTTTCTGCTACTCCACCAGCAAGCACTCCCGCACCCGAATCAACTCCT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2GR11TF 720 0 0
GG
ATTGCTGCCGCCTGCGATCGATCTGAGCTTAGTTTCGCCGGAGGATCGGTCACTGCTACG
AGAATTTTGACGGAGAAGAGAAGATGAAGATATTTGTGAAAACTCTCAAGGGGACTCACT
TCGCGATCGAAGTAAAACCTGAGGATTCGGTAGCTGATGTGAAGAAGAACATAGAGACTG
TGCAGGGAGCAGACGTTTATCCTGCTGCCAAACTGATGCTTATTCACCAAGGGAAAGTGC
TTAAAGATGAGACCACCATTGAGGAGAACAAGGTTGCTGAGAACAGTTTTATTGTCATTA
TGATGGCCAAGAGTAAACCTGCCTCAGCTGGAGCGTCTAGTGCATCTGCTGCCACTTCAG
TGCTGGCTAAGTCGTTGCCTACCTCATCAACTCAGCCTTCAGCTTCCCCTCAGCCTCCAG
CTTCTGTAGCAATTCCAGTTGCAACTGCACCAACGCCTGCAGCTGCCACTGAAACTGTGG
CTGCACCTGAATCTGTTTCTGCTACTCCACCAGCAAGCACTCCCGCACCCGAATCAACTC
CTGCAGGATCTCAGGGTGATGTCTACGGACAAGCAGCATCCAACCTGGCCGCTGGGAGTA
ATTTAGAGAGTACCATTCTGCAGATTCTGGACATGGGCGGAGGAGCCTGGGATCGGGACA
CTGTTGTCCGTGCACTCCGTGCTGCATTTAACAACCCTGAAAGAGCTGTGGAATATCT

QA 3 720 3 720
DS 



AS 1 2

CO CL7127Contig1 785 2 6 U
ATCTCTCTGCTACGTTGCAAAAATGGGCTAATAGCGATTGGCTTGTAGCTTCCATCGCAT
TCGTCTTGGTCGTGTTCTTCATCTCTTTTTTCTTAGATCCCACGGTCCCCTTCTTCTTTG
ACAGATCTAAGATCATTACATCCCCAACTAATCTGGTCAAACTCAAGATGCCTCACAGAT
GAATGTTCTGCATGGTTTTCGCAGCTCTCTGATGGATGCCATAGGGAAATTCAATCAGAA
CAAAGCTGGTGGAATGTTCATAGATTCATGCTTCATTCATTGCCAGACAGTTACGCCAGG
GACATGGCACTCCCCAACCTCAACAAGAATCGAAAATAAGACAATTGCAGAGTCTGTAGG
TGATTGGTACTTCAACCGAAAACCGGTTAAGCTAATTGATTGTCCTTACCCTTGCAATCC
CTCTTGTCCCAACTTGAAGTTCACCTGAACTTGCCTTATAGCTGCACTGACCAACTACTT
TGCTTCACTTGAGGAGCACAGCCATTTCCTCGAATTCACAATCAGGTTGAGTCTCAAAAG
GGTTTTCATGTTCTCGAAGCATGTGATGAAGATAATATCTAGAGGCTTTCGCCTGCTTTG
TATAATAAAGTAGTTGATTGATCATCGAGAAACATTTTATTACGAAAGCAGCGTGATTCA
CAGTTCATATTGGCATATTTTTCCACGTTGGGATCTTCTGAGATTGCATATGTATATATA
TATTTGTGATCATAATGTACTGAAACAAGGTTGGCTTTTATGTGTAAAGAAGTTCCAGAG
TTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2C682TF U 1
AF RR2C682JQ C 129
BS 1 525 RR2C682TF
BS 526 526 RR2C682JQ
BS 527 664 RR2C682TF
BS 665 665 RR2C682JQ
BS 666 679 RR2C682TF
BS 680 785 RR2C682JQ

RD RR2C682TF 679 0 0
ATCTCTCTGCTACGTTGCAAAAATGGGCTAATAGCGATTGGCTTGTAGCTTCCATCGCAT
TCGTCTTGGTCGTGTTCTTCATCTCTTTTTTCTTAGATCCCACGGTCCCCTTCTTCTTTG
ACAGATCTAAGATCATTACATCCCCAACTAATCTGGTCAAACTCAAGATGCCTCACAGAT
GAATGTTCTGCATGGTTTTCGCAGCTCTCTGATGGATGCCATAGGGAAATTCAATCAGAA
CAAAGCTGGTGGAATGTTCATAGATTCATGCTTCATTCATTGCCAGACAGTTACGCCAGG
GACATGGCACTCCCCAACCTCAACAAGAATCGAAAATAAGACAATTGCAGAGTCTGTAGG
TGATTGGTACTTCAACCGAAAACCGGTTAAGCTAATTGATTGTCCTTACCCTTGCAATCC
CTCTTGTCCCAACTTGAAGTTCACCTGAACTTGCCTTATAGCTGCACTGACCAACTACTT
TGCTTCACTTGAGGAGCACAGCCATTTCCTCGAATTCACAATCAG*TTGAGTCTCAAAAG
GGTTTTCATGTTCTCGAAGCATGTGATGAAGATAATATCTAGAGGCTTTCGCCTGCTTTG
TATAATAAAGTAGTTGATTGATCATCGAGAAACATTTTATTACGAAAGCAGCGTGATTCA
CAGT*CATATTGGCATATT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2C682JQ 657 0 0
AAGATCATTACATCCCCAACTAATCTGGTCAAACTCAAGATGCCTCACAGATGAATGTTC
TGCATGGTTTTCGCAGCTCTCTGATGGATGCCATAGGGAAATTCAATCAGAACAAAGCTG
GTGGAATGTTCATAGATTCATGCTTCATTCATTGCCAGACAGTTACGCCAGGGACATGGC
ACTCCCCAACCTCAACAAGAATCGAAAATAAGACAATTGCAGAGTCTGTAGGTGATTGGT
ACTTCAACCGAAAACCGGTTAAGCTAATTGATTGTCCTTACCCTTGCAATCCCTCTTGTC
CCAACTTGAAGTTCACCTGAACTTGCCTTATAGCTGCACTGACCAACTACTTTGCTTCAC
TTGAGGAGCACAGCCATTTCCTCGAATTCACAATCAGGTTGAGTCTCAAAAGGGTTTTCA
TGTTCTCGAAGCATGTGATGAAGATAATATCTAGAGGCTTTCGCCTGCTTTGTATAATAA
AGTAGTTGATTGATCATCGAGAAACATTTTATTACGAAAGCAGCGTGATTCACAGTTCAT
ATTGGCATATTTTTCCACGTTGGGATCTTCTGAGATTGCATATGTATATATATATTTGTG
ATCATAATGTACTGAAACAAGGTTGGCTTTTATGTGTAAAGAAGTTCCAGAGTTAAA

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL7128Contig1 707 2 2 U
GGTAAAACAGCAAAGCAAAAGAGAATAAAGAGGAAACAGAGTACAGTTGGCGTAGTCACA
GAGAAAAGGAGTAGGTGGATGGAGCATGTGCCAGGATCGTTCGGCACCAGCGCCAGCTTC
GCTCTTCGTTTCGGCCAAATCATATTCTCCTCCGCTTCTCTCATCTTCATGTGCTTGGAT
TACGACTTCTATGACTTCACTACCTTCTGCTATTTGACGACTGTGATGGCTTTCGTAACT
CCATGGAGCATCTCACTTGCACTGGCCGATACATACTCTGTTTTACTGAAACAACTTCCT
CACGAACCAAGACTCCTGTCCATGGTTCTCGCCGGTGATATCGTAATGTCGTTTCTTTCA
CTGGGTGGTGCTTGTGGTGTAGCCAGTGCAACTGAGCTGCTTTCGTCTATGGGTGCACCT
ATATGCGGTGATAACCTCTGTAGCCAATACCAAGTCTCGGCTACATTGGCTTTCTTGTGT
TGGTTTCTGTTACTTGCTTCAGCTCTTTTCAATCTTTGGAGTTTACCTTCGTTATTATAC
TGACATGGCTTACATTACATATATAGATAGGAGTCATAATAACAACAATCATAGAACATG
AATGTACATTGACATTTCCTTTACTCAAGAACATATTCCGTTAGTGTAAAGTAAATTATA
CCAGCTTTATATACACACACGTTATAAATAAAAGTAAACCATAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AC39TF U 1
AF RR2AC39JQ C 156
BS 1 705 RR2AC39TF
BS 706 707 RR2AC39JQ

RD RR2AC39TF 705 0 0
GGTAAAACAGCAAAGCAAAAGAGAATAAAGAGGAAACAGAGTACAGTTGGCGTAGTCACA
GAGAAAAGGAGTAGGTGGATGGAGCATGTGCCAGGATCGTTCGGCACCAGCGCCAGCTTC
GCTCTTCGTTTCGGCCAAATCATATTCTCCTCCGCTTCTCTCATCTTCATGTGCTTGGAT
TACGACTTCTATGACTTCACTACCTTCTGCTATTTGACGACTGTGATGGCTTTCGTAACT
CCATGGAGCATCTCACTTGCACTGGCCGATACATACTCTGTTTTACTGAAACAACTTCCT
CACGAACCAAGACTCCTGTCCATGGTTCTCGCCGGTGATATCGTAATGTCGTTTCTTTCA
CTGGGTGGTGCTTGTGGTGTAGCCAGTGCAACTGAGCTGCTTTCGTCTATGGGTGCACCT
ATATGCGGTGATAACCTCTGTAGCCAATACCAAGTCTCGGCTACATTGGCTTTCTTGTGT
TGGTTTCTGTTACTTGCTTCAGCTCTTTTCAATCTTTGGAGTTTACCTTCGTTATTATAC
TGACATGGCTTACATTACATATATAGATAGGAGTCATAATAACAACAATCATAGAACATG
AATGTACATTGACATTTCCTTTACTCAAGAACATATTCCGTTAGTGTAAAGTAAATTATA
CCAGCTTTATATACACACACGTTATAAATAAAAGTAAACCATAAA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2AC39JQ 552 0 0
TTCTCTCATCTTCATGTGCTTGGATTACGACTTCTATGACTTCACTACCTTCTGCTATTT
GACGACTGTGATGGCTTTCGTAACTCCATGGAGCATCTCACTTGCACTGGCCGATACATA
TTCTGTTTTACTGAAACAACTTCCTCACGAACCAAGACTCCTGTCCATGGTTCTCGCCGG
TGATATCGTAATGTCGTTTCTTTCACTGGGTGGTGCTTGTGGTGTAGCCAGTGCAACTGA
GCTGCTTTCGTCTATGGGTGCACCTATATGCGGTGATAACCTCTGTAGCCAATACCAAGT
TTCGGCTACATTGGCTTTCTTGTGTTGGTTTCTGTTACTTGCTTCAGCTCTTTTCAATCT
TTGGAGTTTACCTTCGTTATTATACTGACATGGCTTACATTACATATATAGATAGGAGTC
ATAATAACAACAATCATAGAACATGAATGTACATTGACATTTCCTTTACTCAAGAACATA
TTCCGTTAGTGTAAAGTAAATTATACCAGCTTTATATACACACACGTTATAAATAAAAGT
AAACCATAAACC

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL7129Contig1 609 2 1 U
GAGAGGAATATAATGTTATTGAGAGGGATTTGGAACAAGCAGGTGAAGAAGAATCTCTTA
TCCTAGAAGGTGATGTAGGTGGTGGACTGGTTCTTCGGCGTAAAATCGCAATACCTAAAG
ATAATCCCCGACTTGTTCAAATTGCCTCTAGCATTGAAGCCCGTAGTGTTGGTGCTGGTT
CTGGTGGATTTTCAAGGCTGGTATGCTTAAGAGTCCATCCAACTTTCGGTCTTATGCATC
CGACGGAATCGTTTGTCTCGTTCACATCGATTGATGGTACAAAGCATGAAGTTTGGCCAG
ACTCTGGAGAGCAATTATATGAAGGGAACAACCTCCCACATGGTGAATGGATGTTGGTAG
ATAAGAGCCTCAATCTAGGGCTGGTAAACAGGTTCGACGTTAGTCAGGTCTTCAAATGTA
GTGTCCACTGGGACTGTGGAACCGTTAACTTGGAGTTATGGTCTGAAGACAGACCTGTTT
CCAAGGAATCACCTCTGAAAATAGAGCATGAATATGAAGTCACAAGTTTCCCATAATTGT
GTTGGGTTATATGTATTTACGATATCAACTCATTACCCTGTTCTAGTTGACTACTTGGGG
ATTGTGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DA81TF U 1
AF RR2DA81JQ C 63
BS 1 609 RR2DA81TF

RD RR2DA81TF 609 0 0
GAGAGGAATATAATGTTATTGAGAGGGATTTGGAACAAGCAGGTGAAGAAGAATCTCTTA
TCCTAGAAGGTGATGTAGGTGGTGGACTGGTTCTTCGGCGTAAAATCGCAATACCTAAAG
ATAATCCCCGACTTGTTCAAATTGCCTCTAGCATTGAAGCCCGTAGTGTTGGTGCTGGTT
CTGGTGGATTTTCAAGGCTGGTATGCTTAAGAGTCCATCCAACTTTCGGTCTTATGCATC
CGACGGAATCGTTTGTCTCGTTCACATCGATTGATGGTACAAAGCATGAAGTTTGGCCAG
ACTCTGGAGAGCAATTATATGAAGGGAACAACCTCCCACATGGTGAATGGATGTTGGTAG
ATAAGAGCCTCAATCTAGGGCTGGTAAACAGGTTCGACGTTAGTCAGGTCTTCAAATGTA
GTGTCCACTGGGACTGTGGAACCGTTAACTTGGAGTTATGGTCTGAAGACAGACCTGTTT
CCAAGGAATCACCTCTGAAAATAGAGCATGAATATGAAGTCACAAGTTTCCCATAATTGT
GTTGGGTTATATGTATTTACGATATCAACTCATTACCCTGTTCTAGTTGACTACTTGGGG
ATTGTGTAC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2DA81JQ 547 0 0
CTAGAAGGTGATGTAGGTGGTGGACTGGTTCTTCGGCGTAAAATCGCAATACCTAAAGAT
AATCCCCGACTTGTTCAAATTGCCTCTAGCATTGAAGCCCGTAGTGTTGGTGCTGGTTCT
GGTGGATTTTCAAGGCTGGTATGCTTAAGAGTCCATCCAACTTTCGGTCTTATGCATCCG
ACGGAATCGTTTGTCTCGTTCACATCGATTGATGGTACAAAGCATGAAGTTTGGCCAGAC
TCTGGAGAGCAATTATATGAAGGGAACAACCTCCCACATGGTGAATGGATGTTGGTAGAT
AAGAGCCTCAATCTAGGGCTGGTAAACAGGTTCGACGTTAGTCAGGTCTTCAAATGTAGT
GTCCACTGGGACTGTGGAACCGTTAACTTGGAGTTATGGTCTGAAGACAGACCTGTTTCC
AAGGAATCACCTCTGAAAATAGAGCATGAATATGAAGTCACAAGTTTCCCATAATTGTGT
TGGGTTATATGTATTTACGATATCAACTCATTACCCTGTTCTAGTTGACTACTTGGG*AT
TGTGTAC

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 2

CO CL7130Contig1 567 2 1 U
GGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAGAAGAAAGATGAACAAGAAGGAGATCTTCAAGCTAGCG
AAGGGCTTCAGGGGAAGAGCGAAGAACTGCATAAGAATCGCGAGGGAGAGAGTGGAGAAA
GCTCTTCAGTACTCTTACAGAGACAGACGCAACAAGAAGCGTGAGATGAGAGGTCTCTGG
ATCGAGCGTATCAACGCCGGCTCTCGTCAGCACGGAGTGAACTACGGTAATTTTATCCAC
GGACTGATGAAGGAGAACATCCAGCTGAACCGGAAAGTCCTCTCTGAGCTGTCTATGCAT
GAGCCTTACAGCTTCAAAGCACTCGTGGACGTCTCCCGCAACTCATTCCCTGGAAACAAA
CACGTGGTCCAAGCGTCTCGGAAAGTGGACGTTTCATCTATCAATGCCTAGTTTATTAGG
ACCAAGTTAGTTTCATTCTCTACCTTCTTTATTCTCTTTCAAACAGAAACAGAAACACAA
TAATACCATTTTGTTATTTGTCTGAATCAAATGTATGCCGGCCCGCCCGGTGATTACTAT
TAAAGTTTTTTTGCATATTTTGAAAAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BG55JQ C 1
AF RR2BG55TF U 1
BS 1 567 RR2BG55TF

RD RR2BG55JQ 567 0 0
GGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAGAAGAAAGATGAACAAGAAGGAGATCTTCAAGCTAGCG
AAGGGCTTCAGGGGAAGAGCGAAGAACTGCATAAGAATCGCGAGGGAGAGAGTGGAGAAA
GCTCTTCAGTACTCTTACAGAGACAGACGCAACAAGAAGCGTGAGATGAGAGGTTTCTGG
ATCGAGCGTATCAACGCCGGCTCTCGTCAGCACGGAGTGAACTACGGTAATTTTATCCAC
GGACTGATGAAGGAGAACATCCAGCTGAACCGGAAAGTCCTCTCTGAGCTGTCTATGCAT
GAGCCTTACAGCTTCAAAGCACTCGTGGACGTCTCCCGCAACTCATTCCCTGGAAACAAA
CACGTGGTCCAAGCGTCTCGGAAAGTGGACGTTTCATCTATCAATGCCTAGTTTATTAGG
ACCAAGTTAGTTTCATTCTCTACCTTCTTTATTCTCTTTCAAACAGAAACAGAAACACAA
TAATACCATTTTGTTATTTGTCTGAATCAAATGTATGCCGGCCCGCCCGGTGATTACTAT
TAAAGTTTTTTTGCATATTTTGAAAAC

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2BG55TF 567 0 0
GGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAGAAGAAAGATGAACAAGAAGGAGATCTTCAAGCTAGCG
AAGGGCTTCAGGGGAAGAGCGAAGAACTGCATAAGAATCGCGAGGGAGAGAGTGGAGAAA
GCTCTTCAGTACTCTTACAGAGACAGACGCAACAAGAAGCGTGAGATGAGAGGTCTCTGG
ATCGAGCGTATCAACGCCGGCTCTCGTCAGCACGGAGTGAACTACGGTAATTTTATCCAC
GGACTGATGAAGGAGAACATCCAGCTGAACCGGAAAGTCCTCTCTGAGCTGTCTATGCAT
GAGCCTTACAGCTTCAAAGCACTCGTGGACGTCTCCCGCAACTCATTCCCTGGAAACAAA
CACGTGGTCCAAGCGTCTCGGAAAGTGGACGTTTCATCTATCAATGCCTAGTTTATTAGG
ACCAAGTTAGTTTCATTCTCTACCTTCTTTATTCTCTTTCAAACAGAAACAGAAACACAA
TAATACCATTTTGTTATTTGTCTGAATCAAATGTATGCCGGCCCGCCCGGTGATTACTAT
TAAAGTTTTTTTGCATATTTTGAAAAC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL7131Contig1 543 2 1 U
GGATCTTATCATTTCGATCTTTCCGGAAAAAAAAAATTCGATTCCGAGAGCGAGAAAAAA
AATGGAGTTCACGGCAGAGCAGCTTAGCCAGTACAACGGGACGGACTCGTCGAAGCCGAT
CTACGTGGCGATCAAGGGCCGAGTATTCGACGTCACCACCGGCAGATCCTTCTACGGTCC
CGGAGGCGATTACGCGATATTCGCGGGAAAAGACGCGAGCAGAGCCCTGGGAAAGATGAG
CAAGAACGAAGAAGACGTATCTCCTTCCCTCGAAGGTCTCACCGAGAAGGAGATGAGCAC
TCTTAATGATTGGGAGACGAAGTTTGAGGCTAAGTATCCCGTCGTTGGCCGCGTTGTCTC
CTAAGGTCAATCAAATCGTTACGATCTCTCTGGTTTGTAACTATGGTGTGTGAGGATCTG
TGTGTTTGTGTTTTCGTGTTTGATCTTATCGTTTGATGACGATTCGAAATATAATAATGT
AATAAATTGGTGTTTCTTCTTACTCTTTAACCTAATGTAATAAATGAAATCATCCTGGAG
TTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RR2AZ05JQ C 1
AF RR2AZ05TFB U 1
BS 1 543 RR2AZ05TFB

RD RR2AZ05JQ 543 0 0
GGATCTTATCATTTCGATCTTTCCGGAAAAAAAAAATTCGATTCCGAGAGCGAGAAAAAA
AATGGAGTTCACGGCAGAGCAGCTTAGCCAGTACAACGGGACGGACTCGTCGAAGCCGAT
CTACGTGGCGATCAAGGGCCGAGTATTCGACGTCACCACCGGCAGATCCTTCTACGGTCC
CGGAGGCGATTACGCGATATTCGCGGGAAAAGACGCGAGCAGAGCCCTGGGAAAGATGAG
CAAGAACGAAGAAGACGTATCTCCTTCCCTCGAAGGTCTCACCGAGAAGGAGATGAGCAC
TCTTAATGATTGGGAGACGAAGTTTGAGGCTAAGTATCCCGTCGTTGGCCGCGTTGTCTC
CTAAGGTCAATCAAATCGTTACGATCTCTCTGGTTTGTAACTATGGTGTGTGAGGATCTG
TGTGTTTGTGTTTTCGTGTTTGATCTTATCGTTTGATGACGATTCGAAATATAATAATGT
AATAAATTGGTGTTTCTTCTTACTCTTTAACCTAATGTAATAAATGAAATCATCCTGGAG
TTT

QA 1 543 1 543
DS 

RD RR2AZ05TFB 543 0 0
GGATCTTATCATTTCGATCTTTCCGGAAAAAAAAAATTCGATTCCGAGAGCGAGAAAAAA
AATGGAGTTCACGGCAGAGCAGCTTAGCCAGTACAACGGGACGGACTCGTCGAAGCCGAT
CTACGTGGCGATCAAGGGCCGAGTATTCGACGTCACCACCGGCAGATCCTTCTACGGTCC
CGGAGGCGATTACGCGATATTCGCGGGAAAAGACGCGAGCAGAGCCCTGGGAAAGATGAG
CAAGAACGAAGAAGACGTATCTCCTTCCCTCGAAGGTCTCACCGAGAAGGAGATGAGCAC
TCTTAATGATTGGGAGACGAAGTTTGAGGCTAAGTATCCCGTCGTTGGCCGCGTTGTCTC
CTAAGGTCAATCAAATCGTTACGATCTCTCTGGTTTGTAACTATGGTGTGTGAGGATCTG
TGTGTTTGTGTTTTCGTGTTTGATCTTATCGTTTGATGACGATTCGAAATATAATAATGT
AATAAATTGGTGTTTCTTCTTACTCTTTAACCTAATGTAATAAATGAAATCATCCTGGAG
TTT

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL7132Contig1 959 2 2 U
TTTTTAATCGATCTCGCTAATGGGGGATTATGGGTATCTATCGGATACAGACGATTCAGC
AGTGGAAGAGCTGATATCGCAAGCGAAGGAGCTTTCGGCTTTGGAGCAAATAGCAGCCAT
CAACTGTTCTGCCTTCACCGACGACTCCTCTACTCTTCCCCATGATCTCGAATCTCGTTT
CCGTCGCCTCAAAACTCTTCCTCCCGCTCGACCCGACCCGGTTTCGTCTAAGGTTAGTAA
CAAGAATCTCACCCACTCCAAGAGCGTGGCGACTAGTTACCCAAAGGACCCAGATTTATC
TGGAAACCCAGTTAAAAAATCTGGTTCTGATGAACCGGGTTTTGAGAGAAGCTCACGAGC
TGGGGGGATTGACTCTGATGGAAGTGGAGACTTCTCTTCAGCTAAACGAGCCCAGAAGCT
TTCTAAAGAGAAACGAAGAGCCGTTTCATCATCATCATCTTCTGTTGATTTAGCGACACC
ACCCTCGTCATCTGATTCAGAACCGGAGAAGAAATCGAAGTCGAAATCAAGCTCATGGGT
TAAGAAGTTGTCTCCATCGAAGATCATTGGATACATTTGGTCTTCTCCGAACAAATCATC
GTCCGCCAAGAAGAAGAACATCAAGAGCATCAAATCGTTTAGTCGCGACAGAGATGTTGA
TTTCGACGAGTTTTTGTCGGATCTAAATGCATATTCTGTCGAGGATCAAAGGAAGATGCT
TAAGAAAGCACTCAAGGAACAGCAGAAGATGCGCAAAGAAGCTGCTCAGATCATCAAAAT
GACCAGAAAGGCATTTGCTAGATTTGATTTTGATGATTAAAGATTCGCCTTGTTGTTTTG
AGTTTGGAAGAAAGCTAGCAGTTACTTTACCAAAAAATAATTTAAATTTACCAAGTATAA
ATAAGTTCTCCTTTTAATTAATAGTATTATTATGTATCAATGATTATTCGTTTCTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DY24TF U 1
AF RR2DY24JQ C 493
BS 1 586 RR2DY24TF
BS 587 959 RR2DY24JQ

RD RR2DY24TF 586 0 0
TTTTTAATCGATCTCGCTAATGGGGGATTATGGGTATCTATCGGATACAGACGATTCAGC
AGTGGAAGAGCTGATATCGCAAGCGAAGGAGCTTTCGGCTTTGGAGCAAATAGCAGCCAT
CAACTGTTCTGCCTTCACCGACGACTCCTCTACTCTTCCCCATGATCTCGAATCTCGTTT
CCGTCGCCTCAAAACTCTTCCTCCCGCTCGACCCGACCCGGTTTCGTCTAAGGTTAGTAA
CAAGAATCTCACCCACTCCAAGAGCGTGGCGACTAGTTACCCAAAGGACCCAGATTTATC
TGGAAACCCAGTTAAAAAATCTGGTTCTGATGAACCGGGTTTTGAGAGAAGCTCACGAGC
TGGGGGGATTGACTCTGATGGAAGTGGAGACTTCTCTTCAGCTAAACGAGCCCAGAAGCT
TTCTAAAGAGAAACGAAGAGCCGTTTCATCATCATCATCTTCTGTTGATTTAGCGACACC
ACCCTCGTCATCTGATTCAGAACCGGAGAAGAAATCGAAGTCGAAATCAAGCTCATGGGT
TAAGAAGTTGTCTCCATCGAAGATCATTGGATACATTTGGTCTTCT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2DY24JQ 467 0 0
TGATTCAGAACCGGAGAAGAAATCGAAGTCGAAATCAAGCTCATGGGTTAAGAAGTTGTC
TCCATCGAAGATCATTGGATACATTTGGTCTTCTCCGAACAAATCATCGTCCGCCAAGAA
GAAGAACATCAAGAGCATCAAATCGTTTAGTCGCGACAGAGATGTTGATTTCGACGAGTT
TTTGTCGGATCTAAATGCATATTCTGTCGAGGATCAAAGGAAGATGCTTAAGAAAGCACT
CAAGGAACAGCAGAAGATGCGCAAAGAAGCTGCTCAGATCATCAAAATGACCAGAAAGGC
ATTTGCTAGATTTGATTTTGATGATTAAAGATTCGCCTTGTTGTTTTGAGTTTGGAAGAA
AGCTAGCAGTTACTTTACCAAAAAATAATTTAAATTTACCAAGTATAAATAAGTTCTCCT
TTTAATTAATAGTATTATTATGTATCAATGATTATTCGTTTCTGTTT

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 2

CO CL7133Contig1 709 2 9 U
TCCTCCGATGAATTCCCCTTGTGCGACACCGACATCATCTCGGGATGCGAGAAAGAGCTT
GCAGAGGCTCAGAAAGGCCAAGACGAAGGGTTTAAGAAGGAATCCATCATGCGTCTCTCA
TGGGCCCTTGTTCACTCCAAGGTGCCTGCGGATATTCAGCGTGGGATAGCAATGCTTGAA
GGTTCGGTGGTTAGTGATACAAGTCCAATGACACTAAGGGAGAAGCTATATCTCCTTGCT
ATTGGATACTATCGAAGCGGTGACTTTTCGAGAAGTCGGGATTATATAGAACGGTGTTTG
GAGGTTTGATCATCTCTTTATCCATGGATTAGTCTAGAGTATCTTATTGTTGTTGCTGTT
GATGTATTCATAAGTACGCTCTCTTTTTGGTTTTTTTAGGTTGAACCGGAGTGGAGACAG
GCTCAGACGCTAAGAACGGCTATAGAGGACCGTATTGTGAAAGATGGTGTTATTGGCGTT
GGAATCGCTGTTACTGCTGTTGGGGTTGTTGCTGGTGTTGCTGCAGCCTTGTTACGCAGA
GGCTGAGAAGAAAAGAACCCGTCGTACCTGTGCATGTTTCCCTGATCTTCAGTGCTTGGA
AGAATGTATTTACTAAAGAAAAGGCTTGGAAGAATGTTTTATTTATTAAAGGAAAACAAA
TAAGTTGTAATTCCAATCTTATTATGAATATAGAGAAACAGCATTACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BZ45TF U 1
AF RR2BZ45JQ C 149
BS 1 623 RR2BZ45TF
BS 624 624 RR2BZ45JQ
BS 625 655 RR2BZ45TF
BS 656 656 RR2BZ45JQ
BS 657 687 RR2BZ45TF
BS 688 688 RR2BZ45JQ
BS 689 697 RR2BZ45TF
BS 698 698 RR2BZ45JQ
BS 699 709 RR2BZ45TF

RD RR2BZ45TF 709 0 0
TCCTCCGATGAATTCCCCTTGTGCGACACCGACATCATCTCGGGATGCGAGAAAGAGCTT
GCAGAGGCTCAGAAAGGCCAAGACGAAGGGTTTAAGAAGGAATCCATCATGCGTCTCTCA
TGGGCCCTTGTTCACTCCAAGGTGCCTGCGGATATTCAGCGTGGGATAGCAATGCTTGAA
GGTTCGGTGGTTAGTGATACAAGTCCAATGACACTAAGGGAGAAGCTATATCTCCTTGCT
ATTGGATACTATCGAAGCGGTGACTTTTCGAGAAGTCGGGATTATATAGAACGGTGTTTG
GAGGTTTGATCATCTCTTTATCCATGGATTAGTCTAGAGTATCTTATTGTTGTTGCTGTT
GATGTATTCATAAGTACGCTCTCTTTTTGGTTTTTTTAGGTTGAACCGGAGTGGAGACAG
GCTCAGACGCTAAGAACGGCTATAGAGGACCGTATTGTGAAAGATGGTGTTATTGGCGTT
GGAATCGCTGTTACTGCTGTTGGGGTTGTTGCTGGTGTTGCTGCAGCCTTGTTACGCAGA
GGCTGAGAAGAAAAGAACCCGTCGTACCTGTGCATGTTTCCCTGATCTTCAGTGCTTGGA
AGAATGTATTTACTAAAGAAAAG*CTTGGAAGAATGTTTTATTTATTAAAGGAAA*CAAA
TAAGTTGTAATTCCAATCTTATTATGA*TATAGAGAA*CAGCATTACTG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2BZ45JQ 561 0 0
CGGATATTCAGCGTGGGATAGCAATGCTTGAAGGTTCGGTGGTTAGTGATACAAGTCCAA
TGACACTAAGGGAGAAGCTATATCTCCTTGCTATTGGATACTATCGAAGCGGTGACTTTT
CGAGAAGTCGGGATTATATAGAACGGTGTTTGGAGGTTTGATCATCTCTTTATCCATGGA
TTAGTCTAGAGTATCTTATTGTTGTTGCTGTTGATGTATTCATAAGTACGCTCTCTTTTT
GGTTTTTTTAGGTTGAACCGGAGTGGAGACAGGCTCAGACGCTAAGAACGGCTATAGAGG
ACCGTATTGTGAAAGATGGTGTTATTGGCGTTGGAATCGCTGTTACTGCTGTTGGGGTTG
TTGCTGGTGTTGCTGCAGCCTTGTTACGCAGAGGCTGAGAAGAAAAGAACCCGTCGTACC
TGTGCATGTTTCCCTGATCTTCAGTGCTTGGAAGAATGTATTTACTAAAGAAAAGGCTTG
GAAGAATGTTTTATTTATTAAAGGAAAACAAATAAGTTGTAATTCCAATCTTATTATGAA
TATAGAGAAACAGCATTACTG

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL7134Contig1 979 2 4 U
GGCTCGACACTTTGAAAAAAAATTACAAAGAGTTCTTCTCCTCTCAATTTCCACCATCAT
TCATTCGTCAAAGATGAAGGAACAAACAGCGAGAAAGATACCACGACCTCGGCCTCTCGA
GACCTGCGGTGCTACCATACTCTCCATGTCACGCGTCGTCTACGCAAGAACCAAGAATCC
GAACAATCCAGCCTCTTTCCTTGTGCAGAGACTCTTCCAACTCCTTTCCTTCTTCGCGTC
CATGACAAGTCCCTTCCACCGTCACATCCTCGCCATCCTCTCCGTAGCCGACGACCACAT
CCTCGCAATCGAGGCTTACTTCCCTTCGACCACCTTCCTCTTCAGCAAGGTCTCCGGTTG
GCTAAACGCAGCAGAGCATCTGCCCATGAAATTCGACGTGTTTCTTGAGAAACTTCCAAG
AACGATGAACAGAACCGCGTGTGTGGACATGATCCTGGTCCAAGCGCTTTGTTGGGTTGA
TTCTCTCGTGAACGTGATAGGTCGTTGGAGAGACAAGAACAGGGGGACGAACGAGAAAGA
GATCACGATGGATGGCAGTTTCAGCAGAACTGGATCGATGTCTGAAGAAGAGATGAAACT
GGGGAATGATGGTAAAAGAGTGAGTTACAAGGAGGCGTTGCAGAGAGGAAGCAGCGGTGA
AGATGGTGGAGGAAGCACCGGTCGCAGCAGCAGCAACCACGGGGATCCTATCTTGGATCT
GTTTGAGAATGGTTGGATCCAGAAGCCCATGAAAAGAAGTAGCAGAAGCGCCGATTCGCT
CACATGCTCTCGTTCTGATTCCTTCGAGACCAGCACCTGAGAGAGGTCTTTAACTCTCAT
TTTTCTTGTAGCTATATATACGACGGATATGGTTCAACAACCACACTAACACCAACTAGT
AGACTATGTTGTCCTACTCGACCTTTATAACTTTTCTGTTCATCTCTTTTGTAAATTAGT
AAATACCATATTTTAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B905TF U 1
AF RR2B905JQ C 204
BS 1 597 RR2B905TF
BS 598 598 RR2B905JQ
BS 599 860 RR2B905TF
BS 861 979 RR2B905JQ

RD RR2B905TF 860 0 0
GGCTCGACACTTTGAAAAAAAATTACAAAGAGTTCTTCTCCTCTCAATTTCCACCATCAT
TCATTCGTCAAAGATGAAGGAACAAACAGCGAGAAAGATACCACGACCTCGGCCTCTCGA
GACCTGCGGTGCTACCATACTCTCCATGTCACGCGTCGTCTACGCAAGAACCAAGAATCC
GAACAATCCAGCCTCTTTCCTTGTGCAGAGACTCTTCCAACTCCTTTCCTTCTTCGCGTC
CATGACAAGTCCCTTCCACCGTCACATCCTCGCCATCCTCTCCGTAGCCGACGACCACAT
CCTCGCAATCGAGGCTTACTTCCCTTCGACCACCTTCCTCTTCAGCAAGGTCTCCGGTTG
GCTAAACGCAGCAGAGCATCTGCCCATGAAATTCGACGTGTTTCTTGAGAAACTTCCAAG
AACGATGAACAGAACCGCGTGTGTGGACATGATCCTGGTCCAAGCGCTTTGTTGGGTTGA
TTCTCTCGTGAACGTGATAGGTCGTTGGAGAGACAAGAACAGGGGGACGAACGAGAAAGA
GATCACGATGGATGGCAGTTTCAGCAGAACTGGATCGATGTCTGAAGAAGAGATGAA*CT
GGGGAATGATGGTAAAAGAGTGAGTTACAAGGAGGCGTTGCAGAGAGGAAGCAGCGGTGA
AGATGGTGGAGGAAGCACCGGTCGCAGCAGCAGCAACCACGGGGATCCTATCTTGGATCT
GTTTGAGAATGGTTGGATCCAGAAGCCCATGAAAAGAAGTAGCAGAAGCGCCGATTCGCT
CACATGCTCTCGTTCTGATTCCTTCGAGACCAGCACCTGAGAGAGGTCTTTAACTCTCAT
TTTTCTTGTAGCTATATATA

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR2B905JQ 776 0 0
TGCAGAGACTCTTCCAACTCCTTTCCTTCTTCGCGTCCATGACAAGTCCCTTCCACCGTC
ACATCCTCGCCATCCTCTCCGTAGCCGACGACCACATCCTCGCAATCGAGGCTTACTTCC
CTTCGACCACCTTCCTCTTCAGCAAGGTCTCCGGTTGGCTAAACGCAGCAGAGCATCTGC
CCATGAAATTCGACGTGTTTCTTGAGAAACTTCCAAGAACGATGAACAGAACCGCGTGTG
TGGACATGATCCTGGTCCAAGCGCTTTGTTGGGTTGATTCTCTCGTGAACGTGATAGGTC
GTTGGAGAGACAAGAACAGGGGGACGAACGAGAAAGAGATCACGATGGATGGCAGTTTCA
GCAGAACTGGATCGATGTCTGAAGAAGAGATGAAACTGGGGAATGATGGTAAAAGAGTGA
GTTACAAGGAGGCGTTGCAGAGAGGAAGCAGCGGTGAAGATGGTGGAGGAAGCACCGGTC
GCAGCAGCAGCAACCACGGGGATCCTATCTTGGATCTGTTTGAGAATGGTTGGATCCAGA
AGCCCATGAAAAGAAGTAGCAGAAGCGCCGATTCGCTCACATGCTCTCGTTTTGATTCCT
TCGAGACCAGCACCTGAGAGAGGTCTTTAACTCTCATTTTTCTTGTAGCTATATATACGA
CGGATATGGTTCAACAACCACACTAACACCAACTAGTAGACTATGTTGTCCTACTCGACC
TTTATAACTTTTCTGTTCATCTCTTTTGTAAATTAGTAAATACCATATTTTAAGTT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL7135Contig1 550 2 1 U
TTGTTAATGTATGATTTTTGGAATGTGCAGCATCGGACTGGTTGTCTTGTGGGGTGCTTG
AGGAAACTTCAGAAATGGTGTTTGACATCGATATTTGATGAGTACCAGCGATTTGCAGCA
GCAAAAGCTAGAGTTTCAGATCAAAGGTTCATGGAGATATTCGACGTCTCCAGCTTCAGT
CACATTCCTATGACTTTCTCTTGTTCCAGCAGGTAAAACAGAGAACCTATCCTCTCCTCA
ACATAAAAGAAGAAAGCCAACAAAAAAAATGAGGAGATTATTCTAATCACATAAGTGTTC
CAGAGGAATCATTCTTCTGTTTCTTTCCCTTTCTCTGGAATCAATAATTTATATTTGAAG
AAAAAATAATTTCTGATTATGATTTTACCATTTTTCTGCTCACTGTAACCCCATTTAGGT
ATACGGATAAAATATATAGGAGTCTGTTTTGAATATAGCCCTTCTTTGGGTATCAACTGT
TGTAGTGTTGTAACATTTCTCCTAATTATAATAACTAGATTCTTTTTCCGCGCTACGCGC
GGATTATGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B272JQ C 1
AF RR2B272TF U 1
BS 1 550 RR2B272TF

RD RR2B272JQ 550 0 0
TTGTTAATGTATGATTTTTGGAATGTGCAGCATCGGACTGGTTGTCTTGTGGGGTGCTTG
AGGAAACTTCAGAAATGGTGTTTGACATCGATATTTGATGAGTACCAGCGATTTGCAGCA
GCAAAAGCTAGAGTTTCAGATCAAAGGTTCATGGAGATATTCGACGTCTCCAGCTTCAGT
CACATTCCTATGACTTTCTCTTGTTCCAGCAGGTAAAACAGAGAACCTATCCTCTCCTCA
ACATAAAAGAAGAAAGCCAACAAAAAAAATGAGGAGATTATTTTAATCACATAAGTGTTC
CAGAGGAATCATTCTTCTGTTTCTTTCCCTTTTTCTGGAATCAATAATTTATATTTGAAG
AAAAAATAATTTCTGATTATGATTTTACCATTTTTCTGCTCACTGTAACCCCATTTAGGT
ATACGGATAAAATATATAGGAGTCTGTTTTGAATATAGCCCTTCTTTGGGTATCAACTGT
TGTAGTGTTGTAACATTTCTCCTAATTATAATAACTAGATTCTTTTTCCGCGCTACGCGC
GGATTATGCT

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2B272TF 550 0 0
TTGTTAATGTATGATTTTTGGAATGTGCAGCATCGGACTGGTTGTCTTGTGGGGTGCTTG
AGGAAACTTCAGAAATGGTGTTTGACATCGATATTTGATGAGTACCAGCGATTTGCAGCA
GCAAAAGCTAGAGTTTCAGATCAAAGGTTCATGGAGATATTCGACGTCTCCAGCTTCAGT
CACATTCCTATGACTTTCTCTTGTTCCAGCAGGTAAAACAGAGAACCTATCCTCTCCTCA
ACATAAAAGAAGAAAGCCAACAAAAAAAATGAGGAGATTATTCTAATCACATAAGTGTTC
CAGAGGAATCATTCTTCTGTTTCTTTCCCTTTCTCTGGAATCAATAATTTATATTTGAAG
AAAAAATAATTTCTGATTATGATTTTACCATTTTTCTGCTCACTGTAACCCCATTTAGGT
ATACGGATAAAATATATAGGAGTCTGTTTTGAATATAGCCCTTCTTTGGGTATCAACTGT
TGTAGTGTTGTAACATTTCTCCTAATTATAATAACTAGATTCTTTTTCCGCGCTACGCGC
GGATTATGCT

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

CO CL7136Contig1 650 2 2 U
AATCAATATAAATATAAGGAAGAATTATTTGTCGAAACTCTTTCAAACTCTATACATAAT
CAAAGACTCATCATAAGTCAATTCCATAGATCACTAAATGTGGATCATGCTTTCTTCTAA
CTCATGTTTAGGTAACGATGTCTCCCCTGGAAACCAACTGTAGCAATGATGAAGACCCAG
AAGAAGGCACAGATAGCACCCACAACTGATAAGAGAAGAAAACCTTCGTTTCCCATACCC
TTCTTAGCTACGGTGACTTTGCAAGTAGTCACTGACGTCCCGTTGAACCTGATGCGGCTC
AAGCTAGACATACGCACAAAGGCCCTATTAAGTGGACCCTCACAGGCAGAGGCTGGTGTT
GAAGGCACTGAGTCCAGCAATGCCCACATAGCTGATGAGAACTGGCTCCTTGTTTCACCA
CCATTTTGGCATTCCTGATCTTGGACATTAACACCCATAACAGGGTTCTTGGATTCAGGC
ATCAAACCTGATGAAGATGAAGCAAATGCTAAAGAAGAAGATTGTGGTTGATCATAGAGA
GCAGCCTGAGCATCTTTAAACCACACATCGTCAACGAATTGATTGGCATTTGGGTTAGGA
TCCATGAAGCTGTTGACCTGAGTCTCAAGGGTCTGGTCCTGAAACTGTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ30JQ U 1
AF RR2H984JQ U 1
BS 1 542 RR2GZ30JQ
BS 543 650 RR2H984JQ

RD RR2GZ30JQ 542 0 0
AATCAATATAAATATAAGGAAGAATTATTTGTCGAAACTCTTTCAAACTCTATACATAAT
CAAAGACTCATCATAAGTCAATTCCATAGATCACTAAATGTGGATCATGCTTTCTTCTAA
CTCATGTTTAGGTAACGATGTCTCCCCTGGAAACCAACTGTAGCAATGATGAAGACCCAG
AAGAAGGCACAGATAGCACCCACAACTGATAAGAGAAGAAAACCTTCGTTTCCCATACCC
TTCTTAGCTACGGTGACTTTGCAAGTAGTCACTGACGTCCCGTTGAACCTGATGCGGCTC
AAGCTAGACATACGCACAAAGGCCCTATTAAGTGGACCCTCACAGGCAGAGGCTGGTGTT
GAAGGCACTGAGTCCAGCAATGCCCACATAGCTGATGAGAACTGGCTCCTTGTTTCACCA
CCATTTTGGCATTCCTGATCTTGGACATTAACACCCATAACAGGGTTCTTGGATTCAGGC
ATCAAACCTGATGAAGATGAAGCAAATGCTAAAGAAGAAGATTGTGGTTGATCATAGAGA
GC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RR2H984JQ 650 0 0
AATCAATATAAATATAAGGAAGAATTATTTGTCGAAACTCTTTCAAACTCTATACATAAT
CAAAGACTCATCATAAGTCAATTCCATAGATCACTAAATGTGGATCATGCTTTCTTCTAA
CTCATGTTTAGGTAACGATGTCTCCCCTGGAAACCAACTGTAGCAATGATGAAGACCCAG
AAGAAGGCACAGATAGCACCCACAACTGATAAGAGAAGAAAACCTTCGTTTCCCATACCC
TTCTTAGCTACGGTGACTTTGCAAGTAGTCACTGACGTCCCGTTGAACCTGATGCGGCTC
AAGCTAGACATACGCACAAAGGCCCTATTAAGTGGACCCTCACAGGCAGAGGCTGGTGTT
GAAGGCACTGAGTCCAGCAATGCCCACATAGCTGATGAGAACTGGCTCCTTGTTTCACCA
CCATTTTGGCATTCCTGATCTTGGACATTAACACCCATAACAGGGTTCTTGGATTCAGGC
ATCAAACCTGATGAAGATGAAGCAAATGCTAAAGAAGAAGATTGTGGTTGATCATAGAGA
GCAGCCTGAGCATCTTTAAACCACACATCGTCAACGAATTGATTGGCATTTGGGTTAGGA
TCCATGAAGCTGTTGACCTGAGTCTCAAGGGTCTGGTCCTGAAACTGTTG

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL7137Contig1 794 2 2 U
GCAACTTCATAGTTCAAATCACTCCTGCATCGCTTCCAAAGGGTCTTCATGCGTTGAACC
TGTCCAAGAACAAGATCAGTGTGATCGAAGGACTGAGAGAACTGACACGTCTAAGAGTGC
TTGATCTCAGTTACAACCGTATTTCTCGCATTGGACAAGGTTTATCAAACTGTACACTGA
TCAAAGAACTATACCTAGCTGGGAACAAGATCAGCAACGTAGAAGGCTTACACAGACTGC
TCAAACTCATCGTTCTTGATCTTAGCTTCAACAAGATCGCAACAACCAAAGCAATAGGCC
AGCTAGTTGCCAACTACAACTCTCTCGTCGCTCTGAACATCCTCGGAAACCCGATTCAGA
GCAATGTAGGCGAGGACCAGCTGCGCAAGACTGTCTCCAGCCTGCTCCCTAAGCTAGTTT
ATCTCAACAAGCAGCTCATCAAGCCACAGAGAGCCAGGGAAGTGCTCAAAGACAGCATCG
CGAAAGCTGCTTTTGGTGGTGGAGGAGACACTCTTCACCACAGACGCAAGAGAACATCCA
CCAAGAGAGTTGTGGGATCACCTTCCTCTAGCGTCCATCACAGAGGACACAACGGAGATG
ATAAACATAAAGGAAAGGGACGTGGCTCTAAAAGTAGAAGCCAACATCAGCTGAAGAAAA
CTTCAACATAAGCCCTTTTTTTAAACAGAATGGTTCCAAGAATGTGTATGAAACATTTGG
TATTGAAAATGAAATACATTTTATTTTTTAAACATCTTTACAAATGTATATAATAAAAAA
ATTTAAGATTCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF02TF U 1
AF RR2DF02JQ C 146
BS 1 609 RR2DF02TF
BS 610 794 RR2DF02JQ

RD RR2DF02TF 609 0 0
GCAACTTCATAGTTCAAATCACTCCTGCATCGCTTCCAAAGGGTCTTCATGCGTTGAACC
TGTCCAAGAACAAGATCAGTGTGATCGAAGGACTGAGAGAACTGACACGTCTAAGAGTGC
TTGATCTCAGTTACAACCGTATTTCTCGCATTGGACAAGGTTTATCAAACTGTACACTGA
TCAAAGAACTATACCTAGCTGGGAACAAGATCAGCAACGTAGAAGGCTTACACAGACTGC
TCAAACTCATCGTTCTTGATCTTAGCTTCAACAAGATCGCAACAACCAAAGCAATAGGCC
AGCTAGTTGCCAACTACAACTCTCTCGTCGCTCTGAACATCCTCGGAAACCCGATTCAGA
GCAATGTAGGCGAGGACCAGCTGCGCAAGACTGTCTCCAGCCTGCTCCCTAAGCTAGTTT
ATCTCAACAAGCAGCTCATCAAGCCACAGAGAGCCAGGGAAGTGCTCAAAGACAGCATCG
CGAAAGCTGCTTTTGGTGGTGGAGGAGACACTCTTCACCACAGACGCAAGAGAACATCCA
CCAAGAGAGTTGTGGGATCACCTTCCTCTAGCGTCCATCACAGAGGACACAACGGAGATG
ATAAACATA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2DF02JQ 649 0 0
TCGCATTGGACAAGGTTTATCAAACTGTACACTGATCAAAGAACTATACCTAGCTGGGAA
CAAGATCAGCAACGTAGAAGGCTTACACAGACTGCTCAAACTCATCGTTCTTGATCTTAG
CTTCAACAAGATCGCAACAACCAAAGCAATAGGCCAGCTAGTTGCCAACTACAACTCTCT
CGTCGCTTTGAACATCCTCGGAAACCCGATTCAGAGCAATGTAGGCGAGGACCAGCTGCG
CAAGACTGTTTCCAGCCTGCTCCCTAAGCTAGTTTATCTCAACAAGCAGCTCATCAAGCC
ACAGAGAGCCAGGGAAGTGCTCAAAGACAGCATCGCGAAAGCTGCTTTTGGTGGTGGAGG
AGACACTTTTCACCACAGACGCAAGAGAACATCCACCAAGAGAGTTGTGGGATCACCTTC
CTCTAGCGTCCATCACAGAGGACACAACGGAGATGATAAACATAAAGGAAAGGGACGTGG
CTCTAAAAGTAGAAGCCAACATCAGCTGAAGAAAACTTCAACATAAGCCCTTTTTTTAAA
CAGAATGGTTCCAAGAATGTGTATGAAACATTTGGTATTGAAAATGAAATACATTTTATT
TTTTAAACATCTTTACAAATGTATATAATAAAAAAATTTAAGATTCTGT

QA 1 649 1 649
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7139Contig1 579 2 2 U
ACTTCACCTTCATTTAATTTAAGAGTATCAGAACATTGCTTGACCAACAAGCCACCAAAA
AGAACCAAAAACAATCTGCAGAGAGAAGCAAATTCATGCAAAGCTTCACATATTCTGCTA
AACATCACATCTCTCATGAAGCTTCTGAGAGATTTTTTTATCAAAATTAAAAAAAAAGAA
ATAAAAGGAGAGATCTTCACATATGAACATCACACCAAACAAGAACACTAGTACTTTTTC
CCAAGAATTATACCGATGATAACGGAGATCAGAGCTACTCCAGAGACGATCTTCAGTGTC
ATGAGATGAGAAGTTGTAGCCGTCTGAGTAGCGGTTACGTCGCTTGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGGAGATGCCTCTGACTTCTTCTTGCTCGTACGTTTCGTTGGAGATGAAAAGGACAAG
TCAACGTCTCGAGATTTAATAACTACATCCTTTGCCTCCGTTTCCTTAGCTTTAGCATCC
GCGAGCTGCACTTTCTGTTCAAGATCTTTGACCATCGATTCAAATTCAGTGACCGCCTTT
TTCTTAGTTTCAATCTCTTCTTGTGATTGCTTAAGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA95TF C 1
AF RR2CA95JQ U 23
BS 1 22 RR2CA95TF
BS 23 579 RR2CA95JQ

RD RR2CA95TF 572 0 0
ACTTCACCTTCATTTAATTTAAGAGTATCAGAACATTGCTTGACCAACAAGCCACCAAAA
AGAACCAAAAACAATCTGCAGAGAGAAGCAAATTCATGCAAAGCTTCACATATTCTGCTA
AACATCACATCTCTCATGAAGCTTTTGAGAGATTTTTTTATCAAAATTAAAAAAAAAGAA
ATAAAAGGAGAGATCTTCACATATGAACATCACACCAAACAAGAACACTAGTACTTTTTC
CCAAGAATTATACCGATGATAACGGAGATCAGAGCTACTCCAGAGACGATCTTCAGTGTC
ATGAGATGAGAAGTTGTAGCCGTCTGAGTAGCGGTTACGTCGCTTGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGGAGATGCCTCTGACTTCTTCTTGCTCGTACGTTTCGTTGGAGATGAAAAGGACAAG
TCAACGTCTCGAGATTTAATAACTACATCCTTTGCCTCCGTTTCCTTAGCTTTAGCATCC
GCGAGCTGCACTTTCTGTTCAAGATCTTTGACCATCGATTCAAATTCAGTGACCGCCTTT
TTCTTAGTTTCAATCTCTTCTTGTGATTGCTT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2CA95JQ 557 0 0
GAGTATCAGAACATTGCTTGACCAACAAGCCACCAAAAAGAACCAAAAACAATCTGCAGA
GAGAAGCAAATTCATGCAAAGCTTCACATATTCTGCTAAACATCACATCTCTCATGAAGC
TTCTGAGAGATTTTTTTATCAAAATTAAAAAAAAAGAAATAAAAGGAGAGATCTTCACAT
ATGAACATCACACCAAACAAGAACACTAGTACTTTTTCCCAAGAATTATACCGATGATAA
CGGAGATCAGAGCTACTCCAGAGACGATCTTCAGTGTCATGAGATGAGAAGTTGTAGCCG
TCTGAGTAGCGGTTACGTCGCTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGATGCCTCTGACTTCT
TCTTGCTCGTACGTTTCGTTGGAGATGAAAAGGACAAGTCAACGTCTCGAGATTTAATAA
CTACATCCTTTGCCTCCGTTTCCTTAGCTTTAGCATCCGCGAGCTGCACTTTCTGTTCAA
GATCTTTGACCATCGATTCAAATTCAGTGACCGCCTTTTTCTTAGTTTCAATCTCTTCTT
GTGATTGCTTAAGTGCC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL7140Contig1 928 2 2 U
GGAGAAACAAAGTCGTGATTTGGTTTTCTTTCTCCCTTAAAAAAGAGTTTTTTTTTCTCC
GACCAGAAAACGGTAAGTGGGGGAGAGATGCAATTGTTTGCGCTGAATCCAGCAGCCATG
TCGGCGCCACGAACCCTAGGCCTTGAGCCGTCCTCGTCCTCGTCCTCTCGTCTTCTTTCT
TCTGCTCAGATTTTGAGCTCTCATCGTGCTTTTGGTCTCCTAGCTAGGCCCTGTCGACGA
TTCCGAGGATTATCTCCATCTCAAGTTGTAAAGGCAGTGGCAACCCCAGACCCACTCTTG
GAAGTACCCCTGACTGAGGAAAACGTAGAGAGCGTTCTGGACGAAATCAGGCCTTACCTC
ATGTCTGATGGTGGTAATGTGGTATTACATGAGATCGATGGAAATATTGTGCGAGTCAAA
TTGCAGGGAGCTTGCGGGTCATGCCCAAGTTCTGTTATGACTATGAAAATGGGTATTGAG
CGTCGCCTTATGGAAAAGATACCTGAAATAGTGGCTGTCGAATCTGTTCCAGATGAAGAG
ACTGGCCTTGAACTCAATGACGAAAACATTGAAAAGGTGCTGGAAGAAATCAGGCCTTAC
TTAATTGGAACAGCTGATGGGTCGCTTGAGCTGGTGGAGATCGAAGAGCCGATCGTGAAG
ATAAGAATCACAGGACCTGCTGCTGGAGTCATGACAGTACGAGTAGCGGTAACTCAGAAA
CTCAGAGAGAAAATTCCTGCAATTGCAGCTGTTCAGCTTATATAAACACGACCTCCTTTC
TTGTATCTCTCTATCTTTCTTTCCTTTGTATTACTAGCCTCCTTGTATAGTGTATAGATA
CTGTGTTGACGTTTGATATTTGTCTCCAAAATAAGGTTTTAACATTTTTGGTCAACTTCA
TTTCTAAGCAATCTTTATATTGTGCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC43TF U 1
AF RR2CC43JQ C 169
BS 1 714 RR2CC43TF
BS 715 928 RR2CC43JQ

RD RR2CC43TF 714 0 0
GGAGAAACAAAGTCGTGATTTGGTTTTCTTTCTCCCTTAAAAAAGAGTTTTTTTTTCTCC
GACCAGAAAACGGTAAGTGGGGGAGAGATGCAATTGTTTGCGCTGAATCCAGCAGCCATG
TCGGCGCCACGAACCCTAGGCCTTGAGCCGTCCTCGTCCTCGTCCTCTCGTCTTCTTTCT
TCTGCTCAGATTTTGAGCTCTCATCGTGCTTTTGGTCTCCTAGCTAGGCCCTGTCGACGA
TTCCGAGGATTATCTCCATCTCAAGTTGTAAAGGCAGTGGCAACCCCAGACCCACTCTTG
GAAGTACCCCTGACTGAGGAAAACGTAGAGAGCGTTCTGGACGAAATCAGGCCTTACCTC
ATGTCTGATGGTGGTAATGTGGTATTACATGAGATCGATGGAAATATTGTGCGAGTCAAA
TTGCAGGGAGCTTGCGGGTCATGCCCAAGTTCTGTTATGACTATGAAAATGGGTATTGAG
CGTCGCCTTATGGAAAAGATACCTGAAATAGTGGCTGTCGAATCTGTTCCAGATGAAGAG
ACTGGCCTTGAACTCAATGACGAAAACATTGAAAAGGTGCTGGAAGAAATCAGGCCTTAC
TTAATTGGAACAGCTGATGGGTCGCTTGAGCTGGTGGAGATCGAAGAGCCGATCGTGAAG
ATAAGAATCACAGGACCTGCTGCTGGAGTCATGACAGTACGAGTAGCGGTAACT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2CC43JQ 760 0 0
CGTCTTCTTTCTTCTGCTCAGATTTTGAGCTCTCATCGTGCTTTTGGTCTCCTAGCTAGG
CCCTGTCGACGATTCCGAGGATTATCTCCATCTCAAGTTGTAAAGGCAGTGGCAACCCCA
GACCCACTCTTGGAAGTACCCCTGACTGAGGAAAACGTAGAGAGCGTTCTGGACGAAATC
AGGCCTTACCTCATGTCTGATGGTGGTAATGTGGTATTACATGAGATCGATGGAAATATT
GTGCGAGTCAAATTGCAGGGAGCTTGCGGGTCATGCCCAAGTTCTGTTATGACTATGAAA
ATGGGTATTGAGCGTCGCCTTATGGAAAAGATACCTGAAATAGTGGCTGTCGAATCTGTT
CCAGATGAAGAGACTGGCCTTGAACTCAATGACGAAAACATTGAAAAGGTGCTGGAAGAA
ATCAGGCCTTACTTAATTGGAACAGCTGATGGGTCGCTTGAGCTGGTGGAGATCGAAGAG
CCGATCGTGAAGATAAGAATCACAGGACCTGCTGCTGGAGTCATGACAGTACGAGTAGCG
GTAACTCAGAAACTCAGAGAGAAAATTCCTGCAATTGCAGCTGTTCAGCTTATATAAACA
CGACCTCCTTTCTTGTATCTCTCTATCTTTCTTTCCTTTGTATTACTAGCCTCCTTGTAT
AGTGTATAGATACTGTGTTGACGTTTGATATTTGTCTCCAAAATAAGGTTTTAACATTTT
TGGTCAACTTCATTTCTAAGCAATCTTTATATTGTGCAGC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL7141Contig1 968 2 2 U
GGAACGAACCCTAACTCGGACATGGAAGGAGAGCTTCAAGAAGACTGGGAAATGGTCATC
GAGAGGTCTGGAACTACTACTCAGGAGGGGGAGAATCCGAAGAGCTTGGAGGAGATTGAA
GAAGGTATGGTTACCTTCGATTACTTCTCTATTGAGAACTCAAACTTTGTGGGCCGCGTT
GATGCGATCGATGAAGATGGATCTGTTCAATCGGGTAGTCCAGGCTGGGTCGAACCTAGC
TCCGACGCTCCCTATGGCCCTAAGCTCTTTAGCGAGTTATGGTCTGATTCCACAGCGATC
GGCTCGATGATCAGAAATTAGATGTGAACAACGAGTTGGGTTTGGAGAAATCAGAGGAAC
ACAGCAAAAGTATAGCGAATGAGAAAGATCAATATGGGTATGAGGAAGGATTTGATACGG
AGAGAGAAGAGGAATCGCCAGTTTCAGTAGTAAAAGGAAAGTCTGTTTCTATTGATTCAT
CTGGTGGTGGAGGAGAAGAAAGGGTATTTGTGTGGTGGAAGATTCCGATTGATGTTTTGA
AGTATTGTGTTTTCAGAGTTAATCCTATCTGGTCTTTCTCCATGGCAGCAGCAGTGGTGG
GGTTTGTTATGTTAGGGCGCAGATTGTATAATATGAAGAAGAGGAAGACCTCTACCTTGC
AGCTTAAGGTCTTCCTTAATGATAAGAAGGTGGCGAATCATGCTGCTCGGTTGAATGAAG
CAGCAATCTCATTAGTGAAACGTGTGCCCATAATCAGGCCAGCACTCCCATCATCGGTGG
TGGGTATGAACCAATGGCCTATGATGAGTTTAAGGTGAAATATAATGCATATATATGCAA
GATAAATGATTGATGTGGTTGGCATGTATCATATGATTGTGTTATATGACAAGTCTCAGA
ATGGTACAAAATATGCTTGTAAGTTTTTACCGTGTGTGTATATAAATACTTTTACTTGTT
TGATGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP24TF U 1
AF RR2EP24JQ C 160
BS 1 684 RR2EP24TF
BS 685 968 RR2EP24JQ

RD RR2EP24TF 684 0 0
GGAACGAACCCTAACTCGGACATGGAAGGAGAGCTTCAAGAAGACTGGGAAATGGTCATC
GAGAGGTCTGGAACTACTACTCAGGAGGGGGAGAATCCGAAGAGCTTGGAGGAGATTGAA
GAAGGTATGGTTACCTTCGATTACTTCTCTATTGAGAACTCAAACTTTGTGGGCCGCGTT
GATGCGATCGATGAAGATGGATCTGTTCAATCGGGTAGTCCAGGCTGGGTCGAACCTAGC
TCCGACGCTCCCTATGGCCCTAAGCTCTTTAGCGAGTTATGGTCTGATTCCACAGCGATC
GGCTCGATGATCAGAAATTAGATGTGAACAACGAGTTGGGTTTGGAGAAATCAGAGGAAC
ACAGCAAAAGTATAGCGAATGAGAAAGATCAATATGGGTATGAGGAAGGATTTGATACGG
AGAGAGAAGAGGAATCGCCAGTTTCAGTAGTAAAAGGAAAGTCTGTTTCTATTGATTCAT
CTGGTGGTGGAGGAGAAGAAAGGGTATTTGTGTGGTGGAAGATTCCGATTGATGTTTTGA
AGTATTGTGTTTTCAGAGTTAATCCTATCTGGTCTTTCTCCATGGCAGCAGCAGTGGTGG
GGTTTGTTATGTTAGGGCGCAGATTGTATAATATGAAGAAGAGGAAGACCTCTACCTTGC
AGCTTAAGGTCTTCCTTAATGATA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2EP24JQ 809 0 0
TCAAACTTTGTGGGCCGCGTTGATGCGATCGATGAAGATGGATCTGTTCAATCGGGTAGT
CCAGGCTGGGTCGAACCTAGCTCCGACGCTCCCTATGGCCCTAAGCTCTTTAGCGAGTTA
TGGTCTGATTCCACAGCGATCGGCTCGATGATCAGAAATTAGATGTGAACAACGAGTTGG
GTTTGGAGAAATCAGAGGAACACAGCAAAAGTATAGCGAATGAGAAAGATCAATATGGGT
ATGAGGAAGGATTTGATACGGAGAGAGAAGAGGAATCGCCAGTTTCAGTAGTAAAAGGAA
AGTCTGTTTCTATTGATTCATCTGGTGGTGGAGGAGAAGAAAGGGTATTTGTGTGGTGGA
AGATTCCGATTGATGTTTTGAAGTATTGTGTTTTCAGAGTTAATCCTATCTGGTCTTTCT
CCATGGCAGCAGCAGTGGTGGGGTTTGTTATGTTAGGGCGCAGATTGTATAATATGAAGA
AGAGGAAGACCTCTACCTTGCAGCTTAAGGTCTTCCTTAATGATAAGAAGGTGGCGAATC
ATGCTGCTCGGTTGAATGAAGCAGCAATCTCATTAGTGAAACGTGTGCCCATAATCAGGC
CAGCACTCCCATCATCGGTGGTGGGTATGAACCAATGGCCTATGATGAGTTTAAGGTGAA
ATATAATGCATATATATGCAAGATAAATGATTGATGTGGTTGGCATGTATCATATGATTG
TGTTATATGACAAGTCTCAGAATGGTACAAAATATGCTTGTAAGTTTTTACCGTGTGTGT
ATATAAATACTTTTACTTGTTTGATGTAC

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

CO CL7142Contig1 1057 2 6 U
GCGATCATGGAGATTCGCGAGGCGATTCGCGAGGAGAGGCCCGTTCAGGTGAGCCTGTTG
AATTACCGCAAATCCGGATCTCCGTTTTGGATGCTGTTTCATATGATTCCTGTCTTCGGG
AGTGACGATGGGAGAGTGATCCATTTCGTCGCGGTTCAGGTCCCCATTTCGGGACAGAAC
ATGAGGGGAGATGTGTCGGGTCGTTCGGAAATGGTGTTTGGTCCTTGTCGGAGAGAGGTT
TGCTTTGGTAGTTACGTGCATCAGGAGGAACGAGCTGTACAAGTTGAACTGGATGAACAA
GAGCTAGAGAACTGGGAACATTGTGAAGCTAGTGAATCCGAGAAGCTTAAATCTGCTGAA
GCAGTTAACAATGTGTTAGCTACTCTGACGCGGTACAGCGAGTTTGCTGGGAGATTAGTA
TGTGGCAAGCGGAACTGTTTGCGTGGTGCAGCAGATTACTGCTTAAGCTCGTCGTTAGTT
ATATCACTCGGTAGAATAAAACAAAGTTTCGTATTAACCAATCCGTGCTTACCAGACATG
CCTATCGTTTATGCTAGTGATGCCTTTTTGACATTGACTGGTTACAAGAGACATGAAGTG
TTGGGACAGAATTGTAGATTTCTGAGTGGGGTTGATACAGACTCCTCGGTACTCTACGAG
ATGAAGGAATGCATTTTAAAGGGGAAACCATGCACAGTGCAAATATTAAATTACAGTAAC
AGAAAAGATAAGAGCACGTTCTGGAATCTTCTTCACATATCACCAGTTCGTAATGCTTCA
GGCAAGACGGCATATTTTGTAGGGGTTCAGATGGAAGCAAGTTGCAGAGATACCGAAAGT
AAAGATCTGAGGCCGGAGACAAGGCAACTGAGTGTGGTTGGTGCGGTTAGAGTTGCGGTC
AGGAGCTCTTTCATGGTGACTTGTTGATAGTTACATACGCCACGAAGAACATGTATATTT
TAGAGAGTATACGGAGTGAATTCAACGTAGCATCTCTATAAATCATTATTGTACATGAAC
ATAAAGTGTTTATTGAGATAATTAAAACTTGGTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU19TF U 1
AF RR2EU19JQ C 176
BS 1 222 RR2EU19TF
BS 223 223 RR2EU19JQ
BS 224 686 RR2EU19TF
BS 687 687 RR2EU19JQ
BS 688 723 RR2EU19TF
BS 724 1057 RR2EU19JQ

RD RR2EU19TF 723 0 0
GCGATCATGGAGATTCGCGAGGCGATTCGCGAGGAGAGGCCCGTTCAGGTGAGCCTGTTG
AATTACCGCAAATCCGGATCTCCGTTTTGGATGCTGTTTCATATGATTCCTGTCTTCGGG
AGTGACGATGGGAGAGTGATCCATTTCGTCGCGGTTCAGGTCCCCATTTCGGGACAGAAC
ATGAGGGGAGATGTGTCGGGTCGTTCGGAAATGGTGTTTGGTTCTTGTCGGAGAGAGGTT
TGCTTTGGTAGTTACGTGCATCAGGAGGAACGAGCTGTACAAGTTGAACTGGATGAACAA
GAGCTAGAGAACTGGGAACATTGTGAAGCTAGTGAATCCGAGAAGCTTAAATCTGCTGAA
GCAGTTAACAATGTGTTAGCTACTCTGACGCGGTACAGCGAGTTTGCTGGGAGATTAGTA
TGTGGCAAGCGGAACTGTTTGCGTGGTGCAGCAGATTACTGCTTAAGCTCGTCGTTAGTT
ATATCACTCGGTAGAATAAAACAAAGTTTCGTATTAACCAATCCGTGCTTACCAGACATG
CCTATCGTTTATGCTAGTGATGCCTTTTTGACATTGACTGGTTACAAGAGACATGAAGTG
TTGGGACAGAATTGTAGATTTCTGAGTGGGGTTGATACAGACTCCTCGGTACTCTACGAG
ATGAAGGAATGCATTTTAAAGGGGAA*CCATGCACAGTGCAAATATTAAATTACAGTAAC
AGA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2EU19JQ 882 0 0
CAG
ACATGAGGGGAGATGTGTCGG*TCGT*CGGAAATGGTGTTTGGTC**TGTCGGAGAGAGG
TTTGCTTTGGTAGTTACGTGCATCAGGAGGAACGAGCTGTACAAGTTGAACTGGATGAAC
AAGAGCTAGAGAACTGGGAACATTGTGAAGCTAGTGAATCCGAGAAGCTTAAATCTGCTG
AAGCAGTTAACAATGTGTTAGCTACTCTGACGCGGTACAGCGAGTTTGCTGGGAGATTAG
TATGTGGCAAGCGGAACTGTTTGCGTGGTGCAGCAGATTACTGCTTAAGCTCGTCGTTAG
TTATATCACTCGGTAGAATAAAACAAAGTTTCGTATTAACCAATCCGTGCTTACCAGACA
TGCCTATCGTTTATGCTAGTGATGCCTTTTTGACATTGACTGGTTACAAGAGACATGAAG
TGTTGGGACAGAATTGTAGATTTCTGAGTGGGGTTGATACAGACTCCTCGGTACTCTACG
AGATGAAGGAATGCATTTTAAAGGGGAAACCATGCACAGTGCAAATATTAAATTACAGTA
ACAGAAAAGATAAGAGCACGTTCTGGAATCTTCTTCACATATCACCAGTTCGTAATGCTT
CAGGCAAGACGGCATATTTTGTAGGGGTTCAGATGGAAGCAAGTTGCAGAGATACCGAAA
GTAAAGATCTGAGGCCGGAGACAAGGCAACTGAGTGTGGTTGGTGCGGTTAGAGTTGCGG
TCAGGAGCTCTTTCATGGTGACTTGTTGATAGTTACATACGCCACGAAGAACATGTATAT
TTTAGAGAGTATACGGAGTGAATTCAACGTAGCATCTCTATAAATCATTATTGTACATGA
ACATAAAGTGTTTATTGAGATAATTAAAACTTGGTCCCT

QA 4 882 4 882
DS 



AS 1 2

CO CL7143Contig1 802 2 2 U
CCTTTCAATTAATTAGCAAACAAATTCACTATTCTCTTCAGAATCCCTCAAAGATTCCAA
AAACCTGCGGGGTCAAGCAACCTTCTCTCTTCTTCGTCTCTATGTTTCTGTACCAGGGCA
GAGCTTAACAGAGAAACTGATTATTTTTCTCTTCCCAAACTCTTCTATGCAAGAGAGAAT
AAAGATAACACAATCAACGAAATCAAGCCTAAGAGGAGAAGAAACATGGTATTTCAAACG
ATTTCCAACGGAAGTTACATGATCATAAGTTTTCTTTAAAGAGGTTATATTAGAAGATGG
TTTATAAAGAGGATCTAGACTGGAGGCTACTACGCTAGATCAAAGTTTCCCATTCTTGGC
TACATCGGATGGTTTCTTTTTCTCAAGAGAGGTTACTGGGGAGGGAGGATTGAGCAGATG
TTAAGCTTTGTTTGCTGCTCTCCAGGAATGCGGTACCGAGAGTTTTTGGATAGCTTCAGG
GATCATCACCAGACAGGGAAGCTGAATCATCTAAAGAAGGTTCTAGGCGTGAAAGGCTCT
CTATGCTTGCTAAACGAGCTGTTTAGGCTGCACAAGCATTGCAGCATAAGAAAGAAGTGT
CAACAGGAACTACTAAGAGTTACAAGTCTAAAGCAGGTGACCGAGTCAAGTTTCTAGGTC
CTTCTTCATCTGCAATTTTGTCTCTTTAAGTCCCGCCACTTAGGGGACCAACCATTGGTT
TCCAGGGAAAAGTAGTCCTTGCTTTGATATTGGATTCGATAGGCCTGTGCCCGATGGCAA
TGATCTTGGTGGCTTCTGCCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A246TF U 1
AF RR2A246JQ C 146
BS 1 699 RR2A246TF
BS 700 802 RR2A246JQ

RD RR2A246TF 699 0 0
CCTTTCAATTAATTAGCAAACAAATTCACTATTCTCTTCAGAATCCCTCAAAGATTCCAA
AAACCTGCGGGGTCAAGCAACCTTCTCTCTTCTTCGTCTCTATGTTTCTGTACCAGGGCA
GAGCTTAACAGAGAAACTGATTATTTTTCTCTTCCCAAACTCTTCTATGCAAGAGAGAAT
AAAGATAACACAATCAACGAAATCAAGCCTAAGAGGAGAAGAAACATGGTATTTCAAACG
ATTTCCAACGGAAGTTACATGATCATAAGTTTTCTTTAAAGAGGTTATATTAGAAGATGG
TTTATAAAGAGGATCTAGACTGGAGGCTACTACGCTAGATCAAAGTTTCCCATTCTTGGC
TACATCGGATGGTTTCTTTTTCTCAAGAGAGGTTACTGGGGAGGGAGGATTGAGCAGATG
TTAAGCTTTGTTTGCTGCTCTCCAGGAATGCGGTACCGAGAGTTTTTGGATAGCTTCAGG
GATCATCACCAGACAGGGAAGCTGAATCATCTAAAGAAGGTTCTAGGCGTGAAAGGCTCT
CTATGCTTGCTAAACGAGCTGTTTAGGCTGCACAAGCATTGCAGCATAAGAAAGAAGTGT
CAACAGGAACTACTAAGAGTTACAAGTCTAAAGCAGGTGACCGAGTCAAGTTTCTAGGTC
CTTCTTCATCTGCAATTTTGTCTCTTTAAGTCCCGCCAC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2A246JQ 657 0 0
TTTTCTC
TCCCAAACTCTTCTATGCAAGAGAGAATAAAGATAACACAATCAACGAAATCAAGCCTAA
GAGGAGAAGAAACATGGTATTTCAAACGATTTCCAACGGAAGTTACATGATCATAAGTTT
TCTTTAAAGAGGTTATATTAGAAGATGGTTTATAAAGAGGATCTAGACTGGAGGCTACTA
CGCTAGATCAAAGTTTCCCATTCTTGGCTACATCGGATGGTTTCTTTTTCTCAAGAGAGG
TTACTGGGGAGG*AGGATTGAGCAGATGTTAAGCTTTGTTTGCTGCTCTCCAGGAATGCG
GTACCGAGAGTTTTTGGATAGCTTCAGGGATCATCACCAGACAGGGAAGCTGAATCATCT
AAAGAAGGTTCTAGGCGTGAAAGGCTCTCTATGCTTGCTAAACGAGCTGTTTAGGCTGCA
CAAGCATTGCAGCATAAGAAAGAAGTGTCAACAGGAACTACTAAGAGTTACAAGTCTAAA
GCAGGTGACCGAGTCAAGTTTCTAGGTCCTTCTTCATCTGCAATTTTGTCTCTTTAAGTC
CCGCCACTTAGGGGACCAACCATTGGTTTCCAGGGAAAAGTAGTCCTTGCTTTGATATTG
GATTCGATAGGCCTGTGCCCGATGGCAATGATCTTGGTGGCTTCTGCCAA

QA 8 657 8 657
DS 



AS 1 2

CO CL7144Contig1 1133 2 2 U
GGTCTCGCTTCCTGTTCTCCACCGTCATCCTCCCACTCAACTTACTCCCGCTCTTCTCTG
CATCACCACTTCCCAAGCCCACTTCGTCGTCAACAACGCTCCCGTCCAGCTCGTAGTCGT
CGCCAACTGCGTCCTCGTCGTAGCTCCTCTCAGTATAAACGGAAACGCCAGATCTATTAT
TTCTGAAGGAAAGCTCGCCAGATCTGCTCTCACCGGCCTTCACACCTCCACTGTGTTGAC
TCCCTCAACGCTCACAGGGAGACACTCTTCCAGATTCGAACCGGGTGCCCAACAACAACG
AAACGTCCGTGGGCTCTGGTTTACATCGACGAGTCCCACCAGATGTGGTGGTTTACTTTC
GTCATTGGTCTCTGGAGTATTTATACGGCCACTACATGAAGCTCTTCACCCCTCACCCAA
CGATAACAATGACTCAAGCGCTTTCAGTTTGATTGGATTTATGGATTGTTTGGTCAGATG
TATTTTGGTAATACTTTGCTGGTTCCGACACGGTAATGTCGAGGTCCGAAGTATAGAACT
GAGTTCAATGTCCACTCCTCCAGCAAAGTTCAATAGTTCCATAGTCTCCATGAAGGTGAA
GATGTCTCCTTTATCAGATTGCTCATCCGGTATGACCAGGGTTCACCTAGCCCAAATCAG
TGATGTTGTGCTTAATTTAAGAACTCTATTTGTTCAGCCATCACAGGTCACTATTCGGTT
TCATGGTCCATCCATTTTGATCGTCAGTTTCAAATCCAGGATGTTTATACTCTCCGTTTC
TGTTGAGATTCACCTAGTCTCTTCGGGGAGCTTTGTCGTCGGAGCTAGAGCTGCTCTTGC
TTGTTCCGCTTCATTCCAAACTTTGCTGTTTGGTTTATTCAACGTCGTTTACGACTATTC
CGTGCTCGTGGTAGTAACCTATTCAGGGATGCACTTGATGATTTCCCACGGTTCTCCTGT
TGTCGAGCAAGTATCTCCCGTTAACTTGTTATCTCTTGTTATATTGTTCTGTTTCTGCAT
TATGTTGTTCATCAAACCGTTGAGAATCCCTCCGGTTATTATCTTATCACCGTTGAGCAT
AGCTCCGGATGTAATCACTTAGACTTTTTCGTTTTAATATAATCGTTTGGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B474TF U 1
AF RR2B474JQ C 271
BS 1 794 RR2B474TF
BS 795 1133 RR2B474JQ

RD RR2B474TF 794 0 0
GGTCTCGCTTCCTGTTCTCCACCGTCATCCTCCCACTCAACTTACTCCCGCTCTTCTCTG
CATCACCACTTCCCAAGCCCACTTCGTCGTCAACAACGCTCCCGTCCAGCTCGTAGTCGT
CGCCAACTGCGTCCTCGTCGTAGCTCCTCTCAGTATAAACGGAAACGCCAGATCTATTAT
TTCTGAAGGAAAGCTCGCCAGATCTGCTCTCACCGGCCTTCACACCTCCACTGTGTTGAC
TCCCTCAACGCTCACAGGGAGACACTCTTCCAGATTCGAACCGGGTGCCCAACAACAACG
AAACGTCCGTGGGCTCTGGTTTACATCGACGAGTCCCACCAGATGTGGTGGTTTACTTTC
GTCATTGGTCTCTGGAGTATTTATACGGCCACTACATGAAGCTCTTCACCCCTCACCCAA
CGATAACAATGACTCAAGCGCTTTCAGTTTGATTGGATTTATGGATTGTTTGGTCAGATG
TATTTTGGTAATACTTTGCTGGTTCCGACACGGTAATGTCGAGGTCCGAAGTATAGAACT
GAGTTCAATGTCCACTCCTCCAGCAAAGTTCAATAGTTCCATAGTCTCCATGAAGGTGAA
GATGTCTCCTTTATCAGATTGCTCATCCGGTATGACCAGGGTTCACCTAGCCCAAATCAG
TGATGTTGTGCTTAATTTAAGAACTCTATTTGTTCAGCCATCACAGGTCACTATTCGGTT
TCATGGTCCATCCATTTTGATCGTCAGTTTCAAATCCAGGATGTTTATACTCTCCGTTTC
TGTTGAGATTCACC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2B474JQ 863 0 0
CAGATTCGAACCGGGTGCCCAACAACAACGAAACGTCCGTGGGCTCTGGTTTACATCGAC
GAGTCCCACCAGATGTGGTGGTTTACTTTCGTCATTGGTCTCTGGAGTATTTATACGGCC
ACTACATGAAGCTCTTCACCCCTCACCCAACGATAACAATGACTCAAGCGCTTTCAGTTT
GATTGGATTTATGGATTGTTTGGTCAGATGTATTTTGGTAATACTTTGCTGGTTCCGACA
CGGTAATGTCGAGGTCCGAAGTATAGAACTGAGTTCAATGTCCACTCCTCCAGCAAAGTT
CAATAGTTCCATAGTCTCCATGAAGGTGAAGATGTCTCCTTTATCAGATTGCTCATCCGG
TATGACCAGGGTTCACCTAGCCCAAATCAGTGATGTTGTGCTTAATTTAAGAACTCTATT
TGTTCAGCCATCACAGGTCACTATTCGGTTTCATGGTCCATCCATTTTGATCGTCAGTTT
CAAATCCAGGATGTTTATACTCTCCGTTTCTGTTGAGATTCACCTAGTCTCTTCGGGGAG
CTTTGTCGTCGGAGCTAGAGCTGCTCTTGCTTGTTCCGCTTCATTCCAAACTTTGCTGTT
TGGTTTATTCAACGTCGTTTACGACTATTCCGTGCTCGTGGTAGTAACCTATTCAGGGAT
GCACTTGATGATTTCCCACGGTTCTCCTGTTGTCGAGCAAGTATCTCCCGTTAACTTGTT
ATCTCTTGTTATATTGTTCTGTTTCTGCATTATGTTGTTCATCAAACCGTTGAGAATCCC
TCCGGTTATTATCTTATCACCGTTGAGCATAGCTCCGGATGTAATCACTTAGACTTTTTC
GTTTTAATATAATCGTTTGGTTG

QA 1 863 1 863
DS 



AS 1 2

CO CL7145Contig1 718 2 14 U
AATACGAAATATCTTTAATTTATATTGTTTCCAAATTCAAGAAGTCTAAAACACGATAAA
AAAAAAGATAACACGAAATCAACCCAAAAACAAAACACACTCGCACACGGAATAAATTAG
GTGCATGTTTCACGTGAAATGCCGAGCCTGGAATTGGGAAGGTCGATGAGAACACGGTGA
TTCTGTTGCTGCATGCTAGCAATGACATTAAGGACGGAGTTTACGGTATTCGGAGCTGCG
GCCATGGCGAGACAGCTTGTGCTACCTGAGGAGCTGTGGATGAAAAGATTGTCCGGAGGC
AAAGTCACGTTCATTCCCGCGAACATAAACGTGACCGATGGGAACACGACGGAGCCGGAG
TAGCAAGTGTCGAAGCCTCCGAGTGCTGTTGCATTTGCGTTCTTGACCCGTCGCCTGAAC
TCATTTCTCACGGCAACGTAAGCTGGTTCCACTAGCCCCGTGTAAACCGTTCCGGAGTCA
AAGATGGTGCCAGCTCCTGTTGCCGGATTAAAGGCGAGTGCACTTGATGGAATATCCACA
ATTTTATTCCCAACACGAATCCCAACCATGTTAACATAGTAAAGCGATGATCTCCCTGGG
TTCTTTAACAATGGAGTGGTCTTGATCCTAACTGGTTGAAACTTAGGGCCTAATCTTAAC
GTTCCCGAGAAACTGCTGGACTTACTATTAGGCAAGCAATACGAGAATGTGGACTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B196JQ U 1
AF RR2CO70JQ U 26
BS 1 62 RR2B196JQ
BS 63 66 RR2CO70JQ
BS 67 104 RR2B196JQ
BS 105 105 RR2CO70JQ
BS 106 179 RR2B196JQ
BS 180 180 RR2CO70JQ
BS 181 209 RR2B196JQ
BS 210 210 RR2CO70JQ
BS 211 225 RR2B196JQ
BS 226 226 RR2CO70JQ
BS 227 457 RR2B196JQ
BS 458 458 RR2CO70JQ
BS 459 654 RR2B196JQ
BS 655 718 RR2CO70JQ

RD RR2B196JQ 654 0 0
AATACGAAATATCTTTAATTTATATTGTTTCCAAATTCAAGAAGTCTAAAACACGATAAA
AA****GATAACACGAAATCAACCCAAAAACAAAACACACTCGCGCACGGAATAAATTAG
GTGCATGTTTCACGTGAAATGCCGAGCCTGGAATTGGGAAGGTCGATGAGAACACGGTGG
TTCTGTTGCTGCATGCTAGCAATGACATTGAGGACGGAGTTTACGTTATTCGGAGCTGCG
GCCATGGCGAGACAGCTTGTGCTACCTGAGGAGCTGTGGATGAAAAGATTGTCCGGAGGC
AAAGTCACGTTCATTCCCGCGAACATAAACGTGACCGATGGGAACACGACGGAGCCGGAG
TAGCAAGTGTCGAAGCCTCCGAGTGCTGTTGCATTTGCGTTCTTGACCCGTCGCCTGAAC
TCATTTCTCACGGCAACGTAAGCTGGTTCCACTAGCCTCGTGTAAACCGTTCCGGAGTCA
AAGATGGTGCCAGCTCCTGTTGCCGGATTAAAGGCGAGTGCACTTGATGGAATATCCACA
ATTTTATTCCCAACACGAATCCCAACCATGTTAACATAGTAAAGCGATGATCTCCCTGGG
TTCTTTAACAATGGAGTGGTCTTGATCCTAACTGGTTGAAACTTAGGGCCTAAT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2CO70JQ 693 0 0
TGTTTCCAAATTCAAGAAGTCTAAAATGCGATAAAAAAAAAGATAACACGAAATCAACCC
AAAAACAAAACACACTTGCACA**GAATAAATTAGGTGCATGTTTCACGTGAAATGCCGA
GCCTGGAATTGGGAAGGTCGATGAGAACACGGTGATTCTGTTGCTGCATGCTAGCAATGA
CGTTAAGGACGGAGTTTACGGTGTTCGGAGCTGCGGCCATGGCGAGACAGCTTGTGCTAC
CTGAGGAGCTGTGGATGAAAAGATTGTCCGGAGGCAAAGTCACGTTCATTCCCGCGAACA
TAAACGTGACCGATGGGAACACGACGGAGCCGGAGTAGCAAGTGTCGAAGCCTCCGAGTG
CTGTTGCATTTGCGTTCTTGACCCGTCGCCTGAACTCATTTCTCACGGCAACGTAAGCTG
GTTCCACTAGCCCCGTGTAGACCGTTCCGGAGTCAAAGATGGTGCCAGCTCCTGTTGCCG
GATTAAAGGCGAGTGCACTTGGTGGGATATCCACAATTTTATTCCCAACACGAATCCCAA
CCATGTTAACATAGTAAAGCGATGATCTCCTTGGGTTCTTTAACAATGGAGTGGTCTTGA
TCCTAACTGGTTGAAACTTAGGGCCTAATCTTAACGTTCCCGAGAAACTGCTGGACTTAC
TATTAGGCAAGCAATACGAGAATGTGGACTTAT

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL7146Contig1 648 2 1 U
GGGGTATGTATTTTGAGTTTTGAGAGTAATATAACAAAAGTTGCAAGGTTTTTCTGCTGA
AGTCATTGCGCGATGGATAGAGTTGAATCATATACGTTTAATTTCTCCGGCGATCAGTCT
TCTTCTGAGTCTTTCTCTTCTTCTTCGACGTCCTCTTCAATTGGGAGGAACAGCGACGAC
GAAGAAGAGGTCCACGGCGACGGAGAAGAGAACAACGAAGCTGAGTCTTCCTACAAAGGG
CCTCTTGATTTGATGGAATCTCTCGAAGAAGTCTTGCCCGTTAGGAAAGGGATATCGAAC
TATTACAGCGGGAAGTCGAAGTCTTTCACGAACTTAGCGGTGGCTGCGTCGGCGATGACT
TCCTCCTCGTCGATGAAAGACCTGGCGAAGCCGGAGAATCCATACAGCCGTCGGAGGAGG
AACCTCCTCTGCCATCAGGTCTGGGAGATCGTACTCGGTGGCGGATATTCCGAGGTGTTT
TCCGGCGACGGCTAGTGGTGTTGGGTCCAGCGACTCGTAGGGATGTTAACAGTTGTTTTA
TTAATTAAATCTTATGTTCTAAAGTTTAACCCTTTTTAGTTTTTTTCTTTTTGGAGTAAC
GTCTGGAGAATGTATATACGAGTTTCAATCAAATCTTTGAAATGGATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B442JQ C 1
AF RR2B442TF U 1
BS 1 648 RR2B442TF

RD RR2B442JQ 648 0 0
GGGGTATGTATTTTGAGTTTTGAGAGTAATATAACAAAAGTTGCAAGGTTTTTCTGCTGA
AGTCATTGCGCGATGGATAGAGTTGAATCATATACGTTTAATTTCTCCGGCGATCAGTCT
TCTTCTGAGTCTTTCTCTTCTTCTTCGACGTCCTCTTCAATTGGGAGGAACAGCGACGAC
GAAGAAGAGGTCCACGGCGACGGAGAAGAGAACAACGAAGCTGAGTCTTCCTACAAAGGG
CCTCTTGATTTGATGGAATCTCTCGAAGAAGTCTTGCCCGTTAGGAAAGGGATATCGAAC
TATTACAGCGGGAAGTCGAAGTCTTTCACGAACTTAGCGGTGGCTGCGTCGGCGATGACT
TCCTCCTCGTCGATGAAAGACCTGGCGAAGCCGGAGAATCCATACAGCCGTCGGAGGAGG
AACCTCCTCTGCCATCAGGTCTGGGAGATCGTACTCGGTGGCGGATATTCCGAGGTGTTT
TCCGGCGACGGCTAGTGGTGTTGGGTCCAGCGACTCGTAGGGATGTTAACAGTTGTTTTA
TTAATTAAATCTTATGTTCTAAAGTTTAACCCTTTTTAGTTTTTTTCTTTTTGGAGTAAC
GTCTGGAGAATGTATATACGAGTTTCAATCAAATCTTTGAAATGGATC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2B442TF 648 0 0
GGGGTATGTATTTTGAGTTTTGAGAGTAATATAACAAAAGTTGCAAGGTTTTTCTGCTGA
AGTCATTGCGCGATGGATAGAGTTGAATCATATACGTTTAATTTCTCCGGCGATCAGTCT
TCTTCTGAGTCTTTCTCTTCTTCTTCGACGTCCTCTTCAATTGGGAGGAACAGCGACGAC
GAAGAAGAGGTCCACGGCGACGGAGAAGAGAACAACGAAGCTGAGTCTTCCTACAAAGGG
CCTCTTGATTTGATGGAATCTCTCGAAGAAGTCTTGCCCGTTAGGAAAGGGATATCGAAC
TATTACAGCGGGAAGTCGAAGTCTTTCACGAACTTAGCGGTGGCTGCGTCGGCGATGACT
TCCTCCTCGTCGATGAAAGACCTGGCGAAGCCGGAGAATCCATACAGCCGTCGGAGGAGG
AACCTCCTCTGCCATCAGGTCTGGGAGATCGTACTCGGTGGCGGATATTCCGAGGTGTTT
TCCGGCGACGGCTAGTGGTGTTGGGTCCAGCGACTCGTAGGGATGTTAACAGTTGTTTTA
TTAATTAAATCTTATGTTCTAAAGTTTAACCCTTTTTAGTTTTTTTCTTTTTGGAGTAAC
GTCTGGAGAATGTATATACGAGTTTCAATCAAATCTTTGAAATGGATC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL7147Contig1 904 2 2 U
GACAGAGGATCAAGAAAGAAGCAACCCGAATGAAACAACTTCAGTGACAGAGAGAGAAGA
GAATAGTAGAGCCGTGGAGGAAGGTCTTCGGAAGCCGTTGCTGATTACTTCAGGACTCAA
GGTGGAAGACGAAGATGAAGAGGATTGCGATGAAAGCGAAGAGTCTGCAGAAGATTCTCG
CAGACCTGCAAATTCTTTCGGTGATGCATACCGACTTCTTACTCCATCTGTTAAGGTTCA
ACTGTTGATCTACTTCATGCTCAAATACGCCATGGAGATATTACTGTCTGAATCTAGCGT
GGTTACTTCATACTATTTTGGCTGGACAACAAGCTCCGTTGCCATCTTTCTGGCCTGCCT
TGGCCTCACGGTGCTACCAATCAACATTCTTGTGGGAAGTTACATCAGTAACATGTTTGA
AGACAGGCAAATCCTTTTGACATCTGAGATCATCGTCTTTATCGGGATCCTCTTCAGTTT
TAATCTGTTTGTTCCATACACCGTGCCTCAATACGTAATCTCTGGTCTAGTAATGTTTGT
CGCTGCTGAAGTACTCGAAGGTGTGAACCTATCGTTGTTATCGAGGGTAATGTCATCGAG
GCTATCAAAAGGAACTTACAACGGAGGATTGCTGTCGACGGAAGCTGGAACGTTGGCTAG
GGTTGTGGCGGATGCAACCATAACATTGGGAGGGTACTTGGGAAGAAACCATCTCTTGAA
TGCAACTCTTCTACCATCACTTGTCATCTGCGTTGGCTCCATTGTTGCTACTTGCTGTAC
TTATAACTCTCTCTATTGATATGTTTTTAAGAGATTTTGCTACCAAATTTTACAATATAG
AATAAAAAAAGGGACAGTGTGTGTGTATGATCCTCTCTTTATTTGATTATTTGTGATCAT
CTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2FR53TF U 1
AF RR2FR53JQ C 77
BS 1 622 RR2FR53TF
BS 623 904 RR2FR53JQ

RD RR2FR53TF 622 0 0
GACAGAGGATCAAGAAAGAAGCAACCCGAATGAAACAACTTCAGTGACAGAGAGAGAAGA
GAATAGTAGAGCCGTGGAGGAAGGTCTTCGGAAGCCGTTGCTGATTACTTCAGGACTCAA
GGTGGAAGACGAAGATGAAGAGGATTGCGATGAAAGCGAAGAGTCTGCAGAAGATTCTCG
CAGACCTGCAAATTCTTTCGGTGATGCATACCGACTTCTTACTCCATCTGTTAAGGTTCA
ACTGTTGATCTACTTCATGCTCAAATACGCCATGGAGATATTACTGTCTGAATCTAGCGT
GGTTACTTCATACTATTTTGGCTGGACAACAAGCTCCGTTGCCATCTTTCTGGCCTGCCT
TGGCCTCACGGTGCTACCAATCAACATTCTTGTGGGAAGTTACATCAGTAACATGTTTGA
AGACAGGCAAATCCTTTTGACATCTGAGATCATCGTCTTTATCGGGATCCTCTTCAGTTT
TAATCTGTTTGTTCCATACACCGTGCCTCAATACGTAATCTCTGGTCTAGTAATGTTTGT
CGCTGCTGAAGTACTCGAAGGTGTGAACCTATCGTTGTTATCGAGGGTAATGTCATCGAG
GCTATCAAAAGGAACTTACAAC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2FR53JQ 828 0 0
GAGGAAGGTCTTCGGAAGCCGTTGCTGATTACTTCAGGACTCAAGGTGGAAGACGAAGAT
GAAGAGGATTGCGATGAAAGCGAAGAGTCTGCAGAAGATTCTCGCAGACC*GCAAATTCT
TTCGGTGATGCATACCGACTTCTTACTCCATCTGTTAAGGTTCAACTGTTGATCTACTTC
ATGCTCAAATACGCCATGGAGATATTACTGTCTGAATCTAGCGTGGTTACTTCATACTAT
TTTGGCTGGACAACAAGCTCCGTTGCCATCTTTCTGGCCTGCCTTGGCCTCACGGTGCTA
CCAATCAACATTCTTGTGGGAAGTTACATCAGTAACATGTTTGAAGACAGGCAAATCCTT
TTGACATCTGAGATCATCGTCTTTATCGGGATCCTCTTCAGTTTTAATCTGTTTGTTCCA
TACACCGTGCCTCAATACGTAATCTCTGGTCTAGTAATGTTTGTCGCTGCTGAAGTACTC
GAAGGTGTGAACCTATCGTTGTTATCGAGGGTAATGTCATCGAGGCTATCAAAAGGAACT
TACAACGGAGGATTGCTGTCGACGGAAGCTGGAACGTTGGCTAGGGTTGTGGCGGATGCA
ACCATAACATTGGGAGGGTACTTGGGAAGAAACCATCTCTTGAATGCAACTCTTCTACCA
TCACTTGTCATCTGCGTTGGCTCCATTGTTGCTACTTGCTGTACTTATAACTCTCTCTAT
TGATATGTTTTTAAGAGATTTTGCTACCAAATTTTACAATATAGAATAAAAAAAGGGACA
GTGTGTGTGTATGATCCTCTCTTTATTTGATTATTTGTGATCATCTAC

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 2

CO CL7148Contig1 546 2 1 U
GGGCGCCTCCCTTGAGATTGCATACAATTCAGAGATCTGCTCCGTGAGGTGAAAATCTCA
ATGATTTATATAGTTTCTTGGGACGAGTTCGATGATCGATCTGTTCAGCTTTTTCGAGCT
GATCCCGATTCTGTAATATGTTATATTTTCCTAGTTTTTGGATTATAATACCTCGATTTG
ATAATTGATTTTGAATTTACATTGTTTCATTACCAAGTAGAATTTAATGTTTTTGTGGTG
CAGACACTGTATGTGATCAAATATTAGACACTGCGATGGCAAGTTGGTCCTCAAGGTTAC
TGATAACAAACATTGTCTTAAAGTTCAAGACAGACCAAGCGCAAGAAGCAAAGAAGATGG
AGAAACTCAATAACATTTTCTTCACCCTCATGGCCCGAGGACCTGACTTTGATCTTTCTG
AAGTCAACGGAAAGGAACATATGGAAACACAGCCTCTGAAGAAAGGAAGAGGAAGGAAGC
AACAAACTCTCATCAAACACTCTATTTTTTTCTTGGTATCAAGATTTTGATCCTTTTATA
AGTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2GD85JQ C 1
AF RR2GD85TF U 1
BS 1 546 RR2GD85TF

RD RR2GD85JQ 546 0 0
GGGCGCCTCCCTTGAGATTGCATACAATTCAGAGATCTGCTCCGTGAGGTGAAAATCTCA
ATGATTTATATAGTTTCTTGGGACGAGTTCGATGATCGATCTGTTCAGCTTTTTCGAGCT
GATCCCGATTCTGTAATATGTTATATTTTCCTAGTTTTTGGATTATAATACCTCGATTTG
ATAATTGATTTTGAATTTACATTGTTTCATTACCAAGTAGAATTTAATGTTTTTGTGGTG
CAGACACTGTATGTGATCAAATATTAGACACTGCGATGGCAAGTTGGTCCTCAAGGTTAC
TGATAACAAACATTGTCTTAAAGTTCAAGACAGACCAAGCGCAAGAAGCAAAGAAGATGG
AGAAACTCAATAACATTTTCTTCACCCTCATGGCCCGAGGACCTGACTTTGATCTTTCTG
AAGTCAACGGAAAGGAACATATGGAAACACAGCCTCTGAAGAAAGGAAGAGGAAGGAAGC
AACAAACTCTCATCAAACACTCTATTTTTTTCTTGGTATCAAGATTTTGATCCTTTTATA
AGTTAC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2GD85TF 546 0 0
GGGCGCCTCCCTTGAGATTGCATACAATTCAGAGATCTGCTCCGTGAGGTGAAAATCTCA
ATGATTTATATAGTTTCTTGGGACGAGTTCGATGATCGATCTGTTCAGCTTTTTCGAGCT
GATCCCGATTCTGTAATATGTTATATTTTCCTAGTTTTTGGATTATAATACCTCGATTTG
ATAATTGATTTTGAATTTACATTGTTTCATTACCAAGTAGAATTTAATGTTTTTGTGGTG
CAGACACTGTATGTGATCAAATATTAGACACTGCGATGGCAAGTTGGTCCTCAAGGTTAC
TGATAACAAACATTGTCTTAAAGTTCAAGACAGACCAAGCGCAAGAAGCAAAGAAGATGG
AGAAACTCAATAACATTTTCTTCACCCTCATGGCCCGAGGACCTGACTTTGATCTTTCTG
AAGTCAACGGAAAGGAACATATGGAAACACAGCCTCTGAAGAAAGGAAGAGGAAGGAAGC
AACAAACTCTCATCAAACACTCTATTTTTTTCTTGGTATCAAGATTTTGATCCTTTTATA
AGTTAC

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 2

CO CL7149Contig1 596 2 3 U
GGTATAAGATAACCAATAAATTTAATTCTGAAAGATAAGACAAATCTACTGGTACAAACG
GCACATATATTGACATGCCTATGGAAATATCAATAACAATATTTTTGATTTATTTAACCA
TATCAAAACCAGCTATAGTTGGTATACAATGTTTCAAAATATGTTTGATACATTGTTATT
ATTTGGCACAAGTCCAGAAACTCATACACTGTTTAAAAATTCTTTCAGCCGCTCCTATTA
GGTTAGGATCATTGTTCGATATAAAAAGATGTTGTAGGCAAACAGCCGCATTATTGTCGC
CAAACACCCTCTTACAACAGGCTTCTCCGTCCCATGGTTTTGCACCCCATGGTTGTTTGT
TTAAAGGATTAAATATGCAACTTGGCATCACGGCTCCCCATTGGTTTGGAATTTCCACCC
TCCCTTCAACGATTTTAATCAGAACTGGAAAGGATGACAAGAGAATGATGAAGGCAGTGG
GAATCAGTGGAGTGATCTTCATTATAGTGGCTTGTCAAATTTCCAACAAAAATGTATGCA
TGTGCGGAAATAACATATGTTTTCTTCGTTTTGTTTTATGTCTTTTATGTAAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT76JQB U 42
AF RR2GT76TF C 1
BS 1 41 RR2GT76TF
BS 42 462 RR2GT76JQB
BS 463 596 RR2GT76TF

RD RR2GT76JQB 421 0 0
AAATCTACTGGTACAAACGGCACATATATTGACATGCCTATGGAAATATCAATAACAATA
TTTTTGATTTATTTAACCATATCAAAACCAGCTATAGTTGGTATACAATGTTTCAAAATA
TGTTTGATACATTGTTATTATTTGGCACAAGTCCAGAAACTCATACACTGTTTAAAAATT
CTTTCAGCCGCTCCTATTAGGTTAGGATCATTGTTCGATATAAAAAGATGTTGTAGGCAA
ACAGCCGCATTATTGTCGCCAAACACCCTCTTACAACAGGCTTCTCCGTCCCATGGTTTT
GCACCCCATGGTTGTTTGTTTAAAGGATTAAATATGCAACTTGGCATCACGGCTCCCCAT
TGGTTTGGAATTTCCACCCTCCCTTCAACGATTTTAATCAGAACTGGAAAGGATGACAAG
A

QA 1 421 1 421
DS 

RD RR2GT76TF 596 0 0
GGTATAAGATAACCAATAAATTTAATTCTGAAAGATAAGACAAATCTACTGGTACAAACG
GCACATATATTGACATGCCTATGGAAATATCAATAACAATATTTTTGATTTATTTAACCA
TATCAAAACCAGCTATAGTTGGTATACAATGTTTCAAAATATGTTTGATACATTGTTATT
ATTTGGCACAAGTCCAGAAACTCATACACTGTTTAAAAATTCTTTCAGCCGCTCCTATTA
GGTTAGGATCATTGTTCGATATAAAAAGATGTTGTAGGCAAACAGCCGCATTATTGTCGC
CAAACACCCTCTTACAACAGGCTTCTCCGTCCCATGGTTTTGCACCCCATGGTTGTTTGT
TTAAAGGATTAAATATGCAACTTGGCATCACGGCTCCGCATTGGTTTGGAATTTCCACCC
TCGCTTCAACGATTTTAATCAGAGCTGGAAAGGATGACAAGAGAATGATGAAGGCAGTGG
GAATCAGTGGAGTGATCTTCATTATAGTGGCTTGTCAAATTTCCAACAAAAATGTATGCA
TGTGCGGAAATAACATATGTTTTCTTCGTTTTGTTTTATGTCTTTTATGTAAGACC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL7150Contig1 1028 2 4 U
TATGAGAGTTCGTGAATGGTACGGTTGGCATTTTCCCGAGCTTGCTAAGATCATCTCCGA
CAATATCCTGTATGCTAAGTCTGTAAAATTAATGGGGGATCGGATCAATGCAGCAAAGCT
AGACTTCTCTGAGATATTGGCTGGTGAAGTTGAAGCGGAACTAAAAGAGGCTTCTGTGAT
ATCTATGGGAACTGAAGTCAGCGACCTTGATTTGTTGCACATCAGGGAACTCTGCGACCA
GGTTCTGTCTCTTGCCGAGTACAGAGCTCAGCTTTATGACTACCTGAAGAGTAGGATGAA
CACAATCGCACCGAATCTGACTGCACTCGTTGGAGAGCTAGTCGGTGCTCGTCTGATTTC
TCACGGCGGTAGTCTGTTGAACCTCTCAAAGCAGCCTGGGAGCACGGTTCAGATTCTTGG
AGCTGAGAAGGCTCTATTTAGAGCCCTCAAGACTAAACACAACACTCCTAAATACGGTCT
GATTTACCATACTTCTCTTGTTGGCCAAGCTGCACCCAAGGACAAGGCTAAGATCTCACG
TTCACTAGCTGCAAAAGCTGCCCTTGCTATCCGGTGTGATGCTCTTGGTGATAGCGAAGA
CAACACTATGGGAGTTGAAAGCCGTTTAAAGGTTGAAACACGGTTGAGAAGTCTGGAAGG
GAAAGACATGGGACGTCTCTCTGGTTCAGCTAAAGGCAAACCAAAGATTGAAGTTTATGA
CAAGGATAAGAAGATTGGATCTGGGGGTCTGATCACTCCTGCTAAGACTTACAACACTGC
TGCAGACTCTCTTCTTGGACAAACTTCCACAGCTGAGAACAACGGTGCCAAGGAGAAGAA
AGATAAAAAGAAAAAGAAGAAGGCTGATGATGCAGAGGAAGAAGAAGCCAAAACCGGAAC
CTTCTAAGAAGAAGTCTAAGAAGAAGAAAACAGAAATAGAAGCTGAAGCCGAAGAGGCCA
AAACGGAGGAACCTTCAAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAACACGAGGAGGAAGAAACAGAAA
TGCCTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO91TF U 1
AF RR2FO91JQ C 354
BS 1 663 RR2FO91TF
BS 664 664 RR2FO91JQ
BS 665 685 RR2FO91TF
BS 686 1028 RR2FO91JQ

RD RR2FO91TF 685 0 0
TATGAGAGTTCGTGAATGGTACGGTTGGCATTTTCCCGAGCTTGCTAAGATCATCTCCGA
CAATATCCTGTATGCTAAGTCTGTAAAATTAATGGGGGATCGGATCAATGCAGCAAAGCT
AGACTTCTCTGAGATATTGGCTGGTGAAGTTGAAGCGGAACTAAAAGAGGCTTCTGTGAT
ATCTATGGGAACTGAAGTCAGCGACCTTGATTTGTTGCACATCAGGGAACTCTGCGACCA
GGTTCTGTCTCTTGCCGAGTACAGAGCTCAGCTTTATGACTACCTGAAGAGTAGGATGAA
CACAATCGCACCGAATCTGACTGCACTCGTTGGAGAGCTAGTCGGTGCTCGTCTGATTTC
TCACGGCGGTAGTCTGTTGAACCTCTCAAAGCAGCCTGGGAGCACGGTTCAGATTCTTGG
AGCTGAGAAGGCTCTATTTAGAGCCCTCAAGACTAAACACAACACTCCTAAATACGGTCT
GATTTACCATACTTCTCTTGTTGGCCAAGCTGCACCCAAGGACAAGGCTAAGATCTCACG
TTCACTAGCTGCAAAAGCTGCCCTTGCTATCCGGTGTGATGCTCTTGGTGATAGCGAAGA
CAACACTATGGGAGTTGAAAGCCGTTTAAAGGTTGAAACACGGTTGAGAAGTCTGGAAGG
GAA*GACATGGGACGTCTCTCTGGT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RR2FO91JQ 675 0 0
TGATTTCTCACGGCGGTAGTCTGTTGAACCTCTCAAAGCAGCCTGGGAGCACGGTTCAGA
TTCTTGGAGCTGAGAAGGCTCTATTTAGAGCCCTCAAGACTAAACACAACACTCCTAAAT
ACGGTCTGATTTACCATACTTCTCTTGTTGGCCAAGCTGCACCCAAGGACAAGGCTAAGA
TCTCACGTTCACTAGCTGCAAAAGCTGCCCTTGCTATCCGGTGTGATGCTCTTGGTGATA
GCGAAGACAACACTATGGGAGTTGAAAGCCGTTTAAAGGTTGAAACACGGTTGAGAAGTC
TGGAAGGGAAAGACATGGGACGTCTCTCTGGTTCAGCTAAAGGCAAACCAAAGATTGAAG
TTTATGACAAGGATAAGAAGATTGGATCTGGGGGTCTGATCACTCCTGCTAAGACTTACA
ACACTGCTGCAGACTCTCTTCTTGGACAAACTTCCACAGCTGAGAACAACGGTGCCAAGG
AGAAGAAAGATAAAAAGAAAAAGAAGAAGGCTGATGATGCAGAGGAAGAAGAAGCCAAAA
CCGGAACCTTCTAAGAAGAAGTCTAAGAAGAAGAAAACAGAAATAGAAGCTGAAGCCGAA
GAGGCCAAAACGGAGGAACCTTCAAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAACACGAGGAGGAAGAA
ACAGAAATGCCTGCC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL7151Contig1 439 2 2 U
GGCCGCCGCAGCTTCCTCGAGGCGGCTCAGGGCGTTCGAGCTTCAGCAATCGCAGTCTTC
TCGCAAGGCTGAGTTGAATAAAGAGAGGAGCCTTAGATCTCTCGCTAAATCGCTCACCGT
GTGGCTCAATTTCTTGTTCGAGAACCCTGAGAGTTGCGGTTGCGATCCGTTAGAGAAGGG
ATCTGCTGTTGTTAGTCTCTCCCTGACCAAGAGAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTT
AGGAAGAATAATCTCTGATACTGCTGAATAAAACCTTGTGTTGTGTCTTCTGTTTCCGAT
GATGGTGTGCTCTGCCTTCGTTCTCTTTTAGCTTTGGTTTCTGTGTGTTTCCTAATAATA
CGTGAGGGCAAGCGTCAGTGTTTGTGTGGTGGTTTGTATTGGATCCTAAGTAGTGCATTT
TAAAATAAAGTTTGTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E523TF U 1
AF RR2E523JQ C 1
BS 1 408 RR2E523TF
BS 409 439 RR2E523JQ

RD RR2E523TF 408 0 0
GGCCGCCGCAGCTTCCTCGAGGCGGCTCAGGGCGTTCGAGCTTCAGCAATCGCAGTCTTC
TCGCAAGGCTGAGTTGAATAAAGAGAGGAGCCTTAGATCTCTCGCTAAATCGCTCACCGT
GTGGCTCAATTTCTTGTTCGAGAACCCTGAGAGTTGCGGTTGCGATCCGTTAGAGAAGGG
ATCTGCTGTTGTTAGTCTCTCCCTGACCAAGAGAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTT
AGGAAGAATAATCTCTGATACTGCTGAATAAAACCTTGTGTTGTGTCTTCTGTTTCCGAT
GATGGTGTGCTCTGCCTTCGTTCTCTTTTAGCTTTGGTTTCTGTGTGTTTCCTAATAATA
CGTGAGGGCAAGCGTCAGTGTTTGTGTGGTGGTTTGTATTGGATCCTA

QA 1 408 1 408
DS 

RD RR2E523JQ 439 0 0
GGCCGCCGCAGCTTCCTCGAGGCGGCTCAGGGCGTTCGAGCTTCAGCAATCGCAGTCTTC
TCGCAAGGCTGAGTTGAATAAAGAGAGGAGCCTTAGATCTCTCGCTAAATCGCTCACCGT
GTGGCTCAATTTCTTGTTCGAGAACCCTGAGAGTTGCGGTTGCGATCCGTTAGAGAAGGG
ATCTGCTGTTGTTAGTCTCTCCCTGACCAAGAGAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTT
AGGAAGAATAATCTCTGATACTGCTGAATAAAACCTTGTGTTGTGTCTTCTGTTTCCGAT
GATGGTGTGCTCTGCCTTCGTTCTCTTTTAGCTTTGGTTTCTGTGTGTTTCCTAATAATA
CGTGAGGGCAAGCGTCAGTGTTTGTGTGGTGGTTTGTATTGGATCCTAAGTAGTGCATTT
TAAAATAAAGTTTGTTTCC

QA 1 439 1 439
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7153Contig1 700 2 4 U
GGGACACAACCAATCACTTTATATTCTATAGCAATAACACTAAATATATACTCTCATGGC
TGCTAAATTTATTACCCTTGCTCAAGTCCACCGCCCCAAAATCTCAATCTCAACCAGAAA
ACCTCGTAGATACAACCAAAACAAGCCCCGACCATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTT
CAGCAATGTTTTTCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTC
AGACCCTCTTACTAATTCAGTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTGAAAGAAGAGGAGTC
AACTCAACAAGAACACCGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGACGACGGTAAGTCGAT
CACCGCAACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAAGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTA
CATGAAATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGCTTTC
TTGTGATTCTTCTGCTGGAAGTAGCACTACGGTTGTGGTCGATCCATATTTTTCTGTTCC
AGTTTTACCTTACAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACGTGATTAAAAGTTGTATT
TAGCATTTCGTTGTGTTGTAATGTGTTGAAAGTCCACATATATGTTAAAAATACGTCAAC
TTATGTAACTAATATTGTTGTATTTAAATTAATTCCGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ90TF U 1
AF RR2BQ90JQ C 224
BS 1 650 RR2BQ90TF
BS 651 651 RR2BQ90JQ
BS 652 682 RR2BQ90TF
BS 683 700 RR2BQ90JQ

RD RR2BQ90TF 682 0 0
GGGACACAACCAATCACTTTATATTCTATAGCAATAACACTAAATATATACTCTCATGGC
TGCTAAATTTATTACCCTTGCTCAAGTCCACCGCCCCAAAATCTCAATCTCAACCAGAAA
ACCTCGTAGATACAACCAAAACAAGCCCCGACCATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTT
CAGCAATGTTTTTCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTC
AGACCCTCTTACTAATTCAGTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTGAAAGAAGAGGAGTC
AACTCAACAAGAACACCGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGACGACGGTAAGTCGAT
CACCGCAACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAAGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTA
CATGAAATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGCTTTC
TTGTGATTCTTCTGCTGGAAGTAGCACTACGGTTGTGGTCGATCCATATTTTTCTGTTCC
AGTTTTACCTTACAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACGTGATTAAAAGTTGTATT
TAGCATTTCGTTGTGTTGTAATGTGTTGAAAGTCCACATATATGTTAAAA*TACGTCAAC
TTATGTAACTAATATTGTTGTA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2BQ90JQ 477 0 0
AATGACCTAAACAATTCAGACCCTCTTACTAATTCAGTACTTTTTATGGAACATCAGCCA
GTGAAAGAAGAGGAGTCAACTCAACAAGAACACCGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAA
GACGACGGTAAGTCGATCACCGCAACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAAGTTGCTCAG
TTAAGCTTGTTGTGGTACATGAAATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCG
TTTTACAATGAGCTTTCTTGTGATTCTTCTGCTGGAAGTAGCACTACGGTTGTGGTCGAT
CCATATTTTTCTGTTCCAGTTTTACCTTACAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACG
TGATTAAAAGTTGTATTTAGCATTTCGTTGTGTTGTAATGTGTTGAAAGTCCACATATAT
GTTAAAAATACGTCAACTTATGTAACTAATATTGTTGTATTTAAATTAATTCCGTGC

QA 1 477 1 477
DS 



AS 1 2

CO CL7154Contig1 1113 2 2 U
GGGAGAATTGAAGAGACAAAGCCTCGATGTCTTGAAGAACACCGTAGATCTCTTTGATCT
TGTTCTTTTTGATGATAGCCCGTGTGAGCGTTTGGCAATCTGAGAAGAATCTGATGGAGG
TGAGTTCTTCTGCCAGAGCTCTCTCCATCCGGCGGCGGAGAGCAAGAGCTTCAGCCATAA
GAGGAGAGGTCACTGATTCAAGAGTTTGCATGTCGGAGATGGGGCAAGTCGACGAAACCC
GATGCGATTTGCTGATGGTGGAGAGGGGTGGATCGAGGCGGATGACGATCGTTGCTGGGG
CTGGAGGATTTGTTTTCGAAGATCAGGCGGTTACGAGCGATCCATAGCTGCCAGCAGACC
TAGGGGATGATTGAGATTCTCACGCCAGATGGGAGGATGCATATAGTGTTCCGATGATGG
ACCAAGAGGTCTGTAAAAGTCCTAAACTCACTCAGCTAGGTGAACTGAGGTCTTGATGGG
GAGGAGGTTCCATACTTCTTTCGCATAAGGGCATTGCCAGAAGACATGTAGCGTTGTCTC
CACTACCTTGCATCTTGGGCAAAACGCTCCTGCATTCATTCCTCTCCTTTGTAGTTCTGC
TCCCACAGGAGGTGCTACAACCATGTTTTGCTGATGAGGGGGTAGCAGGCAGGTCGCCTT
TGAGTTGTAGCCAGACCGGATGGAGTATTCTCCTGATTTAAGCGGTAGCCAGACGTGAAT
ATCTTCAGCTCCTTTCCTATTAGGCCTTAGATTTTGGATTTGTCTGCTGAAGTCAGGTTT
TCCTTCAGGAGGTCTCTACCATGTAGGATACTTCTCCAGCCGTGGGAGTACACCGAGGGG
ACTTGGGCGTCGAGGAAGCTTCTCTTGTGGCAATACTTGCCTTTCAAAACTCGCGCTAGC
AGGCAACTTGGCGATGTAAGTATCCTCCATGCAACTTTAGCGAGTAGGACTTGGTTGAAT
AATTGTATATCTCTCAAACCTAGACTTCCTGATGACTTAGGTTTAGTGAGCTTTTGCCAT
GCAATCGAACTCATTTTCCTTTTATCTTGCGAATGACTTAGGGCGTGGTTCAGTTTATTA
AACATTTTGTCACTTTGCATTTATCTTATCCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU80TF U 1
AF RR2CU80JQ C 326
BS 1 644 RR2CU80TF
BS 645 1113 RR2CU80JQ

RD RR2CU80TF 644 0 0
GGGAGAATTGAAGAGACAAAGCCTCGATGTCTTGAAGAACACCGTAGATCTCTTTGATCT
TGTTCTTTTTGATGATAGCCCGTGTGAGCGTTTGGCAATCTGAGAAGAATCTGATGGAGG
TGAGTTCTTCTGCCAGAGCTCTCTCCATCCGGCGGCGGAGAGCAAGAGCTTCAGCCATAA
GAGGAGAGGTCACTGATTCAAGAGTTTGCATGTCGGAGATGGGGCAAGTCGACGAAACCC
GATGCGATTTGCTGATGGTGGAGAGGGGTGGATCGAGGCGGATGACGATCGTTGCTGGGG
CTGGAGGATTTGTTTTCGAAGATCAGGCGGTTACGAGCGATCCATAGCTGCCAGCAGACC
TAGGGGATGATTGAGATTCTCACGCCAGATGGGAGGATGCATATAGTGTTCCGATGATGG
ACCAAGAGGTCTGTAAAAGTCCTAAACTCACTCAGCTAGGTGAACTGAGGTCTTGATGGG
GAGGAGGTTCCATACTTCTTTCGCATAAGGGCATTGCCAGAAGACATGTAGCGTTGTCTC
CACTACCTTGCATCTTGGGCAAAACGCTCCTGCATTCATTCCTCTCCTTTGTAGTTCTGC
TCCCACAGGAGGTGCTACAACCATGTTTTGCTGATGAGGGGGTA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2CU80JQ 788 0 0
GGCGGTTACGAGCGATCCATAGCTGCCAGCAGAC*TAGGGGATGATTGAGATTCTCACGC
CAGATGGGAGGATGCATATAGTGTTCCGATGATGGACCAAGAGGTCTGTAAAAGTCCTAA
ACTCACTCAGCTAGGTGAACTGAGGTCTTGATGGGGAGGAGGTTCCATACTTCTTTCGCA
TAAGGGCATTGCCAGAAGACATGTAGCGTTGTCTCCACTACCTTGCATCTTGGGCAAAAC
GCTCCTGCATTCATTCCTCTCCTTTGTAGTTCTGCTCCCACAGGAGGTGCTACAACCATG
TTTTGCTGATGAGGGGGTAGCAGGCAGGTCGCCTTTGAGTTGTAGCCAGACCGGATGGAG
TATTCTCCTGATTTAAGCGGTAGCCAGACGTGAATATCTTCAGCTCCTTTCCTATTAGGC
CTTAGATTTTGGATTTGTCTGCTGAAGTCAGGTTTTCCTTCAGGAGGTCTCTACCATGTA
GGATACTTCTCCAGCCGTGGGAGTACACCGAGGGGACTTGGGCGTCGAGGAAGCTTCTCT
TGTGGCAATACTTGCCTTTCAAAACTCGCGCTAGCAGGCAACTTGGCGATGTAAGTATCC
TCCATGCAACTTTAGCGAGTAGGACTTGGTTGAATAATTGTATATCTCTCAAACCTAGAC
TTCCTGATGACTTAGGTTTAGTGAGCTTTTGCCATGCAATCGAACTCATTTTCCTTTTAT
CTTGCGAATGACTTAGGGCGTGGTTCAGTTTATTAAACATTTTGTCACTTTGCATTTATC
TTATCCAA

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL7155Contig1 939 2 2 U
GGGTCCGAATCCTGATCGTCAGAGCAATTTCCAACGACTTACCGAAGGAGTTATCTCCCC
GCTTAGGCCTGAGAAAGAAAGATTACAAGTAGGCGACTCTGTTCTGTTCTTACTAAGATG
GGATCAAAAACTCCTTCCACATCGACTCATGAAGCCAATGCTCCTCCTGTAGATGAAAGG
TCTAAAAAAGGTAAAGTACCCAAAAGGATTAACAAGGCTGTTAGGGAGAGGCTTAAACGC
GAGCAATTGAATGATCTTTTCATCGAATTAGCTGATTCACTTGAGCTGAATCAGCAGAAC
AGTGGAAAAGCTTCGGTACTGTGTGAAGCTACTCGGTTCTTGAAGGACGTGTTTGGTCAG
ATTGAGTCTCTTAGAAAAGAGCACACGTCCCTCCTCTCTGAATCTAACTACGTAACCACA
GAGAAGAATGAGCTCAAGGAAGAAACATCAGTGCTCGAGACGGAGATCTCTAGACTACAA
TCCGAGATAGAAGCAAGAGTGAATCAGGCCAAACCAGACTTGAACACCTCTCCTGCGCCT
GAGTACCATCATCATCATCATCACTATCAACAACATGCCGAGCTTGCATCCCAGTTTTCA
GGACTTCCCATTTTCCAAGGCGCCGCCGGCTTTCACCAATTTTTTGCTGCGGCTCCTCCT
CCTCCTGGTTCCACAGTTTTTGTCCTTCCGATGCAACCTGATCTCCAGACACAAGCGCCT
TTGATGTATAATAATAATAGCTCAAATGTGAGTAAGCCGTGTCCAAGATATGCTAGCGCG
GCTGACTCGTGGCCTTTTCGGCTACTTGGAGAGCGTTTGAAAGCTAATGAATGAGAGTCT
TTTAAGTGTCCTTTTGGGTTTTGGCCTGAGCCATTTTTTGTTTTTGTTGTGGTTTGTTCA
TAGGATCAGAGCTTTTGTGACAAATAAGGAAATTTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F112TF U 1
AF RR2F112JQ C 183
BS 1 594 RR2F112TF
BS 595 939 RR2F112JQ

RD RR2F112TF 594 0 0
GGGTCCGAATCCTGATCGTCAGAGCAATTTCCAACGACTTACCGAAGGAGTTATCTCCCC
GCTTAGGCCTGAGAAAGAAAGATTACAAGTAGGCGACTCTGTTCTGTTCTTACTAAGATG
GGATCAAAAACTCCTTCCACATCGACTCATGAAGCCAATGCTCCTCCTGTAGATGAAAGG
TCTAAAAAAGGTAAAGTACCCAAAAGGATTAACAAGGCTGTTAGGGAGAGGCTTAAACGC
GAGCAATTGAATGATCTTTTCATCGAATTAGCTGATTCACTTGAGCTGAATCAGCAGAAC
AGTGGAAAAGCTTCGGTACTGTGTGAAGCTACTCGGTTCTTGAAGGACGTGTTTGGTCAG
ATTGAGTCTCTTAGAAAAGAGCACACGTCCCTCCTCTCTGAATCTAACTACGTAACCACA
GAGAAGAATGAGCTCAAGGAAGAAACATCAGTGCTCGAGACGGAGATCTCTAGACTACAA
TCCGAGATAGAAGCAAGAGTGAATCAGGCCAAACCAGACTTGAACACCTCTCCTGCGCCT
GAGTACCATCATCATCATCATCACTATCAACAACATGCCGAGCTTGCATCCCAG

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2F112JQ 757 0 0
TAAAAAAGGTAAAGTACCCAAAAGGATTAACAAGGCTGTTAGGGAGAGGCTTAAACGCGA
GCAATTGAATGATCTTTTCATCGAATTAGCTGATTCACTTGAGCTGAATCAGCAGAACAG
TGGAAAAGCTTCGGTACTGTGTGAAGCTACTCGGTTCTTGAAGGACGTGTTTGGTCAGAT
TGAGTTTTTTAGAAAAGAGCACACGTCCCTCCTCTTTGAATCTAACTACGTAACCACAGA
GAAGAATGAGCTCAAGGAAGAAACATCAGTGCTCGAGACGGAGATCTCTAGACTACAATC
CGAGATAGAAGCAAGAGTGAATCAGGCCAAACCAGACTTGAACACCTTTCCTGCGCCTGA
GTACCATCATCATCATCATCACTATCAACAACATGCCGAGCTTGCATCCCAGTTTTCAGG
ACTTCCCATTTTCCAAGGCGCCGCCGGCTTTCACCAATTTTTTGCTGCGGCTCCTCCTCC
TCCTGGTTCCACAGTTTTTGTCCTTCCGATGCAACCTGATCTCCAGACACAAGCGCCTTT
GATGTATAATAATAATAGCTCAAATGTGAGTAAGCCGTGTCCAAGATATGCTAGCGCGGC
TGACTCGTGGCCTTTTCGGCTACTTGGAGAGCGTTTGAAAGCTAATGAATGAGAGTCTTT
TAAGTGTCCTTTTGGGTTTTGGCCTGAGCCATTTTTTGTTTTTGTTGTGGTTTGTTCATA
GGATCAGAGCTTTTGTGACAAATAAGGAAATTTAGCT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL7156Contig1 807 2 12 U
GGAGAGAAGAATCGCAGATTCAAAGAGATCTGAAGAGTCACACATCACCACGACTCCATT
CTTCAGATCTCATGATTTGAACTATCACTCGGTGATCGAAGATAGTCAGCGACGATGGAA
TCCGATGGAGAAACCGCGGGGAAGCCGGGCGTTGGTGGGCAGATATGCCAGATCTGTCAT
GATAATGTTGGCAAGACTGTTGATGGCGATCGGTTCGCCGTGTTTCAAGGTTTTCTCAAA
GTCCTTGCTGGTATCGACACAAACTTCACAGTCACGTCAAAAGCTTCGGACGAGGACGGA
GACTTCGCGGAGCTCTACATGTTCAAATGGACGACGCTTCTGATTCCGCCGACGACGCTG
CTCATTGTAAACCTCGTGGGAGTTGTTGCGGGTTTCTCGTACGCCATCAACAGTGGATAC
CAGTCGTGGGGACCGCTCTTTGGTAAGCTGTTCTTCGCCTTTTGGGTGATTGTTCACTTG
TACCCTTTCCTCAAGGGTTTGATGGGGAGACAGAACAGGACTCCTACTATTGTTGTGGTC
TGGTCTGTTCTCTTGGCTTCGATCTTCTCCTTGTTGTGGGTTAGGATCGATCCTTTCACT
AAAAGAGTCACTGGCCCGGACATACTTGAATGTGGAATCAACTGTTGAGAAGTGTGAGCA
ATAATATGCTTTTGGGGTTAAAAAAACACTTAATTATAAAGTTCATATCTATTGTTTTAT
TTGTTTTGTGTATTGTCTGTTGTGTCGTGGTGTAAGATTAAACAGTATTTTTGTTAATGT
GATGAAGATGCAAAGCCAGTGGATGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX69TF U 1
AF RR2FX69JQ C 61
BS 1 685 RR2FX69TF
BS 686 686 RR2FX69JQ
BS 687 699 RR2FX69TF
BS 700 700 RR2FX69JQ
BS 701 726 RR2FX69TF
BS 727 727 RR2FX69JQ
BS 728 749 RR2FX69TF
BS 750 750 RR2FX69JQ
BS 751 754 RR2FX69TF
BS 755 755 RR2FX69JQ
BS 756 771 RR2FX69TF
BS 772 807 RR2FX69JQ

RD RR2FX69TF 772 0 0
GGAGAGAAGAATCGCAGATTCAAAGAGATCTGAAGAGTCACACATCACCACGACTCCATT
CTTCAGATCTCATGATTTGAACTATCACTCGGTGATCGAAGATAGTCAGCGACGATGGAA
TCCGATGGAGAAACCGCGGGGAAGCCGGGCGTTGGTGGGCAGATATGCCAGATCTGTCAT
GATAATGTTGGCAAGACTGTTGATGGCGATCGGTTCGCCGTGTTTCAAGGTTTTCTCAAA
GTCCTTGCTGGTATCGACACAAACTTCACAGTCACGTCAAAAGCTTCGGACGAGGACGGA
GACTTCGCGGAGCTCTACATGTTCAAATGGACGACGCTTCTGATTCCGCCGACGACGCTG
CTCATTGTAAACCTCGTGGGAGTTGTTGCGGGTTTCTCGTACGCCATCAACAGTGGATAC
CAGTCGTGGGGACCGCTCTTTGGTAAGCTGTTCTTCGCCTTTTGGGTGATTGTTCACTTG
TACCCTTTCCTCAAGGGTTTGATGGGGAGACAGAACAGGACTCCTACTATTGTTGTGGTC
TGGTCTGTTCTCTTGGCTTCGATCTTCTCCTTGTTGTGGGTTAGGATCGATCCTTTCACT
AAAAGAGTCACTGGCCCGGACATACTTGAATGTGGAATCAACTGTTGAGAAGTGTGAGCA
ATAATATGCTTTTGGGGTTAAAAAA*CACTTAATTATAA*GTTCATATCTATTGTTTTAT
TTGTTT*GTGTATTGTCTGTTGTGTCGTG*TGTA*GATTAAACAGTATTTT
G

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2FX69JQ 747 0 0
CTTCAGATCTCATGATTTGAACTATCACTCGGTGATCGAAGATAGTCAGCGACGATGGAA
TCCGATGGAGAAACCGCGGGGAAGCCGGGCGTTGGTGGGCAGATATGCCAGATCTGTCAT
GATAATGTTGGCAAGACTGTTGATGGCGATCGGTTCGCCGTGTTTCAAGGTTTTCTCAAA
GTCCTTGCTGGTATCGACACAAACTTCACAGTCACGTCAAAAGCTTCGGACGAGGACGGA
GACTTCGCGGAGCTCTACATGTTCAAATGGACGACGCTTCTGATTCCGCCGACGACGCTG
CTCATTGTAAACCTCGTGGGAGTTGTTGCGGGTTTCTCGTACGCCATCAACAGTGGATAC
CAGTCGTGGGGACCGCTCTTTGGTAAGCTGTTCTTCGCCTTTTGGGTGATTGTTCACTTG
TACCCTTTCCTCAAGGGTTTGATGGGGAGACAGAACAGGACTCCTACTATTGTTGTGGTC
TGGTCTGTTCTCTTGGCTTCGATCTTCTCCTTGTTGTGGGTTAGGATCGATCCTTTCACT
AAAAGAGTCACTGGCCCGGACATACTTGAATGTGGAATCAACTGTTGAGAAGTGTGAGCA
ATAATATGCTTTTGGGGTTAAAAAAACACTTAATTATAAAGTTCATATCTATTGTTTTAT
TTGTTTTGTGTATTGTCTGTTGTGTCGTGGTGTAAGATTAAACAGTATTTTTGTTAATGT
GATGAAGATGCAAAGCCAGTGGATGAT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL7157Contig1 549 2 1 U
GATTAAACTAAATCAATATGGATGGGGCTAAAAAAAATGCAAGAAGATACCAAAGAAATA
AAATAAGTATCTATATGTAATGAATTCCAAGGTTTCGGCATAAGAAAAAGTGGAAAGACA
TCATAATGAGATCCTAATCTCAAAGCAAAAAGGGGGATATGGCGGAATTGGTAGACGCTA
CGGACTTAATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCA
GAGAAACCCTGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATTCTGAGTTACGCGAACAAA
CCAGAGCTTAGAAAGCGGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGA
GTTCAATCCCTTGTGTTGAATCAAATGATTCACTTCATAGTCTGATAGATCCTTGGTGGA
ACTTATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACTGACAACA
ATGAAATTTATAGTAAGATGAAAATCCGTTGACTTTTAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCC
TCTATCCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AE89JQ C 1
AF RR2AE89TF U 1
BS 1 549 RR2AE89TF

RD RR2AE89JQ 549 0 0
GATTAAACTAAATCAATATGGATGGGGCTAAAAAAAATGCAAGAAGATACCAAAGAAATA
AAATAAGTATCTATATGTAATGAATTCCAAGGTTTCGGCATAAGAAAAAGTGGAAAGACA
TCATAATGAGATCCTAATCTCAAAGCAAAAAGGGGGATATGGCGGAATTGGTAGACGCTA
CGGACTTAATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCA
GAGAAACCCTGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATTTTGAGTTACGCGAACAAA
CCAGAGCTTAGAAAGCGGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGA
GTTCAATCCCTTGTGTTGAATCAAATGATTCACTTCATAGTCTGATAGATCCTTGGTGGA
ACTTATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACTGACAACA
ATGAAATTTATAGTAAGATGAAAATCCGTTGACTTTTAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCC
TCTATCCCC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RR2AE89TF 549 0 0
GATTAAACTAAATCAATATGGATGGGGCTAAAAAAAATGCAAGAAGATACCAAAGAAATA
AAATAAGTATCTATATGTAATGAATTCCAAGGTTTCGGCATAAGAAAAAGTGGAAAGACA
TCATAATGAGATCCTAATCTCAAAGCAAAAAGGGGGATATGGCGGAATTGGTAGACGCTA
CGGACTTAATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACTAAGTGATAACTTTCAAATTCA
GAGAAACCCTGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATTCTGAGTTACGCGAACAAA
CCAGAGCTTAGAAAGCGGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAATGGA
GTTCAATCCCTTGTGTTGAATCAAATGATTCACTTCATAGTCTGATAGATCCTTGGTGGA
ACTTATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACTGACAACA
ATGAAATTTATAGTAAGATGAAAATCCGTTGACTTTTAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCC
TCTATCCCC

QA 1 549 1 549
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7159Contig1 732 2 1 U
GGGCAGGACTCCGGTTCTTGTTGCAACTGATGTCGCTGCTCGTGGACTGGACGTTAAGGA
CATTAGGGCGGTCATAAACTATGATTTCCCCAATGGAGTGGAAGACTATGTTCATAGAAT
CGGAAGAACAGGAAGAGCTGGAGCGACTGGTCAGGCATTCACATTCTTTGGCGATCCAGA
CTCGAAGCATGCTTCGGATCTGATCAAGATCTTGGAAGGAGCAGATCAGAGAGTTCCTCC
TCAGATCCGCGAAATGGCTGCACGTGGTGGTGGGATGAACAAATTCAGCCGTTGGGGTCC
TCCTGGAGGTCGTGGTGGTCGTGGCAGTGGCTCTGGTTATGGTGGCAGAGTTAGCTTCGG
TTCACGTGACAGTGGAATGGGAAGCGGAAGCAGTAATGGATGGGCAAGAGATCGTGATAG
GAGTCGTAGCCCGGAGAGATTCAACAGAGTTCCACCACCGTCTTCCAATGGATCTCCTCC
TCGCAGCTTCCACTAGGCCATGTTGAAACACACTGATAAAGAGCAAACAAACTCGAGCCT
ACTGCTCAAATGAAGGTGTTATTGGGAGAATATTTCTTACATCAAATGACGCATTATATT
TTTTTTTTGGCCGATGATGTTAAACTAGAATTGTCTGTTTTCTTATGTATTTCCTTATGT
GTTATACTCCGACTTCCGCAGATTTGATACTCAGAAATTGTTGTTTAGATATGGGATACT
TATTTTAGCTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B551JQ C 1
AF RR2B551TF U 1
BS 1 732 RR2B551TF

RD RR2B551JQ 732 0 0
GGGCAGGACTCCGGTTCTTGTTGCAACTGATGTCGCTGCTCGTGGACTGGACGTTAAGGA
CATTAGGGCGGTCATAAACTATGATTTCCCCAATGGAGTGGAAGACTATGTTCATAGAAT
CGGAAGAACAGGAAGAGCTGGAGCGACTGGTCAGGCATTCACATTCTTTGGCGATCCAGA
CTCGAAGCATGCTTCGGATCTGATCAAGATCTTGGAAGGAGCAGATCAGAGAGTTCCTCC
TCAGATCCGCGAAATGGCTGCACGTGGTGGTGGGATGAACAAATTCAGCCGTTGGGGTCC
TCCTGGAGGTCGTGGTGGTCGTGGCAGTGGCTCTGGTTATGGTGGCAGAGTTAGCTTCGG
TTCACGTGACAGTGGAATGGGAAGCGGAAGCAGTAATGGATGGGCAAGAGATCGTGATAG
GAGTCGTAGCCCGGAGAGATTCAACAGAGTTCCACCACCGTCTTCCAATGGATCTCCTCC
TCGCAGCTTCCACTAGGCCATGTTGAAACACACTGATAAAGAGCAAACAAACTCGAGCCT
ACTGCTCAAATGAAGGTGTTATTGGGAGAATATTTCTTACATCAAATGACGCATTATATT
TTTTTTTTGGCCGATGATGTTAAACTAGAATTGTCTGTTTTCTTATGTATTTCCTTATGT
GTTATACTCCGACTTCCGCAGATTTGATACTCAGAAATTGTTGTTTAGATATGGGATACT
TATTTTAGCTTG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2B551TF 732 0 0
GGGCAGGACTCCGGTTCTTGTTGCAACTGATGTCGCTGCTCGTGGACTGGACGTTAAGGA
CATTAGGGCGGTCATAAACTATGATTTCCCCAATGGAGTGGAAGACTATGTTCATAGAAT
CGGAAGAACAGGAAGAGCTGGAGCGACTGGTCAGGCATTCACATTCTTTGGCGATCCAGA
CTCGAAGCATGCTTCGGATCTGATCAAGATCTTGGAAGGAGCAGATCAGAGAGTTCCTCC
TCAGATCCGCGAAATGGCTGCACGTGGTGGTGGGATGAACAAATTCAGCCGTTGGGGTCC
TCCTGGAGGTCGTGGTGGTCGTGGCAGTGGCTCTGGTTATGGTGGCAGAGTTAGCTTCGG
TTCACGTGACAGTGGAATGGGAAGCGGAAGCAGTAATGGATGGGCAAGAGATCGTGATAG
GAGTCGTAGCCCGGAGAGATTCAACAGAGTTCCACCACCGTCTTCCAATGGATCTCCTCC
TCGCAGCTTCCACTAGGCCATGTTGAAACACACTGATAAAGAGCAAACAAACTCGAGCCT
ACTGCTCAAATGAAGGTGTTATTGGGAGAATATTTCTTACATCAAATGACGCATTATATT
TTTTTTTTGGCCGATGATGTTAAACTAGAATTGTCTGTTTTCTTATGTATTTCCTTATGT
GTTATACTCCGACTTCCGCAGATTTGATACTCAGAAATTGTTGTTTAGATATGGGATACT
TATTTTAGCTTG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL7160Contig1 925 2 4 U
GGGGAAACAGAAATGTACAAAACTCAACTCTTATCCCTCTCCGCTTGTACCGTTAGTCCA
AATCTTCCCTTCCTTGTCTCCCAGAGTCGAACACTTTCTCTCCACAACAAACTCAACTCT
TATCCCTCTCTGGTCGCTGTTTCTGCTAATTCCGACAACATCGCCGGCGAAAATGACGAC
GGGGTGTCGGAAGTAGAGAAGAAAGGGTCGGGAACGACGGCGAGAGGAAGGAGACTACTC
AAAGTTAGAGAAGAGAAGAGAAAACGTGACTACGATCGTCTCCACGATTACCCATCTTGG
GCCAAGGTACTTGAGACTGCTTGTAAAGATGATGAAGAGCTTCGAGCTGTTCTTGGTGAT
AGCATTGGAAACCCTGAGCTCATGAGAAAGAAGGTCGAGGAAAGGGTAAGGAAGAAGGGA
AAAGATTTCCAGAAGCAGAAGACTGGCTCTGTGCTTTCTTTCAAAGTTAGCTTCAGAGAT
TTCAATCCTGTTGACTCCTTCATATGGTTTGAGCTCTATGGATCGCCTTCAGATCGAGAT
GTTGATCTTTTTGGAAGTGTTATACAGGCATGGTATGTTATGGGGGAGATTGGGGCGCTT
TCAATACATCCAACTTGCAGCTAGCAAACTCATCTATGGGAATATGATCCTCTCTACGAC
GCAGAGAAAGGGCTTCAAAGTGATGCCTTCATCCTTCCATGACATCAGCGACGTTGAATT
TCACGACAACTGGGGTCGTGTCTGGGTTGATCTAGGCACTTCTGATATATTCGCCCTGGA
TGTGCTTCTCAACAGTTTGACTGTCATGAGTTCAGAGTACTTGGGCATTCAACAAGTAGT
ATTTGGTGGTAAAAGAACGGGAGATTGGGAGGAGGGGATGACAAATCCTGATTTTGGTTA
CAAGTACTTCAAGATATGAAGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AN32TF U 1
AF RR2AN32JQ C 123
BS 1 755 RR2AN32TF
BS 756 756 RR2AN32JQ
BS 757 829 RR2AN32TF
BS 830 925 RR2AN32JQ

RD RR2AN32TF 829 0 0
GGGGAAACAGAAATGTACAAAACTCAACTCTTATCCCTCTCCGCTTGTACCGTTAGTCCA
AATCTTCCCTTCCTTGTCTCCCAGAGTCGAACACTTTCTCTCCACAACAAACTCAACTCT
TATCCCTCTCTGGTCGCTGTTTCTGCTAATTCCGACAACATCGCCGGCGAAAATGACGAC
GGGGTGTCGGAAGTAGAGAAGAAAGGGTCGGGAACGACGGCGAGAGGAAGGAGACTACTC
AAAGTTAGAGAAGAGAAGAGAAAACGTGACTACGATCGTCTCCACGATTACCCATCTTGG
GCCAAGGTACTTGAGACTGCTTGTAAAGATGATGAAGAGCTTCGAGCTGTTCTTGGTGAT
AGCATTGGAAACCCTGAGCTCATGAGAAAGAAGGTCGAGGAAAGGGTAAGGAAGAAGGGA
AAAGATTTCCAGAAGCAGAAGACTGGCTCTGTGCTTTCTTTCAAAGTTAGCTTCAGAGAT
TTCAATCCTGTTGACTCCTTCATATGGTTTGAGCTCTATGGATCGCCTTCAGATCGAGAT
GTTGATCTTTTTGGAAGTGTTATACAGGCATGGTATGTTATGGGGGAGATTGGGGCGCTT
TCAATACATCCAACTTGCAGCTAGCAAACTCATCTATGGGAATATGATCCTCTCTACGAC
GCAGAGAAAGGGCTTCAAAGTGATGCCTTCATCCTTCCATGACATCAGCGACGTTGAATT
TCACGACAACTGGGGTCGTGTCTGGGTTGATCTAG*CACTTCTGATATATTCGCCCTGGA
TGTGCTTCTCAACAGTTTGACTGTCATGAGTTCAGAGTACTTGGGCATT

QA 1 829 1 829
DS 

RD RR2AN32JQ 803 0 0
TCCCTCTCTGGTCGCTGTTTCTGCTAATTCCGACAACATCGCCGGCGAAAATGACGACGG
GGTGTCGGAAGTAGAGAAGAAAGGGTCGGGAACGACGGCGAGAGGAAGGAGACTACTCAA
AGTTAGAGAAGAGAAGAGAAAACGTGACTACGATCGTCTCCACGATTACCCATCTTGGGC
CAAGGTACTTGAGACTGCTTGTAAAGATGATGAAGAGCTTCGAGCTGTTCTTGGTGATAG
CATTGGAAACCCTGAGCTCATGAGAAAGAAGGTCGAGGAAAGGGTAAGGAAGAAGGGAAA
AGATTTCCAGAAGCAGAAGACTGGCTCTGTGCTTTCTTTCAAAGTTAGCTTCAGAGATTT
CAATCCTGTTGACTCCTTCATATGGTTTGAGCTCTATGGATCGCCTTCAGATCGAGATGT
TGATCTTTTTGGAAGTGTTATACAGGCATGGTATGTTATGGGG*AGATTGGG*CGCTTTC
AATACATCCAACTTGCAGCTAGCAAACTCATCTATGG*AATATGATCCTCTTTACGACGC
AGAGAA*GGGCTTCAAAGTGATGCCTTCATCCTTCCATGACATCAGCGACGTTGAATTTC
AGGACAACTGGGGTCGTGTCTGGGTTGATCTAGGCACTTTTGATATATTCGCCCTGGATG
TGCTTCTCAACAGTTTGACTGTCATGAGTTCAGAGTACTTGGGCATTCAACAAGTAGTAT
TTGGTGGTAAAAGAACGGGAGATTGGGAGGAGGGGATGACAAATCCTGATTTTGGTTACA
AGTACTTCAAGATATGAAGGATC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7162Contig1 683 2 2 U
GATCCCCACCATGATTGATGCTTCCTATCAATTTCATTTAACTTTCTCCTCTTCTCTTCC
TCCATCCATGTAACGAATAAAGCACTTAGCTAACCTCTCTCTCTCTCACTCTCACTCTGC
CTCAAACTATTGTTTGTCTCTATCAAAAAGCAAGTCATTGTGTTCAAAACAGAATAGTAT
TTGATTCCAAGATTACAGATTCGAGAAAAGAAAAAAAGAGCAGCATTTTGTGCTTGTTTG
TTTGTTTGCTTGCTAATAGCTGTGGAGTCATCAGTGTTTCACGCCCAAATGGCTAAAAAA
GACGTGGAAGCAGCGCCGAGGAGGAGGGAGAGGAAAGCAGCCAAGTGAAGCCAGAGATTA
GATTGCAATCTTGGATTGACGAAATCAGGAGCAATAAGATCAACCAGTGACATGTAAATG
AGAATCCCAGCTGATGCAGCGTTCAGCATTCCTTCCACCATGATTGCCTCTTTGCTCTCT
CTCCGGTAGCCTAAACCACTCGACATCCCCATACCTATCCCTATCCCAACAGGCGCCGTC
ACTGAGAAGAATGTCGCCATTATCACCGTTGATTTGGACTGTAACTCCGCGAGAGAGATG
CAGCCACCGAGGCCAAGACCTTCAAAGAACTGATGGAAAGAAAGTGCAGCCATGAGTGGC
TTTATAGTGTCTATACTCTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CW40TF C 1
AF RR2CW40JQ U 23
BS 1 22 RR2CW40TF
BS 23 683 RR2CW40JQ

RD RR2CW40TF 683 0 0
GATCCCCACCATGATTGATGCTTCCTATCAATTTCATTTAACTTTCTCCTCTTCTCTTCC
TCCATCCATGTAACGAATAAAGCACTTAGCTAACCTCTCTCTCTCTCACTCTCACTCTGC
CTCAAACTATTGTTTGTCTCTATCAAAAAGCAAGTCATTGTGTTCAAAACAGAATAGTAT
TTGATTCCAAGATTACAGATTCGAGAAAAGAAAAAAAGAGCAGCATTTTGTGCTTGTTTG
TTTGTTTGCTTGCTAATAGCTGTGGAGTCATCAGTGTTTCACGCCCAAATGGCTAAGAGA
GACGTGGAAGCAGCGCCGAGGAGGAGGGAGAGGAAAGCAGCCAAGTGAAGCCAGAGATTA
GATTGCAATCTTGGATTGACGAAATCAGGAGCAATAAGATCAACCAGTGACATGTAAATG
AGAATCCCAGCTGATGCAGCGTTCAGCATTCCTTCCACCATGATTGCCTCTTTGCTCTCT
CTCCGGTAGCCTAAACCACTCGACATCCCCATAC*TATCCCTATCCCAACAGGCGCCGTC
ACTGAGAAGAATGTCGCCATTATCACCGTTGATTTGGACTGTAACTCCGCGAGAGAGATG
CAGCCACCGAGGCCAAGACCTTCAAAGAACTGATGGAAAGAAAGTGCAGCCATGAGTGGC
TTTATAGTGTCTATACTCTGTGC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2CW40JQ 661 0 0
TCCTATCAATTTCATTTAACTTTCTCCTCTTCTCTTCCTCCATCCATGTAACGAATAAAG
CACTTAGCTAACCTCTCTCTCTCTCACTCTCACTCTGCCTCAAACTATTGTTTGTCTCTA
TCAAAAAGCAAGTCATTGTGTTCAAAACAGAATAGTATTTGATTCCAAGATTACAGATTC
GAGAAAAGAAAAAAAGAGCAGCATTTTGTGCTTGTTTGTTTGTTTGCTTGCTAATAGCTG
TGGAGTCATCAGTGTTTCACGCCCAAATGGCTAAAAAAGACGTGGAAGCAGCGCCGAGGA
GGAGGGAGAGGAAAGCAGCCAAGTGAAGCCAGAGATTAGATTGCAATCTTGGATTGACGA
AATCAGGAGCAATAAGATCAACCAGTGACATGTAAATGAGAATCCCAGCTGATGCAGCGT
TCAGCATTCCTTCCACCATGATTGCCTCTTTGCTCTCTCTCCGGTAGCCTAAACCACTCG
ACATCCCCATACCTATCCCTATCCCAACAGGCGCCGTCACTGAGAAGAATGTCGCCATTA
TCACCGTTGATTTGGACTGTAACTCCGCGAGAGAGATGCAGCCACCGAGGCCAAGACCTT
CAAAGAACTGATGGAAAGAAAGTGCAGCCATGAGTGGCTTTATAGTGTCTATACTCTGTG
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL7163Contig1 815 2 6 U
AGGGACCGAGATGCTCCGGGTCAAAAATACTGGAAAATTCACCTGAGCAAAAATGTTCGC
GAGGCGTCTCACTTCCGCCTTCAAACGATCTTCGACCTCAACTAGCTCGTCGGACAAAGC
AGCAGGGAAGGAAAATGGGACTCTGGGATCATTTGGTCGGAAGGCAGTGTCTTTTGTGTT
GATTACGGTCACTGGTGGTGTTGCTTTGAGTGCCCTCGACGACCTTTCTATCTATCGCGG
TTGTAGCAGCAAGGCCATGGAGAAGGTGATGAGGAATAAGGCTATGATCGAAGCTATGGG
AGAGCCAATTGAGAAAGAGCCGTGGTACAATGCCTCACTAGCTGTTTCTCAGCAAAGGCA
CTCTGTCTCTTGTTCCTTTCCTCTGGTTGGCCCACAAGGCACCGGAATCTTGCATCTCAA
AGCTGTTCGCAATGGAGAAGATAGCTTGTTTGGGTTTCTCCAGCAAAGGGACTGGGACAT
TCTGATAATGGACGCACTTGTCCACGTCCCTTCTAACGATGGACCCCAACGAACCTTGAG
AATCGACATCTCTGACTTTGCTCCTCCTTCGGCTGCTACAGACTACAAACCTGCTTCCGA
ACCAGAAAAGCCAGAGAAGAGCTAAGAAGAGAGAATACTACGTAAGCTTTTGTGGATCAC
CTTGCTAGAGTTTTATTCCTTTCCTTGATGTTCTTCTGTGCGACAAGTATACCAACAAGA
TGTTTTGTGTACTGACAAATAAAAACATAATTCTTTTTGGTACTATACAAAAGTTGAATA
CATGACTGGTAAACTAACCAGTGCGTTTGGATGTG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CB59TF U 1
AF RR2CB59JQ C 5
BS 1 744 RR2CB59TF
BS 745 745 RR2CB59JQ
BS 746 771 RR2CB59TF
BS 772 772 RR2CB59JQ
BS 773 794 RR2CB59TF
BS 795 815 RR2CB59JQ

RD RR2CB59TF 794 0 0
AGGGACCGAGATGCTCCGGGTCAAAAATACTGGAAAATTCACCTGAGCAAAAATGTTCGC
GAGGCGTCTCACTTCCGCCTTCAAACGATCTTCGACCTCAACTAGCTCGTCGGACAAAGC
AGCAGGGAAGGAAAATGGGACTCTGGGATCATTTGGTCGGAAGGCAGTGTCTTTTGTGTT
GATTACGGTCACTGGTGGTGTTGCTTTGAGTGCCCTCGACGACCTTTCTATCTATCGCGG
TTGTAGCAGCAAGGCCATGGAGAAGGTGATGAGGAATAAGGCTATGATCGAAGCTATGGG
AGAGCCAATTGAGAAAGAGCCGTGGTACAATGCCTCACTAGCTGTTTCTCAGCAAAGGCA
CTCTGTCTCTTGTTCCTTTCCTCTGGTTGGCCCACAAGGCACCGGAATCTTGCATCTCAA
AGCTGTTCGCAATGGAGAAGATAGCTTGTTTGGGTTTCTCCAGCAAAGGGACTGGGACAT
TCTGATAATGGACGCACTTGTCCACGTCCCTTCTAACGATGGACCCCAACGAACCTTGAG
AATCGACATCTCTGACTTTGCTCCTCCTTCGGCTGCTACAGACTACAAACCTGCTTCCGA
ACCAGAAAAGCCAGAGAAGAGCTAAGAAGAGAGAATACTACGTAAGCTTTTGTGGATCAC
CTTGCTAGAGTTTTATTCCTTTCCTTGATGTTCTTCTGTGCGACAAGTATACCAACAAGA
TGTTTTGTGTACTGACAAATAAAA*CATAATTCTTTTTGGTACTATACAAA*GTTGAATA
CATGACTGGTAAAC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2CB59JQ 811 0 0
ACCGAGATGCTCCGGGTCAAAAATACTGGAAAATTCAC*TGAGCAAAAATGTTCGCGAGG
CGTCTCACTTCCGCCTTCAAACGATCTTCGACCTCAACTAGCTCGTCGGACAAAGCAGCA
GGGAAGGAAAATGGGACTCTGGGATCATTTGGTCGGAAGGCAGTGTCTTTTGTGTTGATT
ACGGTCACTGGTGGTGTTGCTTTGAGTGCCCTCGACGACCTTTCTATCTATCGCGGTTGT
AGCAGCAAGGCCATGGAGAAGGTGATGAGGAATAAGGCTATGATCGAAGCTATGGGAGAG
CCAATTGAGAAAGAGCCGTGGTACAATGCCTCACTAGCTGTTTCTCAGCAAAGGCACTCT
GTCTCTTGTTCCTTTCCTCTGGTTGGCCCACAAGGCACCGGAATCTTGCATCTCAAAGCT
GTTCGCAATGGAGAAGATAGCTTGTTTGGGTTTCTCCAGCAAAGGGACTGGGACATTCTG
ATAATGGACGCACTTGTCCACGTCCCTTCTAACGATGGACCCCAACGAACCTTGAGAATC
GACATCTCTGACTTTGCTCCTCCTTCGGCTGCTACAGACTACAAACCTGCTTCCGAACCA
GAAAAGCCAGAGAAGAGCTAAGAAGAGAGAATACTACGTAAGCTTTTGTGGATCACCTTG
CTAGAGTTTTATTCCTTTCCTTGATGTTTTTCTGTGCGACAAGTATACCAACAAGATGTT
TTGTGTACTGACAAATAAAAACATAATTCTTTTTGGTACTATACAAAAGTTGAATACATG
ACTGGTAAACTAACCAGTGCGTTTGGATGTG

QA 1 811 1 811
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7165Contig1 1026 2 4 U
GGACGGCGAGAGAGAGAGAGAGACGGCGCGTGATGATCAACTCTTAAATATACCATCGGC
GACTTTTACCCTCTTCCTTCCCCCCGTCGCCGCCGTGTTCGAATCCCAAGATTCGGAAAC
CAATCGTTTGGATTGGGAGGAGATGCCGTCAAACGGGGATCTGGACCGTCAGATCGAGCA
GCTGATGGAGTGTAAGCCGTTGGCAGAAGCGGACGTGAAGATCCTCTGCGATCAAGCCGA
GGCCATTCTCGTTGAGGAGTGGAACGTTCAACCGGTTAAGTGTCCTGTTACCGTATGCGG
CGATATCCACGGCCAGTTTTATGACCTAATCGAGCTCTTCCGTATCGGTGGTAACCCGCC
TGATACTAATTATCTATTCATGGGTGATTACGTAGATCGTGGCCACTACTCAGTTGAAAC
AGTCTCCCTATTGGTGGCACTGAAGGTGCGTTACAGAGACAGACTCACGAAGGACCAATG
TGCGATTTACTCTGGTCTGATCCAGACGATCGTTGTGGTTGGGGAATATCTCCCCGTGGT
GCTGGCTACACGTTTGGATAGGACATTGCAACTCAGTTTAATCATAACAATGGACTGAGT
TTGATATCAAGAGCGCATCAACTTGTAATGGAAGGCTTTAATTGGTGTCAGGAGAAAAAC
GTAGTTACAGTGTTTAGTGCACCAAACTACTGTTACAGATGTGGAAACATGGCAGCAATA
CTTGAGATTGGAGAGAAGATGGAACGGAACTTCCTTCAGTTCGATCCAGCACCCAGACAG
GTCGAACCTGATACCACTCGCAAGACTCCTGATTATTTTTTGTGATTCTCTTTCCACTTC
TATTTTTTATTTTTATTTAATTCGAAAGTATGTTTGTTGCTGTATCATTGTAGTAGATGT
GTCTCTTTGTTTCATTTTGTTTGGCGATGGATTTTCTAGTTCCACATGTTGGGATGTTTG
ATAAAAGCTGAAATGTACTTTGCATAAATGCAAGTGAATAGAACATGAGTTATCGTCTCC
CTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2D170TF U 1
AF RR2D170JQ C 289
BS 1 632 RR2D170TF
BS 633 633 RR2D170JQ
BS 634 651 RR2D170TF
BS 652 1026 RR2D170JQ

RD RR2D170TF 655 0 0
GGACGGCGAGAGAGAGAGAGAGACGGCGCGTGATGATCAACTCTTAAATATACCATCGGC
GACTTTTACCCTCTTCCTTCCCCCCGTCGCCGCCGTGTTCGAATCCCAAGATTCGGAAAC
CAATCGTTTGGATTGGGAGGAGATGCCGTCAAACGGGGATCTGGACCGTCAGATCGAGCA
GCTGATGGAGTGTAAGCCGTTGGCAGAAGCGGACGTGAAGATCCTCTGCGATCAAGCCGA
GGCCATTCTCGTTGAGGAGTGGAACGTTCAACCGGTTAAGTGTCCTGTTACCGTATGCGG
CGATATCCACGGCCAGTTTTATGACCTAATCGAGCTCTTCCGTATCGGTGGTAACCCGCC
TGATACTAATTATCTATTCATGGGTGATTACGTAGATCGTGGCCACTACTCAGTTGAAAC
AGTCTCCCTATTGGTGGCACTGAAGGTGCGTTACAGAGACAGACTCACGAAGGACCAATG
TGCGATTTACTCTGGTCTGATCCAGACGATCGTTGTGGTTGGGGAATATCTCCCCGTGGT
GCTGGCTACACGTTTGGATAGGACATTGCAACTCAGTTTAATCATAACAATGGACTGAGT
TTGATATCAAGAGCGCATCAACTTGTAATGGA*GGCTTTAATTGGTGTCAG
AGAA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2D170JQ 738 0 0
TACCGTATGCGGCGATATCCACGGCCAGTTTTATGACCTAATCGAGCTCTTCCGTATCGG
TGGTAACCCGCCTGATACTAATTATCTATTCATGGGTGATTACGTAGATCGTGGCCACTA
CTCAGTTGAAACAGTCTCCCTATTGGTGGCACTGAAGGTGCGTTACAGAGACAGACTCAC
GAAGGACCAATGTGCGATTTACTCTGGTCTGATCCAGACGATCGTTGTGGTTGGGGAATA
TCTCCCCGTGGTGCTGGCTACACGTTTGGATAGGACATTGCAACTCAGTTTAATCATAAC
AATGGACTGAGTTTGATATCAAGAGCGCATCAACTTGTAATGGAAGGCTTTAATTGGTGT
CAGGAGAAAAACGTAGTTACAGTGTTTAGTGCACCAAACTACTGTTACAGATGTGGAAAC
ATGGCAGCAATACTTGAGATTGGAGAGAAGATGGAACGGAACTTCCTTCAGTTCGATCCA
GCACCCAGACAGGTCGAACCTGATACCACTCGCAAGACTCCTGATTATTTTTTGTGATTC
TCTTTCCACTTCTATTTTTTATTTTTATTTAATTCGAAAGTATGTTTGTTGCTGTATCAT
TGTAGTAGATGTGTCTCTTTGTTTCATTTTGTTTGGCGATGGATTTTCTAGTTCCACATG
TTGGGATGTTTGATAAAAGCTGAAATGTACTTTGCATAAATGCAAGTGAATAGAACATGA
GTTATCGTCTCCCTTTGC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL7166Contig1 751 2 4 U
GCCGGTCAGTTTTACTGTTTGGCTTTTGGTCTCTGGCCTGGTTCTCTGGTCAATCCATTG
GTTTAGTTAACTGTGTGAATTATTAATATGGTTGTGTTTGGCTCCACTTTTCTTTTCTTT
TTTTCTTTGCTCAACACATTTTATTTCACCAATAAAAGGTACGGCTTTAGTATTACCCTG
AATCACTTACTTGGGTTTAATGCTATCAACCAGTCACCATTGCATTTTCAACCACAACAA
CGAGATCAAAATATGGTTGATAAATATTTAAAAATACATATTTTATAAATGTTTTCAAAA
TACTAGGATTCATCAGTTAATTGGATCTTCAATCTGCATGATAAATATTTGAATTAAACA
AAGGTTGTTGTTGCTCTTGAGTTCTTTTTTGCATGATTCTCTCTTTTTCTAATCATATAT
ACTCATGTATATCAATATTTACAAAATTTAAATTAGTTTAACTGATTCATGGAATTCTGT
TTATGACATTCTCTTAGTTGAAAATTATCATAATTATTGATGAATTTTAATTAGTTTTTG
GTTTTTAATGAATCTAATCAAACTAAAATGAATCAAATAAAAATGTTGATTTAAAAATAT
TAATCAATGGATAATCAGCAGGAAAAGAATCAATCTCATATGACTATGGGTCAGTCATGT
GTTGGGCTGAGTCTAGTGCGAAATCAGGACGGTCTGGACATGTGATTGGGCTAAGGATCG
ACCCAAGAAAGCGTAGTTATAGGCATCTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER91TF U 1
AF RR2DH48JQ U 129
BS 1 154 RR2ER91TF
BS 155 155 RR2DH48JQ
BS 156 223 RR2ER91TF
BS 224 751 RR2DH48JQ

RD RR2ER91TF 223 0 0
GCCGGTCAGTTTTACTGTTTGGCTTTTGGTCTCTGGCCTGGTTCTCTGGTCAATCCATTG
GTTTAGTTAACTGTGTGAATTATTAATATGGTTGTGTTTGGCTCCACTTTTCTTTTCTTT
TTTTCTTTGCTCAACACATTTTATTTCACCAATAGAAGGTACGGCTTTAGTATTACCCTG
AATCACTTACTTGGGTTTAATGCTATCAACCAGTCACCATTGC

QA 1 223 1 223
DS 

RD RR2DH48JQ 623 0 0
GCTCAACACATTTTATTTCACCAATAAAAGGTACGGCTTTAGTATTACCCTGAATCACTT
ACTTGGGTTTAATGCTATCAACCAGTCACCATTGCATTTTCAACCACAACAACGAGATCA
AAATATGGTTGATAAATATTTAAAAATACATATTTTATAAATGTTTTCAAAATACTAGGA
TTCATCAGTTAATTGGATCTTCAATCTGCATGATAAATATTTGAATTAAACAAAGGTTGT
TGTTGCTCTTGAGTTCTTTTTTGCATGATTCTCTCTTTTTCTAATCATATATACTCATGT
ATATCAATATTTACAAAATTTAAATTAGTTTAACTGATTCATGGAATTCTGTTTATGACA
TTCTCTTAGTTGAAAATTATCATAATTATTGATGAATTTTAATTAGTTTTTGGTTTTTAA
TGAATCTAATCAAACTAAAATGAATCAAATAAAAATGTTGATTTAAAAATATTAATCAAT
GGATAATCAGCAGGAAAAGAATCAATCTCATATGACTATGGGTCAGTCATGTGTTGGGCT
GAGTCTAGTGCGAAATCAGGACGGTCTGGACATGTGATTGGGCTAAGGATCGACCCAAGA
AAGCGTAGTTATAGGCATCTCAC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL7167Contig1 1040 2 8 U
GGACCTACCTTCCAACTTCTCCGACAATCCCCAGTTCACAGACCGCCGCCGGGAAAAGGA
GAGGCGACTGAGATTCACGCAATGGCATCATTTCACTCTACCCTCACATACTGGTTCGTT
AACCACCCCAACATCGCCAATTTCACGTGGACCGAAGGTAAGACTCTTGGCTCCACTATC
TTCTTCGTGTCCGTTGTAGTCTCGGTCTACCTCTCCTCTACGTTAATCCTCCGATTTAAC
ATCGATTCACTCCCTTCTCTCGGTCCCAGAATTCTCAAACCAATGACGGCACTACACAGC
CTCATCCTCTGCATTCTCTCTTTAATCATGGCCGTTGGTTGCACACTCTCTATCACCACA
GACCCGACAGCAAGTTTGTTCAATTCTATCTGTTTCCCTGTCGATGTTAAACCCAGCGGA
CCGCTTTTCCTCTGGGCACGAGTCTTCTACCTCTCGAAGATACTCGAGTTCGGAGACACA
ATTCTCATCATACTCGGAAAGTCAGTCCAACGGTTGTCCTTCCTCCACGTGTACCACCAC
GCGACAGTTGTGGTCATGTGCTTCCTCTGGCTCCGAACCAGACAGTCAATGTTTCCCATT
GCGCTTGTGACGAACTCGACTGTCCATGTCATCATGTACGGTTATTACTTCCTATGTGCT
TTAGGATCGAGACCGAAGTGGAAGAGGTTGGTGACTGATTGTCAGATCGTGCAGTTTGTT
TTCAGCTTCGGGTTATCTGGTTGGATGCTCAAAGAGCATTTGTTCGGGTTGCTCCGGGAT
TTGGGGATGGTGTTTCAATGCTGCCTTTAATGCTTCTCTTTGGCTCTCTTCTTCAACTTC
CATTCCAAGAACTATGCTAAAAAGACTAGCAGGCAAGGAGACAGTAAAAGCAATTAGTTT
AGTGGTGTCTTGTCTTTCCATTGTTTGAAATTGTTTTATGAATAAGGTGTGACATATAAG
TCATGAAATGGATTCGTTGTCTGATTCATAGATTGTATGGATCTTTTCTTTCTTTAAGAA
TTGAACACTGATATTAGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B845TF U 1
AF RR2B845JQ C 256
BS 1 664 RR2B845TF
BS 665 665 RR2B845JQ
BS 666 686 RR2B845TF
BS 687 687 RR2B845JQ
BS 688 777 RR2B845TF
BS 778 778 RR2B845JQ
BS 779 814 RR2B845TF
BS 815 1040 RR2B845JQ

RD RR2B845TF 814 0 0
GGACCTACCTTCCAACTTCTCCGACAATCCCCAGTTCACAGACCGCCGCCGGGAAAAGGA
GAGGCGACTGAGATTCACGCAATGGCATCATTTCACTCTACCCTCACATACTGGTTCGTT
AACCACCCCAACATCGCCAATTTCACGTGGACCGAAGGTAAGACTCTTGGCTCCACTATC
TTCTTCGTGTCCGTTGTAGTCTCGGTCTACCTCTCCTCTACGTTAATCCTCCGATTTAAC
ATCGATTCACTCCCTTCTCTCGGTCCCAGAATTCTCAAACCAATGACGGCACTACACAGC
CTCATCCTCTGCATTCTCTCTTTAATCATGGCCGTTGGTTGCACACTCTCTATCACCACA
GACCCGACAGCAAGTTTGTTCAATTCTATCTGTTTCCCTGTCGATGTTAAACCCAGCGGA
CCGCTTTTCCTCTGGGCACGAGTCTTCTACCTCTCGAAGATACTCGAGTTCGGAGACACA
ATTCTCATCATACTCGGAAAGTCAGTCCAACGGTTGTCCTTCCTCCACGTGTACCACCAC
GCGACAGTTGTGGTCATGTGCTTCCTCTGGCTCCGAACCAGACAGTCAATGTTTCCCATT
GCGCTTGTGACGAACTCGACTGTCCATGTCATCATGTACGGTTATTACTTCCTATGTGCT
TTAG*ATCGAGACCGAAGTGGAAGAG*TTGGTGACTGATTGTCAGATCGTGCAGTTTGTT
TTCAGCTTCGGGTTATCTGGTTGGATGCTCAAAGAGCATTTGTTCGGGTTGCTCCGG*AT
TTGGGGATGGTGTTTCAATGCTGCCTTTAATGCT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RR2B845JQ 785 0 0
TCTCTCGGTCCCAGAATTCTCAAACCAATGACGGCACTACACAGCCTCATCCTCTGCATT
CTCTCTTTAATCATGGCCGTTGGTTGCACACTCTCTATCACCACAGACCCGACAGCAAGT
TTGTTCAATTCTATCTGTTTCCCTGTCGATGTTAAACCCAGCGGACCGCTTTTCCTCTGG
GCACGAGTCTTCTACCTCTCGAAGATACTCGAGTTCGGAGACACAATTCTCATCATACTC
GGAAAGTCAGTCCAACGGTTGTCCTTCCTCCACGTGTACCACCACGCGACAGTTGTGGTC
ATGTGCTTCCTCTGGCTCCGAACCAGACAGTCAATGTTTCCCATTGCGCTTGTGACGAAC
TCGACTGTCCATGTCATCATGTACGGTTATTACTTCCTATGTGCTTTAGGATCGAGACCG
AAGTGGAAGAGGTTGGTGACTGATTGTCAGATCGTGCAGTTTGTTTTCAGCTTCGGGTTA
TCTGGTTGGATGCTCAAAGAGCATTTGTTCGGGTTGCTCCGGGATTTGGGGATGGTGTTT
CAATGCTGCCTTTAATGCTTCTCTTTGGCTCTCTTCTTCAACTTCCATTCCAAGAACTAT
GCTAAAAAGACTAGCAGGCAAGGAGACAGTAAAAGCAATTAGTTTAGTGGTGTCTTGTCT
TTCCATTGTTTGAAATTGTTTTATGAATAAGGTGTGACATATAAGTCATGAAATGGATTC
GTTGTCTGATTCATAGATTGTATGGATCTTTTCTTTCTTTAAGAATTGAACACTGATATT
AGCCG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL7168Contig1 497 2 2 U
CATTCATAACCAATATAAGCATTACCCAAAGACAAAAAAAACGAGTTCATCTTCACAAGA
CTCAAACCCAGTTTCTTTCCTGACCAATCATCATATACCTCAATCACAACAACCTCTTTC
TACGTATAAAACATGAAAACGGTAAGAGAAAAAAAAAGCAAACAACTAAGACGAAGAAGG
GAGAGGACGAGGCGGCGGCAACATTTGACGAAGATTCGGACCACCACTCGATTTGAGTAT
AAAAGGATGCTGCAAAAGCTGTTGAGCAGACCATCTCTTAGGAGGATCACTCTGCAAGCA
ACAAGAGATGAAGTGACGAAACTCCTCAAACGCCGTCGCCGGAGCTTCCGGCGGCTGAGT
CATACATATAGCACACATCAAACTCGCCCAGTCACCTTGTCTACTCACAGCGAAAGGGAA
CCTCCCCAAGTAAAACTCCAAGACGCTAACACCGAGACTCCATATATCCCCCGCGTAACC
GTCGTAACGTCCGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ES52TF C 1
AF RR2ES52JQ U 53
BS 1 52 RR2ES52TF
BS 53 497 RR2ES52JQ

RD RR2ES52TF 497 0 0
CATTCATAACCAATATAAGCATTACCCAAAGACAAAAAAAACGAGTTCATCTTCACAAGA
CTCAAACCCAGTTTCTTTCCTGACCAATCATCATATACCTCAATCACAACAACCTCTTTC
TACGTATAAAACATGAAAACGGTAAGAGAAAAAAAAAGCAAACAACTAAGACGAAGAAGG
GAGAGGACGAGGCGGCGGCAACATTTGACGAAGATTCGGACCACCACTCGATTTGAGTAT
AAAAGGATGCTGCAAAAGCTGTTGAGCAGACCATCTCTTAGGAGGATCACTCTGCAAGCA
ACAAGAGATGAAGTGACGAAACTCCTCAGACGCCGTCGCCGGAGCTTCCGGCGGCTGAGT
CATACATATAGCACACATCAAACTCGCCCAGTCACCTTGTCTACTCACAGCGAAAGGGAA
CCTCCCCAAGTAAAACTCCAAGACGCTAACACCGAGACTCCATATATCCCCCGCGTAACC
GTCGTAACGTCCGTGAC

QA 1 497 1 497
DS 

RD RR2ES52JQ 445 0 0
TCACAAGACTCAAACCCAGTTTCTTTCCTGACCAATCATCATATACCTCAATCACAACAA
CCTCTTTCTACGTATAAAACATGAAAACGGTAAGAGAAAAAAAAAGCAAACAACTAAGAC
GAAGAAGGGAGAGGACGAGGCGGCGGCAACATTTGACGAAGATTCGGACCACCACTCGAT
TTGAGTATAAAAGGATGCTGCAAAAGCTGTTGAGCAGACCATCTCTTAGGAGGATCACTC
TGCAAGCAACAAGAGATGAAGTGACGAAACTCCTCAAACGCCGTCGCCGGAGCTTCCGGC
GGCTGAGTCATACATATAGCACACATCAAACTCGCCCAGTCACCTTGTCTACTCACAGCG
AAAGGGAACCTCCCCAAGTAAAACTCCAAGACGCTAACACCGAGACTCCATATATCCCCC
GCGTAACCGTCGTAACGTCCGTGAC

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 2

CO CL7169Contig1 502 2 1 U
GAACCCGGTGTGTTCAGCTGGTGGACTAGCTGTTCTAAACGTTATTGACAAGGAGAGACG
CCAAACACATTGTGCTGAGGTCGGTTCACACCTTATTCAACGTTTGAAAGATCTACAGAA
AAGACATGATATTATTGGAGATGTGAGAGGGAGAGGATTAATGGTTGGGATAGAGCTTGT
GACTGACCGGAAGGACAAGACACCAGCCAAGGCTGAAACAGCTGTCTTGTTTGAGCAACT
TAGAGAACTTGGCATACTCGTTGGAAAGGGAGGGCTTCATGGGAATGTTTTCAGGATAAA
ACCACCAATGTGTTTCACCAAAGACGATGCAGATTTCTTGGTAGATGCAATGGACTATTC
CATCTCCAAATTGTGATGAAAGCTTATAAGGATCGTGTGATCTGTTTTAGTGTTCTTTTT
TCATTCTCTTCCTTTAATGAACCGATCCAACTCTATCCTCCTTTTATTTCCAAATAAATA
AAATGGACTGCAAAAATGTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AD52JQ C 1
AF RR2AD52TF U 1
BS 1 502 RR2AD52TF

RD RR2AD52JQ 502 0 0
GAACCCGGTGTGTTCAGCTGGTGGACTAGCTGTTCTAAACGTTATTGACAAGGAGAGACG
CCAAACACATTGTGCTGAGGTCGGTTCACACCTTATTCAACGTTTGAAAGATCTACAGAA
AAGACATGATATTATTGGAGATGTGAGAGGGAGAGGATTAATGGTTGGGATAGAGCTTGT
GACTGACCGGAAGGACAAGACACCAGCCAAGGCTGAAACAGCTGTCTTGTTTGAGCAACT
TAGAGAACTTGGCATACTCGTTGGAAAGGGAGGGCTTCATGGGAATGTTTTCAGGATAAA
ACCACCAATGTGTTTCACCAAAGACGATGCAGATTTCTTGGTAGATGCAATGGACTATTC
CATCTCCAAATTGTGATGAAAGCTTATAAGGATCGTGTGATCTGTTTTAGTGTTCTTTTT
TCATTCTCTTCCTTTAATGAACCGATCCAACTCTATCCTCCTTTTATTTCCAAATAAATA
AAATGGACTGCAAAAATGTTTT

QA 1 502 1 502
DS 

RD RR2AD52TF 502 0 0
GAACCCGGTGTGTTCAGCTGGTGGACTAGCTGTTCTAAACGTTATTGACAAGGAGAGACG
CCAAACACATTGTGCTGAGGTCGGTTCACACCTTATTCAACGTTTGAAAGATCTACAGAA
AAGACATGATATTATTGGAGATGTGAGAGGGAGAGGATTAATGGTTGGGATAGAGCTTGT
GACTGACCGGAAGGACAAGACACCAGCCAAGGCTGAAACAGCTGTCTTGTTTGAGCAACT
TAGAGAACTTGGCATACTCGTTGGAAAGGGAGGGCTTCATGGGAATGTTTTCAGGATAAA
ACCACCAATGTGTTTCACCAAAGACGATGCAGATTTCTTGGTAGATGCAATGGACTATTC
CATCTCCAAATTGTGATGAAAGCTTATAAGGATCGTGTGATCTGTTTTAGTGTTCTTTTT
TCATTCTCTTCCTTTAATGAACCGATCCAACTCTATCCTCCTTTTATTTCCAAATAAATA
AAATGGACTGCAAAAATGTTTT

QA 1 502 1 502
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7171Contig1 537 2 2 U
GGACAGTCGAGAGAAAAAAAAAAACGAAAATGGAGAAACTAACTTTCCTCTCGCTCCTCT
TGCACTTCGTCGTCTTCATCGCTAGCACATCTCAGTCATCTTCTATTATACTGAACGATC
GCAGCTTCGAGATACCGAGCTTGCCTTCATCGCGCGCCGAGAAGCTGATCCGGGAGCTAA
ACCTCTTTCCGAATCTGGAGGTGAACGTGATCGATGTCTCGACTCTCGCTTCTGACGTGG
AGGAGGTAGCATCGATTGTCGAACGGAGATTCATATTCCCGAATATTCTTTCCGATGTCG
GCGGCGGCAGCCCTTCCCTCGAGGATCTAGGTCATCATGCTGGTGGAGAACATCCTGTAG
GTACTACAGAAGGCGATGATCTGGTTGCTCAGATGTAATAGCAGCAAACAAAGAAAATGT
GTAGACTGTGTGTTGTGTAAACACTTTACGTTTCCTTCTGTAATTTGATCTCTAAAGAAA
AGAAAACTATATGTAGGGGTTGTAAAGGTTACGTGTAAGTCAAAACGCTTATGAACC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CK26JQ C 1
AF RR2CK26TF U 6
BS 1 5 RR2CK26JQ
BS 6 537 RR2CK26TF

RD RR2CK26JQ 537 0 0
GGACAGTCGAGAGAAAAAAAAAAACGAAAATGGAGAAACTAACTTTCCTCTCGCTCCTCT
TGCACTTCGTCGTCTTCATCGCTAGCACATCTCAGTCATCTTCTATTATACTGAACGATC
GCAGCTTCGAGATACCGAGCTTGCCTTCATCGCGCGCCGAGAAGCTGATCCGGGAGCTAA
ACCTCTTTCCGAATCTGGAGGTGAACGTGATCGATGTCTCGACTCTCGCTTCTGACGTGG
AGGAGGTAGCATCGATTGTCGAACGGAGATTCATATTCCCGAATATTCTTTCCGATGTCG
GCGGCGGCAGCCCTTCCCTCGAGGATCTAGGTCATCATGCTGGTGGAGAACATCCTGTAG
GTACTACAGAAGGCGATGATCTGGTTGCTCAGATGTAATAGCAGCAAACAAAGAAAATGT
GTAGACTGTGTGTTGTGTAAACACTTTACGTTTCCTTCTGTAATTTGATCTCTAAAGAAA
AGAAAACTATATGTAGGGGTTGTAAAGGTTACGTGTAAGTCAAAACGCTTATGAACC

QA 1 537 1 537
DS 

RD RR2CK26TF 532 0 0
GTCGAGAGAAAAAAAAAAACGAAAATGGAGAAACTAACTTTCCTCTCGCTCCTCTTGCAC
TTCGTCGTCTTCATCGCTAGCACATCTCAGTCATCTTCTATTATACTGAACGATCGCAGC
TTCGAGATACCGAGCTTGCCTTCATCGCGCGCCGAGAAGCTGATCCGGGAGCTAAACCTC
TTTCCGAATCTGGAGGTGAACGTGATCGATGTCTCGACTCTCGCTTCTGACGTGGAGGAG
GTAGCATCGATTGTCGAACGGAGATTCATATTCCCGAATATTCTTTCCGATGTCGGCGGC
GGCAGCCCTTCCCTCGAGGATCTAGGTCATCATGCTGGTGGAGAACATCCTGTAGGTACT
ACAGAAGGCGATGATCTGGTTGCTCAGATGTAATAGCAGCAAACAAAGAAAATGTGTAGA
CTGTGTGTTGTGTAAACACTTTACGTTTCCTTCTGTAATTTGATCTCTAAAGAAAAGAAA
ACTATATGTAGGGGTTGTAAAGGTTACGTGTAAGTCAAAACGCTTATGAACC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL7172Contig1 511 2 2 U
CCATTCTATTCTTACTACTATACGATAGTGTATTCTCCTTTTTTTTTTTATCTTTTCCAT
ATTCACATAAGGACAATGATATTCACGATAAGTCACAATGTAAGGGTACTTTTACTTTCC
AACTAAAGCTTACGCACTTAAAAATTAAGGACCCACTTTCCGACATAAAACGAACGATTA
CATTTATATCAAGATCTGCTCATCTTAATGTGTTAAGAAAATTAAGGAACTCACAGACAG
TATCGCCAATATGGAAAGTTTTGGTTGAAGCCCATAGCTTGTAATCTACGTTAGCTATGG
TTGTCCAGCCTGCTGAGTCGCCGACTTTATACACCGCTGCTTCGCTCAGCCGTAGCATTA
CCACCATACATGCCAAAACTACCACTATCCTTGCCGTCATTCTTTCAATCTTCTTCTTCA
ATCTCTGGTTGAGAGCCCTACACGGTTTTCTTCTTTAGTTTCTTTCTTTCTCTTATTTTT
TTGTATGTATATGTATATACAATGAGGTATC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E042TF C 1
AF RR2E042JQ U 3
BS 1 2 RR2E042TF
BS 3 511 RR2E042JQ

RD RR2E042TF 511 0 0
CCATTCTATTCTTACTACTATACGATAGTGTATTCTCCTTTTTTTTTTTATCTTTTCCAT
ATTCACATAAGGACAATGATATTCACGATAAGTCACAATGTAAGGGTACTTTTACTTTCC
AACTAAAGCTTACGCACTTAAGAATTAAGGACCCACTTTCCGACATAAAACGAACGATTA
CATTTATATCAAGATCTGCTCATCTTAATGTGTTAAGAAAATTAAGGAACTCACAGACAG
TATCGCCAATATGGAAAGTTTTGGTTGAAGCCCATAGCTTGTAATCTACGTTAGCTATGG
TTGTCCAGCCTGCTGAGTCGCCGACTTTATACACCGCTGCTTCGCTCAGCCGTAGCATTA
CCACCATACATGCCAAAACTACCACTATCCTTGCCGTCATTCTTTCAATCTTCTTCTTCA
ATCTCTGGTTGAGAGCCCTACACGGTTTTCTTCTTTAGTTTCTTTCTTTCTCTTATTTTT
TTGTATGTATATGTATATACAATGAGGTATC

QA 1 511 1 511
DS 

RD RR2E042JQ 509 0 0
ATTCTATTCTTACTACTATACGATAGTGTATTCTCCTTTTTTTTTTTATCTTTTCCATAT
TCACATAAGGACAATGATATTCACGATAAGTCACAATGTAAGGGTACTTTTACTTTCCAA
CTAAAGCTTACGCACTTAAAAATTAAGGACCCACTTTCCGACATAAAACGAACGATTACA
TTTATATCAAGATCTGCTCATCTTAATGTGTTAAGAAAATTAAGGAACTCACAGACAGTA
TCGCCAATATGGAAAGTTTTGGTTGAAGCCCATAGCTTGTAATCTACGTTAGCTATGGTT
GTCCAGCCTGCTGAGTCGCCGACTTTATACACCGCTGCTTCGCTCAGCCGTAGCATTACC
ACCATACATGCCAAAACTACCACTATCCTTGCCGTCATTCTTTCAATCTTCTTCTTCAAT
CTCTGGTTGAGAGCCCTACACGGTTTTCTTCTTTAGTTTCTTTCTTTCTCTTATTTTTTT
GTATGTATATGTATATACAATGAGGTATC

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 2

CO CL7173Contig1 573 2 13 U
GGATCACTTCTCCATACAACAAAATATTACAAACAAGTCGAAAATGGCTTCCAAGGCATT
AGTTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCGACATCCGA
AGAGCGGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTGACCATGACCAATATGG
TGGCGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGTTACAACAAAGGAGGAGGATACAACGGAGGAGG
CCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCATGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAG
GTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGGTAAT
GTATTAACCACCACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATCGTGGT
GTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTAAGAGG
CCAAATTATGAGAATAAAGTTTGATCATGTAATGTCATTGCGTTTGAGTTGTTATCTTTC
GTGGCTGTCATAATAAAATCGTTTGTAGTTTAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2C405TF U 1
AF RR2FQ22TF U 1
BS 1 28 RR2C405TF
BS 29 29 RR2FQ22TF
BS 30 36 RR2C405TF
BS 37 37 RR2FQ22TF
BS 38 179 RR2C405TF
BS 180 180 RR2FQ22TF
BS 181 183 RR2C405TF
BS 184 184 RR2FQ22TF
BS 185 214 RR2C405TF
BS 215 216 RR2FQ22TF
BS 217 505 RR2C405TF
BS 506 506 RR2FQ22TF
BS 507 573 RR2C405TF

RD RR2C405TF 573 0 0
GGATCACTTCTCCATACAACAAAATATTCCAAACAATTCGAAAATGGCTTCCAAGGCATT
AGTTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCGACATCCGA
AGAGCGGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTGACCATGACCAATATGT
TGGTGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGTTACAACGGAGGAGGAGGATACAACGGAGGAGG
CCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCATGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAG
GTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGGTAAT
GTATTAACCACCACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATCGTGGT
GTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTAAGAGG
CCAAATTATGAGAATAAAGTTTGATTATGTAATGTCATTGCGTTTGAGTTGTTATCTTTC
GTGGCTGTCATAATAAAATCGTTTGTAGTTTAT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2FQ22TF 572 0 0
GGATCACTTCTCCATACAACAAAATATTATAAACAAGTTGAAAATGGCTTCCAAGGCATT
AGTTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCGACATCGGA
AGAGCGGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTGACCATGACCAATATGG
TGGCGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGTTACA*CAATGGAGGAGGATACAACGGAGGAGG
CCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCATGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAG
GTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGGTAAT
GTATTAACCACCACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATCGTGGT
GTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCATGATTGATTAAGAGG
CCAAATTATGAGAATAAAGTTTGATCATGTAATGTCATTGCGTTTGAGTTGTTATCTTTC
GTGGCTGTCATAATAAAATCGTTTGTAGTTTA

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL7174Contig1 1109 2 6 U
ATGAGCAACATAATCCCATCGGAGAAACGATCGATCGTCACCTTCGTTTTACTTGCCGGT
CTTATCGGCAGCGCTCTACTCTTCACAGCCTTCATACGATCAGCCGACGACGCTTTCTTC
CTCTGCTCCACCGCAAGCGCCAAAAGCCGAGCGGTGGCCGCAGCGGCAGATTACTCAGCG
ACACCGATCCAGCTCCAAGCCATCGTCCACTACGCGACCTCCACCATAACCCCACAGCAA
AACATCCAGGAGATCTCAATCTCTTTCAACGTCTTGAAAGAGCTAGCTCCGGCCAACTTC
CTCGTCTTCGGTCTGGGCCTCGACTCGCTCATGTGGGCCTCTCTTAACCCACGTGGCAAA
ACCATATTCCTCGAAGAAGATCTCGAGTGGTTTCAGAAAGTAACCAAAGACTCTCCTTTC
CTCCATGCCCATCACGTGCGTTACAGAACGCAGCTACAAGAAGCCGACAAGCTTCTGCGT
TCTTACAAAACCGAACCTAGCTGTTTCCCGGCGAAGGCGTATCTCAGAGGAAACGAACGT
TGTAAGCTCGCTCTCACGGGGCTTCCGGACGAGTTCTACGACACGGAGTGGGATCTGATC
ATGCTCGATGCTCCTAAAGGTTACTTCGCCGAAGCTCCGGGAAGAATGGCGGCGATTTAC
TCGGCGGCGGTTATGGCTAGGAACCGGAAGAAACCTGGAGTCACTCACGTGTTCTTGCAC
GACGTTGACCGGAGGGTTGAGAAGACTTTCGCGGAGGAGTTTCTATGCGCAAAATACAGA
GTTCATGCCGCCGGGAGGTTATGGCATTTCGCGATTCCTCCCGTGGCTGCAATCGCTACA
ATCGACGGTGGCGATTACAGGTTTTGTTAAGGATTGTGACACGTCACACAGCTTTTGTTA
TTTCCACTTTTGCCCCTTTTTACTTTTCGGATCTTATTACATAGGGTTCACTTATTATCT
GATTTAATGCCGACAGTTTTGGATTTCATCTCGTGTTTCGGATCTACTACATCTCGGTAT
TGTTTTAGTTTCGTGGACTTTCCTTATCTTGCATAGGTCATTTTTACGGAATACTTTCGT
CATTTATGAATTATGATAATTTGACACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM29TF U 1
AF RR2CM29JQ C 272
BS 1 619 RR2CM29TF
BS 620 620 RR2CM29JQ
BS 621 645 RR2CM29TF
BS 646 646 RR2CM29JQ
BS 647 659 RR2CM29TF
BS 660 1109 RR2CM29JQ

RD RR2CM29TF 659 0 0
ATGAGCAACATAATCCCATCGGAGAAACGATCGATCGTCACCTTCGTTTTACTTGCCGGT
CTTATCGGCAGCGCTCTACTCTTCACAGCCTTCATACGATCAGCCGACGACGCTTTCTTC
CTCTGCTCCACCGCAAGCGCCAAAAGCCGAGCGGTGGCCGCAGCGGCAGATTACTCAGCG
ACACCGATCCAGCTCCAAGCCATCGTCCACTACGCGACCTCCACCATAACCCCACAGCAA
AACATCCAGGAGATCTCAATCTCTTTCAACGTCTTGAAAGAGCTAGCTCCGGCCAACTTC
CTCGTCTTCGGTCTGGGCCTCGACTCGCTCATGTGGGCCTCTCTTAACCCACGTGGCAAA
ACCATATTCCTCGAAGAAGATCTCGAGTGGTTTCAGAAAGTAACCAAAGACTCTCCTTTC
CTCCATGCCCATCACGTGCGTTACAGAACGCAGCTACAAGAAGCCGACAAGCTTCTGCGT
TCTTACAAAACCGAACCTAGCTGTTTCCCGGCGAAGGCGTATCTCAGAGGAAACGAACGT
TGTAAGCTCGCTCTCACGGGGCTTCCGGACGAGTTCTACGACACGGAGTGGGATCTGATC
ATGCTCGATGCTCCTAAAG*TTACTTCGCCGAAGCTCCGGGAAGA*TGGCGGCGATTTA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2CM29JQ 838 0 0
TCTTGAAAGAGCTAGCTCCGGCCA*CTTCCTCGTCTTCGGTCTGGGCCTCGACTCGCTCA
TGTGGGCCTCTCTTAACCCACGTGGCAAAACCATATTCCTCGAAGAAGATCTCGAGTGGT
TTCAGAAAGTAACCAAAGACTCTCCTTTCCTCCATGCCCATCACGTGCGTTACAGAACGC
AGCTACAAGAAGCCGACAAGCTTCTGCGTTCTTACAAAACCGAACCTAGCTGTTTCCCGG
CGAAGGCGTATCTCAGAGGAAACGAACGTTGTAAGCTCGCTCTCACGGGGCTTCCGGACG
AGTTTTACGACACGGAGTGGGATCTGATCATGCTCGATGCTCCTAAAGGTTACTTCGCCG
AAGCTCCGGGAAGAATGGCGGCGATTTACTCGGCGGCGGTTATGGCTAGGAACCGGAAGA
AACCTGGAGTCACTCACGTGTTCTTGCACGACGTTGACCGGAGGGTTGAGAAGACTTTCG
CGGAGGAGTTTCTATGCGCAAAATACAGAGTTCATGCCGCCGGGAGGTTATGGCATTTCG
CGATTCCTCCCGTGGCTGCAATCGCTACAATCGACGGTGGCGATTACAGGTTTTGTTAAG
GATTGTGACACGTCACACAGCTTTTGTTATTTCCACTTTTGCCCCTTTTTACTTTTCGGA
TCTTATTACATAGGGTTCACTTATTATCTGATTTAATGCCGACAGTTTTGGATTTCATCT
CGTGTTTCGGATCTACTACATCTCGGTATTGTTTTAGTTTCGTGGACTTTCCTTATCTTG
CATAGGTCATTTTTACGGAATACTTTCGTCATTTATGAATTATGATAATTTGACACTT

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 2

CO CL7175Contig1 699 2 2 U
TTTTTATAAGATAATAACATTAAAATAGAGGAAGAAGAAAATTTGAATCTTTGAGTCATA
TGTTTCTTTTTCTAGTGTACCCACTTTGACTATAACCGATAGAATTCTCAATTAAGATAT
CGCTGGTATTGCAACTCTCTGTTGTTAAGTGTGGTATGTGACTTTTGTCCTGTCACTAGT
ACGGGATGTCTCCAAAGATAGCGATGCATTTAAACTTTTTAGTTCTCTGCGGATCACTTA
ACTGCCTACTTTGACAGATGGTGTAAAAACAATTTGATAAGAATTTTGTTTACGAAAGAT
CTCATTTATCCAGTAATCTACAGAATTTCAAGTACTTGTAGCGAATGCTAACTATCAAAT
CTATCATTGGATTGTTGATTTGCAAATATAGTTATAATCAAACAAAATTCATCGACAATT
CCTCTACTATAGCTAAAATATTAAAAACTGGTAAAACGACTCTTCTTGGTGTCTTTTCTG
TTAAGAAAACCCGTGGTGAGATCAAAGGAGAGATTCGATCGAGTTGGAGGGTACCCTAAG
GTTCAAGAAACATTTGCACGAGTATCAGGTTACTGTGAACAGTTTGATATTCCTTCTCCT
AATATAACAGTGGAAGAATCTTTGAAATACTCTGCTTGGCTTCGACTTCCCTATAACATC
GATTCAAAGATCAAAGAATGTAAGCAATCACACTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL85TF U 1
AF RR2GL85JQ C 141
BS 1 659 RR2GL85TF
BS 660 699 RR2GL85JQ

RD RR2GL85TF 659 0 0
TTTTTATAAGATAATAACATTAAAATAGAGGAAGAAGAAAATTTGAATCTTTGAGTCATA
TGTTTCTTTTTCTAGTGTACCCACTTTGACTATAACCGATAGAATTCTCAATTAAGATAT
CGCTGGTATTGCAACTCTCTGTTGTTAAGTGTGGTATGTGACTTTTGTCCTGTCACTAGT
ACGGGATGTCTCCAAAGATAGCGATGCATTTAAACTTTTTAGTTCTCTGCGGATCACTTA
ACTGCCTACTTTGACAGATGGTGTAAAAACAATTTGATAAGAATTTTGTTTACGAAAGAT
CTCATTTATCCAGTAATCTACAGAATTTCAAGTACTTGTAGCGAATGCTAACTATCAAAT
CTATCATTGGATTGTTGATTTGCAAATATAGTTATAATCAAACAAAATTCATCGACAATT
CCTCTACTATAGCTAAAATATTAAAAACTGGTAAAACGACTCTTCTTGGTGTCTTTTCTG
TTAAGAAAACCCGTGGTGAGATCAAAGGAGAGATTCGATCGAGTTGGAGGGTACCCTAAG
GTTCAAGAAACATTTGCACGAGTATCAGGTTACTGTGAACAGTTTGATATTCCTTCTCCT
AATATAACAGTGGAAGAATCTTTGAAATACTCTGCTTGGCTTCGACTTCCCTATAACAT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2GL85JQ 559 0 0
GTTGTTAAGTGTGGTATGTGACTTTTGTCCTGTCACTAGTACGGGATGTCTCCAAAGATA
GCGATGCATTTAAACTTTTTAGTTCTCTGCGGATCACTTAACTGCCTACTTTGACAGATG
GTGTAAAAACAATTTGATAAGAATTTTGTTTACGAAAGATCTCATTTATCCAGTAATCTA
CAGAATTTCAAGTACTTGTAGCGAATGCTAACTATCAAATCTATCATTGGATTGTTGATT
TGCAAATATAGTTATAATCAAACAAAATTCATCGACAATTCCTCTACTATAGCTAAAATA
TTAAAAACTGGTAAAACGACTCTTCTTGGTGTCTTTTCTGTTAAGAAAACCCGTGGTGAG
ATCAAAGGAGAGATTCGATCGAGTTGGAGGGTACCCTAAGGTTCAAGAAACATTTGCACG
AGTATCAGGTTACTGTGAACAGTTTGATATTCCTTCTCCTAATATAACAGTGGAAGAATC
TTTGAAATACTCTGCTTGGCTTCGACTTCCCTATAACATCGATTCAAAGATCAAAGAATG
TAAGCAATCACACTCTCCC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL7176Contig1 861 2 6 U
GGGCTACAGTGACCGTTTCTAGTGCTTATAGAGAGAGTACGAGAAAGACAGATAATCTCG
CTAAGGCCTCTCTGTGAGCGAATCTATCCACGACTCTTCGATCATCGGATTCTCTCTCTC
CACCACTTGTTCGTATCCTCCACTTCTTCAGTGGCTCTGCGCCACCGTCGATATATATAT
TTTTTTGGGAATGAAGAGTGAGATGAGTTCAAGTTAGAAATTTTGCAAAGCTATGTCAGA
GTCTCGCCAAAGGCCTCCTTTTAAGGGCCCGAGATGGATTATCACTTTGGTTGCTCTCGT
TACGCTCGTTGTCATCACTGCACTCGTTTACCCTCCTCGTAACTCTGTCACTTGCTACAT
GTTTTCTGGTCCTGGATGTCAGTTATACCAACAGTTCTTGTTCGTGCCTTCAAGGGAACT
CACTGATACTGAAGCTGCAGCTCAGGTTGTGACCAATGAGATCATGAATCTACCTGAGTC
TAAGACAGCTAATCCCAAGATTGCATTCATGTTCTTGACACCAGGGGCTTTGCCTTTTGA
GCCTCTCTGGGAGATGTTCCTCCGTGGTCATGAGAACAAGTTTTCGATTTATGTGCACGC
GTCAAAGAAAAGTCCTGCACACACTAGCAACTACTTTGTTGGTCGAGATATTCACAGTCA
CAAGGTTGCTTGGGGTCAGATATCGATGGTTGATGCTGAAAGAAGGCTATTAGCTCATGC
TCTCATTGATCCTGATAACCAACACTTTGTGTTGCTTTCAGATAGTTGCGTACCGCTATT
CGACTTTAAGTATATCTATAATCACTTGATCTTCGCTAATCTTAGCTACATTGATTGTTT
TGAGGATCCTGGACCTCATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CO28TF U 1
AF RR2A533TF U 58
BS 1 432 RR2CO28TF
BS 433 433 RR2A533TF
BS 434 664 RR2CO28TF
BS 665 665 RR2A533TF
BS 666 701 RR2CO28TF
BS 702 861 RR2A533TF

RD RR2CO28TF 701 0 0
GGGCTACAGTGACCGTTTCTAGTGCTTATAGAGAGAGTACGAGAAAGACAGATAATCTCG
CTAAGGCCTCTCTGTGAGCGAATCTATCCACGACTCTTCGATCATCGGATTCTCTCTCTC
CACCACTTGTTCGTATCCTCCACTTCTTCAGTGGCTCTGCGCCACCGTCGATATATATAT
TTTTTTGGGAATGAAGAGTGAGATGAGTTCAAGTTAGAAATTTTGCAAAGCTATGTCAGA
GTCTCGCCAAAGGCCTCCTTTTAAGGGCCCGAGATGGATTATCACTTTGGTTGCTCTCGT
TACGCTCGTTGTCATCACTGCACTCGTTTACCCTCCTCGTAACTCTGTCACTTGCTACAT
GTTTTCTGGTCCTGGATGTCAGTTATACCAACAGTTCTTGTTCGTGCCTTCAAGGGAACT
CACTGATACTGAGGCTGCAGCTCAGGTTGTGACCAATGAGATCATGAATCTACCTGAGTC
TAAGACAGCTAATCCCAAGATTGCATTCATGTTCTTGACACCAGGGGCTTTGCCTTTTGA
GCCTCTCTGGGAGATGTTCCTCCGTGGTCATGAGAACAAGTTTTCGATTTATGTGCACGC
GTCAAAGAAAAGTCCTGCACACACTAGCAACTACTTTGTTGGTCGAGATATTCACAGTCA
CAAG*TTGCTTGGGGTCAGATATCGATGGTTGATGCTGAAA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2A533TF 804 0 0
GG
GCTAAGGCCTCTCTGTGAGCGAATCTATCCACGACTCTTCGATCATCGGATTCTCTCTCT
CCACCACTTGTTCGTATCCTCCGCTTCTTCAGTGGCTCTGCGCCACCGTCGATATATATA
TTTTTTTGGGAATGAAGAGTGAGATGAGTTCAAGTTAGAAATTTTGCAAAGCTATGTCAG
AGTCTCGCCAAAGGCCTCCTTTTAAGGGCCCGAGATGGATTATCACTTTGGTTGCTCTCG
TTACGCTCGTTGTCATCACTGCACTCGTTTACCCTCCTCGTAACTCTGTCACTTGCTACA
TGTTTTCTGGTCCTGGATGTCAGTTATACCAACAGTTCTTGTTCGTGCCTTCAAGGGAAC
TCACTGATACTGAAGCTGCAGCTCAGGTTGTGACCAATGAGATCATGAATCTACCTGAGT
CTAAGACAGCTAATCCCAAGATTGCATTCATGTTCTTGACACCAGGGGCTTTGCCTTTTG
AGCCTCTCTGGGAGATGTTCCTCCGTGGTCATGAGAACAAGTTTTCGATTTATGTGCACG
CGTCAAAGAAAAGTCCTGCACACACTAGCAACTACTTTGTTGGTCGAGATATTCACAGTC
ACAAGGTTGCTTGGGGTCAGATATCGATGGTTGATGCTGAAAGAAGGCTATTAGCTCATG
CTCTCATTGATCCTGATAACCAACACTTTGTGTTGCTTTCAGATAGTTGCGTACCGCTAT
TCGACTTTAAGTATATCTATAATCACTTGATCTTCGCTAATCTTAGCTACATTGATTGTT
TTGAGGATCCTGGACCTCATGG

QA 3 804 3 804
DS 



AS 1 2

CO CL7177Contig1 880 2 2 U
GAACTTGTTCTGTTTCGTCAGATCCTCGAGCTTCTCTCTCAGAAACAGAGTTTCCGAGTC
TTTAAGCTTGTACTGACACTCAAGCTTCTTCCCCATGATCTCATACGTCTTCAACAAACT
CCTCAGCTCTTGAATCTCCGCAAGAACCAGAGTCCTTTCGGGGTTCGGATCGATTTGTTT
CTTCAAGAAGCATTGTTTCAGCTCAGACAATGTCTTCAGCTCGGACACGACCAAGTTGTC
TGCTTTCTGAATCCCGATTGCGTCGTATGGAGACTGAGAATGCTGCAGCTGCGCGTAACC
AGCTTTGATGGAAGAAACCGTAGCGAAAAGCTTTGCGAGAAGAGCTTCTAATGTCAGACT
TCTCTCATACTCTTCCTCAAGCTTGTAGAAAGACTGAGACAACTTAACATTCTCGGAATC
AAACTTTGTCTTCTTCATTTCCTCTTCTGGAGCAACACCAGTTAGCTTATGTATGTTGAG
AACTTTAGCAAACGTGCGTCTGAATTTACCCTTGTGAGCAGCTACCACTGGCTTCACTGT
CTCCATCTGTGGATCAATCGCAAAGAAGCTTAGTAAAGAGACAATAGCATCAAGAACACA
GTAACAAACAAGACAAGAAAGCACCACAAAAGTAATGAAAAAAAAGCAAAGGAGAAGGAG
AGGAGAGAGCTTGTAATGATGAAAGTTTCAATGCATAAAGAAAAAGAGAAACAAGCTTTA
ATACTTGGATCAAGGACCGTTAATGGAGGGCCACAAGCTTCTTTATGAAATATTCTCCAA
ATAGTACTTGCTTTATGTGAAGAAACTATATGAAAAAAAGCTCAAAGCAAAAGGATGTTT
CCCTCATAAAATATCTATTAAACAAAAGAGAGATCTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC40TF U 1
AF RR2CC40JQ C 126
BS 1 644 RR2CC40TF
BS 645 880 RR2CC40JQ

RD RR2CC40TF 644 0 0
GAACTTGTTCTGTTTCGTCAGATCCTCGAGCTTCTCTCTCAGAAACAGAGTTTCCGAGTC
TTTAAGCTTGTACTGACACTCAAGCTTCTTCCCCATGATCTCATACGTCTTCAACAAACT
CCTCAGCTCTTGAATCTCCGCAAGAACCAGAGTCCTTTCGGGGTTCGGATCGATTTGTTT
CTTCAAGAAGCATTGTTTCAGCTCAGACAATGTCTTCAGCTCGGACACGACCAAGTTGTC
TGCTTTCTGAATCCCGATTGCGTCGTATGGAGACTGAGAATGCTGCAGCTGCGCGTAACC
AGCTTTGATGGAAGAAACCGTAGCGAAAAGCTTTGCGAGAAGAGCTTCTAATGTCAGACT
TCTCTCATACTCTTCCTCAAGCTTGTAGAAAGACTGAGACAACTTAACATTCTCGGAATC
AAACTTTGTCTTCTTCATTTCCTCTTCTGGAGCAACACCAGTTAGCTTATGTATGTTGAG
AACTTTAGCAAACGTGCGTCTGAATTTACCCTTGTGAGCAGCTACCACTGGCTTCACTGT
CTCCATCTGTGGATCAATCGCAAAGAAGCTTAGTAAAGAGACAATAGCATCAAGAACACA
GTAACAAACAAGACAAGAAAGCACCACAAAAGTAATGAAAAAAA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2CC40JQ 755 0 0
GCTCTTGAATCTCCGCAAGAACCAGAGTCCTTTCGGGGTTCGGATCGATTTGTTTCTTCA
AGAAGCATTGTTTCAGCTCAGACAATGTCTTCAGCTCGGACACGACCAAGTTGTCTGCTT
TCTGAATCCCGATTGCGTCGTATGGAGACTGAGAATGCTGCAGCTGCGCGTAACCAGCTT
TGATGGAAGAAACCGTAGCGAAAAGCTTTGCGAGAAGAGCTTCTAATGTCAGACTTCTCT
CATACTCTTCCTCAAGCTTGTAGAAAGACTGAGACAACTTAACATTCTCGGAATCAAACT
TTGTCTTCTTCATTTCCTCTTCTGGAGCAACACCAGTTAGCTTATGTATGTTGAGAACTT
TAGCAAACGTGCGTCTGAATTTACCCTTGTGAGCAGCTACCACTGGCTTCACTGTCTCCA
TCTGTGGATCAATCGCAAAGAAGCTTAGTAAAGAGACAATAGCATCAAGAACACAGTAAC
AAACAAGACAAGAAAGCACCACAAAAGTAATGAAAAAAAAGCAAAGGAGAAGGAGAGGAG
AGAGCTTGTAATGATGAAAGTTTCAATGCATAAAGAAAAAGAGAAACAAGCTTTAATACT
TGGATCAAGGACCGTTAATGGAGGGCCACAAGCTTCTTTATGAAATATTCTCCAAATAGT
ACTTGCTTTATGTGAAGAAACTATATGAAAAAAAGCTCAAAGCAAAAGGATGTTTCCCTC
ATAAAATATCTATTAAACAAAAGAGAGATCTATAC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL7178Contig1 1138 2 2 U
GATTGGCTCCGGTAATTTCGGAGTTGCGGGATTGATGAGAGACAAGCAGAGTAACGAGCT
TGTTGCTGTCAAATATATCGAGCGAGGTGAGAAGATAGATGAAAATGTGAAAAGGGAGAT
AATTAATCACAGGTCCTTAAGACATCCCAATATAGTAAGGTTCAAAGAGGTCATATTAAC
ACCAACCCATTTGGCTATTGTTATGGAATACGCAGCCGGAGGAGAACTCTTTGAGCGTAT
CTGCAATGCAGGCCGGTTCAGCGAAGACGAGGCAAGGTTTTTCTTCCAGCAACTCATTTC
AGGAGTTAGTTACTGTCATGCTATGCAAGTATGTCACCGAGATTTGAAGCTCGAGAATAC
GTTACTAGATGGTAGCTCTGCACCTCGTCTAAAGATATGTGATTTTGGATATTCCAAGTC
CTCGGTGTTACATTCACAGCCAAAATCAACTGTTGGGACCCCTGCTTATATTGCTCCAGA
GGTTTTACTAAAGAAAGAATATGATGCTTGTTGGTGCATACCCTTTTGAAGATCCAGATG
AGCCTAAAAATTTCAAGAAAACAATACATAGAATCTTGAATGTTCAGTACGCTATTCCAG
ATTATGTCCACATATCTCCTGAATGTCAACATCTGATCTCCAGAATATTCGTTGCTGATT
CTGCAAAGAGGATATCAATCCCTGAGATAAGGAACCATGAATGGTTTCTCAAGAATCTAC
CGGCAGATATCATGAATGATAACGTGATGAATAGCCAGTTTGATGAATCAGACCAACCAG
GTCAAAGCATTGAAGAGATCATGCAGATTGTTGCAGAAGCGACTGTTCCTCCTGCTGGCA
CTCAGAGTCTCAACCATTATCTCACAGGAAGCCTGGATTTGGAGGATGATATGGATGAAG
ATCTAGAGAGCGACTTGGATGATCTTGACATCGATAGTAGCGGAGAGATTGTGTATGCAA
TGTGATGTGATATCTCAATGGTTTCTGATACAAAAAAAAATGAACAATAAGGTGTGTTGT
TTGGTATTAATATTTGAGTTCTCTTGATATTTCCCCAACTTTGTCAATGGGCACAGTTTG
TAACCGTTGTTGATATGCAAAAAAAGATAAGGGCGCTAGTAGTGTACTGTTACTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AF05TF U 1
AF RR2AF05JQ C 298
BS 1 816 RR2AF05TF
BS 817 1138 RR2AF05JQ

RD RR2AF05TF 816 0 0
GATTGGCTCCGGTAATTTCGGAGTTGCGGGATTGATGAGAGACAAGCAGAGTAACGAGCT
TGTTGCTGTCAAATATATCGAGCGAGGTGAGAAGATAGATGAAAATGTGAAAAGGGAGAT
AATTAATCACAGGTCCTTAAGACATCCCAATATAGTAAGGTTCAAAGAGGTCATATTAAC
ACCAACCCATTTGGCTATTGTTATGGAATACGCAGCCGGAGGAGAACTCTTTGAGCGTAT
CTGCAATGCAGGCCGGTTCAGCGAAGACGAGGCAAGGTTTTTCTTCCAGCAACTCATTTC
AGGAGTTAGTTACTGTCATGCTATGCAAGTATGTCACCGAGATTTGAAGCTCGAGAATAC
GTTACTAGATGGTAGCTCTGCACCTCGTCTAAAGATATGTGATTTTGGATATTCCAAGTC
CTCGGTGTTACATTCACAGCCAAAATCAACTGTTGGGACCCCTGCTTATATTGCTCCAGA
GGTTTTACTAAAGAAAGAATATGATGCTTGTTGGTGCATACCCTTTTGAAGATCCAGATG
AGCCTAAAAATTTCAAGAAAACAATACATAGAATCTTGAATGTTCAGTACGCTATTCCAG
ATTATGTCCACATATCTCCTGAATGTCAACATCTGATCTCCAGAATATTCGTTGCTGATT
CTGCAAAGAGGATATCAATCCCTGAGATAAGGAACCATGAATGGTTTCTCAAGAATCTAC
CGGCAGATATCATGAATGATAACGTGATGAATAGCCAGTTTGATGAATCAGACCAACCAG
GTCAAAGCATTGAAGAGATCATGCAGATTGTTGCAG

QA 1 816 1 816
DS 

RD RR2AF05JQ 841 0 0
TTCAGGAGTTAGTTACTGTCATGCTATGCAAGTATGTCACCGAGATTTGAAGCTCGAGAA
TACGTTACTAGATGGTAGCTCTGCACCTCGTCTAAAGATATGTGATTTTGGATATTCCAA
GTCCTCGGTGTTACATTCACAGCCAAAATCAACTGTTGGGACCCCTGCTTATATTGCTCC
AGAGGTTTTACTAAAGAAAGAATATGATGCTTGTTGGTGCATACCCTTTTGAAGATCCAG
ATGAGCCTAAAAATTTCAAGAAAACAATACATAGAATCTTGAATGTTCAGTACGCTATTC
CAGATTATGTCCACATATCTCCTGAATGTCAACATCTGATCTCCAGAATATTCGTTGCTG
ATTCTGCAAAGAGGATATCAATCCCTGAGATAAGGAACCATGAATGGTTTCTCAAGAATC
TACCGGCAGATATCATGAATGATAACGTGATGAATAGCCAGTTTGATGAATCAGACCAAC
CAGGTCAAAGCATTGAAGAGATCATGCAGATTGTTGCAGAAGCGACTGTTCCTCCTGCTG
GCACTCAGAGTCTCAACCATTATCTCACAGGAAGCCTGGATTTGGAGGATGATATGGATG
AAGATCTAGAGAGCGACTTGGATGATCTTGACATCGATAGTAGCGGAGAGATTGTGTATG
CAATGTGATGTGATATCTCAATGGTTTCTGATACAAAAAAAAATGAACAATAAGGTGTGT
TGTTTGGTATTAATATTTGAGTTCTCTTGATATTTCCCCAACTTTGTCAATGGGCACAGT
TTGTAACCGTTGTTGATATGCAAAAAAAGATAAGGGCGCTAGTAGTGTACTGTTACTCTT
T

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 2

CO CL7179Contig1 704 2 2 U
GGCGGAGCTGAAGCATCTCGAGCTGACGGAGAACGGAATCTCCGGCGAGATCCCGGCGGA
TTTCGGATCGTTGAAGATGCTGAGCAGGGCGTTACTGAGCCGTAACGAACTAACCGGTTC
GCTTCCTGAGTCGATGTCCGGTATGGACCGGTTAGCGGATCTGGATCTATCGAGGAACCA
TATCGAGGGTCCGATACCGGAATGGGTGGGTAACATGAAGGTGCTCTCTCTTTTGAATCT
CGACTGCAACTCGTTAACCGGTCCGATCCCCGGTTCGATTCTAAGCAATTCCGGTTTTGG
TGTTTTGAATCTGAGCCGAAACGCGTTGGAAGGAACCATACCCGACGCTTTCGGATCCAC
GACCTATTTCGTGGCGCTTGATTTGTCTTACAATAATCTAGCGGGTCGGATCCCTGACTC
GCTATCGTCAGCTAAGTTTGTGGGCCATCTCGATATCAGCAACAACAAGCTTTGTGGGCC
TATTCCAACGGGTTCTCCTTTTGATCACCTGGAAGCGTCGTCGTTTAGTGACAACCAGTG
TTTGTGCGGTGGTCCGTTGATGAAGACATGTTAATAAAACAATCGATTATGGTTCCGGTT
CTGCTGAACCGGATGTTTTACCAAGTTCCTTGTTGCTCTTGTTCCATATTGGTTTAACTG
TTTATTTATTTACCTTTTCAAATTATAAGTGCCTGCCAATTGCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2G344JQ C 1
AF RR2G344TF U 1
BS 1 703 RR2G344TF
BS 704 704 RR2G344JQ

RD RR2G344JQ 704 0 0
GGCGGAGCTGAAGCATCTCGAGCTGACGGAGAACGGAATCTCCGGCGAGATCCCGGCGGA
TTTCGGATCGTTGAAGATGCTGAGCAGGGCGTTACTGAGCCGTAACGAACTAACCGGTTC
GCTTCCTGAGTCGATGTCCGGTATGGACCGGTTAGCGGATCTGGATCTATCGAGGAACCA
TATCGAGGGTCCGATACCGGAATGGGTGGGTAACATGAAGGTGCTCTCTCTTTTGAATCT
CGACTGCAACTCGTTAACCGGTCCGATCCCCGGTTCGATTTTAAGCAATTCCGGTTTTGG
TGTTTTGAATTTGAGCCGAAACGCGTTGGAAGGAACCATACCCGACGCTTTCGGATCCAC
GACCTATTTCGTGGCGCTTGATTTGTCTTACAATAATCTAGCGGGTCGGATCCCTGACTC
GCTATCGTCAGCTAAGTTTGTGGGCCATCTCGATATCAGCAACAACAAGCTTTGTGGGCC
TATTCCAACGGGTTCTCCTTTTGATCACCTGGAAGCGTCGTCGTTTAGTGACAACCAGTG
TTTGTGCGGTGGTCCGTTGATGAAGACATGTTAATAAAACAATCGATTATGGTTCCGGTT
TTGCTGAACCGGATGTTTTACCAAGTTCCTTGTTGCTCTTGTTCCATATTGGTTTAACTG
TTTATTTATTTACCTTTTCAAATTATAAGTGCCTGCCAATTGCG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2G344TF 703 0 0
GGCGGAGCTGAAGCATCTCGAGCTGACGGAGAACGGAATCTCCGGCGAGATCCCGGCGGA
TTTCGGATCGTTGAAGATGCTGAGCAGGGCGTTACTGAGCCGTAACGAACTAACCGGTTC
GCTTCCTGAGTCGATGTCCGGTATGGACCGGTTAGCGGATCTGGATCTATCGAGGAACCA
TATCGAGGGTCCGATACCGGAATGGGTGGGTAACATGAAGGTGCTCTCTCTTTTGAATCT
CGACTGCAACTCGTTAACCGGTCCGATCCCCGGTTCGATTCTAAGCAATTCCGGTTTTGG
TGTTTTGAATCTGAGCCGAAACGCGTTGGAAGGAACCATACCCGACGCTTTCGGATCCAC
GACCTATTTCGTGGCGCTTGATTTGTCTTACAATAATCTAGCGGGTCGGATCCCTGACTC
GCTATCGTCAGCTAAGTTTGTGGGCCATCTCGATATCAGCAACAACAAGCTTTGTGGGCC
TATTCCAACGGGTTCTCCTTTTGATCACCTGGAAGCGTCGTCGTTTAGTGACAACCAGTG
TTTGTGCGGTGGTCCGTTGATGAAGACATGTTAATAAAACAATCGATTATGGTTCCGGTT
CTGCTGAACCGGATGTTTTACCAAGTTCCTTGTTGCTCTTGTTCCATATTGGTTTAACTG
TTTATTTATTTACCTTTTCAAATTATAAGTGCCTGCCAATTGC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL7180Contig1 757 2 2 U
GGAGACAGAACAAAAAAGAAAAAGCAAACGTCCCGGTCGGGAAGGAGAGAGCGATGGAGG
AAGAGGAGCACGAGGTTTACGGGGGAGAGATTCCCGACGTCGGAGAGATGGATGGTGACG
TGGAGGCTCATAATCCTGATTTGGACATGGCTGCTACCGATGACGATGCTGCTAAGGAGT
TGGATGAGATGAAGAAACGGTTGAAGGATATCGAGGATGAAGCTGCTGCTCTTCGTGAGA
TGCAAGCCAAAGTTGAGAAGGAGATGGGAGCTCAAGATCCTGCTGCTATAGCAGCAAATC
AAGCAGGCAAGGAGGAGGTTGATGCTCGGTCTGTTTTTGTTGGCAATGTCGATTACGCTT
GTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGGACTGTGCATCGGGTGACAA
TTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGATTTGCTTATGTGGAGTTTGTGGAAGTTG
AAGCCATACAAGAGGCTCTACAACTGAATGAATCAGAGTTACATGGTCGTCAACTAAAGG
TGCTGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGTGGTAGACGATTCAACC
CGTACATGGGCTACCGGTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATGTATTCTCCTTATG
GATATGGGAAAGCCCCCCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATACCAATAAA
AAAGCCTTTCATTGGCGCTTTAAAACAAAGAGGGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF37TF U 1
AF RR2BF37JQ C 373
BS 1 673 RR2BF37TF
BS 674 757 RR2BF37JQ

RD RR2BF37TF 680 0 0
GGAGACAGAACAAAAAAGAAAAAGCAAACGTCCCGGTCGGGAAGGAGAGAGCGATGGAGG
AAGAGGAGCACGAGGTTTACGGGGGAGAGATTCCCGACGTCGGAGAGATGGATGGTGACG
TGGAGGCTCATAATCCTGATTTGGACATGGCTGCTACCGATGACGATGCTGCTAAGGAGT
TGGATGAGATGAAGAAACGGTTGAAGGATATCGAGGATGAAGCTGCTGCTCTTCGTGAGA
TGCAAGCCAAAGTTGAGAAGGAGATGGGAGCTCAAGATCCTGCTGCTATAGCAGCAAATC
AAGCAGGCAAGGAGGAGGTTGATGCTCGGTCTGTTTTTGTTGGCAATGTCGATTACGCTT
GTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGGACTGTGCATCGGGTGACAA
TTCTGACAGACAAGTTCGGGCAGCCAAAGGGATTTGCTTATGTGGAGTTTGTGGAAGTTG
AAGCCATACAAGAGGCTCTACAACTGAATGAATCAGAGTTACATGGTCGTCAACTAAAGG
TGCTGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGTGGTAGACGATTCAACC
CGTACATGGGCTACCGGTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATGTATTCTCCTTATG
GATATGGGAAAGC
GCCGCCT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2BF37JQ 385 0 0
AAGTGCAGCAACATTTCCAATCATGCGGGACTGTGCATCGGGTGACAATTTTGACAGACA
AGTTCGGGCAGCCAAAGGGATTTGCTTATGTGGAGTTTGTGGAAGTTGAAGCCATACAAG
AGGCTTTACAACTGAATGAATCAGAGTTACATGGTCGTCAACTAAAGGTGCTGCCTAAGA
GAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGTGGTAGAGGATTCAACCCGTACATGGGCT
ACCGGTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCGTATATGTATTCTCCTTATGGATATGGGAAAG
CCCCCCCTAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATACCAATAAAAAAGCCTTTCAT
TGGCGCTTTAAAACAAAGAGGGGAT

QA 1 385 1 385
DS 



AS 1 2

CO CL7181Contig1 948 2 2 U
TGAAGATGATGCTAAAGCCTCGCCGGAGAAGGAGAAGGAGAAGCCAGGCGGGACAGCTCA
GACGAGGGATTACTACTTGGAGTCACGGCGGAGAAGAAGCTTTGATCGGTCATCATCGAG
ACATGGATTGGTGGTGGATGTTGAGGAAGTGAAAGCTAAGTTGCCGCCTGAGAGTGTTGG
TTTGTTTCATGGAGCTAAGCTGCTTGTCACCGAGAGGGAACTTAGAGATTCGGATTGGTA
TTCCATCAAAAATTATAAACCGGAGGGCTTGGAGTTAGCTTCTAAAGGTGTTTCTGCTGG
TGGTGAAGTGAAGCAGGATGGTTTCGGATTGAAGAAGACTGGAAAGAAATGGGGGAAAGG
ATGGAATCTTTGGGGGTTGATTCAGAGGAAAGGTGACACAGCCAAGAACGAGGTTAAAAC
CGAGCAAAGCTTGAAACTTGGAGGTAATGAAATGGAGGGTGGTTCTCTTGCTGAGTCTCT
CTTGAAGCTTAGGAGAGTGGCGGCTAAAGGAGGAGAAAGCAACGGTGATGTCAGCGAGAA
ACTCTTGAGAAGTTACAGCGTTAGTGCAAGGAAGTCTTGTGATGGCATGATGTTTCATCA
TGGTGGTTCTGTTGTTAGTGGCGGCTTCGAAGGTGGAAGAAGCTCTTGCGATGGTCTGTT
CCATGGCTCTGTTACTGGTGGTGGTGCTGAGGCTGCTGGAAGAAGAAGCTTGTGCGAGGA
CAAGCTTGGTGCTTCTTACTCGCCGGATAGCATCAGAAACGGTATGGTTAGATTCTACTT
GACGCCGTTAAAGAGCCATGTGACAAGCAACTCTGGGAAAAGTAGGCTGATGGTGTGATG
ATGGATAATTATATTTGATAGTACTGTGTGTTGTAATTAGCCATTACCATGTATTGTTTA
CTTATTATCCCATTGTTCTATAGATATATGAAGCAACATCATATGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH14TF U 1
AF RR2BH14JQ C 171
BS 1 690 RR2BH14TF
BS 691 948 RR2BH14JQ

RD RR2BH14TF 690 0 0
TGAAGATGATGCTAAAGCCTCGCCGGAGAAGGAGAAGGAGAAGCCAGGCGGGACAGCTCA
GACGAGGGATTACTACTTGGAGTCACGGCGGAGAAGAAGCTTTGATCGGTCATCATCGAG
ACATGGATTGGTGGTGGATGTTGAGGAAGTGAAAGCTAAGTTGCCGCCTGAGAGTGTTGG
TTTGTTTCATGGAGCTAAGCTGCTTGTCACCGAGAGGGAACTTAGAGATTCGGATTGGTA
TTCCATCAAAAATTATAAACCGGAGGGCTTGGAGTTAGCTTCTAAAGGTGTTTCTGCTGG
TGGTGAAGTGAAGCAGGATGGTTTCGGATTGAAGAAGACTGGAAAGAAATGGGGGAAAGG
ATGGAATCTTTGGGGGTTGATTCAGAGGAAAGGTGACACAGCCAAGAACGAGGTTAAAAC
CGAGCAAAGCTTGAAACTTGGAGGTAATGAAATGGAGGGTGGTTCTCTTGCTGAGTCTCT
CTTGAAGCTTAGGAGAGTGGCGGCTAAAGGAGGAGAAAGCAACGGTGATGTCAGCGAGAA
ACTCTTGAGAAGTTACAGCGTTAGTGCAAGGAAGTCTTGTGATGGCATGATGTTTCATCA
TGGTGGTTCTGTTGTTAGTGGCGGCTTCGAAGGTGGAAGAAGCTCTTGCGATGGTCTGTT
CCATGGCTCTGTTACTGGTGGTGGTGCTGA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2BH14JQ 778 0 0
AGAGTGTTGGTTTGTTTCATGGAGCTAAGCTGCTTGTCACCGAGAGGGAACTTAGAGATT
CGGATTGGTATTCCATCAAAAATTATAAACCGGAGGGCTTGGAGTTAGCTTCTAAAGGTG
TTTCTGCTGGTGGTGAAGTGAAGCAGGATGGTTTCGGATTGAAGAAGACTGGAAAGAAAT
GGGGGAAAGGATGGAATCTTTGGGGGTTGATTCAGAGGAAAGGTGACACAGCCAAGAACG
AGGTTAAAACCGAGCAAAGCTTGAAACTTGGAGGTAATGAAATGGAGGGTGGTTCTCTTG
CTGAGTCTCTCTTGAAGCTTAGGAGAGTGGCGGCTAAAGGAGGAGAAAGCAACGGTGATG
TCAGCGAGAAACTCTTGAGAAGTTACAGCGTTAGTGCAAGGAAGTCTTGTGATGGCATGA
TGTTTCATCATGGTGGTTCTGTTGTTAGTGGCGGCTTCGAAGGTGGAAGAAGCTCTTGCG
ATGGTCTGTTCCATGGCTCTGTTACTGGTGGTGGTGCTGAGGCTGCTGGAAGAAGAAGCT
TGTGCGAGGACAAGCTTGGTGCTTCTTACTCGCCGGATAGCATCAGAAACGGTATGGTTA
GATTCTACTTGACGCCGTTAAAGAGCCATGTGACAAGCAACTCTGGGAAAAGTAGGCTGA
TGGTGTGATGATGGATAATTATATTTGATAGTACTGTGTGTTGTAATTAGCCATTACCAT
GTATTGTTTACTTATTATCCCATTGTTCTATAGATATATGAAGCAACATCATATGCTT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL7182Contig1 643 2 1 U
GGACCAATCTCAGAATAAGAACACTACAATCTTCTTTCAAGGCTAAGAAAAATGGCTTTT
AGAAACTCTCTTGCCATCTTCTTTGCCTTGAACATCATCTTCTTCACAATAACAGAAGCT
GCCCGCTCTGGTTGTCCACCTGGGTCATACAAACCCAAGCCGCCTTCCCCAACCCCTCCA
GCCATCCAGACATGCCCAAAAGATACAATAAAGCTCGGTGTTTGTGTTAAGGCGCTTAAC
TTATTGAATGTGACATTAGGTGCTCCTCCAGTTAAACCGTGTTGCAGCCTCATTGACGGT
TTGGTCGATCTAGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGTACCGCGCTTAAAGCTAGCGTTCTCGGC
ATCAACATTAACCTTCCAATCAACCTTAGCTTGCTTCTCAACGCTTGCAGCAGAAAGGCT
CCACGCGGCTTCCAATGCCCTTAATTTCTCAAACACGTCAAAATATTGCTAAATTCTGAA
TTTCTTGCTATGTTTCAATTTGGTCGAACTTTTGTTTGTGTTTCCTGTGTTTTTTTTTAT
CTTCTCTTCTTTGAACTGGTGGATGAGGATAAGTAATGAGTTTCTTTTGTAATTTATTTC
AATTGTTTTGATGAATAAGATATAACACTTTCGGTGTTACGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G552JQ C 1
AF RR2G552TF U 1
BS 1 643 RR2G552TF

RD RR2G552JQ 643 0 0
GGACCAATCTCAGAATAAGAACACTACAATCTTCTTTCAAGGCTAAGAAAAATGGCTTTT
AGAAACTCTCTTGCCATCTTCTTTGCCTTGAACATCATCTTCTTCACAATAACAGAAGCT
GCCCGCTCTGGTTGTCCACCTGGGTCATACAAACCCAAGCCGCCTTCCCCAACCCCTCCA
GCCATCCAGACATGCCCAAAAGATACAATAAAGCTCGGTGTTTGTGTTAAGGCGCTTAAC
TTATTGAATGTGACATTAGGTGCTCCTCCAGTTAAACCGTGTTGCAGCCTCATTGACGGT
TTGGTCGATCTAGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGTACCGCGCTTAAAGCTAGCGTTCTCGGC
ATCAACATTAACCTTCCAATCAACCTTAGCTTGCTTCTCAACGCTTGCAGCAGAAAGGCT
CCACGCGGCTTCCAATGCCCTTAATTTCTCAAACACGTCAAAATATTGCTAAATTCTGAA
TTTCTTGCTATGTTTCAATTTGGTCGAACTTTTGTTTGTGTTTCCTGTGTTTTTTTTTAT
CTTCTCTTCTTTGAACTGGTGGATGAGGATAAGTAATGAGTTTCTTTTGTAATTTATTTC
AATTGTTTTGATGAATAAGATATAACACTTTCGGTGTTACGTT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2G552TF 643 0 0
GGACCAATCTCAGAATAAGAACACTACAATCTTCTTTCAAGGCTAAGAAAAATGGCTTTT
AGAAACTCTCTTGCCATCTTCTTTGCCTTGAACATCATCTTCTTCACAATAACAGAAGCT
GCCCGCTCTGGTTGTCCACCTGGGTCATACAAACCCAAGCCGCCTTCCCCAACCCCTCCA
GCCATCCAGACATGCCCAAAAGATACAATAAAGCTCGGTGTTTGTGTTAAGGCGCTTAAC
TTATTGAATGTGACATTAGGTGCTCCTCCAGTTAAACCGTGTTGCAGCCTCATTGACGGT
TTGGTCGATCTAGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGTACCGCGCTTAAAGCTAGCGTTCTCGGC
ATCAACATTAACCTTCCAATCAACCTTAGCTTGCTTCTCAACGCTTGCAGCAGAAAGGCT
CCACGCGGCTTCCAATGCCCTTAATTTCTCAAACACGTCAAAATATTGCTAAATTCTGAA
TTTCTTGCTATGTTTCAATTTGGTCGAACTTTTGTTTGTGTTTCCTGTGTTTTTTTTTAT
CTTCTCTTCTTTGAACTGGTGGATGAGGATAAGTAATGAGTTTCTTTTGTAATTTATTTC
AATTGTTTTGATGAATAAGATATAACACTTTCGGTGTTACGTT

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL7183Contig1 1105 2 4 U
GGGGACAACAATGAGTTTCTCGGTGGTCTTGTTCCACAATCCCTACTCCGCAACACCAAT
CTTACCCTTCACTACCATCTTCACAATCTCATCATCATCCTCATCATCATCTTTTATACC
AAGAAGAAGACTATCTTCTTCAACCAATCGCATCTTCCCTATCAACCAACCAAAACCCAT
AACCAAAACGCTCCAAACCCAAACCCTAGCCGCCAGAGACACAATCATAGACTTCGGCAA
GCACAAGGGCAAAATGCTCGGCTCTTTGCCTTCCGCTTACCTCAAATGGGTCTCCAAGAA
TCTACGAGCAGGAGACACTGAGTACTGGGCAAAGCTTGCAGACGAAGTGCTCGAGGACGA
TGTTTATAAAGACAGAATTGAGTGGGAGTTTGCAGAGAAAGTCCTCCATGGAAGTGATGA
GAGCATCAAAGAGAAGAAAAACAGAGGGGATGTAAGCTCTGTTTCGATGTTGTTGGAGAT
TAGTGAGAGGTTTGGTTGGGACAATGACGATAAGATTGGTTGGAGCAAAACCAACTACGA
GCTCTTGGGGACAAGCAGAGGTGGTCGGATTCCTAGGTTAGGAGAGAGTAGAGGAGATAT
GGTAAGAAGAAGAAGAGAGGTGAAGAAGGAGGGAGAGGAGGAAGATGGTAGTGGGTGGAG
GAGAAGAGAGAGGCGTGAGAGGATGAGGCAGAATCTTGGGAGAGAGAAGGAGAATGTTGA
TGGCAAAGCTGTGAATAGGAGTGATCAGAAGGGTGTTTTGGGAAGGTTAGAAGAAGTAGA
GAAGCAAATTGAGCCAAAGATTCATAGTCCTTTCCCAGGACGTGAGTTTCTGTTGAAGAA
AGTTATGAACAAGAGAAGGTCTCAATGACATGACTTAGAGTCTGTTGTTTCCTTTGATTG
AGTTTGCATTTCACATTGTTCACTAGAAGCAGAGTAAAGGCAGTTCCTTTGTGTATTCAT
CTCAAGTGTGTTGAAGAAAGTTATGAACAAAAGGAGGTCTCAATGACACATAAGAGTATG
TTGTTCCTTTTGATTGAGTTTACATTAAGCAGAGTAAAGGCAGTTCCTTTGTGTATTCAT
CTCAAGTGTGTTGAAGAAAGTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G635TF U 1
AF RR2G635JQ C 570
BS 1 628 RR2G635TF
BS 629 629 RR2G635JQ
BS 630 678 RR2G635TF
BS 679 1105 RR2G635JQ

RD RR2G635TF 678 0 0
GGGGACAACAATGAGTTTCTCGGTGGTCTTGTTCCACAATCCCTACTCCGCAACACCAAT
CTTACCCTTCACTACCATCTTCACAATCTCATCATCATCCTCATCATCATCTTTTATACC
AAGAAGAAGACTATCTTCTTCAACCAATCGCATCTTCCCTATCAACCAACCAAAACCCAT
AACCAAAACGCTCCAAACCCAAACCCTAGCCGCCAGAGACACAATCATAGACTTCGGCAA
GCACAAGGGCAAAATGCTCGGCTCTTTGCCTTCCGCTTACCTCAAATGGGTCTCCAAGAA
TCTACGAGCAGGAGACACTGAGTACTGGGCAAAGCTTGCAGACGAAGTGCTCGAGGACGA
TGTTTATAAAGACAGAATTGAGTGGGAGTTTGCAGAGAAAGTCCTCCATGGAAGTGATGA
GAGCATCAAAGAGAAGAAAAACAGAGGGGATGTAAGCTCTGTTTCGATGTTGTTGGAGAT
TAGTGAGAGGTTTGGTTGGGACAATGACGATAAGATTGGTTGGAGCAAAACCAACTACGA
GCTCTTGGGGACAAGCAGAGGTGGTCGGATTCCTAGGTTAGGAGAGAGTAGAGGAGATAT
GGTAAGAAGAAGAAGAGAGGTGAAGAAG*AGGGAGAGGAGGAAGATGGTAGTGGGTGGAG
GAGAAGAGAGAGGCGTGA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2G635JQ 536 0 0
TTCCTAGGTTAGGAGAGAGTAGAGGAGATATGGTAAGAAGAAGAAGAGAGGTGAAGAAGG
AGGGAGAGGAGGAAGATGGTAGTGGGTGGAGGAGAAGAGAGAGGCGTGAGAGGATGAGGC
AGAATCTTGGGAGAGAGAAGGAGAATGTTGATGGCAAAGCTGTGAATAGGAGTGATCAGA
AGGGTGTTTTGGGAAGGTTAGAAGAAGTAGAGAAGCAAATTGAGCCAAAGATTCATAGTC
CTTTCCCAGGACGTGAGTTTCTGTTGAAGAAAGTTATGAACAAGAGAAGGTCTCAATGAC
ATGACTTAGAGTCTGTTGTTTCCTTTGATTGAGTTTGCATTTCACATTGTTCACTAGAAG
CAGAGTAAAGGCAGTTCCTTTGTGTATTCATCTCAAGTGTGTTGAAGAAAGTTATGAACA
AAAGGAGGTCTCAATGACACATAAGAGTATGTTGTTCCTTTTGATTGAGTTTACATTAAG
CAGAGTAAAGGCAGTTCCTTTGTGTATTCATCTCAAGTGTGTTGAAGAAAGTTATG

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 2

CO CL7184Contig1 802 2 4 U
GGCGGAGAAGAGAGAAAAGAAGAAAAACAAAAATCAAAATGGTCGGAAGGATCTTCCTCC
TTTTCCTCTCCATCCTCGTCACGGTGGTCATCGCTGGAAAAGCTCCACCACCAACATTCA
CGGAGACAGGCAAAGCCTTAGTTGAAAAACTCTGCGAGAAATCCGAAGACAAAGCGTTTT
GCGTTTCGAGCCTAACCTCACGTCCCGAGTCAGAAACCGCAAACGCTCCAAAACTCGGCG
TGATCGCGTTAAGCATCGCGTCTACAAACGCTTCGGACACGTCTTTCTACATCAAATCGA
AACTAAACCAAAGAAACCTGGAGCCAGCTTTGGAAGACACGCTGGACGATTGTTCTAAGA
ATTACTTAGACTCAGTCGCGCAGCTAGACGATTCTCTCGCCGCTCTGCTCGCCAATGCAT
ACATCGACGTTGATATTTGGCTTAACACGGCGATTAGCGACGGAGAGGCTTGTGAAGATG
CTTTGAGTGAACGTGCGGGAAATGACGCTGAGCTTGCTCGTAGGAACACAAACTTCTTGA
AGCTTTGCAAAGATGCTCTTCTCATCAACACTATTTTAACTCCGTAAAATTCAAAATTTG
TTACCGATATATTAATTTATTTTGGTTTGCTTGTTGTAACTTTTTTTTATAAATGGCTTC
GTTGTTGTGTGGGTTAAATTAAACGGTATTTGAAAACTTGTATTTTGGGAAATTTTGAAT
GAGCATACTCCACTATATATATAGTACATACAGTGAATATGTATATTTTATTAATTTATG
AAATATATTTTTTATTAGGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI81TF U 1
AF RR2GI81JQB C 117
BS 1 523 RR2GI81TF
BS 524 524 RR2GI81JQB
BS 525 640 RR2GI81TF
BS 641 802 RR2GI81JQB

RD RR2GI81TF 640 0 0
GGCGGAGAAGAGAGAAAAGAAGAAAAACAAAAATCAAAATGGTCGGAAGGATCTTCCTCC
TTTTCCTCTCCATCCTCGTCACGGTGGTCATCGCTGGAAAAGCTCCACCACCAACATTCA
CGGAGACAGGCAAAGCCTTAGTTGAAAAACTCTGCGAGAAATCCGAAGACAAAGCGTTTT
GCGTTTCGAGCCTAACCTCACGTCCCGAGTCAGAAACCGCAAACGCTCCAAAACTCGGCG
TGATCGCGTTAAGCATCGCGTCTACAAACGCTTCGGACACGTCTTTCTACATCAAATCGA
AACTAAACCAAAGAAACCTGGAGCCAGCTTTGGAAGACACGCTGGACGATTGTTCTAAGA
ATTACTTAGACTCAGTCGCGCAGCTAGACGATTCTCTCGCCGCTCTGCTCGCCAATGCAT
ACATCGACGTTGATATTTGGCTTAACACGGCGATTAGCGACGGAGAGGCTTGTGAAGATG
CTTTGAGTGAACGTGCGGGAAATGACGCTGAGCTTGCTCGTAG*AACACAAACTTCTTGA
AGCTTTGCAAAGATGCTCTTCTCATCAACACTATTTTAACTCCGTAAAATTCAAAATTTG
TTACCGATATATTAATTTATTTTGGTTTGCTTGTTGTAAC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RR2GI81JQB 686 0 0
TTCACGGAGACAGGCAAAGCCTTAGTTGAAAAACTCTGCGAGAAATCCGAAGACAAAGCG
TTTTGCGTTTCGAGCCTAACCTCACGTCCCGAGTCAGAAACCGCAAACGCTCCAAAACTC
GGCGTGATCGCGTTAAGCATCGCGTCTACAAACGCTTCGGACACGTCTTTCTACATCAAA
TCGAAACTAAACCAAAGAAACCTGGAGCCAGCTTTGGAAGACACGCTGGACGATTGTTCT
AAGAATTACTTAGACTCAGTCGCGCAGCTAGACGATTCTCTCGCCGCTCTGCTCGCCAAT
GCATACATCGACGTTGATATTTGGCTTAACACGGCGATTAGCGACGGAGAGGCTTGTGAA
GATGCTTTGAGTGAACGTGCGGGAAATGACGCTGAGCTTGCTCGTAGGAACACAAACTTC
TTGAAGCTTTGCAAAGATGCTCTTCTCATCAACACTATTTTAACTCCGTAAAATTCAAAA
TTTGTTACCGATATATTAATTTATTTTGGTTTGCTTGTTGTAACTTTTTTTTATAAATGG
CTTCGTTGTTGTGTGGGTTAAATTAAACGGTATTTGAAAACTTGTATTTTGGGAAATTTT
GAATGAGCATACTCCACTATATATATAGTACATACAGTGAATATGTATATTTTATTAATT
TATGAAATATATTTTTTATTAGGATT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL7185Contig1 728 2 8 U
GATCGAAACATGGTTCACAGGATACTGAGAGATCATGACGCCGATGGATGGGAACGCTCC
GATTTCCCAATCGTCTGCGAGTCTTGCCTCGGTGACAATCCCTACGTTCGAATGACGAAG
GCGGAGTATGATAAGGAGTGTAAGATATGCACAAGACCTTTCACTGTCTTTAGGTGGAGA
CCTGGCAGAGACGCTAGGTACAAGAAAACCGAGATTTGTCAGACTTGCTGCAAGCTGAAG
AACGTGTGTCAAGTCTGTCTTCTGGATCTTGAGTATGGTCTTCCTGTTCAAGCTAGGGAC
ACTGCCCTCAACATCACTACTCATGACTCTATCCCAAAGAGTGATGTCAACAGAGAGTAC
TTCGCTGAGGAGCATGACAGGAAGACTAGAGCTGGACTGGATTATGAATCTTCGTTTGGG
AAGATGCGTCCTAATGATACTATTCTAAAGCTTCAAAGGACAACACCGTACTATAAGAGG
AACAGAGCGCATGTTTGTAGTTTCTACATTAGGGGTGAGTGTACTAGAGGCGAGGAATGT
CCGTATCGGCATGAGATGTCTGAAACAGGATCCGCTCAGCAACCTCCTGCTGCTTCTACT
ACGACTGATTCATCTCAATAGAAGAATCCTTGCTTAAAACGTTCAGCAACGTTTATCTTT
GTCATGCTCAAAAGATTTTTGTACTCTGAATGAATCATTTTCAGCTGTTTTAGTTTAAAC
TTTGAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GT14TF U 1
AF RR2GT14JQB C 106
BS 1 672 RR2GT14TF
BS 673 673 RR2GT14JQB
BS 674 679 RR2GT14TF
BS 680 680 RR2GT14JQB
BS 681 700 RR2GT14TF
BS 701 701 RR2GT14JQB
BS 702 710 RR2GT14TF
BS 711 728 RR2GT14JQB

RD RR2GT14TF 715 0 0
GATCGAAACATGGTTCACAGGATACTGAGAGATCATGACGCCGATGGATGGGAACGCTCC
GATTTCCCAATCGTCTGCGAGTCTTGCCTCGGTGACAATCCCTACGTTCGAATGACGAAG
GCGGAGTATGATAAGGAGTGTAAGATATGCACAAGACCTTTCACTGTCTTTAGGTGGAGA
CCTGGCAGAGACGCTAGGTACAAGAAAACCGAGATTTGTCAGACTTGCTGCAAGCTGAAG
AACGTGTGTCAAGTCTGTCTTCTGGATCTTGAGTATGGTCTTCCTGTTCAAGCTAGGGAC
ACTGCCCTCAACATCACTACTCATGACTCTATCCCAAAGAGTGATGTCAACAGAGAGTAC
TTCGCTGAGGAGCATGACAGGAAGACTAGAGCTGGACTGGATTATGAATCTTCGTTTGGG
AAGATGCGTCCTAATGATACTATTCTAAAGCTTCAAAGGACAACACCGTACTATAAGAGG
AACAGAGCGCATGTTTGTAGTTTCTACATTAGGGGTGAGTGTACTAGAGGCGAGGAATGT
CCGTATCGGCATGAGATGTCTGAAACAGGATCCGCTCAGCAACCTCCTGCTGCTTCTACT
ACGACTGATTCATCTCAATAGAAGAATCCTTGCTTAAAACGTTCAGCAACGTTTATCTTT
GTCATGCTCAAA*GATTTT*GTACTCTGAATGAATCATTT*CAGCTGTTT
AGTTA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2GT14JQB 623 0 0
GTTCGAATGACGAAGGCGGAGTATGATAAGGAGTGTAAGATATGCACAAGACCTTTCACT
GTCTTTAGGTGGAGACCTGGCAGAGACGCTAGGTACAAGAAAACCGAGATTTGTCAGACT
TGCTGCAAGCTGAAGAACGTGTGTCAAGTCTGTCTTCTGGATCTTGAGTATGGTCTTCCT
GTTCAAGCTAGGGACACTGCCCTCAACATCACTACTCATGACTCTATCCCAAAGAGTGAT
GTCAACAGAGAGTACTTCGCTGAGGAGCATGACAGGAAGACTAGAGCTGGACTGGATTAT
GAATCTTCGTTTGGGAAGATGCGTCCTAATGATACTATTCTAAAGCTTCAAAGGACAACA
CCGTACTATAAGAGGAACAGAGCGCATGTTTGTAGTTTCTACATTAGGGGTGAGTGTACT
AGAGGCGAGGAATGTCCGTATCGGCATGAGATGTCTGAAACAGGATCCGCTCAGCAACCT
CCTGCTGCTTCTACTACGACTGATTCATCTCAATAGAAGAATCCTTGCTTAAAACGTTCA
GCAACGTTTATCTTTGTCATGCTCAAAAGATTTTTGTACTCTGAATGAATCATTTTCAGC
TGTTTTAGTTTAAACTTTGAAGT

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL7186Contig1 976 2 4 U
GGAACTTGAAAGTAAAATCTACTGATAGATGCAGAATCTGTGAAGTTTGCTGGTTTTTTT
AGGATATAGAAGAGGGAAAAATGGTGGCGGCTGCGACGCAGATATTTCAGTTACCGTTAC
AGTACTCTGTTTCTTCCGGCCGACGGAGTTATCACGGTGTTTGCTCGCCGTCTCCGGTTG
TAGTCCGTAGGAGTAGTGGACAGAGGAAGAATCGGAGAGTGGTAGTTCATCAGGAGAAAG
GAGAGGCCGCGGAAATTCGAGTTCCGGTTCCGTTAACATTGGAGCAACAAGAGAAGGAGA
AAGTAGACAGAGACGACGAAGATGAAGACGAAGGAGAAGTGGATCCTGAAGATCTTAAAT
ACGTCAATGAGATCAAACGGGTGTTGGAGCTACTGAGGAGGAACAGAGACATGATGTTCA
ATGAGGTGAAGTTGACCATAATGATTGAGGACCCAAGGGAATTGGAAAAGAGGAGACTTC
TTGGCATAGAAGAGGAGGATGCCCCTAGTAGGGAAGACTTAGCCGATGCCTTGGAACTGG
TAAATGAAGGGAAAATCCCTAAAGATCGTCTCACTCTCCAGATGCTGTATGAGGAAATGA
TCCGTTGGCCAAATTTAGAGGTTGAGGTTTCAAAGAAGCAGCGAACAAAATCATTGTATG
CGAAATCCACAGACACCGGAATAGATCCAAAAGAGGCAGCCAAGAGACTCAACCTAGAGT
GGGATTCAGCTGCTGCAATTGAAGAAGCCGATGTCGATGATGATGACACTGGAGTAGCCA
AGAAAGCCATGGGTTATGGAGCGTTGTACTTAGTCTCATCTTTTCCAGTTATCATCGGTA
TATCGGTTGTCTTAATCTTGTTTTACAATTCCCTTCAGTATATTCCAAAACCTTTTCGGT
TTTTCACATACACCAATATTTGGCCCCATCATGGATGGTTTGTAACTTCATATTATGAAA
TGAATTTTAATTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR84TF U 1
AF RR2BR84JQ C 190
BS 1 691 RR2BR84TF
BS 692 692 RR2BR84JQ
BS 693 702 RR2BR84TF
BS 703 976 RR2BR84JQ

RD RR2BR84TF 708 0 0
GGAACTTGAAAGTAAAATCTACTGATAGATGCAGAATCTGTGAAGTTTGCTGGTTTTTTT
AGGATATAGAAGAGGGAAAAATGGTGGCGGCTGCGACGCAGATATTTCAGTTACCGTTAC
AGTACTCTGTTTCTTCCGGCCGACGGAGTTATCACGGTGTTTGCTCGCCGTCTCCGGTTG
TAGTCCGTAGGAGTAGTGGACAGAGGAAGAATCGGAGAGTGGTAGTTCATCAGGAGAAAG
GAGAGGCCGCGGAAATTCGAGTTCCGGTTCCGTTAACATTGGAGCAACAAGAGAAGGAGA
AAGTAGACAGAGACGACGAAGATGAAGACGAAGGAGAAGTGGATCCTGAAGATCTTAAAT
ACGTCAATGAGATCAAACGGGTGTTGGAGCTACTGAGGAGGAACAGAGACATGATGTTCA
ATGAGGTGAAGTTGACCATAATGATTGAGGACCCAAGGGAATTGGAAAAGAGGAGACTTC
TTGGCATAGAAGAGGAGGATGCCCCTAGTAGGGAAGACTTAGCCGATGCCTTGGAACTGG
TAAATGAAGGGAAAATCCCTAAAGATCGTCTCACTCTCCAGATGCTGTATGAGGAAATGA
TCCGTTGGCCAAATTTAGAGGTTGAGGTTTCAAAGAAGCAGCGAACAAAATCATTGTATG
CGAAATCCACAGACACCGGAATAGATCCAAA*GAGGCAGCCA
GAGACT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2BR84JQ 787 0 0
GGAGTAGTGGACAGAGGAAGAATCGGAGAGTGGTAGTTCATCAGGAGAAAGGAGAGGCCG
CGGAAATTCGAGTTCCGGTTCCGTTAACATTGGAGCAACAAGAGAAGGAGAAAGTAGACA
GAGACGACGAAGATGAAGACGAAGGAGAAGTGGATCCTGAAGATCTTAAATACGTCAATG
AGATCAAACGGGTGTTGGAGCTACTGAGGAGGAACAGAGACATGATGTTCAATGAGGTGA
AGTTGACCATAATGATTGAGGACCCAAGGGAATTGGAAAAGAGGAGACTTCTTGGCATAG
AAGAGGAGGATGCCCCTAGTAGGGAAGACTTAGCCGATGCCTTGGAACTGGTAAATGAAG
GGAAAATCCCTAAAGATCGTCTCACTCTCCAGATGCTGTATGAGGAAATGATCCGTTGGC
CAAATTTAGAGGTTGAGGTTTCAAAGAAGCAGCGAACAAAATCATTGTATGCGAAATCCA
CAGACACCGGAATAGATCCAAAAGAGGCAGCCAAGAGACTCAACCTAGAGTGGGATTCAG
CTGCTGCAATTGAAGAAGCCGATGTCGATGATGATGACACTGGAGTAGCCAAGAAAGCCA
TGGGTTATGGAGCGTTGTACTTAGTCTCATCTTTTCCAGTTATCATCGGTATATCGGTTG
TCTTAATCTTGTTTTACAATTCCCTTCAGTATATTCCAAAACCTTTTCGGTTTTTCACAT
ACACCAATATTTGGCCCCATCATGGATGGTTTGTAACTTCATATTATGAAATGAATTTTA
ATTATTT

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL7187Contig1 638 2 2 U
GGAGACCAAGCAACAAGTTTTCTCAAAGAAGATATCATAATGAGCTACGACTACGGGAAG
GTTCCGCCTGAAACGTATCCTCCTCCAGGTTACCAATCTCAGTATCCTCCCCCGCCTCCG
GTATATCCTCCGTCGCACCATCACGAAGGATATCCTCAACACCCACACGGATATCCATCG
TATCCACCACCACGACCGCCTTCACGTCCTCCTCACGAAGGCGGCTATCAGGAGTACTTC
TCCGGTGGCTTTCCTCCTCCTCTTCCAACTCCGCCGCAGCAATACAATCAGTGCCATCAT
GATCATCACTATTACCAGGATTCGAACTCTGGTTGCACCTCTTTCCTCCGTGGCTGTCTC
GCTGCTCTCTGTTGCTGCTGTCTGTTAGACGATATCTTCGTCTAAGATTGGAGAGTTACT
CAATTCTCATAAAAACTTATATGATTTGGTGTATGTTTCTTTCTCGAAGCTGTCAATCTA
TACTTAAAAGATGACTCCATTGGGTGTTGGAATGAGCTTACAGAGCCATGGTACCAAAAC
CATAGCTTATTGGCATTCATTTATAGTTTGCATGCTTTATTTGAACACAAGCAGCTTGAG
TATTGATAACAACTTTAATCTACATGCTAATTTTCCAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ32TF U 1
AF RR2GJ32JQB C 1
BS 1 519 RR2GJ32TF
BS 520 638 RR2GJ32JQB

RD RR2GJ32TF 519 0 0
GGAGACCAAGCAACAAGTTTTCTCAAAGAAGATATCATAATGAGCTACGACTACGGGAAG
GTTCCGCCTGAAACGTATCCTCCTCCAGGTTACCAATCTCAGTATCCTCCCCCGCCTCCG
GTATATCCTCCGTCGCACCATCACGAAGGATATCCTCAACACCCACACGGATATCCATCG
TATCCACCACCACGACCGCCTTCACGTCCTCCTCACGAAGGCGGCTATCAGGAGTACTTC
TCCGGTGGCTTTCCTCCTCCTCTTCCAACTCCGCCGCAGCAATACAATCAGTGCCATCAT
GATCATCACTATTACCAGGATTCGAACTCTGGTTGCACCTCTTTCCTCCGTGGCTGTCTC
GCTGCTCTCTGTTGCTGCTGTCTGTTAGACGATATCTTCGTCTAAGATTGGAGAGTTACT
CAATTCTCATAAAAACTTATATGATTTGGTGTATGTTTCTTTCTCGAAGCTGTCAATCTA
TACTTAAAAGATGACTCCATTGGGTGTTGGAATGAGCTT

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2GJ32JQB 638 0 0
GGAGACCAAGCAACAAGTTTTCTCAAAGAAGATATCATAATGAGCTACGACTACGGGAAG
GTTCCGCCTGAAACGTATCCTCCTCCAGGTTACCAATCTCAGTATCCTCCCCCGCCTCCG
GTATATCCTCCGTCGCACCATCACGAAGGATATCCTCAACACCCACACGGATATCCATCG
TATCCACCACCACGACCGCCTTCACGTCCTCCTCACGAAGGCGGCTATCAGGAGTACTTC
TCCGGTGGCTTTCCTCCTCCTCTTCCAACTCCGCCGCAGCAATACAATCAGTGCCATCAT
GATCATCACTATTACCAGGATTCGAACTCTGGTTGCACCTCTTTCCTCCGTGGCTGTCTC
GCTGCTCTCTGTTGCTGCTGTCTGTTAGACGATATCTTCGTCTAAGATTGGAGAGTTACT
CAATTCTCATAAAAACTTATATGATTTGGTGTATGTTTCTTTCTCGAAGCTGTCAATCTA
TACTTAAAAGATGACTCCATTGGGTGTTGGAATGAGCTTACAGAGCCATGGTACCAAAAC
CATAGCTTATTGGCATTCATTTATAGTTTGCATGCTTTATTTGAACACAAGCAGCTTGAG
TATTGATAACAACTTTAATCTACATGCTAATTTTCCAG

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL7188Contig1 961 2 8 U
GGGATCAGTCTCTCTCTTTCTCTCTCCATGGAAGCTACTGAGTTATGATCTGATCTGACT
GTCTTTTAACTGTGATGTTCTGCTGAGAAACAAAGCATCTCTAAACTAATTAATGGCTGA
TCAACTTCCATCTCCAACACCTAACACCTATTACCCATCTGTCTTCTTTAGCTCTCCAAA
GTTTAGGTTTTTCTCTTCTAAGATCACTCCTGTTGACTCCATCATCAGCCCTACTTCCAC
CCTCGATGGCAACCACCCATTCGTTTTCTTCTCCTCCTCCAAAAGCCTTAAACCCCAAAG
GTTTCTTCACCCACCTGAAGCCTTTGGCCTCGCCGATCTCGTCAAAAACAGAGACCGCTC
CAACAAACCTGTCAACATGATGGTCCTTTTCGGGTCAAAGCTCAGAGTCCAGATACCTTC
AGCTGATTTTGGTACTAAATCTGCTCCTTGCACCAGCCAGCTCAGCCCTTGTCTCAAAAC
AAAGGTCTTAACTGTGAGCGAGGTTGACCAGACGACGGGGGACTACACTCGCGTCATATC
TCACGGTGCAAACCCAACCATCACCCATATCTTCGATAACTCTGTTTTCGTGGAGGCGAC
TCCTCCTTGCTCTGTTCCTTTGCCACAAGTACCCACGGAGACCAAGACCAATTTCTTTAG
TTATTGCTACACTTGCAACAAGAATCTTGACCAAAAACATGACATCTATATTTACAGAGG
AGAAAAAGGGTTTTGCAGCAGCGAGTGCAGGTACCAGGAGATGCTTCTTGATCAGATCGA
TGGCTAGCACCACCACCATTTCTCTCTTCTCTGATTTTTTTTCCCTTTTTTCATTTTTGT
CACAATAAAATCTACTATTTGTTGTGTTTTTATTTTTTTAATTAGTTCTCTTCTTCTTCT
TCTTTTTTTCTTGGTATTTTGTTATAATAACCTTTCTAGCCCGCAGATGTATTAAAGATA
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BM90TF U 1
AF RR2BM90JQ C 214
BS 1 696 RR2BM90TF
BS 697 697 RR2BM90JQ
BS 698 719 RR2BM90TF
BS 720 720 RR2BM90JQ
BS 721 726 RR2BM90TF
BS 727 727 RR2BM90JQ
BS 728 746 RR2BM90TF
BS 747 961 RR2BM90JQ

RD RR2BM90TF 746 0 0
GGGATCAGTCTCTCTCTTTCTCTCTCCATGGAAGCTACTGAGTTATGATCTGATCTGACT
GTCTTTTAACTGTGATGTTCTGCTGAGAAACAAAGCATCTCTAAACTAATTAATGGCTGA
TCAACTTCCATCTCCAACACCTAACACCTATTACCCATCTGTCTTCTTTAGCTCTCCAAA
GTTTAGGTTTTTCTCTTCTAAGATCACTCCTGTTGACTCCATCATCAGCCCTACTTCCAC
CCTCGATGGCAACCACCCATTCGTTTTCTTCTCCTCCTCCAAAAGCCTTAAACCCCAAAG
GTTTCTTCACCCACCTGAAGCCTTTGGCCTCGCCGATCTCGTCAAAAACAGAGACCGCTC
CAACAAACCTGTCAACATGATGGTCCTTTTCGGGTCAAAGCTCAGAGTCCAGATACCTTC
AGCTGATTTTGGTACTAAATCTGCTCCTTGCACCAGCCAGCTCAGCCCTTGTCTCAAAAC
AAAGGTCTTAACTGTGAGCGAGGTTGACCAGACGACGGGGGACTACACTCGCGTCATATC
TCACGGTGCAAACCCAACCATCACCCATATCTTCGATAACTCTGTTTTCGTGGAGGCGAC
TCCTCCTTGCTCTGTTCCTTTGCCACAAGTACCCACGGAGACCAAGACCAATTTCTTTAG
TTATTGCTACACTTGCAACAAGAATCTTGACCAAAA*CATGACATCTATATTTACAGAG*
AGAAAA*GGGTTTTGCAGCAGCGAGT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2BM90JQ 748 0 0
TGACTCCATCATCAGCCCTACTTCCACCCTCGATGGCAACCACCCATTCGTTTTCTTCTC
CTCCTCCAAAAGCCTTAAACCCCAAAGGTTTCTTCACCCACCTGAAGCCTTTGGCCTCGC
CGATCTCGTCAAAAACAGAGACCGCTCCAACAAACCTGTCAACATGATGGTCCTTTTCGG
GTCAAAGCTCAGAGTCCAGATACCTTCAGCTGATTTTGGTACTAAATCTGCTCCTTGCAC
CAGCCAGCTCAGCCCTTGTCTCAAAACAAAGGTCTTAACTGTGAGCGAGGTTGACCAGAC
GACGGGGGACTACACTCGCGTCATATCTCACGGTGCAAACCCAACCATCACCCATATCTT
CGATAACTCTGTTTTCGTGGAGGCGACTCCTCCTTGCTCTGTTCCTTTGCCACAAGTACC
CACGGAGACCAAGACCAATTTCTTTAGTTATTGCTACACTTGCAACAAGAATCTTGACCA
AAAACATGACATCTATATTTACAGAGGAGAAAAAGGGTTTTGCAGCAGCGAGTGCAGGTA
CCAGGAGATGCTTCTTGATCAGATCGATGGCTAGCACCACCACCATTTCTCTCTTCTCTG
ATTTTTTTTCCCTTTTTTCATTTTTGTCACAATAAAATCTACTATTTGTTGTGTTTTTAT
TTTTTTAATTAGTTCTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTCTTGGTATTTTGTTATAATAACCT
TTCTAGCCCGCAGATGTATTAAAGATAG

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL7189Contig1 1286 2 8 U
GGCGAAACCAAGTCATGGCGAACATCAGAGCTTTACCACTCACAAGTTTGGAATCAACAT
CGCTGCTCTTCGGTAAAAGAAGAGTTCTTGTCAAGAACACTTCGATTATCAGTTCCACGG
AAACCCATTTTCTCCGACAGTCGATTCCGACAGGCATCGCACGGTCTCGAACTCCAAAGG
GAGCTGGGTCCGTCTCATGTTCTTCTGCCACAGAGAAAGCTTCTTCTACCTTCGAAGATG
TTTCTCCCGAAGTTCGAACCTTGACATGGAACTGGAAAGGTTACTCAATTAGATATCAAT
GTGCTGGAACCAGTGGTCTGCCTTAGTCTTGGTTCATGGTTTCGGTGCTAACAGTGACCA
TTGGAGGAAGAACACACCTATTCTTGGCAAATCATATAGGGTCTACTCAATCGATCTTAT
CGGGTATGGATACTCAGATAAACCGAATCCTCGTGAGTTTGGAGGAGAACCGTTCTACAC
TTTTGAGACATGGGGTGAGCAGCTCAATGATTTCTGTCTTGATGTTGTCAAAGATGAAGC
CTTTTTTATATGCAACTCTATCGGAGGACTTGTTGGTCTTCAGGCAGCAGTGAGTAAGCC
AGAGATATGCAGAGGGCTTATGCTTATCAACATATCTCTCCGTATGCTTCATATCAAGAA
ACAACCATTCATTGGAAGACCTTTCATCAGATCCTTCCAGAATTTACTTAGGAATACTCC
GGTTGGGAAACTATTTTTCAAGAGCATTGCTAAACCGGAGACTGTAAGAAGCATTCTTAG
CCAGTGCTACCATGATAGCTCTCAAGTGACTGATGAACTAGTTGAGGCAATTCTAAGGCC
AGGTCTTGAGCCTGGTGCTGTTGATGTCTTCCTTGAATTCATCTGTTACTCTGGTGGACC
GCTTCCAGAGGATTTACTCCCACTGGTCAAGTGCCCGGTTCTGATCGCATGGGGAGAAAA
AGATCCATGGGAGCCAATCGAGCTTGGACGAGCTTACGGTGATTTTGATGCGGTTGAAGA
GTTCGTTGTTCTGCCTGAAGCCGGCCACTGTCCTCAGGACGAGAAGCCGGAAATGGTGAA
TCCACTTATCGAATCATTCGTTGCGAGACATTCGAAGTCCAGTACAGCCCTTGCTCCGGA
CATATGATCTCAGTTGCTATCTTTACCTTCTTGTTACATTTTTTTTTTATATCTGTACAG
AAACATACATTTTGAACCAGCACAAACCATGCATGATACTGTCCCACGTTTGAGAACTCA
ATGTGACAAAAACAGTGAATGTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET53TF U 1
AF RR2ET53JQ C 544
BS 1 675 RR2ET53TF
BS 676 676 RR2ET53JQ
BS 677 790 RR2ET53TF
BS 791 791 RR2ET53JQ
BS 792 804 RR2ET53TF
BS 805 805 RR2ET53JQ
BS 806 818 RR2ET53TF
BS 819 1286 RR2ET53JQ

RD RR2ET53TF 818 0 0
GGCGAAACCAAGTCATGGCGAACATCAGAGCTTTACCACTCACAAGTTTGGAATCAACAT
CGCTGCTCTTCGGTAAAAGAAGAGTTCTTGTCAAGAACACTTCGATTATCAGTTCCACGG
AAACCCATTTTCTCCGACAGTCGATTCCGACAGGCATCGCACGGTCTCGAACTCCAAAGG
GAGCTGGGTCCGTCTCATGTTCTTCTGCCACAGAGAAAGCTTCTTCTACCTTCGAAGATG
TTTCTCCCGAAGTTCGAACCTTGACATGGAACTGGAAAGGTTACTCAATTAGATATCAAT
GTGCTGGAACCAGTGGTCTGCCTTAGTCTTGGTTCATGGTTTCGGTGCTAACAGTGACCA
TTGGAGGAAGAACACACCTATTCTTGGCAAATCATATAGGGTCTACTCAATCGATCTTAT
CGGGTATGGATACTCAGATAAACCGAATCCTCGTGAGTTTGGAGGAGAACCGTTCTACAC
TTTTGAGACATGGGGTGAGCAGCTCAATGATTTCTGTCTTGATGTTGTCAAAGATGAAGC
CTTTTTTATATGCAACTCTATCGGAGGACTTGTTGGTCTTCAGGCAGCAGTGAGTAAGCC
AGAGATATGCAGAGGGCTTATGCTTATCAACATATCTCTCCGTATGCTTCATATCAAGAA
ACAACCATTCATTGGGAGACCTTTCATCAGATCCTTCCAGAATTTACTTAGGAATACTCC
GGTTGGGAAACTATTTTTCAAGAGCATTGCTAAACCGGAGACTGTAAGAAGCATTCTTAG
CCAGTGCTAC*ATGATAGCTCTCA*GTGACTGATGAAC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2ET53JQ 743 0 0
TTTTATATGCAACTCTATCGGAGGACTTGTTGGTCTTCAGGCAGCAGTGAGTAAGCCAGA
GATATGCAGAGGGCTTATGCTTATCAACATATCTCTCCGTATGCTTCATATCAAGAAACA
ACCATTCATTGGAAGACCTTTCATCAGATCCTTCCAGAATTTACTTAGGAATACTCCGGT
TGGGAAACTATTTTTCAAGAGCATTGCTAAACCGGAGACTGTAAGAAGCATTCTTAGCCA
GTGCTACCATGATAGCTCTCAAGTGACTGATGAACTAGTTGAGGCAATTCTAAGGCCAGG
TCTTGAGCCTGGTGCTGTTGATGTCTTCCTTGAATTCATCTGTTACTCTGGTGGACCGCT
TCCAGAGGATTTACTCCCACTGGTCAAGTGCCCGGTTCTGATCGCATGGGGAGAAAAAGA
TCCATGGGAGCCAATCGAGCTTGGACGAGCTTACGGTGATTTTGATGCGGTTGAAGAGTT
CGTTGTTCTGCCTGAAGCCGGCCACTGTCCTCAGGACGAGAAGCCGGAAATGGTGAATCC
ACTTATCGAATCATTCGTTGCGAGACATTCGAAGTCCAGTACAGCCCTTGCTCCGGACAT
ATGATCTCAGTTGCTATCTTTACCTTCTTGTTACATTTTTTTTTTATATCTGTACAGAAA
CATACATTTTGAACCAGCACAAACCATGCATGATACTGTCCCACGTTTGAGAACTCAATG
TGACAAAAACAGTGAATGTATGC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL7190Contig1 1001 2 8 U
GGAGATATGCAGCTCATCTCCGAGGCGTATGATGTGTTGAAGAACGTCGGAGGGTTGAGC
AACGAGGAGCTCGCGGAGATCTTCGCGGAGTGGAATCGAGGTGAGCTGGAGAGTTTCTTG
GTTGAGATTACTTCGGATATCTTTAGGGTGAAGGATGAGTTCGGTGGTGGAGAGTTGGTG
GATAAGATTTTGGATAAGACTGGGATGAAAGGTACGGGGAAATGGACTGTTCAGCAGGCG
GCGGAGCTCTCTGTTGCGGCTCCGACGATTGCTGCTTCTTTGGATTGTCGGTACTTGAGC
GGATTGAAAGATGAGAGGGAGAATGCTGCTAGAGTGTTGAGAGAAGCTGGGTTGGAGGAA
GAGATTGGTACTGCTGGGTCAGGTGGGATTGATAAGAAGAGGTTGGTTGATGATGTTAGA
CAAGCTCTGTACGCGTCGAAGATATGTAGTTACGCTCAAGGGATGAATCTGCTTAGAGCT
AAGAGCTTGGAGAAGAGCTGGGACTTGAATTTCGGTGAGTTGGCTAGGATTTGGAAAGGT
GGGTGTATCATAAGAGCGGTGTTCTTGGATAGGATCAAGAAAGCTTACCAGAGGAATCCG
GATTTGGCGAGCCTTGTGGTTGATCCTGAGTTTGCTAAAGAGATGGTTCAGAGACAAGCT
GCTTGGAGGAGAGTCGTGGGTTTGGCCGTCTCTGCTGGGATTAGCACTCCTGGAATGTGT
GCGAGTCTTGCGTATTTTGATACGTATAGGCGTGCGAGATTGCCGGCGAATCTGGTCCAG
GCGCAGAGAGATCTGTTTGGAGCTCATACTTACGAGAGGATTGATCGTTCTGGTGCGTAC
CACACGGAGTGGACTAAGCTTGCTATGAAGAGCAATTGAGGTTTTTGTATTCGTGGAAAC
CGTTGTCTTGCTTATGGGTTTTTTTTAAAACCCAAATTGTTTCGAGAGCATTTTGTTAAG
ATTTCAAAAATAAGAAATGCACTACTAGATTGATCTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH57TF U 1
AF RR2H725TF U 434
BS 1 749 RR2DH57TF
BS 750 750 RR2H725TF
BS 751 765 RR2DH57TF
BS 766 766 RR2H725TF
BS 767 777 RR2DH57TF
BS 778 778 RR2H725TF
BS 779 806 RR2DH57TF
BS 807 1001 RR2H725TF

RD RR2DH57TF 806 0 0
GGAGATATGCAGCTCATCTCCGAGGCGTATGATGTGTTGAAGAACGTCGGAGGGTTGAGC
AACGAGGAGCTCGCGGAGATCTTCGCGGAGTGGAATCGAGGTGAGCTGGAGAGTTTCTTG
GTTGAGATTACTTCGGATATCTTTAGGGTGAAGGATGAGTTCGGTGGTGGAGAGTTGGTG
GATAAGATTTTGGATAAGACTGGGATGAAAGGTACGGGGAAATGGACTGTTCAGCAGGCG
GCGGAGCTCTCTGTTGCGGCTCCGACGATTGCTGCTTCTTTGGATTGTCGGTACTTGAGC
GGATTGAAAGATGAGAGGGAGAATGCTGCTAGAGTGTTGAGAGAAGCTGGGTTGGAGGAA
GAGATTGGTACTGCTGGGTCAGGTGGGATTGATAAGAAGAGGTTGGTTGATGATGTTAGA
CAAGCTCTGTACGCGTCGAAGATATGTAGTTACGCTCAAGGGATGAATCTGCTTAGAGCT
AAGAGCTTGGAGAAGAGCTGGGACTTGAATTTCGGTGAGTTGGCTAGGATTTGGAAAGGT
GGGTGTATCATAAGAGCGGTGTTCTTGGATAGGATCAAGAAAGCTTACCAGAGGAATCCG
GATTTGGCGAGCCTTGTGGTTGATCCTGAGTTTGCTAAAGAGATGGTTCAGAGACAAGCT
GCTTGGAGGAGAGTCGTGGGTTTGGCCGTCTCTGCTGGGATTAGCACTCCTGGAATGTGT
GCGAGTCTTGCGTATTTTGATACGTATAG*CGTGCGAGATTGCCG*CGAATCTGGTC*AG
GCGCAGAGAGATCTGTTTGGAGCTCA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2H725TF 568 0 0
G
GTCGAAGATATGTAGTTACGCTCAAGGGATGAATCTGCTTAGAGCTAAGAGCTTGGAGAA
GAGCTGGGACTTGAATTTCGGTGAGTTGGCTAGGATTTGGAAAGGTGGGTGTATCATAAG
AGCGGTGTTCTTGGATAGGATCAAGAAAGCTTACCAGAGGAATCCGGATTTGGCGAGCCT
TGTGGTTGATCCTGAGTTTGCTAAAGAGATGGTTCAGAGACAAGCTGCTTGGAGGAGAGT
CGTGGGTTTGGCCGTCTCTGCTGGGATTAGCACTCCTGGAATGTGTGCGAGTCTTGCGTA
TTTTGATACGTATAGGCGTGCGAGATTGCCGGCGAATCTGGTCCAGGCGCAGAGAGATCT
GTTTGGAGCTCATACTTACGAGAGGATTGATCGTTCTGGTGCGTACCACACGGAGTGGAC
TAAGCTTGCTATGAAGAGCAATTGAGGTTTTTGTATTCGTGGAAACCGTTGTCTTGCTTA
TGGGTTTTTTTTAAAACCCAAATTGTTTCGAGAGCATTTTGTTAAGATTTCAAAAATAAG
AAATGCACTACTAGATTGATCTTTGTT

QA 2 568 2 568
DS 



AS 1 2

CO CL7191Contig1 605 2 2 U
CAAGAAAACAAACTCCATTGCATAAACGAAAAAGCGTTCACCATAAAGGAGCAAATTACA
CCAAGAGATTAAGTAGAAAACGAAATTCGTAAAAAACACAGTCCCTTAGTTTCACAAACG
AAACATCAGTCGGAGCCTTAAAGAGACTCTTCATACCGAGACACCCAATCCCTTAAATTA
GAAGCTTCTCAATAGCATCCTTGAGCTGCTGAATCTGTGCCTTCAACGGGCTTGCGTCGT
TCGATGTAACTGAACAAGCGATCACAGGTCTGGTCACTCCACATGCTCTTCCCAACGCTT
GTTTCGATGGTACAAACACATACGGCACATTCTTGTCTTCGGCAAGGAGAGGAAGATGGA
GAAAAATCTCAAGAGGCTCAGCATCGGCAGCCATAACGACGAACTCAAAGATCCCACGGT
TCAAAGTCCTGGTAGCTTCGTTAGCTCCCTTCTTCAGCTGCTTGTAGTTCGTAGCCTGTT
GAACAAGGTCCAGAATCGTTATCGCTAGCTGAGAATCAGCCAACGGATACGCCTTAGGGT
TCACTGCTTCCACCGTCATCTTCGTCTTTTTGAAAGAGCTCAGCGAAGAAAAGCGACGAC
GAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2A125TF C 1
AF RR2A125JQ U 135
BS 1 134 RR2A125TF
BS 135 605 RR2A125JQ

RD RR2A125TF 258 0 0
CAAGAAAACAAACTCCATTGCATAAACGAAAAAGCGTTCACCATAAAGGAGCAAATTACA
CCAAGAGATTAAGTAGAAAACGAAATTCGTAAAAAACACAGTCCCTTAGTTTCACAAACG
AAACATCAGTCGGAGCCTTAAAGAGACTCTTCATACCGAGACACCCAATCCCTTAGATTA
GAAGCTTCTCAATAGCATCCTTGAGCTGCTGAATCTGTGCCTTCAACTGGCTTGCGTCGT
TCGATGTAACTGAACAAG

QA 1 258 1 258
DS 

RD RR2A125JQ 471 0 0
GCCTTAAAGAGACTCTTCATACCGAGACACCCAATCCCTTAAATTAGAAGCTTCTCAATA
GCATCCTTGAGCTGCTGAATCTGTGCCTTCAACGGGCTTGCGTCGTTCGATGTAACTGAA
CAAGCGATCACAGGTCTGGTCACTCCACATGCTCTTCCCAACGCTTGTTTCGATGGTACA
AACACATACGGCACATTCTTGTCTTCGGCAAGGAGAGGAAGATGGAGAAAAATCTCAAGA
GGCTCAGCATCGGCAGCCATAACGACGAACTCAAAGATCCCACGGTTCAAAGTCCTGGTA
GCTTCGTTAGCTCCCTTCTTCAGCTGCTTGTAGTTCGTAGCCTGTTGAACAAGGTCCAGA
ATCGTTATCGCTAGCTGAGAATCAGCCAACGGATACGCCTTAGGGTTCACTGCTTCCACC
GTCATCTTCGTCTTTTTGAAAGAGCTCAGCGAAGAAAAGCGACGACGAGCC

QA 1 471 1 471
DS 



AS 1 2

CO CL7192Contig1 518 2 1 U
GGATCACTTCTCCATACAACAAAATATTCCAAACAATTCGAAAATGGCTTCCAAGGCATT
AGTTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCGACATCCGA
AGAGCGGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTGACCATGACCAACGGAG
GAGGCCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCATGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGCGGCTGCT
CAAGGTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGG
TAATGTATTAACCACCACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATCG
TGGTGTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTAA
GAGGCCAAATTATGAGAATAAAGTTTGATTATGTAATGTCATTGCGTTTGAGTTGTTATC
TTTCGTGGCTGTCATAATAAAATCGTTTGTAGTTTATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FL11JQ C 1
AF RR2FL11TF U 1
BS 1 518 RR2FL11TF

RD RR2FL11JQ 518 0 0
GGATCACTTCTCCATACAACAAAATATTCCAAACAATTCGAAAATGGCTTCCAAGGCATT
AGTTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCGACATCCGA
AGAGCGGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTGACCATGACCAACGGAG
GAGGCCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCATGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGCGGCTGCT
CAAGGTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGG
TAATGTATTAACCACCACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATCG
TGGTGTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTAA
GAGGCCAAATTATGAGAATAAAGTTTGATTATGTAATGTCATTGCGTTTGAGTTGTTATC
TTTCGTGGCTGTCATAATAAAATCGTTTGTAGTTTATG

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2FL11TF 518 0 0
GGATCACTTCTCCATACAACAAAATATTCCAAACAATTCGAAAATGGCTTCCAAGGCATT
AGTTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCGACATCCGA
AGAGCGGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTGACCATGACCAACGGAG
GAGGCCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCATGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGCGGCTGCT
CAAGGTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGG
TAATGTATTAACCACCACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAAACCATCG
TGGTGTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGTGACTTTTAGAGAAGGCCAGGATTGATTAA
GAGGCCAAATTATGAGAATAAAGTTTGATTATGTAATGTCATTGCGTTTGAGTTGTTATC
TTTCGTGGCTGTCATAATAAAATCGTTTGTAGTTTATG

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

CO CL7193Contig1 767 2 7 U
GGAAACCTCAGTGAGAGCGAGAAAACAACGGAACCATGGCGGCTACGACAACGACGACTC
CTCTTGGCTTTGTTTTGCCGACGGGTTTATCTCCCCGTCGCGGTGGATTCAGGTTTTCAC
TCATCCGATGCTCCGCCTCTCCTCTCACGTCATCCACCGCCTCTGTGGAGAAGCCGTGGA
GTTCGTATAACGCTAGGCTTGTGTTGGAAGACGGGTCCATCTGGCCTGCTAAGTCCTTCG
GTGCTCCTGGAACCCGTGTTGCTGAATTGGTCTTCAACACCTCCTTGACAGGGTATCAAG
AGATTCTGACGGATCCTAGTTATGCCGGACAGTTTGTGCTTATGACAAACCCACAAATTG
GTAACACCGGTGTCAATCTCGATGATGAAGAATCTGAGCAATGCTTCCTTGCTGGTTTGG
TCATAAGAAGTCTAAGCATCAGTACCTCGAACTGGAGATGCAAGAAAACACTTGCTGACT
ATCTAACCGAGAGGAACCTCATGGGAATCTATGATCTTGACACTCGAGCAATAACTCGTC
GACTAAGAGAAGAAGGTAGTCTTAACGGTGTGCTAAGCACAGAGCAAACCAAAACAGACG
AAGAGCTTCTCCAAATGTCCCGTTCATGGGATATCGTAGGTATTGATCTAATAAGTGGTG
TCTCCTGCAAATCTCCCTACGAGTGGGTCGACAAAACAGACCCTGATTGGGATTTTAACA
CTAACACACGCGATGGAAACTCCTACAGAGTTATCGCATACGATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA64TF U 92
AF RR2B375TF U 1
BS 1 148 RR2B375TF
BS 149 149 RR2CA64TF
BS 150 214 RR2B375TF
BS 215 215 RR2CA64TF
BS 216 325 RR2B375TF
BS 326 326 RR2CA64TF
BS 327 767 RR2B375TF

RD RR2CA64TF 547 0 0
TCCCCGTCGCGGTGGATTCAGGTTTTCACTCGTCCGATGCTCCGCCTCTCCTCTCACGTC
ATCCACCGCCTCTGTGGAGAAGCCGTGGAGTTCGTATAACGCTAGGCTTGTGTTGGAAGA
CGGGTCCATCTGGCCTGCTAAGTCCTTCGGTGCTCCTGGAACCCGTGTTGCTGAATTGGT
CTTTAACACCTCCTTGACAGGGTATCAAGAGATTCTGACTGATCCTAGTTATGCCGGACA
GTTTGTGCTTATGACGAACCCACAAATTGGTAACACCGGTGTCAATCTCGATGATGAAGA
ATCTGAGCAATGCTTCCTTGCTGGTTTGGTCATAAGA*GTCTAAGCATCAGTACCTCGAA
CTGGAGATGCAAGAAAACACTTGCTGACTATCTAACCGAGAGGAACCTCATGGGAATCTA
TGATCTTGACACTCGAGCAATAACTCGTCGACTAAGAGAAGAAGGTAGTCTTAACGGTGT
GCTAAGCACAGAGCAAACCAAAACAGACGATGAGCTTCTCCAAATGTCCCGTTCTTGGGA
TATCG
AA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2B375TF 767 0 0
GGAAACCTCAGTGAGAGCGAGAAAACAACGGAACCATGGCGGCTACGACAACGACGACTC
CTCTTGGCTTTGTTTTGCCGACGGGTTTATCTCCCCGTCGCGGTGGATTCAGGTTTTCAC
TCATCCGATGCTCCGCCTCTCCTCTCACTTCATCCACCGCCTCTGTGGAGAAGCCGTGGA
GTTCGTATAACGCTAGGCTTGTGTTGGAAGACGGTTCCATCTGGCCTGCTAAGTCCTTCG
GTGCTCCTGGAACCCGTGTTGCTGAATTGGTCTTCAACACCTCCTTGACAGGGTATCAAG
AGATTCTGACGGATCCTAGTTATGCTGGACAGTTTGTGCTTATGACAAACCCACAAATTG
GTAACACCGGTGTCAATCTCGATGATGAAGAATCTGAGCAATGCTTCCTTGCTGGTTTGG
TCATAAGAAGTCTAAGCATCAGTACCTCGAACTGGAGATGCAAGAAAACACTTGCTGACT
ATCTAACCGAGAGGAACCTCATGGGAATCTATGATCTTGACACTCGAGCAATAACTCGTC
GACTAAGAGAAGAAGGTAGTCTTAACGGTGTGCTAAGCACAGAGCAAACCAAAACAGACG
AAGAGCTTCTCCAAATGTCCCGTTCATGGGATATCGTAGGTATTGATCTAATAAGTGGTG
TCTCCTGCAAATCTCCCTACGAGTGGGTCGACAAAACAGACCCTGATTGGGATTTTAACA
CTAACACACGCGATGGAAACTCCTACAGAGTTATCGCATACGATTTT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL7194Contig1 973 2 10 U
GGGATTGCCAAAAGCGATTTCGACTTCGTTTGACGGCGAGACTTCAAAGGCGAGAGACGA
TGGGGCAAGGAAGTTGCGAAAGGCTAGTTTTTTTCGATTAGGCGTCGGATAACATAGATT
GTAATTTGGTTATGATAGATCCGAATGGATGTTCCTAAAACTGGTAGCTCAATTGCAAAA
AAAATCATAGAAGAAAAAAGATGTTTCCCAAATTTGAACCAAATCCAATTACAGAAGATT
CTTAAGAAGAACCCTAAGATGAAGAAGATGAAGTTACAACAATATTATCTCGTTTTTCTT
TTTCTTTCTTAGCCGAAGTAATATATCAAGAGACAACCTCATCTAACAAACTCCAGCTGC
TCTACTCCCCCGTGTTTGGGTGTATCTCCGATGAGGCGTCGGGGGATTTTGTTCTGGGCC
TAGCTGGTGGGTATGTGTTTTGGGGTGCCTAAATGCCTAATCGATATGTGTTTTTTGAAG
AGGAGGCTCCTCCTGTTGAAGCCGCGGACCTGTACACCAGCAAACAGTTATATGTCTACT
TAACATTGGAACTGTGGTGAGGTAATTTGATGGTGCTCCAAGGAAAACAATTCTCGTCCT
CTTACTTGTAATTTTTGCTCAAGTATCTGTCTGGAGAGAGAGAAGAATAAGAAACTGAAG
TACATATCTCCGAGGATTCTTTGTCTAAGGAAGAAGACGATCTCATAAATCCCATCACCA
TTCCGCTTGCATCGAAACAAAAAACTCCAGGAGACATGATCTTACTTTAGAAGAGAGACA
CCGCATGGCAATGAGTGAAGTAAACTCTGTATCTTTACCTATGTATTTATGTGATTTTGC
CAGTAGTATTTAATTCTGTTATTTTCTAGTTAAATTTATGTTTGTTTCTATGTTTTCAAA
ACATTTGTATTTGGTGTCTGTGAGTGAAGAATGATTTTGATCTTCTCTTGTATGGACGTG
ATCTCTGACTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D322TF U 1
AF RR2D322JQ C 258
BS 1 689 RR2D322TF
BS 690 690 RR2D322JQ
BS 691 694 RR2D322TF
BS 695 695 RR2D322JQ
BS 696 743 RR2D322TF
BS 744 744 RR2D322JQ
BS 745 771 RR2D322TF
BS 772 772 RR2D322JQ
BS 773 790 RR2D322TF
BS 791 973 RR2D322JQ

RD RR2D322TF 797 0 0
GGGATTGCCAAAAGCGATTTCGACTTCGTTTGACGGCGAGACTTCAAAGGCGAGAGACGA
TGGGGCAAGGAAGTTGCGAAAGGCTAGTTTTTTTCGATTAGGCGTCGGATAACATAGATT
GTAATTTGGTTATGATAGATCCGAATGGATGTTCCTAAAACTGGTAGCTCAATTGCAAAA
AAAATCATAGAAGAAAAAAGATGTTTCCCAAATTTGAACCAAATCCAATTACAGAAGATT
CTTAAGAAGAACCCTAAGATGAAGAAGATGAAGTTACAACAATATTATCTCGTTTTTCTT
TTTCTTTCTTAGCCGAAGTAATATATCAAGAGACAACCTCATCTAACAAACTCCAGCTGC
TCTACTCCCCCGTGTTTGGGTGTATCTCCGATGAGGCGTCGGGGGATTTTGTTCTGGGCC
TAGCTGGTGGGTATGTGTTTTGGGGTGCCTAAATGCCTAATCGATATGTGTTTTTTGAAG
AGGAGGCTCCTCCTGTTGAAGCCGCGGACCTGTACACCAGCAAACAGTTATATGTCTACT
TAACATTGGAACTGTGGTGAGGTAATTTGATGGTGCTCCAAGGAAAACAATTCTCGTCCT
CTTACTTGTAATTTTTGCTCAAGTATCTGTCTGGAGAGAGAGAAGAATAAGAAACTGAAG
TACATATCTCCGAGGATTCTTTGTCTAAG*AAGA*GACGATCTCATAAATCCCATCACCA
TTCCGCTTGCATCGAAACAAAAA*CTCCAGGAGACATGATCTTACTTTAGA*GAGAGACA
CCGCATGGCA
TGAGTGA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2D322JQ 716 0 0
GATGAAGAAGATGAAGTTACAACAATATTATCTCGTTTTTCTTTTTCTTTCTTAGCCGAA
GTAATATATCAAGAGACAACCTCATCTAACAAACTCCAGCTGCTCTACTCCCCCGTGTTT
GGGTGTATCTCCGATGAGGCGTCGGGGGATTTTGTTCTGGGCCTAGCTGGTGGGTATGTG
TTTTGGGGTGCCTAAATGCCTAATCGATATGTGTTTTTTGAAGAGGAGGCTCCTCCTGTT
GAAGCCGCGGACCTGTACACCAGCAAACAGTTATATGTCTACTTAACATTGGAACTGTGG
TGAGGTAATTTGATGGTGCTCCAAGGAAAACAATTCTCGTCCTCTTACTTGTAATTTTTG
CTCAAGTATCTGTCTGGAGAGAGAGAAGAATAAGAAACTGAAGTACATATCTCCGAGGAT
TCTTTGTCTAAGGAAGAAGACGATCTCATAAATCCCATCACCATTCCGCTTGCATCGAAA
CAAAAAACTCCAGGAGACATGATCTTACTTTAGAAGAGAGACACCGCATGGCAATGAGTG
AAGTAAACTCTGTATCTTTACCTATGTATTTATGTGATTTTGCCAGTAGTATTTAATTCT
GTTATTTTCTAGTTAAATTTATGTTTGTTTCTATGTTTTCAAAACATTTGTATTTGGTGT
CTGTGAGTGAAGAATGATTTTGATCTTCTCTTGTATGGACGTGATCTCTGACTGTC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL7195Contig1 651 2 1 U
GGGCGCAGCCGCATTTTAGAGGTGATCTCTCTTCGTCTAGGGTTTCATCAAGCCGTCGTC
TTCGTCGCATTTCCTCAACGCAAACCATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTGCTCAACC
CTCCAGCTGAGCTCGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTGCAATCTCCTAACT
CTTTCTTCATGGACGTTAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACAGTGTTCAGCCACT
CTCAGACAGTTGTAGTGTGTGGTAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCTACTGGTGGTA
AAGCCAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGAATTATATTTCTCACG
TTAATCATCTTTTCAAAAATGTCGCTGTGAGAGAGAAGTCATATCTTTATTCAGTTTGCT
TTAGTACTACTTTTTGTCTTATGACGGTTTTTTTTTAATCATGAGAAGATTTTGAAACCA
TCATCAAACTACTAGTTGGTTTCCTCTACTCTTTCTCATTTAGTTATAAATCATTTCCCG
AATCGCATCAACTGTCTGGGTTCTTGTTTATTGTCTACATGTCTGTTTTGTCAATCGTTG
AATAAACACTAAACGGCCATTCTTTAATCTTTATGGAGGCTTTCTTTTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CL68JQ C 1
AF RR2CL68TF U 1
BS 1 651 RR2CL68TF

RD RR2CL68JQ 651 0 0
GGGCGCAGCCGCATTTTAGAGGTGATCTCTCTTCGTCTAGGGTTTCATCAAGCCGTCGTC
TTCGTCGCATTTCCTCAACGCAAACCATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTGCTCAACC
CTCCAGCTGAGCTCGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTGCAATCTCCTAACT
CTTTCTTCATGGACGTTAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACAGTGTTCAGCCACT
CTCAGACAGTTGTAGTGTGTGGTAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCTACTGGTGGTA
AAGCCAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGAATTATATTTCTCACG
TTAATCATCTTTTCAAAAATGTCGCTGTGAGAGAGAAGTCATATCTTTATTCAGTTTGCT
TTAGTACTACTTTTTGTCTTATGACGGTTTTTTTTTAATCATGAGAAGATTTTGAAACCA
TCATCAAACTACTAGTTGGTTTCCTCTACTCTTTCTCATTTAGTTATAAATCATTTCCCG
AATCGCATCAACTGTCTGGGTTCTTGTTTATTGTCTACATGTCTGTTTTGTCAATCGTTG
AATAAACACTAAACGGCCATTCTTTAATCTTTATGGAGGCTTTCTTTTTCT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2CL68TF 651 0 0
GGGCGCAGCCGCATTTTAGAGGTGATCTCTCTTCGTCTAGGGTTTCATCAAGCCGTCGTC
TTCGTCGCATTTCCTCAACGCAAACCATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTGCTCAACC
CTCCAGCTGAGCTCGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTGCAATCTCCTAACT
CTTTCTTCATGGACGTTAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACAGTGTTCAGCCACT
CTCAGACAGTTGTAGTGTGTGGTAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCTACTGGTGGTA
AAGCCAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGAATTATATTTCTCACG
TTAATCATCTTTTCAAAAATGTCGCTGTGAGAGAGAAGTCATATCTTTATTCAGTTTGCT
TTAGTACTACTTTTTGTCTTATGACGGTTTTTTTTTAATCATGAGAAGATTTTGAAACCA
TCATCAAACTACTAGTTGGTTTCCTCTACTCTTTCTCATTTAGTTATAAATCATTTCCCG
AATCGCATCAACTGTCTGGGTTCTTGTTTATTGTCTACATGTCTGTTTTGTCAATCGTTG
AATAAACACTAAACGGCCATTCTTTAATCTTTATGGAGGCTTTCTTTTTCT

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL7196Contig1 424 2 1 U
GCAGCGGCTGGAGTAAAGAAGTTGTCGGACGACAAGTCAGTGGTGTGTCACAAACAGAAG
TACCCATTCGCAGTGTTCTACTGCCACAAGGCGATGATGACGAGCGTTTACTCGGTTCCG
CTCGAAGGAGAGAACGGGTTGAGGGCTAAGGCGGTTGCTGTATGCCACAAGAACACCTCA
GCTTGGAACCCAAACCACTTGGCCTTCAAAGTCCTTAAAGTGAAGCCAGGGACTGTTCCG
GTCTGCCATTTCCTCCCTGAGACCCATGTTGTCTGGTTCGGCTATTAGATATGCTTTCTA
TATTGTGTGATATCGAATAATGTTTGAGACAATCTATCTTTTAGGATGTTTAATATACAT
ATAGTAATGTGTGATTTTCCATATAATCAAAGATCGACGGTATCTATATGTTTTTAGTTT
ACTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2AG12JQ C 1
AF RR2AG12TF U 1
BS 1 424 RR2AG12TF

RD RR2AG12JQ 424 0 0
GCAGCGGCTGGAGTAAAGAAGTTGTCGGACGACAAGTCAGTGGTGTGTCACAAACAGAAG
TACCCATTCGCAGTGTTCTACTGCCACAAGGCGATGATGACGAGCGTTTACTCGGTTCCG
CTCGAAGGAGAGAACGGGTTGAGGGCTAAGGCGGTTGCTGTATGCCACAAGAACACCTCA
GCTTGGAACCCAAACCACTTGGCCTTCAAAGTCCTTAAAGTGAAGCCAGGGACTGTTCCG
GTCTGCCATTTCCTCCCTGAGACCCATGTTGTCTGGTTCGGCTATTAGATATGCTTTCTA
TATTGTGTGATATCGAATAATGTTTGAGACAATCTATCTTTTAGGATGTTTAATATACAT
ATAGTAATGTGTGATTTTCCATATAATCAAAGATCGACGGTATCTATATGTTTTTAGTTT
ACTT

QA 1 424 1 424
DS 

RD RR2AG12TF 424 0 0
GCAGCGGCTGGAGTAAAGAAGTTGTCGGACGACAAGTCAGTGGTGTGTCACAAACAGAAG
TACCCATTCGCAGTGTTCTACTGCCACAAGGCGATGATGACGAGCGTTTACTCGGTTCCG
CTCGAAGGAGAGAACGGGTTGAGGGCTAAGGCGGTTGCTGTATGCCACAAGAACACCTCA
GCTTGGAACCCAAACCACTTGGCCTTCAAAGTCCTTAAAGTGAAGCCAGGGACTGTTCCG
GTCTGCCATTTCCTCCCTGAGACCCATGTTGTCTGGTTCGGCTATTAGATATGCTTTCTA
TATTGTGTGATATCGAATAATGTTTGAGACAATCTATCTTTTAGGATGTTTAATATACAT
ATAGTAATGTGTGATTTTCCATATAATCAAAGATCGACGGTATCTATATGTTTTTAGTTT
ACTT

QA 1 424 1 424
DS 



AS 1 2

CO CL7197Contig1 1147 2 2 U
GGATCCCCAGATCAAGAACCCAATAAGATCGACTCTTACTACGAATCTCTCAACTTACGG
AACTCCCACGTACATACATACATACATACCCACAAGAATCAAGATCCAAGAAGATTCATC
GTACATATACTTCCATGGACCAGTATTCATCGTCTTTGGTTGATACTTCTTTAGATCTCA
CTATCGGTATTACTCGTATGCGAGTTGAAGAAGATTCCACGACAAGTGCATTGGTGGAGG
AATTAAAAAGAGTGAATGCTGAGAACAAGAAGCTCTCAGAGATGCTAACTTTGATGTGTG
AAAACTACAACGTCTTAAGGAAACAGCTGATGGAATATGTTAACAAGAGCGAGAGAGACC
AAACCAGTCCTCCCAAAACGCAAATCTCCAGCCAGAGATGACGCAGTTAGCTCTACGGTA
ATTGGTGGAGTGTCGGAGAGTAGCTCTACGGATCAAGATGATCAGTATCTTTGTAAGAAG
CAAAGAGAAGAGACCGTTGTGAAGGAGAAAGTCTCAAGGGTTTATTACAAGACCGAAGCT
TCTGACACTACCCTTGTAGTGAAAGATGGGTATCAATGGAGGAAATATGGACAGAAAGTG
ACTAGAGACAATCCATCTCCAAGAGCTTACTTCAAATGTGCTTGTGCTCCAAGCTGTTCT
GTCAAAAAGAAGGTTCAGAGAAGTGTGGAGGATCAGTCCGTGTTGGTAGCGACTTATGAG
GGTGAACATAACCATCCAATGCCATCGCAGATGGATTCGAACAGTGGCTTAAACCGTTAC
ATCTCTCTTGGTGGTGGTCACGCTGCATCAGCCAAGGGAAGTAGTAGCTTGGCTAATAAG
CCTGTGACTACGGTTGATCTGACTGAATCCAAGAAAGTGACGAGCCCATCAAGAATCGAA
TTTCCAGAAGTACAAAAGCTTTTGGTGGAGCAAATGGCTTCTTCCTTGACAAAAAGATCC
TAACTTCACAGCAGCATTAGCAGCAGCTGTTACCGGGAGATTGTATCAAACCGACAAATA
GCTTAGCTTTTCAACTTTTCAACTACTGTTAGTGTTTTTAGATTGAATTTGGCATATCAG
AGAGAGTAGACATGTAATCGTTTCCATGCAATCACCAATAATCAGCTTAGCAACTCCTAC
TAGTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX31TF U 1
AF RR2FX31JQ C 394
BS 1 657 RR2FX31TF
BS 658 1147 RR2FX31JQ

RD RR2FX31TF 662 0 0
GGATCCCCAGATCAAGAACCCAATAAGATCGACTCTTACTACGAATCTCTCAACTTACGG
AACTCCCACGTACATACATACATACATACCCACAAGAATCAAGATCCAAGAAGATTCATC
GTACATATACTTCCATGGACCAGTATTCATCGTCTTTGGTTGATACTTCTTTAGATCTCA
CTATCGGTATTACTCGTATGCGAGTTGAAGAAGATTCCACGACAAGTGCATTGGTGGAGG
AATTAAAAAGAGTGAATGCTGAGAACAAGAAGCTCTCAGAGATGCTAACTTTGATGTGTG
AAAACTACAACGTCTTAAGGAAACAGCTGATGGAATATGTTAACAAGAGCGAGAGAGACC
AAACCAGTCCTCCCAAAACGCAAATCTCCAGCCAGAGATGACGCAGTTAGCTCTACGGTA
ATTGGTGGAGTGTCGGAGAGTAGCTCTACGGATCAAGATGATCAGTATCTTTGTAAGAAG
CAAAGAGAAGAGACCGTTGTGAAGGAGAAAGTCTCAAGGGTTTATTACAAGACCGAAGCT
TCTGACACTACCCTTGTAGTGAAAGATGGGTATCAATGGAGGAAATATGGACAGAAAGTG
ACTAGAGACAATCCATCTCCAAGAGCTTACTTCAAATGTGCTTGTGCTCCAAGCTGT
CTGTC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2FX31JQ 754 0 0
AGAGATGACGCAGTTAGCTCTACGGTAATTGGTGGAGTGTCGGAGAGTAGCTCTACGGAT
CAAGATGATCAGTATCTTTGTAAGAAGCAAAGAGAAGAGACCGTTGTGAAGGAGAAAGTC
TCAAGGGTTTATTACAAGACCGAAGCTTCTGACACTACCCTTGTAGTGAAAGATGGGTAT
CAATGGAGGAAATATGGACAGAAAGTGACTAGAGACAATCCATCTCCAAGAGCTTACTTC
AAATGTGCTTGTGCTCCAAGCTGTTCTGTCAAAAAGAAGGTTCAGAGAAGTGTGGAGGAT
CAGTCCGTGTTGGTAGCGACTTATGAGGGTGAACATAACCATCCAATGCCATCGCAGATG
GATTCGAACAGTGGCTTAAACCGTTACATCTCTCTTGGTGGTGGTCACGCTGCATCAGCC
AAGGGAAGTAGTAGCTTGGCTAATAAGCCTGTGACTACGGTTGATCTGACTGAATCCAAG
AAAGTGACGAGCCCATCAAGAATCGAATTTCCAGAAGTACAAAAGCTTTTGGTGGAGCAA
ATGGCTTCTTCCTTGACAAAAAGATCCTAACTTCACAGCAGCATTAGCAGCAGCTGTTAC
CGGGAGATTGTATCAAACCGACAAATAGCTTAGCTTTTCAACTTTTCAACTACTGTTAGT
GTTTTTAGATTGAATTTGGCATATCAGAGAGAGTAGACATGTAATCGTTTCCATGCAATC
ACCAATAATCAGCTTAGCAACTCCTACTAGTTCG

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL7198Contig1 838 2 2 U
GGAAGTTCCCTAATCTACAGTAAGTTCCGTTGTTTGCTCCGGCGTCGATCAATTCTCCAA
TAGCTTTGTCCAATTCCTCTGCTCCTTCGGGTCGATATCGCGGCGGATTGATAGAGAAGT
TAAACCGACATCAGACACGAAAAATCAGCTTAGTTCCATGGCGCCAAGATGGAAATCAAA
AGGCGCAGAAGCAGAGGCTCTTGCAGAACCTATTTCAAAATCAGTCTCAGAGCTCCAGCT
ATCTCTAGCCAAAACAGAGTCATCCGGTTCCCTCTTGAGTTGCAACGTGCTTCTAGCCGT
TGAGCCAGAGCAAGCTAAGCTGCTCGGCCGCTGTTGTTTCGGCAGACTCGTCCTGTCCGC
TGAGAAAGTCAAGAAATGGATTCAGTTATCCTTTGAAGAAGCTTTCTATTTGCTCTACAT
CCTCAAATGCATCAAACTCACCCTGCAAGGACGTTACTTGGAGAACGAAGTCGACACATG
GATGTACATGAAATCAAAAAGACCAAACTTCCCGGTGTTTTTCAAAGCTTATTTACATTT
GCGTTCCAAGAACTGGGTATTGAGATCAGGGCTGCAGTACGGGTGTGGGATTTCGTGGCG
TACCGTCACCATCCATCTCTTGTCCACTCTGAATACTCTGTTCTGGTTCAGTCTGGTGAC
GGTGATCGGTTAAGAGTGTGGGTCCGATGTCCATTGTGCTGTTCGGTTAAGCGGAAGTGT
TGCCAAAACGTTGTTAACTCTCCATGTCAGTGGTAATTCTAATGGAGAGAATTTGAACCT
GCCTATGTGTTTGGAGAACTACAGGGTGGAAGAGCAAACGATAAGTCGATGGAGCCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A193TF U 1
AF RR2A193JQ C 668
BS 1 760 RR2A193TF
BS 761 838 RR2A193JQ

RD RR2A193TF 760 0 0
GGAAGTTCCCTAATCTACAGTAAGTTCCGTTGTTTGCTCCGGCGTCGATCAATTCTCCAA
TAGCTTTGTCCAATTCCTCTGCTCCTTCGGGTCGATATCGCGGCGGATTGATAGAGAAGT
TAAACCGACATCAGACACGAAAAATCAGCTTAGTTCCATGGCGCCAAGATGGAAATCAAA
AGGCGCAGAAGCAGAGGCTCTTGCAGAACCTATTTCAAAATCAGTCTCAGAGCTCCAGCT
ATCTCTAGCCAAAACAGAGTCATCCGGTTCCCTCTTGAGTTGCAACGTGCTTCTAGCCGT
TGAGCCAGAGCAAGCTAAGCTGCTCGGCCGCTGTTGTTTCGGCAGACTCGTCCTGTCCGC
TGAGAAAGTCAAGAAATGGATTCAGTTATCCTTTGAAGAAGCTTTCTATTTGCTCTACAT
CCTCAAATGCATCAAACTCACCCTGCAAGGACGTTACTTGGAGAACGAAGTCGACACATG
GATGTACATGAAATCAAAAAGACCAAACTTCCCGGTGTTTTTCAAAGCTTATTTACATTT
GCGTTCCAAGAACTGGGTATTGAGATCAGGGCTGCAGTACGGGTGTGGGATTTCGTGGCG
TACCGTCACCATCCATCTCTTGTCCACTCTGAATACTCTGTTCTGGTTCAGTCTGGTGAC
GGTGATCGGTTAAGAGTGTGGGTCCGATGTCCATTGTGCTGTTCGGTTAAGCGGAAGTGT
TGCCAAAACGTTGTTAACTCTCCATGTCAGTGGTAATTCT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2A193JQ 171 0 0
GGTTAAGAGTGTGG*TCCGATGTCCATTGTGCTGTTCGGTTAAGCGGAAGTGTTGCCAAA
ACGTTGTTAACTCTCCATGTCAGTGGTAATTCTAATGGAGAGAATTTGAACCTGCCTATG
TGTTTGGAGAACTACAGGGTGGAAGAGCAAACGATAAGTCGATGGAGCCCA

QA 1 171 1 171
DS 



AS 1 2

CO CL7199Contig1 519 2 1 U
GAGATGATCAACGACCTCAACAATGAAGTTGGATCTTCGGCCTTCATTGCCGCTAATACT
CAACAAATGCACATGGACTTTATCAGCGACCCACAAGCATATGGATTCGTAACGTCGAAG
GTGGCGTGTTGTGGACAAGGACCGTATAATGGGATAGGACTATGCACAGTGTTATCAAAT
CTCTGCCCAAACAGAGATCTCTTCGCCTTTTGGGATCCTTTTCATCCATCAGAGAAAGCT
AGTAGAATCATTGCTCAACAAGTCCTCAACGGTTCTCCCGAGTACATGCATCCCATGAAC
CTCAGCACTATCCTCACCCTTGATTCCACAACTTAATCTTCTGTTCATCTCTCCAAATTC
CCACTCTATGTTCTCTTTTAGTTGTTTGATTTTCTCTTTAATTATGTATTCGACATGGCT
GCTTTAAATAGTTTCCATGAGTTATGTTGTGTGTTTTGTCTTCTTTATCAATAATTGAAT
CGCCAATTGTTACTTCAGAAGTAATATCTGTTTTCCAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BX10JQ C 1
AF RR2BX10TF U 1
BS 1 519 RR2BX10TF

RD RR2BX10JQ 519 0 0
GAGATGATCAACGACCTCAACAATGAAGTTGGATCTTCGGCCTTCATTGCCGCTAATACT
CAACAAATGCACATGGACTTTATCAGCGACCCACAAGCATATGGATTCGTAACGTCGAAG
GTGGCGTGTTGTGGACAAGGACCGTATAATGGGATAGGACTATGCACAGTGTTATCAAAT
CTCTGCCCAAACAGAGATCTCTTCGCCTTTTGGGATCCTTTTCATCCATCAGAGAAAGCT
AGTAGAATCATTGCTCAACAAGTCCTCAACGGTTCTCCCGAGTACATGCATCCCATGAAC
CTCAGCACTATCCTCACCCTTGATTCCACAACTTAATCTTCTGTTCATCTCTCCAAATTC
CCACTCTATGTTCTCTTTTAGTTGTTTGATTTTCTCTTTAATTATGTATTCGACATGGCT
GCTTTAAATAGTTTCCATGAGTTATGTTGTGTGTTTTGTCTTCTTTATCAATAATTGAAT
CGCCAATTGTTACTTCAGAAGTAATATCTGTTTTCCAGC

QA 1 519 1 519
DS 

RD RR2BX10TF 519 0 0
GAGATGATCAACGACCTCAACAATGAAGTTGGATCTTCGGCCTTCATTGCCGCTAATACT
CAACAAATGCACATGGACTTTATCAGCGACCCACAAGCATATGGATTCGTAACGTCGAAG
GTGGCGTGTTGTGGACAAGGACCGTATAATGGGATAGGACTATGCACAGTGTTATCAAAT
CTCTGCCCAAACAGAGATCTCTTCGCCTTTTGGGATCCTTTTCATCCATCAGAGAAAGCT
AGTAGAATCATTGCTCAACAAGTCCTCAACGGTTCTCCCGAGTACATGCATCCCATGAAC
CTCAGCACTATCCTCACCCTTGATTCCACAACTTAATCTTCTGTTCATCTCTCCAAATTC
CCACTCTATGTTCTCTTTTAGTTGTTTGATTTTCTCTTTAATTATGTATTCGACATGGCT
GCTTTAAATAGTTTCCATGAGTTATGTTGTGTGTTTTGTCTTCTTTATCAATAATTGAAT
CGCCAATTGTTACTTCAGAAGTAATATCTGTTTTCCAGC

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 2

CO CL7200Contig1 893 2 2 U
GGACATTTAAAAAATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAAGGTATGACTGCTCTTGTAACTGG
TGGAGGCAGAGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAAGAGTTAGCTGGTTTTGGAGCTAAAAT
CTATGTATGCGACATATCCGAAGTTTTGCTCAATCAAAGTTTAAGGGAATGGGAAAAGAA
AGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTATGTGATGTAACTTCTCCATCCGAGAGAGAAACTTT
AATGCAAAAGGTCTCCTCTCTGTTCAATGGCAAGCTCAATATTTTCGTGAACAATGTGGG
CGGACTTCGTTCAAAGCCAACGACAGAATATGATGCAGACGATTTTGATTTCCATATCAC
AACAAACTTGGAACCTGCTTTCCATTTTGCCAGCTTTCACATCCTCTCCTAAAGGCTTCA
GGCTATGGAAGTATCGTCTTCATTTCATCTGTTGCTGGGGTTGTATTCTTTGAATCTGGA
TCCCTTTATAGTCTAGCCAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAGGAAATTTGGCATGTGAA
TGGGCAAAAGATGGTATAAGAACCAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAGACTCCTCTG
TCTCAACCATATCTTGATGACGTCGGTTTCAAGGAGGGATTTATGGGTAGAACTCCACTT
GGTCGCGCTGGAGAACCAAATGAAGTTGCATCAATGGTGGCCTTCTTGTGTCTACCTGCA
GCGTCTTATATAACAGGTCAAACCATTTGTGTTGATGGAGGCCTCACCGTTAACGGTTTC
TCCTACCAATCACATGCTTGAGAATGGCCTTGTCGCGTTTTATTTTCTGGCACTGTCTTT
GAACTCTTAAAGTCTGCTCTCTAATAAAAATTGTCACACTGTGAGTTTAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX55TF U 1
AF RR2FX55JQ C 151
BS 1 672 RR2FX55TF
BS 673 893 RR2FX55JQ

RD RR2FX55TF 672 0 0
GGACATTTAAAAAATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAAGGTATGACTGCTCTTGTAACTGG
TGGAGGCAGAGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAAGAGTTAGCTGGTTTTGGAGCTAAAAT
CTATGTATGCGACATATCCGAAGTTTTGCTCAATCAAAGTTTAAGGGAATGGGAAAAGAA
AGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTATGTGATGTAACTTCTCCATCCGAGAGAGAAACTTT
AATGCAAAAGGTCTCCTCTCTGTTCAATGGCAAGCTCAATATTTTCGTGAACAATGTGGG
CGGACTTCGTTCAAAGCCAACGACAGAATATGATGCAGACGATTTTGATTTCCATATCAC
AACAAACTTGGAACCTGCTTTCCATTTTGCCAGCTTTCACATCCTCTCCTAAAGGCTTCA
GGCTATGGAAGTATCGTCTTCATTTCATCTGTTGCTGGGGTTGTATTCTTTGAATCTGGA
TCCCTTTATAGTCTAGCCAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAGGAAATTTGGCATGTGAA
TGGGCAAAAGATGGTATAAGAACCAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAGACTCCTCTG
TCTCAACCATATCTTGATGACGTCGGTTTCAAGGAGGGATTTATGGGTAGAACTCCACTT
GGTCGCGCTGGA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RR2FX55JQ 743 0 0
CAATCAAAGTTTAAGGGAATGGGAAAAGAAAGGGTTTCAAGTGAGTGGTTCAGTATGTGA
TGTAACTTCTCCATCCGAGAGAGAAACTTTAATGCAAAAGGTCTCCTCTCTGTTCAATGG
CAAGCTCAATATTTTCGTGAACAATGTGGGCGGACTTCGTTCAAAGCCAACGACAGAATA
TGATGCAGACGATTTTGATTTCCATATCACAACAAACTTGGAACCTGCTTTCCATTTTGC
CAGCTTTCACATCCTCTCCTAAAGGCTTCAGGCTATGGAAGTATCGTCTTCATTTCATCT
GTTGCTGGGGTTGTATTCTTTGAATCTGGATCCCTTTATAGTCTAGCCAAAGGAGCTTTG
AATCAGCTAGCAGGAAATTTGGCATGTGAATGGGCAAAAGATGGTATAAGAACCAACGCT
GTTGCTCCTAATGTTATCAAGACTCCTCTGTCTCAACCATATCTTGATGACGTCGGTTTC
AAGGAGGGATTTATGGGTAGAACTCCACTTGGTCGCGCTGGAGAACCAAATGAAGTTGCA
TCAATGGTGGCCTTCTTGTGTCTACCTGCAGCGTCTTATATAACAGGTCAAACCATTTGT
GTTGATGGAGGCCTCACCGTTAACGGTTTCTCCTACCAATCACATGCTTGAGAATGGCCT
TGTCGCGTTTTATTTTCTGGCACTGTCTTTGAACTCTTAAAGTCTGCTCTCTAATAAAAA
TTGTCACACTGTGAGTTTAATAT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7202Contig1 863 2 5 U
GGAGATTCAGCTACTTTCTCTCTCTTAGAAAAAAATGGCGGGTGGATCCAGTCACACCAG
CTACCAAATGGACTCTACGTCTCGGGAAAGCTCGAGCAGCCCAAAGAGCCACGGAGTTGT
ATGAGTACAAAGGTCTTGGTGGGAGATCCGCAAATCCAAAACATCGATGCTTTTCTTGGG
GATCTAGACATGCAGAGAAATATGTTTCGGATTTTTACATATCAGATTTTCAATCTGGAT
TGAGAGCGCTAGTAAAAGCAGGGTATGGAGCAAAGGTTTCTCCTTTTGTCAAACCGGCGA
CAGTGGCTGATGTAACGGCTCAGAACAAAGACTTGTCTCCCAGCTTCCTTAAGTGGCTGT
CGGATCGCAACCTCTCTGCTGATAACCGTGTCATGCGTCTCAAAGAAGGATACATAAAAG
AAGGAAGCACGGTGAGCGTGACGGGAATGGTGAGAAGACACGACAACGTTCTGATGATAG
TCCCTCCTACGGAAGCTGTCTCCAGTGGCTGCCGGTGGTGGCGCTGCCTCCTCCCGACCT
ACGCAGATGGTCTAATCATCACCTGCGAAGATAATCAAAACGCTGATGTCATCCCTGTCT
GAAACCAAAATGTGTGTAATGCTTTCTTTTTGCCCCCATATTTCAATGCTTAATTAAGAG
TTAGGCTCACGAGAACTAAAGGAATGAGAGCTGGGCCCATGTTGGTTTAAAAAGGAAACC
AGATGGGCTTTGTCTCTTGCCATGACCATATTAGCTGTTCTTGTTTCCCCTTGGATGAGG
TTTATGTTTGTTTGCAACTTTCTGTACATAACGATCCCAATTGTAAATATGCTTAAATAA
ATATTATGCTCCATTTACTATTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ49TFB U 6
AF RR2AZ49JQ C 1
BS 1 5 RR2AZ49JQ
BS 6 38 RR2AZ49TFB
BS 39 39 RR2AZ49JQ
BS 40 660 RR2AZ49TFB
BS 661 863 RR2AZ49JQ

RD RR2AZ49TFB 655 0 0
TTCAGCTACTTTCTCTCTCTTAGAAAAAAATGGGGGGTGGATCCAGTCACACCAGCTACC
AAATGGACTCTACGTCTCGGGAAAGCTCGAGCAGCCCAAAGAGCCACGGAGTTGTATGAG
TACAAAGGTCTTGGTGGGAGATCCGCAAATCCAAAACATCGATGCTTTTCTTGGGGATCT
AGACATGCAGAGAAATATGTTTCGGATTTTTACATATCAGATTTTCAATCTGGATTGAGA
GCGCTAGTAAAAGCAGGGTATGGAGCAAAGGTTTCTCCTTTTGTCAAACCGGCGACAGTG
GCTGATGTAACGGCTCAGAACAAAGACTTGTCTCCCAGCTTCCTTAAGTGGCTGTCGGAT
CGCAACCTCTCTGCTGATAACCGTGTCATGCGTCTCAAAGAAGGATACATAAAAGAAGGA
AGCACGGTGAGCGTGACGGGAATGGTGAGAAGACACGACAACGTTCTGATGATAGTCCCT
CCTACGGAAGCTGTCTCCAGTGGCTGCCGGTGGTGGCGCTGCCTCCTCCCGACCTACGCA
GATGGTCTAATCATCACCTGCGAAGATAATCAAAACGCTGATGTCATCCCTGTCTGAAAC
CAAAATGTGTGTAATGCTTTCTTTTTGCCCCCATATTTCAATGCTTAATTAAGAG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2AZ49JQ 863 0 0
GGAGATTCAGCTACTTTCTCTCTCTTAGAAAAAAATGGCGGGTGGATCCAGTCACACCAG
CTACCAAATGGACTCTACGTCTCGGGAAAGCTCGAGCAGCCCAAAGAGCCACGGAGTTGT
ATGAGTACAAAGGTCTTGGTGGGAGATCCGCAAATCCAAAACATCGATGCTTTTCTTGGG
GATCTAGACATGCAGAGAAATATGTTTCGGATTTTTACATATCAGATTTTCAATCTGGAT
TGAGAGCGCTAGTAAAAGCAGGGTATGGAGCAAAGGTTTCTCCTTTTGTCAAACCGGCGA
CAGTGGCTGATGTAACGGCTCAGAACAAAGACTTGTCTCCCAGCTTCCTTAAGTGGCTGT
CGGATCGCAACCTCTCTGCTGATAACCGTGTCATGCGTCTCAAAGAAGGATACATAAAAG
AAGGAAGCACGGTGAGCGTGACGGGAATGGTGAGAAGACACGACAACGTTCTGATGATAG
TCCCTCCTACGGAAGCTGTCTCCAGTGGCTGCCGGTGGTGGCGCTGCCTCCTCCCGACCT
ACGCAGATGGTCTAATCATCACCTGCGAAGATAATCAAAACGCTGATGTCATCCCTGTCT
GAAACCAAAATGTGTGTAATGCTTTCTTTTTGCCCCCATATTTCAATGCTTAATTAAGAG
TTAGGCTCACGAGAACTAAAGGAATGAGAGCTGGGCCCATGTTGGTTTAAAAAGGAAACC
AGATGGGCTTTGTCTCTTGCCATGACCATATTAGCTGTTCTTGTTTCCCCTTGGATGAGG
TTTATGTTTGTTTGCAACTTTCTGTACATAACGATCCCAATTGTAAATATGCTTAAATAA
ATATTATGCTCCATTTACTATTC

QA 1 863 1 863
DS 



AS 1 2

CO CL7203Contig1 1039 2 2 U
CTCATTTCCTCTCCTCTTCTCTTAGATGTGTGAAGGCTGAAACTGAGATAGGCGGCGTAG
TCTGAATCGAACAATATAGTTCTTCCTTTATTCTTCACCTAAAGCAAAGTAACGACCACC
GTGGAAGCAAAAAAAGTAAAGATGAACGACGACATGAACGAAGTGCTGAACAGATTCAAG
GAAGAGAGAGAGCAGCTGATGAAAACATTTACCGAAGGGTACAAGAAGCTACTCAAGGAC
AAGGACGAAGAGCTCGAGAAAATGTTCAAGGACAAGAACGAAGAGCTCAACGAAGCAATG
AAGGAAGAGCGTAGCGAGTTTGAAGATCTGGAGTATTTAAACACTGCGCTCTGCATCAAA
TTACGACAAACCAATGACGAGATCCAAGAAGCACACAAAGAATTAATTACTGGACTGAGA
GGCTTATCGGGTGAAAGGTCCATGATCAGAGTAAAGACGATGGGACAAGTTGATGAAAAG
CCTTTCCTGAAAGTATGCGAGCAGAGATTCAGTGGCCAAGACGTTGTTGCGCTGCAAAGC
GCCAGGCTTTGCTCGGAATGGCAGGAACGCGTCGGTGATCCACGATGGCAGCCATTTAAA
ATTCAGACATGTGGAGATAAAATTAAGGAGGTTGTGGATGAGGAAGATGAGGAACTTAAG
AACCTGAGCGAAGAGTGGGGAGAAGACGCGAAGGAGGCAGTTAAGACAGTACTTGAAGGA
ATGAACGAGTTTAACGCAAGTGGTCGTTTTCTAGTTCCTGTACTGTGGAATTTTCAACAT
GGGAGAAGAGCAACACTCAAGGAAGCGATTGCTGCTCACGTGAAGCATCAGATCAACAAT
CTTAAACGCAAACGAACCTGAAGCAAATTAAGCAATGTTGATCCTTGTTGATTGGTACGG
GTTGTAAAAATGTTTGGGGCTTCAGGAATCTTAAATCTGTGTTTCTCATTTTGTATTTTC
ATTAACTAAAACCCATGGACGGTTCTTTTTAGAACTTTCGCTTGTGTATTTCCTATGAAT
ATAAACTAGATTAAGCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B294TF U 1
AF RR2B294JQ C 200
BS 1 717 RR2B294TF
BS 718 1039 RR2B294JQ

RD RR2B294TF 717 0 0
CTCATTTCCTCTCCTCTTCTCTTAGATGTGTGAAGGCTGAAACTGAGATAGGCGGCGTAG
TCTGAATCGAACAATATAGTTCTTCCTTTATTCTTCACCTAAAGCAAAGTAACGACCACC
GTGGAAGCAAAAAAAGTAAAGATGAACGACGACATGAACGAAGTGCTGAACAGATTCAAG
GAAGAGAGAGAGCAGCTGATGAAAACATTTACCGAAGGGTACAAGAAGCTACTCAAGGAC
AAGGACGAAGAGCTCGAGAAAATGTTCAAGGACAAGAACGAAGAGCTCAACGAAGCAATG
AAGGAAGAGCGTAGCGAGTTTGAAGATCTGGAGTATTTAAACACTGCGCTCTGCATCAAA
TTACGACAAACCAATGACGAGATCCAAGAAGCACACAAAGAATTAATTACTGGACTGAGA
GGCTTATCGGGTGAAAGGTCCATGATCAGAGTAAAGACGATGGGACAAGTTGATGAAAAG
CCTTTCCTGAAAGTATGCGAGCAGAGATTCAGTGGCCAAGACGTTGTTGCGCTGCAAAGC
GCCAGGCTTTGCTCGGAATGGCAGGAACGCGTCGGTGATCCACGATGGCAGCCATTTAAA
ATTCAGACATGTGGAGATAAAATTAAGGAGGTTGTGGATGAGGAAGATGAGGAACTTAAG
AACCTGAGCGAAGAGTGGGGAGAAGACGCGAAGGAGGCAGTTAAGACAGTACTTGAA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2B294JQ 840 0 0
TGAAAACATTTACCGAAGGGTACAAGAAGCTACTCAAGGACAAGGACGAAGAGCTCGAGA
AAATGTTCAAGGACAAGAACGAAGAGCTCAACGAAGCAATGAAGGAAGAGCGTAGCGAGT
TTGAAGATCTGGAGTATTTAAACACTGCGCTCTGCATCAAATTACGACAAACCAATGACG
AGATCCAAGAAGCACACAAAGAATTAATTACTGGACTGAGAGGCTTATCGGGTGAAAGGT
CCATGATCAGAGTAAAGACGATGGGACAAGTTGATGAAAAGCCTTTCCTGAAAGTATGCG
AGCAGAGATTCAGTGGCCAAGACGTTGTTGCGCTGCAAAGCGCCAGGCTTTGCTCGGAAT
GGCAGGAACGCGTCGGTGATCCACGATGGCAGCCATTTAAAATTCAGACATGTGGAGATA
AAATTAAGGAGGTTGTGGATGAGGAAGATGAGGAACTTAAGAACCTGAGCGAAGAGTGGG
GAGAAGACGCGAAGGAGGCAGTTAAGACAGTACTTGAAGGAATGAACGAGTTTAACGCAA
GTGGTCGTTTTCTAGTTCCTGTACTGTGGAATTTTCAACATGGGAGAAGAGCAACACTCA
AGGAAGCGATTGCTGCTCACGTGAAGCATCAGATCAACAATCTTAAACGCAAACGAACCT
GAAGCAAATTAAGCAATGTTGATCCTTGTTGATTGGTACGGGTTGTAAAAATGTTTGGGG
CTTCAGGAATCTTAAATCTGTGTTTCTCATTTTGTATTTTCATTAACTAAAACCCATGGA
CGGTTCTTTTTAGAACTTTCGCTTGTGTATTTCCTATGAATATAAACTAGATTAAGCTCG

QA 1 840 1 840
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7205Contig1 988 2 4 U
GAGAGACTTCTGTGATGGAGATGGCGGGAAACACGGACTGTGATAGATGCGGAGAGGTTT
CGAGCAGCACGCGCGAGCATAGCGAGAGGTTAGCAGTAGCGTTTGCGATACTCAACACTA
GTCCAGGGACGGAGATTCTTGTGATAAAGAACCTGAGGGTTTGTGAAGATTGTCATGTGT
TCATCAAGATGGTAAGCAAGATTGTAGATCGTAGGTTTGTCGTAAGAGATGCATCACGGT
TCCATTATTTCGAAGATGGGCTTTGCTCGTGCAAGGATTACTGGTGATTCTCTCTCATAG
TCTCACAAAGTGTACTACTACAGAGGATGTATATAAAAAAATGGTTACAGAAGGTTGAAG
GTTGCACTCTAACTACAAAAATATTCTTTCAGAAATAAGTTGGTCTTCTACAAAGGGGAT
GGTTTTCCGAACAATCACCCTCATAGGAGCTCCTGCAAGAAGGAAAAAGATGTGATGAAT
AAACCACAAAACCAATGGATCCTTTATGTCAACTTAAAATGCACCTTCGTCAGCTTGCTC
ATCTTCAGTACAGACTGCAGCATAATGAGAATCAGTCAACACCAAAAGGGAAAACTTCCA
TCTTCCGTTGCATTTCTCTGTCTCCTCCAGTGGATTGGCTGTCATTTCAGATGTCTACAG
AAAACAATCAAAGGGGTCTTTAAAGAAATGAATAGTGCTTCAACACTTGCTCGTGCTCAT
TTCCAGAATCTAAGTCTAAAAAACAAACCTTGCAAAGACTGTAGCCTCCCTCTGTTCCAG
GCTTAGACTGGATCGTGAAGGTACTAAAAGGTGCAGCGGAGAAGCCTTTCCCTAATGCTT
TCACATATGCCTCCTGGATACACAATCACCCACCACAAGAGTTTCTAGCCTTTTTGAGAA
GTAACAATTATTTCAGGCCTCATGTGTTATCTGTAATTTGTAGAGAGACTACCTTAAGAG
TCCATAGCTTAATAAATTCCTTTCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD13TF U 1
AF RR2BD13JQ C 254
BS 1 769 RR2BD13TF
BS 770 770 RR2BD13JQ
BS 771 795 RR2BD13TF
BS 796 988 RR2BD13JQ

RD RR2BD13TF 795 0 0
GAGAGACTTCTGTGATGGAGATGGCGGGAAACACGGACTGTGATAGATGCGGAGAGGTTT
CGAGCAGCACGCGCGAGCATAGCGAGAGGTTAGCAGTAGCGTTTGCGATACTCAACACTA
GTCCAGGGACGGAGATTCTTGTGATAAAGAACCTGAGGGTTTGTGAAGATTGTCATGTGT
TCATCAAGATGGTAAGCAAGATTGTAGATCGTAGGTTTGTCGTAAGAGATGCATCACGGT
TCCATTATTTCGAAGATGGGCTTTGCTCGTGCAAGGATTACTGGTGATTCTCTCTCATAG
TCTCACAAAGTGTACTACTACAGAGGATGTATATAAAAAAATGGTTACAGAAGGTTGAAG
GTTGCACTCTAACTACAAAAATATTCTTTCAGAAATAAGTTGGTCTTCTACAAAGGGGAT
GGTTTTCCGAACAATCACCCTCATAGGAGCTCCTGCAAGAAGGAAAAAGATGTGATGAAT
AAACCACAAAACCAATGGATCCTTTATGTCAACTTAAAATGCACCTTCGTCAGCTTGCTC
ATCTTCAGTACAGACTGCAGCATAATGAGAATCAGTCAACACCAAAAGGGAAAACTTCCA
TCTTCCGTTGCATTTCTCTGTCTCCTCCAGTGGATTGGCTGTCATTTCAGATGTCTACAG
AAAACAATCAAAGGGGTCTTTAAAGAAATGAATAGTGCTTCAACACTTGCTCGTGCTCAT
TTCCAGAATCTAAGTCTAAAAAACAAACCTTGCAAAGACTGTAGCCTCC*TCTGTTCCAG
GCTTAGACTGGATCG

QA 1 795 1 795
DS 

RD RR2BD13JQ 735 0 0
AGATGGGCTTTGCTCGTGCAAGGATTACTGGTGATTCTCTCTCATAGTCTCACAAAGTGT
ACTACTACAGAGGATGTATATAAAAAAATGGTTACAGAAGGTTGAAGGTTGCACTCTAAC
TACAAAAATATTCTTTCAGAAATAAGTTGGTCTTCTACAAAGGGGATGGTTTTCCGAACA
ATCACCCTCATAGGAGCTCCTGCAAGAAGGAAAAAGATGTGATGAATAAACCACAAAACC
AATGGATCCTTTATGTCAACTTAAAATGCACCTTCGTCAGCTTGCTCATCTTCAGTACAG
ACTGCAGCATAATGAGAATCAGTCAACACCAAAAGGGAAAACTTCCATCTTCCGTTGCAT
TTCTCTGTCTCCTCCAGTGGATTGGCTGTCATTTCAGATGTCTACAGAAAACAATCAA*G
GGGTCTTTAAGGAAATGAATAGTGCTTCAACACTTGCTCGTGCTCATTTCCAGAATTTAA
GTTTAAAAAACAAACCTTGCAAAGACTGTAGCCTCCCTCTGTTCCAGGCTTAGACTGGAT
CGTGAAGGTACTAAAAGGTGCAGCGGAGAAGCCTTTCCCTAATGCTTTCACATATGCCTC
CTGGATACACAATCACCCACCACAAGAGTTTCTAGCCTTTTTGAGAAGTAACAATTATTT
CAGGCCTCATGTGTTATCTGTAATTTGTAGAGAGACTACCTTAAGAGTCCATAGCTTAAT
AAATTCCTTTCTTTG

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL7206Contig1 1102 2 2 U
GGACTATTCTTTTGCTTATTCTTTTGCTTCAGACCCTTCTCTCTTTCAGGAAGAAATATA
ATACTATGCCGATCTTTAACTGGGTGCAGAAGAAGCTGCACCAAAATGTCATCAGAGATG
GTATGACGAAAAGCGAGAAAAAGAAGAGAGGTGAAGGAACAAGTGAGATAGAGAAGAACG
CGAAAGCTATATTGGATCAGGTTGGGTTAGTGGATGCTCTTGATAACTGGTTTGATGGAG
TTCTCACCATCGGCACTTTCGGTTTTGACACTTTGAGATTTCAAGAAGAAGCCGAAATAG
ATGATGGTGATGAATGCGAGAGTGTGGGTATCGACTATGTTGTAGTCGATGGTAGCATCA
TCAAGAACGTCAACCAAGAGTCAGACCCTCTTATCTCCAATGAAAATAAGGTTTATGATC
ATCATGAGGATTTAGGGGTATTGGACATTGATCACTCTGACTCAGTCAAAACGGTTGAAA
ATCTCGTGGTCATGGCCGCGGTGGAGGCTGAGGTGGATCCGGAGAAGAAGAGGACAACCC
TAGCTGAACTCTTCATGGAAGACCAAGACCATGATACAAAGCATGACAAGGAGAAACAAA
AGAACCCTAATCTTAATGTTGATGGTCAGAAGGTTAAATATCATAAACAAAACGGGTCAA
AGCTGTGTAGTAAGTTCACGTTTGCTAAGAGGATGGTCACTTCAAAGTCCAAAGATAAAG
AACAAGACTCGCGTCCAACCAAGAAAGTGCATGACTCGCGTCCAATCAAGAAAGTGCATC
AGATAATAAAGAGGATGTTAAAGAAGAAGATTCATCCAGATGTCGATTCGACTAAGGCTT
CTAAAAAGGACGGTCCATACAAGCCAGCCCTGAAATGTGAAGCTCTCGAGACACTTTATC
TTCTTAATGTTCCAGATTGCGTTGCTTAGAAGTCTGAGAAGAACGACAACACAGAGCAAT
TACTGGACTTGTGCTTTTCATATTATATATATGTGGTTTCTATTTTTTTGTTATTTGAGA
ATGTGTTGTGGGTTAAGAATGATTGTAGAACGAGAATGTGTTGTCACTGTTTGTTTATGT
TTTATGCGTATTTTATTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT67TF U 1
AF RR2FT67JQ C 250
BS 1 793 RR2FT67TF
BS 794 1102 RR2FT67JQ

RD RR2FT67TF 793 0 0
GGACTATTCTTTTGCTTATTCTTTTGCTTCAGACCCTTCTCTCTTTCAGGAAGAAATATA
ATACTATGCCGATCTTTAACTGGGTGCAGAAGAAGCTGCACCAAAATGTCATCAGAGATG
GTATGACGAAAAGCGAGAAAAAGAAGAGAGGTGAAGGAACAAGTGAGATAGAGAAGAACG
CGAAAGCTATATTGGATCAGGTTGGGTTAGTGGATGCTCTTGATAACTGGTTTGATGGAG
TTCTCACCATCGGCACTTTCGGTTTTGACACTTTGAGATTTCAAGAAGAAGCCGAAATAG
ATGATGGTGATGAATGCGAGAGTGTGGGTATCGACTATGTTGTAGTCGATGGTAGCATCA
TCAAGAACGTCAACCAAGAGTCAGACCCTCTTATCTCCAATGAAAATAAGGTTTATGATC
ATCATGAGGATTTAGGGGTATTGGACATTGATCACTCTGACTCAGTCAAAACGGTTGAAA
ATCTCGTGGTCATGGCCGCGGTGGAGGCTGAGGTGGATCCGGAGAAGAAGAGGACAACCC
TAGCTGAACTCTTCATGGAAGACCAAGACCATGATACAAAGCATGACAAGGAGAAACAAA
AGAACCCTAATCTTAATGTTGATGGTCAGAAGGTTAAATATCATAAACAAAACGGGTCAA
AGCTGTGTAGTAAGTTCACGTTTGCTAAGAGGATGGTCACTTCAAAGTCCAAAGATAAAG
AACAAGACTCGCGTCCAACCAAGAAAGTGCATGACTCGCGTCCAATCAAGAAAGTGCATC
AGATAATAAAGAG

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2FT67JQ 853 0 0
TCGGCACTTTCGGTTT*GACACTT*GAGATT*CAAGAAGAA*CCGAAATAGATGATGGTG
ATGAATGCGAGAGTGTGG*TATCGACTATGTTGTAGTCGATGGTAGCATCATCAAGAACG
TCAACCAAGAGTCAGACCCTCTTATCTCCAATGAAAATAAGGTTTATGATCATCATGAGG
ATTTAGGGGTATTGGACATTGATCACTCTGACTCAGTCAAAACGGTTGAAAATCTCGTGG
TCATGGCCGCGGTGGAGGCTGAGGTGGATCCGGAGAAGAAGAGGACAACCCTAGCTGAAC
TCTTCATGGAAGACCAAGACCATGATACAAAGCATGACAAGGAGAAACAAAAGAACCCTA
ATCTTAATGTTGATGGTCAGAAGGTTAAATATCATAAACAAAACGGGTCAAAGCTGTGTA
GTAAGTTCACGTTTGCTAAGAGGATGGTCACTTCAAAGTCCAAAGATAAAGAACAAGACT
CGCGTCCAACCAAGAAAGTGCATGACTCGCGTCCAATCAAGAAAGTGCATCAGATAATAA
AGAGGATGTTAAAGAAGAAGATTCATCCAGATGTCGATTCGACTAAGGCTTCTAAAAAGG
ACGGTCCATACAAGCCAGCCCTGAAATGTGAAGCTCTCGAGACACTTTATCTTCTTAATG
TTCCAGATTGCGTTGCTTAGAAGTCTGAGAAGAACGACAACACAGAGCAATTACTGGACT
TGTGCTTTTCATATTATATATATGTGGTTTCTATTTTTTTGTTATTTGAGAATGTGTTGT
GGGTTAAGAATGATTGTAGAACGAGAATGTGTTGTCACTGTTTGTTTATGTTTTATGCGT
ATTTTATTTTATT

QA 1 853 1 853
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7208Contig1 1047 2 2 U
GGAGGCATCGGTAAAAATTATTAAACAAAGCGATCCCATTTGAAGAGGAAACTCTTTATC
AAGAAGAAGAAGAAGACGAAGACGAAGACGTTAATGGCGGATTCCGTCGAGCTACCGAGT
CGGTTAGCAATTCTACCATTCAGGAACAAGGTTCTGTTACCAGGCGCCATTATTCGAATC
CGCTGCACTTCTCATAGCAGTGTGACGCTAGTGGAGCAGGAGCTATGGCAGAAAGAAGAG
AAGGGGTTGATTGGTATTCTACCTGTTCGAGATGATGCTGAGGGTTCTTCAGTTGGGACT
ATGATCAATCCAGGTGGTGGAAGTGATTCTGGAGAAAGAAGCTTGAAGTTTCTAGTTGGC
ACAACAGATGCTCAAAAGTCTGATGCTAAAGATCAGCAGGAAGTTCACTGGCATACCAGG
GGAGTAGCAGCTCGTGCTCTGCATCTTTCGAGAGGGGTGGAGAAACCAAGTGGAAGAGTT
ACGTATGTCGTTGTCCTTGAAGGTCTGAGTAGGTTTAATGTTCAGGAGCTTGGAAAAAGA
GGACCTTACTCTGTTGCGCGGATTACGTCGCTCGAAATGACTAAGGGAGAGTTGGAGCAA
GTGGAACAAGACCCAGATTTTGTATCACTGTCACGCCAGTTTAAGACCACTGCTATGGAG
CTGGTTTCTGTGCTTGAGCAGAAACAGAAAACTGGTGGAAGGACAAAAGTTCTTTTGGAG
ACGGTTCCCATTCATAAACTAGCAGACATATTTGTTGCTAGTTTTGAGATGAGTTTTGAA
GAGCAACTATCCATGCTGGATTCAGTTGACCTCAAAGTTAGACTTTCAAAGGCTACCGAA
CTAGTTGATCGGCATTTGCAGTCAATTCGTGTGGCAGAGAAGATTACTCAAAAAGTGGAG
GGCCAGTTGTCAAAGTCACAGAGGGAATATCTCTTGCGCCAGCAGATGAGGGCTATTAAA
GAAGAGCTTGGTGACAACGATGATGATGAAGATGATGTAGCTGCACTTGAAAGAAAGATG
CAAGCTGCGGGAATGCCGTCTAACATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL07TF U 1
AF RR2BL07JQ C 269
BS 1 675 RR2BL07TF
BS 676 1047 RR2BL07JQ

RD RR2BL07TF 675 0 0
GGAGGCATCGGTAAAAATTATTAAACAAAGCGATCCCATTTGAAGAGGAAACTCTTTATC
AAGAAGAAGAAGAAGACGAAGACGAAGACGTTAATGGCGGATTCCGTCGAGCTACCGAGT
CGGTTAGCAATTCTACCATTCAGGAACAAGGTTCTGTTACCAGGCGCCATTATTCGAATC
CGCTGCACTTCTCATAGCAGTGTGACGCTAGTGGAGCAGGAGCTATGGCAGAAAGAAGAG
AAGGGGTTGATTGGTATTCTACCTGTTCGAGATGATGCTGAGGGTTCTTCAGTTGGGACT
ATGATCAATCCAGGTGGTGGAAGTGATTCTGGAGAAAGAAGCTTGAAGTTTCTAGTTGGC
ACAACAGATGCTCAAAAGTCTGATGCTAAAGATCAGCAGGAAGTTCACTGGCATACCAGG
GGAGTAGCAGCTCGTGCTCTGCATCTTTCGAGAGGGGTGGAGAAACCAAGTGGAAGAGTT
ACGTATGTCGTTGTCCTTGAAGGTCTGAGTAGGTTTAATGTTCAGGAGCTTGGAAAAAGA
GGACCTTACTCTGTTGCGCGGATTACGTCGCTCGAAATGACTAAGGGAGAGTTGGAGCAA
GTGGAACAAGACCCAGATTTTGTATCACTGTCACGCCAGTTTAAGACCACTGCTATGGAG
CTGGTTTCTGTGCTT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2BL07JQ 779 0 0
GAGATGATGCTGAGGGTTCTTCAGTTGGGACTATGATCAATCCAGGTGGTGGAAGTGATT
CTGGAGAAAGAAGCTTGAAGTTTCTAGTTGGCACAACAGATGCTCAAAAGTCTGATGCTA
AAGATCAGCAGGAAGTTCACTGGCATACCAGGGGAGTAGCAGCTCGTGCTCTGCATCTTT
CGAGAGGGGTGGAGAAACCAAGTGGAAGAGTTACGTATGTCGTTGTCCTTGAAGGTCTGA
GTAGGTTTAATGTTCAGGAGCTTGGAAAAAGAGGACCTTACTCTGTTGCGCGGATTACGT
CGCTCGAAATGACTAAGGGAGAGTTGGAGCAAGTGGAACAAGACCCAGATTTTGTATCAC
TGTCACGCCAGTTTAAGACCACTGCTATGGAGCTGGTTTCTGTGCTTGAGCAGAAACAGA
AAACTGGTGGAAGGACAAAAGTTCTTTTGGAGACGGTTCCCATTCATAAACTAGCAGACA
TATTTGTTGCTAGTTTTGAGATGAGTTTTGAAGAGCAACTATCCATGCTGGATTCAGTTG
ACCTCAAAGTTAGACTTTCAAAGGCTACCGAACTAGTTGATCGGCATTTGCAGTCAATTC
GTGTGGCAGAGAAGATTACTCAAAAAGTGGAGGGCCAGTTGTCAAAGTCACAGAGGGAAT
ATCTCTTGCGCCAGCAGATGAGGGCTATTAAAGAAGAGCTTGGTGACAACGATGATGATG
AAGATGATGTAGCTGCACTTGAAAGAAAGATGCAAGCTGCGGGAATGCCGTCTAACATA

QA 1 779 1 779
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7210Contig1 772 2 2 U
GGGGTAACAACAACGAGATCGGTGTGCCCTCTCTCTGCATCCAAATCGCCTCTCCCTATC
AGCGTAAGGTTGAAGCAGCAAAGCAGAGCAGCAGCACACAATGATGATGTCCTTCGAGAT
GAATGACCGGAAAAAAATTGGGTTAGGGCTGACAGCATTTGGCGTTTTCTTTTCCTTTTT
GGGAATCATGTTTGTCTTCGATAAGGGCTTACTTGCCATGGGAAATATTCTTTTCATCTC
TGGGGTTAGTCTTACCATTGGCCTCAAGTCTACCATGCAGTTTTTCACCAAGCGTCAGAA
CTATAAGGGAACCATATCTTTTGGGACCGGCTTCTTCTTTGTAGTCCTTGGATGGCCTAT
CCTTGGAATGATGTTAGAGACCTATGGCTTTTTTGTTCTCTTCAGCGGCTTCTGGCCGAC
CTTGGCAGTTTTCGTACAAAAGATACCTGTTCTCGGTTGGATCATTCAGCTACCATATAT
AAGATCCTTCTTTGACAAGTACAGGGGCAAGCGTGTGCCCGTCTAAGTCAACTCGAGGGA
CAAACGATTGAAGTGTTTGGATGTTATGCTTGTAGAGAAGTAGTAAAACCCCGTAGGAGA
AAGAAAAATACTGGCGTGGAGTGGAGCAGCAAAAGATATGACTTGAAAGCTTTGTGTTTC
TTCTGTCTGTGTACTTAAAAAAAAACTAACTCAGTGACTTGAAACGACCTCTCTTGGTGG
GTTTGTAATCATTTTGGTTTTGAAGAGTTTTTAGGGGTTTTTTATTCTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D371TF U 1
AF RR2D371JQ C 60
BS 1 592 RR2D371TF
BS 593 772 RR2D371JQ

RD RR2D371TF 592 0 0
GGGGTAACAACAACGAGATCGGTGTGCCCTCTCTCTGCATCCAAATCGCCTCTCCCTATC
AGCGTAAGGTTGAAGCAGCAAAGCAGAGCAGCAGCACACAATGATGATGTCCTTCGAGAT
GAATGACCGGAAAAAAATTGGGTTAGGGCTGACAGCATTTGGCGTTTTCTTTTCCTTTTT
GGGAATCATGTTTGTCTTCGATAAGGGCTTACTTGCCATGGGAAATATTCTTTTCATCTC
TGGGGTTAGTCTTACCATTGGCCTCAAGTCTACCATGCAGTTTTTCACCAAGCGTCAGAA
CTATAAGGGAACCATATCTTTTGGGACCGGCTTCTTCTTTGTAGTCCTTGGATGGCCTAT
CCTTGGAATGATGTTAGAGACCTATGGCTTTTTTGTTCTCTTCAGCGGCTTCTGGCCGAC
CTTGGCAGTTTTCGTACAAAAGATACCTGTTCTCGGTTGGATCATTCAGCTACCATATAT
AAGATCCTTCTTTGACAAGTACAGGGGCAAGCGTGTGCCCGTCTAAGTCAACTCGAGGGA
CAAACGATTGAAGTGTTTGGATGTTATGCTTGTAGAGAAGTAGTAAAACCCC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2D371JQ 713 0 0
CAGCGTAAGGTTGAAGCAGCAAAGCAGAGCAGCAGCACACAATGATGATGTCCTTCGAGA
TGAATGACCGGAAAAAAATTGGGTTAGGGCTGACAGCATTTGGCGTTTTCTTTTCCTTTT
TGGGAATCATGTTTGTCTTCGATAAGGGCTTACTTGCCATGGGAAATATTCTTTTCATCT
CTGGGGTTAGTCTTACCATTGGCCTCAAGTCTACCATGCAGTTTTTCACCAAGCGTCAGA
ACTATAAGGGAACCATATCTTTTGGGACCGGCTTTTTCTTTGTAGTCCTTGGATGGCCTA
TCCTTGGAATGATGTTAGAGACCTATGGCTTTTTTGTTTTCTTCAGCGGCTTCTGGCCGA
CCTTGGCAGTTTTCGTACAAAAGATACCTGTTCTCGGTTGGATCATTCAGCTACCATATA
TAAGATCCTTCTTTGACAAGTACAGGGGCAAGCGTGTGCCCGTTTAAGTCAACTCGAGGG
ACAAACGATTGAAGTGTTTGGATGTTATGCTTGTAGAGAAGTAGTAAAACCCCGTAGGAG
AAAGAAAAATACTGGCGTGGAGTGGAGCAGCAAAAGATATGACTTGAAAGCTTTGTGTTT
CTTCTGTCTGTGTACTTAAAAAAAAACTAACTCAGTGACTTGAAACGACCTCTCTTGGTG
GGTTTGTAATCATTTTGGTTTTGAAGAGTTTTTAGGGGTTTTTTATTCTTTCT

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL7211Contig1 986 2 2 U
GGAGACGAAGATTTGTTAACACTCAGGGGAAAAAAGAGAGAGAAAGATGCAGATCTTCGT
GAAAACCCTCACCGGAAAAACGATAACCCTAGAGGTGGAGAGCAGCGACACCATCGACAA
TGTCAAAGCCAAAATCCAGGTTCCAATTTTAGGGCTCCTTAGTTCGTTTCAATTACTAAG
CTCTTGTTTTTTTTTGCGAATCGATCTGTAGTTATTTGATCTGAATTGTCTGAGAAACGA
AACCACTAAGATCAACAAATATTCGTGTATTGAAGCTAAACTCTACTGTGCTTATGTAAC
TTTGAAGCAGGACAAAGAAGGTATACCACCGGACCAACAAAGGCTCATCTTCGCCGGTAA
GCAGCTTGAAGACGGCAGAACCTTAGCCGATTACAACATCCAGAAAGAGTCTACTCTCCA
TCTCGTCTTGAGGCTCAGAGGTGGCACCATGATCAAGGTCAAGACCCTCACCGGCAAAGA
AATCGAGATTGATATCGAACCAACCGACACTATTGACCGTATCAAGGAACGTGTCGAAGA
GAAAGAAGGCATCCCTCCCGTCCAACAAAGGTCTTTAATTTCATAATGTTTTTGTCATGT
GTTACTTGTTTGGATTTTTAACTCTTTAAAGAGTTTTTTTTTTTTTTGGCAGGCTTATCT
ATGCAGGGAAGCAGCTTGCTGATGACAAAACGGCCAAAGATTACAACATAGAGGGTGGCT
CTGTTCTTCATTTGGTTCTTGCTCTTAGGGGTGGTGGTTGTGTTTGAAATCAGAACATGC
ATCTTTTTTTTTTTATTTATATTTGAAATATTTATCATGTTTTTTCTGATTGTGTTTTGG
ACTTCATATGAACCCCCTGATTTGATATGATGATATTGGCATGTTGGTTATATTGTCTCG
TGGATAATGCATCTATCATTGAATAAATTACGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACACC
GAATAAATTACACTTCTATTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF60TF U 1
AF RR2DF60JQ C 441
BS 1 566 RR2DF60TF
BS 567 986 RR2DF60JQ

RD RR2DF60TF 566 0 0
GGAGACGAAGATTTGTTAACACTCAGGGGAAAAAAGAGAGAGAAAGATGCAGATCTTCGT
GAAAACCCTCACCGGAAAAACGATAACCCTAGAGGTGGAGAGCAGCGACACCATCGACAA
TGTCAAAGCCAAAATCCAGGTTCCAATTTTAGGGCTCCTTAGTTCGTTTCAATTACTAAG
CTCTTGTTTTTTTTTGCGAATCGATCTGTAGTTATTTGATCTGAATTGTCTGAGAAACGA
AACCACTAAGATCAACAAATATTCGTGTATTGAAGCTAAACTCTACTGTGCTTATGTAAC
TTTGAAGCAGGACAAAGAAGGTATACCACCGGACCAACAAAGGCTCATCTTCGCCGGTAA
GCAGCTTGAAGACGGCAGAACCTTAGCCGATTACAACATCCAGAAAGAGTCTACTCTCCA
TCTCGTCTTGAGGCTCAGAGGTGGCACCATGATCAAGGTCAAGACCCTCACCGGCAAAGA
AATCGAGATTGATATCGAACCAACCGACACTATTGACCGTATCAAGGAACGTGTCGAAGA
GAAAGAAGGCATCCCTCCCGTCCAAC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2DF60JQ 546 0 0
GTGGCACCATGATCAAGGTCAAGACCCTCACCGGCAAAGAAATCGAGATTGATATCGAAC
CAACCGACACTATTGACCGTATCAAGGAACGTGTCGAAGAGAAAGAAGGCATCCCTCCCG
TCCAACAAAGGTCTTTAATTTCATAATGTTTTTGTCATGTGTTACTTGTTTGGATTTTTA
ACTCTTTAAAGAGTTTTTTTTTTTTTTGGCAGGCTTATCTATGCAGGGAAGCAGCTTGCT
GATGACAAAACGGCCAAAGATTACAACATAGAGGGTGGCTCTGTTCTTCATTTGGTTCTT
GCTCTTAGGGGTGGTGGTTGTGTTTGAAATCAGAACATGCATCTTTTTTTTTTTATTTAT
ATTTGAAATATTTATCATGTTTTTTCTGATTGTGTTTTGGACTTCATATGAACCCCCTGA
TTTGATATGATGATATTGGCATGTTGGTTATATTGTCTCGTGGATAATGCATCTATCATT
GAATAAATTACGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACACCGAATAAATTACACTTCTATT
TTGACC

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 2

CO CL7212Contig1 605 2 6 U
GGTCCTCTCCTTGACTACATCCGTTACGGAGTCATCAACCTCGACAAACCCTCCAACCCT
TCTTCCCACGAGGTCGTCGCTTGGATCAAACGCATCCTCCGCGTCGAGAAGACAGGACAC
AGTGGGACCCTCGACCCTAAAGTCACAGGTAACCTCATCGTCTGCATCGACAGAGCCACG
AGGCTTGTGAAGTCTCAGCAAGGCGCCGGGAAAGAGTACGTTTGTGTTGCTCGTCTTCAC
TCTGCTGTCCCTGATGTGGCGAAAGTGGCGAGGGCGCTTGAGTCTCTCACCGGAGCTGTG
TTTCAGAGACCTCCTTTGATCTCTGCTGTGAAGAGACAGCTGAGGATTAGGACGATTTAC
CAGAGTAAGTTGCTTGAGTATGACGCCGACAGGCATTTGGTTGTGTTCTGGGTTTCTTGT
GAGGCGGGTACTTATATTAGGACCATGTGTGTTCACTTGGGTTTGCTTCTTGGTGTCGGT
GGACATATGCAAGAGCTTAGGAGGGTTAGGTCTGGGATTTTGGGTGAGAATGATAACATG
GTTACTATGCATGATGTGATGGATGCTCAGTGGATGTATGATAATTACAAGGACGAGAGT
TATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 

AF RR2GY36TF U 1
AF RR2EK43TF U 84
BS 1 196 RR2GY36TF
BS 197 197 RR2EK43TF
BS 198 577 RR2GY36TF
BS 578 578 RR2EK43TF
BS 579 604 RR2GY36TF
BS 605 605 RR2EK43TF

RD RR2GY36TF 604 0 0
GGTCCTCTCCTTGACTACATCCGTTACGGAGTCATCAACCTCGACAAACCCTCCAACCCT
TCTTCCCACGAGGTCGTCGCTTGGATCAAACGCATCCTCCGCGTCGAGAAGACAGGACAC
AGTGGGACCCTCGACCCTAAAGTCACAGGTAACCTCATCGTCTGCATCGACAGAGCCACG
AGGCTTGTGAAGTCTCTGCAAGGCGCCGGGAAAGAGTACGTTTGTGTTGCTCGTCTTCAC
TCTGCTGTCCCTGATGTGGCGAAAGTGGCGAGGGCGCTTGAGTCTCTCACCGGAGCTGTG
TTTCAGAGACCTCCTTTGATCTCTGCTGTGAAGAGACAGCTGAGGATTAGGACGATTTAC
CAGAGTAAGTTGCTTGAGTATGACGCCGACAGGCATTTGGTTGTGTTCTGGGTTTCTTGT
GAGGCGGGTACTTATATTAGGACCATGTGTGTTCACTTGGGTTTGCTTCTTGGTGTCGGT
GGACATATGCAAGAGCTTAGGAGGGTTAGGTCTGGGATTTTGGGTGAGAATGATAACATG
GTTACTATGCATGATGTGATGGATGCTCAGTGGATGTGTGATAATTACAAGGACGAGAGT
TATC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2EK43TF 522 0 0
GATCAAACGCATCCTCCGCGTCGAGAAGACAGGACACAGTGGGACCCTCGACCCTAAAGT
CACAGGTAACCTCATCGTCTGCATCGACAGAGCCACGAGGCTTGTGAAGTCTCAGCAAGG
CGCCGGGAAAGAGTACGTTTGTGTTGCTCGTCTTCACTCTGCTGTCCCTGATGTGGCGAA
AGTGGCGAGGGCGCTTGAGTCTCTCACCGGAGCTGTGTTTCAGAGACCTCCTTTGATCTC
TGCTGTGAAGAGACAGCTGAGGATTAGGACGATTTACCAGAGTAAGTTGCTTGAGTATGA
CGCCGACAGGCATTTGGTTGTGTTCTGGGTTTCTTGTGAGGCGGGTACTTATATTAGGAC
CATGTGTGTTCACTTGGGTTTGCTTCTTGGTGTCGGTGGACATATGCAAGAGCTTAGGAG
GGTTAGGTCTGGGATTTTGGGTGAGAATGATAACATGGTTACTATGCATGATGTGATGGA
TGCTCAGTGGATGTATGATAATTACAAGGACGAGAGTTATCT

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 2

CO CL7213Contig1 902 2 4 U
GGATGCATCTTGCGAAACCCTAAATACCCAAATGTCATTCGCCGACGAATTTGAATCTAA
TCTTGTCTCGTTGGCCCATGTTTTGCAGAAGAAATATGCACTCCTCCGTGATTTGGACAA
AAGTTTGCAAGAAAATCAAAGACAGAACGAACAACGGTGTGAAAAGGAGATAGAGGATAT
AAGAAGAGGCAGAACCGGAAATGTCACACCCAATACACACTTCTCCGAGGAAGCAATTGA
TGAACAGAAGCACAGCGTCAGGATTGCTGATGAGAAAGTCGCTTTGGCTATGCAAGCTTA
TGATCTGGTGGATATGCATGTTCAGCAACTTGACCAGTACATGAAAAAATCCAATGAGGA
GATGCGCCGAGAGAAAGAAAATGCCTCTGCTTCAAACCTCGAGAACAGCGCAGAAGCCGG
TAAGGCAGGTGAAGGTAGAAGAGGAGGGCGAAAGAAGACAAGGCTAGCAACTGCAGCGTC
AACAGCAGCAGTAGCATCAGCATCAACTGGTATGACTTCAACTGGTATGGATTTGGATCT
GCCTGTGGATCCAAACGAACCAACTTACTGCATCTGCAACCAAGTTAGCTACGGAGAGAT
GATTGCCTGCGATAACAATGAGTGTAAGATTGAGTGGTTCCATTTTGGTTGCGTGGGTCT
GAAAGATCAACCCAAAGGGAAATGGTACTGTCCGGATTGTGCTACAGTCAAGAAGAGCAG
GAAAGGCCGATGATTCTGAATCTGAAAAGCTCGTGTGTTTCGTTTAAAACGGTCTAGTAG
TTGTATATCTACTTCCATGTAAACCACTGACCATTGAATAATGACTACGGGTTGCTCATG
CTCTATATATAAGACCTTCCATTCCCAATAAACACAAGATAAATAGAGTATTAGTTAAGA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2DT17TF U 1
AF RR2DT17JQ C 392
BS 1 681 RR2DT17TF
BS 682 682 RR2DT17JQ
BS 683 710 RR2DT17TF
BS 711 902 RR2DT17JQ

RD RR2DT17TF 720 0 0
GGATGCATCTTGCGAAACCCTAAATACCCAAATGTCATTCGCCGACGAATTTGAATCTAA
TCTTGTCTCGTTGGCCCATGTTTTGCAGAAGAAATATGCACTCCTCCGTGATTTGGACAA
AAGTTTGCAAGAAAATCAAAGACAGAACGAACAACGGTGTGAAAAGGAGATAGAGGATAT
AAGAAGAGGCAGAACCGGAAATGTCACACCCAATACACACTTCTCCGAGGAAGCAATTGA
TGAACAGAAGCACAGCGTCAGGATTGCTGATGAGAAAGTCGCTTTGGCTATGCAAGCTTA
TGATCTGGTGGATATGCATGTTCAGCAACTTGACCAGTACATGAAAAAATCCAATGAGGA
GATGCGCCGAGAGAAAGAAAATGCCTCTGCTTCAAACCTCGAGAACAGCGCAGAAGCCGG
TAAGGCAGGTGAAGGTAGAAGAGGAGGGCGAAAGAAGACAAGGCTAGCAACTGCAGCGTC
AACAGCAGCAGTAGCATCAGCATCAACTGGTATGACTTCAACTGGTATGGATTTGGATCT
GCCTGTGGATCCAAACGAACCAACTTACTGCATCTGCAACCAAGTTAGCTACGGAGAGAT
GATTGCCTGCGATAACAATGAGTGTAAGATTGAGTGGTTCCATTTTGGTTGCGTGGGTCT
GAAAGATCAACCCAAAGGGAA*TGGTACTGTCCGGATTGTGCTACAGTCA
GAGAGCAGAA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2DT17JQ 511 0 0
TCAAACCTCGAGAACAGCGCAGAAGCCGGTAAGGCAGGTGAAGGTAGAAGAGGAGGGCGA
AAGAAGACAAGGCTAGCAACTGCAGCGTCAACAGCAGCAGTAGCATCAGCATCAACTGGT
ATGACTTCAACTGGTATGGATTTGGATCTGCCTGTGGATCCAAACGAACCAACTTACTGC
ATCTGCAACCAAGTTAGCTACGGAGAGATGATTGCCTGCGATAACAATGAGTGTAAGATT
GAGTGGTTCCATTTTGGTTGCGTGGGTCTGAAAGATCAACCCAAAGGGAAATGGTACTGT
CCGGATTGTGCTACAGTCAAGAAGAGCAGGAAAGGCCGATGATTCTGAATCTGAAAAGCT
CGTGTGTTTCGTTTAAAACGGTCTAGTAGTTGTATATCTACTTCCATGTAAACCACTGAC
CATTGAATAATGACTACGGGTTGCTCATGCTCTATATATAAGACCTTCCATTCCCAATAA
ACACAAGATAAATAGAGTATTAGTTAAGACC

QA 1 511 1 511
DS 



AS 1 2

CO CL7214Contig1 750 2 3 U
TTTTCTCAGCAAATCCTTAAACCACAATGGATTACGACTTCAGGAACAAGTCAGGTCCCT
CCTACGGCCGCCCTATGTATCCATCCCCTTCTCCATCATCTATGTACACCGGTCCTCCCG
GATACCCAAAGATCGGCGGTGGCCAACCGTTTTTCCCTCCCCCGCCGGAGAGAACCCCCT
CGTTTCAACACAACCCATCTCCTTCTTCATCTGGATTAGGAATCAAGGTGACTCTCAAGC
CTGACTATCGTATCACTCCTCCGCCTCCGTTGTTGCCTCGAGTTGGAGATGTTCCTCGGA
GCAGCTTTCAGTTCGATTTCGGACTAGAAAGGAAGGTTCTTGCGGAGGCTGAGAAGGATA
ACCCTGATTGGAGCAAGTTTGGGTCCGACCATCCTCCTCCTCCTCCTCCACCGGCGAACT
TTTCGCAACCGCCGCCGGCTAACTTTGCACAACCACCACCGGCACATTCAATGGGTGTAG
ATCCTGTAGTGATGAAATATGCTGGGCTAAACCGAGAAGCTGTCAACATCGCTGTTGCAA
ACTATGGTGATAATCCAACAAAGGTTCATGAATTTGCAAATGGGTTCAGTGCGATAAGGG
AGATGGGGTTCCCAACTAACGCTGTTGCAGATGCTCTCTTCATGTTTGAGAACGACACTG
AGGAGGCATTGTCGCATTTGCTCCATGGTTCTTCCTGAACTTTTTAGACTTTCAACTTAT
CCTTCTATTAGTGTGTATAAGTAAAACATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT04TF U 1
AF RR2BF48TF U 1
BS 1 361 RR2BF48TF
BS 362 362 RR2CT04TF
BS 363 750 RR2BF48TF

RD RR2CT04TF 662 0 0
TTTTCTCAGCAAATCCTTAAACCACAATGGGTTACGACTTCAGGAACAAGTCAGGTCCCT
CCTACGGCCGCCCTATGTATCCATCCCCTTCTCCATCATCTATGTACACCGGTCCTCCCG
GATACCCAAAGATCGGCGGTGGCCAACCGTTTTTCCCTCCCCCGCCGGAGAGAACCCCCT
CGTTTCAACACAACCCATCTCCTTCTTCATCTGGATTAGGAATCAAGGTGACTCTCAAGC
CTGACTATCGTATCACTCCTCCGCCTCCGTTGTTGCCTCGAGTTGGAGATGTTCCTCGGA
GCAGCTTTCAGTTCGATTTCGGACTAGAAAGGAAGGTTCTTGCGGAGGCTGAGAAGGATA
ACCCTGATTGGAGCAAGTTTGGGTCCGACCATCCTCCTCCTCCTCCTCCACCGGCGAACT
TTTCGCAACCGCCGCCGGCTAACTTTGCACAACCACCACCGGCACATTCAATGGGTGTAG
ATCCTGTAGTGATGAAATATGCTGGGCTAAACCGAGAAGCTGTCAACATCGCTGTTGCAA
ACTATGGTGATAATCCAACAAAGGTTCATGAATTTGCAAATGGGTTCAGTGCGATAAGGG
AGATGGGTTTCCCAACTAACGCTGTTGCAGATGCTCTCTTCATGTTTGAGAACGACACTG
AG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2BF48TF 750 0 0
TTTTCTCAGCAAATCCTTAAACCACAATGGATTACGACTTCAGGAACAAGTCAGGTCCCT
CCTACGGCCGCCCTATGTATCCATCCCCTTCTCCATCATCTATGTACACCGGTCCTCCCG
GATACCCAAAGATCGGCGGTGGCCAACCGTTTTTCCCTCCCCCGCCGGAGAGAACCCCCT
CGTTTCAACACAACCCATCTCCTTCTTCATCTGGATTAGGAATCAAGGTGACTCTCAAGC
CTGACTATCGTATCACTCCTCCGCCTCCGTTGTTGCCTCGAGTTGGAGATGTTCCTCGGA
GCAGCTTTCAGTTCGATTTCGGACTAGAAAGGAAGGTTCTTGCGGAGGCTGAGAAGGATA
ATCCTGATTGGAGCAAGTTTGGGTCCGACCATCCTCCTCCTCCTCCTCCACCGGCGAACT
TTTCGCAACCGCCGCCGGCTAACTTTGCACAACCACCACCGGCACATTCAATGGGTGTAG
ATCCTGTAGTGATGAAATATGCTGGGCTAAACCGAGAAGCTGTCAACATCGCTGTTGCAA
ACTATGGTGATAATCCAACAAAGGTTCATGAATTTGCAAATGGGTTCAGTGCGATAAGGG
AGATGGGGTTCCCAACTAACGCTGTTGCAGATGCTCTCTTCATGTTTGAGAACGACACTG
AGGAGGCATTGTCGCATTTGCTCCATGGTTCTTCCTGAACTTTTTAGACTTTCAACTTAT
CCTTCTATTAGTGTGTATAAGTAAAACATC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL7215Contig1 691 2 1 U
GGGGATTCGAGGCTCACAATGTTGTCCCTGACATAGTTACCATGGCAAAGGGAATTGGGA
ATGGGTTTCCTTTGGGAGCGGTTGTGACGACTCCGGAGATAGCAGGAGTGTTGACACGCC
GATGCTACTTCAACACATTTGGTGGGAATGCTGTGTCTACTACAGCAGGTCTCGCTGTTC
TGAATGTGATTGAGAAGGAGAAGCTTCAGGAAAATGCTTCAATGGTCGGATCTTATCTTA
AAGGAAAACTCAATCAGCTGAAAGAGAAACATGAAATTATTGGGGATGTACGTGGAAGAG
GACTGATGCTTGGAGTTGAGCTGGTAAGTGATCGCAAGCTCAAGACTCCTGCAACTGCCG
AGACTCTGCACATCATGGATCAAATGAAAGAGTTGGGTGTGTTGGTTGGAAAATGAGGCT
ACTTTGGAAACGTGTTTAGAATCACACCACCTCTCTGCTTCACTAAGGAAGACGCAGATT
ATCTGGTGGAAGCCATGGACTACTCAATCTCCAAGATGTGAAGAAAACTAAAGGATGCGT
CTCTTTGCTTTGCTTGTTACTTTGATATATTGGAACAACCAACATGATTGATGAGCCAAC
ATCTCGTTGCTTCTCAATCACTCTGTTTTCTTAATGTAAAAAGTATGTTTTTCTCTGAGA
CTTATGGTGCAAGTAATCTCAATTGTTATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FT65JQ C 1
AF RR2FT65TF U 1
BS 1 691 RR2FT65TF

RD RR2FT65JQ 691 0 0
GGGGATTCGAGGCTCACAATGTTGTCCCTGACATAGTTACCATGGCAAAGGGAATTGGGA
ATGGGTTTCCTTTGGGAGCGGTTGTGACGACTCCGGAGATAGCAGGAGTGTTGACACGCC
GATGCTACTTCAACACATTTGGTGGGAATGCTGTGTCTACTACAGCAGGTCTCGCTGTTC
TGAATGTGATTGAGAAGGAGAAGCTTCAGGAAAATGCTTCAATGGTCGGATCTTATCTTA
AAGGAAAACTCAATCAGCTGAAAGAGAAACATGAAATTATTGGGGATGTACGTGGAAGAG
GACTGATGCTTGGAGTTGAGCTGGTAAGTGATCGCAAGCTCAAGACTCCTGCAACTGCCG
AGACTCTGCACATCATGGATCAAATGAAAGAGTTGGGTGTGTTGGTTGGAAAATGAGGCT
ACTTTGGAAACGTGTTTAGAATCACACCACCTCTCTGCTTCACTAAGGAAGACGCAGATT
ATCTGGTGGAAGCCATGGACTACTCAATCTCCAAGATGTGAAGAAAACTAAAGGATGCGT
CTCTTTGCTTTGCTTGTTACTTTGATATATTGGAACAACCAACATGATTGATGAGCCAAC
ATCTCGTTGCTTCTCAATCACTCTGTTTTCTTAATGTAAAAAGTATGTTTTTCTCTGAGA
CTTATGGTGCAAGTAATCTCAATTGTTATTC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2FT65TF 691 0 0
GGGGATTCGAGGCTCACAATGTTGTCCCTGACATAGTTACCATGGCAAAGGGAATTGGGA
ATGGGTTTCCTTTGGGAGCGGTTGTGACGACTCCGGAGATAGCAGGAGTGTTGACACGCC
GATGCTACTTCAACACATTTGGTGGGAATGCTGTGTCTACTACAGCAGGTCTCGCTGTTC
TGAATGTGATTGAGAAGGAGAAGCTTCAGGAAAATGCTTCAATGGTCGGATCTTATCTTA
AAGGAAAACTCAATCAGCTGAAAGAGAAACATGAAATTATTGGGGATGTACGTGGAAGAG
GACTGATGCTTGGAGTTGAGCTGGTAAGTGATCGCAAGCTCAAGACTCCTGCAACTGCCG
AGACTCTGCACATCATGGATCAAATGAAAGAGTTGGGTGTGTTGGTTGGAAAATGAGGCT
ACTTTGGAAACGTGTTTAGAATCACACCACCTCTCTGCTTCACTAAGGAAGACGCAGATT
ATCTGGTGGAAGCCATGGACTACTCAATCTCCAAGATGTGAAGAAAACTAAAGGATGCGT
CTCTTTGCTTTGCTTGTTACTTTGATATATTGGAACAACCAACATGATTGATGAGCCAAC
ATCTCGTTGCTTCTCAATCACTCTGTTTTCTTAATGTAAAAAGTATGTTTTTCTCTGAGA
CTTATGGTGCAAGTAATCTCAATTGTTATTC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7217Contig1 543 2 1 U
AAACAATTCTTTTCACTAAAACCAAAAATAATAAGAGGCGATAACATCTATTATACATCC
ATCATTCATAAGCCAAAAAAAAACAGCAAGTTATAAATCCATCTAAAGCCAAAAACCAGC
AAGTTATACATCCATCTAAATCCATAAACCAGCAAGTTATACATCATGTAATTCAGTAGC
CAAAAAAAAACAAAAAACTAATTTATTTGGCCTTCTCAAACACCTCTTCATAAATATCAG
CTGCCAACTTCAAACGCAATGATGTTATAATCTGATCATTCAGGCCTTCAAAGTTACGTC
CAAAAGCTAGACATTCAATGTACATCAACGAGTACACACCGCAATCTCCCGGATTCTCAT
TTTGGGGGATCTTCTTGTGCCTGATATAACTGAACTGTTTTTCCATTTTCGTTCTCGTTT
TAGCAGGAAGCATCTTGTTAAGCACTGCCGGTAGCATTCTCATGAAAGGCCGGCACTCCT
CTTTCATCTGCTTATCACTCAAATGTGTACGGATACTATCATAAACATGTATTGCCTCCT
TGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2H769JQB U 1
AF RR2GJ80JQB U 1
BS 1 543 RR2GJ80JQB

RD RR2H769JQB 521 0 0
AAACAATTCTTTTCACTAAAACCAAAAATAATAAGAGGCGATAACATCTATTATACATCC
ATCATTCATAAGCCAAAAAAAAACAGCAAGTTATAAATCCATCTAAAGCCAAAAACCAGC
AAGTTATACATCCATCTAAATCCATAAACCAGCAAGTTATACATCATGTAATTCAGTAGC
CAAAAAAAAACAAAAAACTAATTTATTTGGCCTTCTCAAACACCTCTTCATAAATATCAG
CTGCCAACTTCAAACGCAATGATGTTATAATCTGATCATTCAGGCCTTCAAAGTTACGTC
CAAAAGCTAGACATTCAATGTACATCAACGAGTACACACCGCAATCTCCCGGATTCTCAT
TTTGGGGGATCTTCTTGTGCCTGATATAACTGAACTGTTTTTCCATTTTCGTTCTCGTTT
TAGCAGGAAGCATCTTGTTAAGCACTGCCGGTAGCATTCTCATGAAAGGCCGGCACTCCT
CTTTCATCTGCTTATCACTCAAATGTGTACGGATACTATCA

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2GJ80JQB 543 0 0
AAACAATTCTTTTCACTAAAACCAAAAATAATAAGAGGCGATAACATCTATTATACATCC
ATCATTCATAAGCCAAAAAAAAACAGCAAGTTATAAATCCATCTAAAGCCAAAAACCAGC
AAGTTATACATCCATCTAAATCCATAAACCAGCAAGTTATACATCATGTAATTCAGTAGC
CAAAAAAAAACAAAAAACTAATTTATTTGGCCTTCTCAAACACCTCTTCATAAATATCAG
CTGCCAACTTCAAACGCAATGATGTTATAATCTGATCATTCAGGCCTTCAAAGTTACGTC
CAAAAGCTAGACATTCAATGTACATCAACGAGTACACACCGCAATCTCCCGGATTCTCAT
TTTGGGGGATCTTCTTGTGCCTGATATAACTGAACTGTTTTTCCATTTTCGTTCTCGTTT
TAGCAGGAAGCATCTTGTTAAGCACTGCCGGTAGCATTCTCATGAAAGGCCGGCACTCCT
CTTTCATCTGCTTATCACTCAAATGTGTACGGATACTATCATAAACATGTATTGCCTCCT
TGC

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL7218Contig1 753 2 3 U
TTTTTTTTGACGAACCAAACATATAACATAATTGATTTGAAAGTTTTGTTTGGAGTACAA
CACAAGCACAAATCATTACATCTCTCTCTATACGTAAAAGAAAGACAAGCTGTGAAATAA
TACCATGTAACTGATACATAAATAAACCCGAATAAAATCACAAAATAGAGAAAGAATCTA
TTTTTGTATTAAAAAAACAGAACCAAACCAGTCTTGTTTTTTTTTTTCTTATTGATATGT
ATTTTTTTCTTTTTCAAAAAGCTCTAAGCAGAAGTAGAGCCCTTGAGCTTCTTGGTGATG
GTAGCAATGTACTTGCCTTGGTGAAACGCTTGCTGTAGCTCCAGCTCCGTTGGCTGCCTC
GACCCATCTCCAGCAAATGTTCCAGCTCCATAAGGGCTACCTCCTTTCACATTCTCCATC
TCGAACATTCCCGCACCGAAAGTGTAACCGATGGGCACAAACACCATCCCGTGGTGAACC
AGCGAGCGACTGAGTCCTCCAGAGTCCACCGGTAGCGTCCAAGAAGGCCTTGAACTGAGC
AGCCATCATACCGAACCTTGTTGGGAATCCGAAGAGGAAGCCATCAGCTTCGGTTAGCTC
GTTGGGTGTGATGATTGGTGATTCACTCTTCGGTCAATTTCTCAACATGACCGTACATTG
AGTAGTACACGATATACACTTTGGTCGCCATATCGAAAAATAGTTGTCTCTGCAGTAGAA
GAATCTCTGAAGCTTTATTGATTGGAGGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2FC75TF C 1
AF RR2FC75JQ U 9
BS 1 8 RR2FC75TF
BS 9 749 RR2FC75JQ
BS 750 753 RR2FC75TF

RD RR2FC75TF 753 0 0
TTTTTTTTGACGAACCAAACATATAACATAATTGATT*GAAAGTTT*GTTTGGAGTACAA
CACAAGCACAAATCATTACATCTCTCTCTATACGTAAAAGAAAGACAAGCTGTGAAATAA
TACCATGTAACTGATACATAAATAAACCCGAATAAAATCACAAAATAGAGAAAGAATCTA
TTTTTGTATTAAAAAAACAGAACCAAACCAGTCTTGTTTTTTTTTTTCTTATTGATATGT
ATTTTTTTCTTTTTCAAAAAGCTCTAAGCAGAAGTAGAGCCCTTGAGCTTCTTGGTGATG
GTAGCAATGTACTTGCCTTGGTGAAACGCTTGCTGTAGCTCCAGCTCCGTTGGCTGCCTC
GACCCATCTCCAGCAAATGTTCCAGCTCCATAAGGGCTACCTCCTTTCACATTCTCCATC
TCGAACATTCCCGCACCGAAAGTGTAACCGATGGGCACAAACACCATCCCGTGGTGAACC
AGCGAGCGACTGAGTCCTCCAGAGTCCACCGGTAGCGTCCAAGAAGGCCTTGAACTGAGC
AGCCATCATACCGAACCTTGTTGGGAATCCGAAGAGGAAGCCATCAGCTTCGGTTAGCTC
GTTGGGTGTGATGATTGGTGATTCACTCTTCGGTCAATTTCTCAACATGACCGTACATTG
AGTAGTACACGATATACACTTTGGTCGCCATATCGAAAAATAGTTGTCTCTGCAGTAGAA
GAATCTCTGAAGCTTTATTGATTGGAGGTTCCC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2FC75JQ 741 0 0
GACGAACCAAACATATAACATAATTGATTTGAAAGTTTTGTTTGGAGTACAACACAAGCA
CAAATCATTACATCTCTCTCTATACGTAAAAGAAAGACAAGCTGTGAAATAATACCATGT
AACTGATACATAAATAAACCCGAATAAAATCACAAAATAGAGAAAGAATCTATTTTTGTA
TTAAAAAAACAGAACCAAACCAGTCTTGTTTTTTTTTTTCTTATTGATATGTATTTTTTT
CTTTTTCAAAAAGCTCTAAGCAGAAGTAGAGCCCTTGAGCTTCTTGGTGATGGTAGCAAT
GTACTTGCCTTGGTGAAACGCTTGCTGTAGCTCCAGCTCCGTTGGCTGCCTCGACCCATC
TCCAGCAAATGTTCCAGCTCCATAAGGGCTACCTCCTTTCACATTCTCCATCTCGAACAT
TCCCGCACCGAAAGTGTAACCGATGGGCACAAACACCATCCCGTGGTGAACCAGCGAGCG
ACTGAGTCCTCCAGAGTCCACCGGTAGCGTCCAAGAAGGCCTTGAACTGAGCAGCCATCA
TACCGAACCTTGTTGGGAATCCGAAGAGGAAGCCATCAGCTTCGGTTAGCTCGTTGGGTG
TGATGATTGGTGATTCACTCTTCGGTCAATTTCTCAACATGACCGTACATTGAGTAGTAC
ACGATATACACTTTGGTCGCCATATCGAAAAATAGTTGTCTCTGCAGTAGAAGAATCTCT
GAAGCTTTATTGATTGGAGGT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL7219Contig1 702 2 5 U
GGAGCATCCTTCAACCTTGTTGTTATTGAGAGCTTCGCTTCTGCTCCGTCGCCGTCGCTG
CAAAACTTTCTCCTCCGATTCCAATTCTTTTCACTTAACGCTTAGATCGCAAAAACATGA
ACGCTCCGGTTCTCGTTCTCAAGGACTCTTTGAAGCGTGAATCTGGAACGAAGGTTCACC
ATGGTAACATTCAAGCTTCCAAGGCTGTGGCTGATATCATCCGCACGACATTGGGTCCTC
GCTCTATGTTGAAGATGCTTCTTGATGCTGGTGGAGGAATTGTTGTTACCAATGATGGGA
ATGCTATTTTGCGTGAACTTGATGTTGCTCACCCTGCAGCTAAGTCGATGATTGAGCTGA
GCCGAACACAGGACGAAGAAGTCGGTGATGGGACTACATCTGTTATTGTTCTTGCTGGTG
AAATGTTACATGTTGCCGAAGCTTTCATTGAAAAGAGTTACCATCCTACAGTCATATGCC
GAGCTTACAATAAGGCTCTAGAGGATGCTATCGCTGTTCTTGACAAGATTGCCATGACAA
TCGATGTGAATGACCGTGCAACAGTACTAGGATTAGTCAAGAGCTGCATAGGAACAAAAT
TCACCAGCCAGTTTGGAGATCTAATTGCTGATTTGGCTATTGATGCCACCACTACTGTTG
GTGTTGATCTTGGACAAGATTGAAGGAAGTGGATATCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2D293TF U 1
AF RR2BM79TF U 30
BS 1 683 RR2D293TF
BS 684 684 RR2BM79TF
BS 685 687 RR2D293TF
BS 688 688 RR2BM79TF
BS 689 702 RR2D293TF

RD RR2D293TF 702 0 0
GGAGCATCCTTCAACCTTGTTGTTATTGAGAGCTTCGCTTCTGCTCCGTCGCCGTCGCTG
CAAAACTTTCTCCTCCGATTCCAATTCTTTTCACTTAACGCTTAGATCGCAAAAACATGA
ACGCTCCGGTTCTCGTTCTCAAGGACTCTTTGAAGCGTGAATCTGGAACGAAGGTTCACC
ATGGTAACATTCAAGCTTCCAAGGCTGTGGCTGATATCATCCGCACGACATTGGGTCCTC
GCTCTATGTTGAAGATGCTTCTTGATGCTGGTGGAGGAATTGTTGTTACCAATGATGGGA
ATGCTATTTTGCGTGAACTTGATGTTGCTCACCCTGCAGCTAAGTCGATGATTGAGCTGA
GCCGAACACAGGACGAAGAAGTCGGTGATGGGACTACATCTGTTATTGTTCTTGCTGGTG
AAATGTTACATGTTGCCGAAGCTTTCATTGAAAAGAGTTACCATCCTACAGTCATATGCC
GAGCTTACAATAAGGCTCTAGAGGATGCTATCGCTGTTCTTGACAAGATTGCCATGACAA
TCGATGTGAATGACCGTGCAACAGTACTAGGATTAGTCAAGAGCTGCATAGGAACAAAAT
TCACCAGCCAGTTTGGAGATCTAATTGCTGATTTGGCTATTGATGCCACCACTACTGTTG
GTGTTGATCTTGGACAAGATTGAGGGAGGTGGATATCAAAAA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2BM79TF 673 0 0
GG
GCTTCGCTTCTGCTCCGTCGCCGTCGCTGCAAAACTTTCTCCTCCGATTCCAATTCTTTT
CACTTAACGCTTAGATCGCAAAAACATGAACGCTCCGGTTCTCGTTCTCAAGGACTCTTT
GAAGCGTGAATCTGGAACGAAGGTTCACCATGGTAACATTCAAGCTTCCAAGGCTGTGGC
TGATATCATCCGCACGACATTGGGTCCTCGCTCTATGTTGAAGATGCTTCTTGATGCTGG
TGGAGGAATTGTTGTTACCAATGATGGGAATGCTATTTTGCGTGAACTTGATGTTGCTCA
CCCTGCAGCTAAGTCGATGATTGAGCTGAGCCGAACACAGGACGAAGAAGTCGGTGATGG
GACTACATCTGTTATTGTTCTTGCTGGTGAAATGTTACATGTTGCCGAAGCTTTCATTGA
AAAGAGTTACCATCCTACAGTCATATGCCGAGCTTACAATAAGGCTCTAGAGGATGCTAT
CGCTGTTCTTGACAAGATTGCCATGACAATCGATGTGAATGACCGTGCAACAGTACTAGG
ATTAGTCAAGAGCTGCATAGGAACAAAATTCACCAGCCAGTTTGGAGATCTAATTGCTGA
TTTGGCTATTGATGCCACCACTACTGTTGGTGTTGATCTTGGACAAGATTGAAGGGAGTG
GATATCAAAAA

QA 3 673 3 673
DS 



AS 1 2

CO CL7220Contig1 691 2 2 U
GGGGGGCTAGAGACATTTTGACCTTTTCACCTCTGTTTCGATATCTCTCTTTCTCTCTTC
GTCTTTCTCGTCTTCGACGATTTCTTTCTTCTCCATCTCCTCTGATCAATCACCGGTTTC
TCGTCTTGATCAATCACCAGTTTGTTGCATGCACGATTCGGTCTCTCTCTCTCTTCGACG
ATTTCTCCTTTCGCCATCGATGCTGTCGAAATCCCAAAGAGAGGCGCTTGTTCTTCCTCT
AAGGTAAAGAAAAAGCTTCTCAGATCTTCCTCGCATTCTAGCCAGGAGTCTCACTTGGGT
GGCAAAGATGGTCGCAGAACGCTTCACTGTCGATTTGGATAGGGCACTTGTCTTTCAGTA
TTATAACACATGGCGATGAAGCCAGGAGGATCAGCATTGAATCCCCACTCAGCAGCTTAC
ATACCACTTGTGTGGGTGTTATAGATCAGATCAGGTAGGTCGTCTTTACAAGAGTCGTGG
GCTTCCAAAGTTACGTGGCATCAAGGTACTTGTTAGATCACCTCAACATGTTTTAGGAAC
TAGAATGTTTCCTCTATGGACGAAACAGAGAACACATGTGTAGATATTTCTTTGGTGTTT
TTGACCAAATGTTTTCTTTATAAGTCATGGCCATTTGCATCTCGTGTATTTGCTTCTAAA
TTATATATATCTTCTAAAACACTTTCATCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR05TF U 1
AF RR2DR05JQ C 1
BS 1 521 RR2DR05TF
BS 522 691 RR2DR05JQ

RD RR2DR05TF 521 0 0
GGGGGGCTAGAGACATTTTGACCTTTTCACCTCTGTTTCGATATCTCTCTTTCTCTCTTC
GTCTTTCTCGTCTTCGACGATTTCTTTCTTCTCCATCTCCTCTGATCAATCACCGGTTTC
TCGTCTTGATCAATCACCAGTTTGTTGCATGCACGATTCGGTCTCTCTCTCTCTTCGACG
ATTTCTCCTTTCGCCATCGATGCTGTCGAAATCCCAAAGAGAGGCGCTTGTTCTTCCTCT
AAGGTAAAGAAAAAGCTTCTCAGATCTTCCTCGCATTCTAGCCAGGAGTCTCACTTGGGT
GGCAAAGATGGTCGCAGAACGCTTCACTGTCGATTTGGATAGGGCACTTGTCTTTCAGTA
TTATAACACATGGCGATGAAGCCAGGAGGATCAGCATTGAATCCCCACTCAGCAGCTTAC
ATACCACTTGTGTGGGTGTTATAGATCAGATCAGGTAGGTCGTCTTTACAAGAGTCGTGG
GCTTCCAAAGTTACGTGGCATCAAGGTACTTGTTAGATCAC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2DR05JQ 691 0 0
GGGGGGCTAGAGACATTTTGACCTTTTCACCTCTGTTTCGATATCTCTCTTTCTCTCTTC
GTCTTTCTCGTCTTCGACGATTTCTTTCTTCTCCATCTCCTCTGATCAATCACCGGTTTC
TCGTCTTGATCAATCACCAGTTTGTTGCATGCACGATTCGGTCTCTCTCTCTCTTCGACG
ATTTCTCCTTTCGCCATCGATGCTGTCGAAATCCCAAAGAGAGGCGCTTGTTCTTCCTCT
AAGGTAAAGAAAAAGCTTCTCAGATCTTCCTCGCATTCTAGCCAGGAGTCTCACTTGGGT
GGCAAAGATGGTCGCAGAACGCTTCACTGTCGATTTGGATAGGGCACTTGTCTTTCAGTA
TTATAACACATGGCGATGAAGCCAGGAGGATCAGCATTGAATCCCCACTCAGCAGCTTAC
ATACCACTTGTGTGGGTGTTATAGATCAGATCAGGTAGGTCGTCTTTACAAGAGTCGTGG
GCTTCCAAAGTTACGTGGCATCAAGGTACTTGTTAGATCACCTCAACATGTTTTAGGAAC
TAGAATGTTTCCTCTATGGACGAAACAGAGAACACATGTGTAGATATTTCTTTGGTGTTT
TTGACCAAATGTTTTCTTTATAAGTCATGGCCATTTGCATCTCGTGTATTTGCTTCTAAA
TTATATATATCTTCTAAAACACTTTCATCCC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL7221Contig1 1068 2 2 U
GGAAAGAGAGAAAAAAAATAATGTCAACTTTCCTTTGTTTCATCTTCCTCTTACCCATTT
TCTTGATCTTCTTGAAAAATCTCAAACCTTCTAGATGGAAGCTTCCTCCAGGACCAAAGA
AGCTTCCCATCATCGGAAACTTACACAACCTCCAAGGAATGCTTCATCTATGCCTTCGAG
ATCTTTCTCATAAGTACGGACCAGTGATGCTTCTCCGGTTCGGGTTCGTGCCTATGGTTG
TGATCACGTCCAAAGAGGCAGCCGAGGAAGTCCTCAAGACGCTAGATCTCGAGTGTTGCA
GCCGACCAGAGACGGTTTCGGGCAGAACGGTCTCTTACAACTTCAAAGACATCGGGTTTG
CTCCATACGGTGAGGAATGGAAGGCGCTGAGGAAGCTCTCCGTGGTGGAGATCTTCAGCG
CGAAGAAGCTTCAGTCTTTCAGGTACATCAGAGAAGAAGAAAACGATCTGTTGGTTAAGA
AACTGTCTGAATCGGCTTCGACGCGTTCCCCTGTGAATCTGAAGGAGTTATTCAGGTTAC
ATCCAGCAGCTCCACTACTACTGCCAAGAGAGACATTGTCAGACGTCAAGATCCAGGGCT
ATGACATCCCGGCAAAGACACAGATCATGGTCAACGTTTACTCGATCGCACGTGATCCTA
AAATATGGACAAACCCGGATGAGTTCAACCCTGATAGGTTTCTAGACACTACTGTGGATT
ACAGGGGGCTGAACTTCGAGCTTTTGCCGTTTGGTTCTGGCCGGAGAATCTGTCCTGGGA
TGACAATGGGGGTCGCTACTGTGGAATTGGGTTTGTTAAATCTTCTCTACTTCTTTGATT
GGGCACTGCCTGAAGGGAAAACGGTGAAGGACATTGACTTGGAAGAGGCAGGGGCTATTG
TTATCGGCAAGAAAGTCAGCCTTGAGCTTGTTCCACTTCTTCATAAATGATTATGTATTT
GATATTTCATTGTGTGTGTGTATTATTCTAAGACCAAAATCCTACCTTGGTTTACTAGAA
TCATTTGAGATTATAATTTCAAAGCAAAAAGGGATTTTGTATGTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D212TF U 1
AF RR2D212JQ C 415
BS 1 668 RR2D212TF
BS 669 1068 RR2D212JQ

RD RR2D212TF 668 0 0
GGAAAGAGAGAAAAAAAATAATGTCAACTTTCCTTTGTTTCATCTTCCTCTTACCCATTT
TCTTGATCTTCTTGAAAAATCTCAAACCTTCTAGATGGAAGCTTCCTCCAGGACCAAAGA
AGCTTCCCATCATCGGAAACTTACACAACCTCCAAGGAATGCTTCATCTATGCCTTCGAG
ATCTTTCTCATAAGTACGGACCAGTGATGCTTCTCCGGTTCGGGTTCGTGCCTATGGTTG
TGATCACGTCCAAAGAGGCAGCCGAGGAAGTCCTCAAGACGCTAGATCTCGAGTGTTGCA
GCCGACCAGAGACGGTTTCGGGCAGAACGGTCTCTTACAACTTCAAAGACATCGGGTTTG
CTCCATACGGTGAGGAATGGAAGGCGCTGAGGAAGCTCTCCGTGGTGGAGATCTTCAGCG
CGAAGAAGCTTCAGTCTTTCAGGTACATCAGAGAAGAAGAAAACGATCTGTTGGTTAAGA
AACTGTCTGAATCGGCTTCGACGCGTTCCCCTGTGAATCTGAAGGAGTTATTCAGGTTAC
ATCCAGCAGCTCCACTACTACTGCCAAGAGAGACATTGTCAGACGTCAAGATCCAGGGCT
ATGACATCCCGGCAAAGACACAGATCATGGTCAACGTTTACTCGATCGCACGTGATCCTA
AAATATGG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2D212JQ 654 0 0
TCAGCGCGAAGAAGCTTCAGTCTTTCAGGTACATCAGAGAAGAAGAAAACGATCTGTTGG
TTAAGAAACTGTCTGAATCGGCTTCGACGCGTTCCCCTGTGAATCTGAAGGAGTTATTCA
GGTTACATCCAGCAGCTCCACTACTACTGCCAAGAGAGACATTGTCAGACGTCAAGATCC
AGGGCTATGACATCCCGGCAAAGACACAGATCATGGTCAACGTTTACTCGATCGCACGTG
ATCCTAAAATATGGACAAACCCGGATGAGTTCAACCCTGATAGGTTTCTAGACACTACTG
TGGATTACAGGGGGCTGAACTTCGAGCTTTTGCCGTTTGGTTCTGGCCGGAGAATCTGTC
CTGGGATGACAATGGGGGTCGCTACTGTGGAATTGGGTTTGTTAAATCTTCTCTACTTCT
TTGATTGGGCACTGCCTGAAGGGAAAACGGTGAAGGACATTGACTTGGAAGAGGCAGGGG
CTATTGTTATCGGCAAGAAAGTCAGCCTTGAGCTTGTTCCACTTCTTCATAAATGATTAT
GTATTTGATATTTCATTGTGTGTGTGTATTATTCTAAGACCAAAATCCTACCTTGGTTTA
CTAGAATCATTTGAGATTATAATTTCAAAGCAAAAAGGGATTTTGTATGTTGCT

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL7222Contig1 1167 2 2 U
TTTTTCGTCTCTAGGGTTTCTCTCTCCTCTCTCTCCCTCTTTCAGTATATAATCTCTCTC
TCTCTCCTTCTCCCACCGAATCCAAAATACAGAGTTTCCCTGAAAGAGAGGGAAAACTAA
AAAAGCCGATCTTTTTTGGTTTCTTTCTCGTGCATCTCCAATACATTCTCACCACCGGAA
CTCGATTCGAGGTCACAGCCGGAGGATATGGAGGGACGCGCTGCGGAAGATGTGTTTAAG
GACTTCAGGGCTCGAAGAGCTGGTCTCACCAAGGCTCTCACTACTGATGTACGCAGGTTT
TACGACAAGTGTAACCCTGCCGAGGAAAACTTGTGTCTCTACAGACTACCAAATGGGTCA
TGGGAGGTTAACCTTCCTGTCGACGAGGTCCCTCCTGAGCTTCCTGAACCAGCTCTTGGC
ATCAATTTCTCAAGGGACGGTATGTCAGAACAAAACTGGGTCTCTTTGGTTGCTGTTCAC
TCTGACTCTTGGCTCATCGCTGTTGCCTTTTACTTCGGTGCACGTTTCTCATTTGATAAA
AACGAGAGGATGAGGCTGTTCAAGATGATAAATGATCTCCCAACCATTTACGAGGTTGTA
ACTGGCAATGCAAAGCCATCCAAGGATCAATCTGCTAACCACAACGGCAGTAGCAAAAGC
AAGTCTAGTGGTGTCAAGGCTCGCCAATCTGAATCTCAGACTAAGGCTTCAAAGAGATCC
CCACCACCATCACCACCAAGAGAAGAAAGTGAGAGCGGAGATGATGATGAGGGGGAAGAC
GAGGAGGGGCAAGGGGAGTTTTGTGGTGTGTGTGTGGAGAGAACGATGATGGAGGAGATG
AGTTCTGGATATGGTGTGATACTTGTGAGAAATGGTTCCATGGGAAATGCGTGAAGATCA
CACCTGCAAGGGCGGAGCACATCAAACATTACAAATGCCCCAGTTGCTGCAATACCAACA
AGAAACAAAGAGCTTGAAAAAGGAAGGAGATGATGATGATATAACAGTTGCATTTGATTG
TGTAGTCTGAATGTGATTGAAAAAACAGCTTTTACAGTTTAGTAATGTCTCCTTTTTTTC
TTTTTCTTGTTGATTTCAAAATGCTGTGACTAATTTCGTCTTGTGGTTCTTAGAAAATTC
TTGTCTTTAAAGACTCTATAGCCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH51TF U 1
AF RR2CH51JQ C 421
BS 1 678 RR2CH51TF
BS 679 1167 RR2CH51JQ

RD RR2CH51TF 678 0 0
TTTTTCGTCTCTAGGGTTTCTCTCTCCTCTCTCTCCCTCTTTCAGTATATAATCTCTCTC
TCTCTCCTTCTCCCACCGAATCCAAAATACAGAGTTTCCCTGAAAGAGAGGGAAAACTAA
AAAAGCCGATCTTTTTTGGTTTCTTTCTCGTGCATCTCCAATACATTCTCACCACCGGAA
CTCGATTCGAGGTCACAGCCGGAGGATATGGAGGGACGCGCTGCGGAAGATGTGTTTAAG
GACTTCAGGGCTCGAAGAGCTGGTCTCACCAAGGCTCTCACTACTGATGTACGCAGGTTT
TACGACAAGTGTAACCCTGCCGAGGAAAACTTGTGTCTCTACAGACTACCAAATGGGTCA
TGGGAGGTTAACCTTCCTGTCGACGAGGTCCCTCCTGAGCTTCCTGAACCAGCTCTTGGC
ATCAATTTCTCAAGGGACGGTATGTCAGAACAAAACTGGGTCTCTTTGGTTGCTGTTCAC
TCTGACTCTTGGCTCATCGCTGTTGCCTTTTACTTCGGTGCACGTTTCTCATTTGATAAA
AACGAGAGGATGAGGCTGTTCAAGATGATAAATGATCTCCCAACCATTTACGAGGTTGTA
ACTGGCAATGCAAAGCCATCCAAGGATCAATCTGCTAACCACAACGGCAGTAGCAAAAGC
AAGTCTAGTGGTGTCAAG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RR2CH51JQ 747 0 0
ATCAATTTCTCAAGGGACGGTATGTCAGAACAAAACTGGGTCTCTTTGGTTGCTGTTCAC
TCTGACTCTTGGCTCATCGCTGTTGCCTTTTACTTCGGTGCACGTTTCTCATTTGATAAA
AACGAGAGGATGAGGCTGTTCAAGATGATAAATGATCTCCCAACCATTTACGAGGTTGTA
ACTGGCAATGCAAAGCCATCCAAGGATCAATCTGCTAACCACAACGGCAGTAGCAAAAGC
AAGTCTAGTGGTGTCAAGGCTCGCCAATCTGAATCTCAGACTAAGGCTTCAAAGAGATCC
CCACCACCATCACCACCAAGAGAAGAAAGTGAGAGCGGAGATGATGATGAGGGGGAAGAC
GAGGAGGGGCAAGGGGAGTTTTGTGGTGTGTGTGTGGAGAGAACGATGATGGAGGAGATG
AGTTCTGGATATGGTGTGATACTTGTGAGAAATGGTTCCATGGGAAATGCGTGAAGATCA
CACCTGCAAGGGCGGAGCACATCAAACATTACAAATGCCCCAGTTGCTGCAATACCAACA
AGAAACAAAGAGCTTGAAAAAGGAAGGAGATGATGATGATATAACAGTTGCATTTGATTG
TGTAGTCTGAATGTGATTGAAAAAACAGCTTTTACAGTTTAGTAATGTCTCCTTTTTTTC
TTTTTCTTGTTGATTTCAAAATGCTGTGACTAATTTCGTCTTGTGGTTCTTAGAAAATTC
TTGTCTTTAAAGACTCTATAGCCTGTT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL7223Contig1 977 2 4 U
GGCAGCTTTCGTTGGAAAGCTAGGTGACGACGAGTTTGGCCACATGCTCGCCGGAATCTT
GAAACAGAACGGCGTCTCGGCCGAAGGAATCAACTTCGATACTGGAGCCAGGACGGCGCT
CGCGTTCGTGACGTTAAGATCCGATGGTGAACGTGAGTTCATGTTTTACCGGAACCCTAG
CGCCGACATGCTCCTCCGTCCTGATGAGCTTAATCTCGATCTCATCAGATCTGCTAAGGT
GTTCCACTATGGATCAATAAGTCTCATCGTTGAGCCATGTCGATCTGCTCACCTGAAGGC
CATGGAGGTGGCTAAAGAAGCAGGTGCGTTGCTCTCGTATGACCCAAACTTGAGGCTGCC
TTTGTGGCCCTCGAAGGAGGAGGCTAAGGAGCAGATTCTTAGCATCTGGGACAAAGCTGA
AGTGATCAAAGTCAGTGACGAAGAGCTTATGTTCTTGACTGGATCTGATAATGTTGATGA
TGAGACTGCTATGTCTCTGTGGCATGATAACTTGAAACTTCTCTTGGTCACTTTGGGTGA
AAAGGGTTGTAATTATTACACCAAGGGCTTTCGTGGATCTGTTGATCCTTTCCGTGTGAA
CGCAGTGGACACAACCGGTGCTGGTGATTCATATGTTGGTGCCTTGCTTTGCAACATTGT
CGATGACCGTGCTGTTCTCGAGGACGAAGTTCGTCTTAGAGAAGTGCTTAGGTTTGCGAA
TGCATGTGGAGCCATTACGACTACAAAGAAAGGAGCAATTCCAGCTCTTCCCACAGAGGC
CGAGGCTCAGAGTCTCCTGAATGGGAACTGATCTACACCATGTCTTGTTTTTAGATTTCA
CGTTTTTCTTTTTTTTTGCTTTTGCTTTTTTGGTCAGCGTTAACAGAACTGTTTGATTCT
GTTAAGGGTCTTGTATTTCGAGTAACTTTCATAAATTAAAACTCATTATCAGATTTTACT
GAACGAATGATTTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EM70TF U 1
AF RR2EM70JQ C 205
BS 1 711 RR2EM70TF
BS 712 712 RR2EM70JQ
BS 713 729 RR2EM70TF
BS 730 977 RR2EM70JQ

RD RR2EM70TF 729 0 0
GGCAGCTTTCGTTGGAAAGCTAGGTGACGACGAGTTTGGCCACATGCTCGCCGGAATCTT
GAAACAGAACGGCGTCTCGGCCGAAGGAATCAACTTCGATACTGGAGCCAGGACGGCGCT
CGCGTTCGTGACGTTAAGATCCGATGGTGAACGTGAGTTCATGTTTTACCGGAACCCTAG
CGCCGACATGCTCCTCCGTCCTGATGAGCTTAATCTCGATCTCATCAGATCTGCTAAGGT
GTTCCACTATGGATCAATAAGTCTCATCGTTGAGCCATGTCGATCTGCTCACCTGAAGGC
CATGGAGGTGGCTAAAGAAGCAGGTGCGTTGCTCTCGTATGACCCAAACTTGAGGCTGCC
TTTGTGGCCCTCGAAGGAGGAGGCTAAGGAGCAGATTCTTAGCATCTGGGACAAAGCTGA
AGTGATCAAAGTCAGTGACGAAGAGCTTATGTTCTTGACTGGATCTGATAATGTTGATGA
TGAGACTGCTATGTCTCTGTGGCATGATAACTTGAAACTTCTCTTGGTCACTTTGGGTGA
AAAGGGTTGTAATTATTACACCAAGGGCTTTCGTGGATCTGTTGATCCTTTCCGTGTGAA
CGCAGTGGACACAACCGGTGCTGGTGATTCATATGTTGGTGCCTTGCTTTGCAACATTGT
CGATGACCGTGCTGTTCTCGAGGACGAAGTTCGTCTTAGAGAAGTGCTTAG*TTTGCGAA
TGCATGTGG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2EM70JQ 773 0 0
TGAGCTTAATCTCGATCTCATCAGATCTGCTAAGGTGTTCCACTATGGATCAATAAGTCT
CATCGTTGAGCCATGTCGATCTGCTCACCTGAAGGCCATGGAGGTGGCTAAAGAAGCAGG
TGCGTTGCTCTCGTATGACCCAAACTTGAGGCTGCCTTTGTGGCCCTCGAAGGAGGAGGC
TAAGGAGCAGATTCTTAGCATCTGGGACAAAGCTGAAGTGATCAAAGTCAGTGACGAAGA
GCTTATGTTCTTGACTGGATCTGATAATGTTGATGATGAGACTGCTATGTCTCTGTGGCA
TGATAACTTGAAACTTCTCTTGGTCACTTTGGGTGAAAAGGGTTGTAATTATTACACCAA
GGGCTTTCGTGGATCTGTTGATCCTTTCCGTGTGAACGCAGTGGACACAACCGGTGCTGG
TGATTCATATGTTGGTGCCTTGCTTTGCAACATTGTCGATGACCGTGCTGTTCTCGAGGA
CGAAGTTCGTCTTAGAGAAGTGCTTAGGTTTGCGAATGCATGTGGAGCCATTACGACTAC
AAAGAAAGGAGCAATTCCAGCTCTTCCCACAGAGGCCGAGGCTCAGAGTCTCCTGAATGG
GAACTGATCTACACCATGTCTTGTTTTTAGATTTCACGTTTTTCTTTTTTTTTGCTTTTG
CTTTTTTGGTCAGCGTTAACAGAACTGTTTGATTCTGTTAAGGGTCTTGTATTTCGAGTA
ACTTTCATAAATTAAAACTCATTATCAGATTTTACTGAACGAATGATTTATTT

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL7224Contig1 520 2 1 U
GCGTAACAAGCCTGGCTGCTCTAGATTTCTTGGTCTGTTTGAAGTCAGATGTGTTTGTGA
TGACACACGGTGGGAACTTTGCAAAACTGATCATTGGAGCAAGGAGATACATGGGTCATC
ACCAGAAATCGATCAAACCGGATAAAGGATTGATGTCGAAATCATTTGGGGATCCTTACA
TGGGATGGGCAACTTTTGTGGAGGATGTAGTTGTAACACATCAAACAAGGACCGGTTTGC
CTGAAGAAACTTTCCCTAACTATGATCTTTGGGAAAATCCTCTCACTCCATGTATGTGTA
AAGCTTAATGATGCTCTTGGTTTTGCATTGTGGACTGATGATTAGCTTTTTAAAAAGAGA
GGAGTTGAGTTTTGGTCTGGACTTTTGTCTTTGAGGAGCTAGATACTATAGAGGTGTGGG
TGGTAGTTTATTCTCTTTCTCTGTTTTTAACCATTCAAATCCTTTGTCTTTGTAATCATT
TTGAAATTATGTAAAGTTTCTAGTGAAGATAAAACAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2FY51TF U 1
AF RR2GQ88TF U 1
BS 1 520 RR2FY51TF

RD RR2FY51TF 520 0 0
GCGTAACAAGCCTGGCTGCTCTAGATTTCTTGGTCTGTTTGAAGTCAGATGTGTTTGTGA
TGACACACGGTGGGAACTTTGCAAAACTGATCATTGGAGCAAGGAGATACATGGGTCATC
ACCAGAAATCGATCAAACCGGATAAAGGATTGATGTCGAAATCATTTGGGGATCCTTACA
TGGGATGGGCAACTTTTGTGGAGGATGTAGTTGTAACACATCAAACAAGGACCGGTTTGC
CTGAAGAAACTTTCCCTAACTATGATCTTTGGGAAAATCCTCTCACTCCATGTATGTGTA
AAGCTTAATGATGCTCTTGGTTTTGCATTGTGGACTGATGATTAGCTTTTTAAAAAGAGA
GGAGTTGAGTTTTGGTCTGGACTTTTGTCTTTGAGGAGCTAGATACTATAGAGGTGTGGG
TGGTAGTTTATTCTCTTTCTCTGTTTTTAACCATTCAAATCCTTTGTCTTTGTAATCATT
TTGAAATTATGTAAAGTTTCTAGTGAAGATAAAACAAAAA

QA 1 520 1 520
DS 

RD RR2GQ88TF 520 0 0
GCGTAACAAGCCTGGCTGCTCTAGATTTCTTGGTCTGTTTGAAGTCAGATGTGTTTGTGA
TGACACACGGTGGGAACTTTGCAAAACTGATCATTGGAGCAAGGAGATACATGGGTCATC
ACCAGAAATCGATCAAACCGGATAAAGGATTGATGTCGAAATCATTTGGGGATCCTTACA
TGGGATGGGCAACTTTTGTGGAGGATGTAGTTGTAACACATCAAACAAGGACCGGTTTGC
CTGAAGAAACTTTCCCTAACTATGATCTTTGGGAAAATCCTCTCACTCCATGTATGTGTA
AAGCTTAATGATGCTCTTGGTTTTGCATTGTGGACTGATGATTAGCTTTTTAAAAAGAGA
GGAGTTGAGTTTTGGTCTGGACTTTTGTCTTTGAGGAGCTAGATACTATAGAGGTGTGGG
TGGTAGTTTATTCTCTTTCTCTGTTTTTAACCATTCAAATCCTTTGTCTTTGTAATCATT
TTGAAATTATGTAAAGTTTCTAGTGAAGATAAAACAAAAA

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 2

CO CL7225Contig1 1373 2 4 U
GGGGAGAAGAATCGGTGCCGGGTCAAAATCCCTTCTTGTTCAACGGCGACAAATCACCTA
ACCCAAAAAAAAAAAAGTTCTAACGAAATCGGATCCACCAACTCACTCTCTGTCTGTCAA
TATAACTGGATTTTACCCGGATTTCGAAATTCTGATGGCGGACGAAGTGGAATTGTCGCC
GTTGGTTCCGCCGTCACCGATGGTGGATCCTTCGGAGATCGATCTCGAAGCAGGACATAG
CGAACAAACTCAGTGCCGAATCTGCCTCGAGACTGATGGTAGGGATTTCATTGCCCCTTG
CAAATGCAAAGGAACTTCAAAGTATGTTCATCGTGATTGCTTGGATCATTGGAGAGCTAT
AAAGGAAGGCTTTGCGTTTGCACACTGCACTACTTGCAAGGCTCCCTACTATCTCCGAGT
TCACGGTGCTGGTGATAAGAAATGGAGGACGCTCAAGTTCCGCTTCTTTGTCACTCGTGA
CATCTTATCCATCTTTCTCGCTGTTCAGCTTGTAATTGCTGCGTTGGCCTACATGGTCTA
TTTCATAGATAGTTACCAGCAATCATGGCTTCGTCATATTTGGGGTTTCGACAGTGAGGT
CTCCTTTTACTACATGTGTGGAGCTTTGTTATTCTTTGCTCTGTTGGGTCTATCTGGATG
CTTCATTACTTGCTACGATCGCAGAGTTCGCAATGACTTAGCTCAGCCTTGCCGTGAATT
GTGTCTCTGCTGCTGTCAACCTGGGGTATGCGCAGACTGCCATCTACCAGGAACTATTTG
CATGTGGGCAGATTGCACGGCATGTACTGAAGGATGTGCAAGTGCAGTTAGTGAATGTGG
TGGTTGCCTTGGAGGTGCAGGGGAAGCTGGATTGCCATTGATTTTCGTAATGGCATTAGT
AGTTCTCGGTTTATTTACGGTTATAGGTATATTCTACAGCGTGTTGGTTGCAACCATGGT
TGGTCAACGTATTTGGCAGCGCCATTACCACATTCTCGCCAAAAGAATGTTAACAAAGGA
GTATGTGGTTGAGGATGTAGATGGAGAAATGACGGGATATGATTGGTCGCCACCGGTTTT
ACCGCCTGAGCATGTCCAGCAGCTGAAGACGCTTGGCCTGCTATGAAAGCCATTATGGCT
TCTCATAGATGTTTTAAATGCTCACAGGAAAATTCATCTGACCAGTGGTGGGAGAGAGAA
TAGTTTAGATTATGAATGTTAAATGTTTAGGGATTCGTTTTGTAAAGAAAGGCTCGAACT
TTAGAGTCAGAGACCTCTCCGATTTACGAATTGAACTTTTGATTTGCATGTTTGCTCCTG
ATGTTTTGTATACAGGTAAATAATATCCACAAGTGTTGTTTTTCTTTGGGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP39TF U 1
AF RR2AP39JQ C 500
BS 1 738 RR2AP39TF
BS 739 739 RR2AP39JQ
BS 740 763 RR2AP39TF
BS 764 1373 RR2AP39JQ

RD RR2AP39TF 763 0 0
GGGGAGAAGAATCGGTGCCGGGTCAAAATCCCTTCTTGTTCAACGGCGACAAATCACCTA
ACCCAAAAAAAAAAAAGTTCTAACGAAATCGGATCCACCAACTCACTCTCTGTCTGTCAA
TATAACTGGATTTTACCCGGATTTCGAAATTCTGATGGCGGACGAAGTGGAATTGTCGCC
GTTGGTTCCGCCGTCACCGATGGTGGATCCTTCGGAGATCGATCTCGAAGCAGGACATAG
CGAACAAACTCAGTGCCGAATCTGCCTCGAGACTGATGGTAGGGATTTCATTGCCCCTTG
CAAATGCAAAGGAACTTCAAAGTATGTTCATCGTGATTGCTTGGATCATTGGAGAGCTAT
AAAGGAAGGCTTTGCGTTTGCACACTGCACTACTTGCAAGGCTCCCTACTATCTCCGAGT
TCACGGTGCTGGTGATAAGAAATGGAGGACGCTCAAGTTCCGCTTCTTTGTCACTCGTGA
CATCTTATCCATCTTTCTCGCTGTTCAGCTTGTAATTGCTGCGTTGGCCTACATGGTCTA
TTTCATAGATAGTTACCAGCAATCATGGCTTCGTCATATTTGGGGTTTCGACAGTGAGGT
CTCCTTTTACTACATGTGTGGAGCTTTGTTATTCTTTGCTCTGTTGGGTCTATCTGGATG
CTTCATTACTTGCTACGATCGCAGAGTTCGCAATGACTTAGCTCAGCCTTGCCGTGAATT
GTGTCTCTGCTGCTGTCACCCTGGGGTATGCGCAGACTGCCAT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2AP39JQ 874 0 0
GCTGTTCAGCTTGTAATTGCTGCGTTGGCCTACATGGTCTATTTCATAGATAGTTACCAG
CAATCATGGCTTCGTCATATTTGGGGTTTCGACAGTGAGGTCTCCTTTTACTACATGTGT
GGAGCTTTGTTATTCTTTGCTCTGTTGGGTCTATCTGGATGCTTCATTACTTGCTACGAT
CGCAGAGTTCGCAATGACTTAGCTCAGCCTTGCCGTGAATTGTGTCTCTGCTGCTGTCAA
CCTGGGGTATGCGCAGACTGCCATCTACCAGGAACTATTTGCATGTGGGCAGATTGCACG
GCATGTACTGAAGGATGTGCAAGTGCAGTTAGTGAATGTGGTGGTTGCCTTGGAGGTGCA
GGGGAAGCTGGATTGCCATTGATTTTCGTAATGGCATTAGTAGTTCTCGGTTTATTTACG
GTTATAGGTATATTCTACAGCGTGTTGGTTGCAACCATGGTTGGTCAACGTATTTGGCAG
CGCCATTACCACATTCTCGCCAAAAGAATGTTAACAAAGGAGTATGTGGTTGAGGATGTA
GATGGAGAAATGACGGGATATGATTGGTCGCCACCGGTTTTACCGCCTGAGCATGTCCAG
CAGCTGAAGACGCTTGGCCTGCTATGAAAGCCATTATGGCTTCTCATAGATGTTTTAAAT
GCTCACAGGAAAATTCATCTGACCAGTGGTGGGAGAGAGAATAGTTTAGATTATGAATGT
TAAATGTTTAGGGATTCGTTTTGTAAAGAAAGGCTCGAACTTTAGAGTCAGAGACCTCTC
CGATTTACGAATTGAACTTTTGATTTGCATGTTTGCTCCTGATGTTTTGTATACAGGTAA
ATAATATCCACAAGTGTTGTTTTTCTTTGGGATT

QA 1 874 1 874
DS 



AS 1 2

CO CL7226Contig1 823 2 2 U
GATACTCCAGCAGTTCTCGGGTATCAATGGAGTTCTCTACTACACTCCTCAGATTCTTGA
ACGCGCTGGTGTGGACATTCTTCTCTCGAGCTTTGGACTTAGCTCCATCTCCGCGTCGTT
CCTCATCAGCGGGTTAACTACTTTACTCATGCTTCCATCTATTGTCGTCGCCATGAGACC
ATGGATGTCTCCGGAAGAAGGGCATTACTTCTCTGGACCATCCCTGTTCTCATCCTCTCA
CTCATCGTCCTCGTCATCAGCGAGCTTGTCCACATCAGCAAAGTCGTAAACGCAGCGCTC
TCCACGGCCTGTGTGATACTCTACTTCTGCTTCTTCGTGATGGGTTACGGTCCCATTCCT
AACATCCTCTGTTCTGAAATCTTCCCGACGAGAGTCCGTGGTCTCTGCATTGCTATCTGC
GCTATGGTGTTCTGGATTGGAGACATTGTCGTCACCTACTCGCTTCCCGTTCTCCTCAGC
TCGATAGGACTCGTCGGTGTGTTCATCATTTACGGTGCGGTTTACGTTATCTCGTGGATC
TTTGTTTACATGAAGGTGCCGGAGACTAAAGGTATGCCCTTGGAGGTTATCACAGACTAC
TTTGCCTTTGGAGCTCAGGCTCAAGCTTCTGCTCCTTCCAAGGATACATAGTTTGTAACC
TTTATTCTTCTTCATTTGCTCTCTGTACTTAAAGATTTCTTTTGGTTCTGAGATACCTTC
ATTTCGTTTTCTTTTTGTCTCTCTTTCTCTGTTTTTGTTATCTAAATTAATCTAATAATT
ACTCAATTTTCTCACTTAACAAGTTGATAATTTTGAAGATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H071TF U 1
AF RR2H071JQ C 58
BS 1 585 RR2H071TF
BS 586 823 RR2H071JQ

RD RR2H071TF 589 0 0
GATACTCCAGCAGTTCTCGGGTATCAATGGAGTTCTCTACTACACTCCTCAGATTCTTGA
ACGCGCTGGTGTGGACATTCTTCTCTCGAGCTTTGGACTTAGCTCCATCTCCGCGTCGTT
CCTCATCAGCGGGTTAACTACTTTACTCATGCTTCCATCTATTGTCGTCGCCATGAGACC
ATGGATGTCTCCGGAAGAAGGGCATTACTTCTCTGGACCATCCCTGTTCTCATCCTCTCA
CTCATCGTCCTCGTCATCAGCGAGCTTGTCCACATCAGCAAAGTCGTAAACGCAGCGCTC
TCCACGGCCTGTGTGATACTCTACTTCTGCTTCTTCGTGATGGGTTACGGTCCCATTCCT
AACATCCTCTGTTCTGAAATCTTCCCGACGAGAGTCCGTGGTCTCTGCATTGCTATCTGC
GCTATGGTGTTCTGGATTGGAGACATTGTCGTCACCTACTCGCTTCCCGTTCTCCTCAGC
TCGATAGGACTCGTCGGTGTGTTCATCATTTACGGTGCGGTTTACGTTATCTCGTGGATC
TTTGTTTACATGAAGGTGCCGGAGACTAAAGGTATGCCCTTGGAG
TTAT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RR2H071JQ 766 0 0
TGAACGCGCTGGTGTGGACATTCTTCTCTCGAGCTTTGGACTTAGCTCCATCTCCGCGTC
GTTCCTCATCAGCGGGTTAACTACTTTACTCATGCTTCCATCTATTGTCGTCGCCATGAG
ACCATGGATGTCTCCGGAAGAAGGGCATTACTTCTCTGGACCATCCCTGTTCTCATCCTC
TCACTCATCGTCCTCGTCATCAGCGAGCTTGTCCACATCAGCAAAGTCGTAAACGCAGCG
CTCTCCACGGCCTGTGTGATACTCTACTTCTGCTTCTTCGTGATGGGTTACGGTCCCATT
CCTAACATCCTCTGTTTTGAAATCTTCCCGACGAGAGTCCGTGGTCTCTGCATTGCTATT
TGCGCTATGGTGTTCTGGATTGGAGACATTGTCGTCACCTACTCGCTTCCCGTTCTCCTC
AGCTCGATAGGACTCGTCGGTGTGTTCATCATTTACGGTGCGGTTTACGTTATCTCGTGG
ATCTTTGTTTACATGAAGGTGCCGGAGACTAAAGGTATGCCCTTGGAGGTTATCACAGAC
TACTTTGCCTTTGGAGCTCAGGCTCAAGCTTCTGCTCCTTCCAAGGATACATAGTTTGTA
ACCTTTATTCTTCTTCATTTGCTCTCTGTACTTAAAGATTTCTTTTGGTTCTGAGATACC
TTCATTTCGTTTTCTTTTTGTCTCTCTTTCTCTGTTTTTGTTATCTAAATTAATCTAATA
ATTACTCAATTTTCTCACTTAACAAGTTGATAATTTTGAAGATTTG

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL7227Contig1 524 2 3 U
GGGAGCGAGCATAGCTGGGTCTTTAGCTTTAATTCGCCGATCTGATTGTATTTGATTAGG
GATCTCTCATCTATCATCTGCGACTCTAAAAAATGAAGCATTAGTAAAGATATTGAGCCT
GTTGGTGGCGACCTCTGCCTTCTGGATTGGTCTTTTGCAGGCTGCTATCGTTCCTCGAAC
CCACACATGGTTGCTACCGATCTACTTTGTAGTGTCTCTCGGATGCTATGGTCTATTAAT
GGTTGGTATTGGGCTAATGCAGTTTCCTACCTGTCCCCAAGAAGCAGTTCTTTTGCAGCA
GGATATTGCAGAGGCCAAGGACTTCTTCAAGCACAAAGGAGTCGATGTCGGATCAGACTG
ATACGATGGCTTGTTAATGACCAAACACTAGAATAGTTCCATCTTTTTATGGCAAGAGAT
CTTACATGTGTCTGTTTGAATAGTTGAATTAAACAAGTGTTTTCTGACTTTACTCGAGGA
AATGTGGCAAACGCCATTAGGCAAAAATCAACAGCTAATAATAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FQ59JQ C 1
AF RR2FQ59TF U 1
BS 1 480 RR2FQ59TF
BS 481 481 RR2FQ59JQ
BS 482 524 RR2FQ59TF

RD RR2FQ59JQ 524 0 0
GGGAGCGAGCATAGCTGGGTCTTTAGCTTTAATTCGCCGATCTGATTGTATTTGATTAGG
GATCTCTCATCTATCATCTGCGACTCTAAAAAATGAAGCATTAGTAAAGATATTGAGCCT
GTTGGTGGCGACCTCTGCCTTCTGGATTGGTCTTTTGCAGGCTGCTATCGTTCCTCGAAC
CCACACATGGTTGCTACCGATCTACTTTGTAGTGTCTCTCGGATGCTATGGTCTATTAAT
GGTTGGTATTGGGCTAATGCAGTTTCCTACCTGTCCCCAAGAAGCAGTTCTTTTGCAGCA
GGATATTGCAGAGGCCAAGGACTTCTTCAAGCACAAAGGAGTCGATGTCGGATCAGACTG
ATACGATGGCTTGTTAATGACCAAACACTAGAATAGTTCCATCTTTTTATGGCAAGAGAT
CTTACATGTGTCTGTTTGAATAGTTGAATTAAACAAGTGTTTTCTGACTTTACTCGAGGA
AATGTGGCAAACGCCATTAGGCAAAAATCAACAGCTAATAATAA

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2FQ59TF 524 0 0
GGGAGCGAGCATAGCTGGGTCTTTAGCTTTAATTCGCCGATCTGATTGTATTTGATTAGG
GATCTCTCATCTATCATCTGCGACTCTAAAAAATGAAGCATTAGTAAAGATATTGAGCCT
GTTGGTGGCGACCTCTGCCTTCTGGATTGGTCTTTTGCAGGCTGCTATCGTTCCTCGAAC
CCACACATGGTTGCTACCGATCTACTTTGTAGTGTCTCTCGGATGCTATGGTCTATTAAT
GGTTGGTATTGGGCTAATGCAGTTTCCTACCTGTCCCCAAGAAGCAGTTCTTTTGCAGCA
GGATATTGCAGAGGCCAAGGACTTCTTCAAGCACAAAGGAGTCGATGTCGGATCAGACTG
ATACGATGGCTTGTTAATGACCAAACACTAGAATAGTTCCATCTTTTTATGGCAAGAGAT
CTTACATGTGTCTGTTTGAATAGTTGAATTAAACAAGTGTTTTCTGACTTTACTCGAGGA
TATGTGGCAAACGCCATTAGGCAAAAATCAACAGCTAATAATAA

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

CO CL7228Contig1 968 2 2 U
GGACACCATCATGGCTTTCTCCACCAGATCAAGACTCTTCTTCTTCTTGTTCTTAACACA
TCTTCTTCTCTCCACTCAAATCAACGCAAGAGACAGCTACTCATTTGGTAAGTTCCATAG
AGAGCACCCCAAAGAACAAAACCCTAACAATCTCCAAACCAACGAGACGAGCGAGCAAGA
CGACCAAAACCCTCCCTTTATGCCCCAGACCGAAAAGGGATACGGCTTGTACGGTCAAGA
GACAACCTACAACAACAATGAAGATCAGTTTAAGAACAACAAATACGACGAGAACGTTAA
CTACGACGACTCTTTCTCAACCCCAAGCCTAAGCCAAACCCAAGAATCTTATAAGACCTA
TGGAGATAACTATCCTAAGACAACTGAGAGTTACGCCGAAAACAACAAGGACTCAAGCTA
CTATTCCAATGGCTACGGGCCAGAGAATAGAGAGGAGGCGTACAAGGGTTATAGCAACAA
CGTGGAGAGACAAGGGATGAGTGATAAGAGTTACTACGAAAACAATAAGGACTCGAGCTA
CGGTTACGAGCCGGAGAAGAGAGAGAAGGAGGCTTACAAGGGTTACAGCAACAACGTGGA
GAGACAAGGGATGAGCGATACGAGGTTCATGGCCAATGGTAAGTACTTCTATGACCTTGA
CGACGACAGAAACCACGGCCGTTTCTACCAGAAGCACTTCTACAACTACAACCCCACCAA
TTACAACGAGGACTCCAGCTTCAAGAATCCATACAGTTCTAAAAACATGATGAATGGACA
GTCCGAGATGTCTGGCGAAGGGCAAGGAGATCAGTTCACTCCATGATCACGCGGAGAACA
AATCATATTTAAATATTTTAAAATTTGTTTTCTAAACTAATATAAGTTACGATGGTTGGT
TTATACGTGAAACTATTAATCGTTTGCATATAAAGTTTGAAGAATAAAGATGTAATGCTT
TTTATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED11TF U 1
AF RR2ED11JQ C 388
BS 1 569 RR2ED11TF
BS 570 968 RR2ED11JQ

RD RR2ED11TF 569 0 0
GGACACCATCATGGCTTTCTCCACCAGATCAAGACTCTTCTTCTTCTTGTTCTTAACACA
TCTTCTTCTCTCCACTCAAATCAACGCAAGAGACAGCTACTCATTTGGTAAGTTCCATAG
AGAGCACCCCAAAGAACAAAACCCTAACAATCTCCAAACCAACGAGACGAGCGAGCAAGA
CGACCAAAACCCTCCCTTTATGCCCCAGACCGAAAAGGGATACGGCTTGTACGGTCAAGA
GACAACCTACAACAACAATGAAGATCAGTTTAAGAACAACAAATACGACGAGAACGTTAA
CTACGACGACTCTTTCTCAACCCCAAGCCTAAGCCAAACCCAAGAATCTTATAAGACCTA
TGGAGATAACTATCCTAAGACAACTGAGAGTTACGCCGAAAACAACAAGGACTCAAGCTA
CTATTCCAATGGCTACGGGCCAGAGAATAGAGAGGAGGCGTACAAGGGTTATAGCAACAA
CGTGGAGAGACAAGGGATGAGTGATAAGAGTTACTACGAAAACAATAAGGACTCGAGCTA
CGGTTACGAGCCGGAGAAGAGAGAGAAGG

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2ED11JQ 581 0 0
GAGTTACGCCGAAAACAACAAGGACTCAAGCTACTATTCCAATGGCTACGGGCCAGAGAA
TAGAGAGGAGGCGTACAAGGGTTATAGCAACAACGTGGAGAGACAAGGGATGAGTGATAA
GAGTTACTACGAAAACAATAAGGACTCGAGCTACGGTTACGAGCCGGAGAAGAGAGAGAA
GGAGGCTTACAAGGGTTACAGCAACAACGTGGAGAGACAAGGGATGAGCGATACGAGGTT
CATGGCCAATGGTAAGTACTTCTATGACCTTGACGACGACAGAAACCACGGCCGTTTCTA
CCAGAAGCACTTCTACAACTACAACCCCACCAATTACAACGAGGACTCCAGCTTCAAGAA
TCCATACAGTTCTAAAAACATGATGAATGGACAGTCCGAGATGTCTGGCGAAGGGCAAGG
AGATCAGTTCACTCCATGATCACGCGGAGAACAAATCATATTTAAATATTTTAAAATTTG
TTTTCTAAACTAATATAAGTTACGATGGTTGGTTTATACGTGAAACTATTAATCGTTTGC
ATATAAAGTTTGAAGAATAAAGATGTAATGCTTTTTATGTT

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL7229Contig1 1024 2 2 U
CTTATACTATTAACACACAAAAAAAATACAAAGTAATAGAATGGTTGTGAAAGTATACGG
ACAGGTTACTGCAGCTTGTCCGCAGAGAGTCTTGCTTTGTCTTCTTGAGAAAGAAATTGA
ATTCGAGATTGTTCACATCGATCTCGATACATTAGAGCAGAAAAGACCAGAACACCTTCT
TCGTCAGGTAAACGTTTCATGTTTTATTTTTCTTCTAAAATATAAACAAACCATTAGTTT
GATTTACTAATGTTTTCTTGCGGCCATTTGGTCAAGTTCCAGCCATAGAAGATGGAGACC
TCAAGCTTTTTGGTTAAGGATCCTAATAACAAATTTTAAAAACATTTATTTAAGACTTGG
TTTATAATCATTATTGTAATGTGTTTTGATATTTTGCGTGTTTTAACCAAAGAATCTCGA
GCCATTGCGAGATACTACGCGACCAAGTACGCGGACCAAGGCACGAACCTTTTGGGAAAG
TCTCTAGAGCACCGAGCCATCGTGGACCAGTGGGCTGGTGTTGAGGTGGGTTACTTCAAC
GTGCTCGTACACCCTTTAGCGATGAACCTAGTCATCAAGCCAAGGCTAGGCGAAGAATGT
GACGCCGTTTTGGTCGAGGAGCTCAAGGTGAAGCTCGGGGTGGTCTTGGACATATACGAC
AACCAGCTTGCTTCGAACCGGTTTTTGGCTGGTGATGAATTCACCATGGCTGATTTAACG
CACATGCCGGTGATGAGGTACTTGATGGGTACCGGTCTAAACCGGATTGTTAAGGCTCGG
GTGAATATGAACCGGTGGTGGGAAGAGATTACGGCTAGACCGGCTTGGAAGAAGCTTATG
AATATTGCTGGTCTCTGAATTATAGCTCAAATTTATATGATGATATATATACTAACAAAA
TAATCTTCATATTTTCTGTTTCTTTTGTTTGTCTGGTTAAATCAATTTACTTTTGAAGAT
TTTAATTTGTCAACTGGATTGGTGTTTTTCATATACGAAATGTTCTATATTGATATAATA
AAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2B057TF U 1
AF RR2B057JQ C 345
BS 1 770 RR2B057TF
BS 771 1024 RR2B057JQ

RD RR2B057TF 770 0 0
CTTATACTATTAACACACAAAAAAAATACAAAGTAATAGAATGGTTGTGAAAGTATACGG
ACAGGTTACTGCAGCTTGTCCGCAGAGAGTCTTGCTTTGTCTTCTTGAGAAAGAAATTGA
ATTCGAGATTGTTCACATCGATCTCGATACATTAGAGCAGAAAAGACCAGAACACCTTCT
TCGTCAGGTAAACGTTTCATGTTTTATTTTTCTTCTAAAATATAAACAAACCATTAGTTT
GATTTACTAATGTTTTCTTGCGGCCATTTGGTCAAGTTCCAGCCATAGAAGATGGAGACC
TCAAGCTTTTTGGTTAAGGATCCTAATAACAAATTTTAAAAACATTTATTTAAGACTTGG
TTTATAATCATTATTGTAATGTGTTTTGATATTTTGCGTGTTTTAACCAAAGAATCTCGA
GCCATTGCGAGATACTACGCGACCAAGTACGCGGACCAAGGCACGAACCTTTTGGGAAAG
TCTCTAGAGCACCGAGCCATCGTGGACCAGTGGGCTGGTGTTGAGGTGGGTTACTTCAAC
GTGCTCGTACACCCTTTAGCGATGAACCTAGTCATCAAGCCAAGGCTAGGCGAAGAATGT
GACGCCGTTTTGGTCGAGGAGCTCAAGGTGAAGCTCGGGGTGGTCTTGGACATATACGAC
AACCAGCTTGCTTCGAACCGGTTTTTGGCTGGTGATGAATTCACCATGGCTGATTTAACG
CACATGCCGGTGATGAGGTACTTGATGGGTACCGGTCTAAACCGGATTGT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2B057JQ 680 0 0
TTTATTTAAGACTTGGTTTATAATCATTATTGTAATGTGTTTTGATATTTTGCGTGTTTT
AACCAAAGAATCTCGAGCCATTGCGAGATACTACGCGACCAAGTACGCGGACCAAGGCAC
GAACCTTTTGGGAAAGTCTCTAGAGCACCGAGCCATCGTGGACCAGTGGGCTGGTGTTGA
GGTGGGTTACTTCAACGTGCTCGTACACCCTTTAGCGATGAACCTAGTCATCAAGCCAAG
GCTAGGCGAAGAATGTGACGCCGTTTTGGTCGAGGAGCTCAAGGTGAAGCTCGGGGTGGT
CTTGGACATATACGACAACCAGCTTGCTTCGAACCGGTTTTTGGCTGGTGATGAATTCAC
CATGGCTGATTTAACGCACATGCCGGTGATGAGGTACTTGATGGGTACCGGTCTAAACCG
GATTGTTAAGGCTCGGGTGAATATGAACCGGTGGTGGGAAGAGATTACGGCTAGACCGGC
TTGGAAGAAGCTTATGAATATTGCTGGTCTCTGAATTATAGCTCAAATTTATATGATGAT
ATATATACTAACAAAATAATCTTCATATTTTCTGTTTCTTTTGTTTGTCTGGTTAAATCA
ATTTACTTTTGAAGATTTTAATTTGTCAACTGGATTGGTGTTTTTCATATACGAAATGTT
CTATATTGATATAATAAAAG

QA 1 680 1 680
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7231Contig1 660 2 1 U
GGACGGCGGAATCAATCGATGATCTCTTGTCTGACGGAATCAGCCGGTGTCTCTCTCGGT
GGAATTTTCGTCAGTCGCTTCTCTCTCGGTCTCTGACGACTCTGCGTGGAGGTCCCTTCT
CTCAAAGCAGTCCTTCTTCTTCTTCTTCCCTCTATCCGAGTCAAAGCGGCCATTGGAGGT
CCCGAAGAACCATTTTAAGCTCTGCTTGTGAAGAACATGGAAACAAAAGATGATCTTTGT
CAGAACCATTGGGGAAGCGCTTCCATTTTGAATTACGAGATAGCTATGTAGGAGGAGGAG
CCTAATTTGCAAGTTTTCAAAGCTTCTTCTTCGGGCCAAGACAACAACACCAACAACAAC
GTATCACGTCGACGGAAACACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCTTCTGGAGAAGCAGAGGT
TGTTCCAGAGCATCCAGAGGCACACCTACTTGAAGGGACCAATGGGCAAGGTCACCTCCG
TTGCCATTCCTCTTGCCTTGGCTGCATTTTCCCTCTACATGATTGTAAGTTTATATCTGT
TTCATTTCCTTGTTTGATGTTTCTAGTTTTCTCCATTCCCCTCTTGTATAGATTTTGTTG
TAAATAGGCTGTAAAGGTCGAAGTCTTTGTTGTATAACAACAAAAAACACTATTGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D907TF U 1
AF RR2D907JQ C 140
BS 1 660 RR2D907TF

RD RR2D907TF 660 0 0
GGACGGCGGAATCAATCGATGATCTCTTGTCTGACGGAATCAGCCGGTGTCTCTCTCGGT
GGAATTTTCGTCAGTCGCTTCTCTCTCGGTCTCTGACGACTCTGCGTGGAGGTCCCTTCT
CTCAAAGCAGTCCTTCTTCTTCTTCTTCCCTCTATCCGAGTCAAAGCGGCCATTGGAGGT
CCCGAAGAACCATTTTAAGCTCTGCTTGTGAAGAACATGGAAACAAAAGATGATCTTTGT
CAGAACCATTGGGGAAGCGCTTCCATTTTGAATTACGAGATAGCTATGTAGGAGGAGGAG
CCTAATTTGCAAGTTTTCAAAGCTTCTTCTTCGGGCCAAGACAACAACACCAACAACAAC
GTATCACGTCGACGGAAACACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCTTCTGGAGAAGCAGAGGT
TGTTCCAGAGCATCCAGAGGCACACCTACTTGAAGGGACCAATGGGCAAGGTCACCTCCG
TTGCCATTCCTCTTGCCTTGGCTGCATTTTCCCTCTACATGATTGTAAGTTTATATCTGT
TTCATTTCCTTGTTTGATGTTTCTAGTTTTCTCCATTCCCCTCTTGTATAGATTTTGTTG
TAAATAGGCTGTAAAGGTCGAAGTCTTTGTTGTATAACAACAAAAAACACTATTGTTCCC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2D907JQ 521 0 0
TTCTTCTTCCCTCTATCCGAGTCAAAGCGGCCATTGGAGGTCCCGAAGAACCATTTTAAG
CTCTGCTTGTGAAGAACATGGAAACAAAAGATGATCTTTGTCAGAACCATTGGGGAAGCG
CTTCCATTTTGAATTACGAGATAGCTATGTAGGAGGAGGAGCCTAATTTGCAAGTTTTCA
AAGCTTCTTCTTCGGGCCAAGACAACAACACCAACAACAACGTATCACGTCGACGGAAAC
ACCATTTAGGCCAAGAGAGAAGCTTCTGGAGAAGCAGAGGTTGTTCCAGAGCATCCAGAG
GCACACCTACTTGAAGGGACCAATGGGCAAGGTCACCTCCGTTGCCATTCCTCTTGCCTT
GGCTGCATTTTCCCTCTACATGATTGTAAGTTTATATCTGTTTCATTTCCTTGTTTGATG
TTTCTAGTTTTCTCCATTCCCCTCTTGTATAGATTTTGTTGTAAATAGGCTGTAAAGGTC
GAAGTCTTTGTTGTATAACAACAAAAAACACTATTGTTCCC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 2

CO CL7232Contig1 812 2 2 U
GCGAGACTCAGCTCCACGACGACCCCAAAGCGGCTCTCTTCTTCTTGGAGAAGGACATGG
TTCCCGGAAAAGCTATGAGCCTTAGGTTTAATGCGGAGGACGGTTACGATGGTAAAACGG
CCTTCTTGCCGCGTGGGGAGGCGGATACGGTGCCGTTTGAGTCGGAGAAGTTCTCTGAGA
TCTTGAGTATTTTCTCGGTGAAGCTAGGTTCGGGAGAAGCTGAGATGATGAAGAAGACTA
TTGAGGAGTGTGAAGCGAAAAGAGTTGGTGGAGAGGAGAAGTATTGTGCGACTTCTTTGG
AGTCAATGGTCGATTTTAGCGTTTCTAAACTTGGCAACTATCACGTCCGTGCTGTTTCCA
CTGAGGTGGCTGAGAAGAATGCACCGATGCAGAAGTACAAAATAGCGGCAGCCGGGATAA
AGAAATTGTCGGACGACAAGTCAGTGGTGTGCCACAAACAGAAGTACCCATTCGCGGTGT
TCTACTGCCACAAGGCCATGATGACGAGCGTTTATGCTGTTCCGCTCGAAGGAGAGAACG
GGCTAAGGGCTAAAGCGGTTGCGGTATGCCACAAGAACACCTCGGCTTGGAACCCAAACC
ACATGGCCTTCAAAGTGCTTAAGGTGAAGCCTGGGACTGTTCCGGTCTGCCATTTCCTCC
CTGAGACCCATGTTGTTTGGTTCAGCTATTAGATAGATAGCTTTCATATATTGTGGGTTA
TGTAATATATAATAATGTTTGACACACTCTTTATCTTTTGCTTTGTTTTGATTATGAATA
TACATATACGCATAGTAATGCGTGGCTTCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA84TF U 1
AF RR2HA84JQ C 125
BS 1 774 RR2HA84TF
BS 775 812 RR2HA84JQ

RD RR2HA84TF 774 0 0
GCGAGACTCAGCTCCACGACGACCCCAAAGCGGCTCTCTTCTTCTTGGAGAAGGACATGG
TTCCCGGAAAAGCTATGAGCCTTAGGTTTAATGCGGAGGACGGTTACGATGGTAAAACGG
CCTTCTTGCCGCGTGGGGAGGCGGATACGGTGCCGTTTGAGTCGGAGAAGTTCTCTGAGA
TCTTGAGTATTTTCTCGGTGAAGCTAGGTTCGGGAGAAGCTGAGATGATGAAGAAGACTA
TTGAGGAGTGTGAAGCGAAAAGAGTTGGTGGAGAGGAGAAGTATTGTGCGACTTCTTTGG
AGTCAATGGTCGATTTTAGCGTTTCTAAACTTGGCAACTATCACGTCCGTGCTGTTTCCA
CTGAGGTGGCTGAGAAGAATGCACCGATGCAGAAGTACAAAATAGCGGCAGCCGGGATAA
AGAAATTGTCGGACGACAAGTCAGTGGTGTGCCACAAACAGAAGTACCCATTCGCGGTGT
TCTACTGCCACAAGGCCATGATGACGAGCGTTTATGCTGTTCCGCTCGAAGGAGAGAACG
GGCTAAGGGCTAAAGCGGTTGCGGTATGCCACAAGAACACCTCGGCTTGGAACCCAAACC
ACATGGCCTTCAAAGTGCTTAAGGTGAAGCCTGGGACTGTTCCGGTCTGCCATTTCCTCC
CTGAGACCCATGTTGTTTGGTTCAGCTATTAGATAGATAGCTTTCATATATTGTGGGTTA
TGTAATATATAATAATGTTTGACACACTCTTTATCTTTTGCTTTGTTTTGATTA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2HA84JQ 688 0 0
CTTGCCGCGTGGGGAGGCGGATACGGTGCCGTTTGAGTCGGAGAAGTTCTCTGAGATCTT
GAGTATTTTCTCGGTGAAGCTAGGTTCGGGAGAAGCTGAGATGATGAAGAAGACTATTGA
GGAGTGTGAAGCGAAAAGAGTTGGTGGAGAGGAGAAGTATTGTGCGACTTCTTTGGAGTC
AATGGTCGATTTTAGCGTTTCTAAACTTGGCAACTATCACGTCCGTGCTGTTTCCACTGA
GGTGGCTGAGAAGAATGCACCGATGCAGAAGTACAAAATAGCGGCAGCCGGGATAAAGAA
ATTGTCGGACGACAAGTCAGTGGTGTGCCACAAACAGAAGTACCCATTCGCGGTGTTCTA
CTGCCACAAGGCCATGATGACGAGCGTTTATGCTGTTCCGCTCGAAGGAGAGAACGGGCT
AAGGGCTAAAGCGGTTGCGGTATGCCACAAGAACACCTCGGCTTGGAACCCAAACCACAT
GGCCTTCAAAGTGCTTAAGGTGAAGCCTGGGACTGTTCCGGTCTGCCATTTCCTCCCTGA
GACCCATGTTGTTTGGTTCAGCTATTAGATAGATAGCTTTCATATATTGTGGGTTATGTA
ATATATAATAATGTTTGACACACTCTTTATCTTTTGCTTTGTTTTGATTATGAATATACA
TATACGCATAGTAATGCGTGGCTTCCAC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL7233Contig1 814 2 2 U
CCATTTCGGACAAAGCTCCGGCGCAAGGAAAAATGGACGGGTTCGGGTCTAATTCGAGGA
CACTCGCCGTTGACCAATGGATGGAGATAGTTAACGGTAAGGGATACGGCGCTGGTAGAG
CAACTCAGTTTCACTCGACCAAGTCCAGCACGTCCGATTTTAAGCTTTCTATCTCACCTC
CGCCGGGAGCAGTTCCGACAACAACTACGAGTGCTCATGTTCATGTCCCCTGGAGTTTCA
TCACCCCGGAAACGAAGAGAAAGAAGAGAATCGCGACGTACAAAGCTTACGCTATGGAAG
ATAAAGTTAAAACCGCGGTTAAAAAAGGGTTTCACTGGATCAAGAACAGGTGCTCCCAGA
TTATACATTAATAAAATATTATTCTTTTTTTTTGTATCATTCCCTGCGGATCGTGCCTTG
GGCTCAGTCGCCTGCGATAATCTTCGGCGACTCATTTATTTGGTGTAAAACGTAAGACAC
GTTGTTGCTGTTGTTGTGCATGAGTATATGATTAGTCAGCAATGATTCAGGTCAAACACA
GTCCATGTTTGTGGCCCGAACAATTCTGTTTACATCTTATTTAAGCCCAAATACTACTTA
AATTAGCCCATAAAGTTAATGGGCATCTGAAATTGTATTTTATTAACAAAGGGACAAAGC
ATCTTCTACGCACGATCATAGCTTAGCACGTGAAGCCACGTCTTCTCTTTATTCACTTTA
CCCAAATAGCCTTTACTTGTTTACTGTTTTGCCCCGCTGGTTTGGTTAACTAGTTGATTA
TTTCCTTTATTAATCAACGTGTGGGTTAAATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B908TF U 1
AF RR2B908JQ C 57
BS 1 806 RR2B908TF
BS 807 814 RR2B908JQ

RD RR2B908TF 813 0 0
CCATTTCGGACAAAGCTCCGGCGCAAGGAAAAATGGACGGGTTCGGGTCTAATTCGAGGA
CACTCGCCGTTGACCAATGGATGGAGATAGTTAACGGTAAGGGATACGGCGCTGGTAGAG
CAACTCAGTTTCACTCGACCAAGTCCAGCACGTCCGATTTTAAGCTTTCTATCTCACCTC
CGCCGGGAGCAGTTCCGACAACAACTACGAGTGCTCATGTTCATGTCCCCTGGAGTTTCA
TCACCCCGGAAACGAAGAGAAAGAAGAGAATCGCGACGTACAAAGCTTACGCTATGGAAG
ATAAAGTTAAAACCGCGGTTAAAAAAGGGTTTCACTGGATCAAGAACAGGTGCTCCCAGA
TTATACATTAATAAAATATTATTCTTTTTTTTTGTATCATTCCCTGCGGATCGTGCCTTG
GGCTCAGTCGCCTGCGATAATCTTCGGCGACTCATTTATTTGGTGTAAAACGTAAGACAC
GTTGTTGCTGTTGTTGTGCATGAGTATATGATTAGTCAGCAATGATTCAGGTCAAACACA
GTCCATGTTTGTGGCCCGAACAATTCTGTTTACATCTTATTTAAGCCCAAATACTACTTA
AATTAGCCCATAAAGTTAATGGGCATCTGAAATTGTATTTTATTAACAAAGGGACAAAGC
ATCTTCTACGCACGATCATAGCTTAGCACGTGAAGCCACGTCTTCTCTTTATTCACTTTA
CCCAAATAGCCTTTACTTGTTTACTGTTTTGCCCCGCTGGTTTGGTTAACTAGTTGATTA
TTTCCTTTATTAATCAACGTGTGGGT
AAATCAC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RR2B908JQ 758 0 0
AGGACACTCGCCGTTGACCAATGGATGGAGATAGTTAACGGTAAGGGATACGGCGCTGGT
AGAGCAACTCAGTTTCACTCGACCAAGTCCAGCACGTCCGATTTTAAGCTTTCTATCTCA
CCTCCGCCGGGAGCAGTTCCGACAACAACTACGAGTGCTCATGTTCATGTCCCCTGGAGT
TTCATCACCCCGGAAACGAAGAGAAAGAAGAGAATCGCGACGTACAAAGCTTACGCTATG
GAAGATAAAGTTAAAACCGCGGTTAAAAAAGGGTTTCACTGGATCAAGAACAGGTGCTCC
CAGATTATACATTAATAAAATATTATTCTTTTTTTTTGTATCATTCCCTGCGGATCGTGC
CTTGGGCTCAGTCGCCTGCGATAATCTTCGGCGACTCATTTATTTGGTGTAAAACGTAAG
ACACGTTGTTGCTGTTGTTGTGCATGAGTATATGATTAGTCAGCAATGATTCAGGTCAAA
CACAGTCCATGTTTGTGGCCCGAACAATTCTGTTTACATCTTATTTAAGCCCAAATACTA
CTTAAATTAGCCCATAAAGTTAATGGGCATCTGAAATTGTATTTTATTAACAA*GGGACA
AAGCATCTTCTACGCACGATCATAGCTTAGCACGTGAAGCCACGTCTTCTCTTTATTCAC
TTTACCCAAATAGCCTTTACTTGTTTACTGTTTTGCCCCGCTGGTTTGGTTAACTAGTTG
ATTATTTCCTTTATTAATCAACGTGTGGGTTAAATCAC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL7234Contig1 688 2 3 U
CATACGAATAGAAAACACGATTAAGCTGTTTTTAATTAATGCCGAGGAGAGCCTTAAATC
AAAAAAAATTCCAGAATTTATTTGATTACTTTTTCTACAATTACATTCTTCTCATTGCTA
GTTACTGTATCTGTTAAACACGTTTTAGACTATTAGAACAAAGCTTCTTTTTTTTTCTGT
CTATTTGCTCGTTTGATTCACATTCACTAGTTAACTATGAATCAGACGATGCAAACGACA
ATATCAAATATCTGTTCATTGATTTGCTTTATGGACTAAAAAAGGTCACAAACCATGGGA
CGAGTCCCACTAATACACTCTTCACTACAGAATTGTCAAAAACTATCAAGAAAATCGAAC
ACCTGCTTTGAAGTTTGCTACTCTGAACAGTGATACTCCCTCTCACATGTTAAATTACCA
AAAAAAATGAGGAGTTTTAAAAAGTTAGTTCCAAAGCTTTTGATGTCAATCAAGCAAAAG
TTCCAGGAACATCCTCACTAGGTGGCTGCGTTGGTCTTTTAGCTCGTGGTGGTGGCTGTG
GCTTTGGTGGTGGTGGTGGTGGTCTTTTTGGTTTCACCTTATCGACTTCCTCAGATCCAA
CTTCAAACTTGTAACCACAGCCTGCGACACACGCGTGAAAGCATTCCTCAGAGTAGCTGG
CAGCTCCAGGAGAACGATCTATATATAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY29JQ U 2
AF RR2BY29TF C 1
BS 1 2 RR2BY29TF
BS 3 547 RR2BY29JQ
BS 548 688 RR2BY29TF

RD RR2BY29JQ 546 0 0
C
TACGAATAGAAAACACGATTAAGCTGTTTTTAATTAATGCCGAGGAGAGCCTTAAATCAA
AAAAAATTCCAGAATTTATTTGATTACTTTTTCTACAATTACATTCTTCTCATTGCTAGT
TACTGTATCTGTTAAACACGTTTTAGACTATTAGAACAAAGCTTCTTTTTTTTTCTGTCT
ATTTGCTCGTTTGATTCACATTCACTAGTTAACTATGAATCAGACGATGCAAACGACAAT
ATCAAATATCTGTTCATTGATTTGCTTTATGGACTAAAAAAGGTCACAAACCATGGGACG
AGTCCCACTAATACACTCTTCACTACAGAATTGTCAAAAACTATCAAGAAAATCGAACAC
CTGCTTTGAAGTTTGCTACTCTGAACAGTGATACTCCCTCTCACATGTTAAATTACCAAA
AAAAATGAGGAGTTTTAAAAAGTTAGTTCCAAAGCTTTTGATGTCAATCAAGCAAAAGTT
CCAGGAACATCCTCACTAGGTGGCTGCGTTGGTCTTTTAGCTCGTGGTGGTGGCTGTGGC
TTTGG

QA 2 546 2 546
DS 

RD RR2BY29TF 688 0 0
CATACGAATAGAAAACACGATTAAGCTGTTTT*AATTAATGCCGAGGAGAGCCTTAAATC
AGAAGAAATTCCAGAATTTATTTGATTACTTTTTCTACAATTACATTCTTCTCATTGCTA
GTTACTGTATCTGTTAAACACGTTTTAGACTATTAGAACAAAGCTTCTTTTTTTTTCTGT
CTATTTGCTCGTTTGATTCACATTCACTAGTTAACTATGAATCAGACGATGCAAACGACA
ATATCAAATATCTGTTCATTGATTTGCTTTATGGACTAAAAAAGGTCACAAACCATGGGA
CGAGTCCCACTAATACACTCTTCACTACAGAATTGTCAAAAACTATCAAGAAAATCGAAC
ACCTGCTTTGAAGTTTGCTACTCTGAACAGTGATACTCCCTCTCACATGTTAGATTACCA
AAAAAAATGAGGAGTTTTAAGAAGTTAGTTCCAAAGCTTTTGATGTCAATCAAGCAGAAG
TTCCAGGAACATCCTCACTAGGTGGCTGCGTTGGTCTTTTAGCTCGTGGTGGTGGCTGTG
GCTTTGGTGGTGGTGGTGGTGGTCTTTTTGGTTTCACCTTATCGACTTCCTCAGATCCAA
CTTCAAACTTGTAACCACAGCCTGCGACACACGCGTGAAAGCATTCCTCAGAGTAGCTGG
CAGCTCCAGGAGAACGATCTATATATAC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL7235Contig1 777 2 1 U
GGGTAACTCCATACTTCCTCATCTTATTTTGCAACTTAGTCCAAAAAGGGAACACGATGA
GCCAACACACGAACCTGTTGCTTCCTTCATTTGAAACAGACCAAGATGAAGAAGTTGAAC
GCAAAACCGAGACGCAGACGCTAAACGGTGGTGGTAATGCCTGGAGGTTCAAAGGAAACA
GGGCGGCCAAAGAAGCGGCAAGTGTCTCAATTAAAGGTGTCCTTTCCAGGTTATTTGACA
ACTGTAGAAAAGACGTAGAAAGGACCATTTTGCCCCTGGGCCACGGTGATCCGTCCGTCT
ACTCTTGCTTCAAGACTTCCGTTGATGCTGAGGATGCCGTTACTGAGTCCCTTCGATCTG
GTGCCGCCAACTCCTACGCCCCAGGGGTTGGTATTTTACCGGCCAGGAGGGCGGTGGCAA
ATTATTTGAACCGAGACCTTCCGCATAAACTAAAATCAGACGATATATTTATGACGGTCG
GGTGCTGCCAAGGGATAGAGACCATAATTCATGTTCTGTCCTGTCCCAAGTCGAATATCT
TGCTCCCCAGTCTTGTCTATCCTCTCTACTATAGTCGCGCTATATATAGCCAAGTCGAGA
TTCGCAAGTATGATCTCCTCCCTGACCAAGCTGGGAGATAGATCTCCAAAGCATTGAAAC
CATTGCAGATGATAATACAATCGCTATAGTGATATCTAACCCTCACAACCATGTGGAAAT
GTGTACACGTATCATCATCTAAAGAGTGGCTGAGATGGCGAGAGCTAGGGATAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED83TF U 141
AF RR2ED71TF U 1
BS 1 777 RR2ED71TF

RD RR2ED83TF 330 0 0
CTAAACGGTGGTGGTAATGCCTGGAGGTTCAAAGGAAACAGGGCGGCCAAAGAAGCGGCA
AGTGTCTCAATTAAAGGTGTCCTTTCCAGGTTATTTGACAACTGTAGAAAAGACGTAGAA
AGGACCATTTTGCCCCTGGGCCACGGTGATCCGTCCGTCTACTCTTGCTTCAAGACTTCC
GTTGATGCTGAGGATGCCGTTACTGAGTCCCTTCGATCTGGTGCCGCCAACTCCTACGCC
CCAGGGGTTGGTATTTTACCGGCCAGGAGGGCGGTGGCAAATTATTTGAACCGAGACCTT
CCGCATAAACTAAAATCAGACGATATATTT

QA 1 330 1 330
DS 

RD RR2ED71TF 777 0 0
GGGTAACTCCATACTTCCTCATCTTATTTTGCAACTTAGTCCAAAAAGGGAACACGATGA
GCCAACACACGAACCTGTTGCTTCCTTCATTTGAAACAGACCAAGATGAAGAAGTTGAAC
GCAAAACCGAGACGCAGACGCTAAACGGTGGTGGTAATGCCTGGAGGTTCAAAGGAAACA
GGGCGGCCAAAGAAGCGGCAAGTGTCTCAATTAAAGGTGTCCTTTCCAGGTTATTTGACA
ACTGTAGAAAAGACGTAGAAAGGACCATTTTGCCCCTGGGCCACGGTGATCCGTCCGTCT
ACTCTTGCTTCAAGACTTCCGTTGATGCTGAGGATGCCGTTACTGAGTCCCTTCGATCTG
GTGCCGCCAACTCCTACGCCCCAGGGGTTGGTATTTTACCGGCCAGGAGGGCGGTGGCAA
ATTATTTGAACCGAGACCTTCCGCATAAACTAAAATCAGACGATATATTTATGACGGTCG
GGTGCTGCCAAGGGATAGAGACCATAATTCATGTTCTGTCCTGTCCCAAGTCGAATATCT
TGCTCCCCAGTCTTGTCTATCCTCTCTACTATAGTCGCGCTATATATAGCCAAGTCGAGA
TTCGCAAGTATGATCTCCTCCCTGACCAAGCTGGGAGATAGATCTCCAAAGCATTGAAAC
CATTGCAGATGATAATACAATCGCTATAGTGATATCTAACCCTCACAACCATGTGGAAAT
GTGTACACGTATCATCATCTAAAGAGTGGCTGAGATGGCGAGAGCTAGGGATAATGG

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL7236Contig1 967 2 4 U
GTCCTCTCCATATTTACCGACAAGCCCTCGGGCTTATCTACCTGTTCTCGCTTCTTCTGT
AACAAATAATCTACTAAACATTGGTTCTCTCGACACACTACCCTTCTCTCATCATCCATC
ACTACCCACTTCCGAAGAGTTTTAAATTTTTAATCTATCAGAAGATCATCAAACCCCCTC
GTTTGTTTTAGCGCATATGCTCTCTCAAAGGCTTTACCTTTTTGTTCCCGCTTTTAGCCC
TTCTCTTGAGAATTTCAAATATTGAGGGTCAATGACGTCATGACGTGACGAGTCAGTGGC
CTCCGTCTGATACAGAGACTTTTGCTTGTTTGGTTATGAATTGTCACATCCTAGATAGAA
CCTTCTTAACTCCTAGACTACTATGCAATACGATGTGACCTAGTTATTATTTTACTTTCG
TATTATAATGGGAACCAATCACATTATTCAACACTTGAAGATTACCGTTCCCCTGTTTTT
TTTTTAATATGTAAATATAGTTAATTACAAGTTCAAAAAAGTATGAAGTTAATTATTTTC
AAAAGTTGTTATAATTTTTCATGATTATATAAATTACAACCAGTCAACCACATAATATAA
CATATGATAGTTAAGTTACCACAATCCTCAAATTCAGCAAAAAAGAAGAAGATAGAAATA
CAGAGTCTACTTGTTTATTTTTAATGAAATCTCACTAAATAAAATTTATCTTTTGCAACC
AAATTTCCTCAATTTGATAGCAAAACAACCATAAGAATAAATAAATCAAAGACTCAAAAA
GGCCACAACCTGTGACCTGAAGAGGAAGCAATTCAAAATCTAACCTCGGCCCACCAAATT
CAGACATGCAAACAGATGATGAAAATAAAGGTAAAAAAATTTGGAGGAAAATCAAAAGGG
AGAGAAAACTGCTCTGGTTGTTTTTTTTTTTCTAAAACAAGCCATGAAAAAATGTTATAT
TTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI55TF U 1
AF RR2DI55JQ C 486
BS 1 744 RR2DI55TF
BS 745 745 RR2DI55JQ
BS 746 765 RR2DI55TF
BS 766 967 RR2DI55JQ

RD RR2DI55TF 765 0 0
GTCCTCTCCATATTTACCGACAAGCCCTCGGGCTTATCTACCTGTTCTCGCTTCTTCTGT
AACAAATAATCTACTAAACATTGGTTCTCTCGACACACTACCCTTCTCTCATCATCCATC
ACTACCCACTTCCGAAGAGTTTTAAATTTTTAATCTATCAGAAGATCATCAAACCCCCTC
GTTTGTTTTAGCGCATATGCTCTCTCAAAGGCTTTACCTTTTTGTTCCCGCTTTTAGCCC
TTCTCTTGAGAATTTCAAATATTGAGGGTCAATGACGTCATGACGTGACGAGTCAGTGGC
CTCCGTCTGATACAGAGACTTTTGCTTGTTTGGTTATGAATTGTCACATCCTAGATAGAA
CCTTCTTAACTCCTAGACTACTATGCAATACGATGTGACCTAGTTATTATTTTACTTTCG
TATTATAATGGGAACCAATCACATTATTCAACACTTGAAGATTACCGTTCCCCTGTTTTT
TTTTTAATATGTAAATATAGTTAATTACAAGTTCAAAAAAGTATGAAGTTAATTATTTTC
AAAAGTTGTTATAATTTTTCATGATTATATAAATTACAACCAGTCAACCACATAATATAA
CATATGATAGTTAAGTTACCACAATCCTCAAATTCAGCAAAAAAGAAGAAGATAGAAATA
CAGAGTCTACTTGTTTATTTTTAATGAAATCTCACTAAATAAAATTTATCTTTTGCAACC
AAATTTCCTCAATTTGATAGCAAA*CAACCATAAGAATAAATAAA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2DI55JQ 482 0 0
AATATGTAAATATAGTTAATTACAAGTTCAAAAAAGTATGAAGTTAATTATTTTCAAAAG
TTGTTATAATTTTTCATGATTATATAAATTACAACCAGTCAACCACATAATATAACATAT
GATAGTTAAGTTACCACAATCCTCAAATTCAGCAAAAAAGAAGAAGATAGAAATACAGAG
TCTACTTGTTTATTTTTAATGAAATCTCACTAAATAAAATTTATCTTTTGCAACCAAATT
TCCTCAATTTGATAGCAAAACAACCATAAGAATAAATAAATCAAAGACTCAAAAAGGCCA
CAACCTGTGACCTGAAGAGGAAGCAATTCAAAATCTAACCTCGGCCCACCAAATTCAGAC
ATGCAAACAGATGATGAAAATAAAGGTAAAAAAATTTGGAGGAAAATCAAAAGGGAGAGA
AAACTGCTCTGGTTGTTTTTTTTTTTCTAAAACAAGCCATGAAAAAATGTTATATTTTGC
CC

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL7237Contig1 1082 2 2 U
GGGGAGAGTTGCTATTGATATCGATTTTATGATGTAGAGTATAAGGAGGAACAAGAGATG
GAGATTGAAGCTCTTGAATCTATACTTGCTCATGACTTCAAAGAGATTCATTCTAGTGAA
AGTGGGCTTAACACTTCCAACCCATGCTTTCAGATAACAGTCACTCCTCAGGATGATGAT
CTGGAGGAGTCATCAATCCCACCAGTTCAGCTGGGTTTGGTTTTCTCTCACACAGACAGT
TATCCTGATGAGGTTCCACTTTTGGATGTTAAAAGTATTCGAGGAATCCATGTTACTGAT
CTCACCATCTTGAAAGACAAGCTTGAACAAGAGGCAACAGAAAATCTTGGAATGGCCATG
ATGTATACATTGGTCTCATCAGCAAAGGACTGGTTGTCCGAGCACTATGGGCAAGATGAT
GGATCTGACTATGCCGAAGAAGAAACTGCCAAAGAGGATGAGGTAATTATTCCACATGGA
GAACCAGTTACGCTGGAGACATTTGTGGCATGGAGAGAGAGATATGAGGCAGAGCTTGCA
CTTGAGCGAGCCAAGCTGATGCCGGAGTCTGCTCTCACGGCACCTAAGGAGAAGAAGCTT
ACAGGAAGACAGTGGTTTGAGAGTGGCAAAGCGAGAGGAACAGTGGTCGCTGCTGATCAA
GAATCTGAGGAGGAGGAAGATGATGAAGAAATTGACTTTGAAGACGAAGACTTTGAAGAT
GATGAAGAAGACATGCTTGAGCACTACTTGGCGGAGAAATCTGATGCAAGGGCCTGAAGC
TAGGGAGCTTTACATAATGGATTTTTTTTAAAAGCCTTTTTCTGGATAGAGATGAGGATG
ACCATTTCTGGATAGAGATGAGGATGACCTTTCATTGAGCAGCATTCAATTCCAAGCTTT
GATATGCTCAAGAGTCAAGACTATACCTCAGAGAGTTGCATTTTATCTTATATATCCACC
TCCACAGTCTGTCATTTATATAAATGCCACTTAGATTTTGTAACTTTTTTTTTATGCTAG
TATCAGCACAAAGCAATTGTCTCAGATCAAATCTTAAAAGACTGAATAGTTGAATCTTAT
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2B162TF U 1
AF RR2B162JQ C 249
BS 1 768 RR2B162TF
BS 769 1082 RR2B162JQ

RD RR2B162TF 768 0 0
GGGGAGAGTTGCTATTGATATCGATTTTATGATGTAGAGTATAAGGAGGAACAAGAGATG
GAGATTGAAGCTCTTGAATCTATACTTGCTCATGACTTCAAAGAGATTCATTCTAGTGAA
AGTGGGCTTAACACTTCCAACCCATGCTTTCAGATAACAGTCACTCCTCAGGATGATGAT
CTGGAGGAGTCATCAATCCCACCAGTTCAGCTGGGTTTGGTTTTCTCTCACACAGACAGT
TATCCTGATGAGGTTCCACTTTTGGATGTTAAAAGTATTCGAGGAATCCATGTTACTGAT
CTCACCATCTTGAAAGACAAGCTTGAACAAGAGGCAACAGAAAATCTTGGAATGGCCATG
ATGTATACATTGGTCTCATCAGCAAAGGACTGGTTGTCCGAGCACTATGGGCAAGATGAT
GGATCTGACTATGCCGAAGAAGAAACTGCCAAAGAGGATGAGGTAATTATTCCACATGGA
GAACCAGTTACGCTGGAGACATTTGTGGCATGGAGAGAGAGATATGAGGCAGAGCTTGCA
CTTGAGCGAGCCAAGCTGATGCCGGAGTCTGCTCTCACGGCACCTAAGGAGAAGAAGCTT
ACAGGAAGACAGTGGTTTGAGAGTGGCAAAGCGAGAGGAACAGTGGTCGCTGCTGATCAA
GAATCTGAGGAGGAGGAAGATGATGAAGAAATTGACTTTGAAGACGAAGACTTTGAAGAT
GATGAAGAAGACATGCTTGAGCACTACTTGGCGGAGAAATCTGATGCA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2B162JQ 834 0 0
TGAGGTTCCACTTTTGGATGTTAAAAGTATTCGAGGAATCCATGTTACTGATCTCACCAT
CTTGAAAGACAAGCTTGAACAAGAGGCAACAGAAAATCTTGGAATGGCCATGATGTATAC
ATTGGTCTCATCAGCAAAGGACTGGTTGTCCGAGCACTATGGGCAAGATGATGGATCTGA
CTATGCCGAAGAAGAAACTGCCAAAGAGGATGAGGTAATTATTCCACATGGAGAACCAGT
TACGCTGGAGACATTTGTGGCATGGAGAGAGAGATATGAGGCAGAGCTTGCACTTGAGCG
AGCCAAGCTGATGCCGGAGTCTGCTCTCACGGCACCTAAGGAGAAGAAGCTTACAGGAAG
ACAGTGGTTTGAGAGTGGCAAAGCGAGAGGAACAGTGGTCGCTGCTGATCAAGAATCTGA
GGAGGAGGAAGATGATGAAGAAATTGACTTTGAAGACGAAGACTTTGAAGATGATGAAGA
AGACATGCTTGAGCACTACTTGGCGGAGAAATCTGATGCAAGGGCCTGAAGCTAGGGAGC
TTTACATAATGGATTTTTTTTAAAAGCCTTTTTCTGGATAGAGATGAGGATGACCATTTC
TGGATAGAGATGAGGATGACCTTTCATTGAGCAGCATTCAATTCCAAGCTTTGATATGCT
CAAGAGTCAAGACTATACCTCAGAGAGTTGCATTTTATCTTATATATCCACCTCCACAGT
CTGTCATTTATATAAATGCCACTTAGATTTTGTAACTTTTTTTTTATGCTAGTATCAGCA
CAAAGCAATTGTCTCAGATCAAATCTTAAAAGACTGAATAGTTGAATCTTATTT

QA 1 834 1 834
DS 



AS 1 2

CO CL7238Contig1 779 2 10 U
GGGTCTCTCTTAACAACTAACGGACTTCTCCTCCTTTGGTCTCGAGTTTCTGAGCGAAAC
CCTAAATTTACTTGAAAGGGCTCTCGCAAGTCTAGTATAGCTTGCAGGGAACTTTTAAGA
GGGAGACGAGATGAGATTGGTCAAGTGTTGGTTCTGCTCTTCTACGATATATCCAGGACA
TGGTATTCAGTTTGCCAACGATGCTAAGATTTTTAGGTTCTGTAGGTCTAAATGCCACAA
GAACTTCAAGATGAAGAGGAACCCTCGTAAAGTGAAGTGGACTAAAGCCTACAGAGCTGC
ACACGGAAAGGACATGACTCAGGATAAAACATTTGAGTTTGAGAAGAAGAGAAACAGACC
TGAGAGATATGATAGGAACGTTACAGAGGATACTCTCAAGGCCATTAAGAAGATTGATAA
GATCAGAAGTCCAAGAGAAGCTTATCACATCAATAAGAGGTTGAAGCCAAACAAACAGAA
GATATTTAAGAGTGAAGTCAAGGAGATAGATCAGCACATTAGTTTGATCATAGCACCAGG
TTCTCGCCAACAAGATTCAGAGAAGATGAAAGTTTCGGTCTCCACAAACAAGTCTGTTCA
GAACGAAGCCATGGAAGAGTGATTCTGTGGAAACTCTTCAAAAAATATCACTTCAGTCTG
ATGCTTATGTCGTCGCCCTTTCAAGAAAGAAGAGAGTTTTGGATTGTTTTTTATTTGCAA
TGTATTATTGTTTATTACCTGGAACGTCATTTTCATTTATTCCGATTTTGTGCTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR72TF U 1
AF RR2GR72JQ C 210
BS 1 430 RR2GR72TF
BS 431 431 RR2GR72JQ
BS 432 644 RR2GR72TF
BS 645 645 RR2GR72JQ
BS 646 683 RR2GR72TF
BS 684 686 RR2GR72JQ
BS 687 690 RR2GR72TF
BS 691 691 RR2GR72JQ
BS 692 731 RR2GR72TF
BS 732 779 RR2GR72JQ

RD RR2GR72TF 731 0 0
GGGTCTCTCTTAACAACTAACGGACTTCTCCTCCTTTGGTCTCGAGTTTCTGAGCGAAAC
CCTAAATTTACTTGAAAGGGCTCTCGCAAGTCTAGTATAGCTTGCAGGGAACTTTTAAGA
GGGAGACGAGATGAGATTGGTCAAGTGTTGGTTCTGCTCTTCTACGATATATCCAGGACA
TGGTATTCAGTTTGCCAACGATGCTAAGATTTTTAGGTTCTGTAGGTCTAAATGCCACAA
GAACTTCAAGATGAAGAGGAACCCTCGTAAAGTGAAGTGGACTAAAGCCTACAGAGCTGC
ACACGGAAAGGACATGACTCAGGATAAAACATTTGAGTTTGAGAAGAAGAGAAACAGACC
TGAGAGATATGATAGGAACGTTACAGAGGATACTCTCAAGGCCATTAAGAAGATTGATAA
GATCAGAAGTTCAAGAGAAGCTTATCACATCAATAAGAGGTTGAAGCCAAACAAACAGAA
GATATTTAAGAGTGAAGTCAAGGAGATAGATCAGCACATTAGTTTGATCATAGCACCAGG
TTCTCGCCAACAAGATTCAGAGAAGATGAAAGTTTCGGTCTCCACAAACAAGTCTGTTCA
GAACGAAGCCATGGAAGAGTGATTCTGTGGAAACTCTTCAAAAA*TATCACTTCAGTCTG
ATGCTTATGTCGTCGCCCTTTCAG**AAGA*GAGAGTTTTGGATTGTTTTTTATTTGCAA
TGTATTATTGT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2GR72JQ 570 0 0
TTTTTAGGTTCTGTAGGTCTAAATGCCACAAGAACTTCAAGATGAAGAGGAACCCTCGTA
AAGTGAAGTGGACTAAAGCCTACAGAGCTGCACACGGAAAGGACATGACTCAGGATAAAA
CATTTGAGTTTGAGAAGAAGAGAAACAGACCTGAGAGATATGATAGGAACGTTACAGAGG
ATACTTTCAAGGCCATTAAGAAGATTGATAAGATCAGAAGTCCAAGAGAAGCTTATCACA
TCAATAAGAGGTTGAAGCCAAACAAACAGAAGATATTTAAGAGTGAAGTCAAGGAGATAG
ATCAGCACATTAGTTTGATCATAGCACCAGGTTCTCGCCAACAAGATTCAGAGAAGATGA
AAGTTTCGGTCTCCACAAACAAGTCTGTTCAGAACGAAGCCATGGAAGAGTGATTCTGTG
GAAACTCTTCAAAAAATATCACTTCAGTTTGATGCTTATGTCGTCGCCCTTTCAAGAAAG
AAGAGAGTTTTGGATTGTTTTTTATTTGCAATGTATTATTGTTTATTACCTGGAACGTCA
TTTTCATTTATTCCGATTTTGTGCTTTGTT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL7239Contig1 1062 2 2 U
GAACAGTGTGATTTTGCTCGTTAGTCCATGTGGTTACTCTGATGCTGATGCTCCTACCGT
CCAAATTTGGGCGAGCAACGACATAAATAAGGAAGCACGGACATTGATGGGAAAGTGGGA
TGTACAGTCCTTTGTTAAATCTTCGCCTGAGCTTTACGGTCCAGAAAAGCCTGGTAGAGA
GGGTAGAGCACCTAGGCATATAAAATTTGCTTTCAAGAATCCTATCCGTTGCCGCATTAT
ATGGGTAACACTGCGTCTTCCTCGGCTTGGATCTAGCTCAGTTAGTTTGGACAGAAACGT
TAATCTCTTGTCTTTGGATGAGAACCCTTTTGCTCCACCAATCCCTCGGCGTGCTTCTTT
TGGAGTTACCATTGAGAGTGAACCATGTCTTCATGCAAAACGCATCTTGGTCAGCGGAAA
CAGTAGGAGGGACAAGGCACTTGCGTCATTACAAAGTGTTGACAGCATGAGCGTAAGAAA
CTGGCTGGACAGACCCCCACGTTTGAATATATTCCTGATACCACTGGAGGCTGAGAGACC
GATGGCTAATGATTTACTCCTGGAACTTTATCTGCAACCTGGTTCACCTTTAGCTTCTGG
ATTCCGTTTGGATGCTTTTAACGCCACCAAGCCTCGTGTTACCCACTCGCCTTCTTCAGA
TGTAGTTGACATTTGGGACCCCACGAGTATCATAATGGAAGATAGGCACGTCTCTCCAGC
CGTCTTGTATATACAAGTATCTGTTCTTCAGGAACAGTACAAGATGGTGACCATAGCGGA
ATACAGGTTGCCTGAGGCGAGAGTTGGAACACCGATGTATTTCGACTTCCCCAAGCAAGT
TCAAGCACGTAGAGTATCCTTTAAGCTGCTTGGAGATGTTGCAGCTTTTGTTGATGTTCC
TGCAGAGACTGATGATTTGAGCGGCAAGGCTTCTCCATTTGCTGCAGGGCTGTCTTTAGC
AAACAGGATCAAGTTGTATTACTATGCTGATCCTTACGAAGTAGGCAAATGGGCTAGCCT
TTCTGCTGTCTGATTTTTACTCTTTTCATTGGATGTAACTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ20TF U 1
AF RR2CZ20JQ C 518
BS 1 656 RR2CZ20TF
BS 657 1062 RR2CZ20JQ

RD RR2CZ20TF 656 0 0
GAACAGTGTGATTTTGCTCGTTAGTCCATGTGGTTACTCTGATGCTGATGCTCCTACCGT
CCAAATTTGGGCGAGCAACGACATAAATAAGGAAGCACGGACATTGATGGGAAAGTGGGA
TGTACAGTCCTTTGTTAAATCTTCGCCTGAGCTTTACGGTCCAGAAAAGCCTGGTAGAGA
GGGTAGAGCACCTAGGCATATAAAATTTGCTTTCAAGAATCCTATCCGTTGCCGCATTAT
ATGGGTAACACTGCGTCTTCCTCGGCTTGGATCTAGCTCAGTTAGTTTGGACAGAAACGT
TAATCTCTTGTCTTTGGATGAGAACCCTTTTGCTCCACCAATCCCTCGGCGTGCTTCTTT
TGGAGTTACCATTGAGAGTGAACCATGTCTTCATGCAAAACGCATCTTGGTCAGCGGAAA
CAGTAGGAGGGACAAGGCACTTGCGTCATTACAAAGTGTTGACAGCATGAGCGTAAGAAA
CTGGCTGGACAGACCCCCACGTTTGAATATATTCCTGATACCACTGGAGGCTGAGAGACC
GATGGCTAATGATTTACTCCTGGAACTTTATCTGCAACCTGGTTCACCTTTAGCTTCTGG
ATTCCGTTTGGATGCTTTTAACGCCACCAAGCCTCGTGTTACCCACTCGCCTTCTT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2CZ20JQ 545 0 0
ATACCACTGGAGGCTGAGAGACCGATGGCTAATGATTTACTCCTGGAACTTTATCTGCAA
CCTGGTTCACCTTTAGCTTCTGGATTCCGTTTGGATGCTTTTAACGCCACCAAGCCTCGT
GTTACCCACTCGCCTTCTTCAGATGTAGTTGACATTTGGGACCCCACGAGTATCATAATG
GAAGATAGGCACGTCTCTCCAGCCGTCTTGTATATACAAGTATCTGTTCTTCAGGAACAG
TACAAGATGGTGACCATAGCGGAATACAGGTTGCCTGAGGCGAGAGTTGGAACACCGATG
TATTTCGACTTCCCCAAGCAAGTTCAAGCACGTAGAGTATCCTTTAAGCTGCTTGGAGAT
GTTGCAGCTTTTGTTGATGTTCCTGCAGAGACTGATGATTTGAGCGGCAAGGCTTCTCCA
TTTGCTGCAGGGCTGTCTTTAGCAAACAGGATCAAGTTGTATTACTATGCTGATCCTTAC
GAAGTAGGCAAATGGGCTAGCCTTTCTGCTGTCTGATTTTTACTCTTTTCATTGGATGTA
ACTTG

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 2

CO CL7240Contig1 513 2 1 U
GGAAGGGGAAGAGAGAAGATGTCTCATACTGTGGTTCTAAAGGTGGCTATGCCGTGTGAG
GGATGCGTGGGAGCTGTGAAACGAGTCCTAGGCAAAATGCAAGGTGTGGAGTCATTTGAT
GTGGATCTGAAAGAGCAGAAGGTAACGGTGAAAGGCAACGTGGAGCCAGAAGCTGTCCTG
CAGACAGTCTCAAAGACAGGAAAGAAAACCAGTTTCTGGGGAGCCGACGAGGCTGAAACT
GCCAAGGCCTAAAACTGGAAGAATCAACAATAAAGCATCTCTGTTTTCAGCAGAGATCCC
CTACCCCCAAAAAATTATTTAAATAATCATATGTAATGGAAACTCAAATAAATATATAAT
CTCTGAAGGACCCTTTTGTTTTTCAAAGAAGAAACGTTTGTGTCTTGTAATCATCCTCTG
TTGTCTTTATTCTCGTGTGTTTATTTTGTCTAAAGTGTTTCCTCTAATTAACATTTGTCT
ACGCAAAGAGCATTTATAAAACCCTAGTAAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EL68JQ C 1
AF RR2EL68TF U 1
BS 1 513 RR2EL68TF

RD RR2EL68JQ 513 0 0
GGAAGGGGAAGAGAGAAGATGTCTCATACTGTGGTTCTAAAGGTGGCTATGCCGTGTGAG
GGATGCGTGGGAGCTGTGAAACGAGTCCTAGGCAAAATGCAAGGTGTGGAGTCATTTGAT
GTGGATCTGAAAGAGCAGAAGGTAACGGTGAAAGGCAACGTGGAGCCAGAAGCTGTCCTG
CAGACAGTCTCAAAGACAGGAAAGAAAACCAGTTTCTGGGGAGCCGACGAGGCTGAAACT
GCCAAGGCCTAAAACTGGAAGAATCAACAATAAAGCATCTCTGTTTTCAGCAGAGATCCC
CTACCCCCAAAAAATTATTTAAATAATCATATGTAATGGAAACTCAAATAAATATATAAT
CTCTGAAGGACCCTTTTGTTTTTCAAAGAAGAAACGTTTGTGTCTTGTAATCATCCTCTG
TTGTCTTTATTCTCGTGTGTTTATTTTGTCTAAAGTGTTTCCTCTAATTAACATTTGTCT
ACGCAAAGAGCATTTATAAAACCCTAGTAAACT

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2EL68TF 513 0 0
GGAAGGGGAAGAGAGAAGATGTCTCATACTGTGGTTCTAAAGGTGGCTATGCCGTGTGAG
GGATGCGTGGGAGCTGTGAAACGAGTCCTAGGCAAAATGCAAGGTGTGGAGTCATTTGAT
GTGGATCTGAAAGAGCAGAAGGTAACGGTGAAAGGCAACGTGGAGCCAGAAGCTGTCCTG
CAGACAGTCTCAAAGACAGGAAAGAAAACCAGTTTCTGGGGAGCCGACGAGGCTGAAACT
GCCAAGGCCTAAAACTGGAAGAATCAACAATAAAGCATCTCTGTTTTCAGCAGAGATCCC
CTACCCCCAAAAAATTATTTAAATAATCATATGTAATGGAAACTCAAATAAATATATAAT
CTCTGAAGGACCCTTTTGTTTTTCAAAGAAGAAACGTTTGTGTCTTGTAATCATCCTCTG
TTGTCTTTATTCTCGTGTGTTTATTTTGTCTAAAGTGTTTCCTCTAATTAACATTTGTCT
ACGCAAAGAGCATTTATAAAACCCTAGTAAACT

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 2

CO CL7241Contig1 735 2 10 U
AAGGCGATGCTTCGAGTGCTAGCTACTTCTTGGCTGGTGCTGCCATTACCGGTGAAACCG
TCACTGTTGAAGGCTGTGGAACAACTATTCTGCAGGGAGATGTGAAATTCGCAGAGGTTC
TTGAGAAAATGGGGTGTAAAGTGTCTTGGACAGACGACAGTGTGACTGTGACTGGACCAT
CAAGAGATGCTTTTGGAATGAGACACTTGCGTGCTGTTGACGTCAACATGAACAAAATGC
CTGATGTAGCCATGACTCTTGCAGTTGTTGCTCTCTTTGCTGATGGTCCAACCACCATTA
GAGATGTGGCTAGCTGGAGAGTTAAGGAGACAGAAAGGATGATTGCCATTTGCACTGAGC
TTCGAAAGCTTGGAGCTACAGCGGAAGAGGGTTCAGATTATTGTGTGATCACTCCACCAG
CAAAGGTGAAACCTGCGGAGATTGATACATATGATGATCATAGAATGGCAATGGCATTCT
CGCTTGCAGCTTGTGCTGATGTTCCAGTCACCATCAAGGATCCTGGTTGCACAAGAAAGA
CTTTCCCTGACTACTTCCAAGTCCTTGAAAGTATCACAAAGCACTAAAAAAAAGATCCAA
ATGTGAGATTGTGTTTGTTTCTTCCTCTCTGTTGCCACTGTAACATTTATTAGAAGAACA
AAGAGTATTATGATTGTTTGCTTGTACTGAAACTGATTGAGATGCAATCGTTGAATCAGT
TTTTTGGGCTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FG58JQ C 1
AF RR2A262TF U 184
BS 1 183 RR2FG58JQ
BS 184 381 RR2A262TF
BS 382 382 RR2FG58JQ
BS 383 481 RR2A262TF
BS 482 482 RR2FG58JQ
BS 483 508 RR2A262TF
BS 509 509 RR2FG58JQ
BS 510 592 RR2A262TF
BS 593 593 RR2FG58JQ
BS 594 735 RR2A262TF

RD RR2FG58JQ 717 0 0
AAGGCGATGCTTCGAGTGCTAGCTACTTCTTGGCTGGTGCTGCCATTACCGGTGAAACCG
TCACTGTTGAAGGCTGTGGAACAACTATTCTGCAGGGAGATGTGAAATTCGCAGAGGTTC
TTGAGAAAATGGGGTGTAAAGTGTCTTGGACAGACGACAGTGTGACTGTGACTGGACCAT
CAAGAGATGCTTTTGGAATGAGACACTTGCGTGCTGTTGACGTCAACATGAACAAAATGC
CTGATGTAGCCATGACTCTTGCAGTTGTTGCTCTCTTTGCTGATGGTCCAACCACCATTA
GAGATGTGGCTAGCTGGAGAGTTAAGGAGACAGAAAGGATGATTGCCATTTGCACTGAGC
TTCGAAAGCTTGGAGCTACAGCGGAAGAGGGTTCAGATTATTGTGTGATCACTCCACCAG
CAAAGGTGAAACCTGCGGAGATTGATACATATGATGATCATAGAATGGCAATGGCGTTCT
CGCTTGCAGCTTGTGCTGATGTTCCAGTCACCATCAAGGATCCTGGTTGCACAAGAAAGA
CTTTCCCTGACTACTTCCAAGTCCTTGAAAGTATCACAAAGCACTAAAAAAAAGATCCAA
ATGTGAGATTGTGTTTGTTTCTTCCTCTCTGTTGCCACTGTAACATTTATTAGAAGAACA
AAGAGTATTATGATTGTTTGCTTGTACTGAAACTGATTGAGATGCAATCGTTGAATC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RR2A262TF 552 0 0
GAGATGCTTTTGGAATGAGACACTTGCGTGCTGTTGACGTCAACATGAACAAAATGCCTG
ATGTAGCCATGACTCTTGCAGTTGTTGCTCTCTTTGCTGATGGTCCAACCACCATTAGAG
ATGTGGCTAGCTGGAGAGTTAAGGAGACAGAAAGGATGATTGCCATTTGCACTGAGCTTC
GAAAGCTTGGAGCTACAGTGGAAGAGGGTTCAGATTATTGTGTGATCACTCCACCAGCAA
AGGTGAAACCTGCGGAGATTGATACATATGATGATCATAGAATGGCAATGGCATTCTCTC
TTGCAGCTTGTGCTGATGTTCCAGTGACCATCAAGGATCCTGGTTGCACAAGAAAGACTT
TCCCTGACTACTTCCAAGTCCTTGAAAGTATCACAAAGCACTAAAAAAA*GATCCAAATG
TGAGATTGTGTTTGTTTCTTCCTCTCTGTTGCCACTGTAACATTTATTAGAAGAACAAAG
AGTATTATGATTGTTTGCTTGTACTGAAACTGATTGAGATGCAATCGTTGAATCAGTTTT
TTGGGCTTTATT

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL7242Contig1 513 2 1 U
GCCTCTCAAGTCTCTGGCCAGCAACATCTCCTTTGGAACGGAAGTCGAATTGCAGCTCGG
AAAACGTCTTCAGGCCTCTGTGGTAAGACAGATGAAAGATTCTGAGATGGCGATGCAATG
GACATTGATTTATAAGCTCACGAGCCGCTTGCGTGTCCTCCTTCAGTCTGCGCCTTCAAA
ACGGTTGCTTTTTGAATACTCTGCAACGTCACAAGACTAAAAAAGCTTGTGATCTTCCTC
TGTTTATGGATGGATGAAGCCGTTTGTGCAAAGGATGGGACTCTTCAAGGTTGTAGTGAC
TTTTGGTTATTAGCATTTGTTATTGACAAGAAAATTATTTTATTATTTGGTCAGCTTGTT
TCATTGTTTTAGCTTCTTCTGGTCTGTAAAAAATTACGTTGTAATGTTAATTGTTAGGGC
ATACAAAATTATGAAATATCCCAGTTTATTACTGAGACGAGGTTTACAAAACAGTGGAAA
TTCTTCTAAATGAATTTTCTAATTTATAGTGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CU27JQ C 1
AF RR2CU27TF U 1
BS 1 513 RR2CU27TF

RD RR2CU27JQ 513 0 0
GCCTCTCAAGTCTCTGGCCAGCAACATCTCCTTTGGAACGGAAGTCGAATTGCAGCTCGG
AAAACGTCTTCAGGCCTCTGTGGTAAGACAGATGAAAGATTCTGAGATGGCGATGCAATG
GACATTGATTTATAAGCTCACGAGCCGCTTGCGTGTCCTCCTTCAGTCTGCGCCTTCAAA
ACGGTTGCTTTTTGAATACTCTGCAACGTCACAAGACTAAAAAAGCTTGTGATCTTCCTC
TGTTTATGGATGGATGAAGCCGTTTGTGCAAAGGATGGGACTCTTCAAGGTTGTAGTGAC
TTTTGGTTATTAGCATTTGTTATTGACAAGAAAATTATTTTATTATTTGGTCAGCTTGTT
TCATTGTTTTAGCTTCTTCTGGTCTGTAAAAAATTACGTTGTAATGTTAATTGTTAGGGC
ATACAAAATTATGAAATATCCCAGTTTATTACTGAGACGAGGTTTACAAAACAGTGGAAA
TTCTTCTAAATGAATTTTCTAATTTATAGTGTC

QA 1 513 1 513
DS 

RD RR2CU27TF 513 0 0
GCCTCTCAAGTCTCTGGCCAGCAACATCTCCTTTGGAACGGAAGTCGAATTGCAGCTCGG
AAAACGTCTTCAGGCCTCTGTGGTAAGACAGATGAAAGATTCTGAGATGGCGATGCAATG
GACATTGATTTATAAGCTCACGAGCCGCTTGCGTGTCCTCCTTCAGTCTGCGCCTTCAAA
ACGGTTGCTTTTTGAATACTCTGCAACGTCACAAGACTAAAAAAGCTTGTGATCTTCCTC
TGTTTATGGATGGATGAAGCCGTTTGTGCAAAGGATGGGACTCTTCAAGGTTGTAGTGAC
TTTTGGTTATTAGCATTTGTTATTGACAAGAAAATTATTTTATTATTTGGTCAGCTTGTT
TCATTGTTTTAGCTTCTTCTGGTCTGTAAAAAATTACGTTGTAATGTTAATTGTTAGGGC
ATACAAAATTATGAAATATCCCAGTTTATTACTGAGACGAGGTTTACAAAACAGTGGAAA
TTCTTCTAAATGAATTTTCTAATTTATAGTGTC

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 2

CO CL7243Contig1 995 2 8 U
GGACAATTTCCATAGCATCGAATCTTAAAAAGAGCGAAAGTTTCTCTCTTTGGAGTGAGA
TTTGGAGGGCGAGATCGAGCTCTGGAAGTGAGATGAATTCTTAAGAAGAAGGAAGATTAA
AAGATGGGAAGAGAGATGTCGTTTTTGTTACAGCCCAGGTGCCTTCTTCTCCTCGTAGCC
CTAACCATCTTTCTCATCTTCGCGCTCTTCAACACCGGCAAGGAGGAGGAGAAGCAAGTG
ATTCAGGATTATGAAATCACACACAGAGTGTTTCTCGATGTTGATATCGACGGCCAACGC
TTAGGCAGGATCGTTATTGGATTATATGGCACTGTTGTACCCAAAACTGTTGAAAACTTC
AGGGCATTATGCACAGGAGAGAAGGGGAAAACATCAAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAA
GGAACACCCTTTCATAGAATAATATCTGGATTCGTGATCCAAGGAGGAGACATCATCCAT
GGTGATGGTAAAGGGAGTGACTCAATCTATGGTGGTACCTTTCCTGACGAAAGTTTCAGG
ATTAAGCATTCACATGCAGGTGTTGTAGCGATGGCTAATACAGGACCTGATTCTAATGGC
TCACAGTTCTTTATCACTACTGTCAAGGCTAGCTGGTTGGAAGGGGAGCATGTTGTGTTT
GGGAAGGTGATACAAGGAATGGACAATGTGTTCGCCATTGAAGGTGGAGCCGGTACTTAC
AGTGGCAAACCAAGGAAGAAAGTTGTGATTGCTGATTCTGGAGAGATCCCTAAAGACAAA
TGGGATGAAGAAAGATGACAGAACATAAAAGCTTACACATTTCAGCAAATCTTTGCTCTT
TTCCTATGAGATCCTTTCTCTTTTTTTTATTTGAATTCTGAACACAATGCCAATGTAGTT
AGTGTTTTTAAAAGCTGGATGCATCTTGTACCTCTTTACTTCAGTTTTTTTTCTTCTCAG
TATACTTTATTTATATGATTTTCTTAGTTCAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D215TF U 1
AF RR2D215JQ C 226
BS 1 645 RR2D215TF
BS 646 646 RR2D215JQ
BS 647 666 RR2D215TF
BS 667 667 RR2D215JQ
BS 668 676 RR2D215TF
BS 677 677 RR2D215JQ
BS 678 701 RR2D215TF
BS 702 995 RR2D215JQ

RD RR2D215TF 707 0 0
GGACAATTTCCATAGCATCGAATCTTAAAAAGAGCGAAAGTTTCTCTCTTTGGAGTGAGA
TTTGGAGGGCGAGATCGAGCTCTGGAAGTGAGATGAATTCTTAAGAAGAAGGAAGATTAA
AAGATGGGAAGAGAGATGTCGTTTTTGTTACAGCCCAGGTGCCTTCTTCTCCTCGTAGCC
CTAACCATCTTTCTCATCTTCGCGCTCTTCAACACCGGCAAGGAGGAGGAGAAGCAAGTG
ATTCAGGATTATGAAATCACACACAGAGTGTTTCTCGATGTTGATATCGACGGCCAACGC
TTAGGCAGGATCGTTATTGGATTATATGGCACTGTTGTACCCAAAACTGTTGAAAACTTC
AGGGCATTATGCACAGGAGAGAAGGGGAAAACATCAAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAA
GGAACACCCTTTCATAGAATAATATCTGGATTCGTGATCCAAGGAGGAGACATCATCCAT
GGTGATGGTAAAGGGAGTGACTCAATCTATGGTGGTACCTTTCCTGACGAAAGTTTCAGG
ATTAAGCATTCACATGCAGGTGTTGTAGCGATGGCTAATACAGGACCTGATTCTAATGGC
TCACAGTTCTTTATCACTACTGTCAAGGCTAGCTGGTTGGAAGGG*AGCATGTTGTGTTT
GGGAAG*TGATACAAG*AATGGACAATGTGTTCGCCATTGA
GGTGGA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RR2D215JQ 770 0 0
GAGGAGAAGCAAGTGATTCAGGATTATGAAATCACACACAGAGTGTTTCTCGATGTTGAT
ATCGACGGCCAACGCTTAGGCAGGATCGTTATTGGATTATATGGCACTGTTGTACCCAAA
ACTGTTGAAAACTTCAGGGCATTATGCACAGGAGAGAAGGGGAAAACATCAAGCGGGAAG
CCTCTACACTACAAAGGAACACCCTTTCATAGAATAATATCTGGATTCGTGATCCAAGGA
GGAGACATCATCCATGGTGATGGTAAAGGGAGTGACTCAATTTATGGTGGTACCTTTCCT
GACGAAAGTTTCAGGATTAAGCATTCACATGCAGGTGTTGTAGCGATGGCTAATACAGGA
CCTGATTTTAATGGCTCACAGTTCTTTATCACTACTGTCAAGGCTAGCTGGTTGGAAGGG
GAGCATGTTGTGTTTGGGAAGGTGATACAAGGAATGGACAATGTGTTCGCCATTGAAGGT
GGAGCCGGTACTTACAGTGGCAAACCAAGGAAGAAAGTTGTGATTGCTGATTCTGGAGAG
ATCCCTAAAGACAAATGGGATGAAGAAAGATGACAGAACATAAAAGCTTACACATTTCAG
CAAATCTTTGCTCTTTTCCTATGAGATCCTTTCTCTTTTTTTTATTTGAATTCTGAACAC
AATGCCAATGTAGTTAGTGTTTTTAAAAGCTGGATGCATCTTGTACCTCTTTACTTCAGT
TTTTTTTCTTCTCAGTATACTTTATTTATATGATTTTCTTAGTTCAGTTT

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL7244Contig1 1027 2 16 U
GGGAGCCGGTGACACGGCTATCAGAGCGGCGCAGTGATCGTAACAGTAATTATGGAAATC
ATGGAAGCTCCATCACCAGCTTTTCAATCTCCTTCTCGTTCCAGTCAACAACAATTGCAT
TTCTACCTCGCCGTGGACCGTCCCCAATTCAAAATGGAGACAGTGGTGGAGTTATTAGGA
GTGCTAGGTCGTCGTCCATGGCTTCCCATTGTAGTCTGTTGCAGCTCTCGCGATGAACTC
GACGCCGTCTCCTCTTCCTTATCCACTCTTCCTTTCATCTCCTTTGCTGCTTTGTACAGT
GATCTGGGAGAGAGAGACCGAGCTATGGTTTTAGAGAAATTCCGACAAGCGACAGTCAAG
TGGAACCAGCAAATTAACTCTGCAGTAGTAGAAGAAGGTTTGGAAGAGAGTCAAACCGGA
AAAGAAGAAGAAGATGAAAAGAAATCTCATCTGGTGGTTGTGACCGATGTTTGTCTTCCC
ATGCTTTCATCTGGAGAGTGGTCTCTTTCCTCACGAGTTCTCATCAATTACGAGCTTCCT
ACTAAGAAGGAAACTTATACTAGGCGTCTAACATCTTGCTTAGCTTCAGGTGGGATTGTC
ATAAACATGGTTGTTGGAGGTGAAGTGACGACTCTCAAAAGCCTTGAAAACCAGCGGCAT
TATCATCGTAGAGATGCCTATCAATATTTCTGAGATTTTGTAACAAACGCATGGCTCCTA
CGACCTGAAGGATACTGTCTAAGCGGGTTTAATGGCTCTGATGCTTCAATATGTATGTTA
CATGACTTCTCTAGAAAAATCAATAGTTTGTGTTAAGCTTCAAAATGTACGTTATATGAC
TTTTCTAGAGAATCAATAGTTTGTGTTAAGCTACAGAAGCTGTTTCTCTGCTCCACTTTT
AGCTTTTGAGAGTTGATTACTTTTGCATACAACGCTGCGTTTTGACTTTTTTGTTCATCT
TGGAAGATTTTTTCTTCTAAAACATTTGGATAAAAGGCATAAAGAGAAACAGAGCGAGCA
ATAGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D782TF U 1
AF RR2D782JQ C 210
BS 1 649 RR2D782TF
BS 650 650 RR2D782JQ
BS 651 698 RR2D782TF
BS 699 699 RR2D782JQ
BS 700 706 RR2D782TF
BS 707 707 RR2D782JQ
BS 708 717 RR2D782TF
BS 718 718 RR2D782JQ
BS 719 728 RR2D782TF
BS 729 730 RR2D782JQ
BS 731 741 RR2D782TF
BS 742 742 RR2D782JQ
BS 743 751 RR2D782TF
BS 752 752 RR2D782JQ
BS 753 762 RR2D782TF
BS 763 1027 RR2D782JQ

RD RR2D782TF 762 0 0
GGGAGCCGGTGACACGGCTATCAGAGCGGCGCAGTGATCGTAACAGTAATTATGGAAATC
ATGGAAGCTCCATCACCAGCTTTTCAATCTCCTTCTCGTTCCAGTCAACAACAATTGCAT
TTCTACCTCGCCGTGGACCGTCCCCAATTCAAAATGGAGACAGTGGTGGAGTTATTAGGA
GTGCTAGGTCGTCGTCCATGGCTTCCCATTGTAGTCTGTTGCAGCTCTCGCGATGAACTC
GACGCCGTCTCCTCTTCCTTATCCACTCTTCCTTTCATCTCCTTTGCTGCTTTGTACAGT
GATCTGGGAGAGAGAGACCGAGCTATGGTTTTAGAGAAATTCCGACAAGCGACAGTCAAG
TGGAACCAGCAAATTAACTCTGCAGTAGTAGAAGAAGGTTTGGAAGAGAGTCAAACCGGA
AAAGAAGAAGAAGATGAAAAGAAATCTCATCTGGTGGTTGTGACCGATGTTTGTCTTCCC
ATGCTTTCATCTGGAGAGTGGTCTCTTTCCTCACGAGTTCTCATCAATTACGAGCTTCCT
ACTAAGAAGGAAACTTATACTAGGCGTCTAACATCTTGCTTAGCTTCAGGTGGGATTGTC
ATAAACATGGTTGTTGGAGGTGAAGTGACGACTCTCAAAAGCCTTGAAA*CCAGCGGCAT
TATCATCGTAGAGATGCCTATCAATATTTCTGAGATTT*GTAACAA*CGCATGGCTC*TA
CGACCTGA**GATACTGTCTA*GCGGGTTTA*TGGCTCTGAT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2D782JQ 818 0 0
TGTAGTCTGTTGCAGCTCTCGCGATGAACTCGACGCCGTCTCCTCTTCTTTATCCACTCT
TCCTTTCATCTCCTTTGCTGCTTTGTACAGTGATCTGGGAGAGAGAGACCGAGCTATGGT
TTTAGAGAAATTCCGACAAGCGACAGTCAAGTGGAACCAGCAAATTAACTCTGCAGTAGT
AGAAGAAGGTTTGGAAGAGAGTCAAACCGGAAAAGAAGAAGAAGATGAAAAGAAATCTCA
TCTGGTGGTTGTGACCGATGTTTGTCTTCCCATGCTTTCATCTGGAGAGTGGTCTCTTTC
CTCACGAGTTCTCATCAATTACGAGCTTCCTACTAAGAAGGAAACTTATACTAGGCGTCT
AACATCTTGCTTAGCTTCAGGTGGGATTGTCATAAACATGGTTGTTGGAGGTGAAGTGAC
GACTCTCAAAAGCCTTGAAAACCAGCGGCATTATCATCGTAGAGATGCCTATCAATATTT
CTGAGATTTTGTAACAAACGCATGGCTCCTACGACCTGAAGGATACTGTCTAAGCGGGTT
TAATGGCTCTGATGCTTCAATATGTATGTTACATGACTTCTCTAGAAAAATCAATAGTTT
GTGTTAAGCTTCAAAATGTACGTTATATGACTTTTCTAGAGAATCAATAGTTTGTGTTAA
GCTACAGAAGCTGTTTCTCTGCTCCACTTTTAGCTTTTGAGAGTTGATTACTTTTGCATA
CAACGCTGCGTTTTGACTTTTTTGTTCATCTTGGAAGATTTTTTCTTCTAAAACATTTGG
ATAAAAGGCATAAAGAGAAACAGAGCGAGCAATAGTGG

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL7245Contig1 1236 2 2 U
GGTGGAGCGAAGCATTTTAACATCACCCTGACAAGGTCGAGGTTTGAGACTCTGGTGAAT
CACTTAATTGAGAGGACCCGTGATCCTTGCAAGAACTGCCTCAAGGATGCTGGTATAAGT
GCTAAAGAAGTTGATGAGGTTCTTCTTGTTGGAGGAATGACTCGTGTCCCCAAGGTGCAA
AATGTTGTTGCGGAGATCTTTGGGAAGACTCCTAGTAAAGGTGTCAACCCTGATGAGGCT
GTTGCTATGGGAGCTGCACTTCAAGGTGGTATCCTCCGTGGTGATGTCAAAGAGTTGCTG
CTTCTAGATGTCACACCTCTGTCGCTTGGTATTGAAACACTTGGTGGTGTCTTTACAAGA
TTGATTGGCCGAAACACAACCATCCCCACGAAGAAGAGTCAGGTGTTCTCAACTGCAGCG
GACAATCAGACGCAAGTTGGGATCAGAGTGCTTCAAGGTGAGCGTGAAATGGCATCAGAC
AACAAGCTGTTGGGAGAATTCGATCTAGTGGGCATTCCACCATCACCAAGAGGCATCCCT
CAGATCGAAGTAACATTCGACATCGATGCAAATGGAATTGTCACAGTCTCTGCCAAGGAC
AAGACGACTGGTAAAGAGCAACAGATCACAATCCGATCATCTGGTGGGCTATCAGAGGAT
GATATCCAGAAGATGGTGAGAGACGCAGAGTTGCATGCTCAGAAAGATAAAGAAAGAAAA
GACTTGATCGACACCAAGAACACAGCGGACACAACAATTTACAGCATAGAGAAGAGCCTC
GGTGAGTACAGAGAGAAGATCCCGAGCGAAGTCGCCAAGGAGATCGAAGATGCTGTGGCG
GATCTGAGGAGCGCTTCGGCTGGAGATGATGTCAATGAGATTAAGGCTAAGATCGATGCG
GCGAACAAAGCTGTTTCAAAGATCGGAGAGCACATGTCTGGTGGTGGAGGTTCTGCACCA
GGAGGAGGAGGATCGGGAACTCAGGGAGGCAGCGAACAAACTCCAGAGGCAGATTACGAG
GAAGTGAAGAAGTGAAGAGTGTGCGTTATTTCTTGTCAGTTGGGTTAAGAAGTTAAGTTA
GACCATGGTTGAGTTCCGATGTCGAAGGAACTTGTCATAAAAACAGCGAGCAGTGTAACT
GTTCCTGTAATAATTTTTTTTTCTTTTGCAGTGAACAAAACTTAATGTTCCTCTCTCTTT
GATATTAGCCTTTTTGTTATATAAGAGAAACGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FT22TF U 1
AF RR2FT22JQ C 561
BS 1 759 RR2FT22TF
BS 760 1236 RR2FT22JQ

RD RR2FT22TF 759 0 0
GGTGGAGCGAAGCATTTTAACATCACCCTGACAAGGTCGAGGTTTGAGACTCTGGTGAAT
CACTTAATTGAGAGGACCCGTGATCCTTGCAAGAACTGCCTCAAGGATGCTGGTATAAGT
GCTAAAGAAGTTGATGAGGTTCTTCTTGTTGGAGGAATGACTCGTGTCCCCAAGGTGCAA
AATGTTGTTGCGGAGATCTTTGGGAAGACTCCTAGTAAAGGTGTCAACCCTGATGAGGCT
GTTGCTATGGGAGCTGCACTTCAAGGTGGTATCCTCCGTGGTGATGTCAAAGAGTTGCTG
CTTCTAGATGTCACACCTCTGTCGCTTGGTATTGAAACACTTGGTGGTGTCTTTACAAGA
TTGATTGGCCGAAACACAACCATCCCCACGAAGAAGAGTCAGGTGTTCTCAACTGCAGCG
GACAATCAGACGCAAGTTGGGATCAGAGTGCTTCAAGGTGAGCGTGAAATGGCATCAGAC
AACAAGCTGTTGGGAGAATTCGATCTAGTGGGCATTCCACCATCACCAAGAGGCATCCCT
CAGATCGAAGTAACATTCGACATCGATGCAAATGGAATTGTCACAGTCTCTGCCAAGGAC
AAGACGACTGGTAAAGAGCAACAGATCACAATCCGATCATCTGGTGGGCTATCAGAGGAT
GATATCCAGAAGATGGTGAGAGACGCAGAGTTGCATGCTCAGAAAGATAAAGAAAGAAAA
GACTTGATCGACACCAAGAACACAGCGGACACAACAATT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2FT22JQ 676 0 0
CATCGATGCAAATGGAATTGTCACAGTCTCTGCCAAGGACAAGACGACTGGTAAAGAGCA
ACAGATCACAATCCGATCATCTGGTGGGCTATCAGAGGATGATATCCAGAAGATGGTGAG
AGACGCAGAGTTGCATGCTCAGAAAGATAAAGAAAGAAAAGACTTGATCGACACCAAGAA
CACAGCGGACACAACAATTTACAGCATAGAGAAGAGCCTCGGTGAGTACAGAGAGAAGAT
CCCGAGCGAAGTCGCCAAGGAGATCGAAGATGCTGTGGCGGATCTGAGGAGCGCTTCGGC
TGGAGATGATGTCAATGAGATTAAGGCTAAGATCGATGCGGCGAACAAAGCTGTTTCAAA
GATCGGAGAGCACATGTCTGGTGGTGGAGGTTCTGCACCAGGAGGAGGAGGATCGGGAAC
TCAGGGAGGCAGCGAACAAACTCCAGAGGCAGATTACGAGGAAGTGAAGAAGTGAAGAGT
GTGCGTTATTTCTTGTCAGTTGGGTTAAGAAGTTAAGTTAGACCATGGTTGAGTTCCGAT
GTCGAAGGAACTTGTCATAAAAACAGCGAGCAGTGTAACTGTTCCTGTAATAATTTTTTT
TTCTTTTGCAGTGAACAAAACTTAATGTTCCTCTCTCTTTGATATTAGCCTTTTTGTTAT
ATAAGAGAAACGTTTC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL7246Contig1 969 2 12 U
GGGAATATGTCCGAAATCATTACATCCAATTGAAACCTAAACGTAGCTTCTTCGTCTTTG
TTGATCTCTGTTTTTCCAGAATCTTTGATTTTGCGCATTTAGAGCAATGATTCCTCCTTA
GGAGCTCTCGCATCTGCTGCGTCATTCCGCATGAGCAAGCGGTAGGTGCCTAGTGCCTCT
CCTCCTGTAGTCCCTTTGCTAAAAAGGTCAACAATGACGGACCAAAGCTCTGTTGATGGG
ATTCTAGAGTTTCTCAAGAAAAATCGTTTCTCCAAGGCAGAGGAAGCTCTGCGTAATGAG
CTCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAACCTTCTGACTTAAATGGGTTTCTTCAA
AATCTTAACTTGGTGGACAAAGATTCAAAACCAAAGTCTGCTGGTCAGGTCTCCAAGGAG
CTTATCGTAAAAGAGATTGGCACGGATGGGTCTGTTATCAAATGGGAGAATGGTGAGAAA
CCTAGCAACAAGGTTATATCAAGGGAGATGAGCTTCACATTCTCTGAAAATTCAGGTGAT
ACTCCTGCTCCTGATGCGCGTTCCTGTAAATTTACTGCTTCAGGTAAGGGTACCTTAGAC
CCTTACCGAAGCACTGATGACACTAGTGGTAGCAGTTTGGTGGATTCATTTGCATTGGAA
CAGTCGAGCCGTGGTATCGATAAGAAGATAGTTGAAACTGGTGAAGATATCGTCTTCTTT
GGCAACAAGACTAATTCATGGTCTGGAAACTCTACTAGTAAAGGGAACTCCGGATCCAAA
GTAAATGAGATTGATAGGCTAGTTGAAAGTTTTGGGAAGCATGAGAACTATATGGGCAGC
ACACGCTTAAGAACTGAAGATGTCGCGGATACTATAACCACAGAGAACTTGAAAGAGTGT
TCTGTGAAGACTCATTCTCAATCTTCGAGGGGCGATGCCTCAACCAGTTACAGTCAGGCT
ACCAGCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FC45TF U 1
AF RR2FC45JQ C 273
BS 1 724 RR2FC45TF
BS 725 727 RR2FC45JQ
BS 728 748 RR2FC45TF
BS 749 749 RR2FC45JQ
BS 750 766 RR2FC45TF
BS 767 767 RR2FC45JQ
BS 768 784 RR2FC45TF
BS 785 785 RR2FC45JQ
BS 786 791 RR2FC45TF
BS 792 792 RR2FC45JQ
BS 793 812 RR2FC45TF
BS 813 969 RR2FC45JQ

RD RR2FC45TF 812 0 0
GGGAATATGTCCGAAATCATTACATCCAATTGAAACCTAAACGTAGCTTCTTCGTCTTTG
TTGATCTCTGTTTTTCCAGAATCTTTGATTTTGCGCATTTAGAGCAATGATTCCTCCTTA
GGAGCTCTCGCATCTGCTGCGTCATTCCGCATGAGCAAGCGGTAGGTGCCTAGTGCCTCT
CCTCCTGTAGTCCCTTTGCTAAAAAGGTCAACAATGACGGACCAAAGCTCTGTTGATGGG
ATTCTAGAGTTTCTCAAGAAAAATCGTTTCTCCAAGGCAGAGGAAGCTCTGCGTAATGAG
CTCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAACCTTCTGACTTAAATGGGTTTCTTCAA
AATCTTAACTTGGTGGACAAAGATTCAAAACCAAAGTCTGCTGGTCAGGTCTCCAAGGAG
CTTATCGTAAAAGAGATTGGCACGGATGGGTCTGTTATCAAATGGGAGAATGGTGAGAAA
CCTAGCAACAAGGTTATATCAAGGGAGATGAGCTTCACATTCTCTGAAAATTCAGGTGAT
ACTCCTGCTCCTGATGCGCGTTCCTGTAAATTTACTGCTTCAGGTAAGGGTACCTTAGAC
CCTTACCGAAGCACTGATGACACTAGTGGTAGCAGTTTGGTGGATTCATTTGCATTGGAA
CAGTCGAGCCGTGGTATCGATAAGAAGATAGTTGAAACTGGTGAAGATATCGTCTTCTTT
GGCAC**AGACTAATTCATGGTCTGGAA*CTCTACTAGTAAAGGGA*CTCCGGATCCAAA
GTAA*TGAGAT*GATAGGCTAGTTGAAAGTTT

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR2FC45JQ 697 0 0
CAAGGCAGAGGAAGCTCTGCGTAATGAGCTCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAA
ACCTTCTGACTTAAATGGGTTTCTTCAAAATCTTAACTTGGTGGACAAAGATTCAAAACC
AAAGTCTGCTGGTCAGGTCTCCAAGGAGCTTATCGTAAAAGAGATTGGCACGGATGGGTC
TGTTATCAAATGGGAGAATGGTGAGAAACCTAGCAACAAGGTTATATCAAGGGAGATGAG
CTTCACATTCTCTGAAAATTCAGGTGATACTCCTGCTCCTGATGCGCGTTCCTGTAAATT
TACTGCTTCAGGTAAGGGTACCTTAGACCCTTACCGAAGCACTGATGACACTAGTGGTAG
CAGTTTGGTGGATTCATTTGCATTGGAACAGTCGAGCCGTGGTATCGATAAGAAGATAGT
TGAAACTGGTGAAGATATCGTCTTCTTTGGCAACAAGACTAATTCATGGTCTGGAAACTC
TACTAGTAAAGGGAACTCCGGATCCAAAGTAAATGAGATTGATAGGCTAGTTGAAAGTTT
TGGGAAGCATGAGAACTATATGGGCAGCACACGCTTAAGAACTGAAGATGTCGCGGATAC
TATAACCACAGAGAACTTGAAAGAGTGTTCTGTGAAGACTCATTCTCAATCTTCGAGGGG
CGATGCCTCAACCAGTTACAGTCAGGCTACCAGCTCG

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL7247Contig1 741 2 3 U
TTTTTTTTTAGAAGAGTAAAGTGAATAATATTTGCTCATCATGTTCAATAACATATATAC
AACATCAGTTTGTGAGGTTTAACTTAAAGTCTATATAGTGTCCATAACATGACGGATATT
ACAAATAAAAAAAATAAACAAATCATAGACCCTTGGAGCCAGGAAGATCTATCCATTGAA
GTTGAACCTCAACCTCACCGCACTCTACATGTTTCAGTCTAAGGACTATTTCCTGAACAA
GCTTACCATCAGACCAAATGATCCGAGAACCCTCCGCTAAGCAATTGTCTCGGCTAGGCT
GGACTGTGGTCACTATTGTCCCATATGGGAGATCTTGCAAGTGCATAGTCAATGCATTGA
TGTACGGCTTAATCTCAAATTCTGCATCTCCCATTTTGTCGTCTTTGGTGAATGTATCGT
GATCATACACCGTCAAGAAGACTTTGAGATTGGGATCGGTTACTGAGAGAGTCAAATCTT
CATTCCACTCAGGATTCACATCATTGTAAATAACTCGAGTCTTCAATTTCTGTTTACCCA
TTTTGACGACGACGTAAGGATCACTACTGTTGAGATCGCGGACGGCGAGATTCACACCGC
GCTTGACACGAATACGAAGAAGACCTAATAGACTATCCATCATAGAAGGCTTCATCGTTA
TGCTTCTCCCCGTCGCAGATATTACGTTTACCTTTTTCCCCCCCCACGTCGCCGCGATCC
GAACACTTCACCGGATCATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C253JQ U 47
AF RR2C253TF C 1
BS 1 46 RR2C253TF
BS 47 697 RR2C253JQ
BS 698 741 RR2C253TF

RD RR2C253JQ 651 0 0
AATAACATATATACAACATCAGTTTGTGAGGTTTAACTTAAAGTCTATATAGTGTCCATA
ACATGACGGATATTACAAATAAAAAAAATAAACAAATCATAGACCCTTGGAGCCAGGAAG
ATCTATCCATTGAAGTTGAACCTCAACCTCACCGCACTCTACATGTTTCAGTCTAAGGAC
TATTTCCTGAACAAGCTTACCATCAGACCAAATGATCCGAGAACCCTCCGCTAAGCAATT
GTCTCGGCTAGGCTGGACTGTGGTCACTATTGTCCCATATGGGAGATCTTGCAAGTGCAT
AGTCAATGCATTGATGTACGGCTTAATCTCAAATTCTGCATCTCCCATTTTGTCGTCTTT
GGTGAATGTATCGTGATCATACACCGTCAAGAAGACTTTGAGATTGGGATCGGTTACTGA
GAGAGTCAAATCTTCATTCCACTCAGGATTCACATCATTGTAAATAACTCGAGTCTTCAA
TTTCTGTTTACCCATTTTGACGACGACGTAAGGATCACTACTGTTGAGATCGCGGACGGC
GAGATTCACACCGCGCTTGACACGAATACGAAGAAGACCTAATAGACTATCCATCATAGA
AGGCTTCATCGTTATGCTTCTCCCCGTCGCAGATATTACGTTTACCTTTTT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2C253TF 741 0 0
TTTTTTTTTAGAAGAGTAAAGTGAATAATATTTGCTCATCATGTTCAATAACATATATAC
AACATCAGTTTGTGAGGTTTAACTTAAAGTCTATATAGTGTCCATAACATGACGGATATT
ACAAATAAAAAAAATAAACAAATCATAGACCCTTGGAGCCAGGAAGATCTATCCATTGAA
GTTGAACCTCAACCTCACCGCACTCTACATGTTTCAGTCTAAGGACTATTTCCTGAACAA
GCTTACCATCAGACCAAATGATCCGAGAACCCTCCGCTAAGCAATTGTCTCGGCTAGGCT
GGACTGTGGTCACTATTGTCCCATATGGGAGATCTTGCAAGTGCATAGTCAATGCATTGA
TGTACGGCTTAATCTCAAATTCTGCATCTCCCATTTTGTCGTCTTTGGTGAATGTATCGT
GATCATACACCGTCAAGAAGACTTTGAGATTGGGATCGGTTACTGAGAGAGTCAAATCTT
CATTCCACTCAGGATTCACATCATTGTAAATAACTCGAGTCTTCAATTTCTGTTTACCCA
TTTTGACGACGACGTAAGGATCACTACTGTTGAGATCGCGGACGGCGAGATTCACACCGC
GCTTGACACGAATACGAAGAAGACCTAATAGACTATCCATCATAGAAGGCTTCATCGTTA
TGCTTCTCCCCGTCGCAGATATTACGTTTACCTTTTTCCCCCCCCACGTCGCCGCGATCC
GAACACTTCACCGGATCATTC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL7248Contig1 514 2 1 U
GGATAGGTATAATAACAGTACTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGATATTA
AGAGAGGTTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAACTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGTA
TGGGGTCTTATAGATCCGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTGT
TGTTTTTAGGATCTGGATCCATTATTCATTCAATGGAAGCTATAGTTGGATATTCTCCTG
ATAAAAGTCAGAATATGATTCTTATGGGTGGTTTAACAAAACATGTGCCGATTACAAAAA
CTGCCTTTTTAGTAGGAACACTCTCACTTTGTGGTATTCCCCCCCTTGCTTGTTTTTGGT
CTAAAGATGAAATTCTTAATGATAGTTTGTTATTTTCGCCAATTTTTGCAATAATAGCTT
GTTCAACAGCGGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGGATTTATTTACTTACTTTTGAAG
GACATTTAAACACTTATTTTATAAATTATAGTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E508JQ C 1
AF RR2E508TF U 1
BS 1 514 RR2E508TF

RD RR2E508JQ 514 0 0
GGATAGGTATAATAACAGTACTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGATATTA
AGAGAGGTTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAACTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGTA
TGGGGTCTTATAGATCCGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTGT
TGTTTTTAGGATCTGGATCCATTATTCATTCAATGGAAGCTATAGTTGGATATTCTCCTG
ATAAAAGTCAGAATATGATTCTTATGGGTGGTTTAACAAAACATGTGCCGATTACAAAAA
CTGCCTTTTTAGTAGGAACACTCTCACTTTGTGGTATTCCCCCCCTTGCTTGTTTTTGGT
CTAAAGATGAAATTCTTAATGATAGTTTGTTATTTTCGCCAATTTTTGCAATAATAGCTT
GTTCAACAGCGGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGGATTTATTTACTTACTTTTGAAG
GACATTTAAACACTTATTTTATAAATTATAGTGG

QA 1 514 1 514
DS 

RD RR2E508TF 514 0 0
GGATAGGTATAATAACAGTACTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGATATTA
AGAGAGGTTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAACTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGTA
TGGGGTCTTATAGATCCGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTGT
TGTTTTTAGGATCTGGATCCATTATTCATTCAATGGAAGCTATAGTTGGATATTCTCCTG
ATAAAAGTCAGAATATGATTCTTATGGGTGGTTTAACAAAACATGTGCCGATTACAAAAA
CTGCCTTTTTAGTAGGAACACTCTCACTTTGTGGTATTCCCCCCCTTGCTTGTTTTTGGT
CTAAAGATGAAATTCTTAATGATAGTTTGTTATTTTCGCCAATTTTTGCAATAATAGCTT
GTTCAACAGCGGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGGATTTATTTACTTACTTTTGAAG
GACATTTAAACACTTATTTTATAAATTATAGTGG

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL7249Contig1 637 2 2 U
AGAACACCAGATTCTGATATTGGCAAGGCAACAAGCTCAGAGAGAAGAAGAATTAGCACA
GACACAGCGGCATATTTTGGCTCTTCAGGATGAAATCGAGGAGCTTGAGCGCGAAAACCG
GCTTCACAGTCAACAGGAAGCCATGCTAAAAACGGAGTTGAGGGAGATGGAAAGAAAACA
GAAAAGAGAAGGTGTAGATATGACATACCTAAAGAATGTAATTTTAAAGCTGTTAGAAAC
AGGTGAAGTGGAAGCTTTACTACCGGTAGTGGGAATGTTGCTCCAGTTCAGTCCGGAGGA
GATACTCAAGTGTCAGCAATCGTACCATAGCTCAACAACAACAACAACACCAACGACAAC
AGCAACGGATGCGAGTGTAGGTGGTGCGGCAAGTGAAGGTTCAGGCCTGTCCCTCTTCTC
AAGATTCCCGTTTTCCTAATTTGGTTGGTGGGCACTGGACACTGGAGACGAGACTACATC
ACATTCTTTTGGGCCAAGATTAGAAGATACACATATATTACTTGTCTTTTTTTTTTTCAA
GTCCTTCGTTTTGTGTAATGAACGTCAAAAGCCAAGAAAACACATTTGTCCAGATGTTTT
TTTTTATTATATAAAAGAAGGTGAATTGAGTTGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ22TF U 1
AF RR2BQ22JQ C 85
BS 1 602 RR2BQ22TF
BS 603 637 RR2BQ22JQ

RD RR2BQ22TF 602 0 0
AGAACACCAGATTCTGATATTGGCAAGGCAACAAGCTCAGAGAGAAGAAGAATTAGCACA
GACACAGCGGCATATTTTGGCTCTTCAGGATGAAATCGAGGAGCTTGAGCGCGAAAACCG
GCTTCACAGTCAACAGGAAGCCATGCTAAAAACGGAGTTGAGGGAGATGGAAAGAAAACA
GAAAAGAGAAGGTGTAGATATGACATACCTAAAGAATGTAATTTTAAAGCTGTTAGAAAC
AGGTGAAGTGGAAGCTTTACTACCGGTAGTGGGAATGTTGCTCCAGTTCAGTCCGGAGGA
GATACTCAAGTGTCAGCAATCGTACCATAGCTCAACAACAACAACAACACCAACGACAAC
AGCAACGGATGCGAGTGTAGGTGGTGCGGCAAGTGAAGGTTCAGGCCTGTCCCTCTTCTC
AAGATTCCCGTTTTCCTAATTTGGTTGGTGGGCACTGGACACTGGAGACGAGACTACATC
ACATTCTTTTGGGCCAAGATTAGAAGATACACATATATTACTTGTCTTTTTTTTTTTCAA
GTCCTTCGTTTTGTGTAATGAACGTCAAAAGCCAAGAAAACACATTTGTCCAGATGTTTT
TT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2BQ22JQ 553 0 0
TCAGGATGAAATCGAGGAGCTTGAGCGCGAAAACCGGCTTCACAGTCAACAGGAAGCCAT
GCTAAAAACGGAGTTGAGGGAGATGGAAAGAAAACAGAAAAGAGAAGGTGTAGATATGAC
ATACCTAAAGAATGTAATTTTAAAGCTGTTAGAAACAGGTGAAGTGGAAGCTTTACTACC
GGTAGTGGGAATGTTGCTCCAGTTCAGTCCGGAGGAGATACTCAAGTGTCAGCAATCGTA
CCATAGCTCAACAACAACAACAACACCAACGACAACAGCAACGGATGCGAGTGTAGGTGG
TGCGGCAAGTGAAGGTTCAGGCCTGTCCCTTTTCTCAAGATTCCCGTTTTCCTAATTTGG
TTGGTGGGCACTGGACACTGGAGACGAGACTACATCACATTCTTTTGGGCCAAGATTAGA
AGATACACATATATTACTTGTCTTTTTTTTTTTCAAGTCCTTCGTTTTGTGTAATGAACG
TCAAAAGCCAAGAAAACACATTTGTCCAGATGTTTTTTTTTATTATATAAAAGAAGGTGA
ATTGAGTTGGGCC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL7250Contig1 1239 2 2 U
GGGAAAGTATTGCCGACTATAGATCTGGCTTTCTGTTAGCTCTTGAGTCATGTTGGAACT
TGTTTTGACCCTAAGCCGATAAGTTTGATTTCATTTCTGTAGTTACCTTGAAACTAATAT
CGCTTTATGGATGATGTCAAGATATAATCCTTGGTCTTTTCTAACTTTCTGAACTTGATT
TTCACATGTAGCCTCTAATGAAAGATAGTATTTTGTACAGTGTAGTGTTCGATTCACTCA
TTCACATAGCTATTTCTGAATATTACGTTCTCAGCTTAACCATACTGTCTCTACATAACT
GCTTTTTTTAATTTCTGAAATTGATTTTGACATGTGGTCTGTCATATTCCTTCGGTGAAG
TTGGACTGAAGAAATGAACAGATGTTTTCATGACTCCTTCGTACAGAAAGTTTCAACATA
ACTCCTTTTCAACGTTTATAGCAACTGATAGTTCTGTTATTGTATTTTCAACTATATAAA
TCAATTGACTTTAAAGTTGCCTGGCTAAGAATGGAATCCATTTTTTACAGCAAAAACGGA
GAAAAGGGGAAGAACACACTGCCAGCACGAAGGTTGACTATAGAAAGATGGTGGATTTAC
CCCCAAAACTGAACATGTTCTCCACCGTGCCACACCAAGATTCTACATATGTCATGAACC
ATATGTGCCAGAGTGCACGCATGCCTTTTGAAGGTTCAAGTGATGCGGTCATTGAGCTTC
TACGGCAGAATGCTCATGCTTTCAGTCAAATTTCTTCAAACCTTTCTGTGTCCAAGCCAC
AAGATAACATCAGCCTATTTCATCTGGCAAGAAATAACATCAGTTCCATCCTGAATGACA
TGAAGGAGATGCCTGGTATCATAAGCCGGATGCCACCACTTCCTGTTTCTATTAACAATG
ATCTTGCAAGCAGGTTAATGACGAGTACACCACAGACGAGATCTTATATCGTTCCTTCGA
GCACCCATCTGAAGCAGGAGCCAAGAAACTGAGGGAGCAGGAAACATTTGATTTTGACCA
ATGCTTAAGGAAATAAGCAAAACCCTTCCATGTCTCAAAACAGAGAAGTTTTTTTTTCCG
GTGTGAAATGTTTAGGTTGCCAATTCAAGATAAGAATTCATTGCACAGATCCGTGGTAGA
TTTGTTTGTATAGATTAGCTGTTTGTTTCGGTAAGGGTTTAGCTAAGAGTTACGTACGTT
TGTAAGTAGACATCTTTTTAAGGTTTGGTCTTTCAATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY73TF U 1
AF RR2CY73JQ C 523
BS 1 688 RR2CY73TF
BS 689 1239 RR2CY73JQ

RD RR2CY73TF 688 0 0
GGGAAAGTATTGCCGACTATAGATCTGGCTTTCTGTTAGCTCTTGAGTCATGTTGGAACT
TGTTTTGACCCTAAGCCGATAAGTTTGATTTCATTTCTGTAGTTACCTTGAAACTAATAT
CGCTTTATGGATGATGTCAAGATATAATCCTTGGTCTTTTCTAACTTTCTGAACTTGATT
TTCACATGTAGCCTCTAATGAAAGATAGTATTTTGTACAGTGTAGTGTTCGATTCACTCA
TTCACATAGCTATTTCTGAATATTACGTTCTCAGCTTAACCATACTGTCTCTACATAACT
GCTTTTTTTAATTTCTGAAATTGATTTTGACATGTGGTCTGTCATATTCCTTCGGTGAAG
TTGGACTGAAGAAATGAACAGATGTTTTCATGACTCCTTCGTACAGAAAGTTTCAACATA
ACTCCTTTTCAACGTTTATAGCAACTGATAGTTCTGTTATTGTATTTTCAACTATATAAA
TCAATTGACTTTAAAGTTGCCTGGCTAAGAATGGAATCCATTTTTTACAGCAAAAACGGA
GAAAAGGGGAAGAACACACTGCCAGCACGAAGGTTGACTATAGAAAGATGGTGGATTTAC
CCCCAAAACTGAACATGTTCTCCACCGTGCCACACCAAGATTCTACATATGTCATGAACC
ATATGTGCCAGAGTGCACGCATGCCTTT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2CY73JQ 717 0 0
TTTTACAGCAAAAACGGAGAAAAGGGGAAGAACACACTGCCAGCACGAAGGTTGACTATA
GAAAGATGGTGGATTTACCCCCAAAACTGAACATGTTCTCCACCGTGCCACACCAAGATT
CTACATATGTCATGAACCATATGTGCCAGAGTGCACGCATGCCTTTTGAAGGTTCAAGTG
ATGCGGTCATTGAGCTTCTACGGCAGAATGCTCATGCTTTCAGTCAAATTTCTTCAAACC
TTTCTGTGTCCAAGCCACAAGATAACATCAGCCTATTTCATCTGGCAAGAAATAACATCA
GTTCCATCCTGAATGACATGAAGGAGATGCCTGGTATCATAAGCCGGATGCCACCACTTC
CTGTTTCTATTAACAATGATCTTGCAAGCAGGTTAATGACGAGTACACCACAGACGAGAT
CTTATATCGTTCCTTCGAGCACCCATCTGAAGCAGGAGCCAAGAAACTGAGGGAGCAGGA
AACATTTGATTTTGACCAATGCTTAAGGAAATAAGCAAAACCCTTCCATGTCTCAAAACA
GAGAAGTTTTTTTTTCCGGTGTGAAATGTTTAGGTTGCCAATTCAAGATAAGAATTCATT
GCACAGATCCGTGGTAGATTTGTTTGTATAGATTAGCTGTTTGTTTCGGTAAGGGTTTAG
CTAAGAGTTACGTACGTTTGTAAGTAGACATCTTTTTAAGGTTTGGTCTTTCAATCG

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL7251Contig1 680 2 5 U
GGGCACACAACACAAAGAAGAACCAAAGAAGAGAAAATGAAGCCTTTGTGTCTGGTTATA
TTCTTATCGATCCTGATCCAACAAAGCTACTTGAAGCTCGGAGCAGATGCGTTTTCGAGG
GATGGGTTCGTGAGAACGAAAGGTGTTCAGTTTAGTCTCAATGGCTATCCATATTACGCT
AATGGCTTCAATGCCTATTGGCTCATGTACGTTGCCTCTGATCCAATCCAAAGGCCTAAG
ATCACCGCGGCCTTCCAAGAGGCCTCTCGCCATGGACTGACCGTAGCTCGAACCTGGGCA
TTCAGTGACGGCGGTTACAGGCCTCTCCAGTATTCCCCTGGCTCTTACAACGAGGATATG
TTTGAGGGTTTGGATTTTGCGATAGCTGAAGCAAGAAAGCATGGGATAAAGATCATACTC
AGCTTTGCCAATAACTATGTGAGCTTTGGAGGGAAGAAGCAATATGTAGACTGGGCTAGA
AGCCAAGGCCGTCCTGTATCTTCTGAAGACGATTTCTTCTCAGACTCTTTAGTTAAAGAT
TTCTACAAGAACCATATCAAGGCTGTGCTGAACAGATTCAATACTTTTACCAAAGTTCAT
TACAGAGATGACCCGACCATTATGGCTTGGGAGCTCATGAACGAGCCTCGCTGTCCTTCA
GATCCAAGCGGACGAACCAT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2EC57TF U 1
AF RR2H971TF U 3
BS 1 224 RR2EC57TF
BS 225 225 RR2H971TF
BS 226 650 RR2EC57TF
BS 651 651 RR2H971TF
BS 652 680 RR2EC57TF

RD RR2EC57TF 680 0 0
GGGCACACAACACAAAGAAGAACCAAAGAAGAGAAAATGAAGCCTTTGTGTCTGGTTATA
TTCTTATCGATCCTGATCCAACAAAGCTACTTGAAGCTCGGAGCAGATGCGTTTTCGAGG
GATGGGTTCGTGAGAACGAAAGGTGTTCAGTTTAGTCTCAATGGCTATCCATATTACGCT
AATGGCTTCAATGCCTATTGGCTCATGTACGTTGCCTCTGATCCGATCCAAAGGCCTAAG
ATCACCGCGGCCTTCCAAGAGGCCTCTCGCCATGGACTGACCGTAGCTCGAACCTGGGCA
TTCAGTGACGGCGGTTACAGGCCTCTCCAGTATTCCCCTGGCTCTTACAACGAGGATATG
TTTGAGGGTTTGGATTTTGCGATAGCTGAAGCAAGAAAGCATGGGATAAAGATCATACTC
AGCTTTGCCAATAACTATGTGAGCTTTGGAGGGAAGAAGCAATATGTAGACTGGGCTAGA
AGCCAAGGCCGTCCTGTATCTTCTGAAGACGATTTCTTCTCAGACTCTTTAGTTAAAGAT
TTCTACAAGAACCATATCAAGGCTGTGCTGAACAGATTCAATACTTTTACCAAAGTTCAT
TACAGAGATGACCCGACCATTATGGCTTGGGAGCTCATGAACGAGCCTCGTTGTCCTTCA
GATCCAAGCGGACGAACCAT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2H971TF 678 0 0
GG
ACACAACACAAAGAAGAACCAAAGAAGAGAAAATGAAGCCTTTGTGTCTGGTTATATTCT
TATCGATCCTGATCCAACAAAGCTACTTGAAGCTCGGAGCAGATGCGTTTTCGAGGGATG
GGTTCGTGAGAACGAAAGGTGTTCAGTTTAGTCTCAATGGCTATCCATATTACGCTAATG
GCTTCAATGCCTATTGGCTCATGTACGTTGCCTCTGATCCAATCCAAAGGCCTAAGATCA
CCGCGGCCTTCCAAGAGGCCTCTCGCCATGGACTGACCGTAGCTCGAACCTGGGCTTTCA
GTGACGGCGGTTACAGGCCTCTCCAGTATTCCCCTGGCTCTTACAACGAGGATATGTTTG
AGGGTTTGGATTTTGCGATAGCTGAAGCAAGAAAGCATGGGATAAAGATCATACTCAGCT
TTGCCAATAACTATGTGAGCTTTGGAGGGAAGAAGCAAT**GTAGACTGGGCTAGAAGCC
AAGGCCGTCCTGTATCTTCTGAAGATGATTTCTTCTCAGACTCTTTAGTTAAAGATTTCT
ACAAGAACCATATCAAGGCTGTGCTGAACAGATTCAATACTTTTACCAAAGTTCATTACA
GAGATGACCCGACCATTATGGCTTGGGAGCTCATGAACGAGCCTCGCTGTCCTTCAGATC
CAAGCGGACGAACCAT

QA 3 678 3 678
DS 



AS 1 2

CO CL7252Contig1 858 2 2 U
GGAGATAAAACTTATGGAAAGAGAGAGAGAAACGAGACTTACCTGGAGCGATTAAGGATC
CGGATCCGATACCTGAACATGCCAAAAGGGTGGATCAAGTTCACGTCATTACATTGCAAG
TCAAAGGCTTTCGATGATGTCTACGACTTTAACAGTTACAGTTGTAGAAAGAGCTCACAT
TGTAGCAAAGACGTGATCGATACAAGAATAGGTAAGAAAAGCGACCCGAAATTAAGGCGT
TTGAAGTCATTTCGAACTGAACCGGAGCTTAACCCGCCTACCCGGACCCGACGGAGCAAA
TCTGCCCGAACATCCGACGCGCTGACCGAGTTGCCCAATGGCCACCCGTCAAGAAACGTA
GTGGAGATTATATTCCAGTCTAGCTGGAGCTCCGAGTAGTTTCCGGGTCGGGTTGAGGTG
ATTTACAAAGTGGAAAACGGGTCAAGAACTGTGACCCGGTTCGAGGAGTACAGAGAGGTT
GTGAAGTCACGTGCGGGTGTAAACGGGGATGGAGACGGTACTTGTGAAGAAGACGTACGG
TGCTTGGCTGACGGTAACGAGATGATGAGGTTTTATCCACTCCCTGACGGGGTTAACGGC
GGCGCGTGGGCTTTTGCCGGCGGGAAAGGTCAGGCTGTGCGTACTTTTTCAAGTAGCGGT
GAAGCGCATGCGAGCGGCGGAGGTGGCGGAGGAAGGAGGGCGATGCTGATATGTCGGGTG
ATAGCGGGTCAGGTTGCTAATAGAATCGGGTTCGGGTCGGACTCAGTAGCTGGTCGTGAC
GGTGAGTTATATGTCTTTGATACGCGAGTGGTGTTGCCTTGTTTCCTAATCATTTTCAGA
TTGTAAAAATAATAGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV76TF U 1
AF RR2CV76JQ C 85
BS 1 682 RR2CV76TF
BS 683 858 RR2CV76JQ

RD RR2CV76TF 690 0 0
GGAGATAAAACTTATGGAAAGAGAGAGAGAAACGAGACTTACCTGGAGCGATTAAGGATC
CGGATCCGATACCTGAACATGCCAAAAGGGTGGATCAAGTTCACGTCATTACATTGCAAG
TCAAAGGCTTTCGATGATGTCTACGACTTTAACAGTTACAGTTGTAGAAAGAGCTCACAT
TGTAGCAAAGACGTGATCGATACAAGAATAGGTAAGAAAAGCGACCCGAAATTAAGGCGT
TTGAAGTCATTTCGAACTGAACCGGAGCTTAACCCGCCTACCCGGACCCGACGGAGCAAA
TCTGCCCGAACATCCGACGCGCTGACCGAGTTGCCCAATGGCCACCCGTCAAGAAACGTA
GTGGAGATTATATTCCAGTCTAGCTGGAGCTCCGAGTAGTTTCCGGGTCGGGTTGAGGTG
ATTTACAAAGTGGAAAACGGGTCAAGAACTGTGACCCGGTTCGAGGAGTACAGAGAGGTT
GTGAAGTCACGTGCGGGTGTAAACGGGGATGGAGACGGTACTTGTGAAGAAGACGTACGG
TGCTTGGCTGACGGTAACGAGATGATGAGGTTTTATCCACTCCCTGACGGGGTTAACGGC
GGCGCGTGGGCTTTTGCCGGCGGGAAAGGTCAGGCTGTGCGTACTTTTTCAAGTAGCGGT
GAAGCGCATGCGAGCGGCGGAG
TGGCGGAG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2CV76JQ 774 0 0
AAAGGGTGGATCAAGTTCACGTCATTACATTGCAAGTCAAAGGCTTTCGATGATGTCTAC
GACTTTAACAGTTACAGTTGTAGAAAGAGCTCACATTGTAGCAAAGACGTGATCGATACA
AGAATAGGTAAGAAAAGCGACCCGAAATTAAGGCGTTTGAAGTCATTTCGAACTGAACCG
GAGCTTAACCCGCCTACCCGGACCCGACGGAGCAAATCTGCCCGAACATCCGACGCGCTG
ACCGAGTTGCCCAATGGCCACCCGTCAAGAAACGTAGTGGAGATTATATTCCAGTCTAGC
TGGAGCTCCGAGTAGTTTCCGGGTCGGGTTGAGGTGATTTACAAAGTGGAAAACGGGTCA
AGAACTGTGACCCGGTTCGAGGAGTACAGAGAGGTTGTGAAGTCACGTGCGGGTGTAAAC
GGGGATGGAGACGGTACTTGTGAAGAAGACGTACGGTGCTTGGCTGACGGTAACGAGATG
ATGAGGTTTTATCCACTCCCTGACGGGGTTAACGGCGGCGCGTGGGCTTTTGCCGGCGGG
AAAGGTCAGGCTGTGCGTACTTTTTCAAGTAGCGGTGAAGCGCATGCGAGCGGCGGAGGT
GGCGGAGGAAGGAGGGCGATGCTGATATGTCGGGTGATAGCGGGTCAGGTTGCTAATAGA
ATCGGGTTCGGGTCGGACTCAGTAGCTGGTCGTGACGGTGAGTTATATGTCTTTGATACG
CGAGTGGTGTTGCCTTGTTTCCTAATCATTTTCAGATTGTAAAAATAATAGTAA

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL7253Contig1 1160 2 2 U
GGGGATTGCACGTAGAGTGCAGAGCAATGAGCACCCTTTACCTCCCTCCGAGATTTGACA
TTCACGGTGGTACTGCAAATCTGAAATTCCCGCACCATGAAAACGTGATTGCCCAGACTT
GTTGTGAAGAAGATAGTAGTGGTGCGAATTTCTGGTTGCACAGTGAGCAAGTCATCTACA
ACGACGACCATAAGTTGCGAAGACATGGTCGATATATTACAATTGGAGAAATGATGGTCG
TGTTTCACCCACTGGCTGTGAGATACTTCTTGATGAGTGTGCACTACCGCACTTCCCTGA
CCTATACCAAGCACGAGCTAGAGGTTTCGTCAGACTCTTTGTATAATGTATATCAGACAT
TACAAGATCTTGTTGAAGCTCTGGCTCCATATCAAGAAGCACTAAAAGACAAGAATAGAA
AGTACTATAAGCAGACTTCAGAAGCTCAAGACGCTATTAAGAAATTGTGGAGGGATTTTG
AAGAGAAAATGTCAGACGACCTGAACTCACCTCACATACTCAGAGACGCGTTGCCAAGAA
CGATGAAACTCATCAAGGTTTTCATCACCAAACTCAAGAAGAAAACGAAGAGGATGTCGC
TGGTTGTGTCGCTGGTGGAGCTCGAGAAAGCAGCGAGGGGAATCCTCGATGTGCTTGGTC
TGCTCACGAGTCTGAGCTACGAAGAGGTTTTGAAAGAGATGAAACAAAAGGCATTAGGAA
GAGGAAACTTAGGGGAAGAAGAAGTATTACAGTTGATTGAAGAAAGGAAAACGAGACGGA
ACCTGAAAGACTTTGAGAGAAGCGACAAGATTAGAGCTTGGTTGAAAAGCAGAGGAATCT
CCCTCATGGATATTCCTGGAGGAAAAGACACTCTGTGGAGGCCCTCCTTCCTTTTCAGCC
CTCAGCCTAAACCTGGAAAATGATACTCTGTGGAGGCCCATGCTCCCTTGCAGCTCTAAG
CCTTAACCTGGCGAGTCAAAGGCAACACCTCCTTGATCATTTTAAACTTATGCTTCTTGT
GCAGCGTAATGAACTCTTTTTATGTGTCTACTCCTCTTTTTTAATTTATGTTTTGTTGTC
TTCCAATGGAAGACATATTGATGACTTAGGGCCTTATGTTTAAACAAATGCTGTGTGTTT
TATATAAGCCTTTATTGGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F141TF U 1
AF RR2F141JQ C 306
BS 1 706 RR2F141TF
BS 707 1160 RR2F141JQ

RD RR2F141TF 706 0 0
GGGGATTGCACGTAGAGTGCAGAGCAATGAGCACCCTTTACCTCCCTCCGAGATTTGACA
TTCACGGTGGTACTGCAAATCTGAAATTCCCGCACCATGAAAACGTGATTGCCCAGACTT
GTTGTGAAGAAGATAGTAGTGGTGCGAATTTCTGGTTGCACAGTGAGCAAGTCATCTACA
ACGACGACCATAAGTTGCGAAGACATGGTCGATATATTACAATTGGAGAAATGATGGTCG
TGTTTCACCCACTGGCTGTGAGATACTTCTTGATGAGTGTGCACTACCGCACTTCCCTGA
CCTATACCAAGCACGAGCTAGAGGTTTCGTCAGACTCTTTGTATAATGTATATCAGACAT
TACAAGATCTTGTTGAAGCTCTGGCTCCATATCAAGAAGCACTAAAAGACAAGAATAGAA
AGTACTATAAGCAGACTTCAGAAGCTCAAGACGCTATTAAGAAATTGTGGAGGGATTTTG
AAGAGAAAATGTCAGACGACCTGAACTCACCTCACATACTCAGAGACGCGTTGCCAAGAA
CGATGAAACTCATCAAGGTTTTCATCACCAAACTCAAGAAGAAAACGAAGAGGATGTCGC
TGGTTGTGTCGCTGGTGGAGCTCGAGAAAGCAGCGAGGGGAATCCTCGATGTGCTTGGTC
TGCTCACGAGTCTGAGCTACGAAGAGGTTTTGAAAGAGATGAAACA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RR2F141JQ 855 0 0
ACCAAGCACGAGCTAGAGGTTTCGTCAGACTCTTTGTATAATGTATATCAGACATTACAA
GATCTTGTTGAAGCTCTGGCTCCATATCAAGAAGCACTAAAAGACAAGAATAGAAAGTAC
TATAAGCAGACTTCAGAAGCTCAAGACGCTATTAAGAAATTGTGGAGGGATTTTGAAGAG
AAAATGTCAGACGACCTGAACTCACCTCACATACTCAGAGACGCGTTGCCAAGAACGATG
AAACTCATCAAGGTTTTCATCACCAAACTCAAGAAGAAAACGAAGAGGATGTCGCTGGTT
GTGTCGCTGGTGGAGCTCGAGAAAGCAGCGAGGGGAATCCTCGATGTGCTTGGTCTGCTC
ACGAGTCTGAGCTACGAAGAGGTTTTGAAAGAGATGAAACAAAAGGCATTAGGAAGAGGA
AACTTAGGGGAAGAAGAAGTATTACAGTTGATTGAAGAAAGGAAAACGAGACGGAACCTG
AAAGACTTTGAGAGAAGCGACAAGATTAGAGCTTGGTTGAAAAGCAGAGGAATCTCCCTC
ATGGATATTCCTGGAGGAAAAGACACTCTGTGGAGGCCCTCCTTCCTTTTCAGCCCTCAG
CCTAAACCTGGAAAATGATACTCTGTGGAGGCCCATGCTCCCTTGCAGCTCTAAGCCTTA
ACCTGGCGAGTCAAAGGCAACACCTCCTTGATCATTTTAAACTTATGCTTCTTGTGCAGC
GTAATGAACTCTTTTTATGTGTCTACTCCTCTTTTTTAATTTATGTTTTGTTGTCTTCCA
ATGGAAGACATATTGATGACTTAGGGCCTTATGTTTAAACAAATGCTGTGTGTTTTATAT
AAGCCTTTATTGGAA

QA 1 855 1 855
DS 



AS 1 2

CO CL7254Contig1 1325 2 2 U
TTTTTCTCATCTCCCAAGAAAGAAAGAAATTTTTTAACCATGAAGTAACCTTTCCTCCTC
CTCCTTCCTCTCCCCCCTCTCTGCGTCGAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCAAACTCTCGTC
AACAAACAAAGCACCACCTTCTCAGCTTCGATCTCTTCTTAATCAAAACTAATGGATCTC
GCGGCGGAGGAGCTTCAATTTCTCAGCATCGGAGGCATACTCCGTGAATCCACCACGATC
CCCAAATTCTCCCCGAGAACATTCTACCTCATAACCCTAACCCTAATCTTCCCTCTCTCC
TTCGCCATCCTCGCCCATTCCCTCTTCACTCAACCCATCCTCAACCAGCTCGACGCTTCC
CCTCCCTCCGCCGACCAGTCTCAGACCAACCACCAATGGACTCTCCTCTTCGTCTACCAG
TTCATCTACATCATCTTCCTCTTCGTCTTCCCTCTCCTCTCCACCGCCGCCGTCGTCTTC
ACCGTCGCCTCCCTCTACACGAGCAAACCCGTTTCCTTCTCCTCCACCATGTCGGCCATC
CCTCTCGTCCTCAAACGCCTCTTCATCACTTTCCTCTGGGTCTCTCTCTGTATGCTCCTC
TACAACTCCGTCTTCTTGATGTTCCTCGTCATCCTCATCGTCGCCATCGACCTCCAGAGC
GTGATCCTCGCTGTCTTCTCAATGGTTATCATCTTCATTCTGTTTCTTGGCGTTCACGTT
TACATGACTGCTTGGTGGCATTTAGCTAGCGTTGTCTCGGTTCTCGAACCCGTCTATGGG
ATCGCCGCCATGAGGAAGAGCTACGAGTTGCTTAAAGGGAGGACTCACATGGCGTGTTCC
ATGGTGTTTATGTATCTTGCTCTTTGCGGGTTCATCGCCGGTGTTTTCGGAGGCGTGGTG
GTTCGTGGAGGAGATGAGTTCGGGTTGTTTGCGAGGATTGTTGTTGGAGGGTTCTTGGTT
GGTGTTTTAGTCGTTGTGAATCTTGTTGGGTTGCTTGTGCAGAGTGTCTTTTACTATGTC
TGCAAGAGCTTTCACCATCAGGCCATTGATAAGTCCGCCTTGCACGATCATCTTGGTGGG
TATCTTGGTGACTATGTGCCTTTAAAGAGCAGTGTTCAGATGGAGAATTTTGACATTTGA
AATAATCAAATGAAAGGATAAAAATTGTAATGTTTGTAATGCTTTATAGTGTTTGTTGTT
ATAGCTTTTATCTGAATTAATCTGGGGGACTAGACTGATATTGCAGATGTGTGTATGTTC
CCTGTAATCTTTGTAGTGTGTTTTGTTCCAAATTGGAAGGTTAATGAAATAAAAGTTGTT
ACTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2G080TF U 1
AF RR2G080JQ C 526
BS 1 748 RR2G080TF
BS 749 1325 RR2G080JQ

RD RR2G080TF 748 0 0
TTTTTCTCATCTCCCAAGAAAGAAAGAAATTTTTTAACCATGAAGTAACCTTTCCTCCTC
CTCCTTCCTCTCCCCCCTCTCTGCGTCGAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCAAACTCTCGTC
AACAAACAAAGCACCACCTTCTCAGCTTCGATCTCTTCTTAATCAAAACTAATGGATCTC
GCGGCGGAGGAGCTTCAATTTCTCAGCATCGGAGGCATACTCCGTGAATCCACCACGATC
CCCAAATTCTCCCCGAGAACATTCTACCTCATAACCCTAACCCTAATCTTCCCTCTCTCC
TTCGCCATCCTCGCCCATTCCCTCTTCACTCAACCCATCCTCAACCAGCTCGACGCTTCC
CCTCCCTCCGCCGACCAGTCTCAGACCAACCACCAATGGACTCTCCTCTTCGTCTACCAG
TTCATCTACATCATCTTCCTCTTCGTCTTCCCTCTCCTCTCCACCGCCGCCGTCGTCTTC
ACCGTCGCCTCCCTCTACACGAGCAAACCCGTTTCCTTCTCCTCCACCATGTCGGCCATC
CCTCTCGTCCTCAAACGCCTCTTCATCACTTTCCTCTGGGTCTCTCTCTGTATGCTCCTC
TACAACTCCGTCTTCTTGATGTTCCTCGTCATCCTCATCGTCGCCATCGACCTCCAGAGC
GTGATCCTCGCTGTCTTCTCAATGGTTATCATCTTCATTCTGTTTCTTGGCGTTCACGTT
TACATGACTGCTTGGTGGCATTTAGCTA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2G080JQ 800 0 0
ACCATGTCGGCCATCCCTCTCGTC*TCAAACGCCTCTTCATCACTTTCCTCTGGGTCTCT
CTCTGTATGCTCCTCTACAACTCCGTCTTCTTGATGTTCCTCGTCATCCTCATCGTCGCC
ATCGACCTCCAGAGCGTGATCCTCGCTGTCTTCTCAATGGTTATCATCTTCATTCTGTTT
CTTGGCGTTCACGTTTACATGACTGCTTGGTGGCATTTAGCTAGCGTTGTCTCGGTTCTC
GAACCCGTCTATGGGATCGCCGCCATGAGGAAGAGCTACGAGTTGCTTAAAGGGAGGACT
CACATGGCGTGTTCCATGGTGTTTATGTATCTTGCTCTTTGCGGGTTCATCGCCGGTGTT
TTCGGAGGCGTGGTGGTTCGTGGAGGAGATGAGTTCGGGTTGTTTGCGAGGATTGTTGTT
GGAGGGTTCTTGGTTGGTGTTTTAGTCGTTGTGAATCTTGTTGGGTTGCTTGTGCAGAGT
GTCTTTTACTATGTCTGCAAGAGCTTTCACCATCAGGCCATTGATAAGTCCGCCTTGCAC
GATCATCTTGGTGGGTATCTTGGTGACTATGTGCCTTTAAAGAGCAGTGTTCAGATGGAG
AATTTTGACATTTGAAATAATCAAATGAAAGGATAAAAATTGTAATGTTTGTAATGCTTT
ATAGTGTTTGTTGTTATAGCTTTTATCTGAATTAATCTGGGGGACTAGACTGATATTGCA
GATGTGTGTATGTTCCCTGTAATCTTTGTAGTGTGTTTTGTTCCAAATTGGAAGGTTAAT
GAAATAAAAGTTGTTACTAG

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL7255Contig1 722 2 3 U
GCAGCTAGTGTCCGATACTGTCTACGATTCAGGAGTGCTCGATAAGCTTCTTGAAGTTCA
GAAGCTGGACAAGCTAGACATTGAAGGAGCGATTCATTGTTATTACAATATAATCAACCA
GCCTTTTCCTATATGTAAAGAAGCTGGAACGTTGGAGGAGGAGGAGTCTCTGCATTGTTT
ACCTTTAGATGAAAGCTTGAAGATAGTCAAGGACTATCTGATTGCTGCAACTGCTAAGGA
CTGTAGTCTTATGATCAGTTTTCGATTGAGGAATGAATTGGATTCAGCACCTTCTTGTGA
TGCCGTCTCTCTAAAATCGACCAATCAGACGTTTGATTACAAGGTACATTTCATTGATTT
AAGCATGAAACCATTGAAGAGAATGGAGGCATACTACAAACTGGATAACAAGATAGTTAG
CTTCTACACTCGGAAGCAGAAGGGAGAAGAACAAGTCAGCGATCCAAAACGTTCAGATAG
CTAAAGGTCATGGATTGTCTCAACCACCACGAGTTTGTTTGTTTATTTGTTTTGTTGTTG
TTAAAAGATAAAAACTAAAAACCCAAAAGGTGACTGTTCATTTCACGAAATACTTGCATC
AAATGTTGGGTTTATTAAAACCCTTTCGACCAATACTTGTTTCTCTACCTCTTTGTGTGC
TTTCATGGACTGGTAATCATAATGATGTGAGGACCTGAACAGACAGGTTCGGTTGTTTGG
AC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2H886TF U 36
AF RR2H886JQ C 1
BS 1 35 RR2H886JQ
BS 36 547 RR2H886TF
BS 548 722 RR2H886JQ

RD RR2H886TF 512 0 0
TGCTCGATAAGCTTCTTGAAGTTCAGAAGCTGGACAAGCTAGACATTGAAGGAGCGATTC
ATTGTTATTACAATATAATCAACCAGCCTTTTCCTATATGTAAAGAAGCTGGAACGTTGG
AGGAGGAGGAGTCTCTGCATTGTTTACCTTTAGATGAAAGCTTGAAGATAGTCAAGGACT
ATCTGATTGCTGCAACTGCTAAGGACTGTAGTCTTATGATCAGTTTTCGATTGAGGAATG
AATTGGATTCAGCACCTTCTTGTGATGCCGTCTCTCTAAAATCGACCAATCAGACGTTTG
ATTACAAGGTACATTTCATTGATTTAAGCATGAAACCATTGAAGAGAATGGAGGCATACT
ACAAACTGGATAACAAGATAGTTAGCTTCTACACTCGGAAGCAGAAGGGAGAAGAACAAG
TCAGCGATCCAAAACGTTCAGATAGCTAAAGGTCATGGATTGTCTCAACCACCACGAGTT
TGTTTGTTTATTTGTTTTGTTGTTGTTAAAAG

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2H886JQ 722 0 0
GCAGCTAGTGTCCGATACTGTCTACGATTCAGGAGTGCTCGATAAGCTTCTTGAAGTTCA
GAAGCTGGACAAGCTAGACATTGAAGGAGCGATTCATTGTTATTACAATATAATCAACCA
GCCTTTTCCTATATGTAAAGAAGCTGGAACGTTGGAGGAGGAGGAGTCTCTGCATTGTTT
ACCTTTAGATGAAAGCTTGAAGATAGTCAAGGACTATCTGATTGCTGCAACTGCTAAGGA
CTGTAGTCTTATGATCAGTTTTCGATTGAGGAATGAATTGGATTCAGCACCTTCTTGTGA
TGCCGTCTCTCTAAAATCGACCAATCAGACGTTTGATTACAAGGTACATTTCATTGATTT
AAGCATGAAACCATTGAAGAGAATGGAGGCATACTACAAACTGGATAACAAGATAGTTAG
CTTCTACACTCGGAAGCAGAAGGGAGAAGAACAAGTCAGCGATCCAAAACGTTCAGATAG
CTAAAGGTCATGGATTGTCTCAACCACCACGAGTTTGTTTGTTTATTTGTTTTGTTGTTG
TTAAAAGATAAAAACTAAAAACCCAAAAGGTGACTGTTCATTTCACGAAATACTTGCATC
AAATGTTGGGTTTATTAAAACCCTTTCGACCAATACTTGTTTCTCTACCTCTTTGTGTGC
TTTCATGGACTGGTAATCATAATGATGTGAGGACCTGAACAGACAGGTTCGGTTGTTTGG
AC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL7256Contig1 889 2 8 U
GGACTGGTGATGCTGCTGCTGAGTCTGACTCTTCATCGTCATCCAGCAGTGAAAGTGAAA
CATATGAGGAGGGAAAGGATGTTAAAAATGACTTTATCCAATTAACCAAGAGTCACGCTC
TGTTAAATGCCGAGCACAGCGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAACATTGCTTCTAGGCAACA
ACAATGAAAATAAAGCAGAAACAGAAGACAAGACAAAGTGCAAAGATCTAGCTTTATTTG
ACACGGCAGCGGCAACAACAACAACAACAACAAGCAAGTCGGAGCAGGACATAATTGAAC
TTCTCAGCCTAACTTTGTCAACAACAGCCCTGCCGTCCCCACAAACGCAGGCTCCACCAA
ACACAAGGTTTTTGGCTGATGATCATATTCTTATGAACAGTTACGTAGTCCCATGGGCAC
AATCACAGGCAGAAGCTCAAGTCCCAAATATGGCGCAGTTTGCTCCATCGGGACCTCAGT
TTCAGCAGCACGAATTTTCATATGGTTATCCTCAGGCACAATGGAACGGTGGTCAAGCAA
ACTATTATAATGACACAGCACGGTGGAGCCAAGGAGGTAGTGAGAATAAGGTATTTGAGC
GAAACTTGCAATACTCAAACTCCTTTCCAGCTAGAGGAGGGGCGGGGGAACCATCAGGTG
CGGAGGTTGAGGGGCAGGCTCAGCAGCAGCCGCAGAGGCCGTATGTTCCTCCTTACAAAT
TGTTTGAAGATTTGAATGTTTTCTGGAAGGGAGATGGAGGCGTTAGGAGTAGCAAATGAG
ATTTTCTTGTGATCCCAAAAGATTAATAAACTGAATAACAATATATAATTTTTGCCTTTG
CTGCAAAGATGGAACAAATAAAAGAGATCCTACTTTGAATTCTTTACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW25TF U 1
AF RR2FW25JQ C 271
BS 1 657 RR2FW25TF
BS 658 658 RR2FW25JQ
BS 659 677 RR2FW25TF
BS 678 678 RR2FW25JQ
BS 679 697 RR2FW25TF
BS 698 698 RR2FW25JQ
BS 699 727 RR2FW25TF
BS 728 889 RR2FW25JQ

RD RR2FW25TF 736 0 0
GGACTGGTGATGCTGCTGCTGAGTCTGACTCTTCATCGTCATCCAGCAGTGAAAGTGAAA
CATATGAGGAGGGAAAGGATGTTAAAAATGACTTTATCCAATTAACCAAGAGTCACGCTC
TGTTAAATGCCGAGCACAGCGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAACATTGCTTCTAGGCAACA
ACAATGAAAATAAAGCAGAAACAGAAGACAAGACAAAGTGCAAAGATCTAGCTTTATTTG
ACACGGCAGCGGCAACAACAACAACAACAACAAGCAAGTCGGAGCAGGACATAATTGAAC
TTCTCAGCCTAACTTTGTCAACAACAGCCCTGCCGTCCCCACAAACGCAGGCTCCACCAA
ACACAAGGTTTTTGGCTGATGATCATATTCTTATGAACAGTTACGTAGTCCCATGGGCAC
AATCACAGGCAGAAGCTCAAGTCCCAAATATGGCGCAGTTTGCTCCATCGGGACCTCAGT
TTCAGCAGCACGAATTTTCATATGGTTATCCTCAGGCACAATGGAACGGTGGTCAAGCAA
ACTATTATAATGACACAGCACGGTGGAGCCAAGGAGGTAGTGAGAATAAGGTATTTGAGC
GAAACTTGCAATACTCAAACTCCTTTCCAGCTAGAGGAGGGGCGGGGGAACCATCAG*TG
CGGAGGTTGAGGGGCAG*CTCAGCAGCAGCCGCAGAG*CCGTATGTTCCTCCTTACAAAT
TGTTTGA
GATCTGAAT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2FW25JQ 619 0 0
CAAGCAAGTCGGAGCAGGACATAATTGAACTTCTCAGCCTAACTTTGTCAACAACAGCCC
TGCCGTCCCCACAAACGCAGGCTCCACCAAACACAAGGTTTTTGGCTGATGATCATATTC
TTATGAACAGTTACGTAGTCCCATGGGCACAATCACAGGCAGAAGCTCAAGTCCCAAATA
TGGCGCAGTTTGCTCCATCGGGACCTCAGTTTCAGCAGCACGAATTTTCATATGGTTATC
CTCAGGCACAATGGAACGGTGGTCAAGCAAACTATTATAATGACACAGCACGGTGGAGCC
AAGGAGGTAGTGAGAATAAGGTATTTGAGCGAAACTTGCAATACTCAAACTCCTTTCCAG
CTAGAGGAGGGGCGGGGGAACCATCAGGTGCGGAGGTTGAGGGGCAGGCTCAGCAGCAGC
CGCAGAGGCCGTATGTTCCTCCTTACAAATTGTTTGAAGATTTGAATGTTTTCTGGAAGG
GAGATGGAGGCGTTAGGAGTAGCAAATGAGATTTTCTTGTGATCCCAAAAGATTAATAAA
CTGAATAACAATATATAATTTTTGCCTTTGCTGCAAAGATGGAACAAATAAAAGAGATCC
TACTTTGAATTCTTTACCG

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL7257Contig1 980 2 2 U
GGAAACCCTAGTCAATCGATTCACATTCTGAGCTCTAGTTAAGACGAAAATGTTGGAGCT
ACGTCTTGTCCAGGGCTCTCTGCTGAAGAAGGTTCTAGAATCGATCAAGGATCTCGTCAA
CGATGCCAACTTCGACTGCTCCAGCACCGGCTTCTCCCTCCAAGCCATGGACTCCAGCCA
CGTGGCGCTCGTCTCCCTCTTGCTGAGATCCGAAGGCTTCGAACACTACAGGTGCGATCG
TAACCTCTCCATGGGGATGAATCTCGGCAACATGTCGAAGATGCTCAAATGCGCCGGAAA
CGATGACATCATCACCATCAAAGCTGACGACGGCGGCGACACCGTCACCTTCATGTTCGA
GAGTCCCAAGCAAGACAAGATTGCAGATTTTGAAATGAAGCTGATGGATATAGACAGTGA
GCATCTGGGTATGCCTGATGCTGAATACCAGTCCATTGTGAGGATGCCTTCCAATGAGTT
CTCAAGGATTTGCAAAGATCTCAGTAGCATTGGTGACACAGTTGTGATCTCTGTGACTAA
AGAAGGAGTTAAGTTTTCTACTGCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTGTTAAGACA
GAACACAACTGTTGACAAGCCGGAAGATGCAATTGTGATAGAGATGAAGGAGCCAGTGTC
ACTCTCGTTTGCCCTGAGGTACATGAATTCCTTCACAAAGGCAACTCCATTGTCAGACAC
GGTGACAATCAGCTTATCGTTTGAGCTGCCGGTTGTGGTGGAGTATAAGGTGGCTGAGAT
GGGTTACATTCGTTACTACTTGGCTCCGAAGATTGAAGAAGATGAAGAAGACACCAAGGC
CTAAGACCCCTTTGTATCCAGAACTTTTTCTGTCCGTCCTAAAATGTCCAAGATTCATGA
TGTTTTTGTGTGATTCCATTAAATTACCCTTTAGAATCAGTTGTTTTGTTTGACTTGGTA
TGTTCTAATGACATGTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES61TF U 1
AF RR2ES61JQ C 120
BS 1 644 RR2ES61TF
BS 645 980 RR2ES61JQ

RD RR2ES61TF 644 0 0
GGAAACCCTAGTCAATCGATTCACATTCTGAGCTCTAGTTAAGACGAAAATGTTGGAGCT
ACGTCTTGTCCAGGGCTCTCTGCTGAAGAAGGTTCTAGAATCGATCAAGGATCTCGTCAA
CGATGCCAACTTCGACTGCTCCAGCACCGGCTTCTCCCTCCAAGCCATGGACTCCAGCCA
CGTGGCGCTCGTCTCCCTCTTGCTGAGATCCGAAGGCTTCGAACACTACAGGTGCGATCG
TAACCTCTCCATGGGGATGAATCTCGGCAACATGTCGAAGATGCTCAAATGCGCCGGAAA
CGATGACATCATCACCATCAAAGCTGACGACGGCGGCGACACCGTCACCTTCATGTTCGA
GAGTCCCAAGCAAGACAAGATTGCAGATTTTGAAATGAAGCTGATGGATATAGACAGTGA
GCATCTGGGTATGCCTGATGCTGAATACCAGTCCATTGTGAGGATGCCTTCCAATGAGTT
CTCAAGGATTTGCAAAGATCTCAGTAGCATTGGTGACACAGTTGTGATCTCTGTGACTAA
AGAAGGAGTTAAGTTTTCTACTGCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTGTTAAGACA
GAACACAACTGTTGACAAGCCGGAAGATGCAATTGTGATAGAGA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2ES61JQ 861 0 0
ACGATGCCAACTTCGACTGCTCCAGCAC*GGCTTCTCCCTCCAAGCCATG*ACTCCAGCC
ACGTGGCGCTCGTCTCCCTCTTGCTGAGATCCGAAGGCTTCGAACACTACAGGTGCGATC
GTAACCTCTCCATGGGGATGAATCTCGGCAACATGTCGAAGATGCTCAAATGCGCCGGAA
ACGATGACATCATCACCATCAAAGCTGACGACGGCGGCGACACCGTCACCTTCATGTTCG
AGAGTCCCAAGCAAGACAAGATTGCAGATTTTGAAATGAAGCTGATGGATATAGACAGTG
AGCATCTGGGTATGCCTGATGCTGAATACCAGTCCATTGTGAGGATGCCTTCCAATGAGT
TCTCAAGGATTTGCAAAGATCTCAGTAGCATTGGTGACACAGTTGTGATCTCTGTGACTA
AAGAAGGAGTTAAGTTTTTTACTGCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTGTTAAGAC
AGAACACAACTGTTGACAAGCCGGAAGATGCAATTGTGATAGAGATGAAGGAGCCAGTGT
CACTCTCGTTTGCCCTGAGGTACATGAATTCCTTCACAAAGGCAACTCCATTGTCAGACA
CGGTGACAATCAGCTTATCGTTTGAGCTGCCGGTTGTGGTGGAGTATAAGGTGGCTGAGA
TGGGTTACATTCGTTACTACTTGGCTCCGAAGATTGAAGAAGATGAAGAAGACACCAAGG
CCTAAGACCCCTTTGTATCCAGAACTTTTTCTGTCCGTCCTAAAATGTCCAAGATTCATG
ATGTTTTTGTGTGATTCCATTAAATTACCCTTTAGAATCAGTTGTTTTGTTTGACTTGGT
ATGTTCTAATGACATGTTTGG

QA 1 861 1 861
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7259Contig1 612 2 4 U
GGGCAACCGGCTGTGGTGGAGAGGAAAGGGTACTTATACGGTGGGGTGATGGCGTTGCTG
ATGGGGATAGTGGGAGTGATGAGGCTAAGCAAGAACACGCCGAGGAAGCTCACAGCGGCG
GATGTTGTGTACCCGGAGGGAGTGACGGTTATGCCGACGCAGGAGTATATGGCGATGGTC
AAGAAGATGACGGATCTCGAGGAGAAGTGCAAATCCATGGATGCTGCTCAGGCTGCTATT
TCTATGGAGAGGGAGAAGGTTCTTGACGCTGCGCTTCGTCGTGTTGAACAGCTCGAGCTT
CAGTTGTCTGAAACCAAGAAGGCGCTGGACGAGACGATGACGAGGCAACATGAGATAATG
GCTTACATCGAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAGAAAGTTCTGTTTTTTCTGAAAGAGTCCT
TCAGCCTCCTAAACTACATTTCCGTTTTCTACAAAATGGATTACTGGAGAAGATATATAT
ATAATGACGAAGTCTTGATTTGCATTGTTGTTGTTCAAAGACTCCAATCTCCCTTTTTGT
GTAATTGTTTCTCTTTAAAAATTAATAATATTTTTTCTTGTTAAACTTATAAATAAACTT
ATAATACTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C584TF U 1
AF RR2C584JQ C 1
BS 1 230 RR2C584TF
BS 231 231 RR2C584JQ
BS 232 528 RR2C584TF
BS 529 612 RR2C584JQ

RD RR2C584TF 528 0 0
GGGCAACCGGCTGTGGTGGAGAGGAAAGGGTACTTATACGGTGGGGTGATGGCGTTGCTG
ATGGGGATAGTGGGAGTGATGAGGCTAAGCAAGAACACGCCGAGGAAGCTCACAGCGGCG
GATGTTGTGTACCCGGAGGGAGTGACGGTTATGCCGACGCAGGAGTATATGGCGATGGTC
AAGAAGATGACGGATCTCGAGGAGAAGTGCAAATCCATGGATGCTGCTCATGCTGCTATT
TCTATGGAGAGGGAGAAGGTTCTTGACGCTGCGCTTCGTCGTGTTGAACAGCTCGAGCTT
CAGTTGTCTGAAACCAAGAAGGCGCTGGACGAGACGATGACGAGGCAACATGAGATAATG
GCTTACATCGAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAGAAAGTTCTGTTTTTTCTGAAAGAGTCCT
TCAGCCTCCTAAACTACATTTCCGTTTTCTACAAAATGGATTACTGGAGAAGATATATAT
ATAATGACGAAGTCTTGATTTGCATTGTTGTTGTTCAAAGACTCCAAT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2C584JQ 612 0 0
GGGCAACCGGCTGTGGTGGAGAGGAAAGGGTACTTATACGGTGGGGTGATGGCGTTGCTG
ATGGGGATAGTGGGAGTGATGAGGCTAAGCAAGAACACGCCGAGGAAGCTCACAGCGGCG
GATGTTGTGTACCCGGAGGGAGTGACGGTTATGCCGACGCAGGAGTATATGGCGATGGTC
AAGAAGATGACGGATCTCGAGGAGAAGTGCAAATCCATGGATGCTGCTCAGGCTGTTATT
TTTATGGAGAGGGAGAAGGTTCTTGACGCTGCGCTTCGTCGTGTTGAACAGCTCGAGCTT
CAGTTGTTTGAAACCAAGAAGGCGCTGGACGAGACGATGACGAGGCAACATGAGATAATG
GCTTACATCGAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAGAAAGTTCTGTTTTTTCTGAAAGAGTCCT
TCAGCCTCCTAAACTACATTTCCGTTTTCTACAAAATGGATTACTGGAGAAGATATATAT
ATAATGACGAAGTCTTGATTTGCATTGTTGTTGTTCAAAGACTCCAATCTCCCTTTTTGT
GTAATTGTTTCTCTTTAAAAATTAATAATATTTTTTCTTGTTAAACTTATAAATAAACTT
ATAATACTTTTT

QA 1 612 1 612
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7261Contig1 544 2 1 U
GATTTGCGACTGGAAAAGTGGTATACTACCTCTTCAGTCTTATTCTCTTCACATATGCAG
TGACAGAGTATGCTTGGAGCATATATCCTACGCAGCAACACGCCGCTGGCTTGGCTCTCA
GATTCATATTTCTTGCCAAAGCAATGTCACTAGCTCTCCAGGCCATACAAATCCGCTATG
GGCTACCTCATAAGAGCACCCTATACCGGCAGTTTCTGACAAGTGAAGTTTCAAGGATCA
ATTACTACGGCTACAGACTTTACCGTGCTCTTCCTTTCCTGTATGAACTGAGATGTGTAC
TTGACTGGTCCTGCACAGCCACATCACTGACAATGTATGACTGGCTCAAGTTGGAAGATG
TAAATGCGAGTTTGTACCTTGTCAAATGCGATACAGTTTTAAATCGAGCTACACACAAAC
ATGGGGAGAGGCAAACAAAAATGACTAAATGCTGTAACGGGATATGTCTCTTCTTCATCT
TGTTATGCGTTATATGGGCCCCTATGCTGGTAAAGATTTCTCCTTACAACGCATAAGTTT
TGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2AJ62JQ C 1
AF RR2AJ62TF U 1
BS 1 544 RR2AJ62TF

RD RR2AJ62JQ 544 0 0
GATTTGCGACTGGAAAAGTGGTATACTACCTCTTCAGTTTTATTCTCTTCACATATGCAG
TGACAGAGTATGCTTGGAGCATATATCCTACGCAGCAACACGCCGCTGGCTTGGCTTTCA
GATTCATATTTCTTGCCAAAGCAATGTCACTAGCTTTCCAGGCCATACAAATCCGCTATG
GGCTACCTCATAAGAGCACCCTATACCGGCAGTTTTTGACAAGTGAAGTTTCAAGGATCA
ATTACTACGGCTACAGACTTTACCGTGCTTTTCCTTTCCTGTATGAACTGAGATGTGTAC
TTGACTGGTCCTGCACAGCCACATCACTGACAATGTATGACTGGCTCAAGTTGGAAGATG
TAAATGCGAGTTTGTACCTTGTCAAATGCGATACAGTTTTAAATCGAGCTACACACAAAC
ATGGGGAGAGGCAAACAAAAATGACTAAATGCTGTAACGGGATATGTTTTTTTTTCATCT
TGTTATGCGTTATATGGGCCCCTATGCTGGTAAAGATTTCTCCTTACAACGCATAAGTTT
TGTT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2AJ62TF 544 0 0
GATTTGCGACTGGAAAAGTGGTATACTACCTCTTCAGTCTTATTCTCTTCACATATGCAG
TGACAGAGTATGCTTGGAGCATATATCCTACGCAGCAACACGCCGCTGGCTTGGCTCTCA
GATTCATATTTCTTGCCAAAGCAATGTCACTAGCTCTCCAGGCCATACAAATCCGCTATG
GGCTACCTCATAAGAGCACCCTATACCGGCAGTTTCTGACAAGTGAAGTTTCAAGGATCA
ATTACTACGGCTACAGACTTTACCGTGCTCTTCCTTTCCTGTATGAACTGAGATGTGTAC
TTGACTGGTCCTGCACAGCCACATCACTGACAATGTATGACTGGCTCAAGTTGGAAGATG
TAAATGCGAGTTTGTACCTTGTCAAATGCGATACAGTTTTAAATCGAGCTACACACAAAC
ATGGGGAGAGGCAAACAAAAATGACTAAATGCTGTAACGGGATATGTCTCTTCTTCATCT
TGTTATGCGTTATATGGGCCCCTATGCTGGTAAAGATTTCTCCTTACAACGCATAAGTTT
TGTT

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 2

CO CL7262Contig1 756 2 2 U
GGGACCATCTTGTCTGATCCCGTAACAGGGGCTTTGATGTCTGATGCTATGATTTTGCCT
TGCGGACACACTTTTGGAGCTGGAGGAATAGAACAAGTAAAACAAATGAAAGCTTGCTAC
ACTTGTTCTCAGCCAGTATCAGAAGACTCGATAACCCCAAATCTCACTCTGCGAGTTGCA
GTACAAGCATTCTGCCGAGAAGAGAAGTCACAGTCGAACCATTCATCTAAGCGAAAACGA
GAAGGATTTGATCAAGAGAGACGCACATTTGGTGACCCGACTTATACAAATCGTTCGAGG
AACAGAACTAATCATTTCCCTTTTGCTGTGGCAGATCGAGTTATAATAAAGGGAAACAAG
AGGACACCACCTCGTTTTGTAGGACGGGAAGCTGTTGACTACTCAATGCTTGAACGGCTG
GTATGTTGTGAAAACACTAGACAATGCAGAGAGTGTTAAGCTTCAGTATCGTTCACTGGC
CAAGGCCACAGAAGATCCATCAGCCAAGGCAACACCAAGCAAGTTGGTCTCCAACTGGCT
CTAAACAGACCTTCCTTGTGAAGAGACTACTTTCTGATAGTACGTTCTCTTATGTAAGGA
ACCAAAACTTATCTACAGATCCATATAGATAACAGTTACATATTGTAAATTATTCTAGTT
GCTCCATTGTCATATGTTTGAAGAAATTAGGTACTAATAGCTTTGTATGATATAATATAC
ATAGTTATAATGCTCTCAATTTTGTTTTATCTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG68TF U 1
AF RR2EG68JQ C 229
BS 1 744 RR2EG68TF
BS 745 756 RR2EG68JQ

RD RR2EG68TF 744 0 0
GGGACCATCTTGTCTGATCCCGTAACAGGGGCTTTGATGTCTGATGCTATGATTTTGCCT
TGCGGACACACTTTTGGAGCTGGAGGAATAGAACAAGTAAAACAAATGAAAGCTTGCTAC
ACTTGTTCTCAGCCAGTATCAGAAGACTCGATAACCCCAAATCTCACTCTGCGAGTTGCA
GTACAAGCATTCTGCCGAGAAGAGAAGTCACAGTCGAACCATTCATCTAAGCGAAAACGA
GAAGGATTTGATCAAGAGAGACGCACATTTGGTGACCCGACTTATACAAATCGTTCGAGG
AACAGAACTAATCATTTCCCTTTTGCTGTGGCAGATCGAGTTATAATAAAGGGAAACAAG
AGGACACCACCTCGTTTTGTAGGACGGGAAGCTGTTGACTACTCAATGCTTGAACGGCTG
GTATGTTGTGAAAACACTAGACAATGCAGAGAGTGTTAAGCTTCAGTATCGTTCACTGGC
CAAGGCCACAGAAGATCCATCAGCCAAGGCAACACCAAGCAAGTTGGTCTCCAACTGGCT
CTAAACAGACCTTCCTTGTGAAGAGACTACTTTCTGATAGTACGTTCTCTTATGTAAGGA
ACCAAAACTTATCTACAGATCCATATAGATAACAGTTACATATTGTAAATTATTCTAGTT
GCTCCATTGTCATATGTTTGAAGAAATTAGGTACTAATAGCTTTGTATGATATAATATAC
ATAGTTATAATGCTCTCAATTTTG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2EG68JQ 528 0 0
AAGCGAAAACGAGAAGGATTTGATCAAGAGAGACGCACATTTGGTGACCCGACTTATACA
AATCGTTCGAGGAACAGAACTAATCATTTCCCTTTTGCTGTGGCAGATCGAGTTATAATA
AAGGGAAACAAGAGGACACCACCTCGTTTTGTAGGACGGGAAGCTGTTGACTACTCAATG
CTTGAACGGCTGGTATGTTGTGAAAACACTAGACAATGCAGAGAGTGTTAAGCTTCAGTA
TCGTTCACTGGCCAAGGCCACAGAAGATCCATCAGCCAAGGCAACACCAAGCAAGTTGGT
CTCCAACTGGCTCTAAACAGACCTTCCTTGTGAAGAGACTACTTTCTGATAGTACGTTTT
CTTATGTAAGGAACCAAAACTTATCTACAGATCCATATAGATAACAGTTACATATTGTAA
ATTATTCTAGTTGCTCCATTGTCATATGTTTGAAGAAATTAGGTACTAATAGCTTTGTAT
GATATAATATACATAGTTATAATGCTCTCAATTTTGTTTTATCTATCC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL7263Contig1 634 2 1 U
GGGAAAAAACCCTAGTTCCGCATCAGAAGATCGGAGGGCGAGAGAACAAAATGGCGACAG
GCAAAACAGTGAAGGATGTGTCTCCACACGAGTTCGTCAAGGCTTACGCTGCCCATCTCA
AACGCTCCGGCAAGATTGAGCTGCCACCGTGGACAGACATAGTGAAGACTGGTAAACTCA
AGGAGCTTGCTCCTTATGACCCTGACTGGTACTACATCAGAGCCGCATCGATGGCAAGGA
AAGTGTACTTGAGAGGTGGGCTTGGAGTCGGTGCCTTCCGCAGGATCTATGGAGGAAGCA
AGAGGAACGGAAGCCGTCCTCCTCATTTCTGTAAGAGCAGTGGTTGTGTTGCTCGTCACA
TTCTTCAGCAGCTTTAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAGGGGGGGGAGGAAG
ATCACATCGAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTTGCGGGAAGGATCGCAGCTGCCGTT
TAAAAATCAAGATCGCAATGAACTGATTGTCATTTTTGAGATTAGTTGTAATCGAATGAG
TTGCGTTTTGAAACCAATAGTGGATAGACTTTCTTCTCCTTTCTTTTTGACGGTTTTTAT
TTCTTTTTGCTCTTGTATTCTCAGTTACTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GA21TF U 1
AF RR2GA21JQ C 119
BS 1 634 RR2GA21TF

RD RR2GA21TF 634 0 0
GGGAAAAAACCCTAGTTCCGCATCAGAAGATCGGAGGGCGAGAGAACAAAATGGCGACAG
GCAAAACAGTGAAGGATGTGTCTCCACACGAGTTCGTCAAGGCTTACGCTGCCCATCTCA
AACGCTCCGGCAAGATTGAGCTGCCACCGTGGACAGACATAGTGAAGACTGGTAAACTCA
AGGAGCTTGCTCCTTATGACCCTGACTGGTACTACATCAGAGCCGCATCGATGGCAAGGA
AAGTGTACTTGAGAGGTGGGCTTGGAGTCGGTGCCTTCCGCAGGATCTATGGAGGAAGCA
AGAGGAACGGAAGCCGTCCTCCTCATTTCTGTAAGAGCAGTGGTTGTGTTGCTCGTCACA
TTCTTCAGCAGCTTTAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAGGGGGGGGAGGAAG
ATCACATCGAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTTGCGGGAAGGATCGCAGCTGCCGTT
TAAAAATCAAGATCGCAATGAACTGATTGTCATTTTTGAGATTAGTTGTAATCGAATGAG
TTGCGTTTTGAAACCAATAGTGGATAGACTTTCTTCTCCTTTCTTTTTGACGGTTTTTAT
TTCTTTTTGCTCTTGTATTCTCAGTTACTTATCC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RR2GA21JQ 516 0 0
CAAACGCTCCGGCAAGATTGAGCTGCCACCGTGGACAGACATAGTGAAGACTGGTAAACT
CAAGGAGCTTGCTCCTTATGACCCTGACTGGTACTACATCAGAGCCGCATCGATGGCAAG
GAAAGTGTACTTGAGAGGTGGGCTTGGAGTCGGTGCCTTCCGCAGGATCTATGGAGGAAG
CAAGAGGAACGGAAGCCGTCCTCCTCATTTCTGTAAGAGCAGTGGTTGTGTTGCTCGTCA
CATTCTTCAGCAGCTTTAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAGGGGGGGGAGGA
AGATCACATCGAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTTGCGGGAAGGATCGCAGCTGCCG
TTTAAAAATCAAGATCGCAATGAACTGATTGTCATTTTTGAGATTAGTTGTAATCGAATG
AGTTGCGTTTTGAAACCAATAGTGGATAGACTTTTTTCTCCTTTCTTTTTGACGGTTTTT
ATTTCTTTTTGCTCTTGTATTCTCAGTTACTTATCC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL7264Contig1 490 2 2 U
GCACGACGGAGAGTGGGGCGAAGTTGGCAGTATTATCTTTTGGAACTACGTTCATGATGG
ACAAGCCAAGGTGGCGAAGGAGAGGATCGAAGCGGTGGAACCTGAGAAGAAACTGGTGAA
GTTTAGGGTTTTAGAGGGAGATCTGATGGAAGAGTTCAAGAGCTTTTTGATTACGATCCA
AGTTACCCCCTAAGCAAGAGAGGAAACGGAAGTATTGTGAAGTGGCACTTCGAGTATGAG
AAGATTGATGAGAACGTGTCTCACCCTGAGACTTTGCTCCCTTTCTTTGCGGAGATGATC
AAAGATATCGACGAACACCTCTTGTCCGAGGCATAGAGGAGAAAATTAATGTTATTTTCT
CCATGCGTTCTATAAATGTATTGAGTTGATGTTATGTTTTATGTTGTAAGTTGCAAATGT
GAAACTTCTGAGTGTATGATGTGATTATAATATTTATAATAAAAGCGAGTATCATACTTG
CTTGCTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G066JQ C 1
AF RR2G066TF U 164
BS 1 163 RR2G066JQ
BS 164 490 RR2G066TF

RD RR2G066JQ 490 0 0
GCACGACGGAGAGTGGGGCGAAGTTGGCAGTATTATCTTTTGGAACTACGTTCATGATGG
ACAAGCCAAGGTGGCGAAGGAGAGGATCGAAGCGGTGGAACCTGAGAAGAAACTGGTGAA
GTTTAGGGTTTTAGAGGGAGATCTGATGGAAGAGTTCAAGAGCTTTTTGATTACGATCCA
AGTTACCCC*TAAGCAAG*GAGGAAACGGAAGTATTGTGAAGTGGCACTTCGAGTATGAG
AAGATTGATGAGAACGTGTCTCACCCTGAGACTTTGCTCCCTTTCTTTGCGGAGATGATC
AAAGATATCGACGAACACCTCTTGTCCGAGGCATAGAGGAGAAAATTAATGTTATTTTCT
CCATGCGTTCTATAAATGTATTGAGTTGATGTTATGTTTTATGTTGTAAGTTGCAAATGT
GAAACTTCTGAGTGTATGATGTGATTATAATATTTATAATAAAAGCGAGTATCATACTTG
CTTGCTTGTC

QA 1 490 1 490
DS 

RD RR2G066TF 327 0 0
TTTTTGATTACGATCCAAGTTACCCCCTAAGCAAGAGAGGAAACGGAAGTATTGTGAAGT
GGCACTTCGAGTATGAGAAGATTGATGAGAACGTGTCTCACCCTGAGACTTTGCTCCCTT
TCTTTGCGGAGATGATCAAAGATATCGACGAACACCTCTTGTCCGAGGCATAGAGGAGAA
AATTAATGTTATTTTCTCCATGCGTTCTATAAATGTATTGAGTTGATGTTATGTTTTATG
TTGTAAGTTGCAAATGTGAAACTTCTGAGTGTATGATGTGATTATAATATTTATAATAAA
AGCGAGTATCATACTTGCTTGCTTGTC

QA 1 327 1 327
DS 



AS 1 2

CO CL7265Contig1 778 2 1 U
GGTTTGATCGGAGAAACCATAGATTCAATCAAATCTATTCAGTTCCGTCAGCTTCTCACT
CAGGCCATCAGTCTTGGGATGATTGTTACATCTGCTTTGATCATATGGAAAGCTTTGATG
TGCGTCACTGGCAGCGAATCTCCTGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGTATGGAACCTGGC
TTCAAGAGGGGAGATATACTGTTCTTGCACATGAGTAAGGACCCTATTCGAGCAGGAGAG
ATTGTTGTTTTCAATGTTGATGGTCGTGATATCCCCATTGTACATCGTGTCATTAAGGTT
CACAAAAGATGGGTTTGATCGGAGAAACCATGGATTCAATCAAATCTATTCAGTTCCGTC
AGCTTCTCACTCAGGCCATCAGTCTTGGGATGATTGTTACATCTGCTTTGATCATATGGA
AAGCTTTGATGTGCGTCACTGGCAGCGAATCTCCTGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGTA
TGGAACCTGGCTTCAAGAGGGGAGATATACTGTTCTTGCCTTACGTTGGATGGGTGACTA
TCATTATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTACATTCTCATAGGGGCATTGGGTTTACTCG
TTATAACGTCCAAAGATTGATCGACTTCTTTGGAAAGGCATGGGACTCTCGTTTTGTCAC
CCTTATGGTCATGTTGTTTTAAGAAGAAAATACAATTTAAAAGACTTGGTCATTTTGTGG
TTTAGACCACTTTAAACAGTAGAATCACAAGCTAATTTTTATTGTTATTGACCACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BB86TF U 1
AF RR2BB86JQ C 26
BS 1 778 RR2BB86TF

RD RR2BB86TF 778 0 0
GGTTTGATCGGAGAAACCATAGATTCAATCAAATCTATTCAGTTCCGTCAGCTTCTCACT
CAGGCCATCAGTCTTGGGATGATTGTTACATCTGCTTTGATCATATGGAAAGCTTTGATG
TGCGTCACTGGCAGCGAATCTCCTGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGTATGGAACCTGGC
TTCAAGAGGGGAGATATACTGTTCTTGCACATGAGTAAGGACCCTATTCGAGCAGGAGAG
ATTGTTGTTTTCAATGTTGATGGTCGTGATATCCCCATTGTACATCGTGTCATTAAGGTT
CACAAAAGATGGGTTTGATCGGAGAAACCATGGATTCAATCAAATCTATTCAGTTCCGTC
AGCTTCTCACTCAGGCCATCAGTCTTGGGATGATTGTTACATCTGCTTTGATCATATGGA
AAGCTTTGATGTGCGTCACTGGCAGCGAATCTCCTGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGTA
TGGAACCTGGCTTCAAGAGGGGAGATATACTGTTCTTGCCTTACGTTGGATGGGTGACTA
TCATTATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTACATTCTCATAGGGGCATTGGGTTTACTCG
TTATAACGTCCAAAGATTGATCGACTTCTTTGGAAAGGCATGGGACTCTCGTTTTGTCAC
CCTTATGGTCATGTTGTTTTAAGAAGAAAATACAATTTAAAAGACTTGGTCATTTTGTGG
TTTAGACCACTTTAAACAGTAGAATCACAAGCTAATTTTTATTGTTATTGACCACCCC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2BB86JQ 753 0 0
CAATCAAATCTATTCAGTTCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCATCAGTCTTGGGATGATTG
TTACATCTGCTTTGATCATATGGAAAGCTTTGATGTGCGTCACTGGCAGCGAATCTCCTG
TTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGTATGGAACCTGGCTTCAAGAGGGGAGATATACTGTTCT
TGCACATGAGTAAGGACCCTATTCGAGCAGGAGAGATTGTTGTTTTCAATGTTGATGGTC
GTGATATCCCCATTGTACATCGTGTCATTAAGGTTCACAAAAGATGGGTTTGATCGGAGA
AACCATGGATTCAATCAAATCTATTCAGTTCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCATCAGTCT
TGGGATGATTGTTACATCTGCTTTGATCATATGGAAAGCTTTGATGTGCGTCACTGGCAG
CGAATCTCCTGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGTATGGAACCTGGCTTCAAGAGGGGAGA
TATACTGTTCTTGCCTTACGTTGGATGGGTGACTATCATTATGACAGAAAAGCCTATCAT
CAAGTACATTCTCATAGGGGCATTGGGTTTACTCGTTATAACGTCCAAAGATTGATCGAC
TTCTTTGGAAAGGCATGGGACTCTCGTTTTGTCACCCTTATGGTCATGTTGTTTTAAGAA
GAAAATACAATTTAAAAGACTTGGTCATTTTGTGGTTTAGACCACTTTAAACAGTAGAAT
CACAAGCTAATTTTTATTGTTATTGACCACCCC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL7266Contig1 651 2 1 U
GGGGACATAAAAGTGCAGAAGCTGGTTCTCAACATCTCCGTCGGTGAGAGTGGAGATCGT
CTCACCAGAGCCTCCAAGGTGTTGGAACAATTGAGTGGCCAGACTCCTGTTTTCTCCAAG
GCACGGTACACTGTTCGTCCTTTCGGTATCAGACGTAACGAAAAGATTGCTTGCTACGTT
ACCGTCAGGGGAGACAAGGCAATGCAGCTCCTTGAGAGTGGACTCAAGGTTAAAGAGTAT
GAGCTCTTGAGAAGGAACTTTAGCGACACTGGTTGCTTTGGTTTTGGTATCCAGGAGCAT
ATTGATTTGGGTATTAAGTATGACCCGTCGACTGGAATCTACGGTATGGACTTCTATGTT
GTTCTTGAGCGTCCTGGTTACCGTGTGGCACGTCGTAGAAGATGCAAGGCTCGTGTTGGA
ATCCAGCATAGAGTGACCAAAGATGATGCCATGAAATGGTTCCAAGTTAAATATGAAGGA
GTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTGGCTAAAGAAATATTGTCTGAAACATATAT
ATATATGTTCGAACCGGGTTTTCTCAGTTTTGTTTTCTTCTTTGAACATTTTAGTTTTCT
TTATAGATTTTGCCTATCTACAATGATTACCATCAATAAATATGATTCTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F184JQ C 1
AF RR2F184TF U 1
BS 1 651 RR2F184TF

RD RR2F184JQ 651 0 0
GGGGACATAAAAGTGCAGAAGCTGGTTCTCAACATCTCCGTCGGTGAGAGTGGAGATCGT
CTCACCAGAGCCTCCAAGGTGTTGGAACAATTGAGTGGCCAGACTCCTGTTTTCTCCAAG
GCACGGTACACTGTTCGTCCTTTCGGTATCAGACGTAACGAAAAGATTGCTTGCTACGTT
ACCGTCAGGGGAGACAAGGCAATGCAGCTCCTTGAGAGTGGACTCAAGGTTAAAGAGTAT
GAGCTCTTGAGAAGGAACTTTAGCGACACTGGTTGCTTTGGTTTTGGTATCCAGGAGCAT
ATTGATTTGGGTATTAAGTATGACCCGTCGACTGGAATCTACGGTATGGACTTCTATGTT
GTTCTTGAGCGTCCTGGTTACCGTGTGGCACGTCGTAGAAGATGCAAGGCTCGTGTTGGA
ATCCAGCATAGAGTGACCAAAGATGATGCCATGAAATGGTTCCAAGTTAAATATGAAGGA
GTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTGGCTAAAGAAATATTGTCTGAAACATATAT
ATATATGTTCGAACCGGGTTTTCTCAGTTTTGTTTTCTTCTTTGAACATTTTAGTTTTCT
TTATAGATTTTGCCTATCTACAATGATTACCATCAATAAATATGATTCTGC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2F184TF 651 0 0
GGGGACATAAAAGTGCAGAAGCTGGTTCTCAACATCTCCGTCGGTGAGAGTGGAGATCGT
CTCACCAGAGCCTCCAAGGTGTTGGAACAATTGAGTGGCCAGACTCCTGTTTTCTCCAAG
GCACGGTACACTGTTCGTCCTTTCGGTATCAGACGTAACGAAAAGATTGCTTGCTACGTT
ACCGTCAGGGGAGACAAGGCAATGCAGCTCCTTGAGAGTGGACTCAAGGTTAAAGAGTAT
GAGCTCTTGAGAAGGAACTTTAGCGACACTGGTTGCTTTGGTTTTGGTATCCAGGAGCAT
ATTGATTTGGGTATTAAGTATGACCCGTCGACTGGAATCTACGGTATGGACTTCTATGTT
GTTCTTGAGCGTCCTGGTTACCGTGTGGCACGTCGTAGAAGATGCAAGGCTCGTGTTGGA
ATCCAGCATAGAGTGACCAAAGATGATGCCATGAAATGGTTCCAAGTTAAATATGAAGGA
GTCATTCTCAACAAGTCTCAGAACATTACTGGCTAAAGAAATATTGTCTGAAACATATAT
ATATATGTTCGAACCGGGTTTTCTCAGTTTTGTTTTCTTCTTTGAACATTTTAGTTTTCT
TTATAGATTTTGCCTATCTACAATGATTACCATCAATAAATATGATTCTGC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL7267Contig1 512 2 1 U
GGGCCTTGAAAGCTTCGGAAGACATCTGGTTGCTATCAAACTCACAAGAGGACATTGCGT
ATCCGAATGATTTCAAGTGCGAGATTACGGTTGACGACGACTTCAAAGCTCTGTTTCGCG
AGACAGAGGTCCCTATGGACTTCTTGGAAGTGGAGAAGGAGTTGAAGAAGTACGGTTTGA
AGCCGGTGACAGACACTGCAGCGAGGAGAGCTGGTGAACAGAAGTACGGGATAGTGATGA
GTAAACCGAAGCATAAGAAGAAGAGGAGACAAGAGATCACCAAGAGAACCAAACTCACCA
ATGCACATCTTCCTGAGCTCTTCCAGAGCCTTAGCGCCAGCACTTCCCGGAACTGAAAAC
CTCATTAATGGATTATGGATAATGATTATGTGATTAAATATTCAAAGTGATCCTTGACTT
TTTTATTACTCATGAAATATGTTGCAGTGGAGAAGAAAACAAATTGTATATGTTATGATC
TTGATTTCACAAAATAGAGAATGTATTATCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DQ96JQ C 1
AF RR2DQ96TF U 1
BS 1 512 RR2DQ96TF

RD RR2DQ96JQ 512 0 0
GGGCCTTGAAAGCTTCGGAAGACATCTGGTTGCTATCAAACTCACAAGAGGACATTGCGT
ATCCGAATGATTTCAAGTGCGAGATTACGGTTGACGACGACTTCAAAGCTCTGTTTCGCG
AGACAGAGGTCCCTATGGACTTCTTGGAAGTGGAGAAGGAGTTGAAGAAGTACGGTTTGA
AGCCGGTGACAGACACTGCAGCGAGGAGAGCTGGTGAACAGAAGTACGGGATAGTGATGA
GTAAACCGAAGCATAAGAAGAAGAGGAGACAAGAGATCACCAAGAGAACCAAACTCACCA
ATGCACATCTTCCTGAGCTCTTCCAGAGCCTTAGCGCCAGCACTTCCCGGAACTGAAAAC
CTCATTAATGGATTATGGATAATGATTATGTGATTAAATATTCAAAGTGATCCTTGACTT
TTTTATTACTCATGAAATATGTTGCAGTGGAGAAGAAAACAAATTGTATATGTTATGATC
TTGATTTCACAAAATAGAGAATGTATTATCTC

QA 1 512 1 512
DS 

RD RR2DQ96TF 512 0 0
GGGCCTTGAAAGCTTCGGAAGACATCTGGTTGCTATCAAACTCACAAGAGGACATTGCGT
ATCCGAATGATTTCAAGTGCGAGATTACGGTTGACGACGACTTCAAAGCTCTGTTTCGCG
AGACAGAGGTCCCTATGGACTTCTTGGAAGTGGAGAAGGAGTTGAAGAAGTACGGTTTGA
AGCCGGTGACAGACACTGCAGCGAGGAGAGCTGGTGAACAGAAGTACGGGATAGTGATGA
GTAAACCGAAGCATAAGAAGAAGAGGAGACAAGAGATCACCAAGAGAACCAAACTCACCA
ATGCACATCTTCCTGAGCTCTTCCAGAGCCTTAGCGCCAGCACTTCCCGGAACTGAAAAC
CTCATTAATGGATTATGGATAATGATTATGTGATTAAATATTCAAAGTGATCCTTGACTT
TTTTATTACTCATGAAATATGTTGCAGTGGAGAAGAAAACAAATTGTATATGTTATGATC
TTGATTTCACAAAATAGAGAATGTATTATCTC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL7268Contig1 527 2 4 U
ATCAATCTCTCCAGAGAACATGAGGTTGAAGTTTTTAAGTTAAATGAAGAAGTTTCACGG
CTGGAGCAGATGTTAGAAGAGCTTAAAGGTGGTGGCAGTGGTAAAACATTGATAACTCAG
AAGGATGTTCCAGAAAATCCAGTTGATATTGAGCGAAGGCAGAAAGTAAAAGAGGCAATG
ATCCATGCTTGGAGCTCATATGAGAAGTATGCTTGGGGAAAAGATGAGCTTCAGCCTCGG
ACAAAAAGATGGCACTGATAGCTTTGGTGGCCTCGGAGCAACTGTGATAGATTCTTTAGA
TACACTCTATATAATGGGTCTTGATGAGCAGTTTCAGAAAGCCAGAGAGTGGGTTGCAAC
CTCATTGGATTTCGACAAGGACTATGACTCCAGTATGTTTGAGACAACCATAAGAGTTGT
AGGGGGGCTTCTCAGTACGTACGATCTTTCAGGGGGACAAACTTTTCCTCGATAAGGCTA
AGGATATCGCAGACAGGTTATTACCTGCATGGAACACTCCAACGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK65TF U 1
AF RR2AK65JQ C 129
BS 1 246 RR2AK65TF
BS 247 247 RR2AK65JQ
BS 248 373 RR2AK65TF
BS 374 527 RR2AK65JQ

RD RR2AK65TF 373 0 0
ATCAATCTCTCCAGAGAACATGAGGTTGAAGTTTTTAAGTTAAATGAAGAAGTTTCACGG
CTGGAGCAGATGTTAGAAGAGCTTAAAGGTGGTGGCAGTGGTAAAACATTGATAACTCAG
AAGGATGTTCCAGAAAATCCAGTTGATATTGAGCGAAGGCAGAAAGTAAAAGAGGCAATG
ATCCATGCTTGGAGCTCATATGAGAAGTATGCTTGGGGAAAAGATGAGCTTCAGCCTCGG
ACAAAA*GATGGCACTGATAGCTTTGGTGGCCTCGGAGCAACTGTGATAGATTCTTTAGA
TACACTCTATATAATGGGTCTTGATGAGCAGTTTCAGAAAGCCAGAGAGTGGGTTGCAAC
CTCATTGGATTTC

QA 1 373 1 373
DS 

RD RR2AK65JQ 399 0 0
TCCAGAAAATCCAGTTGATATTGAGCGAAGGCAGAAAGTAAAAGAGGCAATGATCCATGC
TTGGAGCTCATATGAGAAGTATGCTTGGGGAAAAGATGAGCTTCAGCCTCGGACAAAAAG
ATGGCACTGATAGCTTTGGTGGCCTCGGAGCAACTGTGATAGATTCTTTAGATACACTCT
ATATAATGGGTCTTGATGAGCAGTTTCAGAAAGCCAGAGAGTGGGTTGCAACCTCATTGG
ATTTCGACAAGGACTATGACTCCAGTATGTTTGAGACAACCATAAGAGTTGTAGGGGGGC
TTCTCAGTACGTACGATCTTTCAGGGGGACAAACTTTTCCTCGATAAGGCTAAGGATATC
GCAGACAGGTTATTACCTGCATGGAACACTCCAACGGGC

QA 1 399 1 399
DS 



AS 1 2

CO CL7269Contig1 536 2 2 U
AAATTGTATATAACTCAAATCTGAATTAATCAAAGCCATATATCAGTTACAAGCAAAATA
TTTTGTAGATAAGTAAAAAACTGACGCATATCCAACCCACTCTCCTACTATTTCTCCTTC
AAGAAAAGACGAATATGAATCTTTCATATTGCTGGAGAGATACACACTAGTTTCAATCCT
TTGTTTGACGCATTTTCTTTCTAGATTTTGGCGTCGCATCTGCTTTACCTCCATCTGTGA
TAGACGAATCCTTTTCCTGTTTCTGTGATCTCATACCCTGTCTCCGTGATTTTCTGTTTC
CTCGACGAATTCTTCAATAAGGCTTCTAACAAAATTTGCTTCAGGTGATGAGGATGGATC
AAATTGCTCTCCCTTAGACATTGCCTCAGCAGCCCACTTCTTTGATAACCTCTTCCACTT
TTTTATCAGATCAGGTTGAAGGCAGAGCTCCATCTGGAAACGTCCATAAGACAAACTGTG
CCAAGATTGTAATCCTGCTAGACTTAGAACAGTCTCATTAACCACCGCGTCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EL67TF C 1
AF RR2EL67JQ U 25
BS 1 24 RR2EL67TF
BS 25 536 RR2EL67JQ

RD RR2EL67TF 536 0 0
AAATTGTATATAACTCAAATCTGAATTAATCAAAGCCATATATCAGTTACAAGCAAAATA
TTTTGTAGATAAGTAAAAAACTGACGCATATCCAACCCACTCTCCTACTATTTCTCCTTC
AAGAAAAGACGAATATGAATCTTTCATATTGCTGGAGAGATACACACTAGTTTCAATCCT
TTGTTTGACGCATTTTCTTTCTAGATTTTGGCGTCGCATCTGCTTTACCTCCATCTGTGA
TAGACGAATCCTTTTCCTGTTTCTGTGATCTCATACCCTGTCTCCGTGATTTTCTGTTTC
CTCGACGAATTCTTCAATAAGGCTTCTAACAAAATTTGCTTCAGGTGATGAGGATGGATC
AAATTGCTCTCCCTTAGACATTGCCTCAGCAGCCCACTTCTTTGATAACCTCTTCCACTT
TTTTATCAGATCAGGTTGAAGGCAGAGCTCCATCTGGAAACGTCCATAAGACAAACTGTG
CCAAGATTGTAATCCTGCTAGACTTAGAACAGTCTCATTAACCACCGCGTCTTCCC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RR2EL67JQ 512 0 0
ATTAATCAAAGCCATATATCAGTTACAAGCAAAATATTTTGTAGATAAGTAAAAAACTGA
CGCATATCCAACCCACTCTCCTACTATTTCTCCTTCAAGAAAAGACGAATATGAATCTTT
CATATTGCTGGAGAGATACACACTAGTTTCAATCCTTTGTTTGACGCATTTTCTTTCTAG
ATTTTGGCGTCGCATCTGCTTTACCTCCATCTGTGATAGACGAATCCTTTTCCTGTTTCT
GTGATCTCATACCCTGTCTCCGTGATTTTCTGTTTCCTCGACGAATTCTTCAATAAGGCT
TCTAACAAAATTTGCTTCAGGTGATGAGGATGGATCAAATTGCTCTCCCTTAGACATTGC
CTCAGCAGCCCACTTCTTTGATAACCTCTTCCACTTTTTTATCAGATCAGGTTGAAGGCA
GAGCTCCATCTGGAAACGTCCATAAGACAAACTGTGCCAAGATTGTAATCCTGCTAGACT
TAGAACAGTCTCATTAACCACCGCGTCTTCCC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL7270Contig1 1213 2 6 U
AGGGGAGGGGTCTCATATGAAGGTGAATATCTAGGGATTTCCCTTTTGGGCTTGTACATG
AACTCATGTAGAATGGTGGAGGCGTGTGTTCTTTTCTCAGAGTTACCAAGCCCTAAGAGC
ATCGTTCTGTTGACGGGGTTGATGTCAGGGCATAGCCAGAACGGTTTCTATGAGGAAGCT
TTGAACTTCTACAAAGAAATGCGTCGTGATGGTGCTTTACCTGACCAAGCAACATTTGTC
ACTGTTCTTCGAGTGTGCTCTGTCTTATCCTCCTTAAGAGAAGGCAGAGCGATCCATTCT
CTTACCTTCCACTTGGCTCATGACCTAGACGAGTTAACCTCTAACACCCTTATAGACATG
TATGCTAAATGTGGGGACATGAAAAGTTCATCACAAGTTTTTAACGAAATGAGGCGTGGA
AGCAACGTTGTCTCATGGAACTCCATCATCAATGGATATGCTAAAAATGGTTACGCTGAA
GAAGCCCTTAAGTTATTTGATTCCATGAGACAGTCGCAAATCATGCCAGATGAAATCACT
TTCCTAGGTGTTCTTACAGCTTGTAGCCATGCAGGGAAAGTGTCAGAAGGACGGAAGATT
TTTGAGATGATGGTTAGTCAATATGGTATTGAAGCGCGTGTAGATCATGTAGCTTGTATG
GTTGATCTTCTTGGAAGATGGGGGTTATCTTGAAGAAGCCGATAACTTCATAGGAGCACA
AAACCTGGAACCAGATGCAAGACTATGGTCATCGCTTCTTGGTGCATGTAGGATCCATGG
AGATGACATTAGGGGAGAAATGGCTGCTGAGAAGCTTATTGAACTTGAACCACAAAACTC
GTCATATATGTTCTTCTTTCGAACATATATGCCTCACAGGGACGCTGGGAGAAGGTCAAT
GCTTTGAGGAAAGACATGAAAGACAGAGGAGTCAGGAAGGTACCTGGGTGTAGCTGGATT
GATGTGGGACAGAGAACACACTTTTTTGGTGCAGGAGATAAATCTCATTCTGATGTAGGA
AAAATCGAGATGTTCCTTGAAGACATATATGATTTGGTGAAAGATGATGCCATAGTCAAT
CATGATATCAAAGAACATGCTTCTCATTATTGTATCTAATAACAGGGGAACTAACTGTTG
GCAGCTTCTCGACCCATGTTTGATATTGTACAAAGCTGAAGATCAGCAGATCAATTCATT
GAATCAGTTACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B776TF U 1
AF RR2B776JQ C 344
BS 1 770 RR2B776TF
BS 771 771 RR2B776JQ
BS 772 862 RR2B776TF
BS 863 863 RR2B776JQ
BS 864 872 RR2B776TF
BS 873 1213 RR2B776JQ

RD RR2B776TF 874 0 0
AGGGGAGGGGTCTCATATGAAGGTGAATATCTAGGGATTTCCCTTTTGGGCTTGTACATG
AACTCATGTAGAATGGTGGAGGCGTGTGTTCTTTTCTCAGAGTTACCAAGCCCTAAGAGC
ATCGTTCTGTTGACGGGGTTGATGTCAGGGCATAGCCAGAACGGTTTCTATGAGGAAGCT
TTGAACTTCTACAAAGAAATGCGTCGTGATGGTGCTTTACCTGACCAAGCAACATTTGTC
ACTGTTCTTCGAGTGTGCTCTGTCTTATCCTCCTTAAGAGAAGGCAGAGCGATCCATTCT
CTTACCTTCCACTTGGCTCATGACCTAGACGAGTTAACCTCTAACACCCTTATAGACATG
TATGCTAAATGTGGGGACATGAAAAGTTCATCACAAGTTTTTAACGAAATGAGGCGTGGA
AGCAACGTTGTCTCATGGAACTCCATCATCAATGGATATGCTAAAAATGGTTACGCTGAA
GAAGCCCTTAAGTTATTTGATTCCATGAGACAGTCGCAAATCATGCCAGATGAAATCACT
TTCCTAGGTGTTCTTACAGCTTGTAGCCATGCAGGGAAAGTGTCAGAAGGACGGAAGATT
TTTGAGATGATGGTTAGTCAATATGGTATTGAAGCGCGTGTAGATCATGTAGCTTGTATG
GTTGATCTTCTTGGAAGATGGGGGTTATCTTGAAGAAGCCGATAACTTCATAGGAGCACA
AAACCTGGAACCAGATGCAAGACTATGGTCATCGCTTCTTGGTGCATGTATGATCCATGG
AGATGACATTAGGGGAGAAATGGCTGCTGAGAAGCTTATTGAACTTGAACCACAAAACTC
GTCATATATGTTCTTCTTTCGA*CATATATGC
TC

QA 1 872 1 872
DS 

RD RR2B776JQ 870 0 0
AACA
CCTTATAGACATGTATGCTAAATGTGGGGACATGAAAAGTTCATCACAAGTTTTTAACGA
AATGAGGCGTGGAAGCAACGTTGTCTCATGGAACTCCATCATCAATGGATATGCTAAAAA
TGGTTACGCTGAAGAAGCCCTTAAGTTATTTGATTCCATGAGACAGTCGCAAATCATGCC
AGATGAAATCACTTTCCTAGGTGTTCTTACAGCTTGTAGCCATGCAGGGAAAGTGTCAGA
AGGACGGAAGATTTTTGAGATGATGGTTAGTCAATATGGTATTGAAGCGCGTGTAGATCA
TGTAGCTTGTATGGTTGATCTTCTTGGAAGATGGGG*TTATCTTGAAGAAGCCGATAACT
TCATAGGAGCACAAAACCTGGAACCAGATGCAAGACTATGGTCATCGCTTCTTGGTGCAT
GTAGGATCCATGGAGATGACATTAGGGGAGAAATGGCTGCTGAGAAGCTTATTGAACTTG
AACCACAAAACTCGTCATATATGTTCTTCTTTCGAACATATATGCCTCACAGGGACGCTG
GGAGAAGGTCAATGCTTTGAGGAAAGACATGAAAGACAGAGGAGTCAGGAAGGTACCTGG
GTGTAGCTGGATTGATGTGGGACAGAGAACACACTTTTTTGGTGCAGGAGATAAATCTCA
TTCTGATGTAGGAAAAATCGAGATGTTCCTTGAAGACATATATGATTTGGTGAAAGATGA
TGCCATAGTCAATCATGATATCAAAGAACATGCTTCTCATTATTGTATCTAATAACAGGG
GAACTAACTGTTGGCAGCTTCTCGACCCATGTTTGATATTGTACAAAGCTGAAGATCAGC
AGATCAATTCATTGAATCAGTTACGC

QA 5 870 5 870
DS 



AS 1 2

CO CL7271Contig1 938 2 2 U
GCAAAACAGCTAAAAAAATTCCCTATATCTTAATCAACAAAAAGAAACACCTTCCAAAAC
ATCGAACAATGTTTTCATCATCTGTCTCAAAACGTACTGTTTTGGTCTCGATCTTGGCCG
TTGGCCTTACAACTCTTCTTTATACGCAGTGTTACATCTGTAAACGAGACCAATGCGTAT
CTATACCACAAATGCTTCGAGAAGGATGGAAAATATAAACCAAAGAGTTTATACGAGGAA
AACATCAACTTTCTCATCTCCAACGTTTGGAAAAATGCTTCTGTAAAAGATTACATCTAT
GGCATTGAGGGTGAACGTCCTAACACCGCCTACCCCGCTATCCAATGCCGTGGTGACTCT
TACGGCTCCAAGTGTGATACATGCCGCGCCACTGCCTACTCCGAGCTACGTAAAAGGTGT
CCGATGAACAAGGGGGCAGTCATATGGTTTGACCGATGTCTTCTCAAGATTTCTCCGACT
ACTTTCCAGAACAAGGTGGATCTCAGGAACAAGTTCTATATGTATAATAACATGAAGAAA
GTGAGAGATCCGGTGTCGTTTAACGCTAAGACAAAGACTCTTCTCACCAAGCTGAAGAAA
GAAGCCACTCGTGGTGGTCCAGAGAGGGAATTTGAAGTGTATTGGTTATACGGGCAAGGG
GATATGAAGCTAGATGGGAAGATGAAGCTATACGGAATGGTGCAGTGCACGCGAGACATA
GGGCAGAAAGGTTGTGAGAAATGTTTGGATAAGATTATTGGGGAGCTTCCTAATTGTTGT
GATGGTAAAGAAGGAGGAAGAGTAGTGAGTGGGAGTTGTAACTTTAGGTATGAGATTTAC
CCTTTTCTTGACACTAAAAGATGAGAGCTCCATGTTTTTTTGTGTACGTGGGATGCTTTA
ACATGTTCATATCAAGAGATAATATTTCGTTATTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CL83TF U 1
AF RR2CL83JQ C 130
BS 1 649 RR2CL83TF
BS 650 938 RR2CL83JQ

RD RR2CL83TF 649 0 0
GCAAAACAGCTAAAAAAATTCCCTATATCTTAATCAACAAAAAGAAACACCTTCCAAAAC
ATCGAACAATGTTTTCATCATCTGTCTCAAAACGTACTGTTTTGGTCTCGATCTTGGCCG
TTGGCCTTACAACTCTTCTTTATACGCAGTGTTACATCTGTAAACGAGACCAATGCGTAT
CTATACCACAAATGCTTCGAGAAGGATGGAAAATATAAACCAAAGAGTTTATACGAGGAA
AACATCAACTTTCTCATCTCCAACGTTTGGAAAAATGCTTCTGTAAAAGATTACATCTAT
GGCATTGAGGGTGAACGTCCTAACACCGCCTACCCCGCTATCCAATGCCGTGGTGACTCT
TACGGCTCCAAGTGTGATACATGCCGCGCCACTGCCTACTCCGAGCTACGTAAAAGGTGT
CCGATGAACAAGGGGGCAGTCATATGGTTTGACCGATGTCTTCTCAAGATTTCTCCGACT
ACTTTCCAGAACAAGGTGGATCTCAGGAACAAGTTCTATATGTATAATAACATGAAGAAA
GTGAGAGATCCGGTGTCGTTTAACGCTAAGACAAAGACTCTTCTCACCAAGCTGAAGAAA
GAAGCCACTCGTGGTGGTCCAGAGAGGGAATTTGAAGTGTATTGGTTAT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2CL83JQ 809 0 0
CAACTCTTCTTTATACGCAGTGTTACATCTGTAAACGAGACCAATGCGTATCTATACCAC
AAATGCTTCGAGAAGGATGGAAAATATAAACCAAAGAGTTTATACGAGGAAAACATCAAC
TTTCTCATCTCCAACGTTTGGAAAAATGCTTCTGTAAAAGATTACATCTATGGCATTGAG
GGTGAACGTCCTAACACCGCCTACCCCGCTATCCAATGCCGTGGTGACTCTTACGGCTCC
AAGTGTGATACATGCCGCGCCACTGCCTACTCCGAGCTACGTAAAAGGTGTCCGATGAAC
AAGGGGGCAGTCATATGGTTTGACCGATGTCTTCTCAAGATTTCTCCGACTACTTTCCAG
AACAAGGTGGATCTCAGGAACAAGTTCTATATGTATAATAACATGAAGAAAGTGAGAGAT
CCGGTGTCGTTTAACGCTAAGACAAAGACTCTTCTCACCAAGCTGAAGAAGGAAGCCACT
CGTGGTGGTCCAGAGAGGGAATTTGAAGTGTATTGGTTATACGGGCAAGGGGATATGAAG
CTAGATGGGAAGATGAAGCTATACGGAATGGTGCAGTGCACGCGAGACATAGGGCAGAAA
GGTTGTGAGAAATGTTTGGATAAGATTATTGGGGAGCTTCCTAATTGTTGTGATGGTAAA
GAAGGAGGAAGAGTAGTGAGTGGGAGTTGTAACTTTAGGTATGAGATTTACCCTTTTCTT
GACACTAAAAGATGAGAGCTCCATGTTTTTTTGTGTACGTGGGATGCTTTAACATGTTCA
TATCAAGAGATAATATTTCGTTATTTATT

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

CO CL7272Contig1 592 2 1 U
GGAACAGTACTCCTCTCCAAACACACAAACGTAAACATGGCTTCAAAGAACATCAACATA
GCTCTCTTCCTCACCATCAACCTCGTCTTCTTCGGCTTTACCATGGCCCAAGATCCTGGA
CCTCAAGCTCCTACGTGTCCCAGAAGCTCAGCCGAGATTGAAGACTGTGCCGTCCGGATC
TTCGTGATCTTCAACCTTCGTCTAACGGCGGGGCGATGCTGCAATCTAGTGGCTGGCCTA
GACGCCTCTGTGGCCTCTGTTTGCATCTGCGATGCCGCCAAACTCGTAGGTCCTGAAGTG
GGGTCGATGAGTTTGTCTCTTGGGGTTCTTAATGCCTGCGGTATTTCTCCCCCAGTTGGT
TTCAGTTGCGCTTAATCTCACTTACAAGACACCAGTTCCGTATTATATATCGGATAATAA
TGGTGCAAGTATGCATCTCTAATAATTAAATGCGTATTATGAATATCTATATGTTGTTAA
AAATAAAGTGAAACATTTGTACTGTTTTCACATGTTATGGATGCTAACCATGTAAGGAAT
ATCTATATGTTTTAACTTGTATCTATTTTGGTTCAGGTGGAAAAATTTACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G390TF U 1
AF RR2G390JQ C 88
BS 1 592 RR2G390TF

RD RR2G390TF 592 0 0
GGAACAGTACTCCTCTCCAAACACACAAACGTAAACATGGCTTCAAAGAACATCAACATA
GCTCTCTTCCTCACCATCAACCTCGTCTTCTTCGGCTTTACCATGGCCCAAGATCCTGGA
CCTCAAGCTCCTACGTGTCCCAGAAGCTCAGCCGAGATTGAAGACTGTGCCGTCCGGATC
TTCGTGATCTTCAACCTTCGTCTAACGGCGGGGCGATGCTGCAATCTAGTGGCTGGCCTA
GACGCCTCTGTGGCCTCTGTTTGCATCTGCGATGCCGCCAAACTCGTAGGTCCTGAAGTG
GGGTCGATGAGTTTGTCTCTTGGGGTTCTTAATGCCTGCGGTATTTCTCCCCCAGTTGGT
TTCAGTTGCGCTTAATCTCACTTACAAGACACCAGTTCCGTATTATATATCGGATAATAA
TGGTGCAAGTATGCATCTCTAATAATTAAATGCGTATTATGAATATCTATATGTTGTTAA
AAATAAAGTGAAACATTTGTACTGTTTTCACATGTTATGGATGCTAACCATGTAAGGAAT
ATCTATATGTTTTAACTTGTATCTATTTTGGTTCAGGTGGAAAAATTTACAC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RR2G390JQ 505 0 0
TTCTTCGGCTTTACCATGGCCCAAGATCCTGGACCTCAAGCTCCTACGTGTCCCAGAAGT
TCAGCCGAGATTGAAGACTGTGCCGTCCGGATCTTCGTGATCTTCAACCTTCGTCTAACG
GCGGGGCGATGCTGCAATCTAGTGGCTGGCCTAGACGCCTCTGTGGCCTCTGTTTGCATC
TGCGATGCCGCCAAACTCGTAGGTCCTGAAGTGGGGTCGATGAGTTTGTCTCTTGGGGTT
CTTAATGCCTGCGGTATTTCTCCCCCAGTTGGTTTCAGTTGCGCTTAATCTCACTTACAA
GACACCAGTTCCGTATTATATATCGGATAATAATGGTGCAAGTATGCATCTCTAATAATT
AAATGCGTATTATGAATATCTATATGTTGTTAAAAATAAAGTGAAACATTTGTACTGTTT
TCACATGTTATGGATGCTAACCATGTAAGGAATATCTATATGTTTTAACTTGTATCTATT
TTGGTTCAGGTGGAAAAATTTACAC

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 2

CO CL7273Contig1 880 2 2 U
GGATTCTCTTATGTCCCGCCTACGCCAAAATCATGTACCCTCGTTCTTCATTCGCAAACT
TGTGACTCAGGTTTTCTCATTCATCAACTTGTCACTTTTCAACAGTCTTCTCCTTCGACG
TGAATGTTGCACATTTTCAAATGGGGAATACGTGAAATCTGGGATTGCAGAATTAGAGAA
GTGGATAGCCAGCGTCAAGGAAGAGTTTTCAGGAACTTCTTGGCACGAGTTAAATTACAT
TAGACAAGCTGTCGGATTCTTGGTTATACACCAGAAGAGAAAAAAATCACTGGAAGAAAT
CAGGCAGGACCTGTGCCCGGCATTGACAATAAGGCAAATATATCGAATAAGTACGATGTA
CTGGGATGATAAGTATGGAACTCAAAGTGTCTCAAGTGAGGTGGTTTCTCAAATGAGGGT
ACTTGTTGACAAGGATAGCCAAAAACTAACATCCAATTCCTTCTTGCTGGATGATGATAT
GAGCATTCCTTTCTCTGCAGAAGATATAGATAAGGCTATTCCAGTTTTAGACCCATCAGA
AATAGAACCACCTAAATTTGTATCTGAATATACGTGTGCACAGTCCCTTGTGAAGAAACC
CTCCACAGCTTCAGCCTCAACGCATATCATTTGATGCATATGAGCTTGATTATGCATCAA
TGAAAGTTAGGAAGAAAAAAACATTTGGTATTTTGCAAATTTCTCTTTTAGGAGAATGAA
ACAATGGAAGCTTAGACTTTGTAACTGTAGAATTTTACTATACGTTGAAGTCAAAATATT
TGTAATTGTGCAATTGTCAGTTTTTTCTTTTCTTTTTTGGGGACTGTAAATGGTACAGCA
TCTTTGTGAATATTAAGTAATGAATTCTCTTAATTCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA68TF U 1
AF RR2EA68JQ C 109
BS 1 666 RR2EA68TF
BS 667 880 RR2EA68JQ

RD RR2EA68TF 666 0 0
GGATTCTCTTATGTCCCGCCTACGCCAAAATCATGTACCCTCGTTCTTCATTCGCAAACT
TGTGACTCAGGTTTTCTCATTCATCAACTTGTCACTTTTCAACAGTCTTCTCCTTCGACG
TGAATGTTGCACATTTTCAAATGGGGAATACGTGAAATCTGGGATTGCAGAATTAGAGAA
GTGGATAGCCAGCGTCAAGGAAGAGTTTTCAGGAACTTCTTGGCACGAGTTAAATTACAT
TAGACAAGCTGTCGGATTCTTGGTTATACACCAGAAGAGAAAAAAATCACTGGAAGAAAT
CAGGCAGGACCTGTGCCCGGCATTGACAATAAGGCAAATATATCGAATAAGTACGATGTA
CTGGGATGATAAGTATGGAACTCAAAGTGTCTCAAGTGAGGTGGTTTCTCAAATGAGGGT
ACTTGTTGACAAGGATAGCCAAAAACTAACATCCAATTCCTTCTTGCTGGATGATGATAT
GAGCATTCCTTTCTCTGCAGAAGATATAGATAAGGCTATTCCAGTTTTAGACCCATCAGA
AATAGAACCACCTAAATTTGTATCTGAATATACGTGTGCACAGTCCCTTGTGAAGAAACC
CTCCACAGCTTCAGCCTCAACGCATATCATTTGATGCATATGAGCTTGATTATGCATCAA
TGAAAG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2EA68JQ 772 0 0
CTCT
CTTCGACGTGAATGTTGCACATTT*CAAATGGGGAATACGTGAAATCTGGGATTGCAGAA
TTAGAGAAGTGGATAGCCAGCGTCAAGGAAGAGTTTTCAGGAACTTCTTGGCACGAGTTA
AATTACATTAGACAAGCTGTCGGATTCTTGGTTATACACCAGAAGAGAAAAAAATCACTG
GAAGAAATCAGGCAGGACCTGTGCCCGGCATTGACAATAAGGCAAATATATCGAATAAGT
ACGATGTACTGGGATGATAAGTATGGAACTCAAAGTGTCTCAAGTGAGGTGGTTTCTCAA
ATGAGGGTACTTGTTGACAAGGATAGCCAAAAACTAACATCCAATTCCTTCTTGCTGGAT
GATGATATGAGCATTCCTTTCTCTGCAGAAGATATAGATAAGGCTATTCCAGTTTTAGAC
CCATCAGAAATAGAACCACCTAAATTTGTATCTGAATATACGTGTGCACAGTCCCTTGTG
AAGAAACCCTCCACAGCTTCAGCCTCAACGCATATCATTTGATGCATATGAGCTTGATTA
TGCATCAATGAAAGTTAGGAAGAAAAAAACATTTGGTATTTTGCAAATTTCTCTTTTAGG
AGAATGAAACAATGGAAGCTTAGACTTTGTAACTGTAGAATTTTACTATACGTTGAAGTC
AAAATATTTGTAATTGTGCAATTGTCAGTTTTTTCTTTTCTTTTTTGGGGACTGTAAATG
GTACAGCATCTTTGTGAATATTAAGTAATGAATTCTCTTAATTCTTTG

QA 5 772 5 772
DS 



AS 1 2

CO CL7274Contig1 523 2 1 U
GGAAACCTTCTGAGATTTCGCCGGAGCAAAGTCGAGAGAGAGAGAGAGAGATCCAAGCCG
TGCCGGAGGAGGACTGGGAGGCGATCGAGAAGCGCCTTGGCTGCGGCCAAGTCGAGGAGC
TCATCGAAGAGGCGCAGGATGAGCTCACGCTCATCGGGAAGATGATCGAATGGGACCCTT
GGGGTGTTCCAGATGACTACGAGTGTGAAGTAATTGAGAACGATGCACCGATTCCAAAGC
ACGTTCCGCAGCACCGACCTGGTCCTCTCCCTGAGGATTTCTACAGAACCCTTGAAGGTC
TGATTTCAGAGTCCAAAACAAAAATCCCAGCTGCTGCTACCTCCACTGAACCGCAGTTGA
AGGAGTAACTTCCAGTTTTTCACATTGTTTGTTTGTGTGCTTTGTTGCTTTGTTTGGCTA
CTGTTCAGAGACAGCGAGCTTCTGAATAAACTGGTTTATAATAATCTTTGAAAACTAAAA
CAATGTCACTCGTTTCATAAATGTTTTTTATCTTTCTTCTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DA39TF U 1
AF RR2DA39JQ C 8
BS 1 523 RR2DA39TF

RD RR2DA39TF 523 0 0
GGAAACCTTCTGAGATTTCGCCGGAGCAAAGTCGAGAGAGAGAGAGAGAGATCCAAGCCG
TGCCGGAGGAGGACTGGGAGGCGATCGAGAAGCGCCTTGGCTGCGGCCAAGTCGAGGAGC
TCATCGAAGAGGCGCAGGATGAGCTCACGCTCATCGGGAAGATGATCGAATGGGACCCTT
GGGGTGTTCCAGATGACTACGAGTGTGAAGTAATTGAGAACGATGCACCGATTCCAAAGC
ACGTTCCGCAGCACCGACCTGGTCCTCTCCCTGAGGATTTCTACAGAACCCTTGAAGGTC
TGATTTCAGAGTCCAAAACAAAAATCCCAGCTGCTGCTACCTCCACTGAACCGCAGTTGA
AGGAGTAACTTCCAGTTTTTCACATTGTTTGTTTGTGTGCTTTGTTGCTTTGTTTGGCTA
CTGTTCAGAGACAGCGAGCTTCTGAATAAACTGGTTTATAATAATCTTTGAAAACTAAAA
CAATGTCACTCGTTTCATAAATGTTTTTTATCTTTCTTCTCAC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2DA39JQ 516 0 0
TTCTGAGATTTCGCCGGAGCAAAGTCGAGAGAGAGAGAGAGAGATCCAAGCCGTGCCGGA
GGAGGACTGGGAGGCGATCGAGAAGCGCCTTGGCTGCGGCCAAGTCGAGGAGCTCATCGA
AGAGGCGCAGGATGAGCTCACGCTCATCGGGAAGATGATCGAATGGGACCCTTGGGGTGT
TCCAGATGACTACGAGTGTGAAGTAATTGAGAACGATGCACCGATTCCAAAGCACGTTCC
GCAGCACCGACCTGGTCCTCTCCCTGAGGATTTCTACAGAACCCTTGAAGGTCTGATTTC
AGAGTCCAAAACAAAAATCCCAGCTGCTGCTACCTCCACTGAACCGCAGTTGAAGGAGTA
ACTTCCAGTTTTTCACATTGTTTGTTTGTGTGCTTTGTTGCTTTGTTTGGCTACTGTTCA
GAGACAGCGAGCTTCTGAATAAACTGGTTTATAATAATCTTTGAAAACTAAAACAATGTC
ACTCGTTTCATAAATGTTTTTTATCTTTCTTCTCAC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL7275Contig1 780 2 2 U
ATATGTGAGCCAAAAAAATAAGTGAGAAGGAAACAAATGGGTTATAAGAAATGGATGAGT
ATTTGAACAGAAGATAAATTAACTCAAGAAGGCAAAGATGAATCTTGTATTACTTTACAT
ATATAAACTCAATGATTCATACCTGCAAAACTGATTTGCCCCACCTCTCTCTCATTTTTT
CTTAAAATCTGAAGCTAAGAAGAAGAAGAAGCTCCAAGGTTTTAAGGGCAAATCATTTCA
CAAATAACTAATGATTGATGACCGGGGATGGAAGAGGTGATGTTGGAGGCTTCATGTCCT
CATACATTGTGTAAGGTGACAATGGTCTTGGCTTTGGCGGATTAGCTGCACTTTCTTCTG
GTGTAAGGGAAGTGTCTGTCACATTGTTAACAGTTTCTGCTTCTGGCAAGGAAGCAGATT
CAGTCGTTTTTACACTACCATCGACTGTTTCCACCACGTCATTGCCTCCAGGCAACTCTG
AGTTTTCTTCTGCAGGTGCTGTTTTCTTGGGACCAGTTGATGCAGGAGTTGGTGAGGTTG
GTGGTTTCAGGTCTGCGTAAGCTGCATAAGGAGAAAGAGGTCTCATTTTTGGTATAACTG
GTGCTTCTGCCTCCTCAGTGACACTTATTTCAACTGTTGAGCTTTCAACAGTACCAGAAT
CGGTTGGAACAGGCGCCGCCACAGGGTCGCTCTTGCGGATACCTGAAGCTTTAGGAGTGG
GTGATGAAGGGGGTTTTAGATTGTCATAGCTAGCATAAGGAGAAAGAGGCCTCTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DZ02JQ U 1
AF RR2AS55TF C 138
BS 1 668 RR2DZ02JQ
BS 669 780 RR2AS55TF

RD RR2DZ02JQ 668 0 0
ATATGTGAGCCAAAAAAATAAGTGAGAAGGAAACAAATGGGTTATAAGAAATGGATGAGT
ATTTGAACAGAAGATAAATTAACTCAAGAAGGCAAAGATGAATCTTGTATTACTTTACAT
ATATAAACTCAATGATTCATACCTGCAAAACTGATTTGCCCCACCTCTCTCTCATTTTTT
CTTAAAATCTGAAGCTAAGAAGAAGAAGAAGCTCCAAGGTTTTAAGGGCAAATCATTTCA
CAAATAACTAATGATTGATGACCGGGGATGGAAGAGGTGATGTTGGAGGCTTCATGTCCT
CATACATTGTGTAAGGTGACAATGGTCTTGGCTTTGGCGGATTAGCTGCACTTTCTTCTG
GTGTAAGGGAAGTGTCTGTCACATTGTTAACAGTTTCTGCTTCTGGCAAGGAAGCAGATT
CAGTCGTTTTTACACTACCATCGACTGTTTCCACCACGTCATTGCCTCCAGGCAACTCTG
AGTTTTCTTCTGCAGGTGCTGTTTTCTTGGGACCAGTTGATGCAGGAGTTGGTGAGGTTG
GTGGTTTCAGGTCTGCGTAAGCTGCATAAGGAGAAAGAGGTCTCATTTTTGGTATAACTG
GTGCTTCTGCCTCCTCAGTGACACTTATTTCAACTGTTGAGCTTTCAACAGTACCAGAAT
CGGTTGGA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2AS55TF 643 0 0
TCATA
CTGCAAAACTGATTTGCCCCACCTCTCTCTCATTTTTTCTTAAAATCTGAAGCTAAGAAG
AAGAAGAAGCTCCAGGGTTTTAAGGGCAAATCATTTCACAAATAACTAATGATTGATGAC
CGGGGATGGAAGAGGTGATGTTGGGGGCTTCATGTCCTCATACATTGTGTAAGGTGGCAA
TGGTCTTGGCTTTGGCGGATTAGCTGCACTTTCTTCTGGTGTAAGGGAAGTGTCTGTCAC
ATTGTTAACAGTTTCTGCTTCTGGCAAGGAAGCAGATTCAGTCGTTTTTACACTACCATC
GACTGTTTCCACCACGTCATTGCCTCCAGGCAACTCTGAGTTTTCTTCTGCAGGTGCTGT
TTTCTTGGGACCAGTTGATGCAGGAGTTGGTGAGGTTGGTGGTTTCAGGTCTGCGTAAGC
TGCATAAGGAGAAAGAGGTCTCATTTTTGGTATAACTGGTGCTTCTGCCTCCTCAGTGAC
ACTTATTTCAACTGTTGAGCTTTCAACAGTACCAGAATCGGTTGGAACAGGCGCCGCCAC
AGGGTCGCTCTTGCGGATACCTGAAGCTTTAGGAGTGGGTGATGAAGGGGGTTTTAGATT
GTCATAGCTAGCATAAGGAGAAAGAGGCCTCTCTTTCC

QA 6 643 6 643
DS 



AS 1 2

CO CL7276Contig1 996 2 6 U
GGACATAACCCCCACATTCTTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCCCCTTCTTCTCCGT
TTCTCAATCTAATATTTCTCTCTTCAATTCAGTCATCGATACAGTACTTAGGGTTTCCCC
TCAAACGCCGCCGATTCTCTGAAATTTGAACAATGGCCATGGACCAATCCTTTGAAGATG
CTTCTGGAGAACTCTATGGAGAAGGTGCATTTTCTTTCAACAATCCCAAGCCTGACCCAA
TCACAGCCTCTCTACATCCTTCTGATGATGATACCAACGGCGATTCCAGCTTCGACTGCA
ACATTTGCCTAGACTCAGTTCAAGAGCCCGTTGTCACCCTCTGTGGCCACCTCTTTTGCT
GGCCCTGCATCCACAAATGGCTTCATGTACAGACCACCGATGAACAACACCAAAGACATA
ATAAACAGTGTCCTGTTTGTAAATCCAAAGTCTCCCTCTCTACTTTGGTTCCCTTGTACG
GACGAGGCGGTGGCAATAGTCAGGACAAAGATAAAACCTGTGCTGTGCCTAGAAGACCGG
TTTACAAGCTTGAGATGGCGAATTCAAGTACCGATGTTCGGTTATCTCAACGGGTTCATT
TCAATAACCGGCATGATGGTTACTATCCTGTCTCAGGGGTGATGAGTTCCAACAGTTTGT
CGTACTCTCCTGTTGTTATGGATCCGATGATGGTGATGGTTGGAGAAATGGTGGCGACGA
GGCTGTTTGGAACCAGAGTTATGGATAGATTCACGTATCCGGACACTTACAATCTCGCGG
AAACTAGCTGCCCGAGGATGAGAAGACAGATAATGAAAGCCGATAAATCATTGGGAAGAA
TCTTCTTGTTTTTGTTATGTTGTGTGGCTCTGTGTCTTGTACTGTTTTAGGGTTCTTCTC
CTCACTAGCTTTGTCTTGCTCTTGTGAGGAAACTTAGACAAAGAATGTACATTTGTGTTG
GTAGAAACGAATGAAAGTTGCTTCATGTCGAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H362TF U 1
AF RR2H362JQ C 228
BS 1 721 RR2H362TF
BS 722 722 RR2H362JQ
BS 723 733 RR2H362TF
BS 734 734 RR2H362JQ
BS 735 759 RR2H362TF
BS 760 996 RR2H362JQ

RD RR2H362TF 759 0 0
GGACATAACCCCCACATTCTTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCCCCTTCTTCTCCGT
TTCTCAATCTAATATTTCTCTCTTCAATTCAGTCATCGATACAGTACTTAGGGTTTCCCC
TCAAACGCCGCCGATTCTCTGAAATTTGAACAATGGCCATGGACCAATCCTTTGAAGATG
CTTCTGGAGAACTCTATGGAGAAGGTGCATTTTCTTTCAACAATCCCAAGCCTGACCCAA
TCACAGCCTCTCTACATCCTTCTGATGATGATACCAACGGCGATTCCAGCTTCGACTGCA
ACATTTGCCTAGACTCAGTTCAAGAGCCCGTTGTCACCCTCTGTGGCCACCTCTTTTGCT
GGCCCTGCATCCACAAATGGCTTCATGTACAGACCACCGATGAACAACACCAAAGACATA
ATAAACAGTGTCCTGTTTGTAAATCCAAAGTCTCCCTCTCTACTTTGGTTCCCTTGTACG
GACGAGGCGGTGGCAATAGTCAGGACAAAGATAAAACCTGTGCTGTGCCTAGAAGACCGG
TTTACAAGCTTGAGATGGCGAATTCAAGTACCGATGTTCGGTTATCTCAACGGGTTCATT
TCAATAACCGGCATGATGGTTACTATCCTGTCTCAGGGGTGATGAGTTCCAACAGTTTGT
CGTACTCTCCTGTTGTTATGGATCCGATGATGGTGATGGTTGGAGAAATGGTGGCGACGA
G*CTGTTTGGAAC*AGAGTTATGGATAGATTCACGTATC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2H362JQ 769 0 0
CAAG
CTGACCCAATCACAGCCTCTCTACATC*TTCTGATGATGATACCAACGGCGATTCCAGCT
TCGACTGCAACATTTGCCTAGACTCAGTTCAAGAGCCCGTTGTCACCCTCTGTGGCCACC
TCTTTTGCTGGCCCTGCATCCACAAATGGCTTCATGTACAGACCACCGATGAACAACACC
AAAGACATAATAAACAGTGTCCTGTTTGTAAATCCAAAGTCTCCCTCTCTACTTTGGTTC
CCTTGTACGGACGAGGCGGTGGCAATAGTCAGGACAAAGATAAAACCTGTGCTGTGCCTA
GAAGACCGGTTTACAAGCTTGAGATGGCGAATTCAAGTACCGATGTTCGGTTATCTCAAC
GGGTTCATTTCAATAACCGGCATGATGGTTACTATCCTGTCTCAGGGGTGATGAGTTCCA
ACAGTTTGTCGTACTCTCCTGTTGTTATGGATCCGATGATGGTGATGGTTGGAGAAATGG
TGGCGACGAGGCTGTTTGGAACCAGAGTTATGGATAGATTCACGTATCCGGACACTTACA
ATCTCGCGGAAACTAGCTGCCCGAGGATGAGAAGACAGATAATGAAAGCCGATAAATCAT
TGGGAAGAATCTTCTTGTTTTTGTTATGTTGTGTGGCTCTGTGTCTTGTACTGTTTTAGG
GTTCTTCTCCTCACTAGCTTTGTCTTGCTCTTGTGAGGAAACTTAGACAAAGAATGTACA
TTTGTGTTGGTAGAAACGAATGAAAGTTGCTTCATGTCGAAAAAA

QA 5 769 5 769
DS 



AS 1 2

CO CL7277Contig1 748 2 2 U
GGACCAACTTCCATCTCGTCTCCTTTATTCCGCATCTTTTCTAAATATCCTCTCTCGATC
AATCCGTCACAAACGATGTCTGCCTTCACCAGCAAATACGCCGATGAGTTGATCGCTAAC
GCTGCCTACATCGGAACACCCGGGAAAGGTATCCTCGCCGCCGACGAGAACGCTTACGGG
TTGGCTAGGTGCGCTGTGATCTGCCAGGAGAACGGTCTTGTACCCATCGTTGAGCCTGAG
ATCCTTGTTGATGGTTCACATGATATCCACAAGTGTGCTGCCGTCACTGAGCGTGTCCTT
GCTGCTTGCTACAAGGCTCTTAGTGACCACCACGTCTTGCTCGAGGGAACTTTGTTGAAG
ACCAAGAAGCCGTGGTCATTGTCTTTCTCTTTCGGACGTGCGTTGCAGCAGAGTACTCTG
AAGCCACTCTCGGAACATACAAGGGTGATGCTAAGCTTGGTGATGGAGCCGCAGAGAGCC
TTCACGTGAAGGACTACAAGTACTGAGGGTCGTCGTCAATGGTTTCTGTTGTGACGTACT
TATCACCCTCGATATAATTCTAAGGGTTTTTCTACTTTTTTTGCTTGACAAAATCGGATT
AACAATGTTTTTTTCGATTTTTCTTTTCGATTTGTGTTTTGATTTTCGTTTGGTGTGTTC
TTTATTTAGAAAATGGTGAGTGTTTGAGAAAACGCACAAATAAAAGGCCATCAGAGGTTA
TATCTGTTTTTCTTATATGATCAAGAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH18TF U 1
AF RR2BH18JQ C 1
BS 1 702 RR2BH18TF
BS 703 748 RR2BH18JQ

RD RR2BH18TF 702 0 0
GGACCAACTTCCATCTCGTCTCCTTTATTCCGCATCTTTTCTAAATATCCTCTCTCGATC
AATCCGTCACAAACGATGTCTGCCTTCACCAGCAAATACGCCGATGAGTTGATCGCTAAC
GCTGCCTACATCGGAACACCCGGGAAAGGTATCCTCGCCGCCGACGAGAACGCTTACGGG
TTGGCTAGGTGCGCTGTGATCTGCCAGGAGAACGGTCTTGTACCCATCGTTGAGCCTGAG
ATCCTTGTTGATGGTTCACATGATATCCACAAGTGTGCTGCCGTCACTGAGCGTGTCCTT
GCTGCTTGCTACAAGGCTCTTAGTGACCACCACGTCTTGCTCGAGGGAACTTTGTTGAAG
ACCAAGAAGCCGTGGTCATTGTCTTTCTCTTTCGGACGTGCGTTGCAGCAGAGTACTCTG
AAGCCACTCTCGGAACATACAAGGGTGATGCTAAGCTTGGTGATGGAGCCGCAGAGAGCC
TTCACGTGAAGGACTACAAGTACTGAGGGTCGTCGTCAATGGTTTCTGTTGTGACGTACT
TATCACCCTCGATATAATTCTAAGGGTTTTTCTACTTTTTTTGCTTGACAAAATCGGATT
AACAATGTTTTTTTCGATTTTTCTTTTCGATTTGTGTTTTGATTTTCGTTTGGTGTGTTC
TTTATTTAGAAAATGGTGAGTGTTTGAGAAAACGCACAAATA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2BH18JQ 748 0 0
GGACCAACTTCCATCTCGTCTCCTTTATTCCGCATCTTTTCTAAATATCCTCTCTCGATC
AATCCGTCACAAACGATGTCTGCCTTCACCAGCAAATACGCCGATGAGTTGATCGCTAAC
GCTGCCTACATCGGAACACCCGGGAAAGGTATCCTCGCCGCCGACGAGAACGCTTACGGG
TTGGCTAGGTGCGCTGTGATCTGCCAGGAGAACGGTCTTGTACCCATCGTTGAGCCTGAG
ATCCTTGTTGATGGTTCACATGATATCCACAAGTGTGCTGCCGTCACTGAGCGTGTCCTT
GCTGCTTGCTACAAGGCTCTTAGTGACCACCACGTCTTGCTCGAGGGAACTTTGTTGAAG
ACCAAGAAGCCGTGGTCATTGTCTTTCTCTTTCGGACGTGCGTTGCAGCAGAGTACTCTG
AAGCCACTCTCGGAACATACAAGGGTGATGCTAAGCTTGGTGATGGAGCCGCAGAGAGCC
TTCACGTGAAGGACTACAAGTACTGAGGGTCGTCGTCAATGGTTTCTGTTGTGACGTACT
TATCACCCTCGATATAATTCTAAGGGTTTTTCTACTTTTTTTGCTTGACAAAATCGGATT
AACAATGTTTTTTTCGATTTTTCTTTTCGATTTGTGTTTTGATTTTCGTTTGGTGTGTTC
TTTATTTAGAAAATGGTGAGTGTTTGAGAAAACGCACAAATAAAAGGCCATCAGAGGTTA
TATCTGTTTTTCTTATATGATCAAGAAG

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL7278Contig1 931 2 6 U
GGGTCGATGACCATTCAGTTTTAAACAAAAAACAAAAAAAAAGGAAGAACAGAATTTTCT
GTCTCGATGTTTCTTTAACGGAAGATGATTTCCATGGTGAAACTCATGATATGAACGGCC
GCGGCGGCGTACTTCCGGTGGTAAAGACGGAAGCGACTGCTTGAAGAGATTAAGATCGAC
GGTAGCAAATCAAAGAACTATCGAGATTTTCAGATTTGTGGAAAACTTCATGACGCTCCA
AACTCGATAGATCCACAGAGGACTTCTCTGTTTCTGATCTATTTAGGCATCCTTGAAAGA
CACGATGAGTTTGAGATGGTTGACGAACTTCACACTTTCAGCTCTGTTTGACATAGTCCA
AAGAAGATTTGAAAGACCACAAATGGGATAAATTTGGATCCAGATAAATACGTTGGATGT
AAGCATTTACCATCACGAAAAGGGAGATCATGGTGATACCAAAAGTAGTACAGGTCGAGC
AGTTAAAGGTTTAGATACAGAAGCTTTATACATTTGAAGGACATGGGACAGAGACATGAC
TGCAAAGAAATACAAACCCAAGGTATAGGGTTTGAGAAAAGAAAAACATGATTTGATGGG
GTTTTCATGGTATAGAGCTTTGATCGTGAAGATGAATTTGATGAGCTGAACAATCATTGC
TGATTGGATTTTAAAACGAAAAGGATAGTCTGCAGCGGGCCTTAATATGTATGTTGGGCT
ATAACGGGTTACAAAAATCAAAGGTTTCTGATTGGTCTGGTTATTTACGATTTTCATTTA
AAAAAAATGGCAGTGGCATTTGGCTGTAATTATTTTGAAAAGGCATGGCAGAATCCTAGT
AGGGATTCTGCTTTAATAGTATAGATTGTGATGAGAACCGCTCCAAAAGGTTTTCAAAGG
TGAAATGCAAGTATGATCGATACATATTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA55TF U 1
AF RR2EA55JQ C 200
BS 1 683 RR2EA55TF
BS 684 684 RR2EA55JQ
BS 685 700 RR2EA55TF
BS 701 701 RR2EA55JQ
BS 702 723 RR2EA55TF
BS 724 931 RR2EA55JQ

RD RR2EA55TF 723 0 0
GGGTCGATGACCATTCAGTTTTAAACAAAAAACAAAAAAAAAGGAAGAACAGAATTTTCT
GTCTCGATGTTTCTTTAACGGAAGATGATTTCCATGGTGAAACTCATGATATGAACGGCC
GCGGCGGCGTACTTCCGGTGGTAAAGACGGAAGCGACTGCTTGAAGAGATTAAGATCGAC
GGTAGCAAATCAAAGAACTATCGAGATTTTCAGATTTGTGGAAAACTTCATGACGCTCCA
AACTCGATAGATCCACAGAGGACTTCTCTGTTTCTGATCTATTTAGGCATCCTTGAAAGA
CACGATGAGTTTGAGATGGTTGACGAACTTCACACTTTCAGCTCTGTTTGACATAGTCCA
AAGAAGATTTGAAAGACCACAAATGGGATAAATTTGGATCCAGATAAATACGTTGGATGT
AAGCATTTACCATCACGAAAAGGGAGATCATGGTGATACCAAAAGTAGTACAGGTCGAGC
AGTTAAAGGTTTAGATACAGAAGCTTTATACATTTGAAGGACATGGGACAGAGACATGAC
TGCAAAGAAATACAAACCCAAGGTATAGGGTTTGAGAAAAGAAAAACATGATTTGATGGG
GTTTTCATGGTATAGAGCTTTGATCGTGAAGATGAATTTGATGAGCTGAACAATCATTGC
TGATTGGATTTTAAAACGAAAAG*ATAGTCTGCAGCGGGC*TTAATATGTATGTTGGGCT
ATA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2EA55JQ 732 0 0
ATCGAGATTTTCAGATTTGTGGAAAACTTCATGACGCTCCAAACTCGATAGATCCACAGA
GGACTTCTCTGTTTCTGATCTATTTAGGCATCCTTGAAAGACACGATGAGTTTGAGATGG
TTGACGAACTTCACACTTTCAGCTCTGTTTGACATAGTCCAAAGAAGATTTGAAAGACCA
CAAATGGGATAAATTTGGATCCAGATAAATACGTTGGATGTAAGCATTTACCATCACGAA
AAGGGAGATCATGGTGATACCAAAAGTAGTACAGGTCGAGCAGTTAAAGGTTTAGATACA
GAAGCTTTATACATTTGAAGGACATGGGACAGAGACATGACTGCAAAGAAATACAAACCC
AAGGTATAGGGTTTGAGAAAAGAAAAACATGATTTGATGGGGTTTTCATGGTATAGAGCT
TTGATCGTGAAGATGAATTTGATGAGCTGAACAATCATTGCTGATTGGATTTTAAAACGA
AAAGGATAGTCTGCAGCGGGCCTTAATATGTATGTTGGGCTATAACGGGTTACAAAAATC
AAAGGTTTCTGATTGGTCTGGTTATTTACGATTTTCATTTAAAAAAAATGGCAGTGGCAT
TTGGCTGTAATTATTTTGAAAAGGCATGGCAGAATCCTAGTAGGGATTCTGCTTTAATAG
TATAGATTGTGATGAGAACCGCTCCAAAAGGTTTTCAAAGGTGAAATGCAAGTATGATCG
ATACATATTACC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL7279Contig1 516 2 1 U
GGAATCTTAATCTTTCATGACCGTCTGCAATGAAGAAATACTATCGAGTTTTGTTACTCA
TCATCAGCATCATCATCTTCTTCATCGCCTTTGCGTTAGCTGAAGAGGACAAAACAGTCG
ACCTGGTTCACAAAGAGAGACTAGACGTCGTCAGAGTAGCTAGTGGCATGAGAGGTCACG
GAAGAATTTCGGAAGTGAGCAAGGCAAGAGGCGTTTATGGAGGTGGATCACTTGTCAGAC
CTACAGGAAAGAAGAACAGAGCCATGTCCTATATGACCAAATCTGCTTCACTCGCTGTGC
TTCAAGTATTAGTTGCAGTTCTGGTCCATCTTTTCTTGCACTGAAAATGCAAAACCTTAA
GTAGAAACAGACAAAGGGTTCATATTCCTACTTTATGTGCAAACTGGCTTTGTTGCAAAG
ATTCAGAATTTATAAATTTATCTTAACATTTTTACATCCACCAAGTAGAGGGACTTCGCA
TGTTTAATAAAAGATATGGAGAGTTCTGTTATCTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ED42JQ C 1
AF RR2ED42TF U 1
BS 1 516 RR2ED42TF

RD RR2ED42JQ 516 0 0
GGAATCTTAATCTTTCATGACCGTCTGCAATGAAGAAATACTATCGAGTTTTGTTACTCA
TCATCAGCATCATCATCTTCTTCATCGCCTTTGCGTTAGCTGAAGAGGACAAAACAGTCG
ACCTGGTTCACAAAGAGAGACTAGACGTCGTCAGAGTAGCTAGTGGCATGAGAGGTCACG
GAAGAATTTCGGAAGTGAGCAAGGCAAGAGGCGTTTATGGAGGTGGATCACTTGTCAGAC
CTACAGGAAAGAAGAACAGAGCCATGTCCTATATGACCAAATCTGCTTCACTCGCTGTGC
TTCAAGTATTAGTTGCAGTTCTGGTCCATCTTTTCTTGCACTGAAAATGCAAAACCTTAA
GTAGAAACAGACAAAGGGTTCATATTCCTACTTTATGTGCAAACTGGCTTTGTTGCAAAG
ATTCAGAATTTATAAATTTATCTTAACATTTTTACATCCACCAAGTAGAGGGACTTCGCA
TGTTTAATAAAAGATATGGAGAGTTCTGTTATCTCT

QA 1 516 1 516
DS 

RD RR2ED42TF 516 0 0
GGAATCTTAATCTTTCATGACCGTCTGCAATGAAGAAATACTATCGAGTTTTGTTACTCA
TCATCAGCATCATCATCTTCTTCATCGCCTTTGCGTTAGCTGAAGAGGACAAAACAGTCG
ACCTGGTTCACAAAGAGAGACTAGACGTCGTCAGAGTAGCTAGTGGCATGAGAGGTCACG
GAAGAATTTCGGAAGTGAGCAAGGCAAGAGGCGTTTATGGAGGTGGATCACTTGTCAGAC
CTACAGGAAAGAAGAACAGAGCCATGTCCTATATGACCAAATCTGCTTCACTCGCTGTGC
TTCAAGTATTAGTTGCAGTTCTGGTCCATCTTTTCTTGCACTGAAAATGCAAAACCTTAA
GTAGAAACAGACAAAGGGTTCATATTCCTACTTTATGTGCAAACTGGCTTTGTTGCAAAG
ATTCAGAATTTATAAATTTATCTTAACATTTTTACATCCACCAAGTAGAGGGACTTCGCA
TGTTTAATAAAAGATATGGAGAGTTCTGTTATCTCT

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL7280Contig1 714 2 2 U
GGGTGTTGACGATATAAGCGGATTACCGGTACGCTTCGGAAAAAGGATAAGTAGTACCCT
CTTCATTTACCGATTCTCTCGTCCTGAACTAGTCCGTGAGCGATGGATTCTACTACTTCA
CTCGTCGTCAAGGTGAGCTATGGAGGTGTGCTTAGGCGATTCAGGATACCGTTCAAAGTT
AATGGACAGCTTGATCTCGACATGGCTGGTCTCAGGGGAAAGATCGCTGCTCTGTTTAAC
CTCTCTCTGGATGATGGATTCTCTCTGACTTATTCCGATGAAGATGGTGATGCGGTGGCT
CTTGTCGATGACAACGACCTGTTTGATGTCACGAATCAGCGCCTTAAGTTCTTGAAGATC
AGTGTGCAGCAGTCCAAAACTAACTCTATTTCCCCGGAGAGCCGTGGGAGTTCTACAGCT
TCTGGCGTGTTTGATAGCCAGAACCCGGTTTCGATAATCCAGAAGGGTATAAATGATGTG
ATGATGGCTGTACCTAACCCGATGCGTGATACTATTTCCAAGGTGTGTGTTGACCTTACT
TCTAAGGCGGCATCTTCGAGTCCTGTAGTTGGCGAGCTGTTTGATTGCATCTCCAAGCTA
GGGAAACTCTCAATTACTCAGGAAGTTGCTCCTTCCTCATCTGTTACCAAGCCTGTTCCT
TCAGTTCCTTCCGCTGGTGAGAAGAAGGATATCTCTAAGAAGTCAGAGACCGGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL38TF U 1
AF RR2DL38JQ C 1
BS 1 617 RR2DL38TF
BS 618 714 RR2DL38JQ

RD RR2DL38TF 617 0 0
GGGTGTTGACGATATAAGCGGATTACCGGTACGCTTCGGAAAAAGGATAAGTAGTACCCT
CTTCATTTACCGATTCTCTCGTCCTGAACTAGTCCGTGAGCGATGGATTCTACTACTTCA
CTCGTCGTCAAGGTGAGCTATGGAGGTGTGCTTAGGCGATTCAGGATACCGTTCAAAGTT
AATGGACAGCTTGATCTCGACATGGCTGGTCTCAGGGGAAAGATCGCTGCTCTGTTTAAC
CTCTCTCTGGATGATGGATTCTCTCTGACTTATTCCGATGAAGATGGTGATGCGGTGGCT
CTTGTCGATGACAACGACCTGTTTGATGTCACGAATCAGCGCCTTAAGTTCTTGAAGATC
AGTGTGCAGCAGTCCAAAACTAACTCTATTTCCCCGGAGAGCCGTGGGAGTTCTACAGCT
TCTGGCGTGTTTGATAGCCAGAACCCGGTTTCGATAATCCAGAAGGGTATAAATGATGTG
ATGATGGCTGTACCTAACCCGATGCGTGATACTATTTCCAAGGTGTGTGTTGACCTTACT
TCTAAGGCGGCATCTTCGAGTCCTGTAGTTGGCGAGCTGTTTGATTGCATCTCCAAGCTA
GGGAAACTCTCAATTAC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2DL38JQ 714 0 0
GGGTGTTGACGATATAAGCGGATTACCGGTACGCTTCGGAAAAAGGATAAGTAGTACCCT
CTTCATTTACCGATTCTCTCGTCCTGAACTAGTCCGTGAGCGATGGATTCTACTACTTCA
CTCGTCGTCAAGGTGAGCTATGGAGGTGTGCTTAGGCGATTCAGGATACCGTTCAAAGTT
AATGGACAGCTTGATCTCGACATGGCTGGTCTCAGGGGAAAGATCGCTGCTCTGTTTAAC
CTCTCTCTGGATGATGGATTCTCTCTGACTTATTCCGATGAAGATGGTGATGCGGTGGCT
CTTGTCGATGACAACGACCTGTTTGATGTCACGAATCAGCGCCTTAAGTTCTTGAAGATC
AGTGTGCAGCAGTCCAAAACTAACTCTATTTCCCCGGAGAGCCGTGGGAGTTCTACAGCT
TCTGGCGTGTTTGATAGCCAGAACCCGGTTTCGATAATCCAGAAGGGTATAAATGATGTG
ATGATGGCTGTACCTAACCCGATGCGTGATACTATTTCCAAGGTGTGTGTTGACCTTACT
TCTAAGGCGGCATCTTCGAGTCCTGTAGTTGGCGAGCTGTTTGATTGCATCTCCAAGCTA
GGGAAACTCTCAATTACTCAGGAAGTTGCTCCTTCCTCATCTGTTACCAAGCCTGTTCCT
TCAGTTCCTTCCGCTGGTGAGAAGAAGGATATCTCTAAGAAGTCAGAGACCGGG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL7281Contig1 866 2 2 U
GGGTGGCGTCTAGCCATTGGGCCGAGGAACGTAACGAATCCGTACCCCTTCGACTTCGCA
GTCACCTTGTCGAGGACCACGATCGCCTTGTCGAGTCTCCGTAGGCGGAGAAGAGCGATC
GGAGACCTTCCGTCGTGGTCTCCGCCGCGAGGCCGCGGATGAAGAGTAACTTTGTTTGAT
TACTTTGAACCCTCTTTGATTATTTGTTGTTGGGGTAAAGGAGAAGTTAGAACCGAGTTT
GATTGTTTGATGCTGGAGAAAGTATTGTTTTTGAGTTGATGATGTGTCTCAGATTTGGGT
TGTGTCTGATGATGCTTTTTAGGATTTTGTTCCCCATCATGGACCCAACGGTAGTGAAGA
GGTGAACCAAACACTTCAATCCGGAAACCAAGCACTCAGGTGTGGCTGATCTCAGACGCA
GGACGCTGAGAACGAGACGCAGAGCTTGTGTGTGTGTGTGTTTGCCTCTCCTGATTCCAT
TAGAGGCGCATAAGTTGATGTCGAGAAACTAAATAAGCGTCCGGCTCCCCCTCATTTATT
CTAAAGGTGGCTATTCTCTTCGAACATGGTGTCATGTTATGTAGCGGGGGGTGATGGTCA
GCCGTTTTTGGGGAAGATTATAACAATGAAGTATGAAGACTATACAAGAAGAGTTGGGAT
CGATGGTACAGCTGAAGCCATCAAAAAAAAGCTAAAAGTAAAGTCTTTTTTGCTTTTCTC
TTCTGCTTGAGGTTTTCTCAGCATCTATATATCCAAAAAATGCAAGAATAGCTGTTAGAT
TGTGTCACTATGATGAGAGTTTGATGGAGGGTTTATCATTGTACATACCATGAAATATTA
ACAAAGTAAGGCTCACCATTGTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV75TF U 1
AF RR2BV75JQ C 142
BS 1 648 RR2BV75TF
BS 649 866 RR2BV75JQ

RD RR2BV75TF 648 0 0
GGGTGGCGTCTAGCCATTGGGCCGAGGAACGTAACGAATCCGTACCCCTTCGACTTCGCA
GTCACCTTGTCGAGGACCACGATCGCCTTGTCGAGTCTCCGTAGGCGGAGAAGAGCGATC
GGAGACCTTCCGTCGTGGTCTCCGCCGCGAGGCCGCGGATGAAGAGTAACTTTGTTTGAT
TACTTTGAACCCTCTTTGATTATTTGTTGTTGGGGTAAAGGAGAAGTTAGAACCGAGTTT
GATTGTTTGATGCTGGAGAAAGTATTGTTTTTGAGTTGATGATGTGTCTCAGATTTGGGT
TGTGTCTGATGATGCTTTTTAGGATTTTGTTCCCCATCATGGACCCAACGGTAGTGAAGA
GGTGAACCAAACACTTCAATCCGGAAACCAAGCACTCAGGTGTGGCTGATCTCAGACGCA
GGACGCTGAGAACGAGACGCAGAGCTTGTGTGTGTGTGTGTTTGCCTCTCCTGATTCCAT
TAGAGGCGCATAAGTTGATGTCGAGAAACTAAATAAGCGTCCGGCTCCCCCTCATTTATT
CTAAAGGTGGCTATTCTCTTCGAACATGGTGTCATGTTATGTAGCGGGGGGTGATGGTCA
GCCGTTTTTGGGGAAGATTATAACAATGAAGTATGAAGACTATACAAG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2BV75JQ 725 0 0
CCGCCGCGAGGCCGCGGATGAAGAGTAACTTTGTTTGATTACTTTGAACCCTCTTTGATT
ATTTGTTGTTGGGGTAAAGGAGAAGTTAGAACCGAGTTTGATTGTTTGATGCTGGAGAAA
GTATTGTTTTTGAGTTGATGATGTGTCTCAGATTTGGGTTGTGTCTGATGATGCTTTTTA
GGATTTTGTTCCCCATCATGGACCCAACGGTAGTGAAGAGGTGAACCAAACACTTCAATC
CGGAAACCAAGCACTCAGGTGTGGCTGATTTCAGACGCAGGACGCTGAGAACGAGACGCA
GAGCTTGTGTGTGTGTGTGTTTGCCTCTCCTGATTCCATTAGAGGCGCATAAGTTGATGT
CGAGAAACTAAATAAGCGTCCGGCTCCCCCTCATTTATTCTAAAGGTGGCTATTCTCTTC
GAACATGGTGTCATGTTATGTAGCGGGGGGTGATGGTCAGCCGTTTTTGGGGAAGATTAT
AACAATGAAGTATGAAGACTATACAAGAAGAGTTGGGATCGATGGTACAGCTGAAGCCAT
CAAAAAAAAGCTAAAAGTAAAGTCTTTTTTGCTTTTCTCTTCTGCTTGAGGTTTTCTCAG
CATCTATATATCCAAAAAATGCAAGAATAGCTGTTAGATTGTGTCACTATGATGAGAGTT
TGATGGAGGGTTTATCATTGTACATACCATGAAATATTAACAAAGTAAGGCTCACCATTG
TACAT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL7282Contig1 1212 2 2 U
GGACCCTGGCCAAGACAAAATGGCGATCAATAAAAAACTCTTATCTCTTATACTCCTCGT
ATCCTCCCTATCATCAATCTCATCATCATCATCTTTCTCAGATCCCGATTCCGATTCAGA
TCTCACCAACGAACTCGTCTCCCTCAGATCAAACTCCGAATCAGGCGTAATCCATCTCGA
CGACCATGGAATCTCCAAATTCCTCATCTCCTCCCCCACTCCACGCCCTTACTCCATCCT
CGTCTTCTTCGACGCCACTCAGCTCCACAGCAAAACCGAGCTCCGTCTCCAAGAGCTCCG
CCGCGAATTCCACCTCCTCTCCGCCACCTTCCTCGCCGTTAACAACAACGGATCCGATCT
AAACAAACTCTTCTTCTGCGAGATCGAGTTCTCCCAATCCCAATCCTCCTTCAAACGATT
CAACGTCAACGCTCTCCCTCACATCCGTCTCGTAACCGCCTCGACTTCCAAACTAACCGA
CGAATCCGGACAAATGGATCAATCCGATTTCTCTAGGTTAGCCGAATCAATGGCCGAGTT
CGTCGAGCAGCGAACGAAACTAACCGTAGGTCCGATCCAACGTCCGCCGCTTCTCTCCAA
GCCCCAGATCAGCGTCATCGTGGCGATGATCGTTATCGCTACTCCGTTTGTCATCAAAAG
GATTCTTAAAGGAGAGACTCTTCTCCATGACCACAGGCTTTGGCTATCGGGCGCCATCTT
CGTCTACTTCTTCAGCGTGGCGGGGACGATGCACAACATTATCAGGAAGATGCCTATGTT
TCTTCAGGATCAAAACGATCCGAACAAGCTTGTTTTCTTCTACCAAGGATCAGGGATGCA
GCTTGGAGCGGAAGGGTTCGCTGTGGGGTTCTTGTACACTGTGGTTGGGTTGCTCTTGGC
GTTTGTTACGAACGTGCTTGTTCGAGTTGGGAACGTCAATGTTCAGAGGTTGGTGATGCT
TGTGGCTCTGGTTGTATCCTCCTGGGCTGTGAAGCAGGTTGTTTACTTGGATAATTGGAA
GACTGGTTACGGGATTCATCCCTATTGGCCTTCCAGTTGGCAGTGATTTCACACTCGTTG
GGTTTAGTTTTCAAGACGTTTTCTTGAACTGAGTTATGATATGTTGGACGTTTTTTTTTG
TGTTTTGATTCTCTACTACTTTGAATCAGTGTAGTACAATTTCAGATGGTTTAAACTCAT
AACTGTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS96TF U 1
AF RR2CS96JQ C 528
BS 1 720 RR2CS96TF
BS 721 1212 RR2CS96JQ

RD RR2CS96TF 720 0 0
GGACCCTGGCCAAGACAAAATGGCGATCAATAAAAAACTCTTATCTCTTATACTCCTCGT
ATCCTCCCTATCATCAATCTCATCATCATCATCTTTCTCAGATCCCGATTCCGATTCAGA
TCTCACCAACGAACTCGTCTCCCTCAGATCAAACTCCGAATCAGGCGTAATCCATCTCGA
CGACCATGGAATCTCCAAATTCCTCATCTCCTCCCCCACTCCACGCCCTTACTCCATCCT
CGTCTTCTTCGACGCCACTCAGCTCCACAGCAAAACCGAGCTCCGTCTCCAAGAGCTCCG
CCGCGAATTCCACCTCCTCTCCGCCACCTTCCTCGCCGTTAACAACAACGGATCCGATCT
AAACAAACTCTTCTTCTGCGAGATCGAGTTCTCCCAATCCCAATCCTCCTTCAAACGATT
CAACGTCAACGCTCTCCCTCACATCCGTCTCGTAACCGCCTCGACTTCCAAACTAACCGA
CGAATCCGGACAAATGGATCAATCCGATTTCTCTAGGTTAGCCGAATCAATGGCCGAGTT
CGTCGAGCAGCGAACGAAACTAACCGTAGGTCCGATCCAACGTCCGCCGCTTCTCTCCAA
GCCCCAGATCAGCGTCATCGTGGCGATGATCGTTATCGCTACTCCGTTTGTCATCAAAAG
GATTCTTAAAGGAGAGACTCTTCTCCATGACCACAGGCTTTGGCTATCGGGCGCCATCTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2CS96JQ 685 0 0
CAATGGCCGAGTTCGTCGAGCAGCGAACGAAACTAACCGTAGGTCCGATCCAACGTCCGC
CGCTTCTCTCCAAGCCCCAGATCAGCGTCATCGTGGCGATGATCGTTATCGCTACTCCGT
TTGTCATCAAAAGGATTCTTAAAGGAGAGACTCTTCTCCATGACCACAGGCTTTGGCTAT
CGGGCGCCATCTTCGTCTACTTCTTCAGCGTGGCGGGGACGATGCACAACATTATCAGGA
AGATGCCTATGTTTCTTCAGGATCAAAACGATCCGAACAAGCTTGTTTTCTTCTACCAAG
GATCAGGGATGCAGCTTGGAGCGGAAGGGTTCGCTGTGGGGTTCTTGTACACTGTGGTTG
GGTTGCTCTTGGCGTTTGTTACGAACGTGCTTGTTCGAGTTGGGAACGTCAATGTTCAGA
GGTTGGTGATGCTTGTGGCTCTGGTTGTATCCTCCTGGGCTGTGAAGCAGGTTGTTTACT
TGGATAATTGGAAGACTGGTTACGGGATTCATCCCTATTGGCCTTCCAGTTGGCAGTGAT
TTCACACTCGTTGGGTTTAGTTTTCAAGACGTTTTCTTGAACTGAGTTATGATATGTTGG
ACGTTTTTTTTTGTGTTTTGATTCTCTACTACTTTGAATCAGTGTAGTACAATTTCAGAT
GGTTTAAACTCATAACTGTTTTCCC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL7283Contig1 688 2 5 U
TTTTTTTTTGTCGCAAGTTGCAAATATTTTATAAGTCGTTACTTAAAGAAAGTTGGATCT
GAAGAGAATTCAAATCCGAATTACATAATTTTTTTAAAAAACTAGATTTTTCTACATATA
CATTCACCAATTTAAACACAAAACACCCAACACATATAACTAAACTGGGGAATGAAACCA
AATTAAGCTTTCTTCGGAGATTTAGCTGGCGACTTGGACGCAACATCCTCAGTCGATTTA
GCAAACTTCTTAGGCAAGAAAACAGAGTTGATGTTCGGCAACACACCACCGTGAGCGATC
GTGACTCCACTCAGTAGCTTCCCCAACTCTTCGTCGTTCCTGATCGCCAAAAGAAGATGC
CTCGGAATGATCCTCGACTTCTTGTTGTCCCTCGCAGCGTTACCAGCAAGCTCCAAAACT
TCGGCGGCGAGGTACTCGAGAACGGCGGCCATGTAAACCGGAGCACCACCACCGAGTCTC
TGAGCGTACCGTCCCTTCTTCAGGAAACGAGTGATTCTCCCCACGGGGAATTGGAGGCCG
GCTTTGATCGATTTCGAGACAGATTTGGTCTTCGGGACACCGGCTTTTCTTCCTCCGAAA
GCCTTCTTCACTTTTCCGGTGGTTTCCATTGCACAGGATGAAGGTTGTTTGCACAAGATT
GCTGGTTGTTAGAGTGGAAAAGGAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H987JQ U 10
AF RR2H987TF C 1
BS 1 9 RR2H987TF
BS 10 209 RR2H987JQ
BS 210 210 RR2H987TF
BS 211 554 RR2H987JQ
BS 555 688 RR2H987TF

RD RR2H987JQ 545 0 0
GTCGCAAGTTGCAAATATTTTATAAGTCGTTACTTAAAGAAAGTTGGATCTGAAGAGAAT
TCAAATCCGAATTACATAATTTTTTTAAAAAACTAGATTTTTCTACATATACATTCACCA
ATTTAAACACAAAACACCCAACACATATAACTAAACTGGGGAATGAAACCAAATTAAGCT
TTCTTCGGAGATTTAGCTGGGGACTTGGACGCAACATCCTCAGTCGATTTAGCAAACTTC
TTAGGCAAGAAAACAGAGTTGATGTTCGGCAACACACCACCGTGAGCGATCGTGACTCCA
CTCAGTAGCTTCCCCAACTCTTCGTCGTTCCTGATCGCCAAAAGAAGATGCCTCGGAATG
ATCCTCGACTTCTTGTTGTCCCTCGCAGCGTTACCAGCAAGCTCCAAAACTTCGGCGGCG
AGGTACTCGAGAACGGCGGCCATGTAAACCGGAGCACCACCACCGAGTCTCTGAGCGTAC
CGTCCCTTCTTCAGGAAACGAGTGATTCTCCCCACGGGGAATTGGAGGCCGGCTTTGATC
GATTT

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2H987TF 688 0 0
TTTTTTTTTGTCGCAAGTTGCAAATATTTTATAAGTCGTTACTTAGAGAAAGTTGGATCT
GAAGAGAATTCAGATCCGAATTACATAATTTTTT*AAAAAACTAGATTTTTCTACATATA
CATTCACCAATTTAAACACAAAACACCCAACACATATAACTAAACTGGTGAATGAAACCA
AATTAAGCTTTCTTCGGAGATTTAGCTGGCGACTTGGACGCAACATCCTCAGTCGATTTA
GCAGACTTCTTAGGCAAGAGAACAGAGTTGATGTTCGGCAACACACCACCGTGAGCGATC
GTGACTCCACTCAGTAGCTTCCCCAACTCTTCGTCGTTCCTGATCGCCAAAAGAAGATGC
CTCGGAATGATCCTCGACTTCTTGTTGTCCCTCGCAGCGTTACCAGCAAGCTCCAAAACT
TCGGCGGCGAGGTACTCGAGAACGGCGGCCATGTAAACCGGAGCACCACCACCGAGTCTC
TGAGCGTACCGTCCCTTCTTCAGGAAACGAGTGATTCTCCCCACGGGGAATTGGAGGCCG
GCTTTGATCGATTTCGAGACAGATTTGGTCTTCGGGACACCGGCTTTTCTTCCTCCGAAA
GCCTTCTTCACTTTTCCGGTGGTTTCCATTGCACAGGATGAAGGTTGTTTGCACAAGATT
GCTGGTTGTTAGAGTGGAAAAGGAGATT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL7284Contig1 896 2 2 U
TTTTTCGGAACGCAAAAAAGTTGTGGATTGGGTAGAGAGGAGAATGGAGACGGAGAAGGA
GAAGCTAGAGAGAGTCGGACCATTGGAGGAGCCGTTGGTGAAAAACATCGTACCAGAGGA
GGAGTCGCTATCATTGTCAGATACTGATAGCGAGATACCAGATTCTCCCGTTCCCATCAA
CGCTCCGATCTACCGGATCTTTGGAAGAGAACGTCCGATCCACATGGTTCTCGGCGGAGG
TAAACCTGCTGATGTGTTGCTATGGAGGGACAAGAAGGTAACCGCAGGATTAGTGGGTGC
AGTGACTGTGATCTGGCTCTTGTTTGGGTTCGGTCATTGTCGTCTTCTTACTTTTGTTTG
TCGTGGATCTATCCTCTTTCTAATTCTTTCGTTCGTCTGGTCCAATGCCCTCAACAGATC
TCCTGAGAAGATAATGGAGATTTACATGCCTGAGAAGCCATTACTCCAAGCTGCTTCTGC
ATTGACCTTTGAGATTAACTGTGCTTTTGCAACCTTGAGGAGCATTGCCTTAGAGAGAGA
CATCAAGAACTTTGCACTGGTAGTCATAGGACTTTGGCTCGTATCTATCATCGGAAGCTG
GTTCAGCTTCTTGTCATTGCTCTACATCTGTTTCGTATTGATTCACACGGTGCCGAAGCT
GTATGAGAAGTATGAAGATGAGATTGATCCAATTGCTGAGAAGGCTGTGATTGAGATGAA
GAAGCATTTCCAAGTATTTGAAGCCAAGGTTTTAAGTAAGATAAATCATTAGCAATTCTA
CTCAAAATAATCGAAATTGAGTTAGTTTCGGTTACCTTAGTTTAGTTCATTTATTTATTT
ATTCATTCCTCTGTTCATGTGGTTTTGGTTACTTCCTACTCAAGATAAAGTTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN94TF U 1
AF RR2BN94JQ C 180
BS 1 695 RR2BN94TF
BS 696 896 RR2BN94JQ

RD RR2BN94TF 695 0 0
TTTTTCGGAACGCAAAAAAGTTGTGGATTGGGTAGAGAGGAGAATGGAGACGGAGAAGGA
GAAGCTAGAGAGAGTCGGACCATTGGAGGAGCCGTTGGTGAAAAACATCGTACCAGAGGA
GGAGTCGCTATCATTGTCAGATACTGATAGCGAGATACCAGATTCTCCCGTTCCCATCAA
CGCTCCGATCTACCGGATCTTTGGAAGAGAACGTCCGATCCACATGGTTCTCGGCGGAGG
TAAACCTGCTGATGTGTTGCTATGGAGGGACAAGAAGGTAACCGCAGGATTAGTGGGTGC
AGTGACTGTGATCTGGCTCTTGTTTGGGTTCGGTCATTGTCGTCTTCTTACTTTTGTTTG
TCGTGGATCTATCCTCTTTCTAATTCTTTCGTTCGTCTGGTCCAATGCCCTCAACAGATC
TCCTGAGAAGATAATGGAGATTTACATGCCTGAGAAGCCATTACTCCAAGCTGCTTCTGC
ATTGACCTTTGAGATTAACTGTGCTTTTGCAACCTTGAGGAGCATTGCCTTAGAGAGAGA
CATCAAGAACTTTGCACTGGTAGTCATAGGACTTTGGCTCGTATCTATCATCGGAAGCTG
GTTCAGCTTCTTGTCATTGCTCTACATCTGTTTCGTATTGATTCACACGGTGCCGAAGCT
GTATGAGAAGTATGAAGATGAGATTGATCCAATTG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2BN94JQ 717 0 0
ACGCTCCGATCTACCGGATCTTTGGAAGAGAACGTCCGATCCACATGGTTCTCGGCGGAG
GTAAACCTGCTGATGTGTTGCTATGGAGGGACAAGAAGGTAACCGCAGGATTAGTGGGTG
CAGTGACTGTGATCTGGCTCTTGTTTGGGTTCGGTCATTGTCGTCTTCTTACTTTTGTTT
GTCGTGGATCTATCCTCTTTCTAATTCTTTCGTTCGTCTGGTCCAATGCCCTCAACAGAT
CTCCTGAGAAGATAATGGAGATTTACATGCCTGAGAAGCCATTACTCCAAGCTGCTTCTG
CATTGACCTTTGAGATTAACTGTGCTTTTGCAACCTTGAGGAGCATTGCCTTAGAGAGAG
ACATCAAGAACTTTGCACTGGTAGTCATAGGACTTTGGCTCGTATCTATCATCGGAAGCT
GGTTCAGCTTCTTGTCATTGCTCTACATCTGTTTCGTATTGATTCACACGGTGCCGAAGC
TGTATGAGAAGTATGAAGATGAGATTGATCCAATTGCTGAGAAGGCTGTGATTGAGATGA
AGAAGCATTTCCAAGTATTTGAAGCCAAGGTTTTAAGTAAGATAAATCATTAGCAATTCT
ACTCAAAATAATCGAAATTGAGTTAGTTTCGGTTACCTTAGTTTAGTTCATTTATTTATT
TATTCATTCCTCTGTTCATGTGGTTTTGGTTACTTCCTACTCAAGATAAAGTTCTGC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7286Contig1 635 2 2 U
TGTGTGTGTTGAGCTGGTGTTGGTTCTGGTCTGTGTGATGAAGTTGGTTCAAGGTTACCT
TTTCATCTCCTAGTTTCGAAGTGGCCTCCCTCTCGCCCTTGTAATAAGTGATCTCCATGG
TCTTCTTTTGCTCTCTGATGTCCTTTGGTTGCTTCCTTTTGTGAAGCAATATATATGAGG
CTGAGGTGCGAAGGTTCTAGATGAAGGTGCGTTTGAGTTGAGTACTCCTTCGGATGCTGT
TTTTCCTGGTTTCTGCCTTTGGTATAGGCGTAGTGGTTCGTTGATTGTCATCATGGACTT
GTGGTTCAGATGAGTTTGTTGTGGTTTGGGTGTTCATGTTCACCTGAGGTCTCTGCTCTA
CACGAAGAAGTCTTCTACGTTGCGTGTTCTTGTGCTTATCATTGCAAGTTCTCCGGCTAG
TCATAGTCTCTTTTAAGTCAGTCTCTTGTATCTTTTGAGTGTTTGTTTCTGGTTTATTTG
AAGAAGTATTAGGACGTTTTCATAGTTCGATGTTTGTATGTAGCCCGGGTGTTTGGGTTC
TTGCTCCCCGTTGGTTCTGTTGGGGTTTAGTTTCCGGGGATGGTTATGTGTTCCGCCGGC
TCTAGTGTTTAATCTTGTATCGTTCCTAAGCTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO14TF U 1
AF RR2DO14JQ C 29
BS 1 591 RR2DO14TF
BS 592 635 RR2DO14JQ

RD RR2DO14TF 591 0 0
TGTGTGTGTTGAGCTGGTGTTGGTTCTGGTCTGTGTGATGAAGTTGGTTCAAGGTTACCT
TTTCATCTCCTAGTTTCGAAGTGGCCTCCCTCTCGCCCTTGTAATAAGTGATCTCCATGG
TCTTCTTTTGCTCTCTGATGTCCTTTGGTTGCTTCCTTTTGTGAAGCAATATATATGAGG
CTGAGGTGCGAAGGTTCTAGATGAAGGTGCGTTTGAGTTGAGTACTCCTTCGGATGCTGT
TTTTCCTGGTTTCTGCCTTTGGTATAGGCGTAGTGGTTCGTTGATTGTCATCATGGACTT
GTGGTTCAGATGAGTTTGTTGTGGTTTGGGTGTTCATGTTCACCTGAGGTCTCTGCTCTA
CACGAAGAAGTCTTCTACGTTGCGTGTTCTTGTGCTTATCATTGCAAGTTCTCCGGCTAG
TCATAGTCTCTTTTAAGTCAGTCTCTTGTATCTTTTGAGTGTTTGTTTCTGGTTTATTTG
AAGAAGTATTAGGACGTTTTCATAGTTCGATGTTTGTATGTAGCCCGGGTGTTTGGGTTC
TTGCTCCCCGTTGGTTCTGTTGGGGTTTAGTTTCCGGGGATGGTTATGTGT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RR2DO14JQ 607 0 0
GTCTGTGTGATGAAGTTGGTTCAAGGTTACCTTTTCATCTCCTAGTTTCGAAGTGGCCTC
CCTCTCGCCCTTGTAATAAGTGATCTCCATGGTCTTCTTTTGCTTTTTGATGTCCTTTGG
TTGCTTCCTTTTGTGAAGCAATATATATGAGGCTGAGGTGCGAAGGTTTTAGATGAAGGT
GCGTTTGAGTTGAGTACTCCTTCGGATGCTGTTTTTCCTGGTTTTTGCCTTTGGTATAGG
GGTAGTGGTTCGTTGATTGTCATCATGGACTTGTGGTTCAGATGAGTTTGTTGTGGTTTG
GGTGTTCATGTTCACCTGAGGTTTTTGCTCTACACGAAGAAGTTTTTTACGTTGCGTGTT
TTTGTGCTTATCATTGCAAGTTTTCCGGCTAGTCATAGTCTCTTTTAAGTCAGTCTCTTG
TATCTTTTGAGTGTTTGTTTTTGGTTTATTTGAAGAAGTATTAGGACGTTTTCATAGTTC
GATGTTTGTATGTAGCCCGGGTGTTTGGGTTCTTGCTCCCCGTTGGTTCTGTTGGGGTTT
AGTTTCCGGGGATGGTTATGTGTTCCGCCGGCTCTAGTGTTTAATCTTGTATCGTTCCTA
AGCTATC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL7287Contig1 535 2 1 U
GGAGTGAGATTTAGGGGAAAATTGAAATCGTGACAATGGAGAAGAATAAGAGTCAATCGG
AACTTTCGAAATCTGATTAAGTCCTCGAATCCACTCTCAATTTTTTATTGGTGATAATTT
TGCTTACAAGTTGTTCATGGTCGTTTATGGGAATGTTAGAGGTTTTTTCTCAAGGCGAAC
CAGGAGAATTCATTTCGGAGATTCTATCGCTCATGTGAAGTTGTGATGCTGAGAAAGGGG
GAAGATCATCTCTTAAAGTGGGTTAAAGAAGCTTTGGTTGAAGAGATTTCTTTGGTTGAA
GCAAGACAGAACAATTGAAGAAGATATTAAAGATATGAGGAAGACAGAGAAAAGTGAAGA
AGATGTGGGTTGACAGTACAATGTTGTCTAAATTTCATTACATGGCTTTGTTGTAAACTT
TGGTAACTGTCAATGGTTGTAGACAATTATGCGTTGTGTTGTTTTGATTACCTTTAGTGT
GCAAGTGTAAACGGTTTGTGTTGTTTTAATAACCTTTTTATCTCATTTGTTTTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EZ09JQ C 1
AF RR2EZ09TF U 1
BS 1 535 RR2EZ09TF

RD RR2EZ09JQ 535 0 0
GGAGTGAGATTTAGGGGAAAATTGAAATCGTGACAATGGAGAAGAATAAGAGTCAATCGG
AACTTTCGAAATCTGATTAAGTCCTCGAATCCACTCTCAATTTTTTATTGGTGATAATTT
TGCTTACAAGTTGTTCATGGTCGTTTATGGGAATGTTAGAGGTTTTTTCTCAAGGCGAAC
CAGGAGAATTCATTTCGGAGATTCTATCGCTCATGTGAAGTTGTGATGCTGAGAAAGGGG
GAAGATCATCTCTTAAAGTGGGTTAAAGAAGCTTTGGTTGAAGAGATTTCTTTGGTTGAA
GCAAGACAGAACAATTGAAGAAGATATTAAAGATATGAGGAAGACAGAGAAAAGTGAAGA
AGATGTGGGTTGACAGTACAATGTTGTCTAAATTTCATTACATGGCTTTGTTGTAAACTT
TGGTAACTGTCAATGGTTGTAGACAATTATGCGTTGTGTTGTTTTGATTACCTTTAGTGT
GCAAGTGTAAACGGTTTGTGTTGTTTTAATAACCTTTTTATCTCATTTGTTTTGT

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2EZ09TF 535 0 0
GGAGTGAGATTTAGGGGAAAATTGAAATCGTGACAATGGAGAAGAATAAGAGTCAATCGG
AACTTTCGAAATCTGATTAAGTCCTCGAATCCACTCTCAATTTTTTATTGGTGATAATTT
TGCTTACAAGTTGTTCATGGTCGTTTATGGGAATGTTAGAGGTTTTTTCTCAAGGCGAAC
CAGGAGAATTCATTTCGGAGATTCTATCGCTCATGTGAAGTTGTGATGCTGAGAAAGGGG
GAAGATCATCTCTTAAAGTGGGTTAAAGAAGCTTTGGTTGAAGAGATTTCTTTGGTTGAA
GCAAGACAGAACAATTGAAGAAGATATTAAAGATATGAGGAAGACAGAGAAAAGTGAAGA
AGATGTGGGTTGACAGTACAATGTTGTCTAAATTTCATTACATGGCTTTGTTGTAAACTT
TGGTAACTGTCAATGGTTGTAGACAATTATGCGTTGTGTTGTTTTGATTACCTTTAGTGT
GCAAGTGTAAACGGTTTGTGTTGTTTTAATAACCTTTTTATCTCATTTGTTTTGT

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 2

CO CL7288Contig1 876 2 4 U
GGATAATAGTCTTAAATCTCTCCTTCTCTCCAACATTGGGTTGTATCTTTATCTTTAGTA
ATTCATCATGAGAATGCTTCTTGGTCTCGTGTTTCTATTGGCCTTAACCAGCTACTCAAG
TGCAACTTACTGTCTATGTAGAGATGGAGTTGCAGAGAAAGATCTTCAAACGTCGATAGA
CTATGCATGCGGAGTTTTAGGAGATTGTAATCAAATCCATGAGAAAGGTCCTTGTTACCA
ACCCAACAATGTCAAGGGCCATTGTGATTGGGCAGTGAATAGCTATTTCCAAAGAGCCCG
TCAAGTTCCTGGAAGCTGTAATTTCTCAGGAACTGCTACTACCAGTCCAAATCCTCCTTC
AACTGTGGTTACTGGTTGCATCTATCCTTCAAGTCCTGGACACACTAGCCGCCAACCACT
TTCTACAGCTGCATTGAAAATAAAAGTTCCTTTTGGTTTCTTTATTTTCAAGATTTGAAA
TGCTGGGACAGGAGCTCCAGGGACACCGATCTTTCCAGGACCTCCTGCGTTTGGTCCGAC
CGGAATTTTTGATCCTTCAGGGAATGATGCTTTGAGTTTGATCACTGCAATAGCACTCAC
ACTTGGTTTCTCCGTCATTGTGTTTCTATATTAGTATGACTAGTCTTTTACAAAAAAAAA
TATATATATTAGTATGACTAGCAAGTGGGGTTAAGGATTTAGATCGAAGGATGAAGTTTT
GCCACATATCAATGCAAGTTCTTTGAGGCAGACATCCACTTAGGGTTGCTTTTCTTGAAG
TTAGGCTTTTTTTATTTCTGTTTGTTTCTTTCTTTCTTTCATGTATGCAATGCAATGTAA
GTAAGAGTTGATGGAATCTTTCTTTTTAAGTGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW22TF U 1
AF RR2BW22JQ C 164
BS 1 659 RR2BW22TF
BS 660 660 RR2BW22JQ
BS 661 691 RR2BW22TF
BS 692 876 RR2BW22JQ

RD RR2BW22TF 693 0 0
GGATAATAGTCTTAAATCTCTCCTTCTCTCCAACATTGGGTTGTATCTTTATCTTTAGTA
ATTCATCATGAGAATGCTTCTTGGTCTCGTGTTTCTATTGGCCTTAACCAGCTACTCAAG
TGCAACTTACTGTCTATGTAGAGATGGAGTTGCAGAGAAAGATCTTCAAACGTCGATAGA
CTATGCATGCGGAGTTTTAGGAGATTGTAATCAAATCCATGAGAAAGGTCCTTGTTACCA
ACCCAACAATGTCAAGGGCCATTGTGATTGGGCAGTGAATAGCTATTTCCAAAGAGCCCG
TCAAGTTCCTGGAAGCTGTAATTTCTCAGGAACTGCTACTACCAGTCCAAATCCTCCTTC
AACTGTGGTTACTGGTTGCATCTATCCTTCAAGTCCTGGACACACTAGCCGCCAACCACT
TTCTACAGCTGCATTGAAAATAAAAGTTCCTTTTGGTTTCTTTATTTTCAAGATTTGAAA
TGCTGGGACAGGAGCTCCAGGGACACCGATCTTTCCAGGACCTCCTGCGTTTGGTCCGAC
CGGAATTTTTGATCCTTCAGGGAATGATGCTTTGAGTTTGATCACTGCAATAGCACTCAC
ACTTGGTTTCTCCGTCATTGTGTTTCTATATTAGTATGACTAGTCTTTTACAAAAAAAA*
TATATATATTAGTATGACTAGCAAGTGGGGT
AA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2BW22JQ 713 0 0
CTTCAAACGTCGATAGACTATGCATGCGGAGTTTTAGGAGATTGTAATCAAATCCATGAG
AAAGGTCCTTGTTACCAACCCAACAATGTCAAGGGCCATTGTGATTGGGCAGTGAATAGC
TATTTCCAAAGAGCCCGTCAAGTTCCTGGAAGCTGTAATTTCTCAGGAACTGCTACTACC
AGTCCAAATCCTCCTTCAACTGTGGTTACTGGTTGCATCTATCCTTCAAGTCCTGGACAC
ACTAGCCGCCAACCACTTTTTACAGCTGCATTGAAAATAAAAGTTCCTTTTGGTTTCTTT
ATTTTCAAGATTTGAAATGCTGGGACAGGAGCTCCAGGGACACCGATCTTTCCAGGACCT
CCTGCGTTTGGTCCGACCGGAATTTTTGATCCTTCAGGGAATGATGCTTTGAGTTTGATC
ACTGCAATAGCACTCACACTTGGTTTTTCCGTCATTGTGTTTCTATATTAGTATGACTAG
TCTTTTACAAAAAAAAATATATATATTAGTATGACTAGCAAGTGGGGTTAAGGATTTAGA
TCGAAGGATGAAGTTTTGCCACATATCAATGCAAGTTCTTTGAGGCAGACATCCACTTAG
GGTTGCTTTTCTTGAAGTTAGGCTTTTTTTATTTCTGTTTGTTTCTTTCTTTCTTTCATG
TATGCAATGCAATGTAAGTAAGAGTTGATGGAATCTTTCTTTTTAAGTGTTAT

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL7289Contig1 681 2 2 U
GAACTTCCCGAATCTCAAGGATCCGAGCGAGCTGCTCGGACTCGGAGACTCCTCTAAGCT
GAACGCCCTCAAAAACGCAGTCGACGGGAGGATCCAGTCGATTTGCCAGAGAGTGAGAAG
AGAGAGAGCCAAAAAGAGCGGGAAAGAGAGTAAAGATTCTCCAACGGCGACGGCGGATTC
ATCCTCGCCGGGAACTCTGTCTTCTCCGGCGACAACTGCCACTGCGGTAAATTCAGAGGA
TAGCTACCGGAATACGCAGATGGGTCTGTGGAATAGCAAGAATAGTTCTCCTGCTTCGGT
TTCTGTCTCCGATGAAGTTCCGGCGACGACAACATCGACGGCGGAGGAGGAGGAAGACAC
GATGATGGATACAGAAGGGTTTTTACTTGCGAGGATGCCATCGTTCGATCCTGAGCTTAT
TTGGGAAGTTCTCGCTAATTAAATCACAAAACTTGGGTATCAAGGAATATGATGAGAAGA
TTAGGGTTTTAGGTGTGAATTAAGGTCTTCGTTCGAAAGTTGTTTTAGGGTTTTTAATTA
AAATTTTAAGCCTCGTGGTTTTTGAGAGAGGTTGTGAAAGCTCCTTTTTTGAAGTTATAT
TATAGTCATCCAAGGACTTTCTGATTGTACTTTGGAACAATTATTATCTGTAACAATTTT
TATTTTAGCAAAAGCTTCCGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2G209JQ C 1
AF RR2G209TF U 1
BS 1 677 RR2G209TF
BS 678 681 RR2G209JQ

RD RR2G209JQ 681 0 0
GAACTTCCCGAATCTCAAGGATCCGAGCGAGCTGCTCGGACTCGGAGACTCCTCTAAGCT
GAACGCCCTCAAAAACGCAGTCGACGGGAGGATCCAGTCGATTTGCCAGAGAGTGAGAAG
AGAGAGAGCCAAAAAGAGCGGGAAAGAGAGTAAAGATTCTCCAACGGCGACGGCGGATTC
ATCCTCGCCGGGAACTCTGTCTTCTCCGGCGACAACTGCCACTGCGGTAAATTCAGAGGA
TAGCTACCGGAATACGCAGATGGGTCTGTGGAATAGCAAGAATAGTTCTCCTGCTTCGGT
TTCTGTCTCCGATGAAGTTCCGGCGACGACAACATCGACGGCGGAGGAGGAGGAAGACAC
GATGATGGATACAGAAGGGTTTTTACTTGCGAGGATGCCATCGTTCGATCCTGAGCTTAT
TTGGGAAGTTCTCGCTAATTAAATCACAAAACTTGGGTATCAAGGAATATGATGAGAAGA
TTAGGGTTTTAGGTGTGAATTAAGGTCTTCGTTCGAAAGTTGTTTTAGGGTTTTTAATTA
AAATTTTAAGCCTCGTGGTTTTTGAGAGAGGTTGTGAAAGCTCCTTTTTTGAAGTTATAT
TATAGTCATCCAAGGACTTTCTGATTGTACTTTGGAACAATTATTATCTGTAACAATTTT
TATTTTAGCAAAAGCTTCCGG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2G209TF 677 0 0
GAACTTCCCGAATCTCAAGGATCCGAGCGAGCTGCTCGGACTCGGAGACTCCTCTAAGCT
GAACGCCCTCAAAAACGCAGTCGACGGGAGGATCCAGTCGATTTGCCAGAGAGTGAGAAG
AGAGAGAGCCAAAAAGAGCGGGAAAGAGAGTAAAGATTCTCCAACGGCGACGGCGGATTC
ATCCTCGCCGGGAACTCTGTCTTCTCCGGCGACAACTGCCACTGCGGTAAATTCAGAGGA
TAGCTACCGGAATACGCAGATGGGTCTGTGGAATAGCAAGAATAGTTCTCCTGCTTCGGT
TTCTGTCTCCGATGAAGTTCCGGCGACGACAACATCGACGGCGGAGGAGGAGGAAGACAC
GATGATGGATACAGAAGGGTTTTTACTTGCGAGGATGCCATCGTTCGATCCTGAGCTTAT
TTGGGAAGTTCTCGCTAATTAAATCACAAAACTTGGGTATCAAGGAATATGATGAGAAGA
TTAGGGTTTTAGGTGTGAATTAAGGTCTTCGTTCGAAAGTTGTTTTAGGGTTTTTAATTA
AAATTTTAAGCCTCGTGGTTTTTGAGAGAGGTTGTGAAAGCTCCTTTTTTGAAGTTATAT
TATAGTCATCCAAGGACTTTCTGATTGTACTTTGGAACAATTATTATCTGTAACAATTTT
TATTTTAGCAAAAGCTT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL7290Contig1 1052 2 2 U
ATCTATTTTAGTCTTCACCTTGCCATCAATACAACCATGGCAAGGACTTCTCTGTTGTTA
TCTTTAGCCCTAGTTCTAGTCATCGCCACCTCCGTCTCGGCACACCCACCTAAGCCCAAG
AAAACACAAAAGAACATATGTCCACCTACTTTGGGGGGAGTCCTAACCTTCCCTTCCCTC
GAAATCTCCAAGTTCATCGAGAATAAGGCTAAATTATCCGCACCAAACAGCGTTCAGTTC
AACACTTTGTTCTCCATATGCAAAACCTTCAGCAACCAGCTCGCAGCCTTCAAGGTCGCA
GGCGCCAGGAATGTGTTTCGCATGGTTTACACCAAATACGCCATGATAACCAAGGCCGTG
TTTGCGGCCGAAGCAGCTATCGGTATTCAAGGCGAGCTCGCGGCTAAGCTAGAGAAGAGC
TACAACGGTATGGCTGGATGTTTTTTTAAGCTTGAGGAGAAAATGGCCGAGATCTCGGCC
AGGTACAAGTACAATGCTAACGCTAAGATAAGCCAAGGGGACAGGGACAAGATGGACGAA
TGTTTGATTAAGTTGAAGGGTGCCATTAATGGTTTCGTCAAGGTGATCACTGAGTGCAGC
GTGAAGTTCTCTTCCGTGAAGCAAATCGGTATCCCTGTCAGAGGCGGTTTGATCGGTAGT
TTCGCCAAGAACGGTGTCGGTTTTGGCTCTGGTTTGATCGGTTTAAGCGGCCACAGCCAA
GCTGAAGCCGAAGCTAAGGTTGGAATTCAAGGTCATGCCGGAGGCAGAAGATTGTTCGGG
GGGTTCTTTGACTTTGGAGGATTCGTTAAGTACGATGCTGCGGGTAAGGCAAAGTTCAGG
GGAGATAGCGAGTTCAGATCACGGGTCCACCCTAGCAAGATACACTTAAACTGAGCAAAG
GCGCAAGTTATGCTTATGAACAACAACAGATGAAGGAGAGCCATGAGTTTATCTTTACTA
CTTTTATTTTGTGTACTACTAATATGAAGGAGGGAAACGCCATGTGATATTTTATCTCTA
TTTGTAACCATTAATAAAAAATCGACATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BF82TF U 1
AF RR2BF82JQ C 294
BS 1 705 RR2BF82TF
BS 706 1052 RR2BF82JQ

RD RR2BF82TF 705 0 0
ATCTATTTTAGTCTTCACCTTGCCATCAATACAACCATGGCAAGGACTTCTCTGTTGTTA
TCTTTAGCCCTAGTTCTAGTCATCGCCACCTCCGTCTCGGCACACCCACCTAAGCCCAAG
AAAACACAAAAGAACATATGTCCACCTACTTTGGGGGGAGTCCTAACCTTCCCTTCCCTC
GAAATCTCCAAGTTCATCGAGAATAAGGCTAAATTATCCGCACCAAACAGCGTTCAGTTC
AACACTTTGTTCTCCATATGCAAAACCTTCAGCAACCAGCTCGCAGCCTTCAAGGTCGCA
GGCGCCAGGAATGTGTTTCGCATGGTTTACACCAAATACGCCATGATAACCAAGGCCGTG
TTTGCGGCCGAAGCAGCTATCGGTATTCAAGGCGAGCTCGCGGCTAAGCTAGAGAAGAGC
TACAACGGTATGGCTGGATGTTTTTTTAAGCTTGAGGAGAAAATGGCCGAGATCTCGGCC
AGGTACAAGTACAATGCTAACGCTAAGATAAGCCAAGGGGACAGGGACAAGATGGACGAA
TGTTTGATTAAGTTGAAGGGTGCCATTAATGGTTTCGTCAAGGTGATCACTGAGTGCAGC
GTGAAGTTCTCTTCCGTGAAGCAAATCGGTATCCCTGTCAGAGGCGGTTTGATCGGTAGT
TTCGCCAAGAACGGTGTCGGTTTTGGCTCTGGTTTGATCGGTTTA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2BF82JQ 759 0 0
GGTCGCAGGCGCCAGGAATGTGTTTCGCATGGTTTACACCAAATACGCCATGATAACCAA
GGCCGTGTTTGCGGCCGAAGCAGCTATCGGTATTCAAGGCGAGCTCGCGGCTAAGCTAGA
GAAGAGCTACAACGGTATGGCTGGATGTTTTTTTAAGCTTGAGGAGAAAATGGCCGAGAT
CTCGGCCAGGTACAAGTACAATGCTAACGCTAAGATAAGCCAAGGGGACAGGGACAAGAT
GGACGAATGTTTGATTAAGTTGAAGGGTGCCATTAATGGTTTCGTCAAGGTGATCACTGA
GTGCAGCGTGAAGTTCTCTTCCGTGAAGCAAATCGGTATCCCTGTCAGAGGCGGTTTGAT
CGGTAGTTTCGCCAAGAACGGTGTCGGTTTTGGCTCTGGTTTGATCGGTTTAAGCGGCCA
CAGCCAAGCTGAAGCCGAAGCTAAGGTTGGAATTCAAGGTCATGCCGGAGGCAGAAGATT
GTTCGGGGGGTTCTTTGACTTTGGAGGATTCGTTAAGTACGATGCTGCGGGTAAGGCAAA
GTTCAGGGGAGATAGCGAGTTCAGATCACGGGTCCACCCTAGCAAGATACACTTAAACTG
AGCAAAGGCGCAAGTTATGCTTATGAACAACAACAGATGAAGGAGAGCCATGAGTTTATC
TTTACTACTTTTATTTTGTGTACTACTAATATGAAGGAGGGAAACGCCATGTGATATTTT
ATCTCTATTTGTAACCATTAATAAAAAATCGACATTTCC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL7291Contig1 539 2 1 U
GGGTTGCTGACAAGTTCGCTGCTGATGCCAACAGCAAGGTTGTGCCAGCATCAGGCATTG
AGGACGGATGGATGGGACTGGACATAGGTCCGGACTCAGTGAAAACATTCAACGAGGCGC
TGGACACAACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGATGGAGAAGT
TTGCTGCTGGAACAGAGGCGGTTGCGAACAAACTAGCAGAGCTAAGCGAGAAAGGAGTGA
CAACTATAATAGGAGGAGGAGACTCAGTGGCTGCAGTGGAGAAAGTAGGAGTTGCAGGAG
TCATGAGTCACATCTCCACTGGTGGTGGAGCCAGCTTGGAGCTCTTGGAAGGTAAAGTAC
TTCCCGGTGTGATTGCTCTTGATGAAGCCATCACTGTCACCGTTTAGAAAACTCCCCCTT
TTGATGTATACTCACGAGTTTCTTTTGCTGTAAATTTAAGACTTATGACCTTTTTTTTTA
AACAAGTACTTGTTGGTCTTAAAAGAACCTTACCAATATTAAAATCTCTGAAACACAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BB72JQ C 1
AF RR2BB72TF U 1
BS 1 539 RR2BB72TF

RD RR2BB72JQ 539 0 0
GGGTTGCTGACAAGTTCGCTGCTGATGCCAACAGCAAGGTTGTGCCAGCATCAGGCATTG
AGGACGGATGGATGGGACTGGACATAGGTCCGGACTCAGTGAAAACATTCAACGAGGCGC
TGGACACAACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGATGGAGAAGT
TTGCTGCTGGAACAGAGGCGGTTGCGAACAAACTAGCAGAGTTAAGCGAGAAAGGAGTGA
CAACTATAATAGGAGGAGGAGACTCAGTGGCTGCAGTGGAGAAAGTAGGAGTTGCAGGAG
TCATGAGTCACATTTCCACTGGTGGTGGAGCCAGCTTGGAGCTCTTGGAAGGTAAAGTAC
TTCCCGGTGTGATTGCTCTTGATGAAGCCATCACTGTCACCGTTTAGAAAACTCCCCCTT
TTGATGTATACTCACGAGTTTTTTTTGCTGTAAATTTAAGACTTATGACCTTTTTTTTTA
AACAAGTACTTGTTGGTTTTAAAAGAACCTTACCAATATTAAAATTTTTGAAACACAAT

QA 1 539 1 539
DS 

RD RR2BB72TF 539 0 0
GGGTTGCTGACAAGTTCGCTGCTGATGCCAACAGCAAGGTTGTGCCAGCATCAGGCATTG
AGGACGGATGGATGGGACTGGACATAGGTCCGGACTCAGTGAAAACATTCAACGAGGCGC
TGGACACAACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGATGGAGAAGT
TTGCTGCTGGAACAGAGGCGGTTGCGAACAAACTAGCAGAGCTAAGCGAGAAAGGAGTGA
CAACTATAATAGGAGGAGGAGACTCAGTGGCTGCAGTGGAGAAAGTAGGAGTTGCAGGAG
TCATGAGTCACATCTCCACTGGTGGTGGAGCCAGCTTGGAGCTCTTGGAAGGTAAAGTAC
TTCCCGGTGTGATTGCTCTTGATGAAGCCATCACTGTCACCGTTTAGAAAACTCCCCCTT
TTGATGTATACTCACGAGTTTCTTTTGCTGTAAATTTAAGACTTATGACCTTTTTTTTTA
AACAAGTACTTGTTGGTCTTAAAAGAACCTTACCAATATTAAAATCTCTGAAACACAAT

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 2

CO CL7292Contig1 1114 2 2 U
GGTAAAAAACATATATGTCCATAAAAAGATCTTCTTCTTCATTAGAGAGTCAGAATCGCG
GGATGGGTAACTGTCACACACTTTTCACCCGACAAGCTGATCCATTTTCAACGGAAGAGC
GTGTGAAAGTCTTCACGGTGGCGGAGCTGAAAAAAACAACTAAGGATTTTAGTAAGGGGA
TGGTAAAAGGAGAGCGCTTTGGCAGCCATGTCAGGGGATACATCAACCCCAAGACGTTAT
CTCCAGCCAAGGAAGGGGTTGGCATGGCCGTAGCGGTTAAGAGATTTTACATGTTCAAGG
ATCTTGATCAAGATTTGCAAGATTGGCTTATTGACCTAGAGTTTCTACGACGTAACTCTC
ATCCAAGCTTGGTGAAGCTCATTGGCTATGGTTCTGATCGTCGTACGTTGTTCATTGTCG
CTGAATACTTTCCAATCGGAAGCTTAGAAAATCACATCTATAGAGAGACTCGTCCAAAGT
CATTGCCCTGGGAGACGCGACTTAACGTATCCATAGGAGTGGCTCAGTGTCTTGCTTTCT
TGCACTCTTGGAAGAAAACCAGTCTTTCTCGCAGATATCTCACCGCTTCTAAAGTCCTGC
TCGATTTGGAGTTCAACGCAAGAGTTTCCTATTACGGACTCAAAAACCTACCTTATATTT
GAAGAAAGGGACACACGTCCCCTCGTTAGATTACGCACCTCCCGAATACATATTATCAGG
GAAGTTGGACATGCCCGGCGATGTGTACAGCTTTGGTGCTATACTGCTCCAGATGTTAAC
TGGTTTAAAAATGCGGCACATAATTCTAAAAATACGAAATGACAGTGAAAGCATTGCTGA
GATGATCGATCCAGATCTAGAGAATAGCTATCCTCTTCAAGAGGGGATGCGTATGTGCGA
GATTATTAAACAATGCCTTGAGGAAGACCCGAAGAATCGACCATCCATGCAACAGGTGCT
GGATAGTTTGAATAGGATAGCTCAGACTTGAGTAAGAGTTGTAAAGGCTAAAAAAATATT
TCCACTAGCTATAAGACAATTATAATATAGTCGAAATACGCATATGCATATATACATTTG
TATTAAACAAGTGCGAATGGAGTTAGTATATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B884TF U 1
AF RR2B884JQ C 587
BS 1 726 RR2B884TF
BS 727 1114 RR2B884JQ

RD RR2B884TF 726 0 0
GGTAAAAAACATATATGTCCATAAAAAGATCTTCTTCTTCATTAGAGAGTCAGAATCGCG
GGATGGGTAACTGTCACACACTTTTCACCCGACAAGCTGATCCATTTTCAACGGAAGAGC
GTGTGAAAGTCTTCACGGTGGCGGAGCTGAAAAAAACAACTAAGGATTTTAGTAAGGGGA
TGGTAAAAGGAGAGCGCTTTGGCAGCCATGTCAGGGGATACATCAACCCCAAGACGTTAT
CTCCAGCCAAGGAAGGGGTTGGCATGGCCGTAGCGGTTAAGAGATTTTACATGTTCAAGG
ATCTTGATCAAGATTTGCAAGATTGGCTTATTGACCTAGAGTTTCTACGACGTAACTCTC
ATCCAAGCTTGGTGAAGCTCATTGGCTATGGTTCTGATCGTCGTACGTTGTTCATTGTCG
CTGAATACTTTCCAATCGGAAGCTTAGAAAATCACATCTATAGAGAGACTCGTCCAAAGT
CATTGCCCTGGGAGACGCGACTTAACGTATCCATAGGAGTGGCTCAGTGTCTTGCTTTCT
TGCACTCTTGGAAGAAAACCAGTCTTTCTCGCAGATATCTCACCGCTTCTAAAGTCCTGC
TCGATTTGGAGTTCAACGCAAGAGTTTCCTATTACGGACTCAAAAACCTACCTTATATTT
GAAGAAAGGGACACACGTCCCCTCGTTAGATTACGCACCTCCCGAATACATATTATCAGG
GAAGTT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2B884JQ 528 0 0
TTCTAAAGTCCTGCTCGATTTGGAGTTCAACGCAAGAGTTTCCTATTACGGACTCAAAAA
CCTACCTTATATT*GAAGAA*GGGACACACGTCCCCTCGTTAGATTACGCACCTCCCGAA
TACATATTATCAGGGAAGTTGGACATGCCCGGCGATGTGTACAGCTTTGGTGCTATACTG
CTCCAGATGTTAACTGGTTTAAAAATGCGGCACATAATTCTAAAAATACGAAATGACAGT
GAAAGCATTGCTGAGATGATCGATCCAGATCTAGAGAATAGCTATCCTCTTCAAGAGGGG
ATGCGTATGTGCGAGATTATTAAACAATGCCTTGAGGAAGACCCGAAGAATCGACCATCC
ATGCAACAGGTGCTGGATAGTTTGAATAGGATAGCTCAGACTTGAGTAAGAGTTGTAAAG
GCTAAAAAAATATTTCCACTAGCTATAAGACAATTATAATATAGTCGAAATACGCATATG
CATATATACATTTGTATTAAACAAGTGCGAATGGAGTTAGTATATGTC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL7293Contig1 745 2 3 U
GGGGGGGCAATTCTCGGTTGTTTGTTACGAGGAAAAACACCTAAGGAAGAAAAAAAAAGA
AAAAGAAAGATATATGTCGGGGGATTCCGCCGCCGCCGCTGATAACGAGATCATGAAGTT
TGGAGACTCGACTGAGTTTTCTCCACCACTGAAGAAGCCAAAGACGGATCCAGTGGGGAA
GGCAGAGGCAGAGGCTGAGGAAAAGGTAGAGCCAGCGGGAGAGGATGATCCACTAGGAAG
ACCGCCTTTCCTCCCAATAGATTGCGATGATCCGAAATATAAGGAACAGGCTGATCTTTT
CATGGAACAAGTTGATAAGTACGAGGGTTTTTATATGGACTTGGATAAATTTGACTACAA
ATTTGCTCCCGTCAAATTTGAATGGGGAAATAAGTTCGATGTTAGACTCAGCAATAAAGA
CTTGATGGATCTTCTCATCAAGACGGCTATCGAGGCAAAAAACGAAGATTATGGAACACA
ACTTGAGCTTGTCGAGTACGTCAGTTGCAATGTAACAGCCGCCCAAGGTTTTTGCTTTTA
CATAACATTGTGGGCTAAAGATCCCTCCTCGCCAAATCCGGAGCCTAAACTTTACCAAAC
ATTAGTGCGCAAGTTCCGTGGTGACTTACATGTTCATGAGTTCAAGCTTAAGCCATCACA
ACAAGAATGATTCATATATCTCTTTGATGAGTACACCTTTTTAAATCTCTTCTAGAGCTG
TTACTTCTGTTAGAGCAACATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS85TF U 265
AF RR2FM24TF U 1
BS 1 487 RR2FM24TF
BS 488 488 RR2DS85TF
BS 489 745 RR2FM24TF

RD RR2DS85TF 330 0 0
CGATGATCCGAAATATAAGGAACAGGCTGATCTTTTCATGGAACAAGTTGATAAGTACGA
GGGTTTTTATATGGACTTGGATAAATTTGACTACAAATTTGCTCCCGTCAAATTTGAATG
GGGAAATAAGTTCGATGTTAGACTCAGCAATAAAGACTTGATTGATCTTCTCATCAAGAC
GGCTATCGAGGCAAAAA*CGAAGATTATGGAACACAACTTGAGCTTGTCGAGTACGTCAG
TTGCAATGTAACAGCCGCCCAAGGTTTTTGCTTTTACATAACATTGTGGGCTAAAGATCC
CTCCTCGCCAAATCCGGAGCCTAAACTTTA

QA 1 330 1 330
DS 

RD RR2FM24TF 745 0 0
GGGGGGGCAATTCTCGGTTGTTTGTTACGAGGAAAAACACCTAAGGAAGAAAAAAAAAGA
AAAAGAAAGATATATGTCGGGGGATTCCGCCGCCGCCGCTGATAACGAGATCATGAAGTT
TGGAGACTCGACTGAGTTTTCTCCACCACTGAAGAAGCCAAAGACGGATCCAGTGGGGAA
GGCAGAGGCAGAGGCTGAGGAAAAGGTAGAGCCAGCGGGAGAGGATGATCCACTAGGAAG
ACCGCCTTTCCTCCCAATAGATTGCGATGATCCGAAATATAAGGAACAGGCTGATCTTTT
CATGGAACAAGTTGATAAGTACGAGGGTTTTTATATGGACTTGGATAAATTTGACTACAA
ATTTGCTCCCGTCAAATTTGAATGGGGAAATAAGTTCGATGTTAGACTCAGCAATAAAGA
CTTGATGGATCTTCTCATCAAGACGGCTATCGAGGCAAAAAACGAAGATTATGGAACACA
ACTTGAGTTTGTCGAGTACGTCAGTTGCAATGTAACAGCCGCCCAAGGTTTTTGCTTTTA
CATAACATTGTGGGCTAAAGATCCCTCCTCGCCAAATCCGGAGCCTAAACTTTACCAAAC
ATTAGTGCGCAAGTTCCGTGGTGACTTACATGTTCATGAGTTCAAGCTTAAGCCATCACA
ACAAGAATGATTCATATATCTCTTTGATGAGTACACCTTTTTAAATCTCTTCTAGAGCTG
TTACTTCTGTTAGAGCAACATTATT

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL7294Contig1 834 2 2 U
GGAAGTCGGAAAGAAATGGATTCATATCATCATCTCTCTCCTCTCTCACTCCTCCATCGG
GTCAAAGATTCCTTCCATTCAACCGTTTCCGCCATCCTCGCCAACCTCTTCTCCGCCTTC
TTCACCTTCTTCTTCGCTCTAGTGGGGACTTTGCTAGGAGCCTTGACAGGGGCTTTGATC
GGGCAAGAAACAGAGACCGGTTTCATCAGAGGAGCAGCCGTTGGTGCTATTACTGGCGCT
GTCTTCTCCATCGATGTCCTTGAGTCTTCCCTCCTCCTCTGGCAATCCGATGATTCTGGT
ATTGCTTGCCTTCTCTACTTGATTGACGTCATTGTCAGCCTTTTGAGCGGGAGGCTAGTT
CGCGAGCGTATTGGTCCTGCAATGCTTAATGCTGTCCAGAGTCGGATGGGAGCTATGGAG
TCACAATTCCAAGACCAAACTCATGATATCTTCGCCACTCCCATTTCAAAAGGTCTCACA
GGGGATTCTCTCGACAGGATCCCAAAGGTCCTCATTACTGACACCTCTGGGGAGATGATG
GTCTCTTGCTCTGTATGCCTTCAGGACTTTCAGGTGGGAGAGACTGTTAGAAGTTTGCCG
CATTGCCATCATATGTTCCACTTACCGTGCATCGACAAGTGGCTTGAAGGGCACGCTTCT
TGTCCCTTGTGCAGAAGAGACCTTTGAATTCTAACCTCTCATCTTCTTTGTAAATGAGGT
ATTATAAAACCCATACACACTACTAGTTGATGTTCCTTGATTATTTAGATTACATATCAA
TCATTGTAACTTGACTCATCTCTCTGATTTTTTTAATGTATACTCATTCTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AI83TF U 1
AF RR2AI83JQ C 129
BS 1 643 RR2AI83TF
BS 644 834 RR2AI83JQ

RD RR2AI83TF 643 0 0
GGAAGTCGGAAAGAAATGGATTCATATCATCATCTCTCTCCTCTCTCACTCCTCCATCGG
GTCAAAGATTCCTTCCATTCAACCGTTTCCGCCATCCTCGCCAACCTCTTCTCCGCCTTC
TTCACCTTCTTCTTCGCTCTAGTGGGGACTTTGCTAGGAGCCTTGACAGGGGCTTTGATC
GGGCAAGAAACAGAGACCGGTTTCATCAGAGGAGCAGCCGTTGGTGCTATTACTGGCGCT
GTCTTCTCCATCGATGTCCTTGAGTCTTCCCTCCTCCTCTGGCAATCCGATGATTCTGGT
ATTGCTTGCCTTCTCTACTTGATTGACGTCATTGTCAGCCTTTTGAGCGGGAGGCTAGTT
CGCGAGCGTATTGGTCCTGCAATGCTTAATGCTGTCCAGAGTCGGATGGGAGCTATGGAG
TCACAATTCCAAGACCAAACTCATGATATCTTCGCCACTCCCATTTCAAAAGGTCTCACA
GGGGATTCTCTCGACAGGATCCCAAAGGTCCTCATTACTGACACCTCTGGGGAGATGATG
GTCTCTTGCTCTGTATGCCTTCAGGACTTTCAGGTGGGAGAGACTGTTAGAAGTTTGCCG
CATTGCCATCATATGTTCCACTTACCGTGCATCGACAAGTGGC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2AI83JQ 706 0 0
CTTCTTCGCTCTAGTGGGGACTTTGCTAGGAGCCTTGACAGGGGCTTTGATCGGGCAAGA
AACAGAGACCGGTTTCATCAGAGGAGCAGCCGTTGGTGCTATTACTGGCGCTGTCTTCTC
CATCGATGTCCTTGAGTCTTCCCTCCTCCTCTGGCAATCCGATGATTCTGGTATTGCTTG
CCTTCTCTACTTGATTGACGTCATTGTCAGCCTTTTGAGCGGGAGGCTAGTTCGCGAGCG
TATTGGTCCTGCAATGCTTAATGCTGTCCAGAGTCGGATGGGAGCTATGGAGTCACAATT
CCAAGACCAAACTCATGATATCTTCGCCACTCCCATTTCAAAAGGTCTCACAGGGGATTC
TCTCGACAGGATCCCAAAGGTCCTCATTACTGACACCTCTGGGGAGATGATGGTCTCTTG
CTCTGTATGCCTTCAGGACTTTCAGGTGGGAGAGACTGTTAGAAGTTTGCCGCATTGCCA
TCATATGTTCCACTTACCGTGCATCGACAAGTGGCTTGAAGGGCACGCTTCTTGTCCCTT
GTGCAGAAGAGACCTTTGAATTCTAACCTCTCATCTTCTTTGTAAATGAGGTATTATAAA
ACCCATACACACTACTAGTTGATGTTCCTTGATTATTTAGATTACATATCAATCATTGTA
ACTTGACTCATCTCTCTGATTTTTTTAATGTATACTCATTCTTGGC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL7295Contig1 792 2 2 U
GGGAGAAACTAAGCCTAGGAAACATTCTCAAGTATGTCCAACGAGCAGCAGAGGAGCTGC
AGATGAAAATAGACAAGAACTCTTTCCTTCTCGTCAACTCAGAGAGCTGGGCTGCTATGA
AAGAGAAAGCAGACGCAGAAGAAGCACAAGAGAACTACCACGAATCCAAAGACGACGAGA
CCAAAGTGTTCCAAACCCTCAGCCAGATTTGGGACCACAACACCAACAACCATCACCAGA
ATCCACACAATGGTAATAATGATTCTCATCTGTGGATGTCAACAGAGAGTAATTTGCTTA
GGAACCGAGAACAGTGGCCAAGCGTCTCCTTCATAGGCGGTAATATGATCAATGAGATAG
AATCCAAAGTATACGAGAGCACCAGTTCTTTGTCCCTGGCCACATTTGCATCTCTTCTGA
TCGAGTTTGTTGCTAGGCTCCAGAATGTTGTTAACGCATTTGAGGAGCTTAGCACCAAAG
CCGGTTTCAAAGAGCCAGTTACTGAGACGCATAAGAAGAAGATAGAGAAAGCTGGGGTTT
TGGACAAGACTTTGCAGTTGCTTCAGCTCCAGGGCTTAGCAGAAGCATTTACAGTTTTTA
ATTATGGTGGTGAAAAGTTGATTTGTATACATAATTGATGTATTTTTTTTTTTCGTTTCG
TCTTGAAATAAGTTCCTAATTCATTGTTTTGGGGAAGTTATAAGTTATGCAACTCAGCTT
GAAGTCTTGTTGTCTTTAATTTTCTTTGTTGAAATACTGTTTTCTTTATTAATTGGATCA
TTTAGTGTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B145TF U 1
AF RR2B145JQ C 19
BS 1 686 RR2B145TF
BS 687 792 RR2B145JQ

RD RR2B145TF 686 0 0
GGGAGAAACTAAGCCTAGGAAACATTCTCAAGTATGTCCAACGAGCAGCAGAGGAGCTGC
AGATGAAAATAGACAAGAACTCTTTCCTTCTCGTCAACTCAGAGAGCTGGGCTGCTATGA
AAGAGAAAGCAGACGCAGAAGAAGCACAAGAGAACTACCACGAATCCAAAGACGACGAGA
CCAAAGTGTTCCAAACCCTCAGCCAGATTTGGGACCACAACACCAACAACCATCACCAGA
ATCCACACAATGGTAATAATGATTCTCATCTGTGGATGTCAACAGAGAGTAATTTGCTTA
GGAACCGAGAACAGTGGCCAAGCGTCTCCTTCATAGGCGGTAATATGATCAATGAGATAG
AATCCAAAGTATACGAGAGCACCAGTTCTTTGTCCCTGGCCACATTTGCATCTCTTCTGA
TCGAGTTTGTTGCTAGGCTCCAGAATGTTGTTAACGCATTTGAGGAGCTTAGCACCAAAG
CCGGTTTCAAAGAGCCAGTTACTGAGACGCATAAGAAGAAGATAGAGAAAGCTGGGGTTT
TGGACAAGACTTTGCAGTTGCTTCAGCTCCAGGGCTTAGCAGAAGCATTTACAGTTTTTA
ATTATGGTGGTGAAAAGTTGATTTGTATACATAATTGATGTATTTTTTTTTTTCGTTTCG
TCTTGAAATAAGTTCCTAATTCATTG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2B145JQ 774 0 0
GAAACATTCTCAAGTATGTCCAACGAGCAGCAGAGGAGCTGCAGATGAAAATAGACAAGA
ACTCTTTCCTTCTTGTCAACTCAGAGAGCTGGGCTGCTATGAAAGAGAAAGCAGACGCAG
AAGAAGCACAAGAGAACTACCACGAATCCAAAGACGACGAGACCAAAGTGTTCCAAACCC
TCAGCCAGATTTGGGACCACAACACCAACAACCATCACCAGAATCCACACAATGGTAATA
ATGATTCTCATCTGTGGATGTCAACAGAGAGTAATTTGCTTAGGAACCGAGAACAGTGGC
CAAGCGTCTCCTTCATAGGCGGTAATATGATCAATGAGATAGAATCCAAAGTATACGAGA
GCACCAGTTCTTTGTCCCTGGCCACATTTGCATCTCTTCTGATCGAGTTTGTTGCTAGGC
TCCAGAATGTTGTTAACGCATTTGAGGAGCTTAGCACCAAAGCCGGTTTCAAAGAGCCAG
TTACTGAGACGCATAAGAAGAAGATAGAGAAAGCTGGG*TTTTGGACAAGACTTTGCAGT
TGCTTCAGCTCCAGGGCTTAGCAGAAGCATTTACAGTTTTTAATTATGGTGGTGAATAGT
TGATTTGTATACATAATTGATGTATTTTTTTTTT*CGTTTCGTCTTGAAATAAGTTCCTA
ATTCATTGTTTTGGGGAAGTTATAAGTTATGCAACTCAGCTTGAAGTCTTGTTGTCTTTA
ATTTTCTTTGTTGAAATACTGTTTTCTTTATTAATTGGATCATTTAGTGTTGCC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL7296Contig1 555 2 7 U
GTTAAGGGGAGACAAATCCTCCAACTTATTTAATAGCAAACAAACACAACAACACATAGG
TTTTGCCTCGGACAAATCCCATTATCCCCTCCCCCTCTATTTTGTGTAAAAGAATCTCAT
CTCCACACAGGCAAATAAATAAAATTATTTAATTCCACCCTGAATGTATGGAGAGAAGGG
GGGAAATTATCTTCCCAAAAAAATAAATAAAAAACTTGGTCCGTCTTGTACCTTAAGTTT
ATAAATGCAAATATTGGAGAGAATGGGGGAAGGGAATGAAACAATCATCATCCATCCATT
CATCACTCGTCTTCGCTTGCGGTGAGAATGAAAGAGAAAGGAGCGAACTTGTAACCATCT
CCTTCGTAGAATTTGTTCTGGAACTCAACCCAATGGAGACGTAGTGCGTGAAGAAACACG
CTCAGTGTCTCCATCACCAGCAGCACTCCCACCGTGGCGAATACGAAGACGATGATCCCA
ACGATCAAGATCAACCAATTGTTATATCCCCAAGCGAGAAGGAGAACCTTCTCATAGAAG
ACTGACGATAGCTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO54JQ U 3
AF RR2AR38TF C 1
BS 1 3 RR2AR38TF
BS 4 35 RR2BO54JQ
BS 36 36 RR2AR38TF
BS 37 417 RR2BO54JQ
BS 418 418 RR2AR38TF
BS 419 534 RR2BO54JQ
BS 535 555 RR2AR38TF

RD RR2BO54JQ 532 0 0
A
AAGGGGAGACAAATCCTCCAACTTATTTAATATCAAACAAACACAACAACACATAGGTTT
TGCCTCGGACAAATCCCATTATCCCCTCCCCCTCTATTTTGTGTAAAAGAATCTCATCTC
CACACAGGCAAATAAATAAAATTATTTAATTCCACCCTGAATGTATGGAGAGAAGGGGGG
AAATTATCTTCCCAAAAAAATAAATAAAAAACTTGGTCCGTCTTGTACCTTAAGTTTATA
AATGCAAATATTGGAGAGAATGGGGGAAGGGAATGAAACAATCATCATCCATCCATTCAT
CACTCGTCTTCGCTTGCGGTGAGAATGAAAGAGAAAGGAGCGAACTTGTAACCATCTCCT
TCGTAGAATTTGTTCTGGAACTCAACCCAATGGAGACGTAGTGCGTGAAGAAACGCGCTC
AGTGTCTCCATCACCAGCAGCACTCCCACCGTGGCGAATACGAAGACGATGATCCCAACG
ATCAAGATCAACCAATTGTTATATCCCCAAGCGAGAAGGAGAACCTTCTCA

QA 2 532 2 532
DS 

RD RR2AR38TF 555 0 0
GTTAAGGGGAGACAAATCCTCCAACTTATTTAATAGCAAACAAACACAACAACACATAGG
TTTTGCCTCGGACAAATCCCATTATCCCCTCCCCCTCTATTTTGTGTAAAAGAATCTCAT
CTCCACACAGGCAAATAAATAAAATTATTTAATTCCACCCTGAATGTATGGAGAGAAGGG
GGGAAATTATCTTCGCAAAAAAATAAATAAAAAACTTGGTCCGTCTTGTACCTTAAGTTT
ATATATGCAAATATTGGAGAGAATGGGGGAAGGGAATGAAACAATCATCATCCATCCATT
CATCACTCGTCTTCGCTTGCGGTGAGAATGAAAGAGAAAGGAGCGAACTTGTAACCATCT
CCTTCGTAGAATTTGTTCTGGAACTCAACCCAATGGAGACGTAGTGCGTGAAGAAACACG
CTCAGTGTCTCCATCACCAGCAGCACTCCCACCGTGGCGAATACGAAGACGATGATCCCA
ACGATCAAGATCAACCAATTGTTATATCCCCAAGCGAGAAGGAGAACCTTCTCATAGAAG
ACTGACGATAGCTCC

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

CO CL7297Contig1 564 2 8 U
GGCTTAAACCTAACATGGTCACTCCCGGCTCAAACAGCGTTAAGGTTGCACCCGAAGTGA
TAGCAGAGTACACAGTGACTGCCCTCCGCCGCACGGTCCCACCAGCGGTTCCAGGAATCG
TGTTCCTCTCAGGAGGACAGAGCGAAGAGGAAGCAACGCTAAATCTGAACGCAATGAACA
AACTCGATTTGTTGAAGCCATGGACGCTCACTTTCTCCTTTGGCCGAGCCCTCCAGCAAA
GCACTCTCAAGGCTTGGGGCGGTAAGAAAGAGAACGTAGCCAAAGCTCAGGCCACGTTCT
TGGTCAGGTGCAAGGCTAACTCTGACGCTACGCTTGGGAAATACATCCCCGGGGCTTCTG
GTGACTCTGCTGCCTCCGAGAGCTTGTTTGTGGAAGGATACAGTTACTAGGGCGTCTGCG
TTTGATACGGTTTGGGTATATCTTATAATATATTTGAACGTTTTGTTGGCGTTGTAACTG
TTTTAAATGTCTGCTCGATTTGGTTTTGCCGTTTGACCAAACCGTGTAGTGTCTTAAGCT
ATATGTCTATTCTCTATTTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H114TF U 1
AF RR2GV39JQB C 82
BS 1 249 RR2H114TF
BS 250 250 RR2GV39JQB
BS 251 453 RR2H114TF
BS 454 455 RR2GV39JQB
BS 456 458 RR2H114TF
BS 459 459 RR2GV39JQB
BS 460 552 RR2H114TF
BS 553 564 RR2GV39JQB

RD RR2H114TF 552 0 0
GGCTTAAACCTAACATGGTCACTCCCGGCTCAAACAGCGTTAAGGTTGCACCCGAAGTGA
TAGCAGAGTACACAGTGACTGCCCTCCGCCGCACGGTCCCACCAGCGGTTCCAGGAATCG
TGTTCCTCTCAGGAGGACAGAGCGAAGAGGAAGCAACGCTAAATCTGAACGCAATGAACA
AACTCGATTTGTTGAAGCCATGGACGCTCACTTTCTCCTTTGGCCGAGCCCTCCAGCAAA
GCACTCTCACGGCTTGGGGCGGTAAGAAAGAGAACGTAGCCAAAGCTCAGGCCACGTTCT
TGGTCAGGTGCAAGGCTAACTCTGACGCTACGCTTGGGAAATACATCCCCGGGGCTTCTG
GTGACTCTGCTGCCTCCGAGAGCTTGTTTGTGGAAGGATACAGTTACTAGGGCGTCTGCG
TTTGATACGGTTTGGGTATATCTTATAATATAT**GAATGTTTTGTTGGCGTTGTAACTG
TTTTAAATGTCTGCTCGATTTGGTTTTGCCGTTTGACCAAACCGTGTAGTGTCTTAAGCT
ATATGTCTATTC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2GV39JQB 483 0 0
CCT
TCCGCCGCACGGTCCCACCAGCGGTTCCAGGAATCGTGTTCCTCTCAGGAGGACAGAGCG
AAGAGGAAGCAACGCTAAATCTGAACGCAATGAACAAGCTCGGTTTGTTGAAGCCGTGGA
CGCTCACTTTCTCCTTTGGCCGAGCCCTCCAGCAAAGCACTCTCAAGGCTTGGGGCGGTA
AGAAAGAGAACGTAGCCAAAGCTCAGGCCACGTTCTTGGTCAGGTGCAAGGCTAACTCTG
ACGCTACGCTTGGGAAATACATCCCCGGGGCTTCTGGTGACTCTGCTGCCTCCGAGAGCT
TGTTTGTGGAAGGATACAGTTACTAGGGCGTCTGCGTTTGATACGGTTTGGGTATATCTT
ATAATATATTTGAACGTTTTGTTGGCGTTGTAACTGTTTTAAATGTCTGCTCGATTTGGT
TTTGCCGTTTGACCAAACCGTGTAGTGTCTTAAGCTATATGTCTATTCTCTATTTCTCTC

QA 4 483 4 483
DS 



AS 1 2

CO CL7298Contig1 725 2 2 U
GCGACTTCAGTTGCCTTTACAAGTTTTGTGATTACAGCAGTTCCCACACTTCTGGCCATG
GGTAGAGCTGCGTCTTCCTTTGCTAAGTTAGCCGACACTGCTCGCCAAGAACTCCCTAGT
ACCTTGGCAGCCATTAGGCTCTCCGGCATGGAAATTAGCGATCTCACTCTTGAATTAAGC
GAGTTAAGGTAATCACTAGATGCTCTTTTCTTTTCTTTTTTCATCATCCCAACTTTAAAA
GAGCTAACATGTTTCAACAGTTATCATCTTGTCTAGAATAAGAAAATATGGTTAATATTT
TCATGATTATGGTGGCGGTTTTCAGCCATGAAGTAAGTGATGGGGTAAACAAATCAGCTA
AGGCGGTTCAAGCAGCTGAAGCTGGAATCCGACAGATTGGAACACTTGCACACCAGCAAA
CTCTCTCAATGATTGAGGAGAGAGCAAGTTTACCAGAAATATCACTGCAACCTGTTGTGG
CTGGTGCAGCGAAGAAGACTTCTCACGCAATAGGCAGAGCATCCAAGACAGTCATGAACA
TTATAACCGGAGGAGGTGACAAGGACGAAGAAGACTCCTAAGACGTTTTTAAAAACTTTC
TCACTTTAACTCTTTGCTCCTTTTTTTTTTGCAAGCTATGAGAATATTAAAGAAATCACG
GTTCAGTTGGTTTCACGGTTCAAACTTTCCGTCATGCGTCAGACCACAACAAAGAGATAG
AAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2GU35TF U 1
AF RR2GU35JQB C 142
BS 1 656 RR2GU35TF
BS 657 725 RR2GU35JQB

RD RR2GU35TF 656 0 0
GCGACTTCAGTTGCCTTTACAAGTTTTGTGATTACAGCAGTTCCCACACTTCTGGCCATG
GGTAGAGCTGCGTCTTCCTTTGCTAAGTTAGCCGACACTGCTCGCCAAGAACTCCCTAGT
ACCTTGGCAGCCATTAGGCTCTCCGGCATGGAAATTAGCGATCTCACTCTTGAATTAAGC
GAGTTAAGGTAATCACTAGATGCTCTTTTCTTTTCTTTTTTCATCATCCCAACTTTAAAA
GAGCTAACATGTTTCAACAGTTATCATCTTGTCTAGAATAAGAAAATATGGTTAATATTT
TCATGATTATGGTGGCGGTTTTCAGCCATGAAGTAAGTGATGGGGTAAACAAATCAGCTA
AGGCGGTTCAAGCAGCTGAAGCTGGAATCCGACAGATTGGAACACTTGCACACCAGCAAA
CTCTCTCAATGATTGAGGAGAGAGCAAGTTTACCAGAAATATCACTGCAACCTGTTGTGG
CTGGTGCAGCGAAGAAGACTTCTCACGCAATAGGCAGAGCATCCAAGACAGTCATGAACA
TTATAACCGGAGGAGGTGACAAGGACGAAGAAGACTCCTAAGACGTTTTTAAAAACTTTC
TCACTTTAACTCTTTGCTCCTTTTTTTTTTGCAAGCTATGAGAATATTAAAGAAAT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2GU35JQB 584 0 0
TCCGGCATGGAAATTAGCGATCTCACTCTTGAATTAAGCGAGTTAAGGTAATCACTAGAT
GCTCTTTTCTTTTCTTTTTTCATCATCCCAACTTTAAAAGAGCTAACATGTTTCAACAGT
TATCATCTTGTCTAGAATAAGAAAATATGGTTAATATTTTCATGATTATGGTGGCGGTTT
TCAGCCATGAAGTAAGTGATGGGGTAAACAAATCAGCTAAGGCGGTTCAAGCAGCTGAAG
CTGGAATCCGACAGATTGGAACACTTGCACACCAGCAAACTCTCTCAATGATTGAGGAGA
GAGCAAGTTTACCAGAAATATCACTGCAACCTGTTGTGGCTGGTGCAGCGAAGAAGACTT
CTCACGCAATAGGCAGAGCATCCAAGACAGTCATGAACATTATAACCGGAGGAGGTGACA
AGGACGAAGAAGACTCCTAAGACGTTTTTAAAAACTTTCTCACTTTAACTCTTTGCTCCT
TTTTTTTTTGCAAGCTATGAGAATATTAAAGAAATCACGGTTCAGTTGGTTTCACGGTTC
AAACTTTCCGTCATGCGTCAGACCACAACAAAGAGATAGAAGAC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL7299Contig1 780 2 2 U
GGGGTAAAGAATGAATTAGTTACGAGTTGTGCGACCTGGTTGGTGATAGGAGATTTTTTT
CTTCCCAGCAGATTCTAGAGACTCTACGCCCACCACATCTCTATATTTTTTTTTTGTCGA
CGTCCATCTTCTAAGATCAAGTGATAGATGGTCCTGAAGCATCCCGTAGAAACGTTCTGT
CCGACTGAATCTGATCTATATGGGAAAAAAGAATACCACTAATTTTCGCCTCCCTGGCAA
GTGAATCGGCACGGTTTCCTTTTACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGATAACAAC
CCTTTCCGGCGAAAGAAGCCCGACCCAACAATTCACGACGAAACCTATAACGATGAAGAG
GAAGAAACAGATTCGCCCGTGAAGACGAAGAAATCCAAAAAGGTCAAAGCTTTGGTTTCA
GATTCCGACGCAGAGGCTGCGGAAGAAAGTGGGTTGGAGTCGAAGAGGAAGAAGAGGAAG
AGAGACGAGATTGAGAACGATTACGAGACGAAGAAGTACGGAGGAAGCGTGGAGGAGACG
ACGAAGAAATTTGCAGGGACTAAGCGTAAACAAGAAAGCAGAACTCCTGAAAGCTTCTCT
AAGAAGAAGAAAGCAAAGCGGGTTTAGACGGGGTTTAGCTGGACTATAAAGTGTGGTTGA
TGTGAACCTCTTTCGTCTCCTTTAGCTGTGATACTTGTTTTCTTTGTATCGTTTTATGAC
AATATGATATAAACTCAGTGTAATGTTGCAACAGTTATGGTTATACTTCAGAGTTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2BE18TF U 1
AF RR2BE18JQ C 190
BS 1 777 RR2BE18TF
BS 778 780 RR2BE18JQ

RD RR2BE18TF 777 0 0
GGGGTAAAGAATGAATTAGTTACGAGTTGTGCGACCTGGTTGGTGATAGGAGATTTTTTT
CTTCCCAGCAGATTCTAGAGACTCTACGCCCACCACATCTCTATATTTTTTTTTTGTCGA
CGTCCATCTTCTAAGATCAAGTGATAGATGGTCCTGAAGCATCCCGTAGAAACGTTCTGT
CCGACTGAATCTGATCTATATGGGAAAAAAGAATACCACTAATTTTCGCCTCCCTGGCAA
GTGAATCGGCACGGTTTCCTTTTACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGATAACAAC
CCTTTCCGGCGAAAGAAGCCCGACCCAACAATTCACGACGAAACCTATAACGATGAAGAG
GAAGAAACAGATTCGCCCGTGAAGACGAAGAAATCCAAAAAGGTCAAAGCTTTGGTTTCA
GATTCCGACGCAGAGGCTGCGGAAGAAAGTGGGTTGGAGTCGAAGAGGAAGAAGAGGAAG
AGAGACGAGATTGAGAACGATTACGAGACGAAGAAGTACGGAGGAAGCGTGGAGGAGACG
ACGAAGAAATTTGCAGGGACTAAGCGTAAACAAGAAAGCAGAACTCCTGAAAGCTTCTCT
AAGAAGAAGAAAGCAAAGCGGGTTTAGACGGGGTTTAGCTGGACTATAAAGTGTGGTTGA
TGTGAACCTCTTTCGTCTCCTTTAGCTGTGATACTTGTTTTCTTTGTATCGTTTTATGAC
AATATGATATAAACTCAGTGTAATGTTGCAACAGTTATGGTTATACTTCAGAGTTTT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2BE18JQ 591 0 0
TCTGATCTATATGGGAAAAAAGAATACCACTAATTTTCGCCTCCCTGGCAAGTGAATCGG
CACGGTTTCCTTTTACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGATAACAACCCTTTCCGG
CGAAAGAAGCCCGACCCAACAATTCACGACGAAACCTATAACGATGAAGAGGAAGAAACA
GATTCGCCCGTGAAGACGAAGAAATCCAAAAAGGTCAAAGCTTTGGTTTCAGATTCCGAC
GCAGAGGCTGCGGAAGAAAGTGGGTTGGAGTCGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAGAGACGAG
ATTGAGAACGATTACGAGACGAAGAAGTACGGAGGAAGCGTGGAGGAGACGACGAAGAAA
TTTGCAGGGACTAAGCGTAAACAAGAAAGCAGAACTCCTGAAAGCTTCTTTAAGAAGAAG
AAAGCAAAGCGGGTTTAGACGGGGTTTAGCTGGACTATAAAGTGTGGTTGATGTGAACCT
CTTTCGTCTCCTTTAGCTGTGATACTTGTTTTCTTTGTATCGTTTTATGACAATATGATA
TAAACTCAGTGTAATGTTGCAACAGTTATGGTTATACTTCAGAGTTTTTAT

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL7300Contig1 1041 2 8 U
CCGCCCTTTCTCCTCTCTCCTCTTTGCGATATTTCTCTCTTCCACATCCGTGGCTTGTAC
CGCAGTGACAGGAAGAGAGGATTCCAGAATAATGGCCCACGACACTCATACCGATGACTT
AGACGAGCTTCTCGACAGCGCCTTGGATGATTTCAAGGATCTCAATCTCACTCAAAAAAG
TGAAGAGGAGAAGAAAGAAGATGGTGGAAAAGAAGAGATGGAGTCGTCATCATTGCCTAG
TGGGGTTCAAGGCCTTGGAATGGGTTTACCAGACATGAGGACCAAGAAGAAAGGAAAGAA
CAAGGTTGCCAAAGAGGACCACGTTACCGAGGCTCTTGATAAACTCAGGGAACAAACCAG
AGAAACCGTCAAAGGCCTCGAGTCCTTGTCTTCCAAGAATCTGCAGCCGCAGGGTTCTTC
TGATGATGCTATGGTTGAAGATTGGATCAAACAATTCGAGGATCTTACTGGATCTCAGGA
TTTGGAGTCGATTGTGGACACGATGATGCAACAGCTGTTATCAAAGGATATTCTCCACGA
ACCAATGAAAGAGATCGGAGCAAGATACCCGAAATGGCTGGAAGAGCATGAAAGCGGTCT
AAGCAAAGAAGATTTCGAACGGTATTCACGCCAGTATGAACTGATCAAAGAGCTCAACTC
GGTGTACGAGGAGGAACCAAACAATTCGACCAAGATTATGGAGATTATGCAGAAGATGCA
AGAGTGTGGACAGCCACCGAGTGATATTGTGCAAGAGATGGATCCTGGCTTTGATTTCGC
TAGTCTAGGGCAAATGTCTCCAGATATGCTCGAGTCTCCACCAAATTGTTGTGTAATGTA
AGAGTCGAAACATGTTTAGTGGCCTGGTCAAGCCATTATTGGAGACCATGTTTTTTCTTC
TTGTTTCTCTTGTGCAACGCAAAGCTTGTGTTTAGGTTTTGTTTTATCTTTGATTACTTA
GTTATTTTATATTGAGATTCAGGTTCTTTTGGATTGTTTGATTTGAGAATAATGTTTACT
ATATTGAAAAGTGAATTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C220TF U 1
AF RR2C220JQ C 299
BS 1 705 RR2C220TF
BS 706 706 RR2C220JQ
BS 707 713 RR2C220TF
BS 714 714 RR2C220JQ
BS 715 720 RR2C220TF
BS 721 721 RR2C220JQ
BS 722 747 RR2C220TF
BS 748 1041 RR2C220JQ

RD RR2C220TF 749 0 0
CCGCCCTTTCTCCTCTCTCCTCTTTGCGATATTTCTCTCTTCCACATCCGTGGCTTGTAC
CGCAGTGACAGGAAGAGAGGATTCCAGAATAATGGCCCACGACACTCATACCGATGACTT
AGACGAGCTTCTCGACAGCGCCTTGGATGATTTCAAGGATCTCAATCTCACTCAAAAAAG
TGAAGAGGAGAAGAAAGAAGATGGTGGAAAAGAAGAGATGGAGTCGTCATCATTGCCTAG
TGGGGTTCAAGGCCTTGGAATGGGTTTACCAGACATGAGGACCAAGAAGAAAGGAAAGAA
CAAGGTTGCCAAAGAGGACCACGTTACCGAGGCTCTTGATAAACTCAGGGAACAAACCAG
AGAAACCGTCAAAGGCCTCGAGTCCTTGTCTTCCAAGAATCTGCAGCCGCAGGGTTCTTC
TGATGATGCTATGGTTGAAGATTGGATCAAACAATTCGAGGATCTTACTGGATCTCAGGA
TTTGGAGTCGATTGTGGACACGATGATGCAACAGCTGTTATCAAAGGATATTCTCCACGA
ACCAATGAAAGAGATCGGAGCAAGATACCCGAAATGGCTGGAAGAGCATGAAAGCGGTCT
AAGCAAAGAAGATTTCGAACGGTATTCACGCCAGTATGAACTGATCAAAGAGCTCAACTC
GGTGTACGAGGAGGAACCAAACAATTCGACCAAGATTATGGAGAT*ATGCAGA*GATGCA
*GAGTGTGGACAGCCACCGAGTGATAT
GT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2C220JQ 743 0 0
AACAAGGTTGCCAAAGAGGACCACGTTACCGAGGCTCTTGATAAACTCAGGGAACAAACC
AGAGAAACCGTCAAAGGCCTCGAGTCCTTGTCTTCCAAGAATCTGCAGCCGCAGGGTTCT
TCTGATGATGCTATGGTTGAAGATTGGATCAAACAATTCGAGGATCTTACTGGATCTCAG
GATTTGGAGTCGATTGTGGACACGATGATGCAACAGCTGTTATCAAAGGATATTTTCCAC
GAACCAATGAAAGAGATCGGAGCAAGATACCCGAAATGGCTGGAAGAGCATGAAAGCGGT
TTAAGCAAAGAAGATTTCGAACGGTATTCACGCCAGTATGAACTGATCAAAGAGCTCAAC
TCGGTGTACGAGGAGGAACCAAACAATTCGACCAAGATTATGGAGATTATGCAGAAGATG
CAAGAGTGTGGACAGCCACCGAGTGATATTGTGCAAGAGATGGATCCTGGCTTTGATTTC
GCTAGTCTAGGGCAAATGTCTCCAGATATGCTCGAGTCTCCACCAAATTGTTGTGTAATG
TAAGAGTCGAAACATGTTTAGTGGCCTGGTCAAGCCATTATTGGAGACCATGTTTTTTCT
TCTTGTTTCTCTTGTGCAACGCAAAGCTTGTGTTTAGGTTTTGTTTTATCTTTGATTACT
TAGTTATTTTATATTGAGATTCAGGTTCTTTTGGATTGTTTGATTTGAGAATAATGTTTA
CTATATTGAAAAGTGAATTCATC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL7301Contig1 976 2 10 U
AGAATACGAAACAAGAAGAAGAAGAAGAAGATTAGGGCTTTCACTGGATTTGAGGAGTCG
TTACGTTACATCTCGTGTCTTCATCTTCTTCTTCGCTTTTTGGTTTCTCTCTTTCGCTGT
CCGAAAAGCTTCTTAGTTACTACTAAGAGTGAGGCATGTCTTCTGATACTACTGCCAAGG
ATTCATCTTTGACTGATTGGAAACAAGATATAGGACACTCTGATGATCCAGATTACAGAA
GCAAAGAAGATCGTAAGCCCTCCTCCAATGTTGAACGAGGTCAGTTTCTTGAAAGTTGGA
ACGAGAGCAAGAAGAGTAAACCAGGGTACCAAACGAGATACTTCATCATCAAAAGTCTAA
ACTACGACAATATTCAACTTTCCCTCGAGAGAGGGATCTGGGCTACTCAAGTCATGAATG
AGCCTATACTGGAAGGTGCTTTTCATAATTCTGGTCGAGTGGTTTTGATTTTTAGCGTGA
ACATGAGCGGATCATGGTGTAACCTCGAGATATCTCCCGGAGCAAGAAAAGTATTTGCGA
TTCAACTCATGGGGTTTGCCTTTGGAGAGCCCTCTAGCGAGTACCCTAACCGATGATGAT
TTTCTTAACATGGTGATTCCACAATCAAGAGTCACACAAGAGCCATCAAATAAAACAGAT
GATGGAAGCAATGGTTCTTCCAAAAACCGGTCATCATCAAGAAAGAGAGGACGGGATTCA
TCCTAGTGTTCAAGCTCGAACCTCTACCGTGAAGTTTGCATCAAAAACGCATAACAATTG
GTCAGTGCCATTTCGATAGCATGGTGATGGAGAAGCTGTTGTCATGCTGTATTCATGTTC
ATTTAGTCTGGTGGTTTTTAAAAACCAGAAGACTGTAGTAGCTAAACAGTTTCTTCTTCT
TCTTATTTTTTTGCCAAAACTTGTACAGTTTTAAATATGGCAAACGCTTAAGCTTTTGGA
AATCTAAACCCTGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ50TF U 1
AF RR2DQ50JQ C 189
BS 1 666 RR2DQ50TF
BS 667 667 RR2DQ50JQ
BS 668 670 RR2DQ50TF
BS 671 671 RR2DQ50JQ
BS 672 685 RR2DQ50TF
BS 686 686 RR2DQ50JQ
BS 687 699 RR2DQ50TF
BS 700 700 RR2DQ50JQ
BS 701 714 RR2DQ50TF
BS 715 976 RR2DQ50JQ

RD RR2DQ50TF 728 0 0
AGAATACGAAACAAGAAGAAGAAGAAGAAGATTAGGGCTTTCACTGGATTTGAGGAGTCG
TTACGTTACATCTCGTGTCTTCATCTTCTTCTTCGCTTTTTGGTTTCTCTCTTTCGCTGT
CCGAAAAGCTTCTTAGTTACTACTAAGAGTGAGGCATGTCTTCTGATACTACTGCCAAGG
ATTCATCTTTGACTGATTGGAAACAAGATATAGGACACTCTGATGATCCAGATTACAGAA
GCAAAGAAGATCGTAAGCCCTCCTCCAATGTTGAACGAGGTCAGTTTCTTGAAAGTTGGA
ACGAGAGCAAGAAGAGTAAACCAGGGTACCAAACGAGATACTTCATCATCAAAAGTCTAA
ACTACGACAATATTCAACTTTCCCTCGAGAGAGGGATCTGGGCTACTCAAGTCATGAATG
AGCCTATACTGGAAGGTGCTTTTCATAATTCTGGTCGAGTGGTTTTGATTTTTAGCGTGA
ACATGAGCGGATCATGGTGTAACCTCGAGATATCTCCCGGAGCAAGAAAAGTATTTGCGA
TTCAACTCATGGGGTTTGCCTTTGGAGAGCCCTCTAGCGAGTACCCTAACCGATGATGAT
TTTCTTAACATGGTGATTCCACAATCAAGAGTCACACAAGAGCCATCAAATAAAACAGAT
GATGGA*GCA*TGGTTCTTCCAAAA*CCGGTCATCATCA*GAAAGAGAGGACGG
ATCATCCTAGTGTT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2DQ50JQ 788 0 0
TTGACTGATTGGAAACAAGATATAGGACACTCTGATGATCCAGATTACAGAAGCAAAGAA
GATCGTAAGCCCTCCTCCAATGTTGAACGAGGTCAGTTTCTTGAAAGTTGGAACGAGAGC
AAGAAGAGTAAACCAGGGTACCAAACGAGATACTTCATCATCAAAAGTCTAAACTACGAC
AATATTCAACTTTCCCTCGAGAGAGGGATCTGGGCTACTCAAGTCATGAATGAGCCTATA
CTGGAAGGTGCTTTTCATAATTCTGGTCGAGTGGTTTTGATTTTTAGCGTGAACATGAGC
GGATCATGGTGTAACCTCGAGATATCTCCCGGAGCAAGAAAAGTATTTGCGATTCAACTC
ATGGGGTTTGCCTTTGGAGAGCCCTCTAGCGAGTACCCTAACCGATGATGATTTTCTTAA
CATGGTGATTCCACAATCAAGAGTCACACAAGAGCCATCAAATAAAACAGATGATGGAAG
CAATGGTTCTTCCAAAAACCGGTCATCATCAAGAAAGAGAGGACGGGATTCATCCTAGTG
TTCAAGCTCGAACCTCTACCGTGAAGTTTGCATCAAAAACGCATAACAATTGGTCAGTGC
CATTTCGATAGCATGGTGATGGAGAAGCTGTTGTCATGCTGTATTCATGTTCATTTAGTC
TGGTGGTTTTTAAAAACCAGAAGACTGTAGTAGCTAAACAGTTTCTTCTTCTTCTTATTT
TTTTGCCAAAACTTGTACAGTTTTAAATATGGCAAACGCTTAAGCTTTTGGAAATCTAAA
CCCTGAAT

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL7302Contig1 939 2 12 U
GATACGCAAAATGGAGACGGTGGAAGAAACTATGGGAGAGGAGGTGGGTTTGCACGTGGT
GGCCAAGGAATGGGAAACCGTGGAGGTCATTGGGGTGGTGCAGCGAGAGGAAGAGGGATA
AACAACATGGCTAACGGTGCTGGTGCTGGACCTTATGGCCCTGGACTTGCTGGTCCAGCG
TTTGGTGGTATGATGCATCCTCAGGGTATGATGGGAGCTGGTGGGTTTGATCCTACATTC
ATGGGTCGTGGTGCTGGTTATGGAGGGTTTCCAGGTCTTGCTTACCCCGGGATGCCTCAA
CCTTATCCCGGTGTGAATCCAATGGGAATGGTCGGGATTGCTCCTCACGTTAACCTCGCC
TTTTTCGGTGGCGCGGGAATGGGAACGATGGGGAACTCAGGGATGAACGGAGTTCACGCA
GCAGGGATGTGGAACGAGGCTAGTGGAGGAGGAGGCGGTGGTGAAGAGGGTGGTTCTGAA
TACGGTGGCTATGAAGATGAAAACCAAGAGAAAGAAGAGAAGCAGCCATCACGAGAGAAA
GAACGAGCTACCACAGAACGTGACTGGTCTGAGAGCAGTGGTGGTGATAGAAGACACAAG
AGTCACCGCGAAGAGAAAGATAGTCACCGCGAGTATAGGCACCGTGTTTCTGAAGAGTAC
GATAGAGGACAATCTTCTTCCAAGTCTCGAAGCAGGTCAAGAATGTCGGAAGATGATCAT
AGGTCCAGGTCAAGAGATGCTGACTACGGAAAGAGAAGGCGTGGAGACTGAATCAGAACA
TCTCATGTTCTTCGATGCATCTAAACAATACCGGTTTAAAGTTACTCTGCATACTACTTA
TCATCCAATATTTGATACAATGTTTCTCTATACCTTGTTTGCTGATGATTGTCTTTGGAG
ACGAGCATATATATATATGTGTAAACTGTGTTTTTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AK52TF U 1
AF RR2AK52JQ C 83
BS 1 695 RR2AK52TF
BS 696 696 RR2AK52JQ
BS 697 710 RR2AK52TF
BS 711 711 RR2AK52JQ
BS 712 748 RR2AK52TF
BS 749 749 RR2AK52JQ
BS 750 758 RR2AK52TF
BS 759 759 RR2AK52JQ
BS 760 777 RR2AK52TF
BS 778 778 RR2AK52JQ
BS 779 809 RR2AK52TF
BS 810 939 RR2AK52JQ

RD RR2AK52TF 809 0 0
GATACGCAAAATGGAGACGGTGGAAGAAACTATGGGAGAGGAGGTGGGTTTGCACGTGGT
GGCCAAGGAATGGGAAACCGTGGAGGTCATTGGGGTGGTGCAGCGAGAGGAAGAGGGATA
AACAACATGGCTAACGGTGCTGGTGCTGGACCTTATGGCCCTGGACTTGCTGGTCCAGCG
TTTGGTGGTATGATGCATCCTCAGGGTATGATGGGAGCTGGTGGGTTTGATCCTACATTC
ATGGGTCGTGGTGCTGGTTATGGAGGGTTTCCAGGTCTTGCTTACCCCGGGATGCCTCAA
CCTTATCCCGGTGTGAATCCAATGGGAATGGTCGGGATTGCTCCTCACGTTAACCTCGCC
TTTTTCGGTGGCGCGGGAATGGGAACGATGGGGAACTCAGGGATGAACGGAGTTCACGCA
GCAGGGATGTGGAACGAGGCTAGTGGAGGAGGAGGCGGTGGTGAAGAGGGTGGTTCTGAA
TACGGTGGCTATGAAGATGAAAACCAAGAGAAAGAAGAGAAGCAGCCATCACGAGAGAAA
GAACGAGCTACCACAGAACGTGACTGGTCTGAGAGCAGTGGTGGTGATAGAAGACACAAG
AGTCACCGCGAAGAGAAAGATAGTCACCGCGAGTATAGGCACCGTGTTTCTGAAGAGTAC
GATAGAGGACAATCTTCTTCCAAGTCTCGAAGCAG*TCAAGAATGTCGGA*GATGATCAT
AGGTCCAGGTCAAGAGATGCTGACTACG*AAAGAGAAG*CGTGGAGACTGAATCAGA*CA
TCTCATGTTCTTCGATGCATCTAAACAAT

QA 1 809 1 809
DS 

RD RR2AK52JQ 857 0 0
GAGGTCATTGGGGTGGTGCAGCGAGAGGAAGAGGGATAAACAACATGGCTAACGGTGCTG
GTGCTGGACCTTATGGCCCTGGACTTGCTGGTCCAGCGTTTGGTGGTATGATGCATCCTC
AGGGTATGATGGGAGCTGGTGGGTTTGATCCTACATTCATGGGTCGTGGTGCTGGTTATG
GAGGGTTTCCAGGTCTTGCTTACCCCGGGATGCCTCAACCTTATCCCGGTGTGAATCCAA
TGGGAATGGTCGGGATTGCTCCTCACGTTAACCTCGCCTTTTTCGGTGGCGCGGGAATGG
GAACGATGGGGAACTCAGGGATGAACGGAGTTCACGCAGCAGGGATGTGGAACGAGGCTA
GTGGAGGAGGAGGCGGTGGTGAAGAGGGTGGTTCTGAATACGGTGGCTATGAAGATGAAA
ACCAAGAGAAAGAAGAGAAGCAGCCATCACGAGAGAAAGAACGAGCTACCACAGAACGTG
ACTGGTTTGAGAGCAGTGGTGGTGATAGAAGACACAAGAGTCACCGCGAAGAGAAAGATA
GTCACCGCGAGTATAGGCACCGTGTTTTTGAAGAGTACGATAGAGGACAATCTTCTTCCA
AGTCTCGAAGCAGGTCAAGAATGTCGGAAGATGATCATAGGTCCAGGTCAAGAGATGCTG
ACTACGGAAAGAGAAGGCGTGGAGACTGAATCAGAACATCTCATGTTTTTCGATGCATCT
AAACAATACCGGTTTAAAGTTACTCTGCATACTACTTATCATCCAATATTTGATACAATG
TTTCTCTATACCTTGTTTGCTGATGATTGTCTTTGGAGACGAGCATATATATATATGTGT
AAACTGTGTTTTTGTTG

QA 1 857 1 857
DS 



AS 1 2

CO CL7303Contig1 1055 2 8 U
GGAAAGACGGCAAATCCGTCCGGTTAACGCTCGATGAATGGACCGGTTCTGGGTTCGTCT
CAAATGATCTTTATTTACATGGATTATTCAGTGCTTCAATCAAACTACCTTCTGATTATT
CAGCAGGAGTAGTTGTTGCTTTTTATATGTCAAATGGAGATACGTATGAGAAAAATCATG
ATGAGATTGATTTTGAGTTTCTTGGTAACATTAGAGGAAGAGAATGGAGGATTCAGACAA
ATATTTATGGTAATGGAAGCACTCATTTGGGAAGAGAAGAAAAGATGTAATCTTTGGTTT
GATCCTACTGAAGATTATCATCAATACAGTATCCTCTGGTCTGATTCTCACATCATATTC
TACGTAGACAACGTTCCTATCAGAGAGGTGAAGCGAACATCATCAATGGGCGGTGACTTC
CCTTCGAAGCCCATGTCTCTATACACAACAATATGTACGGTTCTAAATGGGCAACTAACG
GTGGAAAATACGGTGTAAACTACAAATATGCGCCTTACATCGCACGGTTCTCTGACCTAG
TCCTGCATGGCTGCCCTGTGGACCCAATCGAGCAGTTTCCGAAGTGCGACGAAGGAGCCA
CCGAGTATATCCGTGCGGCGCAGGAGATTAGCCCGTCACAGAGGGCTAAAATGGAGGTTT
TCAGGCGTAAACACATGACTTATTCGTATTGCTATGATCGGACCAGGTACAAGGTTTCTT
TGCCGGAGTGCGTTTTGAATCCAGCAGAGGCTCAGCGGCTTAGGGTTTATGATCCAGTCA
CGTTTGGTGGTATTCCGAGGCGCCGCCGCAGCGGAAAGCACAGGAGCAAGAGAAGCCGTA
TGGATGGAATAGAGTCGATATGATTGATTGTACATTGTCATTAAATTATGGTGTTGGTTT
GGATGGGGGAGGGGTTTCTAAAATAAGTCTTTTTATTGGTATACTTTTGTTACAATGCAT
TTTTTGTTATTCACAGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGGGGGGAGTTTTGTTCA
TTTGTTGCTTGTATATGAAATAAAGTGATTTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A956TF U 1
AF RR2A956JQ C 232
BS 1 282 RR2A956TF
BS 283 283 RR2A956JQ
BS 284 664 RR2A956TF
BS 665 665 RR2A956JQ
BS 666 713 RR2A956TF
BS 714 714 RR2A956JQ
BS 715 760 RR2A956TF
BS 761 1055 RR2A956JQ

RD RR2A956TF 760 0 0
GGAAAGACGGCAAATCCGTCCGGTTAACGCTCGATGAATGGACCGGTTCTGGGTTCGTCT
CAAATGATCTTTATTTACATGGATTATTCAGTGCTTCAATCAAACTACCTTCTGATTATT
CAGCAGGAGTAGTTGTTGCTTTTTATATGTCAAATGGAGATACGTATGAGAAAAATCATG
ATGAGATTGATTTTGAGTTTCTTGGTAACATTAGAGGAAGAGAATGGAGGATTCAGACAA
ATATTTATGGTAATGGAAGCACTCATTTGGGAAGAGAAGAAA*GATGTAATCTTTGGTTT
GATCCTACTGAAGATTATCATCAATACAGTATCCTCTGGTCTGATTCTCACATCATATTC
TACGTAGACAACGTTCCTATCAGAGAGGTGAAGCGAACATCATCAATGGGCGGTGACTTC
CCTTCGAAGCCCATGTCTCTATACACAACAATATGTACGGTTCTAAATGGGCAACTAACG
GTGGAAAATACGGTGTAAACTACAAATATGCGCCTTACATCGCACGGTTCTCTGACCTAG
TCCTGCATGGCTGCCCTGTGGACCCAATCGAGCAGTTTCCGAAGTGCGACGAAGGAGCCA
CCGAGTATATCCGTGCGGCGCAGGAGATTAGCCCGTCACAGAGGGCTAAAATGGAGGTTT
TCAG*CGTAAACACATGACTTATTCGTATTGCTATGATCGGACCAGGTACAAG*TTTCTT
TGCCGGAGTGCGTTTTGAATCCAGCAGAGGCTCAGCGGCT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2A956JQ 824 0 0
TTCAGACAAATATTTATGGTAATGGAAGCACTCATTTGGGAAGAGAAGAAAAGATGTAAT
CTTTGGTTTGATCCTACTGAAGATTATCATCAATACAGTATCCTCTGGTCTGATTCTCAC
ATCATATTCTACGTAGACAACGTTCCTATCAGAGAGGTGAAGCGAACATCATCAATGGGC
GGTGACTTCCCTTCGAAGCCCATGTCTCTATACACAACAATATGTACGGTTCTAAATGGG
CAACTAACGGTGGAAAATACGGTGTAAACTACAAATATGCGCCTTACATCGCACGGTTCT
CTGACCTAGTCCTGCATGGCTGCCCTGTGGACCCAATCGAGCAGTTTCCGAAGTGCGACG
AAGGAGCCACCGAGTATATCCGTGCGGCGCAGGAGATTAGCCCGTCACAGAGGGCTAAAA
TGGAGGTTTTCAGGCGTAAACACATGACTTATTCGTATTGCTATGATCGGACCAGGTACA
AGGTTTCTTTGCCGGAGTGCGTTTTGAATCCAGCAGAGGCTCAGCGGCTTAGGGTTTATG
ATCCAGTCACGTTTGGTGGTATTCCGAGGCGCCGCCGCAGCGGAAAGCACAGGAGCAAGA
GAAGCCGTATGGATGGAATAGAGTCGATATGATTGATTGTACATTGTCATTAAATTATGG
TGTTGGTTTGGATGGGGGAGGGGTTTCTAAAATAAGTCTTTTTATTGGTATACTTTTGTT
ACAATGCATTTTTTGTTATTCACAGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGGGGGGAG
TTTTGTTCATTTGTTGCTTGTATATGAAATAAAGTGATTTATTT

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

CO CL7304Contig1 793 2 2 U
GGCTCCTCCTCTTACGTAACCCTAGCGAATCTCTGCTAGATCTATCTTGATTCCATTTTC
AAATCGCCCTTGGAATCGGACGCGCAAGGTGTGTGGGATTGATTCTTACTAGTCACAGAG
AGATAGAGAGTAATGGATTTGGATCAATGGATTTCGAAGGTTAAAGACGGTCAGCATCTC
TCCGAGGACGAGCTTCAGCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATTCTGATTGAGGAGTCG
AACGTTCAGCCTGTCAACAGTCCGGTCACCGTCTGTGGTGACATCCATGGCCAGTTTCAT
GATCTCATGAAGCTTTTTCAGACCGGCGGTCATGTTCCCGACACTAACTACATTTTTATG
GGGGACTTTGTGGATAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTCTTCGCTATTCTTTTGCTTCTT
AAAGCTAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAAATCATGAAAGTAGGCAGCTA
ACGCAGGTATATGGTTTCTATGACGAATGCCAGAGGAAGTATGGTAACGCCAATGCGTGG
CGATATTGCACAGATGTTTTTGACTATCTTACCCTATCAGCTATATTATATTTGTGCCTC
TTTACATTGCTGTGATGATGATGATGAAGCCATTGCTGCTACCAATGGCAATATGTTCAG
TCTCACAAGGTGTTATTATGTAGATATATAATATTATCTACTAATGGGTTTCATTTACTT
CCATTATCTATGTCCTTTTACGTAAAACATTTTTTGCCTTGTGAAATTCAAAAAAGGTGA
ACACTTGGGTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E028TF U 1
AF RR2E028JQ C 139
BS 1 664 RR2E028TF
BS 665 793 RR2E028JQ

RD RR2E028TF 664 0 0
GGCTCCTCCTCTTACGTAACCCTAGCGAATCTCTGCTAGATCTATCTTGATTCCATTTTC
AAATCGCCCTTGGAATCGGACGCGCAAGGTGTGTGGGATTGATTCTTACTAGTCACAGAG
AGATAGAGAGTAATGGATTTGGATCAATGGATTTCGAAGGTTAAAGACGGTCAGCATCTC
TCCGAGGACGAGCTTCAGCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATTCTGATTGAGGAGTCG
AACGTTCAGCCTGTCAACAGTCCGGTCACCGTCTGTGGTGACATCCATGGCCAGTTTCAT
GATCTCATGAAGCTTTTTCAGACCGGCGGTCATGTTCCCGACACTAACTACATTTTTATG
GGGGACTTTGTGGATAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTCTTCGCTATTCTTTTGCTTCTT
AAAGCTAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAAATCATGAAAGTAGGCAGCTA
ACGCAGGTATATGGTTTCTATGACGAATGCCAGAGGAAGTATGGTAACGCCAATGCGTGG
CGATATTGCACAGATGTTTTTGACTATCTTACCCTATCAGCTATATTATATTTGTGCCTC
TTTACATTGCTGTGATGATGATGATGAAGCCATTGCTGCTACCAATGGCAATATGTTCAG
TCTC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2E028JQ 655 0 0
TTGGATCAATGGATTTCGAAGGTTAAAGACGGTCAGCATCTCTCCGAGGACGAGCTTCAG
CTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATTCTGATTGAGGAGTCGAACGTTCAGCCTGTCAAC
AGTCCGGTCACCGTCTGTGGTGACATCCATGGCCAGTTTCATGATCTCATGAAGCTTTTT
CAGACCGGCGGTCATGTTCCCGACACTAACTACATTTTTATGGGGGACTTTGTGGATAGA
GGTTACAACAGCCTTGAAGTCTTCGCTATTCTTTTGCTTCTTAAAGCTAGACATCCAGCC
AATATTACACTTCTGCGTGGAAATCATGAAAGTAGGCAGCTAACGCAGGTATATGGTTTC
TATGACGAATGCCAGAGGAAGTATGGTAACGCCAATGCGTGGCGATATTGCACAGATGTT
TTTGACTATCTTACCCTATCAGCTATATTATATTTGTGCCTCTTTACATTGCTGTGATGA
TGATGATGAAGCCATTGCTGCTACCAATGGCAATATGTTCAGTCTCACAAGGTGTTATTA
TGTAGATATATAATATTATCTACTAATGGGTTTCATTTACTTCCATTATCTATGTCCTTT
TACGTAAAACATTTTTTGCCTTGTGAAATTCAAAAAAGGTGAACACTTGGGTAAT

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL7305Contig1 804 2 14 U
GGGTTGCAAACATTCAAGTCTCTTCACGCAGAGTTAAGTCTTCTTCAAGTTCCCAGGGAT
CCAAGCTTGAAACAAAATGGCGCAAGTCTTGGCAGCTTCTCCAACATGTCAAATGAAATT
GACTAAACCGAGCCCCATTGCATCTTCAAAGTTATGGAGCTCGGTTGTCTTGAAACAGAA
GAAACAGAGCAGTAGCAAACTAAGAAGCTTTAAAGTGATGGCTGTTCAATCTGATAACAG
TACAATCAATAGAGTTGAGAGTCTTCTCAATTTAGACACCAAACCTTTCACTGACCGGAT
CATCGCTGAGTACATTTGGATTGGAGGATCAGGAATTGACCTTAGGAGCAAGTCAAGGAC
TCTTGAAAAGCCTGTGGAAGATCCTTCTGAGCTTCCCAAGTGGAACTATGATGGTTCCAG
TACCGGGCAAGCACCTGGTGAAGATAGTGAAGTGATTCTATATCCGCAAGCTATCCTCAG
AGATCCTTTCCGTGGAGGCAATAACATATTGGTTATCTGTGATACTTACACCCCAGCTGG
TGAGCCAATTCCAACAAACAAACGTGCAAGAGCTGCTGAGATTTTCAGCAACAAGAAAGT
CAATGAAGAGATTCCATGGTTTGGCACCGAACAAGAGTACACTTTACTTCAGCCAAATGT
GAACTGGCCATTGGGTTGGCCCGTTGGAGCGTATCCTGGTCCTCAGGACCTTACTACTGT
GGAGTCGAGCTGAAAGTCATGGGGACGTGACATTTCAGATGCTCATACAAGCTGTTATAT
GCTGGATTACATCAGTGGTACTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ65TF U 1
AF RR2GI14TF U 24
BS 1 475 RR2GQ65TF
BS 476 476 RR2GI14TF
BS 477 597 RR2GQ65TF
BS 598 598 RR2GI14TF
BS 599 626 RR2GQ65TF
BS 627 627 RR2GI14TF
BS 628 662 RR2GQ65TF
BS 663 663 RR2GI14TF
BS 664 681 RR2GQ65TF
BS 682 682 RR2GI14TF
BS 683 709 RR2GQ65TF
BS 710 710 RR2GI14TF
BS 711 749 RR2GQ65TF
BS 750 804 RR2GI14TF

RD RR2GQ65TF 749 0 0
GGGTTGCAAACATTCAAGTCTCTTCACGCAGAGTTAAGTCTTCTTCAAGTTCCCAGGGAT
CCAAGCTTGAAACAAAATGGCGCAAGTCTTGGCAGCTTCTCCAACATGTCAAATGAAATT
GACTAAACCGAGCCCCATTGCATCTTCAAAGTTATGGAGCTCGGTTGTCTTGAAACAGAA
GAAACAGAGCAGTAGCAAACTAAGAAGCTTTAAAGTGATGGCTGTTCAATCTGATAACAG
TACAATCAATAGAGTTGAGAGTCTTCTCAATTTAGACACCAAACCTTTCACTGACCGGAT
CATCGCTGAGTACATTTGGATTGGAGGATCAGGAATTGACCTTAGGAGCAAGTCAAGGAC
TCTTGAAAAGCCTGTGGAAGATCCTTCTGAGCTTCCCAAGTGGAACTATGATGGTTCCAG
TACCGGGCAAGCACCTGGTGAAGATAGTGAAGTGATTCTATATCCGCAAGCTATCTTCAG
AGATCCTTTCCGTGGAGGCAATAACATATTGGTTATCTGTGATACTTACACCCCAGCTGG
TGAGCCAATTCCAACAAACAAACGTGCAAGAGCTGCTGAGATTTTCAGCAACAAGAAGGT
CAATGAAGAGATTCCATGGTTTGGCATCGAACAAGAGTACACTTTACTTCAGCCAAATGT
GA*CTGGCCATTGGGTTGGCC*GTTGGAGCGTATCCTGGTCCTCAGGAC*TTACTACTGT
GGAGTCGAGCTGAAAGTCATGGGGACGTG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2GI14TF 781 0 0
GG
ACGCAGAGTTAAGTCT*CTTCAAGTTCCCAGGGATCCAAGCTTGAAACAAAATGGCGCAA
GTCTTGGCAGCTTCTCCAACATGTCAAATGAAATTGACTAAACCGAGCCCCATTGCATCT
TCAAAGTTATGGAGCTCGGTTGTCTTGAAACAGAAGAAACAGAGCAGTAGCAAACTAAGA
AGCTTTAAAGTGATGGCTGTTCAATCTGATAACAGTACAATCAATAGAGTTGAGAGTCTT
CTCAATTTAGACACCAAACCTTTCACTGACCGGATCATCGCTGAGTACATTTGGATTGGA
GGATCAGGAATTGACCTTAGGAGCAAGTCAAGGACTCTTGAAAAGCCTGTGGAAGATCCT
TCTGAGCTTCCCAAGTGGAACTATGATGGTTCCAGTACCGGGCAAGCACCTGGTGAAGAT
AGTGAAGTGATTCTATATCCGCAAGCTATCCTCAGAGATCCTTTCCGTGGAGGCAATAAC
ATATTGGTTATCTGTGATACTTACACCCCAGCTGGTGAGCCAATTCCAACAAACAAACGT
GCAAGAGCTGCTGAGATTTTCAGCAACAAGAAAGTCAATGAAGAGATTCCATGGTTTGGC
ACCGAACAAGAGTACACTTTACTTCAGCCAAATGTGAACTGGCCATTGGGTTGGCCCGTT
GGAGCGTATTCTGGTCCTCAGGACCTTACTACTGTGGAGTCGAGCTGAAAGTCATGGGGA
CGTGACATTTCAGATGCTCATACAAGCTGTTATATGCTGGATTACATCAGTGGTACTAT

QA 3 781 3 781
DS 



AS 1 2

CO CL7306Contig1 724 2 4 U
GATGGGATTGATATGAAATGCAAAGTTGTGGACTTTGGGAACGCGTGTTGGGCTGAAAAC
AAGTTTGCGGAAGAAATACAGACAAGACAGTACAGAGCTCCTGAAGTAATACTTCAGTCA
GGCTACTCTTTCTCTGTTGATATGTGGTCTTTCGCTTGCACCGCTTTCGAGCTTGCCACA
GGAGACATGCTTTTTGCTCCAAAGGATGGAAATGGTTATGGAGAAGACGAGGACCACCTT
GCTCTTATGATGGAACTCTTAGGAAAAATACCTCGGAAGATTGCCATTGGAGGTGCGAAA
TCAAAGGATTACTTTGACAGACATGGTGACCTAAAGAGGATCCGGAGGTTGAAATATTGG
CCACTGGACCGTTTACTGACAGATAAGTACAAGCTTCAAGAAGCAGAAGCACAAGAATTT
GCAGATTTTCTTTGTCCGATTCTTTCTTTTGAGCCAGAGAAACGACCAAGTGCTCAACAA
TGCCTGCAGCATCCTTGGCTGAATCTCAGGGCACAGAACAATGAAGATCATATTGAAGGT
CAGATGAGTAACTTGCAGATCAAAGGTTGAAGAACTTTCACTTTTCAATTATGACCTTTT
TGGCTTACAAATGATATAGAACTTCTCTTCTTTTTTCTCCTTTTCATTATTTGGTTCGTT
TCTGTTTGAATAATTTTGATTCTTTATTTGTTTGTTCCTCTTTTTTTTTTACTAAATTTT
GGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2GN07TF U 1
AF RR2GN07JQ C 133
BS 1 635 RR2GN07TF
BS 636 636 RR2GN07JQ
BS 637 670 RR2GN07TF
BS 671 724 RR2GN07JQ

RD RR2GN07TF 670 0 0
GATGGGATTGATATGAAATGCAAAGTTGTGGACTTTGGGAACGCGTGTTGGGCTGAAAAC
AAGTTTGCGGAAGAAATACAGACAAGACAGTACAGAGCTCCTGAAGTAATACTTCAGTCA
GGCTACTCTTTCTCTGTTGATATGTGGTCTTTCGCTTGCACCGCTTTCGAGCTTGCCACA
GGAGACATGCTTTTTGCTCCAAAGGATGGAAATGGTTATGGAGAAGACGAGGACCACCTT
GCTCTTATGATGGAACTCTTAGGAAAAATACCTCGGAAGATTGCCATTGGAGGTGCGAAA
TCAAAGGATTACTTTGACAGACATGGTGACCTAAAGAGGATCCGGAGGTTGAAATATTGG
CCACTGGACCGTTTACTGACAGATAAGTACAAGCTTCAAGAAGCAGAAGCACAAGAATTT
GCAGATTTTCTTTGTCCGATTCTTTCTTTTGAGCCAGAGAAACGACCAAGTGCTCAACAA
TGCCTGCAGCATCCTTGGCTGAATCTCAGGGCACAGAACAATGAAGATCATATTGAAGGT
CAGATGAGTAACTTGCAGATCAAAGGTTGAAGAACTTTCACTTTTCAATTATGACCTTTT
TGGCTTACAAATGATATAGAACTTCTCTTCTTTTT*CTCCTTTTCATTATTTGGTTCGTT
TCTGTTTGAA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2GN07JQ 592 0 0
TCTGTTGATATGTGGTCTTTCGCTTGCACCGCTTTCGAGCTTGCCACAGGAGACATGCTT
TTTGCTCCAAAGGATGGAAATGGTTATGGAGAAGACGAGGACCACCTTGCTCTTATGATG
GAACTTTTAGGAAAAATACCTCGGAAGATTGCCATTGGAGGTGCGAAATCAAAGGATTAC
TTTGACAGACATGGTGACCTAAAGAGGATCCGGAGGTTGAAATATTGGCCACTGGACCGT
TTACTGACAGATAAGTACAAGCTTCAAGAAGCAGAAGCACAAGAATTTGCAGATTTTCTT
TGTCCGATTCTTTCTTTTGAGCCAGAGAAACGACCAAGTGCTCAACAATGCCTGCAGCAT
CCTTGGCTGAATCTCAGGGCACAGAACAATGAAGATCATATTGAAGGTCAGATGAGTAAC
TTGCAGATCAAAGGTTGAAGAACTTTCACTTTTCAATTATGACCTTTTTGGCTTACAAAT
GATATAGAACTTCTCTTCTTTTTTCTCCTTTTCATTATTTGGTTCGTTTCTGTTTGAATA
ATTTTGATTCTTTATTTGTTTGTTCCTCTTTTTTTTTTACTAAATTTTGGAG

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL7307Contig1 720 2 4 U
GAGCCTCATACACAGCAGGGTTATCCTCAAGCGCAACAGCCTCATACACAGCAGGGTTAT
TCTCAACCGCAACAGCAACAGCCTCATGCACTGCAGGGTTATTCTCAAACGCAACAGCAA
CAGCCTCAAGCACAGCAGGGTTATTCTCAACCGCAACAGCAACAGCCTCAAATACAGCAG
GGCTATTCTCAACCGCAACCGCAAGCTAGACCTCAGAGTCCATTTGAATATCCGCCTCCG
CCATGGGCTTCAACATCAGCGAACGCTTACTATACTCCACGGGCTAATACGACTGCGTCA
TACACAGAGACAAGTGCCGGGAGATCACTGCAGTCCAACTCATTCCCCGCTAGAACCGGA
GATCCCCAGGTTACTTCAGCTGCAAGCAATCCAGGTGTCTCTGGAGGACAGAAGCCGTTT
GTTCCATCGTACAGATTGTTCGAAGATCTGGATGTGTTTGGTAGCACAGAGGGGAAGCAT
AATAATAAGTCTACCAACAGTAATAATGCTTCTCAGGCGCAGCAGAGTATGATAGGAGGG
AGGAAAATGATTTAACATAAAGTTTGCATGCTTCGTTATTTTCTCATTTGTGAATATAGT
GGTGTACAACTGAATGTACATTTTCTCTTTCTCCCCGTTTTTTTTTATCTTGTTTGATTT
TAGGATTTGGTATGACATACTGAAACGATTTGATGAGACTATGAGATTTTTTATTTGTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY93TF U 1
AF RR2BY93JQ C 1
BS 1 645 RR2BY93TF
BS 646 646 RR2BY93JQ
BS 647 659 RR2BY93TF
BS 660 720 RR2BY93JQ

RD RR2BY93TF 659 0 0
GAGCCTCATACACAGCAGGGTTATCCTCAAGCGCAACAGCCTCATACACAGCAGGGTTAT
TCTCAACCGCAACAGCAACAGCCTCATGCACTGCAGGGTTATTCTCAAACGCAACAGCAA
CAGCCTCAAGCACAGCAGGGTTATTCTCAACCGCAACAGCAACAGCCTCAAATACAGCAG
GGCTATTCTCAACCGCAACCGCAAGCTAGACCTCAGAGTCCATTTGAATATCCGCCTCCG
CCATGGGCTTCAACATCAGCGAACGCTTACTATACTCCACGGGCTAATACGACTGCGTCA
TACACAGAGACAAGTGCCGGGAGATCACTGCAGTCCAACTCATTCCCCGCTAGAACCGGA
GATCCCCAGGTTACTTCAGCTGCAAGCAATCCAGGTGTCTCTGGAGGACAGAAGCCGTTT
GTTCCATCGTACAGATTGTTCGAAGATCTGGATGTGTTTGGTAGCACAGAGGGGAAGCAT
AATAATAAGTCTACCAACAGTAATAATGCTTCTCAGGCGCAGCAGAGTATGATAGGAGGG
AGGAAAATGATTTAACATAAAGTTTGCATGCTTCGTTATTTTCTCATTTGTGAATATAGT
GGTGTACAACTGAATGTACATTTTCTCTTTCTCCCCGTTTTTTTT*ATCTTGTTTGATT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2BY93JQ 720 0 0
GAGCCTCATACACAGCAGGGTTATCCTCAAGCGCAACAGCCTCATACACAGCAGGGTTAT
TCTCAACCGCAACAGCAACAGCCTCATGCACTGCAGGGTTATTCTCAAACGCAACAGCAA
CAGCCTCAAGCACAGCAGGGTTATTCTCAACCGCAACAGCAACAGCCTCAAATACAGCAG
GGCTATTCTCAACCGCAACCGCAAGCTAGACCTCAGAGTCCATTTGAATATCCGCCTCCG
CCATGGGCTTCAACATCAGCGAACGCTTACTATACTCCACGGGCTAATACGACTGCGTCA
TACACAGAGACAAGTGCCGGGAGATCACTGCAGTCCAACTCATTCCCCGCTAGAACCGGA
GATCCCCAGGTTACTTCAGCTGCAAGCAATCCAGGTGTCTCTGGAGGACAGAAGCCGTTT
GTTCCATCGTACAGATTGTTCGAAGATCTGGATGTGTTTGGTAGCACAGAGGGGAAGCAT
AATAATAAGTCTACCAACAGTAATAATGCTTTTCAGGCGCAGCAGAGTATGATAGGAGGG
AGGAAAATGATTTAACATAAAGTTTGCATGCTTCGTTATTTTCTCATTTGTGAATATAGT
GGTGTACAACTGAATGTACATTTTCTCTTTCTCCCCGTTTTTTTTTATCTTGTTTGATTT
TAGGATTTGGTATGACATACTGAAACGATTTGATGAGACTATGAGATTTTTTATTTGTCG

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL7308Contig1 526 2 1 U
GGAAAACGGGGTTTGCGTCTCCGTCTCGCCGTTTCTCTTGCCGTTGCCGCACTTGCTTTG
CTTCTCCTCAGTGTTTTGGATTTTGGATTGATCTACAATTCAAGCTAATAAATCAAGATG
CAGAACGAAGAGGGTCAGATCACAGAACTATACGTTCCTAGGAAATGCTCTGCTACTGAC
CGGATGATCACATCAAAGGATCATGCCTCTGTCCAGCTCAACATTGGTCATTTAGATGCT
GATGGCGTCTACACCGGACAGTTCACTACCTTTGCTCTCTGTGGTTTTGTTCGTGCCCAG
GGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAGCCAAACAA
GTTTAAGATGCTCTTATTTAAGCCTTTTTTCATTTGTTATTTAATTAAACAAAGATTATT
GACAATACTGAAGTAATTGATTCTTGCTCTCTATGCTTGGTTTATTTCTCTTGCTTGTTC
TGAATATTCATCTAGTGAGAGATCCGAGATTGCAGTATAAGACCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AX41JQ C 1
AF RR2AX41TFB U 1
BS 1 526 RR2AX41TFB

RD RR2AX41JQ 526 0 0
GGAAAACGGGGTTTGCGTCTCCGTCTCGCCGTTTCTCTTGCCGTTGCCGCACTTGCTTTG
CTTCTCCTCAGTGTTTTGGATTTTGGATTGATCTACAATTCAAGCTAATAAATCAAGATG
CAGAACGAAGAGGGTCAGATCACAGAACTATACGTTCCTAGGAAATGCTCTGCTACTGAC
CGGATGATCACATCAAAGGATCATGCCTCTGTCCAGCTCAACATTGGTCATTTAGATGCT
GATGGCGTCTACACCGGACAGTTCACTACCTTTGCTCTCTGTGGTTTTGTTCGTGCCCAG
GGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAGCCAAACAA
GTTTAAGATGCTCTTATTTAAGCCTTTTTTCATTTGTTATTTAATTAAACAAAGATTATT
GACAATACTGAAGTAATTGATTCTTGCTCTCTATGCTTGGTTTATTTCTCTTGCTTGTTC
TGAATATTCATCTAGTGAGAGATCCGAGATTGCAGTATAAGACCTT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2AX41TFB 526 0 0
GGAAAACGGGGTTTGCGTCTCCGTCTCGCCGTTTCTCTTGCCGTTGCCGCACTTGCTTTG
CTTCTCCTCAGTGTTTTGGATTTTGGATTGATCTACAATTCAAGCTAATAAATCAAGATG
CAGAACGAAGAGGGTCAGATCACAGAACTATACGTTCCTAGGAAATGCTCTGCTACTGAC
CGGATGATCACATCAAAGGATCATGCCTCTGTCCAGCTCAACATTGGTCATTTAGATGCT
GATGGCGTCTACACCGGACAGTTCACTACCTTTGCTCTCTGTGGTTTTGTTCGTGCCCAG
GGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAGCCAAACAA
GTTTAAGATGCTCTTATTTAAGCCTTTTTTCATTTGTTATTTAATTAAACAAAGATTATT
GACAATACTGAAGTAATTGATTCTTGCTCTCTATGCTTGGTTTATTTCTCTTGCTTGTTC
TGAATATTCATCTAGTGAGAGATCCGAGATTGCAGTATAAGACCTT

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 2

CO CL7309Contig1 529 2 1 U
GAGTTATGAAACAATGAAGAAGAGGTGGGAGATATTAAACAAGATCTTGTCCACGTCCAC
GCGTTTCTCGCTCGAGACAATACAACCTGAGTACTGCAGCTATTTCAAGAAACGCAGAGA
CTTTACTCCTGCTTATGCGTGGGTGAAGTGTGAAAGATTAGAAGATACAAACTGCTATGA
GATATTCAGAGGGGCAAAGATAAAAGGACGTGAAGGAAAAGTGTTTGGATCAGAGGAGCG
TTTCGTTCGATTAAGTCTCATCAGAACACAAGACGACTTTGATCAGCTGACTGATCTGTT
GAAGAAGTTGGTCTCCGAGGAAGTTGTGCGAGGTCACTCCACCTAAAGTTAAATATTGAT
TTTCCTAATCAAATGTATTATTCAAATGTTGTATCCATCACATATGTATTCAAGGTTTAC
TCATGCTGTCCAATCATCGATCCCTAGATAGTCTATCCCTTTTACTTGCTATATCTAAAT
AAAGAATAATGTTTCCTCCTCGAATATTATCAAAATAATCTCTTGTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CH75JQ C 1
AF RR2CH75TF U 1
BS 1 529 RR2CH75TF

RD RR2CH75JQ 529 0 0
GAGTTATGAAACAATGAAGAAGAGGTGGGAGATATTAAACAAGATCTTGTCCACGTCCAC
GCGTTTCTCGCTCGAGACAATACAACCTGAGTACTGCAGCTATTTCAAGAAACGCAGAGA
CTTTACTCCTGCTTATGCGTGGGTGAAGTGTGAAAGATTAGAAGATACAAACTGCTATGA
GATATTCAGAGGGGCAAAGATAAAAGGACGTGAAGGAAAAGTGTTTGGATCAGAGGAGCG
TTTCGTTCGATTAAGTCTCATCAGAACACAAGACGACTTTGATCAGCTGACTGATCTGTT
GAAGAAGTTGGTCTCCGAGGAAGTTGTGCGAGGTCACTCCACCTAAAGTTAAATATTGAT
TTTCCTAATCAAATGTATTATTCAAATGTTGTATCCATCACATATGTATTCAAGGTTTAC
TCATGCTGTCCAATCATCGATCCCTAGATAGTCTATCCCTTTTACTTGCTATATCTAAAT
AAAGAATAATGTTTCCTCCTCGAATATTATCAAAATAATCTCTTGTTTT

QA 1 529 1 529
DS 

RD RR2CH75TF 529 0 0
GAGTTATGAAACAATGAAGAAGAGGTGGGAGATATTAAACAAGATCTTGTCCACGTCCAC
GCGTTTCTCGCTCGAGACAATACAACCTGAGTACTGCAGCTATTTCAAGAAACGCAGAGA
CTTTACTCCTGCTTATGCGTGGGTGAAGTGTGAAAGATTAGAAGATACAAACTGCTATGA
GATATTCAGAGGGGCAAAGATAAAAGGACGTGAAGGAAAAGTGTTTGGATCAGAGGAGCG
TTTCGTTCGATTAAGTCTCATCAGAACACAAGACGACTTTGATCAGCTGACTGATCTGTT
GAAGAAGTTGGTCTCCGAGGAAGTTGTGCGAGGTCACTCCACCTAAAGTTAAATATTGAT
TTTCCTAATCAAATGTATTATTCAAATGTTGTATCCATCACATATGTATTCAAGGTTTAC
TCATGCTGTCCAATCATCGATCCCTAGATAGTCTATCCCTTTTACTTGCTATATCTAAAT
AAAGAATAATGTTTCCTCCTCGAATATTATCAAAATAATCTCTTGTTTT

QA 1 529 1 529
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7311Contig1 798 2 2 U
GGCTGCAAGAAATTTCCACACTTTCTCTCTCTAGAACTCATTTTCGTTCTCTCTAGTAAA
AGAAAGTTCCAAGCTTTACTCGAAAAAGACTCTGTTTGCTATCCTGCCATCAAGTTTCTC
TCGAAAATGGCAATCGAAGATCAAGAGAACACAATCCGAGAAATCAAGCCTAAGAACAGA
AGAATCATGGGAGCTGGTGGACCGGAGGAGGAAGATAACCGATGGCCGCCATGGCTTAAA
CCTCTGCTTAAAGAGCACTTCTTTGTTCACTGCAAGTTGCATGTAGACTCTCACAAGAGT
GAATGCAATATGTATTGCTTAGACTGCACCAACGGCCCGCTCTGCTCTCTCTGTCTTGCC
CATCACAAGGATCACCACACCATTCAGATAAGGAGATCTTCTTATCATGATGTTATAAGG
GTGAATTAGATACAAAAGTATCTTGACATATCAGGTATCCAGACTTATGTGATAAATAGT
GCTAAAGTCGTCTTCTTGAACGAGAGGCCTCAGCCTAAGACAGGAAAGGCGTTACCAATA
CCTGCAAAGTTTGCTACCGTACTCTCGTTGACGACAGCTTCCGCTTCTGTTCTCTTGGCT
GCAAGATCGCTGGATCATCTAGAGGCTTTGAAAAGGGAAGGAAGAACCTTTTGATGGAAT
CAGAGGATTCACGTAGCAGCATGGGAATTGGGAGGAACGTATCAAATCTCCAGAGTTTCA
GCCCATCAACACCTCCACTGACTACATCTAGTAGTTGCAGAATCGCCAAACGAAGAAAGG
GAATCCCTCACCGTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A910TF U 1
AF RR2A910JQ C 341
BS 1 774 RR2A910TF
BS 775 798 RR2A910JQ

RD RR2A910TF 774 0 0
GGCTGCAAGAAATTTCCACACTTTCTCTCTCTAGAACTCATTTTCGTTCTCTCTAGTAAA
AGAAAGTTCCAAGCTTTACTCGAAAAAGACTCTGTTTGCTATCCTGCCATCAAGTTTCTC
TCGAAAATGGCAATCGAAGATCAAGAGAACACAATCCGAGAAATCAAGCCTAAGAACAGA
AGAATCATGGGAGCTGGTGGACCGGAGGAGGAAGATAACCGATGGCCGCCATGGCTTAAA
CCTCTGCTTAAAGAGCACTTCTTTGTTCACTGCAAGTTGCATGTAGACTCTCACAAGAGT
GAATGCAATATGTATTGCTTAGACTGCACCAACGGCCCGCTCTGCTCTCTCTGTCTTGCC
CATCACAAGGATCACCACACCATTCAGATAAGGAGATCTTCTTATCATGATGTTATAAGG
GTGAATTAGATACAAAAGTATCTTGACATATCAGGTATCCAGACTTATGTGATAAATAGT
GCTAAAGTCGTCTTCTTGAACGAGAGGCCTCAGCCTAAGACAGGAAAGGCGTTACCAATA
CCTGCAAAGTTTGCTACCGTACTCTCGTTGACGACAGCTTCCGCTTCTGTTCTCTTGGCT
GCAAGATCGCTGGATCATCTAGAGGCTTTGAAAAGGGAAGGAAGAACCTTTTGATGGAAT
CAGAGGATTCACGTAGCAGCATGGGAATTGGGAGGAACGTATCAAATCTCCAGAGTTTCA
GCCCATCAACACCTCCACTGACTACATCTAGTAGTTGCAGAATCGCCAAACGAA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2A910JQ 458 0 0
TCTGCTCTCTCTGTCTTGCCCATCACAAGGATCACCACACCATTCAGATAAGGAGATCTT
CTTATCATGATGTTATAAGGGTGAATTAGATACAAAAGTATCTTGACATATCAGGTATCC
AGACTTATGTGATAAATAGTGCTAAAGTCGTCTTCTTGAACGAGAGGCCTCAGCCTAAGA
CAGGAAAGGCGTTACCAATACCTGCAAAGTTTGCTACCGTACTCTCGTTGACGACAGCTT
CCGCTTCTGTTCTCTTGGCTGCAAGATCGCTGGATCATCTAGAGGCTTTGAAAAGGGAAG
GAAGAACCTTTTGATGGAATCAGAGGATTCAGGTAGCAGCATGGGAATTGGGAGGAACGT
ATCAAATCTCCAGAGTTTCAGCCCATCAACACCTCCACTGACTACATCTAGTAGTTGCAG
AATCGCCAAACGAAGAAAGGGAATCCCTCACCGTTCTC

QA 1 458 1 458
DS 



AS 1 2

CO CL7312Contig1 986 2 2 U
GGACATCCAACTTTATCTTCTCTGCCCTCATCTTCCTTCGCTAATTACAGTTGTGCCACT
CTGGTTATGCTAGCTTCCTTGGACCGGCGAGAAAGATTTTGAAAAGCCGCAGATTTGCTA
AGCATGCCGGTTGTAAACTCGAAGAACGCTAACCGGAAAGGAGCCACCGGAGGAGAAACC
GAGAAGAGTCGCCGAGGAAAGCTACAGGAGAAAGCGATGTCGTTTCACGGCAGAGGAACG
ATGCCTCATCCGAATCCAGGAGAGCTTCGAAGACCGAAGACTCTACCGGAGTTATTCTCC
AGCGGTCGGACCGCCGTCGTCGAACCGGTGTCTTCTAAACCGCCGCGACTGACGAAACTG
CTCCTCAACGTGACGGTTCAAGGGAGTTCAGGAGCTCTGCAGATTATAATCTCGCCGGAA
TCAACCGTGGACGATTTGATCGACGCCGCGATTCGTCTTTACGTGAAGGAAGCTCGCCGA
CCTTTCTTGTCGGAATCTGAACCGTCCCGGTTTGATCTCCATTACTCGCAGTTCAGCCTC
GAAAGTATAGGAAGAGAACAGAAGCTGATCTCGCTTGGGTCAAGGAACTTCTTCTTGTGT
GGTCGGAAAGAGAACGGAGGATTGGTCCGGAGTGGATCGTCGGAGTCTTGTTCAAAGGAA
GCAGAGAAAGCGGGGAAAACTGGTTTTCACTGGCTCAAATTCATGGGTTTCTAGAAGTTT
TTTTACCATTTTTAAATTTAATTCATACTTTTATTTTTTTTTTTTCACTTTTTAGGGAAT
AAATATGGATTTAAGGAAACTTCGTGTTACCTTCCTAGGAAAGGACAAAAAGATAGGGAT
TGTTTGCTTTTTATTATGAGTCAAACGTTTAAAATCTGTGTATATATAGTATTCTAGATA
AGAAGAAAACAAAGAAAAAAAACAAAGTCATTAACTAGGGGGGTATAATGTATTTTTAAT
CAAATTATATGCCAATAATTGTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BI82TF U 1
AF RR2BI82JQ C 501
BS 1 734 RR2BI82TF
BS 735 986 RR2BI82JQ

RD RR2BI82TF 734 0 0
GGACATCCAACTTTATCTTCTCTGCCCTCATCTTCCTTCGCTAATTACAGTTGTGCCACT
CTGGTTATGCTAGCTTCCTTGGACCGGCGAGAAAGATTTTGAAAAGCCGCAGATTTGCTA
AGCATGCCGGTTGTAAACTCGAAGAACGCTAACCGGAAAGGAGCCACCGGAGGAGAAACC
GAGAAGAGTCGCCGAGGAAAGCTACAGGAGAAAGCGATGTCGTTTCACGGCAGAGGAACG
ATGCCTCATCCGAATCCAGGAGAGCTTCGAAGACCGAAGACTCTACCGGAGTTATTCTCC
AGCGGTCGGACCGCCGTCGTCGAACCGGTGTCTTCTAAACCGCCGCGACTGACGAAACTG
CTCCTCAACGTGACGGTTCAAGGGAGTTCAGGAGCTCTGCAGATTATAATCTCGCCGGAA
TCAACCGTGGACGATTTGATCGACGCCGCGATTCGTCTTTACGTGAAGGAAGCTCGCCGA
CCTTTCTTGTCGGAATCTGAACCGTCCCGGTTTGATCTCCATTACTCGCAGTTCAGCCTC
GAAAGTATAGGAAGAGAACAGAAGCTGATCTCGCTTGGGTCAAGGAACTTCTTCTTGTGT
GGTCGGAAAGAGAACGGAGGATTGGTCCGGAGTGGATCGTCGGAGTCTTGTTCAAAGGAA
GCAGAGAAAGCGGGGAAAACTGGTTTTCACTGGCTCAAATTCATGGGTTTCTAGAAGTTT
TTTTACCATTTTTA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2BI82JQ 486 0 0
ACCGTCCCGGTTTGATCTCCATTACTCGCAGTTCAGCCTCGAAAGTATAGGAAGAGAACA
GAAGCTGATCTCGCTTGGGTCAAGGAACTTCTTTTTGTGTGGTCGGAAAGAGAACGGAGG
ATTGGTCCGGAGTGGATCGTCGGAGTTTTGTTCAAAGGAAGCAGAGAAAGCGGGGAAAAC
TGGTTTTCACTGGCTCAAATTCATGGGTTTCTAGAAGTTTTTTTACCATTTTTAAATTTA
ATTCATACTTTTATTTTTTTTTTTTCACTTTTTAGGGAATAAATATGGATTTAAGGAAAC
TTCGTGTTACCTTCCTAGGAAAGGACAAAAAGATAGGGATTGTTTGCTTTTTATTATGAG
TCAAACGTTTAAAATCTGTGTATATATAGTATTCTAGATAAGAAGAAAACAAAGAAAAAA
AACAAAGTCATTAACTAGGGGGGTATAATGTATTTTTAATCAAATTATATGCCAATAATT
GTAATT

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 2

CO CL7313Contig1 726 2 1 U
GGACTCACTTGTGTCCCCTTCTCTCCCAGTCTCCGGCGTCATCGCCGGCGATCGTTTTAA
CCACCGCCGCTACAAATTATCCTCGTCTCCCTAGATCTTGTCCTGTCCGTTAAAACCAAA
GAAATGGAATGTCCCAAAGAACCATTGGAATCACAGTGTTCTTTATCCGAGATCGATGAT
TTCGATCTGACTCGAGCTTTGGACAAGCCGAGGCTCAAGATCGAAAGGAAGAGATCGTTT
GATGAGAGGTCTATGAGCGAGTTATCGACTGGCTACTCAAGACATGAGCTCGACATGGCT
CATTCTCCTGGAAGCAGGTCGTTTGTGGACACACCTCTCTCTTACGTTAGGAACTCGTTC
GAGCCTCACCCAATGGTTGCAGAGGCCTGGGAAGCTCTGAGAAGGTCAATGGTGTTCTTC
CGTGGTCAACCCGTTGGTACCATTGCAGCTTATGACCATGCCTCTGAGGAGGTCTTGAAC
TACGACCAGGTGTTTGTACGAGACTTTGTACCGAGTGCACTGGCGTTTCTGATGAACGGA
GAGCCAGACATAGTGAAAAACTTCTTGCTCAAGACACTTCAGCTTCAAGGTTGGGAGAAA
CGGGTGGACCGGTTCAAGCTTGGGGAAAGAGTTATGCCAGCGAGCTTCAAGTGCTTCATG
ATCCAGTCCGTAAACGGATACATCGTTGCGGATTTTGGAGAAGTGCTATAGAGAGTAGCA
CGGTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX83TF U 1
AF RR2BL26TF U 1
BS 1 726 RR2BL26TF

RD RR2CX83TF 647 0 0
GGACTCACTTGTGTCCCCTTCTCTCCCAGTCTCCGGCGTCATCGCCGGCGATCGTTTTAA
CCACCGCCGCTACAAATTATCCTCGTCTCCCTAGATCTTGTCCTGTCCGTTAAAACCAAA
GAAATGGAATGTCCCAAAGAACCATTGGAATCACAGTGTTCTTTATCCGAGATCGATGAT
TTCGATCTGACTCGAGCTTTGGACAAGCCGAGGCTCAAGATCGAAAGGAAGAGATCGTTT
GATGAGAGGTCTATGAGCGAGTTATCGACTGGCTACTCAAGACATGAGCTCGACATGGCT
CATTCTCCTGGAAGCAGGTCGTTTGTGGACACACCTCTCTCTTACGTTAGGAACTCGTTC
GAGCCTCACCCAATGGTTGCAGAGGCCTGGGAAGCTCTGAGAAGGTCAATGGTGTTCTTC
CGTGGTCAACCCGTTGGTACCATTGCAGCTTATGACCATGCCTCTGAGGAGGTCTTGAAC
TACGACCAGGTGTTTGTACGAGACTTTGTACCGAGTGCACTGGCGTTTCTGATGAACGGA
GAGCCAGACATAGTGAAAAACTTCTTGCTCAAGACACTTCAGCTTCAAGGTTGGGAGAAA
CGGGTGGACCGGTTCAAGCTTGGGGAAGGAGTTATGCCAGCGAGCTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2BL26TF 726 0 0
GGACTCACTTGTGTCCCCTTCTCTCCCAGTCTCCGGCGTCATCGCCGGCGATCGTTTTAA
CCACCGCCGCTACAAATTATCCTCGTCTCCCTAGATCTTGTCCTGTCCGTTAAAACCAAA
GAAATGGAATGTCCCAAAGAACCATTGGAATCACAGTGTTCTTTATCCGAGATCGATGAT
TTCGATCTGACTCGAGCTTTGGACAAGCCGAGGCTCAAGATCGAAAGGAAGAGATCGTTT
GATGAGAGGTCTATGAGCGAGTTATCGACTGGCTACTCAAGACATGAGCTCGACATGGCT
CATTCTCCTGGAAGCAGGTCGTTTGTGGACACACCTCTCTCTTACGTTAGGAACTCGTTC
GAGCCTCACCCAATGGTTGCAGAGGCCTGGGAAGCTCTGAGAAGGTCAATGGTGTTCTTC
CGTGGTCAACCCGTTGGTACCATTGCAGCTTATGACCATGCCTCTGAGGAGGTCTTGAAC
TACGACCAGGTGTTTGTACGAGACTTTGTACCGAGTGCACTGGCGTTTCTGATGAACGGA
GAGCCAGACATAGTGAAAAACTTCTTGCTCAAGACACTTCAGCTTCAAGGTTGGGAGAAA
CGGGTGGACCGGTTCAAGCTTGGGGAAAGAGTTATGCCAGCGAGCTTCAAGTGCTTCATG
ATCCAGTCCGTAAACGGATACATCGTTGCGGATTTTGGAGAAGTGCTATAGAGAGTAGCA
CGGTGA

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL7314Contig1 649 2 2 U
GTGCAGAATTGGATTCCCTAAGGCGTAAGCTTCATTTGGTAGGAAACAGGTCTGTTGAGC
TTAACTCGGAGCTCCAGGCTTTGGAAAGAAAATCTGCTTCAAATGCAAGACTCGTTGATG
AAGCTTCAAAGCTTTATGATCAATCATCAGTGGACGATATGTTCAAAGAAATGACAGAAA
TGGCATCCGAACTTCGCACAGAGATCATCAATAGGCTGAAAGCAAGAAATATGAATGCTG
CTGCTGAAAGCGCCTTAGTAGAGAGGCTAAAGAACAGTGGAAATGATTTCTCGGCTACGG
CTCCCGATGGGAAGATGGAAGACCTCGACAAATTTCTAGCCGAGCTAAGAAAGATGTGAA
CAATTGCCTTTGAACTCTGCCCTTTTGTAGACTTCGTCGTATTTAGCTTTACCTAATGGC
CACTTCTCCGCGTATCTAATGTTTGTTTTGTTAACAAACAAAAAGATCTACGCATATCTA
GATATAAAGCTTGGAAGCAGAGCTCGTTTATGCTAATGAAAACCCAACTTTGATTCACAT
CTCTCGTAAGCAAAAAAAGAACAAAAAAGTTACAAAGGTTTCGTCGTGTGCTATAGCGTA
AATGCATGTAAATTTAGCCAAGAGATTAATCGCATAGTGAGTGTTCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2H504TF U 1
AF RR2H504JQB C 99
BS 1 647 RR2H504TF
BS 648 649 RR2H504JQB

RD RR2H504TF 647 0 0
GTGCAGAATTGGATTCCCTAAGGCGTAAGCTTCATTTGGTAGGAAACAGGTCTGTTGAGC
TTAACTCGGAGCTCCAGGCTTTGGAAAGAAAATCTGCTTCAAATGCAAGACTCGTTGATG
AAGCTTCAAAGCTTTATGATCAATCATCAGTGGACGATATGTTCAAAGAAATGACAGAAA
TGGCATCCGAACTTCGCACAGAGATCATCAATAGGCTGAAAGCAAGAAATATGAATGCTG
CTGCTGAAAGCGCCTTAGTAGAGAGGCTAAAGAACAGTGGAAATGATTTCTCGGCTACGG
CTCCCGATGGGAAGATGGAAGACCTCGACAAATTTCTAGCCGAGCTAAGAAAGATGTGAA
CAATTGCCTTTGAACTCTGCCCTTTTGTAGACTTCGTCGTATTTAGCTTTACCTAATGGC
CACTTCTCCGCGTATCTAATGTTTGTTTTGTTAACAAACAAAAAGATCTACGCATATCTA
GATATAAAGCTTGGAAGCAGAGCTCGTTTATGCTAATGAAAACCCAACTTTGATTCACAT
CTCTCGTAAGCAAAAAAAGAACAAAAAAGTTACAAAGGTTTCGTCGTGTGCTATAGCGTA
AATGCATGTAAATTTAGCCAAGAGATTAATCGCATAGTGAGTGTTCC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2H504JQB 551 0 0
TCAAATGCAAGACTCGTTGATGAAGCTTCAAAGCTTTATGATCAATCATCAGTGGACGAT
ATGTTCAAAGAAATGACAGAAATGGCATCCGAACTTCGCACAGAGATCATCAATAGGCTG
AAAGCAAGAAATATGAATGCTGCTGCTGAAAGCGCCTTAGTAGAGAGGCTAAAGAACAGT
GGAAATGATTTTTCGGCTACGGCTCCCGATGGGAAGATGGAAGACCTCGACAAATTTCTA
GCCGAGCTAAGAAAGATGTGAACAATTGCCTTTGAATTTTGCCCTTTTGTAGACTTCGTC
GTATTTAGCTTTACCTAATGGCCACTTTTCCGCGTATTTAATGTTTGTTTTGTTAACAAA
CAAAAAGATTTACGCATATCTAGATATAAAGCTTGGAAGCAGAGCTCGTTTATGCTAATG
AAAACCCAACTTTGATTCACATCTCTCGTAAGCAAAAAAAGAACAAAAAAGTTACAAAGG
TTTCGTCGTGTGCTATAGCGTAAATGCATGTAAATTTAGCCAAGAGATTAATCGCATAGT
GAGTGTTCCAT

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

CO CL7315Contig1 1096 2 2 U
GGGGATATCCTACATTCTAAGGACGTCATTGCGACCGGAGGAATCGATACAACTGCCGTT
CTCTTTGATCGTCCATCAGGACAAATCTTGCCAACGTTGACTGGTCATTCAAAGAAGGTT
ACAAGTATTAAGTTTGTAGGTGACACCGATCTTGTTTTGACTGGTTCATCAGACAAGACA
GTCCGTATCTGGGGGAGTTCCGAGTATGGGAACTATACCTGTAGACATACATTGAAAGAT
CACTCTGCAGAAGTGCGAACTGTCACTGTCCATGCAACGAATAAATACTTTGTATCTGCA
TCGCTTGACAGTACGTGGTGCTTCTACGACATGTCCTCCGGTTTATGCCTGGCCCAGGTA
ACAGATGATTCCGAAAAGGTGGATTACACGGCTGCTGCTTTCCATCCTGATGGTCTCATT
CTTGGAACTTGTACTGCTCAATCTATTGTCAAAATCTGGGATGTAAAAAGTCAGGCAAAC
GTGGCGAAGTTCGGTGGACACACTGGAGAGATCACATCTGTATCATTCTCTGAAAACGGC
TATTTCCTCGCGACTGCTGCGCTGGATGGTGTTAGGTTGTGGGACCTGCGCAAGCTAAAG
AACTTCCGAACATTTGAATTTCCAGACGCAAACTCAGTGGAGTTTGACCATAGTGGATCT
TATCTTGGCATTGCTGCTTCAGATATAAGAGTATTCCAAACGGCGAGTGTAAAAGCAGAG
TGGAACCCCGTAAAGACACTTCCTGATCTGTCCGGTACAGGTAAAGCAACATGTGTTAAG
TTTGGTCCTGACGCCAAATACGTAGCAGTCGGTTCAATGGACCGTAATCTCAGGATATTT
GGTTTACCTAGCACTGACAGCACTGAAGATTCTGCACAAGATTCATGAATAGAAGATGCC
TCTCAAGTCTCACCGTCAAGAGCAGAGCCTTGGCTTTCTTATAGAAACTTAAACCTTCCA
CTAGGGCATCATTTGCTAGAAAATAACTAAATTCTTGTTTCAACAATAATATATTGTATT
TATCTTTAATTTTACTATAATTTGCAATAATTTGTCACATCTCTCTACGCTGTTGTTTAA
TCAATTTGATATAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B916TF U 1
AF RR2B916JQ C 429
BS 1 751 RR2B916TF
BS 752 1096 RR2B916JQ

RD RR2B916TF 751 0 0
GGGGATATCCTACATTCTAAGGACGTCATTGCGACCGGAGGAATCGATACAACTGCCGTT
CTCTTTGATCGTCCATCAGGACAAATCTTGCCAACGTTGACTGGTCATTCAAAGAAGGTT
ACAAGTATTAAGTTTGTAGGTGACACCGATCTTGTTTTGACTGGTTCATCAGACAAGACA
GTCCGTATCTGGGGGAGTTCCGAGTATGGGAACTATACCTGTAGACATACATTGAAAGAT
CACTCTGCAGAAGTGCGAACTGTCACTGTCCATGCAACGAATAAATACTTTGTATCTGCA
TCGCTTGACAGTACGTGGTGCTTCTACGACATGTCCTCCGGTTTATGCCTGGCCCAGGTA
ACAGATGATTCCGAAAAGGTGGATTACACGGCTGCTGCTTTCCATCCTGATGGTCTCATT
CTTGGAACTTGTACTGCTCAATCTATTGTCAAAATCTGGGATGTAAAAAGTCAGGCAAAC
GTGGCGAAGTTCGGTGGACACACTGGAGAGATCACATCTGTATCATTCTCTGAAAACGGC
TATTTCCTCGCGACTGCTGCGCTGGATGGTGTTAGGTTGTGGGACCTGCGCAAGCTAAAG
AACTTCCGAACATTTGAATTTCCAGACGCAAACTCAGTGGAGTTTGACCATAGTGGATCT
TATCTTGGCATTGCTGCTTCAGATATAAGAGTATTCCAAACGGCGAGTGTAAAAGCAGAG
TGGAACCCCGTAAAGACACTTCCTGATCTGT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2B916JQ 668 0 0
TTGTACTGCTCAATCTATTGTCAAAATCTGGGATGTAAAAAGTCAGGCAAACGTGGCGAA
GTTCGGTGGACACACTGGAGAGATCACATCTGTATCATTCTCTGAAAACGGCTATTTCCT
CGCGACTGCTGCGCTGGATGGTGTTAGGTTGTGGGACCTGCGCAAGCTAAAGAACTTCCG
AACATTTGAATTTCCAGACGCAAACTCAGTGGAGTTTGACCATAGTGGATCTTATCTTGG
CATTGCTGCTTCAGATATAAGAGTATTCCAAACGGCGAGTGTAAAAGCAGAGTGGAACCC
CGTAAAGACACTTCCTGATCTGTCCGGTACAGGTAAAGCAACATGTGTTAAGTTTGGTCC
TGACGCCAAATACGTAGCAGTCGGTTCAATGGACCGTAATCTCAGGATATTTGGTTTACC
TAGCACTGACAGCACTGAAGATTCTGCACAAGATTCATGAATAGAAGATGCCTCTCAAGT
CTCACCGTCAAGAGCAGAGCCTTGGCTTTCTTATAGAAACTTAAACCTTCCACTAGGGCA
TCATTTGCTAGAAAATAACTAAATTCTTGTTTCAACAATAATATATTGTATTTATCTTTA
ATTTTACTATAATTTGCAATAATTTGTCACATCTCTCTACGCTGTTGTTTAATCAATTTG
ATATAAGC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL7316Contig1 776 2 1 U
GTGATCACCAGTCGCAAAGAAATTCTTTACTGCTTCTTCAATTTACTAACGACACTAGAA
CGACACCTCTTTACCTTCGCTTTCCCACCCCATCCTCGCTATATAACAGTGGCTAGGTTC
AAGTCAGATATAATCCTCACAACCAGTCGCTACTTTCAAGACACCAAGTCTCCACGGCCT
CTGATCGCCGTTACGCCATTGTTCCTCCAGTGGAGGATTAGTCATAAACGAAGGTATCTC
GAAGCCTTCTTCACGGAAACCCCTTCCAAGCACGAAGCCATCCAGGTTTCTGATGTTACG
CAGTAGCGGTTGATCTCGCACGGTTCCGTAGATGTCAAATATGCCAGACACTAGCCAAGT
TTTTCCCACAGCAGGTCACCACCGGCTGACTTATGTAGCTGACCAACATCGCCGGTGCAG
CTATCCACGGTTTGCTCCAGTTTGGGTCGGACGCTTTTGAAAAGCTTTAAAAAGAAACAA
CAAAAGGAAAGTGGGTGAGAAGAAGGCACATACCACCATGAGACGTACGCGCGTAGGCGC
CTGGCAACTCAACCAAGGAGGCAAGATTTGCTATGTTTTTCTTTCTTTGGCTTTATCAAA
TCGGACAAGGGACATACTGTAGCGTGTTCGGTGCATGAGAGCCTGAAACATGAAGAATAG
TGGCTTCCAAGAAAGCTAGGTTCGACAATTTGAGCCAGATAGTGTTTGGTCATTCACAAG
ACTGTGTGTGATCATCCCAGCATTATCAAACTACAGCACTTGATAATATCTGTCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H318TF U 1
AF RR2GH42TF U 1
BS 1 776 RR2GH42TF

RD RR2H318TF 713 0 0
GTGATCACCAGTCGCAAAGAAATTCTTTACTGCTTCTTCAATTTACTAACGACACTAGAA
CGACACCTCTTTACCTTCGCTTTCCCACCCCATCCTCGCTATATAACAGTGGCTAGGTTC
AAGTCAGATATAATCCTCACAACCAGTCGCTACTTTCAAGACACCAAGTCTCCACGGCCT
CTGATCGCCGTTACGCCATTGTTCCTCCAGTGGAGGATTAGTCATAAACGAAGGTATCTC
GAAGCCTTCTTCACGGAAACCCCTTCCAAGCACGAAGCCATCCAGGTTTCTGATGTTACG
CAGTAGCGGTTGATCTCGCACGGTTCCGTAGATGTCAAATATGCCAGACACTAGCCAAGT
TTTTCCCACAGCAGGTCACCACCGGCTGACTTATGTAGCTGACCAACATCGCCGGTGCAG
CTATCCACGGTTTGCTCCAGTTTGGGTCGGACGCTTTTGAAAAGCTTTAAAAAGAAACAA
CAAAAGGAAAGTGGGTGAGAAGAAGGCACATACCACCATGAGACGTACGCGCGTAGGCGC
CTGGCAACTCAACCAAGGAGGCAAGATTTGCTATGTTTTTCTTTCTTTGGCTTTATCAAA
TCGGACAAGGGAC*TACTGTAGCGTGTTCGGTGCATGAGAGCCTGAAACATGAAGAATAG
TGGCTTCCAG**AAGCTAG*TTCGACA*TTTGAGCCAGATAGTGTTTGGTCAT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2GH42TF 776 0 0
GTGATCACCAGTCGCAAAGAAATTCTTTACTGCTTCTTCAATTTACTAACGACACTAGAA
CGACACCTCTTTACCTTCGCTTTCCCACCCCATCCTCGCTATATAACAGTGGCTAGGTTC
AAGTCAGATATAATCCTCACAACCAGTCGCTACTTTCAAGACACCAAGTCTCCACGGCCT
CTGATCGCCGTTACGCCATTGTTCCTCCAGTGGAGGATTAGTCATAAACGAAGGTATCTC
GAAGCCTTCTTCACGGAAACCCCTTCCAAGCACGAAGCCATCCAGGTTTCTGATGTTACG
CAGTAGCGGTTGATCTCGCACGGTTCCGTAGATGTCAAATATGCCAGACACTAGCCAAGT
TTTTCCCACAGCAGGTCACCACCGGCTGACTTATGTAGCTGACCAACATCGCCGGTGCAG
CTATCCACGGTTTGCTCCAGTTTGGGTCGGACGCTTTTGAAAAGCTTTAAAAAGAAACAA
CAAAAGGAAAGTGGGTGAGAAGAAGGCACATACCACCATGAGACGTACGCGCGTAGGCGC
CTGGCAACTCAACCAAGGAGGCAAGATTTGCTATGTTTTTCTTTCTTTGGCTTTATCAAA
TCGGACAAGGGACATACTGTAGCGTGTTCGGTGCATGAGAGCCTGAAACATGAAGAATAG
TGGCTTCCAAGAAAGCTAGGTTCGACAATTTGAGCCAGATAGTGTTTGGTCATTCACAAG
ACTGTGTGTGATCATCCCAGCATTATCAAACTACAGCACTTGATAATATCTGTCCC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL7317Contig1 551 2 3 U
CTGAACACAGTCCGGGTTTGCTGGGAGATTCTGGAAAAATTCTCCATCATTGTTGATCCT
ATTTCGCGATTGATCGATAATCCAAACACATGAAACACTCGGCGAATCAGTCTCCAACGC
CTGATGAAGACGAGAAGGACGAGCTCACGCTTCGAGAAATCATCAACCTCAAGTTGGTGG
AGAGCGGAGAGAAAGAGAATCTGATGGAGCTCGTGAGAGATAGATTGGTTGAGTCTGGTT
GGAAAGATGAGATGAGAATTGCTTGCAGGGAGCATGTAAAGAAGAAAGGGAGAAAAGATG
TTACAGTCGATGAACTGATACGAGTCATCACTCCCAAAGGCAGAGCTTCAGTACCGGATG
CTGTCAAGGAAGAGTTGTTGAACAGAATCCAAAACTTCATTCGGTCGGCGGCTCTTTAAT
TGATCCAAGATCATTTACTACGAAGATGATGGTGGTGGTTTCTACTTGTAAACAACACTA
ACGAAATGTATCATCTTTGCTGTTGTAGAATTAGCTTTTCCTGTTTCAACCCTTTTATGT
ACCAAATGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GX25TF U 1
AF RR2GO69TF U 7
BS 1 379 RR2GX25TF
BS 380 380 RR2GO69TF
BS 381 551 RR2GX25TF

RD RR2GX25TF 551 0 0
CTGAACACAGTCCGGGTTTGCTGGGAGATTCTGGAAAAATTCTCCATCATTGTTGATCCT
ATTTCGCGATTGATCGATAATCCAAACACATGAAACACTCGGCGAATCAGTCTCCAACGC
CTGATGAAGACGAGAAGGACGAGCTCACGCTTCGAGAAATCATCAACCTCAAGTTGGTGG
AGAGCGGAGAGAAAGAGAATCTGATGGAGCTCGTGAGAGATAGATTGGTTGAGTCTGGTT
GGAAAGATGAGATGAGAATTGCTTGCAGGGAGCATGTAAAGAAGAAAGGGAGAAAAGATG
TTACAGTCGATGAACTGATACGAGTCATCACTCCCAAAGGCAGAGCTTCAGTACCGGATG
CTGTCAAGGAAGAGTTGTTTAACAGAATCCAAAACTTCATTCGGTCGGCGGCTCTTTAAT
TGATCCAAGATCATTTACTACGAAGATGATGGTGGTGGTTTCTACTTGTAAACAACACTA
ACGAAATGTATCATCTTTGCTGTTGTAGAATTAGCTTTTCCTGTTTCAACCCTTTTATGT
ACCAAATGAAA

QA 1 551 1 551
DS 

RD RR2GO69TF 541 0 0
GG
AGTCCGGGTTTGCTGGGAGATTCTGGAAAAATTCTCCATCATTGTTGATCCTATTTCGCG
ATTGATCGATAATCCAAACACATGAAACACTCGGCGAATCGGTCTCCAACGCCTGATGAA
GACGAGAAGGACGAGCTCACGCTTCGAGAAATCATCAACCTCAAGTTGGTGGAGAGCGGA
GAGAAAGAGAATCTGATGGAGCTCGTGAGAGATAGATTGGTTGAGTCTGGTTGGAAAGAT
GAGATGAGAATTGCTTGCAGGGAGCATGTAAAGAAGAAAGGGAGAAAAGATGTTACAGTC
GATGAACTGATACGAGTCATCACTCCCAAAGGCAGAGCTTCAGTACCGGATGCTGTCAAG
GAAGAGTTGTTGAACAGAATCCAAAACTTCATTCGGTCGGCGGCTCTTTAATTGATCCAA
GATCATTTACTACGAAGATGATGGTGGTGGTTTCTACTTGTAAACAACACTAACGAAATG
TATCATCTTTGCTGTTGTAGAATTAGCTTTTCCTGTTTCAACCCTTTTATGTACCAA
TG

QA 3 539 3 539
DS 



AS 1 2

CO CL7318Contig1 731 2 3 U
GGGGCAGCTCCGGCGGCTTCCATAGCGTCGGAGCTGTGCTTCCATGTTTGTAAATCTTCT
CGGTGTGTTTTTTTTTAAGATCCATTTAGTATCTATTTTTTTCTCTGTCTCTTCTGTAGA
AATCTTCTTGTGTCAAGTGTGTGGGTTTTTAGATGTTTGTGGGTTTGAGGAGAGTCTGCG
GTGGCTCGCTGGATTGATTTAACTAGATTTGTAATTTTTTCTGGTGTACGGTGCTGGTTG
ATGCCGTCTCTGATGTGGGTTGCTAATTCTTCCATCAGATTTAGTTAAATCTCTGTTTTC
TGAGTCATTTGTGGTCGGCGTTTAGGTCTTTGTGCTCATATCTTTTTTGGTGTCTGGCTA
TCGAAGAATCTCCACTTTTGTCTCTCCATGGTTGGGGCTGTTGGCTCTGGGAAGAGGTGG
TTCACATAACACCATATTTGCCGGCTTTCGTCTCCGGGAAGAGGTGATTCCTTTACACCA
TCTTCACCGGCGTTTATCTGGTTTTATTAAGCTACCGGCTTCTGTTGGCGGAGTTCTGGC
GTGCATGATTTCAGACTCCGGAGGAAGTACTTGCCGTTCGATGGTCTTGTGGTGGATGAT
GTTGGGCTTTGTTAACCCTTAAACCTAGTTAAGACTAATGTATTTGATGTTTTGGGCTTT
GTTAAGCCTTTGCGTTTGCTGTAAGTGTTGGGTTTTGTTGGATTTGAACTTTTAATAAAA
TACCAGATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A429TF U 1
AF RR2A429JQ C 34
BS 1 615 RR2A429TF
BS 616 616 RR2A429JQ
BS 617 731 RR2A429TF

RD RR2A429TF 731 0 0
GGGGCAGCTCCGGCGGCTTCCATAGCGTCGGAGCTGTGCTTCCATGTTTGTAAATCTTCT
CGGTGTGTTTTTTTTTAAGATCCATTTAGTATCTATTTTTTTCTCTGTCTCTTCTGTAGA
AATCTTCTTGTGTCAAGTGTGTGGGTTTTTAGATGTTTGTGGGTTTGAGGAGAGTCTGCG
GTGGCTCGCTGGATTGATTTAACTAGATTTGTAATTTTTTCTGGTGTACGGTGCTGGTTG
ATGCCGTCTCTGATGTGGGTTGCTAATTCTTCCATCAGATTTAGTTAAATCTCTGTTTTC
TGAGTCATTTGTGGTCGGCGTTTAGGTCTTTGTGCTCATATCTTTTTTGGTGTCTGGCTA
TCGAAGAATCTCCACTTTTGTCTCTCCATGGTTGGGGCTGTTGGCTCTGGGAAGAGGTGG
TTCACATAACACCATATTTGCCGGCTTTCGTCTCCGGGAAGAGGTGATTCCTTTACACCA
TCTTCACCGGCGTTTATCTGGTTTTATTAAGCTACCGGCTTCTGTTGGCGGAGTTCTGGC
GTGCATGATTTCAGACTCCGGAGGAAGTACTTGCCGTTCGATGGTCTTGTGGTGGATGAT
GTTGGGCTTTGTTAAGCCTTAAACCTAGTTAAGACTAATGTATTTGATGTTTTGGGCTTT
GTTAAGCCTTTGCGTTTGCTGTAAGTGTTGGGTTTTGTTGGATTTGAACTTTTAATAAAA
TACCAGATGAC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2A429JQ 698 0 0
CTGTGCTTCCATGTTTGTAAATCTTCTCGGTGTGTTTTTTTTTAAGATCCATTTAGTATC
TATTTTTTTCTCTGTCTCTTCTGTAGAAATCTTCTTGTGTCAAGTGTGTGGGTTTTTAGA
TGTTTGTGGGTTTGAGGAGAGTCTGCGGTGGCTCGCTGGATTGATTTAACTAGATTTGTA
ATTTTTTCTGGTGTACGGTGCTGGTTGATGCCGTCTCTGATGTGGGTTGCTAATTCTTCC
ATCAGATTTAGTTAAATCTCTGTTTTCTGAGTCATTTGTGGTCGGCGTTTAGGTCTTTGT
GCTCATATCTTTTTTGGTGTCTGGCTATCGAAGAATCTCCACTTTTGTCTCTCCATGGTT
GGGGCTGTTGGCTCTGGGAAGAGGTGGTTCACATAACACCATATTTGCCGGCTTTCGTCT
CCGGGAAGAGGTGATTCCTTTACACCATCTTCACCGGCGTTTATCTGGTTTTATTAAGCT
CCCGGCTTCTGTTGGCGGAGTTCTGGCGTGCATGATTTCAGACTCCGGAGGAAGTACTTG
CCGTTCGATGGTCTTGTGGTGGATGATGTTGGGCTTTGTTAACCCTTAAACCTAGTTAAG
ACTAATGTATTTGATGTTTTGGGCTTTGTTAAGCCTTTGCGTTTGCTGTAAGTGTTGGGT
TTTGTTGGATTTGAACTTTTAATAAAATACCAGATGAC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL7319Contig1 901 2 2 U
AGGGTATCATTAATGGAGGTCTCATCAACGTCATCCCCGTGTTCAAAACCTGAACAAATC
ATGCCAAACTCCCCTCCCCTAATCTCATCTCCTAAGTTTCAGCATCAGATGGCAAGAACT
CCTCATCATGCTCAGCATCAACATCTCTCAAATCCTTACCCAACAACATTTGTCCAAGCA
GACACTTCCACTTTCAAACAAGTTGTTCAGATGCTTACGGGCTCCTCTTCCACCGATACC
AACACCGAGAAACACCACGAAGCTCCTTCTCCTTCTCCGGTGAACAACAGCAAAGGAGGT
TTCTCAATCCCACCCATCAAGAAAACCAACAGCTTCAAGCTCTACGAAAGAAGACAAAAC
AATAATAACAACATGTTTGCTAAGAATGATCTAATGATCAATACTTTAAGGCTTCAGAAT
TCTCAGAGGTTGATGTTCTCAAGCGGAAACAATGTTCATCAAAGCCCAAGATTCTCTCCG
AGGAAAACTCATCAGAGAATATTCTTCTGTCTCCAAGCATGCTAGATTTCCCGAAGCTAG
GGTTAAACAGTCCCGTTACGCCACTGAGAAGCAACAATGACCCCTTCAACAAGTCATCTC
CTCTGTCTTTAGGCATCTCATCTGAAGAAGACAAAGCCATTGCCGAAAAAGGATACTATC
TTCATCCTTCTCCAGTTTCAACTCCTAGAGACTTTCAGCCACTGCTTCTTCCTCTTTTTC
CGGTTACTTTTCCGAGGAATCTATAAATCCCGAGGAGTGTTCCCATTCTATATTTGATAT
TAAGTTAAATATATTCTTGGACTTTGCTTTTAACTATAACTAAGATATATAACTTCTTAG
TAATGGAATAACTGTAATGTTTATGCGGTTTATATATTCAATAATTCGTTGCAAAAAAAA
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BN27TF U 1
AF RR2BN27JQ C 398
BS 1 648 RR2BN27TF
BS 649 901 RR2BN27JQ

RD RR2BN27TF 648 0 0
AGGGTATCATTAATGGAGGTCTCATCAACGTCATCCCCGTGTTCAAAACCTGAACAAATC
ATGCCAAACTCCCCTCCCCTAATCTCATCTCCTAAGTTTCAGCATCAGATGGCAAGAACT
CCTCATCATGCTCAGCATCAACATCTCTCAAATCCTTACCCAACAACATTTGTCCAAGCA
GACACTTCCACTTTCAAACAAGTTGTTCAGATGCTTACGGGCTCCTCTTCCACCGATACC
AACACCGAGAAACACCACGAAGCTCCTTCTCCTTCTCCGGTGAACAACAGCAAAGGAGGT
TTCTCAATCCCACCCATCAAGAAAACCAACAGCTTCAAGCTCTACGAAAGAAGACAAAAC
AATAATAACAACATGTTTGCTAAGAATGATCTAATGATCAATACTTTAAGGCTTCAGAAT
TCTCAGAGGTTGATGTTCTCAAGCGGAAACAATGTTCATCAAAGCCCAAGATTCTCTCCG
AGGAAAACTCATCAGAGAATATTCTTCTGTCTCCAAGCATGCTAGATTTCCCGAAGCTAG
GGTTAAACAGTCCCGTTACGCCACTGAGAAGCAACAATGACCCCTTCAACAAGTCATCTC
CTCTGTCTTTAGGCATCTCATCTGAAGAAGACAAAGCCATTGCCGAAA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2BN27JQ 504 0 0
TCAATACTTTAAGGCTTCAGAATTCTCAGAGGTTGATGTTCTCAAGCGGAAACAATGTTC
ATCAAAGCCCAAGATTCTCTCCGAGGAAAACTCATCAGAGAATATTTTTCTGTCTCCAAG
CATGCTAGATTTCCCGAAGCTAGGGTTAAACAGTCCCGTTACGCCACTGAGAAGCAACAA
TGACCCCTTCAACAAGTCATCTCCTCTGTCTTTAGGCATCTCATCTGAAGAAGACAAAGC
CATTGCCGAAAAAGGATACTATCTTCATCCTTCTCCAGTTTCAACTCCTAGAGACTTTCA
GCCACTGCTTCTTCCTCTTTTTCCGGTTACTTTTCCGAGGAATCTATAAATCCCGAGGAG
TGTTCCCATTCTATATTTGATATTAAGTTAAATATATTCTTGGACTTTGCTTTTAACTAT
AACTAAGATATATAACTTCTTAGTAATGGAATAACTGTAATGTTTATGCGGTTTATATAT
TCAATAATTCGTTGCAAAAAAAAA

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL7320Contig1 215 2 1 U
GGGAGGAGGAGAAGCCGGATACGACGGCGAAGACGGTTGCACCGCTGTCATATAGACGGT
CCAGGAGGAAGAACACACCGGTGAAGAGCTGGTAAACTTTAATTACCAAACCATTGGAGC
TTTGATATTGTGTTGTGTGTTATTCATGGATTAACTATCGCTGAGTTATAAATTAATCAA
AACCCCTCATGGGAAGACAAGAACCTTTGATTTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CC95JQ C 1
AF RR2CC95TF U 1
BS 1 215 RR2CC95TF

RD RR2CC95JQ 215 0 0
GGGAGGAGGAGAAGCCGGATACGACGGCGAAGACGGTTGCACCGCTGTCATATAGACGGT
CCAGGAGGAAGAACACACCGGTGAAGAGCTGGTAAACTTTAATTACCAAACCATTGGAGC
TTTGATATTGTGTTGTGTGTTATTCATGGATTAACTATCGCTGAGTTATAAATTAATCAA
AACCCCTCATGGGAAGACAAGAACCTTTGATTTAT

QA 1 215 1 215
DS 

RD RR2CC95TF 215 0 0
GGGAGGAGGAGAAGCCGGATACGACGGCGAAGACGGTTGCACCGCTGTCATATAGACGGT
CCAGGAGGAAGAACACACCGGTGAAGAGCTGGTAAACTTTAATTACCAAACCATTGGAGC
TTTGATATTGTGTTGTGTGTTATTCATGGATTAACTATCGCTGAGTTATAAATTAATCAA
AACCCCTCATGGGAAGACAAGAACCTTTGATTTAT

QA 1 215 1 215
DS 



AS 1 2

CO CL7321Contig1 1066 2 4 U
GGAAAATTCATTTGCCGATTCCTTCCTCAGGTATGCTGTTGACTAGGGTTTTATCGAGAG
TTTCTCGCACCTCGAGCTTACGCTCGTCTCTCTCCTCCTTGGCTTCTTCTCCTCAGAGGA
ATCAGATTGTTCCCATTCTTTCCAGCCAATTTCACTCCCTCGCACGCGGAACTCCCAATA
AGCTTGTTGCAGCTCCAGTGTCGCTTCTAAACCATTCATCTCCAGATCTCAATGTCTTCC
AAAGGTTTGGCTTTTTCTCCTCTTCCTCAGCTGAATCCAAGGAAAATGAGACCACTCAAG
CTTCTGAGGATGATGTGGAGGCTATGAAACCTACAACAGATGATTTTGAGGGTTTGTCAA
GGGACGATTTGGTGAAGCTTGTGGTTGAGAAAGGAAGATCTTGTCAATGTTCAGAAGGAA
GAGGTTAAGGAAATGCAAGATAAAGTTCTTCGAACTTATGCTGAGATGGAGAATCTAATG
GCCAGGACTAAACGTAATGCTGAGAACGACAAAAAGTTCGCCATACAGAAATTTGCAACC
AGCCTCCTGGATGTGGCGGATAATCTTGGGAGAGCTTCTTCGGTTGTAAAGGAGAGTTTT
TCTAAGATTGACACTTCAAAAGATTCTGCTGGTGCTACTCCGCTGTTGAAAACCCTTTTA
GAAGGAGTGGAGATGACTGAGAAACAACTAGCTGAGGTATTTAAGAAATCTGGTTTGGTG
AAAGAAGATCCTGTAAATGAACTGTTTGATCCAAACCGACATAACGCAGTGTTCCAAGTC
CCAGATGCGTCCAAGCCAGCAGGCACAATTGCTCATGTCCTAAAGTCTGGATACTCGTTG
TTTGATCGAGTTATAAGACCAGCTGAGGTTGGTGTTACTTGCGCTGTGGTGAACCAAGAG
AAAGAGTCTGAAGCTTGAAAAACTCCAAAACAACAAAGAGTTGAGCTTTGCTTGAACTTT
TACACCTTCATGCTGTTGTTTTCTTTTATACTTGTTAGCTCTCTCTCACACACTCACATA
TTCATTGGATGAACAAGATCTCATAAAGGTAGCTTAACGTTGCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY33TF U 1
AF RR2FY33JQ C 348
BS 1 391 RR2FY33TF
BS 392 392 RR2FY33JQ
BS 393 582 RR2FY33TF
BS 583 1066 RR2FY33JQ

RD RR2FY33TF 586 0 0
GGAAAATTCATTTGCCGATTCCTTCCTCAGGTATGCTGTTGACTAGGGTTTTATCGAGAG
TTTCTCGCACCTCGAGCTTACGCTCGTCTCTCTCCTCCTTGGCTTCTTCTCCTCAGAGGA
ATCAGATTGTTCCCATTCTTTCCAGCCAATTTCACTCCCTCGCACGCGGAACTCCCAATA
AGCTTGTTGCAGCTCCAGTGTCGCTTCTAAACCATTCATCTCCAGATCTCAATGTCTTCC
AAAGGTTTGGCTTTTTCTCCTCTTCCTCAGCTGAATCCAAGGAAAATGAGACCACTCAAG
CTTCTGAGGATGATGTGGAGGCTATGAAACCTACAACAGATGATTTTGAGGGTTTGTCAA
GGGACGATTTGGTGAAGCTTGTGGTTGAGAA*GGAAGATCTTGTCAATGTTCAGAAGGAA
GAGGTTAAGGAAATGCAAGATAAAGTTCTTCGAACTTATGCTGAGATGGAGAATCTAATG
GCCAGGACTAAACGTAATGCTGAGAACGACAAAAAGTTCGCCATACAGAAATTTGCAACC
AGCCTCCTGGATGTGGCGGATAATCTTGGGAGAGCTTCTTCG
TTGT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2FY33JQ 719 0 0
GAGGGTTTGTCAAGGGACGATTTGGTGAAGCTTGTGGTTGAGAAAGGAAGATCTTGTCAA
TGTTCAGAAGGAAGAGGTTAAGGAAATGCAAGATAAAGTTCTTCGAACTTATGCTGAGAT
GGAGAATCTAATGGCCAGGACTAAACGTAATGCTGAGAACGACAAAAAGTTCGCCATACA
GAAATTTGCAACCAGCCTCCTGGATGTGGCGGATAATCTTGGGAGAGCTTCTTCGGTTGT
AAAGGAGAGTTTTTCTAAGATTGACACTTCAAAAGATTCTGCTGGTGCTACTCCGCTGTT
GAAAACCCTTTTAGAAGGAGTGGAGATGACTGAGAAACAACTAGCTGAGGTATTTAAGAA
ATCTGGTTTGGTGAAAGAAGATCCTGTAAATGAACTGTTTGATCCAAACCGACATAACGC
AGTGTTCCAAGTCCCAGATGCGTCCAAGCCAGCAGGCACAATTGCTCATGTCCTAAAGTC
TGGATACTCGTTGTTTGATCGAGTTATAAGACCAGCTGAGGTTGGTGTTACTTGCGCTGT
GGTGAACCAAGAGAAAGAGTCTGAAGCTTGAAAAACTCCAAAACAACAAAGAGTTGAGCT
TTGCTTGAACTTTTACACCTTCATGCTGTTGTTTTCTTTTATACTTGTTAGCTCTCTCTC
ACACACTCACATATTCATTGGATGAACAAGATCTCATAAAGGTAGCTTAACGTTGCTGC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL7322Contig1 480 2 1 U
GGGGGGGGAGAGAAAAAAAAGCAAAGAAAAACAAGAATGATGAAGAAGCAAGTGATAATA
GTGGCGGCTCTTCTGATTCTGATGGCTTTATCTTCCAACTTGGATATGGTTGCTGAGGCT
CAGTTAGGCCCTGGAGACTGCTACGACGGTTGCTCCACCGCCTGCGTCCAGCGCGACTCG
AGAAAGACGGCACGATGCGATCGCAAGTGCTCCATTCGGTGTGGCCCAGATGCTAAAAAG
GCAAGAGAGACCGGTGCTTAAACTTTTATATCCATTTTAGATTTAGTTATGTTGTTATCT
TCCTTTAATAATTTTATCTCTGCAAAACAAATTATGTATTGTTTATGTTGCTGTAGTAGC
CAGTAACCATAATTACAGCTACAGTGTTCGATTTAACTACTAGTACCATAATGATAATGT
AATAAACTTTGAAATGTAATGAAAACTGGACCAGCCGGTCTATGTACGATTCAGCGATCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AF60TF U 1
AF RR2AF60JQ C 6
BS 1 480 RR2AF60TF

RD RR2AF60TF 480 0 0
GGGGGGGGAGAGAAAAAAAAGCAAAGAAAAACAAGAATGATGAAGAAGCAAGTGATAATA
GTGGCGGCTCTTCTGATTCTGATGGCTTTATCTTCCAACTTGGATATGGTTGCTGAGGCT
CAGTTAGGCCCTGGAGACTGCTACGACGGTTGCTCCACCGCCTGCGTCCAGCGCGACTCG
AGAAAGACGGCACGATGCGATCGCAAGTGCTCCATTCGGTGTGGCCCAGATGCTAAAAAG
GCAAGAGAGACCGGTGCTTAAACTTTTATATCCATTTTAGATTTAGTTATGTTGTTATCT
TCCTTTAATAATTTTATCTCTGCAAAACAAATTATGTATTGTTTATGTTGCTGTAGTAGC
CAGTAACCATAATTACAGCTACAGTGTTCGATTTAACTACTAGTACCATAATGATAATGT
AATAAACTTTGAAATGTAATGAAAACTGGACCAGCCGGTCTATGTACGATTCAGCGATCC

QA 1 480 1 480
DS 

RD RR2AF60JQ 475 0 0
GGGAGAGAAAAAAAAGCAAAGAAAAACAAGAATGATGAAGAAGCAAGTGATAATAGTGGC
GGCTCTTCTGATTCTGATGGCTTTATCTTCCAACTTGGATATGGTTGCTGAGGCTCAGTT
AGGCCCTGGAGACTGTTACGACGGTTGCTCCACCGCCTGCGTCCAGCGCGACTCGAGAAA
GACGGCACGATGCGATCGCAAGTGCTCCATTCGGTGTGGCCCAGATGCTAAAAAGGCAAG
AGAGACCGGTGCTTAAACTTTTATATCCATTTTAGATTTAGTTATGTTGTTATCTTCGTT
TAATAATTTTATCTCTGCAAAACAAATTATGTATTGTTTATGTTGCTGTAGTAGCCAGTA
ACCATAATTACAGCTACAGTGTTCGATTTAACTACTAGTACCATAATGATAATGTAATAA
ACTTTGAAATGTAATGAAAACTGGACCAGCCGGTCTATGTACGATTCAGCGATCC

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 2

CO CL7323Contig1 650 2 2 U
GGTGGTGTGAAGGTGGAGGATATTGCGTGCGGGTCTGATCACTCGTTAGTCCTTTGTTGT
GATGGCACTCTTTTGAGCTCTGGGAGCAATGTGTATGGTCAGTTGGGTCGTAGGTGTAGT
AAGCAAGACCTAGGAATGTCACCTGTTGATATAACCGGGTCTCCGGTTTCAATAGCAGCT
GGTCTTGGTCATTCTCTAGCGATCTGCAATGTTCAATCAGATTCCAACGCGAGGAGGAGG
GTTGTTGTCTCATCATGGGGTTGGAACCGTAGCCAGCAGCTTGGCAGGGGAAAGCCAGAA
GAGGTGCCATGAGAAGTGGAGGGTTTGGATGGGGAAGCTCCAGCTTCGGTATCAGCAGGG
CGTGTGCATTCCTTGTGTGTGACAGAGAAAGGAGAAGCTTGGGTTTGGGGATGCGGAAAG
AGCGGTAGGCTCGGTTTAGGAAGCTCGGTTGATGAACCTGAACCCATGTTGCTGGAAGAC
ATCGAGGGTTGTGTTCTTCAAGCAGTTGCTGGGTTTGATCACAGCCTTATCTTAGTGTCT
GATTGTCTAGATTAATCTTATGAATAAAGGTAAACTTCCACTACTACTGGAGATCTTTGT
TTGTTATCATTTTTGTAAGAGCATAGTAATAAACCAAAAACCTGTTCCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2AE29JQ C 1
AF RR2AE29TF U 1
BS 1 647 RR2AE29TF
BS 648 650 RR2AE29JQ

RD RR2AE29JQ 650 0 0
GGTGGTGTGAAGGTGGAGGATATTGCGTGCGGGTCTGATCACTCGTTAGTCCTTTGTTGT
GATGGCACTCTTTTGAGCTCTGGGAGCAATGTGTATGGTCAGTTGGGTCGTAGGTGTAGT
AAGCAAGACCTAGGAATGTCACCTGTTGATATAACCGGGTCTCCGGTTTCAATAGCAGCT
GGTCTTGGTCATTCTCTAGCGATCTGCAATGTTCAATCAGATTCCAACGCGAGGAGGAGG
GTTGTTGTCTCATCATGGGGTTGGAACCGTAGCCAGCAGCTTGGCAGGGGAAAGCCAGAA
GAGGTGCCATGAGAAGTGGAGGGTTTGGATGGGGAAGCTCCAGCTTCGGTATCAGCAGGG
CGTGTGCATTCCTTGTGTGTGACAGAGAAAGGAGAAGCTTGGGTTTGGGGATGCGGAAAG
AGCGGTAGGCTCGGTTTAGGAAGCTCGGTTGATGAACCTGAACCCATGTTGCTGGAAGAC
ATCGAGGGTTGTGTTCTTCAAGCAGTTGCTGGGTTTGATCACAGCCTTATCTTAGTGTCT
GATTGTCTAGATTAATCTTATGAATAAAGGTAAACTTCCACTACTACTGGAGATCTTTGT
TTGTTATCATTTTTGTAAGAGCATAGTAATAAACCAAAAACCTGTTCCCC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RR2AE29TF 650 0 0
GGTGGTGTGAAGGTGGAGGATATTGCGTGCGGGTCTGATCACTCGTTAGTCCTTTGTTGT
GATGGCACTCTTTTGAGCTCTGGGAGCAATGTGTATGGTCAGTTGGGTCGTAGGTGTAGT
AAGCAAGACCTAGGAATGTCACCTGTTGATATAACCGGGTCTCCGGTTTCAATAGCAGCT
GGTCTTGGTCATTCTCTAGCGATCTGCAATGTTCAATCAGATTCCAACGCGAGGAGGAGG
GTTGTTGTCTCATCATGGGGTTGGAACCGTAGCCAGCAGCTTGGCAGGGGAAAGCCAGAA
GAGGTGCCATGAGAAGTGGAGGGTTTGGATGGGGAAGCTCCAGCTTCGGTATCAGCAGGG
CGTGTGCATTCCTTGTGTGTGACAGAGAAAGGAGAAGCTTGGGTTTGGGGATGCGGAAAG
AGCGGTAGGCTCGGTTTAGGAAGCTCGGTTGATGAACCTGAACCCATGTTGCTGGAAGAC
ATCGAGGGTTGTGTTCTTCAAGCAGTTGCTGGGTTTGATCACAGCCTTATCTTAGTGTCT
GATTGTCTAGATTAATCTTATGAATAAAGGTAAACTTCCACTACTACTGGAGATCTTTGT
TTGTTATCATTTTTGTAAGAGCATAGTAATAAACCAAAAACCTGTTC
ACC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL7324Contig1 528 2 1 U
GGGATCTTCGAAGGCGAGGCGCTTCTGAGGAAGATGAACCGCTACGGGCTTCTCGACGAG
AGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCGCTGACCGTGGAGAACTTTCTCGAGCGTCGT
CTCCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTC
ATCAGACACAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAACATTCCATCGTTCATGGTT
AGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCTCTAACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGT
CCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAAAGCCTCAGGTGGCGAT
GCTGACGGTGATGATGAAGAGTAAATCTATCTCTCACCGGTGTTTTAGCTATGCGATTTT
AGCTATTTTGTACTTCGTTTATTGAGGATTGTTTAATGCCTTCTTTAAGAGTTTGCGAAC
GTTTTGCTTATTTACTACATTTGCCTAAATCCAAACTTTTTTCAGCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B368JQ C 1
AF RR2B368TF U 1
BS 1 528 RR2B368TF

RD RR2B368JQ 528 0 0
GGGATCTTCGAAGGCGAGGCGCTTCTGAGGAAGATGAACCGCTACGGGCTTCTCGACGAG
AGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCGCTGACCGTGGAGAACTTTCTCGAGCGTCGT
CTCCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTC
ATCAGACACAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAACATTCCATCGTTCATGGTT
AGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCTCTAACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGT
CCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAAAGCCTCAGGTGGCGAT
GCTGACGGTGATGATGAAGAGTAAATCTATCTCTCACCGGTGTTTTAGCTATGCGATTTT
AGCTATTTTGTACTTCGTTTATTGAGGATTGTTTAATGCCTTCTTTAAGAGTTTGCGAAC
GTTTTGCTTATTTACTACATTTGCCTAAATCCAAACTTTTTTCAGCCC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2B368TF 528 0 0
GGGATCTTCGAAGGCGAGGCGCTTCTGAGGAAGATGAACCGCTACGGGCTTCTCGACGAG
AGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCGCTGACCGTGGAGAACTTTCTCGAGCGTCGT
CTCCAGACTATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTC
ATCAGACACAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAACATTCCATCGTTCATGGTT
AGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCTCTAACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGT
CCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAAAGCCTCAGGTGGCGAT
GCTGACGGTGATGATGAAGAGTAAATCTATCTCTCACCGGTGTTTTAGCTATGCGATTTT
AGCTATTTTGTACTTCGTTTATTGAGGATTGTTTAATGCCTTCTTTAAGAGTTTGCGAAC
GTTTTGCTTATTTACTACATTTGCCTAAATCCAAACTTTTTTCAGCCC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL7325Contig1 839 2 4 U
GGGAACTCATCCTCTCTCTCTCGCTCACTCCACAACGAAACAAGAAGGCTTTGTTATCAT
GGCTGCTTCCTCAATTCCGCCGTCAACCGCCGCAACCTCCGTCGTTCGCAAATCGCTCTT
CCTCTCCACCACTTTCTCCTCCTTCCCCGCTTCTTCCTTGCCTCCCGCCGTCAAATCACC
GCAAAAACACATTAACAGAAGACTTCTCCTAGCTTCCTCCTCCTCCGCCGCCGTTCCTTC
CGATTCCAAACCGGCGGCGAAGAAAGAAACTGTCTATTTCGACGGCGGAGCTCACTACGG
GGATCTACTGGCCAACCTCGTGTTAGGCCTAACCATCCTGTGGCTCCCGCTGACGCTGGC
CGCCGTGTCTCGAGCGTTTAACCTCCGTTACAGGTTCACCGACCTCCGCGTGACGGTGAT
ATCGGGGCTCACCGGAGAAGAACGGAGCGATTTCTCGTACAAGGTGATCAAGGACGTCCA
GGTTGTGCCGAGGTTCATCGGAGAGTGGGGTGACATCATCATCACGTTGAGAGACGGGAC
GAAGGTGGATCTGAGAAGCGTTCCCAAGTTCAGAGAGATTGCTAAGTACTGCTTGTCCAT
GGCTGATCAACCTGCCGTTGTCAAAGAATCTGGTGCCAAAGGCTTCTGAAATCTTGTTTC
TCTATTTTCTTGCTAAATTAAAAAAAAAATTAAATCTTGTCTTGTTATTTTTTTTTCAGT
AGAGTTTGTATCGTTCCATGTCGATATTTGTTACTGATTTCATCTTCTTTGTATGTTCTA
TCTTATCCATGAGAGAGTCGACGGTGAGACAGCATGTATACTAATGCTATAGTTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CX47TF U 1
AF RR2CX47JQ C 146
BS 1 641 RR2CX47TF
BS 642 642 RR2CX47JQ
BS 643 680 RR2CX47TF
BS 681 839 RR2CX47JQ

RD RR2CX47TF 680 0 0
GGGAACTCATCCTCTCTCTCTCGCTCACTCCACAACGAAACAAGAAGGCTTTGTTATCAT
GGCTGCTTCCTCAATTCCGCCGTCAACCGCCGCAACCTCCGTCGTTCGCAAATCGCTCTT
CCTCTCCACCACTTTCTCCTCCTTCCCCGCTTCTTCCTTGCCTCCCGCCGTCAAATCACC
GCAAAAACACATTAACAGAAGACTTCTCCTAGCTTCCTCCTCCTCCGCCGCCGTTCCTTC
CGATTCCAAACCGGCGGCGAAGAAAGAAACTGTCTATTTCGACGGCGGAGCTCACTACGG
GGATCTACTGGCCAACCTCGTGTTAGGCCTAACCATCCTGTGGCTCCCGCTGACGCTGGC
CGCCGTGTCTCGAGCGTTTAACCTCCGTTACAGGTTCACCGACCTCCGCGTGACGGTGAT
ATCGGGGCTCACCGGAGAAGAACGGAGCGATTTCTCGTACAAGGTGATCAAGGACGTCCA
GGTTGTGCCGAGGTTCATCGGAGAGTGGGGTGACATCATCATCACGTTGAGAGACGGGAC
GAAGGTGGATCTGAGAAGCGTTCCCAAGTTCAGAGAGATTGCTAAGTACTGCTTGTCCAT
GGCTGATCAACCTGCCGTTGTCAAAGAATCTGGTGCCAAAG*CTTCTGAAATCTTGTTTC
TCTATTTTCTTGCTAAATTA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2CX47JQ 694 0 0
CCCGCTTCTTCCTTGCCTCCCGCCGTCAAATCACCGCAAAAACACATTAACAGAAGACTT
CTCCTAGCTTCCTCCTCCTCCGCCGCCGTTCCTTCCGATTCCAAACCGGCGGCGAAGAAA
GAAACTGTCTATTTCGACGGCGGAGCTCACTACGGGGATCTACTGGCCAACCTCGTGTTA
GGCCTAACCATCCTGTGGCTCCCGCTGACGCTGGCCGCCGTGTCTCGAGCGTTTAACCTC
CGTTACAGGTTCACCGACCTCCGCGTGACGGTGATATCGGGGCTCACCGGAGAAGAACGG
AGCGATTTTTCGTACAAGGTGATCAAGGACGTCCAGGTTGTGCCGAGGTTCATCGGAGAG
TGGGGTGACATCATCATCACGTTGAGAGACGGGACGAAGGTGGATCTGAGAAGCGTTCCC
AAGTTCAGAGAGATTGCTAAGTACTGCTTGTCCATGGCTGATCAACCTGCCGTTGTCAAA
GAATCTGGTGCCAAAGGCTTCTGAAATCTTGTTTCTCTATTTTCTTGCTAAATTAAAAAA
AAAATTAAATCTTGTCTTGTTATTTTTTTTTCAGTAGAGTTTGTATCGTTCCATGTCGAT
ATTTGTTACTGATTTCATCTTCTTTGTATGTTCTATCTTATCCATGAGAGAGTCGACGGT
GAGACAGCATGTATACTAATGCTATAGTTTCTTT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL7326Contig1 1113 2 4 U
GTCATCGATTGGCTCTGCAAGTTGTTGGAATCACCATACAAAGACTCAGTCGAATGGTCA
AAGTGGCACGTCTTTTGGGTGGACGAGAGGGTTTGTTCACATGAAGATCGAGACAGCAAC
TACAAACTCGCCATGGATGGTTTTATCTCCAAGGTTGGGATTCCGAAAGAGAACATCTAC
ACAATCGACAAACAATGTGCCGCTGATGGTGACGCGGAGCGTTGTGCGACGCTCTACGAG
GAGTGCTTGAGGAACCTGGTGAAGGAAAAGATACTCCCACTAAGTCCAAATGGCCAATAT
CCTCAGTTCGATCTCCGGCTTCAAGGGATGGGTCCTGATGGCCACATGGCGTCTCTCTTC
CCGAAATGTCCTCAGATCAATGAGACGGACAAATGGGTCACTCACATTACCGACTCCCCA
AAACCGCCACCAAGGAGAATCACAATGACTTTACCGGTCATCAATTCGTCTTTGTACAAT
CTTATGGCCGTTTGCGACGACAACACAGACCAATGTGCACGTTCCATCGCTGGAATCTTT
AAGAACAACAATCTTGACTTACCTGCTGCTCATCTTACTGCCCAAGTCGAAACTATGTGG
TACCTTGACAAAGCAGCTGCTTCATTGCTTTAGAGAGCCAAACACATTAATAAACGCATG
GTGTTCTTGATATGAGTAATAAATCTCTCCAAGTCATGCTTTTGTGGAGCGTGTTGTTGG
AGTTTGCTTGCATGTATGTTGAATAACAACCACGAGTCAGTGATCGGGTGGTACATGTCG
TTTCAGGATTCCTAAGAGACCTGAGTTCGAATCCGTTGCCACTCAGATTACCCTGACTTG
TGGTCACGCGGATATAGGTCATGCTTTTGGCCCATTTGAAAATCCGGAGAAAATGTCTAT
CCGTGGGCTGCACCTCTCCTTGGAAATTAGTCTGGATTTCGGCCTGCGATACCCCTAGAT
TAAAAAAAAAATGTCTGTTAAATAACCGGCTAATAATGCATTTTGCGTACTTACGTATAG
TATATATACCAAATGATTTGAAACGCCGATTCATTTATTTTTTATGTCTAATTAATGTAA
CTTGTGTTTGAGTGACTATGACACTGTTATAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B526TF U 1
AF RR2B526JQ C 339
BS 1 786 RR2B526TF
BS 787 787 RR2B526JQ
BS 788 869 RR2B526TF
BS 870 1113 RR2B526JQ

RD RR2B526TF 869 0 0
GTCATCGATTGGCTCTGCAAGTTGTTGGAATCACCATACAAAGACTCAGTCGAATGGTCA
AAGTGGCACGTCTTTTGGGTGGACGAGAGGGTTTGTTCACATGAAGATCGAGACAGCAAC
TACAAACTCGCCATGGATGGTTTTATCTCCAAGGTTGGGATTCCGAAAGAGAACATCTAC
ACAATCGACAAACAATGTGCCGCTGATGGTGACGCGGAGCGTTGTGCGACGCTCTACGAG
GAGTGCTTGAGGAACCTGGTGAAGGAAAAGATACTCCCACTAAGTCCAAATGGCCAATAT
CCTCAGTTCGATCTCCGGCTTCAAGGGATGGGTCCTGATGGCCACATGGCGTCTCTCTTC
CCGAAATGTCCTCAGATCAATGAGACGGACAAATGGGTCACTCACATTACCGACTCCCCA
AAACCGCCACCAAGGAGAATCACAATGACTTTACCGGTCATCAATTCGTCTTTGTACAAT
CTTATGGCCGTTTGCGACGACAACACAGACCAATGTGCACGTTCCATCGCTGGAATCTTT
AAGAACAACAATCTTGACTTACCTGCTGCTCATCTTACTGCCCAAGTCGAAACTATGTGG
TACCTTGACAAAGCAGCTGCTTCATTGCTTTAGAGAGCCAAACACATTAATAAACGCATG
GTGTTCTTGATATGAGTAATAAATCTCTCCAAGTCATGCTTTTGTGGAGCGTGTTGTTGG
AGTTTGCTTGCATGTATGTTGAATAACAACCACGAGTCAGTGATCGGGTGGTACATGTCG
TTTCAG*ATTCCTAAGAGACCTGAGTTCGAATCCGTTGCCACTCAGATTACCCTGACTTG
TGGTCACGCGGATATAGGTCATGCTTTTG

QA 1 869 1 869
DS 

RD RR2B526JQ 775 0 0
TGGCCACATGGCGTCTCTCTTCCCGAAATGTCCTCAGATCAATGAGACGGACAAATGGGT
CACTCACATTACCGACTCCCCAAAACCGCCACCAAGGAGAATCACAATGACTTTACCGGT
CATCAATTCGTCTTTGTACAATCTTATGGCCGTTTGCGACGACAACACAGACCAATGTGC
ACGTTCCATCGCTGGAATCTTTAAGAACAACAATCTTGACTTACCTGCTGCTCATCTTAC
TGCCCAAGTCGAAACTATGTGGTACCTTGACAAAGCAGCTGCTTCATTGCTTTAGAGAGC
CAAACACATTAATAAACGCATGGTGTTCTTGATATGAGTAATAAATCTCTCCAAGTCATG
CTTTTGTGGAGCGTGTTGTTGGAGTTTGCTTGCATGTATGTTGAATAACAACCACGAGTC
AGTGATCGGGTGGTACATGTCGTTTCAGGATTCCTAAGAGACCTGAGTTCGAATCCGTTG
CCACTCAGATTACCCTGACTTGTGGTCACGCGGATATAGGTCATGCTTTTGGCCCATTTG
AAAATCCGGAGAAAATGTCTATCCGTGGGCTGCACCTCTCCTTGGAAATTAGTCTGGATT
TCGGCCTGCGATACCCCTAGATTAAAAAAAAAATGTCTGTTAAATAACCGGCTAATAATG
CATTTTGCGTACTTACGTATAGTATATATACCAAATGATTTGAAACGCCGATTCATTTAT
TTTTTATGTCTAATTAATGTAACTTGTGTTTGAGTGACTATGACACTGTTATAAC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL7327Contig1 1046 2 2 U
GGAGACAAACCAAAAAAAAATCAAAATCCCATCGCCCAAGCTTGTCTCTCTCGCTGCTCT
TCACAAGAAACCCTAAGTAACAAGTATGGGTCGTGAATCTGTGGTTGCTGTTGTTTCTTC
TACTCCGGCGACTGCGCCGAGTACTGTCGTGGCGGCGACGGCGCTTGCTCCTGGCTTCAG
ATTTCACCCGACAGACGAGAAACAGCCAGTCAGCGAGCAAGGACATCATTAACATCAACG
AGGCACCAAGAGAGACTACTACTCCAATGGATATCGAAGTCAACCATAAGGATAACAACA
ATAACCATTGTGATGAAGATGAGGATGAGGAAGCACTCAAACGTGAGGAGGCAGATGAAG
AAGATGGGCATCCTCCTCCTCCTCCTTTATGCATTCTCAACAAAGAAGCTCCGTTGCCTC
TCCTCCAATACAAACGCAGACGCCAAAACGAATCAACCAGGACCACCACCACACAGGACC
ACTGCTCGTCCACAATAACAACCGTCGACAACACACCAACAACTACTGCTGCAGCTGCTG
CCACCAACACTGCCATTTCTGCGTTGCTCGAGTTCTCACTCATGGGCCTCTCCGACAAAA
AAGACAGCCACCCGCAGCCTCTTACTCCACTTCCATCTCCTGAAGAGAAGATGAACGATC
TCCAGAAAGAGATTCACCAGATGTCTGTTGAGAGAGAGACTTTCAAGCTTGAGATGATGA
GTGCTGATGCTATGATCAGTATTCTCCAGTCCAGGATCGATGCTCTGCGTCAGGAGAACG
ATGAGCTGAAGAAGAACAGCGCTAATGGACACTAAATGCTCTAAACCCCCATCTCTCCAG
GCTTCTTCTTCTTCTCTGCTTTAGTAGCTGTGATCTCCCTAAAGTACTGTGACCTATCTA
TTAGCTTCTTCAGACGGATTGAGAACCGTGTAAAATTAGGATAAACCGGACCGGTTTGGG
TGTTTTTTTTTTCTGGTTTCTACATCTTTTGAGAACATTCTCAGGTTACTCCATTGTGAT
ATATTATCATCCAAGTCTATTCAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV94TF U 1
AF RR2AV94JQ C 158
BS 1 687 RR2AV94TF
BS 688 1046 RR2AV94JQ

RD RR2AV94TF 687 0 0
GGAGACAAACCAAAAAAAAATCAAAATCCCATCGCCCAAGCTTGTCTCTCTCGCTGCTCT
TCACAAGAAACCCTAAGTAACAAGTATGGGTCGTGAATCTGTGGTTGCTGTTGTTTCTTC
TACTCCGGCGACTGCGCCGAGTACTGTCGTGGCGGCGACGGCGCTTGCTCCTGGCTTCAG
ATTTCACCCGACAGACGAGAAACAGCCAGTCAGCGAGCAAGGACATCATTAACATCAACG
AGGCACCAAGAGAGACTACTACTCCAATGGATATCGAAGTCAACCATAAGGATAACAACA
ATAACCATTGTGATGAAGATGAGGATGAGGAAGCACTCAAACGTGAGGAGGCAGATGAAG
AAGATGGGCATCCTCCTCCTCCTCCTTTATGCATTCTCAACAAAGAAGCTCCGTTGCCTC
TCCTCCAATACAAACGCAGACGCCAAAACGAATCAACCAGGACCACCACCACACAGGACC
ACTGCTCGTCCACAATAACAACCGTCGACAACACACCAACAACTACTGCTGCAGCTGCTG
CCACCAACACTGCCATTTCTGCGTTGCTCGAGTTCTCACTCATGGGCCTCTCCGACAAAA
AAGACAGCCACCCGCAGCCTCTTACTCCACTTCCATCTCCTGAAGAGAAGATGAACGATC
TCCAGAAAGAGATTCACCAGATGTCTG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2AV94JQ 889 0 0
ACGGCGCTTGCTCCTGGCTTCAGATTTCACCCGACAGACGAGAAACAGCCAGTCAGCGAG
CAAGGACATCATTAACATCAACGAGGCACCAAGAGAGACTACTACTCCAATGGATATCGA
AGTCAACCATAAGGATAACAACAATAACCATTGTGATGAAGATGAGGATGAGGAAGCACT
CAAACGTGAGGAGGCAGATGAAGAAGATGGGCATCCTCCTCCTCCTCCTTTATGCATTCT
CAACAAAGAAGCTCCGTTGCCTCTCCTCCAATACAAACGCAGACGCCAAAACGAATCAAC
CAGGACCACCACCACACAGGACCACTGCTCGTCCACAATAACAACCGTCGACAACACACC
AACAACTACTGCTGCAGCTGCTGCCACCAACACTGCCATTTCTGCGTTGCTCGAGTTCTC
ACTCATGGGCCTCTCCGACAAAAAAGACAGCCACCCGCAGCCTCTTACTCCACTTCCATC
TCCTGAAGAGAAGATGAACGATCTCCAGAAGGAGATTCACCAGATGTCTGTTGAGAGAGA
GACTTTCAAGCTTGAGATGATGAGTGCTGATGCTATGATCAGTATTCTCCAGTCCAGGAT
CGATGCTCTGCGTCAGGAGAACGATGAGCTGAAGAAGAACAGCGCTAATGGACACTAAAT
GCTCTAAACCCCCATCTCTCCAGGCTTCTTCTTCTTCTCTGCTTTAGTAGCTGTGATCTC
CCTAAAGTACTGTGACCTATCTATTAGCTTCTTCAGACGGATTGAGAACCGTGTAAAATT
AGGATAAACCGGACCGGTTTGGGTGTTTTTTTTTTCTGGTTTCTACATCTTTTGAGAACA
TTCTCAGGTTACTCCATTGTGATATATTATCATCCAAGTCTATTCAGCT

QA 1 889 1 889
DS 



AS 1 2

CO CL7328Contig1 661 2 2 U
GGGCCTCTTAGCTCGTGTTTGTAGTTCAGCATAAACCCTAGCTTTGTTCGACTCGAGTCA
AAAATAGCAATGGATCAACAGCCCGAACCAGTTACTTACGTCTGCGGCGATTGTGGGCAG
GAGAACACTTTGAAGTCTGGGGATGTGATCCAATGCAGAGAGTGTGGCTACCGTATTCTC
TACAAGAAGCGTACCCGTAGAGGTGAACGTTGTTAATATAAAATACTAATCCTTACTCCT
CCTCTGGTTTTAGGTTTCCTTGACGACTCTCTTTTTGGTCTTGTTCTTATTGAGTCTTAT
CACACTGATATGACATGATTTTTGATTAGGTTCGTGTAAATAAGTTTGTGTATAGTCTAC
TACTTTTTGTTTGTTTGTTTGCAGTGCTAATCTATCAACTTTCTGACTACTTATGTCGTT
GTTGATTCTCTTGCAGTTGTTCAATACGAAGCTCGCTGAGAACACAATCCCAAAAGATGA
TTGCAAGTCTGTTAAGATGACTCTTTCCTGCCTATGTTTGTAATATAACCTCGACTAGAA
AATCTGTCGTTGTTTTTGCTAAGTGGCTTGGTTTGGTGTGATTTGATTACAATTGAGCGT
GCCTTTGTAATAATCTCTTTGCCTTTTTGGTAAAAAAGAAATGTTATGCTGACGGATTCA
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2E791TF U 1
AF RR2E791JQ C 106
BS 1 631 RR2E791TF
BS 632 661 RR2E791JQ

RD RR2E791TF 631 0 0
GGGCCTCTTAGCTCGTGTTTGTAGTTCAGCATAAACCCTAGCTTTGTTCGACTCGAGTCA
AAAATAGCAATGGATCAACAGCCCGAACCAGTTACTTACGTCTGCGGCGATTGTGGGCAG
GAGAACACTTTGAAGTCTGGGGATGTGATCCAATGCAGAGAGTGTGGCTACCGTATTCTC
TACAAGAAGCGTACCCGTAGAGGTGAACGTTGTTAATATAAAATACTAATCCTTACTCCT
CCTCTGGTTTTAGGTTTCCTTGACGACTCTCTTTTTGGTCTTGTTCTTATTGAGTCTTAT
CACACTGATATGACATGATTTTTGATTAGGTTCGTGTAAATAAGTTTGTGTATAGTCTAC
TACTTTTTGTTTGTTTGTTTGCAGTGCTAATCTATCAACTTTCTGACTACTTATGTCGTT
GTTGATTCTCTTGCAGTTGTTCAATACGAAGCTCGCTGAGAACACAATCCCAAAAGATGA
TTGCAAGTCTGTTAAGATGACTCTTTCCTGCCTATGTTTGTAATATAACCTCGACTAGAA
AATCTGTCGTTGTTTTTGCTAAGTGGCTTGGTTTGGTGTGATTTGATTACAATTGAGCGT
GCCTTTGTAATAATCTCTTTGCCTTTTTGGT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2E791JQ 556 0 0
GGCGATTGTGGGCAGGAGAACACTTTGAAGTCTGGGGATGTGATCCAATGCAGAGAGTGT
GGCTACCGTATTCTCTACAAGAAGCGTACCCGTAGAGGTGAACGTTGTTAATATAAAATA
CTAATCCTTACTCCTCCTCTGGTTTTAGGTTTCCTTGACGACTCTCTTTTTGGTCTTGTT
CTTATTGAGTCTTATCACACTGATATGACATGATTTTTGATTAGGTTCGTGTAAATAAGT
TTGTGTATAGTCTACTACTTTTTGTTTGTTTGTTTGCAGTGCTAATCTATCAACTTTCTG
ACTACTTATGTCGTTGTTGATTCTCTTGCAGTTGTTCAATACGAAGCTCGCTGAGAACAC
AATCCCAAAAGATGATTGCAAGTCTGTTAAGATGACTCTTTCCTGCCTATGTTTGTAATA
TAACCTCGACTAGAAAATCTGTCGTTGTTTTTGCTAAGTGGCTTGGTTTGGTGTGATTTG
ATTACAATTGAGCGTGCCTTTGTAATAATCTCTTTGCCTTTTTGGTAAAAAAGAAATGTT
ATGCTGACGGATTCAC

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 2

CO CL7329Contig1 528 2 1 U
GGAACGGAGGTTTTGTGTTCAAGTATGGAGCAAATTCTCTCTAGATATGGGTACAGTGCT
GCTGATCATAGACAAAGAGAACAACAGCAACTTCTACTCTGTTCTTCTCAAGAAAATGGT
GTTGTGTTGCGGAAAGATGGATCTATGACGAGTGAACTTAAGAGATTACAGCTTGCATTC
GAAAGACTGAAGGGTAAGGAGCTTGAGGGTATGAGTTTCTCGGATCTTATTTCTCTTGAA
AACCCTCAGATAGAGTCGATGGTGGGGAGAGGTTCATCAGGATCACAAGTAGAGCCCGAG
AGCTCTTCATCAGACGAAGATGACGAGAATGACAACCATTCCGATACTTCCTTGCAGCTG
GGCTGGGGAAAGAGAAAGAAGCTGAAGATCGAACCGCCCTGTGATAACTCTGGAAGTCAA
GCGTCTTTTGATTGATCTATATCAATCACTCTCTTTAGTTTTGGTGTTTGGTATTAGAGA
GGTTTTATTGTGCATTCTTCTTTGTTTAGTACAGAGTTTGCTTTACGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EA59JQ C 1
AF RR2EA59TF U 1
BS 1 528 RR2EA59TF

RD RR2EA59JQ 528 0 0
GGAACGGAGGTTTTGTGTTCAAGTATGGAGCAAATTCTCTCTAGATATGGGTACAGTGCT
GCTGATCATAGACAAAGAGAACAACAGCAACTTCTACTCTGTTCTTCTCAAGAAAATGGT
GTTGTGTTGCGGAAAGATGGATCTATGACGAGTGAACTTAAGAGATTACAGCTTGCATTC
GAAAGACTGAAGGGTAAGGAGCTTGAGGGTATGAGTTTCTCGGATCTTATTTCTCTTGAA
AACCCTCAGATAGAGTCGATGGTGGGGAGAGGTTCATCAGGATCACAAGTAGAGCCCGAG
AGCTCTTCATCAGACGAAGATGACGAGAATGACAACCATTCCGATACTTCCTTGCAGCTG
GGCTGGGGAAAGAGAAAGAAGCTGAAGATCGAACCGCCCTGTGATAACTCTGGAAGTCAA
GCGTCTTTTGATTGATCTATATCAATCACTCTCTTTAGTTTTGGTGTTTGGTATTAGAGA
GGTTTTATTGTGCATTCTTCTTTGTTTAGTACAGAGTTTGCTTTACGT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2EA59TF 528 0 0
GGAACGGAGGTTTTGTGTTCAAGTATGGAGCAAATTCTCTCTAGATATGGGTACAGTGCT
GCTGATCATAGACAAAGAGAACAACAGCAACTTCTACTCTGTTCTTCTCAAGAAAATGGT
GTTGTGTTGCGGAAAGATGGATCTATGACGAGTGAACTTAAGAGATTACAGCTTGCATTC
GAAAGACTGAAGGGTAAGGAGCTTGAGGGTATGAGTTTCTCGGATCTTATTTCTCTTGAA
AACCCTCAGATAGAGTCGATGGTGGGGAGAGGTTCATCAGGATCACAAGTAGAGCCCGAG
AGCTCTTCATCAGACGAAGATGACGAGAATGACAACCATTCCGATACTTCCTTGCAGCTG
GGCTGGGGAAAGAGAAAGAAGCTGAAGATCGAACCGCCCTGTGATAACTCTGGAAGTCAA
GCGTCTTTTGATTGATCTATATCAATCACTCTCTTTAGTTTTGGTGTTTGGTATTAGAGA
GGTTTTATTGTGCATTCTTCTTTGTTTAGTACAGAGTTTGCTTTACGT

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL7330Contig1 698 2 3 U
AGAATTTTAAAACAATCTCACAGATAAAAGAATCTAGACAAAAGTCTATATAGGTAAAAA
AAAACTCAGAGCAAAACGATTGCTAATCCAACAAATCCCATTAAAACCCCAACTCGACTG
GTCAAATAAGAAGCAGAACCAGTCGCAGGAGGAACAGCTTGAGCTTCCAAATGAGCAGGA
GAAGGTGCCGGAGAAGGAGCAGAGCCACTGAAGAAACTACCACCACGAGATGACATGACG
ACAATGTGGAGCTTCTCGCCTTGGACACAGTTGCTTTTAGAGCCGCTGATGAAGAAGAAA
GGTCCAGATCTCTCTAGCTTCACCTTAGTGTTTCCACTGCTGTAACTAGCTACTGGATTT
GTGGTGTTGCAGTTAATGTACGCCTCTTTCGTCACTTGCAGAACCGAGTCCTTTTCACCA
TCGTACCTCCATACGAGAGAGTCTCCAACATGAAACCGCAAACTCTCAGCCCATTTGTTG
AGTGAATCAGAGGGTGAAGAAGGGATTTTCCAAGCACTGGGTTTGCCTCCAACCAGAATC
TCCTTGCAACAGGCAAGATGTGCAGCAGACAACAACAAGAGGAAGGAGAATAATGGACAG
CAAGATTCAACAAGAGTTCTCTGAGCCATTAGAGTTAAGTTGTGTATGAGACAAGGACAG
AAGAAGATGAGACTGATGTGGTTTTATTTGGAGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV89JQ U 143
AF RR2AV89TF C 1
BS 1 142 RR2AV89TF
BS 143 333 RR2AV89JQ
BS 334 698 RR2AV89TF

RD RR2AV89JQ 191 0 0
TCGCAGGAGGAACAGCTTGAGCTTCCAAATGAGCAGGAGAAGGTGCCGGAGAAGGAGCAG
AGCCACTGAAGAAACTACCACCACGAGATGACATGACGACAATGTGGAGCTTCTCGCCTT
GGACACAGTTGCTTTTAGAGCCGCTGATGAAGAAGAAAGGTCCAGATCTCTCTAGCTTCA
CCTTAGTGTTT

QA 1 191 1 191
DS 

RD RR2AV89TF 698 0 0
AGAATTTTAAAACAATCTCACAGATAAAAGAATCTAGACAAAAGTCTATATAGGTAAAAA
AAAACTCAGAGCAAAACGATTGCTAATCCAACAAATCCCATTAAAACCCCAACTCGACTG
GTCAAATAAGAAGCAGAACCAGTCGCAGGAGGAACAGCTTGAGCTTCCAAATGAGCAGGA
GAAGGTGCCGGAGAAGGAGCAGAGCCACTGAAGAAACTACCACCACGAGATGACATGACG
ACAATGTGGAGCTTCTCGCCTTGGACACAGTTGCTTTTAGAGCCGCTGATGAAGAAGAAA
GGTCCAGATCTCTCTAGCTTCACCTTAGTGTTTCCACTGCTGTAACTAGCTACTGGATTT
GTGGTGTTGCAGTTAATGTACGCCTCTTTCGTCACTTGCAGAACCGAGTCCTTTTCACCA
TCGTACCTCCATACGAGAGAGTCTCCAACATGAAACCGCAAACTCTCAGCCCATTTGTTG
AGTGAATCAGAGGGTGAAGAAGGGATTTTCCAAGCACTGGGTTTGCCTCCAACCAGAATC
TCCTTGCAACAGGCAAGATGTGCAGCAGACAACAACAAGAGGAAGGAGAATAATGGACAG
CAAGATTCAACAAGAGTTCTCTGAGCCATTAGAGTTAAGTTGTGTATGAGACAAGGACAG
AAGAAGATGAGACTGATGTGGTTTTATTTGGAGTCTCC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL7331Contig1 1290 2 4 U
GGCAACCAGTCTATTTTCTCGAGCTTTCGTGCCCGAGGAGCTCTTCCTTTTTCTTTCACC
ATGGCATCTTGCTTACAAGCATCCATGAACTCTCTGCTTCCACGCTCTTCTTCTTTTACT
TCCAGTCCCGGGAGAAGAAACTCGAAGAGCTTTCGTTACGCCTTTCCCGCCAAAGCCGCT
GCCAAAATCCCTATGCCTCCGATAAACCCCAACGATCCTTTCCTCTCTACGCTCGCTTCC
GTCGCCGCTAAATCTCCGGAGAAGCTTCTCAACCGGCCTGTAAACTCTGATACCCCGCCG
TATCTCGACATCTTCGATTCGCCTCAACTCATGTCTTCTCCTGCTCAGGTTGAGAGATCA
GTGGCTTATAACGAGCACCGGCCAAGAACTCCTCCACCAGATTTGCCGTCTATGCTTCTT
GACGGGAGAATTGTTTACATTGGGATGCCTCTGGTGCCGGCGGTTACGGAGCTTGTTGTC
GCTGAGCTAATGTATCTTCAGTGGCTTGATCCTAAAGAACCTATATATATTTACATCAAC
TCCACAGGGACCACTCGTGACGATGGAGAGACGGTTGGAATGGAATCAGAAGGTTTTGCG
ATCTATGATTCTTTGATGCAACTTAAAAACGAGGTACATACAGTCTGTGTGGGAGCAGCT
ATCGGTCACGCATGTCTGTTGCTTTCAGCGGGAACAAAGGGTAAACGATTTATGATGCCA
CATTCCAAAGCGATGATCCAGCAACCTCGTGTGCCTTCTTCTGGTTTGATGCCTGCTAGT
GATGTCCTGATTCGTGCCAAAGAGGTTATAACAAACAGGGATATACTTGTGGAACTACTA
TCAAAGCACACTGGGAATTCTGTGGAGACTGTGGCTAACGTTATGAGAAGGCCATATTGC
ATGGATGCACCAAAAGCTAAAGAATTTGGAGTCATTGACAAGATTCTTTGGCGTGGTCAG
GAGAAGATTATCGCGGACGTTGTTCCTTCAGACGAATTCGACAAGAACGCGGGAATTAGA
AGCGCTGAACGAGTTTAGTTTTAAGTCCTCTGGCCTCAAATCTCCGTTTTAATGGAGAAC
AATGAATAGAATTACAGACTTATCAAACTCCCTTAGCTGTGACTGCCTTGTTTCGAACCA
CATGGTAAATTTCCATCATGCGATTAGGAGATTCATATTAAGATGTGATAAAGTTGTAAT
GTTTTTCAAAAGCCAAAGTAAATACAATGTTCAACTCTCTTTTCTTTTTCTTCTCCATTT
CCATTAATGAAAAACTGCTCCTTTTCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H079TF U 1
AF RR2H079JQ C 517
BS 1 700 RR2H079TF
BS 701 701 RR2H079JQ
BS 702 716 RR2H079TF
BS 717 1290 RR2H079JQ

RD RR2H079TF 716 0 0
GGCAACCAGTCTATTTTCTCGAGCTTTCGTGCCCGAGGAGCTCTTCCTTTTTCTTTCACC
ATGGCATCTTGCTTACAAGCATCCATGAACTCTCTGCTTCCACGCTCTTCTTCTTTTACT
TCCAGTCCCGGGAGAAGAAACTCGAAGAGCTTTCGTTACGCCTTTCCCGCCAAAGCCGCT
GCCAAAATCCCTATGCCTCCGATAAACCCCAACGATCCTTTCCTCTCTACGCTCGCTTCC
GTCGCCGCTAAATCTCCGGAGAAGCTTCTCAACCGGCCTGTAAACTCTGATACCCCGCCG
TATCTCGACATCTTCGATTCGCCTCAACTCATGTCTTCTCCTGCTCAGGTTGAGAGATCA
GTGGCTTATAACGAGCACCGGCCAAGAACTCCTCCACCAGATTTGCCGTCTATGCTTCTT
GACGGGAGAATTGTTTACATTGGGATGCCTCTGGTGCCGGCGGTTACGGAGCTTGTTGTC
GCTGAGCTAATGTATCTTCAGTGGCTTGATCCTAAAGAACCTATATATATTTACATCAAC
TCCACAGGGACCACTCGTGACGATGGAGAGACGGTTGGAATGGAATCAGAAGGTTTTGCG
ATCTATGATTCTTTGATGCAACTTAAAAACGAGGTACATACAGTCTGTGTGGGAGCAGCT
ATCGGTCACGCATGTCTGTTGCTTTCAGCGGGAACAAAGG*TAAACGATTTATGAT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2H079JQ 774 0 0
AGAA
CTATATATATTTACATCAACTCCACAGGGACCACTCGTGACGATGGAGAGACGGTTGGAA
TGGAATCAGAAGGTTTTGCGATCTATGATTCTTTGATGCAACTTAAAAACGAGGTACATA
CAGTCTGTGTGGGAGCAGCTATCGGTCACGCATGTCTGTTGCTTTCAGCGGGAACAAAGG
GTAAACGATTTATGATGCCACATTCCAAAGCGATGATCCAGCAACCTCGTGTGCCTTCTT
CTGGTTTGATGCCTGCTAGTGATGTCCTGATTCGTGCCAAAGAGGTTATAACAAACAGGG
ATATACTTGTGGAACTACTATCAAAGCACACTGGGAATTCTGTGGAGACTGTGGCTAACG
TTATGAGAAGGCCATATTGCATGGATGCACCAAAAGCTAAAGAATTTGGAGTCATTGACA
AGATTCTTTGGCGTGGTCAGGAGAAGATTATCGCGGACGTTGTTCCTTCAGACGAATTCG
ACAAGAACGCGGGAATTAGAAGCGCTGAACGAGTTTAGTTTTAAGTCCTCTGGCCTCAAA
TCTCCGTTTTAATGGAGAACAATGAATAGAATTACAGACTTATCAAACTCCCTTAGCTGT
GACTGCCTTGTTTCGAACCACATGGTAAATTTCCATCATGCGATTAGGAGATTCATATTA
AGATGTGATAAAGTTGTAATGTTTTTCAAAAGCCAAAGTAAATACAATGTTCAACTCTCT
TTTCTTTTTCTTCTCCATTTCCATTAATGAAAAACTGCTCCTTTTCTGTC

QA 5 774 5 774
DS 



AS 1 2

CO CL7332Contig1 931 2 4 U
GGAGGGGTTTTCTAATCTTCTTCTAGACCCGCATCGATCATGGCGACTGATGAAACGATA
CTCAATCACCTGAAAGTAGAAATCCCAGTAGACGAGGAATCTCTTCTTCTGAACCCAGAC
TCGAGCGTCGGTCTCGTCATCATTGACGTGGTCAACGGCTTCTGCACCGTTGGCTCCGGC
AACATGGCTCCAACAAAGCCGAGCGAACAGATATCGAAGATGGTTGAGGAATCTGCACGG
CTCGCAAGAGGGTTCTGCGATCGTAAATGGCCCGTCTTTGCGTTTCTCGACACTCATCAT
CCTGATGTTCCGGAGATCCCTTACCCACCTCATTGTATTATAGGAACTCAAGAAGCAGAG
CTTGTCCCTGCACTACAGTGGCTTGAAAGTGAGGATTGTGTCACTCTTATGAGGAAGGAT
TGCATTAATGGGTTTGTGGGTTCGATGGAGAAAGACGGTTCTAATAAGTTTGTGGATTGG
GTTAAGGAGAAACAGATCAAAGTTATTGTGGTTGTGGGTATCTGCACAGACATATGTGTG
TTTGATTTTGTGGCTACTGTACTCTCTGCTCGAAACCACAGTGTTCTTCCTCCTCTGGAA
GATGTGATAGTGTACTCACGTGGATGCGCCACTTATGACCTTCCTCTTAATGTCGCAAAA
ACCATTAAAGGCGCTCAGGCTCATCCCCAGGAGATGATGCACCATGTAGGTCTATACATG
GCTAAAGGAAGAGGAGCTAAGGTAGTCTCTGAAGTTTCTTTTGATCCTTGAAAGACTAAA
ACTTATATCATTCTTGATTTCGATTGATTCAGTCGATTGTTGGGTTTGTCTTTTTATGTT
GTAAATTGTTCATGAAAGCTTGTTTGCTGAAGATCAACTTATATGTAATTGAATTCTCAT
TTGTCTAAATGAAATGTTTCAGTTTGATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G284TF U 1
AF RR2G284JQ C 192
BS 1 678 RR2G284TF
BS 679 679 RR2G284JQ
BS 680 724 RR2G284TF
BS 725 931 RR2G284JQ

RD RR2G284TF 724 0 0
GGAGGGGTTTTCTAATCTTCTTCTAGACCCGCATCGATCATGGCGACTGATGAAACGATA
CTCAATCACCTGAAAGTAGAAATCCCAGTAGACGAGGAATCTCTTCTTCTGAACCCAGAC
TCGAGCGTCGGTCTCGTCATCATTGACGTGGTCAACGGCTTCTGCACCGTTGGCTCCGGC
AACATGGCTCCAACAAAGCCGAGCGAACAGATATCGAAGATGGTTGAGGAATCTGCACGG
CTCGCAAGAGGGTTCTGCGATCGTAAATGGCCCGTCTTTGCGTTTCTCGACACTCATCAT
CCTGATGTTCCGGAGATCCCTTACCCACCTCATTGTATTATAGGAACTCAAGAAGCAGAG
CTTGTCCCTGCACTACAGTGGCTTGAAAGTGAGGATTGTGTCACTCTTATGAGGAAGGAT
TGCATTAATGGGTTTGTGGGTTCGATGGAGAAAGACGGTTCTAATAAGTTTGTGGATTGG
GTTAAGGAGAAACAGATCAAAGTTATTGTGGTTGTGGGTATCTGCACAGACATATGTGTG
TTTGATTTTGTGGCTACTGTACTCTCTGCTCGAAACCACAGTGTTCTTCCTCCTCTGGAA
GATGTGATAGTGTACTCACGTGGATGCGCCACTTATGACCTTCCTCTTAATGTCGCAAAA
ACCATTAAAGGCGCTCAG*CTCATCCCCAGGAGATGATGCACCATGTAGGTCTATACATG
GCTA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2G284JQ 740 0 0
AACAAAGCCGAGCGAACAGATATCGAAGATGGTTGAGGAATCTGCACGGCTCGCAAGAGG
GTTCTGCGATCGTAAATGGCCCGTCTTTGCGTTTCTCGACACTCATCATCCTGATGTTCC
GGAGATCCCTTACCCACCTCATTGTATTATAGGAACTCAAGAAGCAGAGCTTGTCCCTGC
ACTACAGTGGCTTGAAAGTGAGGATTGTGTCACTCTTATGAGGAAGGATTGCATTAATGG
GTTTGTGGGTTCGATGGAGAAAGACGGTTCTAATAAGTTTGTGGATTGGGTTAAGGAGAA
ACAGATCAAAGTTATTGTGGTTGTGGGTATCTGCACAGACATATGTGTGTTTGATTTTGT
GGCTACTGTACTCTCTGCTCGAAACCACAGTGTTCTTCCTCCTCTGGAAGATGTGATAGT
GTACTCACGTGGATGCGCCACTTATGACCTTCCTCTTAATGTCGCAAAAACCATTAAAGG
CGCTCAGGCTCATCCCCAGGAGATGATGCACCATGTAGGTCTATACATGGCTAAAGGAAG
AGGAGCTAAGGTAGTCTCTGAAGTTTCTTTTGATCCTTGAAAGACTAAAACTTATATCAT
TCTTGATTTCGATTGATTCAGTCGATTGTTGGGTTTGTCTTTTTATGTTGTAAATTGTTC
ATGAAAGCTTGTTTGCTGAAGATCAACTTATATGTAATTGAATTCTCATTTGTCTAAATG
AAATGTTTCAGTTTGATTGT

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL7333Contig1 528 2 1 U
GATCGTTGGATTACCTGTTTCGCTTCTATTGCTCAAGGCTGATGCTACTGTTACAACCGT
ACATTCCCACACCAGAGATCCTGAGGCTATCATACGGGAAGCTGACATCGTTATTGCTGC
AGCCGGACAAGCCTGCATGATTAAGGGGGACTGGATTAAACCAGGGGCTGCGGTGATCGA
TGTTGGAACCAATGCAGTGAGCGACCCGAGCAGGAAATCAGGATACCGGTTGGTTGGAGA
TGTGGATTACGCAGAGGCTTGTAAAGTTGCAGGGTTCGCAACTCCGGTCCCTGGTGGTGT
TGGTCCAATGACCGTGGCAATGCTGCTTAGGAACACCTTAGACGGCGCCAAGCGGGTCAT
TGGCCAGTAAGATATCCATCCTACTGTATGTTATAAAATGAATCTCAAGTTTATCCATTA
TATAACTCATTACCCTCTCGCTTTGATAACATTATTCCTCTCAAATAAATCCTTTGAATG
TTTGTTTTCCCGCCAATTTGTACACAACATGAGGCTTAGCATCATTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H972JQ C 1
AF RR2H972TF U 1
BS 1 528 RR2H972TF

RD RR2H972JQ 528 0 0
GATCGTTGGATTACCTGTTTCGCTTCTATTGCTCAAGGCTGATGCTACTGTTACAACCGT
ACATTCCCACACCAGAGATCCTGAGGCTATCATACGGGAAGCTGACATCGTTATTGCTGC
AGCCGGACAAGCCTGCATGATTAAGGGGGACTGGATTAAACCAGGGGCTGCGGTGATCGA
TGTTGGAACCAATGCAGTGAGCGACCCGAGCAGGAAATCAGGATACCGGTTGGTTGGAGA
TGTGGATTACGCAGAGGCTTGTAAAGTTGCAGGGTTCGCAACTCCGGTCCCTGGTGGTGT
TGGTCCAATGACCGTGGCAATGCTGCTTAGGAACACCTTAGACGGCGCCAAGCGGGTCAT
TGGCCAGTAAGATATCCATCCTACTGTATGTTATAAAATGAATCTCAAGTTTATCCATTA
TATAACTCATTACCCTCTCGCTTTGATAACATTATTCCTCTCAAATAAATCCTTTGAATG
TTTGTTTTCCCGCCAATTTGTACACAACATGAGGCTTAGCATCATTTT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2H972TF 528 0 0
GATCGTTGGATTACCTGTTTCGCTTCTATTGCTCAAGGCTGATGCTACTGTTACAACCGT
ACATTCCCACACCAGAGATCCTGAGGCTATCATACGGGAAGCTGACATCGTTATTGCTGC
AGCCGGACAAGCCTGCATGATTAAGGGGGACTGGATTAAACCAGGGGCTGCGGTGATCGA
TGTTGGAACCAATGCAGTGAGCGACCCGAGCAGGAAATCAGGATACCGGTTGGTTGGAGA
TGTGGATTACGCAGAGGCTTGTAAAGTTGCAGGGTTCGCAACTCCGGTCCCTGGTGGTGT
TGGTCCAATGACCGTGGCAATGCTGCTTAGGAACACCTTAGACGGCGCCAAGCGGGTCAT
TGGCCAGTAAGATATCCATCCTACTGTATGTTATAAAATGAATCTCAAGTTTATCCATTA
TATAACTCATTACCCTCTCGCTTTGATAACATTATTCCTCTCAAATAAATCCTTTGAATG
TTTGTTTTCCCGCCAATTTGTACACAACATGAGGCTTAGCATCATTTT

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL7334Contig1 908 2 8 U
GGATATATAAAACTGCAGACACGTATTCAGTAAGGATGCAATTGGGCGAGAGATACTGAG
CATAGCGTTTCCAGCGGCTTTGGCTTTAGCTGCTGATCCAATAGCTTCTCTGATTGATAC
CGCTTACATCGGACGTTTAGGTGCGGTTGAGCTAGCAGCGGTTGGAGTATCTATTGCGAT
ATTCAATCAAGCTTCCAGAATCACGATATTCCCAATTGTGAGCGTTACAACTTCCTTTGT
CGCTGAGGAAGACACGATTGAGAAGATGAGAGAAGACGAAGCAAAGAAAACTAGTCTTGT
TCATGCAAATACTTTAGCTGTTCAAGATTCACTAGAAAAAGGCACTGCGTCACCCACAAG
TAACAACACTAACCAGCCGCAGCAGACGCCAGCTACAGATACAAAGTCAAACAGCGGGAA
CAAATCAAATAAGAAAGGAAAGAAGAATATCAAATCAGCATCAACGGCCATGATCATAGG
CCTAATCCTGGGCCTTGTGCAAGCTATAGTCTTGATTTTCAGCTCGAGAGTGCTTCTAGG
TGTCATGGGGAGTGAAACCGAATTCGGCAGTGTTATCACCAGCTCACAAGTACTTGACCA
TACGGTCACTAGGTGCTCCTGCATTGCTTCTATCGCTTTCCATGCAAGGCATCTTTCGTG
GCTTCAAGGACACTAAAACTCCTCTCTATGCTACCATCGTAGCAGATGTCATCAATATCA
TTCTCGACCCGATTTTCATCTTTGTGCTTCACCTTGGAGTCAGCGGTGCAGCCATTGCCC
ATGTCATTTCTCAGTACTTCATGACTCTAATACTATTCATCCGCCTCGCGAGTAAAGTTA
ATTTGATGCCACCAAACTTTGGAGCTTTGCAGTTCGGCAAGTTCCTTAAAATGGGGGACT
ATTGCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CN19TF U 1
AF RR2BE80TF U 36
BS 1 648 RR2CN19TF
BS 649 649 RR2BE80TF
BS 650 668 RR2CN19TF
BS 669 669 RR2BE80TF
BS 670 721 RR2CN19TF
BS 722 722 RR2BE80TF
BS 723 736 RR2CN19TF
BS 737 908 RR2BE80TF

RD RR2CN19TF 736 0 0
GGATATATAAAACTGCAGACACGTATTCAGTAAGGATGCAATTGGGCGAGAGATACTGAG
CATAGCGTTTCCAGCGGCTTTGGCTTTAGCTGCTGATCCAATAGCTTCTCTGATTGATAC
CGCTTACATCGGACGTTTAGGTGCGGTTGAGCTAGCAGCGGTTGGAGTATCTATTGCGAT
ATTCAATCAAGCTTCCAGAATCACGATATTCCCAATTGTGAGCGTTACAACTTCCTTTGT
CGCTGAGGAAGACACGATTGAGAAGATGAGAGAAGACGAAGCAAAGAAAACTAGTCTTGT
TCATGCAAATACTTTAGCTGTTCAAGATTCACTAGAAAAAGGCACTGCGTCACCCACAAG
TAACAACACTAACCAGCCGCAGCAGACGCCAGCTACAGATACAAAGTCAAACAGCGGGAA
CAAATCAAATAAGAAAGGAAAGAAGAATATCAAATCAGCATCAACGGCCATGATCATAGG
CCTAATCCTGGGCCTTGTGCAAGCTATAGTCTTGATTTTCAGCTCGAGAGTGCTTCTAGG
TGTCATGGGGAGTGAAACCGAATTCGGCAGTGTTATCACCAGCTCACAAGTACTTGACCA
TACGGTCACTAGGTGCTCCTGCATTGCTTCTATCGCTTTCCATGCAAG*CATCTTTCGTG
GCTTCAAG*ACACTAAAACTCCTCTCTATGCTACCATCGTAGCAGATGTCATCAATATCA
T*CTCGACCCGATTTT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2BE80TF 873 0 0
GG
GCAATTGGGCGAGAGATACTGAGCATAGCGTTTCCAGCGGCTTTGGCTTTAGCTGCTGAT
CCAATAGCTTCTCTGATTGATACCGCTTACATCGGACGTTTAGGTGCGGTTGAGCTAGCA
GCGGTTGGAGTATCTATTGCGATATTCAATCAAGCTTCCAGAATCACGATATTCCCAATT
GTGAGCGTTACAACTTCCTTTGTCGCTGAGGAAGACACGATTGAGAAGATGAGAGAAGAC
GAAGCAAAGAAAACTAGTCTTGTTCATGCAAATACTTTAGCTGTTCAAGATTCACTAGAA
AAAGGCACTGCGTCACCCACAAGTAACAACACTAACCAGCCGCAGCAGACGCCAG*****
*ATACAAAGTCAAACAGCGGGAACAAATCAAATAAGAAAGGAAAGAAGAATATCAAATCA
GCATCAACGGCCATGATCATAGGCCTAATCCTGGGCCTTGTGCAAGCTATAGTCTTGATT
TTCAGCTCGAGAGTGCTTCTAGGTGTCATGGG*AGTGAAACCGAATTCGGCAGTGTTATC
ACCAGCTCACAAGTACTTGACCATACGGTCACTAGGTGCTCCTGCATTGCTTCTATCGCT
TTCCATGCAAGGCATCTTTCGTGGCTTCAAGGACACTAAAACTCCTCTCTATGCTACCAT
CGTAGCGGATGTCATCAATATCATTCTCGACCCGATTTTCATCTTTGTGCTTCACCTTGG
AGTCAGCGGTGCAGCCATTGCCCATGTCATTTCTCAGTACTTCATGACTCTAATACTATT
CATCCGCCTCGCGAGTAAAGTTAATTTGATGCCACCAAACTTTGGAGCTTTGCAGTTCGG
CAAGTTCCTTAAAATGGGGGACTATTGCTCG

QA 3 873 3 873
DS 



AS 1 2

CO CL7335Contig1 727 2 2 U
GGAGACACGGATAACGCAAAACCTCTAGTCTTCCCAAAATCCACCACCTCACAACGAGAA
CGACGACGATGGCTCTTTCTACTGGAATCTTCTCCACCTCCTTCCTCTGCGCCAAAACGG
CGCCGTTCTGCAGCTCACCGTCTCTCCGCGTTTCCCCTCATCCGGCTAACCTGCGCTTGG
TTCGAGCCGTGACCTCCGCGACGGCGGCGTCCTCCGAGCCGCCAACCACCAAGGTTCGGG
AGCCTCGCGGAATCATGAAGCCTCGCCCAGTGTCCCCCGAGATGCAGGACGTCGTCGGTG
AGCCGGTGATTCCTCGCACGCAGGCTCTCAAGCGCATTTGGGCCTACATCAAGGAGCGCG
ACCTTCAAGATCCACAAGACAAGAAGGTTATAATCTGCGACGAGAAGCTGAAGAAGATAT
TTGCAGGCAAAGACCGTGTCGGCTTCTTGGAGATTGCAAAGCTCATCGGTCCTCACTTCC
TCTGAATGAATCTTGGCCGAGAGATGACTATCAATCACTGTCGTATGTTTTGCAGCTATC
AAGAGATTCAAGACCAAGAAATATCATATTACATATTAGTAACGTTAGGTTTAAGAACTT
TTATGCAACAAAGTAGTAGTCAATGCCTTCGGACAATATCTTTTGCTTTTGCTCGTTATG
TCTTATTGCTTCCGACTGCATTTCAAATTTTCTTTGTCGTCTTAGGACTTGAACAACTCT
TTCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD69TF U 1
AF RR2CD69JQ C 146
BS 1 705 RR2CD69TF
BS 706 727 RR2CD69JQ

RD RR2CD69TF 709 0 0
GGAGACACGGATAACGCAAAACCTCTAGTCTTCCCAAAATCCACCACCTCACAACGAGAA
CGACGACGATGGCTCTTTCTACTGGAATCTTCTCCACCTCCTTCCTCTGCGCCAAAACGG
CGCCGTTCTGCAGCTCACCGTCTCTCCGCGTTTCCCCTCATCCGGCTAACCTGCGCTTGG
TTCGAGCCGTGACCTCCGCGACGGCGGCGTCCTCCGAGCCGCCAACCACCAAGGTTCGGG
AGCCTCGCGGAATCATGAAGCCTCGCCCAGTGTCCCCCGAGATGCAGGACGTCGTCGGTG
AGCCGGTGATTCCTCGCACGCAGGCTCTCAAGCGCATTTGGGCCTACATCAAGGAGCGCG
ACCTTCAAGATCCACAAGACAAGAAGGTTATAATCTGCGACGAGAAGCTGAAGAAGATAT
TTGCAGGCAAAGACCGTGTCGGCTTCTTGGAGATTGCAAAGCTCATCGGTCCTCACTTCC
TCTGAATGAATCTTGGCCGAGAGATGACTATCAATCACTGTCGTATGTTTTGCAGCTATC
AAGAGATTCAAGACCAAGAAATATCATATTACATATTAGTAACGTTAGGTTTAAGAACTT
TTATGCAACAAAGTAGTAGTCAATGCCTTCGGACAATATCTTTTGCTTTTGCTCGTTATG
TCTTATTGCTTCCGACTGCATTTCAAATTTTCTTTGTCGTCTTAG
ACTT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2CD69JQ 582 0 0
CCGCGTTTCCCCTCATCCGGCTAACCTGCGCTTGGTTCGAGCCGTGACCTCCGGGACGGG
GGCGTCCTCCGAGCCGCCAACCACCAAGGTTCGGGAGCCTCGCGGAATCATGAAGCCTCG
CCCAGTGTCCCCCGAGATGCAGGACGTCGTCGGTGAGCCGGTGATTCCTCGCACGCAGGC
TTTCAAGCGCATTTGGGCCTACATCAAGGAGCGCGACCTTCAAGATCCCCAAGACAAGAA
GGTTATAATTTGGGACGAGAAGCTGAAGAAGATATTTGCAGGCAAAGACCGTGTCGGCTT
CTTGGAGATTGCAAAGCTCATCGGTCCTCACTTCCTCTGAATGAATCTTGGCCGAGAGAT
GACTATCAATCACTGTCGTATGTTTTGCAGCTATCAAGAGATTCAAGACCAAGAAATATC
ATATTACATATTAGTAACGTTAGGTTTAAGAACTTTTATGCAACAAAGTAGTAGTCAATG
CCTTCGGACAATATCTTTTGCTTTTGCTCGTTATGTCTTATTGCTTCCGACTGCATTTCA
AATTTTTTTTGTCGTTTTAGGACTTGAACAACTCTTTCATGC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

CO CL7336Contig1 1056 2 2 U
GGCCCGAGAGTTTGGTCTGTCTCATTCTAGTTTTAACACTGCCCTTCTCTATATAAAGCT
CACAGGTCGAGAGAGAGACAAGAGACACCACATAAACGATCATTGATTAGAAAAAGAACT
CTGTCGGAAAATGGAAAACATCGACCAAGAGTTCAACAACTACTGGGAACCAAACTCCTT
CCTCCAAAACGAAGACTTCGAATATGACAGCTGGCCTTTGGAGGAAGCGATTTCTGGGTC
GTATGATTCTAGCTCGCCGGACGGCGCGGCTTCGTCTCCAGCTTCTAAGAATATTGTGTC
GGAAAGAAACAGGAGACAGAAGCTTAACCAGAGACTATTTGCTCTTCGATCAGTTGTCCC
CAATATCACTAAGATGGATAAAGCATCAATAATCAAAGATGCTATTAGTTACATACAAGG
GTTGCAATATGAAGAGTCGAAGCTCGAGTCTGAGATCAGAGAACTTGAATCTACACCAAA
GACTAGCCCGAGCTTCAGTAAAGATTTTGATCGTGATCTGCTGGTTCCCGTCACATCCAA
GAAGATGAGGCAGCTTGATTCTGGTCCTTCCCGTTCTCTCATCGAAGTTCTCGAATTGAA
GGTAACATACATGGGAGAGAGGACGGTGGTGGTGAATATAACATGTAATAAGAGGCCAGA
CACAATGGTGAAACTGTGTGAAGTCTTTGAGTCATTAAATCTCAAAATCCTCACTTCCAA
TCTCAACTCTTTCTCTGGCATGATCTTCAACACTGTCTTTATTGAGGCGGATGAAGAAGA
ACAAGAGGTGGTGAGGTTAAAAATAGAAACAGGAATAGGAGCTTATAATGAAACTCAAAG
CCCCACTTTGAGCATCGACTCTCTTTACTAATCATTTTTTAAAAATATTTTTTGGCGTCT
CTCTCTATAGAAATAAATAATATGTTATCTTTCCATTTTCGTTTTGTTGGTTCATCACGA
AGACTTCTTGTGTGTTTATATAGTGTCTATAACAATAATCGTACGCATTGTGTTTTCTTT
TACTTTTGGGTGTGTGGGAATGGTATGTTTATCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES90TF U 1
AF RR2ES90JQ C 208
BS 1 759 RR2ES90TF
BS 760 1056 RR2ES90JQ

RD RR2ES90TF 759 0 0
GGCCCGAGAGTTTGGTCTGTCTCATTCTAGTTTTAACACTGCCCTTCTCTATATAAAGCT
CACAGGTCGAGAGAGAGACAAGAGACACCACATAAACGATCATTGATTAGAAAAAGAACT
CTGTCGGAAAATGGAAAACATCGACCAAGAGTTCAACAACTACTGGGAACCAAACTCCTT
CCTCCAAAACGAAGACTTCGAATATGACAGCTGGCCTTTGGAGGAAGCGATTTCTGGGTC
GTATGATTCTAGCTCGCCGGACGGCGCGGCTTCGTCTCCAGCTTCTAAGAATATTGTGTC
GGAAAGAAACAGGAGACAGAAGCTTAACCAGAGACTATTTGCTCTTCGATCAGTTGTCCC
CAATATCACTAAGATGGATAAAGCATCAATAATCAAAGATGCTATTAGTTACATACAAGG
GTTGCAATATGAAGAGTCGAAGCTCGAGTCTGAGATCAGAGAACTTGAATCTACACCAAA
GACTAGCCCGAGCTTCAGTAAAGATTTTGATCGTGATCTGCTGGTTCCCGTCACATCCAA
GAAGATGAGGCAGCTTGATTCTGGTCCTTCCCGTTCTCTCATCGAAGTTCTCGAATTGAA
GGTAACATACATGGGAGAGAGGACGGTGGTGGTGAATATAACATGTAATAAGAGGCCAGA
CACAATGGTGAAACTGTGTGAAGTCTTTGAGTCATTAAATCTCAAAATCCTCACTTCCAA
TCTCAACTCTTTCTCTGGCATGATCTTCAACACTGTCTT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2ES90JQ 849 0 0
TGACAGCTGGCTTTGA
GAAGCGATTTCTGG*TCGTATGATTCTAGCTCGC*GGACGGCGCGGCTTCGTCTCCAGCT
TCTAAGAATAT*GTGTCGGAAAGAAACAGGAGACAGAAGCTTAACCAGAGACTATTTGCT
CTTCGATCAGTTGTCCCCAATATCACTAAGATGGATAAAGCATCAATAATCAAAGATGCT
ATTAGTTACATACAAGGGTTGCAATATGAAGAGTCGAAGCTCGAGTCTGAGATCAGAGAA
CTTGAATCTACACCAAAGACTAGCCCGAGCTTCAGTAAAGATTTTGATCGTGATCTGCTG
GTTCCCGTCACATCCAAGAAGATGAGGCAGCTTGATTCTGGTCCTTCCCGTTCTCTCATC
GAAGTTCTCGAATTGAAGGTAACATACATGGGAGAGAGGACGGTGGTGGTGAATATAACA
TGTAATAAGAGGCCAGACACAATGGTGAAACTGTGTGAAGTCTTTGAGTCATTAAATCTC
AAAATCCTCACTTCCAATCTCAACTCTTTCTCTGGCATGATCTTCAACACTGTCTTTATT
GAGGCGGATGAAGAAGAACAAGAGGTGGTGAGGTTAAAAATAGAAACAGGAATAGGAGCT
TATAATGAAACTCAAAGCCCCACTTTGAGCATCGACTCTCTTTACTAATCATTTTTTAAA
AATATTTTTTGGCGTCTCTCTCTATAGAAATAAATAATATGTTATCTTTCCATTTTCGTT
TTGTTGGTTCATCACGAAGACTTCTTGTGTGTTTATATAGTGTCTATAACAATAATCGTA
CGCATTGTGTTTTCTTTTACTTTTGGGTGTGTGGGAATGGTATGTTTATCCTT

QA 17 849 17 849
DS 



AS 1 2

CO CL7337Contig1 872 2 4 U
GGGTCTTCACTTCAAGTATCTCTCGTTTTGACCTACCTACTACATAGCAGAAGAAAAATG
GAATCGAGTCCTCCTCCTCCTCCTCACTTCAAGGTGGTTTTGGGATCTTCATCGATTGCT
CGAAGAAGTATATTAACAGACATGGGATACCAATTCAGTCTAATGAGTGCTGATATTGAC
GAGAAAAGCATCCGTAAGCAGAATCCTGAAGACTTGGTTTTAGCTTTAACTGAGGCAAAG
GCTGAAGCAATCATGCAGCGGATGGCTGATGACGACGACATAAAGGAGACCTTACTTGTT
ACTTGTGACCAAGTAATGTTTTATTGGACAACCATTTCTGAAATTACTTTTTAGTTACTT
ATTTATAGCTTTGTTTAGGTTGTTTTATAAATGGTATTTTGGTGGATCTTGAATTAGTTT
AGTTGAATTTTAATGGGTTTATGAAGGTTGTCGTCTATGCAAATGCCGTTAGGGAGAAAC
CCTCGAGTGTGGAAGAAGCAAGGGAATACATAAGAGGCAAGTAAAGCAAACAAGCTCCTT
CCTTTTACTTTGTTTTAATTACAATTCTCAAGGCTTCAAAACACACACACACACACAGGC
TATTCCAAGGGACACACAGCAACAGTCAGTTCTGTGGTTGTAACAAATACCAAAACAGGA
TTCAGAAAAGGAGGCGTCGATAGAGTGGAGATCTACTTCAACGAAATATCAGAGGAGATT
ATCGCGAAACTGATTGAGGAAGGCACGGTGCTTAAGGTGGCTGGTGCACTCCTAATCGAA
CATCCTCTAATATCGCCATGCGTCAAAGAAATGGTTGGGACAATAGATAGCGTCATGGGT
CTGCCTAAAGAATTGACTGAGAAACTCCTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C506TF U 1
AF RR2C506JQ C 198
BS 1 719 RR2C506TF
BS 720 720 RR2C506JQ
BS 721 741 RR2C506TF
BS 742 872 RR2C506JQ

RD RR2C506TF 741 0 0
GGGTCTTCACTTCAAGTATCTCTCGTTTTGACCTACCTACTACATAGCAGAAGAAAAATG
GAATCGAGTCCTCCTCCTCCTCCTCACTTCAAGGTGGTTTTGGGATCTTCATCGATTGCT
CGAAGAAGTATATTAACAGACATGGGATACCAATTCAGTCTAATGAGTGCTGATATTGAC
GAGAAAAGCATCCGTAAGCAGAATCCTGAAGACTTGGTTTTAGCTTTAACTGAGGCAAAG
GCTGAAGCAATCATGCAGCGGATGGCTGATGACGACGACATAAAGGAGACCTTACTTGTT
ACTTGTGACCAAGTAATGTTTTATTGGACAACCATTTCTGAAATTACTTTTTAGTTACTT
ATTTATAGCTTTGTTTAGGTTGTTTTATAAATGGTATTTTGGTGGATCTTGAATTAGTTT
AGTTGAATTTTAATGGGTTTATGAAGGTTGTCGTCTATGCAAATGCCGTTAGGGAGAAAC
CCTCGAGTGTGGAAGAAGCAAGGGAATACATAAGAGGCAAGTAAAGCAAACAAGCTCCTT
CCTTTTACTTTGTTTTAATTACAATTCTCAAGGCTTCAAAACACACACACACACACAGGC
TATTCCAAGGGACACACAGCAACAGTCAGTTCTGTGGTTGTAACAAATACCAAAACAGGA
TTCAGAAAAGGAGGCGTCGATAGAGTGGAGATCTACTTCAACGAAATATCAGAGGAGAT*
ATCGCGAAACTGATTGAGGAA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2C506JQ 675 0 0
AGCAGAAT
CTGAAGACTTGGTTT*AGCTTTAACTGAGGCAAAGGCTGAAGCAATCATGCAGCGGATGG
CTGATGACGACGACATAAAGGAGACCTTACTTGTTACTTGTGACCAAGTAATGTTTTATT
GGACAACCATTTCTGAAATTACTTTTTAGTTACTTATTTATAGCTTTGTTTAGGTTGTTT
TATAAATGGTATTTTGGTGGATCTTGAATTAGTTTAGTTGAATTTTAATGGGTTTATGAA
GGTTGTCGTCTATGCAAATGCCGTTAGGGAGAAACCCTCGAGTGTGGAAGAAGCAAGGGA
ATACATAAGAGGCAAGTAAAGCAAACAAGCTCCTTCCTTTTACTTTGTTTTAATTACAAT
TCTCAAGGCTTCAAAACACACACACACACACAGGCTATTCCAAGGGACACACAGCAACAG
TCAGTTCTGTGGTTGTAACAAATACCAAAACAGGATTCAGAAAAGGAGGCGTCGATAGAG
TGGAGATCTACTTCAACGAAATATCAGAGGAGATTATCGCGAAACTGATTGAGGAAGGCA
CGGTGCTTAAGGTGGCTGGTGCACTCCTAATCGAACATCCTCTAATATCGCCATGCGTCA
AAGAAATGGTTGGGACAATAGATAGCGTCATGGGTCTGCCTAAAGAATTGACTGAGAAAC
TCCTAAA

QA 9 675 9 675
DS 



AS 1 2

CO CL7338Contig1 974 2 4 U
GGGTTTTAACCCTAATCTTTTAACAAGGTCCGGATAACAAAAGAAGCGATGCATAGTGTT
TTTCACCTTCTTCTCATCGCCACCGTTACGATCTCGATCCCTGTTGTTTTCTCCGAGAAT
GATTCGATATACGACGTCCTTCGAGCACACGCCTTACCGATGGGGCTATTACCAAAGGGA
GTAAAGGACTTCGACGTCGTCGTGAAGACCGGACAGTTCTCGGTTTGGTTAAACCGATCT
TGCAAGGCCAAGTACGAGAGCGAGATACATTACGAAGCCAACATCACGGGGACGATAGGC
TACGGAAGCATCGGTGGTTTATCGGGTATATCGGCTCAGGATCTCTTCCTGTGGTTTCCG
GTTAAAGGGATCCGCGTGGACATACCTAGCTCCGGCGTTATATACTTCGATGTCGGAGTT
GTTCGCAAGCGGTACTCCATGTCTTTGTTCGAGACTCCGAAAGATTGTGTTGCTGTTGAG
AAGGAAGCTGAGCTGTTTCGTGGGGATAATAAGATTCAGTCATCTATGTTGCAATTCTAC
GAAGTAGATCAAAGTGTTGGAAGAGGCATTGTGTAGCCAAAAAGAGTCGATGGCTGTTGT
AATGAAGATGTGTTTACATTATACAAGTTGGAAACTTTTAGCTGCTCATGGATTTTTTGA
AGACACACACACACCTTCCATTTGAGGTCAGATACTCCTTTCTTCCCAAGTTGCTTTCAT
TACTCTGTTTGAAGTGAAAATGAGAGAGAGTCATGTGAGCAAGTTAGATGGGAAGAACAA
GTGTTGGTGGGTTTTGTTTGAGATGTCCAGATTCATCACAGGTGACTGAATGTTTTTGTG
AATTTTTGCTTTTATGTTTTGCACTGTCATGCATCTCTATTCTCCCTGTAATATAATATA
TAATCTATTGTATGATATGCATGTCCATTTTGTAATCATATTCTTTTATCCCAATAAGAT
TTTGTATAGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB53TF U 1
AF RR2FB53JQ C 194
BS 1 706 RR2FB53TF
BS 707 707 RR2FB53JQ
BS 708 729 RR2FB53TF
BS 730 974 RR2FB53JQ

RD RR2FB53TF 729 0 0
GGGTTTTAACCCTAATCTTTTAACAAGGTCCGGATAACAAAAGAAGCGATGCATAGTGTT
TTTCACCTTCTTCTCATCGCCACCGTTACGATCTCGATCCCTGTTGTTTTCTCCGAGAAT
GATTCGATATACGACGTCCTTCGAGCACACGCCTTACCGATGGGGCTATTACCAAAGGGA
GTAAAGGACTTCGACGTCGTCGTGAAGACCGGACAGTTCTCGGTTTGGTTAAACCGATCT
TGCAAGGCCAAGTACGAGAGCGAGATACATTACGAAGCCAACATCACGGGGACGATAGGC
TACGGAAGCATCGGTGGTTTATCGGGTATATCGGCTCAGGATCTCTTCCTGTGGTTTCCG
GTTAAAGGGATCCGCGTGGACATACCTAGCTCCGGCGTTATATACTTCGATGTCGGAGTT
GTTCGCAAGCGGTACTCCATGTCTTTGTTCGAGACTCCGAAAGATTGTGTTGCTGTTGAG
AAGGAAGCTGAGCTGTTTCGTGGGGATAATAAGATTCAGTCATCTATGTTGCAATTCTAC
GAAGTAGATCAAAGTGTTGGAAGAGGCATTGTGTAGCCAAAAAGAGTCGATGGCTGTTGT
AATGAAGATGTGTTTACATTATACAAGTTGGAAACTTTTAGCTGCTCATGGATTTTTTGA
AGACACACACACACCTTCCATTTGAGGTCAGATACTCCTTTCTTCC*AAGTTGCTTTCAT
TACTCTGTT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2FB53JQ 781 0 0
ACGTCGTCGTGAAGACCGGACAGTTCTCGGTTTGGTTAAACCGATCTTGCAAGGCCAAGT
ACGAGAGCGAGATACATTACGAAGCCAACATCACGGGGACGATAGGCTACGGAAGCATCG
GTGGTTTATCGGGTATATCGGCTCAGGATCTCTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAGGGATCC
GCGTGGACATACCTAGCTCCGGCGTTATATACTTCGATGTCGGAGTTGTTCGCAAGCGGT
ACTCCATGTCTTTGTTCGAGACTCCGAAAGATTGTGTTGCTGTTGAGAAGGAAGCTGAGC
TGTTTCGTGGGGATAATAAGATTCAGTCATCTATGTTGCAATTCTACGAAGTAGATCAAA
GTGTTGGAAGAGGCATTGTGTAGCCAAAAAGAGTCGATGGCTGTTGTAATGAAGATGTGT
TTACATTATACAAGTTGGAAACTTTTAGCTGCTCATGGATTTTTTGAAGACACACACACA
CCTTCCATTTGAGGTCAGATACTCCTTTCTTCCCAAGTTGCTTTCATTACTCTGTTTGAA
GTGAAAATGAGAGAGAGTCATGTGAGCAAGTTAGATGGGAAGAACAAGTGTTGGTGGGTT
TTGTTTGAGATGTCCAGATTCATCACAGGTGACTGAATGTTTTTGTGAATTTTTGCTTTT
ATGTTTTGCACTGTCATGCATCTCTATTCTCCCTGTAATATAATATATAATCTATTGTAT
GATATGCATGTCCATTTTGTAATCATATTCTTTTATCCCAATAAGATTTTGTATAGTTTG
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL7339Contig1 738 2 2 U
TTTTTTAACCAGACGAAGAAGCAATATAGAAATTACATGTTCACAATCAGACATTTGACA
ATCCGATATAGAATGTCTGAGAAACAGAAATCCAAAGGGGAACGAAAACAGAATTGGAAA
TGAAATGAGCAGGGATTATTATGTGAATGACATAGCAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGG
TGGCTTGTAGGCGATGAAACTGATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGAT
TCTAATGAAGGCGTTAGGGTACTCCTTCTTGCACTCTTGCACCTCCTTCAATACTTGAGC
AGAGTCAGTGCATCCGAATAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTA
TCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCACGGTAGACAAATCCATGCTCCAACTCAAATTCAACACA
AGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCAACGTCACTAAG
GTCAGGAAGATAAGATAAAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCAT
GCAGCTAACTCTTCCCCCGTTGCTTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGT
GACTGGGAATGCAGCGGATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGC
TGGGGAGGTAACCACAGCGGCGGAGGAGAGCATAGAGGAAGCCATTACTACTTTTTCTCT
TTTCTCTTACTTACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FM07TF C 1
AF RR2FM07JQ U 20
BS 1 19 RR2FM07TF
BS 20 738 RR2FM07JQ

RD RR2FM07TF 738 0 0
TTTTTTAACCAGACGAAGAAGCAATATAGAAATTACATGTTCACAATCAGACATTTGACA
ATCCGATATAGAATGTCTGAGAAACAGAAATCCAAAGGGGAACGAAAACAGAATTGGAAA
TGAAATGAGCAGGGATTATTATGTGAATGACATAGCAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGG
TGGCTTGTAGGCGATGAAACTGATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGAT
TCTAATGAAGGCGTTAGGGTACTCCTTCTTGCACTCTTGCACCTCCTTCAATACTTGAGC
AGAGTCAGTGCATCCGAATAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTA
TCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCACGGTAGACAAATCCATGCTCCAACTCAAATTCAACACA
AGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCAACGTCACTAAG
GTCAGGAAGATAAGATAAAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCAT
GCAGCTAACTCTTCCCCCGTTGCTTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGT
GACTGGGAATGCAGCGGATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGC
TGGGGAGGTAACCACAGCGGCGGAGGAGAGCATAGAGGAAGCCATTACTACTTTTTCTCT
TTTCTCTTACTTACTTCC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2FM07JQ 719 0 0
AGCAATATAGAAATTACATGTTCACAATCAGACATTTGACAATCCGATATAGAATGTCTG
AGAAACAGAAATCCAAAGGGGAACGAAAACAGAATTGGAAATGAAATGAGCAGGGATTAT
TATGTGAATGACATAGCAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGAAA
CTGATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGTTAGGG
TACTCCTTCTTGCACTCTTGCACCTCCTTCAATACTTGAGCAGAGTCAGTGCATCCGAAT
AAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTCCGTGC
TCACGGTAGACAAATCCATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGG
AGAAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCAACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAGATAAA
GTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCCCG
TTGCTTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGGAT
GACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAGCG
GCGGAGGAGAGCATAGAGGAAGCCATTACTACTTTTTCTCTTTTCTCTTACTTACTTCC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL7340Contig1 991 2 8 U
GGACTCTCAGGCATTCACAATCTCACAGACTTTTCTTCTCAATTTCTTCTCTTCCATTAA
AGAATATTTGGTCCAGAGAAAACCACAACACATTCTTCTCTCCTGACCGTTGTTATATTT
GGAAATAAAAAATCCAATCTCTCTTTCATTCCTCTCCATTCAAAATTCGAGATCTAACCG
ATAAAACAGCCAAAAATGTCAGAGCAGTTTTCTGTTGGAAAAAAATAAAATTTTGACTGT
TATTTTGAATTGTGTTTGTCAAAAAGAAGAATATGGCCGAGGATGTCAAGAATGTTCAGG
GAGATGTACTTCCTCGAAGCAGCTCCAACTTATTAGACGATGATGGCCGTCCCAAGCGAA
CCGGGACGGTGTGGACAACAAGTGCACATATCATAACGGCAGTAATTGGGTCAGGAGTAT
TGTCTCTGGCATGGGCTATTGCTCAGCTTGGTTGGGTGGCTGGTCCAGTGGCAATGCTAC
TCTTCTCTTTCGTCAGTTATTACACTTCTACTCTCCTCGCTTCTTGTTACCGCTCCGGGG
ACCCTGTCACCGGCAAGAGAAACTACACTTACATGGACGCTATCCACTCCAACCTTGGTG
GCATTAAAGTGAAATTATGTGGAGTTGTGCAGTATGTTAATCTCTTTGGTACTGCAATTG
GATACACTATTGCATCAGCTATAAGCCTCATAGCAATCCAGAGGACAACTTGCCTACATA
ACAATGGGGGAAAAGAACCATGTCCTGTCAATGGCAGTGCTTACATTATTGGGTTCGGTG
TACTACAAATCCTATTATCTCAGATTCCTGATTTTGATCAGTTATGGTGGCTGTCCCTCG
TTGCTGCAGTCATGTTTTTTGGTTACTCCACCATTGGGCTTGGCCTTGGAATCTCCAAAG
TGATTGAGACAAAGAGATAAAGCACTCTCACTGGAGTCGCCGTTGGGACAGTGACACCCC
CGAGAAAATGTGGAGAACCTTTCAGCTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP96TF U 1
AF RR2EL75TF U 212
BS 1 694 RR2AP96TF
BS 695 695 RR2EL75TF
BS 696 777 RR2AP96TF
BS 778 778 RR2EL75TF
BS 779 814 RR2AP96TF
BS 815 815 RR2EL75TF
BS 816 848 RR2AP96TF
BS 849 991 RR2EL75TF

RD RR2AP96TF 848 0 0
GGACTCTCAGGCATTCACAATCTCACAGACTTTTCTTCTCAATTTCTTCTCTTCCATTAA
AGAATATTTGGTCCAGAGAAAACCACAACACATTCTTCTCTCCTGACCGTTGTTATATTT
GGAAATAAAAAATCCAATCTCTCTTTCATTCCTCTCCATTCAAAATTCGAGATCTAACCG
ATAAAACAGCCAAAAATGTCAGAGCAGTTTTCTGTTGGAAAAAAATAAAATTTTGACTGT
TATTTTGAATTGTGTTTGTCAAAAAGAAGAATATGGCCGAGGATGTCAAGAATGTTCAGG
GAGATGTACTTCCTCGAAGCAGCTCCAACTTATTAGACGATGATGGCCGTCCCAAGCGAA
CCGGGACGGTGTGGACAACAAGTGCACATATCATAACGGCAGTAATTGGGTCAGGAGTAT
TGTCTCTGGCATGGGCTATTGCTCAGCTTGGTTGGGTGGCTGGTCCAGTGGCAATGCTAC
TCTTCTCTTTCGTCAGTTATTACACTTCTACTCTCCTCGCTTCTTGTTACCGCTCCGGGG
ACCCTGTCACCGGCAAGAGAAACTACACTTACATGGACGCTATCCACTCCAACCTTGGTG
GCATTAAAGTGAAATTATGTGGAGTTGTGCAGTATGTTAATCTCTTTGGTACTGCAATTG
GATACACTATTGCATCAGCTATAAGCCTCATAGCGATCCAGAGGACAACTTGCCTACATA
ACAATGGGGGAAAAGAACCATGTCCTGTCAATGGCAGTGCTTACATTATTGGGTTCG*TG
TACTACAAATCCTATTATCTCAGATTCCTGATTT*GATCAGTTATGGTGGCTGTCCCTCG
TTGCTGCA

QA 1 848 1 848
DS 

RD RR2EL75TF 780 0 0
GG
GTTGGAAAAAAATAAAATTTTGACTGTTATTTTGAATTGTGTTTGTCAAAAAGAAGAATA
TGGTCGAGGATGTCAAGAATGTTCAGGGAGATGTACTTCCTCGAAGCAGCTCCAACTTAT
TAGACGATGATGGCCGTCCCAAGCGAACCGGGACGGTGTGGACAACAAGTGCACATATCA
TAACGGCAGTAATTGGGTCAGGAGTATTGTCTCTGGCATGGGCTATTGCTCAGCTTGGTT
GGGTGGCTGGTCCAGTGGCAATGCTACTCTTCTCTTTCGTCAGTTATTACACTTCTACTC
TCCTCGCTTCTTGTTACCGCTCCGGGGACCCTGTCACCGGCAAGAGAAACTACACTTACA
TGGACGCTATCCACTCCAACCTTGGTGGCATTAAGGTGAAATTATGTGGAGTTGTGCAGT
ATGTTAATCTCTTTGGTACTGCAATTGGATACACTATTGCATCAGCTATAAGCCTCATAG
CAATCCAGAGGACAACTTGCCTACATAACAATGGGGGAAAAGAACCATGTCCTGTCAATG
GCAGTGCTTACATTATTGGGTTCGGTGTACTACAAATCCTATTATCTCAGATTCCTGATT
TTGATCAGTTATGGTGGCTGTCCCTCGTTGCTGCAGTCATGTTTTTTGGTTACTCCACCA
TTGGGCTTGGCCTTGGAATCTCCAAAGTGATTGAGACAAAGAGATAAAGCACTCTCACTG
GAGTCGCCGTTGGGACAGTGACACCCCCGAGAAAATGTGGAGAACCTTTCAGCTCTTG

QA 3 780 3 780
DS 



AS 1 2

CO CL7341Contig1 859 2 6 U
GGGAAACCCTCCGAAACTACACAACACACTCTCTTCTCTCTCTCCGCCTCCATTATCTTC
GAAAGACCAAATCTGATCCTCTCTCTCTCTTCTTCTACCCGTTTCCTCCATTAACACACA
GAGAGCTCCAACAAGCTTCCTCCTTTACCTAAAGAGGAGAGAGAGAGAGAGTTTCCAGAT
CGGATCTGATTTTGAAAGATGCAGACGGCAAACAACGGTCCAGATTCGTCGTCGGCTACA
CCAGCCGGGACAACGCCACCTCCTCCCTCGCAACAACAACAACAACAGTGGCAACAACAT
CAACAATGGATGGCGGCTATGGCTATGATGCAGCAGCAGCAACAGATGATGATGTATCCT
CCTCACCACCAATACGCTCCTTACAACCAAGCTGCTGCTTATCCTCAGTTTCAATACGCT
CCTCCTTATCACCAGCAACAACAACAGAAGCAGCGTGGTGGATCTGGTGCTGGTGGAGAC
GATGTGAAGACTCTCTGGATCGGTGATCTTCTCCATTGGATGGACGAGACCTATCTCCAC
ACCTGTTTCTCTCACACCAACCAGGCTTCCTCTGTGAAAGTGATACGAAACAAGCAAACT
TGTCAGTCAGAAGGGTACGGTTTTGTCGAGTTCCTCTCACGTTCCGCAGCTGAGGAAGTT
CTTCAGAGCTATAGCGGCGTTACAATGCCTAACGCCGAGCAGCCCTTCCGTTTGAACTGG
GCATCTTTCAGTACCGGCGAGAAGAGAGCTCCGAAACACGGTCAGATCTATCTTTATTCG
TAGAGATTGGCTCCTGATGTGACGATACTCTGCTGATGAGACTTTGCTGCGTACAATCTG
TCAAAGTGCAAAGTTGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX27TF U 1
AF RR2GM14TF U 24
BS 1 87 RR2FX27TF
BS 88 89 RR2GM14TF
BS 90 168 RR2FX27TF
BS 169 170 RR2GM14TF
BS 171 609 RR2FX27TF
BS 610 859 RR2GM14TF

RD RR2FX27TF 609 0 0
GGGAAACCCTCCGAAACTACACAACACACTCTCTTCTCTCTCTCCGCCTCCATTATCTTC
GAAAGACCAAATCTGATCCTCTCTCTC**TTCTTCTACCCGTTTCCTCCATTAACACACA
GAGAGCTCCAACAAGCTTCCTCCTTTACCTAAAGAGGAGAGAGAGAGA**GTTTCCAGAT
CGGATCTGATTTTGAAAGATGCAGACGGCAAACAACGGTCCAGATTCGTCGTCGGCTACA
CCAGCCGGGACAACGCCACCTCCTCCCTCGCAACAACAACAACAACAGTGGCAACAACAT
CAACAATGGATGGCGGCTATGGCTATGATGCAGCAGCAGCAACAGATGATGATGTATCCT
CCTCACCACCAATACGCTCCTTACAACCAAGCTGCTGCTTATCCTCAGTTTCAATACGCT
CCTCCTTATCACCAGCAACAACAACAGAAGCAGCGTGGTGGATCTGGTGCTGGTGGAGAC
GATGTGAAGACTCTCTGGATCGGTGATCTTCTCCATTGGATGGACGAGACCTATCTCCAC
ACCTGTTTCTCTCACACCAACCAGGCTTCCTCTGTGAAAGTGATACGAAACAAGCAAACT
TGTCAGTCA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2GM14TF 836 0 0
GG
ACACTCTCTTCTCTCTCTCCGCCTCCATTATCTTCGAAAGACCAAATCTGATCCTCTCTC
TCTCTTCTTCTACCCGTTTCCTCCATTAACACACAGAGAGCTCCAACAAGCTTCCTCCTT
TACCTAAAGAGGAGAGAGAGAGAGAGTTTCCAGATCGGATCTGATTTTGAAAGATGCAGA
CGGCAAACAACGGTCCAGATTCGTCGTCGGCTACACCAGCCGGGACAACGCCACCTCCTC
CCTCGCAACAACAACAACA***GTGGCAACAACATCAACAATGGATGGCGGCTATGGCTA
TGATGCAGCAGCAGCAACAGATGATGATGTATCCTCCTCACCACCAGTACGCTCCTTACA
ACCAAGCTGCTGCTTATCCTCAGTTTCAATACGCTCCTCCTTATCACCAGCAACAACAAC
AGAAGCAGCGTGGTGGATCTGGTGCTGGTGGAGACGATGTGAAGACTCTCTGGATCGGTG
ATCTTCTCCATTGGATGGACGAGACTTATCTCCACACCTGTTTCTC**ACACCAACCAGG
TTTCCTCTGTGAAAGTGATACGAAACAAGCAAACTTGTCAGTCAGAAGGGTACGGTTTTG
TCGAGTTCCTCTCACGTTCCGCAGCTGAGGAAGTTCTTCAGAGCTATAGCGGCGTTACAA
TGCCTAACGCCGAGCAGCCCTTCCGTTTGAACTGGGCATCTTTCAGTACCGGCGAGAAGA
GAGCTCCGAAACACGGTCAGATCTATCTTTATTCGTAGAGATTGGCTCCTGATGTGACGA
TACTCTGCTGATGAGACTTTGCTGCGTACAATCTGTCAAAGTGCAAAGTTGTGA

QA 3 836 3 836
DS 



AS 1 2

CO CL7342Contig1 626 2 5 U
GGTGAAACTTATATTATTAAAGCAACACACATACATTTATTTAGGTTTGACAATACTTGA
CTAGTGACAAAAAAAAAAAGACAATACTTGACTAAACACTTGTGACTTTTGGAATAAGAG
ACACAATTCTCCAATCTAAGGTCACAATTCTTACACACACCTTTTGATACAACATGATAG
CTTACTTAATAACTAAGTAACATAGAACTAAGAACTCAATTACAAAATAACACCTTATTC
GAAGATTTTCAAATATCTTCCAAACACCGTTCCAAAGAGAGGAAGTAGTTATTGCGGCAG
ATATTATAAGAGGAAGGAAGACCAGACGTAACTCAGAGTTGGAGAGATGATAGCAATGAT
TGGCTGATGTTTCAAATCCTGAGCTGGTGTAACCTAGGAATGGTGATCTCATTTGAACTG
AAGATCTCTGAGATCTCGGTCATGGAACAGTCTCTATACTTGCGAGGGTTATCTTCTGAG
AGGAGCTCTTTGATGGGTCCATATACACGAGGATTCACCTTCTTGAACGTGGTGAAGAAA
TATGGCACTGAAACCCTCGGTACAGAAGCAGTATGCGCTAGCACTCTATGCTCCGCGCTT
ATGAACATGTCATTGGTTATGAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A595JQ U 31
AF RR2DB73JQ U 1
BS 1 363 RR2DB73JQ
BS 364 364 RR2A595JQ
BS 365 374 RR2DB73JQ
BS 375 375 RR2A595JQ
BS 376 626 RR2DB73JQ

RD RR2A595JQ 400 0 0
ATACATTTATTTAGGTTTGACAATACTTGACTAGTGACAAAAAAAAAAAGACAATACTTG
ACTAAACACTTGTGACTTTTGGAATAAGAGACACAATTCTCCAATCTAAGGTCACAATTC
TTACACACACCTTTTGATACAACATGATAGCTTACTTAATAACTAAGTAACATAGAACTA
AGAACTCAATTACAAAATAACACCTTATTCGAAGATTTTCAAATATCTTCCAAACACCGT
TCCAAAGAGAGGAAGTAGTTATTGCGGCAGATATTATAAGAGGAAGGAAGACCAGACGTA
ACTCAGAGTTGGAGAGATGATAGCAATGATTGGCTGATGTTTCAAATCCTGAGCTGGTGT
AACCTAGGAATGGTGATCTCATTTGAACTGAAGATCTCTG

QA 1 400 1 400
DS 

RD RR2DB73JQ 626 0 0
GGTGAAACTTATATTATTAAAGCAACACACATACATTTATTTAGGTTTGACAATACTTGA
CTAGTGACAAAAAAAAAAAGACAATACTTGACTAAACACTTGTGACTTTTGGAATAAGAG
ACACAATTCTCCAATCTAAGGTCACAATTCTTACACACACCTTTTGATACAACATGATAG
CTTACTTAATAACTAAGTAACATAGAACTAAGAACTCAATTACAAAATAACACCTTATTC
GAAGATTTTCAAATATCTTCCAAACACCGTTCCAAAGAGAGGAAGTAGTTATTGCGGCAG
ATATTATAAGAGGAAGGAAGACCAGACGTAACTCAGAGTTGGAGAGATGATAGCAATGAT
TGGTTGATGTTTCAGATCCTGAGCTGGTGTAACCTAGGAATGGTGATCTCATTTGAACTG
AAGATCTCTGAGATCTCGGTCATGGAACAGTCTCTATACTTGCGAGGGTTATCTTCTGAG
AGGAGCTCTTTGATGGGTCCATATACACGAGGATTCACCTTCTTGAACGTGGTGAAGAAA
TATGGCACTGAAACCCTCGGTACAGAAGCAGTATGCGCTAGCACTCTATGCTCCGCGCTT
ATGAACATGTCATTGGTTATGAACTG

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL7343Contig1 877 2 2 U
GTGAGCATAGAAACACTCAAAACTTAACCAAAAACAAAAATGGGAGAGGAAGAGAAGAAG
CAAGAAGTACCAGAGGAGAAGAACATGGAGGAGAACAAACCAGAGGAGGATAAAAAAGAA
GAAGGAAAGGAAGTTGAGGTTGGTGAGGAAAAAGGAGAAGATTCCGAGAAGAAAACTCAA
GAAGGAGAAGCTACTAAAGATTACAAAGATGAGTCTCCACCGGCGGCGCCGGAAGCTCCA
GCGCCACCTCCACCACCGCAAGAGATTATTCTCAAGGTGTACATGCACTGTGAAGGCTGT
GCAAGAAAAGTCCGCCGTTGCCTCAAAGGTTTCGAAGGAGTGGAAGATGTGATGACTGAT
TGTAAAGCGGGTAAAGTGGTGGTGAAGGGAGAAAAAGCTGACCCATTGAAAGTATTGGCC
AGAGTTCAAAAGAAGACCCACCGTGAAGTGGTGCTTATTTCTCCTATTCCTCCGCCATCT
CAGCCACCAGAGAAGAAAGCGGAGGAGGAGAAGCCCAAAGTGGAGGAAAAGAAAGTGGAG
CCTCCCGTAGTGGTTACGGTGGTCCTCAAGGTTCACATGCATTGCGAAGCTTGTGCGACG
GAGATCAAGAAACGGATCATGAGAATGAAAGGAGTGGAATCTGCTGAATCCGATTTGAAA
GCTTCTGAAGTGACGGTGAAAGGAGTGTTTGAACCGCAAAAGCTTGTAGAACACATTTAC
AAGCGGACTGGAAAACATGCTGCAATTATGAAAATTGATCCACCACCACCACCGCCACCT
GAAGAAGCGGCTGAGAAGAAGGAAGAAGGGAAAGGAGAAAATGACGGTGGAGAGTCCAAA
GGCGAGGAAGGGAAGGACGAGAAAGCAAAGACTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG92TF U 1
AF RR2EG92JQ C 125
BS 1 671 RR2EG92TF
BS 672 877 RR2EG92JQ

RD RR2EG92TF 671 0 0
GTGAGCATAGAAACACTCAAAACTTAACCAAAAACAAAAATGGGAGAGGAAGAGAAGAAG
CAAGAAGTACCAGAGGAGAAGAACATGGAGGAGAACAAACCAGAGGAGGATAAAAAAGAA
GAAGGAAAGGAAGTTGAGGTTGGTGAGGAAAAAGGAGAAGATTCCGAGAAGAAAACTCAA
GAAGGAGAAGCTACTAAAGATTACAAAGATGAGTCTCCACCGGCGGCGCCGGAAGCTCCA
GCGCCACCTCCACCACCGCAAGAGATTATTCTCAAGGTGTACATGCACTGTGAAGGCTGT
GCAAGAAAAGTCCGCCGTTGCCTCAAAGGTTTCGAAGGAGTGGAAGATGTGATGACTGAT
TGTAAAGCGGGTAAAGTGGTGGTGAAGGGAGAAAAAGCTGACCCATTGAAAGTATTGGCC
AGAGTTCAAAAGAAGACCCACCGTGAAGTGGTGCTTATTTCTCCTATTCCTCCGCCATCT
CAGCCACCAGAGAAGAAAGCGGAGGAGGAGAAGCCCAAAGTGGAGGAAAAGAAAGTGGAG
CCTCCCGTAGTGGTTACGGTGGTCCTCAAGGTTCACATGCATTGCGAAGCTTGTGCGACG
GAGATCAAGAAACGGATCATGAGAATGAAAGGAGTGGAATCTGCTGAATCCGATTTGAAA
GCTTCTGAAGT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2EG92JQ 753 0 0
GAAAGGAAGTTGAGGTTGGTGAGGAAAAAGGAGAAGATTCCGCGAAGAAAACTCAAGAAG
GAGAAGCTACTAAAGATTACAAAGATGAGTCTCCACCGGCGGCGCCGGAAGCTCCAGCGC
CACCTCCACCACCGCAAGAGATTATTCTCAAGGTGTACATGCACTGTGAAGGCTGTGCAA
GAAAAGTCCGCCGTTGCCTCAAAGGTTTCGAAGGAGTGGAAGATGTGATGACTGATTGTA
AAGCGGGTAAAGTGGTGGTGAAGGGAGAAAAAGCTGACCCATTGAAAGTATTGGCCAGAG
TTCAAAAGAAGACCCACCGTGAAGTGGTGCTTATTTTTCCTATTCCTCCGCCATCTCAGC
CACCAGAGAAGAAAGCGGAGGAGGAGAAGCCCAAAGTGGAGGAAAAGAAAGTGGAGCCTC
CCGTAGTGGTTACGGTGGTCCTCAAGGTTCACATGCATTGCGAAGCTTGTGCGACGGAGA
TCAAGAAACGGATCATGAGAATGAAAGGAGTGGAATTTGCTGAATCCGATTTGAAAGCTT
TTGAAGTGACGGTGAAAGGAGTGTTTGAACCGCAAAAGCTTGTAGAACACATTTACAAGC
GGACTGGAAAACATGCTGCAATTATGAAAATTGATCCACCACCACCACCGCCACCTGAAG
AAGCGGCTGAGAAGAAGGAAGAAGGGAAAGGAGAAAATGACGGTGGAGAGTCCAAAGGCG
AGGAAGGGAAGGACGAGAAAGCAAAGACTGATG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL7344Contig1 690 2 1 U
GCTGAGAAGATATGGCTCTACTTTGAAAGACACTGAGATCCAAGACCTTATGGAAGCGGC
TGATGTGGACAACAGTGGTACAATAGATTACAGTGAGTTTATTGCAGCGACGATTCATCT
GAATAAACTAGACAGAGAAGAGCATCTTGTGTCTGCGTTTCAGTACTTTGATAAAGATGG
AAGTGGTTACATCACCATTGATGAGCTGCAACAATCTTGCGTGGAACATGGGATGACCGA
TGTTTTTCTTGAGGATGTCATCAAAGAAGTTGATCAAGACAATGATGGACGGATTGACTA
TGGAGAATTTGTTGCGATGATGCAAAAGGGAAATGCTGGTATCGGGAGACGAACAATGAG
AAATAGCCTAAACATCAGCATGAGAGATGTGTAGGCACATACACACTACACAGCCAGTGT
ATTTGAACCATTTGCTCGGCCCAAGCTACAGAGAAGACTGAAGAGAAAACCGGATTAATA
GGTGCAGGAAGGGAGCTGAATCCCTTGAAGGTTTGAGTTTAAAATGTCTACTGTATGATT
ATTGGTGGATGAATAAGCAAAAAGTGTTTCCTTATGTTTCATCAGTAGGTGAGAGGACTA
TTTATATCGTCTCTCTGTTTTGTTTTGTTTGTTTGTAGCAAATGGTAAAGTTTGGTGAGC
TTTGTTTCATCTCCATTGTTAAAAGCTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BI27JQ C 1
AF RR2BI27TF U 1
BS 1 690 RR2BI27TF

RD RR2BI27JQ 690 0 0
GCTGAGAAGATATGGCTCTACTTTGAAAGACACTGAGATCCAAGACCTTATGGAAGCGGC
TGATGTGGACAACAGTGGTACAATAGATTACAGTGAGTTTATTGCAGCGACGATTCATCT
GAATAAACTAGACAGAGAAGAGCATCTTGTGTCTGCGTTTCAGTACTTTGATAAAGATGG
AAGTGGTTACATCACCATTGATGAGCTGCAACAATCTTGCGTGGAACATGGGATGACCGA
TGTTTTTCTTGAGGATGTCATCAAAGAAGTTGATCAAGACAATGATGGACGGATTGACTA
TGGAGAATTTGTTGCGATGATGCAAAAGGGAAATGCTGGTATCGGGAGACGAACAATGAG
AAATAGCCTAAACATCAGCATGAGAGATGTGTAGGCACATACACACTACACAGCCAGTGT
ATTTGAACCATTTGCTCGGCCCAAGCTACAGAGAAGACTGAAGAGAAAACCGGATTAATA
GGTGCAGGAAGGGAGCTGAATCCCTTGAAGGTTTGAGTTTAAAATGTCTACTGTATGATT
ATTGGTGGATGAATAAGCAAAAAGTGTTTCCTTATGTTTCATCAGTAGGTGAGAGGACTA
TTTATATCGTCTCTCTGTTTTGTTTTGTTTGTTTGTAGCAAATGGTAAAGTTTGGTGAGC
TTTGTTTCATCTCCATTGTTAAAAGCTTTG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2BI27TF 690 0 0
GCTGAGAAGATATGGCTCTACTTTGAAAGACACTGAGATCCAAGACCTTATGGAAGCGGC
TGATGTGGACAACAGTGGTACAATAGATTACAGTGAGTTTATTGCAGCGACGATTCATCT
GAATAAACTAGACAGAGAAGAGCATCTTGTGTCTGCGTTTCAGTACTTTGATAAAGATGG
AAGTGGTTACATCACCATTGATGAGCTGCAACAATCTTGCGTGGAACATGGGATGACCGA
TGTTTTTCTTGAGGATGTCATCAAAGAAGTTGATCAAGACAATGATGGACGGATTGACTA
TGGAGAATTTGTTGCGATGATGCAAAAGGGAAATGCTGGTATCGGGAGACGAACAATGAG
AAATAGCCTAAACATCAGCATGAGAGATGTGTAGGCACATACACACTACACAGCCAGTGT
ATTTGAACCATTTGCTCGGCCCAAGCTACAGAGAAGACTGAAGAGAAAACCGGATTAATA
GGTGCAGGAAGGGAGCTGAATCCCTTGAAGGTTTGAGTTTAAAATGTCTACTGTATGATT
ATTGGTGGATGAATAAGCAAAAAGTGTTTCCTTATGTTTCATCAGTAGGTGAGAGGACTA
TTTATATCGTCTCTCTGTTTTGTTTTGTTTGTTTGTAGCAAATGGTAAAGTTTGGTGAGC
TTTGTTTCATCTCCATTGTTAAAAGCTTTG

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL7345Contig1 717 2 4 U
GGACGTTCTGCACAACCATCCCAGCGACGTGGTTGATTGGACGAGCAGGTACAGTATTGC
AGTTGGCATAGCTCAGGGCATCTGCTACTTGTATGGATCCAAATCCAACACTCGTGATCC
AATCCTTGTACCAGATCTCTCTAGTAAAAAAATAATGCTTAAGTCGCTCACTGAGCCACT
AGTAGCAGACATTGAACTGTTCAAGGTAATTGATCCTTCCAGAAGCAACAGCAGCCTCTC
GGCAGTTGCAGGCACCATCGGCTACATTCCACCAGAGTATGCTTACACGATGAGAGTGAC
AATGGCTGGGAATGTGTACAGCTTTGGGGTGATTCTTCTGGAGTTGTTAACGGGAAAGCC
AGCTGTCAGCGAAGGAAGAGAGTTGGCGAAATGGGTGCAGAGCCAACAAGAGGAGCGCAA
CAACATTCTTGACCAAAGAGTGAGCAAAACATCAGGTGTAGCAACAAAGCAGATGATCCG
TGCCCTCAGTATTGCACTTGCCTGCATTAACATCTCTCCTGGGGCAAGGCCAAAGATGAA
GACTGTCCTACGAATGCTCACAAGACTCTAAGTATTAAGTATAAGATGATGCAATGATGT
GTTAATTTTTGCTTCTCTGGAAGCCTATTTATCTGCATCTCCATTTTTAAGATGCTCAGA
AACAACAAGGATCCAATGCATTCAAATTTGTAGTTTAAATCAGTCAATATCAGATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D051TF U 1
AF RR2D051JQ C 145
BS 1 649 RR2D051TF
BS 650 650 RR2D051JQ
BS 651 665 RR2D051TF
BS 666 717 RR2D051JQ

RD RR2D051TF 665 0 0
GGACGTTCTGCACAACCATCCCAGCGACGTGGTTGATTGGACGAGCAGGTACAGTATTGC
AGTTGGCATAGCTCAGGGCATCTGCTACTTGTATGGATCCAAATCCAACACTCGTGATCC
AATCCTTGTACCAGATCTCTCTAGTAAAAAAATAATGCTTAAGTCGCTCACTGAGCCACT
AGTAGCAGACATTGAACTGTTCAAGGTAATTGATCCTTCCAGAAGCAACAGCAGCCTCTC
GGCAGTTGCAGGCACCATCGGCTACATTCCACCAGAGTATGCTTACACGATGAGAGTGAC
AATGGCTGGGAATGTGTACAGCTTTGGGGTGATTCTTCTGGAGTTGTTAACGGGAAAGCC
AGCTGTCAGCGAAGGAAGAGAGTTGGCGAAATGGGTGCAGAGCCAACAAGAGGAGCGCAA
CAACATTCTTGACCAAAGAGTGAGCAAAACATCAGGTGTAGCAACAAAGCAGATGATCCG
TGCCCTCAGTATTGCACTTGCCTGCATTAACATCTCTCCTGGGGCAAGGCCAAAGATGAA
GACTGTCCTACGAATGCTCACAAGACTCTAAGTATTAAGTATAAGATGATGCAATGATGT
GTTAATTTTTGCTTCTCTGGAAGCCTATTTATCTGCATCTCCATTTTTA*GATGCTCAGA
AACAA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2D051JQ 573 0 0
TAAAAAAATAATGCTTAAGTCGCTCACTGAGCCACTAGTAGCAGACATTGAACTGTTCAA
GGTAATTGATCCTTCCAGAAGCAACAGCAGCCTCTCGGCAGTTGCAGGCACCATCGGCTA
CATTCCACCAGAGTATGCTTACACGATGAGAGTGACAATGGCTGGGAATGTGTACAGCTT
TGGGGTGATTTTTCTGGAGTTGTTAACGGGAAAGCCAGCTGTCAGCGAAGGAAGAGAGTT
GGCGAAATGGGTGCAGAGCCAACAAGAGGAGCGCAACAACATTCTTGACCAAAGAGTGAG
CAAAACATCAGGTGTAGCAACAAAGCAGATGATCCGTGCCCTCAGTATTGCACTTGCCTG
CATTAACATCTCTCCTGGGGCAAGGCCAAAGATGAAGACTGTCCTACGAATGCTCACAAG
ACTCTAAGTATTAAGTATAAGATGATGCAATGATGTGTTAATTTTTGCTTCTCTGGAAGC
CTATTTATCTGCATCTCCATTTTTAAGATGCTCAGAAACAACAAGGATCCAATGCATTCA
AATTTGTAGTTTAAATCAGTCAATATCAGATGA

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL7346Contig1 1039 2 4 U
GGATTGACATCTGTTGTAAACCTCTCACTCGGTTCTTTCTTCTAAGCGTCTCAGAAACTA
AAGGATATGGATATCTCAGACATAGCAAGAAAGCTCGATCTCTCTAACAACAAGCTTGTC
GTCCGGAAAGCTGCCGAGATTCGCCGTCTTTGCGATGCTCAGTTCGATTCATCCGCCATC
GGTGTTGGTGAGATCTGTAAAGCTGTGATCTGTCTCGAAATCGCAGCGTCTCGGTTGCAG
GTTATTTTCGACAGACAAGCAGCGATTAAGTTGAGTGGTATGTCGGAAAAGGCATACACG
AGATCATTCAATAGCCTCCAAAACGTTATTGGAGTCAAGATTAAGCTCAATGTAAAAGAA
CTGGCGATTCAGTTTGGGTGCGTTAGGATCATCAAATCCGTGCAAAATATGCTATCTTTG
TATAAAGAGAGGTTTCTTGCATCGCTACCAGCGTCAAGACGGGCGAATGCTGACTTCACT
AGACCTGTATTTACAGCTGCTGCTTTCTATTTGTGTGCTAAGAAGCAAAAGCTTAAGGTA
GATAAGCTTAGGTTGGTTGAGGTTTGTGGAACATCAGAATCTGAATTCTCCTGCGTGTCT
ACCTCCATGATGGACCTTTGCTTTGACTGTGTTGGGGTCTCCAAGGAGAAGAAAGATGCA
AAAGACGTCAAAGGAAACAGAGAGTTGCTTGATGTGATACCTGGAAAGAGGAGACTAGAG
GACGGTGGATATTCATCTGATGATGAGTCTTCTTGCTACAAAAGACACAAGAAGATGGAG
AAGGCTAAGTACGAGGATTGGAAATCGACAGTTGTTAATTCGATCAAGAAGAATCCAGAG
AAAGGACCTAAGAAAGTTATACAGACTAGTCTCAATTTCACAAAGAAAGCTGAGACTGAA
GAGTTGCAAGTTGATTCGTAGTCAAAGACTCAGATCCCGTTCAATTTCTTGTTGTTTTCA
CCACATGATATATGTGTAAATTACAGTCCTTGAAAGAAATATTTTTTCCTATACCATTCT
GCTCAATGACATTTGGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BB62TF U 1
AF RR2BB62JQ C 75
BS 1 762 RR2BB62TF
BS 763 763 RR2BB62JQ
BS 764 783 RR2BB62TF
BS 784 1039 RR2BB62JQ

RD RR2BB62TF 790 0 0
GGATTGACATCTGTTGTAAACCTCTCACTCGGTTCTTTCTTCTAAGCGTCTCAGAAACTA
AAGGATATGGATATCTCAGACATAGCAAGAAAGCTCGATCTCTCTAACAACAAGCTTGTC
GTCCGGAAAGCTGCCGAGATTCGCCGTCTTTGCGATGCTCAGTTCGATTCATCCGCCATC
GGTGTTGGTGAGATCTGTAAAGCTGTGATCTGTCTCGAAATCGCAGCGTCTCGGTTGCAG
GTTATTTTCGACAGACAAGCAGCGATTAAGTTGAGTGGTATGTCGGAAAAGGCATACACG
AGATCATTCAATAGCCTCCAAAACGTTATTGGAGTCAAGATTAAGCTCAATGTAAAAGAA
CTGGCGATTCAGTTTGGGTGCGTTAGGATCATCAAATCCGTGCAAAATATGCTATCTTTG
TATAAAGAGAGGTTTCTTGCATCGCTACCAGCGTCAAGACGGGCGAATGCTGACTTCACT
AGACCTGTATTTACAGCTGCTGCTTTCTATTTGTGTGCTAAGAAGCAAAAGCTTAAGGTA
GATAAGCTTAGGTTGGTTGAGGTTTGTGGAACATCAGAATCTGAATTCTCCTGCGTGTCT
ACCTCCATGATGGACCTTTGCTTTGACTGTGTTGGGGTCTCCAAGGAGAAGAAAGATGCA
AAAGACGTCAAAGGAAACAGAGAGTTGCTTGATGTGATACCTGGAAAGAGGAGACTAGAG
GACGGTGGATATTCATCTGATGATGAGTCTTCTTGCTACAAA*GACACAAGAAGATGGAG
AAG
CTAAGTA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2BB62JQ 965 0 0
CTCAGACATAGCAAGAAAGCTCGATCTCTCTAACA*CAAGCT*GTCGTC*GGAAAGCTGC
CGAGATTCGC*GTCTTTGCGATGCTCAGTTCGATTCATCCGCCATCGGTGTTGGTGAGAT
CTGTAAAGCTGTGATCTGTCTCGAAATCGCAGCGTCTCGGTTGCAGGTTATTTTCGACAG
ACAAGCAGCGATTAAGTTGAGTGGTATGTCGGAAAAGGCATACACGAGATCATTCAATAG
CCTCCAAAACGTTATTGGAGTCAAGATTAAGCTCAATGTAAAAGAACTGGCGATTCAGTT
TGGGTGCGTTAGGATCATCAAATCCGTGCAAAATATGCTATCTTTGTATAAAGAGAGGTT
TCTTGCATCGCTACCAGCGTCAAGACGGGCGAATGCTGACTTCACTAGACCTGTATTTAC
AGCTGCTGCTTTCTATTTGTGTGCTAAGAAGCAAAAGCTTAAGGTAGATAAGCTTAGGTT
GGTTGAGGTTTGTGGAACATCAGAATCTGAATTCTCCTGCGTGTCTACCTCCATGATGGA
CCTTTGCTTTGACTGTGTTGGGGTCTCCAAGGAGAAGAAAGATGCAAAAGACGTCAAAGG
AAACAGAGAGTTGCTTGATGTGATACCTGGAAAGAGGAGACTAGAGGACGGTGGATATTC
ATCTGATGATGAGTCTTCTTGCTACAAAAGACACAAGAAGATGGAGAAGGCTAAGTACGA
GGATTGGAAATCGACAGTTGTTAATTCGATCAAGAAGAATCCAGAGAAAGGACCTAAGAA
AGTTATACAGACTAGTCTCAATTTCACAAAGAAAGCTGAGACTGAAGAGTTGCAAGTTGA
TTCGTAGTCAAAGACTCAGATCCCGTTCAATTTCTTGTTGTTTTCACCACATGATATATG
TGTAAATTACAGTCCTTGAAAGAAATATTTTTTCCTATACCATTCTGCTCAATGACATTT
GGCAT

QA 1 965 1 965
DS 



AS 1 2

CO CL7347Contig1 839 2 2 U
GGAACACGCGACGGACCACGAACGCCGGTGACCTAATCTCCTCGCTATTCTCCACCGATC
GAATATCTCCTACTGACGCTTGAAGATAACTGATAAATGGACAACAACACTGTGAGTAGC
ATTAAGCAAGAATCACCACCGCCTCTTCCTCCAGGGATCTATGAGATACCGGGAGAGCCT
GCGGTTGTTATCAACGGTGTCCCTGATGAGCCTCAAACAGACTCCATGATTGCCAAAGAC
GAACCGAAACCAACGAGTGCCGCCACTGTAGGATGCGGAGAATGGCTTGAAGGCAGAGAA
GTTCGCAAGTTTTTCTTGGGTCAGTACTATTCAGGTACGGTGACGAAGTTCGACAAAGGT
ACTGGTTGGTACATGGTCGAGTATGAAGATGGGGATTCTGAAGAGCTTGATTGGTCTGAG
CTAGAGGAAGTGCTTCTACCTATGGATGTTACTGTACCACTGAGATCAATCTCCTTATGG
GTCATCAAGAATCGTCAGACGCAGGCCCAAGCTTATGGAAGCATGGTGAAACACTAATGG
GTCTTTTGCTTATTGTGCAGAGTGAATATGGTGAAGCACGATGAGAAGAGGTTACAAGTC
TTTTGAACATTTCCTTATTAGTTGAATATTTTTATGCCTTTCGTAAACACTTTAACAATC
TTTTGAACATTTCCTCATCAGTTGAATATTTTTATATTCAATCAAACTGAATATAGTAGT
CAATTAAAGAATCATTCCAAGATGTTGATCCACATCGTGGAGTTTTGCTTGTAAGCACGT
CTCCTTATTGGTTTCGCTGTAATTATCAGACATATGTTAGTTATTTAGATGTCGCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F071TF U 1
AF RR2F071JQ C 207
BS 1 760 RR2F071TF
BS 761 839 RR2F071JQ

RD RR2F071TF 760 0 0
GGAACACGCGACGGACCACGAACGCCGGTGACCTAATCTCCTCGCTATTCTCCACCGATC
GAATATCTCCTACTGACGCTTGAAGATAACTGATAAATGGACAACAACACTGTGAGTAGC
ATTAAGCAAGAATCACCACCGCCTCTTCCTCCAGGGATCTATGAGATACCGGGAGAGCCT
GCGGTTGTTATCAACGGTGTCCCTGATGAGCCTCAAACAGACTCCATGATTGCCAAAGAC
GAACCGAAACCAACGAGTGCCGCCACTGTAGGATGCGGAGAATGGCTTGAAGGCAGAGAA
GTTCGCAAGTTTTTCTTGGGTCAGTACTATTCAGGTACGGTGACGAAGTTCGACAAAGGT
ACTGGTTGGTACATGGTCGAGTATGAAGATGGGGATTCTGAAGAGCTTGATTGGTCTGAG
CTAGAGGAAGTGCTTCTACCTATGGATGTTACTGTACCACTGAGATCAATCTCCTTATGG
GTCATCAAGAATCGTCAGACGCAGGCCCAAGCTTATGGAAGCATGGTGAAACACTAATGG
GTCTTTTGCTTATTGTGCAGAGTGAATATGGTGAAGCACGATGAGAAGAGGTTACAAGTC
TTTTGAACATTTCCTTATTAGTTGAATATTTTTATGCCTTTCGTAAACACTTTAACAATC
TTTTGAACATTTCCTCATCAGTTGAATATTTTTATATTCAATCAAACTGAATATAGTAGT
CAATTAAAGAATCATTCCAAGATGTTGATCCACATCGTGG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2F071JQ 633 0 0
TGAGCCTCAAACAGACTCCATGATTGCCAAAGACGAACCGAAACCAACGAGTGCCGCCAC
TGTAGGATGCGGAGAATGGCTTGAAGGCAGAGAAGTTCGCAAGTTTTTCTTGGGTCAGTA
CTATTCAGGTACGGTGACGAAGTTCGACAAAGGTACTGGTTGGTACATGGTCGAGTATGA
AGATGGGGATTCTGAAGAGCTTGATTGGTCTGAGCTAGAGGAAGTGCTTCTACCTATGGA
TGTTACTGTACCACTGAGATCAATCTCCTTATGGGTCATCAAGAATCGTCAGACGCAGGC
CCAAGCTTATGGAAGCATGGTGAAACACTAATGGGTCTTTTGCTTATTGTGCAGAGTGAA
TATGGTGAAGCACGATGAGAAGAGGTTACAAGTCTTTTGAACATTTCCTTATTAGTTGAA
TATTTTTATGCCTTTCGTAAACACTTTAACAATCTTTTGAACATTTCCTCATCAGTTGAA
TATTTTTATATTCAATCAAACTGAATATAGTAGTCAATTAAAGAATCATTCCAAGATGTT
GATCCACATCGTGGAGTTTTGCTTGTAAGCACGTCTCCTTATTGGTTTCGCTGTAATTAT
CAGACATATGTTAGTTATTTAGATGTCGCTTTC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL7348Contig1 726 2 2 U
GGAGAAAAATCTGGAACAAAAACAAAGCATAGACGCGAGAGAAGGAAGAGGGAGGAAATC
AACTCAGCTCCGCTAGTTTCCAAGCATCACAGCGTCAATGTCAGTAACATTGCACACGAA
TCTGGGGGATATAAAGTGCGAGATCTTCTGTGACGAGGTTCCAAAGAGTGCCGAGAACTT
TCTGGCGCTATGTGCAAGTGGCTATTACGATGGGACTATCTTTCACAGGAATATAAAAGG
CTTCATGATTCAAGGCGGAGACCCAACCGGTACAGGGAAAGGAGGAACTAGCATCTGGGG
AAAGAAATTCAATGACGAGATTCGTGACTCCCTTAAGCACAATGCAAGAGGGATGCTCTC
GATGGCAAACAGTGGCCCAAACACAAACGGGAGCCAGTTCTTCCTTACCTATGCCAAACA
ACCTCATCTCAATGGATTATACACCATCTTTGGCAAAGTCATCCATGGCTTCGAAGTGCT
TGACATTATGGAAAAGACTCAAACAGGTGCGGGAGATAGGCCGCTTGCTGAGATAAGGCT
AAACCGTGTGACAATCCACGCCAATCCACTTGCTGCTTAATAAGTCAGAATCCCGCTGCC
GCAGAGCTGAACCAAAGCCCTATTCGTCTTCACCTATTAAAAAGTTTGTACTGTTTTTTT
TTTTTTATTATCACTCACTGTCATCATCAAGTTTAGAAATCCATGTCCTGAGGGAGAGAG
AGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE72TF U 1
AF RR2CE72JQ C 191
BS 1 643 RR2CE72TF
BS 644 726 RR2CE72JQ

RD RR2CE72TF 643 0 0
GGAGAAAAATCTGGAACAAAAACAAAGCATAGACGCGAGAGAAGGAAGAGGGAGGAAATC
AACTCAGCTCCGCTAGTTTCCAAGCATCACAGCGTCAATGTCAGTAACATTGCACACGAA
TCTGGGGGATATAAAGTGCGAGATCTTCTGTGACGAGGTTCCAAAGAGTGCCGAGAACTT
TCTGGCGCTATGTGCAAGTGGCTATTACGATGGGACTATCTTTCACAGGAATATAAAAGG
CTTCATGATTCAAGGCGGAGACCCAACCGGTACAGGGAAAGGAGGAACTAGCATCTGGGG
AAAGAAATTCAATGACGAGATTCGTGACTCCCTTAAGCACAATGCAAGAGGGATGCTCTC
GATGGCAAACAGTGGCCCAAACACAAACGGGAGCCAGTTCTTCCTTACCTATGCCAAACA
ACCTCATCTCAATGGATTATACACCATCTTTGGCAAAGTCATCCATGGCTTCGAAGTGCT
TGACATTATGGAAAAGACTCAAACAGGTGCGGGAGATAGGCCGCTTGCTGAGATAAGGCT
AAACCGTGTGACAATCCACGCCAATCCACTTGCTGCTTAATAAGTCAGAATCCCGCTGCC
GCAGAGCTGAACCAAAGCCCTATTCGTCTTCACCTATTAAAAA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2CE72JQ 536 0 0
TGTGCAAGTGGCTATTACGATGGGACTATCTTTCACAGGAATATAAAAGGCTTCATGATT
CAAGGCGGAGACCCAACCGGTACAGGGAAAGGAGGAACTAGCATTTGGGGAAAGAAATTC
AATGACGAGATTCGTGACTCCCTTAAGCACAATGCAAGAGGGATGCTCTGGATGGCAAAC
AGTGGCCCAAACACAAACGGGAGCCAGTTTTTCCTTACCTATGCCAAACAACCTCATCTC
AATGGATTATACACCATTTTTGGCAAAGTCATCCATGGCTTCGAAGTGCTTGACATTATG
GAAAAGACTCAAACAGGTGCGGGAGATAGGCCGCTTGCTGAGATAAGGCTAAACCGTGTG
ACAATCCACGCCAATCCACTTGCTGCTTAATAAGTCAGAATCCCGCTGCCGCAGAGCTGA
ACCAAAGCCCTATTCGTTTTCACCTATTAAAAAGTTTGTACTGTTTTTTTTTTTTTATTA
TCACTCACTGTCATCATCAAGTTTAGAAATCCATGTCCTGAGGGAGAGAGAGTTCC

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 2

CO CL7349Contig1 760 2 5 U
TTGTTGTTTACGGTACCGAAGGTTCCAAGATTGTGAAAGCGTTTAGGAACCTTCCTGGTG
TTGAGCTTTGCCACGTGGAGAGGCTTAACTTGTTGAAGCTTGCTCCTGGTAGTCACCTCG
GGAGGTTTGTGGTTTGGACCAAGTCTGCTTTCGAGAAGCTTGAGGGGATCTATGGGTCGT
TTGAGAAGGGTTCGGAGATGAAGAAAGGGTATGTGCTTCCTAGGGCTAAGATGGTGAATG
CTGATTTGGCGAGGATTATTAACTCTGACGAGGTTCAGAGTGTGGTGAAGCCGATTAAGA
AGGATGCGGCGAGGGCTGTGATGAAGAAGAATCCTTTGAAGAATTTGAATGTGATGTTGA
AGTTGAATCCGTATGCTAAGACTGCTAAGAGGATGTCTTTGTTGGCCGAGGCGCAGAGGG
TTAAGTCCAAGAGTGAGAAACTCACCAAGAAGAGGAAGACGGTTACTAAGGAGGAGGCAT
TGGCGATCAAAGCAGCAGGGAAGTCGTGGTACCAGACTATGATCTCCGACAGTGACTACA
CCGAGTTTGACAACTTCACCAAATGGCTCGGTGCTAGCCAGTGATACTATCTATCATATG
CGTGAAATGTTGTCGTCTTTAGGGAAAGGTTTTGGTTTTATATCTATTTGGTTTTTTTAT
GTCGTAATTCTAAGTTCAGCTTTGGACAAGTTATGTCATTTTTCATTTTTGGACCTTGCT
TTCATCAATCGAACCAAGTTTAAGACAGCTTTATTCTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G340JQ C 1
AF RR2BB92TF U 44
BS 1 44 RR2G340JQ
BS 45 110 RR2BB92TF
BS 111 111 RR2G340JQ
BS 112 742 RR2BB92TF
BS 743 760 RR2G340JQ

RD RR2G340JQ 760 0 0
TTGTTGTTTACGGTACCGAAGGTTCCAAGATTGTGAAAGCGTTTAGGAACCTTCCTGGTG
TTGAGCTTTGCCACGTGGAGAGGCTTAACTTGTTGAAGCTTGCTCCTGGTAGTCACCTCG
GGAGGTTTGTGGTTTGGACCAAGTCTGCTTTCGAGAAGCTTGAGGGGATCTATGGGTCGT
TTGAGAAGGGTTCGGAGATGAAGAAAGGGTATGTGCTTCCTAGGGCTAAGATGGTGAATG
CTGATTTGGCGAGGATTATTAACTCTGACGAGGTTCAGAGTGTGGTGAAGCCGATTAAGA
AGGATGCGGCGAGGGCTGTGATGAAGAAGAATCCTTTGAAGAATTTGAATGTGATGTTGA
AGTTGAATCCGTATGCTAAGACTGCTAAGAGGATGTCTTTGTTGGCCGAGGCGCAGAGGG
TTAAGTCCAAGAGTGAGAAACTCACCAAGAAGAGGAAGACGGTTACTAAGGAGGAGGCAT
TGGCGATCAAAGCAGCAGGGAAGTCGTGGTACCAGACTATGATCTCCGACAGTGACTACA
CCGAGTTTGACAACTTCACCAAATGGCTCGGTGCTAGCCAGTGATACTATCTATCATATG
CGTGAAATGTTGTCGTCTTTAGGGAAAGGTTTTGGTTTTATATCTATTTGGTTTTTTTAT
GTCGTAATTCTAAGTTCATCTTTGGACAAGTTATGTCATTTTTCATTTTTGGACCTTGCT
TTCATCAATCGAACCAAGTTTAAGACAGCTTTATTCTTCT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2BB92TF 699 0 0
G
AGGAACCTTCCTGGTGTTGAGCTTTGCCACGTGGAGAGGCTTAACTTGTTGAAGCTTGCT
CCTGGTGGTCACCTCGGGAGGTTTGTGGTTTGGACCAAGTCTGCTTTCGAGAAGCTTGAG
GGGATCTATGGGTCGTTTGAGAAGGGTTCGGAGATGAAGAAAGGGTATGTGCTTCCTAGG
GCTAAGATGGTGAATGCTGATTTGGCGAGGATTATTAACTCTGACGAGGTTCAGAGTGTG
GTGAAGCCGATTAAGAAGGATGCGGCGAGGGCTGTGATGAAGAAGAATCCTTTGAAGAAT
TTGAATGTGATGTTGAAGTTGAATCCGTATGCTAAGACTGCTAAGAGGATGTCTTTGTTG
GCCGAGGCGCAGAGGGTTAAGTCCAAGAGTGAGAAACTCACCAAGAAGAGGAAGACGGTT
ACTAAGGAGGAGGCATTGGCGATCAAAGCAGCAGGGAAGTCGTGGTACCAGACTATGATC
TCCGACAGTGACTACACCGAGTTTGACAACTTCACCAAATGGCTCGGTGCTAGCCAGTGA
TACTATCTATCATATGCGTGAAATGTTGTCGTCTTTAGGGAAAGGTTTTGGTTTTATATC
TATTTGGTTTTTTTATGTCGTAATTCTAAGTTCAGCTTTGGACAAGTTATGTCATTTTTC
ATTTTTGGACCTTGCTTTCATCAATCGAACCAAGTTTA

QA 2 699 2 699
DS 



AS 1 2

CO CL7350Contig1 946 2 2 U
GGGACGTTCGTTACTAACTGAAACTCTCGACGCCAAGTTGCGTAGCCGTAATCGTCCTCA
CTGTTCTCGTGATTCCTCTCCTTCTCTCTCTGTGGAGGTTTAAGAATCGGAATGTATGAT
CCGGTCAAAAACGTGTACGTTGGGAAAGACCATGTAGGTGATGTTCCATTGAGCAAGAAA
ATCCTTGCTGGTTTGACAACAGCGAATCCCACGGATCTTGTGAAAGTAATACTCCAAGCT
GAAGGGAAACTAGCTGCAGGTGTACCAAAACGGTACACTGGAGCGCTGAATGCGTATTCA
ACAATTGTGAGACAGGAAGGAGTCCGAGCTCTTTGGACTGGTCTTGGACCTAATGTAGCT
AGAAACGCTATCATCAATGCTGCTGAATTAGCGAGTTACGATCAAGTGAAACAGACAATC
TTGAAGGTTCCTGGTTTCACTGATAACGTTGTCACACATATTCTATCTGGACTGGGAGCA
GGATTCTTTGCTGTCTGCATCGGTTCCCCTGTTGACGTGGTGAAGTCAAGAATGATGGGC
GATTCTGCTTACAAGAACACTATAGACTGCTTCGTCAAAACACTGAAGAGCGACGGTCCT
ATGTCATTTTACAAAGGTTTCCTCCCTAACTTTGGACGCCTTGGCTCATGGAACGTCATC
ATGTTTTTGACCCTCGAACAGGCAAAGAAGTATGTCCGAGAACTAGATTCATCTAAATAA
TACGGAGACACACAAAGCTTCAGGCAGAGATAATAAGAGCACCACTGTTTTCTAGTTAAT
TTCGGTGGTCGAGAGAGAGGACTAGAATCGTCCAGAATAGCGAGTTGCTTTCAATCAAAA
CTGTGAAATAAATTTCCTGTTGGTAGTAGCTCATATTTGGGCTTGTACCATTCAAACATT
TATATGAACACCAGAGATCCATCTAAATAATCCTCATATCTCTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A591TF U 1
AF RR2A591JQ C 190
BS 1 720 RR2A591TF
BS 721 946 RR2A591JQ

RD RR2A591TF 720 0 0
GGGACGTTCGTTACTAACTGAAACTCTCGACGCCAAGTTGCGTAGCCGTAATCGTCCTCA
CTGTTCTCGTGATTCCTCTCCTTCTCTCTCTGTGGAGGTTTAAGAATCGGAATGTATGAT
CCGGTCAAAAACGTGTACGTTGGGAAAGACCATGTAGGTGATGTTCCATTGAGCAAGAAA
ATCCTTGCTGGTTTGACAACAGCGAATCCCACGGATCTTGTGAAAGTAATACTCCAAGCT
GAAGGGAAACTAGCTGCAGGTGTACCAAAACGGTACACTGGAGCGCTGAATGCGTATTCA
ACAATTGTGAGACAGGAAGGAGTCCGAGCTCTTTGGACTGGTCTTGGACCTAATGTAGCT
AGAAACGCTATCATCAATGCTGCTGAATTAGCGAGTTACGATCAAGTGAAACAGACAATC
TTGAAGGTTCCTGGTTTCACTGATAACGTTGTCACACATATTCTATCTGGACTGGGAGCA
GGATTCTTTGCTGTCTGCATCGGTTCCCCTGTTGACGTGGTGAAGTCAAGAATGATGGGC
GATTCTGCTTACAAGAACACTATAGACTGCTTCGTCAAAACACTGAAGAGCGACGGTCCT
ATGTCATTTTACAAAGGTTTCCTCCCTAACTTTGGACGCCTTGGCTCATGGAACGTCATC
ATGTTTTTGACCCTCGAACAGGCAAAGAAGTATGTCCGAGAACTAGATTCATCTAAATAA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2A591JQ 757 0 0
GGTTTGACAACAGCGAATCCCACGGATCTTGTGAAAGTAATACTCCAAGCTGAAGGGAAA
CTAGCTGCAGGTGTACCAAAACGGTACACTGGAGCGCTGAATGCGTATTCAACAATTGTG
AGACAGGAAGGAGTCCGAGCTCTTTGGACTGGTCTTGGACCTAATGTAGCTAGAAACGCT
ATCATCAATGCTGCTGAATTAGCGAGTTACGATCAAGTGAAACAGACAATCTTGAAGGTT
CCTGGTTTCACTGATAACGTTGTCACACATATTCTATCTGGACTGGGAGCAGGATTCTTT
GCTGTCTGCATCGGTTCCCCTGTTGACGTGGTGAAGTCAAGAATGATGGGCGATTCTGCT
TACAAGAACACTATAGACTGCTTCGTCAAAACACTGAAGAGCGACGGTCCTATGTCATTT
TACAAAGGTTTCCTCCCTAACTTTGGACGCCTTGGCTCATGGAACGTCATCATGTTTTTG
ACCCTCGAACAGGCAAAGAAGTATGTCCGAGAACTAGATTCATCTAAATAATACGGAGAC
ACACAAAGCTTCAGGCAGAGATAATAAGAGCACCACTGTTTTCTAGTTAATTTCGGTGGT
CGAGAGAGAGGACTAGAATCGTCCAGAATAGCGAGTTGCTTTCAATCAAAACTGTGAAAT
AAATTTCCTGTTGGTAGTAGCTCATATTTGGGCTTGTACCATTCAAACATTTATATGAAC
ACCAGAGATCCATCTAAATAATCCTCATATCTCTCAC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7352Contig1 996 2 2 U
GGACCCTAATTTTGAGCGTAGATTTATTGGTTGTTGTTCAGAGAAGAAGAAGAAGACGAT
GGGAAGAGGAAGGATTGAGATTAAGAAGATTGAGAATGTGAACAGTCGTCAAGTCACTTT
CTCCAAAAGACGTAACGGGTTGATGAAGAAGGGCAAGGAACTTTCTATCCTCTGCGACGC
TGAGGTTGCTCTTATCATCTTCTCCAGCACCGGCAAGGTTTACGATTTCTCCAGCGGCTG
TATGGAACAAACCCTTTCAAGATATGGACACAGTGCTGCGTCCGCCGATCATAAACCAAA
AGAAGAAGAAGAACAACTTCTACTCTGTTCTTCGCAAGAGAACGGTGCTGTTGTGTTGCG
TAAAGATGATGCTATGAAGAACGAACTTGAGAGATTACAGCTTGCAATTCAGAGGCTGAA
GGGTAAGGAGCTTGAGGGTATGAGTTTCTCGGATCTTATCTCTCTTGAAAACCAGTTGAA
TGATAGCTTGCATAGTGTCAAGGATCAAAAGACTCAAATCTTGCTCAACCAGGTGGAAAG
ATCCCGGTTAAAGGAAAGAAGAGCATTGGAAGAGAACCAAATCTTGCGCAAACAGGTAGA
GATGTTGGGGAGAGTTTCATCAGGACCAAAAGGGCTGAGTGAAATACCTCAGTTTTCTAG
CCCACAAGCGGAGCCCGAGAGCTCTTCATCAGATGATGACGACGAGAATGACCTTCATTC
CGACACTTCCTTGCAGCTGGGGTTGTCGTCATCGGGGTATGGTACAAAGAGAAAGAAGCC
GAAGATTGAATCTCCATGTGGCTATAACTCTGGAAGTCAAGTTGCTTCTGATTTATTAAA
TATCAATTTGTTAGTCTCCTAATTATGGTGTTTAGTAGAGGTTTTAAATGTGTATTCTCC
TTGTTTCTCCAAGTAGAGATTGATTTTATGTGTTTAAGTTGATTTTATGTGTTTAAGTGA
ACCATTTTTTTCCTTTAAATCAAGAAGGATTTGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX64TFB U 1
AF RR2AX64JQ C 217
BS 1 748 RR2AX64TFB
BS 749 996 RR2AX64JQ

RD RR2AX64TFB 748 0 0
GGACCCTAATTTTGAGCGTAGATTTATTGGTTGTTGTTCAGAGAAGAAGAAGAAGACGAT
GGGAAGAGGAAGGATTGAGATTAAGAAGATTGAGAATGTGAACAGTCGTCAAGTCACTTT
CTCCAAAAGACGTAACGGGTTGATGAAGAAGGGCAAGGAACTTTCTATCCTCTGCGACGC
TGAGGTTGCTCTTATCATCTTCTCCAGCACCGGCAAGGTTTACGATTTCTCCAGCGGCTG
TATGGAACAAACCCTTTCAAGATATGGACACAGTGCTGCGTCCGCCGATCATAAACCAAA
AGAAGAAGAAGAACAACTTCTACTCTGTTCTTCGCAAGAGAACGGTGCTGTTGTGTTGCG
TAAAGATGATGCTATGAAGAACGAACTTGAGAGATTACAGCTTGCAATTCAGAGGCTGAA
GGGTAAGGAGCTTGAGGGTATGAGTTTCTCGGATCTTATCTCTCTTGAAAACCAGTTGAA
TGATAGCTTGCATAGTGTCAAGGATCAAAAGACTCAAATCTTGCTCAACCAGGTGGAAAG
ATCCCGGTTAAAGGAAAGAAGAGCATTGGAAGAGAACCAAATCTTGCGCAAACAGGTAGA
GATGTTGGGGAGAGTTTCATCAGGACCAAAAGGGCTGAGTGAAATACCTCAGTTTTCTAG
CCCACAAGCGGAGCCCGAGAGCTCTTCATCAGATGATGACGACGAGAATGACCTTCATTC
CGACACTTCCTTGCAGCTGGGGTTGTCG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2AX64JQ 780 0 0
GGTTTACGATTTCTCCAGCGGCTGTATGGAACAAACCCTTTCAAGATATGGACACAGTGC
TGCGTCCGCCGATCATAAACCAAAAGAAGAAGAAGAACAACTTCTACTCTGTTCTTCGCA
AGAGAACGGTGCTGTTGTGTTGCGTAAAGATGATGCTATGAAGAACGAACTTGAGAGATT
ACAGCTTGCAATTCAGAGGCTGAAGGGTAAGGAGCTTGAGGGTATGAGTTTCTCGGATCT
TATCTCTCTTGAAAACCAGTTGAATGATAGCTTGCATAGTGTCAAGGATCAAAAGACTCA
AATCTTGCTCAACCAGGTGGAAAGATCCCGGTTAAAGGAAAGAAGAGCATTGGAAGAGAA
CCAAATCTTGCGCAAACAGGTAGAGATGTTGGGGAGAGTTTCATCAGGACCAAAAGGGCT
GAGTGAAATACCTCAGTTTTCTAGCCCACAAGCGGAGCCCGAGAGCTCTTCATCAGATGA
TGACGACGAGAATGACCTTCATTCCGACACTTCCTTGCAGCTGGGGTTGTCGTCATCGGG
GTATGGTACAAAGAGAAAGAAGCCGAAGATTGAATCTCCATGTGGCTATAACTCTGGAAG
TCAAGTTGCTTCTGATTTATTAAATATCAATTTGTTAGTCTCCTAATTATGGTGTTTAGT
AGAGGTTTTAAATGTGTATTCTCCTTGTTTCTCCAAGTAGAGATTGATTTTATGTGTTTA
AGTTGATTTTATGTGTTTAAGTGAACCATTTTTTTCCTTTAAATCAAGAAGGATTTGAAT

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL7353Contig1 705 2 2 U
GGATCCTCTCCAAACTATTAATCTTCGCCTGAAACCGAGTCGACTCAGTGAGTCAACCCA
AATGGGTATATGCATGTCGTACGAGTCGACACAGGTGGCCACGGCGAAACTGATCTTGCA
AGACGGAAGGATGATGGAGTTCACGACTCCGGTCAAAGTGGGCTACGTTCTGCAGAAGCA
TCCCATGTCTTTTATATGTAACTCCGATGATATGGATTTTGACGACGCCGTGTCCGCCAT
TAGCGCCGACGAGGAGCTTCAGCTTGGACAGCTTTACTTCGCTTTACCTCTCAGCTCGCT
TCATCGGTCTTTTAAAGCGGAGGAGATGGCTGCATTGGCTGTTAAAGCTAGCTCTGCTCT
TATGAGAAGCGGTGGTTCTTGCGGCCAAGATAAATGCCGGTGTCGCCGGAAATGTGTTTC
TCCGGTTATCTTCTCTGCCCGGAGAGTTGCGGCGGCGGGATCTAACGGTCAGACGAGGAA
TGGGAAAAGACGCGGCGGTGGTGGTAGCGGGAGGAGGAAGTATGAGGCCAAGTTGAGTAA
GATAGAAGAGTGAAAGGTAGTTTGGGGATTTAGTAATCATTGTAGGGTTAAATTTGTGAA
TATCTAGTTATTAAGGGGTGCAAATCGCATTTTAAAACGTGGAAAAGGTGATTGTACTTG
GTTTACAATCATATGATTGGATGATTTACGTCCTAAAATTGAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO28TF U 1
AF RR2FO28JQ C 27
BS 1 581 RR2FO28TF
BS 582 705 RR2FO28JQ

RD RR2FO28TF 581 0 0
GGATCCTCTCCAAACTATTAATCTTCGCCTGAAACCGAGTCGACTCAGTGAGTCAACCCA
AATGGGTATATGCATGTCGTACGAGTCGACACAGGTGGCCACGGCGAAACTGATCTTGCA
AGACGGAAGGATGATGGAGTTCACGACTCCGGTCAAAGTGGGCTACGTTCTGCAGAAGCA
TCCCATGTCTTTTATATGTAACTCCGATGATATGGATTTTGACGACGCCGTGTCCGCCAT
TAGCGCCGACGAGGAGCTTCAGCTTGGACAGCTTTACTTCGCTTTACCTCTCAGCTCGCT
TCATCGGTCTTTTAAAGCGGAGGAGATGGCTGCATTGGCTGTTAAAGCTAGCTCTGCTCT
TATGAGAAGCGGTGGTTCTTGCGGCCAAGATAAATGCCGGTGTCGCCGGAAATGTGTTTC
TCCGGTTATCTTCTCTGCCCGGAGAGTTGCGGCGGCGGGATCTAACGGTCAGACGAGGAA
TGGGAAAAGACGCGGCGGTGGTGGTAGCGGGAGGAGGAAGTATGAGGCCAAGTTGAGTAA
GATAGAAGAGTGAAAGGTAGTTTGGGGATTTAGTAATCATT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2FO28JQ 679 0 0
GCCTGAAACCGAGTCGACTCAGTGAGTCAACCCAAATGGGTATATGCATGTCGTACGAGT
CGACACAGGTGGCCACGGCGAAACTGATCTTGCAAGACGGAAGGATGATGGAGTTCACGA
CTCCGGTCAAAGTGGGCTACGTTCTGCAGAAGCATCCCATGTCTTTTATATGTAACTCCG
ATGATATGGATTTTGACGACGCCGTGTCCGCCATTAGCGCCGACGAGGAGCTTCAGCTTG
GACAGCTTTACTTCGCTTTACCTTTCAGCTCGCTTCATCGGTCTTTTAAAGCGGAGGAGA
TGGCTGCATTGGCTGTTAAAGCTAGCTTTGCTTTTATGAGAAGCGGTGGTTCTTGCGGCC
AAGATAAATGCCGGTGTCGCCGGAAATGTGTTTTTCCGGTTATTTTTTCTGCCCGGAGAG
TTGCGGCGGCGGGATCTAACGGTCAGACGAGGAATGGGAAAAGACGCGGCGGTGGTGGTA
GCGGGAGGAGGAAGTATGAGGCCAAGTTGAGTAAGATAGAAGAGTGAAAGGTAGTTTGGG
GATTTAGTAATCATTGTAGGGTTAAATTTGTGAATATCTAGTTATTAAGGGGTGCAAATC
GCATTTTAAAACGTGGAAAAGGTGATTGTACTTGGTTTACAATCATATGATTGGATGATT
TACGTCCTAAAATTGAGAC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL7354Contig1 1053 2 4 U
GGCAAAACAAAAAACAAAAAAAACGTAAAATTGATTATCAACCGTTAGATTATTCATATT
GCCATCAACGCCAACCAATCGCTACACAGATCATCTGCCTTCTCTCTTTATTTTGCTGCT
TCTCGCTCATCTCCCTCTCTGTATCTCTCCGGCTAGCCGTTCTCTTAGGTGGTGTAACGG
TAACAATCAAGCTTTAGCAGCCGTTGAATTATCGCGGTTTCCATCTGTAAATGGGCTGCT
TCCACTCAAAGGTAGCTAGAGAATTCCGAGTACACGAAGACCCTGCAAAGCTTGCCTCCG
AGACTGCCTTTAGTGTGAGTGAGGTTGAAGCATTGTTTGAGCTGTTCAAGAGCATAAGCA
GTTCCGTTGTTAATGATGGTTTGATAAACAAGGAGGAGTTCCAACTTGCCTTGTTTAAGA
GCAGGAAAAGGGAGAATATATTTGCCAACAGGATATTTGATATGTTTGATGTTAAACGAA
AAGGAGTAATTGATTTTGGAGACTTTGTAAGATCACTCAATGTGTTCCACCCCAATGCTT
CTCTAGAGGACAAAATTGATTTTACGTTTAGGCTCTATGACATGGACTGCACGGGTTTCA
TTGAACGTCAGGAGGTTAAGCAAATGTTGATCGCCCTTCTCTGTGAATCTGAAATGAAGT
TGGCTGATGAAACCATAGAGATAATATTAGATAAGACATTTGAGGATGCAGACGTGAATC
AGGATGGAAAGATTGATAAATTAGAGTGGAGGGACTTCGTGAACAAAAATCCATCACTGC
TTAAGATCATGACACTCCCATATCTCAGGGATATTACTACAACGTTTCCGAGCTTTGTCT
TTAATTCTGAGGTCGATGAGATTGCCACATGAAGAAACGGGTTTCACAAAGTTTGAAGAA
AAGAAGAAGAAAGAACTAAACCAGTTCTGAGTTGATCAGCATCTGTTTGCAAATACTGTA
GAGCTAGAGCATATCTTTTTTTTTTTAATTGTTTAATTTTCTGGGTTCCTATTTAATTCT
CAGAACAGTTTTGAAATCTTGAGTTTTTTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE21TF U 1
AF RR2BE21JQ C 183
BS 1 704 RR2BE21TF
BS 705 705 RR2BE21JQ
BS 706 718 RR2BE21TF
BS 719 1053 RR2BE21JQ

RD RR2BE21TF 718 0 0
GGCAAAACAAAAAACAAAAAAAACGTAAAATTGATTATCAACCGTTAGATTATTCATATT
GCCATCAACGCCAACCAATCGCTACACAGATCATCTGCCTTCTCTCTTTATTTTGCTGCT
TCTCGCTCATCTCCCTCTCTGTATCTCTCCGGCTAGCCGTTCTCTTAGGTGGTGTAACGG
TAACAATCAAGCTTTAGCAGCCGTTGAATTATCGCGGTTTCCATCTGTAAATGGGCTGCT
TCCACTCAAAGGTAGCTAGAGAATTCCGAGTACACGAAGACCCTGCAAAGCTTGCCTCCG
AGACTGCCTTTAGTGTGAGTGAGGTTGAAGCATTGTTTGAGCTGTTCAAGAGCATAAGCA
GTTCCGTTGTTAATGATGGTTTGATAAACAAGGAGGAGTTCCAACTTGCCTTGTTTAAGA
GCAGGAAAAGGGAGAATATATTTGCCAACAGGATATTTGATATGTTTGATGTTAAACGAA
AAGGAGTAATTGATTTTGGAGACTTTGTAAGATCACTCAATGTGTTCCACCCCAATGCTT
CTCTAGAGGACAAAATTGATTTTACGTTTAGGCTCTATGACATGGACTGCACGGGTTTCA
TTGAACGTCAGGAGGTTAAGCAAATGTTGATCGCCCTTCTCTGTGAATCTGAAATGAAGT
TGGCTGATGAAACCATAGAGATAATATTAGATAAGACATTTGAG*ATGCAGACGTGAA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2BE21JQ 871 0 0
ACAATCAAGCTTTAGCAGCCGTTGAATTATCGCGGTTTCCATCTGTAAATGGGCTGCTTC
CACTCAAAGGTAGCTAGAGAATTCCGAGTACACGAAGACCCTGCAAAGCTTGCCTCCGAG
ACTGCCTTTAGTGTGAGTGAGGTTGAAGCATTGTTTGAGCTGTTCAAGAGCATAAGCAGT
TCCGTTGTTAATGATGGTTTGATAAACAAGGAGGAGTTCCAACTTGCCTTGTTTAAGAGC
AGGAAAAGGGAGAATATATTTGCCAACAGGATATTTGATATGTTTGATGTTAAACGAAAA
GGAGTAATTGATTTTGGAGACTTTGTAAGATCACTCAATGTGTTCCACCCCAATGCTTCT
CTAGAGGACAAAATTGATTTTACGTTTAGGCTCTATGACATGGACTGCACGGGTTTCATT
GAACGTCAGGAGGTTAAGCAAATGTTGATCGCCCTTCTCTGTGAATCTGAAATGAAGTTG
GCTGATGAAACCATAGAGATAATATTAGATAAGACATTTGAGGATGCAGACGTGAATCAG
GATGGAAAGATTGATAAATTAGAGTGGAGGGACTTCGTGAACAAAAATCCATCACTGCTT
AAGATCATGACACTCCCATATCTCAGGGATATTACTACAACGTTTCCGAGCTTTGTCTTT
AATTCTGAGGTCGATGAGATTGCCACATGAAGAAACGGGTTTCACAAAGTTTGAAGAAAA
GAAGAAGAAAGAACTAAACCAGTTCTGAGTTGATCAGCATCTGTTTGCAAATACTGTAGA
GCTAGAGCATATCTTTTTTTTTTTAATTGTTTAATTTTCTGGGTTCCTATTTAATTCTCA
GAACAGTTTTGAAATCTTGAGTTTTTTAGCT

QA 1 871 1 871
DS 



AS 1 2

CO CL7355Contig1 640 2 15 U
GGATTCGTCATCTAGTCTCATCTCTCTCCATAACTATGGACATCAATCATTCACCGTTAG
GGTTTCTCATTTCACTCTTCTTCATTGTTACCTTTCTTGCACCACAAGTCAAATCTAGGG
CTTTCTACGTCTTTGGTGACTCTCTCGTCGACAATGGAAACAATGATTACCTTGTCACCA
CTGCTCGCGCAGACAATTACCCGTATGGTATCGATTACCCGACCCGTCGACCCACCGGAC
GTTTCTCTAACGGCCTTAACATCCCTGACATTATCAGTGAGGCTATAGGCATGCCATCCA
CTTTGCCGTACCTTAGCCCGCAGCTCACCGGAGAAAATCTTCTCGTCGGCGCTAATTTCG
CCTCCGCCGGTATTGGAATCCTCAATGACACTGGAATTCAATTTGTAAACATAATTAGAA
TATCCAAGCAGTTCGAATACTTCGAACAGTACCAGCAACGAGTGAGCGCATTGATTGGAC
CAGAGGCTACACAACAGCTAGTTAACCAAGCTCTTGTCTTAATCACACTCGGCGGCAACG
ATTTCGTCAACAACTATTATCTCATTCCTTTTTCTGCTCGTTCGCGCCAATTCGCGTTAC
CCGACTACGTTGTTTATCTCATTTCGGAATACGGAAAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H512TF U 5
AF RR2DN39TF U 1
BS 1 58 RR2DN39TF
BS 59 59 RR2H512TF
BS 60 124 RR2DN39TF
BS 125 125 RR2H512TF
BS 126 190 RR2DN39TF
BS 191 191 RR2H512TF
BS 192 331 RR2DN39TF
BS 332 332 RR2H512TF
BS 333 349 RR2DN39TF
BS 350 350 RR2H512TF
BS 351 424 RR2DN39TF
BS 425 425 RR2H512TF
BS 426 497 RR2DN39TF
BS 498 498 RR2H512TF
BS 499 640 RR2DN39TF

RD RR2H512TF 581 0 0
GGGTCC
TCTAGTCTCATCTCTCTCCATAACTATGGATATCAATCATTCACCGTTAGGGTTTCTCAT
TTCACTCTTCTTCATTGTTACCTTTCTTGCACCACAAGTCAAATCTAGGGCTTTCTACGT
CTTTGGTGACTCTCTCGTCGACAATGGAAACAATGATTACCTTGTCACCACTGCTCGCGC
AGACAATTACCCGTATGGTATCGATTACCCGACCCGTCGGCCCACCGGACGTTTCTCTAA
CGGCCTTAACATCCCTGACATTATCAGTGAGGCTATAGGCATGCCATCCACTTTGCCGTA
CCTTAGCCCGCAGCTCACCGGAGAAAATCTTCTCGTCGGCGCTAATTTCGCCTCCGCTGG
TATTGGAATCCTCAATGACACTGGAATTCAATTTGTAAACATAATTAGAATATCCAAGCA
GTTCGAATACTTCGAACAGTACCAGCAACGAGTGAGCGCATTTATTGGACCAGAGGCTAC
ACAACAGCTAGTTAACCAAGCTCTTGTCTTAATCACACTCGGCGGCAACGATTTCGTCAA
CAACTATTATCTCATTCCTTTTTCTGCTCGTTCGC

QA 7 581 7 581
DS 

RD RR2DN39TF 640 0 0
GGATTCGTCATCTAGTCTCATCTCTCTCCATAACTATGGACATCAATCATTCACCGTTTG
GGTTTCTCATTTCACTCTTCTTCATTGTTACCTTTCTTGCACCACAAGTCAAATCTAGGG
CTTTTTACGTCTTTGGTGACTCTCTCGTCGACAATGGAAACAATGATTACCTTGTCACCA
CTGCTCGCGCCGACAATTACCCGTATGGTATCGATTACCCGACCCGTCGACCCACCGGAC
GTTTCTCTAACGGCCTTAACATCCCTGACATTATCAGTGAGGCTATAGGCATGCCATCCA
CTTTGCCGTACCTTAGCCCGCAGCTCACCGGGGAAAATCTTCTCGTCGGTGCTAATTTCG
CCTCCGCCGGTATTGGAATCCTCAATGACACTGGAATTCAATTTGTAAACATAATTAGAA
TATCTAAGCAGTTCGAATACTTCGAACAGTACCAGCAACGAGTGAGCGCATTGATTGGAC
CAGAGGCTACACAACAGTTAGTTAACCAAGCTCTTGTCTTAATCACACTCGGCGGCAACG
ATTTCGTCAACAACTATTATCTCATTCCTTTTTCTGCTCGTTCGCGCCAATTCGCGTTAC
CCGACTACGTTGTTTATCTCATTTCGGAATACGGAAAGAT

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL7356Contig1 896 2 8 U
GTAATGCTACAACTTGTAGCATTCCAGTTCTAGCACCAAAGCCTCTTCAGATTGTACCAC
CTGCTGCTCCTAGTTATGGTGAACAGAGACCGAGTCACCCTCCACCTATGATTCTTAACA
AGAAAATGTGTGTTGACAAGTCGTTTCTGGAGCTAAAGCCACCGTCTCTTCGAGCTGTCG
ATCAAAAACCATACCAGTTTGTGCGTAACCACCAGCAAGGAGTGTACTATCGAAGCAATA
GTGGTTTAAATCTGAAGTTTGATGGGTCTGGTGGTGGTAGTTGCTATTCTCCAAGTGTGT
CCAACGGTTCAAGATCGTTTGTTTCATCTCTTAGTATGGATGGGAGTGTGACTGATTACG
ATAGAAACTCGTTTCATTTGATCGGACTAACACCTCAGGGATCTGATCATATATCGCAGC
ATTCCAGGAGGACAAGCTGCTCTGGTAGTTTGAAATGTGGAAGTAAGAGCAAGTGTCATT
GCTCCAAGAAAAGGAAGTTGAGAGTGAAAAGATCCATCAAAGTACCTGCGATAAGTAACA
AGATTGCTGATATACCTCCAGATGAATATTCATGGAGGAAGTACGGACAAAAGCCAATAA
AGGGTTCTCCTCATCCTAGGGGGTACTATAAATGTAGCAGCGTGAGAGGTTGTCCAGCAA
GGAAGCATGTTGAACGTTGTGTAGACGAAACTTCGATGCTTATTGTGACTTACGAAGGTG
AGCATAACCATGCAGAATGCTCTCTTCCCAATCAGCTCACACCTGATTAACTAAACCGGT
CTAGTAGTTGTGATATGCAATTGTATATTCTACTTGAACTTAGGTTATTCTGCATCACAA
GTTTGGCATCAGTCTTATCTATATATAGATATTGTTATAAATGGCATAATCTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO92TF U 1
AF RR2BO92JQ C 167
BS 1 622 RR2BO92TF
BS 623 623 RR2BO92JQ
BS 624 648 RR2BO92TF
BS 649 649 RR2BO92JQ
BS 650 677 RR2BO92TF
BS 678 678 RR2BO92JQ
BS 679 711 RR2BO92TF
BS 712 896 RR2BO92JQ

RD RR2BO92TF 711 0 0
GTAATGCTACAACTTGTAGCATTCCAGTTCTAGCACCAAAGCCTCTTCAGATTGTACCAC
CTGCTGCTCCTAGTTATGGTGAACAGAGACCGAGTCACCCTCCACCTATGATTCTTAACA
AGAAAATGTGTGTTGACAAGTCGTTTCTGGAGCTAAAGCCACCGTCTCTTCGAGCTGTCG
ATCAAAAACCATACCAGTTTGTGCGTAACCACCAGCAAGGAGTGTACTATCGAAGCAATA
GTGGTTTAAATCTGAAGTTTGATGGGTCTGGTGGTGGTAGTTGCTATTCTCCAAGTGTGT
CCAACGGTTCAAGATCGTTTGTTTCATCTCTTAGTATGGATGGGAGTGTGACTGATTACG
ATAGAAACTCGTTTCATTTGATCGGACTAACACCTCAGGGATCTGATCATATATCGCAGC
ATTCCAGGAGGACAAGCTGCTCTGGTAGTTTGAAATGTGGAAGTAAGAGCAAGTGTCATT
GCTCCAAGAAAAGGAAGTTGAGAGTGAAAAGATCCATCAAAGTACCTGCGATAAGTAACA
AGATTGCTGATATACCTCCAGATGAATATTCATGGAGGAAGTACGGACAAAAGCCAATAA
AGGGTTCTCCTCATCCTAGGGG*TACTATAAATGTAGCAGCGTGAGAG*TTGTCCAGCAA
GGAAGCATGTTGAACGT*GTGTAGACGAAACTTCGATGCTTATTGTGACTT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2BO92JQ 730 0 0
TCTTCGAGCTGTCGATCAAAAACCATACCAGTTTGTGCGTAACCACCAGCAAGGAGTGTA
CTATCGAAGCAATAGTGGTTTAAATCTGAAGTTTGATGGGTCTGGTGGTGGTAGTTGCTA
TTCTCCAAGTGTGTCCAACGGTTCAAGATCGTTTGTTTCATCTCTTAGTATGGATGGGAG
TGTGACTGATTACGATAGAAACTCGTTTCATTTGATCGGACTAACACCTCAGGGATCTGA
TCATATATCGCAGCATTCCAGGAGGACAAGCTGCTCTGGTAGTTTGAAATGTGGAAGTAA
GAGCAAGTGTCATTGCTCCAAGAAAAGGAAGTTGAGAGTGAAAAGATCCATCAAAGTACC
TGCGATAAGTAACAAGATTGCTGATATACCTCCAGATGAATATTCATGGAGGAAGTACGG
ACAAAAGCCAATAAAGGGTTCTCCTCATCCTAGGGGGTACTATAAATGTAGCAGCGTGAG
AGGTTGTCCAGCAAGGAAGCATGTTGAACGTTGTGTAGACGAAACTTCGATGCTTATTGT
GACTTACGAAGGTGAGCATAACCATGCAGAATGCTCTCTTCCCAATCAGCTCACACCTGA
TTAACTAAACCGGTCTAGTAGTTGTGATATGCAATTGTATATTCTACTTGAACTTAGGTT
ATTCTGCATCACAAGTTTGGCATCAGTCTTATCTATATATAGATATTGTTATAAATGGCA
TAATCTAGCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL7357Contig1 1404 2 4 U
GGGACCCGTTTTGTATTTACTTTTGACCCCATTCATTGTTCCTCCTCCTTCTGCGATCAA
AAGAAATTAGAAAATGGCTGACGGTGAAGACATTCAACCCCTTGTCTGGGACAATGGAAC
CGGAATGGTTAAGGCTGGTTTTGCTGGGGATGATGCACCAAGGGCTGTGTTTCCAAGCAT
CGTAGGCCGTCCACGTCACACCGGAGTCATGGTTGGGATGGGACAGAAGGATGCATACGT
TGGCGATGAAGCTCAGTCCAAGCGTGGTATCCTAACTCTCAAATACCCTATTGAGCACGG
TATCGTCAACAACTGGGATGACATGGAGAAAATCTGGCATCATACTTTCTACAACGAGCT
CCGTGTTGCCCCCGAGGAGCATCCCATTCTCCTCACCGAAGCTCCTCTCAACCCAAAGGC
TAACCGTGAGAAGATGACTCAGATCATGTTCGAAACTTTCAATGCTCCCGCCATGTATGT
TGCCATCCAAGCTGTCCTCTCTCTTTACGCTAGTGGTCGTACTACTGGGATTGTGCTCGA
CTCTGGAGATGGTGTGAGCCACACGGTTCCTATCTACGAGGGTTACGCGCTTCCACACGC
CATCCTACGTCTCGATCTGGCCGGTCGTGACCTCACGGATGCTCTCATGAAGATCCTTAC
TGAGCGTGGATACTCTTTCACCACGACAGCCGAGCGTGAGATTGTCAGAGACATAAAGGA
GAAGCTCTGTTACATTGCTCTGGACTATGAGCAGGAGCTTGAGACGGCTAACACCAGCTC
TTCTGTGGAGAAGAACTATGAGTTACCTGATGGGCAAGTGATCACTATTGGGTCAGAGCG
GTTCCGTTGCCCGGAGGTTCTTTACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAATGCTGGTAT
CCATGAGGCCACTTACAACTCCATAATGAAATGTGACGTGGATATCAGAAAGGATTTGTA
TGGTGACATTGTGCTCAGTGGTGGAACAACTATGTTCCCTGGGATTGCTGATAGGATGAG
CAAAGAGATCACCGCTTTGGCACCGAGCAGCATGAAGATCAAAGTGGTTGCGCCGCCTGA
GAGGAAATACTCTGTTTGGATTGGAGGGTCCATCTTGGCCTCCCTCAGTACCTTCCAGCA
GATGTGGATCGCAAAGGCTGAGTATGATGAGTCAGGCCCTTCCATTGTTCACAGGAAATG
TTTTTGAGTTTAAAGTTTAAGTCTTTGCCCTGTGGGTTTCCTTGATAAGTTTTATCTTCG
TTCCTGCTTGTTTTTCAGTATTTTCAGATTTTGACTCTTAAGACATTTCAGAGAACTTTT
AAGTATCTTTATGTAACATGGTTGTCCTTGTTCCTTCTTCTCATTAACTTTCTTTTATTG
GATAATAAGACCACTGTTTGAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS48TF U 1
AF RR2AS48JQ C 624
BS 1 791 RR2AS48TF
BS 792 792 RR2AS48JQ
BS 793 843 RR2AS48TF
BS 844 1404 RR2AS48JQ

RD RR2AS48TF 843 0 0
GGGACCCGTTTTGTATTTACTTTTGACCCCATTCATTGTTCCTCCTCCTTCTGCGATCAA
AAGAAATTAGAAAATGGCTGACGGTGAAGACATTCAACCCCTTGTCTGGGACAATGGAAC
CGGAATGGTTAAGGCTGGTTTTGCTGGGGATGATGCACCAAGGGCTGTGTTTCCAAGCAT
CGTAGGCCGTCCACGTCACACCGGAGTCATGGTTGGGATGGGACAGAAGGATGCATACGT
TGGCGATGAAGCTCAGTCCAAGCGTGGTATCCTAACTCTCAAATACCCTATTGAGCACGG
TATCGTCAACAACTGGGATGACATGGAGAAAATCTGGCATCATACTTTCTACAACGAGCT
CCGTGTTGCCCCCGAGGAGCATCCCATTCTCCTCACCGAAGCTCCTCTCAACCCAAAGGC
TAACCGTGAGAAGATGACTCAGATCATGTTCGAAACTTTCAATGCTCCCGCCATGTATGT
TGCCATCCAAGCTGTCCTCTCTCTTTACGCTAGTGGTCGTACTACTGGGATTGTGCTCGA
CTCTGGAGATGGTGTGAGCCACACGGTTCCTATCTACGAGGGTTACGCGCTTCCACACGC
CATCCTACGTCTCGATCTGGCCGGTCGTGACCTCACGGATGCTCTCATGAAGATCCTTAC
TGAGCGTGGATACTCTTTCACCACGACAGCCGAGCGTGAGATTGTCAGAGACATAAAGGA
GAAGCTCTGTTACATTGCTCTGGACTATGAGCAGGAGCTTGAGACGGCTAACACCAGCTC
TTCTGTGGAGA*GAACTATGAGTTACCTGATGGGCAAGTGATCACTATTGGGTCAGAGCG
GTT

QA 1 843 1 843
DS 

RD RR2AS48JQ 781 0 0
GTCGTGACCTCACGGATGCTCTCATGAAGATCCTTACTGAGCGTGGATACTCTTTCACCA
CGACAGCCGAGCGTGAGATTGTCAGAGACATAAAGGAGAAGCTCTGTTACATTGCTCTGG
ACTATGAGCAGGAGCTTGAGACGGCTAACACCAGCTCTTCTGTGGAGAAGAACTATGAGT
TACCTGATGGGCAAGTGATCACTATTGGGTCAGAGCGGTTCCGTTGCCCGGAGGTTCTTT
ACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAATGCTGGTATCCATGAGGCCACTTACAACTCCA
TAATGAAATGTGACGTGGATATCAGAAAGGATTTGTATGGTGACATTGTGCTCAGTGGTG
GAACAACTATGTTCCCTGGGATTGCTGATAGGATGAGCAAAGAGATCACCGCTTTGGCAC
CGAGCAGCATGAAGATCAAAGTGGTTGCGCCGCCTGAGAGGAAATACTCTGTTTGGATTG
GAGGGTCCATCTTGGCCTCCCTCAGTACCTTCCAGCAGATGTGGATCGCAAAGGCTGAGT
ATGATGAGTCAGGCCCTTCCATTGTTCACAGGAAATGTTTTTGAGTTTAAAGTTTAAGTC
TTTGCCCTGTGGGTTTCCTTGATAAGTTTTATCTTCGTTCCTGCTTGTTTTTCAGTATTT
TCAGATTTTGACTCTTAAGACATTTCAGAGAACTTTTAAGTATCTTTATGTAACATGGTT
GTCCTTGTTCCTTCTTCTCATTAACTTTCTTTTATTGGATAATAAGACCACTGTTTGAGT
G

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL7358Contig1 507 2 1 U
GGAGCGTTCTAGCTACGGTTCTGAGTCCGGTTCGGGCTCGGGCTCATCAGACCGTGTTTA
TGTGGGTAACCTTTCGTGGGGTGTGGATGACATGGCTCTTGAGAGCTTGTTTAGTGAGCA
AGGAAAGGTTGTCGAGGCCAGGGTCATTTACGACAGGGACACTGGTCGATCCAAGGGTTT
TGGGTTTGTCACACTCGGTTCTCCTCAAGAGGTCACAAGAGCCATCAATTCTTTGAATGG
AGCTGATTTGGATGGAAGACAGATTAGAGTCTCGGAGGCGGAGGCTAGACCACCAAGGCG
CCAATTTTGAGTGACCACGCAACTTCATGTTCTGGAATCTAGAGGTTTAGCTCATCTTGA
CTGGCGACAAGCTATTTATGTTTTGGGCTTTTGTTTCTTTATTTTACTTCAATTCGTTTT
GCGCTTTGAATGTTTTGCGTTTATCTCTGTAGACTAGGAGTTTGAACTCTGTTTTCTTTT
TATATACTAGTACTCCCTTTCTTTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A628JQ C 1
AF RR2A628TF U 1
BS 1 507 RR2A628TF

RD RR2A628JQ 507 0 0
GGAGCGTTCTAGCTACGGTTCTGAGTCCGGTTCGGGCTCGGGCTCATCAGACCGTGTTTA
TGTGGGTAACCTTTCGTGGGGTGTGGATGACATGGCTCTTGAGAGCTTGTTTAGTGAGCA
AGGAAAGGTTGTCGAGGCCAGGGTCATTTACGACAGGGACACTGGTCGATCCAAGGGTTT
TGGGTTTGTCACACTCGGTTCTCCTCAAGAGGTCACAAGAGCCATCAATTCTTTGAATGG
AGCTGATTTGGATGGAAGACAGATTAGAGTCTCGGAGGCGGAGGCTAGACCACCAAGGCG
CCAATTTTGAGTGACCACGCAACTTCATGTTCTGGAATCTAGAGGTTTAGCTCATCTTGA
CTGGCGACAAGCTATTTATGTTTTGGGCTTTTGTTTCTTTATTTTACTTCAATTCGTTTT
GCGCTTTGAATGTTTTGCGTTTATCTCTGTAGACTAGGAGTTTGAACTCTGTTTTCTTTT
TATATACTAGTACTCCCTTTCTTTCTC

QA 1 507 1 507
DS 

RD RR2A628TF 507 0 0
GGAGCGTTCTAGCTACGGTTCTGAGTCCGGTTCGGGCTCGGGCTCATCAGACCGTGTTTA
TGTGGGTAACCTTTCGTGGGGTGTGGATGACATGGCTCTTGAGAGCTTGTTTAGTGAGCA
AGGAAAGGTTGTCGAGGCCAGGGTCATTTACGACAGGGACACTGGTCGATCCAAGGGTTT
TGGGTTTGTCACACTCGGTTCTCCTCAAGAGGTCACAAGAGCCATCAATTCTTTGAATGG
AGCTGATTTGGATGGAAGACAGATTAGAGTCTCGGAGGCGGAGGCTAGACCACCAAGGCG
CCAATTTTGAGTGACCACGCAACTTCATGTTCTGGAATCTAGAGGTTTAGCTCATCTTGA
CTGGCGACAAGCTATTTATGTTTTGGGCTTTTGTTTCTTTATTTTACTTCAATTCGTTTT
GCGCTTTGAATGTTTTGCGTTTATCTCTGTAGACTAGGAGTTTGAACTCTGTTTTCTTTT
TATATACTAGTACTCCCTTTCTTTCTC

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 2

CO CL7359Contig1 579 2 4 U
CTCTCCTCTATCGCTCTCCTCTATCGCACAGACGAAACCATTTGAACACACAGACCAATC
CATCTCTTCTCTTCTCCAGAACCTTCTCCTCTATCGCTCTCCTCTATCGCTCTCCCAATC
CATCTCTTCTCTTCTCCAGAACCTTCTCCTCTACTACACTTTTCGTCAAAGGTTGGGGAT
GCAGGGCCCATTCTTGATATGTTGGCGGTTGTTCTTGAGACGATATCCACTAATGTACTC
GTTGCTAGGACCACAGGAAGCGAGTGATGACGTCTCTGTCCCTGTCTCTAGGTCTCTTGG
ATTTTCCTCCGTCGCAGTCATCGTGTAAGCTCCCTCTCTCTCACACTACTAAATCTATGC
GAAAACAAAGCTGAGCCTTTTCTCTAATAAGTCTCAAAGTTAGTATGTATATCTTCACTT
TCTCTCTTCGTTTTCATGTGAATTTATTTTTGAGGCTTCACCTGTTGGAAGTACAAAACA
TCTTGTAATATCTTGTAATATTTTGTCCTGAATCTTTGTGATGTTCCCATAAAAGTAAGT
TGGGAACTTTTTAGATGATGATTCGACCTTGCAAGAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU46TF U 1
AF RR2BE10TF U 22
BS 1 351 RR2FU46TF
BS 352 352 RR2BE10TF
BS 353 560 RR2FU46TF
BS 561 579 RR2BE10TF

RD RR2FU46TF 560 0 0
CTCTCCTCTATCGCTCTCCTCTATCGCACAGACGAAACCATTTGAACACACAGACCAATC
CATCTCTTCTCTTCTCCAGAACCTTCTCCTCTATCGCTCTCCTCTATCGCTCTCCCAATC
CATCTCTTCTCTTCTCCAGAACCTTCTCCTCTACTACACTTTTCGTCAAAGGTTGGGGAT
GCAGGGCCCATTCTTGATATGTTGGCGGTTGTTCTTGAGACGATATCCACTAATGTACTC
GTTGCTAGGACCACAGGAAGCGAGTGATGACGTCTCTGTCCCTGTCTCTAGGTCTCTTGG
ATTTTCCTCCGTCGCAGTCATCGTGTAAGCTCCCTCTCTCTCACACTACTAGATCTATGC
GAAAACAAAGCTGAGCCTTTTCTCTAATAAGTCTCAAAGTTAGTATGTATATCTTCACTT
TCTCTCTTCGTTTTCATGTGAATTTATTTTTGAGGCTTCACCTGTTGGAAGTACAAAACA
TCTTGTAATATCTTGTAATATTTTGTCCTGAATCTTTGTGATGTTCCCATAAAAGTAAGT
TGGGAACTTTTTAGATGATG

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2BE10TF 558 0 0
G
ATCGCACAGACGAAACCATTTGAACACACAGACCAATCCATCTCTTCTCTTCTCCAGAAC
CTTCTCCTCTATCGCTCTCCTCTATCGCTCTCCCAATCCATCTCTTCTCTTCTCCAGAAC
CTTCTCCTCTACTACACTTTTCGTCAAAGGTTGGGGATGCAGGGCCCATTCTTGATATGT
TGGCGGTTGTTCTTGAGACGATATCCACTAATGTACTCGTTGCTAGGACCACAGGAAGCG
AGTGATGACGTCTCTGTCTCTGTCTCTAGGTCTCTTGGATTTTCCTCCGTCGCAGTCATC
GTGTAAGCTCCCTCTCTCTCACACTACTAAATCTATGCGAAAACAAAGCTGAGCCTTTTC
TCTAATAAGTCTCAAAGTTAGTATGTATATCTTCACTTTCTCTCTTCGTTTTCATGTGAA
TTTATTTTTGAGGCTTCACCTGTTGGAAGTACAAAACATCTTGTAATATCTTGTAATATT
TTGTCCTGAATCTTTGTGATGTTCCCATAAAAGTAAGTTGGGAACTTTTTAGATGATGAT
TCGACCTTGCAAGAACA

QA 2 558 2 558
DS 



AS 1 2

CO CL7360Contig1 914 2 4 U
GGAAGTATATCGAAACCGTTGTTACGGGCTCGATGGGACAGTATGTTCCCACGTTGAACT
ACTATTGCAGCGACTTGCCTCTCGTTTCAACGACTTATGGCTCTTCCTAGACTACGTTTG
GGGTCAATGTTGATCCTCTCTGCAAACCTGAAGATGTGTCTTACGCTTTCATGCCTAACA
TGTCTTACTTTGAGTTCATAACGATGGATGGAGACAAGCGTGATGTGGTCGACCTTCATG
AAGTGAAAGTTGGGTGTACTTATGAACCTGTCGTCACAAACTTCTCTGGATTGTATAGAA
TGAGAGTGGGAGATGTTCTTTTGGTGACTGGTTTCTACAACAACGCACCTCAGTTTAGGT
TTGTAAGAAGAGAGAACGTGGTCCTAAGCATCGATTCCGATAAAACCAACGAAGAAGATT
TGTTCAAGGCAGTGAGTCAAGCCAAGCTCGTTCTCGACTCATCTGATCTCGTTCTTGTAG
ACTTCACCAGCTATGCTGACACCTCGACATTTCCTGGTCATTACGTGCTTTATGTGGAAG
CAAAGGCCAAAGAGGGAAACAATCATTTCGAACTCAACGAAGAGGTGTTCTCCAAGTGTT
GTTCAGTGATGGAGGATTCGCTTGACAATGTTTACAAGAGATGTAGGTTCAAAGATGGAT
CGGTTGGGCCTTTGGAGATAAGAGTGGTGCGTCAAGGGACGTTTGATGCTCTCATGGACT
TTTTTATCAACCAGGGTGCTTCCATTGGTCAATACAAGACTCCTAGATGCATTAAATCAG
GAAAGGCTTTAGAGTTCATGGAGGATCGCGTGGTTGCTAAATTCTTTAGTACTTGAAATT
GTTATTTCTTTGGATTGATAAGTCCAGGTGACTTGATAGCAGCCTATAAACATACATATG
CCTGTGCTGTGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D742TF U 1
AF RR2D742JQ C 179
BS 1 646 RR2D742TF
BS 647 647 RR2D742JQ
BS 648 718 RR2D742TF
BS 719 914 RR2D742JQ

RD RR2D742TF 718 0 0
GGAAGTATATCGAAACCGTTGTTACGGGCTCGATGGGACAGTATGTTCCCACGTTGAACT
ACTATTGCAGCGACTTGCCTCTCGTTTCAACGACTTATGGCTCTTCCTAGACTACGTTTG
GGGTCAATGTTGATCCTCTCTGCAAACCTGAAGATGTGTCTTACGCTTTCATGCCTAACA
TGTCTTACTTTGAGTTCATAACGATGGATGGAGACAAGCGTGATGTGGTCGACCTTCATG
AAGTGAAAGTTGGGTGTACTTATGAACCTGTCGTCACAAACTTCTCTGGATTGTATAGAA
TGAGAGTGGGAGATGTTCTTTTGGTGACTGGTTTCTACAACAACGCACCTCAGTTTAGGT
TTGTAAGAAGAGAGAACGTGGTCCTAAGCATCGATTCCGATAAAACCAACGAAGAAGATT
TGTTCAAGGCAGTGAGTCAAGCCAAGCTCGTTCTCGACTCATCTGATCTCGTTCTTGTAG
ACTTCACCAGCTATGCTGACACCTCGACATTTCCTGGTCATTACGTGCTTTATGTGGAAG
CAAAGGCCAAAGAGGGAAACAATCATTTCGAACTCAACGAAGAGGTGTTCTCCAAGTGTT
GTTCAGTGATGGAGGATTCGCTTGACAATGTTTACAAGAGATGTAG*TTCAAAGATGGAT
CGGTTGGGCCTTTGGAGATAAGAGTGGTGCGTCAAGGGACGTTTGATGCTCTCATGGA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RR2D742JQ 736 0 0
CATGTCTTACTTTGAGTTCATAACGATGGATGGAGACAAGCGTGATGTGGTCGACTTTCA
TGAAGTGAAAGTTGGGTGTACTTATGAACCTGTCGTCACAAACTTCTCTGGATTGTATAG
AATGAGAGTGGGAGATGTTCTTTTGGTGACTGGTTTCTACAACAACGCACCTCAGTTTAG
GTTTGTAAGAAGAGAGAACGTGGTCCTAAGCATCGATTCCGATAAAACCAACGAAGAAGA
TTTGTTCAAGGCAGTGAGTCAAGCCAAGCTCGTTCTCGACTCATCTGATCTCGTTCTTGT
AGACTTCACCAGCTATGCTGACACCTCGACATTTCCTGGTCATTACGTGCTTTATGTGGA
AGCAAAGGCCAAAGAGGGAAACAATCATTTCGAACTCAACGAAGAGGTGTTCTCCAAGTG
TTGTTCAGTGATGGAGGATTCGCTTGACAATGTTTACAAGAGATGTAGGTTCAAAGATGG
ATCGGTTGGGCCTTTGGAGATAAGAGTGGTGCGTCAAGGGACGTTTGATGCTCTCATGGA
CTTTTTTATCAACCAGGGTGCTTCCATTGGTCAATACAAGACTCCTAGATGCATTAAATC
AGGAAAGGCTTTAGAGTTCATGGAGGATCGCGTGGTTGCTAAATTCTTTAGTACTTGAAA
TTGTTATTTCTTTGGATTGATAAGTCCAGGTGACTTGATAGCAGCCTATAAACATACATA
TGCCTGTGCTGTGTAG

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL7361Contig1 662 2 1 U
GGAGCGCTTCGTTCTTCACTAGTGAATCAACCACGGTGTCGAGGACTAGAAATCTCAAAC
GGCGAAGATGAGTTCATCTATGGCTCTTCGAGATTTGCAGAGAGACCTAGAGTCCAAGGC
CAATGATCTCGCCAAAATCCAGAAAGATATCGCCAAGGATCACCAGCTGAGGAAGAAGTA
TACGATCCAACTCGGTGAGAACGAGCTTGTGCTTAAGGAGTTGGATTTGCTAGAAGAAGA
AGCAAACGTCTACAAGTTGATTGGTCCAGTGCTTGTGAAACAGGATTTGGCAGAAGCTAA
TGCGAATGTTCGCAAACGCATCGAGTACATCTCTGCTGAACTGAAACGGGTTGATGCATC
TATCCAAGATAATGAAGGACAACAGAACAGCAAGAGAGAAGCAATGATGAAGCTACAACA
ACGGTTACAATCTATCCAGGCAGGAAAAGCAAAGGCTTGATCTTCCAAGTCCTTCACTTG
TGCACGGCCCTGTCATAGTGGTTTCATATTCAGTTATTGAGTGTTCGTGTGGTTTCAGTT
TTGTGGTGATTAATGTCTCTGTATCCCTCATCTTCGTTTTGTTGACAACTGCACTTGGAT
GTGTGTAAACTTATACAAATATTGTCGCCCTTTTTCAAGTTATGAATTTGGAGATTTACA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2GC09TF U 1
AF RR2GC09JQ C 129
BS 1 662 RR2GC09TF

RD RR2GC09TF 662 0 0
GGAGCGCTTCGTTCTTCACTAGTGAATCAACCACGGTGTCGAGGACTAGAAATCTCAAAC
GGCGAAGATGAGTTCATCTATGGCTCTTCGAGATTTGCAGAGAGACCTAGAGTCCAAGGC
CAATGATCTCGCCAAAATCCAGAAAGATATCGCCAAGGATCACCAGCTGAGGAAGAAGTA
TACGATCCAACTCGGTGAGAACGAGCTTGTGCTTAAGGAGTTGGATTTGCTAGAAGAAGA
AGCAAACGTCTACAAGTTGATTGGTCCAGTGCTTGTGAAACAGGATTTGGCAGAAGCTAA
TGCGAATGTTCGCAAACGCATCGAGTACATCTCTGCTGAACTGAAACGGGTTGATGCATC
TATCCAAGATAATGAAGGACAACAGAACAGCAAGAGAGAAGCAATGATGAAGCTACAACA
ACGGTTACAATCTATCCAGGCAGGAAAAGCAAAGGCTTGATCTTCCAAGTCCTTCACTTG
TGCACGGCCCTGTCATAGTGGTTTCATATTCAGTTATTGAGTGTTCGTGTGGTTTCAGTT
TTGTGGTGATTAATGTCTCTGTATCCCTCATCTTCGTTTTGTTGACAACTGCACTTGGAT
GTGTGTAAACTTATACAAATATTGTCGCCCTTTTTCAAGTTATGAATTTGGAGATTTACA
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2GC09JQ 534 0 0
TCGCCAAAATCCAGAAAGATATCGCCAAGGATCACCAGCTGAGGAAGAAGTATACGATCC
AACTCGGTGAGAACGAGCTTGTGCTTAAGGAGTTGGATTTGCTAGAAGAAGAAGCAAACG
TCTACAAGTTGATTGGTCCAGTGCTTGTGAAACAGGATTTGGCAGAAGCTAATGCGAATG
TTCGCAAACGCATCGAGTACATTTCTGCTGAACTGAAACGGGTTGATGCATCTATCCAAG
ATAATGAAGGACAACAGAACAGCAAGAGAGAAGCAATGATGAAGCTACAACAACGGTTAC
AATCTATCCAGGCAGGAAAAGCAAAGGCTTGATCTTCCAAGTCCTTCACTTGTGCACGGC
CCTGTCATAGTGGTTTCATATTCAGTTATTGAGTGTTCGTGTGGTTTCAGTTTTGTGGTG
ATTAATGTCTCTGTATCCCTCATCTTCGTTTTGTTGACAACTGCACTTGGATGTGTGTAA
ACTTATACAAATATTGTCGCCCTTTTTCAAGTTATGAATTTGGAGATTTACACC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 2

CO CL7362Contig1 1072 2 4 U
GGGCATACGCTCCAGAGGAACAGAGGAATACATCTCTCAAATGGCGACAATTAGAGTCCC
AGACGAAGTCCCTTCTCCAGCTCAGGATTCTGAAACTCTCAACAAAGCTTTTCGCGGATG
GGGAACAGACGAGAAGGCTATCATACGCGTTTTAGGAAAAAGAAACGAGACCCAGAGAAA
GAGAATCAGAGAGAGCTACAGAGAGATTTACGGCAAAGATCTTATCGACGATCTCTCCTC
TGAACTCTCTGGTGATTTCAAGAAAGCTGTGATTCTGTGGACGAAAGATCCAGCAGAGAG
AGACGCAAGGCTTGCTTACAAAGTCTTGAACGAGAAAAAGAAAACCATAGAGAAACTCAA
GATCATCGTGGAGATCGCTTGCAAAATTCTCCTGACCATTTGATTGCTGTGAGGAAAGCG
TATTGTTCTCTCTACGACTCATCCCTTGAAGAACACATTGCTTCCTCTGTTCCCTTTCCT
CTTGCAAAGTTGCTGGCGACATTAGCAACTTCGTTCAGATATGATAAAAAGAAGGTTGAC
AAAGAAGTAGCTACAATAGAGGCGGGTATGCTGCATGAAGCCATAGCAAAGAAGCAGTTA
GATCATGATCATGTCCTTTACATAATAGGAACTCGCAGTATCTTCCAGCTCAGAGCAACT
TTTGCTGCTTACAAGCAGAGTTATGGAAACACATTAGATAAGGATGTTGATGGATGTCCA
GGAGATGCTGATCTGAGAAGTCTATTGCAGATGGTAATCTTGTGCATTGAGTTCCCTGAG
AAACACTTTGCGAAGGTTGTACATGATTCTATTGAGGGGTTTGGAACAGATGAAGATTCG
TTGACGAGAGCGATTGTGATGCGTGCAGAGATTGATCTGATGAAAGTAAGAGGAGAGTAT
TTCAATATGTATAATTCAAGCATGGATAACGCTATCATTGGTGATGTTTCTGGTGACTAC
AAGGACTTCCTCATGACTCTACTTGGTTCCAAAATCTGATCTTTGATTTATAATCTTGGC
TTGTGATTTGTGACTTGTATCAAAACTTCTCGTTCCAATTCTGATTTGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ36TF U 1
AF RR2CQ36JQ C 334
BS 1 688 RR2CQ36TF
BS 689 689 RR2CQ36JQ
BS 690 699 RR2CQ36TF
BS 700 1072 RR2CQ36JQ

RD RR2CQ36TF 699 0 0
GGGCATACGCTCCAGAGGAACAGAGGAATACATCTCTCAAATGGCGACAATTAGAGTCCC
AGACGAAGTCCCTTCTCCAGCTCAGGATTCTGAAACTCTCAACAAAGCTTTTCGCGGATG
GGGAACAGACGAGAAGGCTATCATACGCGTTTTAGGAAAAAGAAACGAGACCCAGAGAAA
GAGAATCAGAGAGAGCTACAGAGAGATTTACGGCAAAGATCTTATCGACGATCTCTCCTC
TGAACTCTCTGGTGATTTCAAGAAAGCTGTGATTCTGTGGACGAAAGATCCAGCAGAGAG
AGACGCAAGGCTTGCTTACAAAGTCTTGAACGAGAAAAAGAAAACCATAGAGAAACTCAA
GATCATCGTGGAGATCGCTTGCAAAATTCTCCTGACCATTTGATTGCTGTGAGGAAAGCG
TATTGTTCTCTCTACGACTCATCCCTTGAAGAACACATTGCTTCCTCTGTTCCCTTTCCT
CTTGCAAAGTTGCTGGCGACATTAGCAACTTCGTTCAGATATGATAAAAAGAAGGTTGAC
AAAGAAGTAGCTACAATAGAGGCGGGTATGCTGCATGAAGCCATAGCAAAGAAGCAGTTA
GATCATGATCATGTCCTTTACATAATAGGAACTCGCAGTATCTTCCAGCTCAGAGCAACT
TTTGCTGCTTACAAGCAGAGTTATGGAA*CACATTAGAT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RR2CQ36JQ 739 0 0
GAAAAAGAAAACCATAGAGAA*CTCAAGATCATCGTGGAGATCGCTTGCAAAATTCTCCT
GACCATTTGATTGCTGTGAGGAAAGCGTATTGTTCTCTCTACGACTCATCCCTTGAAGAA
CACATTGCTTCCTCTGTTCCCTTTCCTCTTGCAAAGTTGCTGGCGACATTAGCAACTTCG
TTCAGATATGATAAAAAGAAGGTTGACAAAGAAGTAGCTACAATAGAGGCGGGTATGCTG
CATGAAGCCATAGCAAAGAAGCAGTTAGATCATGATCATGTCCTTTACATAATAGGAACT
CGCAGTATCTTCCAGCTCAGAGCAACTTTTGCTGCTTACAAGCAGAGTTATGGAAACACA
TTAGATAAGGATGTTGATGGATGTCCAGGAGATGCTGATCTGAGAAGTCTATTGCAGATG
GTAATCTTGTGCATTGAGTTCCCTGAGAAACACTTTGCGAAGGTTGTACATGATTCTATT
GAGGGGTTTGGAACAGATGAAGATTCGTTGACGAGAGCGATTGTGATGCGTGCAGAGATT
GATCTGATGAAAGTAAGAGGAGAGTATTTCAATATGTATAATTCAAGCATGGATAACGCT
ATCATTGGTGATGTTTCTGGTGACTACAAGGACTTCCTCATGACTCTACTTGGTTCCAAA
ATCTGATCTTTGATTTATAATCTTGGCTTGTGATTTGTGACTTGTATCAAAACTTCTCGT
TCCAATTCTGATTTGAAAA

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL7363Contig1 811 2 2 U
GGGTTGTTCAGTGGGTCCGCAAGTTCCCTTTCTTTTGTAGCGACAGGGAGTATATCATTG
GCAGGAGAATATGGGACGCTGGTCGAGTCTTTTACTGCGTTACAAAGGGAGTACCATACC
CGTCTGTACCACGACAGAGCAAGCCGCGGCGTGTTGACTTGTACTATTCAAGCTGGTGCA
TCCGTGCAGTTGAATCGAAAAGAGGGGATGGTGAGATGACATCTTGTGAGGTTCTACTTT
TTCACCACGAGGATATGGGAATACCGTGGGAGATAGCAAAGCTCGGGGTGAGACAGGGGA
TGTGGGGCGCGGTGAAGAAGATAGAGCCAGGGCTACGTGCATATCAGAGGGCTAGAGCAG
GAGGAGGAGCAGGTTTATCACCGAGCGCATCGATGGCTCAGATCAACACCAAAGTGAGTG
CGGAGGAGTTTATGAACGAGAGGGATTCGGCGGGAGAGGTTGCTGGAGATGAGAAGCCGT
CGTCAGGGAAAAACATACCGAAGTTACTAGTGGTGGGAGGGGCGGTTGCGCTTGCGTGTA
CGCTGGACAAAGGGCTGTTGACGAAGGCGGTGATATTCGGAGTAGCGAGAAGGTTTGCAA
GAATGGGGAAGAGGATGTAGGAGGGATGAATGTGTACATTGTGTGAGAGGGTCACTCTCC
TTTTGCAATTCTAAATAGAGAAAGAAAGAATGTTTCATTATGTCTTGGTGAATGTATCAA
TCATGTAAAAGCAAAGAGAAAAAAAAAGAAAGAGAGGGAGTTAATTCTTTTAGTGTTGGA
TTTGTGATAATAAACATATGAAACTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ61TF U 1
AF RR2BQ61JQ C 32
BS 1 562 RR2BQ61TF
BS 563 811 RR2BQ61JQ

RD RR2BQ61TF 562 0 0
GGGTTGTTCAGTGGGTCCGCAAGTTCCCTTTCTTTTGTAGCGACAGGGAGTATATCATTG
GCAGGAGAATATGGGACGCTGGTCGAGTCTTTTACTGCGTTACAAAGGGAGTACCATACC
CGTCTGTACCACGACAGAGCAAGCCGCGGCGTGTTGACTTGTACTATTCAAGCTGGTGCA
TCCGTGCAGTTGAATCGAAAAGAGGGGATGGTGAGATGACATCTTGTGAGGTTCTACTTT
TTCACCACGAGGATATGGGAATACCGTGGGAGATAGCAAAGCTCGGGGTGAGACAGGGGA
TGTGGGGCGCGGTGAAGAAGATAGAGCCAGGGCTACGTGCATATCAGAGGGCTAGAGCAG
GAGGAGGAGCAGGTTTATCACCGAGCGCATCGATGGCTCAGATCAACACCAAAGTGAGTG
CGGAGGAGTTTATGAACGAGAGGGATTCGGCGGGAGAGGTTGCTGGAGATGAGAAGCCGT
CGTCAGGGAAAAACATACCGAAGTTACTAGTGGTGGGAGGGGCGGTTGCGCTTGCGTGTA
CGCTGGACAAAGGGCTGTTGAC

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2BQ61JQ 780 0 0
CTTTTGTAGCGACAGGGAGTATATCATTGGCAGGAGAATATGGGACGCTGGTCGAGTCTT
TTACTGCGTTACAAAGGGAGTACCATACCCGTCTGTACCACGACAGAGCAAGCCGCGGCG
TGTTGACTTGTACTATTCAAGCTGGTGCATCCGTGCAGTTGAATCGAAAAGAGGGGATGG
TGAGATGACATCTTGTGAGGTTCTACTTTTTCACCACGAGGATATGGGAATACCGTGGGA
GATAGCAAAGCTCGGGGTGAGACAGGGGATGTGGGGCGCGGTGAAGAAGATAGAGCCAGG
GCTACGTGCATATCAGAGGGCTAGAGCAGGAGGAGGAGCAGGTTTATCACCGAGCGCATC
GATGGCTCAGATCAACACCAAAGTGAGTGCGGAGGAGTTTATGAACGAGAGGGATTCGGC
GGGAGAGGTTGCTGGAGATGAGAAGCCGTCGTCAGGGAAAAACATACCGAAGTTACTAGT
GGTGGGAGGGGCGGTTGCGCTTGCGTGTACGCTGGACAAAGGGCTGTTGACGAAGGCGGT
GATATTCGGAGTAGCGAGAAGGTTTGCAAGAATGGGGAAGAGGATGTAGGAGGGATGAAT
GTGTACATTGTGTGAGAGGGTCACTCTCCTTTTGCAATTCTAAATAGAGAAAGAAAGAAT
GTTTCATTATGTCTTGGTGAATGTATCAATCATGTAAAAGCAAAGAGAAAAAAAAAGAAA
GAGAGGGAGTTAATTCTTTTAGTGTTGGATTTGTGATAATAAACATATGAAACTTTTTTT

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL7364Contig1 779 2 4 U
GAGAGAAATCGACAGCCGTTGGACCTGTCTCCGATCATTCATCGTCGACGCAGAGCTGGT
CGAGCTCTTCTTCGTTGACACGACTCCTTTCGTTAAAGAATACTACACGGAAGAAGATGG
TCACACGTACGACTGGCGTGCGGTCCCTTCTCGCAACTCTTACGTTAAGCATCTACTCCG
TGATGTCGAAGCTTCTTTGAAGAGATCCAAAGCGACGTGGAAGATTGTGGTTGGTCATCA
CGCGATGAGAAGCATTGGTCATCATGGAAACACTGTAGAGCTCGTTGAAGAGCTTTTGCC
GATTATGAAAGAGAACGGTGTTGATCTTTATATGAATGGACATGACCATTGTCTCGAACA
TATTAGCGATGAAGATAGTCCTATTTCAGTTTTTGACGAGCGGTGCTGGTTCCAAGGCTT
GGAGAGGTGATGTTGACCCGACCACCAACAATCCTAAGTCTGTGAGGTTTTATTATTATG
GTCAAGGGTTCATGTCTGCTAGATTCACTCACTCAGATGCAGAGATAGTCTTCTACAATG
TGTTTGGTGAGGTTTTGCACAAGTGGGTTACTTCTAAGGAGCTTCTTCATTCCTCTGTTT
GATCAGAAGTATAAATAAATTTTTGTTTCCTTTGTAATCTTTGTAACATATCTTTCAAGT
CCTATTGCAGGCTAGGTAGGCTTCCTGCTTAGTTTAGCATCATTTAGCTATAGCTTATCC
CAATAAAACATTATTTAAATGTAATGTAATGATTGTCTTAATGATTATCTTCTTAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP03TF U 1
AF RR2BP03JQ C 29
BS 1 675 RR2BP03TF
BS 676 676 RR2BP03JQ
BS 677 722 RR2BP03TF
BS 723 779 RR2BP03JQ

RD RR2BP03TF 728 0 0
GAGAGAAATCGACAGCCGTTGGACCTGTCTCCGATCATTCATCGTCGACGCAGAGCTGGT
CGAGCTCTTCTTCGTTGACACGACTCCTTTCGTTAAAGAATACTACACGGAAGAAGATGG
TCACACGTACGACTGGCGTGCGGTCCCTTCTCGCAACTCTTACGTTAAGCATCTACTCCG
TGATGTCGAAGCTTCTTTGAAGAGATCCAAAGCGACGTGGAAGATTGTGGTTGGTCATCA
CGCGATGAGAAGCATTGGTCATCATGGAAACACTGTAGAGCTCGTTGAAGAGCTTTTGCC
GATTATGAAAGAGAACGGTGTTGATCTTTATATGAATGGACATGACCATTGTCTCGAACA
TATTAGCGATGAAGATAGTCCTATTTCAGTTTTTGACGAGCGGTGCTGGTTCCAAGGCTT
GGAGAGGTGATGTTGACCCGACCACCAACAATCCTAAGTCTGTGAGGTTTTATTATTATG
GTCAAGGGTTCATGTCTGCTAGATTCACTCACTCAGATGCAGAGATAGTCTTCTACAATG
TGTTTGGTGAGGTTTTGCACAAGTGGGTTACTTCTAAGGAGCTTCTTCATTCCTCTGTTT
GATCAGAAGTATAAATAAATTTTTGTTTCCTTTGTAATCTTTGTAACATATCTTTCAAGT
CCTATTGCAGGCTAG*TAGGCTTCCTGCTTAGTTTAGCATCATTTAGCTATAGCTTATCC
CA
TAAACA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2BP03JQ 751 0 0
CTCCGATCATTCATCGTCGACGCAGAGCTGGTCGAGCTCTTCTTCGTTGACACGACTCCT
TTCGTTAAAGAATACTACACGGAAGAAGATGGTCACACGTACGACTGGCGTGCGGTCCCT
TCTCGCAACTCTTACGTTAAGCATCTACTCCGTGATGTCGAAGCTTCTTTGAAGAGATCC
AAAGCGACGTGGAAGATTGTGGTTGGTCATCACGCGATGAGAAGCATTGGTCATCATGGA
AACACTGTAGAGCTCGTTGAAGAGCTTTTGCCGATTATGAAAGAGAACGGTGTTGATCTT
TATATGAATGGACATGACCATTGTCTCGAACATATTAGCGATGAAGATAGTCCTATTTCA
GTTTTTGACGAGCGGTGCTGGTTCCAAGGCTTGGAGAGGTGATGTTGACCCGACCACCAA
CAATCCTAAGTCTGTGAGGTTTTATTATTATGGTCAAGGGTTCATGTCTGCTAGATTCAC
TCACTCAGATGCAGAGATAGTCTTCTACAATGTGTTTGGTGAGGTTTTGCACAAGTGGGT
TACTTCTAAGGAGCTTCTTCATTCCTCTGTTTGATCAGAAGTATAAATAAATTTTTGTTT
CCTTTGTAATCTTTGTAACATATCTTTCAAGTCCTATTGCAGGCTAGGTAGGCTTCCTGC
TTAGTTTAGCATCATTTAGCTATAGCTTATCCCAATAAAACATTATTTAAATGTAATGTA
ATGATTGTCTTAATGATTATCTTCTTAATGT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL7365Contig1 531 2 1 U
GGAACTCAAAACATCTTAAAACACAAAATCCGACTTATCTCACAAGCATTAACCGAGAGA
TCTTATGAGCGACAAGTGAACTATCAAAGCAATGGCATCGATGACCATGACAGCTGCATT
CCTCCCTGCCATCGCTAAGCTTCCGTCAACCACAGGCGGACGAAGGCTATCAGTAGTCAG
AGCCTCAACGAGAACTCAACCAGCTTACAAGTCAAGGCCAATGAGAAACATAGCAGCTCT
ACAATGAGGAGGGATCTCATGTTCACTGCTGCAGCCGCGGCCGTTTGTTCCTTGGCTAAG
GCAGCCATGGCTGATGAGGAGGAGCCTAAGTGAGGGACAGAGGCGGCTAAGAAGAAGTAC
GCTCAAGTTTGTGTCATCATCATGCCTACGGCCAAGATCTGCCGCTAATGATTCCAACAA
TCCACCTTTCATGTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCAATTAAGTTTGGTATGTAATCATAT
ATTTGATCAAATATCTTTCTACTAGAATCATCGCCTTTCACCATTCAACAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FU10JQ C 1
AF RR2FU10TF U 1
BS 1 531 RR2FU10TF

RD RR2FU10JQ 531 0 0
GGAACTCAAAACATCTTAAAACACAAAATCCGACTTATCTCACAAGCATTAACCGAGAGA
TCTTATGAGCGACAAGTGAACTATCAAAGCAATGGCATCGATGACCATGACAGCTGCATT
CCTCCCTGCCATCGCTAAGCTTCCGTCAACCACAGGCGGACGAAGGCTATCAGTAGTCAG
AGCCTCAACGAGAACTCAACCAGCTTACAAGTCAAGGCCAATGAGAAACATAGCAGCTCT
ACAATGAGGAGGGATCTCATGTTCACTGCTGCAGCCGCGGCCGTTTGTTCCTTGGCTAAG
GCAGCCATGGCTGATGAGGAGGAGCCTAAGTGAGGGACAGAGGCGGCTAAGAAGAAGTAC
GCTCAAGTTTGTGTCATCATCATGCCTACGGCCAAGATCTGCCGCTAATGATTCCAACAA
TCCACCTTTCATGTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCAATTAAGTTTGGTATGTAATCATAT
ATTTGATCAAATATCTTTCTACTAGAATCATCGCCTTTCACCATTCAACAA

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2FU10TF 531 0 0
GGAACTCAAAACATCTTAAAACACAAAATCCGACTTATCTCACAAGCATTAACCGAGAGA
TCTTATGAGCGACAAGTGAACTATCAAAGCAATGGCATCGATGACCATGACAGCTGCATT
CCTCCCTGCCATCGCTAAGCTTCCGTCAACCACAGGCGGACGAAGGCTATCAGTAGTCAG
AGCCTCAACGAGAACTCAACCAGCTTACAAGTCAAGGCCAATGAGAAACATAGCAGCTCT
ACAATGAGGAGGGATCTCATGTTCACTGCTGCAGCCGCGGCCGTTTGTTCCTTGGCTAAG
GCAGCCATGGCTGATGAGGAGGAGCCTAAGTGAGGGACAGAGGCGGCTAAGAAGAAGTAC
GCTCAAGTTTGTGTCATCATCATGCCTACGGCCAAGATCTGCCGCTAATGATTCCAACAA
TCCACCTTTCATGTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCAATTAAGTTTGGTATGTAATCATAT
ATTTGATCAAATATCTTTCTACTAGAATCATCGCCTTTCACCATTCAACAA

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 2

CO CL7366Contig1 718 2 2 U
GGGGAACCAAAACCAGCAGTGCGGTATCCTTGATCTTGAGAGGTGCAAATGACTACATGC
TTGATGAGATGGAGAGAGCACTGCACGATTCTTTGTGTATTGTCAAGGGGACCCTCGAGT
CCAACACGGTGGTTGCGGGTGGAGGTGCAGTTGAGTCAGCATTGTCTGTGTATCTGGAGC
ACCTTGCTACAACCTTGGGCTCTCGCGAACAATTGGCAATTGCTGAATTTGCAGAGGCGT
TATTGGTTATACCTAAGGTGCTTGCTGTAAACGCCGCCAAGGATGCAACGGAGTTGGTAG
CTAAACTAAGAGCATACCACCACACCGCACAAACCAAGGCTGATAAGAAGCACTATTCAA
GCATGGGACTTGACCTTGTAAACGGAATAGTCCGTAACAATTTGGAAGCAGGAGTGATCG
AACCAGCGATGAGCAAAGTGAAAATTATCCAGTTTGCAACAGAGGCAGCCATTACGATTC
TGAGAATCGACGACATGATCAAACTGGTGAAGGAAGATGTCCAAGGCGATGAGTAAACCA
ATCCAAAAGCTCAAAAACTTTTCTTTTATTAGTGTGTTTTTTTGTCCGCGTTTGCAGCAA
CCACCGGTTTTTTTTCTACCCTTCTTTCTGTATTTTTTTTTTCTTTTGGTATTTAGCGTT
TGTACCCAATGGGATATTCTTTGCACTTTTTAGATACTAAACGAAGTCAGATTTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ65TF U 1
AF RR2DQ65JQ C 34
BS 1 544 RR2DQ65TF
BS 545 718 RR2DQ65JQ

RD RR2DQ65TF 544 0 0
GGGGAACCAAAACCAGCAGTGCGGTATCCTTGATCTTGAGAGGTGCAAATGACTACATGC
TTGATGAGATGGAGAGAGCACTGCACGATTCTTTGTGTATTGTCAAGGGGACCCTCGAGT
CCAACACGGTGGTTGCGGGTGGAGGTGCAGTTGAGTCAGCATTGTCTGTGTATCTGGAGC
ACCTTGCTACAACCTTGGGCTCTCGCGAACAATTGGCAATTGCTGAATTTGCAGAGGCGT
TATTGGTTATACCTAAGGTGCTTGCTGTAAACGCCGCCAAGGATGCAACGGAGTTGGTAG
CTAAACTAAGAGCATACCACCACACCGCACAAACCAAGGCTGATAAGAAGCACTATTCAA
GCATGGGACTTGACCTTGTAAACGGAATAGTCCGTAACAATTTGGAAGCAGGAGTGATCG
AACCAGCGATGAGCAAAGTGAAAATTATCCAGTTTGCAACAGAGGCAGCCATTACGATTC
TGAGAATCGACGACATGATCAAACTGGTGAAGGAAGATGTCCAAGGCGATGAGTAAACCA
ATCC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RR2DQ65JQ 685 0 0
TCTTGAGAGGTGCAAATGACTACATGCTTGATGAGATGGAGAGAGCACTGCACGATTCTT
TGTGTATTGTCAAGGGGACCCTCGAGTCCAACACGGTGGTTGCGGGTGGAGGTGCAGTTG
AGTCAGCATTGTCTGTGTATCTGGAGCACCTTGCTACAACCTTGGGCTCTCGCGAACAAT
TGGCAATTGCTGAATTTGCAGAGGCGTTATTGGTTATACCTAAGGTGCTTGCTGTAAACG
CCGCCAAGGATGCAACGGAGTTGGTAGCTAAACTAAGAGCATACCACCACACCGCACAAA
CCAAGGCTGATAAGAAGCACTATTCAAGCATGGGACTTGACCTTGTAAACGGAATAGTCC
GTAACAATTTGGAAGCAGGAGTGATCGAACCAGCGATGAGCAAAGTGAAAATTATCCAGT
TTGCAACAGAGGCAGCCATTACGATTTTGAGAATCGACGACATGATCAAACTGGTGAAGG
AAGATGTCCAAGGCGATGAGTAAACCAATCCAAAAGCTCAAAAACTTTTCTTTTATTAGT
GTGTTTTTTTGTCCGCGTTTGCAGCAACCACCGGTTTTTTTTCTACCCTTCTTTCTGTAT
TTTTTTTTTCTTTTGGTATTTAGCGTTTGTACCCAATGGGATATTCTTTGCACTTTTTAG
ATACTAAACGAAGTCAGATTTTCCT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL7367Contig1 1058 2 8 U
GGGAACAAAGAAGGATTGAAGAAGTTGCTAAGCTTCTCTGTTGGGAGAAGAAGTATGAAC
ACGGCGAGATCGCTATCTGGCAGAAGAGGGTCAATGATGAGGCATGCCGTTCAAGACAAG
ATGACCCTAGAGCCGACTTCCGCAAAACTGGTGATACTGATGATGTCTGGTACAAGAAAA
TGGAAGCATGTATTACACCTTATCCGGAGACTAGTAGCTCAGTGGCTGGAGGAGAACTTC
AGGTGTTTCCAGATAGACTCAATGCAGTGCCGCCTAGGATCTCTAGTGGTTCCATCTCTG
GTGTCACGGTTGATGCTTATGAAGATGATAACAGACAGTGGAGAAAACATGTGAAAGCTT
ACAAGAGAATCAACAGTTTACTTGATACTGGAAGGTACCGTAACATCATGGACATGAACG
CAGGGTTTGGTGGGTTTGCTGCTGCTCTTGAATCTACAAAGCTTTGGGTTATGAATGTTG
TCCCAACGATTGCTGAAAAGAATAGACTTGGAGTTGTATATGAACGAGGACTCATTGGAA
TCTACCATGACTGGTGTGAGGCTTTCTCTACATATCCAAGAACATATGACTTAATCCATG
CGAATCATCTCTTCAGTCTGTACAAGAACAAGTGCAATGCGGATGACATTCTTCTGGAGA
TGGATAGGATTCTCCGACCAGAAGGAGCGGTTATAATCAGAGATGATGTTGACACATTGA
TAAAGGTGAAGAGAATCATCTCTGGGATGAGATGGGATTCGAAGCTGGTTGATCATGAGG
ATGGTCCTTTAGTTAATGAGAAGGTTTTGATTGCGGTGAAGCAGTATTGGGTCACCAACT
CCACCTCGGCTCACTGAAGTGTCAGTGTGACCTGGACATTTTGATCAAATGATAGGAAGC
TTTATTCGTCCTTAGGGAATGTGAGAGAGCTAGACTCTCGTATTTGTTACACTTCTTCAA
GTATCCCTATTTATTTAATGTAATAGTTTACCAGGTAATTAACCCGCTCCTCTTTTTTTG
GTTTTTGACATGAAAGAAAAAAATCTGGGTTTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D880TF U 1
AF RR2D880JQ C 392
BS 1 684 RR2D880TF
BS 685 685 RR2D880JQ
BS 686 725 RR2D880TF
BS 726 726 RR2D880JQ
BS 727 734 RR2D880TF
BS 735 735 RR2D880JQ
BS 736 777 RR2D880TF
BS 778 1058 RR2D880JQ

RD RR2D880TF 777 0 0
GGGAACAAAGAAGGATTGAAGAAGTTGCTAAGCTTCTCTGTTGGGAGAAGAAGTATGAAC
ACGGCGAGATCGCTATCTGGCAGAAGAGGGTCAATGATGAGGCATGCCGTTCAAGACAAG
ATGACCCTAGAGCCGACTTCCGCAAAACTGGTGATACTGATGATGTCTGGTACAAGAAAA
TGGAAGCATGTATTACACCTTATCCGGAGACTAGTAGCTCAGTGGCTGGAGGAGAACTTC
AGGTGTTTCCAGATAGACTCAATGCAGTGCCGCCTAGGATCTCTAGTGGTTCCATCTCTG
GTGTCACGGTTGATGCTTATGAAGATGATAACAGACAGTGGAGAAAACATGTGAAAGCTT
ACAAGAGAATCAACAGTTTACTTGATACTGGAAGGTACCGTAACATCATGGACATGAACG
CAGGGTTTGGTGGGTTTGCTGCTGCTCTTGAATCTACAAAGCTTTGGGTTATGAATGTTG
TCCCAACGATTGCTGAAAAGAATAGACTTGGAGTTGTATATGAACGAGGACTCATTGGAA
TCTACCATGACTGGTGTGAGGCTTTCTCTACATATCCAAGAACATATGACTTAATCCATG
CGAATCATCTCTTCAGTCTGTACAAGAACAAGTGCAATGCGGATGACATTCTTCTGGAGA
TGGATAGGATTCTCCGACCAGAAG*AGCGGTTATAATCAGAGATGATGTTGACACATTGA
TAAAG*TGAAGAGA*TCATCTCTGGGATGAGATGGGATTCGAAGCTGGTTGATCATG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RR2D880JQ 667 0 0
AAGGTACCGTAACATCATGGACATGAACGCAGGGTTTGGTGGGTTTGCTGCTGCTCTTGA
ATCTACAAAGCTTTGGGTTATGAATGTTGTCCCAACGATTGCTGAAAAGAATAGACTTGG
AGTTGTATATGAACGAGGACTCATTGGAATCTACCATGACTGGTGTGAGGCTTTCTCTAC
ATATCCAAGAACATATGACTTAATCCATGCGAATCATCTCTTCAGTCTGTACAAGAACAA
GTGCAATGCGGATGACATTCTTCTGGAGATGGATAGGATTTTCCGACCAGAAGGAGCGGT
TATAATCAGAGATGATGTTGACACATTGATAAAGGTGAAGAGAATCATCTCTGGGATGAG
ATGGGATTCGAAGCTGGTTGATCATGAGGATGGTCCTTTAGTTAATGAGAAGGTTTTGAT
TGCGGTGAAGCAGTATTGGGTCACCAACTCCACCTCGGCTCACTGAAGTGTCAGTGTGAC
CTGGACATTTTGATCAAATGATAGGAAGCTTTATTCGTCCTTAGGGAATGTGAGAGAGCT
AGACTCTCGTATTTGTTACACTTCTTCAAGTATCCCTATTTATTTAATGTAATAGTTTAC
CAGGTAATTAACCCGCTCCTCTTTTTTTGGTTTTTGACATGAAAGAAAAAAATCTGGGTT
TTTTTCC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL7368Contig1 773 2 4 U
GGAAAAAGTGAAAGAAGCTGGACTTGAGGATCGGATTAAGTTTAAGCTCTGCGATTATCG
CCAACTATCTGATGCTCACAAATATGACAGGATTATATCTTGCGAGATGCTAGAAGCTGT
TGGCCATGAATTCATGGAGACATTTTTTAGACATTGTGAAGCTGCACTTGCAGAAGACGG
TGTTTTTGTACTGCAGTTCATATCAATACCTGAGGAACGTTATGATGAGTACAGACTAAG
TTCAGATTTCATAAAAGAATACATATTCCCTGGTGGATGCCTTCCTTCTTTAGCCAGAGT
TACTTCAGCCATGGCATCTTCTTCTAGGCTATGCATTGAAAACGTTGAGAACATTGGGAT
TCATTACTACCAAACATTGAGATTGTGGAGGAAGACCTTCTTGGAAAGACAGAAACAAAT
AAATGATCTTGGATTCGACGATAAATTCATAAGGACATGGGAATATTATTTTGACTACTG
TGCAGCTGGTTTCAAGACTCTTACGCTTGGAAACTATCAGGTAGTTTTCTCACGTCCTGG
AAATGTGGCTGCACTTGGGGATCCATTCCGCAGCTTCCCTTCTGCTCAAGTATAATCTAG
AATATATGAATCTCCCCTTTTTAAATTTCTTAAAGTACTACTTTAATAACTTGTGTTGTT
TCCTATAATTTGTTTGCGTGTGAAAGTATATATGTAAACATGTAAAAGTATATGGTTCCA
TAATTCTCTACCAACAATATTGCATTATTAATACATTCTACAACAAAATTTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C185JQ C 1
AF RR2C185TF U 1
BS 1 624 RR2C185TF
BS 625 625 RR2C185JQ
BS 626 754 RR2C185TF
BS 755 773 RR2C185JQ

RD RR2C185JQ 773 0 0
GGAAAAAGTGAAAGAAGCTGGACTTGAGGATCGGATTAAGTTTAAGCTCTGCGATTATCG
CCAACTATCTGATGCTCACAAATATGACAGGATTATATCTTGCGAGATGCTAGAAGCTGT
TGGCCATGAATTCATGGAGACATTTTTTAGACATTGTGAAGCTGCACTTGCAGAAGACGG
TGTTTTTGTACTGCAGTTCATATCAATACCTGAGGAACGTTATGATGAGTACAGACTAAG
TTCAGATTTCATAAAAGAATACATATTCCCTGGTGGATGCCTTCCTTCTTTAGCCAGAGT
TACTTCAGCCATGGCATCTTCTTCTAGGCTATGCATTGAAAACGTTGAGAACATTGGGAT
TCATTACTACCAAACATTGAGATTGTGGAGGAAGACCTTCTTGGAAAGACAGAAACAAAT
AAATGATCTTGGATTCGACGATAAATTCATAAGGACATGGGAATATTATTTTGACTACTG
TGCAGCTGGTTTCAAGACTCTTACGCTTGGAAACTATCAGGTAGTTTTCTCACGTCCTGG
AAATGTGGCTGCACTTGGGGATCCATTCCGCAGCTTCCCTTCTGCTCAAGTATAATCTAG
AATATATGAATCTCCCCTTTTTAAATTTCTTAAAGTACTACTTTAATAACTTGTGTTGTT
TCCTATAATTTGTTTGCGTGTGAAAGTATATATGTAAACATGTAAAAGTATATGGTTCCA
TAATTCTCTACCAACAATATTGCATTATTAATACATTCTACAACAAAATTTAT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2C185TF 754 0 0
GGAAAAAGTGAAAGAAGCTGGACTTGAGGATCGGATTAAGTTTAAGCTCTGCGATTATCG
CCAACTATCTGATGCTCACAAATATGACAGGATTATATCTTGCGAGATGCTAGAAGCTGT
TGGCCATGAATTCATGGAGACATTTTTTAGACATTGTGAAGCTGCACTTGCAGAAGACGG
TGTTTTTGTACTGCAGTTCATATCAATACCTGAGGAACGTTATGATGAGTACAGACTAAG
TTCAGATTTCATAAAAGAATACATATTCCCTGGTGGATGCCTTCCTTCTTTAGCCAGAGT
TACTTCAGCCATGGCATCTTCTTCTAGGCTATGCATTGAAAACGTTGAGAACATTGGGAT
TCATTACTACCAAACATTGAGATTGTGGAGGAAGACCTTCTTGGAAAGACAGAAACAAAT
AAATGATCTTGGATTCGACGATAAATTCATAAGGACATGGGAATATTATTTTGACTACTG
TGCAGCTGGTTTCAAGACTCTTACGCTTGGAAACTATCAGGTAGTTTTCTCACGTCCTGG
AAATGTGGCTGCACTTGGGGATCCATTCCGCAGCTTCCCTTCTGCTCAAGTATAATCTAG
AATATATGAATCTCCCCTTTTTAA*TTTCTTAAAGTACTACTTTAATAACTTGTGTTGTT
TCCTATAATTTGTTTGCGTGTGAAAGTATATATGTAAACATGTAAAAGTATATGGTTCCA
TAATTCTCTACCAACAATATTGCATTATTAATAC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL7369Contig1 665 2 2 U
GGAAGTAAAAAAAAAAAAACCCTAACTCCCCCGACGACGAATCGATGGAGCGAGACGAAG
AATCAAGCGGACCGATGATGGAGATGTGCACTAACGGAGGAGGCGAAGATACGTCGAATC
GGAGACCAATTATAAGCGGCGAACCTCTCGACGTGGAAGCTTACGCGACGCTGTACAAGG
GACGAACGAAGATCATGCGGTTACTCTTCATCGCTAGCCATTGCGGTGGGAACCAGACGA
TGCAGCTCGAGGCGTTGAGGATGGCTTACGATGAGATTAAGAAGGGGGAGAACACTCAGT
TGTTCAGAGATGTGGTCAATAGGATCAACGGGAGGCTCGGGGATAAGTATGGGATGGATT
CGGGTTGGTGTGAAAGTGTGGATCGTCGCGCTGAGCAGAAGAAAGGAAGGCTGGAGAACG
AGCTCAGTTCGTATCGGACTAATCTGATCAAGGAAAGCATCAGAATGGGTCATAATGACT
TTGGTGACTTCTACTATGCCTGTGGTTTGCTCAATGATGCTTTCAAGAACTACGTTCGAA
CACGGGACTACTGCACCACGGCTAAGCACATTATTCACATGTGTATGAACGCCATTCTCG
TCAGCATCGAGATGGGACAGTTCAGTCATGTTTCAAGCTACGTTAACAAGCAGAGCAGAC
CCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2EB30TF U 1
AF RR2BQ43TF U 108
BS 1 646 RR2EB30TF
BS 647 665 RR2BQ43TF

RD RR2EB30TF 646 0 0
GGAAGTAAAAAAAAAAAAACCCTAACTCCCCCGACGACGAATCGATGGAGCGAGACGAAG
AATCAAGCGGACCGATGATGGAGATGTGCACTAACGGAGGAGGCGAAGATACGTCGAATC
GGAGACCAATTATAAGCGGCGAACCTCTCGACGTGGAAGCTTACGCGACGCTGTACAAGG
GACGAACGAAGATCATGCGGTTACTCTTCATCGCTAGCCATTGCGGTGGGAACCAGACGA
TGCAGCTCGAGGCGTTGAGGATGGCTTACGATGAGATTAAGAAGGGGGAGAACACTCAGT
TGTTCAGAGATGTGGTCAATAGGATCAACGGGAGGCTCGGGGATAAGTATGGGATGGATT
CGGGTTGGTGTGAAAGTGTGGATCGTCGCGCTGAGCAGAAGAAAGGAAGGCTGGAGAACG
AGCTCAGTTCGTATCGGACTAATCTGATCAAGGAAAGCATCAGAATGGGTCATAATGACT
TTGGTGACTTCTACTATGCCTGTGGTTTGCTCAATGATGCTTTCAAGAACTACGTTCGAA
CACGGGACTACTGCACCACGGCTAAGCACATTATTCACATGTGTATGAACGCCATTCTCG
TCAGCATCGAGATGGGACAGTTCAGTCATGTTTCAAGCTACGTTAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2BQ43TF 558 0 0
GATACGTCGAATCGGAGACCAATTATAAGCGGCGAGCCTCTCGACGTGGAAGCTTACGCG
ACGCTGTACAAGGGACGAACGAAGATCATGCGGTTACTCTTCATCGCTAGCCATTGCGGT
GGGAACCAGACGATGCAGCTCGAGGCGTTGAGGATGGCTTACGATGAGATTAAGAAGGGG
GAGAACACTCAGTTGTTCAGAGATGTGGTCAATAGGATCAACGGGAGGCTCGGGGATAAG
TATGGGATGGATTCGGGTTGGTGTGAAAGTGTGGATCGTCGCGCTGAGCAGAAGAAAGGA
AGGCTGGAGAACGAGCTCAGTTCGTATCGGACTAATCTGATCAAGGAAAGCATCAGAATG
GGTCATAATGACTTTGGTGGCTTCTACTATGCCTGTGGTTTGCTCAATGATGCTTTCAAG
AACTACGTTCGAACACGGGACTACTGCACCACGGCTAAGCACATTATTCACATGTGTATG
AACGCCATTCTCGTCAGCATCGAGATGGGACAGTTCAGTCATGTTTCAAGCTACGTTAAC
AAGCAGAGCAGACCCAGA

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL7370Contig1 1047 2 10 U
GTGCTGGTGACAAATCAAACGTTGAGGAACCCATGATGTATGCTACTAAGCAGGAGGCTA
AAGCTGCTTTCAAGTCTCTTTTGGAATCTGTAAATGTTCAGTCCGACTGGACATGGGAAC
AGACAACTAAAGAGATTGTTCATGATAAAAGATATGGTGCTTTGAGGACACTCGGTGAGC
GGAAACAAGCTTTTAACGAGTATCTCGGTCAAAGGAAAAAAGTGGAAGCTGAGGAAAGGC
GATGGAGACAGAAGAAAGCGCGGGAAGAATTTGTCAAGATGCTAGAGGAGTGTGAAGAAT
TATCATCATCCCTGAAATGGAGCAAAGCTTTGAGTTTGTTTGAAAATGATGAGCGTTTTA
AAGCTGTTGATCGCCCAAGGGATCGTGAAGATCTTTTTGACAATTATATTGTGGAACTTG
AGAGGAAGGAAAGAGAGAAGGCAGTGGCAGAACATCGGCAGAAGATGGCAGAATATCGGA
AGTTTCTTGAAACCTGTGACTATATCAAAGCCAGTACACAATGACGCAAAATTCAGGATA
GACTGGAGGATGATGAAAGAAGCGCATCTCTTGAAAAGATAGATCGTTTGATTGGTTTTG
AGGATTACATTAATGACCTGGAGAAAGAAGAAGAGGAGCTGAAGAGGGTAGAGAAAGAAC
ATGTTAGACGGGCCGAGAGAAAAAATCGTGATGCATTTCGTACACTATTGGAAGAACATG
TCGCTGCTGGCATCCTTACAGCCAAGACGTATTGGTTGGAGTATTGCATTGAGGTAAGAG
ACTTGCCTCAATACCAAGCTGTTGCATCTAATTTGTCTGGCTCAACTCCGAAAGACTTAT
TTGAAGATATCACGGAAGAATTAGAGAAGCAGTATCACGAGGACAAGAGTCGCGTAAAGG
ATGCGATGAAGTCAAGGAAGGTTTCCATGGTCGCCTCATGGATGTTTGAAGATTTTCAAT
CTGCTCTTTCAGAAGATCTCAGTTCTCAACCAATATCAGACATAAATTTAAAGCTTATAT
ATAATGACTTGGTTGAGAGGATGAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GL82TF U 1
AF RR2GL82JQ C 430
BS 1 684 RR2GL82TF
BS 685 685 RR2GL82JQ
BS 686 715 RR2GL82TF
BS 716 716 RR2GL82JQ
BS 717 744 RR2GL82TF
BS 745 745 RR2GL82JQ
BS 746 776 RR2GL82TF
BS 777 777 RR2GL82JQ
BS 778 789 RR2GL82TF
BS 790 1047 RR2GL82JQ

RD RR2GL82TF 789 0 0
GTGCTGGTGACAAATCAAACGTTGAGGAACCCATGATGTATGCTACTAAGCAGGAGGCTA
AAGCTGCTTTCAAGTCTCTTTTGGAATCTGTAAATGTTCAGTCCGACTGGACATGGGAAC
AGACAACTAAAGAGATTGTTCATGATAAAAGATATGGTGCTTTGAGGACACTCGGTGAGC
GGAAACAAGCTTTTAACGAGTATCTCGGTCAAAGGAAAAAAGTGGAAGCTGAGGAAAGGC
GATGGAGACAGAAGAAAGCGCGGGAAGAATTTGTCAAGATGCTAGAGGAGTGTGAAGAAT
TATCATCATCCCTGAAATGGAGCAAAGCTTTGAGTTTGTTTGAAAATGATGAGCGTTTTA
AAGCTGTTGATCGCCCAAGGGATCGTGAAGATCTTTTTGACAATTATATTGTGGAACTTG
AGAGGAAGGAAAGAGAGAAGGCAGTGGCAGAACATCGGCAGAAGATGGCAGAATATCGGA
AGTTTCTTGAAACCTGTGACTATATCAAAGCCAGTACACAATGACGCAAAATTCAGGATA
GACTGGAGGATGATGAAAGAAGCGCATCTCTTGAAAAGATAGATCGTTTGATTGGTTTTG
AGGATTACATTAATGACCTGGAGAAAGAAGAAGAGGAGCTGAAGAGGGTAGAGAAAGAAC
ATGTTAGACGGGCCGAGAGAAAAA*TCGTGATGCATTTCGTACACTATTGGAAGA*CATG
TCGCTGCTGGCATCCTTACAGCCA*GACGTATTGGTTGGAGTATTGCATTGAGGTA*GAG
ACTTGCCTC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2GL82JQ 618 0 0
AAAGAGAGAAGGCAGTGGCAGAACATCGGCAGAAGATGGCAGAATATCGGAAGTTTCTTG
AAACCTGTGACTATATCAAAGCCAGTACACAATGACGCAAAATTCAGGATAGACTGGAGG
ATGATGAAAGAAGCGCATCTCTTGAAAAGATAGATCGTTTGATTGGTTTTGAGGATTACA
TTAATGACCTGGAGAAGGAAGAAGAGGAGCTGAAGAGGGTAGAGAAAGAACATGTTAGAC
GGGCCGAGAGAAAAAATCGTGATGCATTTCGTACACTATTGGAAGAACATGTCGCTGCTG
GCATCCTTACAGCCAAGACGTATTGGTTGGAGTATTGCATTGAGGTAAGAGACTTGCCTC
AATACCAAGCTGTTGCATCTAATTTGTCTGGCTCAACTCCGAAAGACTTATTTGAAGATA
TCACGGAAGAATTAGAGAAGCAGTATCACGAGGACAAGAGTCGCGTAAAGGATGCGATGA
AGTCAAGGAAGGTTTCCATGGTCGCCTCATGGATGTTTGAAGATTTTCAATCTGCTCTTT
CAGAAGATCTCAGTTCTCAACCAATATCAGACATAAATTTAAAGCTTATATATAATGACT
TGGTTGAGAGGATGAAGG

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL7371Contig1 760 2 11 U
GCATCAAAGCTTAAACCCCCCTCCTCATTTTCTTAGATAAAACCTATGACAATTTGAAAA
GTAGTAGCCATTGTATGACAAGCAACCCTTACATTCATCTTTATTAAAACGAACATTTTT
AAAATAATACAAGTAGACCCTTAAAAACAAGTAGACACCATTGTGGGATATCATCTTCAT
GATTCGGGGAAATAAGAAGGAAGAACACTAATCAACTTCTTACTAGCAAAGTCCTCGTAC
GCTTCTTTTATGAAATCATCGTCGTCCCATTCATCGCGGTAATTTTCAGGTTTAGAGACA
AGTCTCCCGTAACCACTGTCAACTTGCTTTTTTCTCCAAGGTTCAACAAGCTGGCAACCA
CATTCTTCTGCGATCCAGTCGAGGTACTTAAACTGAATTTTACCCAATTTATGTGTATGT
CTCTTGGGAATACCTAACGCTTCAAGCATGGTATACGATGCAATAAGATCTTCCATCATC
ATTTCCGGTGAAGGAAGTGTAACTCGTCCAGACAAAACCGCAGCTACCCATTTGCTTTGG
ATTTCAAACATAACGAATTGTATGCCCATCCCTGGTAAACCAACAAAAGAAAGCCCTGGG
GCAAGCGCTGGTGGAAAGACATGTTTGTATAAAGGCTCAACGCGGTTATCATCAATGCTC
ATATAGCCATTGGTTTCAAGAAACGGAAACTTATACTTGTACCCGGTGCAATACACAACG
GTATCTGCATGAACTGCTTTCCCATTTTTGAAAATAATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY69JQ U 1
AF RR2CP52JQ U 161
BS 1 204 RR2FY69JQ
BS 205 206 RR2CP52JQ
BS 207 253 RR2FY69JQ
BS 254 254 RR2CP52JQ
BS 255 257 RR2FY69JQ
BS 258 258 RR2CP52JQ
BS 259 390 RR2FY69JQ
BS 391 391 RR2CP52JQ
BS 392 485 RR2FY69JQ
BS 486 486 RR2CP52JQ
BS 487 760 RR2FY69JQ

RD RR2FY69JQ 760 0 0
GCATCAAAGCTTAAACCCCCCTCCTCATTTTCTTAGATAAAACCTATGACAATTTGAAAA
GTAGTAGCCATTGTATGACAAGCAACCCTTACATTCATCTTTATTAAAACGAACATTTTT
AAAATAATACAAGTAGACCCTTAAAAACAAGTAGACACCATTGTGGGATATCATCTTCAT
GATTCGGGGAAATAAGAAGGAAGACTACTAATCAACTTCTTACTAGCAAAGTCCTCGTAC
GCTTCTTTTATGAGATCGTCGTCGTCCCATTCATCGCGGTAATTTTCAGGTTTAGAGACA
AGTCTCCCGTAACCACTGTCAACTTGCTTTTTTCTCCAAGGTTCAACAAGCTGGCAACCA
CATTCTTCTGCGATCCAGTCGAGGTACTTAGACTGAATTTTACCCAATTTATGTGTATGT
CTCTTGGGAATACCTAACGCTTCAAGCATGGTATACGATGCAATAAGATCTTCCATCATC
ATTTCTGGTGAAGGAAGTGTAACTCGTCCAGACAAAACCGCAGCTACCCATTTGCTTTGG
ATTTCAAACATAACGAATTGTATGCCCATCCCTGGTAAACCAACAAAAGAAAGCCCTGGG
GCAAGCGCTGGTGGAAAGACATGTTTGTATAAAGGCTCAACGCGGTTATCATCAATGCTC
ATATAGCCATTGGTTTCAAGAAACGGAAACTTATACTTGTACCCGGTGCAATACACAACG
GTATCTGCATGAACTGCTTTCCCATTTTTGAAAATAATTG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2CP52JQ 567 0 0
TTGTGAGG
TATCATCTTCATGATTCGGGGAAATAAGAAGGAAGAACACTAATCAACTTCTTACTAGCA
AAGTCCTCGTACGCTTCTTTTATGAAATCATCGTCGTCCCATTCATCGCGGTAATTTTCA
GGTTTAGAGACAAGTCTCCCGTAACCATTGTCAACTTGCTTTTTTCTCCAAGGTTCAACA
AGCTGGCAACCACATTCTTCTGCGATCCAGTCGAGGTACTTAAACTGAATTTTACCCAAT
TTATGTGTATGTCTCTTGGGAATACCTAACGCTTCAAGCATGGTATACGATGCAATAAGA
TCTTCCATCATCATTTCCGGTGAAGGAAGTGTAACTCGTCCAGACAAAACCGCAGCTACC
CATTTGCTTTGGATTTCAAACATAACGAATTGTATGCCCATGCCTGGTAAACCAACAAAA
GAAAGCCCTGGGGCAAGCGCTGGTGGAAAGACATGTTTGTATAAAGGCTCAACGCGGTTA
TCATCAATGCTCATATAGCCATTGGTTTCAAGAAATGGAAACTTATACTTGTACCCGGTG
CAATACACAACGGTATCTG

QA 9 567 9 567
DS 



AS 1 2

CO CL7372Contig1 702 2 2 U
GGAGAAAAAAAAGAAAAAAAGAGATGACGACACTTCTTCTTCCTCAATTAAACTGTATCT
ACAAACCACTACGAGTATCAAACCAACGCCTCCGAAAGCCGTACAGACTTCCAGTGATAT
CCGCCGTATCCGGTCAGCAGCTAGTGGCTTCCGGCGAAGTCCGGGCGGTGGAGCCGAGAG
AAGCGAAAACAGTGGTCTCGTCGGATGGATACGTGCTGTTAGACGTGAGGCCAGCTTGGG
AAAGAGAAAAGGCACATGTTAAAGGATCATTACACGTGCCACTGTTCGTGGAGGATCCTG
ACAATGGGCCGATCACACTGCTGAAGAAATGGATTCATTTGGGTTATATTGGGCTTTGGA
CGGGCCAGAGATTCACCATGTTTAATGACGAGTTTACCCTCCGTGTCGTAGAGGCTTTCC
CGGACAAGAAGAGTAAAGTGCTTGTCGCGTGCGGTGAAGGCCTCAGGTCGTTGATGGCAA
TATCAAAGCTGCACAGAGAAGGTTACAAAAGCTTAGGATGGTTAACCGGAGGGTTTAACA
GAGCAACCGAAGGAGATTTCCCAGAGATTGAAGGACCAGAAGAGCTTAAGTTTGCAACTA
TAGGTGGCGCATCATACTATTTCCTCAAACTACTTGTATTGGTGCAGAGCTTTGGCAAAG
AGAACCGTTAAATTTCATTCAATAAGAAAAAAAATTGAAATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AM14JQ C 1
AF RR2AM14TF U 1
BS 1 686 RR2AM14TF
BS 687 702 RR2AM14JQ

RD RR2AM14JQ 702 0 0
GGAGAAAAAAAAGAAAAAAAGAGATGACGACACTTCTTCTTCCTCAATTAAACTGTATTT
ACAAACCACTACGAGTATCAAACCAACGCCTCCGAAAGCCGTACAGACTTCCAGTGATAT
CCGCCGTATCCGGTCAGCAGCTAGTGGCTTCCGGCGAAGTCCGGGCGGTGGAGCCGAGAG
AAGCGAAAACAGTGGTCTCGTCGGATGGATACGTGCTGTTAGACGTGAGGCCAGCTTGGG
AAAGAGAAAAGGCACATGTTAAAGGATCATTACACGTGCCACTGTTCGTGGAGGATCCTG
ACAATGGGCCGATCACACTGCTGAAGAAATGGATTCATTTGGGTTATATTGGGCTTTGGA
CGGGCCAGAGATTCACCATGTTTAATGACGAGTTTACCCTCCGTGTCGTAGAGGCTTTCC
CGGACAAGAAGAGTAAAGTGCTTGTCGCGTGCGGTGAAGGCCTCAGGTCGTTGATGGCAA
TATCAAAGCTGCACAGAGAAGGTTACAAAAGCTTAGGATGGTTAACCGGAGGGTTTAACA
GAGCAACCGAAGGAGATTTCCCAGAGATTGAAGGACCAGAAGAGCTTAAGTTTGCAACTA
TAGGTGGCGCATCATACTATTTCCTCAAACTACTTGTATTGGTGCAGAGCTTTGGCAAAG
AGAACCGTTAAATTTCATTCAATAAGAAAAAAAATTGAAATT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2AM14TF 686 0 0
GGAGAAAAAAAAGAAAAAAAGAGATGACGACACTTCTTCTTCCTCAATTAAACTGTATCT
ACAAACCACTACGAGTATCAAACCAACGCCTCCGAAAGCCGTACAGACTTCCAGTGATAT
CCGCCGTATCCGGTCAGCAGCTAGTGGCTTCCGGCGAAGTCCGGGCGGTGGAGCCGAGAG
AAGCGAAAACAGTGGTCTCGTCGGATGGATACGTGCTGTTAGACGTGAGGCCAGCTTGGG
AAAGAGAAAAGGCACATGTTAAAGGATCATTACACGTGCCACTGTTCGTGGAGGATCCTG
ACAATGGGCCGATCACACTGCTGAAGAAATGGATTCATTTGGGTTATATTGGGCTTTGGA
CGGGCCAGAGATTCACCATGTTTAATGACGAGTTTACCCTCCGTGTCGTAGAGGCTTTCC
CGGACAAGAAGAGTAAAGTGCTTGTCGCGTGCGGTGAAGGCCTCAGGTCGTTGATGGCAA
TATCAAAGCTGCACAGAGAAGGTTACAAAAGCTTAGGATGGTTAACCGGAGGGTTTAACA
GAGCAACCGAAGGAGATTTCCCAGAGATTGAAGGACCAGAAGAGCTTAAGTTTGCAACTA
TAGGTGGCGCATCATACTATTTCCTCAAACTACTTGTATTGGTGCAGAGCTTTGGCAAAG
AGAACCGTTAAATTTCATTCAATAAG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL7373Contig1 552 2 1 U
GGACCATTAGCTTATTAGCCAAGATGAAATTTGGTTTTCGATTTTTGCTTATTGGTTTCG
TTATACTCACAACTCTTCTACTCGAAACATTTACACCTGAAGTCACTTTTCCTCTTCTAT
ATTACACGGTAATCAGTGACAATGTTGAGTGACATCATTGGAACTTGATTATGAGTGACA
TCATTGGAACCACCGATCTGAAGTGGGCGTATAGCAGATAGAAAAATAATACCTTTGGAA
CTTGATGATGGCACCGGAGATGACGATGGAGTAAGAGTGGAAATGGGAATTTGTAATGGA
GGCAGAGGAGATGATGGAGAGGATGAACCCGATAAAGCTGAGGAGAATAATCTGTTTCAT
GTTTCTTGTTGCAGTTTTGACCATTTTTTGGTAGGACTACTTTATGGCTTTTTCATCGCC
ATCATATGTGGTCATCGTGTCAATGAGTGGCATTACCATGTTTTTGCCAAATAAGATCTC
ACAAAGGTTCAGTTTCTTGCAGATTCTTTATCCCCTTATTATTTTACTGTGATTAAACTG
TGATTATTATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D618JQ C 1
AF RR2D618TF U 1
BS 1 552 RR2D618TF

RD RR2D618JQ 552 0 0
GGACCATTAGCTTATTAGCCAAGATGAAATTTGGTTTTCGATTTTTGCTTATTGGTTTCG
TTATACTCACAACTCTTCTACTCGAAACATTTACACCTGAAGTCACTTTTCCTCTTCTAT
ATTACACGGTAATCAGTGACAATGTTGAGTGACATCATTGGAACTTGATTATGAGTGACA
TCATTGGAACCACCGATCTGAAGTGGGCGTATAGCAGATAGAAAAATAATACCTTTGGAA
CTTGATGATGGCACCGGAGATGACGATGGAGTAAGAGTGGAAATGGGAATTTGTAATGGA
GGCAGAGGAGATGATGGAGAGGATGAACCCGATAAAGCTGAGGAGAATAATCTGTTTCAT
GTTTCTTGTTGCAGTTTTGACCATTTTTTGGTAGGACTACTTTATGGCTTTTTCATCGCC
ATCATATGTGGTCATCGTGTCAATGAGTGGCATTACCATGTTTTTGCCAAATAAGATCTC
ACAAAGGTTCAGTTTCTTGCAGATTCTTTATCCCCTTATTATTTTACTGTGATTAAACTG
TGATTATTATTC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RR2D618TF 552 0 0
GGACCATTAGCTTATTAGCCAAGATGAAATTTGGTTTTCGATTTTTGCTTATTGGTTTCG
TTATACTCACAACTCTTCTACTCGAAACATTTACACCTGAAGTCACTTTTCCTCTTCTAT
ATTACACGGTAATCAGTGACAATGTTGAGTGACATCATTGGAACTTGATTATGAGTGACA
TCATTGGAACCACCGATCTGAAGTGGGCGTATAGCAGATAGAAAAATAATACCTTTGGAA
CTTGATGATGGCACCGGAGATGACGATGGAGTAAGAGTGGAAATGGGAATTTGTAATGGA
GGCAGAGGAGATGATGGAGAGGATGAACCCGATAAAGCTGAGGAGAATAATCTGTTTCAT
GTTTCTTGTTGCAGTTTTGACCATTTTTTGGTAGGACTACTTTATGGCTTTTTCATCGCC
ATCATATGTGGTCATCGTGTCAATGAGTGGCATTACCATGTTTTTGCCAAATAAGATCTC
ACAAAGGTTCAGTTTCTTGCAGATTCTTTATCCCCTTATTATTTTACTGTGATTAAACTG
TGATTATTATTC

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL7374Contig1 578 2 4 U
GCGAGGAGAAACGTACGGTACGCTCAGCTTCCAGGGGACGAAGACGATGAGGATTACGGA
AACGGTGGCGGGAGGAGAAGAGATTACGATCCTCGCTTCGATTATACACCGAAGGCGTTT
GATAGAGTTCCGTGGAAGTCGATAGCGTTAGCTTTGTTTCTTCTGTTTCTTGGTTGCTTG
CTTCTTCTGTTGGCGATTTTTATTTTCACTGGTCACATGGAAGGAGATAGCTCCCAGGGT
TACGCGCTTCTTGTTCTTGGCATCCTGACTTTCCTCCCTGGGTTCTATGAGACTCGGATT
GCTTACTATTCGTGGAGAGGAGCTGAAGGGTATCGTTTCGCAGCCATTCCTTCCTACTGA
ATGTAATTAGCTGGAGACGTTACACGACTCTATCTGTGCATAAACTTATTGGAGAAATGT
AATAATAGACTTGAAGTGTTTCATGAATCACGCACTCCAAAAGGCTAGGATTATAGATAG
AGAGATACTACACAGACTGTTGTTATGTTTTATTGATCTTAACTTGTGAATCTAATTGAA
CCTCGTTTTTTTATCAAAATGTCTTATGCGTCCTGCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW58TF U 1
AF RR2BH55TF U 44
BS 1 533 RR2BW58TF
BS 534 534 RR2BH55TF
BS 535 570 RR2BW58TF
BS 571 578 RR2BH55TF

RD RR2BW58TF 570 0 0
GCGAGGAGAAACGTACGGTACGCTCAGCTTCCAGGGGACGAAGACGATGAGGATTACGGA
AACGGTGGCGGGAGGAGAAGAGATTACGATCCTCGCTTCGATTATACACCGAAGGCGTTT
GATAGAGTTCCGTGGAAGTCGATAGCGTTAGCTTTGTTTCTTCTGTTTCTTGGTTGCTTG
CTTCTTCTGTTGGCGATTTTTATTTTCACTGGTCACATGGAAGGAGATAGCTCCCAGGGT
TACGCGCTTCTTGTTCTTGGCATCCTGACTTTCCTCCCTGGGTTCTATGAGACTCGGATT
GCTTACTATTCGTGGAGAGGAGCTGAAGGGTATCGTTTCGCAGCCATTCCTTCCTACTGA
ATGTAATTAGCTGGAGACGTTACACGACTCTATCTGTGCATAAACTTATTGGAGAAATGT
AATAATAGACTTGAAGTGTTTCATGAATCACGCACTCCAAAAGGCTAGGATTATAGATAG
AGAGATACTACACAGACTGTTGTTATGTTTTATTGATCTTAACTTGTGAATCTTATTGAA
CCTCGTTTTTTTATCAAAATGTCTTATGCG

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2BH55TF 535 0 0
ACGATGAGGATTACGGAAACGGTGGCGGGAGGAGAAGAGATTACGATCCTCGCTTCGATT
ATACACCGAAGGCGTTTGATAGAGTTCCGTGGAAGTCGATAGCGTTAGCTTTGTTTCTTC
TGTTTCTTGGTTGCTTGCTTCTTCTGTTGGCGATTTTTATTTTCACTGGTCACATGGAAG
GAGATAGCTCCCAGGGTTACGCGCTTCTTGTTCTTGGCATCCTGACTTTCCTCCCTGGGT
TCTATGAGACTCGGATTGCTTACTATTCGTGGAGAGGAGCTGAAGGGTATCGTTTCGCAG
CCATTCCTTCCTACTGAATGTAATTAGCTGGAGACGTTACACGACTCTATCTGTGCATAA
ACTTATTGGAGAAATGTAATAATAGACTTGAAGTGTTTCATGAATCACGCACTCCAAAAG
GCTAGGATTATAGATAGAGAGATACTACACAGACTGTTGTTATGTTTTATTGATCTTAAC
TTGTGAATCTAATTGAACCTCGTTTTTTTATCAAAATGTCTTATGCGTCCTGCAA

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 2

CO CL7375Contig1 472 2 1 U
GGGACACAACTGTTTCTCCCCTTCAGATCCATCAACGAAACACTTAGTTATGGGTTTATT
TGTTCGTAGGGCGTGTGTGTGTATCTTTGTATTCGCTCTCGTAGCCGAATTTGCCTTAGG
ACATGTCGAGGTTAAGGACGACAAACACTTGTTTCACAAACCTCGTCCATTCTTCCACAA
GAAGGGTTTTAGAAAGGGTTTGGGAGGCGGAGGTGGATTTGGAGGCGGTTACGGTGGCGG
TGGCCATCACTAATGAGTGATGAGGCTCATGCTCATGCTCATGCATTCGTACGTTGTTAT
TATTTAATTAAATGAAACATGATAATTAATTACAATAAAAATGATATATAGCAATCGTGA
ATGTTTGTTTCTATTAGTTGTCACTTGTATTGTAATGCTATTTTCATGTTATGCTATGGT
TTGTTTCAAGTTTCAACTTTCAATTTTGGCTAATAAAATGGCTGCTTTACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A072JQ C 1
AF RR2A072TF U 1
BS 1 472 RR2A072TF

RD RR2A072JQ 472 0 0
GGGACACAACTGTTTCTCCCCTTCAGATCCATCAACGAAACACTTAGTTATGGGTTTATT
TGTTCGTAGGGCGTGTGTGTGTATCTTTGTATTCGCTCTCGTAGCCGAATTTGCCTTAGG
ACATGTCGAGGTTAAGGACGACAAACACTTGTTTCACAAACCTCGTCCATTCTTCCACAA
GAAGGGTTTTAGAAAGGGTTTGGGAGGCGGAGGTGGATTTGGAGGCGGTTACGGTGGCGG
TGGCCATCACTAATGAGTGATGAGGCTCATGCTCATGCTCATGCATTCGTACGTTGTTAT
TATTTAATTAAATGAAACATGATAATTAATTACAATAAAAATGATATATAGCAATCGTGA
ATGTTTGTTTCTATTAGTTGTCACTTGTATTGTAATGCTATTTTCATGTTATGCTATGGT
TTGTTTCAAGTTTCAACTTTCAATTTTGGCTAATAAAATGGCTGCTTTACCC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2A072TF 472 0 0
GGGACACAACTGTTTCTCCCCTTCAGATCCATCAACGAAACACTTAGTTATGGGTTTATT
TGTTCGTAGGGCGTGTGTGTGTATCTTTGTATTCGCTCTCGTAGCCGAATTTGCCTTAGG
ACATGTCGAGGTTAAGGACGACAAACACTTGTTTCACAAACCTCGTCCATTCTTCCACAA
GAAGGGTTTTAGAAAGGGTTTGGGAGGCGGAGGTGGATTTGGAGGCGGTTACGGTGGCGG
TGGCCATCACTAATGAGTGATGAGGCTCATGCTCATGCTCATGCATTCGTACGTTGTTAT
TATTTAATTAAATGAAACATGATAATTAATTACAATAAAAATGATATATAGCAATCGTGA
ATGTTTGTTTCTATTAGTTGTCACTTGTATTGTAATGCTATTTTCATGTTATGCTATGGT
TTGTTTCAAGTTTCAACTTTCAATTTTGGCTAATAAAATGGCTGCTTTACCC

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 2

CO CL7376Contig1 1004 2 2 U
GCCATGGAGATCGAAGACGAGGAAGCTGAGAAACCCGAGGGATGGTTAGGTGATGAGCCT
GAGGAGGTCGACGACCCAGAGGCGACCAAACCTGAAGATTGGGATGATGAGGAAGATGGT
ATGTGGGAGGCTCCAAAGGTTGATAACCCCAAGTGTGAAACAGCACCTGGTTGCGGTGAG
TGGAAGAGACCCACGAAGAAGAATCCTGCTTACAAGGGCAAGTGGAGCGCACCGATGATA
GACAACCCTGCTTACAAAGGGATCTGGAAGCCCAGAGACATCCCTAACCCTGACTACTTT
GAGCTAGACCGACCTGATTTCGAACCCATTGCGGCGATCGGTATTGAGATCTGGACGATG
CAAGACGGTATCTTGTTTGACAACATGTTGATAGCGAAAGACGAGAAGGTCGCTGAGGTT
TACAGACAGACAACTTGGAAGCCGAAGTTCGATGTTGAGAAAGAGAAACAAAAGGCAGAA
GAGGAGGCCGCTAGCTCTGCAGGTGGTCTCAAGAGCTACCAGAAGGTTGTGTTCGACCTC
TTGAACAAGGTTGCTGACATATCTTTCCTAAGTGCCTACAAGTCTAAGATCACTGAGCTG
ATTGAGAAAGCAGAGGAACAACCAAACTTAACCATTGGTGTTCTTGTCTCCATTGTCGTT
GTTTTCTTCTCTCTCTTCATCAAGCTTATCTTCGGTGGCAAAAAGGCGGCGCCGGCAGCA
GCTGTGGAGAAAAAGAAGAAGAAACCAGAAGTAGGAGAGAGCTCAAGCTCAAAGAGTGAA
GATGAGACGGAGAAGAAGGAAGAAACCGCTGCTCCTCGCAAAAGGCAACCCAGACGTGAT
AATTAAAAATAGTGGTTTTTAGAATGTTTTCGAGATGTTGAAATTATTTTTGATTTTTAC
TTGTGTTCTGGTCGGATTTTCTTTTCTGCTGTAAAACCAAGTTGGGATTAGCTAAATTGT
AGTTTCTGTTACTTCTTTGTTTAGTTTCTCACAAATTGGGGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C389TF U 1
AF RR2C389JQ C 292
BS 1 690 RR2C389TF
BS 691 1004 RR2C389JQ

RD RR2C389TF 690 0 0
GCCATGGAGATCGAAGACGAGGAAGCTGAGAAACCCGAGGGATGGTTAGGTGATGAGCCT
GAGGAGGTCGACGACCCAGAGGCGACCAAACCTGAAGATTGGGATGATGAGGAAGATGGT
ATGTGGGAGGCTCCAAAGGTTGATAACCCCAAGTGTGAAACAGCACCTGGTTGCGGTGAG
TGGAAGAGACCCACGAAGAAGAATCCTGCTTACAAGGGCAAGTGGAGCGCACCGATGATA
GACAACCCTGCTTACAAAGGGATCTGGAAGCCCAGAGACATCCCTAACCCTGACTACTTT
GAGCTAGACCGACCTGATTTCGAACCCATTGCGGCGATCGGTATTGAGATCTGGACGATG
CAAGACGGTATCTTGTTTGACAACATGTTGATAGCGAAAGACGAGAAGGTCGCTGAGGTT
TACAGACAGACAACTTGGAAGCCGAAGTTCGATGTTGAGAAAGAGAAACAAAAGGCAGAA
GAGGAGGCCGCTAGCTCTGCAGGTGGTCTCAAGAGCTACCAGAAGGTTGTGTTCGACCTC
TTGAACAAGGTTGCTGACATATCTTTCCTAAGTGCCTACAAGTCTAAGATCACTGAGCTG
ATTGAGAAAGCAGAGGAACAACCAAACTTAACCATTGGTGTTCTTGTCTCCATTGTCGTT
GTTTTCTTCTCTCTCTTCATCAAGCTTATC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2C389JQ 713 0 0
GACTACTTTGAGCTAGACCGACCTGATTTCGAACCCATTGCGGCGATCGGTATTGAGATC
TGGACGATGCAAGACGGTATCTTGTTTGACAACATGTTGATAGCGAAAGACGAGAAGGTC
GCTGAGGTTTACAGACAGACAACTTGGAAGCCGAAGTTCGATGTTGAGAAAGAGAAACAA
AAGGCAGAAGAGGAGGCCGCTAGCTCTGCAGGTGGTCTCAAGAGCTACCAGAAGGTTGTG
TTCGACCTCTTGAACAAGGTTGCTGACATATCTTTCCTAAGTGCCTACAAGTCTAAGATC
ACTGAGCTGATTGAGAAAGCAGAGGAACAACCAAACTTAACCATTGGTGTTCTTGTCTCC
ATTGTCGTTGTTTTCTTCTCTCTCTTCATCAAGCTTATCTTCGGTGGCAAAAAGGCGGCG
CCGGCAGCAGCTGTGGAGAAAAAGAAGAAGAAACCAGAAGTAGGAGAGAGCTCAAGCTCA
AAGAGTGAAGATGAGACGGAGAAGAAGGAAGAAACCGCTGCTCCTCGCAAAAGGCAACCC
AGACGTGATAATTAAAAATAGTGGTTTTTAGAATGTTTTCGAGATGTTGAAATTATTTTT
GATTTTTACTTGTGTTCTGGTCGGATTTTCTTTTCTGCTGTAAAACCAAGTTGGGATTAG
CTAAATTGTAGTTTCTGTTACTTCTTTGTTTAGTTTCTCACAAATTGGGGTGG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL7377Contig1 531 2 1 U
GGGACCCACCAATCTTATAAAAAAAAACCTCAAGAAATAGTTCATAAAGGATCTTCAAAG
TGATGAACAACATTTTCTTAGCCGGAGAGGCACCACCAGAAAAAAATGTAGAAGAAGGCC
TTCAAGGAGGAGACAGGGGAACCCCAATAGTTTGTTTAGCTTGGCCATGAGAAGCAAGGA
GACAACATGGGTCTTATAACTTATGGTAATGGCAAAAACCGGCAAGTCATATATCGGCAT
CAGGCTCGTGTGTTTCGAGTTGTAATATAGATCTTTTGAGTTGTTTAAGATTTAATCTCT
ACCGTATGAAATCATCTTTGATACTTTTGTACCAGTAAGAAAGAATATTGTAATATTGAT
CGTCTTGTGTGTGTGTGTGTTTCTTTCCTGGTTTTTTTTCTGGAATAAAAGGTGGACAAT
GTTTGGCTGCTCTTGAGTCTTTATATTATGTTTCTAGGTCCAAAAGAAATTTGTATCTGA
AAGAGAGACAAACCAAAAGAGTTTTCAAGAAATTATTGCAAGTAGTTCAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BX31JQ C 1
AF RR2BX31TF U 1
BS 1 531 RR2BX31TF

RD RR2BX31JQ 531 0 0
GGGACCCACCAATCTTATAAAAAAAAACCTCAAGAAATAGTTCATAAAGGATCTTCAAAG
TGATGAACAACATTTTTTTAGCCGGAGAGGCACCACCAGAAAAAAATGTAGAAGAAGGCC
TTCAAGGAGGAGACAGGGGAACCCCAATAGTTTGTTTAGCTTGGCCATGAGAAGCAAGGA
GACAACATGGGTCTTATAACTTATGGTAATGGCAAAAACCGGCAAGTCATATATCGGCAT
CAGGCTCGTGTGTTTCGAGTTGTAATATAGATCTTTTGAGTTGTTTAAGATTTAATCTCT
ACCGTATGAAATCATCTTTGATACTTTTGTACCAGTAAGAAAGAATATTGTAATATTGAT
CGTCTTGTGTGTGTGTGTGTTTCTTTCCTGTTTTTTTTTCTGGAATAAAAGGTGGACAAT
GTTTGGCTGCTCTTGAGTCTTTATATTATGTTTCTAGGTCCAAAAGAAATTTGTATCTGA
AAGAGAGACAAACCAAAAGAGTTTTCAAGAAATTATTGCAAGTAGTTCAGT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RR2BX31TF 531 0 0
GGGACCCACCAATCTTATAAAAAAAAACCTCAAGAAATAGTTCATAAAGGATCTTCAAAG
TGATGAACAACATTTTCTTAGCCGGAGAGGCACCACCAGAAAAAAATGTAGAAGAAGGCC
TTCAAGGAGGAGACAGGGGAACCCCAATAGTTTGTTTAGCTTGGCCATGAGAAGCAAGGA
GACAACATGGGTCTTATAACTTATGGTAATGGCAAAAACCGGCAAGTCATATATCGGCAT
CAGGCTCGTGTGTTTCGAGTTGTAATATAGATCTTTTGAGTTGTTTAAGATTTAATCTCT
ACCGTATGAAATCATCTTTGATACTTTTGTACCAGTAAGAAAGAATATTGTAATATTGAT
CGTCTTGTGTGTGTGTGTGTTTCTTTCCTGGTTTTTTTTCTGGAATAAAAGGTGGACAAT
GTTTGGCTGCTCTTGAGTCTTTATATTATGTTTCTAGGTCCAAAAGAAATTTGTATCTGA
AAGAGAGACAAACCAAAAGAGTTTTCAAGAAATTATTGCAAGTAGTTCAGT

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 2

CO CL7378Contig1 702 2 1 U
GAAGAAGTGTAAAAAAAATAAGACGAGAATCTTTTAACATTTTCAGACAAAATGGCGTCC
AAAGCCATCTTCTTCTTCTTCTTTGTCTCCGCCGTGTGCCTATCCTCTCTCACCGGCAAG
GCCGTCGCTGACGCCGATGACCTTGACAGTTTCCAGATTCAGGGATCCGTTTACTGCGAC
ACTTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTCCTCGAAGGAGCCAAAGTGAAG
CTAGAGTGCAGGAGCAGAACCAACGGAACCGTGACGTTGACAAAAGAAGCCGTGACTGAC
AAATCAGGCAGCTACAAAATGGAAGTGACCGGTGACCACGAAGAGGAAGTCTGTGAGCTT
GTTCTCCTCCAGTCACCAGACAGTGGTTGCAGCGATGTCAGCCAAGATGCTTACCTACGT
AACGCCGCTAAGGTTAGCCTGACGGCCAATGACGGTATCGTCTCTCACGAGACACGTATC
GTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTCCTACACCGTCAGCTGAATGCCCCGCCGCTTTCAAG
GAGCTCGGGATCGTCCCTGACGTCATATTCTAAATATGATGATGACTTATATCTCAGAGA
TCGTTATTTAACTGTCATGACCATCTCTGTTGTTTATTTTCTTATATATACAAAAAGTGT
AATTTGATATAAAAAATGCAAAATGCGGTAATTAAAATAAAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A580JQ C 1
AF RR2A580TF U 1
BS 1 702 RR2A580TF

RD RR2A580JQ 702 0 0
GAAGAAGTGTAAAAAAAATAAGACGAGAATCTTTTAACATTTTCAGACAAAATGGCGTCC
AAAGCCATCTTCTTCTTCTTCTTTGTCTCCGCCGTGTGCCTATCCTCTCTCACCGGCAAG
GCCGTCGCTGACGCCGATGACCTTGACAGTTTCCAGATTCAGGGATCCGTTTACTGCGAC
ACTTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTCCTCGAAGGAGCCAAAGTGAAG
CTAGAGTGCAGGAGCAGAACCAACGGAACCGTGACGTTGACAAAAGAAGCCGTGACTGAC
AAATCAGGCAGCTACAAAATGGAAGTGACCGGTGACCACGAAGAGGAAGTCTGTGAGCTT
GTTCTCCTCCAGTCACCAGACAGTGGTTGCAGCGATGTCAGCCAAGATGCTTACCTACGT
AACGCCGCTAAGGTTAGCCTGACGGCCAATGACGGTATCGTCTCTCACGAGACACGTATC
GTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTCCTACACCGTCAGCTGAATGCCCCGCCGCTTTCAAG
GAGCTCGGGATCGTCCCTGACGTCATATTCTAAATATGATGATGACTTATATCTCAGAGA
TCGTTATTTAACTGTCATGACCATCTCTGTTGTTTATTTTCTTATATATACAAAAAGTGT
AATTTGATATAAAAAATGCAAAATGCGGTAATTAAAATAAAC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2A580TF 702 0 0
GAAGAAGTGTAAAAAAAATAAGACGAGAATCTTTTAACATTTTCAGACAAAATGGCGTCC
AAAGCCATCTTCTTCTTCTTCTTTGTCTCCGCCGTGTGCCTATCCTCTCTCACCGGCAAG
GCCGTCGCTGACGCCGATGACCTTGACAGTTTCCAGATTCAGGGATCCGTTTACTGCGAC
ACTTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTCCTCGAAGGAGCCAAAGTGAAG
CTAGAGTGCAGGAGCAGAACCAACGGAACCGTGACGTTGACAAAAGAAGCCGTGACTGAC
AAATCAGGCAGCTACAAAATGGAAGTGACCGGTGACCACGAAGAGGAAGTCTGTGAGCTT
GTTCTCCTCCAGTCACCAGACAGTGGTTGCAGCGATGTCAGCCAAGATGCTTACCTACGT
AACGCCGCTAAGGTTAGCCTGACGGCCAATGACGGTATCGTCTCTCACGAGACACGTATC
GTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTCCTACACCGTCAGCTGAATGCCCCGCCGCTTTCAAG
GAGCTCGGGATCGTCCCTGACGTCATATTCTAAATATGATGATGACTTATATCTCAGAGA
TCGTTATTTAACTGTCATGACCATCTCTGTTGTTTATTTTCTTATATATACAAAAAGTGT
AATTTGATATAAAAAATGCAAAATGCGGTAATTAAAATAAAC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL7379Contig1 523 2 1 U
GGTATTCAGGATTGTACTTTATTGGTAACTCTTTGTTTGGGTGGAACTGTCTTGCTCCAT
GGTTCTCTTGTTCCACCCGTTCTGCCATTCGTCGCAAGTTTAACCTTGAGGGAAGCTTTG
AGGCGATGAACAGGTCGTGTGGTTGCTGCGGTAGCTGCATAGAGGACGAAATGCAAAGAG
AACATATGGAGACGACTTGTGACTTTGTGACGCACCTCCTTTGCCATACATGTGCCCTTT
GTCAAGAAGGCCGTGAGCTCCGCAGGAAGGTTCTTCACCCGGGTTTCAACGCTCAGTCCA
CCGTTGTGGTGCTCCCACCAAGTGAACAAACCATGGGCCGTAAGTGAAGCTTCCTTTCAG
TCCAGTGGTCTGAATAGCACTTGTTACATATATACATCTCTTGCTTACTTTTTTGAATAA
AATCCTTCTACGTGTGTAATTTTGTCGCGTGTCCTTTATCTTTTCTTCTACGCACACAAA
CATATGTATATCTTTATGTTAATAGTATTTGCAGTTTGAATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GZ77JQ C 1
AF RR2GZ77TF U 1
BS 1 523 RR2GZ77TF

RD RR2GZ77JQ 523 0 0
GGTATTCAGGATTGTACTTTATTGGTAACTCTTTGTTTGGGTGGAACTGTCTTGCTCCAT
GGTTCTCTTGTTCCACCCGTTCTGCCATTCGTCGCAAGTTTAACCTTGAGGGAAGCTTTG
AGGCGATGAACAGGTCGTGTGGTTGCTGCGGTAGCTGCATAGAGGACGAAATGCAAAGAG
AACATATGGAGACGACTTGTGACTTTGTGACGCACCTCCTTTGCCATACATGTGCCCTTT
GTCAAGAAGGCCGTGAGCTCCGCAGGAAGGTTCTTCACCCGGGTTTCAACGCTCAGTCCA
CCGTTGTGGTGCTCCCACCAAGTGAACAAACCATGGGCCGTAAGTGAAGCTTCCTTTCAG
TCCAGTGGTCTGAATAGCACTTGTTACATATATACATCTCTTGCTTACTTTTTTGAATAA
AATCCTTCTACGTGTGTAATTTTGTCGCGTGTCCTTTATCTTTTCTTCTACGCACACAAA
CATATGTATATCTTTATGTTAATAGTATTTGCAGTTTGAATCC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2GZ77TF 523 0 0
GGTATTCAGGATTGTACTTTATTGGTAACTCTTTGTTTGGGTGGAACTGTCTTGCTCCAT
GGTTCTCTTGTTCCACCCGTTCTGCCATTCGTCGCAAGTTTAACCTTGAGGGAAGCTTTG
AGGCGATGAACAGGTCGTGTGGTTGCTGCGGTAGCTGCATAGAGGACGAAATGCAAAGAG
AACATATGGAGACGACTTGTGACTTTGTGACGCACCTCCTTTGCCATACATGTGCCCTTT
GTCAAGAAGGCCGTGAGCTCCGCAGGAAGGTTCTTCACCCGGGTTTCAACGCTCAGTCCA
CCGTTGTGGTGCTCCCACCAAGTGAACAAACCATGGGCCGTAAGTGAAGCTTCCTTTCAG
TCCAGTGGTCTGAATAGCACTTGTTACATATATACATCTCTTGCTTACTTTTTTGAATAA
AATCCTTCTACGTGTGTAATTTTGTCGCGTGTCCTTTATCTTTTCTTCTACGCACACAAA
CATATGTATATCTTTATGTTAATAGTATTTGCAGTTTGAATCC

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 2

CO CL7380Contig1 948 2 2 U
GGGAATTTTGATCACAAAAAAAAAAGCGAATCGCGATTTCGAGCTCTCTAAATCTAATGG
TGTCTCTAAACGCTAGACCTGCTCCGTTCTTCGATCCCGTGAGCATGAGTTTACCTGGTC
TCGATTCGAGGGCGTCGGGCTCCGACGACGGGTTTGGTTTGACTCCGATCGCAAGGAGAG
ACACGGCGTCGTTTCGCGAGGATACGACGGCGAAGATTCGGAAGCCATACACGATCAAGA
ATTCGAGAGAGAACTGGTCAGAGCAGGAACACGATAAGTTTCTAGAAGCGCTCCATTTAT
TCGATCGAGATTGGAAGAAAATCGAAGCATTTGTTGGATCAAAGACAGTCGTCCAGATAG
TTACAAAAAGCCACGTAGAGTGATGCCAAACTTTGCCGAAGTCTACAGATTTATTGGAAG
TGTGTTTGATCCCAACACATCAGGTCACCTCCAGAGATTAAAGCAGATGGACCCAATAAA
TATGGAGACGGTTCTTTTACTGATGAGAAACCTATCTGTAAATCTGACAAGTCCAGAGTT
TTCTGAACAAAGGAAGTTGATATCATCATACAGCAGTAAAGCTTTGAAATAGATATTTGG
AAAAAGCAACAATGGACCTTATGAGAGCAAGAAATTCTCATTCATTGGATGAGCAAATGA
ATGCCACTTAAGTTCTGGTTTATGTCTTTGAAGTCTTAGTTAACCGGAGTGGTTTGTCCT
ATATTGTCTATATTCGTATGGGTGATAGAGAGGGTTTTGCAGAGGTATAATATATATATA
CATATACGTGTAGATATGTGTTTATAAGGGCAACGTTTGTTTATCAAGCTTGGAACGATC
TCAGGAGGTCTTAAGTGTCGAGTCTCTGTGAAGGCGCAAGTTAGTTTTTTTTGGGGAAGT
TGAGATAGAGTGAGAAATGAGAATAATAAGAAGAAAAACTTTTGAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C486TF U 1
AF RR2C486JQ C 218
BS 1 745 RR2C486TF
BS 746 948 RR2C486JQ

RD RR2C486TF 745 0 0
GGGAATTTTGATCACAAAAAAAAAAGCGAATCGCGATTTCGAGCTCTCTAAATCTAATGG
TGTCTCTAAACGCTAGACCTGCTCCGTTCTTCGATCCCGTGAGCATGAGTTTACCTGGTC
TCGATTCGAGGGCGTCGGGCTCCGACGACGGGTTTGGTTTGACTCCGATCGCAAGGAGAG
ACACGGCGTCGTTTCGCGAGGATACGACGGCGAAGATTCGGAAGCCATACACGATCAAGA
ATTCGAGAGAGAACTGGTCAGAGCAGGAACACGATAAGTTTCTAGAAGCGCTCCATTTAT
TCGATCGAGATTGGAAGAAAATCGAAGCATTTGTTGGATCAAAGACAGTCGTCCAGATAG
TTACAAAAAGCCACGTAGAGTGATGCCAAACTTTGCCGAAGTCTACAGATTTATTGGAAG
TGTGTTTGATCCCAACACATCAGGTCACCTCCAGAGATTAAAGCAGATGGACCCAATAAA
TATGGAGACGGTTCTTTTACTGATGAGAAACCTATCTGTAAATCTGACAAGTCCAGAGTT
TTCTGAACAAAGGAAGTTGATATCATCATACAGCAGTAAAGCTTTGAAATAGATATTTGG
AAAAAGCAACAATGGACCTTATGAGAGCAAGAAATTCTCATTCATTGGATGAGCAAATGA
ATGCCACTTAAGTTCTGGTTTATGTCTTTGAAGTCTTAGTTAACCGGAGTGGTTTGTCCT
ATATTGTCTATATTCGTATGGGTGA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2C486JQ 731 0 0
TCGGAAGCCATACACGATCAAGAATTCGAGAGAGAACTGGTCAGAGCAGGAACACGATAA
GTTTCTAGAAGCGCTCCATTTATTCGATCGAGATTGGAAGAAAATCGAAGCATTTGTTGG
ATCAAAGACAGTCGTCCAGATAGTTACAAAAAGCCACGTAGAGTGATGCCAAACTTTGCC
GAAGTCTACAGATTTATTGGAAGTGTGTTTGATCCCAACACATCAGGTCACCTCCAGAGA
TTAAAGCAGATGGACCCAATAAATATGGAGACGGTTTTTTTACTGATGAGAAACCTATCT
GTAAATCTGACAAGTCCAGAGTTTTCTGAACAAAGGAAGTTGATATCATCATACAGCAGT
AAAGCTTTGAAATAGATATTTGGAAAAAGCAACAATGGACCTTATGAGAGCAAGAAATTC
TCATTCATTGGATGAGCAAATGAATGCCACTTAAGTTCTGGTTTATGTCTTTGAAGTCTT
AGTTAACCGGAGTGGTTTGTCCTATATTGTCTATATTCGTATGGGTGATAGAGAGGGTTT
TGCAGAGGTATAATATATATATACATATACGTGTAGATATGTGTTTATAAGGGCAACGTT
TGTTTATCAAGCTTGGAACGATCTCAGGAGGTCTTAAGTGTCGAGTCTCTGTGAAGGCGC
AAGTTAGTTTTTTTTGGGGAAGTTGAGATAGAGTGAGAAATGAGAATAATAAGAAGAAAA
ACTTTTGAGTC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL7381Contig1 753 2 1 U
GGGCACAACTACAGGAAGAGTCCAAAGGAGATCAAACTAGAAGAAGCGGCAATTCTGCAC
TACACTTATCCCAAATTTTCAGATCTTACTTCAAGACGTGATCGTTGTGGTTGCAAGCCT
ACCAAGGTGGATGTTAAGAGATGTTTCATGTTGGAGTTTGACAGAGCCGCATTTATCATT
GCTTCAACAGCAAGCTCAGAGGAAATGCTTCAATGGTACAGAGAGCACGTTGTGTGGACA
GACGATGCATTAAGGCTGAAACTCCTTAGGAAGGGAATCCTGACTCGCATTTATGCCCCC
ATGGTTATAATCCAAGAGTTAAGAGAGGCAGGTGTGTTCAGCTCGGTGGTAAACTCAGCT
CACATGTCACTGAACAACTCTTCAACCGTAAGCATAAGCCGAGACTCATCTCAGGTGACT
GGTAGGAGGAGAGTGTTGGAAGCCCATCTTGATCTTGATAGTGAATCTCAAGCATCAGCC
GTACCACCAGAATCGCCTCCAGGCTTGGAAGCAACCCAGATAGAACAACAATCTGAATAG
ATTTTTTATTCGTAAAGAGAGAGTGATTTTCGCAAGGTTTTGAAACATGAGCCGCTGGTG
TACATTTCGGAAAAGTTTGTTTCCCAATAGGTTGGTTATACACACAGATGAATAGGAGGA
AATAGAACGATTAGCAGGGTTTCTATTCTCTATGTAATATGCAGAATACTTGATTCTATT
ACTTCTAATACAAAGTCATCACCTTTCTTATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A939JQ C 1
AF RR2A939TF U 1
BS 1 753 RR2A939TF

RD RR2A939JQ 753 0 0
GGGCACAACTACAGGAAGAGTCCAAAGGAGATCAAACTAGAAGAAGCGGCAATTCTGCAC
TACACTTATCCCAAATTTTCAGATCTTACTTCAAGACGTGATCGTTGTGGTTGCAAGCCT
ACCAAGGTGGATGTTAAGAGATGTTTCATGTTGGAGTTTGACAGAGCCGCATTTATCATT
GCTTCAACAGCAAGCTCAGAGGAAATGCTTCAATGGTACAGAGAGCACGTTGTGTGGACA
GACGATGCATTAAGGCTGAAACTCCTTAGGAAGGGAATCCTGACTCGCATTTATGCCCCC
ATGGTTATAATCCAAGAGTTAAGAGAGGCAGGTGTGTTCAGCTCGGTGGTAAACTCAGCT
CACATGTCACTGAACAACTCTTCAACCGTAAGCATAAGCCGAGACTCATCTCAGGTGACT
GGTAGGAGGAGAGTGTTGGAAGCCCATCTTGATCTTGATAGTGAATCTCAAGCATCAGCC
GTACCACCAGAATCGCCTCCAGGCTTGGAAGCAACCCAGATAGAACAACAATCTGAATAG
ATTTTTTATTCGTAAAGAGAGAGTGATTTTCGCAAGGTTTTGAAACATGAGCCGCTGGTG
TACATTTCGGAAAAGTTTGTTTCCCAATAGGTTGGTTATACACACAGATGAATAGGAGGA
AATAGAACGATTAGCAGGGTTTCTATTCTCTATGTAATATGCAGAATACTTGATTCTATT
ACTTCTAATACAAAGTCATCACCTTTTTTATCC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2A939TF 753 0 0
GGGCACAACTACAGGAAGAGTCCAAAGGAGATCAAACTAGAAGAAGCGGCAATTCTGCAC
TACACTTATCCCAAATTTTCAGATCTTACTTCAAGACGTGATCGTTGTGGTTGCAAGCCT
ACCAAGGTGGATGTTAAGAGATGTTTCATGTTGGAGTTTGACAGAGCCGCATTTATCATT
GCTTCAACAGCAAGCTCAGAGGAAATGCTTCAATGGTACAGAGAGCACGTTGTGTGGACA
GACGATGCATTAAGGCTGAAACTCCTTAGGAAGGGAATCCTGACTCGCATTTATGCCCCC
ATGGTTATAATCCAAGAGTTAAGAGAGGCAGGTGTGTTCAGCTCGGTGGTAAACTCAGCT
CACATGTCACTGAACAACTCTTCAACCGTAAGCATAAGCCGAGACTCATCTCAGGTGACT
GGTAGGAGGAGAGTGTTGGAAGCCCATCTTGATCTTGATAGTGAATCTCAAGCATCAGCC
GTACCACCAGAATCGCCTCCAGGCTTGGAAGCAACCCAGATAGAACAACAATCTGAATAG
ATTTTTTATTCGTAAAGAGAGAGTGATTTTCGCAAGGTTTTGAAACATGAGCCGCTGGTG
TACATTTCGGAAAAGTTTGTTTCCCAATAGGTTGGTTATACACACAGATGAATAGGAGGA
AATAGAACGATTAGCAGGGTTTCTATTCTCTATGTAATATGCAGAATACTTGATTCTATT
ACTTCTAATACAAAGTCATCACCTTTCTTATCC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL7382Contig1 806 2 6 U
GGAAACAAGAACCACATAATATCTGCCGCAGTTAGTTCCCCCATGGCTTCTCTTCAGCTC
TGGAAGAAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAACGGTCGTATGTGGAAGATGGCTTGTACA
ACGGTGGCTGCGCCGTTTTCATCTGGCGTCGAGAGCTCAGCACCGGTCAAGGTTGAGAAG
GAGAGCTCTGGTCCGATAAAGCCAGAGAAACAGAAAGTGGAGAAGAGGAAGGTATTTCAG
AAGCTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGAAAAGAAG
GGCGTTTTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAA
CCTGAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCC
TCTCAACTTGAGCTTTATGTGGATCTTCTTGGCAAGGTTAAAGGAGATGCAGCAGCTTCA
GCCTACTTCAACAAAGTAGAGCCAAATTTCGATGAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCGC
CCTGCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGGG
CCAAGACCATATGTTCTCAAGTACCCTAAATGTGATGATAATTGGAATCTTCTCGAGTGA
ATTTGTTGTTTCAAGCTGTTTGGTGTGTGTTTTAATGAATAAAGCAGGACTTTCACATGC
CTTCTTGTAGTCACTCATCTATGTAATAATCTTTTGCTCTGTAAAACGAATCCTAAGTTA
AATTGCATCTCTTCTGTTTATAGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ22TF U 1
AF RR2FJ22JQ C 56
BS 1 707 RR2FJ22TF
BS 708 708 RR2FJ22JQ
BS 709 754 RR2FJ22TF
BS 755 755 RR2FJ22JQ
BS 756 765 RR2FJ22TF
BS 766 806 RR2FJ22JQ

RD RR2FJ22TF 770 0 0
GGAAACAAGAACCACATAATATCTGCCGCAGTTAGTTCCCCCATGGCTTCTCTTCAGCTC
TGGAAGAAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAACGGTCGTATGTGGAAGATGGCTTGTACA
ACGGTGGCTGCGCCGTTTTCATCTGGCGTCGAGAGCTCAGCACCGGTCAAGGTTGAGAAG
GAGAGCTCTGGTCCGATAAAGCCAGAGAAACAGAAAGTGGAGAAGAGGAAGGTATTTCAG
AAGCTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGAAAAGAAG
GGCGTTTTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAA
CCTGAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCC
TCTCAACTTGAGCTTTATGTGGATCTTCTTGGCAAGGTTAAAGGAGATGCAGCAGCTTCA
GCCTACTTCAACAAAGTAGAGCCAAATTTCGATGAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCGC
CCTGCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGGG
CCAAGACCATATGTTCTCAAGTACCCTAAATGTGATGATAATTGGAATCTTCTCGAGTGA
ATTTGTTGTTTCAAGCTGTTTGGTGTGTGTTTTAATGAATAAAGCAG*ACTTTCACATGC
CTTCTTGTAGTCACTCATCTATGTAATAATCTTT*GCTCTGTAAA
CGAAT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2FJ22JQ 751 0 0
AGCTCTGGAAGAAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAACGGTCGTATGTGGAAGATGGCTT
GTACAACGGTGGCTGCGCCGTTTTCATCTGGCGTCGAGAGCTCAGCACCGGTCAAGGTTG
AGAAGGAGAGCTCTGGTCCGATAAAGCCAGAGAAACAGAAAGTGGAGAAGAGGAAGGTAT
TTCAGAAGCTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGAAA
AGAAGGGCGTTTTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACC
GCAAACCTGAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTT
CTCCCTCTCAACTTGAGCTTTATGTGGATCTTCTTGGCAAGGTTAAAGGAGATGCAGCAG
CTTCAGCCTACTTCAACAAAGTAGAGCCAAATTTCGATGAGATGGACGTTGATGCCAAAA
ACCGCCCTGCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTA
AAGGGCCAAGACCATATGTTCTCAAGTACCCTAAATGTGATGATAATTGGAATCTTCTCG
AGTGAATTTGTTGTTTCAAGCTGTTTGGTGTGTGTTTTAATGAATAAAGCAGGACTTTCA
CATGCCTTCTTGTAGTCACTCATCTATGTAATAATCTTTTGCTCTGTAAAACGAATCCTA
AGTTAAATTGCATCTCTTCTGTTTATAGTCG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL7383Contig1 696 2 2 U
GGAGAGCTTCAGCGATCTTCTTCCTCCTCTGGTTTCGTATCTAAATCGTAAGTTTCCTTT
TTACCCCAAAGGGTTTTGATGCACCGTAACCTAGATCTAAGATTAGGAATCGAATTTGAT
TGAAAACCCTAATTTCAAAATCAGTTGCAGTGATTTGGGGAAAGAGATGGGTTTCATAAT
GGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGATGGAGGATCCGGAGGTGAGAGACAGGAA
AGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAGGTGCAAGAAGATTAAGGAGATGTGGGC
TTTGCCTATTCGTCCTTATGGTTTCTGGACTTTTGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTG
GGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAGGGACCCTTATGATGATCTCCTCCAGGA
CCATCCTTCTTCTTCATCTTCAAACTGATCCAACAGTGAACGAAGACGTCTTATGATACT
GTCTGGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTTTGTTCTTCAGGTGCCTGGAAGCT
TGGTACAAACTCAAATAATAACTCTTGAAGACTTGTTTTGAGAGAGTGCTCATTGTTTCT
TAGTAAAGCTGTTTTGATTCTCTATTTGCATCTTTGATGTGAATATACTTTTCTGAAATG
TGATAATTTTTTTAATGTTTAAAAAAGTTGGTTGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E877TF U 1
AF RR2E877JQ C 1
BS 1 523 RR2E877TF
BS 524 696 RR2E877JQ

RD RR2E877TF 523 0 0
GGAGAGCTTCAGCGATCTTCTTCCTCCTCTGGTTTCGTATCTAAATCGTAAGTTTCCTTT
TTACCCCAAAGGGTTTTGATGCACCGTAACCTAGATCTAAGATTAGGAATCGAATTTGAT
TGAAAACCCTAATTTCAAAATCAGTTGCAGTGATTTGGGGAAAGAGATGGGTTTCATAAT
GGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGATGGAGGATCCGGAGGTGAGAGACAGGAA
AGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAGGTGCAAGAAGATTAAGGAGATGTGGGC
TTTGCCTATTCGTCCTTATGGTTTCTGGACTTTTGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTG
GGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAGGGACCCTTATGATGATCTCCTCCAGGA
CCATCCTTCTTCTTCATCTTCAAACTGATCCAACAGTGAACGAAGACGTCTTATGATACT
GTCTGGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTTTGTTCT

QA 1 523 1 523
DS 

RD RR2E877JQ 696 0 0
GGAGAGCTTCAGCGATCTTCTTCCTCCTCTGGTTTCGTATCTAAATCGTAAGTTTCCTTT
TTACCCCAAAGGGTTTTGATGCACCGTAACCTAGATCTAAGATTAGGAATCGAATTTGAT
TGAAAACCCTAATTTCAAAATCAGTTGCAGTGATTTGGGGAAAGAGATGGGTTTCATAAT
GGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGATGGAGGATCCGGAGGTGAGAGACAGGAA
AGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAGGTGCAAGAAGATTAAGGAGATGTGGGC
TTTGCCTATTCGTCCTTATGGTTTCTGGACTTTTGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTG
GGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAGGGACCCTTATGATGATCTCCTCCAGGA
CCATCCTTCTTCTTCATCTTCAAACTGATCCAACAGTGAACGAAGACGTCTTATGATACT
GTCTGGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTTTGTTCTTCAGGTGCCTGGAAGCT
TGGTACAAACTCAAATAATAACTCTTGAAGACTTGTTTTGAGAGAGTGCTCATTGTTTCT
TAGTAAAGCTGTTTTGATTCTCTATTTGCATCTTTGATGTGAATATACTTTTCTGAAATG
TGATAATTTTTTTAATGTTTAAAAAAGTTGGTTGCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7385Contig1 397 2 1 U
GGATCGAGCTTGCAGTCTCGCCAAACAGGCTTTTGATGAAGCAATCTCTGAGCTGGACAC
ATTAGGCGAAGAATCATACAAAGACAGTACACTGATAATGCAACTTCTCCGTGACAATCT
GACCCTCTGGACTTCTGACCTCAATGATGAGGTGGGTGGTGATGGGATCAAGGAGGCGTC
AAAAGACGAGCCTGAAGAAGGAAAACAAGCGTAGACGTCGAAGTTACCTCAGGAAGGGAG
CGAGCAAGACATTTCTAAGTATGTATGGTCTGGATTTGGCTTTAGTTTCTGAAAACATTA
TGATTTGAGGTTTGTAGAAGCAAAGGGAAGGTCATGATTTGGTTTTCTTCTTTGGAAACT
CTGAACTCTGTTCTTTTTTTAATGGGGTTTTTAAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AU12JQ C 1
AF RR2AU12TF U 1
BS 1 397 RR2AU12TF

RD RR2AU12JQ 397 0 0
GGATCGAGCTTGCAGTCTCGCCAAACAGGCTTTTGATGAAGCAATCTCTGAGCTGGACAC
ATTAGGCGAAGAATCATACAAAGACAGTACACTGATAATGCAACTTCTCCGTGACAATCT
GACCCTCTGGACTTCTGACCTCAATGATGAGGTGGGTGGTGATGGGATCAAGGAGGCGTC
AAAAGACGAGCCTGAAGAAGGAAAACAAGCGTAGACGTCGAAGTTACCTCAGGAAGGGAG
CGAGCAAGACATTTCTAAGTATGTATGGTCTGGATTTGGCTTTAGTTTCTGAAAACATTA
TGATTTGAGGTTTGTAGAAGCAAAGGGAAGGTCATGATTTGGTTTTCTTCTTTGGAAACT
CTGAACTCTGTTCTTTTTTTAATGGGGTTTTTAAGCC

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR2AU12TF 397 0 0
GGATCGAGCTTGCAGTCTCGCCAAACAGGCTTTTGATGAAGCAATCTCTGAGCTGGACAC
ATTAGGCGAAGAATCATACAAAGACAGTACACTGATAATGCAACTTCTCCGTGACAATCT
GACCCTCTGGACTTCTGACCTCAATGATGAGGTGGGTGGTGATGGGATCAAGGAGGCGTC
AAAAGACGAGCCTGAAGAAGGAAAACAAGCGTAGACGTCGAAGTTACCTCAGGAAGGGAG
CGAGCAAGACATTTCTAAGTATGTATGGTCTGGATTTGGCTTTAGTTTCTGAAAACATTA
TGATTTGAGGTTTGTAGAAGCAAAGGGAAGGTCATGATTTGGTTTTCTTCTTTGGAAACT
CTGAACTCTGTTCTTTTTTTAATGGGGTTTTTAAGCC

QA 1 397 1 397
DS 



AS 1 2

CO CL7386Contig1 526 2 1 U
GGAGCCTCCCCCTCCTTCCTCATTTTAAAAAAACCTCTAATTCGCCGTTCGCTCCTCCGT
CGAAGTCAACATGGCGCCCAAGAAGGACAAGGTTCCGCCACCATCATCAAAGCCGGCGAA
ATCCGGAGGTGGAAAGCAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGT
GAACAACATGGTGTTGTTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAAGCTCCCAA
GTTCAAGCTCATCACCCCTTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATTAACGGTTCTCTAGC
AAGGAGGGCGATTAGGGAGCTAATGGCAAAGGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCATTC
GAGCCAGCAGATCTACACTCGTGCCACCAACACCTAAGAATGTTTTTTGGTTTTTGATTC
CGGCTTGACCGTGGACTTGTTTTTATTATCTCCTTTGTTTGGTTCTTCAGTAACTCGTTT
AGAATCTTGTTTTCAGATATTTTGAGCAATGCATTGCGACTCTATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GS76JQB C 1
AF RR2GS76TF U 1
BS 1 526 RR2GS76TF

RD RR2GS76JQB 526 0 0
GGAGCCTCCCCCTCCTTCCTCATTTTAAAAAAACCTCTAATTCGCCGTTCGCTCCTCCGT
CGAAGTCAACATGGCGCCCAAGAAGGACAAGGTTCCGCCACCATCATCAAAGCCGGCGAA
ATCCGGAGGTGGAAAGCAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGT
GAACAACATGGTGTTGTTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAAGCTCCCAA
GTTCAAGCTCATCACCCCTTCCATTCTTTCCGACCGTATGAGGATTAACGGTTCTCTAGC
AAGGAGGGCGATTAGGGAGCTAATGGCAAAGGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCATTC
GAGCCAGCAGATCTACACTCGTGCCACCAACACCTAAGAATGTTTTTTGGTTTTTGATTC
CGGCTTGACCGTGGACTTGTTTTTATTATCTCCTTTGTTTGGTTCTTCAGTAACTCGTTT
AGAATCTTGTTTTCAGATATTTTGAGCAATGCATTGCGACTCTATT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RR2GS76TF 526 0 0
GGAGCCTCCCCCTCCTTCCTCATTTTAAAAAAACCTCTAATTCGCCGTTCGCTCCTCCGT
CGAAGTCAACATGGCGCCCAAGAAGGACAAGGTTCCGCCACCATCATCAAAGCCGGCGAA
ATCCGGAGGTGGAAAGCAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGT
GAACAACATGGTGTTGTTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAAGCTCCCAA
GTTCAAGCTCATCACCCCTTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATTAACGGTTCTCTAGC
AAGGAGGGCGATTAGGGAGCTAATGGCAAAGGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCATTC
GAGCCAGCAGATCTACACTCGTGCCACCAACACCTAAGAATGTTTTTTGGTTTTTGATTC
CGGCTTGACCGTGGACTTGTTTTTATTATCTCCTTTGTTTGGTTCTTCAGTAACTCGTTT
AGAATCTTGTTTTCAGATATTTTGAGCAATGCATTGCGACTCTATT

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 2

CO CL7387Contig1 627 2 1 U
GGAGAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAGTTTAGAGCAGTAGTAATGGCGAC
ATCTGTTGCGACTCTATCTTCTCCCCCACCAGTTTCTCTGCCTCTCTCCTCATCTCGCTC
TTCCTTATTCTCCAACTGCTTCACAGTAACGACCCGACAAAACACCACCCGGTCCCTGGT
GGCGGGAGGAATCCGACCGAGAAAGGCACTGACTTGTAATGCCCTGTTTGGTCTCGGTGT
CCCTGAGCTTGCCGTGATTGCTGGCGTCGCTGCCTTGCTTTTCGGACCCAAGAAGCTTCC
TGAGATCGGTAAAAGCATTGGCAAGACCGTCAAGAGCTTTCAACAGGCTGCAAAAGAGTT
TGAATCTGAGCTAAAGACCGAGCCTGAAGATTCTGTTACTGACTCATCTCCCGTATCAAT
GAACAACAATGCAGAGGGAAAAACTGAGGTTTCGTCAAGCTCCAAGGACAATGTATGACA
ATGATGAATGAGACTTTTTGCTTTTGCTTTTTTTTTTCATGTAGCTACAAGGGTTTGTGA
GATGAGTTTTAGATCAAATACTCTTTGTTGAAGGAAGCTGAGTAGTCTTCCTGTAAGAAT
TGGGCTCCATAGTGTTTGAATCTCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AQ87TF U 1
AF RR2AQ87JQ C 98
BS 1 627 RR2AQ87TF

RD RR2AQ87TF 627 0 0
GGAGAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAGTTTAGAGCAGTAGTAATGGCGAC
ATCTGTTGCGACTCTATCTTCTCCCCCACCAGTTTCTCTGCCTCTCTCCTCATCTCGCTC
TTCCTTATTCTCCAACTGCTTCACAGTAACGACCCGACAAAACACCACCCGGTCCCTGGT
GGCGGGAGGAATCCGACCGAGAAAGGCACTGACTTGTAATGCCCTGTTTGGTCTCGGTGT
CCCTGAGCTTGCCGTGATTGCTGGCGTCGCTGCCTTGCTTTTCGGACCCAAGAAGCTTCC
TGAGATCGGTAAAAGCATTGGCAAGACCGTCAAGAGCTTTCAACAGGCTGCAAAAGAGTT
TGAATCTGAGCTAAAGACCGAGCCTGAAGATTCTGTTACTGACTCATCTCCCGTATCAAT
GAACAACAATGCAGAGGGAAAAACTGAGGTTTCGTCAAGCTCCAAGGACAATGTATGACA
ATGATGAATGAGACTTTTTGCTTTTGCTTTTTTTTTTCATGTAGCTACAAGGGTTTGTGA
GATGAGTTTTAGATCAAATACTCTTTGTTGAAGGAAGCTGAGTAGTCTTCCTGTAAGAAT
TGGGCTCCATAGTGTTTGAATCTCTAT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2AQ87JQ 530 0 0
CTGCCTCTCTCCTCATCTCGCTCTTCCTTATTCTCCAACTGCTTCACAGTAACGACCCGA
CAAAACACCACCCGGTCCCTGGTGGCGGGAGGAATCCGACCGAGAAAGGCACTGACTTGT
AATGCCCTGTTTGGTCTCGGTGTCCCTGAGCTTGCCGTGATTGCTGGGGTCGCTGCCTTG
CTTTTCGGACCCAAGAAGCTTCCTGAGATCGGTAAAAGCATTGGCAAGACCGTCAAGAGC
TTTCAACAGGCTGCAAAAGAGTTTGAATTTGAGCTAAAGACCGAGCCTGAAGATTCTGTT
ACTGACTCATCTCCCGTATCAATGAACAACAATGCAGAGGGAAAAACTGAGGTTTCGTCA
AGCTCCAAGGACAATGTATGACAATGATGAATGAGACTTTTTGCTTTTGCTTTTTTTTTT
CATGTAGCTACAAGGGTTTGTGAGATGAGTTTTAGATCAAATACTCTTTGTTGAAGGAAG
CTGAGTAGTCTTCCTGTAAGAATTGGGCTCCATAGTGTTTGAATCTCTAT

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 2

CO CL7388Contig1 549 2 2 U
GGACAATGATCATATCCATCTCGATGGCAGCGCTCCTCGTGGCACTAGTTGCATCCATCC
CCATGGTTTCAGCATCTCCTGAAGCAGAGTTTGTTAAGAAGACCATCTCTTCCCACAAGA
TCGTCATCTTCTCCAAATCCTACTGCCCTTATTGCAGGAGAGCGAAGTCTGTGTTCAGTG
AGCTGAATCAGGCTCCTCATGTTGTTGAGCTTGACGAAAGAGAAGATGGGGGGAGTATCC
AGAGTGCACTTGGAGAGATTGTTGGAAGGCGAACAGTGCCACAGGTTTTCATTAACGGAA
AGCACATCGGAGGATCAGATGATACCGTAGACGCGCATGAGAGCGGGGAACTGGCCAAGC
TTCTTGGCGTTTCCGGAAACACAAGAGCTGAACTCTAGGCTGAACTATAGTTCAAATAAC
TGATAAACAACCTCTGTGTCTGTGATATTATCAGTTGTTCGAAAATTTGTAATGGGGTTC
TGAAGATTTTAAAACAGCTTGACAATGGCCTTGTTAAAACATATATTATCAATTACTACA
AGTTGAGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CR36TF U 1
AF RR2CR36JQ C 1
BS 1 251 RR2CR36TF
BS 252 549 RR2CR36JQ

RD RR2CR36TF 251 0 0
GGACAATGATCATATCCATCTCGATGGCAGCGCTCCTCGTGGCACTAGTTGCATCCATCC
CCATGGTTTCAGCATCTCCTGAAGCAGAGTTTGTTAAGAAGACCATCTCTTCCCACAAGA
TCGTCATCTTCTCCAAATCCTACTGCCCTTATTGCAGGAGAGCGAAGTCTGTGTTCAGTG
AGCTGAATCAGGCTCCTCATGTTGTTGAGCTTGACGAAAGAGAAGATGGGGGGAGTATCC
AGAGTGCACTT

QA 1 251 1 251
DS 

RD RR2CR36JQ 549 0 0
GGACAATGATCATATCCATCTCGATGGCAGCGCTCCTCGTGGCACTAGTTGCATCCATCC
CCATGGTTTCAGCATCTCCTGAAGCAGAGTTTGTTAAGAAGACCATCTCTTCCCACAAGA
TCGTCATCTTCTCCAAATCCTACTGCCCTTATTGCAGGAGAGCGAAGTCTGTGTTCAGTG
AGCTGAATCAGGCTCCTCATGTTGTTGAGCTTGACGAAAGAGAAGATGGGGGGAGTATCC
AGAGTGCACTTGGAGAGATTGTTGGAAGGCGAACAGTGCCACAGGTTTTCATTAACGGAA
AGCACATCGGAGGATCAGATGATACCGTAGACGCGCATGAGAGCGGGGAACTGGCCAAGC
TTCTTGGCGTTTCCGGAAACACAAGAGCTGAACTCTAGGCTGAACTATAGTTCAAATAAC
TGATAAACAACCTCTGTGTCTGTGATATTATCAGTTGTTCGAAAATTTGTAATGGGGTTC
TGAAGATTTTAAAACAGCTTGACAATGGCCTTGTTAAAACATATATTATCAATTACTACA
AGTTGAGTT

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

CO CL7389Contig1 885 2 2 U
GAGTATCGAGCTGAATCTTAAGGAGACTGAGCTGTGTCTTGGTCTTCCCGGTGGAGTGAC
CGGAACCAAGAGAGGATTCTCGGAGACGGTTGATCTGAAACTCAATCTGAACAATGAACC
TGAAAGCAAAGAAGTTTCTAAGACTCATGACGTCGTGACTTCTGTTTCTAAAGAAAAGAG
TACATGTCCCAAAGATCCTACCAAGCCTCCTGCCAAGGCACAAGTTGTGGGATGGCCACC
GGTGAGATCGTACCGGAAGAACGTGATGGGTTCGAGCCAAAAATCAAGCGGTGTAAAGGA
GACGGCGGTGTTTGTAAAGGTTTCGATGGATGGAGCACCGTACTTGAGGAAAGTCGACTT
AAAGATGTATAATAGCTACGACGAACTCTCTAATGCTTTGTCCAACACGTTCAGCTCTTT
TACCATGGGAAAAAATGGAGGAGAGGAAGGAATGATAGACTTCATGAATGAACGGAAACT
TAGGGATGTAGTGAGCAGTTGGGACTATGTTCCCTCTTATGAAGACAAAGACGGTGACTG
GATGCTCGTCGGCGACGTCCCTTGGCCAATGTTCGTTGATACATGCAAGCGTTTACGTCT
CATGAAAGGATCTGACGCCATTGGTCTCGCTCCGAGAGCAATGGAGAAGTGCAAGAGCAG
AACTTGAAGTTAAAAGCGTAAGTGGTCATGCTCATATATTTGATTAACACATCTATGAGT
GTTAATTGTGTTTTTACGATGAAAAATATTGTTCAATATCTACTTTCCTTTAATTGTCTG
TTTTGATATGAATTATGTGGTATGTAGATAATGAACTTAAGTTAAATTTGTGAGACGTTT
GTAATGGAAAATATGTAATAATTTGAACATCTTTTTATGTTCGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH35TF U 1
AF RR2GH35JQB C 214
BS 1 670 RR2GH35TF
BS 671 885 RR2GH35JQB

RD RR2GH35TF 670 0 0
GAGTATCGAGCTGAATCTTAAGGAGACTGAGCTGTGTCTTGGTCTTCCCGGTGGAGTGAC
CGGAACCAAGAGAGGATTCTCGGAGACGGTTGATCTGAAACTCAATCTGAACAATGAACC
TGAAAGCAAAGAAGTTTCTAAGACTCATGACGTCGTGACTTCTGTTTCTAAAGAAAAGAG
TACATGTCCCAAAGATCCTACCAAGCCTCCTGCCAAGGCACAAGTTGTGGGATGGCCACC
GGTGAGATCGTACCGGAAGAACGTGATGGGTTCGAGCCAAAAATCAAGCGGTGTAAAGGA
GACGGCGGTGTTTGTAAAGGTTTCGATGGATGGAGCACCGTACTTGAGGAAAGTCGACTT
AAAGATGTATAATAGCTACGACGAACTCTCTAATGCTTTGTCCAACACGTTCAGCTCTTT
TACCATGGGAAAAAATGGAGGAGAGGAAGGAATGATAGACTTCATGAATGAACGGAAACT
TAGGGATGTAGTGAGCAGTTGGGACTATGTTCCCTCTTATGAAGACAAAGACGGTGACTG
GATGCTCGTCGGCGACGTCCCTTGGCCAATGTTCGTTGATACATGCAAGCGTTTACGTCT
CATGAAAGGATCTGACGCCATTGGTCTCGCTCCGAGAGCAATGGAGAAGTGCAAGAGCAG
AACTTGAAGT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2GH35JQB 672 0 0
CAAGGCACAAGTTGTGGGATGGCCACCGGTGAGATCGTACCGGAAGAACGTGATGGGTTC
GAGCCAAAAATCAAGCGGTGTAAAGGAGACGGCGGTGTTTGTAAAGGTTTCGATGGATGG
AGCACCGTACTTGAGGAAAGTCGACTTAAAGATGTATAATAGTTACGACGAACTCTTTAA
TGCTTTGTCCAACACGTTCAGCTCTTTTACCATGGGAAAAAATGGAGGAGAGGAAGGAAT
GATAGACTTCATGAATGAACGGAAACTTAGGGATGTAGTGAGCAGTTGGGACTATGTTCC
CTCTTATGAAGACAAAGACGGTGACTGGATGTTCGTCGGCGACGTCCCTTGGCCAATGTT
CGTTGATACATGCAAGCGTTTACGTCTCATGAAAGGATCTGACGCCATTGGTCTCGCTCC
GAGAGCAATGGAGAAGTGCAAGAGCAGAACTTGAAGTTAAAAGCGTAAGTGGTCATGCTC
ATATATTTGATTAACACATCTATGAGTGTTAATTGTGTTTTTACGATGAAAAATATTGTT
CAATATCTACTTTCCTTTAATTGTCTGTTTTGATATGAATTATGTGGTATGTAGATAATG
AACTTAAGTTAAATTTGTGAGACGTTTGTAATGGAAAATATGTAATAATTTGAACATCTT
TTTATGTTCGGC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL7390Contig1 744 2 7 U
GGATATTCATTTCTTACATCCATATCAACAACTATGGCTCGCATTGACTCTCTCCTCCTC
TCCCTCCTCCTCATCGCCACCGTCTCTGTCGCCGCATTGGCCGAACAAGAATGCGTCTAC
ACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAAAGGTGACTCCGGCACCGATTCAATCATAGGGGCT
TCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTGCAGACCTAGAGAGATGGGGTGGT
GTAATGGGACGAGGACACGACTACTACGAGAACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACA
GCGCGGTGCCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGAATCTGAACTCTGACGGCTCCGGTGAT
AAGCCCGGCTGGTATGTTCAATACGTGGAGGTAAAGACGACCAGAGCTGGAGCTGAGACC
AAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAGTGGCTTGCCGTCGACGAGCCGCCACATGAGCTA
TCTGTCGAACGGAACAATTGCCCGCAGACGGTGAGTGCAAGTGTCGGTGTCGGGTGTGAG
AACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCGTCTGAAAGCGTCGAGGGGACGTAACATGGCAATAT
ATAATGCAAAATTGAATAAAAAAATTCTGTAAACGCGTGAAGCAATATTGTTAGATTGAA
TAAAACTGCCTCTCCTTGTGAGTGTGGGATGGCATTGATTTCCAATCCAATTTAACTGTG
AGAGTCAAACAATTGGTTATCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H043TF U 1
AF RR2H043JQ C 189
BS 1 623 RR2H043TF
BS 624 624 RR2H043JQ
BS 625 664 RR2H043TF
BS 665 665 RR2H043JQ
BS 666 704 RR2H043TF
BS 705 705 RR2H043JQ
BS 706 744 RR2H043TF

RD RR2H043TF 744 0 0
GGATATTCATTTCTTACATCCATATCAACAACTATGGCTCGCATTGACTCTCTCCTCCTC
TCCCTCCTCCTCATCGCCACCGTCTCTGTCGCCGCATTGGCCGAACAAGAATGCGTCTAC
ACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAAAGGTGACTCCGGCACCGATTCAATCATAGGGGCT
TCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTGCAGACCTAGAGAGATGGGGTGGT
GTAATGGGACGAGGACACGACTACTACGAGAACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACA
GCGCGGTGCCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGAATCTGAACTCTGACGGCTCCGGTGAT
AAGCCCGGCTGGTATGTTCAATACGTGGAGGTAAAGACGACCAGAGCTGGAGCTGAGACC
AAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAGTGGCTTGCCGTCGACGAGCCGCCACATGAGCTA
TCTGTCGAACGGAACAATTGCCCGCAGACGGTGAGTGCAAGTGTCGGTGTCGGGTGTGAG
AACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCGTCTGAAAGCGTCGAGGGGACGTAACATGGCAATAT
ATAATGCAAAATTGAATAAAAAA*TTCTGTAAACGCGTGAAGCAATATTGTTAGATTGAA
TAAA*CTGCCTCTCCTTGTGAGTGTGGGATGGCATTGATTTCCA*TCCAATTTAACTGTG
AGAGTCAAACAATTGGTTATCTTT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RR2H043JQ 556 0 0
GGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTGCAGACCTAGAGAGATGGGGTGGTGTAATGGG
ACGAGGACACGACTACTACGAGAACGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCGGTG
CCTTCCGAGCCCAGTGTGCTTTTTGAATTTGAACTTTGACGGCTCCGGTGATAAGCCCGG
CTGGTATGTTCAATACGTGGAGGTAAAGACGACCAGAGCTGGAGCTGAGACCAAGCGTCA
GTACTTCGATGTAGAGCAGTGGCTTGCCGTCGACGAGCCGCCACATGAGCTATCTGTCGA
ACGGAACAATTGCCCGCAGACGGTGAGTGCAAGTGTCGGTGTCGGGTGTGAGAACAGGAA
GTGCATCTTTTCAATCGTTTGAAAGGGTCGAGGGGACGTAACATGGCAATATATAATGCA
AAATTGAATAAAAAAATTCTGTAAACGCGTGAAGCAATATTGTTAGATTGAATAAAACTG
CCTCTCCTTGTGAGTGTGGGATGGCATTGATTTCCAATCCAATTTAACTGTGAGAGTCAA
ACAATTGGTTATCTTT

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 2

CO CL7391Contig1 995 2 6 U
GGGGAGCTTTCTTCTCCAGGGAAGAGCGGGAGCGTCTTCTTCTTGTCTCAGGATGATAGG
TTCATGATTAAAACACTCAGGAAATCTGAAGTCAAGGTTCTCCTGAGGATGCTTCCATAT
TACCATCATCATGTGAAGACGTATGAGAACACACTCATTACTAAATTCTTTGGGCTTCAC
AGAATCAAACCATCAAGTGGTCAAAAGTTCCGGTTTGTGGTGATGGGTAACATGTTCTTC
ACAGACCTAAGAATCCACCGGAGATTTGACCTTAAAGGTTCGAAGCTAGGACGCTCTGCA
GACAAAGTGGAGATAGACGAGAACACGATACTTAAAGATTTGGATCTCAACTACAGCTTC
TTCTTGGAACCTTCTTGGCGGGAGGGTTTACTAACGCAACTAGAGATCGATAGCAAGTTC
TTGGTGGAACAGAACATAATGGATTACAGCCTTTTGCTCGGTGTGCATCACCGAGCTCCA
GAGCATTTAAGGACACAGTTGGTCCGTTCTTGAAGTATAACAGCTGATGCGTTGGAAAGT
GTAGCTGAAGATGATACAATCGAGGACGACATGTTATCTTACCACCAGGGATTAGTTCTT
GTTCCTGGAGGGAGTGACAATATTGTAACTGGTCCTCACATCAGAGGCAGCAGATTACGT
GCATCCGCGGTAGGAGATGAAGAAGTCGATCTCCTCCTTCCTGGAACAGCCAGGCTGCAG
ATACAGCAAGGGGTGAACATGCCTGCAAGAGCAGAGCTGATACCGGGAAGAGAAGAGAAA
GACAGACAGATACTGCACGACTGCTGCGACGTGGTGCTTTATCTCGGCATCATAGACATA
CTGCAAGAGTACAACATGACGAAGAAGATCGAGCATGCTTACAAGTCTCTTCATTTTGAT
TCTAAATCGATCTCGGCCGTTGATCCTACTTACTACTCCCAACGTTTTCTTGACTTCATC
GAGAAGGTGTTTCCTCAGAACAATGCATAACAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP37TF U 1
AF RR2EP37JQ C 275
BS 1 773 RR2EP37TF
BS 774 774 RR2EP37JQ
BS 775 779 RR2EP37TF
BS 780 780 RR2EP37JQ
BS 781 805 RR2EP37TF
BS 806 995 RR2EP37JQ

RD RR2EP37TF 805 0 0
GGGGAGCTTTCTTCTCCAGGGAAGAGCGGGAGCGTCTTCTTCTTGTCTCAGGATGATAGG
TTCATGATTAAAACACTCAGGAAATCTGAAGTCAAGGTTCTCCTGAGGATGCTTCCATAT
TACCATCATCATGTGAAGACGTATGAGAACACACTCATTACTAAATTCTTTGGGCTTCAC
AGAATCAAACCATCAAGTGGTCAAAAGTTCCGGTTTGTGGTGATGGGTAACATGTTCTTC
ACAGACCTAAGAATCCACCGGAGATTTGACCTTAAAGGTTCGAAGCTAGGACGCTCTGCA
GACAAAGTGGAGATAGACGAGAACACGATACTTAAAGATTTGGATCTCAACTACAGCTTC
TTCTTGGAACCTTCTTGGCGGGAGGGTTTACTAACGCAACTAGAGATCGATAGCAAGTTC
TTGGTGGAACAGAACATAATGGATTACAGCCTTTTGCTCGGTGTGCATCACCGAGCTCCA
GAGCATTTAAGGACACAGTTGGTCCGTTCTTGAAGTATAACAGCTGATGCGTTGGAAAGT
GTAGCTGAAGATGATACAATCGAGGACGACATGTTATCTTACCACCAGGGATTAGTTCTT
GTTCCTGGAGGGAGTGACAATATTGTAACTGGTCCTCACATCAGAGGCAGCAGATTACGT
GCATCCGCGGTAGGAGATGAAGAAGTCGATCTCCTCCTTCCTGGAACAGCCAGGCTGCAG
ATACAGCAAGGGGTGAACATGCCTGCAAGAGCAGAGCTGATACCGGGAAGAGA*GAGAA*
GACAGACAGATACTGCACGACTGCT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2EP37JQ 721 0 0
AAGGTTCGAAGCTAGGACGCTCTGCAGACAAAGTGGAGATAGACGAGAACACGATACTTA
AAGATTTGGATCTCAACTACAGCTTCTTCTTGGAACCTTCTTGGCGGGAGGGTTTACTAA
CGCAACTAGAGATCGATAGCAAGTTCTTGGTGGAACAGAACATAATGGATTACAGCCTTT
TGCTCGGTGTGCATCACCGAGCTCCAGAGCATTTAAGGACACAGTTGGTCCGTTCTTGAA
GTATAACAGCTGATGCGTTGGAAAGTGTAGCTGAAGATGATACAATCGAGGACGACATGT
TATCTTACCACCAGGGATTAGTTCTTGTTCCTGGAGGGAGTGACAATATTGTAACTGGTC
CTCACATCAGAGGCAGCAGATTACGTGCATCCGCGGTAGGAGATGAAGAAGTCGATCTCC
TCCTTCCTGGAACAGCCAGGCTGCAGATACAGCAAGGGGTGAACATGCCTGCAAGAGCAG
AGCTGATACCGGGAAGAGAAGAGAAAGACAGACAGATACTGCACGACTGCTGCGACGTGG
TGCTTTATCTCGGCATCATAGACATACTGCAAGAGTACAACATGACGAAGAAGATCGAGC
ATGCTTACAAGTCTCTTCATTTTGATTCTAAATCGATCTCGGCCGTTGATCCTACTTACT
ACTCCCAACGTTTTCTTGACTTCATCGAGAAGGTGTTTCCTCAGAACAATGCATAACAGA
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7393Contig1 696 2 2 U
TTTTTCATATTAAAGTCTCAGCTTTATACCACAAGTCTTACACATGAAGGGTGTATAAAC
ATTCATAGATACGTATTGTTCTCTGGTTTATCGACTCTGTTTTGGTTACATTAAAAGGAA
AACTCCTAAAGTGAGTTCATGTCACTACTCCTTTCGGTTTTTCCATATTGTAACAAGCGA
GACACCCATCAGAGACATAACCACCGTTGAGATTGCTGGAGGCACTCCAACGAGAGGATC
TTGAAAGAACTTTGTGGCAAGGGCCAGAGCGAGAAGACTACTTTGCATTCCTGTTTCATA
GGATAATGTTCTTTGTAGGGCTTTTACATCAGGTACCTTGCTGAAGAAGAAACCAGTGAA
AAAGTAACCAGCTACGAAAGCCAAGAGATGAAACATGATGACGAGGAATAAAATGGTTGC
ACCAAACGGAGACAAGACTGAATCTATGTTCAAAGCGAGGGGTGCTCCGATGCAACAAGC
CATATCGATTAGCGTTAACGCCGGGAGAAAAGGTTTGATTGCACTGGACAACCTTGGCAA
TAACCGGTTTAGAAGTAGTCCAGCGGCAATAGGTGTAACCACGACCTGGAGAATGCTAGA
GATCATCCCAATCACGTCGACGGGAAGCTTTTTACCAATGAGTAAGAGAGAAAGCATGGG
TGTAACGAGGGCCGCCGTAGCGGTTGAGATCGATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS91TF C 1
AF RR2EY03JQ U 47
BS 1 46 RR2GS91TF
BS 47 696 RR2EY03JQ

RD RR2GS91TF 573 0 0
TTTTTCATATTAAAGTCTCAGCTTTATACCACAAGTCTTACACATGAAGGGTGTATAAAC
ATTCATAGATACGTATTGTTCTCTGGTTTATCGACTCTGTTTTGGTTACATTAAAAGGAA
AACTCCTAAAGTGAGTTCATGTCACTACTCCTTTCGGTTTTTCCATATTGTAACAAGCGA
GACACCCATCAGAGACATAACCACCGTTGAGATTGCTGGAGGCACTCCAACGAGAGGATC
TTGAAAGAACTTTGTGGCAAGGGCCAGAGCGAGAAGACTACTTTGCATTCCTGTTTCATA
GGATAATGTTCTTTGTAGGGCTTTTACATCAGGTGCCTTGCTGAAGAAGAAACCAGTGAA
AAAGTAACCAGCTACGAAAGCCAAGAGATGAAACATGATGACGAGGAATAAAATGGTTGC
ACCAAACGGAGACAAGACTGAATCTATGTTCAAAGCGAGGGGTGCTCCGATGCAACAAGC
CATATCGATTAGCGTTAACGCCGGGAGAAAAGGTTTGATTGCACTGGACAACCTTGGCAA
TAACCGGTTTAGAAGTAGTCCAGCGGCAATAG
C

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2EY03JQ 650 0 0
AAGGGTGTATAAACATTCATAGATACGTATTGTTCTCTGGTTTATCGACTCTGTTTTGGT
TACATTAAAAGGAAAACTCCTAAAGTGAGTTCATGTCACTACTCCTTTCGGTTTTTCCAT
ATTGTAACAAGCGAGACACCCATCAGAGACATAACCACCGTTGAGATTGCTGGAGGCACT
CCAACGAGAGGATCTTGAAAGAACTTTGTGGCAAGGGCCAGAGCGAGAAGACTACTTTGC
ATTCCTGTTTCATAGGATAATGTTCTTTGTAGGGCTTTTACATCAGGTACCTTGCTGAAG
AAGAAACCAGTGAAAAAGTAACCAGCTACGAAAGCCAAGAGATGAAACATGATGACGAGG
AATAAAATGGTTGCACCAAACGGAGACAAGACTGAATCTATGTTCAAAGCGAGGGGTGCT
CCGATGCAACAAGCCATATCGATTAGCGTTAACGCCGGGAGAAAAGGTTTGATTGCACTG
GACAACCTTGGCAATAACCGGTTTAGAAGTAGTCCAGCGGCAATAGGTGTAACCACGACC
TGGAGAATGCTAGAGATCATCCCAATCACGTCGACGGGAAGCTTTTTACCAATGAGTAAG
AGAGAAAGCATGGGTGTAACGAGGGCCGCCGTAGCGGTTGAGATCGATGT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL7394Contig1 435 2 1 U
GGGTTCTTAAATCGTTATTTCAGAAAAGATTAAAAGAAACAGAAGATATATTTTAAGTGC
GAAAATGGCAATGGATGCGACAACTTTTCCCGAAGGAGTCTCAGAAGCTGAGTTAAATCC
TGCCCAAAACAAGAGTTTGGAAGTAGATCCTGTTTCTTCTGAAATCGCTTCTCATAAGAT
AAAACAAAACTTGGAAAGGATAAAAAACGCAAACTCCAAGAGCTCCAAGAGGGACGCCAC
ACAAACACTAAAAAAAGACGATCATAGTATCAGCGGTGATCGTGGCCGTCGCGGGAGCGG
CTTTCGCCATCACCAAAAAAACTGAAAGAGAAATGATTTTGATATAACTTTTACAAATTT
CCACTAAATTAAGAAATATATATAATTTAATTCTATATTTGTATATATATGTAAATTTCA
AATTAAACAATGCAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H916JQ C 1
AF RR2H916TF U 1
BS 1 435 RR2H916TF

RD RR2H916JQ 435 0 0
GGGTTCTTAAATCGTTATTTCAGAAAAGATTAAAAGAAACAGAAGATATATTTTAAGTGC
GAAAATGGCAATGGATGCGACAACTTTTCCCGAAGGAGTCTCAGAAGCTGAGTTAAATCC
TGCCCAAAACAAGAGTTTGGAAGTAGATCCTGTTTCTTCTGAAATCGCTTCTCATAAGAT
AAAACAAAACTTGGAAAGGATAAAAAACGCAAACTCCAAGAGCTCCAAGAGGGACGCCAC
ACAAACACTAAAAAAAGACGATCATAGTATCAGCGGTGATCGTGGCCGTCGCGGGAGCGG
CTTTCGCCATCACCAAAAAAACTGAAAGAGAAATGATTTTGATATAACTTTTACAAATTT
CCACTAAATTAAGAAATATATATAATTTAATTCTATATTTGTATATATATGTAAATTTCA
AATTAAACAATGCAG

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR2H916TF 435 0 0
GGGTTCTTAAATCGTTATTTCAGAAAAGATTAAAAGAAACAGAAGATATATTTTAAGTGC
GAAAATGGCAATGGATGCGACAACTTTTCCCGAAGGAGTCTCAGAAGCTGAGTTAAATCC
TGCCCAAAACAAGAGTTTGGAAGTAGATCCTGTTTCTTCTGAAATCGCTTCTCATAAGAT
AAAACAAAACTTGGAAAGGATAAAAAACGCAAACTCCAAGAGCTCCAAGAGGGACGCCAC
ACAAACACTAAAAAAAGACGATCATAGTATCAGCGGTGATCGTGGCCGTCGCGGGAGCGG
CTTTCGCCATCACCAAAAAAACTGAAAGAGAAATGATTTTGATATAACTTTTACAAATTT
CCACTAAATTAAGAAATATATATAATTTAATTCTATATTTGTATATATATGTAAATTTCA
AATTAAACAATGCAG

QA 1 435 1 435
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7396Contig1 946 2 8 U
GGGATGGACGCCTTGGCCACTCGATGGACCGCTCTAAAACGGCCCGCCCTGAAGTCAACT
GCTCTATTAACCGTGCCAACTTCCATGATGGTGTGTTGAAGGTACTCCGCCAAGTTCTCT
CCGAGCTAGCCCGCCTTAAACAAGACCTTTCAGACGCTGAAATTCTAGAACGCGTTGAAT
CTGTCGCTACCGCCCTCGCATATGGTGTTGACATTATGGCTTATCTTAAGCTAAGAGCTA
TCAACCTCTTCCGTCCCACTGAGGCTTCGAAATTTCTTACCAAGCCTAAGGTCCCGGATC
ATTTCGAGATCCCAACTCCTTTCGCTTTTGCTATCTCCCAGCTAGGAGTCGTAGAAGTTA
GCAGTTTACCCAAAAGGATGATCTGCTATCCGACTGCAGATCTCGCCGACGCGCAACAAC
ATTTAGTTGAAAACAAGCGCCACTGGTCTCAAACTGCCTACGCCAAAGCTGTTCGCTATG
CAAAACATCTAGGAATGTCGTTCTCGACAGTCGACCTGGATGTCAAAGTTGGCTCCTCAT
GGTGGCTATTCAAGCCCGACGTAACCGACGGACTTCTCTCAATACGCTGCCCGCTCCCAG
AGGACAACTACACTCTCGCAGGTGCCACCGTTTTTATGCTCTTCTACCATGACGTTGGAT
CGGACCCCGCAATCGATCTCTTCAACATCGCCTCTCTCGGCACTGATGACTACGGCTCGT
TCATTCGCAATCCACGCGATGGATTTAACGCCTCGTCCTACTATGCCATCTCTTCAGAGG
GAACTGATGAAATGTGGAAGTCGTCCGCTTAGTACAAGCACCAAATCTTGTCTGAACGGG
AATACCCGATAATTTGTGTCGTTCTATTTTAATAGTTATCTATTTCAATGGTCTGTAATA
ATGAACTCGTTAACTTGAGCTTTATTTTAAGTGTGATTTTATTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT91TF U 1
AF RR2BT91JQ C 257
BS 1 684 RR2BT91TF
BS 685 685 RR2BT91JQ
BS 686 729 RR2BT91TF
BS 730 730 RR2BT91JQ
BS 731 747 RR2BT91TF
BS 748 748 RR2BT91JQ
BS 749 766 RR2BT91TF
BS 767 946 RR2BT91JQ

RD RR2BT91TF 773 0 0
GGGATGGACGCCTTGGCCACTCGATGGACCGCTCTAAAACGGCCCGCCCTGAAGTCAACT
GCTCTATTAACCGTGCCAACTTCCATGATGGTGTGTTGAAGGTACTCCGCCAAGTTCTCT
CCGAGCTAGCCCGCCTTAAACAAGACCTTTCAGACGCTGAAATTCTAGAACGCGTTGAAT
CTGTCGCTACCGCCCTCGCATATGGTGTTGACATTATGGCTTATCTTAAGCTAAGAGCTA
TCAACCTCTTCCGTCCCACTGAGGCTTCGAAATTTCTTACCAAGCCTAAGGTCCCGGATC
ATTTCGAGATCCCAACTCCTTTCGCTTTTGCTATCTCCCAGCTAGGAGTCGTAGAAGTTA
GCAGTTTACCCAAAAGGATGATCTGCTATCCGACTGCAGATCTCGCCGACGCGCAACAAC
ATTTAGTTGAAAACAAGCGCCACTGGTCTCAAACTGCCTACGCCAAAGCTGTTCGCTATG
CAAAACATCTAGGAATGTCGTTCTCGACAGTCGACCTGGATGTCAAAGTTGGCTCCTCAT
GGTGGCTATTCAAGCCCGACGTAACCGACGGACTTCTCTCAATACGCTGCCCGCTCCCAG
AGGACAACTACACTCTCGCAGGTGCCACCGTTTTTATGCTCTTCTACCATGACGTTGGAT
CGGACCCCGCAATCGATCTCTTCA*CATCGCCTCTCTCGGCACTGATGACTACGGCTCGT
TCATTCGCA*TCCACGCGATGGATTTA*CGCCTCGTCCTACTATGC
ATCTCTT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2BT91JQ 690 0 0
CACTGAGGCTTCGAAATTTCTTACCAAGCCTAAGGTCCCGGATCATTTCGAGATCCCAAC
TCCTTTCGCTTTTGCTATCTCCCAGCTAGGAGTCGTAGAAGTTAGCAGTTTACCCAAAAG
GATGATCTGCTATCCGACTGCAGATCTCGCCGACGCGCAACAACATTTAGTTGAAACCAA
GCGCCACTGGTCTCAAACTGCCTACGCCAAAGCTGTTCGCTATGCAAAACATCTAGGAAT
GTCGTTCTCGACAGTCGACCTGGATGTCAAAGTTGGCTCCTCATGGTGGCTATTCAAGCC
CGACGTAACCGACGGACTTCTCTCAATACGCTGCCCGCTCCCAGAGGACAACTACACTCT
CGCAGGTGCCACCGTTTTTATGCTCTTCTACCATGACGTTGGATCGGACCCCGCAATCGA
TCTCTTCAACATCGCCTCTCTCGGCACTGATGACTACGGCTCGTTCATTCGCAATCCACG
CGATGGATTTAACGCCTCGTCCTACTATGCCATCTCTTCAGAGGGAACTGATGAAATGTG
GAAGTCGTCCGCTTAGTACAAGCACCAAATCTTGTCTGAACGGGAATACCCGATAATTTG
TGTCGTTCTATTTTAATAGTTATCTATTTCAATGGTCTGTAATAATGAACTCGTTAACTT
GAGCTTTATTTTAAGTGTGATTTTATTCCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL7397Contig1 837 2 2 U
AGGAATTCAACCAAAAGAGATACTGAATACATGGGAGATGGTTATAGCACTAATTCGATG
GAAATGGTGAATAAAGGAGTCGATATGTTATTTGAGCTGATCCGGACAGACTTCGGAGGT
ATCGACTTTTCAGGAAACAACCTTTCTGGAAAGATACCTGAATCTATTGGATTGTTGAAG
GGATTGCGTATTCTCAACTTGTCGAGTAACGGATTCACAAACAGTATACCTCAGTCGCTG
GCAAATCTGACAAATCTCGAGGCATTAGACCTATCTCGAAATCAGCTCTCGGGTCAGATT
CCTCAAATTCTTGCCATGCTCTCTTTTTTGTCGATTATGAACTTCTCCCGTAACAATCTC
CAAGGTCCGATACCACGAAGCACACAGTTTGAAAGACAAAACTGTTCAGCATTCATGGAT
AACCCCAGACTCTACGGTCTTGAAGATATATGTGGAAAATCTCATGTCTCTAATCCTACA
CCACAAGAACGTGAAGATCTTTCTGAGCCAAAAGAACAAGTGATTAGTTGGATATCTGCG
GTGATAGCCTATGTACCGGGTGTGTTTTGCGGATTGGTGATTGGACATATCTCCACTCCT
CATGTAAACAAGTGGTTCATGTAAAAGTTCCCTCCAAAGCAAGCCCAAAAATAGTGGCCA
GAACTGCATGTTGGGCATCATCTCTCTTTAAGTGTTTGTGAAGCATATATATATATATGT
ATGTGTGTGTGTTCTCAAGATGTACTTTTTATGTTTTACGATTTTGTAGTAAAACGTCTT
TGGTTTGGTGTCATTTGGTCTTAAATTGACAATGCATTCAGAAACTTCTTCCTAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G345TF U 1
AF RR2G345JQ C 81
BS 1 610 RR2G345TF
BS 611 837 RR2G345JQ

RD RR2G345TF 610 0 0
AGGAATTCAACCAAAAGAGATACTGAATACATGGGAGATGGTTATAGCACTAATTCGATG
GAAATGGTGAATAAAGGAGTCGATATGTTATTTGAGCTGATCCGGACAGACTTCGGAGGT
ATCGACTTTTCAGGAAACAACCTTTCTGGAAAGATACCTGAATCTATTGGATTGTTGAAG
GGATTGCGTATTCTCAACTTGTCGAGTAACGGATTCACAAACAGTATACCTCAGTCGCTG
GCAAATCTGACAAATCTCGAGGCATTAGACCTATCTCGAAATCAGCTCTCGGGTCAGATT
CCTCAAATTCTTGCCATGCTCTCTTTTTTGTCGATTATGAACTTCTCCCGTAACAATCTC
CAAGGTCCGATACCACGAAGCACACAGTTTGAAAGACAAAACTGTTCAGCATTCATGGAT
AACCCCAGACTCTACGGTCTTGAAGATATATGTGGAAAATCTCATGTCTCTAATCCTACA
CCACAAGAACGTGAAGATCTTTCTGAGCCAAAAGAACAAGTGATTAGTTGGATATCTGCG
GTGATAGCCTATGTACCGGGTGTGTTTTGCGGATTGGTGATTGGACATATCTCCACTCCT
CATGTAAACA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RR2G345JQ 757 0 0
CGATATGTTATTTGAGCTGATCCGGACAGACTTCGGAGGTATCGACTTTTCAGGAAACAA
CCTTTCTGGAAAGATACCTGAATCTATTGGATTGTTGAAGGGATTGCGTATTCTCAACTT
GTCGAGTAACGGATTCACAAACAGTATACCTCAGTCGCTGGCAAATCTGACAAATCTCGA
GGCATTAGACCTATCTCGAAATCAGCTCTCGGGTCAGATTCCTCAAATTCTTGCCATGCT
CTCTTTTTTGTCGATTATGAACTTCTCCCGTAACAATCTCCAAGGTCCGATACCACGAAG
CACACAGTTTGAAAGACAAAACTGTTCAGCATTCATGGATAACCCCAGACTCTACGGTCT
TGAAGATATATGTGGAAAATCTCATGTCTCTAATCCTACACCACAAGAACGTGAAGATCT
TTTTGAGCCAAAAGAACAAGTGATTAGTTGGATATTTGCGGTGATAGCCTATGTACCGGG
TGTGTTTTGCGGATTGGTGATTGGACATATCTCCACTCCTCATGTAAACAAGTGGTTCAT
GTAAAAGTTCCCTCCAAAGCAAGCCCAAAAATAGTGGCCAGAACTGCATGTTGGGCATCA
TCTCTCTTTAAGTGTTTGTGAAGCATATATATATATATGTATGTGTGTGTGTTCTCAAGA
TGTACTTTTTATGTTTTACGATTTTGTAGTAAAACGTCTTTGGTTTGGTGTCATTTGGTC
TTAAATTGACAATGCATTCAGAAACTTCTTCCTAGGT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7399Contig1 770 2 3 U
TCATGGCACCTAAGATGGCTCGCAGGGGAGGTAAGGATGAGCCTTTTGCATGGGAAAGCA
AGGAGTTTCTTAGGAAACTTTGCATTGGAAAGGAAGTTGCTTTCAAAGTGGATTACAAAG
TGGAAGCTATTGCTGGAAGAGAATTTGGCTCTGTTTTTCTAGGAAACCAGAATGTTGCAA
AGCTTGTTGTTCAAAATGGTTGGGCCAAGGTTAGGGATCCAGGTCAGAATAATCAGGGTA
AGGTTAGTCCTTACATTACAGAGCTGCTACAGCTCCAAGAGCAGTCTAACCAAGAAGGGT
TTGGTTGTTTTAGCAAGGTTCCTGGTGCTGCTGAGGCGTCTATCAGAGACCTTCCTCCTT
CTGCCATTGGAGACTCTGCAGGCTTTGATGCAATGGGGCTTTTAGCTGCCAACAAGGGCA
AGCCTATGGAAGGCATCGTTGAGCAAGTACGCGATGGAAGTACTATCCGTGTGTATCTTC
TTCCAGAGTTCCAGTTTGTACAAGTGTTCGTTGCTGGAATCCAGGTGAATTAAACTTCCT
TCTCTGTTTGACTATTTTAAACATTTTAAGAGCATCTCCAATGGTGTTACTACCATTGGA
GTCCTTAGGATTATAAAACTATTTTTTTTTTATTTTTAGAATAGTTAAGGACTCTAATCA
AAATAGAATGTCCAATGGTGTTTTCCAATTTGGAATCCTTAGAAATAAAAAGTATTAAAT
TTGAAAACATGTAATCTGATCAAATGTGTATGATCAAATATGTATGGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AN36TF U 1
AF RR2AN36JQ C 17
BS 1 687 RR2AN36TF
BS 688 688 RR2AN36JQ
BS 689 770 RR2AN36TF

RD RR2AN36TF 770 0 0
TCATGGCACCTAAGATGGCTCGCAGGGGAGGTAAGGATGAGCCTTTTGCATGGGAAAGCA
AGGAGTTTCTTAGGAAACTTTGCATTGGAAAGGAAGTTGCTTTCAAAGTGGATTACAAAG
TGGAAGCTATTGCTGGAAGAGAATTTGGCTCTGTTTTTCTAGGAAACCAGAATGTTGCAA
AGCTTGTTGTTCAAAATGGTTGGGCCAAGGTTAGGGATCCAGGTCAGAATAATCAGGGTA
AGGTTAGTCCTTACATTACAGAGCTGCTACAGCTCCAAGAGCAGTCTAACCAAGAAGGGT
TTGGTTGTTTTAGCAAGGTTCCTGGTGCTGCTGAGGCGTCTATCAGAGACCTTCCTCCTT
CTGCCATTGGAGACTCTGCAGGCTTTGATGCAATGGGGCTTTTAGCTGCCAACAAGGGCA
AGCCTATGGAAGGCATCGTTGAGCAAGTACGCGATGGAAGTACTATCCGTGTGTATCTTC
TTCCAGAGTTCCAGTTTGTACAAGTGTTCGTTGCTGGAATCCAGGTGAATTAAACTTCCT
TCTCTGTTTGACTATTTTAAACATTTTAAGAGCATCTCCAATGGTGTTACTACCATTGGA
GTCCTTAGGATTATAAAACTATTTTTTTTTTATTTTTAGAATAGTTAAGGACTCTAATCA
AAATAGAATGTCCAATGGTGTTTTCCA*TTTGGAATCCTTAGAAATAAAAAGTATTAAAT
TTGAAAACATGTAATCTGATCAAATGTGTATGATCAAATATGTATGGAAC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RR2AN36JQ 754 0 0
GGCTCGCAGGGGAGGTAAGGATGAGCCTTTTGCATGGGAAAGCAAGGAGTTTCTTAGGAA
ACTTTGCATTGGAAAGGAAGTTGCTTTCAAAGTGGATTACAAAGTGGAAGCTATTGCTGG
AAGAGAATTTGGCTCTGTTTTTCTAGGAAACCAGAATGTTGCAAAGCTTGTTGTTCAAAA
TGGTTGGGCCAAGGTTAGGGATCCAGGTCAGAATAATCAGGGTAAGGTTAGTCCTTACAT
TACAGAGCTGCTACAGCTCCAAGAGCAGTCTAACCAAGAAGGGTTTGGTTGTTTTAGCAA
GGTTCCTGGTGCTGCTGAGGCGTCTATCAGAGACCTTCCTCCTTCTGCCATTGGAGACTC
TGCAGGCTTTGATGCAATGGGGCTTTTAGCTGCCAACAAGGGCAAGCCTATGGAAGGCAT
CGTTGAGCAAGTACGCGATGGAAGTACTATCCGTGTGTATCTTCTTCCAGAGTTCCAGTT
TGTACAAGTGTTCGTTGCTGGAATCCAGGTGAATTAAACTTCCTTCTCTGTTTGACTATT
TTAAACATTTTAAGAGCATCTCCAATGGTGTTACTACCATTGGAGTCCTTAGGATTATAA
AACTATTTTTTTTTTATTTTTAGAATAGTTAAGGACTCTAATCAAAATAGAATGTCCAAT
GGTGTTTTCCAATTTGGAATCCTTAGAAATAAAAAGTATTAAATTTGAAAACATGTAATC
TGATCAAATGTGTATGATCAAATATGTATGGAAC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL7400Contig1 647 2 6 U
GACATATACGCTGTAACAAATCTATTGAATCTTGTGTATAAACATAGTTAAGAAGTGTGT
GAGCCGAGTGAATCAGAGTTATATCTAAAGCTATATAAATCACGGGAAAGATGAAAGACA
TTTGGTATCAGTAAAACCCAGAATCTGATAAGCAATCTGAAGCAGAGTTTGGAGCCAAAT
GCTAGGACCGAAAGAGAGAGAGAAAGAGGTCAGAGTATAGAGTAAGCACGAACTGCCTCA
ACCACAGGGGCTTGACACATGGGACATTTTCCTCCAGCTTCCACTAGCTTCTTTGCACAC
TTCTCGCAAGTGTTCATATGTCCGCATCTGTACAATAAGGAATCAATGTTACTCTCGCAG
CAAATGCAGCAGATCCCTTTCCTTACGTATTCCCATTTTGACTCGTAGCTCTCAGCCTCC
TTGGATGATGAACCTGATGAGCCTGCTGAGCGGTGCATCGCCGCAGAGACCTCTTGTCTT
ATAGACCGTTGTAGCTCGAGTTGCATTTCCATGCAAGCCTCCAGCATCCTCTGCAGGTTA
TCCATCCTTTGATGTATCCTTCCCATGTCGATCCTCAGATCGTTGATCGAGTCCCAATCC
ATTCCAATGCGTTCATGCATATCATGTGCCGGCCAGCTTGAATTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2DT19JQ U 1
AF RR2ET04JQ U 105
BS 1 553 RR2DT19JQ
BS 554 555 RR2ET04JQ
BS 556 635 RR2DT19JQ
BS 636 636 RR2ET04JQ
BS 637 643 RR2DT19JQ
BS 644 647 RR2ET04JQ

RD RR2DT19JQ 643 0 0
GACATATACGCTGTAACAAATCTATTGAATCTTGTGTATAAACATAGTTAAGAAGTGTGT
GAGCCGAGTGAATCAGAGTTATATCTAAAGCTATATAAATCACGGGAAAGATGAAAGACA
TTTGGTATCAGTAAAACCCAGAATCTGATAAGCAATCTGAAGCAGAGTTTGGAGCCAAAT
GCTAGGACCGAAAGAGAGAGAGAAAGAGGTCAGAGTATAGAGTAAGCACGAACTGCCTCA
ACCACAGGGGCTTGACACATGGGACATTTTCCTCCAGCTTCCACTAGCTTCTTTGCACAC
TTCTCGCAAGTGTTCATATGTCCGCATCTGTACAATAAGGAATCAATGTTACTCTCGCAG
CAAATGCAGCAGATCCCTTTCCTTACGTATTCCCATTTTGACTCGTAGCTCTCAGCCTCC
TTGGATGATGAACCTGATGAGCCTGCTGAGCGGTGCATCGCCGCAGAGACCTCTTGTCTT
ATAGACCGTTGTAGCTCGAGTTGCATTTCCATGCAAGCCTCCAGCATCCTCTGCAGGTTA
TCCATCCTTTGAT**ATCCTTCCCATGTCGATCCTCAGATCGTTGATCGAGTCCCAATCC
ATTCCAATGCGTTCATGCATATCATGTGCCGGCCATCTTGAAT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2ET04JQ 543 0 0
GGAAAGATGAAAGACATTTGGTATCAGTAAAACCCAGAATCTGATAAGCAATCTGAAGCA
GAGTTTGGAGCCAAATGCTAGGACCGAAAGAGAGAGAGAAAGAGGTCAGAGTATAGAGTA
AGCACGAACTGCCTCAACCACAGGGGCTTGACACATGGGACATTTTCCTCCAGCTTCCAC
TAGCTTCTTTGCACACTTCTCGCAAGTGTTCATATGTCCGCATCTGTACAATAAGGAATC
AATGTTACTCTCGCAGCAAATGCAGCAGATCCCTTTCCTTACGTATTCCCATTTTGACTC
GTAGCTCTCAGCCTCCTTGGATGATGAACCTGATGAGTCTGCTGAGCGGTGCATCGCCGC
AGAGACCTCTTGTCTTATAGACCGTTGTAGCTCGAGTTGCATTTCCATGCAAGCCTCCAG
CATCCTCTGCAGGTTATCCATCCTTTGATGTATCCTTCCCATGTCGATCCTCAGATCGTT
GATCGAGTCCCAATCCATTCCAATGCGTTCATGCATATCATGTGCCGGCCAGCTTGAATT
GGA

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL7401Contig1 267 2 1 U
GGTTGACGCAGGAGCTTCAAGGTATGGTTGTTGCTGTCCCTGAAGCTAAGCCTTGGGATA
TCCCGTAAGCCTTAGCTTTTATAAGTCTTTGCGTTATTGTTTGTTTTTTGCGTTCTGGTG
GTAATAAATCGCAGTACTTTGGCAGATGATTATGATGATTTCGAATCTGTAATTTTCATT
TTGAAACTTTATTGTAATGTTGGTGAAGAATTTGCTTTGTTTAGACGATGATTCCCTACT
TCATGTATGGATTTTGCAATTTCAATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BW59JQ C 1
AF RR2BW59TF U 1
BS 1 267 RR2BW59TF

RD RR2BW59JQ 267 0 0
GGTTGACGCAGGAGCTTCAAGGTATGGTTGTTGCTGTCCCTGAAGCTAAGCCTTGGGATA
TCCCGTAAGCCTTAGCTTTTATAAGTCTTTGCGTTATTGTTTGTTTTTTGCGTTCTGGTG
GTAATAAATCGCAGTACTTTGGCAGATGATTATGATGATTTCGAATCTGTAATTTTCATT
TTGAAACTTTATTGTAATGTTGGTGAAGAATTTGCTTTGTTTAGACGATGATTCCCTACT
TCATGTATGGATTTTGCAATTTCAATT

QA 1 267 1 267
DS 

RD RR2BW59TF 267 0 0
GGTTGACGCAGGAGCTTCAAGGTATGGTTGTTGCTGTCCCTGAAGCTAAGCCTTGGGATA
TCCCGTAAGCCTTAGCTTTTATAAGTCTTTGCGTTATTGTTTGTTTTTTGCGTTCTGGTG
GTAATAAATCGCAGTACTTTGGCAGATGATTATGATGATTTCGAATCTGTAATTTTCATT
TTGAAACTTTATTGTAATGTTGGTGAAGAATTTGCTTTGTTTAGACGATGATTCCCTACT
TCATGTATGGATTTTGCAATTTCAATT

QA 1 267 1 267
DS 



AS 1 2

CO CL7402Contig1 775 2 4 U
GGATGGTCATATCAAGTTGACAGATTTTGGGCTCTCCAAAGTTGGTCTCATCAACAGCAC
AGATGATCTGTCTGGTCCTGGGATATCTCTGCTTGATGAGGAGGAATCACGATTACCAAC
ATCCGAGCATCAGCTTGAAAGGCGCAAGAAACGGTCTGCTGTGGGTACTCCTGACTACTT
AGCGCCAGAAATTCTTTTAGGGACAGGACATGCTGCAACTGCGGATTGGTGGTCTGTTGG
AATCATTCTGTTTGAACTCATTGTGGGGATTCCACCTTTCAATGCTGAGCAACCTCAGCA
AATATTTGACAATATTCTCAATCGTAACATACCATGGCCTCATGTCCCGGAAGAAATGAG
TGCTGAAGCCCACGATATTATAGACCGATTTTTAACAGAAGACCCTCACCTGAGACTTGG
AGCTAGAGGGGCTGCTGAGGTCAAGCAGCACATCTTCTTTAAAGACATCAATTAGGATAC
ACCGTTCGATTTGGGCTTGTTTATGTGGATTTCAACGATGGATGTAAGAGAAAGCTGAAA
GATTCGGCTCGTTGGTTCAGCAATTTCTTAAAATAAAAGAAAAGAAATTGATGGGGACGG
TACTATATTTTTTTTTGTCAACGGAGACGGTACTATCCGTTTGGAAATAATAAGCAATAT
CCTAGTTTAAATTTTATAATAAGAAATAATACGGAATCCTAAGAATCGTGTTATTTTTAA
TTTTTATTATGTTTCTCTATTTAAAACTTTTACTTATATATAATTGAGTTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FQ30TF U 1
AF RR2FQ30JQ C 80
BS 1 599 RR2FQ30TF
BS 600 600 RR2FQ30JQ
BS 601 618 RR2FQ30TF
BS 619 775 RR2FQ30JQ

RD RR2FQ30TF 618 0 0
GGATGGTCATATCAAGTTGACAGATTTTGGGCTCTCCAAAGTTGGTCTCATCAACAGCAC
AGATGATCTGTCTGGTCCTGGGATATCTCTGCTTGATGAGGAGGAATCACGATTACCAAC
ATCCGAGCATCAGCTTGAAAGGCGCAAGAAACGGTCTGCTGTGGGTACTCCTGACTACTT
AGCGCCAGAAATTCTTTTAGGGACAGGACATGCTGCAACTGCGGATTGGTGGTCTGTTGG
AATCATTCTGTTTGAACTCATTGTGGGGATTCCACCTTTCAATGCTGAGCAACCTCAGCA
AATATTTGACAATATTCTCAATCGTAACATACCATGGCCTCATGTCCCGGAAGAAATGAG
TGCTGAAGCCCACGATATTATAGACCGATTTTTAACAGAAGACCCTCACCTGAGACTTGG
AGCTAGAGGGGCTGCTGAGGTCAAGCAGCACATCTTCTTTAAAGACATCAATTAGGATAC
ACCGTTCGATTTGGGCTTGTTTATGTGGATTTCAACGATGGATGTAAGAGAAAGCTGAAA
GATTCGGCTCGTTGGTTCAGCAATTTCTTAAAATAAAAGAAAAGAAATTGATGGGGACG*
TACTATATTTTTTTTTGT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RR2FQ30JQ 696 0 0
GGGATATCTCTGCTTGATGAGGAGGAATCACGATTACCAACATCCGAGCATCAGCTTGAA
AGGCGCAAGAAACGGTCTGCTGTGGGTACTCCTGACTACTTAGCGCCAGAAATTCTTTTA
GGGACAGGACATGCTGCAACTGCGGATTGGTGGTCTGTTGGAATCATTCTGTTTGAACTC
ATTGTGGGGATTCCCCCTTTCAATGCTGAGCAACCTCAGCAAATATTTGACAATATTTTC
AATCGTAACATACCATGGCCTCATGTCCCGGAAGAAATGAGTGCTGAAGCCCACGATATT
ATAGACCGATTTTTAACAGAAGACCCTCACCTGAGACTTGGAGCTAGAGGGGCTGCTGAG
GTCAAGCAGCACATTTTCTTTAAAGACATCAATTAGGATACACCGTTCGATTTGGGCTTG
TTTATGTGGATTTCAACGATGGATGTAAGAGAAAGCTGAAAGATTCGGCTCGTTGGTTCA
GCAATTTCTTAAAATAAAAGAAAAGAAATTGATGGGGACGGTACTATATTTTTTTTTGTC
AACGGAGACGGTACTATCCGTTTGGAAATAATAAGCAATATCCTAGTTTAAATTTTATAA
TAAGAAATAATACGGAATCCTAAGAATCGTGTTATTTTTAATTTTTATTATGTTTCTCTA
TTTAAAACTTTTACTTATATATAATTGAGTTTTTAC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL7403Contig1 748 2 9 U
GGAAATCCCCTCAAGTTCCCGAGATATTTGATCATACGGTGGGTATAGAGAAGACGAGAA
TGAGGAGAGTTTTCGGCGCGAAAAAGAACACAGAGCCTCCTCCCTCCATTCAGGATGCCT
CCGATCGGATAAATAAAAGAGGAGAATCAGTGGAAGAGAAGATAAAGAAGGCAGATGTTG
AGCTCTGCAAATACAGAGAACAGATTCAAAAGACGCGACCTGGCCCTGCTCAACAAGCTC
TCAAAGCTCGCGCTATGAGGCTTCTCAAGCAGAAGAAAATGTACGAAGGACAACGTGACA
TGCTCTATAATCAAACATTCAATCTCGATCAAGTCTCTTTCGCTGCTGAAGGCCTCAAAG
ACGCTCAACAAACTATGACAGCGCTAAAATCTGCGAACAAGGAGCTGAAAGGGATGATGA
AAACCGTTCAGATTCAAGATATCGATAATTTGCAAGATGAGATGATGGATCTGATGGATG
TGAGTTCTGAGATTCAAGAAACGCTTGGTAGGAGCTACAATGTTCCTGATGGTCTTGACG
AAGATGATCTCATGGGAGAGCTGGAGGCGCTTGAAGCTGATATGGGAGACGAGACAGAAG
CAGATGGAGTGCCTTCTTATCTCCAACCCGATAAGCATAGTGATTACGATGATGAACTTA
ACTTGCCTTCAGTACCCATAGACAGACTGGAGCTCCACCTGGTCGAGTTCACGCTGGGGA
TGAGTTTGGATTGCCCGCGGTACCACGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D391TF U 53
AF RR2H509TF U 1
BS 1 171 RR2H509TF
BS 172 172 RR2D391TF
BS 173 265 RR2H509TF
BS 266 266 RR2D391TF
BS 267 283 RR2H509TF
BS 284 284 RR2D391TF
BS 285 452 RR2H509TF
BS 453 453 RR2D391TF
BS 454 748 RR2H509TF

RD RR2D391TF 625 0 0
GCG
GAGAATGAGGAGAGTTTTCGGCGCGAAAAAGAACACAGAGCCTCCTCCCTCCATTCAGGA
TGCCTCCGATCGGATAAATAAGAGGGGAGAATCAGTGGAAGAGAAGATAAAGAAGGCTGA
TGTTGAGCTCTGCAAATACAGAGAACAGATTCAAAAGACGCGACCTGGTCCTGCTCAACA
AGCTCTCAAAGCTCGTGCTATGAGGCTTCTCAAGCAGAAGAAAATGTACGAAGGACAACG
TGACATGCTCTATAATCAAACATTCAATCTCGATCAAGTCTCTTTCGCTGCTGAAGGCCT
CAAAGACGCTCAACAAACTATGACGGCGCTAAAGTCTGCTAACAAGGAGCTGAAAGGGAT
GATGAAAACCGTTCAGATTCAAGATATCGATAATTTGCAAGGTGAGATGATGGATCTGAT
GGATGTGAGTTCTGAGATTCAAGATACGCTTGGTAGGAGCTACAATGTTCCTGATGGTCT
TGACGAAGATGATCTCATGGGAGAGCTGGAGGCTCTTGAAGCTGATATGGGAGACGAGAC
AGAAGCAGATGGAGTGCCTTCTTATCTCCAACCCGATAAGCATAGTGATTACGATGATGA
ACTTAACTTGCCTTCAGTACCC

QA 4 625 4 625
DS 

RD RR2H509TF 748 0 0
GGAAATCCCCTCAAGTTCCCGAGATATTTGATCATACGGTGGGTATAGAGAAGACGAGAA
TGAGGAGAGTTTTCGGCGCGAAAAAGAACACAGAGCCTCCTCCCTCCATTCAGGATGCCT
CCGATCGGATAAATAAAAGAGGAGAATCAGTGGAAGAGAAGATAAAGAAGGTAGATGTTG
AGCTCTGCAAATACAGAGAACAGATTCAAAAGACGCGACCTGGCCCTGCTCAACAAGCTC
TCAAAGCTCGCGCTATGAGGCTTCTTAAGCAGAAGAAAATGTATGAAGGACAACGTGACA
TGCTCTATAATCAAACATTCAATCTCGATCAAGTCTCTTTCGCTGCTGAAGGCCTCAAAG
ACGCTCAACAAACTATGACAGCGCTAAAATCTGCGAACAAGGAGCTGAAAGGGATGATGA
AAACCGTTCAGATTCAAGATATCGATAATTTGTAAGATGAGATGATGGATCTGATGGATG
TGAGTTCTGAGATTCAAGAAACGCTTGGTAGGAGCTACAATGTTCCTGATGGTCTTGACG
AAGATGATCTCATGGGAGAGCTGGAGGCGCTTGAAGCTGATATGGGAGACGAGACAGAAG
CAGATGGAGTGCCTTCTTATCTCCAACCCGATAAGCATAGTGATTACGATGATGAACTTA
ACTTGCCTTCAGTACCCATAGACAGACTGGAGCTCCACCTGGTCGAGTTCACGCTGGGGA
TGAGTTTGGATTGCCCGCGGTACCACGA

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL7404Contig1 525 2 1 U
GGACAGAGCAAAATTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTAA
TCGGAGTTCTCTTATAAACAATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACAA
ATAATTAATAATAATATGGGGATGTCTAAAAGTATCAAAGTTATTTTCTCTGTGGTTCTT
GTGGTGTTTTTGGCTCTTGCAGCAACCAAGATAGATGCAACATACCTAAGTTATCCTGCC
ATTATCGCGGGAGATCACATACACGGTTGCAGTAAACTACACCCGAAACTTTGCAAGAAG
AAGGAACCAGCCAATCCTTATAGGAGAGGTTGCGAGGCTAGCCAGCGCTGCCGTGGCTCT
CCCAACCAGAAAAAGTGAATCAATCAGAGCACCACTCTTGGATAATTTTACAAATCCAAT
CCCCATATTAATATCAGATGATTAATTTCATGTGTTTGTTATTCATACTTTGTTATTGCT
TATGTAACTGATTGTTACCCTATTATTTATGATGATCAATAAAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EJ63JQ C 1
AF RR2EJ63TF U 1
BS 1 525 RR2EJ63TF

RD RR2EJ63JQ 525 0 0
GGACAGAGCAAAATTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTAA
TCGGAGTTCTCTTATAAACAATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACAA
ATAATTAATAATAATATGGGGATGTCTAAAAGTATCAAAGTTATTTTCTCTGTGGTTCTT
GTGGTGTTTTTGGCTCTTGCAGCAACCAAGATAGATGCAACATACCTAAGTTATCCTGCC
ATTATCGCGGGAGATCACATACACGGTTGCAGTAAACTACACCCGAAACTTTGCAAGAAG
AAGGAACCAGCCAATCCTTATAGGAGAGGTTGCGAGGCTAGCCAGCGCTGCCGTGGCTCT
CCCAACCAGAAAAAGTGAATCAATCAGAGCACCACTCTTGGATAATTTTACAAATCCAAT
CCCCATATTAATATCAGATGATTAATTTCATGTGTTTGTTATTCATACTTTGTTATTGCT
TATGTAACTGATTGTTACCCTATTATTTATGATGATCAATAAAAT

QA 1 525 1 525
DS 

RD RR2EJ63TF 525 0 0
GGACAGAGCAAAATTCAAATACAATTAAATCATATAAATACAAAATAATTGAGCTCCTAA
TCGGAGTTCTCTTATAAACAATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACAA
ATAATTAATAATAATATGGGGATGTCTAAAAGTATCAAAGTTATTTTCTCTGTGGTTCTT
GTGGTGTTTTTGGCTCTTGCAGCAACCAAGATAGATGCAACATACCTAAGTTATCCTGCC
ATTATCGCGGGAGATCACATACACGGTTGCAGTAAACTACACCCGAAACTTTGCAAGAAG
AAGGAACCAGCCAATCCTTATAGGAGAGGTTGCGAGGCTAGCCAGCGCTGCCGTGGCTCT
CCCAACCAGAAAAAGTGAATCAATCAGAGCACCACTCTTGGATAATTTTACAAATCCAAT
CCCCATATTAATATCAGATGATTAATTTCATGTGTTTGTTATTCATACTTTGTTATTGCT
TATGTAACTGATTGTTACCCTATTATTTATGATGATCAATAAAAT

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 2

CO CL7405Contig1 1313 2 10 U
GGAAGCAAGCAAGCATCCCGTGTTTCACTCCTCTCTCTCTATCTCTCTCTATTCTCGCTT
CATTGTCTCTGCGTGTGATTAAACAAAAAAACGGTTGGTGAATCCTTTCCATGGATTCCC
TCCGATTTCTTCGGATTCTTCTCGTTTCGTCTTCGATCCTACTCGTCTATCTCCTTTCTA
CTGCCACCGCTGGTGATATTGTTCATCAGGACGATTTAGCTCCGAAGAAGCCTGGTTGCG
AAAACGACTTCGTTTTGGTTAAAGTTCAAACTTGGATTGATGGTACTGAAGATGCGGAGT
TTGTTGGCGTCGGTGCTAGATTTGGGAGGCGGATTGTCTCCAAGGAGAAGAACGCTAACC
AGACCCACGTTGTTTTCGCTAATCCTCGTGATTGTTGTTCACCGCTCAAGACTAAGCTTA
TTGGAGATGTTGTGATAGTGGACCGGGGCAACTGTCGGTTCACTGCTAAGGCTAATAACG
CGGAAGCTGCTGGTGCCTCTGCTCTCCTTATCATTAATAACCAGAAAGAGCTTTACAAAA
TGGTTTGTGAGCCGGATGAGACGGATTTAGACATTCAGATTCCTGCCGTCATGCTCCCGC
AAGACGCTGGTGCAACCTTGGAAAAAATGCTTATCAACAGTTCTAAAGTGTCGGTGCAGC
TTTACTCCCCAAGACGACCAGCTGTTGATGTAGCCGAAGTCTCTTTGTGGTTAATGGCTA
TTGGGACCATCTTGTGTGTATCTTATTGGTCTGCATGGAGTGCCCGAGAGGCTGCTATTG
AACATGATAAGCTACTCAAGGATGCTATAGACGAAACGCCTAGCACAAATGATGGGGGTA
GCGGTGTCGTTGAGATCAATACTCTTTCAGCTATTTGTTTCGTGTTTCTTGCTTCCGGCT
TCCTGGTGGTTCTTTACAAGCTCATGTCTTATTGGTTTGTGGAGCTTCTTGTGGTTGTTT
TCTGCATTGGTGGTGTTGAGGGTTTGCAAACTTGCCTTGTCGCTTTGCTATCAAGAGTGT
TTTGAGTAATGAGACGACCTCACGAATTAATGGATACAAGATATATAAAAAGCCTTTCGG
GTTTGTAACCAATGTAACGTAAGCTGTAAGATTCTTATCCTCTCCAGTCCTCTTTAATTT
ATGTTTGCATCGTCATCATTGAAGAAGAATCCACGATCGTTCTGTGTCTATATGGTTTGT
TTCTTTTGTAAGAGAAGTGTTGTATATACACATAGTACAAACATGTTTAAGCTATCAATA
TCATCATTGTGTTGGACGATTTTGTAATCTAATTAATCATTATTATCTTGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU63TF U 1
AF RR2FU63JQ C 519
BS 1 626 RR2FU63TF
BS 627 627 RR2FU63JQ
BS 628 697 RR2FU63TF
BS 698 698 RR2FU63JQ
BS 699 770 RR2FU63TF
BS 771 771 RR2FU63JQ
BS 772 781 RR2FU63TF
BS 782 782 RR2FU63JQ
BS 783 791 RR2FU63TF
BS 792 1313 RR2FU63JQ

RD RR2FU63TF 791 0 0
GGAAGCAAGCAAGCATCCCGTGTTTCACTCCTCTCTCTCTATCTCTCTCTATTCTCGCTT
CATTGTCTCTGCGTGTGATTAAACAAAAAAACGGTTGGTGAATCCTTTCCATGGATTCCC
TCCGATTTCTTCGGATTCTTCTCGTTTCGTCTTCGATCCTACTCGTCTATCTCCTTTCTA
CTGCCACCGCTGGTGATATTGTTCATCAGGACGATTTAGCTCCGAAGAAGCCTGGTTGCG
AAAACGACTTCGTTTTGGTTAAAGTTCAAACTTGGATTGATGGTACTGAAGATGCGGAGT
TTGTTGGCGTCGGTGCTAGATTTGGGAGGCGGATTGTCTCCAAGGAGAAGAACGCTAACC
AGACCCACGTTGTTTTCGCTAATCCTCGTGATTGTTGTTCACCGCTCAAGACTAAGCTTA
TTGGAGATGTTGTGATAGTGGACCGGGGCAACTGTCGGTTCACTGCTAAGGCTAATAACG
CGGAAGCTGCTGGTGCCTCTGCTCTCCTTATCATTAATAACCAGAAAGAGCTTTACAAAA
TGGTTTGTGAGCCGGATGAGACGGATTTAGACATTCAGATTCCTGCCGTCATGCTCCCGC
AAGACGCTGGTGCAACCTTGGAAAAA*TGCTTATCAACAGTTCTAAAGTGTCGGTGCAGC
TTTACTCCCCAAGACGACCAGCTGTTGATGTAGCCGA*GTCTCTTTGTGGTTAATGGCTA
TTGGGACCATCTTGTGTGTATCTTATTGGTCTGCATGGAGTGCCCGAGAG*CTGCTATTG
A*CATGATAAG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RR2FU63JQ 795 0 0
AACCAGAAAGAGCTTTACAAAATGGTTTGTGAGCCGGATGAGACGGATTTAGACATTCAG
ATTCCTGCCGTCATGCTCCCGCAAGACGCTGGTGCAACCTTGGAAAAAATGCTTATCAAC
AGTTCTAAAGTGTCGGTGCAGCTTTACTCCCCAAGACGACCAGCTGTTGATGTAGCCGAA
GTCTCTTTGTGGTTAATGGCTATTGGGACCATCTTGTGTGTATCTTATTGGTCTGCATGG
AGTGCCCGAGAGGCTGCTATTGAACATGATAAGCTACTCAAGGATGCTATAGACGAAACG
CCTAGCACAAATGATGGGGGTAGCGGTGTCGTTGAGATCAATACTCTTTCAGCTATTTGT
TTCGTGTTTCTTGCTTCCGGCTTCCTGGTGGTTCTTTACAAGCTCATGTCTTATTGGTTT
GTGGAGCTTCTTGTGGTTGTTTTCTGCATTGGTGGTGTTGAGGGTTTGCAAACTTGCCTT
GTCGCTTTGCTATCAAGAGTGTTTTGAGTAATGAGACGACCTCACGAATTAATGGATACA
AGATATATAAAAAGCCTTTCGGGTTTGTAACCAATGTAACGTAAGCTGTAAGATTCTTAT
CCTCTCCAGTCCTCTTTAATTTATGTTTGCATCGTCATCATTGAAGAAGAATCCACGATC
GTTCTGTGTCTATATGGTTTGTTTCTTTTGTAAGAGAAGTGTTGTATATACACATAGTAC
AAACATGTTTAAGCTATCAATATCATCATTGTGTTGGACGATTTTGTAATCTAATTAATC
ATTATTATCTTGCCG

QA 1 795 1 795
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7407Contig1 819 2 2 U
GGAAAGCAAAGGGCCCCCTCCTAAACTTCCAATCTCATCTCTCCAACATCCGCGGAAACA
AACCCTAATCAACGACGATGATGCTCAGGCAAGCTGCGAAGAACGCTCTAGGCCTTACGT
CGCGCCAATCGACCCCGTGGTCCGTCGGTATCTTCCGATCATACCACGAGAACGTCATCG
ACCACTACGATAACCCCCGCAACGTCGGGTCTTTCGACAGGAACGATCCCAGCATCGGCA
CGGGTCTCGTCGGAGCTCCCGCGTGCGGCGATGTGATGAAGCTTCAGATCAAGGTCGATG
AGAAGACCGGTCAGATCGTCGATGCTCGTTTCAAGACCTTTGGTTGTGGCTACGCTATCG
CCTCTTCGTCTGTCGCCACTGAATGGGTGAAAGGCAAAGCTATGGAGGAAGTTCTGACCA
TCAAGAACACCGAAATCGCCAAGCATCTTTCTCTCCCACCAGTGAAGCTCCATTGCAGTA
TGCTAGCCGAGGACGCCATCAAGGCAGCTGTCAAAGACTACAAGGAGAAGCGAGTGAAAA
CAAACGGTGCTGCAGCAGCAGCAGCTGGAGAAACCGCGTAGGCTTGATTCCTTCTGCTAA
TGTTTATACCATAATGTGTATATGATGGTACAAACAGGGGAGATGTGTAGAAGAGGATTA
CGTACAACCTATATGGTATAATTCTCTAAAGGGTCAAGTCTAGGAAGTATTATGAATAAA
CTCTGTTTGACAAATACATTTGGGATGTAAGCTGTTTGATGTTTTGTTATGTTTTTTCCT
TGCTTCGTGAGATTTATTATCTATTAAAGACAAGTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CN84TF U 1
AF RR2CN84JQ C 147
BS 1 671 RR2CN84TF
BS 672 819 RR2CN84JQ

RD RR2CN84TF 671 0 0
GGAAAGCAAAGGGCCCCCTCCTAAACTTCCAATCTCATCTCTCCAACATCCGCGGAAACA
AACCCTAATCAACGACGATGATGCTCAGGCAAGCTGCGAAGAACGCTCTAGGCCTTACGT
CGCGCCAATCGACCCCGTGGTCCGTCGGTATCTTCCGATCATACCACGAGAACGTCATCG
ACCACTACGATAACCCCCGCAACGTCGGGTCTTTCGACAGGAACGATCCCAGCATCGGCA
CGGGTCTCGTCGGAGCTCCCGCGTGCGGCGATGTGATGAAGCTTCAGATCAAGGTCGATG
AGAAGACCGGTCAGATCGTCGATGCTCGTTTCAAGACCTTTGGTTGTGGCTACGCTATCG
CCTCTTCGTCTGTCGCCACTGAATGGGTGAAAGGCAAAGCTATGGAGGAAGTTCTGACCA
TCAAGAACACCGAAATCGCCAAGCATCTTTCTCTCCCACCAGTGAAGCTCCATTGCAGTA
TGCTAGCCGAGGACGCCATCAAGGCAGCTGTCAAAGACTACAAGGAGAAGCGAGTGAAAA
CAAACGGTGCTGCAGCAGCAGCAGCTGGAGAAACCGCGTAGGCTTGATTCCTTCTGCTAA
TGTTTATACCATAATGTGTATATGATGGTACAAACAGGGGAGATGTGTAGAAGAGGATTA
CGTACAACCTA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RR2CN84JQ 673 0 0
GGTATCTTCCGATCATACCACGAGAACGTCATCGACCACTACGATAACCCCCGCAACGTC
GGGTCTTTCGACAGGAACGATCCCAGCATCGGCACGGGTCTCGTCGGAGCTCCCGCGTGC
GGCGATGTGATGAAGCTTCAGATCAAGGTCGATGAGAAGACCGGTCAGATCGTCGATGCT
CGTTTCAAGACCTTTGGTTGTGGCTACGCTATCGCCTCTTCGTCTGTCGCCACTGAATGG
GTGAAAGGCAAAGCTATGGAGGAAGTTCTGACCATCAAGAACACCGAAATCGCCAAGCAT
CTTTCTCTCCCACCAGTGAAGCTCCATTGCAGTATGCTAGCCGAGGACGCCATCAAGGCA
GCTGTCAAAGACTACAAGGAGAAGCGAGTGAAAACAAACGGTGCTGCAGCAGCAGCAGCT
GGAGAAACCGCGTAGGCTTGATTCCTTCTGCTAATGTTTATACCATAATGTGTATATGAT
GGTACAAACAGGGGAGATGTGTAGAAGAGGATTACGTACAACCTATATGGTATAATTCTC
TAAAGGGTCAAGTCTAGGAAGTATTATGAATAAACTCTGTTTGACAAATACATTTGGGAT
GTAAGCTGTTTGATGTTTTGTTATGTTTTTTCCTTGCTTCGTGAGATTTATTATCTATTA
AAGACAAGTCTAC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7409Contig1 532 2 2 U
GGAACTCGAACAACAAAACTGTAGGGTTCCTCCTCCTCCTCCTTTTGGGTCTAGATCCTC
TTCCCTCTCGATTAGTTTACAGGTTCCGACAGACTTTACGACATGGCAGAAGATGAAGTT
GTTGATCCAAAGAAGTACCTTGAGGAATCTTGCAATCCAAAATGTGTCAAGCCACTAATC
GAATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCTGGCCAAAAGCATTGCACT
GGGCAGTACTTCGACTATTGGCAGTGCATTGACAAATGTGTTGCACCCAAGCTATTTACA
AAACTGAAATGAAACAAGGCGAAGCTGGAGTTGAAATTGTCTTTCAGATGAAGGAATGTA
TAAAACGCAGTTGATATTGAACTTTTTTTTTTCAACTGCAACCCTGAATAATGCAAAATG
GCTCTGCTTCTCGTTTTTATTATTTTTTTTGCCCAAGACATTGTTTACTGTTTCTTCTTT
TGAAGTAATGGCATGCATAATAATAAGTAATAACAAGAATTTGTTACGTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2E740JQ C 1
AF RR2E740TF U 1
BS 1 529 RR2E740TF
BS 530 532 RR2E740JQ

RD RR2E740JQ 532 0 0
GGAACTCGAACAACAAAACTGTAGGGTTCCTCCTCCTCCTCCTTTTGGGTCTAGATCCTC
TTCCCTCTCGATTAGTTTACAGGTTCCGACAGACTTTACGACATGGCAGAAGATGAAGTT
GTTGATCCAAAGAAGTACCTTGAGGAATCTTGCAATCCAAAATGTGTCAAGCCACTAATC
GAATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCTGGCCAAAAGCATTGCACT
GGGCAGTACTTCGACTATTGGCAGTGCATTGACAAATGTGTTGCACCCAAGCTATTTACA
AAACTGAAATGAAACAAGGCGAAGCTGGAGTTGAAATTGTCTTTCAGATGAAGGAATGTA
TAAAACGCAGTTGATATTGAACTTTTTTTTTTCAACTGCAACCCTGAATAATGCAAAATG
GCTTTGCTTCTCGTTTTTATTATTTTTTTTGCCCAAGACATTGTTTACTGTTTCTTCTTT
TGAAGTAATGGCATGCATAATAATAAGTAATAACAAGAATTTGTTACGTTTG

QA 1 532 1 532
DS 

RD RR2E740TF 532 0 0
GGAACTCGAACAACAAAACTGTAGGGTTCCTCCTCCTCCTCCTTTTGGGTCTAGATCCTC
TTCCCTCTCGATTAGTTTACAGGTTCCGACAGACTTTACGACATGGCAGAAGATGAAGTT
GTTGATCCAAAGAAGTACCTTGAGGAATCTTGCAATCCAAAATGTGTCAAGCCACTAATC
GAATATCAGGCGTGTGTGAAGAGAATCCAAGGTGATGACTCTGGCCAAAAGCATTGCACT
GGGCAGTACTTCGACTATTGGCAGTGCATTGACAAATGTGTTGCACCCAAGCTATTTACA
AAACTGAAATGAAACAAGGCGAAGCTGGAGTTGAAATTGTCTTTCAGATGAAGGAATGTA
TAAAACGCAGTTGATATTGAACTTTTTTTTTTCAACTGCAACCCTGAATAATGCAAAATG
GCTCTGCTTCTCGTTTTTATTATTTTTTTTGCCCAAGACATTGTTTACTGTTTCTTCTTT
TGAAGTAATGGCATGCATAATAATAAGTAATAACAAGAATTTGTTACGT
CTG

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL7410Contig1 825 2 4 U
GGAAATCAAGCATGGCCGGCATCAAAGTTCACGGAGTTCCCATATCCACGACCACAATGC
GCGTTCTCGCTACTCTTTACGAGAAGGGTCTCGATTTCGAGTTAGTCCCCGTCGACATGA
AAGGCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTCTTATTTCTCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTG
CTCTCCTAGACGGTGATTTGACGCTTTTCGAGTCAAGAGCCATCACAGAGTACATAGCAG
AGGAGTACAGCGACAAAGGCGAGAAGCTTCTCTGCCAAGGCTGCAAGAAACTGAAGGCCA
TCACAAAGGTGTGGCTTCAAGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCTAAGTTAG
CCTACGAGCGTGTCTTCAAAGGTATGCTTGGCATGACCACTGATCCAGCCGCTGCGGAAG
AGCTCGAAGCTAAGTTGGTCAAGGTCTTGGATATCTACGAGGCCAGGCTCTCCAAATCCC
CCTTCTTGGCTGGTGATTGCTTCACTCTGGCTGATCTCCACCGCCTCCCAATCATCTATT
ACTTGATGGGCACCGAATCCAAGAAGCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAGGTTAGCGAGTGGA
TCAAGAAGATCACTGCAAGGCCTGCTTGGGTTAAGGTTCTTAACCTCCAAAAGAAGTGAC
ATGGTGCTTTTGTAACATCCCTGAGATATTTTCCTTGGTTTGACATAAATGATTTGTTCC
TTGTTGCTTAATTATCATTATTATTAGGTTATGTACCTCTTACTCTCTTTTCTCTTTGGT
GTTATGTGTTTGCTGTGCAATAAAAACAACGAAGATCATGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES81TF U 1
AF RR2ES81JQ C 169
BS 1 749 RR2ES81TF
BS 750 750 RR2ES81JQ
BS 751 772 RR2ES81TF
BS 773 825 RR2ES81JQ

RD RR2ES81TF 772 0 0
GGAAATCAAGCATGGCCGGCATCAAAGTTCACGGAGTTCCCATATCCACGACCACAATGC
GCGTTCTCGCTACTCTTTACGAGAAGGGTCTCGATTTCGAGTTAGTCCCCGTCGACATGA
AAGGCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTCTTATTTCTCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTG
CTCTCCTAGACGGTGATTTGACGCTTTTCGAGTCAAGAGCCATCACAGAGTACATAGCAG
AGGAGTACAGCGACAAAGGCGAGAAGCTTCTCTGCCAAGGCTGCAAGAAACTGAAGGCCA
TCACAAAGGTGTGGCTTCAAGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCTAAGTTAG
CCTACGAGCGTGTCTTCAAAGGTATGCTTGGCATGACCACTGATCCAGCCGCTGCGGAAG
AGCTCGAAGCTAAGTTGGTCAAGGTCTTGGATATCTACGAGGCCAGGCTCTCCAAATCCC
CCTTCTTGGCTGGTGATTGCTTCACTCTGGCTGATCTCCACCGCCTCCCAATCATCTATT
ACTTGATGGGCACCGAATCCAAGAAGCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAGGTTAGCGAGTGGA
TCAAGAAGATCACTGCAAGGCCTGCTTGGGTTAAGGTTCTTAACCTCCAAAAGAAGTGAC
ATGGTGCTTTTGTAACATCCCTGAGATATTTTCCTTGGTTTGACATAAATGATTTGTTCC
TTGTTGCTTAATTATCATTATTATTAGGT*ATGTACCTCTTACTCTCTTTTC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2ES81JQ 657 0 0
GTCAAATCCCTGCTCTCCTAGACGGTGATTTGACGCTTTTCGAGTCAAGAGCCATCACAG
AGTACATAGCAGAGGAGTACAGCGACAAAGGCGAGAAGCTTCTCTGCCAAGGCTGCAAGA
AACTGAAGGCCATCACAAAGGTGTGGCTTCAAGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCG
CCTCTAAGTTAGCCTACGAGCGTGTCTTCAAAGGTATGCTTGGCATGACCACTGATCCAG
CCGCTGCGGAAGAGCTCGAAGCTAAGTTGGTCAAGGTCTTGGATATCTACGAGGCCAGGC
TCTCCAAATCCCCCTTCTTGGCTGGTGATTGCTTCACTCTGGCTGATCTCCACCGCCTCC
CAATCATCTATTACTTGATGGGCACCGAATCCAAGAAGCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAGG
TTAGCGAGTGGATCAAGAAGATCACTGCAAGGCCTGCTTGGGTTAAGGTTCTTAACCTCC
AAAAGAAGTGACATGGTGCTTTTGTAACATCCCTGAGATATTTTCCTTGGTTTGACATAA
ATGATTTGTTCCTTGTTGCTTAATTATCATTATTATTAGGTTATGTACCTCTTACTCTCT
TTTCTCTTTGGTGTTATGTGTTTGCTGTGCAATAAAAACAACGAAGATCATGTATCC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL7411Contig1 658 2 2 U
TAGAAGAGACCTCCATTTCCCCCAAAAAGACCCGGCGGCGAAGATGAAGTACAACCCAAG
AGTCACCTCCTCCCGCAGGAAGAACCGCAAGGCCCACTTCACAGCCTCGTCGAGCGAGAG
ACGCGTCATCATGAGCTCGCCTCTCTCCACCGACCTCCGCGCCAAGTACAACGTCAGATC
CATGCCCATCCGCAAGGACGACGAGGTCCAGATCGTCCGCGGGACCTACAAGGGCCGCGA
GGGAAAGGTCGTCCAGGTGTACCGTCGCAAGTGGGTCATCCACATCGAGAGGATCACGAG
GGAGAAGGTGAACGGGACGACGGTGAACGTCGGCGTTCAGCCGTCGAAGGTTGTGATAAC
GAAGCTGAGGTTGGACAAGGACAGGAAGTCGCTTTTGGAGAGGAAGGCCAAGGGACGTGC
CGCCGCGGATAAGGACAAGGGGACCAAGTTCACCGCTGAGGATGTTATGCAGAACGTTGA
TTAAACAAAAAGGTTTTTAATCTTTTAGTTTTAATCGTTAAGGGTACTGTTTTGTCTTTG
GTGGAATGTTTTATTTATGTTGCGGACATGAGAAGGATCATTTCAGTTTCGATTATGAGT
TTGACTCTTTAGCCATTTATATATTGCTTTTATAGTTTTATATATGAATGTTTGCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2B269TF U 1
AF RR2B269JQ C 126
BS 1 655 RR2B269TF
BS 656 658 RR2B269JQ

RD RR2B269TF 655 0 0
TAGAAGAGACCTCCATTTCCCCCAAAAAGACCCGGCGGCGAAGATGAAGTACAACCCAAG
AGTCACCTCCTCCCGCAGGAAGAACCGCAAGGCCCACTTCACAGCCTCGTCGAGCGAGAG
ACGCGTCATCATGAGCTCGCCTCTCTCCACCGACCTCCGCGCCAAGTACAACGTCAGATC
CATGCCCATCCGCAAGGACGACGAGGTCCAGATCGTCCGCGGGACCTACAAGGGCCGCGA
GGGAAAGGTCGTCCAGGTGTACCGTCGCAAGTGGGTCATCCACATCGAGAGGATCACGAG
GGAGAAGGTGAACGGGACGACGGTGAACGTCGGCGTTCAGCCGTCGAAGGTTGTGATAAC
GAAGCTGAGGTTGGACAAGGACAGGAAGTCGCTTTTGGAGAGGAAGGCCAAGGGACGTGC
CGCCGCGGATAAGGACAAGGGGACCAAGTTCACCGCTGAGGATGTTATGCAGAACGTTGA
TTAAACAAAAAGGTTTTTAATCTTTTAGTTTTAATCGTTAAGGGTACTGTTTTGTCTTTG
GTGGAATGTTTTATTTATGTTGCGGACATGAGAAGGATCATTTCAGTTTCGATTATGAGT
TTGACTCTTTAGCCATTTATATATTGCTTTTATAGTTTTATATATGAATGTTTGC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2B269JQ 533 0 0
TCATCATGAGCTCGCCTCTCTCCACCGACCTCCGCGCCAAGTACAACGTCAGATCCATGC
CCATCCGCAAGGACGACGAGGTCCAGATCGTCCGCGGGACCTACAAGGGCCGCGAGGGAA
AGGTCGTCCAGGTGTACCGTCGCAAGTGGGTCATCCACATCGAGAGGATCACGAGGGAGA
AGGTGAACGGGACGACGGTGAACGTCGGCGTTCAGCCGTCGAAGGTTGTGATAACGAAGC
TGAGGTTGGACAAGGACAGGAAGTCGCTTTTGGAGAGGAAGGCCAAGGGACGTGCCGCCG
CGGATAAGGACAAGGGGACCAAGTTCACCGCTGAGGATGTTATGCAGAACGTTGATTAAA
CAAAAAGGTTTTTAATCTTTTAGTTTTAATCGTTAAGGGTACTGTTTTGTTTTTGGTGGA
ATGTTTTATTTATGTTGCGGACATGAGAAGGATCATTTCAGTTTCGATTATGAGTTTGAC
TCTTTAGCCATTTATATATTGCTTTTATAGTTTTATATATGAATGTTTGCTTT

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 2

CO CL7412Contig1 874 2 4 U
GGAAAACGAAGGAGAAGAGAAGAAACAGCGAAAATGGCTTCCCTGAGGTCTCCACTGCAT
CTGATCATCCTCTTCATCTACGCTGTTGCTATCTCATCATCGTTTCTCGCCGTCAGTTCA
CACGAACAGAACAACGGAGATAAAGAGATGAGAAGAAGCGGCGGCGGTGGGCGTAGGCTC
CTTCTAGGTTTCAAAGAGACTCCAAAAGGAAGCAACGTCACCTTCGAGTGCTCTCCTTCA
GGTCCTTGCGTCTCCTGCAATTCCTCCGAAAAGAGAAAAGAGAAGTATCGTTGTAGTGAA
ACTGGTTATCGGATTCCTTTCAAATGTAGAGAGGTGATGAGAGGAGAGGAAGCTTCTTCA
CACAAGAAAGACGTTGAAGAGACGCAACAAAATGATCAATCTAATGCCAGTAATAATGAT
GACGAAGAAGTTGTTGATGCATCATCTGTGAAACAGAGGAACCTGCGTGATGACACTTCA
CCAGCGTCCAAAGCTAAGAAGTCTCAGTCTTACAAAACTTACAGAAGCTGTGTCCCTTCT
GCGGATGAGAAGAGAGTTTCGGTTCTTGGTTTCGAGGCGGTTATGCTAGGACTGTTACTC
GTGAGTGGATCCGCTGTATATTACAGAAAGAAACAGACAGTACCGATGGCCAGCGTATCC
AGTGGAAGATCACAGAGCAATTCCCGGTTTTAAGAGAAAACCTTTTTTTCGATTTATGTA
AAAGCTTTCAACGTTTCTTTTTCATTGTTGCGAGAAACAGAGATATTACTACGAGTGTAT
AGAATATAAGCTTTTAGGGGCTTTGATATAACTGGATACTTACTTGTTTATGAGATCAAT
TCCCATTTGAAAAAGATGTTTATCACTTGCCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H584TF U 1
AF RR2H584JQB C 470
BS 1 549 RR2H584TF
BS 550 550 RR2H584JQB
BS 551 572 RR2H584TF
BS 573 874 RR2H584JQB

RD RR2H584TF 572 0 0
GGAAAACGAAGGAGAAGAGAAGAAACAGCGAAAATGGCTTCCCTGAGGTCTCCACTGCAT
CTGATCATCCTCTTCATCTACGCTGTTGCTATCTCATCATCGTTTCTCGCCGTCAGTTCA
CACGAACAGAACAACGGAGATAAAGAGATGAGAAGAAGCGGCGGCGGTGGGCGTAGGCTC
CTTCTAGGTTTCAAAGAGACTCCAAAAGGAAGCAACGTCACCTTCGAGTGCTCTCCTTCA
GGTCCTTGCGTCTCCTGCAATTCCTCCGAAAAGAGAAAAGAGAAGTATCGTTGTAGTGAA
ACTGGTTATCGGATTCCTTTCAAATGTAGAGAGGTGATGAGAGGAGAGGAAGCTTCTTCA
CACAAGAAAGACGTTGAAGAGACGCAACAAAATGATCAATCTAATGCCAGTAATAATGAT
GACGAAGAAGTTGTTGATGCATCATCTGTGAAACAGAGGAACCTGCGTGATGACACTTCA
CCAGCGTCCAAAGCTAAGAAGTCTCAGTCTTACAAAACTTACAGAAGCTGTGTCCCTTCT
GCGGATGAGGAGAGAGTTTCGGTTCTTGGTTT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2H584JQB 405 0 0
ATGACACTTCACCAGCGTCCAAAGCTAAGAAGTCTCAGTCTTACAAAACTTACAGAAGCT
GTGTCCCTTCTGCGGATGAGAAGAGAGTTTCGGTTCTTGGTTTCGAGGCGGTTATGCTAG
GACTGTTACTCGTGAGTGGATCCGCTGTATATTACAGAAAGAAACAGACAGTACCGATGG
CCAGCGTATCCAGTGGAAGATCACAGAGCAATTCCCGGTTTTAAGAGAAAACCTTTTTTT
CGATTTATGTAAAAGCTTTCAACGTTTCTTTTTCATTGTTGCGAGAAACAGAGATATTAC
TACGAGTGTATAGAATATAAGCTTTTAGGGGCTTTGATATAACTGGATACTTACTTGTTT
ATGAGATCAATTCCCATTTGAAAAAGATGTTTATCACTTGCCTTT

QA 1 405 1 405
DS 



AS 1 2

CO CL7413Contig1 1244 2 8 U
GGACACAATTCACCAAAAACTTGAAAAGTGTTTTAAGAGAGAAAAAGAATCAAAGAGACT
CACGGAAATGGAGAATGCAGTAGCGAAACAGAGCATCCCTCTCCTCACTCCCTACAAGAT
GGGAAGATTCAATCTCTCCCACAGGGTTGTTCTGGCACCACTGACGAGACAGAGATCATA
CGGAAACGTTCCTCAGCCTCACGCTGTCTTGTACTACTCTCAGAGAACGAGCCCAGGAGG
GTTTCTTGTCACTGAAGCTACAGGAGTTTCAGACACAGCTCAAGGCTATCAAGATACGCC
TGGGATATGGACTAAAGAGCATGTGGAGGCATGGAAGCCAATTGTGGATGCTGTTCATGC
CAAAGGTGGTGTATTCTTCTGTCAAATCTGGCATGTTGGCCGTGTCTCTAACCGAGGTTT
TCAACCAAATGGGCAAGCTCCCATCTCTTGTTCAGACAAGCCATTGATGCCTCAAATCCG
CTCTAATGGCATCGATGAAGCCATGTTCACCCCTCCAAGACGGTTAACTACTGAAGAAAT
ACCCAGCATTGTCAACGACTTTAGGCTCGCAGCAAGAAACGCCATGGAAGCTGGCTTTGA
TGGAGTTGAGATTCATGGTGCTAATGGCTATCTGATAGACCAGTTCATGAAAGATACTGT
GAATGACAGAACAGATGAATACAGTAGATCTTTACAAAACCGTTGCAAATTTGCTTTAGA
CATAGTTGAAGCAGGGGCTAACGAGATAGGACCAGACCGTGTTGGCATCAGGCTCTCTCC
CTTTGCTGACTACATGGAGTCAGCAGACACTAACCCACAAGCGTTAGCCCTTCACATGGG
TGAATCTTTAAACAAATACGGGATCCTCTACTGTCATGTGATAGAGCCAAGAATGAAAAC
AATGGGAGAGATAACGGAGTGTCCTCACTTGCTAGTGCCGATGAGGAAAGCCTTTCAGGG
GACTTTCATTTCAGCGGGAGGTTACACGAGGAAAGATGGGAATGAGGCAGTGGCAGAGGG
ACGGACCGATCTTGTGGCTTATGGTCGGTGGTTTCTAGCGAACCCTGATCTGCCTAAGAG
GTTTGAAGTGGATGCAGAGCTGAATAAATATGATAGGCCAACGTTTTACATTTCTGATCC
TGTCGTGGGTTATACGGATTACCCTTTTCTTGAATCAATAGCTTAGACATTGTCATTAAT
AATGTTAATGTGCGTTCCTCTTTCATATAATAAGTTTATCTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV54TF U 1
AF RR2EV54JQ C 635
BS 1 698 RR2EV54TF
BS 699 699 RR2EV54JQ
BS 700 736 RR2EV54TF
BS 737 737 RR2EV54JQ
BS 738 771 RR2EV54TF
BS 772 772 RR2EV54JQ
BS 773 808 RR2EV54TF
BS 809 1244 RR2EV54JQ

RD RR2EV54TF 808 0 0
GGACACAATTCACCAAAAACTTGAAAAGTGTTTTAAGAGAGAAAAAGAATCAAAGAGACT
CACGGAAATGGAGAATGCAGTAGCGAAACAGAGCATCCCTCTCCTCACTCCCTACAAGAT
GGGAAGATTCAATCTCTCCCACAGGGTTGTTCTGGCACCACTGACGAGACAGAGATCATA
CGGAAACGTTCCTCAGCCTCACGCTGTCTTGTACTACTCTCAGAGAACGAGCCCAGGAGG
GTTTCTTGTCACTGAAGCTACAGGAGTTTCAGACACAGCTCAAGGCTATCAAGATACGCC
TGGGATATGGACTAAAGAGCATGTGGAGGCATGGAAGCCAATTGTGGATGCTGTTCATGC
CAAAGGTGGTGTATTCTTCTGTCAAATCTGGCATGTTGGCCGTGTCTCTAACCGAGGTTT
TCAACCAAATGGGCAAGCTCCCATCTCTTGTTCAGACAAGCCATTGATGCCTCAAATCCG
CTCTAATGGCATCGATGAAGCCATGTTCACCCCTCCAAGACGGTTAACTACTGAAGAAAT
ACCCAGCATTGTCAACGACTTTAGGCTCGCAGCAAGAAACGCCATGGAAGCTGGCTTTGA
TGGAGTTGAGATTCATGGTGCTAATGGCTATCTGATAGACCAGTTCATGAAAGATACTGT
GAATGACAGAACAGATGAATACAGTAGATCTTTACAAA*CCGTTGCAAATTTGCTTTAGA
CATAGTTGAAGCAGGG*CTAACGAGATAGGACCAGACCGTGTTGGCATCAG*CTCTCTCC
CTTTGCTGACTACATGGAGTCAGCAGAC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2EV54JQ 610 0 0
ATAGACCAGTTCATGAAAGATACTGTGAATGACAGAACAGATGAATACGGTAGATCTTTA
CAAAACCGTTGCAAATTTGCTTTAGACATAGTTGAAGCAGGGGCTAACGAGATAGGACCA
GACCGTGTTGGCATCAGGCTCTCTCCCTTTGCTGACTACATGGAGTCAGCAGACACTAAC
CCACAAGCGTTAGCCCTTCACATGGGTGAATCTTTAAACAAATACGGGATCCTCTACTGT
CATGTGATAGAGCCAAGAATGAAAACAATGGGAGAGATAACGGAGTGTCCTCACTTGCTA
GTGCCGATGAGGAAAGCCTTTCAGGGGACTTTCATTTCAGCGGGAGGTTACACGAGGAAA
GATGGGAATGAGGCAGTGGCAGAGGGACGGACCGATCTTGTGGCTTATGGTCGGTGGTTT
CTAGCGAACCCTGATCTGCCTAAGAGGTTTGAAGTGGATGCAGAGCTGAATAAATATGAT
AGGCCAACGTTTTACATTTCTGATCCTGTCGTGGGTTATACGGATTACCCTTTTCTTGAA
TCAATAGCTTAGACATTGTCATTAATAATGTTAATGTGCGTTCCTCTTTCATATAATAAG
TTTATCTGGC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL7414Contig1 793 2 2 U
GACAGACAATCAACATTTCAGCTAGAGCTCGAGATCCAACAGTGGCATCACTCTTTCTGC
AACTTAGTCAAGGCCCAGCGTGACTACATCCAGTCACTCACGGGCTGGCTAAGGCTAAGT
CTGTTCCAGTTCAGCAAGAATCCACTCGTCAGGAGCAGCTACGAGTCAAAGATATACAGC
TTCTGCGAGGAATGGCATCTGGCTATCGACAGGATCCCTGACAAAGTAGCATCCGAAGGG
ATCAACAGCTTTCTCACCGCGGTCCACGGGATCGTGGCTCAGCAGGCCGAGGAGCATAAG
CAGAAGAAGAGATCAGACTCAATGTCGAAAGACTTTGAGAAGAAAGCTGCTTCGCTGAGG
GCGCTGGAGAGCAAGTATAGTCCGTACTCGGTGGCGGCTGAGAGCAGCGGGAGGAAGAAG
AAGAACCCGGTGGTGGAGAAGAGAGCGAAGGTTGAGTTTTTGAAAGGGAAAGCGGAAGAA
GAGAAGAGTAAGCATGAGAAGGCGGTGAGTGTGACTAGAGCCATGACTCTGAATAACTTG
CAGATGGGTTTCCCTCATGTGTTTCAGGCCATGGTTGGGTTCTCGAGTGTGTGTATGCAA
GCCTTTGAGTCTGTTTATAACCAAGCTAAGTGCATCGGTGAGGAGGAGCAAGAGGAAGTC
AAGAGGTTGCTTCCTTAGAGTCATTGCTTTACCCTTTTCTTCTCTGTTCTTGTTTGATCC
TTTAGGCACAACAAAACATGTTATGAACTTGAGTTGAGTTTATGCTATTTTTAGAAAACT
GAACTTTTCATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV21TF U 1
AF RR2AV21JQ C 1
BS 1 719 RR2AV21TF
BS 720 793 RR2AV21JQ

RD RR2AV21TF 719 0 0
GACAGACAATCAACATTTCAGCTAGAGCTCGAGATCCAACAGTGGCATCACTCTTTCTGC
AACTTAGTCAAGGCCCAGCGTGACTACATCCAGTCACTCACGGGCTGGCTAAGGCTAAGT
CTGTTCCAGTTCAGCAAGAATCCACTCGTCAGGAGCAGCTACGAGTCAAAGATATACAGC
TTCTGCGAGGAATGGCATCTGGCTATCGACAGGATCCCTGACAAAGTAGCATCCGAAGGG
ATCAACAGCTTTCTCACCGCGGTCCACGGGATCGTGGCTCAGCAGGCCGAGGAGCATAAG
CAGAAGAAGAGATCAGACTCAATGTCGAAAGACTTTGAGAAGAAAGCTGCTTCGCTGAGG
GCGCTGGAGAGCAAGTATAGTCCGTACTCGGTGGCGGCTGAGAGCAGCGGGAGGAAGAAG
AAGAACCCGGTGGTGGAGAAGAGAGCGAAGGTTGAGTTTTTGAAAGGGAAAGCGGAAGAA
GAGAAGAGTAAGCATGAGAAGGCGGTGAGTGTGACTAGAGCCATGACTCTGAATAACTTG
CAGATGGGTTTCCCTCATGTGTTTCAGGCCATGGTTGGGTTCTCGAGTGTGTGTATGCAA
GCCTTTGAGTCTGTTTATAACCAAGCTAAGTGCATCGGTGAGGAGGAGCAAGAGGAAGTC
AAGAGGTTGCTTCCTTAGAGTCATTGCTTTACCCTTTTCTTCTCTGTTCTTGTTTGATC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2AV21JQ 793 0 0
GACAGACAATCAACATTTCAGCTAGAGCTCGAGATCCAACAGTGGCATCACTCTTTCTGC
AACTTAGTCAAGGCCCAGCGTGACTACATCCAGTCACTCACGGGCTGGCTAAGGCTAAGT
CTGTTCCAGTTCAGCAAGAATCCACTCGTCAGGAGCAGCTACGAGTCAAAGATATACAGC
TTCTGCGAGGAATGGCATCTGGCTATCGACAGGATCCCTGACAAAGTAGCATCCGAAGGG
ATCAACAGCTTTCTCACCGCGGTCCACGGGATCGTGGCTCAGCAGGCCGAGGAGCATAAG
CAGAAGAAGAGATCAGACTCAATGTCGAAAGACTTTGAGAAGAAAGCTGCTTCGCTGAGG
GCGCTGGAGAGCAAGTATAGTCCGTACTCGGTGGCGGCTGAGAGCAGCGGGAGGAAGAAG
AAGAACCCGGTGGTGGAGAAGAGAGCGAAGGTTGAGTTTTTGAAAGGGAAAGCGGAAGAA
GAGAAGAGTAAGCATGAGAAGGCGGTGAGTGTGACTAGAGCCATGACTCTGAATAACTTG
CAGATGGGTTTCCCTCATGTGTTTCAGGCCATGGTTGGGTTCTCGAGTGTGTGTATGCAA
GCCTTTGAGTCTGTTTATAACCAAGCTAAGTGCATCGGTGAGGAGGAGCAAGAGGAAGTC
AAGAGGTTGCTTCCTTAGAGTCATTGCTTTACCCTTTTCTTCTCTGTTCTTGTTTGATCC
TTTAGGCACAACAAAACATGTTATGAACTTGAGTTGAGTTTATGCTATTTTTAGAAAACT
GAACTTTTCATTG

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL7415Contig1 518 2 1 U
GATCCAGAGTAGTTATCTTACAACTTAGTAGCTCAGCTTTAAGAAATTCCAAGAGCTTCA
AAATGGGCACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTCTTGCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCG
TCTTTCTCAAGTTTGGTTGCAATGTTGAGTTTTGGATATGTCTGATATTGACGCTGTTTG
GTTATATTCCCGGAATCATCTACGCTCTTTATGCCATCACCAAGGAGTAAGGACTGATTG
TTTCTAGCTCCACTGTTCTCTCCTTTTGGTCTCCTTAGGGAGGGAACATGCGGCTTCACC
GTGTTAACTCATTGGGAGTGATTCATCATTTGTTTTATGTTATGAGCAATTATATTTCAT
TATTGTATTTTGAATTATTATAATTTATGTGATATGAAAAAAAGCCTTTTGAATAGTTGG
AAATTGGATCATACCGTCTGACTAAAACAATCATAATGTTGAAATACATGTATCGAAGTT
TAGTCAAATTTGAACTTTTCACTTGGTCTTATAATCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GD34JQ C 1
AF RR2GD34TF U 1
BS 1 518 RR2GD34TF

RD RR2GD34JQ 518 0 0
GATCCAGAGTAGTTATCTTACAACTTAGTAGTTCAGCTTTAAGAAATTCCAAGAGCTTCA
AAATGGGCACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTCTTGCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCG
TCTTTCTCAAGTTTGGTTGCAATGTTGAGTTTTGGATATGTCTGATATTGACGCTGTTTG
GTTATATTCCCGGAATCATTTACGCTCTTTATGCCATCACCAAGGAGTAAGGACTGATTG
TTTCTAGCTCCACTGTTCTCTCCTTTTGGTCTCCTTAGGGAGGGAACATGCGGCTTCACC
GTGTTAACTCATTGGGAGTGATTCATCATTTGTTTTATGTTATGAGCAATTATATTTCAT
TATTGTATTTTGAATTATTATAATTTATGTGATATGAAAAAAAGCCTTTTGAATAGTTGG
AAATTGGATCATACCGTCTGACTAAAACAATCATAATGTTGAAATACATGTATCGAAGTT
TAGTCAAATTTGAACTTTTCACTTGGTCTTATAATCTT

QA 1 518 1 518
DS 

RD RR2GD34TF 518 0 0
GATCCAGAGTAGTTATCTTACAACTTAGTAGCTCAGCTTTAAGAAATTCCAAGAGCTTCA
AAATGGGCACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTCTTGCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCG
TCTTTCTCAAGTTTGGTTGCAATGTTGAGTTTTGGATATGTCTGATATTGACGCTGTTTG
GTTATATTCCCGGAATCATCTACGCTCTTTATGCCATCACCAAGGAGTAAGGACTGATTG
TTTCTAGCTCCACTGTTCTCTCCTTTTGGTCTCCTTAGGGAGGGAACATGCGGCTTCACC
GTGTTAACTCATTGGGAGTGATTCATCATTTGTTTTATGTTATGAGCAATTATATTTCAT
TATTGTATTTTGAATTATTATAATTTATGTGATATGAAAAAAAGCCTTTTGAATAGTTGG
AAATTGGATCATACCGTCTGACTAAAACAATCATAATGTTGAAATACATGTATCGAAGTT
TAGTCAAATTTGAACTTTTCACTTGGTCTTATAATCTT

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

CO CL7416Contig1 800 2 2 U
GGGATCTATCAGAACTCTACAGTTGTGTCGCAGAACGAGAGAGAGAGAGATAGAGACAAT
GGCGGCGACTCTTATGAACAGAGCAATCTCCAGAACCGAAACAACCGGTGCTTTCAGACT
CTCGCTCAACCTCCTGAGAAACTTCTCAGCTCCGGCGGCGGCATCTCCGTCATCTGAAAA
CCCTAGCTCCGATCCGATAAAACCGAAACGAAGGAAGAAGAAGAACCTAATCGAAGTCGC
TCAGTTCTTACCTAAATGGGGAATCGGATACCATATGGCTAAAGCTCACTGGAACGGAGT
CTCTTATGAGATCACTAAGATCAATCTCTACAAGGATGGTAGGCATGGCAAAGCGTGGGG
GATCGTTCACAAAGATGGGTTGCGAGCTGCGGATGCTCCTAAGAAGATAAGCGGGGTTCA
CAAACGCTGCTGGAAGTATATCCCTAACCTGTCCAAGACCACGCTTGCAACAACGAACTC
TGCACCCGCCGCTGAAGTTCAAGCTGCTTGATCTGTTTGCTTCCGTTGTTTGTTGGGGTA
CTTCTCAGGATATATCTGTTTGCAGTTTGTTTACCTTTTGGAAGATACAACTCTTTGTTA
CTTGATGAGTCACTTTTGAATTCGGTGGTAGCTTTGTAGGAAAAGATCCATAATAAAGAC
TTTGGATGATGATTGGCTTTTTGGTCCATCTTATAAAAGACTTCTACGCTTCTTGACATG
GATTGTGATTGGCTTTTGTGTGAACTTGTGTTGTAGGAGATCTTCTGGTTTTAAACATCT
AATAAAATACATCATTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ08TF U 1
AF RR2GQ08JQ C 357
BS 1 432 RR2GQ08TF
BS 433 800 RR2GQ08JQ

RD RR2GQ08TF 432 0 0
GGGATCTATCAGAACTCTACAGTTGTGTCGCAGAACGAGAGAGAGAGAGATAGAGACAAT
GGCGGCGACTCTTATGAACAGAGCAATCTCCAGAACCGAAACAACCGGTGCTTTCAGACT
CTCGCTCAACCTCCTGAGAAACTTCTCAGCTCCGGCGGCGGCATCTCCGTCATCTGAAAA
CCCTAGCTCCGATCCGATAAAACCGAAACGAAGGAAGAAGAAGAACCTAATCGAAGTCGC
TCAGTTCTTACCTAAATGGGGAATCGGATACCATATGGCTAAAGCTCACTGGAACGGAGT
CTCTTATGAGATCACTAAGATCAATCTCTACAAGGATGGTAGGCATGGCAAAGCGTGGGG
GATCGTTCACAAAGATGGGTTGCGAGCTGCGGATGCTCCTAAGAAGATAAGCGGGGTTCA
CAAACGCTGCTG

QA 1 432 1 432
DS 

RD RR2GQ08JQ 444 0 0
GGGGGATCGTTCACAAAGATGGGTTGCGAGCTGCGGATGCTCCTAAGAAGATAAGCGGGG
TTCACAAACGCTGCTGGAAGTATATCCCTAACCTGTCCAAGACCACGCTTGCAACAACGA
ACTCTGCACCCGCCGCTGAAGTTCAAGCTGCTTGATCTGTTTGCTTCCGTTGTTTGTTGG
GGTACTTCTCAGGATATATCTGTTTGCAGTTTGTTTACCTTTTGGAAGATACAACTCTTT
GTTACTTGATGAGTCACTTTTGAATTCGGTGGTAGCTTTGTAGGAAAAGATCCATAATAA
AGACTTTGGATGATGATTGGCTTTTTGGTCCATCTTATAAAAGACTTCTACGCTTCTTGA
CATGGATTGTGATTGGCTTTTGTGTGAACTTGTGTTGTAGGAGATCTTCTGGTTTTAAAC
ATCTAATAAAATACATCATTTACC

QA 1 444 1 444
DS 



AS 1 2

CO CL7417Contig1 728 2 4 U
GGAACACAAATCGCACATCAATGGCGGCTGCCGGGGAAGAGATGACCACTAAGGAAGGCG
CTAACCTCTTGGGGAAACCAAAGTACAAGAAACTCGAGAACGGGAGATTCAGATGCGTGC
AAACGGGTCACGAGCTGCTAGAGAAAGACAAGAAGGTTTATTCAGAGAGTAAACGGTGCC
GTTTAGGGCTTATCGATCATGCCTTATCTCACAGCAAGCCACCACTTAACTTGTTCGAAC
AAGACCAAAGCTCTCGCTCGAAACTGAAATGTAAGCTAACGGGTGATACGGTGAACAAGA
CTGAGGAACATATTTGGAAGCATATCAATGGACGACGCTTCCTCAACAAGCTAGAGGAGA
AGGAAAGAGAGAAAGAGTCCGGTGCTATCCCAGAGGAAGGTGGAGAAACTGTGGTGAAGG
TCGATGAAGATGGAAAGAGTAGCTTAGATGATTGCATAATAGATGAAGTTGATGAAGATG
AAACTCCTGAAAGCAGTAAAAAGAGGAAGCCTGAAGAACTCAGTTCCAATAGCCTTCCTT
TCAAGAAGAACGAGAAGAAGAAGGTCAAAACAACAGCTTCACAAATCTGATCTCTCTCTT
ATGCTTTTTTTCCTTTTTTTTTGCATTTTCACTTACTAGTCTACGACTCTACGCTACTAC
GTATTTCATTCAGCTTATGGGTTCACTTTTGATAGTATTTAATGGTGAGAGAAAACAGGT
TAATGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ66TF U 1
AF RR2BQ66JQ C 11
BS 1 621 RR2BQ66TF
BS 622 622 RR2BQ66JQ
BS 623 665 RR2BQ66TF
BS 666 728 RR2BQ66JQ

RD RR2BQ66TF 665 0 0
GGAACACAAATCGCACATCAATGGCGGCTGCCGGGGAAGAGATGACCACTAAGGAAGGCG
CTAACCTCTTGGGGAAACCAAAGTACAAGAAACTCGAGAACGGGAGATTCAGATGCGTGC
AAACGGGTCACGAGCTGCTAGAGAAAGACAAGAAGGTTTATTCAGAGAGTAAACGGTGCC
GTTTAGGGCTTATCGATCATGCCTTATCTCACAGCAAGCCACCACTTAACTTGTTCGAAC
AAGACCAAAGCTCTCGCTCGAAACTGAAATGTAAGCTAACGGGTGATACGGTGAACAAGA
CTGAGGAACATATTTGGAAGCATATCAATGGACGACGCTTCCTCAACAAGCTAGAGGAGA
AGGAAAGAGAGAAAGAGTCCGGTGCTATCCCAGAGGAAGGTGGAGAAACTGTGGTGAAGG
TCGATGAAGATGGAAAGAGTAGCTTAGATGATTGCATAATAGATGAAGTTGATGAAGATG
AAACTCCTGAAAGCAGTAAAAAGAGGAAGCCTGAAGAACTCAGTTCCAATAGCCTTCCTT
TCAAGAAGAACGAGAAGAAGAAGGTCAAAACAACAGCTTCACAAATCTGATCTCTCTCTT
ATGCTTTTTTTCCTTTTTTTT*GCATTTTCACTTACTAGTCTACGACTCTACGCTACTAC
GTATT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RR2BQ66JQ 718 0 0
TCGCACATCAATGGCGGCTGCCGGGGAAGAGATGACCACTAAGGAAGGCGCTAACCTCTT
GGGGAAACCAAAGTACAAGAAACTCGAGAACGGGAGATTCAGATGCGTGCAAACGGGTCA
CGAGCTGCTAGAGAAAGACAAGAAGGTTTATTCAGAGAGTAAACGGTGCCGTTTAGGGCT
TATCGATCATGCCTTATCTCACAGCAAGCCACCACTTAACTTGTTCGAACAAGACCAAAG
CTCTCGCTCGAAACTGAAATGTAAGCTAACGGGTGATACGGTGAACAAGACTGAGGAACA
TATTTGGAAGCATATCAATGGACGACGCTTCCTCAACAAGCTAGAGGAGAAGGAAAGAGA
GAAAGAGTCCGGTGCTATCCCAGAGGAAGGTGGAGAAACTGTGGTGAAGGTCGATGAAGA
TGGAAAGAGTAGCTTAGATGATTGCATAATAGATGAAGTTGATGAAGATGAAACTCCTGA
AAGCAGTAAAAAGAGGAAGCCTGAAGAACTCAGTTCCAATAGCCTTCCTTTCAAGAAGAA
CGAGAAGAAGAAGGTCAAAACAACAGCTTCACAAATCTGATCTCTCTCTTATGCTTTTTT
TCCTTTTTTTTTGCATTTTCACTTACTAGTCTACGACTCTACGCTACTACGTATTTCATT
CAGCTTATGGGTTCACTTTTGATAGTATTTAATGGTGAGAGAAAACAGGTTAATGATT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL7418Contig1 673 2 3 U
AGATAAGATAAAGTAGCTAACCAGATCAGACATCACGCATTACAATCCATCCGTTTATAT
ATAAGCAAAAGGTTTCAAAAGGCGCGCACAAACATCTTCTGAAACAGAAAAAAGATGTCC
AAGGCTATTACAGCTATCGCCACTTATGTCTATAAATCAAAAGTCTTAATTATGCAGCAT
ACATAAACACAAAATCATACTTATTCGTAGAATCCATCTCATCCTCATCATCAAGAACCC
ACTACTTGCATGCTTAAAGATCCTTATTGAGGTGGGGATAGAATTATCACTCTCACAGCA
TCCAGCCAGGGATGTAGCCGTTGTTTCCTGGTTGGGAGGACTGACCTTGCGCAGTTACAG
CCATTTGCTCAAAACACACTGGATGGTTATATCCCATTTGCAAAGTGGGATCACATTCAA
GAGAGTGGAATAGTCCCTGAGACTGAAACTGAGCCTGATGATGCCCATAGGCAACATTTT
GGTGATCACTACCACCTTCCCACGCCCCTCCTATATGGTGACTTCTCACACCGATCATAT
CTTCCAGCTTCATTGACAAAGCTCTATTGGCTTCAAGCAAGATATGCTCTTTGCCTTGGA
GGTCAGTGAGCTGATCAAGCATATACTGCGTCTTGATGCAGCGAACTTGCTTAAGAGAGC
CGTCTAGTTGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA02JQ U 42
AF RR2CS53JQ U 1
BS 1 109 RR2CS53JQ
BS 110 110 RR2FA02JQ
BS 111 673 RR2CS53JQ

RD RR2FA02JQ 555 0 0
ACAATCCATCCGTTTATATATAAGCAAAAGGTTTCAAAAGGCGCGCACAAACATCTTCTG
AAACAGAAAAGAGATGTCCAAGGCTATTACAGCTATCGCCACTTATGTCTATAAATCAAA
AGTCTTAATTATGCAGCATACATAAACACAAAATCATACTTATTCGTAGAATCCATCTCA
TCCTCATCATCAAGAACCCACTACTTGC*TGCTTAAAGATCCTTATTGAGGTGGGGATAG
AATTATCACTCTCACAGCATCCAGCCAGGGATGTAGCCGTTGTTTCCTGGTTGGGAGGAC
TGACCTTGCGCAGTTACAGCCATTTGCTCAGAACACACTGGATGGTTATATCCCATTTGC
AAAGTGGGATCACATTCAAGAGAGTGGAATAGTCCCTGAGACTGAGACTGAGCCTGATGA
TGTCCATAGGCAACATTTTGTTGATCACTACCACCTTCCCACGCCCCTCCTATATGGTGA
CTTCTCACACCGATCATATCTTCCAGCTTCATTGACAAAGCTCTATTGGCTTCAAGCAAG
ATATGCTCTTTGCCT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2CS53JQ 673 0 0
AGATAAGATAAAGTAGCTAACCAGATCAGACATCACGCATTACAATCCATCCGTTTATAT
ATAAGCAAAAGGTTTCAAAAGGCGCGCACAAACATCTTCTGAAACAGAAGAAAGATGTCC
AAGGCTATTACAGCTATCGCCACTTATGTCTATAAATCAAAAGTCTTAATTATGCAGCAT
ACATAAACACAAAATCATACTTATTCGTAGAATCCATCTCATCCTCATCATCAAGAACCC
ACTACTTGCATGCTTAAAGATCCTTATTGAGGTGGGGATAGAATTATCACTCTCACAGCA
TCCAGCCAGGGATGTAGCCGTTGTTTCCTGGTTGGGAGGACTGACCTTGCGCAGTTACAG
CCATTTGCTCAAAACACACTGGATGGTTATATCCCATTTGCAAAGTGGGATCACATTCAA
GAGAGTGGAATAGTCCCTGAGACTGAAACTGAGCCTGATGATGCCCATAGGCAACATTTT
GGTGATCACTACCACCTTCCCACGCCCCTCCTATATGGTGACTTCTCACACCGATCATAT
CTTCCAGCTTCATTGACAAAGCTCTATTGGCTTCAAGCAAGATATGCTCTTTGCCTTGGA
GGTCAGTGAGCTGATCAAGCATATACTGCGTCTTGATGCAGCGAACTTGCTTAAGAGAGC
CGTCTAGTTGTCG

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL7419Contig1 1137 2 2 U
GGGATCTGTATCATCCTCTCCCACTGGTTAAAAAAAATCCTCTCTTTCCGAGCCCTATTC
TCTCCTTTTCTCTATTCAATAAAAATTTTTTTATTGAATTGAGAAAAAAAGCTTTAATTT
TTTTTTTAGCTTTCTAAAAAAAACTGCAAAACTCTGTGCTTAGTGTTGGTCTGAACGAAA
GCTTGTTTCTTTTTTGTTGTTGTTGCAGGTATAACGGAAAATGCGAGGGATATCGAGTCG
ATCACTTTATTCTTTGACACGATCTCTGTTATCACGCGCCCGTCACGGGATCACAGTGGA
GACGTCATCAAGTGGATGCACACCTGCGCTTGGTTCTCTGTGGTCTGCTCTTCAGAGCCG
TGGCGTTAAAGTTAACGCCATCCAGTTAAGGCCAGGGAACGTTATTGAACGAACAGGACG
TACTTTCCGGGTTGTAGAATCAGAGCATAAACAACAAGGCAGAGGAGGAGCCTCCATACA
GGTAGAGCTTCGCGATGTTGACAACGGGAGCAAACTTAACTTGCGGTTTGGAGCTGAGGA
GTCCGTTGAGAAGGTTTTTGTTCAGGAGAAATCTTTCACATGTTTATATACTGAAGGAGA
TACTGCCTTCCTGATTGAGCCTGATACGTTTGAGCAAGTTGAGGTGCCCTTGGACATATT
TGGCAAAGCTGCTGTATATTTGAAAGAGGAAATGGGAGTCCAGTTGCAGCTGTATGATGG
AAGAGCTTTATCTGCATCTGTCCCTAAGCATGTCACATGCACAATCCAAGAAACACAACT
TCCCATGAAAGGCTTGACCTCAGCTCCTCGTTACAAGAGAGCTCTCCTGGATAATGGTTC
TACTATTCAAGTACCATCTTATCTGGAGGCAGGCGAAAAGATTGTGATAAACACCGAGGA
TGATTCTTTTGTCAAGAGGGACAACAAATGAAATAATCAAATGCTGGCTTCTATGGAGGA
AGAAGCTAAAAATTTTTTACTCAAGACTTGTAGAAACTTATGATTATGATGTTGAGAAGC
GTTTCAAAGAGAGATTAGGATGCTATTATTATAAATGTTATCCAAGTTCTCATAATCTCT
GAACACCTCCATTGATTGAGGTGTTACAAATTCGATATAAAGTTTACAGATTCTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C167TF U 1
AF RR2C167JQ C 355
BS 1 684 RR2C167TF
BS 685 1137 RR2C167JQ

RD RR2C167TF 684 0 0
GGGATCTGTATCATCCTCTCCCACTGGTTAAAAAAAATCCTCTCTTTCCGAGCCCTATTC
TCTCCTTTTCTCTATTCAATAAAAATTTTTTTATTGAATTGAGAAAAAAAGCTTTAATTT
TTTTTTTAGCTTTCTAAAAAAAACTGCAAAACTCTGTGCTTAGTGTTGGTCTGAACGAAA
GCTTGTTTCTTTTTTGTTGTTGTTGCAGGTATAACGGAAAATGCGAGGGATATCGAGTCG
ATCACTTTATTCTTTGACACGATCTCTGTTATCACGCGCCCGTCACGGGATCACAGTGGA
GACGTCATCAAGTGGATGCACACCTGCGCTTGGTTCTCTGTGGTCTGCTCTTCAGAGCCG
TGGCGTTAAAGTTAACGCCATCCAGTTAAGGCCAGGGAACGTTATTGAACGAACAGGACG
TACTTTCCGGGTTGTAGAATCAGAGCATAAACAACAAGGCAGAGGAGGAGCCTCCATACA
GGTAGAGCTTCGCGATGTTGACAACGGGAGCAAACTTAACTTGCGGTTTGGAGCTGAGGA
GTCCGTTGAGAAGGTTTTTGTTCAGGAGAAATCTTTCACATGTTTATATACTGAAGGAGA
TACTGCCTTCCTGATTGAGCCTGATACGTTTGAGCAAGTTGAGGTGCCCTTGGACATATT
TGGCAAAGCTGCTGTATATTTGAA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2C167JQ 783 0 0
GAGCCGTGGCGTTAAAGTTAACGCCATCCAGTTAAGGCCAGGGAACGTTATTGAACGAAC
AGGACGTACTTTCCGGGTTGTAGAATCAGAGCATAAACAACAAGGCAGAGGAGGAGCCTC
CATACAGGTAGAGCTTCGCGATGTTGACAACGGGAGCAAACTTAACTTGCGGTTTGGAGC
TGAGGAGTCCGTTGAGAAGGTTTTTGTTCAGGAGAAATCTTTCACATGTTTATATACTGA
AGGAGATACTGCCTTCCTGATTGAGCCTGATACGTTTGAGCAAGTTGAGGTGCCCTTGGA
CATATTTGGCAAAGCTGCTGTATATTTGAAAGAGGAAATGGGAGTCCAGTTGCAGCTGTA
TGATGGAAGAGCTTTATCTGCATCTGTCCCTAAGCATGTCACATGCACAATCCAAGAAAC
ACAACTTCCCATGAAAGGCTTGACCTCAGCTCCTCGTTACAAGAGAGCTCTCCTGGATAA
TGGTTCTACTATTCAAGTACCATCTTATCTGGAGGCAGGCGAAAAGATTGTGATAAACAC
CGAGGATGATTCTTTTGTCAAGAGGGACAACAAATGAAATAATCAAATGCTGGCTTCTAT
GGAGGAAGAAGCTAAAAATTTTTTACTCAAGACTTGTAGAAACTTATGATTATGATGTTG
AGAAGCGTTTCAAAGAGAGATTAGGATGCTATTATTATAAATGTTATCCAAGTTCTCATA
ATCTCTGAACACCTCCATTGATTGAGGTGTTACAAATTCGATATAAAGTTTACAGATTCT
TGG

QA 1 783 1 783
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL7422Contig1 1059 2 2 U
GGGAACGTTGTCGTATTAAACAGCATCTTCTTCCTCTCCGGCGACAATTTTTTTTCTTTT
ATTACTTTCCTCCGGTCGCGTCGCCATGATCGTCGACTTCTCTACCTTCATCCTCTTCGT
CTCTCTCTTCACTTCCTCAGCTAACGCCAAGTCTACCTTATCAATCTCCCCCAAAACTCT
AAACCGATCCGGCGATTCCGTCATCTACTCTCCCCCAGACTCTCCTCACGACCACTTCAT
CGGCTACAAGTTCCTCAACGTCTCGCCAACGTGGAGATCAGGTTCCGGCACCATCTCCCT
CCCTCTCACCAACCTCCGATCAAACTACACCTTCCGGATCTTCCGATGGACTCAGTCCGA
GATCAACCCGAAGCGCATGGATCACGACCAGAACCCTCTGCCGGGAACCAAGCATCTTCT
GGCGGAATCGGAGCAGGTGGGTTTCGGATCCGGCGGCGTCGGGATGCCGGAGCAGATCCA
TCTGGCATTCGAGGACAAGGTTAACAGGATGCAGGTCACGTTCGTTGCTGGCGACGGAGA
AGAGCTGTTCGTGAGGTACGGGGGAGGCGGAGGATACGCTGGGAAACTCCGCGGGCGGCG
CGTGGGATTAGTTACGAGAGAGAGCATATGTGTAACGCTCCGGCTAATTCCACCGTCGGA
TGGAGAGATCCCGGGTGGATTTTTCATACCGTTATGAAGAATTTGAACGGTGGCGTTAGG
TATTACTATCAGGTAAAACACAATCAGAATCAAAAGGTTATGTCTTTAATTTTTGGACGT
AGTTGTAAGAACATCAAAGGTTATGTATTTATGACAGATGATCATCAAAGGTTATGCCTT
TATGATAGATGATTTATGTCTTTTTTTTTTTGAAAGTAGATGTGAGAACATCAAAGGTTA
TGTCTTTATGACAGATGATCATCAAAGGTTATGTCTTTTTCCTTTTTCTGAAAGTAGATG
TAAGAGTATCAGAGGTTATGTATTTATGACAGATGATCATCAAAGGTTTATGTCTTTTTT
TTTGAAAGTAGATGTGAGAATATGAAAGGTTATGTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD40TF U 1
AF RR2CD40JQ C 289
BS 1 646 RR2CD40TF
BS 647 1059 RR2CD40JQ

RD RR2CD40TF 653 0 0
GGGAACGTTGTCGTATTAAACAGCATCTTCTTCCTCTCCGGCGACAATTTTTTTTCTTTT
ATTACTTTCCTCCGGTCGCGTCGCCATGATCGTCGACTTCTCTACCTTCATCCTCTTCGT
CTCTCTCTTCACTTCCTCAGCTAACGCCAAGTCTACCTTATCAATCTCCCCCAAAACTCT
AAACCGATCCGGCGATTCCGTCATCTACTCTCCCCCAGACTCTCCTCACGACCACTTCAT
CGGCTACAAGTTCCTCAACGTCTCGCCAACGTGGAGATCAGGTTCCGGCACCATCTCCCT
CCCTCTCACCAACCTCCGATCAAACTACACCTTCCGGATCTTCCGATGGACTCAGTCCGA
GATCAACCCGAAGCGCATGGATCACGACCAGAACCCTCTGCCGGGAACCAAGCATCTTCT
GGCGGAATCGGAGCAGGTGGGTTTCGGATCCGGCGGCGTCGGGATGCCGGAGCAGATCCA
TCTGGCATTCGAGGACAAGGTTAACAGGATGCAGGTCACGTTCGTTGCTGGCGACGGAGA
AGAGCTGTTCGTGAGGTACGGGGGAGGCGGAGGATACGCTGGGAAACTCCGCGGGCGGCG
CGTGGGATTAGTTACGAGAGAGAGCATATGTGTAACGCTCCGGCTA
TTCCACC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2CD40JQ 771 0 0
CACCATCTCCCTCCCTCTCACCAAC*TCCGATCAAACTACACCTTCCGGATCTTCCGATG
GACTCAGTCCGAGATCAACCCGAAGCGCATGGATCACGACCAGAACCCTCTGCCGGGAAC
CAAGCATCTTCTGGCGGAATCGGAGCAGGTGGGTTTCGGATCCGGCGGCGTCGGGATGCC
GGAGCAGATCCATCTGGCATTCGAGGACAAGGTTAACAGGATGCAGGTCACGTTCGTTGC
TGGCGACGGAGAAGAGCTGTTCGTGAGGTACGGGG*AGGCGGAGGATACGCTGGGAAACT
CCGCGG*CGGCGCGTGGGATTAGTTACGAGAGAGAGCATATGTGTAACGCTCCGGCTAAT
TCCACCGTCGGATGGAGAGATCCCGGGTGGATTTTTCATACCGTTATGAAGAATTTGAAC
GGTGGCGTTAGGTATTACTATCAGGTAAAACACAATCAGAATCAAAAGGTTATGTCTTTA
ATTTTTGGACGTAGTTGTAAGAACATCAAAGGTTATGTATTTATGACAGATGATCATCAA
AGGTTATGCCTTTATGATAGATGATTTATGTCTTTTTTTTTTTGAAAGTAGATGTGAGAA
CATCAAAGGTTATGTCTTTATGACAGATGATCATCAAAGGTTATGTCTTTTTCCTTTTTC
TGAAAGTAGATGTAAGAGTATCAGAGGTTATGTATTTATGACAGATGATCATCAAAGGTT
TATGTCTTTTTTTTTGAAAGTAGATGTGAGAATATGAAAGGTTATGTCTCT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL7423Contig1 528 2 1 U
GGGTGATGAGAGATCCGGATTCATGGGAAGAACCAGACAAGTTTCAACCGGAGAGGTTCA
TGGTTTCTCCCTCAAAGGGGAAAGAAGAGATAAGAGAGCAGTTAGCTTTGAACTACCTTC
CTTTTGGGAGCGGAAGAAGAGGATGCCCTGGATCAAACTTAGCTTATATCTTCATTGGGG
TAGCCATTGGAACAATGGTGCAGTGTTTTGACTGGATTGTTAATGATAATAAGGTGAACA
TGGAAGAGGCTGGAGATATGACGTTGCGTATGGCTCATCCACTTAAATGCACTCTTGTTG
CTCGAATTGACCCTTCTGGTTGATGGTTGAGTTTGATATGTCCTGTTGAAGTTGTAGACA
TACATCATGTCTGGTAATGTTGTTTTGTACCTTTCGTAACATAACTTGTTGTCTTTATGT
CTAAGACATCTGTTAAATAAGGGATGGTGATTGTGAAACTTCTGTAGTAAGTCAGAAAAT
TTGCAGATAACAAGAAATGCCAAAGACGTCAAAGGAAGATAGTTGCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E583JQ C 1
AF RR2E583TF U 1
BS 1 528 RR2E583TF

RD RR2E583JQ 528 0 0
GGGTGATGAGAGATCCGGATTCATGGGAAGAACCAGACAAGTTTCAACCGGAGAGGTTCA
TGGTTTCTCCCTCAAAGGGGAAAGAAGAGATAAGAGAGCAGTTAGCTTTGAACTACCTTC
CTTTTGGGAGCGGAAGAAGAGGATGCCCTGGATCAAACTTAGCTTATATCTTCATTGGGG
TAGCCATTGGAACAATGGTGCAGTGTTTTGACTGGATTGTTAATGATAATAAGGTGAACA
TGGAAGAGGCTGGAGATATGACGTTGCGTATGGCTCATCCACTTAAATGCACTCTTGTTG
CTCGAATTGACCCTTCTGGTTGATGGTTGAGTTTGATATGTCCTGTTGAAGTTGTAGACA
TACATCATGTCTGGTAATGTTGTTTTGTACCTTTCGTAACATAACTTGTTGTCTTTATGT
TTAAGACATCTGTTAAATAAGGGATGGTGATTGTGAAACTTCTGTAGTAAGTCAGAAAAT
TTGCAGATAACAAGAAATGCCAAAGACGTCAAAGGAAGATAGTTGCAC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2E583TF 528 0 0
GGGTGATGAGAGATCCGGATTCATGGGAAGAACCAGACAAGTTTCAACCGGAGAGGTTCA
TGGTTTCTCCCTCAAAGGGGAAAGAAGAGATAAGAGAGCAGTTAGCTTTGAACTACCTTC
CTTTTGGGAGCGGAAGAAGAGGATGCCCTGGATCAAACTTAGCTTATATCTTCATTGGGG
TAGCCATTGGAACAATGGTGCAGTGTTTTGACTGGATTGTTAATGATAATAAGGTGAACA
TGGAAGAGGCTGGAGATATGACGTTGCGTATGGCTCATCCACTTAAATGCACTCTTGTTG
CTCGAATTGACCCTTCTGGTTGATGGTTGAGTTTGATATGTCCTGTTGAAGTTGTAGACA
TACATCATGTCTGGTAATGTTGTTTTGTACCTTTCGTAACATAACTTGTTGTCTTTATGT
CTAAGACATCTGTTAAATAAGGGATGGTGATTGTGAAACTTCTGTAGTAAGTCAGAAAAT
TTGCAGATAACAAGAAATGCCAAAGACGTCAAAGGAAGATAGTTGCAC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL7424Contig1 815 2 4 U
GGGGGTTATAGATTCAATCGAGCTAGGGGATAACACGATTGAAGATCTGGATTATCGGGT
CTGATTAGAGGAGAATTAGGGTGAGATAGATCGAATAAAGGAGGCGACTTTTTTTTTTGA
TCGAAGCTATGGATCGTGCGGTTGGTGGCAAGTATAAGCTTGGACGTAAACTCGGAAGCG
GATCATTCGGTGAACTCTTTCTAGGTAAGAATGTTCAAACTGGAGACGAAGTTGCTGTGA
AGCTTGAACCTGCGCGGGCTAGGCATCCTCAACTTCATTATGAGTCAAAGCTCTATATGC
TCCTTCAAGGAGGAACTGGTATTCCACACCTGAAATGGTACGGGGTGGAAGGTGAATACA
ACTGCATGGTGATTGATCTTCTGGGGCCTAGCCTGGAGGATTTGTTTAATTATTGCAGTC
GGAGGTTCAATCTCAAGACTGTTCTAATGCTCGCTGATCAGATGTTAAATCGAGTTGAGT
ATATGCATGTCCGGGGGTTTCTTCATCGTGATATTAAGCCGGATAACTTTCTGATGGGTC
TTGGACGTAAAGCAAACCAGGTGTACATTATTGACTACGGGCTTGCAAAAAAGTACAGAG
ATCTTCAAACTCATAGGCACATTCCCTACAGAGAAAACAAGAATCTTACTGGAACAGCTC
GATACGCAAGTGTTAACACTCATCTTGGTATTGAGCAAAGTAGGAGGGATGATTTGGAAT
CCCTTGGCTATGTGCTTATGTATTTTCTTCGTGGAAGTCTACCTTGGCAAGGCCTTCGCG
CGGGTACGAAAAAGCAGAAGTATGACAAGATCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A325TF U 1
AF RR2A325JQ C 49
BS 1 703 RR2A325TF
BS 704 704 RR2A325JQ
BS 705 756 RR2A325TF
BS 757 815 RR2A325JQ

RD RR2A325TF 756 0 0
GGGGGTTATAGATTCAATCGAGCTAGGGGATAACACGATTGAAGATCTGGATTATCGGGT
CTGATTAGAGGAGAATTAGGGTGAGATAGATCGAATAAAGGAGGCGACTTTTTTTTTTGA
TCGAAGCTATGGATCGTGCGGTTGGTGGCAAGTATAAGCTTGGACGTAAACTCGGAAGCG
GATCATTCGGTGAACTCTTTCTAGGTAAGAATGTTCAAACTGGAGACGAAGTTGCTGTGA
AGCTTGAACCTGCGCGGGCTAGGCATCCTCAACTTCATTATGAGTCAAAGCTCTATATGC
TCCTTCAAGGAGGAACTGGTATTCCACACCTGAAATGGTACGGGGTGGAAGGTGAATACA
ACTGCATGGTGATTGATCTTCTGGGGCCTAGCCTGGAGGATTTGTTTAATTATTGCAGTC
GGAGGTTCAATCTCAAGACTGTTCTAATGCTCGCTGATCAGATGTTAAATCGAGTTGAGT
ATATGCATGTCCGGGGGTTTCTTCATCGTGATATTAAGCCGGATAACTTTCTGATGGGTC
TTGGACGTAAAGCAAACCAGGTGTACATTATTGACTACGGGCTTGCAAAAAAGTACAGAG
ATCTTCAAACTCATAGGCACATTCCCTACAGAGAAAACAAGAATCTTACTGGAACAGCTC
GATACGCAAGTGTTAACACTCATCTTGGTATTGAGCAAAGTAG*AGGGATGATTTGGAAT
CCCTTGGCTATGTGCTTATGTATTTTCTTCGTGGAA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2A325JQ 767 0 0
GGATTATCGGGTCTGATTAGAGGAGAATTAGGGTGAGATAGATCGAATAAAGGAGGCGAC
TTTTTTTTTTGATCGAAGCTATGGATCGTGCGGTTGGTGGCAAGTATAAGCTTGGACGTA
AACTCGGAAGCGGATCATTCGGTGAACTCTTTCTAGGTAAGAATGTTCAAACTGGAGACG
AAGTTGCTGTGAAGCTTGAACCTGCGCGGGCTAGGCATCCTCAACTTCATTATGAGTCAA
AGCTCTATATGCTCCTTCAAGGAGGAACTGGTATTCCACACCTGAAATGGTACGGGGTGG
AAGGTGAATACAACTGCATGGTGATTGATCTTCTGGGGCCTAGCCTGGAGGATTTGTTTA
ATTATTGCAGTCGGAGGTTCAATCTCAAGACTGTTTTAATGCTCGCTGATCAGATGTTAA
ATCGAGTTGAGTATATGCATGTCCGGGGGTTTTTTCATCGTGATATTAAGCCGGATAACT
TTTTGATGGGTCTTGGACGTAAAGCAAACCAGGTGTACATTATTGACTACGGGCTTGCAA
AAAAGTACAGAGATCTTCAAACTCATAGGCACATTCCCTACAGAGAAAACAAGAATCTTA
CTGGAACAGCTCGATACGCAAGTGTTAACACTCATCTTGGTATTGAGCAAAGTAGGAGGG
ATGATTTGGAATCCCTTGGCTATGTGCTTATGTATTTTCTTCGTGGAAGTCTACCTTGGC
AAGGCCTTCGCGCGGGTACGAAAAAGCAGAAGTATGACAAGATCAGC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL7425Contig1 1176 2 4 U
GGAGCAATGAAGCTACTACTCTCCCAAGCTCGCCGCCAATCTCCCACCAAACCCTTCTCA
TCTCCATTCCCACAAATCAATAGACTCTTCTCTTCCTCTCCTCCATCGTCAGATCCGTAT
CCATCTCCTCCGCCGCCGCCGAATGAATCGAGCTAGGAGAAGGTTCTTGAGAGCTACTGC
CGTGGAAGAGGATACGTCTTCGCTTCCTCTGCCCACGCTGCTTAAACCAGAGCTGAAGCA
TGGAAAGAAACCTATTTTCGATCTCATGGAGGCCATTAGAGAGATAAAGGGCAATGCCAA
GGCCAAGTTTGATGAGACTCTTGAGGCTCATGTGAGGTTAGGCATCGAGAAAGGCCGATC
TGAGTTGATTGTTCATGGTACTTTGGCTCTACCACACTCTGTTAAAAAGGATGTGAGAGT
GGCTTTCTTTGCCGAGGGTTCGGATGCAGAGGATGCAAAGGCTGCAGGAGCTGATGTTGT
CGGTGGTCTTGAGCTTATTGAGGAAATCTTGAAAAGTGGCAAGATCGACTTTGATAGATG
TCTCGCAACTCCCAAAATGATGCCCCGTGTTTACAAGATATCAAGGATTCTTAACAATCA
TGGTCTGATGCCTAACCCCAAACAAGGGAGTGTGACCAAGGATGTAATGAAAGCAGTGAA
AGACGCAAAAGCAGGACATACCAAATTCAGAATGGATAAAACTTCCATTCTTCATGTGCC
ACTTGGAAGGATGAGCTTTCCTGAGGATGCTTTGAAGGAGAACGTTGGTGCATTCATGAA
CGCCCTGTTGCTGGCTAAGCCTGCCGGATTGAAAAAGACTTTAAAATATGCTGGTTATGT
GAATGCATTCCACTTATGCAGCACGATGGGAAAGGGTTATCCGGTATCGATACAGTCGTT
ATCTAGAGCAGCAGATCACTATACCAAATTGCAGCTCAAGTGAGCAGTAGACTTCAAAAG
ATAAAAGCTATGTTGTTGCAGGCGTTTTTATTTTTTCCCGGGGGGAGTTTTATTACTTTT
TTCCCAGTGCTGAATCTTTGGAACAGTATTATGATTTTGTTGTTTACCAGCGGTTAGTAT
TTTTCATAGCTCGATGGATTGGATTTGCTTTGATACAATAAAGTCAAATTCATGTCATAA
GAATGATATGACAATATGTTTAAATTGCTACTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HA21TF U 1
AF RR2HA21JQ C 433
BS 1 640 RR2HA21TF
BS 641 641 RR2HA21JQ
BS 642 670 RR2HA21TF
BS 671 1176 RR2HA21JQ

RD RR2HA21TF 670 0 0
GGAGCAATGAAGCTACTACTCTCCCAAGCTCGCCGCCAATCTCCCACCAAACCCTTCTCA
TCTCCATTCCCACAAATCAATAGACTCTTCTCTTCCTCTCCTCCATCGTCAGATCCGTAT
CCATCTCCTCCGCCGCCGCCGAATGAATCGAGCTAGGAGAAGGTTCTTGAGAGCTACTGC
CGTGGAAGAGGATACGTCTTCGCTTCCTCTGCCCACGCTGCTTAAACCAGAGCTGAAGCA
TGGAAAGAAACCTATTTTCGATCTCATGGAGGCCATTAGAGAGATAAAGGGCAATGCCAA
GGCCAAGTTTGATGAGACTCTTGAGGCTCATGTGAGGTTAGGCATCGAGAAAGGCCGATC
TGAGTTGATTGTTCATGGTACTTTGGCTCTACCACACTCTGTTAAAAAGGATGTGAGAGT
GGCTTTCTTTGCCGAGGGTTCGGATGCAGAGGATGCAAAGGCTGCAGGAGCTGATGTTGT
CGGTGGTCTTGAGCTTATTGAGGAAATCTTGAAAAGTGGCAAGATCGACTTTGATAGATG
TCTCGCAACTCCCAAAATGATGCCCCGTGTTTACAAGATATCAAGGATTCTTAACAATCA
TGGTCTGATGCCTAACCCCAAACAAGGGAGTGTGACCAAG*ATGTAATGAAAGCAGTGAA
AGACGCAAAA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2HA21JQ 744 0 0
CGAGGGTTCGGATGCAGAGGATGCAAAGGCTGCAGGAGCTGATGTTGTCGGTGGTCTTGA
GCTTATTGAGGAAATCTTGAAAAGTGGCAAGATCGACTTTGATAGATGTCTCGCAACTCC
CAAAATGATGCCCCGTGTTTACAAGATATCAAGGATTCTTAACAATCATGGTCTGATGCC
TAACCCCAAACAAGGGAGTGTGACCAAGGATGTAATGAAAGCAGTGAAAGACGCAAAAGC
AGGACATACCAAATTCAGAATGGATAAAACTTCCATTCTTCATGTGCCACTTGGAAGGAT
GAGCTTTCCTGAGGATGCTTTGAAGGAGAACGTTGGTGCATTCATGAACGCCCTGTTGCT
GGCTAAGCCTGCCGGATTGAAAAAGACTTTAAAATATGCTGGTTATGTGAATGCATTCCA
CTTATGCAGCACGATGGGAAAGGGTTATCCGGTATCGATACAGTCGTTATCTAGAGCAGC
AGATCACTATACCAAATTGCAGCTCAAGTGAGCAGTAGACTTCAAAAGATAAAAGCTATG
TTGTTGCAGGCGTTTTTATTTTTTCCCGGGGGGAGTTTTATTACTTTTTTCCCAGTGCTG
AATCTTTGGAACAGTATTATGATTTTGTTGTTTACCAGCGGTTAGTATTTTTCATAGCTC
GATGGATTGGATTTGCTTTGATACAATAAAGTCAAATTCATGTCATAAGAATGATATGAC
AATATGTTTAAATTGCTACTCATC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL7426Contig1 548 2 2 U
GAAGATGTGAGAAAAGCACAACCTGATGTTGTTGCTCATGGATCAGCTGGAATCATAAAC
CGTTTACAAGAAGCTGGTGATAAACTAGCTGAAGCACTTAGATCTTTGTGTTGGAGATAC
TACGGTATTCAAGCTGAGGAAGTGAAGCTGATAGGGTTAGATTCCCTTGGTTTTGACCTC
AGGCTTTGCGCAGGAGCAAAGATTGAGTCATTGCGGTTTGCATTCTCGACAAGGGCAACA
TCTGAAGATGACGCAGAGGAACAAATAAAAGAACTATTATTCCCGACAAGAGACCCGTCG
AAGCCGCCACTGGGAACAAGTCAGAAGGAGGCTTCTTAGTGCTCTCTAGTGATCGTTTAA
TGAAACTGCTAGGAGGAAACAGTAATCCAAACTGCAAATGCCATTGTCTGTGGGACAAAA
CATGTACAAGGGTGGGTTGAAGCATTCAATTGATTTTCGACGCTGTAATTGTGGTTTCTA
GTTTTTTGTTTTGTTTTGGGTTTACTTTTGCACAAATTGAGCATTCTAGTTTCAACCCAT
TCTTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2GK10TF U 1
AF RR2GK10JQ C 22
BS 1 545 RR2GK10TF
BS 546 548 RR2GK10JQ

RD RR2GK10TF 545 0 0
GAAGATGTGAGAAAAGCACAACCTGATGTTGTTGCTCATGGATCAGCTGGAATCATAAAC
CGTTTACAAGAAGCTGGTGATAAACTAGCTGAAGCACTTAGATCTTTGTGTTGGAGATAC
TACGGTATTCAAGCTGAGGAAGTGAAGCTGATAGGGTTAGATTCCCTTGGTTTTGACCTC
AGGCTTTGCGCAGGAGCAAAGATTGAGTCATTGCGGTTTGCATTCTCGACAAGGGCAACA
TCTGAAGATGACGCAGAGGAACAAATAAAAGAACTATTATTCCCGACAAGAGACCCGTCG
AAGCCGCCACTGGGAACAAGTCAGAAGGAGGCTTCTTAGTGCTCTCTAGTGATCGTTTAA
TGAAACTGCTAGGAGGAAACAGTAATCCAAACTGCAAATGCCATTGTCTGTGGGACAAAA
CATGTACAAGGGTGGGTTGAAGCATTCAATTGATTTTCGACGCTGTAATTGTGGTTTCTA
GTTTTTTGTTTTGTTTTGGGTTTACTTTTGCACAAATTGAGCATTCTAGTTTCAACCCAT
TCTTT

QA 1 545 1 545
DS 

RD RR2GK10JQ 527 0 0
CCTGATGTTGTTGCTCATGGATCAGCTGGAATCATAAACCGTTTACAAGAAGCTGGTGAT
AAACTAGCTGAAGCACTTAGATCTTTGTGTTGGAGATACTACGGTATTCAAGCTGAGGAA
GTGAAGCTGATAGGGTTAGATTCCCTTGGTTTTGACCTCAGGCTTTGCGCAGGAGCAAAG
ATTGAGTCATTGCGGTTTGCATTCTCGACAAGGGCAACATCTGAAGATGACGCAGAGGAA
CAAATAAAAGAACTATTATTCCCGACAAGAGACCCGTCGAAGCCGCCACTGGGAACAAGT
CAGAAGGAGGCTTCTTAGTGCTCTCTAGTGATCGTTTAATGAAACTGCTAGGAGGAAACA
GTAATCCAAACTGCAAATGCCATTGTCTGTGGGACAAAACATGTACAAGGGTGGGTTGAA
GCATTCAATTGATTTTCGACGCTGTAATTGTGGTTTCTAGTTTTTTGTTTTGTTTTGGGT
TTACTTTTGCACAAATTGAGCATTCTAGTTTCAACCCATTCTTTAGC

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 2

CO CL7427Contig1 524 2 1 U
GGGATGCGCCGGTTGAGATTCTTCTTCATCAGTAAACGCTTCCTCTTCTCAAATATGTGT
GTTCCCATCTGTGAATTTGATCAGTCCATTCCCCTAAATCATTTTCTTTCCAAAAATTAC
AGAGCTTGGAAAAGCAAACGATTATCAACTACTCTCCGATTTGAAAGCCGGCTCCACCGT
CAAAGTTCTTATCTTGGGATTATGGGAGACTGGCAATGTAAGATAAGGATCCTAGCTTCT
GTGTCTCACAAGTCACAACTCTGATGAAGAGGCCAAGAGCAGATAACTCAAGGTCCATAT
TTTTTTCTTCGTTCAATCTCAAGAAATCTGTCTTTTGAGTATATTTGACCTTTTTCCGTA
TGCATCCTTTTTCTGAATCATTCTTAAATCCAAGCTGATAACCATGTCTTTACTTTTCTG
TTTAGCTTTTTTGTTTTTTTCTCTCTCCAGATTTTGATGTTTCTGTTAAGAATTCCAGAA
AAAATGTTGTAAAGTTCTCTCCTTTTGATCAAAGCTTTGAGGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C596JQ C 1
AF RR2C596TF U 1
BS 1 524 RR2C596TF

RD RR2C596JQ 524 0 0
GGGATGCGCCGGTTGAGATTCTTCTTCATCAGTAAACGCTTCCTCTTCTCAAATATGTGT
GTTCCCATCTGTGAATTTGATCAGTCCATTCCCCTAAATCATTTTCTTTCCAAAAATTAC
AGAGCTTGGAAAAGCAAACGATTATCAACTACTCTCCGATTTGAAAGCCGGCTCCACCGT
CAAAGTTCTTATCTTGGGATTATGGGAGACTGGCAATGTAAGATAAGGATCCTAGCTTCT
GTGTCTCACAAGTCACAACTCTGATGAAGAGGCCAAGAGCAGATAACTCAAGGTCCATAT
TTTTTTCTTCGTTCAATCTCAAGAAATCTGTCTTTTGAGTATATTTGACCTTTTTCCGTA
TGCATCCTTTTTCTGAATCATTCTTAAATCCAAGCTGATAACCATGTCTTTACTTTTCTG
TTTAGCTTTTTTGTTTTTTTCTCTCTCCAGATTTTGATGTTTCTGTTAAGAATTCCAGAA
AAAATGTTGTAAAGTTCTCTCCTTTTGATCAAAGCTTTGAGGAC

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2C596TF 524 0 0
GGGATGCGCCGGTTGAGATTCTTCTTCATCAGTAAACGCTTCCTCTTCTCAAATATGTGT
GTTCCCATCTGTGAATTTGATCAGTCCATTCCCCTAAATCATTTTCTTTCCAAAAATTAC
AGAGCTTGGAAAAGCAAACGATTATCAACTACTCTCCGATTTGAAAGCCGGCTCCACCGT
CAAAGTTCTTATCTTGGGATTATGGGAGACTGGCAATGTAAGATAAGGATCCTAGCTTCT
GTGTCTCACAAGTCACAACTCTGATGAAGAGGCCAAGAGCAGATAACTCAAGGTCCATAT
TTTTTTCTTCGTTCAATCTCAAGAAATCTGTCTTTTGAGTATATTTGACCTTTTTCCGTA
TGCATCCTTTTTCTGAATCATTCTTAAATCCAAGCTGATAACCATGTCTTTACTTTTCTG
TTTAGCTTTTTTGTTTTTTTCTCTCTCCAGATTTTGATGTTTCTGTTAAGAATTCCAGAA
AAAATGTTGTAAAGTTCTCTCCTTTTGATCAAAGCTTTGAGGAC

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

CO CL7428Contig1 831 2 2 U
GTGGAAGACTCGGTTCAACATCATGGAAGGAATTTCCAGAGGTCTTTTGTACCTTCACAG
AGATTCAAGACTTAAGATCATACACAGAGATCTGAAAGCTAGCAACATTTTGTTAGATGA
CAATCTGAATCCAAAGATATCTGATTTTGGCCTTGCAAGAGTTTTCGAAGGGAATGAAGA
TGAAGCAGAAACAAGAAGAGTTGTTGGAACGTACGGCTATATGTCACCCGAGTATGCAAT
GGAAGGTTACTTTTCTGAAAAATCAGACGTTTTCAGCTTGGGGGTTATCTTTCTAGAGAT
CATAATGAAGAAAACAATCTCAACCTTTTAGCTTATGCGTGGAACCTGTGGAATGATGGG
AAGGCTGCTTCTCTAGCAAATCCAACAGTCTTCGATGAGTGTTTTGAGAAGGAAATAGCC
AAATGTGTTCAAATTGGTTTGTTATGTGTTCAAGAACTTGCGAACGATAGACCGAACGTT
TCGAACGTGATTTGGATGCTAACTACCGAGAATGCACACCTCCCCGAGGCAAAGCAGCCT
GCGTTTATAGCAAGAAGAGATTTTTCTGTGGTTGGATTATCTGACCGGAGTAGTCAAATG
GTCACTATCGATGATGCGAGTGTCACAGCTATAACAGGACGTTAAGCTCACAAAACCAAT
CTGTGTGTTTATATTATGTTTTGTGAATCTCATATGTTTACCACCTTTATTATTCTCTGC
TTATGTGTTAAAGGTTAGGTTAAAGATTAGGAGATGTATTTTAAAGAATTTATGTCAGGA
TCACTGACAACATGTTTTGTATTATTACCAGAGTTAAAAACAACTTGTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES95TF U 1
AF RR2ES95JQ C 10
BS 1 703 RR2ES95TF
BS 704 831 RR2ES95JQ

RD RR2ES95TF 703 0 0
GTGGAAGACTCGGTTCAACATCATGGAAGGAATTTCCAGAGGTCTTTTGTACCTTCACAG
AGATTCAAGACTTAAGATCATACACAGAGATCTGAAAGCTAGCAACATTTTGTTAGATGA
CAATCTGAATCCAAAGATATCTGATTTTGGCCTTGCAAGAGTTTTCGAAGGGAATGAAGA
TGAAGCAGAAACAAGAAGAGTTGTTGGAACGTACGGCTATATGTCACCCGAGTATGCAAT
GGAAGGTTACTTTTCTGAAAAATCAGACGTTTTCAGCTTGGGGGTTATCTTTCTAGAGAT
CATAATGAAGAAAACAATCTCAACCTTTTAGCTTATGCGTGGAACCTGTGGAATGATGGG
AAGGCTGCTTCTCTAGCAAATCCAACAGTCTTCGATGAGTGTTTTGAGAAGGAAATAGCC
AAATGTGTTCAAATTGGTTTGTTATGTGTTCAAGAACTTGCGAACGATAGACCGAACGTT
TCGAACGTGATTTGGATGCTAACTACCGAGAATGCACACCTCCCCGAGGCAAAGCAGCCT
GCGTTTATAGCAAGAAGAGATTTTTCTGTGGTTGGATTATCTGACCGGAGTAGTCAAATG
GTCACTATCGATGATGCGAGTGTCACAGCTATAACAGGACGTTAAGCTCACAAAACCAAT
CTGTGTGTTTATATTATGTTTTGTGAATCTCATATGTTTACCA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2ES95JQ 822 0 0
CTCGG
TCAACATCATGGAAGGAATTTCCAGAGGTCTTTTGTACCTTCACAGAGATTCAAGACTTA
AGATCATACACAGAGATCTGAAAGCTAGCAACATTTTGTTAGATGACAATCTGAATCCAA
AGATATCTGATTTTGGCCTTGCAAGAGTTTTCGAAGGGAATGAAGATGAAGCAGAAACAA
GAAGAGTTGTTGGAACGTACGGCTATATGTCACCCGAGTATGCAATGGAAGGTTACTTTT
CTGAAAAATCAGACGTTTTCAGCTTGGGGGTTATCTTTCTAGAGATCATAATGAAGAAAA
CAATCTCAACCTTTTAGCTTATGCGTGGAACCTGTGGAATGATGGGAAGGCTGCTTCTCT
AGCAAATCCAACAGTCTTCGATGAGTGTTTTGAGAAGGAAATAGCCAAATGTGTTCAAAT
TGGTTTGTTATGTGTTCAAGAACTTGCGAACGATAGACCGAACGTTTCGAACGTGATTTG
GATGCTAACTACCGAGAATGCACACCTCCCCGAGGCAAAGCAGCCTGCGTTTATAGCAAG
AAGAGATTTTTCTGTGGTTGGATTATCTGACCGGAGTAGTCAAATGGTCACTATCGATGA
TGCGAGTGTCACAGCTATAACAGGACGTTAAGCTCACAAAACCAATCTGTGTGTTTATAT
TATGTTTTGTGAATCTCATATGTTTACCACCTTTATTATTCTCTGCTTATGTGTTAAAGG
TTAGGTTAAAGATTAGGAGATGTATTTTAAAGAATTTATGTCAGGATCACTGACAACATG
TTTTGTATTATTACCAGAGTTAAAAACAACTTGTGCG

QA 6 822 6 822
DS 



AS 1 2

CO CL7429Contig1 524 2 1 U
GGGTCCAGTTTAAACCGAGTGAAACAATGGCTCCTCCGCAGAAGCTCGTTCTTGCCGCCA
TTCTCTCCGCCTTCATTGTCGCCACCACCACCGGAGATGGTTCTAGTAATGCTGCGGAAG
ATATTGTACATTCCTCCTGCGTTCACGCGAGCTATCCATTGCTATGCATCCGTACGCTCT
CTACTTACTCCGGTCCGACCATCACAAACCGCAGATGAGCAACGCGCAGACGTGGGCTAG
TGCTGCGTTGACGGACGACGACACGTGTCTCGATGGGTTTCAAGGGATCGACGGTGAGGT
CAAGTCGGAGGTGAAGGAGTGGATGACGAAAGTGGCGAGGGTTACGAGCAACGCGCTTTA
CATGATCAACCAGCTAGATGATAAACGTGGCAAGCCCCGCGTCGTACGTCCTTGATGTTA
ATGTACTTGTTGTCCTAATGGACTGTTGTGATGTTGTTAGTTTTTATTCGCGTGTGTTTA
ATTGCAAGTCATCTACAATATAAAAGGAAAGAGTTTTTAAAAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AI79JQ C 1
AF RR2AI79TF U 1
BS 1 524 RR2AI79TF

RD RR2AI79JQ 524 0 0
GGGTCCAGTTTAAACCGAGTGAAACAATGGCTCCTCCGCAGAAGCTCGTTCTTGCCGCCA
TTCTCTCCGCCTTCATTGTCGCCACCACCACCGGAGATGGTTCTAGTAATGCTGCGGAAG
ATATTGTACATTCCTCCTGCGTTCACGCGAGCTATCCATTGCTATGCATCCGTACGCTCT
CTACTTACTCCGGTCCGACCATCACAAACCGCAGATGAGCAACGCGCAGACGTGGGCTAG
TGCTGCGTTGACGGACGACGACACGTGTCTCGATGGGTTTCAAGGGATCGACGGTGAGGT
CAAGTCGGAGGTGAAGGAGTGGATGACGAAAGTGGCGAGGGTTACGAGCAACGCGCTTTA
CATGATCAACCAGCTAGATGATAAACGTGGCAAGCCCCGCGTCGTACGTCCTTGATGTTA
ATGTACTTGTTGTCCTAATGGACTGTTGTGATGTTGTTAGTTTTTATTCGCGTGTGTTTA
ATTGCAAGTCATCTACAATATAAAAGGAAAGAGTTTTTAAAAGC

QA 1 524 1 524
DS 

RD RR2AI79TF 524 0 0
GGGTCCAGTTTAAACCGAGTGAAACAATGGCTCCTCCGCAGAAGCTCGTTCTTGCCGCCA
TTCTCTCCGCCTTCATTGTCGCCACCACCACCGGAGATGGTTCTAGTAATGCTGCGGAAG
ATATTGTACATTCCTCCTGCGTTCACGCGAGCTATCCATTGCTATGCATCCGTACGCTCT
CTACTTACTCCGGTCCGACCATCACAAACCGCAGATGAGCAACGCGCAGACGTGGGCTAG
TGCTGCGTTGACGGACGACGACACGTGTCTCGATGGGTTTCAAGGGATCGACGGTGAGGT
CAAGTCGGAGGTGAAGGAGTGGATGACGAAAGTGGCGAGGGTTACGAGCAACGCGCTTTA
CATGATCAACCAGCTAGATGATAAACGTGGCAAGCCCCGCGTCGTACGTCCTTGATGTTA
ATGTACTTGTTGTCCTAATGGACTGTTGTGATGTTGTTAGTTTTTATTCGCGTGTGTTTA
ATTGCAAGTCATCTACAATATAAAAGGAAAGAGTTTTTAAAAGC

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

CO CL7430Contig1 778 2 3 U
GGGGCGGTGAACGATGAAACCTCCACATCTCTCCTCTGGCCATGAATTCATCGCCATGAA
AGCTTGAGCTCTCTCTCTCCGTGACTCTCTCTCTCCGCCATCTCTCTCTCCGCGTCTCTC
TGTCAGCGTCTCTCTCTTCGCATCTCTCTCGCCATGAAAGCTTGAGATCTCTCTCTCCGC
CTCTCTCTCTCCGTATCTCTCTCTCTCCGCGTCTCTCTCTCCGCATCTCTCTCTCAGGGG
ATGTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGACCCACCTTCAAAGTCCGTGAGTCCCAGGTTCA
TGAGAGTTTCCCTTTCTCCATTTCGCTGGCGTGGAAAGGAGCAGCTGTTAATGCTCAAAA
TGAAGGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTCCCCAAAGGAAACTCAATTCCTAG
TGCCAAGGCCCTAACGTTTTACCGCTCTGGAACATTCTCTGTCGATGTGCAGTACATTGA
TGTGACTGACTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGGTTTGATCTTTGCCCAA
TGTCGTGTGTATCCTTAAGACTGTAGCATGCCTTTTTTCAGTTGATGGATCTTATTATCA
GTCACGAGTTTGTTTGCTGAGTCTGAGATCATTTTGTGTTGAGTCAAGTCTCATATGTGG
GTTTTAGTTTTGAGAAATGGTGAATGATGATGTATGATTCAGTAATTGTTAAACCTATGT
TGTGTTTGTGTTGTTGTTGCAGGAAATGTAACGATGTATAAAGCTATATTTTGTGGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CL05JQ C 1
AF RR2CL05TF U 1
BS 1 742 RR2CL05TF
BS 743 743 RR2CL05JQ
BS 744 778 RR2CL05TF

RD RR2CL05JQ 778 0 0
GGGGCGGTGAACGATGAAACCTCCACATCTCTCCTCTGGCCATGAATTCATCGCCATGAA
AGCTTGAGCTCTCTCTCTCCGTGACTCTCTCTCTCCGCCATCTCTCTCTCCGCGTCTCTC
TGTCAGCGTCTCTCTCTTCGCATCTCTCTCGCCATGAAAGCTTGAGATCTCTCTCTCCGC
CTCTCTCTCTCCGTGTCTCTCTCTCTCCGCGTCTCTCTCTCCGCATCTCTCTCTCAGGGG
ATGTGCCTTGCAGTGTGCCATTTTCAGACCCACCTTCAAAGTCCGTGAGTCCCAGGTTCA
TGAGAGTTTCCCTTTCTCCATTTCGCTGGCGTGGAAAGGAGCAGCTGTTAATGCTCAAAA
TGAAGGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTCCCCAAAGGAAACTCAATTCCTAG
TGCCAAGGCCCTAACGTTTTACCGCTCTGGAACATTCTCTGTCGATGTGCAGTACATTGA
TGTGACTGACTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGGTTTGATCTTTGCCCAA
TGTCGTGTGTATCCTTAAGACTGTAGCATGCCTTTTTTCAGTTGATGGATCTTATTATCA
GTCACGAGTTTGTTTGCTGAGTCTGAGATCATTTTGTGTTGAGTCAAGTCTCATATGTGG
GTTTTAGTTTTGAGAAATGGTGAATGATGATGTATGATTCAGTAATTGTTAAACCTATGT
TGTGTTTGTGTTGTTGTTGCAGGAAATGTAACGATGTATAAAGCTATATTTTGTGGGC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2CL05TF 778 0 0
GGGGCGGTGAACGATGAAACCTCCACATCTCTCCTCTGGCCATGAATTCATCGCCATGAA
AGCTTGAGCTCTCTCTCTCCGTGACTCTCTCTCTCCGCCATCTCTCTCTCCGCGTCTCTC
TGTCAGCGTCTCTCTCTTCGCATCTCTCTCGCCATGAAAGCTTGAGATCTCTCTCTCCGC
CTCTCTCTCTCCGTATCTCTCTCTCTCCGCGTCTCTCTCTCCGCATCTCTCTCTCAGGGG
ATGTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGACCCACCTTCAAAGTCCGTGAGTCCCAGGTTCA
TGAGAGTTTCCCTTTCTCCATTTCGCTGGCGTGGAAAGGAGCAGCTGTTAATGCTCAAAA
TGAAGGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTCCCCAAAGGAAACTCAATTCCTAG
TGCCAAGGCCCTAACGTTTTACCGCTCTGGAACATTCTCTGTCGATGTGCAGTACATTGA
TGTGACTGACTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGGTTTGATCTTTGCCCAA
TGTCGTGTGTATCCTTAAGACTGTAGCATGCCTTTTTTCAGTTGATGGATCTTATTATCA
GTCACGAGTTTGTTTGCTGAGTCTGAGATCATTTTGTGTTGAGTCAAGTCTCATATGTGG
GTTTTAGTTTTGAGAAATGGTGAATGATGATGTATGATTCAGTAATTGTTAAACCTATGT
TGTGTTTGTGTTGTTGTTGCAG*AAATGTAACGATGTATAAAGCTATATTTTGTGGGC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL7431Contig1 901 2 2 U
GCAAAAGGGATTCAAGTGCAAGTTCTCTCATGATTTGAACATTCAAAGGAAGGGTGAGAA
GATCGATATCTACAGCGACAAGCGTGATGAAGATGGAGATATGGAGGAGTGGGATCAAGA
GACCCTTGAGAAGGTTGTGGAATCGAAGAAAAATGAATACAACCAGAACAAGCCAACTGA
TATTGTTTGCAAGTATTTTCTGGACGCGGTGGAAAAGAAACAGTATGGGTGTTTCTGGGC
TTGCCCCAATGGTGGAAAAGAGTGTCATTACAGACACGCTCTTCCTCCTGGATATATCCT
TAAATCTCAGATGCCGGTCGAAGAAGAAATCGAAAACGAGCGTGCAAAACTGAAAACGGC
AACGCAAATGACACCTGCGCTATTTATGGAGTGGAAGAGGAAGAAAATAGCTGAGAGAGA
TGCAGGTTTGGCTGCTTCTCAAGCCGAGAGAGCTAAGAACGACCGTATGAGTGGTCGGGA
GCTGTTTCTGTCCAATGCAAGCTTGTTTGTGGATGATGCTGAGGCTTTTGAAGAGTACCA
GAGGGAAAAGGAAGAGGAAGAGATTGAACAAAAGGAAAAGAACAAAGAAACAGAGGCAGG
GACAAGCAAGAGCAGTGGTGATGCTGAACAGAGTTCGAAAGAAGTGGATGAAGACGACGA
AGATGATGATGATGATGATGATTTGGACATGGACGAGCTTGATGAATTGGAAGCAAGCTT
GTCGAAAGCTTCGATCCAGATTCGTGAGCCAAACAATGAAGGATCATCATCTTGAGATGT
GTGAGAGGAAAGCACATGTTTTGGTTTGTGTACTTTCGATAATGTTGGATTGTGTACTTT
CAGTTACTGTCTTCAGATTTTAAAGCTCATCAAAGACTAATACCACCACCTCTTGTTGAG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2CH77TF U 1
AF RR2CH77JQ C 288
BS 1 595 RR2CH77TF
BS 596 901 RR2CH77JQ

RD RR2CH77TF 595 0 0
GCAAAAGGGATTCAAGTGCAAGTTCTCTCATGATTTGAACATTCAAAGGAAGGGTGAGAA
GATCGATATCTACAGCGACAAGCGTGATGAAGATGGAGATATGGAGGAGTGGGATCAAGA
GACCCTTGAGAAGGTTGTGGAATCGAAGAAAAATGAATACAACCAGAACAAGCCAACTGA
TATTGTTTGCAAGTATTTTCTGGACGCGGTGGAAAAGAAACAGTATGGGTGTTTCTGGGC
TTGCCCCAATGGTGGAAAAGAGTGTCATTACAGACACGCTCTTCCTCCTGGATATATCCT
TAAATCTCAGATGCCGGTCGAAGAAGAAATCGAAAACGAGCGTGCAAAACTGAAAACGGC
AACGCAAATGACACCTGCGCTATTTATGGAGTGGAAGAGGAAGAAAATAGCTGAGAGAGA
TGCAGGTTTGGCTGCTTCTCAAGCCGAGAGAGCTAAGAACGACCGTATGAGTGGTCGGGA
GCTGTTTCTGTCCAATGCAAGCTTGTTTGTGGATGATGCTGAGGCTTTTGAAGAGTACCA
GAGGGAAAAGGAAGAGGAAGAGATTGAACAAAAGGAAAAGAACAAAGAAACAGAG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2CH77JQ 614 0 0
CTGGATATATCCTTAAATCTCAGATGCCGGTCGAAGAAGAAATCGAAAACGAGCGTGCAA
AACTGAAAACGGCAACGCAAATGACACCTGCGCTATTTATGGAGTGGAAGAGGAAGAAAA
TAGCTGAGAGAGATGCAGGTTTGGCTGCTTCTCAAGCCGAGAGAGCTAAGAACGACCGTA
TGAGTGGTCGGGAGCTGTTTCTGTCCAATGCAAGCTTGTTTGTGGATGATGCTGAGGCTT
TTGAAGAGTACCAGAGGGAAAAGGAAGAGGAAGAGATTGAACAAAAGGAAAAGAACAAAG
AAACAGAGGCAGGGACAAGCAAGAGCAGTGGTGATGCTGAACAGAGTTCGAAAGAAGTGG
ATGAAGACGACGAAGATGATGATGATGATGATGATTTGGACATGGACGAGCTTGATGAAT
TGGAAGCAAGCTTGTCGAAAGCTTCGATCCAGATTCGTGAGCCAAACAATGAAGGATCAT
CATCTTGAGATGTGTGAGAGGAAAGCACATGTTTTGGTTTGTGTACTTTCGATAATGTTG
GATTGTGTACTTTCAGTTACTGTCTTCAGATTTTAAAGCTCATCAAAGACTAATACCACC
ACCTCTTGTTGAGC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7433Contig1 836 2 2 U
ATTCTGCCACCTGATGCTAATTAATTTTTTTTGTTGGTTGTGCAGATAATAGATATTGTG
GGAGAGTTGTTTCCGTTTATATTCAATAAAATAAACGAGAATTGCCAAAAGGAACTTGAA
GCTATTAGGAAGCAATACCCATTTGAGCCGTTGAAGTTTCTTCCAAAAACATTGAAATTA
ACCTTTGCAGAAGGGATCCAAATGCTTAAGGAAGTTGGCGTCGAGGCTGATCCTCTTGGA
GATCTAAATACAGAAACAGAGAGAAAACTTGGCCAGCTAGTTCGTGAAAAGTACGACACG
GACTTCTACATTCTGCATCGCTATCCTTCGGCGGTTAGGCCATTCTACACTATGCCATGT
GCGGACGACCCTAACTACAGCAACTCATTCGATGTCTTCATAAGAGGTGAGGAGATCATA
TCAGGAGCTCAACGTGTCCATGACCCAGAACTCTTGACGGAACAGGCTAAACGATTTGGG
ATTGATGTCGAGACAATAAAAACGTACATCGATTCATTCAGGTACGGTGCACCACCTCAC
GGTGGATTCGGAGTGGGACTGGAGCGAGTGGTAATACTCTTTTGTGGCCTCAACAACATC
CGCAAGACATCGCTATTCCCTCGCGACCCTCTAAGGCTCGCTCCTTAAACATATGATTTT
CATCTCAAAAGCTAAAGCTTGGAGACTCGGCAGATTTTTCTCTCATGAATATGTTTTGAG
AGTTATAATGGATCTCATAGTCTCTGACTGATTCTTGCCCTTTTAACTGCAAAGTTAAAC
TTGATTTAGTTGTGTGATACTTGCGCTTCATTCGCATTACCGAGTAAAACTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG84TF U 1
AF RR2BG84JQ C 82
BS 1 813 RR2BG84TF
BS 814 836 RR2BG84JQ

RD RR2BG84TF 813 0 0
ATTCTGCCACCTGATGCTAATTAATTTTTTTTGTTGGTTGTGCAGATAATAGATATTGTG
GGAGAGTTGTTTCCGTTTATATTCAATAAAATAAACGAGAATTGCCAAAAGGAACTTGAA
GCTATTAGGAAGCAATACCCATTTGAGCCGTTGAAGTTTCTTCCAAAAACATTGAAATTA
ACCTTTGCAGAAGGGATCCAAATGCTTAAGGAAGTTGGCGTCGAGGCTGATCCTCTTGGA
GATCTAAATACAGAAACAGAGAGAAAACTTGGCCAGCTAGTTCGTGAAAAGTACGACACG
GACTTCTACATTCTGCATCGCTATCCTTCGGCGGTTAGGCCATTCTACACTATGCCATGT
GCGGACGACCCTAACTACAGCAACTCATTCGATGTCTTCATAAGAGGTGAGGAGATCATA
TCAGGAGCTCAACGTGTCCATGACCCAGAACTCTTGACGGAACAGGCTAAACGATTTGGG
ATTGATGTCGAGACAATAAAAACGTACATCGATTCATTCAGGTACGGTGCACCACCTCAC
GGTGGATTCGGAGTGGGACTGGAGCGAGTGGTAATACTCTTTTGTGGCCTCAACAACATC
CGCAAGACATCGCTATTCCCTCGCGACCCTCTAAGGCTCGCTCCTTAAACATATGATTTT
CATCTCAAAAGCTAAAGCTTGGAGACTCGGCAGATTTTTCTCTCATGAATATGTTTTGAG
AGTTATAATGGATCTCATAGTCTCTGACTGATTCTTGCCCTTTTAACTGCAAAGTTAAAC
TTGATTTAGTTGTGTGATACTTGCGCTTCATTC

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2BG84JQ 755 0 0
TTCAATAAAATAAACGAGAATTGCCAAAAGGAACTTGAAGCTATTAGGAAGCAATACCCA
TTTGAGCCGTTGAAGTTTCTTCCAAAAACATTGAAATTAACCTTTGCAGAAGGGATCCAA
ATGCTTAAGGAAGTTGGCGTCGAGGCTGATCCTCTTGGAGATCTAAATACAGAAACAGAG
AGAAAACTTGGCCAGCTAGTTCGTGAAAAGTACGACACGGACTTCTACATTCTGCATCGC
TATCCTTCGGCGGTTAGGCCATTCTACACTATGCCATGTGCGGACGACCCTAACTACAGC
AACTCATTCGATGTCTTCATAAGAGGTGAGGAGATCATATCAGGAGCTCAACGTGTCCAT
GACCCAGAACTCTTGACGGAACAGGCTAAACGATTTGGGATTGATGTCGAGACAATAAAA
ACGTACATCGATTCATTCAGGTACGGTGCACCACCTCACGGTGGATTCGGAGTGGGACTG
GAGCGAGTGGTAATACTCTTTTGTGGCCTCAACAACATCCGCAAGACATCGCTATTCCCT
CGCGACCCTCTAAGGCTCGCTCCTTAAACATATGATTTTCATCTCAAAAGCTAAAGCTTG
GAGACTCGGCAGATTTTTCTCTCATGAATATGTTTTGAGAGTTATAATGGATCTCATAGT
CTCTGACTGATTCTTGCCCTTTTAACTGCAAAGTTAAACTTGATTTAGTTGTGTGATACT
TGCGCTTCATTCGCATTACCGAGTAAAACTTTATC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL7434Contig1 746 2 4 U
GTCAACACATTACTTTGTTTTCTTTCTTCATCATCTTACTGTTTTCTCAAATGCATGTAA
TACAAGATCTGTAAGTGCCAATTTGCAGATATCAAACAGAGAGACATCTTTGGGTTACTC
TATAGAGTGAGGGTAAAAACAGAAAGAAACTTCAAAATTTCAGCTAGTTGAGAAAGTGGG
AGAGAGGAATCAAACAACATTTTGATTCTAAAGACCCCTCCAGAAAAAAGATCTTGGTCA
TTCCTGCAAATAGTTTAGCTTCACCTTCTCCATCACTTTCCATAGTGCAGCTTTAGCTTC
TTCTAGTGTTTCAACGCCATGACCTTCCTCAAATGCTAGCCTTTGTATGTTAAACTGAGC
ACCTTGACGAACACGTACATCTATCCCTTTGCTATCTATAGAGATGAGTGCAGCATCGTC
TACTTCTGATTCAGTAGACAGTAGCTCCCTAAGCGGCTTTGAGAAGATAGCATTTAGTTC
CTTGAGGTTATGCTCACCACCATCAACAGCGATTTTATCTGGCTGTAAAGCCTCATACTC
CTTGACATCAACCCAAGCGACAGTCCCAAAACCTCCAATGAAATATATATCACTGATGTT
GTGCATTCTAAAATAGTGGAAGTTTCCCCACTGCTCGGAAGGTCCGTGATGGTGCTTTGC
ACTATATTGCTTATGTGCCCACTCCTGTTCATCTTGGGACAATGGGTGCACATCACCAAA
TAATGTCACTCTTGCATTCGATAAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GJ60JQB U 1
AF RR2GR14JQ U 1
BS 1 224 RR2GJ60JQB
BS 225 225 RR2GR14JQ
BS 226 736 RR2GJ60JQB
BS 737 746 RR2GR14JQ

RD RR2GJ60JQB 736 0 0
GTCAACACATTACTTTGTTTTCTTTCTTCATCATCTTACTGTTTTCTCAAATGCATGTAA
TACAAGATCTGTAAGTGCCAATTTGCAGATATCAAACAGAGAGACATCTTTGGGTTACTC
TATAGAGTGAGGGTAAAAACAGAAAGAAACTTCAAAATTTCAGCTAGTTGAGAAAGTGGG
AGAGAGGAATCAAACAACATTTTGATTCTAAAGACCCCTCCAGAGAAAAGATCTTGGTCA
TTCCTGCAAATAGTTTAGCTTCACCTTCTCCATCACTTTCCATAGTGCAGCTTTAGCTTC
TTCTAGTGTTTCAACGCCATGACCTTCCTCAAATGCTAGCCTTTGTATGTTAAACTGAGC
ACCTTGACGAACACGTACATCTATCCCTTTGCTATCTATAGAGATGAGTGCAGCATCGTC
TACTTCTGATTCAGTAGACAGTAGCTCCCTAAGCGGCTTTGAGAAGATAGCATTTAGTTC
CTTGAGGTTATGCTCACCACCATCAACAGCGATTTTATCTGGCTGTAAAGCCTCATACTC
CTTGACATCAACCCAAGCGACAGTCCCAAAACCTCCAATGAAATATATATCACTGATGTT
GTGCATTCTAAAATAGTGGAAGTTTCCCCACTGCTCGGAAGGTCCGTGATGGTGCTTTGC
ACTATATTGCTTATGTGCCCACTCCTGTTCATCTTGGGACAATGGGTGCACATCACCAAA
TAATGTCACTCTTGCA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RR2GR14JQ 746 0 0
GTCAACACATTACTTTGTTTTCTTTCTTCATCATCTTACTGTTTTCTCAAATGCATGTAA
TACAAGATCTGTAAGTGCCAATTTGCAGATATCAAACAGAGAGACATCTTTGGGTTACTC
TATAGAGTGAGGGTAAAAACAGAAAGAAACTTCAAAATTTCAGCTAGTTGAGAAAGTGGG
AGAGAGGAATCAAACAACATTTTGATTCTAAAGACCCCTCCAGAAAAAAGATCTTGGTCA
TTCCTGCAAATAGTTTAGCTTCACCTTCTCCATCACTTTCCATAGTGCAGCTTTAGCTTC
TTCTAGTGTTTCAACGCCATGACCTTCCTCAAATGCTAGCCTTTGTATGTTAAACTGAGC
ACCTTGACGAACACGTACATCTATCCCTTTGCTATCTATAGAGATGAGTGCAGCATCGTC
TACTTCTGATTCAGTAGACAGTAGCTCCCTAAGCGGCTTTGAGAAGATAGCATTTAGTTC
CTTGAGGTTATGCTCACCACCATCAACAGCGATTTTATCTGGCTGTAAAGCCTCATACTC
CTTGACATCAACCCAAGCGACAGTCCCAAAACCTCCAATGAAATATATATCACTGATGTT
GTGCATTCTAAAATAGTGGAAGTTTCCCCACTGCTCGGAAGGTCCGTGATGGTGCTTTGC
ACTATATTGCTTATGTGCCCACTCCTGTTCATCTTGGGACAATGGGTGCACATCACCAAA
TAATGTCACTCTTGCATTCGATAAGC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL7435Contig1 884 2 6 U
GGGAAGACTATCAAAGTCTCCTTCATAGGGATGTTTCTCGGTACGCCGGAGAGACTCTTA
AACATAACGAAAAAGAGCTTCCCGGAGCTACACTTGACGACGTCGGATTGCATGGTGAAG
AAGTGGATAGACACGGTGGTCTTCTGGGCGAACTACCCAGAGAAGGCACCGATAGAGATT
CTCCTCAAGAGGATCTCAGCGAACGAGTACTACTGGAAACGTACGTCAGACTTTGTTCAA
ACTCCTATCCCAAAGGAGGGTCTGGCGAAGATCTTCCAGACGATGATCGACCACTCGCCG
CTCCCGCGGCGAGTTTGGATGCAGTGGAACCCGTGGGGAGGGAGAATGGGTGAGATTCCC
TCTGACGCGACGGCGTTTGTTCATAGAGGAGGTAACTTGTTCATGATAGAGCATTTCATG
AACTGGTATAGACCTGGAGATGAGCTTGAGGAGAAGTTCTTGGCGATAGCGAGAAGCTTT
AAAGAAGCGATGGCTCCTTATGTTTCAAAGAACCCAAGAGAGGCTTTCTTTAATTACAGA
GACGTTGATATTGGTATCACGGTGCCGGGATATAATGCGACGTACGAAGGAGCTAAGGTT
TATGGGGAGAAGTATTTCAAAGGGAATTATTTGAGGTTGGTTAAGATTAAAGCCCGGTTC
GACCGGACTAACTTTTTCCCGGTCTCAGCAAGGGATTCCCGGTTCTTGCTTAGTCCCGGA
TTTGAGACTGGGCAGTATCATAAGAAATAAATGATGAAATTTGGGACTGGATTTGCGTTA
TTTCCGTGGTCAACGTGTATTGTTAAACTGTGATTTATTTTAGTCTCTAGGATAAGTCAT
CGTTGTAACTTCAGTCTATAATAAATGGAATGTGTTTTTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD66TF U 1
AF RR2AD66JQ C 19
BS 1 830 RR2AD66TF
BS 831 831 RR2AD66JQ
BS 832 834 RR2AD66TF
BS 835 835 RR2AD66JQ
BS 836 862 RR2AD66TF
BS 863 884 RR2AD66JQ

RD RR2AD66TF 862 0 0
GGGAAGACTATCAAAGTCTCCTTCATAGGGATGTTTCTCGGTACGCCGGAGAGACTCTTA
AACATAACGAAAAAGAGCTTCCCGGAGCTACACTTGACGACGTCGGATTGCATGGTGAAG
AAGTGGATAGACACGGTGGTCTTCTGGGCGAACTACCCAGAGAAGGCACCGATAGAGATT
CTCCTCAAGAGGATCTCAGCGAACGAGTACTACTGGAAACGTACGTCAGACTTTGTTCAA
ACTCCTATCCCAAAGGAGGGTCTGGCGAAGATCTTCCAGACGATGATCGACCACTCGCCG
CTCCCGCGGCGAGTTTGGATGCAGTGGAACCCGTGGGGAGGGAGAATGGGTGAGATTCCC
TCTGACGCGACGGCGTTTGTTCATAGAGGAGGTAACTTGTTCATGATAGAGCATTTCATG
AACTGGTATAGACCTGGAGATGAGCTTGAGGAGAAGTTCTTGGCGATAGCGAGAAGCTTT
AAAGAAGCGATGGCTCCTTATGTTTCAAAGAACCCAAGAGAGGCTTTCTTTAATTACAGA
GACGTTGATATTGGTATCACGGTGCCGGGATATAATGCGACGTACGAAGGAGCTAAGGTT
TATGGGGAGAAGTATTTCAAAGGGAATTATTTGAGGTTGGTTAAGATTAAAGCCCGGTTC
GACCGGACTAACTTTTTCCCGGTCTCAGCAAGGGATTCCCGGTTCTTGCTTAGTCCCGGA
TTTGAGACTGGGCAGTATCATAAGAAATAAATGATGAAATTTGGGACTGGATTTGCGTTA
TTTCCGTGGTCAACGTGTATTGTTAAACTGTGATTTATTTTAGTCTCTAG*ATA*GTCAT
CGTTGTAACTTCAGTCTATAAT

QA 1 862 1 862
DS 

RD RR2AD66JQ 866 0 0
CT
CTTCATAGGGATGTTTCTCGGTACGC*GGAGAGACTCTTAAACATAACGAAAAAGAGCTT
CCCGGAGCTACACTTGACGACGTCGGATTGCATGGTGAAGAAGTGGATAGACACGGTGGT
CTTCTGGGCGAACTACCCAGAGAAGGCACCGATAGAGATTCTCCTCAAGAGGATCTCAGC
GAACGAGTACTACTGGAAACGTACGTCAGACTTTGTTCAAACTCCTATCCCAAAGGAGGG
TCTGGCGAAGATCTTCCAGACGATGATCGACCACTCGCCGCTCCCGCGGCGAGTTTGGAT
GCAGTGGAACCCGTGGGGAGGGAGAATGGGTGAGATTCCCTCTGACGCGACGGCGTTTGT
TCATAGAGGAGGTAACTTGTTCATGATAGAGCATTTCATGAACTGGTATAGACCTGGAGA
TGAGCTTGAGGAGAAGTTCTTGGCGATAGCGAGAAGCTTTAAAGAAGCGATGGCTCCTTA
TGTTTCAAAGAACCCAAGAGAGGCTTTCTTTAATTACAGAGACGTTGATATTGGTATCAC
GGTGCCGGGATATAATGCGACGTACGAAGGAGCTAAGGTTTATGGGGAGAAGTATTTCAA
AGGGAATTATTTGAGGTTGGTTAAGATTAAAGCCCGGTTCGACCGGACTAACTTTTTCC*
GGTCTCAGCAAGGGATTCC*GGTTCTTGCTTAGTCCCGGATTTGAGACTGGGCAGTATCA
TAAGAAATAAATGATGAAATTTGGGACTGGATTTGCGTTATTTCCGTGGTCAACGTGTAT
TGTTAAACTGTGATTTATTTTAGTCTCTAGGATAAGTCATCGTTGTAACTTCAGTCTATA
ATAAATGGAATGTGTTTTTGTTTT

QA 3 866 3 866
DS 



AS 1 2

CO CL7436Contig1 437 2 1 U
GGACAGCAAAAAAAAAGGCATCAAAAGAAGAAGACAAACAAAAAAATTACAAGTTTAAAA
TCAAAGAGAAGTAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCAAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAA
ATGTGGTGACTCTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACATGGAGTGCGACAACTGCAGCTG
TGGATCAAACTGCAGCTGCGGCGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAACTGTGGTGTATCACA
TGCGTGCAGGAAAAACTGGGGGAAAAGTGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTG
AATAAAGATTTGGCATCATGTTGCCTAATAACTCTCTTAGCCTTGGCTTTTTCTCTATGT
GTTTGGTGTTTATTGTGTAATGTTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAAAATATCTATCGA
CTTTTGTGATTGTTATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A878JQ C 1
AF RR2A878TF U 1
BS 1 437 RR2A878TF

RD RR2A878JQ 437 0 0
GGACAGCAAAAAAAAAGGCATCAAAAGAAGAAGACAAACAAAAAAATTACAAGTTTAAAA
TCAAAGAGAAGTAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCAAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAA
ATGTGGTGACTCTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACATGGAGTGCGACAACTGCAGCTG
TGGATCAAACTGCAGCTGCGGCGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAACTGTGGTGTATCACA
TGCGTGCAGGAAAAACTGGGGGAAAAGTGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTG
AATAAAGATTTGGCATCATGTTGCCTAATAACTCTCTTAGCCTTGGCTTTTTCTCTATGT
GTTTGGTGTTTATTGTGTAATGTTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAAAATATCTATCGA
CTTTTGTGATTGTTATT

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR2A878TF 437 0 0
GGACAGCAAAAAAAAAGGCATCAAAAGAAGAAGACAAACAAAAAAATTACAAGTTTAAAA
TCAAAGAGAAGTAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCAAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAA
ATGTGGTGACTCTTGCAGTTGCGAGAAGAACTACAACATGGAGTGCGACAACTGCAGCTG
TGGATCAAACTGCAGCTGCGGCGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAACTGTGGTGTATCACA
TGCGTGCAGGAAAAACTGGGGGAAAAGTGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTG
AATAAAGATTTGGCATCATGTTGCCTAATAACTCTCTTAGCCTTGGCTTTTTCTCTATGT
GTTTGGTGTTTATTGTGTAATGTTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAAAATATCTATCGA
CTTTTGTGATTGTTATT

QA 1 437 1 437
DS 



AS 1 2

CO CL7437Contig1 885 2 6 U
GGTCATTCAAACCAAACCACCAAAGAATACAAACAAAGGAGCATATACATAAGTTTTGAT
TCCTCGACCAGTGGCAATAAGTGATATACATTAAAAAAACTATGATCTTATTGGACAAGA
GAGCGAAACATATATATAAAGACACGATTTTTTTTCAAAAGGGCAATCATCAAAAGTACC
TTTCAAGAAGAAGAAACAAAAGGTGAACTTGTGTCATACGTCTCTTTCTTCGATTCCTTG
CACTCGAAGCCACAGCCACACTGAGGCGACGCTAAGAACTCCTTGATCCCGAAATTCGCC
GACGTGATCCCGACGGAGAACTCCATCTCGTCCCCGTTCCTGATAACCTCGACGATGTTG
AGCCACAAGAACAGAACTTTCACCTTGATACCAGTCAGTTTCGTGAGCTTGTTCTCGGAG
ATGTAACCGCTGATCGTCGATTTGTAGTTCAGCTGGTAAGAGCCCACGAGCGAGAAGCTG
CATGAGTCTTTGAAATACGCGTGGAATTTGCCTGTCGATGTGTCTAAATCATAGGCGACG
ACTCCTTTTGGAAGGATTCCGACAGGAAAGTTGTAGCTCTGGAGGAGAGAATACGCCGTC
GGGGAATCTGATTCGGCGAGTGGAGAAGGTAGGTGGTAGAGGAAGAGACAAGCAGCGATG
AGAATCGGGAGACGAGACATTGGTTTGATTTTGATTTCGTTTTGCCGTCAGAGAGCTTTT
TGTATCGGTCGTTAGGAAGAAAGAGATACGATGGCGTTTTTGAGAAGACAACTGGACACA
TGAGTAACAGGCTGTTTCGTTTTAATGATAAGTCTAATTATTTCTGGAAAGGTATATCAT
CTACTTGATTAAGTTTAAATAATCTGCAATAAGACGTTTGTCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA58TF U 1
AF RR2BA58JQ C 269
BS 1 770 RR2BA58TF
BS 771 771 RR2BA58JQ
BS 772 790 RR2BA58TF
BS 791 791 RR2BA58JQ
BS 792 851 RR2BA58TF
BS 852 885 RR2BA58JQ

RD RR2BA58TF 856 0 0
GGTCATTCAAACCAAACCACCAAAGAATACAAACAAAGGAGCATATACATAAGTTTTGAT
TCCTCGACCAGTGGCAATAAGTGATATACATTAAAAAAACTATGATCTTATTGGACAAGA
GAGCGAAACATATATATAAAGACACGATTTTTTTTCAAAAGGGCAATCATCAAAAGTACC
TTTCAAGAAGAAGAAACAAAAGGTGAACTTGTGTCATACGTCTCTTTCTTCGATTCCTTG
CACTCGAAGCCACAGCCACACTGAGGCGACGCTAAGAACTCCTTGATCCCGAAATTCGCC
GACGTGATCCCGACGGAGAACTCCATCTCGTCCCCGTTCCTGATAACCTCGACGATGTTG
AGCCACAAGAACAGAACTTTCACCTTGATACCAGTCAGTTTCGTGAGCTTGTTCTCGGAG
ATGTAACCGCTGATCGTCGATTTGTAGTTCAGCTGGTAAGAGCCCACGAGCGAGAAGCTG
CATGAGTCTTTGAAATACGCGTGGAATTTGCCTGTCGATGTGTCTAAATCATAGGCGACG
ACTCCTTTTGGAAGGATTCCGACAGGAAAGTTGTAGCTCTGGAGGAGAGAATACGCCGTC
GGGGAATCTGATTCGGCGAGTGGAGAAGGTAGGTGGTAGAGGAAGAGACAAGCAGCGATG
AGAATCGGGAGACGAGACATTGGTTTGATTTTGATTTCGTTTTGCCGTCAGAGAGCTTTT
TGTATCGGTCGTTAGGAAGAAAGAGATACGATGGCGTTTTTGAGAAGACA*CTGGACACA
TGAGTAACAG*CTGTTTCGTTTTAATGATAAGTCTAATTATTTCTGGAAAGGTATATCAT
CTACTTGATTA
GTTTA

QA 1 851 1 851
DS 

RD RR2BA58JQ 617 0 0
ACGCTAAGAACTCCTTGATCCCGAAATTCGCCGACGTGATCCCGACGGAGAACTCCATCT
CGTCCCCGTTCCTGATAACCTCGACGATGTTGAGCCACAAGAACAGAACTTTCACCTTGA
TACCAGTCAGTTTCGTGAGCTTGTTCTCGGAGATGTAACCGCTGATCGTCGATTTGTAGT
TCAGCTGGTAAGAGCCCACGAGCGAGAAGCTGCATGAGTCTTTGAAATACGCGTGGAATT
TGCCTGTCGATGTGTCTAAATCATAGGCGACGACTCCTTTTGGAAGGATTCCGACAGGAA
AGTTGTAGCTCTGGAGGAGAGAATACGCCGTCGGGGAATTTGATTCGGCGAGTGGAGAAG
GTAGGTGGTAGAGGAAGAGACAAGCAGCGATGAGAATCGGGAGACGAGACATTGGTTTGA
TTTTGATTTCGTTTTGCCGTCAGAGAGCTTTTTGTATCGGTCGTTAGGAAGAAAGAGATA
CGATGGCGTTTTTGAGAAGACAACTGGACACATGAGTAACAGGCTGTTTCGTTTTAATGA
TAAGTCTAATTATTTCTGGAAAGGTATATCATCTACTTGATTAAGTTTAAATAATCTGCA
ATAAGACGTTTGTCAAC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL7438Contig1 776 2 10 U
GGATTGAAAACTGCAGCCTTTTAGCTCCCAAAAACAAAACCAAAAAATGGCTGAACAACA
AGATCATCACAAAGAGCTTCAGCTTTTGCCTTCTCCACCGTCGACGGAATCTCCGGTTAG
GAAACTCCGAGCAACAGTTATAACAACCGATCACCACCATTCCTCATCCATGATCCACCA
TGATCTCGACCTCAAACTCTCCATCAGCCTCAGCACAATTCCAACGGCGACGGTGGAGCA
TCTAAGCGATGGCGGAGGAGGAGGTGGTGGTTTGGAGGACCTGAAGTGGCAGGCAGCGGA
GCAGATAAGACTAGCGGCGATTGAGAAAGCTTACGCGGAGAGAGTCAGAGAGCTGACTCG
CCGTGAGATGGAGGTGGCTCAAGCTGAATTTGCTCGTGCAAGGTAAGGAAGCTTAAAGTA
TACGTAGTTCCGGTTTATTTTAGTTTGGTTTGGTTAACGGTTTTTGAATTTGGGATCAGG
GTGATATGGCGGAAGGCTAGGGAGGGGGTGGAGAGAGCGGAGAGGATGAAGGAGAGATCA
ATGACAAAGATCGATACGACTTGCTTGGAGATCACTTGCCACTCTTGCAGGCAACGGTTT
AGGCCTTAATTTATGCATTTAATTGTTTCTATTAACTATTGTTATTATAAACGAAATTTG
AATACTTGTTTAATTAGTATGATAAAATAATTTGGAAAAAGAGAGAAATTCCTTTGTTTA
AATCATTTCTTTGTTGTTATTTTCCATAACAAATTTGTGGCAAAGAGTTTGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ32TF U 1
AF RR2FJ32JQ C 22
BS 1 686 RR2FJ32TF
BS 687 687 RR2FJ32JQ
BS 688 699 RR2FJ32TF
BS 700 700 RR2FJ32JQ
BS 701 721 RR2FJ32TF
BS 722 722 RR2FJ32JQ
BS 723 742 RR2FJ32TF
BS 743 743 RR2FJ32JQ
BS 744 752 RR2FJ32TF
BS 753 776 RR2FJ32JQ

RD RR2FJ32TF 757 0 0
GGATTGAAAACTGCAGCCTTTTAGCTCCCAAAAACAAAACCAAAAAATGGCTGAACAACA
AGATCATCACAAAGAGCTTCAGCTTTTGCCTTCTCCACCGTCGACGGAATCTCCGGTTAG
GAAACTCCGAGCAACAGTTATAACAACCGATCACCACCATTCCTCATCCATGATCCACCA
TGATCTCGACCTCAAACTCTCCATCAGCCTCAGCACAATTCCAACGGCGACGGTGGAGCA
TCTAAGCGATGGCGGAGGAGGAGGTGGTGGTTTGGAGGACCTGAAGTGGCAGGCAGCGGA
GCAGATAAGACTAGCGGCGATTGAGAAAGCTTACGCGGAGAGAGTCAGAGAGCTGACTCG
CCGTGAGATGGAGGTGGCTCAAGCTGAATTTGCTCGTGCAAGGTAAGGAAGCTTAAAGTA
TACGTAGTTCCGGTTTATTTTAGTTTGGTTTGGTTAACGGTTTTTGAATTTGGGATCAGG
GTGATATGGCGGAAGGCTAGGGAGGGGGTGGAGAGAGCGGAGAGGATGAAGGAGAGATCA
ATGACAAAGATCGATACGACTTGCTTGGAGATCACTTGCCACTCTTGCAGGCAACGGTTT
AGGCCTTAATTTATGCATTTAATTGTTTCTATTAACTATTGTTATTATAAACGAAATTTG
AATACTTGTTTAATTAGTATGATAAA*TAATTTGGAAAA*GAGAGAAATTCCTTTGTTTA
A*TCATTTCTTTGTTGTTATTT*CCATAACAA
TTGTG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2FJ32JQ 755 0 0
TAGCTCCCAAAAACAAAACCAAAAAATGGCTGAACAACAAGATCATCACAAAGAGCTTCA
GCTTTTGCCTTCTCCACCGTCGACGGAATCTCCGGTTAGGAAACTCCGAGCAACAGTTAT
AACAACCGATCACCACCATTCCTCATCCATGATCCACCATGATCTCGACCTCAAACTCTC
CATCAGCCTCAGCACAATTCCAACGGCGACGGTGGAGCATCTAAGCGATGGCGGAGGAGG
AGGTGGTGGTTTGGAGGACCTGAAGTGGCAGGCAGCGGAGCAGATAAGACTAGCGGCGAT
TGAGAAAGCTTACGCGGAGAGAGTCAGAGAGCTGACTCGCCGTGAGATGGAGGTGGCTCA
AGCTGAATTTGCTCGTGCAAGGTAAGGAAGCTTAAAGTATACGTAGTTCCGGTTTATTTT
AGTTTGGTTTGGTTAACGGTTTTTGAATTTGGGATCAGGGTGATATGGCGGAAGGCTAGG
GAGGGGGTGGAGAGAGCGGAGAGGATGAAGGAGAGATCAATGACAAAGATCGATACGACT
TGCTTGGAGATCACTTGCCACTCTTGCAGGCAACGGTTTAGGCCTTAATTTATGCATTTA
ATTGTTTCTATTAACTATTGTTATTATAAACGAAATTTGAATACTTGTTTAATTAGTATG
ATAAAATAATTTGGAAAAAGAGAGAAATTCCTTTGTTTAAATCATTTCTTTGTTGTTATT
TTCCATAACAAATTTGTGGCAAAGAGTTTGTGTCC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL7439Contig1 579 2 1 U
GGAAATCGGGTGAGAGAAGAGAGAGGTGCGGAAACCCTAGATCTATCGGAGTAACAAGGA
AGCAATGTCGGATCCTTACGAGAGGGTTAACGGTGGAAGGTTAGCCTTCAAAGGAGGTGA
TCTAGCCACGAGTAAGTCCATCGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAACAACAGAAGAAGAA
CAAGAAGAAGCTCGACGAAGGCGCTGCTGACATTGAAAAGAACAACTCTTCAGCGAATTC
CTCCACCCCCGCAGACGACATCTACTCTATCGACGCCGCAAGAAGAAGAAGTACGACGAT
CTGTTCCCCGTGGAGGCAAAGAAATTCGGTTACATTCCCAAATCGAACTTCGAATCAGTA
GCAGAGGCTCTTGACGATCGAGTCACGAAGAAGGCAGATCGCTACTGTAAATAGAATGTT
TTACCATCCCAACTTGTATTCGTTATTGCATTGGTGTTTGTAGAATCTAATGACTTTATT
TTGATAAGAGTTAAATCTATTTGTAGCAGTTAAGAAAAAAAAAATTGAGTTGTAGTATTA
TGTATTTCAATACTTGAGTTTACTTCTGAGATATTCAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GL79JQ C 1
AF RR2GL79TF U 1
BS 1 579 RR2GL79TF

RD RR2GL79JQ 579 0 0
GGAAATCGGGTGAGAGAAGAGAGAGGTGCGGAAACCCTAGATCTATCGGAGTAACAAGGA
AGCAATGTCGGATCCTTACGAGAGGGTTAACGGTGGAAGGTTAGCCTTCAAAGGAGGTGA
TCTAGCCACGAGTAAGTCCATCGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAACAACAGAAGAAGAA
CAAGAAGAAGCTCGACGAAGGCGCTGCTGACATTGAAAAGAACAACTTTTCAGCGAATTC
CTCCACCCCCGCAGACGACATTTACTCTATCGACGCCGCAAGAAGAAGAAGTACGACGAT
CTGTTCCCCGTGGAGGCAAAGAAATTCGGTTACATTCCCAAATCGAACTTCGAATCAGTA
GCAGAGGCTCTTGACGATCGAGTCACGAAGAAGGCAGATCGCTACTGTAAATAGAATGTT
TTACCATCCCAACTTGTATTCGTTATTGCATTGGTGTTTGTAGAATCTAATGACTTTATT
TTGATAAGAGTTAAATCTATTTGTAGCAGTTAAGAAAAAAAAAATTGAGTTGTAGTATTA
TGTATTTCAATACTTGAGTTTACTTCTGAGATATTCAGC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2GL79TF 579 0 0
GGAAATCGGGTGAGAGAAGAGAGAGGTGCGGAAACCCTAGATCTATCGGAGTAACAAGGA
AGCAATGTCGGATCCTTACGAGAGGGTTAACGGTGGAAGGTTAGCCTTCAAAGGAGGTGA
TCTAGCCACGAGTAAGTCCATCGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAACAACAGAAGAAGAA
CAAGAAGAAGCTCGACGAAGGCGCTGCTGACATTGAAAAGAACAACTCTTCAGCGAATTC
CTCCACCCCCGCAGACGACATCTACTCTATCGACGCCGCAAGAAGAAGAAGTACGACGAT
CTGTTCCCCGTGGAGGCAAAGAAATTCGGTTACATTCCCAAATCGAACTTCGAATCAGTA
GCAGAGGCTCTTGACGATCGAGTCACGAAGAAGGCAGATCGCTACTGTAAATAGAATGTT
TTACCATCCCAACTTGTATTCGTTATTGCATTGGTGTTTGTAGAATCTAATGACTTTATT
TTGATAAGAGTTAAATCTATTTGTAGCAGTTAAGAAAAAAAAAATTGAGTTGTAGTATTA
TGTATTTCAATACTTGAGTTTACTTCTGAGATATTCAGC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL7440Contig1 602 2 2 U
TTTTTAATTCAGGCAACTTAGCTAAACAAAAAGCACCAGTTTCAAGTGATCCTGCAATAT
CTAAAGATGTAATGTTGTCATCTAGCTCTAGCTTTCTCCGCGCAACTGGGTCATCAAGAC
GTGCAGCTGTCTCCAGTAGTCGCGAGGCTGGAGTTCCTGGAACTGATTCCGAGCCATCAA
ACCCTCAAATCATTGAAGCTGGATCAAGCTCCAACCCAAAGACCCATGGTGGTCGAAACT
CACCTATCGTCTCATCTGAGAAGAAGATAGCATCATCATCATCTCCGTCAAGGGGAAATA
CTTCAGTCATGAAGAAGAACTATGAGTCCAATCTGAAAGGGATCGAGAGTCTGCACTTTT
AGTCGCTGGGTACTACTGACCAGTGAATGATCATAAACCCGGCCGGGACCAGTGTAAATT
TAAAGACAAAGAAAGCCTTTGTTAGACCACCCCCCCCCATGTTTTACAGGGAGGGAAGAC
TTTGCTTGTGCTTGTAAGCAACTCTCAAAATAACAAAAAGATAAAGAAAAGACTCTGAAG
AAGTGATTCCAGAGGAATACAGACTCAAAGAGGGGTGAGATCAAGGAGTCAATTGTCTTA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2CC58TF U 1
AF RR2CC58JQ C 450
BS 1 595 RR2CC58TF
BS 596 602 RR2CC58JQ

RD RR2CC58TF 595 0 0
TTTTTAATTCAGGCAACTTAGCTAAACAAAAAGCACCAGTTTCAAGTGATCCTGCAATAT
CTAAAGATGTAATGTTGTCATCTAGCTCTAGCTTTCTCCGCGCAACTGGGTCATCAAGAC
GTGCAGCTGTCTCCAGTAGTCGCGAGGCTGGAGTTCCTGGAACTGATTCCGAGCCATCAA
ACCCTCAAATCATTGAAGCTGGATCAAGCTCCAACCCAAAGACCCATGGTGGTCGAAACT
CACCTATCGTCTCATCTGAGAAGAAGATAGCATCATCATCATCTCCGTCAAGGGGAAATA
CTTCAGTCATGAAGAAGAACTATGAGTCCAATCTGAAAGGGATCGAGAGTCTGCACTTTT
AGTCGCTGGGTACTACTGACCAGTGAATGATCATAAACCCGGCCGGGACCAGTGTAAATT
TAAAGACAAAGAAAGCCTTTGTTAGACCACCCCCCCCCATGTTTTACAGGGAGGGAAGAC
TTTGCTTGTGCTTGTAAGCAACTCTCAAAATAACAAAAAGATAAAGAAAAGACTCTGAAG
AAGTGATTCCAGAGGAATACAGACTCAAAGAGGGGTGAGATCAAGGAGTCAATTG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2CC58JQ 153 0 0
CCCCCCCCCATGTTTTACAGGGAGGGAAGACTTTGCTTGTGCTTGTAAGCAACTCTCAAA
ATAACAAAAAGATAAAGAAAAGACTCTGAAGAAGTGATTCCAGAGGAATACAGACTCAAA
GAGGG*TGAGATCAAGGAGTCAATTGTCTTACC

QA 1 153 1 153
DS 



AS 1 2

CO CL7441Contig1 654 2 3 U
TTTTTTTGGCAATGGATTTAGCTTTTTATTTATCAATCAGTTTGCATATTACATCACCAA
CCAAAACCAAAAAAAAATATTCAGAAACCGAACACAGAATTTGTTAGACTTTCGGTCGCT
CCTCGTAGGCGTCACTGTCGGAGTCATTTTCATCATCACTCATCATGTCTTGTCTCTCAT
CTTTCCCTTCTAATTGTATACATTTGTACCATCTTGCACATGCAATGTACATCACTAGGT
CAACACTGGTCAACGCAGCCAGGAGGAAATAGAATCTGTCCAAGTGACCTTTGTTGAGGT
TCCTTGGAATCCAACCAGGCATGTGATCCACTGTAGAGATCTTCACCATCATCGTCACCA
GCAAGCTACTCACAAAGTTCCCCATCGACATTGACATCATACACAGTGCACTCCCAAAGC
TCTTCAGTCCATCTGGCGTCTGCGCATTGAAGAACTCGAGCTGACCCACGTACATGAATA
CTTCTGATGCTCCAATGAGTGAGTATTGTGGAACCTGCCAGAAGATGCTTAATGAGCTTG
AGCCATCACACTGAATGCAACTCTTGTCTGCATACTTAAGTCTAAAGCATTCCACAACCC
CAGCTGCAACCATAGCTAAGATAGCAATCACAAGTCCGATACCCATCCTGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CQ92JQ U 8
AF RR2CQ92TF C 1
BS 1 7 RR2CQ92TF
BS 8 578 RR2CQ92JQ
BS 579 654 RR2CQ92TF

RD RR2CQ92JQ 574 0 0
GGCAATGGATTTAGCTTTTTATTTATCAATCAGTTTGCATATTACATCACCAACCAAAAC
CAAAAAAAAATATTCAGAAACCGAACACAGAATTTGTTAGACTTTCGGTCGCTCCTCGTA
GGCGTCACTGTCGGAGTCATTTTCATCATCACTCATCATGTCTTGTCTCTCATCTTTCCC
TTCTAATTGTATACATTTGTACCATCTTGCACATGCAATGTACATCACTAGGTCAACACT
GGTCAACGCAGCCAGGAGGAAATAGAATCTGTCCAAGTGACCTTTGTTGAGGTTCCTTGG
AATCCAACCAGGCATGTGATCCACTGTAGAGATCTTCACCATCATCGTCACCAGCAAGCT
ACTCACAAAGTTCCCCATCGACATTGACATCATACACAGTGCACTCCCAAAGCTCTTCAG
TCCATCTGGCGTCTGCGCATTGAAGAACTCGAGCTGACCCACGTACATGAATACTTCTGA
TGCTCCAATGAGTGAGTATTGTGGAACCTGCCAGAAGATGCTTAATGAGCTTGAGCCATC
ACACTGAATGCAACTCTTGTCTGCATACTTA
GTC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2CQ92TF 654 0 0
TTTTTTTGGCAATGGATTTAGCTTTTTATTTATCAATCAGTTTGCATATTACATCACCAA
CCAAAACCAAAAAAAAATATTCAGAAACCGAACACAGAATTTGTTAGACTTTCGGTCGCT
CCTCGTAGGCGTCACTGTCGGAGTCATTTTCATCATCACTCATCATGTCTTGTCTCTCAT
CTTTCCCTTCTAATTGTATACATTTGTACCATCTTGCACATGCAATGTACATCACTAGGT
CAACACTGGTCAACGCAGCCAGGAGGAAATAGAATCTGTCCAAGTGACCTTTGTTGAGGT
TCCTTGGAATCCAACCAGGCATGTGATCCACTGTAGAGATCTTCACCATCATCGTCACCA
GCAAGCTACTCACAAAGTTCCCCATCGACATTGACATCATACACAGTGCACTCCCAAAGC
TCTTCAGTCCATCTGGCGTCTGCGCATTGAAGAACTCGAGCTGACCCACGTACATGAATA
CTTCTGATGCTCCAATGAGTGAGTATTGTGGAACCTGCCAGAAGATGCTTAATGAGCTTG
AGCCATCACACTGAATGCAACTCTTGTCTGCATACTTAAGTCTAAAGCATTCCACAACCC
CAGCTGCAACCATAGCTAAGATAGCAATCACAAGTCCGATACCCATCCTGTGCC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL7442Contig1 833 2 8 U
GGGGGGAAAGTTTCAGAGTCAAACCAAAACAGTGAAAGAAAACAAAGTCGTCGTCGACCC
ATGCCGTGATGTCTCCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGCTGTATAAATAATTTTCCT
TCTTCTTCTTCTGCATCGGAGCTATATCAATTGAAAACTGAAAGTGAGATGTCAAACTAT
CCGAAGATGACATGCGTATCATCATCGCATCAGAATCTAATGGAGAAGCTAATGCAACTC
CAGGAGAGGTTCTCCCATCTCCAAGCCGCCAGGAGAGAAGGGAGGCTCAACGATCACGCC
CTTCTCGAAGCGCAAATCTCTCAGAATCTCCTGGTCCCTTCGAGTGGCATCTCTTTGAGT
ACCAGATCAATGAATCCGATGCATGCGCCTTGTACCGACTAGAGCTCAAGTTGACAAACG
GAGAGAAGAGTCCTAAGGGAAGAGTCGCAAAAGACCCTCTGGCTGATCTGCAGAAGAAGA
TGGAGAAGATGGGACAGTTGACACCTGAGGTGGCTTCGGACAAACCGTCGCCTCCAACAA
AAGGTCGTGCAAAGGCTAACAAAGGAGTTAAAGCAGCAACCGGCAATCTAACTCAAGAGA
CTACAGTTCCTGCAACAGCAGCTTCGACGTATGGGCCAAACAATGAGCCGTGATAGTTTC
AGTATCTGAGTACTATCCGTTGAGAGATAGATAAGGATCATTGTAGTTATAACCTCTTAT
TTTTTTCTGAGAACCTGTGATGAGTTGTAAATGTTTTTAGCTTCTCTAAAGCCGCTTTGG
GTTTCGTCGAAAAAATTCTTGTGGAATTCTCTTGTATCATGTTTCAATATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO39TF U 1
AF RR2BO39JQ C 99
BS 1 695 RR2BO39TF
BS 696 696 RR2BO39JQ
BS 697 725 RR2BO39TF
BS 726 726 RR2BO39JQ
BS 727 732 RR2BO39TF
BS 733 733 RR2BO39JQ
BS 734 750 RR2BO39TF
BS 751 833 RR2BO39JQ

RD RR2BO39TF 768 0 0
GGGGGGAAAGTTTCAGAGTCAAACCAAAACAGTGAAAGAAAACAAAGTCGTCGTCGACCC
ATGCCGTGATGTCTCCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGCTGTATAAATAATTTTCCT
TCTTCTTCTTCTGCATCGGAGCTATATCAATTGAAAACTGAAAGTGAGATGTCAAACTAT
CCGAAGATGACATGCGTATCATCATCGCATCAGAATCTAATGGAGAAGCTAATGCAACTC
CAGGAGAGGTTCTCCCATCTCCAAGCCGCCAGGAGAGAAGGGAGGCTCAACGATCACGCC
CTTCTCGAAGCGCAAATCTCTCAGAATCTCCTGGTCCCTTCGAGTGGCATCTCTTTGAGT
ACCAGATCAATGAATCCGATGCATGCGCCTTGTACCGACTAGAGCTCAAGTTGACAAACG
GAGAGAAGAGTCCTAAGGGAAGAGTCGCAAAAGACCCTCTGGCTGATCTGCAGAAGAAGA
TGGAGAAGATGGGACAGTTGACACCTGAGGTGGCTTCGGACAAACCGTCGCCTCCAACAA
AAGGTCGTGCAAAGGCTAACAAAGGAGTTAAAGCAGCAACCGGCAATCTAACTCAAGAGA
CTACAGTTCCTGCAACAGCAGCTTCGACGTATGGGCCAAACAATGAGCCGTGATAGTTTC
AGTATCTGAGTACTATCCGTTGAGAGATAGATAAG*ATCATTGTAGTTATAACCTCTTAT
TTTTT*CTGAGA*CCTGTGATGAGTTGTAA
TGTTTTAGCTCTCTAAGC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RR2BO39JQ 735 0 0
TCGCTGTATAAATAATTTTCCTTCTTCTTCTTCTGCATCGGAGCTATATCAATTGAAAAC
TGAAAGTGAGATGTCAAACTATCCGAAGATGACATGCGTATCATCATCGCATCAGAATCT
AATGGAGAAGCTAATGCAACTCCAGGAGAGGTTCTCCCATCTCCAAGCCGCCAGGAGAGA
AGGGAGGCTCAACGATCACGCCCTTCTCGAAGCGCAAATCTCTCAGAATCTCCTGGTCCC
TTCGAGTGGCATCTCTTTGAGTACCAGATCAATGAATCCGATGCATGCGCCTTGTACCGA
CTAGAGCTCAAGTTGACAAACGGAGAGAAGAGTCCTAAGGGAAGAGTCGCAAAAGACCCT
CTGGCTGATCTGCAGAAGAAGATGGAGAAGATGGGACAGTTGACACCTGAGGTGGCTTCG
GACAAACCGTCGCCTCCAACAAAAGGTCGTGCAAAGGCTAACAAAGGAGTTAAAGCAGCA
ACCGGCAATCTAACTCAAGAGACTACAGTTCCTGCAACAGCAGCTTCGACGTATGGGCCA
AACAATGAGCCGTGATAGTTTCAGTATCTGAGTACTATCCGTTGAGAGATAGATAAGGAT
CATTGTAGTTATAACCTCTTATTTTTTTCTGAGAACCTGTGATGAGTTGTAAATGTTTTT
AGCTTCTCTAAAGCCGCTTTGGGTTTCGTCGAAAAAATTCTTGTGGAATTCTCTTGTATC
ATGTTTCAATATTCG

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL7443Contig1 698 2 3 U
GCTCCCTCTGGACACGATCAAAACGAAGCTCCAGGCCAAAGGCGCGTCGCAGTTGTACAG
CAGTAGCTTCGACGCTATAGTGAAGACTTTTCAAGAGAGAAGACGTATGAGTACTGCGTG
TACGGCACGGACATAGCTACGAGCTATGGAGCTGGTGCCTTTCTCCTCCTCTTTATAAGC
CAAGTCCTTATTATGAGTGCTAGCCGCTGCTTCTGCTGTGGGAGGTCTCTTAACCCGGGC
GGTTCAAGAGCTTGTGCCCTCCTTCTCTTCCTCATTTGCTGGGTATTCTTCCTGGTCGCT
GAGGTATGTTTGCTTGCCGCATCAATCAGAAACGCGTACCACACAAAATACAGGAAGATG
TGGAACATCGATAACCCGCCGAGCTGTGAAGTTATAAGGAAAGGAGTGTTCGCAGCTGGT
GCTGCTTTTACTCTCTTCACCGCCATCGTCTCTCAGTTCTATTACGTTTGCTACTCGCGT
GCTAGAGATGCCTACCAGAATCCGTCCTACTAAAATATGTCATACTTTCACAGCAAGCTA
CGTTTAGGCTTCAAGAGTTGGAAACCATATTCATGTGGGCAGTGAGTTTGTTTAGTTTCA
AGTGATACTACTTATTCGATGTTAAAAATTTGATGGTTTATCTTGAGGATGATACATTGA
GAAGTGGTTGTTTCTTAGTAAAAACATGCTTTTATATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DD91JQ C 1
AF RR2DD91TF U 1
BS 1 547 RR2DD91TF
BS 548 548 RR2DD91JQ
BS 549 698 RR2DD91TF

RD RR2DD91JQ 698 0 0
GCTCCCTCTGGACACGATCAAAACGAAGCTCCAGGCCAAAGGCGCGTCGCAGTTGTACAG
CAGTAGCTTCGACGCTATAGTGAAGACTTTTCAAGAGAGAAGACGTATGAGTACTGCGTG
TACGGCACGGACATAGCTACGAGCTATGGAGCTGGTGCCTTTCTCCTCCTCTTTATAAGC
CAAGTCCTTATTATGAGTGCTAGCCGCTGCTTCTGCTGTGGGAGGTCTCTTAACCCGGGC
GGTTCAAGAGCTTGTGCCCTCCTTCTCTTCCTCATTTGCTGGGTATTCTTCCTGGTCGCT
GAGGTATGTTTGCTTGCCGCATCAATCAGAAACGCGTACCACACAAAATACAGGAAGATG
TGGAACATCGATAACCCGCCGAGCTGTGAAGTTATAAGGAAAGGAGTGTTCGCAGCTGGT
GCTGCTTTTACTCTCTTCACCGCCATCGTCTCTCAGTTCTATTACGTTTGCTACTCGCGT
GCTAGAGATGCCTACCAGAATCCGTCCTACTAAAATATGTCATACTTTCACAGCAAGCTA
CGTTTAGGCTTCAAGAGTTGGAAACCATATTCATGTGGGCAGTGAGTTTGTTTAGTTTCA
AGTGATACTACTTATTCGATGTTAAAAATTTGATGGTTTATCTTGAGGATGATACATTGA
GAAGTGGTTGTTTCTTAGTAAAAACATGCTTTTATATT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2DD91TF 698 0 0
GCTCCCTCTGGACACGATCAAAACGAAGCTCCAGGCCAAAGGCGCGTCGCAGTTGTACAG
CAGTAGCTTCGACGCTATAGTGAAGACTTTTCAAGAGAGAAGACGTATGAGTACTGCGTG
TACGGCACGGACATAGCTACGAGCTATGGAGCTGGTGCCTTTCTCCTCCTCTTTATAAGC
CAAGTCCTTATTATGAGTGCTAGCCGCTGCTTCTGCTGTGGGAGGTCTCTTAACCCGGGC
GGTTCAAGAGCTTGTGCCCTCCTTCTCTTCCTCATTTGCTGGGTATTCTTCCTGGTCGCT
GAGGTATGTTTGCTTGCCGCATCAATCAGAAACGCGTACCACACAAAATACAGGAAGATG
TGGAACATCGATAACCCGCCGAGCTGTGAAGTTATAAGGAAAGGAGTGTTCGCAGCTGGT
GCTGCTTTTACTCTCTTCACCGCCATCGTCTCTCAGTTCTATTACGTTTGCTACTCGCGT
GCTAGAGATGCCTACCAGAATCCGTCCTACTAAAATATGTCATACTTTCACAGCAAGCTA
CGTTTAG*CTTCAAGAGTTGGAAACCATATTCATGTGGGCAGTGAGTTTGTTTAGTTTCA
AGTGATACTACTTATTCGATGTTAAAAATTTGATGGTTTATCTTGAGGATGATACATTGA
GAAGTGGTTGTTTCTTAGTAAAAACATGCTTTTATATT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL7444Contig1 637 2 1 U
GGCTCATAGCAGAAGCAACACAGCTGATTGAATCTTTAGAAATTAGTCATGTAGCTGCTT
CAGATGAAGATGGTACTCACCATCAGCCTAATACCGAAGATTCAAATGATCAAGAACAGC
CAGGAGAAGTGAACGGAACACACACATTACCACCAATCAATGGAGAGAGTCTTCACTTGA
ACTTGAGGTGTAGTGATTTGCCGACATTCAACATACAAGGTACCACAACAGTTGGGGTGA
TTCAACAGCCAAACGGAACAAGAGTTGATCCTCCTCCACCAGAGTATAATGGAGCTATCA
GACTTCCAAATGGTTCTCATGCTCGCCATGGAGTGGATGAAAAGGCGGAAGAATCTTTGG
AATCAGGGAATGTAACGAAGAAGTGGGTTCGTGGAAGGCTCGTAGAAGTCACATAAGCAG
CCTAAACTTGTTTTTTTTTCTTTCAAGTGGACATGAGGTGATTGTTGTAGAGGTTTAGCA
GAGAAAAAAAAACATATTGTTCAATTAGTGATTCGAAGTTTTGGCTTCTTGTTTGGTCTC
ATGCCGTGAGAGAAGCAGTTTCCAGTTTGAGAAGTGGCAGTTGTATCTATAATAACTCAA
TTGTATGTCAGAGTTTCAGCTTAGTAAACAATTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EY82TF U 1
AF RR2EY82JQ C 59
BS 1 637 RR2EY82TF

RD RR2EY82TF 637 0 0
GGCTCATAGCAGAAGCAACACAGCTGATTGAATCTTTAGAAATTAGTCATGTAGCTGCTT
CAGATGAAGATGGTACTCACCATCAGCCTAATACCGAAGATTCAAATGATCAAGAACAGC
CAGGAGAAGTGAACGGAACACACACATTACCACCAATCAATGGAGAGAGTCTTCACTTGA
ACTTGAGGTGTAGTGATTTGCCGACATTCAACATACAAGGTACCACAACAGTTGGGGTGA
TTCAACAGCCAAACGGAACAAGAGTTGATCCTCCTCCACCAGAGTATAATGGAGCTATCA
GACTTCCAAATGGTTCTCATGCTCGCCATGGAGTGGATGAAAAGGCGGAAGAATCTTTGG
AATCAGGGAATGTAACGAAGAAGTGGGTTCGTGGAAGGCTCGTAGAAGTCACATAAGCAG
CCTAAACTTGTTTTTTTTTCTTTCAAGTGGACATGAGGTGATTGTTGTAGAGGTTTAGCA
GAGAAAAAAAAACATATTGTTCAATTAGTGATTCGAAGTTTTGGCTTCTTGTTTGGTCTC
ATGCCGTGAGAGAAGCAGTTTCCAGTTTGAGAAGTGGCAGTTGTATCTATAATAACTCAA
TTGTATGTCAGAGTTTCAGCTTAGTAAACAATTATCC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2EY82JQ 579 0 0
TTCAGATGAAGATGGTACTCACCATCAGCCTAATACCGAAGATTCAAATGATCAAGAACA
GCCAGGAGAAGTGAACGGAACACACACATTACCACCAATCAATGGAGAGAGTCTTCACTT
GAACTTGAGGTGTAGTGATTTGCCGACATTCAACATACAAGGTACCACAACAGTTGGGGT
GATTCAACAGCCAAACGGAACAAGAGTTGATCCTCCTCCACCAGAGTATAATGGAGCTAT
CAGACTTCCAAATGGTTTTCATGCTCGCCATGGAGTGGATGAAAAGGCGGAAGAATCTTT
GGAATCAGGGAATGTAACGAAGAAGTGGGTTCGTGGAAGGCTCGTAGAAGTCACATAAGC
AGCCTAAACTTGTTTTTTTTTTTTTCAAGTGGACATGAGGTGATTGTTGTAGAGGTTTAG
CAGAGAAAAAAAAACATATTGTTCAATTAGTGATTCGAAGTTTTGGCTTCTTGTTTGGTC
TCATGCCGTGAGAGAAGCAGTTTCCAGTTTGAGAAGTGGCAGTTGTATCTATAATAACTC
AATTGTATGTCAGAGTTTCAGCTTAGTAAACAATTATCC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL7445Contig1 674 2 1 U
GGACTACTCTCTGCGCCGCGCTCTCTCTCTCGATCTTTCTGTTCCCTAAGCTTCTACGAT
CTTCCTCCTGTGGTTTCGTTTCTAAAAGAGTACAGAAGCAATGGCGAGCGGCTTGAGAGA
ACCACCGAACGAGCAAGCCGTTCTGAACATCTACGAGTCCATGAGATCAGAGCTGAGCCA
GATCTATTCCAACATCACCGATCTCGAGATGCAAGTCAGCGAACACTCCCTCGTCATCAA
CGCAATCCAGCCTCTCGACCAGTCGAGGAAATGCTTCCGCATGATAGGAGGCGTTCTTGT
GGAGAGAACCGTCAGAGAGGTGCTCCCAGCTGTCCAGCGCAATAAGGAAGGGCTCGAGGA
GGTTGTGAGGAAGCTTTACGAGACGTTGGAGAAGAAGAAGAAAGATATGAGTGAGTTTGA
AGCTAAGTATCAGATCAGGCTAAGGAAGCATGACGATTCCAAGGAAGAGGGTAATAACAA
AAAGGAAGGTAATGCTCAAGGTGTTCTTGTCGGCGCTGCTGCTGCCGCTGCCACTTCCAG
CCAGTAAAACTTTCTTCCTTCTTTTTATGTGTCTTCTTTAATGGTGTTTTGCTAAGTTTC
TCTGGAATGTTTTGCATGTTACAAAACTTAGTAGACTGGAGACTTATTACCAATTTATAG
ATCAGTTTTGTGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AS02JQ C 1
AF RR2AS02TF U 1
BS 1 674 RR2AS02TF

RD RR2AS02JQ 674 0 0
GGACTACTCTCTGCGCCGCGCTCTCTCTCTCGATCTTTCTGTTCCCTAAGCTTCTACGAT
CTTCCTCCTGTGGTTTCGTTTCTAAAAGAGTACAGAAGCAATGGCGAGCGGCTTGAGAGA
ACCACCGAACGAGCAAGCCGTTCTGAACATCTACGAGTCCATGAGATCAGAGCTGAGCCA
GATCTATTCCAACATCACCGATCTCGAGATGCAAGTCAGCGAACACTCCCTCGTCATCAA
CGCAATCCAGCCTCTCGACCAGTCGAGGAAATGCTTCCGCATGATAGGAGGCGTTCTTGT
GGAGAGAACCGTCAGAGAGGTGCTCCCAGCTGTCCAGCGCAATAAGGAAGGGCTCGAGGA
GGTTGTGAGGAAGCTTTACGAGACGTTGGAGAAGAAGAAGAAAGATATGAGTGAGTTTGA
AGCTAAGTATCAGATCAGGCTAAGGAAGCATGACGATTCCAAGGAAGAGGGTAATAACAA
AAAGGAAGGTAATGCTCAAGGTGTTCTTGTCGGCGCTGCTGCTGCCGCTGCCACTTCCAG
CCAGTAAAACTTTCTTCCTTCTTTTTATGTGTCTTCTTTAATGGTGTTTTGCTAAGTTTC
TCTGGAATGTTTTGCATGTTACAAAACTTAGTAGACTGGAGACTTATTACCAATTTATAG
ATCAGTTTTGTGAT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2AS02TF 674 0 0
GGACTACTCTCTGCGCCGCGCTCTCTCTCTCGATCTTTCTGTTCCCTAAGCTTCTACGAT
CTTCCTCCTGTGGTTTCGTTTCTAAAAGAGTACAGAAGCAATGGCGAGCGGCTTGAGAGA
ACCACCGAACGAGCAAGCCGTTCTGAACATCTACGAGTCCATGAGATCAGAGCTGAGCCA
GATCTATTCCAACATCACCGATCTCGAGATGCAAGTCAGCGAACACTCCCTCGTCATCAA
CGCAATCCAGCCTCTCGACCAGTCGAGGAAATGCTTCCGCATGATAGGAGGCGTTCTTGT
GGAGAGAACCGTCAGAGAGGTGCTCCCAGCTGTCCAGCGCAATAAGGAAGGGCTCGAGGA
GGTTGTGAGGAAGCTTTACGAGACGTTGGAGAAGAAGAAGAAAGATATGAGTGAGTTTGA
AGCTAAGTATCAGATCAGGCTAAGGAAGCATGACGATTCCAAGGAAGAGGGTAATAACAA
AAAGGAAGGTAATGCTCAAGGTGTTCTTGTCGGCGCTGCTGCTGCCGCTGCCACTTCCAG
CCAGTAAAACTTTCTTCCTTCTTTTTATGTGTCTTCTTTAATGGTGTTTTGCTAAGTTTC
TCTGGAATGTTTTGCATGTTACAAAACTTAGTAGACTGGAGACTTATTACCAATTTATAG
ATCAGTTTTGTGAT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL7446Contig1 936 2 2 U
GGGCGTATTTCTGCTGCTGATGTTCTTCAGCATCCGTGGCTTAGAGAAGGTGGAGAAGCA
TCGGACAAGCCTATTGACAGTGCTGTACTATCAAGGATGAAACAATTCAGAGCAATGAAT
AAGCTAAAGAAACTTGCTCTAAAGGTCATTGCGGAGAATATTAACACGGAAGAGATCCAA
GGATTGAAGGCAATGTTTGCTAACATAGACACAGACAACAGTGGCACAATCACATATGAA
GAACTGAGAGAAGGTTTAGCCAAACTGGGATCTAAACTCACAGAAGCTGAAGTGAAGCAG
CTCATGGATGCTGCTGATGTTGACGGGAACGGGTCAATAGACTACATTGAGTTTATTACT
GCAACTATGCATAGACACAGGCTTGAAAGTGATGAGAATCTTTACAAAGCTTTCCAGCAT
TTTGACAAAGACAGCAGCGGATACATTACAACAGACGAGCTGGAAGTAGCACTGAAAGAA
TATGGAATGGGAGATGATGCAACAATCAAAGAGGTTCTCTCAGATGTTGACTCTGATAAC
GATGGTAGAATCAACTATGAAGAGTTCTGTGCGATGATGAGAAGTGGAAATCCACAACAG
CAACAACCTCGACTGTTCTAGGGGATATTCTCAATGTCGTTCTCAGGTTTTTTTGTTTTT
TTTTCCTGTAAAACCGGAGATCCACAAGATCAAGAGGAGATGATTTGTATTTAATCAAGA
AAGTGGGGGAGCTGTATTGATATTTACCAAGACAAAAAATACATAAAGAGGAAGAAACTC
AAAACTCTGATTGCTTGTGTTTTGTACTTTACTTCTGTTTTGTTCCTCTTTTGTGTTTCT
GTGCCAAGGCTCTTGTGATAAGAGAGAAAGAGAGAAATATTCTTTATAAGAGTATGTATG
ATTTTACAATGTTTATTAACCTTTATGGAAGATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CT78TF U 1
AF RR2CT78JQ C 318
BS 1 646 RR2CT78TF
BS 647 936 RR2CT78JQ

RD RR2CT78TF 658 0 0
GGGCGTATTTCTGCTGCTGATGTTCTTCAGCATCCGTGGCTTAGAGAAGGTGGAGAAGCA
TCGGACAAGCCTATTGACAGTGCTGTACTATCAAGGATGAAACAATTCAGAGCAATGAAT
AAGCTAAAGAAACTTGCTCTAAAGGTCATTGCGGAGAATATTAACACGGAAGAGATCCAA
GGATTGAAGGCAATGTTTGCTAACATAGACACAGACAACAGTGGCACAATCACATATGAA
GAACTGAGAGAAGGTTTAGCCAAACTGGGATCTAAACTCACAGAAGCTGAAGTGAAGCAG
CTCATGGATGCTGCTGATGTTGACGGGAACGGGTCAATAGACTACATTGAGTTTATTACT
GCAACTATGCATAGACACAGGCTTGAAAGTGATGAGAATCTTTACAAAGCTTTCCAGCAT
TTTGACAAAGACAGCAGCGGATACATTACAACAGACGAGCTGGAAGTAGCACTGAAAGAA
TATGGAATGGGAGATGATGCAACAATCAAAGAGGTTCTCTCAGATGTTGACTCTGATAAC
GATGGTAGAATCAACTATGAAGAGTTCTGTGCGATGATGAGAAGTGGAAATCCACAACAG
CAACAACCTCGACTGTTCTAGGGGATATTCTCAATGTCGTTCTCAG
TCTTTTTGTTTT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2CT78JQ 619 0 0
TGTTGACGGGAACGGGTCAATAGACTACATTGAGTTTATTACTGCAACTATGCATAGACA
CAGGCTTGAAAGTGATGAGAATCTTTACAAAGCTTTCCAGCATTTTGACAAAGACAGCAG
GGGATACATTACAACAGACGAGCTGGAAGTAGCACTGAAAGAATATGGAATGGGAGATGA
TGCAACAATCAAAGAGGTTTTTTCAGATGTTGATTTTGATAACGATGGTAGAATCAACTA
TGAAGAGTTTTGTGCGATGATGAGAAGTGGAAATCCACAACAGCAACAACCTCGACTGTT
TTAGGGGATATTTTCAATGTCGTTTTCAGGTTTTTTTGTTTTTTTTTCCTGTAAAACCGG
AGATCCACAAGATCAAGAGGAGATGATTTGTATTTAATCAAGAAAGTGGGGGAGCTGTAT
TGATATTTACCAAGACAAAAAATACATAAAGAGGAAGAAACTCAAAACTCTGATTGCTTG
TGTTTTGTACTTTACTTCTGTTTTGTTCCTCTTTTGTGTTTCTGTGCCAAGGCTCTTGTG
ATAAGAGAGAAAGAGAGAAATATTCTTTATAAGAGTATGTATGATTTTACAATGTTTATT
AACCTTTATGGAAGATTTG

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL7447Contig1 1070 2 2 U
TTTTTTTTCTTCTCTCTCTCTCTCAATTCGAATCGAGAAAGAAACAAAAAAAGAGAGGAT
AGGATCTTCATCTCCGTCTCTCTGTTTGATTTCAGATTCATTTCGCGCCACGCAGCACAG
GTTCCTTAGGAGTGGTTAGGATCTTACTTTTATACTGAGCGATTGGATATTAAGATGTGG
CGATATTTCACATCTCAACCGCCAGTGTATGCGAGGAACTGGGCGAAAGTTCAGAACTTG
GTCGAATCGACTAAGATACAAGTAGTACCTAGTAACAAGGTGCACCGCAAAGAAAAGAAG
GAGAGCAAGAAACATAAGAACGTGAAATCCATTAAACAGCTATATCTACCGACCAAGAAA
TTGTCTGATGAGTCTGAACAGCTTGAGGGAAGTTGTTTGACAGAAGAGAATGTGAATCAT
CACCACGTTGGTTATTTATCTGATGGTAGCTAAAACAGTAACAAGAGAAGAAGGGAAGCT
TCTCCTGCTAACATCACAGCGACACCTGTAGTTAGTAAGCCTCTACGGATACGCTTTGTC
TTCAAGAAACCTTCTAAAGAAGCTGAAGTTTTTGTTCCTCGAGAGGATCGTCTTTACTCC
ACTTCAGGGACTGATCTACCTAGCATAGTATCAAGTTCTTCTGTCTCAGCTCATGATGAG
AATCTTCTTTCAACTTCTCTCGAGAATGACAAGACTGCAGTTCCTTCTGAATCAAAGAAG
AAAAAGAAACATAGGATTAGCAAAGAATCTCGGTACAGTTCATTGTTTGATGAACCGGTT
CTTCCCTACATTTTGATGGAGGTAGATGATGATAACAACAGCGATGACTGGCTTCTTGGT
GCAAGGCAGCATAACAAGGCTCCTTTCAAGTCTTGTATGAATGAACAAGACATGGTATCT
AACATGCACAAGTCAGGAGATTCCTGTTTCCCTAGTCCCCAGTTTTTGCCTGATGTGGAG
ATTTTTTCATTGCCATACACAGTCCTGTTTTAGCCCCCCACCCAATAATTGTTTTGTTCT
TTTTCAGCTTAGCCTTAGGCCTTAGTTTTGTTCAGTTCCACCGATTGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C488TF U 1
AF RR2C488JQ C 354
BS 1 660 RR2C488TF
BS 661 1070 RR2C488JQ

RD RR2C488TF 660 0 0
TTTTTTTTCTTCTCTCTCTCTCTCAATTCGAATCGAGAAAGAAACAAAAAAAGAGAGGAT
AGGATCTTCATCTCCGTCTCTCTGTTTGATTTCAGATTCATTTCGCGCCACGCAGCACAG
GTTCCTTAGGAGTGGTTAGGATCTTACTTTTATACTGAGCGATTGGATATTAAGATGTGG
CGATATTTCACATCTCAACCGCCAGTGTATGCGAGGAACTGGGCGAAAGTTCAGAACTTG
GTCGAATCGACTAAGATACAAGTAGTACCTAGTAACAAGGTGCACCGCAAAGAAAAGAAG
GAGAGCAAGAAACATAAGAACGTGAAATCCATTAAACAGCTATATCTACCGACCAAGAAA
TTGTCTGATGAGTCTGAACAGCTTGAGGGAAGTTGTTTGACAGAAGAGAATGTGAATCAT
CACCACGTTGGTTATTTATCTGATGGTAGCTAAAACAGTAACAAGAGAAGAAGGGAAGCT
TCTCCTGCTAACATCACAGCGACACCTGTAGTTAGTAAGCCTCTACGGATACGCTTTGTC
TTCAAGAAACCTTCTAAAGAAGCTGAAGTTTTTGTTCCTCGAGAGGATCGTCTTTACTCC
ACTTCAGGGACTGATCTACCTAGCATAGTATCAAGTTCTTCTGTCTCAGCTCATGATGAG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2C488JQ 717 0 0
CAAGAAATTGTCTGATGAGTCTGAACAGCTTGAGGGAAGTTGTTTGACAGAAGAGAATGT
GAATCATCACCACGTTGGTTATTTATCTGATGGTAGCTAAAACAGTAACAAGAGAAGAAG
GGAAGCTTCTCCTGCTAACATCACAGCGACACCTGTAGTTAGTAAGCCTCTACGGATACG
CTTTGTCTTCAAGAAACCTTCTAAAGAAGCTGAAGTTTTTGTTCCTCGAGAGGATCGTCT
TTACTCCACTTCAGGGACTGATCTACCTAGCATAGTATCAAGTTCTTCTGTCTCAGCTCA
TGATGAGAATCTTCTTTCAACTTCTCTCGAGAATGACAAGACTGCAGTTCCTTCTGAATC
AAAGAAGAAAAAGAAACATAGGATTAGCAAAGAATCTCGGTACAGTTCATTGTTTGATGA
ACCGGTTCTTCCCTACATTTTGATGGAGGTAGATGATGATAACAACAGCGATGACTGGCT
TCTTGGTGCAAGGCAGCATAACAAGGCTCCTTTCAAGTCTTGTATGAATGAACAAGACAT
GGTATCTAACATGCACAAGTCAGGAGATTCCTGTTTCCCTAGTCCCCAGTTTTTGCCTGA
TGTGGAGATTTTTTCATTGCCATACACAGTCCTGTTTTAGCCCCCCACCCAATAATTGTT
TTGTTCTTTTTCAGCTTAGCCTTAGGCCTTAGTTTTGTTCAGTTCCACCGATTGTAA

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL7448Contig1 867 2 2 U
GGGGGGAACACCCTGGCACAACTATTGTTACAGACAGTGTCACTTCTGACGGTTTAACCT
CATTCATTGAGAAGAAGCTCGGGGGAAAGCATCACAGGTTCAAAAGAGGATACAAGAATG
TCATTGATGAAGCTATTCGCTTGAACTCTACTGGAGAAGAAACACATCTGGCTATAGAAA
CTAGTGGCCATGGAGCTTTGAAAGAAAACCATTGGCTTGATGATGGGGCTTATCTCATGG
TAAAAATATTGAATAAACTGGCTTCTGCCAGAGCTGCTGGTAAAGGAAGTGGCAGCAAAG
TTTTAACTGATCTTGTTGAAGGTCTTGATGAGCCCAAAGTGGCTTTGGAACTGAGGCTTA
AAATCGACAAGAATCACTCCGACCTTGAAGGAAGAGATTTTCGGGAGTATGGAGAGATGG
CCTTGCAACAAGTGTCGAACAATAGAAACGAATCCAAATCTAAAAAGAGCTCCAGTTAAC
TATGAAGGGATCCGTGTTTCGGGTTTTGGTGGATGGTTTCTTCTCAGACTTTCTCTCCAC
GACCCTGTTCTTCCCCTTAACATCGAGGCGCAGAGTGAGGATGATGCTGTGAAGTTAGGC
CTTGTGGTTGCTAACGCAGTGAAAGAGTTCAAAGCTTTGGACACCTCTGCCTTGTCCAAT
CTCACTCATTCATAAAAGATTGGTTTACCTGGGTCTTGCGGATGCTGTGGAAACTTCTTG
TCCTGTTTTCTTCATTCTTAAATCGAACAAAACAAAGTTACTCTTTCCGGATCATATCAA
ATGTTGTTATATATTTGAAAACCTTTTGAGTGTGTTTTACATTCTCAATTTTCAGTGCAT
ACATTTAATAAAAATTAATTTTATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AO81TF U 1
AF RR2AO81JQ C 49
BS 1 765 RR2AO81TF
BS 766 867 RR2AO81JQ

RD RR2AO81TF 765 0 0
GGGGGGAACACCCTGGCACAACTATTGTTACAGACAGTGTCACTTCTGACGGTTTAACCT
CATTCATTGAGAAGAAGCTCGGGGGAAAGCATCACAGGTTCAAAAGAGGATACAAGAATG
TCATTGATGAAGCTATTCGCTTGAACTCTACTGGAGAAGAAACACATCTGGCTATAGAAA
CTAGTGGCCATGGAGCTTTGAAAGAAAACCATTGGCTTGATGATGGGGCTTATCTCATGG
TAAAAATATTGAATAAACTGGCTTCTGCCAGAGCTGCTGGTAAAGGAAGTGGCAGCAAAG
TTTTAACTGATCTTGTTGAAGGTCTTGATGAGCCCAAAGTGGCTTTGGAACTGAGGCTTA
AAATCGACAAGAATCACTCCGACCTTGAAGGAAGAGATTTTCGGGAGTATGGAGAGATGG
CCTTGCAACAAGTGTCGAACAATAGAAACGAATCCAAATCTAAAAAGAGCTCCAGTTAAC
TATGAAGGGATCCGTGTTTCGGGTTTTGGTGGATGGTTTCTTCTCAGACTTTCTCTCCAC
GACCCTGTTCTTCCCCTTAACATCGAGGCGCAGAGTGAGGATGATGCTGTGAAGTTAGGC
CTTGTGGTTGCTAACGCAGTGAAAGAGTTCAAAGCTTTGGACACCTCTGCCTTGTCCAAT
CTCACTCATTCATAAAAGATTGGTTTACCTGGGTCTTGCGGATGCTGTGGAAACTTCTTG
TCCTGTTTTCTTCATTCTTAAATCGAACAAAACAAAGTTACTCTT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2AO81JQ 819 0 0
ACGGTTTAACCTCATTCATTGAGAAGAAGCTCGGGGGAAAGCATCACAGGTTCAAAAGAG
GATACAAGAATGTCATTGATGAAGCTATTCGCTTGAACTCTACTGGAGAAGAAACACATC
TGGCTATAGAAACTAGTGGCCATGGAGCTTTGAAAGAAAACCATTGGCTTGATGATGGGG
CTTATCTCATGGTAAAAATATTGAATAAACTGGCTTCTGCCAGAGCTGCTGGTAAAGGAA
GTGGCAGCAAAGTTTTAACTGATCTTGTTGAAGGTCTTGATGAGCCCAAAGTGGCTTTGG
AACTGAGGCTTAAAATCGACAAGAATCACTCCGACCTTGAAGGAAGAGATTTTCGGGAGT
ATGGAGAGATGGCCTTGCAACAAGTGTCGAACAATAGAAACGAATCCAAATCTAAAAAGA
GCTCCAGTTAACTATGAAGGGATCCGTGTTTCGGGTTTTGGTGGATGGTTTCTTCTCAGA
CTTTCTCTCCACGACCCTGTTCTTCCCCTTAACATCGAGGCGCAGAGTGAGGATGATGCT
GTGAAGTTAGGCCTTGTGGTTGCTAACGCAGTGAAGGAGTTCAAAGCTTTGGACACCTCT
GCCTTGTCCAATCTCACTCATTCATAAAAGATTGGTTTACCTGGGTCTTGCGGATGCTGT
GGAAACTTCTTGTCCTGTTTTCTTCATTCTTAAATCGAACAAAACAAAGTTACTCTTTCC
GGATCATATCAAATGTTGTTATATATTTGAAAACCTTTTGAGTGTGTTTTACATTCTCAA
TTTTCAGTGCATACATTTAATAAAAATTAATTTTATCTT

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 2

CO CL7449Contig1 607 2 1 U
GGAAACCAAGTTCGCACAATGGGTTCTGCCTCCAATCCTCTCGTCACTCCCTCCGCCGTC
GACTCCTCCTCGCCGCTCCCCTCGAAGAAGTTCGTGGTGATCGTCGACGAGTCGAAGCTC
GTGAAGCATCTCGGAGGGAGCGGGCTCGCCGTCCCCGTGGAGGTCGTGCCGTTCTGCTGC
GACTTCACGAGGGGGAAGCTTGAGGAGCTTTTTAAGGAAGCGGGGTGCACGGCGAAGCTT
AGGGTTGTGATCGGAGCTAACGGCGGTGAGACGGCGGCTGTGACGGACAATGGGAACTAC
GTGGTGGATCTGTACTGGAGAGGGATATGGGAGATTTGGAGGCGGCGAGTGAGAAGATAC
TGAGGTTGCCTGGAGTGGTGGAGCACAGGATGTTTCTTGGGATTGCGACGACCTTGATCG
TCGCCGGGAAAGCCGGTATGACGGTTAGTGATAGGTTTGGGTAAAAGAGTAATTTCGTTG
GGGGGAAAATTAGGGTTTATGGTTTGGTTTTTTGGTTTAAGATGGATCTTTGCTTCTGTA
AACCCTTTGACTTATTCTAGTACGTGTAAGAGTTTGACTCTTGAATGCTTACTGTTTGGT
TGGTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EU14JQ C 1
AF RR2EU14TF U 1
BS 1 607 RR2EU14TF

RD RR2EU14JQ 607 0 0
GGAAACCAAGTTCGCACAATGGGTTCTGCCTCCAATCCTCTCGTCACTCCCTCCGCCGTC
GACTCCTCCTCGCCGCTCCCCTCGAAGAAGTTCGTGGTGATCGTCGACGAGTCGAAGCTC
GTGAAGCATCTCGGAGGGAGCGGGCTCGCCGTCCCCGTGGAGGTCGTGCCGTTCTGCTGC
GACTTCACGAGGGGGAAGCTTGAGGAGCTTTTTAAGGAAGCGGGGTGCACGGCGAAGCTT
AGGGTTGTGATCGGAGCTAACGGCGGTGAGACGGCGGCTGTGACGGACAATGGGAACTAC
GTGGTGGATCTGTACTGGAGAGGGATATGGGAGATTTGGAGGCGGCGAGTGAGAAGATAC
TGAGGTTGCCTGGAGTGGTGGAGCACAGGATGTTTCTTGGGATTGCGACGACCTTGATCG
TCGCCGGGAAAGCCGGTATGACGGTTAGTGATAGGTTTGGGTAAAAGAGTAATTTCGTTG
GGGGGAAAATTAGGGTTTATGGTTTGGTTTTTTGGTTTAAGATGGATCTTTGCTTCTGTA
AACCCTTTGACTTATTCTAGTACGTGTAAGAGTTTGACTCTTGAATGCTTACTGTTTGGT
TGGTTTT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2EU14TF 607 0 0
GGAAACCAAGTTCGCACAATGGGTTCTGCCTCCAATCCTCTCGTCACTCCCTCCGCCGTC
GACTCCTCCTCGCCGCTCCCCTCGAAGAAGTTCGTGGTGATCGTCGACGAGTCGAAGCTC
GTGAAGCATCTCGGAGGGAGCGGGCTCGCCGTCCCCGTGGAGGTCGTGCCGTTCTGCTGC
GACTTCACGAGGGGGAAGCTTGAGGAGCTTTTTAAGGAAGCGGGGTGCACGGCGAAGCTT
AGGGTTGTGATCGGAGCTAACGGCGGTGAGACGGCGGCTGTGACGGACAATGGGAACTAC
GTGGTGGATCTGTACTGGAGAGGGATATGGGAGATTTGGAGGCGGCGAGTGAGAAGATAC
TGAGGTTGCCTGGAGTGGTGGAGCACAGGATGTTTCTTGGGATTGCGACGACCTTGATCG
TCGCCGGGAAAGCCGGTATGACGGTTAGTGATAGGTTTGGGTAAAAGAGTAATTTCGTTG
GGGGGAAAATTAGGGTTTATGGTTTGGTTTTTTGGTTTAAGATGGATCTTTGCTTCTGTA
AACCCTTTGACTTATTCTAGTACGTGTAAGAGTTTGACTCTTGAATGCTTACTGTTTGGT
TGGTTTT

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL7450Contig1 743 2 4 U
TCTAGAGATCCTAGTCGTTGAAGAGACATGTTTTGGGAGGGAGGGCTTTTTCCTTTCGTC
CCCCAAACTCCAGTTTAGTAAGAACTTTTGGGTTCCAGGCCGGAGGTTCGTACCTCACAT
CAGCTACAACATATCCGAGGAGAAAAAAAGCATTGTGCATGAAGAATTTATGAACAACAT
GATATCCGGGGAGCTTTGTGAATTGATTGGAGATGTGCATAAATCAATGTCGGTGAATAT
AGATTTAATGAATCGGAGGGAAGTTGAGAGGTTACGACAAGTCTTACGTCTATGGATTTG
TGAAATGTTGGTACTCGAGATCATATTTAAGGATAACAACAAGAATTCTCCTAATGAGTC
TTGGGAGAAGGAGAAGAAGTTGTGGGAAGAGGATAATGACAAGAATAATGTTGTTGCGTT
CCCCGATGCTAAATTCCGCGTGAAAGCTCTGTGGATGCCTAACTTCAGCGGTTCTGAGGA
AGAGTTTGCCTTTGCGTCGTGTTTGATCAAGCATGGGACGATGGTAGATAAGGTGATGAT
AAAGACGTCGGTGTTTACTGCAAGTAAGAAGTTGGAGGTAGAAGCTGCGGTGGATAAGCT
GAGAGCGCTTCAAACAGAAGAAGACCAATTAAAGATCAAATGTTTCTGATGGAATTTTAA
TTTGTTTCAAATCTAATACAAGATACCTGTGCAAGTTTTAGACTCTCACAATCTTCAGGA
TATCATTAACTTTTAAATGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DB77TF U 1
AF RR2DB77JQ C 16
BS 1 467 RR2DB77TF
BS 468 468 RR2DB77JQ
BS 469 559 RR2DB77TF
BS 560 743 RR2DB77JQ

RD RR2DB77TF 559 0 0
TCTAGAGATCCTAGTCGTTGAAGAGACATGTTTTGGGAGGGAGGGCTTTTTCCTTTCGTC
CCCCAAACTCCAGTTTAGTAAGAACTTTTGGGTTCCAGGCCGGAGGTTCGTACCTCACAT
CAGCTACAACATATCCGAGGAGAAAAAAAGCATTGTGCATGAAGAATTTATGAACAACAT
GATATCCGGGGAGCTTTGTGAATTGATTGGAGATGTGCATAAATCAATGTCGGTGAATAT
AGATTTAATGAATCGGAGGGAAGTTGAGAGGTTACGACAAGTCTTACGTCTATGGATTTG
TGAAATGTTGGTACTCGAGATCATATTTAAGGATAACAACAAGAATTCTCCTAATGAGTC
TTGGGAGAAGGAGAAGAAGTTGTGGGAAGAGGATAATGACAAGAATAATGTTGTTGCGTT
CCCCGATGCTAAATTCCGCGTGAAAGCTCTGTGGATGCCTAACTTCATCGGTTCTGAGGA
AGAGTTTGCCTTTGCGTCGTGTTTGATCAAGCATGGGACGATGGTAGATAAGGTGATGAT
AAAGACGTCGGTGTTTACT

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2DB77JQ 728 0 0
CGTTGAAGAGACATGTTTTGGGAGGGAGGGCTTTTTCCTTTCGTCCCCCAAACTCCAGTT
TAGTAAGAACTTTTGGGTTCCAGGCCGGAGGTTCGTACCTCACATCAGCTACAACATATC
CGAGGAGAAAAAAAGCATTGTGCATGAAGAATTTATGAACAACATGATATCCGGGGAGCT
TTGTGAATTGATTGGAGATGTGCATAAATCAATGTCGGTGAATATAGATTTAATGAATCG
GAGGGAAGTTGAGAGGTTACGACAAGTCTTACGTTTATGGATTTGTGAAATGTTGGTACT
CGAGATCATATTTAAGGATAACAACAAGAATTCTCCTAATGAGTCTTGGGAGAAGGAGAA
GAAGTTGTGGGAAGAGGATAATGACAAGAATAATGTTGTTGCGTTCCCCGATGCTAAATT
CCGCGTGAAAGCTCTGTGGATGCCTAACTTCAGCGGTTCTGAGGAAGAGTTTGCCTTTGC
GTCGTGTTTGATCAAGCATGGGACGATGGTAGATAAGGTGATGATAAAGACGTCGGTGTT
TACTGCAAGTAAGAAGTTGGAGGTAGAAGCTGCGGTGGATAAGCTGAGAGCGCTTCAAAC
AGAAGAAGACCAATTAAAGATCAAATGTTTCTGATGGAATTTTAATTTGTTTCAAATCTA
ATACAAGATACCTGTGCAAGTTTTAGACTCTCACAATCTTCAGGATATCATTAACTTTTA
AATGAAGC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7452Contig1 1071 2 2 U
AGGGTTCATCATGTTCTCAACTTCTTTCCTTATACTGACCATGGAGTTTCGAGAGTGTTA
TGGGAGATGAATATTCACGTCCTATCTCTGCTGCGAGCTGACATTCGCGTCGATTCGTCT
GTCTTTCTTCTCGCCGACAAAGGGAAACCGGAACCGTTACGGGGTACATTCAATCGTTGT
CATTACAAACTTCTTAATCCCTTTTCTCCACTCCTTCCACGATTCCTCATTCACTGCATC
CGTTACTATCTCCTGTTCTCTGAATATGTAGCTATAAATAGAATCGAAAACTCTGTTCTT
CTCCTCGCTGCTTGAAGGTCGAGCAATGTAACACCACCGTAGGAGTTTGTCAGTGTGGAA
AAGCTTCTCCTTTTAAGATTTTATTCTTCGTTCACTTCCATTTTATATTAATGGGTTCTT
GATTTAGTTTCCGTGTTCAATTGTTTCTCTGCAAATATGATCTTTTTACAGTTTATTAAT
GATGGTTCTCAGAAAAGGAATGAACTTTGTGAGAATCTTCAGATAAGAGAAATGGTCTCT
ACTACCTTCATCTTTAGAGTGATCAATCATCATCAGCAGCAGCACATAAGGGAGAAAGAG
AGATACTTAGCAAAGTGCACGGTAGGAGCTTTACCTACACCTTCAACGAACTCATACTTG
CAACCAGAAACTTCAGAACAAAATGTGTTGTCTGAGAAGGCAGTTTTGTTCTGACTAGAG
GATTGATCGATGAGACTACTCTAAATCCAGCATTGATATTGTAGTTGTTGTCAAGCGTCT
TAACTCTGATGGATTTCATGGTCACCAAGAATGGCTGGTCGGACAGAGATCAACTACTTG
GGGCAATTAAGTCACGCAAACTTAGTTAAACTGATTGGTTGTCGTTTGGAAGATCAACAA
TGGCTTCTTCTGTCCGAGTTTATGCATAAGGTTAATCTTGAGGATCATCTGTGTACAAGT
GAGTTTATAAATCAAGAAATTAATGAAACTGTCAGGCGATTATTCTTATGTTTCAATGGT
GTTGAAGCAGATTATGTGCATTTCTTCATAGCTATAATTTAACTATATGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B762TF U 1
AF RR2B762JQ C 233
BS 1 804 RR2B762TF
BS 805 1071 RR2B762JQ

RD RR2B762TF 804 0 0
AGGGTTCATCATGTTCTCAACTTCTTTCCTTATACTGACCATGGAGTTTCGAGAGTGTTA
TGGGAGATGAATATTCACGTCCTATCTCTGCTGCGAGCTGACATTCGCGTCGATTCGTCT
GTCTTTCTTCTCGCCGACAAAGGGAAACCGGAACCGTTACGGGGTACATTCAATCGTTGT
CATTACAAACTTCTTAATCCCTTTTCTCCACTCCTTCCACGATTCCTCATTCACTGCATC
CGTTACTATCTCCTGTTCTCTGAATATGTAGCTATAAATAGAATCGAAAACTCTGTTCTT
CTCCTCGCTGCTTGAAGGTCGAGCAATGTAACACCACCGTAGGAGTTTGTCAGTGTGGAA
AAGCTTCTCCTTTTAAGATTTTATTCTTCGTTCACTTCCATTTTATATTAATGGGTTCTT
GATTTAGTTTCCGTGTTCAATTGTTTCTCTGCAAATATGATCTTTTTACAGTTTATTAAT
GATGGTTCTCAGAAAAGGAATGAACTTTGTGAGAATCTTCAGATAAGAGAAATGGTCTCT
ACTACCTTCATCTTTAGAGTGATCAATCATCATCAGCAGCAGCACATAAGGGAGAAAGAG
AGATACTTAGCAAAGTGCACGGTAGGAGCTTTACCTACACCTTCAACGAACTCATACTTG
CAACCAGAAACTTCAGAACAAAATGTGTTGTCTGAGAAGGCAGTTTTGTTCTGACTAGAG
GATTGATCGATGAGACTACTCTAAATCCAGCATTGATATTGTAGTTGTTGTCAAGCGTCT
TAACTCTGATGGATTTCATGGTCA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2B762JQ 839 0 0
ACTGCATCCGTTACTATCTCCTGTTCTCTGAATATGTAGCTATAAATAGAATCGAAAACT
CTGTTCTTCTCCTCGCTGCTTGAAGGTCGAGCAATGTAACACCACCGTAGGAGTTTGTCA
GTGTGGAAAAGCTTCTCCTTTTAAGATTTTATTCTTCGTTCACTTCCATTTTATATTAAT
GGGTTCTTGATTTAGTTTCCGTGTTCAATTGTTTCTCTGCAAATATGATCTTTTTACAGT
TTATTAATGATGGTTCTCAGAAAAGGAATGAACTTTGTGAGAATCTTCAGATAAGAGAAA
TGGTCTCTACTACCTTCATCTTTAGAGTGATCAATCATCATCAGCAGCAGCACATAAGGG
AGAAAGAGAGATACTTAGCAAAGTGCACGGTAGGAGCTTTACCTACACCTTCAACGAACT
CATACTTGCAACCAGAAACTTCAGAACAAAATGTGTTGTCTGAGAAGGCAGTTTTGTTCT
GACTAGAGGATTGATCGATGAGACTACTCTAAATCCAGCATTGATATTGTAGTTGTTGTC
AAGCGTCTTAACTCTGATGGATTTCATGGTCACCAAGAATGGCTGGTCGGACAGAGATCA
ACTACTTGGGGCAATTAAGTCACGCAAACTTAGTTAAACTGATTGGTTGTCGTTTGGAAG
ATCAACAATGGCTTCTTCTGTCCGAGTTTATGCATAAGGTTAATCTTGAGGATCATCTGT
GTACAAGTGAGTTTATAAATCAAGAAATTAATGAAACTGTCAGGCGATTATTCTTATGTT
TCAATGGTGTTGAAGCAGATTATGTGCATTTCTTCATAGCTATAATTTAACTATATGAG

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

CO CL7453Contig1 581 2 1 U
AGGAAATCTGAAAATCAGCTTGTTCCGATGGCGTCGAAAGTGTGCAGATTATCATCGAAG
ATACAATCTTTAACGCAGAAGCTAAGCAAGACGAATGTCCACGTCTCGTCCATACCCTCT
CCTATTAAATCTTCATTACCCACTTCCCGTAACATCAATCCATCTTTTAGAGTACCAGTG
GAGCTGAGTAGCTGTGTATCACTGTTTCCACTACACAGTGCTACTGCATCTTCCAGATTA
GTGTCAAGTCTCTCTGTTGAATCCATCAGCTGGGGTTTAGTTCCTCAAGGTATTTCAATG
CCTTTATGACAGTATTTTCATCTTACAAACAAGTTTCCTGGATGAGAAAATTGTGTGGCT
CTTTTTATCTCTCATCGAATCTAAAGGGGTCCTGAATTCAAGACTGGTTTTTTGCTCAAA
ACTCTTATTTTGAGTTGTCATTTTTTTTGTTCGTGGGTTTATCAGGAATTGAGTTATCAG
TGTAATGCTGCTGGCAAAGATTATACTCTTAGTTTTCATTGAAATGTCTCATCGTTTACC
ATGAGTCGGTAATGGTTGGGATTAATAAAATTCTTACACAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BH32JQ C 1
AF RR2BH32TF U 1
BS 1 581 RR2BH32TF

RD RR2BH32JQ 581 0 0
AGGAAATCTGAAAATCAGCTTGTTCCGATGGCGTCGAAAGTGTGCAGATTATCATCGAAG
ATACAATCTTTAACGCAGAAGCTAAGCAAGACGAATGTCCACGTTTCGTCCATACCCTCT
CCTATTAAATCTTCATTACCCACTTCCCGTAACATCAATCCATCTTTTAGAGTACCAGTG
GAGCTGAGTAGCTGTGTATCACTGTTTCCACTACACAGTGCTACTGCATCTTCCAGATTA
GTGTCAAGTCTCTCTGTTGAATCCATCAGCTGGGGTTTAGTTCCTCAAGGTATTTCAATG
CCTTTATGACAGTATTTTCATCTTACAAACAAGTTTCCTGGATGAGAAAATTGTGTGGCT
CTTTTTATCTCTCATCGAATCTAAAGGGGTCCTGAATTCAAGACTGGTTTTTTGCTCAAA
ACTCTTATTTTGAGTTGTCATTTTTTTTGTTCGTGGGTTTATCAGGAATTGAGTTATCAG
TGTAATGCTGCTGGCAAAGATTATACTCTTAGTTTTCATTGAAATGTCTCATCGTTTACC
ATGAGTCGGTAATGGTTGGGATTAATAAAATTCTTACACAC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2BH32TF 581 0 0
AGGAAATCTGAAAATCAGCTTGTTCCGATGGCGTCGAAAGTGTGCAGATTATCATCGAAG
ATACAATCTTTAACGCAGAAGCTAAGCAAGACGAATGTCCACGTCTCGTCCATACCCTCT
CCTATTAAATCTTCATTACCCACTTCCCGTAACATCAATCCATCTTTTAGAGTACCAGTG
GAGCTGAGTAGCTGTGTATCACTGTTTCCACTACACAGTGCTACTGCATCTTCCAGATTA
GTGTCAAGTCTCTCTGTTGAATCCATCAGCTGGGGTTTAGTTCCTCAAGGTATTTCAATG
CCTTTATGACAGTATTTTCATCTTACAAACAAGTTTCCTGGATGAGAAAATTGTGTGGCT
CTTTTTATCTCTCATCGAATCTAAAGGGGTCCTGAATTCAAGACTGGTTTTTTGCTCAAA
ACTCTTATTTTGAGTTGTCATTTTTTTTGTTCGTGGGTTTATCAGGAATTGAGTTATCAG
TGTAATGCTGCTGGCAAAGATTATACTCTTAGTTTTCATTGAAATGTCTCATCGTTTACC
ATGAGTCGGTAATGGTTGGGATTAATAAAATTCTTACACAC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL7454Contig1 579 2 2 U
GTGTCCTGAGTTGTCTAGCTGCATGATTGCTCGTGGAGCACTGATCAAGCCTTGGATATT
TACTGAAATTAAAGAGCAACGGCATTGGGACATTACCTCCGGGGAAAGACTTAACATCTT
AAAGGACTTCGTACGTTTTGGTCTTCAACATTGGGGATCCGACACAAAAGGAGTAGAGAC
AACAAGGCATTTCTTGCTGGAGTGGCTAAGCTACACGTTTAGGTACATACCTGTAGGTCT
ACTGGATGTGATCCCGCGGCAAATCAACTGGCGCCCGCCTTCTTATTTTGGTCGTGATGA
TCTCGAGACTCTCATGATGTCTGAATCTGCGGGTGACTGGGTGAGGATATCGGAATTGCT
GCTTGGGAAGGTTCCAGAAGGCTTCACGTTTGCACCCAAGCACAAATCCAACGCTTATGG
CCGAGCTGAAAATTGCTAATTCCAGCCCACCTCTCTTATGTAAGCTCAAAAACAATAAAC
TTGTCTGAAACTGTGATGAGCAAATTTTTATTCAATAGTTTCGCATTCGAGAACAATGTA
TTATTGCCTTTTTCTTAAACCATAATCTCATAACCAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2BM53JQ C 1
AF RR2BM53TF U 1
BS 1 575 RR2BM53TF
BS 576 579 RR2BM53JQ

RD RR2BM53JQ 579 0 0
GTGTCCTGAGTTGTCTAGCTGCATGATTGCTCGTGGAGCACTGATCAAGCCTTGGATATT
TACTGAAATTAAAGAGCAACGGCATTGGGACATTACCTCCGGGGAAAGACTTAACATCTT
AAAGGACTTCGTACGTTTTGGTCTTCAACATTGGGGATCCGACACAAAAGGAGTAGAGAC
AACAAGGCATTTCTTGCTGGAGTGGCTAAGCTACACGTTTAGGTACATACCTGTAGGTCT
ACTGGATGTGATCCCGCGGCAAATCAACTGGCGCCCGCCTTCTTATTTTGGTCGTGATGA
TCTCGAGACTCTCATGATGTCTGAATCTGCGGGTGACTGGGTGAGGATATCGGAATTGCT
GCTTGGGAAGGTTCCAGAAGGCTTCACGTTTGCACCCAAGCACAAATCCAACGCTTATGG
CCGAGCTGAAAATTGCTAATTCCAGCCCCCCTCTCTTATGTAAGCTCAAAAACAATAAAC
TTGTCTGAAACTGTGATGAGCAAATTTTTATTCAATAGTTTCGCATTCGAGAACAATGTA
TTATTGCCTTTTTCTTAAACCATAATCTCATAACCAAAA

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2BM53TF 575 0 0
GTGTCCTGAGTTGTCTAGCTGCATGATTGCTCGTGGAGCACTGATCAAGCCTTGGATATT
TACTGAAATTAAAGAGCAACGGCATTGGGACATTACCTCCGGGGAAAGACTTAACATCTT
AAAGGACTTCGTACGTTTTGGTCTTCAACATTGGGGATCCGACACAAAAGGAGTAGAGAC
AACAAGGCATTTCTTGCTGGAGTGGCTAAGCTACACGTTTAGGTACATACCTGTAGGTCT
ACTGGATGTGATCCCGCGGCAAATCAACTGGCGCCCGCCTTCTTATTTTGGTCGTGATGA
TCTCGAGACTCTCATGATGTCTGAATCTGCGGGTGACTGGGTGAGGATATCGGAATTGCT
GCTTGGGAAGGTTCCAGAAGGCTTCACGTTTGCACCCAAGCACAAATCCAACGCTTATGG
CCGAGCTGAAAATTGCTAATTCCAGCCCACCTCTCTTATGTAAGCTCAAAAACAATAAAC
TTGTCTGAAACTGTGATGAGCAAATTTTTATTCAATAGTTTCGCATTCGAGAACAATGTA
TTATTGCCTTTTTCTTAAACCATAATCTCATAACC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL7455Contig1 860 2 4 U
GGGCACACTTTCGGATTACCAGTTCATGCGCCCACGAGCACGTGACAAGAAGCTCCAGCA
AGAATGGGCTGTCCCACTGAAAGGCATTGATGATGTTCAAGAGAAATTCAAAGAGCTCTG
TCTTGGAAACTTAAAAAGCAGTCCATGGTCTGAGTTGGATGGACTCCAGCCAGAAACAAA
GATCATAAACGAGAAACTCGGAAAAATAAACTCCAACGGCTTCCTGACCATCAATAGCCA
ACCATCAGTCAATGCAGCCAAATCTGATTCCCCAGCTATTGGATGGGGTGGTCCTGGTGG
TTATGTCTACCAGAAAGCTTACCTAGAGTTCTTCTGCTCTAAGGATAAGTTAGACACACT
TGTGGAGAAGTCCAAAGCTTTTCCTTCCATCACCTTCATGGCCGTGAACAAAGCAGAGAA
CTGGGTATCAAACATTGGTGAATCCGATGTGAATGCAGTTACCTGGGGAGTGTTTCCAGC
TAAGGAGGTTATTCAACCGACAATTGTGGATCCAGCCAGTTTCAAAGTCTGGAAAGACGA
AGCCTTTGAGATCTGGTCAAGAAGCTGGGCTAACTTGTACCCTGAGGATGACCCTTCTAG
AAAGCTGCTCGAAGAGGTGAAGAACAGCTACTATTTGGTAAGCTTAGTGGACAACGATTA
CATCAGTGGTGATATATTCTCAGTCTTTGCCTGATCTCTGAGAAACCCCAATGGGGGAAA
TGAGGAAACCATTCGATTTTCACGATTTGTTGTAACTTTTTTAAAGATATTTGTGATGTA
TCAACAGTACTCATCAGTTTCATTGTGGCTTGTTTTTTTATATATGTCGAAACAAATAAA
TTAAGAAATGTTGCTTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F819TF U 1
AF RR2F819JQ C 381
BS 1 704 RR2F819TF
BS 705 705 RR2F819JQ
BS 706 719 RR2F819TF
BS 720 860 RR2F819JQ

RD RR2F819TF 720 0 0
GGGCACACTTTCGGATTACCAGTTCATGCGCCCACGAGCACGTGACAAGAAGCTCCAGCA
AGAATGGGCTGTCCCACTGAAAGGCATTGATGATGTTCAAGAGAAATTCAAAGAGCTCTG
TCTTGGAAACTTAAAAAGCAGTCCATGGTCTGAGTTGGATGGACTCCAGCCAGAAACAAA
GATCATAAACGAGAAACTCGGAAAAATAAACTCCAACGGCTTCCTGACCATCAATAGCCA
ACCATCAGTCAATGCAGCCAAATCTGATTCCCCAGCTATTGGATGGGGTGGTCCTGGTGG
TTATGTCTACCAGAAAGCTTACCTAGAGTTCTTCTGCTCTAAGGATAAGTTAGACACACT
TGTGGAGAAGTCCAAAGCTTTTCCTTCCATCACCTTCATGGCCGTGAACAAAGCAGAGAA
CTGGGTATCAAACATTGGTGAATCCGATGTGAATGCAGTTACCTGGGGAGTGTTTCCAGC
TAAGGAGGTTATTCAACCGACAATTGTGGATCCAGCCAGTTTCAAAGTCTGGAAAGACGA
AGCCTTTGAGATCTGGTCAAGAAGCTGGGCTAACTTGTACCCTGAGGATGACCCTTCTAG
AAAGCTGCTCGAAGAGGTGAAGAACAGCTACTATTTGGTAAGCTTAGTGGACAACGATTA
CATCAGTGGTGATATATTCTCAGTCTTTGCCTGATCTCTGAGAA*CCCCAATGGGGGAA
T

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2F819JQ 480 0 0
TTCCTTCCATCACCTTCATGGCCGTGAACAAAGCAGAGAACTGGGTATCAAACATTGGTG
AATCCGATGTGAATGCAGTTACCTGGGGAGTGTTTCCAGCTAAGGAGGTTATTCAACCGA
CAATTGTGGATCCAGCCAGTTTCAAAGTTTGGAAAGACGAAGCCTTTGAGATTTGGTCAA
GAAGGTGGGCTAACTTGTACCCTGAGGATGACCCTTTTAGAAAGCTGCTCGAAGAGGTGA
AGAACAGCTACTATTTGGTAAGCTTAGTGGACAACGATTACATCAGTGGTGATATATTTT
CAGTCTTTGCCTGATTTTTGAGAAACCCCAATGGGGGAAATGAGGAAACCATTCGATTTT
CACGATTTGTTGTAACTTTTTTAAAGATATTTGTGATGTATCAACAGTACTCATCAGTTT
CATTGTGGCTTGTTTTTTTATATATGTCGAAACAAATAAATTAAGAAATGTTGCTTGCTT

QA 1 480 1 480
DS 



AS 1 2

CO CL7456Contig1 803 2 2 U
GGGAAATCTACAGCGAGGAAGAAGAACCAGAAATGGCGAATTCATCAATGGCTACGCTTT
CGAGAAGACTCTATCGATCTCTTCTCTCAAACCCCAGACTCTCTCAGGCTTCCATGTCCT
TCAGCACCAACAACATCTCCGACTTATCGGACACCGAATCTCCCCTCGAAACGAAGACTT
CATATTCAAAAGATCGAGAAGAACGCGTGATGGAGGAGCGTCCACTCGAGAACGGCCTTG
ACTATGGCGTCTTCAAGGCGATATTGGTGGGGCAAGTAGGGCAGCTTCCTCTGCAGAAGA
AGCTCAAGAACGGTAGAACTGTCACTCTCTTCTCCGTAGGAACCGGTGGGATGAGGAATA
ACAGGAGACCGTTGATCAACGAAGATCCGAGAGAGTATGCTAACCGCTCTGAGGTGCAGT
GGCACCGTGTCTCTGTTTACCCTGAGCGTTTGGCTGAGCTTGTCTTGAAGAATGTTGAAC
CCGGCACACTTGTTTACTTGGAGGGTAATCTTGAGACGAAGATTTTCAGTGATCCTGTCA
CTGGTTTGGTTCGACGTATTCGAGAAGTAGCCATTCGTAGAAACGGGCGAGTTGTGTTTC
TAGGAAAAGCCGGTGATATGCAGCAGCCTAGTTCTGCTGAGCTTAGAGGCGTTGGCTACT
ACTGATTGTTGTATTGTAGCTTTACTGTTCTTCTCTTTTTGGTATCTTGAGGGTTTTTTC
TCAGTGTTTCTACTGCCATTGGTCCTTTTACTTTTTGTGGCGAATAAACCGAACCAAAAA
ACCCAACAAATACATTTTTCACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2B993JQ C 1
AF RR2B993TF U 1
BS 1 802 RR2B993TF
BS 803 803 RR2B993JQ

RD RR2B993JQ 803 0 0
GGGAAATCTACAGCGAGGAAGAAGAACCAGAAATGGCGAATTCATCAATGGCTACGCTTT
CGAGAAGACTCTATCGATCTCTTCTCTCAAACCCCAGACTCTCTCAGGCTTCCATGTCCT
TCAGCACCAACAACATCTCCGACTTATCGGACACCGAATCTCCCCTCGAAACGAAGACTT
CATATTCAAAAGATCGAGAAGAACGCGTGATGGAGGAGCGTCCACTCGAGAACGGCCTTG
ACTATGGCGTCTTCAAGGCGATATTGGTGGGGCAAGTAGGGCAGCTTCCTCTGCAGAAGA
AGCTCAAGAACGGTAGAACTGTCACTCTCTTCTCCGTAGGAACCGGTGGGATGAGGAATA
ACAGGAGACCGTTGATCAACGAAGATCCGAGAGAGTATGCTAACCGCTCTGAGGTGCAGT
GGCACCGTGTCTCTGTTTACCCTGAGCGTTTGGCTGAGCTTGTCTTGAAGAATGTTGAAC
CCGGCACACTTGTTTACTTGGAGGGTAATCTTGAGACGAAGATTTTCAGTGATCCTGTCA
CTGGTTTGGTTCGACGTATTCGAGAAGTAGCCATTCGTAGAAACGGGCGAGTTGTGTTTC
TAGGAAAAGCCGGTGATATGCAGCAGCCTAGTTCTGCTGAGCTTAGAGGCGTTGGCTACT
ACTGATTGTTGTATTGTAGCTTTACTGTTCTTCTCTTTTTGGTATCTTGAGGGTTTTTTC
TCAGTGTTTCTACTGCCATTGGTCCTTTTACTTTTTGTGGCGAATAAACCGAACCAAAAA
ACCCAACAAATACATTTTTCACC

QA 1 803 1 803
DS 

RD RR2B993TF 802 0 0
GGGAAATCTACAGCGAGGAAGAAGAACCAGAAATGGCGAATTCATCAATGGCTACGCTTT
CGAGAAGACTCTATCGATCTCTTCTCTCAAACCCCAGACTCTCTCAGGCTTCCATGTCCT
TCAGCACCAACAACATCTCCGACTTATCGGACACCGAATCTCCCCTCGAAACGAAGACTT
CATATTCAAAAGATCGAGAAGAACGCGTGATGGAGGAGCGTCCACTCGAGAACGGCCTTG
ACTATGGCGTCTTCAAGGCGATATTGGTGGGGCAAGTAGGGCAGCTTCCTCTGCAGAAGA
AGCTCAAGAACGGTAGAACTGTCACTCTCTTCTCCGTAGGAACCGGTGGGATGAGGAATA
ACAGGAGACCGTTGATCAACGAAGATCCGAGAGAGTATGCTAACCGCTCTGAGGTGCAGT
GGCACCGTGTCTCTGTTTACCCTGAGCGTTTGGCTGAGCTTGTCTTGAAGAATGTTGAAC
CCGGCACACTTGTTTACTTGGAGGGTAATCTTGAGACGAAGATTTTCAGTGATCCTGTCA
CTGGTTTGGTTCGACGTATTCGAGAAGTAGCCATTCGTAGAAACGGGCGAGTTGTGTTTC
TAGGAAAAGCCGGTGATATGCAGCAGCCTAGTTCTGCTGAGCTTAGAGGCGTTGGCTACT
ACTGATTGTTGTATTGTAGCTTTACTGTTCTTCTCTTTTTGGTATCTTGAGGGTTTTTTC
TCAGTGTTTCTACTGCCATTGGTCCTTTTACTTTTTGTGGCGAATAAACCGAACCAAAAA
ACCCAACAAATACATTTTTCAC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL7457Contig1 1306 2 2 U
GCTCCTCGGTGCTATCCTCAACTCTTTGCCAGAGATCTAGGCATGTTGATTGGTGGTCGT
ATCCTCCTTGGCTGCGGTATCGGTTTTGGTAACCAGACCGTTCCATTGTTCATCTCGGAG
ATCGCACCGGCTAGAATCAGAGGAGGACTAAACATCGCGTTTCAGTTTCTCATCACCGTT
GGAATCCTAGGAGCAAGTTTCGTGAACTATTTAACCTCCACGATGCAAAACGGGTGGAGA
TACTCTCTCGGAGGCGCGGCTGTTCCCGCTTTGATCCTCTTGGTGGGATCCTTCTTCATC
CACGAGACTCCAGCTAGCCTCATCGAGCGGGGAAAAGACGAGGAAGGGAAGAAAGTCCTG
AGGAAGATCAGAGGCATCGACAACATCGAGCTCGAGTTCAGATCAAACGCGCCACGGAGA
TTTCGAACAAGGTGAAGAGCCCTTTCAAAGAGCTGTTCACCAAACGCGAGAACAGACCGC
CGCTCGTGTGCGGGACGCTGCTTCAGTTCTTCCAGCAGTTCACGGGAATCAACGTGGTTA
TGTTCTACGCTCCGGTCTTGTTTCAGACCATGGGGAGTGGTAACAACGCCTCTTTGGTCT
CTACCGTTGTCACCAACGGTGTGAACGCACTCGCTACGGTTTTGGCCGTTATCATGGTTG
ATAGCTCGATAGAAAGTTCTTTTTGGTCGAAGAGCACTCAAATGATGGCTACACAGTTAA
CTATCGGAGCCTTGTTATTAAACTACTTACACCTAGTGGGACCTATCACAAGCCACACCG
TGCCACTTATAGTACTGATCCTCATCTGCATCTACGTGTCCGGGTTCGCGTGGTCGTGGG
GACCGCTGGGATGGCTTATTCCGTCTGAGATCTATCAGCTCGAGGTGAGAACCTCGGGTT
ACTTTTGCGCGGTGGCGATGAACATGGTGTGCACTTTCGTTATCGGACAGTTCTTCCTGT
TTGCGCTATGCAGATTCAGATCGGGATTGTTTTTTTTCTTTGCAGCCATGAATGTTATCA
TGGGACTGTTTGCGATATTTTTCCTCCCGGAGACCAGAGGTGTTCCTATCGAGGATATGG
CGGAGCAGCGCTGGAAGAAGCACTGGCACTGGAAGAAATATTTCAAGCAAAACCGATTTT
TTCCATCCATCTTGTTGCTTTTAGGATTTTCTTTAGATAGTTGAGTCGGGTTGTTCGGAT
CCTGTTGGAGTTTTTTTAAGTTGTTTTTTTTTGTTTGTTTCCTTTTGCAATTTATATAAC
TTGTGAAGCTTCTAATTTTAACCAATTGAAGTTTTGGGACTTGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FL48TF U 1
AF RR2FL48JQ C 678
BS 1 745 RR2FL48TF
BS 746 1306 RR2FL48JQ

RD RR2FL48TF 745 0 0
GCTCCTCGGTGCTATCCTCAACTCTTTGCCAGAGATCTAGGCATGTTGATTGGTGGTCGT
ATCCTCCTTGGCTGCGGTATCGGTTTTGGTAACCAGACCGTTCCATTGTTCATCTCGGAG
ATCGCACCGGCTAGAATCAGAGGAGGACTAAACATCGCGTTTCAGTTTCTCATCACCGTT
GGAATCCTAGGAGCAAGTTTCGTGAACTATTTAACCTCCACGATGCAAAACGGGTGGAGA
TACTCTCTCGGAGGCGCGGCTGTTCCCGCTTTGATCCTCTTGGTGGGATCCTTCTTCATC
CACGAGACTCCAGCTAGCCTCATCGAGCGGGGAAAAGACGAGGAAGGGAAGAAAGTCCTG
AGGAAGATCAGAGGCATCGACAACATCGAGCTCGAGTTCAGATCAAACGCGCCACGGAGA
TTTCGAACAAGGTGAAGAGCCCTTTCAAAGAGCTGTTCACCAAACGCGAGAACAGACCGC
CGCTCGTGTGCGGGACGCTGCTTCAGTTCTTCCAGCAGTTCACGGGAATCAACGTGGTTA
TGTTCTACGCTCCGGTCTTGTTTCAGACCATGGGGAGTGGTAACAACGCCTCTTTGGTCT
CTACCGTTGTCACCAACGGTGTGAACGCACTCGCTACGGTTTTGGCCGTTATCATGGTTG
ATAGCTCGATAGAAAGTTCTTTTTGGTCGAAGAGCACTCAAATGATGGCTACACAGTTAA
CTATCGGAGCCTTGTTATTAAACTA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RR2FL48JQ 629 0 0
TTTTTGGTCGAAGGAGC
CACTCAAATGATGGCTACACAGTTAACTATCGGAGCCTTGTTATTAAACTACTTACACCT
AGTGGGACCTATCACAAGCCACACCGTGCCACTTATAGTACTGATCCTCATCTGCATCTA
CGTGTCCGGGTTCGCGTGGTCGTGGGGACCGCTGGGATGGCTTATTCCGTCTGAGATCTA
TCAGCTCGAGGTGAGAACCTCGGGTTACTTTTGCGCGGTGGCGATGAACATGGTGTGCAC
TTTCGTTATCGGACAGTTCTTCCTGTTTGCGCTATGCAGATTCAGATCGGGATTGTTTTT
TTTCTTTGCAGCCATGAATGTTATCATGGGACTGTTTGCGATATTTTTCCTCCCGGAGAC
CAGAGGTGTTCCTATCGAGGATATGGCGGAGCAGCGCTGGAAGAAGCACTGGCACTGGAA
GAAATATTTCAAGCAAAACCGATTTTTTCCATCCATCTTGTTGCTTTTAGGATTTTCTTT
AGATAGTTGAGTCGGGTTGTTCGGATCCTGTTGGAGTTTTTTTAAGTTGTTTTTTTTTGT
TTGTTTCCTTTTGCAATTTATATAACTTGTGAAGCTTCTAATTTTAACCAATTGAAGTTT
TGGGACTTGCAT

QA 18 629 18 629
DS 



AS 1 2

CO CL7458Contig1 942 2 2 U
CTAAATATCAGCAACCGTGGCGAAGCTATATAAAAAGGAAGAGGAGAGCAAAAAGGTAAT
GGAGGAGGAAGAAGAGGAGGAAGACGACACGTTCGAGGATGCCGTGTGTAACAAAACACC
AGCCAGAGTCACGAACGATGCCGTGTGCAACAAGACACCAGCCAGAGTCAACACCCCTTT
GTCTATTATCACCGAGGCGTTCGAAAATCTAGCTGATCAGCTGAAACCGGACATAACAAC
CGAAGAAGACGGACTTAAGCTTGATGCTTTCTGCAATGCGTGTACTCATGTCTCTGTCCT
CTTCAGCTGCCTCGGATTCGCCTTCAAATTCGCTGAGATGGAGTACATCTCCAAAGTTAA
CGATTTGGTTGAAGCTTCGAAAACATTGGACACGTTACAGAATATTTTGGACCTAGACGT
GGAGAAAGATACGGTGAAAACACCAGGTAGTCGTTCGCGTAACCTAAGACGCGTGAGACT
AGGGTTAGACCTAATCCGGGCAATTTTCGAGAAGTTCTTGATGACAGATGAGTACTCTTT
GAAAGACGCTGCGACAACAGCTTACACGGAAGTATGCGCACCGTTTCATACATGGGCTGT
TAGAACCGCGGTTTACGCGGGTATGTATACGCTTCCAACGAGGGATCAGCTTCTGTTACG
GCTCAATGAGACTGAACAATCTGTTGAGAAGAACATGAGGAGGTACATGGAAGCGTCACG
ACCCATCATAGAGTATATTGACAAACTTTACATTGAAAGGAACATTAAACTCGACTGGTA
ACAACGTTGTCCTTGTAAATTACTAATATTACTACTAATATTTTCTTTTATCTTTTTCCT
TGTAAATTAAAATGGAGCTTTTGTCTGAAGGCCAAAAAAAAAACGAGGGTTTGTCATTGT
CACTTGATGTAATACTCACGTTAATCAAATCTAAACGTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A428TF U 1
AF RR2A428JQ C 205
BS 1 775 RR2A428TF
BS 776 942 RR2A428JQ

RD RR2A428TF 775 0 0
CTAAATATCAGCAACCGTGGCGAAGCTATATAAAAAGGAAGAGGAGAGCAAAAAGGTAAT
GGAGGAGGAAGAAGAGGAGGAAGACGACACGTTCGAGGATGCCGTGTGTAACAAAACACC
AGCCAGAGTCACGAACGATGCCGTGTGCAACAAGACACCAGCCAGAGTCAACACCCCTTT
GTCTATTATCACCGAGGCGTTCGAAAATCTAGCTGATCAGCTGAAACCGGACATAACAAC
CGAAGAAGACGGACTTAAGCTTGATGCTTTCTGCAATGCGTGTACTCATGTCTCTGTCCT
CTTCAGCTGCCTCGGATTCGCCTTCAAATTCGCTGAGATGGAGTACATCTCCAAAGTTAA
CGATTTGGTTGAAGCTTCGAAAACATTGGACACGTTACAGAATATTTTGGACCTAGACGT
GGAGAAAGATACGGTGAAAACACCAGGTAGTCGTTCGCGTAACCTAAGACGCGTGAGACT
AGGGTTAGACCTAATCCGGGCAATTTTCGAGAAGTTCTTGATGACAGATGAGTACTCTTT
GAAAGACGCTGCGACAACAGCTTACACGGAAGTATGCGCACCGTTTCATACATGGGCTGT
TAGAACCGCGGTTTACGCGGGTATGTATACGCTTCCAACGAGGGATCAGCTTCTGTTACG
GCTCAATGAGACTGAACAATCTGTTGAGAAGAACATGAGGAGGTACATGGAAGCGTCACG
ACCCATCATAGAGTATATTGACAAACTTTACATTGAAAGGAACATTAAACTCGAC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2A428JQ 738 0 0
AAATCTAGCTGATCAGCTGAAACCGGACATAACAACCGAAGAAGACGGACTTAAGCTTGA
TGCTTTCTGCAATGCGTGTACTCATGTCTCTGTCCTCTTCAGCTGCCTCGGATTCGCCTT
CAAATTCGCTGAGATGGAGTACATCTCCAAAGTTAACGATTTGGTTGAAGCTTCGAAAAC
ATTGGACACGTTACAGAATATTTTGGACCTAGACGTGGAGAAAGATACGGTGAAAACACC
AGGTAGTCGTTCGCGTAACCTAAGACGCGTGAGACTAGGGTTAGACCTAATCCGGGCAAT
TTTCGAGAAGTTCTTGATGACAGATGAGTACTCTTTGAAAGACGCTGCGACAACAGCTTA
CACGGAAGTATGCGCACCGTTTCATACATGGGCTGTTAGAACCGCGGTTTACGCGGGTAT
GTATACGCTTCCAACGAGGGATCAGCTTCTGTTACGGCTCAATGAGACTGAACAATCTGT
TGAGAAGAACATGAGGAGGTACATGGAAGCGTCACGACCCATCATAGAGTATATTGACAA
ACTTTACATTGAAAGGAACATTAAACTCGACTGGTAACAACGTTGTCCTTGTAAATTACT
AATATTACTACTAATATTTTCTTTTATCTTTTTCCTTGTAAATTAAAATGGAGCTTTTGT
CTGAAGGCCAAAAAAAAAACGAGGGTTTGTCATTGTCACTTGATGTAATACTCACGTTAA
TCAAATCTAAACGTTTTC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7460Contig1 680 2 2 U
GGGTAGCCGTTCTCTTCTGTCTCTTTCCTTTATAGCTTATAGTTTCTCCCACTCAATCCT
TCCTTTTCTCCAATCTGATAATGTAAATCCACAGACAGAAAAATTTTAAACAAAACAACT
AAACATCATTGTGTTCGTTAAATCGTTGCTGCTCAAGAAAAGAAAAGCAAAGAAAGAAGA
TTAATGGATTTGTTCAAGATCCTGCTTCTTACGTTCTTGGTGAACTTCAGTTTCTGCTTC
GCTGCAGATCCATATTCTTTCTACAACTTCGAAGTCTCCTACATTACCGCTTCTCCACTT
GGTGTTCCTCAACAGGTCATTGCTATAAATGGAAAGTTCCCTGGTCCTACAATCAATGTC
ACGACCAATGAGAACCTTGTGGTGAATGTGAGAAACAAATTAGACGAGGGACTTCTTCTC
CACTGGTCTGGAATCCAACAGAGACGTGTTTCTTGGCAAGACGGACTTGCAGGAACCAAC
TGTCCAATCCCACCAAAGTGGAACTGGACTTATGAGTTTCAAGTTAAGGACCAGATTGGT
AGCTTCTTCTACTTCCCATCTCTCCATTTCCAAAGAGCTTCTGGTGGGTTTGGCTCCTTC
ATTGTCAACCCTAGATCAGTTATTCCAGTCCCTTTCTCTACTCCAGACGGTGATATCACC
ATTGCCATTGGTGATTGGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D593TF U 1
AF RR2BO61TF U 58
BS 1 644 RR2D593TF
BS 645 680 RR2BO61TF

RD RR2D593TF 644 0 0
GGGTAGCCGTTCTCTTCTGTCTCTTTCCTTTATAGCTTATAGTTTCTCCCACTCAATCCT
TCCTTTTCTCCAATCTGATAATGTAAATCCACAGACAGAAAAATTTTAAACAAAACAACT
AAACATCATTGTGTTCGTTAAATCGTTGCTGCTCAAGAAAAGAAAAGCAAAGAAAGAAGA
TTAATGGATTTGTTCAAGATCCTGCTTCTTACGTTCTTGGTGAACTTCAGTTTCTGCTTC
GCTGCAGATCCATATTCTTTCTACAACTTCGAAGTCTCCTACATTACCGCTTCTCCACTT
GGTGTTCCTCAACAGGTCATTGCTATAAATGGAAAGTTCCCTGGTCCTACAATCAATGTC
ACGACCAATGAGAACCTTGTGGTGAATGTGAGAAACAAATTAGACGAGGGACTTCTTCTC
CACTGGTCTGGAATCCAACAGAGACGTGTTTCTTGGCAAGACGGACTTGCAGGAACCAAC
TGTCCAATCCCACCAAAGTGGAACTGGACTTATGAGTTTCAAGTTAAGGACCAGATTGGT
AGCTTCTTCTACTTCCCATCTCTCCATTTCCAAAGAGCTTCTGGTGGGTTTGGCTCCTTC
ATTGTCAACCCTAGATCAGTTATTCCAGTCCCTTTCTCTACTCC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RR2BO61TF 623 0 0
AGGG
CCTTTTCTCCAATCTGATAATGTAAATTCACAGACAGAAAAATTTTAAACAAAACAACTA
AACATCATTGTGTTCGTTAAATCGTTGTTGCTCAAGAAAAGAAAAGCAAAGAAAGAAGAT
TAATGGATTTGTTCAAGATCCTGCTTCTTACGTTCTTGGTGAACTTCAGTTTCTGCTTCG
CTGCAGATCCATATTCTTTCTACAACTTCGAAGTCTCCTACATTACCGCTTCTCCACTTG
GTGTTCCTCAACAGGTCATTGCTATAAATGGAAAGTTCCCTGGTCCTACAATCAATGTCA
CGACCAATGAGAACCTTGTGGTGAATGTGAGAAACAAATTAGACGAGGGACTTCTTCTCC
ACTGGTCTGGAATCCGACAGAGACGTGTTTCTTGGCAAGACGGACTTGCAGGAACCAACT
GTCCAATCCCACCAAAGTGGAACTGGACTTATGAGTTTCAAGTTAAGGACCAGATTGGTA
GCTTCTTCTACTTCCCATCTCTCCATTTCCAAAGAGCTTCTGGTGGGTTTGGCTCCTTCA
TTGTCAACCCTAGATCAGTTATTCCAGTCCCTTTCTCTACTCCAGACGGTGATATCACCA
TTGCCATTGGTGATTGGTA

QA 5 623 5 623
DS 



AS 1 2

CO CL7461Contig1 1208 2 2 U
GGATTGGAAGATCCAATCAATCAATCAATTGAAGCTGCAAAACTCAATCAAAGAAGATCC
AAATGTCGAGAGAGAGAACCAGACGTGAACTACCTCCCGTTCAAGAGCATATTGATAAAT
TGAAGAAAGTGGTAGAGGAAGGCAATGGCTACGGAGCTTTGCAGATGTACAAATCCATCA
GTGCCAGATATGTTACAGCTCAGAGATTCTCTGAAGCTCTTGATATCCTCTTCTCAGGGG
CATGCGTTGAGCTAGAGCACGGCCTGGTGAATTGTGGGGCCGACCTTGCTATTTTGTTTG
TCGACACACTAGTTAAAGCCAAGTCACCTTGCAATGATGAATCTCTTGATCGTATCAGGT
GTATGTTCAAGTTGTTTCCTAGGGTTCCTGTACCTCCTCATTTGGTTGATGTGAGCGATG
ATGAGGATGTTCATAATATTCAAGAATCTCTTGGGGAAGCTAGATCACGTATTGATAACT
TGACTTCCTTCTTGAGAGCTGCTATAAGATGGTCTGCGGAGTTTGGAGGGCCAAGTACAG
GGTATCCTGAGTTGCATGCTATGCTGGCTGATTATCTTTACACCGAGTGTCCTGAACTTG
ACATGGTTCGAATATCAAGGCATTTTGTTAGGGCCGAGGACCCTGAGAAGTTTGCATCTA
TGCTGATCAACTTTATGGGGAGGTGTTATCCTGGCGAAGATGACCTTGCTATTGCACGAG
CAGTTCTTATGTATTTATCTATGGGTGACATGAAAGATGCAAATGTTCTGATGGATGAGA
TTAAGAAACAAGCGGAGACCCTTTCAGAATCAGACCTTATCCAATTTATCACTTATTTTC
TGGAAACGTTGCAGAGAGATGCATTGCCTCTTTTCAGTATGTTAAGAGCGAAATTTAGGT
CTTGCGTAGATAGAGAACCGCTGCTTAATGAGTTGCTGGACGAGATTGCAGAGAGGTTTT
ACGGTGTGCAGCGTAAGAATCCTTTGCAAGGAATGTTTGGAGACATCTTCAAGATGATGG
GCTAAAGGAAGAAAATAGAAGTTGCAACTTCCTTTCGTCATTTTGTTTTTGTATTTGGCA
AAGTTCTAATAATGGATAGCTTCTGAGAATTCAATTTGTTTCTCTTATCCTCAAGTGGGT
AAGAGTTTTTGTTCTTTGTAACATTATACATTTGTTTTCATTCATCATATTACTATATCT
TCAACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA36TF U 1
AF RR2GA36JQ C 535
BS 1 617 RR2GA36TF
BS 618 1208 RR2GA36JQ

RD RR2GA36TF 617 0 0
GGATTGGAAGATCCAATCAATCAATCAATTGAAGCTGCAAAACTCAATCAAAGAAGATCC
AAATGTCGAGAGAGAGAACCAGACGTGAACTACCTCCCGTTCAAGAGCATATTGATAAAT
TGAAGAAAGTGGTAGAGGAAGGCAATGGCTACGGAGCTTTGCAGATGTACAAATCCATCA
GTGCCAGATATGTTACAGCTCAGAGATTCTCTGAAGCTCTTGATATCCTCTTCTCAGGGG
CATGCGTTGAGCTAGAGCACGGCCTGGTGAATTGTGGGGCCGACCTTGCTATTTTGTTTG
TCGACACACTAGTTAAAGCCAAGTCACCTTGCAATGATGAATCTCTTGATCGTATCAGGT
GTATGTTCAAGTTGTTTCCTAGGGTTCCTGTACCTCCTCATTTGGTTGATGTGAGCGATG
ATGAGGATGTTCATAATATTCAAGAATCTCTTGGGGAAGCTAGATCACGTATTGATAACT
TGACTTCCTTCTTGAGAGCTGCTATAAGATGGTCTGCGGAGTTTGGAGGGCCAAGTACAG
GGTATCCTGAGTTGCATGCTATGCTGGCTGATTATCTTTACACCGAGTGTCCTGAACTTG
ACATGGTTCGAATATCA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2GA36JQ 674 0 0
GTACAGGGTATCCTGAGTTGCATGCTATGCTGGCTGATTATCTTTACACCGAGTGTCCTG
AACTTGACATGGTTCGAATATCAAGGCATTTTGTTAGGGCCGAGGACCCTGAGAAGTTTG
CATCTATGCTGATCAACTTTATGGGGAGGTGTTATCCTGGCGAAGATGACCTTGCTATTG
CACGAGCAGTTCTTATGTATTTATCTATGGGTGACATGAAAGATGCAAATGTTCTGATGG
ATGAGATTAAGAAACAAGCGGAGACCCTTTCAGAATCAGACCTTATCCAATTTATCACTT
ATTTTCTGGAAACGTTGCAGAGAGATGCATTGCCTCTTTTCAGTATGTTAAGAGCGAAAT
TTAGGTCTTGCGTAGATAGAGAACCGCTGCTTAATGAGTTGCTGGACGAGATTGCAGAGA
GGTTTTACGGTGTGCAGCGTAAGAATCCTTTGCAAGGAATGTTTGGAGACATCTTCAAGA
TGATGGGCTAAAGGAAGAAAATAGAAGTTGCAACTTCCTTTCGTCATTTTGTTTTTGTAT
TTGGCAAAGTTCTAATAATGGATAGCTTCTGAGAATTCAATTTGTTTCTCTTATCCTCAA
GTGGGTAAGAGTTTTTGTTCTTTGTAACATTATACATTTGTTTTCATTCATCATATTACT
ATATCTTCAACACC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL7462Contig1 757 2 2 U
GACACATTCAGCACCTCAAGCTTCCAGTGACATGCATGCCTGTCTTCCCAGGACTCAGCA
TTTTCCTCATTCTCTCCCTTTATTACTCTGTCTTCGTCCCTATCACCAGAAGAATCACTG
GCAATCCCCATGGTGCTTCCCAGCTTCAAAGGGTGGGGATAGGGCTAGCAGTTTCAATCA
TATCAGTAGCTTGGGCTGGACTATTCGAGAACTACAGGAGAAATTACGCGATACAACATG
GTTTCGAGTTCAACTTCTTGACCCAAATGCCTGATCTAACAGCATACTGGTTGTTAATCC
AGTACTGTCTCATCGGTATAGCAGAGGTTTTCTGCATCGTTGGGCTACTGGAGTTCCTCT
ACGAGGAAGCACCTGATGCTATGAAGAGTATTGGTTCTGCCTACGCAGCGCTAGCCGGCG
GTTTAGGGTGTTTTGCTGCCACCATCTTGAACAACATCGTGAAGGCTGCGACCAGGAACT
CAGATGGGAACTCGTGGTTGTCGCAGAACATAAACACAGGGAGATTCGACTGTTTGTACT
GGCTCCTCACGCTTCTGAGCCTTTTGAACTTCTGTGTTTTCCTTTGGTCAGCATAGGTAT
AAGTACAGGGCTGTTGAAACTGAGGATGACAAGAGTAGAGCATCTTTTTAAAGACACTGA
CTATGTGTTCTGTTCTGTTCCTAAGATTTGTTTGTTTGTAAGAAAACTATAAAAGTCATG
TAAACGTATCTCTGCAATTTTCAATGCATCAACCGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2EU40TF U 1
AF RR2EU40JQ C 44
BS 1 756 RR2EU40TF
BS 757 757 RR2EU40JQ

RD RR2EU40TF 756 0 0
GACACATTCAGCACCTCAAGCTTCCAGTGACATGCATGCCTGTCTTCCCAGGACTCAGCA
TTTTCCTCATTCTCTCCCTTTATTACTCTGTCTTCGTCCCTATCACCAGAAGAATCACTG
GCAATCCCCATGGTGCTTCCCAGCTTCAAAGGGTGGGGATAGGGCTAGCAGTTTCAATCA
TATCAGTAGCTTGGGCTGGACTATTCGAGAACTACAGGAGAAATTACGCGATACAACATG
GTTTCGAGTTCAACTTCTTGACCCAAATGCCTGATCTAACAGCATACTGGTTGTTAATCC
AGTACTGTCTCATCGGTATAGCAGAGGTTTTCTGCATCGTTGGGCTACTGGAGTTCCTCT
ACGAGGAAGCACCTGATGCTATGAAGAGTATTGGTTCTGCCTACGCAGCGCTAGCCGGCG
GTTTAGGGTGTTTTGCTGCCACCATCTTGAACAACATCGTGAAGGCTGCGACCAGGAACT
CAGATGGGAACTCGTGGTTGTCGCAGAACATAAACACAGGGAGATTCGACTGTTTGTACT
GGCTCCTCACGCTTCTGAGCCTTTTGAACTTCTGTGTTTTCCTTTGGTCAGCATAGGTAT
AAGTACAGGGCTGTTGAAACTGAGGATGACAAGAGTAGAGCATCTTTTTAAAGACACTGA
CTATGTGTTCTGTTCTGTTCCTAAGATTTGTTTGTTTGTAAGAAAACTATAAAAGTCATG
TAAACGTATCTCTGCAATTTTCAATGCATCAACCGA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2EU40JQ 714 0 0
CTTCCCAGGACTCAGCATTTTCCTCATTCTCTCCCTTTATTACTCTGTCTTCGTCCCTAT
CACCAGAAGAATCACTGGCAATCCCCATGGTGCTTCCCAGCTTCAAAGGGTGGGGATAGG
GCTAGCAGTTTCAATCATATCAGTAGCTTGGGCTGGACTATTCGAGAACTACAGGAGAAA
TTACGCGATACAACATGGTTTCGAGTTCAACTTCTTGACCCAAATGCCTGATCTAACAGC
ATACTGGTTGTTAATCCAGTACTGTCTCATCGGTATAGCAGAGGTTTTCTGCATCGTTGG
GCTACTGGAGTTCCTCTACGAGGAAGCACCTGATGCTATGAAGAGTATTGGTTCTGCCTA
CGCAGCGCTAGCCGGCGGTTTAGGGTGTTTTGCTGCCACCATCTTGAACAACATCGTGAA
GGCTGCGACCAGGAACTCAGATGGGAACTCGTGGTTGTCGCAGAACATAAACACAGGGAG
ATTCGACTGTTTGTACTGGCTCCTCACGCTTCTGAGCCTTTTGAACTTCTGTGTTTTCCT
TTGGTCAGCATAGGTATAAGTACAGGGCTGTTGAAACTGAGGATGACAAGAGTAGAGCAT
CTTTTTAAAGACACTGACTATGTGTTCTGTTCTGTTCCTAAGATTTGTTTGTTTGTAAGA
AAACTATAAAAGTCATGTAAACGTATCTCTGCAATTTTCAATGCATCAACCGAG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL7463Contig1 720 2 2 U
AGATCTCAAATCAATCTACATATCGAACATTGAGGAAATCTCGACCTTGTCCATATAAAA
TAAAAATTAAACTTACAATGTAAACAAAAATCGATAATATATTTCTCACCGAGCATATAC
TATAAGAAAAAAAAAATGGAAGTTAATAAATATGCTGGGATAATAAAAATGAATTGGTAG
CTTTAAGCAGCTTTCTTGGCTTTGAAGCAAGACAAAGAATCTAACGGTTGTTGTAGTGAC
TTAGTTCTCAAGACACCTTCGGACAAAACAAAAGCTTTAAGCTTAAGCTTTGGATTTGTC
TCCCCTTTTTAAACTATTTTGTTTCAGATGAATACCACAGCTTCTTCTGGCAAATCAATA
GCTTCTCATTCTCTGATTCAGACTCTGTTTGTTCCTTACGGCAACTCCATCTCAGTCCTT
TAGCAACCGATGCAATAGTATCCGCAAAATAGCTCTATTCGCGTATAATGGCATACCCAT
TAGGACGCAAGATCCTATCCATTTCCAGCATAACATACTTCATCTCACACCTTTGGCTCT
CTGATGTAAACAGACCATCAACATGAAGAAGATCATAAGTTCTTGGATACGTCGAAAACG
CTTCACACCAGTCGTGATACGTTCCAATCAATCCACGATCAAACACAACGGGAAGTGTAT
TAGGTGCGTAAGAAGAGACAACGTTCATGACCCACAAAGGATCATCGACCAAAGCAGCAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR07JQ U 1
AF RR2GS31JQB U 1
BS 1 553 RR2GR07JQ
BS 554 720 RR2GS31JQB

RD RR2GR07JQ 553 0 0
AGATCTCAAATCAATCTACATATCGAACATTGAGGAAATCTCGACCTTGTCCATATAAAA
TAAAAATTAAACTTACAATGTAAACAAAAATCGATAATATATTTCTCACCGAGCATATAC
TATAAGAAAAAAAAAATGGAAGTTAATAAATATGCTGGGATAATAAAAATGAATTGGTAG
CTTTAAGCAGCTTTCTTGGCTTTGAAGCAAGACAAAGAATCTAACGGTTGTTGTAGTGAC
TTAGTTCTCAAGACACCTTCGGACAAAACAAAAGCTTTAAGCTTAAGCTTTGGATTTGTC
TCCCCTTTTTAAACTATTTTGTTTCAGATGAATACCACAGCTTCTTCTGGCAAATCAATA
GCTTCTCATTCTCTGATTCAGACTCTGTTTGTTCCTTACGGCAACTCCATCTCAGTCCTT
TAGCAACCGATGCAATAGTATCCGCAAAATAGCTCTATTCGCGTATAATGGCATACCCAT
TAGGACGCAAGATCCTATCCATTTCCAGCATAACATACTTCATCTCACACCTTTGGCTCT
CTGATGTAAACAG

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2GS31JQB 720 0 0
AGATCTCAAATCAATCTACATATCGAACATTGAGGAAATCTCGACCTTGTCCATATAAAA
TAAAAATTAAACTTACAATGTAAACAAAAATCGATAATATATTTCTCACCGAGCATATAC
TATAAGAAAAAAAAAATGGAAGTTAATAAATATGCTGGGATAATAAAAATGAATTGGTAG
CTTTAAGCAGCTTTCTTGGCTTTGAAGCAAGACAAAGAATCTAACGGTTGTTGTAGTGAC
TTAGTTCTCAAGACACCTTCGGACAAAACAAAAGCTTTAAGCTTAAGCTTTGGATTTGTC
TCCCCTTTTTAAACTATTTTGTTTCAGATGAATACCACAGCTTCTTCTGGCAAATCAATA
GCTTCTCATTCTCTGATTCAGACTCTGTTTGTTCCTTACGGCAACTCCATCTCAGTCCTT
TAGCAACCGATGCAATAGTATCCGCAAAATAGCTCTATTCGCGTATAATGGCATACCCAT
TAGGACGCAAGATCCTATCCATTTCCAGCATAACATACTTCATCTCACACCTTTGGCTCT
CTGATGTAAACAGACCATCAACATGAAGAAGATCATAAGTTCTTGGATACGTCGAAAACG
CTTCACACCAGTCGTGATACGTTCCAATCAATCCACGATCAAACACAACGGGAAGTGTAT
TAGGTGCGTAAGAAGAGACAACGTTCATGACCCACAAAGGATCATCGACCAAAGCAGCAG

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL7464Contig1 932 2 2 U
GATAAACCTGTTTATATTGTTTCCTCTTTGAAAAGATACGAAGAATCTAGAAGACTCAGA
GTGGCTATTATACATGGAATGGCGAGAATGGCTGCAGTTATGGCTTCTACTTACAAAGCA
TACTTAGGTGTTGGGCTTGGTCCTCTCTCTTTCTTGGCTAAGTTTTAGAGTACCACATCC
CGGAATAATTGGTGGAAGATTCTTCATGGACATGACTATGCCGTTGATGCTTGACTGGGT
CCTTGGTGGTAACAGTGAAAAACTGGAAGGAAGGTCACCTAGTTGCAGACTCACTGACAA
GGCTGATGACCGCCTTCGTGAGTGGTTTGAAGACGACGAGGCTCTTGAACTTACTATAAA
TGGAGAGTGGTATCTTATTCCATATGGCAGCAAGTGTAGCGTTTCTGAAACATTACGTCT
AACCAAAGATAAGGATCAACCTTGCATTATCGGAAGAAGTAAACCAGACCAAAATGTTCC
TGGAACCCACATTGTGATCCGTTCCCCTCAGGTATCGAAGATGCATGCACGTGTAATATA
CAAAGATGGAGCTTTCTTCTTGATGGATCTTCGAAGCGACCATGGAACCTATGTGACCGA
TAACTTAGGAAGAAGATATAGAGTGACACCAAACTTCCCTGCGCGGTTTAGACCTTTTGA
TATCATCGAGTTTGGTTCAGACAAGAAGGCAGCATTTAAGGTCAAAGTGATCAGGACAAC
TCCGAAGTTGACCAGAAGGGATGCGAAGAGTAACGGTAAATTGCTTCAGGCAGCTTGACA
CTTAAAAGTTAACCAACGGTGAAATTAAATATTTTACCAGTCTAGCAGATCATTTGTGTA
GTATTAATCTATTACTTGTATTGCGATGTATATATAGGTACGAACACAAAAGATAATTAA
TTATGGAGAACGTTATCTTTATTTGCTTGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP71TF U 1
AF RR2AP71JQ C 407
BS 1 607 RR2AP71TF
BS 608 932 RR2AP71JQ

RD RR2AP71TF 609 0 0
GATAAACCTGTTTATATTGTTTCCTCTTTGAAAAGATACGAAGAATCTAGAAGACTCAGA
GTGGCTATTATACATGGAATGGCGAGAATGGCTGCAGTTATGGCTTCTACTTACAAAGCA
TACTTAGGTGTTGGGCTTGGTCCTCTCTCTTTCTTGGCTAAGTTTTAGAGTACCACATCC
CGGAATAATTGGTGGAAGATTCTTCATGGACATGACTATGCCGTTGATGCTTGACTGGGT
CCTTGGTGGTAACAGTGAAAAACTGGAAGGAAGGTCACCTAGTTGCAGACTCACTGACAA
GGCTGATGACCGCCTTCGTGAGTGGTTTGAAGACGACGAGGCTCTTGAACTTACTATAAA
TGGAGAGTGGTATCTTATTCCATATGGCAGCAAGTGTAGCGTTTCTGAAACATTACGTCT
AACCAAAGATAAGGATCAACCTTGCATTATCGGAAGAAGTAAACCAGACCAAAATGTTCC
TGGAACCCACATTGTGATCCGTTCCCCTCAGGTATCGAAGATGCATGCACGTGTAATATA
CAAAGATGGAGCTTTCTTCTTGATGGATCTTCGAAGCGACCATGGAACCTATGTGACCGA
TAACTTA
CG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RR2AP71JQ 526 0 0
GAAACATTACGTCTAACCAAAGATAAGGATCAACCTTGCATTATCGGAAGAAGTAAACCA
GACCAAAATGTTCCTGGAACCCACATTGTGATCCGTTCCCCTCAGGTATCGAAGATGCAT
GCACGTGTAATATACAAAGATGGAGCTTTTTTCTTGATGGATTTTCGAAGCGACCATGGA
ACCTATGTGACCGATAACTTAGGAAGAAGATATAGAGTGACACCAAACTTCCCTGCGCGG
TTTAGACCTTTTGATATCATCGAGTTTGGTTCAGACAAGAAGGCAGCATTTAAGGTCAAA
GTGATCAGGACAACTCCGAAGTTGACCAGAAGGGATGCGAAGAGTAACGGTAAATTGCTT
CAGGCAGCTTGACACTTAAAAGTTAACCAACGGTGAAATTAAATATTTTACCAGTCTAGC
AGATCATTTGTGTAGTATTAATCTATTACTTGTATTGCGATGTATATATAGGTACGAACA
CAAAAGATAATTAATTATGGAGAACGTTATCTTTATTTGCTTGTCT

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 2

CO CL7465Contig1 1127 2 4 U
GGCACAAAGCCAACATGGCAATGGTGTTTGTACAGATTATATACGCAGGAATGCCATTGC
TCTCAAAAGTGGCCATCTCTCAAGGGACCAACCCTTTTGTCTTTGTTTTCTACCGACAAG
CCTTCGCTGCTCTGGCGTTGTCCCCTTTCGCATTCTTCCTTGAAAGCGCCAAATCATCCC
CTTTGTCCTTCTTCTTGCTGCTGAAAATTTTCATGATCTCCTTATGCGGACTCACGCTAA
GTCTTAACCTCTTCTATGTGGCCATCGACAACACCACTGCCACCTTTGCAGCAGCAACCA
CCAACGCCATTCCCTCTATCACCTTCGTATTGGCTTTTCTTTTCGGATTAGAGACGGTGA
CGTTAAAGAAGTCATACGGACTGGCGAAAGTATTTGGTTCGATGGTTGGTATGTTGGGCG
CACTAGTGTTCGCATTTGTGAAAGGGCCAAGTTTGATCAATCATGACAGCAACAAGACCA
TTCGAAACAAGGCCATTCCATCAACAAAAAATTCAGTAAAAGGATCCATCACTATGCTTG
CCGCCAATACCTGCTGGTGTTTGTGGATTGTATTGCAGAGCAAGGTGATGAAAGAATACA
CAGCTAAGCTGCGATTGGTAACACTTCAATGCGTCTTCAGTTGTATGCAAACCGCAGTTT
GGGCACTCGCAGTGAATAGAAGTCCATCAGTTTGGAAGATCGAATTTGGCTTACCTCTTC
TATCAATGGCTTATTGTGGAATTATGGTAACTGGATTCACATATTGGTTACAAGTATGGG
CTATAGAGAAGAAAGGACCAGTATTCACTGCACTCTACACTCCTTTAGCTCTCATCATTA
CATGCATCGTCTCGTCTTTCCTTTTTAAGGAAACCCTCTATCTTGGAAGTGTTTGTGGAG
CCTTTCTGTTGGTGTGTGGACTATACATTGGTCTTTGGGGTAAAACTAAAGAAGAAGAAG
AACGAACATATGGTGAGAAGCAAATCCTACAAGAGACTAAAGGAGAGATGACTGTCTAAT
ATTTCGTCTCTATGCACTTTGTTCCAACTATCACCATTATCAATAATGTCCGCGTGTAAT
CATGAATGTGGAGTTTTTTCCCTTCTTCTTTCTTATCTTCGGCGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ53TF U 1
AF RR2DJ53JQ C 499
BS 1 756 RR2DJ53TF
BS 757 757 RR2DJ53JQ
BS 758 793 RR2DJ53TF
BS 794 1127 RR2DJ53JQ

RD RR2DJ53TF 793 0 0
GGCACAAAGCCAACATGGCAATGGTGTTTGTACAGATTATATACGCAGGAATGCCATTGC
TCTCAAAAGTGGCCATCTCTCAAGGGACCAACCCTTTTGTCTTTGTTTTCTACCGACAAG
CCTTCGCTGCTCTGGCGTTGTCCCCTTTCGCATTCTTCCTTGAAAGCGCCAAATCATCCC
CTTTGTCCTTCTTCTTGCTGCTGAAAATTTTCATGATCTCCTTATGCGGACTCACGCTAA
GTCTTAACCTCTTCTATGTGGCCATCGACAACACCACTGCCACCTTTGCAGCAGCAACCA
CCAACGCCATTCCCTCTATCACCTTCGTATTGGCTTTTCTTTTCGGATTAGAGACGGTGA
CGTTAAAGAAGTCATACGGACTGGCGAAAGTATTTGGTTCGATGGTTGGTATGTTGGGCG
CACTAGTGTTCGCATTTGTGAAAGGGCCAAGTTTGATCAATCATGACAGCAACAAGACCA
TTCGAAACAAGGCCATTCCATCAACAAAAAATTCAGTAAAAGGATCCATCACTATGCTTG
CCGCCAATACCTGCTGGTGTTTGTGGATTGTATTGCAGAGCAAGGTGATGAAAGAATACA
CAGCTAAGCTGCGATTGGTAACACTTCAATGCGTCTTCAGTTGTATGCAAACCGCAGTTT
GGGCACTCGCAGTGAATAGAAGTCCATCAGTTTGGAAGATCGAATTTGGCTTACCTCTTC
TATCAATGGCTTATTGTGGAATTATGGTAACTGGAT*CACATATTGGTTACAAGTATGGG
CTATAGAGAAGAA

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2DJ53JQ 629 0 0
CATCAACAAAAAATTCAGTAAAAGGATCCATCACTATGCTTGCCGCCAATACCTGCTGGT
GTTTGTGGATTGTATTGCAGAGCAAGGTGATGAAAGAATACACAGCTAAGCTGCGATTGG
TAACACTTCAATGCGTCTTCAGTTGTATGCAAACCGCAGTTTGGGCACTCGCAGTGAATA
GAAGTCCATCAGTTTGGAAGATCGAATTTGGCTTACCTCTTCTATCAATGGCTTATTGTG
GAATTATGGTAACTGGATTCACATATTGGTTACAAGTATGGGCTATAGAGAAGAAAGGAC
CAGTATTCACTGCACTCTACACTCCTTTAGCTCTCATCATTACATGCATCGTCTCGTCTT
TCCTTTTTAAGGAAACCCTCTATCTTGGAAGTGTTTGTGGAGCCTTTCTGTTGGTGTGTG
GACTATACATTGGTCTTTGGGGTAAAACTAAAGAAGAAGAAGAACGAACATATGGTGAGA
AGCAAATCCTACAAGAGACTAAAGGAGAGATGACTGTCTAATATTTCGTCTCTATGCACT
TTGTTCCAACTATCACCATTATCAATAATGTCCGCGTGTAATCATGAATGTGGAGTTTTT
TCCCTTCTTCTTTCTTATCTTCGGCGAAT

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL7466Contig1 800 2 2 U
GTTCATCTCCAAACCATTTCAACTCAAAGTAAAGGTTGATTACAAAAAATGCTCCGACTA
GCGATTTCTTTGTTCCTCTTTGCATTGTTCTCTCTCACATCTGCAAGATCTTTCGTCACC
ACAAGACCTGGACCGATTGATTCATTTCTCCCTAAACCCAAGCTAGAGGGTGCGAGTGTG
TGTTCTTACACAGTGATCATTAAGACAAGCTGTTCGTCAGTGTCTTACACCAGAGATAAG
ATCAGTATTGCCTTTGGTGATGTGTACGGCAACGAGGTGTACGTGAAGAGACTAGACAAT
CCAAAGGCGAGGGCATTTGAAAAGTGTTCATCAGACACATACAAGATAACGGGACCGTGT
ATGCGTGACGTCTGTTATCTCCACCTACTCAGGCAAGGATCCAACGGCTGGAAACCAGAG
AACGTCAAGGTCTACGGCTCATCCATCAGATCAGTCACTTTCTACTATAACCTCTTTTTG
CCTAACGGTGTTTGGTACGGCTTTAATGTCTGCAACGGCATTGCCAATGCCAACGACAAG
TCTTCTCAACCCATCATTGCCTCCGTTGCTGCTATGTAAGATTAATAAATACAAAAAAGG
TTGATGAATTTGCTATTTTTGTGGCGTGAAGTGAAGAAAGGCAATGTGTGTTTTGAGTAT
GTTTGTGAGAAAAAAAAAACATGCAAGTTATGTAATGCCTTGATTTGATGTCTTGCAAGT
TGGGGCTTAGCAAGTGGCCAAGTCCTTTTTTTATATGAAATAAATAATAAATAACATGCA
TTGGAAGAAAATGCATAATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AE65TF U 1
AF RR2AE65JQ C 1
BS 1 766 RR2AE65TF
BS 767 800 RR2AE65JQ

RD RR2AE65TF 767 0 0
GTTCATCTCCAAACCATTTCAACTCAAAGTAAAGGTTGATTACAAAAAATGCTCCGACTA
GCGATTTCTTTGTTCCTCTTTGCATTGTTCTCTCTCACATCTGCAAGATCTTTCGTCACC
ACAAGACCTGGACCGATTGATTCATTTCTCCCTAAACCCAAGCTAGAGGGTGCGAGTGTG
TGTTCTTACACAGTGATCATTAAGACAAGCTGTTCGTCAGTGTCTTACACCAGAGATAAG
ATCAGTATTGCCTTTGGTGATGTGTACGGCAACGAGGTGTACGTGAAGAGACTAGACAAT
CCAAAGGCGAGGGCATTTGAAAAGTGTTCATCAGACACATACAAGATAACGGGACCGTGT
ATGCGTGACGTCTGTTATCTCCACCTACTCAGGCAAGGATCCAACGGCTGGAAACCAGAG
AACGTCAAGGTCTACGGCTCATCCATCAGATCAGTCACTTTCTACTATAACCTCTTTTTG
CCTAACGGTGTTTGGTACGGCTTTAATGTCTGCAACGGCATTGCCAATGCCAACGACAAG
TCTTCTCAACCCATCATTGCCTCCGTTGCTGCTATGTAAGATTAATAAATACAAAAAAGG
TTGATGAATTTGCTATTTTTGTGGCGTGAAGTGAAGAAAGGCAATGTGTGTTTTGAGTAT
GTTTGTGAGAAAAAAAAAACATGCAAGTTATGTAATGCCTTGATTTGATGTCTTGCAAGT
TGGGGCTTAGCAAGTGGCCAAGTCCTTTTTTTATATGAAATAAATA
T

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2AE65JQ 800 0 0
GTTCATCTCCAAACCATTTCAACTCAAAGTAAAGGTTGATTACAAAAAATGCTCCGACTA
GCGATTTCTTTGTTCCTCTTTGCATTGTTCTCTCTCACATCTGCAAGATCTTTCGTCACC
ACAAGACCTGGACCGATTGATTCATTTCTCCCTAAACCCAAGCTAGAGGGTGCGAGTGTG
TGTTCTTACACAGTGATCATTAAGACAAGCTGTTCGTCAGTGTCTTACACCAGAGATAAG
ATCAGTATTGCCTTTGGTGATGTGTACGGCAACGAGGTGTACGTGAAGAGACTAGACAAT
CCAAAGGCGAGGGCATTTGAAAAGTGTTCATCAGACACATACAAGATAACGGGACCGTGT
ATGCGTGACGTCTGTTATCTCCACCTACTCAGGCAAGGATCCAACGGCTGGAAACCAGAG
AACGTCAAGGTTTACGGCTCATCCATCAGATCAGTCACTTTTTACTATAACCTCTTTTTG
CCTAACGGTGTTTGGTACGGCTTTAATGTTTGCAACGGCATTGCCAATGCCAACGACAAG
TCTTCTCAACCCATCATTGCCTCCGTTGCTGCTATGTAAGATTAATAAATACAAAAAAGG
TTGATGAATTTGCTATTTTTGTGGCGTGAAGTGAAGAAAGGCAATGTGTGTTTTGAGTAT
GTTTGTGAGAAAAAAAAAACATGCAAGTTATGTAATGCCTTGATTTGATGTCTTGCAAGT
TGGGGCTTAGCAAGTGGCCAAGTCCTTTTTTTATATGAAATAAATAATAAATAACATGCA
TTGGAAGAAAATGCATAATT

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL7467Contig1 575 2 2 U
GTTTGACCGCAAAAATATCATTATTGGCCCTTTACTTACAATCCAAATCCAGCGGTTTGA
ACAAGTGAAAAAGAAGAAAAAAACAGATCAAAACGCTCATTTGAATCGCTACATAACACA
CTCGCAAGATGTGGTATCTACTTGCATAACAATCTTACATAAATAATATGTATTTGAGTT
TCTGGTTCTCATGTTGACAGATACTTATAAATCTACTCTTCTAAGACTCAGACTGCTAAC
TTAGTTGCATCCACCGGTTTCTCAACTCCTCCACTTGTAGGGAATCCACTCAAGACTTTG
ATGGCGTCATAAAAGAACCATTGCAAGGTTATGACAGGCCCCACGATGGTGATTCGAACA
GGAAGACTTCTAGTGAATAGACCAACAAACCCAATGTTCCTCACAGCCTGCAACACGTTC
TTGGCTTTGTTGTTGTAGAGAGAAGAAACAACCACATCCGCGGGGTTAGAGATGATTGTA
CCTACGGCACCAGCAGTGTAGCCAGCAAGACATGTGACACCGAGTTGCTGAGCTTTAGAG
CAATCTTGCTTCCTTTTCTGGATGATGTTCCGATC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C985TF C 1
AF RR2C985JQ U 5
BS 1 4 RR2C985TF
BS 5 575 RR2C985JQ

RD RR2C985TF 575 0 0
GTTTGACCGCAAAAATATCATTATTGGCCCTTTACTTACAATCCAAATCCAGCGGTTTGA
ACAAGTGAAAAAGAAGAAAAAAACAGATCAAAACGCTCATTTGAATCGCTACATAACACA
CTCGCAAGATGTGGTATCTACTTGCATAACAATCTTACATAAATAATATGTATTTGAGTT
TCTGGTTCTCATGTTGACAGATACTTATAAATCTACTCTTCTAAGACTCAGACTGCTAAC
TTAGTTGCATCCACCGGTTTCTCAACTCCTCCACTTGTAGGGAATCCACTCAAGACTTTG
ATGGCGTCATAAAAGAACCATTGCAAGGTTATGACAGGCCCCACGATGGTGATTCGAACA
GGAAGACTTCTAGTGAATAGACCAACAAACCCAATGTTCCTCACAGCCTGCAACACGTTC
TTGGCTTTGTTGTTGTAGAGAGAAGAAACAACCACATCCGCGGGGTTAGAGATGATTGTA
CCTACGGCACCAGCAGTGTAGCCAGCAAGACATGTGACACCGAGTTGCTGAGCTTTAGAG
CAATCTTGCTTCCTTTTCTGGATGATGTTCCGATC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2C985JQ 571 0 0
GACCGCAAAAATATCATTATTGGCCCTTTACTTACAATCCAAATCCAGCGGTTTGAACAA
GTGAAAAAGAAGAAAAAAACAGATCAAAACGCTCATTTGAATCGCTACATAACACACTCG
CAAGATGTGGTATCTACTTGCATAACAATCTTACATAAATAATATGTATTTGAGTTTCTG
GTTCTCATGTTGACAGATACTTATAAATCTACTCTTCTAAGACTCAGACTGCTAACTTAG
TTGCATCCACCGGTTTCTCAACTCCTCCACTTGTAGGGAATCCACTCAAGACTTTGATGG
CGTCATAAAAGAACCATTGCAAGGTTATGACAGGCCCCACGATGGTGATTCGAACAGGAA
GACTTCTAGTGAATAGACCAACAAACCCAATGTTCCTCACAGCCTGCAACACGTTCTTGG
CTTTGTTGTTGTAGAGAGAAGAAACAACCACATCCGCGGGGTTAGAGATGATTGTACCTA
CGGCACCAGCAGTGTAGCCAGCAAGACATGTGACACCGAGTTGCTGAGCTTTAGAGCAAT
CTTGCTTCCTTTTCTGGATGATGTTCCGATC

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

CO CL7468Contig1 571 2 1 U
GAGCATTGTCCTTAGCGGAGAAAGCCTGCGAGTCTTTTAACGGTGAGCTAGGCATTTACG
CCTTCAAGACTCTGCCAAACTCAACCATACAAGTGAGAATCGAACGGCTCAGTAACAAGT
CCGGTTCTCCGACTATGGAAGACATCGAAGCGTATTCAACCACTTACAGAGCGAAACTGT
CTGAAGCTGAACTCGCCAAGACCGTACCAGACAATATCTCCTTAGAGGTGTCATCTCCTG
GTGTTGAAAGAGTAGTAAGAGTTCCTCAGGATCTTGACCGGTACAAGGACAGGTCAATGT
ACGTGAGGTACGTTAACGAGGAAGCTGAGAAGGACGGTGATGGTATCTTCAGGCTAGTTT
CTTTCGATGAGGAAGCCAAAAGCTGCATTTGGGGGATAGCTGATATTAGAGTGAACCGTG
AGAAGGCATGCAAAGGGAGACCTTTGAGCAAGAAGCAAAGAGAATGGCGTCTTGAAACTT
CTTTTGAGTCACTACGTTTAGTTCGTTTGCATTCTGAATGTTGAAACACATAACATTTTT
TTTATTGAATGAAAAACATAATGTTTTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E525JQ C 1
AF RR2E525TF U 1
BS 1 571 RR2E525TF

RD RR2E525JQ 571 0 0
GAGCATTGTCCTTAGCGGAGAAAGCCTGCGAGTCTTTTAACGGTGAGCTAGGCATTTACG
CCTTCAAGACTCTGCCAAACTCAACCATACAAGTGAGAATCGAACGGCTCAGTAACAAGT
CCGGTTCTCCGACTATGGAAGACATCGAAGCGTATTCAACCACTTACAGAGCGAAACTGT
CTGAAGCTGAACTCGCCAAGACCGTACCAGACAATATCTCCTTAGAGGTGTCATCTCCTG
GTGTTGAAAGAGTAGTAAGAGTTCCTCAGGATCTTGACCGGTACAAGGACAGGTCAATGT
ACGTGAGGTACGTTAACGAGGAAGCTGAGAAGGACGGTGATGGTATCTTCAGGCTAGTTT
CTTTCGATGAGGAAGCCAAAAGCTGCATTTGGGGGATAGCTGATATTAGAGTGAACCGTG
AGAAGGCATGCAAAGGGAGACCTTTGAGCAAGAAGCAAAGAGAATGGCGTCTTGAAACTT
CTTTTGAGTCACTACGTTTAGTTCGTTTGCATTCTGAATGTTGAAACACATAACATTTTT
TTTATTGAATGAAAAACATAATGTTTTTTTT

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2E525TF 571 0 0
GAGCATTGTCCTTAGCGGAGAAAGCCTGCGAGTCTTTTAACGGTGAGCTAGGCATTTACG
CCTTCAAGACTCTGCCAAACTCAACCATACAAGTGAGAATCGAACGGCTCAGTAACAAGT
CCGGTTCTCCGACTATGGAAGACATCGAAGCGTATTCAACCACTTACAGAGCGAAACTGT
CTGAAGCTGAACTCGCCAAGACCGTACCAGACAATATCTCCTTAGAGGTGTCATCTCCTG
GTGTTGAAAGAGTAGTAAGAGTTCCTCAGGATCTTGACCGGTACAAGGACAGGTCAATGT
ACGTGAGGTACGTTAACGAGGAAGCTGAGAAGGACGGTGATGGTATCTTCAGGCTAGTTT
CTTTCGATGAGGAAGCCAAAAGCTGCATTTGGGGGATAGCTGATATTAGAGTGAACCGTG
AGAAGGCATGCAAAGGGAGACCTTTGAGCAAGAAGCAAAGAGAATGGCGTCTTGAAACTT
CTTTTGAGTCACTACGTTTAGTTCGTTTGCATTCTGAATGTTGAAACACATAACATTTTT
TTTATTGAATGAAAAACATAATGTTTTTTTT

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

CO CL7469Contig1 1508 2 2 U
AAGACCAGATTATTCATGTGAATCTCACACAAGATAATCTAAGGCCGTTAGAAGCAGGGA
GGACGGTGGACTTGACATATTCTGTGAATTGGATCCCAACCGATGTCACATTTGCCCGGC
GTTTTGATGTTTATCTAGACTATCCGTTCTTCGAACACCAGATCCATTGGTTCTCCATCT
TTAACTCGTTCATGATGGTTATCTTCCTTACTGGTTTGGTTTCAATGATATTAATGAGGA
CTCTCAGGAATGATTATGCTAAGTATGCTCGGGAAGACGACGACCTGGAGAGCTTGGAAC
GGGATGTCAATGAAGAATCTGGATGGAAACTCGTACACGGAGATGTGTTCCGACCACCAA
GCAGTCTGGTTCTTCTCTCGGCTGTTGTTGGTACAGGTGCACAGTTGGCGTTGCTTGTTC
TTCTTGTCATATTAATGGCAATCATTGGGACACTTTATGTTGGGAGAGGAGCGATCGTCA
CAACTTTTATAGTTTGCTACGCCCTGACGTCATTTATATCTGGTTATGTGAGCGGTGGAA
TGTACTCAAGAAGTGGAGGTAAACATTGGATCAAGTGCATGATCCTCACGGCTTCTCTCT
TCCCATTCTTGTGCTTTGGGATCGGATTCCTCTTAAACACAATCGCTATATTCTACGGAT
CTCTTGCTGCTATTCCTTTCGGACAATGGTGGTTGTCTTCGTAATTTGGGGTTTCATTTC
GTTTCCTCTTGCCCTCCTCGGAACAGTCGTGGGTAGAAACTGGAGTGGTGCCCCAAACAA
TCCATGCCGAGTGAAGACAATTCCACGTCCAATCCCTGAGAAAAAATGGTACTTGACTCC
ATCAGTAGTCTCTCTTATGGGAGGTCTCTTACCCTTTGGCAGCATCTTCATTGAAATGTA
CTTCGTTTTCACATCCTTTTGGAATTACAAGGTATACTACGTGTACGGCTTCATGCTGCT
TGTGTTTTTGATTCTTGTTGTGGTGACCGTCTGTGTGACGATTGTGGGAACATACTTCTT
GCTGAATGCGGAGAACTATCACTGGCAATGGACATCGTTCTTTTCAGCCGCTTCGACGGC
GGTTTACGTCTACTTATACTCTATCTATTACTACTACGTGAAGACAAAGATGTTTGGGTT
TTTCCAGACCAGCTTCTACTTCGGATACACTTTGATGTTTTGTCTGGGTCTCGGAATCCT
TTGCGGAGCTGTTGGGTTCTTAGGATCAAATCTGTTTGTTAGAAGGATCTACAGAAACAT
CAAGTGCGACTAGAGAGAAGTGACCGAACCAAAAAGGCGGTAAAGATGGATCGTGGAATG
TTCTTGGAGGCAGTTAATTCTGTTAGAAAGAAGCTTCTAGGTTATTTAATACACAAGGGA
AATTTGAGCGGGAATGGAGGAAGAGCTTGTATGGTGATCAAAAAAGTTATATTTTTATTT
GGTTTAATCTCCCTTTTTGGTGAAGTTGCATCTGCTCTTATTTATTTTAGGTTTCAGAGA
TTCTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE15TF U 1
AF RR2BE15JQ C 684
BS 1 757 RR2BE15TF
BS 758 1508 RR2BE15JQ

RD RR2BE15TF 757 0 0
AAGACCAGATTATTCATGTGAATCTCACACAAGATAATCTAAGGCCGTTAGAAGCAGGGA
GGACGGTGGACTTGACATATTCTGTGAATTGGATCCCAACCGATGTCACATTTGCCCGGC
GTTTTGATGTTTATCTAGACTATCCGTTCTTCGAACACCAGATCCATTGGTTCTCCATCT
TTAACTCGTTCATGATGGTTATCTTCCTTACTGGTTTGGTTTCAATGATATTAATGAGGA
CTCTCAGGAATGATTATGCTAAGTATGCTCGGGAAGACGACGACCTGGAGAGCTTGGAAC
GGGATGTCAATGAAGAATCTGGATGGAAACTCGTACACGGAGATGTGTTCCGACCACCAA
GCAGTCTGGTTCTTCTCTCGGCTGTTGTTGGTACAGGTGCACAGTTGGCGTTGCTTGTTC
TTCTTGTCATATTAATGGCAATCATTGGGACACTTTATGTTGGGAGAGGAGCGATCGTCA
CAACTTTTATAGTTTGCTACGCCCTGACGTCATTTATATCTGGTTATGTGAGCGGTGGAA
TGTACTCAAGAAGTGGAGGTAAACATTGGATCAAGTGCATGATCCTCACGGCTTCTCTCT
TCCCATTCTTGTGCTTTGGGATCGGATTCCTCTTAAACACAATCGCTATATTCTACGGAT
CTCTTGCTGCTATTCCTTTCGGACAATGGTGGTTGTCTTCGTAATTTGGGGTTTCATTTC
GTTTCCTCTTGCCCTCCTCGGAACAGTCGTGGGTAGA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2BE15JQ 825 0 0
CAATGGTGGT*GTCTTCGTAATTTGGGGTTTCATTTCGTTTCCTCTTGCCCTCCTCGGAA
CAGTCGTGGGTAGAAACTGGAGTGGTGCCCCAAACAATCCATGCCGAGTGAAGACAATTC
CACGTCCAATCCCTGAGAAAAAATGGTACTTGACTCCATCAGTAGTCTCTCTTATGGGAG
GTCTCTTACCCTTTGGCAGCATCTTCATTGAAATGTACTTCGTTTTCACATCCTTTTGGA
ATTACAAGGTATACTACGTGTACGGCTTCATGCTGCTTGTGTTTTTGATTCTTGTTGTGG
TGACCGTCTGTGTGACGATTGTGGGAACATACTTCTTGCTGAATGCGGAGAACTATCACT
GGCAATGGACATCGTTCTTTTCAGCCGCTTCGACGGCGGTTTACGTCTACTTATACTCTA
TCTATTACTACTACGTGAAGACAAAGATGTTTGGGTTTTTCCAGACCAGCTTCTACTTCG
GATACACTTTGATGTTTTGTCTGGGTCTCGGAATCCTTTGCGGAGCTGTTGGGTTCTTAG
GATCAAATCTGTTTGTTAGAAGGATCTACAGAAACATCAAGTGCGACTAGAGAGAAGTGA
CCGAACCAAAAAGGCGGTAAAGATGGATCGTGGAATGTTCTTGGAGGCAGTTAATTCTGT
TAGAAAGAAGCTTCTAGGTTATTTAATACACAAGGGAAATTTGAGCGGGAATGGAGGAAG
AGCTTGTATGGTGATCAAAAAAGTTATATTTTTATTTGGTTTAATCTCCCTTTTTGGTGA
AGTTGCATCTGCTCTTATTTATTTTAGGTTTCAGAGATTCTTGCT

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

CO CL7470Contig1 771 2 3 U
TTTTTGAAGATGGGGAGAGGAAGGATTGAGATTAAGAAGATTGAGAATGTGAACAGTCGT
CAAGTCACTTTCTCCAAAAGACGTAACGGCTTGATGAAGAAGGCCAAAGAGCTTTCGATC
CTCTGCGACGCGGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCCAGCACCGGCAAGGTTTACGATTTC
TCCAGCGGCTGTATGGAGCAAACTCTTTCGAGATATGGGTACAATGCTGAAACGGCAGAT
CATAAACAAATAGAACAAAAACAGCTTTTGCTTTGTTCTTCTTCACATGAAAATGGTGTT
GTGTTGCGGAAAGACGAATCTGTGAGGAGCGAACTTGAGAGACTTCAGCTTGCTATTGAG
AGGCTGAAGGGTAAGGAGCTTGAGGGTATGAGCTTCTCGGATCTTATTTCTCTTGAAAAC
CAGTTGAATGATAGCTTGCACAGTGTCAAGAATCAAAAGACACAACTCTTGCTCAGCCAG
GTGGAAAGATCCAGGTTACAGGAGAGAAGGGCATTGGAAGAGAACCAACTCTTGCGCAAA
CAGGTAGAGATGTTGGGGAGAGGTTCATCACGACCAAAAGGGTTGAGTGAAATACCTCAA
TTCTCTAGCCCACAAGCGGAGCACGAGAGCTCTTCTTCAGATGATGACGATAATGACAAT
GAGACCACTATTCCGACACTTCCTTGCAGCTGGGGTTGTCATGGTCGGGGTATTGTAGAA
AGACAAAGAAGCCTAATATCGAATCACCCTGTGATAACTCTGGAAGTCAGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H019TF U 1
AF RR2GQ93TF U 1
BS 1 570 RR2GQ93TF
BS 571 571 RR2H019TF
BS 572 771 RR2GQ93TF

RD RR2H019TF 576 0 0
TTTTTGAAGATGGGGAGAGGAAGGATTGAGATTAAGAAGATTGAGAATGTGAACAGTCGT
CAAGTCACTTTCTCCAAAAGACGTAACGGCTTGATGAAGAAGGCCAAAGAGCTTTCGATC
CTCTGCGACGCGGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCCAGCACCGGCAAGGTTTACGATTTC
TCCAGCGGCTGTATGGAGCAAACTCTTTCGAGATATGGGTACAATGCTGAAACGGCAGAT
CATAAACAAATAGAACAAAAACAGCTTTTGCTTTGTTCTTCTTCACATGAAAATGGTGTT
GTGTTGCGGAAAGACGAATCTGTGAGGAGCGAACTTGAGAGACTTCAGCTTGCTATTGAG
AGGCTGAAGGGTAAGGAGCTTGAGGGTATGAGCTTCTCGGATCTTATTTCTCTTGAAAAC
CAGTTGAATGATAGCTTGCACAGTGTCAAGAATCAAAAGACACAACTCTTGCTCAGCCAG
GTGGAAAGATCCAGGTTACAGGAGAGAAGGGCATTGGAAGAGAACCAACTCTTGCGCAAA
CAGGTAGAGATGTTGGGGAGAGGTTCATCACGACCA

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2GQ93TF 771 0 0
TTTTTGAAGATGGGGAGAGGAAGGATTGAGATTAAGAAGATTGAGAATGTGAACAGTCGT
CAAGTCACTTTCTCCAAAAGACGTAACGGCTTGATGAAGAAGGCCAAAGAGCTTTCGATC
CTCTGCGACGCGGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCCAGCACCGGCAAGGTTTACGATTTC
TCCAGCGGCTGTATGGAGCAAACTCTTTCGAGATATGGGTACAATGCTGAAACGGCAGAT
CATAAACAAATAGAACAAAAACAGCTTTTGCTTTGTTCTTCTTCACATGAAAATGGTGTT
GTGTTGCGGAAAGACGAATCTGTGAGGAGCGAACTTGAGAGACTTCAGCTTGCTATTGAG
AGGCTGAAGGGTAAGGAGCTTGAGGGTATGAGCTTCTCGGATCTTATTTCTCTTGAAAAC
CAGTTGAATGATAGCTTGCACAGTGTCAAGAATCAAAAGACACAACTCTTGCTCAGCCAG
GTGGAAAGATCCAGGTTACAGGAGAGAAGGGCATTGGAAGAGAACCAACTCTTGCGCAAA
CAGGTAGAGATGTTGGGGAGAGGTTCATCAGGACCAAAAGGGTTGAGTGAAATACCTCAA
TTCTCTAGCCCACAAGCGGAGCACGAGAGCTCTTCTTCAGATGATGACGATAATGACAAT
GAGACCACTATTCCGACACTTCCTTGCAGCTGGGGTTGTCATGGTCGGGGTATTGTAGAA
AGACAAAGAAGCCTAATATCGAATCACCCTGTGATAACTCTGGAAGTCAGT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL7471Contig1 640 2 2 U
GGGACTACATACACTTTCGTACGCTTCCCTCTTTTCGCTATCACCGAGTCGTCGTCTTCG
TCTCTTTCTGAAATCACAAATGGCTGGTCGTGGAAAAACTCTCGGATCTGGAGTCGCCAA
GAAGGCAACCTCTCGGAGCAGCAAAGCCGGTCTCCAGTTCCCCGTGGGTCGTATCGCCCG
GTTCTTGAAAAACGGCAAATACGCCGAACGTGTCGGCGCCGGAGCCCCGGTCTACCTAGC
CGCCGTTCTCGAATACCTAGCCGCAGAGGTTCTCGAATTGGCTGGGAACGCGGCGAGGGA
CAACAAGAAGACGAGAATCGTGCCACGTCATATCCAGTTGGCGGTGAGGAACGACGAGGA
GCTGAGCAAGTTGCTTGGGGATGTGACGATTGCTAACGGAGGTGTGATGCCCAACATTCA
CAACCTTCTTCTTCCCAAGAAGGCTGGTGGTGCTTCCAAACCTTCCGGTGATGACGAGTA
GATTCAGTTTCTCTGTGTTTGTGGTGTTTTCAGCTTATGAATGTGTAGCCGTAGGTTTAG
GTTAGGTCTTTTATGTTTCGTTAGACTACGGTGCAGTGTCCTTTCGTGTTATATGAAGCT
ATGTGTTCTTAATATAAGTGTTATGATTTGATTCTCGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2DA15TF U 1
AF RR2DA15JQ C 63
BS 1 638 RR2DA15TF
BS 639 640 RR2DA15JQ

RD RR2DA15TF 638 0 0
GGGACTACATACACTTTCGTACGCTTCCCTCTTTTCGCTATCACCGAGTCGTCGTCTTCG
TCTCTTTCTGAAATCACAAATGGCTGGTCGTGGAAAAACTCTCGGATCTGGAGTCGCCAA
GAAGGCAACCTCTCGGAGCAGCAAAGCCGGTCTCCAGTTCCCCGTGGGTCGTATCGCCCG
GTTCTTGAAAAACGGCAAATACGCCGAACGTGTCGGCGCCGGAGCCCCGGTCTACCTAGC
CGCCGTTCTCGAATACCTAGCCGCAGAGGTTCTCGAATTGGCTGGGAACGCGGCGAGGGA
CAACAAGAAGACGAGAATCGTGCCACGTCATATCCAGTTGGCGGTGAGGAACGACGAGGA
GCTGAGCAAGTTGCTTGGGGATGTGACGATTGCTAACGGAGGTGTGATGCCCAACATTCA
CAACCTTCTTCTTCCCAAGAAGGCTGGTGGTGCTTCCAAACCTTCCGGTGATGACGAGTA
GATTCAGTTTCTCTGTGTTTGTGGTGTTTTCAGCTTATGAATGTGTAGCCGTAGGTTTAG
GTTAGGTCTTTTATGTTTCGTTAGACTACGGTGCAGTGTCCTTTCGTGTTATATGAAGCT
ATGTGTTCTTAATATAAGTGTTATGATTTGATTCTCGA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2DA15JQ 578 0 0
TCTTTCTGAAATCACAAATGGCTGGTCGTGGAAAAACTCTCGGATCTGGAGTCGCCAAGA
AGGCAACCTCTCGGAGCAGCAAAGCCGGTCTCCAGTTCCCCGTGGGTCGTATCGCCCGGT
TCTTGAAAAACGGCAAATACGCCGAACGTGTCGGCGCCGGAGCCCCGGTCTACCTAGCCG
CCGTTCTCGAATACCTAGCCGCAGAGGTTCTCGAATTGGCTGGGAACGCGGCGAGGGACA
ACAAGAAGACGAGAATCGTGCCACGTCATATCCAGTTGGCGGTGAGGAACGACGAGGAGC
TGAGCAAGTTGCTTGGGGATGTGACGATTGCTAACGGAGGTGTGATGCCCAACATTCACA
ACCTTTTTCTTCCCAAGAAGGCTGGTGGTGCTTCCAAACCTTCCGGTGATGACGAGTAGA
TTCAGTTTCTCTGTGTTTGTGGTGTTTTCAGCTTATGAATGTGTAGCCGTAGGTTTAGGT
TAGGTCTTTTATGTTTCGTTAGACTACGGTGCAGTGTCCTTTCGTGTTATATGAAGCTAT
GTGTTCTTAATATAAGTGTTATGATTTGATTCTCGATT

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL7472Contig1 576 2 1 U
GGAGATTCACTCCATTGTTGTTACTCTGGGGATAAGAAAGTTAAAAAGAAAAAGACAAGA
AAGATGTTTCTTTGGCTAGTAATTGTCTTAATGGTTTCAGGTTCTGCCTCTTCAAATGAA
TACAAACTCCATTGCGCTATTCCTCCTGCAAATGCTTCAACAATTCTTAACGATTGGGCT
TCCAGTCAACGGTTCCAAGTTGGAGACACCATTCGTTTCAAGTACAAAAAAGATTCCGTG
ATGCAAGTGACAAAGGAGGGTTATATGCAATGCAATTCGTCTCACCCAAGATTCTACTCG
AATACGGGCAAGACCCGGTTCATGTTTGATCACTCAGTTCCTTACTATTTCATAAGTGGA
ACGTCTGGTCACTGTGAAAAAGGTCAGAAAATGAGCGTCGAGGTCATGACTCACGACCGT
TCTAGCACATCCTCAGCTCCTCCAGCTGCAGTGGCCGTTTGGTTCTGTTTCTTAAGCTTC
ATGTTATCTCTTGTAGCTTAGTGTCAATGTTAAATTTAGGTTACTATTAGCTTGTTTATG
CTTTGCTGCTTCTATGATAATTTCGTTTACTTGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BL88JQ C 1
AF RR2BL88TF U 1
BS 1 576 RR2BL88TF

RD RR2BL88JQ 576 0 0
GGAGATTCACTCCATTGTTGTTACTCTGGGGATAAGAAAGTTAAAAAGAAAAAGACAAGA
AAGATGTTTCTTTGGCTAGTAATTGTCTTAATGGTTTCAGGTTCTGCCTCTTCAAATGAA
TACAAACTCCATTGCGCTATTCCTCCTGCAAATGCTTCAACAATTCTTAACGATTGGGCT
TCCAGTCAACGGTTCCAAGTTGGAGACACCATTCGTTTCAAGTACAAAAAAGATTCCGTG
ATGCAAGTGACAAAGGAGGGTTATATGCAATGCAATTCGTCTCACCCAAGATTCTACTCG
AATACGGGCAAGACCCGGTTCATGTTTGATCACTCAGTTCCTTACTATTTCATAAGTGGA
ACGTCTGGTCACTGTGAAAAAGGTCAGAAAATGAGCGTCGAGGTCATGACTCACGACCGT
TTTAGCACATCCTCAGCTCCTCCAGCTGCAGTGGCCGTTTGGTTCTGTTTCTTAAGCTTC
ATGTTATCTCTTGTAGCTTAGTGTCAATGTTAAATTTAGGTTACTATTAGCTTGTTTATG
CTTTGCTGCTTCTATGATAATTTCGTTTACTTGTTT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2BL88TF 576 0 0
GGAGATTCACTCCATTGTTGTTACTCTGGGGATAAGAAAGTTAAAAAGAAAAAGACAAGA
AAGATGTTTCTTTGGCTAGTAATTGTCTTAATGGTTTCAGGTTCTGCCTCTTCAAATGAA
TACAAACTCCATTGCGCTATTCCTCCTGCAAATGCTTCAACAATTCTTAACGATTGGGCT
TCCAGTCAACGGTTCCAAGTTGGAGACACCATTCGTTTCAAGTACAAAAAAGATTCCGTG
ATGCAAGTGACAAAGGAGGGTTATATGCAATGCAATTCGTCTCACCCAAGATTCTACTCG
AATACGGGCAAGACCCGGTTCATGTTTGATCACTCAGTTCCTTACTATTTCATAAGTGGA
ACGTCTGGTCACTGTGAAAAAGGTCAGAAAATGAGCGTCGAGGTCATGACTCACGACCGT
TCTAGCACATCCTCAGCTCCTCCAGCTGCAGTGGCCGTTTGGTTCTGTTTCTTAAGCTTC
ATGTTATCTCTTGTAGCTTAGTGTCAATGTTAAATTTAGGTTACTATTAGCTTGTTTATG
CTTTGCTGCTTCTATGATAATTTCGTTTACTTGTTT

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

CO CL7473Contig1 772 2 5 U
GGAAGAAGAGGTGGGGAGGAAAAAAATCGATAGCGCCATGAACGCGAGAGCTCTTCTCTA
CTCTCCCAATCTCCACCCTCTCTACACTTCAAATCGTCCACCCGAGACCTCTCCTCGAAA
CCGCCGGACTCCAAAAACTGATCCGAAGCCGTTACGGATATGGATTCACCAGCGGAACAT
GTCCAGCGTTTTCCGGGTGCTAGTTCGGAGCTCCGACAAGAGAGAGAGCAGTAGTAACTC
GTACGCGGAGACGATAAAAGAAGGCCGAGAGATAGTTAATGGGAACGGCGTCGTATCTGA
TTCGCTAAGCTCGGTTCCGTGGTGGGAAGAGTTTCCGAAGCGGTGGGTGATAGTGCTTCT
CTGTTTCTCAGCTTTTCTTCTCTGTAATATGGACAGAGTGAACATGAGCATAGCAATACT
TCCCATGTCGGCTGAGTATGGTTGGAATCCAGCGACAGTTGGTCTGATTCAGTCTTCCTT
CTTCTGGGGTTACCTTCTCACTCAAATAGCTGGAGGGATATGGGCAGACACGGTAGGTGA
CAAAATGGTTCTTGGATTCGGCGTTATCTGGTGGTCCGTCGCTACAATACTTACTCCTAT
CGCAGCTAAACTCGGTCTCCCCTTCTTGCTCGTTGTTCGTGCTTTCATGGGAGTTGGCGA
GGGTGTTGCGATGCCTGCTATGAACAATATACTGTCCAAGTGGGTGCCTGTGCAAGAGAG
AAGCAGATCTCTCGCGCTTTTTACAGCGGATGTACCTGGATCCGTCACCGGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC28TF U 1
AF RR2GZ50TF U 1
BS 1 686 RR2GC28TF
BS 687 687 RR2GZ50TF
BS 688 714 RR2GC28TF
BS 715 715 RR2GZ50TF
BS 716 772 RR2GC28TF

RD RR2GC28TF 772 0 0
GGAAGAAGAGGTGGGGAGGAAAAAAATCGATAGCGCCATGAACGCGAGAGCTCTTCTCTA
CTCTCCCAATCTCCACCCTCTCTACACTTCAAATCGTCCACCCGAGACCTCTCCTCGAAA
CCGCCGGACTCCAAAAACTGATCCGAAGCCGTTACGGATATGGATTCACCAGCGGAACAT
GTCCAGCGTTTTCCGGGTGCTAGTTCGGAGCTCCGACAAGAGAGAGAGCAGTAGTAACTC
GTACGCGGAGACGATAAAAGAAGGCCGAGAGATAGTTAATGGGAACGGCGTCGTATCTGA
TTCGCTAAGCTCGGTTCCGTGGTGGGAAGAGTTTCCGAAGCGGTGGGTGATAGTGCTTCT
CTGTTTCTCAGCTTTTCTTCTCTGTAATATGGACAGAGTGAACATGAGCATAGCAATACT
TCCCATGTCGGCTGAGTATGGTTGGAATCCAGCGACAGTTGGTCTGATTCAGTCTTCCTT
CTTCTGGGGTTACCTTCTCACTCAAATAGCTGGAGGGATATGGGCAGACACGGTAGGTGA
CAAAATGGTTCTTGGATTCGGCGTTATCTGGTGGTCCGTCGCTACAATACTTACTCCTAT
CGCAGCTAAACTCGGTCTCCCCTTCTTGCTCGTTGTTCGTGCTTTCATGGGAGTTGGCGA
GGGTGTTGCGATGCCTGCTATGAACA*TATACTGTCCAAGTGGGTGCCTGTGCA*GAGAG
AAGCAGATCTCTCGCGCTTTTTACAGCGGATGTACCTGGATCCGTCACCGGT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2GZ50TF 730 0 0
GGAAGAAGAGGTGGGGAGGAAAAAAATCGATAGCGCCATGAACGCGAGAGCTCTTCTCTA
CTCTCCCAATCTCCACCCTCTCTACACTTCAAATCGTCCACCCGAGACCTCTCCTCGAAA
CCGCCGGACTCCAAAAACTGATCCGAAGCCGTTACGGATATGGATTCACCAGCGGAACAT
GTCCAGCGTTTTCCGGGTGCTAGTTCGGAGCTCCGACAAGAGAGAGAGCAGTAGTAACTC
GTACGCGGAGACGATAAAAGAAGGCCGAGAGATAGTTAATGGGAACGGCGTCGTATCTGA
TTCGCTAAGCTCGGTTCCGTGGTGGGAAGAGTTTCCGAAGCGGTGGGTGATAGTGCTTCT
CTGTTTCTCAGCTTTTCTTCTCTGTAATATGGACAGAGTGAACATGAGCATAGCAATACT
TCCCATGTCGGCTGAGTATGGTTGGAATCCAGCGACAGTTGGTCTGATTCAGTCTTCCTT
CTTCTGGGGTTACCTTCTCACTCAAATAGCTGGAGGGATATGGGCAGACACGGTAGGTGA
CAAAATGGTTCTTGGATTCGGCGTTATCTGGTGGTCCGTCGCTACAATACTTACTCCTAT
CGCAGCTAAACTCGGTCTCCCCTTCTTGCTCGTTGTTCGTGCTTTCATGGGAGTTGGCGA
GGGTGTTGCGATGCCTGCTATGAACAATATACTGTCCAAGTGGGTGCCTGTGCAAGAGAG
AAGCAGATCT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL7474Contig1 1277 2 14 U
CCAGAAGAGTAATTGTGTACAGTTTTCGTTTCATCAAGCTCCAACTGCTAATCATCAGAG
ATGGCAACGAATGGAACGACGACGAAGCCACCACCGATGCCTTCTCCACTGCGTAATTCC
AAGTTTTTGCAGTCAAATATGAGGATCTTGGTGACAGGAGGAGCTGGATTCATTGGTTCA
CATTTGGTTGATAGATTGATGCAAAACGAAAAGAATGAAGTAATCGTCGCTGATAATTAC
TTCACTGGATCAAAAGACAATCTTAAGAAATGGATTGGTCATCCAAGATTTGAACTTATT
CGTCATGATGTGACAGAACCTCTCATGGTCGAGGTTGATCGAATCTACCATTTAGCGTGT
CCTGCATCTCCAATTTTCTACAAATACAACCCTGTTAAGACGATAAAAACAAATGCGATT
GGCACACTTAATATGTTGGGACTAGCTAAGCGAGTTGGAGCAAGAATTTTACTTACTTCC
ACATCTGAAGTGTACGGTGATCCTCTTGTTCATCCTCAGACCGAGAGCTACTGGGGAAAA
TGTAAACCCCATCGGTGTTAGAAGCTGTTACGATGAAGGAAAAACGTGTTGCAGAGACTC
TGATGTTTGATTACCATAGGCAACATGGGATTGAAATACGCATAGCCAGAATATTCAACA
CATATGGTCCTCGTATGAACATTGATGATGGTCGTGTCGTGAGCAACTTCATTGCTCAGG
CTCTCAGAGGAGAAGCGCTAACTGTTCAGAAACCGGGAACACAAACCCGAAGTTTCTGTT
ATGTTTCAGACATGGTCGATGGTCTAATGCGTCTGATGGAAGGAGACCAAACCGGACCAA
TCAATATAGGCAATCCAGGTGAATTCACGATGGTTGAACTCGCTGAGACGGTTAAAGAGC
TTATTAAGCCGGACGTAGAGATAAAGATGGTGGAGAATACACCAGATTATCCGAGACAGA
GAAAACCAGACATAAGCAAAGCTAGAGAAGTTCTTGGTTGGGGACCAAAGGTGAAGCTCC
GTGAAGGGCTTCCTCTTATGGAAGAAGATTTTCGTCTCAGGCTTGGCGTTCTCAGGAAAT
GAAGTAATAACAAAATGTGAGAAAATGTGTTTTTAAATTTCATTTGATTGTGTGTGTTTT
ATCAGTCTTTTTTTTTCTGAGTTTGCTGGGAATAAGGATGTCCTGACTAGGAACAATTTC
GAGATTGGTGTTGTTACTTTAAAATTTTTGCTATGAGAATGTGATCAATGAGATGCTTTA
TGCCAAAAAAAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GN35TF U 1
AF RR2GN35JQ C 462
BS 1 539 RR2GN35TF
BS 540 540 RR2GN35JQ
BS 541 583 RR2GN35TF
BS 584 584 RR2GN35JQ
BS 585 719 RR2GN35TF
BS 720 720 RR2GN35JQ
BS 721 740 RR2GN35TF
BS 741 741 RR2GN35JQ
BS 742 751 RR2GN35TF
BS 752 752 RR2GN35JQ
BS 753 759 RR2GN35TF
BS 760 760 RR2GN35JQ
BS 761 779 RR2GN35TF
BS 780 1277 RR2GN35JQ

RD RR2GN35TF 779 0 0
CCAGAAGAGTAATTGTGTACAGTTTTCGTTTCATCAAGCTCCAACTGCTAATCATCAGAG
ATGGCAACGAATGGAACGACGACGAAGCCACCACCGATGCCTTCTCCACTGCGTAATTCC
AAGTTTTTGCAGTCAAATATGAGGATCTTGGTGACAGGAGGAGCTGGATTCATTGGTTCA
CATTTGGTTGATAGATTGATGCAAAACGAAAAGAATGAAGTAATCGTCGCTGATAATTAC
TTCACTGGATCAAAAGACAATCTTAAGAAATGGATTGGTCATCCAAGATTTGAACTTATT
CGTCATGATGTGACAGAACCTCTCATGGTCGAGGTTGATCGAATCTACCATTTAGCGTGT
CCTGCATCTCCAATTTTCTACAAATACAACCCTGTTAAGACGATAAAAACAAATGCGATT
GGCACACTTAATATGTTGGGACTAGCTAAGCGAGTTGGAGCAAGAATTTTACTTACTTCC
ACATCTGAAGTGTACGGTGATCCTCTTGTTCATCCTCAGACCGAGAGCTACTGGGGAAA*
TGTAAACCCCATCGGTGTTAGAAGCTGTTACGATGAAGGAAAA*CGTGTTGCAGAGACTC
TGATGTTTGATTACCATAGGCAACATGGGATTGAAATACGCATAGCCAGAATATTCAACA
CATATGGTCCTCGTATGAACATTGATGATGGTCGTGTCGTGAGCAACTTCATTGCTCAG*
CTCTCAGAGGAGAAGCGCTA*CTGTTCAGAA*CCGGGAA*ACAAACCCGAAGTTTCTGT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2GN35JQ 816 0 0
AAGAATTTTACTTACTTCCACATCTGAAGTGTACGGTGATCCTCTTGTTCATCCTCAGAC
CGAGAGCTACTGGGGAAAATGTAAACCCCATCGGTGTTAGAAGCTGTTACGATGAAGGAA
AAACGTGTTGCAGAGACTCTGATGTTTGATTACCATAGGCAACATGGGATTGAAATACGC
ATAGCCAGAATATTCAACACATATGGTCCTCGTATGAACATTGATGATGGTCGTGTCGTG
AGCAACTTCATTGCTCAGGCTCTCAGAGGAGAAGCGCTAACTGTTCAGAAACCGGGAACA
CAAACCCGAAGTTTCTGTTATGTTTCAGACATGGTCGATGGTCTAATGCGTCTGATGGAA
GGAGACCAAACCGGACCAATCAATATAGGCAATCCAGGTGAATTCACGATGGTTGAACTC
GCTGAGACGGTTAAAGAGCTTATTAAGCCGGACGTAGAGATAAAGATGGTGGAGAATACA
CCAGATTATCCGAGACAGAGAAAACCAGACATAAGCAAAGCTAGAGAAGTTCTTGGTTGG
GGACCAAAGGTGAAGCTCCGTGAAGGGCTTCCTCTTATGGAAGAAGATTTTCGTCTCAGG
CTTGGCGTTCTCAGGAAATGAAGTAATAACAAAATGTGAGAAAATGTGTTTTTAAATTTC
ATTTGATTGTGTGTGTTTTATCAGTCTTTTTTTTTCTGAGTTTGCTGGGAATAAGGATGT
CCTGACTAGGAACAATTTCGAGATTGGTGTTGTTACTTTAAAATTTTTGCTATGAGAATG
TGATCAATGAGATGCTTTATGCCAAAAAAAGAAAAA

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

CO CL7475Contig1 663 2 3 U
GGAAAAGTTCAAAACTACAAAGCTCCTCCTCCCTTCTCCTACCGTGTGTATAGTTGCCAG
GACATAAAAATTATCGGAAGCCGTCGACTTTATAGGAGAATCAGCTTTTGATTACAATAC
TAGACAATGGGAGGAGGATTTAGAGTATTGCATTTGGTGAGGCCGTTCTTGGCTTTCCTT
CCAGAGGTACAGAGTGCTGACAGGAAGGTGCCTTTCAGAGAGAAGGTTATCTACACCGTC
ATCTCTCTCTTCATCTTCCTCGTCTGCAGTCAGCTTCCTCTCTACGGTATCCACTCCACC
ACCGGCGCCGATCCCTTCTACTGGATGCGTGTCATTCTCGCCTCCAACCGTGGTACCGTC
ATGGAGCTTGGTATCACTCCCATCGTCACCTCTGGCCTCGTGATGCAGCTCTTGGCTGGT
TCTAAGATTATTGAGGTTGACAACAATGTCCGCGAGGATCGTGCCCTCTTGAATGGTGCT
CAGAAGCTTCTTGGTATTCTGATCGCCATCGGTGAAGCTGTTGCGTATGTTCTTTCCGGA
ATGTATGGCCCCGTTGGTCAGCTCGGTGTTGGTAATGCCATTCTCATCATCCTCCAGCTT
TTCTTTGCCGGAATCATTGTTATCTGCCTTGACGAGCTTCTCCAGAAGGGATACGGTCTC
GGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 

AF RR2DH01TF U 1
AF RR2GC57TF U 39
BS 1 314 RR2DH01TF
BS 315 315 RR2GC57TF
BS 316 663 RR2DH01TF

RD RR2DH01TF 663 0 0
GGAAAAGTTCAAAACTACAAAGCTCCTCCTCCCTTCTCCTACCGTGTGTATAGTTGCCAG
GACATAAAAATTATCGGAAGCCGTCGACTTTATAGGAGAATCAGCTTTTGATTACAATAC
TAGACAATGGGAGGAGGATTTAGAGTATTGCATTTGGTGAGGCCGTTCTTGGCTTTCCTT
CCAGAGGTACAGAGTGCTGACAGGAAGGTGCCTTTCAGAGAGAAGGTTATCTACACCGTC
ATCTCTCTCTTCATCTTCCTCGTCTGCAGTCAGCTTCCTCTCTACGGTATCCACTCCACC
ACCGGCGCCGATCCTTTCTACTGGATGCGTGTCATTCTCGCCTCCAACCGTGGTACCGTC
ATGGAGCTTGGTATCACTCCCATCGTCACCTCTGGCCTCGTGATGCAGCTCTTGGCTGGT
TCTAAGATTATTGAGGTTGACAACAATGTCCGCGAGGATCGTGCCCTCTTGAATGGTGCT
CAGAAGCTTCTTGGTATTCTGATCGCCATCGGTGAAGCTGTTGCGTATGTTCTTTCCGGA
ATGTATGGCCCCGTTGGTCAGCTCGGTGTTGGTAATGCCATTCTCATCATCCTCCAGCTT
TTCTTTGCCGGAATCATTGTTATCTGCCTTGACGAGCTTCTCCAGAAGGGATACGGTCTC
GGC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RR2GC57TF 625 0 0
GG
ACCGTGTGTATAGTTGCCAGGACATAAAAATTATCGGAAGCCGTCGACTTTATAGGAGAA
TCAGCTTTTGATTACAATACTAGACAATGGGAGGAGGATTTAGAGTATTGCATTTGGTGA
GGCCGTTCTTGGCTTTCCTTCCAGAGGTACAGAGTGCTGACAGGAAGGTGCCTTTCAGAG
AGAAGGTTATCTACACCGTCATCTCTCTCTTCATCTTCCTCGTCTGCAGTCAGCTTCCTC
TCTACGGTATCCACTCCACCACCGGCGCCGATCCCTTCTACTGGATGCGTGTCATTCTCG
CCTCCAACCGTGGTACCGTCATGGAGCTTGGTATCACTCCCATCGTCACCTCTGGCCTCG
TGATGCAGCTCTTGGCTGGTTCTAAGATTATTGAGGTTGACAACAATGTCCGCGAGGATC
GTGCCCTCTTGAATGGTGCTCAGAAGCTTCTTGGTATTCTGATCGCCATCGGTGAAGCTG
TTGCGTATGTTCTTTCCGGAATGTATGGCCCCGTTGGTCAGCTCGGTGTTGGTAATGCCA
TTCTCATCATCCTCCAGCTTTTCTTTGCCGGAATCATTGTTATCTGCCTTGACGAGCTTC
TCCAGAAGGGATACGGTCTCGGC

QA 3 625 3 625
DS 



AS 1 2

CO CL7476Contig1 1111 2 2 U
GGGACAGTCACATGGAAACTCCACTTCTTTCTCCAACCTTCGCCAAATCTCTCTGACTCA
CGACGGAGACAGATGGCGAGGAGTCACCGGTTTAGCTACCGGTCACTCCTTCTCCTTTTA
CTAAGCTTCGAAACGGCACGGCGTTTAACTTCAGCTGATCCAAACGACGAGGCGTGTTTG
AAGAATCTCCGACAAAGCTTGGAGGATCCGGCGCGTAATCTCCGGAACTGGACAAACAAC
GTCTTCTCCAACCCTTGTTCCGGCTTCACCTCTTACCTCCCCGGCGCCACCTGTAACAAC
GGCAGAATCTATAAGCTACCTCTCACCAACCTCTCACTTCGCGGCTCAATCTCTCCGTTT
CTCTCCAACTGCACCAACCTCCAGTCCTTGGATCTATCGTCAAACCAGATCTCCGGTGAC
ATCCCGCAGGAGATACAGTTTCTCGTAAACCTCGCCGTACTCAACCTCTCGTCGAACCGT
CTCTCCGGCGAAATCTCTCCGCAGTTAGCTCTCTGCGCGTACCTAAACGTCATCGACCTC
CATGATAACCAGCTCTCCGGTCAAATCCCTCAGCAGCTAGGACTCCTTGCGAGGCTGTCG
GCGTTTGACGTGTCCAACAACAAACTCTCCGGCCAGATTCCGACATATTTGTCGAACAGG
ACAGGGAGTTTTCCGAGGTTTAACGCGAGCTCGTTCGTGGGGAACAGGGGGTTGTACGGG
TACCCGTTGCAGGAGATGGGGAAGAGCAGGGGCTTATCGGTGATGGCGATCGTTGGGATA
GGGCTTGGAAGTGGAGTGGCGAGCTTGACGATTAGTTTCACAGGTGTTTGTATTTGGCTG
AGGATCACTGAGAAGAAGATGGCTGAAGAAGAAGAAGGCAAGATTAGTTAGTCAATGCCT
GACTACTAAAATTTAATCAAGGGCTTTTCTTAAACCGCTATTGTTAATTATTCACGGCTG
TTTTTGAAACAAGAAGATTCAATATTCTTCTTGTAATGTGTGAATTTTTTGGGTCTATTC
TTTCTTTGGGATTTTCTCTATAATTTTCTTTTGTTTCTTATCTTATTTCACATCTACTTT
AGTCTTATTAATATTATGGACGATGGATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU54TF U 1
AF RR2CU54JQ C 415
BS 1 655 RR2CU54TF
BS 656 1111 RR2CU54JQ

RD RR2CU54TF 655 0 0
GGGACAGTCACATGGAAACTCCACTTCTTTCTCCAACCTTCGCCAAATCTCTCTGACTCA
CGACGGAGACAGATGGCGAGGAGTCACCGGTTTAGCTACCGGTCACTCCTTCTCCTTTTA
CTAAGCTTCGAAACGGCACGGCGTTTAACTTCAGCTGATCCAAACGACGAGGCGTGTTTG
AAGAATCTCCGACAAAGCTTGGAGGATCCGGCGCGTAATCTCCGGAACTGGACAAACAAC
GTCTTCTCCAACCCTTGTTCCGGCTTCACCTCTTACCTCCCCGGCGCCACCTGTAACAAC
GGCAGAATCTATAAGCTACCTCTCACCAACCTCTCACTTCGCGGCTCAATCTCTCCGTTT
CTCTCCAACTGCACCAACCTCCAGTCCTTGGATCTATCGTCAAACCAGATCTCCGGTGAC
ATCCCGCAGGAGATACAGTTTCTCGTAAACCTCGCCGTACTCAACCTCTCGTCGAACCGT
CTCTCCGGCGAAATCTCTCCGCAGTTAGCTCTCTGCGCGTACCTAAACGTCATCGACCTC
CATGATAACCAGCTCTCCGGTCAAATCCCTCAGCAGCTAGGACTCCTTGCGAGGCTGTCG
GCGTTTGACGTGTCCAACAACAAACTCTCCGGCCAGATTCCGACATATTTGTCGA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2CU54JQ 697 0 0
GGTGACATCCCGCAGGAGATACAGTTTCTCGTAAACCTCGCCGTACTCAACCTCTCGTCG
AACCGTCTCTCCGGCGAAATCTCTCCGCAGTTAGCTCTCTGCGCGTACCTAAACGTCATC
GACCTCCATGATAACCAGCTCTCCGGTCAAATCCCTCAGCAGCTAGGACTCCTTGCGAGG
CTGTCGGCGTTTGACGTGTCCAACAACAAACTCTCCGGCCAGATTCCGACATATTTGTCG
AACAGGACAGGGAGTTTTCCGAGGTTTAACGCGAGCTCGTTCGTGGGGAACAGGGGGTTG
TACGGGTACCCGTTGCAGGAGATGGGGAAGAGCAGGGGCTTATCGGTGATGGCGATCGTT
GGGATAGGGCTTGGAAGTGGAGTGGCGAGCTTGACGATTAGTTTCACAGGTGTTTGTATT
TGGCTGAGGATCACTGAGAAGAAGATGGCTGAAGAAGAAGAAGGCAAGATTAGTTAGTCA
ATGCCTGACTACTAAAATTTAATCAAGGGCTTTTCTTAAACCGCTATTGTTAATTATTCA
CGGCTGTTTTTGAAACAAGAAGATTCAATATTCTTCTTGTAATGTGTGAATTTTTTGGGT
CTATTCTTTCTTTGGGATTTTCTCTATAATTTTCTTTTGTTTCTTATCTTATTTCACATC
TACTTTAGTCTTATTAATATTATGGACGATGGATCAC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL7477Contig1 757 2 2 U
TTTTCATAATATATCCAAAAGGAAGCATTCATTAAAATCTCCAAAAAGTTACAACATGAA
ATGGCCACAAATAGCCAGCAAAGACGTTGAATGTAATCCAAGGCTTGTTACATACTACAT
TGATAGCAAGAAGACAAAAATCCTTGAATATAACCCCAAACAAGACGAGACCAAAAAAAC
AAAAAAAAAGGTAATGAGAAACTCTGGAAGATTTCTCTGGGGATTTTGATAATACAACAA
AACTGGTGAAGCAACCTGTGAAGGTTTCTCTCCAAAAAAAATCTTCACTGCAAAAAGAGT
TTTGTCAGGGTAAATTTAACACCCCACCCCGATTTACAGAACTCTAGGGTGTGTCGATGA
TATGATTATAATATAAAAAAAAATCTTATCTTTAGATCTTCATTTTTCCTCAACTTTCTT
TACCTCTGCTTGGTTGGTTAGTTCTCCTTCAAGAAAGGATCGGTTCCATTAGGAGGTTCT
TCTTGGTTTTCTGAAACGGAAGGGATGCTAAAGCTGTTGTGGTTATCAATGCTACTGCTT
CGTGGCTTTCCTGGTCTCGATCGTATGTTGGTACCCATTGGAAATGGTTCCTGATCACCA
GCATTTGGACCATCAGTGTGGAAAAGAATAGGCCGGCAACGTTTGTCTTCGTTCATTAAG
CTTGAGTTCTGGAAATGGGCAATAAGAGCTACTTTCCCTTGGATTCTAGCATATGTAAGA
GTTGCCACCTTCTCGCTGTTAAACTTTTCCCACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FW30TF C 1
AF RR2FW30JQ U 28
BS 1 27 RR2FW30TF
BS 28 757 RR2FW30JQ

RD RR2FW30TF 757 0 0
TTTTCATAATATATCCAAAAGGAAGCATTCATTAAAATCTCCAAAAAGTTACAACATGAA
ATGGCCACAAATAGCCAGCAAAGACGTTGAATGTAATCCAAGGCTTGTTACATACTACAT
TGATAGCAAGAAGACAAAAATCCTTGAATATAACCCCAAACAAGACGAGACCAAAAAAAC
AAAAAAAAAGGTAATGAGAAACTCTGGAAGATTTCTCTGGGGATTTTGATAATACAACAA
AACTGGTGAAGCAACCTGTGAAGGTTTCTCTCCAAAAAAAATCTTCACTGCAAAAAGAGT
TTTGTCAGGGTAAATTTAACACCCCACCCCGATTTACAGAACTCTAGGGTGTGTCGATGA
TATGATTATAATATAAAAAAAAATCTTATCTTTAGATCTTCATTTTTCCTCAACTTTCTT
TACCTCTGCTTGGTTGGTTAGTTCTCCTTCAAGAAAGGATCGGTTCCATTAGGAGGTTCT
TCTTGGTTTTCTGAAACGGAAGGGATGCTAAAGCTGTTGTGGTTATCAATGCTACTGCTT
CGTGGCTTTCCTGGTCTCGATCGTATGTTGGTACCCATTGGAAATGGTTCCTGATCACCA
GCATTTGGACCATCAGTGTGGAAAAGAATAGGCCGGCAACGTTTGTCTTCGTTCATTAAG
CTTGAGTTCTGGAAATGGGCAATAAGAGCTACTTTCCCTTGGATTCTAGCATATGTAAGA
GTTGCCACCTTCTCGCTGTTAAACTTTTCCCACTTCC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2FW30JQ 730 0 0
TTCATTAAAATCTCCAAAAAGTTACAACATGAAATGGCCACAAATAGCCAGCAAAGACGT
TGAATGTAATCCAAGGCTTGTTACATACTACATTGATAGCAAGAAGACAAAAATCCTTGA
ATATAACCCCAAACAAGACGAGACCAAAAAAACAAAAAAAAAGGTAATGAGAAACTCTGG
AAGATTTCTCTGGGGATTTTGATAATACAACAAAACTGGTGAAGCAACCTGTGAAGGTTT
CTCTCCAAAAAAAATCTTCACTGCAAAAAGAGTTTTGTCAGGGTAAATTTAACACCCCAC
CCCGATTTACAGAACTCTAGGGTGTGTCGATGATATGATTATAATATAAAAAAAAATCTT
ATCTTTAGATCTTCATTTTTCCTCAACTTTCTTTACCTCTGCTTGGTTGGTTAGTTCTCC
TTCAAGAAAGGATCGGTTCCATTAGGAGGTTCTTCTTGGTTTTCTGAAACGGAAGGGATG
CTAAAGCTGTTGTGGTTATCAATGCTACTGCTTCGTGGCTTTCCTGGTCTCGATCGTATG
TTGGTACCCATTGGAAATGGTTCCTGATCACCAGCATTTGGACCATCAGTGTGGAAAAGA
ATAGGCCGGCAACGTTTGTCTTCGTTCATTAAGCTTGAGTTCTGGAAATGGGCAATAAGA
GCTACTTTCCCTTGGATTCTAGCATATGTAAGAGTTGCCACCTTCTCGCTGTTAAACTTT
TCCCACTTCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL7478Contig1 622 2 2 U
CAAAGCAAATGTTTTAGTATATTATTAAACCAAACACCAATTTGAACCAAAACCATACAA
CGATACTTGAAGAGACCTTTATTTCTAGCGACTAGTTCTTAAACATTGCTTCTTCTTAAA
AAAAAAAATCCGCCCCACAAGCTAAAACGGTAAACAAACCCTTTTGAAAGACATAAATTG
AGCCTGGGTCAAAAGGGGTTTGCAGTACCATTCTTATTGTGTTCACAGCTTTGAAGGCTT
GGGGAAAATGTCAGGGGTGAACTTCTGTGCAGCACTGAAACTACCCTTGATCTTCATTGC
ACCCCTGATGAAAGCAATCTGAGGATTCATCTTGCCAGTAGCAACTTTGACAAAGTCATC
ATCTTTGAAGGAGAAAGTAGCATCCACTTTCCCTCCTTCGTATTTTCCTTTGGTGACTTC
TCCTTTCTTCAGATCAACGATGTACGTAACCTCTTCGAACCCCAATTTCTTGGGAGCGAC
GTTGATCTGGTAAACGAGGCCGATCTTCTCAGTGAGCTCTTTACCGGCGTCGGTGGAGAG
ATGCTGCTTCATCATATCCATGATCGCATCTGATTTGAGCTGGGTCGTTGCCATTTTTTC
TTTCTTTTTCGATTGGAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2F282TF C 1
AF RR2F282JQ U 42
BS 1 41 RR2F282TF
BS 42 622 RR2F282JQ

RD RR2F282TF 622 0 0
CAAAGCAAATGTTTTAGTATATTATTAAACCAAACACCAATTTGAACCAGAACCATACAA
CGATACTTGAAGAGACCTTTATTTCTAGCGACTAGTTCTTAAACATTGCTTCTTCTTAAA
AAAAAAAATCCGCCCCACAAGCTAAAACGGTAAACAAACCCTTTTGAAAGACATAAATTG
AGCCTGGGTCAAAAGGGGTTTGCAGTACCATTCTTATTGTGTTCACAGCTTTGAAGGCTT
GGGGAAAATGTCAGGGGTGAACTTCTGTGCAGCACTGAGACTACCCTTGATCTTCATTGC
ACCCCTGATGAAAGCAATCTGAGGATTCATCTTGCCAGTAGCAACTTTGACAAAGTCATC
ATCTTTGAAGGAGAAAGTAGCATCCACTTTCCCTCCTTCGTATTTTCCTTTGGTGACTTC
TCCTTTCTTCAGATCAACGATGTACGTAACCTCTTCGAACCCCAATTTCTTGGGAGCGAC
GTTGATCTGGTAAACGAGGCCGATCTTCTCAGTGAGCTCTTTACCGGCGTCGGTGGAGAG
ATGCTGCTTCATCATATCCATGATCGCATCTGATTTGAGCTGGGTCGTTGCCATTTTTTC
TTTCTTTTTCGATTGGAGAGCC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RR2F282JQ 581 0 0
TTGAACCAAAACCATACAACGATACTTGAAGAGACCTTTATTTCTAGCGACTAGTTCTTA
AACATTGCTTCTTCTTAAAAAAAAAAATCCGCCCCACAAGCTAAAACGGTAAACAAACCC
TTTTGAAAGACATAAATTGAGCCTGGGTCAAAAGGGGTTTGCAGTACCATTCTTATTGTG
TTCACAGCTTTGAAGGCTTGGGGAAAATGTCAGGGGTGAACTTCTGTGCAGCACTGAAAC
TACCCTTGATCTTCATTGCACCCCTGATGAAAGCAATCTGAGGATTCATCTTGCCAGTAG
CAACTTTGACAAAGTCATCATCTTTGAAGGAGAAAGTAGCATCCACTTTCCCTCCTTCGT
ATTTTCCTTTGGTGACTTCTCCTTTCTTCAGATCAACGATGTACGTAACCTCTTCGAACC
CCAATTTCTTGGGAGCGACGTTGATCTGGTAAACGAGGCCGATCTTCTCAGTGAGCTCTT
TACCGGCGTCGGTGGAGAGATGCTGCTTCATCATATCCATGATCGCATCTGATTTGAGCT
GGGTCGTTGCCATTTTTTCTTTCTTTTTCGATTGGAGAGCC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL7479Contig1 949 2 2 U
GGGCAGCCCAAATCGAAAGTCAAAATCTGGTCCACGTCCTCCTCAACTTACACTTTACTG
CCGAGTGAGTGAGTGAGAGAGAGAGATGGCAGGGGCGACGAGGAGGAGGAAGGCAGAGGA
GTTGGTGGAGAAGGCGATGAAGGGAAACAATGCTTCTCATGATGCCTCACACGTGTGGAG
GGTTCGAGACCTAGCTCTCTCCATTGCTCGCGAGGAAGGTCTCTCTTCCAACTCCCACTC
CATGGAAATTGTGGAGCTTGCAGCTCTTCTCCATGATATTGGTGATTACAAGTATATAAG
AGACCCTTCGGAAGCTAAACTTGTTGAGAACTTCCTGGATGAGGAAGGTGTTGAAGAGAC
CAAGAAGGTGAAAATTCTGAAGATCATCAATGGAATGGGTTTCAAAGACGAATTATCAGG
GCAAGCACTCTGCGAATCTCTTCCAGAATTTGGGGTTGTTCAAGATGCTGATCGCCTTGA
TGCCATTGGCGCCATTGGAATTGCTCGTTGCTTTACATTTGGTGGAAGCGGGAACAGAGT
GCTTCACGATCCTGAGATCAAGCCTCGGACAGAGTTAACCAAAGAGCAGTACATGAAGAA
AGAGGACCAAACGACTATTAACCACTTCCATGAGAAACTCCTCAAGCTGAAGAAGCTCAT
GAAAACCGAGGCAGGTAAAAGGAGAGCAGAGAAAAGGCACGAGTTCATGGAGGAGTTTCT
TAAGGAGTTCTATCAAGAGTGGGATGGGAGAGCTTGATAATGGATCATATGCATGGAGAA
GAAAAGCAGAGGATGTATTCAAAGGGTTGCTTAACCGGACCTCAATGAGTAAGTTGTACC
AAACCAAACCGGCCAACATGTGGTTTGTGTTTAAAACAAGTCAAAACTGTTAAACCTGAA
AATATTTATCCCGTGTTGAATTTATAAAAAGTTAAGATTTTTGATTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV66TF U 1
AF RR2BV66JQ C 250
BS 1 664 RR2BV66TF
BS 665 949 RR2BV66JQ

RD RR2BV66TF 673 0 0
GGGCAGCCCAAATCGAAAGTCAAAATCTGGTCCACGTCCTCCTCAACTTACACTTTACTG
CCGAGTGAGTGAGTGAGAGAGAGAGATGGCAGGGGCGACGAGGAGGAGGAAGGCAGAGGA
GTTGGTGGAGAAGGCGATGAAGGGAAACAATGCTTCTCATGATGCCTCACACGTGTGGAG
GGTTCGAGACCTAGCTCTCTCCATTGCTCGCGAGGAAGGTCTCTCTTCCAACTCCCACTC
CATGGAAATTGTGGAGCTTGCAGCTCTTCTCCATGATATTGGTGATTACAAGTATATAAG
AGACCCTTCGGAAGCTAAACTTGTTGAGAACTTCCTGGATGAGGAAGGTGTTGAAGAGAC
CAAGAAGGTGAAAATTCTGAAGATCATCAATGGAATGGGTTTCAAAGACGAATTATCAGG
GCAAGCACTCTGCGAATCTCTTCCAGAATTTGGGGTTGTTCAAGATGCTGATCGCCTTGA
TGCCATTGGCGCCATTGGAATTGCTCGTTGCTTTACATTTGGTGGAAGCGGGAACAGAGT
GCTTCACGATCCTGAGATCAAGCCTCGGACAGAGTTAACCAAAGAGCAGTACATGAAGAA
AGAGGACCAAACGACTATTAACCACTTCCATGAGAAACTCCTCAAGCTGAAGAAGCTCAT
GAAA
CCGAGCAGT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2BV66JQ 700 0 0
TGTGGAGCTTGCAGCTCTTCTCCATGATATTGGTGATTACAAGTATATAAGAGACCCTTC
GGAAGCTAAACTTGTTGAGAACTTCCTGGATGAGGAAGGTGTTGAAGAGACCAAGAAGGT
GAAAATTCTGAAGATCATCAATGGAATGGGTTTCAAAGACGAATTATCAGGGCAAGCACT
CTGCGAATCTCTTCCAGAATTTGGGGTTGTTCAAGATGCTGATCGCCTTGATGCCATTGG
CGCCATTGGAATTGCTCGTTGCTTTACATTTGGTGGAAGCGGGAACAGAGTGCTTCACGA
TCCTGAGATCAAGCCTCGGACAGAGTTAACCAAAGAGCAGTACATGAAGAAAGAGGACCA
AACGACTATTAACCACTTCCATGAGAAACTCCTCAAGCTGAAGAAGCTCATGAAAACCGA
GGCAGGTAAAAGGAGAGCAGAGAAAAGGCACGAGTTCATGGAGGAGTTTCTTAAGGAGTT
CTATCAAGAGTGGGATGGGAGAGCTTGATAATGGATCATATGCATGGAGAAGAAAAGCAG
AGGATGTATTCAAAGGGTTGCTTAACCGGACCTCAATGAGTAAGTTGTACCAAACCAAAC
CGGCCAACATGTGGTTTGTGTTTAAAACAAGTCAAAACTGTTAAACCTGAAAATATTTAT
CCCGTGTTGAATTTATAAAAAGTTAAGATTTTTGATTGAC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL7480Contig1 885 2 4 U
GGACCAAGAACGCGAACTCGTATCTGTAACACTGTTAGGTTTAAACAAGTGTCGATCTTA
CTTGTTCAACAAGCATAACAGAGATATCTTGATTAGAAGCAGCCATGTCAATTTTGCTTT
CTTTGTTTCTTTTCTTCTCCATGATTATTCAAACGCGGCCGTTTGTGTTTGTAAGGACGG
AGACGACCAAGCGCTTCAGAAGGTAATAGATTACGCGTGTGGATCAGGCGCTGACTGTTC
GCAGATTGAGCAAAATGGTTCTTGTTTCCAACCGAACACCGTGAAAAACCACTGCGATGT
CGCCGTTAACAGCTTTTATCAGAAGAAAGTTTCCACTGGTGCAACGTGCGACTTTAACGG
CGCCGCCGTCATCTCCACTTCCCCTCCTTCAAATGCTTCAAGTTGTTTATCTTCTTCTAG
CTCCACTAGTACTCCAACCACCGGATCTCCATCCACCGGCAATTTTACCACCGGAACCCC
ATCCATCGGAAATTCAACCTTGGGGATGCCAACCAATCCCACCACTGGAGTGCCGACTTC
ATCTGTATTCCCTGGAACTACTATGGGACCATCAGGGAGCACCGGTTTCGATCCCAGCGG
TGTAGATGGGCTCTCTGTCCGAATCAAGACAATCATCGTACTAACCACTATCGTCACTGT
GGCATTGCGAATTTAGGTGTGAGATCATCCCAGACTGGGGTTTTACTTGCTATGGACGGC
ATAGATTTTGCCAACGGTGTGTTTACGTAGGTGAAAAGCTAGAGCTGTCTCTTTTGCTTC
CCACTTTCTTTTCTGGTTTGTTTTAAAACTCTTTTTAGGGTTTGGATTTACTTCTTTAAT
TAGTATTTTGTTCTATATATAAAGTTCAAAACGAATAAAGAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FN21TF U 1
AF RR2FN21JQ C 149
BS 1 676 RR2FN21TF
BS 677 677 RR2FN21JQ
BS 678 726 RR2FN21TF
BS 727 885 RR2FN21JQ

RD RR2FN21TF 726 0 0
GGACCAAGAACGCGAACTCGTATCTGTAACACTGTTAGGTTTAAACAAGTGTCGATCTTA
CTTGTTCAACAAGCATAACAGAGATATCTTGATTAGAAGCAGCCATGTCAATTTTGCTTT
CTTTGTTTCTTTTCTTCTCCATGATTATTCAAACGCGGCCGTTTGTGTTTGTAAGGACGG
AGACGACCAAGCGCTTCAGAAGGTAATAGATTACGCGTGTGGATCAGGCGCTGACTGTTC
GCAGATTGAGCAAAATGGTTCTTGTTTCCAACCGAACACCGTGAAAAACCACTGCGATGT
CGCCGTTAACAGCTTTTATCAGAAGAAAGTTTCCACTGGTGCAACGTGCGACTTTAACGG
CGCCGCCGTCATCTCCACTTCCCCTCCTTCAAATGCTTCAAGTTGTTTATCTTCTTCTAG
CTCCACTAGTACTCCAACCACCGGATCTCCATCCACCGGCAATTTTACCACCGGAACCCC
ATCCATCGGAAATTCAACCTTGGGGATGCCAACCAATCCCACCACTGGAGTGCCGACTTC
ATCTGTATTCCCTGGAACTACTATGGGACCATCAGGGAGCACCGGTTTCGATCCCAGCGG
TGTAGATGGGCTCTCTGTCCGAATCAAGACAATCATCGTACTAACCACTATCGTCACTGT
GGCATTGCGAATTTAG*TGTGAGATCATCCCAGACTGGGGTTTTACTTGCTATGGACGGC
ATAGAT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RR2FN21JQ 737 0 0
TCAAACGCGGCCGTTTGTGTTTGTAAGGACGGAGACGACCAAGCGCTTCAGAAGGTAATA
GATTACGCGTGTGGATCAGGCGCTGACTGTTCGCAGATTGAGCAAAATGGTTCTTGTTTC
CAACCGAACACCGTGAAAAACCACTGCGATGTCGCCGTTAACAGCTTTTATCAGAAGAAA
GTTTCCACTGGTGCAACGTGCGACTTTAACGGCGCCGCCGTCATCTCCACTTCCCCTCCT
TCAAATGCTTCAAGTTGTTTATCTTCTTCTAGCTCCACTAGTACTCCAACCACCGGATCT
CCATCCACCGGCAATTTTACCACCGGAACCCCATCCATCGGAAATTCAACCTTGGGGATG
CCAACCAATCCCACCACTGGAGTGCCGACTTCATCTGTATTCCCTGGAACTACTATGGGA
CCATCAGGGAGCACCGGTTTCGATCCCAGCGGTGTAGATGGGCTCTCTGTCCGAATCAAG
ACAATCATCGTACTAACCACTATCGTCACTGTGGCATTGCGAATTTAGGTGTGAGATCAT
CCCAGACTGGGGTTTTACTTGCTATGGACGGCATAGATTTTGCCAACGGTGTGTTTACGT
AGGTGAAAAGCTAGAGCTGTCTCTTTTGCTTCCCACTTTCTTTTCTGGTTTGTTTTAAAA
CTCTTTTTAGGGTTTGGATTTACTTCTTTAATTAGTATTTTGTTCTATATATAAAGTTCA
AAACGAATAAAGAGCTT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL7481Contig1 655 2 1 U
GGGACGGACACTCACAAAACTCATTGGCAAAATGCTAAGATTAAACGTTAATTACCCTTT
GCTTCCGAAGATACCAGCCAATCGCGTTTGTAACAGAAAGCTCGGCAGCTACTATGATTA
TTCGCCGAACGTTAAATATGGCGATGATGATGGTAAGAAGAAGCAGATGTTTCTAAGCGT
TTCTGTGAAAGCAATGAAGGAAGAAGGTAACGGAAGTGGAAGCATGAGTTTCTCTGGACA
AAGCTGGGATCCTAGCTCTGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAAAGGCCTGTGAATGAGTA
TTCGGCTTTGAAGGAAGGGACGTTGTATTCATGGGGAGAACTGAGTCCAACCCAATTCTT
TCTTCGTATAGGTGGTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCTGC
TGCTAGCTTTAATCCTTCCACAGAACCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCAGGGACAGGAAC
TTTATTCCTGGCTTCATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGA
TAGATTACTCTCTGCTGTTATTCCGTACGTAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTG
GGTTAAGCCACCTGAGGTATTGGCTCGGGACAGGTTGTTAGTTCGTACAAGTGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G923TF U 1
AF RR2G769TF U 1
BS 1 655 RR2G769TF

RD RR2G923TF 597 0 0
GGGACGGACACTCACAAAACTCATTGGCAAAATGCTAAGATTAAACGTTAATTACCCTTT
GCTTCCGAAGATACCAGCCAATCGCGTTTGTAACAGAAAGCTCGGCAGCTACTATGATTA
TTCGCCGAACGTTAAATATGGCGATGATGATGGTAAGAAGAAGCAGATGTTTCTAAGCGT
TTCTGTGAAAGCAATGAAGGAAGAAGGTAACGGAAGTGGAAGCATGAGTTTCTCTGGACA
AAGCTGGGATCCTAGCTCTGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAAAGGCCTGTGAATGAGTA
TTCGGCTTTGAAGGAAGGGACGTTGTATTCATGGGGAGAACTGAGTCCAACCCAATTCTT
TCTTCGTATAGGTGGTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCTGC
TGCTAGCTTTAATCCTTCCACAGAACCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCAGGGACAGGAAC
TTTATTCCTGGCTTCATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGA
TAGATTACTCTCTGCTGTTATTCCGTACGTAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAAT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RR2G769TF 655 0 0
GGGACGGACACTCACAAAACTCATTGGCAAAATGCTAAGATTAAACGTTAATTACCCTTT
GCTTCCGAAGATACCAGCCAATCGCGTTTGTAACAGAAAGCTCGGCAGCTACTATGATTA
TTCGCCGAACGTTAAATATGGCGATGATGATGGTAAGAAGAAGCAGATGTTTCTAAGCGT
TTCTGTGAAAGCAATGAAGGAAGAAGGTAACGGAAGTGGAAGCATGAGTTTCTCTGGACA
AAGCTGGGATCCTAGCTCTGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAAAGGCCTGTGAATGAGTA
TTCGGCTTTGAAGGAAGGGACGTTGTATTCATGGGGAGAACTGAGTCCAACCCAATTCTT
TCTTCGTATAGGTGGTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTTGGTGTTCCCATCGCTGC
TGCTAGCTTTAATCCTTCCACAGAACCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCAGGGACAGGAAC
TTTATTCCTGGCTTCATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGA
TAGATTACTCTCTGCTGTTATTCCGTACGTAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTG
GGTTAAGCCACCTGAGGTATTGGCTCGGGACAGGTTGTTAGTTCGTACAAGTGAA

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL7482Contig1 763 2 15 U
TGATGCATTTGATCCGAGGTTATTGGTAGCTCCCCCCATGTTTCATACAATTGATTTCAC
TCAGATGAAGGAAGAAGACTTTTATGAGATCGATGTCCCGTTGAAATTTACTGCTTCTAT
GTGTACTCGAGTACATGGACTTGCCTGCTGGTTTGACGTTCTCTTTGATGGGAGCACGGT
ACAAAGATGGCTAACAACTGCTCCTGGTGCACCTACCACGCACTGGTACCAAATCAGATG
TGTCCTCGCGCAACCCATTTATGTAATGGCAGGTCAAGAGATCACTGGTAGACTTCATTT
GATAGCCCACAGTGCTCAGAGTTACACAATAGATCTAACTCTATCAGCTAAAATGTGGGG
TCCGGGAGCAAGTCAAGGCGGAATCCTCCAATCATCGACATGCAAATTCGATCTGAAAGA
ACCTTATTATAGAATGTCTCAGCCACAAGCATACCCTGTTGCACAAGAACCACCATTACC
ACCACAACCGCAGCTAAATACTCAGGACATACAGATACAGAACGATGAATTCGAAGAAGA
GTTATTACAAGAACCGCCACAGAAGGCGAGTACCCAGCTCTGAAGCTTAGATCATTGAAT
CTCAGTCATCTTTGGTTCCTTGCGAGTTTGGTATGGTCCTATTTTAAATGGTAGTAAGCA
CGAAACAGAATTTTATCATTCCCAATGCTTCCATGTAACAGTGTCTTTACCTTTGTGTTT
TTTTTTCCACATGAATCAAGTTATCTATCCACATGATTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF03JQ C 1
AF RR2CP75TF U 142
BS 1 142 RR2CF03JQ
BS 143 156 RR2CP75TF
BS 157 157 RR2CF03JQ
BS 158 181 RR2CP75TF
BS 182 182 RR2CF03JQ
BS 183 252 RR2CP75TF
BS 253 253 RR2CF03JQ
BS 254 331 RR2CP75TF
BS 332 332 RR2CF03JQ
BS 333 512 RR2CP75TF
BS 513 513 RR2CF03JQ
BS 514 637 RR2CP75TF
BS 638 638 RR2CF03JQ
BS 639 747 RR2CP75TF
BS 748 763 RR2CF03JQ

RD RR2CF03JQ 763 0 0
TGATGCATTTGATCCGAGGTTATTGGTAGCTCCCCCCATGTTTCATACAATTGATTTCAC
TCAGATGAAGGAAGAAGACTTTTATGAGATCGATGTCCCGTTGAAATTTACTGCTTCTAT
GTGTACTCGAGTACATGGACTTGCCTGCTGGTTTGACGTTCTCTTTGATGGGAGCACGGT
ACAAAGATGGCTAACAACTGCTCCTGGTGCACCTACCACGCACTGGTACCAAATCAGATG
TGTCCTCGCGCAACCCATTTATGTAATGGCAGGTCAAGAGATCACTGGTAGACTTCATTT
GATAGCCCACAGTGCTCAGAGTTACACAATAGATCTAACTCTATCAGCTAAAATGTGGGG
TCCGGGAGCAAGTCAAGGCGGAATCCTCCAATCATCGACATGCAAATTCGATCTGAAAGA
ACCTTATTATAGAATGTTTCAGCCACAAGCATACCCTGTTGCACAAGAACCACCATTACC
ACCACAACCGCAGCTAAATACTCAGGACATACAGATACAGAACGATGAATTCGAAGAAGA
GTTATTACAAGAACCGCCACAGAAGGCGAGTACCCAGCTCTGAAGCTTAGATCATTGAAT
CTCAGTCATCTTTGGTTCCTTGCTAGTTTGGTATGGTCCTATTTTAAATGGTAGTAAGCA
CGAAACAGAATTTTATCATTCCCAATGCTTCCATGTAACAGTGTCTTTACCTTTGTGTTT
TTTTTTCCACATGAATCAAGTTATCTATCCACATGATTTTTTT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2CP75TF 606 0 0
G
GCCTGCTGGTTTGATGTTCTCTTTGATGGGAGCACGGTATAAAGATGGCTAACAACTGCT
CCTGGTGCACCTACCACGCACTGGTACCAAATCAGATGTGTCCTCGCGCAGCCCATTTAT
GTAATGGCAGGTCAAGAGATCACTGGTAGACTTCATTTGATAGCCCACAGTGCTCAGAGT
TACACAATATATCTAACTCTATCAGCTAAAATGTGGGGTCCGGGAGCAAGTCAAGGCGGA
ATCCTCCAATCATCGACATGCAAATTCGATCTGAAAGAACCTTATTATAGAATGTCTCAG
CCACAAGCATACCCTGTTGCACAAGAACCACCATTACCACCACAACCGCAGCTAAATACT
CAGGACATACGGATACAGAACGATGAATTCGAAGAAGAGTTATTACAAGAACCGCCACAG
AAGGCGAGTACCCAGCTCTGAAGCTTAGATCATTGAATCTCAGTCATCTTTGGTTCCTTG
CGAGTTTGGTATGGTTCTATTTTAAATGGTAGTAAGCACGAAACAGAATTTTATCATTCC
CAATGCTTCCATGTAACAGTGTCTTTACCTTTGTGTTTTTTTTTCCACATGAATCAAGTT
ATCTA

QA 2 606 2 606
DS 



AS 1 2

CO CL7483Contig1 1304 2 2 U
GGAACTTTAGATTGTGTTTCAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGACGAGAAATGACGACAA
TGACGGGAGTGAATCTACCGAACGATTTGGAATCGGAGATCCTCGCTAGGGTTCCGGCCA
AGTCTCTTTCCGAACTGAAGACGACGTGCAAGCGATGGTACGCCCTACTCAAAGATCCGA
AGTTCGTGGAGAAGAACAAGAAGATGAGTAGTGAATCTGCAAGAGAGTCGATGGTACTGA
GCAATCGGCAGGTTTACTCAATCGCCGGAGATCTCCACAACAGCGGCGACATCGAATCAT
CTCTGGAGTTCACCGGTAAACTTCCAAAGGACTTGTCTATGATCTCTCACTGCGACGGTT
TGGTCCTATGCCAAGCGAAGAATAACTCTAGCGTTGTGGTTTGGAATCCATGTACTGGTC
AAACGAAGATGATCGAACCTAGAACTTGTTACCGTAATACCGATAGATTCGCTTTAGGAT
ACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGTAGCTACAAGATCCTGAGGTGTGACTATTATGTAA
ACGAGGAGAAAGTATTGGCTGTTGAGTGGGAGATGTATGATCTTTGCTCTGATTCTTGGA
GGTTTCTTGATTCCTGCACTCTTGACTATGAAACGTACTGCAGGGGCGTGTCTTTGAGAG
GAGACACTTACTTCGTTGCTTCAGGATATGAAGACTCCGGTTTCTTCCTGATGAAGTTTG
ATTTCACGGAAGAGAGGTTCGTGCGTCTCTCTCTGCCGTTTCAGAGAGTAGATTTCGCGG
ACGCCGCGGCTCTGTCTGTTGTGAGGGATGAGAAGCTCTCTGTGTGTCATCAGGACACTC
GTTCTGGATCGAATATGGTGAGGATATGGGTAAGCAATAAGGTTGATGAAGATGGCAAAG
AGATATCGTGGAGGAAGGAGTTTGTCTTGGAAGTTAATTTTGATAAGTTTGAGCTTTCGC
ATACGGCAAATGTGTTGAGCTTTTTGTTGGACGAGGAGAAGAAAGTGGCAGTGTGTTGTG
AGTTTTGTGAGGAAGAAGACTGTAGTAGTAGTAGACCTATTGCTAAAAACAGGACCAACA
TCTACATTGTTGGAGAGGATATGTACAAAAGTGTTTACAACGCTCCTGCAAAGGGATACT
GTCCACTTGTCCTCACCTATGTTCCAAACTTGGTTCACATTCACTAAGAGACAACTTGGT
TATGTTTTTTTTGGTGTCTCTTCTTTACGCTTTTTGTGTATTGGATCTTTTGTTCAGTTA
CATTGTTCTGCTTGTAGCCACTTTTAACTACAAAATGTTCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B983TF U 1
AF RR2B983JQ C 457
BS 1 680 RR2B983TF
BS 681 1304 RR2B983JQ

RD RR2B983TF 680 0 0
GGAACTTTAGATTGTGTTTCAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGACGAGAAATGACGACAA
TGACGGGAGTGAATCTACCGAACGATTTGGAATCGGAGATCCTCGCTAGGGTTCCGGCCA
AGTCTCTTTCCGAACTGAAGACGACGTGCAAGCGATGGTACGCCCTACTCAAAGATCCGA
AGTTCGTGGAGAAGAACAAGAAGATGAGTAGTGAATCTGCAAGAGAGTCGATGGTACTGA
GCAATCGGCAGGTTTACTCAATCGCCGGAGATCTCCACAACAGCGGCGACATCGAATCAT
CTCTGGAGTTCACCGGTAAACTTCCAAAGGACTTGTCTATGATCTCTCACTGCGACGGTT
TGGTCCTATGCCAAGCGAAGAATAACTCTAGCGTTGTGGTTTGGAATCCATGTACTGGTC
AAACGAAGATGATCGAACCTAGAACTTGTTACCGTAATACCGATAGATTCGCTTTAGGAT
ACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGTAGCTACAAGATCCTGAGGTGTGACTATTATGTAA
ACGAGGAGAAAGTATTGGCTGTTGAGTGGGAGATGTATGATCTTTGCTCTGATTCTTGGA
GGTTTCTTGATTCCTGCACTCTTGACTATGAAACGTACTGCAGGGGCGTGTCTTTGAGAG
GAGACACTTACTTCGTTGCT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2B983JQ 848 0 0
ATACCGATAGATTCGCTTTAGGATACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGTAGCTACAAGA
TCCTGAGGTGTGACTATTATGTAAACGAGGAGAAAGTATTGGCTGTTGAGTGGGAGATGT
ATGATCTTTGCTCTGATTCTTGGAGGTTTCTTGATTCCTGCACTCTTGACTATGAAACGT
ACTGCAGGGGCGTGTCTTTGAGAGGAGACACTTACTTCGTTGCTTCAGGATATGAAGACT
CCGGTTTCTTCCTGATGAAGTTTGATTTCACGGAAGAGAGGTTCGTGCGTCTCTCTCTGC
CGTTTCAGAGAGTAGATTTCGCGGACGCCGCGGCTCTGTCTGTTGTGAGGGATGAGAAGC
TCTCTGTGTGTCATCAGGACACTCGTTCTGGATCGAATATGGTGAGGATATGGGTAAGCA
ATAAGGTTGATGAAGATGGCAAAGAGATATCGTGGAGGAAGGAGTTTGTCTTGGAAGTTA
ATTTTGATAAGTTTGAGCTTTCGCATACGGCAAATGTGTTGAGCTTTTTGTTGGACGAGG
AGAAGAAAGTGGCAGTGTGTTGTGAGTTTTGTGAGGAAGAAGACTGTAGTAGTAGTAGAC
CTATTGCTAAAAACAGGACCAACATCTACATTGTTGGAGAGGATATGTACAAAAGTGTTT
ACAACGCTCCTGCAAAGGGATACTGTCCACTTGTCCTCACCTATGTTCCAAACTTGGTTC
ACATTCACTAAGAGACAACTTGGTTATGTTTTTTTTGGTGTCTCTTCTTTACGCTTTTTG
TGTATTGGATCTTTTGTTCAGTTACATTGTTCTGCTTGTAGCCACTTTTAACTACAAAAT
GTTCGACC

QA 1 848 1 848
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7485Contig1 408 2 1 U
GATAAGCATCCAAGACAGACAGATTACTTTACTTGATAGGAAAGAAAGACTCTCTAACAT
TAAACATTATTAAAACAGCTAAAAGCATCATTCCACTATAAGGGAGGATGAAAGTCTCAT
TTTCTGCCGGTTGACACTCTTGGCTTCCCCTTGACCTCACTTTCCTGAGGCACGCGCAAA
AAAATGCTGCTTTTAGCAGTTGCCGGGTTGTGATTCTCTGCACCTTTGCTCCAGTCATAG
CACGACGCATATGCATAGAGCGACCCATCGTGATTAAACGAACTGCAAGGAATTGGCTGG
CTGCACCTTGACATGGCCTTGAGTCTCTGTTTGCTATCCTTGTCCCAAAAATTGAAAGCC
CCATCTGAGCCAGCAGTGGCAAAAGTTCCTTGTACCGGGTGGAAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CY76JQ U 152
AF RR2FC42JQ U 1
BS 1 408 RR2FC42JQ

RD RR2CY76JQ 152 0 0
TGACCTCACTTTCCTGAGGCACGTGCAAAAAAATGCTGCTTTTAGCAGTTGCCGGGTTGT
GATTCTCTGCACCTTTGCTCCAGTCATAGCACGACGCATATGCATAGAGCGACCCATCGT
GATTAAACGAACTGCAAGGAATTGGCTGGCTG

QA 1 152 1 152
DS 

RD RR2FC42JQ 408 0 0
GATAAGCATCCAAGACAGACAGATTACTTTACTTGATAGGAAAGAAAGACTCTCTAACAT
TAAACATTATTAAAACAGCTAAAAGCATCATTCCACTATAAGGGAGGATGAAAGTCTCAT
TTTCTGCCGGTTGACACTCTTGGCTTCCCCTTGACCTCACTTTCCTGAGGCACGCGCAAA
AAAATGCTGCTTTTAGCAGTTGCCGGGTTGTGATTCTCTGCACCTTTGCTCCAGTCATAG
CACGACGCATATGCATAGAGCGACCCATCGTGATTAAACGAACTGCAAGGAATTGGCTGG
CTGCACCTTGACATGGCCTTGAGTCTCTGTTTGCTATCCTTGTCCCAAAAATTGAAAGCC
CCATCTGAGCCAGCAGTGGCAAAAGTTCCTTGTACCGGGTGGAAGTTG

QA 1 408 1 408
DS 



AS 1 2

CO CL7486Contig1 982 2 4 U
GACCTTGAAAGAACATCCATGTATCTTCTTTTACATCTTTGTCTCCGTTGATTGTTCTCG
TACTCGAACCTGATCTGCATTTCAAGACTGTTTTCGCTATATTTGAGATTATATCCTTCT
GCCATGGTACCTTGCTATACAAGGCATCACATAACACTGCTAGGTTTTCGGTATTCATTT
CTTTAAACCTAGAAGAGGCATGTTCCACCTCCATTCCTTCGCTTGAAGAAGCTTCTGAGT
TGACTGCTGAGTTAGGATACGAAGAGAGAAGCTCTGGAAGGAACACTCTTAAGGGGAATG
CATCACCATTGGTTTGAAGATGATGCATAGTACTACAAGGTTGAGTGGAACCAGAAGCTG
GAGAAGATAGTGTGAGTGTTTCTAAGGATGGTCTATTGTGGATTGCACCGCAGATTTTGT
TCCACTTAACCACAAGTTCTTTCATAGAATCTGAATCCTGCGAAGTCCAAGAATCAAACA
TAGACAGCTCTTAAAAGAAGAAAATGAGTAAGGAGACATGAATTAATTTTGGTGTTTTAT
ACAACTCACATTGTGACTATTTTGAGTCTCCTTCTTGCATAGCTGAAGCCACGCCGGTAA
AACTGTTGCAGTGTTTACATTTCTGTTGTTATTCCTGCATCGCAAGAACCGAGCTTCTTC
TTCGAATTTGACAGAACATTCCTCACAGAAACTGAGCTGATCCTCTGATGAATCCAGCTG
CAGAGGTAACCTCTCTGATTTCTTGACTTCAAGCTCACTGATTTAAACAAAAATGGCCAT
GATTAGTATTGGAGATATATAAATTGGGAATCAAGATGAAGATTGTGAAACCCTGATGAC
ACTCTTGAAGAATAAATGAAAACATTTGAAGAATAACTAATAGTATTACTGCATAGTCAT
TATTACTATATTTATATTTATGTGTTACATTTGGATTAGAAAGGTTTACATTATATATTT
GTTAATATAAACCGAATAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GK83TF U 1
AF RR2GK83JQ C 397
BS 1 772 RR2GK83TF
BS 773 773 RR2GK83JQ
BS 774 789 RR2GK83TF
BS 790 982 RR2GK83JQ

RD RR2GK83TF 794 0 0
GACCTTGAAAGAACATCCATGTATCTTCTTTTACATCTTTGTCTCCGTTGATTGTTCTCG
TACTCGAACCTGATCTGCATTTCAAGACTGTTTTCGCTATATTTGAGATTATATCCTTCT
GCCATGGTACCTTGCTATACAAGGCATCACATAACACTGCTAGGTTTTCGGTATTCATTT
CTTTAAACCTAGAAGAGGCATGTTCCACCTCCATTCCTTCGCTTGAAGAAGCTTCTGAGT
TGACTGCTGAGTTAGGATACGAAGAGAGAAGCTCTGGAAGGAACACTCTTAAGGGGAATG
CATCACCATTGGTTTGAAGATGATGCATAGTACTACAAGGTTGAGTGGAACCAGAAGCTG
GAGAAGATAGTGTGAGTGTTTCTAAGGATGGTCTATTGTGGATTGCACCGCAGATTTTGT
TCCACTTAACCACAAGTTCTTTCATAGAATCTGAATCCTGCGAAGTCCAAGAATCAAACA
TAGACAGCTCTTAAAAGAAGAAAATGAGTAAGGAGACATGAATTAATTTTGGTGTTTTAT
ACAACTCACATTGTGACTATTTTGAGTCTCCTTCTTGCATAGCTGAAGCCACGCCGGTAA
AACTGTTGCAGTGTTTACATTTCTGTTGTTATTCCTGCATCGCAAGAACCGAGCTTCTTC
TTCGAATTTGACAGAACATTCCTCACAGAAACTGAGCTGATCCTCTGATGAATCCAGCTG
CAGAGGTAACCTCTCTGATTTCTTGACTTCAAGCTCACTGATTTAAACAAAA*TGGCCAT
GATTAGTAT
GGAGA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RR2GK83JQ 586 0 0
TGTGGATTGCACCGCAGATTTTGTTCCACTTAACCACAAGTTCTTTCATAGAATCTGAAT
CCTGCGAAGTCCAAGAATCAAACATAGACAGCTTTTAAAAGAAGAAAATGAGTAAGGAGA
CATGAATTAATTTTGGTGTTTTATACAACTCACATTGTGACTATTTTGAGTCTCCTTCTT
GCATAGCTGAAGCCACGCCGGTAAAACTGTTGCAGTGTTTACATTTCTGTTGTTATTCCT
GCATCGCAAGAACCGAGCTTTTTCTTCGAATTTGACAGAACATTCCTCACAGAAACTGAG
CTGATCCTTTGATGAATCCAGCTGCAGAGGTAACCTCTCTGATTTCTTGACTTCAAGCTC
ACTGATTTAAACAAAAATGGCCATGATTAGTATTGGAGATATATAAATTGGGAATCAAGA
TGAAGATTGTGAAACCCTGATGACACTCTTGAAGAATAAATGAAAACATTTGAAGAATAA
CTAATAGTATTACTGCATAGTCATTATTACTATATTTATATTTATGTGTTACATTTGGAT
TAGAAAGGTTTACATTATATATTTGTTAATATAAACCGAATAATGG

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL7487Contig1 841 2 6 U
CTAGGTCTTGTTCATCCGTGTTTCAGATCTAGTGGTCGGGAATTCGAATGGATCAAAGAA
CAGGTGATCCAAGAATATACATCGTCACTCTTCTCTTTCTTTCATGTATCATCCCAGGAG
GAGTCCTCCTTGGGGTTTACCTCCTCCAAAACGATGCGAATCCTCTGTTTCTGGAAGCGG
GTATGCTCTTCGTTGGCATCCCTTGGTTCTTCTGGTTCTTGGCTTACCTCTACTCTTGCC
TCCTCAAGCCTTGCATCGTCTCCCTAAGCCAGAGAGTTTCTAGATTCGATCCGGAGAAAG
GAGGGGAGCAGGAGCAGGAGGAGGAGAAGAACAATAAAAGCATCACGGAGATCGCCATGT
CAGCTTCAGAACCCGTGGCTGCGGTGGAGCCGCCGAGGGATGGTGAGAAGCACGTGCAGT
TCGGGAATGTGGTGGTTCTTGGAGATGAAGGACGAGGAGGAAAAGCACAAGAAGAGGAGG
AGGATGTAAATGAGAGAAGTACTAATAAACTGATTCCGGATCATATGAGGATGGGAGACG
AAGATAATCAAGAACATAGTGGCGGTGATACGGATTGCGATAGAACTCCTTTGAGATTAT
CCGTGGGGAACAAATGATCATGGAACTGATTTGTCTTTTTTATTCGGGTTGTAAAACAGA
GAGGAAAGGCTTTGGAAAAAAAAGCTAGCCCTAATAGACGTGTGAGACAAGGAACAACGT
TTCTTTGCGTATGAACAAAAAAGAAAGTCCGTCCATAGAAGATTTTGTTTTCTTGTAGCT
TTGTTTCTTCTATTGTTCTTTAACTTCTTATGGTTTTGGATGAATTGAGAAAATAATCAG
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2C394TF U 1
AF RR2C394JQ C 168
BS 1 640 RR2C394TF
BS 641 641 RR2C394JQ
BS 642 655 RR2C394TF
BS 656 656 RR2C394JQ
BS 657 682 RR2C394TF
BS 683 841 RR2C394JQ

RD RR2C394TF 682 0 0
CTAGGTCTTGTTCATCCGTGTTTCAGATCTAGTGGTCGGGAATTCGAATGGATCAAAGAA
CAGGTGATCCAAGAATATACATCGTCACTCTTCTCTTTCTTTCATGTATCATCCCAGGAG
GAGTCCTCCTTGGGGTTTACCTCCTCCAAAACGATGCGAATCCTCTGTTTCTGGAAGCGG
GTATGCTCTTCGTTGGCATCCCTTGGTTCTTCTGGTTCTTGGCTTACCTCTACTCTTGCC
TCCTCAAGCCTTGCATCGTCTCCCTAAGCCAGAGAGTTTCTAGATTCGATCCGGAGAAAG
GAGGGGAGCAGGAGCAGGAGGAGGAGAAGAACAATAAAAGCATCACGGAGATCGCCATGT
CAGCTTCAGAACCCGTGGCTGCGGTGGAGCCGCCGAGGGATGGTGAGAAGCACGTGCAGT
TCGGGAATGTGGTGGTTCTTGGAGATGAAGGACGAGGAGGAAAAGCACAAGAAGAGGAGG
AGGATGTAAATGAGAGAAGTACTAATAAACTGATTCCGGATCATATGAGGATGGGAGACG
AAGATAATCAAGAACATAGTGGCGGTGATACGGATTGCGATAGAACTCCTTTGAGATTAT
CCGTGGGGAACAAATGATCATGGAACTGATTTGTCTTTTT*ATTCGGGTTGTAAA*CAGA
GAGGAAAGGCTTTGGAAAAAAA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2C394JQ 674 0 0
TTTCTGGAAGCGGGTATGCTCTTCGTTGGCATCCCTTGGTTCTTCTGGTTCTTGGCTTAC
CTCTACTCTTGCCTCCTCAAGCCTTGCATCGTCTCCCTAAGCCAGAGAGTTTCTAGATTC
GATCCGGAGAAAGGAGGGGAGCAGGAGCAGGAGGAGGAGAAGAACAATAAAAGCATCACG
GAGATCGCCATGTCAGCTTCAGAACCCGTGGCTGCGGTGGAGCCGCCGAGGGATGGTGAG
AAGCACGTGCAGTTCGGGAATGTGGTGGTTCTTGGAGATGAAGGACGAGGAGGAAAAGCA
CAAGAAGAGGAGGAGGATGTAAATGAGAGAAGTACTAATAAACTGATTCCGGATCATATG
AGGATGGGAGACGAAGATAATCAAGAACATAGTGGCGGTGATACGGATTGCGATAGAACT
CCTTTGAGATTATCCGTGGGGAACAAATGATCATGGAACTGATTTGTCTTTTTTATTCGG
GTTGTAAAACAGAGAGGAAAGGCTTTGGAAAAAAAAGCTAGCCCTAATAGACGTGTGAGA
CAAGGAACAACGTTTCTTTGCGTATGAACAAAAAAGAAAGTCCGTCCATAGAAGATTTTG
TTTTCTTGTAGCTTTGTTTCTTCTATTGTTCTTTAACTTCTTATGGTTTTGGATGAATTG
AGAAAATAATCAGT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL7488Contig1 1259 2 4 U
GGATTGACAAACCTGAAACTCCCTTCAATGGCGGGGGAAGAAGAGAAGCCAACTACTACT
ACACCTGAACCTACTCTTCCTTCTCCGCCGGAATCTCCCTCAAAACCTGACGATCCGCCG
CCGGAAACGGCTAAATTCGATCCTACTCGAAGTAATTCTCTAATTTCTCTCTTTCCTTGT
GCAGCAATCATATTGATTTCTAGGGCTTTCTTAGCTTATAAAATTCAATCAGACTGATGT
AATTATCCCCAAAGGTCCTCTCTCTTTCCCACAAGAACCAATTGGGTTCTGACCAAATGT
AGAGAAAGAGCTTAACTTTGATCTGATAGTGAGAGATATTAGATTGGAGCTGAATCTGAT
TGATGTGAACACTTACTCTCTGTTTCTTTGTTTCAGATCCATCCATGAATGTTGTAATAT
ATATTATGTTGTGTAACAAGTTGAATCACTAATGTTTCTGAAAGATCCATTCACCATCTT
GCTCTGTTTTGATTCTTTCTAACATCTTCGTTATGACTCTTAAAAGTGATTGGGATCATC
AAGAGGAACGCTTTGATTAAGGATTTAGCTGCAGCTTACCACAACGACTGTATTGCTTAT
TCTCGAGAGCTTCTCGAGCTCCAAAACAGAAAGGCCGAGGTTTAGCAAAGTCGATCTCCT
ATCCATTCATAGTAAAGCATGTTTGTTTATTTATTTGAATTTGTTCGTATTGGGTAGAAT
AGATAGATATATGCTGAGTTGTGCAATGGACCCTATTATTGAATCCTAAACAATGTTGAC
TCTTTAATAATCTTAAACGAATTTATCATGAAACTAGTGTGTTGTTCTGTTCTTCCAAGT
AGGGATTGAAGCTGTTAAACTTTGATCCTAATCGGTGAAACTCAATGGCAAAACTTTTAG
GCTTTCGTGTTGTGAGTTGTAACCTGTTTGATTTTGCTTCTTTCTGTGCAGCCGTTTCTG
TACACGAAAGCTCCAGAAGATTTGAGAAAAGAGACGTTGAGGTCTTCTTCCAAAGGAGCT
AAGAAAAGACGTTAAGAAAAGACAACGTGTATGGTGCTTAATTTTACGGCCTGACTGGTT
CAAACGTAGTGGTTGCGATTGCGGTTGCGGGAGTTTGCGGGTGCGGGTGGTTGCGGTTTC
AAGTGTTACATGACGTTTTGTATGACTGGCGTAACGTTTAAAAATTGTTGCGTTTGCGGG
ATGTTTGTGACTGGTTGATTATGAAACATTGCAGCGGTTTAATAATAAATTATCAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC37TF U 1
AF RR2GC37JQ C 617
BS 1 639 RR2GC37TF
BS 640 640 RR2GC37JQ
BS 641 703 RR2GC37TF
BS 704 1259 RR2GC37JQ

RD RR2GC37TF 703 0 0
GGATTGACAAACCTGAAACTCCCTTCAATGGCGGGGGAAGAAGAGAAGCCAACTACTACT
ACACCTGAACCTACTCTTCCTTCTCCGCCGGAATCTCCCTCAAAACCTGACGATCCGCCG
CCGGAAACGGCTAAATTCGATCCTACTCGAAGTAATTCTCTAATTTCTCTCTTTCCTTGT
GCAGCAATCATATTGATTTCTAGGGCTTTCTTAGCTTATAAAATTCAATCAGACTGATGT
AATTATCCCCAAAGGTCCTCTCTCTTTCCCACAAGAACCAATTGGGTTCTGACCAAATGT
AGAGAAAGAGCTTAACTTTGATCTGATAGTGAGAGATATTAGATTGGAGCTGAATCTGAT
TGATGTGAACACTTACTCTCTGTTTCTTTGTTTCAGATCCATCCATGAATGTTGTAATAT
ATATTATGTTGTGTAACAAGTTGAATCACTAATGTTTCTGAAAGATCCATTCACCATCTT
GCTCTGTTTTGATTCTTTCTAACATCTTCGTTATGACTCTTAAAAGTGATTGGGATCATC
AAGAGGAACGCTTTGATTAAGGATTTAGCTGCAGCTTACCACAACGACTGTATTGCTTAT
TCTCGAGAGCTTCTCGAGCTCCAAAACAGAAAGGCCGAG*TTTAGCAAAGTCGATCTCCT
ATCCATTCATAGTAAAGCATGTTTGTTTATTTATTTGAATTTG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2GC37JQ 643 0 0
AGCTCCAAAACAGAAAGGCCGAGGTTTAGCAAAGTCGATCTCCTATCCATTCATAGTAAA
GCATGTTTGTTTATTTATTTGAATTTGTTCGTATTGGGTAGAATAGATAGATATATGCTG
AGTTGTGCAATGGACCCTATTATTGAATCCTAAACAATGTTGACTCTTTAATAATCTTAA
ACGAATTTATCATGAAACTAGTGTGTTGTTCTGTTCTTCCAAGTAGGGATTGAAGCTGTT
AAACTTTGATCCTAATCGGTGAAACTCAATGGCAAAACTTTTAGGCTTTCGTGTTGTGAG
TTGTAACCTGTTTGATTTTGCTTCTTTCTGTGCAGCCGTTTCTGTACACGAAAGCTCCAG
AAGATTTGAGAAAAGAGACGTTGAGGTCTTCTTCCAAAGGAGCTAAGAAAAGACGTTAAG
AAAAGACAACGTGTATGGTGCTTAATTTTACGGCCTGACTGGTTCAAACGTAGTGGTTGC
GATTGCGGTTGCGGGAGTTTGCGGGTGCGGGTGGTTGCGGTTTCAAGTGTTACATGACGT
TTTGTATGACTGGCGTAACGTTTAAAAATTGTTGCGTTTGCGGGATGTTTGTGACTGGTT
GATTATGAAACATTGCAGCGGTTTAATAATAAATTATCAATAT

QA 1 643 1 643
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7490Contig1 688 2 2 U
GATTGAGTGCATAAATGTAGATTACAAATCTACACGAAAAGAATCATTTTATGACCTTCA
GCTGGATGTTAAAGGCTGCGAGGATGTTTATGCTTCTTTTGACAAATATGTTGAAGTTGA
ACGCCTTGAAGGAGATAACAAATATCATGCAGAAGGACATGGTTTACAGGATGCAAAAAA
AGGCGTTCTTTTCATCGACTTTCCACCGGTTCTTCAGCTCCAGCTCAAGAGGTTTGAATA
TGACTTCATGAGGGACACCATGGTGAAGATAAATGATCGGTATGAATTCCCTCTTCAACT
GGATCTTGATAGAGAGAATGGAAAGTATTTATCCCCTGATGCTGACAGGAGTGTCCGCAA
CCTTTACACGCTTCACAGTGTGTTAGTTCATAGTGGAGGAGTACATGGTGGGCATTATTA
CGCTTTTATAAGGCCGACGCTCTCTGATCAGTGGTATAAATTTGATGATGAACGAGTAAC
TAAAGAAGATTTGAAAAGGGCACTGGAGGAGCAATATGGTGGTGAAGAAGAGCTACCACA
AACTAATCCTGGTTTCAATAACCCTCCTTTCAAATTCACAAAGTACTCGAATGCATACAT
GCTTGTATATATCCGGGAAAGTGACAAAGATAAAATTATCTGCAATGTTGATGAGAAAGA
CATTGCTGAACATTTAAGGATAAGGCTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH90JQ C 1
AF RR2CH90TF U 1
BS 1 674 RR2CH90TF
BS 675 688 RR2CH90JQ

RD RR2CH90JQ 688 0 0
GATTGAGTGCATAAATGTAGATTACAAATCTACACGAAAAGAATCATTTTATGACCTTCA
GCTGGATGTTAAAGGCTGCGAGGATGTTTATGCTTCTTTTGACAAATATGTTGAAGTTGA
ACGCCTTGAAGGAGATAACAAATATCATGCAGAAGGACATGGTTTACAGGATGCAAAAAA
AGGCGTTCTTTTCATCGACTTTCCACCGGTTCTTCAGCTCCAGCTCAAGAGGTTTGAATA
TGACTTCATGAGGGACACCATGGTGAAGATAAATGATCGGTATGAATTCCCTCTTCAACT
GGATCTTGATAGAGAGAATGGAAAGTATTTATCCCCTGATGCTGACAGGAGTGTCCGCAA
CCTTTACACGCTTCACAGTGTGTTAGTTCATAGTGGAGGAGTACATGGTGGGCATTATTA
CGCTTTTATAAGGCCGACGCTCTCTGATCAGTGGTATAAATTTGATGATGAACGAGTAAC
TAAAGAAGATTTGAAAAGGGCACTGGAGGAGCAATATGGTGGTGAAGAAGAGCTACCACA
AACTAATCCTGGTTTCAATAACCCTCCTTTCAAATTCACAAAGTACTCGAATGCATACAT
GCTTGTATATATCCGGGAAAGTGACAAAGATAAAATTATCTGCAATGTTGATGAGAAAGA
CATTGCTGAACATTTAAGGATAAGGCTG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2CH90TF 674 0 0
GATTGAGTGCATAAATGTAGATTACAAATCTACACGAAAAGAATCATTTTATGACCTTCA
GCTGGATGTTAAAGGCTGCGAGGATGTTTATGCTTCTTTTGACAAATATGTTGAAGTTGA
ACGCCTTGAAGGAGATAACAAATATCATGCAGAAGGACATGGTTTACAGGATGCAAAAAA
AGGCGTTCTTTTCATCGACTTTCCACCGGTTCTTCAGCTCCAGCTCAAGAGGTTTGAATA
TGACTTCATGAGGGACACCATGGTGAAGATAAATGATCGGTATGAATTCCCTCTTCAACT
GGATCTTGATAGAGAGAATGGAAAGTATTTATCCCCTGATGCTGACAGGAGTGTCCGCAA
CCTTTACACGCTTCACAGTGTGTTAGTTCATAGTGGAGGAGTACATGGTGGGCATTATTA
CGCTTTTATAAGGCCGACGCTCTCTGATCAGTGGTATAAATTTGATGATGAACGAGTAAC
TAAAGAAGATTTGAAAAGGGCACTGGAGGAGCAATATGGTGGTGAAGAAGAGCTACCACA
AACTAATCCTGGTTTCAATAACCCTCCTTTCAAATTCACAAAGTACTCGAATGCATACAT
GCTTGTATATATCCGGGAAAGTGACAAAGATAAAATTATCTGCAATGTTGATGAGAAAGA
CATTGCTGAACATT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL7491Contig1 584 2 1 U
GGAATCTCGTTGGTCGTCAGCCTCTCCAGTCTCTACTCCGCCGCACAGATCCAAGACAAA
CTAAAAAATGGTGACGGCCAAGAAAACGAAGAAGTCACACGAGGGAATCAACAGCAGGTT
GGCACTTGTAATGAAGAGTGGCAAATACACTCTTGGTTACAAGTCTGTCCTCAAGTCTCT
AAGAGGCTCCAAAGGGAAACTGATTCTCATCTCCTCGAATTGCCCACCGTTGAGGAGATC
AGAGATTGAGTATTACGCTATGCTCGCCAAAGTTGGTGTTCACCACTACAATGGAAACAA
TGTTGATTTGGGAACAGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTTTCTTGTCTGAGCATTGTTGA
TCCTGGTGATTCTGACATTATCAAGAGCATTCCTGGTGATCAGTGATAAACCTTTCTCGA
TTTTGTTTTCTTTTTCTTGCGACGTTTATCTATTTATGTATCCGAGCTTATCTCAACTTT
TATGAGCAAAAGACTATGTTTAGGTATTTTGCTTCAAGTTTTCAGTGAAGAAATTTTTTT
TTTGCTGACACATAATTAAGTTGATACTTTTATCTGTTAAGTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B825JQ C 1
AF RR2B825TF U 1
BS 1 584 RR2B825TF

RD RR2B825JQ 584 0 0
GGAATCTCGTTGGTCGTCAGCCTCTCCAGTCTTTACTCCGCCGCACAGATCCAAGACAAA
CTAAAAAATGGTGACGGCCAAGAAAACGAAGAAGTCACACGAGGGAATCAACAGCAGGTT
GGCACTTGTAATGAAGAGTGGCAAATACACTCTTGGTTACAAGTCTGTCCTCAAGTCTTT
AAGAGGCTCCAAAGGGAAACTGATTCTCATCTCCTCGAATTGCCCACCGTTGAGGAGATC
AGAGATTGAGTATTACGCTATGCTCGCCAAAGTTGGTGTTCACCACTACAATGGAAACAA
TGTTGATTTGGGAACAGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTTTCTTGTCTGAGCATTGTTGA
TCCTGGTGATTTTGACATTATCAAGAGCATTCCTGGTGATCAGTGATAAACCTTTCTCGA
TTTTGTTTTCTTTTTCTTGCGACGTTTATCTATTTATGTATCCGAGCTTATCTCAACTTT
TATGAGCAAAAGACTATGTTTAGGTATTTTGCTTCAAGTTTTCAGTGAAGAAATTTTTTT
TTTGCTGACACATAATTAAGTTGATACTTTTATCTGTTAAGTCG

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2B825TF 584 0 0
GGAATCTCGTTGGTCGTCAGCCTCTCCAGTCTCTACTCCGCCGCACAGATCCAAGACAAA
CTAAAAAATGGTGACGGCCAAGAAAACGAAGAAGTCACACGAGGGAATCAACAGCAGGTT
GGCACTTGTAATGAAGAGTGGCAAATACACTCTTGGTTACAAGTCTGTCCTCAAGTCTCT
AAGAGGCTCCAAAGGGAAACTGATTCTCATCTCCTCGAATTGCCCACCGTTGAGGAGATC
AGAGATTGAGTATTACGCTATGCTCGCCAAAGTTGGTGTTCACCACTACAATGGAAACAA
TGTTGATTTGGGAACAGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTTTCTTGTCTGAGCATTGTTGA
TCCTGGTGATTCTGACATTATCAAGAGCATTCCTGGTGATCAGTGATAAACCTTTCTCGA
TTTTGTTTTCTTTTTCTTGCGACGTTTATCTATTTATGTATCCGAGCTTATCTCAACTTT
TATGAGCAAAAGACTATGTTTAGGTATTTTGCTTCAAGTTTTCAGTGAAGAAATTTTTTT
TTTGCTGACACATAATTAAGTTGATACTTTTATCTGTTAAGTCG

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL7492Contig1 572 2 1 U
GCGACGGTCTTCTATGAAAAAGTTCTTCTTCTTGCCTGGGGGTATGAGAACATTTTGATC
AGGTTAATTGGATTGTGGTGTTTGCGTTTGCAACAGCGTTCATACTTCTGATGATGGAAA
CACTGAGTGCGTTTCTTCATGCTCTGCGTCTTCACTGGGTTGAGTTCATGGGAAAGTTCT
TCCATGGAGATGGTTACAAGTTCAAGCCTTTCTCATTTGCTTTAATCTCAGATGACGATG
AATAAAGTATACACCCCTAAAATCCTCCTAAGCCATTTGCACATCCCACTTTCCCCTCCC
ATTATCCACCCCCAAAAAGAATATATAGAAGAAAATTTGCTCGAAACAGATTATAGGTAA
CATCCATTTGCGTCTGTCTTTTTTACCTTTTGATCTTTTTAACCGATGCTTTTGAAATTA
GTATTGTAGTTAACGTCAAAAGTGGAGAGTGTCTTTGCTTACCCCCTAAAAGCAGACCAT
GTTAGATCACTTTTTGAGTTTTTTTTAATGTATACATATCCCTGTCATGGATTTTTTGGA
GGCGAGAGATAAATGAAAACTCTATGTTGCAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CT10JQ C 1
AF RR2CT10TF U 1
BS 1 572 RR2CT10TF

RD RR2CT10JQ 572 0 0
GCGACGGTCTTCTATGAAAAAGTTCTTCTTCTTGCCTGGGGGTATGAGAACATTTTGATC
AGGTTAATTGGATTGTGGTGTTTGCGTTTGCAACAGCGTTCATACTTCTGATGATGGAAA
CACTGAGTGCGTTTCTTCATGCTCTGCGTCTTCACTGGGTTGAGTTCATGGGAAAGTTCT
TCCATGGAGATGGTTACAAGTTCAAGCCTTTCTCATTTGCTTTAATCTCAGATGACGATG
AATAAAGTATACACCCCTAAAATCCTCCTAAGCCATTTGCACATCCCACTTTCCCCTCCC
ATTATCCACCCCCAAAAAGAATATATAGAAGAAAATTTGCTCGAAACAGATTATAGGTAA
CATCCATTTGCGTCTGTCTTTTTTACCTTTTGATCTTTTTAACCGATGCTTTTGAAATTA
GTATTGTAGTTAACGTCAAAAGTGGAGAGTGTCTTTGCTTACCCCCTAAAAGCAGACCAT
GTTAGATCACTTTTTGAGTTTTTTTTAATGTATACATATCCCTGTCATGGATTTTTTGGA
GGCGAGAGATAAATGAAAACTCTATGTTGCAG

QA 1 572 1 572
DS 

RD RR2CT10TF 572 0 0
GCGACGGTCTTCTATGAAAAAGTTCTTCTTCTTGCCTGGGGGTATGAGAACATTTTGATC
AGGTTAATTGGATTGTGGTGTTTGCGTTTGCAACAGCGTTCATACTTCTGATGATGGAAA
CACTGAGTGCGTTTCTTCATGCTCTGCGTCTTCACTGGGTTGAGTTCATGGGAAAGTTCT
TCCATGGAGATGGTTACAAGTTCAAGCCTTTCTCATTTGCTTTAATCTCAGATGACGATG
AATAAAGTATACACCCCTAAAATCCTCCTAAGCCATTTGCACATCCCACTTTCCCCTCCC
ATTATCCACCCCCAAAAAGAATATATAGAAGAAAATTTGCTCGAAACAGATTATAGGTAA
CATCCATTTGCGTCTGTCTTTTTTACCTTTTGATCTTTTTAACCGATGCTTTTGAAATTA
GTATTGTAGTTAACGTCAAAAGTGGAGAGTGTCTTTGCTTACCCCCTAAAAGCAGACCAT
GTTAGATCACTTTTTGAGTTTTTTTTAATGTATACATATCCCTGTCATGGATTTTTTGGA
GGCGAGAGATAAATGAAAACTCTATGTTGCAG

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL7493Contig1 908 2 2 U
GTGAGGCAAAGACAATAGAATTGAAAAGTCAAGCATCACACTAGTCAACGTTTGATAAAC
CTCTTCTCTTTCTTCTTCGTCTCTTCTCCTTATCACATATCATCTCTCTTTCTTCGTAAA
GGTACCCTCTCTCTGGACCAGCTTCTCTAATGGCAGAGCGTTCGAATGTTCCAAAGTTTG
GGAACTGGGAAGGAGAGGAGAATGTTCCTTACACGGCTTACTTTGAGAAAGCGCGTAAAG
GACGCGCCGCCCCAGGCGGTAGAGTAACGAACCCGAACGACCCGGAGTATAACTCGACCA
AACCTGAGGAAGTTGTTGACCCGGTTAGAAAGTCGCGTGAAGGGACGAGAAGCCGAGAAG
AGAGCGAGCTGAAGCAGTTTGGTGGTGGTGGTGATGGTAGTGGTTCGTCAAACGAGAAAA
GACAAGGAAAGTCTTCTCAGAACAATAGCTACGATAATAAGTCCCCATTGCATAAGAACT
CATATGATGGCACTGGACGATCAAAGCCCAGACCAAACCTTAGACCTGACGAAAGCCCTG
AAAAGGTGACGGTGGTGCCGAAATTCGGTGATTGGGATGAGAATAATCCGGCGTCAGCTG
ATGGATATACACACATTTTCAACAAAGTCCGTGAAGAGAGAAGCACTGGAGCTAATAAAG
TGAGTGGGTCTTCGAGAACGCCAACTCACGCCATCTCACGTAATAGCCCTTCCGGCAGTT
CCAAATGTTGCTGCTTTGGCTTTGGAGGAAAATGAATGGGAAGACCGTTTGTTTCGGGAA
TAATTGTGTGTATAGTTATCGAGAAATATGTGTGTGTTGTGATCTTAATGATCAGACGGT
CGAGTAACTTTAGATGGAATAAGGCATATCAGTCATAAAATTTGTATACTATAGCTTTTG
TATGTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CH28TF U 1
AF RR2CH28JQ C 139
BS 1 710 RR2CH28TF
BS 711 908 RR2CH28JQ

RD RR2CH28TF 714 0 0
GTGAGGCAAAGACAATAGAATTGAAAAGTCAAGCATCACACTAGTCAACGTTTGATAAAC
CTCTTCTCTTTCTTCTTCGTCTCTTCTCCTTATCACATATCATCTCTCTTTCTTCGTAAA
GGTACCCTCTCTCTGGACCAGCTTCTCTAATGGCAGAGCGTTCGAATGTTCCAAAGTTTG
GGAACTGGGAAGGAGAGGAGAATGTTCCTTACACGGCTTACTTTGAGAAAGCGCGTAAAG
GACGCGCCGCCCCAGGCGGTAGAGTAACGAACCCGAACGACCCGGAGTATAACTCGACCA
AACCTGAGGAAGTTGTTGACCCGGTTAGAAAGTCGCGTGAAGGGACGAGAAGCCGAGAAG
AGAGCGAGCTGAAGCAGTTTGGTGGTGGTGGTGATGGTAGTGGTTCGTCAAACGAGAAAA
GACAAGGAAAGTCTTCTCAGAACAATAGCTACGATAATAAGTCCCCATTGCATAAGAACT
CATATGATGGCACTGGACGATCAAAGCCCAGACCAAACCTTAGACCTGACGAAAGCCCTG
AAAAGGTGACGGTGGTGCCGAAATTCGGTGATTGGGATGAGAATAATCCGGCGTCAGCTG
ATGGATATACACACATTTTCAACAAAGTCCGTGAAGAGAGAAGCACTGGAGCTAATAAAG
TGAGTGGGTCTTCGAGAACGCCAACTCACGCCATCTCACGTAATAGCCCT
CCCG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2CH28JQ 770 0 0
CAGCTTCTCTAATGGCAGAGCGTTCGAATGTTCCAAAGTTTGGGAACTGGGAAGGAGAGG
AGAATGTTCCTTACACGGCTTACTTTGAGAAAGCGCGTAAAGGACGCGCCGCCCCAGGCG
GTAGAGTAACGAACCCGAACGACCCGGAGTATAACTCGACCAAACCTGAGGAAGTTGTTG
ACCCGGTTAGAAAGTCGCGTGAAGGGACGAGAAGCCGAGAAGAGAGCGAGCTGAAGCAGT
TTGGTGGTGGTGGTGATGGTAGTGGTTCGTCAAACGAGAAAAGACAAGGAAAGTCTTCTC
AGAACAATAGCTACGATAATAAGTCCCCATTGCATAAGAACTCATATGATGGCACTGGAC
GATCAAAGCCCAGACCAAACCTTAGACCTGACGAAAGCCCTGAAAAGGTGACGGTGGTGC
CGAAATTCGGTGATTGGGATGAGAATAATCCGGCGTCAGCTGATGGATATACACACATTT
TCAACAAAGTCCGTGAAGAGAGAAGCACTGGAGCTAATAAAGTGAGTGGGTCTTCGAGAA
CGCCAACTCACGCCATCTCACGTAATAGCCCTTCCGGCAGTTCCAAATGTTGCTGCTTTG
GCTTTGGAGGAAAATGAATGGGAAGACCGTTTGTTTCGGGAATAATTGTGTGTATAGTTA
TCGAGAAATATGTGTGTGTTGTGATCTTAATGATCAGACGGTCGAGTAACTTTAGATGGA
ATAAGGCATATCAGTCATAAAATTTGTATACTATAGCTTTTGTATGTATG

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL7494Contig1 776 2 2 U
GATTCAGAGCAGCTTTCAAGTATGCAATCAAGAAGGATGTGAGGAACCTCCACATGCTGC
AAGATATGTACAAACACTGGCCGTTTTTCCGTGTCACCATCGATCTTATTGAGATGGTGT
TCGCCAAGGGAGACCCCGGGATCGCTGCATTGTATGACAAACTTCTTGTCTCAAAAGATT
TATGGGTCTTTGGAGAGAAACTCAGGACTAACTTTGAAGAAACCAAGACCCTCGTCCTCC
AGACTGCTGGACACAAAGATCTTCTTGAAGAAGACCCTTACTTGAAACAGAGACTTAGGC
TGCGTGACTCTTACATTACAACCCTCAACGTTTGCCAAGCCTATACGTTGAAGAGAATCC
GTGATCCAAACTATAACGTGACCCTGCGTCCACACATTTCCAAAGAGATCTTGCAATCAA
GTAAATCGGCACAGGAGCTCGTTAAGCTTAACCCAACGAGTGAATACGCGCCTGGGCTTG
AGGACACGCTCATCTTAACCATGAAGGGTATTGCCGCAGGACTTCAGAACACCGGTTAAG
TGAGTTGAGTCACCCGAGAGAAAGCAGACTTTTGAGTCTCTCTTTCCTGTTTTTCTTTTT
AAGAATAATCTCTTTGTTTGAAATCGAAAATAATAAGCTGTTACGGTTGGATTACAGTTT
ACTTTTTGTGTCCACACCGTTGAGAAAAGTTTTAATCTTCTCATTGTATGAAACTCAACA
CTGCTCTGTTTCTGAGACAGTTTTCAATCTTAAATCTTATCTTATTTTTTGTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP93TF U 1
AF RR2EP93JQ C 86
BS 1 762 RR2EP93TF
BS 763 776 RR2EP93JQ

RD RR2EP93TF 762 0 0
GATTCAGAGCAGCTTTCAAGTATGCAATCAAGAAGGATGTGAGGAACCTCCACATGCTGC
AAGATATGTACAAACACTGGCCGTTTTTCCGTGTCACCATCGATCTTATTGAGATGGTGT
TCGCCAAGGGAGACCCCGGGATCGCTGCATTGTATGACAAACTTCTTGTCTCAAAAGATT
TATGGGTCTTTGGAGAGAAACTCAGGACTAACTTTGAAGAAACCAAGACCCTCGTCCTCC
AGACTGCTGGACACAAAGATCTTCTTGAAGAAGACCCTTACTTGAAACAGAGACTTAGGC
TGCGTGACTCTTACATTACAACCCTCAACGTTTGCCAAGCCTATACGTTGAAGAGAATCC
GTGATCCAAACTATAACGTGACCCTGCGTCCACACATTTCCAAAGAGATCTTGCAATCAA
GTAAATCGGCACAGGAGCTCGTTAAGCTTAACCCAACGAGTGAATACGCGCCTGGGCTTG
AGGACACGCTCATCTTAACCATGAAGGGTATTGCCGCAGGACTTCAGAACACCGGTTAAG
TGAGTTGAGTCACCCGAGAGAAAGCAGACTTTTGAGTCTCTCTTTCCTGTTTTTCTTTTT
AAGAATAATCTCTTTGTTTGAAATCGAAAATAATAAGCTGTTACGGTTGGATTACAGTTT
ACTTTTTGTGTCCACACCGTTGAGAAAAGTTTTAATCTTCTCATTGTATGAAACTCAACA
CTGCTCTGTTTCTGAGACAGTTTTCAATCTTAAATCTTATCT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2EP93JQ 691 0 0
TTTCCGTGTCACCATCGATCTTATTGAGATGGTGTTCGCCAAGGGAGACCCCGGGATCGC
TGCATTGTATGACAAACTTCTTGTCTCAAAAGATTTATGGGTCTTTGGAGAGAAACTCAG
GACTAACTTTGAAGAAACCAAGACCCTCGTCCTCCAGACTGCTGGACACAAAGATCTTCT
TGAAGAAGACCCTTACTTGAAACAGAGACTTAGGCTGCGTGACTCTTACATTACAACCCT
CAACGTTTGCCAAGCCTATACGTTGAAGAGAATCCGTGATCCAAACTATAACGTGACCCT
GCGTCCACACATTTCCAAAGAGATCTTGCAATCAAGTAAATCGGCACAGGAGCTCGTTAA
GCTTAACCCAACGAGTGAATACGCGCCTGGGCTTGAGGACACGCTCATCTTAACCATGAA
GGGTATTGCCGCAGGACTTCAGAACACCGGTTAAGTGAGTTGAGTCACCCGAGAGAAAGC
AGACTTTTGAGTCTTTCTTTCCTGTTTTTCTTTTTAAGAATAATCTCTTTGTTTGAAATC
GAAAATAATAAGCTGTTACGGTTGGATTACAGTTTACTTTTTGTGTCCACACCGTTGAGA
AAAGTTTTAATCTTCTCATTGTATGAAACTCAACACTGCTCTGTTTCTGAGACAGTTTTC
AATCTTAAATCTTATCTTATTTTTTGTCTCT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL7495Contig1 673 2 3 U
TTTTTTTTGGAATTGCAATCTACACGTGTTATTATCATTCAAGCAAAAGCCAAACTGAAT
ACAAACAAGTCATATTCAAAATTTGACTACAGGTTTTGTAATAAGTAGACATCTTTTGCT
TATTATATTAAAATAGATTTTAGTGAGAAGGCTTCATTTCAGCTTTAATGGCAGCAACAA
GGTGATCATAAGCCTGACCCCAAGCAGATTTCATTTCCGGTGACCACATCTCCGGCACCG
CCTCCTTTATCGTCTCCAACAATGCATACTTGGTCACCTCGAAGTGTTCATCAACGACGC
CGTATTTAGAGTGATTGGCTCCTAGCCTCTTCAGGGTTGTCTCCTTCACTGTAACGTTTC
CTGTTTTTCTCAGCTGTGCTGCTGACTCACAACACATGACAAAAACAGACATGGCATGAG
GCTTGAGCTTTGGGTTTTGCTCAGCAGGGATGGGTGAGTCTCTCAAAAACGAGAACAACT
TCTTCGTTGTTGGTGCAATCTCAAAGATCTTGATGAATAGTTTGAGACCCAAATCAGCTG
AATTTTTCTTCATGACACTCCATGACTTCACCACAAGAGCTTCTTGCTCTTCTGTAAACA
CGATCTTTCCCTCACTCTCCATATCCTCAGAGGCTAAATTATTTGATATACAGTTCTTTT
CCGTAACGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM78TF C 1
AF RR2CM78JQ U 9
BS 1 8 RR2CM78TF
BS 9 661 RR2CM78JQ
BS 662 673 RR2CM78TF

RD RR2CM78TF 673 0 0
TTTTTTTTGGAATTGCAATCTACACGTGTTAT*ATCAT*CAAGCAAAAGCCAAACTGAAT
ACAAACAAGTCATATTCAAAATTTGACTACAGGTTTTGTAATAAGTAGACATCTTTTGCT
TATTATATTAAAATAGATTTTAGTGAGAAGGCTTCATTTCAGCTTTAATGGCAGCAACAA
GGTGATCATAAGCCTGACCCCAAGCAGATTTCATTTCCGGTGACCACATCTCCGGCACCG
CCTCCTTTATCGTCTCCAACAATGCATACTTGGTCACCTCGAAGTGTTCATCAACGACGC
CGTATTTAGAGTGATTGGCTCCTAGCCTCTTCAGGGTTGTCTCCTTCACTGTAACGTTTC
CTGTTTTTCTCAGCTGTGCTGCTGACTCACAACACATGACAAAAACAGACATGGCATGAG
GCTTGAGCTTTGGGTTTTGCTCAGCAGGGATGGGTGAGTCTCTCAAAAACGAGAACAACT
TCTTCGTTGTTGGTGCAATCTCAAAGATCTTGATGAATAGTTTGAGACCCAAATCAGCTG
AATTTTTCTTCATGACACTCCATGACTTCACCACAAGAGCTTCTTGCTCTTCTGTAAACA
CGATCTTTCCCTCACTCTCCATATCCTCAGAGGCTAAATTATTTGATATACAGTTCTTTT
CCGTAACGAAAAA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2CM78JQ 653 0 0
GGAATTGCAATCTACACGTGTTATTATCATTCAAGCAAAAGCCAAACTGAATACAAACAA
GTCATATTCAAAATTTGACTACAGGTTTTGTAATAAGTAGACATCTTTTGCTTATTATAT
TAAAATAGATTTTAGTGAGAAGGCTTCATTTCAGCTTTAATGGCAGCAACAAGGTGATCA
TAAGCCTGACCCCAAGCAGATTTCATTTCCGGTGACCACATCTCCGGCACCGCCTCCTTT
ATCGTCTCCAACAATGCATACTTGGTCACCTCGAAGTGTTCATCAACGACGCCGTATTTA
GAGTGATTGGCTCCTAGCCTCTTCAGGGTTGTCTCCTTCACTGTAACGTTTCCTGTTTTT
CTCAGCTGTGCTGCTGACTCACAACACATGACAAAAACAGACATGGCATGAGGCTTGAGC
TTTGGGTTTTGCTCAGCAGGGATGGGTGAGTCTCTCAAAAACGAGAACAACTTCTTCGTT
GTTGGTGCAATCTCAAAGATCTTGATGAATAGTTTGAGACCCAAATCAGCTGAATTTTTC
TTCATGACACTCCATGACTTCACCACAAGAGCTTCTTGCTCTTCTGTAAACACGATCTTT
CCCTCACTCTCCATATCCTCAGAGGCTAAATTATTTGATATACAGTTCTTTTC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL7496Contig1 686 2 2 U
GGGCCGCACACTTTAACCTCTCTTCTCTCGATAGACGATCATCACCACATCCACAACAAG
CGCCGGGAAAAGAAAAAAAGATGGCGTCGAGAGAGCAAGTAAAGGCGTCGCACATTCTGA
TAAAGCACCAAGGATCTCGTAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCCGAAGGAAAGATCATAA
TGACTACCACGAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTCAAATCGATCCGCGAAGACATTCTCT
CTGGCAAAGCTAACTTCGAGGATGTTGCCACTCGCGTTTCCGACTGTAGCTCCGCCAAAC
GCGGCGGCGATCTAGGTCCGTTTGGGAGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAGGCAA
CATACGCACTCAAGGTTGGTGATATAAGCGAGATTGTGGATACAGACAGTGGAGTCCATA
TCATTAAGAGAACTGCTTGATCTCCTCCAATTTATCAAAAGTTGCCTGTTTTTTTTTTTC
CATTGTCTTCTTGACCAAAGATGAAGATAGAAGAATAATAAGAAAAGCTTTGCTATTGTG
GTTTTAATTCTGCATGATTTTTGATACAAGCAAAAACATGTAATAAAAACAAATTGTATC
ATCTCAATTTCTTCTTTATAGCTTCAGAATAACACATCCCTGTTGCTGACTCTGACTTGT
GTTATCATTCTGTGTGAAAATTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F426TF U 1
AF RR2F426JQ C 242
BS 1 679 RR2F426TF
BS 680 686 RR2F426JQ

RD RR2F426TF 685 0 0
GGGCCGCACACTTTAACCTCTCTTCTCTCGATAGACGATCATCACCACATCCACAACAAG
CGCCGGGAAAAGAAAAAAAGATGGCGTCGAGAGAGCAAGTAAAGGCGTCGCACATTCTGA
TAAAGCACCAAGGATCTCGTAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCCGAAGGAAAGATCATAA
TGACTACCACGAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTCAAATCGATCCGCGAAGACATTCTCT
CTGGCAAAGCTAACTTCGAGGATGTTGCCACTCGCGTTTCCGACTGTAGCTCCGCCAAAC
GCGGCGGCGATCTAGGTCCGTTTGGGAGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAGGCAA
CATACGCACTCAAGGTTGGTGATATAAGCGAGATTGTGGATACAGACAGTGGAGTCCATA
TCATTAAGAGAACTGCTTGATCTCCTCCAATTTATCAAAAGTTGCCTGTTTTTTTTTTTC
CATTGTCTTCTTGACCAAAGATGAAGATAGAAGAATAATAAGAAAAGCTTTGCTATTGTG
GTTTTAATTCTGCATGATTTTTGATACAAGCAAAAACATGTAATAAAAACAAATTGTATC
ATCTCAATTTCTTCTTTATAGCTTCAGAATAACACATCCCTGTTGCTGACTCTGACTTGT
GTTATCATTCTGTGTGAAA
TTTCCC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2F426JQ 445 0 0
TGGCAAAGCTAACTTCGAGGATGTTGCCACTCGCGTTTCCGACTGTAGCTCCGCCAAACG
CGGCGGCGATCTAGGTCCGTTTGGGAGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAGGCAAC
ATACGCACTCAAGGTTGGTGATATAAGCGAGATTGTGGATACAGACAGTGGAGTCCATAT
CATTAAGAGAACTGCTTGATTTCCTCCAATTTATCAAAAGTTGCCTGTTTTTTTTTTTCC
ATTGTCTTCTTGACCAAAGATGAAGATAGAAGAATAATAAGAAAAGCTTTGCTATTGTGG
TTTTAATTCTGCATGATTTTTGATACAAGCAAAAACATGTAATAAAAACAAATTGTATCA
TCTCAATTTCTTCTTTATAGCTTCAGAATAACACATCCCTGTTGCTGACTCTGACTTGTG
TTATCATTCTGTGTGAAAATTTCCC

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 2

CO CL7497Contig1 805 2 18 U
GGGATGGCTATCGGTTTTGGAGACAGGGTTTCTGGAGAGAACATTTACGTGGTAGGCCAT
ACCATATCAGTGCTTTGTACGTTGTTGACTTGGTTAAATTCCGAGAGACGGCGGCAGGAG
ATAATCTAAGAGTATTCTATGAGACGCTTAGCAAGGATCCAAACAGTTTGTCCAATCTAG
ATCAGGATCTTCCTAATTATGCTCAGCACACTGTTCCTATATTTTCACTTCCCCAAGAGT
GGTTATGGTGTGAATCATGGTGTGGAAACGCCACCAAATCAAAGGCTAGAACAATAGACC
TGTGCAATAATCCCATGACAAAGGAGCCAAAGCTTCAGGGTGCCAGAAGAATTGTAACTG
AATGGCCCGATCTTGATCTCGAGGCACGCAAGTTCACAGCAAAAATCTTGGGTGAAGATT
TGGAATTCAACGAGCCAGTAGCTGCTGCTGCTACGGACAAGCCTAATCCTCCTCCATCAA
GTGACATCTCTGAAGATTCAGAACAAGACTTGGAATCTAAGGATGAACTTTAAATGCAGG
TTCCTGTAGCTTTTAAAGGGGGAGAAGATAGCATCACGCGTTGTTATTTTCAATGGATGG
GGCTAGATAAGGTTTCTAGTATTTTTGTACCATTTTCCAAGACATAATATTTTCAGCAGA
ACTATAGTTTAGCAGGGAGAATGAACAAACAACTACAGTTCGCAATGTTAGATTCAACAT
TATCTGAAGGTTACTTAACACTTATGCAGGTGAATAATATCAGTATAATATGGTTTATTC
ACTACTCAAATAATAACAAAAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET27TF U 1
AF RR2ET27JQ C 99
BS 1 611 RR2ET27TF
BS 612 612 RR2ET27JQ
BS 613 676 RR2ET27TF
BS 677 677 RR2ET27JQ
BS 678 704 RR2ET27TF
BS 705 705 RR2ET27JQ
BS 706 716 RR2ET27TF
BS 717 717 RR2ET27JQ
BS 718 729 RR2ET27TF
BS 730 730 RR2ET27JQ
BS 731 749 RR2ET27TF
BS 750 750 RR2ET27JQ
BS 751 753 RR2ET27TF
BS 754 754 RR2ET27JQ
BS 755 767 RR2ET27TF
BS 768 768 RR2ET27JQ
BS 769 787 RR2ET27TF
BS 788 805 RR2ET27JQ

RD RR2ET27TF 787 0 0
GGGATGGCTATCGGTTTTGGAGACAGGGTTTCTGGAGAGAACATTTACGTGGTAGGCCAT
ACCATATCAGTGCTTTGTACGTTGTTGACTTGGTTAAATTCCGAGAGACGGCGGCAGGAG
ATAATCTAAGAGTATTCTATGAGACGCTTAGCAAGGATCCAAACAGTTTGTCCAATCTAG
ATCAGGATCTTCCTAATTATGCTCAGCACACTGTTCCTATATTTTCACTTCCCCAAGAGT
GGTTATGGTGTGAATCATGGTGTGGAAACGCCACCAAATCAAAGGCTAGAACAATAGACC
TGTGCAATAATCCCATGACAAAGGAGCCAAAGCTTCAGGGTGCCAGAAGAATTGTAACTG
AATGGCCCGATCTTGATCTCGAGGCACGCAAGTTCACAGCAAAAATCTTGGGTGAAGATT
TGGAATTCAACGAGCCAGTAGCTGCTGCTGCTACGGACAAGCCTAATCCTCCTCCATCAA
GTGACATCTCTGAAGATTCAGAACAAGACTTGGAATCTAAGGATGAACTTTAAATGCAGG
TTCCTGTAGCTTTTAAAGGGGGAGAAGATAGCATCACGCGTTGTTATTTTCAATGGATGG
GGCTAGATAAG*TTTCTAGTATTTTTGTACCATTTTCCAAGACATAATATTTTCAGCAGA
ACTATAGTTTAGCAGG*AGAATGAACAAACAACTACAGTTCGCA*TGTTAGATTCA*CAT
TATCTGAAG*TTACTTAACACTTATGCAG*TGA*TAATATCAGTATA*TATGGTTTATTC
ACTACTC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RR2ET27JQ 707 0 0
TTCCGAGAGACGGCGGCAGGAGATAATCTAAGAGTATTCTATGAGACGCTTAGCAAGGAT
CCAAACAGTTTGTCCAATCTAGATCAGGATCTTCCTAATTATGCTCAGCACACTGTTCCT
ATATTTTCACTTCCCCAAGAGTGGTTATGGTGTGAATCATGGTGTGGAAACGCCACCAAA
TCAAAGGCTAGAACAATAGACCTGTGCAATAATCCCATGACAAAGGAGCCAAAGCTTCAG
GGTGCCAGAAGAATTGTAACTGAATGGCCCGATCTTGATCTCGAGGCACGCAAGTTCACA
GCAAAAATCTTGGGTGAAGATTTGGAATTCAACGAGCCAGTAGCTGCTGCTGCTACGGAC
AAGCCTAATCCTCCTCCATCAAGTGACATCTCTGAAGATTCAGAACAAGACTTGGAATCT
AAGGATGAACTTTAAATGCAGGTTCCTGTAGCTTTTAAAGGGGGAGAAGATAGCATCACG
CGTTGTTATTTTCAATGGATGGGGCTAGATAAGGTTTCTAGTATTTTTGTACCATTTTCC
AAGACATAATATTTTCAGCAGAACTATAGTTTAGCAGGGAGAATGAACAAACAACTACAG
TTCGCAATGTTAGATTCAACATTATCTGAAGGTTACTTAACACTTATGCAGGTGAATAAT
ATCAGTATAATATGGTTTATTCACTACTCAAATAATAACAAAAGTTG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL7498Contig1 774 2 4 U
GGGGCAGACTCAGAGCTATGGAGGGTCTGGTTCCAATGCAGGCTTTGGACGGCCCTTTAG
CCCAGGATATGCTGGAAGGTACGGTAGCCAGATTGAGTCTGGAGGAGGTAACGGTTCTGT
GCTAAATGCAGCAGCCAAGAACAACTTATGGGGAAATGGTGGTGGTGGTGGTCTAGGTTA
CATGTCAAACTCTCTGATATCTAGGAGCAGCTTTAACGGAAACTCTGGAATGTCTTCACT
AGGCAGCATTGGGGACAGCTTTGGACGTTCACGTAGTGGTGGCTATCGCAGTGAGGGAGG
AGGAGGAGGTGTAGGATTAGAAGCAATGAGAGGGGTTCATGTTGGTGGTTACAGCAGCAG
TGGCGGCTCAAGCAGCTTGGAGGCAGACTCTCTGTACAGTGACTCGGCGTGGCTTTCTTC
GTTGCCTGGAAAGGCGGAGGAAAGATTGGGAATGGGAGCATTTGACTTCATGTCTAAAGG
ACCAGCTGGATACATCAACAGGCAACCAAACGGAGGTATTGCAGCTTAGAGAAGTGTGAG
AAAATCCTATGGAGATTTACAGGAATTGGTTATATTTGCAGAATGAGAGTTTTTAGAAAG
AGGAAAACTTATTTGTTCAAAGCTTTTATTTACTTCTTTTTTTTACTATTTTGATTGTTG
CTATAGTTTTTAATTTCACCCTTTCCTAATTTGGGGTTTGTTTCTTTTATCTTAAAGAAA
ATTAAAAATGTAAACTGAGTTTATATAAAGAGACAAAGAACAATGAAGTGTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM90TF U 1
AF RR2FM90JQ C 60
BS 1 643 RR2FM90TF
BS 644 644 RR2FM90JQ
BS 645 707 RR2FM90TF
BS 708 774 RR2FM90JQ

RD RR2FM90TF 709 0 0
GGGGCAGACTCAGAGCTATGGAGGGTCTGGTTCCAATGCAGGCTTTGGACGGCCCTTTAG
CCCAGGATATGCTGGAAGGTACGGTAGCCAGATTGAGTCTGGAGGAGGTAACGGTTCTGT
GCTAAATGCAGCAGCCAAGAACAACTTATGGGGAAATGGTGGTGGTGGTGGTCTAGGTTA
CATGTCAAACTCTCTGATATCTAGGAGCAGCTTTAACGGAAACTCTGGAATGTCTTCACT
AGGCAGCATTGGGGACAGCTTTGGACGTTCACGTAGTGGTGGCTATCGCAGTGAGGGAGG
AGGAGGAGGTGTAGGATTAGAAGCAATGAGAGGGGTTCATGTTGGTGGTTACAGCAGCAG
TGGCGGCTCAAGCAGCTTGGAGGCAGACTCTCTGTACAGTGACTCGGCGTGGCTTTCTTC
GTTGCCTGGAAAGGCGGAGGAAAGATTGGGAATGGGAGCATTTGACTTCATGTCTAAAGG
ACCAGCTGGATACATCAACAGGCAACCAAACGGAGGTATTGCAGCTTAGAGAAGTGTGAG
AAAATCCTATGGAGATTTACAGGAATTGGTTATATTTGCAGAATGAGAGTTTTTAGAAAG
AGGAAAACTTATTTGTTCAAAGCTTTTATTTACTTCTTTTTTT*ACTATTTTGATTGTTG
CTATAGTTTTTAATTTCACCCTTTCCTAATTTGGGGTTTGTTTCTTT
AT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2FM90JQ 715 0 0
GCCCAGGATATGCTGGAAGGTACGGTAGCCAGATTGAGTCTGGAGGAGGTAACGGTTCTG
TGCTAAATGCAGCAGCCAAGAACAACTTATGGGGAAATGGTGGTGGTGGTGGTCTAGGTT
ACATGTCAAACTCTCTGATATCTAGGAGCAGCTTTAACGGAAACTCTGGAATGTCTTCAC
TAGGCAGCATTGGGGACAGCTTTGGACGTTCACGTAGTGGTGGCTATCGCAGTGAGGGAG
GAGGAGGAGGTGTAGGATTAGAAGCAATGAGAGGGGTTCATGTTGGTGGTTACAGCAGCA
GTGGCGGCTCAAGCAGCTTGGAGGCAGACTCTCTGTACAGTGACTCGGCGTGGCTTTCTT
CGTTGCCTGGAAAGGCGGAGGAAAGATTGGGAATGGGAGCATTTGACTTCATGTCTAAAG
GACCAGCTGGATACATCAACAGGCAACCAAACGGAGGTATTGCAGCTTAGAGAAGTGTGA
GAAAATCCTATGGAGATTTACAGGAATTGGTTATATTTGCAGAATGAGAGTTTTTAGAAA
GAGGAAAACTTATTTGTTCAAAGCTTTTATTTACTTCTTTTTTTTACTATTTTGATTGTT
GCTATAGTTTTTAATTTCACCCTTTCCTAATTTGGGGTTTGTTTCTTTTATCTTAAAGAA
AATTAAAAATGTAAACTGAGTTTATATAAAGAGACAAAGAACAATGAAGTGTATT

QA 1 715 1 715
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7500Contig1 928 2 2 U
GGGAGATAAGTGAATCACCGGCGGCACATGTAAGAAGCACATCAGAAGTAGGAGCATCAA
CTGCCACTGATGACTGCTCTCTCTATGATCACTCTAAGCTACAAGAAAAGGATGTGAATG
AAACTCCTCACACCACGTCAGCCTCAGAAACAGAGCCAGAGAGTTGTGAACCAGAAACAC
CTGGTTTAGGAGTTGATGATGAAACTCCAGAGTGCAACAACGTAAATGCAGTGGATGATG
ATGACTGCTCTGAGAAGAATATGGCACATGCTTCTGTGGATCACCACAACTCCTTGGCTC
CTCCTGTAAACGAAATTTCAGATGAGTCAACAGTACTTGTGGAGTGTCCAGGTCAGAAAG
AGCCGAAGAGCCTCACGCTTGAAGAAGCCACTGATGCAATACTGTTCTGCAGCTCCATTG
TCCACGACCTAGTTTACCAAGCTGCGTCAATAGCCATGGACAAAGGAAGGGATGTGGCGG
CAACCGAAGAAGAAGAAGAAATATTGCGTTCAACAGTGACAGTACTCGGAAAGTCAAATG
CGAACAGGAGTAGTTACACAAGCGGTGGTGGTACAAAGACTAACAAGAAACAGAGTTCCA
AATCAGCCAAAGCGAACCGGAAGCAAACGGAAACAGAGGAGAAAACAGAGGTACATATAG
AGAATGATGAGAATGCAGGGGAAGCAGCAGGGATGATGATAAGTAACGTTGGGGTTCTTC
CTAGTAATAATAAAGCAGATAATTTGAAACCTCCTCCTAAGCTGGAGAATAAATGCAATT
GCTCAATAATGTGATTTTTTTTTTTTTACTAGTAAAGTTTTTAATTATGTTTGTTCATAA
AGTTTGTAGTTGGTTGTGTTGTTGTTTGGGTGTATTTACGTTTGCTGCAGCTAATTTGTG
AGAGGAAAGCACATGATTTCGGTTGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP02TF U 1
AF RR2AP02JQ C 115
BS 1 686 RR2AP02TF
BS 687 928 RR2AP02JQ

RD RR2AP02TF 686 0 0
GGGAGATAAGTGAATCACCGGCGGCACATGTAAGAAGCACATCAGAAGTAGGAGCATCAA
CTGCCACTGATGACTGCTCTCTCTATGATCACTCTAAGCTACAAGAAAAGGATGTGAATG
AAACTCCTCACACCACGTCAGCCTCAGAAACAGAGCCAGAGAGTTGTGAACCAGAAACAC
CTGGTTTAGGAGTTGATGATGAAACTCCAGAGTGCAACAACGTAAATGCAGTGGATGATG
ATGACTGCTCTGAGAAGAATATGGCACATGCTTCTGTGGATCACCACAACTCCTTGGCTC
CTCCTGTAAACGAAATTTCAGATGAGTCAACAGTACTTGTGGAGTGTCCAGGTCAGAAAG
AGCCGAAGAGCCTCACGCTTGAAGAAGCCACTGATGCAATACTGTTCTGCAGCTCCATTG
TCCACGACCTAGTTTACCAAGCTGCGTCAATAGCCATGGACAAAGGAAGGGATGTGGCGG
CAACCGAAGAAGAAGAAGAAATATTGCGTTCAACAGTGACAGTACTCGGAAAGTCAAATG
CGAACAGGAGTAGTTACACAAGCGGTGGTGGTACAAAGACTAACAAGAAACAGAGTTCCA
AATCAGCCAAAGCGAACCGGAAGCAAACGGAAACAGAGGAGAAAACAGAGGTACATATAG
AGAATGATGAGAATGCAGGGGAAGCA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RR2AP02JQ 814 0 0
TGAATGAAACTCCTCACACCACGTCAGCCTCAGAAACAGAGCCAGAGAGTTGTGAACCAG
AAACACCTGGTTTAGGAGTTGATGATGAAACTCCAGAGTGCAACAACGTAAATGCAGTGG
ATGATGATGACTGCTCTGAGAAGAATATGGCACATGCTTCTGTGGATCACCACAACTCCT
TGGCTCCTCCTGTAAACGAAATTTCAGATGAGTCAACAGTACTTGTGGAGTGTCCAGGTC
AGAAAGAGCCGAAGAGCCTCACGCTTGAAGAAGCCACTGATGCAATACTGTTCTGCAGCT
CCATTGTCCACGACCTAGTTTACCAAGCTGCGTCAATAGCCATGGACAAAGGAAGGGATG
TGGCGGCAACCGAAGAAGAAGAAGAAATATTGCGTTCAACAGTGACAGTACTCGGAAAGT
CAAATGCGAACAGGAGTAGTTACACAAGCGGTGGTGGTACAAAGACTAACAAGAAACAGA
GTTCCAAATCAGCCAAAGCGAACCGGAAGCAAACGGAAACAGAGGAGAAAACAGAGGTAC
ATATAGAGAATGATGAGAATGCAGGGGAAGCAGCAGGGATGATGATAAGTAACGTTGGGG
TTCTTCCTAGTAATAATAAAGCAGATAATTTGAAACCTCCTCCTAAGCTGGAGAATAAAT
GCAATTGCTCAATAATGTGATTTTTTTTTTTTTACTAGTAAAGTTTTTAATTATGTTTGT
TCATAAAGTTTGTAGTTGGTTGTGTTGTTGTTTGGGTGTATTTACGTTTGCTGCAGCTAA
TTTGTGAGAGGAAAGCACATGATTTCGGTTGCCT

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL7501Contig1 672 2 3 U
TTCGGAGCAGATTATTGTTTTACTTCTTGTGGTGCCATAGCTTCTTAGAAAGATAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGATTGGGATAGCGTTGCCGCTGAGGATGTGATCGAGGCG
CTAAGAGAGGTTGAGTGGTCGACGCGTCCTCGTTCTTTCGCCGAGCTCTTCTCCAGATTC
GCCTTCCCTCGCTCTTTCTCTAAGTGGACGAGTCGTCTCAAATGCAATCTCTACTACTAT
AGGACGAATTACTTCATACTGTTGATTCTCGTTCTGGGTCTTGCACTTATCACGAGACCT
CTGGCCATTCTTGGTGCTCCTCTTACTGCCCTAAGCTTAGCCTTCCTTAACGACAGCTTT
GCCGCTACTTTTAATGAGAAGATGATCCGGACCATTAGGCATTTCTCGCCACATTTAGCT
GCAAAGATGAGACCTCCCCACATGCCCGTCATTCGTGGGCGATCTGCAGCTAGAAAGAAG
GTTTACGTTTGTGGCAAACCACGTTTGGTATTTGTCTTACTTGGTTTAACCGCCAGCTTT
GTCTTGTGGTTCACTTCCTGCGGTTTGTTATGGGTCCTCTATGCATTTGCCACTGCCCTT
CTCATGATCATTCTTCACGCAAGCCTGAGAACTCCAAACCTCAAGCACGCCTGAACACAT
TCCGTGAAGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D776TF U 21
AF RR2DH52TF U 1
BS 1 518 RR2DH52TF
BS 519 519 RR2D776TF
BS 520 672 RR2DH52TF

RD RR2D776TF 602 0 0
G
ACTTCTTGTGGTGCCATAGCTTCTTAGAAAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA**TG
GATTGGGATAGCGTTGCCGCTGAGGATGTGATCGAGGCGCTAAGAGAGGTTGAGTGGTCG
ACGCGTCCTCGTTCTTTCGCCGAGCTCTTCTCCAGATTCGCCTTCCCTCGCTCTTTCTCT
AAGTGGACGAGTCGTCTCAAATGCAATCTCTACTACTATAGGACGAATTGCTTCATACTG
TTGATTCTCGTTCTGGGTCTTGCACTTATCATGAGACCTCTGGCCATTCTTGGTGCTCCT
CTTACTGCCCTAAGCTTATCTTTCCTTAACGACAGCTTTGCCGCTACTTTTAATGAGAAG
ATGATCCGGACCATTAGGCATTTCTCGCCACATTTAGCTGCAAAGATGAGACCTCCCCAC
ATGCCCGTCATTCGTGGGCGATCTGCAGCTAGAAAGAAGGTTTACGTTTGTGGCAAACCA
CGTTTGGTATTTGTCTTACTTGGTTTAACCGCCAGCTTTGTCTTGTGGTTCACTTCCTGC
GGTTTGTTATGGGTCCTCTATGCATTTGCCACTGCCCTTCTCATGATCATTCTTCACGCA
A

QA 2 602 2 602
DS 

RD RR2DH52TF 672 0 0
TTCGGAGCAGATTATTGTTTTACTTCTTGTGGTGCCATAGCTTCTTAGAAAGATAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGATTGGGATAGCGTTGCCGCTGAGGATGTGATCGAGGCG
CTAAGAGAGGTTGAGTGGTCGACGCGTCCTCGTTCTTTCGCCGAGCTCTTCTCCAGATTC
GCCTTCCCTCGCTCTTTCTCTAAGTGGACGAGTCGTCTCAAATGCAATCTCTACTACTAT
AGGACGAATTACTTCATACTGTTGATTCTCGTTCTGGGTCTTGCACTTATCACGAGACCT
CTGGCCATTCTTGGTGCTCCTCTTACTGCCCTAAGCTTAGCCTTCCTTAACGACAGCTTT
GCCGCTACTTTTAATGAGAAGATGATCCGGACCATTAGGCATTTCTCGCCACATTTAGCT
GCAAAGATGAGACCTCCCCACATGCCCGTCATTCGTGGGCGATCTGCAGCTAGAAAGAAG
GTTTACGTTTGTGGCAAACCACGTTTGGTATTTGTCTTGCTTGGTTTAACCGCCAGCTTT
GTCTTGTGGTTCACTTCCTGCGGTTTGTTATGGGTCCTCTATGCATTTGCCACTGCCCTT
CTCATGATCATTCTTCACGCAAGCCTGAGAACTCCAAACCTCAAGCACGCCTGAACACAT
TCCGTGAAGAAT

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL7502Contig1 802 2 1 U
GGGGGAGCTCACATAACTAAACAAGATCCGATCTAACCCCGGTTCTCGTCGGAATCTCTT
TAACGGTTAACCGGCGTTCCTCATCCACCTTTCGTTATGGAAGACGTCAAGGGAAAGGAG
CTTGTTGATGATACTCCACCTCCTGTTGACCAAAACGATAACAAGAATGAAACTGAGGTT
CATAAACAGCCATCATCTGAGTCAGAGGAAAATGCGATCAAGAAAAAGTATGGAGGATTG
TTGCCAAAGAAGATTCCTTTGATTTCCAAGGATCATGAGCGCGCGTTTTTTGACTCTGCT
GATTGGGCATTAGGCAAGCAAAAAGGACAAAAGCCTAAAGGGCCTTTGGAAGCTCTCCGA
CCAAAACTGCAGCCAACCCCGCACCAGCAACCTAGAGCAAGACGGATGGCTTTGTCTTCA
GGCGACAACACTGAAGACGCTGAGGCTGACAACAACGAACCTCTCGATGACCAAGCTAGT
GCATCAGCTGCTGACAACGCCAAGGATGATGGAGGAGGCATCGATGCTACTGACGCCGCG
AAAGACAACGTCAAGTCATGAACAAAAACATATCACAAGTCAATTTTACAGAAGAATAAG
CGACCAGGTTTGCTGCTATGCAAACGGTCGTAGTAATATCGAGTCTCCCTCTCTCTCTCT
TTACATTATATTCCATACATACTTGGGCACCACCAGCAAATCTGTATCACCATACAAAAC
CTAGTGGTTGTTTGAAACGTCTATTTGACGATTTGCAAAATGGTTTGCTTTTTAATCATC
CATCAAATACCCTCTTTCTATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AC89JQ C 1
AF RR2AC89TF U 1
BS 1 802 RR2AC89TF

RD RR2AC89JQ 802 0 0
GGGGGAGCTCACATAACTAAACAAGATCCGATCTAACCCCGGTTCTCGTCGGAATCTCTT
TAACGGTTAACCGGCGTTCCTCATCCACCTTTCGTTATGGAAGACGTCAAGGGAAAGGAG
CTTGTTGATGATACTCCACCTCCTGTTGACCAAAACGATAACAAGAATGAAACTGAGGTT
CATAAACAGCCATCATCTGAGTCAGAGGAAAATGCGATCAAGAAAAAGTATGGAGGATTG
TTGCCAAAGAAGATTCCTTTGATTTCCAAGGATCATGAGCGCGCGTTTTTTGACTCTGCT
GATTGGGCATTAGGCAAGCAAAAAGGACAAAAGCCTAAAGGGCCTTTGGAAGCTCTCCGA
CCAAAACTGCAGCCAACCCCGCACCAGCAACCTAGAGCAAGACGGATGGCTTTGTCTTCA
GGCGACAACACTGAAGACGCTGAGGCTGACAACAACGAACCTCTCGATGACCAAGCTAGT
GCATCAGCTGCTGACAACGCCAAGGATGATGGAGGAGGCATCGATGCTACTGACGCCGCG
AAAGACAACGTCAAGTCATGAACAAAAACATATCACAAGTCAATTTTACAGAAGAATAAG
CGACCAGGTTTGCTGCTATGCAAACGGTCGTAGTAATATCGAGTCTCCCTCTCTCTCTCT
TTACATTATATTCCATACATACTTGGGCACCACCAGCAAATCTGTATCACCATACAAAAC
CTAGTGGTTGTTTGAAACGTCTATTTGACGATTTGCAAAATGGTTTGCTTTTTAATCATC
CATCAAATACCCTCTTTCTATC

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2AC89TF 802 0 0
GGGGGAGCTCACATAACTAAACAAGATCCGATCTAACCCCGGTTCTCGTCGGAATCTCTT
TAACGGTTAACCGGCGTTCCTCATCCACCTTTCGTTATGGAAGACGTCAAGGGAAAGGAG
CTTGTTGATGATACTCCACCTCCTGTTGACCAAAACGATAACAAGAATGAAACTGAGGTT
CATAAACAGCCATCATCTGAGTCAGAGGAAAATGCGATCAAGAAAAAGTATGGAGGATTG
TTGCCAAAGAAGATTCCTTTGATTTCCAAGGATCATGAGCGCGCGTTTTTTGACTCTGCT
GATTGGGCATTAGGCAAGCAAAAAGGACAAAAGCCTAAAGGGCCTTTGGAAGCTCTCCGA
CCAAAACTGCAGCCAACCCCGCACCAGCAACCTAGAGCAAGACGGATGGCTTTGTCTTCA
GGCGACAACACTGAAGACGCTGAGGCTGACAACAACGAACCTCTCGATGACCAAGCTAGT
GCATCAGCTGCTGACAACGCCAAGGATGATGGAGGAGGCATCGATGCTACTGACGCCGCG
AAAGACAACGTCAAGTCATGAACAAAAACATATCACAAGTCAATTTTACAGAAGAATAAG
CGACCAGGTTTGCTGCTATGCAAACGGTCGTAGTAATATCGAGTCTCCCTCTCTCTCTCT
TTACATTATATTCCATACATACTTGGGCACCACCAGCAAATCTGTATCACCATACAAAAC
CTAGTGGTTGTTTGAAACGTCTATTTGACGATTTGCAAAATGGTTTGCTTTTTAATCATC
CATCAAATACCCTCTTTCTATC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL7503Contig1 718 2 4 U
GGCATCAAAACCACCGGTGATAAGATTCTCTCTCAGCCGCTTGCTGACATTGGTGGGAAG
GGGCTTTTCACCAAAGAGATAGACAAGGCCTTGATTAACGGCCATATCGACATAGCAGTC
CATTCCATGAAAGACGTCCCACTTATCTACCTGAGAAAACGGTTTTGCCTGCAGAACTGA
TGATGATAAAATGGCAAATTACTTAGCCTCGTTAAACCACGAGGAAACAAGACTAGCGGT
GGCATGCGAGAGAGCGTTTCTTGAAACACTGGACGGCTCATGTCGTACTCCGATTGCTGG
ATACGCGGCCAAGGACGAAGAAGGCAACTGCTATTTCAGAGGATTGGTTGCATCACCTGA
CGGTACCCGAGTTCTTGAGACCTCAAGAAAAGGTCCATACGTGTTTGAAGACATGTTGAA
GATGGGAAAAGACGCGGGGCAAGAACTGCTTTCCCGTGCTGGTCCAGGCTTCTTCGGCAA
TTAAGCCATTCGAAGAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAGAAGGGCTGTGGACATGGACAGAGT
CTAGGGTTTTAGGAGTTTTCCAACATGATAGATCCCTTTTCTTCTTCCTCTTAATCTGTT
GTAACTTTTTTGATTTAGAGAGAAAGAGAACCTTCTTGTATTGATTGTTTTCTTGTATGC
AGAGATAAAATTTCCTCTTGCAGTTGTACCATTTCATCCTACTATGAAACTCGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP09TF U 1
AF RR2EP09JQ C 64
BS 1 520 RR2EP09TF
BS 521 521 RR2EP09JQ
BS 522 643 RR2EP09TF
BS 644 718 RR2EP09JQ

RD RR2EP09TF 643 0 0
GGCATCAAAACCACCGGTGATAAGATTCTCTCTCAGCCGCTTGCTGACATTGGTGGGAAG
GGGCTTTTCACCAAAGAGATAGACAAGGCCTTGATTAACGGCCATATCGACATAGCAGTC
CATTCCATGAAAGACGTCCCACTTATCTACCTGAGAAAACGGTTTTGCCTGCAGAACTGA
TGATGATAAAATGGCAAATTACTTAGCCTCGTTAAACCACGAGGAAACAAGACTAGCGGT
GGCATGCGAGAGAGCGTTTCTTGAAACACTGGACGGCTCATGTCGTACTCCGATTGCTGG
ATACGCGGCCAAGGACGAAGAAGGCAACTGCTATTTCAGAGGATTGGTTGCATCACCTGA
CGGTACCCGAGTTCTTGAGACCTCAAGAAAAGGTCCATACGTGTTTGAAGACATGTTGAA
GATGGGAAAAGACGCGGGGCAAGAACTGCTTTCCCGTGCTGGTCCAGGCTTCTTCGGCAA
TTAAGCCATTCGAAGAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAGAAGG*CTGTGGACATGGACAGAGT
CTAGGGTTTTAGGAGTTTTCCAACATGATAGATCCCTTTTCTTCTTCCTCTTAATCTGTT
GTAACTTTTTTGATTTAGAGAGAAAGAGAACCTTCTTGTATTG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2EP09JQ 655 0 0
TTTTCAC
CCAAAGAGATAGACAAGGCCTTGATTAACGGCCATATCGACATAGCAGTCCATTCCATGA
AAGACGTCCCACTTATCTACCTGAGAAAACGGTTTTGCCTGCAGAACTGATGATGATAAA
ATGGCAAATTACTTAGCCTCGTTAAACCACGAGGAAACAAGACTAGCGGTGGCATGCGAG
AGAGCGTTTCTTGAAACACTGGACGGCTCATGTCGTACTCCGATTGCTGGATACGCGGCC
AAGGACGAAGAAGGCAACTGCTATTTCAGAGGATTGGTTGCATCACCTGACGGTACCCGA
GTTCTTGAGACCTCAAGAAAAGGTCCATACGTGTTTGAAGACATGTTGAAGATGGGAAAA
GACGCGGGGCAAGAACTGCTTTCCCGTGCTGGTCCAGGCTTTTTCGGCAATTAAGCCATT
CGAAGAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAGAAGGGCTGTGGACATGGACAGAGTCTAGGGTTTT
AGGAGTTTTCCAACATGATAGATCCCTTTTCTTCTTCCTCTTAATCTGTTGTAACTTTTT
TGATTTAGAGAGAAAGAGAACCTTCTTGTATTGATTGTTTTCTTGTATGCAGAGATAAAA
TTTCCTCTTGCAGTTGTACCATTTCATCCTACTATGAAACTCGTTCCC

QA 8 655 8 655
DS 



AS 1 2

CO CL7504Contig1 751 2 6 U
TTTGTCAACTTCTTCAGCTCAGCCATGGCTCTCGGGAACGCTTCAAGTGGACAGACAAGT
GGACCAACGTACCAACAACCATCAGCAATTCCACTGCAACCTCACCAACCCACCCTTGCC
CCTCCTGCACCGACAGCTGCACCTCCACAGATATTATCACCACCGCCTCTACAATCCTCC
TCTCCTATGATGCCTCTCTTTGACAACAATCCTGAACTTATCAGCAGTAAGTCCAATGTT
CACACGGACTTGGTGACGCCGTCCTCGTTCTTTGGACCCCCACGGATGATGGCACAACCA
CACCTCATTCCTGGTTCATCTATTCCCACAACACCTCCTATGAACCTTAATAATGCGACT
CACCAGCAGCGCCCATATGGTACTCCAATGCTCCAGCCTTTCCCACCACCAACTCCACCA
GCATCACTCGCTCCTGCACACAGTGGCCCGGTTATCAACAGAGACAAAGTCAAAGAAGCC
CTGTTAGCACTGGTTCAGGAGAATGAATTCATCGACATGGTGACCCGAGCTTTACAAAAT
GCGCATCAACCGTGAAGCTGAGCGGGGTGGGCCGTCTATGCGTGGGGGGTTTCATGTAGA
ATATGTAGTTAAAACGTAGTTTTGTTCTACTTTCAACCACTCTTCTAGCCAAGTGTTATT
CTCCATGTCTCTTTAAACTTCAATGAACCTCTTTCTGTTAAACTTAAAGTTATTTTCGTA
CATACGATGTTAAAATTACGTTTGATTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RR2EB53JQ C 1
AF RR2CV34TF U 142
BS 1 142 RR2EB53JQ
BS 143 329 RR2CV34TF
BS 330 330 RR2EB53JQ
BS 331 489 RR2CV34TF
BS 490 490 RR2EB53JQ
BS 491 751 RR2CV34TF

RD RR2EB53JQ 748 0 0
TTTGTCAACTTCTTCAGCTCAGCCATGGCTCTCGGGAACGCTTCAAGTGGACAGACAAGT
GGACCAACGTACCAACAACCATCAGCAATTCCACTGCAACCTCACCAACCCACCCTTGCC
CCTCCTGCACCGACAGCTGCACCTCCACAGATATTATCACCACCGCCTCTACAATCCTCC
TCTCCTATGATGCCTCTCTTTGACAACAATCCTGATCTTATCAGCAGTAAGTCCAATGTT
CACACGGATTTGGTGACGCCGTCCTCGTTCTTTGGGCCCCCACGGATGATGGCACGACCA
CACCTCATTCCTGGTTCATCTATTCCCACAACACCTCCTATGAACCTTAATAATGCGACT
CACCAGCAGCGCCCATATGGTACTCCAATGCTCCAGCCTTTCCCACCACCAACTCCACCA
GCATCACTCGCTCCTGCACACAGTGGCCCGGTTATCAACAGAGACAAAGTCAAAGAAGCC
CTGTTAGCACTGGTTCAGGAGAATGAATTCATCGACATGGTGACCCGAGCTTTACAAAAT
GCGCATCAACCGTGAAGCTG*GCGGGGTGGGCCGTCTATGCGTGGGGG*TTTCATGTAGA
ATATGTAGTTAAAACGTAGTTTTGTTCTACTTTCGACCACTCTTCTAGCCAAGTGTTATT
CTCCATGTCTCTTTAAACTTCAATGAACCTCTTTCTGTTAAACTTAAAGTTATTTTCGTA
CATACGATGTTAAAATTACGTTTGAT
CG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2CV34TF 610 0 0
G
CTCCACAGATATTATCACCACCGCCTCTACAATCCTCCTCTCCTATGATGCCTCTCTTTG
ACAACAATCCTGAACTTATCAGCAGTAAGTCCAATGTTCACACGGACTTGGTGACGCCGT
CCTCGTTCTTTGGACCCCCACGGATGATGGCACAACCACACCTCATTCCTGGTTCATCTA
TTCCCACTACACCTCCTATGAACCTTAATAATGCGACTCACCAGCAGCGCCCATATGGTA
CTCCAATGCTCCAGCCTTTCCCACCACCAACTCCACCAGCATCACTCGCTCCTGCACACA
GTGGCCCGGTTATCAACAGAGACAAAGTCAAAGAAGCCCTGTTAGCATTGGTTCAGGAGA
ATGAATTCATCGACATGGTGACCCGAGCTTTACAAAATGCGCATCAACCGTGAAGCTGAG
CGGGGTGGGCCGTCTATGCGTGGGGGGTTTCATGTAGAATATGTAGTTAAAACGTAGTTT
TGTTCTACTTTCAACCACTCTTCTAGCCAAGTGTTATTCTCCATGTCTCTTTAAACTTCA
ATGAACCTCTTTCTGTTAAACTTAAAGTTATTTTCGTACATACGATGTTAAAATTACGTT
TGATTGTTT

QA 2 610 2 610
DS 



AS 1 2

CO CL7505Contig1 835 2 2 U
GGACTCCGCAGGCGATCATCCATGATGCTCATGAGGGTAACACTTACTCTCTGGCAAGAA
GCCACAGTGGGGATTTCCTGTTTACCGGTGGAGAAGATGGAGGGATCAAAATGTTTGAGA
TCAGAAAACACGGTAGTGTAACAAGCGTACTACTCATATCTCAATGGATGCCTCACACCG
GTCCTGTCTACTCTCTTTCTTTCGAGTTTCCCTGGCTTGTATCAGCATCTGGTGACGGTA
AACTCGCGCTTATAGACGTTAGGAAGTTGTTGAAGACTAACCGCCGTGGCTTACCCAAAA
GGGTTTCTTCGAGAATTGTGGAACCGCCACAAAGGATGCTGCACGGGTTCGGTTCAAACT
TGTTCTCTGTGGACGTTGGTTGTGACCGTATAGTTTGTGGAGGTGAAGAAGGCGTAGTCA
GGATATGGAACTTCACACAAGCGTTGGAGATAGAGAAAAGAGCTCGAGCTCTGAAAGGAA
TGAGGCTTGAGAACAGGATGAGGCGAAGGAGGACACAAATGGAGATGAATGCAAATAGTG
GAAGGCCTGACCAATGCTCCATTGCTGCTCATAAGAACCCTGTCACTGGCGATAGGAATC
GAGCGTGGCATACAAAACGAAGAGCGAGCGGGAAGGCGAAGGCCTAAGCATATGGTATTC
GTTTTCCCTCCAACACCCACTCAGTGAGGCAAATTAAAAAAAACTTGGTACATTTAGGTT
TTGAGCTAAGCAGACTTGTGTCTTATGCTTGAATGCAAACTGAAAATATTCGGTTTTAGA
TCGTTTTTTCAATTCCTATGTTTCGGAGAACGTTAATTGAAGAAGTTCGTTCGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU88TF U 1
AF RR2EU88JQ C 125
BS 1 684 RR2EU88TF
BS 685 835 RR2EU88JQ

RD RR2EU88TF 684 0 0
GGACTCCGCAGGCGATCATCCATGATGCTCATGAGGGTAACACTTACTCTCTGGCAAGAA
GCCACAGTGGGGATTTCCTGTTTACCGGTGGAGAAGATGGAGGGATCAAAATGTTTGAGA
TCAGAAAACACGGTAGTGTAACAAGCGTACTACTCATATCTCAATGGATGCCTCACACCG
GTCCTGTCTACTCTCTTTCTTTCGAGTTTCCCTGGCTTGTATCAGCATCTGGTGACGGTA
AACTCGCGCTTATAGACGTTAGGAAGTTGTTGAAGACTAACCGCCGTGGCTTACCCAAAA
GGGTTTCTTCGAGAATTGTGGAACCGCCACAAAGGATGCTGCACGGGTTCGGTTCAAACT
TGTTCTCTGTGGACGTTGGTTGTGACCGTATAGTTTGTGGAGGTGAAGAAGGCGTAGTCA
GGATATGGAACTTCACACAAGCGTTGGAGATAGAGAAAAGAGCTCGAGCTCTGAAAGGAA
TGAGGCTTGAGAACAGGATGAGGCGAAGGAGGACACAAATGGAGATGAATGCAAATAGTG
GAAGGCCTGACCAATGCTCCATTGCTGCTCATAAGAACCCTGTCACTGGCGATAGGAATC
GAGCGTGGCATACAAAACGAAGAGCGAGCGGGAAGGCGAAGGCCTAAGCATATGGTATTC
GTTTTCCCTCCAACACCCACTCAG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RR2EU88JQ 711 0 0
AAAACACGGTAGTGTAACAAGCGTACTACTCATATCTCAATGGATGCCTCACACCGGTCC
TGTCTACTCTCTTTCTTTCGAGTTTCCCTGGCTTGTATCAGCATCTGGTGACGGTAAACT
CGCGCTTATAGACGTTAGGAAGTTGTTGAAGACTAACCGCCGTGGCTTACCCAAAAGGGT
TTCTTCGAGAATTGTGGAACCGCCACAAAGGATGCTGCACGGGTTCGGTTCAAACTTGTT
CTCTGTGGACGTTGGTTGTGACCGTATAGTTTGTGGAGGTGAAGAAGGCGTAGTCAGGAT
ATGGAACTTCACACAAGCGTTGGAGATAGAGAAAAGAGCTCGAGCTCTGAAAGGAATGAG
GCTTGAGAACAGGATGAGGCGAAGGAGGACACAAATGGAGATGAATGCAAATAGTGGAAG
GCCTGACCAATGCTCCATTGCTGCTCATAAGAACCCTGTCACTGGCGATAGGAATCGAGC
GTGGCATACAAAACGAAGAGCGAGCGGGAAGGCGAAGGCCTAAGCATATGGTATTCGTTT
TCCCTCCAACACCCACTCAGTGAGGCAAATTAAAAAAAACTTGGTACATTTAGGTTTTGA
GCTAAGCAGACTTGTGTCTTATGCTTGAATGCAAACTGAAAATATTCGGTTTTAGATCGT
TTTTTCAATTCCTATGTTTCGGAGAACGTTAATTGAAGAAGTTCGTTCGGG

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL7506Contig1 909 2 2 U
AGGGGAGGAATTGAGTAAGATGGATCCGGACGCAGTCAAGTCGACCCTCTCGAACCTGGC
GTTTGGGAATGTATTGGCAGCAGCTGCTAGAGATTATAAGAAGGAAGTGCTTGCAAATGA
GAAGGCACAATCATCAAGTCATGTCAATGAGGAGGTTGATCTTGATGAACTTATGGATGA
CCCAGAGCTAGAAAAATTGCACGCTGATAGGATTGCAGCACTCAAGAGAGAAGTTGAGAA
GAGGGAAGCGTTCAAAAGACAAGGGCATGGTGAGTATCGAGAGGTGAGCGAGGGAGATTT
TTTGGGGGAAGTCACCAGGAGTGAGAAAGTTATATGCCATTTCTACCACAAGGAGTTTTA
CCGCTGCAAGATTATGGACAAGCATCTGAAGACTCTTGCGCCTAAACATGTGGACACTAA
GTTCATTAAAGTGGACGCAGAGAATGCTCCTTTCTTTGTTGCGAAGCTAGCAATAAAGAC
CTTGCCTTGCGTTTTGCTTTTCAGCAAGGGAATCGCAATAGATAGGCTAGTTGGGTTCCA
GGATTTGGGGACAAAGGACGATTTCAGCACTGCCAAACTGGAAAACGTTCTGGTTAAAAA
AGGAATGCTCAGCAAGAAGAAGAAAGAGGAAGATGATGAAGATGCTGAGTACCAAGAGAG
CATAAGACGGTCGGTTAGGTCTTCAGAGAATCTGGACTCTGACTCTGACTGATCAACCAC
CTTACATCACAGATTTGTCTCTGTTTTGCCTTTTGCTCCTTTCTTATATGTTTATTAGGT
AAGGAAGCTTCATATTGTATGTGTACTACATTGACTTGATTTTGGCTTTAAGAAAAAGCT
AGAAAACAGATGTTCATGATTTGAAAGAAGGGTATGTTAGAAGTAAGATCATTGCAGAGG
TTTAGTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE75TF U 1
AF RR2GE75JQ C 108
BS 1 674 RR2GE75TF
BS 675 909 RR2GE75JQ

RD RR2GE75TF 674 0 0
AGGGGAGGAATTGAGTAAGATGGATCCGGACGCAGTCAAGTCGACCCTCTCGAACCTGGC
GTTTGGGAATGTATTGGCAGCAGCTGCTAGAGATTATAAGAAGGAAGTGCTTGCAAATGA
GAAGGCACAATCATCAAGTCATGTCAATGAGGAGGTTGATCTTGATGAACTTATGGATGA
CCCAGAGCTAGAAAAATTGCACGCTGATAGGATTGCAGCACTCAAGAGAGAAGTTGAGAA
GAGGGAAGCGTTCAAAAGACAAGGGCATGGTGAGTATCGAGAGGTGAGCGAGGGAGATTT
TTTGGGGGAAGTCACCAGGAGTGAGAAAGTTATATGCCATTTCTACCACAAGGAGTTTTA
CCGCTGCAAGATTATGGACAAGCATCTGAAGACTCTTGCGCCTAAACATGTGGACACTAA
GTTCATTAAAGTGGACGCAGAGAATGCTCCTTTCTTTGTTGCGAAGCTAGCAATAAAGAC
CTTGCCTTGCGTTTTGCTTTTCAGCAAGGGAATCGCAATAGATAGGCTAGTTGGGTTCCA
GGATTTGGGGACAAAGGACGATTTCAGCACTGCCAAACTGGAAAACGTTCTGGTTAAAAA
AGGAATGCTCAGCAAGAAGAAGAAAGAGGAAGATGATGAAGATGCTGAGTACCAAGAGAG
CATAAGACGGTCGG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2GE75JQ 802 0 0
TGCTTGCAAATGAGAAGGCACAATCATCAAGTCATGTCAATGAGGAGGTTGATCTTGATG
AACTTATGGATGACCCAGAGCTAGAAAAATTGCACGCTGATAGGATTGCAGCACTCAAGA
GAGAAGTTGAGAAGAGGGAAGCGTTCAAAAGACAAGGGCATGGTGAGTATCGAGAGGTGA
GCGAGGGAGATTTTTTGGGGGAAGTCACCAGGAGTGAGAAAGTTATATGCCATTTCTACC
ACAAGGAGTTTTACCGCTGCAAGATTATGGACAAGCATCTGAAGACTCTTGCGCCTAAAC
ATGTGGACACTAAGTTCATTAAAGTGGACGCAGAGAATGCTCCTTTCTTTGTTGCGAAGC
TAGCAATAAAGACCTTGCCTTGCGTTTTGCTTTTCAGCAAGGGAATCGCAATAGATAGGC
TAGTTGGGTTCCAGGATTTGGGGACAAAGGACGATTTCAGCACTGCCAAACTGGAAAACG
TTCTGGTTAAAAAAGGAATGCTCAGCAAGAAGAAGAAAGAGGAAGATGATGAAGATGCTG
AGTACCAAGAGAGCATAAGACGGTCGGTTAGGTCTTCAGAGAATCTGGACTCTGACTCTG
ACTGATCAACCACCTTACATCACAGATTTGTCTCTGTTTTGCCTTTTGCTCCTTTCTTAT
ATGTTTATTAGGTAAGGAAGCTTCATATTGTATGTGTACTACATTGACTTGATTTTGGCT
TTAAGAAAAAGCTAGAAAACAGATGTTCATGATTTGAAAGAAGGGTATGTTAGAAGTAAG
ATCATTGCAGAGGTTTAGTTAG

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL7507Contig1 648 2 5 U
TTTTTTCTTTTTAATTTGTTTTTCTGGGTGGCGAGGAGAAACCAAGAGAAAATCTCGTGA
CCCTGTTCTCTCGAGAGCGCACACACAAATCTCTCTCTCCGTTGCTTCCTCCCATCGATC
GATGTAATACAACCCTCCCTTGTTTTGAGCTTCTCGTAGGGCCTAGTGGAATACAGAGTT
TTGCCCCCCCTACAGCGATCGAGGAAGGGAGCACGAGATCTCGATTCCCCCTATACAATA
CCAAGATTCGGAATCGAGAGACACGAACAATGCATATGAATCCTATCTCGAAGCTAGCTC
TGGTGTGGTTAACACTTGTCGGCTCAGTTCTTGTCTCCTCTGCGGAGGAGCTCGAGTTTG
GTCATTGCGAGAGAGTTGTGAAAAAGTGGGCAGAGACTTCTTCTTCTAACGAAGAGCATC
CTAACAAAGACAAACGCTCGCTTAAGGATCTGCTCTTCTTTCTCCATGTTCCTCGAACTG
GAGGCAGAACTTATTTCCACTGTTTCTTGAGGAAGTTGTATGATAACGCGGAGGAATGTC
CTCGTTCTTACGACAAGCTCCATTTCGATCCTAGGAAGCAAAAGTGCAAGTTGTTGGCCA
CTCATGATGATTATAGTTTAATGTCTAAGCTTCCGAGGGAGAGAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C837TF U 24
AF RR2C414TF U 1
BS 1 260 RR2C414TF
BS 261 261 RR2C837TF
BS 262 391 RR2C414TF
BS 392 392 RR2C837TF
BS 393 648 RR2C414TF

RD RR2C837TF 575 0 0
CTGGGTGGCGAGGAGAAACCAAGAGAAAATCTCGTGACCCTGTTCTCTCGAGAGCGCACA
CACAAATCTCTCTCTCCGTTGCTTCCTCCCATCGATCGATGTAATACAACCCTCCCTTGT
TTTGAGCTTCTCGTAGGGCCTAGTGGAATACAGAGTTTTGCCCCCCCTACAGCGATCGAG
GAAGGGAGCACGAGATCTCGATTCCCCCTATACAATACCAAGATTCGGAATCGAGAGACA
CGAACAATGCATATGAATCCTATCTCGAAGCTAGCTCTGGTGTGGTTAACACTTGTCGGC
TCAGTTCTTGTCTCCTCTGCGGAGGAGCTCGAGTTTGGTCATTGCGAGAGAGTTGTGAAA
AAGTGGGCAGAGACTTCTTCTTCTAACGAAGAGCATCCTAACAAAGACAAACGCTCGCTT
AAGGATCTGCTCTTCTTTCTCCATGTTCCTCGAACTGGAGGCAGAACTTATTTCCACTGT
TTCTTGAGGAAGTTGTATGATAACGCGGAGGAATGTCCTCGTTCTTACGACAAGCTCCAT
TTCGATCCTAGGAAGCAAAAGTGCAAGTTGTTGGC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2C414TF 648 0 0
TTTTTTCTTTTTAATTTGTTTTTCTGGGTGGCGAGGAGAAACCAAGAGAAAATCTCGTGA
CCCTGTTCTCTCGAGAGCGCACACACAAATCTCTCTCTCCGTTGCTTCCTCCCATCGATC
GATGTAATACAACCCTCCCTTGTTTTGAGCTTCTCGTAGGGCCTAGTGGAATACAGAGTT
TTGCCCCCCCTACAGCGATCGAGGAAGGGAGCACGAGATCTCGATTCCCCCTATACAATA
CCAAGATTCGGAATCGAGAGGCACGAACAATGCATATGAATCCTATCTCGAAGCTAGCTC
TGGTGTGGTTAACACTTGTCGGCTCAGTTCTTGTCTCCTCTGCGGAGGAGCTCGAGTTTG
GTCATTGCGAGAGAGTTGTGAAAAAGTGGGCTGAGACTTCTTCTTCTAACGAAGAGCATC
CTAACAAAGACAAACGCTCGCTTAAGGATCTGCTCTTCTTTCTCCATGTTCCTCGAACTG
GAGGCAGAACTTATTTCCACTGTTTCTTGAGGAAGTTGTATGATAACGCGGAGGAATGTC
CTCGTTCTTACGACAAGCTCCATTTCGATCCTAGGAAGCAAAAGTGCAAGTTGTTGGCCA
CTCATGATGATTATAGTTTAATGTCTAAGCTTCCGAGGGAGAGAACTT

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL7508Contig1 673 2 1 U
CCTTTCAATGCTTCTTCTCCTCATCCCTTGTCAGATCATCATGTCCCCTGATCCCTTCTC
CTTCATATCTTCTTCTTCTCCTAATTAATCTTGACTCAGATAATTAATATTATTTTAACC
TCCGATCGAGATCCATTCCTCGTCGGAGAATTCAGATCGACTATAAACCCTTATGGAGAG
TTCTTTAGGTTTCATGGCGGTCTTCGCCGTCTCAGGAAGCGTCGTGTTCCTCGCTAGTCA
ATTCCACAAGCGTCTCCTCTCCGATTACATGGACAAGTTCGAATTCGAAATCCGATCGAG
AGAGAATGTGGTGATGAAGAAGAAGGTGAGATTTGCGGCGGATGTGGTGGAGCCGTCGGG
GAATAACAAAGAGTATCGCCGGAGACACTCTTCCAAGGCTAAATTTGATAAGGAATCCAA
GATGGCGGCAATTGTTTGAAGGTTTTTTTTCTTTTTTTTTTCGAAGGAGTGGTTGTGTAA
TTATTCAATTGGGGTCTGTGGTTTGATTTGATTTGATTTTCGTTATTAATTTTGGGGGAA
AATTCTATCTCAAATCTGATGAATCTGGGGAAAAACCTTTTAGGTCTTCCCATGGTCAAA
TATTTTTCCTATTTTTGTAACTTTTTCTTGGGTTTGTAAATATTTGTTTGTGTAAATACA
AAATGTGATTGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AC04JQ C 1
AF RR2AC04TF U 1
BS 1 673 RR2AC04TF

RD RR2AC04JQ 673 0 0
CCTTTCAATGCTTCTTCTCCTCATCCCTTGTCAGATCATCATGTCCCCTGATCCCTTCTC
CTTCATATCTTCTTCTTCTCCTAATTAATCTTGACTCAGATAATTAATATTATTTTAACC
TCCGATCGAGATCCATTCCTCGTCGGAGAATTCAGATCGACTATAAACCCTTATGGAGAG
TTCTTTAGGTTTCATGGCGGTCTTCGCCGTCTCAGGAAGCGTCGTGTTCCTCGCTAGTCA
ATTCCACAAGCGTCTCCTCTCCGATTACATGGACAAGTTCGAATTCGAAATCCGATCGAG
AGAGAATGTGGTGATGAAGAAGAAGGTGAGATTTGCGGCGGATGTGGTGGAGCCGTCGGG
GAATAACAAAGAGTATCGCCGGAGACACTCTTCCAAGGCTAAATTTGATAAGGAATCCAA
GATGGCGGCAATTGTTTGAAGGTTTTTTTTCTTTTTTTTTTCGAAGGAGTGGTTGTGTAA
TTATTCAATTGGGGTCTGTGGTTTGATTTGATTTGATTTTCGTTATTAATTTTGGGGGAA
AATTCTATCTCAAATCTGATGAATCTGGGGAAAAACCTTTTAGGTCTTCCCATGGTCAAA
TATTTTTCCTATTTTTGTAACTTTTTCTTGGGTTTGTAAATATTTGTTTGTGTAAATACA
AAATGTGATTGCC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2AC04TF 673 0 0
CCTTTCAATGCTTCTTCTCCTCATCCCTTGTCAGATCATCATGTCCCCTGATCCCTTCTC
CTTCATATCTTCTTCTTCTCCTAATTAATCTTGACTCAGATAATTAATATTATTTTAACC
TCCGATCGAGATCCATTCCTCGTCGGAGAATTCAGATCGACTATAAACCCTTATGGAGAG
TTCTTTAGGTTTCATGGCGGTCTTCGCCGTCTCAGGAAGCGTCGTGTTCCTCGCTAGTCA
ATTCCACAAGCGTCTCCTCTCCGATTACATGGACAAGTTCGAATTCGAAATCCGATCGAG
AGAGAATGTGGTGATGAAGAAGAAGGTGAGATTTGCGGCGGATGTGGTGGAGCCGTCGGG
GAATAACAAAGAGTATCGCCGGAGACACTCTTCCAAGGCTAAATTTGATAAGGAATCCAA
GATGGCGGCAATTGTTTGAAGGTTTTTTTTCTTTTTTTTTTCGAAGGAGTGGTTGTGTAA
TTATTCAATTGGGGTCTGTGGTTTGATTTGATTTGATTTTCGTTATTAATTTTGGGGGAA
AATTCTATCTCAAATCTGATGAATCTGGGGAAAAACCTTTTAGGTCTTCCCATGGTCAAA
TATTTTTCCTATTTTTGTAACTTTTTCTTGGGTTTGTAAATATTTGTTTGTGTAAATACA
AAATGTGATTGCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL7509Contig1 673 2 1 U
GAAGCTCAGATGGGAGTGTTGTACTATATGATGGGGAAGTACTTGGAGTCGTACAACACG
TTCAAGCGAGCCGTCTTGAAACTAAGGGCGACGGGGAAGAAACAGTCGACGTTTTTCGGG
ATTGCGCTTAACCAGATGGGTTTAGCTTGCATTCAGCTCGACGCGATAGAAGAGGCTGTT
GAGCTGTTTGAAGAAGCCAAGTGTATTTTGGAACAAGAATGTGGTCCGTACCATCCTGAA
ACACTTGGATTGTACAATAACCTCGCAGGAGCTTATGATGCTATTGGCAGGTTGGATGAT
GCAATTGAGCTGCTAGGACATGTGGTTGGGGCTCGAGAGGAGAAGCTAGGGACGGCGAAT
CCTGGAACAGAAGAGGAGAAGAGAAGGTTGGTTCAACTCTTGAAAGAAGCTGGTAAGGTT
ACAGGAAGGAAAGCTAAATCTCTCCAGACTCTGATTGATTCCGATCTCATGACTTCCTCA
GCTCATCGCTAACACATAATGTGCTGTTGTCACCTTTTCTTCTATGTATAGAAAAAATGT
GCATACGTTATTCTTTGTCATTTGTGATTATTATTGTTTGTGGAAGTTCCTTTGTCTTGC
TTGATGCGGTGTACTTTGGATAACAGTCTCACATATTTGTTTTAATTGTTGAATGAGAAG
AATCATTACCAGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CJ83JQ C 1
AF RR2CJ83TF U 1
BS 1 673 RR2CJ83TF

RD RR2CJ83JQ 673 0 0
GAAGCTCAGATGGGAGTGTTGTACTATATGATGGGGAAGTACTTGGAGTCGTACAACACG
TTCAAGCGAGCCGTCTTGAAACTAAGGGCGACGGGGAAGAAACAGTCGACGTTTTTCGGG
ATTGCGCTTAACCAGATGGGTTTAGCTTGCATTCAGCTCGACGCGATAGAAGAGGCTGTT
GAGCTGTTTGAAGAAGCCAAGTGTATTTTGGAACAAGAATGTGGTCCGTACCATCCTGAA
ACACTTGGATTGTACAATAACCTCGCAGGAGCTTATGATGCTATTGGCAGGTTGGATGAT
GCAATTGAGCTGCTAGGACATGTGGTTGGGGCTCGAGAGGAGAAGCTAGGGACGGCGAAT
CCTGGAACAGAAGAGGAGAAGAGAAGGTTGGTTCAACTCTTGAAAGAAGCTGGTAAGGTT
ACAGGAAGGAAAGCTAAATCTCTCCAGACTCTGATTGATTCCGATCTCATGACTTCCTCA
GCTCATCGCTAACACATAATGTGCTGTTGTCACCTTTTCTTCTATGTATAGAAAAAATGT
GCATACGTTATTCTTTGTCATTTGTGATTATTATTGTTTGTGGAAGTTCCTTTGTCTTGC
TTGATGCGGTGTACTTTGGATAACAGTCTCACATATTTGTTTTAATTGTTGAATGAGAAG
AATCATTACCAGT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2CJ83TF 673 0 0
GAAGCTCAGATGGGAGTGTTGTACTATATGATGGGGAAGTACTTGGAGTCGTACAACACG
TTCAAGCGAGCCGTCTTGAAACTAAGGGCGACGGGGAAGAAACAGTCGACGTTTTTCGGG
ATTGCGCTTAACCAGATGGGTTTAGCTTGCATTCAGCTCGACGCGATAGAAGAGGCTGTT
GAGCTGTTTGAAGAAGCCAAGTGTATTTTGGAACAAGAATGTGGTCCGTACCATCCTGAA
ACACTTGGATTGTACAATAACCTCGCAGGAGCTTATGATGCTATTGGCAGGTTGGATGAT
GCAATTGAGCTGCTAGGACATGTGGTTGGGGCTCGAGAGGAGAAGCTAGGGACGGCGAAT
CCTGGAACAGAAGAGGAGAAGAGAAGGTTGGTTCAACTCTTGAAAGAAGCTGGTAAGGTT
ACAGGAAGGAAAGCTAAATCTCTCCAGACTCTGATTGATTCCGATCTCATGACTTCCTCA
GCTCATCGCTAACACATAATGTGCTGTTGTCACCTTTTCTTCTATGTATAGAAAAAATGT
GCATACGTTATTCTTTGTCATTTGTGATTATTATTGTTTGTGGAAGTTCCTTTGTCTTGC
TTGATGCGGTGTACTTTGGATAACAGTCTCACATATTTGTTTTAATTGTTGAATGAGAAG
AATCATTACCAGT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL7510Contig1 825 2 2 U
TTTTTGAAGTCAAATAATCATATGATTAGAGTGTGGGATAGGATTGGTTATTATTAGGTG
AATTCGAGCTTGAAATTAGCTTTTAGTTTGATTATTCTCCGATGAAACCACCTGTTTTTG
TTTTGTTTTGCATCTAAAAGCTTAAAGATTAGAGCTTAGCAAGACTAAAGTTTCAATTTT
TATTATCAATCATGGTGCTTTGTCTATAGTTTATGCAAAGGTCTGCCTTAAAAGAGGACA
AGAAGAAGAAGATTGATGAGCCTAATGCGAATTTTACTCCTTCCCCCAGTTGTGTTAAAA
AGAAGTGTGTGGTCATAACAGACTGGGATCCTCAGCCAGGAACATTGTTAGGACGCTTGT
CATTTCAGTCTTTCAACCCCTCTATCCAGAAACTGAATGAAGAGGCCATAAGCGGTCAAA
AAAACAGATGCTTCTCCCACAATCTCTACCAGTAATGGAGGCAAGATGTCCTTTAGTGAA
CCCAAGAAGGTCGAGACCAGCGCCGAAACAAATGGTGACTTGAAAAAGGAAACAGTCTGA
GGAACAAAACCATCCAAGCAAGTCCCCACGGAGCAATGACAAACCATCACCAAGCAACAA
ACAAGGCAATGGTTTCAAGAAACCCAAGAGCAGGAAAAGGCTCCCTGGAGCGTATTGAAG
CCACCAAAACCCTCAAACCAAAAAATTAGCTTAACTGCAGTCTGTCTACCTAGTTGAAAT
TTTACTTCACACAGGTTCCATATGTGATTTAGTACTAGATACTTCATTTCACTGTCTGTA
TCATCATCATTCACGTGGTGCAGCAACTCATTTGATATTATTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H565TF U 1
AF RR2H565JQB C 146
BS 1 527 RR2H565TF
BS 528 825 RR2H565JQB

RD RR2H565TF 527 0 0
TTTTTGAAGTCAAATAATCATATGATTAGAGTGTGGGATAGGATTGGTTATTATTAGGTG
AATTCGAGCTTGAAATTAGCTTTTAGTTTGATTATTCTCCGATGAAACCACCTGTTTTTG
TTTTGTTTTGCATCTAAAAGCTTAAAGATTAGAGCTTAGCAAGACTAAAGTTTCAATTTT
TATTATCAATCATGGTGCTTTGTCTATAGTTTATGCAAAGGTCTGCCTTAAAAGAGGACA
AGAAGAAGAAGATTGATGAGCCTAATGCGAATTTTACTCCTTCCCCCAGTTGTGTTAAAA
AGAAGTGTGTGGTCATAACAGACTGGGATCCTCAGCCAGGAACATTGTTAGGACGCTTGT
CATTTCAGTCTTTCAACCCCTCTATCCAGAAACTGAATGAAGAGGCCATAAGCGGTCAAA
AAAACAGATGCTTCTCCCACAATCTCTACCAGTAATGGAGGCAAGATGTCCTTTAGTGAA
CCCAAGAAGGTCGAGACCAGCGCCGAAACAAATGGTGACTTGAAAAA

QA 1 527 1 527
DS 

RD RR2H565JQB 680 0 0
AGATTAGAGCTTAGCAAGACTAAAGTTTCAATTTTTATTATCAATCATGGTGCTTTGTCT
ATAGTTTATGCAAAGGTCTGCCTTAAAAGAGGACAAGAAGAAGAAGATTGATGAGCCTAA
TGCGAATTTTACTCCTTCCCCCAGTTGTGTTAAAAAGAAGTGTGTGGTCATAACAGACTG
GGATCCTCAGCCAGGAACATTGTTAGGACGCTTGTCATTTCAGTCTTTCAACCCCTCTAT
CCAGAAACTGAATGAAGAGGCCATAAGCGGTCAAAAAAACAGATGCTTCTCCCACAATCT
CTACCAGTAATGGAGGCAAGATGTCCTTTAGTGAACCCAAGAAGGTCGAGACCAGCGCCG
AAACAAATGGTGACTTGAAAAAGGAAACAGTCTGAGGAACAAAACCATCCAAGCAAGTCC
CCACGGAGCAATGACAAACCATCACCAAGCAACAAACAAGGCAATGGTTTCAAGAAACCC
AAGAGCAGGAAAAGGCTCCCTGGAGCGTATTGAAGCCACCAAAACCCTCAAACCAAAAAA
TTAGCTTAACTGCAGTCTGTCTACCTAGTTGAAATTTTACTTCACACAGGTTCCATATGT
GATTTAGTACTAGATACTTCATTTCACTGTCTGTATCATCATCATTCACGTGGTGCAGCA
ACTCATTTGATATTATTTAC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL7511Contig1 743 2 5 U
GGAATCAACTATATTTTCTTTGGCATTAGGAGAGAGAGAAAATGGGAGATGTGGTTTGTG
GCGCACAAAAACCACACGTAGTTTGCATCCCTTACCCAGCTCAAGGCCACATCAACCCGA
TGCTGAAAGTGGCTAAACTCCTCCACGCAAAAGGCTTTCACGTCACCTTCGTCAACACCA
TCTACAACCACAAGCGCATACTCCGTTCCCGTGGTCCCAACGCCCTGGACGGACTTCCTT
CCTTTCAGTTTGAAGCCATACCTGATGGTCTACCGGAGACTGAGGTTGATGCCACGCAAG
ACATCCCTTCCCTTTCCGAGTCCACCATGAAGAACTGTCTAACTCCTTTCAAGGAACTTC
TCCGGCAGATCAACGCCAGAGATGATGTTCCTTCGCTCAGTTGTATTGTATCGGACGGTG
CCATGAGCTTTACACTTGACGCTGCCGAGGAGCTCGGTGTCCCGGAGGTTCTTTTCTGGA
CCCCGAGTGTACCTGGCGTCATGGGTTATTTACACTTTTATCCCTTCATCGAGAAAGGTT
TATCTCCTTTTAAAGATGAGAGTTGTTTGACAAAGAAACACTTGGACACACCAATAGATC
GGATACCACCGATGAAGAATCTGAAACTAAAAGACATCCCCACCTTCGTCCGTACCACTA
ACCCCAACGACATAATGCTCAACTTCCTTGTCCGCGAGACAGACCGATCCAAACGCGCCT
CTGCCATCATTCTCAACACGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EL10TF U 1
AF RR2GX02TF U 5
BS 1 288 RR2EL10TF
BS 289 289 RR2GX02TF
BS 290 608 RR2EL10TF
BS 609 609 RR2GX02TF
BS 610 743 RR2EL10TF

RD RR2EL10TF 743 0 0
GGAATCAACTATATTTTCTTTGGCATTAGGAGAGAGAGAAAATGGGAGATGTGGTTTGTG
GCGCACAAAAACCACACGTAGTTTGCATCCCTTACCCAGCTCAAGGCCACATCAACCCGA
TGCTGAAAGTGGCTAAACTCCTCCACGCAAAAGGCTTTCACGTCACCTTCGTCAACACCA
TCTACAACCACAAGCGCATACTCCGTTCCCGTGGTCCCAACGCCCTGGACGGACTTCCTT
CCTTTCAGTTTGAAGCCATACCTGATGGTCTACCGGAGACTGAGGTTGGTGCCACGCAAG
ACATCCCTTCCCTTTCCGAGTCCACCATGAAGAACTGTCTAACTCCTTTCAAGGAACTTC
TCCGGCAGATCAACGCCAGAGATGATGTTCCTTCGCTCAGTTGTATTGTATCGGACGGTG
CCATGAGCTTTACACTTGACGCTGCCGAGGAGCTCGGTGTCCCGGAGGTTCTTTTCTGGA
CCCCGAGTGTACCTGGCGTCATGGGTTATTTACACTTTTATCCCTTCATCGAGAAAGGTT
TATCTCCTTTTAAAGATGAGAGTTGTTTGACAAAGAAACACTTGGACACACCAATAGATC
GGATACCATCGATGAAGAATCTGAAACTAAAAGACATCCCCACCTTCGTCCGTACCACTA
ACCCCAACGACATAATGCTCAACTTCCTTGTCCGCGAGACAGACCGATCCAAACGCGCCT
CTGCCATCATTCTCAACACGTTC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RR2GX02TF 729 0 0
GG
AACTATATTTTCTTTGGCATTAGGAGAGAGAGAAAATGGGAGATGTGGTTTGTGGCGCAC
AAAAACCACACGTAGTTTGCATCCCTTACCCAGCTCAAGGCCACATCAACCCGATGCTGA
AAGTGGCTAAACTCCTCCACGCAAAAGGCTTTCACGTCACCTTCGTCAACACCATCTACA
ACCACAAGCGCATACTCCGTTCCCGTGGTCCCAACGCCCTGGACGGACTTCCTTCCTTTC
AGTTTGAAGCCATACCTGATGGTCTACCGGAGACTGAGGTTGATGCCACGCAAGACATCC
CTTCCCTTTCCGAGTCCACCATGAAGAACTGTCTAACTCCTTTCAAGGAACTTCTCCGGC
AGATCAACGCCAGAGATGATGTTCCTTCGCTCAGTTGTATTGTATCGGACGGTGCCATGA
GCTTTACACTTGACGCTGCCGAGGAGCTCGGTGTCCCGGAGGTTCTTTTCTGGACCCCGA
GTGTACCTGGCGTCATGGGTTATTTACACTTTTATCTCTTCATCGAGAAAGGTTTATCTC
CTTTTAAAGATGAGAGTTGTTTGACAAAGAAACACTTGGACACACCAATAGATTGGATAC
CACCGATGAAGAATCTGAAACTAAAAGACATCCCCACCTTCGTCCGTACCACTAACCCCA
ACGACATAATTCTCAACTTCCTTGTCCGCGAGACAGACCGATCCAAACTCGCCTCTGCCA
TCATTCT

QA 3 729 3 729
DS 



AS 1 2

CO CL7512Contig1 1083 2 14 U
GATCGTCTGCGCTCTAAGATGCAAAGAGGCAGCAGAACTGTTACTACTATGAAAGGTCCA
GGTGCATCCTTTGTCTCAAGCGACTCTCATGTGAGACTGAGGATCAAGTCATTCAGGGTG
CCTGAGCTTTTCGTAGAGATTCCAGAAACCGCCACTGTTGGCTCCTTGAAGAGAATGGTG
ATGGAAGCAGTGAGCACTTTATTGAGTGATGGACACCGAGTTGGTCTGATGGTTCAAGTG
AAGAAAGTCAGAGATGATAACAAAACACTTCATCAGACTGGGATCTCTCAGGATAACACC
CACTTGGACTCTCTTGATTTCAGCCTTGAACCCAGCTCAGAAGCGCCTCATCTGTTATCT
AGTAACCCGTTGGGACATGTGTGCGAGGAACTGCCTATATGCCATGCTTCTGACATGGAC
ACCGTGTTCAAATCTGAGCATGATTTAGCACTGTTTGACAAGGAAACCGCAACAGATGTT
TCTAAAGCTCTGGTCCCTACTGCTGCGCTCACCGAACTGTCTCCTCAACCGCCTCGTCAT
AAATCTAAACAGCAACAGCAGCATCAGACTGCACAGCGAAGAATGCGCCGACCTTTCTCT
GTTACTGAAGTAGAAGCACTTGTTCAAGCTGTTGAGAAACTCGGTACTGGAAGGTGGAGA
GATGTTAAGCATAGTGCTTTCGAAGATGCAGACCACCGCACTTACGTTGATCTCAAGGAC
AAGTGGAAAACGCTGGTCCATACAGCTAAGATATCGCCACAGCAGAGGAGAGGAGAGCCA
GTTCCGCAGGAACTTCTAAACCGTGTGTTGAACGCTCACGGCTACTGGTCACAGCAACAC
ATGGAGACATCACTGGCTCTGCCTAAACCAGAGTCTGTGCTGCTTCTCTAATCAAAATGT
GCTTTGCAGATCCTCTCTCTCTCTCTATATCTCTCCCCTTTGTGTATTGTTGTAAGATTC
TGACGGACATAGATGCACAAATTTAGTCTCTGACTTGTCTCTTTGGTTTTTATTTCTTTC
TTTTTAACTTTCTCAATGTAAAGTTTTAATTGGAATAAGGTGGATGTTCCTGACCAATTT
AGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2E166TF U 1
AF RR2E166JQ C 399
BS 1 653 RR2E166TF
BS 654 654 RR2E166JQ
BS 655 693 RR2E166TF
BS 694 694 RR2E166JQ
BS 695 717 RR2E166TF
BS 718 718 RR2E166JQ
BS 719 729 RR2E166TF
BS 730 730 RR2E166JQ
BS 731 738 RR2E166TF
BS 739 739 RR2E166JQ
BS 740 748 RR2E166TF
BS 749 749 RR2E166JQ
BS 750 767 RR2E166TF
BS 768 1083 RR2E166JQ

RD RR2E166TF 774 0 0
GATCGTCTGCGCTCTAAGATGCAAAGAGGCAGCAGAACTGTTACTACTATGAAAGGTCCA
GGTGCATCCTTTGTCTCAAGCGACTCTCATGTGAGACTGAGGATCAAGTCATTCAGGGTG
CCTGAGCTTTTCGTAGAGATTCCAGAAACCGCCACTGTTGGCTCCTTGAAGAGAATGGTG
ATGGAAGCAGTGAGCACTTTATTGAGTGATGGACACCGAGTTGGTCTGATGGTTCAAGTG
AAGAAAGTCAGAGATGATAACAAAACACTTCATCAGACTGGGATCTCTCAGGATAACACC
CACTTGGACTCTCTTGATTTCAGCCTTGAACCCAGCTCAGAAGCGCCTCATCTGTTATCT
AGTAACCCGTTGGGACATGTGTGCGAGGAACTGCCTATATGCCATGCTTCTGACATGGAC
ACCGTGTTCAAATCTGAGCATGATTTAGCACTGTTTGACAAGGAAACCGCAACAGATGTT
TCTAAAGCTCTGGTCCCTACTGCTGCGCTCACCGAACTGTCTCCTCAACCGCCTCGTCAT
AAATCTAAACAGCAACAGCAGCATCAGACTGCACAGCGAAGAATGCGCCGACCTTTCTCT
GTTACTGAAGTAGAAGCACTTGTTCAAGCTGTTGAGAAACTCGGTACTGGAAG*TGGAGA
GATGTTAAGCATAGTGCTTTCGAAGATGCAGAC*ACCGCACTTACGTTGATCTCAAG*AC
AAGTGGAAA*CGCTGGTC*ATACAGCTA*GATATCGCCACAGCAGAG
AGAGGAG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2E166JQ 685 0 0
ATGCCATGCTTCTGACATGGACACCGTGTTCAAATCTGAGCATGATTTAGCACTGTTTGA
CAAGGAAACCGCAACAGATGTTTCTAAAGCTCTGGTCCCTACTGCTGCGCTCACCGAACT
GTCTCCTCAACCGCCTCGTCATAAATCTAAACAGCAACAGCAGCATCAGACTGCACAGCG
AAGAATGCGCCGACCTTTCTCTGTTACTGAAGTAGAAGCACTTGTTCAAGCTGTTGAGAA
ACTCGGTACTGGAAGGTGGAGAGATGTTAAGCATAGTGCTTTCGAAGATGCAGACCACCG
CACTTACGTTGATCTCAAGGACAAGTGGAAAACGCTGGTCCATACAGCTAAGATATCGCC
ACAGCAGAGGAGAGGAGAGCCAGTTCCGCAGGAACTTCTAAACCGTGTGTTGAACGCTCA
CGGCTACTGGTCACAGCAACACATGGAGACATCACTGGCTCTGCCTAAACCAGAGTCTGT
GCTGCTTCTCTAATCAAAATGTGCTTTGCAGATCCTCTCTCTCTCTCTATATCTCTCCCC
TTTGTGTATTGTTGTAAGATTCTGACGGACATAGATGCACAAATTTAGTCTCTGACTTGT
CTCTTTGGTTTTTATTTCTTTCTTTTTAACTTTCTCAATGTAAAGTTTTAATTGGAATAA
GGTGGATGTTCCTGACCAATTTAGG

QA 1 685 1 685
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7514Contig1 841 2 6 U
GGCTGTATATAGATTCAAAGCACGTCCATTTAACCGAAAGATATTTGATGCTCCCTCATT
ACCCATCCGTAAAAAGAGCACTCCGAAACCAACTGAATTCCAAGAATTTCATTTGAAGAC
TTCAGAAAGGGCTATGCAACATTCTTCAGCAGTAACAACAAGGTCTAATCAGGGAAATCA
TGCATATAAGGGGTCCGAAAAATCTAATATAACTGATGCACTTGACGGTATTAACAGGGA
AAGTAGGAGACCAAGCGCTATGGATATATCTAAGCATGATGCCTCAGAAGGAAACCACGT
TTTTAAAGCTCGTCCTCTGAACAAGAAGATACTTTCAAGCAGAGGAGACATGGGCGTTTT
CAAAAATAGCAAGCGAGAAACAACAGTTCCTTTGGAGTTTAGTTTTAATACAGAAAAGAG
AGTTCAACCAGATTTACCAACAGACCTTTTCAGCAAACTTTCCATCAAGCAAAACAGTGG
ATCTCACACAAGATTTCCACAAGAAAAGGGGTTCAAGGAAAATAGAGTGCACTCTTTCCA
AGCAGGGAATGATGTAACAAGACTGGCAACTGGAAAAACGGTTTCTTCAGCTGGACAACA
GATACAATCTGGTCATAGCGAAACAAACCAGCGATGGACGCCTAGTAGGAGCTTGGGCAT
TCGCTGATGGTATAGAAACAGCTTTTGTAGCATATGGAATCATCATCAACAACTCCATCT
TACAGTTAGTAGCATAAGAAAAAAAAAGATGTAAGAAACAGAATGTTTTGACCAAAAAAA
AAGAAACAGAATGTAAATCAGAAAATACTCTCAAGCTCTTAATACAACCTGTGGTTCATA
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BS75TF U 1
AF RR2BS75JQ C 184
BS 1 647 RR2BS75TF
BS 648 648 RR2BS75JQ
BS 649 746 RR2BS75TF
BS 747 747 RR2BS75JQ
BS 748 772 RR2BS75TF
BS 773 841 RR2BS75JQ

RD RR2BS75TF 772 0 0
GGCTGTATATAGATTCAAAGCACGTCCATTTAACCGAAAGATATTTGATGCTCCCTCATT
ACCCATCCGTAAAAAGAGCACTCCGAAACCAACTGAATTCCAAGAATTTCATTTGAAGAC
TTCAGAAAGGGCTATGCAACATTCTTCAGCAGTAACAACAAGGTCTAATCAGGGAAATCA
TGCATATAAGGGGTCCGAAAAATCTAATATAACTGATGCACTTGACGGTATTAACAGGGA
AAGTAGGAGACCAAGCGCTATGGATATATCTAAGCATGATGCCTCAGAAGGAAACCACGT
TTTTAAAGCTCGTCCTCTGAACAAGAAGATACTTTCAAGCAGAGGAGACATGGGCGTTTT
CAAAAATAGCAAGCGAGAAACAACAGTTCCTTTGGAGTTTAGTTTTAATACAGAAAAGAG
AGTTCAACCAGATTTACCAACAGACCTTTTCAGCAAACTTTCCATCAAGCAAAACAGTGG
ATCTCACACAAGATTTCCACAAGAAAAGGGGTTCAAGGAAAATAGAGTGCACTCTTTCCA
AGCAGGGAATGATGTAACAAGACTGGCAACTGGAAAAACGGTTTCTTCAGCTGGACAACA
GATACAATCTGGTCATAGCGAAACAAACCAGCGATGGACGCCTAGTATGAGCTTGGGCAT
TCGCTGATGGTATAGAAACAGCTTTTGTAGCATATGGAATCATCATCAACAACTCCATCT
TACAGTTAGTAGCATAAGAAAAAAAA*GATGTAAGAAACAGAATGTTTTGAC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2BS75JQ 658 0 0
ATATAAGGGGTCCGAAAAATCTAATATAACTGATGCACTTGACGGTATTAACAGGGAAAG
TAGGAGACCAAGCGCTATGGATATATCTAAGCATGATGCCTCAGAAGGAAACCACGTTTT
TAAAGCTCGTCCTCTGAACAAGAAGATACTTTCAAGCAGAGGAGACATGGGCGTTTTCAA
AAATAGCAAGCGAGAAACAACAGTTCCTTTGGAGTTTAGTTTTAATACAGAAAAGAGAGT
TCAACCAGATTTACCAACAGACCTTTTCAGCAAACTTTCCATCAAGCAAAACAGTGGATT
TCACACAAGATTTCCACAAGAAAAGGGGTTCAAGGAAAATAGAGTGCACTCTTTCCAAGC
AGGGAATGATGTAACAAGACTGGCAACTGGAAAAACGGTTTTTTCAGCTGGACAACAGAT
ACAATCTGGTCATAGCGAAACAAACCAGCGATGGACGCCTAGTAGGAGCTTGGGCATTCG
CTGATGGTATAGAAACAGCTTTTGTAGCATATGGAATCATCATCAACAACTCCATTTTAC
AGTTAGTAGCATAAGAAAAAAAAAGATGTAAGAAACAGAATGTTTTGACCAAAAAAAAAG
AAACAGAATGTAAATCAGAAAATACTCTCAAGCTCTTAATACAACCTGTGGTTCATAT

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL7515Contig1 704 2 5 U
GGAAGATAACTTTAAGGTTAAAGCAATGAAAGCAATGGGAGCAATGGAGGAAGGTGATGC
TGTGTTTGGCTCTAATGCTGAAGTGAACCTTGATTCTGAGGTATACTGGTGGCATGACAA
GTACCGGCCAAGAAAACCGAAGTATTTCAACAGAGTTCACACGGGTTACGAGTGGAACAA
GTATAACCAAACGCACTATGATCACGACAACCCGCCTCCAAAGATCGTTCAAGGGTACAA
GTTTAACATCTTTTACCCGGATTTGGTGGATAAGATCAAGGCTCCCACTTACACTATAGA
AAAAGATGGGACAAGCGCTGAAACTTGTATGATCCGGTTCCATGCTGGTCCTCCTTATGA
AGACATTGCGTTCCGTATTGTGAATAAAGAATGGGAGTATTCTCACAAGAAGGGGTTCAA
ATGCACGTTTGAGCGTGGGATTCCGCACTTGTACATCAACTTTAAACGACATCGTTACAG
GCGATAAACTCATCAGAGTTTGGCCGGAGACTACTACGAAGTTGGCAGTTGTAATACTTT
GGCAGGTGTTTTGTTTGTAACAAAAGGGCGATACATAGTATTATGTTGGACTGTTTTTCA
TTAAATTTATTATCAAACATAACAGAGTAGACATCAGTTTTGCCAATGTGACGAGTTCAA
AAACTTAAATGCTTGCTAACAAAATGTGATGTTGATTATTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EQ74JQ C 1
AF RR2ET62TF U 158
BS 1 158 RR2EQ74JQ
BS 159 526 RR2ET62TF
BS 527 527 RR2EQ74JQ
BS 528 663 RR2ET62TF
BS 664 704 RR2EQ74JQ

RD RR2EQ74JQ 704 0 0
GGAAGATAACTTTAAGGTTAAAGCAATGAAAGCAATGGGAGCAATGGAGGAAGGTGATGC
TGTGTTTGGCTCTAATGCTGAAGTGAACCTTGATTCTGAGGTATACTGGTGGCATGACAA
GTACCGGCCAAGAAAACCGAAGTATTTCAACAGAGTTCACACGGGTTACGAGTGGAACAA
GTATAACCAAACGCACTATGATCACGACAACCCGCCTCCAAAGATCGTTCAAGGGTACAA
GTTTAACATCTTTTACCCGGATTTGGTGGATAAGATCAAGGCTCCCACTTACACTATAGA
AAAAGATGGGACAAGCGCTGAAACTTGTATGATCCGGTTCCATGCTGGTCCTCCTTATGA
AGACATTGCGTTCCGTATTGTGAATAAAGAATGGGAGTATTCTCACAAGAAGGGGTTCAA
ATGCACGTTTGAGCGTGGGATTCTGCACTTGTACATCAACTTTAAACGACATCGTTACAG
GCGATAAACTCATCAGAGTTTGGCCGGAGACTACTACGAAGTTGGCAGTTGTAATACTTT
GGCAGGTGTTTTGTTTGTAACAAAAGGGCGATACATAGTATTATGTTGGACTGTTTTTCA
TTT**TTTATTATCAAACATAACAGAGTAGACATCAGTTTTGCCAATGTGACGAGTTCAA
AAACTTAAATGCTTGCTAACAAAATGTGATGTTGATTATTTGCT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2ET62TF 506 0 0
G
ACACGGGTTACGAGTGGAACAAGTATAACCAAACGCACTATGATCACGACAACCCGCCTC
CAAAGATCGTTCAAGGGTACAAGTTTAACATCTTTTACCCGGATTTGGTGGATAAGATCA
AGGCTCCCACTTACACTATAGAAAAAGATGGGACAAGCGCTGAAACTTGTATGATCCGGT
TCCATGCTGGTCCTCCTTATGAAGACATTGCGTTCCGTATTGTGAATAAAGAATGGGAGT
ATTCTCACAAGAAGGGGTTCAAATGCACGTTTGAGCGTGGGATTCCGCACTTGTACATCA
ACTTTAAACGACATCGTTACAGGCGATAAACTCATCAGAGTTTGGCCGGAGACTACTACG
AAGTTGGCGGTTGTAATACTTTGGCAGGTGTTTTGTTTGTAACAAAAGGGCGATACATAG
TATTATGTTGGACTGTTTTTCATTAAATTTATTATCAAACATAACAGAGTAGACATCAGT
TTTGCCAATGTGACGAGTTCAAAAA

QA 2 506 2 506
DS 



AS 1 2

CO CL7516Contig1 676 2 2 U
GGAAGCAAGAATCAAAGCAGAAGCGATCAGAGATCGAAAGCAATTCCTTCCTCTCAGGTT
TGTTAGAACATGTCTCGAAGATATGACAGCCGCACCACAATCTTCTCCCCAGAAGGCCGT
CTCTACCAAGTCGAGTACGCAATGGAGGCCATAGGCAACGCCGGTTCCGCCATCGGCATC
TTATCCAAAGACGGCGTCGTATTGATCGGCGAGAAGAAAGTCACCTCCAAGCTCCTCCAA
ACCTCAACCTCCTCAGTCTATTCTGAAGCAGGACTACAAGGATGATGCGACTAGAGAAGA
GGCGGTTGAGCTTGCCTTGAAGGTTTTGAGCAAGACGATGGACAGCACTAGCTTGACGTC
TGAGAAGCTTGAGCTTGCTGAGGTGTTTCTGACTCCTTCGGGGAGTGTTAAGTACCATGT
TCACTCTCCTGACTCGCTTACTAAGCTGTTGGTGAAGCATGGTGTGACTCAACCCGCTGC
TGAATCGTCCTGAGCGCAACACTATTGCTGAGAGTCTTGATATCTGCTTGGTGATGTGTC
TCCTTTATCTATCTTGTTAGTTTCTCTGTTTTACATTTAGACTATGGCGATGAAACTTGA
ATTTCTGAATGTTATGAGAATTTTATTTGAAGGTATTTGGGTTGGATTCTATCATTAATG
TACAAATATCAGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY95TF U 1
AF RR2EY95JQ C 90
BS 1 656 RR2EY95TF
BS 657 676 RR2EY95JQ

RD RR2EY95TF 656 0 0
GGAAGCAAGAATCAAAGCAGAAGCGATCAGAGATCGAAAGCAATTCCTTCCTCTCAGGTT
TGTTAGAACATGTCTCGAAGATATGACAGCCGCACCACAATCTTCTCCCCAGAAGGCCGT
CTCTACCAAGTCGAGTACGCAATGGAGGCCATAGGCAACGCCGGTTCCGCCATCGGCATC
TTATCCAAAGACGGCGTCGTATTGATCGGCGAGAAGAAAGTCACCTCCAAGCTCCTCCAA
ACCTCAACCTCCTCAGTCTATTCTGAAGCAGGACTACAAGGATGATGCGACTAGAGAAGA
GGCGGTTGAGCTTGCCTTGAAGGTTTTGAGCAAGACGATGGACAGCACTAGCTTGACGTC
TGAGAAGCTTGAGCTTGCTGAGGTGTTTCTGACTCCTTCGGGGAGTGTTAAGTACCATGT
TCACTCTCCTGACTCGCTTACTAAGCTGTTGGTGAAGCATGGTGTGACTCAACCCGCTGC
TGAATCGTCCTGAGCGCAACACTATTGCTGAGAGTCTTGATATCTGCTTGGTGATGTGTC
TCCTTTATCTATCTTGTTAGTTTCTCTGTTTTACATTTAGACTATGGCGATGAAACTTGA
ATTTCTGAATGTTATGAGAATTTTATTTGAAGGTATTTGGGTTGGATTCTATCATT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2EY95JQ 587 0 0
CCGCACCACAATCTTCTCCCCAGAAGGCCGTCTCTACCAAGTCGAGTACGCAATGGAGGC
CATAGGCAACGCCGGTTCCGCCATCGGCATCTTATCCAAAGACGGCGTCGTATTGATCGG
CGAGAAGAAAGTCACCTCCAAGCTCCTCCAAACCTCAACCTCCTCAGTCTATTCTGAAGC
AGGACTACAAGGATGATGCGACTAGAGAAGAGGCGGTTGAGCTTGCCTTGAAGGTTTTGA
GCAAGACGATGGACAGCACTAGCTTGACGTCTGAGAAGCTTGAGCTTGCTGAGGTGTTTC
TGACTCCTTCGGGGAGTGTTAAGTACCATGTTCACTCTCCTGACTCGCTTACTAAGCTGT
TGGTGAAGCATGGTGTGACTCAACCCGCTGCTGAATCGTCCTGAGCGCAACACTATTGCT
GAGAGTCTTGATATCTGCTTGGTGATGTGTCTCCTTTATCTATCTTGTTAGTTTCTCTGT
TTTACATTTAGACTATGGCGATGAAACTTGAATTTCTGAATGTTATGAGAATTTTATTTG
AAGGTATTTGGGTTGGATTCTATCATTAATGTACAAATATCAGCTAC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL7517Contig1 656 2 1 U
GATACCAAAGAACACAGAGGTGTTAAAGGGTTTGATGGTGCGCATCCCATCGATGCAAAC
TCGATACTGGTCGAGGATTGTGATATCCTCATCCCTGCAGCACTTGGTGGTGTCATCAAC
AGGGAGAATGCTAATGAGATTAAAGCAAAGTTTATCATTGAAGCTGCTAACCATCCAACT
TATCCTGATGCTGATGAGATCTTGAGTAAGAAAGGTGTGGTCATTCTCCCAGACATATAT
GCAAACTCTGGAGGAGTCACTGTCAGCTACTTCGAATGGGTTCAGAACATACAAGGGTTT
ATGTGGGAGGAAGAGAAGGTGAACAATGAGCTGAAGACATACATGAACCGTGGATTCAAA
GATATGAAAGAGATGTGCAAAACTCACTCGTGTGATCTTAGGATGGGAGCTTTCACGCTC
GGTGTTAACCGTGTGGCTCGTGCTACCGTTCTCAGAGGCCGGGGAGCTTAAAGTGATCTC
TTTGAAACTCCTTAAATAAAACGAGCATATCTCTAATCCTTTGTCTTTTTTTTAATCATC
TACTTTTGGGTTAGAGATGCTCATGGGTTTAACATATCTGAGTTTATAACCAGATTGATG
CTTGTGTGTAATAAAACCATGGAATCTGATAATTGCTCAACATTTTAATTACTTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CE61JQ C 1
AF RR2CE61TF U 1
BS 1 656 RR2CE61TF

RD RR2CE61JQ 656 0 0
GATACCAAAGAACACAGAGGTGTTAAAGGGTTTGATGGTGCGCATCCCATCGATGCAAAC
TCGATACTGGTCGAGGATTGTGATATCCTCATCCCTGCAGCACTTGGTGGTGTCATCAAC
AGGGAGAATGCTAATGAGATTAAAGCAAAGTTTATCATTGAAGCTGCTAACCATCCAACT
TATCCTGATGCTGATGAGATCTTGAGTAAGAAAGGTGTGGTCATTCTCCCAGACATATAT
GCAAACTCTGGAGGAGTCACTGTCAGCTACTTCGAATGGGTTCAGAACATACAAGGGTTT
ATGTGGGAGGAAGAGAAGGTGAACAATGAGCTGAAGACATACATGAACCGTGGATTCAAA
GATATGAAAGAGATGTGCAAAACTCACTCGTGTGATCTTAGGATGGGAGCTTTCACGCTC
GGTGTTAACCGTGTGGCTCGTGCTACCGTTCTCAGAGGCCGGGGAGCTTAAAGTGATCTC
TTTGAAACTCCTTAAATAAAACGAGCATATCTCTAATCCTTTGTCTTTTTTTTAATCATC
TACTTTTGGGTTAGAGATGCTCATGGGTTTAACATATCTGAGTTTATAACCAGATTGATG
CTTGTGTGTAATAAAACCATGGAATCTGATAATTGCTCAACATTTTAATTACTTAT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RR2CE61TF 656 0 0
GATACCAAAGAACACAGAGGTGTTAAAGGGTTTGATGGTGCGCATCCCATCGATGCAAAC
TCGATACTGGTCGAGGATTGTGATATCCTCATCCCTGCAGCACTTGGTGGTGTCATCAAC
AGGGAGAATGCTAATGAGATTAAAGCAAAGTTTATCATTGAAGCTGCTAACCATCCAACT
TATCCTGATGCTGATGAGATCTTGAGTAAGAAAGGTGTGGTCATTCTCCCAGACATATAT
GCAAACTCTGGAGGAGTCACTGTCAGCTACTTCGAATGGGTTCAGAACATACAAGGGTTT
ATGTGGGAGGAAGAGAAGGTGAACAATGAGCTGAAGACATACATGAACCGTGGATTCAAA
GATATGAAAGAGATGTGCAAAACTCACTCGTGTGATCTTAGGATGGGAGCTTTCACGCTC
GGTGTTAACCGTGTGGCTCGTGCTACCGTTCTCAGAGGCCGGGGAGCTTAAAGTGATCTC
TTTGAAACTCCTTAAATAAAACGAGCATATCTCTAATCCTTTGTCTTTTTTTTAATCATC
TACTTTTGGGTTAGAGATGCTCATGGGTTTAACATATCTGAGTTTATAACCAGATTGATG
CTTGTGTGTAATAAAACCATGGAATCTGATAATTGCTCAACATTTTAATTACTTAT

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL7518Contig1 851 2 8 U
GGGTGTGGAGACTCTTCTCTTGATTTCTCAATTGGTTTTCCTCTGCCATCGATTTGTTCA
TACAGTAACGCCTAGACTCTAAACTAACTTTCTTACCAAGACAGAGGAGAAATGAAGCCA
GGAGGAGCATTTGCATTGAATCCGAATGCAGCATCATACGTACCACTCTCCAACAGAGTG
GACCATGCTGATCTGGAAGGTTTCGTGTTTGCCAACCCCACCACACAAGAGATAAGTTTC
GCAGGCGTTCGAGTGTCCATGCCGCCTGAGAAATCATCTGAGATGGCGTACAAGCATATA
AGGGACGATGATTTGGATTTGGAAATGGATATAGACATGGATATTGAGTACCTTCTGGTC
ACATTCTCTGGTCTCTCGCAAGAGTCTATCACTGATGTGTACTTGGCGAATAGCGGTGAC
CTTGAAGCAACCATTGAGATGCTGACTCAGCTTGAGATATACAGCGATGAAACTCAAGAA
AACCTCCCAGAGACGCTGGATATCTGTGAATCAGGGCCTTCAACCTCAAAGGCTTCAACA
CAAAAGAAGCCAGCTACTGAAGTCATTGCATCATCTGTTATCCCCAATGCAACTGTATCT
GCCTGATCTGATGAATCATTGGTTGTGAAGTTTTACTTTAATTTGTTTATGTTTTCACAC
CTATAATAAATACAGTAATGAGGGTGTTGTATCAATGAAGTTTGATGGTAATCTTAGGGG
AAATGATGGGACAAAAATGTATAGTTTTTGGGAGTGCAAATTTGAGTTGTTTGGCAGATT
AGTCTGGTCTTTTGACCCCTTTTATTTGCCACTCCATTTGTAATGAATGATATTGATATT
TTTTTTTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G215TF U 1
AF RR2G215JQ C 58
BS 1 710 RR2G215TF
BS 711 711 RR2G215JQ
BS 712 719 RR2G215TF
BS 720 720 RR2G215JQ
BS 721 736 RR2G215TF
BS 737 737 RR2G215JQ
BS 738 748 RR2G215TF
BS 749 851 RR2G215JQ

RD RR2G215TF 750 0 0
GGGTGTGGAGACTCTTCTCTTGATTTCTCAATTGGTTTTCCTCTGCCATCGATTTGTTCA
TACAGTAACGCCTAGACTCTAAACTAACTTTCTTACCAAGACAGAGGAGAAATGAAGCCA
GGAGGAGCATTTGCATTGAATCCGAATGCAGCATCATACGTACCACTCTCCAACAGAGTG
GACCATGCTGATCTGGAAGGTTTCGTGTTTGCCAACCCCACCACACAAGAGATAAGTTTC
GCAGGCGTTCGAGTGTCCATGCCGCCTGAGAAATCATCTGAGATGGCGTACAAGCATATA
AGGGACGATGATTTGGATTTGGAAATGGATATAGACATGGATATTGAGTACCTTCTGGTC
ACATTCTCTGGTCTCTCGCAAGAGTCTATCACTGATGTGTACTTGGCGAATAGCGGTGAC
CTTGAAGCAACCATTGAGATGCTGACTCAGCTTGAGATATACAGCGATGAAACTCAAGAA
AACCTCCCAGAGACGCTGGATATCTGTGAATCAGGGCCTTCAACCTCAAAGGCTTCAACA
CAAAAGAAGCCAGCTACTGAAGTCATTGCATCATCTGTTATCCCCAATGCAACTGTATCT
GCCTGATCTGATGAATCATTGGTTGTGAAGTTTTACTTTAATTTGTTTATGTTTTCACAC
CTATAATAAATACAGTAATGAGGGTGTTGTATCAATGAAGTTTGATGGTA*TCTTAGGG*
AAATGATGGGACAAAA*TGTATAGTTTT
GG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2G215JQ 794 0 0
TCATACAGTAACGCCTAGACTCTAAACTA*CTTTCTTACCAAGACAGAGGAGAAATGAAG
CCAGGAGGAGCATTTGCATTGAATCCGAATGCAGCATCATACGTACCACTCTCCAACAGA
GTGGACCATGCTGATCTGGAAGGTTTCGTGTTTGCCAACCCCACCACACAAGAGATAAGT
TTCGCAGGCGTTCGAGTGTCCATGCCGCCTGAGAAATCATCTGAGATGGCGTACAAGCAT
ATAAGGGACGATGATTTGGATTTGGAAATGGATATAGACATGGATATTGAGTACCTTCTG
GTCACATTCTCTGGTCTCTCGCAAGAGTCTATCACTGATGTGTACTTGGCGAATAGCGGT
GACCTTGAAGCAACCATTGAGATGCTGACTCAGCTTGAGATATACAGCGATGAAACTCAA
GAAAACCTCCCAGAGACGCTGGATATCTGTGAATCAGGGCCTTCAACCTCAAAGGCTTCA
ACACAAAAGAAGCCAGCTACTGAAGTCATTGCATCATCTGTTATCCCCAATGCAACTGTA
TCTGCCTGATCTGATGAATCATTGGTTGTGAAGTTTTACTTTAATTTGTTTATGTTTTCA
CACCTATAATAAATACAGTAATGAGGGTGTTGTATCAATGAAGTTTGATGGTAATCTTAG
GGGAAATGATGGGACAAAAATGTATAGTTTTTGGGAGTGCAAATTTGAGTTGTTTGGCAG
ATTAGTCTGGTCTTTTGACCCCTTTTATTTGCCACTCCATTTGTAATGAATGATATTGAT
ATTTTTTTTTTGGT

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL7519Contig1 770 2 23 U
GATACAAACTCAACATCGAAATTAACAGATAGCCAGTCATATTATTCAGATGTTTTATTA
CAATCCAAAACCAAAAAGCCTTGAATTCTACACAGCCAATTAATTCGTTAACTGCAGTAA
AAAATGGATAGACCATATGGTATTCCTTTGTAAGGTGATTTCAAATGATTGGTTGGAGAG
AACATCCGTCACAGCCAGCCAAACCACGTAAAAGCTTTCACGGATATCCAGAAGCAATTC
GGAAGGCAGTTCTTGACGGGACGATTTTAGCCAAAAAAAAAATAAAAGATGACACTCCAT
GAAAGGAAGACAAAAGAAATAAGAAAACCCCAAAGAATCAAAATATCTAAACTGTGCTAA
CTTAAATGGTAAAAAAAAACTTTTATAAAAAGTTGATGCAATGGTGGTTGCTTCTGTTTT
TTTTTCTTTCTTAAGCCTATGAAAAAAGCTTGTAGCTTTTTGCTGAAAGGATAATGTGTC
TCATTCCTCCAATTGGCGCAAAGATTGCTATCAAGACCCCAATTGTTATTGCAAACCAAG
AGGCAAACCAATGGAAGCTAAATAGTTTTGGTCGCTTCATGACCAACCATATAATGCAAG
GTATGAAGTATGAGGTTGATGCGAAGACTAGGCCACCGAAGAACCCTAAAAGACCTCCGA
AGAAGGGGATACAAATTGCAATAAGACATACAATTGCAACATATGTGCTACGTGCAGCTA
GACGCAGCATTGCTGAAGAGTGAGCTTCAGTGTTTGCACCAGATATGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AR57JQ U 19
AF RR2C089JQ U 1
BS 1 79 RR2C089JQ
BS 80 80 RR2AR57JQ
BS 81 119 RR2C089JQ
BS 120 120 RR2AR57JQ
BS 121 210 RR2C089JQ
BS 211 211 RR2AR57JQ
BS 212 281 RR2C089JQ
BS 282 282 RR2AR57JQ
BS 283 332 RR2C089JQ
BS 333 333 RR2AR57JQ
BS 334 356 RR2C089JQ
BS 357 357 RR2AR57JQ
BS 358 371 RR2C089JQ
BS 372 372 RR2AR57JQ
BS 373 388 RR2C089JQ
BS 389 389 RR2AR57JQ
BS 390 424 RR2C089JQ
BS 425 425 RR2AR57JQ
BS 426 442 RR2C089JQ
BS 443 443 RR2AR57JQ
BS 444 445 RR2C089JQ
BS 446 446 RR2AR57JQ
BS 447 770 RR2C089JQ

RD RR2AR57JQ 619 0 0
CTT
TTAACGGATAGCCAGTCATATTATTCAGATGTTTTATTACAATCCAAAACCAAAAAGCCT
TGAATTCTACACAGCCAATTAATTCGTTAACTGCAGTAAAAAATGGATAGACCATATGGT
ATTCCTTTGTAAGGTGATTTCAAATGATTGGTTGGAGAGAACATCCGTCACAGCCAGCCA
AACCACGTAAAAGCTTTCACGGATATCCAGAAGCAATTCGGAAGGCAGTTCTTGACGGGA
CGATTTTAGCCAAAAAAAAAATAAAAGATGACACTCCATGAAAGGAAGACAAAAGAAATA
AGAAAACCCCAAAGAATCAAAATATCTAAACTGTGCTAACTTAAATGGTAAAAAAAAACT
TTTATAAAAAGTTGATGCAATGGTGGTTGCTTCTGTTTTTTTTTCTTTCTTAAGCCTATG
AAAAAAGCTTGTAGCTTTTTGCTGAAAGGATAATGTGTCTCATTCCTCCAATTGGCGCAA
AGATTGCTATCAAGACCCCAATTGTTATTGCAAACCAAGAGGCAAACCAATGGAAGCTAA
ATAGTTTTGGTCGCTTCATGACCAACCATATAATGCAAGGTATGAAGTATGAGGTTGATG
CGAAGACTAGGCCACC

QA 4 619 4 619
DS 

RD RR2C089JQ 770 0 0
GATACAAACTCAACATCGAAATTAACAGATAGCCAGTCATATTATTCAGATGTTTTATTA
CAATCCAAAACCAAAAAGCTTTGAATTCTACACAGCCAATTAATTCGTTAACTGCAGTAG
AAAATGGATAGACCATATGGTATTCCTTTGTAAGGTGATTTCAAATGATTGGTTGGAGAG
AACATCCGTCACAGCCAGCCAAACCACGTAGAAGCTTTCACGGATATCCAGAAGCAATTC
GGAAGGCAGTTCTTGACGGGACGATTTTAGCCAAAAAAAAA*TAAAAGATGACACTCCAT
GAAAGGAAGACAAAAGAAATAAGAAAACCCCAGAGAATCAAAATATCTAAACTGTGTTAA
CTTAAATGGTAGAAAAAAACTTTTATAAGAAGTTGATGCAATGGTGGTTGCTTCTGTTTT
TTTT*CTTTCTTAAGCCTATGAGAAGAGCTTGTAGCTTTTTGCTGAAAGGATAATGTGTC
TCATTCCTCCAATTGGCGCAAAGATTGCTATCAAGACCCCAATTGTTATTGCAAACCAAG
AGGCAAACCAATGGAAGCTAAATAGTTTTGGTCGCTTCATGACCAACCATATAATGCAAG
GTATGAAGTATGAGGTTGATGCGAAGACTAGGCCACCGAAGAACCCTAAAAGACCTCCGA
AGAAGGGGATACAAATTGCAATAAGACATACAATTGCAACATATGTGCTACGTGCAGCTA
GACGCAGCATTGCTGAAGAGTGAGCTTCAGTGTTTGCACCAGATATGACT

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL7520Contig1 697 2 1 U
GGACACACAACACTTAACACTTTAATCACACATCACCAACTGGTCTCTCTCATACCAATC
TAACCAAATGGGTTCTTATTCTACACCTCAAGAAGAGCCTCAACTAGTAGATACACCTGA
TATTGTTCCTTCTCCGATAGCTCAGGAACCGGACAACGATGTACCGGCCCCGGGAAATCA
GTTTGCTGAGTTCGCCGCCGGTTGTTTCTGGGGGGTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATCCC
TGGTGTGACAGAGACTGAGGTTGGGTACACTCAGGGGATCTCTCACAATCCTTCTTACAA
GGATGTCTGCACCAACACAACGAACCATGCAGAAGAAACTAGAGAAGAAGATTGTGACTG
AGATATTACCGGCCAAGAAATTCTACAAAGCTGAGGAATACCATCAGCATTACCTCTCTA
AAGGTGGGACGAGTGGCCATGCACAGTCCCCTGCAAAGAGCTGCAAAGACCCTATCAGCT
GCTTTGGCTAAGGAAAAGCATTTGTTCCTCTTCACCCAAACAGAGGATTCTCTGAGGTTT
CGTATCAGTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCCTGCGTGTGTGTGTGTGTTGATTT
TTAAGTCTCAGTTAGTAATAAAGATGCATGTGGGATCATCTCAACTGTGTAAGTGTAACT
TGTCTTAGTTTCTAAACTTTGAACTGATGTTTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G350TF U 1
AF RR2G350JQ C 135
BS 1 697 RR2G350TF

RD RR2G350TF 697 0 0
GGACACACAACACTTAACACTTTAATCACACATCACCAACTGGTCTCTCTCATACCAATC
TAACCAAATGGGTTCTTATTCTACACCTCAAGAAGAGCCTCAACTAGTAGATACACCTGA
TATTGTTCCTTCTCCGATAGCTCAGGAACCGGACAACGATGTACCGGCCCCGGGAAATCA
GTTTGCTGAGTTCGCCGCCGGTTGTTTCTGGGGGGTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATCCC
TGGTGTGACAGAGACTGAGGTTGGGTACACTCAGGGGATCTCTCACAATCCTTCTTACAA
GGATGTCTGCACCAACACAACGAACCATGCAGAAGAAACTAGAGAAGAAGATTGTGACTG
AGATATTACCGGCCAAGAAATTCTACAAAGCTGAGGAATACCATCAGCATTACCTCTCTA
AAGGTGGGACGAGTGGCCATGCACAGTCCCCTGCAAAGAGCTGCAAAGACCCTATCAGCT
GCTTTGGCTAAGGAAAAGCATTTGTTCCTCTTCACCCAAACAGAGGATTCTCTGAGGTTT
CGTATCAGTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCCTGCGTGTGTGTGTGTGTTGATTT
TTAAGTCTCAGTTAGTAATAAAGATGCATGTGGGATCATCTCAACTGTGTAAGTGTAACT
TGTCTTAGTTTCTAAACTTTGAACTGATGTTTGTTTG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2G350JQ 563 0 0
CGATAGCTCAGGAACCGGACAACGATGTACCGGCCCCGGGAAATCAGTTTGCTGAGTTCG
CCGCCGGTTGTTTCTGGGGGGTGGAGCTTGCTTTCCAGAGGATCCCTGGTGTGACAGAGA
CTGAGGTTGGGTACACTCAGGGGATCTCTCACAATCCTTCTTACAAGGATGTTTGCACCA
ACACAACGAACCATGCAGAAGAAACTAGAGAAGAAGATTGTGACTGAGATATTACCGGCC
AAGAAATTTTACAAAGCTGAGGAATACCATCAGCATTACCTCTCTAAAGGTGGGACGAGT
GGCCATGCACAGTCCCCTGCAAAGAGCTGCAAAGACCCTATCAGCTGCTTTGGCTAAGGA
AAAGCATTTGTTCCTCTTCACCCAAACAGAGGATTTTTTGAGGTTTCGTATCAGTTTTTT
TTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCCTGCGTGTGTGTGTGTGTTGATTTTTAAGTCTCAGTTA
GTAATAAAGATGCATGTGGGATCATCTCAACTGTGTAAGTGTAACTTGTCTTAGTTTCTA
AACTTTGAACTGATGTTTGTTTG

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 2

CO CL7521Contig1 996 2 4 U
AGGGAGAGATATCGAACTGTGATTACACAAGAACAATCTCTCCTTAGTCCCTATAGTGTA
ATCAGTTAAATAGACCAATGAAGATACATCGTGCCATAATCCTGGTGACACTCTTGGCCT
TGATCAAGACCGCGGTTTCCCAACTTCAATCGATTGAGCAGTGCAGAGAGGTGTTCGAAA
GTTTCATGCCGTGCATGGGCTTCGTCGAGGGAATCTTCCAGCAACCTTCTCCGCAATGCT
GCAGAGGCGTGACCCACTTGAACAACGTCGTAAAGTTCAAGACTCCAGTTACTACTCTTT
CTCCATTTACGATTTCTTTTTAGTATAGAGCGGTCATCGGCCCTACCAAGTGAAAACATT
GGTTTTGAACCTCCAAAATGTTATAAATATATATGTACATAGAGACCCAAATTATTTTAA
AATTATTTTATTAAAATCGTACTAAATTGTTTACGTTTTCTGGAGATCTCAAGGCCGGTC
TACTTTTCACCGTCAGGCGTCAGCTATTAGTAATCTGACGATATATATATTAAGCAGGGA
TCGAGGAAGAATGAGCAGGGGACTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATAGAGATA
ATGGGAAAAGCAGATCATCTTCCTTTTCTGGCATCCGCCATCAACAATCTTCCACCCCTT
TGTTCTCTTAGTCTCAGCTTCCCTATATCTGTTGGAATGGACCGTTCTCAGTTAATTATG
TTCTCCTCTCCATAATTTTTTAACATAAAAGCGTCATTTTGGTACATTTTTTCTAGGTGT
ACAGGAACTTAATTGGATTATTTTCTTTCTTTACAGGTTCAGAAACATGAAGGAACTCGA
TGCTGAAAAGTTAAATTAGTTACAAGTGTGTTGAATAATGGAAATGGAACACTTGTAATG
GCTATGCATGATACATAATGGAACTTATTGTATTAGTGACCAGCGTAACAAAAAATAATA
CGAATTAGTCAAGAAAGAGCGGATAAAACTTGATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EV58TF U 1
AF RR2EV58JQ C 203
BS 1 740 RR2EV58TF
BS 741 741 RR2EV58JQ
BS 742 769 RR2EV58TF
BS 770 996 RR2EV58JQ

RD RR2EV58TF 769 0 0
AGGGAGAGATATCGAACTGTGATTACACAAGAACAATCTCTCCTTAGTCCCTATAGTGTA
ATCAGTTAAATAGACCAATGAAGATACATCGTGCCATAATCCTGGTGACACTCTTGGCCT
TGATCAAGACCGCGGTTTCCCAACTTCAATCGATTGAGCAGTGCAGAGAGGTGTTCGAAA
GTTTCATGCCGTGCATGGGCTTCGTCGAGGGAATCTTCCAGCAACCTTCTCCGCAATGCT
GCAGAGGCGTGACCCACTTGAACAACGTCGTAAAGTTCAAGACTCCAGTTACTACTCTTT
CTCCATTTACGATTTCTTTTTAGTATAGAGCGGTCATCGGCCCTACCAAGTGAAAACATT
GGTTTTGAACCTCCAAAATGTTATAAATATATATGTACATAGAGACCCAAATTATTTTAA
AATTATTTTATTAAAATCGTACTAAATTGTTTACGTTTTCTGGAGATCTCAAGGCCGGTC
TACTTTTCACCGTCAGGCGTCAGCTATTAGTAATCTGACGATATATATATTAAGCAGGGA
TCGAGGAAGAATGAGCAGGGGACTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATAGAGATA
ATGGGAAAAGCAGATCATCTTCCTTTTCTGGCATCCGCCATCAACAATCTTCCACCCCTT
TGTTCTCTTAGTCTCAGCTTCCCTATATCTGTTGGAATGGACCGTTCTCAGTTAATTATG
TTCTCCTCTCCATAATTTTT*AACATAAAAGCGTCATTTTGGTACATTT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RR2EV58JQ 794 0 0
CGTCGAGGGAATCTTCCAGCAAC*TTCTCCGCAATGCTGCAGAGGCGTGACCCACTTGAA
CAACGTCGTAAAGTTCAAGACTCCAGTTACTACTCTTTCTCCATTTACGATTTCTTTTTA
GTATAGAGCGGTCATCGGCCCTACCAAGTGAAAACATTGGTTTTGAACCTCCAAAATGTT
ATAAATATATATGTACATAGAGACCCAAATTATTTTAAAATTATTTTATTAAAATCGTAC
TAAATTGTTTACGTTTTCTGGAGATCTCAAGGCCGGTCTACTTTTCACCGTCAGGCGTCA
GCTATTAGTAATCTGACGATATATATATTAAGCAGGGATCGAGGAAGAATGAGCAGGGGA
CTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATAGAGATAATGGGAAAAGCAGATCATCTTC
CTTTTCTGGCATCCGCCATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTTCTCTTAGTCTCAGCTTCC
CTATATCTGTTGGAATGGACCGTTCTCAGTTAATTATGTTCTCCTCTCCATAATTTTTTA
ACATAAAAGCGTCATTTTGGTACATTTTTTCTAGGTGTACAGGAACTTAATTGGATTATT
TTCTTTCTTTACAGGTTCAGAAACATGAAGGAACTCGATGCTGAAAAGTTAAATTAGTTA
CAAGTGTGTTGAATAATGGAAATGGAACACTTGTAATGGCTATGCATGATACATAATGGA
ACTTATTGTATTAGTGACCAGCGTAACAAAAAATAATACGAATTAGTCAAGAAAGAGCGG
ATAAAACTTGATCG

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL7522Contig1 486 2 1 U
GGACACAGAAACGCAAAAACACAATGACTAACGTTGCAGTAATAGCCGCTATTCTGATTG
CAGCATTGTTATCAGCTAGCGTGACAGAACAAATGGCTCCATCTCCTTCCTCAGGACCTT
CGGTTGAACCAGACTGCATGACGAATCTGTTGAACATGACGGACTGTCTTTCGTACGTGC
AGGTAGGAAACCGTGGTGGTGCGGCCAATCCAGACAAATCTTGTTGTCCGGAGCTTGCCG
GCCTTGTCGATAACTCGCCGCAATGCCTCTGCTACCTACTCGGCGGAGATATGGAGGTTC
AGTATGGAATCAAGATTGATAAGGCAAAGGCTCTCAAGCTTCCCGGAGTTTGTGGCGTCG
TTACTCCAGATCCCTCACTATGTTCACGTAATTTTTAACTTTCACTCTGGATTTTTTTTT
AAACTAAAAATAAAGGAGTATTGAAGTTGTTGATTATTACTCTTTTAACCAAAAAAGTTG
TTGACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RR2BX36JQ C 1
AF RR2BX36TF U 1
BS 1 486 RR2BX36TF

RD RR2BX36JQ 486 0 0
GGACACAGAAACGCAAAAACACAATGACTAACGTTGCAGTAATAGCCGCTATTCTGATTG
CAGCATTGTTATCAGCTAGCGTGACAGAACAAATGGCTCCATCTCCTTCCTCAGGACCTT
CGGTTGAACCAGACTGCATGACGAATCTGTTGAACATGACGGACTGTCTTTCGTACGTGC
AGGTAGGAAACCGTGGTGGTGCGGCCAATCCAGACAAATCTTGTTGTCCGGAGCTTGCCG
GCCTTGTCGATAACTCGCCGCAATGCCTCTGCTACCTACTCGGCGGAGATATGGAGGTTC
AGTATGGAATCAAGATTGATAAGGCAAAGGCTCTCAAGCTTCCCGGAGTTTGTGGCGTCG
TTACTCCAGATCCCTCACTATGTTCACGTAATTTTTAACTTTCACTCTGGATTTTTTTTT
AAACTAAAAATAAAGGAGTATTGAAGTTGTTGATTATTACTCTTTTAACCAAAAAAGTTG
TTGACT

QA 1 486 1 486
DS 

RD RR2BX36TF 486 0 0
GGACACAGAAACGCAAAAACACAATGACTAACGTTGCAGTAATAGCCGCTATTCTGATTG
CAGCATTGTTATCAGCTAGCGTGACAGAACAAATGGCTCCATCTCCTTCCTCAGGACCTT
CGGTTGAACCAGACTGCATGACGAATCTGTTGAACATGACGGACTGTCTTTCGTACGTGC
AGGTAGGAAACCGTGGTGGTGCGGCCAATCCAGACAAATCTTGTTGTCCGGAGCTTGCCG
GCCTTGTCGATAACTCGCCGCAATGCCTCTGCTACCTACTCGGCGGAGATATGGAGGTTC
AGTATGGAATCAAGATTGATAAGGCAAAGGCTCTCAAGCTTCCCGGAGTTTGTGGCGTCG
TTACTCCAGATCCCTCACTATGTTCACGTAATTTTTAACTTTCACTCTGGATTTTTTTTT
AAACTAAAAATAAAGGAGTATTGAAGTTGTTGATTATTACTCTTTTAACCAAAAAAGTTG
TTGACT

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 2

CO CL7523Contig1 875 2 2 U
GGGGATGACAGCATCTCTTTTCTCGCAGGCCGTGTTTGTTCCAATTGATGTTGTCAGTTA
GTTTGATGGTGCAAGGATACTCTGGTCATGCTACATATACTTGTGGTATTGATGTTGCCA
CAAAATTCTCAATTTAGTTAGTTGAAAGCATGGCCCAACCGGTCGTGGTCATCAAGACAT
TAAGTGTGCAGTTCTACACTTCAACTTATGCTTTCAGGTAGTATGCACAAGACCACTCTT
GAACACATCAATGTATGTATTGTTGGGGATGAGAATGCGTCTTTCTCTGAAGATGAGAAC
ACAACAAGGCAAGGCAAAAGTAAACCCCTGTCAACAGAATCCTCTGTAAATGGCAAGTCC
ATGAGAATGAGATTCAAAAAAGGAAAGGTCCTGGACGTTGGATCACAAGACAACAACAGT
CCAAAGCTCAAGTTCAAGAGAGGAAAGATCGACACCAGAGCAGACACATCCTCAAAAGAC
TCAAGTCTGAGAAGCTTAAGATCAAAGGAACAAACTTCAACAACGACAAGGAAAAATAAC
AACACAAACCCAAATCATTGGAAGTTGTTCTATAACACCAAGAACAGAGAAGAAGAGTGA
TCAAGAGTGTTGTTGCTCAACAATGTAATCGAGGAAACAGCTAATAAGCTTGTGGAGACT
CGCAAGAACAAAGTGAAGGCCTTAGTGGGTGCTTTTGAGTTTTGTCATATTCTCTAACTA
AATATTATTTTTCACCAGTGTTTCACCAGTGTTTATGAATTTATGTAAAACATATGTACA
TGTATAAGAGTGTAATCACTCGCATAAGATTCTAGCGTTATCATGTTCACTAATCATGTG
ATTATATACATAAAAAGATATAAGGAAGGTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER21TF U 1
AF RR2ER21JQ C 37
BS 1 673 RR2ER21TF
BS 674 875 RR2ER21JQ

RD RR2ER21TF 673 0 0
GGGGATGACAGCATCTCTTTTCTCGCAGGCCGTGTTTGTTCCAATTGATGTTGTCAGTTA
GTTTGATGGTGCAAGGATACTCTGGTCATGCTACATATACTTGTGGTATTGATGTTGCCA
CAAAATTCTCAATTTAGTTAGTTGAAAGCATGGCCCAACCGGTCGTGGTCATCAAGACAT
TAAGTGTGCAGTTCTACACTTCAACTTATGCTTTCAGGTAGTATGCACAAGACCACTCTT
GAACACATCAATGTATGTATTGTTGGGGATGAGAATGCGTCTTTCTCTGAAGATGAGAAC
ACAACAAGGCAAGGCAAAAGTAAACCCCTGTCAACAGAATCCTCTGTAAATGGCAAGTCC
ATGAGAATGAGATTCAAAAAAGGAAAGGTCCTGGACGTTGGATCACAAGACAACAACAGT
CCAAAGCTCAAGTTCAAGAGAGGAAAGATCGACACCAGAGCAGACACATCCTCAAAAGAC
TCAAGTCTGAGAAGCTTAAGATCAAAGGAACAAACTTCAACAACGACAAGGAAAAATAAC
AACACAAACCCAAATCATTGGAAGTTGTTCTATAACACCAAGAACAGAGAAGAAGAGTGA
TCAAGAGTGTTGTTGCTCAACAATGTAATCGAGGAAACAGCTAATAAGCTTGTGGAGACT
CGCAAGAACAAAG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2ER21JQ 839 0 0
TT
TTCCAATTGATGTTGTCAGTTAGTTTGATGGTGCAAGGATACTCTGGTCATGCTACATAT
ACTTGTGGTATTGATGTTGCCACAAAATTCTCAATTTAGTTAGTTGAAAGCATGGCCCAA
CCGGTCGTGGTCATCAAGACATTAAGTGTGCAGTTCTACACTTCAACTTATGCTTTCAGG
TAGTATGCACAAGACCACTCTTGAACACATCAATGTATGTATTGTTGGGGATGAGAATGC
GTCTTTCTCTGAAGATGAGAACACAACAAGGCAAGGCAAAAGTAAACCCCTGTCAACAGA
ATCCTCTGTAAATGGCAAGTCCATGAGAATGAGATTCAAAAAAGGAAAGGTCCTGGACGT
TGGATCACAAGACAACAACAGTCCAAAGCTCAAGTTCAAGAGAGGAAAGATCGACACCAG
AGCAGACACATCCTCAAAAGACTCAAGTCTGAGAAGCTTAAGATCAAAGGAACAAACTTC
AACAACGACAAGGAAAAATAACAACACAAACCCAAATCATTGGAAGTTGTTCTATAACAC
CAAGAACAGAGAAGAAGAGTGATCAAGAGTGTTGTTGCTCAACAATGTAATCGAGGAAAC
AGCTAATAAGCTTGTGGAGACTCGCAAGAACAAAGTGAAGGCCTTAGTGGGTGCTTTTGA
GTTTTGTCATATTCTCTAACTAAATATTATTTTTCACCAGTGTTTCACCAGTGTTTATGA
ATTTATGTAAAACATATGTACATGTATAAGAGTGTAATCACTCGCATAAGATTCTAGCGT
TATCATGTTCACTAATCATGTGATTATATACATAAAAAGATATAAGGAAGGTTTTGT

QA 3 839 3 839
DS 



AS 1 2

CO CL7524Contig1 767 2 2 U
GGAGACACAGACAGAAACAAGACCGATCGGCGATCAGCTGTCCGAAACCATATCCACCGG
CGAGCAATCGGAAATCATCCGCTAAGTAAAAAGATGATGATCTCTCAGTTCTTCGTCTTA
TCTCAGCGTGGAGATAACATCGTCTTCCGCGACTATCGAGCTGAGGTACCAAAAGGAAGT
ACAGAGACATTCTTCCGTAAAGTCAAGTTCTGGAAGGAGGATGGTAATGCCGAGGCACCA
CCTATCTTTAATGTAGATGGTGTGAACTACTTCCATGTCAAGGTTGTTGGTCTATATTTT
GTTGCGACAACGAGGGTTAATGTTTCGCCGTCTCTTGTCCTGGAGCTTCTACAAAGGATC
GCTCGTGTTATCAAGGATTACCTCGGTGTTTTGAACGAAGATTCATTCAGGAAAAATTTT
GTGCTCGTGTATGAGTTGCTTGATGAAGTCATTGATTTTGGCTATGTGCAAACTACATCA
ACGGAGGTTTTGAAATCCTATGTATTCAACGAGCCAATTTTGATTGCTCCTGCACGCCTT
CAACCTATCGATCCTGCTGCCATCTTCAATCAAGGAGCCAAAAGGATGCCTGGAACAGCA
GTTACAAAGTCGGTTGTAGCTAATGATCCTAGTGGTCGGAGAAGAGAGGAAATTTTTGTG
GACATCATTGAGAAAATCAGTGTTACTTTTAGTTCAAGCGGCTATATACTGACTTCCGAG
ATTGATGGCACCATTCAAATGAAGAGTTATCTTTCTGGTATCCAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD25TF U 1
AF RR2G013TF U 7
BS 1 574 RR2GD25TF
BS 575 767 RR2G013TF

RD RR2GD25TF 577 0 0
GGAGACACAGACAGAAACAAGACCGATCGGCGATCAGCTGTCCGAAACCATATCCACCGG
CGAGCAATCGGAAATCATCCGCTAAGTAAAAAGATGATGATCTCTCAGTTCTTCGTCTTA
TCTCAGCGTGGAGATAACATCGTCTTCCGCGACTATCGAGCTGAGGTACCAAAAGGAAGT
ACAGAGACATTCTTCCGTAAAGTCAAGTTCTGGAAGGAGGATGGTAATGCCGAGGCACCA
CCTATCTTTAATGTAGATGGTGTGAACTACTTCCATGTCAAGGTTGTTGGTCTATATTTT
GTTGCGACAACGAGGGTTAATGTTTCGCCGTCTCTTGTCCTGGAGCTTCTACAAAGGATC
GCTCGTGTTATCAAGGATTACCTCGGTGTTTTGAACGAAGATTCATTCAGGAAAAATTTT
GTGCTCGTGTATGAGTTGCTTGATGAAGTCATTGATTTTGGCTATGTGCAAACTACATCA
ACGGAGGTTTTGAAATCCTATGTATTCAACGAGCCAATTTTGATTGCTCCTGCACGCCTT
CAACCTATCGATCCTGCTGCCATCTTCAATCAAG
AGC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2G013TF 761 0 0
GG
AGACAGAAACAAGACCGATCGGCGATCAGCTGTCCGAAACCATATCCACCGGCGAGCAAT
CGGAAATCATCCGCTAAGTAAAAAGATGATGATCTCTCAGTTCTTCGTCTTATCTCAGCG
TGGAGATAACATCGTCTTCCGCGACTATCGAGCTGAGGTACCAAAAGGAAGTACAGAGAC
ATTCTTCCGTAAAGTCAAGTTCTGGAAGGAGGATGGTAATGCCGAGGCACCACCTATCTT
TAATGTAGATGGTGTGAACTACTTCCATGTCAAGGTTGTTGGTCTATATTTTGTTGCGAC
AACGAGGGTTAATGTTTCGCCGTCTCTTGTCCTGGAGCTTCTACAAAGGATCGCTCGTGT
TATCAAGGATTACCTCGGTGTTTTGAACGAAGATTCATTCAGGAAAAATTTTGTGCTCGT
GTATGAGTTGCTTGATGAAGTCATTGATTTTGGCTATGTGCAAACTACATCAACGGAGGT
TTTGAAATCCTATGTATTCAACGAGCCAATTTTGATTGCTCCTGCACGCCTTCAACCTAT
CGATCCTGCTGCCATCTTCAATCAAGGAGCCAAAAGGATGCCTGGAACAGCAGTTACAAA
GTCGGTTGTAGCTAATGATCCTAGTGGTCGGAGAAGAGAGGAAATTTTTGTGGACATCAT
TGAGAAAATCAGTGTTACTTTTAGTTCAAGCGGCTATATACTGACTTCCGAGATTGATGG
CACCATTCAAATGAAGAGTTATCTTTCTGGTATCCAGAA

QA 3 761 3 761
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7526Contig1 848 2 2 U
GAGAAACCAAAAAAAAAAGATTGAGAGCCGGCATCAAAAACGAAGAGGAAGAAAATGATC
CTAAACAACATAAAACCAAATCTCCAAGCGGTTCTTTGCAGGAGAGACCTATACAAGAAA
GAACCTCCCATACTTAATAAGTGCATGCAATTAGATACAGAGAACCTAAGCTTCAATACC
GGAGAACAGAATGCTTTGTTCTATAACATTCAATCCAGAATGGCGAAGTCGAGACTACCA
TGAGGACGACTAGGAAGCGCCTACTGAGAAGCAGTGAAGGGCGAAGACTCGAGCAGAACC
ACAACACTCCGACCAACATCAGACTTGAAAAACAAGTGTGAAGAGGAATCGAGTCGAAGC
GAAGCCAAAGACACCAAACCATAGAGAAAAGGAACATGCAGCTTAGGAGACACACTACCA
TGCTGTTGATCTTGCGGATCCAGAGCTCCAATCTCGAAACAGCTAAATCCGAACAGATCT
AGAAACAGATCTGTAACTTTAGCTTAACACCTCCGTAATCAAATATGCAAAAGAACGAAT
GAAATACAAGGAAAAGACAAAAAGATAAACCCGACTCCAGCCATGTAGAAGCGGTCGGAG
CCGGTGAACGATGAAGAACAGATCCTCATTAGTTTTTACTATAAATTTTTGAGTTGAATG
TAAAATTTACTCAAAAAGAAAATATTATTTAAGCAAGAATAAACTTTTTACAACAAACGC
ATCATGATTTTGACAGTTTCTACTTTTCAGAAACGGATACATGAAAGAACAGAGAGAACA
GAGAGAATATGTTGAAGAATACTTGTCATTCACATATCACGTTACAACTGAATATATACA
TCTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H305TF U 1
AF RR2H305JQ C 111
BS 1 676 RR2H305TF
BS 677 848 RR2H305JQ

RD RR2H305TF 678 0 0
GAGAAACCAAAAAAAAAAGATTGAGAGCCGGCATCAAAAACGAAGAGGAAGAAAATGATC
CTAAACAACATAAAACCAAATCTCCAAGCGGTTCTTTGCAGGAGAGACCTATACAAGAAA
GAACCTCCCATACTTAATAAGTGCATGCAATTAGATACAGAGAACCTAAGCTTCAATACC
GGAGAACAGAATGCTTTGTTCTATAACATTCAATCCAGAATGGCGAAGTCGAGACTACCA
TGAGGACGACTAGGAAGCGCCTACTGAGAAGCAGTGAAGGGCGAAGACTCGAGCAGAACC
ACAACACTCCGACCAACATCAGACTTGAAAAACAAGTGTGAAGAGGAATCGAGTCGAAGC
GAAGCCAAAGACACCAAACCATAGAGAAAAGGAACATGCAGCTTAGGAGACACACTACCA
TGCTGTTGATCTTGCGGATCCAGAGCTCCAATCTCGAAACAGCTAAATCCGAACAGATCT
AGAAACAGATCTGTAACTTTAGCTTAACACCTCCGTAATCAAATATGCAAAAGAACGAAT
GAAATACAAGGAAAAGACAAAAAGATAAACCCGACTCCAGCCATGTAGAAGCGGTCGGAG
CCGGTGAACGATGAAGAACAGATCCTCATTAGTTTTTACTATAAATTTTTGAGTTGAATG
TAAAATTTACTCAAAA
GA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2H305JQ 738 0 0
ATACAAGAAAGAACCTCCCATACTTAATAAGTGCATGCAATTAGATACAGAGAACCTAAG
CTTCAATACCGGAGAACAGAATGCTTTGTTCTATAACATTCAATCCAGAATGGCGAAGTC
GAGACTACCATGAGGACGACTAGGAAGCGCCTACTGAGAAGCAGTGAAGGGCGAAGACTC
GAGCAGAACCACAACACTCCGACCAACATCAGACTTGAAAAACAAGTGTGAAGAGGAATC
GAGTCGAAGCGAAGCCAAAGACACCAAACCATAGAGAAAAGGAACATGCAGCTTAGGAGA
CACACTACCATGCTGTTGATCTTGCGGATCCAGAGCTCCAATCTCGAAACAGCTAAATCC
GAACAGATCTAGAAACAGATCTGTAACTTTAGCTTAACACCTCCGTAATCAAATATGCAA
AAGAACGAATGAAATACAAGGAAAAGACAAAAAGATAAACCCGACTCCAGCCATGTAGAA
GCGGTCGGAGCCGGTGAACGATGAAGAACAGATCCTCATTAGTTTTTACTATAAATTTTT
GAGTTGAATGTAAAATTTACTCAAAAAGAAAATATTATTTAAGCAAGAATAAACTTTTTA
CAACAAACGCATCATGATTTTGACAGTTTCTACTTTTCAGAAACGGATACATGAAAGAAC
AGAGAGAACAGAGAGAATATGTTGAAGAATACTTGTCATTCACATATCACGTTACAACTG
AATATATACATCTCGACT

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL7527Contig1 815 2 2 U
GGGACCCCAGTGACCAAGCTCGGGCGTCTCGTGAAAGACGGAAAGATCCAGAAGCTCGAG
CAGATCTACCTCCACTCCCTCCCCGTCAAGGAGTACCAGATCATCGACCTCCTCGTGGGT
CCCACTTTGAAAGACGAGGTGATGAAGATCATGCCGGTCCAGAAACAGACCAGAGCCGGT
CAGAGGACGAGGTTCAAGGCCTTTGTCGTTGTCGGAGACACGAACGGACACGTCGGATTG
GGAGTGAAGTGCTCCAAGGAGGTGGCCACTGCTATTAGAGGTGGGATCATACTTGCGAAG
CTGTCTGTGATTCCTGTGAGGAGAGGGTACTGGGGGAACAAGATTGGGAAGCCTCATACG
GTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGGTCCGTTACGGTGAGGATGGTGCCTGCTCCT
AGAGGTGCTGAGATTGTGGCTGCTAGGGTTCCTAAGAAGGTGCTTCAGTTCGCTGGGATT
GATGACGTGTTCACTTCTTCCAGGGGGTCTACCAAGACTCTTGGAAACTTCGTAAAGGCT
ACATTTGATTGCCTCCGGAAGACTTATGGATTCTTGACACCAGAGTTCTGGAAAGAGACG
AGCTTTAAGAAATCGCCATACCAAGAGTACACTGATTTGCTCGCCAGTAAGGGAACTACG
ACCAAAGTCATCACCGAGGTCGAAGACCAAGCCTCCTAAACAATGTCTACCCTTGTTTTG
TTTTTGGATCATCATCTTTTCTTGAGTTTATTTTGTTCGAACCTTTAGTATATGTTTGTT
GCTGGATTGCATCTTTTATATTCCATCATCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E863TF U 1
AF RR2E863JQ C 88
BS 1 649 RR2E863TF
BS 650 815 RR2E863JQ

RD RR2E863TF 649 0 0
GGGACCCCAGTGACCAAGCTCGGGCGTCTCGTGAAAGACGGAAAGATCCAGAAGCTCGAG
CAGATCTACCTCCACTCCCTCCCCGTCAAGGAGTACCAGATCATCGACCTCCTCGTGGGT
CCCACTTTGAAAGACGAGGTGATGAAGATCATGCCGGTCCAGAAACAGACCAGAGCCGGT
CAGAGGACGAGGTTCAAGGCCTTTGTCGTTGTCGGAGACACGAACGGACACGTCGGATTG
GGAGTGAAGTGCTCCAAGGAGGTGGCCACTGCTATTAGAGGTGGGATCATACTTGCGAAG
CTGTCTGTGATTCCTGTGAGGAGAGGGTACTGGGGGAACAAGATTGGGAAGCCTCATACG
GTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGGTCCGTTACGGTGAGGATGGTGCCTGCTCCT
AGAGGTGCTGAGATTGTGGCTGCTAGGGTTCCTAAGAAGGTGCTTCAGTTCGCTGGGATT
GATGACGTGTTCACTTCTTCCAGGGGGTCTACCAAGACTCTTGGAAACTTCGTAAAGGCT
ACATTTGATTGCCTCCGGAAGACTTATGGATTCTTGACACCAGAGTTCTGGAAAGAGACG
AGCTTTAAGAAATCGCCATACCAAGAGTACACTGATTTGCTCGCCAGTA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2E863JQ 728 0 0
AAGGAGTACCAGATCATCGACCTCCTCGTGGGTCCCACTTTGAAAGACGAGGTGATGAAG
ATCATGCCGGTCCAGAAACAGACCAGAGCCGGTCAGAGGACGAGGTTCAAGGCCTTTGTC
GTTGTCGGAGACACGAACGGACACGTCGGATTGGGAGTGAAGTGCTCCAAGGAGGTGGCC
ACTGCTATTAGAGGTGGGATCATACTTGCGAAGCTGTCTGTGATTCCTGTGAGGAGAGGG
TACTGGGGGAACAAGATTGGGAAGCCTCATACGGTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGT
GGGTCCGTTACGGTGAGGATGGTGCCTGCTCCTAGAGGTGCTGAGATTGTGGCTGCTAGG
GTTCCTAAGAAGGTGCTTCAGTTCGCTGGGATTGATGACGTGTTCACTTCTTCCAGGGGG
TCTACCAAGACTCTTGGAAACTTCGTAAAGGCTACATTTGATTGCCTCCGGAAGACTTAT
GGATTCTTGACACCAGAGTTCTGGAAAGAGACGAGCTTTAAGAAATCGCCATACCAAGAG
TACACTGATTTGCTCGCCAGTAAGGGAACTACGACCAAAGTCATCACCGAGGTCGAAGAC
CAAGCCTCCTAAACAATGTCTACCCTTGTTTTGTTTTTGGATCATCATCTTTTCTTGAGT
TTATTTTGTTCGAACCTTTAGTATATGTTTGTTGCTGGATTGCATCTTTTATATTCCATC
ATCTTTCC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL7528Contig1 1103 2 4 U
GGGAATCCTATTCGGAGAGAAATGAACTAAATCCTAATTCGGACAGCAGAATTAGAACAA
CCAATGAAAGCTGCTGTCTTTCCCTCTAAAATCGCAAATCTAGGCCTCCTCCCTTCTGGC
CGTTGCTGCACACTGTTCTTCCGGTCACCGGCATTGTCTTCCTCGTTATCTACAACTCCT
TGTCGGAAGCTGACAAGAGGAAGAAAAGGTATTGAAGGATTGATGTCTCAGTCTCAGTCG
TCATCTTCTCAATTGTTTTCGTCTCTATCGAATTCATTCTCCTCTCAGTCGGAATCGGAG
TTACCTCAGGTTCAGTTACCTTCTCCGAAGCCAAAGTCTCCGCCGCCGCAGCTCCCGTGG
CTCATAGTCGGTTTGGGGAATCCCGGAAAGAAGTACCAGGGCACTCGCCATAACGTTGGG
TTTGAGATGGTGGACGCTCTGGCTGAGGCAGAAGGGATATCCATGAACACTGTTAACTTC
AAGGCCTTGTTTGGCAAAGGCGTTATTGGAAACATACCGATTATGCTGGCGAAACCTCAA
ACTTTCATGAACGCCAGTGGTGAGTCTGTTGGACAAACTGTTTCCTTTTACAAGATCCCG
CTAAAGCAAGTACTTGTGATTTACGATGATTTAGACTTGCCCTTTGGTAAATTGCGTTTA
TTGCCAAAAGGTGGTCACGGAGGGCACAATGGGATGAGAAGCATTATAGACCGGCTAAAA
GGGAGCCGTGATTTTCCCCGTCTAAGAATAGGGATTGGACGGCCTCCAGGGAAGATGGAT
ACAGCCAATTATGTTCTTCGTCAGTTTAATAAACAAGAACAGGAAGAGTTGGACTATACA
TTTCAAACAGGGTTAGAGGCAATAAGGATCATGTTGCTTGAAGGGTTCAACAAAAGTGCA
ACCTTTGTCAACACTCAGAAATCTATGCAACAACTCAGTTGAAAAAAAGAGAGCTTGTCC
CATCGGATATGAAGAACTGCAGATTTTTCAGGCCGATTCATTTATTAGAAAATCAATTCA
TATTTCCTTTGAGCAAATTGTATATCACAAGAAAACCAAAAATTTATTAGCCTTTGTCAT
AATTTGCTCTTGATTATAATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H745TF U 1
AF RR2H745JQB C 508
BS 1 650 RR2H745TF
BS 651 651 RR2H745JQB
BS 652 670 RR2H745TF
BS 671 1103 RR2H745JQB

RD RR2H745TF 678 0 0
GGGAATCCTATTCGGAGAGAAATGAACTAAATCCTAATTCGGACAGCAGAATTAGAACAA
CCAATGAAAGCTGCTGTCTTTCCCTCTAAAATCGCAAATCTAGGCCTCCTCCCTTCTGGC
CGTTGCTGCACACTGTTCTTCCGGTCACCGGCATTGTCTTCCTCGTTATCTACAACTCCT
TGTCGGAAGCTGACAAGAGGAAGAAAAGGTATTGAAGGATTGATGTCTCAGTCTCAGTCG
TCATCTTCTCAATTGTTTTCGTCTCTATCGAATTCATTCTCCTCTCAGTCGGAATCGGAG
TTACCTCAGGTTCAGTTACCTTCTCCGAAGCCAAAGTCTCCGCCGCCGCAGCTCCCGTGG
CTCATAGTCGGTTTGGGGAATCCCGGAAAGAAGTACCAGGGCACTCGCCATAACGTTGGG
TTTGAGATGGTGGACGCTCTGGCTGAGGCAGAAGGGATATCCATGAACACTGTTAACTTC
AAGGCCTTGTTTGGCAAAGGCGTTATTGGAAACATACCGATTATGCTGGCGAAACCTCAA
ACTTTCATGAACGCCAGTGGTGAGTCTGTTGGACAAACTGTTTCCTTTTACAAGATCCCG
CTAAAGCAAGTACTTGTGATTTACGATGATTTAGACTTGCCCTTTGGTAA*TTGCGTTTA
TTGCCAAAAG
TGGTCACG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2H745JQB 596 0 0
GGAAACATACCGATTATGCTGGCGAAACCTCAAACTTTCATGAACGCCAGTGGTGAGTCT
GTTGGACAAACTGTTTCCTTTTACAAGATCCCGCTAAAGCAAGTACTTGTGATTTACGAT
GATTTAGACTTGCCCTTTGGTAAATTGCGTTTATTGCCAAAAGGTGGTCACGGAGGGCAC
AATGGGATGAGAAGCATTATAGACCGGCTAAAAGGGAGCCGTGATTTTCCCCGTCTAAGA
ATAGGGATTGGACGGCCTCCAGGGAAGATGGATACAGCCAATTATGTTCTTCGTCAGTTT
AATAAACAAGAACAGGAAGAGTTGGACTATACATTTCAAACAGGGTTAGAGGCAATAAGG
ATCATGTTGCTTGAAGGGTTCAACAAAAGTGCAACCTTTGTCAACACTCAGAAATCTATG
CAACAACTCAGTTGAAAAAAAGAGAGCTTGTCCCATCGGATATGAAGAACTGCAGATTTT
TCAGGCCGATTCATTTATTAGAAAATCAATTCATATTTCCTTTGAGCAAATTGTATATCA
CAAGAAAACCAAAAATTTATTAGCCTTTGTCATAATTTGCTCTTGATTATAATAAA

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL7529Contig1 792 2 2 U
GCAGAAAGCGGTTCAGTCAATTTGTGAGTCAGCCACAGACAAAGGTTCATGTGCAAAAAC
ACTTGAGCCTGTCAAAAGCGACGATCCAAGTAAGCTTATCAAAGCCTTCATGCTGGCTAC
AAAAGACGCGGTCACAAAATCCTCAAGCTTCGCGGCTGCAACCGAAGAAGGCATGGGGAA
AAACATGAACGCAACTAACAAAGCCGTTCTTGATTACTGCAAGAGAGTGCTGATGTACGC
TCTTGAGGATCTTGAGACCATTGTTGAAGAAATGGGTGAAGATCTTCAGCAGAGTGGAAG
TAAGATGGACCAGCTTAAACAATGGTTAACCAGACTCTAGTTGGATGGGCGCGTCCGTTG
TTTAAAGATAGGAAGAATTTCAAGAAAATGGTTGATCCGTTGATGGAAGGAGATTATCCG
GTTAGAGGATTGTATCAAGCGCTTGCGATAGCTGCAATGTGTGTTCAAGATCAGCCTGGT
ATGAGACCGGTGATATCTGATGTAGTAATGGCTTTGGATCACTTGGCTTCTTGCAATTAT
GATCATAATCACAAGGAAAAGCAGTCTAATGTGACAGAGACAAGAGTCGATGTTGAAGAC
AAGAGAGTGATCGAATCTAATGTTTGTATGGAGGAAGGAAAACAAGAGATCAAGATATGT
TCAGCACAAGCAAATTAATCAACAACGGTTCTTTGTTTAAAAAAAAAAAAAAACATTTCT
TTCCAAAAATTTGTAGAATGCTTCGTTTATAGGAGCAACAATTTTGTTTCGAGCGATACT
GTGGTTTCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BG60TF U 1
AF RR2BG60JQ C 121
BS 1 698 RR2BG60TF
BS 699 792 RR2BG60JQ

RD RR2BG60TF 698 0 0
GCAGAAAGCGGTTCAGTCAATTTGTGAGTCAGCCACAGACAAAGGTTCATGTGCAAAAAC
ACTTGAGCCTGTCAAAAGCGACGATCCAAGTAAGCTTATCAAAGCCTTCATGCTGGCTAC
AAAAGACGCGGTCACAAAATCCTCAAGCTTCGCGGCTGCAACCGAAGAAGGCATGGGGAA
AAACATGAACGCAACTAACAAAGCCGTTCTTGATTACTGCAAGAGAGTGCTGATGTACGC
TCTTGAGGATCTTGAGACCATTGTTGAAGAAATGGGTGAAGATCTTCAGCAGAGTGGAAG
TAAGATGGACCAGCTTAAACAATGGTTAACCAGACTCTAGTTGGATGGGCGCGTCCGTTG
TTTAAAGATAGGAAGAATTTCAAGAAAATGGTTGATCCGTTGATGGAAGGAGATTATCCG
GTTAGAGGATTGTATCAAGCGCTTGCGATAGCTGCAATGTGTGTTCAAGATCAGCCTGGT
ATGAGACCGGTGATATCTGATGTAGTAATGGCTTTGGATCACTTGGCTTCTTGCAATTAT
GATCATAATCACAAGGAAAAGCAGTCTAATGTGACAGAGACAAGAGTCGATGTTGAAGAC
AAGAGAGTGATCGAATCTAATGTTTGTATGGAGGAAGGAAAACAAGAGATCAAGATATGT
TCAGCACAAGCAAATTAATCAACAACGGTTCTTTGTTT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2BG60JQ 672 0 0
AAAAGACGCGGTCACAAAATCCTCAAGCTTCGCGGCTGCAACCGAAGAAGGCATGGGGAA
AAACATGAACGCAACTAACAAAGCCGTTCTTGATTACTGCAAGAGAGTGCTGATGTACGC
TCTTGAGGATCTTGAGACCATTGTTGAAGAAATGGGTGAAGATTTTCAGCAGAGTGGAAG
TAAGATGGACCAGCTTAAACAATGGTTAACCAGACTCTAGTTGGATGGGCGCGTCCGTTG
TTTAAAGATAGGAAGAATTTCAAGAAAATGGTTGATCCGTTGATGGAAGGAGATTATCCG
GTTAGAGGATTGTATCAAGCGCTTGCGATAGCTGCAATGTGTGTTCAAGATCAGCCTGGT
ATGAGACCGGTGATATTTGATGTAGTAATGGCTTTGGATCACTTGGCTTCTTGCAATTAT
GATCATAATCACAAGGAAAAGCAGTCTAATGTGACAGAGACAAGAGTCGATGTTGAAGAC
AAGAGAGTGATCGAATTTAATGTTTGTATGGAGGAAGGAAAACAAGAGATCAAGATATGT
TCAGCACAAGCAAATTAATCAACAACGGTTCTTTGTTTAAAAAAAAAAAAAAACATTTCT
TTCCAAAAATTTGTAGAATGCTTCGTTTATAGGAGCAACAATTTTGTTTCGAGCGATACT
GTGGTTTCATGC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL7530Contig1 567 2 1 U
GGGAGAGGAAAGTCTCTTTACATTCTCTCAACATTCGCCGTCTTCCTTCCTCTAATCTCT
CTCTCTCCATCGATTTCTTCTCCGCGATTTCAAATGTCGAGCCGTTGGTTGAGACCTGAG
GTGTATCCCTTGTTCGCCGCTACAGGAGCTGCGGTTGGGATCTGTGCGTTCTCGTTGATT
AGGAACATCACCGGAAACCCTGAAGTCAGATGTACCAAGGAGAACAGGGCTGCCGGAATT
TTGGATAACCATGCAGAGGGAGAGAAGTACAAGGAGAATTTCTTGAGGAAGTATGTTCGC
GACAAGCGTCCAGAAATCATGCCTGGCCTCAACAAGTTCTTCACTGATCCTACTTACTGA
ACCCACCATTTTTCTCAAGACTTTCGCACTATTGTTTTACCTGGAATATTGGGATTTTGA
TTGAATCTCTCTCAGTGTCTCTTAATAAAAATCTCATTTGTCATGTTGCTACTTCATTTA
TGCTGGTGGCTTATGTTGTCGCTTTTAAGCAGAATTACAACTATCTGTATTGAACTGCTC
TTTGGATACATAACTGGAGTTTATTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AO19JQ C 1
AF RR2AO19TF U 1
BS 1 567 RR2AO19TF

RD RR2AO19JQ 567 0 0
GGGAGAGGAAAGTCTCTTTACATTCTCTCAACATTCGCCGTCTTCCTTCCTCTAATCTCT
CTCTCTCCATCGATTTCTTCTCCGCGATTTCAAATGTCGAGCCGTTGGTTGAGACCTGAG
GTGTATCCCTTGTTCGCCGCTACAGGAGCTGCGGTTGGGATCTGTGCGTTCTCGTTGATT
AGGAACATCACCGGAAACCCTGAAGTCAGATGTACCAAGGAGAACAGGGCTGCCGGAATT
TTGGATAACCATGCAGAGGGAGAGAAGTACAAGGAGAATTTCTTGAGGAAGTATGTTCGC
GACAAGCGTCCAGAAATCATGCCTGGCCTCAACAAGTTCTTCACTGATCCTACTTACTGA
ACCCACCATTTTTCTCAAGACTTTCGCACTATTGTTTTACCTGGAATATTGGGATTTTGA
TTGAATCTCTCTCAGTGTCTCTTAATAAAAATCTCATTTGTCATGTTGCTACTTCATTTA
TGCTGGTGGCTTATGTTGTCGCTTTTAAGCAGAATTACAACTATCTGTATTGAACTGCTC
TTTGGATACATAACTGGAGTTTATTTT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RR2AO19TF 567 0 0
GGGAGAGGAAAGTCTCTTTACATTCTCTCAACATTCGCCGTCTTCCTTCCTCTAATCTCT
CTCTCTCCATCGATTTCTTCTCCGCGATTTCAAATGTCGAGCCGTTGGTTGAGACCTGAG
GTGTATCCCTTGTTCGCCGCTACAGGAGCTGCGGTTGGGATCTGTGCGTTCTCGTTGATT
AGGAACATCACCGGAAACCCTGAAGTCAGATGTACCAAGGAGAACAGGGCTGCCGGAATT
TTGGATAACCATGCAGAGGGAGAGAAGTACAAGGAGAATTTCTTGAGGAAGTATGTTCGC
GACAAGCGTCCAGAAATCATGCCTGGCCTCAACAAGTTCTTCACTGATCCTACTTACTGA
ACCCACCATTTTTCTCAAGACTTTCGCACTATTGTTTTACCTGGAATATTGGGATTTTGA
TTGAATCTCTCTCAGTGTCTCTTAATAAAAATCTCATTTGTCATGTTGCTACTTCATTTA
TGCTGGTGGCTTATGTTGTCGCTTTTAAGCAGAATTACAACTATCTGTATTGAACTGCTC
TTTGGATACATAACTGGAGTTTATTTT

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL7531Contig1 823 2 4 U
TTTTTCCGAGCAACTAAAATGGTGTTTGCGACCACCACCAACATCCTCCCCCTTCGCTCT
TCAGTCCTCGTCAACCCTAGATTCCACCATCCTCTTAATCGTCGTAATCCGCCTCTCCGT
CTCTCCTTTCCCTACAAACCCTCCCTCAGAAACCCTAGAACCATCGTCTCCGCCGCCGCC
GCCGCCTCCACATCTCCAACACTCTTCGCTAAACCCTCTCCTCGATTTCCCTTCTCCGAC
TCAACCAAATCAATCACGACCCTCGCGATTCTCGCCGGAATCTTAACCAAAGCCCTTGTC
CAAAAGCTCTCCACCGCTGTCGTGACCGTATCCCCACAGATTCAAGCCTCTGTCCGAGTC
TCGGGTCCTCTGTTCTTTGCGGCGATTCGCGATCGTCCTGCTGGTTATCTCAACACTCCG
TTGACGGTTGTTGCGGCTGGTTTGTCCAAGTGGCTAGATATCTACAGTGGTGTGTTGATG
GTTAGGGTTTTACTGAGTTGGTTCCCCAACATTCCTTGGGACCGTCAGCCTTTGTCTGCC
ATTAGGGATCTTTGTGATCCTTATCTCAATCTCTTCAGGAACATCATCCCTCCCGTCTTT
GACACGCTTGACGTCAGCCCTCTCCTTGCTTTTGCTGTTTTGGGAACTTTGGGTTCCATT
CTCAACAATAGCAGATGATTACTACTCTGCTTTGCAGGAGCTTATGGATCTTTGGGTGTT
TTATATATTTTCTCTAGTTAATGTATTGGACTCAAACGCGTCGGTATCAAAATATCTTTT
GTTCTGTGTTTCTGGCACTGAATGAGTTTGGTTTCAATGTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FV21TF U 1
AF RR2FV21JQ C 168
BS 1 697 RR2FV21TF
BS 698 698 RR2FV21JQ
BS 699 738 RR2FV21TF
BS 739 823 RR2FV21JQ

RD RR2FV21TF 738 0 0
TTTTTCCGAGCAACTAAAATGGTGTTTGCGACCACCACCAACATCCTCCCCCTTCGCTCT
TCAGTCCTCGTCAACCCTAGATTCCACCATCCTCTTAATCGTCGTAATCCGCCTCTCCGT
CTCTCCTTTCCCTACAAACCCTCCCTCAGAAACCCTAGAACCATCGTCTCCGCCGCCGCC
GCCGCCTCCACATCTCCAACACTCTTCGCTAAACCCTCTCCTCGATTTCCCTTCTCCGAC
TCAACCAAATCAATCACGACCCTCGCGATTCTCGCCGGAATCTTAACCAAAGCCCTTGTC
CAAAAGCTCTCCACCGCTGTCGTGACCGTATCCCCACAGATTCAAGCCTCTGTCCGAGTC
TCGGGTCCTCTGTTCTTTGCGGCGATTCGCGATCGTCCTGCTGGTTATCTCAACACTCCG
TTGACGGTTGTTGCGGCTGGTTTGTCCAAGTGGCTAGATATCTACAGTGGTGTGTTGATG
GTTAGGGTTTTACTGAGTTGGTTCCCCAACATTCCTTGGGACCGTCAGCCTTTGTCTGCC
ATTAGGGATCTTTGTGATCCTTATCTCAATCTCTTCAGGAACATCATCCCTCCCGTCTTT
GACACGCTTGACGTCAGCCCTCTCCTTGCTTTTGCTGTTTTGGGAACTTTGGGTTCCATT
CTCAACAATAGCAGATGATTACTACTCTGCTTTGCAG*AGCTTATGGATCTTTGGGTGTT
TTATATATTTTCTCTAGT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2FV21JQ 656 0 0
CTCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCACATCTCCAACACTCTTCGCTAAACCCTCTCCTCGATT
TCCCTTCTCCGACTCAACCAAATCAATCACGACCCTCGCGATTCTCGCCGGAATCTTAAC
CAAAGCCCTTGTCCAAAAGCTCTCCACCGCTGTCGTGACCGTATCCCCACAGATTCAAGC
CTCTGTCCGAGTCTCGGGTCCTCTGTTCTTTGCGGCGATTCGCGATCGTCCTGCTGGTTA
TCTCAACACTCCGTTGACGGTTGTTGCGGCTGGTTTGTCCAAGTGGCTAGATATCTACAG
TGGTGTGTTGATGGTTAGGGTTTTACTGAGTTGGTTCCCCAACATTCCTTGGGACCGTCA
GCCTTTGTCTGCCATTAGGGATCTTTGTGATCCTTATCTCAATCTCTTCAGGAACATCAT
CCCTCCCGTCTTTGACACGCTTGACGTCAGCCCTCTCCTTGCTTTTGCTGTTTTGGGAAC
TTTGGGTTCCATTCTCAACAATAGCAGATGATTACTACTCTGCTTTGCAGGAGCTTATGG
ATCTTTGGGTGTTTTATATATTTTCTCTAGTTAATGTATTGGACTCAAACGCGTCGGTAT
CAAAATATCTTTTGTTCTGTGTTTCTGGCACTGAATGAGTTTGGTTTCAATGTGAT

QA 1 656 1 656
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7533Contig1 705 2 2 U
GGGCGGCTCTGCGAAAACTTGGAAAATGGGTGCTTACAAGTATGTGTCTGAGCTATGGAG
GAAGAAACAGTCCGATGTCATGAGGTTCGTGCAGAGGGTTAGGTGCTGGGAGTACAGACA
GCAGCCTTCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGAGGCCAGTGCCAAA
GGGTATTGTGTATGGTAAGCCCACAAACCAGGGAGTCACCCAACTCAAGTTCCAGAGGAG
CAAGCGTTCTGTTGCCGAAGAGCGTGCTGGAAGGAAACTTGGCGGCCTCAGAGTCGTCAA
CTCCTACTGGCTCAACGAGGATTCGACCTACAAGTACTACGAGATCATCTTGGTTGACCC
GGCACACAACGCAGTGCGTAATGACCCGAGGATCAACTGGATCTGCAACCCGGTGCACAA
ACACCGTGAGCTCAGAGGACTTACGTCCGAGGGAAAGAAGAACAGAGGACTGCGCGGAAA
AGGTCACAACAACCACAAGAACCGCCCGTCTCGCAGAGCAACCTGGAAGAAGAACAACTC
TCTCTCCCTTCGTCGTTACCGTTGATTGCTCTTTTGCTATCATCATTGTTTCTGCTGCTT
TCTTCACTCTTCGTTTAGGTTTCATGTTGTTGCTGTTTTATCTATTCCGTGATGACTTTT
TGTTTTTGCAAATTTTGGATACTATACAATTGCCTTCGGATTAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2AC03JQ C 1
AF RR2AC03TF U 1
BS 1 703 RR2AC03TF
BS 704 705 RR2AC03JQ

RD RR2AC03JQ 705 0 0
GGGCGGCTCTGCGAAAACTTGGAAAATGGGTGCTTACAAGTATGTGTCTGAGCTATGGAG
GAAGAAACAGTCCGATGTCATGAGGTTCGTGCAGAGGGTTAGGTGCTGGGAGTACAGACA
GCAGCCTTCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGAGGCCAGTGCCAAA
GGGTATTGTGTATGGTAAGCCCACAAACCAGGGAGTCACCCAACTCAAGTTCCAGAGGAG
CAAGCGTTCTGTTGCCGAAGAGCGTGCTGGAAGGAAACTTGGCGGCCTCAGAGTCGTCAA
CTCCTACTGGCTCAACGAGGATTCGACCTACAAGTACTACGAGATCATCTTGGTTGACCC
GGCACACAACGCAGTGCGTAATGACCCGAGGATCAACTGGATCTGCAACCCGGTGCACAA
ACACCGTGAGCTCAGAGGACTTACGTCCGAGGGAAAGAAGAACAGAGGACTGCGCGGAAA
AGGTCACAACAACCACAAGAACCGCCCGTCTCGCAGAGCAACCTGGAAGAAGAACAACTC
TCTCTCCCTTCGTCGTTACCGTTGATTGCTCTTTTGCTATCATCATTGTTTCTGCTGCTT
TCTTCACTCTTCGTTTAGGTTTCATGTTGTTGCTGTTTTATCTATTCCGTGATGACTTTT
TGTTTTTGCAAATTTTGGATACTATACAATTGCCTTCGGATTAAT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RR2AC03TF 703 0 0
GGGCGGCTCTGCGAAAACTTGGAAAATGGGTGCTTACAAGTATGTGTCTGAGCTATGGAG
GAAGAAACAGTCCGATGTCATGAGGTTCGTGCAGAGGGTTAGGTGCTGGGAGTACAGACA
GCAGCCTTCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCGACAAGAGGCCAGTGCCAAA
GGGTATTGTGTATGGTAAGCCCACAAACCAGGGAGTCACCCAACTCAAGTTCCAGAGGAG
CAAGCGTTCTGTTGCCGAAGAGCGTGCTGGAAGGAAACTTGGCGGCCTCAGAGTCGTCAA
CTCCTACTGGCTCAACGAGGATTCGACCTACAAGTACTACGAGATCATCTTGGTTGACCC
GGCACACAACGCAGTGCGTAATGACCCGAGGATCAACTGGATCTGCAACCCGGTGCACAA
ACACCGTGAGCTCAGAGGACTTACGTCCGAGGGAAAGAAGAACAGAGGACTGCGCGGAAA
AGGTCACAACAACCACAAGAACCGCCCGTCTCGCAGAGCAACCTGGAAGAAGAACAACTC
TCTCTCCCTTCGTCGTTACCGTTGATTGCTCTTTTGCTATCATCATTGTTTCTGCTGCTT
TCTTCACTCTTCGTTTAGGTTTCATGTTGTTGCTGTTTTATCTATTCCGTGATGACTTTT
TGTTTTTGCAAATTTTGGATACTATACAATTGCCTTCGGATTA

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL7534Contig1 765 2 3 U
TTTTTAGTAAATCTCATTCACTTATATAACAAAATCTTGAAAATTTTACACTGGTGTCAT
GTGTGCGGTGGCTCTGACTACAAGTACAACATTGTATCAGAAACCAGTATTCATTCATGT
AAAAGAACATCAGTATCTCAAACTAAAAAAATCATGATGAACCATCTAGATCGAAACAAT
TTTTAACTAAGGTTACTACCAGATTTCTTGGCCTTTTTGCTAGCATGAATCTTAGCATAA
ATCTCCTTTGTCCTATAAGCCAACAGAATATCTAAACAGACTCCAATAATAGAAGCTAAA
GCCATCACCAAGAAGATGAGACGGTAACAATGAGCTCCGACGCAAGTGTTGCCCCCACCA
GGAGTTGGTGTAGCCTCTGCATCGTAAAGGAACCCAGCGAGGAGACCAGAGAAGAGGAAC
GAGCCGAGTGGTAAGTTAAGTATTAAGATGTTGTAGATGAGACCATAGTATTTGAGACCA
AAGAGTTCTGATGCTGTGGGTACGGTAATGGCTAGACGGACACCATAACAAACTCCGACT
ATCATTGAACCGATGTAAAGTGAATTGGGCACAGCAAAAGCCATTAGTAGATACCCTACA
GCCATGAGGATTTGAGATGCTGCGTTCCATAGTGGTCTTGGTGTTCCAGCTTTCTTGAGA
AAGTGTTCGGATAGTGTACCGGAGAAAATACGACCGAAGAAGCCCCAAATGCTAGTCATG
GAGACGAAGATCGAGACGTCAGTGTAACCAAGTGCAAGACCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FF76TF C 1
AF RR2FF76JQ U 5
BS 1 8 RR2FF76TF
BS 9 729 RR2FF76JQ
BS 730 765 RR2FF76TF

RD RR2FF76TF 765 0 0
TTTTTAGTAAATCTCATTCACTTATATA**CAAATCT*GAAAATTTTACACTGGTGTCAT
GTGTGCGGTGGCTCTGACTACAAGTACAACATTGTATCAGAAACCAGTATTCATTCATGT
AAAAGAACATCAGTATCTCAAACTAAAAAAATCATGATGAACCATCTAGATCGAAACAAT
TTTTAACTAAGGTTACTACCAGATTTCTTGGCCTTTTTGCTAGCATGAATCTTAGCATAA
ATCTCCTTTGTCCTATAAGCCAACAGAATATCTAAACAGACTCCAATAATAGAAGCTAAA
GCCATCACCAAGAAGATGAGACGGTAACAATGAGCTCCGACGCAAGTGTTGCCCCCACCA
GGAGTTGGTGTAGCCTCTGCATCGTAGAGGAACCCAGCGAGGAGACCAGAGAAGAGGAAC
GAGCCGAGTGGTAAGTTAAGTATTAAGATGTTGTAGATGAGACCATAGTATTTGAGACCA
AAGAGTTCTGATGCTGTGGGTACGGTAATGGCTAGACGGACACCATAACAAACTCCGACT
ATCATTGAACCGATGTAAAGTGAATTGGGCACAGCAAAAGCCATTAGTAGATACCCTACA
GCCATGAGGATTTGAGATGCTGCGTTCCATAGTGGTCTTGGTGTTCCAGCTTTCTTGAGA
AAGTGTTCGGATAGTGTACCGGAGAAAATACGACCGAAGAAGCCCCAAATGCTAGTCATG
GAGACGAAGATCGAGACGTCAGTGTAACCAAGTGCAAGACCAATC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2FF76JQ 725 0 0
AGTA
AAATCTCATTCACTTATATAACAAAATCTTGAAAATTTTACACTGGTGTCATGTGTGCGG
TGGCTCTGACTACAAGTACAACATTGTATCAGAAACCAGTATTCATTCATGTAAAAGAAC
ATCAGTATCTCAAACTAAAAAAATCATGATGAACCATCTAGATCGAAACAATTTTTAACT
AAGGTTACTACCAGATTTCTTGGCCTTTTTGCTAGCATGAATCTTAGCATAAATCTCCTT
TGTCCTATAAGCCAACAGAATATCTAAACAGACTCCAATAATAGAAGCTAAAGCCATCAC
CAAGAAGATGAGACGGTAACAATGAGCTCCGACGCAAGTGTTGCCCCCACCAGGAGTTGG
TGTAGCCTCTGCATCGTAAAGGAACCCAGCGAGGAGACCAGAGAAGAGGAACGAGCCGAG
TGGTAAGTTAAGTATTAAGATGTTGTAGATGAGACCATAGTATTTGAGACCAAAGAGTTC
TGATGCTGTGGGTACGGTAATGGCTAGACGGACACCATAACAAACTCCGACTATCATTGA
ACCGATGTAAAGTGAATTGGGCACAGCAAAAGCCATTAGTAGATACCCTACAGCCATGAG
GATTTGAGATGCTGCGTTCCATAGTGGTCTTGGTGTTCCAGCTTTCTTGAGAAAGTGTTC
GGATAGTGTACCGGAGAAAATACGACCGAAGAAGCCCCAAATGCTAGTCATGGAGACGAA
G

QA 5 725 5 725
DS 



AS 1 2

CO CL7535Contig1 574 2 1 U
GTGGTGGATGGACTTGTAGCGTTAATGGAAACGATCACGTAGGACCTTTCAATCTTGGTA
ACCCAGGGGAATTCACAATGCTTGAGCTCGCAGAGGTGGTTAAGGAGGTGATTGACTCGA
GCGCAACTATAGAGTTCAGACCGAACACAGCGGATGATCCTCACAAGAGAAAACCAGACA
TAAGCAAAGCAAAGGAACTTCTGAACTGGGAACCAAAGATCTCTCTGCGTGATGGTCTGC
CTCGAATGGTAAGTGACTTCCGTAACCGAATCTTGAACGAAGACGAAGGCAAAGGTCTCT
AAGTGAGAGCCACACAAAGATCTTCCTTCTTGGTTTAAGATTCATATATGTATAGTCTCT
TTCGCAAGAGCTCTGCTAAGTTTTTTTTTTTTTCTTCTCTTCTTGTCTTATTTCTTTTTC
TTTTTCTTTTTTGTTCTTTCATCAGTGACACAAATTACTACTGACATTACTTTAGCTAAT
ATTTGTAGTTGTCTTTAATGGATTACTATTTGGCCAGGCACTAGGGCCCGGTGGACTCAA
TTTTAGTGGAAGAATATAGTAATATTTTCCCGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C729JQ C 1
AF RR2C729TF U 1
BS 1 574 RR2C729TF

RD RR2C729JQ 574 0 0
GTGGTGGATGGACTTGTAGCGTTAATGGAAACGATCACGTAGGACCTTTCAATCTTGGTA
ACCCAGGGGAATTCACAATGCTTGAGCTCGCAGAGGTGGTTAAGGAGGTGATTGACTCGA
GCGCAACTATAGAGTTCAGACCGAACACAGCGGATGATCCTCACAAGAGAAAACCAGACA
TAAGCAAAGCAAAGGAACTTTTGAACTGGGAACCAAAGATCTCTTTGCGTGATGGTCTGC
CTCGAATGGTAAGTGACTTCCGTAACCGAATCTTGAACGAAGACGAAGGCAAAGGTCTCT
AAGTGAGAGCCACACAAAGATCTTCCTTCTTGGTTTAAGATTCATATATGTATAGTCTCT
TTCGCAAGAGCTCTGCTAAGTTTTTTTTTTTTTCTTCTCTTCTTGTCTTATTTCTTTTTC
TTTTTCTTTTTTGTTCTTTCATCAGTGACACAAATTACTACTGACATTACTTTAGCTAAT
ATTTGTAGTTGTCTTTAATGGATTACTATTTGGCCAGGCACTAGGGCCCGGTGGACTCAA
TTTTAGTGGAAGAATATAGTAATATTTTCCCGTT

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2C729TF 574 0 0
GTGGTGGATGGACTTGTAGCGTTAATGGAAACGATCACGTAGGACCTTTCAATCTTGGTA
ACCCAGGGGAATTCACAATGCTTGAGCTCGCAGAGGTGGTTAAGGAGGTGATTGACTCGA
GCGCAACTATAGAGTTCAGACCGAACACAGCGGATGATCCTCACAAGAGAAAACCAGACA
TAAGCAAAGCAAAGGAACTTCTGAACTGGGAACCAAAGATCTCTCTGCGTGATGGTCTGC
CTCGAATGGTAAGTGACTTCCGTAACCGAATCTTGAACGAAGACGAAGGCAAAGGTCTCT
AAGTGAGAGCCACACAAAGATCTTCCTTCTTGGTTTAAGATTCATATATGTATAGTCTCT
TTCGCAAGAGCTCTGCTAAGTTTTTTTTTTTTTCTTCTCTTCTTGTCTTATTTCTTTTTC
TTTTTCTTTTTTGTTCTTTCATCAGTGACACAAATTACTACTGACATTACTTTAGCTAAT
ATTTGTAGTTGTCTTTAATGGATTACTATTTGGCCAGGCACTAGGGCCCGGTGGACTCAA
TTTTAGTGGAAGAATATAGTAATATTTTCCCGTT

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL7536Contig1 724 2 1 U
GGCTCCTACGACCTGTCATCCGTCCAAAAACTTTCGTGAGTCTGTACCATCCTTCTCTAA
TGTCCGTAAACGTCAAGGACGAGCCAGTGCTTGCGCCTAACTGCGATGTCATCGAGAACA
CAGAGGTTGAAGTTGTCAATGGAGATGAGGGAAGTAAGCTTGAGGATTATGGGACTTGCG
TTGATGTTATAACCGAGAGAGTCAATCAGCTTGAGCAGAAAGTTGTGGAGGTTGAACAGT
TTTACTCTACCAAAGACGGAGCAGGTCAAACAAACACTTCCAAGAGTAACTCCGGTGGGA
AAAAAGTTGCTATCTCTCAACCCTCCAAGTGTAGCTCTGCTGGGAAAGATAAAGCAAGAG
GGAAACATGTTTCCAGCCCTGAACTTATGCGTCAGTTTGCTACAATTTTTCGTCAGATTG
CTCAACAAAAATGGGCGTGGCCATTTCTGCAACCTGTTGATGTTAAAGGGCTTGGACTCG
ATGATTATCACAAGGTTATAGAGAAGCCAATGGATTTGGGAACTATTAAAACTAAAATGG
AAGGTTCAGAGTACAGCAATGTCCGGGAGATATATGCTGATGTTAGGCTAGTTTTCAAGA
ACGCTATGAGATATAACGAAGAGAAAGATGATGTCTATGTGATGGCTGAGTCTCTTTTGG
AGAAGTTTGAGGAGAAGTGGCTTACCATTATGCCTAGACTCGTCGAAGAGGAAAGAAACA
AGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2CT72TF U 6
AF RR2DN25TF U 1
BS 1 724 RR2DN25TF

RD RR2CT72TF 663 0 0
GG
ACGACCTGTCATCCGTCCAAAAACTTTCGTGAGTCTGTACCATCCTTCTCTAATGTCCGT
AAACGTCAAGGAGGAGCCAGTGCTTGCGCCTAACTGCGATGTCATCGAGAACACAGAGGT
TGAAGTTGTCAATGGAGATGAGGGAAGTAAGCTTGAGGATTATGGGACTTGCGTTGATGT
TATAACCGAGAGAGTCAATCAGCTTTAGCAGAAAGTTGTGGAGGTTGAACAGTTTTACTC
TACCAAAGACGGAGCAGGTCAAACAAACACTTCCAAGAGTAACTCCGGTGGGAAAAAAGT
TGCTATCTCTCAACCCTCCAAGTGTAGCTCTGCTGGGAAAGATAAAGCAAGAGGGAAACA
TGTTTCCAGCCCTGAACTTATGCGTCAGTTTGCTACAATTTTTCGTCAGATTGCTCAACA
AAAATGGGCGTGGCCATTTCTGCAACCTGTTGATGTTAAAGGGCTTGGACTCGATGATTA
TCACAAGGTTATAGAGAAGCCAATGGATTTGGGAACTATTAAAACTAAAATGGAAGGTTC
AGAGTACAGCAATGTCCGGGAGATATATGCTGATGTTAGGCTAGTTTTCAAGAACGCTAT
GAGATATAACGAAGAGAAAGATGATGTCT**GTGATGGCTGAGTCTCTTTTGGAGAAGTT
T

QA 3 663 3 663
DS 

RD RR2DN25TF 724 0 0
GGCTCCTACGACCTGTCATCCGTCCAAAAACTTTCGTGAGTCTGTACCATCCTTCTCTAA
TGTCCGTAAACGTCAAGGACGAGCCAGTGCTTGCGCCTAACTGCGATGTCATCGAGAACA
CAGAGGTTGAAGTTGTCAATGGAGATGAGGGAAGTAAGCTTGAGGATTATGGGACTTGCG
TTGATGTTATAACCGAGAGAGTCAATCAGCTTGAGCAGAAAGTTGTGGAGGTTGAACAGT
TTTACTCTACCAAAGACGGAGCAGGTCAAACAAACACTTCCAAGAGTAACTCCGGTGGGA
AAAAAGTTGCTATCTCTCAACCCTCCAAGTGTAGCTCTGCTGGGAAAGATAAAGCAAGAG
GGAAACATGTTTCCAGCCCTGAACTTATGCGTCAGTTTGCTACAATTTTTCGTCAGATTG
CTCAACAAAAATGGGCGTGGCCATTTCTGCAACCTGTTGATGTTAAAGGGCTTGGACTCG
ATGATTATCACAAGGTTATAGAGAAGCCAATGGATTTGGGAACTATTAAAACTAAAATGG
AAGGTTCAGAGTACAGCAATGTCCGGGAGATATATGCTGATGTTAGGCTAGTTTTCAAGA
ACGCTATGAGATATAACGAAGAGAAAGATGATGTCTATGTGATGGCTGAGTCTCTTTTGG
AGAAGTTTGAGGAGAAGTGGCTTACCATTATGCCTAGACTCGTCGAAGAGGAAAGAAACA
AGCA

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL7537Contig1 793 2 2 U
GGCAAGGAAGTGTTCTCCGATGGCGGTCCTGGAGTTATTCCTTCTCAAGATAAAATCCAG
CAGCTTCGAGACATTCTTGACAACATGAAACCAGAGGATGTCGGATTAACTCCGACCATG
CCGTATTTCCGACCAGACTACGGACCGGAGAGCGGGTCTTCGCCGCCGATAACGTATCTG
CATCTACACCAATGCGAACAATTCTCGATTGGGATTTTCTGTTTGCCGCCTTCTGGTGTC
ATTCCTCTTCATAACCATCCAGGGATGACGGTGTTTAGCAAGCTTCTCTTTGGTACAATG
CACATCAAGTCGTATGATTGGGTTGCTGATGCTCCAATGAGAGATCCGAAAACCCGGTTG
GCAAAACTGAAGATGGACTCAACGTTAACCGCACCATGCAACGCCTCCATTCTGTACCCG
GAAGATGGTGGGAACATGCATAGGTTCACAGCCAGAACAGCGTGCGCGGTTCTAGACGTG
CTTGGCCCTCCTTACTGCAATCCAGAAGGCAGACATTGTACTTACTTCTTAGAGTTCCCT
TTAGACAACTTCTCATCAGAGGAAGATAACGTTTTGAGAGGTGAAGTGGAGAAAGAAGGT
CATGCATGGCTGCAAGAAAGAGATGATAAACCAGAGGATCTTAACGTAGTTGGAGCTTTA
TACACAGGCCCAAAGGTTGAGGACTGAGAGCTTTTTTTTATCTATTGCACTTACTTTTTC
AGATTTGGAATCAGTTTTTTTTCTCTTTTTTTTATTGGCCTTCTTAGTTTAAATTCTTCT
TTGTACATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C945TF U 1
AF RR2C945JQ C 92
BS 1 664 RR2C945TF
BS 665 793 RR2C945JQ

RD RR2C945TF 664 0 0
GGCAAGGAAGTGTTCTCCGATGGCGGTCCTGGAGTTATTCCTTCTCAAGATAAAATCCAG
CAGCTTCGAGACATTCTTGACAACATGAAACCAGAGGATGTCGGATTAACTCCGACCATG
CCGTATTTCCGACCAGACTACGGACCGGAGAGCGGGTCTTCGCCGCCGATAACGTATCTG
CATCTACACCAATGCGAACAATTCTCGATTGGGATTTTCTGTTTGCCGCCTTCTGGTGTC
ATTCCTCTTCATAACCATCCAGGGATGACGGTGTTTAGCAAGCTTCTCTTTGGTACAATG
CACATCAAGTCGTATGATTGGGTTGCTGATGCTCCAATGAGAGATCCGAAAACCCGGTTG
GCAAAACTGAAGATGGACTCAACGTTAACCGCACCATGCAACGCCTCCATTCTGTACCCG
GAAGATGGTGGGAACATGCATAGGTTCACAGCCAGAACAGCGTGCGCGGTTCTAGACGTG
CTTGGCCCTCCTTACTGCAATCCAGAAGGCAGACATTGTACTTACTTCTTAGAGTTCCCT
TTAGACAACTTCTCATCAGAGGAAGATAACGTTTTGAGAGGTGAAGTGGAGAAAGAAGGT
CATGCATGGCTGCAAGAAAGAGATGATAAACCAGAGGATCTTAACGTAGTTGGAGCTTTA
TACA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2C945JQ 702 0 0
CAGAGGATGTCGGATTAACTCCGACCATGCCGTATTTCCGACCAGACTACGGACCGGAGA
GCGGGTCTTCGCCGCCGATAACGTATCTGCATCTACACCAATGCGAACAATTCTCGATTG
GGATTTTCTGTTTGCCGCCTTCTGGTGTCATTCCTCTTCATAACCATCCAGGGATGACGG
TGTTTAGCAAGCTTTTCTTTGGTACAATGCACATCAAGTCGTATGATTGGGTTGCTGATG
CTCCAATGAGAGATCCGAAAACCCGGTTGGCAAAACTGAAGATGGACTCAACGTTAACCG
CACCATGCAACGCCTCCATTCTGTACCCGGAAGATGGTGGGAACATGCATAGGTTCACAG
CCAGAACAGCGTGCGCGGTTCTAGACGTGCTTGGCCCTCCTTACTGCAATCCAGAAGGCA
GACATTGTACTTACTTCTTAGAGTTCCCTTTAGACAACTTCTCATCAGAGGAAGATAACG
TTTTGAGAGGTGAAGTGGAGAAAGAAGGTCATGCATGGCTGCAAGAAAGAGATGATAAAC
CAGAGGATCTTAACGTAGTTGGAGCTTTATACACAGGCCCAAAGGTTGAGGACTGAGAGC
TTTTTTTTATCTATTGCACTTACTTTTTCAGATTTGGAATCAGTTTTTTTTCTCTTTTTT
TTATTGGCCTTCTTAGTTTAAATTCTTCTTTGTACATAAAAA

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL7538Contig1 876 2 2 U
GGAAAGTGGGATACCTTCTTCCTCATAACTCCTATGACATTTATTCAACTTCCTGGTTAT
TCTATACTTATTAATGGTTTCAAATCAAGCTTCTTACATCTTGGTTTATGCTGGCTTGAT
ATGAATCATCAAGATATTGCGATATGTCCGAACAGGCTAATCTGGAATCATCTGAATAGA
AAGTGGGATAACTTCTTCCTCATAACTCCTATGAGATTTATTCAACTTCCTGGTCATTCT
ATACTTACTAATGATTTCAAATCAAGCTTCTTACATCTTGGTTCCTCCTGGTTTGATAAG
AATCATGAAGATATTCACTACAAGGGAAGGAGGTAAAGATAGCATAAGAAGATAGCGTTC
TAGGTCAAAATGCCATCTTTGATACAACTCATGATTTAAGATAGCGTTTTATTTTATCAA
TGCTATAAAAACTCTATATATAACATTAAAACGCAATCTTAAGTCTAGGCGGAAAATAAT
TTCACTTTTCCCGCTCCTAAATACTTAGTGAAAATAAAAGTGAGGCAAATATTTTCATTT
TCCCACACTTAGAAAAAAACAATAGAAAATAGTCCTTATCTTTGGGTCTAACTGGTGACC
AAGGAATGAAGAGGAATAATGCATTCCTTAATGTTCCTAACAAATTTTACCATTCATTAA
GAATAGTCATTCCTTTTCATTCCTTCTCATTCCTTTTATTGTAGAGAATTAAAGAACAAA
TTTATTCCTCACTAAATTTGATATGGAATAACCGTTCCTCATCATTCCCATAATTTTATT
CCCATCAATTATTTTCCTTTTTGTTCCTACTATTCCCGAGATGGTCACCCAGTTAGACCC
TTTATCTGTCTCTCGACAACCCTATCCCCCTCCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BQ68TF U 1
AF RR2BQ68JQ C 71
BS 1 643 RR2BQ68TF
BS 644 876 RR2BQ68JQ

RD RR2BQ68TF 643 0 0
GGAAAGTGGGATACCTTCTTCCTCATAACTCCTATGACATTTATTCAACTTCCTGGTTAT
TCTATACTTATTAATGGTTTCAAATCAAGCTTCTTACATCTTGGTTTATGCTGGCTTGAT
ATGAATCATCAAGATATTGCGATATGTCCGAACAGGCTAATCTGGAATCATCTGAATAGA
AAGTGGGATAACTTCTTCCTCATAACTCCTATGAGATTTATTCAACTTCCTGGTCATTCT
ATACTTACTAATGATTTCAAATCAAGCTTCTTACATCTTGGTTCCTCCTGGTTTGATAAG
AATCATGAAGATATTCACTACAAGGGAAGGAGGTAAAGATAGCATAAGAAGATAGCGTTC
TAGGTCAAAATGCCATCTTTGATACAACTCATGATTTAAGATAGCGTTTTATTTTATCAA
TGCTATAAAAACTCTATATATAACATTAAAACGCAATCTTAAGTCTAGGCGGAAAATAAT
TTCACTTTTCCCGCTCCTAAATACTTAGTGAAAATAAAAGTGAGGCAAATATTTTCATTT
TCCCACACTTAGAAAAAAACAATAGAAAATAGTCCTTATCTTTGGGTCTAACTGGTGACC
AAGGAATGAAGAGGAATAATGCATTCCTTAATGTTCCTAACAA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2BQ68JQ 806 0 0
ATTAATGG
TTCAAATCAAGCTTCTTACATCTTGGTTTATGCTGGCTTGATATGAATCATCAAGATATT
GCGATATGTCCGAACAGGCTAATCTGGAATCATCTGAATAGAAAGTGGGATAACTTCTTC
CTCATAACTCCTATGAGATTTATTCAACTTCCTGGTCATTCTATACTTACTAATGATTTC
AAATCAAGCTTCTTACATCTTGGTTCCTCCTGGTTTGATAAGAATCATGAAGATATTCAC
TACAAGGGAAGGAGGTAAAGATAGCATAAGAAGATAGCGTTCTAGGTCAAAATGCCATCT
TTGATACAACTCATGATTTAAGATAGCGTTTTATTTTATCAATGCTATAAAAACTCTATA
TATAACATTAAAACGCAATCTTAAGTCTAGGCGGAAAATAATTTCACTTTTCCCGCTCCT
AAATACTTAGTGAAAATAAAAGTGAGGCAAATATTTTCATTTTCCCACACTTAGAAAAAA
ACAATAGAAAATAGTCCTTATCTTTGGGTCTAACTGGTGACCAAGGAATGAAGAGGAATA
ATGCATTCCTTAATGTTCCTAACAAATTTTACCATTCATTAAGAATAGTCATTCCTTTTC
ATTCCTTCTCATTCCTTTTATTGTAGAGAATTAAAGAACAAATTTATTCCTCACTAAATT
TGATATGGAATAACCGTTCCTCATCATTCCCATAATTTTATTCCCATCAATTATTTTCCT
TTTTGTTCCTACTATTCCCGAGATGGTCACCCAGTTAGACCCTTTATCTGTCTCTCGACA
ACCCTATCCCCCTCCCCG

QA 9 806 9 806
DS 



AS 1 2

CO CL7539Contig1 627 2 2 U
GGGAAGCCGCAGCGAGAGAGAGAGAGTAGCATCACAAACCGCAGAGCTCAGTGTGATCTC
GGAGAAATCGCAGCAGCCATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAGGACCAGGAAGCAGTTT
GTTATTGATGTTCTTCACCCAGGAAGAGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAG
TTGGCAAGGATGTACGAGGTTAAGGACCCAAACGCAATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACC
CACTTTGGAGGTGGCAAATCTTCTGGATTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGTGCC
AAGAAGTTCGAGCCCAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGACTTGACACCAAGATTGAGAAA
TCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGGGCCAAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAG
ACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTGAGGTGTTAAAGACTAGCCGGCAGCATTTTGG
GTTTTGTTCTGCATCATCCCTTCTTTATTTGGATTTTGTACTTGTCATTGTCACATTGTT
CTGTCTCGTTTTGCATTATGCGTTAAGCTTTAGAGAATCATGTGCTAAAGATTTTGCTGA
ATACATTTATTTAAAAAACTTCGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BE36JQ C 1
AF RR2BE36TF U 59
BS 1 58 RR2BE36JQ
BS 59 627 RR2BE36TF

RD RR2BE36JQ 627 0 0
GGGAAGCCGCAGCGAGAGAGAGAGAGTAGCATCACAAACCGCAGAGCTCAGTGTGATCTC
GGAGAAATCGCAGCAGCCATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAGGACCAGGAAGCAGTTT
GTTATTGATGTTCTTCACCCAGGAAGAGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAG
TTGGCAAGGATGTACGAGGTTAAGGACCCAAACGCAATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACC
CACTTTGGAGGTGGCAAATCTTCTGGATTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGTGCC
AAGAAGTTCGAGCCCAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGACTTGACACCAAGATTGAGAAA
TCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGGGCCAAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAG
ACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTGAGGTGTTAAAGACTAGCCGGCAGCATTTTGG
GTTTTGTTCTGCATCATCCCTTCTTTATTTGGATTTTGTACTTGTCATTGTCACATTGTT
CTGTCTCGTTTTGCATTATGCGTTAAGCTTTAGAGAATCATGTGCTAAAGATTTTGCTGA
ATACATTTATTTAAAAAACTTCGCTCC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2BE36TF 569 0 0
TCGGAGAAATCGCAGCAGCCATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAGGACCAGGAAGCAGT
TTGTTATTGATGTTCTTCACCCAGGAAGAGCCAATGTTTCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGA
AGTTGGCAAGGATGTACGAGGTTAAGGACCCAAACGCAATCTTTGTTTTCAAATTCAGAA
CCCACTTTGGAGGTGGCAAATCTTCTGGATTTGGTTTGATCTATGACAATGTCGAGAGTG
CCAAGAAGTTCGAGCCCAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGACTTGACACCAAGATTGAGA
AATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGGGCCAAGAAAATCCGTGGTGTTAAGA
AGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTGAGGTGTTAAAGACTAGCCGGCAGCATTTT
GGGTTTTGTTCTGCATCATCCCTTCTTTATTTGGATTTTGTACTTGTCATTGTCACATTG
TTCTGTCTCGTTTTGCATTATGCGTTAAGCTTTAGAGAATCATGTGCTAAAGATTTTGCT
GAATACATTTATTTAAAAAACTTCGCTCC

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

CO CL7540Contig1 683 2 2 U
GGACTCACAAATCTCATAACCTCTTCCACTGCATTATCATCTCACTCGTCCAAATCGATC
TTCGCTCGCAATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAGGCATTCGGAGGAAGGAAAGCCGG
CGGACCAAAGACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCGGTCGG
AAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCACAGAGACTCGGTGGCGGAGCTCC
GGTTTACATGGCCGCCGTGCTCGAATACCTCGCAGCCGAAGTTTTGGAGCTTGCTGGTAA
CGCGGCGAGAGACAACAAGAAGTCGAGGATCATCCCGAGGCATCTTCTGTTGGCGATTAA
GAATGATGAGGAGCTGGGGAAGCTTTTGAGTGGAGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTGTT
GCCTAACATCAATTCTGTTTTGCTGCCTAAGAAGTCTGCTAAGTCGACCGAGGAAGCTGC
GTCCAAGTCACCGGCTAAGTCTCCTAAGAAGGCTTAAGCGACACGATGTTGCTTTTTATT
TGTGTTCTTTGTGTTGAGATTGGTGAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTTTTATGTTT
TAATTATGTAATCTGGGGTTTGATTCTCTTCGGATCCAACTTTCTAAGTTTTAACAATTT
ATAAAATCTTTGCAATTTGCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2FJ12TF U 1
AF RR2FJ12JQ C 38
BS 1 681 RR2FJ12TF
BS 682 683 RR2FJ12JQ

RD RR2FJ12TF 681 0 0
GGACTCACAAATCTCATAACCTCTTCCACTGCATTATCATCTCACTCGTCCAAATCGATC
TTCGCTCGCAATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAGGCATTCGGAGGAAGGAAAGCCGG
CGGACCAAAGACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCGGTCGG
AAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCACAGAGACTCGGTGGCGGAGCTCC
GGTTTACATGGCCGCCGTGCTCGAATACCTCGCAGCCGAAGTTTTGGAGCTTGCTGGTAA
CGCGGCGAGAGACAACAAGAAGTCGAGGATCATCCCGAGGCATCTTCTGTTGGCGATTAA
GAATGATGAGGAGCTGGGGAAGCTTTTGAGTGGAGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTGTT
GCCTAACATCAATTCTGTTTTGCTGCCTAAGAAGTCTGCTAAGTCGACCGAGGAAGCTGC
GTCCAAGTCACCGGCTAAGTCTCCTAAGAAGGCTTAAGCGACACGATGTTGCTTTTTATT
TGTGTTCTTTGTGTTGAGATTGGTGAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTTTTATGTTT
TAATTATGTAATCTGGGGTTTGATTCTCTTCGGATCCAACTTTCTAAGTTTTAACAATTT
ATAAAATCTTTGCAATTTGCT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2FJ12JQ 646 0 0
CATCTCACTCGTCCAAATCGATCTTCGCTCGCAATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAG
GCATTCGGAGGAAGGAAAGCCGGCGGACCAAAGACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAA
GCCGGTCTCCAATTCCCGGTCGGAAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCA
CAGAGACTCGGTGGCGGAGCTCCGGTTTACATGGCCGCCGTGCTCGAATACCTCGCAGCC
GAAGTTTTGGAGCTTGCTGGTAACGCGGCGAGAGACAACAAGAAGTCGAGGATCATCCCG
AGGCATCTTCTGTTGGCGATTAAGAATGATGAGGAGCTGGGGAAGCTTTTGAGTGGAGTC
ACGATCGCTCACGGTGGTGTGTTGCCTAACATCAATTCTGTTTTGCTGCCTAAGAAGTCT
GCTAAGTCGACCGAGGAAGCTGCGTCCAAGTCACCGGCTAAGTCTCCTAAGAAGGCTTAA
GCGACACGATGTTGCTTTTTATTTGTGTTCTTTGTGTTGAGATTGGTGAATGCATATGTA
GAAAATCTCTAGCTTTTATGTTTTAATTATGTAATCTGGGGTTTGATTCTCTTCGGATCC
AACTTTCTAAGTTTTAACAATTTATAAAATCTTTGCAATTTGCTTT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL7541Contig1 779 2 2 U
GCCTGCCCCCGCCTTCTCAAGATTCATCAAACGCAGACACCTACTTCTGGGAGATTGAAG
GGTCAAAGGCAAAAGGTTTCTCAACTAAGGAGACTTGGGAGGTACTCCGACCACGTGAGC
AACTAAAAGACTGGGCGCCTTCTGTCTGGTTTAAAGGTGCTGTTCCACGTCAATCTTTCA
CTCACTGGGTAGCTCAGTATGATCGGCTCCCTACAAGGGAAAGGTTGGCGAGTTGGGGCT
TACAGGTCCCTTTATGCTGCTGCCTCTGTAATACCATGATTGAGAACAGAGATCATCTTT
TCCTGAGATGCACTTGGTCAGAGGAACTCTGGAATATGGTTCTGCGTAGATTAGGCCTAA
GTCAATTGGCTTTTCACACATGGACAGCTTTCTCGGAGTGGCTAAAATTAAGGATCCCTC
ACTGCTCTAGGCTCCTCAAATGTCTTGTCTCCCAAGCAACAATCTACAACATCTGGGTCT
CAAGGAACAGAAGATTACACGACAACAACAACTCAACACCAGCCCAAGTCTTCAAGATCA
TTGACCGCCAAGTCCGTGACACCATTCTAGGACACCGGCAACAACAGAAATTCAGCGACC
TAATGCAACATTGGCTTGCTTTTGAGTAAACCCACAGCCACTTCCATTCTTGTTGGAAAT
TTCTCACCTAGACTGAGCCCTGTTTTTATTATTTTTGCCAGGGCAAATTCTAGTTTGTTT
AAAAAAACTATTGTATCTTTACAATCCCGCTTCATTAATATGAAAATTCACATTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA85TF U 1
AF RR2BA85JQ C 18
BS 1 720 RR2BA85TF
BS 721 779 RR2BA85JQ

RD RR2BA85TF 720 0 0
GCCTGCCCCCGCCTTCTCAAGATTCATCAAACGCAGACACCTACTTCTGGGAGATTGAAG
GGTCAAAGGCAAAAGGTTTCTCAACTAAGGAGACTTGGGAGGTACTCCGACCACGTGAGC
AACTAAAAGACTGGGCGCCTTCTGTCTGGTTTAAAGGTGCTGTTCCACGTCAATCTTTCA
CTCACTGGGTAGCTCAGTATGATCGGCTCCCTACAAGGGAAAGGTTGGCGAGTTGGGGCT
TACAGGTCCCTTTATGCTGCTGCCTCTGTAATACCATGATTGAGAACAGAGATCATCTTT
TCCTGAGATGCACTTGGTCAGAGGAACTCTGGAATATGGTTCTGCGTAGATTAGGCCTAA
GTCAATTGGCTTTTCACACATGGACAGCTTTCTCGGAGTGGCTAAAATTAAGGATCCCTC
ACTGCTCTAGGCTCCTCAAATGTCTTGTCTCCCAAGCAACAATCTACAACATCTGGGTCT
CAAGGAACAGAAGATTACACGACAACAACAACTCAACACCAGCCCAAGTCTTCAAGATCA
TTGACCGCCAAGTCCGTGACACCATTCTAGGACACCGGCAACAACAGAAATTCAGCGACC
TAATGCAACATTGGCTTGCTTTTGAGTAAACCCACAGCCACTTCCATTCTTGTTGGAAAT
TTCTCACCTAGACTGAGCCCTGTTTTTATTATTTTTGCCAGGGCAAATTCTAGTTTGTTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2BA85JQ 762 0 0
CAAGATTCATCAAACGCAGACACCTACTTCTGGGAGATTGAAGGGTCAAAGGCAAAAGGT
TTCTCAACTAAGGAGACTTGGGAGGTACTCCGACCACGTGAGCAACTAAAAGACTGGGCG
CCTTCTGTCTGGTTTAAAGGTGCTGTTCCACGTCAATCTTTCACTCACTGGGTAGCTCAG
TATGATCGGCTCCCTACAAGGGAAAGGTTGGCGAGTTGGGGCTTACAGGTCCCTTTATGC
TGCTGCCTCTGTAATACCATGATTGAGAACAGAGATCATCTTTTCCTGAGATGCACTTGG
TCAGAGGAACTCTGGAATATGGTTCTGCGTAGATTAGGCCTAAGTCAATTGGCTTTTCAC
ACATGGACAGCTTTCTCGGAGTGGCTAAAATTAAGGATCCCTCACTGCTCTAGGCTCCTC
AAATGTCTTGTCTCCCAAGCAACAATCTACAACATCTGGGTCTCAAGGAACAGAAGATTA
CACGACAACAACAACTCAACACCAGCCCAAGTCTTCAAGATCATTGACCGCCAAGTCCGT
GACACCATTCTAGGACACCGGCAACAACAGAAATTCAGCGACCTAATGCAACATTGGCTT
GCTTTTGAGTAAACCCACAGCCACTTCCATTCTTGTTGGAAATTTCTCACCTAGACTGAG
CCCTGTTTTTATTATTTTTGCCAGGGCAAATTCTAGTTTGTTTAAAAAAACTATTGTATC
TTTACAATCCCGCTTCATTAATATGAAAATTCACATTTTGGC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL7542Contig1 799 2 16 U
TTTTTGAAGCAGGAGATAGATTTTCGGTGTGCTGTTCCTTTGTGGGGGTTTTACAACGCT
GCTCTAAACTTTGGTGTCTCTGGAGGTGTCACATTCCCATGGGGAAGCGGATACCAAAAC
CGCCCTTCCTCTGTGCCAGAGAGGTTCTTCTTGGGTGGAAATTCATCACCTGTATGCTCT
TTAGGTGGGCCATCAGCTCTATGGGGATTCAAGACCAGAGGACTTGGTCCCAACGAGCCA
AAGAGGAAAGGAGATAACGAAAGAGATTTCGTTGGAGGAGACGCTGCCGTGACTGCATTT
GCGGATCTCTCATTTGATTTGCCAGTGAGATGGTTAAGAGAGAGAGGTGTGCACGGGCAT
GTGTTTGCTTGTGCTGGGAATATGGCAAAACTATCAGAGAATGAGTTTAGAAACTTAACT
GCTCCAAAGTTGTTGGAGACGTTTAGAACTTCAGTTGGTGCTGGATTCGTGTTGCCAACT
AGTCTTTTCCGTATGGAGATTAACTACTGCCATATATTGAAGAAGCAAGAACACGATCGA
GCCAAATCTGGTTTTTTCCTGACATTCTCAGCCTGAGGAACTTTATTTGAAGAAGGTACT
CAATATGATATGACCTCTTTCTTTTTCTTAAGCTGTTCTGCAATGTCTGGCAGAATCTTT
GGTTTCAGGGCATATCTTATTTCATTGTTGAATCTAAATTGTTTTGAAAGAGTTGATTTT
TTTTTTGGTCATGTTTTGCATGGAGTTCTCATTTTTGGACTCACGAGAAATAAGAAGAGG
AAGAATAATTGTTCTCCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G233TF U 1
AF RR2DY02JQ C 128
BS 1 134 RR2G233TF
BS 135 135 RR2DY02JQ
BS 136 353 RR2G233TF
BS 354 354 RR2DY02JQ
BS 355 389 RR2G233TF
BS 390 390 RR2DY02JQ
BS 391 400 RR2G233TF
BS 401 401 RR2DY02JQ
BS 402 669 RR2G233TF
BS 670 670 RR2DY02JQ
BS 671 697 RR2G233TF
BS 698 698 RR2DY02JQ
BS 699 722 RR2G233TF
BS 723 725 RR2DY02JQ
BS 726 755 RR2G233TF
BS 756 799 RR2DY02JQ

RD RR2G233TF 757 0 0
TTTTTGAAGCAGGAGATAGATTTTCGGTGTGCTGTTCCTTTGTGGGGGTTTTACAACGCT
GCTCTAAACTTTGGTGTCTCTGGAGGTGTCACATTCCCATGGGGAAGCGGATACCAAAAC
CGCCCTTCCTCTGTTCCAGAGAGGTTCTTCTTGGGTGGAAATTCATCACCTGTATGCTCT
TTAGGTGGGCCATCAGCTCTATGGGGATTCAAGACCAGAGGACTTGGTCCCAACGAGCCA
AAGAGGAAAGGAGATAACGAAAGAGATTTCGTTGGAGGAGACGCTGCCGTGACTGCATTT
GCGGATCTCTCATTTGATTTGCCAGTGAGATGGTTAAGAGAGAGAGGTGTGCATGGGCAT
GTGTTTGCTTGTGCTGGGAATATGGCAAAGCTATCAGAGAGTGAGTTTAGAAACTTAACT
GCTCCAAAGTTGTTGGAGACGTTTAGAACTTCAGTTGGTGCTGGATTCGTGTTGCCAACT
AGTCTTTTCCGTATGGAGATTAACTACTGCCATATATTGAAGAAGCAAGAACACGATCGA
GCCAAATCTGGTTTTTTCCTGACATTCTCAGCCTGAGGAACTTTATTTGAAGAAGGTACT
CAATATGATATGACCTCTTTCTTTTTCTTAAGCTGTTCTGCAATGTCTGGCAGAATCTTT
GGTTTCAGG*CATATCTTATTTCATTGTTGAATCTAA*TTGTTTTGAAAGAGTTGATTTT
TT***TGGTCATGTTTTGCATGGAGTTCTCATTTT
GG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2DY02JQ 672 0 0
CCTCTGTGCCAGAGAGGTTCTTCTTGGGTGGCAATTCGTCTCCTGTATGCTCTTTAGGTG
GGCCATCAGCTCTATGGGGATTCGAGACCAGAGGACTTGGTCCCAACGAGCCAAAGAGGA
AAGGAGATAACGAAAGAGATTTCGTTGGAGGAGACGCTGCCGTGACTGCATTTGCGGATC
TCTCATTTGATTTGCCAGTGAGATGGTTAAGAGAGAGAGGTGTGCACGGGCATGTGTTTG
CTTGTGCTGGGAATATGGCAAAACTATCAGATAATGAGTTTAGAAACTTAACTGCTCCAA
AGTTGTTGGAGACGTTTAGAACTTCAGTTGGTGCTGGATTCGTGTTGCCAACTAGTCTTT
TCCGTATGGAGATTAACTACTGCCATATATTGAAGAAGCAAGAACACGATCGAGCCAAAT
CTGGTTTTTTCCTGACATTCTCAGCCTGAGGAACTTTATTTGAAGAAGGTACTCAATATG
ATATGACCTCTTTCTTTTTCTTAAGCTGTTCTGCAATGTCTGGCAGAATCTTTGGTTTCA
GGGCATATCTTATTTCATTGTTGAATCTAAATTGTTTTGAAAGAGTTGATTTTTTTTTTG
GTCATGTTTTGCATGGAGTTCTCATTTTTGGACTCACGAGAAATAAGAAGAGGAAGAATA
ATTGTTCTCCTG

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL7543Contig1 1222 2 2 U
GGGCGTTACGTCAATTTGTAGAAGCAATCGTTTTCTCCAATTTTTCGAAAAACATCATCC
TTCGAAGCTCCGAAGCTCTCTCTCCTCCTCCTCCGGCAATCTCCGTTATCTCTTCCGGTT
TTTGAATTTGATCGATCGAATGGGGAAAATCAAGAAAGTGAATCGTAGGAATCGCGTTGC
TGCTCCTTACACATCAGCACCGTCTTGTTGCAAGAAAGAATGGGCAGGCTCGACCTGTCC
AGTATGTTTGGAGTCTCCGCACAACGCTGTTCTTCTCCTGTGTTCATCCTATCACAAAGG
ATGCCGTCCTTACATGTGCGCGACGAGCAGCCGTTTCGCCAACTGTCTTGACCAGTACAA
GAAGTCGTACGGTAACGAAGAAGACTCGGAGCAGCCTCAGAAGCTTCTGTGTCCGCTATG
CAGAGGTCAGGTGAAAGGCTGGACTGTCGTGGAAGACGCGCGTTTGCATTTCAACTCCAA
GCGAAGGACCTGTATGCAGGAGAAGTGTTCCTTTGTGGGGAACTTCAAGAAGTTCAAGAA
GCACATGAAGGAGAAGCACCCGGATGCTTGTCCTAGGGCTATTGATCCGGCTCTTGAGAC
CAAATGGAAGAGGCTGGAGAGGGAGAGAGACAGAAGAGACGTGATAAGCACGATCATGTC
GTCGATACCAGGTGCTGTTGTGTTGGGGGGATTATGTCATAGAGCCTCGTAACGGAGGTG
TTTATGATGAAGAAGATGATGATGATTACAGCTCAGATGATGATGATGATATGAGCAACA
ACGGTGTACTGGATCTTGATTCATGGCAAGGACAAGGCCATCACATTCGGTTTATAGATA
TGGATGCAAGCGACTTTGCATCGTCTTCCCGTTCCCATGCTTCTCCAAGCAGTTTGCTCT
TCCCAAGGAACCAGAGAGGCGGCAATAGAGATCGGCAACTATGATTTAACACCGAAGCAA
ATTCATGTTCAGTCTCCTCTGCATATAATCTCAAACTCTCTCCTGCGGTACAAATTGGCT
TCAGACTTGCAGGAGCAGTATAAAAGGCTAACATGACTAAGACAACTAGCCATACAGGAA
ATTGATTATTAAAAACACTCGCAGTCTCTTTTTATTTATTTTCATGTAAATTATGTATTC
TCTGTAATTGTATTATTGTTTCAGCATTGTTGTACCTTTTCTCAGTTCTCGTTTCTCTGT
ATTGATTTACTTTCATCTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B353TF U 1
AF RR2B353JQ C 665
BS 1 802 RR2B353TF
BS 803 1222 RR2B353JQ

RD RR2B353TF 802 0 0
GGGCGTTACGTCAATTTGTAGAAGCAATCGTTTTCTCCAATTTTTCGAAAAACATCATCC
TTCGAAGCTCCGAAGCTCTCTCTCCTCCTCCTCCGGCAATCTCCGTTATCTCTTCCGGTT
TTTGAATTTGATCGATCGAATGGGGAAAATCAAGAAAGTGAATCGTAGGAATCGCGTTGC
TGCTCCTTACACATCAGCACCGTCTTGTTGCAAGAAAGAATGGGCAGGCTCGACCTGTCC
AGTATGTTTGGAGTCTCCGCACAACGCTGTTCTTCTCCTGTGTTCATCCTATCACAAAGG
ATGCCGTCCTTACATGTGCGCGACGAGCAGCCGTTTCGCCAACTGTCTTGACCAGTACAA
GAAGTCGTACGGTAACGAAGAAGACTCGGAGCAGCCTCAGAAGCTTCTGTGTCCGCTATG
CAGAGGTCAGGTGAAAGGCTGGACTGTCGTGGAAGACGCGCGTTTGCATTTCAACTCCAA
GCGAAGGACCTGTATGCAGGAGAAGTGTTCCTTTGTGGGGAACTTCAAGAAGTTCAAGAA
GCACATGAAGGAGAAGCACCCGGATGCTTGTCCTAGGGCTATTGATCCGGCTCTTGAGAC
CAAATGGAAGAGGCTGGAGAGGGAGAGAGACAGAAGAGACGTGATAAGCACGATCATGTC
GTCGATACCAGGTGCTGTTGTGTTGGGGGGATTATGTCATAGAGCCTCGTAACGGAGGTG
TTTATGATGAAGAAGATGATGATGATTACAGCTCAGATGATGATGATGATATGAGCAACA
ACGGTGTACTGGATCTTGATTC

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2B353JQ 558 0 0
ATACCAGGTGCTGTTGTGTTGGGGG*ATTATGTCATAGAGCCTCGTAACGGAGGTGTTTA
TGATGAAGAAGATGATGATGATTACAGCTCAGATGATGATGATGATATGAGCAACAACGG
TGTACTGGATCTTGATTCATGGCAAGGACAAGGCCATCACATTCGGTTTATAGATATGGA
TGCAAGCGACTTTGCATCGTCTTCCCGTTCCCATGCTTCTCCAAGCAGTTTGCTCTTCCC
AAGGAACCAGAGAGGCGGCAATAGAGATCGGCAACTATGATTTAACACCGAAGCAAATTC
ATGTTCAGTCTCCTCTGCATATAATCTCAAACTCTCTCCTGCGGTACAAATTGGCTTCAG
ACTTGCAGGAGCAGTATAAAAGGCTAACATGACTAAGACAACTAGCCATACAGGAAATTG
ATTATTAAAAACACTCGCAGTCTCTTTTTATTTATTTTCATGTAAATTATGTATTCTCTG
TAATTGTATTATTGTTTCAGCATTGTTGTACCTTTTCTCAGTTCTCGTTTCTCTGTATTG
ATTTACTTTCATCTTCCT

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL7544Contig1 800 2 6 U
GGAGCCAGGCATAATGCTCATCAGTACTACGGGTTATCATCTTCTGATCTCCACCATTAC
TACTTAAACAGACCTCCTCCTCCTCCACCACCTCAACCATCATCAACAACTCTCCCTCTA
TCTCAGCCTCTAGGGTTGCGAAACATCGATAGCAGAAACGAGAAAGGGTTCTGTTTCTTG
ACCATGGGGACAACACCGTGTAACGATGCAGAATCTAAAAAAGTCTCAACACATCGTGTT
GTTCGGAAAGCTCATACTACCCGAGGAGCAGATCTCAGAGAAAGGGTCAACGGATACGGC
AAGCACATCAGGAGCATCGAAACTGTCTTCATCAGACGAAGGATCACCTTGCTCCAACAA
AGCTCATGATGCGGCAGGTTTGGAGACGGGGCATTGTAAAGTGTTTATGGAGTCAGATGA
CGTGGGTCGAACGTTAGACCTATCGGTTCTTGGCTCGTACGAAGAGCTGAGTAGGAAACT
GTCTGACATGTTTGGTATTCAAAAGGCTGAGATGTTGAGCTCTGTTCTCTATAGGGATGC
GTCTGGTGCCATCAAGTACGCAGGAAACGAACCTTTCAGTGAGTTCTTGAAGACAGCTCG
GAGATTGACGATTCTGACTGAGCAAGGAAGAGAGAGCGTTGTAGTATAAAGTGGGTTGAG
TGTTTTTGTTGGAGCTTGGAAGTCAAAGCTTTGAAGCTTGAAACGTTTATTTATTTATAT
TTATTTATTCTGGATTCTGTAATTTTCAAAATACAGTCACAATCTATTTGCAAATAAAAT
AGATTCATCTTTTCTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CM55TF U 1
AF RR2CM55JQ C 116
BS 1 626 RR2CM55TF
BS 627 627 RR2CM55JQ
BS 628 666 RR2CM55TF
BS 667 667 RR2CM55JQ
BS 668 694 RR2CM55TF
BS 695 800 RR2CM55JQ

RD RR2CM55TF 694 0 0
GGAGCCAGGCATAATGCTCATCAGTACTACGGGTTATCATCTTCTGATCTCCACCATTAC
TACTTAAACAGACCTCCTCCTCCTCCACCACCTCAACCATCATCAACAACTCTCCCTCTA
TCTCAGCCTCTAGGGTTGCGAAACATCGATAGCAGAAACGAGAAAGGGTTCTGTTTCTTG
ACCATGGGGACAACACCGTGTAACGATGCAGAATCTAAAAAAGTCTCAACACATCGTGTT
GTTCGGAAAGCTCATACTACCCGAGGAGCAGATCTCAGAGAAAGGGTCAACGGATACGGC
AAGCACATCAGGAGCATCGAAACTGTCTTCATCAGACGAAGGATCACCTTGCTCCAACAA
AGCTCATGATGCGGCAGGTTTGGAGACGGGGCATTGTAAAGTGTTTATGGAGTCAGATGA
CGTGGGTCGAACGTTAGACCTATCGGTTCTTGGCTCGTACGAAGAGCTGAGTAGGAAACT
GTCTGACATGTTTGGTATTCAAAAGGCTGAGATGTTGAGCTCTGTTCTCTATAGGGATGC
GTCTGGTGCCATCAAGTACGCAGGAAACGAACCTTTCAGTGAGTTCTTGAAGACAGCTCG
GAGATTGACGATTCTGACTGAGCAAG*AAGAGAGAGCGTTGTAGTATAAAGTGGGTTGAG
TGTTTT*GTTGGAGCTTGGAAGTCAAAGCTTTGA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2CM55JQ 685 0 0
CTCTATCTCAGCCTCTAGGGTTGCGAAACATCGATAGCAGAAACGAGAAAGGGTTCTGTT
TCTTGACCATGGGGACAACACCGTGTAACGATGCAGAATCTAAAAAAGTCTCAACACATC
GTGTTGTTCGGAAAGCTCATACTACCCGAGGAGCAGATTTCAGAGAAAGGGTCAACGGAT
ACGGCAAGCACATCAGGAGCATCGAAACTGTTTTCATCAGACGAAGGATCACCTTGCTCC
AACAAAGCTCATGATGCGGCAGGTTTGGAGACGGGGCATTGTAAAGTGTTTATGGAGTCA
GATGACGTGGGTCGAACGTTAGACCTATCGGTTCTTGGCTCGTACGAAGAGCTGAGTAGG
AAACTGTCTGACATGTTTGGTATTCAAAAGGCTGAGATGTTGAGCTCTGTTCTCTATAGG
GATGCGTCTGGTGCCATCAAGTACGCAGGAAACGAACCTTTCAGTGAGTTCTTGAAGACA
GCTCGGAGATTGACGATTCTGACTGAGCAAGGAAGAGAGAGCGTTGTAGTATAAAGTGGG
TTGAGTGTTTTTGTTGGAGCTTGGAAGTCAAAGCTTTGAAGCTTGAAACGTTTATTTATT
TATATTTATTTATTCTGGATTCTGTAATTTTCAAAATACAGTCACAATCTATTTGCAAAT
AAAATAGATTCATCTTTTCTTGATT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL7545Contig1 697 2 3 U
GGCCTTTTCTTTTCCTTCCCCCAAATCGCACTATCTAGGGTTTCGTATCTCGCTCTTCCT
CTAGGAATCGATCTTGCGCAGTTACAGCAATGGGGAAAAGGAAGTCAAGAGCAAAGCCTG
CTACGACGAAGCGTACGGACAAGCTTGACACTGTCTTTAGTTGTCCTTTCTGCAATCACG
GCTCTAGTGTCGAATGCCAAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATTGCAACTTGTAGAA
TCTGTGAAGAAAGCTTTAGCACAACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATCTATA
GTGAATGGATTGACGAGTGTGAGAGGGTTAACACTGTGGAAGATGATATTGAGCAAGAAG
AAGAAGCTGAAGCTGAAGAAGAAGAAGTTTATGAAGAAGAGGAAGAAGAAGATGAAGAGG
AAGATGACCGTGTGTCTGTCAAAAGGAAGTTTAATTACCGAGACGATTAATCTTTATCCA
AAACCAGGCAAGTCATGTTAGACATTTGCCTTTGTATTCTAGTATCTATCTATCTGAAGA
AAATTGCAAGAACAGTCTCTAGTGTTTTCTCAGTGTCTGGTGTGATGGTTGCCAAATGAA
TTAAAGCCTTTACCAAATTGGTTTTTTTATCATACATTTATGTAAAACACATAACAAGAT
CGAGAAGCTGAATGCATTCCCCTCACTCGTTGTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D691TF U 1
AF RR2D691JQ C 123
BS 1 627 RR2D691TF
BS 628 628 RR2D691JQ
BS 629 697 RR2D691TF

RD RR2D691TF 697 0 0
GGCCTTTTCTTTTCCTTCCCCCAAATCGCACTATCTAGGGTTTCGTATCTCGCTCTTCCT
CTAGGAATCGATCTTGCGCAGTTACAGCAATGGGGAAAAGGAAGTCAAGAGCAAAGCCTG
CTACGACGAAGCGTACGGACAAGCTTGACACTGTCTTTAGTTGTCCTTTCTGCAATCACG
GCTCTAGTGTCGAATGCCAAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATTGCAACTTGTAGAA
TCTGTGAAGAAAGCTTTAGCACAACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATCTATA
GTGAATGGATTGACGAGTGTGAGAGGGTTAACACTGTGGAAGATGATATTGAGCAAGAAG
AAGAAGCTGAAGCTGAAGAAGAAGAAGTTTATGAAGAAGAGGAAGAAGAAGATGAAGAGG
AAGATGACCGTGTGTCTGTCAAAAGGAAGTTTAATTACCGAGACGATTAATCTTTATCCA
AAACCAGGCAAGTCATGTTAGACATTTGCCTTTGTATTCTAGTATCTATCTATCTGAAGA
AAATTGCAAGAACAGTCTCTAGTGTTTTCTCAGTGTCTGGTGTGATGGTTGCCAAATGAA
TTAAAGCCTTTACCAAATTGGTTTTTT*ATCATACATTTATGTAAAACACATAACAAGAT
CGAGAAGCTGAATGCATTCCCCTCACTCGTTGTTATC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2D691JQ 575 0 0
ACGACGAAGCGTACGGACAAGCTTGACACTGTCTTTAGTTGTCCTTTCTGCAATCACGGC
TCTAGTGTCGAATGCCAAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATTGCAACTTGTAGAATC
TGTGAAGAAAGCTTTAGCACAACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATCTATAGT
GAATGGATTGACGAGTGTGAGAGGGTTAACACTGTGGAAGATGATATTGAGCAAGAAGAA
GAAGCTGAAGCTGAAGAAGAAGAAGTTTATGAAGAAGAGGAAGAAGAAGATGAAGAGGAA
GATGACCGTGTGTCTGTCAAAAGGAAGTTTAATTACCGAGACGATTAATCTTTATCCAAA
ACCAGGCAAGTCATGTTAGACATTTGCCTTTGTATTCTAGTATCTATCTATCTGAAGAAA
ATTGCAAGAACAGTCTCTAGTGTTTTCTCAGTGTCTGGTGTGATGGTTGCCAAATGAATT
AAAGCCTTTACCAAATTGGTTTTTTTATCATACATTTATGTAAAACACATAACAAGATCG
AGAAGCTGAATGCATTCCCCTCACTCGTTGTTATC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL7546Contig1 457 2 1 U
GGGAAACAAGGACTGTACGTATCTAAAGACGTAATGGAAGTCGCTCGACATGCACTCAGA
GCAAACATCGCAACGCTACGTCGTCTCGAGCCTTGTTTCCAGCATATATGCGTACTTGCG
ACGAGTAAGACAGCTCTCGACGAGATTCAGAAGGATCTCAAACTAACGGAAGAGAACATG
GAGGCGTCGAGGAAGACGCTGGAACGGTTTGGGAATACGTCGAGCAGCAGCGTGTGGTAC
GAGCTGGCTTACTTGGAACACAAGGGGAAGATGAAAAGAGGAGACAAGGTTTGGCAGATC
GGTTTCGGGTCAGGGTTTAAATGCAACAGTGTTGTATGGAAAGCCCTTAAAAACATTGAC
CCTCCGAGACACAATAATAACCCATGGAGGAATCTCTGAGGATTTAAGTGTATTGATATA
AAGTAACTCACTAATGAAAATAATACAAGTGCATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E155TF U 1
AF RR2E155JQ C 81
BS 1 457 RR2E155TF

RD RR2E155TF 457 0 0
GGGAAACAAGGACTGTACGTATCTAAAGACGTAATGGAAGTCGCTCGACATGCACTCAGA
GCAAACATCGCAACGCTACGTCGTCTCGAGCCTTGTTTCCAGCATATATGCGTACTTGCG
ACGAGTAAGACAGCTCTCGACGAGATTCAGAAGGATCTCAAACTAACGGAAGAGAACATG
GAGGCGTCGAGGAAGACGCTGGAACGGTTTGGGAATACGTCGAGCAGCAGCGTGTGGTAC
GAGCTGGCTTACTTGGAACACAAGGGGAAGATGAAAAGAGGAGACAAGGTTTGGCAGATC
GGTTTCGGGTCAGGGTTTAAATGCAACAGTGTTGTATGGAAAGCCCTTAAAAACATTGAC
CCTCCGAGACACAATAATAACCCATGGAGGAATCTCTGAGGATTTAAGTGTATTGATATA
AAGTAACTCACTAATGAAAATAATACAAGTGCATTTG

QA 1 457 1 457
DS 

RD RR2E155JQ 377 0 0
TCGTCTCGAGCCTTGTTTCCAGCATATATGCGTACTTGCGACGAGTAAGACAGCTCTCGA
CGAGATTCAGAAGGATCTCAAACTAACGGAAGAGAACATGGAGGCGTCGAGGAAGACGCT
GGAACGGTTTGGGAATACGTCGAGCAGCAGCGTGTGGTACGAGCTGGCTTACTTGGAACA
CAAGGGGAAGATGAAAAGAGGAGACAAGGTTTGGCAGATCGGTTTCGGGTCAGGGTTTAA
ATGCAACAGTGTTGTATGGAAAGCCCTTAAAAACATTGACCCTCCGAGACACAATAATAA
CCCATGGAGGAATCTCTGAGGATTTAAGTGTATTGATATAAAGTAACTCACTAATGAAAA
TAATACAAGTGCATTTG

QA 1 377 1 377
DS 



AS 1 2

CO CL7547Contig1 636 2 2 U
GGATCACAAAAATTTTCAGATAAAAAAAGTTCAAATTTCTAATACATTTAACATCATTGT
TTCAGAAACACACATAAAGAGACAGACATAAAAATCATGTAGAACGTCTTGAAAAAAAGG
AAGATATTACAGAGACAGTAAAAGGTAAAAAACAAACAAACATTTGTTCTTTCTTTCTTT
CTTTTTCCCCAACTTCAAATCCTTCTTTGAGATCTTACACCACTCAATCTGAATCATCGT
ACACATCCCCATCTGATAGCTCGTCAAAAGTCCTCATATCAAGCTGGTACCTCAACAACC
CACCAATCCCACCAAAACCTCTACAGAACTGCGACCCTTCTTGCGACTTGTTAGTCACGA
ACTCAAGCGTACAACCAAAACGTTTATACTCATTAGCAAACCATTCAAGCAGAGGCATCT
TCTCCACAACTTCCAACTCCGCATTGCTCTCCGCATCATGAAAATTACTCTGATCATTCT
CCTGATCCTTCCCCAGATGCTTAACCACAATCTCCCCGGTGGTGTTGTTCTTCAACTCAT
ACCTATTGATATCAAGATTCTCCCACACTATAAGAGTCTCAACGGCACCCATGTCTAACG
CCTTTAACGTATCATCAACTCCGAAAACGTACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A142TF C 1
AF RR2A142JQ U 67
BS 1 66 RR2A142TF
BS 67 636 RR2A142JQ

RD RR2A142TF 636 0 0
GGATCACAAAAATTTTCAGATAAAAAAAGTTCAAATTTCTAATACATTTAACATCATTGT
TTCAGAAACACACATAAAGAGACAGACATAAAAATCATGTAGAACGTCTTGAAAAAAAGG
AAGATATTACAGAGACAGTAAAAGGTAAAAAACAAACAAACATTTGTTCTTTCTTTCTTT
CTTTTTCCCCAACTTCAAATCCTTCTTTGAGATCTTACACCACTCAATCTGAATCATCGT
ACACATCCCCATCTGATAGCTCGTCAAAAGTCCTCATATCAAGCTGGTACCTCAACAACC
CACCAATCCCACCAAAACCTCTACAGAACTGCGACCCTTCTTGCGACTTGTTAGTCACGA
ACTCAAGCGTACAACCAAAACGTTTATACTCATTAGCAAACCATTCAAGCAGAGGCATCT
TCTCCACAACTTCCAACTCCGCATTGCTCTCCGCATCATGAAAATTACTCTGATCATTCT
CCTGATCCTTCCCCAGATGCTTAACCACAATCTCCCCGGTGGTGTTGTTCTTCAACTCAT
ACCTATTGATATCAAGATTCTCCCACACTATAAGAGTCTCAACGGCACCCATGTCTAACG
CCTTTAACGTATCATCAACTCCGAAAACGTACTTCC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RR2A142JQ 570 0 0
AACACACATAAAGAGACAGACATAAAAATCATGTAGAACGTCTTGAAAAAAAGGAAGATA
TTACAGAGACAGTAAAAGGTAAAAAACAAACAAACATTTGTTCTTTCTTTCTTTCTTTTT
CCCCAACTTCAAATCCTTCTTTGAGATCTTACACCACTCAATCTGAATCATCGTACACAT
CCCCATCTGATAGCTCGTCAAAAGTCCTCATATCAAGCTGGTACCTCAACAACCCACCAA
TCCCACCAAAACCTCTACAGAACTGCGACCCTTCTTGCGACTTGTTAGTCACGAACTCAA
GCGTACAACCAAAACGTTTATACTCATTAGCAAACCATTCAAGCAGAGGCATCTTCTCCA
CAACTTCCAACTCCGCATTGCTCTCCGCATCATGAAAATTACTCTGATCATTCTCCTGAT
CCTTCCCCAGATGCTTAACCACAATCTCCCCGGTGGTGTTGTTCTTCAACTCATACCTAT
TGATATCAAGATTCTCCCACACTATAAGAGTCTCAACGGCACCCATGTCTAACGCCTTTA
ACGTATCATCAACTCCGAAAACGTACTTCC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL7548Contig1 921 2 2 U
GGGAGAACAACGGTCCTGAGCTGTCCATCTTCGTCGGAGACTTGTCTCCCGATGTGACTG
ACACTCTGTTGCAGGAGTTGTTCGCTGAGAGTTATCCCTCTGTCAAAAGCGCCAAAGTCG
TGATCGATTCCAACACCGGGAGGTCCAAAGGTTACGGTTTCGTTAGGTTCGGTGATGAGG
AGGAGAGGTCGAGGGCTTTGAACGAGATGAATGGAGCTTTGGGTTGCAACAGGCAGATGC
GTGTCGGTGTCGCCACTCCTAAAAGGGCGGTTGCTAATAATCAGCACCAACATTCTTCAC
AAGCTGTGATAGTGGCTGGTGGGCATTGAGCAAATGGTTTCACTGCTCATGGCTCGCAGT
CTGATGGTGATTCAACCAACTCAACAATATTCGTTGGCGGAGTTGGCCCTGATGTAACTG
AAGAAGACCTCAGAGAACCATTTACACAATTTGGCGAAGTCGTTTCAGTGAAGATCCCAG
TAGGGAAAGGATGTGGATTTGTTCAACTTTCTAACAGGAAGAGTGCTGATGATGCCATCC
AGAGCTTGAACGGGACAGTCATCGGCAAGAACACTGTCAGGCTCTCTTGGGGTAGAACTC
CGAACAAGCAGTGGAGAGGAGACAATGGAGGATATTCACGAGGACAAGGGTACAACAATG
GAGGTTACGCTAACAACCACCACGACTCCAACAACTATCCCGCCGAGACTACTTGAAGAG
AATAAGAGACTCAAGAATGATCATGGATCATAGTGGTTTAAGCCTTCTGTGATTCATAAG
ACATCAATCAATGCTAAACTTGTAGTCGAAAAAAAAGAAGAATTTTGTTAGATTTAATTT
GGTTTTAATAGACTGAAAACATATGTTGGTTACTGTTGTCTTTGTCTGAAGACTAACATA
AATGGTTATGCTCGTTAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FW95TF U 1
AF RR2FW95JQ C 284
BS 1 576 RR2FW95TF
BS 577 921 RR2FW95JQ

RD RR2FW95TF 576 0 0
GGGAGAACAACGGTCCTGAGCTGTCCATCTTCGTCGGAGACTTGTCTCCCGATGTGACTG
ACACTCTGTTGCAGGAGTTGTTCGCTGAGAGTTATCCCTCTGTCAAAAGCGCCAAAGTCG
TGATCGATTCCAACACCGGGAGGTCCAAAGGTTACGGTTTCGTTAGGTTCGGTGATGAGG
AGGAGAGGTCGAGGGCTTTGAACGAGATGAATGGAGCTTTGGGTTGCAACAGGCAGATGC
GTGTCGGTGTCGCCACTCCTAAAAGGGCGGTTGCTAATAATCAGCACCAACATTCTTCAC
AAGCTGTGATAGTGGCTGGTGGGCATTGAGCAAATGGTTTCACTGCTCATGGCTCGCAGT
CTGATGGTGATTCAACCAACTCAACAATATTCGTTGGCGGAGTTGGCCCTGATGTAACTG
AAGAAGACCTCAGAGAACCATTTACACAATTTGGCGAAGTCGTTTCAGTGAAGATCCCAG
TAGGGAAAGGATGTGGATTTGTTCAACTTTCTAACAGGAAGAGTGCTGATGATGCCATCC
AGAGCTTGAACGGGACAGTCATCGGCAAGAACACTG

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2FW95JQ 638 0 0
GCACCAACATTCTTCACAAGCTGTGATAGTGGCTGGTGGGCATTGAGCAAATGGTTTCAC
TGCTCATGGCTCGCAGTCTGATGGTGATTCAACCAACTCAACAATATTCGTTGGCGGAGT
TGGCCCTGATGTAACTGAAGAAGACCTCAGAGAACCATTTACACAATTTGGCGAAGTCGT
TTCAGTGAAGATCCCAGTAGGGAAAGGATGTGGATTTGTTCAACTTTCTAACAGGAAGAG
TGCTGATGATGCCATCCAGAGCTTGAACGGGACAGTCATCGGCAAGAACACTGTCAGGCT
CTCTTGGGGTAGAACTCCGAACAAGCAGTGGAGAGGAGACAATGGAGGATATTCACGAGG
ACAAGGGTACAACAATGGAGGTTACGCTAACAACCACCACGACTCCAACAACTATCCCGC
CGAGACTACTTGAAGAGAATAAGAGACTCAAGAATGATCATGGATCATAGTGGTTTAAGC
CTTCTGTGATTCATAAGACATCAATCAATGCTAAACTTGTAGTCGAAAAAAAAGAAGAAT
TTTGTTAGATTTAATTTGGTTTTAATAGACTGAAAACATATGTTGGTTACTGTTGTCTTT
GTCTGAAGACTAACATAAATGGTTATGCTCGTTAGACC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL7549Contig1 625 2 2 U
GGATCCCGCCGTCTAATTATCCGATTTCACCGTCTCCTGTCTCTGCTCCATCGACGTCAC
TCAGGAGAAATCGTGGATGGATCCGCAGACGCAGAATACTTCTTTGCAGCGACTCCAGAA
TGTGGAGAGGAGAGTGGTAAGGGTATTGGATATAGCTGGAGGTGTGATGGAAGAACTGTC
GAGCCCTTCTGGCCCCAGGAAAGATTTCGTCAACAGCCATTGCCGAGAGTTCATGCAATC
CATCAAGGATATTCAAGTGACACTAAGGGAAGAGATCAAAAGCGCGTACGAGTACCGTCC
CTTTGAGAAAAGCGGCTACAATGCAAGGATAGCTAACGAGATCTGCTTCCAGAAGCTTGA
ATATGTTCTCTCTCAGCTTCATGACCTCGAAATAACCCTTGATCACTATCCTTCTTCCGC
TTGAACTTTTTATCAAACTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGAGGCTTTCTCGAGGTTCCTCAA
AATTTCCTCTTTTATGTTGTTGTTAATTAATACTAGTATTCATAATAGGTGGTTTACTTT
GAGGAATGAATGATGCAAAACCATCCATTATGATTGTAGTTTCTAGAACAAATACAATTT
ATCCTACTTAAAGTAGGTCCTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP79TF U 1
AF RR2DP79JQ C 48
BS 1 616 RR2DP79TF
BS 617 625 RR2DP79JQ

RD RR2DP79TF 624 0 0
GGATCCCGCCGTCTAATTATCCGATTTCACCGTCTCCTGTCTCTGCTCCATCGACGTCAC
TCAGGAGAAATCGTGGATGGATCCGCAGACGCAGAATACTTCTTTGCAGCGACTCCAGAA
TGTGGAGAGGAGAGTGGTAAGGGTATTGGATATAGCTGGAGGTGTGATGGAAGAACTGTC
GAGCCCTTCTGGCCCCAGGAAAGATTTCGTCAACAGCCATTGCCGAGAGTTCATGCAATC
CATCAAGGATATTCAAGTGACACTAAGGGAAGAGATCAAAAGCGCGTACGAGTACCGTCC
CTTTGAGAAAAGCGGCTACAATGCAAGGATAGCTAACGAGATCTGCTTCCAGAAGCTTGA
ATATGTTCTCTCTCAGCTTCATGACCTCGAAATAACCCTTGATCACTATCCTTCTTCCGC
TTGAACTTTTTATCAAACTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGAGGCTTTCTCGAGGTTCCTCAA
AATTTCCTCTTTTATGTTGTTGTTAATTAATACTAGTATTCATAATAGGTGGTTTACTTT
GAGGAATGAATGATGCAAAACCATCCATTATGATTGTAGTTTCTAGAACAAATACAATTT
ATCCTACTTAAAGTAG
TCCTGCCC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2DP79JQ 578 0 0
CCATCGACGTCACTCAGGAGAAATCGTGGATGGATCCGCAGACGCAGAATACTTCTTTGC
AGCGACTCCAGAATGTGGAGAGGAGAGTGGTAAGGGTATTGGATATAGCTGGAGGTGTGA
TGGAAGAACTGTCGAGCCCTTCTGGCCCCAGGAAAGATTTCGTCAACAGCCATTGCCGAG
AGTTCATGCAATCCATCAAGGATATTCAAGTGACACTAAGGGAAGAGATCAAAAGCGCGT
ACGAGTACCGTCCCTTTGAGAAAAGCGGCTACAATGCAAGGATAGCTAACGAGATCTGCT
TCCAGAAGCTTGAATATGTTCTCTTTCAGCTTCATGACCTCGAAATAACCCTTGATCACT
ATCCTTCTTCCGCTTGAACTTTTTATCAAACTTTCTCTTTTTTTTTTGCAGAGGCTTTCT
CGAGGTTCCTCAAAATTTCCTCTTTTATGTTGTTGTTAATTAATACTAGTATTCATAATA
GGTGGTTTACTTTGAGGAATGAATGATGCAAAACCATCCATTATGATTGTAGTTTCTAGA
ACAAATACAATTTATCCTACTTAAAGTAGGTCCTGCCC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7551Contig1 714 2 1 U
GAGTTTGGACAATGATTCTGCTAAGCCAACACCAAGACTGGCAGGTTCGTGCACGAGAAG
AAGTGAAGCAAGTGTTTGGTGATAAAGAACCTGATACAGAAGGCCTTAACCATCTCAAAA
CTATGACAATGATAATTAATGAAGTCCTTAGGTTATATCCTCCAGTAACTCAGCTGAGTC
GAACCATTCACAAAGAAATGAAGCTAGGCGACCTGACGCTACCAGGTGGCGTTCACATCA
GTCTGCCTATTATGCTAGTCCAACACGATACCCAGCTATGGGGTAACGATGCAGCAGAGT
TCAAGCCGGAGAGATTCGAAGATGGTGTCTCAAAGGCAACAAAGAGCCAAGTCTCCTTCT
TTCCCTTTGCTTGGGGACCAAGGATCTGTATTGGCCAAAATTTTGCCTTATTAGAGGCAA
AGATGGCAATGACATTGATTCTACAGAGATTCTCCTTTGAGCTTTCTCCTTCCTATGTCC
ATGCTCCTTACACAGTCTTCACCCTTCACCCAGAGTATGGTGCTCATCTCATCCTCCACA
AGCTATAGTTCCATACCAGAGCAGTAAAAGTAGAAAAACTCAAAGGCTCTGCTCACCAGA
TCTTTCCTGGCTATTAAATAATGTTCAATTCCATTATAACTTTATGATAATATCAACCGT
TTCATGCATTCAAAGTTTCTACATAAATATCTATATGAGTACAGTTTCTACATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AE90JQ C 1
AF RR2AE90TF U 1
BS 1 714 RR2AE90TF

RD RR2AE90JQ 714 0 0
GAGTTTGGACAATGATTCTGCTAAGCCAACACCAAGACTGGCAGGTTCGTGCACGAGAAG
AAGTGAAGCAAGTGTTTGGTGATAAAGAACCTGATACAGAAGGCCTTAACCATCTCAAAA
CTATGACAATGATAATTAATGAAGTCCTTAGGTTATATCCTCCAGTAACTCAGCTGAGTC
GAACCATTCACAAAGAAATGAAGCTAGGCGACCTGACGCTACCAGGTGGCGTTCACATCA
GTCTGCCTATTATGCTAGTCCAACACGATACCCAGCTATGGGGTAACGATGCAGCAGAGT
TCAAGCCGGAGAGATTCGAAGATGGTGTCTCAAAGGCAACAAAGAGCCAAGTCTCCTTCT
TTCCCTTTGCTTGGGGACCAAGGATCTGTATTGGCCAAAATTTTGCCTTATTAGAGGCAA
AGATGGCAATGACATTGATTCTACAGAGATTCTCCTTTGAGCTTTCTCCTTCCTATGTCC
ATGCTCCTTACACAGTCTTCACCCTTCACCCAGAGTATGGTGCTCATCTCATCCTCCACA
AGCTATAGTTCCATACCAGAGCAGTAAAAGTAGAAAAACTCAAAGGCTCTGCTCACCAGA
TCTTTCCTGGCTATTAAATAATGTTCAATTCCATTATAACTTTATGATAATATCAACCGT
TTCATGCATTCAAAGTTTCTACATAAATATCTATATGAGTACAGTTTCTACATT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2AE90TF 714 0 0
GAGTTTGGACAATGATTCTGCTAAGCCAACACCAAGACTGGCAGGTTCGTGCACGAGAAG
AAGTGAAGCAAGTGTTTGGTGATAAAGAACCTGATACAGAAGGCCTTAACCATCTCAAAA
CTATGACAATGATAATTAATGAAGTCCTTAGGTTATATCCTCCAGTAACTCAGCTGAGTC
GAACCATTCACAAAGAAATGAAGCTAGGCGACCTGACGCTACCAGGTGGCGTTCACATCA
GTCTGCCTATTATGCTAGTCCAACACGATACCCAGCTATGGGGTAACGATGCAGCAGAGT
TCAAGCCGGAGAGATTCGAAGATGGTGTCTCAAAGGCAACAAAGAGCCAAGTCTCCTTCT
TTCCCTTTGCTTGGGGACCAAGGATCTGTATTGGCCAAAATTTTGCCTTATTAGAGGCAA
AGATGGCAATGACATTGATTCTACAGAGATTCTCCTTTGAGCTTTCTCCTTCCTATGTCC
ATGCTCCTTACACAGTCTTCACCCTTCACCCAGAGTATGGTGCTCATCTCATCCTCCACA
AGCTATAGTTCCATACCAGAGCAGTAAAAGTAGAAAAACTCAAAGGCTCTGCTCACCAGA
TCTTTCCTGGCTATTAAATAATGTTCAATTCCATTATAACTTTATGATAATATCAACCGT
TTCATGCATTCAAAGTTTCTACATAAATATCTATATGAGTACAGTTTCTACATT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL7552Contig1 676 2 2 U
GGGAAAAAATTAGAACTGGTTTTGGGTCTGGTGTACGGCCGGCGCGTGAGCGACCGTGCT
GTCACCGGAATCTTCCTGCTCCCATCAGTTAGCTAGTTCTTTGCTTCTTCTTCGACCCCA
TTCCCATTCCCATACCGCTTTGTCTGAGCTCTGGTTCGGCTTCCATCTTCGATTTCGTCT
TTAGCTCGCTGAGACGAAACGGTGGCTCTGCTTATTCTGGAGTTAAGGCGCGGTAGTGAG
GGTTTTCGATTGGTGAAGTGGGCTTTTCGGGTTTTCAGAGAAGATCGATTTGAGCTGCTT
AGGGTTTTCTTTTTCTTGCTGTCTAGTTTTGTTTCAGGGATGATAGTTGCGTCTTTCCGG
TATGTTATAGCGGCAGATTGGCTACGTGGCCTTGGAAACGCAGGGGGTGATAGAGAATGG
TCCTGAGGCATTCCTGTTGGGTCTTGGTGTTTGGATTCTTGGGCTTGATTACAGCAACAG
TGTAAAAAGTGGTGTGCTATTGGTGTGTCTGGTGTGCTGTTGGTGAGGTGGTGTGGGGAA
AGCAGAACATGTCTAACACCTTTGAGAAGATTCAGGTTCTTGGCGCCGCTATCTCTGTGT
TATAGAGTCCTTTTCCTGGCCTTTGAATAATTATCTCTTCCGGAGTGTCTTGTGCTTCTC
TTGTCCTCAGTGGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RR2BO17TF U 1
AF RR2BR16TF U 1
BS 1 674 RR2BO17TF
BS 675 676 RR2BR16TF

RD RR2BO17TF 674 0 0
GGGAAAAAATTAGAACTGGTTTTGGGTCTGGTGTACGGCCGGCGCGTGAGCGACCGTGCT
GTCACCGGAATCTTCCTGCTCCCATCAGTTAGCTAGTTCTTTGCTTCTTCTTCGACCCCA
TTCCCATTCCCATACCGCTTTGTCTGAGCTCTGGTTCGGCTTCCATCTTCGATTTCGTCT
TTAGCTCGCTGAGACGAAACGGTGGCTCTGCTTATTCTGGAGTTAAGGCGCGGTAGTGAG
GGTTTTCGATTGGTGAAGTGGGCTTTTCGGGTTTTCAGAGAAGATCGATTTGAGCTGCTT
AGGGTTTTCTTTTTCTTGCTGTCTAGTTTTGTTTCAGGGATGATAGTTGCGTCTTTCCGG
TATGTTATAGCGGCAGATTGGCTACGTGGCCTTGGAAACGCAGGGGGTGATAGAGAATGG
TCCTGAGGCATTCCTGTTGGGTCTTGGTGTTTGGATTCTTGGGCTTGATTACAGCAACAG
TGTAAAAAGTGGTGTGCTATTGGTGTGTCTGGTGTGCTGTTGGTGAGGTGGTGTGGGGAA
AGCAGAACATGTCTAACACCTTTGAGAAGATTCAGGTTCTTGGCGCCGCTATCTCTGTGT
TATAGAGTCCTTTTCCTGGCCTTTGAATAATTATCTCTTCCGGAGTGTCTTGTGCTTCTC
TTGTCCTCAGTGGT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RR2BR16TF 676 0 0
GGGAAAAAATTAGAACTGGTTTTGGGTCTGGTGTACGGCCGGCGCGTGAGCGACCGTGCT
GTCACCGGAATCTTCCTGCTCCCATCAGTTAGCTAGTTCTTTGCTTCTTCTTCGACCCCA
TTCCCATTCCCATACCGCTTTGTCTGAGCTCTGGTTCGGCTTCCATCTTCGATTTCGTCT
TTAGCTCGCTGAGACGAAACGGTGGCTCTGCTTATTCTGGAGTTAAGGCGCGGTAGTGAG
GGTTTTCGATTGGTGAAGTGGGCTTTTCGGGTTTTCAGAGAAGATCGATTTGAGCTGCTT
AGGGTTTTCTTTTTCTTGCTGTCTAGTTTTGTTTCAGGGATGATAGTTGCGTCTTTCCGG
TATGTTATAGCGGCAGATTGGCTACGTGGCCTTGGAAACGCAGGGGGTGATAGAGAATGG
TCCTGAGGCATTCCTGTTGGGTCTTGGTGTTTGGATTCTTGGGCTTGATTACAGCAACAG
TGTAAAAAGTGGTGTGCTATTGGTGTGTCTGGTGTGCTGTTGGTGAGGTGGTGTGGGGAA
AGCAGAACATGTCTAACACCTTTGAGAAGATTCAGGTTCTTGGCGCCGCTATCTCTGTGT
TATAGAGTCCTTTTCCTGGCCTTTGAATAATTATCTCTTCCGGAGTGTCTTGTGCTTCTC
TTGTCCTCAGTGGTTT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL7553Contig1 776 2 20 U
CCCTCTCTCTCTCTCTCTGGTTCCTTGTACCTTCCTCTCCAAAAATTTCTCCATCTCTTT
TATCTTGTACCTTACCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCGTAGACATACGAATTGGTGGAGT
CCTAAGTATGATCCCGCGGAGATCTCTCAGCTGTTTCTGGCTTGTTCTGGGATTGTTGCT
GTACAGTGGTAGTTTGGTTTATGGTGGAGACATAGTCCACCACGACGACTCCCTTCCACA
GAGACCTGGTTGCAACAACAATTTCGTATTGGTCAAAGTCCCAACTCGAGTCGATGGGAA
AGAAAAAGAAGAGTTTGTTGGTGTCGGTGCTAGGTTTGGCCCTACCTTGGAATCTAAGGA
GAAGCATGCTACCCTCATCAAACTCGCCGTTGCAGACCCTCCTGATTGTTGCACTACTCC
CAAAAACAAGCTTACTGGAGAGGTCATTCTTGTTCACCGCGGTAATTGTAGTTTTACCAC
CAAAACTAAGGTAGCTGAAGCAGCTGGTGCCTCTGCCATCCTCATCATAAACAACAGCAC
AGATCTTTTTAAGATGGTATGTGAGAAGGGTGAAAACGTTTTAGATATCAACATCCCTGT
TGTTATGCTACCTATTGATGATGGTAGAAGCCTCGAGGAAACCGTTAACAGTAACTCCAT
AGTTACTTTGCAGCTATATTCCCCCAAACGTCCAGCAGTTGATGTGGCTGATGTCTTTCT
CTGGCTTATGGCTGTTGGTACCATTTTATGTGCTTCTTATTGGTCTGCGTGGACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS84TF U 1
AF RR2D475TF U 64
BS 1 96 RR2AS84TF
BS 97 97 RR2D475TF
BS 98 101 RR2AS84TF
BS 102 102 RR2D475TF
BS 103 103 RR2AS84TF
BS 104 104 RR2D475TF
BS 105 145 RR2AS84TF
BS 146 146 RR2D475TF
BS 147 160 RR2AS84TF
BS 161 161 RR2D475TF
BS 162 276 RR2AS84TF
BS 277 277 RR2D475TF
BS 278 309 RR2AS84TF
BS 310 310 RR2D475TF
BS 311 339 RR2AS84TF
BS 340 340 RR2D475TF
BS 341 620 RR2AS84TF
BS 621 621 RR2D475TF
BS 622 711 RR2AS84TF
BS 712 776 RR2D475TF

RD RR2AS84TF 718 0 0
CCCTCTCTCTCTCTCTCTGGTTCCTTGTACCTTCCTCTCCAAAAATTTCTCCATCTCTTT
TATCTTGTACCTTACCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTTGGTAGCCGTACGAATTGGTGGAGT
CCTAAGTATGATCCCGCGGAGATCTTTCAGCTGTTTCTGGTTTGTTCTGGGATTGTTGCT
GTACAGTGGTAGTTTGGTTTATGGTGGAGACATAGTCCACCACGACGACTCCCTTCCACA
GAGACCTGGTTGCAACAACAATTTCGTATTGGTCAAGGTCCCAACTCGAGTCGATGGGAA
AGAAAAAGAGGAGTTTGTTGGTGTCGGTGCTAGGTTTGGGCCTACCTTGGAATCTAAGGA
GAAGCATGCTACCCTCATCAAACTCGCCGTTGCAGACCCTCCTGATTGTTGCACTACTCC
CAAAAACAAGCTTACTGGAGAGGTCATTCTTGTTCACCGCGGTAATTGTAGTTTTACCAC
CAAAACTAAGGTAGCTGAAGCAGCTGGTGCCTCTGCCATCCTCATCATAAACAACAGCAC
AGATCTTTTTAAGATGGTATGTGAGAAGGGTGAAAACGTTTTAGATATCAACATCCCTGT
TGTTATGCTACCTATTGATGCTGGTAGAAGCCTCGAGGAAACCGTTAACAGTAACTCCAT
AGTTACTTTGCAGCTATATTCCCCCAAACGTCCAGCAGTTGATGTGGCTGA
GTCTTTC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2D475TF 713 0 0
GGACCTTTCCT
CCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCGTAGACATATGAATTGGTGGAGTCCTAAGTATGATCC
CGCGGAGATCTCTCAGCTGTTTCTGGCTTGTTCTGGGATTGTTGCTGTACAGTGGTAGTT
TGGTTTCTGGTGGAGACATAGTTCACCACGACGACTCCCTTCCACAGAGACCTGGTTGCA
ACAATAATTTTGTATTGGTCAAAGTCCCAACTCGAGTCGATGGGAAAGAAAAAGAAGAGT
TTGTTGGTGTCGGTGCTAGGTTTGGCCCTACCTTGGAATCTAAGGAGAAGCATGCTACCC
TCATCAAACTCGCCGTTGCAGACCCTCCTGATTGTTGCACTACTCCCAAACACAAGCTTA
CTGGAGAGGTCATTCTTGTTCACCGCGGTAATTGTAGTTTTACCACCAAAACTAAGGTAG
CTGAAGCAGCTGGTGCCTCTGCCATCCTTATTATAAACAACAGCACAGATCTTTTTAAGA
TGGTATGTGAGAAGGGTGAAAACGTTTTAGATATCAACATCCCTGTTGTTATGCTACCTA
TTGATGATGGTAGAAGCCTCGAGGAAACCGTTCACAGTAACTCCATAGTTACTTTGCAGC
TATATTCCCCCAAACGTCCAGCAGTTGATGTGGCTGATGTCTTTCTCTGGCTTATGGCTG
TTGGTACCATTTTATGTGCTTCTTATTGGTCTGCGTGGACCG

QA 12 713 12 713
DS 



AS 1 2

CO CL7554Contig1 623 2 1 U
TTTTTGTTACTTTTGATTACAGAGACAACAAAATGGATACTTCGCATAGCCGTCGTCAAG
GCTACATCTTTCTTCTCGTTCTATCTTATTCCTCTGTGCTTGGTTTAGCTTCCAATATGA
ATATTTCTTCCAATGATGCAAGAGGCAACAAAACCGACAGTTTCTTTGAAGATCAATATA
CTTACACTCATTATGGCACAGACATGGGCAAGGAATATATTATCTGTGCAGAATCTACTA
TGGAATATCCGTGGGTGCTTGGTTGCAATAAGTCTAAAGAAGTTTCTACAAAGATCAATT
TTGCTGATTATGGAGATCCTTCCGGCAAGTGTGAACACTATAGACATGGAAATTGCGGCG
CAGAAACTGCCTTTAAGGTCGCCAAAAAGAATTGTGTTGGAAAAAACATATGTGTGTTTA
TGACTTCGGACGAGATGTTTGGTACGAGTCACTGCAATAAAGAGGCTAAGTTTTTTGTTC
AACTCACTTGTAAAAAGGCTTAAGTTTCTTAGTTGCTCCTTAATTAATAAGGTATTAAGA
AAATGGTTGCATGGTTTGTTTTCTTGTAATGATCAAGTTCTTATTGATTATTAAAGGAAT
GTCCGATATAAGTTATTTATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H495TF U 1
AF RR2H495JQB C 56
BS 1 623 RR2H495TF

RD RR2H495TF 623 0 0
TTTTTGTTACTTTTGATTACAGAGACAACAAAATGGATACTTCGCATAGCCGTCGTCAAG
GCTACATCTTTCTTCTCGTTCTATCTTATTCCTCTGTGCTTGGTTTAGCTTCCAATATGA
ATATTTCTTCCAATGATGCAAGAGGCAACAAAACCGACAGTTTCTTTGAAGATCAATATA
CTTACACTCATTATGGCACAGACATGGGCAAGGAATATATTATCTGTGCAGAATCTACTA
TGGAATATCCGTGGGTGCTTGGTTGCAATAAGTCTAAAGAAGTTTCTACAAAGATCAATT
TTGCTGATTATGGAGATCCTTCCGGCAAGTGTGAACACTATAGACATGGAAATTGCGGCG
CAGAAACTGCCTTTAAGGTCGCCAAAAAGAATTGTGTTGGAAAAAACATATGTGTGTTTA
TGACTTCGGACGAGATGTTTGGTACGAGTCACTGCAATAAAGAGGCTAAGTTTTTTGTTC
AACTCACTTGTAAAAAGGCTTAAGTTTCTTAGTTGCTCCTTAATTAATAAGGTATTAAGA
AAATGGTTGCATGGTTTGTTTTCTTGTAATGATCAAGTTCTTATTGATTATTAAAGGAAT
GTCCGATATAAGTTATTTATTCT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RR2H495JQB 568 0 0
TCAAGGCTACATCTTTCTTCTCGTTCTATCTTATTCCTCTGTGCTTGGTTTAGCTTCCAA
TATGAATATTTCTTCCAATGATGCAAGAGGCAACAAAACCGACAGTTTCTTTGAAGATCA
ATATACTTACACTCATTATGGCACAGACATGGGCAAGGAATATATTATCTGTGCAGAATC
TACTATGGAATATCCGTGGGTGCTTGGTTGCAATAAGTCTAAAGAAGTTTCTACAAAGAT
CAATTTTGCTGATTATGGAGATCCTTCCGGCAAGTGTGAACACTATAGACATGGAAATTG
CGGCGCAGAAACTGCCTTTAAGGTCGCCAAAAAGAATTGTGTTGGAAAAAACATATGTGT
GTTTATGACTTCGGACGAGATGTTTGGTACGAGTCACTGCAATAAAGAGGCTAAGTTTTT
TGTTCAACTCACTTGTAAAAAGGCTTAAGTTTCTTAGTTGCTCCTTAATTAATAAGGTAT
TAAGAAAATGGTTGCATGGTTTGTTTTCTTGTAATGATCAAGTTCTTATTGATTATTAAA
GGAATGTCCGATATAAGTTATTTATTCT

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

CO CL7555Contig1 616 2 1 U
GGGATCATCGCCACGAGGCTTTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCGAGAATCTCTCCAGGGAG
TACTAAAAACCAAGTAGTCATTTTTGTGTATCAAAAGCCTCACACAAGAAGAATGAGCTT
TGCGTGTCTCGTGTGTCACAGTGTAGAGAGCCCCTCCCACTCCTTTAGAAGCTACTCCGT
GTCTAGCTCAGACAATGAAGGAAGATGCTCTGTGATCGTGAGCTGCCTCACCAGGAAATC
ACTCATTCAAGCTGCAAGATCCAACACTTTCCCTGCTTCATCTTCCTCAAAGGTAACACC
ACAACCCAATTTCCAGGCAGGTGATCTGATGATAACACAAGGAGCCTCCCCAAGGTTAGT
GCGAAGCCGTGCAGGGAGAAGAGACTGGAACTTCAACGAAATCGAGGCAGCGCTTTAAAA
AAATCAAATCTGACTCTTTTCTCTGTAGACTAGTGTTAGTTTGTTAAATCTCCACCACAA
CTCAGTGTTCACCTCAGGTGATCTTACCAGTCTCCTGAGTTCTGTTCAATGATCTTACAT
TCATCACTTGTCAAATTTTGTACTGTTCTCACTACTTTATAAACCAATAAATCTATGAAA
TTATATTTCATGTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BC58JQ C 1
AF RR2BC58TF U 1
BS 1 616 RR2BC58TF

RD RR2BC58JQ 616 0 0
GGGATCATCGCCACGAGGCTTTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCGAGAATCTCTCCAGGGAG
TACTAAAAACCAAGTAGTCATTTTTGTGTATCAAAAGCCTCACACAAGAAGAATGAGCTT
TGCGTGTCTCGTGTGTCACAGTGTAGAGAGCCCCTCCCACTCCTTTAGAAGCTACTCCGT
GTCTAGCTCAGACAATGAAGGAAGATGCTCTGTGATCGTGAGCTGCCTCACCAGGAAATC
ACTCATTCAAGCTGCAAGATCCAACACTTTCCCTGCTTCATCTTCCTCAAAGGTAACACC
ACAACCCAATTTCCAGGCAGGTGATCTGATGATAACACAAGGAGCCTCCCCAAGGTTAGT
GCGAAGCCGTGCAGGGAGAAGAGACTGGAACTTCAACGAAATCGAGGCAGCGCTTTAAAA
AAATCAAATCTGACTCTTTTCTCTGTAGACTAGTGTTAGTTTGTTAAATCTCCACCACAA
CTCAGTGTTCACCTCAGGTGATCTTACCAGTCTCCTGAGTTCTGTTCAATGATCTTACAT
TCATCACTTGTCAAATTTTGTACTGTTCTCACTACTTTATAAACCAATAAATCTATGAAA
TTATATTTCATGTTTC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RR2BC58TF 616 0 0
GGGATCATCGCCACGAGGCTTTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCGAGAATCTCTCCAGGGAG
TACTAAAAACCAAGTAGTCATTTTTGTGTATCAAAAGCCTCACACAAGAAGAATGAGCTT
TGCGTGTCTCGTGTGTCACAGTGTAGAGAGCCCCTCCCACTCCTTTAGAAGCTACTCCGT
GTCTAGCTCAGACAATGAAGGAAGATGCTCTGTGATCGTGAGCTGCCTCACCAGGAAATC
ACTCATTCAAGCTGCAAGATCCAACACTTTCCCTGCTTCATCTTCCTCAAAGGTAACACC
ACAACCCAATTTCCAGGCAGGTGATCTGATGATAACACAAGGAGCCTCCCCAAGGTTAGT
GCGAAGCCGTGCAGGGAGAAGAGACTGGAACTTCAACGAAATCGAGGCAGCGCTTTAAAA
AAATCAAATCTGACTCTTTTCTCTGTAGACTAGTGTTAGTTTGTTAAATCTCCACCACAA
CTCAGTGTTCACCTCAGGTGATCTTACCAGTCTCCTGAGTTCTGTTCAATGATCTTACAT
TCATCACTTGTCAAATTTTGTACTGTTCTCACTACTTTATAAACCAATAAATCTATGAAA
TTATATTTCATGTTTC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL7556Contig1 593 2 2 U
GCTTGATTAAATAATCGTAATTTCGTGGGACGTTCTAAATTCTCTAATTCGTTTCCGCGT
TAACTCCCTTTTGTTGATCCCTTCTTCTACGTCTTCGTCTTAGTCTTCGCATTGATTTGG
TCCCTCTTTTCTCATTAAGAACCCAATCTTCTTCTTCTTCTTCCTCATCGATTCCACTTC
TTCGGTCATCCACGTAGGAAGGGAAGGTTTTATTACTTAGCAAAACCCAATTCTTTCTGT
GAGATATATTACTTTTGAAAGAGACCGAGACAATGTTTGGTTTGAGGAAATCACCGGCTA
AGCTTCCCAAGCACCACTCTGCTGATCCTGGTTTCCACAAATCTTCCAAGCCCAATCCTT
TCGACTCAGATGATGAATTGGACAACAAGAAACACACACTTAACCCCTCCAAGAGGACTT
CCTCTGAACCTTCCTTGGCTGAAATGACCACCAACCCTTTTGATGGTGATAAGGTTCATA
CTTCTTCCTCATCCAAGCAGTCCTCTAACTCCAGATACCAGTACAAGAACAACTTCCGCG
ATTCCGGAGGCGTTGAAAGCCAGTCTGTTCAGGAGCTTGAGGGCTATGCTGTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G250TF U 1
AF RR2GZ71TF U 1
BS 1 568 RR2G250TF
BS 569 593 RR2GZ71TF

RD RR2G250TF 568 0 0
GCTTGATTAAATAATCGTAATTTCGTGGGACGTTCTAAATTCTCTAATTCGTTTCCGCGT
TAACTCCCTTTTGTTGATCCCTTCTTCTACGTCTTCGTCTTAGTCTTCGCATTGATTTGG
TCCCTCTTTTCTCATTAAGAACCCAATCTTCTTCTTCTTCTTCCTCATCGATTCCACTTC
TTCGGTCATCCACGTAGGAAGGGAAGGTTTTATTACTTAGCAAAACCCAATTCTTTCTGT
GAGATATATTACTTTTGAAAGAGACCGAGACAATGTTTGGTTTGAGGAAATCACCGGCTA
AGCTTCCCAAGCACCACTCTGCTGATCCTGGTTTCCACAAATCTTCCAAGCCCAATCCTT
TCGACTCAGATGATGAATTGGACAACAAGAAACACACACTTAACCCCTCCAAGAGGACTT
CCTCTGAACCTTCCTTGGCTGAAATGACCACCAACCCTTTTGATGGTGATAAGGTTCATA
CTTCTTCCTCATCCAAGCAGTCCTCTAACTCCAGATACCAGTACAAGAACAACTTCCGCG
ATTCCGGAGGCGTTGAAAGCCAGTCTGT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RR2GZ71TF 593 0 0
GCTTGATTAAATAATCGTAATTTCGTGGGACGTTCTAAATTCTCTAATTCGTTTCCGCGT
TAACTCCCTTTTGTTGATCCCTTCTTCTACGTCTTCGTCTTAGTCTTCGCATTGATTTGG
TCCCTCTTTTCTCATTAAGAACCCAATCTTCTTCTTCTTCTTCCTCATCGATTCCACTTC
TTCGGTCATCCACGTAGGAAGGGAAGGTTTTATTACTTAGCAAAACCCAATTCTTTCTGT
GAGATATATTACTTTTGAAAGAGACCGAGACAATGTTTGGTTTGAGGAAATCACCGGCTA
AGCTTCCCAAGCACCACTCTGCTGATCCTGGTTTCCACAAATCTTCCAAGCCCAATCCTT
TCGACTCAGATGATGAATTGGACAACAAGAAACACACACTTAACCCCTCCAAGAGGACTT
CCTCTGAACCTTCCTTGGCTGAAATGACCACCAACCCTTTTGATGGTGATAAGGTTCATA
CTTCTTCCTCATCCAAGCAGTCCTCTAACTCCAGATACCAGTACAAGAACAACTTCCGCG
ATTCCGGAGGCGTTGAAAGCCAGTCTGTTCAGGAGCTTGAGGGCTATGCTGTT

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

CO CL7557Contig1 627 2 1 U
GGAAAAAAGAGAAGACAAGGAGAGAGATCCAGAAGAAGAAGAGAAGATGGCTTTGCAATG
GCTGATTCTGTCGTACGTGGTGGCCGCCGAAGCTGTGATCGCGGTGTTGCTGACTTTACC
GTACCCTATGCTAGTGAAGAAACGCGTCGTGTCACTTGTCTCTCTCATTCTCCAACCTGC
TGCTTCCATCGTCGCCTTCGCCGCCTTTCAGCTCTGCGATATATACTGGAAGAATGAACA
TAGACTCTCTTGCTCATCTGAGGTCTGCACTGCTACAGAGCGTGATCGCTACGAGAAATC
TATCTACAAGGCTCAGAGGAATGCTGTTCTGTGCGCTGCAGGAATTCTTCTCTACTGGTG
CATCTACCGTATCTGCAAGTACAACAAGGACCTGGAGCTTTTGGAAGAAGCTGTGAAGAG
AGAGGCACACAAGGACGAGTAATCTACTTGAGTATAGAGAGACTTGGTTCCTCAAAACCA
TATAAGTAAAGTCTTTTTATTGTTTTCTTACATCTAATACCACTAAACCTGAAGAAAACA
GTGAGTATCAACAACAGGTTGTAAACAAATATATATCATCAGTGTTCAATGCTTGTTTCA
TTCCTCTATATATTCTCGATTATCACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BJ53JQ C 1
AF RR2BJ53TF U 1
BS 1 627 RR2BJ53TF

RD RR2BJ53JQ 627 0 0
GGAAAAAAGAGAAGACAAGGAGAGAGATCCAGAAGAAGAAGAGAAGATGGCTTTGCAATG
GCTGATTCTGTCGTACGTGGTGGCCGCCGAAGCTGTGATCGCGGTGTTGCTGACTTTACC
GTACCCTATGCTAGTGAAGAAACGCGTCGTGTCACTTGTCTCTCTCATTCTCCAACCTGC
TGCTTCCATCGTCGCCTTCGCCGCCTTTCAGCTCTGCGATATATACTGGAAGAATGAACA
TAGACTCTCTTGCTCATCTGAGGTCTGCACTGCTACAGAGCGTGATCGCTACGAGAAATC
TATCTACAAGGCTCAGAGGAATGCTGTTCTGTGCGCTGCAGGAATTCTTCTCTACTGGTG
CATCTACCGTATCTGCAAGTACAACAAGGACCTGGAGCTTTTGGAAGAAGCTGTGAAGAG
AGAGGCACACAAGGACGAGTAATCTACTTGAGTATAGAGAGACTTGGTTCCTCAAAACCA
TATAAGTAAAGTCTTTTTATTGTTTTCTTACATCTAATACCACTAAACCTGAAGAAAACA
GTGAGTATCAACAACAGGTTGTAAACAAATATATATCATCAGTGTTCAATGCTTGTTTCA
TTCCTCTATATATTCTCGATTATCACT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2BJ53TF 627 0 0
GGAAAAAAGAGAAGACAAGGAGAGAGATCCAGAAGAAGAAGAGAAGATGGCTTTGCAATG
GCTGATTCTGTCGTACGTGGTGGCCGCCGAAGCTGTGATCGCGGTGTTGCTGACTTTACC
GTACCCTATGCTAGTGAAGAAACGCGTCGTGTCACTTGTCTCTCTCATTCTCCAACCTGC
TGCTTCCATCGTCGCCTTCGCCGCCTTTCAGCTCTGCGATATATACTGGAAGAATGAACA
TAGACTCTCTTGCTCATCTGAGGTCTGCACTGCTACAGAGCGTGATCGCTACGAGAAATC
TATCTACAAGGCTCAGAGGAATGCTGTTCTGTGCGCTGCAGGAATTCTTCTCTACTGGTG
CATCTACCGTATCTGCAAGTACAACAAGGACCTGGAGCTTTTGGAAGAAGCTGTGAAGAG
AGAGGCACACAAGGACGAGTAATCTACTTGAGTATAGAGAGACTTGGTTCCTCAAAACCA
TATAAGTAAAGTCTTTTTATTGTTTTCTTACATCTAATACCACTAAACCTGAAGAAAACA
GTGAGTATCAACAACAGGTTGTAAACAAATATATATCATCAGTGTTCAATGCTTGTTTCA
TTCCTCTATATATTCTCGATTATCACT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL7558Contig1 736 2 2 U
GGACCCTCATAGCTGCGTCTAATAATCTTTTATTCGGAGAAAGAAATTTGAAGAAAAAAA
ACAATAAGCAACAATGTTGGTGTACCAAGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTCTGTCTGA
CTCTTTCTCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTTTGGGAAGTTGAAGGAAAGTGGAC
TACCGTTGGAGCTCTAGATGTGAACATCGGTGCCAATCCCTCTGCTGAAGAAGGTGGTGA
GGACGAGGGTGTTGATGACACTGCTCAAAAGGTTGTTGACATTGTGGACACCTTCAGACT
TCAGGAGCAACCGACTTATGATAAGAAGGGCTTCATCGCCTATATTAAAAAGTACATCAA
GCTTTTGACACCCAAGCTCAGCGAGGAAGATCAAGCAGCCTTCAAGAAGGGTATCGAGGG
AGCTACCAAGTTCTTGCTCCCCAAGCTCAATGACTTCCAATTCTTTGTTGGGGAGGGGAT
GCATGATGACAGCACTTTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCAACTAACCCAACATT
TTTGTACTTCGCTCATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTGAGTGGTCGGTCGCAGCTTCTT
TATTTTGTTCTGTGTTTGGTCGTCTCCTATTAAAATTACCTACCACCATTCTGCTTTTTA
TCTTCTAGTTAAGTTATTTAATCCGAAAACAACGGTTTATCATTTACTATTAATTGAATT
TTGTGGATTGCTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FR09TF U 1
AF RR2FR09JQ C 129
BS 1 683 RR2FR09TF
BS 684 736 RR2FR09JQ

RD RR2FR09TF 683 0 0
GGACCCTCATAGCTGCGTCTAATAATCTTTTATTCGGAGAAAGAAATTTGAAGAAAAAAA
ACAATAAGCAACAATGTTGGTGTACCAAGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTCTGTCTGA
CTCTTTCTCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTTTGGGAAGTTGAAGGAAAGTGGAC
TACCGTTGGAGCTCTAGATGTGAACATCGGTGCCAATCCCTCTGCTGAAGAAGGTGGTGA
GGACGAGGGTGTTGATGACACTGCTCAAAAGGTTGTTGACATTGTGGACACCTTCAGACT
TCAGGAGCAACCGACTTATGATAAGAAGGGCTTCATCGCCTATATTAAAAAGTACATCAA
GCTTTTGACACCCAAGCTCAGCGAGGAAGATCAAGCAGCCTTCAAGAAGGGTATCGAGGG
AGCTACCAAGTTCTTGCTCCCCAAGCTCAATGACTTCCAATTCTTTGTTGGGGAGGGGAT
GCATGATGACAGCACTTTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCAACTAACCCAACATT
TTTGTACTTCGCTCATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTGAGTGGTCGGTCGCAGCTTCTT
TATTTTGTTCTGTGTTTGGTCGTCTCCTATTAAAATTACCTACCACCATTCTGCTTTTTA
TCTTCTAGTTAAGTTATTTAATC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2FR09JQ 608 0 0
CTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCTTTGGGAAGTTGAAGGAAAGTGGACTACCGTTG
GAGCTCTAGATGTGAACATCGGTGCCAATCCCTCTGCTGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGG
GTGTTGATGACACTGCTCAAAAGGTTGTTGACATTGTGGACACCTTCAGACTTCAGGAGC
AACCGACTTATGATAAGAAGGGCTTCATCGCCTATATTAAAAAGTACATCAAGCTTTTGA
CACCCAAGCTCAGCGAGGAAGATCAAGCAGCCTTCAAGAAGGGTATCGAGGGAGCTACCA
AGTTCTTGCTCCCCAAGCTCAATGACTTCCAATTCTTTGTTGGGGAGGGGATGCATGATG
ACAGCACTTTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCAACTAACCCAACATTTTTGTACT
TCGCTCATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTGAGTGGTCGGTCGCAGCTTCTTTATTTTGT
TCTGTGTTTGGTCGTCTCCTATTAAAATTACCTACCACCATTCTGCTTTTTATCTTCTAG
TTAAGTTATTTAATCCGAAAACAACGGTTTATCATTTACTATTAATTGAATTTTGTGGAT
TGCTTACC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL7559Contig1 729 2 13 U
GGATCGAACAGAGAGAGTAACACACAAAATGAAGAGAAAGAAAAGAAAACAGCAACGACG
TTCTTCCTCGTTCACCCCCGCGAGCTCCTTCGATCGTCCTCAATTCAAAAAGGTAAGAGC
CTTAGAAGAAATGACTGCTTTCCCCAATCTCAACTCTGATGCTGGACTGAAGAAGCTAGA
CGAGCATCTTCTCACTCGTTATTACATTACAAGTCACAAGGCTTCAAAAGATGATATCAC
TGTCTATGCCGCTCTTTCGAAACCTCCACATTCAAAGTATGTGAATGCATCACGCTGGTA
CAACCACATCGAAACTCTCTTGAGTATCTCAGGTATATCTACTGAAGTGAGTGGTGTTAC
TATTGATGGATTGGCCTCTATCACAGAAGAGGCTAATGGTAATTCTAAGGATGGTGTGGT
GGTTATGGATGATGATGACAATGATCAAAATGTTGAAGAGGTTGAAGAGAGACCAGCTTC
TTTGATAGCATCCACAAAAAAAAAAATATCTTGGTTGTCGATAGTAATAGTTGTCATACC
GCCGGATGATGAGACCGACATGAATAAGCTAGAGAAACATTTAAGATCTATTCAAATGGA
AGGAGTGGTTTGTGGAGCATCAAAAGTTGTCCCAGTTGGCTATGGAGTCGAGTTGTTTCG
GATCATAGTCACAGTGTCCTTAGATGACAAATTTGATGTTTTGGACGAACTTATCGATAC
ACATATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2CQ75TF U 1
AF RR2CD88TF U 23
BS 1 78 RR2CQ75TF
BS 79 79 RR2CD88TF
BS 80 263 RR2CQ75TF
BS 264 264 RR2CD88TF
BS 265 438 RR2CQ75TF
BS 439 439 RR2CD88TF
BS 440 501 RR2CQ75TF
BS 502 502 RR2CD88TF
BS 503 509 RR2CQ75TF
BS 510 510 RR2CD88TF
BS 511 522 RR2CQ75TF
BS 523 523 RR2CD88TF
BS 524 729 RR2CQ75TF

RD RR2CQ75TF 729 0 0
GGATCGAACAGAGAGAGTAACACACAAAATGAAGAGAAAGAAAAGAAAACAGCAACGACG
TTCTTCCTCGTTCACCCCGGCGAGCTCCTTCGATCGTCCTCAATTCAAAAAGGTAAGAGC
CTTAGAAGAAATGACTGCTTTCCCCAATCTCAACTCTGATGCTGGACTGAAGAAGCTAGA
CGAGCATCTTCTCACTCGTTATTACATTACAAGTCACAAGGCTTCAAAAGATGATATCAC
TGTCTATGCCGCTCTTTCGAAACTTCCACATTCAAAGTATGTGAATGCATCACGCTGGTA
CAACCACATCGAAACTCTCTTGAGTATCTCAGGTATATCTACTGAAGTGAGTGGTGTTAC
TATTGATGGATTGGCCTCTATCACAGAAGAGGCTAATGGTAATTCTAAGGATGGTGTGGT
GGTTATGGATGATGATGATAATGATCAAAATGTTGAAGAGGTTGAAGAGAGACCAGCTTC
TTTGATAGCATCCACAAAAAAGAAAATATTTTGGTTGTCGATGGTAATAGTTGTCATACC
GCCGGATGATGAGACCGACATGAATAAGCTAGAGAAACATTTAAGATCTATTCAAATGGA
AGGAGTGGTTTGTGGAGCATCAAAAGTTGTCCCAGTTGGCTATGGAGTCGAGTTGTTTCG
GATCATAGTCACAGTGTCCTTAGATGACAAATTTGATGTTTTGGACGAACTTATCGATAC
ACATATATT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2CD88TF 707 0 0
G
ACAAAATGAAGAGAAAGAAAAGAAAACAGCAACGACGTTCTTCCTCGTTCACCCCCGCGA
GCTCCTTTGATCGTCCTCAATTCAAAAAGGTAAGAGCCTTAGAAGAAATGACTGCTTTCC
CCAATCTCAACTCTGATGCTGGACTGAAGAAGCTAGACGATCATCTTCTCACTCGTTATT
ACATTACAAGTCACAAGGCTTCAAAAGATGGTATCACTGTCTATGCCGCTCTTTCGAAAC
CTCCACATTCGAAGTATGTGAATGCATCACGCTGGTACAACCACATCGAAACTCTCTTGA
GTATCTCAGGTATATCTACTGAAGTGAGTGGTGTTACTATTGGTGGATTGGCCTCTATCA
CAGAAGAGGCTAATGGTAATTCTAAGGATGGTGTGGTGGTTATGGATGATGATGACAATG
ATCAAAATGTTGAAGAGGTTGAAGAGAGACCAGCTTCTTTGATAGCATCCACAAAAAAAA
A****TCTTGGTTGTCGATAGTAATAGTTGTCATACCGCCGGATGATGAGACCGACATGA
ATAAGCTAGAGAAACATTTAAGATCTATTCAAATGGAAGGAGTGGTTTGTGGAGCATCAA
AAGTTGTCCCAGTTGGCTATGGAGTCGAGTTGTTTCGGATCATAGTCACAGTGTCCTTAG
ATGACGAATTTGATGTTTTGGACGAACTTATCGATACACATATATT

QA 2 707 2 707
DS 



AS 1 2

CO CL7560Contig1 969 2 2 U
GAGTGCTAGCATTTGCGAGGAACATAGCAATGCATCCTGAAACTTGGTTAGACTTTCCTC
TCGACCCCGACGAAGACCTTGATGATTTGGAAATGTCTGACGCACAAAGAGGCCATGCTT
TAGCTATAGAACGTCTTGCTCCGAGGTTAGCCGCCCTCAGAATAGAACTCTGTCCATGCC
ATATGACTGTTGGTTACTTCTGGAAAGTCTATTTTGTTCTTCTCCTCTCAAGGCTCAATA
AACACGATGCTCAGCTTTTGTCCTCTCCACAGGTGATGGAAGCAAGAGCATTGTGGATGA
AAGAGCTTCATAATCAAAACAGTTCCACAAAACCAGGCTATGGAGATATTCTTAAGGAAG
AGATTACACCATCCACTTCGAGTTACTACAACCAAGCTCCCCCTGAGTTTCTGTCTCCAA
GAATATATGCCTTCGAACCTCCTTCAATCATGTATCGCGATTTCGAAACGGCAGATCGCG
GGTCTGAGAATGCAGAGTTCATTGATAAAGCTGTTATCGAGGAACAACCAATCCAGAAGA
ACGATGCAAGCCTGAACCTAACACCCAATGATGAGGATGATGATGATGATGATTGGCCAG
AAGAGGAAGACGATGCTCCTGATTGGGCGCCAATGTTCACAGGGAATGAGGATGATGTTT
CTTTCAGTGATCTCGAAGGTGACGACGATATAAGTAGCTTAGCACTCAAGTTTAAGAGTT
CCTCAAAGGGCACAGACCAAAAAGGAACATGAAACATCATCTCAGGTCGTAACGAAACAG
GCTTGTTGCTTTGTCTTACCTCAAGATCAAATCAGTGGAACTGAACATAAAAGGATTTGT
ACCGAGTCAAAGCGTGAAGTTTTTTGGGTGAGTTTGATTGTTTGTCAAATGAAAAAAAAA
AGAAGAAGGTTTGAAACATGTACAGAAGATTTATTCAGTCATTTCAATTGCATTTGTAAT
GTTTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF59TF U 1
AF RR2EF59JQ C 378
BS 1 673 RR2EF59TF
BS 674 969 RR2EF59JQ

RD RR2EF59TF 673 0 0
GAGTGCTAGCATTTGCGAGGAACATAGCAATGCATCCTGAAACTTGGTTAGACTTTCCTC
TCGACCCCGACGAAGACCTTGATGATTTGGAAATGTCTGACGCACAAAGAGGCCATGCTT
TAGCTATAGAACGTCTTGCTCCGAGGTTAGCCGCCCTCAGAATAGAACTCTGTCCATGCC
ATATGACTGTTGGTTACTTCTGGAAAGTCTATTTTGTTCTTCTCCTCTCAAGGCTCAATA
AACACGATGCTCAGCTTTTGTCCTCTCCACAGGTGATGGAAGCAAGAGCATTGTGGATGA
AAGAGCTTCATAATCAAAACAGTTCCACAAAACCAGGCTATGGAGATATTCTTAAGGAAG
AGATTACACCATCCACTTCGAGTTACTACAACCAAGCTCCCCCTGAGTTTCTGTCTCCAA
GAATATATGCCTTCGAACCTCCTTCAATCATGTATCGCGATTTCGAAACGGCAGATCGCG
GGTCTGAGAATGCAGAGTTCATTGATAAAGCTGTTATCGAGGAACAACCAATCCAGAAGA
ACGATGCAAGCCTGAACCTAACACCCAATGATGAGGATGATGATGATGATGATTGGCCAG
AAGAGGAAGACGATGCTCCTGATTGGGCGCCAATGTTCACAGGGAATGAGGATGATGTTT
CTTTCAGTGATCT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2EF59JQ 592 0 0
TCGAGTTACTACAACCAAGCTCCCCCTGAGTTTCTGTCTCCAAGAATATATGCCTTCGAA
CCTCCTTCAATCATGTATCGCGATTTCGAAACGGCAGATCGCGGGTCTGAGAATGCAGAG
TTCATTGATAAAGCTGTTATCGAGGAACAACCAATCCAGAAGAACGATGCAAGCCTGAAC
CTAACACCCAATGATGAGGATGATGATGATGATGATTGGCCAGAAGAGGAAGACGATGCT
CCTGATTGGGCGCCAATGTTCACAGGGAATGAGGATGATGTTTCTTTCAGTGATCTCGAA
GGTGACGACGATATAAGTAGCTTAGCACTCAAGTTTAAGAGTTCCTCAAAGGGCACAGAC
CAAAAAGGAACATGAAACATCATCTCAGGTCGTAACGAAACAGGCTTGTTGCTTTGTCTT
ACCTCAAGATCAAATCAGTGGAACTGAACATAAAAGGATTTGTACCGAGTCAAAGCGTGA
AGTTTTTTGGGTGAGTTTGATTGTTTGTCAAATGAAAAAAAAAAGAAGAAGGTTTGAAAC
ATGTACAGAAGATTTATTCAGTCATTTCAATTGCATTTGTAATGTTTTTCTT

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL7561Contig1 975 2 6 U
GAAGCAAAGACAATCAATCGTCGTCTTCTTCTTCACTTTGACTCTTACAGTATCAATCAA
TCAATCGATGGCTTCTTCGTCTCCATTGCAAATGGTTCACACTTCTCGCACCATCTCTCA
GATTGGTGTGAAGTCGCAGCTAGTCTCTGCACATGGAAAACCTCAATCAGTTTGCTTCGG
AGCTCGTTCCTCTGGTTTCTCACTATCTTCAAGACTACACTACGCGACAAGCTTCCCTCT
TAAGCAATTGTCAGGAGCTTACAAGCTCCAGAGAACAGCTTGTGTTAAATCAATGGCCGC
TGAGGAGGAAGAAGAAGTATTAGCACCTCCTCGGGCTAAAGTGACACACAAAGTTTACTT
TGATGTGGAGATTGGAGGTGAAGTGGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGT
TGTCCCTAGAACCGTTGAAAACTTCCGTGCCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTA
CAAAGGTTCTTCCTTTCACCGTATCATTAAGGACTTCATGATCCAAGGAGGTGATTTCAC
TGAGGGAAATGGTACTGGAGGTATTAGTATCTACGGTGCCAAGTTTGAAGATGAAAACTT
CACCCTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGTATGGCTAACGCTGGTCCTAATACTAA
TGGAAGCCAGTTTTTCATTTGCACCGCCAAGACTTCATGGTTAGATGGGATGCATGTTGT
GTTTGGACAAGTCATTGAAGGTATGAACATTGTGAGGAGACTTGAGTCTCAGGAGACGCG
TGCCATGGATGTTCCCAAGAAACCTTGCAGAATCTATGCCTGTGGAGAGCTCCCAATGGA
AGCTTGATTAACGTTGGATCTTAGTTCTGTTTTTATTTTCTTTTTTTCATGAGAAGCCAG
AGATTTTGAAGTTATGTCTCTTTTGTTTCTTTACTATGGATGCATGAGTTAAGAAGTACA
ATAAGGTTCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A337TF U 1
AF RR2A337JQ C 176
BS 1 689 RR2A337TF
BS 690 690 RR2A337JQ
BS 691 740 RR2A337TF
BS 741 741 RR2A337JQ
BS 742 753 RR2A337TF
BS 754 975 RR2A337JQ

RD RR2A337TF 753 0 0
GAAGCAAAGACAATCAATCGTCGTCTTCTTCTTCACTTTGACTCTTACAGTATCAATCAA
TCAATCGATGGCTTCTTCGTCTCCATTGCAAATGGTTCACACTTCTCGCACCATCTCTCA
GATTGGTGTGAAGTCGCAGCTAGTCTCTGCACATGGAAAACCTCAATCAGTTTGCTTCGG
AGCTCGTTCCTCTGGTTTCTCACTATCTTCAAGACTACACTACGCGACAAGCTTCCCTCT
TAAGCAATTGTCAGGAGCTTACAAGCTCCAGAGAACAGCTTGTGTTAAATCAATGGCCGC
TGAGGAGGAAGAAGAAGTATTAGCACCTCCTCGGGCTAAAGTGACACACAAAGTTTACTT
TGATGTGGAGATTGGAGGTGAAGTGGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGT
TGTCCCTAGAACCGTTGAAAACTTCCGTGCCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTA
CAAAGGTTCTTCCTTTCACCGTATCATTAAGGACTTCATGATCCAAGGAGGTGATTTCAC
TGAGGGAAATGGTACTGGAGGTATTAGTATCTACGGTGCCAAGTTTGAAGATGAAAACTT
CACCCTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGTATGGCTAACGCTGGTCCTAATACTAA
TGGAAGCCAGTTTTTCATTTGCACCGCCA*GACTTCATGGTTAGATGGGATGCATGTTGT
GTTTGGACAAGTCATTGAAG*TATGAACATTGT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RR2A337JQ 800 0 0
TTCGGAGCTCGTTCCTCTGGTTTCTCACTATCTTCAAGACTACACTACGCGACAAGCTTC
CCTCTTAAGCAATTGTCAGGAGCTTACAAGCTCCAGAGAACAGCTTGTGTTAAATCAATG
GCCGCTGAGGAGGAAGAAGAAGTATTAGCACCTCCTCGGGCTAAAGTGACACACAAAGTT
TACTTTGATGTGGAGATTGGAGGTGAAGTGGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGT
GATGTTGTCCCTAGAACCGTTGAAAACTTCCGTGCCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTAT
GGGTACAAAGGTTCTTCCTTTCACCGTATCATTAAGGACTTCATGATCCAAGGAGGTGAT
TTCACTGAGGGAAATGGTACTGGAGGTATTAGTATCTACGGTGCCAAGTTTGAAGATGAA
AACTTCACCCTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGTATGGCTAACGCTGGTCCTAAT
ACTAATGGAAGCCAGTTTTTCATTTGCACCGCCAAGACTTCATGGTTAGATGGGATGCAT
GTTGTGTTTGGACAAGTCATTGAAGGTATGAACATTGTGAGGAGACTTGAGTCTCAGGAG
ACGCGTGCCATGGATGTTCCCAAGAAACCTTGCAGAATCTATGCCTGTGGAGAGCTCCCA
ATGGAAGCTTGATTAACGTTGGATCTTAGTTCTGTTTTTATTTTCTTTTTTTCATGAGAA
GCCAGAGATTTTGAAGTTATGTCTCTTTTGTTTCTTTACTATGGATGCATGAGTTAAGAA
GTACAATAAGGTTCTCTCCC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL7562Contig1 616 2 2 U
CCAGCGGCCGTCTCTTCTCCGCTCATATCGTCGCTCGGAGCTCCTAGATCGCGTAGTTTC
CTTGCGCGTGTGACACCTTCTTCCTCCTCCGGGTTCAGGTCGAAATCTTAGGAGAAGACC
AAGAGCCATGGCCAAGCATCACCCTGATTTGATCATGTGCCGGAAACAACCTGGCATCGC
CATCGGGCGGTTGTGCGAGAAATGTGATGGGAAATGCGTGGTCTGCGATTCCTACGTGCG
CCCCTGTACGCTGGTTCGGATTTGCGACGAATGCAACTACGGTTCGTTCCAAGGACGGTG
CGTCATATGCGGAGGGGTTGGAATCTCAGATGCTTACTACTGCAAAGAGTGTACACAGCA
GGAGAAAGATAGGGATGGTTGTCCCAAGATTGTCAATCTCGGGAGTGCCAAGACTGATTT
GTTTTATGAACGTAAGAAATATGGATTTAAGAAACGATAGATTGTTTGATTATTACTCGG
GGTATTCATTTATTGTCCTAGGTAAAGTGTCTGTACTTGTCTGTGTTTAGGCATTGATTC
AAAGAAAAGACCATTGTTTAAAACTCTTTGTGGCTTTATCGATTAGCCGAACGTGATAAC
TTTGTTATGGTTGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BN69TF U 1
AF RR2BN69JQ C 1
BS 1 577 RR2BN69TF
BS 578 616 RR2BN69JQ

RD RR2BN69TF 577 0 0
CCAGCGGCCGTCTCTTCTCCGCTCATATCGTCGCTCGGAGCTCCTAGATCGCGTAGTTTC
CTTGCGCGTGTGACACCTTCTTCCTCCTCCGGGTTCAGGTCGAAATCTTAGGAGAAGACC
AAGAGCCATGGCCAAGCATCACCCTGATTTGATCATGTGCCGGAAACAACCTGGCATCGC
CATCGGGCGGTTGTGCGAGAAATGTGATGGGAAATGCGTGGTCTGCGATTCCTACGTGCG
CCCCTGTACGCTGGTTCGGATTTGCGACGAATGCAACTACGGTTCGTTCCAAGGACGGTG
CGTCATATGCGGAGGGGTTGGAATCTCAGATGCTTACTACTGCAAAGAGTGTACACAGCA
GGAGAAAGATAGGGATGGTTGTCCCAAGATTGTCAATCTCGGGAGTGCCAAGACTGATTT
GTTTTATGAACGTAAGAAATATGGATTTAAGAAACGATAGATTGTTTGATTATTACTCGG
GGTATTCATTTATTGTCCTAGGTAAAGTGTCTGTACTTGTCTGTGTTTAGGCATTGATTC
AAAGAAAAGACCATTGTTTAAAACTCTTTGTGGCTTT

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2BN69JQ 616 0 0
CCAGCGGCCGTCTCTTCTCCGCTCATATCGTCGCTCGGAGCTCCTAGATCGCGTAGTTTC
CTTGCGCGTGTGACACCTTCTTCCTCCTCCGGGTTCAGGTCGAAATTTTAGGAGAAGACC
AAGAGCCATGGCCAAGCATCACCCTGATTTGATCATGTGCCGGAAACAACCTGGCATCGC
CATCGGGCGGTTGTGCGAGAAATGTGATGGGAAATGCGTGGTTTGCGATTCCTACGTGCG
CCCCTGTACGCTGGTTCGGATTTGCGACGAATGCAACTACGGTTCGTTCCAAGGACGGTG
CGTCATATGCGGAGGGGTTGGAATCTCAGATGCTTACTACTGCAAAGAGTGTACACAGCA
GGAGAAAGATAGGGATGGTTGTCCCAAGATTGTCAATCTCGGGAGTGCCAAGACTGATTT
GTTTTATGAACGTAAGAAATATGGATTTAAGAAACGATAGATTGTTTGATTATTACTCGG
GGTATTCATTTATTGTCCTAGGTAAAGTGTCTGTACTTGTCTGTGTTTAGGCATTGATTC
AAAGAAAAGACCATTGTTTAAAACTCTTTGTGGCTTTATCGATTAGCCGAACGTGATAAC
TTTGTTATGGTTGTTT

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL7563Contig1 822 2 8 U
GGGATTCTTCATTTTGATAGCTACCTTCTTCGAGCCGCGGCTACAAAGTTACCTTCTTCT
CTTGTAGAGCCATGGCCGCCACCGTAGAAATCGACGCTGAGATTCAGCAGCAGCTTACCA
ACGAGGTCAAGCTCTTCAACCGTTGGAGCTTTGACGACGTCTCGGTCACGGACATTAGTC
TTGTTGACTACATTGGTGTTCAGCCTGCTAAACACGCCACTTTTGTCCCCCACACTGCTG
GAAGATACTCTGTCAAGAGGTTCAGGAAGGCTCAGTGTCCTATCGTCGAGAGGCTCACTA
ACTCTCTCATGATGCACGGCAGGAACAACGGTAAGAAGTTGATGGCTGTCAGGATCATCA
AGCACGCCATGGAGATTATCCACCTCTTGACTGATGCCAACCCTATTCAGGTTATCATCG
ATGCCATTGTTAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCGACCAGGATCGGGTCTGCTGGTGTGG
TGAGGAGACAGGCCGTTGATATCTCTCCTCTGAGACGTGTAAACCAAGCCATCTTCTTGC
TCACCACTGGTGCACGTGAAGCTGCCTTCAGAAACATCAAGACAATCGCTGAGTGCCTTG
CTGATGAGCTCATCAATGCTGCTAAAGGATCTTCCAACAGCTATGCCATCAAGAAGAAAG
ATGAGATCGAGAGAGTTGCTAAGGCCAACCGTTAAGTGGTTTTCCTTAGTTTTTTCCTTT
TTGCATTATTATCTCAAATAAGCTTTTGTACTGTTTTCGCTAGCTTTTGATATGTTAAAG
AATATTTCTCTATCTTTTAATGAAGTTTTGACGCTTGAATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H579TF U 1
AF RR2H579JQB C 249
BS 1 683 RR2H579TF
BS 684 684 RR2H579JQB
BS 685 716 RR2H579TF
BS 717 718 RR2H579JQB
BS 719 746 RR2H579TF
BS 747 747 RR2H579JQB
BS 748 756 RR2H579TF
BS 757 822 RR2H579JQB

RD RR2H579TF 762 0 0
GGGATTCTTCATTTTGATAGCTACCTTCTTCGAGCCGCGGCTACAAAGTTACCTTCTTCT
CTTGTAGAGCCATGGCCGCCACCGTAGAAATCGACGCTGAGATTCAGCAGCAGCTTACCA
ACGAGGTCAAGCTCTTCAACCGTTGGAGCTTTGACGACGTCTCGGTCACGGACATTAGTC
TTGTTGACTACATTGGTGTTCAGCCTGCTAAACACGCCACTTTTGTCCCCCACACTGCTG
GAAGATACTCTGTCAAGAGGTTCAGGAAGGCTCAGTGTCCTATCGTCGAGAGGCTCACTA
ACTCTCTCATGATGCACGGCAGGAACAACGGTAAGAAGTTGATGGCTGTCAGGATCATCA
AGCACGCCATGGAGATTATCCACCTCTTGACTGATGCCAACCCTATTCAGGTTATCATCG
ATGCCATTGTTAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCGACCAGGATCGGGTCTGCTGGTGTGG
TGAGGAGACAGGCCGTTGATATCTCTCCTCTGAGACGTGTAAACCAAGCCATCTTCTTGC
TCACCACTGGTGCACGTGAAGCTGCCTTCAGAAACATCAAGACAATCGCTGAGTGCCTTG
CTGATGAGCTCATCAATGCTGCTAAAGGATCTTCCAACAGCTATGCCATCAAGAAGAAAG
ATGAGATCGAGAGAGTTGCTAAG*CCAACCGTTAAGTGGTTTTCCTTAGTTTTTTC**TT
TTGCATTATTATCTCAAATAAGCTTT*GTACTGTTT
CGCTAG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2H579JQB 574 0 0
TCTGTCAAGAGGTTCAGGAAGGCTCAGTGTCCTATCGTCGAGAGGCTCACTAACTCTCTC
ATGATGCACGGCAGGAACAACGGTAAGAAGTTGATGGCTGTCAGGATCATCAAGCACGCC
ATGGAGATTATCCACCTCTTGACTGATGCCAACCCTATTCAGGTTATCATCGATGCCATT
GTTAACAGTGGTCCACGTGAAGATGCGACCAGGATCGGGTCTGCTGGTGTGGTGAGGAGA
CAGGCCGTTGATATCTTTCCTTTGAGACGTGTAAACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACT
GGTGCACGTGAAGCTGCCTTCAGAAACATCAAGACAATCGCTGAGTGCCTTGCTGATGAG
CTCATCAATGCTGCTAAAGGATCTTCCAACAGCTATGCCATCAAGAAGAAAGATGAGATC
GAGAGAGTTGCTAAGGCCAACCGTTAAGTGGTTTTCCTTAGTTTTTTTCTTTTTGCATTA
TTATCTCAAATAAGCTTTTGTACTGTTTTCGCTAGCTTTTGATATGTTAAAGAATATTTC
TCTATCTTTTAATGAAGTTTTGACGCTTGAATCG

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL7564Contig1 703 2 5 U
GGGCCAACTAAAACGACGACTACAGTAACTAATCAACTTATCCTTTCCATCCATCTTTCT
CCCCAATTTTGTTTCCTTAAACCCTTCCACAAAAATTAGGGTTTCTTCCACACTCAAAAC
TCCTTGGTGTGTGTGGATTGATTGATTTGTTATGAAAAGATGAATCTGATATCCAAATCC
TCCTTGACAAGAATCGAGTGCTCACCGTTTCTCCACCACTCGAGAGCTCTCGAAACCCCA
ACCGGAAAACGAATCACCCCTCAGCGAATCCGTTTCCACCCCTCCGCAGCCGTCTCCGGG
AGCGGCGGAAAGAAACAAAGAGCCAAGGCACCTCCGGAGATGGTGACGACGGCGAAGAAG
AAGGAACTTGGTCGGCCAAATGAGATAGCTTACGAGAAGGAAGCAGCGAATTGGGTGAAT
CTGATAGGGTTCGTGGATCAGCCAGTTCAATTCGAGGCTTCTCCCGACGGAAAGTTCTGG
GCAGGCACTGTTATCTCCCAGAGGCCTGCTTCAGATTCCTCTACTGCTTTCTGGATTCCG
ATTATATTTGAAGGTGATTTAGCTAAGACAGCTGATCGATATATAAGTAAAGACGATCTG
ATTCATGTTTCTGGAAAGCTTTTCATTGATTCCCCTCCTCCCAATATGACCTATGCTCAA
TCCAATGTCCAGGTATTGGTACAGAATCTTAGCTTTGTGCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2BK45TF U 1
AF RR2H652TF U 38
BS 1 203 RR2BK45TF
BS 204 204 RR2H652TF
BS 205 504 RR2BK45TF
BS 505 505 RR2H652TF
BS 506 703 RR2BK45TF

RD RR2BK45TF 703 0 0
GGGCCAACTAAAACGACGACTACAGTAACTAATCAACTTATCCTTTCCATCCATCTTTCT
CCCCAATTTTGTTTCCTTAAACCCTTCCACAAAAATTAGGGTTTCTTCCACACTCAAAAC
TCCTTGGTGTGTGTGGATTGATTGATTTGTTATGAAAAGATGAATCTGATATCCAAATCC
TCCTTGACAAGAATCGAGTGCTCGCCGTTTCTCCACCACTCGAGAGCTCTCGAAACCCCA
ACCGGAAAACGAATCACCCCTCAGCGAATCCGTTTCCACCCCTCCGCAGCCGTCTCCGGG
AGCGGCGGAAAGAAACAAAGAGCCAAGGCACCTCCGGAGATGGTGACGACGGCGAAGAAG
AAGGAACTTGGTCGGCCAAATGAGATAGCTTACGAGAAGGAAGCAGCGAATTGGGTGAAT
CTGATAGGGTTCGTGGATCAGCCAGTTCAATTCGAGGCTTCTCCCGACGGAAAGTTCTGG
GCAGGCACTGTTATCTCCCAGAGGTCTGCTTCAGATTCCTCTACTGCTTTCTGGATTCCG
ATTATATTTGAAGGTGATTTAGCTAAGACAGCTGATCGATATATAAGTAAAGACGATCTG
ATTCATGTTTCTGGAAAGCTTTTCATTGATTCCCCTCCTCCCAATATGACCTATGCTCAA
TCCAATGTCCAGGTATTGGTACAGAATCTTAGCTTTGTGCAGC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2H652TF 663 0 0
GG
ATCCTTTCCATCCATCTTTCTCCCCAATTTTGTTTCCTTAAACCCTTCCACAAAAATTAG
GGTTTCTTCCACACTCAAAACTCCTTGGTGTGTGTGGATTGATTGATTTGTTATGAAAAG
ATGAATCTGATATCCAAATCCTCCTTGACAAGAATCGAGTGCTCACCGTTTCTCCACCAC
TCGAGAGCTCTCGAAACCCCAACCGGAAAACGAATCACCCCTCAGCGAATCCGTTTCCAC
CCCTCCGCAGCCGTCTCCGGGAGCGGCGGAAAGAAACAAAGAGCCAAGGCACCTCCGGAG
ATGGTGACGACGGCGAAGAAGAAGGAACTTGGTCGGCCAAATGAGATAGCTTACGAGAAG
GAAGCAGCGAATTGGGTGAATCTGATAGGGTTCGTGGATCAGCCAGTTCAATTCGAGGCT
TCTCCCGACGGAAAGTTCTGGGCAGGCACTGTTATCTCCCAGAGGCCTGCTTCAGATTCC
TCTACTGCTTTCTGGATTCCGATTATATTTGAAGGTGATTTAGCTAAGACAGCTGATCGA
TATATAAGTAAAGACGATCTGATTCATGTTTCTGGAAAGCTTTTCATTGATTCCCC**CT
CCCAATATGACCTATGCTCAATCCAATGTCCAGGTATTGGTACAGAATCTTAGCTTTGTG
C

QA 3 663 3 663
DS 



AS 1 2

CO CL7565Contig1 569 2 2 U
GGATAACATATAACGTAGAGAAAAGAAAAAAGAAGAAGATAGGAAAAGATGTCGTGGCAA
ACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTTGGTGATGGTCAGGGTCATCACCTAACC
GCTGCAGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCTCAGAGTGCCAACTTCCCTCAG
TTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGAAAGAAGGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGAAAACA
GGACAATCATGTGTATTTGGGATCTATGAAGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATG
GTCGTTGAGAGGCTAGGTGATTATCTCCTCGAACAGGATCTCTAAGCCCCACACTTCATC
AAACCTTCTAGAATGTTCTACCTGCTTCCACATTATTTTCTTATACAAACTAATATAATA
GGATTTGGTTTCTGGATTCTCTCTAAGAAGCTGAATCCTGATTGAGAGTCTGATTCTTTA
AATTGGTTTTCTTCATTTCCATACGTTTCATTTTGTTGTGTTTTTTCTTGTTAACCATGT
TTAATTAATGTTCTTTATCTTCTGTTGCA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2C773JQ C 1
AF RR2C773TF U 1
BS 1 568 RR2C773TF
BS 569 569 RR2C773JQ

RD RR2C773JQ 569 0 0
GGATAACATATAACGTAGAGAAAAGAAAAAAGAAGAAGATAGGAAAAGATGTCGTGGCAA
ACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTTGGTGATGGTCAGGGTCATCACCTAACC
GCTGCAGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCTCAGAGTGCCAACTTCCCTCAG
TTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGAAAGAAGGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGAAAACA
GGACAATCATGTGTATTTGGGATCTATGAAGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATG
GTCGTTGAGAGGCTAGGTGATTATCTCCTCGAACAGGATCTCTAAGCCCCACACTTCATC
AAACCTTCTAGAATGTTCTACCTGCTTCCACATTATTTTCTTATACAAACTAATATAATA
GGATTTGGTTTCTGGATTCTCTCTAAGAAGCTGAATCCTGATTGAGAGTCTGATTCTTTA
AATTGGTTTTCTTCATTTCCATACGTTTCATTTTGTTGTGTTTTTTCTTGTTAACCATGT
TTAATTAATGTTCTTTATCTTCTGTTGCA

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2C773TF 568 0 0
GGATAACATATAACGTAGAGAAAAGAAAAAAGAAGAAGATAGGAAAAGATGTCGTGGCAA
ACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTTGGTGATGGTCAGGGTCATCACCTAACC
GCTGCAGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCTCAGAGTGCCAACTTCCCTCAG
TTCAAGGCACAAGAGTTCACTGGAAAGAAGGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGAAAACA
GGACAATCATGTGTATTTGGGATCTATGAAGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATG
GTCGTTGAGAGGCTAGGTGATTATCTCCTCGAACAGGATCTCTAAGCCCCACACTTCATC
AAACCTTCTAGAATGTTCTACCTGCTTCCACATTATTTTCTTATACAAACTAATATAATA
GGATTTGGTTTCTGGATTCTCTCTAAGAAGCTGAATCCTGATTGAGAGTCTGATTCTTTA
AATTGGTTTTCTTCATTTCCATACGTTTCATTTTGTTGTGTTTTTTCTTGTTAACCATGT
TTAATTAATGTTCTTTATCTTCTGTTGC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

CO CL7566Contig1 883 2 4 U
GGGCAGATCCCTCGTCTTACATCATCTTCCTTGTCCGTCTGTAACTCCTATTTTACTAAA
CTACCCCTTCAAACCGTTCAAATTATCCAGCCTGTCCTTCCCCCATCGCTGCCGTCAGTC
TCCAGCATCCTCCTCCTCCTCCGCCGCTCGTTGTTGTTCTTCTTCTTCTTCGACGAAAAT
GGAATCTCCACCGGAAGGTTACAGAAGAAACGTCGGTGTCTGTCTCATGAATCCTTCGAA
AAAGATCTTCGCGGCGTCGAGGTTGGATATTCCCAGTGCTTGGCAGATGCCTCAGGTGTT
GTTGTTGTTTATCTCTTGATTCGATTTTTGTGTTTTGTTTTTAGATTATCTAAGATAGAA
TCAGATAAAGAGTAGAATCGGTGTTTGGTATTGGATTGGGTTGATACTTGATAGGGTGGA
ATCGACGAGGGTGAAGATCCGAGAGTTGCTGTCATGAGGGAGCTTAAAGAAGAGACTGGT
GTTCACTCTGCTGAGATCATCGCTGAGGCACCTCACTGGGTGACTTATGATTTCCCTCCA
GATGTTAGGGAGAAGCTTAAAGTCCGTTGGGGATCTGACTGGAAAGGCCAAGCTCAGAAG
TGGTTTCTTCTGAAATTTACTGGGGAAGACAAAGAAATCAATCTTCTCGGTGATGGAACT
GAGAAACCTGAGTTTGGGGAATGGTCTTGGGTGTCTCCTGATCAACTCGTTGATCTTGCA
GTGGATTTCAAGAAGCCAGTATACAAGGAAGTCATGTCAGCTTTCGCTTCTCATCTCCAG
TAATACAACAAAACCATATGTTATAACTCACTCACTGCTTTTTAAGTTTTATTTTTTTTG
TTTTGGTATCAAACTCGAGGAATAAGCTCTTCTTGAAATACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GZ13TF U 1
AF RR2GZ13JQ C 143
BS 1 649 RR2GZ13TF
BS 650 650 RR2GZ13JQ
BS 651 723 RR2GZ13TF
BS 724 883 RR2GZ13JQ

RD RR2GZ13TF 723 0 0
GGGCAGATCCCTCGTCTTACATCATCTTCCTTGTCCGTCTGTAACTCCTATTTTACTAAA
CTACCCCTTCAAACCGTTCAAATTATCCAGCCTGTCCTTCCCCCATCGCTGCCGTCAGTC
TCCAGCATCCTCCTCCTCCTCCGCCGCTCGTTGTTGTTCTTCTTCTTCTTCGACGAAAAT
GGAATCTCCACCGGAAGGTTACAGAAGAAACGTCGGTGTCTGTCTCATGAATCCTTCGAA
AAAGATCTTCGCGGCGTCGAGGTTGGATATTCCCAGTGCTTGGCAGATGCCTCAGGTGTT
GTTGTTGTTTATCTCTTGATTCGATTTTTGTGTTTTGTTTTTAGATTATCTAAGATAGAA
TCAGATAAAGAGTAGAATCGGTGTTTGGTATTGGATTGGGTTGATACTTGATAGGGTGGA
ATCGACGAGGGTGAAGATCCGAGAGTTGCTGTCATGAGGGAGCTTAAAGAAGAGACTGGT
GTTCACTCTGCTGAGATCATCGCTGAGGCACCTCACTGGGTGACTTATGATTTCCCTCCA
GATGTTAGGGAGAAGCTTAAAGTCCGTTGGGGATCTGACTGGAAAGGCCAAGCTCAGAAG
TGGTTTCTTCTGAAATTTACTGGGGAAGACAAAGAAATCAATCTTCTCG*TGATGGAACT
GAGAAACCTGAGTTTGGGGAATGGTCTTGGGTGTCTCCTGATCAACTCGTTGATCTTGCA
GTG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2GZ13JQ 741 0 0
GCCGCTCGTTGTTGTTCTTCTTCTTCTTCGACGAAAATGGAATCTCCACCGGAAGGTTAC
AGAAGAAACGTCGGTGTCTGTCTCATGAATCCTTCGAAAAAGATCTTCGCGGCGTCGAGG
TTGGATATTCCCAGTGCTTGGCAGATGCCTCAGGTGTTGTTGTTGTTTATCTCTTGATTC
GATTTTTGTGTTTTGTTTTTAGATTATCTAAGATAGAATCAGATAAAGAGTAGAATCGGT
GTTTGGTATTGGATTGGGTTGATACTTGATAGGGTGGAATCGACGAGGGTGAAGATCCGA
GAGTTGCTGTCATGAGGGAGCTTAAAGAAGAGACTGGTGTTCACTCTGCTGAGATCATCG
CTGAGGCACCTCACTGGGTGACTTATGATTTCCCTCCAGATGTTAGGGAGAAGCTTAAGG
TCCGTTGGGGATCTGACTGGAAGGGCCAAGCTCAGAAGTGGTTTCTTCTGAAATTTACTG
GGGAAGACAAAGAAATCAATCTTCTCGGTGATGGAACTGAGAAACCTGAGTTTGGGGAAT
GGTCTTGGGTGTCTCCTGATCAACTCGTTGATCTTGCAGTGGATTTCAAGAAGCCAGTAT
ACAAGGAAGTCATGTCAGCTTTCGCTTCTCATCTCCAGTAATACAACAAAACCATATGTT
ATAACTCACTCACTGCTTTTTAAGTTTTATTTTTTTTGTTTTGGTATCAAACTCGAGGAA
TAAGCTCTTCTTGAAATACAC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL7567Contig1 716 2 5 U
GGAGCGAGGAGAAGACGAAAACAACTTCGTATTAAGGAGTAGCCGTCGTACAGATCCTCG
GAGAGAAGAGAAAGTTCCCCCCAAATCAACTCATCTTCTTCTTCTTCCTCACTTCAGTTG
CACAAACACAAAGGGTACGGTTTTGTGAAGATGGCATCAAAGTTGATACAAGTTCAATCA
AAGGCATGTGAGGCTTCCAAGTTTGTGGCCAAGCATGGAACTTCTTACTACAGGCAGTTG
CTTGAAAAGAACAAGCACTATATCCAGGAACCTGCTACGGTGGACAAGTGCCAAGAGTTG
TCTAAGCAACTTCTCTACACCCGTCTTGCTAGCATTCCTGGACGCTGTGAAACATTCCGG
AAGGAAGTAGACTACGCGAAGAACTTGTGGAAGAACAGAACCGATCTGAAGGTAGAAGAT
GCCGGAGTCGCTGCATTGTTTGGTCTCGAATGCTTTGCGTGGTACTGCGCTGGTGAAATC
GTCGGGAGAGGGTTCACCTTCACCGGCTATTACCCTTGAATGTGAGGAACACTAACTTGA
ACAAGATTGTGTGTAATCCCCATATTTTAGTTTCCATGAATCATTTTTTTTTTCCTTCCA
GCCTTGCCCTGAAACGGAAACAGAGCCTTTGTAGCTGAGAAAAAACATCCATTTTGCTAA
ACTCTTTTTGATGAAGATTGCGATCAAATAAGAACAGAACTTTCCACATGAAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BL79TF U 1
AF RR2BL79JQ C 51
BS 1 81 RR2BL79TF
BS 82 82 RR2BL79JQ
BS 83 644 RR2BL79TF
BS 645 645 RR2BL79JQ
BS 646 716 RR2BL79TF

RD RR2BL79TF 716 0 0
GGAGCGAGGAGAAGACGAAAACAACTTCGTATTAAGGAGTAGCCGTCGTACAGATCCTCG
GAGAGAAGAGAAAGTTCCCCC*AAATCAACTCATCTTCTTCTTCTTCCTCACTTCAGTTG
CACAAACACAAAGGGTACGGTTTTGTGAAGATGGCATCAAAGTTGATACAAGTTCAATCA
AAGGCATGTGAGGCTTCCAAGTTTGTGGCCAAGCATGGAACTTCTTACTACAGGCAGTTG
CTTGAAAAGAACAAGCACTATATCCAGGAACCTGCTACGGTGGACAAGTGCCAAGAGTTG
TCTAAGCAACTTCTCTACACCCGTCTTGCTAGCATTCCTGGACGCTGTGAAACATTCCGG
AAGGAAGTAGACTACGCGAAGAACTTGTGGAAGAACAGAACCGATCTGAAGGTAGAAGAT
GCCGGAGTCGCTGCATTGTTTGGTCTCGAATGCTTTGCGTGGTACTGCGCTGGTGAAATC
GTCGGGAGAGGGTTCACCTTCACCGGCTATTACCCTTGAATGTGAGGAACACTAACTTGA
ACAAGATTGTGTGTAATCCCCATATTTTAGTTTCCATGAATCATTTTTTTTTTCCTTCCA
GCCTTGCCCTGAAACGGAAACAGAGCCTTTGTAGCTGAGAAAAA*CATCCATTTTGCTAA
ACTCTTTTTGATGAAGATTGCGATCAAATAAGAACAGAACTTTCCACATGAAGTTC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2BL79JQ 666 0 0
CAGATCCTCGGAGAGAAGAGAAAGTTCCCCCCAAATCAACTCATCTTCTTCTTCTTCCTC
ACTTCAGTTGCACAAACACAAAGGGTACGGTTTTGTGAAGATGGCATCAAAGTTGATACA
AGTTCAATCAAAGGCATGTGAGGCTTCCAAGTTTGTGGCCAAGCATGGAACTTCTTACTA
CAGGCAGTTGCTTGAAAAGAACAAGCACTATATCCAGGAACCTGCTACGGTGGACAAGTG
CCAAGAGTTGTTTAAGCAACTTCTCTACACCCGTCTTGCTAGCATTCCTGGACGCTGTGA
AACATTCCGGAAGGAAGTAGACTACGCGAAGAACTTGTGGAAGAACAGAACCGATCTGAA
GGTAGAAGATGCCGGAGTCGCTGCATTGTTTGGTCTCGAATGCTTTGCGTGGTACTGCGC
TGGTGAAATCGTCGGGAGAGGGTTCACCTTCACCGGCTATTACCCTTGAATGTGAGGAAC
ACTAACTTGAACAAGATTGTGTGTAATCCCCATATTTTAGTTTCCATGAATCATTTTTTT
TTTCCTTCCAGCCTTGCCCTGAAACGGAAACAGAGCCTTTGTAGCTGAGAAAAAACATCC
ATTTTGCTAAACTCTTTTTGATGAAGATTGCGATCAAATAAGAACAGAACTTTCCACATG
AAGTTC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7569Contig1 610 2 7 U
GGTACTAAATACTCAAATTCTCGTTGTTAATCGAAAACCTTGTTCTATTCTCTAAACTCT
GTAGAAATGATATAATGTAATAACAAGAATCACAATAATTAACCGTAACCACCTCTCTCC
ATCACACACACACACACACAAAACTACCGAGTCTTGATCGTCTTTCATTCAAGATGAAGC
CGCTTCTGCTTCTTTTTCTTCTGCGTTTCCTTGTGCTGTGGCTTCTTCTCCTTCAGCTTC
ACTGGGCTTTTCTGGTCCAGGTCCAGCTGATACTTTCACCATTGAAGGACGTAGAAGCCT
TTCCCCTAGCAAGAAACCCTTCCTGTATTCTTCAAGTACTATACCTTCTTCATATTCTGA
AGAATCCTCCCTCATTATTGCCTCATGAAGCATTGGATCAAACTGCTTGCCAACTGTCTC
CACGGTGACCACACCAAGCGACCCCAGAATCTCCACAAACTGTTTGTATATGCTCTGATA
GCTGTTAGTGACTCTCTCCTCTCCTTCAGTCTCCACTTTAATCTGAGACTTAGCTCTCTC
GAAATTATCCAAAACCGCCAAAAGATTCTCCACAACCTCTCCCTGAGCATTGGAAACAAG
GTTCAGCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G737JQ U 37
AF RR2GM64TF C 1
BS 1 36 RR2GM64TF
BS 37 318 RR2G737JQ
BS 319 319 RR2GM64TF
BS 320 421 RR2G737JQ
BS 422 422 RR2GM64TF
BS 423 507 RR2G737JQ
BS 508 610 RR2GM64TF

RD RR2G737JQ 471 0 0
ACCTTGTTCTATTCTCTAAACTCTGTAGAAATGATATAATGTAATAACAAGAATCACAAT
AATTAACCGTAACCACCTCTCTCCATCACACACACACACACACAAAACTACCGAGTCTTG
ATCGTCTTTCATTCAAGATGAAGCCGCTTCTGCTTCTTTTTCTTCTGCGTTTCCTTGTGC
TGTGGCTTCTTCTCCTTCAGCTTCACTGGGCTTTTCTGGTCCAGGTCCAGCTGATACTTT
CACCATTGAAGGACGTAGAAGCCTTTCCCCTAGCAAGAAACCTTTCCTGTATTCTTCAAG
TACTATACCTTCTTCATATTCTGAAGAATCCTCCCTCATTATTGCCTCATGAAGCATTGG
ATCAAACTGCTTGCCAACTGTCTCCGCGGTGACCACACCAAGCGACCCCAGAATCTCCAC
AAACTGTTTGTATATGCTCTGATAGCTGTTAGTGACTCTCTCCTCTCCTTC

QA 1 471 1 471
DS 

RD RR2GM64TF 610 0 0
GGTACTAAATACTCAAATTCTCGTTGTTAATCGAAAACCTTGTTCTATTCTCTAAACTCT
GTAGAAATGATATAATGTAATAACAAGAATCACAATAATTAACCGTAACCACCTCTCTCC
ATCACACACACACACACA**AAACTACCGAGTCTTGATCGTCTTTCATTCAAGATGAAGC
CGCTTCTGCTTCTTTTTCTTCTGCGTTTCCTTGTGCTGTGGCTTCTTCTCCTTCAGCTTC
ACTGGGCTTTTCTGGTCCAGGTCCAGCTGATACTTTCACCATTGAAGGACGTAGAAGCCT
TTCCCCTAGCAAGAAACCCTTCCTGTATTCTTCAAGTACTATACCTTCTTCATATTCTGA
AGAATCCTCCCTCATTATTGCCTCATGAAGCATTGGATCAAACTGCTTGCCAACTGTCTC
CACGGTGACCACACCAAGCGACCCCAGAATCTCCACAAACTGTTTGTATATGCTCTGATA
GCTGTTAGTGACTCTCTCCTCTCCTTCAGTCTCCACTTTAATCTGAGACTTAGCTCTCTC
GAAATTATCCAAAACCGCCAAAAGATTCTCCACAACCTCTCCCTGAGCATTGGAAACAAG
GTTCAGCCTC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL7570Contig1 731 2 1 U
GGGTTCGAAGCAGTAACAATGGCGGCTCCGTCGCGCGAGGATCTTGTGTACATGGCTAAG
CTAGCGGAGCAGGCGGAGAGGTACGAGGAGATGGTCGAGTTCATGGAGAAAGTCTCCGCC
GCAACAGATGGCACAGAGCTCACAATCGAGGAGCGAAACCTCCTCTCAGTCGCTTACAAG
AACGTAATCGGCGCTCGCCGCGCCTCGTGGAGAATCATCTCATCGATCGAGCAGAAAGAA
GAGAGCCGCGGGAACGCCGAACGCGTCAACACGATCCGCGACTACAAGGCCAAGATCGAG
ACGGAGCTCTCGGGGATCTGCGGCGGAATCCTAAAGCTGCTCGAGTCTACGCTCATCCCT
TCCGCTGCTTCCGAGGAGTCCAAGGTTTTCTATTACGAGATCCTCGAGTCTCCTGACCGT
GCCTGCGACCTAGCTAAAACGGCTTTTGATGCGGCCATTGCTGAGCTAGACACACTAGGG
GAAGAGTCATACAAGGATAGCACTTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGATAACCTCACTCTC
TGGACATCCGACATGCAGGATGAAGCTGCAGACGAGATCAAGGAAGCAGCTGTGAAGCCA
GCAGAAGAGCAGAAATGAAGAATCTTTGTGTGAAATGGTACTGCTAGGTGTTTTTGTCTG
TTCGGTTCTTTCCTTCATATGTTTTGTAGCAACTTAAGACTTTCGTCTTCAATCAAGAAC
ATGATTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B045TF U 1
AF RR2B045JQ C 118
BS 1 731 RR2B045TF

RD RR2B045TF 731 0 0
GGGTTCGAAGCAGTAACAATGGCGGCTCCGTCGCGCGAGGATCTTGTGTACATGGCTAAG
CTAGCGGAGCAGGCGGAGAGGTACGAGGAGATGGTCGAGTTCATGGAGAAAGTCTCCGCC
GCAACAGATGGCACAGAGCTCACAATCGAGGAGCGAAACCTCCTCTCAGTCGCTTACAAG
AACGTAATCGGCGCTCGCCGCGCCTCGTGGAGAATCATCTCATCGATCGAGCAGAAAGAA
GAGAGCCGCGGGAACGCCGAACGCGTCAACACGATCCGCGACTACAAGGCCAAGATCGAG
ACGGAGCTCTCGGGGATCTGCGGCGGAATCCTAAAGCTGCTCGAGTCTACGCTCATCCCT
TCCGCTGCTTCCGAGGAGTCCAAGGTTTTCTATTACGAGATCCTCGAGTCTCCTGACCGT
GCCTGCGACCTAGCTAAAACGGCTTTTGATGCGGCCATTGCTGAGCTAGACACACTAGGG
GAAGAGTCATACAAGGATAGCACTTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGATAACCTCACTCTC
TGGACATCCGACATGCAGGATGAAGCTGCAGACGAGATCAAGGAAGCAGCTGTGAAGCCA
GCAGAAGAGCAGAAATGAAGAATCTTTGTGTGAAATGGTACTGCTAGGTGTTTTTGTCTG
TTCGGTTCTTTCCTTCATATGTTTTGTAGCAACTTAAGACTTTCGTCTTCAATCAAGAAC
ATGATTTTATT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2B045JQ 614 0 0
GCCGCAACAGATGGCACAGAGCTCACAATCGAGGAGCGAAACCTCCTCTCAGTCGCTTAC
AAGAACGTAATCGGCGCTCGCCGCGCCTCGTGGAGAATCATTTCATCGATCGAGCAGAAA
GAAGAGAGCCGCGGGAACGCCGAACGCGTCAACACGATCCGCGACTACAAGGCCAAGATC
GAGACGGAGCTCTCGGGGATTTGCGGCGGAATCCTAAAGCTGCTCGAGTTTACGCTCATC
CCTTCCGCTGCTTCCGAGGAGTCCAAGGTTTTTTATTACGAGATCCTCGAGTTTCCTGAC
CGTGCCTGCGACCTAGCTAAAACGGCTTTTGATGCGGCCATTGCTGAGCTAGACACACTA
GGGGAAGAGTCATACAAGGATAGCACTTTGATCATGCAGCTTTTCCGTGATAACCTCACT
CTCTGGACATCCGACATGCAGGATGAAGCTGCAGACGAGATCAAGGAAGCAGCTGTGAAG
CCAGCAGAAGAGCAGAAATGAAGAATCTTTGTGTGAAATGGTACTGCTAG*TGTTTTTGT
CTGTTCGGTTCTTTCCTTCATATGTTTTGTAGCAACTTAAGACTTTTGTTTTCAATCAAG
AACATGATTTTATT

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL7571Contig1 533 2 5 U
CATCATCCCCTTATGTTTTGGACACAATAACATTTACATGACAAATTTCGAGATTTACAT
ATATGTTTTTTTGTACAGAATGAGATAAATATATGAAAGAATGTTAACTTAAACCCGTTT
CTTTGATTCTCTTGAACGTCTTCAGGGCTTGTTTTCTCTTTTCTTGCTTTTAGTGACGAG
TTCCATTGACATGGAACGAAGTCTGCTTATTATCTCGGTGAAAGGGGGACGAACATCCGG
GTCTATGTCCCAGCATTGTTCCATCAGCTTTTTCCATTCCGGAAAACATGTTTTCGGTAT
CGGAGGTCGAAGCGTGTTCTTCACAATCCCACCAATGATTGCTCCACAATGCATATCTGC
ATAGGGTTCCTCTCCTGTTAGAATCTCCCATAGGCAGATCCCATATGAAAATACATCAAC
TTTCTCTGAAACCCGGGTGCTGCTTCCGTTCAAGAGTTCTGGTGCCATCCATGGAAGTGT
TCCTCTCACTCCCCCAGATACCAAAGTGTTACGTTTGATTCTAGATAAGCCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C675JQ U 175
AF RR2C606JQ U 1
BS 1 195 RR2C606JQ
BS 196 196 RR2C675JQ
BS 197 208 RR2C606JQ
BS 209 209 RR2C675JQ
BS 210 533 RR2C606JQ

RD RR2C675JQ 222 0 0
GACGAGTTCCATTGACATGGAACGAAGTCTGCTTATTATCTCGGTGAAAGGGGGACGAAC
ATCCGGGTCTATGTCCCAGCATTGTTCCATCAGCTTTTTCCATTCCGGAAAACATGTTTT
CGGTATCGGAGGTCGAAGCGTGTTCTTCACAATCCCACCAATGATTGCTCCACAATGCAT
ATCTGCATAGGGTTCCTCTCCTGTTAGAATCTCCCATAGGCA

QA 1 222 1 222
DS 

RD RR2C606JQ 533 0 0
CATCATCCCCTTATGTTTTGGACACAATAACATTTACATGACAAATTTCGAGATTTACAT
ATATGTTTTTTTGTACAGAATGAGATAAATATATGAAAGAATGTTAACTTAAACCCGTTT
CTTTGATTCTCTTGAACGTCTTCAGGGCTTGTTTTCTCTTTTCTTGCTTTTAGTGACGAG
TTCCATTGACATGGATCGAAGTCTGCTTGTTATCTCGGTGAAAGGGGGACGAACATCCGG
GTCTATGTCCCAGCATTGTTCCATCAGCTTTTTCCATTCCGGAAAACATGTTTTCGGTAT
CGGAGGTCGAAGCGTGTTCTTCACAATCCCACCAATGATTGCTCCACAATGCATATCTGC
ATAGGGTTCCTCTCCTGTTAGAATCTCCCATAGGCAGATCCCATATGAAAATACATCAAC
TTTCTCTGAAACCCGGGTGCTGCTTCCGTTCAAGAGTTCTGGTGCCATCCATGGAAGTGT
TCCTCTCACTCCCCCAGATACCAAAGTGTTACGTTTGATTCTAGATAAGCCAA

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 2

CO CL7572Contig1 400 2 1 U
GGACCTGATGACCGAAGGATCTTTTGTTGTTGTGGAGACGCTGCGTGGAGAGAAATGGGT
GCCAGTGTATGATGACGATGACTTCAGTGTGAAGTTTAAGTGGTCGAGACCGGGGAGGCT
TAGCTCTGAGAGCCAAGCCACGGTGGAGTGGAGGATACCGGAATCTGCGGTGGCTGGAGT
TTATAGATTAAGACATTATGGAGCTTCTAAGTCGCTAGTTGGATCCATTACCAGCTTCTC
TGGTTCTTCCAGCGCCTTTGTAGTTGTATGACAATTTACCTAACGTAACATATCCGTGCA
TGGTGTACAATTTATGAAATAAAAAGTGATGAAAAAAGATTTTAAACACACAATGTTAAG
TTATATATATGGAGAGTATAACGCCTTGTCCGTCCGTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BJ17JQ C 1
AF RR2BJ17TF U 1
BS 1 400 RR2BJ17TF

RD RR2BJ17JQ 400 0 0
GGACCTGATGACCGAAGGATCTTTTGTTGTTGTGGAGACGCTGCGTGGAGAGAAATGGGT
GCCAGTGTATGATGACGATGACTTCAGTGTGAAGTTTAAGTGGTCGAGACCGGGGAGGCT
TAGCTCTGAGAGCCAAGCCACGGTGGAGTGGAGGATACCGGAATCTGCGGTGGCTGGAGT
TTATAGATTAAGACATTATGGAGCTTTTAAGTCGCTAGTTGGATCCATTACCAGCTTCTC
TGGTTCTTCCAGCGCCTTTGTAGTTGTATGACAATTTACCTAACGTAACATATCCGTGCA
TGGTGTACAATTTATGAAATAAAAAGTGATGAAAAAAGATTTTAAACACACAATGTTAAG
TTATATATATGGAGAGTATAACGCCTTGTCCGTCCGTCCC

QA 1 400 1 400
DS 

RD RR2BJ17TF 400 0 0
GGACCTGATGACCGAAGGATCTTTTGTTGTTGTGGAGACGCTGCGTGGAGAGAAATGGGT
GCCAGTGTATGATGACGATGACTTCAGTGTGAAGTTTAAGTGGTCGAGACCGGGGAGGCT
TAGCTCTGAGAGCCAAGCCACGGTGGAGTGGAGGATACCGGAATCTGCGGTGGCTGGAGT
TTATAGATTAAGACATTATGGAGCTTCTAAGTCGCTAGTTGGATCCATTACCAGCTTCTC
TGGTTCTTCCAGCGCCTTTGTAGTTGTATGACAATTTACCTAACGTAACATATCCGTGCA
TGGTGTACAATTTATGAAATAAAAAGTGATGAAAAAAGATTTTAAACACACAATGTTAAG
TTATATATATGGAGAGTATAACGCCTTGTCCGTCCGTCCC

QA 1 400 1 400
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7574Contig1 800 2 1 U
GGGTCCCAAAAGCAAGTTAGGGTTCATTCATCCAAGGAGAGAGGATATTTTTTATTTTTT
GACGAGGCGATGCCTGAAGCATTTGAAGGCTGGAATCAGTGGGTCGAAGATCCGTGTTTG
TCTTGGCGACCTGGGGATTATAACTATCAGACGCCTAAGCATGATCCCGAAAAGGCTATC
TACACACCTGAACAAGAGTATGAAAGAATGAGGGAAGAAGTCGATAATACCGAGGGTTTC
GACATCGATTTCGATAGCTTCCGTTGCGTTTTCAACTACCATCGTGCATACTTCGACTCA
AATGAGTTCGTGGATGAGCCAGAAACCACTGGAGATTTACTCGTGAGGCTCTCCAAGGAG
GCCCTCGATGATCACAATGGAAAATATGAGACAGATTTTGAGTTTGTCAAGGTTGTTAAA
GCCAACTTTCACTACTCTGCTGGATTCATGTTTCTCATAACGTTTGAAGTTCGTGATCCT
TATGATGGTCTTATCAAACCATTCCAAGCAAGGGTGCGCCACCTTAAACATACCTTCACT
GAGCATGTCTTCTGCAGGCCTAAACCCAACGCCGGAGTGGAATACTTTGGGAATGCCAAG
ACAGATATCGAGAAAGATGCCAAGAAACAAAGATTGGACTAGGAGCTTTACTATTCGGCT
ACGAGTAGTGAGTAGTGAAACCTTGAGATATATCTCTCTTGTTTAGTTATCTATTTGCAT
CCTGACTTTTGTGCGTTTTCTTAATACTCAACTGTGACTTTACTTCTTGTGTTTTCATTA
AATAATAGACCTATCGGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2E047TF U 1
AF RR2E047JQ C 74
BS 1 800 RR2E047TF

RD RR2E047TF 800 0 0
GGGTCCCAAAAGCAAGTTAGGGTTCATTCATCCAAGGAGAGAGGATATTTTTTATTTTTT
GACGAGGCGATGCCTGAAGCATTTGAAGGCTGGAATCAGTGGGTCGAAGATCCGTGTTTG
TCTTGGCGACCTGGGGATTATAACTATCAGACGCCTAAGCATGATCCCGAAAAGGCTATC
TACACACCTGAACAAGAGTATGAAAGAATGAGGGAAGAAGTCGATAATACCGAGGGTTTC
GACATCGATTTCGATAGCTTCCGTTGCGTTTTCAACTACCATCGTGCATACTTCGACTCA
AATGAGTTCGTGGATGAGCCAGAAACCACTGGAGATTTACTCGTGAGGCTCTCCAAGGAG
GCCCTCGATGATCACAATGGAAAATATGAGACAGATTTTGAGTTTGTCAAGGTTGTTAAA
GCCAACTTTCACTACTCTGCTGGATTCATGTTTCTCATAACGTTTGAAGTTCGTGATCCT
TATGATGGTCTTATCAAACCATTCCAAGCAAGGGTGCGCCACCTTAAACATACCTTCACT
GAGCATGTCTTCTGCAGGCCTAAACCCAACGCCGGAGTGGAATACTTTGGGAATGCCAAG
ACAGATATCGAGAAAGATGCCAAGAAACAAAGATTGGACTAGGAGCTTTACTATTCGGCT
ACGAGTAGTGAGTAGTGAAACCTTGAGATATATCTCTCTTGTTTAGTTATCTATTTGCAT
CCTGACTTTTGTGCGTTTTCTTAATACTCAACTGTGACTTTACTTCTTGTGTTTTCATTA
AATAATAGACCTATCGGACG

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2E047JQ 727 0 0
CC
GAAGCATTTGAAGGCTGGAATCAGTGGGTCGAAGATCCGTGTTTGTCTTGGCGACCTGGG
GATTATAACTATCAGACGCCTAAGCATGATCCCGAAAAGGCTATCTACACACCTGAACAA
GAGTATGAAAGAATGAGGGAAGAAGTCGATAATACCGAGGGTTTCGACATCGATTTCGAT
AGCTTCCGTTGCGTTTTCAACTACCATCGTGCATACTTCGACTCAAATGAGTTCGTGGAT
GAGCCAGAAACCACTGGAGATTTACTCGTGAGGCTCTCCAAGGAGGCCCTCGATGATCAC
AATGGAAAATATGAGACAGATTTTGAGTTTGTCAAGGTTGTTAAAGCCAACTTTCACTAC
TTTGCTGGATTCATGTTTCTCATAACGTTTGAAGTTCGTGATCCTTATGATGGTCTTATC
AAACCATTCCAAGCAAGGGTGCGCCACCTTAAACATACCTTCACTGAGCATGTCTTCTGC
AGGCCTAAACCCAACGCCGGAGTGGAATACTTTGGGAATGCCAAGACAGATATCGAGAAA
GATGCCAAGAAACAAAGATTGGACTAGGAGCTTTACTATTCGGCTACGAGTAGTGAGTAG
TGAAACCTTGAGATATATCTCTCTTGTTTAGTTATCTATTTGCATCCTGACTTTTGTGCG
TTTTCTTAATACTCAACTGTGACTTTACTTCTTGTGTTTTCATTAAATAATAGACCTATC
GGACG

QA 3 727 3 727
DS 



AS 1 2

CO CL7575Contig1 744 2 2 U
GCAGAAGGGGAGAAGCTAAACTCCATGAATCTCCTCCTTTATATGGCACCCATAGCTGTT
GTGTTCCTTCTTCCTGCTACACTCATCATGGAGAAGAACGTTGTTGGCATCACGATCGCA
CTCGCCAGAGACGATTTTAGAATCGTTTGGTATCTGCTTTTCAATTCCGCCCTTGCTTAT
ATTCGTCAACTTGACCAATTTCTTAGTCACTAAACACACTAGCGCTCTGACTCTGCAGGT
GCTGGGAAACGCCAAAGGTGCAGTAGCGGTGGTAGTTTCGATCCTGATATTCAAGAATCC
TGTCTCAGTGACTGGAATGTTGGGTTACTCGCTCACTGTCTGTGGAGTTATCCTCTACAG
TGAAGCCAAGAAACGAAGCAAATGAGAAATGAAATTATTCGCTTTTTATTTGTTAGGTCC
TCAGTTTCATTCAGGTAAAAACACAAAAAAGAAGTTTCTTTTTTACTGTAAACAAGAAAC
CTTAAACAGCATCTTCTTAGGACCAAGCATCAAAGGATCAGAGTACTACCAACAGCTATC
ATTTAAAGGACTTTTGACAAACACGTGATATTTTTTTTTCCCTTCTTTGTGTTGTGTTTT
CCACAGCTTTTGTCGTAGGTTGTTCCAAGGGTAACTTGGATTTAGCTTTCTTATTTTTGT
TTGATTCTTTACAACCTAGTTCTGTGATGTCAACATTTACAAACACTGATTAATTAATGG
AAAAGACAAAAAGGCTTTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX68TF U 1
AF RR2BX68JQ C 38
BS 1 614 RR2BX68TF
BS 615 744 RR2BX68JQ

RD RR2BX68TF 614 0 0
GCAGAAGGGGAGAAGCTAAACTCCATGAATCTCCTCCTTTATATGGCACCCATAGCTGTT
GTGTTCCTTCTTCCTGCTACACTCATCATGGAGAAGAACGTTGTTGGCATCACGATCGCA
CTCGCCAGAGACGATTTTAGAATCGTTTGGTATCTGCTTTTCAATTCCGCCCTTGCTTAT
ATTCGTCAACTTGACCAATTTCTTAGTCACTAAACACACTAGCGCTCTGACTCTGCAGGT
GCTGGGAAACGCCAAAGGTGCAGTAGCGGTGGTAGTTTCGATCCTGATATTCAAGAATCC
TGTCTCAGTGACTGGAATGTTGGGTTACTCGCTCACTGTCTGTGGAGTTATCCTCTACAG
TGAAGCCAAGAAACGAAGCAAATGAGAAATGAAATTATTCGCTTTTTATTTGTTAGGTCC
TCAGTTTCATTCAGGTAAAAACACAAAAAAGAAGTTTCTTTTTTACTGTAAACAAGAAAC
CTTAAACAGCATCTTCTTAGGACCAAGCATCAAAGGATCAGAGTACTACCAACAGCTATC
ATTTAAAGGACTTTTGACAAACACGTGATATTTTTTTTTCCCTTCTTTGTGTTGTGTTTT
CCACAGCTTTTGTC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RR2BX68JQ 707 0 0
TTTATATGGCACCCATAGCTGTTGTGTTCCTTCTTCCTGCTACACTCATCATGGAGAAGA
ACGTTGTTGGCATCACGATCGCACTCGCCAGAGACGATTTTAGAATCGTTTGGTATCTGC
TTTTCAATTCCGCCCTTGCTTATATTCGTCAACTTGACCAATTTCTTAGTCACTAAACAC
ACTAGCGCTCTGACTCTGCAGGTGCTGGGAAACGCCAAAGGTGCAGTAGCGGTGGTAGTT
TCGATCCTGATATTCAAGAATCCTGTCTCAGTGACTGGAATGTTGGGTTACTCGCTCACT
GTCTGTGGAGTTATCCTCTACAGTGAAGCCAAGAAACGAAGCAAATGAGAAATGAAATTA
TTCGCTTTTTATTTGTTAGGTCCTCAGTTTCATTCAGGTAAAAACACAAAAAAGAAGTTT
CTTTTTTACTGTAAACAAGAAACCTTAAACAGCATCTTCTTAGGACCAAGCATCAAAGGA
TCAGAGTACTACCAACAGCTATCATTTAAAGGACTTTTGACAAACACGTGATATTTTTTT
TTCCCTTCTTTGTGTTGTGTTTTCCACAGCTTTTGTCGTAGGTTGTTCCAAGGGTAACTT
GGATTTAGCTTTCTTATTTTTGTTTGATTCTTTACAACCTAGTTCTGTGATGTCAACATT
TACAAACACTGATTAATTAATGGAAAAGACAAAAAGGCTTTTCTTCC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL7576Contig1 784 2 2 U
GGGGGCTCTCATATTGGTCTTTGTATCATTGCCCTAATTGTTCGCTGGAAGATCTGCAGA
TCGTCTCTCCCTCACTGCGGCAGGAATGCGTGGCTTCTGAGCTTCCTTTCCCTGACTGAA
GCGGGAGGAATTCTAACTTCATGTTTATTCCAATTAATTCCGACGCCCACTATAAGTTCT
TCAATGCGTCGTTAGTATCGCCGAGGCGGTGTCTAATCTGTATAAATATGTGAGTACTTC
TCATTTTGAAGTCATCCTCTCTTTCTATATCTTGTGTATACTGATTCGTGTTGTTATGGC
TAATGCGAGATTTTTCTTCTCCGGCTTGAATTCCGGCTGCTCCTCCGTCGTCGAGGCTAG
GCTGCTTCCGTTCTAGGAGGCGAGAAATGGTAAAGGTAGATGAGAAATGGTATCGTCATA
CTGTGGTCAAAAGGATTTTGCATTTTTTGAGTGGCGCATGGTGTCAAGAAGGGAGATGAG
CCGATGGGTGCCGATATGTTTTCGATTGAGGAGAAGTCTATGATTAATCATACCTCTACT
AGCGTCCATCGCCTAAATACTTCTCAGAGAATGAGCTCTTTGGCTTCAATTTAACCGTCA
GCATATATATTTCATAGAGAGAGATTGAATTTGGTTCATTTGGTTTGTTAAATGCAGCAG
CAGATCTTATTTTATTCTATGAAGAGATACTTCTCTTTGTTCAAACTATGCCGTTGGCCA
TCTCGCAAACAGAAATAATCTTCTCAAAGCTTGTCTCTGGATTATATGAATGCAAGATTC
TTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2GU52TF U 1
AF RR2GU52JQB C 122
BS 1 677 RR2GU52TF
BS 678 784 RR2GU52JQB

RD RR2GU52TF 677 0 0
GGGGGCTCTCATATTGGTCTTTGTATCATTGCCCTAATTGTTCGCTGGAAGATCTGCAGA
TCGTCTCTCCCTCACTGCGGCAGGAATGCGTGGCTTCTGAGCTTCCTTTCCCTGACTGAA
GCGGGAGGAATTCTAACTTCATGTTTATTCCAATTAATTCCGACGCCCACTATAAGTTCT
TCAATGCGTCGTTAGTATCGCCGAGGCGGTGTCTAATCTGTATAAATATGTGAGTACTTC
TCATTTTGAAGTCATCCTCTCTTTCTATATCTTGTGTATACTGATTCGTGTTGTTATGGC
TAATGCGAGATTTTTCTTCTCCGGCTTGAATTCCGGCTGCTCCTCCGTCGTCGAGGCTAG
GCTGCTTCCGTTCTAGGAGGCGAGAAATGGTAAAGGTAGATGAGAAATGGTATCGTCATA
CTGTGGTCAAAAGGATTTTGCATTTTTTGAGTGGCGCATGGTGTCAAGAAGGGAGATGAG
CCGATGGGTGCCGATATGTTTTCGATTGAGGAGAAGTCTATGATTAATCATACCTCTACT
AGCGTCCATCGCCTAAATACTTCTCAGAGAATGAGCTCTTTGGCTTCAATTTAACCGTCA
GCATATATATTTCATAGAGAGAGATTGAATTTGGTTCATTTGGTTTGTTAAATGCAGCAG
CAGATCTTATTTTATTC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2GU52JQB 663 0 0
CGGGAGGAATTCTAACTTCATGTTTATTCCAATTAATTCCGACGCCCACTATAAGTTCTT
CAATGCGTCGTTAGTATCGCCGAGGCGGTGTCTAATCTGTATAAATATGTGAGTACTTCT
CATTTTGAAGTCATCCTCTCTTTCTATATCTTGTGTATACTGATTCGTGTTGTTATGGCT
AATGCGAGATTTTTCTTCTCCGGCTTGAATTCCGGCTGCTCCTCCGTCGTCGAGGCTAGG
CTGCTTCCGTTCTAGGAGGCGAGAAATGGTAAAGGTAGATGAGAAATGGTATCGTCATAC
TGTGGTCAAAAGGATTTTGCATTTTTTGAGTGGCGCATGGTGTCAAGAAGGGAGATGAGC
CGATGGGTGCCGATATGTTTTCGATTGAGGAGAAGTCTATGATTAATCATACCTCTACTA
GCGTCCATCGCCTAAATACTTCTCAGAGAATGAGCTCTTTGGCTTCAATTTAACCGTCAG
CATATATATTTCATAGAGAGAGATTGAATTTGGTTCATTTGGTTTGTTAAATGCAGCAGC
AGATCTTATTTTATTCTATGAAGAGATACTTCTCTTTGTTCAAACTATGCCGTTGGCCAT
CTCGCAAACAGAAATAATCTTCTCAAAGCTTGTCTCTGGATTATATGAATGCAAGATTCT
TTC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL7577Contig1 931 2 8 U
GATCAAGAAAATTCTCTAACCAAAGTATCAGAGGCCACTTAGATTGGATGTCCAAGCTCA
ACCATCCTCATCTCCTTAGCTTATTGGGCCATTGCACTCAAACCAGCGGAGATCATGATC
CTGCAGCGAACGTACTCTACCTTGTATACGAGTATATGCCCAACGGGACCTATCGTGCAC
ATCTGTCAGAATCTTGCTCGGAGAAGATCCTAACGTGGCCAGACCGTCTAGCAATTCTGA
TTGAGATTGCAAAGGCAGTTCATTTTCTTCATACCGGTGTAATGCCTGGCTCCTTCAATA
ATCAGCTGAAGACTAACAACATTTTGCTTGACGAACACAAGATTGCAAAGCTCAGTGACT
ATGGAGTCTCTGCCATCTTTGAAGAGAATGAAAAGCTTGAGACAAAGTCAGAACCCCACA
ACAAGTCAAAGAAAATGGCTAAAAGAGAAGATGATGTGTACAACTTTGGATTCATTCTTC
TGGAATCTCTCATAGGACCATTGCCCACTGCAAAGGGAGAAGCCTTTCTTCTAAACGAAA
TGACGTCATTTGAGAGCCAAGATGGTCGACAGAAAATAGTGAGTCCAACGGTACTAACAA
CTAGCTCTCAAGAGTCTTTGGCGATTGCGGTATCAATCGCTAATAAATGCGTTTTGCTTG
AACCTTCAGCAAGGCCTTCCTTTGAAGATGTTCTATGGAACTTACAATATGCAGCTCAAA
TGCAGTCTGTTGCAGACGCTGAACGCAAATCTGACACGTCCCCATGAATCCGGAGTGCTA
ATGTTTGACAAAAAAAATGTTATTTTCGGTCTTTCGAAAATGTAAAGTTTTATAAGTTTG
GTCTTAATACAAGGTAGCATGTTAAGGTTTTTAATACATGGATTAGCTTGTAACTTTAGA
AACCATCATATACATACATTTCTGGGGGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DE21TF U 1
AF RR2DE21JQ C 309
BS 1 706 RR2DE21TF
BS 707 707 RR2DE21JQ
BS 708 719 RR2DE21TF
BS 720 720 RR2DE21JQ
BS 721 748 RR2DE21TF
BS 749 749 RR2DE21JQ
BS 750 766 RR2DE21TF
BS 767 931 RR2DE21JQ

RD RR2DE21TF 766 0 0
GATCAAGAAAATTCTCTAACCAAAGTATCAGAGGCCACTTAGATTGGATGTCCAAGCTCA
ACCATCCTCATCTCCTTAGCTTATTGGGCCATTGCACTCAAACCAGCGGAGATCATGATC
CTGCAGCGAACGTACTCTACCTTGTATACGAGTATATGCCCAACGGGACCTATCGTGCAC
ATCTGTCAGAATCTTGCTCGGAGAAGATCCTAACGTGGCCAGACCGTCTAGCAATTCTGA
TTGAGATTGCAAAGGCAGTTCATTTTCTTCATACCGGTGTAATGCCTGGCTCCTTCAATA
ATCAGCTGAAGACTAACAACATTTTGCTTGACGAACACAAGATTGCAAAGCTCAGTGACT
ATGGAGTCTCTGCCATCTTTGAAGAGAATGAAAAGCTTGAGACAAAGTCAGAACCCCACA
ACAAGTCAAAGAAAATGGCTAAAAGAGAAGATGATGTGTACAACTTTGGATTCATTCTTC
TGGAATCTCTCATAGGACCATTGCCCACTGCAAAGGGAGAAGCCTTTCTTCTAAACGAAA
TGACGTCATTTGAGAGCCAAGATGGTCGACAGAAAATAGTGAGTCCAACGGTACTAACAA
CTAGCTCTCAAGAGTCTTTGGCGATTGCGGTATCAATCGCTAATAAATGCGTTTTGCTTG
AACCTTCAGCAAGGCCTTCCTTTGAAGATGTTCTATGGAACTTACA*TATGCAGCTCAA*
TGCAGTCTGTTGCAGACGCTGAACGCAA*TCTGACACGTCCCCATG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2DE21JQ 623 0 0
AAGACTAACAACATTTTGCTTGACGAACACAAGATTGCAAAGCTCAGTGACTATGGAGTC
TCTGCCATCTTTGAAGAGAATGAAAAGCTTGAGACAAAGTCAGAACCCCACAACAAGTCA
AAGAAAATGGCTAAAAGAGAAGATGATGTGTACAACTTTGGATTCATTCTTCTGGAATCT
CTCATAGGACCATTGCCCACTGCAAAGGGAGAAGCCTTTCTTCTAAACGAAATGACGTCA
TTTGAGAGCCAAGATGGTCGACAGAAAATAGTGAGTCCAACGGTACTAACAACTAGCTCT
CAGGAGTCTTTGGCGATTGCGGTATCAATCGCTAATAAATGCGTTTTGCTTGAACCTTCA
GCAAGGCCTTCCTTTGAAGATGTTCTATGGAACTTACAATATGCAGCTCAAATGCAGTTT
GTTGCAGACGCTGAACGCAAATCTGACACGTCCCCATGAATCCGGAGTGCTAATGTTTGA
CAAAAAAAATGTTATTTTCGGTCTTTCGAAAATGTAAAGTTTTATAAGTTTGGTCTTAAT
ACAAGGTAGCATGTTAAGGTTTTTAATACATGGATTAGCTTGTAACTTTAGAAACCATCA
TATACATACATTTCTGGGGGTGG

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL7578Contig1 1060 2 2 U
GGCTTCTCAGTCTCCCTCCAAAACTATGGCGTCGGCGTCCTCTTCAAACGCAGTCGCCGG
AAGGCTTCGAAACGCATCGTTGGTTCTCGTATCCGATAACGATTCCACAATCTCTGATAT
ACGTAAAGCTGTGACTCTGATGAAGAACATTGCTGTTCAGTTGGAGAAAGATAACCAAAC
TGAGAAGGTTAAGGATCTTGAAAACTCTGTGGCTGAGCTGTTGGAATTGTATGGTGATTG
TGCACATCGTTCCTCAGCAATTCATTCTGTTGCTAATGGGTACCAGCCTGGGGAACAGTT
AACTGACTTTAAAAAGTTGCTTGACGAGGAGTTCACGAACCTCAAGACTACAACTCCTTC
AGTGCCAGAAAATCATCATTTGATGCGACAGTTCAGGGAAGCTGTTTGGAACGTTCATCA
TGCAGGTCAACCAATGCCTGGCGACGACGAAGAGGACATTGTCATGACCAGTACTCAGTG
CCCTTTCCTAAACGTGAAATGCCCTGTGAGCGGGAAGCCTCTAACTGAACTAGCAGATCC
AGTTCGAAGTATGGATTGCAAGCACGTCTACGACAAAGCCTCAATCATGCATTACATAGC
CACTAATCCCAATGCGAAATGTCCTATAGCTGGCTGCCGAGGTAAACTGAAGAGCAACAA
AGTGGTTTGTGATCCAATGCTCAAGTTTGAAATCGAGGAGCTGCGCACGATGAACAAACA
ATCTAACAGAGACGAAGTGATTGAAGACTTCACAAATGCAGACGATGAAGATTAGAGATC
AAAACATCTCCTAAGCAAAGTTGAAAGCCCTATGTTTCTTAAAGCTCGCAGCTTACTAAC
TATATTTTAATCTAATGTTCAAGTCTGCTACCAATATGTTTTCCACTTTTGGATGTAAAT
AGGCAGTGTTGCTCTTTGATTCAACTGCTCGTTTTGGCTAAGTTTGAGTTCATTCTTTGA
GGGGAGAGCTTATCTTATTTCGGTTTAAGACAATTAATCGGTTTGGTTTGATACTTATTG
TTTTGGTTTGGTTTGGTTATGGTTAGAGTTTAATTAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BJ94TF U 1
AF RR2BJ94JQ C 360
BS 1 804 RR2BJ94TF
BS 805 1060 RR2BJ94JQ

RD RR2BJ94TF 804 0 0
GGCTTCTCAGTCTCCCTCCAAAACTATGGCGTCGGCGTCCTCTTCAAACGCAGTCGCCGG
AAGGCTTCGAAACGCATCGTTGGTTCTCGTATCCGATAACGATTCCACAATCTCTGATAT
ACGTAAAGCTGTGACTCTGATGAAGAACATTGCTGTTCAGTTGGAGAAAGATAACCAAAC
TGAGAAGGTTAAGGATCTTGAAAACTCTGTGGCTGAGCTGTTGGAATTGTATGGTGATTG
TGCACATCGTTCCTCAGCAATTCATTCTGTTGCTAATGGGTACCAGCCTGGGGAACAGTT
AACTGACTTTAAAAAGTTGCTTGACGAGGAGTTCACGAACCTCAAGACTACAACTCCTTC
AGTGCCAGAAAATCATCATTTGATGCGACAGTTCAGGGAAGCTGTTTGGAACGTTCATCA
TGCAGGTCAACCAATGCCTGGCGACGACGAAGAGGACATTGTCATGACCAGTACTCAGTG
CCCTTTCCTAAACGTGAAATGCCCTGTGAGCGGGAAGCCTCTAACTGAACTAGCAGATCC
AGTTCGAAGTATGGATTGCAAGCACGTCTACGACAAAGCCTCAATCATGCATTACATAGC
CACTAATCCCAATGCGAAATGTCCTATAGCTGGCTGCCGAGGTAAACTGAAGAGCAACAA
AGTGGTTTGTGATCCAATGCTCAAGTTTGAAATCGAGGAGCTGCGCACGATGAACAAACA
ATCTAACAGAGACGAAGTGATTGAAGACTTCACAAATGCAGACGATGAAGATTAGAGATC
AAAACATCTCCTAAGCAAAGTTGA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RR2BJ94JQ 701 0 0
CAGTGCCAGAAAATCATCATTTGATGCGACAGTTCAGGGAAGCTGTTTGGAACGTTCATC
ATGCAGGTCAACCAATGCCTGGCGACGACGAAGAGGACATTGTCATGACCAGTACTCAGT
GCCCTTTCCTAAACGTGAAATGCCCTGTGAGCGGGAAGCCTCTAACTGAACTAGCAGATC
CAGTTCGAAGTATGGATTGCAAGCACGTCTACGACAAAGCCTCAATCATGCATTACATAG
CCACTAATCCCAATGCGAAATGTCCTATAGCTGGCTGCCGAGGTAAACTGAAGAGCAACA
AAGTGGTTTGTGATCCAATGCTCAAGTTTGAAATCGAGGAGCTGCGCACGATGAACAAAC
AATCTAACAGAGACGAAGTGATTGAAGACTTCACAAATGCAGACGATGAAGATTAGAGAT
CAAAACATCTCCTAAGCAAAGTTGAAAGCCCTATGTTTCTTAAAGCTCGCAGCTTACTAA
CTATATTTTAATCTAATGTTCAAGTCTGCTACCAATATGTTTTCCACTTTTGGATGTAAA
TAGGCAGTGTTGCTCTTTGATTCAACTGCTCGTTTTGGCTAAGTTTGAGTTCATTCTTTG
AGGGGAGAGCTTATCTTATTTCGGTTTAAGACAATTAATCGGTTTGGTTTGATACTTATT
GTTTTGGTTTGGTTTGGTTATGGTTAGAGTTTAATTAGTTC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL7579Contig1 1125 2 2 U
GGCCTTCCCTTCCCTCACTCCCCCCCAAAGAAAATGTCGTCGTTAGCCTATTGTCCCTCC
GCCGTCGCTGTATCTCCCGCTTCCTCCACCTCTACCTTTAAACCCTTATTCCCCTCCCTC
AGACTCTTCAATCGCTTTCCACCAAAATCCTTCAAACTCGTCGCCAGTTTCCTCAATCCC
ATCTCCCTCCATTCCAATACCCGTCGCCACCGTTTCTCCTGCGCCGCCGATACCGAAGAC
GAACTCCCCGTCGCATCAGAAGACGAAGAAGAAGAAGAAGATGTGAAACAGACGACGCAA
GCCAGTGGTGAGGAAGGGAGGCTGTACGTTGGAAACTTACCATACACAATCACTTCTTCC
GAGCTCTCTCAACTTTTCCGACAAGCTGGAAATGTCGTAGATGTTCAGATTGTGTATGAT
AAAGTCACTGACAGAAGCAGAGGGTTTGGATTCGTAACGATGGGAAGCATTGAAGAAGCC
AAAGAAGCTATTCAGATGTTCAACACCTCTCAAATTGGTGGTAGAACGGTGAAAGTGAAC
TTCCCGGAGGTGCCAAGAGGCGGAGAGAGAGAAGTAATGAGAGCAGCCAAGATCCGTGAT
GGTAACCGGAGCTATGTTGACAGTCCTCACAAGCTCTATGCAGGAAACCTTGGTTGGGAT
CTAACCTCGCAAGGTCTGAAAGATGCATTTGCTGACCAACCTGGTGTGCTTGGTGCTAAA
GTCGTGTATGAAAGAGACAGCGGGAGGTCTCGGGGGGTTTGGTTTCGTCTCTTTTGAATC
TGCACAAGACCTTCAGTCTGCCCTGAGGGCCATGAATGGCGTGGAAGTTGAAGGCAGAGA
ACTGAGGCTAAATTTGACTTCAGAGAGAGCCACCGTGTCTCGTCCTTCTGTTACAGAAGA
GGGAAGCAGTCTTGAGAGCAGTGAGATGATTTCAAACATCAGTACATGAAGCAGCAAAAC
CACAATATCTTTTTTTGTATTCTATTGAGGCTAAAAGAAGAAGATAATATATGCGATAAA
GAACAGGAGGTTGGCTGTAGTCTTATTCAAAAATGTTTCTTCCATCACATATAGTGTAAT
GTAATATCTCTTAAGTCTCATAGAAATGCAAAATAGTTTTGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AC32TF U 1
AF RR2AC32JQ C 277
BS 1 819 RR2AC32TF
BS 820 1125 RR2AC32JQ

RD RR2AC32TF 820 0 0
GGCCTTCCCTTCCCTCACTCCCCCCCAAAGAAAATGTCGTCGTTAGCCTATTGTCCCTCC
GCCGTCGCTGTATCTCCCGCTTCCTCCACCTCTACCTTTAAACCCTTATTCCCCTCCCTC
AGACTCTTCAATCGCTTTCCACCAAAATCCTTCAAACTCGTCGCCAGTTTCCTCAATCCC
ATCTCCCTCCATTCCAATACCCGTCGCCACCGTTTCTCCTGCGCCGCCGATACCGAAGAC
GAACTCCCCGTCGCATCAGAAGACGAAGAAGAAGAAGAAGATGTGAAACAGACGACGCAA
GCCAGTGGTGAGGAAGGGAGGCTGTACGTTGGAAACTTACCATACACAATCACTTCTTCC
GAGCTCTCTCAACTTTTCCGACAAGCTGGAAATGTCGTAGATGTTCAGATTGTGTATGAT
AAAGTCACTGACAGAAGCAGAGGGTTTGGATTCGTAACGATGGGAAGCATTGAAGAAGCC
AAAGAAGCTATTCAGATGTTCAACACCTCTCAAATTGGTGGTAGAACGGTGAAAGTGAAC
TTCCCGGAGGTGCCAAGAGGCGGAGAGAGAGAAGTAATGAGAGCAGCCAAGATCCGTGAT
GGTAACCGGAGCTATGTTGACAGTCCTCACAAGCTCTATGCAGGAAACCTTGGTTGGGAT
CTAACCTCGCAAGGTCTGAAAGATGCATTTGCTGACCAACCTGGTGTGCTTGGTGCTAAA
GTCGTGTATGAAAGAGACAGCGGGAGGTCTCGGGGGGTTTGGTTTCGTCTCTTTTGAATC
TGCACAAGACCTTCAGTCTGCCCTGAGGGCCATGAATGG
G

QA 1 819 1 819
DS 

RD RR2AC32JQ 849 0 0
GAAGATGTGAAACAGACGACGCAAGCCAGTGGTGAGGAAGGGAGGCTGTACGTTGGAAAC
TTACCATACACAATCACTTCTTCCGAGCTCTCTCAACTTTTCCGACAAGCTGGAAATGTC
GTAGATGTTCAGATTGTGTATGATAAAGTCACTGACAGAAGCAGAGGGTTTGGATTCGTA
ACGATGGGAAGCATTGAAGAAGCCAAAGAAGCTATTCAGATGTTCAACACCTCTCAAATT
GGTGGTAGAACGGTGAAAGTGAACTTCCCGGAGGTGCCAAGAGGCGGAGAGAGAGAAGTA
ATGAGAGCAGCCAAGATCCGTGATGGTAACCGGAGCTATGTTGACAGTCCTCACAAGCTC
TATGCAGGAAACCTTGGTTGGGATCTAACCTCGCAAGGTCTGAAAGATGCATTTGCTGAC
CAACCTGGTGTGCTTGGTGCTAAAGTCGTGTATGAAAGAGACAGCGGGAGGTCTCGGGGG
*TTTGGTTTCGTCTCTTTTGAATCTGCACAAGACCTTCAGTCTGCCCTGAGGGCCATGAA
TGGCGTGGAAGTTGAAGGCAGAGAACTGAGGCTAAATTTGACTTCAGAGAGAGCCACCGT
GTCTCGTCCTTCTGTTACAGAAGAGGGAAGCAGTCTTGAGAGCAGTGAGATGATTTCAAA
CATCAGTACATGAAGCAGCAAAACCACAATATCTTTTTTTGTATTCTATTGAGGCTAAAA
GAAGAAGATAATATATGCGATAAAGAACAGGAGGTTGGCTGTAGTCTTATTCAAAAATGT
TTCTTCCATCACATATAGTGTAATGTAATATCTCTTAAGTCTCATAGAAATGCAAAATAG
TTTTGTCTT

QA 1 849 1 849
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7581Contig1 863 2 2 U
GTCGCCAAGCGTGTTGGAGCTAGAATCCTGCTCACCTCGACCTCGGAGGTCTACGGAGAT
CCTCTCATCCACCCTCAACCAGAGAGCTACTGGGGAAACGTCAACCCTATCGGTGTCCGG
AGTTGCTACGACGAAGGCAAGCGTGTAGCTGAGACGTTGATGTTTGACTACCACAGACAA
CATGGCATTGAAATCCGCATTGCTAGGATCTTCAACACGTACGGTCCTAGGATGAACATA
GATGATGGGCGTGTGGTGAGCAACTTCATTGCTCAAGCACTCAGAGGTGAGGCTTTGACA
GTTCAGAAACCGGGGACGCAGACTCGTAGTTTCTGCTATGTATCAGACATGGTGGATGGA
CTTATCCGTCTCATGGAAGGAGATGATACTGGTCCTATCAACATCGGTAACCCAGGTGAG
TTCACAATGGTGGAACTGGCTGAGACAGTTAAGGAGCTGATTAACCCGAGCATAGAGATA
AAGATGGTGGAGAACACACCAGACGATCCAAGACAGAGGAAACCAGACATAAGCAAGGCT
AAAGAAGTGTTGGGTTGGGAGCCAAAGGTGAAGCTTAGAGAAGGACTTCCTTTCATGGAA
GAAGACTTCCGGCTAAGGCTTAACGTCCCCAAAAACTAAAGAAATGTGAAGGCACAGGAG
AAAACGTTTTTTGAGTTTTAAGAGTATATGGAGTTTTAAGAGAAAACGTTTTTTGAGTGA
TGGTTTGGTTTCATACTTTCATGTATTGTTATCGATCTTTCCTTCTATTCATAGAAAAAT
AAGTTGGGAAATTTTTTTTTTCTTTTCTTAATGAGGATCGACTCTTTTTGTTTGAATATA
TTGTGGTATTGTTATCGTGTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GI31TF U 1
AF RR2GI31JQB C 366
BS 1 528 RR2GI31TF
BS 529 863 RR2GI31JQB

RD RR2GI31TF 528 0 0
GTCGCCAAGCGTGTTGGAGCTAGAATCCTGCTCACCTCGACCTCGGAGGTCTACGGAGAT
CCTCTCATCCACCCTCAACCAGAGAGCTACTGGGGAAACGTCAACCCTATCGGTGTCCGG
AGTTGCTACGACGAAGGCAAGCGTGTAGCTGAGACGTTGATGTTTGACTACCACAGACAA
CATGGCATTGAAATCCGCATTGCTAGGATCTTCAACACGTACGGTCCTAGGATGAACATA
GATGATGGGCGTGTGGTGAGCAACTTCATTGCTCAAGCACTCAGAGGTGAGGCTTTGACA
GTTCAGAAACCGGGGACGCAGACTCGTAGTTTCTGCTATGTATCAGACATGGTGGATGGA
CTTATCCGTCTCATGGAAGGAGATGATACTGGTCCTATCAACATCGGTAACCCAGGTGAG
TTCACAATGGTGGAACTGGCTGAGACAGTTAAGGAGCTGATTAACCCGAGCATAGAGATA
AAGATGGTGGAGAACACACCAGACGATCCAAGACAGAGGAAACCAGAC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RR2GI31JQB 498 0 0
CCGTCTCATGGAAGGAGATGATACTGGTCCTATCAACATCGGTAACCCAGGTGAGTTCAC
AATGGTGGAACTGGCTGAGACAGTTAAGGAGCTGATTAACCCGAGCATAGAGATAAAGAT
GGTGGAGAACACACCAGACGATCCAAGACAGAGGAAACCAGACATAAGCAAGGCTAAAGA
AGTGTTGGGTTGGGAGCCAAAGGTGAAGCTTAGAGAAGGACTTCCTTTCATGGAAGAAGA
CTTCCGGCTAAGGCTTAACGTCCCCAAAAACTAAAGAAATGTGAAGGCACAGGAGAAAAC
GTTTTTTGAGTTTTAAGAGTATATGGAGTTTTAAGAGAAAACGTTTTTTGAGTGATGGTT
TGGTTTCATACTTTCATGTATTGTTATCGATCTTTCCTTCTATTCATAGAAAAATAAGTT
GGGAAATTTTTTTTTTCTTTTCTTAATGAGGATCGACTCTTTTTGTTTGAATATATTGTG
GTATTGTTATCGTGTCAC

QA 1 498 1 498
DS 



AS 1 2

CO CL7582Contig1 867 2 2 U
GGAAGCTTAACCATTAGATCTATCCAAAACTAAGAGTTCTATACTTCTATTAGTGAGCTT
AAGGGTACTGTGAGACTCATCAAAAACTAAAGGTGTCTCCATTTTCTTCTATTTTCTTGG
CAAAGAGTTGTAGTGGAAAAATCAAGTGAGGCAAAAAAGAGTGATTAATTAACTAATTAA
TTAATTGATTGGTTAAGAGAGAGATCGAGATAATGGTGAGACCCCCTTGTTGTGACAAAG
GAGGAGTGAAGAAAGGGCCATGGACTCCTGAAGAAGATATCATTTTAGTTACTTACATCC
AAGAACATGGTCCTGGCAATTGGAGAGCTGTTCCCACCAATACTGGGTTGCTTAGATGCA
GCAAGAGTTGTAGGCTTAGATGGACAAACTATTTAAGGCCAGGAATCAAAAGAGGCAACT
TCACAGGAAATGAAGAGAATATGATTGTCCATCTCCAAGCCCTCTTAGGCAATAGATGGG
CTGCAATTGCCTCTTATCTTCCACAAAGGACAGATAATGACATTAAGAACTATTGGAACA
CTCACTTGAAGAAGAAACTCAATAAAGCCAATCAAGATTCTCATCAACAACTTGATCAAT
CAAGAGACAATTCCTCACTCTCTTCTTCTCCATCGTCTTCCTCTGCTAATTCCAACCCAA
ACATCGCAAGAGGCCAATGGGAAAGAAGGCTTCAAACCGATATTCACTTGGCAAAAAAGG
CTCTCTCTGAGGCTTTGTCTCCTGACATATTATTGGATGAAAGCCCTAATTTCTTCTGAA
ATTTTTGGTTAATCAGATGGTTTTCGAATTAACTCGCTAAAATTAGGGTTAGCTGAATCG
TTTATAATTTAATTTATTTTCCTTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EO18TF U 1
AF RR2EO18JQ C 139
BS 1 569 RR2EO18TF
BS 570 867 RR2EO18JQ

RD RR2EO18TF 572 0 0
GGAAGCTTAACCATTAGATCTATCCAAAACTAAGAGTTCTATACTTCTATTAGTGAGCTT
AAGGGTACTGTGAGACTCATCAAAAACTAAAGGTGTCTCCATTTTCTTCTATTTTCTTGG
CAAAGAGTTGTAGTGGAAAAATCAAGTGAGGCAAAAAAGAGTGATTAATTAACTAATTAA
TTAATTGATTGGTTAAGAGAGAGATCGAGATAATGGTGAGACCCCCTTGTTGTGACAAAG
GAGGAGTGAAGAAAGGGCCATGGACTCCTGAAGAAGATATCATTTTAGTTACTTACATCC
AAGAACATGGTCCTGGCAATTGGAGAGCTGTTCCCACCAATACTGGGTTGCTTAGATGCA
GCAAGAGTTGTAGGCTTAGATGGACAAACTATTTAAGGCCAGGAATCAAAAGAGGCAACT
TCACAGGAAATGAAGAGAATATGATTGTCCATCTCCAAGCCCTCTTAGGCAATAGATGGG
CTGCAATTGCCTCTTATCTTCCACAAAGGACAGATAATGACATTAAGAACTATTGGAACA
CTCACTTGAAGAAGAAACTCAATAAAGCC
CAA

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2EO18JQ 729 0 0
AAATCAAGTGAGGCAAAAAAGAGTGATTAATTAACTAATTAATTAATTGATTGGTTAAGA
GAGAGATCGAGATAATGGTGAGACCCCCTTGTTGTGACAAAGGAGGAGTGAAGAAAGGGC
CATGGACTCCTGAAGAAGATATCATTTTAGTTACTTACATCCAAGAACATGGTCCTGGCA
ATTGGAGAGCTGTTCCCACCAATACTGGGTTGCTTAGATGCAGCAAGAGTTGTAGGCTTA
GATGGACAAACTATTTAAGGCCAGGAATCAAAAGAGGCAACTTCACAGGAAATGAAGAGA
ATATGATTGTCCATCTCCAAGCCCTCTTAGGCAATAGATGGGCTGCAATTGCCTCTTATC
TTCCACAAAGGACAGATAATGACATTAAGAACTATTGGAACACTCACTTGAAGAAGAAAC
TCAATAAAGCCAATCAAGATTCTCATCAACAACTTGATCAATCAAGAGACAATTCCTCAC
TCTCTTCTTCTCCATCGTCTTCCTCTGCTAATTCCAACCCAAACATCGCAAGAGGCCAAT
GGGAAAGAAGGCTTCAAACCGATATTCACTTGGCAAAAAAGGCTCTCTCTGAGGCTTTGT
CTCCTGACATATTATTGGATGAAAGCCCTAATTTCTTCTGAAATTTTTGGTTAATCAGAT
GGTTTTCGAATTAACTCGCTAAAATTAGGGTTAGCTGAATCGTTTATAATTTAATTTATT
TTCCTTCGT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL7583Contig1 1075 2 4 U
GACTAAATATGGCTGCCGACCTACCTGACAGTATCCAGACACCCAAGCTAGGTCCATGCC
TCAGTATTTCCTACAGGAGTGGTGAAGATGCAAAGCTTGATTATGTGAAGAAGTTAGGCT
TTGAAACGTGTGACACGGTCGATATCTTGTTGCATGTCACAGAAACAGAAGTGTCCACAA
AACAGATCTGCAGAATAAGAAAGCTAATGAGAAAAATCGGAAGAGTAAGATCTAAAACCC
CAGGAAAGGTCAAGGATAGCAGATTTGGTAGGGGAAATAGACTAGATAGGAATGATGCTT
CATACGTTCAGATGGATCTGCTGGACGACTATTCTAGTTCTGACTCAGAATCTTCACAAC
TCTGTTTAGGCAGTGAGTTTCAGGTAGAGGAAAGAGAAAGTTCCAATGACTCCTGTGTAG
AAGAAAGCCTAAGCAACTCTTGTGGTGCTCAATGGGATGTATTCCGGACGCAAGATGTTT
CTAAACTTCTTGAGTATATGAACAACCATTATCTTGAGCTAGCATCCATGGATTCCACCA
AAACAAGAGCAAGTCATCCATTACTTGAGCAGAGTTACTATCTTGATGAGTATCACAAAG
CAAGGCTTAAAGAAGAGTTTGACGTTGAACCATGGAGTTTTGATCAATGTGTTGGGGAAG
CAGTCATCGTCCCTGCTGGATGTCCATACCAAAATAGAAAGAACACGTCTTGCGTAAATG
CGGTCCTGAATTTTCTTTCACCTGAGCACGTTGCTGAATCTATCAAACAAGTGGACGAGC
TTAATCAACTTCCTCAGAGCGTCAAAACGAAAGCAAACAAGATTGAAGTGAAGAAAATGG
CGATCCATAAAGTCAGCGAAGCTATAAAGGAAATCCGGGAGCGCACATCTTCGGATTCAA
GCGCTGCATCGAGGTTTATAAATAGAACTAGAGGTACCAAATCTTGATTCTTGACCATTG
AGCAGGATGTAAAAAATATATAGAAATAAACAAACAAGAAAGCAAAAGGGGGGGGGGATT
CATTTGTCATTTAAATTGTTGCCGGGTGTTGAGTAACAAATAAGCATTGATATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD84TF U 1
AF RR2CD84JQ C 303
BS 1 717 RR2CD84TF
BS 718 718 RR2CD84JQ
BS 719 763 RR2CD84TF
BS 764 1075 RR2CD84JQ

RD RR2CD84TF 763 0 0
GACTAAATATGGCTGCCGACCTACCTGACAGTATCCAGACACCCAAGCTAGGTCCATGCC
TCAGTATTTCCTACAGGAGTGGTGAAGATGCAAAGCTTGATTATGTGAAGAAGTTAGGCT
TTGAAACGTGTGACACGGTCGATATCTTGTTGCATGTCACAGAAACAGAAGTGTCCACAA
AACAGATCTGCAGAATAAGAAAGCTAATGAGAAAAATCGGAAGAGTAAGATCTAAAACCC
CAGGAAAGGTCAAGGATAGCAGATTTGGTAGGGGAAATAGACTAGATAGGAATGATGCTT
CATACGTTCAGATGGATCTGCTGGACGACTATTCTAGTTCTGACTCAGAATCTTCACAAC
TCTGTTTAGGCAGTGAGTTTCAGGTAGAGGAAAGAGAAAGTTCCAATGACTCCTGTGTAG
AAGAAAGCCTAAGCAACTCTTGTGGTGCTCAATGGGATGTATTCCGGACGCAAGATGTTT
CTAAACTTCTTGAGTATATGAACAACCATTATCTTGAGCTAGCATCCATGGATTCCACCA
AAACAAGAGCAAGTCATCCATTACTTGAGCAGAGTTACTATCTTGATGAGTATCACAAAG
CAAGGCTTAAAGAAGAGTTTGACGTTGAACCATGGAGTTTTGATCAATGTGTTGGGGAAG
CAGTCATCGTCCCTGCTGGATGTCCATACCAAAATAGAAAGAACACGTCTTGCGTAA*TG
CGGTCCTGAATTTTCTTTCACCTGAGCACGTTGCTGAATCTAT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2CD84JQ 773 0 0
TACGTTCAGATGGATCTGCTGGACGACTATTCTAGTTCTGACTCAGAATCTTCACAACTC
TGTTTAGGCAGTGAGTTTCAGGTAGAGGAAAGAGAAAGTTCCAATGACTCCTGTGTAGAA
GAAAGCCTAAGCAACTCTTGTGGTGCTCAATGGGATGTATTCCGGACGCAAGATGTTTCT
AAACTTCTTGAGTATATGAACAACCATTATCTTGAGCTAGCATCCATGGATTCCACCAAA
ACAAGAGCAAGTCATCCATTACTTGAGCAGAGTTACTATCTTGATGAGTATCACAAAGCA
AGGCTTAAAGAAGAGTTTGACGTTGAACCATGGAGTTTTGATCAATGTGTTGGGGAAGCA
GTCATCGTCCCTGCTGGATGTCCATACCAAAATAGAAAGAACACGTCTTGCGTAAATGCG
GTCCTGAATTTTCTTTCACCTGAGCACGTTGCTGAATCTATCAAACAAGTGGACGAGCTT
AATCAACTTCCTCAGAGCGTCAAAACGAAAGCAAACAAGATTGAAGTGAAGAAAATGGCG
ATCCATAAAGTCAGCGAAGCTATAAAGGAAATCCGGGAGCGCACATCTTCGGATTCAAGC
GCTGCATCGAGGTTTATAAATAGAACTAGAGGTACCAAATCTTGATTCTTGACCATTGAG
CAGGATGTAAAAAATATATAGAAATAAACAAACAAGAAAGCAAAAGGGGGGGGGGATTCA
TTTGTCATTTAAATTGTTGCCGGGTGTTGAGTAACAAATAAGCATTGATATTC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL7584Contig1 745 2 4 U
GGATAAAGACGAGAGAGAGAGAGAGAGAATCATATTTGAAGTTGAGTTAATTAACCGGTT
GTCCAATGGCGGCAGCAAAGACAGGCCTCCTACTCTCGTGGCTTATCCCATCATCATCGG
CGGCGGCGGCTCCGCCGTTTTCAGTTGCTGTTAAGTTGCCAGTGGTGAGAGGGAGGAAAG
CAGAGAAGGATGTATCTGTCTCTGTCGCCTTCAATCCTTCTGGCAATTTCGATATCTCTG
CCTTCGACTCTCACGACGATTCAGATAAAGTGGAACCTCCGATGCCTCCAACGAGCGGCC
GATACGAAGTAGCCATAGATAACGACTCTATTCAACGCCTTGACTTATCTCCTTTTCAGA
CTGCCACCGGCATCACCTCACCTTCCTCAGCTGATCCAAGAGAGTATATGGATCGGAGCA
TCGGATTCACGATCAATTACAAGAGAGAAGACCCAGGGGATCCCCGTGAGCTTTCCGAGT
ATCCGGACATAAGGCTTTGGTTCGTCAGACTCGATGCCATGTACCCTTGGCTTCCTCTCC
TCCTTGACTGGAGAGCCGGTGAGCTTGCTCGTTACGCCGCCATGCTTGTCCCTCACCAGA
TGAGCTTGAGAATGGGTGTTGTTTTCAATCCCGAGGCGCTGGAGCTCTTCGTCATGACCA
AAGTCTTTGTGGTTTATCCTTGGCTCAAACGTCACGGTGTCCCCAAGCCTAGCTCAAGAC
CTCTGACATGGCTAGGATGCTCGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP95TF U 1
AF RR2CL59TF U 63
BS 1 312 RR2AP95TF
BS 313 313 RR2CL59TF
BS 314 649 RR2AP95TF
BS 650 745 RR2CL59TF

RD RR2AP95TF 649 0 0
GGATAAAGACGAGAGAGAGAGAGAGAGAATCATATTTGAAGTTGAGTTAATTAACCGGTT
GTCCAATGGCGGCAGCAAAGACAGGCCTCCTACTCTCGTGGCTTATCCCATCATCATCGG
CGGCGGCGGCTCCGCCGTTTTCAGTTGCTGTTAAGTTGCCAGTGGTGAGAGGGAGGAAAG
CAGAGAAGGATGTATCTGTCTCTGTCGCCTTCAATCCTTCTGGCAATTTCGATATCTCTG
CCTTCGACTCTCACGACGATTCAGATAAAGTGGAACCTCCGATGCCTCCAACGAGCGGCC
GATACGAAGTAGTCATAGATAACGACTCTATTCAACGCCTTGACTTATCTCCTTTTCAGA
CTGCCACCGGCATCACCTCACCTTCCTCAGCTGATCCAAGAGAGTATATGGATCGGAGCA
TCGGATTCACGATCAATTACAAGAGAGAAGACCCAGGGGATCCCCGTGAGCTTTCCGAGT
ATCCGGACATAAGGCTTTGGTTCGTCAGACTCGATGCCATGTACCCTTGGCTTCCTCTCC
TCCTTGACTGGAGAGCCGGTGAGCTTGCTCGTTACGCCGCCATGCTTGTCCCTCACCAGA
TGAGCTTGAGAATGGGTGTTGTTTTCAATCCCGAGGCGCTGGAGCTCTT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RR2CL59TF 683 0 0
GG
AATGGCGGCAGCAAAGACAGGCCTCCTACTCTCGTGGCTTATCCCATCATCATCGGCGGC
GGCGGCTCCGCCGTTTTCAGTTGCTGTTAAGTTGCCAGTGGTGAGAGGGAGGAAAGCAGA
GAAGGATGTATCTGTCTCTGTCGCCTTCAATCCTTCTGGCAATTTCGATATCTCTGCCTT
CGACTCTCACGACGATTCAGATAAAGTGGAACCTCCGATGCCTCCAACGAGCGGCCGATA
CGAAGTAGCCATAGATAACGACTCTATTCAGCGCCTTGACTTATCTCCTTTTCAGACTGC
CACCGGCATCACCTCACCTTCCTCAGCTGATCCAAGAGAGTATATGGATCGGAGCATCGG
ATTCACGATCAATTACAAGAGAGAAGACCCAGGGGATCCCCGTGAGCTTTCCGAGTATCC
GGACATAAGGCTTTGGTTCGTCAGACTCGATGCCATGTACCCTTGGCTTCCTCTCCTCCT
TGACTGGAGAGCCGGTGAGCTTGCTCGTTACGCCGCCATGCTTGTCCCTCACCAGATGAG
CTTGAGAATGGGTGTTGTTTTCAATCCCGAGGCGCTGGAGCTCTTCGTCATGACCAAAGT
CTTTGTGGTTTATCCTTGGCTCAAACGTCACGGTGTCCCCAAGCCTAGCTCAAGACCTCT
GACATGGCTAGGATGCTCGGC

QA 3 683 3 683
DS 



AS 1 2

CO CL7585Contig1 803 2 2 U
GGTCGGAGATGGAAGCTTTAACCGAAGACCCCAAACTCAATCTACAACGAATCAGCGCCG
AAAAGTCCTCGAATCCGGCAAAAACGAGTAGATCTGACCCACCAGGAACCAAAACTAAGC
TCCCAATGCATATCTCAAGCTCTACCGGAGAAGACAGCACCACCATAGTCCAGAGCCAAA
AACACAGTCGACATAACGACACGAAGGAGAAGGAAAAAACAGAGAAGAGGGGAAGAGAAG
AGCATACGGCGAAGACGCTGAAACCCCTCTCCTCCCACACAGAATCGATGACGGCTACTA
AGGTTTGCAGATGAGGAAGAGAGACACTAGAGAGAGTTTCTAAACCCTCTCTCTCTCCCG
TGTTTTTTTTTTGTTTTTGTAGCATATATTCACTTTCTTATGTCTTATTTTAAAAAAGAC
AACCATATCTCCAATGTAAGTCATCGGAGGATGAGATTTTCTTAATTTTAAGTTTCAAAA
GATTTCACGTTATATTTACTAGCCTCGATCACATTTAAAACCTGTCATTTACATGACACA
CAATACCACTATTAAACATGCAGTGACTAGCTATACGTCTGTTGAGTTTAACCATTTTTC
AATTGCACTCCCAGTTAAAAGAAATTCAACCATTATACATCTGCACTTAAAAGATTTATG
TAAATTCTACAGTATCCTTCTTCTTATACATCTCTTCACTCTTTTTCCACACTCCACATC
CATCACATTTTCATTTTCAACATCTCAAGGATTTCTAACATCCCCGCAATAACTAATGCC
TACAAACCTGTACAGAACTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D622TF U 1
AF RR2D622JQ C 155
BS 1 796 RR2D622TF
BS 797 803 RR2D622JQ

RD RR2D622TF 796 0 0
GGTCGGAGATGGAAGCTTTAACCGAAGACCCCAAACTCAATCTACAACGAATCAGCGCCG
AAAAGTCCTCGAATCCGGCAAAAACGAGTAGATCTGACCCACCAGGAACCAAAACTAAGC
TCCCAATGCATATCTCAAGCTCTACCGGAGAAGACAGCACCACCATAGTCCAGAGCCAAA
AACACAGTCGACATAACGACACGAAGGAGAAGGAAAAAACAGAGAAGAGGGGAAGAGAAG
AGCATACGGCGAAGACGCTGAAACCCCTCTCCTCCCACACAGAATCGATGACGGCTACTA
AGGTTTGCAGATGAGGAAGAGAGACACTAGAGAGAGTTTCTAAACCCTCTCTCTCTCCCG
TGTTTTTTTTTTGTTTTTGTAGCATATATTCACTTTCTTATGTCTTATTTTAAAAAAGAC
AACCATATCTCCAATGTAAGTCATCGGAGGATGAGATTTTCTTAATTTTAAGTTTCAAAA
GATTTCACGTTATATTTACTAGCCTCGATCACATTTAAAACCTGTCATTTACATGACACA
CAATACCACTATTAAACATGCAGTGACTAGCTATACGTCTGTTGAGTTTAACCATTTTTC
AATTGCACTCCCAGTTAAAAGAAATTCAACCATTATACATCTGCACTTAAAAGATTTATG
TAAATTCTACAGTATCCTTCTTCTTATACATCTCTTCACTCTTTTTCCACACTCCACATC
CATCACATTTTCATTTTCAACATCTCAAGGATTTCTAACATCCCCGCAATAACTAATGCC
TACAAACCTGTACAGA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RR2D622JQ 649 0 0
CAGCACCACCATAGTCCAGAGCCAAAAACACAGTCGACATAACGACACGAAGGAGAAGGA
AAAAACAGAGAAGAGGGGAAGAGAAGAGCATACGGCGAAGACGCTGAAACCCCTCTCCTC
CCACACAGAATCGATGACGGCTACTAAGGTTTGCAGATGAGGAAGAGAGACACTAGAGAG
AGTTTCTAAACCCTCTCTCTCTCCCGTGTTTTTTTTTTGTTTTTGTAGCATATATTCACT
TTCTTATGTCTTATTTTAAAAAAGACAACCATATCTCCAATGTAAGTCATCGGAGGATGA
GATTTTCTTAATTTTAAGTTTCAAAAGATTTCACGTTATATTTACTAGCCTCGATCACAT
TTAAAACCTGTCATTTACATGACACACAATACCACTATTAAACATGCAGTGACTAGCTAT
ACGTCTGTTGAGTTTAACCATTTTTCAATTGCACTCCCAGTTAAAAGAAATTCAACCATT
ATACATCTGCACTTAAAAGATTTATGTAAATTCTACAGTATCCTTCTTCTTATACATCTC
TTCACTCTTTTTCCACACTCCACATCCATCACATTTTCATTTTCAACATCTCAAGGATTT
CTAACATCCCCGCAATAACTAATGCCTACAAACCTGTACAGAACTCACC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL7586Contig1 661 2 29 U
GGAGATCAAACAAGACGACGTCGCTATCAATGGCAAAGCCCAAAACTCACCTCTTCTCTC
TGCTTCTTCTCCACTTCTCAACCGTCTCATTGGCCCAGACGCTCTTCGTCTTCGGCGATG
GTCTCTACGACGCCGGCAACAAACAGTTCGTCTCCTCGAACCGCGTCGACGCTAGCTTTC
CTCCGTATGGAATCACTCTAGGAGAGGCTACGGGACGGTGGTCCGATGGTCGCATCGTTC
CCGACTATCTCGCTAGTTTCATGAGTATTCCTCAAATCCCTCCGATCCTCCGTGGCACGG
CGGATTTCTCGCACGGAGCTAGCTTCGCCATCGCCGACGCCACCGTTCTCGGATCCCCTC
CGGAGACGATGACACTGTCACAACAAGTGATCAAGTTCTCTGAAAACAAGAACAAATGGA
CAGCCCAAGCACGTTCTGAAGCTATCTACTTGTTCTACATTGCCTCTGATGATTACTTGA
ACTATGCCAAGAACAATCCGAATCCTTCTGATGATCAGAAACAAGCTTTTGTGAATCGAG
TCGTCGCTGCTATAGAAGCAGAACTAAAGGTGATTTATGGGTCTGGGGGTAGGAAGTCCG
CGTTCCAGAACTTGGCACCGTTGGGTTGCTTACCAGCCGTGAAACAAACAAATGGAAATG
T


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RR2DN53TF U 1
AF RR2ED75TF U 1
BS 1 27 RR2DN53TF
BS 28 28 RR2ED75TF
BS 29 37 RR2DN53TF
BS 38 38 RR2ED75TF
BS 39 48 RR2DN53TF
BS 49 49 RR2ED75TF
BS 50 88 RR2DN53TF
BS 89 89 RR2ED75TF
BS 90 109 RR2DN53TF
BS 110 110 RR2ED75TF
BS 111 154 RR2DN53TF
BS 155 155 RR2ED75TF
BS 156 160 RR2DN53TF
BS 161 161 RR2ED75TF
BS 162 209 RR2DN53TF
BS 210 210 RR2ED75TF
BS 211 241 RR2DN53TF
BS 242 242 RR2ED75TF
BS 243 289 RR2DN53TF
BS 290 290 RR2ED75TF
BS 291 334 RR2DN53TF
BS 335 335 RR2ED75TF
BS 336 343 RR2DN53TF
BS 344 344 RR2ED75TF
BS 345 374 RR2DN53TF
BS 375 375 RR2ED75TF
BS 376 597 RR2DN53TF
BS 598 598 RR2ED75TF
BS 599 661 RR2DN53TF

RD RR2DN53TF 661 0 0
GGAGATCAAACAAGACGACGTCGCTATTAATGGCAAATCCCAAAACTCGCCTCTTCTCTC
TGCTTCTTCTCCACTTCTCAACCGTCTCCTTGGCCCAGACGCTCTTCGTGTTCGGCGATG
GTCTCTACGACGCCGGCAACAAACAGTTCGTCTCTTCGAATCGCGTCGACGCTAGCTTTC
CTCCGTATGGAATCACTCTAGGAGAGGCTTCGGGACGGTGGTCCGATGGTCGCATCGTTC
CTGACTATCTCGCTAGTTTCATGAGTATTCCTCAAATCCCTCCGATCCTTCGTGGCACGG
CGGATTTCTCGCACGGAGCTAGCTTCGCCATCGCTGACGCCACTGTTCTCGGATCCCCTC
CGGAGACGATGACATTGTCACAACAAGTGATCAAGTTCTCTGAAAACAAGAACAAATGGA
CAGCCCAAGCACGTTCTGAAGCTATCTACTTGTTCTACATTGCCTCTGATGATTACTTGA
ACTATGCCAAGAACAATCCGAATCCTTCTGATGATCAGAAACAAGCTTTTGTGAATCGAG
TCGTCGCTGCTATAGAAGCAGAACTAAAGGTGATTTATGGGTCTGGGGGTAGGAAGTTCG
CGTTCCAGAACTTGGCACCGTTGGGTTGCTTACCAGCCGTGAAACAAACAAATGGAAATG
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2ED75TF 661 0 0
GGAGATCAAACAAGACGACGTCGCTTTCAATGGCAAAGCCCAAAACTCACCTCTTCTCTC
TGCTTCTTCTCCACTTCTCAACCGTCTCATTGGCCCAGACGCTCTTCGTCTTCGGCGATG
GTCTCTACGACGCCGGCAACAAACAGTTCGTCTCCTCGAACCGCGTCGACGCTAGCTTTC
CTCCGTATGGAATCACTCTAGGAGAGGCTACGGGACGGTGGTCCGATGGTCTCATCGTTC
CCGACTATCTCGCTAGTTTCATGGGTATTCCTCAAATCCCTCCGATCCTCCGTGGCACGG
CGGATTTCTCTCACGGAGCTAGCTTCGCCATCGCCGATGCCACCGTTCTCGGATCCCCTC
CGGAGACGATGACACTGTCACAACAAGTGATCAAGTTCTCTGAAAACAAGAACAAATGGA
CAGCTCAAGCACGTTCTGAAGCTATCTACTTGTTCTACATTGCCTCTGATGATTACTTGA
ACTATGCCAAGAACAATCCGAATCCTTCTGATGATCAGAAACAAGCTTTTGTGAATCGAG
TCGTCGCTGCTATAGAAGCAGAACTAAAGGTGATTTATGGGTCTGGGGGTAGGAAGTCCG
CGTTCCAGAACTTGGCACCGTTGGGTTGCTTACCAGCCGTGAA*CAAACAAATGGAAATG
T

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL7587Contig1 756 2 13 U
GGGAGACAAGAAGCTTACATAAATCAGGAGAAACTGTCCGAAGCTTTGTCAAACAATGTA
CACTCTTATATGTCTTTATAGATTAAAAACCCAAATCAACAAGCTTGTACATATTAATAT
AGACTAAAAAGCAGTTAAGAAACACAGAGAGCCCTGCTTTAAATAAAACATGGGATTCCA
ACGTCTTTTACTCTTAGTCTTGGTGACTCGATTTCTCACGGATGCATCTGGCGGCTTCCA
GATGATGTCATCAAGCTTGCCACAAAACGTCTTGTAAAACTTGAGGTATTCTTCTGCATC
TCCTGCTGCATTTTGGATGTCTACCATGAGAAATGTTGGTGCAACTTTGAAAACTTCTAG
AATGACGGAGAAATGAGACGACTTATTTGCAGATAGTCCTTCTACTCTCATTTTGTAATT
GCGAATGTGCGTCTTAAATCCCATGGACTGCGACACAACTTCCATGCTTGAAAGAACCAC
GTTTGCTGGCTTGTGCGAGATGAACCTTGTCTGATGCTTCATGGAGTCCTTTCCACGGTC
AAAAAGAGTTGCAAGGTTCAGGCCTTGAGACAGAATAATTAGGTCAAATGCATTTAGAGC
AAGTGGACCCGTGTCTCCTGTTCCATCACGTACATCTTTTTGTTCCTCAGGGTCATCAAA
AGCAGCATATACATCATCCAGGTTTACATGTTCGTAATCAATAACTTGTACAGGAGTGTA
ATCTCTTACAAACCACTCATCTTTCCTGATTTCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RR2BE92JQ U 1
AF RR2G270JQ U 42
BS 1 152 RR2BE92JQ
BS 153 153 RR2G270JQ
BS 154 252 RR2BE92JQ
BS 253 253 RR2G270JQ
BS 254 276 RR2BE92JQ
BS 277 277 RR2G270JQ
BS 278 351 RR2BE92JQ
BS 352 352 RR2G270JQ
BS 353 609 RR2BE92JQ
BS 610 610 RR2G270JQ
BS 611 711 RR2BE92JQ
BS 712 712 RR2G270JQ
BS 713 756 RR2BE92JQ

RD RR2BE92JQ 756 0 0
GGGAGACAAGAAGCTTACATAAATCAGGAGAAACTGTCCGAAGCTTTGTCAAACAATGTA
CACTCTTATATGTCTTTATAGATTAAAAACCCAAATCAACAAGCTTGTACATATTAATAT
AGACTAAAAAGCAGTTAAGAAACACAGAGAGCTCTGCTTTAAATAAAACATGGGATTCCA
ACGTCTTTTACTCTTAGTCTTGGTGACTCGATTTCTCACGGATGCATCTGGCGGCTTCCA
GATGATGTCATCCAGCTTGCCACAAAACGTCTTGTAGAACTTGAGGTATTCTTCTGCATC
TCCTGCTGCATTTTGGATGTCTACCATGAGAAATGTTGGTGCAACTTTGAAGACTTCTAG
AATGACGGAGAAATGAGACGACTTATTTGCAGATAGTCCTTCTACTCTCATTTTGTAATT
GCGAATGTGCGTCTTAAATCCCATGGACTGCGACACAACTTCCATGCTTGAAAGAACCAC
GTTTGCTGGCTTGTGCGAGATGAACCTTGTCTGATGCTTCATGGAGTCCTTTCCACGGTC
AAAAAGAGTTGCAAGGTTCAGGCCTTGAGACAGAATAATTAGGTCAAATGCATTTAGAGC
AAGTGGACCTGTGTCTCCTGTTCCATCACGTACATCTTTTTGTTCCTCAGGGTCATCAAA
AGCAGCATATACATCATCCAGGTTTACATGTTCGTAATCAATAACTTGTACTGGAGTGTA
ATCTCTTACAAACCACTCATCTTTCCTGATTTCAGT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RR2G270JQ 711 0 0
AGCTTTGTCAAACAATGTACACTCTTATATGTCTTTATAGATTAAAAACCCAAATCAACA
AGCTTGTACATATTCATATAGACTAAAAAGCAGTTAAGAA*CACAGAGAGCCCTGCTTTA
AATAAAACATGG*ATTTCAACGTCTTTTACTCTTGGTCTTGGTGACTCGATTTCTCACGG
ATGCATCTGGCGGCTTCCAGATGATGTCATCAAGCTTGCCACAAAACGTCTTGTAAAACT
TGAGGTATTCTTCTGCATCTCCTGCTGCATTTTGGATGTCTACCATGAGAAATGTTGGTG
CAACTTTGAAAACTTCTAGAATGACGGAGAAATGAGACGACTTATTTGCAGATAGTCCTT
CTACTCTCATTTTGTAATTTCGAATGTGCGTCTTAAATCCCATGGACTGCGACACAACTT
CCATGCTTGAAAGAACCACGTTTGCTGGCTTGTGCGAGATGGACCTTGTCTGATGCTTCA
TGGAGTCCTTTCCACGGTCAAAGAGAGTTGCAAGGTTCAGGCCTTGAGAGAGAATAATTA
GGTCAAATGCATTTAGAGCAAGTGGACCCGTGTCTCCTGTTCCATCACGTACATCTTTTT
GTTCCTCAGGGTCATCAAAAGCAGCATATACATCATCCAGGTTTACATGTTCGTAATCAA
TAACTTGTACAGGAGTGTAATCTCTTACGAACCGCTCATCTTTCCTGATTT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL7588Contig1 731 2 2 U
GGGCACATCCTCTCTTCACTACAAAACCTAGATCTCTTTTAAATCAATGGCGTCCGCTGA
TGTTGAGTACCGGTGCTTTGTCGGAGGTCTAGCATGGGCCACCGATGAGAGATCTCTCGA
GACAGCCTTCTCTCAGTTCGGCGAGCTTGTTGATTCCAAGATCATTAACGATCGTGAGAC
GGGAAGGTCAAGGGGATTTGGGTTCGTCACTTTCAAGGATGAGCAGGCCATGAAGGACGC
CATCGAAGGGATGAACGGACAGGAGCTCGATGGTCGCAGCATCACTGTGAACGAGGCTCA
GTCCCGAGGAAGCGGCGGCGGAGGTGGTGGCCGTGGTGGTGGCGGTGGATACCGCGGTGG
AGGTGGTGGTGGATACGGAGGTGGCGGTGGTGGTTACGGAGGTGGAAGACGCGAGGGTGG
ATACAGTGGTGGCGGAGGTGGCTACTCCTCAAGAGGAGGTGGTGGCGGAGGATACGGTGG
AGGTGGAAGACGTGAGGGTGGGGGTTGCGGTTGTGGTGAAGGTGGAGGCTACGGAGGAGG
CGGTGGTGGTGGTTGGTAATTAGATTAGGTGTTTGAGACCGTTATGTCTGGTTCGGGTTT
TATTGTTCTCTTATGTGTTATGGTGTTTGGTTCTGCTGTCTGGTTCTGGTTTGTGGTGTT
TTGGATTGTAACAGTTCGTGATTAGGTATCTGATATCTGGAAACACAATGTTAAATCATT
ATCTTTCTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F241TF U 1
AF RR2F241JQ C 32
BS 1 658 RR2F241TF
BS 659 731 RR2F241JQ

RD RR2F241TF 658 0 0
GGGCACATCCTCTCTTCACTACAAAACCTAGATCTCTTTTAAATCAATGGCGTCCGCTGA
TGTTGAGTACCGGTGCTTTGTCGGAGGTCTAGCATGGGCCACCGATGAGAGATCTCTCGA
GACAGCCTTCTCTCAGTTCGGCGAGCTTGTTGATTCCAAGATCATTAACGATCGTGAGAC
GGGAAGGTCAAGGGGATTTGGGTTCGTCACTTTCAAGGATGAGCAGGCCATGAAGGACGC
CATCGAAGGGATGAACGGACAGGAGCTCGATGGTCGCAGCATCACTGTGAACGAGGCTCA
GTCCCGAGGAAGCGGCGGCGGAGGTGGTGGCCGTGGTGGTGGCGGTGGATACCGCGGTGG
AGGTGGTGGTGGATACGGAGGTGGCGGTGGTGGTTACGGAGGTGGAAGACGCGAGGGTGG
ATACAGTGGTGGCGGAGGTGGCTACTCCTCAAGAGGAGGTGGTGGCGGAGGATACGGTGG
AGGTGGAAGACGTGAGGGTGGGGGTTGCGGTTGTGGTGAAGGTGGAGGCTACGGAGGAGG
CGGTGGTGGTGGTTGGTAATTAGATTAGGTGTTTGAGACCGTTATGTCTGGTTCGGGTTT
TATTGTTCTCTTATGTGTTATGGTGTTTGGTTCTGCTGTCTGGTTCTGGTTTGTGGTG

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2F241JQ 700 0 0
ATCTCTTTTAAATCAATGGCGTCCGCTGATGTTGAGTACCGGTGCTTTGTCGGAGGTCTA
GCATGGGCCACCGATGAGAGATCTCTCGAGACAGCCTTCTCTCAGTTCGGCGAGCTTGTT
GATTCCAAGATCATTAACGATCGTGAGACGGGAAGGTCAAGGGGATTTGGGTTCGTCACT
TTCAAGGATGAGCAGGCCATGAAGGACGCCATCGAAGGGATGAACGGACAGGAGCTCGAT
GGTCGCAGCATCACTGTGAACGAGGCTCAGTCCCGAGGAAGCGGCGGCGGAGGTGGTGGC
CGTGGTGGTGGCGGTGGATACCGCGGTGGAGGTGGTGGTGGATACGGAGGTGGCGGTGGT
GGTTACGGAGGTGGAAGACGCGAGGGTGGATACAGTGGTGGCGGAGGTGGCTACTCCTCA
AGAGGAGGTGGTGGCGGAGGATACGGTGGAGGTGGAAGACGTGAGGGTGGGGGTTGCGGT
TGTGGTGAAGGTGGAGGCTACGGAGGAGGCGGTGGTGGTGGTTGGTAATTAGATTAGGTG
TTTGAGACCGTTATGTCTGGTTCGGGTTTTATTGTTCTCTTATGTGTTATGGTGTTTGGT
TCTGCTGTCTGGTTCTGGTTTGTGGTGTTTTGGATTGTAACAGTTCGTGATTAGGTATCT
GATATCTGGAAACACAATGTTAAATCATTATCTTTCTCGC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL7589Contig1 517 2 5 U
AGAAAAGACTCGAATTTATTGAGATTTTGGTGGTGAAGACGAGATCTATAATTATAGTAC
AGAGACAGACAATATGCGATATTGGCGGTTGTCCATTGCAACAATTAGACAATTACAGGA
CAATGGAGATTAAGAGAAAGGAGAACTCAAGAAGACTTGTCGGAATTGGAACAGAGATGA
TTCCAGAGATAGCGGCCACTTGCCATGTCAACGCATGTCCAAAATCCAGACTTCATTGCC
ATTCCCACCTTACAGAATCTGGAAGCAGAGTCAGAGTCAGCGTCGAGGGGGTCACCTTCG
GTGAGAGGGTCGGCGAGAGGATCATCGTAGGAAGTGTTGAGCTTCTTGAGAACAAAGAAC
CCAGCTAGAGTCGCCGACAAGAATATGAGAATCAGTCTTAACGGACACATCTCTCTTTCT
TCCTTCCTCCTCTCTTGATTTTTTTCTTTTCTCCAGTTGATATGAAAGACAATGAGAAGA
GAGAAAGAGGGGTTGAGAGAGAGAGAGAGAGGGTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AS50JQ U 12
AF RR2AS50TF C 1
BS 1 11 RR2AS50TF
BS 12 240 RR2AS50JQ
BS 241 241 RR2AS50TF
BS 242 326 RR2AS50JQ
BS 327 517 RR2AS50TF

RD RR2AS50JQ 315 0 0
GAATTTATTGAGATTTTGGTGGTGAAGACGAGATCTATAATTATAGTACAGAGACAGACA
ATATGCGATATTGGCGGTTGTCCATTGCAACAATTAGACAATTACAGGACAATGGAGATT
AAGAGAAAGGAGAACTCAAGAAGACTTGTCGGAATTGGAACAGAGATGATTCCAGAGATA
GCGGCCACTTGCCATGTCAACGCATGTCCAAAATCCAGACTTCATTGCCCTTCCCACCTT
ACAGAATCTGGAAGCAGAGTCAGAGTCAGCGTCGAGGGGGTCACCTTCGGTGAGAGGGTC
GGCGAGAGGATCATC

QA 1 315 1 315
DS 

RD RR2AS50TF 517 0 0
AGAAAAGACTCGAATTTATTGAGATTTTGGTGGTGAAGACGAGATCTATAATTATAGTAC
AGAGACAGACAATATGCGATATTGGCGGTTGTCCATTGCAACAATTAGACAATTACAGGA
CAATGGAGATTAAGAGAAAGGAGAACTCAAGAAGACTTGTCGGAATTGGAACAGAGATGA
TTCCAGAGATAGCGGCCACTTGCCATGTCAACGCATGTCCAAAATCCAGACTTCATTGCC
ATTCCCACCTTAGAGAATCTGGAAGCAGAGTCAGAGTCAGCGTCGAGGGGGTCAGCTTCG
GTGAGAGGGTCGGCGAGAGGATCATCGTAGGAAGTGTTGAGCTTCTTGAGAACAAAGAAC
CCAGCTAGAGTCGCCGACAAGAATATGAGAATCAGTCTTAACGGACACATCTCTCTTTCT
TCCTTCCTCCTCTCTTGATTTTTTTCTTTTCTCCAGTTGATATGAAAGACAATGAGAAGA
GAGAAAGAGGGGTTGAGAGAGAGAGAGAGAGGGTAAG

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 2

CO CL7590Contig1 582 2 1 U
GAAGCAGGGACAGCAGAGGATCAAGCGGCGTTTATTAAAGAAGTTGAGGCCTATAACAAG
GAGCATTTCCTCGATTTTAAAGCTCCCAAGTTCTATGGTCAGCCCTTAAACTGTCTCAAG
CTATGGCGAGCCGTTATCAAGTTAGGTGGCTATGACGTGGTCACCACATCAAAGCTATGG
CGGCAAGTTGGAGAACCCTTCAATCCTCCCAAGACATGCACTACAGTCTCCTGGACATTC
CGCATTTTCTATGAGAAGTCACTCTTGGAGTATGAAAAGTATTTAAGGCAAAATGGTGAG
CTTAACCTTCCTGGTTTACCTCTTCTTCCACCTGCCGGCCTTGCAAAGGAGGCAATTAGC
CACCAAGGTTCTGGGTCAGGCAGAGCACGAAGAGATGCTGCAGCTCGTGCTATGCAAGGT
TGGCATTCTCAACGCCTTCTTGAATCTGGGGATGTTACTGAGCCTATTGTTAAGGATAAA
GGTTTGAGTTCTACTCCAAAGCAAAAGAACCTCAAAAACATTGGGGTACAGAAACAAAAA
ACACCAACTGGCATGGACCTAGTTTTATCACATGAAACAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AL39JQ C 1
AF RR2AL39TF U 1
BS 1 582 RR2AL39TF

RD RR2AL39JQ 582 0 0
GAAGCAGGGACAGCAGAGGATCAAGCGGCGTTTATTAAAGAAGTTGAGGCCTATAACAAG
GAGCATTTCCTCGATTTTAAAGCTCCCAAGTTCTATGGTCAGCCCTTAAACTGTCTCAAG
TTATGGCGAGCCGTTATCAAGTTAGGTGGTTATGACGTGGTCACCACATCAAAGCTATGG
CGGCAAGTTGGAGAACCCTTCAATCCTCCCAAGACATGCACTACAGTTTCCTGGACATTC
CGCATTTTTTATGAGAAGTCACTCTTGGAGTATGAAAAGTATTTAAGGCAAAATGGTGAG
CTTAACCTTCCTGGTTTACCTCTTTTTCCACCTGCCGGCCTTGCAAAGGAGGCAATTAGC
CACCAAGGTTTTGGGTCAGGCAGAGCACGAAGAGATGCTGCAGCTCGTGCTATGCAAGGT
TGGCATTCTCAACGCCTTCTTGAATCTGGGGATGTTACTGAGCCTATTGTTAAGGATAAA
GGTTTGAGTTCTACTCCAAAGCAAAAGAACCTCAAAAACATTGGGGTACAGAAACAAAAA
ACACCAACTGGCATGGACCTAGTTTTATCACATGAAACAGAC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RR2AL39TF 582 0 0
GAAGCAGGGACAGCAGAGGATCAAGCGGCGTTTATTAAAGAAGTTGAGGCCTATAACAAG
GAGCATTTCCTCGATTTTAAAGCTCCCAAGTTCTATGGTCAGCCCTTAAACTGTCTCAAG
CTATGGCGAGCCGTTATCAAGTTAGGTGGCTATGACGTGGTCACCACATCAAAGCTATGG
CGGCAAGTTGGAGAACCCTTCAATCCTCCCAAGACATGCACTACAGTCTCCTGGACATTC
CGCATTTTCTATGAGAAGTCACTCTTGGAGTATGAAAAGTATTTAAGGCAAAATGGTGAG
CTTAACCTTCCTGGTTTACCTCTTCTTCCACCTGCCGGCCTTGCAAAGGAGGCAATTAGC
CACCAAGGTTCTGGGTCAGGCAGAGCACGAAGAGATGCTGCAGCTCGTGCTATGCAAGGT
TGGCATTCTCAACGCCTTCTTGAATCTGGGGATGTTACTGAGCCTATTGTTAAGGATAAA
GGTTTGAGTTCTACTCCAAAGCAAAAGAACCTCAAAAACATTGGGGTACAGAAACAAAAA
ACACCAACTGGCATGGACCTAGTTTTATCACATGAAACAGAC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

CO CL7591Contig1 705 2 4 U
GGAAACCAAAGAGTCAATAACTTCGGTTTAGAGATTTGATAAAACCGAAGAAGAAGAAAG
CAACGCCTCCTCGTCCACTCCATTAAACCCTAGAGCCTAAGTCGTCGTCCCCTTTCAGTA
AGTTTCGGCGCCATGGCTCCCAAAGACGAGAACTCTGTGAAGCTCTTCCTCAGCATCGGC
CTGGACGAGAAAACAGCCACCACTACCATCAACAACCCCAAGGTCACAGCTAATCTCACC
GCCGTTGTTAACGAGGCTGGTGTAACTGATGGATGCGATCGAACTACTGGGAATCTCTTG
TACACGGTCGCTACTAAGCACCATTCAAATCTTCGTCTGCATCGTCCTACGTTGTTCGAT
TACATTGTTTCCTCCAAGATTAAAACTCCAGCGCAATTGGATGCTGCAGTTTCGTTTTTT
GACAAGAACTCTCCTGAGGACTTTAAGATAAATGAGTTTGAGGAGGCGTGTGGTGTTGGG
GGTTGAAGTTTCTGCAGAAGATATCGAGAAAGCAGCTGAAGAAGTTTTTGCAGAGCATAA
GAGTGCAATATTGGAGCAGCGCTACCGAACTAATGTGGGTCAGTTGCTTGGACATGTCCG
GAAAAGTTTGCCATGGGCAGATCCTAAGATTGTAAAGGACGTCATAGACAGAAAAATGTA
TGAACTGCTTGGTGAGAAAACTGCTGCGGATAATGAAAAACCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ56TF U 1
AF RR2CJ56JQ C 114
BS 1 655 RR2CJ56TF
BS 656 656 RR2CJ56JQ
BS 657 698 RR2CJ56TF
BS 699 705 RR2CJ56JQ

RD RR2CJ56TF 698 0 0
GGAAACCAAAGAGTCAATAACTTCGGTTTAGAGATTTGATAAAACCGAAGAAGAAGAAAG
CAACGCCTCCTCGTCCACTCCATTAAACCCTAGAGCCTAAGTCGTCGTCCCCTTTCAGTA
AGTTTCGGCGCCATGGCTCCCAAAGACGAGAACTCTGTGAAGCTCTTCCTCAGCATCGGC
CTGGACGAGAAAACAGCCACCACTACCATCAACAACCCCAAGGTCACAGCTAATCTCACC
GCCGTTGTTAACGAGGCTGGTGTAACTGATGGATGCGATCGAACTACTGGGAATCTCTTG
TACACGGTCGCTACTAAGCACCATTCAAATCTTCGTCTGCATCGTCCTACGTTGTTCGAT
TACATTGTTTCCTCCAAGATTAAAACTCCAGCGCAATTGGATGCTGCAGTTTCGTTTTTT
GACAAGAACTCTCCTGAGGACTTTAAGATAAATGAGTTTGAGGAGGCGTGTGGTGTTGGG
GGTTGAAGTTTCTGCAGAAGATATCGAGAAAGCAGCTGAAGAAGTTTTTGCAGAGCATAA
GAGTGCAATATTGGAGCAGCGCTACCGAACTAATGTGGGTCAGTTGCTTGGACATGTCCG
GAAAAGTTTGCCATGGGCAGATCCTAAGATTGTAAAGGACGTCATAGACAGAAAA*TGTA
TGAACTGCTTGGTGAGAAAACTGCTGCGGATAATGAAA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2CJ56JQ 592 0 0
TTCAGTAAGTTTCGGCGCCATGGCTCCCAAAGACGAGAACTCTGTGAAGCTCTTCCTCAG
CATCGGCCTGGACGAGAAAACAGCCACCACTACCATCAACAACCCCAAGGTCACAGCTAA
TCTCACCGCCGTTGTTAACGAGGCTGGTGTAACTGATGGATGCGATCGAACTACTGGGAA
TCTCTTGTACACGGTCGCTACTAAGCACCATTCAAATCTTCGTCTGCATCGTCCTACGTT
GTTCGATTACATTGTTTCCTCCAAGATTAAAACTCCAGCGCAATTGGATGCTGCAGTTTC
GTTTTTTGACAAGAACTCTCCTGAGGACTTTAAGATAAATGAGTTTGAGGAGGCGTGTGG
TGTTGGGG*TTGAAGTTTCTGCAGAAGATATCGAGAAAGCAGCTGAAGAAGTTTTTGCAG
AGCATAAGAGTGCAATATTGGAGCAGCGCTACCGAACTAATGTGGGTCAGTTGCTTGGAC
ATGTCCGGAAAAGTTTGCCATGGGCAGATCCTAAGATTGTAAAGGACGTCATAGACAGAA
AAATGTATGAACTGCTTGGTGAGAAAACTGCTGCGGATAATGAAAAACCTAC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7593Contig1 1119 2 2 U
GCTGCAAAACCTTCCATGTTTGATGAATCTGTCCCGAGCACTCCAGCAACAACCACTGCC
TCTTACCCAGGCAAGCAATCATACTTCGATGAGTCTGTTCCAAGCACTCCTGCCTACCCA
GGCAAGCAATCATACTTCGATGAGTCTGTTCCAAGCACCCCTGCCTACGCAGGAAAATCA
TTCTTCGACGACTCGGTTCCGAGCACTCCTGCTTATCCCGGCAGCTTGTTTCCTGAAAAG
AAATCCTTCTTCGATGACTCAGTCCCAAGCACTCCTGCTTATAACACGTCTGAATTTGGT
GGGAAGCCGTTTGCATCAGAGACTCCTCGTTCGGATAGCTTGTTCCCAGGAAGAAGTCCC
TTCATGTTCGACTCTGTCCCAAGCACACCTGCTGCACACGATGACTTCTCTTCCAACAGC
TTCTCCCGCTTCGATTCGTTCAACAGCAATAACAACAACAACGACGCTTTCTCTCTATCC
CGCTCAGGCTCGATGCGCAGCACAAGCGAGCCTGACCTATTCGCATCCAGGTTTGATTCT
TTCAACTACCAAAGATATGATTCCTTCAATGCACAAAGCTACGACAATGCCGCATCAGAG
ACGCCTAAAGCGTCATTGTCGAGATTCGACTCGATGGGAAGCACAAGAGACTCTGATTAC
AGTCACGGGTTTGGGTTCGATGACCATGACCCGTTCGGTTCTACGGGACCATTCAAAACA
ACGTCAACAACAGCTGAGACGCCTCGGAGCTCTGATCACTGGAGTGCCTTCTAGCCCCCA
CGTGTGATACGAATACGATGATCATCACATATCAATATACTAGTTCCCTGTGTTTCTTGC
ATGTCGAGCTTGTTTGGTTTGCCGGTTTGCCCTCTGCTTGCTTCATTTATATTGTCGATA
TATAATTGCTAGTTTTTGTCCGCTTTTAAAACCATTTTTTACGAGTGTCCTTCAATCTCC
GAGTAGCGTTTCTTTACTCTTCTTTGTTATGATGAATATGTGTACCTGTGTAACCGTCTC
GCATGGATGGATTTTTTTCAGATCTTTTCATATTATATTGATTGTTATTTTTGGAATATT
CCCTATTCATCAATAATTTGATTTAGTTTAAATTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DJ23TF U 1
AF RR2DJ23JQ C 435
BS 1 738 RR2DJ23TF
BS 739 1119 RR2DJ23JQ

RD RR2DJ23TF 738 0 0
GCTGCAAAACCTTCCATGTTTGATGAATCTGTCCCGAGCACTCCAGCAACAACCACTGCC
TCTTACCCAGGCAAGCAATCATACTTCGATGAGTCTGTTCCAAGCACTCCTGCCTACCCA
GGCAAGCAATCATACTTCGATGAGTCTGTTCCAAGCACCCCTGCCTACGCAGGAAAATCA
TTCTTCGACGACTCGGTTCCGAGCACTCCTGCTTATCCCGGCAGCTTGTTTCCTGAAAAG
AAATCCTTCTTCGATGACTCAGTCCCAAGCACTCCTGCTTATAACACGTCTGAATTTGGT
GGGAAGCCGTTTGCATCAGAGACTCCTCGTTCGGATAGCTTGTTCCCAGGAAGAAGTCCC
TTCATGTTCGACTCTGTCCCAAGCACACCTGCTGCACACGATGACTTCTCTTCCAACAGC
TTCTCCCGCTTCGATTCGTTCAACAGCAATAACAACAACAACGACGCTTTCTCTCTATCC
CGCTCAGGCTCGATGCGCAGCACAAGCGAGCCTGACCTATTCGCATCCAGGTTTGATTCT
TTCAACTACCAAAGATATGATTCCTTCAATGCACAAAGCTACGACAATGCCGCATCAGAG
ACGCCTAAAGCGTCATTGTCGAGATTCGACTCGATGGGAAGCACAAGAGACTCTGATTAC
AGTCACGGGTTTGGGTTCGATGACCATGACCCGTTCGGTTCTACGGGACCATTCAAAACA
ACGTCAACAACAGCTGAG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RR2DJ23JQ 685 0 0
TTCGTTCAACAGCAATAACAACAACAACGACGCTTTCTCTCTATCCCGCTCAGGCTCGAT
GCGCAGCACAAGCGAGCCTGACCTATTCGCATCCAGGTTTGATTCTTTCAACTACCAAAG
ATATGATTCCTTCAATGCACAAAGCTACGACAATGCCGCATCAGAGACGCCTAAAGCGTC
ATTGTCGAGATTCGACTCGATGGGAAGCACAAGAGACTCTGATTACAGTCACGGGTTTGG
GTTCGATGACCATGACCCGTTCGGTTCTACGGGACCATTCAAAACAACGTCAACAACAGC
TGAGACGCCTCGGAGCTCTGATCACTGGAGTGCCTTCTAGCCCCCACGTGTGATACGAAT
ACGATGATCATCACATATCAATATACTAGTTCCCTGTGTTTCTTGCATGTCGAGCTTGTT
TGGTTTGCCGGTTTGCCCTCTGCTTGCTTCATTTATATTGTCGATATATAATTGCTAGTT
TTTGTCCGCTTTTAAAACCATTTTTTACGAGTGTCCTTCAATCTCCGAGTAGCGTTTCTT
TACTCTTCTTTGTTATGATGAATATGTGTACCTGTGTAACCGTCTCGCATGGATGGATTT
TTTTCAGATCTTTTCATATTATATTGATTGTTATTTTTGGAATATTCCCTATTCATCAAT
AATTTGATTTAGTTTAAATTTCTCC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL7594Contig1 1019 2 2 U
GGGATCGCTTCCGTCGAGAGAGCCTTGTACTCATCACCTATCGAGAAAGAAGATGTTTTC
AAACAGTCAATTCGAGCCCAATTCCGCTTTCTCCGGCGGCGGATTCATGTCTTCTCAACC
CACTCAGCCCTACGAATCCTCCTCCTCCTCCTCCACTACTAAGGGAATAGTTCCAGTGAC
GGTGAAGCAAATCAACGAATCATCTCACTCCGGCGGTGAAAAATCGGGTATCGTCATCAA
CGGGATCGAACTTACAAACGTGTCACTCGTTGGGCTAGTGTGTGACAAAGACGTCTCTAA
AGTCACTGAAGTTAAGTTCACTCTTGATGATGGCACTGGTCGCATCGACTGTAAAAGATG
GGTGAATGAAAGTTTCGACGCTAGAGAAATGGAGTCGGTTCAAGATGGAACCTATGTGCG
TCTCAATGGTCATTTGAAGACTTTTCAGGGGAATCAGCAGCTTCTTGTTTTCTCTGTCAG
ACCTATTGTGGATTTCAACGAGGTGACTTTTCACTATATTGAGTGTATACACTTCTATTC
CAAGAACTCTGAATCACAGTTGGGACAGCAAGTTGGTGATGCCACTCAATCCCATACCGT
CAATGCAAACCAGGCAACCACGTTGAACCCTGTGATGCCCTCTCAAAACAGTGATGGAAA
TGGGCGCAAGAACTTGGATGATATGATTCTAGACTATCTAAAGCAACCTGCTTGCACTGC
AAGACAACAGGGGATACACCTGGATGAAATTGCCCAGCAGTTGAAGGTTCCAAAGAACAA
GCTTGAGGGTGTTATTCAGTCACTGGAAGGGGATGGTCTTATATACTCGACTATCGATGA
GTATCACTTCAAGCATGTCGAGCTTTGATCATCAGTAGGGAAGAGTCGGTTGAATCTTCT
TTTCATCTAGTATCATTCTGCAACTACTTTAAGCTTATGTGCTTGCTTAAACTGAAAATG
GATTGATTTTCCTAATGATGTTCTTGGTTTAGTTTTCCATTTTCTTTGTAATTCCATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F865TF U 1
AF RR2F865JQ C 439
BS 1 721 RR2F865TF
BS 722 1019 RR2F865JQ

RD RR2F865TF 723 0 0
GGGATCGCTTCCGTCGAGAGAGCCTTGTACTCATCACCTATCGAGAAAGAAGATGTTTTC
AAACAGTCAATTCGAGCCCAATTCCGCTTTCTCCGGCGGCGGATTCATGTCTTCTCAACC
CACTCAGCCCTACGAATCCTCCTCCTCCTCCTCCACTACTAAGGGAATAGTTCCAGTGAC
GGTGAAGCAAATCAACGAATCATCTCACTCCGGCGGTGAAAAATCGGGTATCGTCATCAA
CGGGATCGAACTTACAAACGTGTCACTCGTTGGGCTAGTGTGTGACAAAGACGTCTCTAA
AGTCACTGAAGTTAAGTTCACTCTTGATGATGGCACTGGTCGCATCGACTGTAAAAGATG
GGTGAATGAAAGTTTCGACGCTAGAGAAATGGAGTCGGTTCAAGATGGAACCTATGTGCG
TCTCAATGGTCATTTGAAGACTTTTCAGGGGAATCAGCAGCTTCTTGTTTTCTCTGTCAG
ACCTATTGTGGATTTCAACGAGGTGACTTTTCACTATATTGAGTGTATACACTTCTATTC
CAAGAACTCTGAATCACAGTTGGGACAGCAAGTTGGTGATGCCACTCAATCCCATACCGT
CAATGCAAACCAGGCAACCACGTTGAACCCTGTGATGCCCTCTCAAAACAGTGATGGAAA
TGGGCGCAAGAACTTGGATGATATGATTCTAGACTATCTAAAGCAACCTGCTTGCACTGC
A
GA

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2F865JQ 581 0 0
GACTTTTCAGGGGAATCAGCAGCTTCTTGTTTTCTCTGTCAGACCTATTGTGGATTTCAA
CGAGGTGACTTTTCACTATATTGAGTGTATACACTTCTATTCCAAGAACTTTGAATCACA
GTTGGGACAGCAAGTTGGTGATGCCACTCAATCCCATACCGTCAATGCAAACCAGGCAAC
CACGTTGAACCCTGTGATGCCCTCTCAAAACAGTGATGGAAATGGGCGCAAGAACTTGGA
TGATATGATTCTAGACTATCTAAAGCAACCTGCTTGCACTGCAAGACAACAGGGGATACA
CCTGGATGAAATTGCCCAGCAGTTGAAGGTTCCAAAGAACAAGCTTGAGGGTGTTATTCA
GTCACTGGAAGGGGATGGTCTTATATACTCGACTATCGATGAGTATCACTTCAAGCATGT
CGAGCTTTGATCATCAGTAGGGAAGAGTCGGTTGAATCTTCTTTTCATCTAGTATCATTC
TGCAACTACTTTAAGCTTATGTGCTTGCTTAAACTGAAAATGGATTGATTTTCCTAATGA
TGTTCTTGGTTTAGTTTTCCATTTTCTTTGTAATTCCATAT

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL7595Contig1 690 2 2 U
TTTTTACGTTTTTCATTACCATTTCCATGAACAAAACCATGAGTTTCCACGTTTCATCCT
TACGGTGATAACTTATCATTCTAAAAAACTCATCTGAGGTAGGAAACGTCTCATATTTTG
ATCTCCAACATTGATCCGGATTCAAACCTTGTGACTCCAAACAGCGGTACAGATCTCTGT
TCTGTAGAGCATAATTAAAAAAAGTTAGCCCAAAGAACACTAACACTTGTGATTGATTAA
AATATCAAATCTTATACAGATTAGCCCTAAAATAAGTGAAAGACATTGTTCTTTCTTTTT
TGACACGTTCCCAGTCAGTTACTAGTTTGCATGGTCTTGTTAATAAAAGAGGTTTATGAG
AAAAACTACCTCTATGTCGATTAAGCATGACGGGCTTGCTTTTAGACTTTTTAGTTGAGG
TGAATTTTGTAGTAACATTGCTAAACCAGGAATAACAGATCTTGTAAGCCTTGTTTCAAC
AGTCAAAGTTTCAACCTTGAACGTTGGATAATGAATACCATGGAGCTCGGCGAGAGACAG
AATCTAGCATAAAAGGATGATGCAAAAGGTCATGATGAACTAATTAAACATAAATCTTTA
CTGGAAAAAAAAAACATTACAAGAACTTATATGGCTTTAAAAGGTTTCGAACAATGAAGC
CTTAATTAATCATCCGCGACATCGAATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DA05TF U 1
AF RR2DA05JQ C 179
BS 1 555 RR2DA05TF
BS 556 690 RR2DA05JQ

RD RR2DA05TF 563 0 0
TTTTTACGTTTTTCATTACCATTTCCATGAACAAAACCATGAGTTTCCACGTTTCATCCT
TACGGTGATAACTTATCATTCTAAAAAACTCATCTGAGGTAGGAAACGTCTCATATTTTG
ATCTCCAACATTGATCCGGATTCAAACCTTGTGACTCCAAACAGCGGTACAGATCTCTGT
TCTGTAGAGCATAATTAAAAAAAGTTAGCCCAAAGAACACTAACACTTGTGATTGATTAA
AATATCAAATCTTATACAGATTAGCCCTAAAATAAGTGAAAGACATTGTTCTTTCTTTTT
TGACACGTTCCCAGTCAGTTACTAGTTTGCATGGTCTTGTTAATAAAAGAGGTTTATGAG
AAAAACTACCTCTATGTCGATTAAGCATGACGGGCTTGCTTTTAGACTTTTTAGTTGAGG
TGAATTTTGTAGTAACATTGCTAAACCAGGAATAACAGATCTTGTAAGCCTTGTTTCAAC
AGTCAAAGTTTCAACCTTGAACGTTGGATAATGAATACCATGGAGCTCGGCGAGAGACAG
AATCTAGCATAAAAG
ATGATGCA

QA 1 555 1 555
DS 

RD RR2DA05JQ 512 0 0
GTTCTGTAGAGCATAATTAAAAAAAGTTAGCCCAAAGAACACTAACACTTGTGATTGATT
AAAATATCAAATCTTATACAGATTAGCCCTAAAATAAGTGAAAGACATTGTTCTTTCTTT
TTTGACACGTTCCCAGTCAGTTACTAGTTTGCATGGTCTTGTTAATAAAAGAGGTTTATG
AGAAAAACTACCTTTATGTCGATTAAGCATGACGGGCTTGCTTTTAGACTTTTTAGTTGA
GGTGAATTTTGTAGTAACATTGCTAAACCAGGAATAACAGATCTTGTAAGCCTTGTTTCA
ACAGTCAAAGTTTCAACCTTGAACGTTGGATAATGAATACCATGGAGCTCGGCGAGAGAC
AGAATCTAGCATAAAAGGATGATGCAAAAGGTCATGATGAACTAATTAAACATAAATCTT
TACTGGAAAAAAAAAACATTACAAGAACTTATATGGCTTTAAAAGGTTTCGAACAATGAA
GCCTTAATTAATCATCCGCGACATCGAATTTT

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL7596Contig1 1278 2 2 U
GGAGTCTCTGGTGCGACTCTCACTTCTTCTTCTTCGTCGAGCTCGACCCAATCTCTGCTT
CATTCCGATTCGATCCGACGAGCGAATACTGGAAAAATTATACACATATCAAATTTTTAT
GGAATCTTGATCATTGAAATGGATGCGAATACATTCGTTTTGCTTCTGTGTATAGCTTTG
CTTTTGGGGACTAGTACTACTAAGGGTGAGGGAGAGGCACAAATTGTATCCAATTTGACA
GATACAAACGTGTCTCAGATTGTTACTGATTCTAAGAGTAGAGATCATTCTACTAACACC
ACCACCACCACCACCAATCAATTAGGCGCTAATAGTGATGGATCTGAGACAAAGCCTATT
GTTGATGATAGTACGAGTCAAAAGAATATAGGAGGAGGAGGAAGCGATGAAAGTGAAAGC
AGCGCTACTACGAGCAGCAACTCCTCATCTTCAAGGAAGAAGAAAGAAGGTGAAGACTGT
GATCCATCTTATATGTGTTCTGATGACCAACATCTCTTTCTCGCTTGTCTCCGTGTCCCT
GGTGATGATGATGATGCGCCTCATCTCTCACTCCTGATTAAGAACAAAGCCAAAACTGCT
TTGCTTCTTACTATAACTGCTCCCAGTTTTGTCCGCTTAGACACCAATAAAGTTCAGCTC
CCTGAAAGCCAAGACACTAAAGTGAAAGTCTCTATTAAGAAGGGAGGCTCCAACGACAGC
TCAATCGTACTCACTTCCAGTAACGGTGGCCATTGCAGCCTTGACTTAAAAGATTTGGCC
GGTGCATCATCACATGATACAGGAAAGGACAGCACAGTGGCTGTTTCACGCCCTTCGATC
CTCAACATCAGCTCGCGGACACTCATCGTGATCGCCATGATTTCGTTCCTAGTTCTCTCC
CTTGTCATCATTCCGGTGATCTACCACGTTTACAAAAGCAAGTCGCAGGGCAAAAGCAAG
TACCAGAGGCTCGACAACATGGAACTGCCAGTCTCTAGCACCGCCGCGGCCGCCGCGTTG
GTGTCGAAATCGGATCAAGAAAGTGGTGATGACGGATGGAACAATAACTGGGGAGATGAT
TGGGGCGATGGAGATGAAGAACAGCCGAATACTCCGGTGCCACCACTCACACCGAGTGTT
TCTTCTAGAGGACTTGCTCCTAGACGACTCAGTAAAGAGGGTTGGAAAGATTAGTAGCTT
TACTCTGTTTCTCTCTTTTGTTTCCTTTGGAGTCTATACATTAGTACAAGATGCCCGGAG
AATTTGACTTCTATTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G416TF U 1
AF RR2G416JQ C 578
BS 1 697 RR2G416TF
BS 698 1278 RR2G416JQ

RD RR2G416TF 697 0 0
GGAGTCTCTGGTGCGACTCTCACTTCTTCTTCTTCGTCGAGCTCGACCCAATCTCTGCTT
CATTCCGATTCGATCCGACGAGCGAATACTGGAAAAATTATACACATATCAAATTTTTAT
GGAATCTTGATCATTGAAATGGATGCGAATACATTCGTTTTGCTTCTGTGTATAGCTTTG
CTTTTGGGGACTAGTACTACTAAGGGTGAGGGAGAGGCACAAATTGTATCCAATTTGACA
GATACAAACGTGTCTCAGATTGTTACTGATTCTAAGAGTAGAGATCATTCTACTAACACC
ACCACCACCACCACCAATCAATTAGGCGCTAATAGTGATGGATCTGAGACAAAGCCTATT
GTTGATGATAGTACGAGTCAAAAGAATATAGGAGGAGGAGGAAGCGATGAAAGTGAAAGC
AGCGCTACTACGAGCAGCAACTCCTCATCTTCAAGGAAGAAGAAAGAAGGTGAAGACTGT
GATCCATCTTATATGTGTTCTGATGACCAACATCTCTTTCTCGCTTGTCTCCGTGTCCCT
GGTGATGATGATGATGCGCCTCATCTCTCACTCCTGATTAAGAACAAAGCCAAAACTGCT
TTGCTTCTTACTATAACTGCTCCCAGTTTTGTCCGCTTAGACACCAATAAAGTTCAGCTC
CCTGAAAGCCAAGACACTAAAGTGAAAGTCTCTATTA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2G416JQ 701 0 0
TTAAGAACAAAGCCAAAACTGCTTTGCTTCTTACTATAACTGCTCCCAGTTTTGTCCGCT
TAGACACCAATAAAGTTCAGCTCCCTGAAAGCCAAGACACTAAGGTGAAAGTCTCTATTA
AGAAGGGAGGCTCCAACGACAGCTCAATCGTACTCACTTCCAGTAACGGTGGCCATTGCA
GCCTTGACTTAAAAGATTTGGCCGGTGCATCATCACATGATACAGGAAAGGACAGCACAG
TGGCTGTTTCACGCCCTTCGATCCTCAACATCAGCTCGCGGACACTCATCGTGATCGCCA
TGATTTCGTTCCTAGTTCTCTCCCTTGTCATCATTCCGGTGATCTACCACGTTTACAAAA
GCAAGTCGCAGGGCAAAAGCAAGTACCAGAGGCTCGACAACATGGAACTGCCAGTCTCTA
GCACCGCCGCGGCCGCCGCGTTGGTGTCGAAATCGGATCAAGAAAGTGGTGATGACGGAT
GGAACAATAACTGGGGAGATGATTGGGGCGATGGAGATGAAGAACAGCCGAATACTCCGG
TGCCACCACTCACACCGAGTGTTTCTTCTAGAGGACTTGCTCCTAGACGACTCAGTAAAG
AGGGTTGGAAAGATTAGTAGCTTTACTCTGTTTCTCTCTTTTGTTTCCTTTGGAGTCTAT
ACATTAGTACAAGATGCCCGGAGAATTTGACTTCTATTGGT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL7597Contig1 937 2 4 U
GGAACACTTAACAGAGAGAGAGATTTAGCTAAACTAAATCAATGGCGGCGATGATAGTAA
AGGCTGGACTTTTCGCCGCCTTTCCTCTCCGTGGTCAACTCCCTCGTTGCTTCTCCTCTT
CATTGAAAACAACGACTACGGTAGTGGCAGTTTCTCGATCTCTTGTAATCTCTGCCGTTA
ATAACCATCACCGTCGAAGCTCCTGGCCTCGAGTTACTACTTTCTGCACGGCGGCGACGA
CGGTTTCAGCGGATGAACCGGAGAAGAAGATCGAGGCTGTGGAGGAGGTGGAGGAGAATG
TGAAGGAGACGGCGAATCTGTTAGACATAAGAGTAGGGAGAATTGTGAAAGCTTGGCAAC
ACGAGGAGGCTGATTCTCTGTATGTTGAAGAAGTCGATATAGGTGGAGCTGAGCCAAGAA
TCATCTGCAGTGGTCTCGTCAAATACGTACCTCTCGATCTCCTACAGGGTGCATCAGTTG
TGGTGTTGGCTAATCTGAAGCCAAGGAACATGAGAGGAGTCAAGTCATGCGGTATGCTTC
TCTGTGCTTCCGACTCATCCCATGAGAATGTTGAGCCTCTGGTTCCACCACAAGGGTCTG
TTCCTGGGGATAGAGTTTGGTTTGGTAATGAAGAAGATCTTGAGCAGCTTCCTGAGCCTG
CACCTCCTAACAAGGTTCAGAAGAAGAAGATGTGGGAAGCGGTTCAACCGCTGTTGAAGA
CTGATGATTCTGGTGTTTCGATGCTTAAGGAGCATTTGATGCGGTCATCTTCTGGTCTTG
TTACTTCCAACACTTTGAAAAAGGCCAACATTTCTTGATTTACTGTATTTGTTTTCAGAG
AGAGATGAGAGATATGAAGAACAAGCCACTAGAGCGAATTTTTTTATTGCAATGAAACTA
ATGTTTTTTTTTGTTGATTCATCAATAAGGTTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH61TF U 1
AF RR2BH61JQ C 84
BS 1 749 RR2BH61TF
BS 750 750 RR2BH61JQ
BS 751 799 RR2BH61TF
BS 800 937 RR2BH61JQ

RD RR2BH61TF 799 0 0
GGAACACTTAACAGAGAGAGAGATTTAGCTAAACTAAATCAATGGCGGCGATGATAGTAA
AGGCTGGACTTTTCGCCGCCTTTCCTCTCCGTGGTCAACTCCCTCGTTGCTTCTCCTCTT
CATTGAAAACAACGACTACGGTAGTGGCAGTTTCTCGATCTCTTGTAATCTCTGCCGTTA
ATAACCATCACCGTCGAAGCTCCTGGCCTCGAGTTACTACTTTCTGCACGGCGGCGACGA
CGGTTTCAGCGGATGAACCGGAGAAGAAGATCGAGGCTGTGGAGGAGGTGGAGGAGAATG
TGAAGGAGACGGCGAATCTGTTAGACATAAGAGTAGGGAGAATTGTGAAAGCTTGGCAAC
ACGAGGAGGCTGATTCTCTGTATGTTGAAGAAGTCGATATAGGTGGAGCTGAGCCAAGAA
TCATCTGCAGTGGTCTCGTCAAATACGTACCTCTCGATCTCCTACAGGGTGCATCAGTTG
TGGTGTTGGCTAATCTGAAGCCAAGGAACATGAGAGGAGTCAAGTCATGCGGTATGCTTC
TCTGTGCTTCCGACTCATCCCATGAGAATGTTGAGCCTCTGGTTCCACCACAAGGGTCTG
TTCCTGGGGATAGAGTTTGGTTTGGTAATGAAGAAGATCTTGAGCAGCTTCCTGAGCCTG
CACCTCCTAACAAGGTTCAGAAGAAGAAGATGTGGGAAGCGGTTCAACCGCTGTTGAAGA
CTGATGATTCTGGTGTTTCGATGCTTAAG*AGCATTTGATGCGGTCATCTTCTGGTCTTG
TTACTTCCAACACTTTGAA

QA 1 799 1 799
DS 

RD RR2BH61JQ 854 0 0
CCTCTCCGTGGTCAACTCCCTCGTTGCTTCTCCTCTTCATTGAAAACAACGACTACGGTA
GTGGCAGTTTCTCGATCTCTTGTAATCTCTGCCGTTAATAACCATCACCGTCGAAGCTCC
TGGCCTCGAGTTACTACTTTCTGCACGGCGGCGACGACGGTTTCAGCGGATGAACCGGAG
AAGAAGATCGAGGCTGTGGAGGAGGTGGAGGAGAATGTGAAGGAGACGGCGAATCTGTTA
GACATAAGAGTAGGGAGAATTGTGAAAGCTTGGCAACACGAGGAGGCTGATTCTCTGTAT
GTTGAAGAAGTCGATATAGGTGGAGCTGAGCCAAGAATCATCTGCAGTGGTCTCGTCAAA
TACGTACCTCTCGATCTCCTACAGGGTGCATCAGTTGTGGTGTTGGCTAATCTGAAGCCA
AGGAACATGAGAGGAGTCAAGTCATGCGGTATGCTTCTCTGTGCTTCCGACTCATCCCAT
GAGAATGTTGAGCCTCTGGTTCCACCACAAGGGTCTGTTCCTGGGGATAGAGTTTGGTTT
GGTAATGAAGAAGATCTTGAGCAGCTTCCTGAGCCTGCACCTCCTAACAAGGTTCAGAAG
AAGAAGATGTGGGAAGCGGTTCAACCGCTGTTGAAGACTGATGATTCTGGTGTTTCGATG
CTTAAGGAGCATTTGATGCGGTCATCTTCTGGTCTTGTTACTTCCAACACTTTGAAAAAG
GCCAACATTTCTTGATTTACTGTATTTGTTTTCAGAGAGAGATGAGAGATATGAAGAACA
AGCCACTAGAGCGAATTTTTTTATTGCAATGAAACTAATGTTTTTTTTTGTTGATTCATC
AATAAGGTTTGTTT

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 2

CO CL7598Contig1 899 2 4 U
GGGAGAAATCCGTAAGACAGTGTTGGGACTAGTTGCACCTGCAGAACTGGTTGAAGAACT
TAAAAGCACTATGAAAAGTTCTGACATGCCATGGCCGGGTGATGAAGGTGAACAGAGATG
GGAGCAAGCTTGGGCCGCCATTAAAAAGGTTTGGGCTTCGAAATGGAACGAGAGAGCCTA
CTTCAGCACGAAGAAAGTAAAACTGGATCATGACTATCTCTGCATGGCTGTTTTGGTCCA
AGAAGTCATCAATGCTGACTACGCATTCGTCATTCACACAACCAACCCTTCTTCTGGTGA
CTCATCAGAGATTTACGCTGAGGTTGTCAAAGGCCTTGGTGAAACTCTTGTAGGAGCGTA
TCCAGGTCGGTCTCTGAGTTTCATCTGCAAGAAAAACAACCTTGATTCGCCTCTGTTGCT
AGGTTACCCGAGCAAACCGATTGGACTGTTCATAAGACGCTCCATCACCTTTAGATCCGA
TTCTAACGGAGAAGATCTCGAAGGTTATGCAAGTGCAGGCCTCTACGACAGTGTACCGAT
GGACGAGGAAGACAAAGTAGTGCTCGATTACACAACGGATCCTCTCATCACTGACGAGAG
CTTCCAGAAAAAGATCCTCTCAGACATTGCACGCGCAGGAGATGCCATCGAGAAGCTGTA
TGGAACTCCACAGGATATTGAAAGTGTGATCAGAGACGGGAAGCTCTATGTCGTCCAGAC
ACGGCCACAAGTGTGATCGAATTCTCCGACCACTTGTCAATGTGTACGTTACGTTATTTG
TTGTCCAGTGAACTTCTTCTTTACTCTATAAGCAAAGAGTGTAAAGCATAAAACGCGCAT
ATAGATTAAAAAATGTGTACTACACAAACATTATTTGGGATTACCACTAAGATGTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G657TF U 1
AF RR2G657JQ C 391
BS 1 699 RR2G657TF
BS 700 700 RR2G657JQ
BS 701 728 RR2G657TF
BS 729 899 RR2G657JQ

RD RR2G657TF 728 0 0
GGGAGAAATCCGTAAGACAGTGTTGGGACTAGTTGCACCTGCAGAACTGGTTGAAGAACT
TAAAAGCACTATGAAAAGTTCTGACATGCCATGGCCGGGTGATGAAGGTGAACAGAGATG
GGAGCAAGCTTGGGCCGCCATTAAAAAGGTTTGGGCTTCGAAATGGAACGAGAGAGCCTA
CTTCAGCACGAAGAAAGTAAAACTGGATCATGACTATCTCTGCATGGCTGTTTTGGTCCA
AGAAGTCATCAATGCTGACTACGCATTCGTCATTCACACAACCAACCCTTCTTCTGGTGA
CTCATCAGAGATTTACGCTGAGGTTGTCAAAGGCCTTGGTGAAACTCTTGTAGGAGCGTA
TCCAGGTCGGTCTCTGAGTTTCATCTGCAAGAAAAACAACCTTGATTCGCCTCTGTTGCT
AGGTTACCCGAGCAAACCGATTGGACTGTTCATAAGACGCTCCATCACCTTTAGATCCGA
TTCTAACGGAGAAGATCTCGAAGGTTATGCAAGTGCAGGCCTCTACGACAGTGTACCGAT
GGACGAGGAAGACAAAGTAGTGCTCGATTACACAACGGATCCTCTCATCACTGACGAGAG
CTTCCAGAAAAAGATCCTCTCAGACATTGCACGCGCAGGAGATGCCATCGAGAAGCTGTA
TGGAACTCCACAGGATATTGAAAGTGTGATCAGAGACGG*AAGCTCTATGTCGTCCAGAC
ACGGCCAC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2G657JQ 509 0 0
GAAAAACAACCTTGATTCGCCTCTGTTGCTAGGTTACCCGAGCAAACCGATTGGACTGTT
CATAAGACGCTCCATCACCTTTAGATCCGATTCTAACGGAGAAGATCTCGAAGGTTATGC
AAGTGCAGGCCTCTACGACAGTGTACCGATGGACGAGGAAGACAAAGTAGTGCTCGATTA
CACAACGGATCCTCTCATCACTGACGAGAGCTTCCAGAAAAAGATCCTTTCAGACATTGC
ACGCGCAGGAGATGCCATCGAGAAGCTGTATGGAACTCCACAGGATATTGAAGGTGTGAT
CAGAGACGGGAAGCTCTATGTCGTCCAGACACGGCCACAAGTGTGATCGAATTCTCCGAC
CACTTGTCAATGTGTACGTTACGTTATTTGTTGTCCAGTGAACTTCTTCTTTACTCTATA
AGCAAAGAGTGTAAAGCATAAAACGCGCATATAGATTAAAAAATGTGTACTACACAAACA
TTATTTGGGATTACCACTAAGATGTAAGC

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 2

CO CL7599Contig1 590 2 2 U
TCCTTGAAAATACTAATTACGTTTTTCTTTCCTTGACAGTAAACAACAACTTTGACTCCT
TGACCATCATATAATAATAACATATCCCTGTTAATAACATTTTTTAAAGAAAATTTACAG
TTTCATAAGCAAAACAATTGTAGCTTCGAACTGCCAACCACCCAACCCAACAAACACTCC
CGTCAACACCGTCAGTAACTAAACGGCGATCCGTAGGTCCCACCACTGCCACGGAACACA
AACAACAAAAGCAAAAAACTTCCCAAAGGCAAGTTGTCAGAGTTCAAAGAGAGAGAGAGT
TGTCAGAGACTAGTTTTGAGATTTGGAGCAAACCAATCTCAGAAACAGACAGGAAGAGAC
TGTCAGAACAATAGCTAAGACTTTCCCGCCTAACAACAACCCAGCAAGCGCAATCACCAT
CATCACCATCGCTTTCGTTAGATCCCCTTTTGGTCTTTCTTCTTCTTCCATCTCTTCACA
GCTCTCCAGCAATGGCGGATTCGGACCATTCTCGTATCTCTCGGAGATTTCGCTCTACGT
TACATCTTCGGAATACAAGCTGGATGCTTCCGTCATAGACGTAGACGACC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GV32TF C 1
AF RR2GV32JQB U 2
BS 1 1 RR2GV32TF
BS 2 590 RR2GV32JQB

RD RR2GV32TF 590 0 0
TCCTTGAAAATACTAATTACGTTTT*CTTTCCTTGACAGTAAACAACAACTTTGACTCCT
TGACCATCATATAATAATAACATATCCCTGTTAATAACATTTTTTAAAGAAAATTTACAG
TTTCATAAGCAAAACAATTGTAGCTTCGAACTGCCAACCACCCAACCCAACAAACACTCC
CGTCAACACCGTCAGTAACTAAACGGCGATCCGTAGGTCCCACCACTGCCACGGAACACA
AACAACAAAAGCAAAAAACTTCCCAAAGGCAAGTTGTCAGAGTTCAGAGAGAGAGAGAGT
TGTCAGAGACTAGTTTTGAGATTTGGAGCAGACCAATCTCAGAAACAGACAGGAAGAGAC
TGTCAGAACAATAGCTAAGACTTTCCCGCCTAACAACAACCCAGCAAGCGCAATCACCAT
CATCACCATCGCTTTCGTTAGATCCCCTTTTGGTCTTTCTTCTTCTTCCATCTCTTCACA
GCTCTCCAGCAATGGCGGATTCGGACCATTCTCGTATCTCTCGGAGATTTCGCTCTACGT
TACATCTTCGGAATACAAGCTGGATGCTTCCGTCATAGACGTAGACGACC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RR2GV32JQB 589 0 0
CCTTGAAAATACTAATTACGTTTTTCTTTCCTTGACAGTAAACAACAACTTTGACTCCTT
GACCATCATATAATAATAACATATCCCTGTTAATAACATTTTTTAAAGAAAATTTACAGT
TTCATAAGCAAAACAATTGTAGCTTCGAACTGCCAACCACCCAACCCAACAAACACTCCC
GTCAACACCGTCAGTAACTAAACGGCGATCCGTAGGTCCCACCACTGCCACGGAACACAA
ACAACAAAAGCAAAAAACTTCCCAAAGGCAAGTTGTCAGAGTTCAAAGAGAGAGAGAGTT
GTCAGAGACTAGTTTTGAGATTTGGAGCAAACCAATCTCAGAAACAGACAGGAAGAGACT
GTCAGAACAATAGCTAAGACTTTCCCGCCTAACAACAACCCAGCAAGCGCAATCACCATC
ATCACCATCGCTTTCGTTAGATCCCCTTTTGGTCTTTCTTCTTCTTCCATCTCTTCACAG
CTCTCCAGCAATGGCGGATTCGGACCATTCTCGTATCTCTCGGAGATTTCGCTCTACGTT
ACATCTTCGGAATACAAGCTGGATGCTTCCGTCATAGACGTAGACGACC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL7600Contig1 891 2 2 U
GGGAGCGGCTTAAAACTGTGTCAACCACCAAAAATCGCCTTCTCCAGCGGGCGGTTCTCC
GGCCAGAAAAAATCTGTAAAATCGAATAATAATGATAAAGCTTTGGAGATGGTACCAGCG
ATGCCTGACGGTTCATCCAGTGAAAACGCAGGTCATCAGCTCCGGTTTCCTTTGGGGATT
TGGCGATGTCACCGCTCAATACATCACTCATTCCACTGCCAAACCTCCTCCTCCTCTTCT
CCGTCTCTCCGACAAGGATAAAGAGGCAGACAAAGATGCAGATTTCAAGGTCAACTGGAA
GCGAGTAGCTATCACGAGCATGTTCGGGCTTGGTTTTGTCGGACCTGTTGGCCACTTCTG
GTACGAAGGCTTGGATAAATTCATAAAACTGAAGCTTCGATACGTACCAAAGTCAACACG
TTTCGTAGCAGCCAAAGTTGCGATGGATGGTCTTATCTTCGGCCCCATAGATCTACTGGT
ATTCTTCACATACATGGGATACGCCACGGGCAAGAACACATCAGAAGTGAAAGTAGGACT
CAAGAGGGATTTTCTTCCGGCTCTAGCTCTCGAAGGAGGAGCATGGCCGCTTCTTCAGAT
CGCAAACTTCAGATACGTTCCCGTCCAGTACCAGCTTCTTTACGTCAACATCTTTTGCCT
TATAGACAGCGCTTTTCTCTCGTGGGTCGACCAACAGAAGGATGCAGCTTGGAAGCAATG
GTTCACTGCTTCGTTTCTAACACTTAAAGAACGAGGTGGCACCGGTGGAGTTTGATTCGT
TTCTCTATGTCGTGAACTTTGAATGAAAACAAAACAGAGTGTAGTTTGACGATTCTCAAC
AACCAAAGTTGCCTTACAGATTCTTGAATCAAAATTATTATTTCGTTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF88TF U 1
AF RR2CF88JQ C 128
BS 1 700 RR2CF88TF
BS 701 891 RR2CF88JQ

RD RR2CF88TF 708 0 0
GGGAGCGGCTTAAAACTGTGTCAACCACCAAAAATCGCCTTCTCCAGCGGGCGGTTCTCC
GGCCAGAAAAAATCTGTAAAATCGAATAATAATGATAAAGCTTTGGAGATGGTACCAGCG
ATGCCTGACGGTTCATCCAGTGAAAACGCAGGTCATCAGCTCCGGTTTCCTTTGGGGATT
TGGCGATGTCACCGCTCAATACATCACTCATTCCACTGCCAAACCTCCTCCTCCTCTTCT
CCGTCTCTCCGACAAGGATAAAGAGGCAGACAAAGATGCAGATTTCAAGGTCAACTGGAA
GCGAGTAGCTATCACGAGCATGTTCGGGCTTGGTTTTGTCGGACCTGTTGGCCACTTCTG
GTACGAAGGCTTGGATAAATTCATAAAACTGAAGCTTCGATACGTACCAAAGTCAACACG
TTTCGTAGCAGCCAAAGTTGCGATGGATGGTCTTATCTTCGGCCCCATAGATCTACTGGT
ATTCTTCACATACATGGGATACGCCACGGGCAAGAACACATCAGAAGTGAAAGTAGGACT
CAAGAGGGATTTTCTTCCGGCTCTAGCTCTCGAAGGAGGAGCATGGCCGCTTCTTCAGAT
CGCAAACTTCAGATACGTTCCCGTCCAGTACCAGCTTCTTTACGTCAACATCTTTTGCCT
TATAGACAGCGCTTTTCTCTCGTGGGTCGACCAACAGAAG
ATGCAGCT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2CF88JQ 764 0 0
ACGGTTCATCCAGTGAAAACGCAGGTCATCAGCTCCGGTTTCCTTTGGGGATTTGGCGAT
GTCACCGCTCAATACATCACTCATTCCACTGCCAAACCTCCTCCTCCTCTTCTCCGTCTC
TCCGACAAGGATAAAGAGGCAGACAAAGATGCAGATTTCAAGGTCAACTGGAAGCGAGTA
GCTATCACGAGCATGTTCGGGCTTGGTTTTGTCGGACCTGTTGGCCACTTCTGGTACGAA
GGCTTGGATAAATTCATAAAACTGAAGCTTCGATACGTACCAAAGTCAACACGTTTCGTA
GCAGCCAAAGTTGCGATGGATGGTCTTATCTTCGGCCCCATAGATCTACTGGTATTCTTC
ACATACATGGGATACGCCACGGGCAAGAACACATCAGAAGTGAAAGTAGGACTCAAGAGG
GATTTTCTTCCGGCTCTAGCTCTCGAAGGAGGAGCATGGCCGCTTCTTCAGATCGCAAAC
TTCAGATACGTTCCCGTCCAGTACCAGCTTCTTTACGTCAACATCTTTTGCCTTATAGAC
AGCGCTTTTCTCTCGTGGGTCGACCAACAGAAGGATGCAGCTTGGAAGCAATGGTTCACT
GCTTCGTTTCTAACACTTAAAGAACGAGGTGGCACCGGTGGAGTTTGATTCGTTTCTCTA
TGTCGTGAACTTTGAATGAAAACAAAACAGAGTGTAGTTTGACGATTCTCAACAACCAAA
GTTGCCTTACAGATTCTTGAATCAAAATTATTATTTCGTTTTCG

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL7601Contig1 1096 2 2 U
GTGTCTGGATTATCTTGCTTGTTACAGCTCTGACGTGGATCGGTTGGTTTCCATTTATTC
TGTTTGATACTGATTGGATGGGTCGAGAGATCTACGGCGGCGAACCGAACCAAGGTGCTT
CTTACAGTGCCGGGGTCAGTATGGGTGCGCTGGGTTTGATGTTGAACTCTGTTTTCCTTG
GGATCACTTCGGTGCTCATGGAGAAGCTTTGTAGAAAGTGCGGGGCTGGTTTCGTTTGGG
GGGTATCAAACATCATAATGGCTGTTTGCTTTCTTGCGATGATCGTTACCTCGTTTGTTG
CGTATCACATTGGCTACATTGGTCACGAACAGCCACCTGCTGGCATTGTGATTGCTGCAG
TATTGATCTTTACAATTCTAGGCATTCCATTGGCAATAACTTACAGCGTTCCCTATGCAC
TGATTTCCATACGTATTGAGTCCTTGGGACTAGGTCAAGGGTTATCTTTGGGTGTGCTGA
ATTTAGCAATAGTCATCCCACAGGTAATTGTGTCTGTTGGAAGTGGTCCTTGGGACCAAC
TATTTGGAGGTGGGAACTCACCGGCGCTTGCAGTTGGAGCAGCTGCAGGGTTCATTGGCG
GAATTGTAGCCATCTTAGCTATTCCGCGAACAAGGATTCAGAAGCCTATCCCTCTCCCAT
AATATCCTCTCTCTCTTTTTGCTACAATACGAGTTCAAAGCGAGGAACCCATCAAGAGAG
AGCATATGGAAGGAGATGCACCGTTTTTTGTGATCCTTGTCGGATTCATGCAATGGCTTC
TCGTGTGACTTTAACTTATTTGAAGCTTTTAGGACCTAATCCCTTCTGGTCTGGGGTCGG
TTTGCGATCCCCGTTTCCCCGAGGAGCCATAGAAAGTTTTACCAACGTAATAATAACACA
TATCTTTAAGATTGTGAGGTCTGTGCATCTGTTCTTTGTTGGAAGCACCCAAATAGGGCT
GGCTCTTCTCTGTTTGTTTGTTGTTTGGCTAAAGCTTGTACCAGTTTTACTAACACGTAC
TTGTAAATTATAACTGAGAACATGTGTACAACGGAGACTGAAATTTCTGAAACTGTTATA
AGTTCATTTCGTAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV61TF U 1
AF RR2AV61JQ C 341
BS 1 710 RR2AV61TF
BS 711 1096 RR2AV61JQ

RD RR2AV61TF 710 0 0
GTGTCTGGATTATCTTGCTTGTTACAGCTCTGACGTGGATCGGTTGGTTTCCATTTATTC
TGTTTGATACTGATTGGATGGGTCGAGAGATCTACGGCGGCGAACCGAACCAAGGTGCTT
CTTACAGTGCCGGGGTCAGTATGGGTGCGCTGGGTTTGATGTTGAACTCTGTTTTCCTTG
GGATCACTTCGGTGCTCATGGAGAAGCTTTGTAGAAAGTGCGGGGCTGGTTTCGTTTGGG
GGGTATCAAACATCATAATGGCTGTTTGCTTTCTTGCGATGATCGTTACCTCGTTTGTTG
CGTATCACATTGGCTACATTGGTCACGAACAGCCACCTGCTGGCATTGTGATTGCTGCAG
TATTGATCTTTACAATTCTAGGCATTCCATTGGCAATAACTTACAGCGTTCCCTATGCAC
TGATTTCCATACGTATTGAGTCCTTGGGACTAGGTCAAGGGTTATCTTTGGGTGTGCTGA
ATTTAGCAATAGTCATCCCACAGGTAATTGTGTCTGTTGGAAGTGGTCCTTGGGACCAAC
TATTTGGAGGTGGGAACTCACCGGCGCTTGCAGTTGGAGCAGCTGCAGGGTTCATTGGCG
GAATTGTAGCCATCTTAGCTATTCCGCGAACAAGGATTCAGAAGCCTATCCCTCTCCCAT
AATATCCTCTCTCTCTTTTTGCTACAATACGAGTTCAAAGCGAGGAACCC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2AV61JQ 756 0 0
TGGCATTGTGATTGCTGCAGTATTGATCTTTACAATTCTAGGCATTCCATTGGCAATAAC
TTACAGCGTTCCCTATGCACTGATTTCCATACGTATTGAGTCCTTGGGACTAGGTCAAGG
GTTATCTTTGGGTGTGCTGAATTTAGCAATAGTCATCCCACAGGTAATTGTGTCTGTTGG
AAGTGGTCCTTGGGACCAACTATTTGGAGGTGGGAACTCACCGGCGCTTGCAGTTGGAGC
AGCTGCAGGGTTCATTGGCGGAATTGTAGCCATCTTAGCTATTCCGCGAACAAGGATTCA
GAAGCCTATCCCTCTCCCATAATATCCTCTCTCTCTTTTTGCTACAATACGAGTTCAAAG
CGAGGAACCCATCAAGAGAGAGCATATGGAAGGAGATGCACCGTTTTTTGTGATCCTTGT
CGGATTCATGCAATGGCTTCTCGTGTGACTTTAACTTATTTGAAGCTTTTAGGACCTAAT
CCCTTCTGGTCTGGGGTCGGTTTGCGATCCCCGTTTCCCCGAGGAGCCATAGAAAGTTTT
ACCAACGTAATAATAACACATATCTTTAAGATTGTGAGGTCTGTGCATCTGTTCTTTGTT
GGAAGCACCCAAATAGGGCTGGCTCTTCTCTGTTTGTTTGTTGTTTGGCTAAAGCTTGTA
CCAGTTTTACTAACACGTACTTGTAAATTATAACTGAGAACATGTGTACAACGGAGACTG
AAATTTCTGAAACTGTTATAAGTTCATTTCGTAAAG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL7602Contig1 578 2 1 U
GCTTGTTGATTCGTTTTAATTTCTCTTTGTTCAAATCTTTTCTTATCTTGTTCTTTAGTG
TTTTTTTTCCATGTCGAACCTCATAGTTCTTGAATTGTGTTTTTGCGTGTTTTACAAGTC
TGAAATTTCTTGAAAATTTTGTCAAATGTTAGGGTTTTGGTATTAGATCAGCAATTGTCT
TTGGTTTCTCCGTTTGAATCTTTTAAGCAGATCTGATGATCTTTGATAAGAAGCAAGACA
TGTATCATACATACCATTCTCAATTCTTCAAGTACAGAAGAAAACAAAAGAAAAACAAAA
AGAAAGGTGAAAAGTAAAGTGTAGCTTCCCTATAAGCTGTGGAGTATCATCATAACCTCG
CAATGCAAGCTTTGAAATCTGTAGAAAATGATTTAGATTCTTTTGAAGTACCCATCATCT
GTTGTTCCTTGTTTGTTTTTGTTCACACTATCTGGTATACTTCATTCGTGTCGTACTGTA
ATAAACGGAAGTTGTATAGGTTACTTTAGCTCTGAATGTTATTATGTGTGATGAAGATGA
TTATGTATCTATGAAAGAAAAAGAAGTTGTGTCTTTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GQ84JQ C 1
AF RR2GQ84TF U 1
BS 1 578 RR2GQ84TF

RD RR2GQ84JQ 578 0 0
GCTTGTTGATTCGTTTTAATTTCTCTTTGTTCAAATCTTTTCTTATCTTGTTCTTTAGTG
TTTTTTTTCCATGTCGAACCTCATAGTTCTTGAATTGTGTTTTTGCGTGTTTTACAAGTC
TGAAATTTCTTGAAAATTTTGTCAAATGTTAGGGTTTTGGTATTAGATCAGCAATTGTCT
TTGGTTTCTCCGTTTGAATCTTTTAAGCAGATCTGATGATCTTTGATAAGAAGCAAGACA
TGTATCATACATACCATTCTCAATTCTTCAAGTACAGAAGAAAACAAAAGAAAAACAAAA
AGAAAGGTGAAAAGTAAAGTGTAGCTTCCCTATAAGCTGTGGAGTATCATCATAACCTCG
CAATGCAAGCTTTGAAATCTGTAGAAAATGATTTAGATTCTTTTGAAGTACCCATCATCT
GTTGTTCCTTGTTTGTTTTTGTTCACACTATCTGGTATACTTCATTCGTGTCGTACTGTA
ATAAACGGAAGTTGTATAGGTTACTTTAGCTCTGAATGTTATTATGTGTGATGAAGATGA
TTATGTATCTATGAAAGAAAAAGAAGTTGTGTCTTTAG

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2GQ84TF 578 0 0
GCTTGTTGATTCGTTTTAATTTCTCTTTGTTCAAATCTTTTCTTATCTTGTTCTTTAGTG
TTTTTTTTCCATGTCGAACCTCATAGTTCTTGAATTGTGTTTTTGCGTGTTTTACAAGTC
TGAAATTTCTTGAAAATTTTGTCAAATGTTAGGGTTTTGGTATTAGATCAGCAATTGTCT
TTGGTTTCTCCGTTTGAATCTTTTAAGCAGATCTGATGATCTTTGATAAGAAGCAAGACA
TGTATCATACATACCATTCTCAATTCTTCAAGTACAGAAGAAAACAAAAGAAAAACAAAA
AGAAAGGTGAAAAGTAAAGTGTAGCTTCCCTATAAGCTGTGGAGTATCATCATAACCTCG
CAATGCAAGCTTTGAAATCTGTAGAAAATGATTTAGATTCTTTTGAAGTACCCATCATCT
GTTGTTCCTTGTTTGTTTTTGTTCACACTATCTGGTATACTTCATTCGTGTCGTACTGTA
ATAAACGGAAGTTGTATAGGTTACTTTAGCTCTGAATGTTATTATGTGTGATGAAGATGA
TTATGTATCTATGAAAGAAAAAGAAGTTGTGTCTTTAG

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL7603Contig1 727 2 10 U
ACAGAACAGAACACATTGGATATAGAATGGTGCAATGATTGTGTTTAATTTACAAGGGAA
GCAGCAACATTTACATCAAAGGCAGACACTACCTACTGTTTATTTGCAGCATATATGTGC
TGTATTACATGAAACTTTCTACTTTGGGAGGCTTGTATTATTTGGATAGAGTTAGTTTTG
AGAAACATGTACTTGTTCAAGTTGAATGTGAGATCCATTGAGTTTGTAGTTCCAGTACCA
GCTCCCTGTTTCCATCACCTCTTCTTCTATTGCTTCCAGATTGATGCTTAAACCTGAATC
TGGACTTCTTCCTCGTGTGATCTTCAGTCTGTGGCCATCTGGTACTTCAAAAACATGGTT
TCCCTCGATAGTTACATTGCTGGCTTCGAATTCTGCATTTCCGTGCAATATGATTTTACA
AGTTTCAAGCCGGTTCACATCGTTTCTCCAGTAAACATTTGATTTACTGTTCCAATCGAT
TCCTCGGTTCATCACTTTGACGTTATGTAGTTTGCATTTGCCACACCTTAGTCCATATTG
CAATATTGGTTCACCATTTTCGCTAATTGTTGTTGAACCCATGGCATTTTCAGCATTGAT
GATCAGGCTACCATCAACCTCAACATTGTTCCATGAGAACTCTGCAATCTCTAGTTGCAG
TTCTGAGCAACTGGAAATTGACCCTCCCTTGAATTTCTGTCTTGAAACTTCCCAAAGAGG
ACCAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY71TF C 1
AF RR2CN35JQ U 5
BS 1 13 RR2EY71TF
BS 14 162 RR2CN35JQ
BS 163 163 RR2EY71TF
BS 164 243 RR2CN35JQ
BS 244 244 RR2EY71TF
BS 245 366 RR2CN35JQ
BS 367 367 RR2EY71TF
BS 368 568 RR2CN35JQ
BS 569 569 RR2EY71TF
BS 570 727 RR2CN35JQ

RD RR2EY71TF 579 0 0
ACAGAACAGAACACATTGGATATAGAATGGTGGAATGATTGTGTTTAATTTACAAGGGAA
GCAGCAACATTTACATCAAAGGCAGATACTACCTACTGTTTATTTGCAGCATATATGTGC
TGTATTACATGAAACTTTCTACTTTGGGAGGCTTGTATTATTTGGATAGAGTTAGTTTTG
AGAAACATGTACTTGTTCAAGTTGAATGTGAGATCCATTGAGTTTGTAGTTCCAGTACCA
GCTCCCTGTTTCCATCACTTCTTCTTCTATTGCTTCCAGTTTGATGCTTAAACCTGAATC
TGGACTTCTTCCTCGTGTGATCTTCAGTCTGTGGCCATCTGGTACTTCAAAAACATGGTT
TCCCTCGATAGTTACATTGCTGGCTTCGAATTCTGCATTTCCGTGCAATATGATTTTACA
AGTTTCAAGCCGGTTCACATCGTTTCTCCAGTAAACATTTGATTTACTGTTCCAATCGAT
TCCTCGGTTCCTCACTTTGACGTTATGTAGTTTGCATTTGCCACACCTTAGTCCGTATTG
TAATATTGGTTCACCATTTTCGCTAATTGTTGTTGAACC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2CN35JQ 723 0 0
GACAGAAGT
CATTGGATATAGAATGGTGCAATGATTGTGTTTAATTTACAAGGGAAGCAGCAACATTTA
CATCAAAGGCAGACACTACCTACTGTTTATTTGCAGCATATATGTGCTGTATTACATGAA
ACTTTCTACTTTGGGAGGCTTGTATTATT*GGATAGAGTTAGTTTTGAGAAACATGTACT
TGTTCAAGTTGAATGTGAGATCCATTGAGTTTGTAGTTCCAGTACCAGCTTCCTGTTTCC
ATCACCTCTTCTTCTATTGCTTCCAGATTGATGCTTAAACCTGAATCTGGACTTCTTCCT
CGTGTGATCTTCAGTCTGTGGCCATCTGGTACTTCAAAAACATGGTTTCCCTCTATAGTT
ACATTGCTGGCTTCGAATTCTGCATTTCCGTGCAATATGATTTTACAAGTTTCAAGCCGG
TTCACATCGTTTCTCCAGTAAACATTTGATTTACTGTTCCAATCGATTCCTCGGTTCATC
ACTTTGACGTTATGTAGTTTGCATTTGCCACACCTTAGTCCATATTGCAATATTGGTTCA
CCATTTTCGCTAATTTTTGTTGAACCCATGGCATTTTCAGCATTGATGATCAGGCTACCA
TCAACCTCAACATTGTTCCATGAGAACTCTGCAATCTCTAGTTGCAGTTCTGAGCAACTG
GAAATTGACCCTCCCTTGAATTTCTGTCTTGAAACTTCCCAAAGAGGACCAAGA

QA 10 723 10 723
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7605Contig1 712 2 5 U
GGATTCATTCAGTCACTCTCTCTTGTCGGAAGGAAGGAAGGAAGAAGAGGAAGATCTCGA
GATGCCTCTGTACGACTGTATGCTTCTGTTCAAGCCGATAATACGCAAGGAGGGTCTGAT
CGATCTCGTTGCGCGCATAGGGAAACACGTGTACAGCAAAAATGGCGTACTCACGGAGGT
CAAATCATTCGGCAAGGTCGAATTGGGTTACGGTATTAAGAAGCTCGACGGAAGACACTA
TCAGGGACAACTGATGCAGATAACAATGATGGCAACACCAAACATCAACAAGGAGCTTCA
CTACCTCAACAAGGAAGACAAACTCCTGCGCTGGCTCCTTGTTAAACACCGCGACATCAA
GATTGGATCATCTGAAATGGAAGATCGTCAGGACGAGTTCAGCAGAGTTACCAACAGGAG
CTTATATGAGGAATCCTCAACGGACGAAGATGACGATATCCTAGGCTTACGACGATGAGA
GAGAGGAGGAAATCGTTTTTCTCACACCAGAGTGTCCTTCAATCTTTGTCTTATGGTTTT
AATGGCTGATAAATGCAAACATGTATTGACACGTCATCTTTGCATGGGCAGAGATGTGTC
TCTGTTTTTAGAATTTTCTCATTTTTGATTTTAATTATTAAAAATAGAGAGGTGATCGTT
GGTGAACAAAACACTTGTTGTCGTTGTTCTATTTTTTACCCTTGGTCGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX35TFB U 69
AF RR2AX35JQ C 1
BS 1 68 RR2AX35JQ
BS 69 241 RR2AX35TFB
BS 242 242 RR2AX35JQ
BS 243 639 RR2AX35TFB
BS 640 712 RR2AX35JQ

RD RR2AX35TFB 571 0 0
TGTACGACTGTATGCTTCTGTTCAAGCCGATAATACGCAAGGAGGGTCTGATCGATCTCG
TTGCGCGCATAGGGAAACACGTGTACAGCAAAAATGGCGTACTCACGGAGGTCAAATCAT
TCGGCAAGGTCGAATTGGGTTACGGTATTAAGAAGCTCGACGGAAGACACTATGAGGGAC
AACTGATGCAGATAACAATGATGGCAACACCAAACATCAACAAGGAGCTTCACTACCTCA
ACAAGGAAGACAAACTCCTGCGCTGGCTCCTTGTTAAACACCGCGACATCAAGATTGGAT
CATCTGAAATGGAAGATCGTCAGGACGAGTTCAGCAGAGTTACCAACAGGAGCTTATATG
AGGAATCCTCAACGGACGAAGATGACGATATCCTAGGCTTACGACGATGAGAGAGAGGAG
GAAATCGTTTTTCTCACACCAGAGTGTCCTTCAATCTTTGTCTTATGGTTTTAATGGCTG
ATAAATGCAAACATGTATTGACACGTCATCTTTGCATGGGCAGAGATGTGTCTCTGTTTT
TAGAATTTTCTCATTTTTGATTTTAATTATT

QA 1 571 1 571
DS 

RD RR2AX35JQ 712 0 0
GGATTCATTCAGTCACTCTCTCTTGTCGGAAGGAAGGAAGGAAGAAGAGGAAGATCTCGA
GATGCCTCTGTACGACTGTATGCTTCTGTTCAAGCCGATAATACGCAAGGAGGGTCTGAT
CGATCTCGTTGCGCGCATAGGGAAACACGTGTACAGCAAAAATGGCGTACTCACGGAGGT
CAAATCATTCGGCAAGGTCGAATTGGGTTACGGTATTAAGAAGCTCGACGGAAGACACTA
TCAGGGACAACTGATGCAGATAACAATGATGGCAACACCAAACATCAACAAGGAGCTTCA
CTACCTCAACAAGGAAGACAAACTCCTGCGCTGGCTCCTTGTTAAACACCGCGACATCAA
GATTGGATCATCTGAAATGGAAGATCGTCAGGACGAGTTCAGCAGAGTTACCAACAGGAG
CTTATATGAGGAATCCTCAACGGACGAAGATGACGATATCCTAGGCTTACGACGATGAGA
GAGAGGAGGAAATCGTTTTTCTCACACCAGAGTGTCCTTCAATCTTTGTCTTATGGTTTT
AATGGCTGATAAATGCAAACATGTATTGACACGTCATCTTTGCATGGGCAGAGATGTGTC
TCTGTTTTTAGAATTTTCTCATTTTTGATTTTAATTATTAAAAATAGAGAGGTGATCGTT
GGTGAACAAAACACTTGTTGTCGTTGTTCTATTTTTTACCCTTGGTCGCTCC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL7606Contig1 690 2 3 U
TGGGAAAGTAATTCAATATATGACTAAAGAACTGTCATTTACATGCGATGACTTTTGTTT
TGATTGTCGGCAGGTTCTTGTTCTTCCAGCTGCTACTGCCGAGGATGCGTAGACTCTGTC
TCAGTATGTCGATCTCTCTTTCCTTCTCGTATCTTTGTTTCTCCTTCAAAGCTATTCTTC
CTTTGAGTGTCTCAATGGTTTCTTCCCTAACTTTAACTTCCTTCCTGAGTTCTTGCACTG
TGTTCTTTGCTTCTCCTTCCTGCGGGTTCGGTCGCAGTGTCTTTCCATATGTTGTGTGGA
TCAGATCATCAAGCTCAGTCTTAATAGCGAAATAGAGTTGTTTCCACCTCACCACAGCTT
CTTCCCTCACAGCTCTCTCTAAGCACATCTGTTCCACGACCCATTCCCACTCGTGCTGTT
TCGCCTTTGCTTCTTCTTTCTCTTGCATCTTTTGCCTCAGCTTCTTCACCTCTTCTCTCA
GATTCTTCCTCTCTTTCCTCCACTCTGTCTCGGCCATCTTCAAAGCCGAAATGGCTCTCT
CTTTCTCATCCAGCTCTCTTCTTGTTGGTCTCCTCCTCTCTTCTATTGATCTCCCCTTGA
TACTTATCCTAGCAGTGCTTCTCTTTTGCTTGCTTGTGGAACCACCCATGGATTAGATCT
TCTTTTTCTCTCTATCTCTCTGTTGAATCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS57JQ U 2
AF RR2DS57TF C 1
BS 1 1 RR2DS57TF
BS 2 287 RR2DS57JQ
BS 288 690 RR2DS57TF

RD RR2DS57JQ 286 0 0
GGGAAAGTAATTCAATATATGACTAAAGAACTGTCATTTACATGCGATGACTTTTGTTTT
GATTGTCGGCAGGTTCTTGTTCTTCCAGCTGCTACTGCCGAGGATGCGTAGACTCTGTCT
CAGTATGTCGATCTCTCTTTCCTTCTCGTATCTTTGTTTCTCCTTCAAAGCTATTCTTCC
TTTGAGTGTCTCAATGGTTTCTTCCCTAACTTTAACTTCCTTCCTGAGTTCTTGCACTGT
GTTCTTTGCTTCTCCTTCCTGCGGGTTCGGTCGCAGTGTCTTTCCA

QA 1 286 1 286
DS 

RD RR2DS57TF 690 0 0
TGGGAAAGTAATTCAATATATGACTAAAGAACTGTCATTTACATGCGATGACTTTTGTTT
TGATTGTCGGCAGGTTCTTGTTCTTCCAGCTGCTACTGCCGAGGATGCGTAGACTCTGTC
TCAGTATGTCGATCTCTCTTTCCTTCTCGTATCTTTGTTTCTCCTTCAAAGCTATTCTTC
CTTTGAGTGTCTCAATGGTTTCTTCCCTAACTTTAACTTCCTTCCTGAGTTCTTGCACTG
TGTTCTTTGCTTCTCCTTCCTGCGGGTTCGGTCGCAGTGTCTTTCCATATGTTGTGTGGA
TCAGATCATCAAGCTCAGTCTTAATAGCGAAATAGAGTTGTTTCCACCTCACCACAGCTT
CTTCCCTCACAGCTCTCTCTAAGCACATCTGTTCCACGACCCATTCCCACTCGTGCTGTT
TCGCCTTTGCTTCTTCTTTCTCTTGCATCTTTTGCCTCAGCTTCTTCACCTCTTCTCTCA
GATTCTTCCTCTCTTTCCTCCACTCTGTCTCGGCCATCTTCAAAGCCGAAATGGCTCTCT
CTTTCTCATCCAGCTCTCTTCTTGTTGGTCTCCTCCTCTCTTCTATTGATCTCCCCTTGA
TACTTATCCTAGCAGTGCTTCTCTTTTGCTTGCTTGTGGAACCACCCATGGATTAGATCT
TCTTTTTCTCTCTATCTCTCTGTTGAATCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL7607Contig1 637 2 2 U
CAAGAATAATAATAATAATAAACATAACAAGACAAAGAAACTCTCTGAACAAAAGACCCT
TTCAAAAGGAAACTTCAACAGTTTATTGCCAAGACTCAAAATGAAACAGTAAACACACAC
ATTTGGTGTTTTTGATCTCTTTAATTAGTAAGAAGCTTCAAAGTTCTTCCAGCCTCCATA
AGACTCCTCTTCAAACCCCCTGCTTCGGTTTTCCGAAGGTTTGAAGGAGAGTGCGATCCA
GATCTCGCCTTTGAACTCTCCATCTTTCACCACATTGTATGCACTTGGTGGGATCTCTCC
TTCCAAGAAAACCGCCTCCAATGGAAGGGTTGCTTCACCAACATGATCATCCTCAGTGCC
AACATCTTTGTCAAAAATTTTGGCTTTTAGCTCTGTCGTTCCTTCAAAAACATTGAAAAT
AAATGTCTCGTTCCATTCTGGAGTCGTGCCTTGTCCTGATGCGACATTGCTCTTCTGATC
TTGAGTCCGACAAGTGAATTGCACATAAGGATCCATGCTGTTCAAAAAATCTGTGTCCTC
AAGTCCTTTGGCGCTGACAAGAACAACTTCAAGAGTTCCATGAGGCATCTTTCTTCTCTC
TTCTTGTCTGTTTTTCTTTTTTGTTTAATTGTCAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GO85TF C 1
AF RR2GO85JQ U 36
BS 1 35 RR2GO85TF
BS 36 637 RR2GO85JQ

RD RR2GO85TF 637 0 0
CAAGAATAATAATAATAATAAACATAACAAGACAAAGAAACTCTCTGAACAAAAGACCCT
TTCAAAAGGAAACTTCAACAGTTTATTGCCAAGACTCAAAATGAAACAGTAAACACACAC
ATTTGGTGTTTTTGATCTCTTTAATTAGTAAGAAGCTTCAGAGTTCTTCCAGCCTCCATA
AGACTCCTCTTCAAACCCCCTGCTTCGGTTTTCCGAAGGTTTGAAGGAGAGTGCGATCCA
GATCTCGCCTTTGAACTCTCCATCTTTCACCACATTGTATGCACTTGGTGGGATCTCTCC
TTCCAAGAAAACCGCCTCCAATGGAAGGGTTGCTTCACCAACATGATCATCCTCAGTGCC
AACATCTTTGTCAAAGATTTTGGCTTTTAGCTCTGTCGTTCCTTCAGAGACATTGAAGAT
AAATGTCTCGTTCCATTCTGGAGTCGTGCCTTGTCCTGATGCGACATTGCTCTTCTGATC
TTGAGTCCGACAAGTGAATTGCACATAAGGATCCATGCTGTTCAGAAAATCTGTGTCCTC
AAGTCCTTTGGCGCTGACAAGAACAACTTCAAGAGTTCCATGAGGCATCTTTCTTCTCTC
TTCTTGTCTGTTTTTCTTTTTTGTTTAATTGTCAGCC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RR2GO85JQ 602 0 0
AGAAACTCTCTGAACAAAAGACCCTTTCAAAAGGAAACTTCAACAGTTTATTGCCAAGAC
TCAAAATGAAACAGTAAACACACACATTTGGTGTTTTTGATCTCTTTAATTAGTAAGAAG
CTTCAAAGTTCTTCCAGCCTCCATAAGACTCCTCTTCAAACCCCCTGCTTCGGTTTTCCG
AAGGTTTGAAGGAGAGTGCGATCCAGATCTCGCCTTTGAACTCTCCATCTTTCACCACAT
TGTATGCACTTGGTGGGATCTCTCCTTCCAAGAAAACCGCCTCCAATGGAAGGGTTGCTT
CACCAACATGATCATCCTCAGTGCCAACATCTTTGTCAAAAATTTTGGCTTTTAGCTCTG
TCGTTCCTTCAAAAACATTGAAAATAAATGTCTCGTTCCATTCTGGAGTCGTGCCTTGTC
CTGATGCGACATTGCTCTTCTGATCTTGAGTCCGACAAGTGAATTGCACATAAGGATCCA
TGCTGTTCAAAAAATCTGTGTCCTCAAGTCCTTTGGCGCTGACAAGAACAACTTCAAGAG
TTCCATGAGGCATCTTTCTTCTCTCTTCTTGTCTGTTTTTCTTTTTTGTTTAATTGTCAG
CC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL7608Contig1 796 2 1 U
GGATCGTAATAAGCACAAGTTTCAACCAAAACGTTTTGCCTCCACAATCGATCTCCGATT
TCCCTCCTCCCTCACTAGAAGCTGATGCCGCCTTTCAAATCTCCAATACCCCTCAAACCA
CCACCTAAAACACATAAGCGGCTTCAAAAACGAGGCCATACTGAGTTGAGACTGATTTTC
CTGAAATCTTCCATCTCTTCTCTCCTTATACATCTCCATCAACGGCTTTGACTATGTCCT
TTCTCCACTGGTTCATTTCTGATCGATTCTCATGTTTGTGTCTAATATTTCTATGGATAT
GGCGCTTCAGTGTTTTGTATATTGAATGAAGTTTTCTTCTCCCACTCTGTTAAATGTTTT
TATGCAGATGGCCCTTCGTATAGGCTGCGTTTCATGGAAGGAAACGGACGCTCAGGTTCT
ACCAGTCTCTGGCTCTGAATTTCTCTTGGCACCTTCTCAGTGGAGTCGTAATGTCATTGG
TATGTTTCTGTTTTTGTTTATGAATGATTGGTCTTGATTAACTGTTACATTCTATAGAAA
AATTAGATCGTTGATTGACTTGAATTCTGAAGATGAGTTCTTGCGAATGGATTCAGAAAC
CAGAAATAGCATGTGCTATACATCTCTGCTTACTGGTGCTTAGGAATCTATGAATTTAAG
TTATGCACTGTTGCCTTTTTGCTACTATTTGTTCCTTTGATGTCATTCTTTTTCCACTTT
TGATTTTTCTGATACTTGGATTAATTGCGTCTTGCTAATGTTTTTTTTTGGCTCGCAGCC
ATGCCTTCTTACGGTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP96TF U 1
AF RR2BI25TF U 1
BS 1 796 RR2BI25TF

RD RR2DP96TF 435 0 0
GGATCGTAATAAGCACAAGTTTCAACCAAAACGTTTTGCCTCCACAATCGATCTCCGATT
TCCCTCCTCCCTCACTAGAAGCTGATGCCGCCTTTCAAATCTCCAATACCCCTCAAACCA
CCACCTAAAACACATAAGCGGCTTCAAAAACGAGGCCATACTGAGTTGAGACTGATTTTC
CTGAAATCTTCCATCTCTTCTCTCCTTATACATCTCCATCAACGGCTTTGACTATGTCCT
TTCTCCACTGGTTCATTTCTGATCGATTCTCATGTTTGTGTCTAATATTTCTATGGATAT
GGCGCTTCAGTGTTTTGTATATTGAATGAAGTTTTCTTCTCCCACTCTGTTAAATGTTTT
TATGCAGATGGCCCTTCGTATAGGCTGCGTTTCATGGAAGGAAACGGACGCTCAGGTTCT
ACCAGTCTCTGGCTC

QA 1 435 1 435
DS 

RD RR2BI25TF 796 0 0
GGATCGTAATAAGCACAAGTTTCAACCAAAACGTTTTGCCTCCACAATCGATCTCCGATT
TCCCTCCTCCCTCACTAGAAGCTGATGCCGCCTTTCAAATCTCCAATACCCCTCAAACCA
CCACCTAAAACACATAAGCGGCTTCAAAAACGAGGCCATACTGAGTTGAGACTGATTTTC
CTGAAATCTTCCATCTCTTCTCTCCTTATACATCTCCATCAACGGCTTTGACTATGTCCT
TTCTCCACTGGTTCATTTCTGATCGATTCTCATGTTTGTGTCTAATATTTCTATGGATAT
GGCGCTTCAGTGTTTTGTATATTGAATGAAGTTTTCTTCTCCCACTCTGTTAAATGTTTT
TATGCAGATGGCCCTTCGTATAGGCTGCGTTTCATGGAAGGAAACGGACGCTCAGGTTCT
ACCAGTCTCTGGCTCTGAATTTCTCTTGGCACCTTCTCAGTGGAGTCGTAATGTCATTGG
TATGTTTCTGTTTTTGTTTATGAATGATTGGTCTTGATTAACTGTTACATTCTATAGAAA
AATTAGATCGTTGATTGACTTGAATTCTGAAGATGAGTTCTTGCGAATGGATTCAGAAAC
CAGAAATAGCATGTGCTATACATCTCTGCTTACTGGTGCTTAGGAATCTATGAATTTAAG
TTATGCACTGTTGCCTTTTTGCTACTATTTGTTCCTTTGATGTCATTCTTTTTCCACTTT
TGATTTTTCTGATACTTGGATTAATTGCGTCTTGCTAATGTTTTTTTTTGGCTCGCAGCC
ATGCCTTCTTACGGTA

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL7609Contig1 736 2 8 U
GAGCCCGACAACAGAGAAGAAGAGAGCCCAGCTCTTGGAACTATTAGAGGCAAATGCATC
ACACAATTACTACTACTTGGTGCTATCAACAGTATCCAGAAAAAATACTGGAGTAATTTG
AAAACAGCACAGAAGGTAGCCATCATGGACATCTTATTCTCTTTCATAGAATTTGCTGCT
TCCTACAATTCATATTCTAACCTCAGAACACGAATGAATCACATTTCCGCGGAAAGGCCA
CCTCTAAACCTTCTCCGACAAGAGCTAGAAGGAACCAACATATATATGGATGTCTTACAT
AAGACAACAACTGGGCTTGGGGATGCTGCATCCGATGACACTGAAGATAAACTCGAAGGT
GCAGCTGAAGAAAAGCTGGTGTCCTTCTGTGAACAAGTGCTGAAAGAAACATCTGATCTC
CAGTCCTCTTTGGGGGAGTCTACGAACATGGATGTTCACCGGGTACTTGAGCTACGTTCT
CCCGTGATTGTCAAGGTTCTGGAAGGAATGTGCTTCATGAACAACAAAATATTCAGGAAA
CACATGAGAGAGTTCTACCCTCTGCTCACGAGGCTTGTCTGCTGTGAACAGATGGACATA
CGAGGTGCATTAGCCAACCTTTTCACAGCACAATTGAAGCCTCTTTTGCAACAGTAAATG
ATCGAAGCCTATGAAATTGTGACAAAGGATACTTTTGCTTCCCACAGTTTGGGTTATTGT
TTTTTTTTTTTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F615TF U 1
AF RR2F615JQ C 105
BS 1 604 RR2F615TF
BS 605 605 RR2F615JQ
BS 606 646 RR2F615TF
BS 647 647 RR2F615JQ
BS 648 687 RR2F615TF
BS 688 688 RR2F615JQ
BS 689 700 RR2F615TF
BS 701 736 RR2F615JQ

RD RR2F615TF 700 0 0
GAGCCCGACAACAGAGAAGAAGAGAGCCCAGCTCTTGGAACTATTAGAGGCAAATGCATC
ACACAATTACTACTACTTGGTGCTATCAACAGTATCCAGAAAAAATACTGGAGTAATTTG
AAAACAGCACAGAAGGTAGCCATCATGGACATCTTATTCTCTTTCATAGAATTTGCTGCT
TCCTACAATTCATATTCTAACCTCAGAACACGAATGAATCACATTTCCGCGGAAAGGCCA
CCTCTAAACCTTCTCCGACAAGAGCTAGAAGGAACCAACATATATATGGATGTCTTACAT
AAGACAACAACTGGGCTTGGGGATGCTGCATCCGATGACACTGAAGATAAACTCGAAGGT
GCAGCTGAAGAAAAGCTGGTGTCCTTCTGTGAACAAGTGCTGAAAGAAACATCTGATCTC
CAGTCCTCTTTGGGGGAGTCTACGAACATGGATGTTCACCGGGTACTTGAGCTACGTTCT
CCCGTGATTGTCAAGGTTCTGGAAGGAATGTGCTTCATGAACAACAAAATATTCAGGAAA
CACATGAGAGAGTTCTACCCTCTGCTCACGAGGCTTGTCTGCTGTGAACAGATGGACATA
CGAG*TGCATTAGCCAACCTTTTCACAGCACAATTGAAGCCTCTTT*GCAACAGTAAATG
ATCGAAGCCTATGAAATTGTGACAAAG*ATACTTTTGCTT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2F615JQ 632 0 0
ATACTGGAGTAATT*GAAAACAGCACAGAAGGTAGCCATCATGGACATCTTATTCTCTTT
CATAGAATTTGCTGCTTCCTACAATTCATATTCTAACCTCAGAACACGAATGAATCACAT
TTCCGCGGAAAGGCCACCTCTAAACCTTCTCCGACAAGAGCTAGAAGGAACCAACATATA
TATGGATGTCTTACATAAGACAACAACTGGGCTTGGGGATGCTGCATCCGATGACACTGA
AGATAAACTCGAAGGTGCAGCTGAAGAAAAGCTGGTGTCCTTCTGTGAACAAGTGCTGAA
AGAAACATCTGATCTCCAGTCCTCTTTGGGGGAGTCTACGAACATGGATGTTCACCGGGT
ACTTGAGCTACGTTCTCCCGTGATTGTCAAGGTTCTGGAAGGAATGTGCTTCATGAACAA
CAAAATATTCAGGAAACACATGAGAGAGTTCTACCCTCTGCTCACGAGGCTTGTCTGCTG
TGAACAGATGGACATACGAGGTGCATTAGCCAACCTTTTCACAGCACAATTGAAGCCTCT
TTTGCAACAGTAAATGATCGAAGCCTATGAAATTGTGACAAAGGATACTTTTGCTTCCCA
CAGTTTGGGTTATTGTTTTTTTTTTTTTCTTT

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL7610Contig1 761 2 1 U
GATCCAAAACACCTCTCTCTCTCGTTCACATCTTTCTTCTTTGTGGTAAACAGAAAGGGA
GATAGAGAGAGACAACAATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGCTGCGGTATCGCCGCCGTCT
ACCCTTCTCTTCTTTCTTCTTCAAAATCTAAATTCGTCTCTGCTGGAGTTGCTCTCCCCA
ACGCCGGGAATGTTGGCCGTGTCAGAATGGCTGCTCACTGGATGCCCGGCGAGCCACGAC
CAGCTTACCTCGACGGTTCTGCTCCTGGTGACTTTGGGTTTGACCCACTCGGACTTGGAG
AGGTTCCAGATAACCTTGAGAGGTACAAAGAATCAGAGCTCATACACAATCTTGGCTATA
GAGTTTTTAGCTATTGCATTTGTTGAGCACCAGAGGAGTATGGAGAAAGACCCTGAGAAA
AAGAAGTACCCGGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCAAAGAAGTTC
GAGGAGTTAAAAGTTAAAGAGATCAAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGCGTTTGTAGGC
TTCTGTGTGCAACAATCTGCCTATCCAGGCACAGGACCATTGGAGAACCTGGCTACTCAC
TTGGCGGATCCATGGCACAAAAACATTGGCGATGTTGTTATCCCTTTCAACTAGTGACTT
GTAAGAAAAAAGATAGTAATATATCCTATGAGCTTTTATGTGTATCAAAACTCTGTGTAG
TGAAAGACAGATTGTGAAACCTATGTTTTGTCTCGGTGAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A492JQ C 1
AF RR2A492TF U 1
BS 1 761 RR2A492TF

RD RR2A492JQ 761 0 0
GATCCAAAACACCTCTCTCTCTCGTTCACATCTTTCTTCTTTGTGGTAAACAGAAAGGGA
GATAGAGAGAGACAACAATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGCTGCGGTATCGCCGCCGTCT
ACCCTTCTCTTCTTTCTTCTTCAAAATCTAAATTCGTCTCTGCTGGAGTTGCTCTCCCCA
ACGCCGGGAATGTTGGCCGTGTCAGAATGGCTGCTCACTGGATGCCCGGCGAGCCACGAC
CAGCTTACCTCGACGGTTCTGCTCCTGGTGACTTTGGGTTTGACCCACTCGGACTTGGAG
AGGTTCCAGATAACCTTGAGAGGTACAAAGAATCAGAGCTCATACACAATCTTGGCTATA
GAGTTTTTAGCTATTGCATTTGTTGAGCACCAGAGGAGTATGGAGAAAGACCCTGAGAAA
AAGAAGTACCCGGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCAAAGAAGTTC
GAGGAGTTAAAAGTTAAAGAGATCAAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGCGTTTGTAGGC
TTCTGTGTGCAACAATCTGCCTATCCAGGCACAGGACCATTGGAGAACCTGGCTACTCAC
TTGGCGGATCCATGGCACAAAAACATTGGCGATGTTGTTATCCCTTTCAACTAGTGACTT
GTAAGAAAAAAGATAGTAATATATCCTATGAGCTTTTATGTGTATCAAAACTCTGTGTAG
TGAAAGACAGATTGTGAAACCTATGTTTTGTCTCGGTGAAG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RR2A492TF 761 0 0
GATCCAAAACACCTCTCTCTCTCGTTCACATCTTTCTTCTTTGTGGTAAACAGAAAGGGA
GATAGAGAGAGACAACAATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGCTGCGGTATCGCCGCCGTCT
ACCCTTCTCTTCTTTCTTCTTCAAAATCTAAATTCGTCTCTGCTGGAGTTGCTCTCCCCA
ACGCCGGGAATGTTGGCCGTGTCAGAATGGCTGCTCACTGGATGCCCGGCGAGCCACGAC
CAGCTTACCTCGACGGTTCTGCTCCTGGTGACTTTGGGTTTGACCCACTCGGACTTGGAG
AGGTTCCAGATAACCTTGAGAGGTACAAAGAATCAGAGCTCATACACAATCTTGGCTATA
GAGTTTTTAGCTATTGCATTTGTTGAGCACCAGAGGAGTATGGAGAAAGACCCTGAGAAA
AAGAAGTACCCGGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCAAAGAAGTTC
GAGGAGTTAAAAGTTAAAGAGATCAAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGCGTTTGTAGGC
TTCTGTGTGCAACAATCTGCCTATCCAGGCACAGGACCATTGGAGAACCTGGCTACTCAC
TTGGCGGATCCATGGCACAAAAACATTGGCGATGTTGTTATCCCTTTCAACTAGTGACTT
GTAAGAAAAAAGATAGTAATATATCCTATGAGCTTTTATGTGTATCAAAACTCTGTGTAG
TGAAAGACAGATTGTGAAACCTATGTTTTGTCTCGGTGAAG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL7611Contig1 916 2 2 U
GAGATGCAAGCCCCATACTGTGATTTCTGTGGAGGGATACGACACTAGTCTGCCTGAGGA
CGATATCAAGAGTGAATTGATTAATCACTTCAAATCATGTGGCGAAGTCTTTAATGTTAT
TCTTCGCGAAGACCCAGATAGCCCTAATCTCGACAGACGTGCTTTGGTTATTCTTCTCGG
AGAAGGCGCGGAAGAGAAGGCCTTGCAACTCAATGGAACTGACATTGGTGGATGGAAGGC
TCTTGTTAAAGTTGAACCAGAGGAGGAAGAAGACGAGGAGACACAACGTTATAAATCCTT
TCTGATTGACGAACTAACGAATGACCGCAGATTTTGGTATGGCGTTACCGTAAGGGGATA
TAACACTTCCCTTCCTGCAGATGAAGTAAAGACTTGTTTGAAACACCACTTCTCTTCTTG
TGGAGATATCACCCATGTTTTTGTCTCTACTCTCGAAAAGATTACTAATATCTATTTTCA
CCAAGAAGAAGGAGAAGCTAAGGCGCTGGATCTTTCTGGAAGTGAAGTGGGAGGATTCAA
AATAGATGTTGAGCGCGTAGCTACAATCTTTACTAACTGTCCCCCTCCCTTTCCCTCTTC
CTCTCCCTCCGATGAAATTTATTACGGCTACTGTATCCCAGCTCATATGATTGAGTTTTC
CGGCGTGATCGAGGACAAGGTCGCTGCTTTTAAGAAGCAGAGGATTTCTATCTAGAAATC
TCTCTCTCTCTCTCAAGAAGCTCAATCTTTGGTGCTTAATAATTAATAAATCTTGTCAGA
TTATACAATGCAATGCAACCTTGGGGCTTTCTTATTTATGTTTAATGTCAGAGCTCATTA
TGTATGTATGATGAGCCGTTTTAGTGTGTCTGGATGATAAACGTACTCTTAATAATTTCC
TTTTATTATTAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD17TF U 1
AF RR2AD17JQ C 131
BS 1 676 RR2AD17TF
BS 677 916 RR2AD17JQ

RD RR2AD17TF 676 0 0
GAGATGCAAGCCCCATACTGTGATTTCTGTGGAGGGATACGACACTAGTCTGCCTGAGGA
CGATATCAAGAGTGAATTGATTAATCACTTCAAATCATGTGGCGAAGTCTTTAATGTTAT
TCTTCGCGAAGACCCAGATAGCCCTAATCTCGACAGACGTGCTTTGGTTATTCTTCTCGG
AGAAGGCGCGGAAGAGAAGGCCTTGCAACTCAATGGAACTGACATTGGTGGATGGAAGGC
TCTTGTTAAAGTTGAACCAGAGGAGGAAGAAGACGAGGAGACACAACGTTATAAATCCTT
TCTGATTGACGAACTAACGAATGACCGCAGATTTTGGTATGGCGTTACCGTAAGGGGATA
TAACACTTCCCTTCCTGCAGATGAAGTAAAGACTTGTTTGAAACACCACTTCTCTTCTTG
TGGAGATATCACCCATGTTTTTGTCTCTACTCTCGAAAAGATTACTAATATCTATTTTCA
CCAAGAAGAAGGAGAAGCTAAGGCGCTGGATCTTTCTGGAAGTGAAGTGGGAGGATTCAA
AATAGATGTTGAGCGCGTAGCTACAATCTTTACTAACTGTCCCCCTCCCTTTCCCTCTTC
CTCTCCCTCCGATGAAATTTATTACGGCTACTGTATCCCAGCTCATATGATTGAGTTTTC
CGGCGTGATCGAGGAC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RR2AD17JQ 786 0 0
GACCCAGATAGCCCTAATCTCGACAGACGTGCTTTGGTTATTCTTCTCGGAGAAGGCGCG
GAAGAGAAGGCCTTGCAACTCAATGGAACTGACATTGGTGGATGGAAGGCTCTTGTTAAA
GTTGAACCAGAGGAGGAAGAAGACGAGGAGACACAACGTTATAAATCCTTTCTGATTGAC
GAACTAACGAATGACCGCAGATTTTGGTATGGCGTTACCGTAAGGGGATATAACACTTCC
CTTCCTGCAGATGAAGTAAAGACTTGTTTGAAACACCACTTTTCTTCTTGTGGAGATATC
ACCCATGTTTTTGTCTTTACTCTCGAAAAGATTACTAATATCTATTTTCACCAAGAAGAA
GGAGAAGCTAAGGCGCTGGATCTTTCTGGAAGTGAAGTGGGAGGATTCAAAATAGATGTT
GAGCGCGTAGCTACAATCTTTACTAACTGTCCCCCTCCCTTTCCCTCTTCCTCTCCCTCC
GATGAAATTTATTACGGCTACTGTATCCCAGCTCATATGATTGAGTTTTCCGGCGTGATC
GAGGACAAGGTCGCTGCTTTTAAGAAGCAGAGGATTTCTATCTAGAAATCTCTCTCTCTC
TCTCAAGAAGCTCAATCTTTGGTGCTTAATAATTAATAAATCTTGTCAGATTATACAATG
CAATGCAACCTTGGGGCTTTCTTATTTATGTTTAATGTCAGAGCTCATTATGTATGTATG
ATGAGCCGTTTTAGTGTGTCTGGATGATAAACGTACTCTTAATAATTTCCTTTTATTATT
AGCTCC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL7612Contig1 583 2 1 U
GGACACAATAACTCAATTTTAAAAATAAAATAAATATTAAATCGATGATAGAGTCGGTGA
AAAAAACACAACAGGAGGCCTCTGCAGCGCTTCTCTCGCGTGCACTCCAAATGTGCCGAG
CCAAACAGATACGTTCTGAAAGTCTGGTATTTGAAGGCGGAGCAAAGGAGATGATTTGCC
AGGCGGTGGAGCAAATGCACGTTGATCTTCTCGTTGTGGGCAGTCGTGGACTTGGCAAGA
TCAGAAGAGCGTTTATTGGGAGTGTTAGCGACTACTGTGCTCATCACGCCAACTGCCCCA
TCCTTATTGTGAAGCCACCAAAGGAGATGACTAGTTAAAGCATCAAGTTCTTCATGTTTG
AGTATTCTTATGAAGAGTGTGTGGTGTCGTTTGTATGTATGCGTGTGTGTAAGAAGACAT
TTAACTTGGATGGATCATAAACAATTCAAGATGTACGAAGAGTAACCTGGAGTCCAATAA
TGAAGCGATAAAACTCGGTACTAGTTTGTCGCTTGTGTGTGCACCTATTATTGTATTTTT
CCTTGTAATCATATTGCTGAACATTTCCAGATCATAATTACCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C895JQ C 1
AF RR2C895TF U 1
BS 1 583 RR2C895TF

RD RR2C895JQ 583 0 0
GGACACAATAACTCAATTTTAAAAATAAAATAAATATTAAATCGATGATAGAGTCGGTGA
AAAAAACACAACAGGAGGCCTCTGCAGCGCTTCTCTCGCGTGCACTCCAAATGTGCCGAG
CCAAACAGATACGTTTTGAAAGTCTGGTATTTGAAGGCGGAGCAAAGGAGATGATTTGCC
AGGCGGTGGAGCAAATGCACGTTGATCTTCTCGTTGTGGGCAGTCGTGGACTTGGCAAGA
TCAGAAGAGCGTTTATTGGGAGTGTTAGCGACTACTGTGCTCATCACGCCAACTGCCCCA
TCCTTATTGTGAAGCCACCAAAGGAGATGACTAGTTAAAGCATCAAGTTCTTCATGTTTG
AGTATTCTTATGAAGAGTGTGTGGTGTCGTTTGTATGTATGCGTGTGTGTAAGAAGACAT
TTAACTTGGATGGATCATAAACAATTCAAGATGTACGAAGAGTAACCTGGAGTCCAATAA
TGAAGCGATAAAACTCGGTACTAGTTTGTCGCTTGTGTGTGCACCTATTATTGTATTTTT
CCTTGTAATCATATTGCTGAACATTTCCAGATCATAATTACCG

QA 1 583 1 583
DS 

RD RR2C895TF 583 0 0
GGACACAATAACTCAATTTTAAAAATAAAATAAATATTAAATCGATGATAGAGTCGGTGA
AAAAAACACAACAGGAGGCCTCTGCAGCGCTTCTCTCGCGTGCACTCCAAATGTGCCGAG
CCAAACAGATACGTTCTGAAAGTCTGGTATTTGAAGGCGGAGCAAAGGAGATGATTTGCC
AGGCGGTGGAGCAAATGCACGTTGATCTTCTCGTTGTGGGCAGTCGTGGACTTGGCAAGA
TCAGAAGAGCGTTTATTGGGAGTGTTAGCGACTACTGTGCTCATCACGCCAACTGCCCCA
TCCTTATTGTGAAGCCACCAAAGGAGATGACTAGTTAAAGCATCAAGTTCTTCATGTTTG
AGTATTCTTATGAAGAGTGTGTGGTGTCGTTTGTATGTATGCGTGTGTGTAAGAAGACAT
TTAACTTGGATGGATCATAAACAATTCAAGATGTACGAAGAGTAACCTGGAGTCCAATAA
TGAAGCGATAAAACTCGGTACTAGTTTGTCGCTTGTGTGTGCACCTATTATTGTATTTTT
CCTTGTAATCATATTGCTGAACATTTCCAGATCATAATTACCG

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL7613Contig1 751 2 7 U
ACTGTAAATACTGAAACTGTTATTACCAGGAAATATGTCACAGTGAAATCAACAAAAACA
ACTTGCACATGTCCAAAGAATGACAGAAATTAACAAAAGCCACCAGATTGATATAAAGAC
AAACCAAGAGAGTATATGTACCACAGTTTCTGAGTTAAGAGAGGATTCGATTCACACGTG
AACCAAGTCCTGAGAGTGAACCACCACCTCATCAAGATGGTAATCCATCACATCAAACAA
GGCTTCCATGAATGCAGCCTCGCTTGTCCCTGGAAGCACCGCTTCTTGAGCTTCCTCTAC
CATCTCCTCCACTAAACATTTCTTGGTCAGAGTTTCTCTGCACATCATGTTTCCAATCTC
AAATGCTGTCAACCCTCTTTCTGCTCCTTTCTTCAGTAGCATCGTTGAAATTCTGAGTGT
TCAAGCCGTTTCCAGTGGCATCTTCCATCCATGGAACTTGAGGAGGCTGATATCTTCCTC
TGCGTCCAGTGATCTTATGTAGTCCAGTGTCTCGGAAGAATATGGTTTCCGAGCTTGCGA
CCAGTAAAGCCACTCGAACGTGCAATCCTCAAAGCTTTCAGGCAAGCTGTATCCATGATC
AATTGGAATCAGAACAATCTTTCCGTTCTCCTCCTTTCTCATTAAAATGTTTCCACCATG
CCTATCAGCGTTGGCCAGTCTAATATCCAGGACAGATATCTTGTGAACTTCCTCTACCGG
AAATGAAGCTGGACCCATATCCTCACAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CJ58JQ U 7
AF RR2H877JQ U 1
BS 1 115 RR2H877JQ
BS 116 116 RR2CJ58JQ
BS 117 422 RR2H877JQ
BS 423 423 RR2CJ58JQ
BS 424 519 RR2H877JQ
BS 520 520 RR2CJ58JQ
BS 521 751 RR2H877JQ

RD RR2CJ58JQ 602 0 0
AAC
ACTGAAACTGTTATTACCAGGAAATATGTCACAGTGAAATCAACAAAAACAACTTGCACA
TGTCCAAAGAATGACAGAAATTAACAAAAGCCACCAGATTGATATAAAGACAAACCAAGA
GAGTATATGTACCACAGTTTCTGAGTTAAGAGAGGATTCGATTCACACGTGAACCAAGTC
CTGAGAGTGAACCACCACCTCATCAAGATGGTAATCCATCACATCAAACAAGGCTTCCAT
GAATGCAGCCTCGCTTGTCCCTGGAAGCACCGCTTCTTGAGCTTCCTCTACCATCTCCTC
CACTAGACATTTCTTGGTCAGAGTTTCTCTGCACATCATGTTTCCAATCTCAAATGCTGT
CAACCCTCTTTCTGCTCCTTTCTTCAGTAGCATCGTTGAGATTCTGAGTGTTCAAGCCGT
TTCCAGTGGCATCTTCCATCCATGGAACTTGAGGAGGCTGATATCTTCCTCTGCGTCCAG
TGATCTTATGTAGTCCAGTGTCTCGGAAGAATATGGTTTCCGAGCTTGCGACCAGTAAAG
CCACTCGAACGTGCAATCCTCAAAGCTTTCAGGCAAGCTGTATCCATGATCAATTGGAA

QA 4 602 4 602
DS 

RD RR2H877JQ 751 0 0
ACTGTAAATACTGAAACTGTTATTACCAGGAAATATGTCACAGTGAAATCAACAAAAACA
ACTTGCACATGTCCAAAGAATGACAGAAATTAACAAAAGCCACCAGATTGATATAGAGAC
AAACCAAGAGAGTATATGTACCACAGTTTCTGAGTTAAGAGAGGATTCGATTCACACGTG
AACCAAGTCCTGAGAGTGAACCACCACCTCATCAAGATGGTAATCCATCACATCAAACAA
GGCTTCCATGAATGCAGCCTCGCTTGTCCCTGGAAGCACCGCTTCTTGAGCTTCCTCTAC
CATCTCCTCCACTAAACATTTCTTGGTCAGAGTTTCTCTGCACATCATGTTTCCAATCTC
AAATGCTGTCAACCCTCTTTCTGCTCCTTTCTTCAGTAGCATCGTTGAAATTCTGAGTGT
TCGAGCCGTTTCCAGTGGCATCTTCCATCCATGGAACTTGAGGAGGCTGATATCTTCCTC
TGCGTCCAGTGATCTTATGTAGTCCAGTGTCTCGGAAGAGTATGGTTTCCGAGCTTGCGA
CCAGTAAAGCCACTCGAACGTGCAATCCTCAAAGCTTTCAGGCAAGCTGTATCCATGATC
AATTGGAATCAGAACAATCTTTCCGTTCTCCTCCTTTCTCATTAAAATGTTTCCACCATG
CCTATCAGCGTTGGCCAGTCTAATATCCAGGACAGATATCTTGTGAACTTCCTCTACCGG
AAATGAAGCTGGACCCATATCCTCACAACTG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL7614Contig1 675 2 2 U
AGGCATTGGGATTGATTTTAAGATAAGAACTATTGAGCTTGATGGCAAACGCATCAAGCT
CCAGATTGGGATACTGCTGGTCAAGAACGTTTTCGAACCATCACCACTGCTTATTACAGA
GGGGCAATGGGCATTTTGCTGGTGTATGATGTCACAGACGAGTCATCCTTCAACAACATT
AGGAACTGGATTCGTAACATCGAGCAGCACGCTTCCGATAATGTCAACAAGATCTTGGTA
GGGAACAAAGCCGATATGGACGAGAGCAAGAGGGCCGTACCAAAAGCAAAGGGTCAAGCA
CTTGCTGATGAATACGGAATCAAGTTCTTTGAAACAAGTGCCAAAACAAATCTAAATGTG
GAAGAAGTTTTCTTCTCGATAGCAAAGGACATTAAGCAGAGACTCGCAGATACTGACTCC
AGGGCAGAGCCTTCGACGATTAGGATCAGCCAAACAGACCAGGCTGCTGGAGCCGGACAG
GCTACGCAGAAGTCTGCTTGCTGTGGAACTTAAAAAAGTCCCAAAAAAATTTTGAAGGTG
AAAAAGAAAAACTGATTGTTCTTGGCTGCGTTTGTAGTTCTTTTTTACTTTTGATGATGA
TTTGGTTTTAAGTTCATTCTTAGCTTGTTATGATGGTAATATAATCTTGAAGAAATCGTT
CATTCTCAGATAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E360TF U 1
AF RR2E360JQ C 44
BS 1 621 RR2E360TF
BS 622 675 RR2E360JQ

RD RR2E360TF 621 0 0
AGGCATTGGGATTGATTTTAAGATAAGAACTATTGAGCTTGATGGCAAACGCATCAAGCT
CCAGATTGGGATACTGCTGGTCAAGAACGTTTTCGAACCATCACCACTGCTTATTACAGA
GGGGCAATGGGCATTTTGCTGGTGTATGATGTCACAGACGAGTCATCCTTCAACAACATT
AGGAACTGGATTCGTAACATCGAGCAGCACGCTTCCGATAATGTCAACAAGATCTTGGTA
GGGAACAAAGCCGATATGGACGAGAGCAAGAGGGCCGTACCAAAAGCAAAGGGTCAAGCA
CTTGCTGATGAATACGGAATCAAGTTCTTTGAAACAAGTGCCAAAACAAATCTAAATGTG
GAAGAAGTTTTCTTCTCGATAGCAAAGGACATTAAGCAGAGACTCGCAGATACTGACTCC
AGGGCAGAGCCTTCGACGATTAGGATCAGCCAAACAGACCAGGCTGCTGGAGCCGGACAG
GCTACGCAGAAGTCTGCTTGCTGTGGAACTTAAAAAAGTCCCAAAAAAATTTTGAAGGTG
AAAAAGAAAAACTGATTGTTCTTGGCTGCGTTTGTAGTTCTTTTTTACTTTTGATGATGA
TTTGGTTTTAAGTTCATTCTT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2E360JQ 632 0 0
GGCAAACGCATCAAGCTCCAGATTGGGATACTGCTGGTCAAGAACGTTTTCGAACCATCA
CCACTGCTTATTACAGAGGGGCAATGGGCATTTTGCTGGTGTATGATGTCACAGACGAGT
CATCCTTCAACAACATTAGGAACTGGATTCGTAACATCGAGCAGCACGCTTCCGATAATG
TCAACAAGATCTTGGTAGGGAACAAAGCCGATATGGACGAGAGCAAGAGGGCCGTACCAA
AAGCAAAGGGTCAAGCACTTGCTGATGAATACGGAATCAAGTTCTTTGAAACAAGTGCCA
AAACAAATCTAAATGTGGAAGAAGTTTTCTTCTCGATAGCAAAGGACATTAAGCAGAGAC
TCGCAGATACTGACTCCAGGGCAGAGCCTTCGACGATTAGGATCAGCCAAACAGACCAGG
CTGCTGGAGCCGGACAGGCTACGCAGAAGTCTGCTTGCTGTGGAACTTAAAAAAGTCCCA
AAAAAATTTTGAAGGTGAAAAAGAAAAACTGATTGTTCTTGGCTGCGTTTGTAGTTCTTT
TTTACTTTTGATGATGATTTGGTTTTAAGTTCATTCTTAGCTTGTTATGATGGTAATATA
ATCTTGAAGAAATCGTTCATTCTCAGATAGAT

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL7615Contig1 578 2 1 U
GGAAAGAAGATAAATTCCCAAGAGCATAGAGGTTGAACACACTATGGGAAGAAGTAGTTC
ACTAGAAAGTCCAAACAAATGTATATTTGGAGGCTGAAGATCAAATATATGGGAAGTGAG
TTTTATATACTGGGTTCGAAGTTATTCAATAACAACACCGAATACATACAAGAAGAAAAG
AGAGGGAAGATGAATTTCAGGAGACCGAGGTTGGGTTTTTCAAGTAAAAGAAAAATGACT
TCTCTGATTACAAGTGTCTTGGGATGCAAGAAAACACTTGCAGGTGAAAACAGAGGAAGG
CGAGATGATTCTGCAGAAGAGACTACTGAAGCTGACGAGACCATGGCTGCTGGTAAAGCT
AAACCCACTTCAGAAAAAGGATAGTTTTTTTTCTGGAAAGCGCAGGAGTTCGACTCAAGA
ACTCATCTCAGTGCATAGATTGAAGACGACGCTTGAGATGTATAGGGACCGTTGATCGGT
TCATGCTGTTATTGATTGTGGCGAGGTATCAATTTCTCGCCCAGAGACATTCACTAAATA
GTCATATGGTCTTATTATACAAACTTTATTTCTTACCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BH17JQ C 1
AF RR2BH17TF U 1
BS 1 578 RR2BH17TF

RD RR2BH17JQ 578 0 0
GGAAAGAAGATAAATTCCCAAGAGCATAGAGGTTGAACACACTATGGGAAGAAGTAGTTC
ACTAGAAAGTCCAAACAAATGTATATTTGGAGGCTGAAGATCAAATATATGGGAAGTGAG
TTTTATATACTGGGTTCGAAGTTATTCAATAACAACACCGAATACATACAAGAAGAAAAG
AGAGGGAAGATGAATTTCAGGAGACCGAGGTTGGGTTTTTCAAGTAAAAGAAAAATGACT
TCTCTGATTACAAGTGTCTTGGGATGCAAGAAAACACTTGCAGGTGAAAACAGAGGAAGG
CGAGATGATTCTGCAGAAGAGACTACTGAAGCTGACGAGACCATGGCTGCTGGTAAAGCT
AAACCCACTTCAGAAAAAGGATAGTTTTTTTTCTGGAAAGCGCAGGAGTTCGACTCAAGA
ACTCATCTCAGTGCATAGATTGAAGACGACGCTTGAGATGTATAGGGACCGTTGATCGGT
TCATGCTGTTATTGATTGTGGCGAGGTATCAATTTCTCGCCCAGAGACATTCACTAAATA
GTCATATGGTCTTATTATACAAACTTTATTTCTTACCG

QA 1 578 1 578
DS 

RD RR2BH17TF 578 0 0
GGAAAGAAGATAAATTCCCAAGAGCATAGAGGTTGAACACACTATGGGAAGAAGTAGTTC
ACTAGAAAGTCCAAACAAATGTATATTTGGAGGCTGAAGATCAAATATATGGGAAGTGAG
TTTTATATACTGGGTTCGAAGTTATTCAATAACAACACCGAATACATACAAGAAGAAAAG
AGAGGGAAGATGAATTTCAGGAGACCGAGGTTGGGTTTTTCAAGTAAAAGAAAAATGACT
TCTCTGATTACAAGTGTCTTGGGATGCAAGAAAACACTTGCAGGTGAAAACAGAGGAAGG
CGAGATGATTCTGCAGAAGAGACTACTGAAGCTGACGAGACCATGGCTGCTGGTAAAGCT
AAACCCACTTCAGAAAAAGGATAGTTTTTTTTCTGGAAAGCGCAGGAGTTCGACTCAAGA
ACTCATCTCAGTGCATAGATTGAAGACGACGCTTGAGATGTATAGGGACCGTTGATCGGT
TCATGCTGTTATTGATTGTGGCGAGGTATCAATTTCTCGCCCAGAGACATTCACTAAATA
GTCATATGGTCTTATTATACAAACTTTATTTCTTACCG

QA 1 578 1 578
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7617Contig1 749 2 2 U
GTACTGGACTCAAGGCGGTACACTCCGTGACGTCCCTGTCGGCGGTGGAATTCGCCGGAG
CTCTTCCAAACGCAACCGCTCTTTCTCCTCCAACGCCACTTCTGCATCCTCCTCTTCCTG
CTCTTCTTCCATCATTACGACGGCCAACGGTTCATAACCAATGAACCAAGGAACCGTCAC
AAACGAAGCAAAGGGTGGTAATGAGATCTCAGGTTACGGAAGCTTTGCGTCTCTGTTAAG
TGGGCAGAGCGACGGAGCAGGGTTTCTGGCGTTGGGAAACGGAAGTGGAAGCGGTGGGTT
AGATTATGGGTTCGGGTACGGATACGGGTTGGAGGAGATGAGTATTGGGTATCTTGGAGG
AGGCTCTGGAGGAGAGATACCGGTGGTGGGTGGTAGTGACACGTGGCAGATTGGGGAGAT
GGAAGGTAAAAGTGGGGACAGTTTATGGCCTGGTCTCGAGATCTCCATGCAAAGCAACGG
TGCTAAGTGAAAAAACCGTTTATGACTCTTGTCTTCTTCTTCCTCTGTTTCTGTCTTTTG
TTTGTTTCCTTTTGGAAATTTCTGTTTGTGTTTTTTATTATTTCCTAGTGGGATAGAGAG
AGACCAAAGAAGCAAATTAAACAGGAATGAAAAAAAAAAAATAGGAGGAAGGTTTAATGT
CTTTTTTCTTCTTTGAGGTCTTACAATGGCGGTTTGTAAATCCTCTGTTGATGAACATAT
TGGAATGCATTTCAAGTAGGAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CW14TF U 1
AF RR2CW14JQ C 118
BS 1 629 RR2CW14TF
BS 630 749 RR2CW14JQ

RD RR2CW14TF 629 0 0
GTACTGGACTCAAGGCGGTACACTCCGTGACGTCCCTGTCGGCGGTGGAATTCGCCGGAG
CTCTTCCAAACGCAACCGCTCTTTCTCCTCCAACGCCACTTCTGCATCCTCCTCTTCCTG
CTCTTCTTCCATCATTACGACGGCCAACGGTTCATAACCAATGAACCAAGGAACCGTCAC
AAACGAAGCAAAGGGTGGTAATGAGATCTCAGGTTACGGAAGCTTTGCGTCTCTGTTAAG
TGGGCAGAGCGACGGAGCAGGGTTTCTGGCGTTGGGAAACGGAAGTGGAAGCGGTGGGTT
AGATTATGGGTTCGGGTACGGATACGGGTTGGAGGAGATGAGTATTGGGTATCTTGGAGG
AGGCTCTGGAGGAGAGATACCGGTGGTGGGTGGTAGTGACACGTGGCAGATTGGGGAGAT
GGAAGGTAAAAGTGGGGACAGTTTATGGCCTGGTCTCGAGATCTCCATGCAAAGCAACGG
TGCTAAGTGAAAAAACCGTTTATGACTCTTGTCTTCTTCTTCCTCTGTTTCTGTCTTTTG
TTTGTTTCCTTTTGGAAATTTCTGTTTGTGTTTTTTATTATTTCCTAGTGGGATAGAGAG
AGACCAAAGAAGCAAATTAAACAGGAATG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RR2CW14JQ 632 0 0
CTGCTCTTCTTCCATCATTACGACGGCCAACGGTTCATAACCAATGAACCAAGGAACCGT
CACAAACGAAGCAAAGGGTGGTAATGAGATCTCAGGTTACGGAAGCTTTGCGTCTCTGTT
AAGTGGGCAGAGCGACGGAGCAGGGTTTCTGGCGTTGGGAAACGGAAGTGGAAGCGGTGG
GTTAGATTATGGGTTCGGGTACGGATACGGGTTGGAGGAGATGAGTATTGGGTATCTTGG
AGGAGGCTCTGGAGGAGAGATACCGGTGGTGGGTGGTAGTGACACGTGGCAGATTGGGGA
GATGGAAGGTAAAAGTGGGGACAGTTTATGGCCTGGTCTCGAGATCTCCATGCAAAGCAA
CGGTGCTAAGTGAAAAAACCGTTTATGACTCTTGTCTTCTTCTTCCTCTGTTTCTGTCTT
TTGTTTGTTTCCTTTTGGAAATTTCTGTTTGTGTTTTTTATTATTTCCTAGTGGGATAGA
GAGAGACCAAAGAAGCAAATTAAACAGGAATGAAAAAAAAAAAATAGGAGGAAGGTTTAA
TGTCTTTTTTCTTCTTTGAGGTCTTACAATGGCGGTTTGTAAATCCTCTGTTGATGAACA
TATTGGAATGCATTTCAAGTAGGAAAAAAAAA

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL7618Contig1 608 2 1 U
GGGGGGTCATCGAAGCAAATCCTTCTTCGTCTTCCGATACCATATCCAGTTGGAGAATAT
CTCTCAAGGAGTCCTAAAAAAACCAAGTCGTTGTCTTTCTTGTGACGACTCATAAGCTAC
AAACCACCCCACGTAAACAAAAAGAAATGAGCTTTGCGTGCCTTGTGTGCCACAGTGTAG
AGAGCCCGTCACACTCGCTTAGAAGCTACTCTGTTTCTAGCTCAGACAATGAAGGAAGAT
GCTCCGTGATTGCGAGCTGCCTCTCAAGGACATCACTCATTCAAGCTGCAAGATCCAACA
CTTTCCCTGCTTCCTCATCATCCTCCTCAAAGGTAACCCCACAACCAAATTTCCAAGGAG
GTGATCTGATGATAACAGAAGGAGCCTCGCCAAGGCTAGTGCGGAGCCGTGCAGTGAGAA
GAGACATTGTCAGAGACTGGAACTTCGACGAAACCGTGACTGAGCTTTAATAAAAGATTG
AAATCTCACTCTCTTCTCTCTATAGATTAGTATTACCATGAATGTTCAACCTCAGGAGAT
CTTTTGTATTCATCACTTGTCAGGTTTTGTATTTTGCTCACTGCTTTATAAACTAATAAT
CTAACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B219TF U 1
AF RR2B219JQ C 31
BS 1 608 RR2B219TF

RD RR2B219TF 608 0 0
GGGGGGTCATCGAAGCAAATCCTTCTTCGTCTTCCGATACCATATCCAGTTGGAGAATAT
CTCTCAAGGAGTCCTAAAAAAACCAAGTCGTTGTCTTTCTTGTGACGACTCATAAGCTAC
AAACCACCCCACGTAAACAAAAAGAAATGAGCTTTGCGTGCCTTGTGTGCCACAGTGTAG
AGAGCCCGTCACACTCGCTTAGAAGCTACTCTGTTTCTAGCTCAGACAATGAAGGAAGAT
GCTCCGTGATTGCGAGCTGCCTCTCAAGGACATCACTCATTCAAGCTGCAAGATCCAACA
CTTTCCCTGCTTCCTCATCATCCTCCTCAAAGGTAACCCCACAACCAAATTTCCAAGGAG
GTGATCTGATGATAACAGAAGGAGCCTCGCCAAGGCTAGTGCGGAGCCGTGCAGTGAGAA
GAGACATTGTCAGAGACTGGAACTTCGACGAAACCGTGACTGAGCTTTAATAAAAGATTG
AAATCTCACTCTCTTCTCTCTATAGATTAGTATTACCATGAATGTTCAACCTCAGGAGAT
CTTTTGTATTCATCACTTGTCAGGTTTTGTATTTTGCTCACTGCTTTATAAACTAATAAT
CTAACATT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2B219JQ 578 0 0
CTTCCGATACCATATCCAGTTGGAGAATATCTCTCAAGGAGTCCTAAAAAAACCAAGTCG
TTGTCTTTCTTGTGACGACTCATAAGCTACAAACCACCCCACGTAAACAAAAAGAAATGA
GCTTTGCGTGCCTTGTGTGCCACAGTGTAGAGAGCCCGTCACACTCGCTTAGAAGCTACT
CTGTTTCTAGCTCAGACAATGAAGGAAGATGCTCCGTGATTGCGAGCTGCCTCTCAAGGA
CATCACTCATTCAAGCTGCAAGATCCAACACTTTCCCTGCTTCCTCATCATCCTCCTCAA
AGGTAACCCCACAACCAAATTTCCAAGGAGGTGATCTGATGATAACAGAAGGAGCCTCGC
CAAGGCTAGTGCGGAGCCGTGCAGTGAGAAGAGACATTGTCAGAGACTGGAACTTCGACG
AAACCGTGACTGAGCTTTAATAAAAGATTGAAATCTCACTCTCTTCTCTCTATAGATTAG
TATTACCATGAATGTTCAACCTCAGGAGATCTTTTGTATTCATCACTTGTCAGGTTTTGT
ATTTTGCTCACTGCTTTATAAACTAATAATCTAACATT

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL7619Contig1 746 2 2 U
TTTGATCGAATTCTGATTTTTATATGAATATCACCTTGTATATTAAATGTTACCTGATCA
CACTTTTCATTAATATTATTGACGCTTAATCATTCACTAAATTCCACCACTAGCTTCCCT
TTTTCTAAAAAATAACAAGATATATGGAATGAGAACAACATGAATAACCTTTTCAACATT
TTTGTGACAGAGCCTGTGTCATCTCACTCTTTTCGACATCTCTTGGGACCAAACCCCAAT
CAATGTCGCCATTAAAATCCATACCATATCTCTCTGTTAAAGGACTACCCTCTGGAATTT
TTCACTTGGTATCAATGCATCTCTGCAATCATGTTTCATCGTCAAAATCATCAGCCACTG
AGTTCTCTTGGCAGATAAATGTGTTATCCTCAACACGATTTGAAACAACAGGCTCCCACA
TCGTTGTCTCATTACCCTGCGCAGTGTTCTCAACATCTTGCTCCTCCTCTGCAGCTTGTT
CAGCCCCATTACAAAGTTGGTCTGCTGCTCCTTGATCCCAGTCTACACCAGCAGGCTCGA
CAGTCTTCTTTTCTGAACCCATCTCATTTCCGGTTTGCTCTTCATCCCCATTAAACGCTA
CAGTAACAGCTTCTTGTTCCTCTGTTTGCTCTGCTGCTTCCTTCTTCGGCCTCTTCCATT
TCTTAGTGGATGAAGTACCATCATCTTCAAAATCTTCTTCTTCTCTGTCTCTGTGTAGAT
ACACCCACAGCTTCCTATCAGAATCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FI10TF C 1
AF RR2FI10JQ U 4
BS 1 3 RR2FI10TF
BS 4 746 RR2FI10JQ

RD RR2FI10TF 746 0 0
TTTGATCGAATTCTGATTTT*ATATGAATATCAC*TTGTATATTAAATGTTAC*TGATCA
CACTTTTCATTAATATTATTGACGCTTAATCATTCACTAAATTCCACCACTAGCTTCCCT
TTTTCTAAAAAATAACAAGATATATGGAATGAGAACAACATGAATAACCTTTTCAACATT
TTTGTGACAGAGCCTGTGTCATCTCACTCTTTTCGACATCTCTTGGGACCAAACCCCAAT
CAATGTCGCCATTAAAATCCATACCATATCTCTCTGTTAAAGGACTACCCTCTGGAATTT
TTCACTTGGTATCAATGCATCTCTGCAATCATGTTTCATCGTCAAAATCATCAGCCACTG
AGTTCTCTTGGCAGATAAATGTGTTATCCTCAACACGATTTGAAACAACAGGCTCCCACA
TCGTTGTCTCATTACCCTGCGCAGTGTTCTCAACATCTTGCTCCTCCTCTGCAGCTTGTT
CAGCCCCATTACAAAGTTGGTCTGCTGCTCCTTGATCCCAGTCTACACCAGCAGGCTCGA
CAGTCTTCTTTTCTGAACCCATCTCATTTCCGGTTTGCTCTTCATCCCCATTAAACGCTA
CAGTAACAGCTTCTTGTTCCTCTGTTTGCTCTGCTGCTTCCTTCTTCGGCCTCTTCCATT
TCTTAGTGGATGAAGTACCATCATCTTCAAAATCTTCTTCTTCTCTGTCTCTGTGTAGAT
ACACCCACAGCTTCCTATCAGAATCC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2FI10JQ 743 0 0
GATCGAATTCTGATTTTTATATGAATATCACCTTGTATATTAAATGTTACCTGATCACAC
TTTTCATTAATATTATTGACGCTTAATCATTCACTAAATTCCACCACTAGCTTCCCTTTT
TCTAAAAAATAACAAGATATATGGAATGAGAACAACATGAATAACCTTTTCAACATTTTT
GTGACAGAGCCTGTGTCATCTCACTCTTTTCGACATCTCTTGGGACCAAACCCCAATCAA
TGTCGCCATTAAAATCCATACCATATCTCTCTGTTAAAGGACTACCCTCTGGAATTTTTC
ACTTGGTATCAATGCATCTCTGCAATCATGTTTCATCGTCAAAATCATCAGCCACTGAGT
TCTCTTGGCAGATAAATGTGTTATCCTCAACACGATTTGAAACAACAGGCTCCCACATCG
TTGTCTCATTACCCTGCGCAGTGTTCTCAACATCTTGCTCCTCCTCTGCAGCTTGTTCAG
CCCCATTACAAAGTTGGTCTGCTGCTCCTTGATCCCAGTCTACACCAGCAGGCTCGACAG
TCTTCTTTTCTGAACCCATCTCATTTCCGGTTTGCTCTTCATCCCCATTAAACGCTACAG
TAACAGCTTCTTGTTCCTCTGTTTGCTCTGCTGCTTCCTTCTTCGGCCTCTTCCATTTCT
TAGTGGATGAAGTACCATCATCTTCAAAATCTTCTTCTTCTCTGTCTCTGTGTAGATACA
CCCACAGCTTCCTATCAGAATCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL7620Contig1 761 2 16 U
GCTTTCGATGCAGTGCACGGTAAGGAGTTGTGGTCGTTCGCAAAGGACAATCCGCGCCAC
AGTGAACTCTTTAATGAGGGCATGGCTTGTGAAGCAAGGCGCGTGGTGCCACTTGTAGCC
AGAGCTTGTCACGGCTTATTTGACGGCGTGGCTACGGTGGTGGACGTAGGAGGTGGTACC
GGAGAGACGATGGAGATATTAGTTAAGGAATTTCCTTGGATCAAAGGAATTAACTTTGAT
CTTCCTCATGTTGTTGAAGTTGTTCAAGTCTTGGATAATGTTGAGAATGTTGGAGGAGAT
ATGTTTGATTCCATTCCTGCATGCGACGCTGTTTTCATCAAGTCTGTGTTACACGATTGG
GGAGACGAAGACTGCATAAAAATATTGAAGAACTGTAAAGAAGCGCTCCCACCAAAAACT
GGAAAAGTATTAATAGTGGAACCTGTAGTCGGAAAAAAGAAAAAAACGATGATAATAGAA
GAAAGAGATGAGAAATTAGAGTATGTGAGATTGGCACTTGATATGATAATGATGGTTCAC
ACAGGCTCAGGTAAGGAAAGAACTCTGAAAGAGTGGGACTTTATCATTAAAGAAGCTGGC
TTTGCTCGATATGAGGTTAGGGATATCGATGATGTTCAGTGGGTTATCATTGCGTATCCC
TCTTAAAAGAAGGAGATAAAGAGTCAAATGCAAGCTGAGGAAGGGCTCAACAACAAAAGC
ATTTGAGCATCTCAAGATATTTGTGAAAATTGTTCTGTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H516TF U 1
AF RR2BU31TF U 54
BS 1 453 RR2H516TF
BS 454 454 RR2BU31TF
BS 455 476 RR2H516TF
BS 477 477 RR2BU31TF
BS 478 482 RR2H516TF
BS 483 483 RR2BU31TF
BS 484 560 RR2H516TF
BS 561 561 RR2BU31TF
BS 562 619 RR2H516TF
BS 620 620 RR2BU31TF
BS 621 667 RR2H516TF
BS 668 668 RR2BU31TF
BS 669 672 RR2H516TF
BS 673 673 RR2BU31TF
BS 674 692 RR2H516TF
BS 693 761 RR2BU31TF

RD RR2H516TF 694 0 0
GCTTTCGATGCAGTGCACGGTAAGGAGTTGTGGTCGTTCGCAAAGGACAATCCGCGCCAC
AGTGAACTCTTTAATGAGGGCATGGCTTGTGAAGCAAGGCGCGTGGTGCCACTTGTAGCC
AGAGCTTGTCACGGCTTATTTGACGGCGTGGCTACGGTGGTGGACGTAGGAGGTGGTACC
GGAGAGACGATGGAGATATTAGTTAAGGAATTTCCTTGGATCAAAGGAATTAACTTTGAT
CTTCCTCATGTTGTTGAAGTTGTTCAAGTCTTGGATAATGTTGAGAATGTTGGAGGAGAT
ATGTTTGATTCCATTCCTGCATGCGACGCTGTTTTCATCAAGTCTGTGTTACACGATTGG
GGAGACGAAGACTGCATAAAAATATTGAAGAACTGTAAAGAAGCGCTCCCACCAAAAACT
GGAAAAGTATTAATAGTGGAACCTGTAGTCGGAGAAAAGAAAAAAACGATGATAATGGAA
GAGAGAGATGAGAAATTAGAGTATGTGAGATTGGCACTTGATATGATAATGATGGTTCAC
ACAGGCTCAGGTAAGGAAAGGACTCTGAAAGAGTGGGACTTTATCATTAAAGAAGCTGGC
TTTGCTCGATATGAGGTTATGGATATCGATGATGTTCAGTGGGTTATCATTGCGTATCCC
TCTTAAA*GAAG*AGATAAAGAGTCAAATGCA
GC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2BU31TF 708 0 0
GCGCCACAGTGAACTGTTTAATGAGGGCATGGCTTGTGAAGCAAGGCGCGTGGTGCCACT
TGTAGCCAGAGCTTGTCACGGCTTATTTGACGGCGTGGCTACGGTGGTGGACGTAGGAGG
TGGTACCGGGGAGACGATGGAGATATTAGTTAAGGAGTTTCCTTGGATCAAAGGAATTAA
CTTTGATCTTCCTCATGTTGTTGAAGTTGTTCAAGTCTTGGATAATGTTGAGAATGTTGG
TGGAGATATGTTTGATTCCATTCCTGCATGCGACGCTGTTTTCATCAAGTCTGTGTTACA
CGATTGGGGAGACGAAGACTGCATAAAAATATTGAAGAACTGTAAAGAAGCGCTCCCACC
AAAAACTGGAAAAGTATTAATAGTGGAGCCTGTAGTCGGAAAAAAGAAAAAAACGATGAT
AATAGAAGAAAGAGATGAGAAATTAGAGTATGTGAGATTGGCACTTGATATGATAATGAT
GGTTCACACAGGCTCAGGTAAGGAAAGAACTCTGAAAGAGTGGGACTTTGTCATTAAAGA
AGCTGGCTTTGCTCGGTATGAGGTTAGGGATATCGATGATGTTCAGTGGGTTATCATTGC
GTATCCCTCTTAAAAGAAGGAGTTAAAGAGTCAAATGCAAGCTGAGGAAGGGCTCAACAA
CAAAAGCATTTGAGCATCTCAAGATATTTGTGAAAATTGTTCTGTGAA

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL7621Contig1 741 2 2 U
TTTTTTTTATTTAAAAGAAGCGATGCAGATATTACATATATATCCATAAATCAGACATTT
GACAATCCGATAGAAAATGTCTCAGACAGAAATCCAAAGAGGATAAAAACAGGCAACTGG
AAGTGAAATGAGCATAGATTATTATATGAGTGTTTTAGAAAGGAAATTAAGCATCGGTGA
AGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGAAACTGATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATC
CAATGATTCTAATGAAGGCGTTAGGGTACTCCTTCTTGCACCCTTGCACTTCCTTCAATA
CTTGAGCAGAGTCAGTGCATCCGAATAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCAT
CATAGTATCCGGGCGTGCTTCCGTGCTCACGGTAGACAAATCCATGCTCCAACTCAAATT
CAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCAACGT
CACTAAGGTCAGGAAGATAAGATAAAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACA
CCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCCCGTTGCTTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTT
TGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGGATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGG
CTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAGCGGCGGAGGAGAGCATAGAGGAAGCCATTACTACTT
TTTCTCTTTTCTCTTACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EU43TF C 1
AF RR2EU43JQ U 10
BS 1 12 RR2EU43TF
BS 13 741 RR2EU43JQ

RD RR2EU43TF 741 0 0
TTTTTTTTATTTAAAAGAAGCGATGCAGATATTACATATATATCCATAAATCAGACATTT
GACAATCCGATAGAAAATGTCTCAGACAGAAATCCAAAGAGGATAAAAACAGGCAACTGG
AAGTGAAATGAGCATAGATTATTATATGAGTGTTTTAGAAAGGAAATTAAGCATCGGTGA
AGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGAAACTGATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATC
CAATGATTCTAATGAAGGCGTTAGGGTACTCCTTCTTGCACCCTTGCACTTCCTTCAATA
CTTGAGCAGAGTCAGTGCATCCGAATAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCAT
CATAGTATCCGGGCGTGCTTCCGTGCTCACGGTAGACAAATCCATGCTCCAACTCAAATT
CAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCAACGT
CACTAAGGTCAGGAAGATAAGATAAAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACA
CCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCCCGTTGCTTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTT
TGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGGATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGG
CTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAGCGGCGGAGGAGAGCATAGAGGAAGCCATTACTACTT
TTTCTCTTTTCTCTTACTTCC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2EU43JQ 732 0 0
TTA
AAAAGAAGCGATGCAGATATTACATATATATCCATAAATCAGACATTTGACAATCCGATA
GAAAATGTCTCAGACAGAAATCCAAAGAGGATAAAAACAGGCAACTGGAAGTGAAATGAG
CATAGATTATTATATGAGTGTTTTAGAAAGGAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCT
TGTAGGCGATGAAACTGATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAA
TGAAGGCGTTAGGGTACTCCTTCTTGCACCCTTGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAGAGT
CAGTGCATCCGAATAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGG
GCGTGCTTCCGTGCTCACGGTAGACAAATCCATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAA
TCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCAACGTCACTAAGGTCAG
GAAGATAAGATAAAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGC
TAACTCTTCCCCCGTTGCTTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTG
GGAATGCAGCGGATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGG
AGGTAACCACAGCGGCGGAGGAGAGCATAGAGGAAGCCATTACTACTTTTTCTCTTTTCT
CTTACTTCC

QA 4 732 4 732
DS 



AS 1 2

CO CL7622Contig1 807 2 3 U
TTAAATAAAGGTTTTAGCTCGTTTCGAACAAGAGAAATAATAACATTTTGTAATTATTAT
ATAGTTTCACAAATTGCAGAAAACGTTTCCATTTGAGAATATTAAACCGAATATTACTAA
TTCCACATAAACCAGCTCCAACAGTAATCTCTTAGCAGATGAGAACATTCTGGATCAGAC
GGAGAGTTCGGTCTTGGAGATCAAGACACCATCACTATCAGCATAAAGCCATTCACCATC
TCTAATCAAAGTCCCTCCAATATAAACCGGCACATTCTTCTCACCATGACCTTTCTTACT
AGACTTCAACGGGTTAGAACCCAACGCCCTAACCCCAACATCACAGTCATTGATCTCATC
CACATCTCTAACGCACCCATTCACCAAAATCCCTACCCACCCGTTGTTCTGAGCTAACTG
TCCGAGGTTTCCTCCAACAAGTGCGCATCTCATGCTTCCACCACCGTCTATAACTAAGAC
TGCGCCTTCTCCTTTTGTCTCAAGTTGGTTTCTGACTAGGACGTTGTCTTCAAAGACCTT
GAGTGTCACGACTGGCCCTGAGAAGCATCTTCTTTGGCCATAGATCTTGAAGATTGGTTG
GAGAGCTAGTAGGTCTCCGTTTGATATTAGTTCTGCGTTGCTGTCACACGCTTCTGCTGT
TGCAAATGCAGCCATGGGAGATTGTATTCACGCGTGTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCAA
GGAAAGAGAGAAGGGCTTCCAAAGATTCTTAAACGGCGATTGTATATACAAGTAAGTAAC
GGGTAAGATCAGCTTTCTCGTGTCAGG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RR2BF33TF C 1
AF RR2BF33JQ U 3
BS 1 2 RR2BF33TF
BS 3 803 RR2BF33JQ
BS 804 807 RR2BF33TF

RD RR2BF33TF 807 0 0
TTAAATAAAGGTTTTAGCTCGTTTCGA*CAAGAGAAATAATAACATTT*GTAATTATTAT
ATAGTTTCACAAATTGCAGAAAACGTTTCCATTTGAGAATATTAAACCGAATATTACTAA
TTCCACATAAACCAGCTCCAACAGTAATCTCTTAGCAGATGAGAACATTCTGGATCAGAC
GGAGAGTTCGGTCTTGGAGATCAAGACACCATCACTATCAGCATAAAGCCATTCACCATC
TCTAATCAAAGTCCCTCCAATATAAACCGGCACATTCTTCTCACCATGACCTTTCTTACT
AGACTTCAACGGGTTAGAACCCAACGCCCTAACCCCAACATCACAGTCATTGATCTCATC
CACATCTCTAACGCACCCATTCACCAAAATCCCTACCCACCCGTTGTTCTGAGCTAACTG
TCCGAGGTTTCCTCCAACAAGTGCGCATCTCATGCTTCCACCACCGTCTATAACTAAGAC
TGCGCCTTCTCCTTTTGTCTCAAGTTGGTTTCTGACTAGGACGTTGTCTTCAAAGACCTT
GAGTGTCACGACTGGCCCTGAGAAGCATCTTCTTTGGCCATAGATCTTGAAGATTGGTTG
GAGAGCTAGTAGGTCTCCGTTTGATATTAGTTCTGCGTTGCTGTCACACGCTTCTGCTGT
TGCAAATGCAGCCATGGGAGATTGTATTCACGCGTGTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCAA
GGAAAGAGAGAAGGGCTTCCAAAGATTCTTAAACGGCGATTGTATATACAAGTAAGTAAC
GGGTAAGATCAGCTTTCTCGTGTCAGG

QA 1 807 1 807
DS 

RD RR2BF33JQ 801 0 0
AAATAAAGGTTTTAGCTCGTTTCGAACAAGAGAAATAATAACATTTTGTAATTATTATAT
AGTTTCACAAATTGCAGAAAACGTTTCCATTTGAGAATATTAAACCGAATATTACTAATT
CCACATAAACCAGCTCCAACAGTAATCTCTTAGCAGATGAGAACATTCTGGATCAGACGG
AGAGTTCGGTCTTGGAGATCAAGACACCATCACTATCAGCATAAAGCCATTCACCATCTC
TAATCAAAGTCCCTCCAATATAAACCGGCACATTCTTCTCACCATGACCTTTCTTACTAG
ACTTCAACGGGTTAGAACCCAACGCCCTAACCCCAACATCACAGTCATTGATCTCATCCA
CATCTCTAACGCACCCATTCACCAAAATCCCTACCCACCCGTTGTTCTGAGCTAACTGTC
CGAGGTTTCCTCCAACAAGTGCGCATCTCATGCTTCCACCACCGTCTATAACTAAGACTG
CGCCTTCTCCTTTTGTCTCAAGTTGGTTTCTGACTAGGACGTTGTCTTCAAAGACCTTGA
GTGTCACGACTGGCCCTGAGAAGCATCTTCTTTGGCCATAGATCTTGAAGATTGGTTGGA
GAGCTAGTAGGTCTCCGTTTGATATTAGTTCTGCGTTGCTGTCACACGCTTCTGCTGTTG
CAAATGCAGCCATGGGAGATTGTATTCACGCGTGTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCAAGG
AAAGAGAGAAGGGCTTCCAAAGATTCTTAAACGGCGATTGTATATACAAGTAAGTAACGG
GTAAGATCAGCTTTCTCGTGT

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL7623Contig1 1018 2 2 U
GAAAGAGAATCTCCTCTCTCTACCAAAATAACTTTGAAACTCTTCTTGTTCTTTGAAAAA
AAGTCAAGGATCATACGGCCGGGGGATCCAGAAGTTGAATATCGATGGGATGGGGAGGAG
AGAAACATGGTGCCGATGATGAATCCCACCCACAGTCGCTCTCATCAGCAGTCTGATGGA
TTCAGCAATGAGGAAGATGAATCGCTTAACGAATGATTCAAATTACAAGACAGTACACCA
TCAGGACCACCATGAGCGGAGGTTGAGTTTGACATCTCTCGTGTCGTCGTCGTCGGTGAA
GCCTCCCTCCTCTCCCATTAGGAGAACCATTGATCTTGGCCATGGAAGCAACCTCATCTA
CATTCAGAGGTTTCTTCCCTTGCAAAAGTCTTGGTCTTCTTTGATTATCTCGACAAACAT
ATTCCTTGGACCAGGCCCACCATTCGTGTCTTCGGTCGTTCTTGCCTTCAGATTTGCGAA
GCGCTTCCTGGAAGCAGATTCAACAGCTTGCTTTTGAATAGGTACAAAGGTGCCAATGAC
TATGTTGGTTGGCATTCAGATGATGAAAAGCTTTACGGTCCTACTCCTGAAATTGCTTCC
CTCTCTTTTGGATGCGAACGTGACTTTGTGCTCAAGAAAAAGAAACTTCAAGATCTTCTC
ATGAGAAAAGAGGAGATGGTGAACCAGCGAAGAAGAGGTTAAAGAAAAGCAGCAGAGGAG
GAGAGGATCAACAAAGTTTCACATTGAAGCATGGATCATTGCTGGTGATGAGGGGATACA
CGCAAAGGGACTGGATTCATTCTGTGCCGAAGCGTGTAAAGGCAGAGGGCACTCGTATCA
ACCTCACCTTCAGGCTTGTTTTATAAACCCAAGCTTGATCTTTCTCCAGTCACATCTTAG
TTCTTTGACATGATGAGATATAAACACAAGCTGGTGTAAGACATTTGAAGAAAGCTAATT
ACTAAACTTAACGTGACAAGATTAATTAAGGAAGAGTGCCAGAGTCTGTTTTGATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX38TFB U 1
AF RR2AX38JQ C 115
BS 1 691 RR2AX38TFB
BS 692 1018 RR2AX38JQ

RD RR2AX38TFB 691 0 0
GAAAGAGAATCTCCTCTCTCTACCAAAATAACTTTGAAACTCTTCTTGTTCTTTGAAAAA
AAGTCAAGGATCATACGGCCGGGGGATCCAGAAGTTGAATATCGATGGGATGGGGAGGAG
AGAAACATGGTGCCGATGATGAATCCCACCCACAGTCGCTCTCATCAGCAGTCTGATGGA
TTCAGCAATGAGGAAGATGAATCGCTTAACGAATGATTCAAATTACAAGACAGTACACCA
TCAGGACCACCATGAGCGGAGGTTGAGTTTGACATCTCTCGTGTCGTCGTCGTCGGTGAA
GCCTCCCTCCTCTCCCATTAGGAGAACCATTGATCTTGGCCATGGAAGCAACCTCATCTA
CATTCAGAGGTTTCTTCCCTTGCAAAAGTCTTGGTCTTCTTTGATTATCTCGACAAACAT
ATTCCTTGGACCAGGCCCACCATTCGTGTCTTCGGTCGTTCTTGCCTTCAGATTTGCGAA
GCGCTTCCTGGAAGCAGATTCAACAGCTTGCTTTTGAATAGGTACAAAGGTGCCAATGAC
TATGTTGGTTGGCATTCAGATGATGAAAAGCTTTACGGTCCTACTCCTGAAATTGCTTCC
CTCTCTTTTGGATGCGAACGTGACTTTGTGCTCAAGAAAAAGAAACTTCAAGATCTTCTC
ATGAGAAAAGAGGAGATGGTGAACCAGCGAA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RR2AX38JQ 904 0 0
GAGGAGAGAAACATGGTGCCGATGATGAATCCCACCCACAGTCGCTCTCATCAGCAGTCT
GATGGATTCAGCAATGAGGAAGATGAATCGCTTAACGAATGATTCAAATTACAAGACAGT
ACACCATCAGGACCACCATGAGCGGAGGTTGAGTTTGACATCTCTCGTGTCGTCGTCGTC
GGTGAAGCCTCCCTCCTCTCCCATTAGGAGAACCATTGATCTTGGCCATGGAAGCAACCT
CATCTACATTCAGAGGTTTCTTCCCTTGCAAAAGTCTTGGTCTTCTTTGATTATCTCGAC
AAACATATTCCTTGGACCAGGCCCACCATTCGTGTCTTCGGTCGTTCTTGCCTTCAGATT
TGCGAAGCGCTTCCTGGAAGCAGATTCAACAGCTTGCTTTTGAATAGGTACAAAGGTGCC
AATGACTATGTTGGTTGGCATTCAGATGATGAAAAGCTTTACGGTCCTACTCCTGAAATT
GCTTCCCTCTCTTTTGGATGCGAACGTGACTTTGTGCTCAAGAAAAAGAAACTTCAAGAT
CTTCTCATGAGAAAAGAGGAGATGGTGAACCAGCGAAGAAGAGGTTAAAGAAAAGCAGCA
GAGGAGGAGAGGATCAACAAAGTTTCACATTGAAGCATGGATCATTGCTGGTGATGAGGG
GATACACGCAAAGGGACTGGATTCATTCTGTGCCGAAGCGTGTAAAGGCAGAGGGCACTC
GTATCAACCTCACCTTCAGGCTTGTTTTATAAACCCAAGCTTGATCTTTCTCCAGTCACA
TCTTAGTTCTTTGACATGATGAGATATAAACACAAGCTGGTGTAAGACATTTGAAGAAAG
CTAATTACTAAACTTAACGTGACAAGATTAATTAAGGAAGAGTGCCAGAGTCTGTTTTGA
TTTC

QA 1 904 1 904
DS 



AS 1 2

CO CL7624Contig1 581 2 2 U
TTTTGAGCAAATATAAAAATCAATTCCGAATATTAAGTAGACATAATATCTCAAAACAGC
CTTCTAAAGAGTTTATCGAGTACGAAGGAGTTCAAACATAAAGAACTATGAGAGCTCTGA
TGAGTAACGTATACATCAAAAGAGATTAGACTGGAGGAACCAAAACATTGACAAAGGTCG
ATCTGTTTTGTTTAGGTGTTGGTGGCACGAGTGTAGATCTGCTGGCTCGAGTGGGCGGCG
ACCATCGTGATCACACCTTTAGCCATTAGCTCCATAATTGCCTTCCTTGCAAGAGACCCG
TTGATCTGTTTTTATTTCCCCAACACTACCATATAAAAAAATGTACTTACATCGGGTACC
AGGAACAGAGGTCATTGCAACAATTATCTGTGAGAAAGAGAGAGAGAGCTCAAGCTTTCA
TGGCGAGAGAGATCCGAAGAGAGAGACGCGGACAAAGAGATGCAGAGAGAGAGATAGGCG
GACGCGGACAGGGAGATGCAGAGAGAGAGATAGGCGGAGAGAGAGAGAGGGGAGGAGAGA
GAGACGGAGAGAGAGAGCTTAAACTTTCATGGCAATGGCCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FM50TF C 1
AF RR2FM50JQ U 5
BS 1 4 RR2FM50TF
BS 5 581 RR2FM50JQ

RD RR2FM50TF 581 0 0
TTTTGAGCAAATATAAAAATCAATTCCGAATATTAAGTAGACATAATATCTCAAAACAGC
CTTCTAAAGAGTTTATCGAGTACGAAGGAGTTCAAACATAAAGAACTATGAGAGCTCTGA
TGAGTAACGTATACATCAAAAGAGATTAGACTGGAGGAACCAAAACATTGACAAAGGTCG
ATCTGTTTTGTTTAGGTGTTGGTGGCACGAGTGTAGATCTGCTGGCTCGAGTGGGCGGCG
ACCATCGTGATCACACCTTTAGCCATTAGCTCCATAATTGCCTTCCTTGCAAGAGACCCG
TTGATCTGTTTTTATTTCCCCAACACTACCATATAAAAAAATGTACTTACATCGGGTACC
AGGAACAGAGGTCATTGCAACAATTATCTGTGAGAAAGAGAGAGAGAGCTCAAGCTTTCA
TGGCGAGAGAGATCCGAAGAGAGAGACGCGGACAAAGAGATGCAGAGAGAGAGATAGGCG
GACGCGGACAGGGAGATGCAGAGAGAGAGATAGGCGGAGAGAGAGAGAGGGGAGGAGAGA
GAGACGGAGAGAGAGAGCTTAAACTTTCATGGCAATGGCCC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2FM50JQ 577 0 0
GAGCAAATATAAAAATCAATTCCGAATATTAAGTAGACATAATATCTCAAAACAGCCTTC
TAAAGAGTTTATCGAGTACGAAGGAGTTCAAACATAAAGAACTATGAGAGCTCTGATGAG
TAACGTATACATCAAAAGAGATTAGACTGGAGGAACCAAAACATTGACAAAGGTCGATCT
GTTTTGTTTAGGTGTTGGTGGCACGAGTGTAGATCTGCTGGCTCGAGTGGGCGGCGACCA
TCGTGATCACACCTTTAGCCATTAGCTCCATAATTGCCTTCCTTGCAAGAGACCCGTTGA
TCTGTTTTTATTTCCCCAACACTACCATATAAAAAAATGTACTTACATCGGGTACCAGGA
ACAGAGGTCATTGCAACAATTATCTGTGAGAAAGAGAGAGAGAGCTCAAGCTTTCATGGC
GAGAGAGATCCGAAGAGAGAGACGCGGACAAAGAGATGCAGAGAGAGAGATAGGCGGACG
CGGACAGGGAGATGCAGAGAGAGAGATAGGCGGAGAGAGAGAGAGGGGAGGAGAGAGAGA
CGGAGAGAGAGAGCTTAAACTTTCATGGCAATGGCCC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7626Contig1 577 2 1 U
GGGTCGTCTGTCTTCTTAAAAGCCCTAGAGTTCAGTTCCTCCGACTCATCCCCGAGCGAA
AGAGAAGAAATGATGAAGCGTCTGATCCCAACATTCAACCGCATCCTTGTGCAGAGAGTC
ATCCAGCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTCCCTGAGAAAGCCTCCAAGCTGAAC
TCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGGATCGAGGGATAAGGACGGGAAATTGATTCCA
GTCTCTGTTAAGGAAGGCGACACTGTTCTTCTTCCAGAGTATGGTGGTACTCAGGTCAAG
CTAGGCGAGAAGGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGGACGTTGCACGAA
GATTGAGAAAGGCTAAGCGGTGGTCTTGTTGGCGTTTTAATCTTATGGGAAGAGAAACAA
ACAAGTTATTTTATAATTTTTAGTTTATGTGGTTGGACATGTCATTGAAATTTACTTTAA
TGGACTATATTTGTCCCTTCTGAGTCGGTCGTTCCAGTTTTTCCAAATTGTCATCAATCC
TAAGATAAGTTAAGTTAACCTGAGTGTTGCATCTTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H814JQ C 1
AF RR2H814TF U 1
BS 1 577 RR2H814TF

RD RR2H814JQ 577 0 0
GGGTCGTCTGTCTTCTTAAAAGCCCTAGAGTTCAGTTCCTCCGACTCATCCCCGAGCGAA
AGAGAAGAAATGATGAAGCGTCTGATCCCAACATTCAACCGCATCCTTGTGCAGAGAGTC
ATCCAGCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTCCCTGAGAAAGCCTCCAAGCTGAAC
TCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGGATCGAGGGATAAGGACGGGAAATTGATTCCA
GTCTCTGTTAAGGAAGGCGACACTGTTCTTCTTCCAGAGTATGGTGGTACTCAGGTCAAG
CTAGGCGAGAAGGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGGACGTTGCACGAA
GATTGAGAAAGGCTAAGCGGTGGTCTTGTTGGCGTTTTAATCTTATGGGAAGAGAAACAA
ACAAGTTATTTTATAATTTTTAGTTTATGTGGTTGGACATGTCATTGAAATTTACTTTAA
TGGACTATATTTGTCCCTTCTGAGTCGGTCGTTCCAGTTTTTCCAAATTGTCATCAATCC
TAAGATAAGTTAAGTTAACCTGAGTGTTGCATCTTGT

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2H814TF 577 0 0
GGGTCGTCTGTCTTCTTAAAAGCCCTAGAGTTCAGTTCCTCCGACTCATCCCCGAGCGAA
AGAGAAGAAATGATGAAGCGTCTGATCCCAACATTCAACCGCATCCTTGTGCAGAGAGTC
ATCCAGCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTCCCTGAGAAAGCCTCCAAGCTGAAC
TCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGGATCGAGGGATAAGGACGGGAAATTGATTCCA
GTCTCTGTTAAGGAAGGCGACACTGTTCTTCTTCCAGAGTATGGTGGTACTCAGGTCAAG
CTAGGCGAGAAGGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTGGGGACGTTGCACGAA
GATTGAGAAAGGCTAAGCGGTGGTCTTGTTGGCGTTTTAATCTTATGGGAAGAGAAACAA
ACAAGTTATTTTATAATTTTTAGTTTATGTGGTTGGACATGTCATTGAAATTTACTTTAA
TGGACTATATTTGTCCCTTCTGAGTCGGTCGTTCCAGTTTTTCCAAATTGTCATCAATCC
TAAGATAAGTTAAGTTAACCTGAGTGTTGCATCTTGT

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

CO CL7627Contig1 586 2 1 U
GGGTCAAGAAGAGAGTAACCCTAGCAGCAGCTTTTCAGCTCAAGAAGAGAGGAGGAATTT
TAGTCGCAGCCGCATATCAGAACATGACTTTCAAGCGTAGGAACGGAGGAAGGAACAAGC
ACAACCGTGGCCACGTCAACCCAATCAGATGCTCCAACTGTGGCAAATGTTGCCCAAAGG
ACAAGGCCATAAAGAGGTTCATAGTGAGGAACATAGTGGAGCAGGCTGCCATTAGAGATG
TTCAGGAAGCCAGTGTCTACGATGGGTACACTCTCCCTAAGCTGTATGCGAAGACGCAGT
ACTGTGTCTCATGTGCCATCCACTCTCACGTTGTTAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGCA
GGGTTCGTACTCCCCCTCCACGTTTCGTCAGACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGAC
AACCTGGTCAGGCTCCTCGTCCTGCTGGAGCTGGAGCTGCTGCACCTCGTGCCTGAAGAA
GCCTTTGAAGATTTGTTTTTTTTTTGTATGTTGCTACTAGTACCATCTGAATCTCAAAAT
GCAGTTTGATGTTTCGACTTTGTTATATTCCAGACATCTTTTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FG89JQ C 1
AF RR2FG89TF U 1
BS 1 586 RR2FG89TF

RD RR2FG89JQ 586 0 0
GGGTCAAGAAGAGAGTAACCCTAGCAGCAGCTTTTCAGCTCAAGAAGAGAGGAGGAATTT
TAGTCGCAGCCGCATATCAGAACATGACTTTCAAGCGTAGGAACGGAGGAAGGAACAAGC
ACAACCGTGGCCACGTCAACCCAATCAGATGCTCCAACTGTGGCAAATGTTGCCCAAAGG
ACAAGGCCATAAAGAGGTTCATAGTGAGGAACATAGTGGAGCAGGCTGCCATTAGAGATG
TTCAGGAAGCCAGTGTTTACGATGGGTACACTCTCCCTAAGCTGTATGGGAAGACGCAGT
ACTGTGTCTCATGTGCCATCCACTCTCACGTTGTTAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGCA
GGGTTCGTACTCCCCCTCCACGTTTCGTCAGACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGAC
AACCTGGTCAGGCTCCTCGTCCTGCTGGAGCTGGAGCTGCTGCACCTCGTGCCTGAAGAA
GCCTTTGAAGATTTGTTTTTTTTTTGTATGTTGCTACTAGTACCATCTGAATCTCAAAAT
GCAGTTTGATGTTTCGACTTTGTTATATTCCAGACATCTTTTTTCC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RR2FG89TF 586 0 0
GGGTCAAGAAGAGAGTAACCCTAGCAGCAGCTTTTCAGCTCAAGAAGAGAGGAGGAATTT
TAGTCGCAGCCGCATATCAGAACATGACTTTCAAGCGTAGGAACGGAGGAAGGAACAAGC
ACAACCGTGGCCACGTCAACCCAATCAGATGCTCCAACTGTGGCAAATGTTGCCCAAAGG
ACAAGGCCATAAAGAGGTTCATAGTGAGGAACATAGTGGAGCAGGCTGCCATTAGAGATG
TTCAGGAAGCCAGTGTCTACGATGGGTACACTCTCCCTAAGCTGTATGCGAAGACGCAGT
ACTGTGTCTCATGTGCCATCCACTCTCACGTTGTTAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGCA
GGGTTCGTACTCCCCCTCCACGTTTCGTCAGACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGAC
AACCTGGTCAGGCTCCTCGTCCTGCTGGAGCTGGAGCTGCTGCACCTCGTGCCTGAAGAA
GCCTTTGAAGATTTGTTTTTTTTTTGTATGTTGCTACTAGTACCATCTGAATCTCAAAAT
GCAGTTTGATGTTTCGACTTTGTTATATTCCAGACATCTTTTTTCC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL7628Contig1 1174 2 2 U
GGCTCTCTCTTCACTCTGGTTCTAGTGATAACCAAACATGCTTTCAACTACTGGGAGAAA
AGAGAAGCTTTCCGTTTCAAAAGGCTCCTATATAGAAGTCTCATCTGACGAACACTACCA
CGCCACTGGCAATGTATGGTACCACGCTCTTCTCCAAGAAAACCTTGCTTCATCCAAGCG
CAAGAAGCTCTCTGTTCTCCACTTGAACCCTCTCTCCAACGAAGACTACTCACCTCCCCT
GACCACAGCCACTTTCCACCGTCTGATCCGTCCCGTTCCGCCGCCTGATCCTTTCCCTGA
AGTTGGTTTTGAGGAAGGTGACATGATTGACGCTGCTCACAGAGGTGGCTGGTGGTCTGG
TTGGGTGATCAAAGCTCTGGATCAGCGTTTCTTGGTTTACCTAAGATACGAGCCAGACGT
CATAGAGGTTGAAAGGAAGGACATGCGTCCACATTGGGTTTGGAAAGATGAAGAGTGGTT
TCGTTGCCAGAAACGACTATTGACTGAGTCAGAGCTTAGAGCAGGGACAAAGGTGGAAGT
GAGAACAAAGGTGGAACCTTTTGGAGATATTTGGGCTCCGGCTATAACCATAAAGAAGAA
TGAAGATGAGACAATGCTGGTGAAGTACGGTGAAGAAGATGCATGCAGAAGGATAAACGT
TCCTAACTCCAAGATCAGGCCTTCACCACCTTCTTTCGGTTTAAGACGTTGTTTTGGGTT
GATGGAGAATGTGGATGCCTTGCTCGAGTGTGGATGGTGGTGTCCGAGTTTAGTAAGCCT
GGTTCTTTGTGAAGATAGATACACCGTACTTTTAGGTCGGAACAAGAAGAGTGAAGACTT
TGACCACTCTCAGTTAAGACCATCGATGGAGTGGAAAGATGGAGTCTGGCGCACAAAAGA
AAAGGTTTTGGATAGAGAGGAGAGTCCACATGTAACTGAAGAAACAATTGGCTCAACTCG
CATAAGAGTAAAACTGAGAGCCACACGCTCTTCTAGTGGAAATACTATGCAGAATCTTCC
TTTTGCCACTGAGAGTGTAACACAGCTCCCCCAAACTCCAGTTTCATCTGGAGAGTTAGC
AAGTAAAATGGCTAATGTTGTGATCAATGAGAACGCTCTGGTCACTAAGAAACCGGAGAT
AGCAGAAGAGTCAGATAAAAGAGGGAACGTGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B804TF U 1
AF RR2B804JQ C 301
BS 1 820 RR2B804TF
BS 821 1174 RR2B804JQ

RD RR2B804TF 820 0 0
GGCTCTCTCTTCACTCTGGTTCTAGTGATAACCAAACATGCTTTCAACTACTGGGAGAAA
AGAGAAGCTTTCCGTTTCAAAAGGCTCCTATATAGAAGTCTCATCTGACGAACACTACCA
CGCCACTGGCAATGTATGGTACCACGCTCTTCTCCAAGAAAACCTTGCTTCATCCAAGCG
CAAGAAGCTCTCTGTTCTCCACTTGAACCCTCTCTCCAACGAAGACTACTCACCTCCCCT
GACCACAGCCACTTTCCACCGTCTGATCCGTCCCGTTCCGCCGCCTGATCCTTTCCCTGA
AGTTGGTTTTGAGGAAGGTGACATGATTGACGCTGCTCACAGAGGTGGCTGGTGGTCTGG
TTGGGTGATCAAAGCTCTGGATCAGCGTTTCTTGGTTTACCTAAGATACGAGCCAGACGT
CATAGAGGTTGAAAGGAAGGACATGCGTCCACATTGGGTTTGGAAAGATGAAGAGTGGTT
TCGTTGCCAGAAACGACTATTGACTGAGTCAGAGCTTAGAGCAGGGACAAAGGTGGAAGT
GAGAACAAAGGTGGAACCTTTTGGAGATATTTGGGCTCCGGCTATAACCATAAAGAAGAA
TGAAGATGAGACAATGCTGGTGAAGTACGGTGAAGAAGATGCATGCAGAAGGATAAACGT
TCCTAACTCCAAGATCAGGCCTTCACCACCTTCTTTCGGTTTAAGACGTTGTTTTGGGTT
GATGGAGAATGTGGATGCCTTGCTCGAGTGTGGATGGTGGTGTCCGAGTTTAGTAAGCCT
GGTTCTTTGTGAAGATAGATACACCGTACTTTTAGGTCGG

QA 1 820 1 820
DS 

RD RR2B804JQ 874 0 0
AGTTGGTTTTGAGGAAGGTGACATGATTGACGCTGCTCACAGAGGTGGCTGGTGGTCTGG
TTGGGTGATCAAAGCTCTGGATCAGCGTTTCTTGGTTTACTTAAGATACGAGCCAGACGT
CATAGAGGTTGAAAGGAAGGACATGCGTCCACATTGGGTTTGGAAAGATGAAGAGTGGTT
TCGTTGCCAGAAACGACTATTGACTGAGTCAGAGCTTAGAGCAGGGACAAAGGTGGAAGT
GAGAACAAAGGTGGAACCTTTTGGAGATATTTGGGCTCCGGCTATAACCATAAAGAAGAA
TGAAGATGAGACAATGCTGGTGAAGTACGGTGAAGAAGATGCATGCAGAAGGATAAACGT
TCCTAACTCCAAGATCAGGCCTTCACCACCTTCTTTCGGTTTAAGACGTTGTTTTGGGTT
GATGGAGAATGTGGATGCCTTGCTCGAGTGTGGATGGTGGTGTCCGAGTTTAGTAAGCCT
GGTTCTTTGTGAAGATAGATACACCGTACTTTTAGGTCGGAACAAGAAGAGTGAAGACTT
TGACCACTCTCAGTTAAGACCATCGATGGAGTGGAAAGATGGAGTCTGGCGCACAAAAGA
AAAGGTTTTGGATAGAGAGGAGAGTCCACATGTAACTGAAGAAACAATTGGCTCAACTCG
CATAAGAGTAAAACTGAGAGCCACACGCTCTTCTAGTGGAAATACTATGCAGAATCTTCC
TTTTGCCACTGAGAGTGTAACACAGCTCCCCCAAACTCCAGTTTCATCTGGAGAGTTAGC
AAGTAAAATGGCTAATGTTGTGATCAATGAGAACGCTCTGGTCACTAAGAAACCGGAGAT
AGCAGAAGAGTCAGATAAAAGAGGGAACGTGAAC

QA 1 874 1 874
DS 



AS 1 2

CO CL7629Contig1 594 2 1 U
TCAATTAATTAAAAAATCGTAAACAAAGAAGAAAAAAGCATGTATAAAAGAGAAAAAGTA
GTTTCCTCCTCTATTATTCTTCTGATACCCTTGTTAATTTTGACAGAAAGAATAAATAGC
TCATAGTCCAAAAGCTTTCGAGCGCCGTTGTCGTGGACTTCCACTCAAAAATCCACCGCC
GGATATGTGTACTAAACTAAATGGTCGTGCTGAATGTGAGCGTCTTTGCAAGGCGTCATC
CAAAAAAACCGGATTTTTTTAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAGCAATGTTCACTATTGCC
ACTGCTACATGTTTATATGCGCTCCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGCAAGAACGGAA
AATAAATATATATACATCTATATTTGTTTATTCCAATAATTTCTCATTAATACTATTTTT
AATATGAAACTATAAATAAAATTAGATCTTTTGTTTTTTTAAACAAGAAATAATAACTAT
ATATTTATATCATCTCCATCTATTTATAGATCAGTGGGAAAAATATAATTTATAATTTGT
TGTAAAACTCAATGTGTTTCTATAGATCAGCAAAAAATAATATTCGTAGAAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GO31TF U 1
AF RR2GO31JQ C 12
BS 1 594 RR2GO31TF

RD RR2GO31TF 594 0 0
TCAATTAATTAAAAAATCGTAAACAAAGAAGAAAAAAGCATGTATAAAAGAGAAAAAGTA
GTTTCCTCCTCTATTATTCTTCTGATACCCTTGTTAATTTTGACAGAAAGAATAAATAGC
TCATAGTCCAAAAGCTTTCGAGCGCCGTTGTCGTGGACTTCCACTCAAAAATCCACCGCC
GGATATGTGTACTAAACTAAATGGTCGTGCTGAATGTGAGCGTCTTTGCAAGGCGTCATC
CAAAAAAACCGGATTTTTTTAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAGCAATGTTCACTATTGCC
ACTGCTACATGTTTATATGCGCTCCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGCAAGAACGGAA
AATAAATATATATACATCTATATTTGTTTATTCCAATAATTTCTCATTAATACTATTTTT
AATATGAAACTATAAATAAAATTAGATCTTTTGTTTTTTTAAACAAGAAATAATAACTAT
ATATTTATATCATCTCCATCTATTTATAGATCAGTGGGAAAAATATAATTTATAATTTGT
TGTAAAACTCAATGTGTTTCTATAGATCAGCAAAAAATAATATTCGTAGAAAGT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2GO31JQ 583 0 0
AAAAATCGTAAACAAAGAAGAAAAAAGCATGTATAAAAGAGAAAAAGTAGTTTCCTCCTC
TATTATTCTTCTGATACCCTTGTTAATTTTGACAGAAAGAATAAAT*GCTCATAGTCCAA
AAGCTTTCGAGCGCCGTTGTCGTGGACTTCCACTCAAAAATCCACCGCCGGATATGTGTA
CTAAACTAAATGGTCGTGCTGAATGTGAGCGTCTTTGCAAGGCGTCATCCAAAAAAACCG
GATTTTTTTAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAGCAATGTTCACTATTGCCACTGCTACATG
TTTATATGCGCTCCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGCAAGAACGGAAAATAAATATAT
ATACATCTATATTTGTTTATTCCAATAATTTCTCATTAATACTATTTTTAATATGAAACT
ATAAATAAAATTAGATCTTTTGTTTTTTTAAACAAGAAATAATAACTATATATTTATATC
ATCTCCATCTATTTATAGATCAGTGGGAAAAATATAATTTATAATTTGTTGTAAAACTCA
ATGTGTTTCTATAGATCAGCAAAAAATAATATTCGTAGAAAGT

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL7630Contig1 861 2 2 U
GGACATGGATTCACAGCTTCAAGAGATTCTCAAGAGAAGAGGAAGACGTCCCGTTTCCAT
TGACCAGCTGCTTCAGGGCATACGTACTGGCTTAACCCTTGCCCCTGCTACTGCTGACGA
TGACTCTACTAACAACAACAACAACCCACCTCCTGCTGCTGCTGATGATGCTGGTAGAGA
GAGAGGACGCGTGATCGTCACCAATTCCTACAACCAGATCGTCGCTGTCCCGAGCTCTGC
TGTTTCCGACACTCTGCCTCCCGTTGATGGCTCTCTCAGCGAGTACTTCATCGGTCCTGA
GTTCGAAGCCATGCTTGAGGATTTGACCGAGACTGATCCCAGGAGGTATGGAACGCCTCC
GGCTCGGAGAGATGCTGTTGAGACTTTGGCTAATGTGATCGTCCTTGTGCCGGGGATGCA
GTGTTTGGTTTGTTTGGATGATCTCGAGATGGGGACTGTTGGGAAACAGATGCCTTGTGA
GCACTTCTTTCACAGTTACTGCTTGCTCTACTGGCTTCAGCTTCATAGCTCCTGCCCGGT
TTGTAGGTCTCAGCTACCGACTGCGGAGGATGAGACAAATGGTGGTGGTGATGGGTCTTC
TACTACAAGCAGCAGCCAGGGATCTGAGAACAGCGACCAGGAGGAGGAGGAGGAGGATCC
CATGACTGCTTAGCCAAGTCCCACCCTGCTTCTCTAGGTAGCAGCAAATCCTTAGGAGCA
ACATAAGAGATGATGAGACCAACTTTAATAAGATCTTCTTTGTGACTCTGTCTTTACTTG
GTTGAATGGCTACTCTTATCATTTTGTGATGTTTTTTTTTAATGGTTCTCAAGACTTATC
TACATTTTGGAGAATTCTGCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BC61TF U 1
AF RR2BC61JQ C 1
BS 1 711 RR2BC61TF
BS 712 861 RR2BC61JQ

RD RR2BC61TF 711 0 0
GGACATGGATTCACAGCTTCAAGAGATTCTCAAGAGAAGAGGAAGACGTCCCGTTTCCAT
TGACCAGCTGCTTCAGGGCATACGTACTGGCTTAACCCTTGCCCCTGCTACTGCTGACGA
TGACTCTACTAACAACAACAACAACCCACCTCCTGCTGCTGCTGATGATGCTGGTAGAGA
GAGAGGACGCGTGATCGTCACCAATTCCTACAACCAGATCGTCGCTGTCCCGAGCTCTGC
TGTTTCCGACACTCTGCCTCCCGTTGATGGCTCTCTCAGCGAGTACTTCATCGGTCCTGA
GTTCGAAGCCATGCTTGAGGATTTGACCGAGACTGATCCCAGGAGGTATGGAACGCCTCC
GGCTCGGAGAGATGCTGTTGAGACTTTGGCTAATGTGATCGTCCTTGTGCCGGGGATGCA
GTGTTTGGTTTGTTTGGATGATCTCGAGATGGGGACTGTTGGGAAACAGATGCCTTGTGA
GCACTTCTTTCACAGTTACTGCTTGCTCTACTGGCTTCAGCTTCATAGCTCCTGCCCGGT
TTGTAGGTCTCAGCTACCGACTGCGGAGGATGAGACAAATGGTGGTGGTGATGGGTCTTC
TACTACAAGCAGCAGCCAGGGATCTGAGAACAGCGACCAGGAGGAGGAGGAGGAGGATCC
CATGACTGCTTAGCCAAGTCCCACCCTGCTTCTCTAGGTAGCAGCAAATCC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2BC61JQ 861 0 0
GGACATGGATTCACAGCTTCAAGAGATTCTCAAGAGAAGAGGAAGACGTCCCGTTTCCAT
TGACCAGCTGCTTCAGGGCATACGTACTGGCTTAACCCTTGCCCCTGCTACTGCTGACGA
TGACTCTACTAACAACAACAACAACCCACCTCCTGCTGCTGCTGATGATGCTGGTAGAGA
GAGAGGACGCGTGATCGTCACCAATTCCTACAACCAGATCGTCGCTGTCCCGAGCTCTGC
TGTTTCCGACACTCTGCCTCCCGTTGATGGCTCTCTCAGCGAGTACTTCATCGGTCCTGA
GTTCGAAGCCATGCTTGAGGATTTGACCGAGACTGATCCCAGGAGGTATGGAACGCCTCC
GGCTCGGAGAGATGCTGTTGAGACTTTGGCTAATGTGATCGTCCTTGTGCCGGGGATGCA
GTGTTTGGTTTGTTTGGATGATCTCGAGATGGGGACTGTTGGGAAACAGATGCCTTGTGA
GCACTTCTTTCACAGTTACTGCTTGCTCTACTGGCTTCAGCTTCATAGCTCCTGCCCGGT
TTGTAGGTCTCAGCTACCGACTGCGGAGGATGAGACAAATGGTGGTGGTGATGGGTCTTC
TACTACAAGCAGCAGCCAGGGATCTGAGAACAGCGACCAGGAGGAGGAGGAGGAGGATCC
CATGACTGCTTAGCCAAGTCCCACCCTGCTTCTCTAGGTAGCAGCAAATCCTTAGGAGCA
ACATAAGAGATGATGAGACCAACTTTAATAAGATCTTCTTTGTGACTCTGTCTTTACTTG
GTTGAATGGCTACTCTTATCATTTTGTGATGTTTTTTTTTAATGGTTCTCAAGACTTATC
TACATTTTGGAGAATTCTGCG

QA 1 861 1 861
DS 



AS 1 2

CO CL7631Contig1 752 2 3 U
TTTAGCAGTATTAAACGGGCTAGGGAAGCTCAAGATAGAAAGCAAGAAACCAAAGTCTAG
CAGTGGTACTAAGGATAATTGACATCATTTAATAACCAAACAATCATCAAGATTCTGTAA
ATAAACCAGAAAAAAGGAGAAACAACTAAATCGGTTCTCTCTTCCGGTTATGTTGCTCGT
AAAGGTGTTGGCATTGTGTAACCAAGATCAATCAATTTTCTGATCAACATTTTCTCAGCT
GTTGCCTCGAGCAAGGGATTGTTTTTAGGGATGTTGCAAGCCATGATTATATTGAGACCA
GTCTTCATCACTAATCTACGGGCAATGCCAGACCCAGTGTTATCAGATGTTCCACCAAGT
ACGGAAGTAACGCTTACTGTATTACTCGGTCGGGTTGAAGCGGCTGCGTAAAGATTCCCA
AATTTGGCGGAATTGTAACCGATCCATACATAAATCTGTTTTGCGAGACGGATGATCTGG
AAGTGAAGAGTGACATCATCGAGAACTTCAGTGAAGCACGAAACCTTTACGCCGTCCTCG
TCTTGGTTCACATCGGCGGAATCACCGGTTTGGTCAGCGATTTTAACATGAGCAACAGAG
TTAAGAACTTGGTCGTATTCAGTCTCCATTGTCTCTAACCGAGGAGAAGAAGACGAAAAG
AAAGAAGTAAGATGGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTAAACTGGTGCCGATGATTTGT
TTCTGTTAGTCTGCCGGCGAGCAGGAGGAGCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EK77TF C 1
AF RR2EK77JQ U 4
BS 1 3 RR2EK77TF
BS 4 732 RR2EK77JQ
BS 733 752 RR2EK77TF

RD RR2EK77TF 752 0 0
TTTAGCAGTATTAAACGGGCTAGGGAAGCTCAAGATAGAAAGCAAGAAACCAAAGTCTAG
CAGTGGTACTAAGGATAATTGACATCATTTAATAACCAAACAATCATCAAGATTCTGTAA
ATAAACCAGAAAAAAGGAGAAACAACTAAATCGGTTCTCTCTTCCGGTTATGTTGCTCGT
AAAGGTGTTGGCATTGTGTAACCAAGATCAATCAATTTTCTGATCAACATTTTCTCAGCT
GTTGCCTCGAGCAAGGGATTGTTTTTAGGGATGTTGCAAGCCATGATTATATTGAGACCA
GTCTTCATCACTAATCTACGGGCAATGCCAGACCCAGTGTTATCAGATGTTCCACCAAGT
ACGGAAGTAACGCTTACTGTATTACTCGGTCGGGTTGAAGCGGCTGCGTAAAGATTCCCA
AATTTGGCGGAATTGTAACCGATCCATACATAAATCTGTTTTGCGAGACGGATGATCTGG
AAGTGAAGAGTGACATCATCGAGAACTTCAGTGAAGCACGAAACCTTTACGCCGTCCTCG
TCTTGGTTCACATCGGCGGAATCACCGGTTTGGTCAGCGATTTTAACATGAGCAACAGAG
TTAAGAACTTGGTCGTATTCAGTCTCCATTGTCTCTAACCGAGGAGAAGAAGACGAAAAG
AAAGAAGTAAGATGGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTAAACTGGTGCCGATGATTTGT
TTCTGTTAGTCTGCCGGCGAGCAGGAGGAGCC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2EK77JQ 729 0 0
AGCAGTATTAAACGGGCTAGGGAAGCTCAAGATAGAAAGCAAGAAACCAAAGTCTAGCAG
TGGTACTAAGGATAATTGACATCATTTAATAACCAAACAATCATCAAGATTCTGTAAATA
AACCAGAAAAAAGGAGAAACAACTAAATCGGTTCTCTCTTCCGGTTATGTTGCTCGTAAA
GGTGTTGGCATTGTGTAACCAAGATCAATCAATTTTCTGATCAACATTTTCTCAGCTGTT
GCCTCGAGCAAGGGATTGTTTTTAGGGATGTTGCAAGCCATGATTATATTGAGACCAGTC
TTCATCACTAATCTACGGGCAATGCCAGACCCAGTGTTATCAGATGTTCCACCAAGTACG
GAAGTAACGCTTACTGTATTACTCGGTCGGGTTGAAGCGGCTGCGTAAAGATTCCCAAAT
TTGGCGGAATTGTAACCGATCCATACATAAATCTGTTTTGCGAGACGGATGATCTGGAAG
TGAAGAGTGACATCATCGAGAACTTCAGTGAAGCACGAAACCTTTACGCCGTCCTCGTCT
TGGTTCACATCGGCGGAATCACCGGTTTGGTCAGCGATTTTAACATGAGCAACAGAGTTA
AGAACTTGGTCGTATTCAGTCTCCATTGTCTCTAACCGAGGAGAAGAAGACGAAAAGAAA
GAAGTAAGATGGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTAAACTGGTGCCGATGATTTGTTTC
TGTTAGTCT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL7632Contig1 938 2 2 U
GGGATAATCAAAAAAATGAGGAATGTGATGATTCATCGTGGAGGAGTCTTCTTCTGCAGC
ACAAAACCACTCTCTATCCTCCCCTCCCTCCTCACTCCTCCCCACCTCCGTCTCTGCTAC
TCCTCCACCGCCGCCGCCGCCGCGGCAGCTTCATCCCCGAATCGATCGATTCACTGCATG
GCCAACGATTCCCCACTCTCTCAGCCATTAACCGGCGGAGATGGCTCCGTCTCCGTCCCT
CCGACTCCTTCCGCTTCGTCCGCCATCGATTTCCTCTCCCTCTGCTCTCGCCTCAAGACA
ACTCCAAGAGCTGGATGGGGTAAAAGAGATGTTAAAAATCCAGAATCAATAGCTGATCAC
ATGTACCGGATGGGTCTTATGGCGCTTATCGCTTCAGATATTGCTGGTGTAAACAGAGAC
AAATGCATTAAAATGGCAATTGTTCATGACATTGCAGAAGCCATTGTAGGAGACATTACA
CCTTCTTGTGGGGTCTCTAAAGAAGAGAAAAATCGAAGAGAAAGTGAAGCACTTGAACAC
ATGTGCAAGCTCTTGGGTGGAGGAGAAAGAGCTGAAGAAATCGCTGAGCTATGGAGAGAA
TATGAAGCAAACGCGTCACCAGAAGCCAAAGTTGTTAAAGATTTCGATAAGCTTGAGTTG
ATACTACAAGCTTTGGAATATGAACAAGAGCAAGGTAAAGATCTAGAAGAGTTTTTCGAA
TCAACCGCAGGGAAGTTCCAGACAGATATAGGCAAAGCTTGGGCGTTGGAGATTGCTTCA
AGAAGAAGAAAGCCACAACATTAGTTAGTTCTCACTTGAGCTAAAATACTCTCTTCCTTT
CAACTTTAAATCATTTCAAGATATTTTGATGTGGAACTGTGGATCTACAATACTTATGTA
GTCTACATTCTTTGGGGTAGAAATCCGAATCCAACCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EA14TF U 1
AF RR2EA14JQ C 136
BS 1 673 RR2EA14TF
BS 674 938 RR2EA14JQ

RD RR2EA14TF 678 0 0
GGGATAATCAAAAAAATGAGGAATGTGATGATTCATCGTGGAGGAGTCTTCTTCTGCAGC
ACAAAACCACTCTCTATCCTCCCCTCCCTCCTCACTCCTCCCCACCTCCGTCTCTGCTAC
TCCTCCACCGCCGCCGCCGCCGCGGCAGCTTCATCCCCGAATCGATCGATTCACTGCATG
GCCAACGATTCCCCACTCTCTCAGCCATTAACCGGCGGAGATGGCTCCGTCTCCGTCCCT
CCGACTCCTTCCGCTTCGTCCGCCATCGATTTCCTCTCCCTCTGCTCTCGCCTCAAGACA
ACTCCAAGAGCTGGATGGGGTAAAAGAGATGTTAAAAATCCAGAATCAATAGCTGATCAC
ATGTACCGGATGGGTCTTATGGCGCTTATCGCTTCAGATATTGCTGGTGTAAACAGAGAC
AAATGCATTAAAATGGCAATTGTTCATGACATTGCAGAAGCCATTGTAGGAGACATTACA
CCTTCTTGTGGGGTCTCTAAAGAAGAGAAAAATCGAAGAGAAAGTGAAGCACTTGAACAC
ATGTGCAAGCTCTTGGGTGGAGGAGAAAGAGCTGAAGAAATCGCTGAGCTATGGAGAGAA
TATGAAGCAAACGCGTCACCAGAAGCCAAAGTTGTTAAAGATTTCGATAAGCTTGAGTTG
ATACTACAAGCTT
GGGAT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2EA14JQ 803 0 0
GCCGCCGCGGCAGCTTCATCCCCGAATCGATCGATTCACTGCATGGCCAACGATTCCCCA
CTCTCTCAGCCATTAACCGGCGGAGATGGCTCCGTCTCCGTCCCTCCGACTCCTTCCGCT
TCGTCCGCCATCGATTTCCTCTCCCTCTGCTCTCGCCTCAAGACAACTCCAAGAGCTGGA
TGGGGTAAAAGAGATGTTAAAAATCCAGAATCAATAGCTGATCACATGTACCGGATGGGT
CTTATGGCGCTTATCGCTTCAGATATTGCTGGTGTAAACAGAGACAAATGCATTAAAATG
GCAATTGTTCATGACATTGCAGAAGCCATTGTAGGAGACATTACACCTTCTTGTGGGGTC
TCTAAAGAAGAGAAAAATCGAAGAGAAAGTGAAGCACTTGAACACATGTGCAAGCTCTTG
GGTGGAGGAGAAAGAGCTGAAGAAATCGCTGAGCTATGGAGAGAATATGAAGCAAACGCG
TCACCAGAAGCCAAAGTTGTTAAAGATTTCGATAAGCTTGAGTTGATACTACAAGCTTTG
GAATATGAACAAGAGCAAGGTAAAGATCTAGAAGAGTTTTTCGAATCAACCGCAGGGAAG
TTCCAGACAGATATAGGCAAAGCTTGGGCGTTGGAGATTGCTTCAAGAAGAAGAAAGCCA
CAACATTAGTTAGTTCTCACTTGAGCTAAAATACTCTCTTCCTTTCAACTTTAAATCATT
TCAAGATATTTTGATGTGGAACTGTGGATCTACAATACTTATGTAGTCTACATTCTTTGG
GGTAGAAATCCGAATCCAACCCG

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL7633Contig1 824 2 6 U
CTTCCAACCATTAAACAAAAAAGTTATTGTGTTATTGGAAGATGGATTTGCTATCATCGA
GATGTAAGATTCAGATGACAACGTTAAGATGGATCATAATGATGACACTGATGATGAGAA
TAGGAGAATCGATGAGATTGGATCTGGAATCAGGCAGCACCAAATGCATCTCCGACGATA
TCAAAATAAATTATATGACTGTAGGAAATTACTCAATCGTCAATCCCAACGAAGCTCTCC
ATCTTCCGGCTTCCCACAAAATCTATGTCACTGTGGCCTCGCCTAAAGGGCACAGTCAGC
ATCATGCGGAAAATGTGGAGTCTGGACAATTCGTGTTCACGGCGATGGAAAGCGGCGATT
ACACAACGTGTTTTGTGGCTCCCGGTTTTAAACCCCCGGCTAAGTTCGCCGTTGATTTTG
AGTGGAAAAGTGGCGTGGAGGCTAAAGATTGGTCCACCATTGCCAAGAGAGGCCAGATTA
ACATGATGGAGGTGGAGGTGAACAAACTACGAGACGTGACGGAATCTATACATGACGAAA
TGTTTGAACTCCGGGAGAGGGAACGGGAAATGCAGGAGCTAAACCGATCGACAAACTCGA
GAATGGCGACTTTAAGCTTACTGTCGATCGTGTTTACGTTGTCGGTCGCTGGCCTACAAC
TATATCATCTCAAGTCATTCTTGGAGAGGAAGAAGCTTCTCTAATCAAACAAGTTGTTTC
TCTTACTTTTATCAGATTTTGGTGTTCTCGGTTTTAGTTTCTTTTTACTAAAAGCATCAC
TTAAAAATAGAAGATCAAAATCAAAATAAACTTAATCTCTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2B835TF U 1
AF RR2B835JQ C 14
BS 1 786 RR2B835TF
BS 787 787 RR2B835JQ
BS 788 791 RR2B835TF
BS 792 792 RR2B835JQ
BS 793 822 RR2B835TF
BS 823 824 RR2B835JQ

RD RR2B835TF 822 0 0
CTTCCAACCATTAAACAAAAAAGTTATTGTGTTATTGGAAGATGGATTTGCTATCATCGA
GATGTAAGATTCAGATGACAACGTTAAGATGGATCATAATGATGACACTGATGATGAGAA
TAGGAGAATCGATGAGATTGGATCTGGAATCAGGCAGCACCAAATGCATCTCCGACGATA
TCAAAATAAATTATATGACTGTAGGAAATTACTCAATCGTCAATCCCAACGAAGCTCTCC
ATCTTCCGGCTTCCCACAAAATCTATGTCACTGTGGCCTCGCCTAAAGGGCACAGTCAGC
ATCATGCGGAAAATGTGGAGTCTGGACAATTCGTGTTCACGGCGATGGAAAGCGGCGATT
ACACAACGTGTTTTGTGGCTCCCGGTTTTAAACCCCCGGCTAAGTTCGCCGTTGATTTTG
AGTGGAAAAGTGGCGTGGAGGCTAAAGATTGGTCCACCATTGCCAAGAGAGGCCAGATTA
ACATGATGGAGGTGGAGGTGAACAAACTACGAGACGTGACGGAATCTATACATGACGAAA
TGTTTGAACTCCGGGAGAGGGAACGGGAAATGCAGGAGCTAAACCGATCGACAAACTCGA
GAATGGCGACTTTAAGCTTACTGTCGATCGTGTTTACGTTGTCGGTCGCTGGCCTACAAC
TATATCATCTCAAGTCATTCTTGGAGAGGAAGAAGCTTCTCTAATCAAACAAGTTGTTTC
TCTTACTTTTATCAGATTTTGGTGTTCTCGGTTTTAGTTTCTTTTTACTAAAAGCATCAC
TTAAAA*TAGA*GATCAAAATCAAAATAAACTTAATCTCTTG

QA 1 822 1 822
DS 

RD RR2B835JQ 811 0 0
AACAAAAAAGTTATTGTGTTATTGGAAGATGGATTTGCTATCATCGAGATGTAAGATTCA
GATGACAACGTTAAGATGGATCATAATGATGACACTGATGATGAGAATAGGAGAATCGAT
GAGATTGGATCTGGAATCAGGCAGCACCAAATGCATCTCCGACGATATCAAAATAAATTA
TATGACTGTAGGAAATTACTCAATCGTCAATCCCAACGAAGCTCTCCATCTTCCGGCTTC
CCACAAAATCTATGTCACTGTGGCCTCGCCTAAAGGGCACAGTCAGCATCATGCGGAAAA
TGTGGAGTCTGGACAATTCGTGTTCACGGCGATGGAAAGCGGCGATTACACAACGTGTTT
TGTGGCTCCCGGTTTTAAACCCCCGGCTAAGTTCGCCGTTGATTTTGAGTGGAAAAGTGG
CGTGGAGGCTAAAGATTGGTCCACCATTGCCAAGAGAGGCCAGATTAACATGATGGAGGT
GGAGGTGAACAAACTACGAGACGTGACGGAATCTATACATGACGAAATGTTTGAACTCCG
GGAGAGGGAACGGGAAATGCAGGAGCTAAACCGATCGACAAACTCGAGAATGGCGACTTT
AAGCTTACTGTCGATCGTGTTTACGTTGTCGGTCGCTGGCCTACAACTATATCATCTCAA
GTCATTCTTGGAGAGGAAGAAGCTTCTCTAATCAAACAAGTTGTTTCTCTTACTTTTATC
AGATTTTGGTGTTCTCGGTTTTAGTTTCTTTTTACTAAAAGCATCACTTAAAAATAGAAG
ATCAAAATCAAAATAAACTTAATCTCTTGCT

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL7634Contig1 711 2 1 U
GGGTAGTTCGTAAGTGACTAGTAAGAAACAAAACAGAGACGAGAGAGAAAGAAGAGAGCA
AGAATGGGAAGGATATTCACGGTGGAGCTTGAAGGAAGATCTTACAGATGCAGGTTCTGC
AGAACCCATCTCGCTCTTCCCGATGATCTTATCTCCAAGTCTTTCCATTGCCGCAGAGGA
AAGGCTTACCTGTTCAATCGTTCGTAAGTATAAACTTCTTTGATATTATTATGTGCTTGT
TCTGTTTCTTCAATGTCAAGCTGTGTAAAGTTTCACTTGACTATATAACAATGTCAGGCT
TAAGCATTCTTTTTTAGCTCTCTAATTCAAGTCTTTATGCAACGAGTTTGGATATATGTA
GAGTGAACATAAGTATGGGTCCTTTAGAGGAAAGAATGATGCTTTCTGGTATGCACACTG
TTGCTGATATTTTCTGCTGCTGTTGCGGACAGAATGTTGGTTGGAAATATGAATCAGCGC
ATGAGAAAGCTCAGAAGTACAAAGAAGGGAAATTTGTTCTAGAAAGGGGAAGGATCGTGG
ATGAAATCGATTTATCAACAGAGGTTTACATGGATACTCGAAGCGACACAGAAGATTCTT
GAATGTTAGCTTTAGATTCTTGCCTTCCTTGTGTGTGTGTGTAATGTTCGTCAAGATCAG
AGCTTGTTAGTGTAAAATATGTAGCATGAGGTTTATAAAAGGATGTGTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BH40JQ C 1
AF RR2BH40TF U 1
BS 1 711 RR2BH40TF

RD RR2BH40JQ 711 0 0
GGGTAGTTCGTAAGTGACTAGTAAGAAACAAAACAGAGACGAGAGAGAAAGAAGAGAGCA
AGAATGGGAAGGATATTCACGGTGGAGCTTGAAGGAAGATCTTACAGATGCAGGTTCTGC
AGAACCCATCTCGCTCTTCCCGATGATCTTATCTCCAAGTCTTTCCATTGCCGCAGAGGA
AAGGCTTACCTGTTCAATCGTTCGTAAGTATAAACTTCTTTGATATTATTATGTGCTTGT
TCTGTTTCTTCAATGTCAAGCTGTGTAAAGTTTCACTTGACTATATAACAATGTCAGGCT
TAAGCATTCTTTTTTAGCTCTCTAATTCAAGTCTTTATGCAACGAGTTTGGATATATGTA
GAGTGAACATAAGTATGGGTCCTTTAGAGGAAAGAATGATGCTTTCTGGTATGCACACTG
TTGCTGATATTTTCTGCTGCTGTTGCGGACAGAATGTTGGTTGGAAATATGAATCAGCGC
ATGAGAAAGCTCAGAAGTACAAAGAAGGGAAATTTGTTCTAGAAAGGGGAAGGATCGTGG
ATGAAATCGATTTATCAACAGAGGTTTACATGGATACTCGAAGCGACACAGAAGATTCTT
GAATGTTAGCTTTAGATTCTTGCCTTCCTTGTGTGTGTGTGTAATGTTCGTCAAGATCAG
AGCTTGTTAGTGTAAAATATGTAGCATGAGGTTTATAAAAGGATGTGTTTG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RR2BH40TF 711 0 0
GGGTAGTTCGTAAGTGACTAGTAAGAAACAAAACAGAGACGAGAGAGAAAGAAGAGAGCA
AGAATGGGAAGGATATTCACGGTGGAGCTTGAAGGAAGATCTTACAGATGCAGGTTCTGC
AGAACCCATCTCGCTCTTCCCGATGATCTTATCTCCAAGTCTTTCCATTGCCGCAGAGGA
AAGGCTTACCTGTTCAATCGTTCGTAAGTATAAACTTCTTTGATATTATTATGTGCTTGT
TCTGTTTCTTCAATGTCAAGCTGTGTAAAGTTTCACTTGACTATATAACAATGTCAGGCT
TAAGCATTCTTTTTTAGCTCTCTAATTCAAGTCTTTATGCAACGAGTTTGGATATATGTA
GAGTGAACATAAGTATGGGTCCTTTAGAGGAAAGAATGATGCTTTCTGGTATGCACACTG
TTGCTGATATTTTCTGCTGCTGTTGCGGACAGAATGTTGGTTGGAAATATGAATCAGCGC
ATGAGAAAGCTCAGAAGTACAAAGAAGGGAAATTTGTTCTAGAAAGGGGAAGGATCGTGG
ATGAAATCGATTTATCAACAGAGGTTTACATGGATACTCGAAGCGACACAGAAGATTCTT
GAATGTTAGCTTTAGATTCTTGCCTTCCTTGTGTGTGTGTGTAATGTTCGTCAAGATCAG
AGCTTGTTAGTGTAAAATATGTAGCATGAGGTTTATAAAAGGATGTGTTTG

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL7635Contig1 1085 2 20 U
GTATCTCTTTGTTAAGTCAATGGTCAAAACTATAATGCAGCCAGCTTCACCTACAACGCT
AGGGAAGGAAATGGCGATTTTCGCGGTGAGGTTAAGCGAAGAGAGAAGATATCTTTCGGA
AACCAAGATCAAGGGGAAGTTTGCAGGTGCTGTTGGGAACTACAACGCTCATATCTCAGC
GTATCCTAATATCGACTGGCCTCATGTTGCAGAGGAGTTTGTTACTTCTCTCGGATTAGC
CTTTAACCCATACGTCACTCAGATTGAGCCTCATGACTATATGGCTAGACTTTTTAATAC
AATCAGCCAGTTCAACAATATCTTGATTGATTTCGATAGAGATATATGGAGCTACATATC
TTTAGGTTGCTTTAAGCAGATAACTAAAGCTGGTGAGATTGGATCATCCACAATGCCTCA
CAAAGTGAATCCTATTGACTTTGAGAACAGTGAAGGGAATCTTGGTAAAGCTAACGCAGA
GCTTGCTTTCCTCAGCATGAAGCTCCCCGTTTCACGAATGCAGCGTGACTTGACTGATTC
GACTGTGTTGAGGAACATGGGTGGAGCTTTAGGACACTCTCTTCTCGCTTACAAGAGCGC
CATACAGGGAATCAGGAAGCTTCAGGTTAATGAAGCTCGGTTAAAAGGAGATTTGGATCA
AACTTGGGAATTCCTTGCTGAACCAATACAAACTGTGATGAGGAGGTATGGTGTTCCAGA
GCCGTATGAGAAGCTGAAGGAGCTGACAAGAGGAAGAGCTGTGAATGAAGAAAGTATAAG
AGAGTTTATCAAAGGTTTGGATTTGCCTGAAGAAGCAAAATCTCAACTTTTAAAGTTAAC
ACCACACACATATGTTGGTGCTGCTGCTGCTTTGGCTTTGGCCGTCGATGAAGCTCTGCA
CTTTGGACGTTGATGATGATCAAATCGGTGATAAGGTTTGGTCTTGTATTATTAATGCCT
CTCTTCCAAATGAAATGGGAAGAAAGAAACTTTGATACAACATATGGTTGGGATTATTTT
TGTACTGTTGTGTTATGTTCCTTCTTTCATGATTTTGACAACCAATCCATTGGTTCAAAG
AAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2BI30TF U 1
AF RR2BI30JQ C 205
BS 1 748 RR2BI30TF
BS 749 749 RR2BI30JQ
BS 750 797 RR2BI30TF
BS 798 798 RR2BI30JQ
BS 799 810 RR2BI30TF
BS 811 813 RR2BI30JQ
BS 814 819 RR2BI30TF
BS 820 820 RR2BI30JQ
BS 821 825 RR2BI30TF
BS 826 826 RR2BI30JQ
BS 827 838 RR2BI30TF
BS 839 839 RR2BI30JQ
BS 840 872 RR2BI30TF
BS 873 873 RR2BI30JQ
BS 874 878 RR2BI30TF
BS 879 879 RR2BI30JQ
BS 880 891 RR2BI30TF
BS 892 892 RR2BI30JQ
BS 893 923 RR2BI30TF
BS 924 1085 RR2BI30JQ

RD RR2BI30TF 925 0 0
GTATCTCTTTGTTAAGTCAATGGTCAAAACTATAATGCAGCCAGCTTCACCTACAACGCT
AGGGAAGGAAATGGCGATTTTCGCGGTGAGGTTAAGCGAAGAGAGAAGATATCTTTCGGA
AACCAAGATCAAGGGGAAGTTTGCAGGTGCTGTTGGGAACTACAACGCTCATATCTCAGC
GTATCCTAATATCGACTGGCCTCATGTTGCAGAGGAGTTTGTTACTTCTCTCGGATTAGC
CTTTAACCCATACGTCACTCAGATTGAGCCTCATGACTATATGGCTAGACTTTTTAATAC
AATCAGCCAGTTCAACAATATCTTGATTGATTTCGATAGAGATATATGGAGCTACATATC
TTTAGGTTGCTTTAAGCAGATAACTAAAGCTGGTGAGATTGGATCATCCACAATGCCTCA
CAAAGTGAATCCTATTGACTTTGAGAACAGTGAAGGGAATCTTGGTAAAGCTAACGCAGA
GCTTGCTTTCCTCAGCATGAAGCTCCCCGTTTCACGAATGCAGCGTGACTTGACTGATTC
GACTGTGTTGAGGAACATGGGTGGAGCTTTAGGACACTCTCTTCTCGCTTACAAGAGCGC
CATACAGGGAATCAGGAAGCTTCAGGTTAATGAAGCTCGGTTAAAAGGAGATTTGGATCA
AACTTGGGAATTCCTTGCTGAACCAATACAAACTGTGATGAGGAGGTATGGTGTTCCAGA
GCCGTATGAGAAGCTGAAGGAGCTGACA*GAGGAAGAGCTGTGAATGAAGAAAGTATAAG
AGAGTTTATCAAAGGTT*GGATTTGCCTGA**GAGCAAA*TCTCA*CTTTTAAAGTTA*C
ACCACACACATATGTTGGTGCTGCTGCTGCTT*GGCTT*GGCCGTCGATGA*GCTCTGCA
CTTTGGACGTTGATGATGATCAA
TC

QA 1 923 1 923
DS 

RD RR2BI30JQ 881 0 0
TGTTGCAGAGGAGTTTGTTACTTCTCTCGGATTAGCCTTTAACCCATACGTCACTCAGAT
TGAGCCTCATGACTATATGGCTAGACTTTTTAATACAATCAGCCAGTTCAACAATATCTT
GATTGATTTCGATAGAGATATATGGAGCTACATATCTTTAGGTTGCTTTAAGCAGATAAC
TAAAGCTGGTGAGATTGGATCATCCACAATGCCTCACAAAGTGAATCCTATTGACTTTGA
GAACAGTGAAGGGAATCTTGGTAAAGCTAACGCAGAGCTTGCTTTCCTCAGCATGAAGCT
CCCCGTTTCACGAATGCAGCGTGACTTGACTGATTCGACTGTGTTGAGGAACATGGGTGG
AGCTTTAGGACACTCTCTTCTCGCTTACAAGAGCGCCATACAGGGAATCAGGAAGCTTCA
GGTTAATGAAGCTCGGTTAAAAGGAGATTTGGATCAAACTTGGGAATTCCTTGCTGAACC
AATACAAACTGTGATGAGGAGGTATGGTGTTCCAGAGCCGTATGAGAAGCTGAAGGAGCT
GACAAGAGGAAGAGCTGTGAATGAAGAAAGTATAAGAGAGTTTATCAAAGGTTTGGATTT
GCCTGAAGAAGCAAAATCTCAACTTTTAAAGTTAACACCACACACATATGTTGGTGCTGC
TGCTGCTTTGGCTTTGGCCGTCGATGAAGCTCTGCACTTTGGACGTTGATGATGATCAAA
TCGGTGATAAGGTTTGGTCTTGTATTATTAATGCCTCTCTTCCAAATGAAATGGGAAGAA
AGAAACTTTGATACAACATATGGTTGGGATTATTTTTGTACTGTTGTGTTATGTTCCTTC
TTTCATGATTTTGACAACCAATCCATTGGTTCAAAGAAAAG

QA 1 881 1 881
DS 



AS 1 2

CO CL7636Contig1 659 2 2 U
GATTTCCCATTCCACACCTTGTGGGTACTTGAACTAGAGGCACCGATTTTTGGTTCCCTG
TCCATTATCCCGTCAAGGCGAAACGTTATTTGCTGCTTAGTTGATGGCCAAGTTGTCGCA
ATGAGCCCGTCTGGAACTATTGTTTGGAAGTATAGGACTGGCGGGCCAATATTTGCTGGG
CCTTGCATGTCACATGTCCTTCCTTCTCAGGTGCTCGTGTGCTGTAGAAATGGAAGAGTT
TATTCACTAGAATCGGAGTCTGGGTGTCATTTGTGGGAATACAATATCGGTGACCCGATC
ACGGCATCGGCATACATCGATGAAAATCTGCATTTTGAATCGCATCAACTCCTTGGAACA
GACAGGTTGGTGCCTGTATGCTCTAGCTCGGGAAGAGTTCATGTCCTTCGCGTGAGACCT
AGTCTTAGCAAAGATTCACGTGAATCAAAAGTAGGAGAAATAGCGAAGTTGGAGTTGCAG
GCAGATATTTTCTCTTCACCAGTGATGATTGGTGGCCGGATTTTTGTTGGCTGTCGTGAC
GACTATGTGCATTGCCTCACTCTTGAGAGTTGTTGCAGGTAGAAGAGGTAAATATGTGGA
AGTTTTGAATTTTTTTGTCAACCTTGTATGTATTATTAAAACAAGAAATTTTTACATGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AD18TF U 1
AF RR2AD18JQ C 1
BS 1 574 RR2AD18TF
BS 575 659 RR2AD18JQ

RD RR2AD18TF 574 0 0
GATTTCCCATTCCACACCTTGTGGGTACTTGAACTAGAGGCACCGATTTTTGGTTCCCTG
TCCATTATCCCGTCAAGGCGAAACGTTATTTGCTGCTTAGTTGATGGCCAAGTTGTCGCA
ATGAGCCCGTCTGGAACTATTGTTTGGAAGTATAGGACTGGCGGGCCAATATTTGCTGGG
CCTTGCATGTCACATGTCCTTCCTTCTCAGGTGCTCGTGTGCTGTAGAAATGGAAGAGTT
TATTCACTAGAATCGGAGTCTGGGTGTCATTTGTGGGAATACAATATCGGTGACCCGATC
ACGGCATCGGCATACATCGATGAAAATCTGCATTTTGAATCGCATCAACTCCTTGGAACA
GACAGGTTGGTGCCTGTATGCTCTAGCTCGGGAAGAGTTCATGTCCTTCGCGTGAGACCT
AGTCTTAGCAAAGATTCACGTGAATCAAAAGTAGGAGAAATAGCGAAGTTGGAGTTGCAG
GCAGATATTTTCTCTTCACCAGTGATGATTGGTGGCCGGATTTTTGTTGGCTGTCGTGAC
GACTATGTGCATTGCCTCACTCTTGAGAGTTGTT

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2AD18JQ 659 0 0
GATTTCCCATTCCACACCTTGTGGGTACTTGAACTAGAGGCACCGATTTTTGGTTCCCTG
TCCATTATCCCGTCAAGGCGAAACGTTATTTGCTGCTTAGTTGATGGCCAAGTTGTCGCA
ATGAGCCCGTCTGGAACTATTGTTTGGAAGTATAGGACTGGCGGGCCAATATTTGCTGGG
CCTTGCATGTCACATGTCCTTCCTTCTCAGGTGCTCGTGTGCTGTAGAAATGGAAGAGTT
TATTCACTAGAATCGGAGTCTGGGTGTCATTTGTGGGAATACAATATCGGTGACCCGATC
ACGGCATCGGCATACATCGATGAAAATCTGCATTTTGAATCGCATCAACTCCTTGGAACA
GACAGGTTGGTGCCTGTATGCTCTAGCTCGGGAAGAGTTCATGTCCTTCGCGTGAGACCT
AGTCTTAGCAAAGATTCACGTGAATCAAAAGTAGGAGAAATAGCGAAGTTGGAGTTGCAG
GCAGATATTTTCTCTTCACCAGTGATGATTGGTGGCCGGATTTTTGTTGGCTGTCGTGAC
GACTATGTGCATTGCCTCACTCTTGAGAGTTGTTGCAGGTAGAAGAGGTAAATATGTGGA
AGTTTTGAATTTTTTTGTCAACCTTGTATGTATTATTAAAACAAGAAATTTTTACATGC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL7637Contig1 732 2 2 U
GTAAGCAAACATTTTAATTAATTAGTCCTAACTTTGACGGATAGCATATCACATATTTTT
AGAAGGAAAACTTAGATTTAAACGAAATATGAAATATTGCATAGTCCAAACAATAAAAGA
AATTTAGCAACCCAATAAGTTAAACCAGGACCATTTCTTGGAATATTTTTTCTTCTTCCT
GTTTGGTTTGCAAGTTTTATTAGCATCCTTCTTCATCCCCAGCAGTGGTTTCTCAATATT
TATCACTTTCTCTTCTTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCAATCTTCTCTTT
TGTTTCCTGAGGGTCTAGTGAATGCTGTAAGGGAATATGAAAAGGATTAATGTTGCTACT
GAAAATGGGTAATGTCTTTGTCAAATCTCTCTTAATCCTTTGACTTGATGTTTCACCGGA
CCCTCCAGTTGAAGTAGAAGATGCACTGCTCGATTCCAACTCCAAACATATCTGAAAAAG
TCTGGTCTCCAAAGCTGCAATTCTATCTAGTAGTGATCCTTTGAAATAAGCTTCTTTAAC
CGCCGTGCCTCTACTGATTAATCCGCGTGTAGTAGATGTGCTTTCATCTTTCCATTTCGG
AACGTCTTGTTGTCTTTCTAAATTCTTTATAACAAAATCCAAATGCTCAAGCCTAGAGAG
CATAGGCAAAGAAGAGAGTGAATGTCTTTGTTGCTCCATTGTCTCCATCAGACCTAATAT
TTTTTTTCTCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GL64TF C 1
AF RR2GL64JQ U 3
BS 1 2 RR2GL64TF
BS 3 732 RR2GL64JQ

RD RR2GL64TF 732 0 0
GTAAGCAAACATTTTAATTAATTAGTCCTAACTTTGACGGATAGCATATCACATATTTT*
AGAAGGAAAACTTAGATTTAAACGAAATATGAAATATTGCATAGTCCAAACAATAAAAGA
AATTTAGCAACC*AATAAGTTAAACCAGGACCATTTCTTGGAATATTTTTTCTTCTTCCT
GTTTGGTTTGCAAGTTTTATTAGCATCCTTCTTCATCCCCAGCAGTGGTTTCTCAATATT
TATCACTTTCTCTTCTTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCAATCTTCTCTTT
TGTTTCCTGAGGGTCTAGTGAATGCTGTAAGGGAATATGAAAAGGATTAATGTTGCTACT
GAAAATGGGTAATGTCTTTGTCAAATCTCTCTTAATCCTTTGACTTGATGTTTCACCGGA
CCCTCCAGTTGAAGTAGAAGATGCACTGCTCGATTCCAACTCCAAACATATCTGAAAAAG
TCTGGTCTCCAAAGCTGCAATTCTATCTAGTAGTGATCCTTTGAAATAAGCTTCTTTAAC
CGCCGTGCCTCTACTGATTAATCCGCGTGTAGTAGATGTGCTTTCATCTTTCCATTTCGG
AACGTCTTGTTGTCTTTCTAAATTCTTTATAACAAAATCCAAATGCTCAAGCCTAGAGAG
CATAGGCAAAGAAGAGAGTGAATGTCTTTGTTGCTCCATTGTCTCCATCAGACCTAATAT
TTTTTTTCTCCC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2GL64JQ 730 0 0
AAGCAAACATTTTAATTAATTAGTCCTAACTTTGACGGATAGCATATCACATATTTTTAG
AAGGAAAACTTAGATTTAAACGAAATATGAAATATTGCATAGTCCAAACAATAAAAGAAA
TTTAGCAACCCAATAAGTTAAACCAGGACCATTTCTTGGAATATTTTTTCTTCTTCCTGT
TTGGTTTGCAAGTTTTATTAGCATCCTTCTTCATCCCCAGCAGTGGTTTCTCAATATTTA
TCACTTTCTCTTCTTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCAATCTTCTCTTTTG
TTTCCTGAGGGTCTAGTGAATGCTGTAAGGGAATATGAAAAGGATTAATGTTGCTACTGA
AAATGGGTAATGTCTTTGTCAAATCTCTCTTAATCCTTTGACTTGATGTTTCACCGGACC
CTCCAGTTGAAGTAGAAGATGCACTGCTCGATTCCAACTCCAAACATATCTGAAAAAGTC
TGGTCTCCAAAGCTGCAATTCTATCTAGTAGTGATCCTTTGAAATAAGCTTCTTTAACCG
CCGTGCCTCTACTGATTAATCCGCGTGTAGTAGATGTGCTTTCATCTTTCCATTTCGGAA
CGTCTTGTTGTCTTTCTAAATTCTTTATAACAAAATCCAAATGCTCAAGCCTAGAGAGCA
TAGGCAAAGAAGAGAGTGAATGTCTTTGTTGCTCCATTGTCTCCATCAGACCTAATATTT
TTTTTCTCCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL7638Contig1 580 2 2 U
GGAACCAATACTTCTCTCTCAGTACTCATCTTTTAGAAACTCAAACAAAAAGAAACCAAA
CTAGTTTGAGTAGATCCAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTAACAAAACAAAAATGGCTAAGTC
ATATGGAGCTCTCTTCCTCTTGGCCCTCGTTGTCTTCTCCTTGCTCCAAACCATGGTTAT
GGCCTCAAAGGGATCTGGAGGGAATTGGAACCCAAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTAAA
ACGTTCCCAATGCCCGAAGGAGTGCGATAGGAGGTGTAGCCAAACACAGTACCACAACGC
GTGCATTTTATTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAATGTTTGTGTGTGCCTCCGGGTTACTA
TGGGAACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAAGGTGGACCAAA
ATGCCCTTGAAAACATCCCAATCGCGGTTCCTTTTTATAATTAAAGTTTTCGATGATATT
TATATTTCACTTTGATCCAACTGTTGGTTTTGTGTTTCTTGTTCTATCTATTTTATTCCT
AATGTTGTAATGCTATGCCACTCCTTTGGGACTTTGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C228JQ C 1
AF RR2C228TF U 7
BS 1 6 RR2C228JQ
BS 7 580 RR2C228TF

RD RR2C228JQ 580 0 0
GGAACCAATACTTCTCTCTCAGTACTCATCTTTTAGAAACTCAAACAAAAAGAAACCAAA
CTAGTTTGAGTAGATCCAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTAACAAAACAAAAATGGCTAAGTC
ATATGGAGCTCTCTTCCTCTTGGCCCTCGTTGTCTTCTCCTTGCTCCAAACCATGGTTAT
GGCCTCAAAGGGATCTGGAGGGAATTGGAACCCAAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTAAA
ACGTTCCCAATGCCCGAAGGAGTGCGATAGGAGGTGTAGCCAAACACAGTACCACAACGC
GTGCATTTTATTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAATGTTTGTGTGTGCCTCCGGGTTACTA
TGGGAACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAAGGTGGACCAAA
ATGCCCTTGAAAACATCCCAATCGCGGTTCCTTTTTATAATTAAAGTTTTCGATGATATT
TATATTTCACTTTGATCCAACTGTTGGTTTTGTGTTTCTTGTTCTATCTATTTTATTCCT
AATGTTGTAATGCTATGCCACTCCTTTGGGACTTTGTTCT

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2C228TF 574 0 0
AATACTTCTCTCTCAGTACTCATCTTTTAGAAACTCAAACAAAAAGAAACCAAACTAGTT
TGAGTAGATCCAGAGGAGTGTTTGGTTCTTTAACAAAACAAAAATGGCTAAGTCATATGG
AGCTCTCTTCCTCTTGGCCCTCGTTGTCTTCTCCTTGCTCCAAACCATGGTTATGGCCTC
AAAGGGATCTGGAGGGAATTGGAACCCAAAACGTTATGGACCAGGAAGCCTAAAACGTTC
CCAATGCCCGAAGGAGTGCGATAGGAGGTGTAGCCAAACACAGTACCACAACGCGTGCAT
TTTATTCTGCAACAAATGCTGCAGAAAATGTTTGTGTGTGCCTCCGGGTTACTATGGGAA
CAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAAGGTGGACCAAAATGCCC
TTGAAAACATCCCAATCGCGGTTCCTTTTTATAATTAAAGTTTTCGATGATATTTATATT
TCACTTTGATCCAACTGTTGGTTTTGTGTTTCTTGTTCTATCTATTTTATTCCTAATGTT
GTAATGCTATGCCACTCCTTTGGGACTTTGTTCT

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL7639Contig1 1100 2 2 U
GGAGTTGGACTAATTGCAGCGGTTGGAGAATCTGTTAAGAATTTGCAAGTTGGGACTCCA
GCTGCTGTTATGACATTTGGAGCATATGCTGAATACATGATAGTTTCTGCTAAGCACGTA
CTCCCTGTTCCAAGGCCAGATCCAGAAGTTGTTGCCATGCTTACCTCAGGATTAACTGCT
TTAACCGCCCTTGAGAAGGCAGGTCAAATGAAATCAGATGAAACAGTACTTGTGACTGCT
GCTGCTGGAGGGACTGGGCAATTTGCAGTCCAGCTTGCAAAGTTAGCCGGAAATAAGGTG
ATTGCTACTTGTGGGGGTTCAGAGAAGGCCAAGCTATTAAAAGATCTTGGGGTCGATAGA
GTCATAGACTACAAAGCCGAAGATATCAAGACGGTCCTGAAAAAGGAGTTTCCAAAGGGT
GTGAATATCATATATGAATCTGTCGGTGGTAAAATGTTTGATCTGTGCTTGAATGCTCTT
GCTGTTTACGGACGACTCATAGTGATTGGAATGATCTCCCAGTATCAAGGAGAGAAGGGA
TGGCAGCCTGCAAACTATCCAGGGCTGTGCGAGAAAATCCTTGCAAAAAGCCAAACGGTG
GCCGGTTTCTTTCTGGTGCAATATAGTCAACTCTGGAAACAAAATCTTGAAAAGTTGTTC
AATCTTTATTCTCTTGGAAAGCTTAAGGTTGGGGTTGATCAGAAAAAGTTTATAGGCCTA
AACACTGTTTCAGACGCTGTTGAGTATCTGCATTCCGGTAAAAGCTCTGGAAAGGTTGTG
GTTTGCATGGATCCTACGTTTGAGCAGACAACGTCGAGGCTGTGAACAAGAACAAGGACA
AATCCAAATCCAGTTTGAGATTCAGTAAAAGAAATCTTAGGATTGGAGTTCTTCAGTAGA
GACGAAGTTGTTTGGTTTTACATTTTCAAATATGGGAAATAAGCTGTTTGATCTCATGTA
GACTCACCCGTTAATAAGCTTTCAATCGTGGACATGCTTAGCTTTCGACTAGATGGTCGT
ACGTCTGAGAGTATTATAGCATATTTGATTTTCTTTTGTGTTATAGGTGAAGATGATATG
ATGATTTACATGATTGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FA08TF U 1
AF RR2FA08JQ C 536
BS 1 682 RR2FA08TF
BS 683 1100 RR2FA08JQ

RD RR2FA08TF 682 0 0
GGAGTTGGACTAATTGCAGCGGTTGGAGAATCTGTTAAGAATTTGCAAGTTGGGACTCCA
GCTGCTGTTATGACATTTGGAGCATATGCTGAATACATGATAGTTTCTGCTAAGCACGTA
CTCCCTGTTCCAAGGCCAGATCCAGAAGTTGTTGCCATGCTTACCTCAGGATTAACTGCT
TTAACCGCCCTTGAGAAGGCAGGTCAAATGAAATCAGATGAAACAGTACTTGTGACTGCT
GCTGCTGGAGGGACTGGGCAATTTGCAGTCCAGCTTGCAAAGTTAGCCGGAAATAAGGTG
ATTGCTACTTGTGGGGGTTCAGAGAAGGCCAAGCTATTAAAAGATCTTGGGGTCGATAGA
GTCATAGACTACAAAGCCGAAGATATCAAGACGGTCCTGAAAAAGGAGTTTCCAAAGGGT
GTGAATATCATATATGAATCTGTCGGTGGTAAAATGTTTGATCTGTGCTTGAATGCTCTT
GCTGTTTACGGACGACTCATAGTGATTGGAATGATCTCCCAGTATCAAGGAGAGAAGGGA
TGGCAGCCTGCAAACTATCCAGGGCTGTGCGAGAAAATCCTTGCAAAAAGCCAAACGGTG
GCCGGTTTCTTTCTGGTGCAATATAGTCAACTCTGGAAACAAAATCTTGAAAAGTTGTTC
AATCTTTATTCTCTTGGAAAGC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2FA08JQ 565 0 0
AGGGATGGCAGCCTGCAAACTATCCAGGGCTGTGCGAGAAAATCCTTGCAAAAAGCCAAA
CGGTGGCCGGTTTCTTTCTGGTGCAATATAGTCAACTCTGGAAACAAAATCTTGAAAAGT
TGTTCAATCTTTATTCTCTTGGAAAGCTTAAGGTTGGGGTTGATCAGAAAAAGTTTATAG
GCCTAAACACTGTTTCAGACGCTGTTGAGTATCTGCATTCCGGTAAAAGCTCTGGAAAGG
TTGTGGTTTGCATGGATCCTACGTTTGAGCAGACAACGTCGAGGCTGTGAACAAGAACAA
GGACAAATCCAAATCCAGTTTGAGATTCAGTAAAAGAAATCTTAGGATTGGAGTTCTTCA
GTAGAGACGAAGTTGTTTGGTTTTACATTTTCAAATATGGGAAATAAGCTGTTTGATCTC
ATGTAGACTCACCCGTTAATAAGCTTTCAATCGTGGACATGCTTAGCTTTCGACTAGATG
GTCGTACGTCTGAGAGTATTATAGCATATTTGATTTTCTTTTGTGTTATAGGTGAAGATG
ATATGATGATTTACATGATTGCTCC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL7640Contig1 815 2 2 U
GCAGCTGTTGAAGTCAATGGGAGTGGATCATGTTGTTGATTTAGGCAGTGAAAATGTTAT
TACGAGCGTCAAAGAGTTCGTCAAGACAAGAAAGCTCAAAGGTGTTGATGTTCTGTATGA
TCCTGTAGGAGGGAAACTCACCAAGGAGTCCATGAAAGTTCTCAACTGGGGAGCTCAGAT
TCTTGTGATTGGTTTCGCAAGCGGTGAAGTACCTCTCATTCCCGCTAACATAGCACTTGT
TAAGAACTGGACGGTTCATGGTCTTTATTGGGGCAGCTACAAAATCCACCAACCCAATGT
TCTCGATGATTCCATCAGAGAGTTGCTGTCATGGCTTGCTAGAGGATTGATCACCATTCA
CATCTCCCATACCTATAGTCTCTCCCAGTCCAATCTTGCATTTGGGGCCATCAAAGACAG
GAAGGCAATAGGAAAAGTGATGATTGCTCTCGACCACAAGGCTACTCTGTCTTCAAAACT
ATAGACACTCTCTCTAGCCAAGCCACAGAAGAGAACTGATTCTGCTTCTCTAAGTTTACC
ATGTCATAATGTAGTTTACCACACATCCTGTTCGAATTTAATAATCATCACTTGTTTGGA
TTCTCTACAAATAACTTTTTCTTTCAGAATAAAACTTTTATGCAAACCGGTTTTGGTTTG
AGGGAAGATTAAGGTTCTGTCTTTCAGGTTAGTACCGGTTTAAGCATAAAAGAAACCAGT
ATAGAATCCAAAGATTCAAGGCTGTAGCCTGTATGAGACTAACATATATCTATGTTGTCT
TTTTACAAAATTAGCAAATCAGTTATTATGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FX65TF U 1
AF RR2FX65JQ C 73
BS 1 646 RR2FX65TF
BS 647 815 RR2FX65JQ

RD RR2FX65TF 646 0 0
GCAGCTGTTGAAGTCAATGGGAGTGGATCATGTTGTTGATTTAGGCAGTGAAAATGTTAT
TACGAGCGTCAAAGAGTTCGTCAAGACAAGAAAGCTCAAAGGTGTTGATGTTCTGTATGA
TCCTGTAGGAGGGAAACTCACCAAGGAGTCCATGAAAGTTCTCAACTGGGGAGCTCAGAT
TCTTGTGATTGGTTTCGCAAGCGGTGAAGTACCTCTCATTCCCGCTAACATAGCACTTGT
TAAGAACTGGACGGTTCATGGTCTTTATTGGGGCAGCTACAAAATCCACCAACCCAATGT
TCTCGATGATTCCATCAGAGAGTTGCTGTCATGGCTTGCTAGAGGATTGATCACCATTCA
CATCTCCCATACCTATAGTCTCTCCCAGTCCAATCTTGCATTTGGGGCCATCAAAGACAG
GAAGGCAATAGGAAAAGTGATGATTGCTCTCGACCACAAGGCTACTCTGTCTTCAAAACT
ATAGACACTCTCTCTAGCCAAGCCACAGAAGAGAACTGATTCTGCTTCTCTAAGTTTACC
ATGTCATAATGTAGTTTACCACACATCCTGTTCGAATTTAATAATCATCACTTGTTTGGA
TTCTCTACAAATAACTTTTTCTTTCAGAATAAAACTTTTATGCAAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2FX65JQ 743 0 0
AGAGTTCGTCAAGACAAGAAAGCTCAAAGGTGTTGATGTTCTGTATGATCCTGTAGGAGG
GAAACTCACCAAGGAGTCCATGAAAGTTCTCAACTGGGGAGCTCAGATTCTTGTGATTGG
TTTCGCAAGCGGTGAAGTACCTCTCATTCCCGCTAACATAGCACTTGTTAAGAACTGGAC
GGTTCATGGTCTTTATTGGGGCAGCTACAAAATCCACCAACCCAATGTTCTCGATGATTC
CATCAGAGAGTTGCTGTCATGGCTTGCTAGAGGATTGATCACCATTCACATCTCCCATAC
CTATAGTCTCTCCCAGTCCAATCTTGCATTTGGGGCCATCAAAGACAGGAAGGCAATAGG
AAAAGTGATGATTGCTCTCGACCACAAGGCTACTCTGTCTTCAAAACTATAGACACTCTC
TCTAGCCAAGCCACAGAAGAGAACTGATTCTGCTTCTCTAAGTTTACCATGTCATAATGT
AGTTTACCACACATCCTGTTCGAATTTAATAATCATCACTTGTTTGGATTCTCTACAAAT
AACTTTTTCTTTCAGAATAAAACTTTTATGCAAACCGGTTTTGGTTTGAGGGAAGATTAA
GGTTCTGTCTTTCAGGTTAGTACCGGTTTAAGCATAAAAGAAACCAGTATAGAATCCAAA
GATTCAAGGCTGTAGCCTGTATGAGACTAACATATATCTATGTTGTCTTTTTACAAAATT
AGCAAATCAGTTATTATGGTTCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL7641Contig1 861 2 12 U
GGTATTGAGCAACACCAAGGGACAGATGTCTGGCCTTCTACTCAGAAGAGTTGATACCGG
AGAAGAAACCGAGCTGGAGGCCAAAGGACTGTTTTATGGAATTGGACATTCGCCGAACAG
TCAGTTACTGGAAGGCCAAGTCGAACTCGACAGCTCAGGGTACGTGTTGGTTCGTGAAGG
ATCATCGAATACATCAGTTGAAGGTGTATTTGCTGCAGGAGATGTGCAGGACCATGAATG
GAGACAAGCTGTAACGGCTGCTGGATCAGGATGCATAGCCGCGTTGTCAGCTGAGAGATA
CCTCACAAGTAACAATCTTCTTGTTGAATTTCACCAGCCTCAAACTGAAGAGACCAAAAA
AGAGTTCACACAGCGGGATGTCCAAGAAAAGTTCGACGTCACTCTTACAAAGCATCGGGG
ACAGTATGCTCTTAGAAAACTATACCATGAGAGTTCAAGAGTTATATGTGTGTTATACAC
ATCACCAACATGTGGTCCCTGTAGGACTCTGAAGCCAATCTTGAACAAGGTGGTCGATGA
GTATAACAATGATGTGCACTTGGTTGAGATTGATATCGAGGAAGATCAAGAAATTGCTGA
AGCAGCCGGGATCATGGGAACACCATGTGTGCAATTCTTCAAGAACAAAGAAATGCTCAG
GACTATATCTGGTGTGAAGATGAAGAAAGAGTACAGGGAACTCATCGAAGCCAATAAATG
AGGATCAGCATATAGATATGATTGTTTCTGGCAGGCACCATTGTTTCATTTTAATACGTT
AGAGTTAACGCCATTGAATCTCAAATGGAAACAGATTAAATGTTCGTTATCTTAAGCTGC
ACGCATGCATTATGTTGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI54TF U 1
AF RR2CI54JQ C 138
BS 1 660 RR2CI54TF
BS 661 661 RR2CI54JQ
BS 662 677 RR2CI54TF
BS 678 678 RR2CI54JQ
BS 679 697 RR2CI54TF
BS 698 698 RR2CI54JQ
BS 699 708 RR2CI54TF
BS 709 709 RR2CI54JQ
BS 710 713 RR2CI54TF
BS 714 714 RR2CI54JQ
BS 715 734 RR2CI54TF
BS 735 861 RR2CI54JQ

RD RR2CI54TF 734 0 0
GGTATTGAGCAACACCAAGGGACAGATGTCTGGCCTTCTACTCAGAAGAGTTGATACCGG
AGAAGAAACCGAGCTGGAGGCCAAAGGACTGTTTTATGGAATTGGACATTCGCCGAACAG
TCAGTTACTGGAAGGCCAAGTCGAACTCGACAGCTCAGGGTACGTGTTGGTTCGTGAAGG
ATCATCGAATACATCAGTTGAAGGTGTATTTGCTGCAGGAGATGTGCAGGACCATGAATG
GAGACAAGCTGTAACGGCTGCTGGATCAGGATGCATAGCCGCGTTGTCAGCTGAGAGATA
CCTCACAAGTAACAATCTTCTTGTTGAATTTCACCAGCCTCAAACTGAAGAGACCAAAAA
AGAGTTCACACAGCGGGATGTCCAAGAAAAGTTCGACGTCACTCTTACAAAGCATCGGGG
ACAGTATGCTCTTAGAAAACTATACCATGAGAGTTCAAGAGTTATATGTGTGTTATACAC
ATCACCAACATGTGGTCCCTGTAGGACTCTGAAGCCAATCTTGAACAAGGTGGTCGATGA
GTATAACAATGATGTGCACTTGGTTGAGATTGATATCGAGGAAGATCAAGAAATTGCTGA
AGCAGCCGGGATCATGGGAACACCATGTGTGCAATTCTTCAAGAACAAAGAAATGCTCAG
*ACTATATCTGGTGTGA*GATGAAGAAAGAGTACAGG*AACTCATCGA*GCCA*TAAATG
AGGATCAGCATATA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RR2CI54JQ 724 0 0
AAGTCGAACTCGACAGCTCAGGGTACGTGTTGGTTCGTGAAGGATCATCGAATACATCAG
TTGAAGGTGTATTTGCTGCAGGAGATGTGCAGGACCATGAATGGAGACAAGCTGTAACGG
CTGCTGGATCAGGATGCATAGCCGCGTTGTCAGCTGAGAGATACCTCACAAGTAACAATC
TTCTTGTTGAATTTCACCAGCCTCAAACTGAAGAGACCAAAAAAGAGTTCACACAGCGGG
ATGTCCAAGAAAAGTTCGACGTCACTCTTACAAAGCATCGGGGACAGTATGCTCTTAGAA
AACTATACCATGAGAGTTCAAGAGTTATATGTGTGTTATACACATCACCAACATGTGGTC
CCTGTAGGACTCTGAAGCCAATCTTGAACAAGGTGGTCGATGAGTATAACAATGATGTGC
ACTTGGTTGAGATTGATATCGAGGAAGATCAAGAAATTGCTGAAGCAGCCGGGATCATGG
GAACACCATGTGTGCAATTCTTCAAGAACAAAGAAATGCTCAGGACTATATCTGGTGTGA
AGATGAAGAAAGAGTACAGGGAACTCATCGAAGCCAATAAATGAGGATCAGCATATAGAT
ATGATTGTTTCTGGCAGGCACCATTGTTTCATTTTAATACGTTAGAGTTAACGCCATTGA
ATCTCAAATGGAAACAGATTAAATGTTCGTTATCTTAAGCTGCACGCATGCATTATGTTG
TTAC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL7642Contig1 574 2 1 U
GGAAGTTTTCTACATCCACACAAAAAAAATTCTCCAGAACATAAGCACACATTTAGAGAC
ACGGATGATCTTGAGTTATTACAAGATCTGTCCAAATTCAACTTCCCAGCAACCATCAAG
ACCCCATCTAAAACCTCTAAAGACAACAAAGACGGCGATGATGACAACGATGAGGGTTTT
AGCTGCAGCACACCCACATCTCAAGAACACAAGATTCCTTCTGTCCACGATTCTCCACCT
CCCCCGCCGCGAAAACCTCGTGCACTGCCTTCAAAACCGTCGCCAACAGCGGCTCTGATG
ATCAGATCGTGTAAGAGGAAGCTCTTAGTGTCCACTCCTGAGATTATCATGAACAAGGAA
GAGATTGACCGGTTCTTCTGCTCCGTCTATAGTGACACGTCGACGACGACGAAACGGCGG
AGACGTTATCTTTATCGTGCACGAAGATGAGCCTTTAGTTCAAGATTTACATTTCTCTAC
AGTTTTACTGGAAATACCGTAAACTCATTATAGTATAAATTTAAAAGCTTCTTATAAAGT
ATTTTTAATTTTATAAAATGGATGGATAATTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BL84JQ C 1
AF RR2BL84TF U 1
BS 1 574 RR2BL84TF

RD RR2BL84JQ 574 0 0
GGAAGTTTTCTACATCCACACAAAAAAAATTCTCCAGAACATAAGCACACATTTAGAGAC
ACGGATGATCTTGAGTTATTACAAGATCTGTCCAAATTCAACTTCCCAGCAACCATCAAG
ACCCCATCTAAAACCTCTAAAGACAACAAAGACGGCGATGATGACAACGATGAGGGTTTT
AGCTGCAGCACACCCACATCTCAAGAACACAAGATTCCTTCTGTCCACGATTCTCCACCT
CCCCCGCCGCGAAAACCTCGTGCACTGCCTTCAAAACCGTCGCCAACAGCGGCTCTGATG
ATCAGATCGTGTAAGAGGAAGCTCTTAGTGTCCACTCCTGAGATTATCATGAACAAGGAA
GAGATTGACCGGTTCTTCTGCTCCGTCTATAGTGACACGTCGACGACGACGAAACGGCGG
AGACGTTATCTTTATCGTGCACGAAGATGAGCCTTTAGTTCAAGATTTACATTTCTCTAC
AGTTTTACTGGAAATACCGTAAACTCATTATAGTATAAATTTAAAAGCTTCTTATAAAGT
ATTTTTAATTTTATAAAATGGATGGATAATTTCC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2BL84TF 574 0 0
GGAAGTTTTCTACATCCACACAAAAAAAATTCTCCAGAACATAAGCACACATTTAGAGAC
ACGGATGATCTTGAGTTATTACAAGATCTGTCCAAATTCAACTTCCCAGCAACCATCAAG
ACCCCATCTAAAACCTCTAAAGACAACAAAGACGGCGATGATGACAACGATGAGGGTTTT
AGCTGCAGCACACCCACATCTCAAGAACACAAGATTCCTTCTGTCCACGATTCTCCACCT
CCCCCGCCGCGAAAACCTCGTGCACTGCCTTCAAAACCGTCGCCAACAGCGGCTCTGATG
ATCAGATCGTGTAAGAGGAAGCTCTTAGTGTCCACTCCTGAGATTATCATGAACAAGGAA
GAGATTGACCGGTTCTTCTGCTCCGTCTATAGTGACACGTCGACGACGACGAAACGGCGG
AGACGTTATCTTTATCGTGCACGAAGATGAGCCTTTAGTTCAAGATTTACATTTCTCTAC
AGTTTTACTGGAAATACCGTAAACTCATTATAGTATAAATTTAAAAGCTTCTTATAAAGT
ATTTTTAATTTTATAAAATGGATGGATAATTTCC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL7643Contig1 876 2 2 U
GGATCGGCGTTCGTGAAAAATATATTTTAAAGAAAATAAAAATAATCTATATCCTTTTTT
CAGTTTTTTCTCTCACACATTATTTTCATCATCTTCACTCGAATCCGGAAGAAACAAAGA
CACACCCAGAAGAAAGAGAGATGTCTTCGCCGAGCAAACGCAGAGAAATGGACATGATGA
AGCTGATGATGAGCGACTATAAAGTGGAGACGATCAACGATGGCATGCAGGAGTTCTTTG
TTGAATTCAATGGCCCCAAAGACAGTCTGTATGAAGGAGGAGTGTGGAAGATAAGGGTTG
AGCTTCCAGATGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCTGTTGGTTTCATCACCAAGATTTATC
ACCCTAATGTTGATGAACTGTCCGGTTCTGTTTGCTTAGATGTGATCAACCAGACTTGGA
GTCCTATGTTTGACCTTGTGAATGTGTTTGAGACATTTCTTCCTCAGCTTCTTTTGTATC
CAAACCCATCTGATCGTCCTACTTATGAACTGCGAGTTAAAGAATACTGTGAGAAGTATG
CAAAACCAGGGGAAGGTTTAGAAGATAAGTCTAGCGATGAAGAGCTAAGTGATGAGGAAT
ATGGTTCTGATGACAATGAAGAAGATGATGATGTTGCAATTGCAGGCAACCCAGATCCTT
AAACCGGGATTTGCCTAGAGCACTTGGTTTTTATGTATATCATGCATTTCTATTTATGCT
TATAAGCTGCCGAACTGTGAAATCTGTCTGCTGTTTCTCCCTTTGTGCTTGTTCGCCTGT
TTAAATGTACCGGTTCCGGACGTTTGTGTACATTATTAGACAGAACCGTACTGTTAAATC
TTTCCGATTTCAAAAATAAACGCGTCATTCCGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK48TF U 1
AF RR2CK48JQ C 69
BS 1 642 RR2CK48TF
BS 643 876 RR2CK48JQ

RD RR2CK48TF 642 0 0
GGATCGGCGTTCGTGAAAAATATATTTTAAAGAAAATAAAAATAATCTATATCCTTTTTT
CAGTTTTTTCTCTCACACATTATTTTCATCATCTTCACTCGAATCCGGAAGAAACAAAGA
CACACCCAGAAGAAAGAGAGATGTCTTCGCCGAGCAAACGCAGAGAAATGGACATGATGA
AGCTGATGATGAGCGACTATAAAGTGGAGACGATCAACGATGGCATGCAGGAGTTCTTTG
TTGAATTCAATGGCCCCAAAGACAGTCTGTATGAAGGAGGAGTGTGGAAGATAAGGGTTG
AGCTTCCAGATGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCTGTTGGTTTCATCACCAAGATTTATC
ACCCTAATGTTGATGAACTGTCCGGTTCTGTTTGCTTAGATGTGATCAACCAGACTTGGA
GTCCTATGTTTGACCTTGTGAATGTGTTTGAGACATTTCTTCCTCAGCTTCTTTTGTATC
CAAACCCATCTGATCGTCCTACTTATGAACTGCGAGTTAAAGAATACTGTGAGAAGTATG
CAAAACCAGGGGAAGGTTTAGAAGATAAGTCTAGCGATGAAGAGCTAAGTGATGAGGAAT
ATGGTTCTGATGACAATGAAGAAGATGATGATGTTGCAATTG

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2CK48JQ 808 0 0
TCTCTCACACATTATTTTCATCATCTTCACTCGAATCCGGAAGAAACAAAGACACACCCA
GAAGAAAGAGAGATGTCTTCGCCGAGCAAACGCAGAGAAATGGACATGATGAAGCTGATG
ATGAGCGACTATAAAGTGGAGACGATCAACGATGGCATGCAGGAGTTCTTTGTTGAATTC
AATGGCCCCAAAGACAGTCTGTATGAAGGAGGAGTGTGGAAGATAAGGGTTGAGCTTCCA
GATGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCTGTTGGTTTCATCACCAAGATTTATCACCCTAAT
GTTGATGAACTGTCCGGTTCTGTTTGCTTAGATGTGATCAACCAGACTTGGAGTCCTATG
TTTGACCTTGTGAATGTGTTTGAGACATTTCTTCCTCAGCTTCTTTTGTATCCAAACCCA
TCTGATCGTCCTACTTATGAACTGCGAGTTAAAGAATACTGTGAGAAGTATGCAAAACCA
GGGGAAGGTTTAGAAGATAAGTCTAGCGATGAAGAGCTAAGTGATGAGGAATATGGTTCT
GATGACAATGAAGAAGATGATGATGTTGCAATTGCAGGCAACCCAGATCCTTAAACCGGG
ATTTGCCTAGAGCACTTGGTTTTTATGTATATCATGCATTTCTATTTATGCTTATAAGCT
GCCGAACTGTGAAATCTGTCTGCTGTTTCTCCCTTTGTGCTTGTTCGCCTGTTTAAATGT
ACCGGTTCCGGACGTTTGTGTACATTATTAGACAGAACCGTACTGTTAAATCTTTCCGAT
TTCAAAAATAAACGCGTCATTCCGGTTT

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL7644Contig1 712 2 23 U
GGGATTTTGGCTCTTATCAACAAAGCCAAGTTAGAGCTTTTAACCAGAAGAAGAAGACGG
ACGAAACAAAAAGGAGAGAAAAAAAACGCAAACTCAACTGTATTTGATAACGGTTGTCGT
ATTAGCATCATTTCTCGTACATCCTCAAGTTTGCTCTCCTACCTGTAGTTTCCCGGCGAT
CTTCAACTTCGGCGACTCTAATTCCGACACAGGAGGTCTCTCCGCCGCCTTCGGACAAGC
CCCTTTCCCGAATGGCGAAACCTTCTTCCACACCCCTTCCGGTCGGTTCTCAGATGGTCG
ACTCATAGTTGACTTCATAGCGGAGGAGTTACGTTTGCCATACCTAAACGCTTTCCTAGA
CTCCATCGGTTCAAACTTCAGCCATAGTGCGAACTTCGCCACCGCTGGATCCACCGTCCG
TCCACCAAACACCACCATTTCTCAGAGCGGTGCGAGTCCAATCTCTCTCGACGTTCAGTT
GGTTCAGTTCTCCGATTTCCTCACTCGTTCACAACTCATTCGCACTCAAGGTGGCGTATT
CGAACATTTACTTCCGAGGAAAGAGTATTTCTCTCAAGCATTGTACACATTCGACATTGG
TCAGAACGATCTCACTACTGGGATTGAAACTCAACATGACAACAGATCAAATCAAGGCTT
ACATTCCAGATGTTCTCGATCAGTTGTCCAATGCCATTCGTAAGTGTATAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
0 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AI82TF U 1
AF RR2CA43TF U 71
BS 1 101 RR2AI82TF
BS 102 102 RR2CA43TF
BS 103 186 RR2AI82TF
BS 187 187 RR2CA43TF
BS 188 264 RR2AI82TF
BS 265 265 RR2CA43TF
BS 266 279 RR2AI82TF
BS 280 280 RR2CA43TF
BS 281 285 RR2AI82TF
BS 286 286 RR2CA43TF
BS 287 306 RR2AI82TF
BS 307 307 RR2CA43TF
BS 308 453 RR2AI82TF
BS 454 454 RR2CA43TF
BS 455 527 RR2AI82TF
BS 528 528 RR2CA43TF
BS 529 537 RR2AI82TF
BS 538 538 RR2CA43TF
BS 539 543 RR2AI82TF
BS 544 544 RR2CA43TF
BS 545 635 RR2AI82TF
BS 636 636 RR2CA43TF
BS 637 712 RR2AI82TF

RD RR2AI82TF 712 0 0
GGGATTTTGGCTCTTATCAACAAAGCCAAGTTAGAGCTTTTAACCAGAAGAAGAAGACGG
ACGAAACAAAAAGGAGAGAAAAAAAACGCAAACTCAACTGTCTTTGATAACGGTTGTCGT
ATTAGCATCATTTCTCGTACATCCTCAAGTTTGCTCTCCTACCTGTAGTTTCCCGGCGAT
CTTCAATTTCGGCGACTCTAATTCCGACACAGGAGGTCTCTCCGCCGCCTTCGGACAAGC
CCCTTTCCCGAATGGCGAAACCTTTTTCCACACCCCTTCTGGTCGTTTCTCAGATGGTCG
ACTCATCGTTGACTTCATAGCGGAGGAGTTACGTTTGCCATACCTAAACGCTTTCCTAGA
CTCCATCGGTTCAAACTTCAGCCATAGTGCGAACTTCGCCACCGCTGGATCCACCGTCCG
TCCACCAAACACCACCATTTCTCAGAGCGGTGCTAGTCCAATCTCTCTCGACGTTCAGTT
GGTTCAGTTCTCCGATTTCCTCACTCGTTCACAACTCATTCGCACTCGAGGTGGCGTGTT
CGAGCATTTACTTCCGAGGAAAGAGTATTTCTCTCAAGCATTGTACACATTCGACATTGG
TCAGAACGATCTCACTACTGGGATTGAAACTCAACTTGACAACAGATCAAATCAAGGCTT
ACATTCCAGATGTTCTCGATCAGTTGTCCAATGCCATTCGTAAGTGTATAAG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RR2CA43TF 628 0 0
GGAAAAGAGAAAAAGAT
GCAAACTCAACTGTATTTGATAACGGTTGTCGTATTAGCATCATTTCTCGTACATCCTCA
AGTTTGCTCTCTTGCCTGTAGTTTCCCGGCGATCTTCAACTTCGGCGACTCTAATTCCGA
CACAGGAGGTCTCTCCGCCGCCTTCGGACAAGCCCCTTTCCCGAATGGCGAAACCTTCTT
CCACACCCCTTCCGGTCGGTTCTCAGATGGTCGCCTCATAGTTGACTTCATAGCGGAGGA
GTTAGGTTTGCCATACCTAAACGCTTTCCTAGACTCCATCGGTTCAAACTTCAGCCATGG
TGCGAACTTCGCCACCGCTGGATCCACCGTCCGTCCACCTAACACCACCATTTCTCAGAG
CGGTGCGAGTCCAATCTCTCTCGACGTTCAGTTGGTTCAGTTCTCCGATTTCCTCACTCG
TTCACAACTCATTCGCAGTCAAGGTGGCGTATTTGAATATTTACTTCCGAGGAAAGAGTA
TTTCTCTCAAGCATTGTACACATTCGACATTGGTCAGAACGATCTCACTACTGG*ATTGA
AACTCAACATGACAACAGATCAAATCAAGGCTTACATTCCAGATGTTCTCGATCAGTTGT
CCAATGCCATT

QA 18 628 18 628
DS 



AS 1 2

CO CL7645Contig1 584 2 2 U
TTAGAAACAGATCTTGACGTATTTCATCATTCATAATCATTAACAACGTACACATCTAAT
GAAGGACTACCAAAACATATAGTTATTCGATTAAAACTAAGTAAATAAAGAAAAGTAACG
TGATCTACCAGAAATTAGATACATCTCGTGAAAAGTGTATGTATACACATGTAACGCTCT
CTTTTGGCTTTCACATTCACCTCTTCGATACTAATAACAAGGGAGATTGCGGTTGCAGTT
TAGAGGGCCAGCGTCTGCGGTTAGAGAAGGAACCATGTTCCCTGGAGCCACTGTGAATCG
CTGAGCGGAACTGTATGGCAACTCAACGCTGCCGTAGCCGGAAGGTACGAAGTAAGCTCC
GTTCTTGAAAACGTCCTTTGAAGTTCTCCATCTCCAATTGTTCCACCCTCCTTTCACTTC
TCTCTTTGTCACCTCTTTACTGTTAGATTTATCAGAAGCAATGAAATAGTTTCCCTCACT
GAAAATGGTTGGATCGGCGCTACCACCAATTGCATACATTATCCATTTATCGTATCTATT
GTTTGCCACATGAGCGCAACCTCGTCTTACCCTTGGCATTCTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2BZ73TF C 1
AF RR2BZ73JQ U 3
BS 1 2 RR2BZ73TF
BS 3 584 RR2BZ73JQ

RD RR2BZ73TF 584 0 0
TTAGAAACAGATCT*GACGTATTTCATCATTCATAATCATTAACAACGTACACATCTAAT
GAAGGACTACCAAAACATATAGTTATTCGATTAAAACTAAGTAAATAAAGAAAAGTAACG
TGATCTACCAGAAATTAGATACATCTCGTGAAAAGTGTATGTATACACATGTAACGCTCT
CTTTTGGCTTTCACATTCACCTCTTCGATACTAATAACAAGGGAGATTGCGGTTGCAGTT
TAGAGGGCCAGCGTCTGCGGTTAGAGAAGGAACCATGTTCCCTGGAGCCACTGTGAATCG
CTGAGCGGAACTGTATGGCAACTCAACGCTGCCGTAGCCGGAAGGTACGAAGTAAGCTCC
GTTCTTGAAAACGTCCTTTGAAGTTCTCCATCTCCAATTGTTCCACCCTCCTTTCACTTC
TCTCTTTGTCACCTCTTTACTGTTAGATTTATCAGAAGCAATGAAATAGTTTCCCTCACT
GAAAATGGTTGGATCGGCGCTACCACCAATTGCATACATTATCCATTTATCGTATCTATT
GTTTGCCACATGAGCGCAACCTCGTCTTACCCTTGGCATTC
CCC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2BZ73JQ 582 0 0
AGAAACAGATCTTGACGTATTTCATCATTCATAATCATTAACAACGTACACATCTAATGA
AGGACTACCAAAACATATAGTTATTCGATTAAAACTAAGTAAATAAAGAAAAGTAACGTG
ATCTACCAGAAATTAGATACATCTCGTGAAAAGTGTATGTATACACATGTAACGCTCTCT
TTTGGCTTTCACATTCACCTCTTCGATACTAATAACAAGGGAGATTGCGGTTGCAGTTTA
GAGGGCCAGCGTCTGCGGTTAGAGAAGGAACCATGTTCCCTGGAGCCACTGTGAATCGCT
GAGCGGAACTGTATGGCAACTCAACGCTGCCGTAGCCGGAAGGTACGAAGTAAGCTCCGT
TCTTGAAAACGTCCTTTGAAGTTCTCCATCTCCAATTGTTCCACCCTCCTTTCACTTCTC
TCTTTGTCACCTCTTTACTGTTAGATTTATCAGAAGCAATGAAATAGTTTCCCTCACTGA
AAATGGTTGGATCGGCGCTACCACCAATTGCATACATTATCCATTTATCGTATCTATTGT
TTGCCACATGAGCGCAACCTCGTCTTACCCTTGGCATTCTCC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

CO CL7646Contig1 643 2 1 U
GGACACAGAAAAATCAAAGAGATCGATTATTGTTGCAGAGAGACATGGTGTTCCGCGGCG
ACACGGTGATGTCTGTAGCCCATTTATCAGCTGAGATATTTCAGCGGTTAAGGTGGATCC
CGCCGTCGGATCGAATCAGAAGCGGCGAGATGTTGCAGCTCGTCTGCTGTTTTCCGCTTC
AGGAGTTGGGTCGATTCGTGTTATGGTTCTGGAATTATATATGTCTTCCACCTCCAGAGA
TTCTTTATTTTGATGATGATCTTGATAACGATGATGTTTATGGATCATCTTCGTCTTCGT
CCATTGTTAATCGCCATAATTACTATCATCTTCGTTTGGAGTGACGAAAATTTCGTATTT
TCTGTTTTTTCTTTTTTTTCTTCTTTTACTTGTATAGTGTTTTCTTTTTCCTTTATTTGT
ATAGAAAAATCATCGTGGTATTTTTTTCTGGAGTTACTTGAGATTGTTGGATAAGTTCTC
AATCCTTGTTTATAGAAATCAGGGGTTCTTGAGCATTTGGTGATTGCATATAGTTTAAGA
CCTTCATCATTTCAGGAGCCAGATGAGCTTGTTTTGATGTATTACTTGTGTATAAATCTT
TGTACTTTTGATGCAGATCATCAAGTAACTCTGAGTTTATTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BS07JQ C 1
AF RR2BS07TF U 1
BS 1 643 RR2BS07TF

RD RR2BS07JQ 643 0 0
GGACACAGAAAAATCAAAGAGATCGATTATTGTTGCAGAGAGACATGGTGTTCCGCGGCG
ACACGGTGATGTCTGTAGCCCATTTATCAGCTGAGATATTTCAGCGGTTAAGGTGGATCC
CGCCGTCGGATCGAATCAGAAGCGGCGAGATGTTGCAGCTCGTCTGCTGTTTTCCGCTTC
AGGAGTTGGGTCGATTCGTGTTATGGTTCTGGAATTATATATGTCTTCCACCTCCAGAGA
TTCTTTATTTTGATGATGATCTTGATAACGATGATGTTTATGGATCATCTTCGTCTTCGT
CCATTGTTAATCGCCATAATTACTATCATCTTCGTTTGGAGTGACGAAAATTTCGTATTT
TCTGTTTTTTCTTTTTTTTCTTCTTTTACTTGTATAGTGTTTTCTTTTTCCTTTATTTGT
ATAGAAAAATCATCGTGGTATTTTTTTCTGGAGTTACTTGAGATTGTTGGATAAGTTCTC
AATCCTTGTTTATAGAAATCAGGGGTTCTTGAGCATTTGGTGATTGCATATAGTTTAAGA
CCTTCATCATTTCAGGAGCCAGATGAGCTTGTTTTGATGTATTACTTGTGTATAAATCTT
TGTACTTTTGATGCAGATCATCAAGTAACTCTGAGTTTATTAT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RR2BS07TF 643 0 0
GGACACAGAAAAATCAAAGAGATCGATTATTGTTGCAGAGAGACATGGTGTTCCGCGGCG
ACACGGTGATGTCTGTAGCCCATTTATCAGCTGAGATATTTCAGCGGTTAAGGTGGATCC
CGCCGTCGGATCGAATCAGAAGCGGCGAGATGTTGCAGCTCGTCTGCTGTTTTCCGCTTC
AGGAGTTGGGTCGATTCGTGTTATGGTTCTGGAATTATATATGTCTTCCACCTCCAGAGA
TTCTTTATTTTGATGATGATCTTGATAACGATGATGTTTATGGATCATCTTCGTCTTCGT
CCATTGTTAATCGCCATAATTACTATCATCTTCGTTTGGAGTGACGAAAATTTCGTATTT
TCTGTTTTTTCTTTTTTTTCTTCTTTTACTTGTATAGTGTTTTCTTTTTCCTTTATTTGT
ATAGAAAAATCATCGTGGTATTTTTTTCTGGAGTTACTTGAGATTGTTGGATAAGTTCTC
AATCCTTGTTTATAGAAATCAGGGGTTCTTGAGCATTTGGTGATTGCATATAGTTTAAGA
CCTTCATCATTTCAGGAGCCAGATGAGCTTGTTTTGATGTATTACTTGTGTATAAATCTT
TGTACTTTTGATGCAGATCATCAAGTAACTCTGAGTTTATTAT

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL7647Contig1 562 2 2 U
GGAACTCAGCGGCTCCTACCTTCTATCTTCTCTGCTTAACGTAGTTGAAAAAAAAAAGTT
TGAAAGCTATGGCGTATGCACCACCGATGAAGCAGGCAAAGGCCGGATTTGAGGAGACTC
AAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCTAAAAACGTCAAGAACCTTGAGA
AGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCGAAAGACAAGAGATTGAGAGTGAAAGGACCAG
TGAGGATGCCAACTAAAGTTCTCAAGATTACCACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAAGGAA
CAAACACATGGGACAGATTTGAGCTACGTGTACACAAGCGTGTGATCGATCTGTTCAGCT
CTCCCGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTCGAGG
TCACCATCGCTGATTTTTAGATGCATGCTGTTTAGTTTACAAAACTTGTCTTTGAATTCC
AGCTACTTCTCGCTTTCTTTTTTGTTGCAAGGTTCAGACTTCTTGTTCTCTTCCCATAAT
ATGTTATATCGTTTTGATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX35TF U 1
AF RR2DX35JQ C 153
BS 1 282 RR2DX35TF
BS 283 562 RR2DX35JQ

RD RR2DX35TF 282 0 0
GGAACTCAGCGGCTCCTACCTTCTATCTTCTCTGCTTAACGTAGTTGAAAAAAAAAAGTT
TGAAAGCTATGGCGTATGCACCACCGATGAAGCAGGCAAAGGCCGGATTTGAGGAGACTC
AAGAGCAGATTCACAAGATCAGAATCACTCTCTCCTCTAAAAACGTCAAGAACCTTGAGA
AGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCGAAAGACAAGAGATTGAGAGTGAAAGGACCAG
TGAGGATGCCAACTAAAGTTCTCAAGATTACCACAAGGAAAG

QA 1 282 1 282
DS 

RD RR2DX35JQ 410 0 0
TCCTCTAAAAACGTCAAGAACCTTGAGAAGGTGTGCACTGACTTGGTCCGTGGAGCGAAA
GACAAGAGATTGAGAGTGAAAGGACCAGTGAGGATGCCAACTAAAGTTCTCAAGATTACC
ACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAAGGAACAAACACATGGGACAGATTTGAGCTACGTGTA
CACAAGCGTGTGATCGATCTGTTCAGCTCTCCCGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATC
ACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTCGAGGTCACCATCGCTGATTTTTAGATGCATGCTGTT
TAGTTTACAAAACTTGTCTTTGAATTCCAGCTACTTCTCGCTTTCTTTTTTGTTGCAAGG
TTCAGACTTCTTGTTCTCTTCCCATAATATGTTATATCGTTTTGATTTTT

QA 1 410 1 410
DS 



AS 1 2

CO CL7648Contig1 922 2 4 U
GGAAGAAGAGGTCCGAAGAGTGGCATACACAGTTGCCCATGGCCATGGCTTATGCTATGG
ACTTATCTACTCCAACCTTCTTCTTATCCCCAACTCCTTATTCTTCATCATCTCTCCGCC
GTCTCTCCTCCCTTCCCGTCTCTACCTTCCCTCGCCACTCTAACCGGAGGCTACAGATAC
TTTGCCAGGCCACAGCCGGAACTCAGCCTCAGAGTCAGAGCAACCTCTCTGACTCTAACT
CCAAACTAGCCGCCCGTTCTGGCCAAGACCGTCTTTTGAAGGTTCCGATAGCGAAGATAA
GGAACTTTAGTATAATAGCACATATTGATCATGGGAAGTCGACGTTGGCGGATAAGTTGC
TTCAGGTGACTGGTACTGTTCAGAACAGAGATATGAAGGAGCAGTTTCTTGATAACATGG
ATTTAGAACGTGAGCGAGGCATCACCATCAAGCTCCAGGCAGCTCGAATGCGCTATGTTT
ATGAGGATACACCGTATTGTCTCAACTTGATTGATACTCCAGGCCATGTTGATTTCTCTT
ACGAGGTTTCTCGATCTCTTGCCGCATGTGAGGGTGCTCTTCTTGTTGTGGATGCATCCC
AGGGTGTGGAAGCGCAAACACTGGCCAACGTTTATTTGGCTCTAGAAAACAACCTCGAAA
TCATTCCTGTTGTGAATAAGATTGACCTTCCAGGCGCTGAGCCAGAGCAAGTTCTCAGGG
AGATTGAAGAGGTTATTGGGTTAGACTGTAGCAAAGCAATACTCTGCTCGGCAAAGGAGG
GAATTGGTATAACGGAGATATTGAATGCAATTGTTGAAAGGATACCTCCACCTCCCGAAA
CTGCAGAAAAACCCTTCAGAGCCTTAATTTTCGACAGTTATTATGATCCATATCGTGGTG
TCATTGTATACTTTCGAGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AP75TF U 1
AF RR2AP75JQ C 146
BS 1 719 RR2AP75TF
BS 720 720 RR2AP75JQ
BS 721 732 RR2AP75TF
BS 733 922 RR2AP75JQ

RD RR2AP75TF 732 0 0
GGAAGAAGAGGTCCGAAGAGTGGCATACACAGTTGCCCATGGCCATGGCTTATGCTATGG
ACTTATCTACTCCAACCTTCTTCTTATCCCCAACTCCTTATTCTTCATCATCTCTCCGCC
GTCTCTCCTCCCTTCCCGTCTCTACCTTCCCTCGCCACTCTAACCGGAGGCTACAGATAC
TTTGCCAGGCCACAGCCGGAACTCAGCCTCAGAGTCAGAGCAACCTCTCTGACTCTAACT
CCAAACTAGCCGCCCGTTCTGGCCAAGACCGTCTTTTGAAGGTTCCGATAGCGAAGATAA
GGAACTTTAGTATAATAGCACATATTGATCATGGGAAGTCGACGTTGGCGGATAAGTTGC
TTCAGGTGACTGGTACTGTTCAGAACAGAGATATGAAGGAGCAGTTTCTTGATAACATGG
ATTTAGAACGTGAGCGAGGCATCACCATCAAGCTCCAGGCAGCTCGAATGCGCTATGTTT
ATGAGGATACACCGTATTGTCTCAACTTGATTGATACTCCAGGCCATGTTGATTTCTCTT
ACGAGGTTTCTCGATCTCTTGCCGCATGTGAGGGTGCTCTTCTTGTTGTGGATGCATCCC
AGGGTGTGGAAGCGCAAACACTGGCCAACGTTTATTTGGCTCTAGAAAACAACCTCGAAA
TCATTCCTGTTGTGAATAAGATTGACCTTCCAGGCGCTGAGCCAGAGCAAGTTCTCAGG*
AGATTGAAGAGG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RR2AP75JQ 777 0 0
CTTCCCTCGCCACTCTAACCGGAGGCTACAGATACTTTGCCAGGCCACAGCCGGAACTCA
GCCTCAGAGTCAGAGCAACCTCTCTGACTCTAACTCCAAACTAGCCGCCCGTTCTGGCCA
AGACCGTCTTTTGAAGGTTCCGATAGCGAAGATAAGGAACTTTAGTATAATAGCACATAT
TGATCATGGGAAGTCGACGTTGGCGGATAAGTTGCTTCAGGTGACTGGTACTGTTCAGAA
CAGAGATATGAAGGAGCAGTTTCTTGATAACATGGATTTAGAACGTGAGCGAGGCATCAC
CATCAAGCTCCAGGCAGCTCGAATGCGCTATGTTTATGAGGATACACCGTATTGTCTCAA
CTTGATTGATACTCCAGGCCATGTTGATTTTTCTTACGAGGTTTCTCGATCTCTTGCCGC
ATGTGAGGGTGCTCTTCTTGTTGTGGATGCATCCCAGGGTGTGGAAGCGCAAACACTGGC
CAACGTTTATTTGGCTCTAGAAAACAACCTCGAAATCATTCCTGTTGTGAATAAGATTGA
CCTTCCAGGCGCTGAGCCAGAGCAAGTTTTCAGGGAGATTGAAGAGGTTATTGGGTTAGA
CTGTAGCAAAGCAATACTCTGCTCGGCAAAGGAGGGAATTGGTATAACGGAGATATTGAA
TGCAATTGTTGAAAGGATACCTCCACCTCCCGAAACTGCAGAAAAACCCTTCAGAGCCTT
AATTTTCGACAGTTATTATGATCCATATCGTGGTGTCATTGTATACTTTCGAGTTAT

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL7649Contig1 780 2 2 U
TTCATTCTGGGAGAGAGAAGAAGATGTGAAGCGCCTTGTCGAGAACGGTGTACAGGACAA
AGGTAATCAACTTTCAGGCATACAACTTGGCTCCAGGATTGAAGGGATCATCGACGGGAA
GTTTGAAACGGGCTATCTTGTGACCATGAAGATGGGATCACAGGAGCTCACAGGAGTGCT
TTACCACTCTGCTCCTCCCGAAACTCCTGGAAGACGCAAGAAGAAAGCAAAACTGTCTCA
TGTGAATTCTTTGCTCCCTAAGGTCAACATAAGCGGTTATAACTTCTTCTTCGCTGAGGA
GTACAAGAGGCTTAAGGCTGCGTACGCTGGGCAGGAACGTTCCCTCGTCAAGGAGATCGC
GAACAAGTGGAGGAACCTCTCTCCATCTGATAGAGAGGTTTATCAAGAAAAAGGGGCTAA
GGATAAAGAGAGACACAAGACACAGATGGCTGCGTACTTATCCTTCATTAATATTGGTGC
GGCGGGAAGTGTTGTTGCGACTGATGATGCTGGGGCTGAGGCTGAAGCTCAAGCTGAGGA
TGAGGCCGAGGAGGGTCTCTAGTCTGTCTTATCTGCTTTATTTTTCAGCATTTTATAATT
TAATAATGAGTTTGTAGAGTTGGCCATAGATTTACATGCGTGTAATCTTTGCCAACTTTT
ACATGGGTTGTTGTCTTTCTTTGTTCTTGTTTTTCTCTGTTTTGCAACTTTTGTGTCTGT
CTCTCTGTTTTTATGTTTCCATTTGACAACTTTTAATTAAATCATAAGTTATTTTACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C179TF U 1
AF RR2C179JQ C 4
BS 1 654 RR2C179TF
BS 655 780 RR2C179JQ

RD RR2C179TF 660 0 0
TTCATTCTGGGAGAGAGAAGAAGATGTGAAGCGCCTTGTCGAGAACGGTGTACAGGACAA
AGGTAATCAACTTTCAGGCATACAACTTGGCTCCAGGATTGAAGGGATCATCGACGGGAA
GTTTGAAACGGGCTATCTTGTGACCATGAAGATGGGATCACAGGAGCTCACAGGAGTGCT
TTACCACTCTGCTCCTCCCGAAACTCCTGGAAGACGCAAGAAGAAAGCAAAACTGTCTCA
TGTGAATTCTTTGCTCCCTAAGGTCAACATAAGCGGTTATAACTTCTTCTTCGCTGAGGA
GTACAAGAGGCTTAAGGCTGCGTACGCTGGGCAGGAACGTTCCCTCGTCAAGGAGATCGC
GAACAAGTGGAGGAACCTCTCTCCATCTGATAGAGAGGTTTATCAAGAAAAAGGGGCTAA
GGATAAAGAGAGACACAAGACACAGATGGCTGCGTACTTATCCTTCATTAATATTGGTGC
GGCGGGAAGTGTTGTTGCGACTGATGATGCTGGGGCTGAGGCTGAAGCTCAAGCTGAGGA
TGAGGCCGAGGAGGGTCTCTAGTCTGTCTTATCTGCTTTATTTTTCAGCATTTTATAATT
TAATAATGAGTTTGTAGAGTTGGCCATAGATTTACATGCGTGTAATCTTTGCCA
CTTTTA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RR2C179JQ 777 0 0
TCATCT
GGAGAGAGAAGAAGATGTGAAGCGCCTTGTCGAGAACGGTGTACAGGACAAAGGTAATCA
ACTTTCAGGCATACAACTTGGCTCCAGGATTGAAGGGATCATCGACGGGAAGTTTGAAAC
GGGCTATCTTGTGACCATGAAGATGGGATCACAGGAGCTCACAGGAGTGCTTTACCACTC
TGCTCCTCCCGAAACTCCTGGAAGACGCAAGAAGAAAGCAAAACTGTCTCATGTGAATTC
TTTGCTCCCTAAGGTCAACATAAGCGGTTATAACTTCTTCTTCGCTGAGGAGTACAAGAG
GCTTAAGGCTGCGTACGCTGGGCAGGAACGTTCCCTCGTCAAGGAGATCGCGAACAAGTG
GAGGAACCTCTCTCCATCTGATAGAGAGGTTTATCAAGAAAAAGGGGCTAAGGATAAAGA
GAGACACAAGACACAGATGGCTGCGTACTTATCCTTCATTAATATTGGTGCGGCGGGAAG
TGTTGTTGCGACTGATGATGCTGGGGCTGAGGCTGAAGCTCAAGCTGAGGATGAGGCCGA
GGAGGGTCTCTAGTCTGTCTTATCTGCTTTATTTTTCAGCATTTTATAATTTAATAATGA
GTT*GTAGAGTTGGCCATAGATTTACATGCGTGTAATCTTTGCCAACTTTTACATGGGTT
GTTGTCTTTCTTTGTTCTTGTTTTTCTCTGTTTTGCAACTTTTGTGTCTGTCTCTCTGTT
TTTATGTTTCCATTTGACAACTTTTAATTAAATCATAAGTTATTTTACTTT

QA 7 777 7 777
DS 



AS 1 2

CO CL7650Contig1 701 2 10 U
GATAACTTTCATTAAGAACCGACTTAGGAAACCAATATACTTCAAAGTTTAAACTAAAAC
AGCTGAAAATGATTCATTCAGAGTACAAAAATCTTTTGAGCATGACAAAGATAAACGTTG
CTGAACGTTTTAAGCAAGGATTCTTCTATTGAGATGAATCAGTCGTAGTAAAAGCAGCAG
GAGGTTGCTGAGCGGATCCTGAAGGTGCGCTAGACCCAGTAGGTGCAGAGTCAGGTGGTG
GAGCAAAGGATGCGTTTGGAGCTGGTGCAGGTCTTGATCCAGGACCAGGTTGCTGTGGGT
ATGATTGGTAAGCAGCTGGAGGTGGTGCATAGTGGTGGTGCATAGGACCAGGATACTGCT
GCTGGTAGGGCGATGGCATGTATCCATATGGAGCTGGCGGGTACGGCTGGTGTGGAGGCA
TCATGTAAGAAGACGAAGGTACGTTGCTCTCAGTGCTTGAACCACCAGCTTCTTGGGTTG
AAACGACTGCACCCATTCTCTGTGGGTCCATAGAAGGGTAATAAGGTTTGTCTTGGTTGG
GTGGTGGTGGGTGCATGTAGTACTGCTGCATTGGTGGCGGTTGATTATGCTGCTGAGATA
TAATGGTTCGAGGTAGCAAACCACTATGAGCCACACCACCCTGCTGGTTCGAACCATCTT
GATCGGGTCTGGGAGCCTGAGGTCTTCCCCACATGAGCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DI13JQ U 1
AF RR2DV90JQ U 26
BS 1 170 RR2DI13JQ
BS 171 171 RR2DV90JQ
BS 172 245 RR2DI13JQ
BS 246 246 RR2DV90JQ
BS 247 440 RR2DI13JQ
BS 441 441 RR2DV90JQ
BS 442 514 RR2DI13JQ
BS 515 515 RR2DV90JQ
BS 516 648 RR2DI13JQ
BS 649 701 RR2DV90JQ

RD RR2DI13JQ 648 0 0
GATAACTTTCATTAAGAACCGACTTAGGAAACCAATATACTTCAAAGTTTAAACTAAAAC
AGCTGAAAATGATTCATTCAGAGTACAAAAATCTTTTGAGCATGACAAAGATAAACGTTG
CTGAACGTTTTAAGCAAGGATTCTTCTATTGAGATGAATCAGTCGTAGTAGAAGCAGCAG
GAGGTTGCTGAGCGGATCCTGAAGGTGCGCTAGACCCAGTAGGTGCAGAGTCAGGTGGTG
GAGCAGAGGATGCGTTTGGAGCTGGTGCAGGTCTTGATCCAGGACCAGGTTGCTGTGGGT
ATGATTGGTAAGCAGCTGGAGGTGGTGCATAGTGGTGGTGCATAGGACCAGGATACTGCT
GCTGGTAGGGCGATGGCATGTATCCATATGGAGCTGGCGGGTACGGCTGGTGTGGAGGCA
TCATGTAAGAAGACGAAGGTGCGTTGCTCTCAGTGCTTGAACCACCAGCTTCTTGGGTTG
AAACGACTGCACCCATTCTCTGTGGGTCCATAGATGGGTAATAAGGTTTGTCTTGGTTGG
GTGGTGGTGGGTGCATGTAGTACTGCTGCATTGGTGGCGGTTGATTATGCTGCTGAGATA
TAATGGTTCGAGGTAGCAAACCACTATGAGCCACACCACCCTGCTGGT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2DV90JQ 676 0 0
AGGAAACCAATATATTTCAAAGTTTAAACTAAAACAGCTGAAAATGATTCATTCAGAGTA
CAAAAATCTTTTGAGCATGACAAAGATAAACGTTGCTGAACGTTTTAAGCAAGGGTTCTT
CTATTGAGATGAATCAGTCGTAGTAAAAGCAGCAGGAGGTTGCTGAGCGGATCCTGAAGG
TGCGCTAGACCCAGTAGGTGCAGAGTCAGGTGGTGGAGCAAAGGCTGCGTTTGGAGCTGG
TGCAGGTCTTGATCCAGGACCAGGTTGCTGTGGGTATGATTGGTAAGCAGCTGGAGGTGG
TGCATAGTGGTGGTGCATAGGACCAGGATACTGCTGCTGGTAGGGCGATGGCATGTATCC
ATATGGTGCTGGCGGGTACGGCTGGTGTGGAGGCATCATGTAAGAAGACGAAGGTACGTT
GCTCTCAGTGCTTGAACCACCAGCTTCTTGGGTTGAAATGACTGCACCCATTCTCTGTGG
GTCCATAGAAGGGTAATAAGGTTTGTCTTGGTTGGGTGGTGGTGGGT**ATGTAGTACTG
CTGCATTGGTGGCGGTTGATTATGTTGCTGAGATATAATGGTTCGAGGTAGCAAACCACT
ATGAGCCACACCACCCTGCTGGTTCGAACCATCTTGATCGGGTCTGGGAGCCTGAGGTCT
TCCCCACATGAGCTTT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL7651Contig1 822 2 2 U
GGAATCTATCAAAACAAGAAATCAGCTAGTGGTCGATTAGAATTTGATTGATTCTTTTTG
TTCAGTACCAAAGAAGAAGAAGATGAACAGCTATGGAAACGCCTTCGAGGAGACTAGGAG
AAACTCTGACGTCGTTTGCCCTCAACCGCGTCGTGTCGATGTCCCCAACCACCACCAACA
CCTTGCTCGATCTCTCAGGTGGCAAGTCAGTCACCAGATGGAGCTGTCTGAATCGAATTC
AAGGAGAGAGATGTTGGATTTCATCCTCGCAAAGGGTGGTGTTGGTAGTTGTGAGCAAGA
TCCTTTCTTCACAGGGTCACCGCCGAGTAGAGTTTCTAACCCTTTAACAAAAGATTCGCT
CTTTCGTGACGAGCTTTACGTGGTGGCTCCTCCTCCGTACGCTCCACGCGTGACCAAGCA
GCCACCACCGTCGTCTCCAAGGAGCGGTGGTGGCGGTTGCGTTAGGGCGGTGGCTAACTT
TAGGAACAAAGCTCCTGTTCGTGTCGTGGGGTTCAATTGCGTTGACAGGGAGAGACGCAG
CAGCGTTCCGACTCTTGCTTAAGGGAAAGATTTTAAGTGCAAATATATAACAGAGATGGA
TAAAAAACAATAAAAAAAGAGAGATTTAGGATTGATAATGATGTGGTTTTTTGGATGAAA
ATGTGCAAATATGTTGGAAATTTGGGTAATTTAAAGAAATGACTGTAATATAAAATTTAG
GATTTTGGATCCAATTTGGGAATTTTTGTAAGTAAAAAAAGGCAAGAAAGAAAGGGTTTT
ATGAGTGGTTGTTTTCATTAGTGAAAATAAAAGCATTAGTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EP81TF U 1
AF RR2EP81JQ C 1
BS 1 709 RR2EP81TF
BS 710 822 RR2EP81JQ

RD RR2EP81TF 709 0 0
GGAATCTATCAAAACAAGAAATCAGCTAGTGGTCGATTAGAATTTGATTGATTCTTTTTG
TTCAGTACCAAAGAAGAAGAAGATGAACAGCTATGGAAACGCCTTCGAGGAGACTAGGAG
AAACTCTGACGTCGTTTGCCCTCAACCGCGTCGTGTCGATGTCCCCAACCACCACCAACA
CCTTGCTCGATCTCTCAGGTGGCAAGTCAGTCACCAGATGGAGCTGTCTGAATCGAATTC
AAGGAGAGAGATGTTGGATTTCATCCTCGCAAAGGGTGGTGTTGGTAGTTGTGAGCAAGA
TCCTTTCTTCACAGGGTCACCGCCGAGTAGAGTTTCTAACCCTTTAACAAAAGATTCGCT
CTTTCGTGACGAGCTTTACGTGGTGGCTCCTCCTCCGTACGCTCCACGCGTGACCAAGCA
GCCACCACCGTCGTCTCCAAGGAGCGGTGGTGGCGGTTGCGTTAGGGCGGTGGCTAACTT
TAGGAACAAAGCTCCTGTTCGTGTCGTGGGGTTCAATTGCGTTGACAGGGAGAGACGCAG
CAGCGTTCCGACTCTTGCTTAAGGGAAAGATTTTAAGTGCAAATATATAACAGAGATGGA
TAAAAAACAATAAAAAAAGAGAGATTTAGGATTGATAATGATGTGGTTTTTTGGATGAAA
ATGTGCAAATATGTTGGAAATTTGGGTAATTTAAAGAAATGACTGTAAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2EP81JQ 822 0 0
GGAATCTATCAAA*CAAGAAATCAGCTAGTGGTCGATTAGAATTTGATTGATTCTTTT*G
TTCAGTACCAAAGAAGAAGAAGATGAACAGCTATGGAAACGCTTTCGAGGAGACTAGGAG
AAACTCTGACGTCGTTTGCCCTCAACCGCGTCGTGTCGATGTCCCCAACCACCACCAACA
CCTTGCTCGATCTCTCAGGTGGCAAGTCAGTCACCAGATGGAGCTGTCTGAATCGAATTC
AAGGAGAGAGATGTTGGATTTCATCCTCGCAAAGGGTGGTGTTGGTAGTTGTGAGCAAGA
TCCTTTCTTCACAGGGTCACCGCCGAGTAGAGTTTCTAACCCTTTAACAAAAGATTCGCT
CTTTCGTGACGAGCTTTACGTGGTGGCTCCTCCTCCGTACGCTCCACGCGTGACCAAGCA
GCCACCACCGTCGTCTCCAAGGAGCGGTGGTGGCGGTTGCGTTAGGGCGGTGGCTAACTT
TAGGAACAAAGCTCCTGTTCGTGTCGTGGGGTTCAATTGCGTTGACAGGGAGAGACGCAG
CAGCGTTCCGACTCTTGCTTAAGGGAAAGATTTTAAGTGCAAATATATAACAGAGATGGA
TAAAAAACAATAAAAAAAGAGAGATTTAGGATTGATAATGATGTGGTTTTTTGGATGAAA
ATGTGCAAATATGTTGGAAATTTGGGTAATTTAAAGAAATGACTGTAATATAAAATTTAG
GATTTTGGATCCAATTTGGGAATTTTTGTAAGTAAAAAAAGGCAAGAAAGAAAGGGTTTT
ATGAGTGGTTGTTTTCATTAGTGAAAATAAAAGCATTAGTGT

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

CO CL7652Contig1 1186 2 2 U
AGGGGACAACTGTCAGATTCTTCGTTGCTTTTGATCATTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCGC
CATTGTCAGAAGGTTTACTGTGATCGGAATCGAATCTTCTGAACCATGAATTATCTTCGT
GGAGCTTTCAAGCCGGCATGCAACATTTCAATCACATTCACTGATGGGAAGAGTCGTAAA
CAGGTTCCGGTTAAGAAAGATAATGGACAAATGGTTATGAACCCACTTTTCCAGAGTCAA
GAAACTATTGCTGGCAAGGTTTGTATTGAACCGTATCAAGGAAAGAAAGTTGAGCACAAT
GGTGTTAAAGTTGAGCTTCTTGGTCAAATAGAAATGTACTTTGACAGAGGCAACTTCTAT
GACTTTACTTCCCTAGTTCGGGAGCTTGATGTACCCGGAGAAATATATGAAAAGAAGGAG
TACCCTTTTGAATTTTCGACCGTTGAGATGCCATATGAGACATACAATGGCGTGAATGTA
CGGCTAAGGTATGTCCTGAAAGTAACAGTTACACGTGGTTATGCTGGAAGTATCGTGGAG
TATCAGGACTTTGTGGTACGCAACTATTCTCCACTACCTCCTATCAACAACAGCATCAAG
ATGGAAGTTGGAATCGAGGACTGCCTGCATATCGAGTTTGAGTACAATAAAAGCAAGTAT
CACCTGAAAGATGTTATCCTCGGGAAAGTATACTTTCTTCTGGTGAGAATCAAGATAAAG
AATATGGATCTTGAGATCAGACGGCGAGAGTCAACAGGAGCAGGAGCTAATACTCACGTC
GAGACAGAAACATTAGCCAAATTTGAGTTAATGGATGGTGCTCCCGTCAGAGGCGAATCA
ATACCTGTAAGACTGTTCTTGACACCATACGATCTGACGCCAACGCATAAGAACATAAAC
AACAAATTCAGTGTTAAGTATTATCTGAATCTTGTCCTGGTTGACGAAGAGGATCGCCGT
TACTTCAAGCAACAAGAAATCACGTTGTACAGGCTCAAGGAGAAGACTTCTTGATGTTTA
CAAAGAAAGAAAAGATACAAATGAGAATTTTTCAGAAAATTTGTAAAGCCTTTTTTTTCT
TAAGACTTCTTTTTTCTGTATGCAATTGGTTGGGGACTTGGTGGAGTCATGAAGTTTAAG
TCATGTTGTTTGGATTCATGTAAGAAAACTAGCAACTCTTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL72TF U 1
AF RR2BL72JQ C 439
BS 1 739 RR2BL72TF
BS 740 1186 RR2BL72JQ

RD RR2BL72TF 739 0 0
AGGGGACAACTGTCAGATTCTTCGTTGCTTTTGATCATTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCGC
CATTGTCAGAAGGTTTACTGTGATCGGAATCGAATCTTCTGAACCATGAATTATCTTCGT
GGAGCTTTCAAGCCGGCATGCAACATTTCAATCACATTCACTGATGGGAAGAGTCGTAAA
CAGGTTCCGGTTAAGAAAGATAATGGACAAATGGTTATGAACCCACTTTTCCAGAGTCAA
GAAACTATTGCTGGCAAGGTTTGTATTGAACCGTATCAAGGAAAGAAAGTTGAGCACAAT
GGTGTTAAAGTTGAGCTTCTTGGTCAAATAGAAATGTACTTTGACAGAGGCAACTTCTAT
GACTTTACTTCCCTAGTTCGGGAGCTTGATGTACCCGGAGAAATATATGAAAAGAAGGAG
TACCCTTTTGAATTTTCGACCGTTGAGATGCCATATGAGACATACAATGGCGTGAATGTA
CGGCTAAGGTATGTCCTGAAAGTAACAGTTACACGTGGTTATGCTGGAAGTATCGTGGAG
TATCAGGACTTTGTGGTACGCAACTATTCTCCACTACCTCCTATCAACAACAGCATCAAG
ATGGAAGTTGGAATCGAGGACTGCCTGCATATCGAGTTTGAGTACAATAAAAGCAAGTAT
CACCTGAAAGATGTTATCCTCGGGAAAGTATACTTTCTTCTGGTGAGAATCAAGATAAAG
AATATGGATCTTGAGATCA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2BL72JQ 748 0 0
ACCGTTGAGATGCCATATGAGACATACAATGGCGTGAATGTACGGCTAAGGTATGTCCTG
AAAGTAACAGTTACACGTGGTTATGCTGGAAGTATCGTGGAGTATCAGGACTTTGTGGTA
CGCAACTATTCTCCACTACCTCCTATCAACAACAGCATCAAGATGGAAGTTGGAATCGAG
GACTGCCTGCATATCGAGTTTGAGTACAATAAAAGCAAGTATCACCTGAAAGATGTTATC
CTCGGGAAAGTATACTTTCTTCTGGTGAGAATCAAGATAAAGAATATGGATCTTGAGATC
AGACGGCGAGAGTCAACAGGAGCAGGAGCTAATACTCACGTCGAGACAGAAACATTAGCC
AAATTTGAGTTAATGGATGGTGCTCCCGTCAGAGGCGAATCAATACCTGTAAGACTGTTC
TTGACACCATACGATCTGACGCCAACGCATAAGAACATAAACAACAAATTCAGTGTTAAG
TATTATCTGAATCTTGTCCTGGTTGACGAAGAGGATCGCCGTTACTTCAAGCAACAAGAA
ATCACGTTGTACAGGCTCAAGGAGAAGACTTCTTGATGTTTACAAAGAAAGAAAAGATAC
AAATGAGAATTTTTCAGAAAATTTGTAAAGCCTTTTTTTTCTTAAGACTTCTTTTTTCTG
TATGCAATTGGTTGGGGACTTGGTGGAGTCATGAAGTTTAAGTCATGTTGTTTGGATTCA
TGTAAGAAAACTAGCAACTCTTTTTTCC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL7653Contig1 573 2 1 U
GAAACAGTCGAGTAACTGCAACAAACTCGCAAATCATTAGATATAAGAAGAAGAAAGAAA
GCAGCAAAGGGAGACTGAAACCGACCATTTTGTGAGCTTTGTGGACATTATAATCCCTGG
CCTTAAGGAAGCGCAACAAAGTCTCTGTTGGATACCCTTGATGAATGTTCTGCAAAAGCA
AGCATAACACAATCATTTATTATTAATCATTTGTCTTTTCTGAAGCTACAAGTTGGTAAA
AGATCCGACTGAAAACTCTGGATCAACCCAATAATCTTCTGACTATAACAACAACTCCCA
CAGATCCATCCAACAACATTTGGATCATATTTTGAATAAACAAAATGCAAACAACTTTAG
AGCAGCCTGACTCAAATATAGATCCAGATCAACTTAGAACCGACATAAACAAAGAAACTG
TGTTTATAGAAAACCGATCCCCAAAATACCAAATCTTGGGGGGTTCATTAAGCCAAAGAT
GTTGGAGTTTAATCACTCTTGAGGAGAAAGCAAGTGAAATTACTAACCCGATACGACTCC
CTCAGTGATTCACCATCAACTAGTCATTACCAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CS04JQ C 1
AF RR2CS04TF U 1
BS 1 573 RR2CS04TF

RD RR2CS04JQ 573 0 0
GAAACAGTCGAGTAACTGCAACAAACTCGCAAATCATTAGATATAAGAAGAAGAAAGAAA
GCAGCAAAGGGAGACTGAAACCGACCATTTTGTGAGCTTTGTGGACATTATAATCCCTGG
CCTTAAGGAAGCGCAACAAAGTCTCTGTTGGATACCCTTGATGAATGTTCTGCAAAAGCA
AGCATAACACAATCATTTATTATTAATCATTTGTCTTTTCTGAAGCTACAAGTTGGTAAA
AGATCCGACTGAAAACTCTGGATCAACCCAATAATCTTCTGACTATAACAACAACTCCCA
CAGATCCATCCAACAACATTTGGATCATATTTTGAATAAACAAAATGCAAACAACTTTAG
AGCAGCCTGACTCAAATATAGATCCAGATCAACTTAGAACCGACATAAACAAAGAAACTG
TGTTTATAGAAAACCGATCCCCAAAATACCAAATCTTGGGGGGTTCATTAAGCCAAAGAT
GTTGGAGTTTAATCACTCTTGAGGAGAAAGCAAGTGAAATTACTAACCCGATACGACTCC
CTCAGTGATTCACCATCAACTAGTCATTACCAG

QA 1 573 1 573
DS 

RD RR2CS04TF 573 0 0
GAAACAGTCGAGTAACTGCAACAAACTCGCAAATCATTAGATATAAGAAGAAGAAAGAAA
GCAGCAAAGGGAGACTGAAACCGACCATTTTGTGAGCTTTGTGGACATTATAATCCCTGG
CCTTAAGGAAGCGCAACAAAGTCTCTGTTGGATACCCTTGATGAATGTTCTGCAAAAGCA
AGCATAACACAATCATTTATTATTAATCATTTGTCTTTTCTGAAGCTACAAGTTGGTAAA
AGATCCGACTGAAAACTCTGGATCAACCCAATAATCTTCTGACTATAACAACAACTCCCA
CAGATCCATCCAACAACATTTGGATCATATTTTGAATAAACAAAATGCAAACAACTTTAG
AGCAGCCTGACTCAAATATAGATCCAGATCAACTTAGAACCGACATAAACAAAGAAACTG
TGTTTATAGAAAACCGATCCCCAAAATACCAAATCTTGGGGGGTTCATTAAGCCAAAGAT
GTTGGAGTTTAATCACTCTTGAGGAGAAAGCAAGTGAAATTACTAACCCGATACGACTCC
CTCAGTGATTCACCATCAACTAGTCATTACCAG

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL7654Contig1 569 2 1 U
GCCGCAAACCCCTACTAATTTTCTTACAACAGATCCAAAATGTCGAAGCGAGGACGTGGA
GGAACGTCGGGTAACAAGTTCAGGATGTCGCTGGGTCTTCCCGTGGCGGCGACGGTGAAC
TGTGCTGACAACACAGGTGCCAAGAACCTTTACATCATTTCTGTGAAAGGGATCAAGGGT
CGTCTCAACAGGTTACCTTCCGCTTGCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTCAAGAAG
GGAAAGCCCGATCTCCGTAAGAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCT
TGGCGCCGAAAGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATCGTGAAC
CCCAGGGGAGAAATGAAAGGTTCTGCAATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGAT
CTCTGGCCAAGGATTGCTAGTGCTGCCAATGCCATTGTCTAATGATAATGATCCAATCAT
CATAGCTAGTCGGTCTTTGTTGCCGTGCGTTTGATTGTTTTTCTGAATCTTGTTCGAGTT
CGAAATATATCACAAACAAATTTGAGGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DB03JQ C 1
AF RR2DB03TF U 1
BS 1 569 RR2DB03TF

RD RR2DB03JQ 569 0 0
GCCGCAAACCCCTACTAATTTTCTTACAACAGATCCAAAATGTCGAAGCGAGGACGTGGA
GGAACGTCGGGTAACAAGTTCAGGATGTCGCTGGGTCTTCCCGTGGCGGCGACGGTGAAC
TGTGCTGACAACACAGGTGCCAAGAACCTTTACATCATTTCTGTGAAAGGGATCAAGGGT
CGTCTCAACAGGTTACCTTCCGCTTGCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTCAAGAAG
GGAAAGCCCGATCTCCGTAAGAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCT
TGGCGCCGAAAGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATCGTGAAC
CCCAGGGGAGAAATGAAAGGTTCTGCAATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGAT
CTCTGGCCAAGGATTGCTAGTGCTGCCAATGCCATTGTCTAATGATAATGATCCAATCAT
CATAGCTAGTCGGTCTTTGTTGCCGTGCGTTTGATTGTTTTTCTGAATCTTGTTCGAGTT
CGAAATATATCACAAACAAATTTGAGGAT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2DB03TF 569 0 0
GCCGCAAACCCCTACTAATTTTCTTACAACAGATCCAAAATGTCGAAGCGAGGACGTGGA
GGAACGTCGGGTAACAAGTTCAGGATGTCGCTGGGTCTTCCCGTGGCGGCGACGGTGAAC
TGTGCTGACAACACAGGTGCCAAGAACCTTTACATCATTTCTGTGAAAGGGATCAAGGGT
CGTCTCAACAGGTTACCTTCCGCTTGCGTCGGAGACATGGTGATGGCCACCGTCAAGAAG
GGAAAGCCCGATCTCCGTAAGAAGGTTATGCCAGCTGTCATCGTTAGGCAGAGGAAGCCT
TGGCGCCGAAAGGATGGTGTCTTCATGTACTTCGAAGATAATGCTGGAGTCATCGTGAAC
CCCAGGGGAGAAATGAAAGGTTCTGCAATCACTGGTCCCATTGGTAAAGAGTGCGCTGAT
CTCTGGCCAAGGATTGCTAGTGCTGCCAATGCCATTGTCTAATGATAATGATCCAATCAT
CATAGCTAGTCGGTCTTTGTTGCCGTGCGTTTGATTGTTTTTCTGAATCTTGTTCGAGTT
CGAAATATATCACAAACAAATTTGAGGAT

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

CO CL7655Contig1 1143 2 2 U
GGAGGGAGTCTCCGGGGCCTATGAGGGAGAGAGTGTTTGCTTTGATTGGGAAGAGGTTTC
TCCCCAGGTGGATCAAAGCTGCTAACTTGCACAATCTCGTCTTCCCTTATGATGATATCG
ATAAGTTGCTTAGGAAAGATCGTGAGCCACCCGTTAAATCTGTGTTCTGGGCATTGTTTG
GTGCTATTTATCTGTGCTACGGGATGCCGGAAGTCTACCGTGTACTTTTCGAGGTGTTTG
GGATGGATCCAGATGCAGATGATTGCCAGCCTCGAGCTAGGAGACAGCTTGAGGATGTAG
GTTATGTCTCTGTTGAATTCGAAGGCAAGAAGCTTGGCTGGCAAGATATTGCTACTTACA
AGCCTCCTGAAGATGCTTTGTTCGCACACCCGAGGCTGTTCAGAGCTTGTGTTCCACCTG
GAATGCATCGTTTTAGGGGGAACATTTGGGATTTCGACAGCAAACCTAAAGTCATGCAGG
CACTAGGTTACCCTCTACCGATGAACGATAGAATCCAAGAGATAACCGAAGCGAGAAACA
TCGAGCTTGGACTCGGTTTACAGCTCTGCTTCTTGCATCTTCAAAGCACAAGTTCGAACA
CCCTCGGTCCTGTTTCGAGAGATTAGAATACGTAGGCCAAAAGATACAGGACATAGCGAT
GGCGGAACGTCTGTTGATGAAGCACCTGGACGCGCCCGGCAAATGGCTGCAAGAGAAACA
CAGGCGTTTGCTGATGAACAAGTTCTGCGGTAGGTATCTGAGGGAGAAACGTCTTCACAA
CTTTATAATCTACTCGGAGGAGGTTCATGATCGGTACGAACACAACAGGAGACTTAGGAA
TCCTGCGACAACAGCTGTTCAGCAAGCTATTCACGGACTAGCCTACACCATCTATGGAAA
ACCTGATGTTAGGAGGCTCATGTTTGAGGTTTTCGACTTCGAACAGATTCAACCTAAAGC
AATCGTCTGAAAAAGCCTCTCTCTCACTGTGTTGTCCTTGTGTTTTTGTATTCATTATTG
TTAGTTTGCTTCTGGATTTGATTTCTTTTAGTTTAATTCTTCAAACGTCAGATGATACCA
AAGTTTTCAGACTCCAAAAACATAAACACCTGACTTCATTAAGTATACCTTTGAATCGTT
TGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2A777TF U 1
AF RR2A777JQ C 383
BS 1 631 RR2A777TF
BS 632 1143 RR2A777JQ

RD RR2A777TF 631 0 0
GGAGGGAGTCTCCGGGGCCTATGAGGGAGAGAGTGTTTGCTTTGATTGGGAAGAGGTTTC
TCCCCAGGTGGATCAAAGCTGCTAACTTGCACAATCTCGTCTTCCCTTATGATGATATCG
ATAAGTTGCTTAGGAAAGATCGTGAGCCACCCGTTAAATCTGTGTTCTGGGCATTGTTTG
GTGCTATTTATCTGTGCTACGGGATGCCGGAAGTCTACCGTGTACTTTTCGAGGTGTTTG
GGATGGATCCAGATGCAGATGATTGCCAGCCTCGAGCTAGGAGACAGCTTGAGGATGTAG
GTTATGTCTCTGTTGAATTCGAAGGCAAGAAGCTTGGCTGGCAAGATATTGCTACTTACA
AGCCTCCTGAAGATGCTTTGTTCGCACACCCGAGGCTGTTCAGAGCTTGTGTTCCACCTG
GAATGCATCGTTTTAGGGGGAACATTTGGGATTTCGACAGCAAACCTAAAGTCATGCAGG
CACTAGGTTACCCTCTACCGATGAACGATAGAATCCAAGAGATAACCGAAGCGAGAAACA
TCGAGCTTGGACTCGGTTTACAGCTCTGCTTCTTGCATCTTCAAAGCACAAGTTCGAACA
CCCTCGGTCCTGTTTCGAGAGATTAGAATAC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RR2A777JQ 761 0 0
CGCACACCCGAGGCTGTTCAGAGCTTGTGTTCCACCTGGAATGCATCGTTTTAGGGGGAA
CATTTGGGATTTCGACAGCAAACCTAAAGTCATGCAGGCACTAGGTTACCCTCTACCGAT
GAACGATAGAATCCAAGAGATAACCGAAGCGAGAAACATCGAGCTTGGACTCGGTTTACA
GCTCTGCTTCTTGCATCTTCAAAGCACAAGTTCGAACACCCTCGGTCCTGTTTCGAGAGA
TTAGAATACGTAGGCCAAAAGATACAGGACATAGCGATGGCGGAACGTCTGTTGATGAAG
CACCTGGACGCGCCCGGCAAATGGCTGCAAGAGAAACACAGGCGTTTGCTGATGAACAAG
TTCTGCGGTAGGTATCTGAGGGAGAAACGTCTTCACAACTTTATAATCTACTCGGAGGAG
GTTCATGATCGGTACGAACACAACAGGAGACTTAGGAATCCTGCGACAACAGCTGTTCAG
CAAGCTATTCACGGACTAGCCTACACCATCTATGGAAAACCTGATGTTAGGAGGCTCATG
TTTGAGGTTTTCGACTTCGAACAGATTCAACCTAAAGCAATCGTCTGAAAAAGCCTCTCT
CTCACTGTGTTGTCCTTGTGTTTTTGTATTCATTATTGTTAGTTTGCTTCTGGATTTGAT
TTCTTTTAGTTTAATTCTTCAAACGTCAGATGATACCAAAGTTTTCAGACTCCAAAAACA
TAAACACCTGACTTCATTAAGTATACCTTTGAATCGTTTGT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL7656Contig1 1060 2 2 U
GATCGACTTATCAAGATGGAGAGAGCTTATGAAAGAAGAGGGAGAATCGGCTAATATAGA
GAAATTCGCCCAATATGTGAAGGGGAATCATTTCATTCCAAACTCCGTTATGGTTGATTG
TACGGCTGAAGCTGATATTGCGAGCTGTTACTACGACTGGTTGCTGCGAGGAATTCATGT
GGTCACCCCAAACAAAAAGGCTAACTCAGGACCACTTGATCAGTATCTAAAGGTCAGAGA
TCTTCAAAGAAAATCGTACACACATTACTTCTATGAAGCAACCGTTGGAGCTGGCCTTCC
AATTATCAGCACTTTACGTGGCCTACTCGAAACAGGGGATAAAATACTGAGGATTGAGGG
AATTTTCAGTGGGACTTTAAGTTACCTTTTCAACAATTTTGTGGGCACGAGAAGCTTCAG
TGACGTTGTAGCAGAAGCAAAGCAGGCAGGTTTCACAGAGCCAGATCCACGAGATGATCT
ATCTGGAACAGATGTCGCCAGAAAAGTGACGATTCTCGCCAGAGAATCAGGATTGAAACT
GGATCTTGACAGCCTACCAGTCCAGAGTCTTGTGCCAAAGCCTCTACAAGCTTGTGCATC
AGCGGAAGAGTTCATGCAGAAGCTACCTCAGTTTGACGAAGAACTATCCAAACAAAGAGA
AGAGGCTGAAGCAGCAGGAGAGGTGTTGAGGTACGTAGGAGTTGTTGATGCGGTAGCGAA
AAAGGGGACAGTAGAGTTGAAACGGTACAAGAAAGATCATCCGTTTGCTCAGCTCTCTGG
TGCTGATAACATCATCGCTTTCACAACCAAGCGGTACAACGAGCAGCCTCTGATTGTTCG
TGGACCTGGTGCTGGGGCTCAAGTCACAGCCGGTGGGATCTTCAGTGACATTCTCCGCCT
TGCGTTCTATCTTGGCGCTCCATCTTAAGTCACATTTTGTTTCTTTTTAGGAACAAATCT
AGTGATCAAACAATGTTTCTTGTAAGCTAGCATCTGTTATCTGCGTTTCAGAATTTGATT
CTTATAGAAGAAATCAAACTTCATGGAATAAAAACATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DP23TF U 1
AF RR2DP23JQ C 358
BS 1 449 RR2DP23TF
BS 450 1060 RR2DP23JQ

RD RR2DP23TF 449 0 0
GATCGACTTATCAAGATGGAGAGAGCTTATGAAAGAAGAGGGAGAATCGGCTAATATAGA
GAAATTCGCCCAATATGTGAAGGGGAATCATTTCATTCCAAACTCCGTTATGGTTGATTG
TACGGCTGAAGCTGATATTGCGAGCTGTTACTACGACTGGTTGCTGCGAGGAATTCATGT
GGTCACCCCAAACAAAAAGGCTAACTCAGGACCACTTGATCAGTATCTAAAGGTCAGAGA
TCTTCAAAGAAAATCGTACACACATTACTTCTATGAAGCAACCGTTGGAGCTGGCCTTCC
AATTATCAGCACTTTACGTGGCCTACTCGAAACAGGGGATAAAATACTGAGGATTGAGGG
AATTTTCAGTGGGACTTTAAGTTACCTTTTCAACAATTTTGTGGGCACGAGAAGCTTCAG
TGACGTTGTAGCAGAAGCAAAGCAGGCAG

QA 1 449 1 449
DS 

RD RR2DP23JQ 703 0 0
GGGAATTTTCAGTGGGACTTTAAGTTACCTTTTCAACAATTTTGTGGGCACGAGAAGCTT
CAGTGACGTTGTAGCAGAAGCAAAGCAGGCAGGTTTCACAGAGCCAGATCCACGAGATGA
TCTATCTGGAACAGATGTCGCCAGAAAAGTGACGATTCTCGCCAGAGAATCAGGATTGAA
ACTGGATCTTGACAGCCTACCAGTCCAGAGTCTTGTGCCAAAGCCTCTACAAGCTTGTGC
ATCAGCGGAAGAGTTCATGCAGAAGCTACCTCAGTTTGACGAAGAACTATCCAAACAAAG
AGAAGAGGCTGAAGCAGCAGGAGAGGTGTTGAGGTACGTAGGAGTTGTTGATGCGGTAGC
GAAAAAGGGGACAGTAGAGTTGAAACGGTACAAGAAAGATCATCCGTTTGCTCAGCTCTC
TGGTGCTGATAACATCATCGCTTTCACAACCAAGCGGTACAACGAGCAGCCTCTGATTGT
TCGTGGACCTGGTGCTGGGGCTCAAGTCACAGCCGGTGGGATCTTCAGTGACATTCTCCG
CCTTGCGTTCTATCTTGGCGCTCCATCTTAAGTCACATTTTGTTTCTTTTTAGGAACAAA
TCTAGTGATCAAACAATGTTTCTTGTAAGCTAGCATCTGTTATCTGCGTTTCAGAATTTG
ATTCTTATAGAAGAAATCAAACTTCATGGAATAAAAACATCCT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL7657Contig1 958 2 6 U
GGGATTAGAAAAAGAAAAGAAAAAACAAATTCAAAGAGATCCGACCACCGTTAAAAATTT
TGGATTCAGATGTCGGGCGGAGGAGCACCGTCGAGGTACGTCAAGTTGACAAAGGAACAA
GCTCCGGTCGATGAGGTTAATCCCGGCGAACTCAATCAACCGATTCAGGTACCTCAACTA
GATGTTTACAAATGCCACGAGTGTGGCCAAACTTTGCCTGAGAATTTTGAAGCTCCAGCA
GATGAGCCATGGACTACCGGAATATTCGGGTGCACTGAAGACATGGATAGCTTTTGGTAA
GGATTCTTTTGCCCAAGTGTTCTGTTCGGACGTGTCTATGAAACTCTGAGTGAGGAGGAA
ACCTCATGGAAGAGAGCATGTGTTTGCCATTCGATTGTAGTAGAAGGCGGTCTTACGGCC
GCATCCTTGCTTGTTTGTATTCCCGGTATAGATCCACATACCACGTTTCTTTTATGGGAA
GGCTTGTTCTTTGTTTGGTGGATGTGTGGGATTTACACTGGAAACGTCAGGCAAACTCTC
CAGCGCAAATATCATCTCCAGGACTCTCCTTGCGACCCATGTATGGTGCATTGTTTCCTC
CATTTCTGTGCTGTTTGTCAAGCACACCGGGAGATGAAGAACCGTCTTTCGGATAACTTT
GTTATGCCAATGACTGTGGTTAACCCGCCACCGGTTCAAGAGATGAGTTCCTCTAATGAC
GGACACCACCATGACTCTGTCCCGGTATCACACCACAGCTCTGACCTCGTGATGCGGCCT
TTGTAGTGCGAAACGATTCAAGGTCTTGTTTTGTATGGACATGAAGATGCATGATTTTAA
TAAGGATAATATATAGACCCACTTGGTTTGTTTAAAACTCATCAATAATAGAGAGATCCT
TATCACAAGATTTGTTTTTTAAAAAAATATAAGAAAAAGTTTATTATTATCTGATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E246TF U 1
AF RR2E246JQ C 231
BS 1 726 RR2E246TF
BS 727 727 RR2E246JQ
BS 728 765 RR2E246TF
BS 766 766 RR2E246JQ
BS 767 812 RR2E246TF
BS 813 958 RR2E246JQ

RD RR2E246TF 817 0 0
GGGATTAGAAAAAGAAAAGAAAAAACAAATTCAAAGAGATCCGACCACCGTTAAAAATTT
TGGATTCAGATGTCGGGCGGAGGAGCACCGTCGAGGTACGTCAAGTTGACAAAGGAACAA
GCTCCGGTCGATGAGGTTAATCCCGGCGAACTCAATCAACCGATTCAGGTACCTCAACTA
GATGTTTACAAATGCCACGAGTGTGGCCAAACTTTGCCTGAGAATTTTGAAGCTCCAGCA
GATGAGCCATGGACTACCGGAATATTCGGGTGCACTGAAGACATGGATAGCTTTTGGTAA
GGATTCTTTTGCCCAAGTGTTCTGTTCGGACGTGTCTATGAAACTCTGAGTGAGGAGGAA
ACCTCATGGAAGAGAGCATGTGTTTGCCATTCGATTGTAGTAGAAGGCGGTCTTACGGCC
GCATCCTTGCTTGTTTGTATTCCCGGTATAGATCCACATACCACGTTTCTTTTATGGGAA
GGCTTGTTCTTTGTTTGGTGGATGTGTGGGATTTACACTGGAAACGTCAGGCAAACTCTC
CAGCGCAAATATCATCTCCAGGACTCTCCTTGCGACCCATGTATGGTGCATTGTTTCCTC
CATTTCTGTGCTGTTTGTCAAGCACACCGGGAGATGAAGAACCGTCTTTCGGATAACTTT
GTTATGCCAATGACTGTGGTTAACCCGCCACCGGTTCAAGAGATGAGTTCCTCTAATGAC
GGACAC*ACCATGACTCTGTCCCGGTATCACACCACAGCTCTGAC*TCGTGATGCGGCCT
TTGTAGTGCGAAACGATTCAAGGTCTTGTTTT
TTTGG

QA 1 812 1 812
DS 

RD RR2E246JQ 728 0 0
AGCTCCAGCAGATGAGCCATGGACTACCGGAATATTCGGGTGCACTGAAGACATGGATAG
CTTTTGGTAAGGATTCTTTTGCCCAAGTGTTCTGTTCGGACGTGTCTATGAAACTCTGAG
TGAGGAGGAAACCTCATGGAAGAGAGCATGTGTTTGCCATTCGATTGTAGTAGAAGGCGG
TCTTACGGCCGCATCCTTGCTTGTTTGTATTCCCGGTATAGATCCACATACCACGTTTCT
TTTATGGGAAGGCTTGTTCTTTGTTTGGTGGATGTGTGGGATTTACACTGGAAACGTCAG
GCAAACTCTCCAGCGCAAATATCATCTCCAGGACTCTCCTTGCGACCCATGTATGGTGCA
TTGTTTCCTCCATTTCTGTGCTGTTTGTCAAGCACACCGGGAGATGAAGAACCGTCTTTC
GGATAACTTTGTTATGCCAATGACTGTGGTTAACCCGCCACCGGTTCAAGAGATGAGTTC
CTCTAATGACGGACACCACCATGACTCTGTCCCGGTATCACACCACAGCTCTGACCTCGT
GATGCGGCCTTTGTAGTGCGAAACGATTCAAGGTCTTGTTTTGTATGGACATGAAGATGC
ATGATTTTAATAAGGATAATATATAGACCCACTTGGTTTGTTTAAAACTCATCAATAATA
GAGAGATCCTTATCACAAGATTTGTTTTTTAAAAAAATATAAGAAAAAGTTTATTATTAT
CTGATTTG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL7658Contig1 906 2 2 U
GGAAGTCAACAAGCTTGTTGTGTTGTGTTGTGTTAGAACACATTTGTTTGTTCGTCCTCA
TCGTCATTCATAGAGAATCTGTCTCGATGCCTAGATCAAGAAGTCGCGTCCTGATTCTCT
TATTACCTCTAGCCTTTGTGTTCTACCTTTACAGGTACCTGCCTTCTCCGGCTATTGTCG
AACAATCATCATACAGCTCCATCTACCACATCTCCGTTAAGGACATTGATGGGAATGATG
TGAGTTTAAGCAAGTTCACTGGAAAGGTGCTTCTTATTGTCAATGTGGCCTCTAAGTGTG
GTCTAACACAGGGAAACTACAAAGAGTTGAACATTCTGTATGCCAAGTACAAAACTAAGG
GGCTTGAGATCTTAGCGTTTCCCTGCAACCAATTTGGAGGTCAAGAGCCAGGTAGCAACA
AGGAGATTAAGGATAACATTTGCACAACCTTCAAAGGAGAGTTTCCCATCTTTGACAAGA
TTGAAGTGAATGGTGAGAATGCTTCACCTCTATACAAGTTCTTGAAAGAACAGAAAGGTG
GATTGTTTGGGGATTCTATCAAGTGGAACTTCGCAAAGTTTCTGGTAGACAGACAAGGAA
ATGTTGTGGATCGATATGCTCCTACAACATCACCTCTTGAGATTGAGAAGGACATAGAGA
AGCTATTGGCATCTACTTGAGCATAAAAAATTTCAATTGCAGGGCAGGAGATCAGAAGCA
TGGAGCATGTCCGATTTGGAGACTTAAGAGCTACTTTTATATGCTTGTGTTGTGTGAATG
AATGTTCTTCATCAAAAGAATAGAACTTTATTTATGTTCTCTTACAAGAATGCATTACAA
CAAAATTTCATTACCAAAATCTTTTTGTACATATCTGAGCAGCTCATGAGAGTTGTGTTT
GTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2E896TF U 1
AF RR2E896JQ C 282
BS 1 593 RR2E896TF
BS 594 906 RR2E896JQ

RD RR2E896TF 593 0 0
GGAAGTCAACAAGCTTGTTGTGTTGTGTTGTGTTAGAACACATTTGTTTGTTCGTCCTCA
TCGTCATTCATAGAGAATCTGTCTCGATGCCTAGATCAAGAAGTCGCGTCCTGATTCTCT
TATTACCTCTAGCCTTTGTGTTCTACCTTTACAGGTACCTGCCTTCTCCGGCTATTGTCG
AACAATCATCATACAGCTCCATCTACCACATCTCCGTTAAGGACATTGATGGGAATGATG
TGAGTTTAAGCAAGTTCACTGGAAAGGTGCTTCTTATTGTCAATGTGGCCTCTAAGTGTG
GTCTAACACAGGGAAACTACAAAGAGTTGAACATTCTGTATGCCAAGTACAAAACTAAGG
GGCTTGAGATCTTAGCGTTTCCCTGCAACCAATTTGGAGGTCAAGAGCCAGGTAGCAACA
AGGAGATTAAGGATAACATTTGCACAACCTTCAAAGGAGAGTTTCCCATCTTTGACAAGA
TTGAAGTGAATGGTGAGAATGCTTCACCTCTATACAAGTTCTTGAAAGAACAGAAAGGTG
GATTGTTTGGGGATTCTATCAAGTGGAACTTCGCAAAGTTTCTGGTAGACAGA

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2E896JQ 625 0 0
AATGTGGCCTCTAAGTGTGGTCTAACACAGGGAAACTACAAAGAGTTGAACATTCTGTAT
GCCAAGTACAAAACTAAGGGGCTTGAGATCTTAGCGTTTCCCTGCAACCAATTTGGAGGT
CAAGAGCCAGGTAGCAACAAGGAGATTAAGGATAACATTTGCACAACCTTCAAAGGAGAG
TTTCCCATCTTTGACAAGATTGAAGTGAATGGTGAGAATGCTTCACCTCTATACAAGTTC
TTGAAAGAACAGAAAGGTGGATTGTTTGGGGATTCTATCAAGTGGAACTTCGCAAAGTTT
CTGGTAGACAGACAAGGAAATGTTGTGGATCGATATGCTCCTACAACATCACCTCTTGAG
ATTGAGAAGGACATAGAGAAGCTATTGGCATCTACTTGAGCATAAAAAATTTCAATTGCA
GGGCAGGAGATCAGAAGCATGGAGCATGTCCGATTTGGAGACTTAAGAGCTACTTTTATA
TGCTTGTGTTGTGTGAATGAATGTTCTTCATCAAAAGAATAGAACTTTATTTATGTTCTC
TTACAAGAATGCATTACAACAAAATTTCATTACCAAAATCTTTTTGTACATATCTGAGCA
GCTCATGAGAGTTGTGTTTGTTGTC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL7659Contig1 710 2 2 U
ACTGCCCAAAAACAAAGCTCGTAAGAGATATTATTACTGTATTTTCAAGCAAGATGTCTT
TGTTCACATAGATTTCATAACAACTCATACTCATCTGTCCAAAACTGCATCCAATCTAAA
CTTGTCGGTACCCGTCTCTCTTTTTACTCTTCTGGCTCAGTTTTTACATACCTGTTTGCG
TAATCTAAATACTCCTGAAGTATAACTACCGCGGCAAACTTGTCCAACATTGTCTTCTCT
TGAACTGGATGCAGTTTCAAAGGCTTCAACATCAGTTCAACGGTCTTTGATGATAAACGC
TCGTCCCAATAAGTGTACTTCACATCCTTGAGTTTTTCGGTTTTACGAAGTTCCTCAATG
AAAAGATTCACAGTGACAACGTCTTCAACATTGTTCAGTTTACCAAAAGGATAACCAACT
ACTAAGCCCGGCACGGAAAATGATTTGACCAGATTCTGAAAATCTGTGGCCATCAAGTCA
ATGTTTGTTTTCTTCCTTAGCAAAACACTAAGTGGAGGAGCAATCATGTTAGAAGGGTCT
GAAACAGCTAAGCCAACATACTTATCACCAACATCTAAACCGAGAAACCGACCAGGTACT
GACGATTTCGTCTTCAAAGCATCACCCAGTAACCTCAGTGGCTTCACATACTTCATTTCC
TTCAATTAGACAAGGAAACAAGTGTTTGAGAAGGGGGAGGGTTTTAGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A868TF C 1
AF RR2A868JQ U 146
BS 1 145 RR2A868TF
BS 146 710 RR2A868JQ

RD RR2A868TF 710 0 0
ACTGCCCAAAAACAAAGCTCGTAAGAGATATTATTACTGTATTTTCAAGCAAGATGTCTT
TGTTCACATAGATTTCATAACAACTCATACTCATCTGTCCAAAACTGCATCCAATCTAAA
CTTGTCGGTACCCGTCTCTCTTTTTACTCTTCTGGCTCAGTTTTTACATACCTGTTTGCG
TAATCTAAATACTCCTGAAGTATAACTACCGCGGCAAACTTGTCCAACATTGTCTTCTCT
TGAACTGGATGCAGTTTCAAAGGCTTCAACATCAGTTCAACGGTCTTTGATGATAAACGC
TCGTCCCAATAAGTGTACTTCACATCCTTGAGTTTTTCGGTTTTACGAAGTTCCTCAATG
AAAAGATTCACAGTGACAACGTCTTCAACATTGTTCAGTTTACCAAAAGGATAACCAACT
ACTAAGCCCGGCACGGAAAATGATTTGACCAGATTCTGAAAATCTGTGGCCATCAAGTCA
ATGTTTGTTTTCTTCCTTAGCAAAACACTAAGTGGAGGAGCAATCATGTTAGAAGGGTCT
GAAACAGCTAAGCCAACATACTTATCACCAACATCTAAACCGAGAAACCGACCAGGTACT
GACGATTTCGTCTTCAAAGCATCACCCAGTAACCTCAGTGGCTTCACATACTTCATTTCC
TTCAATTAGACAAGGAAACAAGTGTTTGAGAAGGGG*AGGGTTTTAGAGA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2A868JQ 565 0 0
ACTCTTCTGGCTCAGTTTTTACATACCTGTTTGCGTAATCTAAATACTCCTGAAGTATAA
CTACCGCGGCAAACTTGTCCAACATTGTCTTCTCTTGAACTGGATGCAGTTTCAAAGGCT
TCAACATCAGTTCAACGGTCTTTGATGATAAACGCTCGTCCCAATAAGTGTACTTCACAT
CCTTGAGTTTTTCGGTTTTACGAAGTTCCTCAATGAAAAGATTCACAGTGACAACGTCTT
CAACATTGTTCAGTTTACCAAAAGGATAACCAACTACTAAGCCCGGCACGGAAAATGATT
TGACCAGATTCTGAAAATCTGTGGCCATCAAGTCAATGTTTGTTTTCTTCCTTAGCAAAA
CACTAAGTGGAGGAGCAATCATGTTAGAAGGGTCTGAAACAGCTAAGCCAACATACTTAT
CACCAACATCTAAACCGAGAAACCGACCAGGTACTGACGATTTCGTCTTCAAAGCATCAC
CCAGTAACCTCAGTGGCTTCACATACTTCATTTCCTTCAATTAGACAAGGAAACAAGTGT
TTGAGAAGGGGGAGGGTTTTAGAGA

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL7660Contig1 757 2 5 U
GGCACTAAAGATCAGAGGGAACTCTTCCTTGCCATTGCTAATGTTCTGAGAGAGAACAAA
AGCTTGGTGAATGAATCCCTTAAGTTCCTGACGAAGTATCTAGCGACTTTCTCAAGTGAG
GATGCTAAGGTCCTAGATGAAGCTAAGGAGGAGGCTGTGCGTGCAGTTATTGAATTTGTC
AAGGCTTCCAGCATCTTCCAGTGTGATTTATTGGAATTGCCAGCCGTAGCACAATTAGAG
AAGGATGCTAAGTATGCCCCGGTTTACCAGCTACTAAAAATCTTTCTTACTCAGAGGCTT
AATGCTTACTCTGAATTCCGAGCTGCAAATTCAGAATGTCTGCAAAGCTATGCACTTGTT
GATGAAGATTGTGTAACGAAGATGAGATTGTTGTCACTAGTGGACTTAGCGTCAGATGAG
TCTGGCAAAATACCATACACCTCAATCAAAGACACTCTACAGGTAAAGGAAGAGGAGGTT
GAACTATGGATCGTGAAGGCAATAACTGCGAAGCTGATCGATTGCAAGATGGATCAGATG
AACCAAGTTGTCATTGTCAGCCGCTGTTCCGAGCGTGAATTCGGGTCAAAGCAATGGCAA
TCACTTCGAACTAAGCTCGCAACCTGGCGGGATAACATTGGAAACGTCATAAGTACAATC
GAGTCGAACAGGTAACCGAGGAAGCTCTCAGCATCATCAGCATCTGCTGCAGCAATTCAA
GGGTTGACTGTTCGTTGAAAGCTATCAGACAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C469TF U 12
AF RR2H188TF U 1
BS 1 278 RR2H188TF
BS 279 279 RR2C469TF
BS 280 570 RR2H188TF
BS 571 571 RR2C469TF
BS 572 757 RR2H188TF

RD RR2C469TF 664 0 0
G
CAGAGGGAACTCTTCCTTGCCATTGCTAATGTTCTGAGAGAGAACAAAAGCTTGGTGAAT
GAATCCCTTAAGTTCCTGACGAAGTATCTAGCGACTTTCTCAAGTGAGGATGCTAAGGTC
CTAGATGAAGCTAAGGAGGAGGCTGTGCGTGCAGTTATTGAATTTGTCAAGGCTTCCAGC
ATCTTCCAGTGTGATTTATTGGAATTGCCAGCCGTAGCACAATTAGAGAAGGATGCTAAG
TATGCCCCGGTTTACCAGCTACTAAAAATCTTTCTTACTCAGAGGCTTAATGCTTACTCT
GAATTCCGAGCTGCAAATTCAGAATGTCTGCAAAGCTATGCACTTGTTGATGAAGATTGT
GTAACGAAGATGAGATTGTTGTCACTAGTGGACTTAGCGTCAGATGAGTCTGGCAAAATA
CCATACACCTCAATCAAAGACACTCTACAGGTAAAGGAAGAGGAGGTTGAACTATGGATC
GTGAAGGCAATAACTGCGAAGCTGATCGATTGTAAGATGGATCAGATGAACCAAGTTGTC
ATTGTCAGCCGCTGTTCCGAGCGTGAATTCGGGTCAAAGCAATGGCAATCACTTCGAACT
AAGCTCGCAACCTGGCGGGATAACATTGGAAACGTCATAAGTACAATCGAGTCGA
CAAGTAAC

QA 2 656 2 656
DS 

RD RR2H188TF 757 0 0
GGCACTAAAGATCAGAGGGAACTCTTCCTTGCCATTGCTAATGTTCTGAGAGAGAACAAA
AGCTTGGTGAATGAATCCCTTAAGTTCCTGACGAAGTATCTAGCGACTTTCTCAAGTGAG
GATGCTAAGGTCCTAGATGAAGCTAAGGAGGAGGCTGTGCGTGCAGTTATTGAATTTGTC
AAGGCTTCCAGCATCTTCCAGTGTGATTTATTGGAATTGCCAGCCGTAGCACAATTAGAG
AAGGATGCTAAGTATGCCCCGGTTTACCAGCTACTAAAGATCTTTCTTACTCAGAGGCTT
AATGCTTACTCTGAATTCCGAGCTGCAAATTCAGAATGTCTGCAAAGCTATGCACTTGTT
GATGAAGATTGTGTAACGAAGATGAGATTGTTGTCACTAGTGGACTTAGCGTCAGATGAG
TCTGGCAAAATACCATACACCTCAATCAAAGACACTCTACAGGTAAAGGAAGAGGAGGTT
GAACTATGGATCGTGAAGGCAATAACTGCGAAGCTGATCGATTGCAAGATGGATCAGATG
AACCAAGTTGTCATTGTCAGCCGCTGTTCCTAGCGTGAATTCGGGTCAAAGCAATGGCAA
TCACTTCGAACTAAGCTCGCAACCTGGCGGGATAACATTGGAAACGTCATAAGTACAATC
GAGTCGAACAGGTAACCGAGGAAGCTCTCAGCATCATCAGCATCTGCTGCAGCAATTCAA
GGGTTGACTGTTCGTTGAAAGCTATCAGACAGAAAAA

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL7661Contig1 732 2 2 U
GTATTACCATGATATGCATGTTATTCAGGACATGCTTGTTCCCCTTTACAAAGTTGGTGA
TGCTCTTGAATGGGTCCACCGCGAAATGGAGGTGTATCCAATCTGGCTATGCCCACACAA
ACTCTACAAGGCACCAATCAAGCAACAGATCTACCCTGAACCAGGTTTTGAGTACGAGAA
GAGACAAGGAGACACGGAAGATGCTCAGATGTACACTGATGTTGGAGTCTACTACGCACC
AGGTCCTGTCCTAAGAGGTGAGGAGTTTGATGGGTCGGAAGCTGTGCGTAGGATGGAGAA
ATGGCTGATAGAGAACCACGGTTTCCAGCCTCAGTACGCTGTCTCTGAGCTTGACGAGAA
GAGCTTCTGGAGGATGTTTGATGGTGACTTGTACGAGCATTGCCGCAAGAAGTACAGAGC
TGTTGGAACTTTCATGAGTGTTTACTACAAGTCGAAGAAAGGGAGGAAGACTGAGAAAGA
AGTTAGAGAGGCAGAGCAGGCTCATCTCGAAACAGCTTATGCTGAGGCAGATTAAGCCAT
GAAAAATATGCGCTTTGAGAGAGGGTTGAGATTATTATTGTTATGGGTGGAGTGGTAGTG
TTTCTTTTGTTTTGTTGCTATGTGTTTCCAGTTTTCAGTTTAGTATTGTCTTTGATAATG
CTTATTGTTGTTTGGTTCTTGTTTGACTTATGGTTTGAATGGATTTTAGAATTTAAGATT
GGATTTGCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DN67TF U 1
AF RR2DN67JQ C 90
BS 1 628 RR2DN67TF
BS 629 732 RR2DN67JQ

RD RR2DN67TF 628 0 0
GTATTACCATGATATGCATGTTATTCAGGACATGCTTGTTCCCCTTTACAAAGTTGGTGA
TGCTCTTGAATGGGTCCACCGCGAAATGGAGGTGTATCCAATCTGGCTATGCCCACACAA
ACTCTACAAGGCACCAATCAAGCAACAGATCTACCCTGAACCAGGTTTTGAGTACGAGAA
GAGACAAGGAGACACGGAAGATGCTCAGATGTACACTGATGTTGGAGTCTACTACGCACC
AGGTCCTGTCCTAAGAGGTGAGGAGTTTGATGGGTCGGAAGCTGTGCGTAGGATGGAGAA
ATGGCTGATAGAGAACCACGGTTTCCAGCCTCAGTACGCTGTCTCTGAGCTTGACGAGAA
GAGCTTCTGGAGGATGTTTGATGGTGACTTGTACGAGCATTGCCGCAAGAAGTACAGAGC
TGTTGGAACTTTCATGAGTGTTTACTACAAGTCGAAGAAAGGGAGGAAGACTGAGAAAGA
AGTTAGAGAGGCAGAGCAGGCTCATCTCGAAACAGCTTATGCTGAGGCAGATTAAGCCAT
GAAAAATATGCGCTTTGAGAGAGGGTTGAGATTATTATTGTTATGGGTGGAGTGGTAGTG
TTTCTTTTGTTTTGTTGCTATGTGTTTC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2DN67JQ 643 0 0
AGGTGTATCCAATCTGGCTATGCCCACACAAACTCTACAAGGCACCAATCAAGCAACAGA
TCTACCCTGAACCAGGTTTTGAGTACGAGAAGAGACAAGGAGACACGGAAGATGCTCAGA
TGTACACTGATGTTGGAGTCTACTACGCACCAGGTCCTGTCCTAAGAGGTGAGGAGTTTG
ATGGGTCGGAAGCTGTGCGTAGGATGGAGAAATGGCTGATAGAGAACCACGGTTTCCAGC
CTCAGTACGCTGTCTCTGAGCTTGACGAGAAGAGCTTCTGGAGGATGTTTGATGGTGACT
TGTACGAGCATTGCCGCAAGAAGTACAGAGCTGTTGGAACTTTCATGAGTGTTTACTACA
AGTCGAAGAAAGGGAGGAAGACTGAGAAAGAAGTTAGAGAGGCAGAGCAGGCTCATCTCG
AAACAGCTTATGCTGAGGCAGATTAAGCCATGAAAAATATGCGCTTTGAGAGAGGGTTGA
GATTATTATTGTTATGGGTGGAGTGGTAGTGTTTCTTTTGTTTTGTTGCTATGTGTTTCC
AGTTTTCAGTTTAGTATTGTCTTTGATAATGCTTATTGTTGTTTGGTTCTTGTTTGACTT
ATGGTTTGAATGGATTTTAGAATTTAAGATTGGATTTGCTTTG

QA 1 643 1 643
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7663Contig1 778 2 6 U
GTCCATATAGCTACGCTGCAATGAGGAACAACCATACATATAACTCATTGGTGGCTCGTA
AACTTGCAGACAAAAGAAACAAACAAGACTCACTAAACATTGAGAGCAGCGAGATTGTTG
TTGACCAGTTGGGAGTGAGCAGGAGATTAAGTACGGAGATGAACAAGTCTTCTTCATGTG
CCTCGTGTGCAACTGTGGCTCTAAAGTATAGGAGGAGAGCCTCGGGCTCGCACCGTTTGT
TCCCAACTCCTATCATTCACTCAATGCTTGCGGTTGCGACTGTATGTGTTTGCGTCTGCG
TTTTCATGCATGCTTTCCCAATCGTCCGGCAAGGATCTCACTTCAGCTGGGGAGGTTTGG
ATTATGGCTCCATCTAGGCAAAAGAACAAGAATGTAAAATTATATACTTGTTATTATTCT
TTTGGCTTCACAACTGAAAAGACAGAGACTTTACTGCGGAGAGCTCATGAGGCTTGACTG
TACGTCTGCGACAACAACGACCAAAGTGCTCTGATCAAAACAGAGGGAGAGTTTCATCGT
CGGCGTCGAGAGTTCTTTGTTTTTTCTGGTTCAGTTATATACTTTTGTATTGCTAATTTT
ATTGTGTATTTTCTGTGTATTTCCTACTTATTATTATGACTAATATAATATTATGCTGCT
TCACAGACAGAGCAGTTTACTATTTTGCTATTTTTTGGTTCTTTGTAAATTTGTACTTTG
TACAAGAGTCTCATGTTATTGTAACTTTAGTTTTTGTTTTCAGTTATGTTTTCATTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DE30JQ C 1
AF RR2DE30TF U 1
BS 1 695 RR2DE30TF
BS 696 696 RR2DE30JQ
BS 697 724 RR2DE30TF
BS 725 725 RR2DE30JQ
BS 726 766 RR2DE30TF
BS 767 778 RR2DE30JQ

RD RR2DE30JQ 778 0 0
GTCCATATAGCTACGCTGCAATGAGGAACAACCATACATATAACTCATTGGTGGCTCGTA
AACTTGCAGACAAAAGAAACAAACAAGACTCACTAAACATTGAGAGCAGCGAGATTGTTG
TTGACCAGTTGGGAGTGAGCAGGAGATTAAGTACGGAGATGAACAAGTCTTCTTCATGTG
CCTCGTGTGCAACTGTGGCTCTAAAGTATAGGAGGAGAGCCTCGGGCTCGCACCGTTTGT
TCCCAACTCCTATCATTCACTCAATGCTTGCGGTTGCGACTGTATGTGTTTGCGTCTGCG
TTTTCATGCATGCTTTCCCAATCGTCCGGCAAGGATCTCACTTCAGCTGGGGAGGTTTGG
ATTATGGCTCCATCTAGGCAAAAGAACAAGAATGTAAAATTATATACTTGTTATTATTCT
TTTGGCTTCACAACTGAAAAGACAGAGACTTTACTGCGGAGAGCTCATGAGGCTTGACTG
TACGTCTGCGACAACAACGACCAAAGTGCTCTGATCAAAACAGAGGGAGAGTTTCATCGT
CGGCGTCGAGAGTTCTTTGTTTTTTCTGGTTCAGTTATATACTTTTGTATTGCTAATTTT
ATTGTGTATTTTCTGTGTATTTCCTACTTATTATTATGACTAATATAATATTATGCTGCT
TCACAGACAGAGCAGTTTACTATTTTGCTATTTTTTGGTTCTTTGTAAATTTGTACTTTG
TACAAGAGTCTCATGTTATTGTAACTTTAGTTTTTGTTTTCAGTTATGTTTTCATTCC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RR2DE30TF 766 0 0
GTCCATATAGCTACGCTGCAATGAGGAACAACCATACATATAACTCATTGGTGGCTCGTA
AACTTGCAGACAAAAGAAACAAACAAGACTCACTAAACATTGAGAGCAGCGAGATTGTTG
TTGACCAGTTGGGAGTGAGCAGGAGATTAAGTACGGAGATGAACAAGTCTTCTTCATGTG
CCTCGTGTGCAACTGTGGCTCTAAAGTATAGGAGGAGAGCCTCGGGCTCGCACCGTTTGT
TCCCAACTCCTATCATTCACTCAATGCTTGCGGTTGCGACTGTATGTGTTTGCGTCTGCG
TTTTCATGCATGCTTTCCCAATCGTCCGGCAAGGATCTCACTTCAGCTGGGGAGGTTTGG
ATTATGGCTCCATCTAGGCAAAAGAACAAGAATGTAAAATTATATACTTGTTATTATTCT
TTTGGCTTCACAACTGAAAAGACAGAGACTTTACTGCGGAGAGCTCATGAGGCTTGACTG
TACGTCTGCGACAACAACGACCAAAGTGCTCTGATCAAAACAGAGGGAGAGTTTCATCGT
CGGCGTCGAGAGTTCTTTGTTTTTTCTGGTTCAGTTATATACTTTTGTATTGCTAATTTT
ATTGTGTATTTTCTGTGTATTTCCTACTTATTATTATGACTAATATAATATTATGCTGCT
TCACAGACAGAGCAGTTTACTATTTTGCTATTTTT*GGTTCTTTGTAAATTTGTACTTTG
TACA*GAGTCTCATGTTATTGTAACTTTAGTTTTTGTTTTCAGTTA

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL7664Contig1 795 2 5 U
ACAATTGTGTGTAGTACAACACACTCTCAGAAATCATTTAGATCGAAACCTCTCTAGTTG
CAGAAATGGCGGCAGCTTTAGCTTCCAGACTTACCAAAGGACGTTCTTTGCTTGGAGGTC
TTACCAATGCTTTCTCTGGTCTGATGAGTTCATCCAGTGGAAGCATCCTTTCTCAGCAGC
AGCAACAAAGGAGGACGTTCATTCAAATGGGAACAAGACTCAAAGTGGTGGATAACTCTG
GTGCAAAGGAGGTGATGTGCATTCAATCTCTAAGAGGAAAGAAAGGAGCAAGACTTGGCG
ATATCGTCGTTTGTTCAGTGAAAGAGTCTGCGCAGAAAGTTGATGTAAAGAAAGGGAAAG
ACGCCATACAAAAAGGCAAAGTGAAGAAAGGGAGCGTCGTGTACGGTGTGGTTGTGCGTG
CTGCGATGCAGAAAGGGCGTGTCGATGGAAGCCAAGTAAGGTTTGATGACAACGCCGTCG
TTATTTTGGGGATTAAGGAGAAAAAGACAGATGAAAAGGGTAAGGAAAAAAAGCAAAACT
ATAAGGGGTGGTTTTAACCAACCGCTTGGTACCCGAGTGCTTGGTCCTGTCCCTCACGAG
ATGCGCCTCAAGAAACAGCTCAAGATCCTTTCTTTGGCTCAGCATCTTGTTTGAGACTGA
GAGAGACTACACCCACCTATCATCTTGTTTGAGACTGAGACTACACCACCTATTATTATT
ATCTCTTTATATTATGCGACTGTAATCCATCCATCGGATAGTCAGACTCCTGTTTTATTA
ATTAAACTATTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AX94TFB U 230
AF RR2AX94JQ C 1
BS 1 232 RR2AX94JQ
BS 233 516 RR2AX94TFB
BS 517 517 RR2AX94JQ
BS 518 583 RR2AX94TFB
BS 584 795 RR2AX94JQ

RD RR2AX94TFB 354 0 0
GGG
TAACTCTGGTGCAAAGGAGGTGATGTGCATTCAATCTCTAAGAGGAAAGAAAGGAGCAAG
ACTTGGCGATATCGTCGTTTGTTCAGTGAAAGAGTCTGCGCAGAAAGTTGATGTAAAGAA
AGGGAAAGACGCCATACAAAAAGGCAAAGTGAAGAAAGGGAGCGTCGTGTACGGTGTGGT
TGTGCGTGCTGCGATGCAGAAAGGGCGTGTCGATGGAAGCCAAGTAAGGTTTGATGACAA
CGCCGTCGTTATTTTGGGGATTAAGGAGAAAAAGACAGATGAAA*GGGTAAGGAAAAAAA
GCAAAACTATAAGGGGTGGTTTTAACCAACCGCTTGGTACCCGAGTGCTTG

QA 4 354 4 354
DS 

RD RR2AX94JQ 795 0 0
ACAATTGTGTGTAGTACAACACACTCTCAGAAATCATTTAGATCGAAACCTCTCTAGTTG
CAGAAATGGCGGCAGCTTTAGCTTCCAGACTTACCAAAGGACGTTCTTTGCTTGGAGGTC
TTACCAATGCTTTCTCTGGTCTGATGAGTTCATCCAGTGGAAGCATCCTTTCTCAGCAGC
AGCAACAAAGGAGGACGTTCATTCAAATGGGAACAAGACTCAAAGTGGTGGATAACTCTG
GTGCAAAGGAGGTGATGTGCATTCAATCTCTAAGAGGAAAGAAAGGAGCAAGACTTGGCG
ATATCGTCGTTTGTTCAGTGAAAGAGTCTGCGCAGAAAGTTGATGTAAAGAAAGGGAAAG
ACGCCATACAAAAAGGCAAAGTGAAGAAAGGGAGCGTCGTGTACGGTGTGGTTGTGCGTG
CTGCGATGCAGAAAGGGCGTGTCGATGGAAGCCAAGTAAGGTTTGATGACAACGCCGTCG
TTATTTTGGGGATTAAGGAGAAAAAGACAGATGAAAAGGGTAAGGAAAAAAAGCAAAACT
ATAAGGG*TGGTTTTAACCAACCGCTTGGTACCCGAGTGCTTGGTCCTGTCCCTCACGAG
ATGCGCCTCAAGAAACAGCTCAAGATCCTTTCTTTGGCTCAGCATCTTGTTTGAGACTGA
GAGAGACTACACCCACCTATCATCTTGTTTGAGACTGAGACTACACCACCTATTATTATT
ATCTCTTTATATTATGCGACTGTAATCCATCCATCGGATAGTCAGACTCCTGTTTTATTA
ATTAAACTATTTGAC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

CO CL7665Contig1 621 2 2 U
TGATTTTATTACAGCAACTGAATTCACGTTTGGTCGGAAAAGTTATAACAAAGACACGAA
GATAGAGCCTATGGCGTTTCAAAATAGGTATATAAAGAAAACATTAGTTTCCAACGTTAT
GGCAGATACATAACTCTCTAAACTCCAAGTTGAACTAATAGAGAGATGCATAATGGTTTG
GGAAGAAACTCTTTAGAGACCTTCTTGTTGAACAAACGGGTTAGCGATTTCTTCAGTTCC
ATCCGTTGGTGAGACGAGCATCACTGCAGTTCCACGGCAAACAATTAAACCGAGGGGTCT
CGTCTGGTCAGTGGTCGTCAAAGGATCATCATGATCTCGAACAAACTCTACAGCCCCATC
CAAAACAAGGTTGAGCAACTGATCGTACCCCTTAAGAGTTCCAGTGACTTGTCTACCACC
GGCGAGCTTAACCTGCACACCCTTGTCAACGAACTTAGCCAAATCCAACACCGTTTCCTT
TCTTCCTGACATGGTAGAGCAGAGTCTTCGACACAAGTTCCCTTTCGGAGAAACGAAGAT
CTCTTCAGAGAACTTTGGCGGCGAAGCAAATCGGAGGGACGATGCTGTAAAGTGGAGAGA
GAGTCGGAGAATCTTTAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C893TF C 1
AF RR2C893JQ U 48
BS 1 47 RR2C893TF
BS 48 621 RR2C893JQ

RD RR2C893TF 621 0 0
TGATTTTATTACAGCAACTGAATTCACGTTTGGTCGGAAAAGTTATAACAAAGACACGAA
GATAGAGCCTATGGCGTTTCAAAATAGGTATATAAAGAAAACATTAGTTTCCAACGTTAT
GGCAGATACATAACTCTCTAAACTCCAAGTTGAACTAATAGAGAGATGCATAATGGTTTG
GGAAGAAACTCTTTAGAGACCTTCTTGTTGAACAAACGGGTTAGCGATTTCTTCAGTTCC
ATCCGTTGGTGAGACGAGCATCACTGCAGTTCCACGGCAAACAATTAAACCGAGGGGTCT
CGTCTGGTCAGTGGTCGTCAAAGGATCATCATGATCTCGAACAAACTCTACAGCCCCATC
CAAAACAAGGTTGAGCAACTGATCGTACCCCTTAAGAGTTCCAGTGACTTGTCTACCACC
GGCGAGCTTAACCTGCACACCCTTGTCAACGAACTTAGCCAAATCCAACACCGTTTCCTT
TCTTCCTGACATGGTAGAGCAGAGTCTTCGACACAAGTTCCCTTTCGGAGAAACGAAGAT
CTCTTCAGAGAACTTTGGCGGCGAAGCAAATCGGAGGGACGATGCTGTAAAGTGGAGAGA
GAGTCGGAGAATCTTTAGTCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2C893JQ 574 0 0
ACAAAGACACGAAGATAGAGCCTATGGCGTTTCAAAATAGGTATATAAAGAAAACATTAG
TTTCCAACGTTATGGCAGATACATAACTCTCTAAACTCCAAGTTGAACTAATAGAGAGAT
GCATAATGGTTTGGGAAGAAACTCTTTAGAGACCTTCTTGTTGAACAAACGGGTTAGCGA
TTTCTTCAGTTCCATCCGTTGGTGAGACGAGCATCACTGCAGTTCCACGGCAAACAATTA
AACCGAGGGGTCTCGTCTGGTCAGTGGTCGTCAAAGGATCATCATGATCTCGAACAAACT
CTACAGCCCCATCCAAAACAAGGTTGAGCAACTGATCGTACCCCTTAAGAGTTCCAGTGA
CTTGTCTACCACCGGCGAGCTTAACCTGCACACCCTTGTCAACGAACTTAGCCAAATCCA
ACACCGTTTCCTTTCTTCCTGACATGGTAGAGCAGAGTCTTCGACACAAGTTCCCTTTCG
GAGAAACGAAGATCTCTTCAGAGAACTTTGGCGGCGAAGCAAATCGGAGGGACGATGCTG
TAAAGTGGAGAGAGAGTCGGAGAATCTTTAGTCC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL7666Contig1 574 2 1 U
GGAAGAAAACTTTCCGAAAATATCGAAGTAAAAACAGAGCTTTTTTTTTTGTTTTGTGTC
AATGTCGGAATCTAGCTCAAGCTTCTCGTCCTTAACTCTCCTACTCGTCATCTTCCTCCT
CGTTTTACTATGTCCATCGCTTTCTTCGTCTTCTTCTGAATCTAACGAAGTTCGTGTTTT
GGATCGGGAGCTGTTGGAGATAAAGACAGATCCGAAGGTGAACAAGACTAGTAGAAAGCC
CAAGTGCTGCGAGATGCGGACCAGATCTCAGTGTTCGGGTTTCCCTAGATGCAGATGGTG
TCGTAGTGAAGCTCTCGACGACCTGTGCTTCAGTAAAACCGAAGCCTTGCGACTTCCTAG
TTAAGTGTTCCGCTGTGAGTTATAAAACTTAACAGATTTTTATCTAAATATGTTGTACTT
CTTATGGAGTTTTTCTTTTTGTGGAAATCTTATATAGAGAGAGATTTTACTTTCTTTCCT
AATTTTGACTTGTATTGAATGTCTATGGTGTTGTTGTAATCGATTTGATTCTCACAAGTT
TTTGGAATGTAATGGATCTTGATTCGTGTATCGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EQ19JQ C 1
AF RR2EQ19TF U 1
BS 1 574 RR2EQ19TF

RD RR2EQ19JQ 574 0 0
GGAAGAAAACTTTCCGAAAATATCGAAGTAAAAACAGAGCTTTTTTTTTTGTTTTGTGTC
AATGTCGGAATCTAGCTCAAGCTTCTCGTCCTTAACTCTCCTACTCGTCATCTTCCTCCT
CGTTTTACTATGTCCATCGCTTTCTTCGTCTTCTTCTGAATCTAACGAAGTTCGTGTTTT
GGATCGGGAGCTGTTGGAGATAAAGACAGATCCGAAGGTGAACAAGACTAGTAGAAAGCC
CAAGTGCTGCGAGATGCGGACCAGATCTCAGTGTTCGGGTTTCCCTAGATGCAGATGGTG
TCGTAGTGAAGCTCTCGACGACCTGTGCTTCAGTAAAACCGAAGCCTTGCGACTTCCTAG
TTAAGTGTTCCGCTGTGAGTTATAAAACTTAACAGATTTTTATCTAAATATGTTGTACTT
CTTATGGAGTTTTTCTTTTTGTGGAAATCTTATATAGAGAGAGATTTTACTTTCTTTCCT
AATTTTGACTTGTATTGAATGTCTATGGTGTTGTTGTAATCGATTTGATTCTCACAAGTT
TTTGGAATGTAATGGATCTTGATTCGTGTATCGC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2EQ19TF 574 0 0
GGAAGAAAACTTTCCGAAAATATCGAAGTAAAAACAGAGCTTTTTTTTTTGTTTTGTGTC
AATGTCGGAATCTAGCTCAAGCTTCTCGTCCTTAACTCTCCTACTCGTCATCTTCCTCCT
CGTTTTACTATGTCCATCGCTTTCTTCGTCTTCTTCTGAATCTAACGAAGTTCGTGTTTT
GGATCGGGAGCTGTTGGAGATAAAGACAGATCCGAAGGTGAACAAGACTAGTAGAAAGCC
CAAGTGCTGCGAGATGCGGACCAGATCTCAGTGTTCGGGTTTCCCTAGATGCAGATGGTG
TCGTAGTGAAGCTCTCGACGACCTGTGCTTCAGTAAAACCGAAGCCTTGCGACTTCCTAG
TTAAGTGTTCCGCTGTGAGTTATAAAACTTAACAGATTTTTATCTAAATATGTTGTACTT
CTTATGGAGTTTTTCTTTTTGTGGAAATCTTATATAGAGAGAGATTTTACTTTCTTTCCT
AATTTTGACTTGTATTGAATGTCTATGGTGTTGTTGTAATCGATTTGATTCTCACAAGTT
TTTGGAATGTAATGGATCTTGATTCGTGTATCGC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL7667Contig1 860 2 4 U
GGAAAGAGAAGAGCATCGTAAACCTATGGCAGAGAAGCTAGAGCCGGCAAAGGTTTTGTA
CTGTGGAGTTTGCTCTCTTCCAGCTGAATACTGCGAGTTCGGTCCTGATTTCGGGAGATG
CAAGCCCTGGCTCGTTGATAACGCACCCGATCTCTATCCTGATCTCCTCAAAGAAGCTAA
TGAGAAGGCAGTAGATAATGTCTCTGACAAACTCCAGTCCGTGGGAATCTCTTCAGCTGG
CGCTGATGGTGCACCCTCTTCATCTCAGTCTGGAGGAGGGACATCCAAGAAGGAGGAAGG
TAAACGCCTTCCCGGGGGAAAACTAAAAAAGAAAGAGAGACAAGAAGTTATTATTGAGAA
GGTTGTGCGCAACAAGCGCAAGTGTATCACCATTGTTAAAGGACTAGAACTGTTTGGGAT
AAAACTCAGTGATGCATCTAAAAAGCTTGGAAAGAAGTTTGCCACTGGAGCTTCAGTTGT
CAAGGGGCCAACTGAAAAGGAGCAAATTGATGTTCAAGGAGATATAATCTATGACATCGT
TGAGTTCATTACAGACACTTGGCCCGACGTACCTGAAAGATCCATTTTCTTCATTGAAGA
TGGGGAAGAAGGTTCAAGCTGGTTGATGACCACCTCACTGTCCTGTTTTTTTTTTTGGGC
ATGGCAGCAGGTTCACTTAGAGAAAGCTAGTTTCCGGTTCCTCCTATGTGTTTTGGAGGA
AACGCTACGCTATAATAACTTACAACATAACATATATATAGCTTTCTTGCTCGGGTTTGT
GATAATTCCTGTTGGTTTCTCCAAGCATCTCTGTTTGTGACATTTTAAAATTTGCTTCGA
AATGACGAATGTGTTTCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF56TF U 1
AF RR2CF56JQ C 207
BS 1 655 RR2CF56TF
BS 656 656 RR2CF56JQ
BS 657 666 RR2CF56TF
BS 667 860 RR2CF56JQ

RD RR2CF56TF 666 0 0
GGAAAGAGAAGAGCATCGTAAACCTATGGCAGAGAAGCTAGAGCCGGCAAAGGTTTTGTA
CTGTGGAGTTTGCTCTCTTCCAGCTGAATACTGCGAGTTCGGTCCTGATTTCGGGAGATG
CAAGCCCTGGCTCGTTGATAACGCACCCGATCTCTATCCTGATCTCCTCAAAGAAGCTAA
TGAGAAGGCAGTAGATAATGTCTCTGACAAACTCCAGTCCGTGGGAATCTCTTCAGCTGG
CGCTGATGGTGCACCCTCTTCATCTCAGTCTGGAGGAGGGACATCCAAGAAGGAGGAAGG
TAAACGCCTTCCCGGGGGAAAACTAAAAAAGAAAGAGAGACAAGAAGTTATTATTGAGAA
GGTTGTGCGCAACAAGCGCAAGTGTATCACCATTGTTAAAGGACTAGAACTGTTTGGGAT
AAAACTCAGTGATGCATCTAAAAAGCTTGGAAAGAAGTTTGCCACTGGAGCTTCAGTTGT
CAAGGGGCCAACTGAAAAGGAGCAAATTGATGTTCAAGGAGATATAATCTATGACATCGT
TGAGTTCATTACAGACACTTGGCCCGACGTACCTGAAAGATCCATTTTCTTCATTGAAGA
TGGGGAAGAAGGTTCAAGCTGGTTGATGACCACCTCACTGTCCTGTTTTTTTTTT*GGGC
ATGGCA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RR2CF56JQ 654 0 0
ACAAACTCCAGTCCGTGGGAATCTCTTCAGCTGGCGCTGATGGTGCACCCTCTTCATCTC
AGTCTGGAGGAGGGACATCCAAGAAGGAGGAAGGTAAACGCCTTCCCGGGGGAAAACTAA
AAAAGAAAGAGAGACAAGAAGTTATTATTGAGAAGGTTGTGCGCAACAAGCGCAAGTGTA
TCACCATTGTTAAAGGACTAGAACTGTTTGGGATAAAACTCAGTGATGCATTTAAAAAGC
TTGGAAAGAAGTTTGCCACTGGAGCTTCAGTTGTCAAGGGGCCAACTGAAAAGGAGCAAA
TTGATGTTCAAGGAGATATAATTTATGACATCGTTGAGTTCATTACAGACACTTGGCCCG
ACGTACCTGAAAGATCCATTTTTTTCATTGAAGATGGG*AAGAAGGTTCAAGCTGGTTGA
TGACCACCTCACTGTCCTGTTTTTTTTTTTGGGCATGGCAGCAGGTTCACTTAGAGAAAG
CTAGTTTCCGGTTCCTCCTATGTGTTTTGGAGGAAACGCTACGCTATAATAACTTACAAC
ATAACATATATATAGCTTTCTTGCTCGGGTTTGTGATAATTCCTGTTGGTTTCTCCAAGC
ATCTCTGTTTGTGACATTTTAAAATTTGCTTCGAAATGACGAATGTGTTTCTCG

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL7668Contig1 903 2 12 U
GGAAACGCAAAGAAAATCATTCGATTTTACAGAAATAAAACTATATAGATAAATCTTTTT
AAAAATCAAGAGAGCGAGAGAAGATGAAGGAAGAACAATGGGCACCAGTGATAGTAATGC
TAATATCAAGTGTTGCAATGGGTTCAGTGAATGCTCTCGTTAAGAAAGCACTTGATGTTG
GAGTTAATCATATGATCTTTGCTGCATATAGAATGGCTATTTCTGCTTTGATATTGGTTC
CGTTTTCTTATATTTGGGAGAGGAAAACAAGACCAATGTTAACGTTCATGCTCTTGTGCG
AGCATTTCATCAGCGGATTACTTGGGGCAAGTTTGATGCAATTTTTCTTTCTTCTTGGAC
TATCGTACACGTCACCCACTGTTGCGATGGCTCTAAATAGCATGTTACCCGCTATTACCT
TTGCCCTGGCTCTTACTTTCAGAATAGAGAATGCACAGAAACTGAAGAGCAGAGCAGGCG
TGCTCAAGTTAATAGGAACCCTAATTTGCATACTTGGAGCAATGTTCTTAACATTCTATA
AAGGTCTTCAAGTATCAAATCCTCATACTCATCCAGAGGCTATTGACAACACATTACATA
ACAATGGTCACGACCAAGCAAAGAAATGGCTTCTAGGCTGTGTTTACTTGTTCACTGGGA
TAGTGTTATTGTCGCTATGGATGTTGTTTCAAGGGAAATTAAGCGTTAAGTATCCCTGTA
CTAAGTACTCAAGTACTTGCCTCATGTCGTTCTTTGCAGCATTTCAATGTGCCATTTTGA
GTCTTTATAAGAGTAGAGAAGTCGAAGATTGGATCATCAAAGACAAACTCGTCATGTTCG
TTATCCTTTACGCTGTAAGTTTTTCATCTATCATAATATATGCAAATATATAAAATTGGC
ATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2FI82TF U 1
AF RR2FI82JQ C 108
BS 1 694 RR2FI82TF
BS 695 695 RR2FI82JQ
BS 696 751 RR2FI82TF
BS 752 752 RR2FI82JQ
BS 753 766 RR2FI82TF
BS 767 767 RR2FI82JQ
BS 768 777 RR2FI82TF
BS 778 778 RR2FI82JQ
BS 779 789 RR2FI82TF
BS 790 790 RR2FI82JQ
BS 791 800 RR2FI82TF
BS 801 903 RR2FI82JQ

RD RR2FI82TF 800 0 0
GGAAACGCAAAGAAAATCATTCGATTTTACAGAAATAAAACTATATAGATAAATCTTTTT
AAAAATCAAGAGAGCGAGAGAAGATGAAGGAAGAACAATGGGCACCAGTGATAGTAATGC
TAATATCAAGTGTTGCAATGGGTTCAGTGAATGCTCTCGTTAAGAAAGCACTTGATGTTG
GAGTTAATCATATGATCTTTGCTGCATATAGAATGGCTATTTCTGCTTTGATATTGGTTC
CGTTTTCTTATATTTGGGAGAGGAAAACAAGACCAATGTTAACGTTCATGCTCTTGTGCG
AGCATTTCATCAGCGGATTACTTGGGGCAAGTTTGATGCAATTTTTCTTTCTTCTTGGAC
TATCGTACACGTCACCCACTGTTGCGATGGCTCTAAATAGCATGTTACCCGCTATTACCT
TTGCCCTGGCTCTTACTTTCAGAATAGAGAATGCACAGAAACTGAAGAGCAGAGCAGGCG
TGCTCAAGTTAATAGGAACCCTAATTTGCATACTTGGAGCAATGTTCTTAACATTCTATA
AAGGTCTTCAAGTATCAAATCCTCATACTCATCCAGAGGCTATTGACAACACATTACATA
ACAATGGTCACGACCAAGCAAAGAAATGGCTTCTAGGCTGTGTTTACTTGTTCACTGGGA
TAGTGTTATTGTCGCTATGGATGTTGTTTCAAGG*AAATTAAGCGTTAAGTATCCCTGTA
CTAAGTACTCAAGTACTTGCCTCATGTCGTT*TTTGCAGCATTTCA*TGTGCCATTT*GA
GTCTTTATA*GAGTAGAGAA

QA 1 800 1 800
DS 

RD RR2FI82JQ 796 0 0
GTGATAGTAATGCTAATATCAAGTGT*GCAATGGGTTCAGTGAATGCTCTCGTTAAGAAA
GCACTTGATGTTGGAGTTAATCATATGATCTTTGCTGCATATAGAATGGCTATTTCTGCT
TTGATATTGGTTCCGTTTTCTTATATTTGGGAGAGGAAAACAAGACCAATGTTAACGTTC
ATGCTCTTGTGCGAGCATTTCATCAGCGGATTACTTGGGGCAAGTTTGATGCAATTTTTC
TTTCTTCTTGGACTATCGTACACGTCACCCACTGTTGCGATGGCTCTAAATAGCATGTTA
CCCGCTATTACCTTTGCCCTGGCTCTTACTTTCAGAATAGAGAATGCACAGAAACTGAAG
AGCAGAGCAGGCGTGCTCAAGTTAATAGGAACCCTAATTTGCATACTTGGAGCAATGTTC
TTAACATTCTATAAAGGTCTTCAAGTATCAAATCCTCATACTCATCCAGAGGCTATTGAC
AACACATTACATAACAATGGTCACGACCAAGCAAAGAAATGGCTTTTAGGCTGTGTTTAC
TTGTTCACTGGGATAGTGTTATTGTCGCTATGGATGTTGTTTCAAGGGAAATTAAGCGTT
AAGTATCCCTGTACTAAGTACTCAAGTACTTGCCTCATGTCGTTCTTTGCAGCATTTCAA
TGTGCCATTTTGAGTCTTTATAAGAGTAGAGAAGTCGAAGATTGGATCATCAAAGACAAA
CTCGTCATGTTCGTTATCCTTTACGCTGTAAGTTTTTCATCTATCATAATATATGCAAAT
ATATAAAATTGGCATT

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL7669Contig1 680 2 2 U
GGACTCACTTCCAAGTATCGGATGGGTTCTGGAACGTGCGAAAGCTGCTGTTCTTCGGCG
TGGGATACGAGGACTTGTCATAGACCCTTACAATGAGCTTGATCATCAACGTACTCAACG
ACAGACGGAGACAGAATATGTTAGCCAGATGCTTACGAAGATAAAACGATTTGCGCAGCA
TCACTCTTGTCATGTCGGGTTCGTTGCACATCCAAAACAGTTGCAACAGTGGGACGGTGG
TCCACCAAACCTTTATGATATTAGCGGGAGTGCGCATTTCATTAACAAATGTGACAATGG
GATTGTTATCCACAGAAACCGTGATGAAAAAGCTGGGCCTCTTGATCTAGTGCAGATTTG
TGTGAGGAAAGTGCGAAACAAGGTTGCAGGACAAATTGGTGATGCATACTTGTGTTACGA
CAGGGCAACTGGTTTATTCTCAGATTCTCCTATCACACCTGAAAAGCCTGAAAGGAGATC
AAGCCGACGGCCATGATCTGGTTTTTTGTGAGTTAAAAGAACGTCAAAACACACATTGGG
ACATAGTCGATAACATTTGTCTGCTAAATTTTATCCTTCTGTAAGACTTAAAAGACTGTC
TCAGTTTAATGTGGATGGTTTACGTGTTACTCTCTTCTTCTATCATGGTGGGTCTGATCA
AAAATACGTGACTTTAGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EG04TF U 1
AF RR2EG04JQ C 1
BS 1 575 RR2EG04TF
BS 576 680 RR2EG04JQ

RD RR2EG04TF 575 0 0
GGACTCACTTCCAAGTATCGGATGGGTTCTGGAACGTGCGAAAGCTGCTGTTCTTCGGCG
TGGGATACGAGGACTTGTCATAGACCCTTACAATGAGCTTGATCATCAACGTACTCAACG
ACAGACGGAGACAGAATATGTTAGCCAGATGCTTACGAAGATAAAACGATTTGCGCAGCA
TCACTCTTGTCATGTCGGGTTCGTTGCACATCCAAAACAGTTGCAACAGTGGGACGGTGG
TCCACCAAACCTTTATGATATTAGCGGGAGTGCGCATTTCATTAACAAATGTGACAATGG
GATTGTTATCCACAGAAACCGTGATGAAAAAGCTGGGCCTCTTGATCTAGTGCAGATTTG
TGTGAGGAAAGTGCGAAACAAGGTTGCAGGACAAATTGGTGATGCATACTTGTGTTACGA
CAGGGCAACTGGTTTATTCTCAGATTCTCCTATCACACCTGAAAAGCCTGAAAGGAGATC
AAGCCGACGGCCATGATCTGGTTTTTTGTGAGTTAAAAGAACGTCAAAACACACATTGGG
ACATAGTCGATAACATTTGTCTGCTAAATTTTATC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RR2EG04JQ 680 0 0
GGACTCACTTCCAAGTATCGGATGGGTTCTGGAACGTGCGAAAGCTGCTGTTCTTCGGCG
TGGGATACGAGGACTTGTCATAGACCCTTACAATGAGCTTGATCATCAACGTACTCAACG
ACAGACGGAGACAGAATATGTTAGCCAGATGCTTACGAAGATAAAACGATTTGCGCAGCA
TCACTCTTGTCATGTCGGGTTCGTTGCACATCCAAAACAGTTGCAACAGTGGGACGGTGG
TCCACCAAACCTTTATGATATTAGCGGGAGTGCGCATTTCATTAACAAATGTGACAATGG
GATTGTTATCCACAGAAACCGTGATGAAAAAGCTGGGCCTCTTGATCTAGTGCAGATTTG
TGTGAGGAAAGTGCGAAACAAGGTTGCAGGACAAATTGGTGATGCATACTTGTGTTACGA
CAGGGCAACTGGTTTATTCTCAGATTCTCCTATCACACCTGAAAAGCCTGAAAGGAGATC
AAGCCGACGGCCATGATCTGGTTTTTTGTGAGTTAAAAGAACGTCAAAACACACATTGGG
ACATAGTCGATAACATTTGTCTGCTAAATTTTATCCTTCTGTAAGACTTAAAAGACTGTC
TCAGTTTAATGTGGATGGTTTACGTGTTACTCTCTTCTTCTATCATGGTGGGTCTGATCA
AAAATACGTGACTTTAGATT

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL7670Contig1 843 2 18 U
GCACATCAACAGTTCCAAAATTAAATTCTCAGAATATTTATTTGAAGTTTTGAACCCAAA
AACAAAATAGAGAGAATCATACAAAACTAAATGGTAATACACAAAAGTGAAGTGACAAAA
GCTGAAAAGAAGAACAAAAGAAACAGAGAGATTACACTAACATAGTGGGAAGCTCCAATA
AAACTTTGGCCTTAAGAGAGTACACCTTCCCATAAGAAACTCATTACAAACCACTTGTTC
CATTTGTCTACAAACGATATAAGACACTTCTCCGGCGACTTTTCAGGTATGAGCCGAGGC
AGCCGTCATTCCTACAGAAGACTCAGGGCTAACATACTCCTCGCTTGCATGCCTGACAAA
CTCCTCCGGCGACATGTGTGAGCCGTGACAAGCGCAAACGATTTTGATCTGGTTTGCATT
GTACCGATATGTAACACCCGAGATTGTTCGACCGTGCGGGCCTGAACCAGTGGTTGAGAC
CCAGGGCAGGTTAGGACGCGCACCAGATCCTCCAAACTTCACATCCGCTGCCATTCCAGG
TTTTATGGCGGAAAAGTCGAAAGAGAAAGCAGTACTGTTGTTGTTGTCTCCTGATGGTAG
TTCTGATGCATCCTCTGATGAGCCTTCTTCTGCAACAGGCTGTTTTCCCTCGCCTTTCGC
CGTAGCTGAGTTTGATGGGCCTCTTGCAGCGAATGGAGATTGAGAAAGGCCAGCAATGCT
GCTTGAGCCATCCTTATCCAGCATAGGGAGCTGAACCGGTGAGTATCCGAACATAACAGG
GAGATTATTCCCAGCATTAGCAGTAAGCTGTGTTAGACTTGTAGCTCCTGCATGTTGTCC
AGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2EN09JQ U 1
AF RR2FS04JQ U 60
BS 1 146 RR2EN09JQ
BS 147 147 RR2FS04JQ
BS 148 222 RR2EN09JQ
BS 223 223 RR2FS04JQ
BS 224 254 RR2EN09JQ
BS 255 255 RR2FS04JQ
BS 256 318 RR2EN09JQ
BS 319 319 RR2FS04JQ
BS 320 426 RR2EN09JQ
BS 427 427 RR2FS04JQ
BS 428 465 RR2EN09JQ
BS 466 466 RR2FS04JQ
BS 467 498 RR2EN09JQ
BS 499 499 RR2FS04JQ
BS 500 598 RR2EN09JQ
BS 599 600 RR2FS04JQ
BS 601 704 RR2EN09JQ
BS 705 843 RR2FS04JQ

RD RR2EN09JQ 704 0 0
GCACATCAACAGTTCCAAAATTAAATTCTCAGAATATTTATTTGAAGTTTTGAACCCAAA
AACAAAATAGAGAGAATCATACAAAACTAAATGGTAATACACAAAAGTGAAGTGACAAAA
GCTGAAAAGAAGAACAAAAGAAACAGCGAGATTACACTAACATAGTGGGAAGCTCCAATA
AAACTTTGGCCTTAAGAGAGTACACCTTCCCATAAGAAACTCGTTACAAACCACTTGTTC
CATTTGTCTACAAA*GATATAAGACACTTCTCCGGCGACTTTTCAGGTATGAGCCGAGGC
AGCCGTCATTCCTACAGATGACTCAGGGCTAACATACTCCTCGCTTGCATGCCTGACAAA
CTCCTCCGGCGACATGTGTGAGCCGTGACAAGCGCAAACGATTTTGATCTGGTTTGCATT
GTACCGGTATGTAACACCCGAGATTGTTCGACCGTGCGGGCCTGAGCCAGTGGTTGAGAC
CCAGGGCAGGTTAGGACGTGCACCAGATCCTCCAAACTTCACATCCGCTGCCATTCCAGG
TTTTATGGCGGAAAAGTCGAAAGAGAAAGCAGTACTGTTGTTGTTGTCTCCTGATGGTCT
TTCTGATGCATCCTCTGATGAGCCTTCTTCTGCAACAGGCTGTTTTCCCTCGCCTTTCGC
CGTAGCTGAGTTTGATGGGCCTCTTGCAGCGAATGGAGATTGAG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2FS04JQ 784 0 0
AAACAAAATAGAGAGAATCATACAAAACTAAATGGTGATACACAA***TGAAGTGATAAA
AGCTGAAAAGAAGAACAAAAGAAACAGAGAGATTACACTAACATAGTGGGAAGCTCCAAT
AAAACTTTGGCCTTAA*AGAGTACACCTTCCCATAAGAAACTCATTACAAACCACTTGTT
CCATTTGTTTACAACCGATATAAGACACTTCTCCGGCGACTTTTCAGGTATGAGCCGAGG
CAGCCGTCATTCCTACAGAAGACTCAGGGCTAACATACTCCTCGCTTGCATGCCTGACAA
ACTCCTCGGGCGACATGTGTGAGCCGTGACAAGCGCAAACGATTTTGATCTGGTTTGCAT
TGTACCGATATGTAACACCCGAGATTGTTCGACCGTGCGGGCCTGAACCAGTGGTTGAGA
CCCAGGGCAGGTTAGGACGCGCACCAGATCCTCCAAACTTCACATCCGCTGCCATTCCAG
GTTTTATGGCGGAAAAGTCGAAAGAGAAAGCAGTACTGTTGTTGTTGTCTCCTGATGGTA
GTTCTGATGCATCCTCTGATGAGCCTTCTTCTGCAACAGGCTGTTTTCCCTCGCCTTTCG
CCGTAGCTGAGTTTGATGGGCCTCTTGCAGCGAATGGAGATTGAGAAAGGCCAGCAATGC
TGCTTGAGCCATCCTTATCCAGCATAGGGAGCTGAACCGGTGAGTATCCGAACATAACAG
GGAGATTATTCCCAGCATTAGCAGTAAGCTGTGTTAGACTTGTAGCTCCTGCATGTTGTC
CAGA

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL7671Contig1 579 2 1 U
GTCAGTCTTGGAAGTACCCTTGACAGAGGAAAACGTTAAAAGCGTTTTAGACGAAATCAG
ACCATACCTTATGTCTGATGGTGGGAATGTCGCATTGCATGAGATCGATGGCAATATTGT
TCGAGTGAAACTGCAGGGAGCGTGTGGTTCATGCCCAAGTTCTGTTACGACGATGAAGAT
GGGTATTGAGCGTCGCCTCATGGAAAAGATCCCTGAAATAGTGGCTGTTGAATCAGTTCC
AGATGAAGAGACTGGCCTTGAACTCAATGACAAAAACATTGAAAAGGTGCTGGAAGAAAT
CAGGCCTTACTTGATCGGAACAGCTGATGGATCCCTCGAACTGGTGGAAATTGAAGAACC
GATCGTGAAGATAAGAATCACAGGACCTGCTGCTGGAGTCATGACCGTACGAGTGGCAGT
AACTCAGAAACTCAGAGAGAAAATTCCTTCTGTTGCAGCTGTTCAACTTATATGAAGTCG
TCTCTTTCTTTGTATAGTTACTATGTACAGATACTGTGTTTGACATTTGTTATCTGTGCC
CAAATAATTAATTTTGTTTTATTTTAACTTTGAGTGTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B403JQ C 1
AF RR2B403TF U 1
BS 1 579 RR2B403TF

RD RR2B403JQ 579 0 0
GTCAGTCTTGGAAGTACCCTTGACAGAGGAAAACGTTAAAAGCGTTTTAGACGAAATCAG
ACCATACCTTATGTTTGATGGTGGGAATGTCGCATTGCATGAGATCGATGGCAATATTGT
TCGAGTGAAACTGCAGGGAGCGTGTGGTTCATGCCCAAGTTCTGTTACGACGATGAAGAT
GGGTATTGAGCGTCGCCTCATGGAAAAGATCCCTGAAATAGTGGCTGTTGAATCAGTTCC
AGATGAAGAGACTGGCCTTGAACTCAATGACAAAAACATTGAAAAGGTGCTGGAAGAAAT
CAGGCCTTACTTGATCGGAACAGCTGATGGATCCCTCGAACTGGTGGAAATTGAAGAACC
GATCGTGAAGATAAGAATCACAGGACCTGCTGCTGGAGTCATGACCGTACGAGTGGCAGT
AACTCAGAAACTCAGAGAGAAAATTCCTTCTGTTGCAGCTGTTCAACTTATATGAAGTCG
TCTCTTTCTTTGTATAGTTACTATGTACAGATACTGTGTTTGACATTTGTTATCTGTGCC
CAAATAATTAATTTTGTTTTATTTTAACTTTGAGTGTGG

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2B403TF 579 0 0
GTCAGTCTTGGAAGTACCCTTGACAGAGGAAAACGTTAAAAGCGTTTTAGACGAAATCAG
ACCATACCTTATGTCTGATGGTGGGAATGTCGCATTGCATGAGATCGATGGCAATATTGT
TCGAGTGAAACTGCAGGGAGCGTGTGGTTCATGCCCAAGTTCTGTTACGACGATGAAGAT
GGGTATTGAGCGTCGCCTCATGGAAAAGATCCCTGAAATAGTGGCTGTTGAATCAGTTCC
AGATGAAGAGACTGGCCTTGAACTCAATGACAAAAACATTGAAAAGGTGCTGGAAGAAAT
CAGGCCTTACTTGATCGGAACAGCTGATGGATCCCTCGAACTGGTGGAAATTGAAGAACC
GATCGTGAAGATAAGAATCACAGGACCTGCTGCTGGAGTCATGACCGTACGAGTGGCAGT
AACTCAGAAACTCAGAGAGAAAATTCCTTCTGTTGCAGCTGTTCAACTTATATGAAGTCG
TCTCTTTCTTTGTATAGTTACTATGTACAGATACTGTGTTTGACATTTGTTATCTGTGCC
CAAATAATTAATTTTGTTTTATTTTAACTTTGAGTGTGG

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL7672Contig1 642 2 1 U
GGATCATCCAAACTCATTACTAACTTAAGCAAAAGAGATAAAACTTAAAGGTTATGGAGG
GGCTCTTAAAGTTGTCGACGTTGGTGATTGTGTGCATGTTAGTGTCCGCTCCAATGGCGT
CCGAGGCAGCAATCTCTTGTGGCGCCGTCGCAAGCAACTTAGGCCAATGTATTAACTACC
TGACCCGAGGTGGTTTCGTTCCTCGAGGGTGTTGTTCTGGCGTTAGGAGGCTAAACGGCA
TGGCTCGCACCACCCGTGACCGCCAACAAGCTTGTCGCTGCATCCAAGGAGCAGCTAGAG
CCTTGGGTTCCAGACTTAACCCAGGACGTGCTGCTCGTCTTCCTGGTGCTTGCCGTGTTA
GGATCGCTTACCCCATCAGCGCAAGAACCAACTGTAACAAAGTCAGGTGAGCATGAGAGT
ATATCGACGTCGTTGAAGGTTTTTCTTTTAATGTAATCGTTGAGATCAGAGTATTAAAGA
ATAATTAAGATGTCACTAGTAAGTGTATCATTTTACTGTTGTGTGCTGTTTTTAAAATTT
GTGTGTTTCGTGTCTTTCTTTATATACGACTGTCCATTTAACTCGTCGTCTGTCTTATGT
ATACCTCCAATGATATATGGAATTACGATATGTATTGTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ER57JQ C 1
AF RR2ER57TF U 1
BS 1 642 RR2ER57TF

RD RR2ER57JQ 642 0 0
GGATCATCCAAACTCATTACTAACTTAAGCAAAAGAGATAAAACTTAAAGGTTATGGAGG
GGCTCTTAAAGTTGTCGACGTTGGTGATTGTGTGCATGTTAGTGTCCGCTCCAATGGCGT
CCGAGGCAGCAATCTCTTGTGGCGCCGTCGCAAGCAACTTAGGCCAATGTATTAACTACC
TGACCCGAGGTGGTTTCGTTCCTCGAGGGTGTTGTTCTGGCGTTAGGAGGCTAAACGGCA
TGGCTCGCACCACCCGTGACCGCCAACAAGCTTGTCGCTGCATCCAAGGAGCAGCTAGAG
CCTTGGGTTCCAGACTTAACCCAGGACGTGCTGCTCGTCTTCCTGGTGCTTGCCGTGTTA
GGATCGCTTACCCCATCAGCGCAAGAACCAACTGTAACAAAGTCAGGTGAGCATGAGAGT
ATATCGACGTCGTTGAAGGTTTTTCTTTTAATGTAATCGTTGAGATCAGAGTATTAAAGA
ATAATTAAGATGTCACTAGTAAGTGTATCATTTTACTGTTGTGTGCTGTTTTTAAAATTT
GTGTGTTTCGTGTCTTTCTTTATATACGACTGTCCATTTAACTCGTCGTCTGTCTTATGT
ATACCTCCAATGATATATGGAATTACGATATGTATTGTTTCC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2ER57TF 642 0 0
GGATCATCCAAACTCATTACTAACTTAAGCAAAAGAGATAAAACTTAAAGGTTATGGAGG
GGCTCTTAAAGTTGTCGACGTTGGTGATTGTGTGCATGTTAGTGTCCGCTCCAATGGCGT
CCGAGGCAGCAATCTCTTGTGGCGCCGTCGCAAGCAACTTAGGCCAATGTATTAACTACC
TGACCCGAGGTGGTTTCGTTCCTCGAGGGTGTTGTTCTGGCGTTAGGAGGCTAAACGGCA
TGGCTCGCACCACCCGTGACCGCCAACAAGCTTGTCGCTGCATCCAAGGAGCAGCTAGAG
CCTTGGGTTCCAGACTTAACCCAGGACGTGCTGCTCGTCTTCCTGGTGCTTGCCGTGTTA
GGATCGCTTACCCCATCAGCGCAAGAACCAACTGTAACAAAGTCAGGTGAGCATGAGAGT
ATATCGACGTCGTTGAAGGTTTTTCTTTTAATGTAATCGTTGAGATCAGAGTATTAAAGA
ATAATTAAGATGTCACTAGTAAGTGTATCATTTTACTGTTGTGTGCTGTTTTTAAAATTT
GTGTGTTTCGTGTCTTTCTTTATATACGACTGTCCATTTAACTCGTCGTCTGTCTTATGT
ATACCTCCAATGATATATGGAATTACGATATGTATTGTTTCC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL7673Contig1 660 2 2 U
TTTTTTTCTTTTTTTGTTGCATAAAAATGGCAATTATCCTCCTTCTATTCGTTCTGGATA
CGGGCCTAGTCCTGAGTGCGCTGTCTGTCTTCTCGGCTGGCCCAAACAACGAGATTGGTC
CTGGGATTAGCACCAAAATTTCTCGGCATCTCATCCTCCTGTTGCTGGTCATTTCCTAAA
GGATCGAAGGTTCAGCCGACGCCTCAAAGTGGATTTGTTGTGCGAAGGGTGCGACCGGGA
TTTAGAGTTAGAATAGCGGGGAAGACTTGACCTCAGGCAGCGTGAAACCAGTTTATTTCA
TTCGATGTAGTGGTCCGATCGCCTAGTGGAAGCCCTGAGGCACTTGATTCTTGCGTACGC
TCGGCTCCTCTACCAATCACCACAGCGCGAGATGCGCAAGAGTGACCCATCTCTCCACAC
CAACTGGACCATACAATACACTCTTTATAAGAAAAAAAGATTTGGAACCGAAAGATAGGA
AATAAATTGACTTCCAGAGCGGAAGGGAATACTTAACCACGCCTCGAGTCCCAGTCTCCT
AGTGGTGAGATGGTAAAGGGCAATGTCCGGTTCTGGCCAAGAGATGTCTTTGCTCCGTCC
CCCTTCTTGTTGGTTGGCACAAGCCCTTGTAGTAGTAAGTCTTTCCTCCGGCCGGATCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FD32TF C 1
AF RR2FD32JQ U 19
BS 1 18 RR2FD32TF
BS 19 660 RR2FD32JQ

RD RR2FD32TF 660 0 0
TTTTTTTCTTTTTTTGTTGCATAAAAATGGCAATTATCCTCCTTCTATTCGTTCTGGATA
CGGGCCTAGTCCTGAGTGCGCTGTCTGTCTTCTCGGCTGGCCCAAACAACGAGATTGGTC
CTGGGATTAGCACCAAAATTTCTCGGCATCTCATCCTCCTGTTGCTGGTCATTTCCTAAA
GGATCGAAGGTTCAGCCGACGCCTCAAAGTGGATTTGTTGTGCGAAGGGTGCGACCGGGA
TTTAGAGTTAGAATAGCGGGGAAGACTTGACCTCAGGCAGCGTGAAACCAGTTTATTTCA
TTCGATGTAGTGGTCCGATCGCCTAGTGGAAGCCCTGAGGCACTTGATTCTTGCGTACGC
TCGGCTCCTCTACCAATCACCACAGCGCGAGATGCGCAAGAGTGACCCATCTCTCCACAC
CAACTGGACCATACAATACACTCTTTATAAGAAAAAAAGATTTGGAACCGAAAGATAGGA
AATAAATTGACTTCCAGAGCGGAAGGGAATACTTAACCACGCCTCGAGTCCCAGTCTCCT
AGTGGTGAGATGGTAAAGGGCAATGTCCGGTTCTGGCCAAGAGATGTCTTTGCTCCGTCC
CCCTTCTTGTTGGTTGGCACAAGCCCTTGTAGTAGTAAGTCTTTCCTCCGGCCGGATCGC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2FD32JQ 642 0 0
GCATAAAAATGGCAATTATCCTCCTTCTATTCGTTCTGGATACGGGCCTAGTCCTGAGTG
CGCTGTCTGTCTTCTCGGCTGGCCCAAACAACGAGATTGGTCCTGGGATTAGCACCAAAA
TTTCTCGGCATCTCATCCTCCTGTTGCTGGTCATTTCCTAAAGGATCGAAGGTTCAGCCG
ACGCCTCAAAGTGGATTTGTTGTGCGAAGGGTGCGACCGGGATTTAGAGTTAGAATAGCG
GGGAAGACTTGACCTCAGGCAGCGTGAAACCAGTTTATTTCATTCGATGTAGTGGTCCGA
TCGCCTAGTGGAAGCCCTGAGGCACTTGATTCTTGCGTACGCTCGGCTCCTCTACCAATC
ACCACAGCGCGAGATGCGCAAGAGTGACCCATCTCTCCACACCAACTGGACCATACAATA
CACTCTTTATAAGAAAAAAAGATTTGGAACCGAAAGATAGGAAATAAATTGACTTCCAGA
GCGGAAGGGAATACTTAACCACGCCTCGAGTCCCAGTCTCCTAGTGGTGAGATGGTAAAG
GGCAATGTCCGGTTCTGGCCAAGAGATGTCTTTGCTCCGTCCCCCTTCTTGTTGGTTGGC
ACAAGCCCTTGTAGTAGTAAGTCTTTCCTCCGGCCGGATCGC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL7674Contig1 808 2 2 U
GGGTCAACAAGTTCAACGTCATCCCTGACTCGATCCCTGAGTGGGTCTTCGACTTCATGC
CTCTCCGTGGCGGCTACTTCATAGGAAACGTCAGTCCAGCTCGTATGGATTTCAGGTGGT
TCGCTCTTGGCAACTGTGTGGCGATCCTTGCTTCTTTAGCCACGCCTGAGCAGTCGGCGG
CGATCATGGACTTGATCGAGGAACGATGGGAAGAGCTTGTCGGAGAGATGCCGGTTAAGA
TTTGTCATCCGGCTATTGAGAGCCATGAGTGGAGGATCGTTACTGGTTGTGACCCTAAGA
ATACTCGGTGGAGTTACCATAACGGAGGTTCTTGGCCAGTGCTTTTGTGGCTATTAACAG
CAGCGTGCATAAAGACGGGACGGCCACAGATAGCAAGACGGGCAATCGACCTGGCGGAGT
CACGGCTGCTGAAAGACGGTTGGCCGGAGTACTACGATGGGAAATCAGGAAGGTTTATCG
GAAAACAGGCGAGGAAGTTTCAGACATGGTCCATCGCTGGTTACTTGGTCGCCAAGATGA
TGTTGGAAGATCCTTCTCACCTTGGAATGATCTCATTGGAAGAGGACAAACAGACCAAAC
CTGTCATTAAGAGATCTCATTCTTGGACTTAGCTTGTCAATCGTTCTCAATATCTTTTGA
GAAAATTTGGCTAAGATTTGATAGTTTCTAAATTTTTGTTTTACAAGTTATCTTCTTCTT
TCTTTAGTCTCTGTTTGCTTATCTTTTATATTTCCCCTACAATCTCTATGCACAATCACT
CTATGTTAGTAAAATTGATGGTTTACTC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW90TF U 1
AF RR2GW90JQ C 5
BS 1 724 RR2GW90TF
BS 725 808 RR2GW90JQ

RD RR2GW90TF 724 0 0
GGGTCAACAAGTTCAACGTCATCCCTGACTCGATCCCTGAGTGGGTCTTCGACTTCATGC
CTCTCCGTGGCGGCTACTTCATAGGAAACGTCAGTCCAGCTCGTATGGATTTCAGGTGGT
TCGCTCTTGGCAACTGTGTGGCGATCCTTGCTTCTTTAGCCACGCCTGAGCAGTCGGCGG
CGATCATGGACTTGATCGAGGAACGATGGGAAGAGCTTGTCGGAGAGATGCCGGTTAAGA
TTTGTCATCCGGCTATTGAGAGCCATGAGTGGAGGATCGTTACTGGTTGTGACCCTAAGA
ATACTCGGTGGAGTTACCATAACGGAGGTTCTTGGCCAGTGCTTTTGTGGCTATTAACAG
CAGCGTGCATAAAGACGGGACGGCCACAGATAGCAAGACGGGCAATCGACCTGGCGGAGT
CACGGCTGCTGAAAGACGGTTGGCCGGAGTACTACGATGGGAAATCAGGAAGGTTTATCG
GAAAACAGGCGAGGAAGTTTCAGACATGGTCCATCGCTGGTTACTTGGTCGCCAAGATGA
TGTTGGAAGATCCTTCTCACCTTGGAATGATCTCATTGGAAGAGGACAAACAGACCAAAC
CTGTCATTAAGAGATCTCATTCTTGGACTTAGCTTGTCAATCGTTCTCAATATCTTTTGA
GAAAATTTGGCTAAGATTTGATAGTTTCTAAATTTTTGTTTTACAAGTTATCTTCTTCTT
TCTT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RR2GW90JQ 804 0 0
CAACAAGTTCAACGTCATCC*TGACTCGATCC*TGAGTGGGTCTTCGACTTCATGCCTCT
CCGTGGCGGCTACTTCATAGGAAACGTCAGTCCAGCTCGTATGGATTTCAGGTGGTTCGC
TCTTGGCAACTGTGTGGCGATCCTTGCTTCTTTAGCCACGCCTGAGCAGTCGGCGGCGAT
CATGGACTTGATCGAGGAACGATGGGAAGAGCTTGTCGGAGAGATGCCGGTTAAGATTTG
TCATCCGGCTATTGAGAGCCATGAGTGGAGGATCGTTACTGGTTGTGACCCTAAGAATAC
TCGGTGGAGTTACCATAACGGAGGTTCTTGGCCAGTGCTTTTGTGGCTATTAACAGCAGC
GTGCATAAAGACGGGACGGCCACAGATAGCAAGACGGGCAATCGACCTGGCGGAGTCACG
GCTGCTGAAAGACGGTTGGCCGGAGTACTACGATGGGAAATCAGGAAGGTTTATCGGAAA
ACAGGCGAGGAAGTTTCAGACATGGTCCATCGCTGGTTACTTGGTCGCCAAGATGATGTT
GGAAGATCCTTCTCACCTTGGAATGATCTCATTGGAAGAGGACAAACAGACCAAACCTGT
CATTAAGAGATCTCATTCTTGGACTTAGCTTGTCAATCGTTCTCAATATCTTTTGAGAAA
ATTTGGCTAAGATTTGATAGTTTCTAAATTTTTGTTTTACAAGTTATCTTCTTCTTTCTT
TAGTCTCTGTTTGCTTATCTTTTATATTTCCCCTACAATCTCTATGCACAATCACTCTAT
GTTAGTAAAATTGATGGTTTACTC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL7675Contig1 786 2 2 U
GGGACCACCCTTCACCTAAAATCTAATCTTTATCATCCTTCTCCACCTCTAATCGCACAA
AAACATGGAGGCAGTAACGGCGATGAAGCCACTGATCAGAGTCGCTGCTATCTCCGGCTC
TCTCCGGAAAGGCTCTTTCAACACCGGTCTACTCCGCGCCGCGATGGAGTTGACGAAGGA
ATCGGTTCCGGGGATCCAGATTGAGCATATAGACATATCTCCGTTGCCGTTGATCAACAC
CGATCTGGAAACCAACGGGACTTATCCTCCCGTCGTCGAAGCTTTCCGGCAGAAGATCCT
TGAGGCCGATAGCATTCTCTTCGCTTCCCCTGAGTACAACTTCTCCGTCGCAGCTCCACT
TAAGAACGCGATCGATTGGGCGTCGAGATCACCTAACGTTTGGGCTGACAAACCTGCTGC
CATCGTAAGCGCCGGTGGAGGTTTTGGTGGAGGAAGGTCGCAGTACCATCTCCGACAGAT
CGGAGTTTTCCTTGATCTTCACTTCATCAACAAACCGGAGTTTACTCTCAACGCGTTTCA
GCCGCCTCAGAAGTTCGATGCAGATGGGAACTTGGTCGATGAAGTGGCTAAGGAGAGGTT
AAAACAAGTGCTTGTCTCGTTACAGGCTTTTACTCTGCGAGTTCAAAGTAAGTGAGAGTG
GAGGGGCAGTACTTGATCATTTGTGTGAGTGAAAATAATGTCGATTCTTGTGAGATAAGA
AACAGTGTCTTTGCCACTTGTCGTATGAATATTTCTATTTCTCATTAATATCGTCTGTGT
TGGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG62TF U 1
AF RR2DG62JQ C 178
BS 1 694 RR2DG62TF
BS 695 786 RR2DG62JQ

RD RR2DG62TF 700 0 0
GGGACCACCCTTCACCTAAAATCTAATCTTTATCATCCTTCTCCACCTCTAATCGCACAA
AAACATGGAGGCAGTAACGGCGATGAAGCCACTGATCAGAGTCGCTGCTATCTCCGGCTC
TCTCCGGAAAGGCTCTTTCAACACCGGTCTACTCCGCGCCGCGATGGAGTTGACGAAGGA
ATCGGTTCCGGGGATCCAGATTGAGCATATAGACATATCTCCGTTGCCGTTGATCAACAC
CGATCTGGAAACCAACGGGACTTATCCTCCCGTCGTCGAAGCTTTCCGGCAGAAGATCCT
TGAGGCCGATAGCATTCTCTTCGCTTCCCCTGAGTACAACTTCTCCGTCGCAGCTCCACT
TAAGAACGCGATCGATTGGGCGTCGAGATCACCTAACGTTTGGGCTGACAAACCTGCTGC
CATCGTAAGCGCCGGTGGAGGTTTTGGTGGAGGAAGGTCGCAGTACCATCTCCGACAGAT
CGGAGTTTTCCTTGATCTTCACTTCATCAACAAACCGGAGTTTACTCTCAACGCGTTTCA
GCCGCCTCAGAAGTTCGATGCAGATGGGAACTTGGTCGATGAAGTGGCTAAGGAGAGGTT
AAAACAAGTGCTTGTCTCGTTACAGGCTTTTACTCTGCGAGTTCAAAGTAAGTGAGAGTG
GAGGGGCAGTACTTGATCATTTGTGTGAGTGAAA
TAATGT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2DG62JQ 609 0 0
GGAATCGGTTCCGGGGATCCAGATTGAGCATATAGACATATCTCCGTTGCCGTTGATCAA
CACCGATCTGGAAACCAACGGGACTTATCCTCCCGTCGTCGAAGCTTTCCGGCAGAAGAT
CCTTGAGGCCGATAGCATTCTCTTCGCTTCCCCTGAGTACAACTTCTCCGTCGCAGCTCC
ACTTAAGAACGCGATCGATTGGGCGTCGAGATCACCTAACGTTTGGGCTGACAAACCTGC
TGCCATCGTAAGCGCCGGTGGAGGTTTTGGTGGAGGAAGGTCGCAGTACCATCTCCGACA
GATCGGAGTTTTCCTTGATCTTCACTTCATCAACAAACCGGAGTTTACTCTCAACGCGTT
TCAGCCGCCTCAGAAGTTCGATGCAGATGGGAACTTGGTCGATGAAGTGGCTAAGGAGAG
GTTAAAACAAGTGCTTGTCTCGTTACAGGCTTTTACTCTGCGAGTTCAAAGTAAGTGAGA
GTGGAGGGGCAGTACTTGATCATTTGTGTGAGTGAAAATAATGTCGATTCTTGTGAGATA
AGAAACAGTGTCTTTGCCACTTGTCGTATGAATATTTCTATTTCTCATTAATATCGTCTG
TGTTGGCAT

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL7676Contig1 835 2 8 U
GGGTTTTCAGCCTGAGGAGGGAAAGCAGAGACGTAACGCCATGGGAAGAAGACCGGCTAG
GTGTTACCGTCAGATCAAGGGCAAACCCTACCCGAAGTCTCGCTACTGTCGTGGTGTCCC
CGATCCCAAAATCAGGATCTACGATGTCGGCATGAAGAGGAAAGGCGTCGACGAGTTCCC
TTTCTGCGTCCATCTCGTCTCCTGGGAGAAGGAGAACGTCTCGAGCGAAGCTCTCGAGGC
CGCGCGTATCGCTTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCGGGAAAAGACGCGTTCCACCT
CAGGATCAGGGTCCACCCGTTCCATGTCCTGAGGATCAACAAGATGCTTTCGTGCGCTGG
AGCCGATAGGCTTCAGACCGGTATGAGAGGTGCGTTCGGAAAGGCCTTGGGGACTTGTGC
TAGGGTGGCGATTGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATGCTCATGGTCACCA
TGCTCAGGAGGCTCTGAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGTCGTCAAAAGATTATCGT
CAGCAGGAAATGGGGTTTCACTAAGTTCAACAGAGCAGACTTTACGAAGTTGAGGCAAGA
GAAGCGTGTTGTTCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTCTCATGCCATGGACCTTTGGC
TAACCGTCAGCCGGGAAGTGCATTTTTGCCAGCTACCTATTGAACTTCAGTGTTGAATTA
TATCTAGAGTCTTGAAACTTTTTCTATAATCTTTGAAAGTATTGTCTTAAAAGTTTTTTA
GTTGGACACATTGAATATTTCTGAACCTTTGTCATATAATGATATTGTTCTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR21TF U 1
AF RR2BR21JQ C 72
BS 1 653 RR2BR21TF
BS 654 654 RR2BR21JQ
BS 655 718 RR2BR21TF
BS 719 719 RR2BR21JQ
BS 720 748 RR2BR21TF
BS 749 749 RR2BR21JQ
BS 750 763 RR2BR21TF
BS 764 835 RR2BR21JQ

RD RR2BR21TF 763 0 0
GGGTTTTCAGCCTGAGGAGGGAAAGCAGAGACGTAACGCCATGGGAAGAAGACCGGCTAG
GTGTTACCGTCAGATCAAGGGCAAACCCTACCCGAAGTCTCGCTACTGTCGTGGTGTCCC
CGATCCCAAAATCAGGATCTACGATGTCGGCATGAAGAGGAAAGGCGTCGACGAGTTCCC
TTTCTGCGTCCATCTCGTCTCCTGGGAGAAGGAGAACGTCTCGAGCGAAGCTCTCGAGGC
CGCGCGTATCGCTTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCGGGAAAAGACGCGTTCCACCT
CAGGATCAGGGTCCACCCGTTCCATGTCCTGAGGATCAACAAGATGCTTTCGTGCGCTGG
AGCCGATAGGCTTCAGACCGGTATGAGAGGTGCGTTCGGAAAGGCCTTGGGGACTTGTGC
TAGGGTGGCGATTGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATGCTCATGGTCACCA
TGCTCAGGAGGCTCTGAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGTCGTCAAAAGATTATCGT
CAGCAGGAAATGGGGTTTCACTAAGTTCAACAGAGCAGACTTTACGAAGTTGAGGCAAGA
GAAGCGTGTTGTTCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTCTCATGCCATGGAC*TTTGGC
TAACCGTCAGCCGGGAAGTGCATTTTTGCCAGCTACCTATTGAACTTCAGTGTTGAAT*A
TATCTAGAGTCTTGAAACTTTTTCTATA*TCTTTGAAAGTATT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RR2BR21JQ 764 0 0
AGATCAAGGGCAA*CCCTACCCGAAGTCTCGCTACTGTCGTGGTGTCCCCGATCCCAAAA
TCAGGATCTACGATGTCGGCATGAAGAGGAAAGGCGTCGACGAGTTCCCTTTCTGCGTCC
ATCTCGTCTCCTGGGAGAAGGAGAACGTCTCGAGCGAAGCTCTCGAGGCCGCGCGTATCG
CTTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCGGGAAAAGACGCGTTCCACCTCAGGATCAGGG
TCCACCCGTTCCATGTCCTGAGGATCAACAAGATGCTTTCGTGCGCTGGAGCCGATAGGC
TTCAGACCGGTATGAGAGGTGCGTTCGGAAAGGCCTTGGGGACTTGTGCTAGGGTGGCGA
TTGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATGCTCATGGTCACCATGCTCAGGAGG
CTCTGAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGTCGTCAAAAGATTATCGTCAGCAGGAAAT
GGGGTTTCACTAAGTTCAACAGAGCAGACTTTACGAAGTTGAGGCAAGAGAAGCGTGTTG
TTCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTCTCATGCCATGGACCTTTGGCTAACCGTCAGC
CGGGAAGTGCATTTTTGCCAGCTACCTATTGAACTTCAGTGTTGAATTATATCTAGAGTC
TTGAAACTTTTTCTATAATCTTTGAAAGTATTGTCTTAAAAGTTTTTTAGTTGGACACAT
TGAATATTTCTGAACCTTTGTCATATAATGATATTGTTCTTTCT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL7677Contig1 627 2 1 U
GGATACAAGAAAGAAAGAAACACATAAACAAATGACTTCTTCAGTAACCACTTTAGCCCT
AACCCTAGTTCTGATCTTCCACCTCACGCCGGAAACAACCGCAGCTCGCCACCTCAATGA
TCAGAAGCCTACCGATGAAATGAAATACCTGTTTCCACCTGGGCTGCCTTTCACCGGCGT
TCCTCCGTTACCGACACTTTTTCCTCCGTTCCCCGGAAACGTTCCACGTTTTCCGTTTCC
GTTTCCGTCGCAGTCATCACCTCCGGCATCTCTTCCTGGTTTACCTGGCGTTACCTTACC
TCCCCTGCCGTTCCTCACGCCGCCACCTGAGTGATTCTATAGGTTATCACCGCCGTTTTT
ATGATACGTGTCCCATTGGAATAAACTACTTATGGATGATCATGTGTGCTCGATGATATA
AAATATTAGTATTCTATGGAAGTTTAATAAAATATATCTCGTGTTAGTGTAACTCAATGT
TGATCTAATAAATAAAGTATTCGATTTGAGTACTAAGTTCTAACATTCTCATGTCCATGG
AGTTTTTTTGAGAAAGTCATGTCCATGAAGTTTACGAGTGCAAGTGATTTTAAAACGACC
ATGTATCCAAGTGAAAATTGACACTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A459JQ C 1
AF RR2A459TF U 1
BS 1 627 RR2A459TF

RD RR2A459JQ 627 0 0
GGATACAAGAAAGAAAGAAACACATAAACAAATGACTTCTTCAGTAACCACTTTAGCCCT
AACCCTAGTTCTGATCTTCCACCTCACGCCGGAAACAACCGCAGCTCGCCACCTCAATGA
TCAGAAGCCTACCGATGAAATGAAATACCTGTTTCCACCTGGGCTGCCTTTCACCGGCGT
TCCTCCGTTACCGACACTTTTTCCTCCGTTCCCCGGAAACGTTCCACGTTTTCCGTTTCC
GTTTCCGTCGCAGTCATCACCTCCGGCATCTCTTCCTGGTTTACCTGGCGTTACCTTACC
TCCCCTGCCGTTCCTCACGCCGCCACCTGAGTGATTCTATAGGTTATCACCGCCGTTTTT
ATGATACGTGTCCCATTGGAATAAACTACTTATGGATGATCATGTGTGCTCGATGATATA
AAATATTAGTATTCTATGGAAGTTTAATAAAATATATCTCGTGTTAGTGTAACTCAATGT
TGATCTAATAAATAAAGTATTCGATTTGAGTACTAAGTTCTAACATTCTCATGTCCATGG
AGTTTTTTTGAGAAAGTCATGTCCATGAAGTTTACGAGTGCAAGTGATTTTAAAACGACC
ATGTATCCAAGTGAAAATTGACACTGC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RR2A459TF 627 0 0
GGATACAAGAAAGAAAGAAACACATAAACAAATGACTTCTTCAGTAACCACTTTAGCCCT
AACCCTAGTTCTGATCTTCCACCTCACGCCGGAAACAACCGCAGCTCGCCACCTCAATGA
TCAGAAGCCTACCGATGAAATGAAATACCTGTTTCCACCTGGGCTGCCTTTCACCGGCGT
TCCTCCGTTACCGACACTTTTTCCTCCGTTCCCCGGAAACGTTCCACGTTTTCCGTTTCC
GTTTCCGTCGCAGTCATCACCTCCGGCATCTCTTCCTGGTTTACCTGGCGTTACCTTACC
TCCCCTGCCGTTCCTCACGCCGCCACCTGAGTGATTCTATAGGTTATCACCGCCGTTTTT
ATGATACGTGTCCCATTGGAATAAACTACTTATGGATGATCATGTGTGCTCGATGATATA
AAATATTAGTATTCTATGGAAGTTTAATAAAATATATCTCGTGTTAGTGTAACTCAATGT
TGATCTAATAAATAAAGTATTCGATTTGAGTACTAAGTTCTAACATTCTCATGTCCATGG
AGTTTTTTTGAGAAAGTCATGTCCATGAAGTTTACGAGTGCAAGTGATTTTAAAACGACC
ATGTATCCAAGTGAAAATTGACACTGC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL7678Contig1 576 2 4 U
GAAACTCAAAACCACTAATTAGAGATTTGCCGTCTCTGTCGGTGATTGTTGATTTGGCTC
GCCGTCCGGTGAAACTCTCTCCCAGCTGGACAAAATATTCGTGTTCCAACTTTTTGTCAT
GACGAGCCTGATATGGTTAACAGCAGAAGAGGCTGCAAAGAACAGAGGCAAAGTGCTTTC
CTTGTATCGCCAGTTACCGAGGAGCATTAACTCACCGAAGCTGCAGCTCAGTTACGCGTC
GAGACTCGCCAAGAAAGCTGAGGTTAAGACCATCTTCTTGTTTGGCTCCGAGGAGGTTTC
TAAACACAACGTTGCCGATCTCATCCGTACCGGTGAATATGCTCTTTCTCAGCTGAAACA
AGGCAAAATCCCAAACAACACTACTCAGTATTGAGCTTTCCATTGGCATTTTGAGCATAG
CACTCTTCAAGTGTCAATGCATTCGCAAACGGTGTGACGCTCTTCTTGTTTTCCTCTTTT
TGAAAACATACTTTGAATCTGCTTTACTGTACAACGTTTTGGCTCAATGCAGTTGGAATA
AACTAGTGATTACTTTGCAATAAATATGATTCACAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BT73JQ C 1
AF RR2BT73TF U 1
BS 1 537 RR2BT73TF
BS 538 538 RR2BT73JQ
BS 539 570 RR2BT73TF
BS 571 576 RR2BT73JQ

RD RR2BT73JQ 576 0 0
GAAACTCAAAACCACTAATTAGAGATTTGCCGTCTCTGTCGGTGATTGTTGATTTGGCTC
GCCGTCCGGTGAAACTCTCTCCCAGCTGGACAAAATATTCGTGTTCCAACTTTTTGTCAT
GACGAGCCTGATATGGTTAACAGCAGAAGAGGCTGCAAAGAACAGAGGCAAAGTGCTTTC
CTTGTATCGCCAGTTACCGAGGAGCATTAACTCACCGAAGCTGCAGCTCAGTTACGCGTC
GAGACTCGCCAAGAAAGCTGAGGTTAAGACCATCTTCTTGTTTGGCTCCGAGGAGGTTTC
TAAACACAACGTTGCCGATCTCATCCGTACCGGTGAATATGCTCTTTCTCAGCTGAAACA
AGGCAAAATCCCAAACAACACTACTCAGTATTGAGCTTTCCATTGGCATTTTGAGCATAG
CACTCTTCAAGTGTCAATGCATTCGCAAACGGTGTGACGCTCTTCTTGTTTTCCTCTTTT
TGAAAACATACTTTGAATCTGCTTTACTGTACAACGTTTTGGCTCAATGCAGTTGGAATA
AACTAGTGATTACTTTGCAATAAATATGATTCACAT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RR2BT73TF 575 0 0
GAAACTCAAAACCACTAATTAGAGATTTGCCGTCTCTGTCGGTGATTGTTGATTTGGCTC
GCCGTCCGGTGAAACTCTCTCCCAGCTGGACAAAATATTCGTGTTCCAACTTTTTGTCAT
GACGAGCCTGATATGGTTAACAGCAGAAGAGGCTGCAAAGAACAGAGGCAAAGTGCTTTC
CTTGTATCGCCAGTTACCGAGGAGCATTAACTCACCGAAGCTGCAGCTCAGTTACGCGTC
GAGACTCGCCAAGAAAGCTGAGGTTAAGACCATCTTCTTGTTTGGCTCCGAGGAGGTTTC
TAAACACAACGTTGCCGATCTCATCCGTACCGGTGAATATGCTCTTTCTCAGCTGAAACA
AGGCAAAATCCCAAACAACACTACTCAGTATTGAGCTTTCCATTGGCATTTTGAGCATAG
CACTCTTCAAGTGTCAATGCATTCGCAAACGGTGTGACGCTCTTCTTGTTTTCCTCTTTT
TGAAAACATACTTTGAATCTGCTTTACTGTACAACGTTTTGGCTCAATGCAGTTGGA*TA
AACTAGTGATTACTTTGCAATAAATATGAT
CACAT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL7679Contig1 720 2 2 U
TTTTTTTTTCTACGAAACAGTTATATATTTATACAGTTTGAATCTTTACATAGACAGAGA
ATTGTGAGGATTTGTTCGAAAGACTTTGTCTGGAGATGTGTGGTTTGTGACGTTACATAC
TGACCTTAGCTTGTGAGATATCTAACAACAGAAGCTCGATATAATAAGTTTAGCAACTTC
TATGTTTTTATGAGGCTCTTAACGTCTGCTTCATGTATCTTAGAGCGGAGCGTAACATGG
ATCTAGCTTTCCTATCTGGTTTGCAGCCTGACATGATCATCTCCTCGTAAACACCGGGTA
CCTTTTGGAACTTATCAACACGAATGAGAGCTTTCATGAGTGTTGTGTATGTCACCACGT
CTGGATTTACGCCGTTTTCTTTCATGTACTGCAAAACGGCAAAGGCTTCGGCGTCTCTCC
TATCCTCTCCAAAGGCATTGATAAGGGAATTGAGAGCCAGTAAACTTGGCTTCAGTCCAT
CTGATGTCATCACTCTAAACGCATTAACAGCTTGCTCCGATAAACCCCTCTGTGCATAGG
CATTGATAAGGGCATTGTACATTGTTGATGATGGTTTCAGCCCAACTGACTTCATCTCCT
CCAAGCAATCTATTGCATCGTTAAACCTACCGGATTTGCCATAAACGTCGACGAGTGTTG
TGTGTGTCACGACGTTAGGCAGTACTCCTTGGCTCTTCATCTTCCCCAACAATCTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FU44TF C 1
AF RR2FU44JQ U 10
BS 1 9 RR2FU44TF
BS 10 720 RR2FU44JQ

RD RR2FU44TF 720 0 0
TTTTTTTTTCTACGAAACAGTTATATATTTATACAGTTTGAATCTTTACATAGACAGAGA
ATTGTGAGGATTTGTTCGAAAGACTTTGTCTGGAGATGTGTGGTTTGTGACGTTACATAC
TGACCTTAGCTTGTGAGATATCTAACAACAGAAGCTCGATATAATAAGTTTAGCAACTTC
TATGTTTTTATGAGGCTCTTAACGTCTGCTTCATGTATCTTAGAGCGGAGCGTAACATGG
ATCTAGCTTTCCTATCTGGTTTGCAGCCTGACATGATCATCTCCTCGTAAACACCGGGTA
CCTTTTGGAACTTATCAACACGAATGAGAGCTTTCATGAGTGTTGTGTATGTCACCACGT
CTGGATTTACGCCGTTTTCTTTCATGTACTGCAAAACGGCAAAGGCTTCGGCGTCTCTCC
TATCCTCTCCAAAGGCATTGATAAGGGAATTGAGAGCCAGTAAACTTGGCTTCAGTCCAT
CTGATGTCATCACTCTAAACGCATTAACAGCTTGCTCCGATAAACCCCTCTGTGCATAGG
CATTGATAAGGGCATTGTACATTGTTGATGATGGTTTCAGCCCAACTGACTTCATCTCCT
CCAAGCAATCTATTGCATCGTTAAACCTACCGGATTTGCCATAAACGTCGACGAGTGTTG
TGTGTGTCACGACGTTAGGCAGTACTCCTTGGCTCTTCATCTTCCCCAACAATCTTTACC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2FU44JQ 711 0 0
CTACGAAACAGTTATATATTTATACAGTTTGAATCTTTACATAGACAGAGAATTGTGAGG
ATTTGTTCGAAAGACTTTGTCTGGAGATGTGTGGTTTGTGACGTTACATACTGACCTTAG
CTTGTGAGATATCTAACAACAGAAGCTCGATATAATAAGTTTAGCAACTTCTATGTTTTT
ATGAGGCTCTTAACGTCTGCTTCATGTATCTTAGAGCGGAGCGTAACATGGATCTAGCTT
TCCTATCTGGTTTGCAGCCTGACATGATCATCTCCTCGTAAACACCGGGTACCTTTTGGA
ACTTATCAACACGAATGAGAGCTTTCATGAGTGTTGTGTATGTCACCACGTCTGGATTTA
CGCCGTTTTCTTTCATGTACTGCAAAACGGCAAAGGCTTCGGCGTCTCTCCTATCCTCTC
CAAAGGCATTGATAAGGGAATTGAGAGCCAGTAAACTTGGCTTCAGTCCATCTGATGTCA
TCACTCTAAACGCATTAACAGCTTGCTCCGATAAACCCCTCTGTGCATAGGCATTGATAA
GGGCATTGTACATTGTTGATGATGGTTTCAGCCCAACTGACTTCATCTCCTCCAAGCAAT
CTATTGCATCGTTAAACCTACCGGATTTGCCATAAACGTCGACGAGTGTTGTGTGTGTCA
CGACGTTAGGCAGTACTCCTTGGCTCTTCATCTTCCCCAACAATCTTTACC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL7680Contig1 1011 2 2 U
TAATATCTACAGGCACCCTAGGAGCAAACGAGCTAAAGTGATTAGGATTCCAGTTTATCA
GCAGAGGGGAAATATTCAAGCTAGTCGAATAGGTGGTGACTATGATTCAGAAGATGATTC
TTTAGAGGAACAAGAAGGTTTCAGTACAAGGAAAAGGCAAACGAGGTCCACAGCTAAACG
TAAAGTAAAAACCGAGATGGTTGAGATTCTGAGAGACACAAGAGGTCGCCGCACTTTGCA
ACAGTCTGGATACAGAAAGAAGAATCAAGATTTAGATCCATACATGGAGGGACCTAGCAC
ACGGCTTAGGGTGAGAAACCTGAAGCCTTCAAGAAAGTCTTCAGAGACAAAACCGAAGAG
AGGAAGTAGTAATGCTTCCTTCTCTAGAGTTGTAAGTGAAGAAGAAGAGTTAGAGGAAGA
TGCTGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAACGTGCTGCTGCTGCTGCTTCTGCGTATAAATGTGA
TATTGAGGGTTGCACGATGAGTTTCAGTTCTGAGAAACAGTTGTCAATGCATAAAAGAAA
CATCTGCCCTGTTAAAGGCTGTGGTAAAAGCTTTTTCTCGCACAAGTATTTGGTCCAACA
CCGGCGTGTCCACTCGGACGACCGTCCACTGAAATGTCCATGGAAGGGATGCAAGATGAC
GTTCAAGTGGGCTTGGTCAAGAACGGAGTACATAAAGGGTTCACACAGGGGAGAGGCCTT
ATCATTGTGCTGAACCGGGTTGCGGGCAGACATTCAGGTTTGTCTCAGATTTTAGCAGGC
ACAAAAAGAAGACGGGTCATTCAGCTAAGAAGACCAAGAAAAGGTGAGAGAGATTGACTT
AGGCTTTTTTTTAACATGGAATCTGTGAGGAAGAGTATTATTAAATCCATTGGATTTGTA
TGGAGAGAATTAGAGTGGTTTCTTGTTAACAATTGAGGACAGGCATTGTTGTTTCAGACA
GAAGCTCCTTTTGTTACACTCTAATGTCATATCTTCTTTACTGTTTGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B571TF U 1
AF RR2B571JQ C 172
BS 1 752 RR2B571TF
BS 753 1011 RR2B571JQ

RD RR2B571TF 752 0 0
TAATATCTACAGGCACCCTAGGAGCAAACGAGCTAAAGTGATTAGGATTCCAGTTTATCA
GCAGAGGGGAAATATTCAAGCTAGTCGAATAGGTGGTGACTATGATTCAGAAGATGATTC
TTTAGAGGAACAAGAAGGTTTCAGTACAAGGAAAAGGCAAACGAGGTCCACAGCTAAACG
TAAAGTAAAAACCGAGATGGTTGAGATTCTGAGAGACACAAGAGGTCGCCGCACTTTGCA
ACAGTCTGGATACAGAAAGAAGAATCAAGATTTAGATCCATACATGGAGGGACCTAGCAC
ACGGCTTAGGGTGAGAAACCTGAAGCCTTCAAGAAAGTCTTCAGAGACAAAACCGAAGAG
AGGAAGTAGTAATGCTTCCTTCTCTAGAGTTGTAAGTGAAGAAGAAGAGTTAGAGGAAGA
TGCTGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAACGTGCTGCTGCTGCTGCTTCTGCGTATAAATGTGA
TATTGAGGGTTGCACGATGAGTTTCAGTTCTGAGAAACAGTTGTCAATGCATAAAAGAAA
CATCTGCCCTGTTAAAGGCTGTGGTAAAAGCTTTTTCTCGCACAAGTATTTGGTCCAACA
CCGGCGTGTCCACTCGGACGACCGTCCACTGAAATGTCCATGGAAGGGATGCAAGATGAC
GTTCAAGTGGGCTTGGTCAAGAACGGAGTACATAAAGGGTTCACACAGGGGAGAGGCCTT
ATCATTGTGCTGAACCGGGTTGCGGGCAGACA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RR2B571JQ 840 0 0
AGCTAAACGTAAAGTAAAAACCGAGATGGTTGAGATTCTGAGAGACACAAGAGGTCGCCG
CACTTTGCAACAGTCTGGATACAGAAAGAAGAATCAAGATTTAGATCCATACATGGAGGG
ACCTAGCACACGGCTTAGGGTGAGAAACCTGAAGCCTTCAAGAAAGTCTTCAGAGACAAA
ACCGAAGAGAGGAAGTAGTAATGCTTCCTTCTCTAGAGTTGTAAGTGAAGAAGAAGAGTT
AGAGGAAGATGCTGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAACGTGCTGCTGCTGCTGCTTCTGCGTA
TAAATGTGATATTGAGGGTTGCACGATGAGTTTCAGTTCTGAGAAACAGTTGTCAATGCA
TAAAAGAAACATCTGCCCTGTTAAAGGCTGTGGTAAAAGCTTTTTCTCGCACAAGTATTT
GGTCCAACACCGGCGTGTCCACTCGGACGACCGTCCACTGAAATGTCCATGGAAGGGATG
CAAGATGACGTTCAAGTGGGCTTGGTCAAGAACGGAGTACATAA*GGGTTCACACAGGGG
AGAGGCCTTATCATTGTGCTGAACCGGGTTGCGGGCAGACATTCAGGTTTGTCTCAGATT
TTAGCAGGCACAAAAAGAAGACGGGTCATTCAGCTAAGAAGACCAAGAAAAGGTGAGAGA
GATTGACTTAGGCTTTTTTTTAACATGGAATCTGTGAGGAAGAGTATTATTAAATCCATT
GGATTTGTATGGAGAGAATTAGAGTGGTTTCTTGTTAACAATTGAGGACAGGCATTGTTG
TTTCAGACAGAAGCTCCTTTTGTTACACTCTAATGTCATATCTTCTTTACTGTTTGAATC

QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 2

CO CL7681Contig1 803 2 2 U
GGCCCTTTTCCCCTTCTAATCACTCATCTCTCTATTAGAAAAATTAAGTAATTATGTTGT
CTACTGTACCGGCCTTTTCCTTCCTGGAACCGGGTACGGTTAATCAATTTTCGGGTTTCC
AAACCGGATTCACTCCTTGGGAGTGGGACTGCTTTGATCTCTTTTCCGTGAACCAATTGT
CTATTGAACCGGCCGTTCCCAGCCCTTGTTATGGTGAATCCGACTCTGGTCTCGTTAGAA
CTAATTCTGGTTTTGATGATAAAACCGGTTCTGACGAATCTTGTGCCGGTTTCACCAAAC
CCGGTTTTGACGACACCGTCAGTTCACAGTGCCTCCTACTGTGCACTCAAGGAGAAAAAC
CGGACCCGGACGACCCAGAACAATTGACAGCCATCGCGAAACCTGATTCAGGAGAGCAGA
ATCACAACCGGAATAATCTGATCAAACCGGAGATGACCGACGAGAGAAAGAGAAAGAGAA
TGGAGTCAAACCGGGAATCAGCGAGACGGTCAAGAATGCGTAAACAGAGTCACATTGATA
ACTTAAGGAACCAAGTAAATCAGCTGGATCTGGAAAACCGTGAGCTCGGTAACCGGCTCC
GGTTAGTTATATACCACCTTCAACAAGTGAACACGGACAATAACAGGCTCGTGACGGAAC
AAGAGATGCTCCGGTTAAGATTCTCGGAGATGAGGCGGATTTTGATTCTCAGACAACTTC
AACAACAACAACAACAGTGGGAACTCAATAACAGGAGAATGATCATGTATGAACAAAACC
CATCTACGATCATATGATCTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CF02TF U 1
AF RR2CF02JQ C 78
BS 1 698 RR2CF02TF
BS 699 803 RR2CF02JQ

RD RR2CF02TF 698 0 0
GGCCCTTTTCCCCTTCTAATCACTCATCTCTCTATTAGAAAAATTAAGTAATTATGTTGT
CTACTGTACCGGCCTTTTCCTTCCTGGAACCGGGTACGGTTAATCAATTTTCGGGTTTCC
AAACCGGATTCACTCCTTGGGAGTGGGACTGCTTTGATCTCTTTTCCGTGAACCAATTGT
CTATTGAACCGGCCGTTCCCAGCCCTTGTTATGGTGAATCCGACTCTGGTCTCGTTAGAA
CTAATTCTGGTTTTGATGATAAAACCGGTTCTGACGAATCTTGTGCCGGTTTCACCAAAC
CCGGTTTTGACGACACCGTCAGTTCACAGTGCCTCCTACTGTGCACTCAAGGAGAAAAAC
CGGACCCGGACGACCCAGAACAATTGACAGCCATCGCGAAACCTGATTCAGGAGAGCAGA
ATCACAACCGGAATAATCTGATCAAACCGGAGATGACCGACGAGAGAAAGAGAAAGAGAA
TGGAGTCAAACCGGGAATCAGCGAGACGGTCAAGAATGCGTAAACAGAGTCACATTGATA
ACTTAAGGAACCAAGTAAATCAGCTGGATCTGGAAAACCGTGAGCTCGGTAACCGGCTCC
GGTTAGTTATATACCACCTTCAACAAGTGAACACGGACAATAACAGGCTCGTGACGGAAC
AAGAGATGCTCCGGTTAAGATTCTCGGAGATGAGGCGG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2CF02JQ 726 0 0
TCCTTCCTGGAACCGGGTACGGTTAATCAATTTTCGGGTTTCCAAACCGGATTCACTCCT
TGGGAGTGGGACTGCTTTGATCTCTTTTCCGTGAACCAATTGTCTATTGAACCGGCCGTT
CCCAGCCCTTGTTATGGTGAATCCGACTCTGGTCTCGTTAGAACTAATTCTGGTTTTGAT
GATAAAACCGGTTCTGACGAATCTTGTGCCGGTTTCACCAAACCCGGTTTTGACGACACC
GTCAGTTCACAGTGCCTCCTACTGTGCACTCAAGGAGAAAAACCGGACCCGGACGACCCA
GAACAATTGACAGCCATCGCGAAACCTGATTCAGGAGAGCAGAATCACAACCGGAATAAT
CTGATCAAACCGGAGATGACCGACGAGAGAAAGAGAAAGAGAATGGAGTCAAACCGGGAA
TCAGCGAGACGGTCAAGAATGCGTAAACAGAGTCACATTGATAACTTAAGGAACCAAGTA
AATCAGCTGGATCTGGAAAACCGTGAGCTCGGTAACCGGCTCCGGTTAGTTATATACCAC
CTTCAACAAGTGAACACGGACAATAACAGGCTCGTGACGGAACAAGAGATGCTCCGGTTA
AGATTCTCGGAGATGAGGCGGATTTTGATTCTCAGACAACTTCAACAACAACAACAACAG
TGGGAACTCAATAACAGGAGAATGATCATGTATGAACAAAACCCATCTACGATCATATGA
TCTAAG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL7682Contig1 580 2 1 U
GGATCTGCCTCGGAGTTCCTCTCCCTAGAAATCCAGACAAAGGAGACAGAAACAAAAGAA
GAAGCAAAAGAGACAATGTCAGAAACAATTGCATACAGCTCTGGGTTAACAACGCCGGAG
TTAATCGCTTTGATCAGTTGGGCTGAATCTGATTCGAACACCACCGCTTGAAGATTCTCT
CTTACGCCCAAGCGGACTGCTTCCAACAGGGCTAAACCTTCAGCCACCAGCGGAGAGGTC
ACGAAGGGAACTCGCTTACTAAAAGGACGATGACCAGAGGAGGAGAGGATTACCCATCCC
AGCCCCGCCATCGTTCTCAATGGTGACCAAGCCGCATCTGTTCTCACTACTGTCGCTCCG
GGAGGCGGTGCCAACAGCAGAGGAGGTCTTCGCTCTTTCCGAGGGGGAGAGACCATCGTC
TCCTTAGACTCTTCCTCTTCACCGTTTTCATGCTTTTTTCTCTTCATATTCTTTCTACTA
CCACTCCACTCTTGCATTTTTTCGTAAGATAAGTTAGAAATATGGTATTTTTGTTATAAT
GCATAAATAACATATGATGAAGATTAAAGAAGTCTATAAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BE13JQ C 1
AF RR2BE13TF U 1
BS 1 580 RR2BE13TF

RD RR2BE13JQ 580 0 0
GGATCTGCCTCGGAGTTCCTCTCCCTAGAAATCCAGACAAAGGAGACAGAAACAAAAGAA
GAAGCAAAAGAGACAATGTCAGAAACAATTGCATACAGCTCTGGGTTAACAACGCCGGAG
TTAATCGCTTTGATCAGTTGGGCTGAATCTGATTCGAACACCACCGCTTGAAGATTCTTT
CTTACGCCCAAGCGGACTGCTTCCAACAGGGCTAAACCTTCAGCCACCAGCGGAGAGGTC
ACGAAGGGAACTCGCTTACTAAAAGGACGATGACCAGAGGAGGAGAGGATTACCCATCCC
AGCCCCGCCATCGTTCTCAATGGTGACCAAGCCGCATCTGTTCTCACTACTGTCGCTCCG
GGAGGCGGTGCCAACAGCAGAGGAGGTCTTCGCTCTTTCCGAGGGGGAGAGACCATCGTC
TCCTTAGACTCTTCCTCTTCACCGTTTTCATGCTTTTTTCTCTTCATATTCTTTCTACTA
CCACTCCACTCTTGCATTTTTTCGTAAGATAAGTTAGAAATATGGTATTTTTGTTATAAT
GCATAAATAACATATGATGAAGATTAAAGAAGTCTATAAC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RR2BE13TF 580 0 0
GGATCTGCCTCGGAGTTCCTCTCCCTAGAAATCCAGACAAAGGAGACAGAAACAAAAGAA
GAAGCAAAAGAGACAATGTCAGAAACAATTGCATACAGCTCTGGGTTAACAACGCCGGAG
TTAATCGCTTTGATCAGTTGGGCTGAATCTGATTCGAACACCACCGCTTGAAGATTCTCT
CTTACGCCCAAGCGGACTGCTTCCAACAGGGCTAAACCTTCAGCCACCAGCGGAGAGGTC
ACGAAGGGAACTCGCTTACTAAAAGGACGATGACCAGAGGAGGAGAGGATTACCCATCCC
AGCCCCGCCATCGTTCTCAATGGTGACCAAGCCGCATCTGTTCTCACTACTGTCGCTCCG
GGAGGCGGTGCCAACAGCAGAGGAGGTCTTCGCTCTTTCCGAGGGGGAGAGACCATCGTC
TCCTTAGACTCTTCCTCTTCACCGTTTTCATGCTTTTTTCTCTTCATATTCTTTCTACTA
CCACTCCACTCTTGCATTTTTTCGTAAGATAAGTTAGAAATATGGTATTTTTGTTATAAT
GCATAAATAACATATGATGAAGATTAAAGAAGTCTATAAC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 2

CO CL7683Contig1 670 2 3 U
TTTTTTCGCAACAAACAATCCAAACACACAACACAAGACATAGAAACAAAACGTCGGAGA
GAGTAAGAGAATCTTCTTTTTTTAGCCAAATCCTAAGAATGTTGTTGAGTTACATTATAG
CATACTTTTTTGCTAACAGCTCACCTTGAACCACGGTGGTGTCTCCTCCTTTCTGGACTC
CCATAAGGAGAGTAAGACCGATCTCTCCTCGACCTTTCCCTACGACGTGGAGGTGAATAG
TCACGCCTTCCTCTCAAAGGTGATGTTCTTGCTGACCTACGCTCTCCATAATCATCACGC
CCATAGTGTCTACCACGGTCTCGGTCACGACCCCCATAATCCCTGTCGTTCTTCAGACCA
AGATAGTGCCCTGGAGTGGGGGTTCTTGGACGCTTCCTCCTTGACCTTTCAACAGTAATG
TAACGGCCCTCCATAACAGACTGGTTCAGGTATTTAATGCAGCGGTCAGCATCTTCATAG
CTATCCATCGTAACAAAGGCAAAACCACGAGATGCACGAGTGCGGGGCTCCACCACGAGA
AAGCACGAGGCAACCTTTCCCTCCTTGGAGAAATGGGTTTCAAGCTCCCTCTCTGTGACC
CTTGTAGATAAGCCCGTCACATAGAGAGTATTCCCAGGGTTTTCAGTTTCAGTCCTTCCA
CGGTCCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY51JQ U 7
AF RR2EY51TF C 1
BS 1 6 RR2EY51TF
BS 7 360 RR2EY51JQ
BS 361 670 RR2EY51TF

RD RR2EY51JQ 354 0 0
CGCAACAAACAATCCAAACACACAACACAAGACATAGAAACAAAACGTCGGAGAGAGTAA
GAGAATCTTCTTTTTTTAGCCAAATCCTAAGAATGTTGTTGAGTTACATTATAGCATACT
TTTTTGCTAACAGCTCACCTTGAACCACGGTGGTGTCTCCTCCTTTCTGGACTCCCATAA
GGAGAGTAAGACCGATCTCTCCTCGACCTTTCCCTACGACGTGGAGGTGAATAGTCACGC
CTTCCTCTCAAAGGTGATGTTCTTGCTGACCTACGCTCTCCATAATCATCACGCCCATAG
TGTCTACCACGGTCTCGGTCACGACCCCCATAATCCCTGTCGTTCTTCAGACCA

QA 1 354 1 354
DS 

RD RR2EY51TF 670 0 0
TTTTTTCGCAACAAACAATCCAAACACACAACACAAGACATAGAAACAAAACGTCGGAGA
GAGTAAGAGAATCTTCTTTTTTTAGCCAAATCCTAAGAATGTTGTTGAGTTACATTATAG
CATACTTTTTTGCTAACAGCTCACCTTGAACCACGGTGGTGTCTCCTCCTTTCTGGACTC
CCATAAGGAGAGTAAGACCGATCTCTCCTCGACCTTTCCCTACGACGTGGAGGTGAATAG
TCACGCCTTCCTCTCAAAGGTGATGTTCTTGCTGACCTACGCTCTCCATAATCATCACGC
CCATAGTGTCTACCACGGTCTCGGTCACGACCCCCATAATCCCTGTCGTTCTTCAGACCA
AGATAGTGCCCTGGAGTGGGGGTTCTTGGACGCTTCCTCCTTGACCTTTCAACAGTAATG
TAACGGCCCTCCATAACAGACTGGTTCAGGTATTTAATGCAGCGGTCAGCATCTTCATAG
CTATCCATCGTAACAAAGGCAAAACCACGAGATGCACGAGTGCGGGGCTCCACCACGAGA
AAGCACGAGGCAACCTTTCCCTCCTTGGAGAAATGGGTTTCAAGCTCCCTCTCTGTGACC
CTTGTAGATAAGCCCGTCACATAGAGAGTATTCCCAGGGTTTTCAGTTTCAGTCCTTCCA
CGGTCCCTCC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL7684Contig1 761 2 2 U
GGGGTATGAGGAGACACTTGATGCTTTCAACCTTGCTACTAAAACTACAGTCCCTCCAAT
CGTTATAGCTCAAGAGAATGCTATGGACGAGGATGATTCATCATATGATTTGCATCAGAG
GAAAACTCTTAGAAAGCTTGTCAGGAATGGTGACATTGACGCTGCTCTGGCTAATCTCCA
AGATTGGTATCCCCAAATTGTACAGGACGATAAATCTGTAGTTTGTTTCCTCCTTCACTG
CCAAAAGTTCATTGAGTTTGTACGGGTAGGAAAACTTACAGAAGGTGTGAAGTATGGCAG
ACTCGAGTTAGCTAAATTTGTTGGGTTAACAAAGTTTCAAGACATAATCGAGGACTGCTT
TGCTTTGCCTGTGTATCCAAAGCCCGAGGAATCACCGGTGGGTTACTTCTTAGAAGACTC
GCAGAGGGAACTAGTTGCTGATGCAGTGAATGCAGCGGTTTTGTCAAACAAGAAAGATGT
GTGTCACTTGCATTCCCGTCTGGAGTTACTGCTGAAACAGCTAACAGTTTGCTGTTTGGA
AAGGCGGTCAATGAATGGTGACCAAGGCGAAACATTCCGGCTTCACCATGTTCTTAACAA
CAACAGTACGAGAAGATGAAATCGGATTTAGCCGCGTATTGTTCTTTTGAAAACTCTTGC
TACTTTGTTTGTTTGGTTGTTTTCATCCTTACGTGGCTCTTGTTCATACATGTGATATTA
TGCATAACTTTCCTATTCTGTGAAAAGAAAAGTTTAAACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FS85TF U 1
AF RR2FS85JQ C 47
BS 1 621 RR2FS85TF
BS 622 761 RR2FS85JQ

RD RR2FS85TF 621 0 0
GGGGTATGAGGAGACACTTGATGCTTTCAACCTTGCTACTAAAACTACAGTCCCTCCAAT
CGTTATAGCTCAAGAGAATGCTATGGACGAGGATGATTCATCATATGATTTGCATCAGAG
GAAAACTCTTAGAAAGCTTGTCAGGAATGGTGACATTGACGCTGCTCTGGCTAATCTCCA
AGATTGGTATCCCCAAATTGTACAGGACGATAAATCTGTAGTTTGTTTCCTCCTTCACTG
CCAAAAGTTCATTGAGTTTGTACGGGTAGGAAAACTTACAGAAGGTGTGAAGTATGGCAG
ACTCGAGTTAGCTAAATTTGTTGGGTTAACAAAGTTTCAAGACATAATCGAGGACTGCTT
TGCTTTGCCTGTGTATCCAAAGCCCGAGGAATCACCGGTGGGTTACTTCTTAGAAGACTC
GCAGAGGGAACTAGTTGCTGATGCAGTGAATGCAGCGGTTTTGTCAAACAAGAAAGATGT
GTGTCACTTGCATTCCCGTCTGGAGTTACTGCTGAAACAGCTAACAGTTTGCTGTTTGGA
AAGGCGGTCAATGAATGGTGACCAAGGCGAAACATTCCGGCTTCACCATGTTCTTAACAA
CAACAGTACGAGAAGATGAAA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RR2FS85JQ 715 0 0
ACAGTCCCTCCAATCGTTATAGCTCAAGAGAATGCTATGGACGAGGATGATTCATCATAT
GATTTGCATCAGAGGAAAACTCTTAGAAAGCTTGTCAGGAATGGTGACATTGACGCTGCT
CTGGCTAATCTCCAAGATTGGTATCCCCAAATTGTACAGGACGATAAATCTGTAGTTTGT
TTCCTCCTTCACTGCCAAAAGTTCATTGAGTTTGTACGGGTAGGAAAACTTACAGAAGGT
GTGAAGTATGGCAGACTCGAGTTAGCTAAATTTGTTGGGTTAACAAAGTTTCAAGACATA
ATCGAGGACTGCTTTGCTTTGCCTGTGTATCCAAAGCCCGAGGAATCACCGGTGGGTTAC
TTCTTAGAAGACTCGCAGAGGGAACTAGTTGCTGATGCAGTGAATGCAGCGGTTTTGTCA
AACAAGAAAGATGTGTGTCACTTGCATTCCCGTCTGGAGTTACTGCTGAAACAGCTAACA
GTTTGCTGTTTGGAAAGGCGGTCAATGAATGGTGACCAAGGCGAAACATTCCGGCTTCAC
CATGTTCTTAACAACAACAGTACGAGAAGATGAAATCGGATTTAGCCGCGTATTGTTCTT
TTGAAAACTCTTGCTACTTTGTTTGTTTGGTTGTTTTCATCCTTACGTGGCTCTTGTTCA
TACATGTGATATTATGCATAACTTTCCTATTCTGTGAAAAGAAAAGTTTAAACCG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7686Contig1 349 2 1 U
GGAAGCTAATACGCATAAAAAAAGCGAAGAAACAGAATGATAAGAAAGGCATGAGCGGTC
CTTGGCTTTTAGGAAACAGACGAGTAGTATATATAGCAATAATTCTATGTTGTTTGTGGT
AATAGCCTATAGTGCCGGGTAAACACATGCACAAGAGCCAAAAGAACTTTTTTTTTGAAC
AAAGGCTTTCAAAAGCCAAAAGAACTTTCACAATTTTCAACGCACTCTTTCTCAGTTCGT
CGCACAAGACTTCTCTTGACGTTTGAATGATCATTGTTTTTCAATGAACTGTCATGTGAT
TCGGTCCCCTTCCTAATCATGTCGGTTTGAAGGTTTTCTTTTTCCACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ET55JQ C 1
AF RR2ET55TF U 1
BS 1 349 RR2ET55TF

RD RR2ET55JQ 349 0 0
GGAAGCTAATACGCATAAAAAAAGCGAAGAAACAGAATGATAAGAAAGGCATGAGCGGTC
CTTGGCTTTTAGGAAACAGACGAGTAGTATATATAGCAATAATTCTATGTTGTTTGTGGT
AATAGCCTATAGTGCCGGGTAAACACATGCACAAGAGCCAAAAGAACTTTTTTTTTGAAC
AAAGGCTTTCAAAAGCCAAAAGAACTTTCACAATTTTCAACGCACTCTTTCTCAGTTCGT
CGCACAAGACTTCTCTTGACGTTTGAATGATCATTGTTTTTCAATGAACTGTCATGTGAT
TCGGTCCCCTTCCTAATCATGTCGGTTTGAAGGTTTTCTTTTTCCACCC

QA 1 349 1 349
DS 

RD RR2ET55TF 349 0 0
GGAAGCTAATACGCATAAAAAAAGCGAAGAAACAGAATGATAAGAAAGGCATGAGCGGTC
CTTGGCTTTTAGGAAACAGACGAGTAGTATATATAGCAATAATTCTATGTTGTTTGTGGT
AATAGCCTATAGTGCCGGGTAAACACATGCACAAGAGCCAAAAGAACTTTTTTTTTGAAC
AAAGGCTTTCAAAAGCCAAAAGAACTTTCACAATTTTCAACGCACTCTTTCTCAGTTCGT
CGCACAAGACTTCTCTTGACGTTTGAATGATCATTGTTTTTCAATGAACTGTCATGTGAT
TCGGTCCCCTTCCTAATCATGTCGGTTTGAAGGTTTTCTTTTTCCACCC

QA 1 349 1 349
DS 



AS 1 2

CO CL7687Contig1 625 2 1 U
GGAACTAACTAGGTTTGTGTCAAACACGGAGAACCTCAACGCCAACGCCAAGCTCCTTCC
CCCATTTGTTGACGACGTGTGCACTTCGGCGTTTTCGTTTTGGCTTTGTTTTGTACCAAT
AAAAGGGGTTAGTTTCCATTCCCTGAGATGGTAGATAAAAGTCAAGTCATCAGCCTCTGT
CGTTCCCTGCTTCGAGCGGGGCGTCAGTACCCTGACTACAACATCAGGCAGTACTCTAAG
CGAAGGACCTTGGATGGGTTCCGCATGAACAAGAATCTCACCGACCATTCTAAGGTGGAG
GAGGCTTATAATGAAGGTAAGGCGCAGCTGGAGGTTGTAGAGGGGGTGGTCAAGGTTTAC
ATGGCGTATCCTCCAAAGACTAAGGACATCATGGAACTCAAGCTTCAGTAGTTTGATGTA
TGTTTGTCATTATTGTTATTGGTTCATGTTTCTTAGTTCTTTTCCAACTATGAAACATTG
CTTTGTGTGATTCTCATGTAATATTTGTGTCTTGATGGCATCAGTACCCTTTATTAAGTG
AAGAAAGGATCAGAGAATAATCTTGGATTAGAGCAGGGATAAAGAGTGTTTTTTGTTGAT
TGTCATTAATAATAAATGTCGCACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BI37JQ C 1
AF RR2BI37TF U 1
BS 1 625 RR2BI37TF

RD RR2BI37JQ 625 0 0
GGAACTAACTAGGTTTGTGTCAAACACGGAGAACCTCAACGCCAACGCCAAGCTCCTTCC
CCCATTTGTTGACGACGTGTGCACTTCGGCGTTTTCGTTTTGGCTTTGTTTTGTACCAAT
AAAAGGGGTTAGTTTCCATTCCCTGAGATGGTAGATAAAAGTCAAGTCATCAGCCTCTGT
CGTTCCCTGCTTCGAGCGGGGCGTCAGTACCCTGACTACAACATCAGGCAGTACTCTAAG
CGAAGGACCTTGGATGGGTTCCGCATGAACAAGAATCTCACCGACCATTCTAAGGTGGAG
GAGGCTTATAATGAAGGTAAGGCGCAGCTGGAGGTTGTAGAGGGGGTGGTCAAGGTTTAC
ATGGCGTATCCTCCAAAGACTAAGGACATCATGGAACTCAAGCTTCAGTAGTTTGATGTA
TGTTTGTCATTATTGTTATTGGTTCATGTTTCTTAGTTCTTTTCCAACTATGAAACATTG
CTTTGTGTGATTCTCATGTAATATTTGTGTCTTGATGGCATCAGTACCCTTTATTAAGTG
AAGAAAGGATCAGAGAATAATCTTGGATTAGAGCAGGGATAAAGAGTGTTTTTTGTTGAT
TGTCATTAATAATAAATGTCGCACC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2BI37TF 625 0 0
GGAACTAACTAGGTTTGTGTCAAACACGGAGAACCTCAACGCCAACGCCAAGCTCCTTCC
CCCATTTGTTGACGACGTGTGCACTTCGGCGTTTTCGTTTTGGCTTTGTTTTGTACCAAT
AAAAGGGGTTAGTTTCCATTCCCTGAGATGGTAGATAAAAGTCAAGTCATCAGCCTCTGT
CGTTCCCTGCTTCGAGCGGGGCGTCAGTACCCTGACTACAACATCAGGCAGTACTCTAAG
CGAAGGACCTTGGATGGGTTCCGCATGAACAAGAATCTCACCGACCATTCTAAGGTGGAG
GAGGCTTATAATGAAGGTAAGGCGCAGCTGGAGGTTGTAGAGGGGGTGGTCAAGGTTTAC
ATGGCGTATCCTCCAAAGACTAAGGACATCATGGAACTCAAGCTTCAGTAGTTTGATGTA
TGTTTGTCATTATTGTTATTGGTTCATGTTTCTTAGTTCTTTTCCAACTATGAAACATTG
CTTTGTGTGATTCTCATGTAATATTTGTGTCTTGATGGCATCAGTACCCTTTATTAAGTG
AAGAAAGGATCAGAGAATAATCTTGGATTAGAGCAGGGATAAAGAGTGTTTTTTGTTGAT
TGTCATTAATAATAAATGTCGCACC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL7688Contig1 1083 2 2 U
GGGGGAAAGAGGCGGCTCTGTTCGTGCCATCCGGTACGATGGGGAATCTGATTTGCGTTA
TGGTCCACTGCGACGTGAGAGGCAGCGAGGTGATTCTTGGTGACACATGTCACATCCATG
TGTACGAGAACGGAGGGATATCGACAATAGGTGGCGTGCATCCCAAGACGATCAAGAATG
AAGAAGACGGGACAATGGACTTGGTGGCTATTGAAGCAGCCATTAGAGATCCTAAAGGAA
GCACGTTTTATCCATCAACAAGGTTGATTTGTTTGGAGAACACACATGCCAACTCTGGTG
GGAGATGTTTGAGTGCTGAATACACAGATAGAGTTGGAGAGATTGCTAAGAGACATGGAT
TGAAGCTTCATGTCGATGGAGCTCGCATTTTTAATGCTTCCGTTGCACTTGGAGTTCCAG
TCCATAGGCTTGTAAAGGCTGCTGACTCTGTTTCGGTGTGTCTCTCTAAAGGTCTTGGAG
CTCCGATAGGATCAGTAATCGTTGGTTCACAGAGTTTCATAGAAAAGGCGAAAACGTTGA
GGAAAACATTAGGTGGAGGAATGAGACAGATAGGCGTCCTGTGTGCAGCCGCTTTGGTCG
CACTCCAAGAGAACCTCCCAAAGCTACAATCTGACCACAAGAAGACAAAGTTGTTAGCTG
AAGGGTTGAACAAAATGAAAGGGATTAGAGTGAACGTTGAAGCCATGGAGACCAACATGA
TATTCATGGATATGGAGGATGGATCAAGACTTACCGCTGAAAGACTCCGCAAGAGTCTAA
CCGAGCATGGCATTCTCGTCATCCCTGAAAACTCTTCCCGAATCAGAATGGTTATACACC
ACCAGATAACAACAAGTGATGTGCATTACACATTATCTTGCTTGCAACAAGCTGTGCAGA
CGATTCAGGAACCATGCCAAAACTAAATTGGCAAACCAAAATGCTCTCTTTTTAAAATAT
TGTTTGTATAAGTTTTTAATTAAAAGTTACAAGGACCGATCTCTCTCTCTCAATGAAATT
GTCACCCTCATGTCATCCGTTTTATTATTGTATTTTTGGTTTATATCTTGCTTACACATG
CAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2FT75TF U 1
AF RR2FT75JQ C 320
BS 1 659 RR2FT75TF
BS 660 1083 RR2FT75JQ

RD RR2FT75TF 659 0 0
GGGGGAAAGAGGCGGCTCTGTTCGTGCCATCCGGTACGATGGGGAATCTGATTTGCGTTA
TGGTCCACTGCGACGTGAGAGGCAGCGAGGTGATTCTTGGTGACACATGTCACATCCATG
TGTACGAGAACGGAGGGATATCGACAATAGGTGGCGTGCATCCCAAGACGATCAAGAATG
AAGAAGACGGGACAATGGACTTGGTGGCTATTGAAGCAGCCATTAGAGATCCTAAAGGAA
GCACGTTTTATCCATCAACAAGGTTGATTTGTTTGGAGAACACACATGCCAACTCTGGTG
GGAGATGTTTGAGTGCTGAATACACAGATAGAGTTGGAGAGATTGCTAAGAGACATGGAT
TGAAGCTTCATGTCGATGGAGCTCGCATTTTTAATGCTTCCGTTGCACTTGGAGTTCCAG
TCCATAGGCTTGTAAAGGCTGCTGACTCTGTTTCGGTGTGTCTCTCTAAAGGTCTTGGAG
CTCCGATAGGATCAGTAATCGTTGGTTCACAGAGTTTCATAGAAAAGGCGAAAACGTTGA
GGAAAACATTAGGTGGAGGAATGAGACAGATAGGCGTCCTGTGTGCAGCCGCTTTGGTCG
CACTCCAAGAGAACCTCCCAAAGCTACAATCTGACCACAAGAAGACAAAGTTGTTAGCT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RR2FT75JQ 764 0 0
ATACACAGATAGAGTTGGAGAGATTGCTAAGAGACATGGATTGAAGCTTCATGTCGATGG
AGCTCGCATTTTTAATGCTTCCGTTGCACTTGGAGTTCCAGTCCATAGGCTTGTAAAGGC
TGCTGACTCTGTTTCGGTGTGTCTCTCTAAAGGTCTTGGAGCTCCGATAGGATCAGTAAT
CGTTGGTTCACAGAGTTTCATAGAAAAGGCGAAAACGTTGAGGAAAACATTAGGTGGAGG
AATGAGACAGATAGGCGTCCTGTGTGCAGCCGCTTTGGTCGCACTCCAAGAGAACCTCCC
AAAGCTACAATCTGACCACAAGAAGACAAAGTTGTTAGCTGAAGGGTTGAACAAAATGAA
AGGGATTAGAGTGAACGTTGAAGCCATGGAGACCAACATGATATTCATGGATATGGAGGA
TGGATCAAGACTTACCGCTGAAAGACTCCGCAAGAGTCTAACCGAGCATGGCATTCTCGT
CATCCCTGAAAACTCTTCCCGAATCAGAATGGTTATACACCACCAGATAACAACAAGTGA
TGTGCATTACACATTATCTTGCTTGCAACAAGCTGTGCAGACGATTCAGGAACCATGCCA
AAACTAAATTGGCAAACCAAAATGCTCTCTTTTTAAAATATTGTTTGTATAAGTTTTTAA
TTAAAAGTTACAAGGACCGATCTCTCTCTCTCAATGAAATTGTCACCCTCATGTCATCCG
TTTTATTATTGTATTTTTGGTTTATATCTTGCTTACACATGCAT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL7689Contig1 970 2 8 U
GAATATGTTTATAAGATCAAATGCAGTTGACGACAATAATCTATTTATATAATTGAAAAT
CCATTTCACACTACTTGCATATCTTTATTCTGATTAAATGTAAGATATTAATATCCGTTA
CTCATCTTGTCACGTTTTCCTCAAAGCATGAACTCAGCACACATGTCTCCATCTATCTTG
TTCGTTTATCTAATTTAAGAAATTAATATTTATTAAAAACATAATTATAGAAGAGAAATT
AGAAAGGTATATGAAAACGTATAATGGGACAAATAAGTCTATTCTAAAATGATAAAAAGC
TCTGAGCAAGTCTTAAGATAGTGATGATGTAGGCGTAGCGTCTGACATTGAAGCCATATG
AAGAATTCGAAAACGAATATGTCGATAAGAAATAAAATACAAGACGATAAATAAAAGCCA
ACCGAAGATGTTTTTGTCTACTAGTTTGGTTTACCCCGATACGTATGCTCTCTAAACATT
ATTCATAATAACTCTATAGAAAATAATACGTATCCTCTTGTTCTTAGTTATAAAATAAAT
ACTAAAATTAACATATATGAGAAAATTCCATGACTACATTCTTTTGTAAATTCAAATAAA
ATACACTAAAAGTGAAAGATTTATACAGTACTAGATTAGCATAGTGGCTTAAAAAAAACA
CTAATAATTAATTAAAAAGAGATAAGCCACCGCATGACTGTAAGAAATATAAAAATCTTA
GTAACTTTATAGAAAATAATATGTATTCTCTCGTTCTTAGTTTTTTTTTTGTCAACGTCT
CTTGTTCTTAGTTATAAAAATAAAGAATAAACTTAACATATATGATAAATATCCATGACT
ACATTCTTTTGAAAATTCAAATAAAATACAGTAAAAGTGAAAGTTTTATACGCTGGATTA
GCATAGTGGCTAAAAATTAAAAACACTAGATAATTAATTAAAAAGAGATAAGCCACCGCA
TGACTGTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FJ13TF U 1
AF RR2FJ13JQ C 198
BS 1 657 RR2FJ13TF
BS 658 658 RR2FJ13JQ
BS 659 702 RR2FJ13TF
BS 703 703 RR2FJ13JQ
BS 704 735 RR2FJ13TF
BS 736 736 RR2FJ13JQ
BS 737 768 RR2FJ13TF
BS 769 970 RR2FJ13JQ

RD RR2FJ13TF 768 0 0
GAATATGTTTATAAGATCAAATGCAGTTGACGACAATAATCTATTTATATAATTGAAAAT
CCATTTCACACTACTTGCATATCTTTATTCTGATTAAATGTAAGATATTAATATCCGTTA
CTCATCTTGTCACGTTTTCCTCAAAGCATGAACTCAGCACACATGTCTCCATCTATCTTG
TTCGTTTATCTAATTTAAGAAATTAATATTTATTAAAAACATAATTATAGAAGAGAAATT
AGAAAGGTATATGAAAACGTATAATGGGACAAATAAGTCTATTCTAAAATGATAAAAAGC
TCTGAGCAAGTCTTAAGATAGTGATGATGTAGGCGTAGCGTCTGACATTGAAGCCATATG
AAGAATTCGAAAACGAATATGTCGATAAGAAATAAAATACAAGACGATAAATAAAAGCCA
ACCGAAGATGTTTTTGTCTACTAGTTTGGTTTACCCCGATACGTATGCTCTCTAAACATT
ATTCATAATAACTCTATAGAAAATAATACGTATCCTCTTGTTCTTAGTTATAAAATAAAT
ACTAAAATTAACATATATGAGAAAATTCCATGACTACATTCTTTTGTAAATTCAAATAAA
ATACACTAAAAGTGAAAGATTTATACAGTACTAGATTAGCATAGTGGCTTAAAAAAA*CA
CTAATAATTAATTAAAAAGAGATAAGCCACCGCATGACTGTA*GAAATATAAAAATCTTA
GTAACTTTATAGAAA*TAATATGTATTCTCTCGTTCTTAGTTTTTTTT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2FJ13JQ 773 0 0
AGAAATTAATATTTATTAAAAACATAATTATAGAAGAGAAATTAGAAAGGTATATGAAAA
CGTATAATGGGACAAATAAGTCTATTCTAAAATGATAAAAAGCTCTGAGCAAGTCTTAAG
ATAGTGATGATGTAGGCGTAGCGTCTGACATTGAAGCCATATGAAGAATTCGAAAACGAA
TATGTCGATAAGAAATAAAATACAAGACGATAAATAAAAGCCAACCGAAGATGTTTTTGT
CTACTAGTTTGGTTTACCCCGATACGTATGCTCTCTAAACATTATTCATAATAACTCTAT
AGAAAATAATACGTATCCTCTTGTTTTTAGTTATAAAATAAATACTAAAATTAACATATA
TGAGAAAATTCCATGACTACATTCTTTTGTAAATTCAAATAAAATACACTAAAAGTGAAA
GATTTATACAGTACTAGATTAGCATAGTGGCTTAAAAAAAACACTAATAATTAATTAAAA
AGAGATAAGCCACCGCATGACTGTAAGAAATATAAAAATCTTAGTAACTTTATAGAAAAT
AATATGTATTCTCTCGTTCTTAGTTTTTTTTTTGTCAACGTCTCTTGTTCTTAGTTATAA
AAATAAAGAATAAACTTAACATATATGATAAATATCCATGACTACATTCTTTTGAAAATT
CAAATAAAATACAGTAAAAGTGAAAGTTTTATACGCTGGATTAGCATAGTGGCTAAAAAT
TAAAAACACTAGATAATTAATTAAAAAGAGATAAGCCACCGCATGACTGTAGG

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL7690Contig1 736 2 2 U
GGGACAAACAGCTCTGAGAACAACATTTCACTTCACGAACGATCAAAGAGACGAAACCCT
AAAACAAGATGGGTGGAAGGAATGAGGAAGAAGCTGGCGGAGATAAAGACAAAGGGGAAG
AGCAAGATGACGACATGTCTGTGCACTCTCCCTGTAAAGCCTTACCTTCCTCCGCTTCTT
CTCTCTCCAAGGAGCAGTCACAGGTTGAATTGGAGCTCACGTTATTAGAAGCTCTTGAAA
TCTATCCTCCCGTTAAACTCCGAGGCATACATCGCCACTTTGTTCTTTATGGTTTGATGG
AGTATCTCGGCAGAAGCTTTGACCGACAGTTCACAGCGGATGAGGTTCTGCAGCTACTGG
ATCGTTTTTACAACATAGAGATGCTGAAATCAGATGATGAGGACATTGACATTTTTAACC
ACGAGGAAGACTTTACCTTGCCTCAGAGTTTCTTTGATAAGGAAGAACAGTGACAGAAGA
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGTGGTGTTTGCTTCCTTTTCACGCCTCTTTTTTTTTTT
TGTATATGGTTGCTTAGGTTTGTCTCCAGCTCTTATGATATTGGTACATGATGGAGTAAT
AGTATAGAACCATCGGAGCACTACTGATCTTGTTTTTTTTTTTTCATTCTGTCAAAGAGT
TCAATATAAACAAACAAACTTTTTTGTTCTCTTTTCATGATATGACAGTTGCAGCCTCGG
TTGTGTTTGTTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC47TF U 1
AF RR2EC47JQ C 185
BS 1 284 RR2EC47TF
BS 285 736 RR2EC47JQ

RD RR2EC47TF 284 0 0
GGGACAAACAGCTCTGAGAACAACATTTCACTTCACGAACGATCAAAGAGACGAAACCCT
AAAACAAGATGGGTGGAAGGAATGAGGAAGAAGCTGGCGGAGATAAAGACAAAGGGGAAG
AGCAAGATGACGACATGTCTGTGCACTCTCCCTGTAAAGCCTTACCTTCCTCCGCTTCTT
CTCTCTCCAAGGAGCAGTCACAGGTTGAATTGGAGCTCACGTTATTAGAAGCTCTTGAAA
TCTATCCTCCCGTTAAACTCCGAGGCATACATCGCCACTTTGTT

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2EC47JQ 552 0 0
CTCCAAGGAGCAGTCACAGGTTGAATTGGAGCTCACGTTATTAGAAGCTCTTGAAATCTA
TCCTCCCGTTAAACTCCGAGGCATACATCGCCACTTTGTTCTTTATGGTTTGATGGAGTA
TCTCGGCAGAAGCTTTGACCGACAGTTCACAGCGGATGAGGTTCTGCAGCTACTGGATCG
TTTTTACAACATAGAGATGCTGAAATCAGATGATGAGGACATTGACATTTTTAACCACGA
GGAAGACTTTACCTTGCCTCAGAGTTTCTTTGATAAGGAAGAACAGTGACAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGTGGTGTTTGCTTCCTTTTCACGCCTCTTTTTTTTTTTTGTA
TATGGTTGCTTAGGTTTGTCTCCAGCTCTTATGATATTGGTACATGATGGAGTAATAGTA
TAGAACCATCGGAGCACTACTGATCTTGTTTTTTTTTTTTCATTCTGTCAAAGAGTTCAA
TATAAACAAACAAACTTTTTTGTTCTCTTTTCATGATATGACAGTTGCAGCCTCGGTTGT
GTTTGTTTGTTC

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL7691Contig1 750 2 5 U
GGAAGTTCGTCGACGTCGGTTTCTGGCTTTCACTGTTTTTTTCTTTCTCTTCCAGCTACA
GCTAATTTGAGCAATGGAGATTGACAGAGAGGATGGAAGAAGGCCGAATCAGCTGAGACC
CCTTGCATGCTCCCGTAACATCCTTCATCGTCCTCATGGCTCTGCTAGCTGGTCCCAAGG
GGATACAAAAGTTCTAGCTGCAGTGTATGGACCTAAACCTGGAACGAGGAAGAACGAGAA
CCCTGAGAAGGCTTGCTTTGAAGTCATATGGAAGCCTAAATCCGGCCAGATTGGAAAAGC
CGAAAAGGAGTATGAGATGATACTAAAAAAGACAATACAGAGTATTTGTGTCTTGACAGT
GAATCCAAATACCACCACCTCCGTGATCGTTCAGGTTGTACATGATGATGGCTCTCTTCT
TCCATGTGCCATAAACGCAGCATGTGCAGCTCTTGTAGACGCAGGAATACCTATGAAGCA
TCTCGCTGTTGCTATATGTTGTTGCCTGGCTGATAGTGGATATGTCGTACTCGATCCAAA
CAAGCTTGAAGAAAAGAAAATGACGGCTTTCGCTTATCTAGTCTTTCCAAATACAACTCT
CTCTGTTCTCCCGGAAATGGAAAGCGAGCCAGTAGAGCATGGGATCATTACATCAGTCAC
GCATGGAGTCATGTCAGTGGACGATTACTTCCTGTGTGTAGAGACGGTCGGGCTGCCACG
GCTAGTTTATCTGCATTTTTAGAGACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY48TF U 36
AF RR2ED27TF U 1
BS 1 236 RR2ED27TF
BS 237 237 RR2BY48TF
BS 238 622 RR2ED27TF
BS 623 623 RR2BY48TF
BS 624 750 RR2ED27TF

RD RR2BY48TF 595 0 0
TTTTTTTCTTTCTCTTCCAGCTACAGCTAATTTGAGCAATGGAGATTGGCAGAGAGGATG
GAAGAAGGCCGAATCAGCTGAGACCCCTTGCATGCTCCCGTAACATCCTTCATCGTCCTC
ATGGCTCTGCTAGCTGGTCCCAAGGGGATGCAAAAGTTCTAGCTGCAGTGTATGGACCTA
AACCTGGAACGAGGAAGAACGAGAACCCTGAGAAGGCTTGCTTTGAAGTCATATGGAAGC
CTAAATCCGGCCAGATTGGAAAAGCCTAAAAGGAGTATGAGATGATACTAAAAAAGACAA
TACAGAGTATTTGTGTCTTGACAGTGAATCCAAATACCACCACCTCCGTGATCGTTCAGG
TTGTACATGATGATGGCTCTCTTCTTCCATGTGCCATAAACGCAGCATGTGCAGCTCTTG
TAGACGCAGGAATACCTATGAAGCATCTCGCTGTTGCTATATGTTGTTGCCTGGCTGATA
GTGGATATGTCGTACTCGATCCAAACAAGCTTGAAGAAAAGAAAATGACGGCTTTCGCTT
ATCTAGTCTTTCCAAATACAACTCTCTCTGTTCTCCCGGAAATGGAAAGCGAGCC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RR2ED27TF 750 0 0
GGAAGTTCGTCGACGTCGGTTTCTGGCTTTCACTGTTTTTTTCTTTCTCTTCCAGCTACA
GCTAATTTGAGCAATGGAGATTGACAGAGAGGATGGAAGAAGGCCGAATCAGCTGAGACC
CCTTGCATGCTCCCGTAACATCCTTCATCGTCCTCATGGCTCTGCTAGCTGGTCCCAAGG
GGATACAAAAGTTCTAGCTGCAGTGTATGGACCTAAACCTGGAACGAGGAAGAACGGGAA
CCCTGAGAAGGCTTGCTTTGAAGTCATATGGAAGCCTAAATCCGGCCAGATTGGAAAAGC
CGAAAAGGAGTATGAGATGATACTAAAAAAGACAATACAGAGTATTTGTGTCTTGACAGT
GAATCCAAATACCACCACCTCCGTGATCGTTCAGGTTGTACATGATGATGGCTCTCTTCT
TCCATGTGCCATAAACGCAGCATGTGCAGCTCTTGTAGACGCAGGAATACCTATGAAGCA
TCTCGCTGTTGCTATATGTTGTTGCCTGGCTGATAGTGGATATGTCGTACTCGATCCAAA
CAAGCTTGAAGAAAAGAAAATGACGGCTTTCGCTTATCTAGTCTTTCCAAATACAACTCT
CTCTGTTCTCCCGGAAATGGAACGCGAGCCAGTAGAGCATGGGATCATTACATCAGTCAC
GCATGGAGTCATGTCAGTGGACGATTACTTCCTGTGTGTAGAGACGGTCGGGCTGCCACG
GCTAGTTTATCTGCATTTTTAGAGACTTCC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL7692Contig1 691 2 2 U
GCGATGCGCAAGGATCTGAACCACCACGGGTTGTAGGCGAGTCTAGTTCCACCTTCTTGG
CTCCAAGAAGCAGTATGCCTTGTGCTCCTCCACCTGGTGACTTGCAGGAACAGATGAGAA
ACCAAATGAAGGATCCAGCGATGCGACAGATGTTCACGTCAATGATAAAGAACATGAACC
CGGAGATGATGGCAAGCATGAGTGAACAATTTGGAATGAAGCTTTCGCAAGAAGATGCTG
CAAAAGCTCAGGAAGCCATGGCTTCTCTTTCTCCTGAAGCTTTGGAGAAAATGATGAGAT
GGGCGGATAGGGCACAAACGGGGATAGAGAAAGCGAAGAAAGCAAAGAAGTGGTTGCTAG
GGAAAGGAGGGTTGATCTTTGCGATATGCATGCTCCTTTTAGCAATCATCCTTCATCGTC
TGGGCTATATTGGAAGGTAAAAAAAGCAACAGAGGTCTTCTCTTAAGACTTTAAACCACT
ACGTCAAGATCATCAGTCTTTTGGTTTTGGGGTTCGTAGTTTGCAACACTGTAACATGGA
CTCTTCTCTCTCTCGGCTTTGTGACCCACCCACCACCTTTTGTCTAGTTTTCTTTCCATC
ATCTATATTATATACTAGTGTTTTTTCTTCTTATAACTTTATACTGTTAAAAAAGAAAAG
AATACGTTACTAATCAAAAGGGTTACCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GV14TF U 1
AF RR2GV14JQB C 57
BS 1 646 RR2GV14TF
BS 647 691 RR2GV14JQB

RD RR2GV14TF 646 0 0
GCGATGCGCAAGGATCTGAACCACCACGGGTTGTAGGCGAGTCTAGTTCCACCTTCTTGG
CTCCAAGAAGCAGTATGCCTTGTGCTCCTCCACCTGGTGACTTGCAGGAACAGATGAGAA
ACCAAATGAAGGATCCAGCGATGCGACAGATGTTCACGTCAATGATAAAGAACATGAACC
CGGAGATGATGGCAAGCATGAGTGAACAATTTGGAATGAAGCTTTCGCAAGAAGATGCTG
CAAAAGCTCAGGAAGCCATGGCTTCTCTTTCTCCTGAAGCTTTGGAGAAAATGATGAGAT
GGGCGGATAGGGCACAAACGGGGATAGAGAAAGCGAAGAAAGCAAAGAAGTGGTTGCTAG
GGAAAGGAGGGTTGATCTTTGCGATATGCATGCTCCTTTTAGCAATCATCCTTCATCGTC
TGGGCTATATTGGAAGGTAAAAAAAGCAACAGAGGTCTTCTCTTAAGACTTTAAACCACT
ACGTCAAGATCATCAGTCTTTTGGTTTTGGGGTTCGTAGTTTGCAACACTGTAACATGGA
CTCTTCTCTCTCTCGGCTTTGTGACCCACCCACCACCTTTTGTCTAGTTTTCTTTCCATC
ATCTATATTATATACTAGTGTTTTTTCTTCTTATAACTTTATACTG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2GV14JQB 635 0 0
TTGGCTCCAAGAAGCAGTATGCCTTGTGCTCCTCCACCTGGTGACTTGCAGGAACAGATG
AGAAACCAAATGAAGGATCCAGCGATGCGACAGATGTTCACGTCAATGATAAAGAACATG
AACCCGGAGATGATGGCAAGCATGAGTGAACAATTTGGAATGAAGCTTTCGCAAGAAGAT
GCTGCAAAAGCTCAGGAAGCCATGGCTTCTCTTTCTCCTGAAGCTTTGGAGAAAATGATG
AGATGGGCGGATAGGGCACAAACGGGGATAGAGAAAGCGAAGAAAGCAAAGAAGTGGTTG
CTAGGGAAAGGAGGGTTGATCTTTGCGATATGCATGCTCCTTTTAGCAATCATCCTTCAT
CGTTTGGGCTATATTGGAAGGTAAAAAAAGCAACAGAGGTCTTCTCTTAAGACTTTAAAC
CACTACGTCAAGATCATCAGTCTTTTGGTTTTGGGGTTCGTAGTTTGCAACACTGTAACA
TGGACTCTTCTCTCTCTCGGCTTTGTGACCCCCCCCCCCCCTTTTGTCTAGTTTTCTTTC
CATCATCTATATTATATACTAGTGTTTTTTCTTCTTATAACTTTATACTGTTAAAAAAGA
AAAGAATACGTTACTAATCAAAAGGGTTACCTTTG

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL7693Contig1 1062 2 6 U
GGGATAACATTGAAGCCCTGGAAGCTGCTGCAGAGAAGTTTGAGAAAGAAGATGGAGGAG
TTTCAGATATGATTACAACTGATGAAGAGTTATACACATATCCATCGTCGTCAATCACAC
TTGCAGCTGCAAAAGAAGATGGATATTCACCGTATTCCACTATATACTTTGACTTCAACA
CCGAGTTAGAGATGACACTTGGAAATCCTGTCACGAGCTACGGAGCAAATGCTCCATGTA
TCTCCTCAGTTACTGATGATTACGTAAATAGACGAGCTCCTAACTGTAGTAGCAGTAGTG
ATTCTAAGCTCCTAGAAGAAGTAGCAAGCAGCAGTAACAAGAAAACTCGGTTCTTCTCTG
CGGTTAAAGATGAACCCATAGTTACGGATCAGGAAAGTGACGGTTCTGATTCCGAGAGTT
TCAGAGTCAAACGCCGTTCATTTAAATTGGAAAACCGAACAGTTGTTTTGGAGACAAGAG
ACTCTGGACATCATCAGGACCTTAAAAGATTGAAGAGACCGCAGAACTACCATGAAGGAA
GATGTAGTGCTAGTATCAATAGTATTATTAAGCAAGAAGAAGAAGTGATGTTAGTAATAT
CAAACAGAGAAGAAACTGATGAGCAGCAAAGCGACGTGATGATGATGAAGGATGAGCATC
ATTTTGGGTGGTGGGTTTAAACGTTTGAAAGTGAAAGGGTTGATAAAGCCGTAACGTGAC
AGCTTCAGCTTCCTCCTCCTAACTACAATTATTTTAATTCTGCTGATTCTAACAATACAG
GAAAGAGAAAGGGAATCAAAAGCAAAATATTCAGTATCCGATTTTTTTTATATTTTTCTA
TTATGGGAGAAAGAAGAAAGAAGCAACAGACAAAAGAAGCATTAACAAAGCCAACCAACA
ACCAAACACTATTGGGTTTCTTTTTAGGATTTACCAAATCTTTGATTCTTTGTGTACATC
TGTCGGTACACCTTTAAACTCTTTCATGTTCCTTCTTCTTATGATGTAAATCTCTTCTCT
CTTTTTTTTTTTTTGGTTATTACAAAAAAGTTTTTAATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CS38TF U 1
AF RR2CS38JQ C 284
BS 1 680 RR2CS38TF
BS 681 681 RR2CS38JQ
BS 682 700 RR2CS38TF
BS 701 701 RR2CS38JQ
BS 702 766 RR2CS38TF
BS 767 1062 RR2CS38JQ

RD RR2CS38TF 766 0 0
GGGATAACATTGAAGCCCTGGAAGCTGCTGCAGAGAAGTTTGAGAAAGAAGATGGAGGAG
TTTCAGATATGATTACAACTGATGAAGAGTTATACACATATCCATCGTCGTCAATCACAC
TTGCAGCTGCAAAAGAAGATGGATATTCACCGTATTCCACTATATACTTTGACTTCAACA
CCGAGTTAGAGATGACACTTGGAAATCCTGTCACGAGCTACGGAGCAAATGCTCCATGTA
TCTCCTCAGTTACTGATGATTACGTAAATAGACGAGCTCCTAACTGTAGTAGCAGTAGTG
ATTCTAAGCTCCTAGAAGAAGTAGCAAGCAGCAGTAACAAGAAAACTCGGTTCTTCTCTG
CGGTTAAAGATGAACCCATAGTTACGGATCAGGAAAGTGACGGTTCTGATTCCGAGAGTT
TCAGAGTCAAACGCCGTTCATTTAAATTGGAAAACCGAACAGTTGTTTTGGAGACAAGAG
ACTCTGGACATCATCAGGACCTTAAAAGATTGAAGAGACCGCAGAACTACCATGAAGGAA
GATGTAGTGCTAGTATCAATAGTATTATTAAGCAAGAAGAAGAAGTGATGTTAGTAATAT
CAAACAGAGAAGAAACTGATGAGCAGCAAAGCGACGTGATGATGATGAAGGATGAGCATC
ATTTTGGGTGGTGGGTTTAA*CGTTTGAAAGTGAAAGGGT*GATAAAGCCGTAACGTGAC
AGCTTCAGCTTCCTCCTCCTAACTACAATTATTTTAATTCTGCTGA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RR2CS38JQ 779 0 0
CTGTAGTAGCAGTAGTGATTCTAAGCTCCTAGAAGAAGTAGCAAGCAGCAGTAACAAGAA
AACTCGGTTCTTCTCTGCGGTTAAAGATGAACCCATAGTTACGGATCAGGAAAGTGACGG
TTCTGATTCCGAGAGTTTCAGAGTCAAACGCCGTTCATTTAAATTGGAAAACCGAACAGT
TGTTTTGGAGACAAGAGACTCTGGACATCATCAGGACCTTAAAAGATTGAAGAGACCGCA
GAACTACCATGAAGGAAGATGTAGTGCTAGTATCAATAGTATTATTAAGCAAGAAGAAGA
AGTGATGTTAGTAATATCAAACAGAGAAGAAACTGATGAGCAGCAAAGCGACGTGATGAT
GATGAAGGATGAGCATCATTTTGG*TGGTGGGTTTAAACGTTTGAAAGTGAAAGGGTTGA
TAAAGCCGTAACGTGACAGCTTCAGCTTCCTCCTCCTAACTACAATTATTTTAATTCTGC
TGATTCTAACAATACAGGAAAGAGAAAGGGAATCAAAAGCAAAATATTCAGTATCCGATT
TTTTTTATATTTTTCTATTATGGGAGAAAGAAGAAAGAAGCAACAGACAAAAGAAGCATT
AACAAAGCCAACCAACAACCAAACACTATTGGGTTTCTTTTTAGGATTTACCAAATCTTT
GATTCTTTGTGTACATCTGTCGGTACACCTTTAAACTCTTTCATGTTCCTTCTTCTTATG
ATGTAAATCTCTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTGGTTATTACAAAAAAGTTTTTAATTTTC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL7694Contig1 1163 2 2 U
GGGCCGCCGTTGCTTCTCACTCTCTCTCTCGTCTCTCAAAATCGCTCATCCTCTCCGTTA
ATCTCTCCAAAGCAAAAACTGCTTCAATTCTCCTCGTCGTGCTCTCCTTTCTAATCAGGA
ATCAAGTAATCATGTCTGATGCAAAGGAAGAGAAAGCACAGGTCGCAGCCGACAGGATCA
AAGCCGCTGCGCTCACCGCCGCCAAAGGACTCAGCCGCACCCAAGCCGAGCGTGCTGCAA
CCGCCGCTGCTCGTAACGTCAACGCTTATGGTCAGAAGGAAGAAGGTCCAAGCCGGTGGC
AGGAGAAGAGGGAAGCCAGGAGGCAGATGTACTTGATGAGTACAGAGAAAGCTGTTAGGC
TTGGCGAAAGGAAAGACAAGTCTATGTCTGCTTCTTCCTCTGCTGTCTTGGGAGGAGGAG
GAGGCGCTTCTCAGTGTCAGAAGTGTTTTCAGACGGGGCACTGGACTTATGAGTGTAAGA
ACGAGAGGGTTTATGTGTCCAGGCCGTCGAGGACTCAGCAGCTTAAGGATCCTAAACTGA
GAACGAAGCCTTCTGTTGATGATCTTGACGGTGGTGAGAAGGTAGAGGTAGCGAATGGGA
AAAAGGATGGGGAGAGGAGGATCAAGAGGAAGCATAGATCTGATTCTGGTAGTGATAGTG
AAGCATCTGTGTTTGAAAGTAGTTCGTCTGGGGAGAGTGATTCGGAGTACAGTTCGTCGT
CTGAGTCAGAGGAGGATAGGAGGAAGAGGAGGAGTAAGAGGAAGAGCAAGAAGAAGAAGC
CTAAGCAGAGGAAGGAAAGGAGGAGGAAGAGAAGTTACAGCTCTTCTTCTTCATCTGAGG
AGGAGTCATCTGATTCAGAATCAGGTTCTGACTCGGAGTCTGGTGAAGACAGAAGAAGCA
GAAGTAGAAAGAAGAAGAGTAAGAGGCACAGCAACAGCAAACATCGTTAGAATTGGTTTA
AAGGATAGTATCTACTTTTCTTAGAGAGAATCGTATTTTTGAGCTTACATGAAGAAACTC
ACACTGCTTCTTTTCTTATTAGAATATTATGTTCTTGTCTAGTGTGTTGTGCACACTGAT
GGATTTGAGGATCTCCTTTAAGGCTCTTTAGAGAACGTTGTAAACCCCACAAAATCAGAG
CTTTTAGTTGCAAATTTGAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H453TF U 1
AF RR2H453JQB C 402
BS 1 601 RR2H453TF
BS 602 1163 RR2H453JQB

RD RR2H453TF 601 0 0
GGGCCGCCGTTGCTTCTCACTCTCTCTCTCGTCTCTCAAAATCGCTCATCCTCTCCGTTA
ATCTCTCCAAAGCAAAAACTGCTTCAATTCTCCTCGTCGTGCTCTCCTTTCTAATCAGGA
ATCAAGTAATCATGTCTGATGCAAAGGAAGAGAAAGCACAGGTCGCAGCCGACAGGATCA
AAGCCGCTGCGCTCACCGCCGCCAAAGGACTCAGCCGCACCCAAGCCGAGCGTGCTGCAA
CCGCCGCTGCTCGTAACGTCAACGCTTATGGTCAGAAGGAAGAAGGTCCAAGCCGGTGGC
AGGAGAAGAGGGAAGCCAGGAGGCAGATGTACTTGATGAGTACAGAGAAAGCTGTTAGGC
TTGGCGAAAGGAAAGACAAGTCTATGTCTGCTTCTTCCTCTGCTGTCTTGGGAGGAGGAG
GAGGCGCTTCTCAGTGTCAGAAGTGTTTTCAGACGGGGCACTGGACTTATGAGTGTAAGA
ACGAGAGGGTTTATGTGTCCAGGCCGTCGAGGACTCAGCAGCTTAAGGATCCTAAACTGA
GAACGAAGCCTTCTGTTGATGATCTTGACGGTGGTGAGAAGGTAGAGGTAGCGAATGGGA
A

QA 1 601 1 601
DS 

RD RR2H453JQB 762 0 0
GCTGTCTTGGGAGGAGGAGGAGGCGCTTCTCAGTGTCAGAAGTGTTTTCAGACGGGGCAC
TGGACTTATGAGTGTAAGAACGAGAGGGTTTATGTGTCCAGGCCGTCGAGGACTCAGCAG
CTTAAGGATCCTAAACTGAGAACGAAGCCTTCTGTTGATGATCTTGACGGTGGTGAGAAG
GTAGAGGTAGCGAATGGGAAAAAGGATGGGGAGAGGAGGATCAAGAGGAAGCATAGATCT
GATTCTGGTAGTGATAGTGAAGCATCTGTGTTTGAAAGTAGTTCGTCTGGGGAGAGTGAT
TCGGAGTACAGTTCGTCGTCTGAGTCAGAGGAGGATAGGAGGAAGAGGAGGAGTAAGAGG
AAGAGCAAGAAGAAGAAGCCTAAGCAGAGGAAGGAAAGGAGGAGGAAGAGAAGTTACAGC
TCTTCTTCTTCATCTGAGGAGGAGTCATCTGATTCAGAATCAGGTTCTGACTCGGAGTCT
GGTGAAGACAGAAGAAGCAGAAGTAGAAAGAAGAAGAGTAAGAGGCACAGCAACAGCAAA
CATCGTTAGAATTGGTTTAAAGGATAGTATCTACTTTTCTTAGAGAGAATCGTATTTTTG
AGCTTACATGAAGAAACTCACACTGCTTCTTTTCTTATTAGAATATTATGTTCTTGTCTA
GTGTGTTGTGCACACTGATGGATTTGAGGATCTCCTTTAAGGCTCTTTAGAGAACGTTGT
AAACCCCACAAAATCAGAGCTTTTAGTTGCAAATTTGAAGTC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL7695Contig1 579 2 1 U
GGATCCTCGCGATAATAAACGAGAAAAAAAAGCTAAAATGGGAGTGGTAGTGATCGACGG
ATCAACGGTGCAGTCGTTCGTGGAGGACGAGGAGCAGTTCAAGAAGACCATAGACGAGAG
GTTCGCCTCTCTGGATCTAAACAACGACGGCGTTTTATCTCGATCCGAGCTACGAAAGAC
GTTCGAATCGATGAGGCTTTTGGAATCGCACTTCGGCGTCGATGTGGTGACACCTCAGGA
GGAGCTGACGAGCCTGTACGACTCGATCTTCGATAAGTTCGACACGGATCAGAGCGGTTC
CGTGGATCTGGAGGAGTTCAGATCGGAGATGAAGAAGATCGTGCTAGCGATTGCCGATGG
GCTCGGATCGTGTCCGATTACGATGGCGTTGGATGACAATGATGATAATTTGCTGAAGAA
GGCGGCGGATCTGGAAGCTTCGAAGCTCGAGAAAAAGGCTTCGTGATGAAACGATGATTA
AATGGTTCTTTTTAAAGTGTTCTTCGTCTTTCGTTGTTGCTTATGTAGTGTTTGTTTGTG
ATGTAAGCAATATGAATAATAAAAGCCTTTCAGTTTGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BE72JQ C 1
AF RR2BE72TF U 1
BS 1 579 RR2BE72TF

RD RR2BE72JQ 579 0 0
GGATCCTCGCGATAATAAACGAGAAAAAAAAGCTAAAATGGGAGTGGTAGTGATCGACGG
ATCAACGGTGCAGTCGTTCGTGGAGGACGAGGAGCAGTTCAAGAAGACCATAGACGAGAG
GTTCGCCTCTCTGGATCTAAACAACGACGGCGTTTTATCTCGATCCGAGCTACGAAAGAC
GTTCGAATCGATGAGGCTTTTGGAATCGCACTTCGGCGTCGATGTGGTGACACCTCAGGA
GGAGCTGACGAGCCTGTACGACTCGATTTTCGATAAGTTCGACACGGATCAGAGCGGTTC
CGTGGATCTGGAGGAGTTCAGATCGGAGATGAAGAAGATCGTGCTAGCGATTGCCGATGG
GCTCGGATCGTGTCCGATTACGATGGCGTTGGATGACAATGATGATAATTTGCTGAAGAA
GGCGGCGGATCTGGAAGCTTCGAAGCTCGAGAAAAAGGCTTCGTGATGAAACGATGATTA
AATGGTTCTTTTTAAAGTGTTCTTCGTCTTTCGTTGTTGCTTATGTAGTGTTTGTTTGTG
ATGTAAGCAATATGAATAATAAAAGCCTTTCAGTTTGTG

QA 1 579 1 579
DS 

RD RR2BE72TF 579 0 0
GGATCCTCGCGATAATAAACGAGAAAAAAAAGCTAAAATGGGAGTGGTAGTGATCGACGG
ATCAACGGTGCAGTCGTTCGTGGAGGACGAGGAGCAGTTCAAGAAGACCATAGACGAGAG
GTTCGCCTCTCTGGATCTAAACAACGACGGCGTTTTATCTCGATCCGAGCTACGAAAGAC
GTTCGAATCGATGAGGCTTTTGGAATCGCACTTCGGCGTCGATGTGGTGACACCTCAGGA
GGAGCTGACGAGCCTGTACGACTCGATCTTCGATAAGTTCGACACGGATCAGAGCGGTTC
CGTGGATCTGGAGGAGTTCAGATCGGAGATGAAGAAGATCGTGCTAGCGATTGCCGATGG
GCTCGGATCGTGTCCGATTACGATGGCGTTGGATGACAATGATGATAATTTGCTGAAGAA
GGCGGCGGATCTGGAAGCTTCGAAGCTCGAGAAAAAGGCTTCGTGATGAAACGATGATTA
AATGGTTCTTTTTAAAGTGTTCTTCGTCTTTCGTTGTTGCTTATGTAGTGTTTGTTTGTG
ATGTAAGCAATATGAATAATAAAAGCCTTTCAGTTTGTG

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL7696Contig1 1130 2 2 U
GGGCACTTTGAAGTTAGAGGAAGATCAATACTTTGATCGATCTTCTTTCACCCCAAAGAA
AGAAAAAGATGAGTTATCATGTCCTTAGGTCTCCTATAACCTTCCGTTCTTACAGCAGCT
CCTTCGTCGGCTTCTTCTCCAAATCTCGTAATCCTCTTCTCTCTGCGAGATGGGTTAAAG
CAGGAGAAGGCAGTTCCATCAGATGTCTTGCTTCTGCTATACGTGGAAAGAACAAGAAAC
AGAGACTGGATGAGGCTTGTCTGGAAAGGTATCAGGAATACAGCCGCACACTAATACAAT
CATGGATTCTACAAGGCAAAGTGCTTGTAGATGGGAAAAGAGCTAGTAAAGCTGGGATGC
CTGTATCAAATGATGTATCCATTAAGATTACAGCTGAGGTTCCCAAATATGTATGTAGAG
GTGGGCTGAAGCTGGAAGCTGCAATAGAGAAGCTAGATGTTGATGTTTCTGAGAAAGTGG
TTCTTGATTCTGGACTTTCTACAGGAGGGTTTACAGATTGTTTGCTTCGTTATGGTGCTG
CTCATGTGTATGGTGTAGATGTTGGTTATGGTCAGGTTGCGGATAAAATTCGTAATGACA
AGAGAGTGACTGTTATGGAAAGAACAAATGTGAGATACCTCCCAGGTCTCCCACAAAAAG
TCGATGTAGTGACACTTGATCTCTCCTTCATTTCCATTCTCAAGGTCATGCCAGCTGTTA
TGAATGTGATGAATGAAGATGCAACTTTAGTTACCCTTGTTAAACCCCAATTTGAAGCTC
GGCGATCACAGGTTGGGAAAGGTGGGATAGTGAGAGACCCTGAAGTACATCAAGAGGTCC
TTGAGAGGATAATAAATGGGGTTGAGGCCTGTGGATTCACCAGCAAAGGGTTTATCGAAT
CTCCAATCAAGGGTGCCGATGGAAACATAGAGTTCTTGGTTCGCTTCGACCGAGGGACAG
TTAAAAAACCCGAAGAAGAAGAGTAGTCCTATCCTAGACTTTATATATTTTCATTGCTGG
GGAAATGCTATTGTTTCTTTTCACTCTTCATTTTTGAACTATTCTCTTGTTTTGGTGATA
TCAGTTATCCCAAAGATAAAAAAATTCCAAAGTAATCTCAAGTTAATCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A652TF U 1
AF RR2A652JQ C 265
BS 1 793 RR2A652TF
BS 794 1130 RR2A652JQ

RD RR2A652TF 793 0 0
GGGCACTTTGAAGTTAGAGGAAGATCAATACTTTGATCGATCTTCTTTCACCCCAAAGAA
AGAAAAAGATGAGTTATCATGTCCTTAGGTCTCCTATAACCTTCCGTTCTTACAGCAGCT
CCTTCGTCGGCTTCTTCTCCAAATCTCGTAATCCTCTTCTCTCTGCGAGATGGGTTAAAG
CAGGAGAAGGCAGTTCCATCAGATGTCTTGCTTCTGCTATACGTGGAAAGAACAAGAAAC
AGAGACTGGATGAGGCTTGTCTGGAAAGGTATCAGGAATACAGCCGCACACTAATACAAT
CATGGATTCTACAAGGCAAAGTGCTTGTAGATGGGAAAAGAGCTAGTAAAGCTGGGATGC
CTGTATCAAATGATGTATCCATTAAGATTACAGCTGAGGTTCCCAAATATGTATGTAGAG
GTGGGCTGAAGCTGGAAGCTGCAATAGAGAAGCTAGATGTTGATGTTTCTGAGAAAGTGG
TTCTTGATTCTGGACTTTCTACAGGAGGGTTTACAGATTGTTTGCTTCGTTATGGTGCTG
CTCATGTGTATGGTGTAGATGTTGGTTATGGTCAGGTTGCGGATAAAATTCGTAATGACA
AGAGAGTGACTGTTATGGAAAGAACAAATGTGAGATACCTCCCAGGTCTCCCACAAAAAG
TCGATGTAGTGACACTTGATCTCTCCTTCATTTCCATTCTCAAGGTCATGCCAGCTGTTA
TGAATGTGATGAATGAAGATGCAACTTTAGTTACCCTTGTTAAACCCCAATTTGAAGCTC
GGCGATCACAGGT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RR2A652JQ 866 0 0
AAAGGTATCAGGAATACAGCCGCACACTAATACAATCATGGATTCTACAAGGCAAAGTGC
TTGTAGATGGGAAAAGAGCTAGTAAAGCTGGGATGCCTGTATCAAATGATGTATCCATTA
AGATTACAGCTGAGGTTCCCAAATATGTATGTAGAGGTGGGCTGAAGCTGGAAGCTGCAA
TAGAGAAGCTAGATGTTGATGTTTCTGAGAAAGTGGTTCTTGATTCTGGACTTTCTACAG
GAGGGTTTACAGATTGTTTGCTTCGTTATGGTGCTGCTCATGTGTATGGTGTAGATGTTG
GTTATGGTCAGGTTGCGGATAAAATTCGTAATGACAAGAGAGTGACTGTTATGGAAAGAA
CAAATGTGAGATACCTCCCAGGTCTCCCACAAAAAGTCGATGTAGTGACACTTGATCTCT
CCTTCATTTCCATTCTCAAGGTCATGCCAGCTGTTATGAATGTGATGAATGAAGATGCAA
CTTTAGTTACCCTTGTTAAACCCCAATTTGAAGCTCGGCGATCACAGGTTGGGAAAGGTG
GGATAGTGAGAGACCCTGAAGTACATCAAGAGGTCCTTGAGAGGATAATAAATGGGGTTG
AGGCCTGTGGATTCACCAGCAAAGGGTTTATCGAATCTCCAATCAAGGGTGCCGATGGAA
ACATAGAGTTCTTGGTTCGCTTCGACCGAGGGACAGTTAAAAAACCCGAAGAAGAAGAGT
AGTCCTATCCTAGACTTTATATATTTTCATTGCTGGGGAAATGCTATTGTTTCTTTTCAC
TCTTCATTTTTGAACTATTCTCTTGTTTTGGTGATATCAGTTATCCCAAAGATAAAAAAA
TTCCAAAGTAATCTCAAGTTAATCCG

QA 1 866 1 866
DS 



AS 1 2

CO CL7697Contig1 722 2 2 U
GGGTCATTAGTGATACTGAAAGTCACAGATGAACCAAGCAGCCTTTCTCATGCTTCAGTG
ATTGATGGAATTGATCTTGAGGCTCATCTACCACCGAAGAAGCTTAAGTCTACTGTTATG
TCAATGGCGCCCTCCACTGCATTCAAGACACTAGAAGCTCTGGTTGCTATGTGGCAGACG
AGGGGATGTGGTGGCAGGTATCTTCTTCCATGGATATACAGTATAATGATAAATCATAGG
CATTACATCATGCCCCAAGAACCAAAAAACCAACAGCTGCTTAATACATTGCAAAAGATA
ACCATGTCCAGAGGAACGGCCTTCAACAGTTACTACAGTTATCTGGGCGCTTGCATCTTG
TTACAGCTCAGATCAATAAAGCTGCAGGGATTGAAACTCAAACAACGGTTAACGAGGAAG
AGACTGATGAAAGTGAAGATGATGTAGAAGAGCATTTCTATGGTGAGAAGGATGATGATT
CCGAATTAAGTAGCGATGATGGAAAGGATGAAGATGACACCTTGATGGAAGAGATATAAG
CGAGATATAGTGAGTGAAGACAAAGAGAAAGAAGCTTTGGTTCTTCTTCTTCACGATTTT
TGTCTTTTCAGAGTTAGAAACTTTTGAGCAAATGATTCACATTTCTATTCAGAACATTCA
TCAATATGTCAGAAACTTTAAATGTAACCAAGAGTTAAAAGAAGGTGTTGTATTACCAAA
AA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2E707TF U 1
AF RR2E707JQ C 97
BS 1 608 RR2E707TF
BS 609 722 RR2E707JQ

RD RR2E707TF 608 0 0
GGGTCATTAGTGATACTGAAAGTCACAGATGAACCAAGCAGCCTTTCTCATGCTTCAGTG
ATTGATGGAATTGATCTTGAGGCTCATCTACCACCGAAGAAGCTTAAGTCTACTGTTATG
TCAATGGCGCCCTCCACTGCATTCAAGACACTAGAAGCTCTGGTTGCTATGTGGCAGACG
AGGGGATGTGGTGGCAGGTATCTTCTTCCATGGATATACAGTATAATGATAAATCATAGG
CATTACATCATGCCCCAAGAACCAAAAAACCAACAGCTGCTTAATACATTGCAAAAGATA
ACCATGTCCAGAGGAACGGCCTTCAACAGTTACTACAGTTATCTGGGCGCTTGCATCTTG
TTACAGCTCAGATCAATAAAGCTGCAGGGATTGAAACTCAAACAACGGTTAACGAGGAAG
AGACTGATGAAAGTGAAGATGATGTAGAAGAGCATTTCTATGGTGAGAAGGATGATGATT
CCGAATTAAGTAGCGATGATGGAAAGGATGAAGATGACACCTTGATGGAAGAGATATAAG
CGAGATATAGTGAGTGAAGACAAAGAGAAAGAAGCTTTGGTTCTTCTTCTTCACGATTTT
TGTCTTTT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RR2E707JQ 626 0 0
AAGAAGCTTAAGTCTACTGTTATGTCAATGGCGCCCTCCACTGCATTCAAGACACTAGAA
GCTCTGGTTGCTATGTGGCAGACGAGGGGATGTGGTGGCAGGTATCTTCTTCCATGGATA
TACAGTATAATGATAAATCATAGGCATTACATCATGCCCCAAGAACCAAAAAACCAACAG
CTGCTTAATACATTGCAAAAGATAACCATGTCCAGAGGAACGGCCTTCAACAGTTACTAC
AGTTATCTGGGCGCTTGCATCTTGTTACAGCTCAGATCAATAAAGCTGCAGGGATTGAAA
CTCAAACAACGGTTAACGAGGAAGAGACTGATGAAAGTGAAGATGATGTAGAAGAGCATT
TTTATGGTGAGAAGGATGATGATTCCGAATTAAGTAGCGATGATGGAAAGGATGAAGATG
ACACCTTGATGGAAGAGATATAAGCGAGATATAGTGAGTGAAGACAAAGAGAAAGAAGCT
TTGGTTCTTCTTCTTCACGATTTTTGTCTTTTCAGAGTTAGAAACTTTTGAGCAAATGAT
TCACATTTCTATTCAGAACATTCATCAATATGTCAGAAACTTTAAATGTAACCAAGAGTT
AAAAGAAGGTGTTGTATTACCAAAAA

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL7698Contig1 609 2 1 U
GGGAAACGTTTCACCTAATCTCTATCTCTATTTGCCCCCCCCCCCCTCTCTCTCTGTCTC
TCTCTGTTCTTCGATGTTACCAATGTAAATCAGTATACGAAACAACAACGAAATCCGATC
AATCTCTTCTCACGAAATCTTTTCAACTCTCCATCCGTTAAGCTATTAGCAAGCGAAAAG
AGGTCGCAAAGGATCGAAGTTTAAATTGGGCCATCTATACATGGAAACGTACGGTTAAAC
AATTGATTTCTCAATGTGAAGATAACCGTGAAGTAAAGAGGAGAACATTACAGAGGGAAT
ATATGAATTAAATATAATCATGGAATATCAAGCTCTTGGAGAAGAAGAGAATTGCAGATT
AAAGTGTTCAGTTGTTTTATTTTTCAAGTAATTCGAAATTTCATGGTTTACGTGAAGAAG
AAAGGAATTTCGTTAATGTGTTGTCATATAATTGTAGTTGACTTAAGAGTTTTCATGTAA
TGTAGTTAATTATAAACAAATATCGCGAATAGGGAAAGTTGTTGTATCCGTTTATAATGC
AAAAAAACAGTGAGAAAATATGCATTAAATTAAGTGGAAAAGACAAGAATTTTTTAAGGA
AGGATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CL17TF U 1
AF RR2CL17JQ C 31
BS 1 609 RR2CL17TF

RD RR2CL17TF 609 0 0
GGGAAACGTTTCACCTAATCTCTATCTCTATTTGCCCCCCCCCCCCTCTCTCTCTGTCTC
TCTCTGTTCTTCGATGTTACCAATGTAAATCAGTATACGAAACAACAACGAAATCCGATC
AATCTCTTCTCACGAAATCTTTTCAACTCTCCATCCGTTAAGCTATTAGCAAGCGAAAAG
AGGTCGCAAAGGATCGAAGTTTAAATTGGGCCATCTATACATGGAAACGTACGGTTAAAC
AATTGATTTCTCAATGTGAAGATAACCGTGAAGTAAAGAGGAGAACATTACAGAGGGAAT
ATATGAATTAAATATAATCATGGAATATCAAGCTCTTGGAGAAGAAGAGAATTGCAGATT
AAAGTGTTCAGTTGTTTTATTTTTCAAGTAATTCGAAATTTCATGGTTTACGTGAAGAAG
AAAGGAATTTCGTTAATGTGTTGTCATATAATTGTAGTTGACTTAAGAGTTTTCATGTAA
TGTAGTTAATTATAAACAAATATCGCGAATAGGGAAAGTTGTTGTATCCGTTTATAATGC
AAAAAAACAGTGAGAAAATATGCATTAAATTAAGTGGAAAAGACAAGAATTTTTTAAGGA
AGGATTATT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RR2CL17JQ 579 0 0
TTTGCCCCCCCCCCCCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTGTTCTTGGATGTTACCAATGTAAAT
CAGTATACGAAACAACAACGAAATCCGATCAATCTCTTCTCACGAAATCTTTTCAACTCT
CCATCCGTTAAGCTATTAGCAAGCGAAAAGAGGTCGCAAAGGATCGAAGTTTAAATTGGG
CCATCTATACATGGAAACGTACGGTTAAACAATTGATTTCTCAATGTGAAGATAACCGTG
AAGTAAAGAGGAGAACATTACAGAGGGAATATATGAATTAAATATAATCATGGAATATCA
AGCTCTTGGAGAAGAAGAGAATTGCAGATTAAAGTGTTCAGTTGTTTTATTTTTCAAGTA
ATTCGAAATTTCATGGTTTACGTGAAGAAGAAAGGAATTTCGTTAATGTGTTGTCATATA
ATTGTAGTTGACTTAAGAGTTTTCATGTAATGTAGTTAATTATAAACAAATATCGCGAAT
AGGGAAAGTTGTTGTATCCGTTTATAATGCAAAAAAACAGTGAGAAAATATGCATTAAAT
TAAGTGGAAAAGACAAGAATTTTTTAAGGAAGGATTATT

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL7699Contig1 704 2 2 U
GTGGGAGCGGTGGGTGGTAACAAGGGCGGACCATTTGACGACGGGGTTTACGATGGTGTG
AAGAAAATAACGGTGGGAAAAGACTGGGACTGTGTTTCTTATATCAAGATTGAGTACGAA
AAGGGTGAAGAAACATTCGATGATGGTGGTGCTTTTGATCATGTAAGAAAAGTTTTTGTT
GGTCAAGGCAATTCCGGTGTGGCTTATATCAAGTTTGAATACGAGAAAGACGGTAGAAGA
GTGACACACGAGCACGGAAAAGAGACATCCCTAGGAACAGAGGAGTTCGAGGTTGATCAA
GGCGACGACATCACATCTGTGAAAGTTTACTACGATAAACTCTTTGGCTCGAAGACAGAG
ATAATAACGTCTCTTACGTTCAAGACACTGAAGGGCATCACCTCTCAGCCGTTTGGAATG
ACCTCAGAGAATTTTTCCTTGCTCGAAGGTGGCAAAATCACCGGTTTTCATGGAAGTTCG
ACGGACGTTCTTCATTCTCTCGGAGCTTATACAGTGGCTTGTGTCGGGAGCTTATAAGCT
ATGATGCACGGGGACGGCATATCCTTGACGTCTCCTGTTCCGTGTTTGGTGGGTTTGTGA
GTTTTAAGAGGTCATTTGCTTGTGTGTTTTAGAAATGTCTACATTTTATGTGTGTTTGGT
CTTTATGAAATAAATCCAATCAATAAGAGTATAACTGGGTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE70TF U 1
AF RR2EE70JQ C 20
BS 1 594 RR2EE70TF
BS 595 704 RR2EE70JQ

RD RR2EE70TF 594 0 0
GTGGGAGCGGTGGGTGGTAACAAGGGCGGACCATTTGACGACGGGGTTTACGATGGTGTG
AAGAAAATAACGGTGGGAAAAGACTGGGACTGTGTTTCTTATATCAAGATTGAGTACGAA
AAGGGTGAAGAAACATTCGATGATGGTGGTGCTTTTGATCATGTAAGAAAAGTTTTTGTT
GGTCAAGGCAATTCCGGTGTGGCTTATATCAAGTTTGAATACGAGAAAGACGGTAGAAGA
GTGACACACGAGCACGGAAAAGAGACATCCCTAGGAACAGAGGAGTTCGAGGTTGATCAA
GGCGACGACATCACATCTGTGAAAGTTTACTACGATAAACTCTTTGGCTCGAAGACAGAG
ATAATAACGTCTCTTACGTTCAAGACACTGAAGGGCATCACCTCTCAGCCGTTTGGAATG
ACCTCAGAGAATTTTTCCTTGCTCGAAGGTGGCAAAATCACCGGTTTTCATGGAAGTTCG
ACGGACGTTCTTCATTCTCTCGGAGCTTATACAGTGGCTTGTGTCGGGAGCTTATAAGCT
ATGATGCACGGGGACGGCATATCCTTGACGTCTCCTGTTCCGTGTTTGGTGGGT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RR2EE70JQ 685 0 0
ACAAGGGCGGACCATTTGACGACGGGGTTTACGATGGTGTGAAGAAAATAACGGTGGGAA
AAGACTGGGACTGTGTTTCTTATATCAAGATTGAGTACGAAAAGGGTGAAGAAACATTCG
ATGATGGTGGTGCTTTTGATCATGTAAGAAAAGTTTTTGTTGGTCAAGGCAATTCCGGTG
TGGCTTATATCAAGTTTGAATACGAGAAAGACGGTAGAAGAGTGACACACGAGCACGGAA
AAGAGACATCCCTAGGAACAGAGGAGTTCGAGGTTGATCAAGGCGACGACATCACATCTG
TGAAAGTTTACTACGATAAACTCTTTGGCTCGAAGACAGAGATAATAACGTCTCTTACGT
TCAAGACACTGAAGGGCATCACCTCTCAGCCGTTTGGAATGACCTCAGAGAATTTTTCCT
TGCTCGAAGGTGGCAAAATCACCGGTTTTCATGGAAGTTCGACGGACGTTCTTCATTCTC
TCGGAGCTTATACAGTGGCTTGTGTCGGGAGCTTATAAGCTATGATGCACGGGGACGGCA
TATCCTTGACGTCTCCTGTTCCGTGTTTGGTGGGTTTGTGAGTTTTAAGAGGTCATTTGC
TTGTGTGTTTTAGAAATGTCTACATTTTATGTGTGTTTGGTCTTTATGAAATAAATCCAA
TCAATAAGAGTATAACTGGGTTTTC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL7700Contig1 787 2 7 U
CAAATCTCGTCTCAAATCAAAGAGAACATAATGGACATTGAATCTTCTACAACCAAATCA
CCACATGTTCACCAAGAATCCACAAACCAAGATCCGCTCATAAAGCATAGAGGAGGATGG
AGAGCTATCAAGTACATTATCGCAAACGAGTCATTCGAGAAGCTGGCGTCCATGAGCTTG
ATAGGGAATCTATCCGCGTACCTCACGACGAAATACAATCTTGGTGGTATTTTCTTGGTG
AACATCATCAATATCTGGTTTGGTTCGTGCAATTTTCTTAGTATCCCAGGTGCTTTTATC
TCTGATGCATACCTCGGAAGATTCTGGACCCTTCTCCTCGGTTCCATCTCCTCTTTCCTC
GGAATGGGAATAATTGCTCTAACTGCGGCTCTCCCGCGTTTAAGACCCGAGGCTTGCAAA
GATCCAACAAATTGTTCAAACCCGCCCGAGCGTTGGCAGCTTGCCGTTCTCTTTGCTGGC
CTAGGTTTAGTAGCCATTGGAGCAGGAGGGATTAGACCATGCAACATCGCATTTGGAGCA
GATCAATTCGATACAAGCACTACAAAGGGCAAATCTAATCTTGAAACATTCTTTAACTGG
TGGTACTTCTCCTTCACCGTGGCTCTTGTCATTGCACTGACGGGTGTCGTGTATATACAG
ACTAACATCAGTTGGGCCATTGGTTTCATGATCCCCACGGCTTGCCTTGCACTCTCTATC
ACTACCTTCCTCATGGGCCAGCACACTTACATCTGTGCAGAGCCTAAGGGAAGTGTGTTC
GCAGACA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F980TF U 1
AF RR2A077TF U 1
BS 1 297 RR2A077TF
BS 298 298 RR2F980TF
BS 299 704 RR2A077TF
BS 705 705 RR2F980TF
BS 706 734 RR2A077TF
BS 735 735 RR2F980TF
BS 736 787 RR2A077TF

RD RR2F980TF 764 0 0
G
AAATCTCGTCTCAAATCAAAGAGAACATAATGGACATTGAATCTTCTACAACCAAATCAC
CACATGTTCACCAAGAATCCACAAACCAAGATCCGCTCATAAAGCATAGAGGAGGATGGA
GAGCTATCAAGTACATTGTCGCAAACGAGTCATTCGAGAAGCTGGCGTCCATGAGCTTGA
TAGGGAATCTATCCGTGTACCTCACGACGAAATACAATCTTGGTGGTATTTTCTTGGTGA
ACATCATCAATATCTGGTTTGGTTCGTGCAATTTTCTTAGTATCCCAGGTGCTTTTATCT
CTGATGCATACCTCGGAAGATTCTGGACCCTTCTCCTCGGTTCCATCTCCTCTTTCCTCG
GAATGGGAATAATTGCTCTAACTGCGGCTCTCCCGCGTTTAAGACCCGAGGCTTGCCGAG
ATCCAACAAATTGTTCAAACCCGCCCGAGCGTTGGCAGCTTGCCGTTCTCTTTGCTGGCC
TAGGTTTAGTAGCCATTGGAGCAGGAGGGATTAGACCATGCAACATCGCATTTGGAGCAG
ATCAATTCGATACAAGCACTACAAAGGGCAAATCTAATCTTGAAACATTCTTTAACTGGT
GGTACTTCTCCTTCACCGTGGCTCTTGTCATTGCACTGACGGGTGTCGTGTATATACAGA
CTAACATCAGTTGGGCCATTGGTTTCATGATCCCCACGGCTTGCCTTGCACTCTCTATCA
CTACCTTCCTCATGGGC*AGCACACTTACATCTGTGCAGAGCC

QA 2 764 2 764
DS 

RD RR2A077TF 787 0 0
CAAATCTCGTCTCAAATCAAAGAGAACATAATGGACATTGAATCTTCTACAACCAAATCA
CCACATGTTCACCAAGAATCCACAAACCAAGATCCGCTCATAAAGCATAGAGGAGGATGG
AGAGCTATCAAGTACATTATCGCAAACGAGTCATTCGAGAAGCTGGCGTCCATGAGCTTG
ATAGGGAATCTATCCGCGTACCTCACGACGAAATACAATCTTGGTGGTATTTTCTTGGTG
AACATCATCAATATCTGGTTTGGTTCGTGCAATTTTCTTAGTATCCCAGGTGCTTTTGTC
TCTGATGCATACCTCGGAAGATTCTGGACCCTTCTCCTCGGTTCCATCTCCTCTTTCCTC
GGAATGGGAATAATTGCTCTAACTGCGGCTCTCCCGCGTTTAAGACCCGAGGCTTGCAAA
GATCCAACAAATTGTTCAAACCCGCCCGAGCGTTGGCAGCTTGCCGTTCTCTTTGCTGGC
CTAGGTTTAGTAGCCATTGGAGCAGGAGGGATTAGACCATGCAACATCGCATTTGGAGCA
GATCAATTCGATACAAGCACTACAAAGGGCAAATCTAATCTTGAAACATTCTTTAACTGG
TGGTACTTCTCCTTCACCGTGGCTCTTGTCATTGCACTGACGGGTGTCGTGTATATACAG
ACTAACATCAGTTGGGCCATTGGTTTCATGATCCCCACGGCTTGTCTTGCACTCTCTATC
ACTACCTTCCTCATTGGCCAGCACACTTACATCTGTGCAGAGCCTAAGGGAAGTGTGTTC
GCAGACA

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL7701Contig1 741 2 9 U
GGAGTGAGAGAGTGTGATAGTGAGAAAAAAGAAAACCAACGTCACCTGCTCAGATAATAG
AAAGAGAGAGCAGCTTAAAATCTAAATGGACGAGAGACCCGAGACAGAGTTAATATCAAT
ACCAGCAACGCCGCGAGTCTCCACTCCGGAGATTCTAACTCCATCCGGTCAAAGATCGCC
TCGTCCCGCCACCAAGCCGTCGTCGGCGGCATGGACTCCGACCTCCTTCATATCGCCAAG
GTTCTTGAGTCCTATTGGGACGCCTATGAAACGCGTTCTTGTCAACATGAAAGGTTATCT
CGAAGAAATGGGTCACCTCACCAAGCTCAACCCACAAGACGCTTGGCTTCCTATCACCGA
GTCTCGCAACGGAAACGCTCACTACGCTGCGTTTCATAACCTCAACGCAGGTGTTGGGTT
TCAAGCCCTCGTTCTTCCCGTCGCGTTTGCGTTTCTTGGCTGGAGTTGGGGGATACTGTC
ATTGACAATAGCCTACTGTTGGCAACTCTATACACTGTGGATTCTAGTTCAGTTACACGA
AGCAGTCCCAGGGAAACGTTACAATCGATATGTCGAGCTTGCACAAGCTGCATTTGGAGA
AAGATTGGGAGCTTGGCTTGCGTTGTTTCCTACGGTTTACTTATCAGCAGGAACGGCGAC
AGCCCTGATTCTGATCGGTGGAGAGACAATGAAACTCTCTTTCAGATAGTTTGTGGTCCG
TTATGCACCTCGAACCGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A586TF U 87
AF RR2G439TF U 1
BS 1 375 RR2G439TF
BS 376 376 RR2A586TF
BS 377 495 RR2G439TF
BS 496 496 RR2A586TF
BS 497 611 RR2G439TF
BS 612 612 RR2A586TF
BS 613 663 RR2G439TF
BS 664 664 RR2A586TF
BS 665 741 RR2G439TF

RD RR2A586TF 595 0 0
G
GGACGAGAGACCCGAGACAGAGTTAATATCAATACCAGCAACGCCGCGAGTCTCCACTCC
GGAGATTCTAACTCCATCCGGTCAAAGATCGCCTCGTCCCGCCACCAAGCCGTCGTCGGC
GGCATGGACTCCGACCTCTTTCATATCGCCAAGGTTCTTGAGTCCTATTGGGACGCCTGT
GAAACGCGTTCTTGTCAACATGAAAGGTTATCTCGAAGAAATGGGTCACCTCACCAAGCT
CAACCCACAAGACGCTTGGCTTCCTATCACCGAGTCTCGCAACGGAAACGCTCACTACGC
TGCGTTTCATAACCTCAACGCCGGTGTTGGGTTTCAAGCCCTCGTTCTTCCCGTCGCGTT
TGCGTTTCTTGGCTGGAGTTGGGGGATACTGTCATTGACAATAGCCTACTGTTGGCAACT
CTATACACTGTGGATTCTAGTTCAGTTACACGAAGCAGTCCCAGGGAAACGTTACAATCG
ATATGTCGAGCTTGCACAAGCTGCATTTGGAGAAAGATTGGGAGCTTGGCTTGCGTTGTT
TCCTACGGTTTACTTATCAGCAGGAACGGCGACAGCCCTGATTCTGATCGGTGG

QA 2 595 2 595
DS 

RD RR2G439TF 741 0 0
GGAGTGAGAGAGTGTGATAGTGAGAAAAAAGAAAACCAACGTCACCTGCTCAGATAATAG
AAAGAGAGAGCAGCTTAAAATCTAAATGGACGAGAGACCCGAGACAGAGTTAATATCAAT
ACCAGCAACGCCGCGAGTCTCCACTCCGGAGATTCTAACTCCATCCGGTCAAAGATCGCC
TCGTCCCGCCACCAAGCCGTCGTCGGCGGCATGGACTCCGACCTCCTTCATATCGCCAAG
GTTCTTGAGTCCTATTGGGACGCCTATGAAACGCGTTCTTGTCAACATGAAAGGTTATCT
CGAAGAAATGGGTCACCTCACCAAGCTCAACCCACAAGACGCTTGGCTTCCTATCACCGA
GTCTCGCAACGGAAATGCTCACTACGCTGCGTTTCATAACCTCAACGCAGGTGTTGGGTT
TCAAGCCCTCGTTCTTCCCGTCGCGTTTGCGTTTCTTGGCTGGAGTTGGGGGATACTGTC
ATTGACAATAGCCTATTGTTGGCAACTCTATACACTGTGGATTCTAGTTCAGTTACACGA
AGCAGTCCCAGGGAAACGTTACAATCGATATGTCGAGCTTGCACAAGCTGCATTTGGAGA
AAGATTGGGAGTTTGGCTTGCGTTGTTTCCTACGGTTTACTTATCAGCAGGAACGGCGAC
AGCTCTGATTCTGATCGGTGGAGAGACAATGAAACTCTCTTTCAGATAGTTTGTGGTCCG
TTATGCACCTCGAACCGTTAC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL7702Contig1 557 2 1 U
CTTTTCCGTCTGGAAGAACCCTAAACCCATCCGCATCGACAGATAATTGTAGAAAAAAAA
ATCACTTGTCTCGTCTGATTTGATTGAATTTTTACGCTCGAAGGATGGAAACGCCAATGG
TTGCAGGTGCTGCTGTAGCTGCTGCTCTAGCTGGTAGATATGGTATACTCGCTTGGCAAG
CCTTCAAGGCCAGGCCACCCGTGGCTAGAATGCGTAGGTTTTATGAAGGTGGTTTCCAAA
CTGCAATGACACGGCGAGAAGCTGCTCTCATTCTTGGAGTTAGGGAGAGGGTAGCGGCGG
AGAAGGTGAAAGAAGCTCACAGGAGAGTTATGGTTGCAAACCACCCTGACGCTGGAGGTA
GCCACTATCTCGCTTCCAAGATCAATGAAGCCAAAGACATTTTGCTCGGCAAGTCCAGTA
ACTCCGGCTCTGCTTTTTGATTCTCATATTAGTTTTTTTTAATACAAACCCAATATGAAA
CTCTTTTGTCTTTTCATTTGATTATGTTTTTCAATGTACCACCATTTCTTGTTTGTATAT
CATTATTATGTTTCCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BB75JQ C 1
AF RR2BB75TF U 1
BS 1 557 RR2BB75TF

RD RR2BB75JQ 557 0 0
CTTTTCCGTCTGGAAGAACCCTAAACCCATCCGCATCGACAGATAATTGTAGAAAAAAAA
ATCACTTGTCTCGTCTGATTTGATTGAATTTTTACGCTCGAAGGATGGAAACGCCAATGG
TTGCAGGTGCTGCTGTAGCTGCTGCTCTAGCTGGTAGATATGGTATACTCGCTTGGCAAG
CCTTCAAGGCCAGGCCACCCGTGGCTAGAATGCGTAGGTTTTATGAAGGTGGTTTCCAAA
CTGCAATGACACGGCGAGAAGCTGCTCTCATTCTTGGAGTTAGGGAGAGGGTAGCGGCGG
AGAAGGTGAAAGAAGCTCACAGGAGAGTTATGGTTGCAAACCACCCTGACGCTGGAGGTA
GCCACTATCTCGCTTCCAAGATCAATGAAGCCAAAGACATTTTGCTCGGCAAGTCCAGTA
ACTCCGGCTCTGCTTTTTGATTCTCATATTAGTTTTTTTTAATACAAACCCAATATGAAA
CTCTTTTGTCTTTTCATTTGATTATGTTTTTCAATGTACCACCATTTCTTGTTTGTATAT
CATTATTATGTTTCCAC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2BB75TF 557 0 0
CTTTTCCGTCTGGAAGAACCCTAAACCCATCCGCATCGACAGATAATTGTAGAAAAAAAA
ATCACTTGTCTCGTCTGATTTGATTGAATTTTTACGCTCGAAGGATGGAAACGCCAATGG
TTGCAGGTGCTGCTGTAGCTGCTGCTCTAGCTGGTAGATATGGTATACTCGCTTGGCAAG
CCTTCAAGGCCAGGCCACCCGTGGCTAGAATGCGTAGGTTTTATGAAGGTGGTTTCCAAA
CTGCAATGACACGGCGAGAAGCTGCTCTCATTCTTGGAGTTAGGGAGAGGGTAGCGGCGG
AGAAGGTGAAAGAAGCTCACAGGAGAGTTATGGTTGCAAACCACCCTGACGCTGGAGGTA
GCCACTATCTCGCTTCCAAGATCAATGAAGCCAAAGACATTTTGCTCGGCAAGTCCAGTA
ACTCCGGCTCTGCTTTTTGATTCTCATATTAGTTTTTTTTAATACAAACCCAATATGAAA
CTCTTTTGTCTTTTCATTTGATTATGTTTTTCAATGTACCACCATTTCTTGTTTGTATAT
CATTATTATGTTTCCAC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL7703Contig1 643 2 3 U
GGGTTTAGGGAAGCTTTAAACCCGATTATTATTAAATTAAAATTAGACAACAAACAAACC
TCATGACTGTTTTGGATTATTATACATTTATGGTTTTGATGGATAGATGGTTTATACTTT
ATCATCGTGGAACCACCATCGAGTCTCCTTTGGGGATCTTCCGTTCTTACAATTCTTCAC
ATATCGGTCATTATCGGTCGGTCGTTGCTTTTCAGTGGAGCTAGAGAGCATGGAGAGAAT
GCTGATGCAGATAGAACTCACAGTCATCGCTGGAGACCACGAATCATACAGTATATCTAA
GCAAATATGCCCATTGCTGTAAATGTGAGGATGCAAAGGAGCCGGAGGAAGAAAAATCAC
TTGCGGCGACTCCATAGGATAGTGCTCGGGAAAATCAACTTGAAGCTGATAGGTCTCGTT
CGCATACACAGTTCCTGGAGCTCCAATAACTTCGATTATCCATCTTTGGAGATTGTCAGT
GACCTTGTGTTTGAACCCCGTAGGTGGATTCATCTGCCACTCCACAAGCTCTTTCTGAAG
CCTTTTACACGCGATCTTGCTCAGAGCCATGTGAGAAGGAGCACCAGAACTTGACATGGC
TTTGTAGAGATGGAGTGAGAAAGAGATGATCGCCTCGTCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C794JQ U 3
AF RR2C794TF C 1
BS 1 5 RR2C794TF
BS 6 562 RR2C794JQ
BS 563 643 RR2C794TF

RD RR2C794JQ 560 0 0
GGG
TAGGGAAGCTTTAAACCCGATTATTATTAAATTAAAATTAGACAACAAACAAACCTCATG
ACTGTTTTGGATTATTATACATTTATGGTTTTGATGGATAGATGGTTTATACTTTATCAT
CGTGGAACCACCATCGAGTCTCCTTTGGGGATCTTCCGTTCTTACAATTCTTCACATATC
GGTCATTATCGGTCGGTCGTTGCTTTTCAGTGGAGCTAGAGAGCATGGAGAGAATGCTGA
TGCAGATAGAACTCACAGTCATCGCTGGAGACCACGAATCATACAGTATATCTAAGCAAA
TATGCCCATTGCTGTAAATGTGAGGATGCAAAGGAGCCGGAGGAAGAAAAATCACTTGCG
GCGACTCCATAGGATAGTGCTCGGGAAAATCAACTTGAAGCTGATAGGTCTCGTTCGCAT
ACACAGTTCCTGGAGCTCCAATAACTTCGATTATCCATCTTTGGAGATTGTCAGTGACCT
TGTGTTTGAACCCCGTAGGTGGATTCATCTGCCACTCCACAAGCTCTTTCTGAAGCCTTT
TACACGCGATCTTGCTC

QA 4 560 4 560
DS 

RD RR2C794TF 643 0 0
GGGTTTAGGGAAGCTTTAAACCCGATTATTATTAAATTAAAATTAGACAACAAACAAACC
TCATGACTGTTTTGGATTATTATACATTTATGGTTTTGATGGATAGATGGTTTATACTTT
ATCATCGTGGAACCACCATCGAGTCTCCTTTGGGGATCTTCCGTTCTTACAATTCTTCAC
ATATCGGTCATTATCGGTCGGTCGTTGCTTTTCAGTGGAGCTAGAGAGCATGGAGAGAAT
GCTGATGCAGATAGAACTCACAGTCATCGCTGGAGACCACGAATCATACAGTATATCTAA
GCAAATATGCCCATTGCTGTAAATGTGAGGATGCAAAGGAGCCGGAGGAAGAAAAATCAC
TTGCGGCGACTCCATAGGATAGTGCTCGGGAAAATCAACTTGAAGCTGATAGGTCTCGTT
CGCATACACAGTTCCTGGAGCTCCAATAACTTCGATTATCCATCTTTGGAGATTGTCAGT
GACCTTGTGTTTGAACCCCGTAGGTGGATTCATCTGCCACTCCACAAGCTCTTTCTGAAG
CCTTTTACACGCGATCTTGCTCAGAGCCATGTGAGAAGGAGCACCAGAACTTGACATGGC
TTTGTAGAGATGGAGTGAGAAAGAGATGATCGCCTCGTCGTCC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL7704Contig1 722 2 1 U
GGACACACACAAATCCTCGGTAAAGAAAATGGCCGATCAACTCACCGATGATCAGATCTC
CGAGTTCAAGGAAGCTTTCAGCCTTTTCGACAAGGACGGAGATGGTTGCATCACAACCAA
AGAGCTTGGCACAGTGATGAGGTCACTCGGACAGAACCCGACAGAAGCAGAGCTTCAAGA
CATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGACCGTAGACTTCCCCGAGTTCCTCAA
CCTGATGGCTCGTAAGATGAAGGACACGGACTCGGAGGAAGAGCTCAAAGAGGCTTTCAG
GGTTTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCCACTGCGGAGCTGAGACATGTGATGAC
CAATCTGGGGGAGAAGTTGACTGATGAAGAGGTCGATGAGATGATCAGAGAAGCTGATGT
TGATGGAGATGGTCAGATCAATTATGAAGAGTTTGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAGG
ATAACCATTTTTCTCAATCTCTCTGTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGATCATCAAAAGAAAA
AGTCTTTATGCTACTTTTTATTGAATTTAAACAAGTGTTTGACCGCTCATCATCATTCAC
CATCATACATCCGTTTTCGTGTTCTGTTGTTTGTTGGTCTTTTGTCATTTTCACCCCAAT
AATTTTATATTTTCTCTGTTAAATTTTTGGAAAACGTCGAAAGAATAAACAGTTTATTCT
GT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RR2B630JQ C 1
AF RR2B630TF U 1
BS 1 722 RR2B630TF

RD RR2B630JQ 722 0 0
GGACACACACAAATCCTCGGTAAAGAAAATGGCCGATCAACTCACCGATGATCAGATCTC
CGAGTTCAAGGAAGCTTTCAGCCTTTTCGACAAGGACGGAGATGGTTGCATCACAACCAA
AGAGCTTGGCACAGTGATGAGGTCACTCGGACAGAACCCGACAGAAGCAGAGCTTCAAGA
CATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGACCGTAGACTTCCCCGAGTTCCTCAA
CCTGATGGCTCGTAAGATGAAGGACACGGACTCGGAGGAAGAGCTCAAAGAGGCTTTCAG
GGTTTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCCACTGCGGAGCTGAGACATGTGATGAC
CAATTTGGGGGAGAAGTTGACTGATGAAGAGGTCGATGAGATGATCAGAGAAGCTGATGT
TGATGGAGATGGTCAGATCAATTATGAAGAGTTTGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAGG
ATAACCATTTTTCTCAATCTCTCTGTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGATCATCAAAAGAAAA
AGTCTTTATGCTACTTTTTATTGAATTTAAACAAGTGTTTGACCGCTCATCATCATTCAC
CATCATACATCCGTTTTCGTGTTCTGTTGTTTGTTGGTCTTTTGTCATTTTCACCCCAAT
AATTTTATATTTTCTCTGTTAAATTTTTGGAAAACGTCGAAAGAATAAACAGTTTATTCT
GT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RR2B630TF 722 0 0
GGACACACACAAATCCTCGGTAAAGAAAATGGCCGATCAACTCACCGATGATCAGATCTC
CGAGTTCAAGGAAGCTTTCAGCCTTTTCGACAAGGACGGAGATGGTTGCATCACAACCAA
AGAGCTTGGCACAGTGATGAGGTCACTCGGACAGAACCCGACAGAAGCAGAGCTTCAAGA
CATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGGACCGTAGACTTCCCCGAGTTCCTCAA
CCTGATGGCTCGTAAGATGAAGGACACGGACTCGGAGGAAGAGCTCAAAGAGGCTTTCAG
GGTTTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCCACTGCGGAGCTGAGACATGTGATGAC
CAATCTGGGGGAGAAGTTGACTGATGAAGAGGTCGATGAGATGATCAGAGAAGCTGATGT
TGATGGAGATGGTCAGATCAATTATGAAGAGTTTGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAGG
ATAACCATTTTTCTCAATCTCTCTGTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGATCATCAAAAGAAAA
AGTCTTTATGCTACTTTTTATTGAATTTAAACAAGTGTTTGACCGCTCATCATCATTCAC
CATCATACATCCGTTTTCGTGTTCTGTTGTTTGTTGGTCTTTTGTCATTTTCACCCCAAT
AATTTTATATTTTCTCTGTTAAATTTTTGGAAAACGTCGAAAGAATAAACAGTTTATTCT
GT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL7705Contig1 721 2 1 U
GAAGAACAAGGAGATGCCGCCTGAATACGCGGCTGTGTTGATCCAGAGGGCTTTCAGAGC
TTATCTGATTCGCCGCTCAAAAGCACTACGTGCTCTTCGTGATCTAGCTATCGCGAAGAC
CAAACTGAAGGAGCTAAGAGCTTCGTTCCACAACTTCAACTACCGTCGCGTGATCTCTCG
TGATGCAGAGGAACGCCAGAAGTTCTCTGAAAAGATCATTGTCCTCCTCCTCACTGTTGA
TGCCATAGAGGGAGTTGATGTAATGGTTCGAGGAGCAAAGAGATCAATGGTGGATGAGCT
GGAAGCAATGCTGGAGGTTGTAGACCCGCAACCGCAGGGGAAATCATTGTCGATGAGGAG
AAGAACATTTGATATGCCAGACAGTATGATCCGCAATGAAATTGCAGAGGGAGTGACTCA
GATTGTGCAAATGCTTGAAACCGAAGAAGAGTGATGGAATCTATGTGTGTACGTGATTCA
GAGGCTTGTTTTGTTGTGTCTTGGAATAATTAATTAGCCTCTTTTTGTTTTGCTTAGTGT
CTTGAGAATATTTCTAATTATGCAGAGAACAAAAATAGTGGGAGTGTCTGTTTATCAGTC
TCATTCCTCGAATCTTCTCTCTGGTGTCTTCGTAGTGTGGTTTGTTCTATCAATTTATGT
GTAATCCTTTGTGTTCCCAAACCCTGTAGACTCTTGTTTCTCAAATTGCTTATGTTTGAT
T


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RR2B518JQ C 1
AF RR2B518TF U 1
BS 1 721 RR2B518TF

RD RR2B518JQ 721 0 0
GAAGAACAAGGAGATGCCGCCTGAATACGCGGCTGTGTTGATCCAGAGGGCTTTCAGAGC
TTATCTGATTCGCCGCTCAAAAGCACTACGTGCTCTTCGTGATCTAGCTATCGCGAAGAC
CAAACTGAAGGAGCTAAGAGCTTCGTTCCACAACTTCAACTACCGTCGCGTGATCTCTCG
TGATGCAGAGGAACGCCAGAAGTTCTCTGAAAAGATCATTGTCCTCCTCCTCACTGTTGA
TGCCATAGAGGGAGTTGATGTAATGGTTCGAGGAGCAAAGAGATCAATGGTGGATGAGCT
GGAAGCAATGCTGGAGGTTGTAGACCCGCAACCGCAGGGGAAATCATTGTCGATGAGGAG
AAGAACATTTGATATGCCAGACAGTATGATCCGCAATGAAATTGCAGAGGGAGTGACTCA
GATTGTGCAAATGCTTGAAACCGAAGAAGAGTGATGGAATCTATGTGTGTACGTGATTCA
GAGGCTTGTTTTGTTGTGTCTTGGAATAATTAATTAGCCTCTTTTTGTTTTGCTTAGTGT
CTTGAGAATATTTCTAATTATGCAGAGAACAAAAATAGTGGGAGTGTCTGTTTATCAGTC
TCATTCCTCGAATCTTCTCTCTGGTGTCTTCGTAGTGTGGTTTGTTCTATCAATTTATGT
GTAATCCTTTGTGTTCCCAAACCCTGTAGACTCTTGTTTCTCAAATTGCTTATGTTTGAT
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RR2B518TF 721 0 0
GAAGAACAAGGAGATGCCGCCTGAATACGCGGCTGTGTTGATCCAGAGGGCTTTCAGAGC
TTATCTGATTCGCCGCTCAAAAGCACTACGTGCTCTTCGTGATCTAGCTATCGCGAAGAC
CAAACTGAAGGAGCTAAGAGCTTCGTTCCACAACTTCAACTACCGTCGCGTGATCTCTCG
TGATGCAGAGGAACGCCAGAAGTTCTCTGAAAAGATCATTGTCCTCCTCCTCACTGTTGA
TGCCATAGAGGGAGTTGATGTAATGGTTCGAGGAGCAAAGAGATCAATGGTGGATGAGCT
GGAAGCAATGCTGGAGGTTGTAGACCCGCAACCGCAGGGGAAATCATTGTCGATGAGGAG
AAGAACATTTGATATGCCAGACAGTATGATCCGCAATGAAATTGCAGAGGGAGTGACTCA
GATTGTGCAAATGCTTGAAACCGAAGAAGAGTGATGGAATCTATGTGTGTACGTGATTCA
GAGGCTTGTTTTGTTGTGTCTTGGAATAATTAATTAGCCTCTTTTTGTTTTGCTTAGTGT
CTTGAGAATATTTCTAATTATGCAGAGAACAAAAATAGTGGGAGTGTCTGTTTATCAGTC
TCATTCCTCGAATCTTCTCTCTGGTGTCTTCGTAGTGTGGTTTGTTCTATCAATTTATGT
GTAATCCTTTGTGTTCCCAAACCCTGTAGACTCTTGTTTCTCAAATTGCTTATGTTTGAT
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL7706Contig1 806 2 6 U
GGATTTTCACTCGTCTCGCCGCAAGCTTTTCTCTTTGACATTCATCTGAGGTGAAGAAAT
GAAGCACAACAATGTCATCCCCAATGGTCACTTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATGTCAA
GACTTGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGGAGAAGAGTTGCGAGACAAAAGAAGGC
AGTGAAGATCTTCCCCCGTCCTACTGCTGGACCTCTCCGCCCTGTTGTGCATGGTCAGAC
TCTCAAGTACAACATGAAAGTCAGAACCGGTAAAGGTTTCACTCTTGAAGAGCTCAAGTC
TGCTGGAATCCCCAAGAAGTTGGCACCAACCATAGGTATCTCTGTTGACCATCGTCGCAA
GAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAGGCTCAAAACCTACAAGGCTAAGT
TGGTCATCTTCCCTCGTCGTGTCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGACTCTACTGCAGAAGAGT
TGGCCAATGCCACTCAAGTCCAAGGGGACTACATGCCTATAGTCCGTGAGAAGCAAGCAA
CGGAGCTTGTGAAGCTTACCGCTGAGATGAAATCGTTCAAGGCTTATGACAAGATCCGTC
TAGAGCGCACAAACAAGAGACACGCCGGTGCTAGGGCCAAGAGAGCTGCTGATGCTGAGA
AGGAAGAGAAGAAGTAAGAGAAGCCGTAGAAGAAACTCTTTTTATCTTGTCATCGTTTGA
ATCTCAGTTTTTGTGTATCAGACTGGTTTTTTCTTCAGATTTTTGCAATTACTTATCTGG
ATTTAAGGAAAACATCCTTCTACATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F438TF U 1
AF RR2F438JQ C 57
BS 1 581 RR2F438TF
BS 582 582 RR2F438JQ
BS 583 615 RR2F438TF
BS 616 616 RR2F438JQ
BS 617 626 RR2F438TF
BS 627 806 RR2F438JQ

RD RR2F438TF 630 0 0
GGATTTTCACTCGTCTCGCCGCAAGCTTTTCTCTTTGACATTCATCTGAGGTGAAGAAAT
GAAGCACAACAATGTCATCCCCAATGGTCACTTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATGTCAA
GACTTGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGGAGAAGAGTTGCGAGACAAAAGAAGGC
AGTGAAGATCTTCCCCCGTCCTACTGCTGGACCTCTCCGCCCTGTTGTGCATGGTCAGAC
TCTCAAGTACAACATGAAAGTCAGAACCGGTAAAGGTTTCACTCTTGAAGAGCTCAAGTC
TGCTGGAATCCCCAAGAAGTTGGCACCAACCATAGGTATCTCTGTTGACCATCGTCGCAA
GAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAGGCTCAAAACCTACAAGGCTAAGT
TGGTCATCTTCCCTCGTCGTGTCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGACTCTACTGCAGAAGAGT
TGGCCAATGCCACTCAAGTCCAAGGGGACTACATGCCTATAGTCCGTGAGAAGCAAGCAA
CGGAGCTTGTGAAGCTTACCGCTGAGATGAAATCGTTCAAG*CTTATGACAAGATCCGTC
TAGAGCGCACAAACA*GAGACACGCC
CGTG

QA 1 626 1 626
DS 

RD RR2F438JQ 750 0 0
AAATGAAGCACAACAATGTCATCCCCAATGGTCACTTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATG
TCAAGACTTGGTTCAACCAGC*TGCCAGGAAAACCAGGAGAAGAGTTGCGAGACAAAAGA
AGGCAGTGAAGATCTTCCCCCGTCCTACTGCTGGACCTCTCCGCCCTGTTGTGCATGGTC
AGACTCTCAAGTACAACATGAAAGTCAGAACCGGTAAAGGTTTCACTCTTGAAGAGCTCA
AGTCTGCTGGAATCCCCAAGAAGTTGGCACCAACCATAGGTATCTCTGTTGACCATCGTC
GCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAGGCTCAAAACCTACAAGGCT
AAGTTGGTCATCTTCCCTCGTCGTGTCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGACTCTACTGCAGAA
GAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAAGGGGACTACATGCCTATAGTCCGTGAGAAGCAA
GCAACGGAGCTTGTGAAGCTTACCGCTGAGATGAAATCGTTCAAGGCTTATGACAAGATC
CGTCTAGAGCGCACAAACAAGAGACACGCCGGTGCTAGGGCCAAGAGAGCTGCTGATGCT
GAGAAGGAAGAGAAGAAGTAAGAGAAGCCGTAGAAGAAACTCTTTTTATCTTGTCATCGT
TTGAATCTCAGTTTTTGTGTATCAGACTGGTTTTTTCTTCAGATTTTTGCAATTACTTAT
CTGGATTTAAGGAAAACATCCTTCTACATT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL7707Contig1 827 2 2 U
GGTGGTGCTGCTTTGAGTGTTAAGGAGGTATCTGGAAAACCGGTAAAACTGGTAGGACGT
GGAGAGAGAATGGAGGATCTTGAGCCCTTTTATCCCAATAGAATGGCTGGACGAATTCTA
GGAATGGGAGATGTGCTTTCGTTTGTAGAGAAGGCACAAGAAGTTATGCGTCAAGAAGAT
GCTGAGGATCTACAGAAGAAGATAATGAGTGAGAAGTTCGACTTCAACGATTTGCTAAAG
CAGACGCGTGCTGTTGCCAAGATAGGTTCGGTGTCACGTGTTCTTGGAATGATTCCTGGG
ATGGGGAAAGTGAGTCCAGCGCAGATCGGAGAAGCTGAGAAAAGTCTTGTAATAATGGAA
GCTATGATCGAAGCCATGACTCCTGAGGAAAAGGAGAAGCCAGAGTTACTAGCAGAGTCT
CCAGAGAGAAGAAAAAGAATAGCTAAAGATTCAGGAAAGACAGAACGACAGGTGAGCCAA
CTTGTAGCACAAATATTCCAAATGAGAGTGAAGATGAAGAACTTGATGGGAGCAATGGAA
GGAGGAGCGAATCCTGCATTCACCGATCTCGCTGACGCAATGAAAGCAGAACAAAAGGGT
CTACCTGGAACCGCAAGGAGGAAGAAAAAGGCGGAATCAAGGAAGAAATTTGTGGAATCA
GCATCAAGCAAGCCAGGTCCCCGTGGCTTTGGCTCTGGCAACTAAAACAGCTGTTTCAGT
CTTTGGGACACTTGCAACTCAAGAATCCTAACTTGATCAATCTCAATGATGGATTCATTT
TTTGTATTGTTATGTTTAATGAATATGGTATTCATCAACTGGAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B665TF U 1
AF RR2B665JQ C 186
BS 1 794 RR2B665TF
BS 795 827 RR2B665JQ

RD RR2B665TF 794 0 0
GGTGGTGCTGCTTTGAGTGTTAAGGAGGTATCTGGAAAACCGGTAAAACTGGTAGGACGT
GGAGAGAGAATGGAGGATCTTGAGCCCTTTTATCCCAATAGAATGGCTGGACGAATTCTA
GGAATGGGAGATGTGCTTTCGTTTGTAGAGAAGGCACAAGAAGTTATGCGTCAAGAAGAT
GCTGAGGATCTACAGAAGAAGATAATGAGTGAGAAGTTCGACTTCAACGATTTGCTAAAG
CAGACGCGTGCTGTTGCCAAGATAGGTTCGGTGTCACGTGTTCTTGGAATGATTCCTGGG
ATGGGGAAAGTGAGTCCAGCGCAGATCGGAGAAGCTGAGAAAAGTCTTGTAATAATGGAA
GCTATGATCGAAGCCATGACTCCTGAGGAAAAGGAGAAGCCAGAGTTACTAGCAGAGTCT
CCAGAGAGAAGAAAAAGAATAGCTAAAGATTCAGGAAAGACAGAACGACAGGTGAGCCAA
CTTGTAGCACAAATATTCCAAATGAGAGTGAAGATGAAGAACTTGATGGGAGCAATGGAA
GGAGGAGCGAATCCTGCATTCACCGATCTCGCTGACGCAATGAAAGCAGAACAAAAGGGT
CTACCTGGAACCGCAAGGAGGAAGAAAAAGGCGGAATCAAGGAAGAAATTTGTGGAATCA
GCATCAAGCAAGCCAGGTCCCCGTGGCTTTGGCTCTGGCAACTAAAACAGCTGTTTCAGT
CTTTGGGACACTTGCAACTCAAGAATCCTAACTTGATCAATCTCAATGATGGATTCATTT
TTTGTATTGTTATG

QA 1 794 1 794
DS 

RD RR2B665JQ 642 0 0
GGATCTACAGAAGAAGATAATGAGTGAGAAGTTCGACTTCAACGATTTGCTAAAGCAGAC
GCGTGCTGTTGCCAAGATAGGTTCGGTGTCACGTGTTCTTGGAATGATTCCTGGGATGGG
GAAAGTGAGTCCAGCGCAGATCGGAGAAGCTGAGAAAAGTTTTGTAATAATGGAAGCTAT
GATCGAAGCCATGACTCCTGAGGAAAAGGAGAAGCCAGAGTTACTAGCAGAGTTTCCAGA
GAGAAGAAAAAGAATAGCTAAAGATTCAGGAAAGACAGAACGACAGGTGAGCCAACTTGT
AGCACAAATATTCCAAATGAGAGTGAAGATGAAGAACTTGATGGGAGCAATGGAAGGAGG
AGCGAATCCTGCATTCACCGATCTCGCTGACGCAATGAAAGCAGAACAAAAGGGTTTACC
TGGAACCGCAAGGAGGAAGAAAAAGGCGGAATCAAGGAAGAAATTTGTGGAATCAGCATC
AAGCAAGCCAGGTCCCCGTGGCTTTGGCTTTGGCAACTAAAACAGCTGTTTCAGTTTTTG
GGACACTTGCAACTCAAGAATCCTAACTTGATCAATTTCAATGATGGATTCATTTTTTGT
ATTGTTATGTTTAATGAATATGGTATTCATCAACTGGAAAAG

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL7708Contig1 876 2 2 U
GATACCTTTCAAGAGTTGGAGGAGAAGGAGTTGTTGTCAAAAGTTTGTCCTGTTTTGACA
ATTGGTCCGACGATTCCATCGATGTACTTAGACCAAAGGATCAAATCAGACACAGACTAC
GATCTGAATCTCTTTGATTCGAAAGACACTGCCTTCTGCACTACCTGGCTCAACACAGAG
CCACAAGGGTCTGTGGTGTATGTAGCATTCGGGAGCATTGCTAAGCTGAACAATGTGCAG
ATGGAGGAACTTGCTTCAGCAGTAAGCGACTTCAGCTTCCTGTGGGTTGTCAGAGATTCA
GAGGAGGCAAAACTGCCATCAGGGTTTCTTGAGACACTCGATAAAGACAAGTGCTTGGTC
TTGAAATGGAGTCCTCAGCTTGGCGTTCTATCAAACAAAGCCATTGGTTGTTTCTTGACT
CATTGTGGCTGGAACTCAACTATGGAGGCATTAACCTTCGGGGTTCCCATGGTGGCTATG
CCTCAATGGACCGATCAACCTATGGACGCAAAGTACATACAAGATGTGTGGAAGGCTGGA
GTCCGTGTAAAGATAGACAATGAGAGCGGGATTGCTAAGAGAGAGGAGATTGAGTTTAGC
ATTAAGGAAGTGATGGAAGGAGAGAAGAGCAAAGAGATGAAGGAGAATGCAGAGAAATGG
AGAGACTTGGCTGTCAAGTCACTCAGTGAAGGAGGCTCTACAGATGTTAACATCGACACA
TTTGTAACAACAGTCCAGAACAAATAAGTTATCATGAAGTAGCGAAGATTTCTTTTATAG
TGTCTTGTTGAGTCAGTATTTCATTCAGTGCATGTAATCTTTAAACTCATCCTTCATCTG
GGTTACTTTCCAATTTAAAAAATAAATAAAAAGACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA16TF U 1
AF RR2BA16JQ C 75
BS 1 630 RR2BA16TF
BS 631 876 RR2BA16JQ

RD RR2BA16TF 630 0 0
GATACCTTTCAAGAGTTGGAGGAGAAGGAGTTGTTGTCAAAAGTTTGTCCTGTTTTGACA
ATTGGTCCGACGATTCCATCGATGTACTTAGACCAAAGGATCAAATCAGACACAGACTAC
GATCTGAATCTCTTTGATTCGAAAGACACTGCCTTCTGCACTACCTGGCTCAACACAGAG
CCACAAGGGTCTGTGGTGTATGTAGCATTCGGGAGCATTGCTAAGCTGAACAATGTGCAG
ATGGAGGAACTTGCTTCAGCAGTAAGCGACTTCAGCTTCCTGTGGGTTGTCAGAGATTCA
GAGGAGGCAAAACTGCCATCAGGGTTTCTTGAGACACTCGATAAAGACAAGTGCTTGGTC
TTGAAATGGAGTCCTCAGCTTGGCGTTCTATCAAACAAAGCCATTGGTTGTTTCTTGACT
CATTGTGGCTGGAACTCAACTATGGAGGCATTAACCTTCGGGGTTCCCATGGTGGCTATG
CCTCAATGGACCGATCAACCTATGGACGCAAAGTACATACAAGATGTGTGGAAGGCTGGA
GTCCGTGTAAAGATAGACAATGAGAGCGGGATTGCTAAGAGAGAGGAGATTGAGTTTAGC
ATTAAGGAAGTGATGGAAGGAGAGAAGAGC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RR2BA16JQ 802 0 0
TCCATCGATGTACTTAGACCAAAGGATCAAATCAGACACAGACTACGATCTGAATCTCTT
TGATTCGAAAGACACTGCCTTCTGCACTACCTGGCTCAACACAGAGCCACAAGGGTCTGT
GGTGTATGTAGCATTCGGGAGCATTGCTAAGCTGAACAATGTGCAGATGGAGGAACTTGC
TTCAGCAGTAAGCGACTTCAGCTTCCTGTGGGTTGTCAGAGATTCAGAGGAGGCAAAACT
GCCATCAGGGTTTCTTGAGACACTCGATAAAGACAAGTGCTTGGTCTTGAAATGGAGTCC
TCAGCTTGGCGTTCTATCAAACAAAGCCATTGGTTGTTTCTTGACTCATTGTGGCTGGAA
CTCAACTATGGAGGCATTAACCTTCGGGGTTCCCATGGTGGCTATGCCTCAATGGACCGA
TCAACCTATGGACGCAAAGTACATACAAGATGTGTGGAAGGCTGGAGTCCGTGTAAAGAT
AGACAATGAGAGCGGGATTGCTAAGAGAGAGGAGATTGAGTTTAGCATTAAGGAAGTGAT
GGAAGGAGAGAAGAGCAAAGAGATGAAGGAGAATGCAGAGAAATGGAGAGACTTGGCTGT
CAAGTCACTCAGTGAAGGAGGCTCTACAGATGTTAACATCGACACATTTGTAACAACAGT
CCAGAACAAATAAGTTATCATGAAGTAGCGAAGATTTCTTTTATAGTGTCTTGTTGAGTC
AGTATTTCATTCAGTGCATGTAATCTTTAAACTCATCCTTCATCTGGGTTACTTTCCAAT
TTAAAAAATAAATAAAAAGACA

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL7709Contig1 743 2 2 U
GGAATACACAATGAAAATGCTGATGTACATTGTTGTGTTTGTTATTCTCTTCAATGGTTG
CATGGCCAACAAAGTAGCAAATTCTCTGATTCAAAAATCTTGCAAAAACGTTTCAGAATT
TTTATTTGTGGAATCTATTCCACATTTCGAAAAGGATTGCATTGCATCTCTCAAAGAGAA
TCCAGAGAGCCAGAAAGCGAGAAATATTGATGATCTGATCTTGGTAGGAACGAATAACGC
CATATCATACTTAAAAAACGCGGACAGAACTGTGGAGAAGATTATAAAAGAGAAGAAATA
TAAGAGTAGCCTTAGTAAGAAGTTTTTGGAAGAGTGCCTTAAGCTTTACTCCAAGGGCGC
TCACATGTTAAACTCAGGTTTGAACAACCTCAAAAAGGGGAACTTCACGAAGGCTCAATT
TGATATTGGTGATGCAGTTGAAGCACCAATATTTTGCGAGTTGAAATTCAACGGCGACAA
TCAACAGATATCTCCCGTTAAAAAGAGAATAATCTTCTCTTAACAATGATCAACATTCCT
CGGGTGTTTATTATGATATATCATCATTAGTCTAGTGGATTGATAGGCCAGATTTTAAAA
AGAGGTGTTAAGTGACGTTTACTGAAAAAATTACGAAAATTATAAATAGTTCTCATTAAT
AATTTTGTTTTGTATGTTAAATTCTTCTTTGGTTGATTATATAATAAAATGATATTTTCT
GGGTCAAAGGAAATAACTTGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GC61TF U 1
AF RR2GC61JQ C 138
BS 1 693 RR2GC61TF
BS 694 743 RR2GC61JQ

RD RR2GC61TF 693 0 0
GGAATACACAATGAAAATGCTGATGTACATTGTTGTGTTTGTTATTCTCTTCAATGGTTG
CATGGCCAACAAAGTAGCAAATTCTCTGATTCAAAAATCTTGCAAAAACGTTTCAGAATT
TTTATTTGTGGAATCTATTCCACATTTCGAAAAGGATTGCATTGCATCTCTCAAAGAGAA
TCCAGAGAGCCAGAAAGCGAGAAATATTGATGATCTGATCTTGGTAGGAACGAATAACGC
CATATCATACTTAAAAAACGCGGACAGAACTGTGGAGAAGATTATAAAAGAGAAGAAATA
TAAGAGTAGCCTTAGTAAGAAGTTTTTGGAAGAGTGCCTTAAGCTTTACTCCAAGGGCGC
TCACATGTTAAACTCAGGTTTGAACAACCTCAAAAAGGGGAACTTCACGAAGGCTCAATT
TGATATTGGTGATGCAGTTGAAGCACCAATATTTTGCGAGTTGAAATTCAACGGCGACAA
TCAACAGATATCTCCCGTTAAAAAGAGAATAATCTTCTCTTAACAATGATCAACATTCCT
CGGGTGTTTATTATGATATATCATCATTAGTCTAGTGGATTGATAGGCCAGATTTTAAAA
AGAGGTGTTAAGTGACGTTTACTGAAAAAATTACGAAAATTATAAATAGTTCTCATTAAT
AATTTTGTTTTGTATGTTAAATTCTTCTTTGGT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2GC61JQ 606 0 0
TTCCACATTTCGAAAAGGATTGCATTGCATCTCTCAAAGAGAATCCAGAGAGCCAGAAAG
CGAGAAATATTGATGATCTGATCTTGGTAGGAACGAATAACGCCATATCATACTTAAAAA
ACGCGGACAGAACTGTGGAGAAGATTATAAAAGAGAAGAAATATAAGAGTAGCCTTAGTA
AGAAGTTTTTGGAAGAGTGCCTTAAGCTTTACTCCAAGGGCGCTCACATGTTAAACTCAG
GTTTGAACAACCTCAAAAAGGGGAACTTCACGAAGGCTCAATTTGATATTGGTGATGCAG
TTGAAGCACCAATATTTTGCGAGTTGAAATTCAACGGCGACAATCAACAGATATCTCCCG
TTAAAAAGAGAATAATCTTCTCTTAACAATGATCAACATTCCTCGGGTGTTTATTATGAT
ATATCATCATTAGTCTAGTGGATTGATAGGCCAGATTTTAAAAAGAGGTGTTAAGTGACG
TTTACTGAAAAAATTACGAAAATTATAAATAGTTCTCATTAATAATTTTGTTTTGTATGT
TAAATTCTTCTTTGGTTGATTATATAATAAAATGATATTTTCTGGGTCAAAGGAAATAAC
TTGTAT

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL7710Contig1 719 2 2 U
GGGTAAAACCCTAGCTCAAAGAATCACATTTCTGATTTCTCCCGATACAGTCACCAGAAG
AAATGGCTTGGCGCAATGCAGGATCTGCTGCCCGTTCTTTCGTCTCCGCCACCGCAAGAG
CACCGTCTCTCCGTTCTCCTACGGCGGCGCTTCCTCGCCTCCGTCCTTCCCCATCCTCAT
CTTTACCTGGCCGTCGCTTCTCCTTTTCATCTCCTTCTAGGAACCTAGGAGCGCTTGGTT
GCACGCAGTCTTTCTTGCCTCTGTACAGTGTTGTGGCTGCTTCTCAGCTCACCTCTCATC
TCAATGTTAATTTGCGTGCTTTCTGCGAGCTACCAAACGGTACTTGAAGAGGCAGAGGAG
CTTGGTATAATGCAACAGTGCATGCATCAATTACTTTGAAGGGGGGTGTGAGAGATCCAA
AGATTGGTTTACCTCAGAAAAAAACTTAAATCATTCTGTTACTTTTGTTTAGAAGTTTTC
AGTTCCATATTGTGTGGGATCCCTTTGGTTATTAATAGCTGTAGAGCTTTTCGTTTCTTG
GCACGATATTTTCTCTCCGAGATCTTTTTGTTTCGGAAAAACGAATAAAATTCTGAAACT
ACTCAGCATTGTTTAATAAGTGTAGTGGATTACAACTAAAAGCGGGGCTGTTCCTAATTC
AATATTTGATGGTGGGTATTTATCAGTGTGAAGTATTTTGTGTTGAAAATTATGTCTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2GW80JQ C 1
AF RR2GW80TF U 1
BS 1 717 RR2GW80TF
BS 718 719 RR2GW80JQ

RD RR2GW80JQ 719 0 0
GGGTAAAACCCTAGCTCAAAGAATCACATTTCTGATTTCTCCCGATACAGTCACCAGAAG
AAATGGCTTGGCGCAATGCAGGATCTGCTGCCCGTTCTTTCGTCTCCGCCACCGCAAGAG
CACCGTCTCTCCGTTCTCCTACGGCGGCGCTTCCTCGCCTCCGTCCTTCCCCATCCTCAT
CTTTACCTGGCCGTCGCTTCTCCTTTTCATCTCCTTCTAGGAACCTAGGAGCGCTTGGTT
GCACGCAGTCTTTCTTGCCTCTGTACAGTGTTGTGGCTGCTTCTCAGCTCACCTCTCATC
TCAATGTTAATTTGCGTGCTTTCTGCGAGCTACCAAACGGTACTTGAAGAGGCAGAGGAG
CTTGGTATAATGCAACAGTGCATGCATCAATTACTTTGAAGGGGGGTGTGAGAGATCCAA
AGATTGGTTTACCTCAGAAAAAAACTTAAATCATTCTGTTACTTTTGTTTAGAAGTTTTC
AGTTCCATATTGTGTGGGATCCCTTTGGTTATTAATAGCTGTAGAGCTTTTCGTTTCTTG
GCACGATATTTTCTCTCCGAGATCTTTTTGTTTCGGAAAAACGAATAAAATTCTGAAACT
ACTCAGCATTGTTTAATAAGTGTAGTGGATTACAACTAAAAGCGGGGCTGTTCCTAATTC
AATATTTGATGGTGGGTATTTATCAGTGTGAAGTATTTTGTGTTGAAAATTATGTCTAC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2GW80TF 717 0 0
GGGTAAAACCCTAGCTCAAAGAATCACATTTCTGATTTCTCCCGATACAGTCACCAGAAG
AAATGGCTTGGCGCAATGCAGGATCTGCTGCCCGTTCTTTCGTCTCCGCCACCGCAAGAG
CACCGTCTCTCCGTTCTCCTACGGCGGCGCTTCCTCGCCTCCGTCCTTCCCCATCCTCAT
CTTTACCTGGCCGTCGCTTCTCCTTTTCATCTCCTTCTAGGAACCTAGGAGCGCTTGGTT
GCACGCAGTCTTTCTTGCCTCTGTACAGTGTTGTGGCTGCTTCTCAGCTCACCTCTCATC
TCAATGTTAATTTGCGTGCTTTCTGCGAGCTACCAAACGGTACTTGAAGAGGCAGAGGAG
CTTGGTATAATGCAACAGTGCATGCATCAATTACTTTGAAGGGGGGTGTGAGAGATCCAA
AGATTGGTTTACCTCAGAAAAAAACTTAAATCATTCTGTTACTTTTGTTTAGAAGTTTTC
AGTTCCATATTGTGTGGGATCCCTTTGGTTATTAATAGCTGTAGAGCTTTTCGTTTCTTG
GCACGATATTTTCTCTCCGAGATCTTTTTGTTTCGGAAAAACGAATAAAATTCTGAAACT
ACTCAGCATTGTTTAATAAGTGTAGTGGATTACAACTAAAAGCGGGGCTGTTCCTAATTC
AATATTTGATGGTGGGTATTTATCAGTGTGAAGTATTTTGTGTTGAAAATTATGTCT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL7711Contig1 841 2 6 U
GGAGTGAAGATGGTGATGGATAGAGAGAGAGGAGAAAAAGAATAATGGAAAGAGGATCAG
ATCGTTTAGCTTTAATCACTGGCCAAGTACATAACTTTGATCCTTCCTCACCGTCGTCTT
CTTCCTCATCATCAGCTTCACACCAACGTACATTCAGCGAATCTTTCATGCCACAGGCTC
AATCTGATCGTCATCTGATTCAAGAAAGCCCGTCTCTTAAGTATCATTTCAAAGAGGAAG
TAAAGGCAAGAGAAGAACCAAAACTCTCGACCATACTTCACAAACCCATAAAAAGTGAAC
CAACAAAACCAGAAGAAGCAAGATCAGCGAAGAGTCAAAGTCAGCGACCTAGGAGTTCCT
TCGGCTCCAAGAAACTCAATGCTAGCATCATAAGCTCAGAAAGAAGTCGGAGTTTGAGCT
CTCTCACAATAGCTGCGTTTGTGATTTTACTCCCGGGATTTAACATCATAAGATCAGACA
CGATCTTAACTTTGAGACCTCTTTGGTTGCTTCTGCTTACTGATTGTGCTATAGTAGTGT
CTCATCTCACCATGGAAGCTTCTGGAGGAGGATCGAGCCATGAAATTGAAGAAGAAGTTA
AGAGTAAAGATGGTAATAATAGAGAAAATTGGTCTGATGCAGAGAAGCTTCTAGAAAGAG
GAGTTGTTCTGTATCAAGTTCTTCGTGGAATGTTCATAGATTGTAGTCTTTATATGGTGG
TTGTTATTTGTGGAGCCTGTCTTACATGATTTTTTTCAATTTTTTTTTGTTTGATCTTTT
TATAAAATAAATATAATGTTTCTAAGAGACCTGATATTTCCTTACACAATTTTCGATTGG
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2BX03TF U 1
AF RR2BX03JQ C 43
BS 1 689 RR2BX03TF
BS 690 690 RR2BX03JQ
BS 691 736 RR2BX03TF
BS 737 737 RR2BX03JQ
BS 738 748 RR2BX03TF
BS 749 841 RR2BX03JQ

RD RR2BX03TF 748 0 0
GGAGTGAAGATGGTGATGGATAGAGAGAGAGGAGAAAAAGAATAATGGAAAGAGGATCAG
ATCGTTTAGCTTTAATCACTGGCCAAGTACATAACTTTGATCCTTCCTCACCGTCGTCTT
CTTCCTCATCATCAGCTTCACACCAACGTACATTCAGCGAATCTTTCATGCCACAGGCTC
AATCTGATCGTCATCTGATTCAAGAAAGCCCGTCTCTTAAGTATCATTTCAAAGAGGAAG
TAAAGGCAAGAGAAGAACCAAAACTCTCGACCATACTTCACAAACCCATAAAAAGTGAAC
CAACAAAACCAGAAGAAGCAAGATCAGCGAAGAGTCAAAGTCAGCGACCTAGGAGTTCCT
TCGGCTCCAAGAAACTCAATGCTAGCATCATAAGCTCAGAAAGAAGTCGGAGTTTGAGCT
CTCTCACAATAGCTGCGTTTGTGATTTTACTCCCGGGATTTAACATCATAAGATCAGACA
CGATCTTAACTTTGAGACCTCTTTGGTTGCTTCTGCTTACTGATTGTGCTATAGTAGTGT
CTCATCTCACCATGGAAGCTTCTGGAGGAGGATCGAGCCATGAAATTGAAGAAGAAGTTA
AGAGTAAAGATGGTAATAATAGAGAAAATTGGTCTGATGCAGAGAAGCTTCTAGAAAGAG
GAGTTGTTCTGTATCAAGTTCTTCGTGGA*TGTTCATAGATTGTAGTCTTTATATGGTGG
TTGTTATTTGTGGAGC*TGTCTTACATG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2BX03JQ 799 0 0
TAATGGAAAGAGGATCAGATCGTTTAGCTTTA*TCACTGGCCAAGTACATAACTTTGATC
CTTCCTCACCGTCGTCTTCTTCCTCATCATCAGCTTCACACCAACGTACATTCAGCGAAT
CTTTCATGCCACAGGCTCAATCTGATCGTCATCTGATTCAAGAAAGCCCGTCTCTTAAGT
ATCATTTCAAAGAGGAAGTAAAGGCAAGAGAAGAACCAAAACTCTCGACCATACTTCACA
AACCCATAAAAAGTGAACCAACAAAACCAGAAGAAGCAAGATCAGCGAAGAGTCAAAGTC
AGCGACCTAGGAGTTCCTTCGGCTCCAAGAAACTCAATGCTAGCATCATAAGCTCAGAAA
GAAGTCGGAGTTTGAGCTCTCTCACAATAGCTGCGTTTGTGATTTTACTCCCGGGATTTA
ACATCATAAGATCAGACACGATCTTAACTTTGAGACCTCTTTGGTTGCTTCTGCTTACTG
ATTGTGCTATAGTAGTGTCTCATCTCACCATGGAAGCTTCTGGAGGAGGATCGAGCCATG
AAATTGAAGAAGAAGTTAAGAGTAAAGATGGTAATAATAGAGAAAATTGGTCTGATGCAG
AGAAGCTTCTAGAAAGAGGAGTTGTTCTGTATCAAGTTCTTCGTGGAATGTTCATAGATT
GTAGTCTTTATATGGTGGTTGTTATTTGTGGAGCCTGTCTTACATGATTTTTTTCAATTT
TTTTTTGTTTGATCTTTTTATAAAATAAATATAATGTTTCTAAGAGACCTGATATTTCCT
TACACAATTTTCGATTGGG

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL7712Contig1 724 2 2 U
CTAAGAAAGCTGTATTGGAGCACTTGAGAAAGAAAATTGAAGTCTGTACTGAAAAGATCC
ATGCTGCTAAGTTGAAAGAAGATGAAGCCAGAAAGGCATATGAAGCAGCATCAAAACTTG
TCAAGGATGAAGAAGCAATAAAGCAGAGCCTTTGCGATGATTTAAACCGTCTGGTTCAAG
AAAGCAGCAATACTCAGTACGCCAGACTTGAGGAACTGAAAAGAAGACTAGAGGCGCTAA
ATCCAAACAGATCATCTACTTCTGTTCAGCAAGTCCATGAACCGGAGACTAAATCTGTAG
CCGACAGCTCAGCAGCAGCAGCCAATGCTAATCAGACTCATCCGGACAAACAAGAAAATA
ATCACGGGAAGGAAGAGGGAGGTAAAGAACAAGGACAGAGGCCTCCTGATGGAGAATCAA
AAGCGAAAAAGAAACCACAGATTCAAGGAAGGGGAAGAGGGGTTGGAATCATGAACAAAG
GCAGAGGAGGTTGGACAGGTGCTGGATTCGATGTGGATGGTAGAAACTGAAAAAGTTGGA
ATATATATATTACAATACACACATCCAAAAAGCTGGCATATGTTGTTACCAGGTAATCTC
TCTTCATCATTTAAATCGATGGACTTGTAGTTACAGAGACCCTCTTATTTACTCATATGT
GTTTTACTGAAAAGAAAAACCATTCATTCACATTTGGCTTTGTTTAGTTCAATCATTTTG
AGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2DF87TF U 1
AF RR2DF87JQ C 120
BS 1 349 RR2DF87TF
BS 350 724 RR2DF87JQ

RD RR2DF87TF 355 0 0
CTAAGAAAGCTGTATTGGAGCACTTGAGAAAGAAAATTGAAGTCTGTACTGAAAAGATCC
ATGCTGCTAAGTTGAAAGAAGATGAAGCCAGAAAGGCATATGAAGCAGCATCAAAACTTG
TCAAGGATGAAGAAGCAATAAAGCAGAGCCTTTGCGATGATTTAAACCGTCTGGTTCAAG
AAAGCAGCAATACTCAGTACGCCAGACTTGAGGAACTGAAAAGAAGACTAGAGGCGCTAA
ATCCAAACAGATCATCTACTTCTGTTCAGCAAGTCCATGAACCGGAGACTAAATCTGTAG
CCGACAGCTCAGCAGCAGCAGCCAATGCTAATCAGACTCATCCGGACAA
CAAGAA

QA 1 349 1 349
DS 

RD RR2DF87JQ 605 0 0
GTCAAGGATGAAGAAGCAATAAAGCAGAGCCTTTGCGATGATTTAAACCGTCTGGTTCAA
GAAAGCAGCAATACTCAGTACGCCAGACTTGAGGAACTGAAAAGAAGACTAGAGGCGCTA
AATCCAAACAGATCATCTACTTCTGTTCAGCAAGTCCATGAACCGGAGACTAAATCTGTA
GCCGACAGCTCAGCAGCAGCAGCCAATGCTAATCAGACTCATCCGGACAAACAAGAAAAT
AATCACGGGAAGGAAGAGGGAGGTAAAGAACAAGGACAGAGGCCTCCTGATGGAGAATCA
AAAGCGAAAAAGAAACCACAGATTCAAGGAAGGGGAAGAGGGGTTGGAATCATGAACAAA
GGCAGAGGAGGTTGGACAGGTGCTGGATTCGATGTGGATGGTAGAAACTGAAAAAGTTGG
AATATATATATTACAATACACACATCCAAAAAGCTGGCATATGTTGTTACCAGGTAATCT
CTCTTCATCATTTAAATCGATGGACTTGTAGTTACAGAGACCCTCTTATTTACTCATATG
TGTTTTACTGAAAAGAAAAACCATTCATTCACATTTGGCTTTGTTTAGTTCAATCATTTT
GAGTT

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL7713Contig1 751 2 3 U
GATTAAACATAAGAATAAAAAATCAATTGTTTCAGACAATTTTCTCTGTTTTATTGTGTT
AGATGGATGGACTCAATCATATCAGATACATCTCCACGCTAAATCTCTATTCTCAGTAGA
ACCAGAGAACGAGAAGGCAAACACAAGTTCTATTGATTCTTTTTAGTAGTGGGAGTGAAT
GATGATGGTGATGATGATGATTTAGAGCTCTGAATCTGATCATCTTTTGATGTTTTGATT
ATAAACAGAAGCGTTTCCACAAGCATCGCCAACACTAGTCCAAGAATCCCACCAGCAGCA
CTCAGAGCGGGGTTTCGGTTGAATAAGGCTCTGAAGGAAGCGTACCCAACCAGATATCCA
GTGAACATGGTAAGACCAACGTGTAAACCAAAACCGAACTGGTCCTTGTAAGAAGAAAAA
GGCTCTTCCACTTGTTTCCTAGGTGTGATATCTTTAACAAGCTCAGCATACTCCTTCCTC
TCCGCTATTTCTCTCAGCTTAACCAACCTCAGCTTCAGTTCTTCACTCTTTTCTCTGGGT
TTAGGGCTGGTGAAGACGAAATCTGAGCGGGAGAAGAGTCCCAACAAGTCCGGTCGGGTC
GAAGGATCGGATCCTGTCCATATAGCTCGGAGCAATTTGTACGGAACGATGTTCCGCGAG
CGCAGATCAGAAGCGATGTCTCTGAGTTCTTCGGAGAGACGATGTTCATCGCAGGCCAAC
GCGAGAAACGATTGGTTCGGTTCGGTTGCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A202JQ U 309
AF RR2A202TF C 1
BS 1 308 RR2A202TF
BS 309 515 RR2A202JQ
BS 516 751 RR2A202TF

RD RR2A202JQ 207 0 0
GGGGTTTCGGTTGAATAAGGCTCTGAAGGAAGCGTACCCAACCAGATATCCAGTGAACAT
GGTAAGACCAACGTGTAAACCAAAACCGAACTGGTCCTTGTAAGAAGAAAAAGGCTCTTC
CACTTGTTTCCTAGGTGTGATATCTTTAACAAGCTCAGCATACTCCTTCCTCTCCGCTAT
TTCTCTCAGCTTAACCAACCTCAGCTT

QA 1 207 1 207
DS 

RD RR2A202TF 751 0 0
GATTAAACATAAGAATAAAAAATCAATTGTTTCAGACAATTTTCTCTGTTTTATTGTGTT
AGATGGATGGACTCAATCATATCAGATACATCTCCACGCTAAATCTCTATTCTCAGTAGA
ACCAGAGAACGAGAAGGCAAACACAAGTTCTATTGATTCTTTTTAGTAGTGGGAGTGAAT
GATGATGGTGATGATGATGATTTAGAGCTCTGAATCTGATCATCTTTTGATGTTTTGATT
ATAAACAGAAGCGTTTCCACAAGCATCGCCAACACTAGTCCAAGAATCCCACCAGCAGCA
CTCAGAGCGGGGTTTCGGTTGAATAAGGCTCTGAAGGAAGCGTACCCAACCAGATATCCA
GTGAACATGGTAAGACCAACGTGTAAACCAAAACCGAGCTGGTCCTTGTAAGAGGAGAAA
GGCTCTTCGACTTGTTTCCTAGGTGTGATATCTTTAACAAGCTCAGCATACTCCTTCCTC
TCCGCTATTTCTCTCAGCTTAACCAACCTCAGCTTCAGTTCTTCACTCTTTTCTCTGGGT
TTAGGGCTGGTGAAGACGAAATCTGAGCGGGAGAAGAGTCCCAACAAGTCCGGTCGGGTC
GAAGGATCGGATCCTGTCCATATAGCTCGGAGCAATTTGTACGGAACGATGTTCCGCGAG
CGCAGATCAGAAGCGATGTCTCTGAGTTCTTCGGAGAGACGATGTTCATCGCAGGCCAAC
GCGAGAAACGATTGGTTCGGTTCGGTTGCGG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL7714Contig1 451 2 1 U
GGGAAGGGGAAATGGCGACGAAAGGCGGGGCGGCGGCGGCGTACCCTAGCGCAGCTCGGA
TATCTGATTCTCCATGTTACCATCAGTACTCTGCATCTCTGAAATGTCTTGAAGAATTTG
GATCAGACAAGAGTAAATGCCAGGATCATTTTGATGTGTACAAGGAATGCAAAAAGAAAG
AGAGGGAAGTTCGACTGGAACGCAATAAGACACGGTCATTGTTCTCCTGAGTGCACAGCG
CCGCGCAGTATGGATCCTCAAATGCCTTATTATATGTCCAAGCAAATAAATGAGTCGTCT
AGTTTCCTCTTTATTTCCTTTGCCTCTGAGAAGTGTTTTTTGTTTTGTTTTTGCATGCTG
TTATAAATAATCATTCTCAAGTGGAAAGTGTTTGTAAACGTTATTTGACTCGCACCTACA
TGTTACTTTTAAGAGAGATGGACTTATAATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BD16JQ C 1
AF RR2BD16TF U 1
BS 1 451 RR2BD16TF

RD RR2BD16JQ 451 0 0
GGGAAGGGGAAATGGCGACGAAAGGCGGGGCGGCGGCGGCGTACCCTAGCGCAGCTCGGA
TATCTGATTCTCCATGTTACCATCAGTACTCTGCATCTCTGAAATGTCTTGAAGAATTTG
GATCAGACAAGAGTAAATGCCAGGATCATTTTGATGTGTACAAGGAATGCAAAAAGAAAG
AGAGGGAAGTTCGACTGGAACGCAATAAGACACGGTCATTGTTCTCCTGAGTGCACAGCG
CCGCGCAGTATGGATCCTCAAATGCCTTATTATATGTCCAAGCAAATAAATGAGTCGTCT
AGTTTCCTCTTTATTTCCTTTGCCTCTGAGAAGTGTTTTTTGTTTTGTTTTTGCATGCTG
TTATAAATAATCATTCTCAAGTGGAAAGTGTTTGTAAACGTTATTTGACTCGCACCTACA
TGTTACTTTTAAGAGAGATGGACTTATAATT

QA 1 451 1 451
DS 

RD RR2BD16TF 451 0 0
GGGAAGGGGAAATGGCGACGAAAGGCGGGGCGGCGGCGGCGTACCCTAGCGCAGCTCGGA
TATCTGATTCTCCATGTTACCATCAGTACTCTGCATCTCTGAAATGTCTTGAAGAATTTG
GATCAGACAAGAGTAAATGCCAGGATCATTTTGATGTGTACAAGGAATGCAAAAAGAAAG
AGAGGGAAGTTCGACTGGAACGCAATAAGACACGGTCATTGTTCTCCTGAGTGCACAGCG
CCGCGCAGTATGGATCCTCAAATGCCTTATTATATGTCCAAGCAAATAAATGAGTCGTCT
AGTTTCCTCTTTATTTCCTTTGCCTCTGAGAAGTGTTTTTTGTTTTGTTTTTGCATGCTG
TTATAAATAATCATTCTCAAGTGGAAAGTGTTTGTAAACGTTATTTGACTCGCACCTACA
TGTTACTTTTAAGAGAGATGGACTTATAATT

QA 1 451 1 451
DS 



AS 1 2

CO CL7715Contig1 557 2 1 U
GGATACCCAAATCCACAGAGCAACCACATGACCGCACAATTTCCCAGATTATCTTCTTCT
ATCTATCATTCTTGTCAACATCTCTCAACATTCTATTTTTTATTTTGTTATAAGTTATAA
CGGTTGATTTCTATTTATTTTATTTTTCTATTTGACTCCATTAATATCTAAAAATCGAAA
TCCCAGACAAAAGCAATTTCACATCTTTACGCAATATATCAAACGTTTTAACATAAAGAT
TCGTGTCATTGCAAGACATCATCAACTTGTACTGAAACAAGGATGCAAGTTTCTCGTTGA
TCTCCCACAGACTTTTCTTTGAGATATAATATAATCTCTCAAGGGTCTGATTCAAATTCA
ATTCTCTGATCAGAAGTTTCCTCTGTTTCACTCCACAGGTACGAAAGCCTGTTCCTTTCT
CCTTCTGAAAACCTCCTCTGTTTTCATATTTCTTCAATCTGAAAATTCGTATTTTTAGAT
ACTTCTGTTCAATTTCATGATCTGGGTCTTCCAAACTCATTGATGGGTATTCCATGCACG
CTTTTGCAGACTAGGCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D833JQ C 1
AF RR2D833TF U 1
BS 1 557 RR2D833TF

RD RR2D833JQ 557 0 0
GGATACCCAAATCCACAGAGCAACCACATGACCGCACAATTTCCCAGATTATCTTCTTCT
ATCTATCATTCTTGTCAACATCTCTCAACATTCTATTTTTTATTTTGTTATAAGTTATAA
CGGTTGATTTCTATTTATTTTATTTTTCTATTTGACTCCATTAATATCTAAAAATCGAAA
TCCCAGACAAAAGCAATTTCACATCTTTACGCAATATATCAAACGTTTTAACATAAAGAT
TCGTGTCATTGCAAGACATCATCAACTTGTACTGAAACAAGGATGCAAGTTTCTCGTTGA
TCTCCCACAGACTTTTCTTTGAGATATAATATAATCTCTCAAGGGTCTGATTCAAATTCA
ATTCTCTGATCAGAAGTTTCCTCTGTTTCACTCCACAGGTACGAAAGCCTGTTCCTTTCT
CCTTCTGAAAACCTCCTCTGTTTTCATATTTCTTCAATCTGAAAATTCGTATTTTTAGAT
ACTTCTGTTCAATTTCATGATCTGGGTCTTCCAAACTCATTGATGGGTATTCCATGCACG
CTTTTGCAGACTAGGCG

QA 1 557 1 557
DS 

RD RR2D833TF 557 0 0
GGATACCCAAATCCACAGAGCAACCACATGACCGCACAATTTCCCAGATTATCTTCTTCT
ATCTATCATTCTTGTCAACATCTCTCAACATTCTATTTTTTATTTTGTTATAAGTTATAA
CGGTTGATTTCTATTTATTTTATTTTTCTATTTGACTCCATTAATATCTAAAAATCGAAA
TCCCAGACAAAAGCAATTTCACATCTTTACGCAATATATCAAACGTTTTAACATAAAGAT
TCGTGTCATTGCAAGACATCATCAACTTGTACTGAAACAAGGATGCAAGTTTCTCGTTGA
TCTCCCACAGACTTTTCTTTGAGATATAATATAATCTCTCAAGGGTCTGATTCAAATTCA
ATTCTCTGATCAGAAGTTTCCTCTGTTTCACTCCACAGGTACGAAAGCCTGTTCCTTTCT
CCTTCTGAAAACCTCCTCTGTTTTCATATTTCTTCAATCTGAAAATTCGTATTTTTAGAT
ACTTCTGTTCAATTTCATGATCTGGGTCTTCCAAACTCATTGATGGGTATTCCATGCACG
CTTTTGCAGACTAGGCG

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL7716Contig1 1181 2 2 U
GGGAAGGAGGGATCTACAATTTCGATCTGGAGGATCTGCTGAGAGCTTCGGCGGAGGTTT
TGGGGAAAGGAAGCGTGGGGACGTCTTATAAGGCGGTGCTTGAGGAAGGCACGACGGTGG
TTGTGAAGCGTTTGAAGGACGTGGCGGCGACCAAGAAGGAGTTCGAATCGCAGATGGAGA
TTGTCGGCAAAGTTAAACACCCGAATGTTGTTCCGTTGAGAGCTTATTATTACTCTAAAG
ATGAGAAGCTTCTTGTCTTTGATTTCATGCCCAACGGAAGCCTCTCTGCTCTTCTTCACG
GGAGCCGTGGATCGGGACGAACTCCGTTAGACTGGGATAACCGTATGAGAATAGCAATAA
CTGCAGCGAGAGGTTTAGCCCATCTTCATGTTTCAGCCAAATTGGTACACGGAAACATCA
AAGCCTCAAACATACTCCTACAACCAAACCAAGACACTTGCGTCTCTGACTATGGACTTA
ACCAACTGTTCAGTAACTCGAGTCCACCAAACCGTTTGGCGGGTTATCATGCTCCCGAAG
TTCTCGAGACACGGAAAGTAACTTTCAAATCAGATGTGTACAGTTTCGGGGTGTTGCTAC
TTGAACTGTTGACTGGCAAATCACCAAACCAGGCATCGCTTGGCGAAGAAGGCATTGATC
TGCCTCGGTGGGTGCTGTCTGTGGTTAGAGAAGAATGGACCGCTGAAGTGTTCGATGTTG
AGCTGATGCGGTACCACAACATTGAGGAAGAGATGGTTCAGCTTCATCAAATCGCAATGG
CTTGTGTCGCTACGGTTCCTGATCAACGACCGGTAATGCAGGAAGTGCTGAGAATGATTG
AGGATGTGAACAGAAGTGAAACAACCGATGACGGGTTAAGACAATCGTCTGATGACCCGT
CCAAAGGTTCAGAGGGTCAGACTCCTCCAGGGGAATCAAGGGCGCCACCACGTTCGGTCG
CGCCTTAGTATTAACTCAAAGCAGCTTTAGTTTGTGTGTGTTCACTTTCTCCTCAAAAGG
AGATAAAAAGAAAAGTGTGTTAGGTCTTTGTTGGGTTACGTTAAAGCAAAAAGGCTGGAC
CAGACCAGTGTGGCATTTGAACCAAGTTCTTAAAAGATGGCATCTCCCATCTATTTTTTT
CTTGATTTTTTCTTTATAAATACATTTCGAGATATTCTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB41TF U 1
AF RR2EB41JQ C 442
BS 1 647 RR2EB41TF
BS 648 1181 RR2EB41JQ

RD RR2EB41TF 647 0 0
GGGAAGGAGGGATCTACAATTTCGATCTGGAGGATCTGCTGAGAGCTTCGGCGGAGGTTT
TGGGGAAAGGAAGCGTGGGGACGTCTTATAAGGCGGTGCTTGAGGAAGGCACGACGGTGG
TTGTGAAGCGTTTGAAGGACGTGGCGGCGACCAAGAAGGAGTTCGAATCGCAGATGGAGA
TTGTCGGCAAAGTTAAACACCCGAATGTTGTTCCGTTGAGAGCTTATTATTACTCTAAAG
ATGAGAAGCTTCTTGTCTTTGATTTCATGCCCAACGGAAGCCTCTCTGCTCTTCTTCACG
GGAGCCGTGGATCGGGACGAACTCCGTTAGACTGGGATAACCGTATGAGAATAGCAATAA
CTGCAGCGAGAGGTTTAGCCCATCTTCATGTTTCAGCCAAATTGGTACACGGAAACATCA
AAGCCTCAAACATACTCCTACAACCAAACCAAGACACTTGCGTCTCTGACTATGGACTTA
ACCAACTGTTCAGTAACTCGAGTCCACCAAACCGTTTGGCGGGTTATCATGCTCCCGAAG
TTCTCGAGACACGGAAAGTAACTTTCAAATCAGATGTGTACAGTTTCGGGGTGTTGCTAC
TTGAACTGTTGACTGGCAAATCACCAAACCAGGCATCGCTTGGCGAA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RR2EB41JQ 740 0 0
AACCAAACCAAGACACTTGCGTCTCTGACTATGGACTTAACCAACTGTTCAGTAACTCGA
GTCCACCAAACCGTTTGGCGGGTTATCATGCTCCCGAAGTTCTCGAGACACGGAAAGTAA
CTTTCAAATCAGATGTGTACAGTTTCGGGGTGTTGCTACTTGAACTGTTGACTGGCAAAT
CACCAAACCAGGCATCGCTTGGCGAAGAAGGCATTGATCTGCCTCGGTGGGTGCTGTCTG
TGGTTAGAGAAGAATGGACCGCTGAAGTGTTCGATGTTGAGCTGATGCGGTACCACAACA
TTGAGGAAGAGATGGTTCAGCTTCATCAAATCGCAATGGCTTGTGTCGCTACGGTTCCTG
ATCAACGACCGGTAATGCAGGAAGTGCTGAGAATGATTGAGGATGTGAACAGAAGTGAAA
CAACCGATGACGGGTTAAGACAATCGTCTGATGACCCGTCCAAAGGTTCAGAGGGTCAGA
CTCCTCCAGGGGAATCAAGGGCGCCACCACGTTCGGTCGCGCCTTAGTATTAACTCAAAG
CAGCTTTAGTTTGTGTGTGTTCACTTTCTCCTCAAAAGGAGATAAAAAGAAAAGTGTGTT
AGGTCTTTGTTGGGTTACGTTAAAGCAAAAAGGCTGGACCAGACCAGTGTGGCATTTGAA
CCAAGTTCTTAAAAGATGGCATCTCCCATCTATTTTTTTCTTGATTTTTTCTTTATAAAT
ACATTTCGAGATATTCTAGC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL7717Contig1 739 2 3 U
GGAAGGATTCAATCATGAAGAATTGTGAGAGAATCGCCAATCTCGCTCCCGCAGGTTTGA
CGGTGGCACCACTTGTTGTGAATGTGAACCCGAACTTGAATGTTGTCCTTACGGCATGTC
TTACAGTTTACGTCGGTTGCTTTCGTTCCGTCAAGGATTCTCCTCCAACGGAGACGATGT
CGAAAGAGCATGCCATGCGTTTCCCATTGGTTGGGAGTGCTATGCTTCTCTCTCTTTTCT
TGTTGTTCAAGTTTCTCTCTAAGGACTTGGTCAATGCTGTGCTCACTGCTTACTTCTTTG
TTCTTGGCATCGTCGCTCTTTCGGCGACATTGTTACCTGCCATCAGCAGGTTTCTGCCAA
AACCATGGAATGATAATCTTATCGTCTGGCGTTTTCCTTATTTCAAATCATTGGAAGTAG
AGTTTACAAAGTCACAAGTTGTTGCGGGAATCCCTGGAACCTTCTTCTGCGCGTGGTACG
CTTGGAAGAAACATTGGCTGGCTAACAATATCCTTGGCCTCTCCTTCTGCATTCAGGGAA
TTGAGATGCTCTCTCTTGGATCATTCAAGACTGGTGCCATCCTTTTGGTAGGACTGTTTT
TCTATGATATATTCTGGGTTTTCTTCACCCCAGTTATGGTTAGTGTTGCCAAATCATTTG
ATGCACCGATAAAGCTTTTGTTCCCTACGGGGGATGCTCTAAGACCATACTCTATGCTAG
GGCTTGGTGATATTGTCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2BE02TF U 1
AF RR2FX28TF U 1
BS 1 28 RR2BE02TF
BS 29 29 RR2FX28TF
BS 30 739 RR2BE02TF

RD RR2BE02TF 739 0 0
GGAAGGATTCAATCATGAAGAATTGTGATAGAATCGCCAATCTCGCTCCCGCAGGTTTGA
CGGTGGCACCACTTGTTGTGAATGTGAACCCGAACTTGAATGTTGTCCTTACGGCATGTC
TTACAGTTTACGTCGGTTGCTTTCGTTCCGTCAAGGATTCTCCTCCAACGGAGACGATGT
CGAAAGAGCATGCCATGCGTTTCCCATTGGTTGGGAGTGCTATGCTTCTCTCTCTTTTCT
TGTTGTTCAAGTTTCTCTCTAAGGACTTGGTCAATGCTGTGCTCACTGCTTACTTCTTTG
TTCTTGGCATCGTCGCTCTTTCGGCGACATTGTTACCTGCCATCAGCAGGTTTCTGCCAA
AACCATGGAATGATAATCTTATCGTCTGGCGTTTTCCTTATTTCAAATCATTGGAAGTAG
AGTTTACAAAGTCACAAGTTGTTGCGGGAATCCCTGGAACCTTCTTCTGCGCGTGGTACG
CTTGGAAGAAACATTGGCTGGCTAACAATATCCTTGGCCTCTCCTTCTGCATTCAGGGAA
TTGAGATGCTCTCTCTTGGATCATTCAAGACTGGTGCCATCCTTTTGGTAGGACTGTTTT
TCTATGATATATTCTGGGTTTTCTTCACCCCAGTTATGGTTAGTGTTGCCAAATCATTTG
ATGCACCGATAAAGCTTTTGTTCCCTACGGGGGATGCTCTAAGACCATACTCTATGCTAG
GGCTTGGTGATATTGTCAT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2FX28TF 739 0 0
GGAAGGATTCAATCATGAAGAATTGTGAGAGAATCGCCAATCTCGCTCTCGCAGGTTTGA
CGGTGGCACCACTTGTTGTGAATGTGAACCCGAACTTGAATGTTGTCCTTACGGCATGTC
TTACAGTTTACGTCGGTTGCTTTCGTTCCGTCAAGGATTCTCCTCCAACGGAGACGATGT
CGAAAGAGCATGCCATGCGTTTCCCATTGGTTGGGAGTGCTGTGCTTCTCTCTCTTTTCT
TGTTGTTCAAGTTTCTCTCTAAGGACTTGGTCAATGCTGTGCTCACTGCTTACTTCTTTG
TTCTTGGCATCGTCGCTCTTTCGGCGACATTGTTACCTGCCATCAGCAGGTTTCTGCCAA
AACCATGGAATGATAATCTTATCGTCTGGCGTTTTCCTTATTTCAAATCATTGGAAGTAG
AGTTTACAAAGTCACAAGTTGTTGCGGGAATCCCTGGAACCTTCTTCTGCGCGTGGTACG
CTTGGAAGAAACATTGGCTGGCTAACAATATCCTTGGCCTCTCCTTCTGCATTCAGGGAA
TTGAGATGCTCTCTCTTGGATCATTCAAGACTGGTGCCATCCTTTTGGTAGGACTGTTTT
TCTATGATATATTCTGGGTTTTCTTCACCCCAGTTATGGTTAGTGTTGCCAAATCATTTG
ATGCACCGATAAAGCTTTTGTTCCCTACGGGG*ATGCTCTAAGACCATACTCTATGCTAG
G*CTTGGTGATATTGTCAT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL7718Contig1 472 2 1 U
GTGCACAATGTGTTCATCAAGAAGCTTTACAGGGAGAACTTGTTTGAGGAAATGCTCCAA
GAGACAGATGAGATAGCAGTTAAGAGGAAACGCACTCAAGAGACTCTCCACGTTCTTCAG
CAAGCTTACAGGACACTAGACGAGTTACCTTTGGAAGCAGAATCAGTGTGCAATCGTGGT
ACCGAGACAACAGGTGTGTCAAAACATCTGGATTTACCGACCTCTTCTTCCAAGTATACC
ACGAGCAATTCCTACACTGCATCTCCGGGTACAGGAAGAAGATCTAGAAGAGCTGGTGAT
CAACACCAAAACGGATATGGATTCTGGCATGATCCCAAATCAATATATCTGACTTTTGAT
AGACACATTTCATTCATTTAATGGTTCTTTAAGGTTTTGGAATTATTAAATTGTGTTGGC
AAAATGAATAATTTTTGATAGAAAATTGGTATACACTGGTTTTGGAGTCTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BA36JQ C 1
AF RR2BA36TF U 1
BS 1 472 RR2BA36TF

RD RR2BA36JQ 472 0 0
GTGCACAATGTGTTCATCAAGAAGCTTTACAGGGAGAACTTGTTTGAGGAAATGCTCCAA
GAGACAGATGAGATAGCAGTTAAGAGGAAACGCACTCAAGAGACTCTCCACGTTCTTCAG
CAAGCTTACAGGACACTAGACGAGTTACCTTTGGAAGCAGAATCAGTGTGCAATCGTGGT
ACCGAGACAACAGGTGTGTCAAAACATCTGGATTTACCGACCTCTTCTTCCAAGTATACC
ACGAGCAATTCCTACACTGCATCTCCGGGTACAGGAAGAAGATCTAGAAGAGCTGGTGAT
CAACACCAAAACGGATATGGATTCTGGCATGATCCCAAATCAATATATCTGACTTTTGAT
AGACACATTTCATTCATTTAATGGTTCTTTAAGGTTTTGGAATTATTAAATTGTGTTGGC
AAAATGAATAATTTTTGATAGAAAATTGGTATACACTGGTTTTGGAGTCTGC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RR2BA36TF 472 0 0
GTGCACAATGTGTTCATCAAGAAGCTTTACAGGGAGAACTTGTTTGAGGAAATGCTCCAA
GAGACAGATGAGATAGCAGTTAAGAGGAAACGCACTCAAGAGACTCTCCACGTTCTTCAG
CAAGCTTACAGGACACTAGACGAGTTACCTTTGGAAGCAGAATCAGTGTGCAATCGTGGT
ACCGAGACAACAGGTGTGTCAAAACATCTGGATTTACCGACCTCTTCTTCCAAGTATACC
ACGAGCAATTCCTACACTGCATCTCCGGGTACAGGAAGAAGATCTAGAAGAGCTGGTGAT
CAACACCAAAACGGATATGGATTCTGGCATGATCCCAAATCAATATATCTGACTTTTGAT
AGACACATTTCATTCATTTAATGGTTCTTTAAGGTTTTGGAATTATTAAATTGTGTTGGC
AAAATGAATAATTTTTGATAGAAAATTGGTATACACTGGTTTTGGAGTCTGC

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 2

CO CL7719Contig1 796 2 3 U
GACGTGGAAGATTCGATTTGTATACAACACAATAGTCATGTAAAGAGATCTTTAAACGAG
TCACACGATGACTTACAATACAATATTGTTTAATGGGCTTGGGCCTCATATGAGTCTACA
CATCATTTGCTTTCTTTAACAACCACTGTGAAACCCTTTTGTTCTGTATATCTATGAGAG
CTTACATGAGCTTCTTCTTGTTCTGTTTCTCTTCTCTCCATTCCTTGATATCATTCTCTA
TCCTGCAGTCAACGCGTGCTTTAAATCCAGGGTATGGCTCGTATCCAAAACCAGACTGCA
TCACCTCGAGCAACACGAAGAAAGGACCCATCAGAAAAGCTTGGACTAGATTGTCTAGAA
GCGCAGGAGCTCGTTTCTCAAACAAGCCGTGACCGAGGAACTGACCGGTCCAGCATAGGA
GCTGAGAAGCTACTCCAACCTTCAAGGTCAAGGAATGTCCTAAACGAGCTGCGAGAAAGC
TGGAGCCGATCCAGCAAGAGAAACATAACAGAGCAGCTAAAACTCCAGACTTCTTATCCA
AACATATGTAGAAGACAGCATAGATCAGAGTGAGGATAAAACCAACGTCCAAGCGTAGGA
CACTGTCAAAGGTCAACGCTTCGATGAACCCTAATTGAGATGGATCAAGAATCGGTTGCG
TACAGTAGAGGCAAAGTAGGGTGGCGAAGACGTTAGGCCATACGAATAGTGTGTGGATGA
TTATGTTCACGTGGTTGTTGTGATAAGCTCCGTAGAAGGCGAAATGCTTCTCTAGATCGA
GTAAACCGATACGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A091JQ U 15
AF RR2A091TF C 1
BS 1 16 RR2A091TF
BS 17 522 RR2A091JQ
BS 523 796 RR2A091TF

RD RR2A091JQ 508 0 0
AT
TTTGTATACAACACAATAGTCATGTAAAGAGATCTTTAAACGAGTCACACGATGACTTAC
AATACAATATTGTTTAATGGGCTTGGGCCTCATATGAGTCTACACATCATTTGCTTTCTT
TAACAACCACTGTGAAACCCTTTTGTTCTGTATATCTATGAGAGCTTACATGAGCTTCTT
CTTGTTCTGTTTCTCTTCTCTCCATTCCTTGATATCATTCTCTATCCTGCAGTCAACGCG
TGCTTTAAATCCAGGGTATGGCTCGTATCCAAAACCAGACTGCATCACCTCGAGCAACAC
GAAGAAAGGACCCATCAGAAAAGCTTGGACTAGATTGTCTAGAAGCGCAGGAGCTCGTTT
CTCAAACAAGCCGTGACCGAGGAACTGACCGGTCCAGCATAGGAGCTGAGAAGCTACTCC
AACCTTCAAGGTCAAGGAATGTCCTAAACGAGCTGCGAGAAAGCTGGAGCCGATCCAGCA
AGAGAAACATAACAGAGCAGCTAAAA

QA 3 508 3 508
DS 

RD RR2A091TF 796 0 0
GACGTGGAAGATTCGATTTGTATACAACACAATAGTCATGTAAAGAGATCTTTAAACGAG
TCACACGATGACTTACAATACAATATTGTTTAATGGGCTTGGGCCTCATATGAGTCTACA
CATCATTTGCTTTCTTTAACAACCACTGTGAAACCCTTTTGTTCTGTATATCTATGAGAG
CTTACATGAGCTTCTTCTTGTTCTGTTTCTCTTCTCTCCATTCCTTGATATCATTCTCTA
TCCTGCAGTCAACGCGTGCTTTAAATCCAGGGTATGGCTCGTATCCAAAACCAGACTGCA
TCACCTCGAGCAACACGAAGAAAGGACCCATCAGAAAAGCTTGGACTAGATTGTCTAGAA
GCGCAGGAGCTCGTTTCTCAAACAAGCCGTGACCGAGGAACTGACCGGTCCAGCATAGGA
GCTGAGAAGCTACTCCAACCTTCAAGGTCAAGGAATGTCCTAAACGAGCTGCGAGAAAGC
TGGAGCCGATCCAGCAAGAGAAACATAACAGAGCAGCTAAAACTCCAGACTTCTTATCCA
AACATATGTAGAAGACAGCATAGATCAGAGTGAGGATAAAACCAACGTCCAAGCGTAGGA
CACTGTCAAAGGTCAACGCTTCGATGAACCCTAATTGAGATGGATCAAGAATCGGTTGCG
TACAGTAGAGGCAAAGTAGGGTGGCGAAGACGTTAGGCCATACGAATAGTGTGTGGATGA
TTATGTTCACGTGGTTGTTGTGATAAGCTCCGTAGAAGGCGAAATGCTTCTCTAGATCGA
GTAAACCGATACGGTT

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL7720Contig1 652 2 3 U
TCAAGATGGAACAAACTTGGCACTGGTTATATAGCAAATCCCCAAAGCCTTTTTAGGCAC
AGCGACATGAAAAAGACTCTGAGGTCAAACATACATAATCAAACACTGATCGAATCCTTT
ATTACATAAGATGTCTGAAGATGCCGATGCATCACGCAAACTTGACAATGAAATTAAAAA
AAAAGGAGAAAAAAGAGAGACCAGAGATTTTTCATGACTTTCAAAATGTTGCCTTAGTGA
TGATGATCTTGAACATAGCGAAGGCCACAGTACTTGCAGACGGCAGGCTCGTCTAGGTCG
AGGCAAATGAACTCAATTGGATGACCGAGTGCTGGATTGGTGTCTCCTTCACAAGCAGCA
ATCCTTCCATCAACTTTGATAGGTGGGACCTCATTGATCAGCTCCATTGGTGACTTCTTG
CTTCTATCCTGCATCCATTTGGCGGTGTGGTTTCCGACTAGATCGTCTGTTGGCACGCCG
AGTTGTGTGGTAGCCGGTGCACTAAAGTGCCTCCTCGTAGATGGAAGAATCTGCGATCGA
ATTAGGGCTTTCACCAGCTTCGACGCCATTTTTTTTATTTGCTCCTCTACCGAAAATAAT
CAGAGGAAGTCTCTTTGCAAAGAGAGAGAGAGAGAGACTTGTTTGTTTCTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW26JQ U 2
AF RR2EW26TF C 1
BS 1 1 RR2EW26TF
BS 2 560 RR2EW26JQ
BS 561 652 RR2EW26TF

RD RR2EW26JQ 559 0 0
CAAGATGGAACAAACTTGGCACTGGTTATATAGCAAATCCCCAAAGCCTTTTTAGGCACA
GCGACATGAAAAAGACTCTGAGGTCAAACATACATAATCAAACACTGATCGAATCCTTTA
TTACATAAGATGTCTGAAGATGCCGATGCATCACGCAAACTTGACAATGAAATTAAAAAA
AAAGGAGAAAAAAGAGAGACCAGAGATTTTTCATGACTTTCAAAATGTTGCCTTAGTGAT
GATGATCTTGAACATAGCGAAGGCCACAGTACTTGCAGACGGCAGGCTCGTCTAGGTCGA
GGCAAATGAACTCAATTGGATGACCGAGTGCTGGATTGGTGTCTCCTTCACAAGCAGCAA
TCCTTCCATCAACTTTGATAGGTGGGACCTCATTGATCAGCTCCATTGGTGACTTCTTGC
TTCTATCCTGCATCCATTTGGCGGTGTGGTTTCCGACTAGATCGTCTGTTGGCACGCCGA
GTTGTGTGGTAGCCGGTGCACTAAAGTGCCTCCTCGTAGATGGAAGAATCTGCGATCGAA
TTAGGGCTTTCACCAGCTT

QA 1 559 1 559
DS 

RD RR2EW26TF 652 0 0
TCAAGATGGAACAAACTTGGCACTGGTTATATAGCAAATCCCCAAAGCCTTTTTAGGCAC
AGCGACATGAAAAAGACTCTGAGGTCAAACATACATAATCAAACACTGATCGAATCCTTT
ATTACATAAGATGTCTGAAGATGCCGATGCATCACGCAAACTTGACAATGAAATTAAAAA
AAAAGGAGAAAAAAGAGAGACCAGAGATTTTTCATGACTTTCAGAATGTTGCCTTAGTGA
TGATGATCTTGAACATAGCGAAGGCCACAGTACTTGCAGACGGCAGGCTCGTCTAGGTCG
AGGCAAATGAACTCAATTGGATGACCGAGTGCTGGATTGGTGTCTCCTTCACAAGCAGCA
ATCCTTCCATCAACTTTGATAGGTGGGACCTCATTGATCAGCTCCATTGGTGACTTCTTG
CTTCTATCCTGCATCCATTTGGCGGTGTGGTTTCCGACTAGATCGTCTGTTGGCACGCCG
AGTTGTGTGGTAGCCGGTGCACTAAAGTGCCTCCTCGTAGATGGAAGAATCTGCGATCGA
ATTAGGGCTTTCACCAGCTTCGACGCCATTTTTTTTATTTGCTCCTCTACCGAAAATAAT
CAGAGGAAGTCTCTTTGCAAAGAGAGAGAGAGAGAGACTTGTTTGTTTCTCC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL7721Contig1 830 2 2 U
GGATTATATTCCATTTTAGTCCTTTATTCAATCTCACACGGTCACACGAGACAATAATAG
TAACATAAATAATGACAAACTACGGCGCCATTCCGACGTCGTCTCATGGCTCTCCGGTGA
TGGATCCTGACTCGATCTCACGCGCCAAGCAACGTATCAAAGACGGACTCGCCATGAGCC
GCCCATGGAGACAGATGTTTGATCTCCACTCCATGAACCTCCCTCACGGCGTCTCCGATG
CTCTCTCGAGGATCAAGAAGAACCTCAGCTACTTCCAGACGAACTACGCGATCGTCGTCT
TGGTCGTGATCTTCCTCAGCCTTATCAAGCATCCGACATCGCTTATTGTCTTGACCGTTT
TTGTTTTCATCTGGATCTTTCTATATTTCTTCCGAGACGAGCCTATCAAGGTGTTTCGTT
ATCAGATAGATGATCACACGGTCTTGGCTTGTTTATCGGTGGTAACCATCGTTCTGTTGT
TCTTGACCGGCGTGACGCTTAACTTAGTTGGGGCGTTGGTGACCGGAGCTGTGTTGGTTT
TGATCCATGCGGTTGTTAGGAAGACGGAGGATCTCTTCTTGGATGAAGAGGCGGCGACGG
CTGAGACTATTCAGGGGTGACGTCATCCCCGTCATCATTAGTCGGTTGATTGATCTCCAA
TTTTCATGTATCATAATTCTGTATGTTATTGTATTGTGTTTTGTATCATTTTATGTGTAA
TGATTTAACAATTTTTATTGGTGCGAGTTTGATTTGGGACTCTTCTGTTTTGGGTGACGA
ATGTTACTAGTTTGAAGTTGAAACATTCAAAATTAATGTTACAACTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CP12TF U 1
AF RR2CP12JQ C 146
BS 1 739 RR2CP12TF
BS 740 830 RR2CP12JQ

RD RR2CP12TF 739 0 0
GGATTATATTCCATTTTAGTCCTTTATTCAATCTCACACGGTCACACGAGACAATAATAG
TAACATAAATAATGACAAACTACGGCGCCATTCCGACGTCGTCTCATGGCTCTCCGGTGA
TGGATCCTGACTCGATCTCACGCGCCAAGCAACGTATCAAAGACGGACTCGCCATGAGCC
GCCCATGGAGACAGATGTTTGATCTCCACTCCATGAACCTCCCTCACGGCGTCTCCGATG
CTCTCTCGAGGATCAAGAAGAACCTCAGCTACTTCCAGACGAACTACGCGATCGTCGTCT
TGGTCGTGATCTTCCTCAGCCTTATCAAGCATCCGACATCGCTTATTGTCTTGACCGTTT
TTGTTTTCATCTGGATCTTTCTATATTTCTTCCGAGACGAGCCTATCAAGGTGTTTCGTT
ATCAGATAGATGATCACACGGTCTTGGCTTGTTTATCGGTGGTAACCATCGTTCTGTTGT
TCTTGACCGGCGTGACGCTTAACTTAGTTGGGGCGTTGGTGACCGGAGCTGTGTTGGTTT
TGATCCATGCGGTTGTTAGGAAGACGGAGGATCTCTTCTTGGATGAAGAGGCGGCGACGG
CTGAGACTATTCAGGGGTGACGTCATCCCCGTCATCATTAGTCGGTTGATTGATCTCCAA
TTTTCATGTATCATAATTCTGTATGTTATTGTATTGTGTTTTGTATCATTTTATGTGTAA
TGATTTAACAATTTTTATT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2CP12JQ 685 0 0
CAAGCAACGTATCAAAGACGGACTCGCCATGAGCCGCCCATGGAGACAGATGTTTGATCT
CCACTCCATGAACCTCCCTCACGGCGTCTCCGATGCTCTCTCGAGGATCAAGAAGAACCT
CAGCTACTTCCAGACGAACTACGCGATCGTCGTCTTGGTCGTGATCTTCCTCAGCCTTAT
CAAGCATCCGACATCGCTTATTGTCTTGACCGTTTTTGTTTTCATCTGGATCTTTCTATA
TTTCTTCCGAGACGAGCCTATCAAGGTGTTTCGTTATCAGATAGATGATCACACGGTCTT
GGCTTGTTTATCGGTGGTAACCATCGTTCTGTTGTTCTTGACCGGCGTGACGCTTAACTT
AGTTGGGGCGTTGGTGACCGGAGCTGTGTTGGTTTTGATCCATGCGGTTGTTAGGAAGAC
GGAGGATCTCTTCTTGGATGAAGAGGCGGCGACGGCTGAGACTATTCAGGGGTGACGTCA
TCCCCGTCATCATTAGTCGGTTGATTGATCTCCAATTTTCATGTATCATAATTCTGTATG
TTATTGTATTGTGTTTTGTATCATTTTATGTGTAATGATTTAACAATTTTTATTGGTGCG
AGTTTGATTTGGGACTCTTCTGTTTTGGGTGACGAATGTTACTAGTTTGAAGTTGAAACA
TTCAAAATTAATGTTACAACTTTTT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL7722Contig1 646 2 1 U
GAAGCCGGTGGATCCGTTTATCTCTTACTGGGTAGACTTGGGTAAGATATGGAAAGACGA
GAAGTTCATGGTGGGTTTGATATCTGCAAATGGAAACTCTTCCAAGCCGCATTATCTCCG
TTCATGGAGCTTTTAGCTGAGGCATCCTTCGATGAGGATTCACTCGCAGCCCCTTGATCC
AAACGCAGTTGTTTCCAAGTCTGTTAAGGGTGAGGATGGGGAGAGGAAGACAGTGGAAGT
GAAGGAGAAGAGCAAGTGTGTTTGGAGAATGTTCAGTGCATTGGTTCTAGGTGCGGTTTG
TGGAACTTTAGGTGCCATGTTAGCGTTATATCTTTGGACAATATGGGGTAATAGGCGGTC
GATGGCAGTGGTTCCTGAGGAGTGTGGTAATGATAAATCAGATATCGTTGTGATGAAAGC
CGCAGCTGGTGTTGTTGAAGAAGCTAAGAATTAGTTTGGTGTTTTCTTAGAATTGTTGTG
TTCGTCTTTTGTGTTTGTAATGTACATTCTTGTGTCCTTCTTCCTCTTGTTCTTCTGTTG
TTTTGTTTTTTTATTAGTTTCAGGTTTGGTGAGATGAGCTTTCACATGTAGAAGAATATT
ACAATATGTATTAGTTAAGATCTTGAAATCTTGATCAATTCAATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H364JQ C 1
AF RR2H364TF U 1
BS 1 646 RR2H364TF

RD RR2H364JQ 646 0 0
GAAGCCGGTGGATCCGTTTATCTCTTACTGGGTAGACTTGGGTAAGATATGGAAAGACGA
GAAGTTCATGGTGGGTTTGATATCTGCAAATGGAAACTCTTCCAAGCCGCATTATCTCCG
TTCATGGAGCTTTTAGCTGAGGCATCCTTCGATGAGGATTCACTCGCAGCCCCTTGATCC
AAACGCAGTTGTTTCCAAGTCTGTTAAGGGTGAGGATGGGGAGAGGAAGACAGTGGAAGT
GAAGGAGAAGAGCAAGTGTGTTTGGAGAATGTTCAGTGCATTGGTTCTAGGTGCGGTTTG
TGGAACTTTAGGTGCCATGTTAGCGTTATATCTTTGGACAATATGGGGTAATAGGCGGTC
GATGGCAGTGGTTCCTGAGGAGTGTGGTAATGATAAATCAGATATCGTTGTGATGAAAGC
CGCAGCTGGTGTTGTTGAAGAAGCTAAGAATTAGTTTGGTGTTTTCTTAGAATTGTTGTG
TTCGTCTTTTGTGTTTGTAATGTACATTCTTGTGTCCTTCTTCCTCTTGTTCTTCTGTTG
TTTTGTTTTTTTATTAGTTTCAGGTTTGGTGAGATGAGCTTTCACATGTAGAAGAATATT
ACAATATGTATTAGTTAAGATCTTGAAATCTTGATCAATTCAATTC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2H364TF 646 0 0
GAAGCCGGTGGATCCGTTTATCTCTTACTGGGTAGACTTGGGTAAGATATGGAAAGACGA
GAAGTTCATGGTGGGTTTGATATCTGCAAATGGAAACTCTTCCAAGCCGCATTATCTCCG
TTCATGGAGCTTTTAGCTGAGGCATCCTTCGATGAGGATTCACTCGCAGCCCCTTGATCC
AAACGCAGTTGTTTCCAAGTCTGTTAAGGGTGAGGATGGGGAGAGGAAGACAGTGGAAGT
GAAGGAGAAGAGCAAGTGTGTTTGGAGAATGTTCAGTGCATTGGTTCTAGGTGCGGTTTG
TGGAACTTTAGGTGCCATGTTAGCGTTATATCTTTGGACAATATGGGGTAATAGGCGGTC
GATGGCAGTGGTTCCTGAGGAGTGTGGTAATGATAAATCAGATATCGTTGTGATGAAAGC
CGCAGCTGGTGTTGTTGAAGAAGCTAAGAATTAGTTTGGTGTTTTCTTAGAATTGTTGTG
TTCGTCTTTTGTGTTTGTAATGTACATTCTTGTGTCCTTCTTCCTCTTGTTCTTCTGTTG
TTTTGTTTTTTTATTAGTTTCAGGTTTGGTGAGATGAGCTTTCACATGTAGAAGAATATT
ACAATATGTATTAGTTAAGATCTTGAAATCTTGATCAATTCAATTC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL7723Contig1 1206 2 10 U
AGGGGCAAGAAAATTTACAGAGAGCAACAAAATGGCGATGAAGAAGCTATTGATGATCTC
CTTCTCTCTAACGTCTCTCCTCTTCTCATTCTTTTACATCATCCCCACAACCACAACTCT
CTTCGCTTCTTCAAAGATCCCCACTACATCTCTTGAATCCAACCAAGACTTCAACTCTAC
ACTCCCCTCTTTCGCCTACCTCATCTCTGCCTCCAAAGGGGACGTTGATAAGCTCAAACG
CCTCCTCCGATCTCTCTACCACCGCAGAAACCACTACTTGATCCACCTAGACCTCGAGGC
CCCCGAGGAGGAGCATTTGGAGATGGCCAGGTTCGTGGCCGGAGAGCCTCTGTTTCAGCC
CGAGGGTAATGTAATGATCGTAGGCAAACCGAATATTGTTACTTACAGAGGACCAACAAT
GCTCGCTACGACGCTTCACGCAATGGCTTTGCTCTTGAGATGTTGTCGGTGGGATTGGTT
CATTAATCTAAGTTCTTCTGATTATCCTCTAGTTAAACAAGACGATCTGATCTATGCTTT
TTCCGAGTTGCCTAGAGATCTCAACTTCATTCAGCACACAAGCCGGTTGGGATGGAAAAT
GAACAAAAGAGGGAAACCAATAATAATAGATCCAGGACTTTATAGCCTCAACAAGTCAGA
GATTTGGTGGGTTATCAAACAACGAAGCCTCCCTACTTCTTTCAAGCTCTTCACAGGTTC
AGCTTGGACGTTCCTATCAAGACCGTTTTCAGAATATTGCATAATAGGTTATGACAACTT
ACCAAGAACACTCCTTCTATACTACACCAACTTCGTTTCATCTCCAGAAGGCTATTTTCA
GACGCTCATATGCAACTCGGATGAGTTCAGGAACACGACCGTGAACCACGATCTCCACTA
CATTGCTTGGGACAATCCGCCAAAGCAGCATCCTAAGACTTTAGGGACAAAGGATTACAG
AAAAATGGTAATGAGTAATAGGCCGTTTGCAAGGAAGTTCAAGAGCAATGACCCGGTTCT
CAATAGGATAGACCGAGATATTCTGAGAAACAAACCCAAGCGTGGGTCAAAACCTGGTCC
TGGTCCGGGGGCTAGGAGGCTGAAGAGTTTGCTTTTGAGGCTTATGTTGAGAAAAAACTT
TGTCAGGAGACAATGTAGATAGGAAGTGTGAGCTATGCTACTCTATATGGAAATACCTTT
GATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2EH69TF U 1
AF RR2EH69JQ C 548
BS 1 716 RR2EH69TF
BS 717 717 RR2EH69JQ
BS 718 753 RR2EH69TF
BS 754 754 RR2EH69JQ
BS 755 767 RR2EH69TF
BS 768 768 RR2EH69JQ
BS 769 776 RR2EH69TF
BS 777 777 RR2EH69JQ
BS 778 818 RR2EH69TF
BS 819 1206 RR2EH69JQ

RD RR2EH69TF 818 0 0
AGGGGCAAGAAAATTTACAGAGAGCAACAAAATGGCGATGAAGAAGCTATTGATGATCTC
CTTCTCTCTAACGTCTCTCCTCTTCTCATTCTTTTACATCATCCCCACAACCACAACTCT
CTTCGCTTCTTCAAAGATCCCCACTACATCTCTTGAATCCAACCAAGACTTCAACTCTAC
ACTCCCCTCTTTCGCCTACCTCATCTCTGCCTCCAAAGGGGACGTTGATAAGCTCAAACG
CCTCCTCCGATCTCTCTACCACCGCAGAAACCACTACTTGATCCACCTAGACCTCGAGGC
CCCCGAGGAGGAGCATTTGGAGATGGCCAGGTTCGTGGCCGGAGAGCCTCTGTTTCAGCC
CGAGGGTAATGTAATGATCGTAGGCAAACCGAATATTGTTACTTACAGAGGACCAACAAT
GCTCGCTACGACGCTTCACGCAATGGCTTTGCTCTTGAGATGTTGTCGGTGGGATTGGTT
CATTAATCTAAGTTCTTCTGATTATCCTCTAGTTAAACAAGACGATCTGATCTATGCTTT
TTCCGAGTTGCCTAGAGATCTCAACTTCATTCAGCACACAAGCCGGTTGGGATGGAAAAT
GAACAAAAGAGGGAAACCAATAATAATAGATCCAGGACTTTATAGCCTCAACAAGTCAGA
GATTTGGTGGGTTATCAAACAACGAAGCCTCCCTACTTCTTTCAAGCTCTTCACAG*TTC
AGCTTGGACGTTCCTATCAAGACCGTTTTCAGA*TATTGCATAATAG*TTATGACA*CTT
ACCAAGAACACTCCTTCTATACTACACCAACTTCGTTT

QA 1 818 1 818
DS 

RD RR2EH69JQ 659 0 0
TTGCCTAGAGATCTCAACTTCATTCAGCACACAAGCCGGTTGGGATGGAAAATGAACAAA
AGAGGGAAACCAATAATAATAGATCCAGGACTTTATAGCCTCAACAAGTCAGAGATTTGG
TGGGTTATCAAACAACGAAGCCTCCCTACTTCTTTCAAGCTCTTCACAGGTTCAGCTTGG
ACGTTCCTATCAAGACCGTTTTCAGAATATTGCATAATAGGTTATGACAACTTACCAAGA
ACACTCCTTCTATACTACACCAACTTCGTTTCATCTCCAGAAGGCTATTTTCAGACGCTC
ATATGCAACTCGGATGAGTTCAGGAACACGACCGTGAACCACGATCTCCACTACATTGCT
TGGGACAATCCGCCAAAGCAGCATCCTAAGACTTTAGGGACAAAGGATTACAGAAAAATG
GTAATGAGTAATAGGCCGTTTGCAAGGAAGTTCAAGAGCAATGACCCGGTTCTCAATAGG
ATAGACCGAGATATTCTGAGAAACAAACCCAAGCGTGGGTCAAAACCTGGTCCTGGTCCG
GGGGCTAGGAGGCTGAAGAGTTTGCTTTTGAGGCTTATGTTGAGAAAAAACTTTGTCAGG
AGACAATGTAGATAGGAAGTGTGAGCTATGCTACTCTATATGGAAATACCTTTGATCTT

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL7724Contig1 1396 2 2 U
GGGATTCTGATCTCTGGCGTTTAGCCACCGTTTCATAATCCAAGACTATGGCAGAAGCTG
AGGAGATTCAACCACTTGTTGTCGATAACGGAACCGGCATGGTCAAGGCTGTTTTGCTGG
TGACGATTCTCCGAGAGCAGTCTTCCCTAGCATCATAGGTCGTCCTAGACATGCTGGTGT
TATGGTTGGAATGGGACAGAAAGATGCTTACGTCGGCGACGAGGCTCAATCCAAAAGAGG
TATACTTTCCTTGAAGTATCCCATTGAACATGGTATTGTTAGTAACTGGGATGACATGGA
GAAGATTTGGCATCACACTTTCTACAATGAGCTTCGTGTTGCTCCTGAGGAACACCCTGT
TCTTCTTACTGAAGCTCCTCTCAACCCTAAAGCCAACAGAGAGAAGATGACTCAGATCAT
GTTTGAGACTTTTGATGTCCCTGCTATGTATGTTGCCATTCAAGCCGTACTTTCGCTTTA
CGCCAGTGGCCGTACCACAGGTATTGTGTTGGATTCAGGTGATGGCGTGAGTCACACGGT
TCCTATATATGAAGGCTATGCCCTTCCTCATGCTATTCTTAGGCTTGACTTAGCTGGAAG
AGATCTGACAGATGCTTTGATGAAGATCTTGACAGAGAGAGGGTATACGTTCACCACAAG
CGCTGAGAGAGAAATCGTGAGAGACATCAAGGAGAAGCTTGCCTATGTGGCGTTGGATTA
TGAGCAGGAGGTTGAGACAGCCAAATCAAGCTCTGCCATCGAGAAGACTTATGAGCTCCC
TGATGGTCAGGTGATCACTATTGGCGCAGAACGGTTCCGCTGTCCGGAAGTCCTCTTTCA
GCCATCGTTTGTCGGAATGGAATCACCAGGGATTCATGAGACAACTTATAACTCTATTAT
GAAATGTGATGTTGACATCAGGAAGGACCTGTACAGTAACATTGTGCTTAGTGGTGGCTC
GACCATGTTTCCAGGAATTGCTGATCGTATGAGCAAAGAGATCACTGCGTTGGCACCAAG
CAGTATGAAGATTAAGGTGGTCGCACCACCTGAGAGGAAGTATAGTGTATGGATTGGAGG
TTCTATCTTGGCTTCTCTTAGCACATTCCAACAGATGTGGATATCGAAGGCAGAATATGA
GGAATCAGGACCAGCCATTGTTCACAGGAAGTGCTTCTAGACACAACCTATTGGCTTTGG
TGTTTGTGGTTTTCTGCTTGTTGATTGATAAAACTGGTTAAAGTGAATATACATATATAT
ATTATATGTTTGGTACTGGCTTCTTATGAGTTTTGTTTCCTTATATGATTGTTCATGTAC
GTTTTGTGGAAAATCGAGTCTTGTGTGTATGAAAATGTTCGACTATTTCTATATTGATAG
TATTGGGTTTGAGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW24TF U 1
AF RR2BW24JQ C 599
BS 1 687 RR2BW24TF
BS 688 1396 RR2BW24JQ

RD RR2BW24TF 687 0 0
GGGATTCTGATCTCTGGCGTTTAGCCACCGTTTCATAATCCAAGACTATGGCAGAAGCTG
AGGAGATTCAACCACTTGTTGTCGATAACGGAACCGGCATGGTCAAGGCTGTTTTGCTGG
TGACGATTCTCCGAGAGCAGTCTTCCCTAGCATCATAGGTCGTCCTAGACATGCTGGTGT
TATGGTTGGAATGGGACAGAAAGATGCTTACGTCGGCGACGAGGCTCAATCCAAAAGAGG
TATACTTTCCTTGAAGTATCCCATTGAACATGGTATTGTTAGTAACTGGGATGACATGGA
GAAGATTTGGCATCACACTTTCTACAATGAGCTTCGTGTTGCTCCTGAGGAACACCCTGT
TCTTCTTACTGAAGCTCCTCTCAACCCTAAAGCCAACAGAGAGAAGATGACTCAGATCAT
GTTTGAGACTTTTGATGTCCCTGCTATGTATGTTGCCATTCAAGCCGTACTTTCGCTTTA
CGCCAGTGGCCGTACCACAGGTATTGTGTTGGATTCAGGTGATGGCGTGAGTCACACGGT
TCCTATATATGAAGGCTATGCCCTTCCTCATGCTATTCTTAGGCTTGACTTAGCTGGAAG
AGATCTGACAGATGCTTTGATGAAGATCTTGACAGAGAGAGGGTATACGTTCACCACAAG
CGCTGAGAGAGAAATCGTGAGAGACAT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RR2BW24JQ 798 0 0
AGAGATCTGACAGATGCTTTGATGAAGATCTTGACAGAGAGAGGGTATACGTTCACCACA
AGCGCTGAGAGAGAAATCGTGAGAGACATCAAGGAGAAGCTTGCCTATGTGGCGTTGGAT
TATGAGCAGGAGGTTGAGACAGCCAAATCAAGCTCTGCCATCGAGAAGACTTATGAGCTC
CCTGATGGTCAGGTGATCACTATTGGCGCAGAACGGTTCCGCTGTCCGGAAGTCCTCTTT
CAGCCATCGTTTGTCGGAATGGAATCACCAGGGATTCATGAGACAACTTATAACTCTATT
ATGAAATGTGATGTTGACATCAGGAAGGACCTGTACAGTAACATTGTGCTTAGTGGTGGC
TCGACCATGTTTCCAGGAATTGCTGATCGTATGAGCAAAGAGATCACTGCGTTGGCACCA
AGCAGTATGAAGATTAAGGTGGTCGCACCACCTGAGAGGAAGTATAGTGTATGGATTGGA
GGTTCTATCTTGGCTTCTCTTAGCACATTCCAACAGATGTGGATATCGAAGGCAGAATAT
GAGGAATCAGGACCAGCCATTGTTCACAGGAAGTGCTTCTAGACACAACCTATTGGCTTT
GGTGTTTGTGGTTTTCTGCTTGTTGATTGATAAAACTGGTTAAAGTGAATATACATATAT
ATATTATATGTTTGGTACTGGCTTCTTATGAGTTTTGTTTCCTTATATGATTGTTCATGT
ACGTTTTGTGGAAAATCGAGTCTTGTGTGTATGAAAATGTTCGACTATTTCTATATTGAT
AGTATTGGGTTTGAGTCT

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

CO CL7725Contig1 1070 2 4 U
GGAGCCTCGTCAAACAATCCATCAGAAAATGGAGGTTTCGCTGTTGGGTTCCTCACGGAG
TTTTCGGGCTATACCCCAAGACACAGACACCGAAACTCGCAAGCCCTTCGACAGAAAGAG
ACTCAGGTTGTCTGAAAATGAGAGTTGGTAATCCAGTTAGATCCCTCAAGTGCAGGTCTG
TCTCTGAGGACTTCGTTGAGAGAAGTAGCCCACTTGAGGTTAAGAAAGAGCTAGAGACTT
GCTTCGACCTCATACATAGGCTTGGGAGAGGGATCCTCTACTTAGGTTCCGCCAGGATCC
AACCAAACCATTCACATTACCTTCAATCACAAGAGTTAAGCAGAGAAGCAGCGAATCTGT
TGGACTGTACTACATGGTCTGGAGCTGGACCAGGACTCATGGATGCTGTCACTAAAGGTG
CTTTGGAAGCTGATAAACCCGTCGGCGGCATCAAAATAGAGAAAGAAGCTGGTGAATGGA
CCGCTTCTAAGGTCCATCCTTATCTCCCTCCTCAAAACTATCACACTTGCAGGTTTTTCT
CCGCGAGAAAGCATGGACTGGTGGACGCAGTGGTTAGAAACAATGTTTCCGACAAGACAG
CGGTTATTGCATTGCCAGGAGGCATTGGCACGCTTGATGAGATGTTCGAGATTTTGGCAT
TGATTCAGCTCAAAAGGATTGGTTCCGTGTTGCCGGTTCCGCTCATTGTGATGAACTATG
ATTCTTTCTACTCAAAGCTGTTTGAGTTCATTGAGAGTTGCGAAGACTTGGGAACTGTTT
ATAAAGGAGAAGTCTCTGCGTTGTGGAAGGTATGCAACAGCAACTCTGAAGCTTTGACAT
ACTTAGCTGAGTTCTATGAACTGCCGCCATATGGCTCTACAAAACCTGAAACTCAACTTA
GAGAAACTGCTTGTGGATGATCATCATCAGTTTCTTAGCTCGTTTTTTTGGGGTTTCAAC
TGTAAGAGAGAATATTTGTGACCATTAACAACATGACTTTTGAAGGGTGTGTGTAGCATA
TGCAGAATGTTACTTTCTATGTAGTTTATGCAATACCACTAAGATTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C035TF U 1
AF RR2C035JQ C 311
BS 1 676 RR2C035TF
BS 677 677 RR2C035JQ
BS 678 695 RR2C035TF
BS 696 1070 RR2C035JQ

RD RR2C035TF 698 0 0
GGAGCCTCGTCAAACAATCCATCAGAAAATGGAGGTTTCGCTGTTGGGTTCCTCACGGAG
TTTTCGGGCTATACCCCAAGACACAGACACCGAAACTCGCAAGCCCTTCGACAGAAAGAG
ACTCAGGTTGTCTGAAAATGAGAGTTGGTAATCCAGTTAGATCCCTCAAGTGCAGGTCTG
TCTCTGAGGACTTCGTTGAGAGAAGTAGCCCACTTGAGGTTAAGAAAGAGCTAGAGACTT
GCTTCGACCTCATACATAGGCTTGGGAGAGGGATCCTCTACTTAGGTTCCGCCAGGATCC
AACCAAACCATTCACATTACCTTCAATCACAAGAGTTAAGCAGAGAAGCAGCGAATCTGT
TGGACTGTACTACATGGTCTGGAGCTGGACCAGGACTCATGGATGCTGTCACTAAAGGTG
CTTTGGAAGCTGATAAACCCGTCGGCGGCATCAAAATAGAGAAAGAAGCTGGTGAATGGA
CCGCTTCTAAGGTCCATCCTTATCTCCCTCCTCAAAACTATCACACTTGCAGGTTTTTCT
CCGCGAGAAAGCATGGACTGGTGGACGCAGTGGTTAGAAACAATGTTTCCGACAAGACAG
CGGTTATTGCATTGCCAGGAGGCATTGGCACGCTTGATGAGATGTTCGAGATTTTGGCAT
TGATTCAGCTCAAAAG*ATTGGTTCCGTGTTGCCG
TTC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RR2C035JQ 760 0 0
TTCACATTAC*TTCAATCACAAGAGTTAAGCAGAGAAGCAGCGAATCTGTTGGACTGTAC
TACATGGTCTGGAGCTGGACCAGGACTCATGGATGCTGTCACTAAAGGTGCTTTGGAAGC
TGATAAACCCGTCGGCGGCATCAAAATAGAGAAAGAAGCTGGTGAATGGACCGCTTCTAA
GGTCCATCCTTATCTCCCTCCTCAAAACTATCACACTTGCAGGTTTTTCTCCGCGAGAAA
GCATGGACTGGTGGACGCAGTGGTTAGAAACAATGTTTCCGACAAGACAGCGGTTATTGC
ATTGCCAGGAGGCATTGGCACGCTTGATGAGATGTTCGAGATTTTGGCATTGATTCAGCT
CAAAAGGATTGGTTCCGTGTTGCCGGTTCCGCTCATTGTGATGAACTATGATTCTTTCTA
CTCAAAGCTGTTTGAGTTCATTGAGAGTTGCGAAGACTTGGGAACTGTTTATAAAGGAGA
AGTCTCTGCGTTGTGGAAGGTATGCAACAGCAACTCTGAAGCTTTGACATACTTAGCTGA
GTTCTATGAACTGCCGCCATATGGCTCTACAAAACCTGAAACTCAACTTAGAGAAACTGC
TTGTGGATGATCATCATCAGTTTCTTAGCTCGTTTTTTTGGGGTTTCAACTGTAAGAGAG
AATATTTGTGACCATTAACAACATGACTTTTGAAGGGTGTGTGTAGCATATGCAGAATGT
TACTTTCTATGTAGTTTATGCAATACCACTAAGATTTCAC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL7726Contig1 938 2 2 U
CAGGAAAGTGTAGATTGAAGTTCTGGTATCTGAATCATGAAGTTCGGTGAGTCTTCTTCT
CCATCATCCTGATTTGCAATCTGATAGATATCAATCCGTCGTAACAACGTTTCTTTCCCG
GAGCTGGCGTCACCGTCGAAGAAGTCCGTTCCGCTTCCCCTGTTTCTGATCCTCCTCCTC
TCTATCCTCCCGTGTTAACCACCCCCGTCTCGTTACCCACTCCGGAAGCTATTGGCTACC
CGAGTGCACAGCAGGTCATGAGCTTCAAAGGTAAGCCCACTGACAAAAGGCAGGTGCTTG
ATGAGATTGAGATAAGAGAGCTGCGCATTGATCACATCGGCCACCGTTGCTGTTGGGGAA
GACATCCTTTTCGCACATGGAAGATCTGTGCTGTCGTCTGCTCGTAACAACGTTTCTTTC
CCCGGATAGTATGGTTGCCACAAAGCTCTTTGCCGAGAAGTCATGGCTGGATCAAGGAGT
TGAATGAGAGCAACGATGATTGCATCACAAAATGATTGGTAGACTTGAATGGTGTTTTGG
TTGTCGTGTTGAGGCTTTTGTTGATGATTTAGATTGTTGTAGTATGGTAGTTGAATGGTG
TTTTGGTTGTCGTGTTGAGGCTTTTGTTGATCATTTCCTCTATTAACATTTACAGTACTT
GTGTTGAACAGGAAGGTAATCTAAAGTACACTCTATATGGTGTGTTAGTTCATTATGGTG
GAAGTATTGATTCTGGTCACTACTACTGCTTTGTTCGCACTTCAAGTGGCATTGGTATTC
CCTTGATAATAACAAGGTTATCCAAGTTAGTGAGAAGTCTGTGTTCAACCAGAAAGCGTA
TAAGTTGATTCGAGTGTAATGAACTTTTTTTCTCAGATCAATGTAATACATTTGAGATGT
GAATTTTAACAAAAAAAAAGAATCTCCTAAGGATTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B183TF U 1
AF RR2B183JQ C 213
BS 1 767 RR2B183TF
BS 768 938 RR2B183JQ

RD RR2B183TF 767 0 0
CAGGAAAGTGTAGATTGAAGTTCTGGTATCTGAATCATGAAGTTCGGTGAGTCTTCTTCT
CCATCATCCTGATTTGCAATCTGATAGATATCAATCCGTCGTAACAACGTTTCTTTCCCG
GAGCTGGCGTCACCGTCGAAGAAGTCCGTTCCGCTTCCCCTGTTTCTGATCCTCCTCCTC
TCTATCCTCCCGTGTTAACCACCCCCGTCTCGTTACCCACTCCGGAAGCTATTGGCTACC
CGAGTGCACAGCAGGTCATGAGCTTCAAAGGTAAGCCCACTGACAAAAGGCAGGTGCTTG
ATGAGATTGAGATAAGAGAGCTGCGCATTGATCACATCGGCCACCGTTGCTGTTGGGGAA
GACATCCTTTTCGCACATGGAAGATCTGTGCTGTCGTCTGCTCGTAACAACGTTTCTTTC
CCCGGATAGTATGGTTGCCACAAAGCTCTTTGCCGAGAAGTCATGGCTGGATCAAGGAGT
TGAATGAGAGCAACGATGATTGCATCACAAAATGATTGGTAGACTTGAATGGTGTTTTGG
TTGTCGTGTTGAGGCTTTTGTTGATGATTTAGATTGTTGTAGTATGGTAGTTGAATGGTG
TTTTGGTTGTCGTGTTGAGGCTTTTGTTGATCATTTCCTCTATTAACATTTACAGTACTT
GTGTTGAACAGGAAGGTAATCTAAAGTACACTCTATATGGTGTGTTAGTTCATTATGGTG
GAAGTATTGATTCTGGTCACTACTACTGCTTTGTTCGCACTTCAAGT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2B183JQ 726 0 0
TTACCCACTCCGGAAGCTATTGGCTACCCGAGTGCACAGCAGGTCATGAGCTTCAAAGGT
AAGCCCACTGACAAAAGGCAGGTGCTTGATGAGATTGAGATAAGAGAGCTGCGCATTGAT
CACATCGGCCACCGTTGCTGTTGGGGAAGACATCCTTTTCGCACATGGAAGATCTGTGCT
GTCGTCTGCTCGTAACAACGTTTCTTTCCCCGGATAGTATGGTTGCCACAAAGCTCTTTG
CCGAGAAGTCATGGCTGGATCAAGGAGTTGAATGAGAGCAACGATGATTGCATCACAAAA
TGATTGGTAGACTTGAATGGTGTTTTGGTTGTCGTGTTGAGGCTTTTGTTGATGATTTAG
ATTGTTGTAGTATGGTAGTTGAATGGTGTTTTGGTTGTCGTGTTGAGGCTTTTGTTGATC
ATTTCCTCTATTAACATTTACAGTACTTGTGTTGAACAGGAAGGTAATCTAAAGTACACT
CTATATGGTGTGTTAGTTCATTATGGTGGAAGTATTGATTCTGGTCACTACTACTGCTTT
GTTCGCACTTCAAGTGGCATTGGTATTCCCTTGATAATAACAAGGTTATCCAAGTTAGTG
AGAAGTCTGTGTTCAACCAGAAAGCGTATAAGTTGATTCGAGTGTAATGAACTTTTTTTC
TCAGATCAATGTAATACATTTGAGATGTGAATTTTAACAAAAAAAAAGAATCTCCTAAGG
ATTCCT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL7727Contig1 700 2 1 U
GGGTGGCGATAAGTACTCTTGGTTGGTTGGTGGATAATCGATTTCACCCATGGCGTCGCT
TCCCTCTGCGAGTTTGCTTCCTTCTCCATCGCTCGTCGTTCTATCCCCCACGAAGATCTC
CTCCTCCTCCTCCTCCTCGCGCTCGACTGTTTGCTCTTCGTCCCGTGCCCATGGTTTCTC
GTCCGTCCCCCGTTCTTCGCCTAGCCTTCGGATGACTAGAAGAGCAAATCATAATAAGCT
GCAAGTCGTGTCTATGGCTCCTGAGGAAGAAAAACTCACCCGTCGCAATCCTCTCGATTT
CCCTATTGAGTGGGAGAGACCTAAACCTGGGAGGAGGCCTGATATTTTCCCCAAGTTTAG
CCCAATGAAGACACCATTGCCACCGCCCATGCCTTATGATCCTCCAGCAGAAGACGAAGA
AGAAGAGGAAGAGAAGAAAGAAGAGGAAGAAGAGAACCCTGACCAAGAAGAAGAGGAACA
ACCTGAGAAGCAACCCTAGTTTTTCTATAGTTTCGAAATCTAAGTCTGTTTCTGAGTTTT
GTATTGTTGTTTTTTTGAAGGAGAAACAAAAAAAGAAAATCAATCAATCGTTCTCACATT
TTGTAGCTAGGATCAAATCTCATGCTCGTGTTACTCGTGTGCTATCTTTGGTGTAATAGT
GATACACTATCATTTATTCTAATCCTCTCGAACAAACTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G946TF U 1
AF RR2G946JQ C 256
BS 1 700 RR2G946TF

RD RR2G946TF 700 0 0
GGGTGGCGATAAGTACTCTTGGTTGGTTGGTGGATAATCGATTTCACCCATGGCGTCGCT
TCCCTCTGCGAGTTTGCTTCCTTCTCCATCGCTCGTCGTTCTATCCCCCACGAAGATCTC
CTCCTCCTCCTCCTCCTCGCGCTCGACTGTTTGCTCTTCGTCCCGTGCCCATGGTTTCTC
GTCCGTCCCCCGTTCTTCGCCTAGCCTTCGGATGACTAGAAGAGCAAATCATAATAAGCT
GCAAGTCGTGTCTATGGCTCCTGAGGAAGAAAAACTCACCCGTCGCAATCCTCTCGATTT
CCCTATTGAGTGGGAGAGACCTAAACCTGGGAGGAGGCCTGATATTTTCCCCAAGTTTAG
CCCAATGAAGACACCATTGCCACCGCCCATGCCTTATGATCCTCCAGCAGAAGACGAAGA
AGAAGAGGAAGAGAAGAAAGAAGAGGAAGAAGAGAACCCTGACCAAGAAGAAGAGGAACA
ACCTGAGAAGCAACCCTAGTTTTTCTATAGTTTCGAAATCTAAGTCTGTTTCTGAGTTTT
GTATTGTTGTTTTTTTGAAGGAGAAACAAAAAAAGAAAATCAATCAATCGTTCTCACATT
TTGTAGCTAGGATCAAATCTCATGCTCGTGTTACTCGTGTGCTATCTTTGGTGTAATAGT
GATACACTATCATTTATTCTAATCCTCTCGAACAAACTGT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2G946JQ 445 0 0
GGCTCCTGAGGAAGAAAAACTCACCCGTCGCAATCCTCTCGATTTCCCTATTGAGTGGGA
GAGACCTAAACCTGGGAGGAGGCCTGATATTTTCCCCAAGTTTAGCCCAATGAAGACACC
ATTGCCACCGCCCATGCCTTATGATCCTCCAGCAGAAGACGAAGAAGAAGAGGAAGAGAA
GAAAGAAGAGGAAGAAGAGAACCCTGACCAAGAAGAAGAGGAACAACCTGAGAAGCAACC
CTAGTTTTTCTATAGTTTCGAAATCTAAGTCTGTTTCTGAGTTTTGTATTGTTGTTTTTT
TGAAGGAGAAACAAAAAAAGAAAATCAATCAATCGTTCTCACATTTTGTAGCTAGGATCA
AATCTCATGCTCGTGTTACTCGTGTGCTATCTTTGGTGTAATAGTGATACACTATCATTT
ATTCTAATCCTCTCGAACAAACTGT

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 2

CO CL7728Contig1 769 2 2 U
TCATAATCTTCTCTCTCCCTTCAAACGTTTTAGTTCCAAAAAGAACTAAAAACCCTAGAA
ACGGAACAATCTTTAGTCTCCAATTCGTTTTCTGATTACCTAATATAGTACGTGTTGCTA
ATCCTTATTAAGCAATATGATTAACTTTGAGCAACGGAGCTGAGGTTAGGGCTGCCGGGT
GAGAATCACGTAGGAGCCATGACTGTGAAGAATAATGGGAAAAGAGGATTTTCTGAGACT
GTTGATCTCAAGTTGAATCTTTCATCGACGGCTGTGGATTCAGTTTCTAAAGTTGATTTA
GAGAATATGAAGGAGAAGGTCTTAAAACCACCGGCCAAGTAAGAACTAATTTTAATCTAT
ATTTCTATTTATGTTAATTTACTTTTTAAATATTGGCGACTCTTTACTTATATGCTCTGT
CTTAAATGGGTTGAGATAATTAGATTATTTGTGGATAGAATCTGTAAAATTAGATGATAC
GATCCGGTCATGGTTTAGCTAGGGATAGAAACATAGGCTTTAACACGCTGAATGAATAAG
CTAATTAGAGTAACATTATGCTCGTATCATCGTATGATCGTGTGGTTGTAATTTTTCATC
TGTTTTCTTTAGTTTTGCTCCATGTTTTCAATAGTTTTGCGAAGATTATTTATATTTGAT
TTGTAAATAACGTTCCCTAGCTAGGACGATGAGTGCATGTTTAGGTTTTTGGTCGGGAAG
AATTAAGAAAAATACAAAACATAAGGAATCTTTACTTTATATACTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FZ26TF U 1
AF RR2FZ26JQ C 59
BS 1 704 RR2FZ26TF
BS 705 769 RR2FZ26JQ

RD RR2FZ26TF 704 0 0
TCATAATCTTCTCTCTCCCTTCAAACGTTTTAGTTCCAAAAAGAACTAAAAACCCTAGAA
ACGGAACAATCTTTAGTCTCCAATTCGTTTTCTGATTACCTAATATAGTACGTGTTGCTA
ATCCTTATTAAGCAATATGATTAACTTTGAGCAACGGAGCTGAGGTTAGGGCTGCCGGGT
GAGAATCACGTAGGAGCCATGACTGTGAAGAATAATGGGAAAAGAGGATTTTCTGAGACT
GTTGATCTCAAGTTGAATCTTTCATCGACGGCTGTGGATTCAGTTTCTAAAGTTGATTTA
GAGAATATGAAGGAGAAGGTCTTAAAACCACCGGCCAAGTAAGAACTAATTTTAATCTAT
ATTTCTATTTATGTTAATTTACTTTTTAAATATTGGCGACTCTTTACTTATATGCTCTGT
CTTAAATGGGTTGAGATAATTAGATTATTTGTGGATAGAATCTGTAAAATTAGATGATAC
GATCCGGTCATGGTTTAGCTAGGGATAGAAACATAGGCTTTAACACGCTGAATGAATAAG
CTAATTAGAGTAACATTATGCTCGTATCATCGTATGATCGTGTGGTTGTAATTTTTCATC
TGTTTTCTTTAGTTTTGCTCCATGTTTTCAATAGTTTTGCGAAGATTATTTATATTTGAT
TTGTAAATAACGTTCCCTAGCTAGGACGATGAGTGCATGTTTAG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RR2FZ26JQ 711 0 0
AAACGGAACAATCTTTAGTCTCCAATTCGTTTTCTGATTACCTAATATAGTACGTGTTGC
TAATCCTTATTAAGCAATATGATTAACTTTGAGCAACGGAGCTGAGGTTAGGGCTGCCGG
GTGAGAATCACGTAGGAGCCATGACTGTGAAGAATAATGGGAAAAGAGGATTTTCTGAGA
CTGTTGATCTCAAGTTGAATCTTTCATCGACGGCTGTGGATTCAGTTTCTAAAGTTGATT
TAGAGAATATGAAGGAGAAGGTCTTAAAACCACCGGCCAAGTAAGAACTAATTTTAATCT
ATATTTCTATTTATGTTAATTTACTTTTTAAATATTGGCGACTCTTTACTTATATGCTCT
GTCTTAAATGGGTTGAGATAATTAGATTATTTGTGGATAGAATCTGTAAAATTAGATGAT
ACGATCCGGTCATGGTTTAGCTAGGGATAGAAACATAGGCTTTAACACGCTGAATGAATA
AGCTAATTAGAGTAACATTATGCTCGTATCATCGTATGATCGTGTGGTTGTAATTTTTCA
TCTGTTTTCTTTAGTTTTGCTCCATGTTTTCAATAGTTTTGCGAAGATTATTTATATTTG
ATTTGTAAATAACGTTCCCTAGCTAGGACGATGAGTGCATGTTTAGGTTTTTGGTCGGGA
AGAATTAAGAAAAATACAAAACATAAGGAATCTTTACTTTATATACTTGAG

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL7729Contig1 1362 2 2 U
GTTTATTCTCAAACATTGGGACAAAATGGCTTCATCATCATCATCTTCATATGCAGAGTT
AAAAGATGCTTGGCATCCATCAACCACAATAGTGGACACAACAGCATCAAGCTACTGGTT
TAACTGGAGGGTTATGATCTGCTGCATATGGATGGCTATAGCAATGGTTATTACCGCTTT
TCTTATATTCAAATGCGAAGGCTTTCGCCGGAAGCAAGGTGGAGACGGTGGAGAGGGAGA
GTGGTCGGGTAATGTATATGAAGATGAGACTTGGAGGCCTTGTCTACGCAATATTCACCC
AGCTTGGCTTCTTGCCTTTCGGGTTGTTGCCTTTCTTGTTCTTCTCATTATGCTTATCGT
TATTGGAGTTGTTGATGGACCTACCATCTTCTTCTACTATACACAGTGGACTTTTGCTTT
AATTACTCTCTATTTTGGACTAGGCTCGCTTCTTTCGCTGCATGGATGTTACCAATACAA
CAAAAGAGTGGCTGGTGATAGAGTTAATAGCACTGAGGCCATGTCCGTAGACTCAGAGAG
AGCGATATCCAAAGGCTCTGATCATACTCTCAACAGAGTCAATACTCCAGTAATCTAGCC
GGTGTTTGGGGATATGTTTTCCAGATAATATTTCAGATGAATGCAGGTGCAGTTTTGCTC
ACTGACTGTGTCTTCTGGTTCATCATTGTTCCTTTCCTTGAGATTCATGATTATAGCCTC
AATGTGCTGGTGATCAGCATGCACTCTCTTAACGCAATTTTCTTGCTTGGTGATGCTGCT
TTGAACTCTTTGAGCTTTCCATGCTTCAGAATTGCTTACTTCTTCTTATGGACAATAGCT
TATGTTTTATTCCAATGGACTCTCCACTCGCTAGTCCATATATGGTGGCCTTACCCATTC
CTGGACTTAGCATCCCACTACGCTCCACTATGGTATTTCTCAGTTGCAGTGATGCACTTG
CCATGCTATGGAGCCTTTACCTTGTTGGTGAAGCTAAAACATCGGCTTCTTCAGAGATGG
TTCCCTGAATTTTACCAAAGTCCTCGGTAGTAGCTTGCATAGAAAGCAACCACGTTTAAA
TGAAAGTCTGATTTAAGTAGATGTTTTTGTGTGAAAAGACAGAAGGAAACAAAAACAAAA
GTGTGAAGCAACAAACTCATGCTTATAAATATGATTTAATATTCTTTGCTCATATCAAAT
AAGTGGTATCTTGAAAAAGATGACAATTTAGACAATAGGAGCATGATAAAAGTGCAATAA
TGCAGTAACTTATTCGTTAATTAGTTTATAAGCCTATAGAGATTGGCTAGCTAGCTTTCA
TTGGACATGTTATGAGCTGTTTATGAACTAATAGTGGATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A655TF U 1
AF RR2A655JQ C 599
BS 1 765 RR2A655TF
BS 766 1362 RR2A655JQ

RD RR2A655TF 765 0 0
GTTTATTCTCAAACATTGGGACAAAATGGCTTCATCATCATCATCTTCATATGCAGAGTT
AAAAGATGCTTGGCATCCATCAACCACAATAGTGGACACAACAGCATCAAGCTACTGGTT
TAACTGGAGGGTTATGATCTGCTGCATATGGATGGCTATAGCAATGGTTATTACCGCTTT
TCTTATATTCAAATGCGAAGGCTTTCGCCGGAAGCAAGGTGGAGACGGTGGAGAGGGAGA
GTGGTCGGGTAATGTATATGAAGATGAGACTTGGAGGCCTTGTCTACGCAATATTCACCC
AGCTTGGCTTCTTGCCTTTCGGGTTGTTGCCTTTCTTGTTCTTCTCATTATGCTTATCGT
TATTGGAGTTGTTGATGGACCTACCATCTTCTTCTACTATACACAGTGGACTTTTGCTTT
AATTACTCTCTATTTTGGACTAGGCTCGCTTCTTTCGCTGCATGGATGTTACCAATACAA
CAAAAGAGTGGCTGGTGATAGAGTTAATAGCACTGAGGCCATGTCCGTAGACTCAGAGAG
AGCGATATCCAAAGGCTCTGATCATACTCTCAACAGAGTCAATACTCCAGTAATCTAGCC
GGTGTTTGGGGATATGTTTTCCAGATAATATTTCAGATGAATGCAGGTGCAGTTTTGCTC
ACTGACTGTGTCTTCTGGTTCATCATTGTTCCTTTCCTTGAGATTCATGATTATAGCCTC
AATGTGCTGGTGATCAGCATGCACTCTCTTAACGCAATTTTCTTG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RR2A655JQ 764 0 0
CCGGTGTTTGGGGATATGTTTTCCAGATAATATTTCAGATGAATGCAGGTGCAGTTTTGC
TCACTGACTGTGTCTTCTGGTTCATCATTGTTCCTTTCCTTGAGATTCATGATTATAGCC
TCAATGTGCTGGTGATCAGCATGCACTCTCTTAACGCAATTTTCTTGCTTGGTGATGCTG
CTTTGAACTCTTTGAGCTTTCCATGCTTCAGAATTGCTTACTTCTTCTTATGGACAATAG
CTTATGTTTTATTCCAATGGACTCTCCACTCGCTAGTCCATATATGGTGGCCTTACCCAT
TCCTGGACTTAGCATCCCACTACGCTCCACTATGGTATTTCTCAGTTGCAGTGATGCACT
TGCCATGCTATGGAGCCTTTACCTTGTTGGTGAAGCTAAAACATCGGCTTCTTCAGAGAT
GGTTCCCTGAATTTTACCAAAGTCCTCGGTAGTAGCTTGCATAGAAAGCAACCACGTTTA
AATGAAAGTCTGATTTAAGTAGATGTTTTTGTGTGAAAAGACAGAAGGAAACAAAAACAA
AAGTGTGAAGCAACAAACTCATGCTTATAAATATGATTTAATATTCTTTGCTCATATCAA
ATAAGTGGTATCTTGAAAAAGATGACAATTTAGACAATAGGAGCATGATAAAAGTGCAAT
AATGCAGTAACTTATTCGTTAATTAGTTTATAAGCCTATAGAGATTGGCTAGCTAGCTTT
CATTGGACATGTTATGAGCTGTTTATGAACTAATAGTGGATTTC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL7730Contig1 1058 2 4 U
AGGGGATCTCTCTTCCTTGCATCATGTAATGAGCTTAAAATAGCAGCAAAGATTGAATTT
TTCTGGCGAAGAACGAGAAAAAGTCAGAGACTTTACATCTGAGTTCGTCGTTTAAAGATT
AAATCTTCAGTTTCTTTTTTTTTTCTCCAATGGGTATGGCAGCAGCGGAATCACAGTTTC
ATGTATTAGCCGTTGATGATAGTTTATTCGATCGGAAACTCATAGAGAGATTACTTCAAA
AGTCTTCTTGTCAAGTAACAACTGTGGAGTCAGGCTATAAGGCTTTAGAGTTTCTGGGTT
TAAGACAAGGTATTGAGAGTAACGACCCAACTGCTCTTTCTCCATCTCCTCAGGAAGTGG
AAGTGAATCTTATCATTACAGATTATTGTATGCCAGGCATGACTGGTTATGATTTGCTCA
AAAAAATCAAGGAATCATCAGCTTTTAAGCACATACCAGTACTGATCATGTCCTCTGAGA
ACGTTCCTGCGAGGATCAGCAGATGTTTGGAAGAAGGAGCTGAAGAGTTTTTCTTGAAAC
CAGTAAGATTGGCTGATCTCAACAAGCTGAAACCTCATATGATGAAAACAAAGTTGAAGA
ACCAGAAGCTTGAAGCAATTGAAAACCCTTCAAATGACAAAAATGGAACCGCAGCAGCAA
TTGAACCAGAGATTAAAGACTCAATAGAAATGGGAATCAAAATCTTGCCTATACAATCAG
AATTAGAACCAAAACAAGTGCTTCTGCAAGTTGTACAACAAGAGGAGCAAACATTGAGTA
ACAACAAGAGGAAGTCGATGGAAGAAGGGCTGTCAACAGATAGACCACGTCCTAGGTTAG
AGGGCATCGCAACCGCTGTTTGATTTCTGTAGATTGTTGTAGGAATGCTTCTGCTGGGGT
AAAACACATGTTTTCACCAGGGAATGCAGCAAGTAAATATAGATGGATGATAATATGAAC
TGAATGATAATGATGTATGGGGATAATGTTTATAAATACATCAGTAAATCATACATGGTA
AATAACCCATTTCCCAATTTTGTTTCACTCCTTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F347TF U 1
AF RR2F347JQ C 238
BS 1 780 RR2F347TF
BS 781 783 RR2F347JQ
BS 784 802 RR2F347TF
BS 803 1058 RR2F347JQ

RD RR2F347TF 802 0 0
AGGGGATCTCTCTTCCTTGCATCATGTAATGAGCTTAAAATAGCAGCAAAGATTGAATTT
TTCTGGCGAAGAACGAGAAAAAGTCAGAGACTTTACATCTGAGTTCGTCGTTTAAAGATT
AAATCTTCAGTTTCTTTTTTTTTTCTCCAATGGGTATGGCAGCAGCGGAATCACAGTTTC
ATGTATTAGCCGTTGATGATAGTTTATTCGATCGGAAACTCATAGAGAGATTACTTCAAA
AGTCTTCTTGTCAAGTAACAACTGTGGAGTCAGGCTATAAGGCTTTAGAGTTTCTGGGTT
TAAGACAAGGTATTGAGAGTAACGACCCAACTGCTCTTTCTCCATCTCCTCAGGAAGTGG
AAGTGAATCTTATCATTACAGATTATTGTATGCCAGGCATGACTGGTTATGATTTGCTCA
AAAAAATCAAGGAATCATCAGCTTTTAAGCACATACCAGTACTGATCATGTCCTCTGAGA
ACGTTCCTGCGAGGATCAGCAGATGTTTGGAAGAAGGAGCTGAAGAGTTTTTCTTGAAAC
CAGTAAGATTGGCTGATCTCAACAAGCTGAAACCTCATATGATGAAAACAAAGTTGAAGA
ACCAGAAGCTTGAAGCAATTGAAAACCCTTCAAATGACAAAAATGGAACCGCAGCAGCAA
TTGAACCAGAGATTAAAGACTCAATAGAAATGGGAATCAAAATCTTGCCTATACAATCAG
AATTAGAACCAAAACAAGTGCTTCTGCAAGTTGTACAACAAGAGGAGCAAACATTGAGTA
C**ACAAGAGGAAGTCGATGGA

QA 1 802 1 802
DS 

RD RR2F347JQ 821 0 0
AAAAGTCTTCTTGTCAAGTAACAACTGTGGAGTCAGGCTATAAGGCTTTAGAGTTTCTGG
GTTTAAGACAAGGTATTGAGAGTAACGACCCAACTGCTCTTTCTCCATCTCCTCAGGAAG
TGGAAGTGAATCTTATCATTACAGATTATTGTATGCCAGGCATGACTGGTTATGATTTGC
TCAAAAAAATCAAGGAATCATCAGCTTTTAAGCACATACCAGTACTGATCATGTCCTCTG
AGAACGTTCCTGCGAGGATCAGCAGATGTTTGGAAGAAGGAGCTGAAGAGTTTTTCTTGA
AACCAGTAAGATTGGCTGATCTCAACAAGCTGAAACCTCATATGATGAAAACAAAGTTGA
AGAACCAGAAGCTTGAAGCAATTGAAAACCCTTCAAATGACAAAAATGGAACCGCAGCAG
CAATTGAACCAGAGATTAAAGACTCAATAGAAATGGGAATCAAAATCTTGCCTATACAAT
CAGAATTAGAACCAAAACAAGTGCTTCTGCAAGTTGTACAACAAGAGGAGCAAACATTGA
GTAACAACAAGAGGAAGTCGATGGAAGAAGGGCTGTCAACAGATAGACCACGTCCTAGGT
TAGAGGGCATCGCAACCGCTGTTTGATTTCTGTAGATTGTTGTAGGAATGCTTCTGCTGG
GGTAAAACACATGTTTTCACCAGGGAATGCAGCAAGTAAATATAGATGGATGATAATATG
AACTGAATGATAATGATGTATGGGGATAATGTTTATAAATACATCAGTAAATCATACATG
GTAAATAACCCATTTCCCAATTTTGTTTCACTCCTTTTTCT

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 2

CO CL7731Contig1 934 2 2 U
GGGGAAGGTAAAGTCAAACAAACAGAAGAGGAGCGAGCGATCATCAGAAGGAGGAGGATC
TTCCTTGTGCGATCTCTGAGATTCCGGCGAACCAGATCTCGTAATTTCAATCGCCCCCTG
CTCTAGGAAGCTCGATCTTCACCTCTGACCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGATAGATTAATC
GGGAAAGTTCGAAATGGTACTGGTTCTGGCATTAGGGGATCTACATGTACCCCATAGAGC
GGCTGATCTGCCTCCAAAGTTCAAATCGATGCTTGTTCCTGGCAAGATTCAACACATCAT
CTGCACTGGCAATCTCTGCATCAAAGAAATCCATGACTACTTGAAGACTATATGCCCTGA
TTTGCATATAGTTCGTGGGGAGTTTGATGAAGATGCACGATACCCTGAGACCAAAACCTT
GACTATCGGCCAGTTCAAGCTTGGTCTCTGCCACGGCCACCAGGTGATCCCATGGGGTGA
TCTAGAATCACTTGCCATGCTTCAGAGACAACTCGACGTGGACATACTTGTAACGGGCCA
CACCCACCAGTTCACTGCCTACAAACACGAGGGAGGAGTCGTGATTAACCCTGGCTCTGC
TACTGGAGCTTATAGTAGCATAAACCAAGATGTTAACCCCAGCTTTGTTCTTATGGATAT
CGATGGTCTTCGAGTTGTGGTCTATGTCTACGAGCTCATCGACGGAGAGGTTAAAGTCGA
CAAGATCGATTTCAAGAAGACCTCCACTTCCAACTCTGCTCCTTAGCCTATTTAACAACC
TGAACTCCTGTTTTCTTTTGTGTGTTTCGTTTGGAATCACTCGTGAAGTTTGGAACGTTC
TTGTGAAAATAATTTTTAAAGATTTGGAAATTGGACACCTGATAACAATGTTTTGCAAAT
CTCTTGAAGTTGATCGACTTTGTTTAAAGTGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH81TF U 1
AF RR2AH81JQ C 147
BS 1 702 RR2AH81TF
BS 703 934 RR2AH81JQ

RD RR2AH81TF 702 0 0
GGGGAAGGTAAAGTCAAACAAACAGAAGAGGAGCGAGCGATCATCAGAAGGAGGAGGATC
TTCCTTGTGCGATCTCTGAGATTCCGGCGAACCAGATCTCGTAATTTCAATCGCCCCCTG
CTCTAGGAAGCTCGATCTTCACCTCTGACCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGATAGATTAATC
GGGAAAGTTCGAAATGGTACTGGTTCTGGCATTAGGGGATCTACATGTACCCCATAGAGC
GGCTGATCTGCCTCCAAAGTTCAAATCGATGCTTGTTCCTGGCAAGATTCAACACATCAT
CTGCACTGGCAATCTCTGCATCAAAGAAATCCATGACTACTTGAAGACTATATGCCCTGA
TTTGCATATAGTTCGTGGGGAGTTTGATGAAGATGCACGATACCCTGAGACCAAAACCTT
GACTATCGGCCAGTTCAAGCTTGGTCTCTGCCACGGCCACCAGGTGATCCCATGGGGTGA
TCTAGAATCACTTGCCATGCTTCAGAGACAACTCGACGTGGACATACTTGTAACGGGCCA
CACCCACCAGTTCACTGCCTACAAACACGAGGGAGGAGTCGTGATTAACCCTGGCTCTGC
TACTGGAGCTTATAGTAGCATAAACCAAGATGTTAACCCCAGCTTTGTTCTTATGGATAT
CGATGGTCTTCGAGTTGTGGTCTATGTCTACGAGCTCATCGA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2AH81JQ 788 0 0
GACCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGATAGATTAATCGGGAAAGTTCGAAATGGTACTGGTTC
TGGCATTAGGGGATCTACATGTACCCCATAGAGCGGCTGATCTGCCTCCAAAGTTCAAAT
CGATGCTTGTTCCTGGCAAGATTCAACACATCATCTGCACTGGCAATCTCTGCATCAAAG
AAATCCATGACTACTTGAAGACTATATGCCCTGATTTGCATATAGTTCGTGGGGAGTTTG
ATGAAGATGCACGATACCCTGAGACCAAAACCTTGACTATCGGCCAGTTCAAGCTTGGTC
TCTGCCACGGCCACCAGGTGATCCCATGGGGTGATCTAGAATCACTTGCCATGCTTCAGA
GACAACTCGACGTGGACATACTTGTAACGGGCCACACCCACCAGTTCACTGCCTACAAAC
ACGAGGGAGGAGTCGTGATTAACCCTGGCTCTGCTACTGGAGCTTATAGTAGCATAAACC
AAGATGTTAACCCCAGCTTTGTTCTTATGGATATCGATGGTCTTCGAGTTGTGGTCTATG
TCTACGAGCTCATCGACGGAGAGGTTAAAGTCGACAAGATCGATTTCAAGAAGACCTCCA
CTTCCAACTCTGCTCCTTAGCCTATTTAACAACCTGAACTCCTGTTTTCTTTTGTGTGTT
TCGTTTGGAATCACTCGTGAAGTTTGGAACGTTCTTGTGAAAATAATTTTTAAAGATTTG
GAAATTGGACACCTGATAACAATGTTTTGCAAATCTCTTGAAGTTGATCGACTTTGTTTA
AAGTGTGT

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL7732Contig1 752 2 2 U
GGAGACATACAGAGTGGTAGAGTCACAACACAAGCCGAAGAGTGAAAAAAATGGCAGCGA
CGACTCTTTCCATCGCAACCACAATCCGCTCCTCCTCCTCTCACCTCCCTCCCCATGTCT
TACCTTTCCGACCCAACCCAACCGCATTTCCCTTTCGCCTCGGTTCATCCTCCTCCACGC
TAACCCACCGCGCAACCCACCTCCGTCCCATCGCCGCCGTCGAAGCCCCGGAGAAAATCG
AGAAGATCGGATCCGAAATCTCATCCCTCACTCTCGAGGAAGCCCGCGTCCTCGTCGACT
ACCTCCAAGACAAGTTCGGAGTCTCGCCTCTCTCCTTAGCTCCCGCTGCAGCGGCTGTGG
CTGCTCCCGGAGACGGCGGCGGCGCGGCGGCTGCGGTGGAGGAGCAGACCGAGTTCGACG
TGGTGATCAACGAGGTCCCTAGCAATGCGCGTATCGCGGTGATCAAAGCGGTGAGGGTGT
TGACTAGCTTGGCGTTGAAGGAAGCGAAGGAGCTCATCGAAGGGTTGCCGAAGAAGTTCA
AGGAAGGTGTGACGAAGGATGAGGCTGAAGAGGCCAAGAAGCAGCTTGAAGAAGCTGGCG
CTAAGGTCTCCATTGCTTAAAGTGTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTGAAGTTGTGTATGGTT
TGTTCCTTGTTGTGTTGTTTAGCATATAGTTTGTGTCTGAGATTGTTTTCGGTTCAGTTC
CTACAAAAAATAATGTGAATCAATTTGCGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG06TF U 1
AF RR2DG06JQ C 252
BS 1 553 RR2DG06TF
BS 554 752 RR2DG06JQ

RD RR2DG06TF 553 0 0
GGAGACATACAGAGTGGTAGAGTCACAACACAAGCCGAAGAGTGAAAAAAATGGCAGCGA
CGACTCTTTCCATCGCAACCACAATCCGCTCCTCCTCCTCTCACCTCCCTCCCCATGTCT
TACCTTTCCGACCCAACCCAACCGCATTTCCCTTTCGCCTCGGTTCATCCTCCTCCACGC
TAACCCACCGCGCAACCCACCTCCGTCCCATCGCCGCCGTCGAAGCCCCGGAGAAAATCG
AGAAGATCGGATCCGAAATCTCATCCCTCACTCTCGAGGAAGCCCGCGTCCTCGTCGACT
ACCTCCAAGACAAGTTCGGAGTCTCGCCTCTCTCCTTAGCTCCCGCTGCAGCGGCTGTGG
CTGCTCCCGGAGACGGCGGCGGCGCGGCGGCTGCGGTGGAGGAGCAGACCGAGTTCGACG
TGGTGATCAACGAGGTCCCTAGCAATGCGCGTATCGCGGTGATCAAAGCGGTGAGGGTGT
TGACTAGCTTGGCGTTGAAGGAAGCGAAGGAGCTCATCGAAGGGTTGCCGAAGAAGTTCA
AGGAAGGTGTGAC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2DG06JQ 501 0 0
TCCGAAATCTCATCCCTCACTCTCGAGGAAGCCCGCGTCCTCGTCGACTACCTCCAAGAC
AAGTTCGGAGTCTCGCCTCTCTCCTTAGCTCCCGCTGCAGCGGCTGTGGCTGCTCCCGGA
GACGGCGGCGGCGCGGCGGCTGCGGTGGAGGAGCAGACCGAGTTCGACGTGGTGATCAAC
GAGGTCCCTAGCAATGCGCGTATCGCGGTGATCAAAGCGGTGAGGGTGTTGACTAGCTTG
GCGTTGAAGGAAGCGAAGGAGCTCATCGAAGGGTTGCCGAAGAAGTTCAAGGAAGGTGTG
ACGAAGGATGAGGCTGAAGAGGCCAAGAAGCAGCTTGAAGAAGCTGGCGCTAAGGTCTCC
ATTGCTTAAAGTGTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTGAAGTTGTGTATGGTTTGTTCCTTGTT
GTGTTGTTTAGCATATAGTTTGTGTCTGAGATTGTTTTCGGTTCAGTTCCTACAAAAAAT
AATGTGAATCAATTTGCGGCC

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL7733Contig1 741 2 2 U
GGGCCGGAGATCGGAAGTTCAAACGGGAAGAGAAGAAATGGCTTCGCTCGGTTTCAACCT
CGGATTCTCCTTCTCCGGTGTACGAACTCAGAAGAATCATCAAGTTTCTCCCGCAAATGG
AAGAGTTCGCGTTATCTCCTGCAACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCACAAGCATCTCC
GCAGGGGATTTCGACGCCTCCTGAGATAGAGCTTGAGTTCTTCGGTCCGAAGCCTGAGAG
CGACGGGACGTATCCGAGGGATAAGACGAAAGCTGTGAGCGTAGAGAAGCTTCTGAGAAG
CATTATGCAGGACAACAAGATCGATCTTTACGCTACTTACGGGAAAGTGATGAATTGTGG
AGGTGGAGGAAGCTGTGGAACTTGCATTGTTGAGATTCTTGATGGCAGAGAACTTCTGAA
CGATAGAACCGATACAGAAAACAAGTACCTGAAGAAAAAGCCTTAATCCTGGAGACTCGC
ATGCCAAACAATAGTAGGGAACAAAGAAAACTCAGGAAAGGTTGTGGTTCAGCGGATTCC
GCAATGGAGGAAGTGAATTCCCCATGTATGTTGTAAGGGTTCTCTATTCGTTTATCAGCT
CCTCGCGAGCCATATTTATATGTCCCATACTAGTTTTCTGTTTGTACATCTCCCAACAGC
TCGATTCCAACTAGAAACTGTTTCAGCTTTTCCTTGTAGATGGCAAATGTCACAAGTATC
TTATTATATAAAGCTTGGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DS10TF U 1
AF RR2DS10JQ C 141
BS 1 696 RR2DS10TF
BS 697 741 RR2DS10JQ

RD RR2DS10TF 696 0 0
GGGCCGGAGATCGGAAGTTCAAACGGGAAGAGAAGAAATGGCTTCGCTCGGTTTCAACCT
CGGATTCTCCTTCTCCGGTGTACGAACTCAGAAGAATCATCAAGTTTCTCCCGCAAATGG
AAGAGTTCGCGTTATCTCCTGCAACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCACAAGCATCTCC
GCAGGGGATTTCGACGCCTCCTGAGATAGAGCTTGAGTTCTTCGGTCCGAAGCCTGAGAG
CGACGGGACGTATCCGAGGGATAAGACGAAAGCTGTGAGCGTAGAGAAGCTTCTGAGAAG
CATTATGCAGGACAACAAGATCGATCTTTACGCTACTTACGGGAAAGTGATGAATTGTGG
AGGTGGAGGAAGCTGTGGAACTTGCATTGTTGAGATTCTTGATGGCAGAGAACTTCTGAA
CGATAGAACCGATACAGAAAACAAGTACCTGAAGAAAAAGCCTTAATCCTGGAGACTCGC
ATGCCAAACAATAGTAGGGAACAAAGAAAACTCAGGAAAGGTTGTGGTTCAGCGGATTCC
GCAATGGAGGAAGTGAATTCCCCATGTATGTTGTAAGGGTTCTCTATTCGTTTATCAGCT
CCTCGCGAGCCATATTTATATGTCCCATACTAGTTTTCTGTTTGTACATCTCCCAACAGC
TCGATTCCAACTAGAAACTGTTTCAGCTTTTCCTTG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RR2DS10JQ 601 0 0
GCAACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCACAAGCATCTCCGCAGGGGATTTCGACGCCTC
CTGAGATAGAGCTTGAGTTCTTCGGTCCGAAGCCTGAGAGCGACGGGACGTATCCGAGGG
ATAAGACGAAAGCTGTGAGCGTAGAGAAGCTTCTGAGAAGCATTATGCAGGACAACAAGA
TCGATCTTTACGCTACTTACGGGAAAGTGATGAATTGTGGAGGTGGAGGAAGCTGTGGAA
CTTGCATTGTTGAGATTCTTGATGGCAGAGAACTTCTGAACGATAGAACCGATACAGAAA
ACAAGTACCTGAAGAAAAAGCCTTAATCCTGGAGACTCGCATGCCAAACAATAGTAGGGA
ACAAAGAAAACTCAGGAAAGGTTGTGGTTCAGCGGATTCCGCAATGGAGGAAGTGAATTC
CCCATGTATGTTGTAAGGGTTCTCTATTCGTTTATCAGCTCCTCGCGAGCCATATTTATA
TGTCCCATACTAGTTTTCTGTTTGTACATCTCCCAACAGCTCGATTCCAACTAGAAACTG
TTTCAGCTTTTCCTTGTAGATGGCAAATGTCACAAGTATCTTATTATATAAAGCTTGGTA
G

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL7734Contig1 755 2 7 U
GGAATCGCTCGCTCGCTAGCTGTTTTCCTCTCTCTCTGTTCTTCTTCTGTCTTCTTCCCT
TTTTATTTTTCTCGCAGAAGCAGCCACTGATAGATAAAAAAAAGAGGAAAGGAATGGCGG
GAGGTGGAGCTCCAGCACCGAAAGCAGACGAACCTCAACCTCATCCTCCTAAAGATCAGC
TTCCTAACATCTCTTACTGCATCACCAGTCCTCCCCCTTGGCCTGAAGCGATTCTTCTCG
GCTTTCAACATTACCTTGTCATGCTCGGCACTACTGTTCTCATTCCCACTGCTCTTGTTC
CCCAGATGGGAGGTGGTTATGAAGAGAAGGCAAAGGTGGTCCAGACTATTCTCTTTGTTG
CCGGCATCAACACCTTGCTCCAATCTCTTTTCGGCACCAGGCTCCCTGCTGTTATCGGAG
CTTCTTACACTTTTGTGCCTACCACCATTTCCATCATCCTCTCTGGCAGATTCAGTGATA
CCTCTAACCCTATTGATCGCTTTGAGAGGATTATGCGAGCGACACAAGGCGCACTGATTG
TTGCTTCTACCCTACAGATGATTCTCGGTTTCAGTGGCCTCTGGCGTAATGTTGTCAGGT
TCTTAAGCCCTATTTCAGCTGTTCCACTGGTGGGTCTCGTTGACTTTGGGCTATACGAGT
TTGGTTTCCCAGGGGTTGCAAAATGCATAGAGATTGGGTTGCCTGAGCTCCTTATCCTAG
TATTTGTCTCACAGTATCTGCCTCATGTGATCAAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2A003TF U 1
AF RR2C202TF U 2
BS 1 102 RR2A003TF
BS 103 103 RR2C202TF
BS 104 642 RR2A003TF
BS 643 643 RR2C202TF
BS 644 709 RR2A003TF
BS 710 710 RR2C202TF
BS 711 755 RR2A003TF

RD RR2A003TF 755 0 0
GGAATCGCTCGCTCGCTAGCTGTTTTCCTCTCTCTCTGTTCTTCTTCTGTCTTCTTCCCT
TTTTATTTTTCTCGCAGAAGCAGCCACTGATAGATAAAAAAA*GAGGAAAGGAATGGCGG
GAGGTGGAGCTCCAGCACCGAAAGCAGACGAACCTCAACCTCATCCTCCTAAAGATCAGC
TTCCTAACATCTCTTACTGCATCACCAGTCCTCCCCCTTGGCCTGAAGCGATTCTTCTCG
GCTTTCAACATTACCTTGTCATGCTCGGCACTACTGTTCTCATTCCCACTGCTCTTGTTC
CCCAGATGGGAGGTGGTTATGAAGAGAAGGCAAAGGTGGTCCAGACTATTCTCTTTGTTG
CCGGCATCAACACCTTGCTCCAATCTCTTTTCGGCACCAGGCTCCCTGCTGTTATCGGAG
CTTCTTACACTTTTGTGCCTACCACCATTTCCATCATCCTCTCTGGCAGATTCAGTGATA
CCTCTAACCCTATTGATCGCTTTGAGAGGATTATGCGAGCGACACAAGGCGCACTGATTG
TTGCTTCTACCCTACAGATGATTCTCGGTTTCAGTGGCCTCTGGCGTAATGTTGTCAGGT
TCTTAAGCCCTATTTCAGCTGTTCCACTGGTGGGTCTCGTTGGCTTTGGGCTATACGAGT
TTGGTTTCCCAGGGGTTGCAAAATGCATAGAGATTGGGTTGCCTGAGCTTCTTATCCTAG
TATTTGTCTCACAGTATCTGCCTCATGTGATCAAA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RR2C202TF 751 0 0
GG
ATCGCTCGCTCGCTAGCTGTTTTCCTCTCTCTCTGTTCTTCTTCTGTCTTCTTCCCTTTT
TATTTTTCTCGCAGAAGCAGCCACTGATAGATAAAAAAAAGAGGAAAGGAATGGCGGGAG
GTGGAGCTCCAGCACCGAAAGCAGACGAACCTCAACCTCATCCTCCTAAAGATCAGCTTC
CTAACATCTCTTACTGCATCACCAGTCCTCCCCCTTGGCCTGAAGCGATTCTTCTTGGCT
TTCAACATTACCTTGTCATGCTCGGCACTACTGTTCTCATTCCCACTGCTCTTGTTCCCC
AGATGGGAGGTGGTTATGAAGAGAAGGCAAAGGTGGTCCAGACTATTCTCTTTGTTGCCG
GCATCAACACCTTGCTCCAATCTCTTTTCGGCACCAGGCTCCCTGCTGTTATCGGAGCTT
CTTACACTTTTGTGCCTACCACCATTTCCATCATCCTCTCTGGCAGATTCAGTGATACCT
CTAACCCTATTGATCGCTTTGAGAGGATTATGCGAGCGACACAAGGCGCACTGATTGTTG
CTTCTACCCTACAGATGATTCTCGGTTTCAGTGGCCTCTGGCGTAATGTTGTCAGGTTCT
TAAGCCCTATTTCAGCTGTTCCACTGGTGGGTCTCGTTGACTTTGGGCTATACGAGTTTG
GTTTCCCAGGGGTTGCAAA*TGCATAGAGATTGG*TTGCCTGAGCTC**TATCCTAGTAT
TTGTCTCACAGTATCTGCCTCATGTGATC

QA 3 751 3 751
DS 



AS 1 2

CO CL7735Contig1 859 2 2 U
ACTGGTCAGATTGGACGCTTGAGATTCAGGTCTCACAGCTTTTCAAAAGGTGGTCCTGCA
AATAATGACTTCATGAGCTATGAAAAGCCAACCAGACCTATCCTGAAGGTTTCCAAACCA
AGAGAGCATTCTGAATATCAAATATGAAATCAATGGAGATAGAGCCGCTGGGGCACACAA
ACCAGTGGATGCAGATAACTCTGGAGCTGATTCTGAAAGGAGAGCTTTGGTGTTCAAGAG
TGCTATCGTTTTGCAGCGTCCAGTGCTTGATCCTAGCCTTACAGTTGGATTTCTCCCACT
TCCTTCTGATGGTCTTAGGGTCGGGAAACTTATTACCATGCAGTGGAGAGTCGGGAGGGT
GAAAGAACTCAAGGGAAGTGATGCCGTAGAACAAAAACATGAGGAAGTGTTATACGAAGT
CAATGCAAATTCGGCGAATTGGATGATTGCAGGTAGAAAGAGAGGTCATGTGTCTCTCTC
AGAAGAGAAAGGTTCAAGAGTAGTAATCTCGATACTATGTGTCCCATTAGTTGCGGGTTA
TGTACGTCCTCCTCAGCTCAGTTTGCCGAACGTGGAAGAAGAAAATGTAAGAAGCAATCC
ACCGAGTCCTCAATTAGTGTGTGTCTTGCCTCCATTTCTCAGTTCTTCCTATTGCGTCCC
TGTCAAGTAGTGAAGGTGGTTCACTTTTAACTTTTTCATACTCACCTCCAAGTTTCATTA
GAGTATTTGCTACGACCAATATCAAAAAGGCGTATTTTATATTTGTATTTTTTTTTTGTT
GGTTTGCAATCGTAGGAATGTCAGGGAAGTTAATCAAAAAAACCAAAAGAGTTAATCAAA
GTGAAAATTGTTTAGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CC51TF U 1
AF RR2CC51JQ C 107
BS 1 488 RR2CC51TF
BS 489 859 RR2CC51JQ

RD RR2CC51TF 488 0 0
ACTGGTCAGATTGGACGCTTGAGATTCAGGTCTCACAGCTTTTCAAAAGGTGGTCCTGCA
AATAATGACTTCATGAGCTATGAAAAGCCAACCAGACCTATCCTGAAGGTTTCCAAACCA
AGAGAGCATTCTGAATATCAAATATGAAATCAATGGAGATAGAGCCGCTGGGGCACACAA
ACCAGTGGATGCAGATAACTCTGGAGCTGATTCTGAAAGGAGAGCTTTGGTGTTCAAGAG
TGCTATCGTTTTGCAGCGTCCAGTGCTTGATCCTAGCCTTACAGTTGGATTTCTCCCACT
TCCTTCTGATGGTCTTAGGGTCGGGAAACTTATTACCATGCAGTGGAGAGTCGGGAGGGT
GAAAGAACTCAAGGGAAGTGATGCCGTAGAACAAAAACATGAGGAAGTGTTATACGAAGT
CAATGCAAATTCGGCGAATTGGATGATTGCAGGTAGAAAGAGAGGTCATGTGTCTCTCTC
AGAAGAGA

QA 1 488 1 488
DS 

RD RR2CC51JQ 753 0 0
AGGTTTCCAAACCAAGAGAGCATTCTGAATATCAAATATGAAATCAATGGAGATAGAGCC
GCTGGGGCACACAAACCAGTGGATGCAGATAACTCTGGAGCTGATTCTGAAAGGAGAGCT
TTGGTGTTCAAGAGTGCTATCGTTTTGCAGCGTCCAGTGCTTGATCCTAGCCTTACAGTT
GGATTTCTCCCACTTCCTTCTGATGGTCTTAGGGTCGGGAAACTTATTACCATGCAGTGG
AGAGTCGGGAGGGTGAAAGAACTCAAGGGAAGTGATGCCGTAGAACAAAAACATGAGGAA
GTGTTATACGAAGTCAATGCAAATTCGGCGAATTGGATGATTGCAGGTAGAAAGAGAGGT
CATGTGTCTCTTTCAGAAGAGAAAGGTTCAAGAGTAGTAATCTCGATACTATGTGTCCCA
TTAGTTGCGGGTTATGTACGTCCTCCTCAGCTCAGTTTGCCGAACGTGGAAGAAGAAAAT
GTAAGAAGCAATCCACCGAGTCCTCAATTAGTGTGTGTCTTGCCTCCATTTCTCAGTTCT
TCCTATTGCGTCCCTGTCAAGTAGTGAAGGTGGTTCACTTTTAACTTTTTCATACTCACC
TCCAAGTTTCATTAGAGTATTTGCTACGACCAATATCAAAAAGGCGTATTTTATATTTGT
ATTTTTTTTTTGTTGGTTTGCAATCGTAGGAATGTCAGGGAAGTTAATCAAAAAAACCAA
AAGAGTTAATCAAAGTGAAAATTGTTTAGGATC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL7736Contig1 834 2 2 U
GGATTTTAAAAACCTCAGAGTCAGTTCTCTTCTTCTTATTGTCCTAATCCAAAACCTAAA
CTCACGCAAGAACTGGATACTCTGGCGGATTCAGAGACCAAGAACCGAGACGTGGTTCTG
AAACTGTATGACGCCCTGAGATTCCGAGACGTCGACTCAGTGCACCGGATCCTAACCCCT
GATCTCGACTACTGGTTTCACGGCCCACCGCCGCACCAGTTTTTGATGCGCACACTCACC
GGAGTCTCTCCCCCGTTTCACTTCGTGCCTCTATCCGTCGTCTCCTTTGGATCCACCGTT
ATCGCCGAGGGCTGCGGCGTTGCTAGCTCCATCTCCTGGATTCACGCTTGGACCGTAGCG
CATGGGATAATCGCTCAGGTGAGGGAGTACTCCAACACTTCTCTCACGGTTACACGAGTC
GGTGACGTTGTTGCCGGACGGTCTGCTGAGATTGCGCCGTCGCACTGTCCATCAGTGTGG
GAAAGTCAGTTCTCGGGTCGGGCTGGAAAATCCGTACCGGGTCTGGTTCTGGCGATTTGA
GGATTTGGTTAAGTAACAGTCACGTCAGGGAATAGTAATAATTAAATAAAGGCTGCTTAC
GTGTTGTTTTCTGGTTGGTTTGTTGTTTATGGGTTGAGGATTTGTGTGGTTGAGACGCGG
TGTGGGGTAACGGCTGCGCTTTGGCTGTCGCTAGTTCTACTTTTGTTGGATATTTGTGTT
TAATCGGGACTTTTGTGTTTTAGTGGGTCAAGCATGGGGAAACTCAACTTGACTTGTGCG
GTTGTGTCGGATGGTTATGTTATAATTGAAATAAAAATTTGCTGTTGGGATACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F059TF U 1
AF RR2F059JQ C 51
BS 1 771 RR2F059TF
BS 772 834 RR2F059JQ

RD RR2F059TF 771 0 0
GGATTTTAAAAACCTCAGAGTCAGTTCTCTTCTTCTTATTGTCCTAATCCAAAACCTAAA
CTCACGCAAGAACTGGATACTCTGGCGGATTCAGAGACCAAGAACCGAGACGTGGTTCTG
AAACTGTATGACGCCCTGAGATTCCGAGACGTCGACTCAGTGCACCGGATCCTAACCCCT
GATCTCGACTACTGGTTTCACGGCCCACCGCCGCACCAGTTTTTGATGCGCACACTCACC
GGAGTCTCTCCCCCGTTTCACTTCGTGCCTCTATCCGTCGTCTCCTTTGGATCCACCGTT
ATCGCCGAGGGCTGCGGCGTTGCTAGCTCCATCTCCTGGATTCACGCTTGGACCGTAGCG
CATGGGATAATCGCTCAGGTGAGGGAGTACTCCAACACTTCTCTCACGGTTACACGAGTC
GGTGACGTTGTTGCCGGACGGTCTGCTGAGATTGCGCCGTCGCACTGTCCATCAGTGTGG
GAAAGTCAGTTCTCGGGTCGGGCTGGAAAATCCGTACCGGGTCTGGTTCTGGCGATTTGA
GGATTTGGTTAAGTAACAGTCACGTCAGGGAATAGTAATAATTAAATAAAGGCTGCTTAC
GTGTTGTTTTCTGGTTGGTTTGTTGTTTATGGGTTGAGGATTTGTGTGGTTGAGACGCGG
TGTGGGGTAACGGCTGCGCTTTGGCTGTCGCTAGTTCTACTTTTGTTGGATATTTGTGTT
TAATCGGGACTTTTGTGTTTTAGTGGGTCAAGCATGGGGAAACTCAACTTG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2F059JQ 784 0 0
AAAACCTAAACTCACGCAAGAACTGGATACTCTGGCGGATTCAGAGACCAAGAACCGAGA
CGTGGTTCTGAAACTGTATGACGCC*TGAGATTCCGAGACGTCGACTCAGTGCACCGGAT
CCTAACCCCTGATCTCGACTACTGGTTTCACGGCCCACCGCCGCACCAGTTTTTGATGCG
CACACTCACCGGAGTCTCTCCCCCGTTTCACTTCGTGCCTCTATCCGTCGTCTCCTTTGG
ATCCACCGTTATCGCCGAGGGCTGCGGCGTTGCTAGCTCCATCTCCTGGATTCACGCTTG
GACCGTAGCGCATGGGATAATCGCTCAGGTGAGGGAGTACTCCAACACTTCTCTCACGGT
TACACGAGTCGGTGACGTTGTTGCCGGACGGTCTGCTGAGATTGCGCCGTCGCACTGTCC
ATCAGTGTGGGAAAGTCAGTTCTCGGGTCGGGCTGGAAAATCCGTACCGGGTCTGGTTCT
GGCGATTTGAGGATTTGGTTAAGTAACAGTCACGTCAGGGAATAGTAATAATTAAATAAA
GGCTGCTTACGTGTTGTTTTCTGGTTGGTTTGTTGTTTATGGGTTGAGGATTTGTGTGGT
TGAGACGCGGTGTGGGGTAACGGCTGCGCTTTGGCTGTCGCTAGTTCTACTTTTGTTGGA
TATTTGTGTTTAATCGGGACTTTTGTGTTTTAGTGGGTCAAGCATGGGGAAACTCAACTT
GACTTGTGCGGTTGTGTCGGATGGTTATGTTATAATTGAAATAAAAATTTGCTGTTGGGA
TACT

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL7737Contig1 819 2 10 U
AACATTTGGCTTCTATTGATTGATTATCAATCAACTCTTCCTTCTTCTGAGATCTCATAA
TCATCTCATATCCCTTTCTCTCTTCTTCTTCTCTCTGTGATGTTGTGAGGTCTTCGTATC
ATCAAACTTAGATCAGCTGCGACCCCAAGAAAGCAAAGAAGCAAGGAGGTATATATAGAC
TTTATCGAGCTCGTTGTTAAGTCATTTGGTGAGACGAGAGATTGGCTCTTTGGAGATATA
TATATATGGCAGAGGGGAAGAAGGATCAGTTAGAGATTAAGTTCCGCTTAAATGATGGTT
CAGATATTGGTCCTAAATCGTTTCCAGATGCTACGACAGTTGCTGCGTTGAAAGAAACTG
TGGTTGCTCAATGGCCTAGAGAAAAGGAGAATGGGCCAAAGACAGTGAAAGATGTGAGAT
TAATAAGCGCAGGTAGAGTATTGGAGAACAACAAGACGGTTGGAGATTGCAGGAGTCCTG
TCTCCAATCTCTCTGATGCTGTCACCACTATGCATGTCCTCATTCAACCTCAGCTTACTG
AAAAAGAGAAGAAGACGAAGAAGAAGCCTAAAGGTGATCTGAAACAGAACAAATGTATCT
GCTTATGTTTTGGACGCCGGTTATGAAAGAAGACCGAGTAGAGTTCAAAGCTTTGGCAGA
TTCACATTCTCTTCTTCAGTCTCTTTGCGTGCGTGCGTGTGTGTGGCAACATTGGCTTTT
TGGTCGCTTGAGATTTGGTTTCTAATGTAATTCTGATTCTTAACACAGTAGAATCATAGA
TAACATTTCAAATTTGCAAACTAGAGTGAATCTTTAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DH66TF U 1
AF RR2DH66JQ C 78
BS 1 661 RR2DH66TF
BS 662 662 RR2DH66JQ
BS 663 708 RR2DH66TF
BS 709 709 RR2DH66JQ
BS 710 720 RR2DH66TF
BS 721 721 RR2DH66JQ
BS 722 735 RR2DH66TF
BS 736 736 RR2DH66JQ
BS 737 772 RR2DH66TF
BS 773 819 RR2DH66JQ

RD RR2DH66TF 775 0 0
AACATTTGGCTTCTATTGATTGATTATCAATCAACTCTTCCTTCTTCTGAGATCTCATAA
TCATCTCATATCCCTTTCTCTCTTCTTCTTCTCTCTGTGATGTTGTGAGGTCTTCGTATC
ATCAAACTTAGATCAGCTGCGACCCCAAGAAAGCAAAGAAGCAAGGAGGTATATATAGAC
TTTATCGAGCTCGTTGTTAAGTCATTTGGTGAGACGAGAGATTGGCTCTTTGGAGATATA
TATATATGGCAGAGGGGAAGAAGGATCAGTTAGAGATTAAGTTCCGCTTAAATGATGGTT
CAGATATTGGTCCTAAATCGTTTCCAGATGCTACGACAGTTGCTGCGTTGAAAGAAACTG
TGGTTGCTCAATGGCCTAGAGAAAAGGAGAATGGGCCAAAGACAGTGAAAGATGTGAGAT
TAATAAGCGCAGGTAGAGTATTGGAGAACAACAAGACGGTTGGAGATTGCAGGAGTCCTG
TCTCCAATCTCTCTGATGCTGTCACCACTATGCATGTCCTCATTCAACCTCAGCTTACTG
AAAAAGAGAAGAAGACGAAGAAGAAGCCTAAAGGTGATCTGAAACAGAACAAATGTATCT
GCTTATGTTTTGGACGCCGGTTATGAAAGAAGACCGAGTAGAGTTCAAAGCTTTGGCAGA
T*CACATTCTCTTCTTCAGTCTCTTTGCGTGCGTGCGTGTGTGTGGCA*CATTGGCTTTT
*GGTCGCTTGAGATT*GGTTTCTAATGTAATTCTGATTCTTAACACAGTAGA
TCA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RR2DH66JQ 742 0 0
TCTCTC
TCTTCTTCTCTCTGTGATGTTGTGAGGTCTTCGTATCATCAAACTTAGATCAGCTGCGAC
CCCAAGAAAGCAAAGAAGCAAGGAGGTATATATAGACTTTATCGAGCTCGTTGTTAAGTC
ATTTGGTGAGACGAGAGATTGGCTCTTTGGAGATATATATATATGGCAGAGGGGAAGAAG
GATCAGTTAGAGATTAAGTTCCGCTTAAATGATGGTTCAGATATTGGTCCTAAATCGTTT
CCAGATGCTACGACAGTTGCTGCGTTGAAAGAAACTGTGGTTGCTCAATGGCCTAGAGAA
AAGGAGAATGGGCCAAAGACAGTGAAAGATGTGAGATTAATAAGCGCAGGTAGAGTATTG
GAGAACAACAAGACGGTTGGAGATTGCAGGAGTCCTGTCTCCAATCTCTCTGATGCTGTC
ACCACTATGCATGTCCTCATTCAACCTCAGCTTACTGAAAAAGAGAAGAAGACGAAGAAG
AAGCCTAAAGGTGATCTGAAACAGAACAAATGTATCTGCTTATGTTTTGGACGCCGGTTA
TGAAAGAAGACCGAGTAGAGTTCAAAGCTTTGGCAGATTCACATTCTCTTCTTCAGTCTC
TTTGCGTGCGTGCGTGTGTGTGGCAACATTGGCTTTTTGGTCGCTTGAGATTTGGTTTCT
AATGTAATTCTGATTCTTAACACAGTAGAATCATAGATAACATTTCAAATTTGCAAACTA
GAGTGAATCTTTAAGT

QA 7 742 7 742
DS 



AS 1 2

CO CL7738Contig1 716 2 1 U
GGCTTGGAACCAAACAAGGGGTTAACATGGCAGATGACAAAGAGAAGAGGAGAACTTGAA
GTCCACAAGATAACAGAAGAAAAACCTGGATGGTGCTCAGATCCTCATCTCCCTCCATGT
GCTGCATTCGTGGAGATCATGGCTCCTGTATTTTCAAGAGACGCCTGGCGATGCGTGTGG
CACATGATCCAGAATGATTTGGTTCATGGTTGGGGACTTGACTTTGCACTCAGAAGATGT
GTTGAGCCTGCACATGAGAAGATAGGTGTAGTAGATTCTCAATGGGTCGTTCATCAAACT
GTCCCTTCCCTTGGCAGCCAAGGTGAGGCAACAGACGGCAAAGCGCCATGGCAAGGGGTG
AGGGACAGATGCAAAAAGGAATGGACCATGTTCCAGAGTAGAATGGCTAACGCAGAGAAG
GATTATTTCAAGTCCTTACAAGTTGAAGGCTCCTCCAATTCAACAGCAACAACCATTTGA
TGGGAGAGCTGTTAAGTAGCAAGACCGAGACGCTGACAGATTCAGTTTACAAAGTGTGTC
TCGCATTTACATATAGAGTCTGTATATGTTAATGTAGTGGATACTCTATCTCTTTTTAGC
CCACAACAAAATATTCCATCGAATAAACAAAAGTGATGCACACACAATATCACAATCTTG
ATCAATTATCCATACCAAGTCGCTCGTTTAAGCAATTGAGTAAGTTCGTTGTCCGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GA09JQ C 1
AF RR2GA09TF U 1
BS 1 716 RR2GA09TF

RD RR2GA09JQ 716 0 0
GGCTTGGAACCAAACAAGGGGTTAACATGGCAGATGACAAAGAGAAGAGGAGAACTTGAA
GTCCACAAGATAACAGAAGAAAAACCTGGATGGTGCTCAGATCCTCATCTCCCTCCATGT
GCTGCATTCGTGGAGATCATGGCTCCTGTATTTTCAAGAGACGCCTGGCGATGCGTGTGG
CACATGATCCAGAATGATTTGGTTCATGGTTGGGGACTTGACTTTGCACTCAGAAGATGT
GTTGAGCCTGCACATGAGAAGATAGGTGTAGTAGATTCTCAATGGGTCGTTCATCAAACT
GTCCCTTCCCTTGGCAGCCAAGGTGAGGCAACAGACGGCAAAGCGCCATGGCAAGGGGTG
AGGGACAGATGCAAAAAGGAATGGACCATGTTCCAGAGTAGAATGGCTAACGCAGAGAAG
GATTATTTCAAGTCCTTACAAGTTGAAGGCTCCTCCAATTCAACAGCAACAACCATTTGA
TGGGAGAGCTGTTAAGTAGCAAGACCGAGACGCTGACAGATTCAGTTTACAAAGTGTGTC
TCGCATTTACATATAGAGTCTGTATATGTTAATGTAGTGGATACTCTATCTCTTTTTAGC
CCACAACAAAATATTCCATCGAATAAACAAAAGTGATGCACACACAATATCACAATCTTG
ATCAATTATCCATACCAAGTCGCTCGTTTAAGCAATTGAGTAAGTTCGTTGTCCGG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2GA09TF 716 0 0
GGCTTGGAACCAAACAAGGGGTTAACATGGCAGATGACAAAGAGAAGAGGAGAACTTGAA
GTCCACAAGATAACAGAAGAAAAACCTGGATGGTGCTCAGATCCTCATCTCCCTCCATGT
GCTGCATTCGTGGAGATCATGGCTCCTGTATTTTCAAGAGACGCCTGGCGATGCGTGTGG
CACATGATCCAGAATGATTTGGTTCATGGTTGGGGACTTGACTTTGCACTCAGAAGATGT
GTTGAGCCTGCACATGAGAAGATAGGTGTAGTAGATTCTCAATGGGTCGTTCATCAAACT
GTCCCTTCCCTTGGCAGCCAAGGTGAGGCAACAGACGGCAAAGCGCCATGGCAAGGGGTG
AGGGACAGATGCAAAAAGGAATGGACCATGTTCCAGAGTAGAATGGCTAACGCAGAGAAG
GATTATTTCAAGTCCTTACAAGTTGAAGGCTCCTCCAATTCAACAGCAACAACCATTTGA
TGGGAGAGCTGTTAAGTAGCAAGACCGAGACGCTGACAGATTCAGTTTACAAAGTGTGTC
TCGCATTTACATATAGAGTCTGTATATGTTAATGTAGTGGATACTCTATCTCTTTTTAGC
CCACAACAAAATATTCCATCGAATAAACAAAAGTGATGCACACACAATATCACAATCTTG
ATCAATTATCCATACCAAGTCGCTCGTTTAAGCAATTGAGTAAGTTCGTTGTCCGG

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL7739Contig1 461 2 2 U
GGGGATGATCATAAAGTCGACATGCACGCTGGTTCCACTTTTAACCACCGTTATGTCGAA
TCCAATCCGCGTGAAGTAGAGAACGCTACTTGGATGCTAACCGTGTTTCAGTGCTTTGGG
CAATACTTCTGCCTCCATTTTGAGGCGTTCCAGCTCGGGATGGGTCCGGTATACATGGCG
TTCCTGAGATTCATGGGGGACGAGGAAGAGGCACGGAGCTACAGCTACAGCTTGAAAGTG
GGAGGCAGTGGGAGGAAGCTAACATGGGAAGGAACACCGAGAAGCATCAGAGATAGCCCC
AGGAAAGTAAGAGACAGCAACGATGGTTTCTTCATCCAGAGAAACATGGCTTTTTTTTTT
TCCGGTGGAGATAGGAAAGAGCTTAAGCTTAGAGTCACTGTTAAAATTTGGAAAGAGCAA
CCCAGTCCAGATTTTGGGCTTTTCATGCCAAACCTATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP38TF U 1
AF RR2BP38JQ C 178
BS 1 284 RR2BP38TF
BS 285 461 RR2BP38JQ

RD RR2BP38TF 284 0 0
GGGGATGATCATAAAGTCGACATGCACGCTGGTTCCACTTTTAACCACCGTTATGTCGAA
TCCAATCCGCGTGAAGTAGAGAACGCTACTTGGATGCTAACCGTGTTTCAGTGCTTTGGG
CAATACTTCTGCCTCCATTTTGAGGCGTTCCAGCTCGGGATGGGTCCGGTATACATGGCG
TTCCTGAGATTCATGGGGGACGAGGAAGAGGCACGGAGCTACAGCTACAGCTTGAAAGTG
GGAGGCAGTGGGAGGAAGCTAACATGGGAAGGAACACCGAGAAG

QA 1 284 1 284
DS 

RD RR2BP38JQ 284 0 0
GCGTTCCTGAGATTCATGGGGGACGAGGAAGAGGCACGGAGCTACAGCTACAGCTTGAAA
GTGGGAGGCAGTGGGAGGAAGCTAACATGGGAAGGAACACCGAGAAGCATCAGAGATAGC
CCCAGGAAAGTAAGAGACAGCAACGATGGTTTCTTCATCCAGAGAAACATGGCTTTTTTT
TTTTCCGGTGGAGATAGGAAAGAGCTTAAGCTTAGAGTCACTGTTAAAATTTGGAAAGAG
CAACCCAGTCCAGATTTTGGGCTTTTCATGCCAAACCTATTTTC

QA 1 284 1 284
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7741Contig1 1239 2 6 U
GGGATCCTCAGCCACAACAGCTTCCTCTCTCTCGCTACAAAGTTCACTACTCGTGGATCT
CGTCTTCAGTGTACACTATCAATGGCTAGATCTGCGGTTGATGAGACATCAGACTCCGGA
GCTTTTCAAAGAACTGCTTCAACGTTCCGTAACTTCGTCTCAAGAGATCCCAACTCTCAG
TTTCCAGCTGAATCTGGTAGATACCATCTTTACATCTCGTATGCATGTCCGTGGGCTTCT
AGATGCATCTCATACTTGAAGATCAAAGGACTTGACGATGCAATAAGCTTCTCATCTGTT
AAACCCATTTGGGGAAGGACCAAGGAAAGTGATGAGCACATGGGATGGGTCTTCCCGGAT
TCAGACGCTGAGGTTCAAGCAGCTGATCCTGACCATCTTAATGGTGCTAAGAGTGTAAGA
GAACTCTATGAGATTGCTAGCCCAAACTACACTGGGAAGTATACTGTTCCTGTTCTGTGG
GATAAGAAGCTGAAGACTGTTGTGAACAATGAGAGCGCAGAGATAATCAGGATGTTCAAC
ACTGAATTCAATCATATTGCGAGAAACCCTGATCTTGATCTTTACCCTTCTCATCTCCAA
GCTAAAATCGATGAAGCTAACGAATGGATCTACAGTGGGATTAATAACGGTGTCTATAGG
TGCGGTTTTGTAAAGAAACAAGAACCTTACGAGGAGGCAGTGCAGCAAGTGTATGAAGCA
TTAGATAGATGCGAGGAGATTCTTGGAAAGCATCGTTACATCTGCGGTAATACATTGACT
GAAACAGATATCAGGTTGTTTGTGACACTGATAAGATTTGACGAGGTTTACGCGGTTCAC
TTCAAATGCAACAAGAAACTCTTAAGGGAGTATCCGAATCTGTTCAACTACACGAAAGAC
GTATTTCAAGTCCCTGGTATGAGTAGCACCGTGAACATGAATCACATCAAGCAGCATTAC
TATGGAAGCCACCCTTCGATTAACCCTTTTGGGATCATCCCTCACGGACCAAACATCGAT
TACTCTTCACCTCATGATCGACACAGATTCTCCAAATGATAAATAACAAAGTATTTTGCA
CTTGGGTTCTGTCTTCAGAAAGTTTCCAAATAAAGTTTGTGACTCAGTTTTAAAGTGATG
TTTGAGAAAATAAAAGCTTGATGTTTATCATGTTACAGTTTGCAGTCTCAGTAGTTGAGA
CAATGTTGGTCTGATCATAAATAAACTTTTCTTCCGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H864TF U 1
AF RR2H864JQ C 506
BS 1 641 RR2H864TF
BS 642 642 RR2H864JQ
BS 643 659 RR2H864TF
BS 660 660 RR2H864JQ
BS 661 689 RR2H864TF
BS 690 1239 RR2H864JQ

RD RR2H864TF 689 0 0
GGGATCCTCAGCCACAACAGCTTCCTCTCTCTCGCTACAAAGTTCACTACTCGTGGATCT
CGTCTTCAGTGTACACTATCAATGGCTAGATCTGCGGTTGATGAGACATCAGACTCCGGA
GCTTTTCAAAGAACTGCTTCAACGTTCCGTAACTTCGTCTCAAGAGATCCCAACTCTCAG
TTTCCAGCTGAATCTGGTAGATACCATCTTTACATCTCGTATGCATGTCCGTGGGCTTCT
AGATGCATCTCATACTTGAAGATCAAAGGACTTGACGATGCAATAAGCTTCTCATCTGTT
AAACCCATTTGGGGAAGGACCAAGGAAAGTGATGAGCACATGGGATGGGTCTTCCCGGAT
TCAGACGCTGAGGTTCAAGCAGCTGATCCTGACCATCTTAATGGTGCTAAGAGTGTAAGA
GAACTCTATGAGATTGCTAGCCCAAACTACACTGGGAAGTATACTGTTCCTGTTCTGTGG
GATAAGAAGCTGAAGACTGTTGTGAACAATGAGAGCGCAGAGATAATCAGGATGTTCAAC
ACTGAATTCAATCATATTGCGAGAAACCCTGATCTTGATCTTTACCCTTCTCATCTCCAA
GCTAAAATCGATGAAGCTAACGAATGGATCTACAGTGGGAT*AATAACGGTGTCTATAG*
TGCGGTTTTGTAAAGAAACAAGAACCTTA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2H864JQ 734 0 0
ACAATGAGAGCGCAGAGATAATCAGGATGTTCAACACTGAATTCAATCATATTGCGAGAA
ACCCTGATCTTGATCTTTACCCTTCTCATCTCCAAGCTAAAATCGATGAAGCTAACGAAT
GGATCTACAGTGGGATTAATAACGGTGTCTATAGGTGCGGTTTTGTAAAGAAACAAGAAC
CTTACGAGGAGGCAGTGCAGCAAGTGTATGAAGCATTAGATAGATGCGAGGAGATTCTTG
GAAAGCATCGTTACATCTGCGGTAATACATTGACTGAAACAGATATCAGGTTGTTTGTGA
CACTGATAAGATTTGACGAGGTTTACGCGGTTCACTTCAAATGCAACAAGAAACTCTTAA
GGGAGTATCCGAATCTGTTCAACTACACGAAAGACGTATTTCAAGTCCCTGGTATGAGTA
GCACCGTGAACATGAATCACATCAAGCAGCATTACTATGGAAGCCACCCTTCGATTAACC
CTTTTGGGATCATCCCTCACGGACCAAACATCGATTACTCTTCACCTCATGATCGACACA
GATTCTCCAAATGATAAATAACAAAGTATTTTGCACTTGGGTTCTGTCTTCAGAAAGTTT
CCAAATAAAGTTTGTGACTCAGTTTTAAAGTGATGTTTGAGAAAATAAAAGCTTGATGTT
TATCATGTTACAGTTTGCAGTCTCAGTAGTTGAGACAATGTTGGTCTGATCATAAATAAA
CTTTTCTTCCGGCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL7742Contig1 1108 2 6 U
GGCAAGCGGGTTTGTCCCAGGTTGATGCGGAGACTGAAGGTTTGTCAAGGAAAAAGAGAG
AGGTGGACGAGTTCGTCGTCTGAGAAGGAGAGAGGAGCCAAACTCCGTGAACTTGTCAGT
GTTTCAACAAATGAGGCAAATGAATATGAGGAAGTTATTAAATTGCGGAAAACTCTTATG
TCATATGTGTCAAAGACTAGAGAAGAGAGAGCGAAGCTTGTAAGTATCGAAGAGAAGCTT
TCTGAGGAAGTCCAGAGGCTACAGAAGGAGGTTTCCAGTACCCGAGAGTCACTAAAGGAG
CAATCTTCTAGAAAGTCGATCATCCAACAGAACATTACATCATTCATGGATAAAATTTTG
TTCATAGAGAAGCGGATGCCGGAGCTTGAAGCAGAGAAGAAAGTGGCTGCGTCAACGAGA
AATTTCAAAGAAGCTGGAAGAATAGCAGCAGAACTTAAGTCCTTAAATCTGGAGAAGGAT
AAGATACAGATCGAAACAGGGCAAGCGAACTCTGAGCTCGAAAAAGCAGAGCAGGAGATT
GAAGAGACAATCAAGAGGCTACAAGAGTTGGAGAGATTGATTTTGTCTAAAGAAAAAGAA
TTGTCTGTCAGCAGATTCCAGAGGTTGAGGATTGACAGTGGCACTGCAAAAGCCGAGAGA
TCAGCTGCTCTGGAGCTCAGCGATCTGGAAGAAGCTAATCTTCTACTTGAGGAAGCACAG
GAAGCAGAGTCCGAAGCAGAGAAGCTTAAACTCACATTCGGTCTCAAAAAAGAAGACGAA
GAAGAAGAGGCTAAAGAATGTTTTGTCTCCATGGAATTAATAGCCACCTTTGGTCTGAAG
AAACTACAAGAACTAGCAGAATCTGTTCCGTCGTAACCAAAGCTGCTTCAGGTTCAACCG
TCAGAACTAAAAGCGCTCACCATGATCAAACAAGATATTTAAAAGGCGTTGTTGATGAGT
CAACAACGTTTAAGTCCGTGTTCCTTAGTCCACATCAACACATGTATGGTTTTGTTTTTC
GGATCCGTGTTTGATTTATTCTTGATGAAAGAAGAGAGTTCAAGCTTGTTCAAGCAATAC
ACTTGTAAGTTGCGTCCCAATACTTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES19TF U 1
AF RR2ES19JQ C 247
BS 1 264 RR2ES19TF
BS 265 265 RR2ES19JQ
BS 266 713 RR2ES19TF
BS 714 714 RR2ES19JQ
BS 715 757 RR2ES19TF
BS 758 1108 RR2ES19JQ

RD RR2ES19TF 757 0 0
GGCAAGCGGGTTTGTCCCAGGTTGATGCGGAGACTGAAGGTTTGTCAAGGAAAAAGAGAG
AGGTGGACGAGTTCGTCGTCTGAGAAGGAGAGAGGAGCCAAACTCCGTGAACTTGTCAGT
GTTTCAACAAATGAGGCAAATGAATATGAGGAAGTTATTAAATTGCGGAAAACTCTTATG
TCATATGTGTCAAAGACTAGAGAAGAGAGAGCGAAGCTTGTAAGTATCGAAGAGAAGCTT
TCTGAGGAAGTCCAGAGGCTACAGGAGGAGGTTTCCAGTACCCGAGAGTCACTAAAGGAG
CAATCTTCTAGAAAGTCGATCATCCAACAGAACATTACATCATTCATGGATAAAATTTTG
TTCATAGAGAAGCGGATGCCGGAGCTTGAAGCAGAGAAGAAAGTGGCTGCGTCAACGAGA
AATTTCAAAGAAGCTGGAAGAATAGCAGCAGAACTTAAGTCCTTAAATCTGGAGAAGGAT
AAGATACAGATCGAAACAGGGCAAGCGAACTCTGAGCTCGAAAAAGCAGAGCAGGAGATT
GAAGAGACAATCAAGAGGCTACAAGAGTTGGAGAGATTGATTTTGTCTAAAGAAAAAGAA
TTGTCTGTCAGCAGATTCCAGAGGTTGAGGATTGACAGTGGCACTGCAAAAGCCGAGAGA
TCAGCTGCTCTGGAGCTCAGCGATCTGGAAGAAGCTAATCTTCTACTTGAGGA*GCACAG
GAAGCAGAGTCCGAAGCAGAGAAGCTTAAACTCACAT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2ES19JQ 862 0 0
GAAGTCCAGAGGCTACAGA**GAGGTTTCCAGTACCCGAGAGTCACTAAAGGAGCAATCT
TCTAGAAAGTCGATCATCCAACAGAACATTACATCATTCATGGATAAAATTTTGTTCATA
GAGAAGCGGATGCCGGAGCTTGAAGCAGAGAAGAAAGTGGCTGCGTCAACGAGAAATTTC
AAAGAAGCTGGAAGAATAGCAGCAGAACTTAAGTCCTTAAATCTGGAGAAGGATAAGATA
CAGATCGAAACAGGGCAAGCGAACTCTGAGCTCGAAAAAGCAGAGCAGGAGATTGAAGAG
ACAATCAAGAGGCTACAAGAGTTGGAGAGATTGATTTTGTCTAAAGAAAAAGAATTGTCT
GTCAGCAGATTCCAGAGGTTGAGGATTGACAGTGGCACTGCAAAAGCCGAGAGATCAGCT
GCTCTGGAGCTCAGCGATCTGGAAGAAGCTAATCTTCTACTTGAGGAAGCACAGGAAGCA
GAGTCCGAAGCAGAGAAGCTTAAACTCACATTCGGTCTCAAAAAAGAAGACGAAGAAGAA
GAGGCTAAAGAATGTTTTGTCTCCATGGAATTAATAGCCACCTTTGGTCTGAAGAAACTA
CAAGAACTAGCAGAATCTGTTCCGTCGTAACCAAAGCTGCTTCAGGTTCAACCGTCAGAA
CTAAAAGCGCTCACCATGATCAAACAAGATATTTAAAAGGCGTTGTTGATGAGTCAACAA
CGTTTAAGTCCGTGTTCCTTAGTCCACATCAACACATGTATGGTTTTGTTTTTCGGATCC
GTGTTTGATTTATTCTTGATGAAAGAAGAGAGTTCAAGCTTGTTCAAGCAATACACTTGT
AAGTTGCGTCCCAATACTTCGT

QA 1 862 1 862
DS 



AS 1 2

CO CL7743Contig1 888 2 6 U
CTCTATACGTATTTTATACTAAAAAAAGAAAAATACATTTCCCTGTATTTTAATTTTTTT
GTGGGTATTAAAGAAAACACATAACAAGAATGACATTCAATGCGCCTCCTTCAGCGGATG
ATGAGGAGAAGAATAACGAGAAGCAAATGGATTACAACGATTGGTTACCGATTACGGCGT
CTAGAGAGGCCAAGTGGTATTACTCCGCCTTCCATAATGTCACGGCCATGGTCGGAGCCG
GAGTTCTAGGTCTCCCTTTCGCCATGTCACAACTTGGCTGGGGACCTGGGCTTGTTGCAA
TAATGGTATCATGGCTTATAACGTTCTACTCGTTATGGCAAATGGTGCACTTACACGAAA
GCGTTCCCGGGAAACGCTTTGACCGTTACAGGGAGCTAGGCCAAGAAGCGTTCGGACCAA
GACTTGGTTACTGGATCGTCTTGCCGCAACAGCTTATGGTCCAGATTGCTTCCGACATAG
TCTACAACGTGACCGGAGGCAAATCGCTTAAGAAATTCGTCGAGCTTCTTTTTCCCCATC
TCCATCATGTCCGTCAAACCTATTACATCCTCGGGTTCGGTGTGCTCCAAGTCGGTCTCT
CTCAGTCTCCTGACTTCAACTCTATCAAGATCATCTCTCTTCTCGCTGCTCTTATGTCTT
TCTTGTACTCAATGATAGCGTCTGTAGCGTCGATAGTGAAAGGAACGGAGCATCATCCAG
CTGAGTACGGAGTCAGAGGACACACCACGGCCTCAATGATCTTTGACGCGTTTAATGGCA
TTGGAACCATAGCGTTTGCGTTCGCAGACACAGTGTGGTTCTTGAGATCCAAGCTACTAT
TCCTTCAACACCTGAAGTCCCTTCTAAGAAACCAATGTGGAAAGGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C089TF U 1
AF RR2AR57TF U 122
BS 1 269 RR2C089TF
BS 270 270 RR2AR57TF
BS 271 618 RR2C089TF
BS 619 619 RR2AR57TF
BS 620 690 RR2C089TF
BS 691 888 RR2AR57TF

RD RR2C089TF 690 0 0
CTCTATACGTATTTTATACTAAAAAAAGAAAAATACATTTCCCTGTATTTTAATTTTTTT
GTGGGTATTAAAGAAAACACATAACAAGAATGACATTCAATGCGCCTCCTTCAGCGGATG
ATGAGGAGAAGAATAACGAGAAGCAAATGGATTACAACGATTGGTTACCGATTACGGCGT
CTAGAGAGGCCAAGTGGTATTACTCCGCCTTCCATAATGTCACGGCCATGGTCGGAGCCG
GAGTTCTAGGTCTCCCTTTCGCCATGTCATAACTTGGCTGGGGACCTGGGCTTGTTGCAA
TAATGGTATCATGGCTTATAACGTTCTACTCGTTATGGCAAATGGTGCACTTACACGAAA
GCGTTCCCGGGAAACGCTTTGACCGTTACAGGGAGCTAGGCCAAGAAGCGTTCGGACCAA
GACTTGGTTACTGGATCGTCTTGCCGCAACAGCTTATGGTCCAGATTGCTTCCGACATAG
TCTACAACGTGACCGGAGGCAAATCGCTTAAGAAATTCGTCGAGCTTCTTTTTCCCCATC
TCCATCATGTCCGTCAAACCTATTACATCCTCGGGTTCGGTGTGCTCCAAGTCGGTCTCT
CTCAGTCTCCTGACTTCA*CTCTATCAAGATCATCTCTCTTCTCGCTGCTCTTATGTCTT
TCTTGTACTCAATGATAGCGTCTGTAGCGT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RR2AR57TF 767 0 0
G
GAGGAGAAGAATAACGAGAAGCAAATGGATTACAACGATTGGTTACCGATTACGGCGTCT
AGAGAGGCCAAGTGGTATTACTCCGCCTTCCATAATGTCACGGCCATGGTCGGAGCCGGA
GTTCTAGGTCTCCCTTTCGCCATGTCACAACTTGGCTGGGGACCTGGGCTTGTTGCAATA
ATGGTATCATGGCTTATAACGTTCTACTCGTTATGGCAAATGGTGCACTTACACGAAAGC
GTTCCCGGGAAACGCTTTGACCGTTACAGGGAGCTAGGCCAAGAAGCGTTCGGACCAAGA
CTTGGTTACTGGATCGTCTTGCCGCAACAGCTTATGGTCCAGATTGCTTCCGACATAGTC
TACAACGTGACCGGAGGCAAATCGCTTAAGAAATTCGTCGAGCTTCTTTTTCCCCATCTC
CATCATGTCCGTCAAACCTATTACATCCTCGGGTTCGGTGTGCTCCAAGTCGGTCTCTCT
CAGTCTCCTGACTTCAACTCTATCAAGATCATCTCTCTTCTCGCTGCTCTTATGTCTTTC
TTGTACTCAATGATAGCGTCTGTAGCGTCGATAGTGAAAGGAACGGAGCATCATCCAGCT
GAGTACGGAGTCAGAGGACACACCACGGCCTCAATGATCTTTGACGCGTTTAATGGCATT
GGAACCATAGCGTTTGCGTTCGCAGACACAGTGTGGTTCTTGAGATCCAAGCTACTATTC
CTTCAACACCTGAAGTCCCTTCTAAGAAACCAATGTGGAAAGGGGT

QA 2 767 2 767
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7745Contig1 1314 2 2 U
GGAAACCATCTCTATTTCCTCCCCTTTTGGTAGAGTTTTGTTCTTAGAGAGAGATGGCGA
GAATGTGTTTAATGATGATGATTATGGTTGCTGTAGCCATTAACATGGTTGCTAGTGATC
CAATTGCACCGTGTTACTTTATATTTGGCGACTCTTTAGTTGATAATGGCAATAATAATC
AGCTTAATTCACTAGCTAGAGCCAATTACTTTCCTTATGGTATTGATTTCTCTTTCGGTC
CAACCGGTCGGTTTAGCAACGGCAAAACTACTGTCGATGTTATCACTGAGCTTTTGGGTT
TCGACGACTACATTACACCATATGCCGCGGCGAGAGGAGAAGAAATCCTCCGTGGAGTCA
ATTATGCTTCCGCTGCTGCCGGAATCCGAGAAGAAACCGGCAGACAATTGGGAGGTAGAA
TAGCGTTTGCAGGTCAAGTAGCAAATCACGTAAACACAGTGTCACAAGTAGTGAACATAC
TCGGCGATGAGAACCAAGCCTCCAGTTACCTCAGCAAATGCATTTACTCTATCGGCTTAG
GCAGTAACGATTACCTCAACAACTACTTCATGCCCACTTTCTACTCTACTGGTAACCAGT
TCTCTCCTGAATCCTTTAGCGACGATCTCATCGCCCGTTACACCGAGCAACTCCGGATAT
TGTATAACAATGGAGCAAGGAAGTTTGCGTTAATAGGAGTCGGAGCTATTGGCTGCAGCC
CGAACGAGCTAGCTCAGAACAGTAGAGATGGGAGAACATGTGACGAAAGGATCAACTCTG
CGAACAGAATCTTCAACAGCAAGCTCATATCAATGGTCGACAACTTTAACCAAAACACTC
CTGATGCTAAGTTCACTTATATCAACGCATACGGCATCTTCCAAGACATCGTTACAAACC
CTGCTCGATACGGGTTTACAGTGACAAATGCAGGGTGTTGTGGAGTTGGGAGGAACAATG
GACAGATAACTTGTCTTCCTGGTCAAGCTCCATGTTTGAATAGGAATGAGTATGTGTTTT
GGGATGCGTTTCATCCTGGTGAAGCTGCTAATGTTATCATCGGAACAAGATCGTTTAAGC
GAGAAACTGCTTCTGATGCTCATCCTTATGATATTCAGCAGCTAGCAACTCTCTAAGTTG
AGAGTGACAAGAAATATAAGAAACTTGTTGTTTTGCTTGTATAAGTGTTTTGATAATGGT
AACTGAGTTTGGACTCATGAAGAGAGAGTGATGTGTGTGATGTAATAAGTGTTTATGTAA
GGATTTTGAGCTACAGTTTTATCTCTAATGTTTTTTTTCTATTATAAATTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F354TF U 1
AF RR2F354JQ C 614
BS 1 739 RR2F354TF
BS 740 1314 RR2F354JQ

RD RR2F354TF 739 0 0
GGAAACCATCTCTATTTCCTCCCCTTTTGGTAGAGTTTTGTTCTTAGAGAGAGATGGCGA
GAATGTGTTTAATGATGATGATTATGGTTGCTGTAGCCATTAACATGGTTGCTAGTGATC
CAATTGCACCGTGTTACTTTATATTTGGCGACTCTTTAGTTGATAATGGCAATAATAATC
AGCTTAATTCACTAGCTAGAGCCAATTACTTTCCTTATGGTATTGATTTCTCTTTCGGTC
CAACCGGTCGGTTTAGCAACGGCAAAACTACTGTCGATGTTATCACTGAGCTTTTGGGTT
TCGACGACTACATTACACCATATGCCGCGGCGAGAGGAGAAGAAATCCTCCGTGGAGTCA
ATTATGCTTCCGCTGCTGCCGGAATCCGAGAAGAAACCGGCAGACAATTGGGAGGTAGAA
TAGCGTTTGCAGGTCAAGTAGCAAATCACGTAAACACAGTGTCACAAGTAGTGAACATAC
TCGGCGATGAGAACCAAGCCTCCAGTTACCTCAGCAAATGCATTTACTCTATCGGCTTAG
GCAGTAACGATTACCTCAACAACTACTTCATGCCCACTTTCTACTCTACTGGTAACCAGT
TCTCTCCTGAATCCTTTAGCGACGATCTCATCGCCCGTTACACCGAGCAACTCCGGATAT
TGTATAACAATGGAGCAAGGAAGTTTGCGTTAATAGGAGTCGGAGCTATTGGCTGCAGCC
CGAACGAGCTAGCTCAGAA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RR2F354JQ 701 0 0
CTTTAGCGACGATCTCATCGCCCGTTACACCGAGCAACTCCGGATATTGTATAACAATGG
AGCAAGGAAGTTTGCGTTAATAGGAGTCGGAGCTATTGGCTGCAGCCCGAACGAGCTAGC
TCAGAACAGTAGAGATGGGAGAACATGTGACGAAAGGATCAACTCTGCGAACAGAATCTT
CAACAGCAAGCTCATATCAATGGTCGACAACTTTAACCAAAACACTCCTGATGCTAAGTT
CACTTATATCAACGCATACGGCATCTTCCAAGACATCGTTACAAACCCTGCTCGATACGG
GTTTACAGTGACAAATGCAGGGTGTTGTGGAGTTGGGAGGAACAATGGACAGATAACTTG
TCTTCCTGGTCAAGCTCCATGTTTGAATAGGAATGAGTATGTGTTTTGGGATGCGTTTCA
TCCTGGTGAAGCTGCTAATGTTATCATCGGAACAAGATCGTTTAAGCGAGAAACTGCTTC
TGATGCTCATCCTTATGATATTCAGCAGCTAGCAACTCTCTAAGTTGAGAGTGACAAGAA
ATATAAGAAACTTGTTGTTTTGCTTGTATAAGTGTTTTGATAATGGTAACTGAGTTTGGA
CTCATGAAGAGAGAGTGATGTGTGTGATGTAATAAGTGTTTATGTAAGGATTTTGAGCTA
CAGTTTTATCTCTAATGTTTTTTTTCTATTATAAATTTGAT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL7746Contig1 1209 2 4 U
TTTTTGATGATAAAAGCAATGGCGGTTGCCTTATCCTCTCCAGGCGTCGCCTTTCGTTCT
CCGGCGTCATCTTCGTCGTCAGGTCTATCCGCCAATAGATTTCTCTTTCGGAACCAGGAC
GCTAGTCCTAGTCTTCTATCTCTTCCAACTCATCGTCCTTCTCGCTCTGTATTTCTTTTT
GCTCGTAGGAAGAATCGAAAGGGATTCGTTTCTTCGTCTTCGTCGTCTCCAAAGAAGAAC
AAAAAGAAAAGTTTTGGGGAAAATGAAAGTGGAGGAGGTGAGGCAGAGGAGGAGGAGGAT
GATCCATTTGAGGCACTGTTTAATCTACTAGAAGAAGATTTGAACAATGATAAATCTTCA
ATAGATGACGAGGAGATAAGCGAGGAAGACTTAGATAGACTAGCAGCAGAGTTAGCTGAA
GTATTGGGTGGTGGTGACGACGTTGATGGCATCGACTTGTTTGTTTCAGACACTGGTGAT
GTTGCTGATGATGAAGAAGATGATGGTCATGATGATGATATCGAGGATGATGATGATGAT
GATGACAGCGAAGAAGAAGATGAAAGACCAACGAAGCTGAAGAATTGGCAGCTTAGGAGA
TTGGCTTATGCATTGAAAGCTGGGCGCCGTAAGACTAGTATAAAGAATCTGGCAGCTGAG
CTTTGTCTTGACAGGGCTTATGTGCTTGAACTGCTACGTGACCCTCCTCCAAAGCTTCTA
ATGCTAAGTGCTACATTACCAGATGAGAAGCCGCCAAGAGCAGCACCTGAGAACTCATCA
AATCCTCTGGAATCAGCAGCAGCTGAAGATGCTGCTGTAGAGGTCGAACCTGAGGAAAAA
GTGAAAGATGAAGCAGTACATGTGATGCAACAGAGATGGTCTGCTCAGAAGAGAGTGAAG
AAAGCTCACATTGAAACACTAGAGAAAGTTTACAGGAGATCAAAACGCCCCACTAATGCT
GTGGTTAGCAGCATTGTTCAAGTTACCAATCTTCCAAGGAGGCGTGTTTTGAAGTGGTTT
GAAGATAGAAGAGCAGAGGATGGTGTTCAGAGAAGCGAGCTCCCTATCAAGCTCCGGTTT
AATGTTTCATATTGGAAAAATATAATGAGCTTCCGGTTCGGTTTGGTTTCCTTCCTAATT
CAAATTAAATAAATGTTTTTTCTTGTCGGCCCAAATTTATTAATAAAGCCCAACGGGTAC
TATTAAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO69TF U 1
AF RR2DO69JQ C 360
BS 1 596 RR2DO69TF
BS 597 597 RR2DO69JQ
BS 598 670 RR2DO69TF
BS 671 1209 RR2DO69JQ

RD RR2DO69TF 670 0 0
TTTTTGATGATAAAAGCAATGGCGGTTGCCTTATCCTCTCCAGGCGTCGCCTTTCGTTCT
CCGGCGTCATCTTCGTCGTCAGGTCTATCCGCCAATAGATTTCTCTTTCGGAACCAGGAC
GCTAGTCCTAGTCTTCTATCTCTTCCAACTCATCGTCCTTCTCGCTCTGTATTTCTTTTT
GCTCGTAGGAAGAATCGAAAGGGATTCGTTTCTTCGTCTTCGTCGTCTCCAAAGAAGAAC
AAAAAGAAAAGTTTTGGGGAAAATGAAAGTGGAGGAGGTGAGGCAGAGGAGGAGGAGGAT
GATCCATTTGAGGCACTGTTTAATCTACTAGAAGAAGATTTGAACAATGATAAATCTTCA
ATAGATGACGAGGAGATAAGCGAGGAAGACTTAGATAGACTAGCAGCAGAGTTAGCTGAA
GTATTGGGTGGTGGTGACGACGTTGATGGCATCGACTTGTTTGTTTCAGACACTGGTGAT
GTTGCTGATGATGAAGAAGATGATGGTCATGATGATGATATCGAGGATGATGATGATGAT
GATGACAGCGAAGAAGAAGATGAAAGACCAACGAAGCTGAAGAATTGGCAGCTTAG*AGA
TTGGCTTATGCATTGAAAGCTGGGCGCCGTAAGACTAGTATAAAGAATCTGGCAGCTGAG
CTTTGTCTTG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RR2DO69JQ 850 0 0
C
ATAGATGACGAG*AGATAAGCGAGGAAGACTTAGATAGACTAGCAGCAGAGTTAGCTGAA
GTATTGGGTGGTGGTGACGACGTTGATGGCATCGACTTGTTTGTTTCAGACACTGGTGAT
GTTGCTGATGATGAAGAAGATGATGGTCATGATGATGATATCGAGGATGATGATGATGAT
GATGACAGCGAAGAAGAAGATGAAAGACCAACGAAGCTGAAGAATTGGCAGCTTAGGAGA
TTGGCTTATGCATTGAAAGCTGGGCGCCGTAAGACTAGTATAAAGAATCTGGCAGCTGAG
CTTTGTCTTGACAGGGCTTATGTGCTTGAACTGCTACGTGACCCTCCTCCAAAGCTTCTA
ATGCTAAGTGCTACATTACCAGATGAGAAGCCGCCAAGAGCAGCACCTGAGAACTCATCA
AATCCTCTGGAATCAGCAGCAGCTGAAGATGCTGCTGTAGAGGTCGAACCTGAGGAAAAA
GTGAAAGATGAAGCAGTACATGTGATGCAACAGAGATGGTCTGCTCAGAAGAGAGTGAAG
AAAGCTCACATTGAAACACTAGAGAAAGTTTACAGGAGATCAAAACGCCCCACTAATGCT
GTGGTTAGCAGCATTGTTCAAGTTACCAATCTTCCAAGGAGGCGTGTTTTGAAGTGGTTT
GAAGATAGAAGAGCAGAGGATGGTGTTCAGAGAAGCGAGCTCCCTATCAAGCTCCGGTTT
AATGTTTCATATTGGAAAAATATAATGAGCTTCCGGTTCGGTTTGGTTTCCTTCCTAATT
CAAATTAAATAAATGTTTTTTCTTGTCGGCCCAAATTTATTAATAAAGCCCAACGGGTAC
TATTAAAGT

QA 2 850 2 850
DS 



AS 1 2

CO CL7747Contig1 835 2 10 U
GGGGACTGGGAGGAGAGGAGAGGATCTACGAAACTTCGATTTGGGGGTTTTCTTTTCTTC
TAGATCCTAGCTAATTCGTCTAAAGACGTCGCCTTTGACGACGACGACGACGACCCATTC
ATCTCGCTAACCTCGTTCTCCCTTTCTCTCTATTCCCCACGCACAACAAAATCTCTCACT
TTTTTCCCTCAGATACGCCTTCCAATACGGCGTCGTCTAGCTCCGCCGCTGCCGGATCTG
TAAATTCTTCCTCCTCCCGTACAAAATCCAAACGACCCAAGTATTCGAAGTTTACACAGC
AGGAGCTCCCTGCGTGCAAGCCTATTCTCACGCCTGGTTGGGTGATTCTGACTTTTTTAG
TCATTAGTGTGATCTTCATTCCACTCGGAGTCGTTTCGCTTTTCGCTTCCCAGGATGTTG
TTGAGATCGTTGATCGGTATGATAATGATTGCGTACCTACGCCTGCTAGGGCTAACAAGG
TTGCTTTTATTCAAGGAGGTGGAGACAAATCTTGTAACCGGACACTAGTGGTTCCTAAGA
AGATGAAGCAGCCTATCTACGTTTATTACCAGCTTGAGAACTTCTACCAGAACCACCGCA
GGTATGTGAAAAGCAGAAGTGATGCGCAGTTGAGAAGTGTGAAAGATGAGAACCAAATCG
ATGCATGCAAGCCTGAGATGATGCTAATGGGCGGCCGATTGTGCCGTGTGGTCTATTGCT
TGGAGTCTCTTTAATGACACATACGCTTTGTCCAAAACACCAGCCTTTGATGTAAGCAGA
GAGCATTGCGTGAAGAGTGACAGGACACATTTGGCAAAATGTATTTCCAAGACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GH12TF U 1
AF RR2FJ66TF U 26
BS 1 154 RR2GH12TF
BS 155 155 RR2FJ66TF
BS 156 195 RR2GH12TF
BS 196 196 RR2FJ66TF
BS 197 313 RR2GH12TF
BS 314 314 RR2FJ66TF
BS 315 391 RR2GH12TF
BS 392 392 RR2FJ66TF
BS 393 534 RR2GH12TF
BS 535 835 RR2FJ66TF

RD RR2GH12TF 534 0 0
GGGGACTGGGAGGAGAGGAGAGGATCTACGAAACTTCGATTTGGGGGTTTTCTTTTCTTC
TAGATCCTAGCTAATTCGTCTAAAGACGTCGCCTTTGACGACGACGACGACGACCCATTC
ATCTCGCTAACCTCGTTCTCCCTTTCTCTCTATTTCCCACGCACAACAAAATCTCTCACT
TTTTTCCCTCAGATATGCCTTCCAATACGGCGTCGTCTAGCTCCGCCGCTGCCGGATCTG
TAAATTCTTCCTCCTCCCGTACAAAATCCAAACGACCCAAGTATTCGAAGTTTACACAGC
AGGAGCTCCCTGCTTGCAAGCCTATTCTCACGCCTGGTTGGGTGATTCTGACTTTTTTAG
TCATTAGTGTGATCTTCATTCCACTCGGAGTTGTTTCGCTTTTCGCTTCCCAGGATGTTG
TTGAGATCGTTGATCGGTATGATAATGATTGCGTACCTACGCCTGCTAGGGCTAACAAGG
TTGCTTTTATTCAAGGAGGTGGAGACAAATCTTGTAACCGGACACTAGTGGTTC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RR2FJ66TF 810 0 0
GG
ACGAAACTTCGATTTGGGGGTTTTCTTTTCTTCTAGATCCTAGCTAATTCGTCTAAAGAC
GTCGCCTTTGACGACGACGACGACGACCCATTCATCTCGCTAACCTCGTTCTCCCTTTCT
CTCTATTCCCCACGCACAACAAAATCTCTCACTTTTTTCCCTCAGATACGCCTTCCAATA
CGGCGTCGTCTAGCTCCGCCGCTGCCGGATCTGTAGATTCTTCCTCCTCCCGTACAAAAT
CCAAACGACCCAAGTATTCGAAGTTTACACAGCAGGAGCTCCCTGCGTGCAAGCCTATTC
TCACGCCTGGTTGGGTGATTCTGACTTTTTTAGTCATTAGTGTGATCTTCATTCCACTCG
GAGTCGTTTCGCTTTTCGCTTCCCAGGATGTTGTTGAGATCGTTGATCGGTATGATAATG
ATTGCGTACCTACGCCTGCTAGGGCTAACAAGGTTGCTTTTATTCAAGGAGGTGGAGACA
AATCTTGTAACCGGACACTAGTGGTTCCTAAGAAGATGAAGCAGCCTATCTACGTTTATT
ACCAGCTTGAGAACTTCTACCAGAACCACCGCAGGTATGTGAAAAGCAGAAGTGATGCGC
AGTTGAGAAGTGTGAAAGATGAGAACCAAATCGATGCATGCAAGCCTGAGATGATGCTAA
TGGGCGGCCGATTGTGCCGTGTGGTCTATTGCTTGGAGTCTCTTTAATGACACATACGCT
TTGTCCAAAACACCAGCCTTTGATGTAAGCAGAGAGCATTGCGTGAAGAGTGACAGGACA
CATTTGGCAAAATGTATTTCCAAGACTT

QA 3 810 3 810
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7749Contig1 725 2 3 U
GAGACTTGTGAATGTGAAACGTTGCAAGAAGAAGTTGCAAACCTAAAGCGGGAGCTCTCT
GATGCCTTGGAACTAGCACAGGAAACCAAAATCGAAGAGCTGAAACAGAAAGCTAAGGAA
CTAAGTGAATCGAAGGAGCAATTAGAACATCGTAACAGGAAACTCGCGGAAGAGAGTTCA
TATGCAAAAGGTCTTGCATCAGCAGCTGCAGTTGAGCTCAAGGCATTGTCTGAAGAAGTT
GCAAAGCTTATGAATCACAACGAGAGACTAGCAGCTGAGCTAACAGCTTTCAAGAGCTCA
GTCCCACAGCGCGGTAATAAGACAGGAACAACAACAACAACAACAAATGCAAGGAACAAT
GGGAGAAGAGAGAGTCTTGTAAAGAGACAAGAGCAAGAGATCTCGTCGATGGAGCTGAAA
AGAGAACTGAGGATGAGCAAAGAGCGCGAACGATCGTACGAAGCTGCGCTTGTTGATAGG
GACCAAAGAGAAGCCGAGCTTGAGAGGATAGTAGAAGAAACGAAACAGAGAGAAGCGTAT
TTGGAGAACGAGCTTGCCAGCATGTGGGTTCTCGTTTCTAAGCTGAGAAGATCTCAAGGA
GGTGGTTCCGAAATCTCTGATTCTGTATCGGAGACGCTACAAACCGATCGATCATTTTGA
GAACATGAAGTAGTAGGATATGTTTGTGCAGTGATTCAAGAGTTTGTGTTGTGTAAAGTA
TGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RR2DD40JQ C 1
AF RR2DD40TF U 1
BS 1 676 RR2DD40TF
BS 677 677 RR2DD40JQ
BS 678 725 RR2DD40TF

RD RR2DD40JQ 725 0 0
GAGACTTGTGAATGTGAAACGTTGCAAGAAGAAGTTGCAAACCTAAAGCGGGAGCTCTCT
GATGCCTTGGAACTAGCACAGGAAACCAAAATCGAAGAGCTGAAACAGAAAGCTAAGGAA
CTAAGTGAATCGAAGGAGCAATTAGAACATCGTAACAGGAAACTCGCGGAAGAGAGTTCA
TATGCAAAAGGTCTTGCATCAGCAGCTGCAGTTGAGCTCAAGGCATTGTCTGAAGAAGTT
GCAAAGCTTATGAATCACAACGAGAGACTAGCAGCTGAGCTAACAGCTTTCAAGAGCTCA
GTCCCACAGCGCGGTAATAAGACAGGAACAACAACAACAACAACAAATGCAAGGAACAAT
GGGAGAAGAGAGAGTCTTGTAAAGAGACAAGAGCAAGAGATCTCGTCGATGGAGCTGAAA
AGAGAACTGAGGATGAGCAAAGAGCGCGAACGATCGTACGAAGCTGCGCTTGTTGATAGG
GACCAAAGAGAAGCCGAGCTTGAGAGGATAGTAGAAGAAACGAAACAGAGAGAAGCGTAT
TTGGAGAACGAGCTTGCCAGCATGTGGGTTCTCGTTTTTAAGCTGAGAAGATCTCAAGGA
GGTGGTTCCGAAATCTCTGATTCTGTATCGGAGACGCTACAAACCGATCGATCATTTTGA
GAACATGAAGTAGTAGGATATGTTTGTGCAGTGATTCAAGAGTTTGTGTTGTGTAAAGTA
TGATT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2DD40TF 725 0 0
GAGACTTGTGAATGTGAAACGTTGCAAGAAGAAGTTGCAAACCTAAAGCGGGAGCTCTCT
GATGCCTTGGAACTAGCACAGGAAACCAAAATCGAAGAGCTGAAACAGAAAGCTAAGGAA
CTAAGTGAATCGAAGGAGCAATTAGAACATCGTAACAGGAAACTCGCGGAAGAGAGTTCA
TATGCAAAAGGTCTTGCATCAGCAGCTGCAGTTGAGCTCAAGGCATTGTCTGAAGAAGTT
GCAAAGCTTATGAATCACAACGAGAGACTAGCAGCTGAGCTAACAGCTTTCAAGAGCTCA
GTCCCACAGCGCGGTAATAAGACAGGAACAACAACAACAACAACAAATGCAAGGAACAAT
GGGAGAAGAGAGAGTCTTGTAAAGAGACAAGAGCAAGAGATCTCGTCGATGGAGCTGAAA
AGAGAACTGAGGATGAGCAAAGAGCGCGAACGATCGTACGAAGCTGCGCTTGTTGATAGG
GACCAAAGAGAAGCCGAGCTTGAGAGGATAGTAGAAGAAACGAAACAGAGAGAAGCGTAT
TTGGAGAACGAGCTTGCCAGCATGTGGGTTCTCGTTTCTAAGCTGAGAAGATCTCAAGGA
GGTGGTTCCGAAATCTCTGATTCTGTATCGGAGACGCTACAAACCGATCGATCATTTTGA
GAACATGAAGTAGTAG*ATATGTTTGTGCAGTGATTCAAGAGTTTGTGTTGTGTAAAGTA
TGATT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL7750Contig1 558 2 1 U
GGAATCTGCTCTGAGATAGCTTTCGATCTTCATCTTCTCAATCTCGTCTCGTCTCGTCTC
GTCTCGTCGTCTCGATCAATCGATCAAAAGAATCAGAGAATGGCATCGACTGCGGCGGTT
CCGTTCTGGAGAGCGGCGGGGATGACGTATATAACGTACTCAAACATCTGCGCGAATCTG
GTCAGGAACTGTCTGAAAGAACCCTTCAAGGCCGAATCGATGAGCCGCGAGAAGGTTCAC
TTCTCCCTCTCCAAATGGGCCGATGGAAAGCCCCAGAAACCAGTTTTGCGGTCAGACGCA
CCTCAAGTTTGAGGCTTTTGATCAAAGCATGGATGGATAAAAGGGATGTTGTAACGTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGACAATTTGTTTCCTTCTGTTTGTTGTCTGCAATGAAA
ACTTTTTGCTCAGGCAATCAATAATGAAAAACACTTCTTCTGTTTCTTGCTCAAGACAAA
TTATATTTTTTTTGTTGTATTTGTTGTCCATTGAGTATTGACTATGGCCTTTCTCTACAG
CAAATCAACCATTTGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CK32JQ C 1
AF RR2CK32TF U 1
BS 1 558 RR2CK32TF

RD RR2CK32JQ 558 0 0
GGAATCTGCTCTGAGATAGCTTTCGATCTTCATCTTCTCAATCTCGTCTCGTCTCGTCTC
GTCTCGTCGTCTCGATCAATCGATCAAAAGAATCAGAGAATGGCATCGACTGCGGCGGTT
CCGTTCTGGAGAGCGGCGGGGATGACGTATATAACGTACTCAAACATCTGCGCGAATCTG
GTCAGGAACTGTCTGAAAGAACCCTTCAAGGCCGAATCGATGAGCCGCGAGAAGGTTCAC
TTCTCCCTCTCCAAATGGGCCGATGGAAAGCCCCAGAAACCAGTTTTGCGGTCAGACGCA
CCTCAAGTTTGAGGCTTTTGATCAAAGCATGGATGGATAAAAGGGATGTTGTAACGTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGACAATTTGTTTCCTTCTGTTTGTTGTCTGCAATGAAA
ACTTTTTGCTCAGGCAATCAATAATGAAAAACACTTCTTCTGTTTCTTGCTCAAGACAAA
TTATATTTTTTTTGTTGTATTTGTTGTCCATTGAGTATTGACTATGGCCTTTCTCTACAG
CAAATCAACCATTTGTCC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2CK32TF 558 0 0
GGAATCTGCTCTGAGATAGCTTTCGATCTTCATCTTCTCAATCTCGTCTCGTCTCGTCTC
GTCTCGTCGTCTCGATCAATCGATCAAAAGAATCAGAGAATGGCATCGACTGCGGCGGTT
CCGTTCTGGAGAGCGGCGGGGATGACGTATATAACGTACTCAAACATCTGCGCGAATCTG
GTCAGGAACTGTCTGAAAGAACCCTTCAAGGCCGAATCGATGAGCCGCGAGAAGGTTCAC
TTCTCCCTCTCCAAATGGGCCGATGGAAAGCCCCAGAAACCAGTTTTGCGGTCAGACGCA
CCTCAAGTTTGAGGCTTTTGATCAAAGCATGGATGGATAAAAGGGATGTTGTAACGTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGACAATTTGTTTCCTTCTGTTTGTTGTCTGCAATGAAA
ACTTTTTGCTCAGGCAATCAATAATGAAAAACACTTCTTCTGTTTCTTGCTCAAGACAAA
TTATATTTTTTTTGTTGTATTTGTTGTCCATTGAGTATTGACTATGGCCTTTCTCTACAG
CAAATCAACCATTTGTCC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL7751Contig1 558 2 1 U
GGAAGCCAATGGATCAGAGGAGCAGGGTTAAGTTTAAAATCATGAGCCTCAAGGTGAAAG
GTCCAATGGACTATGTGCCTGAGCTGTTTGATGAGCAAAAAGATGATGTGTCCAAGGAGC
AAATATTGCGTGTTATCTTCTTGGATCCAGAACGTCCGAACCCTGCACTGGAGAAACTGA
AGCGTCAGTTAGCTGAAGCGGATGCAGCAGTGGAGACAAGGAAGAAACCACCAGAGGAAA
CAGGTCCAAAGATGATTGGAGAAGGACTTGTGATCGATGAATGGAAGGAGCGACGAGAGA
GATATCTTGCACAGCAACAAGGCGAAGGAGTTGAGTCTGTCTAAGAACTATAAAGAAGAT
CCTTCTCAGAACAAAAACAAGTGTGTGTGTGTGTGCTTGTGAAGAAAGAAGAAGAAGAAG
AGACCACGATATTCAATTTCTCTCTTCTAACTTCAAAATTCATAATGCATTCTAAGGATG
ATGTTGGTATAAAAGACAAAACATTTTCATGTAAAAAAAAAATGTAAACGTGGGGTTTGA
TAAAGAATTGTTCATGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AT20JQ C 1
AF RR2AT20TF U 1
BS 1 558 RR2AT20TF

RD RR2AT20JQ 558 0 0
GGAAGCCAATGGATCAGAGGAGCAGGGTTAAGTTTAAAATCATGAGCCTCAAGGTGAAAG
GTCCAATGGACTATGTGCCTGAGCTGTTTGATGAGCAAAAAGATGATGTGTCCAAGGAGC
AAATATTGCGTGTTATCTTCTTGGATCCAGAACGTCCGAACCCTGCACTGGAGAAACTGA
AGCGTCAGTTAGCTGAAGCGGATGCAGCAGTGGAGACAAGGAAGAAACCACCAGAGGAAA
CAGGTCCAAAGATGATTGGAGAAGGACTTGTGATCGATGAATGGAAGGAGCGACGAGAGA
GATATCTTGCACAGCAACAAGGCGAAGGAGTTGAGTCTGTCTAAGAACTATAAAGAAGAT
CCTTCTCAGAACAAAAACAAGTGTGTGTGTGTGTGCTTGTGAAGAAAGAAGAAGAAGAAG
AGACCACGATATTCAATTTCTCTCTTCTAACTTCAAAATTCATAATGCATTCTAAGGATG
ATGTTGGTATAAAAGACAAAACATTTTCATGTAAAAAAAAAATGTAAACGTGGGGTTTGA
TAAAGAATTGTTCATGTT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RR2AT20TF 558 0 0
GGAAGCCAATGGATCAGAGGAGCAGGGTTAAGTTTAAAATCATGAGCCTCAAGGTGAAAG
GTCCAATGGACTATGTGCCTGAGCTGTTTGATGAGCAAAAAGATGATGTGTCCAAGGAGC
AAATATTGCGTGTTATCTTCTTGGATCCAGAACGTCCGAACCCTGCACTGGAGAAACTGA
AGCGTCAGTTAGCTGAAGCGGATGCAGCAGTGGAGACAAGGAAGAAACCACCAGAGGAAA
CAGGTCCAAAGATGATTGGAGAAGGACTTGTGATCGATGAATGGAAGGAGCGACGAGAGA
GATATCTTGCACAGCAACAAGGCGAAGGAGTTGAGTCTGTCTAAGAACTATAAAGAAGAT
CCTTCTCAGAACAAAAACAAGTGTGTGTGTGTGTGCTTGTGAAGAAAGAAGAAGAAGAAG
AGACCACGATATTCAATTTCTCTCTTCTAACTTCAAAATTCATAATGCATTCTAAGGATG
ATGTTGGTATAAAAGACAAAACATTTTCATGTAAAAAAAAAATGTAAACGTGGGGTTTGA
TAAAGAATTGTTCATGTT

QA 1 558 1 558
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7753Contig1 1392 2 2 U
AGAGACGCCCAATTTCAACTCTTCAGTGAGCCGATTCCAGCGAAAACTTCTCCGCTGCGT
CCGCCGGGCTTATCGATCGGCTGAAGATTCGACATGGAAGGGAACTCTAGCGGAGGACCG
GCAACGGGAGGTGGAGGAGGAGGAGGGAGCGATGTGGAGTTGGTGAGCAAGACGTTGCAG
GTGGAGCACAAGCTTTTCTATTTCGATCTCAAGGAGAATCCTCGCGGAAGGTATCTCAAG
ATATCTGAGAAGACGTCGGCGACGAGGTCAACCATCATCGTTCCTTCCTCCGGCATCTCA
TGGTTCCTCGATCTCTTCAATTACTACGTCAATTCCGAGGAACACGAGCTTTTCAGCAAA
GAGCTGCAGCTTGATTCCAAGGTGTTTTACTTTGACATCGGTGATAACAGGAGGGGGAGG
TTCTTGAAGGTGTCAGAAGCATCTGTTAGTAGAAATCGAAACACCATTATTGTTCCTGCT
GGAAGCTCCCCTGATGAAGGATGGGCAGCTTTCAGGAACATATTGGCTGAGATCCATGAA
GCTTGTGGGCTTTTCGTGATGCCAAATCAGAAACCTTCTGATGGACAAGAACATCTGGTT
GGACTTTCAGATGATGTTGGCGCTGGATTTATACCTGGTCATGGTAACCAACCAGCATCC
TCTTCTTCAGATCTTACTGTGGATCGAACAACTGACTTGCCTGGCCAGGATGAAGCCGGA
TTGACTGGTGTTTCTAAAGTAATCAGAGCTGACCAGAAACGCTTCTTCTTTGATCTTGGG
AACAACAACAGGGGCCATTTCCTCAGGATATCCGAGGTGGCAGGTTCGGACAGGTCATCG
ATCATTCTACCGTTATCTGGTTTAAGACAGTTTCATGAAGTAGTTGGTCACTTTGTGGAG
ATCACCAAAGATAAGATTGATGGGATGACAGGTGCAAATGTCAGGACTATTGATCCTCCT
CATAGATGAGCAACTTGATTCTTTTAGGGGTTGGGGAAATAATTTTGAATCCATTCGAAA
TTTCCAATCCTCTTGAATTTCAGCGACTTTTCAAGTAGCTGTCTGATCACCTGTGTGCAA
TAGTTTCAAGTAATTTATCACCCATTCACATCATCTAAAAAATAATTCAGCAGAATCATC
ATTGTCTTTTAGTAGCAGATTAAAAAAAAGGGGGTTGGAGTCTGCAACTGGAAATAAGCT
GAAGTCATCCCTCCCTGCCTCCTTCCCCACTCTTCTCATTTGGTTATGTTCTGTTTTAAC
TTTTTTTGTTTGTTATCAGTTTGGGCCATTGGTTGTATATCTGTTGACAGCTTTGCATTT
CGGTTGTAGAAGAACATTGGGTTTGGGCTAATGCCAGTTGTGTAATAATAATCAATAAAT
AATTGATGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ43TFB U 1
AF RR2AZ43JQ C 633
BS 1 714 RR2AZ43TFB
BS 715 1392 RR2AZ43JQ

RD RR2AZ43TFB 714 0 0
AGAGACGCCCAATTTCAACTCTTCAGTGAGCCGATTCCAGCGAAAACTTCTCCGCTGCGT
CCGCCGGGCTTATCGATCGGCTGAAGATTCGACATGGAAGGGAACTCTAGCGGAGGACCG
GCAACGGGAGGTGGAGGAGGAGGAGGGAGCGATGTGGAGTTGGTGAGCAAGACGTTGCAG
GTGGAGCACAAGCTTTTCTATTTCGATCTCAAGGAGAATCCTCGCGGAAGGTATCTCAAG
ATATCTGAGAAGACGTCGGCGACGAGGTCAACCATCATCGTTCCTTCCTCCGGCATCTCA
TGGTTCCTCGATCTCTTCAATTACTACGTCAATTCCGAGGAACACGAGCTTTTCAGCAAA
GAGCTGCAGCTTGATTCCAAGGTGTTTTACTTTGACATCGGTGATAACAGGAGGGGGAGG
TTCTTGAAGGTGTCAGAAGCATCTGTTAGTAGAAATCGAAACACCATTATTGTTCCTGCT
GGAAGCTCCCCTGATGAAGGATGGGCAGCTTTCAGGAACATATTGGCTGAGATCCATGAA
GCTTGTGGGCTTTTCGTGATGCCAAATCAGAAACCTTCTGATGGACAAGAACATCTGGTT
GGACTTTCAGATGATGTTGGCGCTGGATTTATACCTGGTCATGGTAACCAACCAGCATCC
TCTTCTTCAGATCTTACTGTGGATCGAACAACTGACTTGCCTGGCCAGGATGAA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RR2AZ43JQ 760 0 0
ACCTGGTCATGGTAACCAACCAGCATCCTCTTCTTCAGATCTTACTGTGGATCGAACAAC
TGACTTGCCTGGCCAGGATGAAGCCGGATTGACTGGTGTTTCTAAAGTAATCAGAGCTGA
CCAGAAACGCTTCTTCTTTGATCTTGGGAACAACAACAGGGGCCATTTCCTCAGGATATC
CGAGGTGGCAGGTTCGGACAGGTCATCGATCATTCTACCGTTATCTGGTTTAAGACAGTT
TCATGAAGTAGTTGGTCACTTTGTGGAGATCACCAAAGATAAGATTGATGGGATGACAGG
TGCAAATGTCAGGACTATTGATCCTCCTCATAGATGAGCAACTTGATTCTTTTAGGGGTT
GGGGAAATAATTTTGAATCCATTCGAAATTTCCAATCCTCTTGAATTTCAGCGACTTTTC
AAGTAGCTGTCTGATCACCTGTGTGCAATAGTTTCAAGTAATTTATCACCCATTCACATC
ATCTAAAAAATAATTCAGCAGAATCATCATTGTCTTTTAGTAGCAGATTAAAAAAAAGGG
GGTTGGAGTCTGCAACTGGAAATAAGCTGAAGTCATCCCTCCCTGCCTCCTTCCCCACTC
TTCTCATTTGGTTATGTTCTGTTTTAACTTTTTTTGTTTGTTATCAGTTTGGGCCATTGG
TTGTATATCTGTTGACAGCTTTGCATTTCGGTTGTAGAAGAACATTGGGTTTGGGCTAAT
GCCAGTTGTGTAATAATAATCAATAAATAATTGATGTTCC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL7754Contig1 764 2 20 U
GAGTCTGTGTCTAATGACTGGGGTGGGTCTAAGCCAGCTGTTGTGGAAGAAGATAAAGAG
TTTTTGGAGAAGAAGGAGAAGATGCTTGATCTTGAGAGAGAGATTGTTAATGCTTCACAG
CAGGCTGAAACACTAGTGAAGGCACAGCAAGAGATGGGGGAGACAATGGGGGAACTAGGA
TTAGCATTCATCAAGCTGACGAAATTCGAGAACGAAGAAGCTGTCTTCAATTCTCAGAGA
GCTCGTGCCAACGATATGAAGAATTTAGCTACCGCAGCTGTAAAAGCAAGCAGGTTTTAC
AGAGAGTTGAATTCTCAGACGGTCAAGCATTTGGACACACTACACGATTACCTTGGCCTA
ATGATGGCGGTCCAGGGGGCGTTTGCAGATAGATCTAGTGCTTTACTGACAGTGCAGACG
CTTTTGTCCGACCTTTCTTCACTGGAAGGAAGAGCAGAGAAGCTAGAAGCTGCGTCGTCA
AAGGTATTTGGTGGTGACAAATCAAGGATTAAGAAGATTGAAGAGATCAAAGAAACAATC
AGGAACACTGAGGACGCCAAGAATGTAGCCATCAGGGAGTACGAGCGGATCAAGGAAAAT
AACTGGAGCGAGGTTGAAAGGCTAGACAGAGAAAGGCGTGCAGACTTCTTGATATGATGA
AAGGGTTCGTTGTTAACCAGTTTGGATATGCAGAGAGATCGCCAGTGTGTGGACAAAGCT
GCAGATGAGACTAGTCATACGATAGAGAGAGCTCTTACAGGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C656TF U 1
AF RR2D592TF U 10
BS 1 26 RR2C656TF
BS 27 27 RR2D592TF
BS 28 96 RR2C656TF
BS 97 97 RR2D592TF
BS 98 128 RR2C656TF
BS 129 129 RR2D592TF
BS 130 132 RR2C656TF
BS 133 133 RR2D592TF
BS 134 164 RR2C656TF
BS 165 165 RR2D592TF
BS 166 359 RR2C656TF
BS 360 360 RR2D592TF
BS 361 410 RR2C656TF
BS 411 411 RR2D592TF
BS 412 428 RR2C656TF
BS 429 429 RR2D592TF
BS 430 460 RR2C656TF
BS 461 461 RR2D592TF
BS 462 628 RR2C656TF
BS 629 764 RR2D592TF

RD RR2C656TF 631 0 0
GAGTCTGTGTCTAATGACTGGGGTGG*TCTAAGCCAGCTGTTGTGGAAGAAGATAAAGAG
TTTTTGGAGAAGAAGGAGAAGATGCTTGATCTTGAGCGAGAGATTGTTAATGCTTCACAG
CAGGCTGAGACATTAGTGAAGGCACAGCAAGAGATGGGGGAGACTATGGGGGAACTAGGA
TTAGCATTCATCAAGCTGACGAAATTCGAGAACGAAGAAGCTGTCTTCAATTCTCAGAGA
GCTCGTGCCAACGATATGAAGAATTTAGCTACCGCAGCTGTAAAAGCAAGCAGGTTTTAC
AGAGAGTTGAATTCTCAGACGGTCAAGCATTTGGACACACTACACGATTACCTTGGCCTG
ATGATGGCGGTCCAGGGGGCGTTTGCAGATAGATCTAGTGCTTTACTGACTGTGCAGACG
CTTTTGTCTGACCTTTCTTCACTGGAAGGAAGAGCAGAGAGGCTAGAAGCTGCGTCGTCA
AAGGTATTTGGTGGTGACAAATCAAGGATTAAGAAGATTGAAGAGATCAAAGAAACAATC
AGGAACACTGAGGACGCCAAGAATGTAGCCATCAGGGAGTACGAGCGGATCAAGGAAAAT
AACTGGAGCGAGGTTGAAAGGCTAGACA
AAG

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2D592TF 755 0 0
G
CTAATGACTGGGGTGGGTCTAAGCCAGCTGTTGTGGAAGAAGATAAAGAGTTTTTGGAGA
AGAAGGAGAAGATGCTTGATCTTGAGAGAGAGATTGTTAATGCTTCACAGCAGGCTGAAA
CACTAGTGAAGGCACAGCAAGAGATGGGGGAGACAATGGGGGAACTGGGATTAGCATTCA
TCAAGCTGACGAAATTCGAGAACGAAGAAGCTGTCTTCAATTCTCAGAGAGCTCGTGCCA
ACGATATGAAGAATTTAGCTACCGCAGCTGTAAAAGCAAGCAGGTTTTACAGAGAGTTGA
ATTCTCAGACGGTCAAGCATTTGGACACACTCCATGATTACCTTGGCCTAATGATGGCGG
TCCAGGGGGCGTTTGCAGATAGATCTAGTGCTTTACTGACAGTGCAGACGCTTTTGTCCG
AGCTTTCTTCACTGGAAGGAAGAGCAGAGAAGCTAGAAGCTGCGTCGTCAAAGGTATTTG
GTGGTTACAAGTCAAGGATTAAGAAGATTGAAGAGATCAAAGAAACAATCAGGAACACTG
AGGACGCCAAGAATGTAGCCATCAGGGAGTACGAGCGGATCAAGGAAAATAACTGGAGCG
AGGTTGAAAGGCTAGACAGAGAAAGGCGTGCAGACTTCTTGATATGATGAAAGGGTTCGT
TGTTAACCAGTTTGGATATGCAGAGAGATCGCCAGTGTGTGGACAAAGCTGCAGATGAGA
CTAGTCATACGATAGAGAGAGCTCTTACAGGAGT

QA 2 755 2 755
DS 



AS 1 2

CO CL7755Contig1 840 2 11 U
AAATTAATAAATTGGATTTGATATATATTATATTTCCATGCATACTAAATTCAATTTCAA
CGAAGCTGTTAATACCCCTTATTTTTGTCGTTATTTGGGAACACATATAACTTCACAATC
TTTTTCCAAACAACTGAATTTAAAACATGAAAACATACACTTGGTTGAGAAGTCTCCTAT
TCTCTTTTCTTTTAAAGCCGTGCTAACGCTGAAATATTGATTGGATAAACGTCGTCAGAC
GATTGCGCATTGTAAAATCGTTGTGCTATGATCGTGTTCGCACGATCCGTTGGATGAAAT
GCATCCCAAAACACGTACTCATCTCTGTTCGGACACGGGGCTTGTCCTGGTAAACATGTA
AGCTGACCTCCATTCCTTCCAACTCCGCAACACGCAGCGTTCGTTACCCTAAACCCATAA
GCAGAGGGATTGGCGATTATGTCCTGGAAAACCCCATAAGCATTAATGTATGTAAACCTA
GCATCAAAGTGGTCCCTGTTGAGCTGTTGGACCATGGACTTAAGCCTGCTGTTGAAGATT
CTGTTGGCCGAGTTGATACGTTCCACGCAAGTTGTTCCATCGGGGCTGCCCTGTGCAAGG
GAGTTCGGGCTACACCCGATGGCTCCCACTCCTACCAGTGCAAACTTTCTAGCGCCATAG
TTGTAAAGGGCATTGAGCTGGTCTCTGTAACGATTGATAAGATCATCAGCATATTATTCG
GGGGTGTACTGTCTGCTAGTGGAGTAGAATTGAGGCATGAAGTAGTTATTAAGATAGTCA
TTGCTTCCCAAACCGACAGAGTAAATGCACTGCCTGAGGTATCAGCCGCACTATTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FY16JQ U 245
AF RR2DP71JQ U 1
BS 1 255 RR2DP71JQ
BS 256 256 RR2FY16JQ
BS 257 352 RR2DP71JQ
BS 353 353 RR2FY16JQ
BS 354 452 RR2DP71JQ
BS 453 453 RR2FY16JQ
BS 454 486 RR2DP71JQ
BS 487 487 RR2FY16JQ
BS 488 494 RR2DP71JQ
BS 495 495 RR2FY16JQ
BS 496 840 RR2DP71JQ

RD RR2FY16JQ 289 0 0
GCGCATTGTAAAATCGTTGTGCTATGATCGTGTTCGCACGATCCGTTGGATGAAATGCAT
CCCAAAACACGTACTCATCTCTGTTCGGACACGGGGCTTGTCCTGGTAAACATGTAAGCT
GACCTCCATTCCTTCCAACTCCGCAACACGCAGCGTTCGTTACCCTAAACCCATAAGCAG
AGGGATTGGCGATTATGTCCTGGAAAACCCCATAAGCATTAATGTATGTAAACCTAGCAT
CAAAGTGGTCCCTGTTGAGCTGTTGGACCATGGACTTAAGCCTGCTGTT

QA 1 289 1 289
DS 

RD RR2DP71JQ 840 0 0
AAATTAATAAATTGGATTTGATATATATTATATTTCCATGCATACTAAATTCAATTTCAA
CGAAGCTGTTAATACCCCTTATTTTTGTCGTTATTTGGGAACACATATAACTTCACAATC
TTTTTCCAAACAACTGAATTTAAAACATGAAAACATACACTTGGTTGAGAAGTCTCCTAT
TCTCTTTTCTTTTAAAGCCGTGCTAACGCTGAAATATTGATTGGATAAACGTCGTCAGAC
GATTGCGCATTGTAAGATCGTTGTGCTATGATCGTGTTCGCACGATCCGTTGGATGAAAT
GCATCCCAAAACACGTACTCATCTCTGTTCGGACACGGGGCTTGTCCTGGTAGACATGTA
AGCTGACCTCCATTCCTTCCAACTCCGCAACACGCAGCGTTCGTTACCCTAAACCCATAA
GCAGAGGGATTGGCGATTATGTCCTGGAAAACGCCATAAGCATTAATGTATGTAAACCTA
GCATCAGAGTGGTCGCTGTTGAGCTGTTGGACCATGGACTTAAGCCTGCTGTTGAAGATT
CTGTTGGCCGAGTTGATACGTTCCACGCAAGTTGTTCCATCGGGGCTGCCCTGTGCAAGG
GAGTTCGGGCTACACCCGATGGCTCCCACTCCTACCAGTGCAAACTTTCTAGCGCCATAG
TTGTAAAGGGCATTGAGCTGGTCTCTGTAACGATTGATAAGATCATCAGCATATTATTCG
GGGGTGTACTGTCTGCTAGTGGAGTAGAATTGAGGCATGAAGTAGTTATTAAGATAGTCA
TTGCTTCCCAAACCGACAGAGTAAATGCACTGCCTGAGGTATCAGCCGCACTATTTTCAT

QA 1 840 1 840
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7757Contig1 660 2 1 U
GGGAATCGTCGTCTCTCTGGTCAAAATAAAAAAACCCTAACGTTCACAGATCTCTCGGAG
ATGAAAGGTGGTGAAACCAAAGCTCAAGCGAAGGGCACTGATGACAGATTGAAGACGAGA
GGTAAGAAAGCTGGAAAGAAAGCCGCAAAGGATCCTAACAAGCCTAAGAGGCCTCCTAGT
GCTTTCTTCGTCTTCCTGGAGGGATTCCGTAAGGAGTTCAATCTAGCTAACCCTGACAAC
AAATCCGTTGGAGCTGTTGGTAAAGCTGCTGGAGCTAAATGGAAATCCATGACTGATGAA
GACAAGGCTCCTTTTGTAGCCAAGGCAGAGACTAAAAAGAGTGAATATACCAAGACTATG
CAAAAATGCAACATGAAATTGGCTAATGGAACTAGCACAGCTGGAGATGATGACTCTGAC
AAGTCCAAGTCTGAAGTCAACGAAGGCGCAAGTGAAGAGGAGGAAGATGATGATTAGAAG
ATGTATCATCGATTTGTACCTTCTGTTGTATTGTTGTTAGCTGCTAGTTTTTAGGGAGAA
GAATAGTTTCACGTTTGCTATGTTTTCTTCCCTTTTTTTATGTTAACTGGGATTATTCGT
ACTATCTGCTACAACTTGTTATGCACAACTTTGGATTTAGCTTGATTTTCGTCTCTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FN85TF U 1
AF RR2FN85JQ C 15
BS 1 660 RR2FN85TF

RD RR2FN85TF 660 0 0
GGGAATCGTCGTCTCTCTGGTCAAAATAAAAAAACCCTAACGTTCACAGATCTCTCGGAG
ATGAAAGGTGGTGAAACCAAAGCTCAAGCGAAGGGCACTGATGACAGATTGAAGACGAGA
GGTAAGAAAGCTGGAAAGAAAGCCGCAAAGGATCCTAACAAGCCTAAGAGGCCTCCTAGT
GCTTTCTTCGTCTTCCTGGAGGGATTCCGTAAGGAGTTCAATCTAGCTAACCCTGACAAC
AAATCCGTTGGAGCTGTTGGTAAAGCTGCTGGAGCTAAATGGAAATCCATGACTGATGAA
GACAAGGCTCCTTTTGTAGCCAAGGCAGAGACTAAAAAGAGTGAATATACCAAGACTATG
CAAAAATGCAACATGAAATTGGCTAATGGAACTAGCACAGCTGGAGATGATGACTCTGAC
AAGTCCAAGTCTGAAGTCAACGAAGGCGCAAGTGAAGAGGAGGAAGATGATGATTAGAAG
ATGTATCATCGATTTGTACCTTCTGTTGTATTGTTGTTAGCTGCTAGTTTTTAGGGAGAA
GAATAGTTTCACGTTTGCTATGTTTTCTTCCCTTTTTTTATGTTAACTGGGATTATTCGT
ACTATCTGCTACAACTTGTTATGCACAACTTTGGATTTAGCTTGATTTTCGTCTCTACCC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RR2FN85JQ 646 0 0
CTCTGGTCAAAATAAAAAAACCCTAACGTTCACAGATCTCTCGGAGATGAAAGGTGGTGA
AACCAAAGCTCAAGCGAAGGGCACTGATGACAGATTGAAGACGAGAGGTAAGAAAGCTGG
AAAGAAAGCCGCAAAGGATCCTAACAAGCCTAAGAGGCCTCCTAGTGCTTTCTTCGTCTT
CCTGGAGGGATTCCGTAAGGAGTTCAATCTAGCTAACCCTGACAACAAATCCGTTGGAGC
TGTTGGTAAAGCTGCTGGAGCTAAATGGAAATCCATGACTGATGAAGACAAGGCTCCTTT
TGTAGCCAAGGCAGAGACTAAAAAGAGTGAATATACCAAGACTATGCAAAAATGCAACAT
GAAATTGGCTAATGGAACTAGCACAGCTGGAGATGATGACTCTGACAAGTCCAAGTCTGA
AGTCAACGAAGGCGCAAGTGAAGAGGAGGAAGATGATGATTAGAAGATGTATCATCGATT
TGTACCTTCTGTTGTATTGTTGTTAGCTGCTAGTTTTTAGGGAGAAGAATAGTTTCACGT
TTGCTATGTTTTCTTCCCTTTTTTTATGTTAACTGGGATTATTCGTACTATCTGCTACAA
CTTGTTATGCACAACTTTGGATTTAGCTTGATTTTCGTCTCTACCC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7759Contig1 1068 2 2 U
GGAACTACGTCTTGATCCATACAATGTCTTCTTCGTCTTCGTCTCCCAGGGAGATGAATG
AAGGAGGAGAATGCGTAGACTGGGCTGAGCTTCCACCGGAGCTGACGTCATCGATTCTTC
ACCGGCTTGGCCCGATTGAGATAGTGGAAACCGCTCAAAAAGTTTGCAGATCGTGGCGTC
GCGTCTGTAAAGACCCTTCGATGTGGCGCAAAATTGTCATACATATTGAAGAATTTGGAG
ACAGGTACTACGAGAAACTGTGCCGCCACGCAGTTGGTAGGGGCCATGGCGGCTTGGTTG
AGATCGATATCTCGCACTTTGGTTCTGATCCCCTCCTCCGTTACATCGCCGATGAGAGTT
CTAGTCATCTGAGAAGCCTAAGAATTTCATTCTGCTATCAGAAGAGTGTCTGAGAGTTGT
AGGCCAGTCTTGTCCAAATCTCAAGGCCTTGAAGAAAAACTGCGTGGGTTACAGGCGTCG
TAGTACTCGAAAGGAGAGTGATGATGTTGCCCTAGCGATCGCTGAAACAATGCTCGGACT
TTGCCTCCTCCAGATTTTCGGGGACACATTAACAGACGCTGGTTTAAACGCCATTCTTGA
CGGTTGTCCTAACCTGAAACATCTTGATCTGCGCCAGTGTTTCAACGTTAACCTTGTTGG
GGATCTGGAGAAGCGGTGTCTCGAGAGGATCAAAGTTGTGAGACGCCCTAATGACTCGGT
TCATGATTACCCATTCGATGCGACGGTTAATGACTACCCTTATGGTTTATCTGATGTTGA
TGTAATGTCAGAAGGTGAGTTATACTATGATGACCTCTCAGATGGTAGTGACAATTCTGA
CTTCGACCCGTACTATTATTAGGATGATCATATCTGTGTTTTTAAACCTTTTCAAACTCG
TTCATGACCTAGTACTTTAAGCATGCTTGTACTTTCGTTGGAGTTCATGTGTCCTTGTGT
AATGTGTGTGACCTTAAATAGTATTTGTCTGGTTGCCTTTTGTCTTTCTGGAAGGTCTAA
ACTCGAAACATGTTTCAAATGATGTGATAGTTTCATCTTCCCGTGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BB64TF U 1
AF RR2BB64JQ C 631
BS 1 790 RR2BB64TF
BS 791 1068 RR2BB64JQ

RD RR2BB64TF 790 0 0
GGAACTACGTCTTGATCCATACAATGTCTTCTTCGTCTTCGTCTCCCAGGGAGATGAATG
AAGGAGGAGAATGCGTAGACTGGGCTGAGCTTCCACCGGAGCTGACGTCATCGATTCTTC
ACCGGCTTGGCCCGATTGAGATAGTGGAAACCGCTCAAAAAGTTTGCAGATCGTGGCGTC
GCGTCTGTAAAGACCCTTCGATGTGGCGCAAAATTGTCATACATATTGAAGAATTTGGAG
ACAGGTACTACGAGAAACTGTGCCGCCACGCAGTTGGTAGGGGCCATGGCGGCTTGGTTG
AGATCGATATCTCGCACTTTGGTTCTGATCCCCTCCTCCGTTACATCGCCGATGAGAGTT
CTAGTCATCTGAGAAGCCTAAGAATTTCATTCTGCTATCAGAAGAGTGTCTGAGAGTTGT
AGGCCAGTCTTGTCCAAATCTCAAGGCCTTGAAGAAAAACTGCGTGGGTTACAGGCGTCG
TAGTACTCGAAAGGAGAGTGATGATGTTGCCCTAGCGATCGCTGAAACAATGCTCGGACT
TTGCCTCCTCCAGATTTTCGGGGACACATTAACAGACGCTGGTTTAAACGCCATTCTTGA
CGGTTGTCCTAACCTGAAACATCTTGATCTGCGCCAGTGTTTCAACGTTAACCTTGTTGG
GGATCTGGAGAAGCGGTGTCTCGAGAGGATCAAAGTTGTGAGACGCCCTAATGACTCGGT
TCATGATTACCCATTCGATGCGACGGTTAATGACTACCCTTATGGTTTATCTGATGTTGA
TGTAATGTCA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RR2BB64JQ 438 0 0
GCGCCAGTGTTTCAACGTTAACCTTGTTGGGGATCTGGAGAAGCGGTGTCTCGAGAGGAT
CAAAGTTGTGAGACGCCCTAATGACTCGGTTCATGATTACCCATTCGATGCGACGGTTAA
TGACTACCCTTATGGTTTATCTGATGTTGATGTAATGTCAGAAGGTGAGTTATACTATGA
TGACCTCTCAGATGGTAGTGACAATTCTGACTTCGACCCGTACTATTATTAGGATGATCA
TATCTGTGTTTTTAAACCTTTTCAAACTCGTTCATGACCTAGTACTTTAAGCATGCTTGT
ACTTTCGTTGGAGTTCATGTGTCCTTGTGTAATGTGTGTGACCTTAAATAGTATTTGTCT
GGTTGCCTTTTGTCTTTCTGGAAGGTCTAAACTCGAAACATGTTTCAAATGATGTGATAG
TTTCATCTTCCCGTGACT

QA 1 438 1 438
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7761Contig1 601 2 3 U
TTTTTTTAAAACAAAGCAGATAAGTTTTTAATTTTAAATCCTTAAATAAAGTTTAAAACA
CACACAAAAGCAGTTATAGGGAAAGCAACGAAACAACTTCAACGGTGATTGTATGGGAGA
GAGAGACATAAAAAGCAAAGCAAAGACCAAACTGGAAATGAAACAAGTTAAGAGAGGTTC
AAGGAAGCGAGCTGCTCAGCTGCACCACCAGCAGCAACGCTCCTCAAAACATCCATTGCC
TCTGCAACTTTCGACTCCAGAGCTTCTGGTGACTCCAAGAGGTGGAGCACTTCGGTCTGG
TCCATCTCCAAAAGCATCCCAGTCACTTTGGCTGCAGACTCTGCCTCCAGCTTCTCCACC
AACGGGTACAGATTCTCACCCAGTATCGTCCTCTGTTGCTCTGGAGAAGCATTAGCCAGA
TTTGAAGCCAAAGTTCCAATGGGCATCGGCATGGTGTTGTTGCCCATGTCATATGGAGGC
ACATCACCACCACTACCGCCACGCCCTTGGGAGTACCGGATGTTCCTACTACCCCTTGGA
TGCATCTGGTGCTGCATCATGGGAGGTTGCTGCTGGAACTGTTGGCGCCCTCCAGGGCGC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RR2C038JQ U 8
AF RR2C038TF C 1
BS 1 7 RR2C038TF
BS 8 569 RR2C038JQ
BS 570 601 RR2C038TF

RD RR2C038JQ 562 0 0
AAAACAAAGCAGATAAGTTTTTAATTTTAAATCCTTAAATAAAGTTTAAAACACACACAA
AAGCAGTTATAGGGAAAGCAACGAAACAACTTCAACGGTGATTGTATGGGAGAGAGAGAC
ATAAAAAGCAAAGCAAAGACCAAACTGGAAATGAAACAAGTTAAGAGAGGTTCAAGGAAG
CGAGCTGCTCAGCTGCACCACCAGCAGCAACGCTCCTCAAAACATCCATTGCCTCTGCAA
CTTTCGACTCCAGAGCTTCTGGTGACTCCAAGAGGTGGAGCACTTCGGTCTGGTCCATCT
CCAAAAGCATCCCAGTCACTTTGGCTGCAGACTCTGCCTCCAGCTTCTCCACCAACGGGT
ACAGATTCTCACCCAGTATCGTCCTCTGTTGCTCTGGAGAAGCATTAGCCAGATTTGAAG
CCAAAGTTCCAATGGGCATCGGCATGGTGTTGTTGCCCATGTCATATGGAGGCACATCAC
CACCACTACCGCCACGCCCTTGGGAGTACCGGATGTTCCTACTACCCCTTGGATGCATCT
GGTGCTGCATCATGGGAGGTTG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2C038TF 601 0 0
TTTTTTTAAAACAAAGCAGATAAGTTTTTAATTTTAAATCCTTAAATAAAGTTTAAAACA
CACACAAAAGCAGTTATAGGGAAAGCAACGAAACAACTTCAACGGTGATTGTATGGGAGA
GAGAGACATAAAAAGCAAAGCAAAGACCAAACTGGAAATGAAACAAGTTAAGAGAGGTTC
AAGGAAGCGAGCTGCTCAGCTGCACCACCAGCAGCAACGCTCCTCAGAACATCCATTGCC
TCTGCAACTTTCGACTCCAGAGCTTCTGGTGACTCCAAGAGGTGGAGCACTTCGGTCTGG
TCCATCTCCAAAAGCATCCCAGTCACTTTGGCTGCAGACTCTGCCTCCAGCTTCTCCACC
AACGGGTACAGATTCTCACCCAGTATCGTCCTCTGTTGCTCTGGAGAAGCATTAGCCAGA
TTTGAAGCCAAAGTTCCAATGGGCATCGGCATGGTGTTGTTGCCCATGTCATATGGAGGC
ACATCACCACCACTACCGCCACGCCCTTGGGAGTACCGGATGTTCCTACTACCCCTTGGA
TGCATCTGGTGCTGCATCATGGGAGGTTGCTGCTGGAACTGTTGGCGCCCTCCAGGGCGC
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL7762Contig1 812 2 5 U
GGATTGGAGCTCCTCACAGAACGGCGCTGAGAGACATCCCACGAGGAAGAAGATCAACTT
CCATCCAAAAAATTTCAAATCTTTTGACTCCATTTTTCTGAATTCTCTCTCCTCTTTCTT
GGAACGGGGAAAGAGAGAGAGAGGAGGAAGAAGGAAGCAGAAGATTCAATGGAAGGGTCA
TCAGGGACATGGCAAGGACTGGCCCTGGTGAGTATTGTGACATGGATCTGTCTATCTTCC
TATCTGAAACTGACCCAGAAGCTTAGATCTCTTGTTCAACCATGGGTCGCTCGTCAAGTC
GTCGGTGGCGTTCCCCTCATCCTCGAAATTCAGAAACATCAGAACGGAGTGATGGATGGT
TTCTTCTCAGGGCTTTCGTGTGTTGTCTCTGTGCCCTTTTACACTGCTTTCTTGCCTCTG
CTCTTCTGGAGTGGACATGGTAGATTGGCTAGGCAGATGACTCTGTTGATTGCATTCTGT
GATTACCTGGGAAACTGCATAAAGGATGTTGTGTCAGCTCCTCGTCCGAGCTGCCCACCT
GTTAGAAGGATTACTGCCACAAAAGATGAGGAAGATAATGCAATGGAGTATGGCTTGCCT
TCCTCACATACTTTAAACACTGTTTGCTTGTCCGGATATCTGTTGCACTATGTGTTATCC
TTTTTTGAACATGAAGATGCGTCTATCCGATACTATGGATTTGCCCTTGCTTGTCTCTTG
GTAGCTTTAATTGCCTTTGGAAGAATTTACTTGGGTATGCACAGTGTGATTGATATCATC
GCTGGTCTTGCCATAGGAGTCCTTACTCTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G450TF U 46
AF RR2A776TF U 1
BS 1 399 RR2A776TF
BS 400 400 RR2G450TF
BS 401 743 RR2A776TF
BS 744 744 RR2G450TF
BS 745 812 RR2A776TF

RD RR2G450TF 735 0 0
GAAGAAGATCAACTTCCATCCAAAAAATTTCAAATCTTTTGACTCCATTTTTCTGAATTC
TCTCTCCTCTTTCTTGGAACGGGGAAAGAGAGAGAGAGGAGGAAGAAGGAAGCAGAAGAT
TCAATGGAAGGGTCATCAGGGACATGGCAAGGACTGGCCCTGGTGAGTATTGTGACATGG
ATCTGTCTATCTTCCTATCTGAAACTGACCCAGAAGCTTAGATCTCTTGTTCAACCATGG
GTCGCTCGTCAAGTCGTCGGTGGCGTTCCCCTCATCCTCGAAATTCAGAAACATCAGAAC
GGAGTGATGGATGGTTTCTTCTCAGGGCTTTCGTGTGTTGTCTCTGTGCCCTTTTACACT
GCTTTCTTGCCTCTGCTCTTCTGGAGTGGACATGGTAGATTGGCTAGGCAGATGACTCTG
TTGATTGCATTCTGTGATTACCTGGGAAACTGCATAAAGGATGTTGTGTCAGCTCCTCGT
CCGAGCTGCCCACCTGTTAGAGGGATTACTGCCACAAAAGATGAGGAAGATAATGCAATG
GAGTATGGCTTGCCTTCCTCACATACTTTAAACACTGTTTGCTTGTCCGGATATCTGTTG
CACTATGTGTTATCCTTTTTTGAACATGAAGATGCGTCTATCCGATACTATGGATTTGCC
CTTGCTTGTCTCTTGGTAGCTTTAATTGCCTTTGGAAGA**TTACTTGGGTATGCACAGT
GTGATTGATATCATC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2A776TF 812 0 0
GGATTGGAGCTCCTCACAGAACGGCGCTGAGAGACATCCCACGAGGAAGAAGATCAACTT
CCATCCAAAAAATTTCAAATCTTTTGACTCCATTTTTCTGAATTCTCTCTCCTCTTTCTT
GGAACGGGGAAAGAGAGAGAGAGGAGGAAGAAGGAAGCAGAAGATTCAATGGAAGGGTCA
TCAGGGACATGGCAAGGACTGGCCCTGGTGAGTATTGTGACATGGATCTGTCTATCTTCC
TATCTGAAACTGACCCAGAAGCTTAGATCTCTTGTTCAACCATGGGTCGCTCGTCAAGTC
GTCGGTGGCGTTCCCCTCATCCTCGAAATTCAGAAACATCAGAACGGAGTGATGGATGGT
TTCTTCTCAGGGCTTTCGTGTGTTGTCTCTGTGCCCTTT*ACACTGCTTTCTTGCCTCTG
CTCTTCTGGAGTGGACATGGTAGATTGGCTAGGCAGATGACTCTGTTGATTGCATTCTGT
GATTACCTGGGAAACTGCATAAAGGATGTTGTGTCAGCTCCTCGTCCGAGCTGCCCACCT
GTTAGAAGGATTACTGCCACAAAAGATGAGGAAGATAATGCAATGGAGTATGGCTTGCCT
TCCTCACATACTTTAAACACTGTTTGCTTGTCCGGATATCTGTTGCACTATGTGTTATCC
TTTTTTGAACATGAAGATGCGTCTATCCGATACTATGGATTTGCCCTTGCTTGTCTCTTG
GTAGCTTTAATTGCCTTTGGAAGGATTTACTTGGGTATGCACAGTGTGATTGATATCATC
GCTGGTCTTGCCATAGGAGTCCTTACTCTCGG

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

CO CL7763Contig1 713 2 2 U
GGATCTTCAACTCATTCAACACACTCACACTAACATTCAGTACAAAAAAAAAAAAAATTT
TGGTTGAACAGTATAAAAATATTTGTTAGCTATGTCTCCTTCTCTTCTGGTAACCATCTG
CCTCTGCATTTTCTTCTTGTCCGTAAATGCCAATGAGGTTACCGTCGGTGGAAAGTCCGG
TGGCTGGAAGATCCCTCCTTCCTCTTCTTACTCTTTCAACGAATGGGGTGACAAGTCTCG
TTTCATAATCGGCGACTTTCTCGTTTTCAGCTACGAAGCCGGTAAAGACTCAGTTCTGCA
AGTGACAAGAGAGGCTTACGAGAAATGCAACACCACGAGCCCGAAAGCCAGCTACACAAC
AGATGGGAACACCAAGGTGAAGCTAGACCAACCCGGTCCGGTCTACTTCATAAGTGGAAC
GCAAGGTCACTGTCAAAAGGGTCAGAAGCTTCGCCTTGTCGTTTACATTCCTCATGTCTC
TGCTTTCTCTCCGGCTCCTTCACCGTTTGACGGTCCCGCCGTCGCGCCTACTAGTGGCGC
TGCTAAGCTCACCAGCTTCTTTGGTGTCGTTGGGCTTGTTGTCGGATTCTGGGCCTTCTT
CTGAGAGAAACTTGAATCTGAAATTATATTCTATTTATTAATTTTTCGAACATCTCCCTA
GTCTTGTTGTTACTAATTTAGTACTCACAAGATTAAATCCAAATGATTCATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G184TF U 1
AF RR2G184JQ C 44
BS 1 689 RR2G184TF
BS 690 713 RR2G184JQ

RD RR2G184TF 689 0 0
GGATCTTCAACTCATTCAACACACTCACACTAACATTCAGTACAAAAAAAAAAAAAATTT
TGGTTGAACAGTATAAAAATATTTGTTAGCTATGTCTCCTTCTCTTCTGGTAACCATCTG
CCTCTGCATTTTCTTCTTGTCCGTAAATGCCAATGAGGTTACCGTCGGTGGAAAGTCCGG
TGGCTGGAAGATCCCTCCTTCCTCTTCTTACTCTTTCAACGAATGGGGTGACAAGTCTCG
TTTCATAATCGGCGACTTTCTCGTTTTCAGCTACGAAGCCGGTAAAGACTCAGTTCTGCA
AGTGACAAGAGAGGCTTACGAGAAATGCAACACCACGAGCCCGAAAGCCAGCTACACAAC
AGATGGGAACACCAAGGTGAAGCTAGACCAACCCGGTCCGGTCTACTTCATAAGTGGAAC
GCAAGGTCACTGTCAAAAGGGTCAGAAGCTTCGCCTTGTCGTTTACATTCCTCATGTCTC
TGCTTTCTCTCCGGCTCCTTCACCGTTTGACGGTCCCGCCGTCGCGCCTACTAGTGGCGC
TGCTAAGCTCACCAGCTTCTTTGGTGTCGTTGGGCTTGTTGTCGGATTCTGGGCCTTCTT
CTGAGAGAAACTTGAATCTGAAATTATATTCTATTTATTAATTTTTCGAACATCTCCCTA
GTCTTGTTGTTACTAATTTAGTACTCACA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2G184JQ 670 0 0
AAAAAAAAAAAAAATTTTGGTTGAACAGTATAAAAATATTTGTTAGCTATGTCTCCTTCT
CTTCTGGTAACCATCTGCCTCTGCATTTTCTTCTTGTCCGTAAATGCCAATGAGGTTACC
GTCGGTGGAAAGTCCGGTGGCTGGAAGATCCCTCCTTCCTCTTCTTACTCTTTCAACGAA
TGGGGTGACAAGTCTCGTTTCATAATCGGCGACTTTCTCGTTTTCAGCTACGAAGCCGGT
AAAGACTCAGTTCTGCAAGTGACAAGAGAGGCTTACGAGAAATGCAACACCACGAGCCCG
AAAGCCAGCTACACAACAGATGGGAACACCAAGGTGAAGCTAGACCAACCCGGTCCGGTC
TACTTCATAAGTGGAACGCAAGGTCACTGTCAAAAGGGTCAGAAGCTTCGCCTTGTCGTT
TACATTCCTCATGTCTCTGCTTTCTCTCCGGCTCCTTCACCGTTTGACGGTCCCGCCGTC
GCGCCTACTAGTGGCGCTGCTAAGCTCACCAGCTTCTTTGGTGTCGTTGGGCTTGTTGTC
GGATTCTGGGCCTTCTTCTGAGAGAAACTTGAATCTGAAATTATATTCTATTTATTAATT
TTTCGAACATCTCCCTAGTCTTGTTGTTACTAATTTAGTACTCACAAGATTAAATCCAAA
TGATTCATAT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL7764Contig1 938 2 2 U
GGGTCAGCCACTATTCCCTGGAGAAAATGCTGTGGATCAGCTAGTTGAAATCATCAAAGT
TCTTGGCACACCAACTCGAGAAGAGATCCGTTGTATGAATCCACATTACACAGACTTTAG
GTTCCCTCAGATAAAGGCACATCCTTGGCACAAGATTTTCCATAAAAGGATGCCTCCAGA
AGCCATTGATTTCGCGTCGAGGCTGCTTCAGTACTCTCCAAGTCTTAGATGCACAGCGCT
GGAAGCTTGTGCGCATCCGTTCTTTGATGAACTGAGAGAACCGAATGCTCGTTTACCAAA
CGGACGGCCTTTCCCGCCAATCTTCAACTTCAAGCAAGAGGTAGCTGGAGCTTCACCTGA
GCTGGTCAACAAGTTGATTCCAGACCATATCAAGAGACAGTTGGGTCTAAGTTTCTTGAA
TCAGCCTGGAACTTAAAACGATCGAGCACAAGATCAAGAACTTTATTATGTATAATGTAC
CATTACTCAAGAGCCAGAAGAAGGTAGTTTGAAGGCAACTTGGAGGATGACAATCAGAAG
TTTTGCCTCCTTAAACTCTGTTCCAGGAATGTTACTATTCAGAGGCAAGTTTGATGATAG
CTTCTACAACCTGACGACTTTCCCAAATCTGCAAAGAAAAGCTTCAGATGTATCTTCTTT
TTCCTTTTTTAAAGTTTGGTTAAAAAAAAACAAAATCTCCCCTTGCACTTCATTCTTTCC
GCATCTGTAAATGAGTTTAGTCAAGAGTTTCTATTTATATAGTAAAGTTTGAGCAGAATG
TGAAAGAATCTTTAGTCAAAGAGGATCCAATGTCTACCAGAAGAGGAAGGCTGGAGGCTG
GAGTTTTCTGTATTTTGTTTCTTTCTCCTTTTGAATGTTTTTTGTGTCTTCTTTTAATGA
AATAGTAGTTTGTTTATGACCTCCCTTCTTACAAAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CZ47TF U 1
AF RR2CZ47JQ C 171
BS 1 661 RR2CZ47TF
BS 662 938 RR2CZ47JQ

RD RR2CZ47TF 662 0 0
GGGTCAGCCACTATTCCCTGGAGAAAATGCTGTGGATCAGCTAGTTGAAATCATCAAAGT
TCTTGGCACACCAACTCGAGAAGAGATCCGTTGTATGAATCCACATTACACAGACTTTAG
GTTCCCTCAGATAAAGGCACATCCTTGGCACAAGATTTTCCATAAAAGGATGCCTCCAGA
AGCCATTGATTTCGCGTCGAGGCTGCTTCAGTACTCTCCAAGTCTTAGATGCACAGCGCT
GGAAGCTTGTGCGCATCCGTTCTTTGATGAACTGAGAGAACCGAATGCTCGTTTACCAAA
CGGACGGCCTTTCCCGCCAATCTTCAACTTCAAGCAAGAGGTAGCTGGAGCTTCACCTGA
GCTGGTCAACAAGTTGATTCCAGACCATATCAAGAGACAGTTGGGTCTAAGTTTCTTGAA
TCAGCCTGGAACTTAAAACGATCGAGCACAAGATCAAGAACTTTATTATGTATAATGTAC
CATTACTCAAGAGCCAGAAGAAGGTAGTTTGAAGGCAACTTGGAGGATGACAATCAGAAG
TTTTGCCTCCTTAAACTCTGTTCCAGGAATGTTACTATTCAGAGGCAAGTTTGATGATAG
CTTCTACAACCTGACGACTTTCCCAAATCTGCAAAGAAAAGCTTCAGATGTATCTTCTTT
T
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RR2CZ47JQ 768 0 0
TGCCTCCAGAAGCCATTGATTTCGCGTCGAGGCTGCTTCAGTACTCTCCAAGTCTTAGAT
GCACAGCGCTGGAAGCTTGTGCGCATCCGTTCTTTGATGAACTGAGAGAACCGAATGCTC
GTTTACCAAACGGACGGCCTTTCCCGCCAATCTTCAACTTCAAGCAAGAGGTAGCTGGAG
CTTCACCTGAGCTGGTCAACAAGTTGATTCCAGACCATATCAAGAGACAGTTGGGTCTAA
GTTTCTTGAATCAGCCTGGAACTTAAAACGATCGAGCACAAGATCAAGAACTTTATTATG
TATAATGTACCATTACTCAAGAGCCAGAAGAAGGTAGTTTGAAGGCAACTTGGAGGATGA
CAATCAGAAGTTTTGCCTCCTTAAACTCTGTTCCAGGAATGTTACTATTCAGAGGCAAGT
TTGATGATAGCTTCTACAACCTGACGACTTTCCCAAATCTGCAAAGAAAAGCTTCAGATG
TATCTTCTTTTTCCTTTTTTAAAGTTTGGTTAAAAAAAAACAAAATCTCCCCTTGCACTT
CATTCTTTCCGCATCTGTAAATGAGTTTAGTCAAGAGTTTCTATTTATATAGTAAAGTTT
GAGCAGAATGTGAAAGAATCTTTAGTCAAAGAGGATCCAATGTCTACCAGAAGAGGAAGG
CTGGAGGCTGGAGTTTTCTGTATTTTGTTTCTTTCTCCTTTTGAATGTTTTTTGTGTCTT
CTTTTAATGAAATAGTAGTTTGTTTATGACCTCCCTTCTTACAAAGGC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL7765Contig1 720 2 1 U
ATCACTCTCAGACTCTAATGGGATAGTGGTACCCAAACCCCTAGAATGTTATAATCAGGT
CTAGTGGCTCCTGGAACGAGGAGCAAGCGGTTGAGAGAATTGAGGAGTTCAAGCTCTATC
GATGGCCAAGCTTACGTTAGGATTCTCCAGCTTACGGTTGTTGGAGGTGTAAAAAGAGGA
GATGAAGCTTTACAGGAGAGGATTTCACCTTCTGGTTTGTCAGAGTTTGTCATATCTTCA
AAGTTTTGGGTCTCTAATTCCAAAATTTGCATTTACACAATTATTGATGGCATAGTGAAA
GACACATGGATATCTTTGCCATCGTTACCAGCTTCCATCATTGGGAGCTCTCCACGTTTG
GATCTGGATCTTGGCCAGTGACCACTACGAAAGCTTTGCGATATGAGATTGTTACCAGTG
CGGTTGGAGTTGAAGATTCACCTGAAGAAGTAAAAAGAATCGGGATAACATAAAGCTGTT
GAAGCTAAAGAGTACTGGATTTTGGCTTATTGAACTGAAGAACAATGAGATTTCAGATGA
TGAGGCAAATGAGCGAGATGAAGGTGGTCTCAAGTATCTTAAGGATATGAACTAGAACAG
GGCTGAAGAGCCAAATGGGCCCAAGCTTGAGTTTTCCTTAGATCAGAACCCTTACTTCAA
GAGTACTGTCTTGACCAAGATAATGGGATTCCTGTCACTGTCTTCCCACTGCAAGTCGCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RR2C247TF U 1
AF RR2FQ36TF U 1
BS 1 720 RR2C247TF

RD RR2C247TF 720 0 0
ATCACTCTCAGACTCTAATGGGATAGTGGTACCCAAACCCCTAGAATGTTATAATCAGGT
CTAGTGGCTCCTGGAACGAGGAGCAAGCGGTTGAGAGAATTGAGGAGTTCAAGCTCTATC
GATGGCCAAGCTTACGTTAGGATTCTCCAGCTTACGGTTGTTGGAGGTGTAAAAAGAGGA
GATGAAGCTTTACAGGAGAGGATTTCACCTTCTGGTTTGTCAGAGTTTGTCATATCTTCA
AAGTTTTGGGTCTCTAATTCCAAAATTTGCATTTACACAATTATTGATGGCATAGTGAAA
GACACATGGATATCTTTGCCATCGTTACCAGCTTCCATCATTGGGAGCTCTCCACGTTTG
GATCTGGATCTTGGCCAGTGACCACTACGAAAGCTTTGCGATATGAGATTGTTACCAGTG
CGGTTGGAGTTGAAGATTCACCTGAAGAAGTAAAAAGAATCGGGATAACATAAAGCTGTT
GAAGCTAAAGAGTACTGGATTTTGGCTTATTGAACTGAAGAACAATGAGATTTCAGATGA
TGAGGCAAATGAGCGAGATGAAGGTGGTCTCAAGTATCTTAAGGATATGAACTAGAACAG
GGCTGAAGAGCCAAATGGGCCCAAGCTTGAGTTTTCCTTAGATCAGAACCCTTACTTCAA
GAGTACTGTCTTGACCAAGATAATGGGATTCCTGTCACTGTCTTCCCACTGCAAGTCGCA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RR2FQ36TF 717 0 0
ATCACTCTCAGACTCTAATGGGATAGTGGTACCCAAACCCCTAGAATGTTATAATCAGGT
CTAGTGGCTCCTGGAACGAGGAGCAAGCGGTTGAGAGAATTGAGGAGTTCAAGCTCTATC
GATGGCCAAGCTTACGTTAGGATTCTCCAGCTTACGGTTGTTGGAGGTGTAAAAAGAGGA
GATGAAGCTTTACAGGAGAGGATTTCACCTTCTGGTTTGTCAGAGTTTGTCATATCTTCA
AAGTTTTGGGTCTCTAATTCCAAAATTTGCATTTACACAATTATTGATGGCATAGTGAAA
GACACATGGATATCTTTGCCATCGTTACCAGCTTCCATCATTGGGAGCTCTCCACGTTTG
GATCTGGATCTTGGCCAGTGACCACTACGAAAGCTTTGCGATATGAGATTGTTACCAGTG
CGGTTGGAGTTGAAGATTCACCTGAAGAAGTAAAAAGAATCGGGATAACATAAAGCTGTT
GAAGCTAAAGAGTACTGGATTTTGGCTTATTGAACTGAAGAACAATGAGATTTCAGATGA
TGAGGCAAATGAGCGAGATGAAGGTGGTCTCAAGTATCTTAAGGATATGAACTAGAACAG
GGCTGAAGAGCCAAATGGGCCCAAGCTTGAGTTTTCCTTAGATCAGAACCCTTACTTCAA
GAGTACTGTCTTGACCAAGATAATGGGATTCCTGTCACTGTCTTCCCACTGCAAGTC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL7766Contig1 719 2 4 U
GAGCCGAGTATTGAGCACTATGGCGGTATGGTGGATTTGCTGTCGGATGGGTAAATTCGA
GGAAGCTGAAGAACTTGTGAACAAGGTTCCACCTGATGAGGCTTCGGTTCTATTGGAATC
TCTTCTTGGTGCATGTAAAAGGTTTGGTCGCACGGAACAAGCAGAGAGTATAGCGAATCG
GTTATTGGAATTGAATCCAGGGGAGACCTCAGGTTATGTTCAGATGTCAAACTTGTATGC
TTCTAATGGAAGATGGGAGGAGGTTATGGAGGTGAGAAGAAAGATGAGAGCAGAAAGAGT
AAGCAAGAAGCCTGGATGTAGCATGATTGAAGTCAACGGGGTCGTCCATGAGTTCTTAGC
TGGTGAAGGACTAATAAACGACTAACACTCGGTTTCAAGTCAGAAGAACCACTCAACTTT
GAAAACCAAGAAGAAGAAACAGGTTTCTTTCGTCCCCATCTCATCATTCCAAAGAATCTG
AAAAAGTTTCGTGGTCTCTTTTTCTACCAGGGGTTTCTTAGGATAGACTATAAAACACTA
TGATAAAAAAAGAGTAAGGGATGTATCTAGAGGTTACTGTTGTAATATGGTTAGGTCGTT
GTGTTTAATAGGGAGATGGAAGATGTTGTCTTAACGTGTAAAAGCTAGTTGCAGTTTGAA
AAAAAAGAAAGAGCGAACCAAACCCGCCTGAAGAATCCTGTGACCACTTTTGGCCTTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GE52JQ C 1
AF RR2GE52TF U 1
BS 1 665 RR2GE52TF
BS 666 666 RR2GE52JQ
BS 667 691 RR2GE52TF
BS 692 719 RR2GE52JQ

RD RR2GE52JQ 719 0 0
GAGCCGAGTATTGAGCACTATGGCGGTATGGTGGATTTGCTGTCGGATGGGTAAATTCGA
GGAAGCTGAAGAACTTGTGAACAAGGTTCCACCTGATGAGGCTTCGGTTCTATTGGAATC
TCTTCTTGGTGCATGTAAAAGGTTTGGTCGCACGGAACAAGCAGAGAGTATAGCGAATCG
GTTATTGGAATTGAATCCAGGGGAGACCTCAGGTTATGTTCAGATGTCAAACTTGTATGC
TTCTAATGGAAGATGGGAGGAGGTTATGGAGGTGAGAAGAAAGATGAGAGCAGAAAGAGT
AAGCAAGAAGCCTGGATGTAGCATGATTGAAGTCAACGGGGTCGTCCATGAGTTCTTAGC
TGGTGAAGGACTAATAAACGACTAACACTCGGTTTCAAGTCAGAAGAACCACTCAACTTT
GAAAACCAAGAAGAAGAAACAGGTTTCTTTCGTCCCCATCTCATCATTCCAAAGAATCTG
AAAAAGTTTCGTGGTCTCTTTTTCTACCAGGGGTTTCTTAGGATAGACTATAAAACACTA
TGATAAAAAAAGAGTAAGGGATGTATCTAGAGGTTACTGTTGTAATATGGTTAGGTCGTT
GTGTTTAATAGGGAGATGGAAGATGTTGTCTTAACGTGTAAAAGCTAGTTGCAGTTTGAA
AAAAAAGAAAGAGCGAACCAAACCCGCCTGAAGAATCCTGTGACCACTTTTGGCCTTAG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2GE52TF 707 0 0
GAGCCGAGTATTGAGCACTATGGCGGTATGGTGGATTTGCTGTCGGATGGGTAAATTCGA
GGAAGCTGAAGAACTTGTGAACAAGGTTCCACCTGATGAGGCTTCGGTTCTATTGGAATC
TCTTCTTGGTGCATGTAAAAGGTTTGGTCGCACGGAACAAGCAGAGAGTATAGCGAATCG
GTTATTGGAATTGAATCCAGGGGAGACCTCAGGTTATGTTCAGATGTCAAACTTGTATGC
TTCTAATGGAAGATGGGAGGAGGTTATGGAGGTGAGAAGAAAGATGAGAGCAGAAAGAGT
AAGCAAGAAGCCTGGATGTAGCATGATTGAAGTCAACGGGGTCGTCCATGAGTTCTTAGC
TGGTGAAGGACTAATAAACGACTAACACTCGGTTTCAAGTCAGAAGAACCACTCAACTTT
GAAAACCAAGAAGAAGAAACAGGTTTCTTTCGTCCCCATCTCATCATTCCAAAGAATCTG
AAAAAGTTTCGTGGTCTCTTTTTCTACCAGGGGTTTCTTAGGATAGACTATAAAACACTA
TGATAAAAAAAGAGTAAGGGATGTATCTAGAGGTTACTGTTGTAATATGGTTAGGTCGTT
GTGTTTAATAGGGAGATGGAAGATGTTGTCTTAACGTGTAAAAGCTAGTTGCAGTTTGAA
AAAAA*GAAAGAGCGAACCAAACCCGCCTGA
GATCCTGTGACACTTT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL7767Contig1 562 2 1 U
GGGCACTGTGAGTCATCTCCTTTAGTCAACGTCGTTTCTTGAGCTACAGGTTTCGCAGGG
GATCAGAAACCTAGAAGAGAAACAACAATGACTCAGTACAATCAACCTCCCGTTGGGGTT
CCTCCTCCTCAAGGTTATCCACCGGAGGGGTATCCACCGCAGGGTTATCCGCCGCAGGGT
TATCCGCCGCAAGGCTACCCACAGCAGGGTTACCCTCAGCAAGGCTATCCTCCTCCGTAT
GCGCCCCAATATCCTCCACCACAGCAGAATCAGCAGCCGCAACAACAGAGCAGTACTACT
GGGTGTCTAGAAGGATGTCTTGCTGCTCTCTGCTGTTGCTGGCTATTCCAATGTTGCGCA
GATGTGGTACTTTAATTGCAAGAGAGTGTTTGCAACACAAGAACCTTGGTTGGAATTAAA
ATAAATTGCTGGATATATATATTCTCTCGTCTATTATATTTCCTTTCTGTTTTCATGTTC
TTCGGTTAAAAAACTGTTGTCTATCGACGTTCTAGCTCGACTTGGATTTGAGAAAAGTGG
GAATGTAAACTGGTGTAGTGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D224JQ C 1
AF RR2D224TF U 1
BS 1 562 RR2D224TF

RD RR2D224JQ 562 0 0
GGGCACTGTGAGTCATCTCCTTTAGTCAACGTCGTTTCTTGAGCTACAGGTTTCGCAGGG
GATCAGAAACCTAGAAGAGAAACAACAATGACTCAGTACAATCAACCTCCCGTTGGGGTT
CCTCCTCCTCAAGGTTATCCACCGGAGGGGTATCCACCGCAGGGTTATCCGCCGCAGGGT
TATCCGCCGCAAGGCTACCCACAGCAGGGTTACCCTCAGCAAGGCTATCCTCCTCCGTAT
GCGCCCCAATATCCTCCACCACAGCAGAATCAGCAGCCGCAACAACAGAGCAGTACTACT
GGGTGTCTAGAAGGATGTCTTGCTGCTTTCTGCTGTTGCTGGCTATTCCAATGTTGCGCA
GATGTGGTACTTTAATTGCAAGAGAGTGTTTGCAACACAAGAACCTTGGTTGGAATTAAA
ATAAATTGCTGGATATATATATTCTCTCGTCTATTATATTTCCTTTCTGTTTTCATGTTC
TTCGGTTAAAAAACTGTTGTCTATCGACGTTCTAGCTCGACTTGGATTTGAGAAAAGTGG
GAATGTAAACTGGTGTAGTGAC

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2D224TF 562 0 0
GGGCACTGTGAGTCATCTCCTTTAGTCAACGTCGTTTCTTGAGCTACAGGTTTCGCAGGG
GATCAGAAACCTAGAAGAGAAACAACAATGACTCAGTACAATCAACCTCCCGTTGGGGTT
CCTCCTCCTCAAGGTTATCCACCGGAGGGGTATCCACCGCAGGGTTATCCGCCGCAGGGT
TATCCGCCGCAAGGCTACCCACAGCAGGGTTACCCTCAGCAAGGCTATCCTCCTCCGTAT
GCGCCCCAATATCCTCCACCACAGCAGAATCAGCAGCCGCAACAACAGAGCAGTACTACT
GGGTGTCTAGAAGGATGTCTTGCTGCTCTCTGCTGTTGCTGGCTATTCCAATGTTGCGCA
GATGTGGTACTTTAATTGCAAGAGAGTGTTTGCAACACAAGAACCTTGGTTGGAATTAAA
ATAAATTGCTGGATATATATATTCTCTCGTCTATTATATTTCCTTTCTGTTTTCATGTTC
TTCGGTTAAAAAACTGTTGTCTATCGACGTTCTAGCTCGACTTGGATTTGAGAAAAGTGG
GAATGTAAACTGGTGTAGTGAC

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 2

CO CL7768Contig1 1095 2 2 U
GAAGACTCTCCGCATCAAGGAGAAGGAGATAACCAGCTGGAACATGATCAAGGACAGCGT
GAAAGCATGAACGTTTCACCAACTTCCAACTTTTCGGTTTCCACTACACCGCACCATCAG
GTAGGAGAGGTGAAGAGAACACAGTCAAATGAGGTAAGGGTGAAGTTTGCAGAGGATGAT
GATGATAGCCCGAGAACAAATATTCCAGCTGTGGAAGACAAAGTGCGTGCAGATATCGAC
GCTGTCTTGGAAGAGAATCTCGAGTTCTGGTTAAGATTTAGCTCATCGGTGCATCAGATA
CAAAAATACCAGACAACAGTTCAGGATTTGAAGTCAGAGTTAACGAAGCTGAGAATCGAA
AGCAGACAGCAGCAAGAATCTTCAAGAAGTAGTAGTAGTAAGCGCACAGCTGCGTCAGAG
GCAAAACCTATCTATAGACATCTAAGAGAGATCCGTACAGAGCTGCAGTTGTGGCTAGAA
AACAGTGCAGTTCTTAAAGACGAACTACAGGGAAGGTTTGGATCACTAGCTAATATCCAA
GAAGAAATCGCAAGAGTCACGCTCACTCGGGTGGTAGTAAAGTAAGTGATTCAGAGATTA
GCGGTTACCAAGCTGCAAAGTTCCATGGAGAGATAGTTAACATGAAACAAGAGAACAAAA
GGGTTTCAAGCGAACTTCAATCGGGTGTTGATCGTGTGAGAGTGTTGAAGACAGACGTAG
AGAGGATTCTGAGTAAACTGGAAGAGGATATTGGGATCTCGAGTGCAACAGAAGCAAGAA
CAACTCCGAGCAAGAGCTCTTCCAGTGGGAAAGCGAGAATTCCATTACGGTCATTCTTGT
TCGGTGTCAAGTTAAAGAAGCAGACAAAACAGAAGCAAGCTTCAGCATCTCTCTTCTCTT
GTGTCAGTCCATTTCCAGCTCCGCAACAACAGTCTAGTTACGTTAAACCTGGAAAGCTCC
CTGAATAATTAATTAATCAAATCATCTGTCTTTCATTTCCTTTCAGTTCCTCGTTTTCTA
GATTTTCTGTCTTTGTACCAAAACTATTGGCCAGTGAGATAGAAATCAAACCGTATCTTT
TTGTTTTACTGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE37TF U 1
AF RR2CE37JQ C 376
BS 1 657 RR2CE37TF
BS 658 1095 RR2CE37JQ

RD RR2CE37TF 657 0 0
GAAGACTCTCCGCATCAAGGAGAAGGAGATAACCAGCTGGAACATGATCAAGGACAGCGT
GAAAGCATGAACGTTTCACCAACTTCCAACTTTTCGGTTTCCACTACACCGCACCATCAG
GTAGGAGAGGTGAAGAGAACACAGTCAAATGAGGTAAGGGTGAAGTTTGCAGAGGATGAT
GATGATAGCCCGAGAACAAATATTCCAGCTGTGGAAGACAAAGTGCGTGCAGATATCGAC
GCTGTCTTGGAAGAGAATCTCGAGTTCTGGTTAAGATTTAGCTCATCGGTGCATCAGATA
CAAAAATACCAGACAACAGTTCAGGATTTGAAGTCAGAGTTAACGAAGCTGAGAATCGAA
AGCAGACAGCAGCAAGAATCTTCAAGAAGTAGTAGTAGTAAGCGCACAGCTGCGTCAGAG
GCAAAACCTATCTATAGACATCTAAGAGAGATCCGTACAGAGCTGCAGTTGTGGCTAGAA
AACAGTGCAGTTCTTAAAGACGAACTACAGGGAAGGTTTGGATCACTAGCTAATATCCAA
GAAGAAATCGCAAGAGTCACGCTCACTCGGGTGGTAGTAAAGTAAGTGATTCAGAGATTA
GCGGTTACCAAGCTGCAAAGTTCCATGGAGAGATAGTTAACATGAAACAAGAGAACA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2CE37JQ 720 0 0
GAATCTTCAAGAAGTAGTAGTAGTAAGCGCACAGCTGCGTCAGAGGCAAAACCTATCTAT
AGACATCTAAGAGAGATCCGTACAGAGCTGCAGTTGTGGCTAGAAAACAGTGCAGTTCTT
AAAGACGAACTACAGGGAAGGTTTGGATCACTAGCTAATATCCAAGAAGAAATCGCAAGA
GTCACGCTCACTCGGGTGGTAGTAAAGTAAGTGATTCAGAGATTAGCGGTTACCAAGCTG
CAAAGTTCCATGGAGAGATAGTTAACATGAAACAAGAGAACAAAAGGGTTTCAAGCGAAC
TTCAATCGGGTGTTGATCGTGTGAGAGTGTTGAAGACAGACGTAGAGAGGATTCTGAGTA
AACTGGAAGAGGATATTGGGATCTCGAGTGCAACAGAAGCAAGAACAACTCCGAGCAAGA
GCTCTTCCAGTGGGAAAGCGAGAATTCCATTACGGTCATTCTTGTTCGGTGTCAAGTTAA
AGAAGCAGACAAAACAGAAGCAAGCTTCAGCATCTCTCTTCTCTTGTGTCAGTCCATTTC
CAGCTCCGCAACAACAGTCTAGTTACGTTAAACCTGGAAAGCTCCCTGAATAATTAATTA
ATCAAATCATCTGTCTTTCATTTCCTTTCAGTTCCTCGTTTTCTAGATTTTCTGTCTTTG
TACCAAAACTATTGGCCAGTGAGATAGAAATCAAACCGTATCTTTTTGTTTTACTGTCTT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL7769Contig1 705 2 3 U
TTTTTTTCCAGAAGTTGTCACATTTATTTCTATTTCCAAAACGGAAAGTGAATGACATCA
CGGTTCACAGAAACAAAGCTTAAGTTACACCAAAAAAAAACCGAAAAATGCAAGTAGGAG
TAATAAACACGATTACATAAAGACTTGAAAACATATCTTCCACCCAACCAACATGACTAA
GCAAAGGCCAATATGGAAAATGAAGTTGGTAAACTGAAGTCCACACACATTCTTACTGTT
GCCTCTTTAAAGTCTCCAACTTTTTCATCAAGCAAAGATACCACATACTTGTAGTCACCC
TCAAGTATATCCTTAGGAACTCCCGGAAAAGGTAACACAAAGTTGGTGCCAAATTCAATA
GCGCATGCCTCACTCACCACACAAAGGGTGGATTGTCTTAAAAGGTCAGTAATATTCTCA
AATTTGGCGTACACCTCTATAGATCCAGCATGGATGCTTTCTTTTGCATGACCGAAAACC
GCAATGCTTAGCTCTCCGTCGTTAGGCCCAACCGGGTTAGGAGAGATCTCAACACGAGTG
ACGGTACCGAAATCATATCCACTTTTGTTGCAGTATTCGAAATTGATGGCACGCAATGCA
GGCAAGAAAAAGAATGATCCAAGGAGAAGAAGCAGAGGCTGGACGTGAGATATCGCCATT
AACCACTTCGTAGATTTTCAAAGAGGGAAAATATTGTTTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EC79JQ U 8
AF RR2EC79TF C 1
BS 1 11 RR2EC79TF
BS 12 496 RR2EC79JQ
BS 497 705 RR2EC79TF

RD RR2EC79JQ 489 0 0
CCAA
AAGTTGTCACATTTATTTCTATTTCCAAAACGGAAAGTGAATGACATCACGGTTCACAGA
AACAAAGCTTAAGTTACACCAAAAAAAAACCGAAAAATGCAAGTAGGAGTAATAAACACG
ATTACATAAAGACTTGAAAACATATCTTCCACCCAACCAACATGACTAAGCAAAGGCCAA
TATGGAAAATGAAGTTGGTAAACTGAAGTCCACACACATTCTTACTGTTGCCTCTTTAAA
GTCTCCAACTTTTTCATCAAGCAAAGATACCACATACTTGTAGTCACCCTCAAGTATATC
CTTAGGAACTCCCGGAAAAGGTAACACAAAGTTGGTGCCAAATTCAATAGCGCATGCCTC
ACTCACCACACAAAGGGTGGATTGTCTTAAAAGGTCAGTAATATTCTCAAATTTGGCGTA
CACCTCTATAGATCCAGCATGGATGCTTTCTTTTGCATGACCGAAAACCGCAATGCTTAG
CTCTC

QA 5 489 5 489
DS 

RD RR2EC79TF 705 0 0
TTTTTTTCCAGAAGTTGTCACATTTATTTCTATTTCCAAAACGGAAAGTGAATGACATCA
CGGTTCACAGAAACAAAGCTTAAGTTACACCAGAGAAAAACCGAAAAATGCAAGTAGGAG
TAATAGACACGATTACATAAAGACTTGAAAACATATCTTCCACCCAACCAACATGACTAA
GCAGAGGCCAATATGGAAGATGAAGTTGGTAAACTGAAGTCCACACACATTCTTACTGTT
GCCTCTTTAGAGTCTCCAACTTTTTCATCAAGCAAAGATACCACATACTTGTAGTCACCC
TCAAGTATATCCTTAGGAACTCCCGGAAGAGGTAACACAAAGTTGGTGCCAGATTCAATA
GCGCATGCCTCACTCACCACACAGAGGGTGGATTGTCTTAGAAGGTCAGTAATATTCTCA
GATTTGGCGTACACCTCTATAGATCCAGCATGGATGCTTTCTTTTGCATGACCGAAAACC
GCAATGCTTAGCTCTCCGTCGTTAGGCCCAACCGGGTTAGGAGAGATCTCAACACGAGTG
ACGGTACCGAAATCATATCCACTTTTGTTGCAGTATTCGAAATTGATGGCACGCAATGCA
GGCAAGAAAAAGAATGATCCAAGGAGAAGAAGCAGAGGCTGGACGTGAGATATCGCCATT
AACCACTTCGTAGATTTTCAAAGAGGGAAAATATTGTTTTCTTCC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL7770Contig1 669 2 2 U
TACTCCGAAGGTGGTCCGAAACTTACTTACAGTGAACTGATGAACTTTGAAACGTGCGCA
CTCAGAGAGACAAGTTATCCCTGCAGCATATTTGAGGATCGGCATCCGTCGACCGTGGCT
ATGACAGTACTTGTTGTTGTAGAGATGTTTAATGCGCTAAATAACCTCAGTGAAAATCAG
TCCCTTCTGGTTATAACCCCAAGGAGTAATCTATGGCTTGTTGGTTCAATTATCCTGACG
ATGGTTCTGCACATGCTGATACTATATGTTCATCCACTGGCAGTCTTGTTTTCTGTCACG
CCTTTGTCCCGGGCCGAGTGGATCGCCGTTCTATATCTTTCGTTTCCAGTTATCATCATC
GATGAGGTTCTGAAGTTCCTCTCTAGAAATACCGGCTTGAGGTTCAGGTTCAGATTGAGG
AAGACGGATTTACTCCCCAAGGACCGGCGTGACAAGTAAGGTTGAGAAAACAAATACATT
GCTTTTTTGGTGATACACAGAGTTTTGGCTCTCAATAGATACACACCGACACAGAGAGAT
AGGGAATCTTAATAGATTGTACTGCAATCCTGAAAGTCCCAACACCATTATTAGACTTTC
CGATTTTGTTTTTGTTGTAACCAGTGTCACTGTATTCTTACATCAAAACATTAGTTTACT
ACTGCTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF03TF U 1
AF RR2DF03JQ C 1
BS 1 655 RR2DF03TF
BS 656 669 RR2DF03JQ

RD RR2DF03TF 655 0 0
TACTCCGAAGGTGGTCCGAAACTTACTTACAGTGAACTGATGAACTTTGAAACGTGCGCA
CTCAGAGAGACAAGTTATCCCTGCAGCATATTTGAGGATCGGCATCCGTCGACCGTGGCT
ATGACAGTACTTGTTGTTGTAGAGATGTTTAATGCGCTAAATAACCTCAGTGAAAATCAG
TCCCTTCTGGTTATAACCCCAAGGAGTAATCTATGGCTTGTTGGTTCAATTATCCTGACG
ATGGTTCTGCACATGCTGATACTATATGTTCATCCACTGGCAGTCTTGTTTTCTGTCACG
CCTTTGTCCCGGGCCGAGTGGATCGCCGTTCTATATCTTTCGTTTCCAGTTATCATCATC
GATGAGGTTCTGAAGTTCCTCTCTAGAAATACCGGCTTGAGGTTCAGGTTCAGATTGAGG
AAGACGGATTTACTCCCCAAGGACCGGCGTGACAAGTAAGGTTGAGAAAACAAATACATT
GCTTTTTTGGTGATACACAGAGTTTTGGCTCTCAATAGATACACACCGACACAGAGAGAT
AGGGAATCTTAATAGATTGTACTGCAATCCTGAAAGTCCCAACACCATTATTAGACTTTC
CGATTTTGTTTTTGTTGTAACCAGTGTCACTGTATTCTTACATCAAAACATTAGT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2DF03JQ 669 0 0
TACTCCGAAGGTGGTCCGAAACTTACTTACAGTGAACTGATGAACTTTGAAACGTGCGCA
CTCAGAGAGACAAGTTATCCCTGCAGCATATTTGAGGATCGGCATCCGTCGACCGTGGCT
ATGACAGTACTTGTTGTTGTAGAGATGTTTAATGCGCTAAATAACCTCAGTGAAAATCAG
TCCCTTCTGGTTATAACCCCAAGGAGTAATTTATGGCTTGTTGGTTCAATTATCCTGACG
ATGGTTCTGCACATGCTGATACTATATGTTCATCCACTGGCAGTCTTGTTTTCTGTCACG
CCTTTGTCCCGGGCCGAGTGGATCGCCGTTCTATATCTTTCGTTTCCAGTTATCATCATC
GATGAGGTTCTGAAGTTCCTCTCTAGAAATACCGGCTTGAGGTTCAGGTTCAGATTGAGG
AAGACGGATTTACTCCCCAAGGACCGGCGTGACAAGTAAGGTTGAGAAAACAAATACATT
GCTTTTTTGGTGATACACAGAGTTTTGGCTCTCAATAGATACACACCGACACAGAGAGAT
AGGGAATCTTAATAGATTGTACTGCAATCCTGAAGGTCCCAACACCATTATTAGACTTTC
CGATTTTGTTTTTGTTGTAACCAGTGTCACTGTATTCTTACATCAAAACATTAGTTTACT
ACTGCTTTT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL7771Contig1 1025 2 2 U
GGGGAAAACACAACAGCGTACTTTCATCATCTTTCTTTTAAGTCAAGACATATTTTGTGC
TATTTCTCGCATCGATCTCCGCCGGATAGATATGTTTAAAATTGCAATTCTGTGCTGGGG
CGGCGCTGCCGCATTCTACTTGAGCGCCTACGAAATTAAACGAAAGGCTGGGTTTCTCAA
GAGTGCCACCCGCGTGAATGATTTGAGAGGGCTAAGTGAATTACTTGATAACAAGACCAC
ACCGCTCCTTGTTGCGATATCCGGAAGAGTTGGCTCTAACACGCCCTTAAAATCCCAACA
TTGTGATGATGTGTTGTGTGTTTTTCTCCTCGAGAAGGCCAAACTTGTTTATGAGACAAG
GAATATATATGGTAAATTGATGCGCAGTTCTGCAGAGCTTCTAGTTAAACCTAAGGAGGT
TCCTTGGTTTCTGGAAGACAACACTGGCCGGGTACATGTAGTGGGAGTTCAATATGCCAA
AGGATTTTTTGATAAACTTAGAGAGATTACGTTCGATAAACCACCAAATGAACTCATCAA
CAAGCTGCCTAAACCGGCTGAGATTCTTGAGCACACTTGCTTTGAGCGTGTTCTTGAGTT
TGGTAAGCCCTTGACTATTGTTGGTGAGGCTGTCAAATACTGCGATGGAACTCTTCTGAT
CAAGATCCCCATGGATGGGCCTTTTATGGTTTTCGATGGATATACTTCTGTTGATAAAAT
GATCTCCTTTTTGGAATCACGCTCACGGACTCTACTATTTATCGCCATAGGCTTGACAGC
TGCTTCTGCACTTGCATATGTCTCCTACCTGATGCCTACAATAAAAAAGGCTTGGTTTCG
TGATAATAAATCAGCCAACAACACAACTGGTCATAGAGCAAAACTTGGGGACCAAACAGA
ACGCGAGGGAAAGGATGAGAGCAAGTAAGCTTTATGTCGACTCTATTGTACTTGTATGCT
TTTTAGACGGCCCTGTGAACCAGGACCGATTAGTTTATGATATCTGTTCATGGATGATTG
ATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RR2FS15TF U 1
AF RR2FS15JQ C 321
BS 1 759 RR2FS15TF
BS 760 1025 RR2FS15JQ

RD RR2FS15TF 765 0 0
GGGGAAAACACAACAGCGTACTTTCATCATCTTTCTTTTAAGTCAAGACATATTTTGTGC
TATTTCTCGCATCGATCTCCGCCGGATAGATATGTTTAAAATTGCAATTCTGTGCTGGGG
CGGCGCTGCCGCATTCTACTTGAGCGCCTACGAAATTAAACGAAAGGCTGGGTTTCTCAA
GAGTGCCACCCGCGTGAATGATTTGAGAGGGCTAAGTGAATTACTTGATAACAAGACCAC
ACCGCTCCTTGTTGCGATATCCGGAAGAGTTGGCTCTAACACGCCCTTAAAATCCCAACA
TTGTGATGATGTGTTGTGTGTTTTTCTCCTCGAGAAGGCCAAACTTGTTTATGAGACAAG
GAATATATATGGTAAATTGATGCGCAGTTCTGCAGAGCTTCTAGTTAAACCTAAGGAGGT
TCCTTGGTTTCTGGAAGACAACACTGGCCGGGTACATGTAGTGGGAGTTCAATATGCCAA
AGGATTTTTTGATAAACTTAGAGAGATTACGTTCGATAAACCACCAAATGAACTCATCAA
CAAGCTGCCTAAACCGGCTGAGATTCTTGAGCACACTTGCTTTGAGCGTGTTCTTGAGTT
TGGTAAGCCCTTGACTATTGTTGGTGAGGCTGTCAAATACTGCGATGGAACTCTTCTGAT
CAAGATCCCCATGGATGGGCCTTTTATGGTTTTCGATGGATATACTTCTGTTGATAAAAT
GATCTCCTTTTTGGAATCACGCTCACGGACTCTACTATT
ATCGCC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RR2FS15JQ 705 0 0
TTTTTCTCCTCGAGAAGGCCAAACTTGTTTATGAGACAAGGAATATATATGGTAAATTGA
TGCGCAGTTCTGCAGAGCTTCTAGTTAAACCTAAGGAGGTTCCTTGGTTTCTGGAAGACA
ACACTGGCCGGGTACATGTAGTGGGAGTTCAATATGCCAAAGGATTTTTTGATAAACTTA
GAGAGATTACGTTCGATAAACCACCAAATGAACTCATCAACAAGCTGCCTAAACCGGCTG
AGATTCTTGAGCACACTTGCTTTGAGCGTGTTCTTGAGTTTGGTAAGCCCTTGACTATTG
TTGGTGAGGCTGTCAAATACTGCGATGGAACTCTTCTGATCAAGATCCCCATGGATGGGC
CTTTTATGGTTTTCGATGGATATACTTCTGTTGATAAAATGATCTCCTTTTTGGAATCAC
GCTCACGGACTCTACTATTTATCGCCATAGGCTTGACAGCTGCTTCTGCACTTGCATATG
TCTCCTACCTGATGCCTACAATAAAAAAGGCTTGGTTTCGTGATAATAAATCAGCCAACA
ACACAACTGGTCATAGAGCAAAACTTGGGGACCAAACAGAACGCGAGGGAAAGGATGAGA
GCAAGTAAGCTTTATGTCGACTCTATTGTACTTGTATGCTTTTTAGACGGCCCTGTGAAC
CAGGACCGATTAGTTTATGATATCTGTTCATGGATGATTGATTCT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7773Contig1 448 2 1 U
GGAACCATCAAACAAGTAAGATTATTCAAAAGAATTAATAATAAAGCGTGTGTATAATAA
ACAATATGTCATCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATTATCTTGATTGCTTTATTTCCTC
TTCATGAATTTGTCGATGCAGCTAAAGATTCTTGCAACCATACCACATGCGGCAAAAACA
CCAAAGTTAAGGATTGCTTTTGTTGTTCCTACAACAATAAGGTTTGTTTGCCGACCAGAA
AAGGGTGTGCAATTTGGTGTCCAACTCGATAAACTACATCAAGGATTTAAGAAAACCCGA
ATAACGATTTTATTAATTATTCCTAATATCTACTTTTGTTTTATATGAAAAACATGCTCA
TCTGAAGACCAAAAAATACATATGCATATTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTTTA
TTCTATATAATGCACATAAGTTAAACTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FI60JQ C 1
AF RR2FI60TF U 1
BS 1 448 RR2FI60TF

RD RR2FI60JQ 448 0 0
GGAACCATCAAACAAGTAAGATTATTCAAAAGAATTAATAATAAAGCGTGTGTATAATAA
ACAATATGTCATCATCACAGTTCGCTATTTTTTGCATTATCTTGATTGCTTTATTTCCTC
TTCATGAATTTGTCGATGCAGCTAAAGATTCTTGCAACCATACCACATGCGGCAAAAACA
CCAAAGTTAAGGATTGCTTTTGTTGTTCCTACAACAATAAGGTTTGTTTGCCGACCAGAA
AAGGGTGTGCAATTTGGTGTCCAACTCGATAAACTACATCAAGGATTTAAGAAAACCCGA
ATAACGATTTTATTAATTATTCCTAATATCTACTTTTGTTTTATATGAAAAACATGCTCA
TTTGAAGACCAAAAAATACATATGCATATTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTTTA
TTCTATATAATGCACATAAGTTAAACTT

QA 1 448 1 448
DS 

RD RR2FI60TF 448 0 0
GGAACCATCAAACAAGTAAGATTATTCAAAAGAATTAATAATAAAGCGTGTGTATAATAA
ACAATATGTCATCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATTATCTTGATTGCTTTATTTCCTC
TTCATGAATTTGTCGATGCAGCTAAAGATTCTTGCAACCATACCACATGCGGCAAAAACA
CCAAAGTTAAGGATTGCTTTTGTTGTTCCTACAACAATAAGGTTTGTTTGCCGACCAGAA
AAGGGTGTGCAATTTGGTGTCCAACTCGATAAACTACATCAAGGATTTAAGAAAACCCGA
ATAACGATTTTATTAATTATTCCTAATATCTACTTTTGTTTTATATGAAAAACATGCTCA
TCTGAAGACCAAAAAATACATATGCATATTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTTTA
TTCTATATAATGCACATAAGTTAAACTT

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 2

CO CL7774Contig1 704 2 4 U
GAAAAGGAGCTCGAGAAGATCACCGGACTCGGGCCGTACTTCAATATCTCCGGCGAGGGA
TCAGTGACGGTGCCGGAGTTAACGTTCGAGTTCAAAGGTGGAGCGAAAATGGAGTTGCCG
CTGTCTAACTACTTTACGCTCGTCGGAAGCGTTGATAGCGTCTGTTTAACAGTGGTTTCT
GATAACACCGTTAGTACCTCCGGTGGAGGCCGGAGTGGTCCGGCGATTATTCTCGGGAGC
TTTCAGCAACAGAACTATCACGTGGAATACGATTTGGAGAATGACAGGTTTGGGTTCGCG
AGGAAGAAGTGCAGCCCGTGAGTTCCCAGGGGTAAATTTGGAAATTTGACTTTTTAAAAA
AAAATTAAAACAATTTTATGATTTAATTTCTTTTCCAGATAAAAAGGTTGTTAACATGTT
TGTAACTATGAGAAATATATTAAGTGCAAAAATAAAATTTTCAAATTTAGCTTGTGATTA
GTTGGATGCTAAAAGTTGTGGACGATGGAAACCAACATGTGAAGCATATAGGCTTTATGC
ATTGTCGGGAGAAAGAAGAAGATGGATGCATGCTGCTAATACAGTGATACCACGTCGATG
TCCATTGGCAAAAGATAACCAAACCAGCCCATTGTACATTCCACTACAGGAAAAAAAATT
GCACACTTGCACCTGCTAATCATGCCAGCTCACAGAAAGTACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EF22TF U 1
AF RR2BV38TF U 23
BS 1 363 RR2EF22TF
BS 364 364 RR2BV38TF
BS 365 476 RR2EF22TF
BS 477 704 RR2BV38TF

RD RR2EF22TF 476 0 0
GAAAAGGAGCTCGAGAAGATCACCGGACTCGGGCCGTACTTCAATATCTCCGGCGAGGGA
TCAGTGACGGTGCCGGAGTTAACGTTCGAGTTCAAAGGTGGAGCGAAAATGGAGTTGCCG
CTGTCTAACTACTTTACGCTCGTCGGAAGCGTTGATAGCGTCTGTTTAACAGTGGTTTCT
GATAACACCGTTAGTACCTCCGGTGGAGGCCGGAGTGGTCCGGCGATTATTCTCGGGAGC
TTTCAGCAACAGAACTATCACGTGGAATACGATTTGGAGAATGACAGGTTTGGGTTCGCG
AGGAAGAAGTGCAGCCCGTGAGTTCCCAGGGGTAAATTTGGAAATTTGACTTTTTAAAAA
AAA*TTAAAACAATTTTATGATTTAATTTCTTTTCCAGATAAAAAGGTTGTTAACATGTT
TGTAACTATGAGAAATATATTAAGTGCAAAAATAAAATTTTCAAATTTAGCTTGTG

QA 1 476 1 476
DS 

RD RR2BV38TF 682 0 0
CCGGACTCGGGCCGTGCTTCAATATCTCCGGCGAGGGATCAGTGACGGTGCCGGAGTTAA
CGTTCGAGTTCAAAGGTGGAGCGAAAATGGAGTTGCCGCTGTCTAACTACTTTACGCTCG
TCGGAAGCGTTGATAGCGTCTGTTTAACAGTGGTTTTTGATAACACCGTTAGTACCTCCG
GTGGAGGCCGGAGTGGTCCGGCGATTATTCTCGGGAGCTTTCAGCAACAGAACTATCACG
TGGAATACGATTTGGAGAATGACAGGTTTGGGTTCGCGAGGAAGAAGTGCAGCCCGTGAG
TTCCCAGGGGTAAATTTGGAAATTTGACTTTTTAAAAAAAAATTAAAACAATTTTATGAT
TTAATTTCTTTTCCAGATAAAAAGGTTGTTAACATGTTTGTAACTATGAGAAATATATTA
AGTGCAAAAATAAAATTTTCAAATTTAGCTTGTGATTAGTTGGATGCTAAAAGTTGTGGA
CGATGGAAACCAACATGTGAAGCATATAGGCTTTATGCATTGTCGGGAGAAAGAAGAAGA
TGGATGCATGCTGCTAATACAGTGATACCACGTCGATGTCCATTGGCAAAAGATAACCAA
ACCAGCCCATTGTACATTCCACTACAGGAAAAAAAATTGCACACTTGCACCTGCTAATCA
TGCCAGCTCACAGAAAGTACCT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL7775Contig1 655 2 3 U
TTCAAGTGTTAAACGCCTGAGATAAAGAATGAGCTAAACGAGTCAAGAAGCGAACCAGAG
AAGCGCAAGCGACAACAACACTTCGACCACGATCTTAAAAACATGATATCCTCGTTAACC
CACATGGGAGCAAACAAGGCAGGACCGAGCCAATATGAAGAAGAGGAGGAAGATGGCATC
GGAGTCATCACGCTTTCTGGAACCAACCTTGGAGCCACCATGAAGACTGAGCTTGACGAC
GACAACCATGTAGACAGCCACAAAAATGGCGGCCACGAGCTTGATTCCCTGACCACCTTT
GTTAACAGCAACTTCCAAGCTGTGAACAACTCGATCATGATAGGCGCCAAGTACGAGACT
CATGATCCAGGTGTTCATCTTGAAATCTCGGGCGATGTTGAGAAGCCTTCGATGAAGGGA
CCTGCGAGGGGGACAAGGGGAAAGAAGGGCAAATCTCCTGGTAGAAGAGATCGTCGTGAA
TCTGAACATACAGATTGATTGGTGACTTAAAGAACAAAGCATTTTGGGTTCTGTTTTAAT
TCTCTTTTATGTTTTTTTCTTATCTAAATAATGAGAAAAGTGGTGCATGACAAAGCACTT
TACTTTCTCTTCAAACTGGTTGTTTTCACTTGAGTTTATCATCAAAAACTTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GD82JQ C 1
AF RR2GD82TF U 1
BS 1 478 RR2GD82TF
BS 479 479 RR2GD82JQ
BS 480 655 RR2GD82TF

RD RR2GD82JQ 655 0 0
TTCAAGTGTTAAACGCCTGAGATAAAGAATGAGCTAAACGAGTCAAGAAGCGAACCAGAG
AAGCGCAAGCGACAACAACACTTCGACCACGATCTTAAAAACATGATATCCTCGTTAACC
CACATGGGAGCAAACAAGGCAGGACCGAGCCAATATGAAGAAGAGGAGGAAGATGGCATC
GGAGTCATCACGCTTTCTGGAACCAACCTTGGAGCCACCATGAAGACTGAGCTTGACGAC
GACAACCATGTAGACAGCCACAAAAATGGCGGCCACGAGCTTGATTCCCTGACCACCTTT
GTTAACAGCAACTTCCAAGCTGTGAACAACTCGATCATGATAGGCGCCAAGTACGAGACT
CATGATCCAGGTGTTCATCTTGAAATCTCGGGCGATGTTGAGAAGCCTTCGATGAAGGGA
CCTGCGAGGGGGACAAGGGGAAAGAAGGGCAAATCTCCTGTTAGAAGAGATCGTCGTGAA
TCTGAACATACAGATTGATTGGTGACTTAAAGAACAAAGCATTTTGGGTTCTGTTTTAAT
TCTCTTTTATGTTTTTTTCTTATCTAAATAATGAGAAAAGTGGTGCATGACAAAGCACTT
TACTTTCTCTTCAAACTGGTTGTTTTCACTTGAGTTTATCATCAAAAACTTTTTT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RR2GD82TF 655 0 0
TTCAAGTGTTAAACGCCTGAGATAAAGAATGAGCTAAACGAGTCAAGAAGCGAACCAGAG
AAGCGCAAGCGACAACAACACTTCGACCACGATCTTAAAAACATGATATCCTCGTTAACC
CACATGGGAGCAAACAAGGCAGGACCGAGCCAATATGAAGAAGAGGAGGAAGATGGCATC
GGAGTCATCACGCTTTCTGGAACCAACCTTGGAGCCACCATGAAGACTGAGCTTGACGAC
GACAACCATGTAGACAGCCACAAAAATGGCGGCCACGAGCTTGATTCCCTGACCACCTTT
GTTAACAGCAACTTCCAAGCTGTGAACAACTCGATCATGATAGGCGCCAAGTACGAGACT
CATGATCCAGGTGTTCATCTTGAAATCTCGGGCGATGTTGAGAAGCCTTCGATGAAGGGA
CCTGCGAGGGGGACAAGGGGAAAGAAGGGCAAATCTCCTGGTAGAAGAGATCGTCGTGGA
TCTGAACATACAGATTGATTGGTGACTTAAAGAACAAAGCATTTTGGGTTCTGTTTTAAT
TCTCTTTTATGTTTTTTTCTTATCTAAATAATGAGAAAAGTGGTGCATGACAAAGCACTT
TACTTTCTCTTCAAACTGGTTGTTTTCACTTGAGTTTATCATCAAAAACTTTTTT

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL7776Contig1 769 2 2 U
GGCTCTTTGTACACTCCGCCATCTTTCCCATCTCTCTCTCTCTCGAGCAGATCTCTCTCG
TGAACAACTACAATGGCGACCACTTTCAGCGCCTCTGTCTCCATGCAAACCACTTCTCTG
GCAACACCATCAAGGATTAGTTTCCAGAAGCCAGCTTTGGTAAGGACTAATCTCTCCTTC
AACCTACGCCGTTCAATCCCCACTCGTCTCTCAGTCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACA
GTAGCGAAAGTGTCTGAGATTGTCAAGAAGCAACTATCACTCAAAGACGATCAAAAAGTC
GTTGCGGAAACCAAGTTTGCTGATCTTGGAGCAGATTCTCTCGACACGGTATGTGATTAA
AGAACTTGTAGAGTTTTCTTTATTAATATGATTAACCGAGTGTTTTGCATGCAGGTTGAG
ATAGTGATGGGTTTAGAGGAAGCGTTTGATATCGAAATGGCGGAAGAGAAAGCACAGAAG
ATTGCAACTGTGGAGCAAGCTGCTGAACTCATTGAAGAGCTCGTGGGACTGAAGAAGTAA
TTTAGTATAATAGCCACCTCTCAATGAAAGTTAAAACCATAAGGCTTTGTGTTTGTTGTC
TTCATATTTTTTTCTGTCATTTTCTTTTAATGTCTCAAGAATCTTCTACTTTGTCCTTGT
CCTAGTTGTTTTACTAGTATCTGTATCCACGCATTGCTATTCTTCTCCTGAAACTTTTGG
TGTTTGGAAAATTCAGAATAACATTGAATGAAAATCTCATTTACATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BK71TF U 1
AF RR2BK71JQ C 19
BS 1 703 RR2BK71TF
BS 704 769 RR2BK71JQ

RD RR2BK71TF 717 0 0
GGCTCTTTGTACACTCCGCCATCTTTCCCATCTCTCTCTCTCTCGAGCAGATCTCTCTCG
TGAACAACTACAATGGCGACCACTTTCAGCGCCTCTGTCTCCATGCAAACCACTTCTCTG
GCAACACCATCAAGGATTAGTTTCCAGAAGCCAGCTTTGGTAAGGACTAATCTCTCCTTC
AACCTACGCCGTTCAATCCCCACTCGTCTCTCAGTCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACA
GTAGCGAAAGTGTCTGAGATTGTCAAGAAGCAACTATCACTCAAAGACGATCAAAAAGTC
GTTGCGGAAACCAAGTTTGCTGATCTTGGAGCAGATTCTCTCGACACGGTATGTGATTAA
AGAACTTGTAGAGTTTTCTTTATTAATATGATTAACCGAGTGTTTTGCATGCAGGTTGAG
ATAGTGATGGGTTTAGAGGAAGCGTTTGATATCGAAATGGCGGAAGAGAAAGCACAGAAG
ATTGCAACTGTGGAGCAAGCTGCTGAACTCATTGAAGAGCTCGTGGGACTGAAGAAGTAA
TTTAGTATAATAGCCACCTCTCAATGAAAGTTAAAACCATAAGGCTTTGTGTTTGTTGTC
TTCATATTTTTTTCTGTCATTTTCTTTTAATGTCTCAAGAATCTTCTACTTTGTCCTTGT
CCTAGTTGTTTTACTAGTATCTGTATCCACGCATTGCTATTCT
CTCTGAAACTTTTG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2BK71JQ 751 0 0
CCATCTTTCCCATCTCTCTCTCTCTCGAGCAGATCTCTCTCGTGAACAACTACAATGGCG
ACCACTTTCAGCGCCTCTGTCTCCATGCAAACCACTTCTCTGGCAACACCATCAAGGATT
AGTTTCCAGAAGCCAGCTTTGGTAAGGACTAATCTCTCCTTCAACCTACGCCGTTCAATC
CCCACTCGTCTCTCAGTCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACAGTAGCGAAAGTGTCTGAG
ATTGTCAAGAAGCAACTATCACTCAAAGACGATCAAAAAGTCGTTGCGGAAACCAAGTTT
GCTGATCTTGGAGCAGATTCTCTCGACACGGTATGTGATTAAAGAACTTGTAGAGTTTTC
TTTATTAATATGATTAACCGAGTGTTTTGCATGCAGGTTGAGATAGTGATGGGTTTAGAG
GAAGCGTTTGATATCGAAATGGCGGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACTGTGGAGCAA
GCTGCTGAACTCATTGAAGAGCTCGTGGGACTGAAGAAGTAATTTAGTATAATAGCCACC
TCTCAATGAAAGTTAAAACCATAAGGCTTTGTGTTTGTTGTCTTCATATTTTTTTCTGTC
ATTTTCTTTTAATGTCTCAAGAATCTTCTACTTTGTCCTTGTCCTAGTTGTTTTACTAGT
ATCTGTATCCACGCATTGCTATTCTTCTCCTGAAACTTTTGGTGTTTGGAAAATTCAGAA
TAACATTGAATGAAAATCTCATTTACATATC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL7777Contig1 892 2 4 U
GATAGTTAACCTTAAGGCTTATTATTGGTCGGTGGAGGAGAAGCTTCTCATCTATGACTA
CGTTCCTAACGGAAGTCTTGCCAATGCAATCCACGGGAATCCAAGTATGATGTCATTCAA
GCCTCTAGCTTGGGATGTTCGGTTAAAAATAATGAGGGGAATCGCTAGAGGTTTATTGTA
TCTTCACGAGTTTAGCCCCAAGAAGTACGTTCATGGATCTCTAAAACTCAGCAACATACT
GCTCGGACAAGACATGGAGCCTCACATCTCGGACTTTGGACTCATGCACCTCTCTATCAT
CGCAGGAACGTTGGAAACAACAACCACAGTTGACCATCCACCGTCAAACAAAAGCGCCTC
ATCGCTCGGTCCACTTGCAAACTTGAGCTCCTTCTACCAGGCTCCTGAAGCCATGAAAGC
AACGGTGAAGCCGTCTCAGAAATGGGACGTGTACTCGTTTGGAGTCATCTTGCTGGAGAT
GATAACGGGAAGGTTACCGATTGTTTTTGTTGGTAAAACAGAGATGGAGATAGTGAAGTG
GATACAGATGTGCATCGATGAGAAGAAATAGATGTCAGACATTTTGGATCCGTATTTGGT
GCCTGATGATGCAGAGATTGAAGAAGAGGTCATTGCTGTGCTCAAGATTGCAATGGCATG
TGTTAGTGTTAGTCCTGAGAAACGGCCACCGACGAAGCATGTCGCCGATGCTTTGAACCA
GATTTTCCTTCAGTGAATTTAGAACAATGTTGTTGCAAAGTTAAAAGTGTGAGTATATGT
TTGAAGTAAATGTCTTGTTTTGATTTTGTTCTGTTCTTCATGTAATATTCAAAATCTTGT
GTTATTTCAAAATATAGTTTCCTTGTGACACATATGTATATATTTTGTTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY16TF U 1
AF RR2EY16JQ C 305
BS 1 736 RR2EY16TF
BS 737 737 RR2EY16JQ
BS 738 746 RR2EY16TF
BS 747 892 RR2EY16JQ

RD RR2EY16TF 753 0 0
GATAGTTAACCTTAAGGCTTATTATTGGTCGGTGGAGGAGAAGCTTCTCATCTATGACTA
CGTTCCTAACGGAAGTCTTGCCAATGCAATCCACGGGAATCCAAGTATGATGTCATTCAA
GCCTCTAGCTTGGGATGTTCGGTTAAAAATAATGAGGGGAATCGCTAGAGGTTTATTGTA
TCTTCACGAGTTTAGCCCCAAGAAGTACGTTCATGGATCTCTAAAACTCAGCAACATACT
GCTCGGACAAGACATGGAGCCTCACATCTCGGACTTTGGACTCATGCACCTCTCTATCAT
CGCAGGAACGTTGGAAACAACAACCACAGTTGACCATCCACCGTCAAACAAAAGCGCCTC
ATCGCTCGGTCCACTTGCAAACTTGAGCTCCTTCTACCAGGCTCCTGAAGCCATGAAAGC
AACGGTGAAGCCGTCTCAGAAATGGGACGTGTACTCGTTTGGAGTCATCTTGCTGGAGAT
GATAACGGGAAGGTTACCGATTGTTTTTGTTGGTAAAACAGAGATGGAGATAGTGAAGTG
GATACAGATGTGCATCGATGAGAAGAAATAGATGTCAGACATTTTGGATCCGTATTTGGT
GCCTGATGATGCAGAGATTGAAGAAGAGGTCATTGCTGTGCTCAAGATTGCAATGGCATG
TGTTAGTGTTAGTCCTGAGAAACGGCCACCGACGAAGCATGTCGCCGATGCTTTGAACCA
GATTTTCCTTCAGTGA*TTTAGAACA
TGTTGTT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RR2EY16JQ 588 0 0
GGAACGTTGGAAACAACAACCACAGTTGACCATCCACCGTCAAACAAAAGCGCCTCATCG
CTCGGTCCACTTGCAAACTTGAGCTCCTTCTACCAGGCTCCTGAAGCCATGAAAGCAACG
GTGAAGCCGTCTCAGAAATGGGACGTGTACTCGTTTGGAGTCATCTTGCTGGAGATGATA
ACGGGAAGGTTACCGATTGTTTTTGTTGGTAAAACAGAGATGGAGATAGTGAAGTGGATA
CAGATGTGCATCGATGAGAAGAAATAGATGTCAGACATTTTGGATCCGTATTTGGTGCCT
GATGATGCAGAGATTGAAGAAGAGGTCATTGCTGTGCTCAAGATTGCAATGGCATGTGTT
AGTGTTAGTCCTGAGAAACGGCCACCGACGAAGCATGTCGCCGATGCTTTGAACCAGATT
TTCCTTCAGTGAATTTAGAACAATGTTGTTGCAAAGTTAAAAGTGTGAGTATATGTTTGA
AGTAAATGTCTTGTTTTGATTTTGTTCTGTTCTTCATGTAATATTCAAAATCTTGTGTTA
TTTCAAAATATAGTTTCCTTGTGACACATATGTATATATTTTGTTTAA

QA 1 588 1 588
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7779Contig1 949 2 10 U
GATCGCCTTCGAATCTGTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAACCATTTACTGAACATGGCAA
ATTCGGGAGAAGAGAAGGAGAAGCTGAAGCTCTACTCTTACTGGAGAAGCTCCTGCGCTC
ATCGTGTCCGTATCGCCCTCTCTCTCAAAGGGCTTGAGTATGAGTATATACCAGTTAATC
TCCTCAAAGGTGAACAATCCGATCCCAGAATTCAAGAAGATCAATCCAATGGGTACTGTA
CCAGCCCTTGTTGATGGAGATATTGTCATTTCTGATTCTCTTGCCATCATTATGTATCTG
GATGAGAAGTATCCTGAACCACCTCTCTTACCTTCTGACCTCCATAAACGTGCTGTCAAT
TTCCAGGCAGCGAGTATTGTCTTGTCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTGGGTGTTATT
AGGTTCATTGAGAAAAAGATCAATTCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACTAATGCTATC
ACAAAAGGATTCACTGCTCTCGAGAAACTGTTGGTGAGCTGCTCTGGCAAACACGCAACT
GGTGGTGAAGTCTACTTGGCTGATCTCTTTCTAGCACCACAGATCTATGGAGCTATCAAC
AGGTTCCAGATTAACATGGAACCGTACCCGACCCTTGCAAAGTGTTACCAGTCATACAAG
GATCTTCCTGCGTTTCAAGACGCGGCACCAGAGAAGCAGCCAGATGCTCCTGCTTCCACC
AGCTGATCCCGTGAACCGGTAGTAAGTAAGCGACTCTCAGTTCAATGAAGCCTCACAGAC
GACAACAATAATGATGATGATAATACCTTGTACACACATATATAGATTGTATCATATGAA
CCAGTTCACTTCTTAGTCCATCTACTTGGTATTATACAATAATAAAGATCACAGACTTTG
GAAGTCGCAAACATATTTATTAATGTATTCCGAAGCCTTTTTATCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AT34TF U 1
AF RR2AT34JQ C 82
BS 1 205 RR2AT34TF
BS 206 206 RR2AT34JQ
BS 207 432 RR2AT34TF
BS 433 433 RR2AT34JQ
BS 434 660 RR2AT34TF
BS 661 661 RR2AT34JQ
BS 662 716 RR2AT34TF
BS 717 717 RR2AT34JQ
BS 718 827 RR2AT34TF
BS 828 949 RR2AT34JQ

RD RR2AT34TF 827 0 0
GATCGCCTTCGAATCTGTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAACCATTTACTGAACATGGCAA
ATTCGGGAGAAGAGAAGGAGAAGCTGAAGCTCTACTCTTACTGGAGAAGCTCCTGCGCTC
ATCGTGTCCGTATCGCCCTCTCTCTCAAAGGGCTTGAGTATGAGTATATACCAGTTAATC
TCCTCAAAGGTGAACAATCCGATCC*AGAATTCAAGAAGATCAATCCAATGGGTACTGTA
CCAGCCCTTGTTGATGGAGATATTGTCATTTCTGATTCTCTTGCCATCATTATGTATCTG
GATGAGAAGTATCCTGAACCACCTCTCTTACCTTCTGACCTCCATAAACGTGCTGTCAAT
TTCCAGGCAGCGAGTATTGTCTTGTCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTGGGTGTTATT
AGGTTCATTGAGGAAAAGATCAATTCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACTAATGCTATC
ACAAAAGGATTCACTGCTCTCGAGAAACTGTTGGTGAGCTGCTCTGGCAAACACGCAACT
GGTGGTGAAGTCTACTTGGCTGATCTCTTTCTAGCACCACAGATCTATGGAGCTATCAAC
AGGTTCCAGATTAACATGGAACCGTACCCGACCCTTGCAAAGTGTTACCAGTCATACAAG
*ATCTTCCTGCGTTTCAAGACGCGGCACCAGAGAAGCAGCCAGATGCTCCTGCTTC*ACC
AGCTGATCCCGTGAACCGGTAGTAAGTAAGCGACTCTCAGTTCAATGAAGCCTCACAGAC
GACAACAATAATGATGATGATAATACCTTGTACACACATATATAGAT

QA 1 827 1 827
DS 

RD RR2AT34JQ 868 0 0
AGCTGAAGCTCTACTCTTACTGGAGAAGCTC*TGCGCTCATCGTGTCCGTATCGCCCTCT
CTCTCAAAGGGCTTGAGTATGAGTATATACCAGTTAATCTCCTCAAAGGTGAACAATCCG
ATCCCAGAATTCAAGAAGATCAATCCAATGGGTACTGTACCAGCCCTTGTTGATGGAGAT
ATTGTCATTTCTGATTCTCTTGCCATCATTATGTATCTGGATGAGAAGTATCCTGAACCA
CCTCTCTTACCTTCTGACCTCCATAAACGTGCTGTCAATTTCCAGGCAGCGAGTATTGTC
TTGTCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTGGGTGTTATTAGGTTCATTGAGAAAAAGATC
AATTCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACTAATGCTATCACAAAAGGATTCACTGCTCTC
GAGAAACTGTTGGTGAGCTGCTCTGGCAAACACGCAACTGGTGGTGAAGTCTACTTGGCT
GATCTCTTTCTAGCACCACAGATCTATGGAGCTATCAACAGGTTCCAGATTAACATGGAA
CCGTACCCGACCCTTGCAAAGTGTTACCAGTCATACAAGGATCTTCCTGCGTTTCAAGAC
GCGGCACCAGAGAAGCAGCCAGATGCTCCTGCTTCCACCAGCTGATCCCGTGAACCGGTA
GTAAGTAAGCGACTCTCAGTTCAATGAAGCCTCACAGACGACAACAATAATGATGATGAT
AATACCTTGTACACACATATATAGATTGTATCATATGAACCAGTTCACTTCTTAGTCCAT
CTACTTGGTATTATACAATAATAAAGATCACAGACTTTGGAAGTCGCAAACATATTTATT
AATGTATTCCGAAGCCTTTTTATCTCCC

QA 1 868 1 868
DS 



AS 1 2

CO CL7780Contig1 790 2 2 U
AGGAGTTGACTTTGATGCGATCAACAGGAGAGAGAAACGGTTTGAGAAACCGACAAACGC
ACCACCAGCAACATCGACTATCAACATGGGTAAAGCAATGGGATCAGGCACTGGCTTAGG
GCGTGCAGGTGCAACTGCTATGAGACCTCCTCCAAATCCAATGGTAGGCTCTGGCATGCC
CATGGGTGCTGGTGGATATGGGGGTATGAACCAAAACCAACACATGGGTATGGGAATGGG
ACCAGGCATGAACCCAAATCAACCAATGGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAATCAAAA
CCAACCTATGGGAATGGGAATGGGACCAGGCATGAACCAAAACCAACCTATGGGTATGGG
AATGGGACCAGGCATGAACATGGGAGGAGGATATGGCCAAGGGTATCCGATGCAACCACA
AAACCAAGGAATGGTCCCTGGTCCGAATATGCCAGGCAACGACAACAACTATAATCCAAT
GATGGGTCAAGGCGGTTTTAACCCTCAACAATCCTATGGTGGTGGATACAGGTAAGATCA
AGCCAAACCATCACTGACAAGAGTCACCACTTGTGAAATCAAGAACAGAACACTCTGGTT
CCATACCTCTCTGTGCTTCTTTGCATTTTTACCTGGGACTGTAATATCAGGGGATAAAAT
AGTGGGATTGGTCAGCCGCTTCACGGAAGTACTCAGGTTACATTAATCATGCCAGCATCA
GGATTTTTTACACTTTTCTTTACCTTTGTTATATGGGGTATAAATTGATATATATTTACA
CAGATTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BO05TF U 1
AF RR2BO05JQ C 194
BS 1 646 RR2BO05TF
BS 647 790 RR2BO05JQ

RD RR2BO05TF 646 0 0
AGGAGTTGACTTTGATGCGATCAACAGGAGAGAGAAACGGTTTGAGAAACCGACAAACGC
ACCACCAGCAACATCGACTATCAACATGGGTAAAGCAATGGGATCAGGCACTGGCTTAGG
GCGTGCAGGTGCAACTGCTATGAGACCTCCTCCAAATCCAATGGTAGGCTCTGGCATGCC
CATGGGTGCTGGTGGATATGGGGGTATGAACCAAAACCAACACATGGGTATGGGAATGGG
ACCAGGCATGAACCCAAATCAACCAATGGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAATCAAAA
CCAACCTATGGGAATGGGAATGGGACCAGGCATGAACCAAAACCAACCTATGGGTATGGG
AATGGGACCAGGCATGAACATGGGAGGAGGATATGGCCAAGGGTATCCGATGCAACCACA
AAACCAAGGAATGGTCCCTGGTCCGAATATGCCAGGCAACGACAACAACTATAATCCAAT
GATGGGTCAAGGCGGTTTTAACCCTCAACAATCCTATGGTGGTGGATACAGGTAAGATCA
AGCCAAACCATCACTGACAAGAGTCACCACTTGTGAAATCAAGAACAGAACACTCTGGTT
CCATACCTCTCTGTGCTTCTTTGCATTTTTACCTGGGACTGTAATA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RR2BO05JQ 597 0 0
GGATATGGGGGTATGAACCAAAACCAACACATGGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAAC
CCAAATCAACCAATGGGTATGGGAATGGGACCAGGCATGAATCAAAACCAACCTATGGGA
ATGGGAATGGGACCAGGCATGAACCAAAACCAACCTATGGGTATGGGAATGGGACCAGGC
ATGAACATGGGAGGAGGATATGGCCAAGGGTATCCGATGCAACCACAAAACCAAGGAATG
GTCCCTGGTCCGAATATGCCAGGCAACGACAACAACTATAATCCAATGATGGGTCAAGGC
GGTTTTAACCCTCAACAATCCTATGGTGGTGGATACAGGTAAGATCAAGCCAAACCATCA
CTGACAAGAGTCACCACTTGTGAAATCAAGAACAGAACACTCTGGTTCCATACCTTTTTG
TGCTTTTTTGCATTTTTACCTGGGACTGTAATATCAGGGGATAAAATAGTGGGATTGGTC
AGCCGCTTCACGGAAGTACTCAGGTTACATTAATCATGCCAGCATCAGGATTTTTTACAC
TTTTCTTTACCTTTGTTATATGGGGTATAAATTGATATATATTTACACAGATTTTAT

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL7781Contig1 937 2 2 U
TATGTTGGATGAGGCCAAGCTGTGTCATAGTGAGAGGAAGCTCGAAGCTCCGCCACCGAT
CGTAGACTATTCATTAACCACAACATTTTCAGATTCCGACGAGGAAGAGATCGATCCCGT
GGAACGCGAGAAGTATCGAAAACAAGTCGTAGAGTCCGGCGGATTCGATGTTGACTTTTT
CCCAGTATATGAGAAGTTAATGTCAAGTGGATCCACTCCTTCCACGGTACTGTTGAGCAA
GGTGGGACTCCATACCTACAACTTTGACAAGGGGACGAATCTACAGTTCAGGAGTGTACA
GAAAGCAAACGAAGAATTTGTTTCATTTACATTTTACTATATAACGGTTGAAGCGGTGGA
TCCGTTCAATGATGATTCAACTGTTACTTTCCAAACCTCTGTCTGGGATGCTGCTACAAA
GAACAACGAGAGCTTGAGATTGGTCACTAAAGTGTGCAGAATCAAAGGAAGTAAAGATGA
AACTTCTCTGTGGGACCACGATGCTGTAGACGAGTTCTATAAAGATGATATCTCTTGGTT
AGAGGATGATGCTCTTACAGGAAGTGATAAGCTACAATACTATGAGGTGAAGGAATCGGA
TCTGCGAGACAACGAATGGCTTTATCTGTATGCTGAAGTTGTATTGTTCTCCAAGTGGGA
AATTGACCTTAGCGCTTATTTGCCGGTGAAGATGAAGAAAGTAGTGGTACGAACGAGGGA
AGATGTAGAGTCGAGTATGAAGCTCAGGTTTAAGAATGCAATTTTTTACATGAGTTTCAC
GGCCTGCGGGGGTCTTGAGTGCAGAAGCATAATAACGCGGACGACGGATGGAAGACCACA
ACACATGAGCTTTCAAGTTAACTGTTGGATCGACAATTAGAGAGATAGATAGATGTTTTC
TTTTGTTATTTGCAATGCACTAAAGAGAATATCCTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A062TF U 1
AF RR2A062JQ C 280
BS 1 668 RR2A062TF
BS 669 937 RR2A062JQ

RD RR2A062TF 668 0 0
TATGTTGGATGAGGCCAAGCTGTGTCATAGTGAGAGGAAGCTCGAAGCTCCGCCACCGAT
CGTAGACTATTCATTAACCACAACATTTTCAGATTCCGACGAGGAAGAGATCGATCCCGT
GGAACGCGAGAAGTATCGAAAACAAGTCGTAGAGTCCGGCGGATTCGATGTTGACTTTTT
CCCAGTATATGAGAAGTTAATGTCAAGTGGATCCACTCCTTCCACGGTACTGTTGAGCAA
GGTGGGACTCCATACCTACAACTTTGACAAGGGGACGAATCTACAGTTCAGGAGTGTACA
GAAAGCAAACGAAGAATTTGTTTCATTTACATTTTACTATATAACGGTTGAAGCGGTGGA
TCCGTTCAATGATGATTCAACTGTTACTTTCCAAACCTCTGTCTGGGATGCTGCTACAAA
GAACAACGAGAGCTTGAGATTGGTCACTAAAGTGTGCAGAATCAAAGGAAGTAAAGATGA
AACTTCTCTGTGGGACCACGATGCTGTAGACGAGTTCTATAAAGATGATATCTCTTGGTT
AGAGGATGATGCTCTTACAGGAAGTGATAAGCTACAATACTATGAGGTGAAGGAATCGGA
TCTGCGAGACAACGAATGGCTTTATCTGTATGCTGAAGTTGTATTGTTCTCCAAGTGGGA
AATTGACC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RR2A062JQ 658 0 0
TCTACAGTTCAGGAGTGTACAGAAAGCAAACGAAGAATTTGTTTCATTTACATTTTACTA
TATAACGGTTGAAGCGGTGGATCCGTTCAATGATGATTCAACTGTTACTTTCCAAACCTC
TGTCTGGGATGCTGCTACAAAGAACAACGAGAGCTTGAGATTGGTCACTAAAGTGTGCAG
AATCAAAGGAAGTAAAGATGAAACTTCTCTGTGGGACCACGATGCTGTAGACGAGTTCTA
TAAAGATGATATCTCTTGGTTAGAGGATGATGCTCTTACAGGAAGTGATAAGCTACAATA
CTATGAGGTGAAGGAATCGGATCTGCGAGACAACGAATGGCTTTATCTGTATGCTGAAGT
TGTATTGTTCTCCAAGTGGGAAATTGACCTTAGCGCTTATTTGCCGGTGAAGATGAAGAA
AGTAGTGGTACGAACGAGGGAAGATGTAGAGTCGAGTATGAAGCTCAGGTTTAAGAATGC
AATTTTTTACATGAGTTTCACGGCCTGCGGGGGTCTTGAGTGCAGAAGCATAATAACGCG
GACGACGGATGGAAGACCACAACACATGAGCTTTCAAGTTAACTGTTGGATCGACAATTA
GAGAGATAGATAGATGTTTTCTTTTGTTATTTGCAATGCACTAAAGAGAATATCCTTA

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL7782Contig1 719 2 1 U
GAAGAAGTCACATTCTCTAATATCTTTGCTGTCTTAGGTTTGCCTCCATCAACCAAACGC
AATGGCGAACGCGGCGTCAGGAATGGCGGTGGAAGACGAATGTAAACTAAAGTTTTTGGA
GTTAAAAGCGAAAAGAAACTATAGATTCATAATATTCAGGATAGACGGACAACAAGTGGT
GGTTGAAAAGCTTGGAAGTCCCGAGGAGAACTACGACGATTTCTCCAATTCCCTACCGCC
CAACGAGTGCCGCTATGCTGTCTATGACTTCGACTTCACCACTGCTGAGAATTGCCAGAA
GAGCAAGATCTTCTTCATAGCTTGGTCACCGGATTCATCGAGGGTGAGGATGAAGATGGT
GTATGCGAGCTCAAAGGACAGGTTCAAGAGAGAACTGGATGGGATCCAGGTGGAGTTACA
AGCCACAGACCCAAGCGAGATGAGTTTCGACATCATCAAAAGTCGAGCTCTCTAGATTCA
TATATATTACCTAATTTCTCATCATATATCCATAAATGTTCCATCATCAACAAATTAAAG
AACTTCTCCATGTTATGTAACTTCCTTGGTTCATTCTCCTTCCTCTTTGACTTTTTTTTT
GTTTATTTACATTTCAAACTGACATGGGTTTCATACTTTGGCTTGGGAGAAGCCTAAAAC
CATGCAGTTCTCGTGTAGTAGCTACATACTCCGTTGAAAAATAAAATATATTACTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AN01JQ C 1
AF RR2AN01TF U 1
BS 1 719 RR2AN01TF

RD RR2AN01JQ 719 0 0
GAAGAAGTCACATTCTCTAATATCTTTGCTGTCTTAGGTTTGCCTCCATCAACCAAACGC
AATGGCGAACGCGGCGTCAGGAATGGCGGTGGAAGACGAATGTAAACTAAAGTTTTTGGA
GTTAAAAGCGAAAAGAAACTATAGATTCATAATATTCAGGATAGACGGACAACAAGTGGT
GGTTGAAAAGCTTGGAAGTCCCGAGGAGAACTACGACGATTTCTCCAATTCCCTACCGCC
CAACGAGTGCCGCTATGCTGTCTATGACTTCGACTTCACCACTGCTGAGAATTGCCAGAA
GAGCAAGATCTTCTTCATAGCTTGGTCACCGGATTCATCGAGGGTGAGGATGAAGATGGT
GTATGCGAGCTCAAAGGACAGGTTCAAGAGAGAACTGGATGGGATCCAGGTGGAGTTACA
AGCCACAGACCCAAGCGAGATGAGTTTCGACATCATCAAAAGTCGAGCTCTCTAGATTCA
TATATATTACCTAATTTCTCATCATATATCCATAAATGTTCCATCATCAACAAATTAAAG
AACTTCTCCATGTTATGTAACTTCCTTGGTTCATTCTCCTTCCTCTTTGACTTTTTTTTT
GTTTATTTACATTTCAAACTGACATGGGTTTCATACTTTGGCTTGGGAGAAGCCTAAAAC
CATGCAGTTCTCGTGTAGTAGCTACATACTCCGTTGAAAAATAAAATATATTACTTTTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RR2AN01TF 719 0 0
GAAGAAGTCACATTCTCTAATATCTTTGCTGTCTTAGGTTTGCCTCCATCAACCAAACGC
AATGGCGAACGCGGCGTCAGGAATGGCGGTGGAAGACGAATGTAAACTAAAGTTTTTGGA
GTTAAAAGCGAAAAGAAACTATAGATTCATAATATTCAGGATAGACGGACAACAAGTGGT
GGTTGAAAAGCTTGGAAGTCCCGAGGAGAACTACGACGATTTCTCCAATTCCCTACCGCC
CAACGAGTGCCGCTATGCTGTCTATGACTTCGACTTCACCACTGCTGAGAATTGCCAGAA
GAGCAAGATCTTCTTCATAGCTTGGTCACCGGATTCATCGAGGGTGAGGATGAAGATGGT
GTATGCGAGCTCAAAGGACAGGTTCAAGAGAGAACTGGATGGGATCCAGGTGGAGTTACA
AGCCACAGACCCAAGCGAGATGAGTTTCGACATCATCAAAAGTCGAGCTCTCTAGATTCA
TATATATTACCTAATTTCTCATCATATATCCATAAATGTTCCATCATCAACAAATTAAAG
AACTTCTCCATGTTATGTAACTTCCTTGGTTCATTCTCCTTCCTCTTTGACTTTTTTTTT
GTTTATTTACATTTCAAACTGACATGGGTTTCATACTTTGGCTTGGGAGAAGCCTAAAAC
CATGCAGTTCTCGTGTAGTAGCTACATACTCCGTTGAAAAATAAAATATATTACTTTTT

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL7783Contig1 469 2 3 U
GGCCCGATCCGCGACTCATCTTCTCGAAAAAAGCAGCGGCGATGGTGAAGGTGTTGACCT
ACTTTGGGATGACATTGGCTGCTTTCCCCTTCTGGCAATCCATGGACAAAGTCCACGTCT
GGATCGCTCTTCACCAAGACGAGAAGCAAGAGAGGATGGAGAAGGAGGCCGAAGTAAAGC
GGGTTAGAGCTGAGTTGCTGCGGAAAGCTAGAGAGGAGGATCCTCTTGCCTGATAATCTT
CTTCAGTTATAATTTGGATTTCTAACCAAATATGAATGAGTTCTTTTTTTTTTCCATTGT
TATGGACCCAAAATGGAGTTTGCATAAAACGACAATACCATATATGCTATTGAATGTGGG
AATGATGATGATCATGAATAAGTAGCTTCCTCTTTGTTGTTGTTCTTCTTGTCAACTAAT
GGAATACTAGTGCAAGAGGTACCAGCATCTTGCTCTGCCTGTCTTCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ER06TF U 1
AF RR2ER06JQ C 21
BS 1 86 RR2ER06TF
BS 87 87 RR2ER06JQ
BS 88 469 RR2ER06TF

RD RR2ER06TF 469 0 0
GGCCCGATCCGCGACTCATCTTCTCGAAAAAAGCAGCGGCGATGGTGAAGGTGTTGACCT
ACTTTGGGATGACATTGGCTGCTTTCGCCTTCTGGCAATCCATGGACAAAGTCCACGTCT
GGATCGCTCTTCACCAAGACGAGAAGCAAGAGAGGATGGAGAAGGAGGCCGAAGTAAAGC
GGGTTAGAGCTGAGTTGCTGCGGAAAGCTAGAGAGGAGGATCCTCTTGCCTGATAATCTT
CTTCAGTTATAATTTGGATTTCTAACCAAATATGAATGAGTTCTTTTTTTTTTCCATTGT
TATGGACCCAAAATGGAGTTTGCATAAAACGACAATACCATATATGCTATTGAATGTGGG
AATGATGATGATCATGAATAAGTAGCTTCCTCTTTGTTGTTGTTCTTCTTGTCAACTAAT
GGAATACTAGTGCAAGAGGTACCAGCATCTTGCTCTGCCTGTCTTCCGC

QA 1 469 1 469
DS 

RD RR2ER06JQ 449 0 0
TTCTCGAAAAAAGCAGCGGCGATGGTGAAGGTGTTGACCTACTTTGGGATGACATTGGCT
GCTTTCCCCTTCTGGCAATCCATGGACAAAGTCCACGTCTGGATCGCTCTTCACCAAGAC
GAGAAGCAAGAGAGGATGGAGAAGGAGGCCGAAGTAAAGCGGGTTAGAGCTGAGTTGCTG
CGGAAAGCTAGAGAGGAGGATCCTCTTGCCTGATAATCTTCTTCAGTTATAATTTGGATT
TCTAACCAAATATGAATGAGTTTTTTTTTTTTTCCATTGTTATGGACCCAAAATGGAGTT
TGCATAAAACGACAATACCATATATGCTATTGAATGTGGGAATGATGATGATCATGAATA
AGTAGCTTCCTCTTTGTTGTTGTTCTTCTTGTCAACTAATGGAATACTAGTGCAAGAGGT
ACCAGCATCTTGCTCTGCCTGTCTTCCGC

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 2

CO CL7784Contig1 882 2 2 U
GTGTCGGAGCATTTAGTGGTCTTGCGTGAAGCTCTGCTTTGGAGCAGTGTTGGATTCGTC
GTCTATGGCGGTTTCAAGGCGACGTTGCAAGCTTCCTCTCAGTCTTCCTTCCTCTTCCCG
TCTAGTTTGGTGCCGTCAATCGAGAGCTGTCGACTTGCTCTTGTTAGTTTTCATTCCCGT
TTTGTGCGTGGTCAAGTCTGATCCTTGCCACAGGTTTCAGCTTCTGGCAGCAAAGACTTT
CTTATCTCCGGTTCTCGGAGGAGACAACCAACGAAGGTTTTCAGAGTTTCCATTTGTCAG
TGGGTTCTTTGGTTCCTCGGTGGCTTGGTTGGTGATAACGGCATTCCGCGCGCCATGAGC
AAGCTGTGTTCATGGTGGTGTCGTCTCACATTGTTTTTTGCAGGTCTTGGAATGTTATCA
GCGTCAACTAGTAGCAGCAGGTTCGAGCCTGTTTTTTCTTTTTTCTGTTTGGTTGAGAGA
CCTTCTCGGGCTCTTGGTCCAGACGGAGTGGCGATATAGGAGTTTCTTAGTGGATACGGA
GCAGTTTTCAATGGGTATGGTCTCCAAATCCTTTCTCCTATGTGCGTGTGAGCTTAAATG
TTAGTGAAAGTTATGAGCTCCAAGGAGATCACCGAAAGCTAGATACTCCGGAAGCGACAT
TGGAGTTCCCGGCATCCGTGGCGACGCGGAGAACCTCACGGTCCGATGATCATCGTGTAC
GGTAGAGAACAGCAACTGGTTTCTAAGAATTTTAAAAACAAGCTATCGGATTGAGCCGGG
TTTAGTGGGTGGGCGAAGGTGGCTTTGTAATACATTGACTTAGGAGCTTTTGTTCGATTT
GGGCTTGTAACCGGATCTAAAATTCCCGTTCTCGGGTTGATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ED23TF U 1
AF RR2ED23JQ C 181
BS 1 620 RR2ED23TF
BS 621 882 RR2ED23JQ

RD RR2ED23TF 620 0 0
GTGTCGGAGCATTTAGTGGTCTTGCGTGAAGCTCTGCTTTGGAGCAGTGTTGGATTCGTC
GTCTATGGCGGTTTCAAGGCGACGTTGCAAGCTTCCTCTCAGTCTTCCTTCCTCTTCCCG
TCTAGTTTGGTGCCGTCAATCGAGAGCTGTCGACTTGCTCTTGTTAGTTTTCATTCCCGT
TTTGTGCGTGGTCAAGTCTGATCCTTGCCACAGGTTTCAGCTTCTGGCAGCAAAGACTTT
CTTATCTCCGGTTCTCGGAGGAGACAACCAACGAAGGTTTTCAGAGTTTCCATTTGTCAG
TGGGTTCTTTGGTTCCTCGGTGGCTTGGTTGGTGATAACGGCATTCCGCGCGCCATGAGC
AAGCTGTGTTCATGGTGGTGTCGTCTCACATTGTTTTTTGCAGGTCTTGGAATGTTATCA
GCGTCAACTAGTAGCAGCAGGTTCGAGCCTGTTTTTTCTTTTTTCTGTTTGGTTGAGAGA
CCTTCTCGGGCTCTTGGTCCAGACGGAGTGGCGATATAGGAGTTTCTTAGTGGATACGGA
GCAGTTTTCAATGGGTATGGTCTCCAAATCCTTTCTCCTATGTGCGTGTGAGCTTAAATG
TTAGTGAAAGTTATGAGCTC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2ED23JQ 702 0 0
TTTGTGCGTGGTCAAGTCTGATCCTTGCCACAGGTTTCAGCTTCTGGCAGCAAAGACTTT
CTTATCTCCGGTTCTCGGAGGAGACAACCAACGAAGGTTTTCAGAGTTTCCATTTGTCAG
TGGGTTCTTTGGTTCCTCGGTGGCTTGGTTGGTGATAACGGCATTCCGCGCGCCATGAGC
AAGCTGTGTTCATGGTGGTGTCGTCTCACATTGTTTTTTGCAGGTCTTGGAATGTTATCA
GCGTCAACTAGTAGCAGCAGGTTCGAGCCTGTTTTTTCTTTTTTCTGTTTGGTTGAGAGA
CCTTCTCGGGCTCTTGGTCCAGACGGAGTGGCGATATAGGAGTTTCTTAGTGGATACGGA
GCAGTTTTCAATGGGTATGGTCTCCAAATCCTTTCTCCTATGTGCGTGTGAGCTTAAATG
TTAGTGAAAGTTATGAGCTCCAAGGAGATCACCGAAAGCTAGATACTCCGGAAGCGACAT
TGGAGTTCCCGGCATCCGTGGCGACGCGGAGAACCTCACGGTCCGATGATCATCGTGTAC
GGTAGAGAACAGCAACTGGTTTCTAAGAATTTTAAAAACAAGCTATCGGATTGAGCCGGG
TTTAGTGGGTGGGCGAAGGTGGCTTTGTAATACATTGACTTAGGAGCTTTTGTTCGATTT
GGGCTTGTAACCGGATCTAAAATTCCCGTTCTCGGGTTGATA

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL7785Contig1 437 2 1 U
GGGAAACAAACAAGACTGTCAAGACTCAAGACGGATCAAAGTTGGTTGCGATTCTTTAGC
ACGCAAACGTTGACAATGGTGAAGAGTGTTATTTCAATGGATCAGCTGAAAGCATTGTGG
CACTCTGAAGTTCACAATGAACAAAAATGGGCTGCTAACATGAAACTTGTGAGAGCACTT
GGGGTGTTTGCAGGAGGAATCTTTTTCATGCGTAAATATGGTGATCTCATGGCTGTCTGA
AGAAACCTTATAACAATGGAGGAGCTTCCATTAGTTTTTATTTTTCACTTTCTCGGTCTC
TTTGTCTAAGACTTGATGGTCTATTTAAGTAAATTTCAGCTCAAGATTTGTTTTTGGTTA
AATAAATATTTTATTCACAATTTACGTTTTCATCTAAATTTCAGACTCTTGATTATTAGT
ATTTTTTTAAAACAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AJ01JQ C 1
AF RR2AJ01TF U 1
BS 1 437 RR2AJ01TF

RD RR2AJ01JQ 437 0 0
GGGAAACAAACAAGACTGTCAAGACTCAAGACGGATCAAAGTTGGTTGCGATTCTTTAGC
ACGCAAACGTTGACAATGGTGAAGAGTGTTATTTCAATGGATCAGCTGAAAGCATTGTGG
CACTCTGAAGTTCACAATGAACAAAAATGGGCTGCTAACATGAAACTTGTGAGAGCACTT
GGGGTGTTTGCAGGAGGAATCTTTTTCATGCGTAAATATGGTGATCTCATGGCTGTCTGA
AGAAACCTTATAACAATGGAGGAGCTTCCATTAGTTTTTATTTTTCACTTTCTCGGTCTC
TTTGTCTAAGACTTGATGGTCTATTTAAGTAAATTTCAGCTCAAGATTTGTTTTTGGTTA
AATAAATATTTTATTCACAATTTACGTTTTCATCTAAATTTCAGACTCTTGATTATTAGT
ATTTTTTTAAAACAACC

QA 1 437 1 437
DS 

RD RR2AJ01TF 437 0 0
GGGAAACAAACAAGACTGTCAAGACTCAAGACGGATCAAAGTTGGTTGCGATTCTTTAGC
ACGCAAACGTTGACAATGGTGAAGAGTGTTATTTCAATGGATCAGCTGAAAGCATTGTGG
CACTCTGAAGTTCACAATGAACAAAAATGGGCTGCTAACATGAAACTTGTGAGAGCACTT
GGGGTGTTTGCAGGAGGAATCTTTTTCATGCGTAAATATGGTGATCTCATGGCTGTCTGA
AGAAACCTTATAACAATGGAGGAGCTTCCATTAGTTTTTATTTTTCACTTTCTCGGTCTC
TTTGTCTAAGACTTGATGGTCTATTTAAGTAAATTTCAGCTCAAGATTTGTTTTTGGTTA
AATAAATATTTTATTCACAATTTACGTTTTCATCTAAATTTCAGACTCTTGATTATTAGT
ATTTTTTTAAAACAACC

QA 1 437 1 437
DS 



AS 1 2

CO CL7786Contig1 610 2 2 U
GGACAGCCAAACCCTTACATCTCAAGCTGATTAAGAAAATCTTTAATCAATATGAACGGC
ATGAGTGGATCTTCTTCGTCGGCTCCTGCACCTTCACCGTCAGCGTTCTTTCAACATCAC
CGCCGTCATCACGGTGGCATGATGCACATGACTTTCTTTTGGGGGAAAAACACGGAGGTT
CTATTCGACGGCTGGCCAGGGACCAACCTGACCATGTATTGGGCATGCCTGGCCACCATT
TTCGTATTTTCGGCATTGTCGGAGTGGATTTCGCGGTGCGGAGTCATGAAAGCCGGTCCG
GCTAGCTTTGGCAGCGGGATAGTTCAGACGGTGGTTTACACCGTGAGGGCTGGTTTGTCT
TATTTGATCATGTTGGCTGTGATGTCATTCAATGGAGGAGTCTTCTTGGCTGCAATGGCT
GGCTTTGGCTTAGGGTTTATGATTTTTGGAAGTAGGGCTTTTAGGGAAACTGGTAGTAAT
CACAATCGCACGGAGGTTCAATCACATTGTTAACTCCCTGTGACATCCAATAATAATGAA
AATAAAATCACATTCTGGGAATTCGTTCTAGTTATTCTCATTTATTGTCTTGTTTAGGTC
TAATATATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D087TF U 1
AF RR2D087JQ C 79
BS 1 280 RR2D087TF
BS 281 610 RR2D087JQ

RD RR2D087TF 280 0 0
GGACAGCCAAACCCTTACATCTCAAGCTGATTAAGAAAATCTTTAATCAATATGAACGGC
ATGAGTGGATCTTCTTCGTCGGCTCCTGCACCTTCACCGTCAGCGTTCTTTCAACATCAC
CGCCGTCATCACGGTGGCATGATGCACATGACTTTCTTTTGGGGGAAAAACACGGAGGTT
CTATTCGACGGCTGGCCAGGGACCAACCTGACCATGTATTGGGCATGCCTGGCCACCATT
TTCGTATTTTCGGCATTGTCGGAGTGGATTTCGCGGTGCG

QA 1 280 1 280
DS 

RD RR2D087JQ 532 0 0
TCGGCTCCTGCACCTTCACCGTCAGCGTTCTTTCAACATCACCGCCGTCATCACGGTGGC
ATGATGCACATGACTTTCTTTTGGGGGAAAAACACGGAGGTTCTATTCGACGGCTGGCCA
GGGACCAACCTGACCATGTATTGGGCATGCCTGGCCACCATTTTCGTATTTTCGGCATTG
TCGGAGTGGATTTCGCGGTGCGGAGTCATGAAAGCCGGTCCGGCTAGCTTTGGCAGCGGG
ATAGTTCAGACGGTGGTTTACACCGTGAGGGCTGGTTTGTCTTATTTGATCATGTTGGCT
GTGATGTCATTCAATGGAGGAGTCTTCTTGGCTGCAATGGCTGGCTTTGGCTTAGGGTTT
ATGATTTTTGGAAGTAGGGCTTTTAGGGAAACTGGTAGTAATCACAATCGCACGGAGGTT
CAATCACATTGTTAACTCCCTGTGACATCCAATAATAATGAAAATAAAATCACATTCTGG
GAATTCGTTCTAGTTATTCTCATTTATTGTCTTGTTTAGGTCTAATATATGA

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL7787Contig1 1002 2 2 U
TGGGATGGAGAAAAAGGACCAGAAGCGGTATGTGCTTGTCCACGGGATCTGCCACGGCGC
GTGGTGCTGGTACAAGGTGAAACCGATTCTCGAGGCTGCAGGTCACATTGTGACAGCAGT
AGACCTAGCTGCGTCCGGCATAAACACAACCAGATTGGAAGAGATTCAAACACTAGAGGA
TTACTGCAAACCGTTGCTTGATGTTCTGAGCTCGCCTGATGAAGATAAGGTGGTTCTCGT
TGCTCATAGCATGGGAGGAATATGCGCAGCGTTTGCAGCTGACATCTTCCCTCATAAGAT
CGCTGCTATGGTCTTTGTGACATCCTTCATGCCTGACACAACAAACCCACCTGCTTATGT
TCTCGAAAATATCATGCCGAGCATGTCACCGCAAGATTGGTTGGATACCGTGCTGGGAAG
CTATGGGAGACCTGATCATCCGTTACAGTCTGCTCTCTTTGGACCAAAGTTCTTGGCCAA
GAATTTGTATCAACTTTCACCAGTCGAGGATCTTGAATTGGCGAAAACGCTGGTGAGGGT
AAACCCATCCGTTACGGACAACCTGGCAGGGACAGGAAGCTTCACTGAGGAAGGGTACGG
ATCTGTTACGCGTATCTACATCACATGCGGAAAGGATAATGTGATACGTAATGATTACCA
GCGTTGGATGATCAACAACTTTCCGGTAAACGAAGTTATGGAAATCAAAGCTGCGGATCA
TATGCCAATGAACTCCAAGCCTCGAGAACTCTGTGCTCGTCTCTTGGAGATTGCACATAG
ATATGCATGAATAAAACATGAGATTGTCACCGCAACATAAGCTTCTTCTTCTAACATCCA
TCTTTATATTGAAAACCGGTGAATAAAACTTAAAATCGCTATTCAAATCTTTTTGTCATC
TCGAAAATGGTTGAATTTTTCTCTAAATGTACAGGCTGATAGTAACTTAAAGAAAAATAA
CAATGTCTATTTTTCATATAATGGTGAATTTATCTTCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C148TF U 1
AF RR2C148JQ C 246
BS 1 683 RR2C148TF
BS 684 1002 RR2C148JQ

RD RR2C148TF 683 0 0
TGGGATGGAGAAAAAGGACCAGAAGCGGTATGTGCTTGTCCACGGGATCTGCCACGGCGC
GTGGTGCTGGTACAAGGTGAAACCGATTCTCGAGGCTGCAGGTCACATTGTGACAGCAGT
AGACCTAGCTGCGTCCGGCATAAACACAACCAGATTGGAAGAGATTCAAACACTAGAGGA
TTACTGCAAACCGTTGCTTGATGTTCTGAGCTCGCCTGATGAAGATAAGGTGGTTCTCGT
TGCTCATAGCATGGGAGGAATATGCGCAGCGTTTGCAGCTGACATCTTCCCTCATAAGAT
CGCTGCTATGGTCTTTGTGACATCCTTCATGCCTGACACAACAAACCCACCTGCTTATGT
TCTCGAAAATATCATGCCGAGCATGTCACCGCAAGATTGGTTGGATACCGTGCTGGGAAG
CTATGGGAGACCTGATCATCCGTTACAGTCTGCTCTCTTTGGACCAAAGTTCTTGGCCAA
GAATTTGTATCAACTTTCACCAGTCGAGGATCTTGAATTGGCGAAAACGCTGGTGAGGGT
AAACCCATCCGTTACGGACAACCTGGCAGGGACAGGAAGCTTCACTGAGGAAGGGTACGG
ATCTGTTACGCGTATCTACATCACATGCGGAAAGGATAATGTGATACGTAATGATTACCA
GCGTTGGATGATCAACAACTTTC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2C148JQ 757 0 0
ATAGCATGGGAGGAATATGCGCAGCGTTTGCAGCTGACATCTTCCCTCATAAGATCGCTG
CTATGGTCTTTGTGACATCCTTCATGCCTGACACAACAAACCCACCTGCTTATGTTCTCG
AAAATATCATGCCGAGCATGTCACCGCAAGATTGGTTGGATACCGTGCTGGGAAGCTATG
GGAGACCTGATCATCCGTTACAGTCTGCTCTCTTTGGACCAAAGTTCTTGGCCAAGAATT
TGTATCAACTTTCACCAGTCGAGGATCTTGAATTGGCGAAAACGCTGGTGAGGGTAAACC
CATCCGTTACGGACAACCTGGCAGGGACAGGAAGCTTCACTGAGGAAGGGTACGGATCTG
TTACGCGTATCTACATCACATGCGGAAAGGATAATGTGATACGTAATGATTACCAGCGTT
GGATGATCAACAACTTTCCGGTAAACGAAGTTATGGAAATCAAAGCTGCGGATCATATGC
CAATGAACTCCAAGCCTCGAGAACTCTGTGCTCGTCTCTTGGAGATTGCACATAGATATG
CATGAATAAAACATGAGATTGTCACCGCAACATAAGCTTCTTCTTCTAACATCCATCTTT
ATATTGAAAACCGGTGAATAAAACTTAAAATCGCTATTCAAATCTTTTTGTCATCTCGAA
AATGGTTGAATTTTTCTCTAAATGTACAGGCTGATAGTAACTTAAAGAAAAATAACAATG
TCTATTTTTCATATAATGGTGAATTTATCTTCTTCCC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7789Contig1 1079 2 2 U
TTGATGATGGTGAGATTTGTAGTAAAGGGTTAGATGAGAAGGGGCGTTGGACACGGATGC
GTGTTGCTAAAGTAAGCCTTTTGATATGTCCGTTTTGGTTCTTGGCGCAGCTCACTTTCA
ATCTCTCTCTCAAGTACACCACAGTTACGTCTAATACAATCTTAAGCAGCTCATCAAGCC
TGTTCACTTTTCTTGTATCACTAATATTCTTGGGAGAGAAGTTCACGTGGGTGAAACTCT
TCAGCGTTCTTCTTTGTATGTCTGGGACTATAATCGTGAGTCTAGGTGACTCAGAATCAA
ACTCGACTGCAACAGCTAAAAACCCTCTTCTTGGAGATGTTCTTTCTCTGCTCTCAGCTG
CTTTCTACGCTGTTTACATAACTCTTATCCGCAAAAAGCTTCCTGATGATGATGAAAGAA
ACGGCCGTTTCAGTATGGCTCAGCTCCTTGGGTTTCTAGGACTCTTCAACTTCTTTATCT
TCCTACCTGTTGCTCTGATACTCAACTTCACAAAGCGAGAACGCTTCAACTCATTAACCT
TGAAACAGTTGGGTCTAGTTGTCGGCAAAGGTTTGTTAGATAATGTGCTCAGTGACTATC
TATGGGCAAAGGCAGTACTTTTGACCACAACTACAGTGGCAACGGCTGGGCTAACCATTC
AGGTTCCATTGGCAGCTATTGTAGACAGCTTAGCAGGGAACAAACCAAGCTTCACCGACT
ACATTGGTGCTGCTGCTGTAATGGTTGGCTTTGCAGGTATCAATATTCCTGCAGAGATGT
TCTGCAGATCCAAAGAGACATCTATTGAGTTAGAACCTGGGACTTCGTTCACAGATCCGC
CTCAGGTTGTGTCGGATAGCATAGGAGTAGATTCTTCAGAGACCCTAGTGTCCCAATTGT
TCGATATACAATACACATGATGCTTATATCATTTTGCTCTCTTGTTTTCTGATATTTTTT
CTCTCTTTTGTTGTGATTGGTATGTAAATCGTTGAACATTGATATACGAATGTAACTGGT
AAAAAAATAGTGTAATAAAATCTCTCAAGGTTATGGACTCCGTCTCAAGGTTTCATCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ40TF U 1
AF RR2GQ40JQ C 460
BS 1 546 RR2GQ40TF
BS 547 1079 RR2GQ40JQ

RD RR2GQ40TF 546 0 0
TTGATGATGGTGAGATTTGTAGTAAAGGGTTAGATGAGAAGGGGCGTTGGACACGGATGC
GTGTTGCTAAAGTAAGCCTTTTGATATGTCCGTTTTGGTTCTTGGCGCAGCTCACTTTCA
ATCTCTCTCTCAAGTACACCACAGTTACGTCTAATACAATCTTAAGCAGCTCATCAAGCC
TGTTCACTTTTCTTGTATCACTAATATTCTTGGGAGAGAAGTTCACGTGGGTGAAACTCT
TCAGCGTTCTTCTTTGTATGTCTGGGACTATAATCGTGAGTCTAGGTGACTCAGAATCAA
ACTCGACTGCAACAGCTAAAAACCCTCTTCTTGGAGATGTTCTTTCTCTGCTCTCAGCTG
CTTTCTACGCTGTTTACATAACTCTTATCCGCAAAAAGCTTCCTGATGATGATGAAAGAA
ACGGCCGTTTCAGTATGGCTCAGCTCCTTGGGTTTCTAGGACTCTTCAACTTCTTTATCT
TCCTACCTGTTGCTCTGATACTCAACTTCACAAAGCGAGAACGCTTCAACTCATTAACCT
TGAAAC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RR2GQ40JQ 620 0 0
GACTCTTCAACTTCTTTATCTTCCTACCTGTTGCTCTGATACTCAACTTCACAAAGCGAG
AACGCTTCAACTCATTAACCTTGAAACAGTTGGGTCTAGTTGTCGGCAAAGGTTTGTTAG
ATAATGTGCTCAGTGACTATCTATGGGCAAAGGCAGTACTTTTGACCACAACTACAGTGG
CAACGGCTGGGCTAACCATTCAGGTTCCATTGGCAGCTATTGTAGACAGCTTAGCAGGGA
ACAAACCAAGCTTCACCGACTACATTGGTGCTGCTGCTGTAATGGTTGGCTTTGCAGGTA
TCAATATTCCTGCAGAGATGTTCTGCAGATCCAAAGAGACATCTATTGAGTTAGAACCTG
GGACTTCGTTCACAGATCCGCCTCAGGTTGTGTCGGATAGCATAGGAGTAGATTCTTCAG
AGACCCTAGTGTCCCAATTGTTCGATATACAATACACATGATGCTTATATCATTTTGCTC
TCTTGTTTTCTGATATTTTTTCTCTCTTTTGTTGTGATTGGTATGTAAATCGTTGAACAT
TGATATACGAATGTAACTGGTAAAAAAATAGTGTAATAAAATCTCTCAAGGTTATGGACT
CCGTCTCAAGGTTTCATCCG

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL7790Contig1 703 2 4 U
GGGACGTCACGTATTGTAAACTTGAATCACTTTGATCGCCTGTCTAAGATGTTAGAGGAG
AAGGAAGTTTCTAATAAAATCGTCTATGGAGGTCAAAAAAACAGAGAGAACCTGAAAATT
TCTCCAACAGTCTTGCTTGACGTGCCATTAGATTCTATGATCATGAGTGAAGAAATATTT
GGCCCTCTCCTGCCAATCGTCACGCTCAACAACCTGGAGGAGTGTTTTGACGTGATTCAT
TCTCGACCCAAGCCACTTGCTGCGTATTTGTTTACCAAAAACCACAAGCTGAAAAAGAAA
TTTACCAAGACAGTTTCTGCTGGAGGCATAGTAGTCAACGACACAGCTGTTCATTTTACA
CTTCCCACATTGCCATTTGGAGGAGTCGGTGAAAGTGGAATTGGTTCTTACCATGGTAAA
TTCTCATTTGATGCATTCAGTCGCAAAAAATCTGTTCTCTTCAAAAGCTTTTTAGGTGAT
TCAGCCATCAGGTATCCACCATACTCTAGACGAAAGCTTGGACTGTTAAAGACACTTGTC
AACAGCAATCTAGTGGACACATTCAAAGTCCTTTTAGGTTTATCCTAAAAGGATGATGAC
AATGGGTTATACATCCCCTTGTATCTTACTTTCTTCGGATATGAACTTTGGTTGTTAAAG
ATATATGTGTGTTGATGAATAAGAGATTTGAGATTTGTTGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DU29TF U 1
AF RR2DU29JQ C 146
BS 1 577 RR2DU29TF
BS 578 578 RR2DU29JQ
BS 579 587 RR2DU29TF
BS 588 703 RR2DU29JQ

RD RR2DU29TF 587 0 0
GGGACGTCACGTATTGTAAACTTGAATCACTTTGATCGCCTGTCTAAGATGTTAGAGGAG
AAGGAAGTTTCTAATAAAATCGTCTATGGAGGTCAAAAAAACAGAGAGAACCTGAAAATT
TCTCCAACAGTCTTGCTTGACGTGCCATTAGATTCTATGATCATGAGTGAAGAAATATTT
GGCCCTCTCCTGCCAATCGTCACGCTCAACAACCTGGAGGAGTGTTTTGACGTGATTCAT
TCTCGACCCAAGCCACTTGCTGCGTATTTGTTTACCAAAAACCACAAGCTGAAAAAGAAA
TTTACCAAGACAGTTTCTGCTGGAGGCATAGTAGTCAACGACACAGCTGTTCATTTTACA
CTTCCCACATTGCCATTTGGAGGAGTCGGTGAAAGTGGAATTGGTTCTTACCATGGTAAA
TTCTCATTTGATGCATTCAGTCGCAAAAAATCTGTTCTCTTCAAAAGCTTTTTAGGTGAT
TCAGCCATCAGGTATCCACCATACTCTAGACGAAAGCTTGGACTGTTAAAGACACTTGTC
AACAGCAATCTAGTGGACACATTCAAAGTCCTTTTAG*TTTATCCTA

QA 1 587 1 587
DS 

RD RR2DU29JQ 558 0 0
CATTAGATTCTATGATCATGAGTGAAGAAATATTTGGCCCTCTCCTGCCAATCGTCACGC
TCAACAACCTGGAGGAGTGTTTTGACGTGATTCATTCTCGACCCAAGCCACTTGCTGCGT
ATTTGTTTACCAAAAACCACAAGCTGAAAAAGAAATTTACCAAGACAGTTTCTGCTGGAG
GCATAGTAGTCAACGACACAGCTGTTCATTTTACACTTCCCACATTGCCATTTGGAGGAG
TCGGTGAAAGTGGAATTGGTTCTTACCATGGTAAATTCTCATTTGATGCATTCAGTCGCA
AAAAATCTGTTCTCTTCAAAAGCTTTTTAGGTGATTCAGCCATCAGGTATCCACCATACT
CTAGACGAAAGCTTGGACTGTTAAAGACACTTGTCAACAGCAATCTAGTGGACACATTCA
AAGTCCTTTTAGGTTTATCCTAAAAGGATGATGACAATGGGTTATACATCCCCTTGTATC
TTACTTTCTTCGGATATGAACTTTGGTTGTTAAAGATATATGTGTGTTGATGAATAAGAG
ATTTGAGATTTGTTGTGG

QA 1 558 1 558
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL7793Contig1 648 2 1 U
GGGCAACCACAGAATCATGAATCTTAACTTCTTCTCTAGTTCTCTCTTCTTGTTTCTACT
ACTCTCAGTATTTTCGAGCTTCATCTCAGATAGTGCATTCATCAAATCTGAAACTTTGGC
TAATGGAAGAAATCTGCTTCAGAAGAAGAAAGCATGTCCAGTGAACTTTGAGTTTATGAA
CTACACAATCATAACAAGCCAATGCAAGGGTCCCAAATACCCACCCAAGAAGTGTTGCAC
CGCATTCAAGGAATTTGCATGTCCTTACGCTGATGAGCTGAACGACTTGAGCAATGATTG
CGCAACCACTATGTTCAGCTACATCAACCTATACGGTAAATACCCACCGGGACTGTTCGC
AAACCGATGCCAAGGTAAAGGAGGTCTCAAGTGCCCCGGTCAAATATGAATTTCTACTCT
AGTTTAACAGGGTGGTCATAGCCTTCCTATCTTCAATAATGTTCTTATTATAATCAACTT
TATCAATAATTGTAGTCAAAATAAATTGTGGAGGAGGCTCCATTGCATCACATGGTCTTA
GCCTTCATATTTTCAATTCATAATATGGTCCTAGCCTTTCATATTTTCAGTTAATAATAT
GTATCTTAACATGATGAATATTAAGAAGCTATAAAAGTGCTCTTATGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RR2GG86TF U 1
AF RR2H875TF U 1
BS 1 648 RR2GG86TF

RD RR2GG86TF 648 0 0
GGGCAACCACAGAATCATGAATCTTAACTTCTTCTCTAGTTCTCTCTTCTTGTTTCTACT
ACTCTCAGTATTTTCGAGCTTCATCTCAGATAGTGCATTCATCAAATCTGAAACTTTGGC
TAATGGAAGAAATCTGCTTCAGAAGAAGAAAGCATGTCCAGTGAACTTTGAGTTTATGAA
CTACACAATCATAACAAGCCAATGCAAGGGTCCCAAATACCCACCCAAGAAGTGTTGCAC
CGCATTCAAGGAATTTGCATGTCCTTACGCTGATGAGCTGAACGACTTGAGCAATGATTG
CGCAACCACTATGTTCAGCTACATCAACCTATACGGTAAATACCCACCGGGACTGTTCGC
AAACCGATGCCAAGGTAAAGGAGGTCTCAAGTGCCCCGGTCAAATATGAATTTCTACTCT
AGTTTAACAGGGTGGTCATAGCCTTCCTATCTTCAATAATGTTCTTATTATAATCAACTT
TATCAATAATTGTAGTCAAAATAAATTGTGGAGGAGGCTCCATTGCATCACATGGTCTTA
GCCTTCATATTTTCAATTCATAATATGGTCCTAGCCTTTCATATTTTCAGTTAATAATAT
GTATCTTAACATGATGAATATTAAGAAGCTATAAAAGTGCTCTTATGT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RR2H875TF 647 0 0
GGGCAACCACAGAATCATGAATCTTAACTTCTTCTCTAGTTCTCTCTTCTTGTTTCTACT
ACTCTCAGTATTTTCGAGCTTCATCTCAGATAGTGCATTCATCAAATCTGAAACTTTGGC
TAATGGAAGAAATCTGCTTCAGAAGAAGAAAGCATGTCCAGTGAACTTTGAGTTTATGAA
CTACACAATCATAACAAGCCAATGCAAGGGTCCCAAATACCCACCCAAGAAGTGTTGCAC
CGCATTCAAGGAATTTGCATGTCCTTACGCTGATGAGCTGAACGACTTGAGCAATGATTG
CGCAACCACTATGTTCAGCTACATCAACCTATACGGTAAATACCCACCGGGACTGTTCGC
AAACCGATGCCAAGGTAAAGGAGGTCTCAAGTGCCCCGGTCAAATATGAATTTCTACTCT
AGTTTAACAGGGTGGTCATAGCCTTCCTATCTTCAATAATGTTCTTATTATAATCAACTT
TATCAATAATTGTAGTCAAAATAAATTGTGGAGGAGGCTCCATTGCATCACATGGTCTTA
GCCTTCATATTTTCAATTCATAATATGGTCCTAGCCTTTCATATTTTCAGTTAATAATAT
GTATCTTAACATGATGAATATTAAGAAGCTATAAAAGTGCTCTTATG

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL7794Contig1 765 2 3 U
GGGAAATATATGTCCCCATCTCCCTCTGTATTTCAACAATCTTTCTCTCTCTCTCTCGCC
CTTTACAATCAAGACAAGATAGAAAAATTGATCCACAAACAGTCATCTAAAATGAAGAGA
TCAGTTGCACAACTGGTGATTTTGTGTCTGATGGTATCATGTACCAATGGAGAAACCAAG
GCTGTTAGAAGCAACTCCGATGGATCAGAAGCTTGGGGATACGTCGAAGTTAGACCAAAA
GCACACATGTTTTGGTGGCATTACAAAAGTCCGTATAGAGTTGAAGATCCTTCTAAGCCA
TGGCCTATTATCCTCTGGCTCCAAGGTGGACCTGGAGCTTCAGGAGTCGGAATAGGGAAT
TTTCAGGAGGTTGGTCCATTAGATACATTTCTCAAGCCCAGAAATTCTACTTGGTTGAAG
AAAGCTGATCTCTTGTTTGTGGATAGTCCAGTTGGGGCAGGGTACAGTTTCGTAGAAGAG
AAGGAATTGTATGTGAAAAGTGATGAAGAAGCAGCAAAGGACTTGACCACACTCTTGCAA
CAACTCTTCAACAAAAATCAGATGCTGAACCAAAGCCCCCTATACATTGTTGCTGAATCT
TATGGAGGTAAAATAGCGGTTAAGCTCGGTTTATCCGTTATCAATGCGGTTCAATCTGGC
AAACTGAAGCTCATCTTGGAGGGGTGGTTTTGGGAGATAGTTGGATATCCCCTGAAGACT
TTGTGTTTTCATGGGGACTCTTCTCACTATGTGTCAAGACTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C234TF U 291
AF RR2C707TF U 1
BS 1 563 RR2C707TF
BS 564 564 RR2C234TF
BS 565 765 RR2C707TF

RD RR2C234TF 387 0 0
TTCTAAGCCATGGCCTATTATCCTCTGGCTCCAAGGTGGACCTGGAGCTTCAGGAGTCGG
AATAGGGAATTTTCAGGAGGTTGGTCCATTAGATACATTTCTCAAGCCCAGAAATTCTAC
TTGGTTGAAGAAAGCTGATCTCTTGTTTGTGGATAGTCCAGTTGGGGCAGGGTACAGTTT
CGTAGAAGAGAAGGAATTGTATGTGAAAAGTGATGAAGAAGCAGCAAAGGACTTGACCAC
ACTCTTGCAACACCTCTTCAACAAAAATCAGATGCTGAACCAAAGCCCTCTATACATTGT
TGCTGAATCTTATGGAGGTAAAATCGCGGTTAAGCTCGGTTTGTCCGTTGTCAATGCGGT
TCAATCTGGCAAACTGA*GCTCATCTT

QA 1 387 1 387
DS 

RD RR2C707TF 765 0 0
GGGAAATATATGTCCCCATCTCCCTCTGTATTTCAACAATCTTTCTCTCTCTCTCTCGCC
CTTTACAATCAAGACAAGATAGAAAAATTGATCCACAAACAGTCATCTAAAATGAAGAGA
TCAGTTGCACAACTGGTGATTTTGTGTCTGATGGTATCATGTACCAATGGAGAAACCAAG
GCTGTTAGAAGCAACTCCGATGGATCAGAAGCTTGGGGATACGTCGAAGTTAGACCAAAA
GCACACATGTTTTGGTGGCATTACAAAAGTCCGTATAGAGTTGAAGATCCTTCTAAGCCA
TGGCCTATTATCCTCTGGCTCCAAGGTGGACCTGGAGCTTCAGGAGTCGGAATAGGGAAT
TTTCAGGAGGTTGGTCCATTAGATACATTTCTCAAGCCCAGAAATTCTACTTGGTTGAAG
AAAGCTGATCTCTTGTTTGTGGATAGTCCAGTTGGGGCAGGGTACAGTTTCGTAGAAGAG
AAGGAATTGTATGTGAAAAGTGATGAAGAAGCAGCAAAGGACTTGACCACACTCTTGCAA
CAACTCTTCAACAAAAATCAGATTCTGAACCAAAGCCCCCTATACATTGTTGCTGAATCT
TATGGAGGTAAAATAGCGGTTAAGCTCGGTTTATCCGTTATCAATGCGGTTCAATCTGGC
AAACTGAAGCTCATCTTGGAGGGGTGGTTTTGGGAGATAGTTGGATATCCCCTGAAGACT
TTGTGTTTTCATGGGGACTCTTCTCACTATGTGTCAAGACTTGAT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL7795Contig1 484 2 2 U
GTATCCGCAAATTGTTTTCATCCGCTGTTCCCAAGGTTTTAAGTTGTTACAAAAACTTCC
GAGAGGCAGGCAAAAGTAACCGGTAATGTTCCGGCAAAAAAACACACCGAAGTGGTTTTC
AAGGAGTGGCTCTAACTGTTGAGGGAAGACAGCATCCCTCCTCCAGCTGAGCTAGACAGC
ACCACTTCCCAACCCGGACCCTTCACTGGAAAAGCTTCCTGTGCTTCTGCCTCGCCCGGT
AAAGTAATCATTAGGTCACTCCTGTCAAGCACACGGTCAAGATCCTCCTCACTTATATCG
GTTTGTATCAGCTTATCTTCAGCAGTTTCGTCGTCTTTAAGCAACGCCAGTATGTCATCT
TCCTCTAGTGGCGTTGAAGACTTCGCACGCTCTTGATGAAACTGCCCTTTGCCAATAACC
ACATGTTCCAGCTTAAGCTTACTGTAAGCTCGTTTCAGTACTCGGCCCTCTATTGACTGA
GCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RR2FN90TF C 1
AF RR2FN90JQ U 45
BS 1 44 RR2FN90TF
BS 45 484 RR2FN90JQ

RD RR2FN90TF 484 0 0
GTATCCGCAAATTGTTTTCATCCGCTGTTCCCAAGGTTTTAAGTTGTTACAAAAACTTCC
GAGAGGCAGGCAAAAGTAACCGGTAATGTTCCGGCAAAAAAACACACCGAAGTGGTTTTC
AAGGAGTGGCTCTAACTGTTGAGGGAAGACAGCATCCCTCCTCCAGCTGAGCTAGACAGC
ACCACTTCCCAACCCGGACCCTTCACTGGAAAAGCTTCCTGTGCTTCTGCCTCGCCCGGT
AAAGTAATCATTAGGTCACTCCTGTCAAGCACACGGTCAAGATCCTCCTCACTTATATCG
GTTTGTATCAGCTTATCTTCAGCAGTTTCGTCGTCTTTAAGCAACGCCAGTATGTCATCT
TCCTCTAGTGGCGTTGAAGACTTCGCACGCTCTTGATGAAACTGCCCTTTGCCAATAACC
ACATGTTCCAGCTTAAGCTTACTGTAAGCTCGTTTCAGTACTCGGCCCTCTATTGACTGA
GCCC

QA 1 484 1 484
DS 

RD RR2FN90JQ 440 0 0
TGTTACAAAAACTTCCGAGAGGCAGGCAAAAGTAACCGGTAATGTTCCGGCAAAAAAACA
CACCGAAGTGGTTTTCAAGGAGTGGCTCTAACTGTTGAGGGAAGACAGCATCCCTCCTCC
AGCTGAGCTAGACAGCACCACTTCCCAACCCGGACCCTTCACTGGAAAAGCTTCCTGTGC
TTCTGCCTCGCCCGGTAAAGTAATCATTAGGTCACTCCTGTCAAGCACACGGTCAAGATC
CTCCTCACTTATATCGGTTTGTATCAGCTTATCTTCAGCAGTTTCGTCGTCTTTAAGCAA
CGCCAGTATGTCATCTTCCTCTAGTGGCGTTGAAGACTTCGCACGCTCTTGATGAAACTG
CCCTTTGCCAATAACCACATGTTCCAGCTTAAGCTTACTGTAAGCTCGTTTCAGTACTCG
GCCCTCTATTGACTGAGCCC

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 2

CO CL7796Contig1 675 2 3 U
TTTGGCAAAAAGATTGCGTGTATAAAAAAATAAAGCACACAAACATTTTCTAAACTTTTA
TAGCTAACTAATAAGTCATTTGATAAGCATTTTACTGCAAAAGTATTGAACAATAGGCAC
TAAAACAACATAGTGTTCCTCTAGTTACTTTTTATGGCTTTTGAGGCACTACATTGCTCT
TGAATCTCGTCATGGTACTCTTCTTCATCGTCTTCACAGCTGTCAACAATGTCATGCTCG
AAATATTCTTCATAGAACTGTTCCTCTGTGTCTTTATGCTGACCGTTTTGATCCTTCTCG
AGCAATTCTTTGGACTCTTGTCGTATTAACTTCTCTTGGATTCGGTCTCTGATGGCAGTT
CCCATCTTATGGCAGCCTTCTTCAAACATTTCAAGGAATCCAGCTACCCAACGATCTGCA
TTCTCCACCCACTCATTACGTACCATTTTCACAGTTTGCATCTTTTCCCCAACTTTTTCT
TGTTGTTCTTTGACCTTCTCCTGAAGTTTCTTCAGCCTCATATTAACTCGAAGTCTCTTT
TCTTTGACAAAGCTAACTCCAAGATCCTCCCTTGAGTATCCCCTGTCAAGGTTACGCATG
ACATACTGGTTATAATCTTTCACTATCCTCATTATTATATCCGAAGTAGATATCCCTTCA
GTTCTCTTAGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2CO87TF C 1
AF RR2CO87JQ U 19
BS 1 18 RR2CO87TF
BS 19 674 RR2CO87JQ
BS 675 675 RR2CO87TF

RD RR2CO87TF 675 0 0
TTTGGCAAAAAGATTGCGTGTATAAGAAAATAAAGCACACAAACATTTTCTAAACTTT*A
TAGCTAACTAATAAGTCATTTGATAAGCATTTTACTGCAAAAGTATTGAACAATAGGCAC
TAAAACAACATAGTGTTCCTCTAGTTACTTTTTATGGCTTTTGAGGCACTACATTGCTCT
TGAATCTCGTCATGGTACTCTTCTTCATCGTCTTCACAGCTGTCAACAATGTCATGCTCG
AAATATTCTTCATAGAACTGTTCCTCTGTGTCTTTATGCTGACCGTTTTGATCCTTCTCG
AGCAATTCTTTGGACTCTTGTCGTATTAACTTCTCTTGGATTCGGTCTCTGATGGCAGTT
CCCATCTTATGGCAGCCTTCTTCAAACATTTCAAGGAATCCAGCTACCCAACGATCTGCA
TTCTCCACCCACTCATTACGTACCATTTTCACAGTTTGCATCTTTTCCCCAACTTTTTCT
TGTTGTTCTTTGACCTTCTCCTGAAGTTTCTTCAGCCTCATATTAACTCGAAGTCTCTTT
TCTTTGACAAAGCTAACTCCAAGATCCTCCCTTGAGTATCCCCTGTCAAGGTTACGCATG
ACATACTGGTTATAATCTTTCACTATCCTCATTATTATATCCGAAGTAGATATCCCTTCA
GTTCTCTTAGTCTCC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RR2CO87JQ 656 0 0
TGTATAAAAAAATAAAGCACACAAACATTTTCTAAACTTTTATAGCTAACTAATAAGTCA
TTTGATAAGCATTTTACTGCAAAAGTATTGAACAATAGGCACTAAAACAACATAGTGTTC
CTCTAGTTACTTTTTATGGCTTTTGAGGCACTACATTGCTCTTGAATCTCGTCATGGTAC
TCTTCTTCATCGTCTTCACAGCTGTCAACAATGTCATGCTCGAAATATTCTTCATAGAAC
TGTTCCTCTGTGTCTTTATGCTGACCGTTTTGATCCTTCTCGAGCAATTCTTTGGACTCT
TGTCGTATTAACTTCTCTTGGATTCGGTCTCTGATGGCAGTTCCCATCTTATGGCAGCCT
TCTTCAAACATTTCAAGGAATCCAGCTACCCAACGATCTGCATTCTCCACCCACTCATTA
CGTACCATTTTCACAGTTTGCATCTTTTCCCCAACTTTTTCTTGTTGTTCTTTGACCTTC
TCCTGAAGTTTCTTCAGCCTCATATTAACTCGAAGTCTCTTTTCTTTGACAAAGCTAACT
CCAAGATCCTCCCTTGAGTATCCCCTGTCAAGGTTACGCATGACATACTGGTTATAATCT
TTCACTATCCTCATTATTATATCCGAAGTAGATATCCCTTCAGTTCTCTTAGTCTC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL7797Contig1 1204 2 2 U
GTGCTCAAACGTTTAGAGTCATCATCTGCCATCTGCAATATCTGTAATGATCCACCAGAA
AACCCTGTTATTTCGCTCTGTGGCCATGTATTTTTCTATCAGTGTGTTTCAGAACACATC
AATGGAGATGAGAACGTGTGCCCTGTAAGGAGATGCAGAGAAGACTTTGGGCGTGATGTT
GTGTTCTCTAAATCTGCCCTTAGAAATTCTACCACTAATGATTCAGGCTCTAGTTCTTCA
CAGAACAAATCATTTTCTCAAAAAAGCGAGTTTAGTTCATCAAAAATCCAAGCAGTCCTA
GATATTCTGCAGTCGCTCTCCAAACAAGGCAGACGAAACTCAGCACAGCATGGTCGAAGC
CCTTCTTCCTCACAGCCACATGAAGATGATGACGATGTAACCATTGTAGAGCCAACGACT
CTTCACTCGTCTTCACCTAGCCAGGGGCCAATAAAGACAATAGTGTTCTCTCAGTGGACC
GGTATGCTTGACTTGGTTGAGGCGAGTTTTGTTGAAAATGGTATAGTATTCAGAAGATTA
GATGGTGCAATGAGTCTTGCAGCAAGAGACAGGGCTGTAAAAGAATTCAGCAAAGTTCCA
CGTGTAGAGGTGATGCTGATGTCGCTAAAAGCTGGAAACCTTGGGTTGAACATGGTAGCT
GCATGTCATGTTATACTTTTGGATCTTTGGTGGAATCCAACAACCGAGGATCAAGCTGTT
GACCGTGCACATCGTATTGGACAAACTCGGCCTGTTAGTGTAACTCGTGTTACTATAAAA
GATACCATTGAGGATAAAATTTTGTCTCTTCAGGAAGATAAAAGGAAAATGGTTGCATCT
GCGTTCGGTGAAGAACATGGTGGAAGCTTTGCGGCTCGACTGACAGTAGATGATCTCAAA
TATCTTTTTATGACGTAGACCAACTGGTTCTTTGCGCCACCTGTAGCCTTATAATGGCTA
CTTGAATTAGGTTGCATAGTACTATTAATATTGGAGATTATCCCCAGCGTTTTTGTTTTT
GATCAAGAAGAAACCTTTAAGCTGCTTTTGTAACTGAAACTTCAATGCTGTGGCTCTCCT
TAGGATTTCGTGTTTTGGGTTTTGTGAGGCCTGTGTCTCGAAGGTGCGTTGACTGGAAGC
ATATGCCATTATGTAAATAACTAAATCGTTTCATGGTATATATACCTCGTAGAAGTTTAA
CGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2AC18TF U 1
AF RR2AC18JQ C 373
BS 1 771 RR2AC18TF
BS 772 1204 RR2AC18JQ

RD RR2AC18TF 771 0 0
GTGCTCAAACGTTTAGAGTCATCATCTGCCATCTGCAATATCTGTAATGATCCACCAGAA
AACCCTGTTATTTCGCTCTGTGGCCATGTATTTTTCTATCAGTGTGTTTCAGAACACATC
AATGGAGATGAGAACGTGTGCCCTGTAAGGAGATGCAGAGAAGACTTTGGGCGTGATGTT
GTGTTCTCTAAATCTGCCCTTAGAAATTCTACCACTAATGATTCAGGCTCTAGTTCTTCA
CAGAACAAATCATTTTCTCAAAAAAGCGAGTTTAGTTCATCAAAAATCCAAGCAGTCCTA
GATATTCTGCAGTCGCTCTCCAAACAAGGCAGACGAAACTCAGCACAGCATGGTCGAAGC
CCTTCTTCCTCACAGCCACATGAAGATGATGACGATGTAACCATTGTAGAGCCAACGACT
CTTCACTCGTCTTCACCTAGCCAGGGGCCAATAAAGACAATAGTGTTCTCTCAGTGGACC
GGTATGCTTGACTTGGTTGAGGCGAGTTTTGTTGAAAATGGTATAGTATTCAGAAGATTA
GATGGTGCAATGAGTCTTGCAGCAAGAGACAGGGCTGTAAAAGAATTCAGCAAAGTTCCA
CGTGTAGAGGTGATGCTGATGTCGCTAAAAGCTGGAAACCTTGGGTTGAACATGGTAGCT
GCATGTCATGTTATACTTTTGGATCTTTGGTGGAATCCAACAACCGAGGATCAAGCTGTT
GACCGTGCACATCGTATTGGACAAACTCGGCCTGTTAGTGTAACTCGTGTT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2AC18JQ 832 0 0
CAGCCACATGAAGATGATGACGATGTAACCATTGTAGAGCCAACGACTCTTCACTCGTCT
TCACCTAGCCAGGGGCCAATAAAGACAATAGTGTTCTCTCAGTGGACCGGTATGCTTGAC
TTGGTTGAGGCGAGTTTTGTTGAAAATGGTATAGTATTCAGAAGATTAGATGGTGCAATG
AGTCTTGCAGCAAGAGACAGGGCTGTAAAAGAATTCAGCAAAGTTCCACGTGTAGAGGTG
ATGCTGATGTCGCTAAAAGCTGGAAACCTTGGGTTGAACATGGTAGCTGCATGTCATGTT
ATACTTTTGGATCTTTGGTGGAATCCAACAACCGAGGATCAAGCTGTTGACCGTGCACAT
CGTATTGGACAAACTCGGCCTGTTAGTGTAACTCGTGTTACTATAAAAGATACCATTGAG
GATAAAATTTTGTCTCTTCAGGAAGATAAAAGGAAAATGGTTGCATCTGCGTTCGGTGAA
GAACATGGTGGAAGCTTTGCGGCTCGACTGACAGTAGATGATCTCAAATATCTTTTTATG
ACGTAGACCAACTGGTTCTTTGCGCCACCTGTAGCCTTATAATGGCTACTTGAATTAGGT
TGCATAGTACTATTAATATTGGAGATTATCCCCAGCGTTTTTGTTTTTGATCAAGAAGAA
ACCTTTAAGCTGCTTTTGTAACTGAAACTTCAATGCTGTGGCTCTCCTTAGGATTTCGTG
TTTTGGGTTTTGTGAGGCCTGTGTCTCGAAGGTGCGTTGACTGGAAGCATATGCCATTAT
GTAAATAACTAAATCGTTTCATGGTATATATACCTCGTAGAAGTTTAACGGG

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 2

CO CL7798Contig1 1058 2 4 U
GGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCA
CGCGCGCTACACTGATGTATTCAACGAGTTCACACCTTGGCCGACAGGCCCGGGTAATCT
TTGAAATTTCATCGTGATGGGGATAGATCATTGCAATTGTTGATCTTCATTTTTCTGGTC
AAATTCTGAAAACGCGTTTAACAATGGATGATCACAATAATGATAATCATAATCATCATC
ATCTAGGTGTGAATAAGATGGGGAAAAACATCCGTAAAGAGCCATTAAATCAGCAAAATC
AACAACAAAATCCTCAAGCTTTGGTTTATAACATCAACAAGACCGATTTCAGATCCATTG
TTCAACAGTTAACCGGCCTAGGCTCAGCTTCTTCTGTCAATCCTCCACAATCAACAAACT
CAAACCCACCAAAACCTCCAAATTCACGGTTGGTCAAAGTTAGACCAGCTCCTTTGACTC
AAGTCAACCGCCCTCCACCGCCACCTCCAATTCAATCGAATCCAATGGCCTCTGAACCGG
TTCAGCCTGTTAATCAATTATCAATCAACCCGGCCGAATCTCCAATCTCGGCTTATATGC
GTTACCTAATCGAATCAAGCCCTGTCGGAAACCAACCTCAACCACACAACCAAAACCCGG
TTCAGCCATCAACTGGTTTGTTTCCTTCACAACAAACCGGTCCTAATTCGATGTTATTCC
AGTCTCCAGCTTCGCAGTTTGTTTTGTCGCCGCAGCCTAGATCGCCGTTTCCACTATTAT
CACCCAATTTCGCGTTTTCACCGCGGTTTTTAGGCGGTAACGAGTCTCTACCTCCGCCGT
CACCAGGCTTTTTCTTCCCGTTGCTCAGTCCGTTGTGGAAAAATCAATAGCCTAAGTAGT
GTGTATTAATAGTCTTTTAATCAATGTATAAACTTGTAAGCATAATGTACGTATGTAACA
TTGTAATAGGAAGACAATTGCTTATTTCTATTTAAGTATTGGAGTGCTGATTTGGATTTA
ATATTTGAAATTCAACAATTTATATGTTGTTTTGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD08TF U 1
AF RR2EI18JQ C 277
BS 1 714 RR2GD08TF
BS 715 715 RR2EI18JQ
BS 716 725 RR2GD08TF
BS 726 1058 RR2EI18JQ

RD RR2GD08TF 725 0 0
GGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCA
CGCGCGCTACACTGATGTATTCAACGAGTTCACACCTTGGCCGACAGGCCCGGGTAATCT
TTGAAATTTCATCGTGATGGGGATAGATCATTGCAATTGTTGATCTTCATTTTTCTGGTC
AAATTCTGAAAACGCGTTTAACAATGGATGATCACAATAATGATAATCATAATCATCATC
ATCTAGGTGTGAATAAGATGGGGAAAAACATCCGTAAAGAGCCATTAAATCAGCAAAATC
AACAACAAAATCCTCAAGCTTTGGTTTATAACATCAACAAGACCGATTTCAGATCCATTG
TTCAACAGTTAACCGGCCTAGGCTCAGCTTCTTCTGTCAATCCTCCACAATCAACAAACT
CAAACCCACCAAAACCTCCAAATTCACGGTTGGTCAAAGTTAGACCAGCTCCTTTGACTC
AAGTCAACCGCCCTCCACCGCCACCTCCAATTCAATCGAATCCAATGGCCTCTGAACCGG
TTCAGCCTGTTAATCAATTATCAATCAACCCGGCCGAATCTCCAATCTCGGCTTATATGC
GTTACCTAATCGAATCAAGCCCTGTCGGAAACCAACCTCAACCACACAACCAAAACCCGG
TTCAGCCATCAACTGGTTTGTTTCCTTCACAACAAACCGGTCCTAATTCGATGT*ATTCC
AGTCT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RR2EI18JQ 782 0 0
AAGAGCCATTAAATCAGCAAAATCAACAACAAAATCCTCAAGCTTTGGTTTATAACATCA
A***GACCGATTTCAGATCCATTGTTCAACAGTTAACCGGCCTAGGCTCAGCTTCTTCTG
TCAATCCTCCACAATCAACAAACTCAAACCCACCAAAACCTCCAAATTCACGGTTGGTCA
AAGTTAGACCAGCTCCTTTGACTCAAGTCAACCGCCCTCTACCGCCACCTCCAATTCAAT
CGAATCCAATGGCCTCTGAACCGGTTCAGCCTGTTAATCAATTATCAATCAACCCGGCCG
AATCTCCAATCTCGGCTTATATGCGTTACCTAATCGAATCAAGCCCTGTCGGAAACCAAC
CTCAACCACACAACCAAAACCCGGTTCAGCCATCAACTGGTTTGTTTCCTTCACAACAAA
CCGGTCCTAATTCGATGTTATTCCAGTCTCCAGCTTCGCAGTTTGTTTTGTCGCCGCAGC
CTAGATCGCCGTTTCCACTATTATCACCCAATTTCGCGTTTTCACCGCGGTTTTTAGGCG
GTAACGAGTCTCTACCTCCGCCGTCACCAGGCTTTTTCTTCCCGTTGCTCAGTCCGTTGT
GGAAAAATCAATAGCCTAAGTAGTGTGTATTAATAGTCTTTTAATCAATGTATAAACTTG
TAAGCATAATGTACGTATGTAACATTGTAATAGGAAGACAATTGCTTATTTCTATTTAAG
TATTGGAGTGCTGATTTGGATTTAATATTTGAAATTCAACAATTTATATGTTGTTTTGTC
TT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL7799Contig1 729 2 3 U
TTTTTTTTGGTTTAAAGAATGCTAATATTGCTTCACGTGAGACGGATGAAACTTTACAGC
TTTCACCAGACACCAATTGCATAAAAGATTTTAAAAACATCACACTGTCCTGGGTACTAA
ATTTACTATAATAACTTTTACGTGACCAAGTAAATGGGAGAAGAAGAGATAGAAATCCTC
TGCTGCTGCTCCATGTTAAGCTCTCGTAGACTCAAATACTGGAACGCCACGTCACCTTTC
CTTCCCGGCGTCATTGTTCCCGCTATAGGTCCCGACGAAGATCTACTCGTCGTCGTCGTA
CGGTACGGCGTGTTCGACCCGGTTCGACTCTCAATTGAGTAAACCGGACTCGACATCGAC
ATCGAACCGGTTACGGCGCGAAAGTTCCTGACCCTACGATCTTCGCCGACGGCCACGGTG
GTAGAGATTGGCCATTTACACCACTTGAAAAAGGGTAAAGCTCTCTTCCACCACCACCGC
TTCCTCCTCTTGTTGCTGTGGTGCATTGTGGACCGGGTCGGGTCATCTTTCGAAATGGGT
TTCTGGATCTTGAAGTGAAGACTGTTGATGATGGATGACTTCGTTGATGTTTCTCTTTTA
TGCTTCCTCGCTTCTTCCATAACCTGAAAGTAGTTAAAGCCATAGTCGCTGAAGTGTTGA
GAGTCAGGGATGGGGAAAACAGGGGAACGGTTCGACATTCTTCTTCTTCAGTAGGTCGTT
TGAGCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FO03JQ U 23
AF RR2FO03TF C 1
BS 1 22 RR2FO03TF
BS 23 663 RR2FO03JQ
BS 664 729 RR2FO03TF

RD RR2FO03JQ 641 0 0
TAATATTGCTTCACGTGAGACGGATGAAACTTTACAGCTTTCACCAGACACCAATTGCAT
AAAAGATTTTAAAAACATCACACTGTCCTGGGTACTAAATTTACTATAATAACTTTTACG
TGACCAAGTAAATGGGAGAAGAAGAGATAGAAATCCTCTGCTGCTGCTCCATGTTAAGCT
CTCGTAGACTCAAATACTGGAACGCCACGTCACCTTTCCTTCCCGGCGTCATTGTTCCCG
CTATAGGTCCCGACGAAGATCTACTCGTCGTCGTCGTACGGTACGGCGTGTTCGACCCGG
TTCGACTCTCAATTGAGTAAACCGGACTCGACATCGACATCGAACCGGTTACGGCGCGAA
AGTTCCTGACCCTACGATCTTCGCCGACGGCCACGGTGGTAGAGATTGGCCATTTACACC
ACTTGAAAAAGGGTAAAGCTCTCTTCCACCACCACCGCTTCCTCCTCTTGTTGCTGTGGT
GCATTGTGGACCGGGTCGGGTCATCTTTCGAAATGGGTTTCTGGATCTTGAAGTGAAGAC
TGTTGATGATGGATGACTTCGTTGATGTTTCTCTTTTATGCTTCCTCGCTTCTTCCATAA
CCTGAAAGTAGTTAAAGCCATAGTCGCTGAAGTGTTGAGAG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RR2FO03TF 729 0 0
TTTTTTTTGGTTTAAAGAATGCTAATATTGCTTCACGTGAGACGGATGAAACTTTACAGC
TTTCACCAGACACCAATTGCATAAAAGATTTTAAAAACATCACACTGTCCTGGGTACTAA
ATTTACTATAATAACTTTTACGTGACCAAGTAAATGGGAGAAGAAGAGATAGAAATCCTC
TGCTGCTGCTCCATGTTAAGCTCTCGTAGACTCAAATACTGGAACGCCACGTCACCTTTC
CTTCCCGGCGTCATTGTTCCCGCTATAGGTCCCGACGAAGATCTACTCGTCGTCGTCGTA
CGGTACGGCGTGTTCGACCCGGTTCGACTCTCAATTGAGTAAACCGGACTCGACATCGAC
ATCGAACCGGTTACGGCGCGAAAGTTCCTGACCCTACGATCTTCGCCGACGGCCACGGTG
GTAGAGATTGGCCATTTACACCACTTGAAAAAGGGTAAAGCTCTCTTCCACCACCACCGC
TTCCTCCTCTTGTTGCTGTGGTGCATTGTGGACCGGGTCGGGTCATCTTTCGAAATGGGT
TTCTGGATCTTGAAGTGAAGACTGTTGATGATGGATGACTTCGTTGATGTTTCTCTTTTA
TGCTTCCTCGCTTCTTCCATAACCTGAAAGTAGTTAAAGCCATAGTCGCTGAAGTGTTGA
GAGTCAGGGATGGGGAAAACAGGGGAACGGTTCGACATTCTTCTTCTTCAGTAGGTCGTT
TGAGCTGTC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL7800Contig1 442 2 1 U
GGGAATAAAAATTCGTCTCCGTTAATCTAAACCTCTACAGAGAGAGTCTCAGGCTTGATA
CGATCTGTAACTATGGCAGCAGAGCAGAAGGCGGCGACTGAAGAAGTGAAGATGGATCTG
TTCGAGGACGACGATGAGTTCGAGGAGTTTGAAATCAACGAAGATTGGGTTGAGAAAGAG
GAAGTGAAGGAAGTTGGACAGCAGTGGGAAGATGACTGGGACGATGATGATGTGAATGAC
GATTCTCGCTTCAGTTAAGGAAGGAGCTTGAGACTAGCTCTGCTGATAAGAAGTGAATGA
GCAGCAGCTCTCAAGATTAAAGATTGTATTTGAATTTGCATCCCTCTGTTTTTTATTATT
GTTGCTTCTACTTTACCCTTTGCAGATTTTACTCTTGGATGCAATATTCCCCATCTTTTA
AGATGATAAAATCTTTAACCGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FU56JQ C 1
AF RR2FU56TF U 1
BS 1 442 RR2FU56TF

RD RR2FU56JQ 442 0 0
GGGAATAAAAATTCGTCTCCGTTAATCTAAACCTCTACAGAGAGAGTTTCAGGCTTGATA
CGATCTGTAACTATGGCAGCAGAGCAGAAGGCGGCGACTGAAGAAGTGAAGATGGATCTG
TTCGAGGACGACGATGAGTTCGAGGAGTTTGAAATCAACGAAGATTGGGTTGAGAAAGAG
GAAGTGAAGGAAGTTGGACAGCAGTGGGAAGATGACTGGGACGATGATGATGTGAATGAC
GATTCTCGCTTCAGTTAAGGAAGGAGCTTGAGACTAGCTCTGCTGATAAGAAGTGAATGA
GCAGCAGCTCTCAAGATTAAAGATTGTATTTGAATTTGCATCCCTCTGTTTTTTATTATT
GTTGCTTCTACTTTACCCTTTGCAGATTTTACTCTTGGATGCAATATTCCCCATCTTTTA
AGATGATAAAATCTTTAACCGC

QA 1 442 1 442
DS 

RD RR2FU56TF 442 0 0
GGGAATAAAAATTCGTCTCCGTTAATCTAAACCTCTACAGAGAGAGTCTCAGGCTTGATA
CGATCTGTAACTATGGCAGCAGAGCAGAAGGCGGCGACTGAAGAAGTGAAGATGGATCTG
TTCGAGGACGACGATGAGTTCGAGGAGTTTGAAATCAACGAAGATTGGGTTGAGAAAGAG
GAAGTGAAGGAAGTTGGACAGCAGTGGGAAGATGACTGGGACGATGATGATGTGAATGAC
GATTCTCGCTTCAGTTAAGGAAGGAGCTTGAGACTAGCTCTGCTGATAAGAAGTGAATGA
GCAGCAGCTCTCAAGATTAAAGATTGTATTTGAATTTGCATCCCTCTGTTTTTTATTATT
GTTGCTTCTACTTTACCCTTTGCAGATTTTACTCTTGGATGCAATATTCCCCATCTTTTA
AGATGATAAAATCTTTAACCGC

QA 1 442 1 442
DS 



AS 1 2

CO CL7801Contig1 889 2 6 U
GGCTACATTTACTTAAAGGAATAAACAAACAATAACAATGAAATTTTCATATTCTCTATC
CAAACAATTTTTTATCCCTATTTTGGCCATACAATTCCTCATCATACATAGTGTTTTGTC
ACTAAACCTTACCAATGAGTATCTTAGCCACAAATGCCTTCTTAATCAAGGGAAATATAA
CTATGGAAGTCAGTACGAGGAAAACCTCATTTGGATCTTTCGTGAAATTCGTACAAGTCC
TTTTGCTATTACTGGTTTCTCACACATAAGTGTTGGAGAAACGGCAACCGATCTTGTTAT
TGTCACTACCCAATGTCGTGGGGACACTTATGAGTCTAAATGCCGTAAATGTATTGACAC
AGCAATTACAGGGTTTCGTGAGAGATGTCCGAGTAACAAAGGAGGAATAATATGGTACAA
TCAATGTCTTCTCTATATTAATACGATCAAAGAACAAATTCCAATCAAGATTAATTACAA
GAATATTATTTCTATGTGCAACCCAAATAACATGAGAGGGGAAGCAAAACTGTTCGCCAT
GAGGGTGATGGATTTTTTCTCTGAGCTAATACTTAAAGTCGAGAAAACCAACAAATATAG
ACCCATATATTACGCTGCGGGGGAAAGAAAGCTCGGTAAAAATACAATATATGCAATGGT
GCAATGTTTGGAACTAAGAACAGATTGTAAAGTTTGTTTGGCATGGAGTATCACAAAGCT
TTTCAAGAACGAAGACATTAAACAAGGAGGGAGAGTTTTGGGTACGGACTGTAATGTAAG
GTACGAGCTATATCCTTTTCTTAGGAGTTAAAGCATTTTTAAGTTATGTTTACTTCTTCT
TTTTTTTGATGAAATGTAATATCCATATATTAATAAAAGAGTGTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CE81TF U 1
AF RR2CE81JQ C 132
BS 1 641 RR2CE81TF
BS 642 642 RR2CE81JQ
BS 643 672 RR2CE81TF
BS 673 673 RR2CE81JQ
BS 674 694 RR2CE81TF
BS 695 889 RR2CE81JQ

RD RR2CE81TF 694 0 0
GGCTACATTTACTTAAAGGAATAAACAAACAATAACAATGAAATTTTCATATTCTCTATC
CAAACAATTTTTTATCCCTATTTTGGCCATACAATTCCTCATCATACATAGTGTTTTGTC
ACTAAACCTTACCAATGAGTATCTTAGCCACAAATGCCTTCTTAATCAAGGGAAATATAA
CTATGGAAGTCAGTACGAGGAAAACCTCATTTGGATCTTTCGTGAAATTCGTACAAGTCC
TTTTGCTATTACTGGTTTCTCACACATAAGTGTTGGAGAAACGGCAACCGATCTTGTTAT
TGTCACTACCCAATGTCGTGGGGACACTTATGAGTCTAAATGCCGTAAATGTATTGACAC
AGCAATTACAGGGTTTCGTGAGAGATGTCCGAGTAACAAAGGAGGAATAATATGGTACAA
TCAATGTCTTCTCTATATTAATACGATCAAAGAACAAATTCCAATCAAGATTAATTACAA
GAATATTATTTCTATGTGCAACCCAAATAACATGAGAGGGGAAGCAAAACTGTTCGCCAT
GAGGGTGATGGATTTTTTCTCTGAGCTAATACTTAAAGTCGAGAAAACCAACAAATATAG
ACCCATATATTACGCTGCGGGGGAAAGAAAGCTCGGTAAAA*TACAATATATGCAATGGT
GCAATGTTTGGA*CTAAGAACAGATTGTAAAGTT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2CE81JQ 758 0 0
CCAATGAGTATCTTAGCCACAAATGCCTTCTTAATCAAGGGAAATATAACTATGGAAGTC
AGTACGAGGAAAACCTCATTTGGATCTTTCGTGAAATTCGTACAAGTCCTTTTGCTATTA
CTGGTTTCTCACACATAAGTGTTGGAGAAACGGCAACCGATCTTGTTATTGTCACTACCC
AATGTCGTGGGGACACTTATGAGTCTAAATGCCGTAAATGTATTGACACAGCAATTACAG
GGTTTCGTGAGAGATGTCCGAGTAACAAAGGAGGAATAATATGGTACAATCAATGTCTTC
TCTATATTAATACGATCAAAGAACAAATTCCAATCAAGATTAATTACAAGAATATTATTT
CTATGTGCAACCCAAATAACATGAGAGGGGAAGCAAAACTGTTCGCCATGAGGGTGATGG
ATTTTTTCTCTGAGCTAATACTTAAAGTCGAGAAAACCAACAAATATAGACCCATATATT
ACGCTGCGGGGGAAAGAAAGCTCGGTAAAAATACAATATATGCAATGGTGCAATGTTTGG
AACTAAGAACAGATTGTAAAGTTTGTTTGGCATGGAGTATCACAAAGCTTTTCAAGAACG
AAGACATTAAACAAGGAGGGAGAGTTTTGGGTACGGACTGTAATGTAAGGTACGAGCTAT
ATCCTTTTCTTAGGAGTTAAAGCATTTTTAAGTTATGTTTACTTCTTCTTTTTTTTGATG
AAATGTAATATCCATATATTAATAAAAGAGTGTTTACC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL7802Contig1 1111 2 8 U
GCGATTTACGCCAGGCTTCAACAGTTCTTTGCAACCATTTTCACCAGGATGCAGGTTAAG
CCCTCTATGCAGCCAATAGTGGTGTCACTGCCCCTCTGTCATTTTGATGATACTGAATCA
GCCAAGGCATCAAGGCGGCAACTTAAGACTGCTATCCTAAATGTCTTGTTTGACATGAAT
GTTCCTGCAGTGTGCGCAGTTAATCAGGCTGTTTTAGCCCTATATGCTGCACGGCGGGCA
TCAGGAATTGTTGTTAACATTGGTTTCCAAGTCATAACCATTCTTCCAATTTTGCATGGC
AAGGTGATGCGCCAGATAGGTGTAGAAATCATTGGTTTTGGAGCGTTGAAACTCACGGGA
TTCCTTAAGGAGAAGATGCAAGAGAACAACATTACATTCCAATCGCTCTACACTGTTCGT
ACTTTAAAAGAGAACCTGTGTTATGTGGCGCTCGATTATAAAGCTGAACTTTCAAGGGAC
ACGCAAGCTTCAATGAAAATTGCGGGTGAAGGATGGTTTACTCTGTCAAAGGAGCGTTTT
CAGACAGGGGAGATATTATTCCAACCACGTCTTGCTGGACTACGTGCAATGAGTTTACAC
CAGGCAGTCTCGCTCTGTATGGACCATTGTGATGCAGCTGGAGTTACAGGTGAGGATAGC
TGGTTCAAGACTGTAGTATTGGCTGGAGGAAGCGCATGTTTGCCAGGACTTGCAGAAAGG
CTAGAGAAAGAACTGCACGACCACCTTCCTTCTTATATATGCAACGGAGTCAGAGTAATC
CCTCCTCCTTGCGGCGTGGACTCAGCATGGCATAGAGCAAAGCTTATCAGTAACTTAAGC
ACGTTTCCTGGTCCTTGGTGTATCACAAGGAAGCAGTTCCGTCGCAAATCAAGACTAATG
TGGTGAATCTTTCAGAAGTTTTCTTCTCTTCAAGACCGAGCTATTCTGTTAGTAAGAGAG
AGACAGTTAATAGTTGCCTGCAAATAGTTCCAAGGTACTTTACATGTCTGAATGTATAGT
TATAGTGTTCCAATATTGATTGTCCTCCACAGACATACAAAACCATTACGAAGAATTAAG
TTTGTTACATTTACTTATACATACTCTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ET74TF U 1
AF RR2ET74JQ C 368
BS 1 731 RR2ET74TF
BS 732 732 RR2ET74JQ
BS 733 743 RR2ET74TF
BS 744 744 RR2ET74JQ
BS 745 763 RR2ET74TF
BS 764 764 RR2ET74JQ
BS 765 774 RR2ET74TF
BS 775 1111 RR2ET74JQ

RD RR2ET74TF 774 0 0
GCGATTTACGCCAGGCTTCAACAGTTCTTTGCAACCATTTTCACCAGGATGCAGGTTAAG
CCCTCTATGCAGCCAATAGTGGTGTCACTGCCCCTCTGTCATTTTGATGATACTGAATCA
GCCAAGGCATCAAGGCGGCAACTTAAGACTGCTATCCTAAATGTCTTGTTTGACATGAAT
GTTCCTGCAGTGTGCGCAGTTAATCAGGCTGTTTTAGCCCTATATGCTGCACGGCGGGCA
TCAGGAATTGTTGTTAACATTGGTTTCCAAGTCATAACCATTCTTCCAATTTTGCATGGC
AAGGTGATGCGCCAGATAGGTGTAGAAATCATTGGTTTTGGAGCGTTGAAACTCACGGGA
TTCCTTAAGGAGAAGATGCAAGAGAACAACATTACATTCCAATCGCTCTACACTGTTCGT
ACTTTAAAAGAGAACCTGTGTTATGTGGCGCTCGATTATAAAGCTGAACTTTCAAGGGAC
ACGCAAGCTTCAATGAAAATTGCGGGTGAAGGATGGTTTACTCTGTCAAAGGAGCGTTTT
CAGACAGGGGAGATATTATTCCAACCACGTCTTGCTGGACTACGTGCAATGAGTTTACAC
CAGGCAGTCTCGCTCTGTATGGACCATTGTGATGCAGCTGGAGTTACAGGTGAGGATAGC
TGGTTCAAGACTGTAGTATTGGCTGGAGGAAGCGCATGTTTGCCAGGACTTGCAGAAAGG
CTAGAGAAAGA*CTGCACGACCATCTTCCTTCTTATATATGCA*CGGAGTCAGA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RR2ET74JQ 744 0 0
AGGAGAAGATGCAAGAGAACAACATTACATTCCAATCGCTCTACACTGTTCGTACTTTAA
AAGAGAACCTGTGTTATGTGGCGCTCGATTATAAAGCTGAACTTTCAAGGGACACGCAAG
CTTCAATGAAAATTGCGGGTGAAGGATGGTTTACTCTGTCAAAGGAGCGTTTTCAGACAG
GGGAGATATTATTCCAACCACGTCTTGCTGGACTACGTGCAATGAGTTTACACCAGGCAG
TCTCGCTCTGTATGGACCATTGTGATGCAGCTGGAGTTACAGGTGAGGATAGCTGGTTCA
AGACTGTAGTATTGGCTGGAGGAAGCGCATGTTTGCCAGGACTTGCAGAAAGGCTAGAGA
AAGAACTGCACGACCACCTTCCTTTTTATATATGCAACGGAGTCAGAGTAATCCCTCCTC
CTTGCGGCGTGGACTCAGCATGGCATAGAGCAAAGCTTATCAGTAACTTAAGCACGTTTC
CTGGTCCTTGGTGTATCACAAGGAAGCAGTTCCGTCGCAAATCAAGACTAATGTGGTGAA
TCTTTCAGAAGTTTTCTTCTCTTCAAGACCGAGCTATTCTGTTAGTAAGAGAGAGACAGT
TAATAGTTGCCTGCAAATAGTTCCAAGGTACTTTACATGTCTGAATGTATAGTTATAGTG
TTCCAATATTGATTGTCCTCCACAGACATACAAAACCATTACGAAGAATTAAGTTTGTTA
CATTTACTTATACATACTCTGTTC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL7803Contig1 839 2 2 U
GACGGTCACTGATGTTTGGTTCCTCCGACAAAAGTGGTTGATGTTTGGAACCGGTGAGAA
TCAAAGCGATGATCAAAACTTTGGGCGTGGCTTCTGCTCGCTTCTTCTTCTTCTCCAGAA
ACCCACCAACGACTCATAACATCCGCTTCTCTAAGCACTCCGTATTGGGTCGCCGGAACT
TCACTATAATGGCCAGTGGAAGCAGCGGCGGCGGAGAAGAGTTCGTAAAAGGAAACGTTT
ATCCAAATGGCGTCGCTGTCATCACTCTTGATCGACCTAAAGCTCTCAACGCCATGAATC
TAGAAATGGATTTGAAGTACAAAAGCTTGCTTGAAGAATGGGAATCTGATCCCAAAGTCA
AATGTGTGATCGTCGAAGGAAGCACTCCTCGAGCCTTTTGTGCAGGGATGGATATTAAAG
GAGTTGTTGCAGATATCTTAATGGACAAACAAACTCCTCTTGTGCAAAAGGTATTTACAG
CTGAGTATACGCTGATTTGCAAGATTGCTGGATACAGAAAGCCATATATCTCTTTAATGG
ATGGCATAACAATGGGATTTGGGCTTGGTCTTTCTGGACATGGGCGCTACCGTGTGATAA
CAGAGAGGACGGTCCTGGCAATGCCAGAAAATGGAATCGGCTTGTTTCCAGATGTTGGAT
TTTCATATATAGCAGCTCATACCCCTGGCAGAGGGTCTGTTGGTGCTTATCTTGGTATGA
CTGGGAGAAGGATCTCACACCTTCTGATGCATGTTTGTGGGTATTGGGACACATTATGTG
CCATCTGGAAAGCTAGCTGCACTCAAAGAAGCTTTTTGCAGCTGACATTTCCAAGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EB27TF U 1
AF RR2FZ12TF U 574
BS 1 635 RR2EB27TF
BS 636 839 RR2FZ12TF

RD RR2EB27TF 635 0 0
GACGGTCACTGATGTTTGGTTCCTCCGACAAAAGTGGTTGATGTTTGGAACCGGTGAGAA
TCAAAGCGATGATCAAAACTTTGGGCGTGGCTTCTGCTCGCTTCTTCTTCTTCTCCAGAA
ACCCACCAACGACTCATAACATCCGCTTCTCTAAGCACTCCGTATTGGGTCGCCGGAACT
TCACTATAATGGCCAGTGGAAGCAGCGGCGGCGGAGAAGAGTTCGTAAAAGGAAACGTTT
ATCCAAATGGCGTCGCTGTCATCACTCTTGATCGACCTAAAGCTCTCAACGCCATGAATC
TAGAAATGGATTTGAAGTACAAAAGCTTGCTTGAAGAATGGGAATCTGATCCCAAAGTCA
AATGTGTGATCGTCGAAGGAAGCACTCCTCGAGCCTTTTGTGCAGGGATGGATATTAAAG
GAGTTGTTGCAGATATCTTAATGGACAAACAAACTCCTCTTGTGCAAAAGGTATTTACAG
CTGAGTATACGCTGATTTGCAAGATTGCTGGATACAGAAAGCCATATATCTCTTTAATGG
ATGGCATAACAATGGGATTTGGGCTTGGTCTTTCTGGACATGGGCGCTACCGTGTGATAA
CAGAGAGGACGGTCCTGGCAATGCCAGAAAATGGA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RR2FZ12TF 266 0 0
G
TGGACATGGGCGCTACCGTGTGATAACAGAGAGGACGGTCCTGGCAATGCCAGAAGATGG
AATCGGCTTGTTTCCAGATGTTGGATTTTCATATATAGCAGCTCATACCCCTGGCAGAGG
GTCTGTTGGTGCTTATCTTGGTATGACTGGGAGAAGGATCTCACACCTTCTGATGCATGT
TTGTGGGTATTGGGACACATTATGTGCCATCTGGAAAGCTAGCTGCACTCAAAGAAGCTT
TTTGCAGCTGACATTTCCAAGATCT

QA 2 266 2 266
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7805Contig1 948 2 4 U
GGGGATTGGTGCGTTTAACTTACCTTCGTATGATATGGACTTGACGCCGTTTCTTGGGAT
GCTTTTGGATGGGAAGGATCATGAGTTTGCATTGAGTGTTAACAATGGGATATCTTACTG
GCTTGTGGATGCTAATTTGCATCTCTGGCTTGATCATGGGTCTTTGGATGTTGAAGCTGG
GAGTGGGGTTTACGAGAGTCCTAAGCGTCATATGGTGAGACAAGAAGTGTTGGAAGAGCT
GCTTGATGGGTCTTTTAAGGTTGAAGCTGAGGTGCGTAGTGAGTTTGATGGGTGGGTTAA
GTCGAGTGAAGGTAATCTGACGACTATGGTTAAGAGTGTGTTGAAAGTTGGGAGTTTGGT
GAAGTTTGAGAAGAATGGAGCGTACAAGAGAGTTGAGCAGAGAGTGGAGACCAAAAGGGT
CGTGGAGGTGACTGATGAATCGGGTAAACAAGTGGATAGAGTTGTTCATCAACGGTCGTA
TCCACGCACGGTGATCACTTCTACTCTTAGAGGGTTGAGTAATGATAAGGATATGTATGT
GCTCGTGACGAATGTTTCGCAGGCGTTGAATGAGAGATATTCAGTTGGAGAAGCTTTGAC
CGAGGTTTACAATAGACAAGACTCGGATGGGTGGATGCAGGTTGAAGATCACAATGTCTT
GGCTGGCGAAGCGAGGACAAGACAGAGTCTCAGTTATATCGATGAGTTTGGATGTTATTC
TCGCACGGTTGTTGCGGCTAATGGTGAAATCGATCAGGACAGTTCAACTGATACTTGTCC
TACGTCTTCATCCTCCTAAACACATTGCGCTTCTGATCACAACAGCGTGAGATCAAGATG
TAAAACTTGCTTTGTATAAGAGATGCTTGTACTAATATAATAACCATGTTCAGGGACAAA
AACAAGAGATACAATACATTTGCTTTATTCATTAAATTATTTCTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2B749TF U 1
AF RR2B749JQ C 153
BS 1 757 RR2B749TF
BS 758 758 RR2B749JQ
BS 759 830 RR2B749TF
BS 831 948 RR2B749JQ

RD RR2B749TF 830 0 0
GGGGATTGGTGCGTTTAACTTACCTTCGTATGATATGGACTTGACGCCGTTTCTTGGGAT
GCTTTTGGATGGGAAGGATCATGAGTTTGCATTGAGTGTTAACAATGGGATATCTTACTG
GCTTGTGGATGCTAATTTGCATCTCTGGCTTGATCATGGGTCTTTGGATGTTGAAGCTGG
GAGTGGGGTTTACGAGAGTCCTAAGCGTCATATGGTGAGACAAGAAGTGTTGGAAGAGCT
GCTTGATGGGTCTTTTAAGGTTGAAGCTGAGGTGCGTAGTGAGTTTGATGGGTGGGTTAA
GTCGAGTGAAGGTAATCTGACGACTATGGTTAAGAGTGTGTTGAAAGTTGGGAGTTTGGT
GAAGTTTGAGAAGAATGGAGCGTACAAGAGAGTTGAGCAGAGAGTGGAGACCAAAAGGGT
CGTGGAGGTGACTGATGAATCGGGTAAACAAGTGGATAGAGTTGTTCATCAACGGTCGTA
TCCACGCACGGTGATCACTTCTACTCTTAGAGGGTTGAGTAATGATAAGGATATGTATGT
GCTCGTGACGAATGTTTCGCAGGCGTTGAATGAGAGATATTCAGTTGGAGAAGCTTTGAC
CGAGGTTTACAATAGACAAGACTCGGATGGGTGGATGCAGGTTGAAGATCACAATGTCTT
GGCTGGCGAAGCGAGGACAAGACAGAGTCTCAGTTATATCGATGAGTTTGGATGTTATTC
TCGCACGGTTGTTGCGGCTAATGGTGAAATCGATCAG*ACAGTTCAACTGATACTTGTCC
TACGTCTTCATCCTCCTAAACACATTGCGCTTCTGATCACAACAGCGTGA

QA 1 830 1 830
DS 

RD RR2B749JQ 796 0 0
ATCATGGGTCTTTGGATGTTGAAGCTGGGAGTGGGGTTTACGAGAGTCCTAAGCGTCATA
TGGTGAGACAAGAAGTGTTGGAAGAGCTGCTTGATGGGTCTTTTAAGGTTGAAGCTGAGG
TGCGTAGTGAGTTTGATGGGTGGGTTAAGTCGAGTGAAGGTAATCTGACGACTATGGTTA
AGAGTGTGTTGAAAGTTGGGAGTTTGGTGAAGTTTGAGAAGAATGGAGCGTACAAGAGAG
TTGAGCAGAGAGTGGAGACCAAAAGGGTCGTGGAGGTGACTGATGAATCGGGTAAACAAG
TGGATAGAGTTGTTCATCAACGGTCGTATCCACGCACGGTGATCACTTCTACTCTTAGAG
GGTTGAGTAATGATAAGGATATGTATGTGCTCGTGACGAATGTTTCGCAGGCGTTGAATG
AGAGATATTCAGTTGGAGAAGCTTTGACCGAGGTTTACAATAGACAAGACTCGGATGGGT
GGATGCAGGTTGAAGATCACAATGTCTTGGCTGGCGAAGCGAGGACAAGACAGAGTCTCA
GTTATATCGATGAGTTTGGATGTTATTCTCGCACGGTTGTTGCGGCTAATGGTGAAATCG
ATCAGGACAGTTCAACTGATACTTGTCCTACGTCTTCATCCTCCTAAACACATTGCGCTT
CTGATCACAACAGCGTGAGATCAAGATGTAAAACTTGCTTTGTATAAGAGATGCTTGTAC
TAATATAATAACCATGTTCAGGGACAAAAACAAGAGATACAATACATTTGCTTTATTCAT
TAAATTATTTCTTCAC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL7806Contig1 936 2 2 U
GGTTGTCTGAATATCGCTTAGATGCAGCAGTTTCATAGTCAATAACGGGTTGAAAGGCTC
CAGCAAGAGCCAAGACCTTGTTCTTCCTCGAGCTCTCTTGCATCTTACTTGCTATTACAT
CGTTGTAGGCTGTTGGAGATTCCTTCTTCCCTTGCACCAACACTTCCTTCTTTGTGCTGA
CCTCTGAGGCATCCACTAGACCGGTCTCCTTCCCTTCCACGGATTCATCGGGTTGTGCAA
CCTGGTCTCTGTCTTCTTCTCTGTGATCAGAACCTTGTACATGGGTCTCAACCTTGATAA
TCTCCTCTTCATCCTCGTGAGGAGGCGCAAGAATAGAAGACTCGGCGGTGATCTCTTTAC
CGGAAGATCTCTTCGGGACAATCTCAGAACCTTCCTTTTTGCTCTTGGAAGAACTAGCAC
CGCTCAGACCGCTCTTCTTTACCCCTGGAGATCCTCTCGAAGCCACCGTACTGCTTCCTC
TGAGACCACCTCTGCTGCTTCCATGGAAAGACGTAGAGCGCAGACCAGTGACAGGCTTCT
CTCTTGGAACAACGGTTCTATCTCGTGTGCGTGCAGGGGGAGAGGAGGCATTGAGATACT
TCTGGGATGGTGAAGTTGATGGAGAAGTCGAAGACGAAGGAGGGCGATCAAAGGATCGTC
TACGAAGAAGCTTGTCTTCCACAGCGTTGTTCTTCTTCGAGAACTTGACCGGGTCTGGTC
TGGAGCTGATTGTTGGTCTCAGATAATTGGGTAAAGGCTTCTCAACTGGTTTCCGACCAG
ACCCATCTGCGCTCGCTTCAGGTTCTGATGATGGTACAGACTTTGGCTTTCTTCCAAGAG
ATCTTGACCTGTTGAGGTTTTGGTTCTCTGGTTTCGTTTTTCCTGTACTAGACGTCGTTG
CCATCATTCAGATATCAAATAAACGACCTGTGACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FP86TF U 1
AF RR2FP86JQ C 280
BS 1 633 RR2FP86TF
BS 634 936 RR2FP86JQ

RD RR2FP86TF 633 0 0
GGTTGTCTGAATATCGCTTAGATGCAGCAGTTTCATAGTCAATAACGGGTTGAAAGGCTC
CAGCAAGAGCCAAGACCTTGTTCTTCCTCGAGCTCTCTTGCATCTTACTTGCTATTACAT
CGTTGTAGGCTGTTGGAGATTCCTTCTTCCCTTGCACCAACACTTCCTTCTTTGTGCTGA
CCTCTGAGGCATCCACTAGACCGGTCTCCTTCCCTTCCACGGATTCATCGGGTTGTGCAA
CCTGGTCTCTGTCTTCTTCTCTGTGATCAGAACCTTGTACATGGGTCTCAACCTTGATAA
TCTCCTCTTCATCCTCGTGAGGAGGCGCAAGAATAGAAGACTCGGCGGTGATCTCTTTAC
CGGAAGATCTCTTCGGGACAATCTCAGAACCTTCCTTTTTGCTCTTGGAAGAACTAGCAC
CGCTCAGACCGCTCTTCTTTACCCCTGGAGATCCTCTCGAAGCCACCGTACTGCTTCCTC
TGAGACCACCTCTGCTGCTTCCATGGAAAGACGTAGAGCGCAGACCAGTGACAGGCTTCT
CTCTTGGAACAACGGTTCTATCTCGTGTGCGTGCAGGGGGAGAGGAGGCATTGAGATACT
TCTGGGATGGTGAAGTTGATGGAGAAGTCGAAG

QA 1 633 1 633
DS 

RD RR2FP86JQ 657 0 0
CATGGGTCTCAACCTTGATAATCTCCTCTTCATCCTCGTGAGGAGGCGCAAGAATAGAAG
ACTCGGCGGTGATCTCTTTACCGGAAGATCTCTTCGGGACAATCTCAGAACCTTCCTTTT
TGCTCTTGGAAGAACTAGCACCGCTCAGACCGCTCTTCTTTACCCCTGGAGATCCTCTCG
AAGCCACCGTACTGCTTCCTCTGAGACCACCTCTGCTGCTTCCATGGAAAGACGTAGAGC
GCAGACCAGTGACAGGCTTCTCTCTTGGAACAACGGTTCTATCTCGTGTGCGTGCAGGGG
GAGAGGAGGCATTGAGATACTTCTGGGATGGTGAAGTTGATGGAGAAGTCGAAGACGAAG
GAGGGCGATCAAAGGATCGTCTACGAAGAAGCTTGTCTTCCACAGCGTTGTTCTTCTTCG
AGAACTTGACCGGGTCTGGTCTGGAGCTGATTGTTGGTCTCAGATAATTGGGTAAAGGCT
TCTCAACTGGTTTCCGACCAGACCCATCTGCGCTCGCTTCAGGTTCTGATGATGGTACAG
ACTTTGGCTTTCTTCCAAGAGATCTTGACCTGTTGAGGTTTTGGTTCTCTGGTTTCGTTT
TTCCTGTACTAGACGTCGTTGCCATCATTCAGATATCAAATAAACGACCTGTGACGC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL7807Contig1 737 2 4 U
TTTTTGCTCTAGATTTTTTTTCTTTTGTGTCTGGAACATTCTTTAAGCCTCTCTCTCTCT
ATAAATCCTTGAACCCTTTTGCTGCTACTCTTACCATTAGACCCATTTGTGTTTGGAACC
CAAAATGGCAAAATGTTTAGATCTTTCTCTGATTCTCTTTGTTCTGTATGTGTCCACTGC
AGCAATAGCCATGGCAAGAAACCTCGGAGACGAATCTAATGAAGATACAGAGTTCGTCAA
AACCTCTTGTGAGACAGCAACGTACCCGGAACCGTGTTTCCAGTCTCTGTCTTCTTACGC
AAGCGAGATCAAGAAGCGGCCACTTCAGCTAGCCGAGACAGCGCTTGCCGTCAGCATGGC
TCGAGCAAAGTCTGCCAAAACCTATATCTCGGACATGACTGACTACAAAGGAATCACCAA
GAGGCAGCACGGGGCTGTGTTGGACTGTGCTGAAGAGATGGGAGATACTGTTGACAGGTT
GAGCAAGTCGCTGAAGGAACTGAAGAGTCTGGAGGAAGGGGAAAGGGAAGAAGACTTCTG
GTTCTGTTTGAGCAATGTCAGGACGTGGACAAGCGCGGCGCTTACAGATGAGACCACTTG
TCTTGATGGGTTTGGAGGGAAAGGCATGGACGGGGAGCTGAAAAGCTTAGTCAGAGCACA
CATTGTGCGTGTGGCTCAACATACGAGTAATGCATTGGCTTTGATCAATGTCTATGCTTC
CAAGCATTGAAAATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GR46TF U 1
AF RR2FG02TF U 27
BS 1 568 RR2GR46TF
BS 569 569 RR2FG02TF
BS 570 606 RR2GR46TF
BS 607 737 RR2FG02TF

RD RR2GR46TF 606 0 0
TTTTTGCTCTAGATTTTTTTTCTTTTGTGTCTGGAACATTCTTTAAGCCTCTCTCTCTCT
ATAAATCCTTGAACCCTTTTGCTGCTACTCTTACCATTAGACCCATTTGTGTTTGGAACC
CAAAATGGCAAAATGTTTAGATCTTTCTCTGATTCTCTTTGTTCTGTATGTGTCCACTGC
AGCAATAGCCATGGCAAGAAACCTCGGAGACGAATCTAATGAAGATACAGAGTTCGTCAA
AACCTCTTGTGAGACAGCAACGTACCCGGAACCGTGTTTCCAGTCTCTGTCTTCTTACGC
AAGCGAGATCAAGAAGCGGCCACTTCAGCTAGCCGAGACAGCGCTTGCCGTCAGCATGGC
TCGAGCAAAGTCTGCCAAAACCTATATCTCGGACATGACTGACTACAAAGGAATCACCAA
GAGGCAGCACGGGGCTGTGTTGGACTGTGCTGAAGAGATGGGAGATACTGTTGACAGGTT
GAGCAAGTCGCTGAAGGAACTGAAGAGTCTGGAGGAAGGGGAAAGGGAAGAAGACTTCTG
GTTCTGTTTGAGCAATGTCAGGACGTGGGCAAGCGCGGCGCTTACAGATGAGACCACTTG
TCTTGA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2FG02TF 711 0 0
GTGTCTGGAACATTCTTTAAGCCTCTCTCTCTCTATAAATCCTTGAACCCTTTTGCTGCT
ACTCTTACCATTAGACCCATTTGTGTTTGGAACCCAAAATGGCAAAATGTTTAGATCTTT
CTCTGATTCTCTTTGTTCTGTATGTGTCCACTGCAGCAATAGCCATGGTAAGAAACCTTG
GAGACGAATCTAATGAAGATACAGAGTTCGTCAAAACCTCTTGTGAGACAGCAACGTACC
CGGAACTGTGTTTCCAGTCTCTGTCTTCTTACGCAAGCGAGATCAAGAAGCGGCCACTTC
AGCTAGCCGAGACAGCGCTTGCCGTCAGCATGGCTCGAGCAAAGTCTGCCAAAACCTATA
TCTCGGACATGACTGACTACAAAGGAATCACCAAGAGGCAGCACGGGGCTGTGTTGGACT
GTGCTGAAGAGATGGGAGATACTGTTGACAGGTTGAGCAAGTCGCTGAAGGAACTGAAGA
GTCTGGAGGAAGGGGAAAGGGAAGAAGACTTCTGGTTCTGTTTGAGCAATGTCAGGACGT
GGACAAGCGCGGCGCTTACAGATGAGACCACTTGTCTTGATGGGTTTGGAGGGAAAGGCA
TGGACGGGGAGCTGAAAAGCTTAGTCAGAGCACACATTGTGCGTGTGGCTCAACATACGA
GTAATGCATTGGCTTTGATCAATGTCTATGCTTCCAAGCATTGAAAATGTT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL7808Contig1 798 2 6 U
GGCGGCTTCCAGACAGATCGTTCTCCGCTAAACGTCTAAAACCCTAGAGAGATAGAGAGA
CGCAAACACATGGCTTTCTTAAGTAAAGTTGGAAGGATATTTAGGCAGACTAGCACCCAT
GTCTCTGCCTCTAACTCAATAATGCTACAGAGCATCCGTTCCATGTCTTCTTCAAAAATC
TTTGTTGGAGGTATCTCCTACAGCACTGATGAGTTTGGCTTAAGAGAAGCTTTTGGCAAA
TATGGAGAAGTTGTTGATGCGAAAATTATTGTGGACCGTGAAACTGGTAGATCTAGGGGT
TTTGCTTTCGTAACGTTTACTTCAACCGAGGAGGCTAGTAATGCAATGCAGTTGGATGGA
CAGGACCTTCACGGTCGAAGAATTAGGGTGAACTACGCAACTGAAAGAGGAAGTGGATTT
GGAGGAAGGGGATTCGGTGGTCCAAGTGGTGGTTACGGAGGTGGTGGTGGTTATGGTGCT
CCAGGCGGTGGTTATGGAGGCGGTGGTGGTTATGGAGAAGAGACTTGCACAAGGTGGGAT
TCGCTTGGCGGCCACTCTTAACCGTATCTTTTCTTCAAAACCTAAGCTTGCTGGAGCTTG
AAAACTAAGTAAAAGGGATGCTCAGTATGATGCAGTCACACTCTATTAGCTCATTAACTC
AAAAAAATGTTTTTAATTACGTTTTGTGCCATGGCTTTTGTTTTAGTTTAGTTTAACTAG
AATAAGAAGTAGTCGATAGCATGCATCAAGTAACTTTGTAGAAAACAGCATATTTCAAAA
TCAAAAATCTTGATTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG26TF U 1
AF RR2DG26JQ C 98
BS 1 666 RR2DG26TF
BS 667 667 RR2DG26JQ
BS 668 708 RR2DG26TF
BS 709 709 RR2DG26JQ
BS 710 779 RR2DG26TF
BS 780 798 RR2DG26JQ

RD RR2DG26TF 781 0 0
GGCGGCTTCCAGACAGATCGTTCTCCGCTAAACGTCTAAAACCCTAGAGAGATAGAGAGA
CGCAAACACATGGCTTTCTTAAGTAAAGTTGGAAGGATATTTAGGCAGACTAGCACCCAT
GTCTCTGCCTCTAACTCAATAATGCTACAGAGCATCCGTTCCATGTCTTCTTCAAAAATC
TTTGTTGGAGGTATCTCCTACAGCACTGATGAGTTTGGCTTAAGAGAAGCTTTTGGCAAA
TATGGAGAAGTTGTTGATGCGAAAATTATTGTGGACCGTGAAACTGGTAGATCTAGGGGT
TTTGCTTTCGTAACGTTTACTTCAACCGAGGAGGCTAGTAATGCAATGCAGTTGGATGGA
CAGGACCTTCACGGTCGAAGAATTAGGGTGAACTACGCAACTGAAAGAGGAAGTGGATTT
GGAGGAAGGGGATTCGGTGGTCCAAGTGGTGGTTACGGAGGTGGTGGTGGTTATGGTGCT
CCAGGCGGTGGTTATGGAGGCGGTGGTGGTTATGGAGAAGAGACTTGCACAAGGTGGGAT
TCGCTTGGCGGCCACTCTTAACCGTATCTTTTCTTCAAAACCTAAGCTTGCTGGAGCTTG
AAAACTAAGTAAAAGGGATGCTCAGTATGATGCAGTCACACTCTATTAGCTCATTAACTC
AAAAAA*TGTTTTTAATTACGTTTTGTGCCATGGCTTTTGTTTTAGTT*AGTTTAACTAG
AATAAGAAGTAGTCGATAGCATGCATCAAGTAACTTTGTAGAAAACAGCATATTTCAAA
TC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2DG26JQ 701 0 0
TATTTAGGCAGACTAGCACCCATGTCTCTGCCTCTAACTCAATAATGCTACAGAGCATCC
GTTCCATGTCTTCTTCAAAAATCTTTGTTGGAGGTATCTCCTACAGCACTGATGAGTTTG
GCTTAAGAGAAGCTTTTGGCAAATATGGAGAAGTTGTTGATGCGAAAATTATTGTGGACC
GTGAAACTGGTAGATCTAGGGGTTTTGCTTTCGTAACGTTTACTTCAACCGAGGAGGCTA
GTAATGCAATGCAGTTGGATGGACAGGACCTTCACGGTCGAAGAATTAGGGTGAACTACG
CAACTGAAAGAGGAAGTGGATTTGGAGGAAGGGGATTCGGTGGTCCAAGTGGTGGTTACG
GAGGTGGTGGTGGTTATGGTGCTCCAGGCGGTGGTTATGGAGGCGGTGGTGGTTATGGAG
AAGAGACTTGCACAAGGTGGGATTCGCTTGGCGGCCACTCTTAACCGTATCTTTTCTTCA
AAACCTAAGCTTGCTGGAGCTTGAAAACTAAGTAAAAGGGATGCTCAGTATGATGCAGTC
ACACTCTATTAGCTCATTAACTCAAAAAAATGTTTTTAATTACGTTTTGTGCCATGGCTT
TTGTTTTAGTTTAGTTTAACTAGAATAAGAAGTAGTCGATAGCATGCATCAAGTAACTTT
GTAGAAAACAGCATATTTCAAAATCAAAAATCTTGATTACG

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL7809Contig1 1128 2 2 U
GGACTTCTACCTGAAAAGAGAGGAAGAACTCGAATATTATCTCAACTTGTGTACGCAAGA
GAGATGGCATCTGAAAGACAAAAACAAGGAGGAGTACAACCTGGCAAAGAACACGTCATG
GACCCAACTCCACAATTCTCTAGTTCAGACTACCAACCCTCCAACAAGCTCCGTGGAAAG
GTCGCCCTGATAACGGGCGGAGACTCGGGGATTGGTAGAGCCGTGAGTTACTGTTCTGCA
CTTGAAGGTGCCACAATTGCCTTCACGTACGTGAAGGGCCAAGAGGAAAAGGATGCACAA
GAGACTCTACAAATGTTGAAGGAAGCAAATACCTCGTAAGCTAAGGACCCGATTGCAATT
CCAACGGATTTAGGATTCGATGAGCACTGCAAGAGGGTTGTAGACGAGGTTGTTAATGCG
TTTGGACGTATTGATGTCTTGATCAATAACGCAGCGGAGCAGTACGAGAGCAATTCCATC
GAAGAGATCGATGAGCCTAGGCTGGAACGTGTCTTCCGGACAAACATTTTCTCTTATTTC
TTCCTCACAAGGCATGCGTTGAAGCATATGAAGGAAGGAAGCAGCATAATAAACACAACA
TCTGTGAACGCCTATAAGGGACATGCATCGCTTCTCGACTACACCGCTACAAAAGGAGCG
ATTGTGGCGTTTACTCGAGGTCTTGCACTTCAGCTTGCTGAGAAAGGGATCCGTGTTAAT
GGTGTAGCACCTGGTCCTATATGGACCCCCCTTATCCCAGCTTCGTTTAATGAGGAGAAA
ATTAAGAGTTTCGGGACAGAAGTCCCAATGAAACGAGCCGGGCAGCCCATTGAGGTGGCA
CCTTCCTATGTTTTCCTGGCTTGTAACCATTGCTCATCTTACTTCACAGGCCAAGTTCTT
CACCCTAACGGAGGTGCTGTTGTGAATGCCTAAGGCATGGCTCGACCGTGACAATGGACT
TATTATGCTGATAGAAGTTGTTGCGTCGTTTTTTTTTCTCTAAGTTGTTCCGTCGTTGTT
GTTCTAATGGCCTTTTGTTAGTCATGTATGTTGGTTATGTGTGAAAACAGTATATTTTGT
AATCTTCTGGAAGTATCAGAAGTGTTGAAATAAAGATGAAGTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DG01TF U 1
AF RR2DG01JQ C 632
BS 1 688 RR2DG01TF
BS 689 1128 RR2DG01JQ

RD RR2DG01TF 688 0 0
GGACTTCTACCTGAAAAGAGAGGAAGAACTCGAATATTATCTCAACTTGTGTACGCAAGA
GAGATGGCATCTGAAAGACAAAAACAAGGAGGAGTACAACCTGGCAAAGAACACGTCATG
GACCCAACTCCACAATTCTCTAGTTCAGACTACCAACCCTCCAACAAGCTCCGTGGAAAG
GTCGCCCTGATAACGGGCGGAGACTCGGGGATTGGTAGAGCCGTGAGTTACTGTTCTGCA
CTTGAAGGTGCCACAATTGCCTTCACGTACGTGAAGGGCCAAGAGGAAAAGGATGCACAA
GAGACTCTACAAATGTTGAAGGAAGCAAATACCTCGTAAGCTAAGGACCCGATTGCAATT
CCAACGGATTTAGGATTCGATGAGCACTGCAAGAGGGTTGTAGACGAGGTTGTTAATGCG
TTTGGACGTATTGATGTCTTGATCAATAACGCAGCGGAGCAGTACGAGAGCAATTCCATC
GAAGAGATCGATGAGCCTAGGCTGGAACGTGTCTTCCGGACAAACATTTTCTCTTATTTC
TTCCTCACAAGGCATGCGTTGAAGCATATGAAGGAAGGAAGCAGCATAATAAACACAACA
TCTGTGAACGCCTATAAGGGACATGCATCGCTTCTCGACTACACCGCTACAAAAGGAGCG
ATTGTGGCGTTTACTCGAGGTCTTGCAC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RR2DG01JQ 497 0 0
TTCTCGACTACACCGCTACAAAAGGAGCGATTGTGGCGTTTACTCGAGGTCTTGCACTTC
AGCTTGCTGAGAAAGGGATCCGTGTTAATGGTGTAGCACCTGGTCCTATATGGACCCCCC
TTATCCCAGCTTCGTTTAATGAGGAGAAAATTAAGAGTTTCGGGACAGAAGTCCCAATGA
AACGAGCCGGGCAGCCCATTGAGGTGGCACCTTCCTATGTTTTCCTGGCTTGTAACCATT
GCTCATCTTACTTCACAGGCCAAGTTCTTCACCCTAACGGAGGTGCTGTTGTGAATGCCT
AAGGCATGGCTCGACCGTGACAATGGACTTATTATGCTGATAGAAGTTGTTGCGTCGTTT
TTTTTTCTCTAAGTTGTTCCGTCGTTGTTGTTCTAATGGCCTTTTGTTAGTCATGTATGT
TGGTTATGTGTGAAAACAGTATATTTTGTAATCTTCTGGAAGTATCAGAAGTGTTGAAAT
AAAGATGAAGTTTGACC

QA 1 497 1 497
DS 



AS 1 2

CO CL7810Contig1 748 2 3 U
TTTTTTTCTTCAACACAAAACTTTCACGTATCCAGGCAATTTATTTATACAATAAATAAT
GGTGGATGATCACCATAGAATGGTATAATGGGTTATACAACTCTGGAAAAACCAGAAATG
TCAGTCTTTGTCGGTCTCAGATGAGGCAGCCTTTCCGGAATACTTGTTGCGCCAAACCTG
TTTATTCTTCTCGATAGTGTTATGGTTATGAGAATATTCAGTAAGCCCTTGTCTGAGTGC
TCCAAGTGTAACCCCATCACCCACCAAGATGCTTGTCACTCCCATTTTAGAAACTGATTT
AATGTTTCTGTCCTCATCATCGAAGAAGAGCATGTCAGTAAACGGCACCCCTGTCCTTGT
GTGTATCTTTTGAAAATGCTCCGTCTCGTGACTCCAACTCGAGAATATTTCCTTGGCGAC
AAACATGGACTTAATATTCAATTTGTCAATGAAAGTGTTGGCGATGTCTGAAGTGGGAGA
TCTGGAAGCAATCGCCATTTGAATTCCTTTCTCTTTCAGAGCACTCACTATACCCTTTGC
TTGTGGATACAAAGACGGCATTTCGCGTTTAGAACGACATTCACAGTAGAAAGGCCAGAG
AGTATAATCGAGATCGAAAACGACAAGTCTAGGAAGGATCTGAAACATTCCAATGATCTG
CATCGCTTCATCTCTAACCTTTTCGTCCGCCATCTTTCTGGAATAACGGAGACGGACTGC
GCCTTCTTACAAAGCCCAAAGGTCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F117JQ U 11
AF RR2F117TF C 1
BS 1 10 RR2F117TF
BS 11 702 RR2F117JQ
BS 703 748 RR2F117TF

RD RR2F117JQ 692 0 0
CAACACAAAACTTTCACGTATCCAGGCAATTTATTTATACAATAAATAATGGTGGATGAT
CACCATAGAATGGTATAATGGGTTATACAACTCTGGAAAAACCAGAAATGTCAGTCTTTG
TCGGTCTCAGATGAGGCAGCCTTTCCGGAATACTTGTTGCGCCAAACCTGTTTATTCTTC
TCGATAGTGTTATGGTTATGAGAATATTCAGTAAGCCCTTGTCTGAGTGCTCCAAGTGTA
ACCCCATCACCCACCAAGATGCTTGTCACTCCCATTTTAGAAACTGATTTAATGTTTCTG
TCCTCATCATCGAAGAAGAGCATGTCAGTAAACGGCACCCCTGTCCTTGTGTGTATCTTT
TGAAAATGCTCCGTCTCGTGACTCCAACTCGAGAATATTTCCTTGGCGACAAACATGGAC
TTAATATTCAATTTGTCAATGAAAGTGTTGGCGATGTCTGAAGTGGGAGATCTGGAAGCA
ATCGCCATTTGAATTCCTTTCTCTTTCAGAGCACTCACTATACCCTTTGCTTGTGGATAC
AAAGACGGCATTTCGCGTTTAGAACGACATTCACAGTAGAAAGGCCAGAGAGTATAATCG
AGATCGAAAACGACAAGTCTAGGAAGGATCTGAAACATTCCAATGATCTGCATCGCTTCA
TCTCTAACCTTTTCGTCCGCCATCTTTCTGGA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2F117TF 748 0 0
TTTTTTTCTTCAACACAAAACTTTCACGTATCCAGGCAATTTATTTATACAATAAATAAT
GGTGGATGATCACCATAGAATGGTATAATGGGTTATACAACTCTGGAAAAACCAGAAATG
TCAGTCTTTGTCGGTCTCAGATGAGGCAGCCTTTCCGGAATACTTGTTGCGCCAAACCTG
TTTATTCTTCTCGATAGTGTTATGGTTATGAGAATATTCAGTAAGCCCTTGTCTGAGTGC
TCCAAGTGTAACCCCATCACCCACCAAGATGCTTGTCACTCCCATTTTAGAAACTGATTT
AATGTTTCTGTCCTCATCATCGAAGAAGAGCATGTCAGTAAACGGCACCCCTGTCCTTGT
GTGTATCTTTTGAAAATGCTCCGTCTCGTGACTCCAACTCGAGAATATTTCCTTGGCGAC
AAACATGGACTTAATATTCAATTTGTCAATGAAAGTGTTGGCGATGTCTGAAGTGGGAGA
TCTGGAAGCAATCGCCATTTGAATTCCTTTCTCTTTCAGAGCACTCACTATACCCTTTGC
TTGTGGATACAAAGACGGCATTTCGCGTTTAGAACGACATTCACAGTAGAAAGGCCAGAG
AGTATAATCGAGATCGAAAACGACAAGTCTAGGAAGGATCTGAAACATTCCAATGATCTG
CATCGCTTCATCTCTAACCTTTTCGTCCGCCATCTTTCTGGAATAACGGAGACGGACTGC
GCCTTCTTACAAAGCCCAAAGGTCGACC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL7811Contig1 673 2 5 U
GGAGATTAAATTAAGATACAGATCTCTTCGGTTTTACATTTCCAAATGGCGTCCTCTTGT
GTTCCTCATCTTTCTCTCTCAGGTGGTTCTCAATCTCATTATGTGAATGCAAATGGACTG
TCCACCGCAAAGCTCAATTCGATCTGTAAATCCTCTGCATTGAGCATCCCGAAGAAATCA
AACCGGACTCGCAACTTGTCAGTATCTGCAGAGTATGGGAGAAGGAGAGGAAGCGGTGGT
GGTGGTGGTGATTTCGTAGCTGGTTTTCTTCTTGGAGGTGCTTTGTTTGGTGCTGCCGCC
TACATCTTTGCTCCACAGATACGAAGATCGATAATGAGTGAAGAAGATGAGTATGGATTC
AAGAAGCCAGATCAACCAAGTTACTACGATGAAGGTTTGGAGAAAACAAGGGAAACTTTG
AACGAGAAGATCGGACAGCTTAACTCGGCTATTGACAATGTCTCTTCGCGTTTAAGAGGT
CGAGGAAAGAAGAGTTCTTCTTCCCCTGTCGAAACTGATGCAGAAGTTGAAGCTACCACT
TGAAAAAAAGAACACAAAAACGCTTGCAAAGTTATTTCCTTCTCTGTTTTTTGTGCTCTT
GTCTTATGTAGAAACTCTTGCAAAGTTACGATGTTACTGTCTCTTTTGGGTTTTTTAGTG
AAATTTTAATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RR2G178JQ C 1
AF RR2GA45TF U 35
BS 1 37 RR2G178JQ
BS 38 413 RR2GA45TF
BS 414 414 RR2G178JQ
BS 415 670 RR2GA45TF
BS 671 673 RR2G178JQ

RD RR2G178JQ 673 0 0
GGAGATTAAATTAAGATACAGATCTCTTCGGTTTTACATTTCCAAATGGCGTCCTCTTGT
GTTCCTCATCTTTCTCTCTCAGGTGGTTCTCAATCTCATTATGTGAATGCAAATGGACTG
TCCACCGCAAAGCTCAATTCGATCTGTAAATCCTCTGCATTGAGCATCCCGAAGAAATCA
AACCGGACTCGCAACTTGTCAGTATCTGCAGAGTATGGGAGAAGGAGAGGAAGCGGTGGT
GGTGGTGGTGATTTCGTAGCTGGTTTTCTTCTTGGAGGTGCTTTGTTTGGTGCTGCCGCC
TACATCTTTGCTCCACAGATACGAAGATCGATAATGAGTGAAGAAGATGAGTATGGATTC
AAGAAGCCAGATCAACCAAGTTACTACGATGAAGGTTTGGAGAAAACAAGGGAAACTTTG
AACGAGAAGATCGGACAGCTTAACTCGGCTATTGACAATGTCTCTTCGCGTTTAAGAGGT
CGAGGAAAGAAGAGTTCTTCTTCCCCTGTCGAAACTGATGCAGAAGTTGAAGCTACCACT
TGAAAAAAAGAACACAAAAACGCTTGCAAAGTTATTTCCTTCTCTGTTTTTTGTGCTCTT
GTCTTATGTAGAAACTCTTGCAAAGTTACGATGTTACTGTCTCTTTTGGGTTTTTTAGTG
AAATTTTAATTTT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RR2GA45TF 636 0 0
GGG
ATTTCCAAATGGCGTCCTCTTGTGTTCCTCATCTTTCTCTCTCAGGTGGTTCTCAATCTC
ATTATGTGAATGCAAATGGACTGTCCACCGCAAAGCTCAATTCGATCTGTAAATCCTCTG
CATTGAGCATCCCGAAGAAATCAAACCGGACTCGCAACTTGTCAGTATCTGCAGAGTATG
GGAGAAGGAGAGGAAGCGGTGGTGGTGGTGGTGATTTCGTAGCTGGTTTTCTTCTTGGAG
GTGCTTTGTTTGGTGCTGCCGCCTACATCTTTGCTCCACAGATACGAAGATCGATAATGA
GTGAAGAAGATGAGTATGGATTCAAGAAGCCAGATCAACCAAGTTACTACGATGAAGGTT
TGGAGAAAACAAGGGAGACTTTGAACGAGAAGATCGGACAGCTTAACTCGGCTATTGACA
ATGTCTCTTCGCGTTTAAGAGGTCGAGGAAAGAAGAGTTCTTCTTCCCCTGTCGAAACTG
ATGCAGAAGTTGAAGCTACCACTTGAAAAAAAGAACACAAAAACGCTTGCAAAGTTATTT
CCTTCTCTGTTTTTTGTGCTCTTGTCTTATGTAGAAACTCTTGCAAAGTTACGATGTTAC
TGTCTCTTTTGGGTTTTTTAGTGAAATTTTAAT

QA 4 636 4 636
DS 



AS 1 2

CO CL7812Contig1 1062 2 2 U
GGATGTAGTACCTACCAATCTGGGGACTTGACAAAGTCGGACAAAGCAGTGGATGGTATA
TTTGGTTTTGGCAAGGGGAAGTTGTCGGTTGTTTCTCAGCTTTCTTCACGAGGGATTACA
CCTCCAGTGTTTTCTCATTGCTTGAAAGGAGACGGTAGTGGAGGAGGTGTCTTTGTCCTT
GGCGAGATACTGGTCCCAGGGATGGTTTACAGTCCTCTTGTCCCATCACAGCCTCATTAT
AACTTAAATCTGCAGAGCATTAGCGTGAACGGACAGATACTGCCCATCGATGCAGTGGCG
TTTGAGACATCAAACGCACGTGGTACTATTGTTGACACGGGAACCACTTTGACATATCTG
GTGAAAGAGGCTTATGATCCCTTTCTCAGTGCCATATCAAACAGCGTGTCGCAGTTGGTA
ACGCCGATCATGTCTAATGGAGAGCAGTGCTATTTGGTCTCCACTAGCATAAATGACATG
TTTCCTCCGGTTAGTCTCAACTTCGCTGGTGGTGCATCAATGATGTTAAGACCTCAGGAC
TACTTATTTCATTATGGTTTCTATGATGGGGCGTCCATGTGGTGCATTGGATTTTCGAAA
GCTCTCGAAGAACAAAACATTTTAGGAGATCTTGTCCCTAAAGATAAAGTATTTGTGTAT
GATCTTGCTAAGCAACGGATTGGATGGGCAGAGTATGATTGTTCGATGTCTGTGAATGTA
TCAGTAACTTCAGGAAAGGATATAGTAAACTCAGGGCAACCATGCTTGAGCATCTCAAGA
AAGGACATGCTTTTGAAATTGTTCTCTAGCATCTTACTGGCTCTTCTTCTTTGTACTTTC
TTCTCCTTGACGTAAAATTTTATAGTTTCAAGTTTTTTTTTGTGGTTTTGTTTTTTAGAG
TAGTGCAGCTGATTCTTTTGGCCATTCACACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTTGTAG
TATGTAGTGGCTTTTTAATTGTAGATAGCTCTACTTGTGGCCTTTAGAAGTCTTACTTTC
TGTAAAACCTTGGTTTATTTTTATTTTCAATGTTTAATGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BD55TF U 1
AF RR2BD55JQ C 575
BS 1 729 RR2BD55TF
BS 730 1062 RR2BD55JQ

RD RR2BD55TF 729 0 0
GGATGTAGTACCTACCAATCTGGGGACTTGACAAAGTCGGACAAAGCAGTGGATGGTATA
TTTGGTTTTGGCAAGGGGAAGTTGTCGGTTGTTTCTCAGCTTTCTTCACGAGGGATTACA
CCTCCAGTGTTTTCTCATTGCTTGAAAGGAGACGGTAGTGGAGGAGGTGTCTTTGTCCTT
GGCGAGATACTGGTCCCAGGGATGGTTTACAGTCCTCTTGTCCCATCACAGCCTCATTAT
AACTTAAATCTGCAGAGCATTAGCGTGAACGGACAGATACTGCCCATCGATGCAGTGGCG
TTTGAGACATCAAACGCACGTGGTACTATTGTTGACACGGGAACCACTTTGACATATCTG
GTGAAAGAGGCTTATGATCCCTTTCTCAGTGCCATATCAAACAGCGTGTCGCAGTTGGTA
ACGCCGATCATGTCTAATGGAGAGCAGTGCTATTTGGTCTCCACTAGCATAAATGACATG
TTTCCTCCGGTTAGTCTCAACTTCGCTGGTGGTGCATCAATGATGTTAAGACCTCAGGAC
TACTTATTTCATTATGGTTTCTATGATGGGGCGTCCATGTGGTGCATTGGATTTTCGAAA
GCTCTCGAAGAACAAAACATTTTAGGAGATCTTGTCCCTAAAGATAAAGTATTTGTGTAT
GATCTTGCTAAGCAACGGATTGGATGGGCAGAGTATGATTGTTCGATGTCTGTGAATGTA
TCAGTAACT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RR2BD55JQ 488 0 0
CCATGTGGTGCATTGGATTTTCGAAAGCTCTCGAAGAACAAAACATTTTAGGAGATCTTG
TCCCTAAAGATAAAGTATTTGTGTATGATCTTGCTAAGCAACGGATTGGATGGGCAGAGT
ATGATTGTTCGATGTCTGTGAATGTATCAGTAACTTCAGGAAAGGATATAGTAAACTCAG
GGCAACCATGCTTGAGCATCTCAAGAAAGGACATGCTTTTGAAATTGTTCTCTAGCATCT
TACTGGCTCTTCTTCTTTGTACTTTCTTCTCCTTGACGTAAAATTTTATAGTTTCAAGTT
TTTTTTTGTGGTTTTGTTTTTTAGAGTAGTGCAGCTGATTCTTTTGGCCATTCACACCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTTGTAGTATGTAGTGGCTTTTTAATTGTAGATAGCTCTAC
TTGTGGCCTTTAGAAGTCTTACTTTCTGTAAAACCTTGGTTTATTTTTATTTTCAATGTT
TAATGTAA

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 2

CO CL7813Contig1 748 2 8 U
GCTGTTATCTATCATGGGGTTTTGTTGCACCATATATCATGGCTGTCATCCACATCACAT
CGGCTTTAAGAATCTACTTTAAGGGATATAGTCAACTTGAAGATACGACCTTTGCTTCTA
GTGGTATGTCGCTTGTTATACTGTTGGCGATCTGCACATTCATCGAACTTCTTTCAATGT
GGAATTTGACAAGACGAGAAGTGACGCTATGCAATCTGTTATCCCCAGAGGCTCCCCGTC
TCTCTCTTGCACCTTACAACTGGGGACTTATATTCGTAGCAATGCTAGTGGATAACTTTC
TGTACCCGATCTCAGCATTCCGTTCTCACTTTTCTCAGTCTATAAACTGGTCTGGAATTA
GATACCACTTGAGAAATGGGAAGGTTTTCAAGATAGAGAGAAGGAATGATATGGTACCAG
CCAAGACTGATTTAGGAGGGAAACACTTGTATGGTAAGAAGGGAGCTTCACAGAAAGCTT
CCTTCTTAAGCTCATTGGGGAGAAACTTGGCTCACTGGCGACAACCAAAGAAGTTTGATG
TTTAATAAGTTCGTTTTGTTTTGTTAAATACAAGTTAGAAAGCAAAGCTCAAAAGTGGTT
TCTCATGCCCGGGAATTAGCGGGTGAACTGATGATTCTTTGGTGATTCTTTTTCCAGATG
GGGGAAGATTTGATCTTTCTTTTTTTTCTCATTTTCTTGGGTACAAATTGTTTATTGGTG
AGGAAAATATGCATGATTTCCCTGTAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C039JQ C 1
AF RR2C039TF U 1
BS 1 686 RR2C039TF
BS 687 687 RR2C039JQ
BS 688 706 RR2C039TF
BS 707 707 RR2C039JQ
BS 708 722 RR2C039TF
BS 723 723 RR2C039JQ
BS 724 736 RR2C039TF
BS 737 748 RR2C039JQ

RD RR2C039JQ 748 0 0
GCTGTTATCTATCATGGGGTTTTGTTGCACCATATATCATGGCTGTCATCCACATCACAT
CGGCTTTAAGAATCTACTTTAAGGGATATAGTCAACTTGAAGATACGACCTTTGCTTCTA
GTGGTATGTCGCTTGTTATACTGTTGGCGATCTGCACATTCATCGAACTTCTTTCAATGT
GGAATTTGACAAGACGAGAAGTGACGCTATGCAATCTGTTATCCCCAGAGGCTCCCCGTC
TCTTTCTTGCACCTTACAACTGGGGACTTATATTCGTAGCAATGCTAGTGGATAACTTTC
TGTACCCGATCTCAGCATTCCGTTCTCACTTTTCTCAGTCTATAAACTGGTCTGGAATTA
GATACCACTTGAGAAATGGGAAGGTTTTCAAGATAGAGAGAAGGAATGATATGGTACCAG
CCAAGACTGATTTAGGAGGGAAACACTTGTATGGTAAGAAGGGAGCTTCACAGAAAGCTT
CCTTCTTAAGCTCATTGGGGAGAAACTTGGCTCACTGGCGACAACCAAAGAAGTTTGATG
TTTAATAAGTTCGTTTTGTTTTGTTAAATACAAGTTAGAAAGCAAAGCTCAAAAGTGGTT
TCTCATGCCCGGGAATTAGCGGGTGAACTGATGATTCTTTGGTGATTCTTTTTCCAGATG
GGGGAAGATTTGATCTTTCTTTTTTTTCTCATTTTCTTGGGTACAAATTGTTTATTGGTG
AGGAAAATATGCATGATTTCCCTGTAGC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RR2C039TF 736 0 0
GCTGTTATCTATCATGGGGTTTTGTTGCACCATATATCATGGCTGTCATCCACATCACAT
CGGCTTTAAGAATCTACTTTAAGGGATATAGTCAACTTGAAGATACGACCTTTGCTTCTA
GTGGTATGTCGCTTGTTATACTGTTGGCGATCTGCACATTCATCGAACTTCTTTCAATGT
GGAATTTGACAAGACGAGAAGTGACGCTATGCAATCTGTTATCCCCAGAGGCTCCCCGTC
TCTCTCTTGCACCTTACAACTGGGGACTTATATTCGTAGCAATGCTAGTGGATAACTTTC
TGTACCCGATCTCAGCATTCCGTTCTCACTTTTCTCAGTCTATAAACTGGTCTGGAATTA
GATACCACTTGAGAAATGGGAAGGTTTTCAAGATAGAGAGAAGGAATGATATGGTACCAG
CCAAGACTGATTTAGGAGGGAAACACTTGTATGGTAAGAAGGGAGCTTCACAGAAAGCTT
CCTTCTTAAGCTCATTGGGGAGAAACTTGGCTCACTGGCGACAACCAAAGAAGTTTGATG
TTTAATAAGTTCGTTTTGTTTTGTTAAATACAAGTTAGAAAGCAAAGCTCAAAAGTGGTT
TCTCATGCCCGGGAATTAGCGGGTGAACTGATGATTCTTTGGTGATTCTTTTTCCAGATG
GGGGAAGATTTGATCTTTCTTTTTTT*CTCATTTTCTTGGGTACAA*TTGTTTATTGGTG
AG*AAAATATGCATGA

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL7814Contig1 840 2 12 U
GTGAAACAATCCATCCGATAGATCCTCAACACACATCCACTTCTTCTAAGCGATCAATAA
CCCCACCGCTTATTAAAATGGTACTGTTATTATGTCATTGATGTTCTATAATCTTTGGTA
GAAGATCGCACTTACCAAAACAAAGGAAAAAGACTGGAATCCTAAAAGTTAGTGACACTT
CACTAATTTTTTTTTCTTTCAAATCTAACACTAAAGAATCAACGAGTCCCCCATACATTT
CCCTATCACCAATTCCAATGAACTTCACCTTCTCGCCGTAGTTGTCAGAAACGGCTTGAA
CGTGAGAGCTACACCGACCACCACTATCAGATTCAGGACGAAAAACACCAAATGTGATCC
TGGTAGAAATGCGGCGTTTAGTCGCCTCTCGCTCCAAGAAAATAAGATGCCAGCTCCAGC
TGGTCCCACAGTCTTAAAGAGAGACATGGCAGTCATGGCAATTCCATTAGCAGCCCCTCT
TTGACTTTGATCCACAGCTTTGTTTTGCAGGATCAGCAAGCCGGTTATGGCCGAAACACT
TAGCACATTGATGAGGATTGATGCACAGTTCAACAGCAAGCTTAAACTGAGACCTGATAA
ATTAGCTATAAATGGATAACTCATCTGTATTGGTATCATCAGTGCCCCAGCAAAACGGGT
GACCAGCACAGGACCTAGCAATCTCTCGGCAAAAGGATAAACAAAAACCTGAAAGGAGAA
TAGGCCGAGACCTGAGATTGCAAGGACTGTACCGACATCATTGGTTGAGTAGCTCAAACC
TCCATATTTCCTTGGACTGTTAGCCCATAAAGCAAATATCTCAGAGTATGCAGTGTCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BX51JQ U 1
AF RR2G564JQ U 75
BS 1 417 RR2BX51JQ
BS 418 418 RR2G564JQ
BS 419 456 RR2BX51JQ
BS 457 457 RR2G564JQ
BS 458 459 RR2BX51JQ
BS 460 460 RR2G564JQ
BS 461 471 RR2BX51JQ
BS 472 472 RR2G564JQ
BS 473 507 RR2BX51JQ
BS 508 508 RR2G564JQ
BS 509 707 RR2BX51JQ
BS 708 840 RR2G564JQ

RD RR2BX51JQ 707 0 0
GTGAAACAATCCATCCGATAGATCCTCAACACACATCCACTTCTTCTAAGCGATCAATAA
CCCCACCGCTTATTAAAATGGTACTGTTATTATGTCATTGATGTTCTATAATCTTTGGTA
GAAGATCGCACTTACCAAAACAAAGGAAAAAGACTGGAATCCTAAAAGTTAGTGACACTT
CACTAATTTTTTTTTCTTTCAAATCTAACACTAAAGAATCAACGAGTCCCCCATACATTT
CCCTATCACCAATTCCAATGAACTTCACCTTCTCGCCGTAGTTGTCAGAAACGGCTTGAA
CGTGAGAGCTACACCGACCACCACTATCAGATTCAGGACGAAAAACACCAAATGTGATCC
TGGTAGAAATGCGGCGTTTAGTCGCCTCTCGCTCCAAGAAAATAAGATGCCAGCTCCGGC
TGGTCCCACAGTCTTAAAGAGAGACATGGCAGTCATTGCGATTCCATTAGCCGCCCCTCT
TTGACTTTGATCCACAGCTTTGTTTTGTAGGATCAGCAAGCCGGTTATGGCCGAAACACT
TAGCACATTGATGAGGATTGATGCACAGTTCAACAGCAAGCTTAAACTGAGACCTGATAA
ATTAGCTATAAATGGATAACTCATCTGTATTGGTATCATCAGTGCCCCAGCAAAACGGGT
GACCAGCACAGGACCTAGCAATCTCTCGGCAAAAGGATAAACAAAAA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2G564JQ 766 0 0
AAAATGGTACTGTTATTATGTCATTGATGTTCTATAATCTTTGGTAGAAGATCGCACTTA
CCAAAACAAAGGAAAAAGACTGGAATCCTAAAAGTTAGTGACACTTCACTAATTTTTTTT
T***TCAAATCTAACACTAAAGAATCAACGAGTCCCCCATACATTTCCCTATCACCAATT
CCAATGAACTTTACCTTCTCGCCGTCGT***CAGAAATGGCTTGAACGTGAGAGCTACAC
CGACCACCACTATCAGATTCAGGACGAAAAACACCAAATGTGATCCTGGTAGAAATGCGG
CGTTTAGTCGCCTCTCGCTCCAAGAAAATAAGATGCCAGCTCCAGCTGGTCCCACAGTCT
TAAAGAGAGACATGGCAGTCATGGCAATTCCATTAGCAGCCCCTCTTTGACTTTGGTCCA
CAGCTTTGTTTTGCAGGATCAGCAAGCCGGTTATGGCCGAAACACTTAGCACATTGATGA
GGATTGATGCACAGTTCAACAGTAAGCTTAGACTGAGACCTGATAAATTAGCTATAAATG
GATAACTCATCTGTATTGGTATCATCAGTGCCCCAGCAAAACGTGTGACCAGCACAGGAC
CTAGTAATCTCTCGGCAAAAGGATAAACAAAAACCTGAAAGGAGAATAGGCCGAGACCTG
AGATTGCAAGGACTGTACCGACATCATTGGTTGAGTAGCTCAAACCTCCATATTTCCTTG
GACTGTTAGCCCATAAAGCAAATATCTCAGAGTATGCAGTGTCATG

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL7815Contig1 782 2 8 U
GAGCATATTCCGGGCCCTTTTTATTTGGTTGAGGCCCAATAAAAATTTATTATATCCAAC
AGAAATCTCACTCAAACTTTAGTCCCATTCAAAAACTGGAATGGATCGATGGTTTAATGT
GAATGGTCCATGAGAGGAAACAAAGGCAAGCCTCAAGGTCTGGGCTTGTGCAGACAAGGC
CTGTTGCAGAAGATCCGGCCATTGGCCCTCATGAATGCTGAGACAGCCACACTGATGCCC
GCCCACACCAATGAGAAAAACAAGTGCTTGTAATCGCTCCCAGCTCGTTTCACAGACATT
GTTGCAAACCATAAACTGATCAGAACCACGGCCAATGCCACTGGAAAGTTGGCTACAGCC
TCGAGACCTCCCTTTCGAGGCACAGGAGCCATGTCTCGGTTAACAGCAACTATATAGTGT
CCTTGCACAAGATCAATCGCATCCTGCTTAGTTCCATCAGCAAAGTTGTTCAGGTAGTAG
CGGGCGAGGGCATTCCAGCCATCATTAAGGATCCCTTGAACAGTCCTTCGACCATACCTG
ACAAAATCTCCTTTAAGTGCAGGAGTGCCGGAATACTGAATGCTAATGTCGTCACCGTGA
TTAGCCCATAATATTTTATAGCGCTCGTCAAAATTAAGATGCGAGCTTATAACTTCTTCG
GCCCCAAAAACACCAATCCTTCTGAGTTGAAGTTCCAGCATCTTGCGGCCTATCATGCTC
TGCGTGACATTTGTACGGTCTAAACAATCAATGCAGTTAGTGCGCACAATACCAGACTGC
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 

AF RR2EH80JQ U 1
AF RR2CB35JQ U 33
BS 1 220 RR2EH80JQ
BS 221 221 RR2CB35JQ
BS 222 572 RR2EH80JQ
BS 573 573 RR2CB35JQ
BS 574 714 RR2EH80JQ
BS 715 715 RR2CB35JQ
BS 716 779 RR2EH80JQ
BS 780 782 RR2CB35JQ

RD RR2EH80JQ 779 0 0
GAGCATATTCCGGGCCCTTTTTATTTGGTTGAGGCCCAATAAAAATTTATTATATCCAAC
AGAAATCTCACTCAAACTTTAGTCCCATTCAAAAACTGGAATGGATCGATGGTTTAATGT
GAATGGTCCATGAGAGGAAACAAAGGCAAGCCTCAAGGTCTGGGCTTGTGCAGACAAGGC
CTGTTGCAGAAGATCCGGCCATTGGCCCTCATGAATGCTGCGACAGCCACACTGATGCCC
GCCCACACCAATGAGAAAAACAAGTGCTTGTAATCGCTCCCAGCTCGTTTCACAGACATT
GTTGCAAACCATAAACTGATCAGAACCACGGCCAATGCCACTGGAAAGTTGGCTACAGCC
TCGAGACCTCCCTTTCGAGGCACAGGAGCCATGTCTCGGTTAACAGCAACTATATAGTGT
CCTTGCACAAGATCAATCGCATCCTGCTTAGTTCCATCAGCAAAGTTGTTCAGGTAGTAG
CGGGCGAGGGCATTCCAGCCATCATTAAGGATCCCTTGAACAGTCCTTCGACCATACCTG
ACAAAATCTCCTTTAAGTGCAGGAGTGCCGGAGTACTGAATGCTAATGTCGTCACCGTGA
TTAGCCCATAATATTTTATAGCGCTCGTCAAAATTAAGATGCGAGCTTATAACTTCTTCG
GCCCCAAAAACACCAATCCTTCTGAGTTGAAGTTCCAGCATCTTGCGGCCTATCGTGCTC
TGCGTGACATTTGTACGGTCTAAACAATCAATGCAGTTAGTGCGCACAATACCAGACTG

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2CB35JQ 750 0 0
GGCCCAATAAAAATT*ATTATATCCAACAGAAATCTCACTCAAACTTTAGTCCCATTCAA
AAACTGGAATGGATCGATGGTTTAATGTGAATGGTCCATGAGAGGAAACAAAGGCAAGCC
TCAAGGTCTGGGCTTGTGCAGACAAGGCCTGTTGCAGAAGATCCGGCCATTGGCCCTCAT
GAATGCTGAGACAGCCACACTGATGCCCGCCCACACCAATGAGAAAAACAAGTGCTTGTA
ATCGCTCCCAGCTCGTTTCACAGACATTGTTGCAAACCATAAACTGATCAGAACCACGGC
CAATGCCACTGGAAAGTTGGCTACAGCCTCGAGACCTTCCTTTCGAGGCACAGGAGCCAT
GTCTCGGTTAACAGCAACTATATAGTGTCCTTGCACAAGATCAATCGCATCCTGCTTAGT
TCCATCAGCAAAGTTGTTCAGGTAGTAGCGGGCGAGGGCATTCCAGCCATCATTAAGGAT
CCCTTGAACAGTCCTTCGAC*ATACCTGACAAAATCTCCTTTAAGTGCAGGAGTGCCGGA
ATACTGAATGCTAATGTCGTCACCGTGATTAGCCCATAATATTTTATAGCGCTCGTCAAA
ATTAAGATGCGAGCTTATAACTTCTTCGGCCCCAAAAACACCAATCCTTCTGAGTTGAAG
TTCCAGCATCTTGCGGCCTATCATGCTCTGCGTGACATTTGTACGGTCTAAACAATCAAT
G*AGTTAGTGCGCACAATACCAGACTGCTC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL7816Contig1 1127 2 2 U
TTGTCTTCCATATCAGGAAGATCAATTGTACAGAATCACAAAGATAACAAATTAGACAAG
ACATACAAGATCACAACCATCAATGAGATATATCCTACTCGTCCTATGTTACACAAAACA
AGAACGATCTCTGATTTGAGACAGTAAGAGATGAAACATCAGATGGCTAGAGAGGACATA
AAAGAACCAGTGCAGGCGAAAGAAGAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAACTACAGCAA
GCTGATTTCTCAGCTGTAGTAGAAGACGATGAAGCAGCATCTTGTTTAGTTATCTTGATG
CCTTGAGGCTGTAAACCAACAGTACATTTTTTTTTACCTCTGTCTGTAATAAGACAATAT
GAAAGAGTGTGAGGTGGAGTACGTTTCTTACCTCTGCCTTTGTATCGGTTTCTGTCAATC
TTTGTTTGATGTCTTTTGCAATAGAGAGGAAAACCGACTCGACATTGAGGTTTGTTTTTG
CACTCTGCAACCATTTTGTAATCACAATCAGTACTCATCAAGAACATAAAAGGACACGTC
ATGTTTTTTTAATATCTAGGCTCACCGTTTCAAAGAATTTGATTCCATATTCATCAGCTA
AAGCTTGGCCCTTTGCTGTTGGGATAGCCTGAGAATATGCATAAGAGTATCTTACAACAA
GGTCATAAAGGAGAGTATGCATATGCAAGTGAAGATATCTACTTTACCCTTTTGCTCTCA
TCCATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCT
ATGTTCTTCATCCAATTCCTAATGTCTGTCATAAAACAATTATGCTCAGTTACTTGATAA
AATACGATAGTAAAGTGGCTCAGAGAAAAGCGAGAGAACATACTGTTGAAGGATGACTCA
TCGGTTACGTCGTAGACAAGCAGTATACCCATCGCTCCTCTGTAATACGCTGCACGAAAA
GAAAAAAAAAGGCCAAAGCGCTTTAGTGACAAGAAGAGAAACAGCTGAATTGTATGTTTT
ACTTTCTCAAAGTAAAAAGTTAAAAGACTCAGGAATCTACCAATGTCAATAGATTCATTA
AATCCAATATTAAAAGAGTTTATTTGCAAGTTTGAAGTAACAAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ER38TF U 1
AF RR2ER38JQ C 415
BS 1 779 RR2ER38TF
BS 780 1127 RR2ER38JQ

RD RR2ER38TF 779 0 0
TTGTCTTCCATATCAGGAAGATCAATTGTACAGAATCACAAAGATAACAAATTAGACAAG
ACATACAAGATCACAACCATCAATGAGATATATCCTACTCGTCCTATGTTACACAAAACA
AGAACGATCTCTGATTTGAGACAGTAAGAGATGAAACATCAGATGGCTAGAGAGGACATA
AAAGAACCAGTGCAGGCGAAAGAAGAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAACTACAGCAA
GCTGATTTCTCAGCTGTAGTAGAAGACGATGAAGCAGCATCTTGTTTAGTTATCTTGATG
CCTTGAGGCTGTAAACCAACAGTACATTTTTTTTTACCTCTGTCTGTAATAAGACAATAT
GAAAGAGTGTGAGGTGGAGTACGTTTCTTACCTCTGCCTTTGTATCGGTTTCTGTCAATC
TTTGTTTGATGTCTTTTGCAATAGAGAGGAAAACCGACTCGACATTGAGGTTTGTTTTTG
CACTCTGCAACCATTTTGTAATCACAATCAGTACTCATCAAGAACATAAAAGGACACGTC
ATGTTTTTTTAATATCTAGGCTCACCGTTTCAAAGAATTTGATTCCATATTCATCAGCTA
AAGCTTGGCCCTTTGCTGTTGGGATAGCCTGAGAATATGCATAAGAGTATCTTACAACAA
GGTCATAAAGGAGAGTATGCATATGCAAGTGAAGATATCTACTTTACCCTTTTGCTCTCA
TCCATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RR2ER38JQ 713 0 0
TCAATCTTTGTTTGATGTCTTTTGCAATAGAGAGGAAAACCGACTCGACATTGAGGTTTG
TTTTTGCACTCTGCAACCATTTTGTAATCACAATCAGTACTCATCAAGAACATAAAAGGA
CACGTCATGTTTTTTTAATATCTAGGCTCACCGTTTCAAAGAATTTGATTCCATATTCAT
CAGCTAAAGCTTGGCCCTTTGCTGTTGGGATAGCCTGAGAATATGCATAAGAGTATCTTA
CAACAAGGTCATAAAGGAGAGTATGCATATGCAAGTGAAGATATCTACTTTACCCTTTTG
CTTTCATCCATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATTTGAGGCATGC
TGCTCTATGTTCTTCATCCAATTCCTAATGTCTGTCATAAAACAATTATGCTCAGTTACT
TGATAAAATACGATAGTAAAGTGGCTCAGAGAAAAGCGAGAGAACATACTGTTGAAGGAT
GACTCATCGGTTACGTCGTAGACAAGCAGTATACCCATCGCTCCTCTGTAATACGCTGCA
CGAAAAGAAAAAAAAAGGCCAAAGCGCTTTAGTGACAAGAAGAGAAACAGCTGAATTGTA
TGTTTTACTTTCTCAAAGTAAAAAGTTAAAAGACTCAGGAATCTACCAATGTCAATAGAT
TCATTAAATCCAATATTAAAAGAGTTTATTTGCAAGTTTGAAGTAACAAGTTC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL7817Contig1 815 2 13 U
GGGCTTCTAACGTGTTATTCCTGGTTCTACTTCAATTCCTAGTTCTTTTGTGTTGAAAAT
CTCCGAAGAAGATGACTGTGGAACAAGAGTTGGAAGCAGTGGACCAGTTTCCAGTAGGGA
TGAGAGTTCTTGCCGTTGACGATGACCAAACTTGTCTCCGTATTCTCGAGACTCTGCTTC
ATCGCTGCCAATACCATGTTACGACAACGGACAGTGCACAGACCGCACTGGAGCTGTTGA
GGGAGAACAAGAACAAGTTTGATCTCGTTATTAGCGATGTGGACATGCCAGACATGGATG
GTTTCAAGCTACTCGAGCTCGTTGGTCTTGAAATGGACTTACCTGTCATAATGTTGTCTG
CGCATAGCGATCCAAAGTATGTGATGAAAGGAGTCAAGCACGGTGCCTGCGACTATCTGC
TTAAACCGGTGCGTATCGAGGAGCTCAAGAACATATGGCAACACGTTGTGAGGAAAAGCA
AGTTCAAGAAGATGAAGAGCATTGTGACTAATGTTGAATCCACAGATAACTCTGATCAAA
ACGGCGTGAAAGCGAACAGAAAACGTAAAGATCAGTTTGAAGAGGTGGTGGAAGAAGAAG
ATGAAGAAAGAGGGAATGAAAACGATGATCCAACGGCTCAAAAGAAGCCACGTGTGCTCT
GGACGCGTGAGCTGCACAATAAGTTCTTAGCAGCTGTTGATCACTTGGGCGTTGAGAAAG
CTCAACCGAAAAGATTCTTGAACTGATGAATGTTGACAGCTCACAAGAGAGATGTTGCTA
GCCATCTTCAGAAGTTCCGCTCCGCGTGAAAAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H371TF U 22
AF RR2EY83TF U 1
BS 1 63 RR2EY83TF
BS 64 64 RR2H371TF
BS 65 187 RR2EY83TF
BS 188 188 RR2H371TF
BS 189 418 RR2EY83TF
BS 419 419 RR2H371TF
BS 420 523 RR2EY83TF
BS 524 524 RR2H371TF
BS 525 544 RR2EY83TF
BS 545 545 RR2H371TF
BS 546 556 RR2EY83TF
BS 557 557 RR2H371TF
BS 558 815 RR2EY83TF

RD RR2H371TF 609 0 0
TTT
TTCTACTTCAATTCCTAGTTCTTTTGTGTTGAAAATCTCCGAAGAAGATGACTGTGGAAC
AAGAGTTTGAAGCAGTGGACCAGTTTCCAGTAGGGATGAGAGTTCTTGCCGTTGACGATG
ACCAAACTTGTCTCCGTATTCTCGAGACTCTGCTTCATCGCTGCCAATACCATGTTACGA
CAACGGACAGTGCACAGACCGCACTGGAGCTGTTGAGGGAGAACAATAACAAGTTTGATC
TCGTTATTAGCGATGTGGACATGCCAGACATGGATGGTTTCAAGCTACTCGAGCTCGTTG
GTCTTGAAATGGACTTACCTGTCATAATGTTGTCTGCGCATAGCGATCCAAAGTATGTGA
TGAAAGGAGTCAAGCACGGTGCCTGCGACTATCTGCTTAAACCGGTGCGTATCGAGGAGC
TCAAGAACATATGGCAACACGTTGTGAGGAAAAGCAAGTTCAAGAAGATGAAGAGCATTG
TGACTAATGTTGAATCCACAGATAACTCTGATCAGAACGGCGTGAAAGCGAACAGAAAAC
GTAAAGATCAGTTTGAAGAGGTGGTGGAAGAAGAAGATGAAGAAAGAGGGAATGAAAACG
ATGATC

QA 4 609 4 609
DS 

RD RR2EY83TF 815 0 0
GGGCTTCTAACGTGTTATTCCTGGTTCTACTTCAATTCCTAGTTCTTTTGTGTTGAAAAT
CTCTGAAGAAGATGACTGTGGAACAAGAGTTGGAAGCAGTGGACCAGTTTCCAGTAGGGA
TGAGAGTTCTTGCCGTTGACGATGACCAAACTTGTCTCCGTATTCTCGAGACTCTGCTTC
ATCGCTGTCAATACCATGTTACGACAACGGACAGTGCACAGACCGCACTGGAGCTGTTGA
GGGAGAACAAGAACAAGTTTGATCTCGTTATTAGCGATGTGGACATGCCAGACATGGATG
GTTTCAAGCTACTCGAGCTCGTTGGTCTTGAAATGGACTTACCTGTCATAATGTTGTCTG
CGCATAGCGATCCAAAGTATGTGATGAAAGGAGTCAAGCACGGTGCCTGCGACTATCTTC
TTAAACCGGTGCGTATCGAGGAGCTCAAGAACATATGGCAACACGTTGTGAGGAAAAGCA
AGTTCAAGAAGATGAAGAGCATTGTGACTAATGTTGAATCCACGGATAACTCTGATCAAA
ACGGTGTGAAAGCGAATAGAAAACGTAAAGATCAGTTTGAAGAGGTGGTGGAAGAAGAAG
ATGAAGAAAGAGGGAATGAAAACGATGATCCAACGGCTCAAAAGAAGCCACGTGTGCTCT
GGACGCGTGAGCTGCACAATAAGTTCTTAGCAGCTGTTGATCACTTGGGCGTTGAGAAAG
CTCAACCGAAAAGATTCTTGAACTGATGAATGTTGACAGCTCACAAGAGAGATGTTGCTA
GCCATCTTCAGAAGTTCCGCTCCGCGTGAAAAGAT

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL7818Contig1 622 2 3 U
TTTTTTTTGCATCAACAATCATATCTCGCGTTTTTATATATAAACTTGTGCAACGAAAAA
GTCAATGACAAATACATCAAAATAATTAATACACGCACGCGTGAGTACAACATGTTACAC
CAATTTTAAGTTGAGTTTTTACATAACTCAAACTTACTTCTCATGGCAAAATCAGTCCTC
CAAGTTAAACTCTTCATTGCACACTCTCTATTGGCAAAGTCAGCCAAAGGGCACCCAAAA
ACAATCCAAACATGTGAATTAGTGTACATGATATCTATATAAATCATGTACATACCCCAA
CCTATATGTCTCAAGTGGGGCATCACGATGGTCAATGTCTCAAACCATGTCTTGTTAGTT
GTCACATCCCAAGTCGACCGTATGATTAAATCATCAGAACCAAAAGGAACCATTACAATT
TTAGCAGAAGCCCAAGATATTAGGGCAAAGTGTGATTACTTTAGTTTATTGCACTTGAAG
ATCAAACCATCGACTTGAGAATATGTTGTCGTCTTCGTCAAGATCAATCAAACCATCTAA
ATCAAAGTATGTGTTTGTGTTCGAACCTGATTCCCATTCGTCCTTCACTACGTGGCTCCC
TAAAATATTGTTGACCAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DV29JQ U 26
AF RR2DV29TF C 1
BS 1 25 RR2DV29TF
BS 26 575 RR2DV29JQ
BS 576 622 RR2DV29TF

RD RR2DV29JQ 550 0 0
TCGCGTTTTTATATATAAACTTGTGCAACGAAAAAGTCAATGACAAATACATCAAAATAA
TTAATACACGCACGCGTGAGTACAACATGTTACACCAATTTTAAGTTGAGTTTTTACATA
ACTCAAACTTACTTCTCATGGCAAAATCAGTCCTCCAAGTTAAACTCTTCATTGCACACT
CTCTATTGGCAAAGTCAGCCAAAGGGCACCCAAAAACAATCCAAACATGTGAATTAGTGT
ACATGATATCTATATAAATCATGTACATACCCCAACCTATATGTCTCAAGTGGGGCATCA
CGATGGTCAATGTCTCAAACCATGTCTTGTTAGTTGTCACATCCCAAGTCGACCGTATGA
TTAAATCATCAGAACCAAAAGGAACCATTACAATTTTAGCAGAAGCCCAAGATATTAGGG
CAAAGTGTGATTACTTTAGTTTATTGCACTTGAAGATCAAACCATCGACTTGAGAATATG
TTGTCGTCTTCGTCAAGATCAATCAAACCATCTAAATCAAAGTATGTGTTTGTGTTCGAA
CCTGATTCCC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RR2DV29TF 622 0 0
TTTTTTTTGCATCAACAATCATATCTCGCGTTTTTATATATAAACTTGTGCAACGAAAAA
GTCAATGACAAATACATCAAAATAATTAATACACGCACGCGTGAGTACAACATGTTACAC
CAATTTTAAGTTGAGTTTTTACATAACTCAAACTTACTTCTCATGGCAAAATCAGTCCTC
CAAGTTAAACTCTTCATTGCACACTCTCTATTGGCAAAGTCAGCCAAAGGGCACCCAAAA
ACAATCCAAACATGTGAATTAGTGTACATGATATCTATATAAATCATGTACATACCCCAA
CCTATATGTCTCAAGTGGGGCATCACGATGGTCAATGTCTCAAACCATGTCTTGTTAGTT
GTCACATCCCAAGTCGACCGTATGATTAAATCATCAGAACCAAAAGGAACCATTACAATT
TTAGCAGAAGCCCAAGATATTAGGGCAAAGTGTGATTACTTTAGTTTATTGCACTTGAAG
ATCAAACCATCGACTTGAGAATATGTTGTCGTCTTCGTCAAGATCAATCAAACCATCTAA
ATCAAAGTATGTGTTTGTGTTCGAACCTGATTCCCATTCGTCCTTCACTACGTGGCTCCC
TAAAATATTGTTGACCAGCTCC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL7819Contig1 653 2 1 U
GATGATCATGTGGTCCGTTACGAGAATAACCCTCGTCATGTGGATAATGGTTTATTTTGC
AATCCTGTCAATGTTCGGTCAGATGATTTCAACAAGCTTCTCAACGAAATCCCATATGCA
CCAGGGCTTGCTCCAAGACATATGAATGAGGTTTCTAGTGCTATGCAGGTCAATAGCCAA
GAAGAGATGCAGAGCACGTTGCTGAATAATTCTTCTGGTGAGTTTCTTACCCCCTGGGAA
GTCGGAATGTTCTTGCCAAGTTGTCAGCCAAACAGCATTCACTCGAGCTATCAGTCCCAT
GTGAGGTCGGCAGACTCATTTGATGGTAGTGAGGTCAAGTCAGCTTTCAAGACCTCTGGC
ATTGCACCTTTCGTGTTTGAGAAGGAGGATTACATTGAAATGGATGATCTTCTCACCCCT
GAACAAGGAGCTGCTGCTTCAGTTGAGAAGCCTGGACAGTTCTTGAACCCTGGTGAAGAA
CATGAACGCTTTAATGACTATGACCAATTGTTCCATGACGTTTCCATGTCTTTCGATTTA
GAACCTGTGTTTCAGGAAACTTACACAGATCTGTCTTCTGTGAGTAATTTTGCTAACGAC
GGAAGTCAGCCTTTTCTTTATCAACAACAGTTTCAGGACCAGACCCTTGAGAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H984TF U 1
AF RR2GZ30TF U 1
BS 1 653 RR2GZ30TF

RD RR2H984TF 553 0 0
GATGATCATGTGGTCCGTTACGAGAATAACCCTCGTCATGTGGATAATGGTTTATTTTGC
AATCCTGTCAATGTTCGGTCAGATGATTTCAACAAGCTTCTCAACGAAATCCCATATGCA
CCAGGGCTTGCTCCAAGACATATGAATGAGGTTTCTAGTGCTATGCAGGTCAATAGCCAA
GAAGAGATGCAGAGCACGTTGCTGAATAATTCTTCTGGTGAGTTTCTTACCCCCTGGGAA
GTCGGAATGTTCTTGCCAAGTTGTCAGCCAAACAGCATTCACTCGAGCTATCAGTCCCAT
GTGAGGTCGGCAGACTCATTTGATGGTAGTGAGGTCAAGTCAGCTTTCAAGACCTCTGGC
ATTGCACCTTTCGTGTTTGAGAAGGAGGATTACATTGAAATGGATGATCTTCTCACCCCT
GAACAAGGAGCTGCTGCTTCAGTTGAGAAGCCTGGACAGTTCTTGAACCCTGGTGAAGAA
CATGAACGCTTTAATGACTATGACCAATTGTTCCATGACGTTTCCATGTCTTTCGATTTA
GAACCTGTGTTTC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2GZ30TF 653 0 0
GATGATCATGTGGTCCGTTACGAGAATAACCCTCGTCATGTGGATAATGGTTTATTTTGC
AATCCTGTCAATGTTCGGTCAGATGATTTCAACAAGCTTCTCAACGAAATCCCATATGCA
CCAGGGCTTGCTCCAAGACATATGAATGAGGTTTCTAGTGCTATGCAGGTCAATAGCCAA
GAAGAGATGCAGAGCACGTTGCTGAATAATTCTTCTGGTGAGTTTCTTACCCCCTGGGAA
GTCGGAATGTTCTTGCCAAGTTGTCAGCCAAACAGCATTCACTCGAGCTATCAGTCCCAT
GTGAGGTCGGCAGACTCATTTGATGGTAGTGAGGTCAAGTCAGCTTTCAAGACCTCTGGC
ATTGCACCTTTCGTGTTTGAGAAGGAGGATTACATTGAAATGGATGATCTTCTCACCCCT
GAACAAGGAGCTGCTGCTTCAGTTGAGAAGCCTGGACAGTTCTTGAACCCTGGTGAAGAA
CATGAACGCTTTAATGACTATGACCAATTGTTCCATGACGTTTCCATGTCTTTCGATTTA
GAACCTGTGTTTCAGGAAACTTACACAGATCTGTCTTCTGTGAGTAATTTTGCTAACGAC
GGAAGTCAGCCTTTTCTTTATCAACAACAGTTTCAGGACCAGACCCTTGAGAC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL7820Contig1 732 2 2 U
GGACATGGTGAAGCAAAAGAAAGAAAAATATCTTCTTTGATTCTCTCTCTCTCTTAAAAA
TCTCTATTATTATTCTTTTGCTATATCCAAGTCATTTTTTTCATCGTCTCTTTTGCTGGA
TTGTTCTTCATCAAGCTTTGAATTTCAGTCTTGTTTGTTTTAAAAGCAAATGGCAACTCC
AGCTAGGAAGAGACTCATGTGGGACTTCAAGAGACTACAGAAAGATCCTCCCTTGGGGAT
CAGTGGATCTCCTCAAGATAACAACATCATGCATTGGAACGCTCTCATCTTTGGACCTGA
TGACAGTCCATGGGATGGAGGTACCTTCAAGTTGACTCTTCAGTTCACTGAGGACTACCC
AAACAAACCACCAGTAGTTCGCTTTGTCTCACGGATGTTTCATCCAAACATTTATGCTGA
TGGAAGCATTTGCTTGGATATATTACAAAACCAATGGAGCCCCATATATGATGTCTCAGC
AATCCTCACATCTATTCAGTCTCTGCTTTGTGATCCAAATCCTAACTCGCCAGCAAACTC
TGAAGCTGCGAGGCTGTTCAGCGAGAACAAACGAGAGTACAACAGGAAAGTTATGGAGAT
TGTGGAGCAGAGCTATGCCTAATAATAATATGATGTAACTATGTATTTATTGACTGTTGA
GTAATATTAGTTGAAACTACAATCACCATTAGAACTCAATCTTCTGATTCTTGAACAACC
TTCTGTATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F381TF U 1
AF RR2F381JQ C 29
BS 1 581 RR2F381TF
BS 582 732 RR2F381JQ

RD RR2F381TF 581 0 0
GGACATGGTGAAGCAAAAGAAAGAAAAATATCTTCTTTGATTCTCTCTCTCTCTTAAAAA
TCTCTATTATTATTCTTTTGCTATATCCAAGTCATTTTTTTCATCGTCTCTTTTGCTGGA
TTGTTCTTCATCAAGCTTTGAATTTCAGTCTTGTTTGTTTTAAAAGCAAATGGCAACTCC
AGCTAGGAAGAGACTCATGTGGGACTTCAAGAGACTACAGAAAGATCCTCCCTTGGGGAT
CAGTGGATCTCCTCAAGATAACAACATCATGCATTGGAACGCTCTCATCTTTGGACCTGA
TGACAGTCCATGGGATGGAGGTACCTTCAAGTTGACTCTTCAGTTCACTGAGGACTACCC
AAACAAACCACCAGTAGTTCGCTTTGTCTCACGGATGTTTCATCCAAACATTTATGCTGA
TGGAAGCATTTGCTTGGATATATTACAAAACCAATGGAGCCCCATATATGATGTCTCAGC
AATCCTCACATCTATTCAGTCTCTGCTTTGTGATCCAAATCCTAACTCGCCAGCAAACTC
TGAAGCTGCGAGGCTGTTCAGCGAGAACAAACGAGAGTACA

QA 1 581 1 581
DS 

RD RR2F381JQ 704 0 0
TATCTTCTTTGATTCTCTCTCTCTCTTAAAAATCTCTATTATTATTCTTTTGCTATATCC
AAGTCATTTTTTTCATCGTCTCTTTTGCTGGATTGTTCTTCATCAAGCTTTGAATTTCAG
TCTTGTTTGTTTTAAAAGCAAATGGCAACTCCAGCTAGGAAGAGACTCATGTGGGACTTC
AAGAGACTACAGAAAGATCCTCCCTTGGGGATCAGTGGATCTCCTCAAGATAACAACATC
ATGCATTGGAACGCTCTCATCTTTGGACCTGATGACAGTCCATGGGATGGAGGTACCTTC
AAGTTGACTCTTCAGTTCACTGAGGACTACCCAAACAAACCACCAGTAGTTCGCTTTGTC
TCACGGATGTTTCATCCAAACATTTATGCTGATGGAAGCATTTGCTTGGATATATTACAA
AACCAATGGAGCCCCATATATGATGTCTCAGCAATCCTCACATCTATTCAGTCTCTGCTT
TGTGATCCAAATCCTAACTCGCCAGCAAACTCTGAAGCTGCGAGGCTGTTCAGCGAGAAC
AAACGAGAGTACAACAGGAAAGTTATGGAGATTGTGGAGCAGAGCTATGCCTAATAATAA
TATGATGTAACTATGTATTTATTGACTGTTGAGTAATATTAGTTGAAACTACAATCACCA
TTAGAACTCAATCTTCTGATTCTTGAACAACCTTCTGTATTATC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL7821Contig1 699 2 4 U
GGCACAGAGAGAAATTGCTACGGCTCACCAGTTGGTGGAGACAATCCCAGAACAAGAGGA
CAATCTTCAAGAAGAAAAGAGATCTTCACTAGATTCCATGTCCTCAACGGAGACCGATGT
GTCTCAATGGAACGTTCTGCAGTTCAACACGGGAGGCTCTTCAGCTCCATTCATCATAAA
ATGCGGAGCTAACTCCAACTCAGAGCTCGTGATCAAAGCGGATGCACGGATTCAAGAACC
TAAAGGAGGAGAAATCGTGAGAGTTGTGCCAAGACCATCCGTTCTAGAAAACATGAGCTT
GGAGGAAATGAAACAAGTGTTTGGTCCGTTGCCAGAAGCAATAAGTTCACTGGCCTTAGC
AAGAACAGCTGACGGCACAAGGGCTAGATATTCCAGACTCTACAGAACTCTAGCCATGAA
GGTTCCCTCTCTTAGGGACCTCGTTGGAGAGCTTGAGAAAGGAGGTGTCTTAAAGATACC
ACCAAATCGACATGAAGAAAACAACAAAAATGGTTCTGTTTTATGTAAGTATTCTTTGTT
TTTTTTGTACTGTGAGGCGCTTAATATACTTTTGGATTTCTTTGTATTTGTGTGTACTTT
GTAGTGTTTTGAGACCACTAATGATGTTATTGTGTTTTAAGAACAGTTTCAGCTAAAAGA
AGCTCTCACTAGAACCTTTGTAAGGCGAGTGAACTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E542TF U 1
AF RR2E542JQ C 225
BS 1 340 RR2E542TF
BS 341 341 RR2E542JQ
BS 342 657 RR2E542TF
BS 658 699 RR2E542JQ

RD RR2E542TF 661 0 0
GGCACAGAGAGAAATTGCTACGGCTCACCAGTTGGTGGAGACAATCCCAGAACAAGAGGA
CAATCTTCAAGAAGAAAAGAGATCTTCACTAGATTCCATGTCCTCAACGGAGACCGATGT
GTCTCAATGGAACGTTCTGCAGTTCAACACGGGAGGCTCTTCAGCTCCATTCATCATAAA
ATGCGGAGCTAACTCCAACTCAGAGCTCGTGATCAAAGCGGATGCACGGATTCAAGAACC
TAAAGGAGGAGAAATCGTGAGAGTTGTGCCAAGACCATCCGTTCTAGAAAACATGAGCTT
GGAGGAAATGAAACAAGTGTTTGGTCCGTTGCCAGAAGCACTAAGTTCACTGGCCTTAGC
AAGAACAGCTGACGGCACAAGGGCTAGATATTCCAGACTCTACAGAACTCTAGCCATGAA
GGTTCCCTCTCTTAGGGACCTCGTTGGAGAGCTTGAGAAAGGAGGTGTCTTAAAGATACC
ACCAAATCGACATGAAGAAAACAACAAAAATGGTTCTGTTTTATGTAAGTATTCTTTGTT
TTTTTTGTACTGTGAGGCGCTTAATATACTTTTGGATTTCTTTGTATTTGTGTGTACTTT
GTAGTGTTTTGAGACCACTAATGATGTTATTGTGTTTTAAGAACAGTTTCAGCTAAA
GAAG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2E542JQ 475 0 0
CACGGATTCAAGAACCTAAAGGAGGAGAAATCGTGAGAGTTGTGCCAAGACCATCCGTTC
TAGAAAACATGAGCTTGGAGGAAATGAAACAAGTGTTTGGTCCGTTGCCAGAAGCAATAA
GTTCACTGGCCTTAGCAAGAACAGCTGACGGCACAAGGGCTAGATATTCCAGACTCTACA
GAACTCTAGCCATGAAGGTTCCCTCTCTTAGGGACCTCGTTGGAGAGCTTGAGAAAGGAG
GTGTCTTAAAGATACCACCAAATCGACATGAAGAAAACAACAAAAATGGTTCTGTTTTAT
GTAAGTATTCTTTGTTTTTTTTGTACTGTGAGGCGCTTAATATACTTTTGGATTTCTTTG
TATTTGTGTGTACTTTGTAGTGTTTTGAGACCACTAATGATGTTATTGTGTTTTAAGAAC
AGTTTCAGCTAAAAGAAGCTCTCACTAGAACCTTTGTAAGGCGAGTGAACTTTAC

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 2

CO CL7822Contig1 560 2 5 U
GCACTAGATCATACTATAACACTAGAGGCATATCATTCATTACACATACAGGAGCCAACA
TAAATACTGAAAATATTATAAGGTCAACGGATGGAGAGTACTCTGGTAGTCTGGTTTGCC
AAATCTAACGAGCAAGATAGTAAATGAGTAGAAATAAACCCAGAAACGATGCCACGAGTG
TCAGCATACTTCGGCTTGATTTTGTTTCAAACACTGTTTTAAACCGGTCCATGGTTCCTG
AGAGAATTCCCCTCGACGAATCCATATCATTACCCATTCTGTCAAGCATGCGGTTATGAG
CATCTACCTCTTCGTTTATATCACCAGAAAGTCGTTTCAAGAGAATGACTCTGTCTTGCA
ACCCTTCCAACCAAAGCACGCTCATTCTCATGCTCATTGATTTCATGAGAGGTGTAAGAA
GAAGAGGAAGCAGCTCTGATTCCTCCCTCTTCAAAGAGCGCACTTCTTCCACCCCGAGGC
TCCCTTCTTGAGGAATAAAACGGTTGAAATGTCGCTGTGGTTTAATCTCTTCAGCGGATC
ATCAACACTCCAACAGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM60JQ U 41
AF RR2DK54TF C 1
BS 1 40 RR2DK54TF
BS 41 132 RR2GM60JQ
BS 133 133 RR2DK54TF
BS 134 150 RR2GM60JQ
BS 151 560 RR2DK54TF

RD RR2GM60JQ 114 0 0
TACACATACAGGAGCCAACATAAATACTGAAAATATTATAAGGTCAACGGATGGAGAGTA
CTCTGGTAGTCTGGTTTGCCAAATCTAACGAGTAAGATAGTAAATGAGTA
AAAA

QA 1 110 1 110
DS 

RD RR2DK54TF 560 0 0
GCACTAGATCATACTATAACACTAGAGGCATATCATTCATTACACATACAGGAGCCAACA
TAGATACTGAAAATATTATAAGGTCAACGGATGGAGAGTACTCTGGTAGTCTGGTTTGCC
AAATCTAACGAGCAAGATAGTAAATGAGTAGAAATAAACCCAGAAACGATGCCACGAGTG
TCAGCATACTTCGGCTTGATTTTGTTTCAAACACTGTTTTAAACCGGTCCATGGTTCCTG
AGAGAATTCCCCTCGACGAATCCATATCATTACCCATTCTGTCAAGCATGCGGTTATGAG
CATCTACCTCTTCGTTTATATCACCAGAAAGTCGTTTCAAGAGAATGACTCTGTCTTGCA
ACCCTTCCAACCAAAGCACGCTCATTCTCATGCTCATTGATTTCATGAGAGGTGTAAGAA
GAAGAGGAAGCAGCTCTGATTCCTCCCTCTTCAAAGAGCGCACTTCTTCCACCCCGAGGC
TCCCTTCTTGAGGAATAAAACGGTTGAAATGTCGCTGTGGTTTAATCTCTTCAGCGGATC
ATCAACACTCCAACAGACCC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

CO CL7823Contig1 1104 2 2 U
GGGAACGTCATCTTCTCCGCAACTTCACCGGAGAAGACAACAAGAATGCATTGCGGATGT
GCTTTCGCTACACCAGCTCTGTCCCCACGTCTTCCATTCGAAATCAAAACCTCACTTCCG
AAGCTCCGAGCTTCATCAGCCCGAAACCATATCCAGATTAACCATCCCGATGATCTCACA
GACAAATCTCCGGCGACGAGGGTTACGTTACCGTCTCACGTGGATTCCATCACCAGCACT
TCAAACCCTTTTGTCAAACACTGCTCGAAGCTCCGCCAAATCGCCTCTTACCGCCGCGCT
CACGGCTCTGTTCTCGTCGTCGGAGCTATCCCAATCAGGGAAGTATGTATGTTCCAAACG
AACAAGCAAGGAGTCGCCACTGAGATTGACTGTCTTCTTCTCCACGAGGAAGCTCAGATT
CCACTAGGGTTAGAGAGTCTAAGTATACGCGTTGTTCGAGTTAGTTCTTTAGTGATGAAG
AAACTCTCCGGAGTGCGGTCTACTGAATCTGTTGAAGCCGTTGCCTTGATGAGAATCCCT
AGCAGCTTCATCGATCTTGAAGATGATGATGAAGACGTGATCATAACAAGAGATTGTGAG
AAGTGGTTCCCTTCTGCTCACCGAGTTCTTGTTCTTGACAACATACAGGACCCTGGGAAC
CTTGGCACGTTAATCAGATCAGCTATGGCTTTTAATTGTGATGGAGCATTTCTGCTTCCG
GGTTGTTGTGATCCATTCAACGACAAAGCTCTGCGAGCAAGCCGAGGTGCTTCCTTTCAA
CTCCCATTAGTTTCTGGTAACTGGAACCACCTTCAGCTTCTACAACGTGAGTTTCAGATG
AAGCTATTGGCTGGTCATCCAGCGAGTACTACTACTAAGAAACCAGTCTCCAAACTTTCC
TTAGAGTTTGCTCAATCTTTAGCAGACAAGCCTTTATGCTTGATCTTAGGTAGTGAAGGG
CAAGGTTTGTTTGAGCAATCACGACAAGTGTGTGAGCTTGTGAGCATTCCCATGGAAAGT
GAGTTTGAATCTCTTAATGTATCGGTTGCTGGTGGTATTTTCTTATTCATGCTTCAATAA
ATATATAAAAAGTTGACCACTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BS19TF U 1
AF RR2BS19JQ C 269
BS 1 709 RR2BS19TF
BS 710 1104 RR2BS19JQ

RD RR2BS19TF 709 0 0
GGGAACGTCATCTTCTCCGCAACTTCACCGGAGAAGACAACAAGAATGCATTGCGGATGT
GCTTTCGCTACACCAGCTCTGTCCCCACGTCTTCCATTCGAAATCAAAACCTCACTTCCG
AAGCTCCGAGCTTCATCAGCCCGAAACCATATCCAGATTAACCATCCCGATGATCTCACA
GACAAATCTCCGGCGACGAGGGTTACGTTACCGTCTCACGTGGATTCCATCACCAGCACT
TCAAACCCTTTTGTCAAACACTGCTCGAAGCTCCGCCAAATCGCCTCTTACCGCCGCGCT
CACGGCTCTGTTCTCGTCGTCGGAGCTATCCCAATCAGGGAAGTATGTATGTTCCAAACG
AACAAGCAAGGAGTCGCCACTGAGATTGACTGTCTTCTTCTCCACGAGGAAGCTCAGATT
CCACTAGGGTTAGAGAGTCTAAGTATACGCGTTGTTCGAGTTAGTTCTTTAGTGATGAAG
AAACTCTCCGGAGTGCGGTCTACTGAATCTGTTGAAGCCGTTGCCTTGATGAGAATCCCT
AGCAGCTTCATCGATCTTGAAGATGATGATGAAGACGTGATCATAACAAGAGATTGTGAG
AAGTGGTTCCCTTCTGCTCACCGAGTTCTTGTTCTTGACAACATACAGGACCCTGGGAAC
CTTGGCACGTTAATCAGATCAGCTATGGCTTTTAATTGTGATGGAGCAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RR2BS19JQ 836 0 0
AGCTCCGCCAAATCGCCTCTTACCGCCGCGCTCACGGCTCTGTTCTCGTCGTCGGAGCTA
TCCCAATCAGGGAAGTATGTATGTTCCAAACGAACAAGCAAGGAGTCGCCACTGAGATTG
ACTGTCTTCTTCTCCACGAGGAAGCTCAGATTCCACTAGGGTTAGAGAGTCTAAGTATAC
GCGTTGTTCGAGTTAGTTCTTTAGTGATGAAGAAACTCTCCGGAGTGCGGTCTACTGAAT
CTGTTGAAGCCGTTGCCTTGATGAGAATCCCTAGCAGCTTCATCGATCTTGAAGATGATG
ATGAAGACGTGATCATAACAAGAGATTGTGAGAAGTGGTTCCCTTCTGCTCACCGAGTTC
TTGTTCTTGACAACATACAGGACCCTGGGAACCTTGGCACGTTAATCAGATCAGCTATGG
CTTTTAATTGTGATGGAGCATTTCTGCTTCCGGGTTGTTGTGATCCATTCAACGACAAAG
CTCTGCGAGCAAGCCGAGGTGCTTCCTTTCAACTCCCATTAGTTTCTGGTAACTGGAACC
ACCTTCAGCTTCTACAACGTGAGTTTCAGATGAAGCTATTGGCTGGTCATCCAGCGAGTA
CTACTACTAAGAAACCAGTCTCCAAACTTTCCTTAGAGTTTGCTCAATCTTTAGCAGACA
AGCCTTTATGCTTGATCTTAGGTAGTGAAGGGCAAGGTTTGTTTGAGCAATCACGACAAG
TGTGTGAGCTTGTGAGCATTCCCATGGAAAGTGAGTTTGAATCTCTTAATGTATCGGTTG
CTGGTGGTATTTTCTTATTCATGCTTCAATAAATATATAAAAAGTTGACCACTTAT

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 2

CO CL7824Contig1 565 2 1 U
GGATTGTATTTCATAGGAGTGTACAAGAAACAATAATTCCTTTTTGTAAAAGAATTTCCT
CATTTTCAGCCATGAGACAGAGTGTTATGTTAATGGTTTCTTGTGTTCTCACATTTCTCA
TTTTAAATAATGTTAAAGTAGAGGTGGAAGCCGGCATGAAAAAGCTTTTCTGCAAATCAT
TACCAAGCAATCATGCTGGAGAATGCGGAAAAAATGGAATTAATTTATGTGTAGAGGACA
TGAAAAAGATGAGTGCAACAAATACTGGAAAACCTGTGCCAAAAGGATGGGGAGTACAAT
GTACCAAATGTATTGATGATCCTCCCAAGCCAGGTTATATTCGCATGCATCAATGTGAAT
GTCGATATGATTGCTAAATTTTAAAATATATATATGCATAATCTCTTTACTAATAAAGAC
ATGAAATCAATGTAATAGAGATCTTCTTGCGTAGATCTAGCAGGAAAAACAGCTCATGTC
TTATTAATAATTTTCCAAGTTAGATTGGTTATGGTTCAAAATATATATAAAGTTTATCTA
ATAATATCCAAATTCTTATTACCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CI50JQ C 1
AF RR2CI50TF U 1
BS 1 565 RR2CI50TF

RD RR2CI50JQ 565 0 0
GGATTGTATTTCATAGGAGTGTACAAGAAACAATAATTCCTTTTTGTAAAAGAATTTCCT
CATTTTCAGCCATGAGACAGAGTGTTATGTTAATGGTTTCTTGTGTTCTCACATTTCTCA
TTTTAAATAATGTTAAAGTAGAGGTGGAAGCCGGCATGAAAAAGCTTTTCTGCAAATCAT
TACCAAGCAATCATGCTGGAGAATGCGGAAAAAATGGAATTAATTTATGTGTAGAGGACA
TGAAAAAGATGAGTGCAACAAATACTGGAAAACCTGTGCCAAAAGGATGGGGAGTACAAT
GTACCAAATGTATTGATGATCCTCCCAAGCCAGGTTATATTCGCATGCATCAATGTGAAT
GTCGATATGATTGCTAAATTTTAAAATATATATATGCATAATCTCTTTACTAATAAAGAC
ATGAAATCAATGTAATAGAGATCTTCTTGCGTAGATTTAGCAGGAAAAACAGCTCATGTC
TTATTAATAATTTTCCAAGTTAGATTGGTTATGGTTCAAAATATATATAAAGTTTATTTA
ATAATATCCAAATTTTTATTACCTC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2CI50TF 565 0 0
GGATTGTATTTCATAGGAGTGTACAAGAAACAATAATTCCTTTTTGTAAAAGAATTTCCT
CATTTTCAGCCATGAGACAGAGTGTTATGTTAATGGTTTCTTGTGTTCTCACATTTCTCA
TTTTAAATAATGTTAAAGTAGAGGTGGAAGCCGGCATGAAAAAGCTTTTCTGCAAATCAT
TACCAAGCAATCATGCTGGAGAATGCGGAAAAAATGGAATTAATTTATGTGTAGAGGACA
TGAAAAAGATGAGTGCAACAAATACTGGAAAACCTGTGCCAAAAGGATGGGGAGTACAAT
GTACCAAATGTATTGATGATCCTCCCAAGCCAGGTTATATTCGCATGCATCAATGTGAAT
GTCGATATGATTGCTAAATTTTAAAATATATATATGCATAATCTCTTTACTAATAAAGAC
ATGAAATCAATGTAATAGAGATCTTCTTGCGTAGATCTAGCAGGAAAAACAGCTCATGTC
TTATTAATAATTTTCCAAGTTAGATTGGTTATGGTTCAAAATATATATAAAGTTTATCTA
ATAATATCCAAATTCTTATTACCTC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL7825Contig1 838 2 6 U
GTGTAAAAGCGTTTCGTTTAGTAATAATGATGTAAATATTATAGAGAAAGAGTACTAAAA
TAGTGGTAAAAATCATCTTACAAAAAATAACCATTTTTATTCATAGTAGTAATAATCACA
CAACAAAAGTGAAAGCCTCTTGGATCTCATCACTCTAAAATCTTCTTTCGAGTTAAGCTT
ACAACGCAGCAGCATTTTGCGGCTGCTCAAGCTCGACAGGAGAAGCTGTCCGGAGAGGTT
CCTGCAGCTCTGGATTGATCGGAAACAGATGGCACTGTGCGTATTGAGCCATCAATTGAT
CCACAAGAACTAAGGCCACCATTGCTTCCACCATCGGCACAGCTCGTGGAACAACACAGG
GATCATGACGTCCACGCGCAATCATCTCTGTTTCTTGCTTGTCTCTGGTTACAGTGTTCT
GCTTTCTTCCGATTGTAGATGTTGGCTTGAAGGCTACTCTCATGTTTATTATCTCACCGT
TTGATATCCCTCCCTGAATTCCACCGGATCGGTTTGTTTTTGTTCGTATTCTTCCGTTTT
CATCGGTATAGAACTCATCATTGTGTTCGAGACCAGTCAGAAAGGTACCTGAAAAGCCAC
TTCCAAACTCAAAGCCCTTTGTTGCAGGTAACGACATACAAGCTTTTGCCAGTTCTGCTT
CAAGTTTATCGAACACCGGAGTACCAAGCCCACGTGGAGCATTACGAACGATGCAGGTCA
CAACACCACCAACAGAGTTCCCTTTAGTCCTGACAGCATCAATGGCAGCAATCATCTTCT
CTGCATACTCTGGATTGGGGCACCTGACAATGTTGTTTTCTATCTGTTCGAGTGTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F462JQ U 1
AF RR2D804JQ U 43
BS 1 540 RR2F462JQ
BS 541 541 RR2D804JQ
BS 542 592 RR2F462JQ
BS 593 593 RR2D804JQ
BS 594 698 RR2F462JQ
BS 699 838 RR2D804JQ

RD RR2F462JQ 698 0 0
GTGTAAAAGCGTTTCGTTTAGTAATAATGATGTAAATATTATAGAGAAAGAGTACTAAAA
TAGTGGTAAAAATCATCTTACAAAAAATAACCATTTTTATTCATAGTAGTAATAATCACA
CAACAAAAGTGAAAGCCTCTTGGATCTCATCACTCTAAAATCTTCTTTCGAGTTAAGCTT
ACAACGCAGCAGCATTTTGCGGCTGCTCAAGCTCGACAGGAGAAGCTGTCCGGAGAGGTT
CCTGCAGCTCTGGATTGATCGGAAACAGATGGCACTGTGCGTATTGAGCCATCAATTGAT
CCACAAGAACTAAGGCCACCATTGCTTCCACCATCGGCACAGCTCGTGGAACAACACAGG
GATCATGACGTCCACGCGCAATCATCTCTGTTTCTTGCTTGTCTCTGGTTACAGTGTTCT
GCTTTCTTCCGATTGTAGATGTTGGCTTGAAGGCTACTCTCATGTTTATTATCTCACCGT
TTGATATCCCTCCCTGAATTCCACCGGATCGGTTTGTTTTTGTTCGTATTCTTCCGTTTT
TATCGGTATAGAACTCATCATTGTGTTCGAGACCAGTCAGAAAGGTACCTGAGAAGCCAC
TTCCAAACTCAAAGCCCTTTGTTGCAGGTAACGACATACAAGCTTTTGCCAGTTCTGCTT
CAAGTTTATCGAACACCGGAGTACCAAGCCCACGTGGA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RR2D804JQ 796 0 0
G
GAGAAAGAGTACTAAAATAGTGGTAAAAATCATCTTACAAAAAATAACCATTTTTATTCA
TAGTAGTAATAATCACACAACAAAAGTGAAAGCCTCTTGGATCTCATCACTCTAAAATCT
TCTTTCGAGTTAAGCTTACAACGCAGCAGCATTTTGCGGCTGCTCAAGCTCGACAGGAGA
AGCTGTCCGGAGAGGTTCCTGCAGCTCTGGATTGATCGGAAACAGATGGCACTGTGCGTA
TTGAGCCATCAATTGATCCACAAGAACTAAGGCCACCATTGCTTCCACCATCGGCACAGC
TCGTGGAACAACACAGGGATCATGACGTCCACGCGCAATCATCTCTGTTTCTTGCTTGTC
TCTGGTTACAGTGTTCTGCTTTCTTCCGATTGTAGATGTTGGCTTGAAGGCTACTCTCAT
GTTTATTATCTCACCGTTTGATATCCCTCCCTGAATTCCACCGGATCGGTTTGTTTTTGT
TCGTATTCTTCCGTTTTCATCGGTATAGAACTCATCATTGTGTTCGAGACCAGTCAGAAA
GGTACCTGAAAAGCCACTTCCAAACTCAAAGCCCTTTGTTGCAGGTAACGACATACAAGC
TTTTGCCAGTTCTGCTTCAAGTTTATCGAACACCGGAGTACCAAGCCCACGTGGAGCATT
ACGAACGATGCAGGTCACAACACCACCAACAGAGTTCCCTTTAGTCCTGACAGCATCAAT
GGCAGCAATCATCTTCTCTGCATACTCTGGATTGGGGCACCTGACAATGTTGTTTTCTAT
CTGTTCGAGTGTCAG

QA 2 796 2 796
DS 



AS 1 2

CO CL7826Contig1 899 2 2 U
GGTCCAGCCAAACTCATACGCACTAGTGGTGAGCACAGAGAACATAACCCAAAACTGGTA
CTTAGGCAACGACCGATCAATGCTTCTATCTAACTGCATCTTCCGTATGGGTGGAGCCGC
CGTACTTCTCTCGAACCGCTCTTCCGATCGCAGCCGTTCAAAATATCAGCTCATCCACAC
CGTCCGCACGCACAAAGGAGCTGACGACAACGCATTTGGCTGCGTTTACCAACGAGAAGA
CAACAACGCTGAAGAAACCGGCAAGGTCGGAGTCTCCCTCTCCAAAAACCTAATGGCAAT
AGCCGGAGAAGCACTCAAGACAAACATCACAACTCTGGGACCACTCGTCCTACCAATGTC
CGAACAGCTTCTCTTTTTCGCAACCCTCGTGGCACGCAAAGTCTTCAAAGTCAAGAAGAT
CAAGCCTTACATTCCCGATTTCAAGCTAGCGTTCGAGCATTTCTGCATTCATGCTGGAGG
TAGAGCCGTGCTTGACGAGATAGAGAAGAATCTCGATTTGTCCGAATGGCATATGGAGCC
ATCGAGGATGACGTTGAACCGGTTTGGTAATACCTCGAGTAGCTCGCTTTGGTATGAGCT
TGCGTATAGTGAAGCCAAAGGAAGGATTAAGAGAGGAGACAGAACTTGGCAGATTGCTTT
TGGGTCCGGTTTCAAGTGTAATAGTGCAGTTTGGAAAGCTTTGAGAACAATTGATCCGGT
TGAAAAGTCTAACCCATGGAGTGATGAGATTCATGAGTTTCCTGTTGCAGTTCCGAGGAT
CACTCCCGTTACGTCCTCGTAGTTATTTTATATTCATTCTTTGGAGAAATATTTGTTATG
GTTGTCTTTTAAATTTTAATGTACTTATGTGACTTATTCTATTACATATCTGATTGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2HB39TF U 1
AF RR2HB39JQ C 337
BS 1 760 RR2HB39TF
BS 761 899 RR2HB39JQ

RD RR2HB39TF 760 0 0
GGTCCAGCCAAACTCATACGCACTAGTGGTGAGCACAGAGAACATAACCCAAAACTGGTA
CTTAGGCAACGACCGATCAATGCTTCTATCTAACTGCATCTTCCGTATGGGTGGAGCCGC
CGTACTTCTCTCGAACCGCTCTTCCGATCGCAGCCGTTCAAAATATCAGCTCATCCACAC
CGTCCGCACGCACAAAGGAGCTGACGACAACGCATTTGGCTGCGTTTACCAACGAGAAGA
CAACAACGCTGAAGAAACCGGCAAGGTCGGAGTCTCCCTCTCCAAAAACCTAATGGCAAT
AGCCGGAGAAGCACTCAAGACAAACATCACAACTCTGGGACCACTCGTCCTACCAATGTC
CGAACAGCTTCTCTTTTTCGCAACCCTCGTGGCACGCAAAGTCTTCAAAGTCAAGAAGAT
CAAGCCTTACATTCCCGATTTCAAGCTAGCGTTCGAGCATTTCTGCATTCATGCTGGAGG
TAGAGCCGTGCTTGACGAGATAGAGAAGAATCTCGATTTGTCCGAATGGCATATGGAGCC
ATCGAGGATGACGTTGAACCGGTTTGGTAATACCTCGAGTAGCTCGCTTTGGTATGAGCT
TGCGTATAGTGAAGCCAAAGGAAGGATTAAGAGAGGAGACAGAACTTGGCAGATTGCTTT
TGGGTCCGGTTTCAAGTGTAATAGTGCAGTTTGGAAAGCTTTGAGAACAATTGATCCGGT
TGAAAAGTCTAACCCATGGAGTGATGAGATTCATGAGTTT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2HB39JQ 563 0 0
GGGACCACTCGTCCTACCAATGTCCGAACAGCTTCTCTTTTTCGCAACCCTCGTGGCACG
CAAAGTCTTCAAAGTCAAGAAGATCAAGCCTTACATTCCCGATTTCAAGCTAGCGTTCGA
GCATTTCTGCATTCATGCTGGAGGTAGAGCCGTGCTTGACGAGATAGAGAAGAATCTCGA
TTTGTCCGAATGGCATATGGAGCCATCGAGGATGACGTTGAACCGGTTTGGTAATACCTC
GAGTAGCTCGCTTTGGTATGAGCTTGCGTATAGTGAAGCCAAAGGAAGGATTAAGAGAGG
AGACAGAACTTGGCAGATTGCTTTTGGGTCCGGTTTCAAGTGTAATAGTGCAGTTTGGAA
AGCTTTGAGAACAATTGATCCGGTTGAAAAGTCTAACCCATGGAGTGATGAGATTCATGA
GTTTCCTGTTGCAGTTCCGAGGATCACTCCCGTTACGTCCTCGTAGTTATTTTATATTCA
TTCTTTGGAGAAATATTTGTTATGGTTGTCTTTTAAATTTTAATGTACTTATGTGACTTA
TTCTATTACATATCTGATTGCAC

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 2

CO CL7827Contig1 751 2 2 U
GAAATCTACAAATTTGTTTGATTTTGTGGCGATCAGTTCGAGACTTGACGACTCCGCCAT
GAACACGGAATCAGTAGTGGAGTTCCTTGGAAACGTTCCCTTACTTCAGAAGCTGCCTAG
TTCTTCTCTTAAGAAAATCGCCCAAGTTGTTGTCTTGAAACGATACGGGAAAGGGGAGTA
TGTGATCCGTGAAGAGCAAGCTTGGGATGGTTGCTATTTCATTTTCTCTGGAGAGGCTCA
AGTTTCCGGACCCGACGATGAAGAAAATCGTTCCGAGTTTCTCTTGAAACAATATGATTA
CTTCGGCCATGGTATTTCTGCCCATGTTCATTCTGCTGACATTATTGCTACCTCCGAGCT
CACATGTTTGGTGTTGCCACGTGATCATTGCTGTTTGCTTCAGACCAACTCAATCTGGCA
GTCTGATCAAGAAGTTGACAAATGCTCTTTAGTTGAACGCATTTTACAACTTGACCCTTT
AGAACTGAACATCTTCAGGGGTATCACTCTACCTGATGCTCCCAAATTTGGCAAAGTTTT
CGGTGGTCAATTTATGGGACAGGCACTTGCTGCGGCATCAAAAACTGTTGATTTCCGGAA
GATTGTCCACAGTTTTCATTCTTATTTTCTTCTCGTTGGAGATATCGACATCCCCATTAT
ATATCAAGTTCACCGTATACGTGATGGGAACAACTTTGCCACCCGAAGAGTAGATGCTAT
ACAGAAAGGGAATATCATTTTCATATTGATG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV81TF U 1
AF RR2F166TF U 2
BS 1 730 RR2CV81TF
BS 731 751 RR2F166TF

RD RR2CV81TF 730 0 0
GAAATCTACAAATTTGTTTGATTTTGTGGCGATCAGTTCGAGACTTGACGACTCCGCCAT
GAACACGGAATCAGTAGTGGAGTTCCTTGGAAACGTTCCCTTACTTCAGAAGCTGCCTAG
TTCTTCTCTTAAGAAAATCGCCCAAGTTGTTGTCTTGAAACGATACGGGAAAGGGGAGTA
TGTGATCCGTGAAGAGCAAGCTTGGGATGGTTGCTATTTCATTTTCTCTGGAGAGGCTCA
AGTTTCCGGACCCGACGATGAAGAAAATCGTTCCGAGTTTCTCTTGAAACAATATGATTA
CTTCGGCCATGGTATTTCTGCCCATGTTCATTCTGCTGACATTATTGCTACCTCCGAGCT
CACATGTTTGGTGTTGCCACGTGATCATTGCTGTTTGCTTCAGACCAACTCAATCTGGCA
GTCTGATCAAGAAGTTGACAAATGCTCTTTAGTTGAACGCATTTTACAACTTGACCCTTT
AGAACTGAACATCTTCAGGGGTATCACTCTACCTGATGCTCCCAAATTTGGCAAAGTTTT
CGGTGGTCAATTTATGGGACAGGCACTTGCTGCGGCATCAAAAACTGTTGATTTCCGGAA
GATTGTCCACAGTTTTCATTCTTATTTTCTTCTCGTTGGAGATATCGACATCCCCATTAT
ATATCAAGTTCACCGTATACGTGATGGGAACAACTTTGCCACCCGAAGAGTAGATGCTAT
ACAGAAAGGG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RR2F166TF 750 0 0
GG
ATCTACAAATTTGTTTGATTTTGTGGCGATCAGTTCGAGACTTGACGACTCCGCCATGAA
CACGGAATCAGTAGTGGAGTTCCTTGGAAACGTTCCCTTACTTCAGAAGCTGCCTAGTTC
TTCTCTTAAGAAAATCGCCCAAGTTGTTGTCTTGAAACGATACGGGAAAGGGGAGTATGT
GATCCGTGAAGAGCGAGCTTGGGATGGTTGCTATTTCATTTTCTCTGGAGAGGCTCAAGT
TTCCGGACCCGACGATGAAGAAAATCGTTCCGAGTTTCTCTTGAAACAATATGATTACTT
CGGCCATGGTATTTCTGCCCATGTTCATTCTGCTGACATTATTGCTACCTCCGAGCTCAC
ATGTTTGGTGTTGCCGCGTGATCATTGCTGTTTGCTTCAGACCAACTCAATCTGGCAGTC
TGATCAAGAAGTTGACAAATGCTCTTTAGTTGAACGCATTTTACAACTTGACCCTTTAGA
ACTGAACATCTTCAGGGGTATCACTCTACCTGATGCTCCCAAATTTGGCAAAGTTTTCGG
TGGTCAATTTATGGGACAGGCACTTGCTGCGGCATCAAAAACTGTTGATTTCCGGAAGAT
TGTCCACAGTTTTCATTCTTATTTTCTTCTCGTTGGAGATATCGACATCCCCATTATATA
TCAAGTTCACCGTATACGTGATGGGAACAACTTTGCCACCCGAAGAGTAGATGCTATACA
GAAAGGGAATATCATTTTCATATTGATG

QA 3 750 3 750
DS 



AS 1 2

CO CL7828Contig1 743 2 2 U
GGAAACCCATAAACACAGACGTCCCTGAAAAGGATGTCTTTGCCCTCCACTTCCTTCAAT
CCCTCTCAAATCTCAGAAGACAAAACGCTTTCAATTCTCCTGAAGACACAACAAACAACC
GTGTGAAGAAGATCAAGAAGGCTGCATACGTATCCATGGCCAGAGCAGCCGGAGGGACTA
ATCGGCTGTGGAGCAGAGCCCTCTTGCGCCGAGCCGCCAAAGAGAACAACAAAGTCGTAA
GATTTTCTAGAAGGAAGAAGAGGGTGACGTGGCTGAGGAGGAGTAACCGGAGTGATCCAG
TGGATGCGGAGAGGCTGAGGAATCTTCTACCGGGAGGCGGAGCAATGGAGACATCAAAGC
TGATGGAAGAGACGGCTCATTACATCAAGTGCCTTAGTATGCAGGTCAAGGTTATGCAGT
GTCTCGTTGACGGCTTATCTGCCAAATGATCATCATCAATGATGCATATAATATTTGGCT
TATCTCCAACATACATAGTATTGGAATTGGGTGATCATTACGCATATATATGTGTACATA
TATTCTTATATGTTATATATACATACGTGTAAGATAGGATATATACATACGAAATGTGTG
GATATGTTTTAGTTAAGTAAAGAAAGAATTTTCTTCTTTTAGTTTTCTTTTCTTTAATTT
TGATAATAAGGAATTTTTTTATATATATATATATCATGGTATTGCTTTCTTGTATTAAAA
TATTATAAACATTAGGGTTTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D821TF U 1
AF RR2D821JQ C 111
BS 1 664 RR2D821TF
BS 665 743 RR2D821JQ

RD RR2D821TF 664 0 0
GGAAACCCATAAACACAGACGTCCCTGAAAAGGATGTCTTTGCCCTCCACTTCCTTCAAT
CCCTCTCAAATCTCAGAAGACAAAACGCTTTCAATTCTCCTGAAGACACAACAAACAACC
GTGTGAAGAAGATCAAGAAGGCTGCATACGTATCCATGGCCAGAGCAGCCGGAGGGACTA
ATCGGCTGTGGAGCAGAGCCCTCTTGCGCCGAGCCGCCAAAGAGAACAACAAAGTCGTAA
GATTTTCTAGAAGGAAGAAGAGGGTGACGTGGCTGAGGAGGAGTAACCGGAGTGATCCAG
TGGATGCGGAGAGGCTGAGGAATCTTCTACCGGGAGGCGGAGCAATGGAGACATCAAAGC
TGATGGAAGAGACGGCTCATTACATCAAGTGCCTTAGTATGCAGGTCAAGGTTATGCAGT
GTCTCGTTGACGGCTTATCTGCCAAATGATCATCATCAATGATGCATATAATATTTGGCT
TATCTCCAACATACATAGTATTGGAATTGGGTGATCATTACGCATATATATGTGTACATA
TATTCTTATATGTTATATATACATACGTGTAAGATAGGATATATACATACGAAATGTGTG
GATATGTTTTAGTTAAGTAAAGAAAGAATTTTCTTCTTTTAGTTTTCTTTTCTTTAATTT
TGAT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2D821JQ 633 0 0
ACAAACAACCGTGTGAAGAAGATCAAGAAGGCTGCATACGTATCCATGGCCAGAGCAGCC
GGAGGGACTAATCGGCTGTGGAGCAGAGCCCTCTTGCGCCGAGCCGCCAAAGAGAACAAC
AAAGTCGTAAGATTTTCTAGAAGGAAGAAGAGGGTGACGTGGCTGAGGAGGAGTAACCGG
AGTGATCCAGTGGATGCGGAGAGGCTGAGGAATCTTCTACCGGGAGGCGGAGCAATGGAG
ACATCAAAGCTGATGGAAGAGACGGCTCATTACATCAAGTGCCTTAGTATGCAGGTCAAG
GTTATGCAGTGTCTCGTTGACGGCTTATCTGCCAAATGATCATCATCAATGATGCATATA
ATATTTGGCTTATCTCCAACATACATAGTATTGGAATTGGGTGATCATTACGCATATATA
TGTGTACATATATTCTTATATGTTATATATACATACGTGTAAGATAGGATATATACATAC
GAAATGTGTGGATATGTTTTAGTTAAGTAAAGAAAGAATTTTCTTCTTTTAGTTTTCTTT
TCTTTAATTTTGATAATAAGGAATTTTTTTATATATATATATATCATGGTATTGCTTTCT
TGTATTAAAATATTATAAACATTAGGGTTTGGG

QA 1 633 1 633
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7830Contig1 569 2 1 U
GAGTTTTCTGTCCGAAAAAATCAATCATTGCTTCATGATATATTAAGCAAAGTGTCCCTG
GAGGATTGAAAATTGAGTTTTTCGATTATAATTCTGCGATTTCGTCCAGAATCAGTAGAT
TGAAGCTTTCCACAATGGAAGGTGTTTCAAAAAAGATTTGTTTCAATTCTTCAGAAGCTT
CGAGGTTGGCACATCCGGCAATTTGAATGAAGGCTTTGAAGAGTCAACGGTTGTTAGGAG
GACACTGATTACAAGAGGTTTCACGGGAGCATGAAACTTTAAAATTGACAAGGTTCAACG
TCTTCGTGAAGAAGGAAGAAAGAGCGTGGGGCAGTGATTCCGGTGAAGCTTACGGCGGAG
ATGCGTCTGGCGGTGAGTCTGTGAACACTCTCTAGTATGAAAGACACGTGTACTCAGTTG
GACAGAGAAGAGCTTTGGGGCGGTGCATCCAAAATTGGACTTTAAAATTTTATTATTCTG
TGTAATCTCTTCGGGGCTTGTTCGTTTAACCTGTTTCCATTTGTATTGTCTTAGAGCTTT
AAGTGAATGAATTCAGTTATGAGTTAAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CJ28JQ C 1
AF RR2CJ28TF U 1
BS 1 569 RR2CJ28TF

RD RR2CJ28JQ 569 0 0
GAGTTTTCTGTCCGAAAAAATCAATCATTGCTTCATGATATATTAAGCAAAGTGTCCCTG
GAGGATTGAAAATTGAGTTTTTCGATTATAATTTTGCGATTTCGTCCAGAATCAGTAGAT
TGAAGCTTTCCACAATGGAAGGTGTTTCAAAAAAGATTTGTTTCAATTTTTCAGAAGCTT
CGAGGTTGGCACATCCGGCAATTTGAATGAAGGCTTTGAAGAGTCAACGGTTGTTAGGAG
GACACTGATTACAAGAGGTTTCACGGGAGCATGAAACTTTAAAATTGACAAGGTTCAACG
TCTTCGTGAAGAAGGAAGAAAGAGCGTGGGGCAGTGATTCCGGTGAAGCTTACGGCGGAG
ATGCGTCTGGCGGTGAGTCTGTGAACACTCTCTAGTATGAAAGACACGTGTACTCAGTTG
GACAGAGAAGAGCTTTGGGGCGGTGCATCCAAAATTGGACTTTAAAATTTTATTATTCTG
TGTAATTTTTTCGGGGCTTGTTCGTTTAACCTGTTTCCATTTGTATTGTCTTAGAGCTTT
AAGTGAATGAATTCAGTTATGAGTTAAGG

QA 1 569 1 569
DS 

RD RR2CJ28TF 569 0 0
GAGTTTTCTGTCCGAAAAAATCAATCATTGCTTCATGATATATTAAGCAAAGTGTCCCTG
GAGGATTGAAAATTGAGTTTTTCGATTATAATTCTGCGATTTCGTCCAGAATCAGTAGAT
TGAAGCTTTCCACAATGGAAGGTGTTTCAAAAAAGATTTGTTTCAATTCTTCAGAAGCTT
CGAGGTTGGCACATCCGGCAATTTGAATGAAGGCTTTGAAGAGTCAACGGTTGTTAGGAG
GACACTGATTACAAGAGGTTTCACGGGAGCATGAAACTTTAAAATTGACAAGGTTCAACG
TCTTCGTGAAGAAGGAAGAAAGAGCGTGGGGCAGTGATTCCGGTGAAGCTTACGGCGGAG
ATGCGTCTGGCGGTGAGTCTGTGAACACTCTCTAGTATGAAAGACACGTGTACTCAGTTG
GACAGAGAAGAGCTTTGGGGCGGTGCATCCAAAATTGGACTTTAAAATTTTATTATTCTG
TGTAATCTCTTCGGGGCTTGTTCGTTTAACCTGTTTCCATTTGTATTGTCTTAGAGCTTT
AAGTGAATGAATTCAGTTATGAGTTAAGG

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

CO CL7831Contig1 553 2 1 U
GGAATCGGTTCTTGGAAGGGTTGAGACTAGAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCGGTTCCAC
TTTCTTTCTCGTCCTCTCTCTCCAATGCCTATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATT
TCCGCAATCCTCGTTCGATGTTTGAGATTCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGGTTCGAA
GAACATCTTTAAAGTGCAATTGCTGCAGCAAAGGGAACGGAGGTGAAAACGAAAACAGAA
ATGTGTTAGATGCTTTCTTTCTGGGAAAGGCACTAGCTGAGGTTATCAACCAGCTGCTGG
TGTTGTTGCCTCTGTTGTAACCCCTACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATGA
TGAAAAGCTGCCGGGTTTCTCCGGATCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTC
TAGCGACGAAGACAGCGACTAAGGGATTGTTCCTTGGGCCAATTTCAAGGTTTGGTTATA
GTATCAGACTTGTTTGAAACGGTTGAGACATCTTCGTTGATATATGTACTTATTACGATG
GAAGTTGAGAATA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ET02JQ C 1
AF RR2ET02TF U 1
BS 1 553 RR2ET02TF

RD RR2ET02JQ 553 0 0
GGAATCGGTTCTTGGAAGGGTTGAGACTAGAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCGGTTCCAC
TTTCTTTCTCGTCCTCTCTCTCCAATGCCTATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATT
TCCGCAATCCTCGTTCGATGTTTGAGATTCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGGTTCGAA
GAACATCTTTAAAGTGCAATTGCTGCAGCAAAGGGAACGGAGGTGAAAACGAAAACAGAA
ATGTGTTAGATGCTTTCTTTCTGGGAAAGGCACTAGCTGAGGTTATCAACCAGCTGCTGG
TGTTGTTGCCTCTGTTGTAACCCCTACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATGA
TGAAAAGCTGCCGGGTTTCTCCGGATCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTC
TAGCGACGAAGACAGCGACTAAGGGATTGTTCCTTGGGCCAATTTCAAGGTTTGGTTATA
GTATCAGACTTGTTTGAAACGGTTGAGACATCTTCGTTGATATATGTACTTATTACGATG
GAAGTTGAGAATA

QA 1 553 1 553
DS 

RD RR2ET02TF 553 0 0
GGAATCGGTTCTTGGAAGGGTTGAGACTAGAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCGGTTCCAC
TTTCTTTCTCGTCCTCTCTCTCCAATGCCTATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATT
TCCGCAATCCTCGTTCGATGTTTGAGATTCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGGTTCGAA
GAACATCTTTAAAGTGCAATTGCTGCAGCAAAGGGAACGGAGGTGAAAACGAAAACAGAA
ATGTGTTAGATGCTTTCTTTCTGGGAAAGGCACTAGCTGAGGTTATCAACCAGCTGCTGG
TGTTGTTGCCTCTGTTGTAACCCCTACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATGA
TGAAAAGCTGCCGGGTTTCTCCGGATCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTC
TAGCGACGAAGACAGCGACTAAGGGATTGTTCCTTGGGCCAATTTCAAGGTTTGGTTATA
GTATCAGACTTGTTTGAAACGGTTGAGACATCTTCGTTGATATATGTACTTATTACGATG
GAAGTTGAGAATA

QA 1 553 1 553
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7833Contig1 598 2 6 U
GGGGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTGTGCAATAGAAGGAACATCATCAT
GGCCTTATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTATTTCCAATCCTGGAGCCATAAA
GCTAGGCAAAATCACAAACCCTTGTCGGATTCATGTACCGCAGCTTGCTGGAAGCCGATC
CACCTTCGCTTCTGGTTCTCCTCTATTGCCATTGGACTTGAGAGTGACTCGTGGAAGAGT
AAGAAGTGGAAGCAGAGGAGGAGCATCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGAAGG
AGGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCAT
TTCTGTTGAGATCGCTACTGGTGAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATT
GCCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACCGCATTGGTTGGTGTTCTAAATGCAGTTTTCATCTT
CCAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTTCCCCCATCTGTTTATTTGTCATCTTTTTG
TTGTATCTAAGATTCTTCTCTCATGAAAACTCTACATTCAGCAGAATGAAATCCCTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A596JQ C 1
AF RR2A596TF U 1
BS 1 277 RR2A596TF
BS 278 278 RR2A596JQ
BS 279 464 RR2A596TF
BS 465 465 RR2A596JQ
BS 466 573 RR2A596TF
BS 574 598 RR2A596JQ

RD RR2A596JQ 598 0 0
GGGGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTGTGCAATAGAAGGAACATCATCAT
GGCCTTATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTATTTCCAATCCTGGAGCCATAAA
GCTAGGCAAAATCACAAACCCTTGTCGGATTCATGTACCGCAGCTTGCTGGAAGCCGATC
CACCTTCGCTTCTGGTTCTCCTCTATTGCCATTGGACTTGAGAGTGACTCGTGGAAGAGT
AAGAAGTGGAAGCAGAGGAGGAGCATCAGTTTCCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGAAGG
AGGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCAT
TTTTGTTGAGATCGCTACTGGTGAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATT
GCCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACCGCATTGGTTGGTGTTCTAAATGCGGTTTTCATCTT
CCAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTTCCCCCATCTGTTTATTTGTCATCTTTTTG
TTGTATTTAAGATTCTTCTCTCATGAAAACTCTACATTCAGCAGAATGAAATCCCTAT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2A596TF 573 0 0
GGGGCGCGAATTGGATATTAACAGCGAAAAAGATCTGTGCAATAGAAGGAACATCATCAT
GGCCTTATCTCAAGTATCTGCGTCTCTAGCCTTCTCTATTTCCAATCCTGGAGCCATAAA
GCTAGGCAAAATCACAAACCCTTGTCGGATTCATGTACCGCAGCTTGCTGGAAGCCGATC
CACCTTCGCTTCTGGTTCTCCTCTATTGCCATTGGACTTGAGAGTGACTCGTGGAAGAGT
AAGAAGTGGAAGCAGAGGAGGAGCATCAGTTTCCATCGGAAGCGAGCAAAGTTCAGAAGG
AGGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTGGCGCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCAT
TTCTGTTGAGATCGCTACTGGTGAAGGACTTCTTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATT
GCCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACCGCATTGGTTGGTGTTCTAACTGCAGTTTTCATCTT
CCAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTTCCCCCATCTGTTTATTTGTCATCTTTTTG
TTGTATCTAAGATTCTTCTCTCATGAAAACTCT

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL7834Contig1 1048 2 6 U
GGGAAACGATCTGGCTGATAATCAGAAATGGCTAAGACAGGGGAAAGCCTGAGAGACAAA
CCAAGATGGAACCTTGGAGGAATGACCGCTCTCGTCACCGGTGGTACCAAAGGCCTTGGG
GAAGCCGTGGTGAAGGAACTAGCCATGTTGGGAGCCAGAGTCCACACGTGCGCCAGAGAC
GAAACTCAGCTTCAAGAAAGCTTACATGAGTGGCAAGCAAACGGGTTTGATGTCACCACT
TCTGTCTGCGACGTTTCTTCTCCTCACCAACGAGAGAAACTCATAGAAACCGTTTCCTCT
GTCTTCCAAGGAAAACTCAACATCTTCGTAAGCAATGTGGGAAGGGGTGTTGTGAAGCCG
ACCATAGAGTGTACATCAGAAGAATTCTCGTTTATCATGGCTACAAATCTGGAGTCAGCG
TTTCATCTAGCACAGCTCGCGCACCCGCTGTTGAAAGCCTCTGGTTCAGGGAACATTGTG
CTCATGTCATCTGTTGCTGGGGTTGTAAATTTGAGTCTTACATCCATCTATGGAGCAACC
AAAGGCATACATACATATATGCATAATCAAATAGTTAATAACCCTTTTGCTTCTATTGTA
ACATTAATTTTCTCACTCTAGGAGCCATGAATCAGCTAGCGAGAAACTTGGCGTGCGAGT
GGGCGAGTGATAACATAAGGGTTAACTCTGTTTGTCCATGGTTCATCAAAACTCCCTCAA
CTAAAGATTTTCTCATTGGTGAAGTAGAAGAAAAGGTGGAAAGTGTGACACCAATGGGGC
GTGTTGGAGAGGCAAATGAAGTGTCATCGCTTGTGGCATTTCTCTGTCTTCCTGCAGCTT
CTTATATCACTGGGCAGACCATCTGCGTTGATGGAGGTTTCACTATCAACGGCTTCTCAT
TCCCTTAAATTACATATATGTATAATTGCCAAATTGTAAAATAATATTGTCAATTACCTT
GTGAACTTTGAACCATCTGTGTTGATGATGGCCATATTTACATATATGTTTACATTCAAA
TATTCAATATATGTTTCAGATTTTAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES65TF U 1
AF RR2ES65JQ C 231
BS 1 753 RR2ES65TF
BS 754 754 RR2ES65JQ
BS 755 756 RR2ES65TF
BS 757 757 RR2ES65JQ
BS 758 785 RR2ES65TF
BS 786 1048 RR2ES65JQ

RD RR2ES65TF 785 0 0
GGGAAACGATCTGGCTGATAATCAGAAATGGCTAAGACAGGGGAAAGCCTGAGAGACAAA
CCAAGATGGAACCTTGGAGGAATGACCGCTCTCGTCACCGGTGGTACCAAAGGCCTTGGG
GAAGCCGTGGTGAAGGAACTAGCCATGTTGGGAGCCAGAGTCCACACGTGCGCCAGAGAC
GAAACTCAGCTTCAAGAAAGCTTACATGAGTGGCAAGCAAACGGGTTTGATGTCACCACT
TCTGTCTGCGACGTTTCTTCTCCTCACCAACGAGAGAAACTCATAGAAACCGTTTCCTCT
GTCTTCCAAGGAAAACTCAACATCTTCGTAAGCAATGTGGGAAGGGGTGTTGTGAAGCCG
ACCATAGAGTGTACATCAGAAGAATTCTCGTTTATCATGGCTACAAATCTGGAGTCAGCG
TTTCATCTAGCACAGCTCGCGCACCCGCTGTTGAAAGCCTCTGGTTCAGGGAACATTGTG
CTCATGTCATCTGTTGCTGGGGTTGTAAATTTGAGTCTTACATCCATCTATGGAGCAACC
AAAGGCATACATACATATATGCATAATCAAATAGTTAATAACCCTTTTGCTTCTATTGTA
ACATTAATTTTCTCACTCTAGGAGCCATGAATCAGCTAGCGAGAAACTTGGCGTGCGAGT
GGGCGAGTGATAACATAAGGGTTAACTCTGTTTGTCCATGGTTCATCAAAACTCCCTCAA
CTAAAGATTTTCTCATTGGTGAAGTAGAAGAAAGGG*GGAAAGTGTGACACCAATGGGGC
GTGTT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RR2ES65JQ 818 0 0
TGTCACCACT*CTGTCTGCGACGTTTCTTCTCCTCACCAACGAGAGAAACTCATAGAAAC
CGTTTCCTCTGTCTTCCAAGGAAAACTCAACATCTTCGTAAGCAATGTGGGAAGGGGTGT
TGTGAAGCCGACCATAGAGTGTACATCAGAAGAATTCTCGTTTATCATGGCTACAAATCT
GGAGTCAGCGTTTCATCTAGCACAGCTCGCGCACCCGCTGTTGAAAGCCTCTGGTTCAGG
GAACATTGTGCTCATGTCATCTGTTGCTGGGGTTGTAAATTTGAGTCTTACATCCATCTA
TGGAGCAACCAAAGGCATACATACATATATGCATAATCAAATAGTTAATAACCCTTTTGC
TTCTATTGTAACATTAATTTTCTCACTCTAGGAGCCATGAATCAGCTAGCGAGAAACTTG
GCGTGCGAGTGGGCGAGTGATAACATAAGGGTTAACTCTGTTTGTCCATGGTTCATCAAA
ACTCCCTCAACTAAAGATTTTCTCATTGGTGAAGTAGAAGAAAAGGTGGAAAGTGTGACA
CCAATGGGGCGTGTTGGAGAGGCAAATGAAGTGTCATCGCTTGTGGCATTTCTCTGTCTT
CCTGCAGCTTCTTATATCACTGGGCAGACCATCTGCGTTGATGGAGGTTTCACTATCAAC
GGCTTCTCATTCCCTTAAATTACATATATGTATAATTGCCAAATTGTAAAATAATATTGT
CAATTACCTTGTGAACTTTGAACCATCTGTGTTGATGATGGCCATATTTACATATATGTT
TACATTCAAATATTCAATATATGTTTCAGATTTTAGCG

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL7835Contig1 1058 2 4 U
GGACTCACATGCAAAACAAAGAAATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAAGGCATGACTGCTC
TTGTAACTGGTGGAGCCTGCGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAAGAGTTAGCTAGTTTTG
GAGCTATAATCCATGTATGTGACATATCCGAAACACTGCTTAATAAAAGTTTAAGCGACT
GGGAAAAGAAAGGGTTCCAAGTTAGTGGTTCAATATGTGATGTATCCTCTCGTCCCGAGA
GAGAAACACTGATGCAAACCGTCTCAAAGATGTTCGATGGCAAGCTGAGCATTCTTGTGA
ATAACGTTGGGGGAATTCGCCTTAAACCAACAACAGAATATGTGGCAGATGATTTCTCGT
TCCATATTTCAACAAACTTGGAATCAGCTTATCATCTTAGCCAGCTTTCACATCCTCTTT
TAAAGGCTTCTGGATATGGAAGCATTGTTATGAATTCTTCTGTTGGAGGGGTGGTATCAA
TGGAATGCGGATCCCTTTATGGTTTATCGAAAGGAGCTATGAATCAGCTATCAAGAAGTT
TGGCGTGTGAGTGGGCAACTGATGGCATAAGAACCAACTCTGTTGCTCCTAATTTTATCC
TCACTGATATGACTGCACCTGTTCTCGGAGACGTTTGTTACAAGAAGAGTTTGTTTAGTA
GAACTCCACTTGCTCGCGCTGGAGAGCCAAAAGAGGTTGCATCACTTGTGGCTTTTCTGT
GTCTGCCTGCAGCTTCATATATTACTGGTCAGACTATTTGTGTTGATGGAGGTCTCACTG
TCAATGGTTTCTCCTATCAGCCGAAGCTTCGAGCCATACTTGTGTGTGTGTGTCTGAATA
ATTTGTCTGGGCAAATAAGAAGAAAGTGATCCTTCTTGCTGTAGGAACATTATCTCATTT
TCCATTTCCACAAGTTAAGGAATCGATGATTCCTTTTCTTTTGTTTCCTATATACACATA
TAAATCATAAAATAATAATGAATAAAGACAGGAGAACTTTGTTTTTTTTAAAGGAAAGTG
TTCTTATGTTTCGTGTTACTAAGATCAAGAATTCTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AV74TF U 1
AF RR2AV74JQ C 200
BS 1 695 RR2AV74TF
BS 696 696 RR2AV74JQ
BS 697 767 RR2AV74TF
BS 768 1058 RR2AV74JQ

RD RR2AV74TF 767 0 0
GGACTCACATGCAAAACAAAGAAATGGATAAAAGATGGAGTCTTCAAGGCATGACTGCTC
TTGTAACTGGTGGAGCCTGCGGAATCGGGTATGCCATAGTAGAAGAGTTAGCTAGTTTTG
GAGCTATAATCCATGTATGTGACATATCCGAAACACTGCTTAATAAAAGTTTAAGCGACT
GGGAAAAGAAAGGGTTCCAAGTTAGTGGTTCAATATGTGATGTATCCTCTCGTCCCGAGA
GAGAAACACTGATGCAAACCGTCTCAAAGATGTTCGATGGCAAGCTGAGCATTCTTGTGA
ATAACGTTGGGGGAATTCGCCTTAAACCAACAACAGAATATGTGGCAGATGATTTCTCGT
TCCATATTTCAACAAACTTGGAATCAGCTTATCATCTTAGCCAGCTTTCACATCCTCTTT
TAAAGGCTTCTGGATATGGAAGCATTGTTATGAATTCTTCTGTTGGAGGGGTGGTATCAA
TGGAATGCGGATCCCTTTATGGTTTATCGAAAGGAGCTATGAATCAGCTATCAAGAAGTT
TGGCGTGTGAGTGGGCAACTGATGGCATAAGAACCAACTCTGTTGCTCCTAATTTTATCC
TCACTGATATGACTGCACCTGTTCTCGGAGACGTTTGTTACAAGAAGAGTTTGTTTAGTA
GAACTCCACTTGCTCGCGCTGGAGAGCCAAAAGAG*TTGCATCACTTGTGGCTTTTCTGT
GTCTGCCTGCAGCTTCATATATTACTGGTCAGACTATTTGTGTTGAT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RR2AV74JQ 859 0 0
AGTTAGTGGTTCAATATGTGATGTATCCTCTCGTCCCGAGAGAGAAACACTGATGCAAAC
CGTCTCAAAGATGTTCGATGGCAAGCTGAGCATTCTTGTGAATAACGTTGGGGGAATTCG
CCTTAAACCAACAACAGAATATGTGGCAGATGATTTCTCGTTCCATATTTCAACAAACTT
GGAATCAGCTTATCATCTTAGCCAGCTTTCACATCCTCTTTTAAAGGCTTCTGGATATGG
AAGCATTGTTATGAATTCTTCTGTTGGAGGGGTGGTATCAATGGAATGCGGATCCCTTTA
TGGTTTATCGAAAGGAGCTATGAATCAGCTATCAAGAAGTTTGGCGTGTGAGTGGGCAAC
TGATGGCATAAGAACCAACTCTGTTGCTCCTAATTTTATCCTCACTGATATGACTGCACC
TGTTCTCGGAGACGTTTGTTACAAGAAGAGTTTGTTTAGTAGAACTCCACTTGCTCGCGC
TGGAGAGCCAAAAGAGGTTGCATCACTTGTGGCTTTTCTGTGTCTGCCTGCAGCTTCATA
TATTACTGGTCAGACTATTTGTGTTGATGGAGGTCTCACTGTCAATGGTTTCTCCTATCA
GCCGAAGCTTCGAGCCATACTTGTGTGTGTGTGTCTGAATAATTTGTCTGGGCAAATAAG
AAGAAAGTGATCCTTCTTGCTGTAGGAACATTATCTCATTTTCCATTTCCACAAGTTAAG
GAATCGATGATTCCTTTTCTTTTGTTTCCTATATACACATATAAATCATAAAATAATAAT
GAATAAAGACAGGAGAACTTTGTTTTTTTTAAAGGAAAGTGTTCTTATGTTTCGTGTTAC
TAAGATCAAGAATTCTACT

QA 1 859 1 859
DS 



AS 1 2

CO CL7836Contig1 761 2 2 U
GGGGCAGAAGAACATACCCAAATTCTCAGTTCAAATCTCAACGATTCACACTAAACGTAG
TTTGCGGTAGTGAGGAAACATTTCGAGCTCGACGATCCCACCTAAAGAAAAGGCTGGTTG
TTCATGCTAAGCTGTCTTTTGTACTGTCTTCATTCTTGACCTCGAGGTGGATCGCGTCTC
ATCTCTTTCTTCACCGACTCCACATTAAGGGTTTGTATCAACGAAATAAGGATTTTCTCG
TTTATAAATGAGCAGAGTTTAACAAAGTAGCTTATATTTGGTTATTTCGCTATCATTTTC
TTATTCTTTATCATTTTAAAAAGAGGTTCGAACAAGGGTTTTGCTATCAGTCCAAAAGCT
TACTTTATCAGGAGATGTCAAAGCTCTGAAATGGAGTGTATATATATTAGAAGCTGGACT
TTTTCTTATGATAAACTTCCCACCGAGCCCATTAGACTCTCCGTTCTCAAACTACATGGC
TCTTCCGTCAGTAAAAAGTGTACCATCATCATACTATCTTTACTTTTCGTTTATAGCTCA
GCAACCCTTGGAGATTCCAAGCTTGCCATAGAGACACGTCCCCAAGATCTCATGGAAGGT
GATGAGGTTTATAGCCAATCTTCCATCTCATTTTCGTGATAGGTCAAGGCAGGAGTGGGA
TTCAGTACATAAAAAGACGTTATATAATTGTTTCAGGTAATGTTCAAGAACCATGTGTCC
GGTCTTGCAAACAAAATAATTCGCAAGTCCTTTAACTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG15TF U 1
AF RR2CG15JQ C 66
BS 1 638 RR2CG15TF
BS 639 761 RR2CG15JQ

RD RR2CG15TF 638 0 0
GGGGCAGAAGAACATACCCAAATTCTCAGTTCAAATCTCAACGATTCACACTAAACGTAG
TTTGCGGTAGTGAGGAAACATTTCGAGCTCGACGATCCCACCTAAAGAAAAGGCTGGTTG
TTCATGCTAAGCTGTCTTTTGTACTGTCTTCATTCTTGACCTCGAGGTGGATCGCGTCTC
ATCTCTTTCTTCACCGACTCCACATTAAGGGTTTGTATCAACGAAATAAGGATTTTCTCG
TTTATAAATGAGCAGAGTTTAACAAAGTAGCTTATATTTGGTTATTTCGCTATCATTTTC
TTATTCTTTATCATTTTAAAAAGAGGTTCGAACAAGGGTTTTGCTATCAGTCCAAAAGCT
TACTTTATCAGGAGATGTCAAAGCTCTGAAATGGAGTGTATATATATTAGAAGCTGGACT
TTTTCTTATGATAAACTTCCCACCGAGCCCATTAGACTCTCCGTTCTCAAACTACATGGC
TCTTCCGTCAGTAAAAAGTGTACCATCATCATACTATCTTTACTTTTCGTTTATAGCTCA
GCAACCCTTGGAGATTCCAAGCTTGCCATAGAGACACGTCCCCAAGATCTCATGGAAGGT
GATGAGGTTTATAGCCAATCTTCCATCTCATTTTCGTG

QA 1 638 1 638
DS 

RD RR2CG15JQ 696 0 0
GGTAGTGAGGAAACATTTCGAGCTCGACGATCCCACCTAAAGAAAAGGCTGGTTGTTCAT
GCTAAGCTGTCTTTTGTACTGTCTTCATTCTTGACCTCGAGGTGGATCGCGTCTCATCTC
TTTCTTCACCGACTCCACATTAAGGGTTTGTATCAACGAAATAAGGATTTTCTCGTTTAT
AAATGAGCAGAGTTTAACAAAGTAGCTTATATTTGGTTATTTCGCTATCATTTTCTTATT
CTTTATCATTTTAAAAAGAGGTTCGAACAAGGGTTTTGCTATCAGTCCAAAAGCTTACTT
TATCAGGAGATGTCAAAGCTCTGAAATGGAGTGTATATATATTAGAAGCTGGACTTTTTC
TTATGATAAACTTCCCACCGAGCCCATTAGACTCTCCGTTCTCAAACTACATGGCTCTTC
CGTCAGTAAAAAGTGTACCATCATCATACTATCTTTACTTTTCGTTTATAGCTCAGCAAC
CCTTGGAGATTCCAAGCTTGCCATAGAGACACGTCCCCAAGATCTCATGGAAGGTGATGA
GGTTTATAGCCAATCTTCCATCTCATTTTCGTGATAGGTCAAGGCAGGAGTGGGATTCAG
TACATAAAAAGACGTTATATAATTGTTTCAGGTAATGTTCAAGAACCATGTGTCCGGTCT
TGCAAACAAAATAATTCGCAAGTCCTTTAACTCTTT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL7837Contig1 889 2 2 U
GGGTGGGTATAGAGAGGACAATGACCGAAGAAAACACAACACCACTGCAACCGCCGCAGA
CGCAGGAGAATGAGGAGGAGAAGAGGGAGATATATGCTGTATGGGCTGTACCAGAGGAAG
ACGTAGAGGATCGACTTCGAAAGGCTTATGGAGGGTCTAAGGTCGGAGTTCGGTGGTCCA
TCGTTTGATCCTCACTTAACGCTCGTCGGACCGCAGAGGCTTACGGCAGGCGAGGCAAAA
CTGATGTTGAGGCGGCGTGTGAAGGTTTTAAGGCGTATCCGGCCACCGTTGACCAAGTTT
CCGCAGGAACTTCCTATTTTCAGTGTGTCTATGTGTCTCTCCGGCACACCGTAGAGGTAA
TGAATGCTGCCGGACATTTTATGGGCCACTTCAAAGCCTTCACCGGGAAACTTTACGTGC
CGCATATGAGTATACTTTACGGCGATCTAACGGAGGAAGAGAAGAAGGAAGCGTTAGAGA
AAGCTTCCACGCTTGATTCTAGTCTCGATGGGCTGAATTTTCGGATAAATCGAGTTGAGT
TGTGGATAACAGATGCAGACGTTGGATCTTGGGTGAAAATCGACGAACATGATCTAATTT
CTTAAATGAAATATATGAGAGAAAAAACATCAAGGTTTTCGGTTTATCTTCGATTGAATT
CTTGTGCTTGTTGGTTAAAGCTTTTTTAATTAAAATTTGATTTCCAGTTATAAGGCTTGT
TTTAGAGTGGTATTGTATTTCCACGGTTTGGTACTTTGGTTCATATTTGTGAACGGTTTG
ACTTGAATGATATTTGCAGTTTGCTTCATGTTTTGTTGTTGTTGCTGCTTGCTACTGGTT
TTGTGATAAGATCTAATGACTATGAAATTTATGAAGTCTCTGTTAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2A988TF U 1
AF RR2A988JQ C 160
BS 1 727 RR2A988TF
BS 728 889 RR2A988JQ

RD RR2A988TF 727 0 0
GGGTGGGTATAGAGAGGACAATGACCGAAGAAAACACAACACCACTGCAACCGCCGCAGA
CGCAGGAGAATGAGGAGGAGAAGAGGGAGATATATGCTGTATGGGCTGTACCAGAGGAAG
ACGTAGAGGATCGACTTCGAAAGGCTTATGGAGGGTCTAAGGTCGGAGTTCGGTGGTCCA
TCGTTTGATCCTCACTTAACGCTCGTCGGACCGCAGAGGCTTACGGCAGGCGAGGCAAAA
CTGATGTTGAGGCGGCGTGTGAAGGTTTTAAGGCGTATCCGGCCACCGTTGACCAAGTTT
CCGCAGGAACTTCCTATTTTCAGTGTGTCTATGTGTCTCTCCGGCACACCGTAGAGGTAA
TGAATGCTGCCGGACATTTTATGGGCCACTTCAAAGCCTTCACCGGGAAACTTTACGTGC
CGCATATGAGTATACTTTACGGCGATCTAACGGAGGAAGAGAAGAAGGAAGCGTTAGAGA
AAGCTTCCACGCTTGATTCTAGTCTCGATGGGCTGAATTTTCGGATAAATCGAGTTGAGT
TGTGGATAACAGATGCAGACGTTGGATCTTGGGTGAAAATCGACGAACATGATCTAATTT
CTTAAATGAAATATATGAGAGAAAAAACATCAAGGTTTTCGGTTTATCTTCGATTGAATT
CTTGTGCTTGTTGGTTAAAGCTTTTTTAATTAAAATTTGATTTCCAGTTATAAGGCTTGT
TTTAGAG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RR2A988JQ 730 0 0
AGGTCGGAGTTCGGTGGTCCATCGTTTGATCCTCACTTAACGCTCGTCGGACCGCAGAGG
CTTACGGCAGGCGAGGCAAAACTGATGTTGAGGCGGCGTGTGAAGGTTTTAAGGCGTATC
CGGCCACCGTTGACCAAGTTTCCGCAGGAACTTCCTATTTTCAGTGTGTCTATGTGTCTC
TCCGGCACACCGTAGAGGTAATGAATGCTGCCGGACATTTTATGGGCCACTTCAAAGCCT
TCACCGGGAAACTTTACGTGCCGCATATGAGTATACTTTACGGCGATCTAACGGAGGAAG
AGAAGAAGGAAGCGTTAGAGAAAGCTTCCACGCTTGATTCTAGTCTCGATGGGCTGAATT
TTCGGATAAATCGAGTTGAGTTGTGGATAACAGATGCAGACGTTGGATCTTGGGTGAAAA
TCGACGAACATGATCTAATTTCTTAAATGAAATATATGAGAGAAAAAACATCAAGGTTTT
CGGTTTATCTTCGATTGAATTCTTGTGCTTGTTGGTTAAGGCTTTTTTAATTAAAATTTG
ATTTCCAGTTATAAGGCTTGTTTTAGAGTGGTATTGTATTTCCACGGTTTGGTACTTTGG
TTCATATTTGTGAACGGTTTGACTTGAATGATATTTGCAGTTTGCTTCATGTTTTGTTGT
TGTTGCTGCTTGCTACTGGTTTTGTGATAAGATCTAATGACTATGAAATTTATGAAGTCT
CTGTTAATAT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL7838Contig1 655 2 2 U
GCCCACTTTGCAATATGTTTAAGTTGTTCATGTGTGCTGTGTGTCAAGTAGAAGTGAAAC
CTGGCGAAGGTGTCTCGATCCATGCTGGATCAGCTAATTGCCAAAAGCTACGTCCATGGG
ATGGTCCATTCCTATGCGCAAGTTGCCAAGAGAAGAAAGACGCAATGGAAGGGAAACGAT
CATCGGGAGATAGACATAGTAGTGAGAGCGACTAGCCAACAGCCATTCCACAACTTGCAA
TTTATTTGGTCAATCTACTAACAAAAACAGTATTGTGAGTAATACGGAGCCGTCTTAAGG
ATCTTATGGTTGTTAATTTTCACCCAGAGATATGAGTTCGTTGATCAAAGCCACCACCAT
CCTCCACCAAACTCCAAAGCAGTTTATTTTATTTTTAACTTTTTGATATGGCTCTCACTT
CGCACCCTCTTGGAAGTTCTTTTCTTTGTTTTTTTTTTTCATTTGTGATGCTTTGGTGTT
TCAAAAATGAGGTGAACTAACTGCTGAGAGATGGTAGGTACAGAAAGATATGCGAGTGTG
AAATTATTTCATGTATAAAACCTTGAACACAATTCTGGATAGAAGCATCATTTTTCATAC
AACTTAAATTATATCTTTCGTGTTCGTCGGTTTATAACATAAGCTATTCTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW48TF U 1
AF RR2EW48JQ C 186
BS 1 487 RR2EW48TF
BS 488 655 RR2EW48JQ

RD RR2EW48TF 487 0 0
GCCCACTTTGCAATATGTTTAAGTTGTTCATGTGTGCTGTGTGTCAAGTAGAAGTGAAAC
CTGGCGAAGGTGTCTCGATCCATGCTGGATCAGCTAATTGCCAAAAGCTACGTCCATGGG
ATGGTCCATTCCTATGCGCAAGTTGCCAAGAGAAGAAAGACGCAATGGAAGGGAAACGAT
CATCGGGAGATAGACATAGTAGTGAGAGCGACTAGCCAACAGCCATTCCACAACTTGCAA
TTTATTTGGTCAATCTACTAACAAAAACAGTATTGTGAGTAATACGGAGCCGTCTTAAGG
ATCTTATGGTTGTTAATTTTCACCCAGAGATATGAGTTCGTTGATCAAAGCCACCACCAT
CCTCCACCAAACTCCAAAGCAGTTTATTTTATTTTTAACTTTTTGATATGGCTCTCACTT
CGCACCCTCTTGGAAGTTCTTTTCTTTGTTTTTTTTTTTCATTTGTGATGCTTTGGTGTT
TCAAAAA

QA 1 487 1 487
DS 

RD RR2EW48JQ 470 0 0
GGAGATAGACATAGTAGTGAGAGCGACTAGCCAACAGCCATTCCACAACTTGCAATTTAT
TTGGTCAATCTACTAACAAAAACAGTATTGTGAGTAATACGGAGCCGTCTTAAGGATCTT
ATGGTTGTTAATTTTCACCCAGAGATATGAGTTCGTTGATCAAAGCCACCACCATCCTCC
ACCAAACTCCAAAGCAGTTTATTTTATTTTTAACTTTTTGATATGGCTCTCACTTCGCAC
CCTCTTGGAAGTTCTTTTCTTTGTTTTTTTTTTTCATTTGTGATGCTTTGGTGTTTCAAA
AATGAGGTGAACTAACTGCTGAGAGATGGTAGGTACAGAAAGATATGCGAGTGTGAAATT
ATTTCATGTATAAAACCTTGAACACAATTCTGGATAGAAGCATCATTTTTCATACAACTT
AAATTATATCTTTCGTGTTCGTCGGTTTATAACATAAGCTATTCTCCTCC

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 2

CO CL7839Contig1 643 2 2 U
GGAGGTGCTGACCAGATGAACTTTGCGGACATAGAGAAAACGATAAACTCTCTTGCTAAG
AAGGCTAATGAAGGAACCATATCAATCGACGAGATGGCTGGAGGATCATTCACAGTATCA
AATGGTGGTGTCTATGGAAGTCTCATAAGCACTCCTATCATCAACCCTCCTCAGTCTGCT
ATTCTTGGAATGCATTCAATCGTGCAACGTCCCATGGTTGTGGGTGGAAGCGTAGTACCA
AGGCCAATGATGTACGTCGCGCTGACCTATGATCATAGGCTGATTGATGGAAGAGAGGCT
GTGTACTTCTTGCGCCGTATCAAGGATGTTGTGGAAGATCCTCAGAGGCTTCTTCTGGAC
ATATGAATAAAGATCTGAGACCAGAAGAGATGGCAAGTCTCTTTGTCTTTTTTTTCACCA
GTTTCCGTTCAGGTAACCATGCAATCTGTGAAAGATACTTCGAAGAAAAAAAACAAACTT
TTTTTTTTTGGAGTTTCGTAATAGTTCCAAGAGATTTTACCGGGCAGGGAAAGCCATCGG
TGTATTGAGTTTTATTATTCATATATATACAGTTTAAAACAAAATGTTGCAATTTTTTAA
TAATGCCACCGGTTTTTATTGGGTAAAACATTTTCATTTGCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2F671TF U 1
AF RR2F045JQ C 8
BS 1 574 RR2F671TF
BS 575 643 RR2F045JQ

RD RR2F671TF 574 0 0
GGAGGTGCTGACCAGATGAACTTTGCGGACATAGAGAAAACGATAAACTCTCTTGCTAAG
AAGGCTAATGAAGGAACCATATCAATCGACGAGATGGCTGGAGGATCATTCACAGTATCA
AATGGTGGTGTCTATGGAAGTCTCATAAGCACTCCTATCATCAACCCTCCTCAGTCTGCT
ATTCTTGGAATGCATTCAATCGTGCAACGTCCCATGGTTGTGGGTGGAAGCGTAGTACCA
AGGCCAATGATGTACGTCGCGCTGACCTATGATCATAGGCTGATTGATGGAAGAGAGGCT
GTGTACTTCTTGCGCCGTATCAAGGATGTTGTGGAAGATCCTCAGAGGCTTCTTCTGGAC
ATATGAATAAAGATCTGAGACCAGAAGAGATGGCAAGTCTCTTTGTCTTTTTTTTCACCA
GTTTCCGTTCAGGTAACCATGCAATCTGTGAAAGATACTTCGAAGAAAAAAAACAAACTT
TTTTTTTTTGGAGTTTCGTAATAGTTCCAAGAGATTTTACCGGGCAGGGAAAGCCATCGG
TGTATTGAGTTTTATTATTCATATATATACAGTT

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2F045JQ 636 0 0
CTGACCAGATGAACTTTGCGGACATAGAGAAAACGATAAACTCTCTTGCTAAGAAGGCTA
ATGAAGGAACCATATCAATCGACGAGATGGCTGGAGGATCATTCACAGTATCAAATGGTG
GTGTCTATGGAAGTCTCATAAGCACTCCTATCATCAACCCTCCTCAGTCTGCTATTCTTG
GAATGCATTCAATCGTGCAACGTCCCATGGTTGTGGGTGGAAGCGTAGTACCAAGGCCAA
TGATGTACGTCGCGCTGACCTATGATCATAGGCTGATTGATGGAAGAGAGGCTGTGTACT
TCTTGCGCCGTATCAAGGATGTTGTGGAAGATCCTCAGAGGCTTTTTCTGGACATATGAA
TAAAGATCTGAGACCAGAAGAGATGGCAAGTCTCTTTGTCTTTTTTTTCACCAGTTTCCG
TTCAGGTAACCATGCAATCTGTGAAAGATACTTCGAAGAAAAAAAACAAACTTTTTTTTT
TTGGAGTTTCGTAATAGTTCCAAGAGATTTTACCGGGCAGGGAAAGCCATCGGTGTATTG
AGTTTTATTATTCATATATATACAGTTTAAAACAAAATGTTGCAATTTTTTAATAATGCC
ACCGGTTTTTATTGGGTAAAACATTTTCATTTGCGC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL7840Contig1 757 2 2 U
GGAAATAACAAAAACCGCATCCTTACGAACGAGACTCATCTCTGTTTCAAGCTTTGAATT
AAAAAAGGAATGGCTTGCAAAACGATCCTGCGCTCTGTTTTCCCATCGACTTCCGCCGCA
ACCAGATGCTTCTTCTTCCCTCCTTGTCTCTCGGCGGTCCGTGGTTTGTTCCCGGCGACA
AAGAGTCTAAGTTTCAATGGTTTTGCCTCAGTCCCTCGTCTCAATTGCACTCTCAATAAC
GATGAATCCGAGCAAGGCCCGCCTCAAGAAGCTGTTCTCAAGGCCATTTCAGAAGTGTCC
AAGAGTGATGGGAGAGTTGGGAAAACTACTAACATGATTATCGGAGGCACTGTGGCTGAT
GATTCTTCTCAAGACTGGCTCCTACTTGACCAAAAGGTCAATACGTACCCAACAGACAGA
GGTTTTACTGCAATCGGGACTGGTGGTGATGATTTTGTGCATGCTATGGTTGTTGCTGTT
GAGTCTGTTATTGAACGTCAAATCCCTCAGGATTGTGTAAAGCAGACATTATCAAGCAAA
GGCAAATATGTGTCGGTGAATATTGGCCCTATTCGAGTTGTCTCTAGCGAACAGGTACAA
GCGGTGTATAATGCAATGAGGAGAGACGAAAGAATGAAATATTTCTTGTAGGTTTTAAGG
TGTGGTAGAATCACGGGTCTGCCCCTTTTCTCCCTTTTCCACTGCGACTATGTAAATTAT
TTTTTGCTATTTACTACAACCAACAAAAGTCCTCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BL12TF U 1
AF RR2AY91JQ C 153
BS 1 651 RR2BL12TF
BS 652 757 RR2AY91JQ

RD RR2BL12TF 655 0 0
GGAAATAACAAAAACCGCATCCTTACGAACGAGACTCATCTCTGTTTCAAGCTTTGAATT
AAAAAAGGAATGGCTTGCAAAACGATCCTGCGCTCTGTTTTCCCATCGACTTCCGCCGCA
ACCAGATGCTTCTTCTTCCCTCCTTGTCTCTCGGCGGTCCGTGGTTTGTTCCCGGCGACA
AAGAGTCTAAGTTTCAATGGTTTTGCCTCAGTCCCTCGTCTCAATTGCACTCTCAATAAC
GATGAATCCGAGCAAGGCCCGCCTCAAGAAGCTGTTCTCAAGGCCATTTCAGAAGTGTCC
AAGAGTGATGGGAGAGTTGGGAAAACTACTAACATGATTATCGGAGGCACTGTGGCTGAT
GATTCTTCTCAAGACTGGCTCCTACTTGACCAAAAGGTCAATACGTACCCAACAGACAGA
GGTTTTACTGCAATCGGGACTGGTGGTGATGATTTTGTGCATGCTATGGTTGTTGCTGTT
GAGTCTGTTATTGAACGTCAAATCCCTCAGGATTGTGTAAAGCAGACATTATCAAGCAAA
GGCAAATATGTGTCGGTGAATATTGGCCCTATTCGAGTTGTCTCTAGCGAACAGGTACAA
GCGGTGTATAATGCAATGAGGAGAGACGAAAGAATGAAATATTTCTTGTAG
TTTT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RR2AY91JQ 605 0 0
GGCGGTCCGTGGTTTGTTCCCGGCGACAAAGAGTCTAAGTTTCAATGGTTTTGCCTCAGT
CCCTCGTCTCAATTGCACTCTCAATAACGATGAATCCGAGCAAGGCCCGCCTCAAGAAGC
TGTTTTCAAGGCCATTTCAGAAGTGTCCAAGAGTGATGGGAGAGTTGGGAAAACTACTAA
CATGATTATCGGAGGCACTGTGGCTGATGATTTTTTTCAAGACTGGCTCCTACTTGACCA
AAAGGTCAATACGTACCCAACAGACAGAGGTTTTACTGCAATCGGGACTGGTGGTGATGA
TTTTGTGCATGCTATGGTTGTTGCTGTTGAGTCTGTTATTGAACGTCAAATCCCTCAGGA
TTGTGTAAAGCAGACATTATCAAGCAAAGGCAAATATGTGTCGGTGAATATTGGCCCTAT
TCGAGTTGTCTCTAGCGAACAGGTACAAGCGGTGTATAATGCAATGAGGAGAGACGAAAG
AATGAAATATTTCTTGTAGGTTTTAAGGTGTGGTAGAATCACGGGTCTGCCCCTTTTCTC
CCTTTTCCACTGCGACTATGTAAATTATTTTTTGCTATTTACTACAACCAACAAAAGTCC
TCCTT

QA 1 605 1 605
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7842Contig1 778 2 2 U
GGGTCCACTTAACGCTATTCCTCCTCGTCGGCTGCTGCTCCTTCAAACGCAGAGGCTTGC
TCTCAATCCCTAAAGGAACATAATTAACTTCAAGTCTGATTATTGTTTGTTATATATCTC
AAGATCATCAAACAACAAGGAAGAAGGAGATGGAGAAGAAGAGCGTTAGTTAAAAAGATA
AGTTTTTTTTATTGGAATTGAATTTTTGATTAAATCTACAGACGAAGGGGATCTAAGAGA
AGTTCCCAAGAAGAGTAGCAGAGAGAACAAGCTACAAAGAAGGGAGGAGAAGAAGAGACT
TGAGGCGCAAGAAACAGAAGAGGGAAGAAGAAGCGTGAATAACAACAAGGAGGAAGAATG
TCAAACAAGAAGAAGCTCTGATTACCACCTTTTTGTTTTGAGAATCCATCCCAACGTCCC
TGCATTGTTAGAAATCTCGTTCCAAACGGCATCTGTTTGGACGACTACTCTCTGTATTAT
TAAATAAGCAGCAAAGAAAGGGTGTTGGAGATAGCTAAAATATCAAATGTTGATGTGGAA
GTTGTTAGATTCATGTCAACTTACAAGTTACAAGAGTAAAGTCTACGCTTGGAAAGAATT
TGAAGGCAGGGGAGGAGGGTACGTAGTGAACTTTGTAAATCCATATAAAGCAGCCTCGAA
CCAACTCTTTCGGTTGATAAAGGAAACAACACGGGGTTGTTTGTCTTGCAAAAATGATCA
TGCTATTGTTCGTTCATTAACATTTTTATTATGTTTTGGAAGCACCGTAGCCTAGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H372TF U 1
AF RR2H372JQ C 234
BS 1 602 RR2H372TF
BS 603 778 RR2H372JQ

RD RR2H372TF 602 0 0
GGGTCCACTTAACGCTATTCCTCCTCGTCGGCTGCTGCTCCTTCAAACGCAGAGGCTTGC
TCTCAATCCCTAAAGGAACATAATTAACTTCAAGTCTGATTATTGTTTGTTATATATCTC
AAGATCATCAAACAACAAGGAAGAAGGAGATGGAGAAGAAGAGCGTTAGTTAAAAAGATA
AGTTTTTTTTATTGGAATTGAATTTTTGATTAAATCTACAGACGAAGGGGATCTAAGAGA
AGTTCCCAAGAAGAGTAGCAGAGAGAACAAGCTACAAAGAAGGGAGGAGAAGAAGAGACT
TGAGGCGCAAGAAACAGAAGAGGGAAGAAGAAGCGTGAATAACAACAAGGAGGAAGAATG
TCAAACAAGAAGAAGCTCTGATTACCACCTTTTTGTTTTGAGAATCCATCCCAACGTCCC
TGCATTGTTAGAAATCTCGTTCCAAACGGCATCTGTTTGGACGACTACTCTCTGTATTAT
TAAATAAGCAGCAAAGAAAGGGTGTTGGAGATAGCTAAAATATCAAATGTTGATGTGGAA
GTTGTTAGATTCATGTCAACTTACAAGTTACAAGAGTAAAGTCTACGCTTGGAAAGAATT
TG

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2H372JQ 545 0 0
TAAGAGAAGTTCCCAAGAAGAGTAGCAGAGAGAACAAGCTACAAAGAAGGGAGGAGAAGA
AGAGACTTGAGGCGCAAGAAACAGAAGAGGGAAGAAGAAGCGTGAATAACAACAAGGAGG
AAGAATGTCAAACAAGAAGAAGCTCTGATTACCACCTTTTTGTTTTGAGAATCCATCCCA
ACGTCCCTGCATTGTTAGAAATCTCGTTCCAAACGGCATCTGTTTGGACGACTACTCTCT
GTATTATTAAATAAGCAGCAAAGAAAGGGTGTTGGAGATAGCTAAAATATCAAATGTTGA
TGTGGAAGTTGTTAGATTCATGTCAACTTACAAGTTACAAGAGTAAGGTCTACGCTTGGA
AGGAATTTGAAGGCAGGGGAGGAGGGTACGTAGTGAACTTTGTAAATCCATATAAAGCAG
CCTCGAACCAACTCTTTCGGTTGATAAAGGAAACAACACGGGGTTGTTTGTCTTGCAAAA
ATGATCATGCTATTGTTCGTTCATTAACATTTTTATTATGTTTTGGAAGCACCGTAGCCT
AGTGG

QA 1 545 1 545
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7844Contig1 883 2 2 U
GGACAACACAAAACATTACTTATAAACCAAAGAAAAACAGAGCAACTACAAAGAAAAAAG
AGAGTGAAAGAGAATGGCTAACTTTGGAACAGAACGTGTTTACCAAGAATTTGAGCCTGC
CACTAGATGGACCTCTGAACCAGACGCCGAGATCCTTGTCGCTGATCTTCCAGGATTCAA
GAAAGAGCAAGTTAAGGTGGCTGTAACCTCCACAAGGAAGCTAAGACTAACGGGAGAACG
TCCAACTGGTGGAAACAAATGGATTCGTTTCCACCAGGAGATACCCGTTCCTCTGACCGT
TGATATCGACTCTGTTTCAGCTATGTTCAAAGATTACAAACTCTACATCAGACATCCCAA
AGTCAAGACAGAAACCCCTCAGACTAAGCCACCACCATCACCGGTCAAACCACCGGTGGT
TACAAAACCCCATGATCAACATGATGCAAAACAAAGCCAAGGTTCTTCCAAGCCAAACGA
TCAGCCGAAACATAATGATGCAGAGCAAAAAGCAGGGGAAGTAAAGAGTGACAAAGAGGG
ATTAGCTAGTGAGCCTAAAGGAACTTTGAGCTCCAACGATGAGGAGAAGGACAGAGTTGG
AGCCAAATGGTTCGAGAAGTACAAAGAGGCAACTGGAAACGTGGTAAAGGAAGCTAAGAG
CAAAAGGCAGTTACTCTGCAATCTGACTGCTTCGATTGTATTGGTTCTGCTAATCCTACT
GTATGCTAGAAATGCAGTACGCTCATCCCTGGTCTGGAACTCCGAGGAATGAGTTACATT
TGCGTTTCATTGATGTATAAGATTTGCTTATGCACAGAAAAACAAATAAATATTTGATAA
TTACCCTATTTATATATATGCATGTACACAAATTTGTGATGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H445TF U 1
AF RR2H445JQB C 463
BS 1 664 RR2H445TF
BS 665 883 RR2H445JQB

RD RR2H445TF 664 0 0
GGACAACACAAAACATTACTTATAAACCAAAGAAAAACAGAGCAACTACAAAGAAAAAAG
AGAGTGAAAGAGAATGGCTAACTTTGGAACAGAACGTGTTTACCAAGAATTTGAGCCTGC
CACTAGATGGACCTCTGAACCAGACGCCGAGATCCTTGTCGCTGATCTTCCAGGATTCAA
GAAAGAGCAAGTTAAGGTGGCTGTAACCTCCACAAGGAAGCTAAGACTAACGGGAGAACG
TCCAACTGGTGGAAACAAATGGATTCGTTTCCACCAGGAGATACCCGTTCCTCTGACCGT
TGATATCGACTCTGTTTCAGCTATGTTCAAAGATTACAAACTCTACATCAGACATCCCAA
AGTCAAGACAGAAACCCCTCAGACTAAGCCACCACCATCACCGGTCAAACCACCGGTGGT
TACAAAACCCCATGATCAACATGATGCAAAACAAAGCCAAGGTTCTTCCAAGCCAAACGA
TCAGCCGAAACATAATGATGCAGAGCAAAAAGCAGGGGAAGTAAAGAGTGACAAAGAGGG
ATTAGCTAGTGAGCCTAAAGGAACTTTGAGCTCCAACGATGAGGAGAAGGACAGAGTTGG
AGCCAAATGGTTCGAGAAGTACAAAGAGGCAACTGGAAACGTGGTAAAGGAAGCTAAGAG
CAAA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2H445JQB 421 0 0
TTCTTCCAAGCCAAACGATCAGCCGAAACATAATGATGCAGAGCAAAAAGCAGGGGAAGT
AAAGAGTGACAAAGAGGGATTAGCTAGTGAGCCTAAAGGAACTTTGAGCTCCAACGATGA
GGAGAAGGACAGAGTTGGAGCCAAATGGTTCGAGAAGTACAAAGAGGCAACTGGAAACGT
GGTAAAGGAAGCTAAGAGCAAAAGGCAGTTACTCTGCAATCTGACTGCTTCGATTGTATT
GGTTCTGCTAATCCTACTGTATGCTAGAAATGCAGTACGCTCATCCCTGGTCTGGAACTC
CGAGGAATGAGTTACATTTGCGTTTCATTGATGTATAAGATTTGCTTATGCACAGAAAAA
CAAATAAATATTTGATAATTACCCTATTTATATATATGCATGTACACAAATTTGTGATGA
G

QA 1 421 1 421
DS 



AS 1 2

CO CL7845Contig1 1497 2 2 U
GCAGTGAGCCAAATTCTGAGGATGAAGCAGCTGGTGGTGGTAAAAGAAGACCTGTTAAGC
GAGAAAGTGGAGGGACTGATGCATCGGCGGCACCTAAAGCACCAAGCTTCACTTCTGATC
CAAAGAGAATCCTAACTGACATTGAACAAGCACAAGCCCTTGTGCGTAAGCTTGACGCTG
AGAAAGGAATTAAGGAGAGTGTTCTATCAGGTTCCGAAACTGAAAAGTCGGGTAGAGATA
ATTTGCACAGTGGTTCAACTGGTCCAGTTATAATCATAAGAGGTTTGACATCGGTGAAAG
GCCTTGAGGGTGTTGAATTGCTTGACACGCTTCTCACATATCTCTGGCGTGTACATGGTG
TGGACTATTACGGAAAGATTGAAACTAATGAAGCCAAGGGTCTGCGGCATGTGAGAGCGG
AAGGAAAAGGTTCTGATGCAAAAGGAGATGAGAGCGAAAACAAATTTGACTCCCATTGGC
AAGAGAGGTTGAAAGGTCAAGATCCCTTGGAAGTGATGGCTGCCAAAGGGAAGCTAGATG
CTGCTGCTATTGAAGCTTTAGATCCACATGTCCGAAAGATTAGGGATGAGAAGTATGGTT
GGAAATATGGTTGTGGAGCTAAAGGCTGCACGAAGCTGTTTCATGCTGCTGAATTTGTGC
ACAAGCATCTCAAGCTCAAACATGCTGAGCTTGTAGTGGATCAGACTGCCAAAGTGCGGG
AAGAACTTTATTTTCAAAACTATATGAATGATCCTAATGCTCCAGGAGGACAACCAGCCA
CGCAACAACCTGGCCCGAGAGATAGAGGTATGATGAGACGCAAGCCAGGCATGGAGAACA
GATTGAGGGATGATCGAGGTGGACGCAGAGACGGACGAGCTTATGGAAATGACAGAATTG
ATCGGTCAGAGGATCAACAGAGAGGAGATGGAAACGGTCCAAATCCGGAGGAAGGTGGTT
TCGAAGCATTTGGTGGGCAAGGCGGTTTTCAGGTTCCTTCCTACTCGGCTGATATAAATG
CACCACCAATGCTGATGCCTGTTCCTGGTGCCGGGCCACTAGGACCATTTGTACCAGCAC
CACCGGAGGTTGCGATGCAGATGTTCAGGGACCCGAGCGGGCCCAATCCTTCTTTTGAAG
GTGGGGGCAGAGGTGGACCAGCCCCTTTTCTGTTGTCTCCGGCCTTTAGACAGGATCCTA
GACGGCTACGCAGCTACCAAGACCTAGATGCGCCAGAGGAAGAGGTGACCGTTATTGATT
ACAGGAGCTTGTAGACAGCGGAGAGAGAGATTGGGATGCCCGGTCTAGCCAGCCGATTGG
AACAACAATCTACATGCTCTTTGATGTCTGTATCTTTTCTTTCTTGTTTCATCCTAATTT
TTACTCAGTAAAGGCGTAAGACACGCACTCTATATATTTTTGTTGATTGCTTTTCATGTG
CTTTAGTTATCGTTTATTTGTACCTTTATGCATTTTCTACTTCTCTTTTCATGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BH67TF U 1
AF RR2BH67JQ C 758
BS 1 824 RR2BH67TF
BS 825 1497 RR2BH67JQ

RD RR2BH67TF 824 0 0
GCAGTGAGCCAAATTCTGAGGATGAAGCAGCTGGTGGTGGTAAAAGAAGACCTGTTAAGC
GAGAAAGTGGAGGGACTGATGCATCGGCGGCACCTAAAGCACCAAGCTTCACTTCTGATC
CAAAGAGAATCCTAACTGACATTGAACAAGCACAAGCCCTTGTGCGTAAGCTTGACGCTG
AGAAAGGAATTAAGGAGAGTGTTCTATCAGGTTCCGAAACTGAAAAGTCGGGTAGAGATA
ATTTGCACAGTGGTTCAACTGGTCCAGTTATAATCATAAGAGGTTTGACATCGGTGAAAG
GCCTTGAGGGTGTTGAATTGCTTGACACGCTTCTCACATATCTCTGGCGTGTACATGGTG
TGGACTATTACGGAAAGATTGAAACTAATGAAGCCAAGGGTCTGCGGCATGTGAGAGCGG
AAGGAAAAGGTTCTGATGCAAAAGGAGATGAGAGCGAAAACAAATTTGACTCCCATTGGC
AAGAGAGGTTGAAAGGTCAAGATCCCTTGGAAGTGATGGCTGCCAAAGGGAAGCTAGATG
CTGCTGCTATTGAAGCTTTAGATCCACATGTCCGAAAGATTAGGGATGAGAAGTATGGTT
GGAAATATGGTTGTGGAGCTAAAGGCTGCACGAAGCTGTTTCATGCTGCTGAATTTGTGC
ACAAGCATCTCAAGCTCAAACATGCTGAGCTTGTAGTGGATCAGACTGCCAAAGTGCGGG
AAGAACTTTATTTTCAAAACTATATGAATGATCCTAATGCTCCAGGAGGACAACCAGCCA
CGCAACAACCTGGCCCGAGAGATAGAGGTATGATGAGACGCAAG

QA 1 824 1 824
DS 

RD RR2BH67JQ 740 0 0
TGCTCCAGGAGGACAACCAGCCACGCAACAACCTGGCCCGAGAGATAGAGGTATGATGAG
ACGCAAGCCAGGCATGGAGAACAGATTGAGGGATGATCGAGGTGGACGCAGAGACGGACG
AGCTTATGGAAATGACAGAATTGATCGGTCAGAGGATCAACAGAGAGGAGATGGAAACGG
TCCAAATCCGGAGGAAGGTGGTTTCGAAGCATTTGGTGGGCAAGGCGGTTTTCAGGTTCC
TTCCTACTCGGCTGATATAAATGCACCACCAATGCTGATGCCTGTTCCTGGTGCCGGGCC
ACTAGGACCATTTGTACCAGCACCACCGGAGGTTGCGATGCAGATGTTCAGGGACCCGAG
CGGGCCCAATCCTTCTTTTGAAGGTGGGGGCAGAGGTGGACCAGCCCCTTTTCTGTTGTC
TCCGGCCTTTAGACAGGATCCTAGACGGCTACGCAGCTACCAAGACCTAGATGCGCCAGA
GGAAGAGGTGACCGTTATTGATTACAGGAGCTTGTAGACAGCGGAGAGAGAGATTGGGAT
GCCCGGTCTAGCCAGCCGATTGGAACAACAATCTACATGCTCTTTGATGTCTGTATCTTT
TCTTTCTTGTTTCATCCTAATTTTTACTCAGTAAAGGCGTAAGACACGCACTCTATATAT
TTTTGTTGATTGCTTTTCATGTGCTTTAGTTATCGTTTATTTGTACCTTTATGCATTTTC
TACTTCTCTTTTCATGTTCC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL7846Contig1 521 2 1 U
GACGTACGAGTATTTAGACAAGATCACAAAGGAGCTAACCAACGGGATCTTGGAAGCAGG
GAGGAAGACTGGACATCCGATGTGCGGGGGTTACATAAGTGGTATGTTCGGTTTCTTTTT
CGCGGAAGGACCGGTGTACAACTTCGCTGACGCGAAGAAGAGCGACACGGAGAAGTTTGG
TAGGTTTTTCAGGGGGATGTTGGAGGAAGGTGTTTACTTTGCACCGTCTCAGTTCGAGGC
TGGGTTTACCAGCTTGGCTCACACTCCTGAGGATATTCAGTTCACTATTTCTGCGGCCGA
GAGGGTCCTCGGAAGGATCTAGACTGTTCTTGTTTTTTTTCGTCGGTATCTTGAGAGTTT
TGTATGATGAAATATATAGCCTTTATGGTGTATTCTCTTGAAGTTATTATTGCTTTGTTC
ATTCAAATAAACAAATGTTGCTATTGAGTTCAAGTTTTCTAGACAAAAATCATAAACATG
TTTAAAGAATAATGGAAAAGAAATAAAAAAGAGCTTTCCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BR13JQ C 1
AF RR2BR13TF U 1
BS 1 521 RR2BR13TF

RD RR2BR13JQ 521 0 0
GACGTACGAGTATTTAGACAAGATCACAAAGGAGCTAACCAACGGGATCTTGGAAGCAGG
GAGGAAGACTGGACATCCGATGTGCGGGGGTTACATAAGTGGTATGTTCGGTTTCTTTTT
CGCGGAAGGACCGGTGTACAACTTCGCTGACGCGAAGAAGAGCGACACGGAGAAGTTTGG
TAGGTTTTTCAGGGGGATGTTGGAGGAAGGTGTTTACTTTGCACCGTCTCAGTTCGAGGC
TGGGTTTACCAGCTTGGCTCACACTCCTGAGGATATTCAGTTCACTATTTCTGCGGCCGA
GAGGGTCCTCGGAAGGATCTAGACTGTTCTTGTTTTTTTTCGTCGGTATCTTGAGAGTTT
TGTATGATGAAATATATAGCCTTTATGGTGTATTCTCTTGAAGTTATTATTGCTTTGTTC
ATTCAAATAAACAAATGTTGCTATTGAGTTCAAGTTTTCTAGACAAAAATCATAAACATG
TTTAAAGAATAATGGAAAAGAAATAAAAAAGAGCTTTCCAC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RR2BR13TF 521 0 0
GACGTACGAGTATTTAGACAAGATCACAAAGGAGCTAACCAACGGGATCTTGGAAGCAGG
GAGGAAGACTGGACATCCGATGTGCGGGGGTTACATAAGTGGTATGTTCGGTTTCTTTTT
CGCGGAAGGACCGGTGTACAACTTCGCTGACGCGAAGAAGAGCGACACGGAGAAGTTTGG
TAGGTTTTTCAGGGGGATGTTGGAGGAAGGTGTTTACTTTGCACCGTCTCAGTTCGAGGC
TGGGTTTACCAGCTTGGCTCACACTCCTGAGGATATTCAGTTCACTATTTCTGCGGCCGA
GAGGGTCCTCGGAAGGATCTAGACTGTTCTTGTTTTTTTTCGTCGGTATCTTGAGAGTTT
TGTATGATGAAATATATAGCCTTTATGGTGTATTCTCTTGAAGTTATTATTGCTTTGTTC
ATTCAAATAAACAAATGTTGCTATTGAGTTCAAGTTTTCTAGACAAAAATCATAAACATG
TTTAAAGAATAATGGAAAAGAAATAAAAAAGAGCTTTCCAC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 2

CO CL7847Contig1 923 2 4 U
GGTGTTACAGAACAGAGAATTGAAGAACCATCTTCAGACTGGTGGGGATTTAAATCCGGG
TTTGTCTCGGGCGGTCTTCTTGGAGCCAAGTCCGGCAAAAAGAAATCATCCAAGTCTAAG
GAGAGAAAAATGTTTTGTGAGGACGATCAAGAGAATCTTTACAACATGGTTCAGGATAAA
GCCACAGCTGGAAAACAAGGACTTGGTATCAAAGACCGTCCAAAGAAGATTGCTGGTGTA
CGTTACCAAGGGAAGAAAACATCTTTTGATATCAGTGATGATGATGATGATAATGATGAT
GAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGTGACGAGGATGATGCCAAGGACTCTGTTATCGAA
AATTCTGTCCAAGCAAAAAGGAAGCGAGAAGAGAGTGAAGAAGAAGACGACAAGGACTCT
GTTATTGAAAACTCTCTCCCAACGAAAAGGAAGCGTGATGAAATCATTGAACCCAAAATC
AAGTTGAAGAACCTATGCAAACAGATTCTTAAAAAGGTCGCTGGTAGTAGCGGATCAATG
AAGCTGAAACAGCTTAAATCTATGATTGATGAACAAGCACCATCAATTCTCTCAGAGTTC
TCTTCAAGGAAAGATGCTATTGCTTACTTGAAACTTAAGATGGAGCGAAGTGACAAGTTT
ATTGTGGAGGGAAAGAAAATCAGTCTCGTATCAAAAAAGGAGTGAGGACAAATATCATTA
TACCTGCCTGCGTTGGAAAGTGGAGATTAGGGCAAGTTTTGTTACTAATCAACATCAGTA
TGTATAACAAGTAGTATCCTTTTTAAAGATGTGTTTTATAGTCTATTCATACATTATATG
AGAGTTATGCATAAAACTCCACAATAATCTCTTCTATTTAAGAACAGTTGGAATACATGA
TTTATTTGAACATATGGTAAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BP43TF U 1
AF RR2BP43JQ C 124
BS 1 678 RR2BP43TF
BS 679 679 RR2BP43JQ
BS 680 692 RR2BP43TF
BS 693 923 RR2BP43JQ

RD RR2BP43TF 692 0 0
GGTGTTACAGAACAGAGAATTGAAGAACCATCTTCAGACTGGTGGGGATTTAAATCCGGG
TTTGTCTCGGGCGGTCTTCTTGGAGCCAAGTCCGGCAAAAAGAAATCATCCAAGTCTAAG
GAGAGAAAAATGTTTTGTGAGGACGATCAAGAGAATCTTTACAACATGGTTCAGGATAAA
GCCACAGCTGGAAAACAAGGACTTGGTATCAAAGACCGTCCAAAGAAGATTGCTGGTGTA
CGTTACCAAGGGAAGAAAACATCTTTTGATATCAGTGATGATGATGATGATAATGATGAT
GAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGTGACGAGGATGATGCCAAGGACTCTGTTATCGAA
AATTCTGTCCAAGCAAAAAGGAAGCGAGAAGAGAGTGAAGAAGAAGACGACAAGGACTCT
GTTATTGAAAACTCTCTCCCAACGAAAAGGAAGCGTGATGAAATCATTGAACCCAAAATC
AAGTTGAAGAACCTATGCAAACAGATTCTTAAAAAGGTCGCTGGTAGTAGCGGATCAATG
AAGCTGAAACAGCTTAAATCTATGATTGATGAACAAGCACCATCAATTCTCTCAGAGTTC
TCTTCAAGGAAAGATGCTATTGCTTACTTGAAACTTAAGATGGAGCGAAGTGACAAGTTT
ATTGTGGAGGGAAAGAAA*TCAGTCTCGTATC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RR2BP43JQ 800 0 0
AGAAAAATGTTTTGTGAGGACGATCAAGAGAATCTTTACAACATGGTTCAGGATAAAGCC
ACAGCTGGAAAACAAGGACTTGGTATCAAAGACCGTCCAAAGAAGATTGCTGGTGTACGT
TACCAAGGGAAGAAAACATCTTTTGATATCAGTGATGATGATGATGATAATGATGATGAA
GAGGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGTGACGAGGATGATGCCAAGGACTCTGTTATCGAAAAT
TCTGTCCAAGCAAAAAGGAAGCGAGAAGAGAGTGAAGAAGAAGACGACAAGGACTCTGTT
ATTGAAAACTCTCTCCCAACGAAAAGGAAGCGTGATGAAATCATTGAACCCAAAATCAAG
TTGAAGAACCTATGCAAACAGATTCTTAAAAAGGTCGCTGGTAGTAGCGGATCAATGAAG
CTGAAACAGCTTAAATCTATGATTGATGAACAAGCACCATCAATTCTCTCAGAGTTCTCT
TCAAGGAAAGATGCTATTGCTTACTTGAAACTTAAGATGGAGCGAAGTGACAAGTTTATT
GTGGAGGGAAAGAAAATCAGTCTCGTATCAAAAAAGGAGTGAGGACAAATATCATTATAC
CTGCCTGCGTTGGAAAGTGGAGATTAGGGCAAGTTTTGTTACTAATCAACATCAGTATGT
ATAACAAGTAGTATCCTTTTTAAAGATGTGTTTTATAGTCTATTCATACATTATATGAGA
GTTATGCATAAAACTCCACAATAATCTCTTCTATTTAAGAACAGTTGGAATACATGATTT
ATTTGAACATATGGTAAAAC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL7848Contig1 564 2 1 U
ATTCCTAAAAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCCCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGCCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTTGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCCGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCCACCAAGCTTCACCGATGCTTAA
TCACGTTACAAGACATTCATAAATAATATCTACTCATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCT
TTTTTTTTCTTTGGCTTTTTGTTTATGAGACATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGAT
TTATGAACATGTAATCTCTATATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CV05JQ C 1
AF RR2CV05TF U 1
BS 1 564 RR2CV05TF

RD RR2CV05JQ 564 0 0
ATTCCTAAAAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCCCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGCCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTTGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCCGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCCACCAAGCTTCACCGATGCTTAA
TCACGTTACAAGACATTCATAAATAATATCTACTCATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCT
TTTTTTTTCTTTGGCTTTTTGTTTATGAGACATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGAT
TTATGAACATGTAATCTCTATATT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2CV05TF 564 0 0
ATTCCTAAAAGTTTCTATGGCTCCTAAGGCTCTTGCAGTTACAGCCCTTCTTCTCACACT
TAATCTTCTTTTCTTCAGTTTTGTAACTTCCACAAAATGTCCACCAACTACTCCTAAAAC
CCCAAAATCTCCAAAGAAGCCCCCGGCGGTTAAACCCACTTGTCCTACCGACACACTTAA
GCTTGGTGTTTGCGCAGACCTATTGGGCTTAGTTAACGTTCTTGTTGGTTCTCCACCAAA
GACCCCTTGTTGTGCACTTCTTAATGGTCTTGCTAACCTTGAAGCTGCAGTTTGTCTTTG
CACCGCTCTTAAAGCCAATATCTTGGGGATTAATCTCAATGTTCCCGTCGATCTGAGCTT
GTTATTGAACTATTGTGGCAAGAAACTTCCTTATGGCCACCAAGCTTCACCGATGCTTAA
TCACGTTACAAGACATTCATAAATAATATCTACTCATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCT
TTTTTTTTCTTTGGCTTTTTGTTTATGAGACATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGAT
TTATGAACATGTAATCTCTATATT

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

CO CL7849Contig1 732 2 3 U
ACAAAGCATCGAGTAAAGCATCACATAGCCATAGTAGAACTTGAGCTTAGTCTCACATAC
ATTCAACAATAAGCACTTAACAAGACTGTAAAAAAGAATCGATTCAACTTAAGACTTTAT
ACGCCGTGTTTGCCTGCACAAAGGAGAAACATTTTTTCGATGATCATGAACGTGTGCACT
TGATGCCCTCACGAATAGCCAACCAGATACAAAACAGAGTCAAGCAAATAGCAGCATCGA
TAGCAAGAACAATCTGAACTAGGCGTCGCCACTTCCATTCAAAGCTTTGAGAACCAGAAC
GTCCTCTTCTCGGCACACACTCCTTCTGCAACGATGTCTCTCCTGCAGACGAAGCTTCAC
AACGCTCGGAGCTCCTGTATTCATCAAGCTCAATGCCTCTAACCGACACGACATGATCTT
TCCCTCCTCTCTTCTTCTCTTGCTTGTTTGACTTCCCCAAAAGCGGAGCTTTCGTAGAAG
AACTCACAGCTTCGCTCTGTTCAGCGAGGTTGTTACTATTATTGTTCTTCAACTCGTTGT
TAGCAGTCTCAGCAGCAGCCACACGCTCAAGCGAAGCAATGAGTTTGGAAACAACATCAT
CTACATTGACAGAACCAATCACCGCAGTGAAGCTTCCTTTCCTAGCAGCTTTCTTGAACT
CGTCTCTCAGATGCTCAAGAAACTTGAGAACGCTGAGTTTCCCTAAAGCCTCGTCAACAA
TGGCGAAATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CU40JQ U 68
AF RR2CU40TF C 1
BS 1 67 RR2CU40TF
BS 68 631 RR2CU40JQ
BS 632 732 RR2CU40TF

RD RR2CU40JQ 564 0 0
AATAAGCACTTAACAAGACTGTAAAAAAGAATCGATTCAACTTAAGACTTTATACGCCGT
GTTTGCCTGCACAAAGGAGAAACATTTTTTCGATGATCATGAACGTGTGCACTTGATGCC
CTCACGAATAGCCAACCAGATACAAAACAGAGTCAAGCAAATAGCAGCATCGATAGCAAG
AACAATCTGAACTAGGCGTCGCCACTTCCATTCAAAGCTTTGAGAACCAGAACGTCCTCT
TCTCGGCACACACTCCTTCTGCAACGATGTCTCTCCTGCAGACGAAGCTTCACAACGCTC
GGAGCTCCTGTATTCATCAAGCTCAATGCCTCTAACCGACACGACATGATCTTTCCCTCC
TCTCTTCTTCTCTTGCTTGTTTGACTTCCCCAAAAGCGGAGCTTTCGTAGAAGAACTCAC
AGCTTCGCTCTGTTCAGCGAGGTTGTTACTATTATTGTTCTTCAACTCGTTGTTAGCAGT
CTCAGCAGCAGCCACACGCTCAAGCGAAGCAATGAGTTTGGAAACAACATCATCTACATT
GACAGAACCAATCACCGCAGTGAA

QA 1 564 1 564
DS 

RD RR2CU40TF 732 0 0
ACAAAGCATCGAGTAAAGCATCACATAGCCATAGTAGAACTTGAGCTTAGTCTCACATAC
ATTCAACAATAAGCACTTAACAAGACTGTAAAAAAGAATCGATTCAACTTAAGACTTTAT
ACGCCGTGTTTGCCTGCACAAAGGAGAAACATTTTTTCGATGATCATGAACGTGTGCACT
TGATGCCCTCACGAATAGCCAACCAGATACAAAACAGAGTCAAGCAAATAGCAGCATCGA
TAGCAAGAACAATCTGAACTAGGCGTCGCCACTTCCATTCAAAGCTTTGAGAACCAGAAC
GTCCTCTTCTCGGCACACACTCCTTCTGCAACGATGTCTCTCCTGCAGACGAAGCTTCAC
AACGCTCGGAGCTCCTGTATTCATCAAGCTCAATGCCTCTAACCGACACGACATGATCTT
TCCCTCCTCTCTTCTTCTCTTGCTTGTTTGACTTCCCCAAAAGCGGAGCTTTCGTAGAAG
AACTCACAGCTTCGCTCTGTTCAGCGAGGTTGTTACTATTATTGTTCTTCAACTCGTTGT
TAGCAGTCTCAGCAGCAGCCACACGCTCAAGCGAAGCAATGAGTTTGGAAACAACATCAT
CTACATTGACAGAACCAATCACCGCAGTGAAGCTTCCTTTCCTAGCAGCTTTCTTGAACT
CGTCTCTCAGATGCTCAAGAAACTTGAGAACGCTGAGTTTCCCTAAAGCCTCGTCAACAA
TGGCGAAATACC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL7850Contig1 1169 2 2 U
GGGATTAAGTGGGTCAGATCTCTTTCTCTCTCCTCTCTTTTTCTCTTTCTTTTTCTCTTT
CTCTTTCCTTACCCAAGCTTCTGTGGCGGATAAACGGTGAAATCTCTTCTCCCTAATCCA
AACCCGGAGAAGAAACTTGTGGAGTTATAAAGATTTCTGATGGAAGAAGATGGTGAGTTT
CGACGTTGGGATGAGTTAATCCCAGACGCTCTTGGTTTAATCTTTAGCCACTTGCCTCTT
CAAGAGATCCTAACAGTGGTGCCTAGGGTTTGCAAAGCATGGAACAGAGCTGTAACTGGA
CCTTATTGCTGGCAAGAGATAGACATTGAGCTATGGAGTAACCGTTGCCACCAGTCCGAT
CATCTCGATCGAATGCTTCAGATGTTGATCCTCAGGAGCTCTGGCTCTTTGCGTAAACTC
TCTGTCACTGGCCTTCAAAATGACTCTATCTTCTCCTTCATTGCACAATGCCGAAGCTGA
AGCGGTTAGAGATCGCGTACCACCGAGTCAGCACAGAAGGAGTGCTCAAAATCTTGTCTT
CTTGCGTTTTTCTCGAGTTCTTGGAACTTAGAGGCTGTTGGGACGTGCAGCTTGATAACA
AGTTCTTTAAGGAGAAGTTTCCAGATATGAAAGTGTTGGGTCCACGCGTGATTGGATTCT
ACGATATGATAAACGATTGGGAGGATTGCTGCTCGGATTATTTCTCTGATGGGTCTGATT
ACTTGGCTTGGGAGTTTCTTGAGGATGGTGAGATGGGAGAGTTCTATGAAGATGAGTTTG
AGCATGGTTGGGGCGATAATTTCTATGCGGATAGTGTGAATATAGACATGGAACCACATA
TTTGGCCGCCATCTCCATGAACCAGGTCTTGTTATGGTCGAGAGCTCTGCCTGAAAGTTG
CTTCTAGGAAAATGGTATTAGCCTCTTATGTGCTTTTGCTCTCTATGTATGGTATGGGTG
CTTGAAACTTGTTTGGATTCTTTGTGTTTTTCTAATCTAAACCGGGCCAGTGTTCTTGCC
TTTTATGTTTCTCTTTTATTCATATATTATATTTTATATATAGATATTTTTATATGTATG
TGTGTATGTATAGATTTGGAGATGTCAAGTTGATGTATAAGAAACAAAAAGTGAAAGAAG
TAAAAAGACAAGCTATTGATGAAGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AH17TF U 1
AF RR2AH17JQ C 268
BS 1 735 RR2AH17TF
BS 736 1169 RR2AH17JQ

RD RR2AH17TF 735 0 0
GGGATTAAGTGGGTCAGATCTCTTTCTCTCTCCTCTCTTTTTCTCTTTCTTTTTCTCTTT
CTCTTTCCTTACCCAAGCTTCTGTGGCGGATAAACGGTGAAATCTCTTCTCCCTAATCCA
AACCCGGAGAAGAAACTTGTGGAGTTATAAAGATTTCTGATGGAAGAAGATGGTGAGTTT
CGACGTTGGGATGAGTTAATCCCAGACGCTCTTGGTTTAATCTTTAGCCACTTGCCTCTT
CAAGAGATCCTAACAGTGGTGCCTAGGGTTTGCAAAGCATGGAACAGAGCTGTAACTGGA
CCTTATTGCTGGCAAGAGATAGACATTGAGCTATGGAGTAACCGTTGCCACCAGTCCGAT
CATCTCGATCGAATGCTTCAGATGTTGATCCTCAGGAGCTCTGGCTCTTTGCGTAAACTC
TCTGTCACTGGCCTTCAAAATGACTCTATCTTCTCCTTCATTGCACAATGCCGAAGCTGA
AGCGGTTAGAGATCGCGTACCACCGAGTCAGCACAGAAGGAGTGCTCAAAATCTTGTCTT
CTTGCGTTTTTCTCGAGTTCTTGGAACTTAGAGGCTGTTGGGACGTGCAGCTTGATAACA
AGTTCTTTAAGGAGAAGTTTCCAGATATGAAAGTGTTGGGTCCACGCGTGATTGGATTCT
ACGATATGATAAACGATTGGGAGGATTGCTGCTCGGATTATTTCTCTGATGGGTCTGATT
ACTTGGCTTGGGAGT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RR2AH17JQ 902 0 0
GG
TTGCAAAGCATGGAACAGAGCTGTAACTGGAC*TTATTGCTGGCAAGAGATAGACATTGA
GCTATGGAGTAACCGTTGCCACCAGTCCGATCATCTCGATCGAATGCTTCAGATGTTGAT
CCTCAGGAGCTCTGGCTCTTTGCGTAAACTCTCTGTCACTGGCCTTCAAAATGACTCTAT
CTTCTCCTTCATTGCACAATGCCGAAGCTGAAGCGGTTAGAGATCGCGTACCACCGAGTC
AGCACAGAAGGAGTGCTCAAAATCTTGTCTTCTTGCGTTTTTCTCGAGTTCTTGGAACTT
AGAGGCTGTTGGGACGTGCAGCTTGATAACAAGTTCTTTAAGGAGAAGTTTCCAGATATG
AAAGTGTTGGGTCCACGCGTGATTGGATTCTACGATATGATAAACGATTGGGAGGATTGC
TGCTCGGATTATTTCTCTGATGGGTCTGATTACTTGGCTTGGGAGTTTCTTGAGGATGGT
GAGATGGGAGAGTTCTATGAAGATGAGTTTGAGCATGGTTGGGGCGATAATTTCTATGCG
GATAGTGTGAATATAGACATGGAACCACATATTTGGCCGCCATCTCCATGAACCAGGTCT
TGTTATGGTCGAGAGCTCTGCCTGAAAGTTGCTTCTAGGAAAATGGTATTAGCCTCTTAT
GTGCTTTTGCTCTCTATGTATGGTATGGGTGCTTGAAACTTGTTTGGATTCTTTGTGTTT
TTCTAATCTAAACCGGGCCAGTGTTCTTGCCTTTTATGTTTCTCTTTTATTCATATATTA
TATTTTATATATAGATATTTTTATATGTATGTGTGTATGTATAGATTTGGAGATGTCAAG
TTGATGTATAAGAAACAAAAAGTGAAAGAAGTAAAAAGACAAGCTATTGATGAAGTTTCC

QA 3 902 3 902
DS 



AS 1 2

CO CL7851Contig1 854 2 8 U
GGGAGTTGACTCGGTCATCGTCTCTGTTCAGGAAGACTCTTAATCTTCGTTTCGTCGTCT
TCTTCTTCGTATCTCCTGATCGCCTTTTTTTTAGCTTTTACTTCACTGACTGTGAAAAGA
TGGAGAGTGAAACACAAGTTGTGGCTGATCTCATTGCTCTCAACGAAAAGAAAGTTGCGA
TGGCTTTGGATGATCTCATCAAGTTGTCAAAGAGGAATAGCAAAGGGCACAAGGGGGGCA
AACGTTCAAGGAGAGCCAGGAACAAAAACCGAAACTTCAATGGTGCTGCGAGAAATAATA
ATACCTGTAAAGAGAAGCATTACGTGAACTCACTTTCTGGAGTTAGACAGGGTGCTGTTG
CTAAGACAAGGTCTAACTTCAAAGGAAATCAGTTTCCTGTTGCAACAAACGTTGCTCATA
AAGCCGCTACTGGTCCTCCACTCAGTGTCCGTAGAAGAGCTTTCAATGCTGGAAGGATGA
CTAGTGCAAATCAGTCGAGGCTTCTTGCTCCACCAGTCCGGAATAGATCTTTACACGCTA
GATTAAAGAGGCATGAGGTGGAACAGAAAATAGAAAATGGAGGAGGGAAGTGGAAGACAC
TGGACTCTCGGTTTGCAATCATGAAAGAGCAGAGGAATAGTAGTAACAACAACAACAACA
GTGGGGGTAAAGTGCAAGCTCCAAGGTTGCCACCATGGGCTAGAGCCAGAAGATTTTAGT
TACTAAGCAAACCACAGAGCTTTAATGCGCGCCCCCTCCCCTCTTAGATTTTTTTGTCTT
TGGGATTTATACTCTTTTGTTAAGCACACTTAACAATGCTGTTCTTTTGTGAATGTATGA
CTTTCTTACGTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DO75TF U 1
AF RR2CM23JQ C 536
BS 1 622 RR2DO75TF
BS 623 623 RR2CM23JQ
BS 624 657 RR2DO75TF
BS 658 658 RR2CM23JQ
BS 659 685 RR2DO75TF
BS 686 686 RR2CM23JQ
BS 687 700 RR2DO75TF
BS 701 854 RR2CM23JQ

RD RR2DO75TF 700 0 0
GGGAGTTGACTCGGTCATCGTCTCTGTTCAGGAAGACTCTTAATCTTCGTTTCGTCGTCT
TCTTCTTCGTATCTCCTGATCGCCTTTTTTTTAGCTTTTACTTCACTGACTGTGAAAAGA
TGGAGAGTGAAACACAAGTTGTGGCTGATCTCATTGCTCTCAACGAAAAGAAAGTTGCGA
TGGCTTTGGATGATCTCATCAAGTTGTCAAAGAGGAATAGCAAAGGGCACAAGGGGGGCA
AACGTTCAAGGAGAGCCAGGAACAAAAACCGAAACTTCAATGGTGCTGCGAGAAATAATA
ATACCTGTAAAGAGAAGCATTACGTGAACTCACTTTCTGGAGTTAGACAGGGTGCTGTTG
CTAAGACAAGGTCTAACTTCAAAGGAAATCAGTTTCCTGTTGCAACAAACGTTGCTCATA
AAGCCGCTACTGGTCCTCCACTCAGTGTCCGTAGAAGAGCTTTCAATGCTGGAAGGATGA
CTAGTGCAAATCAGTCGAGGCTTCTTGCTCCACCAGTCCGGAATAGATCTTTACACGCTA
GATTAAAGAGGCATGAGGTGGAACAGAAAATAGAAAATGGAGGAGGGAAGTGGAAGACAC
TGGACTCTCGGTTTGCAATCATTAAAGAGCAGAGGAATAGTAGTAACAACAACAACA*CA
GTGGGGGTAAAGTGCAAGCTCCAAG*TTGCCACCATGGGC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RR2CM23JQ 319 0 0
CGCTAGATTAAAGAGGCATGAGGTGGAACAGAAAATAGAAAATGGAGGAGGGAAGTGGAA
GACACTGGACTCTCGGTTTGCAATCATGAAAGAGCAGAGGAATAGTAGTAACAACAACAA
CAACAGTGGGGGTAAAGTGCAAGCTCCAAGGTTGCCACCATGGGCTAGAGCCAGAAGATT
TTAGTTACTAAGCAAACCACAGAGCTTTAATGCGCGCCCCCTCCCCTCTTAGATTTTTTT
GTCTTTGGGATTTATACTCTTTTGTTAAGCACACTTAACAATGCTGTTCTTTTGTGAATG
TATGACTTTCTTACGTGAA

QA 1 319 1 319
DS 



AS 1 2

CO CL7852Contig1 707 2 2 U
GAACAATCTCAGCAATTCCCTTTCTTGAGCAACACTTCAGGGTTGGATCAATCTCCAAAT
GTGTTGTATCCATTACTAGAAGGAAATGAGGGTGTTAACCAAGCTAATCCCCAACAAGAG
AGTAGTGACTATTCTAGTCAGCTAAGGTCTAAACCCTTGATGGATACAGAACAACCTAGA
AATGTGAAGGCGGAAGAGAATGATCAGGATCTTGATAAGGATGGGAACGGAGTGAATAAT
TTATCTACAAACTTTTTGGGGAATATTAACTTAAACCCCTCAGGGAATGATGAATACACA
TCATGGGGAGGTAATAGTAGCATTAATAGTTCTTGGACCGGTTTCACCTCCAACAACTCA
ACAGGTCATCTCTCATTCAAAGTACTCAGCTCTAGTCTTGATGATTATTTTGTTAGTTGG
GTTGTACATGGATCGCTTGTCATGGGAGATATATATTACTGGGGAGAGATCAAACCATGG
AGTTATTATATACATGATCCAAGGCTAATTTTGGGAACCAACGGAAAGGTACGGTTATAA
ATTTTTCTTTTTTGATCTTTTAGACGATCTTTAAAGTGTGAGTATGTTCTGGTAGGCTTC
TGGTGGTATTTGTGTTTTAGCATTATTGGGTTTATTGGCTATATATAAATGTTTGGGTTA
TGTACGACTTGAGGAATTGGTATTGATGGATACGGTTCTGTGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E134TF U 1
AF RR2E134JQ C 48
BS 1 617 RR2E134TF
BS 618 707 RR2E134JQ

RD RR2E134TF 617 0 0
GAACAATCTCAGCAATTCCCTTTCTTGAGCAACACTTCAGGGTTGGATCAATCTCCAAAT
GTGTTGTATCCATTACTAGAAGGAAATGAGGGTGTTAACCAAGCTAATCCCCAACAAGAG
AGTAGTGACTATTCTAGTCAGCTAAGGTCTAAACCCTTGATGGATACAGAACAACCTAGA
AATGTGAAGGCGGAAGAGAATGATCAGGATCTTGATAAGGATGGGAACGGAGTGAATAAT
TTATCTACAAACTTTTTGGGGAATATTAACTTAAACCCCTCAGGGAATGATGAATACACA
TCATGGGGAGGTAATAGTAGCATTAATAGTTCTTGGACCGGTTTCACCTCCAACAACTCA
ACAGGTCATCTCTCATTCAAAGTACTCAGCTCTAGTCTTGATGATTATTTTGTTAGTTGG
GTTGTACATGGATCGCTTGTCATGGGAGATATATATTACTGGGGAGAGATCAAACCATGG
AGTTATTATATACATGATCCAAGGCTAATTTTGGGAACCAACGGAAAGGTACGGTTATAA
ATTTTTCTTTTTTGATCTTTTAGACGATCTTTAAAGTGTGAGTATGTTCTGGTAGGCTTC
TGGTGGTATTTGTGTTT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RR2E134JQ 660 0 0
TCAATCTCCAAATGTGTTGTATCCATTACTAGAAGGAAATGAGGGTGTTAACCAAGCTAA
TCCCCAACAAGAGAGTAGTGACTATTCTAGTCAGCTAAGGTCTAAACCCTTGATGGATAC
AGAACAACCTAGAAATGTGAAGGCGGAAGAGAATGATCAGGATCTTGATAAGGATGGGAA
CGGAGTGAATAATTTATCTACAAACTTTTTGGGGAATATTAACTTAAACCCCTCAGGGAA
TGATGAATACACATCATGGGGAGGTAATAGTAGCATTAATAGTTCTTGGACCGGTTTCAC
CTCCAACAACTCAACAGGTCATCTTTCATTCAAAGTATTCAGCTCTAGTCTTGATGATTA
TTTTGTTAGTTGGGTTGTACATGGATCGCTTGTCATGGGAGATATATATTACTGGGGAGA
GATCAAACCATGGAGTTATTATATACATGATCCAAGGCTAATTTTGGGAACCAACGGAAA
GGTACGGTTATAAATTTTTCTTTTTTGATCTTTTAGACGATCTTTAAAGTGTGAGTATGT
TCTGGTAGGCTTCTGGTGGTATTTGTGTTTTAGCATTATTGGGTTTATTGGCTATATATA
AATGTTTGGGTTATGTACGACTTGAGGAATTGGTATTGATGGATACGGTTCTGTGTGTCC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL7853Contig1 570 2 1 U
GGGAATCTCGCCGCCGTTAGAAAGAAAGAAGAAAGATGGGAGTATTCACATTCGTTTGCA
AAAGCAAAGGCGGAGAATGGACCGCTAAGCAACACGAGGGAGACCTCGAAGCCTCCGCTT
CTTCCACCTACGATCTTCAGCGCAAGCTTGTTCAGGCTGCTCTCTCCGCCGATTCCTCCG
GTGGCGTTCAGTCTTCCTTCTCTCTCGTCTGCCCTACCTCCGCCGTCTGCCAGGTGATCA
TTGGCGGTGGTTCTGGAGGAGGATTTGCTGCCGGAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGGAGGTG
GTGGTGGTGAGACCGCCGCGGCTGCTAAGGAGGAAGAGAAGAAGAAGGAAGAATCTGAAG
AGGGGGAAGGCGACTTTGGATTTGATCTCTTTGGTTAAGACCGAGAGAGAGCGAAAAACA
TAAAAACACTTTCCGAGGTGTTGTTTAGTTTCTGAGGTTTTTGATCTCAGATTATTTATT
TTTGCTTTTTCTGTTTTTCATTTTAAAACGGTTTTGAGGTTGTGCTCTATGATTTATGCA
ATGTCAGAAATATATGTTTGGTTTCTGGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FJ30JQ C 1
AF RR2FJ30TF U 1
BS 1 570 RR2FJ30TF

RD RR2FJ30JQ 570 0 0
GGGAATCTCGCCGCCGTTAGAAAGAAAGAAGAAAGATGGGAGTATTCACATTCGTTTGCA
AAAGCAAAGGCGGAGAATGGACCGCTAAGCAACACGAGGGAGACCTCGAAGCCTCCGCTT
CTTCCACCTACGATCTTCAGCGCAAGCTTGTTCAGGCTGCTCTCTCCGCCGATTCCTCCG
GTGGCGTTCAGTCTTCCTTCTCTCTCGTCTGCCCTACCTCCGCCGTTTGCCAGGTGATCA
TTGGCGGTGGTTCTGGAGGAGGATTTGCTGCCGGAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGGAGGTG
GTGGTGGTGAGACCGCCGCGGCTGCTAAGGAGGAAGAGAAGAAGAAGGAAGAATCTGAAG
AGGGGGAAGGCGACTTTGGATTTGATCTCTTTGGTTAAGACCGAGAGAGAGCGAAAAACA
TAAAAACACTTTCCGAGGTGTTGTTTAGTTTTTGAGGTTTTTGATCTCAGATTATTTATT
TTTGCTTTTTCTGTTTTTCATTTTAAAACGGTTTTGAGGTTGTGCTCTATGATTTATGCA
ATGTCAGAAATATATGTTTGGTTTCTGGTT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RR2FJ30TF 570 0 0
GGGAATCTCGCCGCCGTTAGAAAGAAAGAAGAAAGATGGGAGTATTCACATTCGTTTGCA
AAAGCAAAGGCGGAGAATGGACCGCTAAGCAACACGAGGGAGACCTCGAAGCCTCCGCTT
CTTCCACCTACGATCTTCAGCGCAAGCTTGTTCAGGCTGCTCTCTCCGCCGATTCCTCCG
GTGGCGTTCAGTCTTCCTTCTCTCTCGTCTGCCCTACCTCCGCCGTCTGCCAGGTGATCA
TTGGCGGTGGTTCTGGAGGAGGATTTGCTGCCGGAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGGAGGTG
GTGGTGGTGAGACCGCCGCGGCTGCTAAGGAGGAAGAGAAGAAGAAGGAAGAATCTGAAG
AGGGGGAAGGCGACTTTGGATTTGATCTCTTTGGTTAAGACCGAGAGAGAGCGAAAAACA
TAAAAACACTTTCCGAGGTGTTGTTTAGTTTCTGAGGTTTTTGATCTCAGATTATTTATT
TTTGCTTTTTCTGTTTTTCATTTTAAAACGGTTTTGAGGTTGTGCTCTATGATTTATGCA
ATGTCAGAAATATATGTTTGGTTTCTGGTT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL7854Contig1 1222 2 2 U
GACGAGGAGAGGGATACAGAAGGATCTTCGAGCTTTGGGTAAAGAGGAGCGTAAGAGGCA
GCAGTTGGCTGTATCGGACGTGATCAAGAACGCTGATGTCATTCTCACGACTCTGACCGG
CGCGCTGACGAGGAAGCTTGATAATATAACTTTTGATTTGGTGATTATTGATGAAGGAGC
GCAGGCTCTCGAGGTTGCTTGCTGGATCGCTTTGCTTAAGGGTTCGAGGTGTATACTTGC
GGGAGACCATCTCCAGCTCCCGCCGACGATACAGAGCGCTGAAGCTGAGAGGAAAGGGTT
GGGGATAACGCTCTTTGAGCGGTTGGCGGATCTTTATGGAGATGAGATTAAGTCCATGCT
TACTGTTCAGTACCGTATGCATGAGCTTATCACGAACTGGTCTTCTGAAGAGCTTTACGG
TGGGAAGATAACAGCGCATTCGAGTGTTGCCTCGCATATGTTTTTTGACTTGGAGAATGT
GGAGAAATCTTCGGCAACAGAGGCGACTCTGCTGTTGGTGGATAGCGCTGGGTGTGACAT
GGAAGAGAAGAAAGACGAGGAAGAGAGCACTTACAACGAAGGTGAAGCAGAGGTTGCAAT
GGCACATGCCAAGAGACTAATCAAGAGTGGAGTTAAACCTTGTAATATTGGAATCATCAC
ACCTTACGCTGCTCAGGTTATGGTGCTCAGGATACTTAGGGGCAAAGAGGAGAAGCTAAA
GGACATGGAGATCTCTACGGTGGATGGTTTCCAAGGACGAGAGAAAGAAGCTATCATCAT
CTCCATGGTTAGATCAAACTCAAAGAAGGAGGTTGGGTTTCTAAAGGACCAAAGGAGAAT
GAACGTGGCTGTGACTCGCGCTAGAAGACAGTGTTGTGTGGTCTGCGATACAATACGGTG
AGCAGTGATGCGTTTCTTAAACGTATGATTGAATACTTTGAGGAGCATGGGGAGTATCTC
AGCGCCTCTGACTACACCAATTGGTAAACTCAGGCCAGTTGATAGATTTGTGCAGAGCCA
ATACTCTTCCTTGGTGAGCATAGGTTCAGACCCTCTGGGATTACTTGTCTGCATACTATA
TCCATGGACATGTTTGTACCTTCTTTACCTGGCTTTGAATAAAAATCTTGGTCCCTCGAG
CATTCTTCAAGGCTTGTCATGTGCTATTTGTGTTGCCACTGTTCGTAATCGCTATTAGTT
TTGAATATTAAGCAATTAAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EE90TF U 1
AF RR2EE90JQ C 519
BS 1 577 RR2EE90TF
BS 578 1222 RR2EE90JQ

RD RR2EE90TF 577 0 0
GACGAGGAGAGGGATACAGAAGGATCTTCGAGCTTTGGGTAAAGAGGAGCGTAAGAGGCA
GCAGTTGGCTGTATCGGACGTGATCAAGAACGCTGATGTCATTCTCACGACTCTGACCGG
CGCGCTGACGAGGAAGCTTGATAATATAACTTTTGATTTGGTGATTATTGATGAAGGAGC
GCAGGCTCTCGAGGTTGCTTGCTGGATCGCTTTGCTTAAGGGTTCGAGGTGTATACTTGC
GGGAGACCATCTCCAGCTCCCGCCGACGATACAGAGCGCTGAAGCTGAGAGGAAAGGGTT
GGGGATAACGCTCTTTGAGCGGTTGGCGGATCTTTATGGAGATGAGATTAAGTCCATGCT
TACTGTTCAGTACCGTATGCATGAGCTTATCACGAACTGGTCTTCTGAAGAGCTTTACGG
TGGGAAGATAACAGCGCATTCGAGTGTTGCCTCGCATATGTTTTTTGACTTGGAGAATGT
GGAGAAATCTTCGGCAACAGAGGCGACTCTGCTGTTGGTGGATAGCGCTGGGTGTGACAT
GGAAGAGAAGAAAGACGAGGAAGAGAGCACTTACAAC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RR2EE90JQ 704 0 0
TGGATAGCGCTGGGTGTGACATGGAAGAGAAGAAAGACGAGGAAGAGAGCACTTACAACG
AAGGTGAAGCAGAGGTTGCAATGGCACATGCCAAGAGACTAATCAAGAGTGGAGTTAAAC
CTTGTAATATTGGAATCATCACACCTTACGCTGCTCAGGTTATGGTGCTCAGGATACTTA
GGGGCAAAGAGGAGAAGCTAAAGGACATGGAGATCTCTACGGTGGATGGTTTCCAAGGAC
GAGAGAAAGAAGCTATCATCATCTCCATGGTTAGATCAAACTCAAAGAAGGAGGTTGGGT
TTCTAAAGGACCAAAGGAGAATGAACGTGGCTGTGACTCGCGCTAGAAGACAGTGTTGTG
TGGTCTGCGATACAATACGGTGAGCAGTGATGCGTTTCTTAAACGTATGATTGAATACTT
TGAGGAGCATGGGGAGTATCTCAGCGCCTCTGACTACACCAATTGGTAAACTCAGGCCAG
TTGATAGATTTGTGCAGAGCCAATACTCTTCCTTGGTGAGCATAGGTTCAGACCCTCTGG
GATTACTTGTCTGCATACTATATCCATGGACATGTTTGTACCTTCTTTACCTGGCTTTGA
ATAAAAATCTTGGTCCCTCGAGCATTCTTCAAGGCTTGTCATGTGCTATTTGTGTTGCCA
CTGTTCGTAATCGCTATTAGTTTTGAATATTAAGCAATTAAGGT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL7855Contig1 562 2 1 U
GGTATAGGAATCGGTTGGACGTGATAGGGATCGACGAGGCGCAGTTCTTCGGGGATCTCG
TGGAGTTCTGCCGCGAGGCTGCTGACGAGGAGGGAAAAACGGTTATTGTGGCGGGATTGG
ATTGATTATCTGAGGAGGAGGTTCGGTTCCGTGCTGGATTTGGTTCCGATTGCGGATACG
GTTACGAAGCTGGGGTCGAGGTGCGAGGTGTGTGGGAAGAGAGCTTCGTTTACGCTGAGG
AAGACTGAGGAGAGGGAGACGGAGTTGATTGGTGGAGCGGAGGTTTATATGCCTGTGTGT
CGGAGTCATTATGTTAGCGGTCAAGGCGTTTTGGAGACCGCTCGTGCCGTTTTGGGTGGT
TCTTCTTCCCAACGAAACGCAATGTGCGGTTCAGAATCTACGAGTACTCTCTCCCCTCCG
TTTTAAATACGCGTGTTGCGTTGTGTAGAGTTTGATTCAAAAGCCTTCCTGATAGCGTTA
GAGGCTTTTAGAAAAGGACCAAATGTGATGTGCCACTTATTAGCTTAATCCCTAATTTTA
ATTATAAAACTTTTGTTCCTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CC47JQ C 1
AF RR2CC47TF U 1
BS 1 562 RR2CC47TF

RD RR2CC47JQ 562 0 0
GGTATAGGAATCGGTTGGACGTGATAGGGATCGACGAGGCGCAGTTCTTCGGGGATCTCG
TGGAGTTCTGCCGCGAGGCTGCTGACGAGGAGGGAAAAACGGTTATTGTGGCGGGATTGG
ATTGATTATCTGAGGAGGAGGTTCGGTTCCGTGCTGGATTTGGTTCCGATTGCGGATACG
GTTACGAAGCTGGGGTCGAGGTGCGAGGTGTGTGGGAAGAGAGCTTCGTTTACGCTGAGG
AAGACTGAGGAGAGGGAGACGGAGTTGATTGGTGGAGCGGAGGTTTATATGCCTGTGTGT
CGGAGTCATTATGTTAGCGGTCAAGGCGTTTTGGAGACCGCTCGTGCCGTTTTGGGTGGT
TCTTCTTCCCAACGAAACGCAATGTGCGGTTCAGAATCTACGAGTACTCTCTCCCCTCCG
TTTTAAATACGCGTGTTGCGTTGTGTAGAGTTTGATTCAAAAGCCTTCCTGATAGCGTTA
GAGGCTTTTAGAAAAGGACCAAATGTGATGTGCCACTTATTAGCTTAATCCCTAATTTTA
ATTATAAAACTTTTGTTCCTAC

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2CC47TF 562 0 0
GGTATAGGAATCGGTTGGACGTGATAGGGATCGACGAGGCGCAGTTCTTCGGGGATCTCG
TGGAGTTCTGCCGCGAGGCTGCTGACGAGGAGGGAAAAACGGTTATTGTGGCGGGATTGG
ATTGATTATCTGAGGAGGAGGTTCGGTTCCGTGCTGGATTTGGTTCCGATTGCGGATACG
GTTACGAAGCTGGGGTCGAGGTGCGAGGTGTGTGGGAAGAGAGCTTCGTTTACGCTGAGG
AAGACTGAGGAGAGGGAGACGGAGTTGATTGGTGGAGCGGAGGTTTATATGCCTGTGTGT
CGGAGTCATTATGTTAGCGGTCAAGGCGTTTTGGAGACCGCTCGTGCCGTTTTGGGTGGT
TCTTCTTCCCAACGAAACGCAATGTGCGGTTCAGAATCTACGAGTACTCTCTCCCCTCCG
TTTTAAATACGCGTGTTGCGTTGTGTAGAGTTTGATTCAAAAGCCTTCCTGATAGCGTTA
GAGGCTTTTAGAAAAGGACCAAATGTGATGTGCCACTTATTAGCTTAATCCCTAATTTTA
ATTATAAAACTTTTGTTCCTAC

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 2

CO CL7856Contig1 769 2 3 U
AAATGAACAACATTTTGGTTACATGACAACCGTTGGAACTGAATACACACATAACCCCAA
AAAGTAATGACACAATCATCATCTTCCTCTAATTAGATTTCATCTCAATGTCTCCATCAT
CCTTATTAGCAACATTGTCCGGAGAATCTTTTGGCAAAAGACCAAGCAGAGGCAGAGGGA
GCAACGAGCTAAGATTGCAGAGGATAATAAGCGTCGACAGGTTATCAAAACTGTCTCTCG
TGATGCCGAACACTTGAGTCAGCCCTGCCCCCATAAGTCCACCAAGAACACTGCCTCCAT
TGGAGATTGACATAAGCGTAGCGAAGAGAGTTGCTTCCATTCCTTCTGGACACAACCTCG
CCGCTAAAACGAGAACCGGCATGAAAGAGGCCTGTGCAAGAACTGTTAGGATTAGAGAGT
CTCCTATTGCAAACCACTCGTCGCTTATTCCCAGCTGCCTGTTGAAACCAGTCACGAGGA
GAACCTGAGTCATCCCAAGGCCTGTTCCGAAAACGGTTGTCACGAGAAAGATTTTTCTCA
AAGGAACGGTTTTGAGGAAGCCATTGTAGAGTCTACTCCAAGCAACGAAGCAATTGAGGT
CACGAGTTTAACTCTTCCTAGAAACTACGGAGTAAAGCCAAGCTTGTTCGTTGTGAAGTA
AAACATTGCGGAATCAGAGTGTGGTGTGGCTTGCCATAAGAAGATAAACAAGGTTGGGAG
GAAAACATTAGGTTGCTTGATAGCACTCCATAGCTGAATCATGTTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EW10JQ U 6
AF RR2EW10TF C 1
BS 1 5 RR2EW10TF
BS 6 567 RR2EW10JQ
BS 568 769 RR2EW10TF

RD RR2EW10JQ 562 0 0
AACAACATTTTGGTTACATGACAACCGTTGGAACTGAATACACACATAACCCCAAAAAGT
AATGACACAATCATCATCTTCCTCTAATTAGATTTCATCTCAATGTCTCCATCATCCTTA
TTAGCAACATTGTCCGGAGAATCTTTTGGCAAAAGACCAAGCAGAGGCAGAGGGAGCAAC
GAGCTAAGATTGCAGAGGATAATAAGCGTCGACAGGTTATCAAAACTGTCTCTCGTGATG
CCGAACACTTGAGTCAGCCCTGCCCCCATAAGTCCACCAAGAACACTGCCTCCATTGGAG
ATTGACATAAGCGTAGCGAAGAGAGTTGCTTCCATTCCTTCTGGACACAACCTCGCCGCT
AAAACGAGAACCGGCATGAAAGAGGCCTGTGCAAGAACTGTTAGGATTAGAGAGTCTCCT
ATTGCAAACCACTCGTCGCTTATTCCCAGCTGCCTGTTGAAACCAGTCACGAGGAGAACC
TGAGTCATCCCAAGGCCTGTTCCGAAAACGGTTGTCACGAGAAAGATTTTTCTCAAAGGA
ACGGTTTTGAGGAAGCCATTGT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2EW10TF 769 0 0
AAATGAACAACATTTTGGTTACATGACAACCGTTGGAACTGAATACACACATAACCCCAA
AAAGTAATGACACAATCATCATCTTCCTCTAATTAGATTTCATCTCAATGTCTCCATCAT
CCTTATTAGCAACATTGTCCGGAGAATCTTTTGGCAAAAGACCAAGCAGAGGCAGAGGGA
GCAACGAGCTAAGATTGCAGAGGATAATAAGCGTCGACAGGTTATCAAAACTGTCTCTCG
TGATGCCGAACACTTGAGTCAGCCCTGCCCCCATAAGTCCACCAAGAACACTGCCTCCAT
TGGAGATTGACATAAGCGTAGCGAAGAGAGTTGCTTCCATTCCTTCTGGACACAACCTCG
CCGCTAAAACGAGAACCGGCATGAAAGAGGCCTGTGCAAGAACTGTTAGGATTAGAGAGT
CTCCTATTGCAAACCACTCGTCGCTTATTCCCAGCTGCCTGTTGAAACCAGTCACGAGGA
GAACCTGAGTCATCCCAAGGCCTGTTCCGAAAACGGTTGTCACGAGAAAGATTTTTCTCA
AAGGAACGGTTTTGAGGAAGCCATTGTAGAGTCTACTCCAAGCAACGAAGCAATTGAGGT
CACGAGTTTAACTCTTCCTAGAAACTACGGAGTAAAGCCAAGCTTGTTCGTTGTGAAGTA
AAACATTGCGGAATCAGAGTGTGGTGTGGCTTGCCATAAGAAGATAAACAAGGTTGGGAG
GAAAACATTAGGTTGCTTGATAGCACTCCATAGCTGAATCATGTTCTGC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL7857Contig1 667 2 2 U
TTTTTTTTTGCAACAAGAACAAAACACATATAATGTTTTACCACCAGTTTCTTCTTAAAC
TCAGAATTCATGCGTGTCAAATTGAAAATACAAACGGAAACGGTAAAGAAATGCCAAACA
ACACTTTAGATCCTATCGATATCCTCATCCTCAAACTCAACATAGTCTTCGGCCAGATTT
TCCTCATCTTCTTCAAGATCACCAACAATTCCTTCGTTAAGGCGAGTATTCTCTGGAAGC
TCACCATACGCCTTGAGAAGCCTGGCCTCATCAGACATGTACTTGAGGATGACATCCGCT
TTGTCATCTTGGTAGTCTCTCAGACCAACAAGTATGATGTCACCTGCTGCAATCCAAACC
TTCTTGTGCATTTTACCACGGATATGGTAGAGGCGTTTAGTGCCATCGATGCACATACAT
TCACATCTTCCATTACCAAGCATACGAAGGACTTGAGCGTATTCTTGTCCATCTTCCTTG
AATATAAGCTCTCGCTTCTAGTCATCCGCTTCATTCTTTCCTCTCTTCCTGTTCTTTCCT
CCCTTTCCCTTGTTCTTCGGCATGGTAACACTAAGAAGAGATCAACTAACTGCTTGGTTG
AGATAAGATTCGCAAATTCCTGTTGGGAATTGGATCAACGTTTTCTTCTCGTGCTGTGCG
GCTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DG46TF C 1
AF RR2DG46JQ U 23
BS 1 22 RR2DG46TF
BS 23 667 RR2DG46JQ

RD RR2DG46TF 667 0 0
TTTTTTTTTGCAACAAGAACAAAACACATATAATGTTTTACCACCAGTTTCTTCTTAAAC
TCAGAATTCATGCGTGTCAAATTGAAAATACAAACGGAAACGGTAAAGAAATGCCAAACA
ACACTTTAGATCCTATCGATATCCTCATCCTCAAACTCAACATAGTCTTCGGCCAGATTT
TCCTCATCTTCTTCAAGATCACCAACAATTCCTTCGTTAAGGCGAGTATTCTCTGGAAGC
TCACCATACGCCTTGAGAAGCCTGGCCTCATCAGACATGTACTTGAGGATGACATCCGCT
TTGTCATCTTGGTAGTCTCTCAGACCAACAAGTATGATGTCACCTGCTGCAATCCAAACC
TTCTTGTGCATTTTACCACGGATATGGTAGAGGCGTTTAGTGCCATCGATGCACATACAT
TCACATCTTCCATTACCAAGCATACGAAGGACTTGAGCGTATTCTTGTCCATCTTCCTTG
AATATAAGCTCTCGCTTCTAGTCATCCGCTTCATTCTTTCCTCTCTTCCTGTTCTTTCCT
CCCTTTCCCTTGTTCTTCGGCATGGTAACACTAAGAAGAGATCAACTAACTGCTTGGTTG
AGATAAGATTCGCAAATTCCTGTTGGGAATTGGATCAACGTTTTCTTCTCGTGCTGTGCG
GCTGCCC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RR2DG46JQ 645 0 0
AACACATATAATGTTTTACCACCAGTTTCTTCTTAAACTCAGAATTCATGCGTGTCAAAT
TGAAAATACAAACGGAAACGGTAAAGAAATGCCAAACAACACTTTAGATCCTATCGATAT
CCTCATCCTCAAACTCAACATAGTCTTCGGCCAGATTTTCCTCATCTTCTTCAAGATCAC
CAACAATTCCTTCGTTAAGGCGAGTATTCTCTGGAAGCTCACCATACGCCTTGAGAAGCC
TGGCCTCATCAGACATGTACTTGAGGATGACATCCGCTTTGTCATCTTGGTAGTCTCTCA
GACCAACAAGTATGATGTCACCTGCTGCAATCCAAACCTTCTTGTGCATTTTACCACGGA
TATGGTAGAGGCGTTTAGTGCCATCGATGCACATACATTCACATCTTCCATTACCAAGCA
TACGAAGGACTTGAGCGTATTCTTGTCCATCTTCCTTGAATATAAGCTCTCGCTTCTAGT
CATCCGCTTCATTCTTTCCTCTCTTCCTGTTCTTTCCTCCCTTTCCCTTGTTCTTCGGCA
TGGTAACACTAAGAAGAGATCAACTAACTGCTTGGTTGAGATAAGATTCGCAAATTCCTG
TTGGGAATTGGATCAACGTTTTCTTCTCGTGCTGTGCGGCTGCCC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL7858Contig1 562 2 1 U
GGTTCAGCGTGCTGTCTCAACATGCCTTTCTCCACTTGTGCAATCAAAAAAAAGAGGATT
TCCCTGCCCTCTTTTCGAGGCTCTTGGATAAGCTAATGAATAGTGATAAATATGGTGAGC
GAAGAGGAGCAGCTTTTGGTCTTGCGGGAGTGGTTATGGGCTTTGGAATTTCTAGCTTGA
AGCAATATGGTCTTGTAGTCACTTTGCAAGAAGCTCTTATCGACAGAAATCTTGCAAAAC
GGCGTGAAGGAGCATTACTAGCATTTGAATGTCTCTGCGAGAAGCTTGGAAAATTATTTG
AACCGTATGTGATCAAGATGTTACCCTTGCTTCTGGTGTCGTTCTCTGACCAAGTTGGGG
CGGTTCGTGAAGCAGCAGAATGTGCTGCTCGAGCTATGATGTCTCATCTATCCGCGTATG
GTGTGAAACTTGTCCTTCCTTCTCTACTCAAGGGTCTTGAAGATAAAGCATGGAGAACAA
AGCAAAGCAGTGTACAGCTCCTCGGAGCTATGGCATTTTGTAATCCTCAGCAACTGTCTC
AATGCCTTCCTAGGGTTGTGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DV28JQ C 1
AF RR2DV28TF U 1
BS 1 562 RR2DV28TF

RD RR2DV28JQ 562 0 0
GGTTCAGCGTGCTGTCTCAACATGCCTTTCTCCACTTGTGCAATCAAAAAAAAGAGGATT
TCCCTGCCCTCTTTTCGAGGCTCTTGGATAAGCTAATGAATAGTGATAAATATGGTGAGC
GAAGAGGAGCAGCTTTTGGTCTTGCGGGAGTGGTTATGGGCTTTGGAATTTCTAGCTTGA
AGCAATATGGTCTTGTAGTCACTTTGCAAGAAGCTCTTATCGACAGAAATCTTGCAAAAC
GGCGTGAAGGAGCATTACTAGCATTTGAATGTCTCTGCGAGAAGCTTGGAAAATTATTTG
AACCGTATGTGATCAAGATGTTACCCTTGCTTCTGGTGTCGTTCTCTGACCAAGTTGGGG
CGGTTCGTGAAGCAGCAGAATGTGCTGCTCGAGCTATGATGTCTCATCTATCCGCGTATG
GTGTGAAACTTGTCCTTCCTTCTCTACTCAAGGGTCTTGAAGATAAAGCATGGAGAACAA
AGCAAAGCAGTGTACAGCTCCTCGGAGCTATGGCATTTTGTAATCCTCAGCAACTGTCTC
AATGCCTTCCTAGGGTTGTGCC

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2DV28TF 562 0 0
GGTTCAGCGTGCTGTCTCAACATGCCTTTCTCCACTTGTGCAATCAAAAAAAAGAGGATT
TCCCTGCCCTCTTTTCGAGGCTCTTGGATAAGCTAATGAATAGTGATAAATATGGTGAGC
GAAGAGGAGCAGCTTTTGGTCTTGCGGGAGTGGTTATGGGCTTTGGAATTTCTAGCTTGA
AGCAATATGGTCTTGTAGTCACTTTGCAAGAAGCTCTTATCGACAGAAATCTTGCAAAAC
GGCGTGAAGGAGCATTACTAGCATTTGAATGTCTCTGCGAGAAGCTTGGAAAATTATTTG
AACCGTATGTGATCAAGATGTTACCCTTGCTTCTGGTGTCGTTCTCTGACCAAGTTGGGG
CGGTTCGTGAAGCAGCAGAATGTGCTGCTCGAGCTATGATGTCTCATCTATCCGCGTATG
GTGTGAAACTTGTCCTTCCTTCTCTACTCAAGGGTCTTGAAGATAAAGCATGGAGAACAA
AGCAAAGCAGTGTACAGCTCCTCGGAGCTATGGCATTTTGTAATCCTCAGCAACTGTCTC
AATGCCTTCCTAGGGTTGTGCC

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 2

CO CL7859Contig1 728 2 2 U
GAGCTTCTTCCTCCGCCGTAATTTCCTTCTCTGGACTGAAGGTTACGGAGAAGAGACAGA
GCGCGACGTTCTCCGACACGCCAGTGGAAAGCGCGAAGGATCCGCCGGTGGAGTCCACTC
CGATCTCTCAGATTTCCGGCGCGATCTCCGATTCCGAAGCTGAGAGTTTTGTGCAAGGAT
CGAGCCTAGACCTGTTGTTATCAACGCCAGAGATTTCTCTTCCGGCTGATGAATCTCCAG
TTTCGACCGTTACTGATAAGGATTTCCACATCGACGCTGATCGGATTCAGTCGATCGTCG
ACTTGCCTGCTTCTGTGGAGTCATTGCGCGCGGAGATCAGTGACCTGAAGAAGTTCATCT
GTTCAGTTGAGAGATCTGAAGAAAGCAACTGGATCGATGGAGCTCTTACTCGCAAATACC
ACCGCATTGCGCTGTTGATTTTTATCCTTTGGGCTGTCTTAGCTGCGATTGTGGTCTCCG
TCAGGTCAGGGGAGAAGATTGCTTACTATGGACCACTTCCAACTTGAAGGATTCAATTCA
AACCACTTCACATGGATGACTTGGCTACTATCACACTACACTGAGAAACAAGGGACCAAA
AACTCAACTACTTATCTAGAAGTTAAGCATAGTATTTTCGTATTTTTCTCTAATGAATTG
TTTAGTTGATATTAAAATTACTAAAAACATATAATTACTGATTTACTATTGGAAATTATC
CTTTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EY54TF U 1
AF RR2EY54JQ C 40
BS 1 602 RR2EY54TF
BS 603 728 RR2EY54JQ

RD RR2EY54TF 602 0 0
GAGCTTCTTCCTCCGCCGTAATTTCCTTCTCTGGACTGAAGGTTACGGAGAAGAGACAGA
GCGCGACGTTCTCCGACACGCCAGTGGAAAGCGCGAAGGATCCGCCGGTGGAGTCCACTC
CGATCTCTCAGATTTCCGGCGCGATCTCCGATTCCGAAGCTGAGAGTTTTGTGCAAGGAT
CGAGCCTAGACCTGTTGTTATCAACGCCAGAGATTTCTCTTCCGGCTGATGAATCTCCAG
TTTCGACCGTTACTGATAAGGATTTCCACATCGACGCTGATCGGATTCAGTCGATCGTCG
ACTTGCCTGCTTCTGTGGAGTCATTGCGCGCGGAGATCAGTGACCTGAAGAAGTTCATCT
GTTCAGTTGAGAGATCTGAAGAAAGCAACTGGATCGATGGAGCTCTTACTCGCAAATACC
ACCGCATTGCGCTGTTGATTTTTATCCTTTGGGCTGTCTTAGCTGCGATTGTGGTCTCCG
TCAGGTCAGGGGAGAAGATTGCTTACTATGGACCACTTCCAACTTGAAGGATTCAATTCA
AACCACTTCACATGGATGACTTGGCTACTATCACACTACACTGAGAAACAAGGGACCAAA
AA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RR2EY54JQ 689 0 0
AGGTTACGGAGAAGAGACAGAGCGCGACGTTCTCCGACACGCCAGTGGAAAGCGCGAAGG
ATCCGCCGGTGGAGTCCACTCCGATCTCTCAGATTTCCGGCGCGATCTCCGATTCCGAAG
CTGAGAGTTTTGTGCAAGGATCGAGCCTAGACCTGTTGTTATCAACGCCAGAGATTTCTC
TTCCGGCTGATGAATCTCCAGTTTCGACCGTTACTGATAAGGATTTCCACATCGACGCTG
ATCGGATTCAGTCGATCGTCGACTTGCCTGCTTCTGTGGAGTCATTGCGCGCGGAGATCA
GTGACCTGAAGAAGTTCATCTGTTCAGTTGAGAGATCTGAAGAAAGCAACTGGATCGATG
GAGCTCTTACTCGCAAATACCACCGCATTGCGCTGTTGATTTTTATCCTTTGGGCTGTCT
TAGCTGCGATTGTGGTCTCCGTCAGGTCAGGGGAGAAGATTGCTTACTATGGACCACTTC
CAACTTGAAGGATTCAATTCAAACCACTTCACATGGATGACTTGGCTACTATCACACTAC
ACTGAGAAACAAGGGACCAAAAACTCAACTACTTATCTAGAAGTTAAGCATAGTATTTTC
GTATTTTTCTCTAATGAATTGTTTAGTTGATATTAAAATTACTAAAAACATATAATTACT
GATTTACTATTGGAAATTATCCTTTCACC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL7860Contig1 837 2 6 U
GCGGCGCCACCTCTCTCAGCGGTGGTGGAGGCGGTGGCAGCGGCGCCGTTGATGGAGTTG
AGGAGTCTAGCGGCGGCGTTAAACTGTCAGAGGCCCTTAGATCTAAGATATCTCAAACGA
GTGTAATAACAACAACCCCTTTCAAGAGATCAAGAAAGAAAAAGACGCTTGCTGAGCTTA
AAGAGGAGGAGAGCTTACTCTTAAAGGAAAAGAAAAGCCTGAAAAATGAACTCGCAAGTG
TGCGCGACATGCTGAAGCAACAAAAAGCAATAAACGAGTCGCTAAAGAAAATGCAGCAGG
CTGCTGAGTCACGAAAGAATGATGATTCCTCGTTCCTGCTCCCTGACCTTAACATACCTC
TCGATAACAACCCTATGGAACCAGCTAATATATAACCAGCCACAACACAGCCATCAGACA
TGGATATTCTTTTGTCAGCCACACGTTCATGACTACGCTATAACTGTGATTATATTTATG
ATACGGATGTCTATAAATAGATAATCGTCCCCCCCTCTCGCGCCCCGTCATTGTCTTTGC
GGAAGGGGAAAAGGATTCTAATGGCAGTGTGGACGAGTTAAATGTTTTTGAATCCTTTTT
TCTTTTCTTTCTTTCATAGATATTAATTCTTACGTCGTAGCAAGTTTTTGATCTTGCCCT
CCTTTAATTCTCTTCTCTCTCTCTTGCTGTTTTTCCACTCTTTTATTTTTTTATGCAATC
AAAAGATGAGATGTAATTTGATAATTAATCCATTATATAGGTACGTTTCTTCTTTTATTG
TGTGTTTTAAATTTAAATTCGACTTTCCATCTTCTGCTATGTTATTGTTTCCCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BW83TF U 1
AF RR2BW83JQ C 56
BS 1 711 RR2BW83TF
BS 712 712 RR2BW83JQ
BS 713 723 RR2BW83TF
BS 724 724 RR2BW83JQ
BS 725 775 RR2BW83TF
BS 776 837 RR2BW83JQ

RD RR2BW83TF 780 0 0
GCGGCGCCACCTCTCTCAGCGGTGGTGGAGGCGGTGGCAGCGGCGCCGTTGATGGAGTTG
AGGAGTCTAGCGGCGGCGTTAAACTGTCAGAGGCCCTTAGATCTAAGATATCTCAAACGA
GTGTAATAACAACAACCCCTTTCAAGAGATCAAGAAAGAAAAAGACGCTTGCTGAGCTTA
AAGAGGAGGAGAGCTTACTCTTAAAGGAAAAGAAAAGCCTGAAAAATGAACTCGCAAGTG
TGCGCGACATGCTGAAGCAACAAAAAGCAATAAACGAGTCGCTAAAGAAAATGCAGCAGG
CTGCTGAGTCACGAAAGAATGATGATTCCTCGTTCCTGCTCCCTGACCTTAACATACCTC
TCGATAACAACCCTATGGAACCAGCTAATATATAACCAGCCACAACACAGCCATCAGACA
TGGATATTCTTTTGTCAGCCACACGTTCATGACTACGCTATAACTGTGATTATATTTATG
ATACGGATGTCTATAAATAGATAATCGTCCCCCCCTCTCGCGCCCCGTCATTGTCTTTGC
GGAAGGGGAAAAGGATTCTAATGGCAGTGTGGACGAGTTAAATGTTTTTGAATCCTTTTT
TCTTTTCTTTCTTTCATAGATATTAATTCTTACGTCGTAGCAAGTTTTTGATCTTGCCCT
CCTTTAATTCTCTTCTCTCTCTCTTGCTGTTTTTCCACTCTTTTATTTTTT*ATGCAATC
AAA*GATGAGATGTAATTTGATAATTAATCCATTATATAGGTACGTTTCTTCTTT
ATGTG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2BW83JQ 782 0 0
GAG
TGAGGAGTCTAGCGGCGGCGTTAAACTGTCAGAGGCCTTTAGATCTAAGATATCTCAAAC
GAGTGTAATAACAACAACCCCTTTCAAGAGATCAAGAAAGAAAAAGACGCTTGCTGAGCT
TAAAGAGGAGGAGAGCTTACTCTTAAAGGAAAAGAAAAGCCTGAAAAATGAACTCGCAAG
TGTGCGCGACATGCTGAAGCAACAAAAAGCAATAAACGAGTCGCTAAAGAAAATGCAGCA
GGCTGCTGAGTCACGAAAGAATGATGATTCCTCGTTCCTGCTCCCTGACCTTAACATACC
TCTCGATAACAACCCTATGGAACCAGCTAATATATAACCAGCCACAACACAGCCATCAGA
CATGGATATTCTTTTGTCAGCCACACGTTCATGACTACGCTATAACTGTGATTATATTTA
TGATACGGATGTCTATAAATAGATAATCGTCCCCCCCTCTCGCGCCCCGTCATTGTCTTT
GCGGAAGGGGAAAAGGATTCTAATGGCAGTGTGGACGAGTTAAATGTTTTTGAATCCTTT
TTTCTTTTCTTTCTTTCATAGATATTAATTCTTACGTCGTAGCAAGTTTTTGATCTTGCC
CTCCTTTAATTCTCTTCTCTCTCTCTTGCTGTTTTTCCACTCTTTTATTTTTTTATGCAA
TCAAAAGATGAGATGTAATTTGATAATTAATCCATTATATAGGTACGTTTCTTCTTTTAT
TGTGTGTTTTAAATTTAAATTCGACTTTCCATCTTCTGCTATGTTATTGTTTCCCTCCC

QA 4 782 4 782
DS 



AS 1 2

CO CL7861Contig1 358 2 1 U
GATCAGGTTGTTCATGACGTGATCAAGGGAAGACATGAGAGAGACTTGACCTTTTTATTG
AGATACTGTTTCCAGGCAGTGATATATGCTTTGTGGCTGGAGAGAAATGTGAGAAGAGTA
GGAGAATCAGAACAGCCAGCTACTTGTTTGATAGCAAGATTGGACAAGTTGGTGAGAAAT
AGAATCACGTCACTGAGAAGAAAGAATGGAGCAAGATACGAAAAAGCTATGGAGAAATGG
TTTGGAAGAAGATAAAATAGTTTTCTTTGATGTTTTGTTTTGCTCTTTCATTTAAACATT
AGCAGTTTTTGCACTGTATCAAGGTTTTTTTTGATATGAATAAATTTAAAATTCTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2EF90JQ C 1
AF RR2EF90TF U 1
BS 1 358 RR2EF90TF

RD RR2EF90JQ 358 0 0
GATCAGGTTGTTCATGACGTGATCAAGGGAAGACATGAGAGAGACTTGACCTTTTTATTG
AGATACTGTTTCCAGGCAGTGATATATGCTTTGTGGCTGGAGAGAAATGTGAGAAGAGTA
GGAGAATCAGAACAGCCAGCTACTTGTTTGATAGCAAGATTGGACAAGTTGGTGAGAAAT
AGAATCACGTCACTGAGAAGAAAGAATGGAGCAAGATACGAAAAAGCTATGGAGAAATGG
TTTGGAAGAAGATAAAATAGTTTTCTTTGATGTTTTGTTTTGCTCTTTCATTTAAACATT
AGCAGTTTTTGCACTGTATCAAGGTTTTTTTTGATATGAATAAATTTAAAATTCTTTC

QA 1 358 1 358
DS 

RD RR2EF90TF 358 0 0
GATCAGGTTGTTCATGACGTGATCAAGGGAAGACATGAGAGAGACTTGACCTTTTTATTG
AGATACTGTTTCCAGGCAGTGATATATGCTTTGTGGCTGGAGAGAAATGTGAGAAGAGTA
GGAGAATCAGAACAGCCAGCTACTTGTTTGATAGCAAGATTGGACAAGTTGGTGAGAAAT
AGAATCACGTCACTGAGAAGAAAGAATGGAGCAAGATACGAAAAAGCTATGGAGAAATGG
TTTGGAAGAAGATAAAATAGTTTTCTTTGATGTTTTGTTTTGCTCTTTCATTTAAACATT
AGCAGTTTTTGCACTGTATCAAGGTTTTTTTTGATATGAATAAATTTAAAATTCTTTC

QA 1 358 1 358
DS 



AS 1 2

CO CL7862Contig1 563 2 1 U
TTTTTACAATCCACTGAAGCTGCCAATGGGTTGGGATGGGAAGCCTATACCATACTGGCT
ATACAAGCTCCATGGCCTTGGCCAGAAATTCGAATGCGAGATATGTGGAAACAGTATCTA
CATGGGGAGAAGGGCTTTTGAGAGACATTTTAAAGAGTTTCAACACCAACATGGAATGCG
TTGCTTAGGGATCCCAAACACAAAGAACTTCAACGAAATCACTTCAATTGAGGAAGCGAA
AGAGTTGTGGAAGAAGATCCAGGAGAGGCAAGGAGTTAACAAATGGAGGCCAGATCTTGA
AGAAGAGTATGAAGATCGTGAAGGTAACATCTACAACAAGAAGACTTACTCTGATCTCCA
ACGTCAAGGTCTCATCTGATTAATCACATTCAGCATTGTACTTGTTTGTCAATTCTCTAT
TTGCTGTATCGTTTACGATTTGTCATCTTTTTTTATGTATTCTCTTTTAGTTTCTTTTAT
TCACAAATGGTCCCTAGGGAAAACATAAAAAACTAAGAAATGTTTTCACATCTGATGTTG
AGAAAACACAACAGTATTACACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2G929JQ C 1
AF RR2G929TF U 1
BS 1 563 RR2G929TF

RD RR2G929JQ 563 0 0
TTTTTACAATCCACTGAAGCTGCCAATGGGTTGGGATGGGAAGCCTATACCATACTGGCT
ATACAAGCTCCATGGCCTTGGCCAGAAATTCGAATGCGAGATATGTGGAAACAGTATCTA
CATGGGGAGAAGGGCTTTTGAGAGACATTTTAAAGAGTTTCAACACCAACATGGAATGCG
TTGCTTAGGGATCCCAAACACAAAGAACTTCAACGAAATCACTTCAATTGAGGAAGCGAA
AGAGTTGTGGAAGAAGATCCAGGAGAGGCAAGGAGTTAACAAATGGAGGCCAGATCTTGA
AGAAGAGTATGAAGATCGTGAAGGTAACATCTACAACAAGAAGACTTACTCTGATCTCCA
ACGTCAAGGTCTCATCTGATTAATCACATTCAGCATTGTACTTGTTTGTCAATTCTCTAT
TTGCTGTATCGTTTACGATTTGTCATCTTTTTTTATGTATTCTCTTTTAGTTTCTTTTAT
TCACAAATGGTCCCTAGGGAAAACATAAAAAACTAAGAAATGTTTTCACATCTGATGTTG
AGAAAACACAACAGTATTACACC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2G929TF 563 0 0
TTTTTACAATCCACTGAAGCTGCCAATGGGTTGGGATGGGAAGCCTATACCATACTGGCT
ATACAAGCTCCATGGCCTTGGCCAGAAATTCGAATGCGAGATATGTGGAAACAGTATCTA
CATGGGGAGAAGGGCTTTTGAGAGACATTTTAAAGAGTTTCAACACCAACATGGAATGCG
TTGCTTAGGGATCCCAAACACAAAGAACTTCAACGAAATCACTTCAATTGAGGAAGCGAA
AGAGTTGTGGAAGAAGATCCAGGAGAGGCAAGGAGTTAACAAATGGAGGCCAGATCTTGA
AGAAGAGTATGAAGATCGTGAAGGTAACATCTACAACAAGAAGACTTACTCTGATCTCCA
ACGTCAAGGTCTCATCTGATTAATCACATTCAGCATTGTACTTGTTTGTCAATTCTCTAT
TTGCTGTATCGTTTACGATTTGTCATCTTTTTTTATGTATTCTCTTTTAGTTTCTTTTAT
TCACAAATGGTCCCTAGGGAAAACATAAAAAACTAAGAAATGTTTTCACATCTGATGTTG
AGAAAACACAACAGTATTACACC

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 2

CO CL7863Contig1 846 2 2 U
GCAGAAGCATTTGTTCTCCAACATTCTCAAAGAGGAGCATTTTTGGTATGATACTCAGAG
AGCACTAATTGCTGCCTATGAGAAGACAGACCAAACCATTCTGTCACATTCTGACCTAGG
CCGCGGTGGCTCAACCGCCGTAACCGCTATTCTGCTGGATGGACGACGTTTGTGGGTGGC
AAATGTGGGTGATTCCCGGGCTGTTTTGTCACGAGGTGGTCAGGCTATACAGATGACTGT
TGATCACGAGCCCCACACTGAAAGGTTAAGCATTGAGGATAAAGGAGGCTTTGTATCAAA
CATGCCAGGAGATGTGCCTCGTGTTAACGGGCAGCTAGCAGTTTCCCGTGCTTTTGGGGA
CAAAAGCCTCAAAACACATCTGCGGTCAGATCCAGACGTTAAAGATTCATCGATAGATGC
TCACACAGATGTTCTAGTTCTTGCTAGTGACGGTCTATGGAAGGTGATGGCTAACCAAGA
GGCGATTGATATCGCCAGAAGAATCAAAGATCCAGTGAAAGCAGCGAAAGAACTAACGAC
CGAAGCACTAAGAAGAGACAGCAAAGATGATATATCTTGCATCGTCGTCAGATTAAGGTG
ATGGAATTTATTCTACAAAACCACCAGAAAACAAAAGGATGAAACTTATTAGAAATGGAA
GAAACCAAATAAATAAAGTTTGATTATCAAGAATAGAAGACGATGTAAAATGTATTTTTA
ATATATTTTTGTTTCCTCCGGTGTAAAATGGTTGATCGGTTTTCCGGATGCTTGGTAATT
TGATTGGTTTGATTTGTGTAAGTGAGTGAGAATCATATTATTTGGTGTATAAACACAACT
TTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2BY47TF U 1
AF RR2BY47JQ C 53
BS 1 620 RR2BY47TF
BS 621 846 RR2BY47JQ

RD RR2BY47TF 620 0 0
GCAGAAGCATTTGTTCTCCAACATTCTCAAAGAGGAGCATTTTTGGTATGATACTCAGAG
AGCACTAATTGCTGCCTATGAGAAGACAGACCAAACCATTCTGTCACATTCTGACCTAGG
CCGCGGTGGCTCAACCGCCGTAACCGCTATTCTGCTGGATGGACGACGTTTGTGGGTGGC
AAATGTGGGTGATTCCCGGGCTGTTTTGTCACGAGGTGGTCAGGCTATACAGATGACTGT
TGATCACGAGCCCCACACTGAAAGGTTAAGCATTGAGGATAAAGGAGGCTTTGTATCAAA
CATGCCAGGAGATGTGCCTCGTGTTAACGGGCAGCTAGCAGTTTCCCGTGCTTTTGGGGA
CAAAAGCCTCAAAACACATCTGCGGTCAGATCCAGACGTTAAAGATTCATCGATAGATGC
TCACACAGATGTTCTAGTTCTTGCTAGTGACGGTCTATGGAAGGTGATGGCTAACCAAGA
GGCGATTGATATCGCCAGAAGAATCAAAGATCCAGTGAAAGCAGCGAAAGAACTAACGAC
CGAAGCACTAAGAAGAGACAGCAAAGATGATATATCTTGCATCGTCGTCAGATTAAGGTG
ATGGAATTTATTCTACAAAA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RR2BY47JQ 794 0 0
ACTCAGAGAGCACTAATTGCTGCCTATGAGAAGACAGACCAAACCATTCTGTCACATTCT
GAC*TAGGCCGCGGTGGCTCAACCGCCGTAACCGCTATTCTGCTGGATGGACGACGTTTG
TGGGTGGCAAATGTGGGTGATTCCCGGGCTGTTTTGTCACGAGGTGGTCAGGCTATACAG
ATGACTGTTGATCACGAGCCCCACACTGAAAGGTTAAGCATTGAGGATAAAGGAGGCTTT
GTATCAAACATGCCAGGAGATGTGCCTCGTGTTAACGGGCAGCTAGCAGTTTCCCGTGCT
TTTGGGGACAAAAGCCTCAAAACACATCTGCGGTCAGATCCAGACGTTAAAGATTCATCG
ATAGATGCTCACACAGATGTTCTAGTTCTTGCTAGTGACGGTCTATGGAAGGTGATGGCT
AACCAAGAGGCGATTGATATCGCCAGAAGAATCAAAGATCCAGTGAAAGCAGCGAAAGAA
CTAACGACCGAAGCACTAAGAAGAGACAGCAAAGATGATATATCTTGCATCGTCGTCAGA
TTAAGGTGATGGAATTTATTCTACAAAACCACCAGAAAACAAAAGGATGAAACTTATTAG
AAATGGAAGAAACCAAATAAATAAAGTTTGATTATCAAGAATAGAAGACGATGTAAAATG
TATTTTTAATATATTTTTGTTTCCTCCGGTGTAAAATGGTTGATCGGTTTTCCGGATGCT
TGGTAATTTGATTGGTTTGATTTGTGTAAGTGAGTGAGAATCATATTATTTGGTGTATAA
ACACAACTTTTCTT

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL7864Contig1 874 2 2 U
GCTTCCAAGTCTGGAAAGGAACATAATGGAACTGATGATGCTGGCAAGTCGGTGTCTACT
CCTAGAAGTAGCAGAAAAGCAAGCATCAGTGAAAAGAGACCAAGCTCTACGCCACCACAA
CCATCTTCTAGTGATGACGATGACTCAGAGATCCAACTTCGTTCAGGAAGAAGAGAAACA
AAACCTCAAACCTCATATCTTCATTCTCGTTTCAGCCATGATGACTCAGAGGAAGAACTT
CCAGCACGAGCTTTTGCCAGAAGTCAAGAGAAGACTCATAGTCCAACAACGAGAGTGAGA
GATCAAAATAGATCAAACCTTAAGATCCCAGCTTCAACTTCGTATGAAGATGATGAAGAA
GAAGTCGAAAGAGTCAGTGCCAAGCCATTTAAAACAACCGGGATATCTCTAAGGACTAAG
GGTCAAGTGAAAGCTCATGAGAAGCGTTCATTTCCAGTTACACCAACGAGAACCAACCAA
GAGTCTCGTGACCATCAATCTCCAAAATCAACTTCAGGGCAAAAGACAGTCTCTGTTGCA
CAAACTGTAAAATCACCAGATCCAGAGACCGCTTCAAGGGCTAGTCACGTTCATCCCAAC
CTCCCAGATTGTGATGATATTTTTGCAAGGCTTGGAGCTTTCCGTACTCCTAATCGCCGC
TGAATCTGCCCATCCTCAGTCTGTTCATACTTGTCACAAAGATCACTCCAAGTCATTTTT
TACTTTGACTAAAATTTGATTTTTTTACACATTATACATATTGAAGCAGTGGTGTGATAA
TACTTGTTATTTTTTTCCTTTTTTGCCTTTTTGGTGTTTTACTTTGACTGAATTTGATAT
TCATACAAATTATACAGATTGAAGCATTGGAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG03TF U 1
AF RR2GG03JQB C 171
BS 1 625 RR2GG03TF
BS 626 874 RR2GG03JQB

RD RR2GG03TF 625 0 0
GCTTCCAAGTCTGGAAAGGAACATAATGGAACTGATGATGCTGGCAAGTCGGTGTCTACT
CCTAGAAGTAGCAGAAAAGCAAGCATCAGTGAAAAGAGACCAAGCTCTACGCCACCACAA
CCATCTTCTAGTGATGACGATGACTCAGAGATCCAACTTCGTTCAGGAAGAAGAGAAACA
AAACCTCAAACCTCATATCTTCATTCTCGTTTCAGCCATGATGACTCAGAGGAAGAACTT
CCAGCACGAGCTTTTGCCAGAAGTCAAGAGAAGACTCATAGTCCAACAACGAGAGTGAGA
GATCAAAATAGATCAAACCTTAAGATCCCAGCTTCAACTTCGTATGAAGATGATGAAGAA
GAAGTCGAAAGAGTCAGTGCCAAGCCATTTAAAACAACCGGGATATCTCTAAGGACTAAG
GGTCAAGTGAAAGCTCATGAGAAGCGTTCATTTCCAGTTACACCAACGAGAACCAACCAA
GAGTCTCGTGACCATCAATCTCCAAAATCAACTTCAGGGCAAAAGACAGTCTCTGTTGCA
CAAACTGTAAAATCACCAGATCCAGAGACCGCTTCAAGGGCTAGTCACGTTCATCCCAAC
CTCCCAGATTGTGATGATATTTTTG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RR2GG03JQB 704 0 0
AAGAGAAACAAAACCTCAAACCTCATATCTTCATTCTCGTTTCAGCCATGATGACTCAGA
GGAAGAACTTCCAGCACGAGCTTTTGCCAGAAGTCAAGAGAAGACTCATAGTCCAACAAC
GAGAGTGAGAGATCAAAATAGATCAAACCTTAAGATCCCAGCTTCAACTTCGTATGAAGA
TGATGAAGAAGAAGTCGAAAGAGTCAGTGCCAAGCCATTTAAAACAACCGGGATATCTTT
AAGGACTAAGGGTCAAGTGAAAGCTCATGAGAAGCGTTCATTTCCAGTTACACCAACGAG
AACCAACCAAGAGTTTCGTGACCATCAATTTCCAAAATCAACTTCAGGGCAAAAGACAGT
TTTTGTTGCACAAACTGTAAAATCACCAGATCCAGAGACCGCTTCAAGGGCTAGTCACGT
TCATCCCAACCTCCCAGATTGTGATGATATTTTTGCAAGGCTTGGAGCTTTCCGTACTCC
TAATCGCCGCTGAATCTGCCCATCCTCAGTCTGTTCATACTTGTCACAAAGATCACTCCA
AGTCATTTTTTACTTTGACTAAAATTTGATTTTTTTACACATTATACATATTGAAGCAGT
GGTGTGATAATACTTGTTATTTTTTTCCTTTTTTGCCTTTTTGGTGTTTTACTTTGACTG
AATTTGATATTCATACAAATTATACAGATTGAAGCATTGGAGTG

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL7865Contig1 563 2 1 U
GGATATCTTTTCTCTCCCCCAAGAAATGGATAGAGATCTAACTCTCACCAACCACCGTAA
ACAACCCTACTTCACCGCTCGATGCTTGAGCTCTCCGTCGTCTTGTCTCTCATTACTACA
GAGGGAAACAGAGTACGCTCGAATCAGTGACCACAACAAGAAGACAAGGTCAAGTCCTAG
GTTTAGGAATTTCCTTAGAAGGATACTATTCATGGTTACAAGCTGCGGACTCCAGGACGC
AAAACCGAAGAGGTCGATAAAGTTTCACTACGATGCTGTGAGTTATGCTCAGAACTTCGA
CGATGGTTTTAACCTGCGCGATGATGATCGAAAGGTTTTCAGAAGTCTCCGAGCACAGAG
TCTCCGTCAATAGCTAATATAATATATTTGCTTTCTTTTTTAATTTTGTTAAATTTTATC
CTCGAACATGATATCAAATTTCATATGTGCCCTCGAGTTTTGTCAATTGCATATTTACGT
GTATCTGATGATTATGTATCTATTTAAGAAAGTTTGTTACCATATTAAAACTAAGCTGTT
ATAATATTTTATCTATTTTTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GF04JQ C 1
AF RR2GF04TF U 1
BS 1 563 RR2GF04TF

RD RR2GF04JQ 563 0 0
GGATATCTTTTCTCTCCCCCAAGAAATGGATAGAGATCTAACTCTCACCAACCACCGTAA
ACAACCCTACTTCACCGCTCGATGCTTGAGCTCTCCGTCGTCTTGTCTCTCATTACTACA
GAGGGAAACAGAGTACGCTCGAATCAGTGACCACAACAAGAAGACAAGGTCAAGTCCTAG
GTTTAGGAATTTCCTTAGAAGGATACTATTCATGGTTACAAGCTGCGGACTCCAGGACGC
AAAACCGAAGAGGTCGATAAAGTTTCACTACGATGCTGTGAGTTATGCTCAGAACTTCGA
CGATGGTTTTAACCTGCGCGATGATGATCGAAAGGTTTTCAGAAGTCTCCGAGCACAGAG
TCTCCGTCAATAGCTAATATAATATATTTGCTTTCTTTTTTAATTTTGTTAAATTTTATC
CTCGAACATGATATCAAATTTCATATGTGCCCTCGAGTTTTGTCAATTGCATATTTACGT
GTATCTGATGATTATGTATCTATTTAAGAAAGTTTGTTACCATATTAAAACTAAGCTGTT
ATAATATTTTATCTATTTTTCCC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2GF04TF 563 0 0
GGATATCTTTTCTCTCCCCCAAGAAATGGATAGAGATCTAACTCTCACCAACCACCGTAA
ACAACCCTACTTCACCGCTCGATGCTTGAGCTCTCCGTCGTCTTGTCTCTCATTACTACA
GAGGGAAACAGAGTACGCTCGAATCAGTGACCACAACAAGAAGACAAGGTCAAGTCCTAG
GTTTAGGAATTTCCTTAGAAGGATACTATTCATGGTTACAAGCTGCGGACTCCAGGACGC
AAAACCGAAGAGGTCGATAAAGTTTCACTACGATGCTGTGAGTTATGCTCAGAACTTCGA
CGATGGTTTTAACCTGCGCGATGATGATCGAAAGGTTTTCAGAAGTCTCCGAGCACAGAG
TCTCCGTCAATAGCTAATATAATATATTTGCTTTCTTTTTTAATTTTGTTAAATTTTATC
CTCGAACATGATATCAAATTTCATATGTGCCCTCGAGTTTTGTCAATTGCATATTTACGT
GTATCTGATGATTATGTATCTATTTAAGAAAGTTTGTTACCATATTAAAACTAAGCTGTT
ATAATATTTTATCTATTTTTCCC

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 2

CO CL7866Contig1 504 2 1 U
GGGAGTCGCGAAAATCTCGTCGTCTTTCATCACAACACTCGGGCCATTGTTTGTAGATCT
GCTCGCGTTTTCAACCCTAATCCCAGAACCGATTATCTACCTGAAACAGACAAAAAGGGT
TGATTTGATTAATCATGGCACTTCTCGAGGGATTTTACAGAGTCATCATGCGCCGTAACT
CCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGGCTGTGGATTACG
GTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAAAATGTTGGGAAACGGTATGAAGACATCTCCGTGT
TGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTCTGTTGTTGTTGTTTTGCACTTGC
AAAGTGACTCTCTTTCTTTGTTGAATAAATCATTTGGATGATGATTTTCATTTACTTTCA
CCTAAAGCTGCTATTTGATTCTGGTTAATTTAATGTTTTTTTGCATTGTGCAATAATTAA
ACCTTTAAAAGACGTCTTTATTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2A661JQ C 1
AF RR2A661TF U 1
BS 1 504 RR2A661TF

RD RR2A661JQ 504 0 0
GGGAGTCGCGAAAATCTCGTCGTCTTTCATCACAACACTCGGGCCATTGTTTGTAGATCT
GCTCGCGTTTTCAACCCTAATCCCAGAACCGATTATCTACCTGAAACAGACAAAAAGGGT
TGATTTGATTAATCATGGCACTTCTCGAGGGATTTTACAGAGTCATCATGCGCCGTAACT
CCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGGCTGTGGATTACG
GTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAAAATGTTGGGAAACGGTATGAAGACATCTCCGTGT
TGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTCTGTTGTTGTTGTTTTGCACTTGC
AAAGTGACTCTCTTTCTTTGTTGAATAAATCATTTGGATGATGATTTTCATTTACTTTCA
CCTAAAGCTGCTATTTGATTCTGGTTAATTTAATGTTTTTTTGCATTGTGCAATAATTAA
ACCTTTAAAAGACGTCTTTATTTC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RR2A661TF 504 0 0
GGGAGTCGCGAAAATCTCGTCGTCTTTCATCACAACACTCGGGCCATTGTTTGTAGATCT
GCTCGCGTTTTCAACCCTAATCCCAGAACCGATTATCTACCTGAAACAGACAAAAAGGGT
TGATTTGATTAATCATGGCACTTCTCGAGGGATTTTACAGAGTCATCATGCGCCGTAACT
CCGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGGCTGTGGATTACG
GTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAAAATGTTGGGAAACGGTATGAAGACATCTCCGTGT
TGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTCTGTTGTTGTTGTTTTGCACTTGC
AAAGTGACTCTCTTTCTTTGTTGAATAAATCATTTGGATGATGATTTTCATTTACTTTCA
CCTAAAGCTGCTATTTGATTCTGGTTAATTTAATGTTTTTTTGCATTGTGCAATAATTAA
ACCTTTAAAAGACGTCTTTATTTC

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL7867Contig1 761 2 4 U
GGATTCATTCTCAAAGCAAAAACAAAACCCTAAAGACACTTTTGCAAATTATCGAGAGAT
CAAGAATGGCAGAAGAAGCATCAAGTTTGGTCGGGATCATTGAGACAACCGTGGAGGTAA
AATCTTCACCAGAGAAGGTGCATGACATGTTTGTGGGGAAACACCGTATCCCCACTGCTT
CTCCATCCTTAGTTCAGGGCTTTGAGCTGCACGAAGGCGAAATTGGCCAAGTTGGTGCTA
TCGTAACCTGGAATTACTTTCACGATGGGGAGGCAATAGTAATGAAAGAGAGGATCGAGT
CAATAGACCCGGAGAACAATCGGGCCACGTACCGGGTGTTGGAGGGTGATTTAATGAACG
AGTACAAGAGTTTCTTGATCACCTTTCAAGTGACCCCTAAGGAAGGTGAACCTGGAAGTA
TTTTACATTGGCACTTTGAGTACGAGAAAATTAGTGAGGAGGTGGCTCACCCTGAGACCC
TCCTCCAGTTTGCCGTCGAGGTCTCCAAAGAGATCGATGCACATCTCATGTCCGAAGAAT
AGAGGATGAATTCTCTTGTCTCAATCCCATATATCCATAATTATATTTGTGTGTTTGCCT
TTAAGTTCTGTCTTTGAAATTACTATAAATAAGGACTAAGGAGACGCCTTGTCCGAGTTT
GTAAAAAGATATGTGTGTCATGAGGAAGTTTTTATGTTTGAGAAGCTAAGTGTAGTAGCA
TCAGCTATGAAGCTACTCAAAATTGATGTATGAAATGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG28TF U 1
AF RR2CG28JQ C 28
BS 1 666 RR2CG28TF
BS 667 667 RR2CG28JQ
BS 668 677 RR2CG28TF
BS 678 761 RR2CG28JQ

RD RR2CG28TF 677 0 0
GGATTCATTCTCAAAGCAAAAACAAAACCCTAAAGACACTTTTGCAAATTATCGAGAGAT
CAAGAATGGCAGAAGAAGCATCAAGTTTGGTCGGGATCATTGAGACAACCGTGGAGGTAA
AATCTTCACCAGAGAAGGTGCATGACATGTTTGTGGGGAAACACCGTATCCCCACTGCTT
CTCCATCCTTAGTTCAGGGCTTTGAGCTGCACGAAGGCGAAATTGGCCAAGTTGGTGCTA
TCGTAACCTGGAATTACTTTCACGATGGGGAGGCAATAGTAATGAAAGAGAGGATCGAGT
CAATAGACCCGGAGAACAATCGGGCCACGTACCGGGTGTTGGAGGGTGATTTAATGAACG
AGTACAAGAGTTTCTTGATCACCTTTCAAGTGACCCCTAAGGAAGGTGAACCTGGAAGTA
TTTTACATTGGCACTTTGAGTACGAGAAAATTAGTGAGGAGGTGGCTCACCCTGAGACCC
TCCTCCAGTTTGCCGTCGAGGTCTCCAAAGAGATCGATGCACATCTCATGTCCGAAGAAT
AGAGGATGAATTCTCTTGTCTCAATCCCATATATCCATAATTATATTTGTGTGTTTGCCT
TTAAGTTCTGTCTTTGAAATTACTATAAATAAGGACTAAGGAGACGCCTTGTCCGAGTTT
GTAAAA*GATATGTGTG

QA 1 677 1 677
DS 

RD RR2CG28JQ 734 0 0
CCCTAAAGACACTTTTGCAAATTATCGAGAGATCAAGAATGGCAGAAGAAGCATCAAGTT
TGGTCGGGATCATTGAGACAACCGTGGAGGTAAAATCTTCACCAGAGAAGGTGCATGACA
TGTTTGTGGGGAAACACCGTATCCCCACTGCTTCTCCATCCTTAGTTCAGGGCTTTGAGC
TGCACGAAGGCGAAATTGGCCAAGTTGGTGCTATCGTAACCTGGAATTACTTTCACGATG
GGGAGGCAATAGTAATGAAAGAGAGGATCGAGTCAATAGACCCGGAGAACAATCGGGCCA
CGTACCGGGTGTTGGAGGGTGATTTAATGAACGAGTACAAGAGTTTCTTGATCACCTTTC
AAGTGACCCCTAAGGAAGGTGAACCTGGAAGTATTTTACATTGGCACTTTGAGTACGAGA
AAATTAGTGAGGAGGTGGCTCACCCTGAGACCCTCCTCCAGTTTGCCGTCGAGGTCTCCA
AAGAGATCGATGCACATCTCATGTCCGAAGAATAGAGGATGAATTCTCTTGTCTCAATCC
CATATATCCATAATTATATTTGTGTGTTTGCCTTTAAGTTCTGTCTTTGAAATTACTATA
AATAAGGACTAAGGAGACGCCTTGTCCGAGTTTGTAAAAAGATATGTGTGTCATGAGGAA
GTTTTTATGTTTGAGAAGCTAAGTGTAGTAGCATCAGCTATGAAGCTACTCAAAATTGAT
GTATGAAATGTTTG

QA 1 734 1 734
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7869Contig1 736 2 8 U
GGATAGTACAAAAGGAAATGAAATGAAAGTAGTATAGTTATATATCCATAGGTATTGCAA
AGCATTTTGAAGCATCACAAGATGGAACCAGATATGGAAAATTTGATTCCGTCCAAAGGA
ATTCTCAAGAACGAGGAGCTCAAAAAGTACATCTTTGAAACAACGGCATATCCAAGAGAG
CATGAAGAGCTCAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAG
ATGGAGGTACCGGTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCC
AAGAACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCACGACGGCCCTCGCA
TTGCCCCAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGT
CTAGAGTTCATCAAGAATGCTGGTGTTGATCACAAAATCAACTTCATCCAATCTGATGGT
CTTCAGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAAAATCCAAAACCGGAGTATGATTTCGCATTT
GTGGACGTTGCCGTGACCAATGGAGGAGGAAGGGGAGGTTGTGGTTGTCTTTTAAGCAAA
AAAAATATATGTAATTTTCCACTTTGATGGATATGTCCGAGATGGTTTGTTGTATGTTTG
TTATGTGTTCCCCTTTCATTTCATAATTCATTTGTGCAGAGAGTTGTAAGCGCCTGTTAT
TTATTTTTTTTATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AL31TF U 1
AF RR2AL31JQ C 504
BS 1 509 RR2AL31TF
BS 510 510 RR2AL31JQ
BS 511 573 RR2AL31TF
BS 574 574 RR2AL31JQ
BS 575 603 RR2AL31TF
BS 604 604 RR2AL31JQ
BS 605 723 RR2AL31TF
BS 724 736 RR2AL31JQ

RD RR2AL31TF 723 0 0
GGATAGTACAAAAGGAAATGAAATGAAAGTAGTATAGTTATATATCCATAGGTATTGCAA
AGCATTTTGAAGCATCACAAGATGGAACCAGATATGGAAAATTTGATTCCGTCCAAAGGA
ATTCTCAAGAACGAGGAGCTCAAAAAGTACATCTTTGAAACAACGGCATATCCAAGAGAG
CATGAAGAGCTCAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAG
ATGGAGGTACCGGTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCC
AAGAACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCACGACGGCCCTCGCA
TTGCCCCAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGT
CTAGAGTTCATCAAGAATGCTGGTGTTGATCACAAAATCAACTTCATCCAATCTGATGGT
CTTCAGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAACCGGAGTATGATTTCGCATTT
GTGGACGTTGCCGTGACCAATGGAGGAGGAAGGTGAGGTTGTGGTTGTCTTTTAAGCAAA
AAAGATATATGTAATTTTCCACTTTGATGGATATGTCCGAGATGGTTTGTTGTATGTTTG
TTATGTGTTCCCCTTTCATTTCATAATTCATTTGTGCAGAGAGTTGTAAGCGCCTGTTAT
TTA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RR2AL31JQ 233 0 0
GACCGAAAATCCAAAACCGGAGTATGATTTCGCATTTGTGGACGTTGCCGTGACCAATGG
AGGAGGAAGGGGAGGTTGTGGTTGTTTTTTAAGCAAAAAAAATATATGTAATTTTCCACT
TTGATGGATATGTCCGAGATGGTTTGTTGTATGTTTGTTATGTGTTCCCCTTTCATTTCA
TAATTCATTTGTGCAGAGAGTTGTAAGCGCCTGTTATTTATTTTTTTTATTAT

QA 1 233 1 233
DS 



AS 1 2

CO CL7870Contig1 1052 2 2 U
AGGGGATTATCTGTGTTATGTCTTGTTTCACTCATAAAATCCTCTCTTGATTCTTAGCCT
TCTAATCAATAGGATGCGAAGAGTTGGTAAATATGAAGTGGGAAGAACAATTGGGGAAGG
AACTTTTGCTAAAGTAAAGTTTGCAAGAAACTCTGAAACTGGTGAACCTGTCGCTCTCAA
GATTCTTGATAAAGAAAAAGTCCTCAAGCATAAGATGTCTGAACAGATCAGAAGAGAGAT
AGCAAATATGAAGTTGATAAAGCATCCAAATGTTGTTCAATTATATGAGGTGATGGCAAG
CAAGACAAAGATATTTATCATCTTGGAGTATGTTACAGGAGGAGAGCTCTTTGATAAGAT
TATAAAATACGGGCGGATGAAAGAAGACAAGGCTCGAAGTTATTTCCAACAGCTTATACA
TGCTGTTGACTACTGTCATAGCAGAGGTGTTTACCATAGAGATCTCAAGCCTGAAAATTT
ACTATTGGATGCCTATGGAAACCTCAAGATCTCAGATTTTGGTTTAAGTGTTTTGTCTCA
ACAAGTCAGGGATGATGGACTGCTTCATACAACGTGTGGAACTCCTCACTACATTGCACC
CGAGGTTCTTAATGATAGAGGCTACGATGGAGCAACAACTGACATGTGGTCATGTGGTGT
TATACTCTATGTCTTGCTAGCTGGTTACTATCCTTTCGATGATTCTAATCTAATGAATAT
TTATAAGAAAATTTCATCTGGTGAATTCAGCTGTCCTCCGTGGCTCTCACTTGGCGCCAC
AAAACTGATCACTCGGATCTTAGATCCGAACCCGATGACTGTAAGTAATTTGACATGCTA
TAATTGCTAAATAAAGGTCCTTTATTAAGTTGTCTGTTACTGGAAGTTTTCAACATGAAC
TTTATAGTCGTTATAAATCCATGAGTTGAGTAAGGGAGCTCTATACTCTTTCCTTTGTAC
CTTTCACTCTATTGTAGGACAATCATGTTTCCGACTTTATCTAGCACAAAAGGGCTGGAG
AAAAATAAAGTTGGAGAACCTGTTTTATACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GQ96TF U 1
AF RR2GQ96JQ C 514
BS 1 768 RR2GQ96TF
BS 769 1052 RR2GQ96JQ

RD RR2GQ96TF 768 0 0
AGGGGATTATCTGTGTTATGTCTTGTTTCACTCATAAAATCCTCTCTTGATTCTTAGCCT
TCTAATCAATAGGATGCGAAGAGTTGGTAAATATGAAGTGGGAAGAACAATTGGGGAAGG
AACTTTTGCTAAAGTAAAGTTTGCAAGAAACTCTGAAACTGGTGAACCTGTCGCTCTCAA
GATTCTTGATAAAGAAAAAGTCCTCAAGCATAAGATGTCTGAACAGATCAGAAGAGAGAT
AGCAAATATGAAGTTGATAAAGCATCCAAATGTTGTTCAATTATATGAGGTGATGGCAAG
CAAGACAAAGATATTTATCATCTTGGAGTATGTTACAGGAGGAGAGCTCTTTGATAAGAT
TATAAAATACGGGCGGATGAAAGAAGACAAGGCTCGAAGTTATTTCCAACAGCTTATACA
TGCTGTTGACTACTGTCATAGCAGAGGTGTTTACCATAGAGATCTCAAGCCTGAAAATTT
ACTATTGGATGCCTATGGAAACCTCAAGATCTCAGATTTTGGTTTAAGTGTTTTGTCTCA
ACAAGTCAGGGATGATGGACTGCTTCATACAACGTGTGGAACTCCTCACTACATTGCACC
CGAGGTTCTTAATGATAGAGGCTACGATGGAGCAACAACTGACATGTGGTCATGTGGTGT
TATACTCTATGTCTTGCTAGCTGGTTACTATCCTTTCGATGATTCTAATCTAATGAATAT
TTATAAGAAAATTTCATCTGGTGAATTCAGCTGTCCTCCGTGGCTCTC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2GQ96JQ 539 0 0
AGATTTTGGTTTAAGTGTTTTGTCTCAACAAGTCAGGGATGATGGACTGCTTCATACAAC
GTGTGGAACTCCTCACTACATTGCACCCGAGGTTCTTAATGATAGAGGCTACGATGGAGC
AACAACTGACATGTGGTCATGTGGTGTTATACTCTATGTCTTGCTAGCTGGTTACTATCC
TTTCGATGATTCTAATCTAATGAATATTTATAAGAAAATTTCATCTGGTGAATTCAGCTG
TCCTCCGTGGCTCTCACTTGGCGCCACAAAACTGATCACTCGGATCTTAGATCCGAACCC
GATGACTGTAAGTAATTTGACATGCTATAATTGCTAAATAAAGGTCCTTTATTAAGTTGT
CTGTTACTGGAAGTTTTCAACATGAACTTTATAGTCGTTATAAATCCATGAGTTGAGTAA
GGGAGCTCTATACTCTTTCCTTTGTACCTTTCACTCTATTGTAGGACAATCATGTTTCCG
ACTTTATCTAGCACAAAAGGGCTGGAGAAAAATAAAGTTGGAGAACCTGTTTTATACAT

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 2

CO CL7871Contig1 974 2 2 U
GACCCGCTTTGGCCTTCTGTAACTCTTACGGAACCGGGCTCACGGACTGGAGTCTAGCAT
CAACCTACGGAAAGATCGGTCTTTTCATAATTGCCTCCGTAGTGGGAAGTGATGGTGGTG
TCATTGCCGGTTTAGCTGCATGTGGTGTCATGATGTCAATCGTCTCAACCGCATCTGATC
TCATGCAAGACTTCAAAACAGGTTACCTCACTTTATCATCAGCAAAATCCATGTTCGTAA
GCCAGCTCGTGGGAACTGCAATGGGCTGCATAATCGCTCCCCTCACGTTTTACTTGTTCT
GGTCTGCTTTCGACATTGGAGACCCCGACGGTCCGTACAAAGCACCTTACGCGGTGATCT
TCCGTGAGATGGCTATTCTCGGTATTGAAGGATTCGCAGAACTGCCTAAGCATTGTCTGG
CTCTTTGTTACGGGTTTTTCATTGCGGCTCTGATAGTGAATCTCTTGAGGGACATTACGC
CTCCTAAGGTCTCTCAGTTTATCCCTATCCCAATGGCGATGGCTGTCCCGTTCTACATTG
GAGCTTACTTCGCCATCGACATGTTCGTTGGGACTGTGATATTGTTCGTGTGGGAAAGGA
TCAACAGGAAAGATGCAGAGGACTTTGCGGGTGCAGTAGCATCAGGTCTGATCTGTGGAG
ATGGAATCTGGACAATTCCATCTGCAATCCTATCGATCTTGAGGGTCAATCCGCCCATCT
GCATGTACTTTAAACCGGCTTTGGCAAGTTAAAAGGGAGTCATAGTCTCTCATGGTCGCA
AGATTGTCTTCATATGTTGTGTATATATGTTTCGAAATCTCAGTCCCAGGAGAAACAAAA
AATGTTGTTGCAAAATCTCTTTATATGTTTTAGACAATGTTGTTGTTTAAGGGATGTTGT
CCCTTTGAATGCTTTCATTTTTAGATATTCACAACACAAGCTCAAGAAAAGTTTGAGACC
ATTTGCCTTTCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FU15TF U 1
AF RR2FU15JQ C 211
BS 1 775 RR2FU15TF
BS 776 974 RR2FU15JQ

RD RR2FU15TF 775 0 0
GACCCGCTTTGGCCTTCTGTAACTCTTACGGAACCGGGCTCACGGACTGGAGTCTAGCAT
CAACCTACGGAAAGATCGGTCTTTTCATAATTGCCTCCGTAGTGGGAAGTGATGGTGGTG
TCATTGCCGGTTTAGCTGCATGTGGTGTCATGATGTCAATCGTCTCAACCGCATCTGATC
TCATGCAAGACTTCAAAACAGGTTACCTCACTTTATCATCAGCAAAATCCATGTTCGTAA
GCCAGCTCGTGGGAACTGCAATGGGCTGCATAATCGCTCCCCTCACGTTTTACTTGTTCT
GGTCTGCTTTCGACATTGGAGACCCCGACGGTCCGTACAAAGCACCTTACGCGGTGATCT
TCCGTGAGATGGCTATTCTCGGTATTGAAGGATTCGCAGAACTGCCTAAGCATTGTCTGG
CTCTTTGTTACGGGTTTTTCATTGCGGCTCTGATAGTGAATCTCTTGAGGGACATTACGC
CTCCTAAGGTCTCTCAGTTTATCCCTATCCCAATGGCGATGGCTGTCCCGTTCTACATTG
GAGCTTACTTCGCCATCGACATGTTCGTTGGGACTGTGATATTGTTCGTGTGGGAAAGGA
TCAACAGGAAAGATGCAGAGGACTTTGCGGGTGCAGTAGCATCAGGTCTGATCTGTGGAG
ATGGAATCTGGACAATTCCATCTGCAATCCTATCGATCTTGAGGGTCAATCCGCCCATCT
GCATGTACTTTAAACCGGCTTTGGCAAGTTAAAAGGGAGTCATAGTCTCTCATGG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RR2FU15JQ 764 0 0
CTTTATCATCAGCAAAATCCATGTTCGTAAGCCAGCTCGTGGGAACTGCAATGGGCTGCA
TAATCGCTCCCCTCACGTTTTACTTGTTCTGGTCTGCTTTCGACATTGGAGACCCCGACG
GTCCGTACAAAGCACCTTACGCGGTGATCTTCCGTGAGATGGCTATTCTCGGTATTGAAG
GATTCGCAGAACTGCCTAAGCATTGTCTGGCTCTTTGTTACGGGTTTTTCATTGCGGCTC
TGATAGTGAATCTCTTGAGGGACATTACGCCTCCTAAGGTCTCTCAGTTTATCCCTATCC
CAATGGCGATGGCTGTCCCGTTCTACATTGGAGCTTACTTCGCCATCGACATGTTCGTTG
GGACTGTGATATTGTTCGTGTGGGAAAGGATCAACAGGAAAGATGCAGAGGACTTTGCGG
GTGCAGTAGCATCAGGTCTGATCTGTGGAGATGGAATCTGGACAATTCCATCTGCAATCC
TATCGATCTTGAGGGTCAATCCGCCCATCTGCATGTACTTTAAACCGGCTTTGGCAAGTT
AAAAGGGAGTCATAGTCTCTCATGGTCGCAAGATTGTCTTCATATGTTGTGTATATATGT
TTCGAAATCTCAGTCCCAGGAGAAACAAAAAATGTTGTTGCAAAATCTCTTTATATGTTT
TAGACAATGTTGTTGTTTAAGGGATGTTGTCCCTTTGAATGCTTTCATTTTTAGATATTC
ACAACACAAGCTCAAGAAAAGTTTGAGACCATTTGCCTTTCGAC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL7872Contig1 727 2 3 U
TTCTTGAATCCCAAATTGGGAGAAGATTCATATAAAAGAAACGTTGGCTGTCTCATGGTC
CTAACAAGCCCCCAGCAACAAGGAGAAGCAAAACCAAAACAAAATATGGAGTTACCATCA
ATTCTTTATGGATCCTATAACCGGATCAACTGATGGTCCTAAAAAAGACGATCAACTTTG
ATTCTTTGGTGAAACGATAACAAAAAGAATGAACCGGGAAGAAGTTTCTTCATGCGTTGA
TGGGATTTGATTCTTTAGACCTCATGATCTTGGCTTGTAGTTTCTGCATAAAAGCTGGAT
TAGCTTGGAGCCTCTGTTTAACATAAGCAGTTCTTATGTCCTCTGCGATCTTGTTAGCCT
TCGCAGCTTCCTCTATCAACCCGTAAAGCGTCCTCAAGCAGTCTTTCCTGTTTTCCCCTC
GATGTTCAAACCTCTCGCTGGTGATTGTAAGCTCGTCTTTCCCTGAATCATATCTTTTTC
CCACGAGCTCCCGTAGCCTTCGAGCTTGATGCTTAGAGAGTCCAAGCTCTTTAACTGTAA
CAGAAAGTTTAACTTTCCTGTTCTTTGGATGCCAAGCATCGCCTCCAGGAGCAAAAACAA
TCCTCGATTGCCACCTTAGGATTGGGCCTTCACCGGGAGGGTCATCCAAGTTTGTGTTCC
TGTAGGAAGGATCTGTTTCATCAAACTTGGGAGGTCCAGCAGCTTCCATTTCATTCCCAT
ATTGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EI32JQ U 9
AF RR2EI32TF C 1
BS 1 8 RR2EI32TF
BS 9 206 RR2EI32JQ
BS 207 727 RR2EI32TF

RD RR2EI32JQ 198 0 0
TCCCAAATTGGGAGAAGATTCATATAAAAGAAACGTTGGCTGTCTCATGGTCCTAACAAG
CCCCCAGCAACAAGGAGAAGCAAAACCAAAACAAAATATGGAGTTACCATCAATTCTTTA
TGGATCCTATAACCGGATCAACTGATGGTCCTAAAAAAGACGATCAACTTTGATTCTTTG
GTGAAACGATAACAAAAA

QA 1 198 1 198
DS 

RD RR2EI32TF 727 0 0
TTCTTGAATCCCAAATTGGGAGAAGATTCATATAAAAGAAACGTTGGCTGTCTCATGGTC
CTAACAAGCCCCCAGCAACAAGGAGAAGCAAAACCAAAACAAAATATGGAGTTACCATCA
ATTCTTTATGGATCCTATAACCGGATCAACTGATGGTCCTAAAAGAGACGATCAACTTTG
ATTCTTTGGTGAAACGATAACAAAAAGAATGAACCGGGAAGAAGTTTCTTCATGCGTTGA
TGGGATTTGATTCTTTAGACCTCATGATCTTGGCTTGTAGTTTCTGCATAAAAGCTGGAT
TAGCTTGGAGCCTCTGTTTAACATAAGCAGTTCTTATGTCCTCTGCGATCTTGTTAGCCT
TCGCAGCTTCCTCTATCAACCCGTAAAGCGTCCTCAAGCAGTCTTTCCTGTTTTCCCCTC
GATGTTCAAACCTCTCGCTGGTGATTGTAAGCTCGTCTTTCCCTGAATCATATCTTTTTC
CCACGAGCTCCCGTAGCCTTCGAGCTTGATGCTTAGAGAGTCCAAGCTCTTTAACTGTAA
CAGAAAGTTTAACTTTCCTGTTCTTTGGATGCCAAGCATCGCCTCCAGGAGCAAAAACAA
TCCTCGATTGCCACCTTAGGATTGGGCCTTCACCGGGAGGGTCATCCAAGTTTGTGTTCC
TGTAGGAAGGATCTGTTTCATCAAACTTGGGAGGTCCAGCAGCTTCCATTTCATTCCCAT
ATTGAAT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL7873Contig1 710 2 6 U
GGCTTCCTCTCTCTCGCTCAATGTCGTTGAAACTCAACACCCGAATTTTGGCGGCGCCAT
CTCTGTTCCCAAATTCGAACCCAAGAGGACCCACCGAGATTCGATTCTCCAACAGATGGG
GCAAAGCTAACGCCGATCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGAATCAACGTTGCAGAAGGGA
TCAAATTCGTTGTTGCGAGAAGGCAGGAGGAGGAGGAGGAGGTGATGTGTCAAAAAAAAC
GGGAGTGTGGTGGGACTTGAACACGTGTCCTCTTCCGGCTGGTTTTGACCCTCGTTGGGT
CCGTCCGTGTATAGAATCTGCCGTGGAAGAGGAGATTGGTTTTCGTACTGAAGTCACCAT
ATATGCAATGGGCAACCTAGAATACATCTCTATTGACCTCTTGGAAAAGATCTCTTCCTC
TGGGATCATTCTTACTCACCCCCCCTGCGTTGGGAAAGGCTTAATGTTATTTATGGACGA
CTGGTTTGGTGATGACTTTAGCAACCCACATCCTCCGGGTTACGTAATGATCATCTCGGG
TGATCAGAAAATGCTTGATCCTTGGCGTTTTCGGAGTTTTGGGCACACTACTTTTGTTGC
ATTTCCAAAAGGTGTTCGCCTACTTGCACCTCATGCCGAACTAAAATTTATTGGCGAACT
GTTTGAGTACGTGTTTGCCAAACAGTTTGTCTGGGAAACTTTATTGACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GG21TF U 1
AF RR2CI90TF U 14
BS 1 439 RR2GG21TF
BS 440 440 RR2CI90TF
BS 441 573 RR2GG21TF
BS 574 574 RR2CI90TF
BS 575 598 RR2GG21TF
BS 599 710 RR2CI90TF

RD RR2GG21TF 598 0 0
GGCTTCCTCTCTCTCGCTCAATGTCGTTGAAACTCAACACCCGAATTTTGGCGGCGCCAT
CTCTGTTCCCAAATTCGAACCCAAGAGGACCCACCGAGATTCGATTCTCCAACAGATGGG
GCAAAGCTAACGCCGATCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGAATCAACGTTGCAGAAGGGA
TCAAATTCGTTGTTGCGAGAAGGCAGGAGGAGGAGGAGGAGGTGATGTGTCAAAAAAAAC
GGGAGTGTGGTGGGACTTGAACACGTGTCCTCTTCCGGCTGGTTTTGACCCTCGTTGGGT
CCGTCCGTGTATAGAATCTGCCGTGGAAGAGGAGATTGGTTTTCGTACTGAAGTCACCAT
ATATGCAATGGGCAACCTAGAATACATCTCTATTGACCTCTTGGAAAAGATCTCTTCCTC
TGGGATCATTCTTACTCACTCCCCCTGCGTTGGGAAAGGCTTAATGTTATTTATGGACGA
CTGGTTTGGTGATGACTTTAGCAACCCACATCCTCCGGGTTACGTAATGATCATCTCGGG
TGATCAGAAAATGCTTGATCCTTGGCGTTTTCG*AGTTTTGGGCACACTACTTTTGTT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RR2CI90TF 697 0 0
GG
GCTCAATGTCGTTGAAACTCAACACCCGAATTTTGGCGGCGCCATCTCTGTTCCCAAATT
CGAACCCAAGAGGACCCACCGAGATTCGATTCTCCAACAGATGGGGCAAAGCTAACGCCG
ATCTCCTCTCTCTCTCTCTCT**TGAATCAACGTTGCAGAAGGGATCAAATTCGTTGTTG
CGAGAAGGCAGGAGGAGGAGGAGGAGGTGATGTGTCAAAAAAAACGGGAGTGTGGTGGGA
CTTGAACACGTGTCCTCTTCCGGCTGGTTTTGACCCTCGTTGGGTCCGTCCGTGTATAGA
ATCTGCCGTGGAAGAGGAGATTGGTTTTCGTACTGAAGTCACCATATATGCAATGGGCAA
CCTAGAATACATCTCTATTGACCTCTTGGAAAAGATCTCTTCCTCTGGGATCATTCTTAC
TCACCCCCCCTGCGTTGGGAAAGGCTTAATGTTATTTATGGACGACTGGTTTGGTGATGA
CTTTAGCAACCCACATCCTCCGGGTTACGTAATGATCATCTCGGGTGATCAGAAAATGCT
TGATCCTTGGCGTTTTCGGAGTTTTGGGCACACTACTTTTGTTGCATTTCCAAAAGGTGT
TCGCCTACTTGCACCTCATGCCGAACTAAAATTTATTGGCGAACTGTTTGAGTACGTGTT
TGCCAAACAGTTTGTCTGGGAAACTTTATTGACTG

QA 3 697 3 697
DS 



AS 1 2

CO CL7874Contig1 669 2 1 U
GGAGGGAGGAAGAGACTCGACGGCGAATATGGAAGGAGTTGGACTGCGAGGTTGTGGACA
GATTCTCCGTCTCGGATTCCCGGTTCGCCGTGGTGTATGCGGCCGTAATCCGGTCCTCAA
GGTTTTTGAAGAGATTCGGAAGGAGTATTGGTACAAGCCTCATGTGAGACTATACGCAGA
TATGATCGCTGCGATGGCGGGTAACAGTTTGCTAGAGGAGGTCAACCGTCTTTACGCAGC
TATGAAATCAGAGAAGGGATTAACTGCTGAGACTGAGAGCTTCGACACACTCTTGGTGAT
TCTTCTGAATCATAAGCTGTTTGAACTTGTCATGGACTGCTACGGCTTTATGCAATCGAT
AGGGTACGAGCCTGATAGGTATTCCTTTAGGATCCTAGTCCAAGGTCTCGAGTCGAATGG
AGAAATGGGCTTGTCGGCTATTGTTAGGCAAGATGCTCTCGAGTATTACGGCGAATCGTT
AGAGTTTACTGAAGAAGTTGAAGACATATCTAGTCTGTTGATTCCACAATGGAGGAGATA
AATTTAGCTTGAAATTTTGATCATACTGTAACTGTGTACTAATCTCTATCAAGTATTCCC
TTTTTTTATATCTGATTTGTGTAGCCGCAAGGCTGTTTGGTATCGATCAGATGATGCATT
GATTCTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AI78TF U 1
AF RR2AI78JQ C 67
BS 1 669 RR2AI78TF

RD RR2AI78TF 669 0 0
GGAGGGAGGAAGAGACTCGACGGCGAATATGGAAGGAGTTGGACTGCGAGGTTGTGGACA
GATTCTCCGTCTCGGATTCCCGGTTCGCCGTGGTGTATGCGGCCGTAATCCGGTCCTCAA
GGTTTTTGAAGAGATTCGGAAGGAGTATTGGTACAAGCCTCATGTGAGACTATACGCAGA
TATGATCGCTGCGATGGCGGGTAACAGTTTGCTAGAGGAGGTCAACCGTCTTTACGCAGC
TATGAAATCAGAGAAGGGATTAACTGCTGAGACTGAGAGCTTCGACACACTCTTGGTGAT
TCTTCTGAATCATAAGCTGTTTGAACTTGTCATGGACTGCTACGGCTTTATGCAATCGAT
AGGGTACGAGCCTGATAGGTATTCCTTTAGGATCCTAGTCCAAGGTCTCGAGTCGAATGG
AGAAATGGGCTTGTCGGCTATTGTTAGGCAAGATGCTCTCGAGTATTACGGCGAATCGTT
AGAGTTTACTGAAGAAGTTGAAGACATATCTAGTCTGTTGATTCCACAATGGAGGAGATA
AATTTAGCTTGAAATTTTGATCATACTGTAACTGTGTACTAATCTCTATCAAGTATTCCC
TTTTTTTATATCTGATTTGTGTAGCCGCAAGGCTGTTTGGTATCGATCAGATGATGCATT
GATTCTTGT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RR2AI78JQ 603 0 0
CCGTCTCGGATTCCCGGTTCGCCGTGGTGTATGCGGCCGTAATCCGGTCCTCAAGGTTTT
TGAAGAGATTCGGAAGGAGTATTGGTACAAGCCTCATGTGAGACTATACGCAGATATGAT
CGCTGCGATGGCGGGTAACAGTTTGCTAGAGGAGGTCAACCGTCTTTACGCAGCTATGAA
ATCAGAGAAGGGATTAACTGCTGAGACTGAGAGCTTCGACACACTCTTGGTGATTTTTTT
GAATCATAAGCTGTTTGAACTTGTCATGGACTGCTACGGCTTTATGCAATCGATAGGGTA
CGAGCCTGATAGGTATTCCTTTAGGATCCTAGTCCAAGGTCTCGAGTCGAATGGAGAAAT
GGGCTTGTCGGCTATTGTTAGGCAAGATGCTCTCGAGTATTACGGCGAATCGTTAGAGTT
TACTGAAGAAGTTGAAGACATATTTAGTCTGTTGATTCCCCAATGGAGGAGATAAATTTA
GCTTGAAATTTTGATCATACTGTAACTGTGTACTAATCTCTATCAAGTATTCCCTTTTTT
TATATTTGATTTGTGTAGCCGCAAGGCTGTTTGGTATCGATCAGATGATGCATTGATTCT
TGT

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL7875Contig1 713 2 2 U
ATTGAGTAACTTGATGCAAATAGAAGGATTAGAGTGAAATGTGATACACACACTTAAACT
CAATCTCGATAACAGTGTGTGACTAAAGCGGATGTATATAATAAGTTACAAGTAAGGGAA
AAGTTGTTACAATTAGGGTTTGACATTTCTCTTTGAACCATTGTCATCATCGTTATCAGA
ACTCGGGTCATCATCATCATCGTCGTCGTCGTCAGAGGGAGGAGAAGGATCGAGACGAGC
AGCGTCTATAGCCCACTGTATCAGCTTCTCCACTTCGTCATCTTCTCCTAATTCACCAGC
CTCATCTCCCATTTCACTCGGACGAAGAACTGACGGCGGAACAGAGGAGGAAGACGAGGA
GGAGGAGGGAAGAGTAGTCTTCAGAGCGGCGAATCTGAGCATGAGATCGTCTGGCGTTTC
TTCAACACCCTTCGATTTCCGCGGAGAAATCGGCCTCCGTTTCTGATCCTTCGTCTCCTT
CTTCTTCTGCTGCGAAGGTTTAGATCTGAGGGCGAGGAATCTAGAGTGAAGATCCGGATC
GAGGTAATCAGGTTTGGAGCGAGAGGCATGAGAATTAACGGAGAGCTTGAGAATCATCTC
GTCTTGAGCGGCTTGAAGCAACTGTTCAACTTCATCGTCTTCATCCTTGCCGCCTCTCCT
CATCTTTCTTCTTCGATCAAATTGGTTTTTTTTTTGTTTGTTACATGACGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FI63TF C 1
AF RR2FI63JQ U 2
BS 1 14 RR2FI63TF
BS 15 713 RR2FI63JQ

RD RR2FI63TF 713 0 0
ATTGAGTAACTTGATGCAAATAGAAGGATTAGAGTGAAATGTGATACACACACTTAAACT
CAATCTCGATAACAGTGTGTGACTAAAGCGGATGTATATAATAAGTTACAAGTAAGGGAA
AAGTTGTTACAATTAGGGTTTGACATTTCTCTTTGAACCATTGTCATCATCGTTATCAGA
ACTCGGGTCATCATCATCATCGTCGTCGTCGTCAGAGGGAGGAGAAGGATCGAGACGAGC
AGCGTCTATAGCCCACTGTATCAGCTTCTCCACTTCGTCATCTTCTCCTAATTCACCAGC
CTCATCTCCCATTTCACTCGGACGAAGAACTGACGGCGGAACAGAGGAGGAAGACGAGGA
GGAGGAGGGAAGAGTAGTCTTCAGAGCGGCGAATCTGAGCATGAGATCGTCTGGCGTTTC
TTCAACACCCTTCGATTTCCGCGGAGAAATCGGCCTCCGTTTCTGATCCTTCGTCTCCTT
CTTCTTCTGCTGCGAAGGTTTAGATCTGAGGGCGAGGAATCTAGAGTGAAGATCCGGATC
GAGGTAATCAGGTTTGGAGCGAGAGGCATGAGAATTAACGGAGAGCTTGAGAATCATCTC
GTCTTGAGCGGCTTGAAGCAACTGTTCAACTTCATCGTCTTCATCCTTGCCGCCTCTCCT
CATCTTTCTTCTTCGATCAAATTGGTTTTTTTTTTGTTTGTTACATGACGTCC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RR2FI63JQ 712 0 0
GAGTTAACTTGAT
TGCAAATAGAAGGATTAGAGTGAAATGTGATACACACACTTAAACTCAATCTCGATAACA
GTGTGTGACTAAAGCGGATGTATATAATAAGTTACAAGTAAGGGAAAAGTTGTTACAATT
AGGGTTTGACATTTCTCTTTGAACCATTGTCATCATCGTTATCAGAACTCGGGTCATCAT
CATCATCGTCGTCGTCGTCAGAGGGAGGAGAAGGATCGAGACGAGCAGCGTCTATAGCCC
ACTGTATCAGCTTCTCCACTTCGTCATCTTCTCCTAATTCACCAGCCTCATCTCCCATTT
CACTCGGACGAAGAACTGACGGCGGAACAGAGGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGGGAAGAG
TAGTCTTCAGAGCGGCGAATCTGAGCATGAGATCGTCTGGCGTTTCTTCAACACCCTTCG
ATTTCCGCGGAGAAATCGGCCTCCGTTTCTGATCCTTCGTCTCCTTCTTCTTCTGCTGCG
AAGGTTTAGATCTGAGGGCGAGGAATCTAGAGTGAAGATCCGGATCGAGGTAATCAGGTT
TGGAGCGAGAGGCATGAGAATTAACGGAGAGCTTGAGAATCATCTCGTCTTGAGCGGCTT
GAAGCAACTGTTCAACTTCATCGTCTTCATCCTTGCCGCCTCTCCTCATCTTTCTTCTTC
GATCAAATTGGTTTTTTTTTTGTTTGTTACATGACGTCC

QA 14 712 14 712
DS 



AS 1 2

CO CL7876Contig1 728 2 17 U
CTGAAGAAGATGGAACCTGACCCTATCCACAACAGTTATATCTCTGAAGTAATACAAGGA
ATGAGATATGAACATAGTAAGGTTAAGTTTTTGAATATTACATATCTGACCGAGTTCAGG
AAAGATGCTCATCCTTCGCGGTATCGAGAGCCAGGAACTCCTCAAGATGCCCCTCAAGAT
TGCAGTCACTGGTGCTTACCCGGTGTACCCGACACATGGAATGAGATCCTCTACGCGCAG
CTATTGGCAATGAATTACCGAACAAAATGAAAAAGAGGTACACGAGTATTCTAGTCATAT
GCTATTTTCTCGATGCTTTCTTCGGCATCAGTTTCGTTTGTTTGCAGTTCCTTGACTTTC
TCAAGCTGTCTCAATAGGTTCAACCTTTCTGGCCCGTATGTGGAAGGAATCAGGCCTGGG
ACATATCTCTGAATTGCAGCCAGCATAGCTGCGTGACCAACCGCTGTAACAGGAAGAAGC
ATCAGAATACCAATGGGAATGACTGATGCCAAGTCAGTCATGGTTCTACGCAGAGCTTTC
TTTTCTTTTTGTGTTAATTCATCACCAATGAGAGACCGCCGAAGTAGCTTCATAGCAGCT
GCTGAGTCAATGGCGAGAAGCTGAGTACCTTGCCACACGTCCGTTGTGGTTTCTCTTAGC
TTGTGAAGAGTTCTCGATCATGCTTTCCTTCTTTATTTGCACCAACTGAACGCCTGTTTG
TCTACTGC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DX74JQ U 3
AF RR2CQ82JQ U 1
BS 1 162 RR2CQ82JQ
BS 163 163 RR2DX74JQ
BS 164 170 RR2CQ82JQ
BS 171 171 RR2DX74JQ
BS 172 271 RR2CQ82JQ
BS 272 272 RR2DX74JQ
BS 273 273 RR2CQ82JQ
BS 274 274 RR2DX74JQ
BS 275 282 RR2CQ82JQ
BS 283 283 RR2DX74JQ
BS 284 303 RR2CQ82JQ
BS 304 304 RR2DX74JQ
BS 305 431 RR2CQ82JQ
BS 432 432 RR2DX74JQ
BS 433 491 RR2CQ82JQ
BS 492 492 RR2DX74JQ
BS 493 728 RR2CQ82JQ

RD RR2DX74JQ 514 0 0
GTC
GAAGATGGAACCTGACCCTATCCACAACAGTTATATCTCTGAAGTAATACAAGGAATGAG
ATATGAACATAGTAAGGTTAAGTTTTTGAATATTACATATCTGACCGAGTTCAGGAAAGA
TGCTCATCCTTCGCGGTATCGAGAGCCAGGAACTCCTCAAGATGCCCCTCAAGATTGCAG
TCACTGGTGCTTACCCGGTGTACCCGACACATGGAATGAGATCCTCTACGCGCAGCTATT
GGCAATGAATTGCCGAACAAAATGAAAAAGAGGTACACGAGTATTCTAGTCATATGCTAT
TTTCTCGATGCTTTCTTCGGCCTCGGTTTCGTTTGTTTGCAGTTCCTTGACTTTCTCGAG
CTGTCTCAATAGGTTCAACCTTTCTGGCCCGTATGTGGAAGGAATCAGGCCTGGGACATA
TCTCTGAATTGCAGCCAGCATAGCTGCGTGACCAACCGCTGTAACAGGAAGAAGCATCAG
AATACCAATGGGAATGACTGATGCCAAGTCA

QA 4 514 4 514
DS 

RD RR2CQ82JQ 728 0 0
CTGAAGAAGATGGAACCTGACCCTATCCACAACAGTTATATCTCTGAAGTAATACAAGGA
ATGAGATATGAACATAGTAAGGTTAAGTTTTTGAATATTACATATCTGACCGAGTTCAGG
AAAGATGCTCATCCTTCGCGGTATCGAGAGCCAGGAACTCCTGAAGATGCTCCTCAAGAT
TGCAGTCACTGGTGCTTACCCGGTGTACCCGACACATGGAATGAGATCCTCTACGCGCAG
CTATTGGCAATGAATTACCGAACAAAATGAAGA*GAGGTACAGGAGTATTCTAGTCATAT
GCTGTTTTCTCGATGCTTTCTTCGGCATCAGTTTCGTTTGTTTGCAGTTCCTTGACTTTC
TCAAGCTGTCTCAATAGGTTCAACCTTTCTGGCCCGTATGTGGAAGGAATCAGGCCTGGG
ACATATCTCTGGATTGCAGCCAGCATAGCTGCGTGACCAACCGCTGTAACAGGAAGAAGC
ATCAGAATACCGATGGGAATGACTGATGCCAAGTCAGTCATGGTTCTACGCAGAGCTTTC
TTTTCTTTTTGTGTTAATTCATCACCAATGAGAGACCGCCGAAGTAGCTTCATAGCAGCT
GCTGAGTCAATGGCGAGAAGCTGAGTACCTTGCCACACGTCCGTTGTGGTTTCTCTTAGC
TTGTGAAGAGTTCTCGATCATGCTTTCCTTCTTTATTTGCACCAACTGAACGCCTGTTTG
TCTACTGC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL7877Contig1 1036 2 2 U
GAGGGCGAAAAAGATCATCTCTCACAGGACAAAGAAGACCATCTCTCCCAGGTCAAAGAA
GACCATCTCTCACAGGGCGAAAAAGATCATCTCTCACCGGGCAAAGAAGACACCTCTGAT
GGCCCCTCCAATGATGTTGAAGAAGATCCCCTCGATTTCCTCGGTCCTATCAGAGACGTC
AAAGAGGTTATGACACCCGTCTTCTGGGATGCCGAGGATTGCCCATTCCCTCTTGGTTCC
ACTCCTGATGAGATCTACCACTCTATCGCATCAGTTCTTAAGGGAAGGACTATCTGTGAT
GAGATTACTATCTGGGCCTATCTTGATGATGACAAGAAAGGTTCTTGGAGGGATGCTTTA
CTTGGTAACAAGACTTGGACCTCCAAAATCTACTTTGTTCCCGCAGGGGATAAAGCCTTG
AGACGTATTAGAATGGCAAGTGACATTCTTCTTTGGGCAAAGCAATATCCTTGTGAACCA
CTTCGAGAAAGTTTGTTCGTAGTCTCTGATCATTTCAGTGGTGACCCCTACTACGTCGAG
CTGCTTCACCATTTGGTGTCCCGATATCTTCATGTTTTCATCGTGACTCCGACTCAGGAT
ATCAATAAACCAGAAAGCCCTGAATGGCCAAGATTGCTAATAGATGAAGGATCATACCGT
TTGCTGGCTGAAATAAGCGAAATCCCTGATGAACCTTGTCCCAAAAGGCGTATATTTGAT
GCAGGATTGCTCTTTAAGCTGGAGGCCAAAGAAAAACCAATTGACATGGATGAAATTGAC
ATGGATGAATTCAGGCTTTTCTGTTACTGGGAACCACCTGGTCCAGCAGGATTGCAAGTG
GATGAAACAAGCCAAAGCTTTGAAGGGTCGGGACTAGCTCCATAGCTCCGTGTCCATGAA
TAAATTGTTCCCCAGTGGTTTCTTGTCTATGTCGAGTTGTGTGTGTTACCGTTTACCAAC
ATTAAGTATGATGTTTTAAAATGTTTTTTTAGTTTATATATTGTTTTGATCCATCAATTA
AATATAAGTTACACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DR93TF U 1
AF RR2DR93JQ C 354
BS 1 593 RR2DR93TF
BS 594 1036 RR2DR93JQ

RD RR2DR93TF 593 0 0
GAGGGCGAAAAAGATCATCTCTCACAGGACAAAGAAGACCATCTCTCCCAGGTCAAAGAA
GACCATCTCTCACAGGGCGAAAAAGATCATCTCTCACCGGGCAAAGAAGACACCTCTGAT
GGCCCCTCCAATGATGTTGAAGAAGATCCCCTCGATTTCCTCGGTCCTATCAGAGACGTC
AAAGAGGTTATGACACCCGTCTTCTGGGATGCCGAGGATTGCCCATTCCCTCTTGGTTCC
ACTCCTGATGAGATCTACCACTCTATCGCATCAGTTCTTAAGGGAAGGACTATCTGTGAT
GAGATTACTATCTGGGCCTATCTTGATGATGACAAGAAAGGTTCTTGGAGGGATGCTTTA
CTTGGTAACAAGACTTGGACCTCCAAAATCTACTTTGTTCCCGCAGGGGATAAAGCCTTG
AGACGTATTAGAATGGCAAGTGACATTCTTCTTTGGGCAAAGCAATATCCTTGTGAACCA
CTTCGAGAAAGTTTGTTCGTAGTCTCTGATCATTTCAGTGGTGACCCCTACTACGTCGAG
CTGCTTCACCATTTGGTGTCCCGATATCTTCATGTTTTCATCGTGACTCCGAC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RR2DR93JQ 683 0 0
TGCTTTACTTGGTAACAAGACTTGGACCTCCAAAATCTACTTTGTTCCCGCAGGGGATAA
AGCCTTGAGACGTATTAGAATGGCAAGTGACATTCTTCTTTGGGCAAAGCAATATCCTTG
TGAACCACTTCGAGAAAGTTTGTTCGTAGTCTCTGATCATTTCAGTGGTGACCCCTACTA
CGTCGAGCTGCTTCACCATTTGGTGTCCGGATATCTTCATGTTTTCATCGTGACTCCGAC
TCAGGATATCAATAAACCAGAAAGCCCTGAATGGCCAAGATTGCTAATAGATGAAGGATC
ATACCGTTTGCTGGCTGAAATAAGCGAAATCCCTGATGAACCTTGTCCCAAAAGGCGTAT
ATTTGATGCAGGATTGCTCTTTAAGCTGGAGGCCAAAGAAAAACCAATTGACATGGATGA
AATTGACATGGATGAATTCAGGCTTTTCTGTTACTGGGAACCACCTGGTCCAGCAGGATT
GCAAGTGGATGAAACAAGCCAAAGCTTTGAAGGGTCGGGACTAGCTCCATAGCTCCGTGT
CCATGAATAAATTGTTCCCCAGTGGTTTCTTGTCTATGTCGAGTTGTGTGTGTTACCGTT
TACCAACATTAAGTATGATGTTTTAAAATGTTTTTTTAGTTTATATATTGTTTTGATCCA
TCAATTAAATATAAGTTACACTG

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL7878Contig1 1044 2 4 U
GGGTTCATCTCCCCCAACAGCACGTCAAACATGGCCTACCAAATAGAGCTAGGAGGAGAT
TCCTCTCCACAGAGGAAATCTGGAGGGAGAGGAAAGATCGAAATCAAACGGATCGAAAAC
ACAACAAATCGCCAAGTCACTTTCTGCAAACGCAGAAATGGTTTGCTCAAGAAAGCTTAC
GAACTCTCTGTTCTTTGTGACGCTGAAGTCGCACTCATCGTCTTCTCTAGCCGCGGTCGT
CTCTATGAGTACTCAAACAACAGTGTAAAAGGGACAATCGAGAGGTACAAGAAGGCAATA
TCGGATAATACTAACACCGGAACGGTAGCAGAAATTAACGCACAGTGTTATCAACAAGAA
TCGGTCAAATTGCGTCAACAAATTATCAGCATACAAAAATCAAACAGGCAATTGATGGGT
GAGACAATAGGGTCAATGTCTCCCAAAGAGCTTAGGAATTTGGAAGGCAGATTAGACCGA
AGTATTAATCGAATCCGATCTAAGAAGAATGAACTCTTATTTGCCGAAATTGACTACATG
CAGAAGCGATCTATGCAGGAGGCTGATTTGCATAGTGATAACGAGCTTCTTCGTGCTAAG
ATAGCTGAAAATGAGGGGAACAATCCAAGTATGAATCTTATGCCAGGAGGATATGAGCAG
ATTATGCAACCGCTTCAAACTCAACCTCAACCGTTTGATTCACGGAACTATTTCCAAGTC
GCTGCATTGCAACCTAACAATCACCATTACTCATCCGCGGGTCGCCAAGACCAAACCGCT
CTTCAGTTAGTGTAGTGCTGGGTGAAGCCTGAAGGGTCGATGAGTGAATAAGAACCATGG
ATTGGGTTCAAAAATGAGCAATATAAAGCTAATGCAATGTTATATATAAATATGTAATAT
CTGTTTATTTATTTCACGAGTGTTGTATCAGTGATTTCTATATTTATTTATATGAAGATA
ACCAATGTGCCTACTTTGGTTAAAAGACAACTACGTGTACAATTATACATTATTACACTA
TTAGCTCAAATGTTTTACTCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CD38TF U 1
AF RR2CD38JQ C 180
BS 1 747 RR2CD38TF
BS 748 748 RR2CD38JQ
BS 749 760 RR2CD38TF
BS 761 1044 RR2CD38JQ

RD RR2CD38TF 760 0 0
GGGTTCATCTCCCCCAACAGCACGTCAAACATGGCCTACCAAATAGAGCTAGGAGGAGAT
TCCTCTCCACAGAGGAAATCTGGAGGGAGAGGAAAGATCGAAATCAAACGGATCGAAAAC
ACAACAAATCGCCAAGTCACTTTCTGCAAACGCAGAAATGGTTTGCTCAAGAAAGCTTAC
GAACTCTCTGTTCTTTGTGACGCTGAAGTCGCACTCATCGTCTTCTCTAGCCGCGGTCGT
CTCTATGAGTACTCAAACAACAGTGTAAAAGGGACAATCGAGAGGTACAAGAAGGCAATA
TCGGATAATACTAACACCGGAACGGTAGCAGAAATTAACGCACAGTGTTATCAACAAGAA
TCGGTCAAATTGCGTCAACAAATTATCAGCATACAAAAATCAAACAGGCAATTGATGGGT
GAGACAATAGGGTCAATGTCTCCCAAAGAGCTTAGGAATTTGGAAGGCAGATTAGACCGA
AGTATTAATCGAATCCGATCTAAGAAGAATGAACTCTTATTTGCCGAAATTGACTACATG
CAGAAGCGATCTATGCAGGAGGCTGATTTGCATAGTGATAACGAGCTTCTTCGTGCTAAG
ATAGCTGAAAATGAGGGGAACAATCCAAGTATGAATCTTATGCCAGGAGGATATGAGCAG
ATTATGCAACCGCTTCAAACTCAACCTCAACCGTTTGATTCACGGAACTATTTCCAAGTC
GCTGCATTGCAACCTAACAATCACCAT*ACTCATCCGCGG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RR2CD38JQ 865 0 0
TTACGACTCTCTGTC
TTGTGACGCTGAAGTCGCACTCATCGTCTTCTCTAGCCGCGGTCGTCTCTATGAGTACTC
AAACAACAGTGTAAAAGGGACAATCGAGAGGTACAAGAAGGCAATATCGGATAATACTAA
CACCGGAACGGTAGCAGAAATTAACGCACAGTGTTATCAACAAGAATCGGTCAAATTGCG
TCAACAAATTATCAGCATACAAAAATCAAACAGGCAATTGATGGGTGAGACAATAGGGTC
AATGTCTCCCAAAGAGCTTAGGAATTTGGAAGGCAGATTAGACCGAAGTATTAATCGAAT
CCGATCTAAGAAGAATGAACTCTTATTTGCCGAAATTGACTACATGCAGAAGCGATCTAT
GCAGGAGGCTGATTTGCATAGTGATAACGAGCTTCTTCGTGCTAAGATAGCTGAAAATGA
GGGGAACAATCCAAGTATGAATCTTATGCCAGGAGGATATGAGCAGATTATGCAACCGCT
TCAAACTCAACCTCAACCGTTTGATTCACGGAACTATTTCCAAGTCGCTGCATTGCAACC
TAACAATCACCATTACTCATCCGCGGGTCGCCAAGACCAAACCGCTCTTCAGTTAGTGTA
GTGCTGGGTGAAGCCTGAAGGGTCGATGAGTGAATAAGAACCATGGATTGGGTTCAAAAA
TGAGCAATATAAAGCTAATGCAATGTTATATATAAATATGTAATATCTGTTTATTTATTT
CACGAGTGTTGTATCAGTGATTTCTATATTTATTTATATGAAGATAACCAATGTGCCTAC
TTTGGTTAAAAGACAACTACGTGTACAATTATACATTATTACACTATTAGCTCAAATGTT
TTACTCTACC

QA 16 865 16 865
DS 



AS 1 2

CO CL7879Contig1 565 2 1 U
GGATAGCAATAACACAGATGGAGGGTCTAATCCCCTTTGTTTACAGAGCCGTCATGCAAA
TCCGTTACGGCGACGATTCGTCGCTTTCTTCTTCTTACTACGTTCGTTTACCGGGTGATT
CAGGCCGGTTCGAGAGATCCGATTTCGAAGTGTTGGGTCTTGGATCTTCTTCCAATATGG
CGTCGTCAAAGACCACAACCACTACGCTTGCTGTTTCCACTGGAGTCCAGTCACCTGTTC
ATCATAGGGTCGTGACATGATGCGAACGCGTTCCTACGGGAACCTGAAGATGCGCGCCTG
AGGGAAAGGGTTCGTGACTTTGTAATTACTACATGGCTAGGCTTAGTGTCTGATATTCTT
ATGAGTGCTTAAACTGGTCGAATAAACCTGATGCAGTAATCGGGGTAGGGAGATTGATTC
TCTAATCGTGGGATTTTAACCGAAGGGTGGTCTCGTGGCTTTGATGTGTTTATTTCTTTT
TTTTTGTTAACAACGCTTTGATGTGTTTATTTCAAGAGACCTTTAATTGTATAAAGTCTA
TGAATGTTATGAGTTACTCGTGAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BN75JQ C 1
AF RR2BN75TF U 1
BS 1 565 RR2BN75TF

RD RR2BN75JQ 565 0 0
GGATAGCAATAACACAGATGGAGGGTCTAATCCCCTTTGTTTACAGAGCCGTCATGCAAA
TCCGTTACGGCGACGATTCGTCGCTTTCTTCTTCTTACTACGTTCGTTTACCGGGTGATT
CAGGCCGGTTCGAGAGATCCGATTTCGAAGTGTTGGGTCTTGGATCTTCTTCCAATATGG
CGTCGTCAAAGACCACAACCACTACGCTTGCTGTTTCCACTGGAGTCCAGTCACCTGTTC
ATCATAGGGTCGTGACATGATGCGAACGCGTTCCTACGGGAACCTGAAGATGCGCGCCTG
AGGGAAAGGGTTCGTGACTTTGTAATTACTACATGGCTAGGCTTAGTGTCTGATATTCTT
ATGAGTGCTTAAACTGGTCGAATAAACCTGATGCAGTAATCGGGGTAGGGAGATTGATTC
TCTAATCGTGGGATTTTAACCGAAGGGTGGTCTCGTGGCTTTGATGTGTTTATTTCTTTT
TTTTTGTTAACAACGCTTTGATGTGTTTATTTCAAGAGACCTTTAATTGTATAAAGTCTA
TGAATGTTATGAGTTACTCGTGAGG

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2BN75TF 565 0 0
GGATAGCAATAACACAGATGGAGGGTCTAATCCCCTTTGTTTACAGAGCCGTCATGCAAA
TCCGTTACGGCGACGATTCGTCGCTTTCTTCTTCTTACTACGTTCGTTTACCGGGTGATT
CAGGCCGGTTCGAGAGATCCGATTTCGAAGTGTTGGGTCTTGGATCTTCTTCCAATATGG
CGTCGTCAAAGACCACAACCACTACGCTTGCTGTTTCCACTGGAGTCCAGTCACCTGTTC
ATCATAGGGTCGTGACATGATGCGAACGCGTTCCTACGGGAACCTGAAGATGCGCGCCTG
AGGGAAAGGGTTCGTGACTTTGTAATTACTACATGGCTAGGCTTAGTGTCTGATATTCTT
ATGAGTGCTTAAACTGGTCGAATAAACCTGATGCAGTAATCGGGGTAGGGAGATTGATTC
TCTAATCGTGGGATTTTAACCGAAGGGTGGTCTCGTGGCTTTGATGTGTTTATTTCTTTT
TTTTTGTTAACAACGCTTTGATGTGTTTATTTCAAGAGACCTTTAATTGTATAAAGTCTA
TGAATGTTATGAGTTACTCGTGAGG

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL7880Contig1 731 2 1 U
GGATGCAAGTCAAAACGAGAGAGATCAGAAACGGTGTTATCTCGCCGCCGGTGCCGGATT
CCACCGTTGATTGTAGCAATCGGAAGTGCTTAACCGGAGTTTCTCAATCCGTAATTTAGT
ACCAAAACGGGAATCCATTTGACTCTTGTTTAGAAAGATGAAGAAGCTGCTGGAGTTTGG
GAGAAAAGCAATGTTCTATGTGAGAGTACTATCTGGGTATGAAGAAAGGAGAATCCGTAA
TTACAGGTTGCAACTCGAGAAGCGTATTCAGCAGGCCCAACAAAGGAAAGCAGAAATAAA
CAGACTCCCAGAGAAGATTGTGTTATCTGAAGTCCGCCGCATGGTTGAACAGATGCAAAA
TTTGAATAAGCAGATTGAGAATACGGAGGCTCAGATTGAAGACTACTTCAAACCGATAGA
CAAGCAAGCTGGTACAATAATGGAGGTTCAGCTGGAATCAGAGAAGAAAACGATGGGGAC
AATGATGAACGCAACACAAGAGGAAACCATAAGAAAAATTGAAGAAGCTGAGAGGCTCGC
TCGGGCACATGGAACTGCAAATGCAACTGTAGATGCAAACATGGGAGAGCAAATTCAAGA
TTCACAATCCTCTGCCAATGAGAAAGTCCAAGCAAAATAAAGTCAGTTTTTGTATTCAGA
GTCTTCTGAAAAAGTCCAATGTTTCAGATTCTCTGTTGGATTTTAATAATATGAATTGAC
TGAATAGAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B557JQ C 1
AF RR2B557TF U 1
BS 1 731 RR2B557TF

RD RR2B557JQ 731 0 0
GGATGCAAGTCAAAACGAGAGAGATCAGAAACGGTGTTATCTCGCCGCCGGTGCCGGATT
CCACCGTTGATTGTAGCAATCGGAAGTGCTTAACCGGAGTTTCTCAATCCGTAATTTAGT
ACCAAAACGGGAATCCATTTGACTCTTGTTTAGAAAGATGAAGAAGCTGCTGGAGTTTGG
GAGAAAAGCAATGTTCTATGTGAGAGTACTATCTGGGTATGAAGAAAGGAGAATCCGTAA
TTACAGGTTGCAACTCGAGAAGCGTATTCAGCAGGCCCAACAAAGGAAAGCAGAAATAAA
CAGACTCCCAGAGAAGATTGTGTTATCTGAAGTCCGCCGCATGGTTGAACAGATGCAAAA
TTTGAATAAGCAGATTGAGAATACGGAGGCTCAGATTGAAGACTACTTCAAACCGATAGA
CAAGCAAGCTGGTACAATAATGGAGGTTCAGCTGGAATCAGAGAAGAAAACGATGGGGAC
AATGATGAACGCAACACAAGAGGAAACCATAAGAAAAATTGAAGAAGCTGAGAGGCTCGC
TCGGGCACATGGAACTGCAAATGCAACTGTAGATGCAAACATGGGAGAGCAAATTCAAGA
TTCACAATCCTCTGCCAATGAGAAAGTCCAAGCAAAATAAAGTCAGTTTTTGTATTCAGA
GTCTTCTGAAAAAGTCCAATGTTTCAGATTCTCTGTTGGATTTTAATAATATGAATTGAC
TGAATAGAACC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2B557TF 731 0 0
GGATGCAAGTCAAAACGAGAGAGATCAGAAACGGTGTTATCTCGCCGCCGGTGCCGGATT
CCACCGTTGATTGTAGCAATCGGAAGTGCTTAACCGGAGTTTCTCAATCCGTAATTTAGT
ACCAAAACGGGAATCCATTTGACTCTTGTTTAGAAAGATGAAGAAGCTGCTGGAGTTTGG
GAGAAAAGCAATGTTCTATGTGAGAGTACTATCTGGGTATGAAGAAAGGAGAATCCGTAA
TTACAGGTTGCAACTCGAGAAGCGTATTCAGCAGGCCCAACAAAGGAAAGCAGAAATAAA
CAGACTCCCAGAGAAGATTGTGTTATCTGAAGTCCGCCGCATGGTTGAACAGATGCAAAA
TTTGAATAAGCAGATTGAGAATACGGAGGCTCAGATTGAAGACTACTTCAAACCGATAGA
CAAGCAAGCTGGTACAATAATGGAGGTTCAGCTGGAATCAGAGAAGAAAACGATGGGGAC
AATGATGAACGCAACACAAGAGGAAACCATAAGAAAAATTGAAGAAGCTGAGAGGCTCGC
TCGGGCACATGGAACTGCAAATGCAACTGTAGATGCAAACATGGGAGAGCAAATTCAAGA
TTCACAATCCTCTGCCAATGAGAAAGTCCAAGCAAAATAAAGTCAGTTTTTGTATTCAGA
GTCTTCTGAAAAAGTCCAATGTTTCAGATTCTCTGTTGGATTTTAATAATATGAATTGAC
TGAATAGAACC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL7881Contig1 691 2 3 U
TGTTTTATTGTAATATTAGCTTATACTTAATATTGAGGGGTTACAACAAAGTTTAGCCTG
GTGGGGTAGATATACGTTTGATGTATAACAAATGATCAAAGAAAAAAAACAAGAAAAAAA
CAAATGATCATATACTATATGAACGCTATATTTTTCATGGCCAGCAACATAAAAAGCGTT
TCCCATATCTGAACATGCAACTACTTAATAAGCACTATGCAAAGACAGTGGCTTCAACTC
TTCGGATTATGAAACGGAAATTCTGGAACCTGCATCAACAAGCATGAAAACCCAGAAATT
CAATATCACAATCAAATCACCAGGGAGCCAAACATGATCAAATCCAATTCCAAGCAGCAT
AAAATACAATCATAGACCCGAAGAAAAATTGCTGAAAGCTAGCAGTGATCCATTAGATAA
CAAAACAATAATTCAAAGAGCATTTAAAAAAAAAAAAGATACACAGAAAAAGAACCACGT
CGATCTATCCATTGCCCACAAGTTTCTGGGTGTCTAACAGCCAAGATCGTTTTTGAAATT
TTAATTAGATTTCTTTATTCATCTCGACTCTTATTGATAGTGGCAATTTGTTATCTTTTA
GATTATATGAATTATACTATGAAAGATGTTTTGAGAAAAAAAGAGAGAGAACTAAGGATT
TTTTTTGGGCAAACGAGAGAACTAAGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GS22JQB U 10
AF RR2GS22TF C 1
BS 1 9 RR2GS22TF
BS 10 544 RR2GS22JQB
BS 545 691 RR2GS22TF

RD RR2GS22JQB 535 0 0
GTAATATTAGCTTATACTTAATATTGAGGGGTTACAACAAAGTTTAGCCTGGTGGGGTAG
ATATACGTTTGATGTATAACAAATGATCAAAGAAAAAAAACAAGAAAAAAACAAATGATC
ATATACTATATGAACGCTATATTTTTCATGGCCAGCAACATAAAAAGCGTTTCCCATATC
TGAACATGCAACTACTTAATAAGCACTATGCAAAGACAGTGGCTTCAACTCTTCGGATTA
TGAAACGGAAATTCTGGAACCTGCATCAACAAGCATGAAAACCCAGAAATTCAATATCAC
AATCAAATCACCAGGGAGCCAAACATGATCAAATCCAATTCCAAGCAGCATAAAATACAA
TCATAGACCCGAAGAAAAATTGCTGAAAGCTAGCAGTGATCCATTAGATAACAAAACAAT
AATTCAAAGAGCATTTAAAAAAAAAAAAGATACACAGAAAAAGAACCACGTCGATCTATC
CATTGCCCACAAGTTTCTGGGTGTCTAACAGCCAAGATCGTTTTTGAAATTTTAA

QA 1 535 1 535
DS 

RD RR2GS22TF 691 0 0
TGTTTTATTGTAATATTAGCTTATACTTAATATTGAGGGGTTACAACAAAGTTTAGCCTG
GTGGGGTAGATATACGTTTGATGTATAACAAATGATCAAAGAAAAAAAACAAGAAAAAAA
CAAATGATCATATACTATATGAACGCTATATTTTTCATGGCCAGCAACATAAAAAGCGTT
TCCCATATCTGAACATGCAACTACTTAATAAGCACTATGCAAAGACAGTGGCTTCAACTC
TTCGGATTATGAAACGGAAATTCTGGAACCTGCATCAACAAGCATGAAAACCCAGAAATT
CAATATCACAATCAAATCACCAGGGAGCCAAACATGATCAAATCCAATTCCAAGCAGCAT
AAAATACAATCATAGACCCGAAGAAAAATTGCTGAAAGCTAGCAGTGATCCATTAGATAA
CAAAACAATAATTCAAAGAGCATTTAAAAAAAAAAAAGATACACAGAAAAAGAACCACGT
CGATCTATCCATTGCCCACAAGTTTCTGGGTGTCTAACAGCCAAGATCGTTTTTGAAATT
TTAATTAGATTTCTTTATTCATCTCGACTCTTATTGATAGTGGCAATTTGTTATCTTTTA
GATTATATGAATTATACTATGAAAGATGTTTTGAGAAAAAAAGAGAGAGAACTAAGGATT
TTTTTTGGGCAAACGAGAGAACTAAGGATCC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL7882Contig1 684 2 2 U
GGCGTGGACGAGTTCCCTTTCTGCGTCCACTTGGTCTCGTGGGAGAAGGAGAACGTCTCC
AGCGAAGCCCTCGAGGCCGCGCGTATCGCTTGCAACAAGTACATGGTGAAGTCGGCCGGG
AAAGACGCTTTCCACCTGAGGATTAGGGTTCACCCGTTCCATGTCCTGAGGATCAACAAG
ATGCTTTCGTGCGCTGGAGCTGATAGGCTTCAGACCGGTATGAGGGGAGCTTTCGAGAAG
GCCTTGGGGACTTGTGCTAGGGTTGCGATTGGACAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAG
GATGCTCATGGTCACCATGCTCAGGAGGCTCTCAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGT
CGTCAAAAGATTATCGTCAGCAGGAAATGGGGTTTCACGAAGTTTAACAGAGCAGACTTC
ACGAAGTTGAGGCAAGAGAAGCGTGTTGTTCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTGTCA
TGCCATGGGCCTTTGGCTAACCGTCAGCCCGGAAGTGCATTTTTACCAGCCACCTATTGA
GAAGATTCAGAGCTTTGTCTACACTCTTTTGAAAGATTATTATTCAGTCTGAAACTTATC
TTTGAAAGTACTTGTCCTAAAAGTTTTTAGTTGGACCTCATTCAGTATCCCGAACCTTTT
TGATATGATATTATTGTTCTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2GI75TF U 1
AF RR2GI75JQB C 39
BS 1 682 RR2GI75TF
BS 683 684 RR2GI75JQB

RD RR2GI75TF 682 0 0
GGCGTGGACGAGTTCCCTTTCTGCGTCCACTTGGTCTCGTGGGAGAAGGAGAACGTCTCC
AGCGAAGCCCTCGAGGCCGCGCGTATCGCTTGCAACAAGTACATGGTGAAGTCGGCCGGG
AAAGACGCTTTCCACCTGAGGATTAGGGTTCACCCGTTCCATGTCCTGAGGATCAACAAG
ATGCTTTCGTGCGCTGGAGCTGATAGGCTTCAGACCGGTATGAGGGGAGCTTTCGAGAAG
GCCTTGGGGACTTGTGCTAGGGTTGCGATTGGACAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAG
GATGCTCATGGTCACCATGCTCAGGAGGCTCTCAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGT
CGTCAAAAGATTATCGTCAGCAGGAAATGGGGTTTCACGAAGTTTAACAGAGCAGACTTC
ACGAAGTTGAGGCAAGAGAAGCGTGTTGTTCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTGTCA
TGCCATGGGCCTTTGGCTAACCGTCAGCCCGGAAGTGCATTTTTACCAGCCACCTATTGA
GAAGATTCAGAGCTTTGTCTACACTCTTTTGAAAGATTATTATTCAGTCTGAAACTTATC
TTTGAAAGTACTTGTCCTAAAAGTTTTTAGTTGGACCTCATTCAGTATCCCGAACCTTTT
TGATATGATATTATTGTTCTTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RR2GI75JQB 646 0 0
GTGGGAGAAGGAGAACGTCTCCAGCGAAGCCCTCGAGGCCGCGCGTATCGCTTGCAACAA
GTACATGGTGAAGTCGGCCGGGAAAGACGCTTTCCACCTGAGGATTAGGGTTCACCCGTT
CCATGTCCTGAGGATCAACAAGATGCTTTCGTGCGCTGGAGCTGATAGGCTTCAGACCGG
TATGAGGGGAGCTTTCGAGAAGGCCTTGGGGACTTGTGCTAGGGTTGCGATTGGACAGGT
GCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATGCTCATGGTCACCATGCTCAGGAGGCTCTCAGGAG
GGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGTCGTCAAAAGATTATCGTCAGCAGGAAATGGGGTTTCAC
GAAGTTTAACAGAGCAGACTTCACGAAGTTGAGGCAAGAGAAGCGTGTTGTTCCTGATGG
TGTTAATGCTAAGTTCCTGTCATGCCATGGGCCTTTGGCTAACCGTCAGCCCGGAAGTGC
ATTTTTACCAGCCACCTATTGAGAAGATTCAGAGCTTTGTCTACACTCTTTTGAAAGATT
ATTATTCAGTCTGAAACTTATCTTTGAAAGTACTTGTCCTAAAAGTTTTTAGTTGGACCT
CATTCAGTATCCCGAACCTTTTTGATATGATATTATTGTTCTTTCG

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL7883Contig1 682 2 2 U
GTATAGGCGAATTTGCAAACGACGCAGGATGCCTTCACTCGTTGAAAATCTTCGAGAGAC
AGGTGGGCACTCCACTGGAGGAAGATCTAGCAAGCTGGGGTCATCATTTTACCTCAAACT
CTGTTCCAGATACTATACTGCAAGCTTCAGCTGGTGACGAGGTTACATTTGTATTCACAA
ACCAGGTGGATGGGAAGCTCATTCCAATCAAATCAAATCCTAGTCCAAAACCAGAACTAA
CCGAAACAAACCGAAACCAAGCTGTAAGCAACCGTGGCTTCAACAAACCGCAACAAAGAC
CTCGGGAACCGCTGCAGCCGTTATCTTGCAACGAGAGCAGCAAAAGAGTGAAGTTGTCTA
CTTATAAGCGTTTACACTGTACTAGTAACACTGATGGTGCTCAAGTGCAAATGCCTTTGC
AAAGACCAAATCAAGTTCCTGTAAACCACGATGATTTTGTATGAAATTTAAAGCTTTTTG
AGCCTTCGGAGAGAGTGTCGTGCTATATTGTGGATATATAATGGAGTTTAAAAAAAAAAA
TCATGTGAGATTCATTAGACTTTGTTCATATTACTCGCATGTGTATTAGTTTGGACAATT
TTGTTAATCTGGCCCATGTGGGATTTGTTTTGATAGTAACACTTCGATGATTGATCGATC
ATATATGTTTCATGTTGGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RR2FN09TF U 1
AF RR2FN09JQ C 125
BS 1 681 RR2FN09TF
BS 682 682 RR2FN09JQ

RD RR2FN09TF 681 0 0
GTATAGGCGAATTTGCAAACGACGCAGGATGCCTTCACTCGTTGAAAATCTTCGAGAGAC
AGGTGGGCACTCCACTGGAGGAAGATCTAGCAAGCTGGGGTCATCATTTTACCTCAAACT
CTGTTCCAGATACTATACTGCAAGCTTCAGCTGGTGACGAGGTTACATTTGTATTCACAA
ACCAGGTGGATGGGAAGCTCATTCCAATCAAATCAAATCCTAGTCCAAAACCAGAACTAA
CCGAAACAAACCGAAACCAAGCTGTAAGCAACCGTGGCTTCAACAAACCGCAACAAAGAC
CTCGGGAACCGCTGCAGCCGTTATCTTGCAACGAGAGCAGCAAAAGAGTGAAGTTGTCTA
CTTATAAGCGTTTACACTGTACTAGTAACACTGATGGTGCTCAAGTGCAAATGCCTTTGC
AAAGACCAAATCAAGTTCCTGTAAACCACGATGATTTTGTATGAAATTTAAAGCTTTTTG
AGCCTTCGGAGAGAGTGTCGTGCTATATTGTGGATATATAATGGAGTTTAAAAAAAAAAA
TCATGTGAGATTCATTAGACTTTGTTCATATTACTCGCATGTGTATTAGTTTGGACAATT
TTGTTAATCTGGCCCATGTGGGATTTGTTTTGATAGTAACACTTCGATGATTGATCGATC
ATATATGTTTCATGTTGGTTT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RR2FN09JQ 558 0 0
TCCAGATACTATACTGCAAGCTTCAGCTGGTGACGAGGTTACATTTGTATTCACAAACCA
GGTGGATGGGAAGCTCATTCCAATCAAATCAAATCCTAGTCCAAAACCAGAACTAACCGA
AACAAACCGAAACCAAGCTGTAAGCAACCGTGGCTTCAACAAACCGCAACAAAGACCTCG
GGAACCGCTGCAGCCGTTATCTTGCAACGAGAGCAGCAAAAGAGTGAAGTTGTCTACTTA
TAAGCGTTTACACTGTACTAGTAACACTGATGGTGCTCAAGTGCAAATGCCTTTGCAAAG
ACCAAATCAAGTTCCTGTAAACCACGATGATTTTGTATGAAATTTAAAGCTTTTTGAGCC
TTCGGAGAGAGTGTCGTGCTATATTGTGGATATATAATGGAGTTTAAAAAAAAAAATCAT
GTGAGATTCATTAGACTTTGTTCATATTACTCGCATGTGTATTAGTTTGGACAATTTTGT
TAATCTGGCCCATGTGGGATTTGTTTTGATAGTAACACTTCGATGATTGATCGATCATAT
ATGTTTCATGTTGGTTTT

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL7884Contig1 693 2 1 U
GGACTTGCTTCTTCTCCAATCCAACATATAATTAAAGCAAGCAAAAATAAAATGGATTTC
TCACGCCTTTCATTTGCTGCTTCTCTCGTTGTCTTCTCATCTCTAATAATATCCTCAGTT
GCTTATTACGGTGATGAAGCAAACCCCGAGAACGGAAAATTAATTCCGGTCGCCGTTGAA
GGTGTCATCATGTGCAAGTCCGGTGACAAATCTTACCCAATTCAAGGTGCGACGGCAAGA
GTTACATGTGTGAAGACAGACGTATATGGGGAAGAGATTGTTCCGGTCTCAATGATGAGC
AGCAAAACTGATGCTAAAGGTTACTTTTTTGCCACGTTATTTCCTTCACAGCTTCGTGAA
GGAAGGATGGTGACCAAGTGCAAAGTTTTCCTTCACAAGTCTCCACTCGCTGATTGCGAC
TTTCCGACCGATGTGAACAAAGGTGTGAAAGGACAGTCATTAAGCAAGTACCGTATTCTT
GAAGACAAGAGTTTCAAGCTTTTCTGGGCTGGTCCTTTCTTCTTCACTTCTGAACCTACC
TACTACTAAAGACCTTCTTTTGATGAACATGATGTTTTCTAAGAATATTTTCTTTTGTCT
GATTATCTTGTAATGTTGTCTGAAAATGAGCTAAGCGTTTGTTTTCTTTGTTTTAATTGA
TTTATCATGCCTTATAAAGTTATAAACAGTTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B034JQ C 1
AF RR2B034TF U 1
BS 1 693 RR2B034TF

RD RR2B034JQ 693 0 0
GGACTTGCTTCTTCTCCAATCCAACATATAATTAAAGCAAGCAAAAATAAAATGGATTTC
TCACGCCTTTCATTTGCTGCTTCTCTCGTTGTCTTCTCATCTCTAATAATATCCTCAGTT
GCTTATTACGGTGATGAAGCAAACCCCGAGAACGGAAAATTAATTCCGGTCGCCGTTGAA
GGTGTCATCATGTGCAAGTCCGGTGACAAATCTTACCCAATTCAAGGTGCGACGGCAAGA
GTTACATGTGTGAAGACAGACGTATATGGGGAAGAGATTGTTCCGGTCTCAATGATGAGC
AGCAAAACTGATGCTAAAGGTTACTTTTTTGCCACGTTATTTCCTTCACAGCTTCGTGAA
GGAAGGATGGTGACCAAGTGCAAAGTTTTCCTTCACAAGTCTCCACTCGCTGATTGCGAC
TTTCCGACCGATGTGAACAAAGGTGTGAAAGGACAGTCATTAAGCAAGTACCGTATTCTT
GAAGACAAGAGTTTCAAGCTTTTCTGGGCTGGTCCTTTCTTCTTCACTTCTGAACCTACC
TACTACTAAAGACCTTCTTTTGATGAACATGATGTTTTCTAAGAATATTTTCTTTTGTCT
GATTATCTTGTAATGTTGTCTGAAAATGAGCTAAGCGTTTGTTTTCTTTGTTTTAATTGA
TTTATCATGCCTTATAAAGTTATAAACAGTTCG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2B034TF 693 0 0
GGACTTGCTTCTTCTCCAATCCAACATATAATTAAAGCAAGCAAAAATAAAATGGATTTC
TCACGCCTTTCATTTGCTGCTTCTCTCGTTGTCTTCTCATCTCTAATAATATCCTCAGTT
GCTTATTACGGTGATGAAGCAAACCCCGAGAACGGAAAATTAATTCCGGTCGCCGTTGAA
GGTGTCATCATGTGCAAGTCCGGTGACAAATCTTACCCAATTCAAGGTGCGACGGCAAGA
GTTACATGTGTGAAGACAGACGTATATGGGGAAGAGATTGTTCCGGTCTCAATGATGAGC
AGCAAAACTGATGCTAAAGGTTACTTTTTTGCCACGTTATTTCCTTCACAGCTTCGTGAA
GGAAGGATGGTGACCAAGTGCAAAGTTTTCCTTCACAAGTCTCCACTCGCTGATTGCGAC
TTTCCGACCGATGTGAACAAAGGTGTGAAAGGACAGTCATTAAGCAAGTACCGTATTCTT
GAAGACAAGAGTTTCAAGCTTTTCTGGGCTGGTCCTTTCTTCTTCACTTCTGAACCTACC
TACTACTAAAGACCTTCTTTTGATGAACATGATGTTTTCTAAGAATATTTTCTTTTGTCT
GATTATCTTGTAATGTTGTCTGAAAATGAGCTAAGCGTTTGTTTTCTTTGTTTTAATTGA
TTTATCATGCCTTATAAAGTTATAAACAGTTCG

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL7885Contig1 624 2 1 U
GGGATTCCCAAACGGTGCGTTTAGATATTTTCTTCTCGGCGTTGCATTCATTCGATGGCG
AACGGAGGACCGTCCTCCTCATCTTCTCATCCGGAAGTTGCAGATGAAACCCAAGACTGG
ATCCTCGGAGCCGGGTCGGGTTGGGTCGAAGCCCGAACATCTTGCGATCACTTGAATTCT
CTTTCTCCCGATTTAGCTCGCTTACCAAATCCTGATACTCCCTGTTCAAGGTGCGAAAAC
CCGGTAGAGAACTGGGTATGTCTTTGTTGTAAAGAGGTTCTGTGCAGCCGTTTTGTGAAC
AGACATATGCTTATGCATCATCAACAGACTGCTCACTGCCTTGCACTCAGCTACAGTGAC
TTGTCAGTATGGTGCTTCTGCTGCGAAGCGTATCTTGATGCTCAGATCATATTACAGCTG
AGACCAGTTCACCAAGCTGCTTATATTCTCAAATTTGGCGAGGCTCCTCCCTTACCCCAA
CTTTGAACATTCAAAGCTCTCTTTTTTTCAACCTTTGATGATTTTGTATCCCTGGATGTT
TTTAGGGATGATGATTTAGTATATTTCAGTGAGACGATATTAATTATCAACCAACCATTT
CAATATAGAGTTTTTTCATCTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2GS70TF U 1
AF RR2GS70JQB C 57
BS 1 624 RR2GS70TF

RD RR2GS70TF 624 0 0
GGGATTCCCAAACGGTGCGTTTAGATATTTTCTTCTCGGCGTTGCATTCATTCGATGGCG
AACGGAGGACCGTCCTCCTCATCTTCTCATCCGGAAGTTGCAGATGAAACCCAAGACTGG
ATCCTCGGAGCCGGGTCGGGTTGGGTCGAAGCCCGAACATCTTGCGATCACTTGAATTCT
CTTTCTCCCGATTTAGCTCGCTTACCAAATCCTGATACTCCCTGTTCAAGGTGCGAAAAC
CCGGTAGAGAACTGGGTATGTCTTTGTTGTAAAGAGGTTCTGTGCAGCCGTTTTGTGAAC
AGACATATGCTTATGCATCATCAACAGACTGCTCACTGCCTTGCACTCAGCTACAGTGAC
TTGTCAGTATGGTGCTTCTGCTGCGAAGCGTATCTTGATGCTCAGATCATATTACAGCTG
AGACCAGTTCACCAAGCTGCTTATATTCTCAAATTTGGCGAGGCTCCTCCCTTACCCCAA
CTTTGAACATTCAAAGCTCTCTTTTTTTCAACCTTTGATGATTTTGTATCCCTGGATGTT
TTTAGGGATGATGATTTAGTATATTTCAGTGAGACGATATTAATTATCAACCAACCATTT
CAATATAGAGTTTTTTCATCTCAC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RR2GS70JQB 568 0 0
GGCGAACGGAGGACCGTCCTCCTCATCTTCTCATCCGGAAGTTGCAGATGAAACCCAAGA
CTGGATCCTCGGAGCCGGGTCGGGTTGGGTCGAAGCCCGAACATCTTGCGATCACTTGAA
TTCTCTTTCTCCCGATTTAGCTCGCTTACCAAATCCTGATACTCCCTGTTCAAGGTGCGA
AAACCCGGTAGAGAACTGGGTATGTCTTTGTTGTAAAGAGGTTCTGTGCAGCCGTTTTGT
GAACAGACATATGCTTATGCATCATCAACAGACTGCTCACTGCCTTGCATTCAGCTACAG
TGACTTGTCAGTATGGTGCTTCTGCTGCGAAGCGTATCTTGATGCTCAGATCATATTACA
GCTGAGACCAGTTCACCAAGCTGCTTATATTCTCAAATTTGGCGAGGCTCCTCCCTTACC
CCAACTTTGAACATTCAAAGCTCTCTTTTTTTCAACCTTTGATGATTTTGTATCCCTGGA
TGTTTTTAGGGATGATGATTTAGTATATTTCAGTGAGACGATATTAATTATCAACCAACC
ATTTCAATATAGAGTTTTTTCATCTCAC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

CO CL7886Contig1 533 2 1 U
GGAACTGGAAACTTATCAGTTTCGCTTGCTAGCCCTGATGGGCGTGTGATTGGTGGTGCC
ATTGGAGGACCTTTAATAGCAGCAAGTCCTGTTCAGGTTATTGTAGGGAGCTTTATATGG
GCAGCTCCAAAGATCAAGAACAAGAAACGAGAAGAAGAAGGTTCTGAAAATGTTCAAGAC
ACAAATGATCATCATCATCATCAAGCTCTGGACCCTGTTCCTCAACACACACAAGGCCAA
AACCTGATATGGTCAACAGGTTCAAGGCAAATGGATATGCGCCATGCTCATGCTGATATT
GATCTAATGCGCGGTTGATATGATGTTACAGTGACATCTCTGTGTACATAAAGCATGGAA
CCTAGGAATTGAACAAGAAGAAGAACATAAGCTAACCTGAAATGTTTTAAGTCTTTATGT
CTGCTTGGAGCTTTGATTCTACTACATCTTTGATTCAGTTGTTAACTGAAAGTAATTACT
TGTTTAACTTTGCTAATCTCGATATTAATACAAACACAAGAACCTCTTTGGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CE03JQ C 1
AF RR2CE03TF U 1
BS 1 533 RR2CE03TF

RD RR2CE03JQ 533 0 0
GGAACTGGAAACTTATCAGTTTCGCTTGCTAGCCCTGATGGGCGTGTGATTGGTGGTGCC
ATTGGAGGACCTTTAATAGCAGCAAGTCCTGTTCAGGTTATTGTAGGGAGCTTTATATGG
GCAGCTCCAAAGATCAAGAACAAGAAACGAGAAGAAGAAGGTTCTGAAAATGTTCAAGAC
ACAAATGATCATCATCATCATCAAGCTCTGGACCCTGTTCCTCAACACACACAAGGCCAA
AACCTGATATGGTCAACAGGTTCAAGGCAAATGGATATGCGCCATGCTCATGCTGATATT
GATTTAATGCGCGGTTGATATGATGTTACAGTGACATCTCTGTGTACATAAAGCATGGAA
CCTAGGAATTGAACAAGAAGAAGAACATAAGCTAACCTGAAATGTTTTAAGTCTTTATGT
CTGCTTGGAGCTTTGATTTTACTACATCTTTGATTCAGTTGTTAACTGAAAGTAATTACT
TGTTTAACTTTGCTAATCTCGATATTAATACAAACACAAGAACCTCTTTGGTC

QA 1 533 1 533
DS 

RD RR2CE03TF 533 0 0
GGAACTGGAAACTTATCAGTTTCGCTTGCTAGCCCTGATGGGCGTGTGATTGGTGGTGCC
ATTGGAGGACCTTTAATAGCAGCAAGTCCTGTTCAGGTTATTGTAGGGAGCTTTATATGG
GCAGCTCCAAAGATCAAGAACAAGAAACGAGAAGAAGAAGGTTCTGAAAATGTTCAAGAC
ACAAATGATCATCATCATCATCAAGCTCTGGACCCTGTTCCTCAACACACACAAGGCCAA
AACCTGATATGGTCAACAGGTTCAAGGCAAATGGATATGCGCCATGCTCATGCTGATATT
GATCTAATGCGCGGTTGATATGATGTTACAGTGACATCTCTGTGTACATAAAGCATGGAA
CCTAGGAATTGAACAAGAAGAAGAACATAAGCTAACCTGAAATGTTTTAAGTCTTTATGT
CTGCTTGGAGCTTTGATTCTACTACATCTTTGATTCAGTTGTTAACTGAAAGTAATTACT
TGTTTAACTTTGCTAATCTCGATATTAATACAAACACAAGAACCTCTTTGGTC

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 2

CO CL7887Contig1 645 2 1 U
GGATCAACCTCACAACATAAAACCATTTCTCAAACTCAAAATCATCACTTTCTGATCACT
CTCTAATGGCGTCTCCTAAATCCTCAACAAGACCGACCCAGCAAAACCAAGAACCCACTT
TCCACGACTTCTTCCCGGCGATGGCCGGTAAACTCGGAGGAAAAGGTCTCATCGACGAGC
TCTGCAAAGGGTTCGAGCTACTCGTGGACAGAGACAGAGGTGTCATCACTTTCGAGAGCT
TGCGGCGAAACGCATCGGCGGTTCTTGGGCTCGGTGACTTGACGGACGACGATGTAAAGT
GTATGATCAACGAAGGGGATTTCGATCGGGACGGCGCGTTGAATCAGATGGAGTTTTGTG
TGCTCATGTTTAGGCTTAGCCCTGAGTTGATGGAGGCGTCACGGTGTGTTGTCACTGAAG
CGATAGAGGAGGAGTTTGGTGATCGAAGGCACAGGCGTTGATGATAGAAAGCTTCTTTCT
CTATGAGAGACTTCGACCTATTTGTTTTTAGTTTTTACTATTTTTAATTTTTTTAACCGA
TTCTTCTTTTATGTTCTCTTTGATTTCCTTTTGCAGTTCGTATAAATTGTTGGATTTTTT
GTTGGATATATTATAATAAACTGATATGGAAAATCATTGACAACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CK70JQ C 1
AF RR2CK70TF U 1
BS 1 645 RR2CK70TF

RD RR2CK70JQ 645 0 0
GGATCAACCTCACAACATAAAACCATTTCTCAAACTCAAAATCATCACTTTCTGATCACT
CTCTAATGGCGTCTCCTAAATCCTCAACAAGACCGACCCAGCAAAACCAAGAACCCACTT
TCCACGACTTCTTCCCGGCGATGGCCGGTAAACTCGGAGGAAAAGGTCTCATCGACGAGC
TCTGCAAAGGGTTCGAGCTACTCGTGGACAGAGACAGAGGTGTCATCACTTTCGAGAGCT
TGCGGCGAAACGCATCGGCGGTTCTTGGGCTCGGTGACTTGACGGACGACGATGTAAAGT
GTATGATCAACGAAGGGGATTTCGATCGGGACGGCGCGTTGAATCAGATGGAGTTTTGTG
TGCTCATGTTTAGGCTTAGCCCTGAGTTGATGGAGGCGTCACGGTGTGTTGTCACTGAAG
CGATAGAGGAGGAGTTTGGTGATCGAAGGCACAGGCGTTGATGATAGAAAGCTTCTTTCT
CTATGAGAGACTTCGACCTATTTGTTTTTAGTTTTTACTATTTTTAATTTTTTTAACCGA
TTCTTCTTTTATGTTCTCTTTGATTTCCTTTTGCAGTTCGTATAAATTGTTGGATTTTTT
GTTGGATATATTATAATAAACTGATATGGAAAATCATTGACAACG

QA 1 645 1 645
DS 

RD RR2CK70TF 645 0 0
GGATCAACCTCACAACATAAAACCATTTCTCAAACTCAAAATCATCACTTTCTGATCACT
CTCTAATGGCGTCTCCTAAATCCTCAACAAGACCGACCCAGCAAAACCAAGAACCCACTT
TCCACGACTTCTTCCCGGCGATGGCCGGTAAACTCGGAGGAAAAGGTCTCATCGACGAGC
TCTGCAAAGGGTTCGAGCTACTCGTGGACAGAGACAGAGGTGTCATCACTTTCGAGAGCT
TGCGGCGAAACGCATCGGCGGTTCTTGGGCTCGGTGACTTGACGGACGACGATGTAAAGT
GTATGATCAACGAAGGGGATTTCGATCGGGACGGCGCGTTGAATCAGATGGAGTTTTGTG
TGCTCATGTTTAGGCTTAGCCCTGAGTTGATGGAGGCGTCACGGTGTGTTGTCACTGAAG
CGATAGAGGAGGAGTTTGGTGATCGAAGGCACAGGCGTTGATGATAGAAAGCTTCTTTCT
CTATGAGAGACTTCGACCTATTTGTTTTTAGTTTTTACTATTTTTAATTTTTTTAACCGA
TTCTTCTTTTATGTTCTCTTTGATTTCCTTTTGCAGTTCGTATAAATTGTTGGATTTTTT
GTTGGATATATTATAATAAACTGATATGGAAAATCATTGACAACG

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL7888Contig1 768 2 2 U
TTTTTTTTCAACGGCTCAGATCTTCAGCTTTTCTGGAAATTAAAATGCTCTGAAGCAGTC
ATTAAGCTTCAAAAGGGTTAACCAAGTGCCGAATAGAACACTGCATACATATAAATTCTA
AGATTACATTCGTTCACATTTTTCTTATGAAACTAGATGACATTCTTCTCACCGCATCCT
CAAAAAGCCAAATAGCAACTATTCAAATCCTAAAGCAAGAAAGTGTTTTCTTCACGACAA
GACTTTCACATGTCGTTATCGATGATATCGCGCATCATCTGTAATGGAATTAGCCCTTCT
GTTCTGATTGCATCTTTGCTTGGGTCAGGACTTATGAATAACAATGTAGGTAAGCCCCGA
ACCTGCATGTCGCGTGCAAACTCGTACTCATCATCTGTATCAACTTTCACAATCATTGCA
TTGCTCTCATACTCTACTGCAAGCATTTCGAGTTCCTGAGCCATCAAGATACAAGGTCCA
CACCAAGTTGCATAAAAATCAACAATGAGCGGCACCTTCCTCTCTCCTTTCACCAGCTCC
TGAAGTTCTTCAGCTGACAGTTTCCTCACAAGATAATCTTCTCTAACAAACTTGCCGCGA
GGAGGAGGGCAGAGAGGAGGAGGATGACAACGGAGAGGTTACCGGACGAGTTTCCCTCCG
GAGGAAGAGAGACGACGGAGCGTGGAGTGTGGATAGAACCGGCGATAACCGGACGTTGAA
GTTAGCAAGAGCTGTGGATTGAACAAGAGCCATTTTTTGGGGAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C015TF C 1
AF RR2C015JQ U 13
BS 1 12 RR2C015TF
BS 13 768 RR2C015JQ

RD RR2C015TF 768 0 0
TTTTTTTTCAACGGCTCAGATCT*CAGCTTTTCTGGAAATTAAAATGCTCTGAAGCAGTC
ATTAAGCTTCAAAAGGGTTAACCAAGTGCCGAATAGAACACTGCATACATATAAATTCTA
AGATTACATTCGTTCACATTTTTCTTATGAAACTAGATGACATTCTTCTCACCGCATCCT
CAAAAAGCCAAATAGCAACTATTCAAATCCTAAAGCAAGAAAGTGTTTTCTTCACGACAA
GACTTTCACATGTCGTTATCGATGATATCGCGCATCATCTGTAATGGAATTAGCCCTTCT
GTTCTGATTGCATCTTTGCTTGGGTCAGGACTTATGAATAACAATGTAGGTAAGCCCCGA
ACCTGCATGTCGCGTGCAAACTCGTACTCATCATCTGTATCAACTTTCACAATCATTGCA
TTGCTCTCATACTCTACTGCAAGCATTTCGAGTTCCTGAGCCATCAAGATACAAGGTCCA
CACCAAGTTGCATAAAAATCAACAATGAGCGGCACCTTCCTCTCTCCTTTCACCAGCTCC
TGAAGTTCTTCAGCTGACAGTTTCCTCACAAGATAATCTTCTCTAACAAACTTGCCGCGA
GGAGGAGGGCAGAGAGGAGGAGGATGACAACGGAGAGGTTACCGGACGAGTTTCCCTCCG
GAGGAAGAGAGACGACGGAGCGTGGAGTGTGGATAGAACCGGCGATAACCGGACGTTGAA
GTTAGCAAGAGCTGTGGATTGAACAAGAGCCATTTTTTGGGGAATCCC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RR2C015JQ 756 0 0
GGCTCAGATCTTCAGCTTTTCTGGAAATTAAAATGCTCTGAAGCAGTCATTAAGCTTCAA
AAGGGTTAACCAAGTGCCGAATAGAACACTGCATACATATAAATTCTAAGATTACATTCG
TTCACATTTTTCTTATGAAACTAGATGACATTCTTCTCACCGCATCCTCAAAAAGCCAAA
TAGCAACTATTCAAATCCTAAAGCAAGAAAGTGTTTTCTTCACGACAAGACTTTCACATG
TCGTTATCGATGATATCGCGCATCATCTGTAATGGAATTAGCCCTTCTGTTCTGATTGCA
TCTTTGCTTGGGTCAGGACTTATGAATAACAATGTAGGTAAGCCCCGAACCTGCATGTCG
CGTGCAAACTCGTACTCATCATCTGTATCAACTTTCACAATCATTGCATTGCTCTCATAC
TCTACTGCAAGCATTTCGAGTTCCTGAGCCATCAAGATACAAGGTCCACACCAAGTTGCA
TAAAAATCAACAATGAGCGGCACCTTCCTCTCTCCTTTCACCAGCTCCTGAAGTTCTTCA
GCTGACAGTTTCCTCACAAGATAATCTTCTCTAACAAACTTGCCGCGAGGAGGAGGGCAG
AGAGGAGGAGGATGACAACGGAGAGGTTACCGGACGAGTTTCCCTCCGGAGGAAGAGAGA
CGACGGAGCGTGGAGTGTGGATAGAACCGGCGATAACCGGACGTTGAAGTTAGCAAGAGC
TGTGGATTGAACAAGAGCCATTTTTTGGGGAATCCC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL7889Contig1 726 2 3 U
TCCATAATTATCATTCTCCGGGAAAGAAACTAAGAAGAAACTCAGCACTCTTTTGATCTA
TATCAAGACAGCCCCTTGAAAAAAAACATCGAGTTAATTGAAAACAATCAAACTAAATAA
TATAGGTCTCCAAAGCAACCAAAAAAGGGGACCACGATCACAAACTAAAAAATCTATATA
AATCTCAGGGTTTCTGATTAGGTAAAGACCTCGAGAAAAAGCCAATACTAGGAAACAATG
CAAGAAAAAAAAAAAACAGAAACTTTAAAGCAAGCAAACTCACTTGGCTAATGCCCATCA
ACTTTGAAACACAATTCTCAAGTCCTCAAGATTCAAATAGTTGAAGCTACAACACAGCAA
CTGTGTGGAAATGGGTGAACTCACTTTAACAGGAAATGCAAAAAACAATACTTTGTAGCA
TTACCGATCTAATTCAAACAAATATGTTTGGAGAAAGGGAGGAATCGAAGCAAAGAAGCT
CTTAGGATTTGCGACCTTGAGCCTTCCTGAGCTTCCTGTACTTATGCTTGTTCATCTTCT
TCTTCCTCTTCTTCTTCACGCTATCAGCGTAAATCGCCACCTCCTTCTCACCTTTCTCCT
CCACCACCGTCTCCGTGAACGGCCTTGACCCCAGTTATTTTGAGGTCATATCTAGTATTC
AGAGTTTGCCTCGATTTGGTACCGCTCTCGCGGCCCGCACCGAAACAGTGCTTTACCCCT
AGATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL80JQ U 48
AF RR2DL80TF C 1
BS 1 47 RR2DL80TF
BS 48 463 RR2DL80JQ
BS 464 726 RR2DL80TF

RD RR2DL80JQ 416 0 0
CTCTTTTGATCTATATCAAGACAGCCCCTTGAAAAAAAACATCGAGTTAATTGAAAACAA
TCAAACTAAATAATATAGGTCTCCAAAGCAACCAAAAAAGGGGACCACGATCACAAACTA
AAAAATCTATATAAATCTCAGGGTTTCTGATTAGGTAAAGACCTCGAGAAAAAGCCAATA
CTAGGAAACAATGCAAGAAAAAAAAAAAACAGAAACTTTAAAGCAAGCAAACTCACTTGG
CTAATGCCCATCAACTTTGAAACACAATTCTCAAGTCCTCAAGATTCAAATAGTTGAAGC
TACAACACAGCAACTGTGTGGAAATGGGTGAACTCACTTTAACAGGAAATGCAAAAAACA
ATACTTTGTAGCATTACCGATCTAATTCAAACAAATATGTTTGGAGAAAGGGAGGA

QA 1 416 1 416
DS 

RD RR2DL80TF 726 0 0
TCCATAATTATCATTCTCCGGGAAAGAAACTAAGAAGAAACTCAGCACTCTTTTGATCTA
TATCAAGACAGCCCCTTGAAAAGAAACATCGAGTTAATTGAAAACAATCAGACTAGATAA
TATAGGTCTCCAAAGCAACCAAGAAAGGTGACCACGATCACAAACTAAAAGATCTATATA
AATCTCAGGGTTTCTGATTAGGTAAAGACCTCGAGAAGAAGCCAATACTAGGAGACAATG
CAAGAAAGAAAAAAGACAGAAACTTTAAAGCAAGCAAACTCACTTGGCTAATGCCCATCA
ACTTTGAAACACAATTCTCAAGTCCTCAAGATTCAAATAGTTGAAGCTACAACACAGCAA
CTGTGTGGAAATGGGTGAACTCACTTTAACAGGAAATGCAGAAAACAATACTTTGTAGCA
TTACCGATCTAATTCAAACAAATATGTTTGGAGAAAGGGAGGAATCGAAGCAAAGAAGCT
CTTAGGATTTGCGACCTTGAGCCTTCCTGAGCTTCCTGTACTTATGCTTGTTCATCTTCT
TCTTCCTCTTCTTCTTCACGCTATCAGCGTAAATCGCCACCTCCTTCTCACCTTTCTCCT
CCACCACCGTCTCCGTGAACGGCCTTGACCCCAGTTATTTTGAGGTCATATCTAGTATTC
AGAGTTTGCCTCGATTTGGTACCGCTCTCGCGGCCCGCACCGAAACAGTGCTTTACCCCT
AGATGC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL7890Contig1 805 2 3 U
GCACTACACTTCTAGGTTAATTGCTCATGTCTCAAACAAGGAAGCTGAGAGTAACTTTTA
CCAAGCACAAGAACTGGAGAGGATTGTTGAATGGGAAGATGGAGAGCCAATAGGTGAAAG
GGCTGCTTCAGACTGGCTTTATATTGTGCCTTGGGGAATCCGGAAGACTTTAAATTACAT
CAGCAAAAAATACAACCACCCTCCAATATTTATTACTGAGAATGGCATGGATGATGAAGA
TGACGGATCTGCTTCTATGCATGAGATGCTAGACGATAAGCGTAGAGTTGCCTACTTCAA
GAGTTACCTTGCCAATGTCGCTGAGGCTATGAAAGACGGAGTGGACATAAAGGGATACTT
TGCGTGGTCTTTGCTGGACAACTTTGAGTGAGCGCAAGGGTTCACCAAAAGGTTCGGTTT
GGTATATGTCGATTACAAGAACGGTTTGACTCGTCACCCAAAATCTTCTGCTTATTGGTT
CATGAAATTCCTGAAAGGTGATGAAGACAACAAAGGTAAAAAAGATTAAAAAAAACAGTA
AGAATAAAGCAAAATCTATGACTACATTTACATGATTTGCGTTGTGTTGTTATAAATTTA
TACCAAATAGATTATTATGAGCCATAACAAACCAAATTACTTGGGTTGTTTTTTTTGGTT
TCAAACTCGTATTCTGACTAAGTTTATCTTCTTCATTAGATACCGAAACAAGTGACAAAC
TGTCTTGTGATGGTTTATATGATTGTTATAAAGGACTAGAAACGGGTGCATTTGCAGGAG
AACCATAATACGTTGATACTGATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2B026TF U 1
AF RR2B026JQ C 21
BS 1 777 RR2B026TF
BS 778 778 RR2B026JQ
BS 779 805 RR2B026TF

RD RR2B026TF 805 0 0
GCACTACACTTCTAGGTTAATTGCTCATGTCTCAAACAAGGAAGCTGAGAGTAACTTTTA
CCAAGCACAAGAACTGGAGAGGATTGTTGAATGGGAAGATGGAGAGCCAATAGGTGAAAG
GGCTGCTTCAGACTGGCTTTATATTGTGCCTTGGGGAATCCGGAAGACTTTAAATTACAT
CAGCAAAAAATACAACCACCCTCCAATATTTATTACTGAGAATGGCATGGATGATGAAGA
TGACGGATCTGCTTCTATGCATGAGATGCTAGACGATAAGCGTAGAGTTGCCTACTTCAA
GAGTTACCTTGCCAATGTCGCTGAGGCTATGAAAGACGGAGTGGACATAAAGGGATACTT
TGCGTGGTCTTTGCTGGACAACTTTGAGTGAGCGCAAGGGTTCACCAAAAGGTTCGGTTT
GGTATATGTCGATTACAAGAACGGTTTGACTCGTCACCCAAAATCTTCTGCTTATTGGTT
CATGAAATTCCTGAAAGGTGATGAAGACAACAAAGGTAAAAAAGATTAAAAAAAACAGTA
AGAATAAAGCAAAATCTATGACTACATTTACATGATTTGCGTTGTGTTGTTATAAATTTA
TACCAAATAGATTATTATGAGCCATAACAAACCAAATTACTTGGGTTGTTTTTTTTGGTT
TCAAACTCGTATTCTGACTAAGTTTATCTTCTTCATTAGATACCGAAACAAGTGACAAAC
TGTCTTGTGATGGTTTATATGATTGTTATAAAGGACTAGAAACGGGTGCATTTGCAG*AG
AACCATAATACGTTGATACTGATGG

QA 1 805 1 805
DS 

RD RR2B026JQ 785 0 0
TTGCTCATGTCTCAAACAAGGAAGCTGAGAGTAACTTTTACCAAGCACAAGAACTGGAGA
GGATTGTTGAATGGGAAGATGGAGAGCCAATAGGTGAAAGGGCTGCTTCAGACTGGCTTT
ATATTGTGCCTTGGGGAATCCGGAAGACTTTAAATTACATCAGCAAAAAATACAACCACC
CTCCAATATTTATTACTGAGAATGGCATGGATGATGAAGATGACGGATCTGCTTCTATGC
ATGAGATGCTAGACGATAAGCGTAGAGTTGCCTACTTCAAGAGTTACCTTGCCAATGTCG
CTGAGGCTATGAAAGACGGAGTGGACATAAAGGGATACTTTGCGTGGTCTTTGCTGGACA
ACTTTGAGTGAGCGCAAGGGTTCACCAAAAGGTTCGGTTTGGTATATGTCGATTACAAGA
ACGGTTTGACTCGTCACCCAAAATTTTTTGCTTATTGGTTCATGAAATTCCTGAAAGGTG
ATGAAGACAACAAAGGTAAAAAAGATTAAAAAAAACAGTAAGAATAAAGCAAAATCTATG
ACTACATTTACATGATTTGCGTTGTGTTGTTATAAATTTATACCAAATAGATTATTATGA
GCCATAACAAACCAAATTACTTGGGTTGTTTTTTT*GGTTTCAAACTCGTATTCTGACTA
AGTTTATCTTCTTCATTAGATACCGAAACAAGTGACAAACTGTCTTGTGATGGTTTATAT
GATTGTTATAA*GGACTAGAAACGGGTGCATTTGCAGGAGAACCATAATACGTTGATACT
GATGG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL7891Contig1 1339 2 2 U
GAGAAGCCTTCTTAATTGTGTAGGACTATTGATTAGATCAGAGATTTTTATAATCTATCA
ATATGATTTTTCTCTCTTTGTCTACCACACTTCCTGCAGCTGATGCTCTCTTAAAAGAGT
AAGGCTGCAAAAGACAAACATTAGTTATCAAATCACCAATAGTTTTTTTTTTTGGCCTCT
TGTATAGTCCTGAAGAGAGGTGAACCAAATGACACTGCTTATTGCAGGCAGCTACACAGC
CCATAAAGAGATTTGACCAGACATGTATGTTGTATTTGTGTTTATTGCTTTATAATTACA
ATGTTTTACAAGCTAACTTTGTTGTTAGGTAGACAAGTCAAAAGAAGATAAAATATTGCT
GCCCTTAACACCCCACTTCTCCATGCGTCTTAAAATCCCATGGCCTTAGGCCACACAGCC
TCACCTCCACCGATCGATTGACTTTGCTTTGTCATCTAAGAAAAATGAAAGCAGCGGTTA
TTCATGCAACTGTTCTCTCCTCCAGTGGCTCCTTCGTTTCTTTATCTAATCCACTTATTT
TGGTTTTCTGTTGCCTAACTTGTTCATCCAGGGACAATGGCTTCTTGCTTTCTTGATCTA
ATCCACTTATCTTTGTTCTCTCCTTCTTAACTTGTTCATCCAGGGACAAGGGCTTCTTGC
TTTCTTGATCTAGTCCACTTATTTTTGCTTTCTCCTTCTTAACTTGTTCATCCAAGGACA
AGGGCTTGCTGCTTTCTTTATCTAGTCGATCTATTTTTGCTTTCTCCTTCTTAACTTGTT
CCTCCAAGGACAAGGGCTTGCTGCTTTCTTTATCTAGTTGATCTATTTTTGTTTTCTCCT
TCTTAACTTGTTCCTTCAAGGATAAGGGCTTCCTGCTTTCTTTATCTAACCGACCTGTTT
TTGATTTCTCCTCTTCAGCCTTCTTCTTAGCTTCAGCTTCGAGTTGTTTTACGTTTTCTT
CATGCGCACGATTGAACAGTCTTACAAAGTTTAGAAGAGTCGACACCCCTGCAATTTGTA
ACCATTAGCCAGATTCAGACAACTTCGAAACACCATGTTTCACATAAAAACTATATATAT
ACAGTTTTGTACATGGTTGGTCTTGTATATGCATACCTTGTTCAAAAGGGCACTTAGCAG
GGTCTTCACCAAAATAGAAAATTAAGCCATCAACGTTTCTTCCCTGCAATACATAATTTA
TTTATTCTGAAAATAGAGCATAGCAAGGTAATATATCTATTGCACATTGGACTTTTGTGG
ACATACCACTCCTGAATAGAGTGAAGCCAATGTCCTTACTTCTGCTTCCGCATAATGAAG
GAACTCCTTCAATATCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BA74TF U 1
AF RR2BA74JQ C 560
BS 1 710 RR2BA74TF
BS 711 1339 RR2BA74JQ

RD RR2BA74TF 710 0 0
GAGAAGCCTTCTTAATTGTGTAGGACTATTGATTAGATCAGAGATTTTTATAATCTATCA
ATATGATTTTTCTCTCTTTGTCTACCACACTTCCTGCAGCTGATGCTCTCTTAAAAGAGT
AAGGCTGCAAAAGACAAACATTAGTTATCAAATCACCAATAGTTTTTTTTTTTGGCCTCT
TGTATAGTCCTGAAGAGAGGTGAACCAAATGACACTGCTTATTGCAGGCAGCTACACAGC
CCATAAAGAGATTTGACCAGACATGTATGTTGTATTTGTGTTTATTGCTTTATAATTACA
ATGTTTTACAAGCTAACTTTGTTGTTAGGTAGACAAGTCAAAAGAAGATAAAATATTGCT
GCCCTTAACACCCCACTTCTCCATGCGTCTTAAAATCCCATGGCCTTAGGCCACACAGCC
TCACCTCCACCGATCGATTGACTTTGCTTTGTCATCTAAGAAAAATGAAAGCAGCGGTTA
TTCATGCAACTGTTCTCTCCTCCAGTGGCTCCTTCGTTTCTTTATCTAATCCACTTATTT
TGGTTTTCTGTTGCCTAACTTGTTCATCCAGGGACAATGGCTTCTTGCTTTCTTGATCTA
ATCCACTTATCTTTGTTCTCTCCTTCTTAACTTGTTCATCCAGGGACAAGGGCTTCTTGC
TTTCTTGATCTAGTCCACTTATTTTTGCTTTCTCCTTCTTAACTTGTTCA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RR2BA74JQ 780 0 0
TTGTTCATCCAGGGACAATGGCTTCTTGCTTTCTTGATCTAATCCACTTATCTTTGTTCT
CTCCTTCTTAACTTGTTCATCCAGGGACAAGGGCTTCTTGCTTTCTTGATCTAGTCCACT
TATTTTTGCTTTCTCCTTCTTAACTTGTTCATCCAAGGACAAGGGCTTGCTGCTTTCTTT
ATCTAGTCGATCTATTTTTGCTTTCTCCTTCTTAACTTGTTCCTCCAAGGACAAGGGCTT
GCTGCTTTCTTTATCTAGTTGATCTATTTTTGTTTTCTCCTTCTTAACTTGTTCCTTCAA
GGATAAGGGCTTCCTGCTTTCTTTATCTAACCGACCTGTTTTTGATTTCTCCTCTTCAGC
CTTCTTCTTAGCTTCAGCTTCGAGTTGTTTTACGTTTTCTTCATGCGCACGATTGAACAG
TCTTACAAAGTTTAGAAGAGTCGACACCCCTGCAATTTGTAACCATTAGCCAGATTCAGA
CAACTTCGAAACACCATGTTTCACATAAAAACTATATATATACAGTTTTGTACATGGTTG
GTCTTGTATATGCATACCTTGTTCAAAAGGGCACTTAGCAGGGTCTTCACCAAAATAGAA
AATTAAGCCATCAACGTTTCTTCCCTGCAATACATAATTTATTTATTCTGAAAATAGAGC
ATAGCAAGGTAATATATCTATTGCACATTGGACTTTTGTGGACATACCACTCCTGAATAG
AGTGAAGCCAATGTCCTTACTTCTGCTTCCGCATAATGAAGGAACTCCTTCAATATCTTC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL7894Contig1 658 2 2 U
TTTTTCCAGGGAAAATGTATTTTGAGTATACACATTTCTTCAAAGGTTTTTAATTATACA
ACAAAAAATCTACTTTAATACAAACTCAACCAGGTTTCCTCTACCACTTAAAGCGGCTTA
AATTACAAACAAACCACGAAATTGCAACCTCGGTTTACTAATCTCAACCTGATCATTCAA
AAACTCACCAATTATTTCTTTCTAAATATCGTCAGTGGGCATGATCTTCAAGAGCTTGAC
CAGATCATATGACTTGAAATCTCTTCCAAAACACAGAGCCATGTCCAATGCTACTTTCCC
ATCCTTTGTTCTTCTTGTCTTATCAGCACCATTGGTCAACAAGATCTTTGTAATGTCTCG
ATTCCTGCTTTGCACAGCGATATGTAAAGGAGTCCATCCTTCATTATCTGTAACATTGAC
GTCTACATTGTACTTGATAAGTAGTTTCACAGTCTGCAAGGCTCCAACTTGAACTGCATA
ATGAAGGGCAAATGCACCGTCCCGATCTTGAACGTGTGGATTTGCTCCTTTCCTCAAAAG
ATGGCCAATCACTGCTTCTTTTTTACCAATGACTGCCTTGTGAAGAGCGGTTTGCCCCTC
CTTGTAAACATCATCAATGTCTAGTCCATTGTCCATGAGGTTGTCCATTAATTGAATC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DA31TF C 1
AF RR2DA31JQ U 6
BS 1 5 RR2DA31TF
BS 6 658 RR2DA31JQ

RD RR2DA31TF 658 0 0
TTTTTCCAGGGAAAATGTATTTTGAGTATACACATTTCTTCAAAGGTTTTTAATTATACA
ACAAAAAATCTACTTTAATACAAACTCAACCAGGTTTCCTCTACCACTTAAAGCGGCTTA
GATTACAAACAAACCACGAAATTGCAACCTCGGTTTACTAATCTCAACCTGATCATTCAA
AAACTCACCAATTATTTCTTTCTAAATATCGTCAGTGGGCATGATCTTCAAGAGCTTGAC
CAGATCATATGACTTGAAATCTCTTCCAAAACACAGAGCCATGTCCAATGCTACTTTCCC
ATCCTTTGTTCTTCTTGTCTTATCAGCACCATTGGTCAACAAGATCTTTGTAATGTCTCG
ATTCCTGCTTTGCACAGCGATATGTAAAGGAGTCCATCCTTCATTATCTGTAACATTGAC
GTCTACATTGTACTTGATAAGTAGTTTCACAGTCTGCAAGGCTCCAACTTGAACTGCATA
ATGAAGGGCAGATGCACCGTCCCGATCTTGAACGTGTGGATTTGCTCCTTTCCTCAAAAG
ATGGCCAATCACTGCTTCTTTTTTACCAATGACTGCCTTGTGAAGAGCGGTTTGCCCCTC
CTTGTAAACATCATCAATGTCTAGTCCATTGTCCATGAGGTTGTCCATTAATTGAATC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RR2DA31JQ 653 0 0
CCAGGGAAAATGTATTTTGAGTATACACATTTCTTCAAAGGTTTTTAATTATACAACAAA
AAATCTACTTTAATACAAACTCAACCAGGTTTCCTCTACCACTTAAAGCGGCTTAAATTA
CAAACAAACCACGAAATTGCAACCTCGGTTTACTAATCTCAACCTGATCATTCAAAAACT
CACCAATTATTTCTTTCTAAATATCGTCAGTGGGCATGATCTTCAAGAGCTTGACCAGAT
CATATGACTTGAAATCTCTTCCAAAACACAGAGCCATGTCCAATGCTACTTTCCCATCCT
TTGTTCTTCTTGTCTTATCAGCACCATTGGTCAACAAGATCTTTGTAATGTCTCGATTCC
TGCTTTGCACAGCGATATGTAAAGGAGTCCATCCTTCATTATCTGTAACATTGACGTCTA
CATTGTACTTGATAAGTAGTTTCACAGTCTGCAAGGCTCCAACTTGAACTGCATAATGAA
GGGCAAATGCACCGTCCCGATCTTGAACGTGTGGATTTGCTCCTTTCCTCAAAAGATGGC
CAATCACTGCTTCTTTTTTACCAATGACTGCCTTGTGAAGAGCGGTTTGCCCCTCCTTGT
AAACATCATCAATGTCTAGTCCATTGTCCATGAGGTTGTCCATTAATTGAATC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL7895Contig1 732 2 8 U
TTTTTTTTGTGTGTTCTCTTTCTTCTCAAATGTTGTTGAAACTTTAGGGTTTAAATCTCT
CTTTCTCCTGTGAGACAAAAGAAACATCTAAGTGGTGGTGCTTTTGATGGGAACTATAGA
CTTCAGTGCTGCTGCTGCAGATGAAACCTCCATTGCTGATCTCAGCGGTCAAGTTCACCA
GGTTCCTTGCTGCATTAGATTCGACGGTCCTGCTCAAGTTTCCAACTATTTCAAGCCCAA
ATCCAGTGAGGTGGAAGTTGATGGAGTGAGAGCAGAGGAAGCTCATTTCAGAGGAAGGAA
GTTGCAGGGAGCAACTATCTCTCTCCCTAGTGCCTACTCTGGTTTTGTGCTTGGACAAGC
GAGTAATAAGAACGCCAATGGAAAGAGAAAAGCTTCTAGTGACACAGAGGAGAATCCGTG
TTGGGAAGCCAAGGCCAAATTCGATAAGATGACATACTGGAATCATGACTCTCTTCCTTC
TAAAGACGATACCATCTTGCGGTCTTTTCACTGGTTCAGCATTGCAGAGGCGCTGCACAA
GCCAGTGACAGTTGAAGACTTGGTTGCAGTAACAGATGGTGGAGGATTGGGATAAAATCA
TCAAATGTCATTTAGCAGATTTGGTTGTTTAAGAAAAGATGTTGTGAAACAAAGTAGAGC
AGTAGGTAATTTGAGAATCATGTACTATTTCTTGTAAAACGATTTTGTTTGAAGGAAACA
AGATTTTGATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BR32TF U 1
AF RR2BR32JQ C 8
BS 1 648 RR2BR32TF
BS 649 649 RR2BR32JQ
BS 650 665 RR2BR32TF
BS 666 666 RR2BR32JQ
BS 667 676 RR2BR32TF
BS 677 677 RR2BR32JQ
BS 678 694 RR2BR32TF
BS 695 732 RR2BR32JQ

RD RR2BR32TF 694 0 0
TTTTTTTTGTGTGTTCTCTTTCTTCTCAAATGTTGTTGAAACTTTAGGGTTTAAATCTCT
CTTTCTCCTGTGAGACAAAAGAAACATCTAAGTGGTGGTGCTTTTGATGGGAACTATAGA
CTTCAGTGCTGCTGCTGCAGATGAAACCTCCATTGCTGATCTCAGCGGTCAAGTTCACCA
GGTTCCTTGCTGCATTAGATTCGACGGTCCTGCTCAAGTTTCCAACTATTTCAAGCCCAA
ATCCAGTGAGGTGGAAGTTGATGGAGTGAGAGCAGAGGAAGCTCATTTCAGAGGAAGGAA
GTTGCAGGGAGCAACTATCTCTCTCCCTAGTGCCTACTCTGGTTTTGTGCTTGGACAAGC
GAGTAATAAGAACGCCAATGGAAAGAGAAAAGCTTCTAGTGACACAGAGGAGAATCCGTG
TTGGGAAGCCAAGGCCAAATTCGATAAGATGACATACTGGAATCATGACTCTCTTCCTTC
TAAAGACGATACCATCTTGCGGTCTTTTCACTGGTTCAGCATTGCAGAGGCGCTGCACAA
GCCAGTGACAGTTGAAGACTTGGTTGCAGTAACAGATGGTGGAGGATTGGGATAAAATCA
TCAAATGTCATTTAGCAGATTTGGTTGTTTAAGAAAAGATGTTGTGAA*CAAAGTAGAGC
AGTAG*TAATTTGAGA*TCATGTACTATTTCTTG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RR2BR32JQ 725 0 0
TGTGTGTTCTCTTTCTTCTCAAATGTTGTTGAAACTTTAGGGTTTAAATCTCTCTTTCTC
CTGTGAGACAAAAGAAACATCTAAGTGGTGGTGCTTTTGATGGGAACTATAGACTTCAGT
GCTGCTGCTGCAGATGAAACCTCCATTGCTGATCTCAGCGGTCAAGTTCACCAGGTTCCT
TGCTGCATTAGATTCGACGGTCCTGCTCAAGTTTCCAACTATTTCAAGCCCAAATCCAGT
GAGGTGGAAGTTGATGGAGTGAGAGCAGAGGAAGCTCATTTCAGAGGAAGGAAGTTGCAG
GGAGCAACTATCTCTCTCCCTAGTGCCTACTCTGGTTTTGTGCTTGGACAAGCGAGTAAT
AAGAACGCCAATGGAAAGAGAAAAGCTTCTAGTGACACAGAGGAGAATCCGTGTTGGGAA
GCCAAGGCCAAATTCGATAAGATGACATACTGGAATCATGACTCTCTTCCTTCTAAAGAC
GATACCATCTTGCGGTCTTTTCACTGGTTCAGCATTGCAGAGGCGCTGCACAAGCCAGTG
ACAGTTGAAGACTTGGTTGCAGTAACAGATGGTGGAGGATTGGGATAAAATCATCAAATG
TCATTTAGCAGATTTGGTTGTTTAAGAAAAGATGTTGTGAAACAAAGTAGAGCAGTAGGT
AATTTGAGAATCATGTACTATTTCTTGTAAAACGATTTTGTTTGAAGGAAACAAGATTTT
GATCG

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL7896Contig1 868 2 2 U
TAAAGGAGCGTTTGGATCCTCGTACAAGGCGAGTTTCGAGCATGGTTTAATTGTGGCTGT
GAAACGGTTGAGAGATGTGGTTGTGCCTGAGAAAGAGTTTAAAGAGAAGTTGCAGGTTCT
TGGTTCAATCAACCATCCCAATCTCGTGACGTTGATCGCTTATTACTTCAGCCGCGACGA
GAAGCTCGTTGTCTTCGAGTACATGCCTAGAGGAAGCTTGTCTGCTCTCTTACACGGGAA
CAAAGGAAGTGGTAGAAGTCCATTGAGTTGGGAAACAAGAGCGAGTATAGCTATAGGAGC
AGCGAGAGCCATTAGTTACCTTCATTCACGTGACGCGACGACATCTCATGGCAACATTAA
ATCTTCTAACATTCTCTTGTCTGAATCTTATGAGGCTAAGGTCTCTGACTACTGCCTTGC
GCCTATGATCAGCCCTACATCTACACCTAACCGTATCGATGGTTACCGTGCTCCTGAAGT
AACAGATGCTCGTAGAATCTCCCAGAAGGCTGATGTTTACAGCTTCGGTGTTCTCATTCT
TGAATTACTCACAGGGAAATCTCCAACGCACCAGCAGTTAAACGAAGAAGGAGTTGATTT
GCCGAGATGGGTTTCATCTATCACTGAACAACAATCACCTTCAGATGTGTTTGATCCAGA
GCTAACTAGGTATCAAGCTGAGGGTAATGAGAACATGATCAGGCTTTTGAAGATCGGTAT
AAGTTGTACTGCTCATTATCCAGATAGTCGTCCGTCCATGGCTGAAGTCACCAGGCTCAT
TGAGGAGGTCTCTCGTTCATCTGGTTCACAAGGTCCTTTGTCTGGTTGATTCTTTTCTTC
TTCTTTTCAGTGTGGGGCCTAAATTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EJ46TF U 1
AF RR2EJ46JQ C 253
BS 1 662 RR2EJ46TF
BS 663 868 RR2EJ46JQ

RD RR2EJ46TF 662 0 0
TAAAGGAGCGTTTGGATCCTCGTACAAGGCGAGTTTCGAGCATGGTTTAATTGTGGCTGT
GAAACGGTTGAGAGATGTGGTTGTGCCTGAGAAAGAGTTTAAAGAGAAGTTGCAGGTTCT
TGGTTCAATCAACCATCCCAATCTCGTGACGTTGATCGCTTATTACTTCAGCCGCGACGA
GAAGCTCGTTGTCTTCGAGTACATGCCTAGAGGAAGCTTGTCTGCTCTCTTACACGGGAA
CAAAGGAAGTGGTAGAAGTCCATTGAGTTGGGAAACAAGAGCGAGTATAGCTATAGGAGC
AGCGAGAGCCATTAGTTACCTTCATTCACGTGACGCGACGACATCTCATGGCAACATTAA
ATCTTCTAACATTCTCTTGTCTGAATCTTATGAGGCTAAGGTCTCTGACTACTGCCTTGC
GCCTATGATCAGCCCTACATCTACACCTAACCGTATCGATGGTTACCGTGCTCCTGAAGT
AACAGATGCTCGTAGAATCTCCCAGAAGGCTGATGTTTACAGCTTCGGTGTTCTCATTCT
TGAATTACTCACAGGGAAATCTCCAACGCACCAGCAGTTAAACGAAGAAGGAGTTGATTT
GCCGAGATGGGTTTCATCTATCACTGAACAACAATCACCTTCAGATGTGTTTGATCCAGA
GC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RR2EJ46JQ 616 0 0
TAGAAGTCCATTGAGTTGGGAAACAAGAGCGAGTATAGCTATAGGAGCAGCGAGAGCCAT
TAGTTACCTTCATTCACGTGACGCGACGACATCTCATGGCAACATTAAATCTTCTAACAT
TCTCTTGTCTGAATCTTATGAGGCTAAGGTCTCTGACTACTGCCTTGCGCCTATGATCAG
CCCTACATCTACACCTAACCGTATCGATGGTTACCGTGCTCCTGAAGTAACAGATGCTCG
TAGAATCTCCCAGAAGGCTGATGTTTACAGCTTCGGTGTTCTCATTCTTGAATTACTCAC
AGGGAAATCTCCAACGCACCAGCAGTTAAACGAAGAAGGAGTTGATTTGCCGAGATGGGT
TTCATCTATCACTGAACAACAATCACCTTCAGATGTGTTTGATCCAGAGCTAACTAGGTA
TCAAGCTGAGGGTAATGAGAACATGATCAGGCTTTTGAAGATCGGTATAAGTTGTACTGC
TCATTATCCAGATAGTCGTCCGTCCATGGCTGAAGTCACCAGGCTCATTGAGGAGGTCTC
TCGTTCATCTGGTTCACAAGGTCCTTTGTCTGGTTGATTCTTTTCTTCTTCTTTTCAGTG
TGGGGCCTAAATTGAT

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL7897Contig1 741 2 2 U
CTTCGGAGGAGGAGCATCATCATCCATCCATCTCCAATGGCGTCTTCTTCTCTGTCTTCC
CTTTCCTTAATTCTCAGCAACCCTCAAGGCTGCTCTCTCTGCTTTAAAGCCTCTACACGA
CGCACTCTCGCTCTAGCATTCCTCTCCTCGAAACTAAACCACACCTCTTCCTCTTCCTCT
TCTGCTCTTCTCCCTCGCTGCTATCGTCTCACACAGAATTCGATCAAGAGGAAGAAAGGG
TTCTCGTTAGATCTTTCCAGAAGCTTCTCTGTTTCTCAAACTGCCGGTTTCGGTAAGTTC
GATGGCCCAAGCCTCCACCAATTCATCTCCAAAGCTCAAACTTCCCTCACTGCTCCACAA
ACCGAATCTGAGTGCACACAAGATTCCGACATTGCATCATCATCACCATCAAAAGGTCGG
ATTTATCACGAAACGTACGGATGTCAGATGAACATAAACGACATGGAGATAGTCCTCTCC
ATCATGAAAAACTCCGGTTACAAAGAAACAGTTGGTGACTTCGTGGAGGTTAGGATAGAG
AGATCGTCGAGGGCGTCTTTGTACGGAGAAGCTCTAGCGATTAGTAAAATGTCCTTGTTT
CACGATGTTGGTGTCGATGCTCTTGTTGTGTCTTGCGCAAGTTAGACTTTTGTGTTGTTT
GTTTTCAAAAAAGCCTCTGGATTTTTTTTTACCTTTATTATGTATACACTTTTTATAGTT
ATCCAAATTAACTTTTTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CK12TF U 1
AF RR2CK12JQ C 13
BS 1 657 RR2CK12TF
BS 658 741 RR2CK12JQ

RD RR2CK12TF 657 0 0
CTTCGGAGGAGGAGCATCATCATCCATCCATCTCCAATGGCGTCTTCTTCTCTGTCTTCC
CTTTCCTTAATTCTCAGCAACCCTCAAGGCTGCTCTCTCTGCTTTAAAGCCTCTACACGA
CGCACTCTCGCTCTAGCATTCCTCTCCTCGAAACTAAACCACACCTCTTCCTCTTCCTCT
TCTGCTCTTCTCCCTCGCTGCTATCGTCTCACACAGAATTCGATCAAGAGGAAGAAAGGG
TTCTCGTTAGATCTTTCCAGAAGCTTCTCTGTTTCTCAAACTGCCGGTTTCGGTAAGTTC
GATGGCCCAAGCCTCCACCAATTCATCTCCAAAGCTCAAACTTCCCTCACTGCTCCACAA
ACCGAATCTGAGTGCACACAAGATTCCGACATTGCATCATCATCACCATCAAAAGGTCGG
ATTTATCACGAAACGTACGGATGTCAGATGAACATAAACGACATGGAGATAGTCCTCTCC
ATCATGAAAAACTCCGGTTACAAAGAAACAGTTGGTGACTTCGTGGAGGTTAGGATAGAG
AGATCGTCGAGGGCGTCTTTGTACGGAGAAGCTCTAGCGATTAGTAAAATGTCCTTGTTT
CACGATGTTGGTGTCGATGCTCTTGTTGTGTCTTGCGCAAGTTAGACTTTTGTGTTG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2CK12JQ 729 0 0
AGCATCATCATCCATCCATCTCCAATGGCGTCTTCTTCTCTGTCTTCCCTTTCCTTAATT
CTCAGCAACCCTCAAGGCTGCTCTCTCTGCTTTAAAGCCTCTACACGACGCACTCTCGCT
CTAGCATTCCTCTCCTCGAAACTAAACCACACCTCTTCCTCTTCCTCTTCTGCTCTTCTC
CCTCGCTGCTATCGTCTCACACAGAATTCGATCAAGAGGAAGAAAGGGTTCTCGTTAGAT
CTTTCCAGAAGCTTCTCTGTTTCTCAAACTGCCGGTTTCGGTAAGTTCGATGGCCCAAGC
CTCCACCAATTCATCTCCAAAGCTCAAACTTCCCTCACTGCTCCACAAACCGAATCTGAG
TGCACACAAGATTCCGACATTGCATCATCATCACCATCAAAAGGTCGGATTTATCACGAA
ACGTACGGATGTCAGATGAACATAAACGACATGGAGATAGTCCTCTCCATCATGAAAAAC
TCCGGTTACAAAGAAACAGTTGGTGACTTCGTGGAGGTTAGGATAGAGAGATCGTCGAGG
GCGTCTTTGTACGGAGAAGCTCTAGCGATTAGTAAAATGTCCTTGTTTCACGATGTTGGT
GTCGATGCTCTTGTTGTGTCTTGCGCAAGTTAGACTTTTGTGTTGTTTGTTTTCAAAAAA
GCCTCTGGATTTTTTTTTACCTTTATTATGTATACACTTTTTATAGTTATCCAAATTAAC
TTTTTTACG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL7898Contig1 680 2 3 U
GGATCACACGACTCTACTCAGAGACATTTCCGCAAACAGATGGTGCTCGCTCCGAACTAA
CCAGCCCTAAAGTGAGAGTCTACCTTGTTTTTTCTCCGATTCAAAGGAGGAAAAAAGAAA
CTAAACAGGAGATCCCATAGCTGAGTGATGCGAGAGCGATAGAAACATGGAAGGAGTTGA
GATGGAACTAGAGAGAAGAAGCAAGTTCTTGAACAGTTTGATACAACAAAAAAAGAAGGC
TAAAGAGCAGCAGGACCTCAAAGAAGAGTTCAATGTCCGTGTTAGAGCTTCAGATATGCC
TCTCCCTGTTCAGAACAGGGCTTTCAGTTTGTCCCGTGAGATATTGAATGCCACGCCTGG
TAAAGCCGACAACAAAAGACTCGCTCTTGCCCTAAAAAAGGACTTCGATTCTGCATATGG
TCCTGCATGGCACTGCATTGTTGGGACCAGCTTTGGTTCATACGTCACTCATTCCATCGG
AGGGTTCATATATTACCAGATCGACAAGGTTTATGTTCTTCTATTCAAGACTGCTGTGGA
ACCCCTTGATCACCAATGAGAATGTTCATCCAATCTTAAAAAAAAAAAGACCATCTTCAA
TTACTCCTTCCCTTTCGATTCCTCTGTCCTGTATTCACACTATTTATTTCGAGTTCAATG
TGTTAAATTGTTAATCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DB95TF U 1
AF RR2DB95JQ C 111
BS 1 587 RR2DB95TF
BS 588 588 RR2DB95JQ
BS 589 680 RR2DB95TF

RD RR2DB95TF 680 0 0
GGATCACACGACTCTACTCAGAGACATTTCCGCAAACAGATGGTGCTCGCTCCGAACTAA
CCAGCCCTAAAGTGAGAGTCTACCTTGTTTTTTCTCCGATTCAAAGGAGGAAAAAAGAAA
CTAAACAGGAGATCCCATAGCTGAGTGATGCGAGAGCGATAGAAACATGGAAGGAGTTGA
GATGGAACTAGAGAGAAGAAGCAAGTTCTTGAACAGTTTGATACAACAAAAAAAGAAGGC
TAAAGAGCAGCAGGACCTCAAAGAAGAGTTCAATGTCCGTGTTAGAGCTTCAGATATGCC
TCTCCCTGTTCAGAACAGGGCTTTCAGTTTGTCCCGTGAGATATTGAATGCCACGCCTGG
TAAAGCCGACAACAAAAGACTCGCTCTTGCCCTAAAAAAGGACTTCGATTCTGCATATGG
TCCTGCATGGCACTGCATTGTTGGGACCAGCTTTGGTTCATACGTCACTCATTCCATCGG
AGGGTTCATATATTACCAGATCGACAAGGTTTATGTTCTTCTATTCAAGACTGCTGTGGA
ACCCCTTGATCACCAATGAGAATGTTCATCCAATCTTAAAAAAAAAA*GACCATCTTCAA
TTACTCCTTCCCTTTCGATTCCTCTGTCCTGTATTCACACTATTTATTTCGAGTTCAATG
TGTTAAATTGTTAATCTCCC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RR2DB95JQ 570 0 0
AAAAAAGAAACTAAACAGGAGATCCCATAGCTGAGTGATGCGAGAGCGATAGAAACATGG
AAGGAGTTGAGATGGAACTAGAGAGAAGAAGCAAGTTCTTGAACAGTTTGATACAACAAA
AAAAGAAGGCTAAAGAGCAGCAGGACCTCAAAGAAGAGTTCAATGTCCGTGTTAGAGCTT
CAGATATGCCTCTCCCTGTTCAGAACAGGGCTTTCAGTTTGTCCCGTGAGATATTGAATG
CCACGCCTGGTAAAGCCGACAACAAAAGACTCGCTCTTGCCCTAAAAAAGGACTTCGATT
CTGCATATGGTCCTGCATGGCACTGCATTGTTGGGACCAGCTTTGGTTCATACGTCACTC
ATTCCATCGGAGGGTTCATATATTACCAGATCGACAAGGTTTATGTTCTTCTATTCAAGA
CTGCTGTGGAACCCCTTGATCACCAATGAGAATGTTCATCCAATCTTAAAAAAAAAAAGA
CCATCTTCAATTACTCCTTCCCTTTCGATTCCTCTGTCCTGTATTCACACTATTTATTTC
GAGTTCAATGTGTTAAATTGTTAATCTCCC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL7899Contig1 915 2 2 U
GGACGTTCCATCTTCTCCTCTTTTGAAACATTTCACCAGCAGAGAGAGCGTGGATCTTTC
GTCGGAGTATCTCCCGGAGAAATCGGTTTAGGAGATGGAGAGGAGGGCAGAGGACAATGA
AGAAACCGCCGCTGAACCTTCTGGAGAAGCCATAAGATCTCGGCTCAGTAACAGAGCAGA
CCCTTTCCTTGTCGTTTGCAGGTGTTTCAGCTTCGTTACATCTCTCGTCGCTGTTCTCTG
CGTTGTTGTTAATGTTCTCGCTGCTATTCGTTCCTTCCGGGACAGCCACGATATATTCGA
TGGAATATTCAGGTGTTATGCTGTGTTGATTGCTTGTTTTGTGGTTCTAGCCGAGACGGA
ATGGGGATTTATACTCAAATTCTCCAAGGTTCTTGAGTACTGGGCTGGGAGAGGAATGCT
TCAGATTTTTGTGGCTGTGATGACAAGAGCTTTCCCTGACTATATGACTCAAAAGAAGGA
TCTCCTGCTTCTTCAGAACATCGCTAGCTACATGCTCCTCGCTTGTGGTCTTGTCTATTT
CATATCAGGGATTCTATGCATTGGTTTTCTGAAACGTGCTCGACAGAAGAAAGAGATCTC
AAAAGAACAAGCTGTCAAGGATCTTGAGGAGATAGACCGGCGCAGGGAAGAACTGGAACA
GTTGCTTCTGGAGCATCGGAGTAGAGACGATGTGTGAATGTGATCATCACATGTACAGTT
GTCGCTTCATTGAACAGACGAGATCAGTTTGTTTATGTCTTAAAGGATTGTGTGACCTCT
CTGTTTTCATCCTTTCCACTTTGGATAGTAACAGCAGATTTTTTCTTTCTTTGTTTGAGT
AAAACAAAACATATCATGTTCAGACATTATTAATCATTGTTTTGCTAAGCTATCAGTAAT
AAGTCAGCAACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D314TF U 1
AF RR2D314JQ C 33
BS 1 642 RR2D314TF
BS 643 915 RR2D314JQ

RD RR2D314TF 642 0 0
GGACGTTCCATCTTCTCCTCTTTTGAAACATTTCACCAGCAGAGAGAGCGTGGATCTTTC
GTCGGAGTATCTCCCGGAGAAATCGGTTTAGGAGATGGAGAGGAGGGCAGAGGACAATGA
AGAAACCGCCGCTGAACCTTCTGGAGAAGCCATAAGATCTCGGCTCAGTAACAGAGCAGA
CCCTTTCCTTGTCGTTTGCAGGTGTTTCAGCTTCGTTACATCTCTCGTCGCTGTTCTCTG
CGTTGTTGTTAATGTTCTCGCTGCTATTCGTTCCTTCCGGGACAGCCACGATATATTCGA
TGGAATATTCAGGTGTTATGCTGTGTTGATTGCTTGTTTTGTGGTTCTAGCCGAGACGGA
ATGGGGATTTATACTCAAATTCTCCAAGGTTCTTGAGTACTGGGCTGGGAGAGGAATGCT
TCAGATTTTTGTGGCTGTGATGACAAGAGCTTTCCCTGACTATATGACTCAAAAGAAGGA
TCTCCTGCTTCTTCAGAACATCGCTAGCTACATGCTCCTCGCTTGTGGTCTTGTCTATTT
CATATCAGGGATTCTATGCATTGGTTTTCTGAAACGTGCTCGACAGAAGAAAGAGATCTC
AAAAGAACAAGCTGTCAAGGATCTTGAGGAGATAGACCGGCG

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2D314JQ 883 0 0
TCACCAGCAGAGAGAGCGTG*ATCTT*CGTCGGAGTATCTCC*GGAGAAATCGGTT*AGG
AGATG*AGAG*AGGGCAGAGGACA*TGAAGAAAC*GCCGCTGAAC*TTCTGGAGAAGCCA
TAAGATCTCGGCTCAGTAACAGAGCAGACCCTTTCCTTGTCGTTTGCAGGTGTTTCAGCT
TCGTTACATCTCTCGTCGCTGTTCTCTGCGTTGTTGTTAATGTTCTCGCTGCTATTCGTT
CCTTCCGGGACAGCCACGATATATTCGATGGAATATTCAGGTGTTATGCTGTGTTGATTG
CTTGTTTTGTGGTTCTAGCCGAGACGGAATGGGGATTTATACTCAAATTCTCCAAGGTTC
TTGAGTACTGGGCTGGGAGAGGAATGCTTCAGATTTTTGTGGCTGTGATGACAAGAGCTT
TCCCTGACTATATGACTCAAAAGAAGGATCTCCTGCTTCTTCAGAACATCGCTAGCTACA
TGCTCCTCGCTTGTGGTCTTGTCTATTTCATATCAGGGATTCTATGCATTGGTTTTCTGA
AACGTGCTCGACAGAAGAAGGAGATCTCAAAAGAACAAGCTGTCAAGGATCTTGAGGAGA
TAGACCGGCGCAGGGAAGAACTGGAACAGTTGCTTCTGGAGCATCGGAGTAGAGACGATG
TGTGAATGTGATCATCACATGTACAGTTGTCGCTTCATTGAACAGACGAGATCAGTTTGT
TTATGTCTTAAAGGATTGTGTGACCTCTCTGTTTTCATCCTTTCCACTTTGGATAGTAAC
AGCAGATTTTTTCTTTCTTTGTTTGAGTAAAACAAAACATATCATGTTCAGACATTATTA
ATCATTGTTTTGCTAAGCTATCAGTAATAAGTCAGCAACTTCC

QA 1 883 1 883
DS 



AS 1 2

CO CL7900Contig1 683 2 10 U
GGATCTTCTCTCTCTCGATCTACACAATGGACTCTCTCGTTGCTCAGCTACAGATGCAAT
ACCGTAACTATGTTCTTTCTCTCTACCAACAGGGCTTTCTGGATGATCAGTTTACCGAGT
TAAAAAGTCTACAAGATGATGGAAGTCCTGATTTTGTGTCTGAGGTTCTCTCTCTCTTCT
TTGACAATTGTGTCAAGCTTGTCGGTAACATGGCTAGAGCTTTGGACCAGACAGGAACTG
TAGATTTTAGTCAGGTTGGTGCTAGTGTGCATCAGTTGAAGGGTAGTAGCTCAAGTGTTG
GTGCCATGAGGGTCAAAGGCTTGTGTATTAACTTCAAGGAACTTTGTGAGGCTAAGGACT
ACGAAGGCTGTGTGAGATGTCTGCAGCAAGTGGATATCGAGTACAAGACGTTAAAGGCAA
AGCTTCAAGATATGTTCAATCTTGAGAAACAAATCGTTCAAGCTGGTGGTATCGTTCCTC
AAGTGGATATAAAATAAAAAGACTTGTTATGCTCTCTGGTGGATGAAGAGAAGAACAAGA
TGATAATGGCTCAAATTTGCATTCTTCAGTTTTTTTTTGTTTATTTAGAAGAAACTCACA
AAAGAATGTTTGGGAGGAAAAGAGAGAAGTGGTGATTCTTGTTGATAAAGCTACTTTTTC
ATTTGTCAATCAAAAGATCTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GW28JQ C 1
AF RR2GW28TF U 1
BS 1 554 RR2GW28TF
BS 555 555 RR2GW28JQ
BS 556 593 RR2GW28TF
BS 594 594 RR2GW28JQ
BS 595 616 RR2GW28TF
BS 617 618 RR2GW28JQ
BS 619 658 RR2GW28TF
BS 659 659 RR2GW28JQ
BS 660 668 RR2GW28TF
BS 669 683 RR2GW28JQ

RD RR2GW28JQ 683 0 0
GGATCTTCTCTCTCTCGATCTACACAATGGACTCTCTCGTTGCTCAGCTACAGATGCAAT
ACCGTAACTATGTTCTTTCTCTCTACCAACAGGGCTTTCTGGATGATCAGTTTACCGAGT
TAAAAAGTCTACAAGATGATGGAAGTCCTGATTTTGTGTCTGAGGTTCTCTCTCTCTTCT
TTGACAATTGTGTCAAGCTTGTCGGTAACATGGCTAGAGCTTTGGACCAGACAGGAACTG
TAGATTTTAGTCAGGTTGGTGCTAGTGTGCATCAGTTGAAGGGTAGTAGCTCAAGTGTTG
GTGCCATGAGGGTCAAAGGCTTGTGTATTAACTTCAAGGAACTTTGTGAGGCTAAGGACT
ACGAAGGCTGTGTGAGATGTCTGCAGCAAGTGGATATCGAGTACAAGACGTTAAAGGCAA
AGCTTCAAGATATGTTCAATCTTGAGAAACAAATCGTTCAAGCTGGTGGTATCGTTCCTC
AAGTGGATATAAAATAAAAAGACTTGTTATGCTCTCTGGTGGATGAAGAGAAGAACAAGA
TGATAATGGCTCAAATTTGCATTCTTCAGTTTTTTTTTGTTTATTTAGAAGAAACTCACA
AAAGAATGTTTGGGAGGAAAAGAGAGAAGTGGTGATTCTTGTTGATAAAGCTACTTTTTC
ATTTGTCAATCAAAAGATCTTTT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RR2GW28TF 671 0 0
GGATCTTCTCTCTCTCGATCTACACAATGGACTCTCTCGTTGCTCAGCTACAGATGCAAT
ACCGTAACTATGTTCTTTCTCTCTACCAACAGGGCTTTCTGGATGATCAGTTTACCGAGT
TAAAAAGTCTACAAGATGATGGAAGTCCTGATTTTGTGTCTGAGGTTCTCTCTCTCTTCT
TTGACAATTGTGTCAAGCTTGTCGGTAACATGGCTAGAGCTTTGGACCAGACAGGAACTG
TAGATTTTAGTCAGGTTGGTGCTAGTGTGCATCAGTTGAAGGGTAGTAGCTCAAGTGTTG
GTGCCATGAGGGTCAAAGGCTTGTGTATTAACTTCAAGGAACTTTGTGAGGCTAAGGACT
ACGAAGGCTGTGTGAGATGTCTGCAGCAAGTGGATATCGAGTACAAGACGTTAAAGGCAA
AGCTTCAAGATATGTTCAATCTTGAGAAACAAATCGTTCAAGCTGGTGGTATCGTTCCTC
AAGTGGATATAAAATAAAAAGACTTGTTATGCTCTCTGGTGGATGAAGAGAAGAACAAGA
TGATAATGGCTCAA*TTTGCATTCTTCAGTTTTTTTTTGTTTATTTAGAAGAA*CTCACA
AAAGAATGTTTGGGAG**AAAGAGAGAAGTGGTGATTCTTGTTGATAAAGCTACTTTT*C
ATTTGTCA
TCA

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL7901Contig1 1210 2 2 U
GGTCATTCCACCGGTGTGATGGAGAAAGGCGAAGCGAAGAGCAAGAAAGCTGGAGGGCCT
CCTCTTCGTCTCTGCTGCATCTGTAACGAGAGACGACCCGTCCTCAAAAGACCCAAAACC
CTTCAACAGATATGCAGAGAGTGCTTTTATGAGGTGTTCGAGGAGGAGATTCACCAAGCC
ATCGTCGAGAACCGGTTGTTCAAATCCGGAGAGCGTGTTGCTATTGGTGCCTCCGGTGGA
AAAGATTCAACGGTGCTGGCTTATGTATTATCAGAGCTAAACAGACGTCATAGTTACGGT
CTGGACCTTTTTCTTCTCTCCATTGATGAAGGCATTACTGGTTACCGTGATGATTCTCTC
GAGACCGTTAAAAGAAACGAACTCCAATATGGGTTGCCTCTACAGATTCTTTCATACAAA
GATCTGTATGGATGGACAATGGACGATATTGTGAAGATGATTGGTCTGAAGAATAACTGC
ACGTTTTGTGGTGTATTCCGTCGCCAGGCGCTTGATCGAGGAGCTGCGTTGTTGAAAGTA
GATAAGCTGGTCACTGGACATAACGCAGACGATATAGCTGAGACAGTTCTCCTAAACATA
CTCCGAGGGGATATCGCTAGGTTGAGTCGGTGCACATCGATCACTACAGGTGAAGATGGT
CCAATTCCAAGATGTAAACCTTTCAAATATACATACGAGAAGGAGATTGTTATGTATGCT
TATTTCAAGAAGCTGGACTACTTCTCAACCGAATGCATATACTCTCCTAATGCTTATCGT
GGGTTTGCCCGTGAGTTCATCAAAGACTTGGAAAGACTGAGGCCAAGAGCTATTCTGGAT
ATCATCAAATCCGGTGAAGACTTTAGAATTGCGACAACCACAAAAATGCCTGAGCAAGGG
ACGTGTGAGCGATGCGGTTACATTTCTAGCCAGAAATGGTGCAAAGCTTGTGTGTTGTTG
GATGGATTGAACCGTGGTTTGCCTAAGATGGGCATCGGAAGAGCCCGAGGAGGTGTCAAT
GGTGGTGGTGATCATAAGAAGGAAACAAAGGCTGGATCTACTGTGAAATCTCTAGAGAGC
AAGCAATGTGGATCTCTAGATTTCTAAATCAATAGAGAAATGGTCTAAAAAATGTAGAAA
TTTGTTCTGTATAAAAGAAACTGTTTAAACACATCATTGTTGTAGGAAGAAATGCCTCTT
ATGGTTTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DL95TF U 1
AF RR2DL95JQ C 532
BS 1 697 RR2DL95TF
BS 698 1210 RR2DL95JQ

RD RR2DL95TF 697 0 0
GGTCATTCCACCGGTGTGATGGAGAAAGGCGAAGCGAAGAGCAAGAAAGCTGGAGGGCCT
CCTCTTCGTCTCTGCTGCATCTGTAACGAGAGACGACCCGTCCTCAAAAGACCCAAAACC
CTTCAACAGATATGCAGAGAGTGCTTTTATGAGGTGTTCGAGGAGGAGATTCACCAAGCC
ATCGTCGAGAACCGGTTGTTCAAATCCGGAGAGCGTGTTGCTATTGGTGCCTCCGGTGGA
AAAGATTCAACGGTGCTGGCTTATGTATTATCAGAGCTAAACAGACGTCATAGTTACGGT
CTGGACCTTTTTCTTCTCTCCATTGATGAAGGCATTACTGGTTACCGTGATGATTCTCTC
GAGACCGTTAAAAGAAACGAACTCCAATATGGGTTGCCTCTACAGATTCTTTCATACAAA
GATCTGTATGGATGGACAATGGACGATATTGTGAAGATGATTGGTCTGAAGAATAACTGC
ACGTTTTGTGGTGTATTCCGTCGCCAGGCGCTTGATCGAGGAGCTGCGTTGTTGAAAGTA
GATAAGCTGGTCACTGGACATAACGCAGACGATATAGCTGAGACAGTTCTCCTAAACATA
CTCCGAGGGGATATCGCTAGGTTGAGTCGGTGCACATCGATCACTACAGGTGAAGATGGT
CCAATTCCAAGATGTAAACCTTTCAAATATACATACG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RR2DL95JQ 679 0 0
TTGAAAGTAGATAAGCTGGTCACTGGACATAACGCAGACGATATAGCTGAGACAGTTCTC
CTAAACATACTCCGAGGGGATATCGCTAGGTTGAGTCGGTGCACATCGATCACTACAGGT
GAAGATGGTCCAATTCCAAGATGTAAACCTTTCAAATATACATACGAGAAGGAGATTGTT
ATGTATGCTTATTTCAAGAAGCTGGACTACTTCTCAACCGAATGCATATACTCTCCTAAT
GCTTATCGTGGGTTTGCCCGTGAGTTCATCAAAGACTTGGAAAGACTGAGGCCAAGAGCT
ATTCTGGATATCATCAAATCCGGTGAAGACTTTAGAATTGCGACAACCACAAAAATGCCT
GAGCAAGGGACGTGTGAGCGATGCGGTTACATTTCTAGCCAGAAATGGTGCAAAGCTTGT
GTGTTGTTGGATGGATTGAACCGTGGTTTGCCTAAGATGGGCATCGGAAGAGCCCGAGGA
GGTGTCAATGGTGGTGGTGATCATAAGAAGGAAACAAAGGCTGGATCTACTGTGAAATCT
CTAGAGAGCAAGCAATGTGGATCTCTAGATTTCTAAATCAATAGAGAAATGGTCTAAAAA
ATGTAGAAATTTGTTCTGTATAAAAGAAACTGTTTAAACACATCATTGTTGTAGGAAGAA
ATGCCTCTTATGGTTTTAG

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL7902Contig1 560 2 1 U
GGATAACAGAAATCATACAAAGAGAAAACTCATAGAAACCGTGAGGGCGAAAAGAGAGAC
AAACCCCCACGACAAAGGTTTTAGTATACGGTATTGATTTTGTCATAAATTATCATCCTC
AAATGGCCAACAAAGCTACCTTCCATCTCATGATCTTCTGCTTCACTCTATCTCAATTAT
TTTTCTTCTTCCCTACCAATGCTTCGAGATTTGGGAGTTTGACGGAGAGGCCCGATCAAT
TTTTCCTACCTCAACAAGATACAATACTGGACGTGAAGAAGGACGTAGAGGAAAGGGTGA
CGATGGAGTTAAACGATTATCCAGGCTCGGGTGCCAACAACCGGCACTCGCCACGTGGAA
GAGGATGCATCGATTGCTGATAAAATTAGAAAAGAAGAATAACGCGATTCACTTATTATA
ATCGATAAGTTTATGTAACTTGTGTCTAATTTAGTGTTTACTTGACTATTAATTGACTTG
TTAACATCGAGGTACATAGACTACTATACTTTACATTTAGTTTTCGTGGAAGAAAACATA
GACTACTATGTTTATTCCGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D836JQ C 1
AF RR2D836TF U 1
BS 1 560 RR2D836TF

RD RR2D836JQ 560 0 0
GGATAACAGAAATCATACAAAGAGAAAACTCATAGAAACCGTGAGGGCGAAAAGAGAGAC
AAACCCCCACGACAAAGGTTTTAGTATACGGTATTGATTTTGTCATAAATTATCATCCTC
AAATGGCCAACAAAGCTACCTTCCATCTCATGATCTTCTGCTTCACTCTATCTCAATTAT
TTTTCTTCTTCCCTACCAATGCTTCGAGATTTGGGAGTTTGACGGAGAGGCCCGATCAAT
TTTTCCTACCTCAACAAGATACAATACTGGACGTGAAGAAGGACGTAGAGGAAAGGGTGA
CGATGGAGTTAAACGATTATCCAGGCTCGGGTGCCAACAACCGGCACTCGCCACGTGGAA
GAGGATGCATCGATTGCTGATAAAATTAGAAAAGAAGAATAACGCGATTCACTTATTATA
ATCGATAAGTTTATGTAACTTGTGTCTAATTTAGTGTTTACTTGACTATTAATTGACTTG
TTAACATCGAGGTACATAGACTACTATACTTTACATTTAGTTTTCGTGGAAGAAAACATA
GACTACTATGTTTATTCCGG

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2D836TF 560 0 0
GGATAACAGAAATCATACAAAGAGAAAACTCATAGAAACCGTGAGGGCGAAAAGAGAGAC
AAACCCCCACGACAAAGGTTTTAGTATACGGTATTGATTTTGTCATAAATTATCATCCTC
AAATGGCCAACAAAGCTACCTTCCATCTCATGATCTTCTGCTTCACTCTATCTCAATTAT
TTTTCTTCTTCCCTACCAATGCTTCGAGATTTGGGAGTTTGACGGAGAGGCCCGATCAAT
TTTTCCTACCTCAACAAGATACAATACTGGACGTGAAGAAGGACGTAGAGGAAAGGGTGA
CGATGGAGTTAAACGATTATCCAGGCTCGGGTGCCAACAACCGGCACTCGCCACGTGGAA
GAGGATGCATCGATTGCTGATAAAATTAGAAAAGAAGAATAACGCGATTCACTTATTATA
ATCGATAAGTTTATGTAACTTGTGTCTAATTTAGTGTTTACTTGACTATTAATTGACTTG
TTAACATCGAGGTACATAGACTACTATACTTTACATTTAGTTTTCGTGGAAGAAAACATA
GACTACTATGTTTATTCCGG

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

CO CL7903Contig1 634 2 3 U
GGGTCGAGGAGCAGAGTAACCCTAGCAGCAAGCAGACATACACAGCTTCTCAGCTCACGA
GAAAGAAGAAGATGACTTTCAAGCGTAGGAACGGAGGGAGGAACAAGCACAACCGTTGCC
ACGTGAACCCAATCAGATGCTCCAACTGCGGCAAATGCTGCCCAAAGGACAAGGCCATCA
AAAGGTTCATCGTGAGGAACATTGTGGAGCAGGCTGCCATCAGAGATGTTCAGGAAGCTA
GCGTCTACGATGGGTACACATTTCCTAAGCTGTATGCTAAGACGCAATACTGTGTCTCAT
GTGCGATCCACTCTCACGTTGTTAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGCAGAGTTCGTACTC
CCCCACCTCGTTTTGTTAGACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGACAACCTGGTCAGG
CTCCTCGTCCTGCTGGAGCTGGAGCTGCACCTCGTGCCTGAAGCCTCTTCTTATCCTATT
TTCATCCTTTAATTTTGTTTTGTTTTAAGTTTGGTTCAAATTATTCATACTAGTACCATG
TGAATCTCGAAAGGTGTTTAGTAGTTCTTGTTTCGACATTGTTATATTTTGAAACTCTTT
GTTTGTTTTTCTCCCAGAGACAGAATTTTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV85TF U 32
AF RR2CV85JQ C 1
BS 1 31 RR2CV85JQ
BS 32 591 RR2CV85TF
BS 592 634 RR2CV85JQ

RD RR2CV85TF 560 0 0
GCAGACATACACAGCTTCTCAGCTCACGAGAAAGAAGAAGATGACTTTCAAGCGTAGGAA
CGGAGGGAGGAACAAGCACAACCGTTGCCACGTGAACCCAATCAGATGCTCCAACTGCGG
CAAATGCTGCCCAAAGGACAAGGCCATCAAAAGGTTCATCGTGAGGAACATTGTGGAGCA
GGCTGCCATCAGAGATGTTCAGGAAGCTAGCGTCTACGATGGGTACACATTTCCTAAGCT
GTATGCTAAGACGCAATACTGTGTCTCATGTGCGATCCACTCTCACGTTGTTAGAGTCCG
TTCCCGCACCAACCGCAGAGTTCGTACTCCCCCACCTCGTTTTGTTAGACGCAAGGAGGA
TGCTCCCAAGCCTGGACAACCTGGTCAGGCTCCTCGTCCTGCTGGAGCTGGAGCTGCACC
TCGTGCCTGAAGCCTCTTCTTATCCTATTTTCATCCTTTAATTTTGTTTTGTTTTAAGTT
TGGTTCAAATTATTCATACTAGTACCATGTGAATCTCGAAAGGTGTTTAGTAGTTCTTGT
TTCGACATTGTTATATTTTG

QA 1 560 1 560
DS 

RD RR2CV85JQ 634 0 0
GGGTCGAGGAGCAGAGTAACCCTAGCAGCAAGCAGACATACACAGCTTCTCAGCTCACGA
GAAAGAAGAAGATGACTTTCAAGCGTAGGAACGGAGGGAGGAACAAGCACAACCGTTGCC
ACGTGAACCCAATCAGATGCTCCAACTGCGGCAAATGCTGCCCAAAGGACAAGGCCATCA
AAAGGTTCATCGTGAGGAACATTGTGGAGCAGGCTGCCATCAGAGATGTTCAGGAAGCTA
GCGTCTACGATGGGTACACATTTCCTAAGCTGTATGCTAAGACGCAATACTGTGTCTCAT
GTGCGATCCACTCTCACGTTGTTAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGCAGAGTTCGTACTC
CCCCACCTCGTTTTGTTAGACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGACAACCTGGTCAGG
CTCCTCGTCCTGCTGGAGCTGGAGCTGCACCTCGTGCCTGAAGCCTCTTCTTATCCTATT
TTCATCCTTTAATTTTGTTTTGTTTTAAGTTTGGTTCAAATTATTCATACTAGTACCATG
TGAATCTCGAAAGGTGTTTAGTAGTTCTTGTTTCGACATTGTTATATTTTGAAACTCTTT
GTTTGTTTTTCTCCCAGAGACAGAATTTTCTTTT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL7904Contig1 907 2 4 U
GGGCTCTCATCAGTTTTGGTAGGCTAAACTTTCGAATACAAAATGGGTATATTCCCTAGA
TTTGGTAGCTGGATCAGTAATAACAGTCAACAGCCTCTTAAGGTCAGCTTATATCATCAA
TCAGAGGACCTGAGGAAGTCAAATAGATATATAAGCACATTTTTATTCTGTTTGTTGATC
TAGGGCGAGGCCAAGAGATCTGTGGCTTATGACTTCTTTTCGCTGACGTATATACCTATC
CCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAACAGAAAAGATCTTACGGGAAAATATAAGAAAGAG
AAAGTAATGTTGATGAAAGTGTTCGAGGGAAACTATAAAGTGGAGCCTGTATATGTAGAT
CAGGAACGTTTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAGAGTCCAGAAGAATAAAAAAGAATATTA
TGATGAAAAAGAGAAGATGAGACAAGATATCCTTTGGCATGATGAAGAGAAGAAGCATCC
TTGGCATAATCCCCCTCCCAAGGTCAGGGTGACAACTAATAAGAAGGGTGTTTACCATAT
GAACTTAGAAATGACGTTGGGGGCACCGCCTGAACTAATCCACTTATGGTTGACTCATCC
ACACGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAATTGGCGCAACCTTATGATAACCAAAACCTC
CAAAAATCTGCTCAATGCGCTTCAGAACACGGCTAAGAGTGTACGAATGGCTGGGCCGCT
GAAAGAACCACCAAAACCGTAGATTAAGACATTTAATCAAATGAGACTCTATTTAGTTTT
ATATTTTATTAATGTTTATTATAAATAATTGATGAAGTTTCTATAGTTAAAATAATATCT
ATTAGTCATTTTCAGTTATAATACTTTCACGACATTATGTTTGAATTTGAAAATTTCTTT
AAATAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CV02TF U 1
AF RR2CV02JQ C 183
BS 1 723 RR2CV02TF
BS 724 726 RR2CV02JQ
BS 727 751 RR2CV02TF
BS 752 907 RR2CV02JQ

RD RR2CV02TF 751 0 0
GGGCTCTCATCAGTTTTGGTAGGCTAAACTTTCGAATACAAAATGGGTATATTCCCTAGA
TTTGGTAGCTGGATCAGTAATAACAGTCAACAGCCTCTTAAGGTCAGCTTATATCATCAA
TCAGAGGACCTGAGGAAGTCAAATAGATATATAAGCACATTTTTATTCTGTTTGTTGATC
TAGGGCGAGGCCAAGAGATCTGTGGCTTATGACTTCTTTTCGCTGACGTATATACCTATC
CCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAACAGAAAAGATCTTACGGGAAAATATAAGAAAGAG
AAAGTAATGTTGATGAAAGTGTTCGAGGGAAACTATAAAGTGGAGCCTGTATATGTAGAT
CAGGAACGTTTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAGAGTCCAGAAGAATAAAAAAGAATATTA
TGATGAAAAAGAGAAGATGAGACAAGATATCCTTTGGCATGATGAAGAGAAGAAGCATCC
TTGGCATAATCCCCCTCCCAAGGTCAGGGTGACAACTAATAAGAAGGGTGTTTACCATAT
GAACTTAGAAATGACGTTGGGGGCACCGCCTGAACTAATCCACTTATGGTTGACTCATCC
ACACGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAATTGGCGCAACCTTATGATAACCAAAACCTC
CAAAAATCTGCTCAATGCGCTTCAGAACACGGCTAAGAGTGTACGAATGGCTGGGCCGCT
GAA**GACCACCAAAACCGTAGATTAAGACA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RR2CV02JQ 725 0 0
GGGCGAGGCCAAGAGATCTGTGGCTTATGACTTCTTTTCGCTGACGTATATACCTATCCC
GTTACATCTAATTGTGGAAGAAAACAGAAAAGATCTTACGGGAAAATATAAGAAAGAGAA
AGTAATGTTGATGAAAGTGTTCGAGGGAAACTATAAAGTGGAGCCTGTATATGTAGATCA
GGAACGTTTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAGAGTCCAGAAGAATAAAAAAGAATATTATG
ATGAAAAAGAGAAGATGAGACAAGATATCCTTTGGCATGATGAAGAGAAGAAGCATCCTT
GGCATAATCCCCCTCCCAAGGTCAGGGTGACAACTAATAAGAAGGGTGTTTACCATATGA
ACTTAGAAATGACGTTGGGGGCACCGCCTGAACTAATCCACTTATGGTTGACTCATCCAC
ACGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAATTGGCGCAACCTTATGATAACCAAAACCTCCA
AAAATCTGCTCAATGCGCTTCAGAACACGGCTAAGAGTGTACGAATGGCTGGGCCGCTGA
AAGAACCACCAAAACCGTAGATTAAGACATTTAATCAAATGAGACTCTATTTAGTTTTAT
ATTTTATTAATGTTTATTATAAATAATTGATGAAGTTTCTATAGTTAAAATAATATCTAT
TAGTCATTTTCAGTTATAATACTTTCACGACATTATGTTTGAATTTGAAAATTTCTTTAA
ATAAT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL7905Contig1 814 2 12 U
GCTAGGGGGGTGTACTTCCACATAGCAATACATATCTAATTTAGAAGTAGTTCTCAACAT
ATCAATTATAAAGAACATTAATGACAACAACCACACAACCACAGATTCCTTCCAATACAC
AAGATCACCCGACATGTTACACACATAATTTACATAAAACGGGCAAAAGTACATAAAATC
TCACTGCGGGCCCTTGTCCCGTGGAGCTTCAGAATGCATAGCATTGTAGTCTTTGGTGTA
AACCCGGTGCCTCCTCTCCCGCGCGTATATAACCCAAAACACCAAAGACAGCATTACAGC
AGTGGACACCAGAACAAGACCCACATAGATCCACTGCGTGTATCTCCTCAGTCCAGGGCA
ATGATCCCTCTCTATATCAGTGAATGTGGACCTCACAAAGTTGCACCCACGCAGATCTGC
CAAGAATGGACCATACTTGTTCAGACCATAGCTTACATTAACTGCCGCAGCCATCTGGGT
GTAAAGCTTTGGGGTCACACGTCCGGGTGTGCTACATGTTCCTGGTGTTATATATTCACA
AGTGTAGTTCTTCCACACCTCTGTTGCATTGTTCAAATGGACCTCACCGGGCTTGCACTG
GTGGTCAGAGAGATCAGCATTGAAGGGGTTACAGAGCAAAGGCATTAGGGGGCCCGACTG
GTTGTAATAAAAGGGTCGGGCTTGAGGCGGGAAGTTCTTGTTGGCCATGGTGTTGATGAT
ATTGTCAACAATTTCAACCAACTTGTATGTCACATCCTTTGTCTGACTCAATGTTTCGCT
AGCGGTTGCGTTATCAACGCATGGTAGAATATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CI89JQ U 1
AF RR2A579JQ U 25
BS 1 42 RR2CI89JQ
BS 43 43 RR2A579JQ
BS 44 60 RR2CI89JQ
BS 61 62 RR2A579JQ
BS 63 360 RR2CI89JQ
BS 361 361 RR2A579JQ
BS 362 456 RR2CI89JQ
BS 457 457 RR2A579JQ
BS 458 585 RR2CI89JQ
BS 586 586 RR2A579JQ
BS 587 613 RR2CI89JQ
BS 614 814 RR2A579JQ

RD RR2CI89JQ 613 0 0
GCTAGGGGGGTGTACTTCCACATAGCAATACATATCTAATTTCGAAGTAGTTCTCAACAT
**CAATTATAAAGAACATTAATGACAACAACCACACAACCACAGATTCCTTCCAATACAC
AAGATCACCCGACATGTTACACACATAATTTACATAAAACGGGCAAAAGTACATAAAATC
TCACTGCGGGCCCTTGTCCCGTGGAGCTTCAGAATGCATAGCATTGTAGTCTTTGGTGTA
AACCCGGTGCCTCCTCTCCCGCGCGTATATAACCCAAAACACCAAAGACAGCATTACAGC
AGTGGACACCAGAACAAGACCCACATAGATCCACTGCGTGTATCTCCTCAGTCCAGGGCA
GTGATCCCTCTCTATATCAGTGAATGTGGACCTCACAAAGTTGCACCCACGCAGATCTGC
CAAGAATGGACCATACTTGTTCAGACCATAGCTTACGTTAACTGCCGCAGCCATCTGGGT
GTAAAGCTTTGGGGTCACACGTCCGGGTGTGCTACATGTTCCTGGTGTTATATATTCACA
AGTGTAGTTCTTCCACACCTCTGTTGCATTGTTCAAATGGACCTCGCCGGGCTTGCACTG
GTGGTCAGAGAGA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RR2A579JQ 790 0 0
GCAATACATATCTAATTTAGAAGTAGTTCTCAACATATCAATTATAAAGAACATTAATGA
CAACAACCACACAACCACAGATTCCTTCCAATACACAAGATCACCCGACATGTTACACAC
ATAATTTACATAAAACGGGCAAAAGTACATAAAATCTCACTGCGGGCCCTTGTCCCGTGG
AGCTTCAGAATGCATAGCATTGTAGTCTTTGGTGTAAACCCGGTGCCTCCTCTCCCGCGC
GTATATAACCCAAAACACCAAAGACAGCATTACAGCAGTGGACACCAGAACAAGACCCAC
ATAGATCCACTGCGTGTATCTCCTCAGTCCAGGGCAATGATCCCTCTCTATATCAGTGAA
TGTGGACCTCACAAAGTTGCACCCACGCAGATCTGCCAAGAATGGACCATACTTGTTCAG
ACCATAGCTTACATTAACTGCCGCAGCCATCTGGGTGTAAAGCTTTGGGGTCACACGTCC
GGGTGTGCTACATGTTCCTGGTGTTATATATTCGCAAGTGTAGTTCTTCCACACCTCTGT
TGCATTGTTCAAATGGACCTCACCGGGCTTGCACTGGTGGTCAGAGAGATCAGCATTGAA
GGGGTTACAGAGCAAAGGCATTAGGGGGCCCGACTGGTTGTAATAAAAGGGTCGGGCTTG
AGGCGGGAAGTTCTTGTTGGCCATGGTGTTGATGATATTGTCAACAATTTCAACCAACTT
GTATGTCACATCCTTTGTCTGACTCAATGTTTCGCTAGCGGTTGCGTTATCAACGCATGG
TAGAATATCG

QA 1 790 1 790
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7907Contig1 1103 2 4 U
GGACTGCTGCGAGCAGGAAGAACGAGTCCTCATCTACGAGTTCATGTCACGTGGTAGCTT
GGAAAACCATTTATTCAAACGGATTTCAATATCGCTGCCGTGGGCGACGAGGCTGAAAAT
CGCTGTCGCGGCTGCTAAGGGTTTGGCCTTTTTGCATGATTTAGAGAGTCCAATAATCTA
CCGTGATTTCAAGACTTCGAATATACTACTCGATTCGGATTTTACTGCGAAACTATCAGA
TTTTGGTTTGGCAACAATGGGACCAGAGGGATCCAAATCTCATGTCACAACTCGAGTCAT
GGGCACGTATGGTTATGCTGCCCCTGAATATGTTTCAACAGGGCATTTAACGACAAAGAG
CGACGTGTATAGTTACGGAGTCGTGTTGCTCGAGCTCCTAACGGGGAGAAGAGCCACCGA
AAAGTCACGGCCAAAAAACCAGCAGAACATCATCGATTGGGCAAAGCCTTACCTAACCAG
CAGCCGTCGTCTTCGATGCGTTATGGACCAGAGGCTCGCTGGTCAATACTCTGTCAAGGC
GGCTAAGGATACCGCTCTTCTCGCCTTACAGTGTGTGAGCCCTAACCCTAAGGATCGACC
TAAGATGCTTGCCGTTGTGAAGGTTCTAGAGAGTCTCATGCATCATAACGACATGGCCGT
TTCCTCCGGCCACTGGCCACCGTCTCCTAGGTCGCCTAAAGTTAGAGGAAATAGTGAGAA
CGGTAGAAAATCAGCCCCGGTTCACTAAGGTCTTGAATATAGGATTGAAGAAATTCAATA
ATGATTGTGTCTTTTGTGTGTATATGTGGCTACAAAATATCTAAGTGTGTAACATAATGA
AAATATTATGAGCAAGGTCTTTTTTAAGGACCATGTTTGAGTCCTTCCACTTGGTTGGAA
TTATTGTTAACCATTGTCCAAAACATTGTGTGAACTCATTATTCTACCTCATATCTGGCA
TCCAGTTAGTCTAAGCGCATACGTGATGCTATTATGTTCATGGATTCAATCTACGGTAGG
AAGAGTGACTTACGCCAAAAACGGTGTTAACAAATAACAAAGACTGGCTTCAGGTCTAAA
TAGAGACAAAGTTCAAGACCCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DM36TF U 1
AF RR2DM36JQ C 461
BS 1 690 RR2DM36TF
BS 691 691 RR2DM36JQ
BS 692 741 RR2DM36TF
BS 742 1103 RR2DM36JQ

RD RR2DM36TF 741 0 0
GGACTGCTGCGAGCAGGAAGAACGAGTCCTCATCTACGAGTTCATGTCACGTGGTAGCTT
GGAAAACCATTTATTCAAACGGATTTCAATATCGCTGCCGTGGGCGACGAGGCTGAAAAT
CGCTGTCGCGGCTGCTAAGGGTTTGGCCTTTTTGCATGATTTAGAGAGTCCAATAATCTA
CCGTGATTTCAAGACTTCGAATATACTACTCGATTCGGATTTTACTGCGAAACTATCAGA
TTTTGGTTTGGCAACAATGGGACCAGAGGGATCCAAATCTCATGTCACAACTCGAGTCAT
GGGCACGTATGGTTATGCTGCCCCTGAATATGTTTCAACAGGGCATTTAACGACAAAGAG
CGACGTGTATAGTTACGGAGTCGTGTTGCTCGAGCTCCTAACGGGGAGAAGAGCCACCGA
AAAGTCACGGCCAAAAAACCAGCAGAACATCATCGATTGGGCAAAGCCTTACCTAACCAG
CAGCCGTCGTCTTCGATGCGTTATGGACCAGAGGCTCGCTGGTCAATACTCTGTCAAGGC
GGCTAAGGATACCGCTCTTCTCGCCTTACAGTGTGTGAGCCCTAACCCTAAGGATCGACC
TAAGATGCTTGCCGTTGTGAAGGTTCTAGAGAGTCTCATGCATCATAACGACATGGCCGT
TTCCTCCGGCCACTGGCCACCGTCTCCTAG*TCGCCTAAAGTTAGAGGAAATAGTGAGAA
CGGTAGAAAATCAGCCCCGGT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RR2DM36JQ 643 0 0
GCAAAGCCTTACCTAACCAGCAGCCGTCGTCTTCGATGCGTTATGGACCAGAGGCTCGCT
GGTCAATACTCTGTCAAGGCGGCTAAGGATACCGCTCTTCTCGCCTTACAGTGTGTGAGC
CCTAACCCTAAGGATCGACCTAAGATGCTTGCCGTTGTGAAGGTTCTAGAGAGTCTCATG
CATCATAAGGACATGGCCGTTTCCTCCGGCCACTGGCCACCGTCTCCTAGGTCGCCTAAG
GTTAGAGGAAATAGTGAGAACGGTAGAAAATCAGCCCCGGTTCACTAAGGTCTTGAATAT
AGGATTGAAGAAATTCAATAATGATTGTGTCTTTTGTGTGTATATGTGGCTACAAAATAT
CTAAGTGTGTAACATAATGAAAATATTATGAGCAAGGTCTTTTTTAAGGACCATGTTTGA
GTCCTTCCACTTGGTTGGAATTATTGTTAACCATTGTCCAAAACATTGTGTGAACTCATT
ATTCTACCTCATATCTGGCATCCAGTTAGTCTAAGCGCATACGTGATGCTATTATGTTCA
TGGATTCAATCTACGGTAGGAAGAGTGACTTACGCCAAAAACGGTGTTAACAAATAACAA
AGACTGGCTTCAGGTCTAAATAGAGACAAAGTTCAAGACCCGA

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL7908Contig1 822 2 16 U
GTACCTCAAGGGCGTCGTGACGGAGATCATCCACGATCCCGGCCGTGGTGCGCCGCTAGC
TCGCGTCGCGTTCCGTCATCCTTTCCGTTACAAGAAGCAGAAGGAGCTCTTCGTCGCCGC
CGAAGGTATGTACACAGGACAGTTCTTGTACTGCGGTAAGAAAGCCACTCTCGTTGTCGG
AAATGTTCTCCCCCTTAGGGCTATTCCTGAAGGAGCTGTTGTCTGCAACGTCGAGCATCA
TGTCGGTGATCGTGGTGTGCTCGCTAGAGCTTCTGGTGATTACGCTATCGTTATTTCACA
CAACCCTGACAACGACACTACTAGGGTCAAGTTGCCATCTGGTTCGAAGAAGATTGTTCC
GAGTGGATGCAGGGCCATGATTGGTCAAGTTGCAGGTGGTGGAAGGACCGAGAAGCCGAT
GCTCAAGGCAGGAAACGCGTACCACAAGTACCGCGTGAAGAGGAACTCATGGCCTAAGGT
TCGTGGTGTGGCTATGAATCCAGTTGAGCATCCCCATGGAGGAGGTAACCATCAGCACAT
TGGTCACGCCAGTACTGTTAGACGTGATGCACCTCCGGGACAGAAGGTTGGTCTTATTGC
TGCTAGGAGAACTGGTCGTCTCAGAGGTCAAGCTGCTGCTTCTGCTGCCAAGGCCGACTA
GGTTTCATAAAATATTTTTGTTTGCGTTTCGCTGTGTTTCCTTTTGGACCTTGTGTTCTG
AAATCTCAAAAATATTTTGTTATAATCTTGTCCTTCTCTGTCGAATTTATTATTATGTCT
CTGCAATTTTCATTTCGCAAGTGTTGATTATATTTGTGCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CG47TF U 1
AF RR2FI40TF U 226
BS 1 375 RR2CG47TF
BS 376 376 RR2FI40TF
BS 377 408 RR2CG47TF
BS 409 409 RR2FI40TF
BS 410 453 RR2CG47TF
BS 454 454 RR2FI40TF
BS 455 576 RR2CG47TF
BS 577 577 RR2FI40TF
BS 578 652 RR2CG47TF
BS 653 653 RR2FI40TF
BS 654 661 RR2CG47TF
BS 662 662 RR2FI40TF
BS 663 704 RR2CG47TF
BS 705 705 RR2FI40TF
BS 706 731 RR2CG47TF
BS 732 822 RR2FI40TF

RD RR2CG47TF 731 0 0
GTACCTCAAGGGCGTCGTGACGGAGATCATCCACGATCCCGGCCGTGGTGCGCCGCTAGC
TCGCGTCGCGTTCCGTCATCCTTTCCGTTACAAGAAGCAGAAGGAGCTCTTCGTCGCCGC
CGAAGGTATGTACACAGGACAGTTCTTGTACTGCGGTAAGAAAGCCACTCTCGTTGTCGG
AAATGTTCTCCCCCTTAGGGCTATTCCTGAAGGAGCTGTTGTCTGCAACGTCGAGCATCA
TGTCGGTGATCGTGGTGTGCTCGCTAGAGCTTCTGGTGATTACGCTATCGTTATTTCACA
CAACCCTGACAACGACACTACTAGGGTCAAGTTGCCATCTGGTTCGAAGAAGATTGTTCC
GAGTGGATGCAGGGCTATGATTGGTCAAGTTGCAGGTGGTGGAAGGACTGAGAAGCCGAT
GCTCAAGGCAGGAAACGCGTACCACAAGTACCGTGTGAAGAGGAACTCATGGCCTAAGGT
TCGTGGTGTGGCTATGAATCCAGTTGAGCATCCCCATGGAGGAGGTAACCATCAGCACAT
TGGTCACGCCAGTACTGTTAGACGTGATGCACCTCCTGGACAGAAGGTTGGTCTTATTGC
TGCTAGGAGAACTGGTCGTCTCAGAGGTCAAGCTGCTGCTTCTGCTGCCAAG*CCGACTA
G*TTTCATAAAATATTTTTGTTTGCGTTTCGCTGTGTTTCCTTT*GGACCTTGTGTTCTG
AAATCTCAAAA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RR2FI40TF 597 0 0
G
AACGTCGAGCATCATGTCGGTGATCGTGGTGTGCTCGCTAGAGCTTCTGGTGATTACGCT
ATCGTTATTTCACACAACCCTGACAACGACACTACTAGGGTCAAGTTGCCATCTGGTTCG
AAGAAGATTGTTCCGAGTGGATGCAGGGCCATGATTGGTCAAGTTGCAGGTGGTGGAAGG
ACCGAGAAGCCGATGCTCAAGGCAGGAAACGCGTACCACAAGTACCGCGTGAAGAGGAAC
TCATGGCCTAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAATCCAGTTGAGCATCCCCATGGAGGAGGT
AACCATCAGCACATTGGTCACGCCAGTACTGTTAGACGTGATGCACCTCCGGGACAGAAG
GTTGGTCTTATTGCTGCTAGGAGAACTGGTCGTCTCAGAGGTCAAGCTGCTGCTTCTGCT
GCCAAGGCCGACTAGGTTTCATAAAATATTTTTGTTTGCGTTTCGCTGTGTTTCCTTTTG
GACCTTGTGTTCTGAAATCTCAAAAATATTTTGTTATAATCTTGTCCTTCTCTGTCGAAT
TTATTATTATGTCTCTGCAATTTTCATTTCGCAAGTGTTGATTATATTTGTGCATT

QA 2 597 2 597
DS 



AS 1 2

CO CL7909Contig1 1355 2 2 U
GTCAAGATTTCAGATGAAGGTAAAGGAAGCAATGAGAATTGGGATTCTTTTCAGAATATT
CTGATGAGGAACGAGGATGGCTCAGATGTTCATTCGATGGGGGAGCATTTCACACAGAGA
GGCTCTAAAGGTTTGCTAGAGAATAACAATGCCTCTGGTGGTGATTCCATCGTTTTAACT
CAGAAAAACGTAAAAACGGAGGAAGCGGAGCGAGCTTTGATCATTTTGGAAGTGAGGAGA
ATGCTCGTAGGGTATCAAAAACACGAGATTCAACAGAAGAATGTATGTTATTGCTAAAAA
GATCAGAAATGGTAGGAGGTGATGAGAGCAAAGACTTGTATAATGATGCTAAGGGGTGAC
TCATTAGTGAACAAGTCAGGGAGTGGAGAGGATTGGTTCACTGCTTCTGATCACCGTGGA
GTGAAAAAAACAGAAAGCAGTTACGGGAGTATGTCGTTTGATGAAAGTCTCATGATGACA
TCTGGAGGCGGTTCAGATCAGAGCAAGAAACAGGAGTTCGTTGATGATTCCTTCATGGTC
CATTCATCGAGGCTTACTGGTGATGATGTTTACGACTCTCGGTGGAGACTGGACATGTCT
GCTGATATCGACGTCGATAACGGTCAGGCGAATGAGAAGCGTGAGATGTCTGGCTCATGG
GAACCAAGTGATCTCTGTATGATTCCTGAACGCGACTCGGGAGAGTTTTTGGATAATGAT
CACTCCATTGACTTCTCTGTCGAGGCGAACGCAAGGCTAACGAGTAACGGAACAGCTCAG
GAGAAAGAAGATAAGGCAGTCTCAAGCGGCGAGAAGAAAACTAATGGGAAGAACCCGGAA
GCTCGTAAGTCTAGAACTCCAGTTAGAAACAGAGGTGAAACCATGTCCAAGAGTGTAAAG
AAACCTGTAGCAGCTAGCAGAACAATGGCACAGAAGAACAAGTTTGAAAAGGAAGAAGAG
ATGAGGAAGAGAATAGAGAATCTTGTTTTGGAAAGGCAGAGAAGAATCGCTGAGAGATCA
GCCGCCACTGCTTCTAGAAAAGCTTCTAACCGAGCTCCTTCGGTTCGTGAAAGGACCACA
TAAGAGGTTCAAGTAAAAGACATTGGATTCAGTTAAAACCGTTGGAAACAAAAAGGGATG
TTCTGCTGCGCCAACTTTAGGTGTACTTCAATTTTTTTTAATACATTCATAAATAAGTAA
GGTGATGGTGATACTCCTTCATTTTCCTTGTGTCACGATTATTTATTTATTAATTTGTTT
TTCCGAATATTGGTTTGTAACTATATATTTGTAATTTGGATTAGAGGTGCTCCCCCCAAA
AGTGAAAATTTAATACATCCTAGTTTGTTTCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BV19TF U 1
AF RR2BV19JQ C 638
BS 1 689 RR2BV19TF
BS 690 1355 RR2BV19JQ

RD RR2BV19TF 695 0 0
GTCAAGATTTCAGATGAAGGTAAAGGAAGCAATGAGAATTGGGATTCTTTTCAGAATATT
CTGATGAGGAACGAGGATGGCTCAGATGTTCATTCGATGGGGGAGCATTTCACACAGAGA
GGCTCTAAAGGTTTGCTAGAGAATAACAATGCCTCTGGTGGTGATTCCATCGTTTTAACT
CAGAAAAACGTAAAAACGGAGGAAGCGGAGCGAGCTTTGATCATTTTGGAAGTGAGGAGA
ATGCTCGTAGGGTATCAAAAACACGAGATTCAACAGAAGAATGTATGTTATTGCTAAAAA
GATCAGAAATGGTAGGAGGTGATGAGAGCAAAGACTTGTATAATGATGCTAAGGGGTGAC
TCATTAGTGAACAAGTCAGGGAGTGGAGAGGATTGGTTCACTGCTTCTGATCACCGTGGA
GTGAAAAAAACAGAAAGCAGTTACGGGAGTATGTCGTTTGATGAAAGTCTCATGATGACA
TCTGGAGGCGGTTCAGATCAGAGCAAGAAACAGGAGTTCGTTGATGATTCCTTCATGGTC
CATTCATCGAGGCTTACTGGTGATGATGTTTACGACTCTCGGTGGAGACTGGACATGTCT
GCTGATATCGACGTCGATAACGGTCAGGCGAATGAGAAGCGTGAGATGTCTGGCTCATGG
GAACCAAGTGATCTCTGTATGATTCCTGA
CGCGAC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RR2BV19JQ 718 0 0
AGCGTGAGATGTCTGGCTCATGGGAACCAAGTGATCTCTGTATGATTCCTGAACGCGACT
CGGGAGAGTTTTTGGATAATGATCACTCCATTGACTTCTCTGTCGAGGCGAACGCAAGGC
TAACGAGTAACGGAACAGCTCAGGAGAAAGAAGATAAGGCAGTCTCAAGCGGCGAGAAGA
AAACTAATGGGAAGAACCCGGAAGCTCGTAAGTCTAGAACTCCAGTTAGAAACAGAGGTG
AAACCATGTCCAAGAGTGTAAAGAAACCTGTAGCAGCTAGCAGAACAATGGCACAGAAGA
ACAAGTTTGAAAAGGAAGAAGAGATGAGGAAGAGAATAGAGAATCTTGTTTTGGAAAGGC
AGAGAAGAATCGCTGAGAGATCAGCCGCCACTGCTTCTAGAAAAGCTTCTAACCGAGCTC
CTTCGGTTCGTGAAAGGACCACATAAGAGGTTCAAGTAAAAGACATTGGATTCAGTTAAA
ACCGTTGGAAACAAAAAGGGATGTTCTGCTGCGCCAACTTTAGGTGTACTTCAATTTTTT
TTAATACATTCATAAATAAGTAAGGTGATGGTGATACTCCTTCATTTTCCTTGTGTCACG
ATTATTTATTTATTAATTTGTTTTTCCGAATATTGGTTTGTAACTATATATTTGTAATTT
GGATTAGAGGTGCTCCCCCCAAAAGTGAAAATTTAATACATCCTAGTTTGTTTCATTT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7911Contig1 948 2 4 U
GGAATCCTCTGATCAGTCAAATACCCATCAATCAATCAAATCCCCAAACACTCCCAAAAC
AAGAAGATCAGCTTCCAGCGTCGTCGAAGCTTTTTTTCTTCTTACAAAATGTCTATGTCG
TCTATGTCTTCTCCTTCCTCAGCTGTTTTTTCACCAGAGCACCTCTCTCCTTCCGACCAT
CTCTGCTATGTCCAATGCAACTTTTGTGAAACAATTCTTGCGGTCAGTGTTCCTTACACA
AGCATGTTCAAGACCGTAACCGTCCGATGCGGTTGCTGCACTAATCTTCTTTCTGTGAAC
ATGAGATCGGCTGGCCTCCCAGCTTCTAACCAGCTCCAGCTCCAGCTTGGTCCTCACTCT
TACTTCAATACCCAGAATATTCTGGAGGAGCTGAGAGATGCACCTTCAAACATGAACATG
ATGGTGATGAATCAGCATCCGAATATGAATGACATACCGTCTTTCATGAATATTCATCAA
CAACATGAGATTCCTAAAACACCACCCGTTAACCGCCCTCCAGAGAAAAGACAGAGAGTC
CCATCCGCATATAACCGATTTATCAAGGAGGAGATCCAACGTATCAAAGCTGGTAATCCT
GATATAAGCCACAGAGAAGCCTTTAGTGCTGCTGCCAAGAATTGGGCCCACTTCCCTCAC
ATACACTTCGGACTGGCACCAGACAATCAACCCGTGAAGAAAACCAACATGCCCCAACAG
GAGGGAGAGGATAAGGTGGGGATAAAAGAAGGGTTTTACGCTCCTGCGGCTAACATTGGT
GTGGCTCCTTACTAAAGATAATTATCGATAAGTATTCGAGAATTTGAAATCCAATATCTG
TAAGATTTATGTTGTCCAAAAGCTAGGTTTCTTTTATGTATTATGTATGCATGCTTCTAC
TTCTGTTGAGTAATCAAAATCTTTCTAATTAATGAGGTTTATTATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2G386TF U 1
AF RR2G386JQ C 147
BS 1 702 RR2G386TF
BS 703 703 RR2G386JQ
BS 704 715 RR2G386TF
BS 716 948 RR2G386JQ

RD RR2G386TF 715 0 0
GGAATCCTCTGATCAGTCAAATACCCATCAATCAATCAAATCCCCAAACACTCCCAAAAC
AAGAAGATCAGCTTCCAGCGTCGTCGAAGCTTTTTTTCTTCTTACAAAATGTCTATGTCG
TCTATGTCTTCTCCTTCCTCAGCTGTTTTTTCACCAGAGCACCTCTCTCCTTCCGACCAT
CTCTGCTATGTCCAATGCAACTTTTGTGAAACAATTCTTGCGGTCAGTGTTCCTTACACA
AGCATGTTCAAGACCGTAACCGTCCGATGCGGTTGCTGCACTAATCTTCTTTCTGTGAAC
ATGAGATCGGCTGGCCTCCCAGCTTCTAACCAGCTCCAGCTCCAGCTTGGTCCTCACTCT
TACTTCAATACCCAGAATATTCTGGAGGAGCTGAGAGATGCACCTTCAAACATGAACATG
ATGGTGATGAATCAGCATCCGAATATGAATGACATACCGTCTTTCATGAATATTCATCAA
CAACATGAGATTCCTAAAACACCACCCGTTAACCGCCCTCCAGAGAAAAGACAGAGAGTC
CCATCCGCATATAACCGATTTATCAAGGAGGAGATCCAACGTATCAAAGCTGGTAATCCT
GATATAAGCCACAGAGAAGCCTTTAGTGCTGCTGCCAAGAATTGGGCCCACTTCCCTCAC
ATACACTTCGGACTGGCACCAGACAATCAACCCGTGAAGAAA*CCAACATGCCCC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RR2G386JQ 802 0 0
TTTTTCACCAGAGCACCTCTCTC*TTCCGACCATCTCTGCTATGTCCAATGCAACTTTTG
TGAAACAATTCTTGCGGTCAGTGTTCCTTACACAAGCATGTTCAAGACCGTAACCGTCCG
ATGCGGTTGCTGCACTAATCTTCTTTCTGTGAACATGAGATCGGCTGGCCTCCCAGCTTC
TAACCAGCTCCAGCTCCAGCTTGGTCCTCACTCTTACTTCAATACCCAGAATATTCTGGA
GGAGCTGAGAGATGCACCTTCAAACATGAACATGATGGTGATGAATCAGCATCCGAATAT
GAATGACATACCGTCTTTCATGAATATTCATCAACAACATGAGATTCCTAAAACACCACC
CGTTAACCGCCCTCCAGAGAAAAGACAGAGAGTCCCATCCGCATATAACCGATTTATCAA
GGAGGAGATCCAACGTATCAAAGCTGGTAATCCTGATATAAGCCACAGAGAAGCCTTTAG
TGCTGCTGCCAAGAATTGGGCCCACTTCCCTCACATACACTTCGGACTGGCACCAGACAA
TCAACCCGTGAAGAAAACCAACATGCCCCAACAGGAGGGAGAGGATAAGGTGGGGATAAA
AGAAGGGTTTTACGCTCCTGCGGCTAACATTGGTGTGGCTCCTTACTAAAGATAATTATC
GATAAGTATTCGAGAATTTGAAATCCAATATCTGTAAGATTTATGTTGTCCAAAAGCTAG
GTTTCTTTTATGTATTATGTATGCATGCTTCTACTTCTGTTGAGTAATCAAAATCTTTCT
AATTAATGAGGTTTATTATGCT

QA 1 802 1 802
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7913Contig1 1024 2 12 U
GATTGATTCTGACATGCATGATGTTGGACGATTTTTAAATCGCCTCTTAGGATTACCACC
TGATATTCAGAATAGGCTGTTTGAATTGTTTACGAGTATATTAGATGTGTTTGTACATAA
TGCTCGAATTGAAGGAACTTTTGATTCGGGAATCGTGGATATGAAAGCTAATAGCGTTGA
ACTGCTGACCACTCCAAAGACCGTCCATGTCGATCAAATGTCTGGTGCATCCACTATGCT
CTTTACTTTCACTCTAGATCGTGGTATTACATGGGAGTCCGCAAGTTCATTGCTAGAGGG
GAAGAGAAGGGATGGGCTTGGCTCGGCTAGTGATGGCTTTTATGAATCTAAGAGGGAATG
GTTAGGAAGACGGCACTTCATATTAGCATTTGAGAGTACGGCCTCAGGGTTGTTTAAGAC
CGTCCGTCCTGCGGTAGGAGAGTCGATCAGAGAGATGTCTCTTTCAGAGTTGAAAACTAA
GTACCGAAAACTCTCTTCTCTGGAGAAGGCTCGTACCGGTTGGGAAGACGAGTACGAAGT
TTCTTCTAAACAGTGTTTGCACGGACCGAAGTGTAAGCTGGGAGAGTATTGCACAGTAGG
AAGAAGAATACAGGAAGTAAATGTTGTGGGTGGCCTTATTCTTCCCATCTGGGGAACCAT
TGAGAAAGCTCTTTCCAAACAAGCCCGTCAAAGCCACAAGAGGATTAGAGTTATACGCAT
AGAGACGACGACGGATAATCAGCGAATAGTGGGCCTCTCTATCCCTAATGCAGCTGTAGA
AACTGTGTTACAAGATTTAGCATGGGTTCAAGAGATAGATGATTGAGACAAAAACAAACA
TTATCCGTCTTGTTTAAGAAGCAAAACCGACACCAACCCCCTCAAGTTCCCCCCATGCCT
ATTCGTATTTTTATTTATTTTATTTTCAAAGGAGAAAACACACTATGACTTCCATTTTTG
TGTATATCACATGGCAATCTGGCAGTAGATGTATTATACTACTATTATTATCTAACGTTT
TGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RR2CN68TF U 1
AF RR2CN68JQ C 297
BS 1 694 RR2CN68TF
BS 695 695 RR2CN68JQ
BS 696 705 RR2CN68TF
BS 706 706 RR2CN68JQ
BS 707 733 RR2CN68TF
BS 734 734 RR2CN68JQ
BS 735 737 RR2CN68TF
BS 738 738 RR2CN68JQ
BS 739 754 RR2CN68TF
BS 755 755 RR2CN68JQ
BS 756 764 RR2CN68TF
BS 765 1024 RR2CN68JQ

RD RR2CN68TF 779 0 0
GATTGATTCTGACATGCATGATGTTGGACGATTTTTAAATCGCCTCTTAGGATTACCACC
TGATATTCAGAATAGGCTGTTTGAATTGTTTACGAGTATATTAGATGTGTTTGTACATAA
TGCTCGAATTGAAGGAACTTTTGATTCGGGAATCGTGGATATGAAAGCTAATAGCGTTGA
ACTGCTGACCACTCCAAAGACCGTCCATGTCGATCAAATGTCTGGTGCATCCACTATGCT
CTTTACTTTCACTCTAGATCGTGGTATTACATGGGAGTCCGCAAGTTCATTGCTAGAGGG
GAAGAGAAGGGATGGGCTTGGCTCGGCTAGTGATGGCTTTTATGAATCTAAGAGGGAATG
GTTAGGAAGACGGCACTTCATATTAGCATTTGAGAGTACGGCCTCAGGGTTGTTTAAGAC
CGTCCGTCCTGCGGTAGGAGAGTCGATCAGAGAGATGTCTCTTTCAGAGTTGAAAACTAA
GTACCGAAAACTCTCTTCTCTGGAGAAGGCTCGTACCGGTTGGGAAGACGAGTACGAAGT
TTCTTCTAAACAGTGTTTGCACGGACCGAAGTGTAAGCTGGGAGAGTATTGCACAGTAGG
AAGAAGAATACAGGAAGTAAATGTTGTGGGTGGCCTTATTCTTCCCATCTGGGGAACCAT
TGAGAAAGCTCTTTCCAAACAAGCCCGTCAAAGC*ACAAGAGGAT*AGAGTTATACGCAT
AGAGACGACGACG*ATA*TCAGCGAATAGTGGGC*TCTCTATCC
TATGCAGCTGTAGAA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RR2CN68JQ 728 0 0
AGGGGAAGAGAAGGGATGGGCTTGGCTCGGCTAGTGATGGCTTTTATGAATCTAAGAGGG
AATGGTTAGGAAGACGGCACTTCATATTAGCATTTGAGAGTACGGCCTCAGGGTTGTTTA
AGACCGTCCGTCCTGCGGTAGGAGAGTCGATCAGAGAGATGTCTCTTTCAGAGTTGAAAA
CTAAGTACCGAAAACTCTCTTCTCTGGAGAAGGCTCGTACCGGTTGGGAAGACGAGTACG
AAGTTTTTTCTAAACAGTGTTTGCACGGACCGAAGTGTAAGCTGGGAGAGTATTGCACAG
TAGGAAGAAGAATACAGGAAGTAAATGTTGTGGGTGGCCTTATTCTTCCCATCTGGGGAA
CCATTGAGAAAGCTCTTTCCAAACAAGCCCGTCAAAGCCACAAGAGGATTAGAGTTATAC
GCATAGAGACGACGACGGATAATCAGCGAATAGTGGGCCTCTCTATCCCTAATGCAGCTG
TAGAAACTGTGTTACAAGATTTAGCATGGGTTCAAGAGATAGATGATTGAGACAAAAACA
AACATTATCCGTCTTGTTTAAGAAGCAAAACCGACACCAACCCCCTCAAGTTCCCCCCAT
GCCTATTCGTATTTTTATTTATTTTATTTTCAAAGGAGAAAACACACTATGACTTCCATT
TTTGTGTATATCACATGGCAATCTGGCAGTAGATGTATTATACTACTATTATTATCTAAC
GTTTTGGC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL7914Contig1 771 2 3 U
TTATATAATTAGTTTATTATTGCAAAATAAATTATCAATTAACATGGTAGCTTTCTAAGT
ATGGACGTCACTGACGTTTACAAGCGAATGATATTGTCGGAGTGACAATAAATTTACAAA
CACAATTTATATGATCAAAAATGATTCATCAATACTATATGATATCATGATTATACCTCG
TTGTACGTTTTATCTTCTTTCAAACGTTTTAATAAGAAGATAAGAACAAAGATTTGGCTC
AATCTACTAATGAATGGAGTCTCGTTCTTGGACAGCAGCTTTGATGTTTTTTAGAGATTC
CTCCCAGTCGTCAAGTAGCCGATGAGTATCGCTTATGACCGTTGGATCTACGGTCAAAGA
AATAGTCATCTTATTCATGTAACTTTGGAAATGGATCGTCAAAGCATGGGGATGGCCATA
AACACTAGGGGCCATATAAGTGATAGGATGTCCAAAGAAGCTGATTTCTTCAATAGGACC
AATCAAGTTTGAAAAGGACATCGTTGTGTTGGACAATGCTCTATTTATTACGTTAGCTGT
CACCTTAACGCCAAATAATCTAATCATGAATTTACCGACGATGAATGTAAGCGCAGCTTC
CAGCGAGTTTTTCTTCCGGTCGATGATCCTTTTGGCACTTCGAAGATGTTCCAACGGATC
TTTGCTTAAGCCGATAGAAAACGGAAAGACTATGTAGCCAATCCAATTCCCCCATCTACA
CTTTGATCCTTTAGCCATCATATCAGATAGATCCTGGATTCCAGTAGTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2CA78JQ U 1
AF RR2GZ59JQ U 66
BS 1 724 RR2CA78JQ
BS 725 725 RR2GZ59JQ
BS 726 771 RR2CA78JQ

RD RR2CA78JQ 771 0 0
TTATATAATTAGTTTATTATTGCAAAATAAATTATCAATTAACATGGTAGCTTTCTAAGT
ATGGACGTCACTGACGTTTACAAGCGAATGATATTGTCGGAGTGACAATAAATTTACAAA
CACAATTTATATGATCAAAAATGATTCATCAATACTATATGATATCATGATTATACCTCG
TTGTACGTTTTATCTTCTTTCAAACGTTTTAATAAGAAGATAAGAACAAAGATTTGGCTC
AATCTACTAATGAATGGAGTCTCGTTCTTGGACAGCAGCTTTGATGTTTTTTAGAGATTC
CTCCCAGTCGTCAAGTAGCCGATGAGTATCGCTTATGACCGTTGGATCTACGGTCAAAGA
AATAGTCATCTTATTCATGTAACTTTGGAAATGGATCGTCAAAGCATGGGGATGGCCATA
AACACTAGGGGCCATATAAGTGATAGGATGTCCAAAGAAGCTGATTTCTTCAATAGGACC
AATCAAGTTTGAAAAGGACATCGTTGTGTTGGACAATGCTCTATTTATTACGTTAGCTGT
CACCTTAACGCCAAATAATCTAATCATGAATTTACCGACGATGAATGTAAGCGCAGCTTC
CAGCGAGTTTTTCTTCCGGTCGATGATCCTTTTGGCACTTCGAAGATGTTCCAACGGATC
TTTGCTTAAGCCGATAGAAAACGGAAAGACTATGTAGCCAATCCAATTCCCCCATCTACA
CTTTTATCCTTTAGCCATCATATCAGATAGATCCTGGATTCCAGTAGTGGG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RR2GZ59JQ 685 0 0
CGTCACTGACGTTTACAAGCGAATGATATTGTCGGAGTGACAATAAATTTGCAAACACAA
TTTATATGATCAAAAATGATTCATCAATACTATATGATATCATGATTATACCTCGTTGTA
CGTTTTATCTTCTTTCAAACGTTTTAATAAGAAGATAAGAACAAAGATTTGGCTCAATCT
ACTAATGAATGGAGTCTCGTTCTTGGACAGCAGCTTTGATGTTTTTTAGAGATTCCTCCC
AGTCGTCAAGTAGCCGATGAGTATCGCTTATGACCGTTGGATCTACGGTCAAAGAAATAG
TCATCTTATTCATGTAACTTTGGAAATGGATCGTCAAAGCATGGGGATGGCCATAAACAC
TAGGGGCCATATAAGTGATAGGATGTCCAAAGAAGCTGATTTCTTCAATAGGACCAATCA
AGTTTGAAAAGGACATCGTTGTGTTGGACAATGCTCTATTTATTACGTTAGCTGTCACCT
TAACGCCAAATAATCTAATCATGAATTTACCGACGATGAATGTAAGCGCAGCTTCCAGCG
AGTTTTTCTTCCGGTCGATGATCCTTTTGGCACTTCGAAGATGTTCCAATGGATCTTTGC
TTAAGCCGATAGAAAACGGAAAGACTATGTAGCCAATCCAATTCCCCCATCTACACTTTG
ATCCTTTAGCCATCATATCAGATAG

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL7915Contig1 133 2 3 U
TTTTTCTCTGTTTGTGTTTTGTTTTTGCTGTCTTCTCTTATGCTGGAAGCTTGGAGCTTT
CAGATTCCATGCTTCATGTCGGATAATGTAATAACAAATCGGAAGCGTTTAGACCGTATC
TTTGTTTCTAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2CZ42TF U 1
AF RR2CN28TF U 22
BS 1 71 RR2CZ42TF
BS 72 72 RR2CN28TF
BS 73 133 RR2CZ42TF

RD RR2CZ42TF 133 0 0
TTTTTCTCTGTTTGTGTTTTGTTTTTGCTGTCTTCTCTTATGCTGGAAGCTTGGAGCTTT
CAGATTCCATGTTTCATGTCGGATAATGTAATAACAAATCGGAAGCGTTTAGACCGTATC
TTTGTTTCTAGTT

QA 1 133 1 133
DS 

RD RR2CN28TF 112 0 0
TTTTTGCTGTCTTCTCTTATGCTGGAAGCTTGGAGCTTTCAGATTCCATGCTTCATGTCG
GATAATGTAATAACAAATCGGAAGCGTTTAGACCGTATCTTTGTTTCTAGTT

QA 1 112 1 112
DS 



AS 1 2

CO CL7916Contig1 464 2 2 U
GTAATGAAACTTTGAATGTCAAGAAACTTAATACTCCACAAAATTAAAACATGAGTTAAA
AACAAGTGTCTAATACTGGTCTAGAGCAGTAACTTTAGGTGTGTTTCAAGCAATGAAACC
GATGATCACTTGACAAAGTACAGCTTGCCCATGACATGAAGGACAGCGACAAAAGCAATG
AAACCGATGCTCATGACAAGGACGACATTAGGGGAGATCTTGAGACCGGGTGCGTCATCC
GTGTAGAACTGAAGCATGGATCCTGCCGCACCACCAGAGGCTCCTCCTCCTCCTCCACTT
CCACTAGGCTTCCTCCTACGCATGCTAGCAGCTGCGGCTGCACTTCCTCTCTGTGGAGCT
CCACTTCCCACCATCCTTCTTTTATTAACAGATTTGGCTTTAGAGATTCTGATGTCGACG
AAAACGATAACGAGACGAAGAGATGTTCGGACCTTTTGTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FJ48TF C 1
AF RR2FJ48JQ U 33
BS 1 32 RR2FJ48TF
BS 33 464 RR2FJ48JQ

RD RR2FJ48TF 464 0 0
GTAATGAAACTTTGAATGTCAAGAAACTTAATACTCCACAAAATTAAAACATGAGTTAAA
AACAAGTGTCTAATACTGGTCTAGAGCAGTAACTTTAGGTGTGTTTCAAGCAATGAAACC
GATGATCACTTGACAAAGTACAGCTTGCCCATGACATGAAGGACAGCGACAAAAGCAATG
AAACCGATGCTCATGACAAGGACGACATTAGGGGAGATCTTGAGACCGGGTGCGTCATCC
GTGTAGAACTGAAGCATGGATCCTGCCGCACCACCAGAGGCTCCTCCTCCTCCTCCACTT
CCACTAGGCTTCCTCCTACGCATGCTAGCAGCTGCGGCTGCACTTCCTCTCTGTGGAGCT
CCACTTCCCACCATCCTTCTTTTATTAACAGATTTGGCTTTAGAGATTCTGATGTCGACG
AGAACGATAACGAGACGAAGAGATGTTCGGACCTTTTGTGTTCC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RR2FJ48JQ 432 0 0
ACTCCACAAAATTAAAACATGAGTTAAAAACAAGTGTCTAATACTGGTCTAGAGCAGTAA
CTTTAGGTGTGTTTCAAGCAATGAAACCGATGATCACTTGACAAAGTACAGCTTGCCCAT
GACATGAAGGACAGCGACAAAAGCAATGAAACCGATGCTCATGACAAGGACGACATTAGG
GGAGATCTTGAGACCGGGTGCGTCATCCGTGTAGAACTGAAGCATGGATCCTGCCGCACC
ACCAGAGGCTCCTCCTCCTCCTCCACTTCCACTAGGCTTCCTCCTACGCATGCTAGCAGC
TGCGGCTGCACTTCCTCTCTGTGGAGCTCCACTTCCCACCATCCTTCTTTTATTAACAGA
TTTGGCTTTAGAGATTCTGATGTCGACGAAAACGATAACGAGACGAAGAGATGTTCGGAC
CTTTTGTGTTCC

QA 1 432 1 432
DS 



AS 1 2

CO CL7917Contig1 516 2 7 U
GGCACAAAAAGTAAGAATATTCAAACACAATTGGACCAGAAACTAAAACATGGGTAGGCA
CATAGGATTACATATATAAAAAGAAACTATTTAACTTACATATATGTAGAAAAACAGCAA
AGCAAATCTGAAAATATTTTCTTGATTCTGCTAGCTGCCCATATAACCTATATATGTGCC
CAATCATGTAAAAAAGACATTCTTGATCCACATCAAATGACACATTCACATGGATCATCA
CATCAGTCTCTTTAATTCAAGAGAGAGAAACAACAAAAAGACACACCACAAGTTGCTCTC
TCTCTCCCACGCCATGTGTAACGTGTAAATGCAATTTGCTTATTCTTCTCAATCTTAATA
TTCTCCACCTCTACTCCTACCCGCTCCTTCTCAATGGATTCTTGACTCTTATTTCTCGAA
AGATTTCTTGCAATGAAAAACGGCTTCGTAAATGGAGCTCTCTGAGTCACAAGACCTTCT
CCAATAACAATCATCTGCAACACTTATTCTTGGCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2DF70JQ U 22
AF RR2GK47JQ U 1
BS 1 42 RR2GK47JQ
BS 43 43 RR2DF70JQ
BS 44 156 RR2GK47JQ
BS 157 157 RR2DF70JQ
BS 158 285 RR2GK47JQ
BS 286 286 RR2DF70JQ
BS 287 516 RR2GK47JQ

RD RR2DF70JQ 392 0 0
CAAACACAATTGGACCAGAAACTAAAACATGGGTAGGCACATAGGATTACATATATAAAA
AGAAACTATTTAACTTACATATATGTAGGAAAACAGCAAAGCAAATCTGAAAATATTTTC
TTGATTCTGCTAGCTGCCCATATAACCTATATATGTGCCCAATCATGTAAAAAAGACATT
CTTGATCCACATCAGATGACACATTCACATGGATCATCACATCAGTCTCTTTAATTCAAG
AGAGAGAAACAACAAAAAGACACACCACAAGTTGCTCTCTCTCTCCCACGCCATGTGTAA
CGTGTAAATGCAATTTGCTTATTCTTCTCAATCTTAATATTCTCCACCTCTACTCCTACC
TGCTCCTTCTCAATGGATTCTTGACTCTTATT

QA 1 392 1 392
DS 

RD RR2GK47JQ 516 0 0
GGCACAAAAAGTAAGAATATTCAAACACAATTGGACCAGAAAGTAAAACATGGGTAGGCA
CATAGGATTACATATATAAAAAGAAACTATTTAACTTACATATATGTAGAAAAACAGCAA
AGCAAATCTGAAAATATTTTCTTGATTCTGCTAGCT*CCCATATAACCTATATATGTGCC
CAATCATGTAAAAAAGACATTCTTGATCCACATCAAATGACACATTCACATGGATCATCA
CATCAGTCTCTTTAATTCAAGAGAGAGAAACAACAAAAAGACACATCACAAGTTGCTCTC
TCTCTCCCACGCCATGTGTAACGTGTAAATGCAATTTGCTTATTCTTCTCAATCTTAATA
TTCTCCACCTCTACTCCTACCCGCTCCTTCTCAATGGATTCTTGACTCTTATTTCTCGAA
AGATTTCTTGCAATGAAAAACGGCTTCGTAAATGGAGCTCTCTGAGTCACAAGACCTTCT
CCAATAACAATCATCTGCAACACTTATTCTTGGCGA

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL7918Contig1 1098 2 2 U
GGGAAGAGTTTACAGAGGAGGATCTTGTCGCAATCGAGGCAATAGAGGCTTCCCATCTCT
CCCAATCGTCGTCTTCGTCTTCTTCTTCGAACGTAAGGCCTTCGACCTCAAATCCGAATC
AGATCCGGCGGCGCCAATTGCCTCGTTCCATCACTTCTCCCACACCCTCTAAGCGATTTC
CACTCTCTCGTTGCAGATCTAAGAATTTTCCAGCGATGAGGTTTGGAGGCAGGATTTTGT
ATAGCAAGACTGCTAGTGAGGTTGATAGGCGAGCAATGCAGCTTCTTAAGGTTCTCGATA
CCAAGAGAGATCATTCTGGTAGAGCTTTTATTGGCTTTGATATTGAGTGGAGACCCAATT
TTCGAAAAGGTGTTCTCCCAGGGAAAGTGGCAGTTGTGCAGATATGTGTAGATAATAGTT
ATTGTGATGTCATGCAAATTATCCACTCTGGTATCCCACAGAGTCTCCAACATCTTATTG
AGGATTCAACACTTGTAAAGGTAGGTATTGGAATCAACGGCGACTCTGTGAAGCTTTTCC
ATGACCATGGAGTGTCCATCAAAGATGTCGAAGATCTTTCTGATTTAGCCAACAAAAAAA
TTGGCGGAGGTTTGAAAAAATGGGGCCTTGCGTCACTTACTGAGACACTTGTTTGCAAAG
AGCTCCTTAAGCCGAATAGAATCACGCTCGGAAACTGGGAGGCGCGTCCTCTGTCAAAGG
AGCAGTTACAGTATGCAGCAACCGATGCTTATGCTTCTTGGCATCTTTACCACGTGCTAA
AGGACCTTCCTGATGCTGTGGATTGATCATAACGTGGACGACGAACCTTAAAGGTTAACT
ACTAGATGCAGTTCTTACGGATTTGCAAAAGAGCATTTGAACATTGTATCTGGTTGCAGT
CCATTTTAGTCGTAACTCATGCTCGGTTTACATGTCTCTGCGGTATAAGATAAAGTATAA
AGTCCTGGTATGGTTAACAATCGAGAAGCCAGGGGCTTTGTTGTGAGCTCTCTGATTCAG
ATTTGGAATAACAATGTAAAGATTTGAAAAGCTCTTCAGTCTCTTTTTATGTTCTTTATA
AATAAATCTTAGAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AQ30TF U 1
AF RR2AQ30JQ C 251
BS 1 813 RR2AQ30TF
BS 814 1098 RR2AQ30JQ

RD RR2AQ30TF 813 0 0
GGGAAGAGTTTACAGAGGAGGATCTTGTCGCAATCGAGGCAATAGAGGCTTCCCATCTCT
CCCAATCGTCGTCTTCGTCTTCTTCTTCGAACGTAAGGCCTTCGACCTCAAATCCGAATC
AGATCCGGCGGCGCCAATTGCCTCGTTCCATCACTTCTCCCACACCCTCTAAGCGATTTC
CACTCTCTCGTTGCAGATCTAAGAATTTTCCAGCGATGAGGTTTGGAGGCAGGATTTTGT
ATAGCAAGACTGCTAGTGAGGTTGATAGGCGAGCAATGCAGCTTCTTAAGGTTCTCGATA
CCAAGAGAGATCATTCTGGTAGAGCTTTTATTGGCTTTGATATTGAGTGGAGACCCAATT
TTCGAAAAGGTGTTCTCCCAGGGAAAGTGGCAGTTGTGCAGATATGTGTAGATAATAGTT
ATTGTGATGTCATGCAAATTATCCACTCTGGTATCCCACAGAGTCTCCAACATCTTATTG
AGGATTCAACACTTGTAAAGGTAGGTATTGGAATCAACGGCGACTCTGTGAAGCTTTTCC
ATGACCATGGAGTGTCCATCAAAGATGTCGAAGATCTTTCTGATTTAGCCAACAAAAAAA
TTGGCGGAGGTTTGAAAAAATGGGGCCTTGCGTCACTTACTGAGACACTTGTTTGCAAAG
AGCTCCTTAAGCCGAATAGAATCACGCTCGGAAACTGGGAGGCGCGTCCTCTGTCAAAGG
AGCAGTTACAGTATGCAGCAACCGATGCTTATGCTTCTTGGCATCTTTACCACGTGCTAA
AGGACCTTCCTGATGCTGTGGATTGATCATAAC

QA 1 813 1 813
DS 

RD RR2AQ30JQ 848 0 0
TGCTAGTGAGGTTGATAGGCGAGCAATGCAGCTTCTTAAGGTTCTCGATACCAAGAGAGA
TCATTCTGGTAGAGCTTTTATTGGCTTTGATATTGAGTGGAGACCCAATTTTCGAAAAGG
TGTTCTCCCAGGGAAAGTGGCAGTTGTGCAGATATGTGTAGATAATAGTTATTGTGATGT
CATGCAAATTATCCACTCTGGTATCCCACAGAGTCTCCAACATCTTATTGAGGATTCAAC
ACTTGTAAAGGTAGGTATTGGAATCAACGGCGACTCTGTGAAGCTTTTCCATGACCATGG
AGTGTCCATCAAAGATGTCGAAGATCTTTCTGATTTAGCCAACAAAAAAATTGGCGGAGG
TTTGAAAAAATGGGGCCTTGCGTCACTTACTGAGACACTTGTTTGCAAAGAGCTCCTTAA
GCCGAATAGAATCAGGCTCGGAAACTGGGAGGCGCGTCCTCTGTCAAAGGAGCAGTTACA
GTATGCAGCAACCGATGCTTATGCTTCTTGGCATCTTTACCACGTGCTAAAGGACCTTCC
TGATGCTGTGGATTGATCATAACGTGGACGACGAACCTTAAAGGTTAACTACTAGATGCA
GTTCTTACGGATTTGCAAAAGAGCATTTGAACATTGTATCTGGTTGCAGTCCATTTTAGT
CGTAACTCATGCTCGGTTTACATGTCTCTGCGGTATAAGATAAAGTATAAAGTCCTGGTA
TGGTTAACAATCGAGAAGCCAGGGGCTTTGTTGTGAGCTCTCTGATTCAGATTTGGAATA
ACAATGTAAAGATTTGAAAAGCTCTTCAGTCTCTTTTTATGTTCTTTATAAATAAATCTT
AGAAACCC

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 2

CO CL7919Contig1 843 2 2 U
GGGCGGCGGCGATTCAACTCATGGCCTTTGCGCTTCCTTCCACTGGCTGAAGCGGCCGAG
TTATAGCTTCGTTTTTAACCTATCCAATTCCATCACCACTGCAATGCGTCGTTCGTATCT
CATAGGCGGTGTCTCTTCTGTATAAATATGTGACTTCTTCTTATCTCGAACTCATCCTCT
CTTTCCATCTCTTGCGCTAGACTGAATCGTGTTTTCATGGCTCATTCAAGGGTTTTTTCT
CCGACTTGAAGTCCGGCCGTTGCTCCTCCGTCATCGAGGCAAGGCTGCTCCGGTCATGGG
AGGCGAGACGTGGTGGCGAGCTCATGTGGGTTGACATGCTCCGGAGATGTAAGTTATTTC
TTCTATTTTTTAAGATCTGAGATCGATCAGTCCGGTGAGTTTCTTTTTTTTGCTGATTCT
GATTTTATTTATCTGATATCCTTATCGCAATTTAAGGATACTTAGATCGATTTCAGTTGA
ATCGGTATTTGTATGTTCGAATTGGTATTATGTTTTGTGTGGGTTAATTTTGATTCAGGC
AATCAATTCTCTGTAACCAGGACCAAGCTGACCAGATCTTGGGAAAAAGAAACTAAAACA
CAAACACATCGAGATCGAAACCGTTCAGTGTAAAGCGGACTTCGTCTGAAGTGTATGGTG
AAGATTCTCTGAGAGGAGATGGAGTTGAGATGAGGAGGAGAGCTCCTACTTCTCTTTGAA
GAAATTTATGGACGGCTCAGACTATTACTCAGTTAGCGTGCTAATTTGGAAAGAGCTTTT
GTTTTTATGCTCGCCGGTGGCGTTAAAGAAGTTTTATTCTACGGCCCCGTTTGTTACTTT
GTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2CY46TF U 1
AF RR2CY46JQ C 116
BS 1 679 RR2CY46TF
BS 680 843 RR2CY46JQ

RD RR2CY46TF 679 0 0
GGGCGGCGGCGATTCAACTCATGGCCTTTGCGCTTCCTTCCACTGGCTGAAGCGGCCGAG
TTATAGCTTCGTTTTTAACCTATCCAATTCCATCACCACTGCAATGCGTCGTTCGTATCT
CATAGGCGGTGTCTCTTCTGTATAAATATGTGACTTCTTCTTATCTCGAACTCATCCTCT
CTTTCCATCTCTTGCGCTAGACTGAATCGTGTTTTCATGGCTCATTCAAGGGTTTTTTCT
CCGACTTGAAGTCCGGCCGTTGCTCCTCCGTCATCGAGGCAAGGCTGCTCCGGTCATGGG
AGGCGAGACGTGGTGGCGAGCTCATGTGGGTTGACATGCTCCGGAGATGTAAGTTATTTC
TTCTATTTTTTAAGATCTGAGATCGATCAGTCCGGTGAGTTTCTTTTTTTTGCTGATTCT
GATTTTATTTATCTGATATCCTTATCGCAATTTAAGGATACTTAGATCGATTTCAGTTGA
ATCGGTATTTGTATGTTCGAATTGGTATTATGTTTTGTGTGGGTTAATTTTGATTCAGGC
AATCAATTCTCTGTAACCAGGACCAAGCTGACCAGATCTTGGGAAAAAGAAACTAAAACA
CAAACACATCGAGATCGAAACCGTTCAGTGTAAAGCGGACTTCGTCTGAAGTGTATGGTG
AAGATTCTCTGAGAGGAGA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RR2CY46JQ 728 0 0
TATCTCATAGGCGGTGTCTCTTCTGTATAAATATGTGACTTCTTCTTATCTCGAACTCAT
CCTCTCTTTCCATCTCTTGCGCTAGACTGAATCGTGTTTTCATGGCTCATTCAAGGGTTT
TT*CTCCGACTTGAAGTCCGGCCGTTGCTCCTCCGTCATCGAGGCAAGGCTGCTCCGGTC
ATGGGAGGCGAGACGTGGTGGCGAGCTCATGTGGGTTGACATGCTCCGGAGATGTAAGTT
ATTTCTTCTATTTTTTAAGATCTGAGATCGATCAGTCCGGTGAGTTTCTTTTTTTTGCTG
ATTCTGATTTTATTTATCTGATATCCTTATCGCAATTTAAGGATACTTAGATCGATTTCA
GTTGAATCGGTATTTGTATGTTCGAATTGGTATTATGTTTTGTGTGGGTTAATTTTGATT
CAGGCAATCAATTCTCTGTAACCAGGACCAAGCTGACCAGATCTTGGGAAAAAGAAACTA
AAACACAAACACATCGAGATCGAAACCGTTCAGTGTAAAGCGGACTTCGTCTGAAGTGTA
TGGTGAAGATTCTCTGAGAGGAGATGGAGTTGAGATGAGGAGGAGAGCTCCTACTTCTCT
TTGAAGAAATTTATGGACGGCTCAGACTATTACTCAGTTAGCGTGCTAATTTGGAAAGAG
CTTTTGTTTTTATGCTCGCCGGTGGCGTTAAAGAAGTTTTATTCTACGGCCCCGTTTGTT
ACTTTGTG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL7920Contig1 649 2 14 U
GTGGATCGTAGCACCATCCTCAAACGCAAGATGGTTGATCAGATTAAGAGGGAGATCTCG
ATCATGAAACTCGTTCGTCATCCTTGCGTTGTTCGTCTCTACGAGGTTCTAGCAAGCCGT
ACTAAGATTTACATCATCTTGGAGTATATTACTGGTGGTGAACTGTTTGATAAGATTGTG
CGTAACGGACGTCTTAGTGAAGCTGAAGCTAGGAAGTACTTTCACCAGCTTATCGATGGA
GTTGATTACTGCCATAGTAAAAGCGTCTACCACAGAGATCTTAAGCCGGAGAATCTTCTA
CTGGATTCTCAAGGAAATCTCAAGATATCTGATTTTGGGCTTAGTGCATTACCTGAGCAA
GGAGTTACCATCCTAAAGACAACGTGTGGGACTCCAAATTACGTTGCTCCTGAGGTTCTG
AGTCATAAGGGTTATAATGGTGCTGTGGCAGATGTATGGTCCTGTGGGGTCATCCTTTAT
GTTCTTATGGCAGGATATCTTCCGTTTGATGAAATGGATCTCCCTACTTTATACAGTAAG
ATTGACAATGCTGAGTTCACTTGCCCCTCATATTTTGCCTTGGGAGCAAAGGCCTTGATC
CGTAGAATTTTGGATCCAAATCCTGAAACTCGAATTACAATTGCTGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2BE92TF U 1
AF RR2G270TF U 12
BS 1 17 RR2BE92TF
BS 18 18 RR2G270TF
BS 19 179 RR2BE92TF
BS 180 180 RR2G270TF
BS 181 251 RR2BE92TF
BS 252 252 RR2G270TF
BS 253 263 RR2BE92TF
BS 264 264 RR2G270TF
BS 265 299 RR2BE92TF
BS 300 300 RR2G270TF
BS 301 493 RR2BE92TF
BS 494 494 RR2G270TF
BS 495 604 RR2BE92TF
BS 605 649 RR2G270TF

RD RR2BE92TF 604 0 0
GTGGATCGTAGCACCATTCTCAAACGCAAGATGGTTGATCAGATTAAGAGGGAGATCTCG
ATCATGAAACTCGTTCGTCATCCTTGCGTTGTTCGTCTCTACGAGGTTCTAGCAAGCCGT
ACTAAGATTTACATCATCTTGGAGTATATTACTGGTGGTGAACTGTTTGATAAGATTGTT
CGTAACGGACGTCTTAGTGAAGCTGAAGCTAGGAAGTACTTTCACCAGCTTATCGATGGA
GTTGATTACTGTCATAGTAAAAGTGTCTACCACAGAGATCTTAAGCCGGAGAATCTTCTG
CTGGATTCTCAAGGAAATCTCAAGATATCTGATTTTGGGCTTAGTGCATTACCTGAGCAA
GGAGTTACCATCCTAAAGACAACGTGTGGGACTCCAAATTACGTTGCTCCTGAGGTTCTG
AGTCATAAGGGTTATAATGGTGCTGTGGCAGATGTATGGTCCTGTGGGGTCATCCTTTAT
GTTCTTATGGCAG*ATATCTTCCGTTTGATGAAATGGATCTCCCTACTTTATACAGTAAG
ATTGACAATGCTGAGTTCACTTGCCCCTCATATTTTGCCTTGGGAGCAAAGGCCTTGATC
CGTA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RR2G270TF 638 0 0
G
ACCATCCTCAAACGCAAGATGGTTGATCAGATTAAGAGGGAGATCTCGATCATGAAACTC
GTTCGTCATCCTTGCGTTGTTCGTCTCTACGAGGTTCTAGCAAGCCGTACTAAGATTTAC
ATCATCTTGGAGTATATTACTGGTGGTGAACTGTTTGATAAGATTGTGCGTAACGGACGT
CTTAGTGAAGCTGAAGCTAGGAAGTACTTTCACCAGCTTATCGATGGAGTTGATTACTGC
CATAGTAAAGGCGTCTACCACAGAGATCTTAAGCCGGAGAATCTTCTACTGGATTCTCAA
GGAAATCTCAAGATATCTGATTTTGGGCTTAGTGCATTACCTGAGCAAGGAGTTACCATC
CTAAAGA*AACGTGTGGGACTCCAAATTACGTTGCTCCTGAGGTTCTGAGTCATAAGGGT
TATAATGGTGCTGTGGCAGATGTATGGTCCTGTGGGGTCATCCTTTATGTTCTTATGGCA
GGATATCTTCCGTTTGATGAAATGGATCTCCCTACTTTATACAGTAAGATTGACAATGCT
GAGTTCACTTGCCCCTCATATTTTGCCTTGGGAGCAAAGGCCTTGATCCGTAGAATTTTG
GATCCAAATCCTGAAACTCGAATTACAATTGCTGAAA

QA 2 638 2 638
DS 



AS 1 2

CO CL7921Contig1 716 2 1 U
GGGGTGTTTCATCTGCCCATAATCTCTAATCTTGTTTTCGTCATCTTTCTCTATGATCTC
ACTGAAGATACAATGAAGTCCAAGTGTTGTTCATCTTTTCGAAATCAAGTCTTCTTCCAT
CAATTTCGACGAAATCTCACAAATCCTCACACAAGAATATTGATTAAAGTTTTTGGAGAG
GGGGAAATACAGGACTTGAAATCTTAGACTTGCTGTTGTCCGGTCCTGATCTTCCGGCGT
TACAGATCTGTGATGATAAGTATTATAGGACTAATCATGTATACTTCTTTGTGAAGCCTA
AGAGTGTCATCGTTTGGTGTGGGAGTTGAACGAGAAGGTGATAAGGTTTGTTCTTGCTGT
ACTCTGTATGAGATTGATGAATATGGGGTGAAGAGTAAATGGGAGACAGAACAAAGCTAT
ATGCGTGAATTGTATTGCGCCTTCATTTGTGGCTACGTGTATGTTCCAATTTTGATCCCT
CTTCCATGGGTAAGAGATTAGGGCTTTGTTTCTTGTTCTATAAGCTTTCGTTTTGCTCTT
TGTTCGTTGATCTTCTGCCATGTATATCTTAAAAGGAACTATATGATACATCTGTGTTGT
GCAGATGTACACTGAACATGACGTTGGGTTTGGTTTTCGTATTACAATCCTGACAAGTTT
TAGTTTATGGTGCACTGTTATATCATGTGTGTCTCAGTAATGATTACGTTGCTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FS14JQ C 1
AF RR2FS14TF U 1
BS 1 716 RR2FS14TF

RD RR2FS14JQ 716 0 0
GGGGTGTTTCATCTGCCCATAATCTCTAATCTTGTTTTCGTCATCTTTCTCTATGATCTC
ACTGAAGATACAATGAAGTCCAAGTGTTGTTCATCTTTTCGAAATCAAGTCTTCTTCCAT
CAATTTCGACGAAATCTCACAAATCCTCACACAAGAATATTGATTAAAGTTTTTGGAGAG
GGGGAAATACAGGACTTGAAATCTTAGACTTGCTGTTGTCCGGTCCTGATCTTCCGGCGT
TACAGATCTGTGATGATAAGTATTATAGGACTAATCATGTATACTTCTTTGTGAAGCCTA
AGAGTGTCATCGTTTGGTGTGGGAGTTGAACGAGAAGGTGATAAGGTTTGTTCTTGCTGT
ACTCTGTATGAGATTGATGAATATGGGGTGAAGAGTAAATGGGAGACAGAACAAAGCTAT
ATGCGTGAATTGTATTGCGCCTTCATTTGTGGCTACGTGTATGTTCCAATTTTGATCCCT
CTTCCATGGGTAAGAGATTAGGGCTTTGTTTCTTGTTCTATAAGCTTTCGTTTTGCTCTT
TGTTCGTTGATCTTCTGCCATGTATATCTTAAAAGGAACTATATGATACATCTGTGTTGT
GCAGATGTACACTGAACATGACGTTGGGTTTGGTTTTCGTATTACAATCCTGACAAGTTT
TAGTTTATGGTGCACTGTTATATCATGTGTGTCTCAGTAATGATTACGTTGCTTTC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RR2FS14TF 716 0 0
GGGGTGTTTCATCTGCCCATAATCTCTAATCTTGTTTTCGTCATCTTTCTCTATGATCTC
ACTGAAGATACAATGAAGTCCAAGTGTTGTTCATCTTTTCGAAATCAAGTCTTCTTCCAT
CAATTTCGACGAAATCTCACAAATCCTCACACAAGAATATTGATTAAAGTTTTTGGAGAG
GGGGAAATACAGGACTTGAAATCTTAGACTTGCTGTTGTCCGGTCCTGATCTTCCGGCGT
TACAGATCTGTGATGATAAGTATTATAGGACTAATCATGTATACTTCTTTGTGAAGCCTA
AGAGTGTCATCGTTTGGTGTGGGAGTTGAACGAGAAGGTGATAAGGTTTGTTCTTGCTGT
ACTCTGTATGAGATTGATGAATATGGGGTGAAGAGTAAATGGGAGACAGAACAAAGCTAT
ATGCGTGAATTGTATTGCGCCTTCATTTGTGGCTACGTGTATGTTCCAATTTTGATCCCT
CTTCCATGGGTAAGAGATTAGGGCTTTGTTTCTTGTTCTATAAGCTTTCGTTTTGCTCTT
TGTTCGTTGATCTTCTGCCATGTATATCTTAAAAGGAACTATATGATACATCTGTGTTGT
GCAGATGTACACTGAACATGACGTTGGGTTTGGTTTTCGTATTACAATCCTGACAAGTTT
TAGTTTATGGTGCACTGTTATATCATGTGTGTCTCAGTAATGATTACGTTGCTTTC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7923Contig1 1117 2 16 U
ATCGAAAAACCTAAAACCTGATAAATAAACTTGGACGCTCCTCACGAATCTCGGATCTGA
GGGTTACCTTTGCCTCTAATCATCTCCTTCCTCCTCCAAACCCTAACTTAATTGAGATTT
TAGGGCTCATTCGGATCGAATCATCCGTCAATTTCACCAGCCATGTCTGCCGTATATTGC
GGAAGTAAGAGATCTTACTTCGAAGAAACTCCTTCTCCGCCGCCGTCTTCGAAGAGGTTC
CGATGTTATTCCCCTTCCAATCCTCCAAACTGGTCCTCCTCCTCCTCTCCTTCCTCATCG
CTCGATCAGCTTCGCACCGCCTTTCCTCATCTTGAACTCTCCGTTCTTGTGGAGGCGTTG
GAAGGACATGGGAGTGACTTAAATGCTGCTATGAAAAGCTTATACGCTTTGGTATCTGCT
GAGGAGGAAAGAGCTGCCGCTATTAAGGAGACTGCTGCTTCACCAGCGAGTGCTGATGAC
TGGGTCTCATTGATAGTGAGGGAAGTCACGCAGTCTACTGGCACGGATGATGCGAAACTC
CGTACTGGAAGAGTCCTCGAGGCTTTAGAGAAGACGTTAAGCGCACGTGCTCACGATGAT
GCTGCCAAAAAATTCCAAGAGGAGAGTGTGGTAGCGCAGCAACAAGTGGAGGTCTTGATC
AAGGACAACACATTGCTGAAACGTGCTGTTGCTATCCAGCATGATCGGCAGAAGACCTTA
GAAGATGCTAACCAGCAGCTAGAATTTTTTAAGCAACTGATTCCTCAGTACCAGGGGAAG
GTCAGGAATCTGGAGGTGAATAATTACGCATTGAAAATGCAACTGGAGCAAATGGAACAC
GGCAACTTTATGATGCCGCAAAGATTCAATCCGGATGTTTTTTAAAGGTGTCAAAAGAGA
AACAAGCAGGGCAGATGGGAGGAGAAGATGCGAACAATAAAAGCGCAACAAGTAGAGGAG
AGATGATCAAAGTAGAAAACACAAGAAAAATGCTTTTGCATTGTATTTGCTGTTGTGTAG
TCAGAACAAAAACATATGTTTCCCTTTCCTTTGTCTTGTTTTATTTCTTTATATTTATAC
TTTGGTGCTGGTTGTTTGATGATCCTGAGGGAATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GU43TF U 1
AF RR2GU43JQB C 520
BS 1 611 RR2GU43TF
BS 612 612 RR2GU43JQB
BS 613 663 RR2GU43TF
BS 664 664 RR2GU43JQB
BS 665 667 RR2GU43TF
BS 668 668 RR2GU43JQB
BS 669 712 RR2GU43TF
BS 713 713 RR2GU43JQB
BS 714 716 RR2GU43TF
BS 717 717 RR2GU43JQB
BS 718 722 RR2GU43TF
BS 723 723 RR2GU43JQB
BS 724 732 RR2GU43TF
BS 733 733 RR2GU43JQB
BS 734 749 RR2GU43TF
BS 750 1117 RR2GU43JQB

RD RR2GU43TF 764 0 0
ATCGAAAAACCTAAAACCTGATAAATAAACTTGGACGCTCCTCACGAATCTCGGATCTGA
GGGTTACCTTTGCCTCTAATCATCTCCTTCCTCCTCCAAACCCTAACTTAATTGAGATTT
TAGGGCTCATTCGGATCGAATCATCCGTCAATTTCACCAGCCATGTCTGCCGTATATTGC
GGAAGTAAGAGATCTTACTTCGAAGAAACTCCTTCTCCGCCGCCGTCTTCGAAGAGGTTC
CGATGTTATTCCCCTTCCAATCCTCCAAACTGGTCCTCCTCCTCCTCTCCTTCCTCATCG
CTCGATCAGCTTCGCACCGCCTTTCCTCATCTTGAACTCTCCGTTCTTGTGGAGGCGTTG
GAAGGACATGGGAGTGACTTAAATGCTGCTATGAAAAGCTTATACGCTTTGGTATCTGCT
GAGGAGGAAAGAGCTGCCGCTATTAAGGAGACTGCTGCTTCACCAGCGAGTGCTGATGAC
TGGGTCTCATTGATAGTGAGGGAAGTCACGCAGTCTACTGGCACGGATGATGCGAAACTC
CGTACTGGAAGAGTCCTCGAGGCTTTAGAGAAGACGTTAAGCGCACGTGCTCACGATGAT
GCTGCCAAAAA*TTCCAAGAGGAGAGTGTGGTAGCGCAGCAACAAGTGGAGGTCTTGATC
AAG*ACA*CACATTGCTGAAACGTGCTGTTGCTATCCAGCATGATCGGCAGA*GAC*TTA
GA*GATGCTAAC*AGCAGCTAGAATTTTT
AAGCACTGATCCTCA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RR2GU43JQB 598 0 0
GGCACGGATGATGCGAAACTCCGTACTGGAAGAGTCCTCGAGGCTTTAGAGAAGACGTTA
AGCGCACGTGCTCACGATGATGCTGCCAAAAAATTCCAAGAGGAGAGTGTGGTAGCGCAG
CAACAAGTGGAGGTCTTGATCAAGGACAACACATTGCTGAAACGTGCTGTTGCTATCCAG
CATGATCGGCAGAAGACCTTAGAAGATGCTAACCAGCAGCTAGAATTTTTTAAGCAACTG
ATTCCTCAGTACCAGGGGAAGGTCAGGAATCTGGAGGTGAATAATTACGCATTGAAAATG
CAACTGGAGCAAATGGAACACGGCAACTTTATGATGCCGCAAAGATTCAATCCGGATGTT
TTTTAAAGGTGTCAAAAGAGAAACAAGCAGGGCAGATGGGAGGAGAAGATGCGAACAATA
AAAGCGCAACAAGTAGAGGAGAGATGATCAAAGTAGAAAACACAAGAAAAATGCTTTTGC
ATTGTATTTGCTGTTGTGTAGTCAGAACAAAAACATATGTTTCCCTTTCCTTTGTCTTGT
TTTATTTCTTTATATTTATACTTTGGTGCTGGTTGTTTGATGATCCTGAGGGAATATC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL7924Contig1 584 2 2 U
GCTTCACTTCCAGATCATCCGTCTCGCAAAACAGATTTATGTATGGATCGGTTATAATTC
CGCCAAATTTGGGAATCTTTACGCAGCCGCTTCAACCCGACCGAGTAATACAGTAAGTGT
TACTTCCGTACTTGATGGAACATCTGATAACACTGGCTCTGGCATTGCCCGTAGATTAGT
GATGAAGACTGGTCTCAATATAATCATGGCTTGCAACATCCCTAAAAACAATCCTTTGCT
TGAGACAAAAGCTGAGAAAGTGTTGAACAGAAAATTGATTGATCTTGGTTACACAATGCC
AACACCTCTACGAGCAACATAACCGGAAGAGTGAATCGAATTACAGAATCTTGATGATTG
TTTGGTTATTAAGTCATGTCAATTATCCTAAGTACAAGTGCTAGACTTCGTTTCTTGCTT
TCTGTGTTTATAATCCTGAGCTTCCCTAGCCCGTTTACTTAATACGCTAATGATTTTTTT
TTTTTTTTCATATCTTCCTATCTTATGCTCTGTCTGTTTCTCGATTACTTCAATGGTCTA
AGTTTCTTGATCTTGAATAAGAAGTGAAAACTATTTTGGTAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C216JQ C 1
AF RR2C216TF U 18
BS 1 17 RR2C216JQ
BS 18 584 RR2C216TF

RD RR2C216JQ 584 0 0
GCTTCACTTCCAGATCATCCGTCTCGCAAAACAGATTTATGTATGGATCGGTTATAATTC
CGCCAAATTTGGGAATCTTTACGCAGCCGCTTCAACCCGACCGAGTAATACAGTAAGTGT
TACTTCCGTACTTGATGGAACATCTGATAACACTGGCTCTGGCATTGCCCGTAGATTAGT
GATGAAGACTGGTCTCAATATAATCATGGCTTGCAACATCCCTAAAAACAATCCTTTGCT
TGAGACAAAAGCTGAGAAAGTGTTGATCAGAAAATTGATTGATCTTGGTTACACAATGCC
AACACCTTTACGAGCAACATAACCGGAAGAGTGAATCGAATTACAGAATCTTGATGATTG
TTTGGTTATTAAGTCATGTCAATTATCCTAAGTACAAGTGCTAGACTTCGTTTCTTGCTT
TCTGTGTTTATAATCCTGAGCTTCCCTAGCCCGTTTACTTAATACGCTAATGATTTTTTT
TTTTTTTTCATATCTTCCTATCTTATGCTCTGTCTGTTTCTCGATTACTTCAATGGTCTA
AGTTTCTTGATCTTGAATAAGAAGTGAAAACTATTTTGGTAGGT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RR2C216TF 567 0 0
TCCGTCTCGCAAAACAGATTTATGTATGGATCGGTTATAATTCCGCCAAATTTGGGAATC
TTTACGCAGCCGCTTCAACCCGACCGAGTAATACAGTAAGTGTTACTTCCGTACTTGATG
GAACATCTGATAACACTGGCTCTGGCATTGCCCGTAGATTAGTGATGAAGACTGGTCTCA
ATATAATCATGGCTTGCAACATCCCTAAAAACAATCCTTTGCTTGAGACAAAAGCTGAGA
AAGTGTTGAACAGAAAATTGATTGATCTTGGTTACACAATGCCAACACCTCTACGAGCAA
CATAACCGGAAGAGTGAATCGAATTACAGAATCTTGATGATTGTTTGGTTATTAAGTCAT
GTCAATTATCCTAAGTACAAGTGCTAGACTTCGTTTCTTGCTTTCTGTGTTTATAATCCT
GAGCTTCCCTAGCCCGTTTACTTAATACGCTAATGATTTTTTTTTTTTTTTCATATCTTC
CTATCTTATGCTCTGTCTGTTTCTCGATTACTTCAATGGTCTAAGTTTCTTGATCTTGAA
TAAGAAGTGAAAACTATTTTGGTAGGT

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL7925Contig1 740 2 5 U
GGGTTCATCACTGTACTACTGTGAAAGTTAGTTAGTTCAACATTACCAAAACAACCAACG
ATGGCTAAAACCAGATGGTCTTGCCTCGCTATCGCCCTTTTGGCTATTACTCATTTCGTC
AACTGTGAAGAAGAAGCTGTCTTGTCTGAGAAAGAGCAGGACAAGGTCTCGAGATTGCCT
GGTCAGGATTTCGATATAGACTTTGCTCACTACTCCGGATTCGTTACTACTAATGAGGAA
CTGGAAAGAGCGCTCTTCTACTGGTTCTTTGAAGCCGCTGAAGATGCTGCGTCTAAGCCT
CTTGTTCTCTGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTTCATCAGTTGGATTTGGTGAAGCAGAA
GAGATAGGACCGTTTCACATTAACCCAGATGGGAAGACTCTTTACCTTAATCAATATTCT
TGGAACCAAGTTGCGAATATTTTGTTCCTTGATGCACCAGTTGGAGTTGGTTATTCATAC
TCAAACACCTCATCTGATTTGCTTACCAATGGTGATATGAGAACCGCGCAAGACTCACTG
AAGTTTCTTCTGAAATGGGTTGAGCGATATCCGGAGTACAAAGGAAGAGAGTTTTATATA
GTTGGAGAGAGCTATGCAGGGCATTACATTCCTCAGCTGAGTCAAGCCATTGTAGAGCAT
AACCAAGCTTATGGAGATAACACCATTAATCTGATGGGTTACATGGTAGTAATGGGCTGA
TGGATGATTTCCATGACAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GM13TF U 6
AF RR2BW92TF U 1
BS 1 111 RR2BW92TF
BS 112 112 RR2GM13TF
BS 113 679 RR2BW92TF
BS 680 680 RR2GM13TF
BS 681 740 RR2BW92TF

RD RR2GM13TF 687 0 0
G
ATCACTGTACTACTGTGAAAGTTAGTTAGTTCAACGTTACCAAAACAACCAACGATGGCT
AAAACCAGATGGTCTTGCCTCGCTATCGCCCTTTTGGCTATTACTCATTTCGTCAACTGT
GAAGAAGAAGCTGTCTTGTCTGAGAAAGAGCAGGACAAGGTCTCGAGATTGCCTGGTCAG
GATTTCGATATAGACTTTGCTCACTACTCCGGATTCGTTACTACTAATGAGGAACTGGAA
AGAGCGCTCTTCTACTGGTTCTTTGAAGCCGCTGAAGATGCTGCGTCTAAGCCTCTTGTT
CTCTGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTTCATCAGTTGGATTTGGTGAAGCAGAAGAGATA
GGACCGTTTCACATTAACCCAGATGGGAAGACTCTTTACCTTAATCAATATTCTTGGAAC
CAAGTTGCGAATATTTTGTTCCTTGATGCACCAGTTGGAGTTGGTTATTCATACTCAAAC
ACCTCATCTGATTTGCTTACCAATGGTGATATGAGAACCGCGCAAGACTCACTGAAGTTT
CTTCTGAAATGGGTTGAGCGATATCCGGAGTACAAAGGAAGAGAGTTTTATATAGTTGGA
GAGAGCTATGCAGGGCATTACATTCCTCAGCTGAGTCAAGCCATTGTAGAGCATAACCAA
GCTTATGGAGATAACACCATTAATCT

QA 2 687 2 687
DS 

RD RR2BW92TF 740 0 0
GGGTTCATCACTGTACTACTGTGAAAGTTAGTTAGTTCAACATTACCAAAACAACCAACG
ATGGCTAAAACCAGATGGTCTTGCCTCGCTATCGCCCTTTTGGCTATTACTTATTTCGTC
AACTGTGAAGAAGAAGCTGTCTTGTCTGAGAAAGAGCAGGACAAGGTCTCGAGATTGCCT
GGTCAGGATTTCGATATAGACTTTGCTCACTACTCCGGATTCGTTACTACTAATGAGGAA
CTGGAAAGAGCGCTCTTCTACTGGTTCTTTGAAGCCGCTGAAGATGCTGCGTCTAAGCCT
CTTGTTCTCTGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTTCATCAGTTGGATTTGGTGAAGCAGAA
GAGATAGGACCGTTTCACATTAACCCAGATGGGAAGACTCTTTACCTTAATCAATATTCT
TGGAACCAAGTTGCGAATATTTTGTTCCTTGATGCACCAGTTGGAGTTGGTTATTCATAC
TCAAACACCTCATCTGATTTGCTTACCAATGGTGATATGAGAACCGCGCAAGACTCACTG
AAGTTTCTTCTGAAATGGGTTGAGCGATATCCGGAGTACAAAGGAAGAGAGTTTTATATA
GTTGGAGAGAGCTATGCAGGGCATTACATTCCTCAGCTGAGTCAAGCCATTGTAGAGCAT
AACCAAGCTTATGGAGATA*CACCATTAATCTGATGGGTTACATGGTAGTAATGGGCTGA
TGGATGATTTCCATGACAGC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL7926Contig1 814 2 2 U
GGAGACGATATAACTTGCGTGCGGTTTATCTACTTTTGTACATGGAAATGTGGCGAAGCA
GTCTTTTCACACATATATACATCAGTACATGGGAATAAACTTTGCCTTAGTACGTGTATA
TACAAGGAAAGGGAATCAGAACTCAAAAGAGTTATTAAGCTGGACAGAGAAAGAAGGCCG
GCCAATACTTGCTGCTAGAGGAGTATCAGCTCTAACTACTATCCCTGCGCGTCCGTTGTT
ACCATTCCATTTCGACCGACCAAAAGATACAGAGGCAAAAGCTGAAGGATGTGCGTTGAG
TGCGTAGCCATATATCAAGTTCAAGTCATCACTCAGCGAGTGTATCACTTCCGCTTTCAT
CCCAGGGTTGCTTCCACCAAACGTGGGACATACACTGAGTTGAAGTGTAGGCTTCATCAG
TAGTCCAGAACTACGCCATGCCAAACCTTGAGAAACCTCTAACGCGAATGATTTGTCAGG
CAAATGAACCATTGGTGTGATTCTGGTTCCACGTTTGTTCTTACAAGAGTAACTAAACCT
CATATCACCAGGATACTGACCCTGTGCTTGAAGAAGACCTCCACAGAAAGGCACAAAGGT
ACTTACTGTCAGCCCCTCGCCAGACACATACGTCAGTTGCCCGTTTGGGAACTGCAAATC
CATAAAAGAGCAAGATAAGGGGTTGAGACATAGCATTGACATCATAAGCCATCTTCGATG
CTTTGACCATACAGCTGGGCAGAGTGAATGCATACCTTTCTTCCTGTCATATCCATACCA
GAGCAAGTGTTGTTTCGATAAGTGTAACGGTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H559TF C 1
AF RR2CE41JQ U 12
BS 1 13 RR2H559TF
BS 14 814 RR2CE41JQ

RD RR2H559TF 575 0 0
GGAGACGATATAACTTGCGTGCGGTTTATCTACTTTTGTACATGGAAATGTGGCGAAGCA
GTCTTTTCACACATATATACATCAGTACATGGGAATAAACTTTGCCTTAGTACGTGTATA
TACAAGGAAAGGGAATCAGAACTCAAAAGAGTTATTAAGCTGGACAGAGAAAGAAGGCCG
GCCAATACTTGCTGCTAGAGGAGTATCAGCTCTAACTACTATCCCTGCGCGTCCGTTGTT
ACCATTCCATTTCGACCGACCAAAAGATACAGAGGCAAAAGCTGAAGGATGTGCGTTGAG
TGCGTAGCCATATATCAAGTTCAAGTCATCACTCAGCGAGTGTATCACTTCCGCTTTCAT
CCCAGGGTTGCTTCCACCAAACGTGGGACATACACTGAGTTGAAGTGTAGGCTTCATCAG
TAGTCCAGAACTACGCCATGCCAAACCTTGAGAAACCTCTAACGCGAATGATTTGTCAGG
CAAATGAACCATTGGTGTGATTCTGGTTCCACGTTTGTTCTTACAAGAGTAACTAAACCT
CATATCGCCAGGATACTGACCCTGTGCTTGAAGA
C

QA 1 574 1 574
DS 

RD RR2CE41JQ 803 0 0
GG
CTTGCGTGCGGTTTATCTACTTTTGTACATGGAAATGTGGCGAAGCAGTCTTTTCACACA
TATATACATCAGTACATGGGAATAAACTTTGCCTTAGTACGTGTATATACAAGGAAAGGG
AATCAGAACTCAAAAGAGTTATTAAGCTGGACAGAGAAAGAAGGCCGGCCAATACTTGCT
GCTAGAGGAGTATCAGCTCTAACTACTATCCCTGCGCGTCCGTTGTTACCATTCCATTTC
GACCGACCAAAAGATACAGAGGCAAAAGCTGAAGGATGTGCGTTGAGTGCGTAGCCATAT
ATCAAGTTCAAGTCATCACTCAGCGAGTGTATCACTTCCGCTTTCATCCCAGGGTTGCTT
CCACCAAACGTGGGACATACACTGAGTTGAAGTGTAGGCTTCATCAGTAGTCCAGAACTA
CGCCATGCCAAACCTTGAGAAACCTCTAACGCGAATGATTTGTCAGGCAAATGAACCATT
GGTGTGATTCTGGTTCCACGTTTGTTCTTACAAGAGTAACTAAACCTCATATCACCAGGA
TACTGACCCTGTGCTTGAAGAAGACCTCCACAGAAAGGCACAAAGGTACTTACTGTCAGC
CCCTCGCCAGACACATACGTCAGTTGCCCGTTTGGGAACTGCAAATCCATAAAAGAGCAA
GATAAGGGGTTGAGACATAGCATTGACATCATAAGCCATCTTCGATGCTTTGACCATACA
GCTGGGCAGAGTGAATGCATACCTTTCTTCCTGTCATATCCATACCAGAGCAAGTGTTGT
TTCGATAAGTGTAACGGTAAG

QA 3 803 3 803
DS 



AS 1 2

CO CL7927Contig1 566 2 1 U
GGATATTATATCGTCTTAATAGAGTTCTTACCACTTGTCTATACAACATTCTTCCAACAC
ATTAACCCGATAAAAACATTCTTTCATCGTTTAAAATAATGGGAGGAGCAACATTAGAAG
GACAAAGAAAGGAATCAATTTGGGTTTTGAGGAGAAAACAAAGAGCTCGAAGGGCACTTG
CGAAGAAGATCATGATCCGACCCAAGAAGAGTCTGGAAGCTACTAGAAGACCTTCTCGTG
CCATTCATAAACGAGTCAAGACGCTGAAAAAGCTTGTTCCCAACACTAAATCATCTTCAG
AAGGTTTGGAAGGACTGTTTATGCAAACGGCGGATTATATTTTGGCTTTGGAAAGGAAAG
TGAGAGTTATGCAAACTATGGTTCAGGTTTTGACCGAAACTGATTGTGTTTAACGACCTT
ATTAATTTTTGTATATCTTGCTGGGGTTTTAAACTTTATTACAATTATAAAATACGTGTT
TTTAGTTGGTATTTGTTCGTGTTTATTTTTATTATCTTGAGTGATTATATTGTGCTATAT
AGAAACAAAATTGAGATGTGTTGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FN71TF U 1
AF RR2FN71JQ C 53
BS 1 566 RR2FN71TF

RD RR2FN71TF 566 0 0
GGATATTATATCGTCTTAATAGAGTTCTTACCACTTGTCTATACAACATTCTTCCAACAC
ATTAACCCGATAAAAACATTCTTTCATCGTTTAAAATAATGGGAGGAGCAACATTAGAAG
GACAAAGAAAGGAATCAATTTGGGTTTTGAGGAGAAAACAAAGAGCTCGAAGGGCACTTG
CGAAGAAGATCATGATCCGACCCAAGAAGAGTCTGGAAGCTACTAGAAGACCTTCTCGTG
CCATTCATAAACGAGTCAAGACGCTGAAAAAGCTTGTTCCCAACACTAAATCATCTTCAG
AAGGTTTGGAAGGACTGTTTATGCAAACGGCGGATTATATTTTGGCTTTGGAAAGGAAAG
TGAGAGTTATGCAAACTATGGTTCAGGTTTTGACCGAAACTGATTGTGTTTAACGACCTT
ATTAATTTTTGTATATCTTGCTGGGGTTTTAAACTTTATTACAATTATAAAATACGTGTT
TTTAGTTGGTATTTGTTCGTGTTTATTTTTATTATCTTGAGTGATTATATTGTGCTATAT
AGAAACAAAATTGAGATGTGTTGTCG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2FN71JQ 514 0 0
TCCAACACATTAACCCGATAAAAACATTCTTTCATCGTTTAAAATAATGGGAGGAGCAAC
ATTAGAAGGACAAAGAAAGGAATCAATTTGGGTTTTGAGGAGAAAACAAAGAGCTCGAAG
GGCACTTGCGAAGAAGATCATGATCCGACCCAAGAAGAGTTTGGAAGCTACTAGAAGACC
TTTTCGTGCCATTCATAAACGAGTCAAGACGCTGAAAAAGCTTGTTCCCAACACTAAATC
ATTTTCAGAAGGTTTGGAAGGACTGTTTATGCAAACGGCGGATTATATTTTGGCTTTGGA
AAGGAAAGTGAGAGTTATGCAAACTATGGTTCAGGTTTTGACCGAAACTGATTGTGTTTA
ACGACCTTATTAATTTTTGTATATCTTGCTGGGGTTTTAAACTTTATTACAATTATAAAA
TACGTGTTTTTAGTTGGTATTTGTTCGTGTTTATTTTTATTATCTTGAGTGATTATATTG
TGCTATATAGAAACAAAATTGAGATGTGTTGTCG

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL7928Contig1 1083 2 2 U
GGGAGGCTTTCACCGGATTTTCAGGACAGTCAGTGTACAATGACTACTACTTGTTACTCT
TCAATGTTGTCCTTACCTCATTGCCAGTGATTGCTCTTGGAGTCTTTGAACAAGATGTTT
CCTCTTAGATTTGCTTACAATTCCCAGCTTTATACCAACAAGGCACAAAGAACCTCTTCT
TTGATTGGTCAAGAATACTTGGATGGATGTGCAACGGCGTCTACTCATCGCTTGTCATAT
TCTTCCTCAACATAGGAATCATCTACTCTCAAGCCTTCAGAGCAGGTGGCCAAACAGCTG
ACATGGACGCTGTCGGCACAACCATGTTCACTTGCATTATATGGGCAGTCAATGTTCAAA
TAGCACTAACCATGTCCCACTTCACTTGGATCCAGCACGTTTTGATCTGGGGAAGCATTG
GGTTCTGGTATCTCTTTGTAGCACTCTACGGGATGATGCCATCAAGCCTCTCCGGAAACG
TTTACAGGATTCTTGAAGAGGTTCTTGCACCTGCACCCATCTACTGGATGGCTACCTTGC
TGGTCACGGTAACTGCGGTTCTTCCTTACGTTACTCACATAGCTTACCAGAGATTCTTGC
ATCCGATGGATCATCACATCATCCAAGAGATCAAGTACTACAAGAGAGATGTGGAGGATG
CGAGACTGTGGACCAGAGAGCGTACAAAGGCACGAGAGGAGACAAAGATTGGTTTCACAG
CTAGAGTTGATGCGAAGATCAGACATCTAAGGTCGAAACTGAGCAAGAAGCAGTCGAATC
TATCTCATTGTTCAGCTCAAGATACAATGTCACCTAGATCATTGTAGCATGTATAGGTTT
GTCTTCTCAATTCTCTGATGTGTCAAGACTTTGAAGATGGTTCTTGATGCTGTTTTTTTT
GTGTGTGGAGAGGTTTTAGGAGTGAGATCGATGTAAAGAGTAGTAGCTGATGTTTTTTTT
AATTGTTGGGCTTATCATTTTTTAACATGCTTTGTTTCTTTTGTACAAAACTTAGGTTTT
GTGGATATGCTTACTTAGGACACAGAATGCTAAAAACTAATTTTATTTTGCGTATATACA
GTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RR2A547TF U 1
AF RR2A547JQ C 283
BS 1 747 RR2A547TF
BS 748 1083 RR2A547JQ

RD RR2A547TF 747 0 0
GGGAGGCTTTCACCGGATTTTCAGGACAGTCAGTGTACAATGACTACTACTTGTTACTCT
TCAATGTTGTCCTTACCTCATTGCCAGTGATTGCTCTTGGAGTCTTTGAACAAGATGTTT
CCTCTTAGATTTGCTTACAATTCCCAGCTTTATACCAACAAGGCACAAAGAACCTCTTCT
TTGATTGGTCAAGAATACTTGGATGGATGTGCAACGGCGTCTACTCATCGCTTGTCATAT
TCTTCCTCAACATAGGAATCATCTACTCTCAAGCCTTCAGAGCAGGTGGCCAAACAGCTG
ACATGGACGCTGTCGGCACAACCATGTTCACTTGCATTATATGGGCAGTCAATGTTCAAA
TAGCACTAACCATGTCCCACTTCACTTGGATCCAGCACGTTTTGATCTGGGGAAGCATTG
GGTTCTGGTATCTCTTTGTAGCACTCTACGGGATGATGCCATCAAGCCTCTCCGGAAACG
TTTACAGGATTCTTGAAGAGGTTCTTGCACCTGCACCCATCTACTGGATGGCTACCTTGC
TGGTCACGGTAACTGCGGTTCTTCCTTACGTTACTCACATAGCTTACCAGAGATTCTTGC
ATCCGATGGATCATCACATCATCCAAGAGATCAAGTACTACAAGAGAGATGTGGAGGATG
CGAGACTGTGGACCAGAGAGCGTACAAAGGCACGAGAGGAGACAAAGATTGGTTTCACAG
CTAGAGTTGATGCGAAGATCAGACATC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RR2A547JQ 801 0 0
CAGGTGGCCAAACAGCTGACATGGACGCTGTCGGCACAACCATGTTCACTTGCATTATAT
GGGCAGTCAATGTTCAAATAGCACTAACCATGTCCCACTTCACTTGGATCCAGCACGTTT
TGATCTGGGGAAGCATTGGGTTCTGGTATCTCTTTGTAGCACTCTACGGGATGATGCCAT
CAAGCCTCTCCGGAAACGTTTACAGGATTCTTGAAGAGGTTCTTGCACCTGCACCCATCT
ACTGGATGGCTACCTTGCTGGTCACGGTAACTGCGGTTCTTCCTTACGTTACTCACATAG
CTTACCAGAGATTCTTGCATCCGATGGATCATCACATCATCCAAGAGATCAAGTACTACA
AGAGAGATGTGGAGGATGCGAGACTGTGGACCAGAGAGCGTACAAAGGCACGAGAGGAGA
CAAAGATTGGTTTCACAGCTAGAGTTGATGCGAAGATCAGACATCTAAGGTCGAAACTGA
GCAAGAAGCAGTCGAATCTATCTCATTGTTCAGCTCAAGATACAATGTCACCTAGATCAT
TGTAGCATGTATAGGTTTGTCTTCTCAATTCTCTGATGTGTCAAGACTTTGAAGATGGTT
CTTGATGCTGTTTTTTTTGTGTGTGGAGAGGTTTTAGGAGTGAGATCGATGTAAAGAGTA
GTAGCTGATGTTTTTTTTAATTGTTGGGCTTATCATTTTTTAACATGCTTTGTTTCTTTT
GTACAAAACTTAGGTTTTGTGGATATGCTTACTTAGGACACAGAATGCTAAAAACTAATT
TTATTTTGCGTATATACAGTT

QA 1 801 1 801
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7930Contig1 792 2 2 U
GAGCCAGAACATATGAAGTGGGTTTATGATGAGGCTATCAAGAGAGCCGAGCTTTTTGGA
ATTCCAGGTGTCACATACTCTCTCACACAAGGTGTGGTGAAAAACATAATACCGGCGATT
GCATCCACCAACGCGATTATATCAGCAGCTTGTGCGCTTGAAACCTTGAAGATTGTATCT
GGATGTAGCAAAACACTTGCAAACTATCTAACGTATAACGGTGGAGAGGGTCTCCACACC
AAAGTGACTGAGTTCGAGAGAGACCAGGACTGTCTTGTGTGTGGTCCGGGCATTCTGATT
GAGCTCGAGACATCAATTACTTTGCAAAAGTTCATTGACATGCTTGAAGAACATCCGAAG
CTTCTACTGTCGAAAGCAAGTGTCAAACACGGCAAAGACAGCCTCTACATGCAGGCGCCT
CCGGTTCTAGAAGAAATGCACAGACCAAACCTAAGCAAGCCGCTCTATGACCTCATGGGA
AGAGTTCAGAAGGACACTGTCCATGTGTTTGGCACAGCCCTCAAGAACGAAGAGAAACAG
TCAAGCTTAACGAAGCTAAGGGTTGTTTTCAAAGGAGCCGATGGTGTTACTGACATGGAT
ACAGCCATCGGAGCATGAACTCTGAGAGAGAAACTGCCTTTTGATCGCAGCTAGATCCAT
TAAGATAATTGGGCAGCTTTAACTTGTCCCGTTCTTATTATTGGTAGCTGTGCCAGAAAA
TTCTTACTGCGTGATGAAAATAAAATTGTTTTTACTCCAAACAGATGGGTTCTTTTACAT
ATATATAGATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2EU18JQ C 1
AF RR2AJ30TF U 58
BS 1 57 RR2EU18JQ
BS 58 792 RR2AJ30TF

RD RR2EU18JQ 758 0 0
GAGCCAGAACATATGAAGTGGGTTTATGATGAGGCTATCAAGAGAGCCGAGCTTTTTGGA
ATTCCAGGTGTCACATACTCTCTCACACAAGGTGTGGTGAAAAACATAATACCGGCGATT
GCATCCACCAACGCGATTATATCAGCAGCTTGTGCGCTTGAAACCTTGAAGATTGTATCT
GGATGTAGCAAAACACTTGCAAACTATCTAACGTATAACGGTGGAGAGGGTCTCCACACC
AAAGTGACTGAGTTCGAGAGAGACCAGGACTGTCTTGTGTGTGGTCCGGGCATTCTGATT
GAGCTCGAGACATCAATTACTTTGCAAAAGTTCATTGACATGCTTGAAGAACATCCGAAG
CTTCTACTGTCGAAAGCAAGTGTCAAACACGGCAAAGACAGCCTCTACATGCAGGCGCCT
CCGGTTCTAGAAGAAATGCACAGACCAAACCTAAGCAAGCCGCTCTATGACCTCATGGGA
AGAGTTCAGAAGGACACTGTCCATGTGTTTGGCACAGCCCTCAAGAACGAAGAGAAACAG
TCAAGCTTAACTAAGCTAAGGGTTGTTTTCAAAGGAGCCGATGGTGTTACTGACATGGAT
ACAGCCATCGGAGCATGAACTCTGAGAGAGAAACTGCCTTTTGATCGCAGCTAGATCCAT
TAAGATAATTGGGCAGCTTTAACTTGTCTCGTTCTTATTATTGGTAGCTGTGCCAGAAAA
TTCTTACTGCGTGATGAAAATAAAATTGTTTTTACTC
T

QA 1 757 1 757
DS 

RD RR2AJ30TF 735 0 0
GGAATTCCAGGTGTCACATACTCTCTCACACAAGGTGTGGTGAAAAACATAATACCGGCG
ATTGCATCCACCAACGCGATTATATCAGCAGCTTGTGCGCTTGAAACCTTGAAGATTGTA
TCTGGATGTAGCAAAACACTTGCAAACTATCTAACGTATAACGGTGGAGAGGGTCTCCAC
ACCAAAGTGACTGAGTTCGAGAGAGACCAGGACTGTCTTGTGTGTGGTCCGGGCATTCTG
ATTGAGCTCGAGACATCAATTACTTTGCAAAAGTTCATTGACATGCTTGAAGAACATCCG
AAGCTTCTACTGTCGAAAGCAAGTGTCAAACACGGCAAAGACAGCCTCTACATGCAGGCG
CCTCCGGTTCTAGAAGAAATGCACAGACCAAACCTAAGCAAGCCGCTCTATGACCTCATG
GGAAGAGTTCAGAAGGACACTGTCCATGTGTTTGGCACAGCCCTCAAGAACGAAGAGAAA
CAGTCAAGCTTAACGAAGCTAAGGGTTGTTTTCAAAGGAGCCGATGGTGTTACTGACATG
GATACAGCCATCGGAGCATGAACTCTGAGAGAGAAACTGCCTTTTGATCGCAGCTAGATC
CATTAAGATAATTGGGCAGCTTTAACTTGTCCCGTTCTTATTATTGGTAGCTGTGCCAGA
AAATTCTTACTGCGTGATGAAAATAAAATTGTTTTTACTCCAAACAGATGGGTTCTTTTA
CATATATATAGATCA

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL7931Contig1 563 2 1 U
GGGTAACTCCTATCTCTTCCATTTTCCAAATCACTAAACTTTCTACAACCATTATGGCGA
GTTCACGACTAGCAAGATTCATAACGGAGGTTGCGCCACCGCAGTTTGTCACGGTGATGC
GGCGAAGAACGGCCAAAGTACTCGACACGATCAAGGAGGAAGAGAGAGAAGTTGGGACCG
ATCATTCCATATTTTCTTCTTCTTTGACTTCCAAAATCTCACCGTTTACTTCTCCTAATC
GTTCTTCCTCCTCCTCCTTGGCTTCTGTTTCAGTATGTGCGGGTCGGACCAGTTTTCCGG
TGACGGAGAATCGGAGCTCTTTTCCCGTTTTCAAGAACTGAATAAAATTCATCGTATCAT
GATCTGCTTTTCATATGTTATTATGTATATGTGTGTGTATGCTTCCGTTGTTGTCGGATG
ATCGGAGTTTTTTCCCTTAACGGGTTGATCAAACCCGGATCAGCATTATGAAGGCAGTAT
AATTGTATAATGAACATGTGGAAGGGACTTTGTTCAACGTCGTTTTTAATGTATTGTTTA
AATGGAAATGATCCTTTTAGTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D404JQ C 1
AF RR2D404TF U 1
BS 1 563 RR2D404TF

RD RR2D404JQ 563 0 0
GGGTAACTCCTATTTCTTCCATTTTCCAAATCACTAAACTTTCTACAACCATTATGGCGA
GTTCACGACTAGCAAGATTCATAACGGAGGTTGCGCCACCGCAGTTTGTCACGGTGATGC
GGCGAAGAACGGCCAAAGTACTCGACACGATCAAGGAGGAAGAGAGAGAAGTTGGGACCG
ATCATTCCATATTTTCTTCTTCTTTGACTTCCAAAATCTCACCGTTTACTTCTCCTAATC
GTTCTTCCTCCTCCTCCTTGGCTTCTGTTTCAGTATGTGCGGGTCGGACCAGTTTTCCGG
TGACGGAGAATCGGAGCTCTTTTCCCGTTTTCAAGAACTGAATAAAATTCATCGTATCAT
GATCTGCTTTTCATATGTTATTATGTATATGTGTGTGTATGCTTCCGTTGTTGTCGGATG
ATCGGAGTTTTTTCCCTTAACGGGTTGATCAAACCCGGATCAGCATTATGAAGGCAGTAT
AATTGTATAATGAACATGTGGAAGGGACTTTGTTCAACGTCGTTTTTAATGTATTGTTTA
AATGGAAATGATCCTTTTAGTCT

QA 1 563 1 563
DS 

RD RR2D404TF 563 0 0
GGGTAACTCCTATCTCTTCCATTTTCCAAATCACTAAACTTTCTACAACCATTATGGCGA
GTTCACGACTAGCAAGATTCATAACGGAGGTTGCGCCACCGCAGTTTGTCACGGTGATGC
GGCGAAGAACGGCCAAAGTACTCGACACGATCAAGGAGGAAGAGAGAGAAGTTGGGACCG
ATCATTCCATATTTTCTTCTTCTTTGACTTCCAAAATCTCACCGTTTACTTCTCCTAATC
GTTCTTCCTCCTCCTCCTTGGCTTCTGTTTCAGTATGTGCGGGTCGGACCAGTTTTCCGG
TGACGGAGAATCGGAGCTCTTTTCCCGTTTTCAAGAACTGAATAAAATTCATCGTATCAT
GATCTGCTTTTCATATGTTATTATGTATATGTGTGTGTATGCTTCCGTTGTTGTCGGATG
ATCGGAGTTTTTTCCCTTAACGGGTTGATCAAACCCGGATCAGCATTATGAAGGCAGTAT
AATTGTATAATGAACATGTGGAAGGGACTTTGTTCAACGTCGTTTTTAATGTATTGTTTA
AATGGAAATGATCCTTTTAGTCT

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 2

CO CL7932Contig1 561 2 1 U
GAAACACAAGATTTCGAGTTGAATATCTTTGCACTTACTAAAAAAGAAAACAAACTGCAA
AAAATGGCGTCATCAAGATTACAACTTGTTGTCCTTCTCGCCATATTCTCTCTCGTTATT
TCTGCCAAATCTCAAGGAAATGATATAATGGACGGACCGTGCCGCTTGAGGGGAACGTGC
AAACAGGACAGCGACTGCGACGTTCATTGCCATCGGAACACTGACCCTCCAGCCATGGGC
GGCCACTGCCTCTTGGCTAGACCCACTGGTCCTGTTTGTTGCTGCCTTTTTGATTAATCC
GATCCTTTTTAATTGTTTAACTCTCCATGATCAATTTTTTGTAGCAAAAGACAAAAGAAG
TCTCACGATCAAATAAGTTCTAAATTTACTCACGGCCCAACTCCCAATAAAGCGAGGAAT
AAAAAGAAAAGATTTTGTGTTTCTTATAACATTATTATTATTTTTGTTTACCGCACAGAC
ACTTGTATCATGTCATGGTAGTTTTTTTTTTAATTGCAAGAGAATGGCTACGATTATTAG
TGAACAATTATATAATTTACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CP37JQ C 1
AF RR2CP37TF U 1
BS 1 561 RR2CP37TF

RD RR2CP37JQ 561 0 0
GAAACACAAGATTTCGAGTTGAATATCTTTGCACTTACTAAAAAAGAAAACAAACTGCAA
AAAATGGCGTCATCAAGATTACAACTTGTTGTCCTTCTCGCCATATTCTCTCTCGTTATT
TCTGCCAAATCTCAAGGAAATGATATAATGGACGGACCGTGCCGCTTGAGGGGAACGTGC
AAACAGGACAGCGACTGGGACGTTCATTGCCATCGGAACACTGACCCTCCAGCCATGGGC
GGCCACTGCCTCTTGGCTAGACCCACTGGTCCTGTTTGTTGCTGCCTTTTTGATTAATCC
GATCCTTTTTAATTGTTTAACTCTCCATGATCAATTTTTTGTAGCAAAAGACAAAAGAAG
TCTCACGATCAAATAAGTTCTAAATTTACTCACGGCCCAACTCCCAATAAAGCGAGGAAT
AAAAAGAAAAGATTTTGTGTTTCTTATAACATTATTATTATTTTTGTTTACCGCACAGAC
ACTTGTATCATGTCATGGTAGTTTTTTTTTTAATTGCAAGAGAATGGCTACGATTATTAG
TGAACAATTATATAATTTACT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2CP37TF 561 0 0
GAAACACAAGATTTCGAGTTGAATATCTTTGCACTTACTAAAAAAGAAAACAAACTGCAA
AAAATGGCGTCATCAAGATTACAACTTGTTGTCCTTCTCGCCATATTCTCTCTCGTTATT
TCTGCCAAATCTCAAGGAAATGATATAATGGACGGACCGTGCCGCTTGAGGGGAACGTGC
AAACAGGACAGCGACTGCGACGTTCATTGCCATCGGAACACTGACCCTCCAGCCATGGGC
GGCCACTGCCTCTTGGCTAGACCCACTGGTCCTGTTTGTTGCTGCCTTTTTGATTAATCC
GATCCTTTTTAATTGTTTAACTCTCCATGATCAATTTTTTGTAGCAAAAGACAAAAGAAG
TCTCACGATCAAATAAGTTCTAAATTTACTCACGGCCCAACTCCCAATAAAGCGAGGAAT
AAAAAGAAAAGATTTTGTGTTTCTTATAACATTATTATTATTTTTGTTTACCGCACAGAC
ACTTGTATCATGTCATGGTAGTTTTTTTTTTAATTGCAAGAGAATGGCTACGATTATTAG
TGAACAATTATATAATTTACT

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL7933Contig1 906 2 2 U
GACTCGGAATATATAGTGTTCTTGATTCTTTATTTGTTGTAATAGGAGGAAACAGCAGTA
GCTTAACCAGATAATAGATGGTGGTTAGAGCTTCTTTCCTCCCTTTTTCTTAATGGACAA
ACGAATAAAAAAACAGAGCAGAGCTATTATAGGGTAGGTAGACGGGAGACGTACATACTA
GCTAGGGTTCTACTGCTATTTCTTCTTCATCTTGATGTATCATGTTGACAAGCATATCGA
CTTGCTCTTTCAACATTGTGTTCTCTCTTTCAATCTCTGTTCTCTTGCTTCTCTCTTGTA
GTAGCTGAAGTTGCAGATGCTCTAAGCAACGTGAGTCCTCTTCTAGCTGCTCGTTTAACC
CATCCATCTCTCGATCCTTTCTGTTCATTTCTTGGACAGCGATTCTACGCATGCTCTCAA
CCACATCAACGTTCACCAGCTTCCTCTTCTTACCAATCAACCAGCCTTTAGGGTAGTTTG
CAGACTCGAAATCTGGAGGTGGCAAGAGGGAATCAGCATCTGTTGGTCGCTTTCCGTTCA
AGTTTGTAATGGGTTCGAGTGGCTCAAACAGAGCTTTTCTTTTCTCGGACAGAACAGGAG
GAGTTGTGGTCATTGGTTCCCCAACTTTCTCGGTTTCCATCGCTGTTGTCTCATCCTTCT
CTGGTGTGACCTCCATAGCAGCTTCTAGTGCCTTGTCCTGGTTCACAGATGCTGATCTTT
TTCTTGACTTCCACGCGATCTTGGTGGTAGAGACAGGGAAAAACCCTCCCACAAATCCAT
CACCAACTGTCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTCTCCCTCAAATCCATTCCCTTTCTCCATTT
TAATACGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGGTTGAACGGTAAAGGTTTGGCGTTTCGGTTGCA
ACTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2DQ25JQ U 1
AF RR2BL41TF C 191
BS 1 762 RR2DQ25JQ
BS 763 906 RR2BL41TF

RD RR2DQ25JQ 769 0 0
GACTCGGAATATATAGTGTTCTTGATTCTTTATTTGTTGTAATAGGAGGAAACAGCAGTA
GCTTAACCAGATAATAGATGGTGGTTAGAGCTTCTTTCCTCCCTTTTTCTTAATGGACAA
ACGAATAAAAAAACAGAGCAGAGCTATTATAGGGTAGGTAGACGGGAGACGTACATACTA
GCTAGGGTTCTACTGCTATTTCTTCTTCATCTTGATGTATCATGTTGACAAGCATATCGA
CTTGCTCTTTCAACATTGTGTTCTCTCTTTCAATCTCTGTTCTCTTGCTTCTCTCTTGTA
GTAGCTGAAGTTGCAGATGCTCTAAGCAACGTGAGTCCTCTTCTAGCTGCTCGTTTAACC
CATCCATCTCTCGATCCTTTCTGTTCATTTCTTGGACAGCGATTCTACGCATGCTCTCAA
CCACATCAACGTTCACCAGCTTCCTCTTCTTACCAATCAACCAGCCTTTAGGGTAGTTTG
CAGACTCGAAATCTGGAGGTGGCAAGAGGGAATCAGCATCTGTTGGTCGCTTTCCGTTCA
AGTTTGTAATGGGTTCGAGTGGCTCAAACAGAGCTTTTCTTTTCTCGGACAGAACAGGAG
GAGTTGTGGTCATTGGTTCCCCAACTTTCTCGGTTTCCATCGCTGTTGTCTCATCCTTCT
CTGGTGTGACCTCCATAGCAGCTTCTAGTGCCTTGTCCTGGTTCACAGATGCTGATCTTT
TTCTTGACTTCCACGCGATCTTGGTGGTAGAGACAGGGAAAA
CCCTCCC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RR2BL41TF 716 0 0
TCTCTGCTATTCC
TCTTCATCTTGATGTATCATGTTGACAAGCATATCGACTTGCTCTTTCAACATTGTGTTC
TCTCTTTCAATCTCTGTTCTCTTGCTTCTCTCTTGTAGTAGCTGAAGTTGCAGATGCTCT
AAGCAACGTGAGTCCTCTTCTAGCTGCTCGTTTAACCCATCTATCTCTCGATCCTTTCTG
TTCATTTCTTGGACAGCGATTCTACGCATGCTCTCAACCACATCAACGTTCACCAGCTTC
CTCTTCTTACCAATCAACCAGCCTTTAGGGTAGTTTGCAGACTCGAAATCTGGAGGTGGC
AAGAGGGAATCAGCATCTGTTGGTCGCTTTCCGTTCAAGTTTGTAATGGGTTCGAGTGGC
TCAAACAGAGCTTTTCTTTTCTCGGACAGAACAGGAGGAGTTGTGGTCATTGGTTCCCCA
ACTTTCTCGGTTTCCATCGCTGTTGTCTCATCCTTCTCTGGTGTGACCTCCATAGCAGCT
TCTAGTGCCTTGTCCTGGTTCACAGATGCTGATCTTTTTCTTGACTTCCACGCGATCTTG
GTGGTAGAGACAGGGAAAAACCCTCCCACAAATCCATCACCAACTGTCTTCTTCTTCTTC
TTGTTCTCTCCCTCAAATCCATTCCCTTTCTCCATTTTAATACGAGGGAGAGAGAGAGAG
AGAGGTTGAACGGTAAAGGTTTGGCGTTTCGGTTGCAACTCCC

QA 14 716 14 716
DS 



AS 1 2

CO CL7934Contig1 883 2 4 U
GGATGTTTCTCCTCTTATATAAAGTCCTTCATCAATGATTTCATCAACCAAATCTACAGC
CTCGCAGAAGAAGATGAAGCCTAAATCTCCTGAAAGTCTCCCTTCTCCACCTGATATTCT
CCTATCCTTCAGAGGGAAGGTTTCATGCGGTGGTCTATGGTCGGTGCTTTAGCTGCTGCC
TCCGTCTGGTTCACTGATGGAAGCCAGGGTTTACAAATGATGGAGAGAGACGGAGGAAGA
TGTGGAAACCCGCGGAGGAGATTTAGATTAGGGTTCCGAAGAGAGCTAAAAGTGGATACG
TTGGTTCCTTATTGCAAAAGTGTCTTTCCGACTATTGTACTGGTTCTTCAATCATTGCAA
AAGTGCGCTTGGTGTTCATATCAGCTTTGTAAGGAGGACGTCAAACTTTTTCCTTCCTTA
GATATTCTAATTATAGTGCTTCTTCAGGTATTAGCTTTGGAAAAAAATTGAAAGTAGAGT
AGATGAAGCTTTAGCATATGTCATAACTTCATCGAAACCAGTGGTGGAGTAAGTGTTTGT
ATCAATCATCTCATTATAGGATCATGATCGCTTATTAGGGTCAAAGACATATCTAAGCAT
GACTTTCTATTTTATTTGGAGAGACCAAGGTGAAAGAGCAAGGGCTTTGAGAATGAGGCC
TGGGAGAAAGACAGGAGCGCTGCAGCAGGAGACTCCGCCAAGCTCCGTCACGAGGATATG
GTCCTACAAAAACAGAAATACGTCAAGGTCATAGTTAGTGGTATCGGTTTCGTTCTCCTC
GCTTCTTATACCCGCAGTTTCTATGTAGGTTTGAATACTGCATCAACTAATCTCTTTGAT
GCAAGATACAAATATTTTATTTAATAATGGTTATAGGTCATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FM48TF U 1
AF RR2FM48JQ C 202
BS 1 731 RR2FM48TF
BS 732 732 RR2FM48JQ
BS 733 773 RR2FM48TF
BS 774 883 RR2FM48JQ

RD RR2FM48TF 778 0 0
GGATGTTTCTCCTCTTATATAAAGTCCTTCATCAATGATTTCATCAACCAAATCTACAGC
CTCGCAGAAGAAGATGAAGCCTAAATCTCCTGAAAGTCTCCCTTCTCCACCTGATATTCT
CCTATCCTTCAGAGGGAAGGTTTCATGCGGTGGTCTATGGTCGGTGCTTTAGCTGCTGCC
TCCGTCTGGTTCACTGATGGAAGCCAGGGTTTACAAATGATGGAGAGAGACGGAGGAAGA
TGTGGAAACCCGCGGAGGAGATTTAGATTAGGGTTCCGAAGAGAGCTAAAAGTGGATACG
TTGGTTCCTTATTGCAAAAGTGTCTTTCCGACTATTGTACTGGTTCTTCAATCATTGCAA
AAGTGCGCTTGGTGTTCATATCAGCTTTGTAAGGAGGACGTCAAACTTTTTCCTTCCTTA
GATATTCTAATTATAGTGCTTCTTCAGGTATTAGCTTTGGAAAAAAATTGAAAGTAGAGT
AGATGAAGCTTTAGCATATGTCATAACTTCATCGAAACCAGTGGTGGAGTAAGTGTTTGT
ATCAATCATCTCATTATAGGATCATGATCGCTTATTAGGGTCAAAGACATATCTAAGCAT
GACTTTCTATTTTATTTGGAGAGACCAAGGTGAAAGAGCAAGGGCTTTGAGAATGAGGCC
TGGGAGAAAGACAGGAGCGCTGCAGCAGGAGACTCCGCCAAGCTCCGTCACGAGGATATG
GTCCTACAAAA*CAGAAATACGTCAAGGTCATAGTTAGTGGTATCGGTTTCGT
CTCCT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RR2FM48JQ 682 0 0
AGCCAGGGTTTACAAATGATGGAGAGAGACGGAGGAAGATGTGGAAACCCGCGGAGGAGA
TTTAGATTAGGGTTCCGAAGAGAGCTAAAAGTGGATACGTTGGTTCCTTATTGCAAAAGT
GTCTTTCCGACTATTGTACTGGTTCTTCAATCATTGCAAAAGTGCGCTTGGTGTTCATAT
CAGCTTTGTAAGGAGGACGTCAAACTTTTTCCTTCCTTAGATATTCTAATTATAGTGCTT
CTTCAGGTATTAGCTTTGGAAAAAAATTGAAAGTAGAGTAGATGAAGCTTTAGCATATGT
CATAACTTCATCGAAACCAGTGGTGGAGTAAGTGTTTGTATCAATCATCTCATTATAGGA
TCATGATCGCTTATTAGGGTCAAAGACATATTTAAGCATGACTTTTTATTTTATTTGGAG
AGACCAAGGTGAAAGAGCAAGGGCTTTGAGAATGAGGCCTGGGAGAAAGACAGGAGCGCT
GCAGCAGGAGACTCCGCCAAGCTCCGTCACGAGGATATGGTCCTACAAAAACAGAAATAC
GTCAAGGTCATAGTTAGTGGTATCGGTTTCGTTCTCCTCGCTTCTTATACCCGCAGTTTC
TATGTAGGTTTGAATACTGCATCAACTAATCTCTTTGATGCAAGATACAAATATTTTATT
TAATAATGGTTATAGGTCATAC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL7935Contig1 693 2 1 U
GATGGAATATGTGGAACAGAGCTAGACCATGGAGTTGTAGCTGTGGGTTACGGAACTGAG
AACGGAAAGGACTACTGGATTGTGAGAAACTCATGGGGAGGAAGCTGGGGAGAAAGCGGA
TACATAAAGATGGCACGTAACATTGCGGAGGCAACGGGAAAGTGTGGAATCGCTATGGAG
GCTTCATACCCTATCAAGAAAGGTCAGAACCCACCAAACCCTGGACCGTCACCACCATCT
CCCATTAAGCCACCGACCCAGTGTGACAAGTACTACTCTTTCCCCGAGAGCAACACTTGT
TGTTGTCTCTTCCAGTACGGCAAGTACTGCTTCGGTTGGGGATGTTGCCCTCTCGAAGCT
GCTACTTGCTGCGATGATAACACTAGCTGCTGTCCTCATGAGTACCCGGTTTGCAATGGC
GATACCTGTTTGATGAGTAAGAACAGTCCTTTCAGTGTTAATGCTTTGAAGCGTACACCC
GCCAAACCTTTCTGGGCACATAGCAGGAAGAACATGGCTTAAGAGAAATGCAAGGAAACA
TCGCTGATGAATTTTATTCCTTCTTAAGAGAGGAGAGACAAGAGTCAAGAGAATTCATCA
AAACGCTTTCTTATTGTTGTTGTTCTGATTATCTTAAAATTGCTGATTCTGCTGCTTGGG
GTTTTCTGTACATATAAAACCTCTTCCTAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2DW62TF U 1
AF RR2DW62JQ C 133
BS 1 693 RR2DW62TF

RD RR2DW62TF 693 0 0
GATGGAATATGTGGAACAGAGCTAGACCATGGAGTTGTAGCTGTGGGTTACGGAACTGAG
AACGGAAAGGACTACTGGATTGTGAGAAACTCATGGGGAGGAAGCTGGGGAGAAAGCGGA
TACATAAAGATGGCACGTAACATTGCGGAGGCAACGGGAAAGTGTGGAATCGCTATGGAG
GCTTCATACCCTATCAAGAAAGGTCAGAACCCACCAAACCCTGGACCGTCACCACCATCT
CCCATTAAGCCACCGACCCAGTGTGACAAGTACTACTCTTTCCCCGAGAGCAACACTTGT
TGTTGTCTCTTCCAGTACGGCAAGTACTGCTTCGGTTGGGGATGTTGCCCTCTCGAAGCT
GCTACTTGCTGCGATGATAACACTAGCTGCTGTCCTCATGAGTACCCGGTTTGCAATGGC
GATACCTGTTTGATGAGTAAGAACAGTCCTTTCAGTGTTAATGCTTTGAAGCGTACACCC
GCCAAACCTTTCTGGGCACATAGCAGGAAGAACATGGCTTAAGAGAAATGCAAGGAAACA
TCGCTGATGAATTTTATTCCTTCTTAAGAGAGGAGAGACAAGAGTCAAGAGAATTCATCA
AAACGCTTTCTTATTGTTGTTGTTCTGATTATCTTAAAATTGCTGATTCTGCTGCTTGGG
GTTTTCTGTACATATAAAACCTCTTCCTAAGTT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RR2DW62JQ 561 0 0
GCACGTAACATTGCGGAGGCAACGGGAAAGTGTGGAATCGCTATGGAGGCTTCATACCCT
ATCAAGAAAGGTCAGAACCCACCAAACCCTGGACCGTCACCACCATCTCCCATTAAGCCA
CCGACCCAGTGTGACAAGTACTACTCTTTCCCCGAGAGCAACACTTGTTGTTGTCTCTTC
CAGTACGGCAAGTACTGCTTCGGTTGGGGATGTTGCCCTCTCGAAGCTGCTACTTGCTGC
GATGATAACACTAGCTGCTGTCCTCATGAGTACCCGGTTTGCAATGGCGATACCTGTTTG
ATGAGTAAGAACAGTCCTTTCAGTGTTAATGCTTTGAAGCGTACACCCGCCAAACCTTTC
TGGGCACATAGCAGGAAGAACATGGCTTAAGAGAAATGCAAGGAAACATCGCTGATGAAT
TTTATTCCTTCTTAAGAGAGGAGAGACAAGAGTCAAGAGAATTCATCAAAACGCTTTCTT
ATTGTTGTTGTTCTGATTATCTTAAAATTGCTGATTCTGCTGCTTGGGGTTTTCTGTACA
TATAAAACCTCTTCCTAAGTT

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL7936Contig1 893 2 2 U
GCATGCCTCAAAGTCAAAGAAACACACATTCTTAATTAGAACAGACATATATCCAGCTTT
TCACTTGAGAGCATGAACTCTGTAAGCTTTTTTTTCTTTGAACACCAGAACTCTGTAAGT
CTATGTAGGTTAAGAAAAGGTAAAAAACGAAATGGTATTTACTATTTAGACTTTACTGGA
ACCAAAATTCTCCAGCGGTAATCGAAGGCAGAAACATTACAAAAAGAACAAAGAAAAAAA
TCCACAATCTCCTCTCTCTCTCTTTTTTCTTTCTGCTAATTTGCTCTCGATACCATTTGT
TCTCTGTTTTTTTTTCTTGTTTAAATAAAAAAAGAAACAGAAGAAAGCGGGCGAAATCTC
CGCCGCCTCATCTCTCCATTTCGCTTTAAAGACGGCTAGAAACGGTGCTCCGATCAATCC
CACGGCGGTGAATGAAACAAAAAGAAAACACACTATCATCGGATTCACTTCTTTTTATAT
TAGATATTATCTACAAATACGTTTTGGAAGATGCTAGTAGTCGATGATAGGTTCTCCGAT
GGTGAGATTTCTCTCCACAGTCCATGGTAAGTCGAAGAGCTTCGCGGTCACAAACTTGAA
GATCTTATTTACGTTTATGTTGTATGAAGCACTCGAGAAGAAGAGCGTCGCGTTTAGCGC
CTTGGCGTAGGTCCTCGCCTGGCTAGCAATAGTCCATTGCAGATCAATAGGAAGCTGAAT
AAACTCGTCAAACTTTGTTCCTACCATAACTGGAATCGCCGTCTGCATAAAGGAGACAAA
GTGTTTTATAAAAAGAGACCAAACTGAGAATGTTATTAGTGTTGTGTCTTAAAAATCTCA
CCTGATTAGACTTTCTAGCTTGTTGATACCAGCTAATCACACTGCATAATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2ES36TF U 1
AF RR2ES36JQ C 172
BS 1 664 RR2ES36TF
BS 665 893 RR2ES36JQ

RD RR2ES36TF 664 0 0
GCATGCCTCAAAGTCAAAGAAACACACATTCTTAATTAGAACAGACATATATCCAGCTTT
TCACTTGAGAGCATGAACTCTGTAAGCTTTTTTTTCTTTGAACACCAGAACTCTGTAAGT
CTATGTAGGTTAAGAAAAGGTAAAAAACGAAATGGTATTTACTATTTAGACTTTACTGGA
ACCAAAATTCTCCAGCGGTAATCGAAGGCAGAAACATTACAAAAAGAACAAAGAAAAAAA
TCCACAATCTCCTCTCTCTCTCTTTTTTCTTTCTGCTAATTTGCTCTCGATACCATTTGT
TCTCTGTTTTTTTTTCTTGTTTAAATAAAAAAAGAAACAGAAGAAAGCGGGCGAAATCTC
CGCCGCCTCATCTCTCCATTTCGCTTTAAAGACGGCTAGAAACGGTGCTCCGATCAATCC
CACGGCGGTGAATGAAACAAAAAGAAAACACACTATCATCGGATTCACTTCTTTTTATAT
TAGATATTATCTACAAATACGTTTTGGAAGATGCTAGTAGTCGATGATAGGTTCTCCGAT
GGTGAGATTTCTCTCCACAGTCCATGGTAAGTCGAAGAGCTTCGCGGTCACAAACTTGAA
GATCTTATTTACGTTTATGTTGTATGAAGCACTCGAGAAGAAGAGCGTCGCGTTTAGCGC
CTTG

QA 1 664 1 664
DS 

RD RR2ES36JQ 722 0 0
TTTACTGGAACCAAAATTCTCCAGCGGTAATCGAAGGCAGAAACATTACAAAAAGAACAA
AGAAAAAAATCCACAATCTCCTCTCTCTCTCTTTTTTCTTTCTGCTAATTTGCTCTCGAT
ACCATTTGTTCTCTGTTTTTTTTTCTTGTTTAAATAAAAAAAGAAACAGAAGAAAGCGGG
CGAAATCTCCGCCGCCTCATCTCTCCATTTCGCTTTAAAGACGGCTAGAAACGGTGCTCC
GATCAATCCCACGGCGGTGAATGAAACAAAAAGAAAACACACTATCATCGGATTCACTTC
TTTTTATATTAGATATTATCTACAAATACGTTTTGGAAGATGCTAGTAGTCGATGATAGG
TTCTCCGATGGTGAGATTTCTCTCCACAGTCCATGGTAAGTCGAAGAGCTTCGCGGTCAC
AAACTTGAAGATCTTATTTACGTTTATGTTGTATGAAGCACTCGAGAAGAAGAGCGTCGC
GTTTAGCGCCTTGGCGTAGGTCCTCGCCTGGCTAGCAATAGTCCATTGCAGATCAATAGG
AAGCTGAATAAACTCGTCAAACTTTGTTCCTACCATAACTGGAATCGCCGTCTGCATAAA
GGAGACAAAGTGTTTTATAAAAAGAGACCAAACTGAGAATGTTATTAGTGTTGTGTCTTA
AAAATCTCACCTGATTAGACTTTCTAGCTTGTTGATACCAGCTAATCACACTGCATAATC
AC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL7937Contig1 657 2 2 U
TTTTTTTTCATCCACACAAAAATACAATAATAGTTCAATACCACCATTCAGGGTTTAGGT
GCCAACACTCTTCAACGCTACTACTTATCTCACCAAAACACAAGTGAAAATAACATGTGA
TGACCAGAAAAACCTCATTTAAAACTGAAACATAATGACTCTACTCTGGATTCTCATTTA
TTCTTATTTAGAACGCCATCCTAGGATCCACAACACCGGAAGCACTGCCTTCACCAGTTA
CAAGCTGTTCAGGATCCTCCATTCCCCATTTAATGTAATCTGGAGATTCCCAGGCCTTGT
ACTCATCTACCAAACTCTCAATGATGTCTCTTGCTTCATCGAACTCTGAGAGATCATTGT
CAAACATGGGAAACTTTCGGTAATTGTCAAGAAAAGCTTGCTTCTTCCTCAATTTATCAT
ATTGGCTCAAACATTTGCTGAAAAGGTGCCTGATACTTGTGTGGCTTGCCAACATAAAAC
CACTGACCCTGTGTGCAGTTTGAACATATGGAGACTTCTTGGAAAGTGCAACCTGTATGC
TTGCAGGTCCCCATTCAATGAAGTTAACAAGCTTCCTTTCTCTTATCCTCTGCAAACTCT
CATGCACCTGAGTGGGATCGACTTCTCCTTGAATGATATTCAAGATTGATATGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H376TF C 1
AF RR2H376JQ U 9
BS 1 8 RR2H376TF
BS 9 657 RR2H376JQ

RD RR2H376TF 657 0 0
TTTTTTTTCATCCACACAAAAATACAATAATAGTTCAATACCACCATTCAGGGTTTAGGT
GCCAACACTCTTCAACGCTACTACTTATCTCACCAAAACACAAGTGAAAATAACATGTGA
TGACCAGAAAAACCTCATTTAAAACTGAAACATAATGACTCTACTCTGGATTCTCATTTA
TTCTTATTTAGAACGCCATCCTAGGATCCACAACACCGGAAGCACTGCCTTCACCAGTTA
CAAGCTGTTCAGGATCCTCCATTCCCCATTTAATGTAATCTGGAGATTCCCAGGCCTTGT
ACTCATCTACCAAACTCTCAATGATGTCTCTTGCTTCATCGAACTCTGAGAGATCATTGT
CAAACATGGGAAACTTTCGGTAATTGTCAAGAAAAGCTTGCTTCTTCCTCAATTTATCAT
ATTGGCTCAAACATTTGCTGAAAAGGTGCCTGATACTTGTGTGGCTTGCCAACATAAGAC
CACTGACCCTGTGTGCAGTTTGAACATATGGAGACTTCTTGGAAAGTGCAACCTGTATGC
TTGCAGGTCCCCATTCAATGAAGTTAACAAGCTTCCTTTCTCTTATCCTCTGCAAACTCT
CATGCACCTGAGTGGGATCGACTTCTCCTTGAATGATATTCAAGATTGATATGTACC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RR2H376JQ 649 0 0
CATCCACACAAAAATACAATAATAGTTCAATACCACCATTCAGGGTTTAGGTGCCAACAC
TCTTCAACGCTACTACTTATCTCACCAAAACACAAGTGAAAATAACATGTGATGACCAGA
AAAACCTCATTTAAAACTGAAACATAATGACTCTACTCTGGATTCTCATTTATTCTTATT
TAGAACGCCATCCTAGGATCCACAACACCGGAAGCACTGCCTTCACCAGTTACAAGCTGT
TCAGGATCCTCCATTCCCCATTTAATGTAATCTGGAGATTCCCAGGCCTTGTACTCATCT
ACCAAACTCTCAATGATGTCTCTTGCTTCATCGAACTCTGAGAGATCATTGTCAAACATG
GGAAACTTTCGGTAATTGTCAAGAAAAGCTTGCTTCTTCCTCAATTTATCATATTGGCTC
AAACATTTGCTGAAAAGGTGCCTGATACTTGTGTGGCTTGCCAACATAAAACCACTGACC
CTGTGTGCAGTTTGAACATATGGAGACTTCTTGGAAAGTGCAACCTGTATGCTTGCAGGT
CCCCATTCAATGAAGTTAACAAGCTTCCTTTCTCTTATCCTCTGCAAACTCTCATGCACC
TGAGTGGGATCGACTTCTCCTTGAATGATATTCAAGATTGATATGTACC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL7938Contig1 746 2 7 U
GGAAAGAAGAAACCCTAGCACAAGCAGGTTTGCCATGGGCTATAAGAACAATAAGAAAAA
GGAGAAAAAGAAGCAGCCGGTTGAGCATGAGCAGGAGAAGCAGCCTACTGCTGAGAAGAA
AGAAGAGAAGCAGAAGCAGGTGGTTGTTGATGAGGAAGACTACATACCCATTAAAACATT
AACTGAGCATGGGATAGATGCACAAACTGTGAAAACACTGCAAGATGCAGACATCTGGAA
TACTCTCCTCCTCACAAACAACAAGAATCTTTTGTCTGGAGTCAAAGGCCTACCACAATC
TATGTATGACCCAATCTGTGAAGCCATCCACAAAATAATGGTTTCCCTAACCTCTGAAGT
TCAACAATTCACGCAAAGGGCTTTAGCTGGTATGGAGGTCTTTTACAAAAAGAAAAAAGA
TGCCGTCATCAGAAAAGTTATTCGAGCCACTCAACAGTATGTCAAAGACTGTTACACCTT
CGATGAGATGGATAAGGCTTTGTCTAGTGAATTTAGGCACTCACGCGATGCAACCCAGAA
AATCTTCGAATGCTTTTTTGAGGGTGAAAAGGGATCCATGGCTTACAAGCAGCTTTCATC
GATACGTTCTGCACAGAGAAAAGCAAATCAGAAGGATAAACATGCTCCTCTTAAGAAAGA
GGAGGCTTTTACTGAGAAGAAAAAGGAGGAGTTTGTTGGGAAGAAGGAGGAGTTTGTTGA
GTTGGAGAAGCAAACTCCTAAGAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D794TF U 15
AF RR2B095TF U 1
BS 1 589 RR2B095TF
BS 590 591 RR2D794TF
BS 592 626 RR2B095TF
BS 627 627 RR2D794TF
BS 628 657 RR2B095TF
BS 658 658 RR2D794TF
BS 659 746 RR2B095TF

RD RR2D794TF 667 0 0
GG
AGCACAAGCAGGTTTGCCATGGGCTATAAGAACAATAAGAAAAAGGAGAAAAAGAAGCAG
CCGGTTGAGCATGAGCAGGAGAAGCAGCCTTCTGCTGAGAAGAAAGAAGAGAAGCAGAAG
CAGGTGGTTGTTGATGAGGAAGACTACATACCCATTAAAACATTAACTGAGCATGGGATA
GATGCACAAACTGTGAAAACACTGCAAGATGCAGACATCTGGAATACTCTCCTCCTCACA
AACAACAAGAATCTTTTGTCTGGAGTCAAAGGCCTACCACAATCTATGTATGACCCAATC
TGTGAAGCCATCCACAAAATAATGGTTTCCCTAACCTCTGAAGTTCAACAATTCACGCAA
AGGGCTTTAGCTGGTATGGAGGTCTTTTACAAAAAGAAAAAAGATGCCGTCATCAGAAAA
GTTATTCGAGCCACTCAACAGTATGTCAAAGACTGTTACACCTTCGATGAGATGGATAAG
GCTTTGTCTAGTGAATTTAGGCACTCACGCGATGCAACCCAGAAAATCTTCGAATGCTTT
TTTGAGGGTGAAAAGGGATCCATGGCTTACAAGCAGCTTTCATCGATACGTTCTGCACAG
AGAAAAGCAAATCAGAAGGATAAACATGCTCCTCTTAAGAAAGAGGAGGCTTTTACTGAG
AAGAA

QA 3 667 3 667
DS 

RD RR2B095TF 746 0 0
GGAAAGAAGAAACCCTAGCACAAGCAGGTTTGCCATGGGCTATAAGAACAATAAGAAAAA
GGAGAAAAAGAAGCAGCCGGTTGAGCATGAGCAGGAGAAGCAGCCTACTGCTGAGAAGAA
AGAAGAGAAGCAGAAGCAGGTGGTTGTTGATGAGGAAGACTACATACCCATTAAAACATT
AACTGAGCATGGGATAGATGCACAAACTGTGAAAACACTGCAAGATGCAGACATCTGGAA
TACTCTCCTCCTCACAAACAACAAGAATCTTTTGTCTGGAGTCAAAGGCCTACCACAATC
TATGTATGACCCAATCTGTGAAGCCATCCACAAAATAATGGTTTCCCTAACCTCTGAAGT
TCAACAATTCACGCAAAGGGCTTTAGCTGGTATGGAGGTCTTTTACAAAAAGAAAAAAGA
TGCCGTCATCAGAAAAGTTATTCGAGCCACTCAACAGTATGTCAAAGACTGTTACACCTT
CGATGAGATGGATAAGGCTTTGTCTAGTGAATTTAGGCACTCACGCGATGCAACCCAGAA
AATCTTCGAATGCTTTTTTGAGGGTGAAAAGGGATCCATGGCTTACAAGTGGCTTTCATC
GATACGTTCTGCACAGAGAAAAGCAACTCAGAAGGATAAACATGCTCCTCTTAAGAAGGA
GGAGGCTTTTACTGAGAAGAAAAAGGAGGAGTTTGTTGGGAAGAAGGAGGAGTTTGTTGA
GTTGGAGAAGCAAACTCCTAAGAAGA

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL7939Contig1 793 2 6 U
ACATCTAAATCTCATTGTTGAGTATTATTATCATCACGAATAAGCTTAACCAAAGAGTTC
TTGTAACCAATGAAATACTCCATGGTTGTCGATAAAAGAGATATATCTTCTATGCACATG
GTCTAGCAAACAGTTGATGAAAATAAGCTGCCCTGTTTCTTAGATAGAAGAGATCTTCAT
GTGATCTATCTTTTCTTGAGTCTCCATGTCGATCACATTCTGCAACGCTCCTTCACCAGT
CAAGAAACTCGGTTGATTTGTCGATGCAAGGAGTCTAGCCCACATCCTATCCGTTAACTT
CACCGTATTCGTCACTTCTGTCACTCGAGAAATTGGGATGTAAGCATGTCTGCTGTTAAC
TGGTCCAACTGTGAAACCTGAGTACCCAGCCATTGCTCCATGAACTGCACTTTGCGCAAG
AAGAGTGCAATAGACATTGTCTGATGCGTTACTCGGTATTGCTCTTATCATATACGTCGG
ATCTATGTACTTCATGTTTATTGTCATTTTTCGAACATTAGTAAAATGATCCTTAATCTG
CTGAGTCAACCATAGTCCCACATCAAGCAAGAGTCTGTTTCCTGACGCATCTTTAGTCTC
AGACGAACGCATGCTTTGAGCAACATAGTCCTGTCCAGCTCCTTCGGCTATCACAATAAC
CATGTGGCTATTCTCCTTGAGTCGTTGTTCAATAAACTCAAAGAGCCCACCCTTCCCTTC
AAGGAAGAATGGTGACTCTGGAATCAGGCAACAATCCACATCACGGTTCGCTAAAGTTGC
AATCATAGCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2H715JQB U 1
AF RR2D506TF C 74
BS 1 150 RR2H715JQB
BS 151 151 RR2D506TF
BS 152 182 RR2H715JQB
BS 183 183 RR2D506TF
BS 184 642 RR2H715JQB
BS 643 793 RR2D506TF

RD RR2H715JQB 642 0 0
ACATCTAAATCTCATTGTTGAGTATTATTATCATCACGAATAAGCTTAACCAAAGAGTTC
TTGTAACCAATGAAATACTCCATGGTTGTCGATAAAAGAGATATATCTTCTATGCACATG
GTCTAGCAAACAGTTGATGAAAATAAGCTGGCCTGTTTCTTAGATAGAAGAGATCTTCAT
GTTATCTATCTTTTCTTGAGTCTCCATGTCGATCACATTCTGCAACGCTCCTTCACCAGT
CAAGAAACTCGGTTGATTTGTCGATGCAAGGAGTCTAGCCCACATCCTATCCGTTAACTT
CACCGTATTCGTCACTTCTGTCACTCGAGAAATTGGGATGTAAGCATGTCTGCTGTTAAC
TGGTCCAACTGTGAAACCTGAGTACCCAGCCATTGCTCCATGAACTGCACTTTGCGCAAG
AAGAGTGCAATAGACATTGTCTGATGCGTTACTCGGTATTGCTCTTATCATATACGTCGG
ATCTATGTACTTCATGTTTATTGTCATTTTTCGAACATTAGTAAAATGATCCTTAATCTG
CTGAGTCAACCATAGTCCCACATCAAGCAAGAGTCTGTTTCCTGACGCATCTTTAGTCTC
AGACGAACGCATGCTTTGAGCAACATAGTCCTGTCCAGCTCC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2D506TF 720 0 0
AATACTCCATGGTTGTCGATAAAAGAGATATATCTTCTATGCACATGGTCTAGCAAACAG
TTGATGAAAATAAGCTGCCCTGTTTCTTAGATAGAAGAGATCTTCATGTGATCTATCTTT
TCTTGAGTCTCCATGTCGATCACATTCTGCAACGCTCCTTCACCAGTCAAGAAACTCGGT
TGATTTGTCGATGCAAGGAGTCTAGCCCACATCCTATCCGTTAACTTCACCGTATTCGTC
ACTTCTGTCACTCGAGAAATTGGGATGTAAGCATGTCTGCTGTTAACTGGTCCAACTGTG
AAACCTGAGTACCCAGCCATTGCTCCATGAACTGCACTTTGCGCAAGAAGAGTGCAATAG
ACATTGTCTGATGCGTTACTCGGTATTGCTCTTATCATATACGTCGGATCTATGTACTTC
ATGTTTATTGTCATTTTTCGAACATTAGTAAAATGATCCTTAATCTGCTGAGTCAACCAT
AGTCCCACATCAAGCAAGAGTCTGTTTCCTGACGCATCTTTAGTCTCAGACGAACGCATG
CTTTGAGCAACATAGTCCTGTCCAGCTCCTTCGGCTATCACAATAACCATGTGGCTATTC
TCCTTGAGTCGTTGTTCAATAAACTCAAAGAGCCCACCCTTCCCTTCAAGGAAGAATGGT
GACTCTGGAATCAGGCAACAATCCACATCACGGTTCGCTAAAGTTGCAATCATAGCAATC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL7940Contig1 628 2 3 U
GGAGAACAGAGTCGTGTAGCTCAGCATAGCTCCACCGCCGACGAAATCGACGTTGCAAAG
AGACTTAAGCTTCAACAGTATACCTAAAACCCTAAACCCTAGCAGAAAGAAATCGTCCAC
GACGGAGGATGAGACCTCACTACAACCGCCCGCAGCGACCGCAACAACAGCAGAACAATG
GGTACCCAAATCAACAACAACAGAATAGGTATCATCAGAACCCAGGGATGATGATGATGA
TGAATCCACAGATGATGATGATGATGATGGGTCACATGAACAACATGCCAATGCATCCTC
ATCAGCCGCCGATTCACCAGTTTGCTTTCCCAAACCCTATCAACCAGCTGCTTCCAAACC
ACCTGGGGAGTCTTCACTCAATACAGCCCACTTATTATCCGCCTCCGTATACTCCTGTTC
CACCTCCACCTCAAAATCAAAATCACCAATCGCGGCCTCCAGGTTTCTCAGAGGCGAGAC
CACAGGTGCAGTCTGTAGGAAACGTCAACAACACCAACAATTTCAATCCGAGAGGGAATG
ATTCTCGTAATAATTTTACAAAACAGCAGAACTTCAGAGGCCCTGGTCAAGGATCTCAGT
CGTATCAAGGAGACAATGCAAAGAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RR2BU57TF U 1
AF RR2FA11TF U 1
BS 1 240 RR2BU57TF
BS 241 243 RR2FA11TF
BS 244 628 RR2BU57TF

RD RR2BU57TF 628 0 0
GGAGAACAGAGTCGTGTAGCTCAGCATAGCTCCACCGCCGACGAAATCGACGTTGCAAAG
AGACTTAAGCTTCAACAGTATACCTAAAACCCTAAACCCTAGCAGAAAGAAATCGTCCAC
GACGGAGGATGAGACCTCACTACAACCGCCCGCAGCGACCGCAACAACAGCAGAACAATG
GGTACCCAAATCAACAACAACAGAATAGGTATCATCAGAACCCAGGGATGATGATGATGA
***ATCCACAGATGATGATGATGATGATGGGTCACATGAACAACATGCCAATGCATCCTC
ATCAGCCGCCGATTCACCAGTTTGCTTTCCCAAACCCTATCAACCAGCTGCTTCCAAACC
ACCTGGGGAGTCTTCACTCAATACAGCCCACTTATTATCCGCCTCCGTATACTCCTGTTC
CACCTCCACCTCAAAATCAAAATCACCAATCGCGGCCTCCAGGTTTCTCAGAGGCGAGAC
CACAGGTGCAGTCTGTAGGAAACGTCAACAACACCAACAATTTCAATCCGAGAGGGAATG
ATTCTCGTAATAATTTTACAAAACAGCAGAACTTCAGAGGCCCTGGTCAAGGATCTCAGT
CGTATCAAGGAGACAATGCAAAGAAAAA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RR2FA11TF 628 0 0
GGAGAACAGAGTCGTGTAGCTCAGCATAGCTCCACCGCCGACGAAATCGACGTTGCAAAG
AGACTTAAGCTTCAACAGTATACCTAAAACCCTAAACCCTAGCAGAAAGAAATCGTCCAC
GACGGAGGATGTGACCTCACTACAACCGCCCGCAGCGACCGCAACAACAGCAGAACAATG
GGTACCCAAATCAACAACAACAGAATGGGTATCATCAGAACCCAGGGATGATGATGATGA
TGAATCCACAGATGATGATGATGATGATGGGTCACATGAACAACATGCCAATGCATCCTC
ATCAGCCGCCGATTCACCAGTTTGCTTTCCCAAACCCTATCAACCAGCTGCTTCCAAACC
ACCTGGGGAGTCTTCACTCAATACAGCCCACTTATTATCCGCCTCCGTATACTCCTGTTC
CACCTCCACCTCAAAATCAAAATCACCAATCGCGGCCTCCAGGTTTCTCAGAGGCGAGAC
CACAGGTGCAGTCTGTAGGAAACGTCAACAACACCAACAATTTCAATCCGAGAGGGAATG
ATTCTCGTAATAATTTTACAAAACAGCAGAACTTCAGAGGCCCTGGTCAAGGATCTCAGT
CGTATCAAGGAGACAATGCAAAGAAAAA

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL7941Contig1 565 2 1 U
GGGGAGATCGAGCCGAGCGAGCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCGGCGGCCATGGGA
GCGTTTTGGGGAACTAGGGTGATGGAAATAGTGAAGAAGCACGATTCAGGTGGTCTCATT
TGGAAGAGAATCAAGCTCACCTCTACTCGTAAAGCCAATGCTAAAACCCGCCTCCGTCGC
GTTTGGCAGAACGAGGCTGTTCTAAAGGCGTGCGGGACATCAGATGCATCAATTTCCCCG
GGAGTTAGCAGCAACACAGAAACCTGTGCCAGTACTGTGAAAAAATGAGTGAGGAGGAGG
ACGAGAAGCTACAAAACATGGTTGTTACTGTAGTGGTATTTGAACTTTGTGTTGTTACTT
GTTAGGTTATATTGGTTTTAAACATGTTGAATCTGCAACAATAAGAGACTTTTGTGTTGT
TATTGTGATCAAGAAAATTATTGGTCAGCTACTCAAAAATACGTCTTGGTCTTTGGTACA
CCAACTTGATCAATCCTTATCCTTGCTATTTTGTTAAACACAGCCGGGGGCTAGACAGTG
GTTGTAGTTATAAGTGTCGTTAAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2C296JQ C 1
AF RR2C296TF U 1
BS 1 565 RR2C296TF

RD RR2C296JQ 565 0 0
GGGGAGATCGAGCCGAGCGAGCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCGGCGGCCATGGGA
GCGTTTTGGGGAACTAGGGTGATGGAAATAGTGAAGAAGCACGATTCAGGTGGTCTCATT
TGGAAGAGAATCAAGCTCACCTCTACTCGTAAAGCCAATGCTAAAACCCGCCTCCGTCGC
GTTTGGCAGAACGAGGCTGTTTTAAAGGCGTGCGGGACATCAGATGCATCAATTTCCCCG
GGAGTTAGCAGCAACACAGAAACCTGTGCCAGTACTGTGAAAAAATGAGTGAGGAGGAGG
ACGAGAAGCTACAAAACATGGTTGTTACTGTAGTGGTATTTGAACTTTGTGTTGTTACTT
GTTAGGTTATATTGGTTTTAAACATGTTGAATCTGCAACAATAAGAGACTTTTGTGTTGT
TATTGTGATCAAGAAAATTATTGGTCAGCTACTCAAAAATACGTCTTGGTCTTTGGTACA
CCAACTTGATCAATCCTTATCCTTGCTATTTTGTTAAACACAGCCGGGGGCTAGACAGTG
GTTGTAGTTATAAGTGTCGTTAAGC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2C296TF 565 0 0
GGGGAGATCGAGCCGAGCGAGCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCGGCGGCCATGGGA
GCGTTTTGGGGAACTAGGGTGATGGAAATAGTGAAGAAGCACGATTCAGGTGGTCTCATT
TGGAAGAGAATCAAGCTCACCTCTACTCGTAAAGCCAATGCTAAAACCCGCCTCCGTCGC
GTTTGGCAGAACGAGGCTGTTCTAAAGGCGTGCGGGACATCAGATGCATCAATTTCCCCG
GGAGTTAGCAGCAACACAGAAACCTGTGCCAGTACTGTGAAAAAATGAGTGAGGAGGAGG
ACGAGAAGCTACAAAACATGGTTGTTACTGTAGTGGTATTTGAACTTTGTGTTGTTACTT
GTTAGGTTATATTGGTTTTAAACATGTTGAATCTGCAACAATAAGAGACTTTTGTGTTGT
TATTGTGATCAAGAAAATTATTGGTCAGCTACTCAAAAATACGTCTTGGTCTTTGGTACA
CCAACTTGATCAATCCTTATCCTTGCTATTTTGTTAAACACAGCCGGGGGCTAGACAGTG
GTTGTAGTTATAAGTGTCGTTAAGC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL7942Contig1 808 2 1 U
GGAGACAGACACATAGCAATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTG
GAAGAACAGAAGATTGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGATGATGACAACGATGAG
GATGACTCCGACGATGATAAAGATGATGATGATGCCAAGGGGCAAGATGGAGAGGGAGGA
GGAAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAGAAGAGCCGCAAGGCCATGCTCAAGCTCGGT
ATGAAACCCATCACCGGTGTCAGCCGTGTCACCGTCAGAAAGAGCAAGAATATCATGTTT
GTCATATCAAAACCTGATGTCTTCAAGAGCCCAGCATCAGACACATACGTAATCTTTGGA
GAGGCCAAGATCGAAGACCTGAGCTCTCAGATGCAGTCGCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAG
GCTCCGGATCTCAGCAACGTGATCAAGGGCGAATCGTCTTCGTCCGGCGCTGCTGCAGTG
GTGCAGGATGATGATGATGAGGAAGTCGACGAGGAAGGTGTTGAGCCAAAGGACATTGAG
TTGGTGATGACACAAGCAGGTGTGCCTAGGCCAAGAGCCGTGAAGGCTCTCAAGGTTGCT
GATGGAGATATCGTCTCTGCCATCATGGAGCTTACCACCTAAAACCAAAAATCTTTTCCA
ACCTTAGATGTGGTTTTTTAACTTGAGTTATATGTGTCCAAGAGATTTTCAAGTTTTTGT
TTCTATCTTGAAGTGATTTTCAATGTTGTATCAGTATTACAGTTAGGTTTGTTATTCAAT
TATCAAGCGTCGGTGGAGAGTTTCAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2AP93JQ C 1
AF RR2AP93TF U 1
BS 1 808 RR2AP93TF

RD RR2AP93JQ 808 0 0
GGAGACAGACACATAGCAATCATGACTAC*GAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTG
GAAGAACAGAAGATTGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGATGATGACAACGATGAG
GATGACTCCGACGATGATAAAGATGATGATGATGCCAAGGGGCAAGATGGAGAGGGAGGA
GGAAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAGAAGAGCCGCAAGGCCATGCTCAAGCTCGGT
ATGAAACCCATCACCGGTGTCAGCCGTGTCACCGTCAGAAAGAGCAAGAATATCATGTTT
GTCATATCAAAACCTGATGTCTTCAAGAGCCCAGCATCAGACACATACGTAATCTTTGGA
GAGGCCAAGATCGAAGACCTGAGCTTTCAGATGCAGTCGCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAG
GCTCCGGATTTCAGCAACGTGATCAAGGGCGAATCGTCTTCGTCCGGCGCTGCTGCAGTG
GTGCAGGATGATGATGATGAGGAAGTCGACGAGGAAGGTGTTGAGCCAAAGGACATTGAG
TTGGTGATGACACAAGCAGGTGTGCCTAGGCCAAGAGCCGTGAAGGCTCTCAAGGTTGCT
GATGGAGATATCGTTTCTGCCATCATGGAGCTTACCACCTAAAACCAAAAATCTTTTCCA
ACCTTAGATGTGGTTTTTTAACTTGAGTTATATGTGTCCAAGAGATTTTCAAGTTTTTGT
TTCTATCTTGAAGTGATTTTCAATGTTGTATCAGTATTACAGTTAGGTTTGTTATTCAAT
TATCAAGCGTCGGTGGAGAGTTTCAGAC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RR2AP93TF 808 0 0
GGAGACAGACACATAGCAATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTG
GAAGAACAGAAGATTGATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGATGATGACAACGATGAG
GATGACTCCGACGATGATAAAGATGATGATGATGCCAAGGGGCAAGATGGAGAGGGAGGA
GGAAAGTCAAAACAAAGCAGAAGTGAGAAGAAGAGCCGCAAGGCCATGCTCAAGCTCGGT
ATGAAACCCATCACCGGTGTCAGCCGTGTCACCGTCAGAAAGAGCAAGAATATCATGTTT
GTCATATCAAAACCTGATGTCTTCAAGAGCCCAGCATCAGACACATACGTAATCTTTGGA
GAGGCCAAGATCGAAGACCTGAGCTCTCAGATGCAGTCGCAGGCTGCAGAGCAGTTCAAG
GCTCCGGATCTCAGCAACGTGATCAAGGGCGAATCGTCTTCGTCCGGCGCTGCTGCAGTG
GTGCAGGATGATGATGATGAGGAAGTCGACGAGGAAGGTGTTGAGCCAAAGGACATTGAG
TTGGTGATGACACAAGCAGGTGTGCCTAGGCCAAGAGCCGTGAAGGCTCTCAAGGTTGCT
GATGGAGATATCGTCTCTGCCATCATGGAGCTTACCACCTAAAACCAAAAATCTTTTCCA
ACCTTAGATGTGGTTTTTTAACTTGAGTTATATGTGTCCAAGAGATTTTCAAGTTTTTGT
TTCTATCTTGAAGTGATTTTCAATGTTGTATCAGTATTACAGTTAGGTTTGTTATTCAAT
TATCAAGCGTCGGTGGAGAGTTTCAGAC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL7943Contig1 399 2 1 U
GGTGGAGGCCCGCAGCGATACTGACGTGCAAATCGTTCGTCTGACTTGGGTATAGGGGCG
AAAGACTAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCCTCCGAAGTTTCCCTCAGGATATCTGG
AGCTCGGAAACGAGTTCTATCGGGTAAAGCCAATGATTAGAGGCATCGGGGGCGCAACGC
CCTCGACCTATTCTCAAACTTTAAATAGGTAGGACGGGGTGGCTGCTTTGTTGAGCCATC
CCACGGAATCGAGAGCTCCAAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGAT
GAACCGGAAGCCGGGTTACGGTGCCCAACTGCGCGCTAACCTAGAACCCACAAAGGGTGT
TGGTCGATTAAGACAGCAGGACGGTGGTCATGGAAGTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FI50JQ C 1
AF RR2FI50TF U 1
BS 1 399 RR2FI50TF

RD RR2FI50JQ 399 0 0
GGTGGAGGCCCGCAGCGATACTGACGTGCAAATCGTTCGTCTGACTTGGGTATAGGGGCG
AAAGACTAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCCTCCGAAGTTTCCCTCAGGATATCTGG
AGCTCGGAAACGAGTTCTATCGGGTAAAGCCAATGATTAGAGGCATCGGGGGCGCAACGC
CCTCGACCTATTCTCAAACTTTAAATAGGTAGGACGGGGTGGCTGCTTTGTTGAGCCATC
CCACGGAATCGAGAGCTCCAAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGAT
GAACCGGAAGCCGGGTTACGGTGCCCAACTGCGCGCTAACCTAGAACCCACAAAGGGTGT
TGGTCGATTAAGACAGCAGGACGGTGGTCATGGAAGTCG

QA 1 399 1 399
DS 

RD RR2FI50TF 399 0 0
GGTGGAGGCCCGCAGCGATACTGACGTGCAAATCGTTCGTCTGACTTGGGTATAGGGGCG
AAAGACTAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCCTCCGAAGTTTCCCTCAGGATATCTGG
AGCTCGGAAACGAGTTCTATCGGGTAAAGCCAATGATTAGAGGCATCGGGGGCGCAACGC
CCTCGACCTATTCTCAAACTTTAAATAGGTAGGACGGGGTGGCTGCTTTGTTGAGCCATC
CCACGGAATCGAGAGCTCCAAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGAT
GAACCGGAAGCCGGGTTACGGTGCCCAACTGCGCGCTAACCTAGAACCCACAAAGGGTGT
TGGTCGATTAAGACAGCAGGACGGTGGTCATGGAAGTCG

QA 1 399 1 399
DS 



AS 1 2

CO CL7944Contig1 562 2 1 U
GGGATTTGGTTATATGCGTGATCAGAGAAAGATATATGCGTGTTGTTTCACCAGGACAAT
GGTTTTTGCTACATGTTCCTCAGGGCCAAGGCACAAATTCCCAAGCCCAGATGTTTTCTG
ATCTTAACAGGGCTATGGATATGATAAAGAAAAACTTCTCCATGATTATTATTCCCCAGA
CGCTCACTTTTGCATGGGTCAACTTCTTCTCTGGATTTTTTGCAGATTTCTTTAATGCTC
AAGTCTATACAAGTGTTTATTATGTATTGTATCTGAGTGTTCTTGGCTTATCCTACAGCC
AAAATACCGTTTCCACTGACCCAGAGGTTCATATCCAATGTTATCAGAATGGGATTTGAG
CACTGTGGATGTTAGCTATGTGAGTAGCCGTTCGTGGTAAGTGCCCAAGTTTCATTAACA
ACTCAATGTTATGCCTCACCCCTTTCCAGATTTTTAGAAATGCAAAACATATTTTGCCCA
TTCTATGTCATGTCACGAGAGCTTTTTCTTTCACTTTTCAGGTACTTTGTATGGTTTTAC
AAAAATAAATATTTGTATGGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2D953JQ C 1
AF RR2D953TF U 1
BS 1 562 RR2D953TF

RD RR2D953JQ 562 0 0
GGGATTTGGTTATATGCGTGATCAGAGAAAGATATATGCGTGTTGTTTCACCAGGACAAT
GGTTTTTGCTACATGTTCCTCAGGGCCAAGGCACAAATTCCCAAGCCCAGATGTTTTCTG
ATCTTAACAGGGCTATGGATATGATAAAGAAAAACTTCTCCATGATTATTATTCCCCAGA
CGCTCACTTTTGCATGGGTCAACTTCTTCTCTGGATTTTTTGCAGATTTCTTTAATGCTC
AAGTCTATACAAGTGTTTATTATGTATTGTATCTGAGTGTTCTTGGCTTATCCTACAGCC
AAAATACCGTTTCCACTGACCCAGAGGTTCATATCCAATGTTATCAGAATGGGATTTGAG
CACTGTGGATGTTAGCTATGTGAGTAGCCGTTCGTGGTAAGTGCCCAAGTTTCATTAACA
ACTCAATGTTATGCCTCACCCCTTTCCAGATTTTTAGAAATGCAAAACATATTTTGCCCA
TTCTATGTCATGTCACGAGAGCTTTTTCTTTCACTTTTCAGGTACTTTGTATGGTTTTAC
AAAAATAAATATTTGTATGGAT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RR2D953TF 562 0 0
GGGATTTGGTTATATGCGTGATCAGAGAAAGATATATGCGTGTTGTTTCACCAGGACAAT
GGTTTTTGCTACATGTTCCTCAGGGCCAAGGCACAAATTCCCAAGCCCAGATGTTTTCTG
ATCTTAACAGGGCTATGGATATGATAAAGAAAAACTTCTCCATGATTATTATTCCCCAGA
CGCTCACTTTTGCATGGGTCAACTTCTTCTCTGGATTTTTTGCAGATTTCTTTAATGCTC
AAGTCTATACAAGTGTTTATTATGTATTGTATCTGAGTGTTCTTGGCTTATCCTACAGCC
AAAATACCGTTTCCACTGACCCAGAGGTTCATATCCAATGTTATCAGAATGGGATTTGAG
CACTGTGGATGTTAGCTATGTGAGTAGCCGTTCGTGGTAAGTGCCCAAGTTTCATTAACA
ACTCAATGTTATGCCTCACCCCTTTCCAGATTTTTAGAAATGCAAAACATATTTTGCCCA
TTCTATGTCATGTCACGAGAGCTTTTTCTTTCACTTTTCAGGTACTTTGTATGGTTTTAC
AAAAATAAATATTTGTATGGAT

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 2

CO CL7945Contig1 941 2 8 U
GACAGATAGGTGAGTCAGTTGGACCGGAATGTAAACCTGTATTACAGGAGATTAATAAGC
TCGTGGAGCTAGGGCTTAAAGTAAACAACAAGGCTATGAAAGTTCTCTTCAACGCCACCG
AGCTTGATGTTGATGCTGACTTCTTGTACTTGATAGCGGATGCACAAGTTGTTGCAGTCC
AATATGGAAACCCAGATAAACTATGTGTCCCTCTCGTGGAAGCTAAAAAGAACGGCAGTG
ATTTAGTGGAAGCATATGCTAAGTATGTTAGAGAGTATTGCGTGGAAGTTTTCGGGTTAA
GCGCTAAAACATATAGCAGGAAACATCTGCTAGACACTGCGGTCACCCCAGAGAGTGCGG
ATAGGCTTTGGTGGTTCCAAACTTGCACTGAAGTTGCTTATTTCCAGGTGGCTCCTGCAA
ACGATAGCATCCGCTCTCACCAAATCAATACAGAGTATCATTTGGACCTGTGCAAGAGTC
TGTTTGGGGGAAGGTGTTTACCCTGAAGTGGATGCAACGAACCTCTACTACGGTGGTGAT
AGAATTGGAGCTACTAAAATCGTATTCACAAATGGGTCACAAGATCCATGGCGCCATGCA
TCCAAACAGACCTCATCCTGAATTGCCTTCTTACATTGTGAATTGTCACAACTGTGGCCA
TGGAAGTGATCTTAGAGGATGCCCTCAGTCTCCAATGATCATTGAAGGTGACTCTAAGAA
TTGCAGTTCACCAGATGCAGTGAACAAAGTGAGGCAACATATAATAGAACACATTGACTT
GTGGCTCTCTGAGTGTCGTGGAGTGCTTAGGAGCTCCATCTAGAGTCTGCACCTCTCACA
CGTTTGTATGTTCGAATAAAAACATCATATGGATGTTTCAAACTTGTAATCAATGTAACT
TTAACCTCCTCTTACTATGTACGTTTAGTACTTTTTTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2C139TF U 1
AF RR2C139JQ C 125
BS 1 641 RR2C139TF
BS 642 642 RR2C139JQ
BS 643 677 RR2C139TF
BS 678 678 RR2C139JQ
BS 679 694 RR2C139TF
BS 695 695 RR2C139JQ
BS 696 707 RR2C139TF
BS 708 941 RR2C139JQ

RD RR2C139TF 711 0 0
GACAGATAGGTGAGTCAGTTGGACCGGAATGTAAACCTGTATTACAGGAGATTAATAAGC
TCGTGGAGCTAGGGCTTAAAGTAAACAACAAGGCTATGAAAGTTCTCTTCAACGCCACCG
AGCTTGATGTTGATGCTGACTTCTTGTACTTGATAGCGGATGCACAAGTTGTTGCAGTCC
AATATGGAAACCCAGATAAACTATGTGTCCCTCTCGTGGAAGCTAAAAAGAACGGCAGTG
ATTTAGTGGAAGCATATGCTAAGTATGTTAGAGAGTATTGCGTGGAAGTTTTCGGGTTAA
GCGCTAAAACATATAGCAGGAAACATCTGCTAGACACTGCGGTCACCCCAGAGAGTGCGG
ATAGGCTTTGGTGGTTCCAAACTTGCACTGAAGTTGCTTATTTCCAGGTGGCTCCTGCAA
ACGATAGCATCCGCTCTCACCAAATCAATACAGAGTATCATTTGGACCTGTGCAAGAGTC
TGTTTGGGGGAAGGTGTTTACCCTGAAGTGGATGCAACGAACCTCTACTACGGTGGTGAT
AGAATTGGAGCTACTAAAATCGTATTCACAAATGGGTCACAAGATCCATGGCGCCATGCA
TCCAAACAGACCTCATCCTGAATTGCCTTCTTACATTGTGA*TTGTCACAACTGTGGCCA
TGGAAGTGATCTTAGAG*ATGCCCTCAGTCTCCA*TGATCATTGAAG
TGAC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RR2C139JQ 817 0 0
TTGATG
TGATGCTGACTTCTTGTACTTGATAGCGGATGCACAAGTTGTTGCAGTCCAATATGGAAA
CCCAGATAAACTATGTGTCCCTCTCGTGGAAGCTAAAAAGAACGGCAGTGATTTAGTGGA
AGCATATGCTAAGTATGTTAGAGAGTATTGCGTGGAAGTTTTCGGGTTAAGCGCTAAAAC
ATATAGCAGGAAACATCTGCTAGACACTGCGGTCACCCCAGAGAGTGCGGATAGGCTTTG
GTGGTTCCAAACTTGCACTGAAGTTGCTTATTTCCAGGTGGCTCCTGCAAACGATAGCAT
CCGCTCTCACCAAATCAATACAGAGTATCATTTGGACCTGTGCAAGAGTCTGTTTGGGG*
AAGGTGTTTACCCTGAAGTGGATGCAACGAACCTCTACTACGGTGGTGATAGAATTGGAG
CTACTAAAATCGTATTCACAAATGGGTCACAAGATCCATGGCGCCATGCATCCAAACAGA
CCTCATCCTGAATTGCCTTCTTACATTGTGAATTGTCACAACTGTGGCCATGGAAGTGAT
CTTAGAGGATGCCCTCAGTCTCCAATGATCATTGAAGGTGACTCTAAGAATTGCAGTTCA
CCAGATGCAGTGAACAAAGTGAGGCAACATATAATAGAACACATTGACTTGTGGCTCTCT
GAGTGTCGTGGAGTGCTTAGGAGCTCCATCTAGAGTCTGCACCTCTCACACGTTTGTATG
TTCGAATAAAAACATCATATGGATGTTTCAAACTTGTAATCAATGTAACTTTAACCTCCT
CTTACTATGTACGTTTAGTACTTTTTTTCAG

QA 7 817 7 817
DS 



AS 1 2

CO CL7946Contig1 607 2 2 U
GGAAGACAAGTTTCTGATCATATTGCGAACAACAATTCCGATTCCCTGATCCCTCCCTTC
AAGTGTTTCTTCTCCGGCGTAATCATGACAACTTCAAAGAGGCTAGCAGACAGGAAGATA
GAAAAGTTTGACAAGAACATTACAAAAAGAGGTTTTGTTCCTGAGACCACCACCAAAAAG
GGTAAGGATTACCCTGTCGGACCCATCCTACTCGGCTTCTTTGTCTTCGTCGTTATCGGT
TCATCTCTCTTCCAGATCATTAGGACTGCAACTAGCGGAGGCATGGCATAAACGAATCTC
TTTCTTCTTTCTCGTCTCACTTTTACTTTAATGTTACCGTAGAATGCTTTAGCTTTCTGT
GTACTACATGTTGTAAGAATTTTGAGTCTTTTCTATGTAAAATCATAAAATTTTCAAACC
TTTTAATGTTGGAGTTTCTTAATGTTGTCTTGAAGCTAGTTGCCGTTGTTGTTGTCATGC
TTTTGTAATTTTTCTTTTGGCCGCTTTATCAATTCGACCGAATATTACTACATGTACGAA
AATTGTTGGAGAAAGAAAAAACTAAAACACTAATAAGAGGTATCATGGGTTATCTCATTA
TTCTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GA59TF U 1
AF RR2GA59JQ C 1
BS 1 561 RR2GA59TF
BS 562 607 RR2GA59JQ

RD RR2GA59TF 561 0 0
GGAAGACAAGTTTCTGATCATATTGCGAACAACAATTCCGATTCCCTGATCCCTCCCTTC
AAGTGTTTCTTCTCCGGCGTAATCATGACAACTTCAAAGAGGCTAGCAGACAGGAAGATA
GAAAAGTTTGACAAGAACATTACAAAAAGAGGTTTTGTTCCTGAGACCACCACCAAAAAG
GGTAAGGATTACCCTGTCGGACCCATCCTACTCGGCTTCTTTGTCTTCGTCGTTATCGGT
TCATCTCTCTTCCAGATCATTAGGACTGCAACTAGCGGAGGCATGGCATAAACGAATCTC
TTTCTTCTTTCTCGTCTCACTTTTACTTTAATGTTACCGTAGAATGCTTTAGCTTTCTGT
GTACTACATGTTGTAAGAATTTTGAGTCTTTTCTATGTAAAATCATAAAATTTTCAAACC
TTTTAATGTTGGAGTTTCTTAATGTTGTCTTGAAGCTAGTTGCCGTTGTTGTTGTCATGC
TTTTGTAATTTTTCTTTTGGCCGCTTTATCAATTCGACCGAATATTACTACATGTACGAA
AATTGTTGGAGAAAGAAAAAA

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2GA59JQ 607 0 0
GGAAGACAAGTTTCTGATCATATTGCGAACAACAATTCCGATTCCCTGATCCCTCCCTTC
AAGTGTTTCTTCTCCGGCGTAATCATGACAACTTCAAAGAGGCTAGCAGACAGGAAGATA
GAAAAGTTTGACAAGAACATTACAAAAAGAGGTTTTGTTCCTGAGACCACCACCAAAAAG
GGTAAGGATTACCCTGTCGGACCCATCCTACTCGGCTTCTTTGTCTTCGTCGTTATCGGT
TCATCTCTCTTCCAGATCATTAGGACTGCAACTAGCGGAGGCATGGCATAAACGAATCTC
TTTCTTCTTTCTCGTCTCACTTTTACTTTAATGTTACCGTAGAATGCTTTAGCTTTCTGT
GTACTACATGTTGTAAGAATTTTGAGTCTTTTCTATGTAAAATCATAAAATTTTCAAACC
TTTTAATGTTGGAGTTTCTTAATGTTGTCTTGAAGCTAGTTGCCGTTGTTGTTGTCATGC
TTTTGTAATTTTTCTTTTGGCCGCTTTATCAATTCGACCGAATATTACTACATGTACGAA
AATTGTTGGAGAAAGAAAAAACTAAAACACTAATAAGAGGTATCATGGGTTATCTCATTA
TTCTTTT

QA 1 607 1 607
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7948Contig1 707 2 2 U
AAGGAAGACATCTCGGAGCTTACCAAGACCTTGAGAAGCCAATTCTGAGGCGTAGCTTCG
TTCCTCTCGCAACCGTCACCATCTCCGAATCTCCAGAGGGAGAGTCCAGATCATGAGGAG
GAGGGGAGGACGAGGATCTGATCGCCGGGATTAGGAACGATTTCGCGGAGATCGGAGGGA
GGTTCAGGACTGGGATTTCGAAGCTCTCCGAGAACTTAGCGTCGAATTTCTTACAGCTGG
GCTCAGAAGGAGTGGATCCGAAGGGTTACGATGACGTAATCGGAGTGACCGAGGAGGTAG
TTGCGTTCGTGAGGGATCTCGCGATGAATCCCGATACTTGGTTGGATCTTCCTTTACCTG
ATGATGATGATGATGATGATTGGTTGAACGATGAAGAGAGTTCAGATGCTGTGAGCGGCA
TGGAAGGAGGAGTAACTACTAAGCATCCTCTTGGTGAAGACGAAGAAGATGTGTCATTCA
GTGATCTAGAAGAAGATGATGATGACGAGGTAAGAGACGTACCCGTGAGTTCCAAGAGAT
CTACTAACTCTAGTTCGCCAGACTGGGTACAGATATAAGACGGCAACGCGGGTCAGGCAA
AAAGAGAACAACAGAATCAAACCATTGTCTTGATGTCGATGAAATGTAATACAAATGACC
ACCTCTAGTGTTCTTTTGGTTATATAAACATAAAATCTCTCAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GP34TF U 1
AF RR2GP34JQ C 261
BS 1 554 RR2GP34TF
BS 555 707 RR2GP34JQ

RD RR2GP34TF 554 0 0
AAGGAAGACATCTCGGAGCTTACCAAGACCTTGAGAAGCCAATTCTGAGGCGTAGCTTCG
TTCCTCTCGCAACCGTCACCATCTCCGAATCTCCAGAGGGAGAGTCCAGATCATGAGGAG
GAGGGGAGGACGAGGATCTGATCGCCGGGATTAGGAACGATTTCGCGGAGATCGGAGGGA
GGTTCAGGACTGGGATTTCGAAGCTCTCCGAGAACTTAGCGTCGAATTTCTTACAGCTGG
GCTCAGAAGGAGTGGATCCGAAGGGTTACGATGACGTAATCGGAGTGACCGAGGAGGTAG
TTGCGTTCGTGAGGGATCTCGCGATGAATCCCGATACTTGGTTGGATCTTCCTTTACCTG
ATGATGATGATGATGATGATTGGTTGAACGATGAAGAGAGTTCAGATGCTGTGAGCGGCA
TGGAAGGAGGAGTAACTACTAAGCATCCTCTTGGTGAAGACGAAGAAGATGTGTCATTCA
GTGATCTAGAAGAAGATGATGATGACGAGGTAAGAGACGTACCCGTGAGTTCCAAGAGAT
CTACTAACTCTAGT

QA 1 554 1 554
DS 

RD RR2GP34JQ 447 0 0
AG
GGGTTACGATGACGTAATCGGAGTGACCGAGGAGGTAGTTGCGTTCGTGAGGGATCTCGC
GATGAATCCCGATACTTGGTTGGATCTTCCTTTACCTGATGATGATGATGATGATGATTG
GTTGAACGATGAAGAGAGTTCAGATGCTGTGAGCGGCATGGAAGGAGGAGTAACTACTAA
GCATCCTCTTGGTGAAGACGAAGAAGATGTGTCATTCAGTGATCTAGAAGAAGATGATGA
TGACGAGGTAAGAGACGTACCCGTGAGTTCCAAGAGATCTACTAACTCTAGTTCGCCAGA
CTGGGTACAGATATAAGACGGCAACGCGGGTCAGGCAAAAAGAGAACAACAGAATCAAAC
CATTGTCTTGATGTCGATGAAATGTAATACAAATGACCACCTCTAGTGTTCTTTTGGTTA
TATAAACATAAAATCTCTCAAGTCC

QA 3 447 3 447
DS 



AS 1 2

CO CL7949Contig1 565 2 1 U
GAACCAATCTCTCTATTTCTCTTTCTCCCAGATTCATCCAATTCGTTTCTTCTTTCTTCA
ACGCTACCCAGCTCTCTCCTTCTCTTCCGTCAATGCTACCTATCTTCTTCTCATTCTCAC
TCCAGTCTTCAAACCCCACTATACTACTTCTTCCTCTGTAATTCTCAAAAACAAACATGC
AATATACTTCCCATTTTCTCTCTTGCATGTCGACATCTGCTCACCTTTTTCGATTGAGTT
CCTGAAACTCCCGTCACAAATCCCGTGCTCGGCGAATGGTTCTCACCACGCCAAAACTCC
ACTGTCACAGCTGCTTGAGATTTTGGTTGGAGAAGAGCCGATCTAGGAAGAGGAAGAAGA
GAGGAGCGAGAGGAAGAAAGAATCGGTGGTGCTCACCGTCAACTCGAAGCAAAGAAGCGG
CGCGGCGGAGAAGATGATGAACAATTTTTTTTTTAGGTTTAGCTCTTTTTGGTTTATTCT
TTTTTTTATAATAATTTGTTTTAGTTTTTGTAATTAATTTGATTTAGTCAGTAAATGATT
TAATTTGTAAACTGACATTAATCTA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2ER19JQ C 1
AF RR2ER19TF U 1
BS 1 565 RR2ER19TF

RD RR2ER19JQ 565 0 0
GAACCAATCTCTCTATTTCTCTTTCTCCCAGATTCATCCAATTCGTTTCTTCTTTCTTCA
ACGCTACCCAGCTCTCTCCTTTTCTTCCGTCAATGCTACCTATCTTCTTCTCATTCTCAC
TCCAGTCTTCAAACCCCACTATACTACTTCTTCCTCTGTAATTCTCAAAAACAAACATGC
AATATACTTCCCATTTTCTCTCTTGCATGTCGACATCTGCTCACCTTTTTCGATTGAGTT
CCTGAAACTCCCGTCACAAATCCCGTGCTCGGCGAATGGTTCTCACCACGCCAAAACTCC
ACTGTCACAGCTGCTTGAGATTTTGGTTGGAGAAGAGCCGATCTAGGAAGAGGAAGAAGA
GAGGAGCGAGAGGAAGAAAGAATCGGTGGTGCTCACCGTCAACTCGAAGCAAAGAAGCGG
CGCGGCGGAGAAGATGATGAACAATTTTTTTTTTAGGTTTAGCTCTTTTTGGTTTATTCT
TTTTTTTATAATAATTTGTTTTAGTTTTTGTAATTAATTTGATTTAGTCAGTAAATGATT
TAATTTGTAAACTGACATTAATCTA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RR2ER19TF 565 0 0
GAACCAATCTCTCTATTTCTCTTTCTCCCAGATTCATCCAATTCGTTTCTTCTTTCTTCA
ACGCTACCCAGCTCTCTCCTTCTCTTCCGTCAATGCTACCTATCTTCTTCTCATTCTCAC
TCCAGTCTTCAAACCCCACTATACTACTTCTTCCTCTGTAATTCTCAAAAACAAACATGC
AATATACTTCCCATTTTCTCTCTTGCATGTCGACATCTGCTCACCTTTTTCGATTGAGTT
CCTGAAACTCCCGTCACAAATCCCGTGCTCGGCGAATGGTTCTCACCACGCCAAAACTCC
ACTGTCACAGCTGCTTGAGATTTTGGTTGGAGAAGAGCCGATCTAGGAAGAGGAAGAAGA
GAGGAGCGAGAGGAAGAAAGAATCGGTGGTGCTCACCGTCAACTCGAAGCAAAGAAGCGG
CGCGGCGGAGAAGATGATGAACAATTTTTTTTTTAGGTTTAGCTCTTTTTGGTTTATTCT
TTTTTTTATAATAATTTGTTTTAGTTTTTGTAATTAATTTGATTTAGTCAGTAAATGATT
TAATTTGTAAACTGACATTAATCTA

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL7950Contig1 713 2 3 U
TTTTTTTTTATCAAACCAAACTTCATTAATTATAAGAGTTCAAACTCCATTCAAGGAAGA
CATACAAGATAGAAAGGCATTACTAGCCAAGGGAGTAGCCATATTACAAGCACAGCAAAA
CACAAGAAAGATCGAATAGCTAATAAGATCCAAATAACACCAAAAGACCAACTCTCTGAA
AGGAGCCAAATGAGTTCTTGACAGTCTGACTTGCACACAAGCTTGGAAATGCTCAGTAAA
ACGGCTGCAACTTGTGCGTCCAAAAGAGCAAGACACTCTTTATCAATCACAGCATCAAAG
GAAGCATCTTCAAAGGCCTTCATACCACGCACATCCATTTTCAAATATTTGAGCTGAGGA
CGGTCTGAGTGTTTTTTGTTCACGGCGTCGATCACAACAGAGGAGATATCGATATTAACT
ACCTCTACGTACCCATCATCCACCATCCCCTCGCTGAATGCTGAGTTGCCGCAGCCGATG
TCGAGGACACGGTGAGTAGGGTGAGGAGGGAGGTAGAGATTGATGAGAGGAGACAATGAA
GAATAGTTTTGGTACCAATCGAAGGGATCATCAAATTCACGATCAGGATGCATTCCAACT
AGATCGATTGATTAACCATGTGAAGAAAAAAAAGAAAAGATTTGAAGGAAGCGCATGTGA
TGGTGGTGCTGGGTAACGAAGAAGAAGAAAAGATTTGAAGAAGAGACGTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D888JQ U 10
AF RR2D888TF C 1
BS 1 9 RR2D888TF
BS 10 389 RR2D888JQ
BS 390 713 RR2D888TF

RD RR2D888JQ 383 0 0
ATCAAACCAAACTTCATTAATTATAAGAGTTCAAACTCCATTCAAGGAAGACATACAAGA
TAGAAAGGCATTACTAGCCAAGGGAGTAGCCATATTACAAGCACAGCAAAACACAAGAAA
GATCGAATAGCTAATAAGATCCAAATAACACCAAAAGACCAACTCTCTGAAAGGAGCCAA
ATGAGTTCTTGACAGTCTGACTTGCACACAAGCTTGGAAATGCTCAGTAAAACGGCTGCA
ACTTGTGCGTCCAAAAGAGCAAGACACTCTTTATCAATCACAGCATCAAAGGAAGCATCT
TCAAAGGCCTTCATACCACGCACATCCATTTTCAAATATTTGAGCTGAGGACGGTCTGAG
TGTTTTTTGTTCACGGCGTC
CAT

QA 1 380 1 380
DS 

RD RR2D888TF 713 0 0
TTTTTTTTTATCAAACCAAACTTCATTAATTATAAGAGTTCAAACTCCATTCAAGGAAGA
CATACAAGATAGAAAGGCATTACTAGCCAAGGGAGTAGCCATATTACAAGCACAGCAAAA
CACAAGAAAGATCGAATAGCTAATAAGATCCAAATAACACCAAAAGACCAACTCTCTGAA
AGGAGCCAAATGAGTTCTTGACAGTCTGACTTGCACACAAGCTTGGAAATGCTCAGTAGA
ACGGCTGCAACTTGTGCGTCCAAAAGAGCAAGACACTCTTTATCAATCACAGCATCAAAG
GAAGCATCTTCAAAGGCCTTCATACCACGCACATCCATTTTCAAATATTTGAGCTGAGGA
CGGTCTGAGTGTTTTTTGTTCACGGCGTCGATCACAACAGAGGAGATATCGATATTAACT
ACCTCTACGTACCCATCATCCACCATCCCCTCGCTGAATGCTGAGTTGCCGCAGCCGATG
TCGAGGACACGGTGAGTAGGGTGAGGAGGGAGGTAGAGATTGATGAGAGGAGACAATGAA
GAATAGTTTTGGTACCAATCGAAGGGATCATCAAATTCACGATCAGGATGCATTCCAACT
AGATCGATTGATTAACCATGTGAAGAAAAAAAAGAAAAGATTTGAAGGAAGCGCATGTGA
TGGTGGTGCTGGGTAACGAAGAAGAAGAAAAGATTTGAAGAAGAGACGTCCCC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL7951Contig1 561 2 1 U
GGAACAGAACCTCTTCGATCTGCAATGGCGGAAGCCTCTAACTCCGACACAGGCAATGAG
AACCCGACGTTCAAGATCCGAAGACTAGAGATCTCCGACAAGAGAAAGGGATACATGGAG
CTCCTCGGTCAACTCACCGTCTCCTTACCACTCACCGACGACGAATTCGATCAACGATTC
CAAGAGATCAGCTCCTACGGAGACGACCACTTCATCTGCGTGATCGAAGACGAGTCTTCA
GGAAAAATCGCCGCGACGGGGAGCGTGATGATAGAGAAGAAGTTCCTGAGGAGCTGCGGG
AAAGTCGGGCACATCGAGGACGTGGTCGTTGACTCGGAGTTCCGCGGGAAGCATCTCGGG
AAGAGAGTCGTCGAGTTTCTTACGGATCACAGCAGATCCATGGGTTGCTACAAGGTGATT
CTCGACTGTAGCGTGGAGAAGAATGTGTTTTATGAGAAGTGTGGGATGTTCAATAGAGGG
ATTCAGATGACCAAGTACTTTTGATTGAAACTTTGTTTTTGCTTTTGTCTTTTTATATGA
AAGTCTCTGTCTTTTTAAAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2BI15JQ C 1
AF RR2BI15TF U 1
BS 1 561 RR2BI15TF

RD RR2BI15JQ 561 0 0
GGAACAGAACCTCTTCGATCTGCAATGGCGGAAGCCTCTAACTCCGACACAGGCAATGAG
AACCCGACGTTCAAGATCCGAAGACTAGAGATCTCCGACAAGAGAAAGGGATACATGGAG
CTCCTCGGTCAACTCACCGTCTCCTTACCACTCACCGACGACGAATTCGATCAACGATTC
CAAGAGATCAGCTCCTACGGAGACGACCACTTCATCTGCGTGATCGAAGACGAGTCTTCA
GGAAAAATCGCCGCGACGGGGAGCGTGATGATAGAGAAGAAGTTCCTGAGGAGCTGCGGG
AAAGTCGGGCACATCGAGGACGTGGTCGTTGACTCGGAGTTCCGCGGGAAGCATCTCGGG
AAGAGAGTCGTCGAGTTTCTTACGGATCACAGCAGATCCATGGGTTGCTACAAGGTGATT
CTCGACTGTAGCGTGGAGAAGAATGTGTTTTATGAGAAGTGTGGGATGTTCAATAGAGGG
ATTCAGATGACCAAGTACTTTTGATTGAAACTTTGTTTTTGCTTTTGTCTTTTTATATGA
AAGTCTCTGTCTTTTTAAAAG

QA 1 561 1 561
DS 

RD RR2BI15TF 561 0 0
GGAACAGAACCTCTTCGATCTGCAATGGCGGAAGCCTCTAACTCCGACACAGGCAATGAG
AACCCGACGTTCAAGATCCGAAGACTAGAGATCTCCGACAAGAGAAAGGGATACATGGAG
CTCCTCGGTCAACTCACCGTCTCCTTACCACTCACCGACGACGAATTCGATCAACGATTC
CAAGAGATCAGCTCCTACGGAGACGACCACTTCATCTGCGTGATCGAAGACGAGTCTTCA
GGAAAAATCGCCGCGACGGGGAGCGTGATGATAGAGAAGAAGTTCCTGAGGAGCTGCGGG
AAAGTCGGGCACATCGAGGACGTGGTCGTTGACTCGGAGTTCCGCGGGAAGCATCTCGGG
AAGAGAGTCGTCGAGTTTCTTACGGATCACAGCAGATCCATGGGTTGCTACAAGGTGATT
CTCGACTGTAGCGTGGAGAAGAATGTGTTTTATGAGAAGTGTGGGATGTTCAATAGAGGG
ATTCAGATGACCAAGTACTTTTGATTGAAACTTTGTTTTTGCTTTTGTCTTTTTATATGA
AAGTCTCTGTCTTTTTAAAAG

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL7952Contig1 397 2 1 U
GGAGATCAAAAACAATCACCAATTCTTTATAGTTCAAAGATTTTCTGAGCCCTCATCAAT
GGCGCCATCAGCTGCAATGCTCATACTTTCGCATCCTCTGATTAGCCACAAAACGACAAA
TCAGTCTCCATCACCGCCAGCCTCTAAGTCGAGACGTATGTTCGATCTTCTTTTGCCGTG
GAAGTCATCGGACAGTGAGGAGGTCGGTCTAGGCCGGCTAGTCTTTGGCGATCCCGCTAC
ACTGGAGAAGCGTTTTCAAGAAGCTCTTGAACTTAGCTGCTGGTAATTTTTCACAATGTC
TAGTGATATCGTTTCACTGGCTGCATCTTCGTAATTATTAAGCGTTTTATTAATATTGTC
TTGTAGATGGAAATAATGTAAAAGTAATGGTTTTACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2CF18JQ C 1
AF RR2CF18TF U 1
BS 1 397 RR2CF18TF

RD RR2CF18JQ 397 0 0
GGAGATCAAAAACAATCACCAATTCTTTATAGTTCAAAGATTTTTTGAGCCCTCATCAAT
GGCGCCATCAGCTGCAATGCTCATACTTTCGCATCCTCTGATTAGCCACAAAACGACAAA
TCAGTCTCCATCACCGCCAGCCTCTAAGTCGAGACGTATGTTCGATCTTCTTTTGCCGTG
GAAGTCATCGGACAGTGAGGAGGTCGGTCTAGGCCGGCTAGTCTTTGGCGATCCCGCTAC
ACTGGAGAAGCGTTTTCAAGAAGCTCTTGAACTTAGCTGCTGGTAATTTTTCACAATGTC
TAGTGATATCGTTTCACTGGCTGCATCTTCGTAATTATTAAGCGTTTTATTAATATTGTC
TTGTAGATGGAAATAATGTAAAAGTAATGGTTTTACC

QA 1 397 1 397
DS 

RD RR2CF18TF 397 0 0
GGAGATCAAAAACAATCACCAATTCTTTATAGTTCAAAGATTTTCTGAGCCCTCATCAAT
GGCGCCATCAGCTGCAATGCTCATACTTTCGCATCCTCTGATTAGCCACAAAACGACAAA
TCAGTCTCCATCACCGCCAGCCTCTAAGTCGAGACGTATGTTCGATCTTCTTTTGCCGTG
GAAGTCATCGGACAGTGAGGAGGTCGGTCTAGGCCGGCTAGTCTTTGGCGATCCCGCTAC
ACTGGAGAAGCGTTTTCAAGAAGCTCTTGAACTTAGCTGCTGGTAATTTTTCACAATGTC
TAGTGATATCGTTTCACTGGCTGCATCTTCGTAATTATTAAGCGTTTTATTAATATTGTC
TTGTAGATGGAAATAATGTAAAAGTAATGGTTTTACC

QA 1 397 1 397
DS 



AS 1 2

CO CL7953Contig1 890 2 2 U
GAGCCCACGAGTAGTCACGATGAGCTCATCTGAAACAAAAAACATGAAGTCACACAAGCT
CTTTATAAAGCCTGTAATGGATCGGACAAGAAAGCAAACATAACATAATCGCCAGTTCGC
CACCATATCCATCTTAGCCCTTATCGTGGTCATCATCGCCGCCAGGATTTCTCTAAAACT
CTCCAAAAACGTTTTACCTCATCGCCTGCGTCCACATCTCGCTGGTTCTCGCCGTGATTT
GCTTCCTCATAATTAATCCGTCGCCGTTACAACAAAAGAGAGGAAGATCCTCGAATCAAG
TTCAACCTCGAGGATCTTGAAGAAGCCATCGACGGGTTCCAGAGCCAATTCATAAAAGGC
GGGTCCAAAGCCCTAGCTGGCTTATCTCCACCAAGATTATAGGTCAAAGATCTTGCATAT
AGACGTAAAGCCAGAGAACATTCTACTCGACGAGGGATTGCAGAGCGGTGGTTACAGACT
TGGGACTCTCCAAGCTGATTGCTAGAGACGAGAGCAGAGTTATGACGGAGATTCTCGGCA
CGTGCGGATACATGGCCCCAGAGTGGCTTCGTGATGAACACGGTATCTATAAGACGTCTG
ATGTCTACAGCTACGGAATCGTGTTACTAGAGATTATGACGAAGGGAGAGGTTGAGGAAA
CAAACAAAAAGACGAACAAGAAGAGCAAGAAGAAGACCAAGAAGAAGAAGCGGGCGAAGA
ATTAGAGAAGTACGGTTTGGTTTCGGTTAGGTTTACTGATTTAACCGAATTCAAGTTATG
AACCGAGATGGAAATGGTTTTATAATTTTATTACATTGCCGGATAAAGGACGGGGTTTTA
AACAATGTTTTTCCAGGTTTATTAATTACAAGTTACAACATGTTACCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2AZ39TFB U 1
AF RR2AZ39JQ C 143
BS 1 703 RR2AZ39TFB
BS 704 890 RR2AZ39JQ

RD RR2AZ39TFB 703 0 0
GAGCCCACGAGTAGTCACGATGAGCTCATCTGAAACAAAAAACATGAAGTCACACAAGCT
CTTTATAAAGCCTGTAATGGATCGGACAAGAAAGCAAACATAACATAATCGCCAGTTCGC
CACCATATCCATCTTAGCCCTTATCGTGGTCATCATCGCCGCCAGGATTTCTCTAAAACT
CTCCAAAAACGTTTTACCTCATCGCCTGCGTCCACATCTCGCTGGTTCTCGCCGTGATTT
GCTTCCTCATAATTAATCCGTCGCCGTTACAACAAAAGAGAGGAAGATCCTCGAATCAAG
TTCAACCTCGAGGATCTTGAAGAAGCCATCGACGGGTTCCAGAGCCAATTCATAAAAGGC
GGGTCCAAAGCCCTAGCTGGCTTATCTCCACCAAGATTATAGGTCAAAGATCTTGCATAT
AGACGTAAAGCCAGAGAACATTCTACTCGACGAGGGATTGCAGAGCGGTGGTTACAGACT
TGGGACTCTCCAAGCTGATTGCTAGAGACGAGAGCAGAGTTATGACGGAGATTCTCGGCA
CGTGCGGATACATGGCCCCAGAGTGGCTTCGTGATGAACACGGTATCTATAAGACGTCTG
ATGTCTACAGCTACGGAATCGTGTTACTAGAGATTATGACGAAGGGAGAGGTTGAGGAAA
CAAACAAAAAGACGAACAAGAAGAGCAAGAAGAAGACCAAGAA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RR2AZ39JQ 748 0 0
ATCGTGGTCATCATCGCCGCCAGGATTTCTCTAAAACTCTCCAAAAACGTTTTACCTCAT
CGCCTGCGTCCACATCTCGCTGGTTCTCGCCGTGATTTGCTTCCTCATAATTAATCCGTC
GCCGTTACAACAAAAGAGAGGAAGATCCTCGAATCAAGTTCAACCTCGAGGATCTTGAAG
AAGCCATCGACGGGTTCCAGAGCCAATTCATAAAAGGCGGGTCCAAAGCCCTAGCTGGCT
TATCTCCACCAAGATTATAGGTCAAAGATCTTGCATATAGACGTAAAGCCAGAGAACATT
CTACTCGACGAGGGATTGCAGAGCGGTGGTTACAGACTTGGGACTCTCCAAGCTGATTGC
TAGAGACGAGAGCAGAGTTATGACGGAGATTCTCGGCACGTGCGGATACATGGCCCCAGA
GTGGCTTCGTGATGAACACGGTATCTATAAGACGTCTGATGTCTACAGCTACGGAATCGT
GTTACTAGAGATTATGACGAAGGGAGAGGTTGAGGAAACAAACAAAAAGACGAACAAGAA
GAGCAAGAAGAAGACCAAGAAGAAGAAGCGGGCGAAGAATTAGAGAAGTACGGTTTGGTT
TCGGTTAGGTTTACTGATTTAACCGAATTCAAGTTATGAACCGAGATGGAAATGGTTTTA
TAATTTTATTACATTGCCGGATAAAGGACGGGGTTTTAAACAATGTTTTTCCAGGTTTAT
TAATTACAAGTTACAACATGTTACCAAC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL7954Contig1 743 2 2 U
CTAATTAGAACTATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGGAAGAAAAATAGGAGAAA
GAAAAGGTCTTAACTGATGAAAAGTAAAAGCGTTGAGATAGATAGATCCATTTGATGCGA
ATCCCGAATCCGAACCGTTCCTCCGATCACGACGACGACGGAGATCCTCTTCTCCTGCTT
TCTTTATGGATGCTCTTGCCATCGCCAAACCTTTTTCGATTCTCTCCGCCGCTTCATCGA
CTTCTTCCACCACCGTTACTTCTGACGACGACTGTTTTATTTTAAAAAACAACATTAATC
GAAAAATGAATTGAAAATCTCGTAGCTAAAATAGCTAACCCTAGAAGACAAAACACAAGA
AAATAAAAAGAAACTAAACGTAAATAAAATAAATAAAACAAGAAGAAGAGTTTGAAGTAC
GTTGTTGAGAGTGGTGGTGAGACATGATGAAGAAGAACGTAAAGGAAAGAGTTTGAAGTA
AGAGAGAACTGATTCGGGAGAAGACGGCGAGGAGACAGAGAGATGACAAGAAGGATCGTC
GGAGGAGAGAAATCCGTTACGGTGGTTAAGGGAGTAGAAGAAGAGGATGATGACGAGTAA
TGGATATAACGCAAACGGCATCGTACATGTGAGATCCGCCATTAGTTTGTAACTTATACC
TTCTTCTTCTACTTCAAGGCGTGAAGAGGATGATTTGTTGTGTTTTTATTAAAGAAGAAT
AAAGGATGATATGAGAATTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2D725TF U 1
AF RR2D725JQ C 81
BS 1 606 RR2D725TF
BS 607 743 RR2D725JQ

RD RR2D725TF 606 0 0
CTAATTAGAACTATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGGAAGAAAAATAGGAGAAA
GAAAAGGTCTTAACTGATGAAAAGTAAAAGCGTTGAGATAGATAGATCCATTTGATGCGA
ATCCCGAATCCGAACCGTTCCTCCGATCACGACGACGACGGAGATCCTCTTCTCCTGCTT
TCTTTATGGATGCTCTTGCCATCGCCAAACCTTTTTCGATTCTCTCCGCCGCTTCATCGA
CTTCTTCCACCACCGTTACTTCTGACGACGACTGTTTTATTTTAAAAAACAACATTAATC
GAAAAATGAATTGAAAATCTCGTAGCTAAAATAGCTAACCCTAGAAGACAAAACACAAGA
AAATAAAAAGAAACTAAACGTAAATAAAATAAATAAAACAAGAAGAAGAGTTTGAAGTAC
GTTGTTGAGAGTGGTGGTGAGACATGATGAAGAAGAACGTAAAGGAAAGAGTTTGAAGTA
AGAGAGAACTGATTCGGGAGAAGACGGCGAGGAGACAGAGAGATGACAAGAAGGATCGTC
GGAGGAGAGAAATCCGTTACGGTGGTTAAGGGAGTAGAAGAAGAGGATGATGACGAGTAA
TGGATA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RR2D725JQ 663 0 0
AAAGTAAAAGCGTTGAGATAGATAGATCCATTTGATGCGAATCCCGAATCCGAACCGTTC
CTCCGATCACGACGACGACGGAGATCCTCTTCTCCTGCTTTCTTTATGGATGCTCTTGCC
ATCGCCAAACCTTTTTCGATTCTCTCCGCCGCTTCATCGACTTCTTCCACCACCGTTACT
TCTGACGACGACTGTTTTATTTTAAAAAACAACATTAATCGAAAAATGAATTGAAAATCT
CGTAGCTAAAATAGCTAACCCTAGAAGACAAAACACAAGAAAATAAAAAGAAACTAAACG
TAAATAAAATAAATAAAACAAGAAGAAGAGTTTGAAGTACGTTGTTGAGAGTGGTGGTGA
GACATGATGAAGAAGAACGTAAAGGAAAGAGTTTGAAGTAAGAGAGAACTGATTCGGGAG
AAGACGGCGAGGAGACAGAGAGATGACAAGAAGGATCGTCGGAGGAGAGAAATCCGTTAC
GGTGGTTAAGGGAGTAGAAGAAGAGGATGATGACGAGTAATGGATATAACGCAAACGGCA
TCGTACATGTGAGATCCGCCATTAGTTTGTAACTTATACCTTCTTCTTCTACTTCAAGGC
GTGAAGAGGATGATTTGTTGTGTTTTTATTAAAGAAGAATAAAGGATGATATGAGAATTT
TAT

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL7955Contig1 671 2 2 U
GGGGGTTTGCAGATATTCAAACAAACTCACCCCCTTTTACTCGCCTCTCTAGCCGATTCT
CAACAGCTGATTAGGGTTTCTGGATTCCGATTGAAAAACCGTTCCTTTCCTCGGTTCCAG
CGGATTGTCCGAATCCGAAGTGTGCAATCCTGAAAAGATAGCAGAGAAAGGAGGAGGAGG
ATGACGGATTCGAGCGCGATGATGCCGGTGGAGATGGCACAATTCGTCGCGACGGCGATG
ACGAATTGGTGGGACGATGTTAATGAGTCAACTGAGTGGCAAGATGGGATCTTCTTCTCT
CTCTGTGGAGCTTATGCTCTTGTCTCAGCCATCGCTCTCGTCCAGTTGGTGAGGATCCAA
ATGAGAGTGCCTGAGTATGGCTGGACCACTCAGAAGGTGTTTCATCTTATGAACTTTGTC
GTCAATGGAGTTCGTGCGGTTCTGTTTGGATTTCACCATCAAGTCTTTCTCGTGCATCCC
AAGGCTCTTTGCTGGATACTATTGGATCTCCCGGGCCTTCTCTTTTTCTCGGCATACACA
CTTCTCGTGCTCTTCTGGGCAGAGATATATCACCAGGCGAGAAGTTTACCAACGGATAAG
CTGCGGATAACCTATATCTCAGTCAATGTGGCTGTATATTTGGCTCAGTTGTAATCTGGG
TATACATCTGG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2GD23TF U 1
AF RR2C950TF U 2
BS 1 566 RR2GD23TF
BS 567 671 RR2C950TF

RD RR2GD23TF 566 0 0
GGGGGTTTGCAGATATTCAAACAAACTCACCCCCTTTTACTCGCCTCTCTAGCCGATTCT
CAACAGCTGATTAGGGTTTCTGGATTCCGATTGAAAAACCGTTCCTTTCCTCGGTTCCAG
CGGATTGTCCGAATCCGAAGTGTGCAATCCTGAAAAGATAGCAGAGAAAGGAGGAGGAGG
ATGACGGATTCGAGCGCGATGATGCCGGTGGAGATGGCACAATTCGTCGCGACGGCGATG
ACGAATTGGTGGGACGATGTTAATGAGTCAACTGAGTGGCAAGATGGGATCTTCTTCTCT
CTCTGTGGAGCTTATGCTCTTGTCTCAGCCATCGCTCTCGTCCAGTTGGTGAGGATCCAA
ATGAGAGTGCCTGAGTATGGCTGGACCACTCAGAAGGTGTTTCATCTTATGAACTTTGTC
GTCAATGGAGTTCGTGCGGTTCTGTTTGGATTTCACCATCAAGTCTTTCTCGTGCATCCC
AAGGCTCTTTGCTGGATACTATTGGATCTCCCGGGCCTTCTCTTTTTCTCGGCATACACA
CTTCTCGTGCTCTTCTGGGCAGAGAT

QA 1 566 1 566
DS 

RD RR2C950TF 670 0 0
GGGGTTTGCAGATATTCAAACAAACTCACCCCCTTTTACTCGCCTCTCTAGCCGATTCTC
AACAGCTGATTAGGGTTTCTGGATTCCGATTGAAAAACCGTTCCTTTCCTCGGTTCCAGC
GGATTGTCCGAATCCGAAGTGTGCAATCCTGAAAAGATAGCAGAGAAAGGAGGAGGAGGA
TGACGGATTCGAGCGCGATGATGCCGGTGGAGATGGCACAATTCGTCGCGACGGCGATGA
CGAATTGGTGGGACGATGTTAATGAGTCAACTGAGTGGCAAGATGGGATCTTCTTCTCTC
TCTGTGGAGCTTATGCTCTTGTCTCAGCCATCGCTCTCGTCCAGTTGGTGAGGATCCAAA
TGAGAGTGCCTGAGTATGGCTGGACCACTCAGAAGGTGTTTCATCTTATGAACTTTGTCG
TCAATGGAGTTCGTGCGGTTCTGTTTGGATTTCACCATCAAGTCTTTCTCGTGCATCCCA
AGGCTCTTTGCTGGATGCTATTGGATCTCCCGGGCCTTCTCTTTTTCTCGGCATACACAC
TTCTCGTGCTCTTCTGGGCAGAGATATATCACCAGGCGAGAAGTTTACCAACGGATAAGC
TGCGGATAACCTATATCTCAGTCAATGTGGCTGTATATTTGGCTCAGTTGTAATCTGGGT
ATACATCTGG

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL7956Contig1 1146 2 4 U
GGGTTTAGTTTCACGCTTTCAAAATATCTCCTCCTCCGACTCTTCAGCTTCATCTTCTCC
AATTTCTAAATTTTTTTTTTGTATAACCTTCATAATTAATGATAATCTTAAAACCATTCT
TGAATGTTCTTTTCCCCTTCCACTTGATCCTTCTCCTATATAAATTTCTATGACTAAACC
TTAATCCATCCAAATCAACCTACTCTGAAGAAGCTACATCCATGCCCATTCGCTTCTATT
TCAACGACGTCTCTACAGTCTCGACCAGAACCAGCTAAGTTAGAGCTTCGATTTCAGTTA
GTCCATTTCTGGGAGGCAAGAAACATTGCTAAAGGTGAAACCTTTATTTGGTTGGAGCTC
CTCATTGAAAAATCAACTAATTAGATTTCTCAAATCAGCCATGTCATTTAGGTAAACATT
AAAACAATTTCAGTTTGATTGTTGTATTTTTCTGTGTGATAACTCAAACGATTCCTCTTT
CTTGCTCTGAAAAACATATATATTTTCAATAAATCTCTCCTTTTTTTTTTGGCCAAGCGT
GATCCAATATTAATCAGAACTTCTTTATCGGAATAATTTTCTCAGCAATCGAATTGAAAA
AGGTATTACGTCTTTCTCTAGGTCTATTTTGTTTGTTTTACAGAGACTGCCTTCCCAACA
AACGTAACAATTTAGCTGCTCCTTTCTATCCAACGTAACTATATGAAACGATTGATGAAG
ATCCAGCCGGAGTCAACATGCAACCAGTGCTTAACCTGGCCTCAAGCGTCTATTTCATCA
TTGGCTGTTTACTAATGTGTTTAGTTGTTCAATCTCCGAGAAACCATTCCTCGATGTGAC
GGAGTTCCAAGCTGGTAGACATTTCTCTTCTCAAACCTACTCTTCACCAAATCTATTTGA
CTGATGAACTAAGACTTGCTAATTTTCAGGGTTCTAGCTCTCTGTTGAGTGCATGATGCA
GAAGCCAAGCTGGTGCTGCTACGAAAACTGATTGATCATTCAGTACCTCACCTGGTTGGG
AGGCAAAGAATCTGCGAAGCTGATAAAAAAGAAATTAACAAGAGTGTGTAATACCAAGCT
AACAACTTATAAAACCATTTAGGTCTTCTTGAATATTTCCATATTTCTAATATATATTTT
CCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RR2D658TF U 1
AF RR2D658JQ C 385
BS 1 621 RR2D658TF
BS 622 622 RR2D658JQ
BS 623 702 RR2D658TF
BS 703 1146 RR2D658JQ

RD RR2D658TF 702 0 0
GGGTTTAGTTTCACGCTTTCAAAATATCTCCTCCTCCGACTCTTCAGCTTCATCTTCTCC
AATTTCTAAATTTTTTTTTTGTATAACCTTCATAATTAATGATAATCTTAAAACCATTCT
TGAATGTTCTTTTCCCCTTCCACTTGATCCTTCTCCTATATAAATTTCTATGACTAAACC
TTAATCCATCCAAATCAACCTACTCTGAAGAAGCTACATCCATGCCCATTCGCTTCTATT
TCAACGACGTCTCTACAGTCTCGACCAGAACCAGCTAAGTTAGAGCTTCGATTTCAGTTA
GTCCATTTCTGGGAGGCAAGAAACATTGCTAAAGGTGAAACCTTTATTTGGTTGGAGCTC
CTCATTGAAAAATCAACTAATTAGATTTCTCAAATCAGCCATGTCATTTAGGTAAACATT
AAAACAATTTCAGTTTGATTGTTGTATTTTTCTGTGTGATAACTCAAACGATTCCTCTTT
CTTGCTCTGAAAAACATATATATTTTCAATAAATCTCTCCTTTTTTTTTTGGCCAAGCGT
GATCCAATATTAATCAGAACTTCTTTATCGGAATAATTTTCTCAGCAATCGAATTGAAAA
AGGTATTACGTCTTTCTCTAG*TCTATTTTGTTTGTTTTACAGAGACTGCCTTCCCAACA
AACGTAACAATTTAGCTGCTCCTTTCTATCCAACGTAACTAT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RR2D658JQ 762 0 0
ATTTCTCAAATCAGCCATGTCATTTAGGTAAACATTAAAACAATTTCAGTTTGATTGTTG
TATTTTTCTGTGTGATAACTCAAACGATTCCTCTTTCTTGCTCTGAAAAACATATATATT
TTCAATAAATCTCTCCTTTTTTTTTTGGCCAAGCGTGATCCAATATTAATCAGAACTTCT
TTATCGGAATAATTTTCTCAGCAATCGAATTGAAAAAGGTATTACGTCTTTCTCTAGGTC
TATTTTGTTTGTTTTACAGAGACTGCCTTCCCAACAAACGTAACAATTTAGCTGCTCCTT
TCTATCCAACGTAACTATATGAAACGATTGATGAAGATCCAGCCGGAGTCAACATGCAAC
CAGTGCTTAACCTGGCCTCAAGCGTCTATTTCATCATTGGCTGTTTACTAATGTGTTTAG
TTGTTCAATCTCCGAGAAACCATTCCTCGATGTGACGGAGTTCCAAGCTGGTAGACATTT
CTCTTCTCAAACCTACTCTTCACCAAATCTATTTGACTGATGAACTAAGACTTGCTAATT
TTCAGGGTTCTAGCTCTCTGTTGAGTGCATGATGCAGAAGCCAAGCTGGTGCTGCTACGA
AAACTGATTGATCATTCAGTACCTCACCTGGTTGGGAGGCAAAGAATCTGCGAAGCTGAT
AAAAAAGAAATTAACAAGAGTGTGTAATACCAAGCTAACAACTTATAAAACCATTTAGGT
CTTCTTGAATATTTCCATATTTCTAATATATATTTTCCATTT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL7957Contig1 478 2 1 U
GAGACACAATCGACGACGACTAGCTGAGAAGAAGAGAGTGAGAGAGATCAGATAGTGAGA
AAAAATGCCGGTGATGGAAAAACTGAGGATGTTCGTGGCGCAGGAGCCTGTTGTCGCCGC
CTCCTGTTTAATCGGCGGTGTTGGGCTCTTTCTGCCTGCTGTTGTGAGGCCTATTCTAGA
CTCACTCGAGGCTTCTAAGCAAGTTAAAGCGCCTCCTCTTACCGATGTTATTGCTGGTGT
CACAGGGAAGAAACAGACCTAATCCAAAGCAATGATTTCCTCTGTTTTCTTACATTCAGA
TCATCATTATTCCTTTTTTGTCTTTAACTCTTTCTATTTACAAATGAAATAAGCCAGACT
CCATGTTTTTTCTTTTGTTCTGAAACTTATATAAAGGCATGTGTGTTTGTACACTCCCTC
TTCATCTTTTTATCACATGTATTCATGGCTAATCAAAAAGCTTGAAAGTTGTGTTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2H252JQ C 1
AF RR2H252TF U 1
BS 1 478 RR2H252TF

RD RR2H252JQ 478 0 0
GAGACACAATCGACGACGACTAGCTGAGAAGAAGAGAGTGAGAGAGATCAGATAGTGAGA
AAAAATGCCGGTGATGGAAAAACTGAGGATGTTCGTGGCGCAGGAGCCTGTTGTCGCCGC
CTCCTGTTTAATCGGCGGTGTTGGGCTCTTTCTGCCTGCTGTTGTGAGGCCTATTCTAGA
CTCACTCGAGGCTTCTAAGCAAGTTAAAGCGCCTCCTCTTACCGATGTTATTGCTGGTGT
CACAGGGAAGAAACAGACCTAATCCAAAGCAATGATTTCCTCTGTTTTCTTACATTCAGA
TCATCATTATTCCTTTTTTGTCTTTAACTCTTTCTATTTACAAATGAAATAAGCCAGACT
CCATGTTTTTTCTTTTGTTCTGAAACTTATATAAAGGCATGTGTGTTTGTACACTCCCTC
TTCATCTTTTTATCACATGTATTCATGGCTAATCAAAAAGCTTGAAAGTTGTGTTCCC

QA 1 478 1 478
DS 

RD RR2H252TF 478 0 0
GAGACACAATCGACGACGACTAGCTGAGAAGAAGAGAGTGAGAGAGATCAGATAGTGAGA
AAAAATGCCGGTGATGGAAAAACTGAGGATGTTCGTGGCGCAGGAGCCTGTTGTCGCCGC
CTCCTGTTTAATCGGCGGTGTTGGGCTCTTTCTGCCTGCTGTTGTGAGGCCTATTCTAGA
CTCACTCGAGGCTTCTAAGCAAGTTAAAGCGCCTCCTCTTACCGATGTTATTGCTGGTGT
CACAGGGAAGAAACAGACCTAATCCAAAGCAATGATTTCCTCTGTTTTCTTACATTCAGA
TCATCATTATTCCTTTTTTGTCTTTAACTCTTTCTATTTACAAATGAAATAAGCCAGACT
CCATGTTTTTTCTTTTGTTCTGAAACTTATATAAAGGCATGTGTGTTTGTACACTCCCTC
TTCATCTTTTTATCACATGTATTCATGGCTAATCAAAAAGCTTGAAAGTTGTGTTCCC

QA 1 478 1 478
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7959Contig1 455 2 1 U
GAAGCAGAGTTCCGCGACGTCCATCAACAACTTGGGAAGAAGATTCTGAGATCAAGACAC
TCGAGTCTCTTCCATTGTATCACCAACACCTAGCTACAGCGAGGACACAGGTGCAAAACG
CAGTGAAACTGTTAGACTCAGGAGCTGTAAGGGCCACGAGGTTCCTTTGGCGGTACCCGA
TAGCTCGGATTCTCCTGCTTTTTTACCTTATCTTTGTTCATCTCTTTTTGATGTATCTAA
TACACCGGCTACAGGCGCAAGCCGAGGCCGAAGAAGTAGGGGACTCAATGGGCCTGACCA
ACAACGTTTTCAGACCATGACAGATTCTATAAATGGGGTTTTCAAGTTACCAAAGAACTT
ACGTATGGATTGTCTTAGAGAAGGTTTTGAACTTTTTATACCGAGGCTGCTTGTCACAAT
TTAATGTAGCAGCAGTTTTACTGTTTTGTTTATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RR2FC77JQ C 1
AF RR2FC77TF U 1
BS 1 455 RR2FC77TF

RD RR2FC77JQ 455 0 0
GAAGCAGAGTTCCGCGACGTCCATCAACAACTTGGGAAGAAGATTCTGAGATCAAGACAC
TCGAGTCTCTTCCATTGTATCACCAACACCTAGCTACAGCGAGGACACAGGTGCAAAACG
CAGTGAAACTGTTAGACTCAGGAGCTGTAAGGGCCACGAGGTTCCTTTGGCGGTACCCGA
TAGCTCGGATTCTCCTGCTTTTTTACCTTATCTTTGTTCATCTCTTTTTGATGTATCTAA
TACACCGGCTACAGGCGCAAGCCGAGGCCGAAGAAGTAGGGGACTCAATGGGCCTGACCA
ACAACGTTTTCAGACCATGACAGATTCTATAAATGGGGTTTTCAAGTTACCAAAGAACTT
ACGTATGGATTGTCTTAGAGAAGGTTTTGAACTTTTTATACCGAGGCTGCTTGTCACAAT
TTAATGTAGCAGCAGTTTTACTGTTTTGTTTATTC

QA 1 455 1 455
DS 

RD RR2FC77TF 455 0 0
GAAGCAGAGTTCCGCGACGTCCATCAACAACTTGGGAAGAAGATTCTGAGATCAAGACAC
TCGAGTCTCTTCCATTGTATCACCAACACCTAGCTACAGCGAGGACACAGGTGCAAAACG
CAGTGAAACTGTTAGACTCAGGAGCTGTAAGGGCCACGAGGTTCCTTTGGCGGTACCCGA
TAGCTCGGATTCTCCTGCTTTTTTACCTTATCTTTGTTCATCTCTTTTTGATGTATCTAA
TACACCGGCTACAGGCGCAAGCCGAGGCCGAAGAAGTAGGGGACTCAATGGGCCTGACCA
ACAACGTTTTCAGACCATGACAGATTCTATAAATGGGGTTTTCAAGTTACCAAAGAACTT
ACGTATGGATTGTCTTAGAGAAGGTTTTGAACTTTTTATACCGAGGCTGCTTGTCACAAT
TTAATGTAGCAGCAGTTTTACTGTTTTGTTTATTC

QA 1 455 1 455
DS 



AS 1 2

CO CL7960Contig1 1121 2 2 U
AAACCTTACCTAGTTGTGTGCTTCTTCATAAAGTGAAGAACCGTCGTGCACTGATCGTGT
CCCGCTACGATCATCAATAGTTATGGATAGAATGTGCGGTTTCCGTTCGGCAGGAGATTA
TCAGGAAAAGGCGGCGGTGGTTATGTCCTCTTCGGAGAGTCTTATGTTGTTGTCTGATTA
CCAGAACTTTATTTGTTCATCAGCCGGAGAGAACTACGTGTTTGGATCCGACGAGCTTTT
CTCAGCAGCAACAGCAGCTTCTGCTTTGTCCTCGGAGGCGGTTTCGATTGCTCCGCGTGT
TCGAAGAGCTGATCGGGACAATAACTTTATAAAGTCTAAAATCGCTTCTCATCCTTTGTA
TCCTCGCTTGCTTCAGACCTACATCGATTGCCAAAAGGTGGGAGCTCCTTTTGAGATAGC
GTGTGTGTTGGAAGAGATTCAGCGAGAGAACGATGTGTACAAAAGAGATGTGGCTCCTTT
ATCTTGTTATGGAGCTGATCCTGAGCTTGACGAGTTCATGGAAACATACTGCGATATATT
GGTTAAGTACAAATCCGATCTAGCGAGGCCGTTCGATGAGGCTACCACTTTCCTGAACAA
GATCGAAACGCAACTACAGGACCTGTGCACTGGTCCCGCTTCTGTTAGAGGCCTTTCAGA
TGATGGTGTAGTTTCATCAGACGAGGAACTGAGAGAAGGTGATGACGTAGCAACCCAGGA
CAGCCAACAAAGAAGTAATGACCGGGAACTCAAGGACCAGCTGCTACGTAAATTCGGTAG
CCATATCAGTTCATTGAAACTCGAGTTCTCTAAGAAGAAGAAAAAAGGGAAGCTACCAAG
AGAAGCAAGACAAGCATTGCTTGATTGGTGGAATGTTCATTATAAATGGCCATACCCAAC
CGAAGCTGACAAAATAGCGCTGGCTGAAGAAACGGGTTTGGATCAAAAACAAATCAACAA
CTGGTTTATAAACCAAAGGAAACGCCATTGGAAGCCTTCGGAAAACATGCCGTTCGCTAT
GATGGACGATTCTAGTGAAACATTCTTTACCGAAGAATGAAAAGTAACAGAATGTGCATT
GACATCATGCGTTGTATAATTTTATATTACATTGTTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2FB24TF U 1
AF RR2FB24JQ C 383
BS 1 642 RR2FB24TF
BS 643 1121 RR2FB24JQ

RD RR2FB24TF 642 0 0
AAACCTTACCTAGTTGTGTGCTTCTTCATAAAGTGAAGAACCGTCGTGCACTGATCGTGT
CCCGCTACGATCATCAATAGTTATGGATAGAATGTGCGGTTTCCGTTCGGCAGGAGATTA
TCAGGAAAAGGCGGCGGTGGTTATGTCCTCTTCGGAGAGTCTTATGTTGTTGTCTGATTA
CCAGAACTTTATTTGTTCATCAGCCGGAGAGAACTACGTGTTTGGATCCGACGAGCTTTT
CTCAGCAGCAACAGCAGCTTCTGCTTTGTCCTCGGAGGCGGTTTCGATTGCTCCGCGTGT
TCGAAGAGCTGATCGGGACAATAACTTTATAAAGTCTAAAATCGCTTCTCATCCTTTGTA
TCCTCGCTTGCTTCAGACCTACATCGATTGCCAAAAGGTGGGAGCTCCTTTTGAGATAGC
GTGTGTGTTGGAAGAGATTCAGCGAGAGAACGATGTGTACAAAAGAGATGTGGCTCCTTT
ATCTTGTTATGGAGCTGATCCTGAGCTTGACGAGTTCATGGAAACATACTGCGATATATT
GGTTAAGTACAAATCCGATCTAGCGAGGCCGTTCGATGAGGCTACCACTTTCCTGAACAA
GATCGAAACGCAACTACAGGACCTGTGCACTGGTCCCGCTTC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RR2FB24JQ 739 0 0
ATCGATTGCCAAAAGGTGGGAGCTCCTTTTGAGATAGCGTGTGTGTTGGAAGAGATTCAG
CGAGAGAACGATGTGTACAAAAGAGATGTGGCTCCTTTATCTTGTTATGGAGCTGATCCT
GAGCTTGACGAGTTCATGGAAACATACTGCGATATATTGGTTAAGTACAAATCCGATCTA
GCGAGGCCGTTCGATGAGGCTACCACTTTCCTGAACAAGATCGAAACGCAACTACAGGAC
CTGTGCACTGGTCCCGCTTCTGTTAGAGGCCTTTCAGATGATGGTGTAGTTTCATCAGAC
GAGGAACTGAGAGAAGGTGATGACGTAGCAACCCAGGACAGCCAACAAAGAAGTAATGAC
CGGGAACTCAAGGACCAGCTGCTACGTAAATTCGGTAGCCATATCAGTTCATTGAAACTC
GAGTTCTCTAAGAAGAAGAAAAAAGGGAAGCTACCAAGAGAAGCAAGACAAGCATTGCTT
GATTGGTGGAATGTTCATTATAAATGGCCATACCCAACCGAAGCTGACAAAATAGCGCTG
GCTGAAGAAACGGGTTTGGATCAAAAACAAATCAACAACTGGTTTATAAACCAAAGGAAA
CGCCATTGGAAGCCTTCGGAAAACATGCCGTTCGCTATGATGGACGATTCTAGTGAAACA
TTCTTTACCGAAGAATGAAAAGTAACAGAATGTGCATTGACATCATGCGTTGTATAATTT
TATATTACATTGTTTTGCC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL7961Contig1 1022 2 2 U
GTCCAAAACGCTGATTAATAACTGGAGCAAGGACAAGGCTGTCCCTGTAGTTACTGGCTT
CCTCGGAAAGGGATGGAGGTCTTGTGCTATAACTACGTTAGGCAGGGGTGGTAGTGATTT
GACGGCAACAACGATTGGGAAAGCGTTAGGACTGAGGGAGATTCAGGTTTGGAAAGATGT
GGATGGAGTTTTGACTTGTGATCCGAACATATACTCTGGAGCTCAGTCTGTTCCATGCTT
AACGTTCGATGAGGCAGCTGAGCTTGCTTACTTTGGTGCCCAGGTGTTGCATCCACTGTC
CATGAGGCCAGCAAGAGATGGTGACATTCCCGTGAGGGTTAAGAACTCGTACAACCCCAA
TGCTCCAGGAACTGTCATCACCAGGTCAAGAGACATGAGTAAGGCCGTTCTCACAAGCAT
TGTTCTGAAACGTAATGTGACCATGTTGGACATAGCAAGCACTCGTATGCTCGGCCAATA
TGGTTTCCTCGCCAAGGTGTTTACCACATTTGAAGACTTAGGCATATCGGTGGATGTTGT
GGCAACAAGTGAAGTTAGTATATCTCTGACACTTGATCCAGCAAAGCTCTGGGGTAGAGA
GTTAGTTCAGCGAGCAAATGAGCTAGATCATGTGGTGGAGGAGCTAGAGAAGATTGCTGT
TGTTAAGCTGCTTCAGCGCAGATCAATCATCTCTCTCATAGGAAACGTTCAGAAATCATC
ACTCATATTAGAGAAGGTTTTTAAAGTACTTAGAAGCAATGGAGTGAATGTGCAGATGAT
CTCACAGGGTGCATTTAAGGTGAACATTTCACTGATAGTGAATGATGAAGAGGCCGAGCA
ATGTGTGAGGGCTCTTCACTCTGCCTTCTTTGAGACCTCTTCTTGATGCACAAGACACAG
AGCTAAAGAATGTGTCTACTAAGACTTGGAACTACTTCACACTCTTCTTCTCTTTCTAGT
TGTTGTTGTGATACGGTTATAATGTTGTTTCAAACTCTATAATCAATAAAATGTCTTTCA
AC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2AF80TF U 1
AF RR2AF80JQ C 219
BS 1 783 RR2AF80TF
BS 784 1022 RR2AF80JQ

RD RR2AF80TF 783 0 0
GTCCAAAACGCTGATTAATAACTGGAGCAAGGACAAGGCTGTCCCTGTAGTTACTGGCTT
CCTCGGAAAGGGATGGAGGTCTTGTGCTATAACTACGTTAGGCAGGGGTGGTAGTGATTT
GACGGCAACAACGATTGGGAAAGCGTTAGGACTGAGGGAGATTCAGGTTTGGAAAGATGT
GGATGGAGTTTTGACTTGTGATCCGAACATATACTCTGGAGCTCAGTCTGTTCCATGCTT
AACGTTCGATGAGGCAGCTGAGCTTGCTTACTTTGGTGCCCAGGTGTTGCATCCACTGTC
CATGAGGCCAGCAAGAGATGGTGACATTCCCGTGAGGGTTAAGAACTCGTACAACCCCAA
TGCTCCAGGAACTGTCATCACCAGGTCAAGAGACATGAGTAAGGCCGTTCTCACAAGCAT
TGTTCTGAAACGTAATGTGACCATGTTGGACATAGCAAGCACTCGTATGCTCGGCCAATA
TGGTTTCCTCGCCAAGGTGTTTACCACATTTGAAGACTTAGGCATATCGGTGGATGTTGT
GGCAACAAGTGAAGTTAGTATATCTCTGACACTTGATCCAGCAAAGCTCTGGGGTAGAGA
GTTAGTTCAGCGAGCAAATGAGCTAGATCATGTGGTGGAGGAGCTAGAGAAGATTGCTGT
TGTTAAGCTGCTTCAGCGCAGATCAATCATCTCTCTCATAGGAAACGTTCAGAAATCATC
ACTCATATTAGAGAAGGTTTTTAAAGTACTTAGAAGCAATGGAGTGAATGTGCAGATGAT
CTC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RR2AF80JQ 804 0 0
GAGCTCAGTCTGTTCCATGCTTAACGTTCGATGAGGCAGCTGAGCTTGCTTACTTTGGTG
CCCAGGTGTTGCATCCACTGTCCATGAGGCCAGCAAGAGATGGTGACATTCCCGTGAGGG
TTAAGAACTCGTACAACCCCAATGCTCCAGGAACTGTCATCACCAGGTCAAGAGACATGA
GTAAGGCCGTTCTCACAAGCATTGTTCTGAAACGTAATGTGACCATGTTGGACATAGCAA
GCACTCGTATGCTCGGCCAATATGGTTTCCTCGCCAAGGTGTTTACCACATTTGAAGACT
TAGGCATATCGGTGGATGTTGTGGCAACAAGTGAAGTTAGTATATTTCTGACACTTGATC
CAGCAAAGCTCTGGGGTAGAGAGTTAGTTCAGCGAGCAAATGAGCTAGATCATGTGGTGG
AGGAGCTAGAGAAGATTGCTGTTGTTAAGCTGCTTCAGCGCAGATCAATCATCTCTCTCA
TAGGAAACGTTCAGAAATCATCACTCATATTAGAGAAGGTTTTTAAAGTACTTAGAAGCA
ATGGAGTGAATGTGCAGATGATCTCACAGGGTGCATTTAAGGTGAACATTTCACTGATAG
TGAATGATGAAGAGGCCGAGCAATGTGTGAGGGCTCTTCACTCTGCCTTCTTTGAGACCT
CTTCTTGATGCACAAGACACAGAGCTAAAGAATGTGTCTACTAAGACTTGGAACTACTTC
ACACTCTTCTTCTCTTTCTAGTTGTTGTTGTGATACGGTTATAATGTTGTTTCAAACTCT
ATAATCAATAAAATGTCTTTCAAC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7963Contig1 730 2 2 U
GGAATTCGCTTAAATCGAGAGTTGACTGACAGATCTCCACTCTCGACGGTAGAGAGAGGA
GCTGCTGCTCTCCGGCGAATCTGCGCAAGCCCTAACTCTCGTCAATGGCGGATCCGAGCT
CCAACACGAAGAAATACACTCCCCCTAATCAAAGGAATCCCTCTGGGAATAGCAAGAAGA
TAGGAGATCGTGCAAGTAGCCAGCAGCACAAGGATGGTGAGAGAAGTCAGCCTCTGGCTA
CTGGTTCTCAGATGGAGAAAGCTTCCCAAAAGATAGCCACTCTGAAGGACTGCGCTACGA
GTGAAGCTCATCAGCTTTTAAGCCAGCGCTGGGCAACTGCAATGCATCAATACAACGACC
CAACTGTGGATTTATCTGAACGACCAATCATGTACTATGGAGGGAGTGTTTGGGGCAAAC
TACCTCACCAGATCCTGGCTGCAGCAAACAATACATTACCTCCAAAGATATCGCCAGCTG
ATTACAGAGCTGAAGTGCGCCGAGGATTGCTGACTCCAAGAACTTCAAGTTCTAGCAACT
GAATGGTCTTTTAGACCACTGATATGGTGTTTGCTGCTTGTCGAGATGGCACAAAGCGGT
GATGTATCAATGACATTCTTCTTTTTCGGGTAGGATAAAAATGATTTCTTTCTGGCTCGA
GTCGTTTCTTCTGGTCCCTGAAAGTGTAGAAACCTAAACCAGAAAACTAACAATGACATT
AAGAATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RR2GX17TF U 1
AF RR2GX17JQ C 80
BS 1 728 RR2GX17TF
BS 729 730 RR2GX17JQ

RD RR2GX17TF 728 0 0
GGAATTCGCTTAAATCGAGAGTTGACTGACAGATCTCCACTCTCGACGGTAGAGAGAGGA
GCTGCTGCTCTCCGGCGAATCTGCGCAAGCCCTAACTCTCGTCAATGGCGGATCCGAGCT
CCAACACGAAGAAATACACTCCCCCTAATCAAAGGAATCCCTCTGGGAATAGCAAGAAGA
TAGGAGATCGTGCAAGTAGCCAGCAGCACAAGGATGGTGAGAGAAGTCAGCCTCTGGCTA
CTGGTTCTCAGATGGAGAAAGCTTCCCAAAAGATAGCCACTCTGAAGGACTGCGCTACGA
GTGAAGCTCATCAGCTTTTAAGCCAGCGCTGGGCAACTGCAATGCATCAATACAACGACC
CAACTGTGGATTTATCTGAACGACCAATCATGTACTATGGAGGGAGTGTTTGGGGCAAAC
TACCTCACCAGATCCTGGCTGCAGCAAACAATACATTACCTCCAAAGATATCGCCAGCTG
ATTACAGAGCTGAAGTGCGCCGAGGATTGCTGACTCCAAGAACTTCAAGTTCTAGCAACT
GAATGGTCTTTTAGACCACTGATATGGTGTTTGCTGCTTGTCGAGATGGCACAAAGCGGT
GATGTATCAATGACATTCTTCTTTTTCGGGTAGGATAAAAATGATTTCTTTCTGGCTCGA
GTCGTTTCTTCTGGTCCCTGAAAGTGTAGAAACCTAAACCAGAAAACTAACAATGACATT
AAGAATTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RR2GX17JQ 651 0 0
TCTGCGCAAGCCCTAACTCTCGTCAATGGCGGATCCGAGCTCCAACACGAAGAAATACAC
TCCCCCTAATCAAAGGAATCCCTCTGGGAATAGCAAGAAGATAGGAGATCGTGCAAGTAG
CCAGCAGCACAAGGATGGTGAGAGAAGTCAGCCTCTGGCTACTGGTTCTCAGATGGAGAA
AGCTTCCCAAAAGATAGCCACTCTGAAGGACTGCGCTACGAGTGAAGCTCATCAGCTTTT
AAGCCAGCGCTGGGCAACTGCAATGCATCAATACAACGACCCAACTGTGGATTTATCTGA
ACGACCAATCATGTACTATGGAGGGAGTGTTTGGGGCAAACTACCTCACCAGATCCTGGC
TGCAGCAAACAATACATTACCTCCAAAGATATCGCCAGCTGATTACAGAGCTGAAGTGCG
CCGAGGATTGCTGACTCCAAGAACTTCAAGTTCTAGCAACTGAATGGTCTTTTAGACCAC
TGATATGGTGTTTGCTGCTTGTCGAGATGGCACAAGGCGGTGATGTATCAATGACATTCT
TCTTTTTCGGGTAGGATAAAAATGATTTCTTTCTGGCTCGAGTCGTTTCTTCTGGTCCCT
GAAAGTGTAGAAACCTAAACCAGAAAACTAACAATGACATTAAGAATTTGC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL7964Contig1 760 2 2 U
GGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCAGAGCAAAAATGGCGATGGCAATGGCTCTTAGGAG
ACTTTCTTCTTCAGTTGACAAACCTATTCGTCCTCTTATCAGATCATCCTCGTGCTACAT
GTCTTCTTTGCCCAGTGAAGCAGTTGATGACAAGGAGAGATCTCGTGTAACTTGGCCAAA
ACAGCTTAACGCATCTTTGGAGGAAGTTGATCCTGAGATTGCTGACATCATTGAGCATGA
GAAAGCTAGACAGTGGAAAGGGCTTGAACTCATTCCATCTGAGAATTTCACATCTGTCTC
GGTGATGCAAGCTGTTGGCTCTGTGATGACTAACAAGTACAGTGAAGGGTACCCTGGTGC
TAGATACTATGGAGGAAATGAGTACATAGACATGGCGGAAACCTTGTGCCAAAGTAGCTG
AATACTTTGACAAAGCTGTGAAGCTGGCTCTCAAAGTCAAATCTGAAGCTCAAGGAACGA
AGCTGAAAGATTTTGTGTCAGCAATGGAATCGTCTTCAGGCATCCAATCAGAGATAGCCA
AGCTGCGCCACGACGTGGAGGAGTTCGCTAAGCAGTTCCCAACTATTGGGTTTGAGAAAG
AAACCATGAAGTACAAGAACTGAATATGTCTTTATTATCCTACAAACAAGTCTTCTCTTT
ATTATTATCATCACATGCTTTGAACTTCCATGTAATGTATAGATAATGCTACATGTACTC
CATCTTATGATATATGCGAAACATACTCACCTTTTAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RR2E696TF U 1
AF RR2E696JQ C 158
BS 1 515 RR2E696TF
BS 516 760 RR2E696JQ

RD RR2E696TF 515 0 0
GGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCAGAGCAAAAATGGCGATGGCAATGGCTCTTAGGAG
ACTTTCTTCTTCAGTTGACAAACCTATTCGTCCTCTTATCAGATCATCCTCGTGCTACAT
GTCTTCTTTGCCCAGTGAAGCAGTTGATGACAAGGAGAGATCTCGTGTAACTTGGCCAAA
ACAGCTTAACGCATCTTTGGAGGAAGTTGATCCTGAGATTGCTGACATCATTGAGCATGA
GAAAGCTAGACAGTGGAAAGGGCTTGAACTCATTCCATCTGAGAATTTCACATCTGTCTC
GGTGATGCAAGCTGTTGGCTCTGTGATGACTAACAAGTACAGTGAAGGGTACCCTGGTGC
TAGATACTATGGAGGAAATGAGTACATAGACATGGCGGAAACCTTGTGCCAAAGTAGCTG
AATACTTTGACAAAGCTGTGAAGCTGGCTCTCAAAGTCAAATCTGAAGCTCAAGGAACGA
AGCTGAAAGATTTTGTGTCAGCAATGGAATCGTCT

QA 1 515 1 515
DS 

RD RR2E696JQ 603 0 0
AGATCTCGTGTAACTTGGCCAAAACAGCTTAACGCATCTTTGGAGGAAGTTGATCCTGAG
ATTGCTGACATCATTGAGCATGAGAAAGCTAGACAGTGGAAAGGGCTTGAACTCATTCCA
TCTGAGAATTTCACATCTGTCTCGGTGATGCAAGCTGTTGGCTCTGTGATGACTAACAAG
TACAGTGAAGGGTACCCTGGTGCTAGATACTATGGAGGAAATGAGTACATAGACATGGCG
GAAACCTTGTGCCAAAGTAGCTGAATACTTTGACAAAGCTGTGAAGCTGGCTCTCAAAGT
CAAATCTGAAGCTCAAGGAACGAAGCTGAAAGATTTTGTGTCAGCAATGGAATCGTCTTC
AGGCATCCAATCAGAGATAGCCAAGCTGCGCCACGACGTGGAGGAGTTCGCTAAGCAGTT
CCCAACTATTGGGTTTGAGAAAGAAACCATGAAGTACAAGAACTGAATATGTCTTTATTA
TCCTACAAACAAGTCTTCTCTTTATTATTATCATCACATGCTTTGAACTTCCATGTAATG
TATAGATAATGCTACATGTACTCCATCTTATGATATATGCGAAACATACTCACCTTTTAA
TGC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL7965Contig1 1502 2 4 U
AGACCCATCTGAGATCACCGCCCTCCAAAGTCCCCAACTTTACGCCTCTGCCACCCTCTC
GCTCACGTTCGTTCTCCGTCTCTTGCACCATCGCGAAGGACCTAATGGCGGAGACAACCA
AGGCCGCTGGATCTGATCCGACCATGTGGAAACGACCCGATTCGTTCGGAAGGTTCGGGA
AGTTCGGTGGGAAGTACGTCCCCGAAACTCTTATGCACGCCCTCTCCGAACTCGAAACTG
CTTTCTACGCTCTTGCCACCGACGATGATTTCCAGAGGGAGTTGGCAGGGATCTTGAAAG
ACTACGTGGGTCGAGAAAGTCCTCTCTACTTTGCAGAGAGGTTCACGGAGCATTACCGCC
GAGAAAACGGCCAAGGACCGCTCATATACCTCAAGAGGGAAGACCTGAACCACACCGGTG
CTCACAAGATCAACAACGCCGTCGCTCAGGCCCTTCTCGCCAAGCGTTTAGGCAAGAAGA
GGATCATCGCCGAGACGGGAGCTGGACAGCACGGTGTAGCGACAGCTACCGTGTGTGCTC
GTTTCGGTTTGGAATGTATCATCTACATGGGTGCTCAGGACATGGAGAGACAAGCTCTCA
ACGTGTTCAGGATGCGTCTTCTCGGCGCTGAGGTGAGAGGGGTACACTCTGGGACGGCGA
CTCTGAAAGACGTGACGTCCGAAGCTATAAAGGGATTGGGTGACGAACGTGGAGACGACT
CATTACATATTGGGATCTGTTGCGGGTCCTCATCCTTACCCTATGATGGTCAGAGATTTT
CATGCGGTGATTGGTAAAGAGACGAGGAGACAAGCGATGGAGAAGTGGGGTGGGAAGCCT
GATGTATTGGTGGCTTGTGTTGGTGGTGGCTCGAATGCCATGGGACTCTTTCATGAGTTT
GTTGATGATGCTGAGGTTCGGATGATTGGTGTTGAAGCTGCTGGGTTTGGATTGGACAGT
GGCAAACACGCTGCCACGTTGACGAAAGGAGATGTTGGTGTGCTACACGGAGCTATGAGT
TACTTGCTGCAAGATGATGATGGACAAATCATTGAACCACACTCCATCAGTGCCGGCTTG
GACTATCCTGGAGTTGGACCTGAGCATAGTTTCCTTAAAGACATGGGACGTGCTGAATAC
TATAGTGTTACTGATGAAGAAGCCTTGGAAGCGTTCAAGAGAGTGTCTCGGTTGGAGGGA
ATAATCCCTGCTTTGGAGACGTCACATGCACTGGCTCATCTCGAGATGCTTTGTCCGACG
TTACCTGATGGAGCCAGAGTTGTTTTAAACTTCAGCGGGAGAGGTGATAAGGATGTTCAG
ACTGCCATCAAGTATCTTGAAGTTTAAAGAGAAGAATACTTGCGTTTTCAGACAGTGACA
TTTTCTTTTAGTGGTTTTGTTAGTTCTTGCTTCTGGTTTGGGAAACTCAAAATAGGAACT
AAGTATCAAGAAGAGAAAGGAAATTTTAAGAATGTAATCCTATAAATAAGACTCTTATGT
GG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RR2BE07TF U 1
AF RR2BE07JQ C 685
BS 1 812 RR2BE07TF
BS 813 813 RR2BE07JQ
BS 814 860 RR2BE07TF
BS 861 1502 RR2BE07JQ

RD RR2BE07TF 860 0 0
AGACCCATCTGAGATCACCGCCCTCCAAAGTCCCCAACTTTACGCCTCTGCCACCCTCTC
GCTCACGTTCGTTCTCCGTCTCTTGCACCATCGCGAAGGACCTAATGGCGGAGACAACCA
AGGCCGCTGGATCTGATCCGACCATGTGGAAACGACCCGATTCGTTCGGAAGGTTCGGGA
AGTTCGGTGGGAAGTACGTCCCCGAAACTCTTATGCACGCCCTCTCCGAACTCGAAACTG
CTTTCTACGCTCTTGCCACCGACGATGATTTCCAGAGGGAGTTGGCAGGGATCTTGAAAG
ACTACGTGGGTCGAGAAAGTCCTCTCTACTTTGCAGAGAGGTTCACGGAGCATTACCGCC
GAGAAAACGGCCAAGGACCGCTCATATACCTCAAGAGGGAAGACCTGAACCACACCGGTG
CTCACAAGATCAACAACGCCGTCGCTCAGGCCCTTCTCGCCAAGCGTTTAGGCAAGAAGA
GGATCATCGCCGAGACGGGAGCTGGACAGCACGGTGTAGCGACAGCTACCGTGTGTGCTC
GTTTCGGTTTGGAATGTATCATCTACATGGGTGCTCAGGACATGGAGAGACAAGCTCTCA
ACGTGTTCAGGATGCGTCTTCTCGGCGCTGAGGTGAGAGGGGTACACTCTGGGACGGCGA
CTCTGAAAGACGTGACGTCCGAAGCTATAAAGGGATTGGGTGACGAACGTGGAGACGACT
CATTACATATTGGGATCTGTTGCGGGTCCTCATCCTTACCCTATGATGGTCAGAGATTTT
CATGCGGTGATTGGTAAAGAGACGAGGAGACA*GCGATGGAGAAGTGGGGTGGGAAGCCT
GATGTATTGGTGGCTTGTGT

QA 1 860 1 860
DS 

RD RR2BE07JQ 818 0 0
GCTAT
AAGGGATTGGGTGACGAACGTGGAGACGACTCATTACATATTGGGATCTGTTGCGGGTCC
TCATCCTTACCCTATGATGGTCAGAGATTTTCATGCGGTGATTGGTAAAGAGACGAGGAG
ACAAGCGATGGAGAAGTGGGGTGGGAAGCCTGATGTATTGGTGGCTTGTGTTGGTGGTGG
CTCGAATGCCATGGGACTCTTTCATGAGTTTGTTGATGATGCTGAGGTTCGGATGATTGG
TGTTGAAGCTGCTGGGTTTGGATTGGACAGTGGCAAACACGCTGCCACGTTGACGAAAGG
AGATGTTGGTGTGCTACACGGAGCTATGAGTTACTTGCTGCAAGATGATGATGGACAAAT
CATTGAACCACACTCCATCAGTGCCGGCTTGGACTATCCTGGAGTTGGACCTGAGCATAG
TTTCCTTAAAGACATGGGACGTGCTGAATACTATAGTGTTACTGATGAAGAAGCCTTGGA
AGCGTTCAAGAGAGTGTCTCGGTTGGAGGGAATAATCCCTGCTTTGGAGACGTCACATGC
ACTGGCTCATCTCGAGATGCTTTGTCCGACGTTACCTGATGGAGCCAGAGTTGTTTTAAA
CTTCAGCGGGAGAGGTGATAAGGATGTTCAGACTGCCATCAAGTATCTTGAAGTTTAAAG
AGAAGAATACTTGCGTTTTCAGACAGTGACATTTTCTTTTAGTGGTTTTGTTAGTTCTTG
CTTCTGGTTTGGGAAACTCAAAATAGGAACTAAGTATCAAGAAGAGAAAGGAAATTTTAA
GAATGTAATCCTATAAATAAGACTCTTATGTGG

QA 6 818 6 818
DS 



